Sequence Modifications Mass Mass Fractional Part Protein Groups Proteins Gene Names Protein Names Unique (Groups) Unique (Proteins) Acetyl (Protein N-term) Oxidation (M) Missed cleavages Experiment C1218 Experiment C1277 Experiment C1368 Experiment C1403 Experiment C1438 Experiment C1563 Experiment C1576 Experiment DMIX1 Experiment DMIX3 Experiment DMIX4 Experiment DMIX5 Experiment DMIX7 Experiment DMIX8 Retention time Calibrated retention time Charges PEP MS/MS scan number Raw file Score Delta score Intensity Intensity C1218 Intensity C1277 Intensity C1368 Intensity C1403 Intensity C1438 Intensity C1563 Intensity C1576 Intensity DMIX1 Intensity DMIX3 Intensity DMIX4 Intensity DMIX5 Intensity DMIX7 Intensity DMIX8 Reverse Potential contaminant id Protein group IDs Peptide ID Evidence IDs MS/MS IDs Best MS/MS Oxidation (M) site IDs MS/MS Count AAAAAAAAAAAAAAAGAGAGAK Unmodified 1595.838 0.83796706 2654 P55011;G3XAL9 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 85.629 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115;116;117;118;119;120;121;122;123;124;125;126;127;128;129;130;131;132;133;134;135;136;137;138;139;140;141;142;143;144;145;146;147;148;149 136 34 AAAAAGAGSGPWAAQEK Acetyl (Protein N-term) 1554.7427 0.74266969 2833 P86791;P86790;F8WD66 CCZ1;CCZ1B Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog;Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 82.286 82.286 2 6.6183E-05 83891 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.245 66.791 50061000 0 27069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22992000 14 2833 13 113;114;115;116;117 150;151;152;153;154;155 154 6 AAAAAGLGGGGAGPGPEAGDFLAR Acetyl (Protein N-term) 2052.0025 0.0024662011 2221 P23610 F8A1 Factor VIII intron 22 protein yes yes 1 0 0 2 2 1 1 1 1 2 2 134.54 134.54 2;3 3.5981E-63 138699 QUIQUE_C1277_190116_001 162.37 149.81 245380000 38684000 58579000 0 0 31381000 0 34812000 0 0 13855000 0 39284000 28782000 15 2221 14 118;119;120;121;122;123;124;125;126;127;128;129 156;157;158;159;160;161;162;163;164;165;166;167 159 12 AAAAAGTATSQR Acetyl (Protein N-term) 1116.5523 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196 28 AAAAASAAGPGGLVAGK Unmodified 1338.7256 0.72556306 542 A6NIH7 UNC119B Protein unc-119 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 38.338 38.338 2 0.010887 34278 QUIQUE_C1218_190116_001 101.79 79.793 29055000 29055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18 542 17 154;155 210;211 210 1 AAAAASGAGGAAGAGTGGAGPAGR Acetyl (Protein N-term) 1795.8561 0.85613631 4561 Q9Y2K2 SIK3 Serine/threonine-protein kinase SIK3 yes yes 1 0 0 1 1 1 53.696 53.696 2 2.6543E-275 52072 QUIQUE_C1218_190116_001 276.59 262.62 85138000 38501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46637000 0 19 4561 18 156;157;158 212;213;214 212 3 AAAAASHLNLDALR Acetyl (Protein N-term) 1434.7579 0.75792582 2962 Q13049;Q5JVY0 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 104.98 104.98 2 4.456E-07 109584 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.57 101.9 316450000 0 58585000 42874000 0 52646000 0 41088000 0 0 21758000 51215000 48280000 0 20 2962 19 159;160;161;162;163;164;165;166 215;216;217;218;219;220;221;222 220 3 AAAAASHLNLDALR Unmodified 1392.7474 0.74736113 2962 Q13049;Q5JVY0 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes no 0 0 0 1 1 79.123 79.123 3 0.011386 81022 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.179 18.791 845500000 0 0 0 0 0 438530000 0 0 0 0 406970000 0 0 21 2962 19 167;168 223;224 224 2 AAAAELSLLEK Acetyl (Protein N-term) 1156.634 0.63395409 1523 O43324;D6RBD7;C9J1V9 EEF1E1;EEF1E1-BLOC1S5 Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1 yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 136.4 136.4 2 9.1694E-05 140608 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.48 94.406 766880000 0 88068000 83065000 65256000 12515000 68926000 60155000 75452000 64082000 39449000 75330000 73094000 61486000 22 1523 20 169;170;171;172;173;174;175;176;177;178;179;180;181;182 225;226;227;228;229;230;231;232;233;234;235;236;237;238;239;240;241;242;243;244;245;246;247;248 245 24 AAAAEQQQFYLLLGNLLSPDNVVR Acetyl (Protein N-term) 2671.397 0.39696528 1117 H0Y3V4 IPO5 yes yes 1 0 0 1 179.87 179.87 3 4.2527E-05 183464 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.175 45.711 30024000 0 0 0 0 0 0 0 0 30024000 0 0 0 0 23 1117 21 183 249 249 1 AAAAKPNNLSLVVHGPGDLR Acetyl (Protein N-term) 2041.1069 0.10687169 2848 Q00796;H0YKB3 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.828 83.828 3 1.8936E-37 85634 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.5 119.58 5478800000 204920000 278590000 248210000 248750000 419040000 0 397280000 595010000 839160000 97804000 768470000 560400000 821140000 24 2848 22 184;185;186;187;188;189;190;191;192;193;194;195 250;251;252;253;254;255;256;257;258;259;260;261;262;263 258 12 AAAAPNAGGSAPETAGSAEAPLQYSLLLQYLVGDKR Acetyl (Protein N-term) 3598.8267 0.82674025 4618 Q9Y584 TIMM22 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 yes yes 1 0 1 2 1 1 1 167.97 167.97 3 8.6193E-54 172457 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.52 102.99 179240000 0 0 0 0 0 0 0 41078000 31466000 0 0 56504000 50194000 25 4618 23 196;197;198;199;200 264;265;266;267;268 266 5 AAAAQLSLTQLSSGNPVYEK Acetyl (Protein N-term) 2089.0691 0.069148783 2449 P42566;B1AUU8 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.03 141.03 2;3 2.3923E-65 145298 QUIQUE_C1277_190116_001 223.72 209.03 398590000 0 70459000 37239000 34266000 0 24512000 34942000 42844000 50719000 16990000 0 41426000 45194000 26 2449 24 201;202;203;204;205;206;207;208;209;210;211;212;213 269;270;271;272;273;274;275;276;277;278;279;280;281;282;283 269 15 AAAAVQGGR Acetyl (Protein N-term) 841.44061 0.44061443 36 E9PL01;A0A087WUC6;E9PI68;Q15005 SPCS2 Signal peptidase complex subunit 2 yes no 1 0 0 2 1 1 28.461 28.461 2 0.021984 23016 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.604 37.076 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27 36 25 214;215;216;217 284;285;286;287 286 4 AAAAVSESWPELELAER Acetyl (Protein N-term) 1869.9109 0.91085723 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 1 0 0 2 1 1 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 155.98 155.98 2;3 2.8317E-75 160276 QUIQUE_C1277_190116_001 241.17 225.8 1171800000 94097000 94025000 101200000 114530000 70937000 63057000 76696000 95404000 122090000 49978000 114970000 94567000 80253000 28 3576 26 218;219;220;221;222;223;224;225;226;227;228;229;230;231;232;233;234;235;236;237;238 288;289;290;291;292;293;294;295;296;297;298;299;300;301;302;303;304;305;306;307;308;309;310;311;312;313 291 24 AAAAVVEFQR Acetyl (Protein N-term) 1102.5771 0.57710791 1388 O00231;J3QRY4 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 103.48 103.48 2 7.8154E-05 106519 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.52 91.83 364020000 0 0 81561000 0 78356000 56418000 39550000 0 74086000 34045000 0 0 0 29 1388 27 239;240;241;242;243;244;245;246;247;248 314;315;316;317;318;319;320;321;322;323;324;325 322 12 AAADGDDSLYPIAVLIDELR Acetyl (Protein N-term) 2158.0794 0.079379118 2309 P30153;C9J9C1;M0QXG4;M0R0K6 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 3 3 2 3 3 2 182.49 182.49 2;3 1.0852E-37 184816 QUIQUE_DMIX7_190116_001 194.48 174.74 2578400000 70864000 27887000 0 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CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 169.7 169.7 3 6.7162E-12 171244 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.33 104.75 187100000 0 18613000 0 13760000 37965000 0 0 40774000 36185000 11608000 0 0 28197000 33 528 31 277;278;279;280;281;282;283;284 357;358;359;360;361;362;363;364;365 360 7 AAAEAAVPR Unmodified 854.46102 0.46101552 4355 Q9NZQ3;C9JSC3;H7C2K2 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 16.504 16.504 2 0.029012 8644 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.721 29.857 17926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17926000 0 0 0 34 4355 32 285 366 366 1 AAAEAGGDDAR Acetyl (Protein N-term) 1044.4472 0.44721595 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.645 22.645 2 0.0019523 16204 QUIQUE_C1438_190116_001 72.643 63.78 468600000 0 33286000 49214000 51313000 37857000 32912000 47871000 0 34232000 0 61948000 52605000 67365000 35 531 33 286;287;288;289;290;291;292;293;294;295 367;368;369;370;371;372;373;374;375;376 370 10 AAAEDVNVTFEDQQK Unmodified 1663.7689 0.76894402 975 E9PQY2;Q9NQP4 PFDN4 Prefoldin subunit 4 yes no 0 0 0 1 58.365 58.365 2 0.0018086 56878 QUIQUE_C1403_190116_001 69.721 56.058 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36 975 34 296 377 377 1 AAAEEEPKPK Acetyl (Protein N-term) 1110.5557 0.55570376 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.604 17.604 2 0.0033845 9780 QUIQUE_C1563_190116_001 95.502 66.353 884860000 76163000 58468000 77423000 71971000 72397000 56308000 66277000 77681000 64578000 0 108970000 66895000 87735000 37 2663 35 297;298;299;300;301;302;303;304;305;306;307;308 378;379;380;381;382;383;384;385;386;387;388;389 383 6 AAAEPSPR Acetyl (Protein N-term) 839.41373 0.41373097 3256 Q53H96;F8WEI0 PYCRL Pyrroline-5-carboxylate reductase 3 yes no 1 0 0 1 1 1 22.52 22.52 2 0.0042216 15557 QUIQUE_C1563_190116_001 94.006 36.195 20960000 0 0 0 0 0 20960000 0 0 0 0 0 0 0 38 3256 36 309;310;311 390;391;392 391 3 AAAEVNQDYGLDPK Unmodified 1489.7049 0.7048872 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.078 51.078 2 2.6688E-10 49291 QUIQUE_C1277_190116_001 133.07 103.52 5721500000 562830000 398880000 494630000 426590000 413340000 436250000 460660000 359590000 459330000 209390000 547380000 436910000 515750000 39 1935 37 312;313;314;315;316;317;318;319;320;321;322;323;324 393;394;395;396;397;398;399;400;401;402;403;404;405;406;407;408;409;410;411;412;413;414;415;416;417;418;419;420 397 28 AAAFEEQENETVVVK Unmodified 1662.8101 0.81008055 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 60.383 60.383 2 8.196E-29 58649 QUIQUE_C1403_190116_001 160.36 128.51 103430000 0 0 0 45139000 0 0 0 35228000 0 23061000 0 0 0 40 4600 38 325;326;327 421;422;423 421 3 AAAFEQLQK Unmodified 1004.5291 0.52909508 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.192 35.192 2 3.0321E-06 30043 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.17 106.36 1489500000 110120000 125300000 131660000 130980000 62414000 120430000 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2 2 2 2 2 156.41 156.41 3;4 6.9015E-131 162054 QUIQUE_C1368_190116_001 157.45 153.82 7604300000 746850000 944140000 885970000 667490000 987620000 590420000 1048800000 105090000 283250000 95762000 454050000 362770000 432120000 43 3050 41 369;370;371;372;373;374;375;376;377;378;379;380;381;382;383;384;385;386;387;388;389;390;391;392;393;394 472;473;474;475;476;477;478;479;480;481;482;483;484;485;486;487;488;489;490;491;492;493;494;495;496;497;498;499;500;501;502;503;504;505;506;507;508;509;510;511;512;513;514;515;516;517;518;519;520;521 482 50 AAAGDLGGDHLAFSCDVAK Unmodified 1873.8629 0.86286118 3594 Q8N4T8;H0Y962 CBR4 Carbonyl reductase family member 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 72.288 72.288 2;3 5.7064E-29 72250 QUIQUE_C1368_190116_001 150.22 135.01 235340000 67835000 0 0 0 0 48349000 64593000 0 0 0 0 54564000 0 44 3594 42 395;396;397;398;399 522;523;524;525;526 523 3 AAAGEFADDPCSSVK Unmodified 1523.6562 0.65622244 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJ41 CTNNA1 Catenin alpha-1 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35334000 0 40704000 0 42606000 37416000 51176000 50 3669 48 435;436;437;438;439;440;441;442;443;444 564;565;566;567;568;569;570;571;572;573 573 3 AAAHCAHVFTTVSQITAIEAQHLLK Unmodified 2716.4119 0.41190384 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 105.18 105.18 3;4;5 8.2531E-09 109177 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.864 60.832 359260000 0 0 21268000 0 28049000 0 105480000 0 0 0 47521000 48357000 108590000 51 2068 49 445;446;447;448;449;450;451 574;575;576;577;578;579;580;581 579 8 AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGK Unmodified 2264.126 0.12595216 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 3 2 3 4 2 2 3 2 4 4 3 3 4 114.31 114.31 2;3 1.0182E-59 118088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.81 145.99 13773000000 1012000000 1147300000 1000900000 1236600000 1067500000 1158500000 1192700000 690000000 1143500000 586510000 1256800000 1040100000 1240200000 52 282 50 452;453;454;455;456;457;458;459;460;461;462;463;464;465;466;467;468;469;470;471;472;473;474;475;476;477;478;479;480;481;482;483;484;485;486;487;488;489;490 582;583;584;585;586;587;588;589;590;591;592;593;594;595;596;597;598;599;600;601;602;603;604;605;606;607;608;609;610;611;612;613;614;615;616;617;618;619;620;621;622;623;624;625;626;627;628;629;630;631;632;633;634;635;636;637;638 616 55 AAALEAMKDYTK Unmodified 1310.654 0.6540376 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 1 1 47.415 47.415 2 0.00045189 44318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.02 96.4 70581000 0 0 0 0 0 0 0 70581000 0 0 0 0 0 53 2343 51 491 639 639 1 AAALEFLNR Unmodified 1003.5451 0.5450795 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.347 78.347 2 1.2889E-07 79140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.11 117.37 3272200000 341660000 376870000 293300000 293610000 279810000 298510000 329720000 106300000 196810000 161380000 205380000 189780000 199090000 54 2343 52 492;493;494;495;496;497;498;499;500;501;502;503;504 640;641;642;643;644;645;646;647;648;649;650;651;652;653;654;655;656;657;658;659 651 20 AAALEFLNRFEEAKR Unmodified 1763.9319 0.93186744 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 2 1 92.556 92.556 4 0.018176 93442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.815 25.407 19649000 0 0 0 0 0 0 0 19649000 0 0 0 0 0 55 2343 53 505 660 660 1 AAALEQFK Unmodified 876.47052 0.47051757 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.641 33.641 2 0.010167 28134 QUIQUE_C1368_190116_001 91.626 60.958 775110000 182600000 0 111500000 126360000 0 0 0 153460000 0 72880000 0 0 128310000 56 2993 54 506;507;508;509;510;511 661;662;663;664;665;666 662 6 AAALSPEDETWEVLEEAPPPVFPLRPGGLPGLCEWLR Unmodified 4098.0561 0.056088261 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 1 1 2 1 169.68 169.68 3;4 4.2315E-32 175084 QUIQUE_C1576_190116_001 90.944 86.871 150420000 0 0 0 0 0 0 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processed yes yes 1 1 0 1 1 1 1 43.368 43.368 2 6.5837E-19 39882 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.1 115.22 12489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12489000 0 0 0 60 2768 57 528;529;530;531 683;684;685;686 684 2199 3 AAAMVPGR Acetyl (Protein N-term) 813.41671 0.41670786 1133 H0Y8X4;O43598 DNPH1 2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1 yes no 1 0 0 1 1 58.986 58.986 2 0.037332 58170 QUIQUE_C1277_190116_001 55.441 33.894 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61 1133 58 532;533 687;688 687 2 AAAPAPEEEMDECEQALAAEPK Unmodified 2356.0199 0.019891683 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 98.196 98.196 2;3 4.4873E-36 101786 QUIQUE_C1218_190116_001 163.8 154 546610000 65927000 56456000 55707000 62268000 43670000 80995000 42503000 0 0 0 41173000 43086000 54821000 62 2255 59 534;535;536;537;538;539;540;541;542;543;544 689;690;691;692;693;694;695;696;697;698;699;700;701 689 13 AAAPGTAVLLVTANVGSLFDDPENLQK Unmodified 2710.4178 0.4177603 3074 Q5T1B5;Q14642 INPP5A Type I inositol 1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 165.74 165.74 3 0.0002068 170848 QUIQUE_C1218_190116_001 44.161 40.45 147030000 31329000 0 27854000 0 0 0 0 0 24819000 0 63024000 0 0 63 3074 60 545;546;547;548 702;703;704;705 702 4 AAAPPSYCFVAFPPR Acetyl (Protein N-term) 1691.813 0.81299786 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 1 0 0 5 2 2 2 6 6 2 1 3 5 3 2 4 144.1 144.1 2 7.7583E-13 147696 QUIQUE_C1277_190116_001 131.28 114.65 2610800000 142740000 158780000 207400000 225090000 140710000 451590000 171640000 0 194830000 180670000 261810000 0 475510000 64 2941 61 549;550;551;552;553;554;555;556;557;558;559;560;561;562;563;564;565;566;567;568;569;570;571;572;573;574;575;576;577;578;579;580;581;582;583;584;585;586;587;588;589;590;591 706;707;708;709;710;711;712;713;714;715;716;717;718;719;720;721;722;723;724;725;726;727;728;729;730;731;732;733;734;735;736;737;738;739;740;741;742;743;744;745;746;747;748;749;750;751;752;753;754;755;756;757;758;759;760;761;762;763;764;765;766;767;768;769;770;771;772;773;774;775;776;777;778;779;780;781;782;783;784;785;786 713 80 AAAQCYIDLIIK Unmodified 1377.7326 0.73262227 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.8 121.8 2 0.00084481 125557 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.21 80.091 210610000 0 0 0 38993000 49232000 0 54308000 0 0 0 0 68077000 0 65 2629 62 592;593;594;595 787;788;789;790 790 4 AAAQLLQSQAQQSGAQQTK Unmodified 1956.0025 0.0024662011 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 41.545 41.545 2;3 1.2532E-132 37896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 289.72 279.11 21167000000 1890500000 1841100000 953040000 2045500000 2006400000 2469400000 1582900000 1853800000 986320000 701320000 1896500000 1488000000 1452100000 66 820 63 596;597;598;599;600;601;602;603;604;605;606;607;608;609;610;611;612;613;614;615;616;617;618;619;620;621 791;792;793;794;795;796;797;798;799;800;801;802;803;804;805;806;807;808;809;810;811;812;813;814;815;816;817;818;819;820;821;822;823 817 33 AAAQLLQSQAQQSGAQQTKK Unmodified 2084.0974 0.097429219 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 29.008 29.008 2;3 1.6158E-17 24242 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.62 110.06 780850000 0 0 0 0 0 0 0 331010000 112650000 0 118050000 110310000 108830000 67 820 64 622;623;624;625;626;627 824;825;826;827;828;829 825 6 AAASGSVLQR Acetyl (Protein N-term) 1000.5302 0.53015772 3338 Q5VWZ2 LYPLAL1 Lysophospholipase-like protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.603 51.603 2 0.00071266 49758 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.635 57.685 1488200000 140770000 0 138360000 98649000 151420000 132160000 101200000 113150000 144390000 57047000 134510000 151810000 124690000 68 3338 65 628;629;630;631;632;633;634;635;636;637;638;639 830;831;832;833;834;835;836;837;838;839;840;841 839 7 AAASTDYYK Unmodified 988.45018 0.45017606 1943 P08559 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 19.361 19.361 2 0.010766 12351 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.665 48.771 745330000 0 138560000 0 0 0 0 0 281710000 0 238060000 0 87005000 0 69 1943 66 640;641;642;643 842;843;844;845 843 2 AAATAEEPDPK Unmodified 1098.5193 0.51931826 3972 Q99733;C9JZI7;C9J6D1;A8MXH2;E9PKT8;H0YCI4 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 13.89 13.89 2 0.0009759 6187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.051 60.978 216680000 0 21288000 0 9992600 0 0 0 90447000 0 84912000 0 10038000 0 70 3972 67 644;645;646;647;648 846;847;848;849;850 848 5 AAATGPSFWLGNETLK Acetyl (Protein N-term) 1703.8519 0.85188578 2049 P12955 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.42 149.42 2 2.1288E-10 151937 QUIQUE_C1563_190116_001 158.4 140.13 3180100000 251390000 272650000 270740000 233580000 264030000 190190000 135790000 293760000 273850000 97311000 319490000 268790000 308570000 71 2049 68 649;650;651;652;653;654;655;656;657;658;659;660;661 851;852;853;854;855;856;857;858;859;860;861;862;863;864;865;866;867;868;869;870;871;872;873;874;875 861 25 AAATPEPAMAQPDSTAPEGATGQAPPSSK Unmodified 2735.2708 0.27083807 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 57.401 57.401 3 0.00013753 55807 QUIQUE_C1403_190116_001 43.256 36.144 42806000 0 0 0 42806000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72 872;3632 69 662 876 876 1 AAATPESQEPQAK Unmodified 1326.6416 0.64155866 2520 P49006 MARCKSL1 MARCKS-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.267 14.267 2 0.00017519 5853 QUIQUE_C1563_190116_001 142.83 121.38 3731100000 551620000 328770000 240340000 228100000 551220000 479250000 324820000 61655000 247070000 46527000 237430000 188280000 245970000 73 2520 70 663;664;665;666;667;668;669;670;671;672;673;674;675 877;878;879;880;881;882;883;884;885;886;887;888;889 882 13 AAATTSQPVLTSQQIETIFFK Unmodified 2280.2002 0.20016296 2020 P11274;H0Y554 BCR Breakpoint cluster region protein yes no 0 0 0 1 1 144.94 144.94 2 0.00080504 150876 QUIQUE_C1218_190116_001 67.964 49.135 30798000 0 0 0 0 0 0 0 30798000 0 0 0 0 0 74 2020 71 676;677 890;891 890 1 AAAVAAAGAGEPQSPDELLPK Acetyl (Protein N-term) 2004.0164 0.016384931 4280 Q9NS69 TOMM22 Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog yes yes 1 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 131.43 131.43 2;3 3.6328E-41 133835 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.29 158.52 899460000 99993000 68336000 73202000 95562000 52695000 64757000 90765000 52205000 57029000 38351000 75701000 61968000 68893000 75 4280 72 678;679;680;681;682;683;684;685;686;687;688;689;690;691;692;693;694;695;696;697 892;893;894;895;896;897;898;899;900;901;902;903;904;905;906;907;908;909;910;911;912;913;914;915;916;917;918 909 26 AAAVDPTPAAPAR Unmodified 1206.6357 0.63568542 3295 Q5SQI0 ATAT1 Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 25.38 25.38 2 0.02625 19407 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.094 28.535 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76 3295 73 698 919 919 1 AAAVLPVLDLAQR Unmodified 1335.7874 0.78743503 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 116.4 116.4 2;3 0.00043338 119097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.67 99.484 5937400000 620760000 537190000 563440000 409160000 436590000 412720000 523620000 311020000 434790000 175740000 547390000 473310000 491650000 77 856 74 699;700;701;702;703;704;705;706;707;708;709;710;711;712;713;714 920;921;922;923;924;925;926;927;928;929;930;931;932;933;934;935;936;937;938;939;940;941;942;943;944;945;946;947;948;949;950 939 31 AAAVPQR Acetyl (Protein N-term) 753.41334 0.41333704 2846 Q00688;G3V5F2 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes no 1 0 0 1 1 1 29.467 29.467 2 0.024433 24025 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.131 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kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.56 134.56 2 1.1974E-12 137612 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.09 122.23 209700000 0 0 38582000 15696000 27443000 17576000 0 29842000 35495000 17792000 0 27271000 0 82 1408 79 760;761;762;763;764;765;766;767 1011;1012;1013;1014;1015;1016;1017;1018 1015 8 AAAVSSVVR Acetyl (Protein N-term) 900.50288 0.50288033 532 A6NDU8;A0A0C4DGW6 C5orf51 UPF0600 protein C5orf51 yes no 1 0 0 1 74.879 74.879 2 0.019319 71023 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.436 31.287 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83 532 80 768 1019 1019 1 AAAYNLVQHGITNLCVIGGDGSLTGANIFR Unmodified 3101.5717 0.57165196 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 1 145.53 145.53 3;4 5.6573E-234 149761 QUIQUE_C1403_190116_001 176.7 170.98 4300500000 405820000 443790000 651360000 542070000 365670000 304250000 334940000 40068000 454930000 198190000 140890000 418530000 0 84 2129 81 769;770;771;772;773;774;775;776;777;778;779;780;781;782;783;784;785;786;787;788 1020;1021;1022;1023;1024;1025;1026;1027;1028;1029;1030;1031;1032;1033;1034;1035;1036;1037;1038;1039;1040;1041;1042;1043;1044;1045;1046;1047;1048;1049;1050;1051;1052;1053 1034 33 AACAQLNDFLQEYGTQGCQV Unmodified 2271.9889 0.98886633 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 143.88 143.88 2 5.5836E-06 150753 QUIQUE_C1438_190116_001 85.522 80.204 25116000 0 0 0 0 25116000 0 0 0 0 0 0 0 0 85 290;327;328 82 789 1054 1054 1 AACLCFR Unmodified 896.39968 0.39967759 6;4349;1765;3650 A0A024RBG1;Q96G61;Q8NFP7;Q9NZJ9;O95989 NUDT4;NUDT11;NUDT10;NUDT3 Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-beta;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-alpha;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 2;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.155 38.155 2 0.037484 33779 QUIQUE_C1277_190116_001 85.306 66.501 1024100000 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1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.813 30.813 2 0.0032345 25602 QUIQUE_C1438_190116_001 132.72 97.825 5857200000 467440000 475260000 507000000 574990000 446080000 361060000 509300000 336890000 473100000 172560000 461590000 559300000 512680000 89 2861 86 806;807;808;809;810;811;812;813;814;815;816;817;818 1074;1075;1076;1077;1078;1079;1080;1081;1082;1083;1084;1085;1086;1087;1088 1078 15 AADAEAEVASLNR Unmodified 1315.6368 0.63680763 1260;1908 J3KN67;P06753 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 43.98 43.98 2;3 7.4916E-06 41369 QUIQUE_C1218_190116_001 123.79 1.8939 1173900000 1007600000 40979000 38542000 42597000 0 29519000 0 0 0 14687000 0 0 0 90 1260;1908 87 819;820;821;822;823;824 1089;1090;1091;1092;1093;1094 1089 6 AADALEEQQR Unmodified 1129.5364 0.53636531 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.956 18.956 2 0.00026426 11808 QUIQUE_C1218_190116_001 126.24 101.4 526150000 32117000 43302000 72808000 39239000 48429000 65003000 0 52893000 42539000 28353000 62215000 0 39249000 91 3091 88 825;826;827;828;829;830;831;832;833;834;835;836 1095;1096;1097;1098;1099;1100;1101;1102;1103;1104;1105;1106 1095 12 AADAVEDLR Unmodified 958.47197 0.47197413 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.75 32.75 2 0.00048805 27589 QUIQUE_C1403_190116_001 114.89 39.785 1816300000 138750000 179130000 0 183180000 158530000 159660000 0 121200000 146980000 78479000 268090000 140850000 241450000 92 4510 89 837;838;839;840;841;842;843;844;845;846;847;848 1107;1108;1109;1110;1111;1112;1113;1114;1115;1116;1117;1118 1109 11 AADCEVEQWDSDEPIPAK Unmodified 2058.8841 0.88405013 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 87.183 87.183 2 2.1136E-38 88650 QUIQUE_C1277_190116_001 211.38 205.89 2040900000 181640000 181250000 248950000 201850000 172450000 147360000 216350000 79884000 155020000 54548000 136180000 140390000 124990000 93 4405 90 849;850;851;852;853;854;855;856;857;858;859;860;861;862 1119;1120;1121;1122;1123;1124;1125;1126;1127;1128;1129;1130;1131;1132;1133;1134;1135;1136;1137 1121 18 AADCEVEQWDSDEPIPAKELER Unmodified 2586.1544 0.15441133 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 97.125 97.125 3 8.9892E-12 101138 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.13 107.67 346570000 0 0 0 0 0 0 0 84868000 43273000 0 88483000 63321000 66625000 94 4405 91 863;864;865;866;867 1138;1139;1140;1141;1142;1143 1141 6 AADDFLEDLPLEETGAIER Unmodified 2103.0008 0.0007944461 3251 Q53G44 IFI44L Interferon-induced protein 44-like yes yes 0 0 0 1 1 1 150.1 150.1 2 1.1477E-07 157084 QUIQUE_C1438_190116_001 108.71 98.591 95246000 0 0 0 0 42243000 0 0 28895000 0 0 24108000 0 0 95 3251 92 868;869;870 1144;1145;1146 1144 3 AADDTWEPFASGK Unmodified 1393.615 0.61500956 1836 P02766;A0A087WT59;A0A087WV45 TTR Transthyretin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.345 86.345 2 5.5021E-17 87796 QUIQUE_C1277_190116_001 185.18 167.74 1480900000 121770000 137500000 159320000 218760000 170550000 184830000 171780000 131050000 106800000 78520000 0 0 0 96 1836 93 871;872;873;874;875;876;877;878;879;880 1147;1148;1149;1150;1151;1152;1153;1154;1155;1156;1157;1158;1159;1160 1149 14 AADEEAFEDNSEEYIR Unmodified 1886.7806 0.78063091 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.826 84.826 2 1.3484E-44 86528 QUIQUE_C1368_190116_001 184.03 169.57 501520000 37330000 56279000 45628000 0 44919000 47158000 44786000 31308000 38274000 0 52477000 46001000 57365000 97 2657 94 881;882;883;884;885;886;887;888;889;890;891 1161;1162;1163;1164;1165;1166;1167;1168;1169;1170;1171 1163 10 AADEEAFEDNSEEYIRR Unmodified 2042.8817 0.88174194 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 1 1 1 69.834 69.834 3 0.00019091 70056 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.407 47.124 61472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29339000 32133000 0 98 2657 95 892;893 1172;1173 1173 2 AADFEDLLSGQGFNAHK Unmodified 1818.8537 0.8536767 1607 O75061 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 113.51 113.51 3 0.0034128 118202 QUIQUE_C1218_190116_001 55.851 49.123 506580000 98896000 0 0 104050000 0 0 107960000 54362000 0 0 0 64265000 77047000 99 1607 96 894;895;896;897;898;899 1174;1175;1176;1177;1178;1179 1174 2 AADFIDQALAQK Unmodified 1289.6616 0.66156582 2580 P51452;K7ES89;K7ELG5 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.891 98.891 2 7.3026E-05 95696 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.24 121.48 452090000 186950000 0 0 0 0 0 0 181330000 0 83809000 0 0 0 100 2580 97 900;901;902;903;904 1180;1181;1182;1183;1184 1183 5 AADFQLHTHVNDGTEFGGSIYQK Unmodified 2534.1826 0.18261541 4545 Q9Y277 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 yes yes 0 0 0 3 3 3 3 2 3 3 4 3 2 3 2 3 78.875 78.875 2;3;4 7.6182E-128 79514 QUIQUE_DMIX1_190116_001 253.48 217.09 7775900000 796420000 678370000 650690000 683170000 421090000 672550000 636220000 578810000 570120000 446450000 551890000 519390000 570730000 101 4545 98 905;906;907;908;909;910;911;912;913;914;915;916;917;918;919;920;921;922;923;924;925;926;927;928;929;930;931;932;933;934;935;936;937;938;939;940;941 1185;1186;1187;1188;1189;1190;1191;1192;1193;1194;1195;1196;1197;1198;1199;1200;1201;1202;1203;1204;1205;1206;1207;1208;1209;1210;1211;1212;1213;1214;1215;1216;1217;1218;1219;1220;1221;1222;1223;1224;1225;1226;1227;1228;1229;1230;1231;1232;1233;1234;1235;1236;1237;1238;1239;1240;1241;1242;1243;1244;1245;1246;1247;1248 1222 64 AADGNYYNAR Unmodified 1113.4839 0.4839358 3457;1140 H0YB09;H0YB62;H0YB11;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.379 20.379 2 1.1857E-06 13413 QUIQUE_C1576_190116_001 160.75 156.33 3481000000 313460000 261890000 355710000 0 285750000 263570000 276920000 243870000 391120000 143210000 393830000 326760000 224880000 102 1140;3457 99 942;943;944;945;946;947;948;949;950;951;952;953 1249;1250;1251;1252;1253;1254;1255;1256;1257;1258;1259;1260 1254 10 AADIDQEVKER Unmodified 1272.631 0.63099397 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 21.06 21.06 2;3 0.00036428 14095 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.55 67.948 981470000 0 0 0 0 0 0 0 248120000 268520000 0 210780000 86377000 167680000 103 3499 100 954;955;956;957;958;959;960 1261;1262;1263;1264;1265;1266;1267;1268 1268 5 AADIHTFSSVLEK Unmodified 1416.7249 0.72489436 4080 Q9BZ71 PITPNM3 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3 yes yes 0 0 0 1 72.456 72.456 3 0.033286 73055 QUIQUE_DMIX3_190116_001 30.998 17.564 28056000 0 0 0 0 0 0 0 0 28056000 0 0 0 0 104 4080 101 961 1269 1269 1 AADISLDNLVEGK Unmodified 1343.6933 0.69325988 551 A6NNK5;Q12888;H7BZY0 TP53BP1 Tumor suppressor p53-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 101.35 101.35 2 0.025809 104638 QUIQUE_C1368_190116_001 63.212 37.826 69726000 0 0 31031000 0 0 38695000 0 0 0 0 0 0 0 105 551 102 962;963 1270;1271 1270 1 AADLLVNPLDPR Unmodified 1292.7089 0.70885036 2808 P78362;H7C5L6 SRPK2 SRSF protein kinase 2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 0 1 1 107.08 107.08 2 0.017643 111419 QUIQUE_C1576_190116_001 60.434 33.919 34068000 0 0 0 0 34068000 0 0 0 0 0 0 0 0 106 2808 103 964;965 1272;1273 1273 2 AADLLYAMCDR Unmodified 1297.5795 0.57949245 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.328 91.328 2 0.010187 95094 QUIQUE_C1218_190116_001 79.974 68.26 432010000 74990000 0 0 0 54825000 0 67576000 0 0 0 79095000 90755000 64764000 107 1749 104 966;967;968;969;970;971;972 1274;1275;1276;1277;1278;1279;1280;1281 1274 6 AADLNLEWISLPR Acetyl (Protein N-term) 1538.8093 0.80929269 4206 Q9HAU0 PLEKHA5 Pleckstrin homology domain-containing family A member 5 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 168.13 168.13 2 2.9826E-06 172995 QUIQUE_C1368_190116_001 125.22 104.44 100130000 17824000 14106000 32738000 12001000 0 19499000 0 0 0 3958100 0 0 0 108 4206 105 973;974;975;976;977;978 1282;1283;1284;1285;1286;1287 1284 6 AADMLSGPR Unmodified 916.44365 0.44365089 2295 P30038;Q5TF55 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.994 29.994 2 0.0023637 24953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.114 50.991 1474200000 150900000 151310000 310650000 222550000 0 152980000 0 160970000 129970000 75563000 0 119260000 0 109 2295 106 979;980;981;982;983;984;985;986;987 1288;1289;1290;1291;1292;1293;1294;1295;1296 1293 9 AADPGPGAELDPAAPPPAR Unmodified 1768.8744 0.87441214 1327 K7EL81;Q9BZL4 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 61.189 61.189 2 0.023347 60739 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.167 47.01 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 110 1327 107 988 1297 1297 1 AADRLPNLSSPSAEGPPGPPSGPAPR Unmodified 2494.2564 0.25644906 1592 O60784 TOM1 Target of Myb protein 1 yes yes 0 0 1 1 72.272 72.272 3 0.0014666 72806 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.167 50.272 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 111 1592 108 989 1298 1298 1 AADVENVPPVISTPHHYLISIYR Unmodified 2590.3544 0.35437219 4566 Q9Y2T2 AP3M1 AP-3 complex subunit mu-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 105.58 105.58 4 3.3613E-06 107919 QUIQUE_C1277_190116_001 65.425 60.193 96860000 44088000 36040000 0 0 0 0 0 0 0 16732000 0 0 0 112 4566 109 990;991;992 1299;1300;1301 1300 3 AADVLVYLADDTVVPLAVENLPSLSAHELHR Unmodified 3326.7511 0.75105611 978 E9PRA3;Q9BZ67 FRMD8 FERM domain-containing protein 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 162.44 162.44 4 2.9792E-06 167108 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.198 50.108 133220000 0 0 0 0 0 0 0 23862000 64841000 4458100 40059000 0 0 113 978 110 993;994;995;996 1302;1303;1304;1305 1303 4 AAEAAAAPAESAAPAAGEEPSKEEGEPK Unmodified 2635.2249 0.22493374 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 3 2 2 1 1 2 1 36.504 36.504 2;3;4 4.3363E-91 31835 QUIQUE_C1438_190116_001 216.35 209.77 9104500000 785420000 897000000 906270000 616230000 3698200000 718190000 719370000 94688000 0 156000000 270230000 0 242860000 114 2817 111 997;998;999;1000;1001;1002;1003;1004;1005;1006;1007;1008;1009;1010;1011;1012;1013;1014;1015;1016 1306;1307;1308;1309;1310;1311;1312;1313;1314;1315;1316;1317;1318;1319;1320;1321;1322;1323;1324;1325;1326;1327;1328;1329;1330 1318 24 AAEAAINILK Unmodified 1012.5917 0.59169534 1646 O75569;G5E9Q4;F8WEG8;C9JMM3 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.048 62.048 2 0.00046618 61385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.17 70.899 1154700000 115820000 101020000 118050000 83237000 0 102010000 85764000 83268000 99068000 0 146650000 96865000 122980000 115 1646 112 1017;1018;1019;1020;1021;1022;1023;1024;1025;1026;1027 1331;1332;1333;1334;1335;1336;1337;1338;1339;1340;1341;1342 1338 12 AAEAAPPTQEAQGETEPTEQAPDALEQAADTSR Unmodified 3379.5288 0.52877991 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 88.427 88.427 3 2.0359E-29 91069 QUIQUE_C1218_190116_001 90.323 81.136 77494000 36806000 0 0 0 40688000 0 0 0 0 0 0 0 0 116 3571 113 1028;1029 1343;1344 1343 2 AAEADGPLKR Acetyl (Protein N-term) 1068.5564 0.55637247 1250 J3QS48;I3L295;J3KT75;J3QW43;J3QRD5;O75352;J3KSI4;I3L1D2;I3L4E0 MPDU1 Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein yes no 1 0 1 1 31.688 31.688 2 0.023581 26517 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.476 57.291 42784000 0 0 0 0 0 0 0 42784000 0 0 0 0 0 117 1250 114 1030 1345 1345 1 AAEAGGAEEQYGFLTTPTK Unmodified 1939.9163 0.91633654 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.494 84.494 2 1.1777E-73 86029 QUIQUE_DMIX7_190116_001 227.42 215.81 5541700000 358370000 347170000 305500000 336770000 368510000 325870000 220470000 692850000 700200000 146380000 577730000 485590000 676320000 118 2483 115 1031;1032;1033;1034;1035;1036;1037;1038;1039;1040;1041;1042;1043 1346;1347;1348;1349;1350;1351;1352;1353;1354;1355;1356;1357;1358;1359;1360;1361;1362;1363;1364;1365 1362 20 AAEALAAEAVASR Acetyl (Protein N-term) 1270.6517 0.65172941 521 A2RTX5;B7ZLP8 TARSL2 Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.23 126.23 2 0.0011123 130615 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.403 80.445 212870000 0 0 21765000 0 29795000 0 22192000 32184000 33167000 0 0 34273000 39495000 119 521 116 1044;1045;1046;1047;1048;1049;1050 1366;1367;1368;1369;1370;1371;1372;1373 1371 6 AAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAK Oxidation (M) 2639.3953 0.39525072 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 150.09 150.09 3 3.045E-36 155517 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.84 100.13 1127000000 92744000 47654000 60618000 29298000 0 97709000 24455000 239790000 159930000 45475000 144570000 0 184740000 120 2483 117 1051;1052;1053;1054;1055;1056;1057;1058;1059;1060;1061;1062;1063;1064;1065;1066;1067;1068;1069 1374;1375;1376;1377;1378;1379;1380;1381;1382;1383;1384;1385;1386;1387;1388;1389;1390;1391;1392;1393;1394;1395;1396 1389 1903 22 AAEAVAAAVGTGATTAAVMAAAGIAAIGPAK Unmodified 2623.4003 0.4003361 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 4 2 3 4 1 3 166.14 166.14 2;3;4 1.1623E-53 167858 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.88 163.06 9658000000 536660000 412790000 369000000 519140000 444840000 378480000 479790000 1737900000 1481600000 245610000 1285200000 555310000 1211700000 121 2483 117 1070;1071;1072;1073;1074;1075;1076;1077;1078;1079;1080;1081;1082;1083;1084;1085;1086;1087;1088;1089;1090;1091;1092;1093;1094;1095 1397;1398;1399;1400;1401;1402;1403;1404;1405;1406;1407;1408;1409;1410;1411;1412;1413;1414;1415;1416;1417;1418;1419;1420;1421;1422;1423;1424;1425;1426;1427;1428;1429;1430;1431;1432;1433;1434;1435;1436;1437;1438;1439;1440 1418 42 AAECNIVVTQPR Unmodified 1356.682 0.68198369 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 39.26 39.26 2 0.016156 35277 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.595 52.66 529500000 88760000 0 0 79934000 151370000 0 122490000 0 0 0 86946000 0 0 122 2916 118 1096;1097;1098;1099;1100 1441;1442;1443;1444;1445 1445 4 AAEDDEDDDVDTK Unmodified 1436.5427 0.54269205 677 B8ZZQ6;P06454;B8ZZA1;B8ZZW7;H7C2N1 PTMA Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.648 17.648 2 2.9804E-06 9590 QUIQUE_C1277_190116_001 128.17 126.36 391950000 83408000 65796000 13037000 25894000 84973000 18505000 23917000 0 13798000 9105000 20060000 12586000 20876000 123 677 119 1101;1102;1103;1104;1105;1106;1107;1108;1109;1110;1111;1112 1446;1447;1448;1449;1450;1451;1452;1453;1454;1455;1456;1457 1447 11 AAEDDEDDDVDTKK Unmodified 1564.6377 0.63765507 677 B8ZZQ6;P06454;B8ZZA1;B8ZZW7;H7C2N1 PTMA Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 11.14 11.14 3 7.1153E-05 3763 QUIQUE_C1218_190116_001 84.566 80.964 92991000 9015800 0 0 8137200 14063000 0 0 22089000 18995000 10836000 0 9856000 0 124 677 120 1113;1114;1115;1116;1117;1118;1119 1458;1459;1460;1461;1462;1463;1464;1465;1466 1458 9 AAEDEEVPAFFK Unmodified 1351.6296 0.62959699 365 A0A1C7CYX9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.005 97.005 2 2.8606E-06 98224 QUIQUE_C1563_190116_001 138.11 128.32 1909700000 0 116210000 93213000 225850000 94961000 138320000 89598000 200740000 203910000 67149000 179910000 147350000 352460000 125 365 121 1120;1121;1122;1123;1124;1125;1126;1127;1128;1129;1130;1131;1132 1467;1468;1469;1470;1471;1472;1473;1474;1475;1476;1477;1478;1479;1480;1481;1482 1473 16 AAEDLFVNIR Unmodified 1146.6033 0.60332266 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 92.644 92.644 2 0.0059453 96368 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.738 62.361 422850000 0 0 42957000 0 37611000 0 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74727000 0 95041000 131 1005;2027 127 1162;1163;1164;1165 1519;1520;1521;1522;1523 1519 5 AAEEPQQQK Acetyl (Protein N-term) 1069.504 0.50400254 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYJ8;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.795 18.795 2 0.00020691 11076 QUIQUE_DMIX8_190116_001 134.06 108.12 2898700000 228350000 277150000 311030000 309470000 0 309090000 255790000 210310000 0 114190000 327140000 202600000 353520000 132 1282 128 1166;1167;1168;1169;1170;1171;1172;1173;1174;1175;1176 1524;1525;1526;1527;1528;1529;1530;1531;1532;1533;1534;1535;1536 1536 10 AAEGAEAQGFSGLFAAYTDHPPPFR Unmodified 2606.219 0.21900092 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 137.36 137.36 3 6.1198E-15 141419 QUIQUE_C1403_190116_001 73.389 70.703 149900000 0 0 0 49086000 0 0 38206000 0 0 0 0 0 62613000 133 4378 129 1177;1178;1179;1180;1181 1537;1538;1539;1540;1541;1542;1543 1537 7 AAEGGLSSPEFSELCIWLGSQIK Unmodified 2478.2101 0.21007572 3246 Q52LJ0 FAM98B Protein FAM98B yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 1 2 165.34 165.34 2;3 1.4161E-06 167233 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.527 62.946 425640000 48763000 35580000 0 18082000 0 0 58839000 77112000 53448000 0 56506000 77305000 0 134 3246 130 1182;1183;1184;1185;1186;1187;1188;1189;1190;1191;1192;1193;1194;1195 1544;1545;1546;1547;1548;1549;1550;1551;1552;1553;1554;1555;1556;1557 1553 13 AAEGVQEVSTACTWNGRPCSLSVHIDK Unmodified 2971.3916 0.39163868 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 80.266 80.266 3;4 1.5247E-18 81662 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.551 83.396 517770000 0 0 0 0 0 0 0 77530000 81517000 0 64814000 124110000 169790000 135 2994 131 1196;1197;1198;1199;1200;1201 1558;1559;1560;1561;1562;1563;1564 1562 7 AAEIGYEDPINPTYEATNAMYHR Unmodified 2625.1806 0.1805665 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.36 102.36 3 6.6115E-12 104409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.848 93.358 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Q8IWB7;C9JJ54 WDFY1 WD repeat and FYVE domain-containing protein 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.549 15.549 3 0.001367 7758 QUIQUE_C1576_190116_001 62.14 51.235 204430000 0 20641000 0 13591000 38054000 0 0 0 34673000 0 29248000 35470000 32758000 139 3536 134 1220;1221;1222;1223;1224;1225;1226;1227 1587;1588;1589;1590;1591;1592;1593;1594;1595 1590 8 AAELETDIR Unmodified 1016.5138 0.51383895 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 36.389 36.389 2 0.042693 32213 QUIQUE_C1368_190116_001 80.219 34.883 42558000 0 0 42558000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 140 1697 135 1228 1596 1596 0 AAELFHQLSQALEVLTDAAAR Unmodified 2253.1753 0.17534519 1165 S4R343;H0YLQ7;H0YK99;Q9NVM6 DNAJC17 DnaJ homolog subfamily C member 17 yes no 0 0 0 1 1 168.34 168.34 3 3.6335E-07 172813 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.165 51.519 100380000 0 0 0 0 0 0 0 26808000 73571000 0 0 0 0 141 1165 136 1229;1230 1597;1598 1598 2 AAELIANSLATAGDGLIELR Unmodified 1997.0793 0.079319539 2370 P35232;C9JW96 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 146.78 146.78 2;3 6.8106E-30 150817 QUIQUE_C1277_190116_001 182.57 161.56 6804000000 474660000 499400000 553680000 679350000 465910000 557870000 793150000 430340000 429300000 214590000 641540000 504630000 559580000 142 2370 137 1231;1232;1233;1234;1235;1236;1237;1238;1239;1240;1241;1242;1243;1244;1245;1246;1247;1248;1249;1250;1251;1252;1253;1254;1255;1256;1257;1258 1599;1600;1601;1602;1603;1604;1605;1606;1607;1608;1609;1610;1611;1612;1613;1614;1615;1616;1617;1618;1619;1620;1621;1622;1623;1624;1625;1626;1627;1628;1629;1630;1631;1632;1633;1634;1635;1636;1637;1638;1639;1640;1641;1642;1643;1644;1645;1646;1647;1648;1649;1650 1603 52 AAELQAQWER Unmodified 1200.5887 0.58873523 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 51.116 51.116 2 0.030725 49227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.816 38.079 139030000 0 0 0 0 0 0 0 58873000 80155000 0 0 0 0 143 1472 138 1259;1260 1651;1652 1651 1 AAEMMASLLK Unmodified 1063.5406 0.54058775 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 83.073 83.073 2 0.03093 83945 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.191 15.228 276820000 0 0 0 0 0 0 0 276820000 0 0 0 0 0 144 2355 139 1261 1653 1653 1 AAEQISWYKPWTK Unmodified 1606.8144 0.81437807 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 84.408 84.408 3 0.00035766 85373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.904 62.226 230740000 0 52998000 55538000 0 0 0 36689000 54841000 0 30672000 0 0 0 145 205 140 1262;1263;1264;1265;1266 1654;1655;1656;1657;1658 1657 5 AAESLADPTEYENLFPGLK Unmodified 2064.0052 0.0051515425 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.71 146.71 2 5.5995E-46 149529 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.48 129.33 776900000 0 0 110690000 115330000 147800000 101020000 0 100980000 104390000 34838000 61844000 0 0 146 2380 141 1267;1268;1269;1270;1271;1272;1273;1274 1659;1660;1661;1662;1663;1664;1665;1666;1667;1668 1664 8 AAESPDQKDTDGGPKEEESPV Unmodified 2184.9659 0.9658655 2634 P53985 SLC16A1 Monocarboxylate transporter 1 yes yes 0 0 2 1 28.711 28.711 3 1.2175E-05 23136 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.148 59.007 25060000 0 0 0 0 0 0 0 25060000 0 0 0 0 0 147 2634 142 1275 1669 1669 1 AAETQTLNFGPEWLR Acetyl (Protein N-term) 1773.8686 0.86859848 686 F8WCD5;C9JPV7;C9JXQ0;C9J0V6;C9JHT0;C9JRZ2;C9JHW1;E7ESB6;I1E4Y6;Q6Y7W6;C9JW88 GIGYF2 PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2 yes no 1 0 0 1 156.21 156.21 2 1.9001E-06 161166 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.66 86.28 20750000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20750000 148 686 143 1276 1670 1670 1 AAETTVVEVEEIVDIGAFAPEDIHIPQIYVHR Unmodified 3559.8199 0.81986396 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 4 1 166.07 166.07 3;4 2.5544E-26 170369 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.819 87.654 523350000 0 0 0 0 0 0 0 0 55699000 0 410440000 57210000 0 149 2673 144 1277;1278;1279;1280;1281;1282 1671;1672;1673;1674;1675;1676 1671 4 AAEVGDDFLGDFVVGER Unmodified 1794.8424 0.84244331 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 140.73 140.73 2 2.155E-11 144585 QUIQUE_C1403_190116_001 121.4 110.85 29658000 0 0 0 29658000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 150 4414 145 1283;1284 1677;1678 1677 2 AAEWLFPLAFSK Unmodified 1378.7285 0.72852317 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 151.87 151.87 2 0.010636 156996 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.979 56.942 75432000 0 0 0 0 0 0 0 0 33430000 0 0 0 42002000 151 3402 146 1285;1286 1679;1680 1679 2 AAEWQLDQPSWSGR Unmodified 1629.7536 0.75356872 4311 Q9NVZ3;F6SKB8;D6RAN6;H0Y970 NECAP2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.681 97.681 2 0.00023203 100461 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.33 103.6 524220000 0 53523000 62010000 68460000 61581000 55749000 0 62495000 57991000 36324000 0 66087000 0 152 4311 147 1287;1288;1289;1290;1291;1292;1293;1294;1295;1296 1681;1682;1683;1684;1685;1686;1687;1688;1689;1690;1691 1688 11 AAFALGGLGSGFASNR Unmodified 1494.7579 0.75792582 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 108.09 108.09 2 0.0017764 111708 QUIQUE_C1277_190116_001 62.258 39.023 43292000 0 0 0 0 0 0 0 0 43292000 0 0 0 0 153 1029 148 1297;1298 1692;1693 1692 2 AAFDDAIAELDTLSEESYK Unmodified 2086.9583 0.95826093 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 5 4 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 161.58 161.58 2;3 0 166595 QUIQUE_C1218_190116_001 344.47 322.24 95741000000 9688200000 9460700000 10631000000 9483200000 8070100000 10042000000 8874900000 2326100000 4528500000 4032900000 7577100000 6361200000 4665100000 154 2745 149 1299;1300;1301;1302;1303;1304;1305;1306;1307;1308;1309;1310;1311;1312;1313;1314;1315;1316;1317;1318;1319;1320;1321;1322;1323;1324;1325;1326;1327;1328;1329;1330;1331;1332;1333 1694;1695;1696;1697;1698;1699;1700;1701;1702;1703;1704;1705;1706;1707;1708;1709;1710;1711;1712;1713;1714;1715;1716;1717;1718;1719;1720;1721;1722;1723;1724;1725;1726;1727;1728;1729;1730;1731;1732;1733;1734;1735;1736;1737;1738;1739;1740;1741;1742;1743;1744;1745;1746;1747;1748;1749;1750;1751;1752;1753;1754;1755;1756;1757;1758;1759;1760;1761;1762;1763;1764;1765;1766;1767;1768;1769;1770;1771;1772 1700 78 AAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLR Unmodified 3257.6013 0.60133991 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 1 1 1 1 2 178.55 178.55 3;4 6.2208E-110 185232 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.13 174.87 456500000 0 0 0 0 0 4037300 0 0 18314000 0 434150000 0 0 155 2745 150 1334;1335;1336;1337;1338 1773;1774;1775;1776;1777 1776 5 AAFDDAIAELDTLSEESYKDSTLIMQLLR Oxidation (M) 3273.5963 0.59625453 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 1 1 2 1 2 1 175.2 175.2 3;4 2.1543E-109 178686 QUIQUE_DMIX7_190116_001 185.35 176.7 4124100000 0 0 0 0 38628000 0 0 0 632960000 0 2671000000 749930000 31588000 156 2745 150 1339;1340;1341;1342;1343;1344;1345 1778;1779;1780;1781;1782;1783;1784;1785 1783 2173 7 AAFEALQVK Unmodified 975.53893 0.53893149 3406 Q6UWE0 LRSAM1 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 yes yes 0 0 0 1 56.93 56.93 2 0.052917 55796 QUIQUE_C1576_190116_001 49.933 22.446 28520000 0 0 0 0 0 0 28520000 0 0 0 0 0 0 157 3406 151 1346 1786 1786 1 AAFECMYTLLDSCLDR Unmodified 1963.8478 0.84780474 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 2 2 1 1 2 152.85 152.85 2;3 3.9478E-06 158527 QUIQUE_C1218_190116_001 132.79 117.59 1387900000 211520000 133160000 119100000 181530000 104660000 170880000 108150000 0 103120000 54013000 50904000 51499000 99387000 158 3499 152 1347;1348;1349;1350;1351;1352;1353;1354;1355;1356;1357;1358;1359;1360;1361;1362;1363;1364 1787;1788;1789;1790;1791;1792;1793;1794;1795;1796;1797;1798;1799;1800;1801;1802;1803;1804;1805;1806;1807;1808 1788 20 AAFFVTLDETEEGYR Unmodified 1746.8101 0.81008055 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 123.68 123.68 2 0.032205 127273 QUIQUE_C1403_190116_001 54.471 47.343 27628000 0 0 0 27628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 159 2562 153 1365 1809 1809 0 AAFGEEVDAVDTGISR Unmodified 1635.774 0.77402939 1393 O00273 DFFA DNA fragmentation factor subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 91.654 91.654 2 2.3713E-06 93909 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.745 74.416 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 160 1393 154 1366;1367;1368;1369;1370 1810;1811;1812;1813;1814 1813 5 AAFGGAEHVPPELWEPFYTDQYAQEHVKPPVTR Unmodified 3765.8216 0.82159529 4375 Q9P1Y5 CAMSAP3 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3 yes yes 0 0 1 1 118.37 118.37 5 0.02455 123133 QUIQUE_C1576_190116_001 19.505 14.55 66796000 0 0 0 0 0 0 66796000 0 0 0 0 0 0 161 4375 155 1371 1815 1815 1 AAFGLSEAGFNTACVTK Unmodified 1742.8298 0.82977013 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.31 101.31 2 7.1669E-30 103714 QUIQUE_C1403_190116_001 196.7 172.62 2591400000 210460000 217630000 279570000 174360000 166090000 244450000 210720000 142250000 201290000 140260000 221720000 200260000 182390000 162 2326 156 1372;1373;1374;1375;1376;1377;1378;1379;1380;1381;1382;1383;1384 1816;1817;1818;1819;1820;1821;1822;1823;1824;1825;1826;1827;1828;1829;1830;1831 1819 14 AAFLGCLTDVR Unmodified 1221.6176 0.61759251 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 1 96.124 96.124 2 0.023868 99045 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.683 26.429 86886000 0 0 0 0 0 0 0 0 34854000 0 52032000 0 0 163 4449 157 1385;1386 1832;1833 1832 2 AAFLNFFR Unmodified 984.51814 0.51813647 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.17 123.17 2 0.0036392 127643 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.96 115.19 149720000 16424000 14299000 13921000 12103000 13998000 16210000 15284000 0 16732000 0 17800000 12955000 0 164 3278 158 1387;1388;1389;1390;1391;1392;1393;1394;1395;1396;1397;1398 1834;1835;1836;1837;1838;1839;1840;1841;1842;1843;1844;1845;1846;1847 1844 12 AAFQIISQVISEATEQVLATTVGK Unmodified 2503.3534 0.35336913 3746 Q92667 AKAP1 A-kinase anchor protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 179.74 179.74 3 2.0402E-18 183492 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.45 99.131 130760000 0 0 0 0 0 0 0 0 92495000 0 38261000 0 0 165 3746 159 1399;1400 1848;1849 1848 2 AAFQLGSPWR Unmodified 1131.5825 0.58252764 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.787 94.787 2 3.7286E-30 97645 QUIQUE_C1277_190116_001 197.3 162.49 15405000000 1398000000 1174700000 1532900000 1041100000 1047800000 1033000000 1196200000 1018200000 1015500000 445230000 1576600000 1296000000 1629700000 166 1875 160 1401;1402;1403;1404;1405;1406;1407;1408;1409;1410;1411;1412;1413 1850;1851;1852;1853;1854;1855;1856;1857;1858;1859;1860;1861;1862;1863;1864;1865;1866;1867;1868;1869;1870;1871;1872;1873;1874;1875;1876;1877;1878;1879;1880;1881 1853 32 AAFQSLLDAQADEAVLDHPDLK Unmodified 2366.1754 0.17540477 4398 Q9UBI1;R4GMW6;H0Y4W0;H0Y6Z9;R4GMX3;R4GN54 COMMD3;COMMD3-BMI1 COMM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.7 131.7 3 7.2109E-06 135667 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.364 62.915 892150000 91900000 99245000 0 90102000 77405000 107000000 90888000 0 105930000 40568000 95852000 93265000 0 167 4398 161 1414;1415;1416;1417;1418;1419;1420;1421;1422;1423 1882;1883;1884;1885;1886;1887;1888;1889;1890;1891;1892 1892 11 AAFSKDESKEPIVEVR Unmodified 1803.9367 0.93667805 2057;28;265 A0A0D9SF30;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 2 1 3 3 2 1 1 36.781 36.781 2;3;4 1.7991E-64 32398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 225.32 200.47 2126400000 0 0 0 0 181070000 0 0 501570000 789240000 0 558790000 35442000 60303000 168 265;28;2057 162 1424;1425;1426;1427;1428;1429;1430;1431;1432;1433;1434 1893;1894;1895;1896;1897;1898;1899;1900;1901;1902;1903 1900 7 AAFTECCQAADK Unmodified 1370.5595 0.55948529 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 25.285 25.285 2 2.5569E-21 19433 QUIQUE_C1563_190116_001 177.06 167.11 47844000000 2711100000 5501900000 1736300000 5200100000 8601700000 4259900000 4182700000 770170000 2509000000 785020000 2493400000 2009400000 7083300000 + 169 769 163 1435;1436;1437;1438;1439;1440;1441;1442;1443;1444;1445;1446;1447;1448 1904;1905;1906;1907;1908;1909;1910;1911;1912;1913;1914;1915;1916;1917;1918;1919;1920;1921;1922;1923;1924;1925;1926;1927;1928;1929;1930;1931;1932;1933;1934;1935;1936;1937 1917 34 AAFVAYALAFPR Unmodified 1295.7026 0.70264277 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 108.35 108.35 2;3 0.0005392 132037 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.162 74.417 266050000 0 0 0 0 0 0 20104000 82281000 55171000 0 0 57054000 51436000 170 3418 164 1449;1450;1451;1452;1453;1454 1938;1939;1940;1941;1942;1943;1944 1943 6 AAFVLPEFAR Unmodified 1119.6077 0.60767975 2150 P19623;K7EL89 SRM Spermidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.4 111.4 2 0.00030203 116276 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.56 83.757 1182400000 109050000 116750000 0 89644000 108100000 90095000 82684000 83051000 107390000 55550000 129170000 81281000 129590000 171 2150 165 1455;1456;1457;1458;1459;1460;1461;1462;1463;1464;1465;1466;1467 1945;1946;1947;1948;1949;1950;1951;1952;1953;1954;1955;1956;1957;1958;1959;1960;1961;1962;1963;1964 1961 20 AAGAAEAAVAAVEEVGSAGQFEELLR Acetyl (Protein N-term) 2557.266 0.26601069 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 1 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 2 178.4 178.4 2;3 5.8305E-46 183673 QUIQUE_C1438_190116_001 179.25 160.42 1131500000 23502000 0 33338000 24873000 176680000 0 209180000 146550000 103690000 0 0 284880000 128810000 172 1676 166 1468;1469;1470;1471;1472;1473;1474;1475;1476;1477;1478;1479;1480;1481;1482 1965;1966;1967;1968;1969;1970;1971;1972;1973;1974;1975;1976;1977;1978;1979;1980;1981;1982;1983;1984 1972 20 AAGAAGAAAAAAR Unmodified 998.52574 0.52574104 530 A6NCS6 C2orf72 Uncharacterized protein C2orf72 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 15.734 15.734 2 0.00041686 8412 QUIQUE_C1218_190116_001 107.69 76.62 158400000 25194000 27949000 0 0 0 24815000 0 0 0 0 0 50863000 29577000 173 530 167 1483;1484;1485;1486;1487 1985;1986;1987;1988;1989 1985 5 AAGAEPDSILKPELLSAIEK Unmodified 2051.115 0.11503634 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 3 1 2 1 1 1 1 119.15 119.15 2;3 4.201E-21 124237 QUIQUE_C1576_190116_001 151.54 135.6 1767600000 186840000 160680000 171250000 132260000 167020000 116790000 217160000 132290000 148210000 74291000 28357000 118120000 114290000 174 4088 168 1488;1489;1490;1491;1492;1493;1494;1495;1496;1497;1498;1499;1500;1501;1502;1503;1504;1505;1506 1990;1991;1992;1993;1994;1995;1996;1997;1998;1999;2000;2001;2002;2003;2004;2005;2006;2007;2008 2001 16 AAGCDFTNVVK Unmodified 1180.5547 0.55465791 2612 P52758;H0YBX3;H0YB34 HRSP12 Ribonuclease UK114 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 50.585 50.585 1;2 7.3517E-19 49122 QUIQUE_C1438_190116_001 200.56 171.41 13703000000 0 1126500000 1521500000 780870000 1047400000 1483800000 965770000 1217600000 1186800000 456550000 1445900000 1236300000 1234300000 175 2612 169 1507;1508;1509;1510;1511;1512;1513;1514;1515;1516;1517;1518;1519;1520;1521;1522 2009;2010;2011;2012;2013;2014;2015;2016;2017;2018;2019;2020;2021;2022;2023;2024 2014 10 AAGELEGGKPLSGLLNALAQDTFHGYPGITEELLR Acetyl (Protein N-term) 3678.8893 0.88934051 3604 Q8N668;E9PE85 COMMD1 COMM domain-containing protein 1 yes no 1 0 1 2 170.52 170.52 3;4 8.7425E-46 174959 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.48 90.434 163420000 0 0 0 0 0 0 0 0 163420000 0 0 0 0 176 3604 170 1523;1524 2025;2026;2027 2026 3 AAGEVLEPANLLAEEK Unmodified 1652.8621 0.86211612 4624 Q9Y5K8;G3V2S6;H0YJH8;G3V2V6 ATP6V1D V-type proton ATPase subunit D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.8 101.8 2 0.00033279 106144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.821 59.945 249060000 0 42072000 0 0 0 51201000 41596000 0 0 33289000 41764000 0 39141000 177 4624 171 1525;1526;1527;1528;1529;1530 2028;2029;2030;2031;2032;2033 2032 6 AAGEVLEPANLLAEEKDEDLLFE Unmodified 2514.2377 0.23773025 4624 Q9Y5K8;G3V2S6;H0YJH8;G3V2V6 ATP6V1D V-type proton ATPase subunit D yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 154.23 154.23 2;3 0.00011271 156699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.707 71.874 1442500000 112410000 158540000 132550000 101360000 97132000 75737000 203890000 156630000 140870000 0 0 137240000 126110000 178 4624 172 1531;1532;1533;1534;1535;1536;1537;1538;1539;1540;1541;1542 2034;2035;2036;2037;2038;2039;2040;2041;2042;2043;2044;2045 2042 8 AAGFDEIEQDLTQR Unmodified 1591.7478 0.74781464 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 0 1 1 1 1 116.13 116.13 2 0.00010493 120349 QUIQUE_C1368_190116_001 113.69 102.47 79016000 0 0 55512000 0 0 23504000 0 0 0 0 0 0 0 179 1750 173 1543;1544;1545;1546 2046;2047;2048;2049;2050 2048 5 AAGFKDPLLASGTDGVGTK Unmodified 1803.9367 0.93667805 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 1 1 1 70.614 70.614 2;3 0.016799 71222 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.067 31.605 53396000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53396000 180 2194 174 1547;1548 2051;2052 2052 2 AAGGDHGSPDSYR Acetyl (Protein N-term) 1330.5538 0.55380628 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A0A6YY92;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY5;A0A096LNY4;B4DEP1;A0A1W2PRX2;A0A096LP72 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.342 23.342 2 2.978E-06 16574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.23 113.16 233590000 26085000 27643000 0 23182000 0 0 40686000 38072000 0 0 38555000 0 39370000 181 338 175 1549;1550;1551;1552;1553;1554;1555;1556 2053;2054;2055;2056;2057;2058;2059;2060;2061 2060 7 AAGGGGPLYGDGYGFR Unmodified 1513.695 0.69499121 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 83.101 83.101 2 6.2691E-05 85461 QUIQUE_C1218_190116_001 95.094 80.936 322330000 50681000 39726000 0 44932000 45304000 0 0 53364000 43279000 0 0 45042000 0 182 103 176 1557;1558;1559;1560;1561;1562;1563 2062;2063;2064;2065;2066;2067;2068 2062 7 AAGGIELFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSR Unmodified 2923.4828 0.48282018 2484 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;D6RB13 GNPDA1 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.5 144.5 3 3.5574E-75 149836 QUIQUE_C1368_190116_001 156.73 137.95 1776900000 110830000 174380000 117110000 87145000 142340000 90223000 142820000 114890000 224140000 47122000 218180000 191500000 116230000 183 2484 177 1564;1565;1566;1567;1568;1569;1570;1571;1572;1573;1574;1575;1576 2069;2070;2071;2072;2073;2074;2075;2076;2077;2078;2079;2080;2081;2082;2083 2072 14 AAGIDEQENWHEGK Unmodified 1582.7012 0.7011988 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 31.806 31.806 2;3 1.2391E-37 26688 QUIQUE_C1277_190116_001 186.02 173.44 1689900000 0 274030000 430130000 101380000 198550000 277240000 205170000 26661000 27199000 20393000 77302000 18545000 33326000 184 2282 178 1577;1578;1579;1580;1581;1582;1583;1584;1585;1586;1587;1588;1589;1590;1591;1592;1593 2084;2085;2086;2087;2088;2089;2090;2091;2092;2093;2094;2095;2096;2097;2098;2099;2100;2101 2085 18 AAGIDEQENWHEGKENIR Unmodified 2094.9719 0.97189435 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 3 1 1 1 3 1 3 1 1 36.679 36.679 2;3;4 3.4833E-247 32061 QUIQUE_C1438_190116_001 334.6 311.51 4153700000 96555000 147250000 205630000 160870000 1146800000 97915000 136530000 307590000 716070000 36084000 723640000 167600000 211160000 185 2282 179 1594;1595;1596;1597;1598;1599;1600;1601;1602;1603;1604;1605;1606;1607;1608;1609;1610;1611;1612 2102;2103;2104;2105;2106;2107;2108;2109;2110;2111;2112;2113;2114;2115;2116;2117;2118;2119;2120;2121;2122 2108 20 AAGISLIVPGK Unmodified 1024.6281 0.62808085 985 F2Z357;J3KPC5;P47736 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 76.318 76.318 2 0.014586 77311 QUIQUE_C1368_190116_001 58.426 31.172 94891000 0 0 21735000 0 36683000 0 0 0 0 0 0 36474000 0 186 985 180 1613;1614;1615 2123;2124;2125 2123 3 AAGPCLLAECR Unmodified 1216.5693 0.56926211 464 A0A2R8YFN3;A1Z1Q3 MACROD2 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.509 51.509 2 0.012341 49456 QUIQUE_C1277_190116_001 60.518 39.572 263350000 55257000 51186000 28030000 28436000 32587000 19697000 26191000 0 0 0 0 21971000 0 187 464 181 1616;1617;1618;1619;1620;1621;1622;1623 2126;2127;2128;2129;2130;2131;2132;2133 2127 7 AAGPGGGSLASSSVAK Unmodified 1315.6732 0.67319314 3612 Q8N7J2 AMER2 APC membrane recruitment protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.973 24.973 2 4.7189E-09 19720 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.38 130.13 562140000 71383000 0 0 0 0 0 65505000 89494000 121030000 28656000 120040000 66030000 0 188 3612 182 1624;1625;1626;1627;1628;1629;1630 2134;2135;2136;2137;2138;2139;2140;2141;2142 2136 5 AAGPLLTDECR Unmodified 1201.5761 0.57612163 3990 Q9BQ69 MACROD1 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD1 yes yes 0 0 0 1 1 1 41.364 41.364 2 0.016185 38026 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.908 56.394 168790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86110000 82685000 0 189 3990 183 1631;1632;1633 2143;2144;2145 2145 3 AAGPSLSHTSGGTQSK Unmodified 1484.7219 0.72193424 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 10.436 10.436 2;3 0.0002501 2852 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.315 47.9 46453000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46453000 0 0 0 190 2265 184 1634;1635 2146;2147 2146 2 AAGQYSTSYAQQK Unmodified 1401.6525 0.6524577 831 E5KLJ9 OPA1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.877 21.877 2 0.00027158 15021 QUIQUE_C1368_190116_001 112.11 84.283 208450000 0 24942000 49557000 0 0 33131000 0 24974000 0 0 37495000 0 38355000 191 831 185 1636;1637;1638;1639;1640;1641;1642 2148;2149;2150;2151;2152;2153;2154;2155 2150 8 AAGSGVSDYDYLDLDK Unmodified 1687.7577 0.75771063 4090 Q9C026 TRIM9 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9 yes yes 0 0 0 1 100.6 100.6 2 0.006882 102997 QUIQUE_C1403_190116_001 57.583 46.364 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 192 4090 186 1643 2156 2156 1 AAGSPSPLPAPDPAPK Unmodified 1471.7671 0.76709352 4082 Q9BZE9;J3KRY8;J3KRF7 ASPSCR1 Tether containing UBX domain for GLUT4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.712 49.712 2 3.3268E-07 47545 QUIQUE_C1277_190116_001 117.86 94.487 375000000 29673000 36986000 36502000 36272000 43737000 0 27340000 27581000 33911000 0 29388000 27355000 46250000 193 4082 187 1644;1645;1646;1647;1648;1649;1650;1651;1652;1653;1654;1655 2157;2158;2159;2160;2161;2162;2163;2164;2165;2166;2167;2168 2158 12 AAGSSGFEAVEVAWPYAETPEALAR Unmodified 2578.234 0.23398228 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;A0A0A0MTR5 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 145.73 145.73 2 2.0843E-10 148555 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.5 95.756 26756000 0 0 0 0 0 0 0 26756000 0 0 0 0 0 194 1025 188 1656 2169 2169 1 AAGTAAALAFLSQESR Acetyl (Protein N-term) 1604.8158 0.81583463 1649 O75607 NPM3 Nucleoplasmin-3 yes yes 1 0 0 1 1 160.82 160.82 2 5.4039E-11 164592 QUIQUE_C1403_190116_001 116.24 91.384 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195 1649 189 1657;1658 2170;2171 2170 2 AAGTEGPFQEVDGVATTR Unmodified 1804.8592 0.85915601 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 1 1 82.377 82.377 2 0.00013533 84592 QUIQUE_C1576_190116_001 89.231 70.606 72572000 0 0 29900000 19159000 0 0 23512000 0 0 0 0 0 0 196 1998 190 1659;1660;1661 2172;2173;2174 2174 2 AAGTLYTYPENWR Acetyl (Protein N-term) 1582.7416 0.74160705 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.71 131.71 2 2.9484E-06 138125 QUIQUE_C1438_190116_001 150.35 140.92 5937300000 461450000 473970000 426670000 493070000 424980000 375560000 417210000 484410000 420960000 184330000 725300000 526220000 523190000 197 2255 191 1662;1663;1664;1665;1666;1667;1668;1669;1670;1671;1672;1673;1674 2175;2176;2177;2178;2179;2180;2181;2182;2183;2184;2185;2186;2187;2188;2189 2180 15 AAGVAGWGVEAEEFEDAPDVEPLEPTLSNIIEQR Acetyl (Protein N-term) 3679.753 0.75296619 1543 O43681;K7ERW9 ASNA1 ATPase ASNA1 yes no 1 0 0 1 1 2 2 1 1 1 174.46 174.46 3;4 2.4632E-46 178425 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.76 102.7 267140000 0 0 0 0 16916000 0 16108000 19334000 79036000 0 88659000 28241000 18847000 198 1543 192 1675;1676;1677;1678;1679;1680;1681;1682;1683 2190;2191;2192;2193;2194;2195;2196;2197;2198;2199 2194 10 AAGVCLMLLATCCEDDIVPHVLPFIK Unmodified 2941.4574 0.45739875 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 166.94 166.94 3 3.1108E-20 169032 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.11 98.009 415710000 0 0 0 0 0 0 0 144480000 108410000 0 0 0 162820000 199 3090 193 1684;1685;1686 2200;2201;2202 2200 3 AAGVEAAAEVAATEIK Acetyl (Protein N-term) 1541.7937 0.7937022 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R019;M0R2T0;M0R0N3;M0QYQ7;M0R0Y6 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 152.05 152.05 2 2.8961E-36 157927 QUIQUE_C1218_190116_001 171.57 138.35 2417500000 374750000 331280000 473040000 531220000 0 449910000 0 0 0 0 0 0 257340000 200 2603 194 1687;1688;1689;1690;1691;1692 2203;2204;2205;2206;2207;2208;2209;2210;2211;2212;2213;2214;2215;2216;2217;2218;2219;2220;2221;2222;2223 2204 21 AAGVNVEPFWPGLFAK Unmodified 1701.8879 0.88787736 1886 P05386 RPLP1 60S acidic ribosomal protein P1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 3 1 147.8 147.8 2;3 2.0083E-29 154677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.36 147.67 7182100000 654400000 587880000 788860000 633410000 735670000 597040000 543400000 427980000 681100000 138210000 705660000 0 688530000 201 1886 195 1693;1694;1695;1696;1697;1698;1699;1700;1701;1702;1703;1704;1705;1706;1707;1708;1709;1710 2224;2225;2226;2227;2228;2229;2230;2231;2232;2233;2234;2235;2236;2237;2238;2239;2240;2241;2242;2243;2244;2245;2246;2247;2248;2249;2250;2251;2252;2253;2254;2255 2250 32 AAGVPSATITWR Unmodified 1228.6564 0.65642086 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 74.023 74.023 2 0.0079089 74786 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.662 56.215 236750000 0 0 0 0 0 50381000 0 0 66863000 0 119500000 0 0 202 2834 196 1711;1712;1713 2256;2257;2258 2257 2 AAGVVLEMIR Unmodified 1057.5954 0.59540051 4536 Q9Y230;M0R0Y3;X6R2L4;M0QXI6 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.344 87.344 2 0.0046555 89839 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.165 57.674 828960000 176750000 0 0 116630000 0 0 134200000 0 0 112930000 181130000 0 107320000 203 4536 197 1714;1715;1716;1717;1718;1719 2259;2260;2261;2262;2263;2264 2263 3 AAHFVFR Unmodified 846.45006 0.4500569 2057;28;1218;265 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A0D9SF30;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.509 26.509 2 7.0626E-05 20757 QUIQUE_C1277_190116_001 174.15 129.18 4876100000 335050000 435030000 466830000 496440000 541120000 0 585860000 424970000 0 0 644130000 323430000 623240000 204 1218;265;28;2057 198 1720;1721;1722;1723;1724;1725;1726;1727;1728;1729 2265;2266;2267;2268;2269;2270;2271;2272;2273;2274;2275 2266 10 AAHGVLLQALDEMR Unmodified 1522.7926 0.79259677 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 96.541 96.541 2;3 0.00015911 98524 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.86 86.002 449460000 22758000 34210000 32329000 31262000 52942000 25259000 30524000 0 29990000 11448000 44941000 45560000 88236000 205 3725 199 1730;1731;1732;1733;1734;1735;1736;1737;1738;1739;1740;1741;1742;1743;1744 2276;2277;2278;2279;2280;2281;2282;2283;2284;2285;2286;2287;2288;2289;2290;2291;2292;2293 2292 15 AAHLCAEAALR Unmodified 1181.5975 0.59752577 4530 Q9UQ80;F8VR77;F8W0A3;H0YIN7 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 0 2 24.053 24.053 2;3 0.0028442 17771 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.15 76.375 136780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 136780000 0 206 4530 200 1745;1746 2294;2295 2295 2 AAHSEGNTTAGLDMR Oxidation (M) 1545.6842 0.68416853 2810 P78371 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 14.022 14.022 2;3 0.00030915 6343 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.617 74.924 161130000 11879000 0 0 37539000 0 0 14207000 69643000 14664000 0 0 0 13199000 207 2810 201 1747;1748;1749;1750;1751;1752;1753 2296;2297;2298;2299;2300;2301;2302 2301 2255 7 AAHSEGNTTAGLDMR Unmodified 1529.6893 0.68925391 2810 P78371 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 21.386 21.386 2;3 6.8887E-66 14957 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.32 187.64 1698200000 251330000 261630000 84295000 212040000 95667000 100150000 110080000 100350000 67699000 123720000 132970000 72374000 85930000 208 2810 201 1754;1755;1756;1757;1758;1759;1760;1761;1762;1763;1764;1765;1766;1767;1768;1769;1770 2303;2304;2305;2306;2307;2308;2309;2310;2311;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318;2319;2320 2314 15 AAHVFFTDSCPDALFNELVK Unmodified 2280.0885 0.088504016 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A0D9SFQ7;A0A0D9SFW6;A0A0D9SEP9;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 141.52 141.52 2;3 2.8602E-196 147318 QUIQUE_C1218_190116_001 269.87 256.46 34431000000 3655700000 4602400000 2911800000 2902100000 3363400000 1899600000 3241700000 1330300000 1687300000 799170000 2930800000 2883000000 2224100000 209 273;342 202 1771;1772;1773;1774;1775;1776;1777;1778;1779;1780;1781;1782;1783;1784;1785;1786;1787;1788;1789;1790;1791;1792;1793;1794;1795;1796;1797;1798 2321;2322;2323;2324;2325;2326;2327;2328;2329;2330;2331;2332;2333;2334;2335;2336;2337;2338;2339;2340;2341;2342;2343;2344;2345;2346;2347;2348;2349;2350;2351;2352;2353;2354;2355;2356;2357;2358;2359 2324 38 AAIAAPILHVNSK Unmodified 1303.7612 0.76122028 2391 P36269;H7C1X2 GGT5 Gamma-glutamyltransferase 5;Gamma-glutamyltransferase 5 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 5 light chain yes no 0 0 0 1 48.16 48.16 2 0.065558 46259 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.73 36.028 20091000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20091000 0 0 210 2391 203 1799 2360 2360 1 AAIAASEVLVDSAEEGSLAAAAELAAQK Acetyl (Protein N-term) 2697.3709 0.37086969 1764 O95926 SYF2 Pre-mRNA-splicing factor SYF2 yes yes 1 0 0 1 1 1 179.37 179.37 3 4.2283E-31 182982 QUIQUE_C1218_190116_001 112.86 110.64 49885000 20099000 0 0 0 12102000 17684000 0 0 0 0 0 0 0 211 1764 204 1800;1801;1802 2361;2362;2363 2361 3 AAIDSYR Unmodified 794.39227 0.39226725 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 21.787 21.787 2 0.0099341 15151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.98 116.99 206190000 0 0 0 0 0 0 0 69571000 65754000 70866000 0 0 0 212 2233 205 1803;1804;1805 2364;2365;2366;2367;2368 2364 5 AAIDWFDGK Unmodified 1021.4869 0.48689592 19;1188 A0A075B7D9;Q92804;H3BPE7;P35637 TAF15;FUS TATA-binding protein-associated factor 2N;RNA-binding protein FUS no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.679 95.679 2 0.00014327 93342 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.39 35.347 2850300000 388260000 331650000 348090000 266450000 259510000 279990000 251160000 0 116000000 100430000 202290000 158180000 148270000 213 19;1188 206 1806;1807;1808;1809;1810;1811;1812;1813;1814;1815;1816;1817 2369;2370;2371;2372;2373;2374;2375;2376;2377;2378;2379;2380;2381;2382;2383;2384;2385;2386;2387;2388;2389;2390;2391;2392 2386 24 AAIDWFDGKEFHGNIIK Unmodified 1959.9843 0.98429694 19 A0A075B7D9;Q92804 TAF15 TATA-binding protein-associated factor 2N yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 106.12 106.12 4 0.00015541 109140 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.85 66.793 249580000 0 0 0 0 0 0 0 62437000 52032000 0 49158000 43823000 42132000 214 19 207 1818;1819;1820;1821;1822 2393;2394;2395;2396;2397;2398 2397 6 AAIDWFDGKEFSGNPIK Unmodified 1893.9261 0.92611336 1188 H3BPE7;P35637 FUS RNA-binding protein FUS yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 119.35 119.35 2;3 3.568E-07 123783 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.551 81.936 598610000 0 0 0 0 0 0 0 0 177080000 0 201080000 220450000 0 215 1188 208 1823;1824;1825;1826;1827 2399;2400;2401;2402;2403 2400 5 AAIEHELPTATQK Unmodified 1407.7358 0.73579339 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 27.884 27.884 3 0.00083816 22829 QUIQUE_C1403_190116_001 67.118 52.242 32464000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32464000 216 3423 209 1828;1829;1830;1831 2404;2405;2406;2407 2405 4 AAIEYGTEEDVVK Unmodified 1422.6878 0.68784015 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 59.924 59.924 2 0.000454 58389 QUIQUE_C1277_190116_001 97.813 80.583 58583000 25672000 32912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 217 264 210 1832;1833 2408;2409 2409 2 AAIGLLAR Unmodified 783.49667 0.49667274 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1;H3BQF1;H3BSW3 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.82 51.82 2 0.0031858 49938 QUIQUE_C1576_190116_001 132.94 26.18 1203800000 70257000 105380000 111850000 91036000 0 116240000 139800000 87634000 108330000 0 201510000 0 171730000 218 1928 211 1834;1835;1836;1837;1838;1839;1840;1841;1842;1843 2410;2411;2412;2413;2414;2415;2416;2417;2418;2419;2420 2416 6 AAIIADSSTFR Unmodified 1150.5982 0.59823728 170 A0A0A0MSA7;A0A0U1RQK7;O43432 EIF4G3 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 yes no 0 0 0 1 1 57.404 57.404 2 0.054204 56031 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.161 30.01 38073000 0 0 0 0 0 0 19944000 0 0 0 0 18129000 0 219 170 212 1844;1845 2421;2422 2422 2 AAILDLEK Unmodified 871.50148 0.50148335 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 57.208 57.208 2 0.023483 56858 QUIQUE_C1438_190116_001 73.26 24.504 142750000 0 0 41239000 0 59282000 0 0 0 0 0 0 42227000 0 220 3108 213 1846;1847;1848 2423;2424;2425 2424 3 AAILGDTIMVAK Acetyl (Protein N-term) 1243.6846 0.68460945 3657 Q8NI60 ADCK3 Atypical kinase ADCK3, mitochondrial yes yes 1 0 0 1 1 151.24 151.24 2 0.0018124 156587 QUIQUE_C1218_190116_001 71.451 40.029 22378000 13988000 0 0 0 0 0 0 8390000 0 0 0 0 0 221 3657 214 1849;1850 2426;2427 2426 2 AAILPTSIFLTNK Unmodified 1387.8075 0.80750177 1440 O14744;H0YJX6 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.4 123.4 2 0.0036921 127190 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.438 72.68 1365800000 151270000 148460000 155100000 128740000 150470000 106950000 125980000 59721000 87734000 0 0 103480000 147950000 222 1440 215 1851;1852;1853;1854;1855;1856;1857;1858;1859;1860;1861 2428;2429;2430;2431;2432;2433;2434;2435;2436;2437;2438 2437 3 AAILPTSIFLTNKK Unmodified 1515.9025 0.90246479 1440 O14744;H0YJX6 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 93.624 93.624 3 0.00022264 96118 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.905 73.122 311420000 0 0 0 0 0 0 0 45221000 56428000 0 67986000 69970000 71809000 223 1440 216 1862;1863;1864;1865;1866 2439;2440;2441;2442;2443;2444 2441 6 AAILQTEVDALR Unmodified 1298.7194 0.71941505 1479;1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2;O15083;H7C4G9 ERC1;ERC2 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1;ERC protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 91.067 91.067 2 0.0061216 94799 QUIQUE_C1218_190116_001 80.755 50.437 444880000 93141000 66142000 50503000 0 67172000 91015000 0 0 0 0 76904000 0 0 224 1107;1479 217 1867;1868;1869;1870;1871;1872 2445;2446;2447;2448;2449;2450 2445 1 AAIQSQLDGVR Unmodified 1156.62 0.62003536 1585 O60645;D6RB59;D6RBR9 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 41.889 41.889 2 0.0017273 40483 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 14.379 6626200000 40779000 0 2296100000 47015000 52653000 1683900000 2296800000 0 42029000 24879000 72191000 69866000 0 225 1585 218 1873;1874;1875;1876;1877;1878;1879;1880;1881;1882;1883 2451;2452;2453;2454;2455;2456;2457;2458;2459;2460;2461;2462 2461 12 AAIQTFQNTYQVLAVTFNDTSDQIISGGIDNDIK Unmodified 3699.8268 0.82679983 3836 Q96DI7 SNRNP40 U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein yes yes 0 0 0 1 170.71 170.71 3 0.028419 176879 QUIQUE_C1438_190116_001 19.505 13.778 27192000 0 0 0 0 27192000 0 0 0 0 0 0 0 0 226 3836 219 1884 2463 2463 1 AAITFLK Unmodified 762.46398 0.46397563 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 1 1 57.472 57.472 2 0.050616 55809 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.439 47.122 86322000 0 0 0 0 0 0 0 28997000 0 12957000 44368000 0 0 227 1416 220 1885;1886;1887 2464;2465;2466 2464 3 AAIYGGVEGGGTR Acetyl (Protein N-term) 1248.6099 0.6098646 4455 Q9UJ70;H7C3G9;H7C1L7 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 1 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 82.002 82.002 2 0.00031959 82598 QUIQUE_C1563_190116_001 86.882 65.935 1965500000 461130000 0 86807000 540790000 78744000 454830000 57399000 0 51166000 0 75591000 74437000 84615000 228 4455 221 1888;1889;1890;1891;1892;1893;1894;1895;1896;1897;1898;1899;1900;1901;1902 2467;2468;2469;2470;2471;2472;2473;2474;2475;2476;2477;2478;2479;2480;2481 2474 12 AALAALCPGDLIQAINGESTELMTHLEAQNR Unmodified 3306.6337 0.63365987 2566 P50479 PDLIM4 PDZ and LIM domain protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 168.86 168.86 3;4 1.893E-05 170638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.048 41.239 131150000 0 33349000 0 64471000 0 0 0 33332000 0 0 0 0 0 229 2566 222 1903;1904;1905 2482;2483;2484 2484 3 AALADVLR Unmodified 827.4865 0.48650199 631 B5MBZ0;Q9HC35 EML4 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 61.47 61.47 2 0.011743 60205 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.55 55.811 64035000 20770000 15884000 0 0 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1609400000 232 3051 225 1922;1923;1924;1925;1926;1927;1928;1929;1930;1931;1932;1933;1934;1935;1936;1937;1938;1939;1940;1941;1942;1943;1944;1945;1946;1947;1948;1949;1950;1951;1952;1953;1954;1955;1956;1957;1958;1959 2503;2504;2505;2506;2507;2508;2509;2510;2511;2512;2513;2514;2515;2516;2517;2518;2519;2520;2521;2522;2523;2524;2525;2526;2527;2528;2529;2530;2531;2532;2533;2534;2535;2536;2537;2538;2539;2540;2541;2542;2543;2544;2545;2546;2547;2548;2549;2550;2551;2552;2553;2554;2555;2556;2557;2558;2559;2560;2561;2562;2563;2564;2565;2566;2567;2568;2569;2570;2571 2507 67 AALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEK Oxidation (M) 2944.4376 0.43756905 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 1 119.48 119.48 3 3.42E-24 116273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.441 87.982 252230000 0 36210000 0 0 0 0 0 0 0 216020000 0 0 0 233 3051 225 1960;1961;1962 2572;2573;2574;2575 2574 2482 4 AALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWR Oxidation (M) 3152.5965 0.59646973 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 1 0 1 4 2 2 3 2 3 3 2 2 3 2 4 161.3 161.3 2;3;4 0 168006 QUIQUE_DMIX5_190116_001 287.01 265.17 25088000000 1239700000 1307600000 2050800000 2040000000 1482000000 1749800000 1436000000 1204000000 1563600000 971270000 2571300000 4087900000 3384300000 234 365 226 1963;1964;1965;1966;1967;1968;1969;1970;1971;1972;1973;1974;1975;1976;1977;1978;1979;1980;1981;1982;1983;1984;1985;1986;1987;1988;1989;1990;1991;1992;1993;1994;1995 2576;2577;2578;2579;2580;2581;2582;2583;2584;2585;2586;2587;2588;2589;2590;2591;2592;2593;2594;2595;2596;2597;2598;2599;2600;2601;2602;2603;2604;2605;2606;2607;2608;2609;2610;2611;2612;2613;2614;2615;2616;2617;2618;2619;2620;2621;2622;2623;2624;2625;2626;2627;2628;2629;2630;2631 2621 254 53 AALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWR Unmodified 3136.6016 0.6015551 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 3 3 3 4 3 2 4 3 4 2 4 6 4 165.56 165.56 2;3;4 0 172851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 400.47 375.93 79137000000 4557200000 7139000000 9432700000 3207100000 4125900000 3026600000 6398900000 5086400000 6068500000 344080000 11837000000 10789000000 7124800000 235 365 226 1996;1997;1998;1999;2000;2001;2002;2003;2004;2005;2006;2007;2008;2009;2010;2011;2012;2013;2014;2015;2016;2017;2018;2019;2020;2021;2022;2023;2024;2025;2026;2027;2028;2029;2030;2031;2032;2033;2034;2035;2036;2037;2038;2039;2040 2632;2633;2634;2635;2636;2637;2638;2639;2640;2641;2642;2643;2644;2645;2646;2647;2648;2649;2650;2651;2652;2653;2654;2655;2656;2657;2658;2659;2660;2661;2662;2663;2664;2665;2666;2667;2668;2669;2670;2671;2672;2673;2674;2675;2676;2677;2678;2679;2680;2681;2682;2683;2684;2685;2686;2687;2688;2689;2690;2691;2692;2693;2694;2695;2696;2697;2698;2699;2700;2701;2702;2703;2704;2705;2706;2707;2708;2709;2710;2711;2712 2694 76 AALAGGTTMILDHVFPDTGVSLLAAYEQWR Oxidation (M) 3218.607 0.60703441 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 1 0 1 1 1 165.91 165.91 3 2.8307E-25 169476 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2722;2723;2724;2725;2726;2727;2728;2729;2730;2731;2732;2733;2734;2735;2736;2737;2738;2739;2740;2741;2742;2743;2744;2745;2746;2747;2748 2743 27 AALAPLPPLPAQFK Acetyl (Protein N-term) 1474.8548 0.85478632 70 A0A087WY55;Q9NP79 VTA1 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.96 153.96 2 0.00021098 158563 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.32 94.296 3760500000 349710000 273740000 271450000 292870000 330630000 242610000 269340000 301410000 263210000 114540000 340730000 326100000 384190000 239 70 229 2072;2073;2074;2075;2076;2077;2078;2079;2080;2081;2082;2083;2084 2749;2750;2751;2752;2753;2754;2755;2756;2757;2758;2759;2760;2761;2762;2763;2764;2765;2766;2767;2768;2769;2770;2771;2772;2773;2774;2775;2776;2777 2773 29 AALCAVHVIR Unmodified 1108.6175 0.61753293 1548 O43747;H3BNR4;H3BR36;H3BUN9 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.408 34.408 3 0.0031377 29767 QUIQUE_C1277_190116_001 68.371 56.735 588510000 59717000 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yes no 0 1 0 1 1 1 73.417 73.417 3 0.0022663 73937 QUIQUE_C1277_190116_001 58.338 54.76 96940000 0 36551000 0 0 0 0 0 0 27282000 0 0 33106000 0 242 2651 231 2119;2120;2121 2820;2821;2822 2820 2088 3 AALCHFIVDELNAK Unmodified 1599.8079 0.80791248 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 99.467 99.467 2;3 2.3443E-22 97682 QUIQUE_DMIX4_190116_001 168.74 152.36 6823400000 451000000 533310000 509610000 526050000 500920000 430330000 775440000 301930000 452360000 500680000 611040000 603530000 627220000 243 4128 232 2122;2123;2124;2125;2126;2127;2128;2129;2130;2131;2132;2133;2134;2135 2823;2824;2825;2826;2827;2828;2829;2830;2831;2832;2833;2834;2835;2836;2837;2838;2839;2840;2841;2842;2843;2844;2845;2846;2847;2848;2849;2850 2844 28 AALDCCVVDVQEYSADPHAIAGALK Unmodified 2672.2574 0.25743661 862 F5H6L3;E7ERK8;Q17R89;A0A087WZS3 ARHGAP44 Rho GTPase-activating protein 44 yes no 0 0 0 1 1 1 118.32 118.32 3 0.00057832 121909 QUIQUE_C1277_190116_001 28.404 25.963 146130000 0 50197000 0 0 45733000 0 50200000 0 0 0 0 0 0 244 862 233 2136;2137;2138 2851;2852;2853 2851 3 AALDGPLDAALDHLR Unmodified 1546.8104 0.81035532 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 3 2 3 119.72 119.72 3 3.0329E-12 122299 QUIQUE_C1563_190116_001 102.28 94.233 259110000 0 32947000 0 0 51954000 0 23904000 0 0 0 48309000 71285000 30714000 245 497 234 2139;2140;2141;2142;2143;2144;2145;2146;2147;2148;2149;2150;2151;2152;2153;2154;2155;2156;2157;2158;2159;2160;2161 2854;2855;2856;2857;2858;2859;2860;2861;2862;2863;2864;2865;2866;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;2874;2875;2876;2877;2878;2879 2864 24 AALDGTPGMIGYGMAK 2 Oxidation (M) 1583.7324 0.73236428 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 2 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 60.024 60.024 2 5.2568E-06 58387 QUIQUE_C1277_190116_001 94.767 79.502 826910000 71721000 106830000 0 54190000 57984000 0 70372000 124260000 200280000 141270000 0 0 0 246 1959 235 2162;2163;2164;2165;2166;2167;2168;2169;2170;2171 2880;2881;2882;2883;2884;2885;2886;2887;2888;2889;2890;2891 2882 1217;1218 10 AALDGTPGMIGYGMAK Oxidation (M) 1567.7374 0.73744965 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 76.319 76.319 2 1.1718E-06 76246 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.86 98.502 1662800000 172020000 221520000 0 0 170150000 140760000 0 162500000 0 172830000 334400000 0 288660000 247 1959 235 2172;2173;2174;2175;2176;2177;2178;2179 2892;2893;2894;2895;2896;2897;2898;2899;2900 2896 1217;1218 7 AALDGTPGMIGYGMAK Unmodified 1551.7425 0.74253503 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.292 92.292 2 9.8156E-08 95895 QUIQUE_C1438_190116_001 139.86 120.1 5204800000 0 0 0 503810000 528820000 585870000 760990000 503430000 444020000 0 806840000 482810000 588170000 248 1959 235 2180;2181;2182;2183;2184;2185;2186;2187;2188 2901;2902;2903;2904;2905;2906;2907;2908;2909;2910 2902 8 AALDSINELPENILLELFTHVPAR Unmodified 2674.433 0.43301644 4265 Q9NRD1 FBXO6 F-box only protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 171.5 171.5 3 6.0878E-25 175793 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.85 118 235820000 0 0 0 0 0 0 0 17695000 54692000 0 98350000 0 65087000 249 4265 236 2189;2190;2191;2192 2911;2912;2913;2914 2912 4 AALDSLSLFTSLGLSEQK Acetyl (Protein N-term) 1921.0044 0.004423261 2496 P47897;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RRI9;A0A0U1RQE9;A0A0U1RQU2;F2Z2V6;A0A0U1RQC3 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.97 174.97 2 7.0841E-163 179100 QUIQUE_DMIX3_190116_001 251.24 214.09 486420000 35547000 25426000 0 5386100 55729000 0 23547000 54074000 92041000 0 84602000 64041000 46025000 250 2496 237 2193;2194;2195;2196;2197;2198;2199;2200;2201;2202 2915;2916;2917;2918;2919;2920;2921;2922;2923;2924 2921 10 AALEALDELDLFGVK Unmodified 1602.8505 0.8504888 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.23 156.23 2 1.2685E-05 151329 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.96 85.448 919660000 44833000 54528000 97185000 53341000 70375000 59168000 170080000 46001000 47900000 24601000 95630000 78358000 77656000 251 550 238 2203;2204;2205;2206;2207;2208;2209;2210;2211;2212;2213;2214;2215 2925;2926;2927;2928;2929;2930;2931;2932;2933;2934;2935;2936;2937;2938 2935 12 AALEALGSCLNNK Unmodified 1359.6816 0.68164933 2360 P34897;G3V5L0;G3V4W5;G3V540;G3V241;G3V3Y8;G3V4T0;G3V4X0;G3V2W0;G3V2E4 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 68.749 68.749 2 1.6373E-07 68622 QUIQUE_C1368_190116_001 131.52 95.092 132400000 0 0 50478000 0 0 48072000 33847000 0 0 0 0 0 0 252 2360 239 2216;2217;2218;2219;2220;2221;2222;2223 2939;2940;2941;2942;2943;2944;2945;2946 2939 8 AALEALLGR Unmodified 912.53927 0.53926584 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 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G5EA30;Q92879;E9PQK4;E9PSH0;E9PKU1 CELF1 CUGBP Elav-like family member 1 yes no 0 0 0 1 36.906 36.906 2 6.2128E-05 32631 QUIQUE_C1218_190116_001 119.68 85.884 29743000 29743000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255 1106 242 2250 2977 2977 1 AALEEEVR Unmodified 915.46616 0.46616048 1022 F6RY50;Q96FS4 SIPA1 Signal-induced proliferation-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 25.328 25.328 2 0.0039304 19864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.01 10.82 938800000 0 0 0 0 0 0 0 417820000 0 223130000 0 0 297860000 256 1022 243 2251;2252;2253 2978;2979;2980 2978 2 AALEELVK Unmodified 871.50148 0.50148335 2035 P12081;B4DDD8;E7ETE2;B4E1C5;D6RF05;A0A2R8YCI2 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.101 54.101 2 0.020244 53279 QUIQUE_C1218_190116_001 77.058 27.699 737860000 54252000 79681000 65407000 71980000 60639000 56301000 0 63819000 0 21710000 97139000 69529000 97402000 257 2035 244 2254;2255;2256;2257;2258;2259;2260;2261;2262;2263;2264 2981;2982;2983;2984;2985;2986;2987;2988;2989;2990;2991 2981 11 AALEEVER Unmodified 915.46616 0.46616048 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.094 25.094 2 0.0036477 18852 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.93 0 1608300000 0 236010000 305110000 0 0 0 227040000 0 522240000 0 0 317910000 0 258 3117 245 2265;2266;2267;2268;2269 2992;2993;2994;2995;2996 2996 4 AALEGFLAALQADPPQAER Unmodified 1967.0112 0.011239973 658 F5GZ08;B7Z4G8;P51693;S4R3U6 APLP1 Amyloid-like protein 1;C30 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 144.32 144.32 2;3 2.6548E-07 150212 QUIQUE_C1218_190116_001 131.53 118.13 699970000 73961000 32868000 107590000 42906000 78001000 47550000 66745000 48892000 27590000 9884800 32550000 75744000 55694000 259 658 246 2270;2271;2272;2273;2274;2275;2276;2277;2278;2279;2280;2281;2282;2283;2284;2285;2286;2287;2288;2289;2290;2291 2997;2998;2999;3000;3001;3002;3003;3004;3005;3006;3007;3008;3009;3010;3011;3012;3013;3014;3015;3016;3017;3018 2998 21 AALEGTATYR Unmodified 1051.5298 0.52982336 4274 Q9NRV9;A0A3B3IRV5 HEBP1 Heme-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.156 27.156 2 1.6972E-14 21525 QUIQUE_DMIX7_190116_001 175.44 149.71 2108100000 225350000 169960000 149570000 183720000 152990000 140490000 168460000 193720000 119130000 88330000 202610000 128150000 185660000 260 4274 247 2292;2293;2294;2295;2296;2297;2298;2299;2300;2301;2302;2303;2304 3019;3020;3021;3022;3023;3024;3025;3026;3027;3028;3029;3030;3031;3032 3030 11 AALEQDLAFWYGPR Unmodified 1635.8045 0.80454166 582 B1AHA8;P09601 HMOX1 Heme oxygenase 1 yes no 0 0 0 1 139.73 139.73 2 0.050259 143619 QUIQUE_C1403_190116_001 64.374 56.807 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 261 582 248 2305 3033 3033 1 AALEQPCEGSLTRPK Unmodified 1655.8301 0.83010449 3400 Q6PUV4;D6RGY3;D6R960 CPLX2 Complexin-2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 35.904 35.904 2;3 9.702E-05 31988 QUIQUE_C1218_190116_001 114.76 97.822 654620000 285430000 30422000 0 194630000 0 0 144140000 0 0 0 0 0 0 262 3400 249 2306;2307;2308;2309;2310 3034;3035;3036;3037;3038 3035 5 AALEYLEDIDLK Unmodified 1391.7184 0.718412 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 124.71 124.71 2 0.00014376 127359 QUIQUE_C1563_190116_001 104.22 80.902 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 263 4006 250 2311;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318;2319;2320 3039;3040;3041;3042;3043;3044;3045;3046;3047;3048 3042 10 AALFENTPK Unmodified 989.5182 0.51819605 1026 F6VCX5;Q16816 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.98 39.98 2 0.00040546 36324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.18 85.082 4383700000 979740000 844720000 1220400000 0 0 70526000 0 461940000 806360000 0 0 0 0 264 1026 251 2321;2322;2323;2324;2325;2326 3049;3050;3051;3052;3053;3054;3055 3054 7 AALFVSNNSR Unmodified 1077.5567 0.55670682 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.09 34.09 2 1.3347E-17 29322 QUIQUE_C1277_190116_001 178.83 144.58 2898800000 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3073;3074;3075;3076;3077;3078;3079;3080;3081 3075 9 AALGYDYKGETEKHESQR Unmodified 2080.9814 0.98139641 2072 P14317 HCLS1 Hematopoietic lineage cell-specific protein yes yes 0 0 2 1 22.624 22.624 3 0.00089468 16095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.488 68.788 27739000 0 0 0 0 0 0 0 27739000 0 0 0 0 0 268 2072 255 2348 3082 3082 1 AALHPPALAVLSHTPDGATQTIAWVGK Unmodified 2721.4602 0.46023424 3639 Q8NDH3;H0YEP3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes no 0 0 0 1 1 1 114.32 114.32 4 9.0472E-06 118339 QUIQUE_C1368_190116_001 52.321 45.289 131840000 0 34822000 51868000 0 0 0 0 45154000 0 0 0 0 0 269 3639 256 2349;2350;2351 3083;3084;3085;3086 3085 4 AALLAELALLEPEALR Unmodified 1691.9822 0.98217168 3225 Q3KQV9;A0A087X226 UAP1L1 UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 164.68 164.68 2;3 3.9808E-10 171247 QUIQUE_C1438_190116_001 117.23 105.17 84127000 0 11970000 0 0 35316000 0 0 0 0 0 36840000 0 0 270 3225 257 2352;2353;2354;2355;2356 3087;3088;3089;3090;3091 3089 3 AALLDQIR Unmodified 898.52362 0.52361577 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 60.552 60.552 2 0.015844 56421 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.097 38.074 64174000 0 0 0 0 0 0 0 39459000 0 24714000 0 0 0 271 1401 258 2357;2358 3092;3093 3093 2 AALLELWELR Unmodified 1212.6867 0.68665836 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.71 141.71 2;3 1.2202E-11 148031 QUIQUE_C1218_190116_001 163.99 125.82 22788000000 2110700000 2324100000 2149500000 2629100000 2265100000 1856300000 2199000000 580320000 1165000000 1122100000 1794200000 1175800000 1416900000 272 267;275;3025 259 2359;2360;2361;2362;2363;2364;2365;2366;2367;2368;2369;2370;2371;2372 3094;3095;3096;3097;3098;3099;3100;3101;3102;3103;3104;3105;3106;3107;3108;3109;3110;3111;3112;3113;3114;3115;3116;3117;3118;3119;3120;3121;3122;3123 3096 30 AALLELWELRR Unmodified 1368.7878 0.78776939 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 3 1 2 2 2 1 2 3 2 111.44 111.44 2;3 7.5584E-30 116275 QUIQUE_DMIX5_190116_001 213.53 161.04 14823000000 51470000 445180000 452990000 236480000 1004100000 107070000 800070000 1860700000 2321000000 36348000 2766800000 2517400000 2223700000 273 267;275;3025 260 2373;2374;2375;2376;2377;2378;2379;2380;2381;2382;2383;2384;2385;2386;2387;2388;2389;2390;2391;2392;2393;2394;2395;2396;2397 3124;3125;3126;3127;3128;3129;3130;3131;3132;3133;3134;3135;3136;3137;3138;3139;3140;3141;3142;3143;3144;3145;3146;3147;3148;3149;3150;3151;3152;3153;3154;3155;3156;3157;3158 3151 35 AALLETLSLLLAK Unmodified 1354.8436 0.84355293 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 166.53 166.53 2 0.00041578 173631 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.143 83.106 237260000 0 0 0 0 0 0 0 22504000 63275000 0 56749000 94735000 0 274 3740 261 2398;2399;2400;2401 3159;3160;3161;3162 3161 2 AALLNQHYQVNFK Unmodified 1544.81 0.80996139 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 65.941 65.941 2;3 0.00012317 63117 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.479 71.279 112390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50779000 36110000 25506000 0 275 1929 262 2402;2403;2404;2405;2406;2407;2408;2409;2410 3163;3164;3165;3166;3167;3168;3169;3170;3171;3172 3170 10 AALLWALAAALER Unmodified 1367.7925 0.79252041 3561 Q8IZ83;F5H4B6 ALDH16A1 Aldehyde dehydrogenase family 16 member A1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 2 2 1 166.85 166.85 2;3 2.2374E-05 173822 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.191 76.98 591240000 21056000 24216000 45050000 0 49246000 29664000 121530000 0 76181000 4268500 100270000 87525000 32235000 276 3561 263 2411;2412;2413;2414;2415;2416;2417;2418;2419;2420;2421;2422;2423;2424;2425;2426 3173;3174;3175;3176;3177;3178;3179;3180;3181;3182;3183;3184;3185;3186;3187;3188 3185 15 AALNELVECVGSTR Unmodified 1517.7508 0.75079153 3119 Q15173;E9PNY3;E9PQN5 PPP2R5B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 98.802 98.802 2 0.019271 102353 QUIQUE_C1218_190116_001 50.354 23.025 199320000 53467000 58019000 0 87835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 277 3119 264 2427;2428;2429 3189;3190;3191 3189 3 AALPSHVVTMLDNFPTNLHPMSQLSAAVTALNSESNFAR 2 Oxidation (M) 4183.0467 0.046662562 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VRP1;F8VX68;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 2 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 139.91 139.91 3;4 1.3462E-128 144403 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.36 166.09 1852500000 66558000 76130000 59999000 0 0 36728000 0 242100000 263650000 235540000 233040000 253320000 385470000 278 612 265 2430;2431;2432;2433;2434;2435;2436;2437;2438;2439;2440;2441;2442;2443;2444;2445 3192;3193;3194;3195;3196;3197;3198;3199;3200;3201;3202;3203;3204;3205;3206;3207;3208;3209;3210 3200 397;398 18 AALPSHVVTMLDNFPTNLHPMSQLSAAVTALNSESNFAR Oxidation (M) 4167.0517 0.05174794 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VRP1;F8VX68;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 151.78 151.78 3;4;5 1.9492E-113 156683 QUIQUE_C1368_190116_001 163 154.87 4968900000 575620000 457060000 543290000 723910000 186380000 564460000 253500000 464290000 0 606570000 0 98282000 495570000 279 612 265 2446;2447;2448;2449;2450;2451;2452;2453;2454;2455;2456;2457;2458;2459;2460;2461 3211;3212;3213;3214;3215;3216;3217;3218;3219;3220;3221;3222;3223;3224;3225;3226;3227;3228;3229;3230;3231 3218 397;398 21 AALPSHVVTMLDNFPTNLHPMSQLSAAVTALNSESNFAR Unmodified 4151.0568 0.056833318 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VRP1;F8VX68;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 3 5 2 2 2 2 3 5 3 1 3 3 4 160.34 160.34 3;4;5 6.4661E-184 165924 QUIQUE_C1218_190116_001 200.91 195.72 15957000000 1245000000 1133800000 1626000000 1184000000 871100000 990870000 1041500000 1332500000 1177900000 37581000 1530000000 2074900000 1711900000 280 612 265 2462;2463;2464;2465;2466;2467;2468;2469;2470;2471;2472;2473;2474;2475;2476;2477;2478;2479;2480;2481;2482;2483;2484;2485;2486;2487;2488;2489;2490;2491;2492;2493;2494;2495;2496;2497;2498;2499 3232;3233;3234;3235;3236;3237;3238;3239;3240;3241;3242;3243;3244;3245;3246;3247;3248;3249;3250;3251;3252;3253;3254;3255;3256;3257;3258;3259;3260;3261;3262;3263;3264;3265;3266;3267;3268;3269;3270;3271;3272;3273;3274;3275;3276;3277;3278;3279 3234 43 AALPTPALSPEDK Unmodified 1308.6925 0.6925316 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 65.748 65.748 2 0.023716 61604 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.452 39.622 20287000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20287000 0 0 0 281 4161 266 2500;2501 3280;3281;3282 3282 3 AALQEEEQASK Unmodified 1202.5779 0.57789577 1377 O00139 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.105 17.105 2 2.6325E-09 10028 QUIQUE_C1218_190116_001 166.33 135.25 1704400000 163080000 153050000 176120000 182490000 90843000 155130000 136370000 152750000 159700000 40762000 120370000 173770000 0 282 1377 267 2502;2503;2504;2505;2506;2507;2508;2509;2510;2511;2512;2513 3283;3284;3285;3286;3287;3288;3289;3290;3291;3292;3293;3294 3283 7 AALQEELQLCK Unmodified 1301.6649 0.66493664 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 71.814 71.814 2 0.003715 71959 QUIQUE_C1277_190116_001 90.709 60.454 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 283 2524 268 2514 3295 3295 1 AALQEGHQFLCSIEA Unmodified 1672.7879 0.78790532 2571 P50583 NUDT2 Bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase [asymmetrical] yes yes 0 0 0 1 1 1 103.53 103.53 2 0.006895 106589 QUIQUE_C1277_190116_001 56.087 38.613 223890000 0 68938000 0 0 0 0 0 74973000 0 0 79980000 0 0 284 2571 269 2515;2516;2517 3296;3297;3298 3296 2 AALQSQAEALR Unmodified 1156.62 0.62003536 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 0 1 1 1 37.007 37.007 2 0.003244 33279 QUIQUE_C1277_190116_001 74.376 9.7226 6346300000 0 1932800000 0 2328700000 2084800000 0 0 0 0 0 0 0 0 285 3725 270 2518;2519;2520 3299;3300;3301;3302;3303 3299 5 AALQSQAEALRR Unmodified 1312.7211 0.72114638 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 1 1 1 27.761 27.761 3 0.0099949 22205 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.592 2.6009 76020000 0 0 0 0 0 0 0 0 31863000 0 0 44157000 0 286 3725 271 2521;2522 3304;3305;3306 3304 3 AALSALESFLK Unmodified 1148.6441 0.64412484 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.92 131.92 2 0.0002806 136098 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.12 91.91 209730000 0 0 14062000 0 0 10449000 17395000 27939000 33215000 9708600 34001000 43321000 19637000 287 2813 272 2523;2524;2525;2526;2527;2528;2529;2530;2531;2532;2533 3307;3308;3309;3310;3311;3312;3313;3314;3315;3316;3317;3318 3317 12 AALSASEGEEVPQDKAPSHVPFLLIGGGTAAFAAAR Unmodified 3534.8107 0.81069626 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 124.38 124.38 4 1.8688E-05 127142 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.003 34.956 45377000 0 0 0 0 0 0 0 45377000 0 0 0 0 0 288 1756 273 2534 3319 3319 1 AALSEMVEYITHNR Unmodified 1632.793 0.7929907 1163 H0YJ75;Q13362;Q96B13;G3V2U3 PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 119.51 119.51 2;3 7.1657E-05 123790 QUIQUE_C1368_190116_001 76.262 69.534 477340000 23185000 39961000 32388000 34252000 24427000 27131000 52298000 59417000 0 0 97365000 41051000 45866000 289 1163 274 2535;2536;2537;2538;2539;2540;2541;2542;2543;2544;2545;2546;2547 3320;3321;3322;3323;3324;3325;3326;3327;3328;3329;3330;3331;3332;3333;3334;3335 3323 14 AALSGANVLTLIEK Unmodified 1398.8082 0.80823006 2911 Q07954;H0YJI8 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes no 0 0 0 1 122.71 122.71 2 0.010968 127098 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.788 54.951 79011000 0 0 0 0 0 0 0 0 79011000 0 0 0 0 290 2911 275 2548 3336 3336 1 AALSGSYVNFGVFR Unmodified 1486.7569 0.75686319 4447 Q9UIA9;E7ESC6;E5RIW1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 118.56 118.56 2 0.00025845 122840 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.23 97.488 161270000 0 0 0 0 0 41092000 0 0 51286000 0 68895000 0 0 291 4447 276 2549;2550;2551 3337;3338;3339 3338 3 AALSSFQK Unmodified 850.45487 0.45486751 2717 P61201;H0YKU5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 24.696 24.696 2 0.020244 18246 QUIQUE_C1368_190116_001 77.058 57.136 461350000 0 0 114600000 0 0 0 0 0 0 0 0 129680000 217060000 292 2717 277 2552;2553;2554 3340;3341;3342 3340 3 AALTAEHFAALQSLLK Acetyl (Protein N-term) 1724.9461 0.94612052 4360 Q9P000;E9PJ95 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes no 1 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 153.08 153.08 2;3 1.2074E-29 157325 QUIQUE_C1277_190116_001 178.58 150.38 1456700000 110440000 149970000 137780000 98761000 137140000 138730000 84293000 28467000 137610000 18741000 108720000 207210000 98820000 293 4360 278 2555;2556;2557;2558;2559;2560;2561;2562;2563;2564;2565;2566;2567;2568;2569;2570;2571;2572;2573;2574;2575 3343;3344;3345;3346;3347;3348;3349;3350;3351;3352;3353;3354;3355;3356;3357;3358;3359;3360;3361;3362;3363 3346 21 AALTGLLHR Unmodified 950.56615 0.56614929 2660 P55084;B5MD38;C9JEY0;C9JE81 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.174 45.174 2 0.00012644 42922 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.36 104.04 1720500000 292010000 236870000 0 206460000 0 155820000 230680000 358970000 0 0 0 0 239670000 294 2660 279 2576;2577;2578;2579;2580;2581;2582 3364;3365;3366;3367;3368;3369;3370;3371;3372 3371 8 AALTLTPSAVNK Unmodified 1184.6765 0.6764876 4032 Q9BUE6;Q5TBE9 ISCA1 Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 53.461 53.461 2 0.0014638 50422 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.08 64.56 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 295 4032 280 2583;2584;2585 3373;3374;3375 3375 3 AALTTLFK Acetyl (Protein N-term) 905.52222 0.52221879 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3KSV5;A0A087WYZ1;J3QRA8;J3QR27;J3QLU1;J3QKQ0;J3QRD0;J3QQN6;J3QL02;J3KSS4;J3QRP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 1 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 145.06 145.06 1;2 0.00081455 147855 QUIQUE_C1563_190116_001 161.11 94.077 25563000000 1692400000 1573300000 2145200000 1781400000 2262600000 1777900000 2143500000 2112400000 2121500000 897640000 2510900000 2180400000 2363900000 296 3897 281 2586;2587;2588;2589;2590;2591;2592;2593;2594;2595;2596;2597;2598;2599;2600;2601;2602;2603;2604;2605;2606;2607;2608;2609;2610;2611 3376;3377;3378;3379;3380;3381;3382;3383;3384;3385;3386;3387;3388;3389;3390;3391;3392;3393;3394;3395;3396;3397;3398;3399;3400;3401;3402;3403;3404;3405;3406;3407;3408;3409;3410;3411;3412;3413;3414;3415;3416;3417;3418 3395 35 AALTTLFK Unmodified 863.51165 0.5116541 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3KSV5;A0A087WYZ1;J3QRA8;J3QR27;J3QLU1;J3QKQ0;J3QRD0;J3QQN6;J3QL02;J3KSS4;J3QRP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 0 1 74.067 74.067 2 0.045295 73703 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.177 42.513 13642000 0 0 0 0 0 0 0 13642000 0 0 0 0 0 297 3897 281 2612 3419;3420 3420 2 AALVAQNYINYQQGTPHR Unmodified 2043.0286 0.028621372 4008 Q9BS40 LXN Latexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.201 68.201 3 8.0719E-05 68110 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.317 72.034 661310000 71485000 54299000 53832000 55372000 60919000 35087000 56157000 0 42489000 28293000 66927000 72472000 63976000 298 4008 282 2613;2614;2615;2616;2617;2618;2619;2620;2621;2622;2623;2624 3421;3422;3423;3424;3425;3426;3427;3428;3429;3430;3431;3432 3428 10 AALVDLEPGTMDSVR Unmodified 1572.7818 0.78175731 4033 Q9BUF5;K7EL29;K7EN98;K7ESQ3;K7EQT3;K7EJ64;K7ERA8;K7EJZ4;K7EPE5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 98.872 98.872 2 1.3674E-05 101414 QUIQUE_C1403_190116_001 96.604 63.516 300890000 0 40943000 0 58444000 45669000 0 0 0 0 0 155840000 0 0 299 4033 283 2625;2626;2627;2628 3433;3434;3435;3436 3434 2 AALVDYLDGK Unmodified 1063.555 0.55497548 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 90.762 90.762 2 0.058232 87376 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.335 23.264 13034000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13034000 0 0 0 300 3391 284 2629 3437 3437 1 AALVEPLGLER Acetyl (Protein N-term) 1208.6765 0.6764876 4204 Q9HAP6 LIN7B Protein lin-7 homolog B yes yes 1 0 0 1 140.74 140.74 2 0.033456 144598 QUIQUE_C1403_190116_001 43.185 29.047 19305000 0 0 0 19305000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 301 4204 285 2630 3438 3438 1 AALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEK Oxidation (M) 2884.4892 0.48921069 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 3 2 1 1 3 1 1 1 145.77 145.77 3 2.5589E-20 141233 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.446 87.996 3182600000 201700000 179370000 0 392020000 245310000 573630000 274190000 161360000 291610000 335040000 200090000 167330000 160950000 302 3050 286 2631;2632;2633;2634;2635;2636;2637;2638;2639;2640;2641;2642;2643;2644;2645;2646;2647;2648;2649 3439;3440;3441;3442;3443;3444;3445;3446;3447;3448;3449;3450;3451;3452;3453;3454;3455;3456;3457;3458;3459;3460;3461;3462;3463 3457 2473 23 AALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEK Unmodified 2868.4943 0.49429607 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 4 4 3 2 1 2 3 3 3 3 4 4 3 151.89 151.89 2;3;4 8.8431E-133 157262 QUIQUE_C1368_190116_001 246.45 236.79 12127000000 875140000 1131200000 1010600000 671370000 644360000 168870000 957000000 1089600000 1125900000 518830000 1163200000 1859100000 911560000 303 3050 286 2650;2651;2652;2653;2654;2655;2656;2657;2658;2659;2660;2661;2662;2663;2664;2665;2666;2667;2668;2669;2670;2671;2672;2673;2674;2675;2676;2677;2678;2679;2680;2681;2682;2683;2684;2685;2686;2687;2688 3464;3465;3466;3467;3468;3469;3470;3471;3472;3473;3474;3475;3476;3477;3478;3479;3480;3481;3482;3483;3484;3485;3486;3487;3488;3489;3490;3491;3492;3493;3494;3495;3496;3497;3498;3499;3500;3501;3502;3503;3504;3505;3506;3507;3508;3509;3510;3511;3512;3513;3514;3515;3516;3517;3518;3519;3520;3521;3522;3523;3524;3525;3526;3527;3528;3529;3530;3531;3532;3533;3534;3535;3536;3537;3538;3539 3486 75 AALVGGTTMIIGHVLPDK Unmodified 1791.9917 0.99169051 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 104.72 104.72 2;3 0.00036065 107917 QUIQUE_C1277_190116_001 76.01 67.878 462820000 0 129710000 66628000 0 68134000 71429000 60788000 0 0 29266000 0 0 36855000 304 3984 287 2689;2690;2691;2692;2693;2694;2695;2696 3540;3541;3542;3543;3544;3545;3546;3547;3548;3549;3550 3542 10 AALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEK Unmodified 2927.5314 0.53140985 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 123.7 123.7 3;4 1.9484E-78 127145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.27 160.47 11966000000 595490000 1052700000 763110000 606330000 1105800000 521960000 1202800000 800870000 1281500000 222930000 1135100000 1074100000 1602800000 305 3984 288 2697;2698;2699;2700;2701;2702;2703;2704;2705;2706;2707;2708;2709;2710;2711;2712;2713;2714;2715;2716;2717;2718;2719;2720;2721;2722 3551;3552;3553;3554;3555;3556;3557;3558;3559;3560;3561;3562;3563;3564;3565;3566;3567;3568;3569;3570;3571;3572;3573;3574;3575;3576;3577;3578;3579;3580;3581;3582;3583;3584;3585;3586;3587;3588;3589;3590;3591;3592;3593;3594;3595;3596;3597;3598;3599 3579 49 AALVGGTTMIIGHVLPDKETSLVDAYEK Oxidation (M) 2943.5263 0.52632448 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 115.68 115.68 3;4 1.8986E-18 119537 QUIQUE_C1368_190116_001 88.917 80.753 1124500000 0 66238000 70622000 40217000 0 0 0 242840000 95283000 37969000 160710000 121440000 289200000 306 3984 288 2723;2724;2725;2726;2727;2728;2729;2730;2731;2732 3600;3601;3602;3603;3604;3605;3606;3607;3608;3609 3601 2820 9 AALVLEDGSVLR Acetyl (Protein N-term) 1283.7085 0.70851601 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.89 147.89 2 2.6705E-07 153309 QUIQUE_C1368_190116_001 168.8 70.764 451500000 0 38360000 42331000 35424000 48293000 36650000 36841000 42838000 38730000 12745000 44017000 40421000 34855000 307 1029 289 2733;2734;2735;2736;2737;2738;2739;2740;2741;2742;2743;2744 3610;3611;3612;3613;3614;3615;3616;3617;3618;3619;3620;3621;3622 3611 12 AAMAAAQSGTPGPVFVELPVDVLYPYFMVQK Unmodified 3295.6661 0.6661292 516 A1L0T0;M0R026;E9PJS0;M0R1B5 ILVBL Acetolactate synthase-like protein yes no 0 0 0 1 171.94 171.94 3 0.0014927 174535 QUIQUE_C1403_190116_001 30.602 25.39 18151000 0 0 0 18151000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 308 516 290 2745 3623 3623 1 AAMAVGGAGGSR Acetyl (Protein N-term) 1045.4975 0.49747738 1440 O14744;G3V580;G3V2X6;G3V2L6;C9JSX3;G3V507;G3V2F5 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 1 0 0 1 50.373 50.373 2 0.029203 48982 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.161 25.647 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 309 1440 291 2746 3624 3624 1 AAMDNSEIAGEK Unmodified 1234.55 0.54996646 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.121 25.121 2 1.5995E-06 18870 QUIQUE_C1438_190116_001 139.43 115.66 1169700000 0 136390000 132590000 129180000 97886000 113800000 123530000 40947000 66181000 50494000 114720000 46518000 117450000 310 693;3205 292 2747;2748;2749;2750;2751;2752;2753;2754;2755;2756;2757;2758 3625;3626;3627;3628;3629;3630;3631;3632;3633;3634;3635;3636;3637;3638;3639;3640 3629 16 AAMDNSEIAGEK Oxidation (M) 1250.5449 0.54488108 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 1 0 1 15.345 15.345 2 0.0021983 7324 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.655 63.511 23590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23590000 0 0 0 311 693;3205 292 2759 3641;3642 3641 426 2 AAMDNSEIAGEKK Unmodified 1362.6449 0.64492948 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 16.388 16.388 2;3 1.1951E-07 8708 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.97 132.35 1677600000 73148000 109590000 107580000 135560000 98174000 0 108440000 194520000 0 0 402010000 204700000 243910000 312 693;3205 293 2760;2761;2762;2763;2764;2765;2766;2767;2768;2769;2770;2771;2772;2773;2774 3643;3644;3645;3646;3647;3648;3649;3650;3651;3652;3653;3654;3655;3656;3657;3658 3653 13 AAMEALVVEVTK Unmodified 1259.6795 0.67952407 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.657 97.657 2 0.0043849 101632 QUIQUE_C1218_190116_001 86.344 75.123 433670000 93870000 0 83656000 0 0 0 74912000 76938000 0 0 104290000 0 0 313 2916 294 2775;2776;2777;2778;2779;2780 3659;3660;3661;3662;3663;3664 3659 4 AAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQR Unmodified 3201.4859 0.485933 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y5Z1;E7EMJ5 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 128.68 128.68 3 0.00053613 125195 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.054 32.502 44275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44275000 0 0 0 314 425 295 2781 3665 3665 1 AAMIVNQLSK Unmodified 1073.5903 0.59031513 2084 P14923;C9JTX4;C9J826;C9JK18;C9JKY1 JUP Junction plakoglobin yes no 0 0 0 1 1 47.473 47.473 2 0.00069041 45134 QUIQUE_C1403_190116_001 107.69 60.25 78463000 0 0 0 46363000 0 0 0 0 0 0 0 0 32100000 315 2084 296 2782;2783 3666;3667;3668 3667 3 AAMIWIVGEYAER Unmodified 1507.7493 0.74933497 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01;Q10567;C9J1E7;H7C034 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 3 3 2 2 3 3 2 130.61 130.61 2;3 0.00010934 136494 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.633 66.755 1580700000 88141000 111550000 0 98382000 92235000 10008000 144370000 233100000 166100000 116460000 179940000 200480000 139920000 316 2777;2938 297 2784;2785;2786;2787;2788;2789;2790;2791;2792;2793;2794;2795;2796;2797;2798;2799;2800;2801;2802;2803;2804;2805;2806;2807;2808;2809;2810;2811;2812 3669;3670;3671;3672;3673;3674;3675;3676;3677;3678;3679;3680;3681;3682;3683;3684;3685;3686;3687;3688;3689;3690;3691;3692;3693;3694;3695;3696;3697;3698;3699;3700;3701;3702;3703;3704;3705;3706;3707;3708;3709;3710;3711;3712;3713;3714;3715 3702 47 AAMIWIVGEYAER Oxidation (M) 1523.7442 0.74424959 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01;Q10567;C9J1E7;H7C034 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 109.64 109.64 2 0.00013923 111192 QUIQUE_C1563_190116_001 117.67 74.93 443640000 0 63339000 0 69701000 49032000 67966000 66901000 33916000 0 34932000 0 57855000 0 317 2777;2938 297 2813;2814;2815;2816;2817;2818;2819;2820;2821;2822;2823;2824 3716;3717;3718;3719;3720;3721;3722;3723;3724;3725;3726;3727;3728;3729;3730 3723 2213 15 AAMLSLLR Unmodified 873.51061 0.51060825 1481 O15111 CHUK Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha yes yes 0 0 0 1 83.582 83.582 2 0.059892 84101 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 33.586 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 318 1481 298 2825 3731 3731 1 AAMTSLMDLTLLLAR Unmodified 1618.8786 0.87863458 1283 J3KR97;Q9BTW9;A0A0J9YWI5;A0A0J9YVR1 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 168.12 168.12 2 1.3837E-12 172806 QUIQUE_C1218_190116_001 132.32 114.51 100640000 28001000 31324000 0 17543000 0 0 0 23773000 0 0 0 0 0 319 1283 299 2826;2827;2828;2829 3732;3733;3734;3735 3732 4 AAMVGMLANFLGFR Unmodified 1496.7632 0.76321089 1801 P01019 AGT Angiotensinogen;Angiotensin-1;Angiotensin-2;Angiotensin-3;Angiotensin-4;Angiotensin 1-9;Angiotensin 1-7;Angiotensin 1-5;Angiotensin 1-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.74 166.74 2 0.00020667 172202 QUIQUE_C1576_190116_001 94.692 79.719 502410000 36569000 29331000 45411000 0 0 20067000 34310000 34156000 42165000 6738100 96554000 129070000 28040000 320 1801 300 2830;2831;2832;2833;2834;2835;2836;2837;2838;2839;2840 3736;3737;3738;3739;3740;3741;3742;3743;3744;3745;3746 3740 8 AANATTNPSQLLPLELVDK Acetyl (Protein N-term) 2036.079 0.078985188 675 B8ZZF8;Q9Y4Y9 LSM5 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.7 157.7 2 1.8889E-11 161872 QUIQUE_C1277_190116_001 140.74 128.18 315840000 32773000 37440000 42829000 0 35848000 0 0 30412000 0 12460000 37867000 47389000 38826000 321 675 301 2841;2842;2843;2844;2845;2846;2847;2848;2849;2850 3747;3748;3749;3750;3751;3752;3753;3754;3755;3756;3757;3758;3759;3760;3761 3748 15 AANDAGYFNDEMAPIEVK Unmodified 1953.8778 0.87784254 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.3 107.3 2 2.5401E-08 110754 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.81 122.72 3380800000 302820000 264060000 346350000 265580000 204970000 241000000 285390000 265320000 230460000 75213000 372130000 266190000 261270000 322 2453 302 2851;2852;2853;2854;2855;2856;2857;2858;2859;2860;2861;2862;2863 3762;3763;3764;3765;3766;3767;3768;3769;3770;3771;3772;3773;3774;3775 3775 13 AANDAGYFNDEMAPIEVK Oxidation (M) 1969.8728 0.87275716 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.992 87.992 2 3.27E-38 89917 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.48 153.78 365540000 0 34550000 0 0 42094000 0 0 54912000 56016000 0 70248000 58431000 49288000 323 2453 302 2864;2865;2866;2867;2868;2869;2870;2871;2872;2873;2874;2875 3776;3777;3778;3779;3780;3781;3782;3783;3784;3785;3786;3787 3783 1874 12 AANEVSSADVK Unmodified 1089.5302 0.5302173 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 15.993 15.993 2 0.0026434 8839 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.523 66.147 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 324 1175 303 2876;2877;2878;2879 3788;3789;3790;3791 3791 4 AANGVVLATEK Unmodified 1071.5924 0.59242362 5 A0A024RA52;P25787 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.041 26.041 2 0.00020688 20175 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.75 46.466 1595100000 115930000 103540000 117280000 114030000 123770000 100020000 137330000 115640000 134740000 57460000 172420000 141190000 161770000 325 5 304 2880;2881;2882;2883;2884;2885;2886;2887;2888;2889;2890;2891;2892 3792;3793;3794;3795;3796;3797;3798;3799;3800;3801;3802;3803;3804;3805 3800 9 AANGVVLATEKK Unmodified 1199.6874 0.68738664 5 A0A024RA52;P25787 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 1 2 16.52 16.52 2;3 0.0041663 9040 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.887 57.347 39542000 0 0 0 0 0 0 0 39542000 0 0 0 0 0 326 5 305 2893;2894 3806;3807 3807 2 AANILVGENLVCK Unmodified 1399.7493 0.74933497 1305;2048 J3QRU1;P07947;P12931 YES1;SRC Non-specific protein-tyrosine kinase;Tyrosine-protein kinase Yes;Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src no no 0 0 0 1 85.678 85.678 2 0.0078538 82417 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.166 43.188 34412000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34412000 0 0 0 327 1305;2048 306 2895 3808;3809 3809 2 AANLNNLVVEAYQK Unmodified 1545.8151 0.81510635 2247 P26012 ITGB8 Integrin beta-8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 90.115 90.115 2 0.00014501 92360 QUIQUE_C1368_190116_001 103.63 72.138 389760000 61267000 0 82058000 0 91051000 0 74308000 0 0 0 81074000 0 0 328 2247 307 2896;2897;2898;2899;2900;2901;2902;2903 3810;3811;3812;3813;3814;3815;3816;3817;3818 3812 6 AANMIPAHDSPLAALAFDASGTK Unmodified 2268.1209 0.12086678 4611 Q9Y4P8 WIPI2 WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 118.22 118.22 3 2.9776E-11 122042 QUIQUE_C1277_190116_001 71.052 63.213 272390000 40474000 59296000 0 52208000 0 0 0 0 0 0 0 58046000 62365000 329 4611 308 2904;2905;2906;2907;2908 3819;3820;3821;3822;3823;3824;3825 3820 7 AANSCTSYSGTTLNLK Unmodified 1686.7883 0.78829925 4520 Q9UPQ0;D6RD46 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.573 54.573 2 0.002049 52515 QUIQUE_C1403_190116_001 63.966 41.048 106820000 20121000 0 0 19891000 24438000 21339000 0 0 0 0 0 21027000 0 330 4520 309 2909;2910;2911;2912;2913 3826;3827;3828;3829;3830 3827 5 AANSLEAFIFETQDK Unmodified 1682.8152 0.81516593 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 132.96 132.96 2;3 2.8817E-06 136098 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.58 125.95 790930000 0 187880000 0 130480000 68137000 52691000 0 71905000 143250000 0 67535000 0 69059000 331 89 310 2914;2915;2916;2917;2918;2919;2920;2921;2922;2923;2924;2925;2926 3831;3832;3833;3834;3835;3836;3837;3838;3839;3840;3841;3842;3843;3844;3845 3842 12 AANVLLSEHGEVK Unmodified 1365.7252 0.72522871 622 B4DR80;Q9Y6E0;H0Y630 STK24 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit yes no 0 0 0 1 32.8 32.8 2 0.045674 27668 QUIQUE_C1277_190116_001 44.299 26.435 18209000 0 18209000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 332 622 311 2927 3846 3846 1 AANWYER Unmodified 908.41407 0.41406533 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 34.12 34.12 2 0.035447 29973 QUIQUE_C1438_190116_001 86.866 71.427 368670000 0 0 0 0 112220000 0 0 0 0 0 148270000 0 108170000 333 1639 312 2928;2929;2930 3847;3848;3849 3847 3 AAPAEGAGEDEDDGASR Unmodified 1616.655 0.65503647 1015 F5H6L7;Q9UPR5 SLC8A2 Sodium/calcium exchanger 2 yes no 0 0 0 1 1 17.931 17.931 2 9.4095E-05 10385 QUIQUE_C1368_190116_001 93.348 86.375 22811000 0 0 11051000 0 0 0 11760000 0 0 0 0 0 0 334 1015 313 2931;2932 3850;3851 3850 1 AAPAPGLISVFSSSQELGAALAQLVAQR Acetyl (Protein N-term) 2793.5025 0.50249299 1723 O95336;M0R261;M0R0U3 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 2 2 3 1 2 2 1 182.61 182.61 2;3 8.7119E-127 188926 QUIQUE_DMIX5_190116_001 243.13 231.66 7132400000 125820000 130700000 250870000 0 598100000 251330000 307110000 798480000 1377700000 25543000 1719600000 1524400000 22738000 335 1723 314 2933;2934;2935;2936;2937;2938;2939;2940;2941;2942;2943;2944;2945;2946;2947;2948;2949;2950;2951 3852;3853;3854;3855;3856;3857;3858;3859;3860;3861;3862;3863;3864;3865;3866;3867;3868;3869;3870;3871;3872;3873;3874;3875;3876;3877;3878 3875 26 AAPAQQTTQPGGGK Acetyl (Protein N-term) 1352.6684 0.66844211 4327 Q9NXG2;H3BNW0 THUMPD1 THUMP domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.484 23.484 2 3.3942E-11 17266 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.36 121.13 464170000 47516000 44789000 0 75422000 0 36744000 44102000 58456000 46311000 0 52588000 0 58242000 336 4327 315 2952;2953;2954;2955;2956;2957;2958;2959;2960 3879;3880;3881;3882;3883;3884;3885;3886;3887;3888 3885 10 AAPAQQTTQPGGGKR Acetyl (Protein N-term) 1508.7696 0.76955314 4327 Q9NXG2;H3BNW0 THUMPD1 THUMP domain-containing protein 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 16.576 16.576 2 1.8895E-06 8886 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.77 96.427 177310000 0 0 0 0 0 0 0 33868000 27201000 0 58619000 28009000 29616000 337 4327 316 2961;2962;2963;2964;2965 3889;3890;3891;3892;3893 3891 5 AAPCIYWLPLTDSQIVQK Unmodified 2102.087 0.087047453 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3;G3V3B0 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 0 1 1 1 144.39 144.39 2 0.00078165 149440 QUIQUE_C1368_190116_001 90.614 79.667 83219000 14671000 0 34110000 34438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 338 4745 317 2966;2967;2968 3894;3895;3896 3895 3 AAPDDPSGFAVLASCAR Unmodified 1703.7937 0.79371898 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 101.6 101.6 2 0.00048238 104495 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.912 56.039 212040000 0 50405000 0 0 0 0 0 0 48192000 0 0 49639000 63801000 339 212 318 2969;2970;2971;2972;2973 3897;3898;3899;3900;3901 3900 5 AAPEASGTPSSDAVSR Unmodified 1501.7009 0.70086445 2327 P31146 CORO1A Coronin-1A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.807 22.807 2 2.4271E-06 16209 QUIQUE_C1218_190116_001 140.91 123.47 6381400000 476000000 512540000 698530000 678380000 521910000 482540000 598720000 381210000 459520000 0 576960000 461720000 533340000 340 2327 319 2974;2975;2976;2977;2978;2979;2980;2981;2982;2983;2984;2985 3902;3903;3904;3905;3906;3907;3908;3909;3910;3911;3912;3913;3914 3902 12 AAPEGSGLGEDAR Acetyl (Protein N-term) 1270.579 0.5789584 3857 Q96G03;E7ENQ8;E9PD70 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.262 53.262 2 0.0020182 51890 QUIQUE_C1218_190116_001 69.65 52.979 472430000 67713000 63921000 72637000 64173000 0 43702000 0 0 0 36595000 0 62539000 61153000 341 3857 320 2986;2987;2988;2989;2990;2991;2992;2993;2994 3915;3916;3917;3918;3919;3920;3921;3922;3923;3924 3915 10 AAPEMVSLLK Unmodified 1057.5842 0.58416712 3771 Q92947;K7EQ99;K7ESA6 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.355 81.355 2 0.0046555 82481 QUIQUE_C1368_190116_001 80.165 40.098 572630000 0 0 148830000 129600000 0 116670000 0 99629000 0 0 0 77899000 0 342 3771 321 2995;2996;2997;2998;2999;3000 3925;3926;3927;3928;3929;3930;3931 3927 4 AAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFK 2 Oxidation (M) 4393.0307 0.030737726 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 2 0 1 169.04 169.04 4 1.5342E-54 176438 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.66 101.96 119410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119410000 0 0 343 1242;2047 322 3001 3932 3932 710;711 1 AAPFSLEYR Unmodified 1052.5291 0.52909508 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.758 74.758 2 2.3278E-06 76864 QUIQUE_C1218_190116_001 170.32 132.08 6632500000 436890000 324010000 448620000 301640000 664500000 181260000 454550000 580840000 552870000 0 613120000 717760000 1356500000 344 3120 323 3002;3003;3004;3005;3006;3007;3008;3009;3010;3011;3012;3013 3933;3934;3935;3936;3937;3938;3939;3940;3941;3942;3943;3944;3945;3946;3947;3948;3949;3950;3951;3952;3953;3954;3955;3956 3934 24 AAPGAEFAPNK Unmodified 1071.5349 0.53490874 3122 Q15233 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 29.887 29.887 2 0.038317 24584 QUIQUE_C1277_190116_001 64.711 41.64 117990000 0 57790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60201000 0 345 3122 324 3014;3015 3957;3958 3957 1 AAPGAEFAPNKR Unmodified 1227.636 0.63601977 3122 Q15233 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 20.144 20.144 2;3 0.0004049 12638 QUIQUE_C1563_190116_001 65.179 57.917 3432300000 235510000 350660000 247430000 429600000 229290000 184200000 155630000 276280000 293410000 57260000 439820000 193930000 339300000 346 3122 325 3016;3017;3018;3019;3020;3021;3022;3023;3024;3025;3026;3027;3028;3029;3030;3031;3032;3033 3959;3960;3961;3962;3963;3964;3965;3966;3967;3968;3969;3970;3971;3972;3973;3974;3975;3976 3968 13 AAPGALLVMGVSGSGK Acetyl (Protein N-term) 1455.7755 0.77554972 3317 Q5T6J7;Q5T6J8 IDNK Probable gluconokinase yes no 1 0 0 1 1 141.65 141.65 2 0.016096 137738 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.013 35.811 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 347 3317 326 3034;3035 3977;3978 3978 2 AAPGDPQDELLPLAGPGSQWLR Acetyl (Protein N-term) 2329.1703 0.17025981 3199 Q16799 RTN1 Reticulon-1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 167.55 167.55 2 4.4009E-09 172341 QUIQUE_C1218_190116_001 96.414 76.575 378210000 80328000 82986000 0 0 90702000 0 0 58229000 65963000 0 0 0 0 348 3199 327 3036;3037;3038;3039;3040 3979;3980;3981;3982;3983 3979 4 AAPGPALCLFDVDGTLTAPR Acetyl (Protein N-term) 2083.0408 0.040825542 1179 H3BR08;H3BM92;H3BV34;H3BT06;H3BNY9;H3BRM0;O15305 PMM2 Phosphomannomutase;Phosphomannomutase 2 yes no 1 0 0 1 1 166.93 166.93 2 2.2535E-06 170127 QUIQUE_C1403_190116_001 92.468 79.267 35562000 0 0 20640000 14922000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 349 1179 328 3041;3042 3984;3985 3985 2 AAPILFASAALALGSSLALK Unmodified 1884.1084 0.10843482 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 169.89 169.89 2;3 6.8947E-65 174262 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.48 167.28 1037200000 59269000 48569000 75255000 26235000 59512000 21860000 75016000 130810000 176960000 20523000 108010000 88084000 147070000 350 3434 329 3043;3044;3045;3046;3047;3048;3049;3050;3051;3052;3053;3054;3055;3056;3057;3058;3059;3060;3061;3062;3063;3064;3065;3066;3067;3068 3986;3987;3988;3989;3990;3991;3992;3993;3994;3995;3996;3997;3998;3999;4000;4001;4002;4003;4004;4005;4006;4007;4008;4009;4010;4011;4012;4013;4014;4015 4007 30 AAPLAGFGYGLPISR Unmodified 1488.8089 0.80889876 3113 Q15120 PDK3 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 121.65 121.65 2 0.0011386 124455 QUIQUE_C1563_190116_001 87.363 73.205 485360000 0 0 67659000 0 63076000 55530000 67373000 0 53213000 0 0 84579000 93926000 351 3113 330 3069;3070;3071;3072;3073;3074;3075 4016;4017;4018;4019;4020;4021;4022 4018 4 AAPLDSIHSLAAYYIDCIR Unmodified 2148.0674 0.067374644 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 3 1 3 3 2 1 1 1 3 2 1 155.43 155.43 2;3 7.4691E-11 162313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.46 112.17 1029400000 58035000 54281000 126180000 77193000 110930000 148550000 55785000 0 91017000 27568000 192980000 86921000 0 352 2524 331 3076;3077;3078;3079;3080;3081;3082;3083;3084;3085;3086;3087;3088;3089;3090;3091;3092;3093;3094;3095;3096;3097;3098 4023;4024;4025;4026;4027;4028;4029;4030;4031;4032;4033;4034;4035;4036;4037;4038;4039;4040;4041;4042;4043;4044;4045;4046;4047;4048;4049;4050;4051;4052 4046 28 AAPLIPLSQQIPTGNSLYESYYK Acetyl (Protein N-term) 2594.3268 0.32682003 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R1V5;K7EJR2;M0R330 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 1 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 162.7 162.7 2;3 7.9291E-11 167696 QUIQUE_C1368_190116_001 89.541 74.379 694220000 97146000 137020000 101320000 83529000 19249000 13172000 0 17176000 0 0 60062000 0 165540000 353 4394 332 3099;3100;3101;3102;3103;3104;3105;3106;3107;3108;3109;3110;3111;3112 4053;4054;4055;4056;4057;4058;4059;4060;4061;4062;4063;4064;4065;4066 4058 14 AAPLQGMLPGLLAPLR Oxidation (M) 1632.9385 0.93853272 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.74 129.74 2 2.6211E-06 126686 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.7 99.798 360770000 35951000 31661000 30235000 0 57948000 44119000 0 48215000 0 37451000 0 0 75191000 354 2037 333 3113;3114;3115;3116;3117;3118;3119;3120 4067;4068;4069;4070;4071;4072;4073;4074;4075;4076 4075 1344 10 AAPLQGMLPGLLAPLR Unmodified 1616.9436 0.9436181 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 149.79 149.79 2;3 5.2523E-05 155659 QUIQUE_C1218_190116_001 116.75 101.6 1409700000 89459000 90985000 87956000 187460000 210860000 135510000 77613000 96892000 76312000 49642000 94292000 81128000 131560000 355 2037 333 3121;3122;3123;3124;3125;3126;3127;3128;3129;3130;3131;3132;3133;3134;3135;3136;3137;3138;3139;3140;3141;3142;3143;3144;3145;3146 4077;4078;4079;4080;4081;4082;4083;4084;4085;4086;4087;4088;4089;4090;4091;4092;4093;4094;4095;4096;4097;4098;4099;4100;4101;4102;4103;4104 4077 27 AAPMTPAARPEDYEAALNAALADVPELAR Acetyl (Protein N-term) 3035.5022 0.50223499 2887 Q04446 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 168.94 168.94 3 2.0992E-24 173495 QUIQUE_C1218_190116_001 100.95 85.308 314570000 48930000 63020000 0 57614000 60521000 67394000 0 0 0 17088000 0 0 0 356 2887 334 3147;3148;3149;3150;3151;3152 4105;4106;4107;4108;4109;4110 4105 6 AAPMTPAARPEDYEAALNAALADVPELAR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 3051.4971 0.49714961 2887 Q04446 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes yes 1 1 1 1 166.52 166.52 3 4.6195E-05 170823 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.511 39.147 49558000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49558000 0 357 2887 334 3153 4111 4111 2369 0 AAPPQPVTHLIFDMDGLLLDTER Acetyl (Protein N-term) 2590.3101 0.31012411 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 172.22 172.22 2;3 5.2171E-12 178092 QUIQUE_C1438_190116_001 97.509 85.076 467560000 61056000 25587000 0 0 40880000 0 52788000 72530000 96158000 13289000 0 62500000 42773000 358 2924 335 3154;3155;3156;3157;3158;3159;3160;3161;3162;3163 4112;4113;4114;4115;4116;4117;4118;4119;4120;4121 4115 10 AAPQWCQGK Unmodified 1044.4811 0.48109903 1412 O00499 BIN1 Myc box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 22.628 22.628 2 0.042346 15664 QUIQUE_C1563_190116_001 80.462 62.614 113080000 0 0 0 0 0 62420000 0 50656000 0 0 0 0 0 359 1412 336 3164;3165 4122;4123 4122 0 AAPRPPPAR Acetyl (Protein N-term) 973.54575 0.5457482 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 1 0 1 1 2 1 19.797 19.797 2 0.0076733 12683 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.777 61.401 247150000 0 0 0 0 0 0 0 70598000 0 0 0 106440000 70105000 360 4392 337 3166;3167;3168;3169 4124;4125;4126;4127 4125 3 AAPSGGVNCEEFAEFQELLK Acetyl (Protein N-term) 2237.031 0.031048717 3242 Q4VC31 CCDC58 Coiled-coil domain-containing protein 58 yes yes 1 0 0 1 166.06 166.06 2 0.0073126 172465 QUIQUE_C1438_190116_001 45.992 24.742 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 361 3242 338 3170 4128 4128 1 AAPSTAPAEATPPKPGEAEAPPK Unmodified 2184.1063 0.10626257 1753 O95817 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes yes 0 0 1 1 35.342 35.342 3 0.062133 30302 QUIQUE_C1563_190116_001 25.924 9.9813 71950000 0 0 0 0 0 71950000 0 0 0 0 0 0 0 362 1753 339 3171 4129 4129 1 AAPSVTLFPPSSEELQANK Unmodified 1985.0106 0.010571271 1989 P0DOY3;P0DOY2;P0CF74;A0M8Q6 IGLC6;IGLC7 Ig lambda-6 chain C region;Ig lambda-7 chain C region yes no 0 0 0 2 1 4 3 4 1 2 2 2 2 2 3 101.78 101.78 2;3 1.6482E-08 104186 QUIQUE_C1438_190116_001 145.6 123.02 1349300000 60181000 0 187220000 111010000 286140000 0 32084000 95267000 98900000 30202000 170770000 67706000 209840000 363 1989 340 3172;3173;3174;3175;3176;3177;3178;3179;3180;3181;3182;3183;3184;3185;3186;3187;3188;3189;3190;3191;3192;3193;3194;3195;3196;3197;3198;3199 4130;4131;4132;4133;4134;4135;4136;4137;4138;4139;4140;4141;4142;4143;4144;4145;4146;4147;4148;4149;4150;4151;4152;4153;4154;4155;4156;4157;4158;4159;4160;4161;4162;4163;4164 4141 31 AAPTEVLSMTAQPGPGHGK Unmodified 1847.92 0.91998213 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 55.669 55.669 3 0.0066595 53894 QUIQUE_C1403_190116_001 20.596 9.5404 438100000 86606000 63572000 92213000 116690000 0 0 0 0 0 0 0 0 79015000 364 1570 341 3200;3201;3202;3203;3204 4165;4166;4167;4168;4169;4170 4169 4 AAPVDLELKK Acetyl (Protein N-term) 1124.6441 0.64412484 837 E5RGS4;O60925;D6RGG5 PFDN1 Prefoldin subunit 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 68.785 68.785 2 0.0033168 68675 QUIQUE_C1368_190116_001 98.033 76.073 434410000 0 0 96417000 0 0 52793000 0 0 0 28514000 67335000 116110000 73240000 365 837 342 3205;3206;3207;3208;3209;3210 4171;4172;4173;4174;4175;4176 4171 1 AAPVVAPPGVVVSR Acetyl (Protein N-term) 1359.7874 0.78743503 508 A0A3B3IUB1;Q13144;A0A3B3ISX3;A0A3B3IS56;A0A3B3IRP4;A0A3B3IUF2;A0A3B3ISM8;C9JRD9;A0A3B3IT53 EIF2B5 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon yes no 1 0 0 1 105.91 105.91 2 0.015563 107757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.35 33.148 15175000 0 0 0 0 0 0 0 15175000 0 0 0 0 0 366 508 343 3211 4177 4177 1 AAPYWITAPQNLVLSPGEDGTLICR Unmodified 2741.3847 0.38468604 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 152.89 152.89 2;3 1.2886E-49 155387 QUIQUE_C1563_190116_001 161.66 142.83 1228500000 46353000 46955000 0 264400000 391400000 0 73811000 29491000 90414000 62901000 82035000 89381000 51365000 367 756 344 3212;3213;3214;3215;3216;3217;3218;3219;3220;3221;3222;3223;3224;3225;3226;3227 4178;4179;4180;4181;4182;4183;4184;4185;4186;4187;4188;4189;4190;4191;4192;4193;4194;4195;4196;4197;4198 4188 18 AAPYWLDEPK Unmodified 1188.5815 0.58152458 1691;1214 H7BY57;D6RBU5;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.546 77.546 2 0.01529 77833 QUIQUE_C1277_190116_001 63.534 50.267 743460000 108120000 143510000 0 0 0 0 128180000 66412000 85110000 0 111440000 100690000 0 368 1214;1691 345 3228;3229;3230;3231;3232;3233;3234 4199;4200;4201;4202;4203;4204;4205 4200 7 AAQALALLR Acetyl (Protein N-term) 967.58147 0.581465 3177 Q16401;F2Z3J2 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.13 144.13 2 0.00022011 148362 QUIQUE_C1277_190116_001 118.05 63.502 862370000 60502000 70425000 0 59904000 85533000 80654000 54480000 81355000 88432000 36745000 87092000 80262000 76990000 369 3177 346 3235;3236;3237;3238;3239;3240;3241;3242;3243;3244;3245;3246 4206;4207;4208;4209;4210;4211;4212;4213;4214;4215;4216;4217;4218;4219;4220 4207 14 AAQAPDGASEPR Unmodified 1168.5473 0.54726434 2020 P11274 BCR Breakpoint cluster region protein yes yes 0 0 0 1 14.909 14.909 2 0.00051588 7275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.309 80.54 26412000 0 0 0 0 0 0 0 26412000 0 0 0 0 0 370 2020 347 3247 4221 4221 1 AAQAPSSFQLLYDLK Unmodified 1650.8617 0.86172219 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 125.77 125.77 2 0.025547 128314 QUIQUE_C1563_190116_001 58.674 45.011 362910000 0 0 0 0 215890000 147020000 0 0 0 0 0 0 0 371 1005;2027 348 3248;3249 4222;4223 4223 1 AAQDFFSTCR Unmodified 1201.5186 0.51860675 1897 P06132;A0A1B0GVZ4;A0A1B0GVN9;H0Y5R6;Q5T446 UROD Uroporphyrinogen decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 62.195 62.195 2 0.0050875 60861 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.857 76.557 159890000 36949000 0 0 0 0 0 53152000 36184000 0 0 0 33606000 0 372 1897 349 3250;3251;3252;3253 4224;4225;4226;4227 4227 4 AAQDRDQIYR Unmodified 1234.6054 0.60544792 2775 P62995;H7C2L4 TRA2B Transformer-2 protein homolog beta yes no 0 0 1 1 1 2 1 14.882 14.882 2;3 0.00011123 7282 QUIQUE_DMIX7_190116_001 147.4 86.432 470130000 0 0 0 0 0 49308000 0 90240000 0 0 0 307500000 23083000 373 2775 350 3254;3255;3256;3257;3258 4228;4229;4230;4231;4232;4233 4230 5 AAQEFKHDSFVPCSEK Unmodified 1878.857 0.85704752 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QL89 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 1 1 33.749 33.749 3 0.00027525 28589 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.121 71.487 80472000 0 0 0 0 0 0 0 80472000 0 0 0 0 0 374 245 351 3259 4234 4234 1 AAQELQEGQR Unmodified 1128.5523 0.55234972 1988 P0DN79;P35520;H7C2H4 CBS Cystathionine beta-synthase yes no 0 0 0 1 14.08 14.08 2 0.0056044 6142 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.79 87.268 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 375 1988 352 3260 4235 4235 1 AAQENKHDSYIPCSER Unmodified 1903.8483 0.84827375 1040 F8WAK2;F8VXI9;Q14161;R4GNG3 GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT2 yes no 0 0 1 1 17.904 17.904 3 0.050087 10414 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.029 27.463 13092000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13092000 0 0 376 1040 353 3261 4236 4236 1 AAQGEPQVQFK Acetyl (Protein N-term) 1243.6197 0.619701 643 B5MDF5;P62826;A0A087X0W0 RAN GTP-binding nuclear protein Ran yes no 1 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 69.936 69.936 1;2 2.3102E-08 66842 QUIQUE_DMIX4_190116_001 151.44 127.41 3616200000 256290000 353330000 264940000 302100000 292800000 273100000 250340000 244290000 231450000 159030000 389740000 284430000 314310000 377 643 354 3262;3263;3264;3265;3266;3267;3268;3269;3270;3271;3272;3273;3274;3275;3276;3277;3278 4237;4238;4239;4240;4241;4242;4243;4244;4245;4246;4247;4248;4249;4250;4251;4252;4253;4254;4255;4256;4257;4258;4259;4260;4261;4262;4263;4264;4265;4266;4267;4268;4269;4270;4271;4272;4273;4274;4275;4276;4277 4269 40 AAQIELLQLLVQIAAENNLGEGVIVK Unmodified 2745.564 0.56403061 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 175.89 175.89 3 8.4648E-08 182971 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.661 52.468 16247000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16247000 0 0 378 645 355 3279 4278 4278 1 AAQIGAHTLSGACLDPGAFK Unmodified 1983.9836 0.98364501 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 81.231 81.231 2 0.0012524 83026 QUIQUE_C1368_190116_001 78.69 56.157 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 379 3169 356 3280 4279 4279 1 AAQLATEIADIK Unmodified 1242.682 0.68196691 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.759 79.759 2 0.00052969 80539 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.568 59.567 392680000 66678000 58519000 0 0 57444000 0 62181000 62228000 0 28210000 0 57416000 0 380 3108 357 3281;3282;3283;3284;3285;3286;3287 4280;4281;4282;4283;4284;4285;4286 4284 4 AAQLCGAGMAAVVDK Oxidation (M) 1476.7065 0.70648388 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.611 38.611 2 9.5015E-06 34298 QUIQUE_C1277_190116_001 105.65 91.414 910220000 69411000 79415000 86895000 66120000 60425000 79176000 73820000 55305000 62182000 36303000 60033000 92192000 88941000 381 2146 358 3288;3289;3290;3291;3292;3293;3294;3295;3296;3297;3298;3299;3300 4287;4288;4289;4290;4291;4292;4293;4294;4295;4296;4297;4298;4299;4300 4289 1489 13 AAQLCGAGMAAVVDK Unmodified 1460.7116 0.71156925 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.026 66.026 2 6.7407E-06 64598 QUIQUE_C1563_190116_001 107.18 96.011 4368900000 648160000 715040000 544020000 696050000 448870000 629630000 687130000 0 0 0 0 0 0 382 2146 358 3301;3302;3303;3304;3305;3306;3307 4301;4302;4303;4304;4305;4306;4307;4308;4309;4310;4311 4310 11 AAQLCGAGMAAVVDKIR Unmodified 1729.8967 0.89674426 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 1 1 87.149 87.149 3 0.00013195 87945 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.013 61.525 78279000 0 0 0 0 0 0 0 78279000 0 0 0 0 0 383 2146 359 3308 4312 4312 1 AAQLDGLEAR Unmodified 1042.5407 0.5407224 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 39.33 39.33 2 0.00062268 36135 QUIQUE_C1438_190116_001 108.74 56.027 887280000 113590000 0 98084000 65413000 180130000 0 109760000 0 0 0 181120000 139180000 0 384 2665 360 3309;3310;3311;3312;3313;3314;3315 4313;4314;4315;4316;4317;4318;4319;4320;4321;4322 4318 9 AAQLGFK Unmodified 733.41227 0.41227441 1971 P09622;E9PEX6;F8WDM5;A0A1W2PR83;F2Z2E3 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 25.503 25.503 2 0.060232 19342 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.432 23.982 26108000 0 0 0 0 0 0 0 26108000 0 0 0 0 0 385 1971 361 3316 4323 4323 1 AAQLIGTCSQNVAAIQEQVLGLGALR Unmodified 2680.433 0.43303321 4350 Q9NZL4;K7EN20;K7EL16 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.93 152.93 3 6.8361E-20 159905 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.32 92.264 790520000 0 111730000 0 56332000 69230000 85391000 81919000 53248000 90274000 36724000 88860000 65679000 51139000 386 4350 362 3317;3318;3319;3320;3321;3322;3323;3324;3325;3326;3327;3328;3329 4324;4325;4326;4327;4328;4329;4330;4331;4332;4333;4334;4335;4336;4337;4338;4339;4340 4337 16 AAQLPNDVVLQIMELCGATR Unmodified 2198.1188 0.11875829 3829 Q96D71;E9PMG1;H0YDT0;F2Z3L2 REPS1 RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 159.2 159.2 3 0.0057641 163085 QUIQUE_C1277_190116_001 39.647 28.025 64709000 0 20298000 20057000 13841000 0 10513000 0 0 0 0 0 0 0 387 3829 363 3330;3331;3332;3333 4341;4342;4343;4344 4341 2 AAQLQEALLHCGR Unmodified 1465.746 0.74598093 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 54.493 54.493 3 0.052858 53459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.215 23.49 40141000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40141000 0 0 388 2882 364 3334 4345 4345 1 AAQLQLPQLPLAALQALGEAASCQLLAR Unmodified 2914.6062 0.60624655 2221 P23610 F8A1 Factor VIII intron 22 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.8 174.8 3 5.4471E-54 181728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.32 136.52 569020000 23997000 45304000 0 16863000 60556000 0 54229000 46260000 23432000 0 116860000 126850000 54665000 389 2221 365 3335;3336;3337;3338;3339;3340;3341;3342;3343;3344 4346;4347;4348;4349;4350;4351;4352;4353;4354;4355;4356 4353 11 AAQLVDKDSTFLSTLEHHLSR Unmodified 2367.2183 0.21827264 3789 Q969V3;K7ELZ9;A0A0C4DGP7;K7EMW4 NCLN Nicalin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 102.43 102.43 4 0.0001353 104982 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.222 57.628 270310000 0 0 0 0 26320000 0 32576000 0 55008000 0 37834000 72114000 46453000 390 3789 366 3345;3346;3347;3348;3349;3350 4357;4358;4359;4360;4361;4362 4361 6 AAQNSGEAEYIEK Unmodified 1408.647 0.64703797 1093 G3XAI2;P07942 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 26.52 26.52 2 0.0035137 20791 QUIQUE_C1438_190116_001 71.221 46.446 35159000 0 0 0 0 35159000 0 0 0 0 0 0 0 0 391 1093 367 3351 4363 4363 1 AAQQAASSSGQGQQAQTPTGK Unmodified 2000.9512 0.95115891 2517 P48729;U3KQ83;U3KPX3;H0Y9X2;U3KQK7 CSNK1A1 Casein kinase I isoform alpha yes no 0 0 0 1 13.75 13.75 3 0.021953 5981 QUIQUE_DMIX3_190116_001 15.522 11.802 5953500 0 0 0 0 0 0 0 0 5953500 0 0 0 0 392 2517 368 3352 4364 4364 1 AAQQQEEQEEKEEEDDEQTLHR Unmodified 2698.159 0.15903902 2802 P78318 IGBP1 Immunoglobulin-binding protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 32.332 32.332 3;4 2.4291E-54 26389 QUIQUE_C1368_190116_001 160.13 149.14 458580000 130140000 62443000 187010000 0 36490000 0 0 42488000 0 0 0 0 0 393 2802 369 3353;3354;3355;3356;3357;3358 4365;4366;4367;4368;4369;4370;4371 4369 6 AAQTELGQQILADFEEAFPSQGTK Unmodified 2578.2551 0.25511165 3331 Q5VIR6;F6VX93 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.3 167.3 3 3.5943E-28 171886 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.97 120.01 811490000 37934000 91748000 33132000 51806000 73506000 46330000 63142000 54241000 58483000 23711000 67078000 130700000 79685000 394 3331 370 3359;3360;3361;3362;3363;3364;3365;3366;3367;3368;3369;3370;3371 4372;4373;4374;4375;4376;4377;4378;4379;4380;4381;4382;4383;4384 4380 9 AAQVFALLFVTEYLTK Unmodified 1813.0026 0.0025727675 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 2 170.69 170.69 2;3 0.00028977 172452 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.288 73.52 15247000 0 0 0 0 0 0 0 15247000 0 0 0 0 0 395 1534 371 3372;3373 4385;4386 4385 2 AAQYACSLLGHALQR Unmodified 1657.8359 0.83585857 1770 O96011 PEX11B Peroxisomal membrane protein 11B yes yes 0 0 0 1 78.061 78.061 3 0.0062586 80312 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.66 41.778 31214000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31214000 0 0 396 1770 372 3374 4387 4387 1 AASAAAAELQASGGPR Acetyl (Protein N-term) 1468.727 0.72701962 4230 Q9HCN4;F8WD09 GPN1 GPN-loop GTPase 1 yes no 1 0 0 1 1 94.234 94.234 2 0.0038861 95564 QUIQUE_C1563_190116_001 53.448 38.182 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 397 4230 373 3375;3376 4388;4389 4388 2 AASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEK Acetyl (Protein N-term) 2428.1102 0.11023833 2983 Q13263 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes yes 1 0 0 1 1 1 1 97.524 97.524 3 6.3628E-25 98996 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.19 79.689 429670000 191360000 0 0 0 0 0 0 67172000 0 0 0 86421000 84717000 398 2983 374 3377;3378;3379;3380 4390;4391;4392;4393 4391 4 AASAAAASAAAASAASGSPGPGEGSAGGEKR Acetyl (Protein N-term) 2584.2113 0.21134936 2983 Q13263 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes yes 1 0 1 1 2 1 2 1 1 81.876 81.876 2;3 9.8099E-103 82767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.26 155.52 543390000 0 0 0 0 46474000 0 0 127370000 76648000 0 88243000 119220000 85430000 399 2983 375 3381;3382;3383;3384;3385;3386;3387;3388 4394;4395;4396;4397;4398;4399;4400;4401 4395 8 AASAAFQENVGR Unmodified 1219.5945 0.59454889 1283 J3KR97;Q9BTW9;I3L0V3 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.643 32.643 2 3.2704E-05 27514 QUIQUE_C1277_190116_001 128.27 108.48 562540000 0 89546000 0 56519000 71819000 58689000 0 48443000 59175000 31785000 70863000 0 75698000 400 1283 376 3389;3390;3391;3392;3393;3394;3395;3396;3397;3398;3399 4402;4403;4404;4405;4406;4407;4408;4409;4410;4411;4412 4402 10 AASAAGAAGSAGGSSGAAGAAGGGAGAGTRPGDGGTASAGAAGPGAATK Unmodified 3668.7123 0.71233221 4479 Q9UKY7 CDV3 Protein CDV3 homolog yes yes 0 0 1 1 1 36.068 36.068 3 1.093E-108 31371 QUIQUE_C1403_190116_001 133.51 127.49 184590000 0 86198000 0 98389000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 401 4479 377 3400;3401 4413;4414 4414 2 AASAAGVPLEASGEQVR Unmodified 1611.8216 0.82164829 1280 J3KQR7;Q9Y4F5 CEP170B Centrosomal protein of 170 kDa protein B yes no 0 0 0 1 53.579 53.579 2 0.0088238 52119 QUIQUE_C1576_190116_001 71.085 48.998 24959000 0 0 0 0 0 0 24959000 0 0 0 0 0 0 402 1280 378 3402 4415 4415 1 AASADSTTEGTPADGFTVLSTK Unmodified 2126.0015 0.0015227276 1626 O75367 H2AFY Core histone macro-H2A.1 yes yes 0 0 0 1 88.651 88.651 2 3.5258E-08 85225 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.911 76.483 23833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23833000 0 0 0 403 1626 379 3403 4416 4416 1 AASAFFTYVSLSQEGR Unmodified 1732.842 0.84204938 1379 O00154 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 122.68 122.68 2;3 8.9364E-36 127929 QUIQUE_C1218_190116_001 207.88 175.55 4285400000 390600000 391740000 337220000 310370000 306930000 271120000 366810000 319840000 354250000 171190000 330580000 376470000 358230000 404 1379 380 3404;3405;3406;3407;3408;3409;3410;3411;3412;3413;3414;3415;3416;3417;3418;3419;3420 4417;4418;4419;4420;4421;4422;4423;4424;4425;4426;4427;4428;4429;4430;4431;4432;4433;4434;4435;4436;4437;4438;4439 4417 23 AASAGQEPLHNEELAGAGR Unmodified 1876.9028 0.90275216 3873 Q96HY6;A0A0A0MRX2 DDRGK1 DDRGK domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 35.087 35.087 3 4.0633E-05 30498 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.51 75.074 118030000 0 0 0 59205000 0 0 0 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0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.514 29.514 2 0.0020592 24750 QUIQUE_C1218_190116_001 94.692 67.438 2750700000 233930000 261130000 0 213500000 247520000 217230000 265250000 246240000 0 103520000 341030000 281780000 339590000 408 2069 384 3440;3441;3442;3443;3444;3445;3446;3447;3448;3449;3450 4462;4463;4464;4465;4466;4467;4468;4469;4470;4471;4472;4473 4462 9 AASCVLLHTGQK Acetyl (Protein N-term) 1325.6762 0.67617003 2076 P14550;Q5T621;V9GYG2;V9GYP9 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 61.636 61.636 2 1.5407E-20 61001 QUIQUE_C1438_190116_001 173.32 155.01 4657300000 770480000 775640000 0 822790000 788920000 0 0 573290000 0 166820000 759320000 0 0 409 2076 385 3451;3452;3453;3454;3455;3456;3457 4474;4475;4476;4477;4478;4479;4480;4481 4477 7 AASDIAMTELPPTHPIR Oxidation (M) 1834.9247 0.92473315 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 0 6 6 5 6 5 5 6 4 6 6 7 5 5 59.547 59.547 2;3 1.5521E-31 58033 QUIQUE_C1277_190116_001 156.69 135.44 10554000000 1128400000 638920000 699150000 1021200000 793400000 918090000 988500000 710810000 855990000 218720000 898600000 800640000 881060000 410 2745 386 3458;3459;3460;3461;3462;3463;3464;3465;3466;3467;3468;3469;3470;3471;3472;3473;3474;3475;3476;3477;3478;3479;3480;3481;3482;3483;3484;3485;3486;3487;3488;3489;3490;3491;3492;3493;3494;3495;3496;3497;3498;3499;3500;3501;3502;3503;3504;3505;3506;3507;3508;3509;3510;3511;3512;3513;3514;3515;3516;3517;3518;3519;3520;3521;3522;3523;3524;3525;3526;3527;3528;3529 4482;4483;4484;4485;4486;4487;4488;4489;4490;4491;4492;4493;4494;4495;4496;4497;4498;4499;4500;4501;4502;4503;4504;4505;4506;4507;4508;4509;4510;4511;4512;4513;4514;4515;4516;4517;4518;4519;4520;4521;4522;4523;4524;4525;4526;4527;4528;4529;4530;4531;4532;4533;4534;4535;4536;4537;4538;4539;4540;4541;4542;4543;4544;4545;4546;4547;4548;4549;4550;4551;4552;4553;4554;4555;4556;4557;4558;4559;4560;4561;4562;4563;4564;4565;4566;4567;4568;4569;4570;4571 4499 2174 82 AASDIAMTELPPTHPIR Unmodified 1818.9298 0.92981853 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 4 5 6 6 5 5 7 3 5 5 6 6 7 74.737 74.737 2;3 3.0511E-201 73517 QUIQUE_C1277_190116_001 322.9 297.46 14381000000 882930000 1237900000 1649200000 1309400000 1234200000 874410000 1731800000 247580000 908310000 381950000 1874300000 265160000 1783800000 411 2745 386 3530;3531;3532;3533;3534;3535;3536;3537;3538;3539;3540;3541;3542;3543;3544;3545;3546;3547;3548;3549;3550;3551;3552;3553;3554;3555;3556;3557;3558;3559;3560;3561;3562;3563;3564;3565;3566;3567;3568;3569;3570;3571;3572;3573;3574;3575;3576;3577;3578;3579;3580;3581;3582;3583;3584;3585;3586;3587;3588;3589;3590;3591;3592;3593;3594;3595;3596;3597;3598;3599 4572;4573;4574;4575;4576;4577;4578;4579;4580;4581;4582;4583;4584;4585;4586;4587;4588;4589;4590;4591;4592;4593;4594;4595;4596;4597;4598;4599;4600;4601;4602;4603;4604;4605;4606;4607;4608;4609;4610;4611;4612;4613;4614;4615;4616;4617;4618;4619;4620;4621;4622;4623;4624;4625;4626;4627;4628;4629;4630;4631;4632;4633;4634;4635;4636;4637;4638;4639;4640;4641;4642;4643;4644;4645;4646;4647;4648;4649;4650;4651;4652;4653;4654;4655;4656;4657;4658;4659;4660;4661;4662;4663;4664;4665;4666;4667;4668;4669;4670;4671;4672;4673;4674;4675;4676;4677;4678;4679;4680;4681;4682;4683;4684;4685;4686;4687;4688;4689;4690;4691;4692;4693;4694;4695;4696;4697;4698;4699;4700;4701;4702;4703;4704;4705;4706;4707;4708;4709;4710;4711;4712;4713;4714;4715;4716;4717;4718;4719;4720;4721;4722;4723;4724;4725;4726;4727;4728;4729;4730;4731;4732;4733;4734;4735;4736;4737;4738;4739;4740;4741;4742;4743 4590 172 AASEFESSEGVFLFPELR Unmodified 2013.9684 0.96837211 1702 O94985;Q5SR54 CLSTN1 Calsyntenin-1;Soluble Alc-alpha;CTF1-alpha yes no 0 0 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0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 414 3423 389 3622 4768 4768 1 AASGFNAMEDAQTLR Oxidation (M) 1596.7202 0.72021968 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 1 0 1 1 1 54.061 54.061 2 0.00036261 51939 QUIQUE_C1218_190116_001 82.505 57.65 55584000 21079000 0 0 0 0 0 0 0 0 34505000 0 0 0 415 1968 390 3623;3624;3625 4769;4770;4771 4769 1237 3 AASGFNAMEDAQTLR Unmodified 1580.7253 0.72530506 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.58 78.58 2 1.5323E-12 78964 QUIQUE_C1403_190116_001 165.09 142.45 1208800000 105100000 119010000 133660000 176740000 86012000 119120000 121050000 78855000 95244000 0 98503000 75480000 0 416 1968 390 3626;3627;3628;3629;3630;3631;3632;3633;3634;3635;3636 4772;4773;4774;4775;4776;4777;4778;4779;4780;4781;4782 4775 11 AASGFNAMEDAQTLRK Unmodified 1708.8203 0.82026808 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 57.461 57.461 3 0.0002721 55138 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.197 53.128 188050000 0 0 0 0 0 0 0 43889000 0 0 53202000 36717000 54241000 417 1968 391 3637;3638;3639;3640 4783;4784;4785;4786 4786 4 AASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDK Unmodified 3576.6501 0.65009779 3767 Q92905;E5RFS1;E5RG35;E5RK55 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 yes no 0 0 2 1 91.162 91.162 5 0.030932 92794 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.507 14.295 221080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 221080000 0 418 3767 392 3641 4787 4787 1 AASHVLQTVWSYK Unmodified 1488.7725 0.77251325 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 1 72.404 72.404 2;3 0.00010946 72439 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109 104.37 417270000 55827000 64842000 29722000 0 0 21978000 0 48953000 45619000 0 51141000 52471000 46713000 419 730 393 3642;3643;3644;3645;3646;3647;3648;3649;3650;3651;3652;3653;3654 4788;4789;4790;4791;4792;4793;4794;4795;4796;4797;4798;4799;4800;4801;4802;4803 4797 16 AASIFGGAKPVDTAAR Unmodified 1530.8154 0.8154407 888 E7EX17;P23588;F8VX11 EIF4B Eukaryotic translation initiation factor 4B yes no 0 0 1 1 46.579 46.579 2 4.4167E-05 43347 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.66 76.723 26973000 0 0 0 0 0 0 0 26973000 0 0 0 0 0 420 888 394 3655 4804 4804 1 AASITSEVFNK Unmodified 1165.5979 0.59790293 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 60.423 60.423 2 0.02083 59564 QUIQUE_C1218_190116_001 60.717 42.178 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 421 4620 395 3656 4805 4805 1 AASKPVEAAVVAAAVPSSGSGVGGGGTAGPGTGGLPR Acetyl (Protein N-term) 3158.632 0.63200361 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 116.09 116.09 3;4 4.6343E-06 121503 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.867 43.889 475900000 0 0 0 0 0 39878000 0 134200000 176680000 0 125140000 0 0 422 1689 396 3657;3658;3659;3660 4806;4807;4808;4809 4809 4 AASLASVESALVSAIQALQHWPAPAHGGAR Unmodified 2965.5522 0.55223715 1111 H0Y2S9;H0Y7E2 MPRIP yes no 0 0 0 1 168.2 168.2 4 1.0047E-09 172496 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.155 62.811 17777000 0 0 0 0 0 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2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.63 136.63 2;3 6.5293E-26 143103 QUIQUE_C1438_190116_001 159.22 128.78 456470000 0 42703000 0 38168000 47529000 0 41651000 41682000 45974000 31559000 58551000 52006000 56647000 426 4436 400 3675;3676;3677;3678;3679;3680;3681;3682;3683;3684;3685 4826;4827;4828;4829;4830;4831;4832;4833;4834;4835;4836 4829 11 AASQGYTVAR Unmodified 1022.5145 0.51450765 4409 Q9UBV2 SEL1L Protein sel-1 homolog 1 yes yes 0 0 0 1 17.709 17.709 2 0.01529 9930 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.534 36.841 14563000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14563000 0 0 0 427 4409 401 3686 4837 4837 1 AASQPGELKDWFVGR Unmodified 1659.8369 0.83690442 2113 P16870;D6RF88;C9JE88;D6R930 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.557 89.557 3 0.0012367 91545 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.709 54.129 548810000 0 0 96718000 0 60167000 0 91280000 0 0 0 87798000 87785000 125070000 428 2113 402 3687;3688;3689;3690;3691;3692 4838;4839;4840;4841;4842;4843;4844;4845;4846 4846 9 AASQQEIEQSIETLNMLMLDLEPASAAAPLHK Unmodified 3448.7218 0.72180617 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 170.15 170.15 3;4 0.00084086 174362 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.936 24.369 157470000 0 0 0 16915000 19081000 0 0 0 66085000 0 55391000 0 0 429 422 403 3693;3694;3695;3696;3697;3698 4847;4848;4849;4850;4851;4852 4851 6 AASQSTQVPTITEGVAAALLLLK Unmodified 2281.2893 0.28931231 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 169.19 169.19 3 0.035594 172042 QUIQUE_C1403_190116_001 24.558 20.964 16091000 0 0 0 16091000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 430 3740 404 3699 4853 4853 1 AASQVLNSMWQYR Unmodified 1552.7456 0.74564657 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.67 103.67 2 1.5048E-13 106629 QUIQUE_C1368_190116_001 187.97 164.12 1176300000 115690000 108850000 126220000 119700000 82721000 81165000 111330000 79748000 107420000 34199000 114290000 0 94999000 431 855;928 405 3700;3701;3702;3703;3704;3705;3706;3707;3708;3709;3710;3711 4854;4855;4856;4857;4858;4859;4860;4861;4862;4863;4864;4865;4866;4867;4868 4857 14 AASQVLNSMWQYR Oxidation (M) 1568.7406 0.7405612 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 1 0 1 1 72.576 72.576 2 2.6079E-05 72862 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.42 89.657 39613000 0 0 0 39613000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 432 855;928 405 3712;3713 4869;4870 4870 507 2 AASSIYINSR Unmodified 1080.5564 0.55637247 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.049 30.049 2 0.0062253 24341 QUIQUE_C1368_190116_001 85.731 62.302 271450000 37550000 36613000 37438000 0 46867000 0 45831000 0 0 0 0 0 67154000 433 877 406 3714;3715;3716;3717;3718;3719 4871;4872;4873;4874;4875;4876 4873 6 AASSSEISEMK Acetyl (Protein N-term) 1180.5282 0.52816838 3469 Q7Z6L0;A0A0G2JLL6;A0A1B0GTP1;A0A1B0GTE9;A0A1B0GTS0;H3BN10;A0A1B0GU37;A0A1B0GTR2;A0A1B0GUW9;A0A1B0GUR0 PRRT2 Proline-rich transmembrane protein 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 59.534 59.534 2 0.0051451 58422 QUIQUE_C1403_190116_001 77.049 66.357 147480000 0 0 42667000 51163000 19306000 0 0 0 0 0 0 0 34344000 434 3469 407 3720;3721;3722;3723 4877;4878;4879;4880 4878 4 AASTASHRPIK Acetyl (Protein N-term) 1179.636 0.63601977 848 E7EMN6;P41236;E7EUI7;Q6NXS1 PPP1R2;PPP1R2P3 Protein phosphatase inhibitor 2;Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3 yes no 1 0 1 2 1 1 1 1 11.013 11.013 2;3 0.00061675 3454 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.68 99.126 166490000 0 0 0 0 0 0 0 88442000 31757000 9711400 0 36584000 0 435 848 408 3724;3725;3726;3727;3728;3729 4881;4882;4883;4884;4885;4886 4882 6 AASTDMAGLEESFR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1541.6668 0.66678713 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 1 0 2 1 1 1 2 97.078 97.078 2 7.1263E-05 99936 QUIQUE_C1218_190116_001 93.345 76.32 222570000 117990000 44541000 0 31069000 0 0 0 0 0 28972000 0 0 0 436 4050 409 3730;3731;3732;3733;3734;3735;3736 4887;4888;4889;4890;4891;4892;4893 4887 2842 6 AASTDMAGLEESFR Acetyl (Protein N-term) 1525.6719 0.67187251 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.02 133.02 2 3.0123E-07 138831 QUIQUE_C1218_190116_001 146.16 118.83 5016500000 845420000 373350000 545640000 557740000 354110000 433840000 472700000 179390000 267640000 200000000 266270000 228560000 291840000 437 4050 409 3737;3738;3739;3740;3741;3742;3743;3744;3745;3746;3747;3748;3749 4894;4895;4896;4897;4898;4899;4900;4901;4902;4903;4904;4905;4906;4907;4908;4909;4910 4895 17 AASTDMAGLEESFRK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1669.7618 0.76175015 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 70.434 70.434 2 7.9156E-44 69746 QUIQUE_DMIX3_190116_001 184.03 160.28 3396100000 88784000 174620000 219120000 157900000 267610000 101500000 227590000 351330000 581030000 0 468490000 483190000 274950000 438 4050 410 3750;3751;3752;3753;3754;3755;3756;3757;3758;3759;3760;3761;3762;3763;3764;3765;3766;3767;3768;3769;3770;3771;3772 4911;4912;4913;4914;4915;4916;4917;4918;4919;4920;4921;4922;4923;4924;4925;4926;4927;4928;4929;4930;4931;4932;4933 4927 2842 18 AASTDMAGLEESFRK Acetyl (Protein N-term) 1653.7668 0.76683553 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.69 104.69 2 6.6784E-23 107262 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.44 134.35 17926000000 640480000 764890000 1067000000 859060000 1347700000 492020000 1163300000 1892300000 2986700000 230770000 2125400000 1882000000 2474500000 439 4050 410 3773;3774;3775;3776;3777;3778;3779;3780;3781;3782;3783;3784;3785 4934;4935;4936;4937;4938;4939;4940;4941;4942;4943;4944;4945;4946;4947;4948;4949;4950;4951;4952;4953;4954;4955 4945 22 AATAAADFTAK Unmodified 1036.5189 0.51892433 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.988 25.988 2 0.00048894 20777 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.43 73.625 1250300000 0 154000000 132000000 0 152810000 0 169320000 134470000 127230000 88137000 141590000 0 150780000 440 4592 411 3786;3787;3788;3789;3790;3791;3792;3793;3794 4956;4957;4958;4959;4960;4961;4962;4963;4964;4965;4966;4967 4963 11 AATAAEAVASGSGEPR Acetyl (Protein N-term) 1485.7059 0.70594983 968 E9PNR8;Q9NWT6 HIF1AN Hypoxia-inducible factor 1-alpha inhibitor yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 85.018 85.018 2 0.0002723 88054 QUIQUE_C1438_190116_001 95.631 72.026 152870000 0 0 0 0 52411000 43590000 0 0 0 0 0 0 56866000 441 968 412 3795;3796;3797;3798;3799 4968;4969;4970;4971;4972;4973 4969 5 AATALKDVVK Unmodified 1014.6073 0.6073454 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 1 1 21.102 21.102 2 0.019404 14416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.01 89.723 78570000 0 0 0 0 0 0 0 78570000 0 0 0 0 0 442 3109 413 3800 4974 4974 0 AATALLEAGLAR Acetyl (Protein N-term) 1197.6717 0.67173657 973 E9PQM0;Q8WUK0 PTPMT1 Phosphatidylglycerophosphatase and protein-tyrosine phosphatase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.68 146.68 2 0.0011617 151193 QUIQUE_C1277_190116_001 90.108 68.808 30206000 0 7008300 0 0 5220100 0 0 10262000 0 0 0 7715700 0 443 973 414 3801;3802;3803;3804;3805;3806;3807;3808 4975;4976;4977;4978;4979;4980;4981;4982 4975 8 AATAPLLEAVDNLSAFASNPEFSSIPAQISPEGR Unmodified 3469.7365 0.73652826 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 3 2 2 2 2 1 2 1 171.08 171.08 3;4 2.7401E-75 174131 QUIQUE_C1403_190116_001 146.5 144.49 3054300000 204780000 276610000 443880000 169980000 250740000 150760000 420310000 347180000 139060000 0 0 542140000 108820000 444 4600 415 3809;3810;3811;3812;3813;3814;3815;3816;3817;3818;3819;3820;3821;3822;3823;3824;3825;3826;3827;3828 4983;4984;4985;4986;4987;4988;4989;4990;4991;4992;4993;4994;4995;4996;4997;4998;4999;5000;5001;5002;5003;5004;5005;5006;5007;5008 4992 24 AATASAGAGGIDGK Acetyl (Protein N-term) 1187.5782 0.57823012 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 1 0 0 1 44.144 44.144 2 4.4078E-05 40988 QUIQUE_C1218_190116_001 114.9 90.047 40706000 40706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 445 2881 416 3829 5009 5009 1 AATASAGAGGIDGKPR Acetyl (Protein N-term) 1440.7321 0.732105 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 1 0 1 2 2 2 2 4 3 3 2 2 2 4 3 3 33.741 33.741 2 1.1745E-35 30691 QUIQUE_C1277_190116_001 182.71 143.69 11309000000 810570000 697960000 1090800000 794130000 543140000 822900000 869730000 879720000 975370000 283290000 1462700000 1004500000 1074100000 446 2881 417 3830;3831;3832;3833;3834;3835;3836;3837;3838;3839;3840;3841;3842;3843;3844;3845;3846;3847;3848;3849;3850;3851;3852;3853;3854;3855;3856;3857;3858;3859;3860;3861;3862;3863 5010;5011;5012;5013;5014;5015;5016;5017;5018;5019;5020;5021;5022;5023;5024;5025;5026;5027;5028;5029;5030;5031;5032;5033;5034;5035;5036;5037;5038;5039;5040;5041;5042;5043;5044;5045;5046;5047;5048;5049;5050;5051;5052;5053;5054;5055;5056;5057;5058 5016 48 AATDIAR Acetyl (Protein N-term) 758.39227 0.39226725 594 B1AMS2;Q14141 SEPT6 Septin-6 yes no 1 0 0 1 36.353 36.353 1 0.039648 32501 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.48 46.895 132890000 0 0 0 0 0 0 0 0 132890000 0 0 0 0 447 594 418 3864 5059 5059 0 AATDLER Acetyl (Protein N-term) 816.39775 0.39774656 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 1 0 0 1 1 1 2 1 42.499 42.499 1;2 0.037985 38484 QUIQUE_C1368_190116_001 139.28 50.545 1929800000 112630000 552700000 598260000 0 0 0 0 505730000 0 160470000 0 0 0 448 535;3739 419 3865;3866;3867;3868;3869;3870 5060;5061;5062;5063;5064;5065 5062 2 AATFFGCIGIDK Unmodified 1298.6329 0.63290823 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 1 1 108.9 108.9 2 0.017799 111722 QUIQUE_C1277_190116_001 54.584 28.776 78731000 0 54823000 0 0 0 0 0 0 0 23908000 0 0 0 449 2663 420 3871;3872 5066;5067 5066 2 AATFFGEVVK Acetyl (Protein N-term) 1109.5757 0.57571092 1731 O95456;F8WBH7 PSMG1 Proteasome assembly chaperone 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.64 144.64 2 0.00016085 149562 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.36 96.427 221710000 20406000 20220000 13781000 16681000 22845000 0 13206000 19395000 25305000 8409900 21280000 19643000 20541000 450 1731 421 3873;3874;3875;3876;3877;3878;3879;3880;3881;3882;3883;3884 5068;5069;5070;5071;5072;5073;5074;5075;5076;5077;5078;5079;5080;5081;5082;5083 5077 16 AATFGLILDDVSLTHLTFGK Unmodified 2118.1361 0.13610614 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 2 155.48 155.48 2;3 1.7653E-13 159356 QUIQUE_C1277_190116_001 90.316 86.928 2132000000 261950000 156590000 177770000 146250000 82687000 152340000 292020000 216380000 0 53543000 302440000 289990000 0 451 2370 422 3885;3886;3887;3888;3889;3890;3891;3892;3893;3894;3895;3896;3897;3898;3899;3900;3901 5084;5085;5086;5087;5088;5089;5090;5091;5092;5093;5094;5095;5096;5097;5098;5099;5100;5101;5102;5103;5104;5105;5106;5107;5108;5109 5087 24 AATFPLQVLGFEIDAVNSVQFSNHTGYAHWK Unmodified 3446.7048 0.70477462 1423 O00764 PDXK Pyridoxal kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 157.36 157.36 3;4 2.9262E-137 162765 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.28 184.56 1576600000 0 0 92236000 0 0 0 0 220330000 293800000 0 505980000 464220000 0 452 1423 423 3902;3903;3904;3905;3906;3907;3908 5110;5111;5112;5113;5114;5115;5116;5117 5113 8 AATGEEVSAEDLGGADLHCR Unmodified 2056.912 0.91199621 4223 Q9HCC0;D6RD67;D6RDF7;D6R9R1 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 61.252 61.252 2;3 8.6284E-24 60404 QUIQUE_C1277_190116_001 136.17 119.95 1093600000 122490000 152010000 0 104060000 109860000 158850000 125050000 48230000 59008000 30923000 44404000 58566000 80178000 453 4223 424 3909;3910;3911;3912;3913;3914;3915;3916;3917;3918;3919;3920;3921;3922 5118;5119;5120;5121;5122;5123;5124;5125;5126;5127;5128;5129;5130;5131 5120 14 AATGPFDR Unmodified 833.40317 0.40316629 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.7 23.7 2 0.01159 17059 QUIQUE_C1277_190116_001 89.752 55.749 725680000 132520000 147800000 0 129130000 110960000 142620000 0 0 0 62655000 0 0 0 454 4356 425 3923;3924;3925;3926;3927;3928 5132;5133;5134;5135;5136;5137;5138 5133 7 AATGPFDREHLLMYLEK Unmodified 1989.9982 0.99823245 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 106.53 106.53 2;3;4 1.261E-11 110989 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.38 75.38 1631800000 0 54862000 0 0 0 0 0 404060000 401030000 0 202280000 171110000 398470000 455 4356 426 3929;3930;3931;3932;3933;3934;3935;3936;3937;3938;3939 5139;5140;5141;5142;5143;5144;5145;5146;5147;5148;5149;5150;5151;5152;5153;5154;5155;5156;5157 5150 18 AATHGLMLGALQGDGPLPAELEELR Unmodified 2558.3163 0.31627212 1193 H3BR29;H3BSM7;Q96GQ5 C16orf58 RUS1 family protein C16orf58 yes no 0 0 0 1 1 1 1 138.11 138.11 3 2.8898E-29 144851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.979 82.292 157240000 0 33931000 47131000 0 0 30965000 0 0 0 0 45217000 0 0 456 1193 427 3940;3941;3942;3943 5158;5159;5160;5161;5162 5162 5 AATHYTITIR Unmodified 1145.6193 0.61930707 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 31.589 31.589 2;3 0.00036089 26213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.63 108.34 1515900000 59232000 55026000 0 77161000 0 0 0 199150000 719040000 99967000 81400000 224880000 0 457 2233 428 3944;3945;3946;3947;3948;3949;3950;3951;3952 5163;5164;5165;5166;5167;5168;5169;5170;5171 5168 9 AATITATSPGALWGLDR Unmodified 1699.8893 0.88933392 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.11 116.11 2 1.0436E-05 121192 QUIQUE_C1438_190116_001 123.64 99.788 3888400000 339800000 383700000 350500000 297990000 385800000 278240000 327580000 328070000 330070000 133390000 0 326980000 406270000 458 2331 429 3953;3954;3955;3956;3957;3958;3959;3960;3961;3962;3963;3964 5172;5173;5174;5175;5176;5177;5178;5179;5180;5181;5182;5183 5176 12 AATITPFR Unmodified 875.4865 0.48650199 2993 Q13423;E9PCX7;H0Y8P5 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.985 42.985 2 0.023413 38899 QUIQUE_C1368_190116_001 73.324 43.948 212560000 79124000 57055000 76385000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 459 2993 430 3965;3966;3967;3968;3969 5184;5185;5186;5187;5188 5186 5 AATIVATSEGSLWGLDR Unmodified 1745.8948 0.89481323 2069 P13861;H7C1L0 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 117.31 117.31 2 8.4843E-53 122168 QUIQUE_C1576_190116_001 185.59 161.3 1340900000 0 185120000 0 122560000 59533000 152740000 117480000 219740000 166060000 84978000 0 232670000 0 460 2069 431 3970;3971;3972;3973;3974;3975;3976;3977;3978;3979 5189;5190;5191;5192;5193;5194;5195;5196;5197;5198;5199;5200;5201;5202;5203 5197 13 AATIVLQSYLR Unmodified 1233.7081 0.70812208 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 1 93.776 93.776 2 0.0056344 96163 QUIQUE_C1368_190116_001 79.974 57.261 67569000 0 0 27400000 0 0 40170000 0 0 0 0 0 0 0 461 4607 432 3980;3981;3982;3983 5204;5205;5206;5207 5204 4 AATLILEPAGR Unmodified 1110.6397 0.63970816 3487;98 A0A087X0W7;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 61.375 61.375 2 0.0002806 61303 QUIQUE_C1218_190116_001 120.12 95.964 1341800000 152620000 92959000 139250000 98509000 141960000 106600000 110250000 123590000 128830000 0 139320000 107900000 0 462 98;3487 433 3984;3985;3986;3987;3988;3989;3990;3991;3992;3993;3994;3995;3996 5208;5209;5210;5211;5212;5213;5214;5215;5216;5217;5218;5219;5220 5208 12 AATLILEPAGR Acetyl (Protein N-term) 1152.6503 0.65027285 3487;98 A0A087X0W7;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.7 123.7 2 0.00021055 127694 QUIQUE_C1403_190116_001 138.4 126.35 908180000 83907000 0 84074000 75106000 84224000 138640000 84117000 238350000 0 119750000 0 0 0 463 98;3487 433 3997;3998;3999;4000;4001;4002;4003;4004;4005 5221;5222;5223;5224;5225;5226;5227;5228;5229;5230;5231;5232;5233;5234;5235;5236;5237;5238;5239;5240 5227 20 AATMLLHTVEESAFVLADNLLK Oxidation (M) 2401.2563 0.25629763 849 E7EMR3;E7ES20;E7ENK1;E7ESV6;E7EUP0;E7EX52;E7EN28;E9PBG4;E7EW95;E7EVD6;E7ETE3;E7EUW2;Q9HAR2;H0Y9K5 ADGRL3;LPHN3 Latrophilin-3 yes no 0 1 0 1 169.95 169.95 3 0.00026874 174278 QUIQUE_C1218_190116_001 47.392 39.399 8571500 8571500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 464 849 434 4006 5241 5241 498 1 AATMLLHTVEESAFVLADNLLK Unmodified 2385.2614 0.261383 849 E7EMR3;E7ES20;E7ENK1;E7ESV6;E7EUP0;E7EX52;E7EN28;E9PBG4;E7EW95;E7EVD6;E7ETE3;E7EUW2;Q9HAR2;H0Y9K5 ADGRL3;LPHN3 Latrophilin-3 yes no 0 0 0 1 170.3 170.3 3 2.1416E-07 177656 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.469 53.941 31169000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31169000 0 0 465 849 434 4007 5242 5242 1 AATMSAVEAATCR Unmodified 1337.6068 0.60676983 3256 Q53H96;A0A0A0MQS1;B5MD87 PYCRL Pyrroline-5-carboxylate reductase 3;Pyrroline-5-carboxylate reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.106 47.106 2 1.1171E-09 44012 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.3 99.271 512640000 63206000 0 40162000 44358000 44358000 54868000 44407000 0 39402000 0 72517000 45687000 63673000 466 3256 435 4008;4009;4010;4011;4012;4013;4014;4015;4016;4017 5243;5244;5245;5246;5247;5248;5249;5250;5251;5252;5253;5254;5255 5255 12 AATNLENQLHSAQK Acetyl (Protein N-term) 1565.7798 0.77978347 1006 F5H2Z7 CCDC92 yes yes 1 0 0 1 67.655 67.655 2 0.00017145 67702 QUIQUE_C1218_190116_001 102.4 84.501 22186000 22186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 467 1006 436 4018 5256 5256 1 AATPTRPPSRPPSR Unmodified 1489.8114 0.81135837 427 H0YH87;A0A2R8Y7P6;A0A2R8YDM9;F8VQP2;F8WB06;V9GY86;A0A2R8Y5A6;Q99700;F8W0B5 ATXN2 Ataxin-2 yes no 0 0 2 1 13.327 13.327 4 0.0027958 5571 QUIQUE_C1218_190116_001 49.483 36.346 3425100 3425100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 468 427 437 4019 5257;5258 5258 2 AATPYTVSIYGVIQGYR Unmodified 1857.9625 0.96249887 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 2 3 1 2 2 2 131.28 131.28 2;3 2.9157E-17 135443 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.75 107.57 900280000 0 0 0 0 0 0 0 163070000 295240000 23250000 144420000 133850000 140450000 469 2233 438 4020;4021;4022;4023;4024;4025;4026;4027;4028;4029;4030;4031 5259;5260;5261;5262;5263;5264;5265;5266;5267;5268;5269;5270;5271;5272;5273 5270 15 AATQFWR Unmodified 878.43989 0.43988615 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.455 47.455 2 0.01933 44241 QUIQUE_C1403_190116_001 114.54 96.978 416680000 62021000 0 61770000 68133000 0 59076000 84218000 0 52503000 28961000 0 0 0 470 2059 439 4032;4033;4034;4035;4036;4037;4038 5274;5275;5276;5277;5278;5279;5280 5276 7 AATRVQDAFAAAK Unmodified 1318.6993 0.69934831 2859 Q01650 SLC7A5 Large neutral amino acids transporter small subunit 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 14.531 14.531 3 0.010412 7049 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.095 25.958 4445900000 830250000 0 0 0 1076400000 1066500000 0 539730000 0 187380000 745620000 0 0 471 2859 440 4039;4040;4041;4042;4043;4044 5281;5282;5283;5284;5285;5286 5284 5 AATSPALFNR Unmodified 1046.5509 0.55089316 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.732 43.732 2 0.00021145 40159 QUIQUE_C1368_190116_001 136.16 111.23 1528800000 43768000 77131000 143980000 73299000 86417000 85441000 112020000 148850000 163780000 70765000 192670000 176120000 154540000 472 3053 441 4045;4046;4047;4048;4049;4050;4051;4052;4053;4054;4055;4056;4057 5287;5288;5289;5290;5291;5292;5293;5294;5295;5296;5297;5298;5299;5300;5301;5302;5303;5304 5291 17 AATSRYTLNFEAAQK Unmodified 1669.8424 0.84238373 912;826 E9PF17;P13611;Q86W61;D6RGZ6 VCAN Versican core protein no no 0 0 1 2 2 1 1 1 3 2 2 2 2 50.791 50.791 2;3 5.6099E-19 48648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.99 128.58 13052000000 0 328360000 400220000 40633000 174440000 0 231470000 0 2999000000 100040000 3241200000 3132200000 2403900000 473 912;826 442 4058;4059;4060;4061;4062;4063;4064;4065;4066;4067;4068;4069;4070;4071;4072;4073;4074;4075 5305;5306;5307;5308;5309;5310;5311;5312;5313;5314;5315;5316;5317;5318;5319;5320;5321;5322;5323;5324 5320 17 AATTEPTEVEEVVPALEPTETLLSEK Unmodified 2782.4012 0.40116677 4062 Q9BXK5;A0A087WX97;A0A087WTL4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 144.3 144.3 2;3 1.0323E-14 148426 QUIQUE_C1403_190116_001 133.86 115.03 361930000 56227000 53460000 60575000 131240000 0 60437000 0 0 0 0 0 0 0 474 4062 443 4076;4077;4078;4079;4080;4081;4082;4083;4084 5325;5326;5327;5328;5329;5330;5331;5332;5333;5334;5335 5330 10 AATTGHVIDIYACALDQTGLLEMK Unmodified 2590.2771 0.27710942 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 1 1 142.6 142.6 3 1.1463E-14 149644 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.83 73.297 146900000 0 0 32402000 0 0 26287000 0 0 0 0 50982000 37232000 0 475 1007 444 4085;4086;4087;4088 5336;5337;5338;5339 5338 4 AATVGSLAGQPLQER Unmodified 1496.7947 0.79470526 1822 P02649;H0Y7L5 APOE Apolipoprotein E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.112 59.112 2 3.2583E-19 57732 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.76 132.87 2826300000 228370000 235200000 341650000 214480000 294320000 223030000 0 207640000 402720000 101620000 310350000 266920000 0 476 1822 445 4089;4090;4091;4092;4093;4094;4095;4096;4097;4098;4099 5340;5341;5342;5343;5344;5345;5346;5347;5348;5349;5350;5351;5352 5349 13 AATVGYGILR Unmodified 1019.5764 0.57637963 3438 Q7L266;A0A087WUG3;A0A087WZI5;E9PJK6 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.023 63.023 2 0.00035535 61600 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.08 112.38 2679300000 190670000 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0.90981137 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.816 88.816 2 2.9681E-28 89887 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.94 122.99 3351400000 310650000 311170000 355570000 308890000 316680000 254230000 316610000 174860000 208350000 60549000 269930000 233210000 230730000 483 2067 452 4173;4174;4175;4176;4177;4178;4179;4180;4181;4182;4183;4184;4185 5490;5491;5492;5493;5494;5495;5496;5497;5498;5499;5500;5501;5502;5503 5498 14 AAVDAGFVPNDMQVGQTGK Oxidation (M) 1919.9047 0.90472599 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.656 67.656 2 2.3179E-16 67465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.09 98.658 435780000 0 40768000 43181000 44321000 55150000 38567000 0 24080000 43300000 23226000 52906000 42110000 28167000 484 2067 452 4186;4187;4188;4189;4190;4191;4192;4193;4194;4195;4196;4197 5504;5505;5506;5507;5508;5509;5510;5511;5512;5513;5514;5515;5516 5512 1391 10 AAVDLEK Acetyl (Protein N-term) 786.41233 0.41233399 2129 P17858;F8WEU2 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.659 53.659 1 0.032702 51994 QUIQUE_C1277_190116_001 143 58.76 1924200000 0 208250000 320310000 0 224980000 182790000 0 0 218450000 0 304310000 219670000 245470000 485 2129 453 4198;4199;4200;4201;4202;4203;4204;4205 5517;5518;5519;5520;5521;5522;5523;5524 5517 5 AAVDSFYLLYR Acetyl (Protein N-term) 1358.6871 0.68705229 3227 Q3SXM5;H3BQI7;H3BT52;H3BNH5 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes no 1 0 0 1 1 160.99 160.99 2 5.5283E-06 165547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.09 103.74 221560000 0 0 0 0 0 0 0 95022000 126540000 0 0 0 0 486 3227 454 4206;4207 5525;5526 5526 2 AAVEALQSQALHATSQQPLR Unmodified 2118.1182 0.11816466 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 1 2 3 2 2 2 75.068 75.068 2;3 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5589;5590;5591;5592;5593;5594;5595;5596;5597;5598;5599;5600;5601;5602;5603;5604;5605;5606;5607;5608;5609;5610;5611;5612;5613;5614;5615;5616;5617;5618;5619;5620;5621;5622;5623;5624;5625;5626;5627;5628;5629;5630;5631;5632;5633;5634;5635;5636;5637;5638;5639;5640;5641;5642;5643;5644;5645;5646;5647;5648;5649;5650;5651;5652;5653;5654;5655;5656;5657 5633 65 AAVELEEPEDAR Unmodified 1327.6256 0.62557424 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 46.937 46.937 2 0.004947 44395 QUIQUE_C1368_190116_001 67.726 38.564 38816000 0 0 38816000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 490 1697 458 4294 5658 5658 1 AAVENLPTFLVELSR Unmodified 1657.9039 0.90392136 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 151.56 151.56 2;3 6.544E-10 154629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.26 133.39 6297500000 446360000 491900000 448370000 455120000 59337000 435070000 554400000 421120000 627100000 149400000 827940000 849400000 532030000 491 3090 459 4295;4296;4297;4298;4299;4300;4301;4302;4303;4304;4305;4306;4307;4308;4309;4310;4311;4312;4313;4314;4315;4316;4317;4318 5659;5660;5661;5662;5663;5664;5665;5666;5667;5668;5669;5670;5671;5672;5673;5674;5675;5676;5677;5678;5679;5680;5681;5682;5683;5684;5685;5686;5687;5688;5689;5690;5691;5692;5693;5694 5674 35 AAVESLGFILFR Unmodified 1321.7394 0.73942221 3954 Q99460;A0A087WW66;H7C378 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.72 145.72 2 6.3541E-14 150458 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.79 111.18 1650600000 103410000 139870000 127590000 118770000 127840000 90610000 124020000 158330000 145790000 62760000 148670000 157870000 145040000 492 3954 460 4319;4320;4321;4322;4323;4324;4325;4326;4327;4328;4329;4330;4331 5695;5696;5697;5698;5699;5700;5701;5702;5703;5704;5705;5706;5707;5708;5709;5710;5711;5712;5713;5714;5715;5716;5717;5718;5719 5710 24 AAVEWFDGK Unmodified 1021.4869 0.48689592 576 B0QYK0;Q01844;A0A0D9SFL3;C9JGE3;H7BY36 EWSR1 RNA-binding protein EWS yes no 0 0 0 1 71.937 71.937 2 0.061333 72466 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.599 16.069 89756000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89756000 493 576 461 4332 5720 5720 1 AAVEWFDGKDFQGSK Unmodified 1683.7893 0.78928553 576 B0QYK0;Q01844;A0A0D9SFL3;C9JGE3;H7BY36 EWSR1 RNA-binding protein EWS yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 81.929 81.929 2;3 1.3972E-17 82958 QUIQUE_DMIX7_190116_001 144.7 127.67 1420000000 34736000 122430000 71342000 71140000 143330000 40014000 38701000 208290000 145600000 0 217590000 188250000 138600000 494 576 462 4333;4334;4335;4336;4337;4338;4339;4340;4341;4342;4343;4344;4345;4346;4347;4348;4349 5721;5722;5723;5724;5725;5726;5727;5728;5729;5730;5731;5732;5733;5734;5735;5736;5737;5738;5739;5740 5739 20 AAVFDLDGVLALPAVFGVLGR Unmodified 2099.1779 0.17791137 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6;H0YAW7;E5RI53 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 2 2 174.9 174.9 2;3 4.1853E-08 181930 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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5758;5759;5760;5761;5762;5763;5764;5765;5766;5767;5768;5769;5770;5771;5772;5773;5774;5775;5776;5777;5778;5779;5780;5781;5782;5783;5784 5768 27 AAVLNAER Acetyl (Protein N-term) 884.47158 0.4715802 4159 Q9H3P7 ACBD3 Golgi resident protein GCP60 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.95 67.95 2 0.0058159 67327 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.55 50.758 165080000 0 16779000 0 20704000 31230000 17979000 0 18657000 0 11699000 0 23599000 24432000 501 4159 469 4380;4381;4382;4383;4384;4385;4386;4387;4388;4389 5785;5786;5787;5788;5789;5790;5791;5792;5793;5794 5794 10 AAVLQQVLER Acetyl (Protein N-term) 1167.6612 0.66117189 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.82 155.82 2 9.3843E-05 161800 QUIQUE_C1576_190116_001 140.5 119.04 563950000 40531000 35550000 40411000 31697000 54999000 59692000 40940000 41710000 56613000 16196000 53376000 50541000 41693000 502 2041 470 4390;4391;4392;4393;4394;4395;4396;4397;4398;4399;4400;4401;4402 5795;5796;5797;5798;5799;5800;5801;5802;5803;5804;5805;5806;5807;5808;5809;5810 5802 16 AAVLVQQWVSYADTELIPAACGATLPALGLR Unmodified 3253.7169 0.71691921 2254 P26640;A0A140T936;A0A140T954;A2ABF4;A0A0G2JJT9;A0A140T904 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 171.11 171.11 3 2.784E-31 176407 QUIQUE_C1576_190116_001 100.95 95.108 166620000 0 0 0 0 17876000 0 48840000 0 0 0 0 99900000 0 503 2254 471 4403;4404;4405 5811;5812;5813 5812 3 AAVMATLLFPGR Unmodified 1245.6904 0.69036353 3863 Q96GX9;S4R3D6 APIP Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase yes no 0 0 0 1 118.74 118.74 2 0.0018106 123793 QUIQUE_C1218_190116_001 78.934 58.605 95614000 95614000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 504 3863 472 4406 5814 5814 1 AAVMVHQLSK Unmodified 1082.5906 0.59064948 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 19.251 19.251 2;3 6.6317E-14 11775 QUIQUE_C1368_190116_001 185.58 156.67 6572300000 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53666000 113040000 52796000 0 143330000 42422000 56703000 507 3615 474 4433;4434;4435;4436;4437;4438;4439;4440;4441;4442;4443;4444;4445;4446 5842;5843;5844;5845;5846;5847;5848;5849;5850;5851;5852;5853;5854;5855;5856 5850 12 AAVPDAVGK Unmodified 826.45487 0.45486751 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.248 20.248 2 0.035453 12721 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.776 34.854 7400100000 522220000 566770000 985810000 729270000 574900000 505800000 628080000 661930000 859360000 0 0 556690000 809300000 508 1872;1371;590 475 4447;4448;4449;4450;4451;4452;4453;4454;4455;4456;4457 5857;5858;5859;5860;5861;5862;5863;5864;5865;5866;5867 5867 3 AAVPELLQQQEEDR Acetyl (Protein N-term) 1666.8162 0.81622856 4636 Q9Y5X3;Q5QPE5;Q5QPE4;U3KQL0;U3KQP5 SNX5 Sorting nexin-5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 126.81 126.81 2 0.00023061 130746 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.46 74.275 1309100000 0 109080000 129810000 145110000 134770000 115600000 93951000 109590000 133760000 54992000 0 131160000 151280000 509 4636 476 4458;4459;4460;4461;4462;4463;4464;4465;4466;4467;4468;4469 5868;5869;5870;5871;5872;5873;5874;5875;5876;5877;5878;5879;5880;5881;5882 5877 14 AAVPIVNLKDELLFPSWEALFSGSEGPLKPGAR Unmodified 3507.8766 0.87659098 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 162.68 162.68 3;4 2.655E-39 165188 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.46 97.089 1510600000 0 52753000 51758000 0 133700000 0 127280000 75445000 211060000 0 435070000 310130000 113400000 510 2419 477 4470;4471;4472;4473;4474;4475;4476;4477;4478;4479;4480 5883;5884;5885;5886;5887;5888;5889;5890;5891;5892;5893 5887 11 AAVPSGASTGIYEALELR Unmodified 1803.9367 0.93667805 1906;1955 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;K7ERS8;A0A2R8Y798;A0A2R8YEG5;P09104;F5H0C8;F5H1C3;E5RI09;E5RG95;K7EPM1;K7EKN2;E5RGZ4 ENO1;ENO2;ENO3 Alpha-enolase;Enolase;Gamma-enolase no no 0 0 0 8 10 6 8 9 8 8 8 12 4 27 14 14 124.96 124.96 2;3 3.3164E-14 129791 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.42 92.755 171330000000 13849000000 14477000000 12431000000 13044000000 13521000000 13717000000 12695000000 13559000000 14041000000 7656700000 16651000000 12395000000 13298000000 511 1906;1955 478 4481;4482;4483;4484;4485;4486;4487;4488;4489;4490;4491;4492;4493;4494;4495;4496;4497;4498;4499;4500;4501;4502;4503;4504;4505;4506;4507;4508;4509;4510;4511;4512;4513;4514;4515;4516;4517;4518;4519;4520;4521;4522;4523;4524;4525;4526;4527;4528;4529;4530;4531;4532;4533;4534;4535;4536;4537;4538;4539;4540;4541;4542;4543;4544;4545;4546;4547;4548;4549;4550;4551;4552;4553;4554;4555;4556;4557;4558;4559;4560;4561;4562;4563;4564;4565;4566;4567;4568;4569;4570;4571;4572;4573;4574;4575;4576;4577;4578;4579;4580;4581;4582;4583;4584;4585;4586;4587;4588;4589;4590;4591;4592;4593;4594;4595;4596;4597;4598;4599;4600;4601;4602;4603;4604;4605;4606;4607;4608;4609;4610;4611;4612;4613;4614;4615;4616 5894;5895;5896;5897;5898;5899;5900;5901;5902;5903;5904;5905;5906;5907;5908;5909;5910;5911;5912;5913;5914;5915;5916;5917;5918;5919;5920;5921;5922;5923;5924;5925;5926;5927;5928;5929;5930;5931;5932;5933;5934;5935;5936;5937;5938;5939;5940;5941;5942;5943;5944;5945;5946;5947;5948;5949;5950;5951;5952;5953;5954;5955;5956;5957;5958;5959;5960;5961;5962;5963;5964;5965;5966;5967;5968;5969;5970;5971;5972;5973;5974;5975;5976;5977;5978;5979;5980;5981;5982;5983;5984;5985;5986;5987;5988;5989;5990;5991;5992;5993;5994;5995;5996;5997;5998;5999;6000;6001;6002;6003;6004;6005;6006;6007;6008;6009;6010;6011;6012;6013;6014;6015;6016;6017;6018;6019;6020;6021;6022;6023;6024;6025;6026;6027;6028;6029;6030;6031;6032;6033;6034;6035;6036;6037;6038;6039;6040;6041;6042;6043;6044;6045;6046;6047;6048;6049;6050;6051;6052;6053;6054;6055;6056;6057;6058;6059;6060;6061;6062;6063;6064;6065;6066;6067;6068;6069;6070;6071;6072;6073;6074;6075;6076;6077;6078;6079;6080;6081;6082;6083;6084;6085;6086;6087;6088;6089;6090;6091;6092;6093;6094;6095;6096;6097;6098;6099;6100;6101;6102;6103;6104;6105;6106;6107;6108;6109;6110;6111;6112;6113;6114;6115;6116;6117;6118;6119;6120;6121;6122;6123;6124;6125;6126;6127;6128;6129;6130;6131;6132;6133;6134;6135;6136;6137;6138;6139;6140;6141;6142;6143;6144;6145;6146;6147;6148;6149;6150;6151;6152;6153;6154;6155;6156;6157;6158;6159;6160;6161;6162;6163;6164;6165;6166;6167;6168;6169;6170;6171;6172;6173;6174;6175;6176;6177;6178;6179;6180;6181;6182;6183;6184;6185;6186;6187;6188;6189;6190;6191;6192;6193;6194;6195;6196 6138 292 AAVPSGASTGIYEALELRDGDK Unmodified 2219.107 0.10699085 1955 P09104;F5H0C8;F5H1C3;E5RI09;E5RG95;K7EPM1;K7EKN2;E5RGZ4 ENO2;ENO3 Gamma-enolase;Enolase no no 0 0 1 1 1 102 102 3 1.1845E-08 104684 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.812 83.232 230980000 0 0 0 0 0 0 0 188220000 42752000 0 0 0 0 512 1955 479 4617;4618 6197;6198;6199 6198 3 AAVPSGASTGIYEALELRDNDK Unmodified 2276.1285 0.12845458 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;K7ERS8;A0A2R8Y798;A0A2R8YEG5 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 1 1 4 2 1 1 3 101.55 101.55 2;3 6.484E-44 103113 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.19 175.83 3575300000 0 0 0 0 79370000 0 0 1492100000 747830000 0 213620000 452500000 589930000 513 1906 480 4619;4620;4621;4622;4623;4624;4625;4626;4627;4628;4629;4630 6200;6201;6202;6203;6204;6205;6206;6207;6208;6209;6210;6211;6212;6213;6214;6215;6216;6217;6218;6219;6220;6221;6222 6214 23 AAVPSGASTGIYEALELRDNDKTR Unmodified 2533.2772 0.27724408 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;K7ERS8;A0A2R8Y798;A0A2R8YEG5 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 2 3 2 1 1 88.334 88.334 3;4 2.9047E-18 89957 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.2 110.54 1510600000 0 0 0 0 0 0 0 1255400000 109670000 0 0 70764000 74768000 514 1906 481 4631;4632;4633;4634;4635;4636;4637 6223;6224;6225;6226;6227;6228;6229;6230;6231;6232;6233;6234 6225 11 AAVPTVSDQAAAMQLSQCAK Unmodified 2045.9874 0.98740976 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 85.689 85.689 2;3 1.8386E-12 87208 QUIQUE_C1403_190116_001 147.35 126.05 298500000 0 0 48782000 63092000 30449000 21455000 42472000 0 0 0 34986000 25920000 31341000 515 4606 482 4638;4639;4640;4641;4642;4643;4644;4645;4646;4647 6235;6236;6237;6238;6239;6240;6241;6242;6243;6244 6237 9 AAVQAAEVK Acetyl (Protein N-term) 927.50255 0.50254598 3103 Q15046;H3BRC9 KARS Lysine--tRNA ligase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 44.724 44.724 2 0.0024898 41817 QUIQUE_C1403_190116_001 87.639 56.061 157640000 0 0 0 35044000 45888000 0 0 0 0 0 38716000 0 37992000 516 3103 483 4648;4649;4650;4651;4652;4653;4654 6245;6246;6247;6248;6249;6250;6251 6247 6 AAVQVLDDIEK Unmodified 1199.6398 0.63976774 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 76.129 76.129 2 0.002477 75238 QUIQUE_C1563_190116_001 78.098 23.941 576110000 66426000 67629000 111110000 0 0 77023000 0 45538000 93232000 33183000 0 81967000 0 517 2191 484 4655;4656;4657;4658;4659;4660;4661;4662 6252;6253;6254;6255;6256;6257;6258;6259 6255 7 AAVSHWQQQSYLDSGIHSGATTTAPSLSGK Unmodified 3084.4901 0.4900904 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;E7EMJ5;E9PDF9;E7EV28;C9IZ65 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 3 2 2 3 1 2 2 75.036 75.036 3;4 3.8068E-197 75204 QUIQUE_DMIX1_190116_001 222.95 211.53 3236600000 318270000 303240000 125180000 366390000 310970000 280800000 214230000 285720000 276640000 156830000 124360000 142670000 331300000 518 425 485 4663;4664;4665;4666;4667;4668;4669;4670;4671;4672;4673;4674;4675;4676;4677;4678;4679;4680;4681;4682;4683;4684;4685;4686;4687;4688;4689;4690 6260;6261;6262;6263;6264;6265;6266;6267;6268;6269;6270;6271;6272;6273;6274;6275;6276;6277;6278;6279;6280;6281;6282;6283;6284;6285;6286;6287;6288;6289;6290;6291;6292;6293;6294;6295;6296;6297;6298;6299;6300;6301;6302 6286 41 AAVTMSVPGR Acetyl (Protein N-term) 1029.5277 0.52771487 3459 Q7Z406;M0QY43;A0A2R8Y4C3;A0A2R8Y454 MYH14 Myosin-14 yes no 1 0 0 1 82.885 82.885 2 0.031082 83754 QUIQUE_C1403_190116_001 45.738 20.844 14332000 0 0 0 14332000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 519 3459 486 4691 6303 6303 1 AAVVTSPPPTTAPHK Unmodified 1472.7987 0.798728 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2;D6RF25;D6RAH3;D6RJE2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 3 2 2 3 1 3 2 2 21.752 21.752 2;3 4.3102E-13 14943 QUIQUE_C1403_190116_001 113.76 109.19 7570400000 489800000 435430000 415480000 823860000 599700000 680470000 451840000 753350000 878050000 202770000 515890000 464710000 859100000 520 854 487 4692;4693;4694;4695;4696;4697;4698;4699;4700;4701;4702;4703;4704;4705;4706;4707;4708;4709;4710;4711;4712;4713;4714;4715;4716;4717;4718;4719;4720;4721;4722;4723 6304;6305;6306;6307;6308;6309;6310;6311;6312;6313;6314;6315;6316;6317;6318;6319;6320;6321;6322;6323;6324;6325;6326;6327;6328;6329;6330;6331;6332;6333;6334;6335;6336;6337;6338;6339;6340;6341;6342;6343;6344;6345;6346;6347;6348;6349 6313 45 AAVWQQVLAVDAR Unmodified 1425.7728 0.7728476 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 yes yes 0 0 0 1 88.232 88.232 3 0.051643 90157 QUIQUE_C1218_190116_001 21.775 0 29880000 29880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 521 4137 488 4724 6350 6350 1 AAVWQQVLAVDAR Acetyl (Protein N-term) 1467.7834 0.78341229 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 yes yes 1 0 0 1 1 1 164.19 164.19 2 0.0015146 165848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.681 82.709 33181000 14335000 0 0 10917000 0 0 0 7928600 0 0 0 0 0 522 4137 488 4725;4726;4727 6351;6352;6353 6353 2 AAVYHHFISDGVR Unmodified 1470.7368 0.73679645 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 3 1 3 3 1 1 1 1 31.843 31.843 2;3;4 0.0010774 27097 QUIQUE_C1438_190116_001 85.845 76.795 923120000 144090000 229680000 46711000 144490000 267230000 16356000 0 0 0 0 46285000 0 28282000 523 1803 489 4728;4729;4730;4731;4732;4733;4734;4735;4736;4737;4738;4739;4740;4741;4742 6354;6355;6356;6357;6358;6359;6360;6361;6362;6363;6364;6365;6366;6367;6368;6369 6365 15 AAWEVDSGR Unmodified 989.45666 0.45665842 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 37.753 37.753 2 0.008597 33256 QUIQUE_C1403_190116_001 78.334 52.44 105200000 0 0 43611000 49079000 0 0 0 0 0 12510000 0 0 0 524 666 490 4743;4744;4745 6370;6371;6372 6371 3 AAWEVDSGRR Unmodified 1145.5578 0.55776945 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 2 1 23.656 23.656 2;3 8.8857E-05 17140 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.048 76.676 306040000 0 0 0 0 0 0 0 55657000 76265000 0 124690000 49437000 0 525 666 491 4746;4747;4748;4749;4750 6373;6374;6375;6376;6377 6377 4 AAWIPHVENR Unmodified 1191.6149 0.6148904 2056 P13521 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.783 44.783 3 0.001951 41166 QUIQUE_C1368_190116_001 60.064 44.804 513960000 82142000 71155000 74879000 38819000 59093000 65189000 0 0 0 23724000 51480000 47474000 0 526 2056 492 4751;4752;4753;4754;4755;4756;4757;4758;4759;4760;4761 6378;6379;6380;6381;6382;6383;6384;6385;6386;6387;6388;6389;6390;6391 6380 13 AAYDIEVNTR Unmodified 1150.5619 0.56185177 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A0A140T9C3;A0A140T959;A0A140T905;A2ABJ5 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.557 50.557 2 0.0013602 49353 QUIQUE_C1438_190116_001 98.582 62.187 250300000 0 0 64236000 0 49471000 0 50144000 0 0 0 47517000 0 38928000 527 1673 493 4762;4763;4764;4765;4766;4767 6392;6393;6394;6395;6396;6397 6394 6 AAYDIEVNTRR Unmodified 1306.663 0.6629628 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A0A140T9C3;A0A140T959;A0A140T905;A2ABJ5 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 1 1 35.947 35.947 3 0.0082556 31508 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.829 33.666 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 528 1673 494 4768 6398 6398 1 AAYDVSSFSFFQR Unmodified 1523.7045 0.70449327 1502 O15498 YKT6 Synaptobrevin homolog YKT6 yes yes 0 0 0 1 130.42 130.42 2 0.027222 126828 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.569 34.789 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 529 1502 495 4769 6399 6399 1 AAYEAELGDAR Unmodified 1164.5411 0.54111633 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.437 42.437 2 0.00010542 39769 QUIQUE_C1218_190116_001 132.01 96.13 5178500000 658430000 589730000 430770000 0 740480000 512220000 408880000 229800000 303610000 211390000 500780000 295410000 296990000 530 1819;3223 496 4770;4771;4772;4773;4774;4775;4776;4777;4778;4779;4780;4781 6400;6401;6402;6403;6404;6405;6406;6407;6408;6409;6410;6411;6412 6400 12 AAYEAELGDARK Unmodified 1292.6361 0.63607935 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 1 1 1 26.761 26.761 3 0.032461 20776 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.737 23.106 286190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 156500000 129680000 0 531 1819;3223 497 4782;4783 6413;6414 6413 2 AAYEAFCR Unmodified 986.428 0.42800083 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.11 39.11 2 0.0036007 34273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.04 109.88 7607100000 500590000 589620000 672560000 423210000 614560000 501660000 674170000 595190000 622190000 182820000 816620000 693520000 720360000 532 2588 498 4784;4785;4786;4787;4788;4789;4790;4791;4792;4793;4794;4795;4796 6415;6416;6417;6418;6419;6420;6421;6422;6423;6424;6425;6426;6427;6428;6429;6430 6426 9 AAYFGIYDTAK Unmodified 1218.5921 0.59208927 1878 P05141 SLC25A5 ADP/ATP translocase 2;ADP/ATP translocase 2, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 82.461 82.461 2 0.00098767 83970 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.867 84.299 4668300000 436480000 0 636180000 378130000 314560000 0 0 478690000 428140000 199170000 772220000 498910000 525780000 533 1878 499 4797;4798;4799;4800;4801;4802;4803;4804;4805;4806;4807 6431;6432;6433;6434;6435;6436;6437;6438;6439;6440;6441 6437 8 AAYFGVYDTAK Unmodified 1204.5764 0.57643921 2038;2039 P12235;V9GYG0;P12236 SLC25A4;SLC25A6 ADP/ATP translocase 1;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.226 71.226 2 0.0014573 72200 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.62 91.259 7005900000 558300000 529490000 831670000 527650000 0 496040000 669020000 613540000 657410000 257670000 1192600000 672560000 0 534 2038;2039 500 4808;4809;4810;4811;4812;4813;4814;4815;4816;4817;4818 6442;6443;6444;6445;6446;6447;6448;6449;6450;6451;6452;6453 6452 11 AAYIYFTDFCPDNLFNK Unmodified 2097.9506 0.95061355 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.82 155.82 2 8.187E-07 160121 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.01 113.23 548900000 32881000 42907000 55511000 30873000 43708000 30233000 54912000 40802000 45242000 12349000 66047000 53403000 40032000 535 1384 501 4819;4820;4821;4822;4823;4824;4825;4826;4827;4828;4829;4830;4831 6454;6455;6456;6457;6458;6459;6460;6461;6462;6463;6464;6465;6466;6467 6466 12 AAYIYIR Unmodified 868.48069 0.48068833 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;E9PMX3;E9PQP1;E9PPR0;E9PLC6;E9PJL9 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.461 50.461 2 0.039103 46772 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.025 45.823 1370400000 256550000 0 243060000 0 171830000 0 195700000 0 202300000 67506000 0 233490000 0 536 1069 502 4832;4833;4834;4835;4836;4837;4838 6468;6469;6470;6471;6472;6473;6474 6473 7 AAYKLVLIR Acetyl (Protein N-term) 1087.6754 0.67536539 2139 P18669;Q8N0Y7 PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 yes no 1 0 1 1 101.02 101.02 2 0.038937 105638 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.207 43.754 36850000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36850000 0 0 537 2139 503 4839 6475 6475 1 AAYLLGCSLEELSSAIFK Unmodified 1971.0023 0.002314771 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 169.01 169.01 2;3 4.4989E-05 174357 QUIQUE_C1576_190116_001 121.04 97.923 611690000 9591100 0 142310000 8194900 49664000 0 218840000 25666000 0 21317000 23530000 0 112580000 538 271 504 4840;4841;4842;4843;4844;4845;4846;4847;4848;4849;4850 6476;6477;6478;6479;6480;6481;6482;6483;6484;6485;6486;6487 6482 12 AAYLQETGKPLDETLK Unmodified 1775.9305 0.93053004 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 64.15 64.15 2;3 1.5887E-12 64847 QUIQUE_C1218_190116_001 163.99 131.47 1414300000 29075000 101990000 192940000 191940000 82650000 218550000 162870000 0 106920000 76747000 70755000 48053000 131810000 539 1853 505 4851;4852;4853;4854;4855;4856;4857;4858;4859;4860;4861;4862;4863;4864;4865;4866;4867;4868;4869;4870;4871 6488;6489;6490;6491;6492;6493;6494;6495;6496;6497;6498;6499;6500;6501;6502;6503;6504;6505;6506;6507;6508;6509;6510;6511;6512 6488 25 AAYLQETGKPLDETLKK Unmodified 1904.0255 0.025493054 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 2 2 2 3 3 1 1 1 1 1 1 1 2 47.916 47.916 2;3;4 1.1501E-87 45476 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.83 148.39 3744400000 130330000 262990000 876420000 671340000 138700000 28237000 311160000 282650000 60160000 193860000 33036000 0 755500000 540 1853 506 4872;4873;4874;4875;4876;4877;4878;4879;4880;4881;4882;4883;4884;4885;4886;4887;4888;4889;4890 6513;6514;6515;6516;6517;6518;6519;6520;6521;6522;6523;6524;6525;6526;6527;6528;6529;6530;6531 6527 15 AAYLQWR Acetyl (Protein N-term) 948.48175 0.48175096 65;4141 A0A087WXL6;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 1 0 0 1 1 1 1 126.17 126.17 2 0.0268 130251 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.618 55.654 34987000 0 12710000 0 0 0 0 0 0 14882000 7394400 0 0 0 541 65;4141 507 4891;4892;4893;4894 6532;6533;6534;6535 6534 4 AAYNLVK Unmodified 777.43849 0.43848916 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VW30 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.399 27.399 2 0.023734 21189 QUIQUE_C1277_190116_001 99.511 44.069 1164900000 0 343750000 0 0 221510000 0 0 112540000 0 87955000 0 399190000 0 542 452 508 4895;4896;4897;4898;4899 6536;6537;6538;6539;6540 6536 5 AAYNLVR Unmodified 805.44464 0.44463717 3040 Q14019 COTL1 Coactosin-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.729 30.729 2 0.019175 25727 QUIQUE_C1277_190116_001 112.27 67.656 7898200000 656840000 605370000 923760000 0 662910000 0 0 0 1066200000 453510000 1226300000 947460000 1355800000 543 3040 509 4900;4901;4902;4903;4904;4905;4906;4907;4908 6541;6542;6543;6544;6545;6546;6547;6548;6549;6550;6551 6542 10 AAYNPGQAVPWNAVK Unmodified 1584.8049 0.80487601 3571 Q8N163;E5RFJ3;H0YC69;E5RGU7;H0YC58 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.001 86.001 2 0.00010916 88641 QUIQUE_C1218_190116_001 89.609 79.085 636840000 77728000 75508000 50955000 0 68601000 47139000 0 80658000 77543000 24821000 56222000 77663000 0 544 3571 510 4909;4910;4911;4912;4913;4914;4915;4916;4917;4918 6552;6553;6554;6555;6556;6557;6558;6559;6560;6561;6562;6563 6552 12 AAYNVTLLNFMDPQK Unmodified 1723.8603 0.86034198 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUC3;A0A1B0GV98;A0A1B0GTC5;A0A1B0GU26;A0A1B0GTY1 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 141.16 141.16 2 0.055957 145426 QUIQUE_C1277_190116_001 53.034 37.657 36200000 0 36200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 545 334 511 4919 6564 6564 1 AAYPDLENPPLLVTPSQQAK Unmodified 2151.1212 0.12118435 2638 P54136;E5RJM9 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 114.01 114.01 2 7.7425E-05 119753 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.265 79.387 122300000 0 36100000 0 0 0 0 0 0 0 0 50713000 0 35489000 546 2638 512 4920;4921;4922 6565;6566;6567 6566 3 AAYQVAALPK Unmodified 1030.5811 0.58113065 2612 P52758;H0YBX3;H0YB34 HRSP12 Ribonuclease UK114 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.832 49.832 2 0.00014671 47058 QUIQUE_C1563_190116_001 122.13 100.6 11579000000 642340000 845710000 1141300000 645240000 875650000 1193700000 711250000 959710000 936950000 319790000 1323300000 874030000 1110600000 547 2612 513 4923;4924;4925;4926;4927;4928;4929;4930;4931;4932;4933;4934;4935 6568;6569;6570;6571;6572;6573;6574;6575;6576;6577;6578;6579;6580 6573 13 AAYSFYNVHTQTPLLDLMSDALVLAK Unmodified 2880.4732 0.47316669 2311 P30419 NMT1 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 168.31 168.31 3 2.7636E-15 175509 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.518 87.759 239390000 0 0 0 25627000 0 0 0 0 0 0 213770000 0 0 548 2311 514 4936;4937 6581;6582 6582 2 AAYSYRPGPGAGPGPAAGAALPDQSFLWNVFQR Acetyl (Protein N-term) 3430.6847 0.68470788 1623 O75340;E7EPW6;A0A087WZ38;D6RA21;Q86W51 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 1 0 1 2 1 1 1 1 163.1 163.1 3;4 4.6908E-74 170356 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.79 135.22 858720000 0 0 0 0 0 0 0 217930000 156430000 0 147060000 217480000 119820000 549 1623 515 4938;4939;4940;4941;4942;4943 6583;6584;6585;6586;6587;6588;6589 6587 7 AAYVLFYQR Unmodified 1129.592 0.59202969 1096;4605;2965 Q9Y4E8;G5E9A6;P51784;Q13107 USP15;USP11;USP4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 no no 0 0 0 1 86.948 86.948 2 0.023353 83561 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.616 57.088 0 0 0 0 0 0 0 0 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18.65 2;3 2.6899E-19 11064 QUIQUE_C1563_190116_001 169.65 137.33 6489000000 455020000 647050000 427070000 452530000 679550000 557530000 780160000 277730000 292380000 221990000 551080000 544220000 602690000 552 3926 518 4971;4972;4973;4974;4975;4976;4977;4978;4979;4980;4981;4982;4983;4984;4985;4986;4987;4988;4989;4990;4991;4992;4993;4994 6636;6637;6638;6639;6640;6641;6642;6643;6644;6645;6646;6647;6648;6649;6650;6651;6652;6653;6654;6655;6656;6657;6658;6659 6646 22 ACALSIEESCRPGDK Unmodified 1691.7607 0.76070429 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3;H0Y8X1 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 37.56 37.56 2;3 6.1492E-28 33355 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.14 127.18 3319200000 387330000 361320000 489770000 315700000 172170000 395040000 398370000 49700000 155560000 116130000 116130000 142320000 219630000 553 2326 519 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no no 0 1 0 1 77.585 77.585 3 5.4339E-05 78892 QUIQUE_C1368_190116_001 50.029 35.72 121360000 0 0 121360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 556 1140;3457 521 5059 6764 6764 662 1 ACCVFIFQPNGK Unmodified 1439.669 0.66897616 4091 Q9C040;A0A0J9YY97 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 89.618 89.618 2 0.0057985 91629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.069 76.862 120030000 0 0 0 40956000 0 0 0 0 0 0 0 0 79077000 557 4091 522 5060;5061;5062;5063 6765;6766;6767;6768 6766 3 ACDSVTSNVLPLLLEQFHK Unmodified 2170.1092 0.10923946 3947 Q96T76;H7C1W5 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.71 147.71 3 0.00014553 153620 QUIQUE_C1218_190116_001 66.779 58.389 477900000 46149000 40191000 34141000 50219000 46775000 34764000 50578000 24071000 35956000 9844900 30673000 25355000 49188000 558 3947 523 5064;5065;5066;5067;5068;5069;5070;5071;5072;5073;5074;5075;5076 6769;6770;6771;6772;6773;6774;6775;6776;6777;6778;6779;6780;6781;6782;6783;6784;6785;6786;6787 6769 19 ACEAITVGK Unmodified 947.47462 0.47461667 2401 P36915;A0A140T8Y2 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.781 21.781 2 0.0014309 14988 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.74 83.457 755970000 0 120730000 100720000 113550000 0 0 0 67942000 111460000 59084000 0 99652000 82826000 559 2401 524 5077;5078;5079;5080;5081;5082;5083;5084;5085 6788;6789;6790;6791;6792;6793;6794;6795;6796;6797 6794 9 ACEFAGFQCQIQFGPHNEQK Unmodified 2395.0474 0.047384258 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 93.839 93.839 3 9.6036E-25 95950 QUIQUE_C1368_190116_001 138.66 135.42 451570000 52871000 0 74879000 81713000 0 44888000 52928000 39091000 46942000 0 0 0 58260000 560 4600 525 5086;5087;5088;5089;5090;5091;5092;5093 6798;6799;6800;6801;6802;6803;6804;6805;6806 6799 9 ACEFGGFQAQIQFGPHVEHK Unmodified 2286.064 0.0640206 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 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Bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase [asymmetrical] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.923 85.923 2 0.0031858 87541 QUIQUE_C1368_190116_001 132.94 88.41 648280000 53230000 55599000 44857000 31306000 40794000 39889000 40525000 64687000 53535000 21060000 56957000 79769000 66069000 568 2571 533 5144;5145;5146;5147;5148;5149;5150;5151;5152;5153;5154;5155;5156 6887;6888;6889;6890;6891;6892;6893;6894;6895;6896;6897;6898;6899;6900 6889 12 ACGLNFADLMAR Unmodified 1337.622 0.62202597 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 118.77 118.77 2 2.8937E-06 121321 QUIQUE_C1563_190116_001 138.08 118.29 3862600000 266210000 312520000 290520000 306010000 297090000 257350000 283180000 272800000 576290000 0 402570000 245600000 352500000 569 3958 534 5157;5158;5159;5160;5161;5162;5163;5164;5165;5166;5167;5168;5169;5170 6901;6902;6903;6904;6905;6906;6907;6908;6909;6910;6911;6912;6913;6914;6915;6916;6917;6918;6919;6920;6921;6922;6923;6924;6925 6912 25 ACGLNFADLMAR Oxidation (M) 1353.6169 0.61694059 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 1 0 1 1 1 91.79 91.79 2 0.0030761 93213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.533 55.753 142740000 0 0 0 0 0 0 0 44564000 63054000 35126000 0 0 0 570 3958 534 5171;5172;5173 6926;6927;6928;6929 6927 2793 3 ACGLNFIDLMVR Oxidation (M) 1423.6952 0.69519091 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 1 0 1 1 120.04 120.04 2 0.011985 124648 QUIQUE_C1576_190116_001 60.518 53.587 62564000 0 0 0 0 0 0 36159000 0 0 26405000 0 0 0 571 4226 535 5174;5175 6930;6931 6930 2886 2 ACGLVASNLNLK Acetyl (Protein N-term) 1300.6809 0.68092105 1958 P09382;F8WEI7 LGALS1 Galectin-1 yes no 1 0 0 1 1 116.42 116.42 2 0.0047334 121524 QUIQUE_C1438_190116_001 61.161 41.375 53013000 31573000 0 0 0 21439000 0 0 0 0 0 0 0 0 572 1958 536 5176;5177 6932;6933 6933 2 ACGLVASNLNLKPGECLR Acetyl (Protein N-term) 2013.0136 0.013564934 1958 P09382;F8WEI7 LGALS1 Galectin-1 yes no 1 0 1 2 2 2 2 3 2 2 2 4 2 3 2 3 112.04 112.04 2;3 1.1619E-104 117271 QUIQUE_C1218_190116_001 231.06 207.31 37267000000 2217400000 2647500000 3485700000 2392300000 3405800000 2859800000 4024900000 2499800000 3327600000 882090000 3087400000 2942500000 3493800000 573 1958 537 5178;5179;5180;5181;5182;5183;5184;5185;5186;5187;5188;5189;5190;5191;5192;5193;5194;5195;5196;5197;5198;5199;5200;5201;5202;5203;5204;5205;5206;5207;5208 6934;6935;6936;6937;6938;6939;6940;6941;6942;6943;6944;6945;6946;6947;6948;6949;6950;6951;6952;6953;6954;6955;6956;6957;6958;6959;6960;6961;6962;6963;6964;6965;6966;6967;6968;6969;6970;6971;6972;6973;6974;6975;6976;6977;6978;6979;6980;6981;6982;6983;6984;6985;6986;6987;6988;6989;6990;6991;6992;6993;6994;6995;6996;6997;6998;6999 6937 66 ACGNFGIPCELR Unmodified 1392.6278 0.62783962 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 84.067 84.067 2 7.1337E-05 85367 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.86 113.06 3781700000 314860000 363510000 361650000 303730000 283590000 331650000 259100000 363210000 415870000 135260000 0 282610000 366660000 574 2195 538 5209;5210;5211;5212;5213;5214;5215;5216;5217;5218;5219;5220;5221 7000;7001;7002;7003;7004;7005;7006;7007;7008;7009;7010;7011;7012;7013;7014;7015 7009 14 ACGQIFCGK Unmodified 1039.4579 0.45792075 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.058 28.058 2 0.0014299 22236 QUIQUE_C1277_190116_001 103.75 76.044 263790000 52576000 68804000 48721000 0 0 0 38651000 0 0 0 0 55043000 0 575 1464 539 5222;5223;5224;5225;5226;5227 7016;7017;7018;7019;7020;7021 7017 6 ACGVDYEVK Unmodified 1039.4644 0.46444592 2528 P49407;E9PM35 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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7038 7038 1 ACIDSNEDGDLSK Unmodified 1422.5933 0.59328784 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.037 30.037 2 6.5921E-05 24983 QUIQUE_C1438_190116_001 116.77 106.39 71599000 0 0 0 37166000 0 0 34433000 0 0 0 0 0 0 579 2285 543 5245;5246;5247;5248;5249;5250;5251;5252 7039;7040;7041;7042;7043;7044;7045;7046 7042 8 ACIGDTLCQK Unmodified 1164.5267 0.5267286 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 35.645 35.645 2 0.0093035 31300 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.542 69.839 184490000 0 0 0 0 0 56371000 64994000 44004000 0 19125000 0 0 0 580 514 544 5253;5254;5255;5256 7047;7048;7049;7050 7049 4 ACISIGNQNFEVK Unmodified 1478.7188 0.71876312 2606 P52564;K7EIW3;A0A0A0MRF7 MAP2K6 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 85.588 85.588 2 0.00041285 87693 QUIQUE_C1368_190116_001 96.015 74.551 259240000 0 0 34225000 0 52946000 50098000 0 0 0 0 121970000 0 0 581 2606 545 5257;5258;5259;5260 7051;7052;7053;7054 7051 4 ACLAEAITLVESTHSR Unmodified 1756.8778 0.87778296 501 A0A3B3ITP4;Q495G5;Q8IVH4;A0A3B3IRG3;D6RIS5 MMAA Methylmalonic aciduria type A protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 16.562 16.562 3 0.023903 105230 QUIQUE_C1563_190116_001 34.909 23.436 37855000 0 37855000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 582 501 546 5261;5262 7055;7056 7056 2 ACLDTAVENMPSLK Oxidation (M) 1563.7273 0.7272789 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 59.546 59.546 2 4.033E-10 58424 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.12 115.49 445770000 0 31032000 0 19239000 31513000 0 0 44590000 40720000 0 100640000 86717000 91320000 583 2524 547 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585 2389 548 5276;5277;5278;5279;5280;5281;5282;5283;5284;5285;5286;5287 7070;7071;7072;7073;7074;7075;7076;7077;7078;7079;7080;7081;7082 7077 11 ACLISLGYDVENDR Unmodified 1623.7563 0.75627084 1544 O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.12 107.12 2 1.8592E-07 104198 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.13 87.334 1043000000 177430000 124330000 103340000 79426000 131710000 84505000 113140000 55092000 62812000 0 53086000 0 58131000 586 1544 549 5288;5289;5290;5291;5292;5293;5294;5295;5296;5297;5298;5299;5300 7083;7084;7085;7086;7087;7088;7089;7090;7091;7092;7093;7094;7095 7093 11 ACLISLGYDVENDRQGEAEFNR Unmodified 2555.1711 0.17106445 1544 O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 105.68 105.68 3 1.3276E-08 108157 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.358 61.486 206280000 0 0 0 0 0 0 0 62355000 47737000 0 50403000 45789000 0 587 1544 550 5301;5302;5303;5304 7096;7097;7098;7099 7096 4 ACLISMGYDLGEAEFAR Unmodified 1901.8652 0.86516936 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 140.43 140.43 2;3 4.6181E-23 145818 QUIQUE_C1218_190116_001 147.87 131.34 175130000 58796000 56547000 0 38198000 0 21589000 0 0 0 0 0 0 0 588 2381 551 5305;5306;5307;5308;5309;5310;5311;5312;5313 7100;7101;7102;7103;7104;7105;7106;7107;7108;7109;7110 7100 11 ACLISMGYNMGEAEFAR Unmodified 1918.8376 0.8375744 1242 H9KV75 ACTN1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 127.66 127.66 2 2.3418E-10 131495 QUIQUE_C1277_190116_001 119.39 97.188 130540000 30295000 43525000 0 24907000 31814000 0 0 0 0 0 0 0 0 589 1242 552 5314;5315;5316;5317 7111;7112;7113;7114;7115 7112 5 ACLSPSQLQK Acetyl (Protein N-term) 1172.586 0.58595803 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0;X6RFQ9;X6RCI6;F8WCG7 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 72.349 72.349 2 0.062298 72975 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.486 38.246 53867000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53867000 590 3296 553 5318 7116 7116 0 ACLYAGVK Unmodified 880.44767 0.44767364 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.669 29.669 1;2 0.014048 24625 QUIQUE_C1438_190116_001 86.512 62.326 9911000000 0 0 3036600000 1435300000 1196500000 1383200000 163330000 0 0 0 0 0 2696100000 591 2086 554 5319;5320;5321;5322;5323;5324;5325 7117;7118;7119;7120;7121;7122;7123 7120 6 ACNCLLLK Unmodified 990.49906 0.49905728 1955 P09104;F5H0C8;U3KQQ1 ENO2 Gamma-enolase;Enolase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 40.851 40.851 1;2 0.0035961 37816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.25 77.372 21887000000 1971100000 2665600000 1977600000 1717000000 2236100000 1674000000 2051900000 1369600000 868980000 603290000 1601700000 1410000000 1739700000 592 1955 555 5326;5327;5328;5329;5330;5331;5332;5333;5334;5335;5336;5337;5338;5339 7124;7125;7126;7127;7128;7129;7130;7131;7132;7133;7134;7135;7136;7137;7138;7139;7140;7141;7142;7143;7144;7145;7146;7147;7148;7149;7150;7151;7152;7153;7154;7155;7156;7157;7158;7159;7160;7161;7162;7163;7164 7147 40 ACNDATLVQITSNMDSVGR Unmodified 2050.9412 0.94118785 4207 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251820000 232490000 265600000 605 2527 568 5438;5439;5440;5441;5442;5443;5444;5445 7276;7277;7278;7279;7280;7281;7282;7283 7280 8 ACVIHGTDLK Unmodified 1112.5648 0.56482866 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.026 21.026 2 1.7349E-05 13873 QUIQUE_C1368_190116_001 147.36 102.28 1577400000 224060000 203770000 352870000 256390000 0 135730000 267260000 0 0 0 137360000 0 0 606 1371 569 5446;5447;5448;5449;5450;5451;5452 7284;7285;7286;7287;7288;7289;7290;7291;7292 7287 8 ACVIHGTDLKDFTSEQIDEILQNHTEIVFAR Unmodified 3598.7726 0.77259619 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 143.84 143.84 4;5 2.2423E-26 148774 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.147 88.994 1226800000 0 123010000 0 0 0 0 60930000 227920000 305840000 0 61424000 75250000 372380000 607 1371 570 5453;5454;5455;5456;5457;5458;5459;5460;5461;5462;5463 7293;7294;7295;7296;7297;7298;7299;7300;7301;7302;7303;7304;7305 7304 13 ACVMMQGR Unmodified 951.40886 0.40886207 1786 P00491;G3V5M2;G3V2H3 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.625 21.625 2 0.0054877 14331 QUIQUE_C1277_190116_001 105.27 69.636 420950000 0 84265000 0 0 0 0 0 105770000 80089000 0 90542000 0 60283000 608 1786 571 5464;5465;5466;5467;5468;5469 7306;7307;7308;7309;7310;7311 7306 5 ACVTDSTGVSNCK Unmodified 1397.5915 0.5915137 2809 P78369 CLDN10 Claudin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.849 20.849 2 0.00041971 14026 QUIQUE_C1576_190116_001 92.239 73.261 212360000 29918000 0 31198000 0 0 0 24628000 24137000 43635000 0 0 24075000 34766000 609 2809 572 5470;5471;5472;5473;5474;5475;5476;5477 7312;7313;7314;7315;7316;7317;7318;7319 7314 8 ACWVLHYFCEVK Unmodified 1610.7374 0.73739007 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 107.28 107.28 2;3 0.00025256 112105 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.66 115.68 191410000 0 0 0 27877000 0 0 47476000 0 0 0 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5495;5496;5497;5498;5499;5500;5501;5502;5503;5504;5505;5506;5507;5508;5509;5510;5511;5512;5513;5514 7342;7343;7344;7345;7346;7347;7348;7349;7350;7351;7352;7353;7354;7355;7356;7357;7358;7359;7360;7361;7362 7350 20 ACYLSINPQKDETLETEK Unmodified 2138.0201 0.02014968 2716 P61163;R4GMT0 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.267 71.267 2;3 6.4696E-104 71628 QUIQUE_DMIX5_190116_001 239.19 225.53 6800800000 456760000 593220000 541880000 448610000 514550000 452270000 618600000 431900000 534350000 184380000 714990000 565570000 743740000 613 2716 576 5515;5516;5517;5518;5519;5520;5521;5522;5523;5524;5525;5526;5527;5528;5529;5530;5531;5532;5533;5534;5535;5536;5537;5538;5539;5540 7363;7364;7365;7366;7367;7368;7369;7370;7371;7372;7373;7374;7375;7376;7377;7378;7379;7380;7381;7382;7383;7384;7385;7386;7387;7388;7389;7390;7391;7392;7393;7394;7395;7396;7397;7398;7399;7400;7401;7402 7395 39 ADAASQVLLGSGLTILSQPLMYVK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2532.3509 0.35092629 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 1 1 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 177.43 177.43 2;3 1.8993E-31 181077 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.44 123.34 1446400000 10999000 144060000 85111000 49472000 159930000 13049000 185940000 162330000 159020000 4231100 197640000 263270000 11328000 614 4650 577 5541;5542;5543;5544;5545;5546;5547;5548;5549;5550;5551;5552;5553;5554;5555;5556;5557;5558;5559;5560;5561;5562 7403;7404;7405;7406;7407;7408;7409;7410;7411;7412;7413;7414;7415;7416;7417;7418;7419;7420;7421;7422;7423;7424;7425;7426;7427;7428 7421 3063 25 ADAASQVLLGSGLTILSQPLMYVK Acetyl (Protein N-term) 2516.356 0.35601167 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 1 0 0 2 1 2 1 2 3 2 2 2 2 1 2 179.37 179.37 2;3 1.406E-75 184483 QUIQUE_C1438_190116_001 175.61 162.25 5234800000 421570000 42157000 117260000 86550000 348460000 0 707230000 775410000 583500000 57321000 1246300000 410330000 438710000 615 4650 577 5563;5564;5565;5566;5567;5568;5569;5570;5571;5572;5573;5574;5575;5576;5577;5578;5579;5580;5581;5582;5583;5584 7429;7430;7431;7432;7433;7434;7435;7436;7437;7438;7439;7440;7441;7442;7443;7444;7445;7446;7447;7448;7449;7450;7451;7452;7453;7454;7455 7439 26 ADAECYTAMK Oxidation (M) 1174.4635 0.46345964 1696 O94905;E5RHW4 ERLIN2 Erlin-2 yes no 0 1 0 1 1 18.459 18.459 2 0.0069253 11085 QUIQUE_C1218_190116_001 76.1 64.379 43081000 21827000 0 0 21254000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 616 1696 578 5585;5586 7456;7457 7456 930 2 ADAEDLLDSFLSNILQDCR Unmodified 2194.0212 0.021212312 3947 Q96T76;H7C1W5 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 178.6 178.6 2 0.00018011 181869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.591 84.799 6079600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6079600 617 3947 579 5587 7458 7458 1 ADAEGESDLENSR Unmodified 1391.5801 0.58008061 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.289 25.289 2 1.5852E-07 18755 QUIQUE_C1368_190116_001 166.86 139.61 1034000000 67181000 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yes no 1 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 175.31 175.31 2;3 1.0624E-13 179482 QUIQUE_C1218_190116_001 103.39 96.807 51130000 5899600 11757000 2189500 0 12005000 0 0 4138400 5662200 0 0 6578000 2900600 620 2446 582 5625;5626;5627;5628;5629;5630;5631;5632;5633;5634 7501;7502;7503;7504;7505;7506;7507;7508;7509;7510;7511 7502 10 ADAGFVYSEAVASHYMR Unmodified 1872.8465 0.84648283 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;A0A2R8YGH2;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.964 99.964 3 0.0019931 101834 QUIQUE_C1403_190116_001 52.52 43.774 351260000 66692000 74936000 0 63840000 0 0 58487000 0 0 32652000 0 54651000 0 621 472;1460 583 5635;5636;5637;5638;5639;5640 7512;7513;7514;7515;7516;7517;7518 7515 6 ADAGPSGQGDSVSIGK Unmodified 1444.6794 0.67940073 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.999 30.999 2 2.8027E-06 26159 QUIQUE_C1576_190116_001 107.17 94.376 1075000000 100120000 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7531;7532;7533;7534;7535;7536;7537;7538;7539;7540;7541;7542;7543;7544;7545;7546;7547;7548;7549;7550;7551;7552;7553;7554;7555;7556;7557;7558;7559;7560;7561;7562;7563;7564;7565;7566;7567 7554 31 ADATNVNNWHWTER Unmodified 1712.7655 0.76553039 1730 O95433;G3V3W9 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 66.345 66.345 2 1.6572E-17 67483 QUIQUE_C1218_190116_001 132.32 95.738 232880000 22616000 0 31844000 33260000 0 34635000 45538000 0 29978000 0 0 0 35004000 624 1730 586 5680;5681;5682;5683;5684;5685;5686;5687 7568;7569;7570;7571;7572;7573;7574;7575;7576 7568 8 ADAVQDSEMVELVELEIR Unmodified 2044.9987 0.99868596 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 156.49 156.49 3 1.3416E-05 161272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.768 71.225 140620000 18873000 0 0 0 16931000 0 0 14948000 23622000 6408400 25469000 34366000 0 625 2529 587 5688;5689;5690;5691;5692;5693;5694;5695;5696;5697 7577;7578;7579;7580;7581;7582;7583;7584;7585;7586;7587 7581 9 ADAWEEIRR Acetyl (Protein N-term) 1186.5731 0.57308516 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 81.277 81.277 2 0.0067219 81556 QUIQUE_C1563_190116_001 101.72 77.691 333540000 0 43693000 43588000 0 43780000 45158000 49171000 0 47950000 0 60196000 0 0 626 1692 588 5698;5699;5700;5701;5702;5703;5704 7588;7589;7590;7591;7592;7593;7594 7591 1 ADCASGIFLAAEK Unmodified 1351.6442 0.6442012 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 79.748 79.748 2 0.0033944 81191 QUIQUE_C1576_190116_001 71.555 58.435 402830000 61112000 62906000 41926000 0 0 0 53761000 30500000 0 0 59855000 50873000 41893000 627 1548 589 5705;5706;5707;5708;5709;5710;5711;5712 7595;7596;7597;7598;7599;7600;7601;7602 7598 5 ADCLVPSEIR Unmodified 1158.5703 0.57030797 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;E7EPG2;F8W9E5;Q99719;E7EX32;E7EQM7 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 0 1 1 1 1 62.892 62.892 2 0.014657 61685 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Unmodified 2059.9264 0.92644899 2196 P22307;H0YF61 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 0 1 161.71 161.71 2 0.056829 167072 QUIQUE_C1368_190116_001 58.508 44.829 36990000 0 0 36990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 631 2196 593 5724 7618 7618 1 ADDADEFGYSR Unmodified 1244.4946 0.49456007 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.123 48.123 2 0.0020261 45475 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.896 70.088 531910000 36899000 0 45089000 55643000 59431000 50861000 39065000 0 50110000 19341000 66127000 50641000 58706000 632 3432 594 5725;5726;5727;5728;5729;5730;5731;5732;5733;5734;5735;5736 7619;7620;7621;7622;7623;7624;7625;7626;7627;7628;7629;7630 7626 11 ADDDDVVVK Unmodified 974.45566 0.45565537 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 22.09 22.09 2 0.015188 15489 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.494 26.469 54092000 0 0 0 0 0 0 0 54092000 0 0 0 0 0 633 4606 595 5737 7631 7631 1 ADDGRPFPQVIK Unmodified 1341.7041 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Serum albumin yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 2 1 1 2 20.922 20.922 2;3 2.9134E-40 14221 QUIQUE_C1218_190116_001 213.84 195.95 4958800000 403990000 493470000 472720000 599760000 0 963150000 879210000 0 86413000 168270000 155220000 150450000 586140000 + 638 769 600 5779;5780;5781;5782;5783;5784;5785;5786;5787;5788;5789;5790;5791;5792;5793;5794 7701;7702;7703;7704;7705;7706;7707;7708;7709;7710;7711;7712;7713;7714;7715;7716 7701 12 ADDKETCFAEEGKK Unmodified 1626.7196 0.71955098 769 CON__P02768-1;P02768;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 2 3 3 2 3 3 3 3 3 2 3 3 3 3 14.512 14.512 2;3;4 2.689E-191 5933 QUIQUE_C1563_190116_001 278.27 260.21 110160000000 9448500000 10336000000 4177800000 9569900000 22547000000 10958000000 10588000000 1515600000 6622700000 1228700000 7338500000 5509600000 10325000000 + 639 769 601 5795;5796;5797;5798;5799;5800;5801;5802;5803;5804;5805;5806;5807;5808;5809;5810;5811;5812;5813;5814;5815;5816;5817;5818;5819;5820;5821;5822;5823;5824;5825;5826;5827;5828;5829;5830;5831 7717;7718;7719;7720;7721;7722;7723;7724;7725;7726;7727;7728;7729;7730;7731;7732;7733;7734;7735;7736;7737;7738;7739;7740;7741;7742;7743;7744;7745;7746;7747;7748;7749;7750;7751;7752;7753;7754;7755;7756;7757 7733 40 ADDKLIAEEGVDSLNVK Unmodified 1814.9262 0.92617294 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 2 2 81.859 81.859 2;3 1.4588E-21 83454 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.65 122.51 366070000 0 53558000 0 0 0 0 0 0 119320000 0 131240000 61960000 0 640 1713 602 5832;5833;5834;5835;5836;5837;5838 7758;7759;7760;7761;7762;7763;7764;7765 7759 8 ADDLDFETGDAGASATFPMQCSALR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2703.1429 0.14286037 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 142.33 142.33 3 9.927E-07 146578 QUIQUE_C1277_190116_001 56.298 53.612 277260000 30628000 39607000 0 0 34706000 0 0 34900000 39518000 0 0 41433000 56466000 641 2786 603 5839;5840;5841;5842;5843;5844;5845 7766;7767;7768;7769;7770;7771;7772 7767 2233 7 ADDLDFETGDAGASATFPMQCSALR Acetyl (Protein N-term) 2687.1479 0.14794574 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 154.87 154.87 2;3 1.9175E-23 160237 QUIQUE_C1368_190116_001 153.95 143.32 198290000 41479000 50969000 15914000 0 0 0 0 42077000 47849000 0 0 0 0 642 2786 603 5846;5847;5848;5849;5850 7773;7774;7775;7776;7777 7775 5 ADDLEPIMELGR Unmodified 1357.6548 0.65476588 2606 P52564;K7EIW3;A0A0A0MRF7 MAP2K6 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 112.68 112.68 2 0.0042744 116202 QUIQUE_C1403_190116_001 69.672 53.79 80141000 0 21149000 0 32949000 0 0 0 0 0 0 26043000 0 0 643 2606 604 5851;5852;5853 7778;7779;7780 7779 2 ADDPSAADRNVEIWK Acetyl (Protein N-term) 1727.8115 0.81147753 2755 P62495;D6RCB3 ETF1 Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 yes no 1 0 1 1 1 1 88.967 88.967 2 0.012617 90636 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.225 38.891 153660000 0 0 0 0 0 0 0 57657000 0 0 51027000 44978000 0 644 2755 605 5854;5855;5856 7781;7782;7783 7783 3 ADDPSSYMEVVQAANTSGNWEELVK Unmodified 2739.2334 0.23338993 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 153.14 153.14 2;3 1.652E-83 160201 QUIQUE_DMIX5_190116_001 213.49 205.71 6733200000 555580000 725790000 566190000 670820000 737170000 531600000 733700000 437490000 593420000 166380000 707240000 153840000 153950000 645 50 606 5857;5858;5859;5860;5861;5862;5863;5864;5865;5866;5867;5868;5869;5870;5871;5872;5873;5874;5875;5876;5877;5878;5879;5880 7784;7785;7786;7787;7788;7789;7790;7791;7792;7793;7794;7795;7796;7797;7798;7799;7800;7801;7802;7803;7804;7805;7806;7807;7808;7809 7807 23 ADDPSSYMEVVQAANTSGNWEELVK Oxidation (M) 2755.2283 0.22830455 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 139.64 139.64 2;3 2.6269E-158 142473 QUIQUE_DMIX1_190116_001 216.99 208.17 2111400000 0 208440000 143630000 166290000 32802000 133860000 137520000 221450000 214930000 99379000 301270000 231240000 220570000 646 50 606 5881;5882;5883;5884;5885;5886;5887;5888;5889;5890;5891;5892;5893;5894;5895;5896;5897;5898;5899;5900;5901;5902;5903;5904 7810;7811;7812;7813;7814;7815;7816;7817;7818;7819;7820;7821;7822;7823;7824;7825;7826;7827;7828;7829;7830;7831;7832;7833;7834;7835;7836;7837;7838;7839 7825 22 30 ADDPTMGEGPDK Oxidation (M) 1247.4976 0.49759654 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.977 16.977 2 2.3881E-05 9341 QUIQUE_C1368_190116_001 129.7 93.009 2271500000 188910000 273920000 235730000 173360000 127080000 130990000 158640000 98333000 137980000 127250000 229300000 182570000 207470000 647 273;342 607 5905;5906;5907;5908;5909;5910;5911;5912;5913;5914;5915;5916;5917 7840;7841;7842;7843;7844;7845;7846;7847;7848;7849;7850;7851;7852;7853;7854;7855 7843 198 16 ADDPTMGEGPDK Unmodified 1231.5027 0.50268192 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.939 23.939 2 3.8192E-14 17360 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.31 138.92 5927700000 472000000 606920000 607530000 485650000 519750000 393480000 740020000 168300000 214530000 199390000 577800000 488700000 453630000 648 273;342 607 5918;5919;5920;5921;5922;5923;5924;5925;5926;5927;5928;5929;5930 7856;7857;7858;7859;7860;7861;7862;7863;7864;7865;7866;7867;7868;7869;7870;7871;7872;7873;7874 7872 17 ADDTFEALCIEPFSSPPELPDVMKPQDSGSSANEQAVQ Unmodified 4105.8409 0.84087127 3132 Q15370;B8ZZU8;I3L0M9 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 0 0 1 1 162.97 162.97 3 0.0025138 166964 QUIQUE_C1277_190116_001 32.233 27.789 19977000 0 19977000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 649 3132 608 5931 7875 7875 1 ADDVDQQQTTNTVEEPLDLIR Acetyl (Protein N-term) 2441.1558 0.15579154 2750 P62310 LSM3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3 yes yes 1 0 0 1 1 1 146.55 146.55 2 9.9244E-40 153667 QUIQUE_C1438_190116_001 142.97 130.42 27889000 0 27889000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 650 2750 609 5932;5933;5934 7876;7877;7878 7877 3 ADDYIEITGAGGK Unmodified 1308.6198 0.61976058 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.607 65.607 2 0.00041511 65179 QUIQUE_C1368_190116_001 96.113 86.775 270970000 0 0 126520000 0 0 0 0 0 0 51944000 46380000 0 46126000 651 4598 610 5935;5936;5937;5938 7879;7880;7881;7882 7879 3 ADEALFLLLHNEMVSGVYK Acetyl (Protein N-term) 2190.1031 0.10309145 3482 Q86SZ2;G3V2H7;G3V4C3 TRAPPC6B Trafficking protein particle complex subunit 6B yes no 1 0 0 2 1 1 1 2 1 169.83 169.83 2;3 1.0513E-28 174489 QUIQUE_C1218_190116_001 145.52 132.12 354350000 81578000 51566000 0 0 31811000 0 0 43766000 0 0 113600000 0 32029000 652 3482 611 5939;5940;5941;5942;5943;5944;5945;5946 7883;7884;7885;7886;7887;7888;7889;7890 7884 5 ADEALFLLLHNEMVSGVYK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2206.098 0.09800607 3482 Q86SZ2;G3V2H7;G3V4C3 TRAPPC6B Trafficking protein particle complex subunit 6B yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.03 163.03 2;3 5.6702E-08 167635 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.37 95.206 233560000 0 23590000 27835000 18029000 25750000 18844000 18036000 0 31566000 0 46288000 0 23618000 653 3482 611 5947;5948;5949;5950;5951;5952;5953;5954;5955 7891;7892;7893;7894;7895;7896;7897;7898;7899 7897 2671 8 ADEANDNLFR Unmodified 1163.5207 0.52071524 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 1 46.963 46.963 2 0.013076 44707 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.305 47.27 39430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39430000 0 0 654 119 612 5956;5957;5958 7900;7901;7902 7902 3 ADEASELACPTPK Unmodified 1387.6289 0.62894506 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.873 39.873 2 4.4846E-06 36086 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.71 99.453 522790000 48343000 58925000 93473000 0 60724000 67187000 77751000 21178000 31016000 13912000 0 50285000 0 655 2524 613 5959;5960;5961;5962;5963;5964;5965;5966;5967;5968;5969;5970 7903;7904;7905;7906;7907;7908;7909;7910;7911;7912;7913;7914 7910 11 ADEAYLIGR Unmodified 1006.5084 0.50835964 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.555 56.555 2 0.0010141 53950 QUIQUE_C1563_190116_001 107.66 80.14 439060000 76473000 0 89947000 0 0 91985000 81455000 0 0 52703000 0 0 46497000 656 2026 614 5971;5972;5973;5974;5975;5976;5977;5978;5979 7915;7916;7917;7918;7919;7920;7921;7922;7923;7924 7918 10 ADEDGEGIHPSAPHR Acetyl (Protein N-term) 1628.7179 0.7179115 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7;A0A2R8Y871;H7C603 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 1 0 0 1 1 1 1 30.699 30.699 3 0.00051544 24736 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.403 46.202 218160000 64886000 0 0 0 0 0 0 46469000 0 34747000 72062000 0 0 657 3899 615 5980;5981;5982;5983 7925;7926;7927;7928 7928 4 ADEDPIMGFHQMFLLK Oxidation (M) 1906.8957 0.89574121 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 126.28 126.28 3 9.6333E-09 134560 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.24 105.12 1185400000 54409000 77569000 62421000 38213000 49236000 0 60341000 192040000 199250000 34104000 204960000 76027000 136820000 658 2734 616 5984;5985;5986;5987;5988;5989;5990;5991;5992;5993;5994;5995;5996;5997;5998 7929;7930;7931;7932;7933;7934;7935;7936;7937;7938;7939;7940;7941;7942;7943;7944;7945;7946;7947;7948;7949 7941 2164;2165 21 ADEDPIMGFHQMFLLK Unmodified 1890.9008 0.90082659 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 137.69 137.69 2;3 5.5839E-06 142658 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.3 90.488 4086500000 181590000 322670000 250250000 91876000 188430000 155850000 246330000 405890000 570690000 58289000 595740000 421000000 597910000 659 2734 616 5999;6000;6001;6002;6003;6004;6005;6006;6007;6008;6009;6010;6011;6012;6013;6014;6015;6016;6017 7950;7951;7952;7953;7954;7955;7956;7957;7958;7959;7960;7961;7962;7963;7964;7965;7966;7967;7968;7969;7970;7971;7972;7973;7974;7975;7976 7976 25 ADEDPIMGFHQMFLLK 2 Oxidation (M) 1922.8907 0.89065583 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 105.33 105.33 2;3 0.015648 109070 QUIQUE_C1368_190116_001 51.03 42.944 272650000 0 15914000 45053000 0 0 0 0 0 63481000 0 0 63190000 85010000 660 2734 616 6018;6019;6020;6021;6022 7977;7978;7979;7980;7981 7978 2164;2165 2 ADEEKLPPGWEK Acetyl (Protein N-term) 1439.6933 0.69325988 3008 Q13526;K7EMU7;O15428 PIN1;PIN1P1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1;Putative PIN1-like protein yes no 1 0 1 1 1 1 2 2 1 2 3 1 2 2 3 71.08 71.08 2 0.00026488 72733 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143 106.41 874140000 0 90167000 53525000 36925000 0 82457000 48733000 116670000 126010000 29548000 186160000 0 103950000 661 3008 617 6023;6024;6025;6026;6027;6028;6029;6030;6031;6032;6033;6034;6035;6036;6037;6038;6039;6040;6041;6042;6043 7982;7983;7984;7985;7986;7987;7988;7989;7990;7991;7992;7993;7994;7995;7996;7997;7998;7999;8000;8001;8002;8003;8004;8005;8006;8007;8008;8009;8010 8005 28 ADEGISFR Unmodified 893.4243 0.42429566 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.057 41.057 2 0.00062707 37271 QUIQUE_C1277_190116_001 152.47 81.111 50022000000 3624400000 3296200000 5254100000 3328100000 4045100000 3122900000 2904000000 4601300000 4828000000 1692800000 4441900000 3826000000 5057000000 662 2904 618 6044;6045;6046;6047;6048;6049;6050;6051;6052;6053;6054;6055;6056 8011;8012;8013;8014;8015;8016;8017;8018;8019;8020;8021;8022;8023;8024;8025;8026;8027;8028;8029;8030;8031;8032;8033;8034;8035;8036;8037 8013 27 ADEHVIDQGDDGDNFYVIER Unmodified 2306.0087 0.0087333705 2069 P13861;H7C1L0 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 92.077 92.077 2;3 5.1474E-102 94137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 201.24 187.21 3517600000 276100000 351640000 325070000 242020000 257600000 249670000 261580000 315230000 207390000 106800000 379770000 244180000 300550000 663 2069 619 6057;6058;6059;6060;6061;6062;6063;6064;6065;6066;6067;6068;6069;6070;6071;6072;6073;6074;6075;6076;6077;6078;6079;6080;6081 8038;8039;8040;8041;8042;8043;8044;8045;8046;8047;8048;8049;8050;8051;8052;8053;8054;8055;8056;8057;8058;8059;8060;8061;8062;8063 8056 26 ADELLCWEDSAGHWLYE Unmodified 2092.8837 0.8836562 2979 Q13232;H3BPR2 NME3 Nucleoside diphosphate kinase 3;Nucleoside diphosphate kinase yes no 0 0 0 1 157.02 157.02 2 0.021175 161548 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.57 53.422 28816000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28816000 0 664 2979 620 6082 8064 8064 1 ADETKDEQFEEYVQNFK Unmodified 2118.9382 0.93819419 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 102.77 102.77 2;3 2.3141E-223 105027 QUIQUE_DMIX7_190116_001 320.57 314.3 5605400000 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ADEVVWVR Unmodified 972.50288 0.50288033 2083 P14868;C9J7S3;C9JLC1;H7C278;C9JQM9 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.393 59.393 2 0.0011854 58511 QUIQUE_C1576_190116_001 144.83 93.867 1979900000 120760000 144330000 172260000 151380000 140720000 123750000 180140000 178530000 178660000 78178000 189980000 156800000 164410000 670 2083 626 6146;6147;6148;6149;6150;6151;6152;6153;6154;6155;6156;6157;6158 8139;8140;8141;8142;8143;8144;8145;8146;8147;8148;8149;8150;8151;8152;8153;8154;8155 8148 14 ADFAQACQDAGVR Unmodified 1407.6201 0.62011171 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.861 48.861 2 7.5087E-08 47079 QUIQUE_C1438_190116_001 162.38 155 2184300000 146520000 201800000 240460000 186150000 205150000 0 196860000 146970000 172520000 80781000 212470000 168680000 225890000 671 2026 627 6159;6160;6161;6162;6163;6164;6165;6166;6167;6168;6169;6170 8156;8157;8158;8159;8160;8161;8162;8163;8164;8165;8166;8167;8168;8169 8162 13 ADFCIIHYAGK Unmodified 1293.6176 0.61759251 2378;2379 P35579;P35580 MYH9;MYH10 Myosin-9;Myosin-10 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 69.258 69.258 2;3 0.00045661 69169 QUIQUE_C1403_190116_001 113.62 90.193 572010000 0 114550000 0 60798000 158040000 0 0 42239000 46751000 0 93895000 55733000 0 672 2378;2379 628 6171;6172;6173;6174;6175;6176;6177;6178;6179;6180 8170;8171;8172;8173;8174;8175;8176;8177;8178;8179;8180 8172 11 ADFDDRVSDEEK Acetyl (Protein N-term) 1466.6161 0.61613177 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 1 0 1 1 1 57.927 57.927 2 0.0010238 56911 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.06 63.748 87765000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49268000 0 38498000 673 2617 629 6181;6182 8181;8182 8182 2 ADFDDRVSDEEKVR Acetyl (Protein N-term) 1721.7857 0.78565671 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 1 0 2 1 59.519 59.519 3 3.5048E-07 57880 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.52 88.112 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676 3106 632 6210;6211;6212 8214;8215;8216 8214 2 ADFSGMSQTDLSLSK Unmodified 1585.7294 0.72938739 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 89.657 89.657 2 7.07E-18 90981 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.56 116.99 769690000 0 57131000 54602000 80296000 48923000 59535000 48655000 73071000 94144000 56394000 62017000 51943000 82977000 677 2371 633 6213;6214;6215;6216;6217;6218;6219;6220;6221;6222;6223;6224;6225;6226;6227 8217;8218;8219;8220;8221;8222;8223;8224;8225;8226;8227;8228;8229;8230;8231;8232;8233 8224 13 ADFSPFGNSQGPSR Unmodified 1465.6586 0.65860571 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 70.493 70.493 2 0.00019123 71760 QUIQUE_C1218_190116_001 93.839 80.748 149080000 46407000 0 0 0 56029000 0 0 0 0 0 0 0 46642000 678 4148 634 6228;6229;6230;6231 8234;8235;8236;8237 8234 4 ADFVLAANSYDLAIK Unmodified 1609.8352 0.83517309 3062 Q14318;U3KQ64;M0R2K9 FKBP8 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP8;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 124.71 124.71 2 0.00027657 121646 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.226 58.35 55115000 0 0 0 0 0 22468000 0 0 0 32647000 0 0 0 679 3062 635 6232;6233 8238;8239 8239 1 ADGDLTLLWAEWQGR Unmodified 1729.8424 0.84238373 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJE4;G3V5J0 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 0 1 1 156.5 156.5 2 1.5484E-06 159130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.39 129.18 28436000 0 0 0 0 0 0 0 23844000 0 4592300 0 0 0 680 4581 636 6234;6235 8240;8241 8240 2 ADGELNVDSLITR Acetyl (Protein N-term) 1443.7205 0.72053726 2740 P62140;C9J9S3;C9JP48 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.3 138.3 2 3.436E-10 143089 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.79 126.76 1649000000 0 0 165890000 0 163620000 196300000 159160000 167770000 153500000 104070000 178560000 178880000 181230000 681 2740 637 6236;6237;6238;6239;6240;6241;6242;6243;6244;6245;6246 8242;8243;8244;8245;8246;8247;8248;8249;8250;8251;8252;8253;8254;8255;8256;8257 8252 16 ADGELNVDSLITR Unmodified 1401.71 0.70997257 2740 P62140;C9J9S3;C9JP48 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 60.326 60.326 2 0.017021 59054 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.683 0 149070000 0 72723000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76347000 0 682 2740 637 6247;6248 8258;8259 8259 2 ADGFGDNPFYHCLVAEILPAPGK Unmodified 2487.1893 0.18928069 3848 Q96F10;I3L0W4 SAT2 Diamine acetyltransferase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 155.39 155.39 3 7.5112E-05 161190 QUIQUE_C1218_190116_001 52.483 49.834 438490000 38657000 0 49642000 48785000 0 0 0 73989000 74320000 0 72488000 80611000 0 683 3848 638 6249;6250;6251;6252;6253;6254;6255 8260;8261;8262;8263;8264;8265;8266;8267 8261 8 ADGFVNLPDFTVER Unmodified 1578.7678 0.7678218 409 A0A2Q2T6B6;G9CGD6;Q8WWN9;E5RGN6;E5RGB6;E5RJQ7 CNKSR3;IPCEF1 Interactor protein for cytohesin exchange factors 1 yes no 0 0 0 1 130.08 130.08 2 0.016946 134238 QUIQUE_C1277_190116_001 66.267 48.16 42345000 0 42345000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 684 409 639 6256 8268 8268 1 ADGGTQVIDTK Unmodified 1103.5459 0.54586736 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.422 20.422 2 2.5508E-24 13864 QUIQUE_C1218_190116_001 182.46 137.38 10046000000 1101700000 943370000 0 0 946150000 969830000 954400000 755520000 937070000 425640000 1132800000 833460000 1046600000 685 1971 640 6257;6258;6259;6260;6261;6262;6263;6264;6265;6266;6267 8269;8270;8271;8272;8273;8274;8275;8276;8277;8278;8279;8280 8270 12 ADGILVPGGFGIR Unmodified 1270.7034 0.70337105 4267 Q9NRF8 CTPS2 CTP synthase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.6 113.6 2 0.005273 118576 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.299 40.74 384000000 31673000 30027000 0 45328000 0 42276000 0 45633000 59360000 0 63545000 0 66159000 686 4267 641 6268;6269;6270;6271;6272;6273;6274;6275 8281;8282;8283;8284;8285;8286;8287;8288;8289 8288 9 ADGLAVIGVLMK Oxidation (M) 1201.674 0.67404476 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RFE7;H0YBE2;E5RG81;E5RJI8;E5RJF6 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 1 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 2 2 103.91 103.91 2 0.0011403 106644 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.522 68.907 1197100000 44795000 70994000 171470000 32457000 238510000 67152000 0 17911000 29028000 17895000 211540000 159000000 136310000 687 1795 642 6276;6277;6278;6279;6280;6281;6282;6283;6284;6285;6286;6287;6288;6289;6290;6291;6292 8290;8291;8292;8293;8294;8295;8296;8297;8298;8299;8300;8301;8302;8303;8304;8305;8306;8307;8308 8304 1019 15 ADGLAVIGVLMK Unmodified 1185.6791 0.67913014 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RFE7;H0YBE2;E5RG81;E5RJI8;E5RJF6 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.8 132.8 2 5.6381E-05 137558 QUIQUE_DMIX8_190116_001 125.57 112.53 6272900000 0 554910000 556700000 356660000 1053100000 604490000 313460000 0 237110000 139140000 989260000 726780000 741210000 688 1795 642 6293;6294;6295;6296;6297;6298;6299;6300;6301;6302;6303 8309;8310;8311;8312;8313;8314;8315;8316;8317;8318;8319;8320;8321;8322;8323;8324;8325;8326 8326 18 ADGLGAGDVAAVLGPLGLQEVASFVTK Unmodified 2554.3643 0.36426817 4028 Q9BU02 THTPA Thiamine-triphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 172.72 172.72 3 4.0652E-08 174001 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.351 50.239 122160000 12504000 19153000 0 0 0 0 23474000 23639000 37950000 5444400 0 0 0 689 4028 643 6304;6305;6306;6307;6308;6309 8327;8328;8329;8330;8331;8332 8330 6 ADGQMPFSCHYPSR Acetyl (Protein N-term) 1693.6977 0.6977101 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 yes yes 1 0 0 1 80.683 80.683 2 0.0044586 82342 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.274 51.255 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 690 4464 644 6310 8333 8333 1 ADGQVAELLLR Acetyl (Protein N-term) 1225.6667 0.6666512 4547 Q9Y285;K7ER16;K7EK06 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 1 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 3 2 2 147.25 147.25 2 0.00010219 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59.597 30.448 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 693 4331 647 6338 8367 8367 1 ADGYVDNLAEAVDLLLQHADK Unmodified 2269.1226 0.12264092 4111 Q9H008 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes yes 0 0 0 3 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 167.92 167.92 2;3 5.9148E-146 172597 QUIQUE_C1218_190116_001 278.2 236.8 30671000000 1956700000 2788500000 3791100000 286650000 2128200000 245860000 3103000000 292070000 6246300000 463530000 3967500000 2806600000 2595400000 694 4111 648 6339;6340;6341;6342;6343;6344;6345;6346;6347;6348;6349;6350;6351;6352;6353;6354;6355;6356;6357;6358;6359;6360;6361 8368;8369;8370;8371;8372;8373;8374;8375;8376;8377;8378;8379;8380;8381;8382;8383;8384;8385;8386;8387;8388;8389;8390 8369 21 ADHDFVVQEDFMK Unmodified 1579.6977 0.69769333 124 A0A087X2I1;P62333 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 83.233 83.233 2;3 1.4842E-17 85878 QUIQUE_C1218_190116_001 165.66 148.44 901570000 26253000 97688000 38831000 83897000 68817000 71788000 95835000 87553000 91460000 17806000 99378000 77811000 44453000 695 124 649 6362;6363;6364;6365;6366;6367;6368;6369;6370;6371;6372;6373;6374;6375;6376;6377;6378;6379;6380;6381;6382;6383 8391;8392;8393;8394;8395;8396;8397;8398;8399;8400;8401;8402;8403;8404;8405;8406;8407;8408;8409;8410;8411;8412;8413;8414;8415 8391 22 ADHESQRRLLEEELR Unmodified 1879.95 0.9500367 4687 yes no 0 0 2 1 16.563 16.563 4 0.028223 8670 QUIQUE_C1277_190116_001 48.704 32.565 38415000 0 38415000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 696 4687 650 6384 8416 8416 0 ADHPPAEVTSHAASGAK Unmodified 1644.7856 0.78559713 4427 Q9UHB6;F8VRN8;F8VTU2 LIMA1 LIM domain and actin-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 3 1 12.142 12.142 3 0.0045787 4030 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.145 50.585 26583000 0 0 0 0 4958700 0 1819400 0 17706000 0 0 0 2099200 697 4427 651 6385;6386;6387;6388;6389;6390 8417;8418;8419;8420;8421;8422 8422 4 ADHQPLTEASYVNLPTIALCNTDSPLR Unmodified 2995.4709 0.47093486 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 133.1 133.1 2;3 6.0179E-144 136936 QUIQUE_C1403_190116_001 256.25 244.61 2245500000 402130000 475370000 0 567380000 0 30543000 0 303290000 327360000 139430000 0 0 0 698 225 652 6391;6392;6393;6394;6395;6396;6397;6398;6399 8423;8424;8425;8426;8427;8428;8429;8430;8431;8432;8433 8427 11 ADHSFSDGVPSDSVEAAK Acetyl (Protein N-term) 1859.8174 0.81735077 3972 Q99733;C9JZI7;C9J6D1;E9PS34;E9PNJ7;E9PKT8;E9PNW0;E9PJJ2;E9PP22;E9PKI2;C9J1B1 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 1 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 2 70.457 70.457 2 4.1939E-141 69621 QUIQUE_C1277_190116_001 234.82 213.19 1406200000 144210000 116540000 0 0 0 0 0 157650000 196930000 78998000 203850000 184120000 323890000 699 3972 653 6400;6401;6402;6403;6404;6405;6406;6407;6408;6409;6410;6411;6412 8434;8435;8436;8437;8438;8439;8440;8441;8442;8443;8444;8445;8446;8447;8448;8449 8435 16 ADHTLSSLEPAYSAK Unmodified 1588.7733 0.77330111 3336 Q5VW32;F5GXQ0 BROX BRO1 domain-containing protein BROX yes no 0 0 0 1 1 54.278 54.278 2 5.0679E-05 52721 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.36 109.41 120790000 0 0 0 0 0 0 59050000 0 0 0 61745000 0 0 700 3336 654 6413;6414 8450;8451 8451 0 ADHVQSLAQLENLCK Acetyl (Protein N-term) 1766.8621 0.8621329 4447 Q9UIA9 XPO7 Exportin-7 yes yes 1 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 109.61 109.61 2;3 5.1897E-25 114559 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.09 157.22 1003400000 92021000 109740000 78027000 71429000 66096000 53750000 127050000 82032000 69409000 0 90296000 87737000 75771000 701 4447 655 6415;6416;6417;6418;6419;6420;6421;6422;6423;6424;6425;6426;6427;6428;6429;6430 8452;8453;8454;8455;8456;8457;8458;8459;8460;8461;8462;8463;8464;8465;8466;8467 8465 13 ADIAVPLVFTK Unmodified 1172.6805 0.68051035 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 111.13 111.13 2 0.0055397 113414 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.261 70.306 1117500000 263460000 202790000 0 0 0 175620000 0 195660000 219790000 60192000 0 0 0 702 3889 656 6431;6432;6433;6434;6435;6436 8468;8469;8470;8471;8472;8473 8471 4 ADIDVSGPSVDTDAPDLDIEGPEGK Unmodified 2511.15 0.15003746 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 117.53 117.53 2 1.9659E-71 119831 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.07 161.03 60389000 0 0 0 0 0 0 0 60389000 0 0 0 0 0 703 2935 657 6437 8474 8474 1 ADIEVACYGYEGIDAVK Unmodified 1871.8611 0.86112984 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 1 108.89 108.89 2 0.011194 105636 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.042 51.136 18477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18477000 0 0 0 704 1883 658 6438 8475 8475 1 ADIFMFDEPSSYLDVK Unmodified 1875.8601 0.86006721 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.27 150.27 2 1.169E-06 155132 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.39 78.442 462580000 44636000 38442000 47486000 40442000 35993000 0 48905000 40834000 41033000 12037000 53098000 59674000 0 705 2718 659 6439;6440;6441;6442;6443;6444;6445;6446;6447;6448;6449 8476;8477;8478;8479;8480;8481;8482;8483;8484;8485;8486;8487;8488 8485 13 ADIFVDPVLHTACALDIK Unmodified 1997.0292 0.029198224 3765 Q92896 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 131.33 131.33 3 0.0014045 135730 QUIQUE_C1403_190116_001 53.278 46.387 87605000 0 0 30648000 29934000 0 0 0 0 0 0 27023000 0 0 706 3765 660 6450;6451;6452 8489;8490;8491 8490 3 ADIGTPSNFQHIGHVGWDPNTGFDLNNLDPELK Unmodified 3617.7175 0.71752415 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 139.68 139.68 4 8.4362E-09 144418 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.383 51.224 405810000 0 0 0 80958000 59167000 0 0 86027000 92013000 0 0 0 87642000 707 1401 661 6453;6454;6455;6456;6457 8492;8493;8494;8495;8496;8497 8495 6 ADIIHACDIVEDAAIAYGYNNIQMTLPK Unmodified 3118.5104 0.51035684 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 160.75 160.75 3 2.5619E-08 165114 QUIQUE_C1277_190116_001 59.011 47.045 64699000 0 64699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 708 4284 662 6458 8498 8498 1 ADIIHACDIVEDAAIAYGYNNIQMTLPK Oxidation (M) 3134.5053 0.50527146 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 1 0 1 156.69 156.69 3 0.0016698 161030 QUIQUE_C1277_190116_001 46.695 40.975 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 709 4284 662 6459 8499 8499 2900 1 ADIIVSELLGSFADNELSPECLDGAQHFLK Unmodified 3287.602 0.60200861 1440 O14744;H0YJD3 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 167.56 167.56 3 6.0394E-64 171051 QUIQUE_C1277_190116_001 147.41 141.69 368210000 74219000 166360000 0 56162000 0 71476000 0 0 0 0 0 0 0 710 1440 663 6460;6461;6462;6463 8500;8501;8502;8503 8501 4 ADIIYPGHGPVIHNAEAK Unmodified 1900.9795 0.97954591 3255 Q53H82 LACTB2 Beta-lactamase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 43.435 43.435 3 0.0098743 40209 QUIQUE_C1576_190116_001 31.836 18.208 81336000 0 0 0 35415000 0 0 23778000 22143000 0 0 0 0 0 711 3255 664 6464;6465;6466 8504;8505;8506 8505 2 ADILYFDGDDAISYR Unmodified 1732.7944 0.79443049 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 1 127.95 127.95 2 1.0409E-05 131734 QUIQUE_C1403_190116_001 102.66 77.808 296870000 57355000 43685000 76463000 33406000 0 28140000 0 0 0 0 0 28435000 29381000 712 2807 665 6467;6468;6469;6470;6471;6472;6473;6474;6475;6476;6477 8507;8508;8509;8510;8511;8512;8513;8514;8515;8516;8517 8512 8 ADIQLLVYTIDDLIDK Unmodified 1846.9928 0.99279594 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 173.04 173.04 2;3 2.368E-44 177429 QUIQUE_C1218_190116_001 182.02 144.84 1992300000 143330000 103760000 261060000 42724000 134110000 31886000 261560000 42275000 137120000 30357000 500280000 197330000 106510000 713 4297 666 6478;6479;6480;6481;6482;6483;6484;6485;6486;6487;6488;6489;6490;6491;6492;6493;6494 8518;8519;8520;8521;8522;8523;8524;8525;8526;8527;8528;8529;8530;8531;8532;8533;8534;8535 8519 18 ADIQMPFTCSVTYYGPSGQK Unmodified 2249.0133 0.013290163 3023 Q13740;F5GXJ9;H7C543 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 119.84 119.84 2 1.4435E-05 123703 QUIQUE_C1277_190116_001 96.247 83.887 208260000 0 52825000 0 27723000 38323000 0 46864000 0 0 0 42524000 0 0 714 3023 667 6495;6496;6497;6498;6499 8536;8537;8538;8539;8540 8536 5 ADISGNITK Unmodified 917.48181 0.48181054 4344 Q9NZD2;F5H0U5 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 21.931 21.931 2 0.053215 14898 QUIQUE_C1403_190116_001 49.85 20.474 100610000 0 0 0 100610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 715 4344 668 6500 8541 8541 1 ADIVHAFLSIPSLSHSVLSQTSFR Unmodified 2611.3758 0.37583591 3683 Q8TDC3;J3KNK0 BRSK1 Serine/threonine-protein kinase BRSK1 yes no 0 0 0 1 152.9 152.9 4 0.025079 157968 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.927 0 20183000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20183000 716 3683 669 6501 8542 8542 1 ADIVQQLLQQGASPNAATTSGYTPLHLSAR Unmodified 3107.6 0.5999752 2953 Q12955 ANK3 Ankyrin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 138.3 138.3 3 1.6885E-30 142926 QUIQUE_C1277_190116_001 95.741 84.43 151320000 0 43244000 0 0 47775000 0 0 0 0 0 0 0 60298000 717 2953 670 6502;6503;6504 8543;8544;8545 8543 3 ADIWALGCLLYK Unmodified 1421.7377 0.73770765 3212 Q2M2I8;E9PG46;K4DI97;Q9NSY1 AAK1;BMP2K AP2-associated protein kinase 1;BMP-2-inducible protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.23 152.23 2 0.00033334 159152 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.84 96.53 781160000 52243000 77082000 58107000 46628000 68231000 57038000 59074000 57746000 60166000 23044000 67900000 82647000 71252000 718 3212 671 6505;6506;6507;6508;6509;6510;6511;6512;6513;6514;6515;6516;6517 8546;8547;8548;8549;8550;8551;8552;8553;8554;8555;8556;8557;8558;8559;8560;8561 8558 16 ADIWSFGITAIELATGAAPYHK Unmodified 2331.1899 0.18993262 1746 O95747;C9JIG9 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes no 0 0 0 1 1 1 171.06 171.06 3 2.9667E-05 178285 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.366 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6525;6526;6527;6528;6529;6530;6531;6532;6533;6534;6535;6536 8569;8570;8571;8572;8573;8574;8575;8576;8577;8578;8579;8580 8576 12 ADKDYHFKVDNDENEHQLSLR Unmodified 2572.1942 0.19424273 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 0 2 1 1 46.447 46.447 5 0.0012662 44522 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.359 52.306 368420000 0 0 0 0 0 0 0 261220000 0 0 0 0 107200000 722 1907 675 6537;6538 8581;8582 8581 1 ADKEAAFDDAVEER Acetyl (Protein N-term) 1606.7111 0.71109479 2933 Q09028;E9PNS6;E9PNS2;E9PIC4 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.262 74.262 2 9.6657E-14 74571 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.47 132.26 1339300000 121990000 0 115910000 90208000 113120000 84392000 91130000 162280000 111650000 62504000 153640000 127530000 104960000 723 2933 676 6539;6540;6541;6542;6543;6544;6545;6546;6547;6548;6549;6550 8583;8584;8585;8586;8587;8588;8589;8590;8591;8592;8593;8594;8595;8596;8597;8598;8599 8593 16 ADKEAGGSDGPR Acetyl (Protein N-term) 1200.5371 0.53709359 1521 O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A yes yes 1 0 1 2 2 1 1 2 1 2 1 13.436 13.436 2 6.9535E-07 5384 QUIQUE_C1403_190116_001 145.99 131.32 278510000 0 20957000 0 9280300 8915500 0 0 107620000 50408000 24532000 0 37338000 19453000 724 1521 677 6551;6552;6553;6554;6555;6556;6557;6558;6559;6560;6561;6562 8600;8601;8602;8603;8604;8605;8606;8607;8608;8609;8610;8611 8602 8 ADKNEVAAEVAK Unmodified 1243.6408 0.64083038 2677 P56192;H0YIP0 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 16.725 16.725 2;3 0.00037182 9710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.44 75.652 550750000 41640000 49216000 39506000 152190000 0 0 37798000 0 129900000 0 0 39927000 60580000 725 2677 678 6563;6564;6565;6566;6567;6568;6569;6570;6571;6572;6573 8612;8613;8614;8615;8616;8617;8618;8619;8620;8621;8622 8618 7 ADLAAIYHER Unmodified 1157.5829 0.58292157 3409 Q6UWR7;D6R9P1 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 44.369 44.369 2;3 0.00029718 40965 QUIQUE_C1368_190116_001 115.71 86.553 2004500000 229800000 259230000 162340000 254900000 182820000 96423000 261060000 131750000 83743000 0 136320000 75730000 130390000 726 3409 679 6574;6575;6576;6577;6578;6579;6580;6581;6582;6583;6584;6585;6586;6587;6588;6589;6590;6591;6592;6593;6594;6595;6596;6597 8623;8624;8625;8626;8627;8628;8629;8630;8631;8632;8633;8634;8635;8636;8637;8638;8639;8640;8641;8642;8643;8644;8645;8646;8647;8648 8628 25 ADLAECNIK Acetyl (Protein N-term) 1074.5016 0.5015597 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 1 0 0 1 71.502 71.502 2 0.044734 67483 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.772 30.193 14573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14573000 0 0 0 727 2355 680 6598 8649 8649 1 ADLAEEYSK Unmodified 1024.4713 0.47130543 2793 P68036 UBE2L3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 31.549 31.549 2 0.0010111 26207 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.69 68.902 1343200000 0 319780000 0 0 308310000 0 0 0 211980000 0 245210000 0 257880000 728 2793 681 6599;6600;6601;6602;6603 8650;8651;8652;8653;8654 8654 4 ADLAEEYSKDR Unmodified 1295.5994 0.59935949 2793 P68036 UBE2L3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 29.342 29.342 2;3 0.00090894 24135 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.16 100.43 442680000 0 0 0 0 0 0 0 50015000 67783000 0 188120000 136760000 0 729 2793 682 6604;6605;6606;6607;6608;6609 8655;8656;8657;8658;8659;8660;8661;8662;8663 8657 9 ADLANEEKPAIAPPVFVFQK Acetyl (Protein N-term) 2225.1732 0.17321992 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7ENJ2;K7EID7;K7ENB9;K7EPW1 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 138.61 138.61 3 0.0013718 142674 QUIQUE_C1403_190116_001 60.034 55.683 175350000 20387000 0 0 38489000 0 0 0 37740000 0 11754000 32416000 0 34559000 730 665 683 6610;6611;6612;6613;6614;6615;6616 8664;8665;8666;8667;8668;8669;8670 8665 6 ADLATAPPHVTVVR Unmodified 1445.7991 0.79906235 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.658 49.658 2;3 0.0018242 47461 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.451 42.936 183500000 0 24349000 36609000 32049000 0 0 0 26830000 35340000 0 0 28324000 0 731 3576 684 6617;6618;6619;6620;6621;6622;6623 8671;8672;8673;8674;8675;8676;8677 8675 4 ADLDKLNIDSIIQR Acetyl (Protein N-term) 1654.889 0.88899957 1041 F8VYE8;P36873;F8VR82;A0A087WYY5 PPP1CC Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit yes no 1 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 139.06 139.06 2;3 1.0256E-21 142002 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.14 146.79 3888300000 24418000 328400000 446560000 326780000 358970000 258980000 310670000 288750000 338320000 88227000 463710000 289050000 365450000 732 1041 685 6624;6625;6626;6627;6628;6629;6630;6631;6632;6633;6634;6635;6636;6637;6638;6639;6640;6641;6642;6643;6644;6645;6646 8678;8679;8680;8681;8682;8683;8684;8685;8686;8687;8688;8689;8690;8691;8692;8693;8694;8695;8696;8697;8698;8699;8700;8701;8702;8703 8692 26 ADLDVSGPK Unmodified 900.45526 0.45526144 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 26.702 26.702 2 0.0089591 20795 QUIQUE_C1563_190116_001 77.318 0 1634000000 0 0 140060000 221770000 0 195880000 211880000 435060000 0 194240000 235150000 0 0 733 2935 686 6647;6648;6649;6650;6651;6652;6653;6654 8704;8705;8706;8707;8708;8709;8710;8711 8706 7 ADLEEQLSDEEK Acetyl (Protein N-term) 1446.6362 0.63619851 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7;F8WED3 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.59 107.59 2 0.00013087 104213 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.77 97.787 1407400000 136910000 167790000 171500000 172650000 125570000 0 146590000 0 115150000 87764000 75015000 99221000 109240000 734 2492 687 6655;6656;6657;6658;6659;6660;6661;6662;6663;6664;6665 8712;8713;8714;8715;8716;8717;8718;8719;8720;8721;8722;8723 8719 12 ADLEEQLSDEEKVR Acetyl (Protein N-term) 1701.8057 0.80572345 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 1 0 1 1 1 1 98.844 98.844 2 0.00064302 101569 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Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 1 0 3 2 2 2 3 1 2 2 2 1 1 3 3 171.47 171.47 2;3 2.0767E-53 172944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.58 145.64 4519700000 249620000 370410000 473860000 91982000 380940000 120150000 146120000 157800000 662630000 100860000 145100000 1130900000 489340000 + 738 776 690 6684;6685;6686;6687;6688;6689;6690;6691;6692;6693;6694;6695;6696;6697;6698;6699;6700;6701;6702;6703;6704;6705;6706;6707;6708;6709;6710 8744;8745;8746;8747;8748;8749;8750;8751;8752;8753;8754;8755;8756;8757;8758;8759;8760;8761;8762;8763;8764;8765;8766;8767;8768;8769;8770;8771 8760 466 20 ADLEMQIESLTEELAYLKK Oxidation (M) 2239.1294 0.12936578 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 160.41 160.41 3 1.3688E-11 162658 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.6 114.72 1739100000 54909000 0 48378000 0 0 0 76691000 368160000 0 0 323940000 867010000 0 + 739 776 691 6711;6712;6713;6714;6715;6716 8772;8773;8774;8775;8776;8777 8775 466 5 ADLEMQIESLTEELAYLKK Unmodified 2223.1345 0.13445116 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 159.2 159.2 3 7.3494E-29 166246 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.4 110.21 1306800000 0 0 0 0 0 0 0 89127000 163890000 0 494510000 259970000 299360000 + 740 776 691 6717;6718;6719;6720;6721 8778;8779;8780;8781;8782;8783;8784 8781 7 ADLESESFRPNLSDPSELLLPDQIEK Unmodified 2941.4557 0.45566195 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.99 137.99 3 4.8507E-51 143809 QUIQUE_C1218_190116_001 146.91 124.78 1562000000 255460000 221080000 0 0 281300000 249750000 0 0 0 0 319760000 234660000 0 741 3597 692 6722;6723;6724;6725;6726;6727 8785;8786;8787;8788;8789;8790 8785 3 ADLGALELWR Unmodified 1142.6084 0.60840804 3957 Q99523 SORT1 Sortilin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.16 125.16 2 0.00062564 128228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.86 82.358 304130000 31382000 34019000 26657000 26406000 30086000 0 34362000 22710000 34489000 0 38367000 0 25652000 742 3957 693 6728;6729;6730;6731;6732;6733;6734;6735;6736;6737;6738 8791;8792;8793;8794;8795;8796;8797;8798;8799;8800;8801;8802 8799 11 ADLIAYLK Unmodified 905.52222 0.52221879 722 C9JFR7;P99999 CYCS Cytochrome c yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.652 93.652 1;2 0.011743 96618 QUIQUE_C1576_190116_001 89.55 33.874 9157500000 1061100000 859010000 758980000 588010000 643480000 591640000 796060000 489410000 704060000 196600000 990000000 700090000 779080000 743 722 694 6739;6740;6741;6742;6743;6744;6745;6746;6747;6748;6749;6750;6751;6752 8803;8804;8805;8806;8807;8808;8809;8810;8811;8812;8813;8814;8815;8816;8817;8818;8819;8820;8821;8822;8823;8824;8825;8826;8827 8815 24 ADLIAYLKK Unmodified 1033.6172 0.61718181 722 C9JFR7;P99999 CYCS Cytochrome c yes no 0 0 1 1 1 66.75 66.75 2 0.02367 66548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.351 42.165 275230000 0 0 0 0 0 0 0 140100000 0 0 135130000 0 0 744 722 695 6753;6754 8828;8829 8828 2 ADLILSYHPPIFR Unmodified 1540.8402 0.84019889 4106 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8831;8832;8833;8834;8835;8836;8837;8838;8839;8840;8841;8842;8843;8844;8845;8846;8847;8848;8849;8850;8851;8852;8853;8854;8855;8856;8857;8858;8859;8860;8861;8862;8863;8864;8865;8866;8867;8868 8840 31 ADLLGIVSELQLK Unmodified 1397.813 0.81298108 3825 Q96CV9;A0A087WY28 OPTN Optineurin yes no 0 0 0 1 155.55 155.55 2 0.061692 150470 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.221 60.392 28408000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28408000 0 0 0 747 3825 698 6777 8869 8869 0 ADLLLSTQPGR Unmodified 1169.6404 0.64043645 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5GZI0 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.541 62.541 2 0.00048719 63023 QUIQUE_C1218_190116_001 113.62 54.272 1555400000 240430000 198550000 131150000 177100000 122900000 123220000 154170000 0 60191000 121060000 101650000 72501000 52454000 748 997 699 6778;6779;6780;6781;6782;6783;6784;6785;6786;6787;6788;6789 8870;8871;8872;8873;8874;8875;8876;8877;8878;8879;8880;8881;8882;8883 8870 10 ADLLLSTQPGREEGSPLELER Unmodified 2309.1863 0.18630381 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762 2337 712 6867;6868;6869;6870;6871;6872;6873;6874;6875;6876;6877;6878;6879;6880;6881;6882;6883;6884;6885;6886;6887;6888;6889;6890;6891;6892 8972;8973;8974;8975;8976;8977;8978;8979;8980;8981;8982;8983;8984;8985;8986;8987;8988;8989;8990;8991;8992;8993;8994;8995;8996;8997;8998;8999;9000;9001;9002;9003;9004;9005;9006;9007;9008;9009;9010;9011;9012;9013;9014;9015;9016 9010 45 ADLTSVLTSVMFSPSSK Acetyl (Protein N-term) 1810.9023 0.90226638 1292 J3KTC1 MSI2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 175.55 175.55 2 1.3708E-05 179674 QUIQUE_C1218_190116_001 129.37 112.16 39679000 6612600 6809500 4356900 3733100 6685000 0 0 5993100 0 0 0 0 5488600 763 1292 713 6893;6894;6895;6896;6897;6898;6899 9017;9018;9019;9020;9021;9022;9023;9024 9017 8 ADMETLQR Unmodified 962.44913 0.4491302 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 26.66 26.66 2 0.030979 21334 QUIQUE_C1218_190116_001 133.81 94.15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 764 2253 714 6900;6901;6902;6903;6904;6905 9025;9026;9027;9028;9029;9030 9025 6 ADMGGAATICSAIVSAAK Unmodified 1692.8175 0.81749089 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.82 111.82 2 5.3778E-07 115479 QUIQUE_C1403_190116_001 126.63 106.5 1444300000 98698000 111290000 227250000 222960000 128110000 0 85459000 181090000 117800000 0 0 116830000 154830000 765 2282 715 6906;6907;6908;6909;6910;6911;6912;6913;6914;6915;6916 9031;9032;9033;9034;9035;9036;9037;9038;9039;9040;9041;9042;9043;9044;9045 9037 14 ADMGGAATICSAIVSAAK Oxidation (M) 1708.8124 0.81240551 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 96.865 96.865 2 0.00037309 99553 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.888 65.089 416200000 0 0 0 0 0 0 0 96266000 90945000 0 120840000 0 108150000 766 2282 715 6917;6918;6919;6920;6921;6922 9046;9047;9048;9049;9050;9051 9048 1663 6 ADMQNLVER Acetyl (Protein N-term) 1116.5234 0.52335778 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0S3;Q5T0R8;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 93.157 93.157 1;2 0.0045683 95550 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.5 130.91 1376200000 63405000 133850000 78555000 107470000 93049000 82582000 79531000 101260000 104440000 0 261310000 107450000 163270000 767 2857;3307 716 6923;6924;6925;6926;6927;6928;6929;6930;6931;6932;6933;6934;6935;6936 9052;9053;9054;9055;9056;9057;9058;9059;9060;9061;9062;9063;9064;9065;9066 9066 12 ADMQNLVER Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1132.5183 0.5182724 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0S3;Q5T0R8;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 1 1 0 1 51.609 51.609 2 0.037368 49637 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.075 26.413 36690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36690000 0 768 2857;3307 716 6937 9067 9067 1 ADMVIEAVFEDLSLK Oxidation (M) 1694.8437 0.84368886 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 160.94 160.94 2;3 9.933E-09 168052 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.54 108.52 2094600000 99439000 125760000 287980000 116830000 134640000 251790000 129440000 146880000 121830000 129950000 176050000 258450000 115610000 769 1153 717 6938;6939;6940;6941;6942;6943;6944;6945;6946;6947;6948;6949;6950;6951;6952;6953;6954;6955;6956;6957;6958;6959;6960;6961;6962;6963;6964 9068;9069;9070;9071;9072;9073;9074;9075;9076;9077;9078;9079;9080;9081;9082;9083;9084;9085;9086;9087;9088;9089;9090;9091;9092;9093;9094;9095;9096;9097;9098 9091 667 30 ADMVIEAVFEDLSLK Unmodified 1678.8488 0.84877424 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 168.16 168.16 2;3 2.6464E-06 169959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.41 95.364 3793100000 282070000 413030000 686430000 191410000 276690000 318240000 390480000 300420000 144440000 83935000 145310000 155290000 405390000 770 1153 717 6965;6966;6967;6968;6969;6970;6971;6972;6973;6974;6975;6976;6977;6978;6979;6980;6981;6982;6983;6984;6985;6986;6987 9099;9100;9101;9102;9103;9104;9105;9106;9107;9108;9109;9110;9111;9112;9113;9114;9115;9116;9117;9118;9119;9120;9121 9113 22 ADMWSFGITAIELATGAAPYHK Unmodified 2349.1464 0.14635325 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 169.46 169.46 2;3 1.942E-08 176707 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.826 54.022 862970000 78310000 0 107030000 59912000 102370000 0 133400000 0 0 12625000 369330000 0 0 771 4417 718 6988;6989;6990;6991;6992;6993;6994;6995 9122;9123;9124;9125;9126;9127;9128;9129 9129 8 ADMWSFGITAIELATGAAPYHK Oxidation (M) 2365.1413 0.14126787 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 1 0 1 1 1 156.22 156.22 3 0.0010595 160522 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N-term) 1807.8224 0.82243615 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 1 0 0 1 1 1 61.474 61.474 2 0.00014981 60969 QUIQUE_C1218_190116_001 79.646 72.986 78287000 26856000 0 0 21291000 0 0 30140000 0 0 0 0 0 0 775 1894 721 7013;7014;7015 9159;9160;9161 9159 3 ADPALLNNHSNLKPAPTVPSSPDATPEPK Unmodified 2977.5145 0.51451424 3567 Q8N111 CEND1 Cell cycle exit and neuronal differentiation protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 65.359 65.359 3;4 0.00020945 64559 QUIQUE_C1403_190116_001 44.726 38.362 292570000 74524000 67575000 0 35623000 0 0 61524000 0 53323000 0 0 0 0 776 3567 722 7016;7017;7018;7019;7020 9162;9163;9164;9165;9166;9167 9164 6 ADPDNLQALHTLHLR Unmodified 1712.8958 0.89581629 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 72.041 72.041 3;4 2.7683E-05 73533 QUIQUE_C1218_190116_001 89.541 74.544 1241100000 128910000 0 132260000 116010000 102680000 101660000 130450000 0 158190000 45989000 123260000 86705000 114970000 777 877 723 7021;7022;7023;7024;7025;7026;7027;7028;7029;7030;7031;7032;7033;7034;7035;7036;7037;7038;7039;7040;7041;7042;7043 9168;9169;9170;9171;9172;9173;9174;9175;9176;9177;9178;9179;9180;9181;9182;9183;9184;9185;9186;9187;9188;9189;9190;9191;9192 9170 25 ADPEAAWEPTEAEAR Unmodified 1641.7271 0.7270792 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.558 72.558 2 9.1453E-13 72613 QUIQUE_C1368_190116_001 134.99 115.25 1016300000 104080000 86088000 87549000 83731000 80984000 78660000 99770000 51551000 71961000 26405000 78068000 73405000 94045000 778 4408 724 7044;7045;7046;7047;7048;7049;7050;7051;7052;7053;7054;7055;7056 9193;9194;9195;9196;9197;9198;9199;9200;9201;9202;9203;9204;9205;9206 9195 11 ADPEELFTKLEK Unmodified 1418.7293 0.72931103 622 B4DR80;Q9Y6E0 STK24 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit yes no 0 0 1 1 92.678 92.678 3 0.06058 93715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.998 24.813 18601000 0 0 0 0 0 0 0 18601000 0 0 0 0 0 779 622 725 7057 9207 9207 1 ADPIVGSLEPGIYAGYFDWK Unmodified 2197.0732 0.073171528 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 1 158.9 158.9 2 0.0011887 165216 QUIQUE_C1576_190116_001 94.09 79.832 21353000 0 21353000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 780 3896 726 7058;7059 9208;9209 9209 2 ADPQDALR Unmodified 884.43519 0.4351947 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 25.495 25.495 2 0.035224 19716 QUIQUE_C1218_190116_001 63.565 40.546 130190000 50967000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79227000 0 0 781 3750 727 7060;7061;7062 9210;9211;9212 9210 3 ADPQEAINCLMR Unmodified 1416.649 0.648969 2651 P54920;M0R2M1;M0R058;M0R0I4 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 97.993 97.993 2 0.00037783 100206 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.4 100.63 711130000 59198000 71548000 75204000 73331000 0 69563000 68228000 61663000 56258000 29126000 65338000 0 81670000 782 2651 728 7063;7064;7065;7066;7067;7068;7069;7070;7071;7072;7073;7074;7075;7076 9213;9214;9215;9216;9217;9218;9219;9220;9221;9222;9223;9224;9225;9226;9227;9228;9229;9230 9230 17 ADPQEAINCLNAAIDIYTDMGR Oxidation (M) 2466.1155 0.1155234 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 161.13 161.13 2 5.4113E-20 166487 QUIQUE_C1218_190116_001 124.92 106.33 54869000 19772000 0 13395000 0 0 0 0 0 0 0 0 21702000 0 783 4128 729 7077;7078;7079;7080 9231;9232;9233;9234 9231 2868 4 ADPQEAINCLNAAIDIYTDMGR Unmodified 2450.1206 0.12060878 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 167.56 167.56 2;3 6.0362E-77 174780 QUIQUE_DMIX5_190116_001 209.67 196.54 1987600000 167560000 207820000 137250000 78089000 117510000 65517000 201320000 102480000 223810000 13530000 290070000 187820000 194860000 784 4128 729 7081;7082;7083;7084;7085;7086;7087;7088;7089;7090;7091;7092;7093;7094;7095;7096;7097;7098;7099;7100;7101;7102;7103;7104;7105 9235;9236;9237;9238;9239;9240;9241;9242;9243;9244;9245;9246;9247;9248;9249;9250;9251;9252;9253;9254;9255;9256;9257;9258;9259;9260;9261;9262;9263;9264 9259 29 ADPSILQNLR Unmodified 1125.6142 0.6142217 1059 F8W9X7;Q567U6 CCDC93 Coiled-coil domain-containing protein 93 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.67 134.67 2 0.023106 137380 QUIQUE_C1563_190116_001 57.281 24.44 3155700000 139340000 144340000 235080000 344310000 202480000 280480000 250210000 182450000 321610000 170290000 286110000 237380000 361580000 785 1059 730 7106;7107;7108;7109;7110;7111;7112;7113;7114;7115;7116;7117;7118 9265;9266;9267;9268;9269;9270;9271;9272;9273;9274;9275;9276;9277;9278;9279;9280;9281;9282 9272 18 ADPSIVQALSLYDGLV Unmodified 1659.872 0.87195253 2741 P62166 NCS1 Neuronal calcium sensor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 173.48 173.48 2 0.00051373 177544 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.4 83.157 228950000 47941000 0 15910000 0 0 0 41807000 28638000 36427000 0 58225000 0 0 786 2741 731 7119;7120;7121;7122;7123;7124 9283;9284;9285;9286;9287;9288 9287 6 ADPSLNPEQLK Unmodified 1210.6194 0.61936665 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 53 53 2 0.003944 50767 QUIQUE_C1368_190116_001 72.638 52.497 292030000 0 0 81947000 0 0 0 62567000 57100000 0 0 45744000 0 44668000 787 4510 732 7125;7126;7127;7128;7129 9289;9290;9291;9292;9293;9294 9289 6 ADPSQFELLK Unmodified 1146.5921 0.59208927 982;2594 F2Z2J1;Q15349;D6RE03;D6RA62;B1AXG2;A0A2R8YGB7;P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17 RPS6KA2;RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2;Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.194 86.194 2 0.0076369 87385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.879 32.878 456160000 0 51292000 47934000 0 62096000 50274000 0 47653000 61992000 24147000 47999000 62773000 0 788 982;2594 733 7130;7131;7132;7133;7134;7135;7136;7137;7138 9295;9296;9297;9298;9299;9300;9301;9302;9303;9304;9305 9300 11 ADPVAGIAGSAAK Acetyl (Protein N-term) 1168.6088 0.60880197 513 A0A5E8;Q99501;C9JFI0;C9JRR6 GAS2L1 GAS2-like protein 1 yes no 1 0 0 1 83.697 83.697 2 0.040528 84227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.383 28.555 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 789 513 734 7139 9306 9306 1 ADPWQECMDYAVTLAR Acetyl (Protein N-term) 1966.8553 0.85533296 2286 P29218;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RG13;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 163.78 163.78 2;3 3.8654E-25 170956 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.8 147.11 980000000 70993000 61923000 82262000 35268000 84725000 48148000 64249000 117720000 110310000 11646000 133750000 80056000 78964000 790 2286 735 7140;7141;7142;7143;7144;7145;7146;7147;7148;7149;7150;7151;7152;7153;7154;7155 9307;9308;9309;9310;9311;9312;9313;9314;9315;9316;9317;9318;9319;9320;9321;9322;9323;9324;9325;9326 9322 20 ADQCYEDVR Unmodified 1154.4662 0.46623683 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0;H3BNA2;H3BU76;H3BSL1 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.187 24.187 2 0.00040478 16956 QUIQUE_C1368_190116_001 122.13 104.84 3358600000 316770000 300630000 548530000 343520000 292050000 251120000 298680000 129540000 121240000 68440000 209890000 278750000 199440000 791 2327 736 7156;7157;7158;7159;7160;7161;7162;7163;7164;7165;7166;7167;7168 9327;9328;9329;9330;9331;9332;9333;9334;9335;9336;9337;9338;9339 9329 13 ADQELLLYSHDNIICGITSVAFSK Unmodified 2693.3371 0.33706714 4207 Q9HAV0 GNB4 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 151.3 151.3 2;3 8.8548E-64 154464 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.14 138.19 2580800000 0 245290000 0 157410000 0 0 264400000 267240000 430950000 125950000 343750000 367310000 378510000 792 4207 737 7169;7170;7171;7172;7173;7174;7175;7176;7177;7178;7179 9340;9341;9342;9343;9344;9345;9346;9347;9348;9349;9350;9351;9352;9353 9345 13 ADQELLMYSHDNIICGITSVAFSR Oxidation (M) 2755.2946 0.2945504 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 145.87 145.87 2;3 8.195E-63 150346 QUIQUE_C1277_190116_001 162.65 151.39 2987400000 152650000 300530000 343710000 420490000 257000000 283780000 0 199260000 277840000 0 251420000 246510000 254190000 793 2769 738 7180;7181;7182;7183;7184;7185;7186;7187;7188;7189;7190;7191;7192;7193 9354;9355;9356;9357;9358;9359;9360;9361;9362;9363;9364;9365;9366;9367;9368;9369 9357 2200 15 ADQELLMYSHDNIICGITSVAFSR Unmodified 2739.2996 0.29963578 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 0 0 2 3 3 2 2 2 4 2 4 2 10 6 3 157.37 157.37 2;3;4 2.0522E-201 156525 QUIQUE_C1368_190116_001 248.76 231.54 12870000000 511300000 1112500000 1101400000 726970000 930170000 691410000 1128500000 1127900000 1085200000 266030000 1443900000 1557200000 1187700000 794 2769 738 7194;7195;7196;7197;7198;7199;7200;7201;7202;7203;7204;7205;7206;7207;7208;7209;7210;7211;7212;7213;7214;7215;7216;7217;7218;7219;7220;7221;7222;7223;7224;7225;7226;7227;7228;7229;7230;7231;7232;7233;7234;7235;7236;7237;7238 9370;9371;9372;9373;9374;9375;9376;9377;9378;9379;9380;9381;9382;9383;9384;9385;9386;9387;9388;9389;9390;9391;9392;9393;9394;9395;9396;9397;9398;9399;9400;9401;9402;9403;9404;9405;9406;9407;9408;9409;9410;9411;9412;9413;9414;9415;9416;9417;9418;9419;9420;9421;9422;9423;9424;9425;9426;9427;9428;9429;9430;9431;9432 9378 62 ADQELMTYSHDNIICGITSVSFSK Unmodified 2715.252 0.25201688 2767;602 P62873;B3KVK2 GNB1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 no no 0 0 0 3 5 2 2 3 3 4 3 2 2 5 4 4 137 137 2;3 1.7104E-201 138388 QUIQUE_DMIX5_190116_001 267.69 248.37 16057000000 1298400000 1610300000 1430700000 1093600000 943790000 1204400000 1683800000 1141500000 1120400000 388160000 1255500000 1334200000 1552600000 795 2767;602 739 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9533;9534;9535;9536;9537;9538;9539;9540;9541;9542;9543;9544;9545;9546 9543 14 ADQLADESLESTRR Unmodified 1589.7645 0.76452734 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 34.796 34.796 2;3 5.6107E-05 30992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.944 65.885 1214400000 78368000 88724000 97882000 129060000 88922000 91937000 158500000 55980000 50323000 23488000 146800000 57070000 147390000 799 2699 742 7308;7309;7310;7311;7312;7313;7314;7315;7316;7317;7318;7319;7320;7321;7322;7323;7324;7325 9547;9548;9549;9550;9551;9552;9553;9554;9555;9556;9557;9558;9559;9560;9561;9562;9563;9564;9565;9566;9567;9568;9569;9570;9571;9572;9573 9564 27 ADQLCQQELR Unmodified 1259.5928 0.59283433 2435 P41219 PRPH Peripherin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.175 33.175 2 6.7259E-14 28894 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.65 137.72 628260000 0 21116000 131450000 33289000 0 65272000 55187000 79218000 33334000 46379000 108580000 0 54430000 800 2435 743 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9631;9632;9633;9634;9635 9631 5 ADRDESSPYAAMLAAQDVAQR Unmodified 2264.0492 0.049158397 451 A0A2R8Y811;P62263;E5RH77 RPS14 40S ribosomal protein S14 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.5 97.5 3 9.2686E-14 100389 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.201 85.7 410970000 33757000 40061000 54698000 68077000 0 0 0 0 55351000 0 37488000 66518000 55017000 806 451 749 7363;7364;7365;7366;7367;7368;7369;7370 9636;9637;9638;9639;9640;9641;9642;9643 9640 6 ADRDQYELLCLDNTR Unmodified 1880.8687 0.86867484 1838 P02787;C9JVG0 TF Serotransferrin yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 82.774 82.774 2;3 1.0707E-128 85244 QUIQUE_C1438_190116_001 274.09 252.54 1850000000 0 232300000 161620000 283270000 855480000 0 0 31813000 0 50225000 0 117180000 118140000 807 1838 750 7371;7372;7373;7374;7375;7376;7377;7378;7379;7380 9644;9645;9646;9647;9648;9649;9650;9651;9652;9653;9654 9649 10 ADRPSSLPLDFNDEFSDLDGVVQQR Unmodified 2819.3362 0.33621552 906 E9PD09;Q96HH9;D6REP5;B7Z4W8 GRAMD3 GRAM domain-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 141.96 141.96 3 3.1659E-05 145856 QUIQUE_C1403_190116_001 53.865 47.305 63107000 0 0 0 63107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 808 906 751 7381 9655 9655 1 ADSEASSGPLLDDK Unmodified 1403.6416 0.64161824 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 40.668 40.668 2 0.0013907 37298 QUIQUE_C1218_190116_001 75.788 60.637 76687000 35148000 0 0 0 0 0 0 0 0 14922000 26617000 0 0 809 1520 752 7382;7383;7384;7385;7386 9656;9657;9658;9659;9660;9661 9656 6 ADSELQLVEQR Acetyl (Protein N-term) 1328.6572 0.65720872 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQF1;H3BSW3 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.76 107.76 2 1.0468E-46 104733 QUIQUE_DMIX4_190116_001 210.27 134.21 1267900000 93013000 104810000 0 0 111560000 103040000 111230000 142580000 136160000 78835000 132350000 102080000 152260000 810 1928 753 7387;7388;7389;7390;7391;7392;7393;7394;7395;7396;7397 9662;9663;9664;9665;9666;9667;9668;9669;9670;9671;9672;9673;9674;9675;9676;9677 9671 16 ADSLLAVVK Unmodified 914.54368 0.54368251 3138;3045 Q15424;Q14151 SAFB;SAFB2 Scaffold attachment factor B1;Scaffold attachment factor B2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.497 68.497 2 0.00098961 68281 QUIQUE_C1368_190116_001 107.9 79.789 562350000 0 57296000 50173000 60056000 57826000 40897000 24200000 61454000 51567000 0 58671000 43675000 56532000 811 3138;3045 754 7398;7399;7400;7401;7402;7403;7404;7405;7406;7407;7408 9678;9679;9680;9681;9682;9683;9684;9685;9686;9687;9688;9689 9679 11 ADSPSIDYAELLQHFEK Unmodified 1961.9371 0.93707198 2930 Q08AM6 VAC14 Protein VAC14 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 133.98 133.98 3 8.9331E-07 139536 QUIQUE_C1218_190116_001 102.78 93.522 213540000 40676000 66471000 0 0 0 0 0 47448000 28158000 30783000 0 0 0 812 2930 755 7409;7410;7411;7412;7413 9690;9691;9692;9693;9694;9695 9690 5 ADSQAQLLLSTVVGVFTAPGLHLK Unmodified 2464.369 0.36895962 1801 P01019 AGT Angiotensinogen;Angiotensin-1;Angiotensin-2;Angiotensin-3;Angiotensin-4;Angiotensin 1-9;Angiotensin 1-7;Angiotensin 1-5;Angiotensin 1-4 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 3 1 1 1 2 1 1 1 2 169.16 169.16 2;3;4 1.2887E-63 173456 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.33 116.99 3411000000 188970000 338430000 510060000 177780000 548550000 180000000 237920000 135140000 273670000 32407000 394340000 141650000 252080000 813 1801 756 7414;7415;7416;7417;7418;7419;7420;7421;7422;7423;7424;7425;7426;7427;7428;7429;7430;7431;7432 9696;9697;9698;9699;9700;9701;9702;9703;9704;9705;9706;9707;9708;9709;9710;9711;9712;9713;9714 9708 19 ADSRDPASDQMQHWK Acetyl (Protein N-term) 1812.7849 0.78494521 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 1 0 1 1 50.006 50.006 3 0.019062 47312 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.265 45.624 28394000 0 0 0 0 0 0 0 28394000 0 0 0 0 0 814 1849 757 7433 9715 9715 1 ADSWVEKEEPAPSN Unmodified 1557.6947 0.69471644 3571 Q8N163;H0YB24 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 51.171 51.171 2 0.00073681 48929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.63 128.28 164920000 0 58822000 0 0 0 0 0 51208000 54892000 0 0 0 0 815 3571 758 7434;7435;7436 9716;9717;9718 9718 3 ADTATTASAAAASAASASSDAPPFQLGKPR Acetyl (Protein N-term) 2830.3733 0.37332931 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;C9JIV5;F8WBH6 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 119.96 119.96 3 7.4389E-64 126104 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.16 118.22 656060000 63022000 0 93654000 0 0 63452000 0 0 96257000 0 112300000 112030000 115350000 816 3679 759 7437;7438;7439;7440;7441;7442;7443;7444 9719;9720;9721;9722;9723;9724;9725;9726;9727;9728 9725 10 ADTIDTIEK Unmodified 1004.5026 0.50260556 4605 Q9Y4E8;F8W0H4;H0YI31;F8VZG8;F8VVY7 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 0 1 33.17 33.17 2 0.038377 26849 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.965 29.022 59503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59503000 0 0 0 817 4605 760 7445 9729 9729 1 ADTLDPALLRPGR Unmodified 1393.7678 0.76776222 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.416 66.416 2;3 8.2852E-07 64761 QUIQUE_C1563_190116_001 105.65 89.893 1186400000 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Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4 SEPT7 Septin-7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.156 54.156 2 2.1757E-13 52705 QUIQUE_C1218_190116_001 157.66 103.06 18113000000 1902300000 1827000000 2341200000 1819400000 1367200000 1695100000 1905700000 407980000 787500000 730600000 1281700000 805410000 1242100000 823 3171 766 7491;7492;7493;7494;7495;7496;7497;7498;7499;7500;7501;7502;7503 9790;9791;9792;9793;9794;9795;9796;9797;9798;9799;9800;9801;9802;9803;9804;9805;9806;9807;9808 9790 19 ADTLTPEECQQFKK Unmodified 1693.7981 0.79813565 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4 SEPT7 Septin-7 no no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 35.335 35.335 2;3 3.0543E-22 31320 QUIQUE_DMIX1_190116_001 182.64 167.05 10135000000 48669000 436760000 425780000 99454000 718660000 62715000 688960000 1579700000 1444000000 124180000 1505000000 1346200000 1654700000 824 3171 767 7504;7505;7506;7507;7508;7509;7510;7511;7512;7513;7514;7515;7516;7517;7518;7519;7520;7521;7522;7523;7524;7525;7526 9809;9810;9811;9812;9813;9814;9815;9816;9817;9818;9819;9820;9821;9822;9823;9824;9825;9826;9827;9828;9829;9830;9831;9832;9833;9834;9835;9836;9837;9838 9822 27 ADTMTLEEK Unmodified 1036.4747 0.47467625 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.458 27.458 2 0.00052236 21476 QUIQUE_C1368_190116_001 112.41 66.459 1517100000 202080000 177400000 183360000 147080000 125400000 0 189010000 0 0 0 167570000 147720000 177480000 825 419 768 7527;7528;7529;7530;7531;7532;7533;7534;7535 9839;9840;9841;9842;9843;9844;9845;9846;9847;9848 9841 5 ADTQTYQPYNK Unmodified 1327.6044 0.60444487 2829 P84090 ERH Enhancer of rudimentary homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.382 24.382 2 1.0891E-83 17885 QUIQUE_C1277_190116_001 234.26 206.35 902070000 155900000 126110000 237520000 54771000 0 0 86623000 57332000 95491000 30868000 0 0 57450000 826 2829 769 7536;7537;7538;7539;7540;7541;7542;7543;7544 9849;9850;9851;9852;9853;9854;9855;9856;9857;9858 9850 10 ADTQTYQPYNKDWIK Unmodified 1869.8897 0.88972785 2829 P84090 ERH Enhancer of rudimentary homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 64.745 64.745 2 6.255E-12 64474 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.18 101.77 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 827 2829 770 7545;7546;7547 9859;9860;9861 9859 3 ADTQYILPNDIGVSSLDCR Acetyl (Protein N-term) 2178.0263 0.02629769 4330 Q9NY33;E9PKK8;E9PPK9;E9PQF2 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 150.21 150.21 2;3 2.0047E-29 155374 QUIQUE_C1368_190116_001 139.86 120.12 86788000 0 0 0 17957000 24004000 17738000 27088000 0 0 0 0 0 0 828 4330 771 7548;7549;7550;7551;7552;7553;7554;7555 9862;9863;9864;9865;9866;9867;9868;9869 9862 8 ADVAVESLIPGLEPPVPQR Unmodified 1986.0786 0.078591257 3212 Q2M2I8 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 139.44 139.44 2 0.0039531 144512 QUIQUE_C1218_190116_001 105.65 91.689 29989000 14927000 0 0 15062000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 829 3212 772 7556;7557 9870;9871 9870 1 ADVDISGPK Unmodified 900.45526 0.45526144 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.812 25.812 2 0.01368 19640 QUIQUE_C1277_190116_001 69.598 1.701 1155900000 168080000 195790000 157870000 0 0 333420000 0 0 0 0 0 0 300710000 830 2935 773 7558;7559;7560;7561;7562 9872;9873;9874;9875;9876 9873 4 ADVDVSGPK Unmodified 886.43961 0.43961137 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 19.167 19.167 2 0.0089591 12140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.318 45.363 458530000 0 0 0 0 0 65573000 0 241190000 45211000 46422000 0 60135000 0 831 2935 774 7563;7564;7565;7566;7567 9877;9878;9879;9880;9881;9882 9878 6 ADVFHAYLSLLK Unmodified 1375.75 0.7499869 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 135.83 135.83 2;3 1.8812E-09 139768 QUIQUE_C1403_190116_001 175.15 138.46 5714100000 459790000 430310000 384570000 346440000 448240000 298730000 443690000 451150000 593660000 144550000 546400000 604030000 562490000 832 3499 775 7568;7569;7570;7571;7572;7573;7574;7575;7576;7577;7578;7579;7580;7581;7582;7583;7584;7585;7586;7587;7588;7589;7590;7591;7592;7593 9883;9884;9885;9886;9887;9888;9889;9890;9891;9892;9893;9894;9895;9896;9897;9898;9899;9900;9901;9902;9903;9904;9905;9906;9907;9908;9909;9910;9911;9912;9913;9914;9915;9916;9917;9918 9894 36 ADVFPGNDSTASQDVANR Acetyl (Protein N-term) 1904.85 0.85004788 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.158 97.158 2;3 2.682E-45 99631 QUIQUE_C1277_190116_001 168.76 146.56 2361500000 152200000 172710000 150620000 224830000 178860000 190640000 177540000 181790000 197260000 86136000 229230000 231580000 188130000 833 2121 776 7594;7595;7596;7597;7598;7599;7600;7601;7602;7603;7604;7605;7606;7607 9919;9920;9921;9922;9923;9924;9925;9926;9927;9928;9929;9930;9931;9932 9920 13 ADVIQATGDAICIFR Unmodified 1648.8243 0.82429083 2927 Q08945;E9PMD4 SSRP1 FACT complex subunit SSRP1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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9962;9963;9964;9965;9966;9967;9968;9969;9970;9971;9972;9973;9974;9975;9976;9977 9963 16 ADVQMEFIQGPKEESK Unmodified 1834.8771 0.87711426 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 64.466 64.466 2;3 4.7192E-12 64625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.06 102 42053000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42053000 0 0 840 2009 783 7647;7648 9978;9979 9978 2 ADVQSIIGLQR Unmodified 1198.667 0.66698555 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.018 86.018 2 0.00017468 88810 QUIQUE_C1218_190116_001 126.31 66.294 1158600000 177820000 125130000 153780000 136790000 120610000 131870000 0 0 56908000 41011000 88789000 62825000 63078000 841 2983 784 7649;7650;7651;7652;7653;7654;7655;7656;7657;7658;7659 9980;9981;9982;9983;9984;9985;9986;9987;9988;9989;9990;9991;9992;9993 9981 12 ADVVESWIGEK Unmodified 1231.6085 0.60846762 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 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10018;10019;10020;10021;10022;10023;10024;10025;10026;10027;10028;10029;10030;10031;10032;10033;10034;10035;10036 10022 19 ADVVESWIGEKENSLKTDDYGR Unmodified 2510.1925 0.1925114 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 100.44 100.44 3 4.6308E-46 102024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.73 145.86 84757000 0 0 0 0 0 0 0 84757000 0 0 0 0 0 844 267;275;3025 787 7687 10037;10038 10038 2 ADVVVSGPK Unmodified 870.48108 0.48108226 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 20.832 20.832 2 0.05836 13670 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.423 30.866 40975000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40975000 0 0 0 845 2935 788 7688 10039 10039 1 ADYEIASK Unmodified 895.42871 0.42871234 4580;569 A8MYV2;Q9NQ29;B8ZZ12;Q9Y383;A0A0A6YYJ8 LUC7L;LUC7L2 Putative RNA-binding protein Luc7-like 1;Putative RNA-binding protein Luc7-like 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 22.977 22.977 2 0.022129 16593 QUIQUE_C1218_190116_001 74.486 51.338 221160000 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A0A2R8Y765;J3QKS7;A0A2R8Y7U4;A0A2U3TZQ7;A0A2R8Y7I9;A0A2R8Y4T4;A0A2R8Y855;B4DGM3;Q969G3;A0A2R8YES3;J3QR61;J3KT85;A0A2R8YD78 SMARCE1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 yes no 0 0 0 1 20.061 20.061 2 0.017757 12668 QUIQUE_C1277_190116_001 61.56 22.768 40380000 0 40380000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 849 423 792 7705 10057 10057 1 AEAALLLLPEAAAER Acetyl (Protein N-term) 1578.8617 0.86172219 3886 Q96JB2 COG3 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 169.09 169.09 2 9.4292E-08 173033 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.4 83.018 209230000 34416000 0 0 21060000 0 17408000 28583000 0 0 9922400 33974000 30467000 33398000 850 3886 793 7706;7707;7708;7709;7710;7711;7712;7713 10058;10059;10060;10061;10062;10063;10064;10065 10065 5 AEAAVESAVAGPQGR Unmodified 1411.7056 0.7055559 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 36.884 36.884 2 0.0040455 33004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.338 45.961 0 0 0 0 0 0 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10126;10127 10126 2 AEAELLQQQK Unmodified 1156.6088 0.60880197 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.738 29.738 2 0.00046618 24284 QUIQUE_C1576_190116_001 111.17 39.788 778560000 0 0 0 0 99600000 91180000 117750000 88649000 142060000 118690000 120640000 0 0 860 3117 803 7760;7761;7762;7763;7764;7765;7766 10128;10129;10130;10131;10132;10133;10134;10135 10131 6 AEAEQSVTCAHCR Unmodified 1517.6351 0.63510985 1508 O43149 ZZEF1 Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 11.729 11.729 3 0.01176 4104 QUIQUE_C1576_190116_001 45.28 39.56 3578100 0 0 0 0 0 0 2225100 0 0 0 0 0 1353000 861 1508 804 7767;7768;7769 10136;10137;10138 10137 3 AEAERPEEQAEASGLK Unmodified 1713.817 0.81695684 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 1 25.442 25.442 3 0.013474 19052 QUIQUE_C1277_190116_001 60.307 48.693 28002000 0 28002000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 862 2880 805 7770 10139 10139 0 AEAERPEEQAEASGLKK Unmodified 1841.9119 0.91191986 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.8 18.8 3 2.0832E-29 11823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.32 123.36 2082200000 85664000 158530000 126840000 113910000 192480000 131760000 103320000 268370000 290360000 30177000 182710000 176250000 221830000 863 2880 806 7771;7772;7773;7774;7775;7776;7777;7778;7779;7780;7781;7782;7783 10140;10141;10142;10143;10144;10145;10146;10147;10148;10149;10150;10151;10152;10153 10148 14 AEAETLVSR Unmodified 974.50327 0.50327426 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 25.24 25.24 2 0.014899 18263 QUIQUE_C1368_190116_001 67.897 28.875 774900000 0 0 146360000 0 0 0 0 85594000 120450000 61749000 132980000 112670000 115090000 864 3643 807 7784;7785;7786;7787;7788;7789;7790;7791 10154;10155;10156;10157;10158;10159;10160;10161 10155 7 AEAFVNTWSSMGQETVEK Unmodified 2012.915 0.91495633 812 D6RC04;Q9Y6G5;D6RJ90;H0Y9N4 COMMD10 COMM domain-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 105.84 105.84 2 0.022466 107666 QUIQUE_C1563_190116_001 49.333 36.133 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 865 812 808 7792 10162 10162 1 AEAGAGSATEFQFR Unmodified 1440.6634 0.66335673 2482 P46783;Q9NQ39 RPS10;RPS10P5 40S ribosomal protein S10;Putative 40S ribosomal protein S10-like yes no 0 0 0 1 65.842 65.842 2 0.0076168 61672 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.819 58.35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 866 2482 809 7793 10163 10163 1 AEAGDAALSVAEWLR Acetyl (Protein N-term) 1599.7893 0.78928553 3914 Q96P48 ARAP1 Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.43 168.43 2 1.7441E-13 172057 QUIQUE_C1277_190116_001 169.89 156.23 367760000 28741000 27212000 18327000 19864000 39867000 19300000 22845000 29893000 47318000 0 36045000 41080000 37273000 867 3914 810 7794;7795;7796;7797;7798;7799;7800;7801;7802;7803;7804;7805 10164;10165;10166;10167;10168;10169;10170;10171;10172;10173;10174;10175 10165 11 AEAGDNLGALVR Unmodified 1184.6149 0.61494998 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.231 63.231 2 6.3075E-05 63266 QUIQUE_C1218_190116_001 124.81 86.387 5635600000 567600000 433540000 499780000 420400000 408690000 420880000 425850000 440140000 480900000 231400000 476470000 422800000 407190000 868 2529 811 7806;7807;7808;7809;7810;7811;7812;7813;7814;7815;7816;7817;7818 10176;10177;10178;10179;10180;10181;10182;10183;10184;10185;10186;10187;10188;10189;10190;10191;10192;10193;10194 10176 18 AEAGEAGQATAEAECHR Unmodified 1756.7435 0.74347432 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 21.93 21.93 3 0.00019578 14675 QUIQUE_C1368_190116_001 72.433 53.6 304480000 73840000 0 103110000 65463000 0 40302000 0 0 0 21758000 0 0 0 869 1741 812 7819;7820;7821;7822;7823 10195;10196;10197;10198;10199 10196 5 AEAGGGWEGSASYK Unmodified 1368.5946 0.59460847 537 K7EIJ0;K7ENL2;A6NG10;K7EMC9;Q969T9;K7EIN1;K7ESN4 WBP2 WW domain-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 40.758 40.758 2 0.0011986 36544 QUIQUE_C1403_190116_001 77.593 60.226 73307000 34217000 0 0 39090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 870 537 813 7824;7825;7826;7827 10200;10201;10202;10203 10202 4 AEAGPEGVAPAPEGEK Unmodified 1507.7155 0.71545188 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 1 32.371 32.371 2 0.0010815 26115 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.641 54.967 24071000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24071000 0 0 0 871 89 814 7828 10204 10204 1 AEAGPEGVAPAPEGEKK Unmodified 1635.8104 0.8104149 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 20.347 20.347 2;3 6.0878E-10 13596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.7 104.61 559950000 0 0 56453000 66445000 0 0 0 67469000 35658000 0 184380000 130280000 19267000 872 89 815 7829;7830;7831;7832;7833;7834;7835;7836;7837 10205;10206;10207;10208;10209;10210;10211;10212;10213 10208 9 AEAGSGGPGFTFTFR Unmodified 1500.6997 0.69974224 2242 P25686;C9JRD2;C9JXB9;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.4 103.4 2 1.0973E-07 107438 QUIQUE_C1218_190116_001 108.72 87.939 293660000 76297000 0 0 0 0 61774000 0 66714000 88871000 0 0 0 0 873 2242 816 7838;7839;7840;7841;7842;7843;7844;7845;7846;7847;7848;7849 10214;10215;10216;10217;10218;10219;10220;10221;10222;10223;10224;10225 10214 9 AEALASAIASTK Unmodified 1131.6136 0.61355299 4310 Q9NVT9 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.705 48.705 2 0.0032442 46818 QUIQUE_C1438_190116_001 72.652 57.501 321110000 68437000 49422000 55499000 48483000 50686000 48580000 0 0 0 0 0 0 0 874 4310 817 7850;7851;7852;7853;7854;7855 10226;10227;10228;10229;10230;10231 10230 6 AEALPLQR Unmodified 896.50797 0.50796571 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.551 35.551 2 0.016146 30391 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.614 34.256 425590000 22682000 33053000 0 40421000 73070000 29480000 50620000 0 51679000 0 44395000 28451000 51742000 875 2207 818 7856;7857;7858;7859;7860;7861;7862;7863;7864;7865 10232;10233;10234;10235;10236;10237;10238;10239;10240;10241;10242 10242 11 AEAQAQYSAAVAK Unmodified 1306.6517 0.65172941 669 B7ZKJ8;Q14624 ITIH4 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 yes no 0 0 0 1 1 25.201 25.201 2 0.00070199 18266 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.62 89.388 15840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15840000 0 0 0 876 669 819 7866;7867 10243;10244 10244 2 AEAQEAEDQQAR Unmodified 1344.5906 0.59058572 4434 Q9UHG2 PCSK1N ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN yes yes 0 0 0 1 11.315 11.315 2 0.00052228 3651 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.78 103.55 7463600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7463600 0 0 0 877 4434 820 7868 10245 10245 1 AEASSGDHPTDTEMKEEQK Unmodified 2088.8906 0.89059207 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 4 2 2 12.725 12.725 2;3;4 6.5607E-55 3241 QUIQUE_C1277_190116_001 169.43 160.38 2077300000 81671000 66167000 159610000 0 253400000 192960000 6975700 209260000 220930000 0 100480000 292840000 492960000 878 2876 821 7869;7870;7871;7872;7873;7874;7875;7876;7877;7878;7879;7880;7881;7882;7883;7884;7885;7886;7887;7888;7889;7890;7891;7892 10246;10247;10248;10249;10250;10251;10252;10253;10254;10255;10256;10257;10258;10259;10260;10261;10262;10263;10264;10265;10266;10267;10268;10269;10270;10271 10248 26 AEAWEGAAVAQDLLALGYGGVPGAASR Unmodified 2599.3031 0.3030649 3207 Q17RN3;K7EQT7 FAM98C Protein FAM98C yes no 0 0 0 1 1 1 165.87 165.87 3 0.0037215 172069 QUIQUE_C1438_190116_001 31.549 23.928 57931000 0 0 0 0 27860000 0 30071000 0 0 0 0 0 0 879 3207 822 7893;7894;7895 10272;10273;10274 10273 3 AECLNPSQPSR Unmodified 1257.5772 0.57718426 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.132 21.132 2 0.00065961 14233 QUIQUE_C1438_190116_001 116.52 95.571 486730000 58165000 73914000 65760000 0 90862000 39908000 25704000 0 25088000 0 52332000 30472000 24529000 880 2075 823 7896;7897;7898;7899;7900;7901;7902;7903;7904;7905 10275;10276;10277;10278;10279;10280;10281;10282;10283;10284;10285;10286 10279 12 AECMLQQAER Unmodified 1234.5434 0.54344129 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.311 33.311 2 0.00020677 28325 QUIQUE_C1403_190116_001 124.23 92.47 540320000 38787000 0 144990000 145540000 91274000 63459000 56280000 0 0 0 0 0 0 881 2066 824 7906;7907;7908;7909;7910;7911 10287;10288;10289;10290;10291;10292;10293 10289 7 AECMLQQAER Oxidation (M) 1250.5384 0.53835592 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 18.71 18.71 2 0.0060905 11256 QUIQUE_C1368_190116_001 78.516 59.245 72993000 0 0 30455000 0 0 0 0 0 0 17089000 25450000 0 0 882 2066 824 7912;7913;7914 10294;10295;10296 10294 1390 3 AECSAEQCYK Unmodified 1244.4802 0.48017233 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 0 1 14.921 14.921 2 0.0028464 6947 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.639 76.418 11747000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11747000 0 0 0 883 2504 825 7915 10297 10297 1 AEDADMRNELEEMQR Acetyl (Protein N-term) 1877.7884 0.7883756 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 100.24 100.24 2;3 3.2949E-65 104381 QUIQUE_DMIX5_190116_001 198.49 157.99 3195200000 151640000 331210000 365760000 289050000 190600000 0 352280000 246390000 231680000 44631000 370620000 225730000 395570000 884 2699 826 7916;7917;7918;7919;7920;7921;7922;7923;7924;7925;7926;7927;7928;7929 10298;10299;10300;10301;10302;10303;10304;10305;10306;10307;10308;10309;10310;10311;10312;10313 10310 14 AEDADMRNELEEMQR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1893.7833 0.78329023 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 1 1 1 2 2 2 1 1 1 2 68.841 68.841 2 6.5159E-06 68055 QUIQUE_C1277_190116_001 109.16 99.837 377550000 0 78129000 55848000 63351000 0 0 34042000 0 34526000 0 36922000 0 74731000 885 2699 826 7930;7931;7932;7933;7934;7935;7936;7937;7938;7939;7940 10314;10315;10316;10317;10318;10319;10320;10321;10322;10323;10324 10314 2128;2129 10 AEDASKFELCQLLPLFLPPTTVPPECYR Unmodified 3290.6356 0.63555735 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 167.65 167.65 3 1.6221E-36 169665 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.62 112.73 962540000 0 35681000 0 0 0 0 0 127530000 137040000 0 377610000 284660000 0 886 4393;697 827 7941;7942;7943;7944;7945 10325;10326;10327;10328;10329 10326 5 AEDAVEAIR Unmodified 972.48762 0.4876242 4055 Q9BWF3;E9PB51;D6R9K7;J3QRR5 RBM4 RNA-binding protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.696 30.696 2 0.00049652 25567 QUIQUE_C1576_190116_001 114.28 64.242 746660000 60360000 60340000 72158000 60963000 60616000 65311000 71279000 55027000 55398000 0 72114000 54801000 58297000 887 4055 828 7946;7947;7948;7949;7950;7951;7952;7953;7954;7955;7956;7957 10330;10331;10332;10333;10334;10335;10336;10337;10338;10339;10340;10341;10342;10343 10338 12 AEDDQPLPGVLLSLSGGLFR Unmodified 2083.095 0.094969603 101 A0A0G2JN29;A0A087X117;Q15155;A0A0G2JP90;A0A087WW46;J3KN36;P69849;Q5JPE7 NOMO1;NOMO3;NOMO2 Nodal modulator 1;Nodal modulator 3;Nodal modulator 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 169.85 169.85 2;3 6.9537E-06 174663 QUIQUE_C1368_190116_001 101.36 95.864 109820000 9369200 0 17818000 0 19939000 0 0 0 0 0 0 27849000 34850000 888 101 829 7958;7959;7960;7961;7962 10344;10345;10346;10347;10348;10349 10345 5 AEDGATPSPSNETPK Unmodified 1499.674 0.673981 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 20.656 20.656 2 7.5139E-14 12693 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.76 75.944 17356000000 2194800000 2397500000 877420000 1629100000 2354900000 1143500000 931330000 621770000 1575100000 439350000 1089900000 962560000 1138800000 889 2293 830 7963;7964;7965;7966;7967;7968;7969;7970;7971;7972;7973;7974;7975;7976;7977;7978;7979;7980;7981;7982;7983;7984;7985;7986;7987;7988 10350;10351;10352;10353;10354;10355;10356;10357;10358;10359;10360;10361;10362;10363;10364;10365;10366;10367;10368;10369;10370;10371;10372;10373;10374;10375;10376;10377;10378;10379;10380;10381;10382;10383 10376 33 AEDGATPSPSNETPKK Unmodified 1627.7689 0.76894402 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 1 2 3 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 13.393 13.393 2;3 1.9709E-18 5328 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.45 122.59 1608300000 122560000 276730000 44516000 32535000 93148000 46029000 90169000 166880000 203110000 0 222840000 61444000 248350000 890 2293 831 7989;7990;7991;7992;7993;7994;7995;7996;7997;7998;7999;8000;8001;8002;8003;8004;8005;8006;8007;8008;8009;8010;8011;8012;8013;8014;8015 10384;10385;10386;10387;10388;10389;10390;10391;10392;10393;10394;10395;10396;10397;10398;10399;10400;10401;10402;10403;10404;10405;10406;10407;10408;10409;10410;10411;10412;10413;10414;10415;10416;10417;10418;10419;10420;10421 10421 38 AEDGENYDIK Unmodified 1152.4935 0.49349744 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6;E5RIX8 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 0 0 1 27.016 27.016 2 0.019456 21087 QUIQUE_C1218_190116_001 82.749 38.302 92951000 92951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 891 843 832 8016 10422 10422 0 AEDGENYDIKK Unmodified 1280.5885 0.58846046 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6;E5RIX8 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 1 2 16.499 16.499 2;3 0.00059427 8763 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.3 88.48 1382400000 106710000 86688000 54199000 190260000 207230000 103290000 172070000 0 0 35013000 143020000 43463000 240400000 892 843 833 8017;8018;8019;8020;8021;8022;8023;8024;8025;8026;8027;8028;8029;8030;8031;8032;8033 10423;10424;10425;10426;10427;10428;10429;10430;10431;10432;10433;10434;10435;10436;10437;10438;10439 10437 17 AEDGIVLDLPLYPAHPQDFHEVEDLIK Unmodified 3072.5444 0.54441738 2296 P30039;A0A0C4DFS0 PBLD Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein yes no 0 0 0 1 151.23 151.23 4 0.02605 153981 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.585 15.189 37050000 0 0 0 0 0 0 0 37050000 0 0 0 0 0 893 2296 834 8034 10440 10440 1 AEDGSVIDYELIDQDAR Unmodified 1907.8749 0.87486565 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;H0YNP5;H0YN28;H0YL33;H0YNA0 ANXA2 Annexin A2;Annexin yes no 0 0 0 1 3 2 3 2 2 2 2 3 3 3 2 2 112.73 112.73 2;3 6.3625E-140 113865 QUIQUE_DMIX1_190116_001 233.37 201.36 3892500000 229700000 392480000 261130000 520900000 300870000 128620000 274350000 250700000 388810000 290800000 356840000 215280000 282000000 894 1920 835 8035;8036;8037;8038;8039;8040;8041;8042;8043;8044;8045;8046;8047;8048;8049;8050;8051;8052;8053;8054;8055;8056;8057;8058;8059;8060;8061;8062;8063;8064 10441;10442;10443;10444;10445;10446;10447;10448;10449;10450;10451;10452;10453;10454;10455;10456;10457;10458;10459;10460;10461;10462;10463;10464;10465;10466;10467;10468;10469;10470;10471;10472;10473;10474;10475;10476;10477;10478 10460 36 AEDHFSVIDFNQNIR Unmodified 1803.854 0.85401105 2153 Q5T985;P19823 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 0 1 94.17 94.17 3 0.0024923 95097 QUIQUE_C1563_190116_001 46.704 39.193 18806000 0 0 0 0 0 18806000 0 0 0 0 0 0 0 895 2153 836 8065 10479 10479 0 AEDLDELLDEVESK Acetyl (Protein N-term) 1645.757 0.75704193 3909 Q96NL8 C8orf37 Protein C8orf37 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 171.52 171.52 2 3.3809E-14 174927 QUIQUE_C1277_190116_001 142.07 129.49 151410000 0 14630000 19695000 0 20847000 0 21490000 14554000 42235000 0 0 17959000 0 896 3909 837 8066;8067;8068;8069;8070;8071;8072;8073 10480;10481;10482;10483;10484;10485;10486;10487 10480 8 AEDLNIAPR Unmodified 997.51926 0.51925868 3944 Q96SZ5 ADO 2-aminoethanethiol dioxygenase yes yes 0 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2;3 1.3569E-05 146034 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.79 79.617 2812600000 334030000 71023000 0 116130000 102590000 72741000 104930000 467890000 605260000 0 308480000 337960000 291590000 900 2495 841 8084;8085;8086;8087;8088;8089;8090;8091;8092;8093;8094;8095;8096;8097;8098 10499;10500;10501;10502;10503;10504;10505;10506;10507;10508;10509;10510;10511;10512;10513;10514;10515;10516;10517 10514 15 AEDRPQQPQLDMPLVLDQGLTR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2577.2857 0.28570027 2495 P47874 OMP Olfactory marker protein yes yes 1 1 1 1 1 2 1 117.54 117.54 2;3 7.5635E-06 121342 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.853 60.758 208670000 0 0 0 0 38329000 0 0 46700000 71341000 0 0 0 52297000 901 2495 841 8099;8100;8101;8102;8103 10518;10519;10520;10521;10522 10520 1923 4 AEDSGEYHCVYHFVSAPK Unmodified 2094.9105 0.91053965 4641 Q9Y639;Q9UFM8 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 2 2 2 2 1 2 2 2 59.398 59.398 2;3;4 1.1521E-75 58263 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.14 182.19 6570300000 711310000 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23 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.682 36.682 2 0.00047031 32479 QUIQUE_C1438_190116_001 106.68 92.009 271780000 0 0 39267000 44792000 86493000 0 0 16975000 0 0 39426000 0 44829000 904 303 844 8142;8143;8144;8145;8146;8147;8148;8149 10564;10565;10566;10567;10568;10569;10570;10571 10566 8 AEDTAVYYCAR Unmodified 1317.566 0.56595087 1814 P01780;A0A0J9YVY3;A0A0B4J1V1;P01763;P01762 IGHV3-21 Ig heavy chain V-III region JON;Ig heavy chain V-III region WEA;Ig heavy chain V-III region TRO no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 41.082 41.082 2 1.8371E-24 37640 QUIQUE_C1277_190116_001 183.65 179.71 931100000 0 593730000 69935000 77460000 101890000 0 0 0 0 27864000 60214000 0 0 905 1814 845 8150;8151;8152;8153;8154;8155;8156;8157 10572;10573;10574;10575;10576;10577;10578;10579;10580 10573 6 AEDYDVVK Unmodified 937.43928 0.43927702 1610 O75116;D6REE7;C9JFJ0 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 28.729 28.729 2 0.030205 23509 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.169 24.169 70150000 0 0 39835000 0 0 0 0 0 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8200;8201;8202;8203;8204;8205;8206;8207;8208;8209;8210;8211 10628;10629;10630;10631;10632;10633;10634;10635;10636;10637;10638;10639 10630 11 AEEEFNIEK Unmodified 1107.5084 0.50841922 2397 P36543;Q96A05 ATP6V1E1;ATP6V1E2 V-type proton ATPase subunit E 1;V-type proton ATPase subunit E 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.216 43.216 2 0.00034436 39887 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.83 113.74 8963600000 997500000 1062500000 791100000 825140000 809170000 735850000 808640000 445260000 460270000 293120000 595230000 516630000 623250000 915 2397 854 8212;8213;8214;8215;8216;8217;8218;8219;8220;8221;8222;8223;8224 10640;10641;10642;10643;10644;10645;10646;10647;10648;10649;10650;10651;10652;10653;10654;10655;10656;10657;10658;10659 10654 20 AEEENEFQIPGR Unmodified 1417.6474 0.64737232 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 69.284 69.284 2 1.0217E-43 69571 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.26 125.69 272020000 0 0 47830000 0 40279000 0 54528000 0 0 0 59240000 0 70145000 916 3565 855 8225;8226;8227;8228;8229;8230;8231;8232 10660;10661;10662;10663;10664;10665;10666;10667;10668;10669 10664 10 AEEEQAGSAPGAGSTATK Unmodified 1660.754 0.75402223 1334 K7ES98;K7EM85;Q92619;F5H1R4;K7ES92 HMHA1 Minor histocompatibility protein HA-1;Minor histocompatibility antigen HA-1 yes no 0 0 0 1 15.956 15.956 2 1.999E-13 8277 QUIQUE_C1368_190116_001 125.97 101.72 19680000 0 0 19680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 917 1334 856 8233 10670 10670 1 AEEGIAAGGVMDVNTALQEVLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2272.1257 0.12567738 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 1 1 0 3 3 1 2 2 3 2 2 1 1 2 1 2 169.13 169.13 2;3 9.5339E-88 172053 QUIQUE_C1403_190116_001 187.37 173.65 1837700000 154830000 275140000 112020000 126180000 223430000 204840000 164850000 107710000 85715000 34979000 134540000 71215000 142240000 918 2240 857 8234;8235;8236;8237;8238;8239;8240;8241;8242;8243;8244;8245;8246;8247;8248;8249;8250;8251;8252;8253;8254;8255;8256;8257;8258 10671;10672;10673;10674;10675;10676;10677;10678;10679;10680;10681;10682;10683;10684;10685;10686;10687;10688;10689;10690;10691;10692;10693;10694;10695 10678 1599 17 AEEGIAAGGVMDVNTALQEVLK Acetyl (Protein N-term) 2256.1308 0.13076276 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 1 0 0 2 2 3 2 2 2 4 3 1 5 2 3 172.13 172.13 2;3 9.4704E-55 176605 QUIQUE_C1368_190116_001 208.47 187.63 2303600000 137410000 139350000 348830000 113390000 137230000 0 257380000 191450000 245190000 22699000 194510000 263650000 252480000 919 2240 857 8259;8260;8261;8262;8263;8264;8265;8266;8267;8268;8269;8270;8271;8272;8273;8274;8275;8276;8277;8278;8279;8280;8281;8282;8283;8284;8285;8286;8287;8288;8289 10696;10697;10698;10699;10700;10701;10702;10703;10704;10705;10706;10707;10708;10709;10710;10711;10712;10713;10714;10715;10716;10717;10718;10719;10720;10721;10722;10723;10724;10725;10726;10727;10728;10729;10730 10700 35 AEEIANEMIEAAK Unmodified 1417.6759 0.67589525 2533 P49588;H3BPK7 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.771 82.771 2 0.00045332 84206 QUIQUE_C1368_190116_001 107.85 68.825 599400000 73565000 70100000 64793000 0 46921000 0 0 50170000 74171000 0 93738000 58618000 67326000 920 2533 858 8290;8291;8292;8293;8294;8295;8296;8297;8298;8299 10731;10732;10733;10734;10735;10736;10737;10738;10739;10740;10741 10734 10 AEELFLWVPR Unmodified 1258.671 0.67100829 3485 Q86TU7;Q6NXR6 SETD3 Histone-lysine N-methyltransferase setd3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.42 136.42 2 0.0001978 141367 QUIQUE_C1368_190116_001 123.92 95.19 177680000 19651000 21509000 19510000 23674000 0 18908000 18526000 0 16322000 10125000 15278000 0 14173000 921 3485 859 8300;8301;8302;8303;8304;8305;8306;8307;8308;8309;8310 10742;10743;10744;10745;10746;10747;10748;10749;10750;10751;10752 10744 11 AEELGLPILGVLR Unmodified 1378.8184 0.81840081 1956 P09110;C9JDE9;H7C131 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 148.33 148.33 2 5.3203E-09 151108 QUIQUE_C1563_190116_001 139.96 129.13 900430000 74573000 73199000 81520000 93861000 64195000 79357000 70000000 54325000 68181000 24661000 85529000 67664000 63359000 922 1956 860 8311;8312;8313;8314;8315;8316;8317;8318;8319;8320;8321;8322;8323;8324;8325 10753;10754;10755;10756;10757;10758;10759;10760;10761;10762;10763;10764;10765;10766;10767;10768;10769;10770;10771;10772;10773;10774;10775;10776;10777;10778;10779;10780;10781;10782;10783 10768 31 AEELHYPLGER Unmodified 1312.6412 0.64116473 3058 Q14257;A8MXP8;H0YL43 RCN2 Reticulocalbin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 44.676 44.676 3 0.0011973 40646 QUIQUE_C1563_190116_001 56.02 37.348 409590000 115370000 71028000 38066000 50505000 0 57165000 0 23976000 0 33105000 20383000 0 0 923 3058 861 8326;8327;8328;8329;8330;8331;8332;8333 10784;10785;10786;10787;10788;10789;10790;10791;10792 10788 9 AEELIQEIQR Unmodified 1227.6459 0.64591575 610 B4DHR0;Q9H5N1;H3BNR8;H3BU67;H3BNR2;H3BT64 RABEP2 Rab GTPase-binding effector protein 2 yes no 0 0 0 1 1 68.882 68.882 2 0.0056777 68832 QUIQUE_C1403_190116_001 107.57 72.35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 924 610 862 8334;8335 10793;10794 10793 2 AEELLAEEK Unmodified 1030.5183 0.51825563 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.203 33.203 2 0.0075401 28263 QUIQUE_C1403_190116_001 116.37 86.186 1042600000 0 0 185400000 254210000 0 0 0 0 0 91050000 0 171980000 339980000 925 1108;1404 863 8336;8337;8338;8339;8340 10795;10796;10797;10798;10799 10796 0 AEELQPGFSK Unmodified 1104.5451 0.54513908 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 37.461 37.461 2 0.0057685 33765 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.345 49.383 131960000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131960000 0 0 926 3949 864 8341 10800 10800 1 AEELVLER Acetyl (Protein N-term) 999.52368 0.52367535 2190 P21980;A2A299;A2A2A0 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 104.18 104.18 2 0.0081048 108625 QUIQUE_C1218_190116_001 83.265 61.494 280540000 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8412;8413;8414;8415;8416;8417;8418;8419;8420;8421;8422;8423;8424;8425;8426;8427;8428;8429;8430;8431 10877;10878;10879;10880;10881;10882;10883;10884;10885;10886;10887;10888;10889;10890;10891;10892;10893;10894;10895;10896;10897;10898;10899;10900;10901;10902;10903;10904;10905;10906;10907;10908 10877 30 AEFAEVSK Unmodified 879.4338 0.43379771 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.572 23.572 2 0.0030423 16922 QUIQUE_C1438_190116_001 133.6 37.807 42252000000 4990000000 0 0 5646400000 9989400000 4032200000 0 1126000000 3715100000 1520800000 5237700000 0 5994700000 + 938 769 874 8432;8433;8434;8435;8436;8437;8438;8439;8440;8441 10909;10910;10911;10912;10913;10914;10915;10916;10917;10918;10919;10920;10921;10922 10912 14 AEFFADVVPAVR Unmodified 1319.6874 0.68738664 4440 Q9UHY7;D6RA00;A0A0C4DGY8 ENOPH1 Enolase-phosphatase E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 115.15 115.15 2;3 0.00015961 117845 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1 1 1 1 1 38.156 38.156 2 0.0040675 33676 QUIQUE_C1563_190116_001 69.672 45.517 950310000 57860000 83478000 90167000 86326000 71908000 64259000 86397000 78849000 80649000 0 95595000 64779000 90042000 941 4169 877 8463;8464;8465;8466;8467;8468;8469;8470;8471;8472;8473;8474 10969;10970;10971;10972;10973;10974;10975;10976;10977;10978;10979;10980;10981;10982;10983;10984 10977 16 AEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEK Unmodified 3833.988 0.98799192 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 171.62 171.62 3;4 5.9589E-39 178851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.56 90.938 1493300000 0 0 0 0 0 0 0 30078000 141090000 0 480260000 771660000 70238000 942 2483 878 8475;8476;8477;8478;8479;8480;8481;8482;8483 10985;10986;10987;10988;10989;10990;10991;10992;10993 10990 9 AEFLGSGLLQHNCK Unmodified 1572.7719 0.77186132 4476;703 Q9UKU0;E7ERD7;C9J3Z0;C9J4I1;C9JK59;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 0 1 1 1 68.913 68.913 3 0.0011787 69056 QUIQUE_C1277_190116_001 61.423 57.815 207090000 0 70394000 0 68012000 0 0 68683000 0 0 0 0 0 0 943 4476;703 879 8484;8485;8486 10994;10995;10996 10994 3 AEFTVETR Unmodified 951.46616 0.46616048 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 34.124 34.124 2 0.035455 29312 QUIQUE_C1218_190116_001 63.419 46.455 27401000 27401000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 944 2178 880 8487;8488;8489 10997;10998;10999 10997 3 AEFVEVTK Unmodified 921.48075 0.48074791 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.395 35.395 2 0.0047749 30076 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.9 67.792 902070000 100530000 67999000 45173000 0 128960000 88326000 0 0 106010000 365080000 0 0 0 + 945 770 881 8490;8491;8492;8493;8494;8495;8496 11000;11001;11002;11003;11004;11005;11006;11007;11008;11009;11010 11009 11 AEGAATEEEGTPK Unmodified 1288.5783 0.5782897 2817 P80723;U3KQP0 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.986 13.986 2 3.2141E-31 5935 QUIQUE_C1403_190116_001 177.57 117.77 2178700000 374990000 561070000 389050000 254590000 296400000 0 0 65445000 117810000 0 47649000 71727000 0 946 2817 882 8497;8498;8499;8500;8501;8502;8503;8504;8505 11011;11012;11013;11014;11015;11016;11017;11018;11019;11020;11021;11022 11014 12 AEGDISNVANGFK Unmodified 1320.631 0.63099397 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2;B1AHE4 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 67.056 67.056 2 0.00012736 67859 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.31 93.09 235530000 0 0 0 0 0 0 0 0 130510000 0 105030000 0 0 947 4392 883 8506;8507 11023;11024 11024 2 AEGDSWVLNGTK Unmodified 1275.6095 0.60953025 2105 P16219 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 63.526 63.526 2 0.0017523 62144 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.311 57.614 42270000 0 0 0 0 0 0 0 42270000 0 0 0 0 0 948 2105 884 8508 11025 11025 1 AEGDVAALNR Unmodified 1014.5094 0.50942227 435;2791 A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;P67936 TPM4 Tropomyosin alpha-4 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.898 26.898 2 3.3688E-11 21017 QUIQUE_C1438_190116_001 195.06 140.29 1580200000 205400000 0 202850000 214940000 280810000 227390000 207530000 0 0 0 137180000 104130000 0 949 435;2791 885 8509;8510;8511;8512;8513;8514;8515;8516 11026;11027;11028;11029;11030;11031;11032;11033 11029 7 AEGEITTFTALTEK Acetyl (Protein N-term) 1551.7668 0.76681875 1884 P05230;C9JDC5;B5MCF4;C9JUP6 FGF1 Fibroblast growth factor 1 yes no 1 0 0 1 140.9 140.9 2 0.0063928 137124 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.451 54.76 46068000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46068000 0 0 0 950 1884 886 8517 11034 11034 0 AEGEPCGDEGAEAPVEGDIHYQR Unmodified 2485.0452 0.045195231 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.052 59.052 3 3.2052E-14 58683 QUIQUE_C1218_190116_001 107.74 104.45 678290000 64404000 78772000 97226000 67878000 69156000 23951000 73696000 29735000 0 17752000 66611000 28790000 60317000 951 4176 887 8518;8519;8520;8521;8522;8523;8524;8525;8526;8527;8528;8529 11035;11036;11037;11038;11039;11040;11041;11042;11043;11044;11045;11046;11047 11035 13 AEGEREEEGRAEAPDK Unmodified 1771.7973 0.79728403 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 1 10.275 10.275 3 9.8853E-06 2660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.67 61.973 35743000 0 0 0 0 0 0 0 11124000 0 0 0 24619000 0 952 921 888 8530;8531 11048;11049 11048 2 AEGFFGMYR Unmodified 1076.475 0.47495102 4134 Q9H1K4 SLC25A18 Mitochondrial glutamate carrier 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.356 93.356 2 0.0058804 95666 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.798 69.58 177200000 26308000 26411000 35020000 0 20155000 0 0 22779000 20977000 0 25546000 0 0 953 4134 889 8532;8533;8534;8535;8536;8537;8538 11050;11051;11052;11053;11054;11055;11056 11055 6 AEGFVDALHR Unmodified 1113.5567 0.55670682 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 47.571 47.571 3 0.011798 45391 QUIQUE_C1277_190116_001 39.937 30.282 182570000 0 41794000 26313000 33905000 0 36712000 0 0 0 0 0 0 43844000 954 3875 890 8539;8540;8541;8542;8543 11057;11058;11059;11060;11061 11057 2 AEGGAADLDTQR Acetyl (Protein N-term) 1244.5633 0.56330834 4605 Q9Y4E8;F8W0H4 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 1 0 0 1 1 52.372 52.372 2 0.0014673 50518 QUIQUE_C1218_190116_001 87.298 65.834 62109000 33230000 0 0 0 0 0 0 28879000 0 0 0 0 0 955 4605 891 8544;8545 11062;11063;11064 11062 3 AEGGGGGGRPGAPAAGDGK Unmodified 1537.7233 0.72333123 2849 Q00839 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes yes 0 0 1 1 1 10.433 10.433 3 3.0062E-05 2771 QUIQUE_C1563_190116_001 91.589 63.728 12539000 0 5305700 0 0 0 7232900 0 0 0 0 0 0 0 956 2849 892 8546;8547 11065;11066 11066 2 AEGILDVFQTVK Unmodified 1318.7133 0.71326704 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.56 127.56 2 0.00044843 131516 QUIQUE_C1403_190116_001 110.38 72.826 628990000 60392000 55683000 80406000 51274000 44182000 46175000 84956000 26310000 52241000 27379000 46734000 0 53259000 957 2137 893 8548;8549;8550;8551;8552;8553;8554;8555;8556;8557;8558;8559 11067;11068;11069;11070;11071;11072;11073;11074;11075;11076;11077;11078;11079;11080;11081 11071 15 AEGIPVEMVVIGDDSAFTVLK Unmodified 2189.129 0.12897185 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 158.45 158.45 2 1.2133E-07 160939 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.993 85.722 477410000 43658000 45195000 48495000 46931000 53083000 55453000 0 49740000 35307000 23070000 0 31845000 44627000 958 3226 894 8560;8561;8562;8563;8564;8565;8566;8567;8568;8569;8570;8571 11082;11083;11084;11085;11086;11087;11088;11089;11090;11091;11092;11093;11094;11095;11096 11089 15 AEGIPVEMVVIGDDSAFTVLKK Unmodified 2317.2239 0.22393487 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 1 1 1 140.95 140.95 3 0.00096852 144157 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.162 35.802 116140000 0 0 0 0 0 0 0 70794000 0 0 45344000 0 0 959 3226 895 8572;8573 11097;11098;11099 11098 3 AEGLGDGYR Unmodified 936.43011 0.43010932 4060 Q9BX68 HINT2 Histidine triad nucleotide-binding protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.974 25.974 2 0.0013568 19579 QUIQUE_C1563_190116_001 104.44 74.252 1525100000 154820000 136340000 129340000 110130000 0 135370000 143520000 94667000 162560000 0 183160000 127530000 147690000 960 4060 896 8574;8575;8576;8577;8578;8579;8580;8581;8582;8583;8584 11100;11101;11102;11103;11104;11105;11106;11107;11108;11109;11110;11111 11104 6 AEGLGHEQTPLPAAQAQVQATGPEAGR Unmodified 2683.3314 0.33140491 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 64.956 64.956 3 1.0642E-53 63853 QUIQUE_DMIX8_190116_001 142.4 134.95 381730000 58332000 0 0 72366000 42317000 0 0 49776000 0 0 57822000 0 101120000 961 3889 897 8585;8586;8587;8588;8589;8590;8591;8592 11112;11113;11114;11115;11116;11117;11118;11119;11120 11119 8 AEGLLDVFQAVK Unmodified 1288.7027 0.70270235 2216 P23469 PTPRE Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon yes yes 0 0 0 1 133.63 133.63 2 0.0014385 129954 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.338 62.359 13328000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13328000 0 0 0 962 2216 898 8593 11121 11121 1 AEGNTLISVDYEIFGK Acetyl (Protein N-term) 1796.8832 0.88324549 1919 P07311;G3V3F8;G3V597 ACYP1 Acylphosphatase-1 yes no 1 0 0 1 1 165.61 165.61 2 3.9102E-05 167644 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.763 66.132 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 963 1919 899 8594;8595 11122;11123 11122 2 AEGPDVAVDLPK Unmodified 1209.6241 0.62411768 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 69.415 69.415 2 0.00054432 68824 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.058 72.728 103900000 0 0 0 0 0 0 0 103900000 0 0 0 0 0 964 2935 900 8596 11124 11124 1 AEGPEVDVNLPK Unmodified 1266.6456 0.6455814 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.255 66.255 2 0.00054432 62799 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.058 75.622 4736000000 0 277080000 251780000 362310000 378730000 528740000 330630000 974210000 310140000 177140000 428440000 338500000 378300000 965 2935 901 8597;8598;8599;8600;8601;8602;8603;8604;8605;8606;8607;8608 11125;11126;11127;11128;11129;11130;11131;11132;11133;11134;11135;11136;11137;11138;11139 11135 15 AEGPPEPSR Unmodified 938.44576 0.44575938 3201 Q16849 PTPRN Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N yes yes 0 0 0 1 1 15.437 15.437 2 0.020857 7149 QUIQUE_C1277_190116_001 62.582 21.46 26872000 13466000 13406000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 966 3201 902 8609;8610 11140;11141 11141 2 AEGSAVSDPQHAAR Acetyl (Protein N-term) 1436.6644 0.66441937 4143 Q9H2C0;A0A3B3ITY2;A0A0S2Z5G5 GAN Gigaxonin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 26.965 26.965 2 4.1006E-18 21565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.48 128.37 406340000 0 0 0 0 67891000 0 0 58455000 76073000 30630000 0 76145000 97148000 967 4143 903 8611;8612;8613;8614;8615;8616 11142;11143;11144;11145;11146;11147;11148;11149;11150 11144 9 AEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAK Oxidation (M) 2509.1312 0.13123305 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 130.17 130.17 2;3 4.3133E-98 134147 QUIQUE_C1403_190116_001 180.62 169.99 1196000000 91099000 296710000 115370000 72720000 72796000 57826000 63872000 0 28944000 81735000 175520000 36677000 102700000 968 1203;2077 904 8617;8618;8619;8620;8621;8622;8623;8624;8625;8626;8627;8628;8629;8630;8631 11151;11152;11153;11154;11155;11156;11157;11158;11159;11160;11161;11162;11163;11164;11165;11166;11167 11158 688 16 AEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAK Unmodified 2493.1363 0.13631842 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 4 3 3 3 2 4 3 2 2 2 2 2 2 152.5 152.5 2;3 1.2267E-217 158284 QUIQUE_C1218_190116_001 192.58 186.12 24889000000 2795000000 2873600000 3293100000 2466700000 2168200000 2127200000 2473300000 679610000 750940000 327460000 1744100000 1907900000 1282200000 969 1203;2077 904 8632;8633;8634;8635;8636;8637;8638;8639;8640;8641;8642;8643;8644;8645;8646;8647;8648;8649;8650;8651;8652;8653;8654;8655;8656;8657;8658;8659;8660;8661;8662;8663;8664;8665 11168;11169;11170;11171;11172;11173;11174;11175;11176;11177;11178;11179;11180;11181;11182;11183;11184;11185;11186;11187;11188;11189;11190;11191;11192;11193;11194;11195;11196;11197;11198;11199;11200;11201;11202;11203;11204;11205;11206;11207;11208;11209;11210;11211;11212;11213;11214;11215;11216;11217;11218;11219;11220;11221;11222;11223;11224;11225;11226;11227;11228;11229 11169 62 AEGSDVANAVLDGADCIMLSGETAKGDYPLEAVR Unmodified 3493.6341 0.63411338 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 1 1 1 155.76 155.76 3 7.6919E-99 158553 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.97 149.18 152430000 0 0 0 0 0 0 0 57165000 27277000 0 67986000 0 0 970 1203;2077 905 8666;8667;8668 11230;11231;11232;11233;11234;11235 11230 6 AEGSSTASSGSQLAEGK Unmodified 1565.7169 0.71690845 4342 Q9NZB2;A0A0C4DH52 FAM120A Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 19.705 19.705 2 7.617E-63 12262 QUIQUE_C1368_190116_001 187.11 166.81 136320000 51073000 0 37528000 0 47721000 0 0 0 0 0 0 0 0 971 4342 906 8669;8670;8671 11236;11237;11238 11237 3 AEGVALTNATGAVESTSQAGDR Unmodified 2104.0033 0.0032540621 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 71.512 71.512 2 5.9609E-66 72305 QUIQUE_C1218_190116_001 174.39 134.28 60094000 32862000 0 0 0 0 27232000 0 0 0 0 0 0 0 972 4069 907 8672;8673 11239;11240 11239 2 AEGYEVAHGGR Unmodified 1144.5261 0.52613497 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 2 13.348 13.348 2;3 0.00066494 5373 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.044 68.882 10099000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10099000 0 0 0 973 1148 908 8674;8675 11241;11242 11241 2 AEGYNLKDEDGR Unmodified 1365.6161 0.61607219 3349 Q66LE6;H0YB06;A0A3B3IRK1 PPP2R2D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B delta isoform yes no 0 0 1 1 1 21.151 21.151 2 0.015489 14474 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.062 57.747 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 974 3349 909 8676;8677 11243;11244 11243 2 AEHDQLLLNYAK Unmodified 1413.7252 0.72522871 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.185 57.185 2 0.00073616 55169 QUIQUE_C1368_190116_001 98.257 80.821 229410000 48375000 40634000 51340000 34209000 0 54847000 0 0 0 0 0 0 0 975 2171 910 8678;8679;8680;8681;8682 11245;11246;11247;11248;11249;11250 11247 6 AEHDSILAEK Unmodified 1111.551 0.55095274 2253 P26639;D6R9F8;D6RCA5;D6RDJ6;D6RBR8 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 18.105 18.105 2;3 0.0049728 10358 QUIQUE_C1277_190116_001 117.01 50.663 185870000 0 0 0 18887000 0 0 0 70717000 28392000 67879000 0 0 0 976 2253 911 8683;8684;8685;8686;8687;8688;8689 11251;11252;11253;11254;11255;11256;11257 11252 5 AEHLDHVMFR Unmodified 1253.5975 0.59752577 1728 O95394;D6RCQ8;D6RF77;D6RCD1;D6RC77 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 31.433 31.433 2;3 0.0030649 25763 QUIQUE_C1368_190116_001 60.434 50.746 416260000 98015000 0 142140000 105310000 0 70790000 0 0 0 0 0 0 0 977 1728 912 8690;8691;8692;8693;8694;8695;8696 11258;11259;11260;11261;11262;11263;11264 11259 6 AEIAFEDRK Unmodified 1077.5455 0.54547343 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 22.405 22.405 3 0.034399 15673 QUIQUE_C1576_190116_001 32.218 22.422 25284000 0 0 0 0 0 0 25284000 0 0 0 0 0 0 978 3061 913 8697 11265 11265 1 AEIDMLDIR Unmodified 1074.5379 0.53794521 1968 P09525;Q6P452 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 1 95.167 95.167 2 0.013805 97526 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.423 35.873 267720000 0 0 0 115410000 0 0 0 0 0 0 0 0 152310000 979 1968 914 8698;8699 11266;11267 11267 2 AEIENLHR Unmodified 980.50394 0.50394296 743 C9JTE0;Q16653;A0A0G2JHM8;Q5SSB8;A0A0G2JIQ0;A0A0G2JHB7;A0A140T9L1;A0A0G2JJE4;A0A0G2JI49;A0A0G2JIU9;A0A0G2JHA9;A0A0G2JKI0;A0A1W2PQ17;E9PG44 MOG Myelin-oligodendrocyte glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.544 17.544 2 0.0036473 10023 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.57 59.183 657820000 0 126260000 41638000 75821000 0 0 44878000 134950000 77901000 102020000 0 0 54351000 980 743 915 8700;8701;8702;8703;8704;8705;8706;8707 11268;11269;11270;11271;11272;11273;11274;11275 11274 6 AEIENYVLTYK Unmodified 1341.6816 0.68163256 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 93.356 93.356 2 0.0014212 93867 QUIQUE_C1403_190116_001 103.7 80.96 958770000 614330000 0 0 0 0 0 0 0 0 344440000 0 0 0 981 3753 916 8708;8709;8710;8711;8712;8713;8714;8715;8716;8717;8718;8719;8720;8721 11276;11277;11278;11279;11280;11281;11282;11283;11284;11285;11286;11287;11288;11289 11278 13 AEIISLCK Unmodified 932.5001 0.50010314 4063 Q9BXP5;H7C3A1;H7C1K0 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 51.032 51.032 2 0.020244 48343 QUIQUE_C1403_190116_001 77.058 47.956 127370000 0 39444000 0 32221000 0 0 0 32607000 23094000 0 0 0 0 982 4063 917 8722;8723;8724;8725 11290;11291;11292;11293 11291 4 AEIQVGLQPGQGEQLLASEPSWWTTGK Unmodified 2909.4559 0.45593672 4192 Q9H993;F5GZY1 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 149.08 149.08 3 0.047344 144629 QUIQUE_DMIX4_190116_001 20.276 15.467 31835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31835000 0 0 0 983 4192 918 8726 11294 11294 1 AEISDLDR Acetyl (Protein N-term) 959.45599 0.45598972 2693 P60510;H3BTA2;H3BV22;I3L4X0;H3BPN5;H3BVE3 PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 1 0 0 1 1 80.534 80.534 2 0.025621 81867 QUIQUE_C1368_190116_001 61.999 40.735 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 984 2693 919 8727;8728 11295;11296 11295 2 AEISELPSIVQDLANGNITWADVEAR Unmodified 2810.4087 0.40865218 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 169.87 169.87 2;3 5.4189E-99 174311 QUIQUE_DMIX3_190116_001 239.58 213.14 1541900000 0 56800000 0 0 83968000 0 254720000 176860000 345010000 0 293420000 167380000 163780000 985 2440 920 8729;8730;8731;8732;8733;8734;8735;8736;8737;8738;8739;8740 11297;11298;11299;11300;11301;11302;11303;11304;11305;11306;11307;11308 11304 12 AEISFEDR Unmodified 965.44543 0.44542503 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5C6 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.942 42.942 2 0.0036626 40617 QUIQUE_C1218_190116_001 119.29 68.325 301140000 44061000 38824000 53347000 0 49258000 39416000 45476000 0 0 0 0 30762000 0 986 2178 921 8741;8742;8743;8744;8745;8746;8747 11309;11310;11311;11312;11313;11314;11315;11316;11317 11309 9 AEISFEDRK Unmodified 1093.5404 0.54038805 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5C6 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 23.164 23.164 2;3 0.00085991 17447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.74 65.313 346610000 0 0 0 0 64102000 0 0 57819000 88739000 0 71562000 0 64389000 987 2178 922 8748;8749;8750;8751;8752 11318;11319;11320;11321;11322 11319 5 AEISNAIDQYVTGTIGEDEDLIK Unmodified 2493.2122 0.21224378 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 3 2 2 2 156.74 156.74 2;3 6.7178E-127 159274 QUIQUE_DMIX1_190116_001 272.95 225.76 1120400000 41430000 48028000 59627000 96919000 98639000 73729000 111810000 87525000 143690000 0 148410000 100370000 110220000 988 2339 923 8753;8754;8755;8756;8757;8758;8759;8760;8761;8762;8763;8764;8765;8766;8767;8768;8769;8770;8771;8772;8773;8774 11323;11324;11325;11326;11327;11328;11329;11330;11331;11332;11333;11334;11335;11336;11337;11338;11339;11340;11341;11342;11343;11344;11345;11346;11347;11348 11335 26 AEITDAEGLGLK Unmodified 1215.6347 0.63468237 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.51 72.51 2 0.00091976 73498 QUIQUE_C1576_190116_001 85.377 46.229 1599800000 187210000 152160000 158090000 146120000 165870000 143890000 199080000 0 0 93271000 0 149530000 204600000 989 890;3052 924 8775;8776;8777;8778;8779;8780;8781;8782;8783;8784 11349;11350;11351;11352;11353;11354;11355;11356;11357;11358;11359;11360 11357 10 AEITFDDHK Unmodified 1074.4982 0.49818889 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 24.231 24.231 3 0.0069624 17916 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.473 36.266 26839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26839000 0 990 1628 925 8785;8786;8787 11361;11362;11363 11363 3 AEIVTEAEPEVDNLLVSDATPDGFR Unmodified 2686.2974 0.2973704 2233 P24821 TNC Tenascin yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 143.45 143.45 2;3 2.5716E-57 146329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.34 188.83 2434200000 0 0 98462000 0 138370000 197790000 96860000 311780000 557160000 139830000 296140000 353370000 244470000 991 2233 926 8788;8789;8790;8791;8792;8793;8794;8795;8796;8797;8798;8799;8800;8801;8802;8803;8804;8805;8806 11364;11365;11366;11367;11368;11369;11370;11371;11372;11373;11374;11375;11376;11377;11378;11379;11380;11381;11382;11383;11384;11385;11386 11373 22 AEKDEPGAWEETFK Unmodified 1635.7417 0.74166663 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 62.729 62.729 2;3 4.0061E-13 61800 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.83 114.82 1618800000 148840000 108820000 149170000 129600000 180860000 104100000 126380000 140380000 114700000 67428000 103300000 141810000 103380000 992 956;3084 927 8807;8808;8809;8810;8811;8812;8813;8814;8815;8816;8817;8818;8819;8820;8821;8822;8823;8824;8825;8826;8827;8828;8829 11387;11388;11389;11390;11391;11392;11393;11394;11395;11396;11397;11398;11399;11400;11401;11402;11403;11404;11405;11406;11407;11408;11409;11410;11411;11412 11403 24 AEKPLFSSNPELDNLMIQAIQVLR Unmodified 2725.4473 0.44728629 1442 O14770;H0YMX5;F5GYS8;H0YNY8;U3KPR8;O00470 MEIS2;MEIS1 Homeobox protein Meis2;Homeobox protein Meis1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 167.47 167.47 3 0.00018521 172218 QUIQUE_C1218_190116_001 47.281 40.847 358470000 93996000 0 0 0 0 0 0 69574000 0 9291600 185610000 0 0 993 1442 928 8830;8831;8832;8833 11413;11414;11415;11416 11413 4 AELAELPLR Unmodified 1010.576 0.57604528 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 75.182 75.182 2 0.0053947 76401 QUIQUE_C1438_190116_001 86.794 43.548 242510000 0 0 0 0 160850000 0 0 0 0 81657000 0 0 0 994 3926 929 8834;8835 11417;11418;11419 11418 2 AELANIER Unmodified 914.48214 0.48214489 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 30.25 30.25 2 0.042452 25259 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.981 21.422 72207000 0 0 0 0 0 0 0 26072000 0 11844000 34291000 0 0 995 4145 930 8836;8837;8838 11420;11421;11422 11420 3 AELATEEFLPVTPILEGFVILR Unmodified 2456.3567 0.3566636 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 2 2 2 2 173.67 173.67 2;3 3.1816E-15 176871 QUIQUE_C1277_190116_001 116.65 108.26 1171000000 72719000 42922000 11607000 7634500 74946000 14651000 34821000 106650000 160940000 0 271400000 247010000 125690000 996 2976 931 8839;8840;8841;8842;8843;8844;8845;8846;8847;8848;8849;8850;8851;8852;8853;8854;8855;8856;8857;8858 11423;11424;11425;11426;11427;11428;11429;11430;11431;11432;11433;11434;11435;11436;11437;11438;11439;11440;11441;11442;11443;11444 11425 22 AELDDTPMR Unmodified 1046.4703 0.47025958 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 36.511 36.511 2 0.0053947 31795 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 60.9 282360000 0 166770000 0 0 0 115590000 0 0 0 0 0 0 0 997 2208 932 8859;8860 11445;11446 11446 1 AELDDTPMR Oxidation (M) 1062.4652 0.4651742 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 1 0 1 1 21.08 21.08 2 0.024792 14368 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.546 38.591 302550000 0 0 0 0 0 0 0 144520000 0 0 158020000 0 0 998 2208 932 8861;8862 11447;11448 11448 2 AELDEVNK Unmodified 916.45018 0.45017606 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 19.947 19.947 2 0.011936 13151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.296 41.447 495270000 0 0 0 90588000 0 0 0 139040000 0 265650000 0 0 0 999 2886 933 8863;8864;8865 11449;11450;11451 11450 3 AELDGTILK Unmodified 958.53351 0.53351176 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.655 56.655 2 0.0089591 55938 QUIQUE_C1218_190116_001 77.318 38.526 720350000 95532000 108310000 90162000 75471000 0 82575000 77292000 68485000 76147000 46380000 0 0 0 1000 3719 934 8866;8867;8868;8869;8870;8871;8872;8873;8874 11452;11453;11454;11455;11456;11457;11458;11459;11460;11461;11462;11463;11464;11465;11466;11467 11453 16 AELEALLSSK Unmodified 1059.5812 0.58119023 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 81.209 81.209 2 0.0085422 83864 QUIQUE_C1438_190116_001 81.338 47.541 53220000 0 0 0 0 53220000 0 0 0 0 0 0 0 0 1001 3459 935 8875 11468 11468 1 AELEALLSSKDDVGK Unmodified 1573.8199 0.81991695 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 78.107 78.107 3 0.036004 78088 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.587 28.147 33549000 0 0 0 0 0 0 0 33549000 0 0 0 0 0 1002 3459 936 8876 11469 11469 1 AELEEMEEVHPSDEEEEDATK Unmodified 2445.0013 0.0013243106 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 68.403 68.403 3 6.2112E-06 67693 QUIQUE_C1403_190116_001 74.047 65.447 113680000 27717000 0 0 40140000 0 45823000 0 0 0 0 0 0 0 1003 921 937 8877;8878;8879 11470;11471;11472 11471 3 AELEEVTLDGKPLQALR Acetyl (Protein N-term) 1923.0313 0.031306714 4745 S4R3H4 ACIN1 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.63 134.63 2 1.0093E-29 140368 QUIQUE_C1218_190116_001 152.89 131.64 384940000 35264000 31054000 0 30442000 38326000 19755000 22389000 44917000 41440000 0 46490000 35182000 39678000 1004 4745 938 8880;8881;8882;8883;8884;8885;8886;8887;8888;8889;8890 11473;11474;11475;11476;11477;11478;11479;11480;11481;11482;11483;11484;11485 11473 13 AELEHLGGK Acetyl (Protein N-term) 994.50836 0.50835964 1563 O60237;Q6GQY8 PPP1R12B Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B yes no 1 0 0 1 1 1 57.827 57.827 2 0.01752 56045 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.679 41.054 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1005 1563 939 8891;8892;8893 11486;11487;11488 11486 3 AELEIQK Unmodified 829.45453 0.45453316 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 23.497 23.497 2 0.019293 17085 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.02 34.569 442630000 0 152260000 0 0 0 130820000 0 0 0 66863000 0 0 92692000 1006 1928 940 8894;8895;8896;8897 11489;11490;11491;11492 11491 4 AELEIQKDALEPGQR Unmodified 1695.8792 0.87916317 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 1 2 58.091 58.091 2;3 0.0002632 55971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.415 56.93 117560000 0 0 0 0 0 0 0 117560000 0 0 0 0 0 1007 1928 941 8898;8899 11493;11494 11493 2 AELELELGR Unmodified 1028.5502 0.55022446 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 76.551 76.551 2 0.00025853 77040 QUIQUE_C1277_190116_001 137.9 39.446 1929300000 137880000 126220000 171730000 43323000 146030000 57227000 149820000 273650000 0 117220000 328470000 228470000 149210000 1008 3117 942 8900;8901;8902;8903;8904;8905;8906;8907;8908;8909;8910;8911;8912 11495;11496;11497;11498;11499;11500;11501;11502;11503;11504;11505;11506;11507;11508;11509;11510;11511;11512;11513;11514;11515;11516;11517;11518;11519;11520;11521;11522;11523 11499 29 AELFTQSCADLDK Unmodified 1496.6817 0.68170891 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 72.146 72.146 2 3.2141E-31 72845 QUIQUE_C1218_190116_001 177.57 164.99 5521300000 738590000 608650000 472860000 540750000 556170000 471460000 466170000 120480000 245350000 358760000 362940000 227750000 351340000 1009 2851 943 8913;8914;8915;8916;8917;8918;8919;8920;8921;8922;8923;8924;8925;8926;8927;8928 11524;11525;11526;11527;11528;11529;11530;11531;11532;11533;11534;11535;11536;11537;11538;11539;11540;11541;11542;11543;11544;11545;11546;11547 11524 23 AELFTQSCADLDKWLHGLESQIQSDDYGK Unmodified 3353.551 0.55103568 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 2 2 161.51 161.51 3;4 8.1931E-284 168531 QUIQUE_DMIX5_190116_001 263.55 257.71 3149600000 0 131650000 0 24115000 142910000 0 164440000 56191000 520510000 0 749790000 845670000 514300000 1010 2851 944 8929;8930;8931;8932;8933;8934;8935;8936;8937;8938;8939;8940;8941;8942;8943 11548;11549;11550;11551;11552;11553;11554;11555;11556;11557;11558;11559;11560;11561;11562;11563;11564;11565;11566;11567 11559 20 AELGALPDDFIDSLEK Unmodified 1731.8567 0.85669639 4078 Q9BYT8;E9PCB6 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.61 149.61 2 2.7934E-09 154502 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.32 109.03 1197000000 106040000 87518000 90307000 101830000 0 59891000 226530000 71353000 202300000 32966000 91180000 60937000 66138000 1011 4078 945 8944;8945;8946;8947;8948;8949;8950;8951;8952;8953;8954;8955 11568;11569;11570;11571;11572;11573;11574;11575;11576;11577;11578;11579;11580;11581;11582;11583;11584 11578 17 AELGAVVDTVLALLEK Unmodified 1639.9396 0.93963816 528 A5YM72 CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 175.69 175.69 2;3 0.0001382 179583 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.22 60.48 203530000 74784000 0 0 0 0 0 51005000 5562200 30831000 0 38062000 0 3284400 1012 528 946 8956;8957;8958;8959;8960;8961;8962 11585;11586;11587;11588;11589;11590;11591 11588 7 AELGEYIR Unmodified 949.4869 0.48689592 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 53.8 53.8 2 0.022525 51794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.127 27.06 403380000 0 0 137210000 0 0 0 0 114440000 151730000 0 0 0 0 1013 3053 947 8963;8964;8965 11592;11593;11594 11594 3 AELGFLESCLR Unmodified 1293.6387 0.63872189 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.33 110.33 2 0.0034399 114429 QUIQUE_C1368_190116_001 109.66 90.393 422190000 0 0 63756000 55649000 81769000 0 72743000 0 59374000 0 0 88900000 0 1014 3750 948 8966;8967;8968;8969;8970;8971;8972;8973;8974;8975 11595;11596;11597;11598;11599;11600;11601;11602;11603;11604 11597 7 AELGIPLEEVPPEEINYLTR Unmodified 2281.1842 0.18417854 3032 Q13907 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.54 147.54 2;3 0.00016207 151861 QUIQUE_C1277_190116_001 92.457 80.765 314440000 37306000 50903000 43899000 22242000 37006000 30684000 21777000 25607000 0 12318000 0 32695000 0 1015 3032 949 8976;8977;8978;8979;8980;8981;8982;8983;8984;8985 11605;11606;11607;11608;11609;11610;11611;11612;11613;11614 11606 9 AELGLNEHHQNEVINYMR Acetyl (Protein N-term) 2208.0382 0.03819978 4249 Q9NQ48 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.271 91.271 3 4.0155E-11 93422 QUIQUE_C1368_190116_001 116.29 101.2 952670000 0 123760000 97787000 0 82766000 111240000 68485000 95205000 87737000 32432000 59916000 78372000 114970000 1016 4249 950 8986;8987;8988;8989;8990;8991;8992;8993;8994;8995;8996 11615;11616;11617;11618;11619;11620;11621;11622;11623;11624;11625;11626;11627;11628;11629 11616 15 AELIVQPELK Unmodified 1138.6598 0.6597749 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 70.971 70.971 2 0.013818 70649 QUIQUE_C1403_190116_001 64.711 44.935 46116000 0 0 0 46116000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1017 2096 951 8997 11630 11630 1 AELLDNEKPAAVVAPITTGYTVK Unmodified 2399.2948 0.29479162 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 1 1 1 99.036 99.036 2;3 1.4366E-16 102135 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.02 135.05 143690000 0 0 0 0 111550000 0 0 0 0 0 0 0 32141000 1018 4212 952 8998;8999 11631;11632;11633 11633 3 AELLVTEAPSKPITVTVEEQR Unmodified 2309.2478 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183860000 1034 1388 966 9125;9126;9127;9128;9129;9130;9131;9132;9133 11794;11795;11796;11797;11798;11799;11800;11801;11802 11797 8 AELSEEALLSVLPTIR Acetyl (Protein N-term) 1781.9775 0.97748023 2472 P45974;F5H571 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 3 1 1 2 1 2 1 1 174.27 174.27 2;3 4.2024E-166 180098 QUIQUE_C1438_190116_001 259.75 243.5 8748300000 439950000 425790000 1128800000 282930000 587610000 2481300000 440510000 441500000 658610000 121030000 640150000 518960000 581060000 1035 2472 967 9134;9135;9136;9137;9138;9139;9140;9141;9142;9143;9144;9145;9146;9147;9148;9149;9150 11803;11804;11805;11806;11807;11808;11809;11810;11811;11812;11813;11814;11815;11816;11817;11818;11819;11820;11821;11822 11809 19 AELSEGQVR Unmodified 987.49852 0.49852324 1019 F5H7S3;B7Z596;H0YL42;H0YK20 TPM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.961 19.961 2 0.00043684 13109 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.08 63.291 1706400000 0 0 283930000 0 242420000 0 227900000 144770000 304490000 0 0 225530000 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9160;9161;9162;9163;9164;9165;9166 11833;11834;11835;11836;11837;11838;11839;11840 11835 575 5 AELTALESLIEMGFPR Acetyl (Protein N-term) 1817.9233 0.92333617 942 E9PJ81;E9PRQ7;Q04323;A0A087WTZ5 UBXN1 UBX domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 2 1 182.91 182.91 2 1.2608E-44 189388 QUIQUE_DMIX5_190116_001 181.66 164.64 128270000 0 0 0 0 0 0 0 9570500 29227000 0 47184000 12693000 29593000 1040 942 971 9167;9168;9169;9170;9171;9172;9173 11841;11842;11843;11844;11845;11846;11847;11848;11849 11846 9 AELTSQESQISTYEEELAK Unmodified 2155.0168 0.016838441 2449 P42566 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 109.68 109.68 2 3.7533E-47 113136 QUIQUE_DMIX3_190116_001 163.99 127.05 131150000 0 0 0 27247000 0 0 0 33625000 34125000 0 0 0 36156000 1041 2449 972 9174;9175;9176;9177 11850;11851;11852;11853 11852 3 AELVAISSSEDEGNLR Unmodified 1688.8217 0.82170787 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 74.972 74.972 2 0.00015948 74727 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.731 75.192 31274000 0 0 0 0 0 0 0 31274000 0 0 0 0 0 1042 1187 973 9178 11854 11854 1 AELVGQLQR Unmodified 1012.5665 0.56654322 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.368 40.368 2 2.7816E-05 37327 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.07 114.27 7133500000 499440000 530200000 719990000 520840000 456820000 577670000 536830000 454570000 519170000 290650000 752530000 594650000 680180000 1043 4111 974 9179;9180;9181;9182;9183;9184;9185;9186;9187;9188;9189;9190;9191 11855;11856;11857;11858;11859;11860;11861;11862;11863;11864;11865;11866;11867;11868;11869;11870;11871;11872;11873 11864 17 AELVQGQSAPVGMK Acetyl (Protein N-term) 1455.7392 0.73916421 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 1 0 0 1 1 96.257 96.257 2 0.0090313 97877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.5 46.258 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1044 3875 975 9192;9193 11874;11875 11875 2 AELVQLEDEITTLR Unmodified 1628.8621 0.86211612 970 E9PPQ1;J3KNE7;Q16890;E9PNK6;E9PNQ9 TPD52L1 Tumor protein D53 yes no 0 0 0 1 1 1 1 133.38 133.38 2 0.00045361 139541 QUIQUE_C1438_190116_001 94.191 73.985 192910000 0 0 0 63487000 58637000 0 38294000 0 0 0 0 0 32489000 1045 970 976 9194;9195;9196;9197 11876;11877;11878;11879 11877 3 AEMADQAAAWLTR Unmodified 1432.6769 0.67689831 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A3B3ISD7;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 106.3 106.3 2;3 0.00049309 109707 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.522 74.668 534920000 0 56506000 0 54518000 84654000 0 0 0 62684000 36719000 172920000 0 66921000 1046 290;327;328 977 9198;9199;9200;9201;9202;9203;9204;9205 11880;11881;11882;11883;11884;11885;11886;11887;11888;11889 11889 9 AEMDAAIASCK Oxidation (M) 1181.5057 0.5056588 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.378 18.378 2 0.00055112 10695 QUIQUE_C1403_190116_001 106.16 80.907 1863500000 142150000 0 254270000 172100000 177090000 192870000 149190000 104740000 161850000 80674000 162550000 132490000 133530000 1047 2870 978 9206;9207;9208;9209;9210;9211;9212;9213;9214;9215;9216;9217 11890;11891;11892;11893;11894;11895;11896;11897;11898;11899;11900;11901 11892 2344 12 AEMDAAIASCK Unmodified 1165.5107 0.51074418 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.8 35.8 2 0.00035758 31327 QUIQUE_C1277_190116_001 117.7 97.073 8443900000 697960000 742160000 812870000 771840000 576720000 792820000 680370000 547140000 589810000 223180000 604700000 630800000 773570000 1048 2870 978 9218;9219;9220;9221;9222;9223;9224;9225;9226;9227;9228;9229;9230 11902;11903;11904;11905;11906;11907;11908;11909;11910;11911;11912;11913;11914 11903 12 AEMDAAIASCKR Oxidation (M) 1337.6068 0.60676983 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 1 13.522 13.522 3 0.001713 6013 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.118 49.751 72122000 0 0 0 0 0 0 0 51748000 11292000 0 0 9082100 0 1049 2870 979 9231;9232;9233 11915;11916;11917 11915 2344 3 AEMDAAIASCKR Unmodified 1321.6119 0.61185521 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 24.166 24.166 2;3 3.6863E-05 17879 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.16 98.586 705000000 0 0 0 0 0 0 0 136960000 112490000 0 204070000 157270000 94219000 1050 2870 979 9234;9235;9236;9237;9238;9239;9240;9241 11918;11919;11920;11921;11922;11923;11924;11925;11926;11927 11923 8 AEMDMVAWGVDLASVEQHINSHR Unmodified 2594.2006 0.20059044 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 144.44 144.44 4 0.028094 148226 QUIQUE_C1403_190116_001 30.976 23.529 21275000 0 0 0 21275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1051 2096 980 9242 11928 11928 0 AEMDQILHGLDK Unmodified 1368.6708 0.6707503 1864 P04424 ASL Argininosuccinate lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.855 85.855 3 0.0001347 86868 QUIQUE_C1403_190116_001 93.011 81.095 264630000 0 31596000 51670000 36597000 27285000 0 31520000 30506000 38748000 16706000 0 0 0 1052 1864 981 9243;9244;9245;9246;9247;9248;9249;9250;9251 11929;11930;11931;11932;11933;11934;11935;11936;11937;11938;11939 11932 11 AEMEAVFLENLR Unmodified 1420.7021 0.70205043 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;J9JIE9;A0A0A0MTR5;H0YB70;F6UJY9;H0YB18 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 124.97 124.97 2 0.00020157 130669 QUIQUE_C1218_190116_001 101.38 76.543 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1053 1025 982 9252;9253;9254;9255 11940;11941;11942;11943 11940 4 AEMEDLVSSKDDVGK Unmodified 1621.7505 0.75051676 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 53.409 53.409 3 0.0044935 51428 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.314 32.319 20863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20863000 0 1054 2385 983 9256 11944 11944 1 AEMELGLR Unmodified 917.46405 0.46405199 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 3 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 54.389 54.389 2 0.0003307 54027 QUIQUE_C1218_190116_001 155.51 89.838 3121000000 0 495450000 400740000 436890000 278840000 310140000 0 152690000 191000000 0 304620000 283410000 267210000 1055 2146 984 9257;9258;9259;9260;9261;9262;9263;9264;9265;9266;9267;9268;9269;9270;9271;9272 11945;11946;11947;11948;11949;11950;11951;11952;11953;11954;11955;11956;11957;11958;11959;11960;11961;11962;11963;11964;11965;11966;11967;11968;11969;11970;11971 11946 27 AEMELGLR Oxidation (M) 933.45897 0.45896661 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 31.202 31.202 2 0.030357 25661 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.342 35.849 333840000 0 0 0 0 0 0 0 98452000 0 84535000 0 150850000 0 1056 2146 984 9273;9274;9275 11972;11973;11974 11974 3 AEMETLVR Unmodified 947.47462 0.47461667 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.898 39.898 2 0.0036031 35147 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.89 54.684 2745700000 414800000 370890000 391840000 359820000 281720000 291230000 358630000 0 189080000 87682000 0 0 0 1057 3984 985 9276;9277;9278;9279;9280;9281;9282;9283;9284 11975;11976;11977;11978;11979;11980;11981;11982;11983;11984;11985 11985 10 AEMETLVR Oxidation (M) 963.46953 0.46953129 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 1 0 1 1 1 20.943 20.943 2 0.035999 14004 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.032 31.152 243150000 0 0 0 0 0 0 0 54230000 0 97964000 0 90953000 0 1058 3984 985 9285;9286;9287 11986;11987;11988 11987 3 AEMEVLLASK Unmodified 1089.574 0.57399637 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 70.217 70.217 2 0.0026934 71016 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.496 53.688 2025800000 0 0 265740000 0 225620000 0 211670000 0 363970000 177270000 331200000 265130000 185190000 1059 3117 986 9288;9289;9290;9291;9292;9293;9294;9295;9296 11989;11990;11991;11992;11993;11994;11995;11996;11997;11998 11995 9 AEMEVLLASK Oxidation (M) 1105.5689 0.56891099 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 1 0 1 37.526 37.526 2 0.03822 33748 QUIQUE_C1576_190116_001 53.756 38.124 86589000 0 0 0 0 0 0 86589000 0 0 0 0 0 0 1060 3117 986 9297 11999 11999 1 AEMIDFNIR Unmodified 1107.5383 0.53827956 1151 H0YEX9;P57087 JAM2 Junctional adhesion molecule B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 93.365 93.365 2 0.015421 95657 QUIQUE_C1277_190116_001 67.169 23.362 152580000 0 38475000 0 0 0 0 0 31915000 46337000 6940200 0 0 28912000 1061 1151 987 9298;9299;9300;9301;9302 12000;12001;12002;12003;12004 12000 5 AEMLEIVQAIYK Unmodified 1406.7479 0.74793799 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.01 137.01 2 0.00016302 141361 QUIQUE_C1277_190116_001 150.61 133.39 1249100000 193970000 195100000 161620000 168840000 121060000 0 0 0 105140000 44454000 117210000 0 141670000 1062 2726 988 9303;9304;9305;9306;9307;9308;9309;9310;9311 12005;12006;12007;12008;12009;12010;12011;12012;12013;12014;12015 12006 9 AEMLEIVQAIYK Oxidation (M) 1422.7429 0.74285261 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 1 0 2 1 103.83 103.83 2 0.01093 106255 QUIQUE_C1403_190116_001 61.56 8.8345 64936000 0 42218000 0 22718000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1063 2726 988 9312;9313;9314 12016;12017;12018 12018 2160 2 AEMMELNDR 2 Oxidation (M) 1139.4587 0.45870861 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 2 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 2 17.773 17.773 2 0.0027416 6526 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.635 87.648 2510400000 46030000 86325000 196650000 50274000 41128000 146600000 0 69623000 199180000 1412800000 75349000 53247000 133180000 1064 389;395;1336 989 9315;9316;9317;9318;9319;9320;9321;9322;9323;9324;9325;9326;9327;9328;9329;9330;9331;9332;9333 12019;12020;12021;12022;12023;12024;12025;12026;12027;12028;12029;12030;12031;12032;12033;12034;12035;12036;12037;12038;12039 12031 274;275 20 AEMMELNDR Oxidation (M) 1123.4638 0.46379399 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 1 0 10 8 10 10 7 8 10 9 10 8 13 7 6 33.482 33.482 2 2.5363E-06 19624 QUIQUE_C1218_190116_001 153.08 146.98 320080000000 14554000000 25084000000 23642000000 30670000000 19177000000 32837000000 26211000000 16335000000 41135000000 8456300000 34013000000 18052000000 29917000000 1065 389;395;1336 989 9334;9335;9336;9337;9338;9339;9340;9341;9342;9343;9344;9345;9346;9347;9348;9349;9350;9351;9352;9353;9354;9355;9356;9357;9358;9359;9360;9361;9362;9363;9364;9365;9366;9367;9368;9369;9370;9371;9372;9373;9374;9375;9376;9377;9378;9379;9380;9381;9382;9383;9384;9385;9386;9387;9388;9389;9390;9391;9392;9393;9394;9395;9396;9397;9398;9399;9400;9401;9402;9403;9404;9405;9406;9407;9408;9409;9410;9411;9412;9413;9414;9415;9416;9417;9418;9419;9420;9421;9422;9423;9424;9425;9426;9427;9428;9429;9430;9431;9432;9433;9434;9435;9436;9437;9438;9439;9440;9441;9442;9443;9444;9445;9446;9447;9448;9449 12040;12041;12042;12043;12044;12045;12046;12047;12048;12049;12050;12051;12052;12053;12054;12055;12056;12057;12058;12059;12060;12061;12062;12063;12064;12065;12066;12067;12068;12069;12070;12071;12072;12073;12074;12075;12076;12077;12078;12079;12080;12081;12082;12083;12084;12085;12086;12087;12088;12089;12090;12091;12092;12093;12094;12095;12096;12097;12098;12099;12100;12101;12102;12103;12104;12105;12106;12107;12108;12109;12110;12111;12112;12113;12114;12115;12116;12117;12118;12119;12120;12121;12122;12123;12124;12125;12126;12127;12128;12129;12130;12131;12132;12133;12134;12135;12136;12137;12138;12139;12140;12141;12142;12143;12144;12145;12146;12147;12148;12149;12150;12151;12152;12153;12154;12155;12156;12157;12158;12159;12160;12161;12162;12163;12164;12165;12166;12167;12168;12169;12170;12171;12172;12173;12174;12175;12176;12177;12178;12179;12180;12181;12182;12183;12184;12185;12186;12187;12188;12189;12190;12191;12192;12193;12194;12195;12196;12197;12198;12199;12200;12201;12202;12203;12204;12205;12206;12207;12208;12209;12210;12211;12212;12213;12214;12215;12216;12217;12218;12219;12220;12221;12222;12223;12224;12225;12226;12227;12228;12229;12230;12231;12232;12233;12234;12235;12236;12237;12238;12239;12240;12241;12242;12243;12244;12245;12246;12247;12248;12249;12250;12251;12252;12253;12254;12255;12256;12257;12258;12259;12260;12261;12262;12263;12264;12265;12266 12041 274;275 224 AEMMELNDR Unmodified 1107.4689 0.46887937 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 2 2 2 2 3 3 4 2 4 2 2 3 3 48.044 48.044 1;2 1.1092E-18 40863 QUIQUE_C1277_190116_001 224.24 188.36 312890000000 21957000000 24301000000 27621000000 27552000000 22497000000 25616000000 24499000000 22795000000 24880000000 15355000000 27547000000 22668000000 25601000000 1066 389;395;1336 989 9450;9451;9452;9453;9454;9455;9456;9457;9458;9459;9460;9461;9462;9463;9464;9465;9466;9467;9468;9469;9470;9471;9472;9473;9474;9475;9476;9477;9478;9479;9480;9481;9482;9483 12267;12268;12269;12270;12271;12272;12273;12274;12275;12276;12277;12278;12279;12280;12281;12282;12283;12284;12285;12286;12287;12288;12289;12290;12291;12292;12293;12294;12295;12296;12297;12298;12299;12300;12301;12302;12303;12304;12305;12306;12307;12308;12309;12310;12311;12312;12313;12314;12315;12316;12317;12318;12319;12320;12321;12322;12323;12324;12325;12326;12327;12328;12329;12330;12331;12332;12333;12334;12335;12336;12337;12338;12339;12340;12341;12342;12343;12344;12345;12346;12347;12348;12349;12350;12351;12352;12353;12354;12355;12356;12357;12358;12359;12360;12361 12279 81 AEMMELNDRFASYIEK Oxidation (M) 1961.8863 0.88629874 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 1 1 3 96.585 96.585 3 0.00036468 99922 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.418 72.138 651170000 0 0 0 0 0 0 0 651170000 0 0 0 0 0 1067 389;395;1336 990 9484;9485;9486 12362;12363;12364 12364 274;275 3 AEMMELNDRFASYIEK Unmodified 1945.8914 0.89138411 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 2 108.28 108.28 2;3 1.4946E-12 110775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146 108.29 751340000 0 0 0 0 0 0 0 751340000 0 0 0 0 0 1068 389;395;1336 990 9487;9488 12365;12366;12367;12368 12368 4 AEMTVFVR Unmodified 951.48479 0.48478743 4638 Q9Y5Z4 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.543 57.543 2 0.0083476 56902 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.662 61.305 871840000 75689000 88795000 78471000 77150000 104970000 0 81615000 113690000 0 0 121770000 0 129700000 1069 4638 991 9489;9490;9491;9492;9493;9494;9495;9496;9497;9498 12369;12370;12371;12372;12373;12374;12375;12376;12377;12378;12379 12375 11 AENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAK Acetyl (Protein N-term) 3263.375 0.37496461 3027 Q13838;Q5STU3;F6WLT2;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;F6R6M7;A0A0G2JHN7;F6U6E2;F6S2B7 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B yes no 1 0 0 2 152.62 152.62 3 9.8349E-20 157596 QUIQUE_C1218_190116_001 77.791 76.942 54364000 54364000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1070 3027 992 9499;9500 12380;12381 12380 1 AENDVDNELLDYEDDEVETAAGGDGAEAPAKK Acetyl (Protein N-term) 3391.4699 0.46992763 3027 Q13838;Q5STU3;F6WLT2;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;F6R6M7;A0A0G2JHN7;F6U6E2;F6S2B7 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 135.46 135.46 3 2.417E-64 138306 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.13 146.53 367210000 0 0 0 0 0 37597000 0 100760000 52118000 0 68110000 56122000 52510000 1071 3027 993 9501;9502;9503;9504;9505;9506 12382;12383;12384;12385;12386;12387 12383 6 AENEEAAACPAWER Unmodified 1602.6733 0.67326949 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.569 48.569 2 9.0327E-07 45605 QUIQUE_C1563_190116_001 144.47 132.61 403260000 59912000 80512000 0 79272000 69058000 53826000 0 0 0 0 0 0 60676000 1072 921 994 9507;9508;9509;9510;9511;9512;9513 12388;12389;12390;12391;12392;12393;12394;12395 12393 8 AENELKELEQK Unmodified 1329.6776 0.67760981 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 35.226 35.226 2 0.033989 30820 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.914 53.744 37085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37085000 0 1073 2385 995 9514 12396 12396 0 AENFFILR Unmodified 1008.5393 0.53926584 1063 F8WCF6;P59998;R4GN08;F8WDD7;A0A0A6YYG9 ARPC4-TTLL3;ARPC4 Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.443 99.443 2 5.2577E-06 102311 QUIQUE_C1277_190116_001 170.06 111.08 4605700000 318870000 288090000 379790000 347610000 375670000 305200000 375280000 292480000 357960000 162580000 531080000 433650000 437410000 1074 1063 996 9515;9516;9517;9518;9519;9520;9521;9522;9523;9524;9525;9526;9527 12397;12398;12399;12400;12401;12402;12403;12404;12405;12406;12407;12408;12409;12410;12411;12412;12413;12414;12415;12416;12417;12418;12419;12420;12421;12422 12400 26 AENNPWVTPIADQFQLGVSHVFEYIR Unmodified 3029.5036 0.50355562 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.74 167.74 3 4.8439E-114 172191 QUIQUE_DMIX3_190116_001 187.95 176.95 1811300000 80607000 138560000 253590000 97140000 0 57239000 0 0 251480000 0 415420000 244720000 272500000 1075 3136 997 9528;9529;9530;9531;9532;9533;9534;9535;9536 12423;12424;12425;12426;12427;12428;12429;12430;12431;12432 12429 10 AENNSEVGASGYGVPGPTWDR Unmodified 2161.9665 0.96647463 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.748 88.748 2 2.1062E-86 89950 QUIQUE_DMIX1_190116_001 191.44 178.24 469720000 32173000 38378000 70597000 46217000 46167000 36808000 0 50934000 0 0 58527000 45001000 44921000 1076 2916 998 9537;9538;9539;9540;9541;9542;9543;9544;9545;9546 12433;12434;12435;12436;12437;12438;12439;12440;12441;12442 12439 9 AENPQCLLGDFVTEFFK Unmodified 2013.9506 0.95061355 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 172.85 172.85 2;3 9.7778E-07 177569 QUIQUE_C1368_190116_001 105 90.126 106940000 6766100 19201000 9326500 4244100 13296000 0 23420000 6990300 0 0 10937000 5552000 7204900 1077 3102 999 9547;9548;9549;9550;9551;9552;9553;9554;9555;9556;9557 12443;12444;12445;12446;12447;12448;12449;12450;12451;12452;12453 12446 10 AENPSLENHR Acetyl (Protein N-term) 1207.5582 0.55816338 1413 O00505 KPNA3 Importin subunit alpha-4 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 24.083 24.083 2 0.0052046 17127 QUIQUE_C1563_190116_001 98.009 90.362 159800000 0 44836000 0 0 0 56541000 0 58427000 0 0 0 0 0 1078 1413 1000 9558;9559;9560;9561;9562;9563 12454;12455;12456;12457;12458;12459 12455 5 AENQVLAMR Unmodified 1030.523 0.52296385 2585 P51572;A0A2R8Y5M6 BCAP31 B-cell receptor-associated protein 31 yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.266 37.266 2 0.0031968 33026 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.853 58.303 425070000 0 0 0 0 0 0 138920000 0 109660000 56789000 0 119700000 0 1079 2585 1001 9564;9565;9566;9567 12460;12461;12462;12463 12461 4 AENSAALGKPTAGTTDAGEAAK Unmodified 2029.9916 0.99162674 3945 Q96T17 MAP7D2 MAP7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.971 22.971 3 2.3731E-07 17067 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.752 73.621 209430000 0 0 0 36407000 40277000 25716000 45808000 27303000 0 0 0 0 33923000 1080 3945 1002 9568;9569;9570;9571;9572;9573 12464;12465;12466;12467;12468;12469 12468 5 AENSSLNLIGK Unmodified 1144.6088 0.60880197 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.89 50.89 2 0.00049397 48210 QUIQUE_C1563_190116_001 101.65 48.48 11421000000 1102600000 1082000000 1047600000 856410000 927610000 663550000 1129500000 527290000 658660000 433160000 1105000000 878670000 1009200000 1081 1245 1003 9574;9575;9576;9577;9578;9579;9580;9581;9582;9583;9584;9585;9586 12470;12471;12472;12473;12474;12475;12476;12477;12478;12479;12480;12481;12482;12483;12484;12485;12486;12487 12477 17 AENTEGDLNSNLLHAPYHTGDPQLDTAIGQWLR Acetyl (Protein N-term) 3687.7554 0.75536622 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.49 156.49 3 4.1968E-65 158948 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.94 127.67 777620000 92158000 85304000 0 59715000 90732000 35197000 93730000 69344000 0 0 0 144910000 106530000 1082 3390 1004 9587;9588;9589;9590;9591;9592;9593;9594;9595 12488;12489;12490;12491;12492;12493;12494;12495;12496;12497;12498;12499 12495 12 AENYDIPSADR Unmodified 1249.5575 0.55749468 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.521 43.521 2 0.0011449 40361 QUIQUE_C1403_190116_001 103.7 86.315 7087700000 563380000 582480000 569890000 701370000 0 537960000 612860000 586490000 620970000 307280000 656100000 657130000 691760000 1083 2197 1005 9596;9597;9598;9599;9600;9601;9602;9603;9604;9605;9606;9607 12500;12501;12502;12503;12504;12505;12506;12507;12508;12509;12510;12511;12512;12513;12514 12503 12 AEPAKIEAFR Unmodified 1130.6084 0.60840804 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 1 1 29.37 29.37 3 0.0087266 24355 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.359 36.597 252580000 0 0 0 0 0 0 0 115610000 0 0 136970000 0 0 1084 1790 1006 9608;9609 12515;12516 12515 2 AEPEDHYFLLTEPPLNTPENR Unmodified 2481.1812 0.18121843 2714 P61158;B4DXW1;F8WDR7 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 4 2 4 3 1 1 2 2 1 2 1 2 3 112.42 112.42 2;3 1.5539E-26 116739 QUIQUE_C1277_190116_001 132.79 118.48 1908500000 212920000 226710000 197890000 200420000 141590000 165280000 195500000 185690000 158580000 169370000 0 0 54514000 1085 2714 1007 9610;9611;9612;9613;9614;9615;9616;9617;9618;9619;9620;9621;9622;9623;9624;9625;9626;9627;9628;9629;9630;9631;9632;9633;9634;9635;9636;9637 12517;12518;12519;12520;12521;12522;12523;12524;12525;12526;12527;12528;12529;12530;12531;12532;12533;12534;12535;12536;12537;12538;12539;12540;12541;12542;12543;12544;12545;12546;12547;12548;12549;12550;12551;12552;12553;12554;12555;12556;12557;12558;12559;12560;12561;12562;12563;12564;12565;12566;12567;12568;12569;12570;12571;12572;12573 12529 56 AEPFENHSALEIAEQLTLLDHLVFK Unmodified 2863.4756 0.47560953 3034 Q13972 RASGRF1 Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1 yes yes 0 0 0 1 165.23 165.23 4 0.02528 172671 QUIQUE_DMIX5_190116_001 24.459 12.379 29051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29051000 0 0 1086 3034 1008 9638 12574 12574 1 AEPLQPDPGAAEDAAAQAVETPGWK Acetyl (Protein N-term) 2560.2082 0.20816146 4638 Q9Y5Z4;Q5THN1 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes no 1 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 146.14 146.14 2;3 1.2364E-56 151607 QUIQUE_C1218_190116_001 151.62 140.99 1133900000 147910000 120030000 103110000 28220000 186820000 115950000 122740000 30057000 0 0 234940000 0 44077000 1087 4638 1009 9639;9640;9641;9642;9643;9644;9645;9646;9647;9648;9649;9650;9651;9652;9653;9654 12575;12576;12577;12578;12579;12580;12581;12582;12583;12584;12585;12586;12587;12588;12589;12590 12576 16 AEPPKAPEQEQAAPGPAAGGEAPK Unmodified 2297.1288 0.12878893 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 1 1 2 1 2 31.397 31.397 2;3 3.1176E-31 27117 QUIQUE_C1438_190116_001 139.67 127.52 7098300000 1190300000 987130000 611040000 763090000 1179600000 756770000 651220000 0 133170000 94035000 324120000 108790000 299090000 1088 2817 1010 9655;9656;9657;9658;9659;9660;9661;9662;9663;9664;9665;9666;9667;9668;9669;9670;9671;9672;9673;9674;9675;9676 12591;12592;12593;12594;12595;12596;12597;12598;12599;12600;12601;12602;12603;12604;12605;12606;12607;12608;12609;12610;12611;12612;12613;12614;12615;12616;12617;12618;12619;12620;12621;12622;12623;12624;12625 12608 35 AEPPQAMNALMR Unmodified 1327.6377 0.63767603 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 68.997 68.997 2 0.038427 70298 QUIQUE_C1218_190116_001 60.828 44.111 113780000 47378000 0 66404000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1089 2951 1011 9677;9678 12626;12627 12626 1 AEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVR Unmodified 3067.4345 0.43454936 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;D6RF23;D6RHJ5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 152.87 152.87 3 0.0010486 155024 QUIQUE_C1563_190116_001 36.311 29.735 86025000 0 0 0 41349000 0 44676000 0 0 0 0 0 0 0 1090 2787 1012 9679;9680 12628;12629;12630 12629 2 AEPSAATQSHSISSSSFGAEPSAPGGGGSPGACPALGTK Acetyl (Protein N-term) 3611.6434 0.64343251 1712;659 O95197;F5H891;F5GWG7;F5H617;B7Z4M1 RTN3 Reticulon-3;Reticulon no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.56 93.56 3 9.0191E-79 95411 QUIQUE_C1277_190116_001 131.95 127.09 2549900000 236520000 162160000 265480000 308790000 234310000 127270000 214930000 134590000 178970000 75968000 253690000 106450000 250830000 1091 1712;659 1013 9681;9682;9683;9684;9685;9686;9687;9688;9689;9690;9691;9692;9693 12631;12632;12633;12634;12635;12636;12637;12638;12639;12640;12641;12642;12643;12644;12645 12632 15 AEPSGAETRPPIR Acetyl (Protein N-term) 1421.7263 0.72629134 4272 Q9NRR5 UBQLN4 Ubiquilin-4 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 39.196 39.196 2 0.022102 35255 QUIQUE_C1368_190116_001 75.387 55.084 198070000 0 0 53626000 0 51515000 0 0 0 0 0 40201000 0 52727000 1092 4272 1014 9694;9695;9696;9697 12646;12647;12648;12649 12646 4 AEPTAAAVPPPAAPIPTQMPPVPSPSQPPSGKPVSAVK Unmodified 3665.9491 0.94910399 2404 P36957;Q86SW4 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 1 1 102.5 102.5 4 0.018159 104989 QUIQUE_C1403_190116_001 20.907 16.145 34161000 0 0 0 34161000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1093 2404 1015 9698 12650 12650 1 AEPVEVVAPR Unmodified 1065.5819 0.58185893 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.317 40.317 2 0.005136 36986 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.516 46.161 691690000 91783000 84828000 104540000 0 59854000 0 80365000 63770000 78011000 30855000 0 97684000 0 1094 1974 1016 9699;9700;9701;9702;9703;9704;9705;9706;9707;9708 12651;12652;12653;12654;12655;12656;12657;12658;12659;12660 12656 10 AEPVSSTEASSLGQK Unmodified 1489.726 0.72601657 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.449 33.449 2 4.0628E-05 29406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.43 75.086 830100000 125410000 0 151480000 0 0 0 91936000 131000000 68342000 0 85734000 68686000 107510000 1095 3452 1017 9709;9710;9711;9712;9713;9714;9715;9716 12661;12662;12663;12664;12665;12666;12667;12668 12664 7 AEPYAADEGSGEGHK Unmodified 1516.643 0.64301522 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 14.781 14.781 2;3 8.8694E-07 6185 QUIQUE_C1563_190116_001 91.076 85.592 493390000 24934000 44411000 45140000 30640000 41170000 46555000 46892000 22690000 42924000 0 71878000 32983000 43177000 1096 3895 1018 9717;9718;9719;9720;9721;9722;9723;9724;9725;9726;9727;9728;9729;9730;9731 12669;12670;12671;12672;12673;12674;12675;12676;12677;12678;12679;12680;12681;12682;12683 12674 15 AEPYCSVLPGFTFIQHLPLSER Unmodified 2560.2784 0.27843005 142 A0A0A0MRA5;B7Z4B8;Q9BUJ2;M0R3F1;M0QYZ0 HNRNPUL1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.74 150.74 3 3.3303E-06 153513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.651 64.881 1321300000 100630000 107390000 127600000 122630000 92786000 104230000 88236000 125060000 85462000 29004000 89827000 104290000 144170000 1097 142 1019 9732;9733;9734;9735;9736;9737;9738;9739;9740;9741;9742;9743;9744 12684;12685;12686;12687;12688;12689;12690;12691;12692;12693;12694;12695;12696;12697;12698 12692 15 AEQEEEFISNTLFK Unmodified 1683.7992 0.79918151 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.15 120.15 2;3 1.1917E-07 125483 QUIQUE_C1218_190116_001 129.84 77.997 678450000 56432000 73460000 72657000 65353000 55097000 69569000 0 0 59068000 42555000 59393000 61052000 63812000 1098 3173 1020 9745;9746;9747;9748;9749;9750;9751;9752;9753;9754;9755;9756;9757 12699;12700;12701;12702;12703;12704;12705;12706;12707;12708;12709;12710;12711;12712;12713;12714;12715;12716 12699 16 AEQEEMEVEER Oxidation (M) 1393.5667 0.56673874 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 1 0 1 1 19.436 19.436 2 0.0009931 11928 QUIQUE_C1368_190116_001 94.409 66.201 48036000 19792000 0 28244000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1099 2806 1021 9758;9759 12717;12718 12718 2251 2 AEQEEMEVEER Unmodified 1377.5718 0.57182411 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.269 30.269 2 0.00039512 24339 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.52 81.222 355440000 70186000 63577000 69220000 66436000 0 0 0 34870000 27120000 24033000 0 0 0 1100 2806 1021 9760;9761;9762;9763;9764;9765;9766 12719;12720;12721;12722;12723;12724;12725 12725 7 AEQEEYVQEGIR Unmodified 1449.6736 0.67358707 2955 Q12965;H0YLE5 MYO1E Unconventional myosin-Ie no no 0 0 0 2 45.691 45.691 2 0.00023846 42572 QUIQUE_C1403_190116_001 99.568 71.359 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1101 2955 1022 9767;9768 12726;12727 12726 2 AEQEPTAEQLAQIAAENEEDEHSVNYKPPAQK Acetyl (Protein N-term) 3605.6758 0.6757785 1293 J3KTF8;J3QQX2;P52565;J3KRE2;J3KRY1;J3KS60 ARHGDIA Rho GDP-dissociation inhibitor 1 yes no 1 0 1 2 2 2 5 2 3 3 2 2 2 2 2 2 111.06 111.06 3;4 5.057E-178 114641 QUIQUE_C1368_190116_001 211.87 206.7 19646000000 1746100000 2096000000 1756300000 1590500000 1619800000 1198400000 1176000000 1454700000 1625100000 841390000 1529800000 1395100000 1617300000 1102 1293 1023 9769;9770;9771;9772;9773;9774;9775;9776;9777;9778;9779;9780;9781;9782;9783;9784;9785;9786;9787;9788;9789;9790;9791;9792;9793;9794;9795;9796;9797;9798;9799 12728;12729;12730;12731;12732;12733;12734;12735;12736;12737;12738;12739;12740;12741;12742;12743;12744;12745;12746;12747;12748;12749;12750;12751;12752;12753;12754;12755;12756;12757;12758;12759;12760;12761;12762;12763;12764;12765;12766;12767;12768;12769;12770;12771;12772;12773;12774;12775;12776;12777;12778 12734 51 AEQFYCGDTEGK Unmodified 1403.5663 0.5663448 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.049 36.049 2 0.0081161 30903 QUIQUE_C1563_190116_001 76.143 72.22 187030000 51516000 32824000 0 31457000 0 28504000 32636000 0 0 10091000 0 0 0 1103 903;2869 1024 9800;9801;9802;9803;9804;9805 12779;12780;12781;12782;12783;12784 12782 3 AEQFYCGDTEGKK Unmodified 1531.6613 0.66130782 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 2 1 2 21.034 21.034 2;3 0.00067463 13756 QUIQUE_C1277_190116_001 97.911 76.539 842910000 69008000 103800000 32511000 0 102590000 81604000 119490000 47684000 22834000 0 99170000 58665000 105550000 1104 903;2869 1025 9806;9807;9808;9809;9810;9811;9812;9813;9814;9815;9816;9817;9818;9819;9820;9821;9822 12785;12786;12787;12788;12789;12790;12791;12792;12793;12794;12795;12796;12797;12798;12799;12800;12801 12787 16 AEQINQAAGEASAVLAK Unmodified 1669.8635 0.8635131 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4;F2Z2I8 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.631 79.631 2;3 7.9078E-38 79414 QUIQUE_C1563_190116_001 164.64 141.27 1218000000 162230000 107060000 144240000 0 89602000 107170000 98594000 62573000 93496000 47216000 125250000 70620000 109960000 1105 4466 1026 9823;9824;9825;9826;9827;9828;9829;9830;9831;9832;9833;9834;9835 12802;12803;12804;12805;12806;12807;12808;12809;12810;12811;12812;12813;12814 12807 13 AEQLASVQYTLPK Unmodified 1446.7718 0.77184455 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 79.216 79.216 2 0.0010548 75893 QUIQUE_DMIX4_190116_001 109.24 89.921 114410000 39424000 0 0 0 0 0 0 0 48381000 26600000 0 0 0 1106 1074 1027 9836;9837;9838;9839;9840 12815;12816;12817;12818;12819 12818 4 AEQLFSSALCAAR Unmodified 1422.6925 0.69254837 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.99 86.99 2 7.2858E-10 89175 QUIQUE_C1277_190116_001 143.5 120.76 3077400000 398480000 400440000 357560000 286380000 356690000 0 0 264390000 271060000 0 385300000 0 357050000 1107 3859 1028 9841;9842;9843;9844;9845;9846;9847;9848;9849 12820;12821;12822;12823;12824;12825;12826;12827;12828;12829 12821 7 AEQMASVQNAQR Unmodified 1331.6252 0.62519709 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.304 20.304 2 1.2662E-09 13593 QUIQUE_C1218_190116_001 183.67 147.12 473720000 85079000 0 0 0 66220000 0 110790000 0 0 29480000 105420000 76737000 0 1108 345 1029 9850;9851;9852;9853;9854;9855 12830;12831;12832;12833;12834;12835 12830 5 AEQMASVQNAQR Oxidation (M) 1347.6201 0.62011171 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 1 0 1 11.368 11.368 2 0.0021983 3748 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.655 61.879 5069200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5069200 0 0 0 1109 345 1029 9856 12836 12836 243 1 AEQSDEAVK Acetyl (Protein N-term) 1017.4615 0.46146903 1773 P00167 CYB5A Cytochrome b5 yes yes 1 0 0 1 22 22 2 0.0051061 15189 QUIQUE_C1368_190116_001 74.301 52.215 21874000 0 0 21874000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1110 1773 1030 9857 12837 12837 1 AEQTILPLVDEALQHTTTK Unmodified 2107.1161 0.11609898 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 125.93 125.93 3 1.2755E-05 123249 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.539 64.583 558300000 39133000 45211000 28026000 55423000 75225000 45323000 27234000 43102000 0 24116000 41556000 29045000 104910000 1111 2225 1031 9858;9859;9860;9861;9862;9863;9864;9865;9866;9867;9868;9869;9870;9871;9872 12838;12839;12840;12841;12842;12843;12844;12845;12846;12847;12848;12849;12850;12851;12852;12853;12854;12855;12856 12852 15 AEQVALSR Acetyl (Protein N-term) 914.48214 0.48214489 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 1 0 0 1 56.227 56.227 2 0.064028 53947 QUIQUE_C1563_190116_001 47.603 8.8111 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1112 2024 1032 9873 12857 12857 1 AEQVDPNFYSK Unmodified 1296.5986 0.59863121 3832 Q96DB5;H0YC67;H0YC27;H0YBD9 RMDN1 Regulator of microtubule dynamics protein 1 yes no 0 0 0 1 50.352 50.352 2 0.0045987 48957 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.53 78.559 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1113 3832 1033 9874 12858 12858 1 AEQVIFVR Unmodified 960.53927 0.53926584 1325 K7EKE8;Q92692 PVRL2 Nectin-2 yes no 0 0 0 1 1 53.415 53.415 2 0.017595 51637 QUIQUE_C1218_190116_001 81.297 47.558 47012000 47012000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1114 1325 1034 9875;9876 12859;12860 12859 2 AEQWNVNYVETSAK Unmodified 1637.7686 0.76855009 2018 P11233;H7C3P7 RALA Ras-related protein Ral-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.573 75.573 2 3.8444E-14 75746 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.31 121.99 2133100000 0 216310000 306780000 282150000 0 184770000 0 197170000 239930000 100760000 420650000 0 184560000 1115 2018 1035 9877;9878;9879;9880;9881;9882;9883;9884;9885 12861;12862;12863;12864;12865;12866;12867;12868;12869;12870;12871;12872 12868 11 AESAPLPVSADDTPEVLNR Unmodified 1979.98 0.97999942 1742 O95674 CDS2 Phosphatidate cytidylyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.852 94.852 2 2.0156E-36 98594 QUIQUE_C1438_190116_001 156.81 139.15 559030000 35904000 25752000 63734000 56274000 43362000 50394000 52681000 53552000 44232000 0 59362000 30477000 43303000 1116 1742 1036 9886;9887;9888;9889;9890;9891;9892;9893;9894;9895;9896;9897 12873;12874;12875;12876;12877;12878;12879;12880;12881;12882;12883;12884 12877 11 AESAVIVANPR Unmodified 1125.6142 0.6142217 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.365 31.365 2 0.00022337 26126 QUIQUE_C1576_190116_001 122.44 99.007 1941700000 257550000 197410000 189340000 0 142610000 249560000 151150000 151280000 143290000 0 145720000 110190000 203610000 1117 4252 1037 9898;9899;9900;9901;9902;9903;9904;9905;9906;9907;9908 12885;12886;12887;12888;12889;12890;12891;12892;12893;12894;12895 12890 11 AESEAETPSTPGEFESK Acetyl (Protein N-term) 1836.7901 0.79013297 3998 Q9BR01;F8WE22 SULT4A1 Sulfotransferase 4A1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 76.901 76.901 2 1.0542E-22 77721 QUIQUE_DMIX7_190116_001 172.99 163.88 390170000 45266000 38976000 0 0 27157000 30879000 45483000 21656000 30816000 0 43895000 59427000 46612000 1118 3998 1038 9909;9910;9911;9912;9913;9914;9915;9916;9917;9918;9919;9920;9921 12896;12897;12898;12899;12900;12901;12902;12903;12904;12905;12906;12907;12908 12907 13 AESEEMETSQAGSK Unmodified 1482.6144 0.61441721 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.983 15.983 2 1.3678E-17 8301 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.3 166.7 1130800000 124350000 153080000 94716000 101040000 78217000 90748000 151000000 38783000 45571000 58659000 83199000 56082000 55350000 1119 2363 1039 9922;9923;9924;9925;9926;9927;9928;9929;9930;9931;9932;9933;9934 12909;12910;12911;12912;12913;12914;12915;12916;12917;12918;12919;12920;12921 12919 13 AESEQEAYLR Unmodified 1194.5517 0.55168102 4261 Q9NR28;A0A024RBT2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 30.655 30.655 2 0.00092514 25350 QUIQUE_C1368_190116_001 104.06 69.871 32808000 0 0 32808000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1120 4261 1040 9935;9936;9937 12922;12923;12924 12923 3 AESEQEAYLRED Unmodified 1438.6212 0.62121715 4261 Q9NR28;A0A024RBT2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.551 42.551 2 0.0028736 39493 QUIQUE_C1438_190116_001 129.16 95.778 622160000 68177000 75445000 49104000 75033000 63748000 43104000 35303000 38072000 62968000 21460000 43700000 46046000 0 1121 4261 1041 9938;9939;9940;9941;9942;9943;9944;9945;9946;9947;9948;9949 12925;12926;12927;12928;12929;12930;12931;12932;12933;12934;12935;12936 12929 12 AESEYTFER Unmodified 1130.488 0.48801813 734 C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 39.908 39.908 2 0.0079449 36379 QUIQUE_C1218_190116_001 80.165 63.389 115160000 37209000 54799000 0 0 0 0 0 23154000 0 0 0 0 0 1122 734 1042 9950;9951;9952 12937;12938;12939 12937 3 AESFFQTK Unmodified 956.46035 0.46034682 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 43.518 43.518 2 0.0036855 40317 QUIQUE_C1576_190116_001 121.99 100.22 704160000 119430000 98101000 0 104650000 119030000 86172000 113300000 0 0 63474000 0 0 0 1123 727 1043 9953;9954;9955;9956;9957;9958;9959 12940;12941;12942;12943;12944;12945;12946;12947;12948;12949 12948 10 AESFMFR Unmodified 886.40072 0.40072345 2966 Q13126;B4DUC8;J3QSB7 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 61.048 61.048 2 0.031782 60917 QUIQUE_C1438_190116_001 89.673 71.907 162630000 0 0 34421000 31766000 28007000 0 0 19985000 21878000 0 0 0 26570000 1124 2966 1044 9960;9961;9962;9963;9964;9965 12950;12951;12952;12953;12954;12955 12952 6 AESGDSLGSEDR Unmodified 1221.5109 0.51093842 4258 Q9NQW6;H7C1K5 ANLN Actin-binding protein anillin yes no 0 0 0 1 1 1 17.294 17.294 2 0.0058509 9904 QUIQUE_C1218_190116_001 65.5 25.878 29705000 14213000 11558000 0 0 0 0 0 0 0 3933400 0 0 0 1125 4258 1045 9966;9967;9968 12956;12957;12958 12956 3 AESGDSLGSEDRDLLYSIDAYR Unmodified 2431.1139 0.11392672 4258 Q9NQW6 ANLN Actin-binding protein anillin yes yes 0 0 1 1 120.25 120.25 3 0.00019128 126554 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.904 40.062 32355000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32355000 0 0 1126 4258 1046 9969 12959 12959 1 AESGESGGPPGSQDSAAGAEGAGAPAAAASAEPK Acetyl (Protein N-term) 2951.3017 0.30168051 4503 Q9UMX0 UBQLN1 Ubiquilin-1 yes yes 1 0 0 1 73.533 73.533 3 5.293E-06 73047 QUIQUE_C1563_190116_001 43.04 40.499 33909000 0 0 0 0 0 33909000 0 0 0 0 0 0 0 1127 4503 1047 9970 12960 12960 0 AESIIIR Acetyl (Protein N-term) 842.48617 0.48616764 3660 Q8TAT6;I3L4U9 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 90.56 90.56 2 0.0096278 93316 QUIQUE_C1218_190116_001 116.11 54.992 59338000 14526000 0 0 0 0 0 0 16569000 0 10908000 0 0 17334000 1128 3660 1048 9971;9972;9973;9974 12961;12962;12963;12964 12961 4 AESLIGVYPEQGDCVISK Unmodified 1963.9561 0.95609286 3079 Q14683;G8JLG1 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 0 1 100.11 100.11 2 0.00065608 103732 QUIQUE_C1576_190116_001 89.629 76.672 40099000 0 0 0 0 0 0 40099000 0 0 0 0 0 0 1129 3079 1049 9975 12965 12965 1 AESLQQEVEALK Unmodified 1343.6933 0.69325988 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 90.369 90.369 2 0.0033855 92291 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.243 35.686 1051000000 182460000 0 203480000 0 0 192100000 0 0 0 95753000 116230000 107540000 153390000 1130 890;3052 1050 9976;9977;9978;9979;9980;9981;9982 12966;12967;12968;12969;12970;12971;12972 12972 3 AESLQQEVEALKER Unmodified 1628.837 0.836964 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 78.424 78.424 2;3 7.7934E-07 79968 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.84 105.05 925360000 0 45652000 0 0 0 0 0 147640000 161450000 0 226900000 172890000 170840000 1131 890;3052 1051 9983;9984;9985;9986;9987;9988;9989;9990;9991;9992;9993 12973;12974;12975;12976;12977;12978;12979;12980;12981;12982;12983 12979 10 AESLQVTR Unmodified 902.48214 0.48214489 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.741 20.741 2 0.0009417 13428 QUIQUE_C1403_190116_001 147.52 60.653 9840700000 1115400000 1569300000 710460000 1115600000 578010000 1090700000 617560000 445290000 663100000 493150000 0 850980000 591130000 1132 1245 1052 9994;9995;9996;9997;9998;9999;10000;10001;10002;10003;10004;10005 12984;12985;12986;12987;12988;12989;12990;12991;12992;12993;12994;12995 12987 7 AESMFTNAVQILEQFK Oxidation (M) 1870.9135 0.91349976 367 A0A1W2PRH3;K7EPJ2;K7EMD7;K7ELE1;A0A1W2PNW5;A0A1W2PPB6;A0A1W2PR74;A0A1W2PPR7;A0A1W2PQZ1;A0A1W2PNQ8;A0A1W2PQR8;A0A1W2PQP4;A0A1W2PNR0;A0A1W2PNH8;A0A1W2PS19;A0A1W2PQA9;O95427 PIGN GPI ethanolamine phosphate transferase 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 136.7 136.7 2 0.00436 138479 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.466 28.591 450950000 65311000 0 0 84634000 117630000 0 0 0 93525000 0 0 0 89852000 1133 367 1053 10006;10007;10008;10009;10010;10011 12996;12997;12998;12999;13000;13001 13000 265 6 AESMFTNAVQILEQFK Unmodified 1854.9186 0.91858514 367 A0A1W2PRH3;K7EPJ2;K7EMD7;K7ELE1;A0A1W2PNW5;A0A1W2PPB6;A0A1W2PR74;A0A1W2PPR7;A0A1W2PQZ1;A0A1W2PNQ8;A0A1W2PQR8;A0A1W2PQP4;A0A1W2PNR0;A0A1W2PNH8;A0A1W2PS19;A0A1W2PQA9;O95427 PIGN GPI ethanolamine phosphate transferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.53 138.53 2 0.0049571 145340 QUIQUE_C1438_190116_001 56.225 16.959 1210500000 0 106370000 0 0 195110000 115170000 149300000 0 174830000 72985000 173130000 0 223590000 1134 367 1053 10012;10013;10014;10015;10016;10017;10018;10019;10020;10021 13002;13003;13004;13005;13006;13007;13008;13009;13010;13011 13004 8 AESMLQQADK Unmodified 1119.523 0.52302343 181 A0A0A0MSQ0;P13797;H7C4N2 PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.142 26.142 2 0.00021235 19975 QUIQUE_C1277_190116_001 129.38 87.276 515820000 44740000 46438000 48824000 39462000 51538000 35932000 48264000 28066000 45724000 18822000 67054000 40960000 0 1135 181 1054 10022;10023;10024;10025;10026;10027;10028;10029;10030;10031;10032;10033 13012;13013;13014;13015;13016;13017;13018;13019;13020;13021;13022;13023;13024;13025;13026 13014 15 AESPTQHPLLR Unmodified 1247.6622 0.66223452 297 A0A0J9YW40 yes yes 0 0 0 1 20.93 20.93 3 0.024639 13941 QUIQUE_C1576_190116_001 31.478 14.453 25846000 0 0 0 0 0 0 25846000 0 0 0 0 0 0 1136 297 1055 10034 13027 13027 1 AESQLLECK Unmodified 1076.5172 0.51720977 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 1 1 29.174 29.174 2 0.011612 23692 QUIQUE_C1438_190116_001 72.485 41.981 90863000 0 0 0 0 32219000 0 29659000 28985000 0 0 0 0 0 1137 2041 1056 10035;10036;10037 13028;13029;13030 13028 3 AESSDKLYR Acetyl (Protein N-term) 1109.5353 0.53530267 1974 P09874;Q5VX84;Q5VX85 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes no 1 0 1 1 30.182 30.182 2 0.061724 25181 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.825 50.846 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1138 1974 1057 10038 13031 13031 1 AESSSDEAVADTSR Unmodified 1423.6063 0.60629536 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363;H0YAP9 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.432 18.432 2 7.3818E-14 11081 QUIQUE_C1438_190116_001 167.6 146.13 262910000 25026000 20740000 30089000 26050000 64795000 0 40229000 0 26680000 9502300 0 0 19798000 1139 130 1058 10039;10040;10041;10042;10043;10044;10045;10046;10047;10048;10049 13032;13033;13034;13035;13036;13037;13038;13039;13040;13041;13042;13043 13037 12 AESTFLFLVGQDDHNWK Unmodified 2005.9534 0.95339074 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 123.21 123.21 2;3 0.00013909 128685 QUIQUE_C1218_190116_001 78.249 69.317 1224500000 79288000 60094000 114990000 118180000 108390000 113570000 111020000 175010000 73306000 55264000 74138000 63817000 77461000 1140 98;3487 1059 10050;10051;10052;10053;10054;10055;10056;10057;10058;10059;10060;10061;10062;10063 13044;13045;13046;13047;13048;13049;13050;13051;13052;13053;13054;13055;13056;13057;13058;13059;13060;13061;13062;13063;13064 13044 21 AESTPEIAEQR Unmodified 1229.5888 0.58879481 721 C9JFE4;Q13098 GPS1 COP9 signalosome complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.669 25.669 2 0.0012865 19271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.55 82.921 911310000 0 0 83364000 0 112860000 119320000 114250000 85052000 0 35753000 140110000 95781000 124810000 1141 721 1060 10064;10065;10066;10067;10068;10069;10070;10071;10072;10073 13065;13066;13067;13068;13069;13070;13071;13072;13073;13074 13072 9 AESVAAPITVR Unmodified 1112.619 0.61897272 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 46.424 46.424 2 0.0098689 42969 QUIQUE_C1277_190116_001 62.823 46.283 111810000 41700000 42308000 0 0 0 0 0 0 0 27799000 0 0 0 1142 3895 1061 10074;10075;10076 13075;13076;13077 13076 3 AETECQNTEYQQLLDIK Unmodified 2081.9575 0.95754942 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 103.48 103.48 2;3 0 101308 QUIQUE_DMIX4_190116_001 336.5 318.92 4055100000 299910000 0 150220000 235300000 246700000 189740000 115060000 213980000 267230000 651590000 402300000 548450000 734590000 + 1143 776 1062 10077;10078;10079;10080;10081;10082;10083;10084;10085;10086;10087;10088;10089;10090;10091;10092;10093;10094;10095;10096;10097;10098 13078;13079;13080;13081;13082;13083;13084;13085;13086;13087;13088;13089;13090;13091;13092;13093;13094;13095;13096;13097;13098;13099;13100;13101;13102;13103;13104;13105;13106;13107;13108;13109;13110;13111 13099 34 AETEEAEEPEEDGEEHVCVSASK Unmodified 2560.0395 0.039500731 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 44.094 44.094 3 1.1684E-05 41082 QUIQUE_C1368_190116_001 71.651 70.582 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1144 2483 1063 10099 13112 13112 1 AETEEGPDVLR Unmodified 1214.5779 0.57789577 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.029 40.029 2 0.0026838 35101 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.815 55.308 473960000 0 0 110330000 0 0 0 92544000 55040000 78653000 49767000 0 0 87623000 1145 1007 1064 10100;10101;10102;10103;10104;10105 13113;13114;13115;13116;13117;13118;13119;13120 13119 6 AETEELIR Unmodified 959.49238 0.49237523 2290 P29590;H3BT57;H3BT29;H3BUJ5 PML Protein PML yes no 0 0 0 1 31.873 31.873 2 0.056145 26784 QUIQUE_C1277_190116_001 54.157 31.138 119350000 0 119350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1146 2290 1065 10106 13121 13121 1 AETLEFNDVYQEVK Acetyl (Protein N-term) 1725.8097 0.8097462 2927 Q08945 SSRP1 FACT complex subunit SSRP1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.72 140.72 2 2.0461E-05 147589 QUIQUE_C1438_190116_001 143.97 127.44 396550000 0 51993000 0 46984000 41862000 0 0 48989000 38292000 0 65634000 51439000 51362000 1147 2927 1066 10107;10108;10109;10110;10111;10112;10113;10114;10115 13122;13123;13124;13125;13126;13127;13128;13129;13130;13131;13132 13127 11 AETLMTVTDPVHDIAFAPNLGR Unmodified 2367.1893 0.18928069 1331 K7ELV2;Q96EE3 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 132.46 132.46 3 1.8749E-09 135347 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.269 86.481 468230000 55732000 57769000 41593000 32434000 61381000 56343000 0 50452000 0 16644000 0 46739000 49143000 1148 1331 1067 10116;10117;10118;10119;10120;10121;10122;10123;10124;10125;10126;10127 13133;13134;13135;13136;13137;13138;13139;13140;13141;13142;13143;13144 13139 10 AETLSGLGDSGAAGAAALSSASSETGTR Acetyl (Protein N-term) 2536.1889 0.18888258 3138 Q15424;K7ES42 SAFB Scaffold attachment factor B1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 135.61 135.61 3 6.2844E-13 140812 QUIQUE_C1218_190116_001 72.035 60.735 209470000 55600000 0 0 52412000 49439000 42737000 0 0 0 9284200 0 0 0 1149 3138 1068 10128;10129;10130;10131;10132 13145;13146;13147;13148;13149 13145 5 AETLVTLDFTSR Unmodified 1351.6983 0.69834526 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 106.51 106.51 2 0.0003686 108903 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.83 81.609 325360000 0 35540000 0 0 39138000 42849000 0 51265000 56096000 38753000 0 61718000 0 1150 57 1069 10133;10134;10135;10136;10137;10138;10139;10140;10141;10142;10143 13150;13151;13152;13153;13154;13155;13156;13157;13158;13159;13160;13161;13162 13154 9 AETPTAAEDDNEGDKK Unmodified 1689.733 0.73295244 42 A0A087WUT6;O60841 EIF5B Eukaryotic translation initiation factor 5B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 11.253 11.253 3 0.00070941 3389 QUIQUE_C1576_190116_001 54.281 49.566 28020000 1720200 0 0 4949900 5658400 0 5489000 0 4874900 0 0 0 5327600 1151 42 1070 10144;10145;10146;10147;10148;10149 13163;13164;13165;13166;13167;13168;13169 13166 7 AETVADTR Acetyl (Protein N-term) 903.42977 0.42977497 1578 O60493 SNX3 Sorting nexin-3 yes yes 1 0 0 1 35.461 35.461 2 0.061794 31557 QUIQUE_C1438_190116_001 42.287 20.585 57423000 0 0 0 0 57423000 0 0 0 0 0 0 0 0 1152 1578 1071 10150 13170 13170 1 AETVADTRR Acetyl (Protein N-term) 1059.5309 0.530886 1578 O60493 SNX3 Sorting nexin-3 yes yes 1 0 1 1 1 1 22.925 22.925 2 0.0059279 16615 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.41 74.528 302810000 0 0 0 0 0 0 0 302810000 0 0 0 0 0 1153 1578 1072 10151;10152;10153 13171;13172;13173 13171 3 AETVQAALEEAQR Unmodified 1414.7052 0.70522155 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 71.197 71.197 2;3 1.174E-12 71886 QUIQUE_C1438_190116_001 152.7 116 714210000 93032000 104160000 72616000 52961000 97038000 0 0 64203000 75433000 71653000 83111000 0 0 1154 2665 1073 10154;10155;10156;10157;10158;10159;10160;10161;10162;10163;10164;10165;10166 13174;13175;13176;13177;13178;13179;13180;13181;13182;13183;13184;13185;13186 13179 12 AETYDFLFK Acetyl (Protein N-term) 1174.5546 0.55464113 2706 P61018 RAB4B Ras-related protein Rab-4B no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.65 154.65 2 0.0005217 158876 QUIQUE_C1277_190116_001 107.29 94.258 350770000 31963000 36148000 36192000 28537000 27672000 24049000 26471000 0 27124000 12788000 36740000 25274000 37816000 1155 2706 1074 10167;10168;10169;10170;10171;10172;10173;10174;10175;10176;10177;10178 13187;13188;13189;13190;13191;13192;13193;13194;13195;13196;13197;13198;13199 13189 10 AETYEGVYQCTAR Unmodified 1546.6722 0.67220686 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.694 48.694 2 2.2409E-17 46977 QUIQUE_C1218_190116_001 164.43 148.8 2005300000 109370000 224930000 184180000 185900000 237560000 185130000 237250000 97505000 121700000 71198000 163800000 186730000 0 1156 756 1075 10179;10180;10181;10182;10183;10184;10185;10186;10187;10188;10189;10190 13200;13201;13202;13203;13204;13205;13206;13207;13208;13209;13210;13211;13212;13213 13201 14 AEVAAEFLNDR Unmodified 1233.599 0.59896556 3664 Q8TBC4;F8W8D4 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.513 75.513 2 0.00065522 72245 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.249 60.773 336620000 67019000 0 0 49167000 0 70545000 0 39725000 0 32318000 77850000 0 0 1157 3664 1076 10191;10192;10193;10194;10195;10196;10197 13214;13215;13216;13217;13218;13219;13220 13219 6 AEVAAIYEPPQIGTQNSLELLEDPKAEVVDEIAAK Unmodified 3749.9251 0.92511689 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 1 1 1 149 149 3 4.7782E-05 153638 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.438 38.629 58887000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28606000 30281000 1158 3660 1077 10198;10199 13221;13222 13221 2 AEVADEKLHVTVR Unmodified 1465.7889 0.7888916 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 1 3 1 1 28.176 28.176 2;3 0.00028434 22441 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.591 63.857 361600000 0 0 0 0 0 0 0 226700000 73824000 0 0 61069000 0 1159 2121 1078 10200;10201;10202;10203;10204 13223;13224;13225;13226;13227;13228 13223 5 AEVCADCSAPDPGWASISR Unmodified 2047.8728 0.87277394 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.747 87.747 2 6.9506E-55 89294 QUIQUE_C1277_190116_001 171.76 162.57 183880000 42323000 39901000 0 31355000 32178000 0 38125000 0 0 0 0 0 0 1160 245 1079 10205;10206;10207;10208;10209;10210 13229;13230;13231;13232;13233;13234 13230 6 AEVDLER Unmodified 830.4134 0.41339662 2405 P36959 GMPR GMP reductase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 23.656 23.656 2 0.022679 17847 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.69 9.2243 290510000 0 0 0 0 0 63487000 0 64882000 0 50894000 0 0 111250000 1161 2405 1080 10211;10212;10213;10214 13235;13236;13237;13238 13236 4 AEVDMDTDAPQVSHKPGGEPK Unmodified 2207.0165 0.016461285 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 1 31.264 31.264 4 0.024085 26156 QUIQUE_C1368_190116_001 27.964 17.864 32587000 0 0 32587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1162 3053 1081 10215 13239 13239 1 AEVEETLK Acetyl (Protein N-term) 959.48114 0.48114184 4240 Q9NP97;Q8TF09;H3BNG9;H3BPA0 DYNLRB1;DYNLRB2 Dynein light chain roadblock-type 1;Dynein light chain roadblock-type 2 no no 1 0 0 1 30.694 30.694 2 0.039494 25452 QUIQUE_C1438_190116_001 48.561 8.4581 210820000 0 0 0 0 210820000 0 0 0 0 0 0 0 0 1163 4240 1082 10216 13240 13240 1 AEVEETLKR Acetyl (Protein N-term) 1115.5823 0.58225287 4240 Q9NP97;Q8TF09;H3BNG9;H3BPA0 DYNLRB1;DYNLRB2 Dynein light chain roadblock-type 1;Dynein light chain roadblock-type 2 no no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.443 54.443 2 0.0039566 52424 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.95 84.422 1037300000 0 153270000 0 0 0 0 150620000 150390000 162860000 43506000 203170000 173450000 0 1164 4240 1083 10217;10218;10219;10220;10221;10222;10223;10224;10225;10226 13241;13242;13243;13244;13245;13246;13247;13248;13249;13250 13247 7 AEVEVADELLENLAK Unmodified 1641.8461 0.84613171 3444 Q7L5D6;C9JPA8;C9JHN8 GET4 Golgi to ER traffic protein 4 homolog yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 143.36 143.36 2;3 2.0284E-07 150530 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.5 102.6 648950000 96583000 96399000 86980000 82711000 92904000 0 0 0 0 28855000 85749000 0 78772000 1165 3444 1084 10227;10228;10229;10230;10231;10232;10233;10234;10235;10236;10237 13251;13252;13253;13254;13255;13256;13257;13258;13259;13260;13261 13260 9 AEVGVIAK Unmodified 785.4647 0.46470391 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 20.99 20.99 2 0.04786 14219 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.122 22.764 18360000 0 0 0 0 0 0 0 18360000 0 0 0 0 0 1166 2990 1085 10238 13262 13262 1 AEVIMNYHVGETVLSLQK Unmodified 2030.0507 0.050661947 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 105.02 105.02 3 9.6152E-05 108256 QUIQUE_C1277_190116_001 78.021 57.93 339940000 0 53000000 33886000 37013000 42394000 32297000 0 35082000 0 0 48657000 57609000 0 1167 3135 1086 10239;10240;10241;10242;10243;10244;10245;10246 13263;13264;13265;13266;13267;13268;13269;13270;13271 13263 9 AEVLISTVGPEDCVVPFLTRPK Unmodified 2426.2879 0.28793211 2677 P56192;F5H2V6;F8VS26;F8W0M7;F8W0S4;F8VZZ9 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.47 130.47 3 3.4627E-08 134893 QUIQUE_C1277_190116_001 87.156 76.012 439620000 0 53681000 54734000 42052000 41332000 0 0 68324000 0 0 64404000 59324000 55767000 1168 2677 1087 10247;10248;10249;10250;10251;10252;10253;10254 13272;13273;13274;13275;13276;13277;13278;13279;13280;13281 13272 10 AEVLSEEPILK Unmodified 1226.6758 0.6758189 3437 Q7L1Q6 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 72.646 72.646 2 0.00049397 69334 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.65 56.893 482200000 92779000 60805000 73895000 77787000 0 0 0 66842000 79429000 30662000 0 0 0 1169 3437 1088 10255;10256;10257;10258;10259;10260;10261 13282;13283;13284;13285;13286;13287;13288 13288 4 AEVLWLMGAK Unmodified 1116.6002 0.60015154 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 112.5 112.5 2 0.020651 116032 QUIQUE_C1277_190116_001 59.245 34.322 11420000 0 11420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1170 1697 1089 10262;10263 13289;13290 13289 2 AEVNGLAAQGK Unmodified 1056.5564 0.55637247 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.92 19.92 2 0.00062229 13288 QUIQUE_C1218_190116_001 117.04 93.607 26749000000 1892900000 2131500000 2135200000 1844900000 2051200000 0 1583000000 3226300000 2913300000 1153400000 3077400000 2767700000 1971800000 1171 1978 1090 10264;10265;10266;10267;10268;10269;10270;10271;10272;10273;10274;10275 13291;13292;13293;13294;13295;13296;13297;13298;13299;13300;13301;13302;13303;13304 13291 11 AEVPGATGGDSPHLQPAEPPGEPR Unmodified 2365.1299 0.12985156 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WWC8 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.87 57.87 3 6.8554E-09 56364 QUIQUE_C1277_190116_001 80.683 72.879 1033200000 107870000 131630000 83036000 108420000 113960000 0 85177000 49181000 80254000 35047000 66269000 92532000 79846000 1172 140 1091 10276;10277;10278;10279;10280;10281;10282;10283;10284;10285;10286;10287 13305;13306;13307;13308;13309;13310;13311;13312;13313;13314;13315;13316 13306 11 AEVQHQLHVAVGSLQESILAQVQR Unmodified 2639.4143 0.41434668 3379 Q6P2E9;I3L3M2 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes no 0 0 0 1 115.88 115.88 4 0.00043923 120288 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.38 13.996 26382000 0 0 0 0 0 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no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.22 137.22 2 0.00057026 142871 QUIQUE_C1218_190116_001 104.22 86.991 111850000 14218000 0 15279000 0 26390000 0 0 20754000 35211000 0 0 0 0 1176 129 1094 10306;10307;10308;10309;10310;10311;10312 13335;13336;13337;13338;13339;13340;13341;13342 13335 8 AEVVETTQVYTEEETR Unmodified 1882.8796 0.87961668 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 64.493 64.493 2 5.6506E-06 60249 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.44 89.904 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1177 3117 1095 10313 13343 13343 1 AEVVETTQVYTEEETRR Unmodified 2038.9807 0.98072771 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 3 4 1 2 2 52.854 52.854 2;3;4 5.2526E-121 50613 QUIQUE_DMIX1_190116_001 226.59 183.78 4134900000 215480000 230690000 252270000 0 279810000 0 307000000 443640000 834030000 296010000 285230000 694780000 295990000 1178 3117 1096 10314;10315;10316;10317;10318;10319;10320;10321;10322;10323;10324;10325;10326;10327;10328;10329;10330;10331;10332;10333;10334;10335 13344;13345;13346;13347;13348;13349;13350;13351;13352;13353;13354;13355;13356;13357;13358;13359;13360;13361;13362;13363;13364;13365;13366;13367;13368;13369 13354 24 AEVVGKPSPEFFK Unmodified 1433.7555 0.7554662 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 56.512 56.512 2;3 0.00087256 55639 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.09 80.667 4442900000 0 128610000 196210000 0 191000000 83382000 182600000 797480000 543140000 0 586690000 760300000 973480000 1179 4111 1097 10336;10337;10338;10339;10340;10341;10342;10343;10344;10345;10346;10347;10348 13370;13371;13372;13373;13374;13375;13376;13377;13378;13379;13380;13381;13382;13383 13376 13 AEVVLGNIIK Unmodified 1054.6386 0.63864553 2985 Q13303;Q5TG80;Q5TG81;K7EKU4;K7EIR5;Q5TG84 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.758 81.758 2 0.0076369 83687 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.879 50.139 694360000 60269000 69307000 64792000 71755000 42157000 48849000 75768000 42121000 35469000 18793000 71279000 39501000 54297000 1180 2985 1098 10349;10350;10351;10352;10353;10354;10355;10356;10357;10358;10359;10360;10361 13384;13385;13386;13387;13388;13389;13390;13391;13392;13393;13394;13395;13396;13397 13394 14 AEVWDLDMLR Unmodified 1246.6016 0.6016081 3379 Q6P2E9 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 130.39 130.39 2 0.027126 134213 QUIQUE_C1403_190116_001 55.461 16.157 87187000 0 0 0 19039000 22558000 14352000 19873000 0 11365000 0 0 0 0 1181 3379 1099 10362;10363;10364;10365;10366;10367 13398;13399;13400;13401;13402;13403 13399 6 AEWLLAVR Unmodified 956.54435 0.54435122 4271 Q9NRN7 AASDHPPT L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.098 96.098 2 0.016541 98719 QUIQUE_C1368_190116_001 120.65 72.141 346500000 0 46719000 43660000 0 0 0 55297000 36624000 38788000 18379000 58084000 48952000 0 1182 4271 1100 10368;10369;10370;10371;10372;10373;10374;10375 13404;13405;13406;13407;13408;13409;13410;13411 13405 3 AEWQVYKEEISR Unmodified 1536.7573 0.75725712 2841 Q00059;H7BYN3 TFAM Transcription factor A, mitochondrial yes no 0 0 1 1 66.617 66.617 3 0.047114 66655 QUIQUE_DMIX3_190116_001 34.179 26.808 25542000 0 0 0 0 0 0 0 0 25542000 0 0 0 0 1183 2841 1101 10376 13412 13412 1 AEYAEFLHCK Unmodified 1266.5703 0.57030797 4528;840 E5RHK8;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 51.683 51.683 2;3 0.00099864 49655 QUIQUE_C1403_190116_001 74.162 55.431 739340000 0 47552000 55047000 63934000 93922000 47512000 89719000 0 28726000 0 110690000 123110000 79124000 1184 840;4528 1102 10377;10378;10379;10380;10381;10382;10383;10384;10385;10386;10387;10388;10389 13413;13414;13415;13416;13417;13418;13419;13420;13421;13422;13423;13424;13425;13426 13415 14 AEYDLTTR Acetyl (Protein N-term) 1009.4716 0.47163978 2690 P60228;E5RHS5;E5RII3;E5RIP5;E5RJ25 EIF3E Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E yes no 1 0 0 1 1 1 72.507 72.507 2 0.016132 72202 QUIQUE_C1277_190116_001 65.246 51.575 59436000 25454000 22475000 0 0 0 0 0 0 0 11507000 0 0 0 1185 2690 1103 10390;10391;10392 13427;13428;13429 13428 3 AEYEFDSPYWDDISDSAK Unmodified 2136.88 0.88001061 3039;3526 Q14012;H7C071;Q8IU85;A0A087WUR6 CAMK1;CAMK1D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.18 133.18 2 1.8869E-10 135794 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.87 124.79 1195800000 103090000 97022000 95895000 98472000 87485000 84376000 101020000 88810000 85357000 30783000 122960000 99451000 101080000 1186 3039;3526 1104 10393;10394;10395;10396;10397;10398;10399;10400;10401;10402;10403;10404;10405 13430;13431;13432;13433;13434;13435;13436;13437;13438;13439;13440;13441;13442 13437 13 AEYEGDGIPTVFVAVAGR Unmodified 1849.921 0.92102798 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.54 129.54 2 2.2718E-07 126131 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.13 126.1 1765300000 229520000 199390000 203710000 184150000 206740000 213300000 0 127490000 167100000 104360000 0 129520000 0 1187 2195 1105 10406;10407;10408;10409;10410;10411;10412;10413;10414;10415 13443;13444;13445;13446;13447;13448;13449;13450;13451;13452 13451 10 AEYGTLLQDLTNNITLEDLEQLK Acetyl (Protein N-term) 2675.3542 0.35415699 3114 Q15121;B1AKZ5 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes no 1 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 1 178.72 178.72 2;3 2.0765E-224 185329 QUIQUE_DMIX5_190116_001 260.12 242.38 1894000000 0 5240900 277640000 10859000 13661000 0 355050000 448890000 232320000 0 445230000 0 105090000 1188 3114 1106 10416;10417;10418;10419;10420;10421;10422;10423;10424;10425;10426;10427;10428 13453;13454;13455;13456;13457;13458;13459;13460;13461;13462;13463;13464;13465 13464 13 AEYLASIFGTEK Acetyl (Protein N-term) 1369.6765 0.67654718 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68;A0A1B0GW87;M0QYK5;M0R2N4;K7EJH3;K7EJM7 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.58 170.58 2 3.4562E-06 174778 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.81 119.13 2445900000 238460000 271240000 212210000 240270000 251090000 189900000 229200000 138610000 126230000 62303000 181510000 145520000 159320000 1189 1987 1107 10429;10430;10431;10432;10433;10434;10435;10436;10437;10438;10439;10440;10441 13466;13467;13468;13469;13470;13471;13472;13473;13474;13475;13476;13477;13478;13479 13474 14 AEYLASIFGTEKDK Acetyl (Protein N-term) 1612.7985 0.79845323 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68;A0A1B0GW87;M0QYK5;M0R2N4;K7EJH3;K7EJM7 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 1 0 1 1 1 1 1 154.1 154.1 2 0.0012353 157017 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.314 57.293 292150000 0 0 0 0 0 0 0 63624000 58682000 0 112950000 0 56894000 1190 1987 1108 10442;10443;10444;10445 13480;13481;13482;13483 13480 2 AEYLASIFGTEKDKVNCSFYFK Acetyl (Protein N-term) 2658.2676 0.26759059 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68;A0A1B0GW87;M0QYK5;M0R2N4 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 1 0 2 1 159.36 159.36 3 8.3947E-15 161874 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.06 112.03 28098000 0 0 0 0 0 0 0 28098000 0 0 0 0 0 1191 1987 1109 10446 13484 13484 1 AFAAGADIK Unmodified 862.45487 0.45486751 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 30.198 30.198 1;2 0.0081912 24513 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.474 28.508 4786900000 459690000 481480000 548230000 406990000 545170000 0 429570000 314770000 438520000 209580000 532650000 420220000 0 1192 2305 1110 10447;10448;10449;10450;10451;10452;10453;10454;10455;10456;10457;10458;10459;10460 13485;13486;13487;13488;13489;13490;13491;13492;13493;13494;13495;13496;13497;13498 13495 11 AFAAQEDLEK Unmodified 1120.5401 0.5400537 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 40.517 40.517 2 4.3648E-05 36441 QUIQUE_C1563_190116_001 144.09 122.64 3657100000 240430000 292130000 175060000 357820000 310850000 315520000 327950000 275430000 393230000 186210000 390720000 391750000 0 1193 434 1111 10461;10462;10463;10464;10465;10466;10467;10468;10469;10470;10471;10472;10473 13499;13500;13501;13502;13503;13504;13505;13506;13507;13508;13509;13510;13511;13512;13513 13504 14 AFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVR Oxidation (M) 3150.5036 0.5035569 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 1 1 1 2 1 168.54 168.54 3 1.9429E-65 170665 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.99 136.42 1012300000 58745000 123070000 119230000 84851000 109690000 137040000 0 126040000 144090000 20759000 88748000 0 0 1194 2514 1112 10474;10475;10476;10477;10478;10479;10480;10481;10482;10483;10484;10485;10486;10487 13514;13515;13516;13517;13518;13519;13520;13521;13522;13523;13524;13525;13526;13527 13523 1936;1937;1938 14 AFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVR Unmodified 3134.5086 0.50864228 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 171.07 171.07 2;3 1.4403E-66 175798 QUIQUE_C1368_190116_001 158.18 146.87 2624700000 135830000 314600000 255180000 73183000 136810000 55220000 256130000 206050000 169120000 13526000 498690000 333730000 176610000 1195 2514 1112 10488;10489;10490;10491;10492;10493;10494;10495;10496;10497;10498;10499;10500;10501 13528;13529;13530;13531;13532;13533;13534;13535;13536;13537;13538;13539;13540;13541 13530 13 AFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELR Unmodified 3029.538 0.53795179 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 1 168.55 168.55 2;3;4 7.1892E-66 172098 QUIQUE_C1277_190116_001 155.73 143.24 6978800000 357290000 584090000 623740000 251570000 434370000 372390000 561140000 705910000 513820000 135390000 956730000 705150000 777190000 1196 2573 1113 10502;10503;10504;10505;10506;10507;10508;10509;10510;10511;10512;10513;10514;10515;10516;10517;10518;10519;10520;10521;10522;10523;10524;10525;10526;10527 13542;13543;13544;13545;13546;13547;13548;13549;13550;13551;13552;13553;13554;13555;13556;13557;13558;13559;13560;13561;13562;13563;13564;13565;13566;13567 13545 26 AFADAMEVIPSTLAENAGLNPISTVTELR Oxidation (M) 3045.5329 0.53286642 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 158.58 158.58 3 1.1512E-15 162276 QUIQUE_C1403_190116_001 77.925 71.697 838420000 108770000 134290000 153750000 94921000 0 125360000 0 63961000 108410000 48957000 0 0 0 1197 2573 1113 10528;10529;10530;10531;10532;10533;10534;10535 13568;13569;13570;13571;13572;13573;13574;13575;13576 13571 2021 8 AFAFQASQDK Unmodified 1111.5298 0.52982336 694 C9J494;Q9H000 MKRN2 Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2 yes no 0 0 0 1 1 42.612 42.612 2 0.029338 39496 QUIQUE_C1576_190116_001 65.474 46.691 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1198 694 1114 10536;10537 13577;13578 13578 2 AFAFVTFADDQIAQSLCGEDLIIK Unmodified 2671.3204 0.32035445 2968 Q13148;B1AKP7;G3V162;A0A087X260;A0A087WYY0;A0A0A0N0M3;A0A1W2PNU8;A0A087WXQ5;A0A087WV68;A0A087WW61;A0A087WX67;A0A087WXV3;A0A087WYE7;A0A087WZC9;A0A087WZM1 TARDBP;TDP43 TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.24 169.24 3 1.8805E-18 171088 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.17 105.63 509220000 0 29502000 30929000 0 79010000 0 67928000 61186000 41379000 0 81430000 74947000 42906000 1199 2968 1115 10538;10539;10540;10541;10542;10543;10544;10545;10546 13579;13580;13581;13582;13583;13584;13585;13586;13587 13583 8 AFAGDIANQLATDAVQILGGNGFNTEYPVEK Unmodified 3222.5833 0.58332208 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 173.76 173.76 3;4 6.4103E-256 180965 QUIQUE_DMIX5_190116_001 209.68 195.22 1241600000 0 36760000 11427000 0 57741000 16984000 141480000 62912000 172420000 0 213140000 426330000 102400000 1200 666 1116 10547;10548;10549;10550;10551;10552;10553;10554;10555;10556;10557 13588;13589;13590;13591;13592;13593;13594;13595;13596;13597;13598;13599 13597 12 AFAHITGGGLLENIPR Unmodified 1664.8998 0.89983903 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.679 96.679 3 1.2466E-05 100523 QUIQUE_C1438_190116_001 71.279 58.402 723930000 0 75795000 68359000 54734000 70478000 59404000 73139000 49979000 73195000 0 83655000 63745000 51443000 1201 2194 1117 10558;10559;10560;10561;10562;10563;10564;10565;10566;10567;10568 13600;13601;13602;13603;13604;13605;13606;13607;13608;13609;13610;13611;13612 13604 13 AFAHLQVPER Unmodified 1166.6196 0.61964142 2834 P98160;A0A0U1RQT3 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 1 43.534 43.534 3 0.029152 40718 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.883 34.28 154700000 0 0 0 0 97309000 0 0 57388000 0 0 0 0 0 1202 2834 1118 10569;10570 13613;13614 13614 2 AFALEVIK Unmodified 889.5273 0.52730417 4150 Q9H2U2 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.576 80.576 2 0.025599 82533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.342 38.872 765110000 0 0 124410000 93497000 95685000 0 88883000 0 97745000 0 125480000 0 139410000 1203 4150 1119 10571;10572;10573;10574;10575;10576;10577 13615;13616;13617;13618;13619;13620;13621;13622;13623 13619 9 AFALNDLDDYEK Unmodified 1412.646 0.64597533 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.6 103.6 2 0.0022296 105919 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.228 52.198 635800000 41401000 47857000 59396000 65305000 57599000 55199000 62238000 28612000 27656000 23158000 74824000 34820000 57735000 1204 3049 1120 10578;10579;10580;10581;10582;10583;10584;10585;10586;10587;10588;10589;10590 13624;13625;13626;13627;13628;13629;13630;13631;13632;13633;13634;13635;13636;13637 13632 14 AFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLR Unmodified 3377.6959 0.69592577 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 2 1 154 154 3;4 1.4414E-87 158104 QUIQUE_C1277_190116_001 160.99 153.22 2789900000 183830000 126390000 0 236480000 250290000 117340000 130860000 388850000 275140000 0 424210000 380020000 276530000 1205 3130 1121 10591;10592;10593;10594;10595;10596;10597;10598;10599;10600;10601;10602;10603;10604;10605 13638;13639;13640;13641;13642;13643;13644;13645;13646;13647;13648;13649;13650;13651;13652;13653;13654;13655;13656 13639 16 AFAMIIDKLEEDINSSMTNSTAASRPPVTLR Oxidation (M) 3393.6908 0.6908404 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 1 2 2 1 4 1 145.76 145.76 3;4 1.5519E-30 159309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.794 90.474 624050000 0 0 0 142240000 0 0 0 70884000 0 0 349540000 0 61392000 1206 3130 1121 10606;10607;10608;10609;10610;10611;10612;10613 13657;13658;13659;13660;13661;13662;13663;13664;13665 13664 2587;2588 9 AFAMIIDKLEEDISSSMTNSTAASRPPVTLR Unmodified 3350.685 0.68502674 3131;1044 F8VZX2;H3BRU6;F8W0G4;F8VXH9;F8W1G6;H3BND9;Q15366 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 2 1 3 2 1 1 1 1 1 3 2 1 2 157.71 157.71 3;4 9.1375E-64 161942 QUIQUE_C1277_190116_001 146.45 140.79 2842900000 51745000 157060000 158200000 179160000 109440000 66214000 287360000 163720000 365780000 0 730350000 314490000 259370000 1207 1044;3131 1122 10614;10615;10616;10617;10618;10619;10620;10621;10622;10623;10624;10625;10626;10627;10628;10629;10630;10631;10632 13666;13667;13668;13669;13670;13671;13672;13673;13674;13675;13676;13677;13678;13679;13680;13681;13682;13683;13684;13685;13686;13687;13688;13689;13690;13691;13692 13668 24 AFANLRK Acetyl (Protein N-term) 860.48684 0.48683634 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34;A0A286YFF3;A0A286YFK5 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 1 0 1 1 1 43.298 43.298 2 0.032271 41004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.54 73.442 173360000 0 0 0 0 0 0 0 0 75957000 0 0 0 97403000 1208 404 1123 10633;10634 13693;13694 13693 0 AFAVGVQQVLLK Unmodified 1271.7602 0.76015765 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.27 102.27 2 0.00053086 104841 QUIQUE_C1277_190116_001 100.02 91.974 1162000000 100960000 118870000 0 104340000 0 85517000 0 117480000 126980000 55776000 182370000 132320000 137420000 1209 1727 1124 10635;10636;10637;10638;10639;10640;10641;10642;10643;10644 13695;13696;13697;13698;13699;13700;13701;13702;13703;13704;13705 13696 7 AFAVVASALGIPSLLPFLK Unmodified 1913.139 0.13900667 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 1 171.12 171.12 2;3 3.2018E-17 178342 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.1 121.79 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13747;13748;13749;13750;13751;13752;13753;13754;13755 13754 3 AFCQEMLQEEPR Unmodified 1536.6701 0.67009837 4214 Q9HBH5 RDH14 Retinol dehydrogenase 14 yes yes 0 0 0 1 1 72.51 72.51 2 0.00045515 72494 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.83 91.518 42501000 0 0 0 0 0 0 0 19328000 0 0 0 23173000 0 1215 4214 1130 10692;10693 13756;13757;13758 13756 2 AFCSFQIYAVPWQGTMTLSK Unmodified 2334.1177 0.11769565 1804 P01034 CST3 Cystatin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 152.57 152.57 2;3 4.28E-06 157513 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.72 115.12 133570000 0 0 0 0 0 0 0 34924000 34972000 0 0 63678000 0 1216 1804 1131 10694;10695;10696 13759;13760;13761 13760 2 AFDITYVR Unmodified 983.50763 0.50763136 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 74.843 74.843 2 0.0064687 75539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.64 70.354 472360000 0 74780000 89314000 0 0 0 68699000 0 77214000 0 91964000 70392000 0 1217 2008 1132 10697;10698;10699;10700;10701;10702 13762;13763;13764;13765;13766;13767 13765 6 AFDLFNPNFK Unmodified 1211.5975 0.597509 1300 J3QLR8;Q9Y3D9 MRPS23 28S ribosomal protein S23, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.3 120.3 2 0.0057299 126237 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.478 59.938 148850000 0 0 24854000 14757000 0 0 0 0 17819000 0 29648000 38533000 23241000 1218 1300 1133 10703;10704;10705;10706;10707;10708;10709;10710;10711;10712;10713 13768;13769;13770;13771;13772;13773;13774;13775;13776;13777;13778 13776 11 AFDLIVDRPVTLVR Unmodified 1612.9301 0.93007653 1767 O96000;H3BPJ9;H3BV16 NDUFB10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 2 2 107.82 107.82 2;3 7.5592E-11 110724 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.84 108.52 8081200000 500680000 802410000 876460000 525600000 458660000 499700000 876980000 438600000 491760000 282280000 738160000 827800000 762090000 1219 1767 1134 10714;10715;10716;10717;10718;10719;10720;10721;10722;10723;10724;10725;10726;10727;10728;10729;10730;10731;10732 13779;13780;13781;13782;13783;13784;13785;13786;13787;13788;13789;13790;13791;13792;13793;13794;13795;13796;13797;13798;13799;13800;13801 13798 21 AFDLVPPEAVPEQK Unmodified 1538.7981 0.7980593 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.826 99.826 2 0.001336 102910 QUIQUE_C1368_190116_001 76.302 50.183 311480000 46773000 0 53705000 64905000 53518000 0 48905000 0 0 0 43677000 0 0 1220 3857 1135 10733;10734;10735;10736;10737;10738;10739 13802;13803;13804;13805;13806;13807;13808 13804 6 AFDLVPPEAVPEQKDPDPEFPTVK Unmodified 2664.3323 0.33229934 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 1 1 119.65 119.65 3 0.017921 124576 QUIQUE_C1368_190116_001 29.47 22.11 135140000 0 0 135140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1221 3857 1136 10740 13809 13809 1 AFDPEAAAVQPYQDQTYQSVYFVSESFSDAK Unmodified 3487.5732 0.57321091 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 156.94 156.94 3 8.3013E-14 162240 QUIQUE_C1368_190116_001 72.603 64.737 83169000 0 0 34215000 25378000 0 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Unmodified 1040.4233 0.42330938 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.954 38.954 2 0.00051151 34474 QUIQUE_C1563_190116_001 128.61 113.94 5993400000 478770000 564630000 529160000 452560000 549100000 348400000 495640000 455400000 436770000 86243000 584160000 458160000 554390000 1229 2851 1143 10802;10803;10804;10805;10806;10807;10808;10809;10810;10811;10812;10813;10814 13876;13877;13878;13879;13880;13881;13882;13883;13884;13885;13886;13887;13888;13889;13890;13891 13884 16 AFEDEMSGR Oxidation (M) 1056.4182 0.418224 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 18.019 18.019 2 0.047156 10742 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.815 92.244 1115300000 0 0 0 0 0 0 0 0 575480000 125360000 0 414460000 0 1230 2851 1143 10815;10816;10817 13892;13893;13894 13894 2 AFEDTLQLMER Unmodified 1351.6442 0.6442012 1707 O95163;F5H2T0;H0YDF3 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 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10865;10866;10867;10868;10869;10870;10871;10872;10873;10874;10875;10876;10877 13945;13946;13947;13948;13949;13950;13951;13952;13953;13954;13955;13956;13957 13952 13 AFENDVDALCNLR Unmodified 1535.7038 0.70384134 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3;E7ENC1 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.09 104.09 2 6.6256E-07 107443 QUIQUE_C1368_190116_001 130.41 114.21 729580000 83405000 0 115030000 0 0 80506000 67358000 67226000 85561000 33674000 74649000 86064000 36115000 1239 739 1151 10878;10879;10880;10881;10882;10883;10884;10885;10886;10887 13958;13959;13960;13961;13962;13963;13964;13965;13966;13967 13959 10 AFEPATGR Unmodified 847.41882 0.41881635 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.585 19.585 2 0.0036229 12877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.69 44.78 8186800000 0 1137100000 326910000 768530000 292060000 1098700000 229060000 1397100000 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10941;10942;10943;10944;10945;10946;10947;10948;10949;10950;10951;10952;10953;10954;10955 14024;14025;14026;14027;14028;14029;14030;14031;14032;14033;14034;14035;14036;14037;14038;14039;14040;14041 14031 14 AFFLFDNLLVYCK Unmodified 1648.8323 0.83233632 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 2 163.41 163.41 2 0.0023561 167770 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.584 69.953 104830000 0 0 0 0 0 0 0 18754000 0 0 35714000 50358000 0 1247 3676 1159 10956;10957;10958;10959 14042;14043;14044;14045 14045 4 AFFNAVK Unmodified 795.42792 0.42792448 4494;981;1154 F1T0E5;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 48.888 48.888 2 0.035358 46267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.935 45.726 183080000 0 0 70147000 0 0 0 0 70539000 0 42395000 0 0 0 1248 981;1154;4494 1160 10960;10961;10962 14046;14047;14048 14047 3 AFFPACYSGDGR Unmodified 1346.5714 0.5713706 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.345 78.345 2 0.0020075 78739 QUIQUE_C1403_190116_001 77.662 71.072 464540000 30452000 47865000 41163000 35612000 34745000 0 37743000 39219000 38195000 14394000 65787000 28472000 50892000 1249 4176 1161 10963;10964;10965;10966;10967;10968;10969;10970;10971;10972;10973;10974 14049;14050;14051;14052;14053;14054;14055;14056;14057;14058;14059;14060;14061;14062;14063;14064;14065;14066;14067;14068 14055 20 AFFPCFDTPAVK Unmodified 1398.6642 0.66420836 4169 Q9H4A4;A6NKB8;A0A087WU27;C9JMZ3;A0A087WUS4 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.72 115.72 2 0.0027223 119072 QUIQUE_C1403_190116_001 74.162 65.204 1248600000 97387000 0 160370000 138350000 126290000 129660000 104380000 78730000 0 65608000 115250000 87789000 144800000 1250 4169 1162 10975;10976;10977;10978;10979;10980;10981;10982;10983;10984;10985 14069;14070;14071;14072;14073;14074;14075;14076;14077;14078;14079;14080;14081 14071 7 AFFPNMVNMIVLDK Unmodified 1637.831 0.83095611 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.71 154.71 2 1.6968E-10 159556 QUIQUE_DMIX3_190116_001 135.66 117.35 5368700000 344200000 0 466620000 516270000 539450000 407370000 613630000 299960000 502790000 107350000 590410000 342410000 638240000 1251 4560 1163 10986;10987;10988;10989;10990;10991;10992;10993;10994;10995;10996;10997 14082;14083;14084;14085;14086;14087;14088;14089;14090;14091;14092;14093;14094;14095;14096 14091 15 AFFPNMVNMIVLDK Oxidation (M) 1653.8259 0.82587073 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 141.1 141.1 2 0.0011404 145272 QUIQUE_C1277_190116_001 79.82 68.607 601230000 46330000 53999000 75489000 94710000 0 95332000 0 46941000 0 71377000 117060000 0 0 1252 4560 1163 10998;10999;11000;11001;11002;11003;11004;11005 14097;14098;14099;14100;14101;14102;14103;14104;14105;14106 14098 3008;3009 9 AFFPNMVNMIVLDK 2 Oxidation (M) 1669.8208 0.82078535 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 2 0 1 1 115.01 115.01 2 0.0020605 112656 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.342 52.403 39788000 0 0 0 0 0 39788000 0 0 0 0 0 0 0 1253 4560 1163 11006;11007 14107;14108 14108 3008;3009 2 AFFSEVER Unmodified 983.47125 0.47124585 4530 Q9UQ80;F8VR77 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.238 62.238 2 0.0036146 61235 QUIQUE_C1403_190116_001 112.17 78.621 1741300000 155500000 160210000 187890000 162950000 164800000 136210000 198200000 153290000 154920000 67134000 0 0 200220000 1254 4530 1164 11008;11009;11010;11011;11012;11013;11014;11015;11016;11017;11018 14109;14110;14111;14112;14113;14114;14115;14116;14117;14118;14119;14120;14121 14113 11 AFGAGADFVMLGGMLAGHSESGGELIER Unmodified 2778.3105 0.31053482 61;1172 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YMB3;H0YLV5;H0YLB8;H0YNS9 GMPR2 GMP reductase;GMP reductase 2 no no 0 0 0 1 148.21 148.21 3 8.0638E-06 155963 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.707 45.719 124880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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11038;11039;11040;11041;11042;11043;11044;11045 14143;14144;14145;14146;14147;14148;14149;14150;14151;14152;14153;14154;14155 14144 13 AFGFNVLFYDPYLSDGVER Unmodified 2208.0528 0.052770437 2989 Q13363;H0Y8W7;H0Y9M9 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 166.29 166.29 2 0.0001623 170442 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.814 65.981 177310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83316000 93991000 0 1258 2989 1168 11046;11047 14156;14157 14157 1 AFGFSHLEALLDDSK Unmodified 1648.8097 0.80968662 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 129.06 129.06 2;3 2.1548E-62 133981 QUIQUE_C1368_190116_001 232.42 196.87 8685500000 898180000 1156300000 886340000 765970000 872710000 867990000 919220000 115510000 428410000 178220000 638480000 461240000 496940000 1259 1282 1169 11048;11049;11050;11051;11052;11053;11054;11055;11056;11057;11058;11059;11060;11061;11062;11063;11064;11065;11066;11067;11068;11069;11070;11071 14158;14159;14160;14161;14162;14163;14164;14165;14166;14167;14168;14169;14170;14171;14172;14173;14174;14175;14176;14177;14178;14179;14180;14181;14182;14183;14184;14185;14186;14187;14188;14189;14190;14191;14192;14193;14194;14195;14196;14197;14198 14164 39 AFGFSHLEALLDDSKELQR Unmodified 2175.096 0.096032235 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 128.47 128.47 3;4 5.662E-55 134402 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.86 112.99 4560200000 76333000 42139000 151260000 81146000 258500000 31717000 263190000 619720000 418790000 0 649200000 703290000 1264900000 1260 1282 1170 11072;11073;11074;11075;11076;11077;11078;11079;11080;11081;11082;11083;11084;11085;11086;11087;11088;11089;11090;11091;11092 14199;14200;14201;14202;14203;14204;14205;14206;14207;14208;14209;14210;14211;14212;14213;14214;14215;14216;14217;14218;14219;14220;14221;14222;14223;14224;14225;14226;14227;14228;14229;14230;14231;14232;14233 14225 34 AFGGPGAGCISEGR Unmodified 1334.6037 0.60373336 4166 Q9H479 FN3K Fructosamine-3-kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.851 45.851 2 6.7309E-05 43322 QUIQUE_C1438_190116_001 116.55 104.02 1805900000 174800000 202900000 149300000 161830000 122970000 131860000 158460000 93239000 104800000 41409000 163750000 146320000 154230000 1261 4166 1171 11093;11094;11095;11096;11097;11098;11099;11100;11101;11102;11103;11104;11105 14234;14235;14236;14237;14238;14239;14240;14241;14242;14243;14244;14245;14246;14247;14248;14249;14250;14251;14252 14243 19 AFGGQSLK Unmodified 806.42865 0.42865276 2326 P31040;D6RFM5 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 21.207 21.207 2 0.039433 14370 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.895 17.849 55076000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55076000 0 1262 2326 1172 11106 14253 14253 1 AFGGVIFQK Unmodified 965.53345 0.53345218 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 73.605 73.605 2 0.014324 73645 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119260000 93359000 106950000 1265 2844 1175 11126;11127;11128;11129;11130;11131;11132;11133;11134 14276;14277;14278;14279;14280;14281;14282;14283;14284;14285;14286;14287 14285 12 AFGPGLEGGLVNK Unmodified 1257.6717 0.67173657 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 76.896 76.896 2 0.023598 74087 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.284 26.254 279520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 114290000 0 0 165240000 1266 3061 1176 11135;11136 14288;14289 14288 1 AFGPGLEPTGCIVDKPAEFTIDAR Unmodified 2560.2632 0.26317392 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.33 117.33 3 1.0583E-11 114435 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.565 77.621 1102000000 79573000 66178000 137000000 149660000 134100000 0 263410000 90154000 0 70394000 0 111520000 0 1267 3061 1177 11137;11138;11139;11140;11141;11142;11143;11144;11145 14290;14291;14292;14293;14294;14295;14296;14297;14298;14299 14298 10 AFGPGLQGGSAGSPAR Unmodified 1428.711 0.71097563 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.406 45.406 2 8.5749E-08 42511 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.71 129.39 2489800000 121840000 157080000 252490000 224860000 279530000 149470000 175000000 165580000 228480000 79505000 237560000 228820000 189600000 1268 2178 1178 11146;11147;11148;11149;11150;11151;11152;11153;11154;11155;11156;11157;11158 14300;14301;14302;14303;14304;14305;14306;14307;14308;14309;14310;14311;14312 14307 9 AFGSPFGLEEPQWVPDKECR Unmodified 2348.0896 0.089566649 3988 Q9BQ24;G3V2M2 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.48 121.48 3 1.0123E-05 125844 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.39 74.711 493030000 0 56813000 0 50653000 43834000 0 0 96612000 69385000 0 0 69062000 106670000 1269 3988 1179 11159;11160;11161;11162;11163;11164;11165 14313;14314;14315;14316;14317;14318;14319;14320;14321 14321 7 AFGSTIVINPEK Unmodified 1274.6871 0.68705229 1310 K4DI93;Q13620 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 72.76 72.76 2 0.00051585 73155 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.297 74.51 217120000 33204000 42996000 28729000 0 0 0 0 25827000 28177000 0 30017000 0 28174000 1270 1310 1180 11166;11167;11168;11169;11170;11171;11172;11173 14322;14323;14324;14325;14326;14327;14328;14329 14327 8 AFGVGVAYR Unmodified 938.4974 0.49740102 4024 Q9BTV5;M0R366;M0R1R0;M0QY68 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 58.285 58.285 2 0.00070122 56857 QUIQUE_C1403_190116_001 110.61 76.424 194490000 0 0 0 56474000 0 0 49003000 43493000 0 0 0 0 45517000 1271 4024 1181 11174;11175;11176;11177 14330;14331;14332;14333;14334;14335 14330 6 AFGYYGPLR Unmodified 1042.5236 0.52361577 2831 P84103;A0A087X2D0 SRSF3 Serine/arginine-rich splicing factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.863 77.863 2 0.00022907 78274 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.62 123.84 4004600000 300120000 387760000 0 315190000 545740000 416590000 347830000 363160000 485520000 214690000 628060000 0 0 1272 2831 1182 11178;11179;11180;11181;11182;11183;11184;11185;11186;11187 14336;14337;14338;14339;14340;14341;14342;14343;14344;14345;14346;14347;14348;14349 14347 14 AFHITNDEPIPFWTFLSR Unmodified 2190.0898 0.089824645 3153 Q15738 NSDHL Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.29 154.29 3 0.00017682 157171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.979 65.112 235360000 0 18178000 19565000 22319000 18047000 0 20438000 19035000 31412000 0 30370000 30197000 25804000 1273 3153 1183 11188;11189;11190;11191;11192;11193;11194;11195;11196;11197 14350;14351;14352;14353;14354;14355;14356;14357;14358;14359 14355 10 AFHNEAQVNPER Unmodified 1410.664 0.66402543 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 18.684 18.684 2;3 7.973E-14 11094 QUIQUE_DMIX8_190116_001 160.18 143.51 6175800000 609510000 0 1099900000 0 673640000 622650000 915120000 235720000 424420000 326950000 505640000 143950000 618290000 1274 2132 1184 11198;11199;11200;11201;11202;11203;11204;11205;11206;11207;11208;11209;11210 14360;14361;14362;14363;14364;14365;14366;14367;14368;14369;14370;14371;14372 14372 9 AFHNEAQVNPERK Unmodified 1538.759 0.75898845 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 3 3 1 1 3 12.413 12.413 2;3;4 0.00020048 4231 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.297 76.253 363240000 0 0 19460000 0 13681000 0 5779000 114740000 60097000 0 76326000 21867000 51286000 1275 2132 1185 11211;11212;11213;11214;11215;11216;11217;11218;11219;11220;11221;11222;11223;11224 14373;14374;14375;14376;14377;14378;14379;14380;14381;14382;14383;14384;14385;14386;14387 14387 15 AFHSAPGRPANPSK Unmodified 1435.732 0.73204542 172 A0A0A0MSB4;Q6ZN50;Q969R2;H7C368;H7C428;H7C1R2;C9JS84;H7C313 OSBP2 Oxysterol-binding protein;Oxysterol-binding protein 2 yes no 0 0 1 1 10.337 10.337 4 8.6821E-05 2714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.887 61.054 8654400 0 0 0 0 0 0 0 8654400 0 0 0 0 0 1276 172 1186 11225 14388 14388 1 AFIDVTAAAENIR Unmodified 1389.7252 0.72522871 2207 P23229;H7BZ97 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes no 0 0 0 1 106.87 106.87 2 0.0018383 109712 QUIQUE_C1403_190116_001 80.763 53.649 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1277 2207 1187 11226 14389 14389 1 AFIGIGFGDR Unmodified 1051.5451 0.5450795 4311 Q9NVZ3;F6SKB8 NECAP2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 99.156 99.156 2 0.0011234 102389 QUIQUE_C1218_190116_001 101.43 80.772 56396000 20507000 0 0 0 0 0 0 10867000 0 25022000 0 0 0 1278 4311 1188 11227;11228;11229 14390;14391;14392 14390 3 AFIIQHFADK Unmodified 1188.6291 0.62914348 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 59.603 59.603 3 0.01966 57551 QUIQUE_C1403_190116_001 45.158 30.951 71599000 40051000 0 0 31548000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1279 4607 1189 11230;11231 14393;14394 14394 2 AFIIQHFADKVEYQCEGFLEK Unmodified 2571.2468 0.24679557 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 114.83 114.83 4 0.01051 120804 QUIQUE_DMIX5_190116_001 26.417 19.619 29716000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29716000 0 0 1280 4607 1190 11232 14395 14395 1 AFIISFK Unmodified 824.47963 0.47962569 4203 Q9HAB8 PPCS Phosphopantothenate--cysteine ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.999 92.999 2 0.023465 95102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.07 28.046 183250000 0 20437000 25733000 0 23984000 0 27121000 24190000 28101000 0 33682000 0 0 1281 4203 1191 11233;11234;11235;11236;11237;11238;11239 14396;14397;14398;14399;14400;14401;14402 14400 7 AFIITGQTYTR Unmodified 1269.6717 0.67173657 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A0A6YY92;A0A096LNY6;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY5;A0A096LP92;A0A096LPA2 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 71.943 71.943 2 0.039667 71281 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.561 15.241 59562000 0 0 0 0 0 0 0 42474000 0 17088000 0 0 0 1282 338 1192 11240;11241 14403;14404 14403 2 AFIITLNSFGTELSK Unmodified 1639.8821 0.88212328 3616 Q8N8Y2 ATP6V0D2 V-type proton ATPase subunit d 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 138.58 138.58 2 3.3275E-24 142679 QUIQUE_C1277_190116_001 186.02 0 3360700000 363870000 340170000 254470000 260280000 383820000 281210000 349680000 161720000 285620000 121680000 318130000 0 240060000 1283 3616 1193 11242;11243;11244;11245;11246;11247;11248;11249;11250;11251;11252;11253;11254;11255 14405;14406;14407;14408;14409;14410;14411;14412;14413;14414;14415;14416;14417;14418;14419;14420;14421;14422;14423;14424;14425;14426;14427;14428;14429 14407 24 AFIITLNSFGTELSKEDR Unmodified 2040.0528 0.052770437 3616 Q8N8Y2 ATP6V0D2 V-type proton ATPase subunit d 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 124.17 124.17 3 3.6563E-19 127811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.02 0 321640000 0 0 0 0 0 0 0 104320000 0 0 121150000 0 96172000 1284 3616 1194 11256;11257;11258 14430;14431;14432 14430 1 AFIPAIDSFGFETDLR Unmodified 1797.8938 0.8937506 3099 Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes yes 0 0 0 1 1 1 1 153.31 153.31 2 5.7253E-07 156240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.14 103.41 354430000 0 0 0 0 0 0 0 71508000 102430000 0 0 98138000 82351000 1285 3099 1195 11259;11260;11261;11262 14433;14434;14435;14436;14437;14438 14433 6 AFIPLPSAVVQAVFGR Unmodified 1670.9508 0.95081197 4269 Q9NRG7;G3V5T1;Q86TZ5;F6RWC2;G3V4N6;G3V4Z0;H0YJ71;G3V451 SDR39U1 Epimerase family protein SDR39U1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.29 168.29 2;3 1.831E-09 173090 QUIQUE_C1368_190116_001 150.04 137.83 4436100000 298780000 292500000 381590000 269550000 408170000 516240000 362740000 243990000 465720000 74967000 472070000 390140000 259600000 1286 4269 1196 11263;11264;11265;11266;11267;11268;11269;11270;11271;11272;11273;11274;11275;11276;11277;11278;11279;11280;11281;11282;11283;11284;11285;11286;11287;11288 14439;14440;14441;14442;14443;14444;14445;14446;14447;14448;14449;14450;14451;14452;14453;14454;14455;14456;14457;14458;14459;14460;14461;14462;14463;14464 14444 26 AFIPQLLSR Unmodified 1043.6128 0.61276513 490 A0A3B3ISG5;P14735 IDE Insulin-degrading enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.15 101.15 2 0.0075799 105380 QUIQUE_C1438_190116_001 81.191 57.235 60276000 0 13727000 0 22043000 24505000 0 0 0 0 0 0 0 0 1287 490 1197 11289;11290;11291;11292;11293;11294 14465;14466;14467;14468;14469;14470;14471;14472 14469 8 AFITVLEMTPVLGTEIINYR Unmodified 2279.2235 0.22354093 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 168.19 168.19 2;3 2.5101E-56 174346 QUIQUE_C1438_190116_001 220.69 195.76 1291100000 78531000 107270000 89832000 31787000 86790000 46018000 117740000 142100000 137490000 25754000 199560000 192170000 36040000 1288 998 1198 11295;11296;11297;11298;11299;11300;11301;11302;11303;11304;11305;11306;11307;11308;11309;11310;11311;11312;11313;11314;11315;11316;11317;11318 14473;14474;14475;14476;14477;14478;14479;14480;14481;14482;14483;14484;14485;14486;14487;14488;14489;14490;14491;14492;14493;14494;14495;14496;14497;14498 14483 26 AFITVLEMTPVLGTEIINYR Oxidation (M) 2295.2185 0.21845556 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 1 0 1 1 160.54 160.54 3 4.4079E-06 164177 QUIQUE_C1403_190116_001 76.713 71.846 55481000 0 30862000 0 24620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1289 998 1198 11319;11320 14499;14500 14500 597 2 AFLADPSAFVAAAPVAAATTAAPAAAAAPAK Unmodified 2751.4596 0.45956554 1888 P05388;F8VWS0;F8W1K8 RPLP0 60S acidic ribosomal protein P0 yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 1 2 2 1 2 2 3 142.3 142.3 2;3;4 4.3479E-46 146762 QUIQUE_DMIX7_190116_001 179.46 168.99 5980600000 363080000 342460000 458800000 660880000 588770000 480140000 268170000 661060000 561800000 10021000 488520000 401650000 695280000 1290 1888 1199 11321;11322;11323;11324;11325;11326;11327;11328;11329;11330;11331;11332;11333;11334;11335;11336;11337;11338;11339;11340;11341;11342;11343;11344;11345;11346 14501;14502;14503;14504;14505;14506;14507;14508;14509;14510;14511;14512;14513;14514;14515;14516;14517;14518;14519;14520;14521;14522;14523;14524;14525;14526;14527;14528;14529;14530;14531;14532;14533;14534;14535 14531 33 AFLAELEQNSPK Unmodified 1345.6878 0.68778057 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 88.204 88.204 2 0.00020157 89980 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.38 84.332 22503000 0 0 0 0 0 22503000 0 0 0 0 0 0 0 1291 1187 1200 11347;11348;11349 14536;14537;14538 14537 3 AFLAQIHAR Unmodified 1025.577 0.57704833 4608;1367 M0QZ28;M0R0C4;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 36.169 36.169 2 0.018555 31691 QUIQUE_C1563_190116_001 64.236 53.822 212950000 0 0 0 64591000 0 58574000 0 0 0 0 0 0 89784000 1292 1367;4608 1201 11350;11351;11352;11353 14539;14540;14541;14542 14540 3 AFLASPEYVNLPINGNGK Unmodified 1902.984 0.98396259 1957 P09211;A8MX94 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 118.88 118.88 2;3 3.3118E-45 122787 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.11 145.4 3625900000 107270000 171200000 171120000 177980000 214170000 167050000 177120000 357190000 492600000 248560000 492780000 453050000 395780000 1293 1957 1202 11354;11355;11356;11357;11358;11359;11360;11361;11362;11363;11364;11365;11366;11367;11368;11369;11370;11371;11372;11373;11374;11375;11376 14543;14544;14545;14546;14547;14548;14549;14550;14551;14552;14553;14554;14555;14556;14557;14558;14559;14560;14561;14562;14563;14564;14565;14566;14567;14568;14569;14570;14571;14572 14561 27 AFLDALQNQAEASSK Unmodified 1591.7842 0.78420015 2952 Q12931 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.799 96.799 2 1.3313E-08 99131 QUIQUE_C1277_190116_001 122.39 74.454 1190000000 135550000 96813000 0 97255000 132990000 0 122720000 77036000 100270000 70722000 154370000 93939000 108370000 1294 2952 1203 11377;11378;11379;11380;11381;11382;11383;11384;11385;11386;11387 14573;14574;14575;14576;14577;14578;14579;14580;14581;14582;14583;14584 14575 10 AFLDFHALPYQVVEVNPVR Unmodified 2213.1633 0.16332394 4184 Q9H7Z7 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 141.42 141.42 2;3 1.3712E-05 146367 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.401 88.012 3145700000 38641000 344180000 346600000 40905000 371640000 194060000 278170000 208280000 326920000 90981000 282380000 284040000 338940000 1295 4184 1204 11388;11389;11390;11391;11392;11393;11394;11395;11396;11397;11398;11399;11400;11401;11402;11403;11404;11405;11406;11407;11408;11409 14585;14586;14587;14588;14589;14590;14591;14592;14593;14594;14595;14596;14597;14598;14599;14600;14601;14602;14603;14604;14605;14606;14607;14608;14609 14602 21 AFLDFHALPYQVVEVNPVRR Unmodified 2369.2644 0.26443497 4184 Q9H7Z7 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 127.23 127.23 4 1.1037E-25 133287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.9 127.6 278020000 0 0 0 0 0 0 0 45865000 46556000 0 91241000 55540000 38815000 1296 4184 1205 11410;11411;11412;11413;11414 14610;14611;14612;14613;14614 14612 5 AFLDFYHSFLEK Unmodified 1515.7398 0.73981614 1369 M0QZR4;Q92888 ARHGEF1 Rho guanine nucleotide exchange factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 137.58 137.58 3 0.0025123 141339 QUIQUE_C1403_190116_001 62.924 48.666 14745000 0 0 0 14745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1297 1369 1206 11415;11416;11417 14615;14616;14617 14616 3 AFLDGFNEVAPLEWLR Unmodified 1875.9519 0.95193418 1397 O00308 WWP2 NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 168.44 168.44 2 3.9066E-11 172379 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.39 90.063 120260000 18373000 33287000 0 0 0 0 0 24721000 0 0 0 43882000 0 1298 1397 1207 11418;11419;11420;11421 14618;14619;14620;14621 14621 3 AFLDNPGILSELCGTLSR Unmodified 1961.9881 0.98806169 3374 Q6NXE6;B4E1N1 ARMC6 Armadillo repeat-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 155.41 155.41 2 1.5359E-45 158153 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.95 151.27 364860000 55860000 56848000 41573000 0 0 37822000 0 29761000 48685000 0 0 57609000 36700000 1299 3374 1208 11422;11423;11424;11425;11426;11427;11428;11429 14622;14623;14624;14625;14626;14627;14628;14629;14630 14627 9 AFLDNPTIILAHIR Acetyl (Protein N-term) 1634.9144 0.91442646 593 B1AMB1;B1AMB2;Q9BPZ7 MAPKAP1 Target of rapamycin complex 2 subunit MAPKAP1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 158.09 158.09 2 0.00049494 162073 QUIQUE_C1403_190116_001 98.943 79.181 104230000 0 15928000 0 15374000 0 12590000 25213000 0 0 0 21035000 0 14088000 1300 593 1209 11430;11431;11432;11433;11434;11435 14631;14632;14633;14634;14635;14636;14637 14632 5 AFLDSLPDVK Unmodified 1103.5863 0.58627561 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.77 101.77 2 0.006665 105431 QUIQUE_C1218_190116_001 74.301 57.188 258350000 54609000 47371000 0 42113000 0 42458000 0 46873000 0 24930000 0 0 0 1301 1497 1210 11436;11437;11438;11439;11440;11441 14638;14639;14640;14641;14642;14643 14638 6 AFLEHMSEVQPDSPQGIYDTLLELR Unmodified 2887.4062 0.40620934 65;4141 A0A087WXL6;B7Z879;A0A0G2JS92;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 0 0 0 1 159.27 159.27 3 0.034912 164888 QUIQUE_C1576_190116_001 23.491 16.616 38007000 0 0 0 0 0 0 38007000 0 0 0 0 0 0 1302 65;4141 1211 11442 14644 14644 1 AFLFDVVSK Unmodified 1024.5593 0.55933258 4213 Q9HB90 RRAGC Ras-related GTP-binding protein C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.28 110.28 2 0.0041331 113475 QUIQUE_C1277_190116_001 89.698 53.513 858070000 76145000 62851000 64024000 59964000 83625000 59247000 78866000 51095000 71496000 31737000 76060000 69096000 73868000 1303 4213 1212 11443;11444;11445;11446;11447;11448;11449;11450;11451;11452;11453;11454;11455 14645;14646;14647;14648;14649;14650;14651;14652;14653;14654;14655;14656;14657;14658;14659;14660;14661;14662;14663 14647 19 AFLFVNK Unmodified 837.47487 0.47487467 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 70.073 70.073 2 0.024217 70557 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.513 61.484 306050000 0 0 0 37972000 43693000 36272000 0 46110000 57432000 0 34931000 0 49637000 1304 3565 1213 11456;11457;11458;11459;11460;11461;11462 14664;14665;14666;14667;14668;14669;14670;14671 14670 8 AFLHVPAK Unmodified 881.51232 0.51232281 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.569 28.569 2 0.016351 22388 QUIQUE_C1368_190116_001 83.287 66.582 268450000 0 0 46121000 45043000 46549000 19057000 0 26788000 46607000 14446000 0 0 23837000 1305 2075 1214 11463;11464;11465;11466;11467;11468;11469;11470 14672;14673;14674;14675;14676;14677;14678;14679 14672 8 AFLIEPEHVNTVGYGK Unmodified 1772.9097 0.90973501 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.575 80.575 3 0.00033451 81178 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.919 59.665 248100000 63105000 40857000 0 38491000 0 27757000 0 32373000 0 0 45518000 0 0 1306 3891 1215 11471;11472;11473;11474;11475;11476;11477;11478 14680;14681;14682;14683;14684;14685;14686;14687 14684 8 AFLLMASQYQQPHENDVAALLKPISEK Oxidation (M) 3056.5641 0.56410697 2422 P40123;A0A087WZ15;A0A087X0J3 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.4 123.4 4 2.8606E-32 127509 QUIQUE_C1277_190116_001 121.35 115.63 722910000 57401000 90296000 74331000 104900000 91210000 79809000 0 39985000 0 0 88067000 0 96907000 1307 2422 1216 11479;11480;11481;11482;11483;11484;11485;11486;11487 14688;14689;14690;14691;14692;14693;14694;14695;14696;14697;14698;14699 14690 1844 12 AFLLMASQYQQPHENDVAALLKPISEK Unmodified 3040.5692 0.56919234 2422 P40123;A0A087WZ15;A0A087X0J3 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 131.86 131.86 3;4 1.1138E-36 137527 QUIQUE_C1576_190116_001 127.14 120.98 4373800000 442310000 384150000 475070000 283460000 345190000 69400000 460870000 349540000 37035000 136190000 801430000 503860000 85341000 1308 2422 1216 11488;11489;11490;11491;11492;11493;11494;11495;11496;11497;11498;11499;11500;11501;11502;11503;11504;11505;11506;11507;11508;11509;11510 14700;14701;14702;14703;14704;14705;14706;14707;14708;14709;14710;14711;14712;14713;14714;14715;14716;14717;14718;14719;14720;14721;14722;14723;14724;14725;14726;14727;14728;14729;14730;14731 14717 31 AFLLMFIK Unmodified 981.57215 0.57214587 910 E9PEM5;P50851 LRBA Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein yes no 0 0 0 1 139.27 139.27 2 0.04028 143806 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.358 22.713 4707400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4707400 0 1309 910 1217 11511 14732 14732 1 AFLLSCMLLGGR Unmodified 1336.6995 0.699548 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 144.47 144.47 2 0.010215 151013 QUIQUE_C1438_190116_001 74.376 57.836 45777000 0 0 0 0 22747000 0 23030000 0 0 0 0 0 0 1310 3676 1218 11512;11513 14733;14734 14733 0 AFLLSLAALR Unmodified 1073.6597 0.65971533 3530 Q8IV08 PLD3 Phospholipase D3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.67 133.67 2 0.00013216 136388 QUIQUE_C1563_190116_001 121.62 87.822 431390000 40702000 35786000 35555000 50254000 41710000 28679000 45316000 0 32096000 19181000 44248000 31001000 26864000 1311 3530 1219 11514;11515;11516;11517;11518;11519;11520;11521;11522;11523;11524;11525;11526 14735;14736;14737;14738;14739;14740;14741;14742;14743;14744;14745;14746;14747;14748;14749;14750 14741 16 AFLMQHAPANDYLVTSHIHLHVPEGATPK Unmodified 3193.6131 0.61312284 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 91.739 91.739 4;5 0.0014413 94193 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.047 26.819 329810000 0 0 250530000 35612000 0 0 0 0 43666000 0 0 0 0 1312 1324 1220 11527;11528;11529;11530 14751;14752;14753;14754 14754 3 AFLNQAQIEVR Unmodified 1287.6935 0.69353465 441 A0A2R8YDF3;A0A2R8Y6L5;A0A2R8Y6I6;Q13627;A0A2R8Y443 DYRK1A Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A yes no 0 0 0 1 76.006 76.006 2 0.042645 75852 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.725 31.197 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1313 441 1221 11531 14755 14755 1 AFLQGGQEATDIALLLR Unmodified 1814.989 0.98904797 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 147.14 147.14 2;3 6.9299E-75 151344 QUIQUE_C1277_190116_001 198.49 179.74 3833400000 307630000 339000000 390510000 252910000 351130000 287670000 346370000 264030000 284670000 136730000 319480000 317940000 235260000 1314 890;3052 1222 11532;11533;11534;11535;11536;11537;11538;11539;11540;11541;11542;11543;11544;11545;11546;11547;11548;11549;11550;11551;11552;11553;11554;11555;11556;11557 14756;14757;14758;14759;14760;14761;14762;14763;14764;14765;14766;14767;14768;14769;14770;14771;14772;14773;14774;14775;14776;14777;14778;14779;14780;14781;14782;14783;14784;14785;14786;14787;14788;14789;14790;14791;14792;14793;14794 14760 39 AFLTGPHISLADLVAITELMHPVGAGCQVFEGR Oxidation (M) 3521.7799 0.77993018 2323 P30711;A0A0G2JRQ5 GSTT1 Glutathione S-transferase theta-1 yes no 0 1 0 1 1 1 156.78 156.78 4 2.7522E-29 160678 QUIQUE_C1403_190116_001 88.688 84.021 289930000 0 0 0 93353000 0 72162000 124410000 0 0 0 0 0 0 1315 2323 1223 11558;11559;11560 14795;14796;14797 14795 1706 3 AFLTGPHISLADLVAITELMHPVGAGCQVFEGRPK Oxidation (M) 3746.9277 0.92765705 2323 P30711;A0A0G2JRQ5 GSTT1 Glutathione S-transferase theta-1 yes no 0 1 1 1 1 146.69 146.69 5 9.4023E-30 149512 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.751 80.762 266160000 0 0 0 220070000 0 0 0 46092000 0 0 0 0 0 1316 2323 1224 11561;11562 14798;14799 14799 1706 1 AFLTLAEDILR Unmodified 1260.7078 0.70778773 2709 P61026 RAB10 Ras-related protein Rab-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 147.66 147.66 2 4.1333E-06 154095 QUIQUE_C1218_190116_001 147.51 112.7 8751400000 440410000 401340000 550680000 1028900000 804640000 742880000 805530000 1095800000 841330000 192600000 859070000 572040000 416180000 1317 2709 1225 11563;11564;11565;11566;11567;11568;11569;11570;11571;11572;11573;11574;11575;11576 14800;14801;14802;14803;14804;14805;14806;14807;14808;14809;14810;14811;14812;14813;14814;14815;14816;14817;14818;14819;14820;14821;14822;14823;14824;14825;14826;14827;14828;14829;14830 14801 31 AFLTLAEDILRK Unmodified 1388.8028 0.80275075 2709 P61026 RAB10 Ras-related protein Rab-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 125.73 125.73 3 0.00025824 131423 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.289 59.594 68981000 0 0 0 0 0 0 0 28483000 13245000 0 27253000 0 0 1318 2709 1226 11577;11578;11579 14831;14832;14833 14833 3 AFLVGIVVPDPEVMPSWAQK Oxidation (M) 2198.1446 0.14456233 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 1 0 1 150.27 150.27 2 8.9418E-05 153112 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.958 53.9 11904000 0 0 0 0 0 0 0 11904000 0 0 0 0 0 1319 4476 1227 11580 14834 14834 2979 1 AFMLLFLK Unmodified 981.57215 0.57214587 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 141.61 141.61 2 0.051145 148459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.039 20.356 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1320 264 1228 11581;11582 14835;14836 14836 2 AFMTADLPNELIELLEK Oxidation (M) 1962.002 0.00198042 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 1 0 2 2 3 2 1 1 2 2 2 2 2 2 168.32 168.32 2;3 7.4454E-53 172916 QUIQUE_C1218_190116_001 182.1 168.42 19177000000 881170000 1751900000 1540400000 1267900000 1996400000 1599600000 1424100000 591160000 1707800000 0 1795400000 1838800000 2782600000 1321 50;2631 1229 11583;11584;11585;11586;11587;11588;11589;11590;11591;11592;11593;11594;11595;11596;11597;11598;11599;11600;11601;11602;11603;11604;11605 14837;14838;14839;14840;14841;14842;14843;14844;14845;14846;14847;14848;14849;14850;14851;14852;14853;14854;14855;14856;14857;14858;14859;14860 14837 23 23 AFMTADLPNELIELLEK Unmodified 1946.0071 0.0070657979 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 170.9 170.9 2;3 4.4131E-63 172510 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.85 177.17 20704000000 1550000000 2790200000 2778700000 566600000 292510000 68795000 163980000 2962000000 2232800000 238300000 3892900000 400780000 2766300000 1322 50;2631 1229 11606;11607;11608;11609;11610;11611;11612;11613;11614;11615;11616;11617;11618;11619;11620;11621;11622;11623;11624;11625 14861;14862;14863;14864;14865;14866;14867;14868;14869;14870;14871;14872;14873;14874;14875;14876;14877;14878;14879;14880;14881 14873 21 AFNDPFIQK Unmodified 1078.5447 0.54474515 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598;R4GN69 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.381 75.381 2 0.0014209 72869 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.83 52.867 1892500000 170340000 197950000 196670000 234700000 0 211500000 236480000 165640000 180770000 80384000 0 218050000 0 1323 180;3738 1230 11626;11627;11628;11629;11630;11631;11632;11633;11634;11635 14882;14883;14884;14885;14886;14887;14888;14889;14890;14891;14892;14893 14892 12 AFNSNYEQR Unmodified 1127.4996 0.49958587 4651 Q9Y6D5 ARFGEF2 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 22.853 22.853 2 0.019974 16321 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.248 64.426 28784000 0 11814000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16970000 0 1324 4651 1231 11636;11637 14894;14895 14895 2 AFPALTSLDLSDNPGLGER Unmodified 1971.9902 0.99017018 1945 P08571;D6RFL4 CD14 Monocyte differentiation antigen CD14;Monocyte differentiation antigen CD14, urinary form;Monocyte differentiation antigen CD14, membrane-bound form yes no 0 0 0 1 1 1 136.22 136.22 2 8.6415E-17 140448 QUIQUE_C1403_190116_001 128.76 96.24 298670000 0 0 134960000 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11642;11643;11644;11645;11646;11647;11648;11649;11650;11651;11652;11653;11654;11655;11656;11657;11658;11659;11660;11661;11662;11663;11664;11665;11666;11667;11668;11669;11670;11671;11672;11673;11674;11675;11676;11677;11678;11679;11680 14900;14901;14902;14903;14904;14905;14906;14907;14908;14909;14910;14911;14912;14913;14914;14915;14916;14917;14918;14919;14920;14921;14922;14923;14924;14925;14926;14927;14928;14929;14930;14931;14932;14933;14934;14935;14936;14937;14938;14939;14940;14941;14942;14943;14944;14945;14946;14947;14948;14949;14950;14951;14952;14953;14954;14955;14956;14957;14958;14959;14960;14961;14962;14963;14964;14965;14966;14967;14968;14969;14970;14971;14972;14973;14974;14975;14976;14977;14978;14979;14980 14900 80 AFPCWDEPAIK Unmodified 1332.6173 0.61725816 959 E9PLK3;P55786;E9PP11 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 97.786 97.786 2 0.029311 100308 QUIQUE_C1277_190116_001 67.563 48.292 91565000 0 91565000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1328 959 1235 11681 14981 14981 0 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14986;14987;14988;14989;14990;14991;14992;14993;14994;14995;14996;14997;14998;14999;15000;15001;15002;15003;15004;15005;15006;15007;15008;15009;15010;15011;15012;15013;15014;15015;15016;15017;15018;15019;15020;15021;15022;15023;15024;15025;15026;15027;15028;15029;15030;15031;15032;15033;15034;15035;15036;15037;15038;15039;15040;15041;15042;15043;15044;15045;15046;15047;15048;15049;15050;15051;15052;15053;15054;15055;15056;15057 14992 72 AFPFHIIFDR Unmodified 1261.6608 0.66077796 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 117.99 117.99 2;3 0.0035252 123540 QUIQUE_C1438_190116_001 58.676 53.578 288010000 26395000 26102000 24866000 21199000 32786000 24862000 39399000 0 12664000 13337000 21929000 19013000 25456000 1331 2867 1238 11716;11717;11718;11719;11720;11721;11722;11723;11724;11725;11726;11727;11728;11729 15058;15059;15060;15061;15062;15063;15064;15065;15066;15067;15068;15069;15070;15071;15072;15073;15074;15075;15076;15077;15078;15079;15080 15065 23 AFPLPALSR Unmodified 970.56 0.56000128 852;554 E7ENQ6;A6XGL0 YJEFN3 YjeF N-terminal domain-containing protein 3 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 89.233 89.233 2 0.0075799 92075 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.191 59.42 261660000 25023000 46423000 46903000 33869000 0 0 0 0 34517000 0 40749000 0 34181000 1332 852;554 1239 11730;11731;11732;11733;11734;11735;11736;11737;11738 15081;15082;15083;15084;15085;15086;15087;15088;15089;15090 15089 9 AFPLPMSFGQDVDAAVGAALVMLR Oxidation (M) 2491.2603 0.26033715 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 1 0 1 1 175.81 175.81 3 4.5009E-07 182804 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.922 66.119 45817000 0 0 0 0 0 0 0 0 27236000 0 18581000 0 0 1333 212 1240 11739;11740 15091;15092 15092 126 2 AFPLPMSFGQDVDAAVGAALVMLR Unmodified 2475.2654 0.26542252 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 178.19 178.19 3 0.0007458 185067 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.198 40.397 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1334 212 1240 11741 15093 15093 1 AFPLQCIHIAEGHTK Unmodified 1720.8719 0.87190972 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YHT2;H0YI78 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 0 1 1 62.216 62.216 3 0.0099042 61808 QUIQUE_C1277_190116_001 43.861 33.58 45230000 0 22186000 23045000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1335 356 1241 11742;11743 15094;15095 15094 2 AFPNPYADYNK Unmodified 1298.5932 0.5931519 1555 O43813;E9PHS0;F8WDS9 LANCL1 LanC-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.095 71.095 2 0.00074623 72410 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 78.346 3637100000 438490000 374140000 305990000 308170000 306930000 0 369400000 341330000 275030000 145960000 348320000 423310000 0 1336 1555 1242 11744;11745;11746;11747;11748;11749;11750;11751;11752;11753;11754;11755 15096;15097;15098;15099;15100;15101;15102;15103;15104;15105;15106;15107;15108;15109 15096 14 AFPVLLLDTVPWYLR Unmodified 1802.0131 0.013077874 368 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QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.866 22.109 134200000 0 0 0 0 0 0 0 60133000 0 0 74068000 0 0 1339 4585 1245 11768;11769 15123;15124 15124 2 AFQNVFAPR Unmodified 1048.5454 0.54541385 1023 H0YFA9;H7C3P4;F6S8M0;P15586;F5H4C6 GNS N-acetylglucosamine-6-sulfatase yes no 0 0 0 1 1 1 68.09 68.09 2 0.012404 68126 QUIQUE_C1403_190116_001 84.244 65.461 58358000 0 0 0 27727000 0 0 0 0 0 0 30631000 0 0 1340 1023 1246 11770;11771;11772 15125;15126;15127;15128 15126 4 AFQPFFVELTMPYSVIR Unmodified 2044.0492 0.049205384 1802 P01023;P20742 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 166.89 166.89 2;3 2.1858E-06 171567 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.87 90.105 544110000 0 0 0 0 0 0 29094000 0 78453000 0 291850000 0 144710000 1341 1802 1247 11773;11774;11775;11776;11777 15129;15130;15131;15132;15133 15130 5 AFQPFFVELTMPYSVIR Oxidation (M) 2060.0441 0.044120006 1802 P01023;P20742 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 1 0 2 1 159.46 159.46 2;3 0.002015 166870 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.185 50.825 186930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119000000 0 67930000 1342 1802 1247 11778;11779;11780 15134;15135;15136 15134 1028 3 AFQSLLTEVNK Unmodified 1248.6714 0.67140222 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.989 86.989 2 0.00014245 88295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.85 113.22 1335000000 112330000 100630000 145540000 112820000 128300000 96463000 0 143680000 122360000 45033000 0 122830000 204960000 1343 2564 1248 11781;11782;11783;11784;11785;11786;11787;11788;11789;11790;11791 15137;15138;15139;15140;15141;15142;15143;15144;15145;15146;15147;15148;15149 15144 13 AFQSVLEVVAAPGSPYHR Unmodified 1926.9952 0.99519598 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 106.03 106.03 3 0.0082797 108064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.212 6.3282 20512000 0 0 0 0 0 0 0 20512000 0 0 0 0 0 1344 2456 1249 11792 15150 15150 1 AFQTDLYLLR Unmodified 1238.6659 0.66592292 3649 Q8NFJ9;E7EQH1 BBS1 Bardet-Biedl syndrome 1 protein yes no 0 0 0 1 1 1 111.25 111.25 2 0.0015158 114708 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.711 42.161 19351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19351000 0 1345 3649 1250 11793;11794;11795 15151;15152;15153 15152 3 AFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIK Unmodified 2746.2697 0.26971586 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 101.95 101.95 3 0.0014825 105070 QUIQUE_C1218_190116_001 37.436 31.177 91897000 91897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1346 2302 1251 11796 15154 15154 1 AFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIKPSPAASK Unmodified 3384.6085 0.60849098 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 3 89.927 89.927 3;4;5 7.7725E-65 92267 QUIQUE_C1368_190116_001 149.29 146.93 21763000000 1891000000 1723400000 2141700000 1492600000 1961100000 1825800000 1960300000 1166600000 1230800000 614910000 1477700000 1717700000 2559200000 1347 2302 1252 11797;11798;11799;11800;11801;11802;11803;11804;11805;11806;11807;11808;11809;11810;11811;11812;11813;11814;11815;11816;11817;11818;11819;11820;11821;11822;11823;11824 15155;15156;15157;15158;15159;15160;15161;15162;15163;15164;15165;15166;15167;15168;15169;15170;15171;15172;15173;15174;15175;15176;15177;15178;15179;15180;15181;15182;15183;15184;15185;15186;15187;15188;15189;15190;15191;15192;15193;15194;15195;15196;15197;15198;15199;15200;15201;15202;15203;15204;15205;15206;15207;15208;15209 15164 55 AFREEFGAEPELAVSAPGR Unmodified 2032.0014 0.0014035686 2583 P51570;K7ERJ9 GALK1 Galactokinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.079 87.079 3 0.00012729 90173 QUIQUE_C1438_190116_001 75.55 64.695 557630000 0 48265000 51440000 0 58748000 0 0 65276000 99489000 22137000 59758000 63824000 88696000 1348 2583 1253 11825;11826;11827;11828;11829;11830;11831;11832;11833 15210;15211;15212;15213;15214;15215;15216;15217;15218 15212 9 AFRPYGLHGGEPGAR Unmodified 1583.7957 0.79570831 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 1 1 2 28.785 28.785 3;4 0.021054 24094 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.332 18.539 140160000 0 0 0 0 0 0 0 31471000 108690000 0 0 0 0 1349 1450 1254 11834;11835;11836 15219;15220;15221 15219 3 AFSDIPSPYLR Unmodified 1264.6452 0.64518747 4324 Q9NXC2 GFOD1 Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 95.462 95.462 2 0.0016231 97699 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.731 60.808 191740000 37222000 0 0 0 0 18930000 0 27528000 27099000 0 38359000 42599000 0 1350 4324 1255 11837;11838;11839;11840;11841;11842 15222;15223;15224;15225;15226;15227 15227 6 AFSDPFVEAEK Unmodified 1238.5819 0.58191851 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.178 85.178 2 0.0011193 86224 QUIQUE_C1403_190116_001 107.21 82.282 3738500000 306610000 258770000 301630000 301970000 310220000 231410000 311850000 279470000 287570000 135770000 355190000 305990000 352090000 1351 2363 1256 11843;11844;11845;11846;11847;11848;11849;11850;11851;11852;11853;11854;11855 15228;15229;15230;15231;15232;15233;15234;15235;15236;15237;15238;15239;15240;15241;15242;15243;15244;15245;15246;15247 15233 20 AFSGLEGLEHLNLGGNAIR Unmodified 1967.0225 0.022473362 3885 Q96JA1 LRIG1 Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 122.25 122.25 3 1.7738E-05 125537 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.418 73.318 100780000 0 0 22470000 0 23458000 0 0 26156000 28700000 0 0 0 0 1352 3885 1257 11856;11857;11858;11859 15248;15249;15250;15251;15252 15250 3 AFSGLLSLEQLTLEK Unmodified 1647.9083 0.90833803 3447 Q7L985 LINGO2 Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 148.79 148.79 2 9.8585E-06 153447 QUIQUE_DMIX8_190116_001 103.43 87.179 64153000 0 0 0 14343000 0 0 19185000 0 0 0 0 0 30626000 1353 3447 1258 11860;11861;11862 15253;15254;15255 15255 3 AFSGLNSLEQLTLEK Unmodified 1648.8672 0.8672015 3851 Q96FE5;H0YMX3 LINGO1 Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 131.11 131.11 2 0.00030423 135656 QUIQUE_C1368_190116_001 82.543 67.341 103400000 27411000 0 34294000 0 0 0 41697000 0 0 0 0 0 0 1354 3851 1259 11863;11864;11865 15256;15257;15258 15257 3 AFSGYLGTDQSK Unmodified 1272.5986 0.59863121 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.974 52.974 2 4.6337E-20 51075 QUIQUE_C1438_190116_001 171.33 153.02 6790100000 826570000 389680000 725030000 667800000 465770000 0 606910000 835220000 460410000 433380000 760060000 619310000 0 1355 2003 1260 11866;11867;11868;11869;11870;11871;11872;11873;11874;11875;11876 15259;15260;15261;15262;15263;15264;15265;15266;15267;15268;15269;15270;15271;15272 15264 12 AFSIDIIR Unmodified 933.52837 0.5283668 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 97.445 97.445 2 0.035224 101255 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.565 21.101 49339000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12445000 36894000 0 0 1356 1187 1261 11877;11878 15273;15274 15274 2 AFSITQGLLK Unmodified 1076.623 0.62299547 1477 O15067;J3KTQ5 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.311 96.311 2 0.0039024 98963 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.75 66.903 350630000 0 39156000 32300000 31246000 45680000 0 0 48640000 33358000 0 48840000 30678000 40729000 1357 1477 1262 11879;11880;11881;11882;11883;11884;11885;11886;11887 15275;15276;15277;15278;15279;15280;15281;15282;15283;15284;15285;15286 15282 12 AFSPWQILSPVQWAK Acetyl (Protein N-term) 1798.9406 0.94064121 1633 O75410;E5RJG6 TACC1 Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 175.29 175.29 2 1.9924E-06 181082 QUIQUE_C1438_190116_001 141.08 125.94 85380000 0 10292000 5969200 0 16549000 0 0 16479000 19871000 0 0 0 16219000 1358 1633 1263 11888;11889;11890;11891;11892;11893 15287;15288;15289;15290;15291;15292 15289 6 AFSQFGK Unmodified 783.39154 0.39153897 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 28.419 28.419 2 0.046614 22645 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.496 52.676 193620000 0 0 0 72899000 0 0 0 58607000 62119000 0 0 0 0 1359 1581 1264 11894;11895;11896 15293;15294;15295 15295 3 AFSSLNTLPEELRPYVPLFCSVLTK Unmodified 2880.5096 0.5095522 3276 Q5JRX3;A0A0A0MRX9 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes no 0 0 1 1 163.74 163.74 3 0.0067051 171162 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.817 28.018 68476000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68476000 0 0 1360 3276 1265 11897 15296 15296 1 AFSVFLFNTENK Unmodified 1415.7085 0.70851601 3032 Q13907;C9JKM8;C9JD53 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 126.83 126.83 2 0.00024692 132684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.55 116.77 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1361 3032 1266 11898;11899;11900;11901;11902;11903 15297;15298;15299;15300;15301;15302 15301 6 AFSVNIFK Unmodified 924.5069 0.50690308 2022 P11279 LAMP1 Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 93.62 93.62 2 0.0048352 97245 QUIQUE_C1218_190116_001 107.67 56.101 172690000 56388000 0 46776000 0 0 35514000 0 0 0 34009000 0 0 0 1362 2022 1267 11904;11905;11906;11907;11908 15303;15304;15305;15306;15307;15308;15309;15310 15303 8 AFSWASVTSK Unmodified 1082.5397 0.53965977 4508 Q9UN86 G3BP2 Ras GTPase-activating protein-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 78.034 78.034 2 0.0054741 79764 QUIQUE_C1218_190116_001 77.355 62.82 178440000 79265000 0 0 57921000 0 41253000 0 0 0 0 0 0 0 1363 4508 1268 11909;11910;11911 15311;15312;15313;15314 15311 4 AFSYLTR Unmodified 856.4443 0.44430282 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 49.821 49.821 2 0.041878 47886 QUIQUE_C1277_190116_001 81.613 69.182 83148000 0 41609000 0 0 41539000 0 0 0 0 0 0 0 0 1364 3445 1269 11912;11913 15315;15316 15315 2 AFSYYGPLR Unmodified 1072.5342 0.53418046 208 A0A0B4J1Z1;C9JAB2;Q16629 SRSF7 Serine/arginine-rich splicing factor 7 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.676 76.676 2 0.0010391 76793 QUIQUE_C1403_190116_001 107.43 78.28 1560400000 0 88282000 69310000 109510000 139160000 157570000 155450000 111700000 127850000 79464000 206400000 139840000 175830000 1365 208 1270 11914;11915;11916;11917;11918;11919;11920;11921;11922;11923;11924;11925;11926 15317;15318;15319;15320;15321;15322;15323;15324;15325;15326;15327;15328;15329;15330;15331 15321 13 AFTDEETEAQTGEGSWPR Unmodified 2009.8603 0.86027822 2932 Q09019;H0YGU4;M0QX08 DMWD Dystrophia myotonica WD repeat-containing protein yes no 0 0 0 1 82.268 82.268 2 2.6062E-05 84128 QUIQUE_C1576_190116_001 92.295 78.633 35924000 0 0 0 0 0 0 35924000 0 0 0 0 0 0 1366 2932 1271 11927 15332 15332 1 AFTDVPSIQIYSSR Unmodified 1582.7991 0.79912193 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 108.52 108.52 2 0.00030271 113504 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.477 76.52 299720000 87516000 0 0 0 0 0 0 0 0 26001000 109540000 0 76661000 1367 310;830 1272 11928;11929;11930;11931;11932 15333;15334;15335;15336;15337 15336 4 AFTELFQVACAKPPPLGLCDYPSSR Unmodified 2823.3724 0.37240679 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 1 1 1 1 137.3 137.3 3 3.1675E-23 142222 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.54 110.09 156770000 0 0 0 0 0 0 45247000 0 0 0 0 58299000 53227000 1368 3049 1273 11933;11934;11935 15338;15339;15340 15340 3 AFTGFIVEADTPGIQIGR Unmodified 1890.984 0.98396259 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 134.54 134.54 2;3 6.7367E-54 139437 QUIQUE_C1368_190116_001 211.67 188.44 1368900000 96191000 96747000 120160000 83674000 0 100900000 117730000 154670000 192220000 30953000 144860000 124900000 105850000 1369 666 1274 11936;11937;11938;11939;11940;11941;11942;11943;11944;11945;11946;11947;11948 15341;15342;15343;15344;15345;15346;15347;15348;15349;15350;15351;15352;15353;15354;15355 15343 14 AFTHTAQYDEAISDYFR Unmodified 2033.9119 0.91191986 2339 P31939;C9JLK0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 3 3 1 2 1 2 2 1 3 2 2 104.68 104.68 2;3 2.3996E-70 108153 QUIQUE_C1368_190116_001 252.02 230.72 3281800000 188740000 215920000 306870000 252290000 239850000 259890000 245920000 134450000 252170000 123860000 401800000 282510000 377560000 1370 2339 1275 11949;11950;11951;11952;11953;11954;11955;11956;11957;11958;11959;11960;11961;11962;11963;11964;11965;11966;11967;11968;11969;11970;11971;11972 15356;15357;15358;15359;15360;15361;15362;15363;15364;15365;15366;15367;15368;15369;15370;15371;15372;15373;15374;15375;15376;15377;15378;15379;15380;15381;15382;15383;15384 15362 27 AFTHTAQYDEAISDYFRK Unmodified 2162.0069 0.006882877 2339 P31939;C9JLK0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 1 1 89.021 89.021 3 0.023045 89847 QUIQUE_DMIX1_190116_001 17.682 13.805 43008000 0 0 0 0 0 0 0 43008000 0 0 0 0 0 1371 2339 1276 11973 15385 15385 1 AFTIQGAPSDSGPLR Unmodified 1515.7682 0.76815616 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.851 79.851 2 1.0459E-12 80258 QUIQUE_C1403_190116_001 148.28 129.5 7228200000 784910000 768720000 0 689810000 640890000 0 597720000 661000000 607440000 252400000 796600000 614840000 813860000 1372 2530 1277 11974;11975;11976;11977;11978;11979;11980;11981;11982;11983;11984 15386;15387;15388;15389;15390;15391;15392;15393;15394;15395;15396;15397;15398 15388 13 AFTKPEEACSFILSADFPALVVK Unmodified 2539.3032 0.30324782 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 1 1 1 1 145.31 145.31 2;3 3.7155E-07 152234 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.055 93.024 226460000 0 0 0 0 0 91422000 109910000 0 0 0 25130000 0 0 1373 2194 1278 11985;11986;11987 15399;15400;15401 15401 3 AFTLTISALFVTPK Unmodified 1507.865 0.86501665 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 2 6 3 154.54 154.54 2 0.00029338 159053 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.45 98.578 659910000 34303000 27194000 23989000 0 0 0 51179000 89776000 64635000 0 261380000 107460000 0 1374 1969 1279 11988;11989;11990;11991;11992;11993;11994;11995;11996;11997;11998;11999;12000;12001;12002;12003;12004;12005 15402;15403;15404;15405;15406;15407;15408;15409;15410;15411;15412;15413;15414;15415;15416;15417;15418;15419;15420;15421;15422;15423;15424;15425 15412 20 AFTLVSAVER Unmodified 1091.5975 0.597509 3698 Q8WUH2 TGFBRAP1 Transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 81.781 81.781 2 0.012155 82411 QUIQUE_C1403_190116_001 66.27 30.777 41610000 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1283 12015;12016;12017;12018;12019;12020;12021;12022;12023;12024;12025;12026;12027;12028;12029;12030;12031;12032;12033;12034;12035 15436;15437;15438;15439;15440;15441;15442;15443;15444;15445;15446;15447;15448;15449;15450;15451;15452;15453;15454;15455;15456;15457 15438 14 AFTYTVAASGGGGVNMGSHQK Oxidation (M) 2054.948 0.94798779 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.334 40.334 3 1.7018E-08 37467 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.963 95.061 976510000 0 47474000 0 54419000 66428000 65525000 73403000 84075000 111170000 98284000 127130000 108230000 140370000 1379 4418 1283 12036;12037;12038;12039;12040;12041;12042;12043;12044;12045;12046 15458;15459;15460;15461;15462;15463;15464;15465;15466;15467;15468;15469;15470 15463 2940 12 AFVAGVLPFK Unmodified 1047.6117 0.6117025 1405 O00442 RTCA RNA 3'-terminal phosphate cyclase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.47 105.47 2 0.014657 109634 QUIQUE_C1576_190116_001 75.854 58.469 522280000 0 74260000 0 0 62009000 0 66206000 0 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region-related protein yes no 0 0 0 1 31.657 31.657 2 0.060883 26566 QUIQUE_C1368_190116_001 69.093 53.461 99009000 0 0 99009000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1384 366 1288 12093 15539 15539 1 AFVELTK Unmodified 806.4538 0.45380487 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;D6RIS6 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 1 43.757 43.757 2 0.043201 39988 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.462 43.369 321350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72076000 0 112170000 137100000 1385 1728 1289 12094;12095;12096 15540;15541;15542 15542 3 AFVENYPQFK Unmodified 1241.6081 0.60807369 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;A0A2R8YF01;A0A1B0GXI6;A0A2R8YEX8 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.389 76.389 2 1.6094E-05 78169 QUIQUE_C1218_190116_001 147.52 117.78 545710000 71936000 45905000 47304000 38861000 47686000 44468000 0 0 42971000 25654000 73132000 49712000 58082000 1386 4276 1290 12097;12098;12099;12100;12101;12102;12103;12104;12105;12106;12107;12108;12109 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16339 949 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDLAALEK Oxidation (M) 3214.4553 0.45534438 1990;688 P0DPH8;P0DPH7;C9J2C0;Q9NY65 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain no no 0 1 1 1 135.33 135.33 4 0.00057758 138221 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.167 38.264 44237000 0 0 0 0 0 0 0 44237000 0 0 0 0 0 1390 1990;688 1293 13024 16848 16848 421 0 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK Oxidation (M) 3232.4118 0.411765 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 1 1 1 1 1 5 2 2 2 4 128.07 128.07 3;4 1.0114E-93 133392 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.3 173.54 6935300000 0 36342000 0 0 36604000 0 121910000 2266300000 1051700000 0 939470000 1222900000 1260000000 1391 2795;2796;3430;3992 1294 13025;13026;13027;13028;13029;13030;13031;13032;13033;13034;13035;13036;13037;13038;13039;13040;13041;13042 16849;16850;16851;16852;16853;16854;16855;16856;16857;16858;16859;16860;16861;16862;16863;16864;16865;16866;16867;16868;16869;16870;16871 16860 2243;2244 21 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK Unmodified 3216.4169 0.41685038 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 2 2 1 3 6 17 12 5 17 7 144.71 144.71 2;3;4 2.364E-144 139877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 203.99 190.58 28930000000 0 122450000 111010000 110330000 187790000 0 1342500000 8709700000 5740600000 0 1719700000 4726300000 6159700000 1392 2795;2796;3430;3992 1294 13043;13044;13045;13046;13047;13048;13049;13050;13051;13052;13053;13054;13055;13056;13057;13058;13059;13060;13061;13062;13063;13064;13065;13066;13067;13068;13069;13070;13071;13072;13073;13074;13075;13076;13077;13078;13079;13080;13081;13082;13083;13084;13085;13086;13087;13088;13089;13090;13091;13092;13093;13094;13095;13096;13097;13098;13099;13100;13101;13102;13103;13104;13105;13106;13107;13108;13109;13110;13111;13112;13113;13114 16872;16873;16874;16875;16876;16877;16878;16879;16880;16881;16882;16883;16884;16885;16886;16887;16888;16889;16890;16891;16892;16893;16894;16895;16896;16897;16898;16899;16900;16901;16902;16903;16904;16905;16906;16907;16908;16909;16910;16911;16912;16913;16914;16915;16916;16917;16918;16919;16920;16921;16922;16923;16924;16925;16926;16927;16928;16929;16930;16931;16932;16933;16934;16935;16936;16937;16938;16939;16940;16941;16942;16943;16944;16945;16946;16947;16948;16949;16950;16951;16952;16953;16954;16955 16893 80 AFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK 2 Oxidation (M) 3248.4067 0.40667963 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 2 1 1 2 2 106.86 106.86 3;4 3.4958E-12 111174 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.227 66.321 375000000 0 0 0 0 0 0 0 129390000 56413000 0 0 189190000 0 1393 2795;2796;3430;3992 1294 13115;13116;13117;13118;13119 16956;16957;16958;16959;16960 16958 2243;2244 5 AFVRPSGTEDVVR Unmodified 1431.747 0.74702678 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;H0Y8I3;H0Y987 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 37.66 37.66 2;3 2.2857E-08 33056 QUIQUE_C1368_190116_001 138.42 110.56 3369800000 206350000 245190000 370380000 244670000 167710000 229090000 253750000 223820000 258250000 91663000 439750000 289680000 349460000 1394 1728 1295 13120;13121;13122;13123;13124;13125;13126;13127;13128;13129;13130;13131;13132;13133 16961;16962;16963;16964;16965;16966;16967;16968;16969;16970;16971;16972;16973;16974 16963 12 AFVVLAAPFK Unmodified 1061.6274 0.62735256 1980 P0C7M7 ACSM4 Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 107.55 107.55 2 0.03391 111112 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.953 57.852 49845000 0 0 0 0 0 0 0 0 12093000 0 0 11890000 25862000 1395 1980 1296 13134;13135;13136 16975;16976;16977 16977 2 AFVYLSNLLYPVPLVHR Unmodified 2000.1248 0.12475359 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.03 147.03 3 0.0010367 151897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.514 50.097 616530000 48054000 0 59972000 41597000 0 37812000 0 57760000 62105000 36206000 99987000 99596000 73440000 1396 497 1297 13137;13138;13139;13140;13141;13142;13143;13144;13145;13146 16978;16979;16980;16981;16982;16983;16984;16985;16986;16987;16988;16989 16984 12 AFWAGGSPSVVDYFPSEDFYR Acetyl (Protein N-term) 2438.0855 0.085527128 1717 O95260 ATE1 Arginyl-tRNA--protein transferase 1 yes yes 1 0 0 1 1 173.68 173.68 2;3 0.0028089 175146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.257 38.159 9125400 0 0 0 0 0 0 0 4179800 0 0 0 0 4945600 1397 1717 1298 13147;13148 16990;16991 16990 2 AFWDVHRPVPGCVNTTEVDIK Unmodified 2439.2005 0.20051408 2549 P49802;Q5T3H5 RGS7 Regulator of G-protein signaling 7 yes no 0 0 1 1 1 94.802 94.802 4 0.0019997 98083 QUIQUE_C1218_190116_001 44.953 37.056 61866000 32606000 29259000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1398 2549 1299 13149;13150 16992;16993 16992 2 AFYAELYHIISSNLEK Unmodified 1896.9622 0.96216452 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 1 3 150.64 150.64 2;3 6.9351E-66 153783 QUIQUE_DMIX1_190116_001 210.41 187.83 5293100000 204130000 173910000 990430000 530260000 220890000 144560000 127040000 677610000 576860000 168280000 743270000 276280000 459620000 1399 114 1300 13151;13152;13153;13154;13155;13156;13157;13158;13159;13160;13161;13162;13163;13164;13165;13166;13167;13168;13169;13170;13171;13172;13173 16994;16995;16996;16997;16998;16999;17000;17001;17002;17003;17004;17005;17006;17007;17008;17009;17010;17011;17012;17013;17014;17015;17016;17017;17018;17019;17020;17021;17022;17023;17024;17025;17026;17027;17028;17029;17030;17031 17012 35 AFYAPVHADDLR Unmodified 1373.6728 0.67279921 2654 P55011;G3XAL9 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 59.664 59.664 3 0.0089004 58636 QUIQUE_C1368_190116_001 38.3 30.724 95400000 0 0 20472000 18030000 0 0 0 0 30139000 0 0 0 26758000 1400 2654 1301 13174;13175;13176;13177 17032;17033;17034;17035 17032 4 AFYELSQTHR Unmodified 1250.6044 0.60438529 4266 Q9NRD5;F6V107 PICK1 PRKCA-binding protein yes no 0 0 0 1 40.228 40.228 3 0.047686 34647 QUIQUE_DMIX4_190116_001 32.034 16.495 10006000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10006000 0 0 0 1401 4266 1302 13178 17036 17036 1 AFYGDTLVTGFAR Unmodified 1416.7038 0.70376498 4223 Q9HCC0 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 115.59 115.59 2 0.01834 112340 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.5 50.35 42574000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42574000 0 0 0 1402 4223 1303 13179 17037 17037 1 AFYGSEEDEAK Unmodified 1244.5197 0.51971219 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 32.519 32.519 2 0.0009759 27235 QUIQUE_C1277_190116_001 92.051 84.571 258120000 42146000 53629000 0 37852000 47985000 0 32578000 0 0 12149000 0 31782000 0 1403 2990 1304 13180;13181;13182;13183;13184;13185;13186;13187;13188 17038;17039;17040;17041;17042;17043;17044;17045;17046 17039 8 AFYLGSMLIK Unmodified 1141.6206 0.62055263 1160 H0YI72;Q7Z6G8;F8VR14;R4GMS8;R4GMN5;R4GN78;R4GMQ4 ANKS1B Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain-containing protein 1B yes no 0 0 0 1 1 122.27 122.27 2 0.0084486 124640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.692 47.671 76939000 50133000 0 0 0 0 0 0 26806000 0 0 0 0 0 1404 1160 1305 13189;13190 17047;17048 17048 1 AFYNNVLGEYEEYITK Unmodified 1951.9204 0.92035928 1856 P04181 OAT Ornithine aminotransferase, mitochondrial;Ornithine aminotransferase, hepatic form;Ornithine aminotransferase, renal form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.81 146.81 2 3.7459E-05 149447 QUIQUE_C1563_190116_001 121.04 108.27 1255700000 113680000 97456000 93443000 99133000 0 85182000 116610000 93278000 153370000 28076000 131330000 146270000 97922000 1405 1856 1306 13191;13192;13193;13194;13195;13196;13197;13198;13199;13200;13201;13202 17049;17050;17051;17052;17053;17054;17055;17056;17057;17058;17059;17060 17053 10 AFYPEEISSMVLTK Unmodified 1613.8011 0.80109577 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 131.36 131.36 2;3 2.2545E-07 136436 QUIQUE_C1368_190116_001 102.73 99.783 10462000000 1122500000 1262200000 1523000000 1536900000 1282200000 1330800000 1492900000 144980000 147160000 92880000 199930000 149570000 177100000 1406 282;2362 1307 13203;13204;13205;13206;13207;13208;13209;13210;13211;13212;13213;13214;13215;13216;13217;13218;13219;13220;13221;13222 17061;17062;17063;17064;17065;17066;17067;17068;17069;17070;17071;17072;17073;17074;17075;17076;17077;17078;17079;17080;17081;17082;17083;17084;17085;17086;17087;17088;17089;17090;17091;17092 17070 32 AFYPEEISSMVLTK Oxidation (M) 1629.796 0.79601039 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 1 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 108.61 108.61 2;3 0.00034221 105404 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.215 81.351 1631700000 0 195990000 0 25172000 135800000 0 141300000 197910000 219190000 161480000 325170000 0 229740000 1407 282;2362 1307 13223;13224;13225;13226;13227;13228;13229;13230;13231;13232;13233 17093;17094;17095;17096;17097;17098;17099;17100;17101;17102;17103;17104 17101 209 12 AFYQQPDADIIGYVASEEAFVK Unmodified 2460.1849 0.18490682 1967 P09497 CLTB Clathrin light chain B yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 155.16 155.16 2;3 6.1886E-10 160836 QUIQUE_C1218_190116_001 101.48 93.163 2241100000 378470000 168840000 143630000 94997000 437690000 113390000 136340000 79162000 105240000 23259000 318800000 124560000 116730000 1408 1967 1308 13234;13235;13236;13237;13238;13239;13240;13241;13242;13243;13244;13245;13246;13247;13248;13249 17105;17106;17107;17108;17109;17110;17111;17112;17113;17114;17115;17116;17117;17118;17119;17120;17121;17122;17123;17124;17125;17126;17127;17128;17129;17130;17131 17108 26 AFYSLGNYIVASEIAK Unmodified 1744.9036 0.903587 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 135.56 135.56 2 5.3395E-07 139834 QUIQUE_C1277_190116_001 115.57 106.09 529420000 73860000 34649000 0 0 0 53796000 0 49175000 66394000 23966000 139710000 0 87873000 1409 3269 1309 13250;13251;13252;13253;13254;13255;13256;13257 17132;17133;17134;17135;17136;17137;17138;17139;17140 17133 8 AFYVNVLNEEQR Unmodified 1480.731 0.73104237 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.885 92.885 2 4.5807E-07 96555 QUIQUE_C1438_190116_001 144.65 125.38 2347400000 142500000 346400000 215800000 141040000 250350000 147740000 176450000 0 196080000 0 323990000 187530000 219460000 1410 1849 1310 13258;13259;13260;13261;13262;13263;13264;13265;13266;13267;13268;13269;13270 17141;17142;17143;17144;17145;17146;17147;17148;17149;17150;17151;17152;17153 17146 4 AGAAAILIR Unmodified 854.53379 0.53378653 3310 Q5T440 IBA57 Putative transferase CAF17, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.12 47.12 2 0.0023496 43288 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.262 40.708 381130000 43012000 48795000 40285000 25730000 36384000 25013000 34472000 0 36568000 11421000 37920000 0 41529000 1411 3310 1311 13271;13272;13273;13274;13275;13276;13277;13278;13279;13280;13281 17154;17155;17156;17157;17158;17159;17160;17161;17162;17163;17164;17165 17163 8 AGAAFFNEVR Unmodified 1080.5352 0.53524309 56 B4DGL8;A0A087WW65;O75027;A0A2R8Y473;E9PJR8 ABCB7 ATP-binding cassette sub-family B member 7, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 66.163 66.163 2 0.028562 67233 QUIQUE_C1218_190116_001 54.982 29.245 88366000 35783000 0 0 0 0 0 20959000 0 0 0 0 0 31624000 1412 56 1312 13282;13283;13284 17166;17167;17168 17166 3 AGAALDPVSFAR Unmodified 1173.6142 0.6142217 1550 O43761;Q96L30 SYNGR3 Synaptogyrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.757 77.757 2 0.0020243 79351 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.883 59.762 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1413 1550 1313 13285;13286;13287;13288;13289;13290;13291;13292;13293 17169;17170;17171;17172;17173;17174;17175;17176;17177 17176 9 AGAAPYVQAFDSLLAGPVAEYLK Unmodified 2350.2209 0.2208984 2857 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 2 2 4 2 1 5 2 2 2 2 2 2 170.57 170.57 2;3 3.9705E-62 175710 QUIQUE_C1368_190116_001 160.8 141.13 9832600000 666900000 529740000 974160000 953840000 611050000 791530000 946290000 0 1009600000 224230000 1003200000 884440000 1237600000 1414 2857 1314 13294;13295;13296;13297;13298;13299;13300;13301;13302;13303;13304;13305;13306;13307;13308;13309;13310;13311;13312;13313;13314;13315;13316;13317;13318;13319;13320;13321 17178;17179;17180;17181;17182;17183;17184;17185;17186;17187;17188;17189;17190;17191;17192;17193;17194;17195;17196;17197;17198;17199;17200;17201;17202;17203;17204;17205;17206;17207;17208;17209;17210;17211;17212;17213 17188 32 AGAATQASLESAPR Acetyl (Protein N-term) 1370.679 0.6790068 4064 Q9BXR0 QTRT1 Queuine tRNA-ribosyltransferase yes yes 1 0 0 1 1 1 67.664 67.664 2 0.005835 67493 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.685 28.961 1697600000 0 0 475050000 0 0 0 0 269880000 0 0 0 952660000 0 1415 4064 1315 13322;13323;13324 17214;17215;17216 17215 2 AGAEDDEEKGEGTPR Unmodified 1559.67 0.66995825 863 E7ERS3;Q86VM9 ZC3H18 Zinc finger CCCH domain-containing protein 18 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.888 10.888 3 7.2006E-07 2889 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.566 94.852 71850000 8208400 0 0 12370000 24476000 0 0 0 14499000 4302100 7993500 0 0 1416 863 1316 13325;13326;13327;13328;13329;13330;13331;13332 17217;17218;17219;17220;17221;17222;17223;17224;17225 17225 9 AGAGALLR Unmodified 727.43407 0.43407249 2435 P41219 PRPH Peripherin yes yes 0 0 0 1 24.589 24.589 2 0.039603 17373 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.788 0.78689 482450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 482450000 0 0 0 1417 2435 1317 13333 17226 17226 1 AGAGGGNDIQWCFSQVK Acetyl (Protein N-term) 1835.8261 0.82608174 2781 P63151;E5RIY1;E5RHQ2;E5RJV2 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes no 1 0 0 1 1 1 1 126.76 126.76 2 1.1437E-44 130702 QUIQUE_C1277_190116_001 171.57 163.06 103280000 0 29151000 0 38082000 36047000 0 0 0 0 0 0 0 0 1418 2781 1318 13334;13335;13336;13337 17227;17228;17229;17230 17227 4 AGAGLSSLCLVLSTR Unmodified 1503.8079 0.80791248 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 120.56 120.56 2 0.037613 124573 QUIQUE_C1277_190116_001 62.088 44.029 34805000 0 34805000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1419 1762 1319 13338 17231 17231 0 AGAGLSSLCLVLSTRPHS Unmodified 1824.9516 0.9516166 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 2 2 103.01 103.01 2;3 8.3246E-75 105602 QUIQUE_DMIX8_190116_001 197.38 182.82 5761600000 254080000 429960000 325070000 273840000 442960000 287880000 444140000 557940000 610180000 130330000 555960000 621960000 827330000 1420 1762 1320 13339;13340;13341;13342;13343;13344;13345;13346;13347;13348;13349;13350;13351;13352;13353;13354;13355;13356 17232;17233;17234;17235;17236;17237;17238;17239;17240;17241;17242;17243;17244;17245;17246;17247;17248;17249;17250;17251;17252;17253;17254;17255;17256;17257;17258;17259;17260;17261 17260 29 AGAGSATLSMAYAGAR Oxidation (M) 1469.6933 0.69327665 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.072 45.072 2 1.0645E-25 41804 QUIQUE_DMIX3_190116_001 158.56 141.73 4594700000 380080000 494490000 486950000 320520000 455430000 247080000 365870000 200220000 230480000 180640000 471170000 398500000 363280000 1421 2431 1321 13357;13358;13359;13360;13361;13362;13363;13364;13365;13366;13367;13368;13369 17262;17263;17264;17265;17266;17267;17268;17269;17270;17271;17272;17273;17274;17275;17276 17271 1854 15 AGAGSATLSMAYAGAR Unmodified 1453.6984 0.69836203 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 3 1 3 64.117 64.117 2 4.2354E-54 63694 QUIQUE_C1218_190116_001 186.87 164.88 14372000000 1400400000 1275700000 1278300000 1016400000 923790000 758310000 1057900000 1116200000 1006300000 628470000 1421200000 1108300000 1380800000 1422 2431 1321 13370;13371;13372;13373;13374;13375;13376;13377;13378;13379;13380;13381;13382;13383;13384;13385;13386;13387;13388;13389;13390;13391;13392;13393;13394 17277;17278;17279;17280;17281;17282;17283;17284;17285;17286;17287;17288;17289;17290;17291;17292;17293;17294;17295;17296;17297;17298;17299;17300;17301;17302;17303;17304;17305;17306;17307;17308;17309;17310;17311;17312;17313;17314;17315;17316;17317 17277 41 AGAIAPCEVTVPAQNTGLGPEK Unmodified 2179.0943 0.094317676 1888 P05388;F8VWS0;F8VW21;F8VU65;F8VPE8;G3V210;F8VQY6;F8VRK7;Q8NHW5 RPLP0;RPLP0P6 60S acidic ribosomal protein P0;60S acidic ribosomal protein P0-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.251 83.251 2 9.5043E-11 85430 QUIQUE_C1218_190116_001 139.66 127.03 1317300000 132390000 227690000 235950000 215800000 0 0 192340000 62877000 96375000 29761000 124130000 0 0 1423 1888 1322 13395;13396;13397;13398;13399;13400;13401;13402;13403 17318;17319;17320;17321;17322;17323;17324;17325;17326;17327;17328 17318 11 AGAISASGPELQGAGHSK Unmodified 1636.8169 0.81689726 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 26.657 26.657 2;3 2.2158E-11 20414 QUIQUE_C1403_190116_001 120.84 106.6 1260000000 76690000 26995000 104800000 155190000 30433000 181400000 33408000 224510000 93240000 40360000 116230000 117040000 59754000 1424 2935 1323 13404;13405;13406;13407;13408;13409;13410;13411;13412;13413;13414;13415;13416;13417;13418;13419;13420;13421;13422;13423;13424;13425 17329;17330;17331;17332;17333;17334;17335;17336;17337;17338;17339;17340;17341;17342;17343;17344;17345;17346;17347;17348;17349;17350;17351;17352;17353 17336 21 AGAKPDQIGIITPYEGQR Unmodified 1913.0007 0.0006752871 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.616 67.616 3 0.0046543 67709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.625 24.967 412740000 0 54522000 0 0 0 34884000 51035000 45668000 58517000 0 60067000 65177000 42873000 1425 3766 1324 13426;13427;13428;13429;13430;13431;13432;13433 17354;17355;17356;17357;17358;17359;17360;17361 17359 6 AGALLPAIHEQLR Unmodified 1387.7936 0.79358304 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.601 66.601 3 0.010466 65011 QUIQUE_C1563_190116_001 46.069 39.188 116620000 0 0 0 27790000 0 30632000 0 0 0 25431000 0 0 32766000 1426 1492 1325 13434;13435;13436;13437 17362;17363;17364;17365;17366;17367 17364 6 AGALNSNDAFVLK Unmodified 1318.6881 0.68811492 166;788 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14 GSN Gelsolin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.997 74.997 2 2.2775E-06 74960 QUIQUE_C1403_190116_001 157.96 121.51 22057000000 1277600000 1295200000 1722900000 1424200000 1560600000 1426900000 1875900000 1714800000 1850300000 1261000000 2476900000 1681200000 2489200000 + 1427 166;788 1326 13438;13439;13440;13441;13442;13443;13444;13445;13446;13447;13448;13449;13450 17368;17369;17370;17371;17372;17373;17374;17375;17376;17377;17378;17379;17380;17381;17382;17383;17384;17385;17386 17373 19 AGALQCSPSDAYTK Unmodified 1467.6664 0.6663932 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.23 37.23 2 0.00019383 32497 QUIQUE_C1368_190116_001 113.63 104.21 1038700000 62963000 85677000 109670000 114960000 100740000 65148000 69544000 46964000 80520000 35922000 94607000 78215000 93784000 1428 4600 1327 13451;13452;13453;13454;13455;13456;13457;13458;13459;13460;13461;13462;13463 17387;17388;17389;17390;17391;17392;17393;17394;17395;17396;17397;17398;17399;17400;17401 17389 15 AGALQVCPTDSYTK Unmodified 1509.7133 0.71334339 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.305 53.305 2 5.7508E-14 52065 QUIQUE_C1218_190116_001 143.24 128.27 604750000 70689000 61012000 48874000 58717000 50206000 41788000 61257000 39935000 0 0 46220000 61308000 64739000 1429 4606 1328 13464;13465;13466;13467;13468;13469;13470;13471;13472;13473;13474;13475 17402;17403;17404;17405;17406;17407;17408;17409;17410;17411;17412;17413;17414;17415 17403 13 AGAPVPEPPKEEQQQALEQFAAAAAHSTPVR Unmodified 3224.6214 0.62143892 143;4559 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;J3QS55;J3KS70;J3QKY2;J3KRD1;J3QKK4;J3QR33;J3QRQ6;J3QLU5;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 2 1 3 1 2 1 2 1 1 1 2 111.19 111.19 3;4 2.3676E-42 114468 QUIQUE_DMIX8_190116_001 119.35 106.86 3622100000 270210000 422380000 241860000 384340000 283560000 452320000 119260000 373680000 0 91819000 267450000 222000000 493220000 1430 143;4559 1329 13476;13477;13478;13479;13480;13481;13482;13483;13484;13485;13486;13487;13488;13489;13490;13491;13492;13493 17416;17417;17418;17419;17420;17421;17422;17423;17424;17425;17426;17427;17428;17429;17430;17431;17432;17433;17434;17435;17436;17437;17438;17439;17440;17441;17442;17443;17444;17445;17446;17447;17448 17448 33 AGAPVPEPPKEEQQQALEQFAAAAAHSTPVRR Unmodified 3380.7225 0.72254995 143;4559 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;J3QS55;J3KS70;J3QKY2;J3KRD1;J3QKK4;J3QR33;J3QRQ6;J3QLU5;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 2 1 99.851 99.851 4 9.421E-20 101506 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.717 68.62 61769000 0 0 0 0 0 0 0 61769000 0 0 0 0 0 1431 143;4559 1330 13494 17449;17450;17451 17450 3 AGAQPGVHALQLKPVCVSDSLK Acetyl (Protein N-term) 2316.226 0.22600055 4250 Q9NQ66;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1 yes no 1 0 1 1 1 92.284 92.284 3 4.9343E-05 93871 QUIQUE_C1277_190116_001 69.72 66.153 297630000 133060000 164570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1432 4250 1331 13495;13496 17452;17453 17453 0 AGASEQELLR Unmodified 1072.5513 0.55128709 4343 Q9NZB8 MOCS1 Molybdenum cofactor biosynthesis protein 1;Cyclic pyranopterin monophosphate synthase;Cyclic pyranopterin monophosphate synthase accessory protein yes yes 0 0 0 1 20.439 20.439 3 0.027993 13453 QUIQUE_C1368_190116_001 45.161 0.71393 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1433 4343 1332 13497 17454 17454 1 AGASISTLAGLSLK Unmodified 1287.7398 0.73981614 4461 Q9UJW0;E5RK21 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 101.54 101.54 2 0.0075876 98872 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.57 46.216 85730000 0 0 0 0 0 0 0 19232000 23329000 21071000 22097000 0 0 1434 4461 1333 13498;13499;13500;13501;13502;13503;13504 17455;17456;17457;17458;17459;17460;17461 17459 7 AGATSEGVLANFFNSLLSK Unmodified 1924.9894 0.9894419 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 168.14 168.14 2;3 8.2255E-37 171191 QUIQUE_C1403_190116_001 198.23 167.67 1691600000 110460000 14139000 153900000 157120000 163590000 201880000 229450000 185950000 31731000 8546400 25211000 211080000 198500000 1435 4653 1334 13505;13506;13507;13508;13509;13510;13511;13512;13513;13514;13515;13516;13517;13518;13519;13520;13521 17462;17463;17464;17465;17466;17467;17468;17469;17470;17471;17472;17473;17474;17475;17476;17477;17478;17479 17466 18 AGAYDFPSPEWDTVTPEAK Unmodified 2079.9426 0.94255129 4533;412;3010;3299;896;803;1135 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;Q9UQM7;A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3;Q13554;H7BXS4 CAMK2D;CAMK2A;CAMK2G;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 120.79 120.79 2;3 1.121E-11 124786 QUIQUE_C1277_190116_001 116.96 113.05 29303000000 2850100000 2903200000 2330700000 1929600000 2741100000 1642700000 2659300000 1698500000 1699600000 902190000 2765700000 2800100000 2380300000 1436 803;896;1135;4533;412;3299;3010 1335 13522;13523;13524;13525;13526;13527;13528;13529;13530;13531;13532;13533;13534;13535;13536;13537;13538;13539;13540;13541;13542;13543;13544;13545;13546;13547 17480;17481;17482;17483;17484;17485;17486;17487;17488;17489;17490;17491;17492;17493;17494;17495;17496;17497;17498;17499;17500;17501;17502;17503;17504;17505;17506;17507;17508;17509;17510;17511;17512;17513;17514;17515;17516;17517;17518;17519;17520;17521;17522;17523;17524;17525;17526;17527;17528;17529;17530;17531;17532;17533;17534;17535;17536 17488 57 AGCECLNESDEHGFDNCLR Unmodified 2281.8787 0.87866395 1526 O43396;K7ER96;K7EML9 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 61.4 61.4 3 7.6384E-08 60386 QUIQUE_C1368_190116_001 83.849 83.849 651540000 58848000 127330000 89417000 111190000 0 84089000 121960000 0 0 19011000 0 0 39699000 1437 1526 1336 13548;13549;13550;13551;13552;13553;13554;13555 17537;17538;17539;17540;17541;17542;17543;17544;17545 17540 8 AGCEVTILFADLHAYLDNMK Unmodified 2280.0919 0.091874835 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 166.56 166.56 3 2.9468E-06 171329 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.356 73.658 308700000 0 0 0 0 0 0 0 0 56194000 0 155290000 97212000 0 1438 2641 1337 13556;13557;13558;13559 17546;17547;17548;17549 17546 3 AGCQVVAPSDMMDGR Unmodified 1592.6745 0.67453182 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.767 66.767 2 1.2078E-05 63472 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.48 109.75 1079400000 103610000 0 126930000 124530000 77250000 85662000 103210000 52544000 85542000 27748000 112440000 72091000 107890000 1439 2061 1338 13560;13561;13562;13563;13564;13565;13566;13567;13568;13569;13570;13571 17550;17551;17552;17553;17554;17555;17556;17557;17558;17559;17560;17561;17562 17559 12 AGCQVVAPSDMMDGR Oxidation (M) 1608.6694 0.66944644 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 1 0 1 1 1 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fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 111.72 111.72 2 1.7394E-10 115607 QUIQUE_C1368_190116_001 135.55 119.92 321470000 29658000 26851000 40540000 0 44153000 27275000 0 0 0 39896000 64968000 0 48132000 1446 1803 1344 13588;13589;13590;13591;13592;13593;13594;13595;13596;13597 17580;17581;17582;17583;17584;17585;17586;17587;17588;17589;17590;17591;17592 17585 12 AGDIITVLEQHPDGR Unmodified 1619.8267 0.82673367 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 89.966 89.966 3 0.00038687 91186 QUIQUE_C1277_190116_001 70.529 52.9 398410000 154740000 93318000 0 0 0 115360000 0 0 0 34991000 0 0 0 1447 3718 1345 13598;13599;13600;13601 17593;17594;17595;17596;17597;17598 17595 5 AGDISCNADINPLK Unmodified 1486.7086 0.70859237 2122 P17301 ITGA2 Integrin alpha-2 yes yes 0 0 0 1 67.592 67.592 2 0.021496 68613 QUIQUE_C1438_190116_001 48.998 34.791 14188000 0 0 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Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes no 1 1 0 1 1 1 164.06 164.06 2 0.00031548 165842 QUIQUE_C1563_190116_001 68.034 59.521 37865000 0 0 14115000 0 0 8309500 15440000 0 0 0 0 0 0 1453 2149 1349 13638;13639;13640 17636;17637;17638 17637 1500 2 AGDLVFAK Unmodified 819.44905 0.44905385 0 A0A024R216;Q9Y3E1;H3BPQ6 HDGFRP3 Hepatoma-derived growth factor-related protein 3 yes no 0 0 0 1 49.462 49.462 2 0.042451 46851 QUIQUE_C1403_190116_001 58.981 18.409 56725000 0 0 0 56725000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1454 0 1350 13641 17639 17639 1 AGDREDITEPAICALR Unmodified 1785.8679 0.86794655 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0;A0A2R8Y815 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 70.746 70.746 2;3 3.1494E-13 70844 QUIQUE_C1277_190116_001 132.08 125.46 4777000000 396990000 478360000 438110000 396790000 436720000 278270000 476550000 277260000 345190000 135580000 357260000 413250000 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17788;17789;17790;17791;17792;17793;17794;17795;17796;17797;17798;17799;17800;17801;17802 17797 12 AGEPDGESLDEQPSSSSSK Unmodified 1905.8076 0.80757395 4160 Q9H3Q1;J3KRZ9 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 31.696 31.696 2 4.5156E-242 26646 QUIQUE_DMIX3_190116_001 344.47 334.24 737110000 34584000 38661000 30115000 68626000 56914000 57169000 29820000 64691000 131170000 24351000 57727000 46925000 96358000 1469 4160 1363 13783;13784;13785;13786;13787;13788;13789;13790;13791;13792;13793;13794;13795;13796;13797;13798 17803;17804;17805;17806;17807;17808;17809;17810;17811;17812;17813;17814;17815;17816;17817;17818;17819;17820;17821 17813 18 AGEPLGVTFR Unmodified 1045.5556 0.55564418 4358 Q9NZW5;B8ZZG1;C9J4Q3;C9JGI8 MPP6 MAGUK p55 subfamily member 6 yes no 0 0 0 1 1 65.036 65.036 2 0.018671 64702 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.828 31.93 109780000 0 0 54476000 0 0 0 0 0 0 0 0 55301000 0 1470 4358 1364 13799;13800 17822;17823 17823 2 AGEQDATIHLK Unmodified 1181.6041 0.60405094 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 22.436 22.436 2;3 4.1752E-09 15354 QUIQUE_C1563_190116_001 182.16 119.57 24825000000 2541100000 637170000 796460000 2400800000 2632700000 1776400000 2352200000 529340000 2341500000 1213000000 2744900000 1725900000 3133700000 1471 1218;28;2057 1365 13801;13802;13803;13804;13805;13806;13807;13808;13809;13810;13811;13812;13813;13814;13815;13816;13817;13818;13819;13820;13821;13822;13823 17824;17825;17826;17827;17828;17829;17830;17831;17832;17833;17834;17835;17836;17837;17838;17839;17840;17841;17842;17843;17844;17845;17846;17847;17848;17849;17850 17835 22 AGEQKPSSNLLEQFILLAK Acetyl (Protein N-term) 2127.1576 0.15756986 1277 J3KQ41;Q9H9Q2;J3QT95;A0A087X1P5;J3KQV6;J3QT67;J3QT66;J3QT69;J3QT50;J3QT43 COPS7B COP9 signalosome complex subunit 7b yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.57 162.57 3 0.00053655 166409 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13837;13838;13839;13840;13841;13842;13843;13844 17864;17865;17866;17867;17868;17869;17870;17871 17869 8 AGESVLVHGASGGVGLAACQIAR Unmodified 2179.1168 0.11678445 2917 Q08257;A6NP24;C9JH92 CRYZ Quinone oxidoreductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.093 83.093 3 4.6033E-07 80343 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.047 63.851 5136300000 378640000 447850000 520100000 411140000 399490000 423980000 267020000 365920000 427990000 175640000 422580000 387700000 508230000 1475 2917 1369 13845;13846;13847;13848;13849;13850;13851;13852;13853;13854;13855;13856;13857 17872;17873;17874;17875;17876;17877;17878;17879;17880;17881;17882;17883;17884;17885;17886;17887;17888;17889;17890 17885 18 AGETPSEEKKGEGDAATEQAAPQAPASSEEK Unmodified 3099.4116 0.41162489 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 2 1 23.334 23.334 4 1.5155E-13 16842 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.514 62.927 87069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87069000 0 1476 2128 1370 13858 17891 17891 1 AGEVFIHK Unmodified 899.4865 0.48650199 3122 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2999.5029 0.50288692 2673 P55809 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 116.56 116.56 3 3.8979E-13 118978 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.974 66.918 49890000 0 0 0 0 0 0 0 49890000 0 0 0 0 0 1500 2673 1392 14065 18168 18168 1 AGGANYDAQTE Unmodified 1095.4469 0.4468816 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.408 22.408 2 0.0025025 15601 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.81 97.036 523820000 135650000 102990000 92147000 94005000 0 0 0 0 0 99030000 0 0 0 1501 3040 1393 14066;14067;14068;14069;14070 18169;18170;18171;18172;18173 18173 2 AGGASPAASSTAQPPTQHR Unmodified 1790.866 0.86597272 3525 Q8IU81 IRF2BP1 Interferon regulatory factor 2-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 14.797 14.797 3 3.1884E-05 7090 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.616 41.497 89564000 15287000 0 0 15090000 0 0 13049000 0 26517000 0 0 0 19621000 1502 3525 1394 14071;14072;14073;14074;14075 18174;18175;18176;18177;18178 18177 5 AGGDAEPRPAEPPAWAGGAR Unmodified 1931.9238 0.92382195 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 50.398 50.398 3 1.9443E-06 48208 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.146 65.593 79502000 0 0 0 0 0 0 0 47191000 32311000 0 0 0 0 1503 3871 1395 14076;14077;14078 18179;18180;18181 18181 1 AGGDATDSSQTALDNK Unmodified 1549.6856 0.68560832 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.419 21.419 2 1.5226E-79 14309 QUIQUE_C1368_190116_001 208.17 192.8 273630000 33615000 40691000 35399000 0 47856000 0 57823000 58244000 0 0 0 0 0 1504 310;830 1396 14079;14080;14081;14082;14083;14084;14085;14086;14087;14088;14089;14090;14091 18182;18183;18184;18185;18186;18187;18188;18189;18190;18191;18192;18193;18194 18184 13 AGGDSGNVDDDCER Unmodified 1465.5376 0.53756387 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 13.902 13.902 2 6.9487E-18 5825 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AGGGRPSSPSPSVVSEK Unmodified 1597.806 0.80599822 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 19.29 19.29 2;3 1.6144E-21 12434 QUIQUE_C1218_190116_001 159.08 99.658 1420600000 202040000 40207000 116890000 105400000 151730000 108510000 127450000 74135000 70271000 40986000 145430000 116410000 121090000 1514 981;4494 1406 14136;14137;14138;14139;14140;14141;14142;14143;14144;14145;14146;14147;14148;14149;14150 18239;18240;18241;18242;18243;18244;18245;18246;18247;18248;18249;18250;18251;18252;18253 18240 12 AGGIETIANEFSDR Unmodified 1478.7001 0.70013617 3738 Q92598;R4GN69 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.94 102.94 2 1.0842E-05 107010 QUIQUE_C1218_190116_001 152.54 124.53 3206500000 246510000 299100000 228870000 268230000 266980000 254670000 327640000 243970000 236840000 126430000 358220000 0 349050000 1515 3738 1407 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type-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 108.53 108.53 2;3 3.4035E-75 111789 QUIQUE_C1277_190116_001 190.37 170.16 494220000 30083000 38409000 43519000 40363000 0 42352000 0 44109000 53108000 19347000 76741000 106180000 0 1520 2169 1412 14198;14199;14200;14201;14202;14203;14204;14205;14206;14207;14208 18307;18308;18309;18310;18311;18312;18313;18314;18315;18316;18317;18318;18319 18309 1517 13 AGGSASAMLQPLLDNQVGFK Unmodified 2003.0146 0.014610792 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 132.68 132.68 2;3 5.0233E-65 138345 QUIQUE_C1218_190116_001 237.32 206.09 2463800000 241590000 133610000 256480000 195150000 134110000 167780000 133000000 201580000 181720000 51180000 353000000 162360000 252260000 1521 2169 1412 14209;14210;14211;14212;14213;14214;14215;14216;14217;14218;14219;14220;14221;14222;14223;14224;14225;14226;14227;14228;14229;14230;14231 18320;18321;18322;18323;18324;18325;18326;18327;18328;18329;18330;18331;18332;18333;18334;18335;18336;18337;18338;18339;18340;18341;18342;18343;18344;18345;18346;18347;18348;18349;18350;18351;18352 18321 33 AGGSLCHILAAAYK Unmodified 1430.734 0.73401926 1039 F8VXC8;Q8TAQ2;F8VZW6 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.716 73.716 3 0.00046261 72929 QUIQUE_C1277_190116_001 75.102 66.066 59892000 40162000 0 0 0 0 0 0 0 0 19731000 0 0 0 1522 1039 1413 14232;14233;14234;14235;14236;14237 18353;18354;18355;18356;18357;18358 18354 6 AGGSPAPGPETPAISPSK Unmodified 1619.8155 0.81550028 2356 P33316;H0YKI0 DUT Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.569 42.569 2 5.5175E-07 38281 QUIQUE_C1563_190116_001 104.41 89.534 398680000 111970000 0 0 57933000 81450000 72041000 0 0 0 26690000 0 0 48594000 1523 2356 1414 14238;14239;14240;14241;14242;14243;14244 18359;18360;18361;18362;18363;18364;18365 18362 7 AGGSPAPGPETPAISPSKR Unmodified 1775.9166 0.91661131 2356 P33316;H0YKI0 DUT Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 30.044 30.044 3 0.0048575 24505 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.819 40.128 79510000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79510000 0 1524 2356 1415 14245;14246 18366;18367 18366 1 AGGVASGLNHVLTNDLTAK Unmodified 1836.9694 0.96937516 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 81.88 81.88 2;3 1.9295E-28 83038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.76 146.29 1257200000 90504000 79533000 176610000 165310000 46894000 46509000 60788000 109560000 93706000 112630000 124220000 32556000 118400000 1525 4664 1416 14247;14248;14249;14250;14251;14252;14253;14254;14255;14256;14257;14258;14259;14260;14261;14262;14263;14264;14265;14266;14267;14268 18368;18369;18370;18371;18372;18373;18374;18375;18376;18377;18378;18379;18380;18381;18382;18383;18384;18385;18386;18387;18388;18389;18390;18391 18382 22 AGGVASGLNHVLTNDLTAKR Unmodified 1993.0705 0.070486187 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 1 1 69.913 69.913 3 0.0033723 69268 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.358 41.075 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1526 4664 1417 14269 18392 18392 1 AGGVFTPGAAFSK Unmodified 1208.619 0.61897272 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 0 1 1 1 69.942 69.942 2 0.001625 70211 QUIQUE_C1403_190116_001 78.513 64.375 326810000 0 0 108090000 88199000 0 0 0 0 0 0 130520000 0 0 1527 3629 1418 14270;14271;14272 18393;18394;18395;18396 18394 4 AGGYGIQALGGMLVESVHGDFLNVVGFPLNHFCK Unmodified 3602.7803 0.78026453 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 168.72 168.72 4 0.048859 173197 QUIQUE_DMIX3_190116_001 16.545 11.784 83118000 0 0 0 0 0 0 0 0 83118000 0 0 0 0 1528 1741 1419 14273 18397 18397 1 AGHDQVVVLLHDVR Unmodified 1556.8423 0.84232415 1285 J3KTF4;J3QRZ2;J3QLB7;J3QKS6;J3QRG5;J3KSJ5;Q9BQA9 C17orf62 Uncharacterized protein C17orf62 yes no 0 0 0 1 1 1 59.93 59.93 3 0.00022716 58023 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.565 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18402;18403;18404;18405;18406;18407;18408;18409;18410;18411;18412;18413;18414;18415;18416;18417;18418;18419;18420;18421;18422;18423;18424;18425;18426;18427;18428;18429 18405 23 AGHLAGPEPAPPPPPPPR Unmodified 1753.9264 0.92638813 855 E7EPC8;Q9UQB3;D6RF55 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 37.691 37.691 3 0.006603 33407 QUIQUE_C1563_190116_001 26.548 15.694 41980000 0 0 0 0 0 41980000 0 0 0 0 0 0 0 1532 855 1423 14304 18430 18430 1 AGHSENGVEEDTEGR Unmodified 1585.6605 0.6604562 4357 Q9NZT2;A0A0A0MRN5 OGFR Opioid growth factor receptor yes no 0 0 0 1 1 11.551 11.551 3 0.0014272 3928 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.709 45.147 5316400 0 0 0 0 2731700 0 0 0 2584700 0 0 0 0 1533 4357 1424 14305;14306 18431;18432;18433 18433 3 AGHYAASIIIR Unmodified 1170.6509 0.65094155 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 39.648 39.648 2;3 0.00019109 35946 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.338 65.708 1111400000 73615000 56459000 62834000 110390000 91257000 69867000 85726000 110360000 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90780000 1536 3373 1427 14331;14332;14333;14334;14335;14336;14337;14338;14339;14340;14341;14342;14343;14344;14345;14346;14347;14348 18462;18463;18464;18465;18466;18467;18468;18469;18470;18471;18472;18473;18474;18475;18476;18477;18478;18479;18480;18481 18463 19 AGIEAVLLSLHPGFR Unmodified 1578.8882 0.88821171 399 H0YN11;A0A286YET3;Q6ZNW5 GDPGP1 GDP-D-glucose phosphorylase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 133.14 133.14 2;3 0.00054857 139237 QUIQUE_C1438_190116_001 67.019 51.221 271470000 23340000 30764000 36032000 21325000 28455000 19698000 21242000 0 20417000 9046700 0 32341000 28807000 1537 399 1428 14349;14350;14351;14352;14353;14354;14355;14356;14357;14358;14359;14360 18482;18483;18484;18485;18486;18487;18488;18489;18490;18491;18492;18493 18486 10 AGIFPSHFPLPAAVAK Unmodified 1621.898 0.89804812 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 107.26 107.26 3 0.036978 108964 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.341 21.061 35448000 0 0 0 0 0 0 0 35448000 0 0 0 0 0 1538 1255;2856 1429 14361 18494 18494 1 AGIFQSVK Unmodified 848.4756 0.47560295 1973 P09669 COX6C Cytochrome c oxidase subunit 6C yes yes 0 0 0 1 1 2 1 40.117 40.117 1;2 0.016576 36975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.3 75.613 690050000 0 64513000 0 0 0 0 0 0 172590000 0 270240000 182700000 0 1539 1973 1430 14362;14363;14364;14365;14366 18495;18496;18497;18498;18499 18496 2 AGIIQVLLEAVAIAAK Unmodified 1578.9709 0.97087871 353 A0A1B0GUZ7;Q14156 EFR3A Protein EFR3 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 177.23 177.23 2;3 0.00031907 184042 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.288 68.911 43957000 0 1844400 0 0 0 0 10839000 6040600 9954700 0 15278000 0 0 1540 353 1431 14367;14368;14369;14370;14371;14372 18500;18501;18502;18503;18504;18505 18505 6 AGIISTVEVLK Unmodified 1128.6754 0.67542497 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 1 90.395 90.395 1;2 0.0035226 92420 QUIQUE_C1368_190116_001 93.098 71.561 11497000000 784860000 929290000 971290000 917100000 923220000 830880000 789090000 1075300000 1093100000 282110000 1084300000 775670000 1041000000 1541 959 1432 14373;14374;14375;14376;14377;14378;14379;14380;14381;14382;14383;14384;14385;14386;14387;14388;14389 18506;18507;18508;18509;18510;18511;18512;18513;18514;18515;18516;18517;18518;18519;18520;18521;18522 18508 10 AGILFEDIFDVK Acetyl (Protein N-term) 1407.7286 0.72858275 733 C9JLU1;P52434 POLR2H DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 yes no 1 0 0 1 1 1 179.26 179.26 2 0.0022502 182798 QUIQUE_C1218_190116_001 68.893 44.671 151380000 31908000 0 0 0 0 37982000 81487000 0 0 0 0 0 0 1542 733 1433 14390;14391;14392 18523;18524;18525 18523 3 AGILFEDIFDVKDIDPEGK Acetyl (Protein N-term) 2162.0783 0.078316486 733 C9JLU1;P52434 POLR2H DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 yes no 1 0 1 1 1 1 173.84 173.84 2 0.0041318 177560 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.588 66.536 72487000 0 0 0 0 0 0 0 30281000 18992000 0 0 23215000 0 1543 733 1434 14393;14394;14395 18526;18527;18528 18528 2 AGIPVYAWK Unmodified 1003.5491 0.54910224 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.889 80.889 2 0.020669 81981 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.717 32.91 2029800000 0 0 313210000 260770000 291060000 0 288190000 0 255910000 0 330450000 290250000 0 1544 2219 1435 14396;14397;14398;14399;14400;14401;14402 18529;18530;18531;18532;18533;18534;18535 18535 7 AGIQQVYTR Unmodified 1034.5509 0.55089316 3016 Q13616;A0A0C4DGX4 CUL1 Cullin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.76 32.76 2 0.0038413 28046 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.37 31.588 260950000 0 32828000 0 28427000 33877000 0 0 24753000 39811000 0 44509000 30354000 26395000 1545 3016 1436 14403;14404;14405;14406;14407;14408;14409;14410;14411 18536;18537;18538;18539;18540;18541;18542;18543;18544;18545 18544 8 AGISEAQLTDAETSK Unmodified 1519.7366 0.73658126 2454 P42768 WAS Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 55.794 55.794 2 1.5604E-05 53993 QUIQUE_C1403_190116_001 93.614 72.151 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1546 2454 1437 14412 18546 18546 1 AGITTIEAVK Acetyl (Protein N-term) 1043.5863 0.58627561 63;3271 Q5HYB6;D6RFM2;A0A087WWU8;D6R904 DKFZp686J1372;TPM3 no no 1 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 94.563 94.563 1;2 0.00020595 97352 QUIQUE_C1368_190116_001 111.95 68.178 7195900000 621590000 961590000 535320000 509050000 569410000 855660000 530510000 327030000 395150000 464080000 437480000 465160000 523890000 1547 3271;63 1438 14413;14414;14415;14416;14417;14418;14419;14420;14421;14422;14423;14424;14425;14426;14427;14428;14429;14430;14431;14432 18547;18548;18549;18550;18551;18552;18553;18554;18555;18556;18557;18558;18559;18560;18561;18562;18563;18564;18565;18566;18567;18568;18569;18570;18571;18572;18573;18574;18575;18576;18577;18578;18579;18580;18581 18553 30 AGITTIEAVKR Acetyl (Protein N-term) 1199.6874 0.68738664 63;3271 Q5HYB6;D6RFM2;A0A087WWU8;D6R904 DKFZp686J1372;TPM3 no no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.963 68.963 2 0.0012194 68943 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.38 108.68 7119300000 152390000 247600000 390970000 222960000 486470000 163620000 426960000 758360000 1550700000 59478000 0 1097900000 1561800000 1548 3271;63 1439 14433;14434;14435;14436;14437;14438;14439;14440;14441;14442;14443;14444 18582;18583;18584;18585;18586;18587;18588;18589;18590;18591;18592;18593 18590 12 AGKEPGLQIWR Unmodified 1253.6881 0.68805534 166;788;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 52.3 52.3 2;3 0.00030165 50294 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.53 87.387 4078600000 0 0 0 0 87556000 0 0 1351700000 509620000 29663000 1085300000 465720000 549110000 + 1549 166;788;3305;311 1440 14445;14446;14447;14448;14449;14450;14451;14452;14453;14454;14455;14456 18594;18595;18596;18597;18598;18599;18600;18601;18602;18603;18604;18605;18606;18607;18608;18609 18604 14 AGKPVICATQMLESMIK Oxidation (M) 1891.957 0.95696126 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 1 1 5 5 7 4 3 3 6 5 4 4 3 2 3 94.541 94.541 2;3 1.9924E-11 100312 QUIQUE_C1403_190116_001 123.38 111.33 8620800000 959440000 1217400000 1101400000 661110000 495750000 371440000 534780000 607480000 413360000 404460000 789030000 492370000 572860000 1550 1203;2077 1441 14457;14458;14459;14460;14461;14462;14463;14464;14465;14466;14467;14468;14469;14470;14471;14472;14473;14474;14475;14476;14477;14478;14479;14480;14481;14482;14483;14484;14485;14486;14487;14488;14489;14490;14491;14492;14493;14494;14495;14496;14497;14498;14499;14500;14501;14502;14503;14504;14505;14506;14507;14508;14509;14510 18610;18611;18612;18613;18614;18615;18616;18617;18618;18619;18620;18621;18622;18623;18624;18625;18626;18627;18628;18629;18630;18631;18632;18633;18634;18635;18636;18637;18638;18639;18640;18641;18642;18643;18644;18645;18646;18647;18648;18649;18650;18651;18652;18653;18654;18655;18656;18657;18658;18659;18660;18661;18662;18663;18664;18665;18666;18667;18668;18669;18670;18671;18672;18673;18674;18675;18676 18634 689;690 60 AGKPVICATQMLESMIK Unmodified 1875.962 0.96204664 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 2 3 2 2 2 3 2 4 2 2 2 2 4 124.93 124.93 2;3 4.7469E-74 128536 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.16 184.2 30899000000 3099400000 2890600000 2859300000 2567600000 1664400000 1940700000 1790700000 2675500000 1586300000 612370000 3285100000 1612700000 4314500000 1551 1203;2077 1441 14511;14512;14513;14514;14515;14516;14517;14518;14519;14520;14521;14522;14523;14524;14525;14526;14527;14528;14529;14530;14531;14532;14533;14534;14535;14536;14537;14538;14539;14540;14541;14542 18677;18678;18679;18680;18681;18682;18683;18684;18685;18686;18687;18688;18689;18690;18691;18692;18693;18694;18695;18696;18697;18698;18699;18700;18701;18702;18703;18704;18705;18706;18707;18708;18709;18710;18711;18712;18713;18714;18715;18716;18717;18718;18719;18720;18721;18722;18723;18724;18725;18726;18727;18728;18729;18730;18731;18732;18733;18734;18735;18736;18737;18738;18739;18740;18741 18717 64 AGKPVICATQMLESMIK 2 Oxidation (M) 1907.9519 0.95187588 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 2 1 1 1 1 70.005 70.005 3 0.00030987 69542 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.307 53.89 50929000 0 0 0 0 0 0 0 0 50929000 0 0 0 0 1552 1203;2077 1441 14543;14544;14545 18742;18743;18744 18743 689;690 2 AGLAASLAGPHSIVGR Unmodified 1475.8209 0.82086043 1942 P08294 SOD3 Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn] yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 64.756 64.756 2;3 0.0014311 64925 QUIQUE_C1438_190116_001 64.65 37.977 779110000 0 66672000 57479000 59794000 0 40922000 67235000 78620000 59811000 36878000 156040000 0 155660000 1553 1942 1442 14546;14547;14548;14549;14550;14551;14552;14553;14554;14555;14556;14557;14558;14559;14560 18745;18746;18747;18748;18749;18750;18751;18752;18753;18754;18755;18756;18757;18758;18759 18749 13 AGLAPETTETPAGASETAQATDLSLSPGGESK Unmodified 3043.4469 0.44694776 3469 Q7Z6L0;A0A0G2JLL6;A0A1B0GTP1;A0A1B0GTE9;A0A1B0GTS0;H3BN10;A0A1B0GU37;A0A1B0GTR2;A0A1B0GUW9;A0A1B0GUR0 PRRT2 Proline-rich transmembrane protein 2 yes no 0 0 0 1 1 99.298 99.298 3 3.5658E-31 101455 QUIQUE_C1403_190116_001 94.929 83.824 81561000 28922000 0 0 52639000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1554 3469 1443 14561;14562 18760;18761 18761 1 AGLAPLEVR Unmodified 924.53927 0.53926584 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 55.196 55.196 2 0.017275 53504 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.156 17.12 1125600000 0 0 0 198730000 200100000 148900000 0 0 0 0 217500000 153310000 207090000 1555 1628 1444 14563;14564;14565;14566;14567;14568 18762;18763;18764;18765;18766;18767 18767 6 AGLAWTR Unmodified 773.41842 0.41842242 2271 P27987 ITPKB Inositol-trisphosphate 3-kinase B yes yes 0 0 0 1 41.25 41.25 2 0.052156 37187 QUIQUE_C1563_190116_001 73.637 47.158 33883000 0 0 0 0 0 33883000 0 0 0 0 0 0 0 1556 2271 1445 14569 18768 18768 1 AGLELGAEPETIVNSGLISPEGLAIDHIR Unmodified 2970.5662 0.56621546 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.16 148.16 3 9.1717E-93 152892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.11 145.39 1869000000 139940000 138030000 102630000 228020000 274420000 97709000 166940000 101930000 149720000 63633000 163400000 152620000 89980000 1557 3042 1446 14570;14571;14572;14573;14574;14575;14576;14577;14578;14579;14580;14581;14582 18769;18770;18771;18772;18773;18774;18775;18776;18777;18778;18779;18780;18781;18782;18783;18784;18785;18786 18780 18 AGLELLSDQGYR Acetyl (Protein N-term) 1362.6779 0.67794416 4242 Q9NPD3;E9PPI9 EXOSC4 Exosome complex component RRP41 yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 138.47 138.47 2 0.00025216 141482 QUIQUE_C1563_190116_001 105.4 85.067 128530000 0 33874000 0 0 0 15567000 18111000 24066000 0 0 18712000 18202000 0 1558 4242 1447 14583;14584;14585;14586;14587;14588;14589;14590 18787;18788;18789;18790;18791;18792;18793;18794 18789 8 AGLELSPEMK Unmodified 1073.5427 0.54269624 1895 P05937 CALB1 Calbindin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 62.58 62.58 2 0.021675 61376 QUIQUE_C1368_190116_001 58.426 21.869 89603000 0 0 73822000 0 0 0 0 0 0 15781000 0 0 0 1559 1895 1448 14591;14592;14593;14594 18795;18796;18797;18798 18795 4 AGLENTVAETECR Unmodified 1448.6566 0.6565568 760;777 K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;CON__P13646-1 KRT13 Keratin, type I cytoskeletal 13 no no 0 0 0 1 1 1 1 46.793 46.793 2 6.5878E-06 42095 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.67 28.654 93265000 0 0 0 41937000 0 0 0 0 0 51328000 0 0 0 + 1560 760;777 1449 14595;14596;14597;14598 18799;18800;18801;18802 18801 4 AGLEVLFASAAPAITCR Acetyl (Protein N-term) 1787.924 0.92400487 3288 Q5QPM7;Q92530;Q5QPM9 PSMF1 Proteasome inhibitor PI31 subunit yes no 1 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 172.85 172.85 2;3 2.4687E-63 180010 QUIQUE_DMIX5_190116_001 237.87 212.21 4546400000 376300000 389450000 241190000 252030000 390180000 351170000 338770000 251040000 491020000 107930000 509010000 455590000 392700000 1561 3288 1450 14599;14600;14601;14602;14603;14604;14605;14606;14607;14608;14609;14610;14611;14612;14613;14614;14615;14616;14617;14618;14619;14620;14621;14622;14623 18803;18804;18805;18806;18807;18808;18809;18810;18811;18812;18813;18814;18815;18816;18817;18818;18819;18820;18821;18822;18823;18824;18825;18826;18827;18828;18829 18824 26 AGLGHPAAFGR Acetyl (Protein N-term) 1094.5621 0.56212655 1684 O94760 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.25 55.25 2 8.641E-26 53591 QUIQUE_C1277_190116_001 191.63 173.3 54455000000 3984300000 3868000000 4239400000 4024700000 4176300000 3415700000 3556000000 4502000000 4947100000 2336100000 5508900000 4711300000 5184900000 1562 1684 1451 14624;14625;14626;14627;14628;14629;14630;14631;14632;14633;14634;14635;14636 18830;18831;18832;18833;18834;18835;18836;18837;18838;18839;18840;18841;18842;18843;18844;18845;18846;18847;18848;18849;18850;18851;18852;18853;18854;18855;18856;18857;18858 18833 29 AGLGLCR Unmodified 745.39049 0.39049311 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 26.72 26.72 2 0.05526 20778 QUIQUE_C1277_190116_001 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18900;18901;18902;18903;18904;18905;18906;18907;18908;18909;18910;18911;18912;18913;18914;18915;18916 18909 15 AGLLFIFNFHPSK Unmodified 1489.8082 0.80817048 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes no 0 0 0 1 1 132.93 132.93 3 0.001317 139817 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.463 49.868 14740000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14740000 0 0 1571 2887 1460 14685;14686 18917;18918 18918 2 AGLLPSGPRPGYAAIQALLSSR Unmodified 2194.2222 0.2222358 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 137.31 137.31 3 0.0099165 140135 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.935 35.829 48479000 0 0 0 0 0 0 0 48479000 0 0 0 0 0 1572 2198 1461 14687 18919 18919 0 AGLLTEQAPGDTLTAVESK Unmodified 1899.9789 0.97893679 4139 Q9H267;A0A2R8YDQ0;F5H008 VPS33B Vacuolar protein sorting-associated protein 33B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.932 98.932 2 3.1449E-45 101616 QUIQUE_C1277_190116_001 159 126.84 291940000 36379000 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Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 1 34.781 34.781 2;3 0.00080839 31263 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.332 55.462 8568100000 662250000 778590000 622830000 365220000 537030000 246970000 818910000 1097000000 1087700000 407070000 422610000 1009700000 512210000 1592 3117 1480 14914;14915;14916;14917;14918;14919;14920;14921;14922;14923;14924;14925;14926;14927;14928;14929;14930;14931;14932;14933;14934 19182;19183;19184;19185;19186;19187;19188;19189;19190;19191;19192;19193;19194;19195;19196;19197;19198;19199;19200;19201;19202;19203;19204;19205;19206;19207;19208;19209;19210;19211 19198 30 AGLYGLPR Unmodified 845.47594 0.4759373 2524 P49327;A0A0U1RQF0;A0A0U1RRG3 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.589 56.589 2 0.014372 55410 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.086 39.735 1088600000 61177000 89410000 0 83866000 88482000 57839000 109730000 84671000 90747000 50344000 122990000 124930000 124420000 1593 2524 1481 14935;14936;14937;14938;14939;14940;14941;14942;14943;14944;14945;14946 19212;19213;19214;19215;19216;19217;19218;19219;19220;19221;19222;19223;19224;19225;19226;19227 19218 16 AGMSAEQAQGLLEK Unmodified 1431.7028 0.70277871 4562 Q9Y2Q3;E9PFN5 GSTK1 Glutathione S-transferase kappa 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.568 69.568 2 1.1494E-86 70671 QUIQUE_C1218_190116_001 218.54 189.49 913410000 85993000 0 86101000 52685000 69070000 56808000 66523000 85898000 87946000 32307000 138520000 61209000 90346000 1594 4562 1482 14947;14948;14949;14950;14951;14952;14953;14954;14955;14956;14957;14958;14959 19228;19229;19230;19231;19232;19233;19234;19235;19236;19237;19238;19239;19240;19241;19242;19243;19244 19228 15 AGNAIHAILLYR Unmodified 1310.7459 0.74590457 2562 P50416;H3BMD2 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.223 73.223 3 0.0026341 71068 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.815 57.675 78213000 0 0 0 20251000 0 18248000 15084000 0 0 9036800 0 15593000 0 1595 2562 1483 14960;14961;14962;14963;14964;14965;14966;14967;14968 19245;19246;19247;19248;19249;19250;19251;19252;19253;19254;19255 19254 11 AGNASKDEIDSAVK Unmodified 1403.6892 0.68923713 2213 P23381;G3V277;G3V3P2;G3V227;G3V3X0;G3V5W1;G3V3S7;G3V4C7;G3V4N8;G3V2F2;G3V3R3;G3V4S4;G3V313;G3V339;G3V2C0 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 18.808 18.808 2;3 1.2002E-85 11266 QUIQUE_C1368_190116_001 215.34 167.74 4433000000 173000000 268620000 693260000 323450000 353830000 198930000 249390000 407870000 348220000 32708000 702770000 331630000 349330000 1596 2213 1484 14969;14970;14971;14972;14973;14974;14975;14976;14977;14978;14979;14980;14981;14982;14983;14984;14985;14986;14987;14988;14989;14990;14991;14992;14993 19256;19257;19258;19259;19260;19261;19262;19263;19264;19265;19266;19267;19268;19269;19270;19271;19272;19273;19274;19275;19276;19277;19278;19279;19280;19281 19260 25 AGNDLIESSAGEEASNLQNK Unmodified 2045.9502 0.95015586 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 76.669 76.669 2 3.9492E-88 78794 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.35 158.47 38595000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38595000 0 0 1597 2882 1485 14994;14995 19282;19283 19283 2 AGNELLESSAGDDASSLR Unmodified 1790.8282 0.82824981 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.084 73.084 2 2.7433E-17 74602 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.99 142.43 300690000 0 0 52291000 0 0 24582000 38226000 0 0 0 75979000 67982000 41630000 1598 1187 1486 14996;14997;14998;14999;15000;15001 19284;19285;19286;19287;19288;19289 19287 6 AGNEYLIFQK Unmodified 1181.6081 0.60807369 911 E9PER6;O15530;Q6A1A2;H3BPW1 PDPK1;PDPK2P 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1;Putative 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 79.486 79.486 2 0.0059387 80123 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.761 56.978 81610000 0 0 0 0 0 0 0 36573000 45038000 0 0 0 0 1599 911 1487 15002;15003;15004 19290;19291;19292 19291 2 AGNILFTLDGDIK Unmodified 1375.7347 0.73473076 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 123.8 123.8 2 0.0018204 128554 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.017 36.297 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1600 4145 1488 15005;15006 19293;19294 19293 2 AGNILLNTEGHAK Unmodified 1336.7099 0.709913 49 A0A087WVN8;Q13043 STK4 Serine/threonine-protein kinase 4;Serine/threonine-protein kinase 4 37kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 4 18kDa subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.152 29.152 3 0.00016134 23685 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.191 82.609 228350000 41420000 47609000 41662000 0 0 31094000 0 0 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Unmodified 1241.6728 0.67279921 1315 K7EJT5;K7EP65;K7EKS7;K7ELC4;K7EMH1;K7ERI7;P35268 RPL22 60S ribosomal protein L22 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.718 56.718 2 0.014059 55071 QUIQUE_C1277_190116_001 65.395 48 453690000 0 100420000 0 0 102990000 0 0 0 0 31705000 111270000 107310000 0 1604 1315 1492 15026;15027;15028;15029;15030 19315;19316;19317;19318;19319 19315 4 AGNNMLLVGVHGPR Unmodified 1433.7562 0.75615168 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 55.744 55.744 2;3 0.00043862 54945 QUIQUE_C1438_190116_001 85.622 66.644 606090000 0 68707000 77616000 68286000 133610000 57082000 0 0 67962000 0 72901000 0 59927000 1605 2178 1493 15031;15032;15033;15034;15035;15036;15037;15038;15039;15040;15041 19320;19321;19322;19323;19324;19325;19326;19327;19328;19329;19330 19325 7 AGNSLAASTAEETAGSAQGR Unmodified 1847.8609 0.86094692 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.301 45.301 2 9.9164E-174 42053 QUIQUE_C1438_190116_001 242.92 221.05 1440000000 104660000 0 139270000 83101000 269580000 0 114750000 65227000 140030000 79517000 186990000 135920000 120960000 1606 2665 1494 15042;15043;15044;15045;15046;15047;15048;15049;15050;15051;15052;15053 19331;19332;19333;19334;19335;19336;19337;19338;19339;19340;19341;19342;19343;19344;19345;19346 19336 16 AGNSLVLPIVLWGR Acetyl (Protein N-term) 1535.8824 0.88239805 4604 Q9Y4E6;A2RRE0;K7EMB8 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.89 172.89 2 4.4364E-08 177067 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.17 153.29 907210000 70334000 87348000 44932000 45100000 84257000 58564000 95717000 65222000 77481000 21601000 104200000 101160000 51288000 1607 4604 1495 15054;15055;15056;15057;15058;15059;15060;15061;15062;15063;15064;15065;15066 19347;19348;19349;19350;19351;19352;19353;19354;19355;19356;19357;19358;19359 19355 13 AGNVIFR Unmodified 775.43407 0.43407249 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.854 31.854 2 0.019819 27660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.68 43.935 4816500000 680290000 519000000 578590000 471300000 456380000 545530000 0 334980000 580450000 0 650030000 0 0 1608 2673 1496 15067;15068;15069;15070;15071;15072;15073;15074;15075 19360;19361;19362;19363;19364;19365;19366;19367;19368 19366 9 AGNVVTGEMVEELILSGADIIK Unmodified 2257.1875 0.18754936 1172 H0YNS9 GMPR2 yes yes 0 0 0 1 170.21 170.21 3 0.00098902 174540 QUIQUE_C1218_190116_001 58.964 50.676 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1609 1172 1497 15076 19369 19369 1 AGNYEEALQLYQHAVQYFLHVVK Unmodified 2719.3758 0.37583591 1625 O75351;K7EL71;K7EKZ3 VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 167.28 167.28 4 2.504E-18 171776 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.52 114.42 436020000 0 0 0 0 0 0 76283000 0 95387000 0 167830000 96519000 0 1610 1625 1498 15077;15078;15079;15080 19370;19371;19372;19373;19374 19372 5 AGPAPPAADELPGPAAR Acetyl (Protein N-term) 1598.8053 0.80526994 177 A0A0A0MSK4;A0A087WVF5 GPSM1 yes no 1 0 0 1 1 92.315 92.315 2 0.0018664 95287 QUIQUE_C1576_190116_001 56.205 42.435 64538000 0 0 0 0 34468000 0 30069000 0 0 0 0 0 0 1611 177 1499 15081;15082 19375;19376 19376 2 AGPDLPSLPSHALEDEGWAAAAPSPGSAR Unmodified 2826.3573 0.35728531 4160 Q9H3Q1 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 119.54 119.54 2;3 2.349E-92 123420 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.86 193.7 3919500000 226380000 218170000 164800000 367550000 312820000 369440000 0 471370000 663110000 148320000 297160000 0 680430000 1612 4160 1500 15083;15084;15085;15086;15087;15088;15089;15090;15091;15092;15093;15094;15095 19377;19378;19379;19380;19381;19382;19383;19384;19385;19386;19387;19388;19389;19390;19391;19392;19393;19394;19395;19396;19397 19388 19 AGPESDAQYQFTGIK Unmodified 1610.7577 0.75765105 3882 Q96IX5 USMG5 Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 74.194 74.194 2 7.3464E-112 75089 QUIQUE_DMIX3_190116_001 231.17 203.74 1536700000 196230000 133510000 0 98446000 56367000 106350000 82988000 188790000 137050000 138410000 168070000 116080000 114410000 1613 3882 1501 15096;15097;15098;15099;15100;15101;15102;15103;15104;15105;15106;15107;15108;15109;15110 19398;19399;19400;19401;19402;19403;19404;19405;19406;19407;19408;19409;19410;19411;19412;19413;19414;19415;19416;19417;19418;19419;19420 19412 23 AGPESDAQYQFTGIKK Unmodified 1738.8526 0.85261407 3882 Q96IX5 USMG5 Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5 yes yes 0 0 1 1 2 1 51.165 51.165 2;3 0.00079389 49325 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.045 36.069 250660000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97887000 100520000 52254000 1614 3882 1502 15111;15112;15113;15114 19421;19422;19423;19424 19421 4 AGPGSSPLFSLLPGYR Unmodified 1617.8515 0.85149185 4126 Q9H0W8 SMG9 Protein SMG9 yes yes 0 0 0 1 1 140.78 140.78 2 0.035664 145759 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.54 28.449 27336000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27336000 1615 4126 1503 15115;15116 19425;19426 19426 2 AGPGTLSVTIEGPSK Unmodified 1412.7511 0.75110911 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 67.488 67.488 2 0.0094248 67707 QUIQUE_C1368_190116_001 58.04 35.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1616 1628 1504 15117 19427 19427 1 AGPILELEQWIDK Unmodified 1510.8031 0.80314468 3847 Q96EY8;S4R3P5;F5H4Z7 MMAB Cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 149.33 149.33 2 0.00051187 155191 QUIQUE_C1576_190116_001 90.05 80.046 164180000 34489000 30741000 0 0 0 53672000 27288000 0 0 0 17990000 0 0 1617 3847 1505 15118;15119;15120;15121;15122;15123 19428;19429;19430;19431;19432;19433;19434 19433 7 AGPIWDLR Unmodified 926.4974 0.49740102 1525;1581 O43390;B4DT28;O60506;B7Z645 HNRNPR;SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.76 84.76 2 0.0064687 87230 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.64 62.425 4069600000 266070000 358000000 449320000 272490000 304250000 312300000 366110000 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176.27 2;3 2.4408E-98 180390 QUIQUE_DMIX3_190116_001 202.6 185.11 3711800000 0 32122000 64637000 0 103860000 42727000 179590000 105850000 1086600000 0 176520000 1626300000 293590000 1621 2201 1509 15139;15140;15141;15142;15143;15144;15145;15146;15147;15148;15149;15150;15151;15152 19453;19454;19455;19456;19457;19458;19459;19460;19461;19462;19463;19464;19465;19466;19467;19468;19469;19470 19465 18 AGPSAQEPGSQTPLK Unmodified 1466.7365 0.73652168 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.423 29.423 2 1.2524E-12 23364 QUIQUE_C1277_190116_001 133.07 72.551 641090000 63676000 59981000 42403000 55752000 65070000 56235000 44454000 58919000 49603000 18461000 72609000 53926000 0 1622 1567 1510 15153;15154;15155;15156;15157;15158;15159;15160;15161;15162;15163;15164;15165 19471;19472;19473;19474;19475;19476;19477;19478;19479;19480;19481;19482;19483;19484;19485;19486;19487;19488 19473 18 AGPVQVLIVK Unmodified 1022.6488 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19519;19520;19521;19522;19523;19524;19525;19526;19527;19528 19519 5 AGQILQAELLAVYGADPGTQDSSGK Unmodified 2488.2445 0.24454697 1040 F8WAK2;F8VXI9;Q14161;R4GNG3;F8W822 GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT2 yes no 0 0 0 1 138.75 138.75 3 0.055504 141603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 19.737 7.8844 40761000 0 0 0 0 0 0 0 40761000 0 0 0 0 0 1628 1040 1516 15204 19529 19529 1 AGQLLSELFTNR Unmodified 1347.7147 0.71466402 2205 P23141 CES1 Liver carboxylesterase 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 119.33 119.33 2 0.00082262 124972 QUIQUE_C1218_190116_001 94.297 0 74610000 0 15082000 24589000 34939000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1629 2205 1517 15205;15206;15207;15208;15209;15210;15211;15212;15213 19530;19531;19532;19533;19534;19535;19536;19537;19538 19530 9 AGQMVTVWAAGAGVAHSPPSTLVWK Oxidation (M) 2536.2897 0.28966344 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 110.85 110.85 3 7.993E-11 115693 QUIQUE_C1218_190116_001 80.102 72.298 441840000 60955000 64646000 0 40415000 0 0 0 81525000 94125000 0 0 0 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no 0 1 0 1 1 1 165.17 165.17 2 5.2034E-18 168615 QUIQUE_C1277_190116_001 120.24 103.02 53707000 0 22614000 0 9736100 0 0 21357000 0 0 0 0 0 0 1637 3549 1523 15275;15276;15277 19611;19612;19613 19611 2684 3 AGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKK Unmodified 2458.1331 0.13308772 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 158.66 158.66 3 4.4247E-09 161409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.726 73.33 146070000 0 0 0 0 0 0 0 45422000 0 0 57031000 0 43617000 1638 3549 1524 15278;15279;15280 19614;19615;19616 19614 2 AGQSSLGGGHVSER Unmodified 1340.6433 0.64328999 705;592 C9JA33;B1ALY0 PALM2;PALM2-AKAP2 no no 0 0 0 1 1 11.434 11.434 3 0.0052096 3695 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.657 29.791 11298000 0 0 0 2971000 0 0 0 8327000 0 0 0 0 0 1639 705;592 1525 15281;15282 19617;19618 19618 2 AGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFLQLLGER Unmodified 3245.4459 0.4459019 1511 O43166;F5GYF8;H0YJY2 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 170.17 170.17 3 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19723;19724;19725;19726;19727;19728;19729;19730;19731;19732;19733;19734;19735;19736;19737;19738;19739;19740;19741;19742;19743;19744;19745;19746;19747;19748;19749;19750;19751;19752;19753;19754 19736 31 AGSDGESIGNCPFSQR Unmodified 1680.7162 0.71619694 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.394 53.394 2 2.2776E-13 51397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.27 122.84 2071700000 167250000 143120000 233120000 208560000 155880000 137970000 193120000 62498000 150360000 85538000 188260000 136080000 209970000 1651 4646 1536 15385;15386;15387;15388;15389;15390;15391;15392;15393;15394;15395;15396;15397 19755;19756;19757;19758;19759;19760;19761;19762;19763;19764;19765;19766;19767 19762 13 AGSDYEYSEGTLVFKPGETQK Unmodified 2305.075 0.075022022 1015 F5H6L7;Q9UPR5 SLC8A2 Sodium/calcium exchanger 2 yes no 0 0 1 1 1 1 78.643 78.643 3 2.8698E-05 79445 QUIQUE_C1368_190116_001 72.585 68.33 123390000 28944000 29387000 65056000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1652 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protein 11 yes yes 0 0 1 1 1 10.435 10.435 3 0.00022948 2824 QUIQUE_C1277_190116_001 73.833 58.276 9032300 0 3859900 0 0 0 5172400 0 0 0 0 0 0 0 1656 1688 1541 15408;15409 19779;19780 19779 2 AGSSESIAAFIQR Unmodified 1335.6783 0.67827852 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 86.97 86.97 2 0.0255 88746 QUIQUE_C1277_190116_001 49.3 31.492 59060000 0 59060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1657 7 1542 15410 19781 19781 1 AGSSSLEAVRR Acetyl (Protein N-term) 1173.6102 0.61019895 1019;1164 F5H7S3;B7Z596;H0YN06;H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 1 0 1 1 1 1 1 1 36.492 36.492 2 7.0558E-24 32451 QUIQUE_DMIX3_190116_001 220.39 199.52 507840000 0 0 0 0 0 0 0 89667000 115250000 0 123110000 101720000 78098000 1658 1019;1164 1543 15411;15412;15413;15414;15415 19782;19783;19784;19785;19786 19783 3 AGSSTPGDAPPAVAEVQGR Unmodified 1765.8595 0.85949036 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 49.977 49.977 2 0.00018452 48528 QUIQUE_C1438_190116_001 76.262 63.685 23447000 0 0 0 0 23447000 0 0 0 0 0 0 0 0 1659 3471 1544 15416 19787 19787 1 AGSTALYWACHGGHK Unmodified 1614.7361 0.73614452 3763 Q92882 OSTF1 Osteoclast-stimulating factor 1 yes yes 0 0 0 1 28.793 28.793 3 0.0043871 22990 QUIQUE_C1403_190116_001 34.432 22.639 39331000 0 0 0 39331000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1660 3763 1545 15417 19788 19788 1 AGSVADSDAVVK Acetyl (Protein N-term) 1159.5721 0.57208211 3232 Q3ZCW2;U3KQ88;F8WF17;B9A055 LGALSL Galectin-related protein;Galectin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 59.958 59.958 2 0.0038776 59409 QUIQUE_C1218_190116_001 63.184 34.035 462330000 87314000 94238000 152990000 0 0 0 0 0 0 39355000 0 88436000 0 1661 3232 1546 15418;15419;15420;15421;15422;15423 19789;19790;19791;19792;19793;19794 19789 4 AGSVPSLAAGLLFGSLAGLGAYQLSQDPR Unmodified 2815.4868 0.48684292 4370 Q9P0S9 TMEM14C Transmembrane protein 14C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 172.36 172.36 3 1.5419E-19 173841 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.723 82.101 1203500000 20897000 0 259100000 0 41995000 25341000 0 218400000 214190000 11571000 216700000 0 195260000 1662 4370 1547 15424;15425;15426;15427;15428;15429;15430;15431;15432;15433 19795;19796;19797;19798;19799;19800;19801;19802;19803;19804 19799 8 AGSVSLDSVLADVR Unmodified 1387.7307 0.73070802 1321 K7EK60;K7EJE6 FMNL1 no no 0 0 0 1 117.13 117.13 2 0.070628 123299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.021 16.557 23004000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23004000 0 0 1663 1321 1548 15434 19805 19805 1 AGTEALPDGLSVEDILNLLGMESAANQK Unmodified 2855.4223 0.42225334 2056 P13521 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes yes 0 0 0 1 1 173.51 173.51 3 6.9117E-13 177355 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.122 65.323 134950000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84785000 0 50160000 1664 2056 1549 15435;15436 19806;19807 19807 2 AGTEDEEEEEEGRR Unmodified 1634.6656 0.66560116 1731 O95456;F8WBH7 PSMG1 Proteasome assembly chaperone 1 yes no 0 0 1 1 1 13.759 13.759 3 0.0096418 5857 QUIQUE_C1438_190116_001 50.563 41.026 8446200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8446200 0 1665 1731 1550 15437;15438 19808;19809 19808 1 AGTEEAIVYSDIDLKK Unmodified 1750.8989 0.89889556 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 1 1 1 74.465 74.465 2 1.8622E-14 75329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.97 128.29 41615000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41615000 0 0 1666 4256 1551 15439;15440 19810;19811 19810 2 AGTFGLQSAR Unmodified 1006.5196 0.51959303 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 36.683 36.683 2 0.016955 32382 QUIQUE_C1563_190116_001 62.201 22.2 251430000 0 0 0 0 0 40072000 0 0 75152000 0 58744000 77461000 0 1667 2225 1552 15441;15442;15443;15444 19812;19813;19814;19815 19812 4 AGTFQAFEQFGQQLLAHGHYASPEIK Unmodified 2874.4089 0.40892695 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 3 2 2 3 2 2 3 3 2 3 2 2 142.01 142.01 2;3;4 6.9146E-218 146654 QUIQUE_C1277_190116_001 246.77 239.74 77273000000 3557500000 6354200000 5900700000 4644900000 5905300000 3546300000 8328700000 5516500000 7857800000 2815500000 8298800000 5708000000 8838700000 1668 267;275;3025 1553 15445;15446;15447;15448;15449;15450;15451;15452;15453;15454;15455;15456;15457;15458;15459;15460;15461;15462;15463;15464;15465;15466;15467;15468;15469;15470;15471;15472;15473;15474;15475 19816;19817;19818;19819;19820;19821;19822;19823;19824;19825;19826;19827;19828;19829;19830;19831;19832;19833;19834;19835;19836;19837;19838;19839;19840;19841;19842;19843;19844;19845;19846;19847;19848;19849;19850;19851;19852;19853;19854;19855;19856;19857;19858;19859;19860;19861;19862;19863;19864;19865;19866;19867;19868;19869;19870;19871;19872;19873;19874;19875;19876;19877;19878;19879;19880;19881;19882;19883;19884;19885;19886;19887 19822 71 AGTGLVAGEVVVDALPYFDQGYEAPGVR Acetyl (Protein N-term) 2891.4341 0.43413865 1668 O75934 BCAS2 Pre-mRNA-splicing factor SPF27 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.62 173.62 3 3.9009E-65 177373 QUIQUE_DMIX8_190116_001 126.46 115.32 319730000 27401000 23607000 11269000 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A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 1 44.853 44.853 2;3 0.0018113 41445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.952 54.599 167450000 0 0 0 0 0 0 0 167450000 0 0 0 0 0 1671 404 1556 15499;15500;15501 19927;19928;19929 19927 2 AGTHILCIK Unmodified 1011.5535 0.55353569 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 24.703 24.703 2 0.011794 17845 QUIQUE_C1368_190116_001 72.23 46.058 241250000 0 0 44809000 73883000 0 0 0 0 0 0 82453000 40104000 0 1672 2026 1557 15502;15503;15504;15505 19930;19931;19932;19933 19930 4 AGTLSITEFADMLSGNAGGFR Unmodified 2114.0103 0.010253695 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 163.94 163.94 2;3 1.3661E-26 170965 QUIQUE_DMIX5_190116_001 195.94 173.71 3059500000 115800000 262350000 404050000 92735000 300830000 182320000 0 397580000 444480000 81194000 312380000 303100000 162720000 1673 3117 1558 15506;15507;15508;15509;15510;15511;15512;15513;15514;15515;15516;15517;15518;15519;15520;15521;15522;15523 19934;19935;19936;19937;19938;19939;19940;19941;19942;19943;19944;19945;19946;19947;19948;19949;19950;19951;19952;19953;19954;19955;19956;19957;19958;19959;19960;19961 19955 25 AGTLSITEFADMLSGNAGGFR Oxidation (M) 2130.0052 0.0051683175 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 148.39 148.39 2;3 6.6834E-19 152877 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.97 99.851 348050000 0 0 0 0 0 0 39940000 59868000 117870000 0 58325000 42890000 29158000 1674 3117 1558 15524;15525;15526;15527;15528;15529;15530 19962;19963;19964;19965;19966;19967;19968;19969 19968 2555 7 AGTLTVEELGATLTSLLAQAQAQAR Unmodified 2512.3497 0.34968074 13 A0A075B730;P58107 EPPK1 Epiplakin yes no 0 0 0 1 1 173.07 173.07 3 3.2504E-05 180319 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.323 46.326 108970000 0 0 0 0 0 0 0 0 34350000 0 74615000 0 0 1675 13 1559 15531;15532 19970;19971 19971 1 AGTPYTVTLHGEVR Unmodified 1499.7732 0.77324153 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P12814;G3V2N5;G3V5M4;G3V380 ACTN1 Alpha-actinin-1 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 114.97 114.97 2;3 5.8191E-104 118679 QUIQUE_C1277_190116_001 222.81 184.18 817650000 88622000 157460000 55546000 85283000 212250000 52023000 36507000 65004000 0 0 0 0 64953000 1680 2047 1564 15588;15589;15590;15591;15592;15593;15594;15595;15596;15597;15598;15599;15600 20032;20033;20034;20035;20036;20037;20038;20039;20040;20041;20042;20043;20044;20045;20046 20036 12 AGTQLLAGLR Unmodified 998.58728 0.58727866 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.92 65.92 2 0.003914 65882 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.53 60.177 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1681 1909 1565 15601;15602;15603;15604;15605;15606 20047;20048;20049;20050;20051;20052 20050 6 AGTYLPQSYLIHEHMVITDR Unmodified 2343.1682 0.16815132 509 A0A3B3IUC0;Q9Y287 ITM2B Integral membrane protein 2B;BRI2, membrane form;BRI2 intracellular domain;BRI2C, soluble form;Bri23 peptide yes no 0 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20200;20201;20202;20203;20204;20205 20202 3000 6 AGVNFSEFTGVWK Unmodified 1440.7038 0.70376498 1623 O75340;A0A024QZ42 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 129.48 129.48 2 0.00030615 133480 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.06 94.6 3554500000 280160000 273620000 250620000 188360000 283900000 249600000 293300000 232190000 360660000 104660000 401820000 317660000 317950000 1696 1623 1579 15738;15739;15740;15741;15742;15743;15744;15745;15746;15747;15748;15749;15750;15751;15752 20206;20207;20208;20209;20210;20211;20212;20213;20214;20215;20216;20217;20218;20219;20220;20221;20222;20223 20223 18 AGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVR Unmodified 2428.1477 0.14767515 1411 O00487;C9JW37 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 175.38 175.38 3 7.2061E-05 179539 QUIQUE_C1218_190116_001 55.127 48.174 155330000 4026100 5866900 3272800 0 0 0 19755000 12887000 33337000 0 50471000 25717000 0 1697 1411 1580 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20241;20242;20243;20244;20245;20246;20247;20248;20249;20250;20251;20252;20253;20254;20255;20256;20257 20255 12 AGVSVYGIVK Unmodified 991.57023 0.57023162 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.05 64.05 2 0.009734 64178 QUIQUE_C1218_190116_001 69.812 50.108 1107300000 122630000 143790000 0 0 118680000 0 0 151400000 163700000 100960000 156320000 149800000 0 1700 3835 1582 15782;15783;15784;15785;15786;15787;15788;15789 20258;20259;20260;20261;20262;20263;20264;20265;20266 20258 5 AGVTCIVLPAENKK Unmodified 1498.8177 0.81774888 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 47.767 47.767 3 0.032598 45942 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.338 15.761 62912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62912000 0 0 1701 1324 1583 15790 20267 20267 1 AGVVGPELHEQLLSAEK Unmodified 1775.9418 0.94176342 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.425 71.425 2;3 9.1464E-64 72018 QUIQUE_C1277_190116_001 229.9 184.07 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20317;20318;20319;20320;20321;20322;20323 20318 5 AGWLDSELNMFTHQYLQPSR Unmodified 2392.127 0.12701479 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 154.37 154.37 3 4.9565E-10 159348 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.18 94.248 137100000 0 24822000 0 0 0 0 0 0 37073000 0 39394000 35814000 0 1704 1705 1586 15824;15825;15826;15827;15828 20324;20325;20326;20327;20328 20326 5 AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2774.2316 0.23161579 1926 P07737;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.73 163.73 3 1.514E-17 165656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.366 97.022 768310000 74765000 84770000 77415000 66898000 93656000 63659000 77289000 34900000 35121000 0 65133000 41378000 53325000 + 1705 1926 1587 15829;15830;15831;15832;15833;15834;15835;15836;15837;15838;15839;15840 20329;20330;20331;20332;20333;20334;20335;20336;20337;20338;20339;20340 20336 1152 12 AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYK Acetyl (Protein N-term) 2758.2367 0.23670117 1926 P07737;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 1 0 0 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 172.12 172.12 2;3 1.165E-98 176381 QUIQUE_DMIX3_190116_001 234.67 217.18 3370800000 0 414750000 0 170720000 336680000 245440000 278560000 272790000 365320000 43020000 621870000 327100000 294510000 + 1706 1926 1587 15841;15842;15843;15844;15845;15846;15847;15848;15849;15850;15851;15852;15853;15854;15855;15856 20341;20342;20343;20344;20345;20346;20347;20348;20349;20350;20351;20352;20353;20354;20355;20356;20357;20358;20359 20353 19 AGWNAYIDNLMADGTCQDAAIVGYKDSPSVWAAVPGK Acetyl (Protein N-term) 3952.84 0.84002383 1926 P07737;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 1 0 1 1 169.37 169.37 3 2.183E-23 171170 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.36 78.591 32343000 0 0 0 0 0 0 0 32343000 0 0 0 0 0 + 1707 1926 1588 15857 20360 20360 1 AGWQSYVDNLMCDGCCQEAAIVGYCDAK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 3298.3134 0.31338964 1099;2367 G5E9Q6;C9JQ45;C9J2N0;C9J5V8;F2Z3G0;P35080 PFN2 Profilin;Profilin-2 no no 1 1 0 1 163.86 163.86 3 0.00012436 165815 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20368;20369;20370;20371;20372;20373;20374;20375;20376;20377;20378;20379;20380;20381;20382;20383 20369 16 AGYAGEDCPK Unmodified 1066.439 0.43895945 1686;1771 O94805;O96019;H7C5S0 ACTL6B;ACTL6A Actin-like protein 6B;Actin-like protein 6A no no 0 0 0 1 1 1 15.547 15.547 2 0.012136 7267 QUIQUE_C1563_190116_001 66.299 49.523 83112000 0 40219000 0 25390000 0 17503000 0 0 0 0 0 0 0 1711 1686;1771 1591 15877;15878;15879 20384;20385;20386 20386 3 AGYAHFLNVQGR Unmodified 1331.6735 0.67346791 3310 Q5T440 IBA57 Putative transferase CAF17, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 55.083 55.083 3 0.026024 53210 QUIQUE_C1277_190116_001 29.39 17.332 64124000 0 64124000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1712 3310 1592 15880 20387 20387 1 AGYIIPLQGPGLTTTESR Unmodified 1872.9945 0.99452728 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.76 110.76 2 4.649E-07 114035 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.65 88.438 1155600000 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Unmodified 1548.8586 0.85855107 3346 Q63ZY3;K7EIU4 KANK2 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 145.83 145.83 2 0.0016503 150188 QUIQUE_C1403_190116_001 68.44 54.021 175090000 17577000 18935000 0 21506000 30122000 14315000 0 0 22724000 0 27776000 22130000 0 1716 3346 1596 15900;15901;15902;15903;15904;15905;15906;15907 20409;20410;20411;20412;20413;20414;20415;20416;20417 20412 9 AGYTDKVVIGMDVAASEFFR Unmodified 2175.067 0.067040293 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 1 10 1 2 2 152.71 152.71 3 7.3682E-24 151461 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.04 121.62 706800000 0 0 0 0 0 0 0 621280000 0 0 0 63677000 21848000 1717 1906 1597 15908;15909;15910;15911;15912;15913;15914;15915;15916;15917;15918;15919;15920;15921;15922 20418;20419;20420;20421;20422;20423;20424;20425;20426;20427;20428;20429;20430;20431;20432;20433;20434 20419 16 AGYVGLVTVPVATLAGR Unmodified 1642.9406 0.94064121 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A1B0GW70 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.07 128.07 2 0.0017133 133651 QUIQUE_C1218_190116_001 76.533 60.396 538030000 75248000 74582000 40745000 65792000 0 49182000 71684000 0 33891000 19193000 42359000 65352000 0 1718 135 1598 15923;15924;15925;15926;15927;15928;15929;15930;15931;15932 20435;20436;20437;20438;20439;20440;20441;20442;20443;20444;20445 20435 11 AHAAQVTCVAASPHK Unmodified 1546.7674 0.76744465 3991 Q9BQA1;H0Y711 WDR77 Methylosome protein 50 yes no 0 0 0 2 2 4 2 2 1 1 2 2 1 2 10.752 10.752 2;3;4 1.8421E-54 2711 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.24 150.53 863030000 40339000 0 150560000 93563000 120480000 0 117440000 34503000 44123000 19993000 71730000 64245000 106060000 1719 3991 1599 15933;15934;15935;15936;15937;15938;15939;15940;15941;15942;15943;15944;15945;15946;15947;15948;15949;15950;15951;15952;15953 20446;20447;20448;20449;20450;20451;20452;20453;20454;20455;20456;20457;20458;20459;20460;20461;20462;20463;20464;20465;20466;20467;20468;20469 20465 23 AHAASVFLTLLHFDSPPIPHVPHR Unmodified 2658.4183 0.41830985 1283 J3KR97;Q9BTW9;A0A0J9YWI5;A0A0J9YVR1;I3L120;A0A0J9YXU4 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 2 119.72 119.72 4;5 5.0561E-12 123722 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.968 87.699 91919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91919000 0 1720 1283 1600 15954;15955 20470;20471 20471 2 AHADDELAALR Unmodified 1180.5836 0.58364985 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 2 39.381 39.381 2;3 0.0009083 35279 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.111 64.902 1229300000 0 62646000 267990000 0 39230000 56722000 177400000 0 177680000 36572000 163560000 56292000 191200000 1721 2515 1601 15956;15957;15958;15959;15960;15961;15962;15963;15964;15965;15966;15967;15968;15969 20472;20473;20474;20475;20476;20477;20478;20479;20480;20481;20482;20483;20484;20485;20486;20487;20488;20489 20488 14 AHAMAQVDAWK Oxidation (M) 1242.5815 0.58154136 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 20.385 20.385 2 5.0398E-05 13110 QUIQUE_C1368_190116_001 137.98 115.41 394180000 0 0 56021000 0 50367000 0 0 83023000 60713000 43048000 54534000 0 46471000 1722 98;3487 1602 15970;15971;15972;15973;15974;15975;15976 20490;20491;20492;20493;20494;20495;20496 20490 69 7 AHAMAQVDAWK Unmodified 1226.5866 0.58662674 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 2 33.97 33.97 2;3 0.0042427 29535 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.732 81.51 183860000 0 0 0 0 0 59220000 0 124640000 0 0 0 0 0 1723 98;3487 1602 15977;15978;15979 20497;20498;20499 20498 3 AHCQTSGWSLTEQDPYNNIVR Unmodified 2475.1237 0.12372032 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.329 90.329 3 1.0849E-07 92455 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.64 84.188 636940000 66877000 50596000 77707000 42515000 58080000 49856000 54678000 50218000 61850000 0 89685000 0 34879000 1724 2191 1603 15980;15981;15982;15983;15984;15985;15986;15987;15988;15989;15990 20500;20501;20502;20503;20504;20505;20506;20507;20508;20509;20510;20511 20509 12 AHDGGIYAISWSPDSTHLLSASGDK Unmodified 2584.2194 0.21939485 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 3 3 4 3 3 3 2 3 3 3 3 3 3 105.55 105.55 2;3;4 2.3847E-142 107837 QUIQUE_DMIX1_190116_001 247.46 222.53 16840000000 1246300000 1285900000 1663800000 1483900000 1209300000 1246700000 1294800000 1125100000 1382500000 650430000 1474200000 1215100000 1561900000 1725 1609 1604 15991;15992;15993;15994;15995;15996;15997;15998;15999;16000;16001;16002;16003;16004;16005;16006;16007;16008;16009;16010;16011;16012;16013;16014;16015;16016;16017;16018;16019;16020;16021;16022;16023;16024;16025;16026;16027;16028;16029 20512;20513;20514;20515;20516;20517;20518;20519;20520;20521;20522;20523;20524;20525;20526;20527;20528;20529;20530;20531;20532;20533;20534;20535;20536;20537;20538;20539;20540;20541;20542;20543;20544;20545;20546;20547;20548;20549;20550;20551;20552;20553;20554;20555;20556;20557;20558;20559;20560;20561;20562;20563;20564;20565;20566;20567;20568;20569;20570;20571;20572;20573;20574;20575;20576;20577 20553 66 AHEACGPMEIDSALNTVQTLK Unmodified 2284.0828 0.082766711 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 106.95 106.95 3 0.0018571 109626 QUIQUE_C1403_190116_001 27.52 24.679 73186000 0 0 0 35585000 0 37601000 0 0 0 0 0 0 0 1726 4606 1605 16030;16031 20578;20579 20578 2 AHEEQLKEAQAVPATLPELEATK Unmodified 2502.2966 0.29658254 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 1 77.72 77.72 3;4 5.1803E-05 77916 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.152 44.719 298960000 0 0 0 0 0 0 0 261720000 0 0 0 37237000 0 1727 3117 1606 16032;16033;16034 20580;20581;20582 20581 2 AHEHIFGMVLMNDWSAR Unmodified 2012.9349 0.93492068 2114 P16930 FAH Fumarylacetoacetase yes yes 0 0 0 1 109.25 109.25 4 0.00064645 113214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.382 39.458 20873000 0 0 0 0 0 0 0 0 20873000 0 0 0 0 1728 2114 1607 16035 20583 20583 1 AHEILPNLVCCSAK Unmodified 1610.7909 0.79088221 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 63.287 63.287 2;3 0.00033439 61740 QUIQUE_C1563_190116_001 101.47 87.048 155500000 0 71205000 47905000 0 0 36388000 0 0 0 0 0 0 0 1729 2572 1608 16036;16037;16038;16039;16040;16041 20584;20585;20586;20587;20588;20589 20588 6 AHELKEHNGHITGIDWAPK Unmodified 2152.0814 0.081385224 369;3752 A0A1W2PNV4;E9PF58;Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 0 0 1 1 37.329 37.329 4 0.0037044 33181 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.347 37.66 46545000 0 0 0 0 0 0 0 46545000 0 0 0 0 0 1730 369;3752 1609 16042 20590 20590 1 AHEQALAELTK Unmodified 1209.6354 0.63535107 3142 Q15477 SKIV2L Helicase SKI2W yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 29.032 29.032 2 0.00047493 24018 QUIQUE_C1218_190116_001 102.05 72.961 103310000 21716000 29143000 0 0 0 0 0 0 24906000 0 0 27543000 0 1731 3142 1610 16043;16044;16045;16046;16047 20591;20592;20593;20594;20595 20591 5 AHETAFLSWFR Unmodified 1363.6673 0.6673199 4317 Q9NX00 TMEM160 Transmembrane protein 160 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 110.5 110.5 3 0.00052869 114088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.261 69.684 18792000 0 0 0 8098200 0 0 0 0 10694000 0 0 0 0 1732 4317 1611 16048;16049;16050;16051;16052 20596;20597;20598;20599;20600 20600 5 AHFLDADPGFVHSDGTISHHDMYDYLHLSR Unmodified 3452.5633 0.56327212 3110 Q15102;M0R1K3 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 4 3 2 1 3 5 3 104.09 104.09 4;5;6;7 4.4255E-14 108151 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.13 69.225 4847500000 55354000 233730000 269400000 238930000 0 113030000 485850000 429280000 691870000 98556000 936640000 447390000 847430000 1733 3110 1612 16053;16054;16055;16056;16057;16058;16059;16060;16061;16062;16063;16064;16065;16066;16067;16068;16069;16070;16071;16072;16073;16074;16075;16076;16077;16078;16079;16080;16081;16082 20601;20602;20603;20604;20605;20606;20607;20608;20609;20610;20611;20612;20613;20614;20615;20616;20617;20618;20619;20620;20621;20622;20623;20624;20625;20626;20627;20628;20629;20630;20631 20621 20 AHFLDADPGFVHSDGTISHHDMYDYLHLSR Oxidation (M) 3468.5582 0.55818674 3110 Q15102;M0R1K3 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 1 0 1 1 1 91.713 91.713 4 4.145E-06 93460 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.971 51.065 183790000 0 0 0 0 0 0 0 35574000 0 0 0 56435000 91781000 1734 3110 1612 16083;16084;16085 20632;20633;20634 20633 2551 3 AHFPAALGHILIK Unmodified 1386.8136 0.81359021 4080 Q9BZ71 PITPNM3 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.551 72.551 3 0.0001424 72819 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.653 80.601 280680000 23310000 34224000 0 20708000 22025000 0 19784000 28066000 30534000 0 34463000 39965000 27601000 1735 4080 1613 16086;16087;16088;16089;16090;16091;16092;16093;16094;16095 20635;20636;20637;20638;20639;20640;20641;20642;20643;20644 20641 10 AHFPLDVQWNDLDYMDSR Unmodified 2220.9899 0.9898526 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 136.29 136.29 3 4.0817E-05 132951 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.942 68.101 100400000 0 34320000 0 0 0 0 0 0 0 11497000 54578000 0 0 1736 1993 1614 16096;16097;16098 20645;20646;20647 20646 3 AHFQNFPNGVTDFIK Unmodified 1733.8526 0.85255449 3772 Q92973;E7EW37 TNPO1 Transportin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 98.697 98.697 3 0.0027192 103120 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.69 33.776 72033000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21892000 29803000 20338000 1737 3772 1615 16099;16100;16101;16102 20648;20649;20650;20651;20652 20649 4 AHGFTFTR Unmodified 935.46135 0.46134987 1943 P08559;Q5JPU0;Q5JPT9;Q5JPU1 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.113 25.113 2 0.0036666 18046 QUIQUE_DMIX8_190116_001 125.25 110.84 2655100000 218860000 0 242960000 0 0 235840000 309790000 230740000 311800000 0 436630000 186670000 481780000 1738 1943 1616 16103;16104;16105;16106;16107;16108;16109;16110;16111 20653;20654;20655;20656;20657;20658;20659;20660;20661 20661 6 AHGGYSVFAGVGER Unmodified 1405.6739 0.67386184 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W079;H0YI37;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 4 4 7 2 2 2 5 5 5 4 6 3 6 51.615 51.615 2;3 2.166E-28 48656 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.3 160.66 27922000000 2249500000 2129100000 2506300000 1526100000 1130300000 1645700000 2243900000 2413500000 2461400000 1216100000 3342100000 1974600000 3083000000 1739 1900;1046 1617 16112;16113;16114;16115;16116;16117;16118;16119;16120;16121;16122;16123;16124;16125;16126;16127;16128;16129;16130;16131;16132;16133;16134;16135;16136;16137;16138;16139;16140;16141;16142;16143;16144;16145;16146;16147;16148;16149;16150;16151;16152;16153;16154;16155;16156;16157;16158;16159;16160;16161;16162;16163;16164;16165;16166 20662;20663;20664;20665;20666;20667;20668;20669;20670;20671;20672;20673;20674;20675;20676;20677;20678;20679;20680;20681;20682;20683;20684;20685;20686;20687;20688;20689;20690;20691;20692;20693;20694;20695;20696;20697;20698;20699;20700;20701;20702;20703;20704;20705;20706;20707;20708;20709;20710;20711;20712;20713;20714;20715;20716;20717;20718;20719;20720;20721;20722;20723;20724;20725;20726;20727;20728;20729;20730;20731;20732;20733;20734;20735;20736 20709 67 AHGIPSQGK Acetyl (Protein N-term) 935.48248 0.48247924 3157 Q15777;F2Z346;E9PQW8 MPPED2 Metallophosphoesterase MPPED2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 17.524 17.524 2 0.0037497 9606 QUIQUE_C1563_190116_001 81.215 60.061 80073000 22660000 18823000 0 16060000 0 22529000 0 0 0 0 0 0 0 1740 3157 1618 16167;16168;16169;16170;16171;16172 20737;20738;20739;20740;20741;20742 20740 6 AHGLEVEPSALEQGFR Unmodified 1738.8638 0.86384745 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 83.878 83.878 2;3 5.1398E-07 86534 QUIQUE_C1438_190116_001 144.57 109.68 1175200000 37572000 73254000 133770000 21974000 101930000 79531000 104340000 92731000 118690000 36934000 140370000 89991000 144110000 1741 4012 1619 16173;16174;16175;16176;16177;16178;16179;16180;16181;16182;16183;16184;16185;16186;16187;16188;16189;16190;16191;16192;16193;16194;16195 20743;20744;20745;20746;20747;20748;20749;20750;20751;20752;20753;20754;20755;20756;20757;20758;20759;20760;20761;20762;20763;20764;20765;20766;20767 20750 25 AHGLLAEENR Unmodified 1108.5625 0.56252048 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 17.547 17.547 3 0.013518 9917 QUIQUE_C1403_190116_001 38.75 26.514 11302000 0 0 0 11302000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1742 3091 1620 16196 20768 20768 1 AHGPGLEGGLVGKPAEFTIDTK Unmodified 2193.143 0.14298243 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 76.839 76.839 3;4 9.9668E-06 77567 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.501 55.731 250740000 0 0 0 0 0 0 0 46073000 46116000 0 60175000 41403000 56974000 1743 1628 1621 16197;16198;16199;16200;16201 20769;20770;20771;20772;20773;20774;20775 20774 6 AHGQDLGTAGSCLR Unmodified 1441.6732 0.67320991 494 A0A3B3ISV3;P02462;P29400 COL4A1;COL4A5 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten;Collagen alpha-5(IV) chain yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 23.576 23.576 2;3 6.6022E-101 16500 QUIQUE_C1368_190116_001 229 197.58 6075700000 387990000 740530000 737520000 130090000 841100000 100080000 252800000 258710000 562390000 147690000 810030000 573860000 532860000 1744 494 1622 16202;16203;16204;16205;16206;16207;16208;16209;16210;16211;16212;16213;16214;16215;16216;16217;16218;16219;16220;16221;16222;16223 20776;20777;20778;20779;20780;20781;20782;20783;20784;20785;20786;20787;20788;20789;20790;20791;20792;20793;20794;20795;20796;20797 20779 15 AHGQDLGTAGSCLRK Unmodified 1569.7682 0.76817293 494 A0A3B3ISV3;P02462 COL4A1 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten yes no 0 0 1 1 17.897 17.897 3 8.5095E-05 10632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.231 54.878 29329000 0 0 0 0 0 0 0 29329000 0 0 0 0 0 1745 494 1623 16224 20798 20798 1 AHHPTSQHGDLETPSSGDEGEILSAEGPPVR Unmodified 3206.4865 0.48646159 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 1 2 3 2 2 1 1 2 59.516 59.516 3;4;5 1.7848E-54 58526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.63 131.14 2325400000 219280000 167070000 224030000 254670000 213690000 56537000 281940000 220780000 178350000 137620000 108850000 75929000 186610000 1746 1436 1624 16225;16226;16227;16228;16229;16230;16231;16232;16233;16234;16235;16236;16237;16238;16239;16240;16241;16242;16243;16244;16245;16246;16247;16248;16249 20799;20800;20801;20802;20803;20804;20805;20806;20807;20808;20809;20810;20811;20812;20813;20814;20815;20816;20817;20818;20819;20820;20821;20822;20823;20824;20825 20817 22 AHIAQLCEK Unmodified 1068.5386 0.53861391 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 2 15.278 15.278 2;3 0.00037878 7601 QUIQUE_DMIX4_190116_001 135 108.61 479280000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 479280000 0 0 0 1747 50;2631 1625 16250;16251 20826;20827 20826 1 AHITLGCAADVEAVQTGLDLLEILR Unmodified 2677.4109 0.41090079 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 3 4 3 2 1 4 2 4 8 1 1 169.1 169.1 2;3;4 1.5621E-264 170609 QUIQUE_DMIX1_190116_001 323.54 312.27 18033000000 870820000 1250800000 0 564700000 224040000 1206900000 3248700000 2029200000 2852300000 0 5567600000 82128000 135590000 1748 1969 1626 16252;16253;16254;16255;16256;16257;16258;16259;16260;16261;16262;16263;16264;16265;16266;16267;16268;16269;16270;16271;16272;16273;16274;16275;16276;16277;16278;16279;16280;16281;16282;16283;16284 20828;20829;20830;20831;20832;20833;20834;20835;20836;20837;20838;20839;20840;20841;20842;20843;20844;20845;20846;20847;20848;20849;20850;20851;20852;20853;20854;20855;20856;20857;20858;20859;20860;20861 20846 24 AHIVFDFHQAADGIQEQQR Unmodified 2209.0665 0.066463441 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80 80 3 4.1998E-05 80633 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.975 72.325 344980000 58043000 47728000 0 50465000 0 0 0 43859000 36044000 12964000 0 39194000 56687000 1749 2320 1627 16285;16286;16287;16288;16289;16290;16291;16292 20862;20863;20864;20865;20866;20867;20868;20869 20865 8 AHLALIDYLTQK Unmodified 1384.7715 0.77145062 3888 Q96JC1 VPS39 Vam6/Vps39-like protein yes yes 0 0 0 1 107.7 107.7 3 0.033625 111011 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O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 46.253 46.253 2 0.03013 44148 QUIQUE_C1218_190116_001 90.939 67.902 77414000 40728000 0 0 0 0 0 36686000 0 0 0 0 0 0 1753 4192 1631 16305;16306 20882;20883 20882 2 AHLLAAALGPAGER Unmodified 1345.7466 0.74663285 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 3 2 1 5 3 2 2 3 3 52.79 52.79 2;3 5.0274E-12 51104 QUIQUE_C1438_190116_001 136.96 116.63 4712100000 390210000 561270000 398660000 363770000 347490000 242000000 143920000 423610000 494180000 254510000 383330000 306610000 402590000 1754 1688 1632 16307;16308;16309;16310;16311;16312;16313;16314;16315;16316;16317;16318;16319;16320;16321;16322;16323;16324;16325;16326;16327;16328;16329;16330;16331;16332;16333;16334;16335;16336;16337;16338;16339 20884;20885;20886;20887;20888;20889;20890;20891;20892;20893;20894;20895;20896;20897;20898;20899;20900;20901;20902;20903;20904;20905;20906;20907;20908;20909;20910;20911;20912;20913;20914;20915;20916;20917;20918;20919;20920;20921;20922;20923;20924;20925;20926;20927;20928;20929;20930 20901 41 AHLLADMAHISGLVAAK Unmodified 1716.9345 0.93450998 2360 P34897;G3V2Y4;H0YIZ0;G3V4W5 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial;Serine hydroxymethyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 96.934 96.934 3;4 0.0040262 98918 QUIQUE_C1368_190116_001 45.614 38.152 48352000 0 0 13863000 0 0 0 11618000 0 0 22871000 0 0 0 1755 2360 1633 16340;16341;16342 20931;20932;20933;20934 20931 3 AHLLAEVIENLECDPR Unmodified 1877.9305 0.93054681 3818 Q96C86;A0A3B3ITF0 DCPS m7GpppX diphosphatase yes no 0 0 0 1 129.22 129.22 3 0.048092 135755 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.939 19.775 32800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32800000 0 0 1756 3818 1634 16343 20935 20935 0 AHLLSLVDVMQR Unmodified 1380.7548 0.7547547 1861 P04275 VWF von Willebrand factor;von Willebrand antigen 2 yes yes 0 0 0 1 99.372 99.372 3 0.0064532 102182 QUIQUE_C1277_190116_001 51.998 44.796 16906000 0 16906000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1757 1861 1635 16344 20936 20936 0 AHLPLDINFR Unmodified 1194.6509 0.65094155 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.729 82.729 3 0.00073328 84272 QUIQUE_C1368_190116_001 75.378 22.8 113590000 0 15705000 17352000 0 32500000 0 0 10785000 10792000 0 0 11245000 15212000 1758 130 1636 16345;16346;16347;16348;16349;16350;16351;16352;16353;16354;16355 20937;20938;20939;20940;20941;20942;20943;20944;20945;20946;20947;20948 20939 12 AHLQAEVQHLR Unmodified 1300.7 0.70001701 1511 O43166;F5GYF8 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.233 19.233 3 0.0044253 11944 QUIQUE_C1403_190116_001 41.338 28.46 164770000 0 0 37381000 53506000 0 0 0 0 29321000 0 44559000 0 0 1759 1511 1637 16356;16357;16358;16359 20949;20950;20951;20952 20950 4 AHLTVGQAAAGGSGNLLTER Unmodified 1921.997 0.99698689 3980 Q99959 PKP2 Plakophilin-2 yes yes 0 0 0 1 60.433 60.433 3 0.00029343 59089 QUIQUE_C1403_190116_001 59.792 49.871 35390000 0 0 0 35390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1760 3980 1638 16360 20953 20953 1 AHLVAVFNEYQR Unmodified 1445.7415 0.74154747 2574 P50995;H0Y6E1 ANXA11 Annexin A11 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 3 1 2 61.477 61.477 2;3 5.3728E-07 61038 QUIQUE_C1576_190116_001 117.67 96.042 1558800000 91389000 103160000 109300000 162310000 97659000 99049000 223710000 0 173400000 100200000 161430000 117420000 119820000 1761 2574 1639 16361;16362;16363;16364;16365;16366;16367;16368;16369;16370;16371;16372;16373;16374;16375;16376;16377;16378 20954;20955;20956;20957;20958;20959;20960;20961;20962;20963;20964;20965;20966;20967;20968;20969;20970;20971;20972;20973;20974;20975;20976;20977;20978;20979;20980;20981;20982 20969 29 AHMGMFTELAILYSK 2 Oxidation (M) 1742.8372 0.8371637 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;A0A087WV74;P53675;A0A087WXH4 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 2 0 3 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 95.087 95.087 2;3 6.7124E-06 97589 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.273 86.638 1178600000 108550000 82196000 0 48726000 108470000 59699000 110380000 134620000 85058000 98446000 148500000 112690000 81235000 1762 50;2631 1640 16379;16380;16381;16382;16383;16384;16385;16386;16387;16388;16389;16390;16391;16392;16393;16394;16395;16396;16397;16398 20983;20984;20985;20986;20987;20988;20989;20990;20991;20992;20993;20994;20995;20996;20997;20998;20999;21000;21001;21002;21003 20994 24;25 18 AHMGMFTELAILYSK Oxidation (M) 1726.8422 0.84224908 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;A0A087WV74;P53675;A0A087WXH4 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 1 0 4 3 4 3 3 3 3 4 2 2 3 3 3 111.81 111.81 2;3 2.1237E-06 121417 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.99 102.24 1782800000 97521000 179450000 168680000 79230000 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1764 50;2631 1640 16439;16440;16441;16442;16443;16444;16445;16446;16447;16448;16449 21048;21049;21050;21051;21052;21053;21054;21055;21056;21057;21058;21059;21060;21061;21062;21063 21061 15 AHMLIDMHFR Unmodified 1269.6111 0.61106735 561 R9WNI0;A8MQB8;G3V0J0;Q06787;Q8IXW7;A0A087WXI3;A0A087WY29 FMR1 Fragile X mental retardation protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61 61 3 0.0054355 60038 QUIQUE_C1368_190116_001 50.108 43.089 48311000 0 0 19830000 14004000 0 0 14477000 0 0 0 0 0 0 1765 561 1641 16450;16451;16452;16453;16454 21064;21065;21066;21067;21068 21064 5 AHNQDLGLAGSCLAR Unmodified 1581.7682 0.76817293 1946 P08572;A0A3B3IS47 COL4A2 Collagen alpha-2(IV) chain;Canstatin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 45.669 45.669 2;3 1.2426E-08 42709 QUIQUE_C1277_190116_001 151.68 124.56 3714600000 301260000 449870000 359890000 193510000 319480000 192120000 124180000 244300000 349500000 124210000 445310000 293390000 317620000 1766 1946 1642 16455;16456;16457;16458;16459;16460;16461;16462;16463;16464;16465;16466;16467;16468;16469;16470;16471;16472;16473;16474;16475;16476;16477;16478;16479 21069;21070;21071;21072;21073;21074;21075;21076;21077;21078;21079;21080;21081;21082;21083;21084;21085;21086;21087;21088;21089;21090;21091;21092;21093;21094;21095;21096 21073 28 AHPASNAIDGTER Unmodified 1337.6324 0.63239096 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 12.76 12.76 3 0.0072143 4889 QUIQUE_DMIX7_190116_001 37.613 23.897 24587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24587000 0 1767 1492 1643 16480 21097 21097 1 AHPVFYQGTYSQALNDAK Unmodified 2008.9643 0.96428978 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.694 70.694 3 0.00016068 72253 QUIQUE_C1218_190116_001 45.157 38.21 427340000 58625000 56679000 59659000 0 59230000 38863000 56573000 0 0 0 41037000 0 56677000 1768 3822 1644 16481;16482;16483;16484;16485;16486;16487;16488 21098;21099;21100;21101;21102;21103;21104;21105;21106;21107 21098 9 AHPVFYQGTYSQALNDAKR Unmodified 2165.0654 0.065400809 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 60.287 60.287 3 6.2227E-05 59884 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.645 58.826 71714000 0 0 0 0 0 0 0 31148000 0 0 40565000 0 0 1769 3822 1645 16489;16490 21108;21109 21108 2 AHQANQLYPFAISLIESVR Unmodified 2156.1378 0.13783747 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 147.35 147.35 2;3 4.5484E-23 152513 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.45 128.63 758960000 0 18567000 89552000 0 59309000 0 43237000 90457000 151180000 28590000 100320000 105350000 72398000 1770 3053 1646 16491;16492;16493;16494;16495;16496;16497;16498;16499;16500;16501;16502;16503;16504 21110;21111;21112;21113;21114;21115;21116;21117;21118;21119;21120;21121;21122;21123;21124;21125;21126;21127;21128;21129;21130 21120 18 AHQITDESLESTRR Unmodified 1641.8071 0.80706086 1177 H3BNE1;H3BR18;H3BM38;H3BPJ0;O00161;H3BNG6;H3BU94 SNAP23 Synaptosomal-associated protein;Synaptosomal-associated protein 23 yes no 0 0 1 1 19.848 19.848 3 0.0020001 12970 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.112 37.006 27567000 0 0 0 0 0 0 0 27567000 0 0 0 0 0 1771 1177 1647 16505 21131 21131 1 AHQLVMEGYNWCHDR Unmodified 1914.8254 0.82537023 2758;2789 P62714;H0YC23;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 2 2 3 3 3 3 3 2 2 1 3 3 3 55.395 55.395 2;3;4 6.6089E-66 53210 QUIQUE_C1368_190116_001 202.44 168.48 7304200000 282910000 347670000 695980000 810180000 601470000 661000000 802490000 417030000 371620000 124170000 865460000 712030000 612190000 1772 2758;2789 1648 16506;16507;16508;16509;16510;16511;16512;16513;16514;16515;16516;16517;16518;16519;16520;16521;16522;16523;16524;16525;16526;16527;16528;16529;16530;16531;16532;16533;16534;16535;16536;16537;16538 21132;21133;21134;21135;21136;21137;21138;21139;21140;21141;21142;21143;21144;21145;21146;21147;21148;21149;21150;21151;21152;21153;21154;21155;21156;21157;21158;21159;21160;21161;21162;21163;21164;21165;21166;21167;21168;21169 21140 35 AHQLVMEGYNWCHDR Oxidation (M) 1930.8203 0.82028486 2758;2789 P62714;H0YC23;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.249 41.249 3 3.8171E-06 35813 QUIQUE_C1368_190116_001 96.208 71.92 531500000 45654000 91661000 211610000 0 53524000 52680000 0 39229000 0 37151000 0 0 0 1773 2758;2789 1648 16539;16540;16541;16542;16543;16544;16545;16546;16547;16548 21170;21171;21172;21173;21174;21175;21176;21177;21178;21179 21172 2182 8 AHQLWLSVEALK Unmodified 1393.7718 0.77178497 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.242 90.242 2;3 1.936E-09 92234 QUIQUE_C1277_190116_001 150.46 122.71 586120000 124160000 112020000 60048000 48532000 48807000 49389000 47062000 24132000 39350000 0 0 32608000 0 1774 693;3205 1649 16549;16550;16551;16552;16553;16554;16555;16556;16557;16558;16559;16560;16561 21180;21181;21182;21183;21184;21185;21186;21187;21188;21189;21190;21191;21192;21193;21194 21183 15 AHQNTLEVYPPFLFFLAVGGVYHPR Unmodified 2871.4861 0.48605506 1453 Q5VV89;O14880;Q5VV87 MGST3 Microsomal glutathione S-transferase 3 yes no 0 0 0 2 1 2 2 3 2 163.18 163.18 3;4 6.311E-37 169875 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.23 128.58 958770000 0 0 0 0 0 0 70991000 40688000 186060000 0 247030000 358650000 55355000 1775 1453 1650 16562;16563;16564;16565;16566;16567;16568;16569;16570;16571;16572;16573 21195;21196;21197;21198;21199;21200;21201;21202;21203;21204;21205;21206;21207;21208;21209;21210;21211;21212 21203 15 AHQTGIHATEELK Acetyl (Protein N-term) 1475.7369 0.73685603 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 1 0 0 2 1 1 1 26.785 26.785 2;3 0.0021241 19762 QUIQUE_C1563_190116_001 70.345 54.338 69202000 69202000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1776 3365 1651 16574;16575;16576;16577;16578 21213;21214;21215;21216;21217 21217 4 AHQTGIHATEELKEFFAK Acetyl (Protein N-term) 2098.0484 0.048353761 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 1 0 1 2 2 2 1 3 2 2 2 2 1 2 1 2 94.565 94.565 3;4 4.1945E-23 97025 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.88 133.71 1875000000 129670000 127880000 102540000 68895000 141440000 133000000 158970000 220250000 148960000 29244000 291820000 96947000 225420000 1777 3365 1652 16579;16580;16581;16582;16583;16584;16585;16586;16587;16588;16589;16590;16591;16592;16593;16594;16595;16596;16597;16598;16599;16600;16601;16602 21218;21219;21220;21221;21222;21223;21224;21225;21226;21227;21228;21229;21230;21231;21232;21233;21234;21235;21236;21237;21238;21239;21240;21241;21242;21243;21244;21245 21238 22 AHQVVEDGYEFFAK Unmodified 1638.7678 0.7678218 2740;2739;1041 P62140;F8VYE8;P36873;F8W0W8;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 80.788 80.788 2;3 7.1478E-72 83427 QUIQUE_C1218_190116_001 211.67 199.45 9710300000 818960000 946340000 827580000 682670000 703880000 673450000 787930000 588360000 609140000 284250000 973420000 771360000 1043000000 1778 2740;1041;2739 1653 16603;16604;16605;16606;16607;16608;16609;16610;16611;16612;16613;16614;16615;16616;16617;16618;16619;16620;16621;16622;16623;16624;16625;16626;16627;16628;16629 21246;21247;21248;21249;21250;21251;21252;21253;21254;21255;21256;21257;21258;21259;21260;21261;21262;21263;21264;21265;21266;21267;21268;21269;21270;21271;21272;21273;21274;21275;21276;21277;21278;21279;21280;21281;21282;21283;21284;21285;21286;21287;21288 21247 43 AHSDGGDGVVSQVK Unmodified 1354.6477 0.64770667 2948 Q12860;H0YIJ1 CNTN1 Contactin-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 15.777 15.777 2;3 1.944E-117 7847 QUIQUE_C1368_190116_001 242.45 200.16 7945900000 689930000 724880000 792940000 778080000 704040000 438540000 878380000 201700000 567820000 276210000 688490000 594370000 610540000 1779 2948 1654 16630;16631;16632;16633;16634;16635;16636;16637;16638;16639;16640;16641;16642;16643;16644;16645;16646;16647;16648;16649;16650;16651;16652;16653;16654 21289;21290;21291;21292;21293;21294;21295;21296;21297;21298;21299;21300;21301;21302;21303;21304;21305;21306;21307;21308;21309;21310;21311;21312;21313;21314;21315 21294 26 AHSLLPVDDAINGLSEEQR Unmodified 2063.0283 0.028346601 192 A0A0A0MT83;P26440;A0A087WVD3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 99.876 99.876 3 0.0030463 103313 QUIQUE_C1368_190116_001 58.01 49.016 39651000 0 0 39651000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1780 192 1655 16655 21316 21316 0 AHSPVQSGLPGMQNLK Acetyl (Protein N-term) 1704.8617 0.86173896 622 B4DR80 STK24 yes yes 1 0 0 1 1 85.076 85.076 2 0.00012386 86772 QUIQUE_C1218_190116_001 87.641 30.685 593330000 498700000 0 0 0 0 0 0 94627000 0 0 0 0 0 1781 622 1656 16656;16657 21317;21318;21319 21318 3 AHSSMVGVNLPQK Oxidation (M) 1382.6976 0.69763375 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 22.805 22.805 2;3 4.0333E-65 17397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 213.25 174.95 7947800000 542490000 528290000 662010000 470350000 496830000 459140000 417570000 511050000 788700000 466890000 1002300000 699490000 902780000 1782 1790 1657 16658;16659;16660;16661;16662;16663;16664;16665;16666;16667;16668;16669;16670;16671;16672;16673;16674;16675;16676;16677;16678;16679;16680;16681;16682;16683;16684 21320;21321;21322;21323;21324;21325;21326;21327;21328;21329;21330;21331;21332;21333;21334;21335;21336;21337;21338;21339;21340;21341;21342;21343;21344;21345;21346;21347;21348;21349;21350;21351;21352;21353;21354;21355;21356 21342 1007 37 AHSSMVGVNLPQK Unmodified 1366.7027 0.70271913 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 34.978 34.978 2;3 6.0058E-139 31536 QUIQUE_C1218_190116_001 260.76 247.4 23362000000 1944100000 2274400000 1798900000 2194700000 1645400000 1811100000 1817400000 1745600000 1640900000 550270000 2547600000 1557200000 1834500000 1783 1790 1657 16685;16686;16687;16688;16689;16690;16691;16692;16693;16694;16695;16696;16697;16698;16699;16700;16701;16702;16703;16704;16705;16706;16707;16708;16709;16710 21357;21358;21359;21360;21361;21362;21363;21364;21365;21366;21367;21368;21369;21370;21371;21372;21373;21374;21375;21376;21377;21378;21379;21380;21381;21382;21383;21384;21385;21386;21387;21388;21389;21390;21391;21392;21393;21394;21395;21396;21397;21398;21399;21400;21401;21402;21403;21404 21358 48 AHSSPASLQLGAVSPGTLTPTGVVSGPAATPTAQHLR Unmodified 3533.859 0.85904343 2485 P46937 YAP1 Transcriptional coactivator YAP1 yes yes 0 0 0 1 97.93 97.93 4 0.00050474 100029 QUIQUE_C1403_190116_001 34.91 19.511 47979000 0 0 0 47979000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1784 2485 1658 16711 21405 21405 1 AHTDFFEAFK Unmodified 1211.5611 0.56112349 2717 P61201;B4DIH5;H0YKU5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.941 78.941 3 5.7359E-05 78720 QUIQUE_C1563_190116_001 101.65 88.055 761580000 76073000 60188000 61597000 54985000 55425000 69610000 67868000 48149000 56148000 31998000 49665000 63883000 65989000 1785 2717 1659 16712;16713;16714;16715;16716;16717;16718;16719;16720;16721;16722;16723;16724;16725 21406;21407;21408;21409;21410;21411;21412;21413;21414;21415;21416;21417;21418;21419;21420;21421 21413 15 AHTDSLNTLVALHQLYQYTQK Unmodified 2443.2496 0.24957276 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 116.14 116.14 3;4 1.3883E-08 120633 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.28 85.972 112330000 0 0 0 0 0 0 0 0 72941000 0 39394000 0 0 1786 1473 1660 16726;16727 21422;21423;21424 21423 3 AHTKDEAEQLAGK Unmodified 1396.6947 0.69465686 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 12.889 12.889 3 0.00039467 5176 QUIQUE_C1368_190116_001 88.163 74.762 137670000 0 0 12979000 0 0 0 0 33309000 0 0 9767600 46240000 35377000 1787 228 1661 16728;16729;16730;16731;16732 21425;21426;21427;21428;21429 21425 5 AHTMTDDVTFWK Oxidation (M) 1466.65 0.65001485 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KSQ2 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 56.951 56.951 2;3 8.5505E-28 56138 QUIQUE_C1438_190116_001 180.07 157.38 3549400000 224280000 191490000 164930000 160820000 162980000 99868000 138080000 207170000 241560000 198640000 700110000 419100000 640400000 1788 50 1662 16733;16734;16735;16736;16737;16738;16739;16740;16741;16742;16743;16744;16745;16746;16747;16748;16749;16750 21430;21431;21432;21433;21434;21435;21436;21437;21438;21439;21440;21441;21442;21443;21444;21445;21446;21447;21448;21449;21450;21451;21452;21453 21437 26 22 AHTMTDDVTFWK Unmodified 1450.6551 0.65510023 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KSQ2 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 78.103 78.103 2;3 1.9008E-09 79343 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.61 133.1 5810300000 652400000 756810000 624160000 629250000 177600000 208240000 681660000 381540000 115940000 149210000 548150000 395540000 489790000 1789 50 1662 16751;16752;16753;16754;16755;16756;16757;16758;16759;16760;16761;16762;16763;16764;16765;16766;16767;16768;16769;16770;16771;16772;16773;16774;16775 21454;21455;21456;21457;21458;21459;21460;21461;21462;21463;21464;21465;21466;21467;21468;21469;21470;21471;21472;21473;21474;21475;21476;21477;21478;21479;21480;21481;21482 21477 25 AHTSSTQLQEELEK Unmodified 1599.774 0.77402939 4670 Q9Y6Y8 SEC23IP SEC23-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 32.366 32.366 3 0.0026324 27574 QUIQUE_C1277_190116_001 56.939 47.093 100510000 0 35048000 0 0 32663000 0 0 0 0 0 0 0 32797000 1790 4670 1663 16776;16777;16778 21483;21484;21485;21486;21487 21484 5 AHVAHHPISDHEATLR Unmodified 1789.8972 0.89721327 278 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21533;21534;21535;21536;21537;21538;21539;21540;21541;21542;21543;21544;21545;21546 21546 2094 13 AHVIVMAATNRPNSIDPALRR Unmodified 2301.2488 0.24880168 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 2 2 1 47.997 47.997 3;4 0.00037256 45286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.125 54.197 145800000 0 0 0 0 0 0 0 115010000 0 0 0 30796000 0 1795 2658 1667 16830;16831;16832 21547;21548;21549;21550;21551 21548 5 AHVLAASVEQATENFLEK Unmodified 1955.9953 0.99525556 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJL0;E5RIE0;E5RFM3 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 114.98 114.98 2;3 4.2682E-19 118984 QUIQUE_C1368_190116_001 146.96 133.98 904020000 66448000 78372000 96782000 157620000 0 95444000 63502000 64750000 82730000 0 94141000 54933000 49294000 1796 2369 1668 16833;16834;16835;16836;16837;16838;16839;16840;16841;16842;16843;16844;16845;16846;16847;16848 21552;21553;21554;21555;21556;21557;21558;21559;21560;21561;21562;21563;21564;21565;21566;21567;21568;21569;21570;21571 21556 18 AHVLAASVEQATQNFLEK Unmodified 1955.0112 0.011239973 2250 P26232;C9IZ88 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 108.08 108.08 2;3 1.0037E-64 112027 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.47 170.46 2872000000 148770000 253280000 266940000 223310000 229890000 225710000 291300000 111810000 188490000 126170000 240120000 299470000 266760000 1797 2250 1669 16849;16850;16851;16852;16853;16854;16855;16856;16857;16858;16859;16860;16861;16862;16863;16864;16865;16866;16867;16868;16869;16870;16871 21572;21573;21574;21575;21576;21577;21578;21579;21580;21581;21582;21583;21584;21585;21586;21587;21588;21589;21590;21591;21592;21593;21594;21595;21596;21597;21598;21599;21600;21601;21602;21603;21604;21605;21606;21607;21608;21609;21610;21611 21602 40 AHVLAQPEAISTIAQSLR Unmodified 1904.048 0.047959831 305 A0A0J9YYF7;Q86T65 DAAM2 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2 yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 99.375 99.375 2;3 5.6801E-06 102493 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.39 98.621 249090000 0 0 0 36373000 32257000 0 0 0 0 23420000 57296000 45962000 53786000 1798 305 1670 16872;16873;16874;16875;16876;16877;16878;16879;16880 21612;21613;21614;21615;21616;21617;21618;21619;21620 21615 8 AHVLHFGK Unmodified 907.50282 0.50282075 4020 Q9BTE3 MCMBP Mini-chromosome maintenance complex-binding protein yes yes 0 0 0 2 1 130.14 130.14 2 0.045185 135975 QUIQUE_C1277_190116_001 77.72 15.005 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1799 4020 1671 16881;16882;16883 21621;21622;21623 21622 3 AHVLYFK Unmodified 876.48577 0.48577371 3486 Q86TV6;G3V3H1 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes no 0 0 0 1 1 1 28.966 28.966 2 0.027719 23092 QUIQUE_C1368_190116_001 92.785 51.577 67253000 0 26709000 19627000 0 0 0 0 0 0 0 0 20917000 0 1800 3486 1672 16884;16885;16886 21624;21625;21626 21625 3 AHVQEVAQHNLK Unmodified 1372.7211 0.72114638 3490 Q86UP2;G3V4Y7 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 2 1 10.649 10.649 2;3 7.4264E-38 3023 QUIQUE_C1403_190116_001 161.48 141.74 816170000 35166000 0 42623000 109040000 33002000 0 29223000 110720000 155180000 43280000 10674000 190340000 56933000 1801 3490 1673 16887;16888;16889;16890;16891;16892;16893;16894;16895;16896;16897;16898;16899;16900;16901 21627;21628;21629;21630;21631;21632;21633;21634;21635;21636;21637;21638;21639;21640;21641;21642 21629 16 AHVSFKPTVAQQR Unmodified 1467.7946 0.79464568 2153 Q5T985;P19823;Q5T987 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 1 1 1 1 19.225 19.225 3 0.018581 12016 QUIQUE_C1218_190116_001 40.767 21.271 116770000 33221000 59321000 0 0 0 0 0 0 0 24224000 0 0 0 1802 2153 1674 16902;16903;16904 21643;21644;21645 21643 3 AHVTGPVEDNAR Unmodified 1264.616 0.61601261 2593 P51805 PLXNA3 Plexin-A3 yes yes 0 0 0 1 13.036 13.036 3 0.0052493 5211 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.354 35.674 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1803 2593 1675 16905 21646 21646 1 AHYGGFTVQNEANK Unmodified 1534.7165 0.71645494 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 30.198 30.198 2;3 5.3147E-241 24963 QUIQUE_DMIX3_190116_001 294.01 272.55 6874600000 260410000 588880000 574710000 912220000 911170000 168560000 751170000 206830000 335840000 331760000 741870000 293290000 797850000 1804 1824 1676 16906;16907;16908;16909;16910;16911;16912;16913;16914;16915;16916;16917;16918;16919;16920;16921;16922;16923;16924;16925;16926;16927;16928;16929;16930 21647;21648;21649;21650;21651;21652;21653;21654;21655;21656;21657;21658;21659;21660;21661;21662;21663;21664;21665;21666;21667;21668;21669;21670;21671 21663 25 AHYGGFTVQNEANKYQISVNK Unmodified 2367.1608 0.16075776 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 1 1 1 65.477 65.477 3;4 9.4776E-07 65542 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.448 61.999 118070000 0 0 0 0 0 0 0 36778000 0 0 0 0 81292000 1805 1824 1677 16931;16932 21672;21673 21672 2 AHYTHSDYQYSQR Unmodified 1654.7124 0.71243219 3980 Q99959 PKP2 Plakophilin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 14.288 14.288 3 1.9764E-07 6396 QUIQUE_C1403_190116_001 130.4 119.14 51826000 0 0 0 26705000 0 0 0 0 0 0 0 9048600 16072000 1806 3980 1678 16933;16934;16935 21674;21675;21676 21674 2 AIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSK Unmodified 3953.0098 0.009849575 1838 P02787;F8WCI6;C9JB55 TF Serotransferrin yes no 0 0 1 2 3 1 2 4 2 1 2 2 2 2 167.09 167.09 3;4 1.3575E-63 171161 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.03 105.34 2745600000 88363000 128350000 34317000 56273000 1171700000 0 152470000 116140000 231720000 0 235690000 302100000 228520000 1807 1838 1679 16936;16937;16938;16939;16940;16941;16942;16943;16944;16945;16946;16947;16948;16949;16950;16951;16952;16953;16954;16955;16956;16957;16958 21677;21678;21679;21680;21681;21682;21683;21684;21685;21686;21687;21688;21689;21690;21691;21692;21693;21694;21695;21696;21697;21698;21699;21700;21701;21702 21701 26 AIADMLR Unmodified 788.42146 0.42145889 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 59.62 59.62 2 0.026322 59067 QUIQUE_DMIX8_190116_001 94.163 40.454 35404000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35404000 1808 4600 1680 16959 21703 21703 1 AIADTGANVVVTGGK Unmodified 1371.7358 0.73579339 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.309 50.309 2 1.0048E-06 47284 QUIQUE_C1368_190116_001 117.86 82.415 4714000000 391350000 424420000 395320000 387030000 397430000 348430000 378740000 321190000 293790000 193980000 444760000 353840000 383760000 1809 2572 1681 16960;16961;16962;16963;16964;16965;16966;16967;16968;16969;16970;16971;16972 21704;21705;21706;21707;21708;21709;21710;21711;21712;21713;21714;21715;21716;21717;21718;21719;21720;21721;21722;21723;21724;21725;21726 21706 23 AIADWYNEK Unmodified 1108.5189 0.51892433 1992 P10155;H0Y9N5 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.021 67.021 2 0.015932 67562 QUIQUE_C1438_190116_001 66.457 54.816 244040000 68014000 0 0 0 52314000 64112000 59598000 0 0 0 0 0 0 1810 1992 1682 16973;16974;16975;16976 21727;21728;21729;21730 21728 4 AIAELGIYPAVDPLDSTSR Unmodified 1987.0262 0.026221336 1900 P06576;H0YH81 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 134.65 134.65 2;3 2.8657E-45 138911 QUIQUE_C1403_190116_001 183.79 160.56 62789000000 5188600000 4412700000 6053100000 3456000000 4160800000 4757500000 4718900000 4210800000 5951700000 2493900000 7054900000 5306600000 5023700000 1811 1900 1683 16977;16978;16979;16980;16981;16982;16983;16984;16985;16986;16987;16988;16989;16990;16991;16992;16993;16994;16995;16996;16997;16998;16999;17000;17001;17002 21731;21732;21733;21734;21735;21736;21737;21738;21739;21740;21741;21742;21743;21744;21745;21746;21747;21748;21749;21750;21751;21752;21753;21754;21755;21756;21757;21758;21759;21760;21761;21762;21763;21764;21765;21766;21767;21768;21769;21770;21771;21772;21773;21774;21775;21776;21777;21778 21745 48 AIAFLQQPR Unmodified 1042.5924 0.59236404 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.096 68.096 2 2.7718E-05 67768 QUIQUE_C1368_190116_001 148.07 114.07 1587600000 128600000 116380000 155330000 116530000 129070000 94398000 117350000 154460000 134380000 39388000 151990000 106510000 143240000 1812 2194 1684 17003;17004;17005;17006;17007;17008;17009;17010;17011;17012;17013;17014;17015 21779;21780;21781;21782;21783;21784;21785;21786;21787;21788;21789;21790;21791;21792;21793;21794 21782 16 AIAFTQYPQYSCSTTGSSLNAIYR Unmodified 2698.2697 0.26971586 2203 P22830;K7ELX4 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 120.01 120.01 3 0.00093575 124046 QUIQUE_C1368_190116_001 39.693 29.71 75612000 26739000 0 48873000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1813 2203 1685 17016;17017 21795;21796 21796 1 AIAGVINQPYYNYEAGPDAVLGR Unmodified 2450.223 0.22302366 1761 O95861;F8VZG4;F8W1J0;F8VRY7 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1 128.4 128.4 2;3 5.0997E-63 132280 QUIQUE_C1277_190116_001 206.2 186.87 1163200000 53912000 50115000 71335000 41005000 59062000 53140000 73273000 182950000 81160000 76679000 178590000 144130000 97867000 1814 1761 1686 17018;17019;17020;17021;17022;17023;17024;17025;17026;17027;17028;17029;17030;17031;17032;17033;17034 21797;21798;21799;21800;21801;21802;21803;21804;21805;21806;21807;21808;21809;21810;21811;21812;21813;21814;21815 21798 19 AIAHYEQQMGQK Unmodified 1402.6663 0.66633362 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 20.035 20.035 2;3 4.6079E-28 12564 QUIQUE_C1368_190116_001 182.46 150.59 356220000 0 0 180510000 0 0 0 0 39280000 53969000 25057000 57405000 0 0 1815 2350 1687 17035;17036;17037;17038;17039;17040 21816;21817;21818;21819;21820;21821 21817 6 AIAHYEQQMGQK Oxidation (M) 1418.6612 0.66124824 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 no no 0 1 0 1 10.965 10.965 3 0.015484 3372 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.604 33.127 6259200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6259200 0 0 0 1816 2350 1687 17041 21822 21822 1 AIAHYEQSADYYK Unmodified 1557.71 0.70997257 4128;2651 Q9H115;A0A087WZQ7;P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R027 NAPB;NAPA Beta-soluble NSF attachment protein;Alpha-soluble NSF attachment protein no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 37.075 37.075 2;3 1.7409E-31 32625 QUIQUE_C1277_190116_001 208.17 187.87 5492800000 547650000 555330000 508770000 477510000 841000000 422220000 509490000 224250000 310260000 291850000 289720000 232090000 282630000 1817 4128;2651 1688 17042;17043;17044;17045;17046;17047;17048;17049;17050;17051;17052;17053;17054;17055;17056;17057;17058;17059;17060;17061;17062;17063;17064;17065;17066;17067 21823;21824;21825;21826;21827;21828;21829;21830;21831;21832;21833;21834;21835;21836;21837;21838;21839;21840;21841;21842;21843;21844;21845;21846;21847;21848;21849;21850 21825 28 AIAHYEQSADYYKGEESNSSANK Unmodified 2561.1306 0.13063942 4128;2651 Q9H115;A0A087WZQ7;P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R027 NAPB;NAPA Beta-soluble NSF attachment protein;Alpha-soluble NSF attachment protein no no 0 0 1 2 3 4 3 3 3 3 3 2 2 3 2 2 35.273 35.273 2;3;4 2.3041E-73 30508 QUIQUE_C1563_190116_001 206.95 195.04 11648000000 857350000 1312600000 760720000 902720000 961410000 900160000 1291500000 1457600000 456640000 350740000 944620000 685390000 766180000 1818 4128;2651 1689 17068;17069;17070;17071;17072;17073;17074;17075;17076;17077;17078;17079;17080;17081;17082;17083;17084;17085;17086;17087;17088;17089;17090;17091;17092;17093;17094;17095;17096;17097;17098;17099;17100;17101;17102 21851;21852;21853;21854;21855;21856;21857;21858;21859;21860;21861;21862;21863;21864;21865;21866;21867;21868;21869;21870;21871;21872;21873;21874;21875;21876;21877;21878;21879;21880;21881;21882;21883;21884;21885;21886;21887;21888;21889;21890;21891;21892;21893 21870 41 AIAIAAGVPVVPGTDAPITSLHEAHEFSNTYGFPIIFK Unmodified 3950.0618 0.061825566 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 153.6 153.6 3;4 1.7714E-32 157861 QUIQUE_C1277_190116_001 90.323 85.996 6727100000 304070000 625510000 617480000 292100000 401710000 756990000 412650000 670580000 525360000 135060000 901420000 546040000 538100000 1819 2026 1690 17103;17104;17105;17106;17107;17108;17109;17110;17111;17112;17113;17114;17115;17116;17117;17118;17119;17120 21894;21895;21896;21897;21898;21899;21900;21901;21902;21903;21904;21905;21906;21907;21908;21909;21910;21911;21912 21895 18 AIALQPENPMAHFLLGR Unmodified 1876.9982 0.99817287 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.69 130.69 3 6.3084E-06 136443 QUIQUE_C1218_190116_001 79.771 74.111 1146400000 102940000 108700000 114990000 92330000 79317000 85074000 100220000 48219000 89239000 25028000 116970000 72939000 110440000 1820 3949 1691 17121;17122;17123;17124;17125;17126;17127;17128;17129;17130;17131;17132;17133 21913;21914;21915;21916;21917;21918;21919;21920;21921;21922;21923;21924;21925;21926;21927;21928 21914 15 AIALQPENPMAHFLLGR Oxidation (M) 1892.9931 0.99308749 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 95.448 95.448 3 0.00057736 97573 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.732 52.17 291310000 0 0 0 0 0 0 0 42133000 58634000 22889000 58272000 50483000 58900000 1821 3949 1691 17134;17135;17136;17137;17138;17139 21929;21930;21931;21932;21933;21934 21934 2782 5 AIANECQANFISIK Unmodified 1577.7872 0.78717704 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.717 79.717 2 1.4334E-36 80400 QUIQUE_C1403_190116_001 178.81 161.45 7757500000 427310000 605200000 637450000 716280000 768990000 486530000 721510000 482050000 540010000 216610000 685540000 615510000 854500000 1822 2658 1692 17140;17141;17142;17143;17144;17145;17146;17147;17148;17149;17150;17151;17152;17153 21935;21936;21937;21938;21939;21940;21941;21942;21943;21944;21945;21946;21947;21948;21949;21950;21951;21952;21953 21940 19 AIAQLATEYVFSDFLLK Acetyl (Protein N-term) 1970.0401 0.040080486 3929 Q96RD7 PANX1 Pannexin-1 yes yes 1 0 0 1 1 184.44 184.44 2 0.003709 190423 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.153 59.783 11236000 0 0 0 0 0 0 4353900 0 0 0 6882200 0 0 1823 3929 1693 17154;17155 21954;21955 21955 2 AIAQSQSVQESLESLLQSIGEVEQNLEGK Unmodified 3113.5728 0.57281698 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 175.9 175.9 3 3.746E-127 179929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.33 184.24 334380000 0 0 0 0 0 0 0 0 104530000 0 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Unmodified 2101.1015 0.10151154 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 2 1 47.187 47.187 3 0.028129 44146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.855 35.429 25217000 0 0 0 0 0 0 0 25217000 0 0 0 0 0 1827 3125 1696 17176 21979 21979 1 AIAVLTSGGDAQGMNAAVR Oxidation (M) 1816.9101 0.91014572 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VP00;F8VW30;F8W1J8;F8VSF7;F8VUB8;F8VYK8;F8VTQ3;F8VVE3 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.303 58.303 2 3.7818E-115 57261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 217.09 184.76 1657600000 83381000 103880000 128840000 75474000 95455000 73990000 72019000 151940000 192190000 110730000 223530000 163690000 182480000 1828 452 1697 17177;17178;17179;17180;17181;17182;17183;17184;17185;17186;17187;17188;17189 21980;21981;21982;21983;21984;21985;21986;21987;21988;21989;21990;21991;21992;21993 21991 325 14 AIAVLTSGGDAQGMNAAVR Unmodified 1800.9152 0.9152311 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VP00;F8VW30;F8W1J8;F8VSF7;F8VUB8;F8VYK8;F8VTQ3;F8VVE3 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 78.426 78.426 2;3 2.0827E-219 80139 QUIQUE_C1438_190116_001 267.75 242.31 3963600000 306970000 378860000 418500000 342300000 262920000 296690000 308030000 244070000 280260000 135950000 398010000 270590000 320490000 1829 452 1697 17190;17191;17192;17193;17194;17195;17196;17197;17198;17199;17200;17201;17202;17203;17204;17205;17206;17207;17208;17209;17210;17211;17212;17213;17214 21994;21995;21996;21997;21998;21999;22000;22001;22002;22003;22004;22005;22006;22007;22008;22009;22010;22011;22012;22013;22014;22015;22016;22017;22018;22019;22020;22021;22022;22023 22004 30 AIAVTAQEMMTK Unmodified 1292.6468 0.64684373 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.353 65.353 2 0.0052816 66099 QUIQUE_C1218_190116_001 66.758 45.856 418360000 41641000 45694000 58789000 52391000 52878000 41192000 0 0 36370000 0 44664000 44742000 0 1830 4606 1698 17215;17216;17217;17218;17219;17220;17221;17222;17223 22024;22025;22026;22027;22028;22029;22030;22031;22032;22033 22024 7 AIAVTVQEMVTK Unmodified 1288.7061 0.70607317 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 80.593 80.593 2 0.011614 81853 QUIQUE_C1368_190116_001 67.207 26.855 124820000 0 0 60666000 64154000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1831 4600 1699 17224;17225 22034;22035 22034 2 AIAYLFPSGLFEK Unmodified 1454.781 0.78095267 2821 P82933 MRPS9 28S ribosomal protein S9, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.87 143.87 2 0.00047983 148512 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.943 80.336 81265000 0 0 0 0 0 0 0 11271000 0 0 30100000 22875000 17019000 1832 2821 1700 17226;17227;17228;17229 22036;22037;22038;22039 22038 3 AICALDLASEVGK Unmodified 1345.6912 0.69115139 4191 Q9H977;B9A049 WDR54 WD repeat-containing protein 54 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.39 100.39 2 7.6496E-06 103077 QUIQUE_C1368_190116_001 143.61 118.84 944170000 56203000 74199000 107940000 103970000 73369000 97830000 102890000 50432000 58984000 0 66717000 67193000 84449000 1833 4191 1701 17230;17231;17232;17233;17234;17235;17236;17237;17238;17239;17240;17241 22040;22041;22042;22043;22044;22045;22046;22047;22048;22049;22050;22051;22052 22043 13 AICIDPAYSK Unmodified 1136.5536 0.55359527 1551 O43765;K7EMD6 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 54.145 54.145 2 0.01116 53538 QUIQUE_C1218_190116_001 68.625 50.639 785140000 106790000 119840000 104980000 0 107560000 112900000 114120000 0 0 0 0 0 118940000 1834 1551 1702 17242;17243;17244;17245;17246;17247;17248 22053;22054;22055;22056;22057;22058;22059 22053 7 AICPLCQAELNVGSK Unmodified 1658.812 0.81201158 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 83.638 83.638 2 1.1824E-05 84964 QUIQUE_C1277_190116_001 100.04 75.746 185040000 32562000 40305000 35497000 43810000 0 0 32866000 0 0 0 0 0 0 1835 4517 1703 17249;17250;17251;17252;17253 22060;22061;22062;22063;22064 22061 5 AICSSTQAGSFHFTR Unmodified 1668.7678 0.76783858 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 64.583 64.583 3 0.0086438 47911 QUIQUE_C1277_190116_001 29.99 23.553 153900000 0 20158000 0 0 0 0 0 0 0 0 85570000 0 48170000 1836 934 1704 17254;17255;17256 22065;22066;22067 22065 3 AICTEAGLMALR Unmodified 1304.6581 0.65807712 2742 P62191 PSMC1 26S protease regulatory subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.034 87.034 2 0.00043535 89308 QUIQUE_C1277_190116_001 111.46 81.788 487720000 46502000 42837000 57524000 0 49789000 38636000 44461000 0 60960000 0 54859000 37505000 54648000 1837 2742 1705 17257;17258;17259;17260;17261;17262;17263;17264;17265;17266;17267 22068;22069;22070;22071;22072;22073;22074;22075;22076;22077;22078;22079;22080 22069 13 AIDAFNAALTVRPEDYSLWNR Unmodified 2421.2077 0.20770795 3552 Q8IYB4 PEX5L PEX5-related protein yes yes 0 0 1 1 1 108.94 108.94 3;4 0.0037749 81021 QUIQUE_C1438_190116_001 25.888 17.7 103680000 0 0 0 0 60737000 0 42947000 0 0 0 0 0 0 1838 3552 1706 17268;17269 22081;22082 22081 2 AIDCLEDEKATLTLAMADWLR Unmodified 2434.1872 0.18723178 1475 O15061 SYNM Synemin yes yes 0 0 1 1 1 159.9 159.9 3 0.0032345 164857 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.353 38.641 46093000 0 0 0 0 0 0 0 0 24143000 0 0 0 21950000 1839 1475 1707 17270;17271 22083;22084 22083 2 AIDEDLTALAK Unmodified 1158.6132 0.61321864 4473 Q9UKE5 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes yes 0 0 0 1 84.121 84.121 2 0.0052917 85940 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.816 20.1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1840 4473 1708 17272 22085 22085 1 AIDENNEPTACFLIR Unmodified 1761.8356 0.83558379 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.48 98.48 2 2.9954E-94 100134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 265.12 239.18 2254300000 166790000 236960000 255560000 263900000 148970000 231820000 224210000 61870000 95607000 179770000 119140000 113570000 156130000 1841 4390 1709 17273;17274;17275;17276;17277;17278;17279;17280;17281;17282;17283;17284;17285 22086;22087;22088;22089;22090;22091;22092;22093;22094;22095;22096;22097;22098;22099;22100 22094 15 AIDGLDR Unmodified 758.39227 0.39226725 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1 member C3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.177 25.177 2 0.024917 19704 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.068 32.291 945080000 0 0 0 103160000 0 91577000 55661000 519820000 174860000 0 0 0 0 1842 183 1710 17286;17287;17288;17289;17290 22101;22102;22103;22104;22105 22104 5 AIDIILR Unmodified 812.51199 0.51198846 4655 Q9Y6K5 OAS3 2'-5'-oligoadenylate synthase 3 yes yes 0 0 0 1 1 71.497 71.497 2 0.020578 72767 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.74 20.163 40115000 0 0 15021000 0 0 0 0 0 0 0 25094000 0 0 1843 4655 1711 17291;17292 22106;22107 22107 2 AIDIYEQVGTNAMDSPLLK Unmodified 2077.0402 0.04015684 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R027 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 134.73 134.73 2;3 8.0296E-55 140131 QUIQUE_C1218_190116_001 218.11 182.91 1069200000 161290000 111720000 185660000 100940000 0 98788000 0 83740000 0 31749000 176570000 118770000 0 1844 2651 1712 17293;17294;17295;17296;17297;17298;17299;17300;17301;17302;17303;17304;17305;17306 22108;22109;22110;22111;22112;22113;22114;22115;22116;22117;22118;22119;22120;22121;22122 22108 15 AIDLFTDAIK Unmodified 1105.6019 0.60192568 2567 P50502;Q3KNR6;H7C3I1;Q8NFI4;F6VDH7;Q8IZP2 ST13;ST13P5;ST13P4 Hsc70-interacting protein;Putative protein FAM10A5;Putative protein FAM10A4 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 108 108 1;2 2.7776E-05 112786 QUIQUE_C1218_190116_001 159.58 107.18 11574000000 822200000 1047200000 781970000 828980000 1013400000 814490000 836910000 906270000 989630000 408880000 1018300000 910230000 1195500000 1845 2567 1713 17307;17308;17309;17310;17311;17312;17313;17314;17315;17316;17317;17318;17319;17320;17321;17322;17323;17324;17325 22123;22124;22125;22126;22127;22128;22129;22130;22131;22132;22133;22134;22135;22136;22137;22138;22139;22140;22141;22142;22143;22144;22145;22146;22147;22148;22149;22150 22125 21 AIDLLYWR Unmodified 1048.5706 0.57056597 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 121.87 121.87 2 8.4217E-15 124329 QUIQUE_C1563_190116_001 191.03 141.67 1429200000 148630000 127850000 113530000 124540000 97520000 86332000 134020000 86846000 96788000 46849000 140240000 110400000 115700000 1846 3199 1714 17326;17327;17328;17329;17330;17331;17332;17333;17334;17335;17336;17337;17338;17339 22151;22152;22153;22154;22155;22156;22157;22158;22159;22160;22161;22162;22163;22164;22165;22166;22167;22168;22169;22170;22171;22172 22159 22 AIDNAADLLIFGK Unmodified 1359.7398 0.73981614 4635 Q9Y5X2 SNX8 Sorting nexin-8 yes yes 0 0 0 1 1 1 132.27 132.27 2 0.0036614 137507 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.808 44.87 2595000000 0 0 0 0 0 0 0 0 29644000 0 2129600000 0 435700000 1847 4635 1715 17340;17341;17342 22173;22174;22175;22176 22175 3 AIDTIYQTTDFSGIR Unmodified 1699.8417 0.84171503 1439 O14672 ADAM10 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.74 107.74 2 2.0759E-35 110201 QUIQUE_DMIX1_190116_001 203.83 177.79 719480000 53482000 69976000 83421000 62189000 56513000 66123000 78074000 47725000 60945000 0 83862000 0 57171000 1848 1439 1716 17343;17344;17345;17346;17347;17348;17349;17350;17351;17352;17353 22177;22178;22179;22180;22181;22182;22183;22184;22185;22186;22187;22188;22189 22185 13 AIDVPGQVQVYELQPSNLEADQPLQAIMEMGAVAADK Unmodified 3937.9442 0.94415455 1753 O95817 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 170.43 170.43 3 5.0766E-07 173275 QUIQUE_C1403_190116_001 52.455 48.054 54782000 0 13696000 0 15192000 0 0 0 25894000 0 0 0 0 0 1849 1753 1717 17354;17355;17356 22190;22191;22192 22191 3 AIEAALAAR Unmodified 884.50797 0.50796571 2295 P30038;Q5TF55 ALDH4A1 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protein 14 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 20.374 20.374 3;4 0.0001642 12896 QUIQUE_C1563_190116_001 96.866 67.061 2047900000 200150000 275270000 221570000 234040000 197230000 201050000 176170000 108320000 81364000 25931000 204770000 60557000 61526000 1852 3919 1720 17373;17374;17375;17376;17377;17378;17379;17380;17381;17382;17383;17384;17385;17386;17387;17388;17389;17390;17391;17392;17393;17394 22215;22216;22217;22218;22219;22220;22221;22222;22223;22224;22225;22226;22227;22228;22229;22230;22231;22232;22233;22234;22235;22236;22237;22238;22239;22240;22241;22242 22228 27 AIEALKEFNEDGALAVLQQFK Unmodified 2333.2267 0.22671206 1581 O60506;F6UXX1 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 1 1 1 1 1 149.74 149.74 3 4.8192E-06 156844 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.957 47.295 329520000 0 0 0 0 0 0 0 81581000 0 0 104320000 72494000 71128000 1853 1581 1721 17395;17396;17397;17398 22243;22244;22245;22246 22244 4 AIEASNAYSR Unmodified 1080.52 0.51998696 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 21.3 21.3 2 0.02761 14537 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.568 47.785 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1854 1492 1722 17399 22247 22247 1 AIEAVAISPWK Unmodified 1183.6601 0.66010926 4169 Q9H4A4;A6NKB8 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 92.314 92.314 2 0.0018421 94410 QUIQUE_C1403_190116_001 116.3 91.382 878330000 0 0 105030000 96340000 0 75268000 0 81128000 96139000 75576000 130220000 83012000 135620000 1855 4169 1723 17400;17401;17402;17403;17404;17405;17406;17407;17408;17409;17410;17411;17412;17413 22248;22249;22250;22251;22252;22253;22254;22255;22256;22257;22258;22259;22260;22261 22249 12 AIEDEGGNPDEIEITSEGNKK Unmodified 2244.0394 0.039364797 3138 Q15424;K7ES42 SAFB Scaffold attachment factor B1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.242 55.242 3 1.1349E-10 53685 QUIQUE_C1277_190116_001 96.79 89.344 832610000 68700000 78220000 65212000 69102000 57291000 54944000 51743000 102620000 55418000 26526000 83513000 56284000 63043000 1856 3138 1724 17414;17415;17416;17417;17418;17419;17420;17421;17422;17423;17424;17425;17426 22262;22263;22264;22265;22266;22267;22268;22269;22270;22271;22272;22273;22274 22263 13 AIEDYINEFSVR Unmodified 1454.7042 0.70415892 1830 P02748 C9 Complement component C9;Complement component C9a;Complement component C9b no no 0 0 0 1 1 1 129.4 129.4 2 0.00042251 135973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.36 83.196 65745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36256000 29489000 0 + 1857 1830 1725 17427;17428;17429 22275;22276;22277 22276 3 AIEEGVNHMWTVSAFQQHPR Unmodified 2336.112 0.11203343 2484;3685 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;V9GYK3;V9GYW0;Q8TDQ7 GNPDA1;GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase;Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 82.402 82.402 3;4 3.7051E-40 82928 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.92 107.88 2945400000 335620000 337910000 204440000 153760000 144610000 202040000 208190000 251950000 0 120040000 404120000 163690000 419030000 1858 2484;3685 1726 17430;17431;17432;17433;17434;17435;17436;17437;17438;17439;17440;17441;17442;17443;17444;17445;17446;17447;17448 22278;22279;22280;22281;22282;22283;22284;22285;22286;22287;22288;22289;22290;22291;22292;22293;22294;22295;22296;22297;22298;22299;22300;22301;22302;22303 22303 22 AIEEGVNHMWTVSAFQQHPR Oxidation (M) 2352.1069 0.10694805 2484;3685 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;V9GYK3;V9GYW0;Q8TDQ7 GNPDA1;GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase;Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 no no 0 1 0 1 1 1 67.985 67.985 3 0.0019522 68059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.278 42.44 41881000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41881000 0 1859 2484;3685 1726 17449;17450;17451 22304;22305;22306 22305 1918 3 AIEFCIAR Unmodified 978.49569 0.49568646 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.841 70.841 2 0.01378 72366 QUIQUE_C1218_190116_001 86.866 63.847 294910000 23922000 27010000 26537000 28271000 34507000 18013000 24957000 22189000 0 0 35329000 24532000 29638000 1860 2285 1727 17452;17453;17454;17455;17456;17457;17458;17459;17460;17461;17462 22307;22308;22309;22310;22311;22312;22313;22314;22315;22316;22317;22318;22319 22307 13 AIEHADGGVAAGVAVLDNPYPV Unmodified 2134.0695 0.069483134 2513 P48637;A0A2R8Y5T7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 124.07 124.07 2 3.9369E-06 128013 QUIQUE_C1277_190116_001 96.734 84.179 60266000 0 0 0 0 0 37389000 0 0 0 22877000 0 0 0 1861 2513 1728 17463;17464;17465;17466;17467 22320;22321;22322;22323;22324 22321 5 AIEHMFYR Unmodified 1065.5066 0.5065855 118 A0A087X256;Q2M389 KIAA1033 WASH complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 40.233 40.233 3 0.0064931 36594 QUIQUE_C1277_190116_001 75.189 42.579 24263000 0 10855000 0 0 0 0 13408000 0 0 0 0 0 0 1862 118 1729 17468;17469;17470 22325;22326;22327 22325 3 AIEIELAK Unmodified 885.51713 0.51713341 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 56.412 56.412 2 0.03977 55822 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.682 0.2923 25626000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25626000 0 0 1863 2882 1730 17471 22328 22328 1 AIEINPDSAQPYK Unmodified 1444.7198 0.71980898 2567 P50502;Q3KNR6;H7C3I1;Q8NFI4;F6VDH7;Q8IZP2 ST13;ST13P5;ST13P4 Hsc70-interacting protein;Putative protein FAM10A5;Putative protein FAM10A4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.958 61.958 2 0.00013043 58857 QUIQUE_DMIX4_190116_001 145.25 131.25 10869000000 779620000 753990000 684750000 806990000 1045600000 787780000 831190000 915070000 866720000 345590000 1072300000 889450000 1090400000 1864 2567 1731 17472;17473;17474;17475;17476;17477;17478;17479;17480;17481;17482;17483;17484 22329;22330;22331;22332;22333;22334;22335;22336;22337;22338;22339;22340;22341;22342;22343;22344;22345;22346;22347;22348 22344 20 AIEIYEQVGANTMDNPLLK Oxidation (M) 2134.0616 0.061620564 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 117.13 117.13 2 6.1536E-29 119705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.52 135.76 198160000 49808000 0 0 0 0 0 41437000 57536000 0 0 49378000 0 0 1865 4128 1732 17485;17486;17487;17488;17489;17490;17491;17492 22349;22350;22351;22352;22353;22354;22355;22356;22357;22358 22356 2869 10 AIEIYEQVGANTMDNPLLK Unmodified 2118.0667 0.066705942 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 2 1 2 1 1 130.65 130.65 2;3 5.4429E-74 134496 QUIQUE_C1277_190116_001 229.68 210.44 1672400000 117120000 169510000 117510000 96792000 125190000 102860000 131710000 134520000 114610000 43755000 200370000 168750000 149720000 1866 4128 1732 17493;17494;17495;17496;17497;17498;17499;17500;17501;17502;17503;17504;17505;17506;17507;17508;17509;17510 22359;22360;22361;22362;22363;22364;22365;22366;22367;22368;22369;22370;22371;22372;22373;22374;22375;22376;22377;22378;22379;22380;22381;22382;22383;22384;22385;22386;22387;22388;22389 22362 30 AIEIYTDMGR Unmodified 1167.5594 0.55940893 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R0I4;M0R027 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.424 72.424 2 0.00046618 73432 QUIQUE_C1576_190116_001 111.17 82.018 1443100000 131440000 131890000 141600000 131570000 85669000 107480000 118840000 112800000 89938000 38732000 127770000 99248000 126120000 1867 2651 1733 17511;17512;17513;17514;17515;17516;17517;17518;17519;17520;17521;17522;17523 22390;22391;22392;22393;22394;22395;22396;22397;22398;22399;22400;22401;22402;22403;22404;22405 22398 16 AIEIYTDMGR Oxidation (M) 1183.5543 0.55432356 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R058;M0R0I4;M0R027 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 48.997 48.997 2 0.015625 46696 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.224 35.058 1909700000 0 0 473930000 0 0 0 512210000 0 411870000 0 511740000 0 0 1868 2651 1733 17524;17525;17526;17527 22406;22407;22408;22409 22409 4 AIEKLAVEALSSLDGDLAGR Unmodified 2027.0899 0.089884225 2044 P12277;G3V4N7 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 144.43 144.43 2;3 1.4671E-12 150428 QUIQUE_C1218_190116_001 84.975 75.928 109980000 25831000 21995000 23795000 0 0 0 0 0 0 10313000 0 17207000 10839000 1869 2044 1734 17528;17529;17530;17531;17532;17533;17534 22410;22411;22412;22413;22414;22415;22416 22410 7 AIELFQR Unmodified 875.4865 0.48650199 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.014 64.014 2 0.019227 64254 QUIQUE_C1218_190116_001 113.08 32.528 779190000 83348000 0 271910000 71118000 0 53127000 0 0 0 30266000 269430000 0 0 1870 1452 1735 17535;17536;17537;17538;17539;17540 22417;22418;22419;22420;22421;22422;22423;22424 22417 6 AIELLEK Unmodified 814.48002 0.48001963 1456;4298 O14910;H0YIA8;J3KN23;Q9NUP9;G3V1D4 LIN7A;LIN7C Protein lin-7 homolog A;Protein lin-7 homolog C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 48.945 48.945 2 0.028867 46593 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.906 27.13 2033200000 0 273630000 273500000 250710000 0 240530000 0 233130000 236750000 0 0 227370000 297580000 1871 1456;4298 1736 17541;17542;17543;17544;17545;17546;17547;17548 22425;22426;22427;22428;22429;22430;22431;22432 22431 8 AIELLQEFSDQHPENAAEIK Unmodified 2281.1226 0.12264092 1683 O76094;D6RDY6 SRP72 Signal recognition particle subunit SRP72 yes no 0 0 0 1 111.91 111.91 3 0.0038964 114763 QUIQUE_C1403_190116_001 30.767 17.592 74261000 0 0 0 74261000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1872 1683 1737 17549 22433 22433 1 AIELNPANAVYFCNR Unmodified 1750.8461 0.8460889 1551 O43765;K7EMD6 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.7 107.7 2 9.693E-44 110813 QUIQUE_DMIX7_190116_001 180.36 147.3 1545000000 123070000 131440000 109780000 111970000 147620000 142310000 115150000 97279000 114950000 45734000 132550000 130280000 142910000 1873 1551 1738 17550;17551;17552;17553;17554;17555;17556;17557;17558;17559;17560;17561;17562 22434;22435;22436;22437;22438;22439;22440;22441;22442;22443;22444;22445;22446;22447 22446 13 AIEMELR Unmodified 860.44259 0.44258826 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 47.757 47.757 2 0.033008 44729 QUIQUE_C1368_190116_001 88.734 32.224 391580000 115420000 0 144210000 0 0 0 131950000 0 0 0 0 0 0 1874 890;3052 1739 17563;17564;17565 22448;22449;22450;22451;22452 22450 5 AIEMLGGELGSK Unmodified 1203.6169 0.61692381 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.545 78.545 2 0.00023168 80046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.67 63.265 3275000000 462860000 0 0 348820000 0 362970000 370750000 282730000 329130000 120450000 341880000 315740000 339650000 1875 1935 1740 17566;17567;17568;17569;17570;17571;17572;17573;17574;17575 22453;22454;22455;22456;22457;22458;22459;22460;22461;22462;22463;22464 22462 12 AIEMLGGELGSK Oxidation (M) 1219.6118 0.61183843 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 53.965 53.965 2 0.0090577 52301 QUIQUE_C1368_190116_001 63.408 32.179 263300000 0 0 84266000 0 0 0 0 0 0 0 91898000 87136000 0 1876 1935 1740 17576;17577;17578;17579;17580 22465;22466;22467;22468;22469;22470 22465 1166 6 AIENCEYAFNLK Unmodified 1470.6813 0.68131498 663 B7Z5N5;Q15796;K7EJX0 SMAD2 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 82.005 82.005 2 0.00122 82320 QUIQUE_C1563_190116_001 82.749 66.525 101220000 0 0 0 28742000 0 32746000 0 0 0 0 0 0 39731000 1877 663 1741 17581;17582;17583 22471;22472;22473 22472 3 AIENELLAR Unmodified 1027.5662 0.56620887 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7;A0A2R8Y6Q7;A0A2R8Y7I7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.976 60.976 2 0.0004112 60125 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.46 57.74 3043100000 298420000 288640000 288850000 239040000 244980000 247180000 239510000 252080000 247590000 101900000 338300000 256600000 0 1878 2513 1742 17584;17585;17586;17587;17588;17589;17590;17591;17592;17593;17594;17595 22474;22475;22476;22477;22478;22479;22480;22481;22482;22483;22484;22485;22486 22485 10 AIENIDTLTNLESLFLGK Unmodified 1990.0623 0.062272491 3140 Q15435;H7C003;C9JD73;B5MBZ8;C9J177 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.83 168.83 2;3 0 171985 QUIQUE_C1403_190116_001 393.64 359.75 11131000000 614440000 568830000 768760000 920600000 770400000 1461800000 716960000 1019300000 1508500000 401070000 786030000 736530000 857850000 1879 3140 1743 17596;17597;17598;17599;17600;17601;17602;17603;17604;17605;17606;17607;17608;17609;17610;17611;17612;17613;17614;17615;17616;17617;17618;17619;17620 22487;22488;22489;22490;22491;22492;22493;22494;22495;22496;22497;22498;22499;22500;22501;22502;22503;22504;22505;22506;22507;22508;22509;22510;22511;22512 22494 26 AIEPNDYTGK Unmodified 1106.5244 0.52440364 1618 O75223;M0QZK8 GGCT Gamma-glutamylcyclotransferase yes no 0 0 0 1 1 28.926 28.926 2 0.015177 23038 QUIQUE_C1277_190116_001 74.464 45.315 769130000 0 395000000 0 0 0 374130000 0 0 0 0 0 0 0 1880 1618 1744 17621;17622 22513;22514 22513 2 AIEPPPLDAVIEAEHTLR Unmodified 1970.0473 0.047291129 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 128.05 128.05 2;3 7.2501E-06 132449 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.573 93.364 2096100000 230200000 217650000 140160000 180860000 210450000 138450000 172600000 169750000 175600000 66271000 212500000 181620000 0 1881 2916 1745 17623;17624;17625;17626;17627;17628;17629;17630;17631;17632;17633;17634;17635;17636 22515;22516;22517;22518;22519;22520;22521;22522;22523;22524;22525;22526;22527;22528;22529;22530;22531;22532;22533;22534;22535;22536;22537;22538;22539;22540;22541;22542;22543 22534 29 AIEPQKEEADENYNSVNTR Unmodified 2206.0138 0.013818748 2947 Q12846;C9JFM5 STX4 Syntaxin-4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 36.194 36.194 2;3 5.8884E-36 31636 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.11 112.51 591270000 0 52701000 57427000 56548000 0 47067000 63288000 53473000 60363000 28866000 67032000 51553000 52951000 1882 2947 1746 17637;17638;17639;17640;17641;17642;17643;17644;17645;17646;17647;17648 22544;22545;22546;22547;22548;22549;22550;22551;22552;22553;22554;22555;22556;22557;22558 22555 15 AIEQADLLQEEDESPR Unmodified 1841.8643 0.86430096 468 A0A2R8YGH5;H7C1E4;P61966 AP1S1 AP-1 complex subunit sigma-1A yes no 0 0 0 1 1 1 77.73 77.73 2 1.8738E-79 79750 QUIQUE_DMIX5_190116_001 206.69 181.25 98715000 0 0 0 0 0 0 31013000 0 0 0 33351000 34351000 0 1883 468 1747 17649;17650;17651 22559;22560;22561 22560 3 AIEQSFDQDESGNR Unmodified 1594.6859 0.68594267 2351 P32856 STX2 Syntaxin-2 yes yes 0 0 0 1 40.502 40.502 2 0.017534 37457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.451 57.585 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1884 2351 1748 17652 22562 22562 1 AIEQSIEQEEGLNR Unmodified 1614.7849 0.78492843 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 3 3 1 67.557 67.557 2;3 4.0223E-72 67523 QUIQUE_DMIX1_190116_001 249.5 223.56 8842300000 901360000 989220000 1082400000 1033800000 689020000 628820000 743220000 398740000 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22636;22637;22638;22639;22640;22641;22642;22643;22644;22645;22646;22647;22648;22649;22650 22644 15 AIFLFVDK Unmodified 951.54295 0.54295423 2694 P60520;H3BSM5;H3BQ50 GABARAPL2 Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.78 106.78 2 0.0095269 110628 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.47 60 2145500000 0 205030000 198790000 141570000 192780000 168650000 198360000 171210000 214580000 0 252390000 208300000 193820000 1893 2694 1757 17722;17723;17724;17725;17726;17727;17728;17729;17730;17731;17732 22651;22652;22653;22654;22655;22656;22657;22658;22659;22660;22661;22662;22663;22664 22659 14 AIFQEVHVQSLPQVDR Unmodified 1864.9795 0.97954591 3947 Q96T76;Q5T454;B0QZ77;F8WCH8 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 89.493 89.493 3 0.0033178 92657 QUIQUE_C1218_190116_001 50.079 43.509 109210000 61937000 0 47270000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1894 3947 1758 17733;17734 22665;22666 22665 1 AIFQTIQNR Unmodified 1089.5931 0.59309232 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.846 51.846 2 1.9345E-09 49580 QUIQUE_C1368_190116_001 173.93 109.13 1557800000 153480000 153610000 120440000 121420000 158480000 113400000 128160000 111890000 165200000 0 205220000 0 126490000 1895 1727 1759 17735;17736;17737;17738;17739;17740;17741;17742;17743;17744;17745 22667;22668;22669;22670;22671;22672;22673;22674;22675;22676;22677;22678 22669 9 AIFSHAAGDNSTLLSFK Unmodified 1777.8999 0.89989861 4531 Q9UQB8;I3L4C2;B4DWA1;I3L3C6 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 92.236 92.236 2;3 5.4949E-06 94537 QUIQUE_C1368_190116_001 117.48 94.243 918840000 149300000 44689000 147250000 40309000 78343000 105680000 54050000 78292000 0 0 68772000 0 152160000 1896 4531 1760 17746;17747;17748;17749;17750;17751;17752;17753;17754;17755;17756;17757;17758;17759 22679;22680;22681;22682;22683;22684;22685;22686;22687;22688;22689;22690;22691;22692 22683 14 AIFSVYVVNK Unmodified 1138.6386 0.63864553 4550 Q9Y296;E9PQE8;E9PKS9;E9PN70;J3KP27;G3V1A0;G5EA23 TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 88.766 88.766 2 0.019059 90807 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.919 52.188 67395000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29919000 37476000 1897 4550 1761 17760;17761 22693;22694 22693 2 AIFTGHSAVVEDVAWHLLHESLFGSVADDQK Unmodified 3377.6681 0.66805477 3183 Q16576;E9PC52;Q5JP02;Q5JP01 RBBP7 Histone-binding protein RBBP7 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 158.23 158.23 4;5 4.7857E-32 162524 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.57 96.727 259100000 0 58127000 0 0 23973000 0 0 0 55316000 0 47429000 74260000 0 1898 3183 1762 17762;17763;17764;17765;17766;17767 22695;22696;22697;22698;22699;22700 22700 5 AIFTGYYGK Unmodified 1018.5124 0.51238239 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.688 64.688 2 0.0015366 65094 QUIQUE_C1438_190116_001 102.72 66.839 13919000000 998430000 1089400000 1423400000 1142100000 1059500000 780490000 1632500000 881710000 970490000 498980000 1655300000 765820000 1020900000 1899 1969 1763 17768;17769;17770;17771;17772;17773;17774;17775;17776;17777;17778;17779;17780 22701;22702;22703;22704;22705;22706;22707;22708;22709;22710;22711;22712;22713;22714;22715;22716;22717;22718;22719;22720;22721;22722;22723;22724;22725 22706 25 AIGAVPLIQGEYMIPCEK Oxidation (M) 2004.006 0.0060199404 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;H7C1V0 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 117.32 117.32 2;3 3.3488E-13 121483 QUIQUE_DMIX8_190116_001 123.95 106.74 3469600000 184090000 378920000 286710000 163870000 341030000 313920000 248910000 193770000 188440000 191490000 346740000 261380000 370360000 1900 358 1764 17781;17782;17783;17784;17785;17786;17787;17788;17789;17790;17791;17792;17793;17794;17795;17796;17797 22726;22727;22728;22729;22730;22731;22732;22733;22734;22735;22736;22737;22738;22739;22740;22741;22742;22743;22744;22745;22746;22747;22748 22748 249 22 AIGAVPLIQGEYMIPCEK Unmodified 1988.0111 0.011105318 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;H7C1V0 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 128.64 128.64 2;3 4.8755E-31 134497 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.02 139.98 10664000000 962280000 1125100000 1089800000 941690000 866950000 901920000 915140000 480830000 431640000 206360000 838950000 772420000 1131200000 1901 358 1764 17798;17799;17800;17801;17802;17803;17804;17805;17806;17807;17808;17809;17810;17811;17812;17813;17814;17815;17816;17817;17818;17819 22749;22750;22751;22752;22753;22754;22755;22756;22757;22758;22759;22760;22761;22762;22763;22764;22765;22766;22767;22768;22769;22770;22771;22772;22773;22774;22775;22776;22777;22778;22779 22773 30 AIGGGLSSVGGGSSTIK Unmodified 1446.7678 0.7678218 764 CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538 KRT6C;KRT6A Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A yes no 0 0 0 1 1 1 54.592 54.592 2 0.0040495 50241 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.412 43.523 87982000 0 0 0 0 0 0 0 29944000 34772000 23265000 0 0 0 + 1902 764 1765 17820;17821;17822 22780;22781;22782 22782 3 AIGGIILTASHNPGGPNGDFGIK Unmodified 2205.1542 0.15421582 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 101.66 101.66 2;3 5.434E-88 103763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.88 115.95 930950000 62131000 36118000 71396000 75421000 0 0 0 266760000 178640000 75262000 85537000 0 79688000 1903 2400 1766 17823;17824;17825;17826;17827;17828;17829;17830;17831;17832;17833;17834;17835 22783;22784;22785;22786;22787;22788;22789;22790;22791;22792;22793;22794;22795;22796;22797;22798;22799;22800 22791 17 AIGHVIEEGGVK Unmodified 1207.6561 0.65608651 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 26.052 26.052 2;3 6.3944E-12 20127 QUIQUE_C1277_190116_001 160.75 129.38 11810000000 1002200000 1130000000 820360000 988980000 993140000 942750000 1091800000 672220000 841610000 227000000 1232200000 742990000 1125100000 1904 419;584 1767 17836;17837;17838;17839;17840;17841;17842;17843;17844;17845;17846;17847;17848;17849;17850;17851;17852;17853;17854;17855;17856;17857;17858;17859;17860 22801;22802;22803;22804;22805;22806;22807;22808;22809;22810;22811;22812;22813;22814;22815;22816;22817;22818;22819;22820;22821;22822;22823;22824;22825;22826;22827;22828 22804 23 AIGIEPSLATYHHIIR Unmodified 1789.9839 0.98390301 3846 Q96EY7 PTCD3 Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 75.498 75.498 4 0.001635 76656 QUIQUE_C1576_190116_001 51.695 47.227 17452000 0 0 0 0 0 0 17452000 0 0 0 0 0 0 1905 3846 1768 17861 22829 22829 1 AIGIGAYLVR Unmodified 1031.6128 0.61276513 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase no no 0 0 0 2 1 1 1 93.723 93.723 2 0.019072 97618 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.508 41.148 63340000 0 0 0 0 20842000 0 0 0 0 0 24371000 0 18127000 1906 2964 1769 17862;17863;17864;17865;17866 22830;22831;22832;22833;22834 22833 5 AIGISNFNHLQVEMILNKPGLK Unmodified 2435.3359 0.33588535 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 0 1 2 2 2 2 3 1 3 3 2 3 2 2 2 116.04 116.04 3;4 3.8196E-09 119854 QUIQUE_C1403_190116_001 93.776 90.502 10061000000 428280000 716570000 963400000 767790000 966830000 391320000 799250000 694790000 856370000 389230000 1088800000 727010000 1271400000 1907 2087 1770 17867;17868;17869;17870;17871;17872;17873;17874;17875;17876;17877;17878;17879;17880;17881;17882;17883;17884;17885;17886;17887;17888;17889;17890;17891;17892;17893;17894;17895 22835;22836;22837;22838;22839;22840;22841;22842;22843;22844;22845;22846;22847;22848;22849;22850;22851;22852;22853;22854;22855;22856;22857;22858;22859;22860;22861;22862;22863;22864;22865;22866;22867;22868;22869;22870;22871;22872;22873;22874;22875;22876;22877;22878;22879;22880;22881 22852 43 AIGISNFNHLQVEMILNKPGLK Oxidation (M) 2451.3308 0.33079997 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 107.69 107.69 3;4 2.4174E-06 111784 QUIQUE_C1576_190116_001 73.315 59.299 1835500000 0 198870000 168070000 173940000 0 256510000 139170000 55302000 254060000 121760000 171890000 0 295910000 1908 2087 1770 17896;17897;17898;17899;17900;17901;17902;17903;17904;17905;17906 22882;22883;22884;22885;22886;22887;22888;22889;22890;22891;22892 22886 1426 11 AIGLLDVDVYGPSVPK Unmodified 1641.8978 0.89777334 3663 Q8TB37;H0YHR7;F8W061 NUBPL Iron-sulfur protein NUBPL yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.47 130.47 2 0.00014486 135077 QUIQUE_C1368_190116_001 96.103 84.237 261490000 32627000 0 0 31398000 0 0 0 31336000 47196000 14341000 51489000 53106000 0 1909 3663 1771 17907;17908;17909;17910;17911;17912;17913;17914 22893;22894;22895;22896;22897;22898;22899;22900 22894 8 AIGMSLAK Unmodified 789.44186 0.44185998 3026 Q13825 AUH Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 36.461 36.461 2 0.048313 31872 QUIQUE_C1403_190116_001 56.014 19.97 82406000 0 0 0 43162000 0 0 0 0 0 0 0 39244000 0 1910 3026 1772 17915;17916 22901;22902 22901 2 AIGNEVTVDKWEPLLNNLGHVCR Unmodified 2633.3384 0.33840455 488 Q5T8C6;A0A3B3ISD2;Q13042 CDC16 Cell division cycle protein 16 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 122.74 122.74 4 0.000142 126575 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.656 45.894 121680000 0 20268000 0 23698000 22986000 0 0 0 0 0 0 25782000 28946000 1911 488 1773 17917;17918;17919;17920;17921 22903;22904;22905;22906;22907 22906 4 AIGNIELGIR Unmodified 1054.6135 0.61349341 2483 P46821;D6RA32;D6RGJ3;D6RCL2 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.96 80.96 2 3.069E-39 82216 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.37 128.9 7257700000 518920000 611420000 557550000 324880000 575770000 467460000 674380000 642460000 548260000 322340000 724550000 671700000 618060000 1912 2483 1774 17922;17923;17924;17925;17926;17927;17928;17929;17930;17931;17932;17933;17934 22908;22909;22910;22911;22912;22913;22914;22915;22916;22917;22918;22919;22920;22921;22922;22923;22924;22925;22926;22927;22928;22929;22930;22931;22932;22933;22934;22935;22936;22937;22938;22939;22940 22928 33 AIGPHDVLATLLNNLK Unmodified 1687.9621 0.96210494 1644 O75533;H7C341 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 151.64 151.64 3 0.00040095 158440 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.246 54.984 232800000 28247000 36110000 0 0 28250000 0 18483000 0 49902000 0 28940000 42872000 0 1913 1644 1775 17935;17936;17937;17938;17939;17940;17941 22941;22942;22943;22944;22945;22946;22947 22946 6 AIGQAGSLTSSEDTLTVVTADHSHVFTFGGYTPR Unmodified 3521.7063 0.70629077 1882 P05186;B1ANL0 ALPL Alkaline phosphatase, tissue-nonspecific isozyme yes no 0 0 0 1 1 126.65 126.65 4 1.1709E-38 130317 QUIQUE_C1403_190116_001 95.586 87.844 126840000 0 52563000 0 74272000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1914 1882 1776 17942;17943 22948;22949;22950 22950 3 AIGSASEGAQSSLQEVYHK Unmodified 1960.949 0.94903365 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 56.613 56.613 2;3 1.5624E-241 55037 QUIQUE_C1277_190116_001 292.76 274.57 8698500000 853500000 708060000 877410000 758520000 834150000 72979000 805030000 524660000 757340000 328360000 147380000 754350000 1276800000 1915 2273 1777 17944;17945;17946;17947;17948;17949;17950;17951;17952;17953;17954;17955;17956;17957;17958;17959;17960;17961;17962;17963;17964;17965;17966 22951;22952;22953;22954;22955;22956;22957;22958;22959;22960;22961;22962;22963;22964;22965;22966;22967;22968;22969;22970;22971;22972;22973;22974;22975;22976;22977;22978 22956 25 AIGTDEDLAHSSIR Unmodified 1483.7267 0.72668527 4647 Q9Y697;H7C0I5;H0YGN5 NFS1 Cysteine desulfurase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.668 42.668 3 0.00034939 39565 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.394 50.041 743600000 115160000 69611000 59883000 79247000 48411000 0 84570000 0 73072000 0 67471000 72673000 73509000 1916 4647 1778 17967;17968;17969;17970;17971;17972;17973;17974;17975;17976 22979;22980;22981;22982;22983;22984;22985;22986;22987;22988;22989;22990 22988 9 AIGTEPDSDVLSEIMHSFAK Unmodified 2146.0252 0.025235058 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 153.37 153.37 2;3 7.2371E-31 156714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.26 129.22 2661800000 192890000 320670000 194980000 286550000 169860000 181360000 171220000 155160000 195040000 64841000 157620000 222290000 349350000 1917 1403 1779 17977;17978;17979;17980;17981;17982;17983;17984;17985;17986;17987;17988;17989;17990;17991;17992;17993 22991;22992;22993;22994;22995;22996;22997;22998;22999;23000;23001;23002;23003;23004;23005;23006;23007;23008;23009;23010;23011;23012;23013;23014;23015;23016;23017;23018;23019;23020;23021;23022;23023;23024 23011 34 AIGTEPDTDVLSEIMNSFAK Unmodified 2137.0249 0.024900707 1582 O60518 RANBP6 Ran-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 168.2 168.2 2 9.34E-18 175561 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.53 98.432 149410000 0 0 0 0 46120000 0 0 0 0 0 103290000 0 0 1918 1582 1780 17994;17995 23025;23026 23026 2 AIGTFLFGAAASQSLTDIAK Unmodified 1981.052 0.052042156 1426 O14494 PPAP2A Lipid phosphate phosphohydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 149.48 149.48 2;3 0.00077708 152682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.62 79.578 19047000 0 0 0 0 0 0 0 0 19047000 0 0 0 0 1919 1426 1781 17996;17997 23027;23028;23029 23027 3 AIGVKPPR Unmodified 836.52322 0.52322184 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 15.202 15.202 2 0.042432 7293 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.94 99.088 63055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63055000 0 0 0 1920 2658 1782 17998 23030 23030 0 AIGVLTSGGDAQGMNAAVR Unmodified 1786.8996 0.89958103 2861;2129 Q01813;P17858 PFKP;PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type;ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 2 76.82 76.82 2;3 3.0779E-55 77635 QUIQUE_C1368_190116_001 174.9 145.14 3787000000 358530000 483780000 371570000 402480000 290230000 0 299370000 244650000 0 173430000 461090000 361970000 339920000 1921 2861;2129 1783 17999;18000;18001;18002;18003;18004;18005;18006;18007;18008;18009;18010;18011;18012;18013;18014;18015 23031;23032;23033;23034;23035;23036;23037;23038;23039;23040;23041;23042;23043;23044;23045;23046;23047;23048 23035 15 AIGVLTSGGDAQGMNAAVR Oxidation (M) 1802.8945 0.89449566 2861;2129 Q01813;P17858 PFKP;PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type;ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 56.661 56.661 2;3 1.0302E-45 55091 QUIQUE_C1277_190116_001 165.58 131.62 2269400000 0 168340000 209750000 139880000 122080000 117920000 127910000 176500000 205350000 208300000 271560000 257830000 264020000 1922 2861;2129 1783 18016;18017;18018;18019;18020;18021;18022;18023;18024;18025;18026;18027;18028 23049;23050;23051;23052;23053;23054;23055;23056;23057;23058;23059;23060;23061;23062 23049 1463 13 AIGYATAADCGR Unmodified 1224.5557 0.55572054 4663 Q9Y6R7;A0A286YF91 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 35.688 35.688 2 0.004947 29750 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.726 45.98 22326000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22326000 0 0 0 1923 4663 1784 18029 23063 23063 1 AIGYLNTGYQR Unmodified 1254.6357 0.63568542 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 59.9 59.9 2 0.0004798 55480 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.57 73.322 54119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54119000 0 0 0 1924 1802 1785 18030 23064 23064 1 AIHEVFEVGVTSHR Unmodified 1579.8107 0.81068967 4213 Q9HB90 RRAGC Ras-related GTP-binding protein C yes yes 0 0 0 1 1 1 42.992 42.992 3 0.0093531 40044 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protein 13-beta no no 0 0 0 1 1 1 1 24.831 24.831 2 0.02784 18610 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.692 37.928 233620000 0 0 0 0 0 0 57037000 44925000 45134000 0 0 0 86523000 1928 4475;3645 1789 18045;18046;18047;18048 23079;23080;23081;23082 23081 4 AIHYALNCCGLAGGVEQFISDICPK Unmodified 2792.3084 0.30842633 415 A6NNI4;A0A2R8Y478;G8JLH6;P21926 CD9 Tetraspanin;CD9 antigen yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 154.05 154.05 2;3 1.2759E-98 159874 QUIQUE_C1218_190116_001 179.42 170.4 6845100000 404640000 1078100000 478520000 311220000 343290000 352130000 611810000 760400000 681960000 196150000 596640000 419240000 610980000 1929 415 1790 18049;18050;18051;18052;18053;18054;18055;18056;18057;18058;18059;18060;18061;18062;18063 23083;23084;23085;23086;23087;23088;23089;23090;23091;23092;23093;23094;23095;23096;23097;23098;23099;23100;23101;23102;23103;23104;23105 23083 23 AIIASNIMYIVGQYPR Unmodified 1807.9655 0.96547575 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 143.33 143.33 2;3 1.6616E-36 146374 QUIQUE_DMIX1_190116_001 175.74 151.05 1079400000 82187000 92251000 57025000 74643000 92212000 56233000 107720000 126610000 108950000 30531000 30700000 117270000 103030000 1930 1470 1791 18064;18065;18066;18067;18068;18069;18070;18071;18072;18073;18074;18075;18076;18077;18078;18079;18080;18081;18082;18083;18084;18085;18086;18087;18088 23106;23107;23108;23109;23110;23111;23112;23113;23114;23115;23116;23117;23118;23119;23120;23121;23122;23123;23124;23125;23126;23127;23128;23129;23130;23131;23132;23133;23134 23122 24 AIIDGVESVSR Unmodified 1144.6088 0.60880197 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.597 61.597 2 0.00034234 57928 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.18 93.255 10438000000 1278700000 1308000000 1351200000 0 0 935150000 1186800000 1076100000 1250200000 452070000 828760000 0 770630000 1931 2217 1792 18089;18090;18091;18092;18093;18094;18095;18096;18097;18098 23135;23136;23137;23138;23139;23140;23141;23142;23143;23144 23142 6 AIIDHVSDSFLDTTVPLLVLIEAAK Unmodified 2679.4735 0.47348427 4446 Q9UI47;V9GYW4 CTNNA3 Catenin alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 172.21 172.21 3 1.2364E-07 173840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.039 54.534 64201000 0 0 0 0 21341000 0 0 42860000 0 0 0 0 0 1932 4446 1793 18099;18100 23145;23146;23147 23147 3 AIIEEMLDLLEQSEGK Unmodified 1816.9128 0.91283106 4328 Q9NXJ5 PGPEP1 Pyroglutamyl-peptidase 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 2 171.39 171.39 2;3 1.3521E-36 174771 QUIQUE_C1277_190116_001 176.05 155.47 470490000 18137000 32433000 39665000 9159600 29804000 7859200 30180000 52326000 111420000 0 31351000 48452000 59700000 1933 4328 1794 18101;18102;18103;18104;18105;18106;18107;18108;18109;18110;18111;18112;18113;18114;18115;18116;18117;18118;18119;18120 23148;23149;23150;23151;23152;23153;23154;23155;23156;23157;23158;23159;23160;23161;23162;23163;23164;23165;23166;23167;23168 23150 21 AIIEEYLHLNDMK Unmodified 1587.7967 0.79667909 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 106.97 106.97 3 0.0040093 111731 QUIQUE_C1438_190116_001 44.457 33.017 117830000 0 31390000 0 0 31558000 24524000 30361000 0 0 0 0 0 0 1934 922 1795 18121;18122;18123;18124 23169;23170;23171;23172 23170 4 AIIESDQEQGR Unmodified 1244.5997 0.59969384 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 22.718 22.718 2 2.9849E-18 15685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 169.12 147.62 24663000000 2349400000 1659900000 0 2118300000 2162300000 2385300000 2551400000 1936200000 2376600000 1353200000 2720600000 0 3049500000 1935 2941 1796 18125;18126;18127;18128;18129;18130;18131;18132;18133;18134;18135;18136 23173;23174;23175;23176;23177;23178;23179;23180;23181;23182;23183;23184;23185;23186;23187;23188;23189;23190 23188 15 AIIESDQEQGRK Unmodified 1372.6947 0.69465686 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 1 2 3 1 3 1 2 2 2 2 2 2 3 2 14.353 14.353 2;3 4.6536E-37 6823 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23224;23225;23226;23227;23228;23229;23230;23231;23232;23233;23234;23235;23236;23237;23238 23224 13 AIIGLYNYAHEMTHGASDR Oxidation (M) 2133.9902 0.99018696 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 1 0 1 61.141 61.141 3 8.0723E-05 56735 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.359 58.2 56048000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56048000 0 0 0 1938 4551 1798 18175 23239 23239 3005 1 AIIIFVPVPQLK Unmodified 1336.8482 0.84824438 2738 P62081;B5MCP9 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 141.34 141.34 2 0.00046265 147065 QUIQUE_C1576_190116_001 109.21 103.48 1649900000 154440000 116820000 115200000 113710000 124020000 129920000 117810000 123680000 170810000 69942000 143960000 142800000 126810000 1939 2738 1799 18176;18177;18178;18179;18180;18181;18182;18183;18184;18185;18186;18187;18188;18189 23240;23241;23242;23243;23244;23245;23246;23247;23248;23249;23250;23251;23252;23253;23254;23255;23256;23257;23258;23259;23260;23261;23262;23263;23264;23265 23252 26 AIIKPQYVDQIPK Unmodified 1511.8712 0.87116466 2718 P61221;D6R9I9;D6RGF4;H0Y990 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 1 1 64.221 64.221 3 0.037563 64026 QUIQUE_C1218_190116_001 56.139 44.699 54508000 54508000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1940 2718 1800 18190 23266 23266 0 AIILNTPHNPLGK Unmodified 1386.7983 0.79833407 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 3 1 1 63.504 63.504 2;3 0.00014633 62421 QUIQUE_C1368_190116_001 105.17 95.637 579480000 47258000 51622000 93961000 0 0 68076000 40781000 102090000 34813000 0 92664000 48215000 0 1941 3422 1801 18191;18192;18193;18194;18195;18196;18197;18198;18199;18200;18201;18202;18203;18204 23267;23268;23269;23270;23271;23272;23273;23274;23275;23276;23277;23278;23279;23280;23281 23269 14 AIINLAVYGK Unmodified 1060.6281 0.62808085 4642 Q9Y646;E5RJA8;E5RH35;E5RJZ7;E5RJP8 CPQ Carboxypeptidase Q yes no 0 0 0 1 88.289 88.289 2 0.063055 85004 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.7 26.969 10869000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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complex subunit sigma-1 yes no 0 0 0 1 40.071 40.071 3 0.056405 35904 QUIQUE_C1563_190116_001 33.359 20.569 33257000 0 0 0 0 0 33257000 0 0 0 0 0 0 0 1952 3735 1812 18229 23306 23306 1 AILIFNNHGKPR Unmodified 1378.7834 0.78335271 3735 Q92572;F5H459 AP3S1 AP-3 complex subunit sigma-1 yes no 0 0 1 1 1 28.641 28.641 3 0.029171 22892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.661 35.818 94095000 0 0 0 0 0 0 0 40316000 53779000 0 0 0 0 1953 3735 1813 18230;18231 23307;23308;23309 23309 3 AILILDNDGDRLFAK Unmodified 1672.9148 0.91482039 1034 F8VVA7;P61923;F8VXB1;F8W156;F8W651;F8VYZ4;F8VUC5;F8VXR1 COPZ1 Coatomer subunit zeta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 107.14 107.14 3 0.00027081 109786 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.094 36.234 120910000 0 0 0 0 0 0 0 46632000 33663000 0 0 0 40614000 1954 1034 1814 18232;18233;18234 23310;23311;23312 23310 3 AILKDPPVILYDEATSSLDSITEETILGAMK Unmodified 3332.7313 0.73129145 56 B4DGL8;A0A087WW65;O75027 ABCB7 ATP-binding cassette sub-family B member 7, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 170.51 170.51 3 2.2364E-07 172230 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.558 39.956 50587000 0 0 0 0 0 0 0 19669000 30918000 0 0 0 0 1955 56 1815 18235;18236 23313;23314 23313 1 AILPCQDTPSVK Unmodified 1327.6806 0.6805867 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.846 54.846 2 0.00040847 50698 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.75 89.32 2259400000 242470000 222730000 253080000 278350000 0 223170000 277730000 111550000 0 77540000 155740000 204670000 212340000 1956 1977 1816 18237;18238;18239;18240;18241;18242;18243;18244;18245;18246;18247 23315;23316;23317;23318;23319;23320;23321;23322;23323;23324;23325;23326 23322 10 AILQATLREEK Unmodified 1270.7245 0.72450043 2950 Q12904;D6R937 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes no 0 0 1 1 35.604 35.604 2 0.053576 30997 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.716 60.579 27772000 0 0 0 0 0 0 0 27772000 0 0 0 0 0 1957 2950 1817 18248 23327 23327 0 AILQEVLDADLSNEAFPFSTHK Unmodified 2444.2224 0.22235496 4480 Q9UL12;A0A0A0MT55;Q5SYV2 SARDH Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 152.6 152.6 3 0.00016499 159005 QUIQUE_C1438_190116_001 33.79 19.925 285340000 46287000 67342000 30696000 0 48334000 30475000 0 49235000 0 12968000 0 0 0 1958 4480 1818 18249;18250;18251;18252;18253;18254;18255 23328;23329;23330;23331;23332;23333;23334;23335 23331 8 AILQQILLLR Unmodified 1179.7703 0.77032841 1132 H7C380;H0Y8P0;Q86TI0 TBC1D1 TBC1 domain family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.45 136.45 2 0.0025779 140772 QUIQUE_C1277_190116_001 89.142 42.061 69143000 0 11059000 0 9886400 8176100 0 12245000 8610800 0 4444000 14722000 0 0 1959 1132 1819 18256;18257;18258;18259;18260;18261;18262;18263;18264;18265 23336;23337;23338;23339;23340;23341;23342;23343;23344;23345 23336 10 AILQQLGLNSTCDDSILVK Unmodified 2087.0933 0.093255043 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 2 130.05 130.05 2;3 8.9239E-55 134545 QUIQUE_C1277_190116_001 210.41 189.35 4821500000 463620000 416860000 411320000 535500000 356300000 609020000 381340000 226700000 185580000 179390000 360050000 334640000 361190000 1960 2146 1820 18266;18267;18268;18269;18270;18271;18272;18273;18274;18275;18276;18277;18278;18279;18280;18281;18282;18283;18284 23346;23347;23348;23349;23350;23351;23352;23353;23354;23355;23356;23357;23358;23359;23360;23361;23362;23363;23364;23365;23366;23367;23368;23369;23370;23371;23372;23373;23374;23375;23376;23377;23378 23349 31 AILSTKPPGTFLLR Unmodified 1512.9028 0.90279914 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 1 1 88.142 88.142 3 0.032304 88808 QUIQUE_C1563_190116_001 42.426 35.386 61233000 0 0 0 0 0 61233000 0 0 0 0 0 0 0 1961 2427 1821 18285 23379 23379 1 AILTAAIVDADR Unmodified 1227.6823 0.68230126 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.32 85.32 2 0.0010001 87922 QUIQUE_C1438_190116_001 84.17 55.771 538990000 40938000 39717000 43166000 37957000 38249000 31461000 35198000 49184000 46613000 18212000 59909000 49173000 49219000 1962 4631 1822 18286;18287;18288;18289;18290;18291;18292;18293;18294;18295;18296;18297;18298 23380;23381;23382;23383;23384;23385;23386;23387;23388;23389;23390;23391;23392 23384 12 AILTTIGVLEEPLGNAR Unmodified 1765.9938 0.993799 1615 O75170;T1ECW5 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 132.36 132.36 3 0.038439 135131 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.536 28.139 46648000 0 0 0 0 0 0 35970000 10678000 0 0 0 0 0 1963 1615 1823 18299;18300 23393;23394;23395 23395 3 AILVDLEPGTMDSVR Oxidation (M) 1630.8236 0.82362212 3030;4044;1922;3006 Q5JP53;P07437;Q13509;A0A0B4J269;G3V5W4;G3V2R8;G3V3R4;G3V2N6;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 4 2 2 2 96.742 96.742 2;3 1.4643E-09 98504 QUIQUE_C1218_190116_001 130.1 95.405 110870000000 7483800000 8068400000 7592200000 6417800000 7350700000 6428600000 7326700000 8590900000 9405000000 7325000000 12773000000 10763000000 11347000000 1964 1922;3006;3030;4044 1824 18301;18302;18303;18304;18305;18306;18307;18308;18309;18310;18311;18312;18313;18314;18315;18316;18317;18318;18319;18320 23396;23397;23398;23399;23400;23401;23402;23403;23404;23405;23406;23407;23408;23409;23410;23411;23412;23413;23414;23415;23416;23417;23418;23419;23420;23421;23422;23423;23424;23425;23426;23427;23428;23429;23430;23431;23432;23433;23434;23435;23436;23437;23438;23439;23440;23441;23442;23443 23397 1146 47 AILVDLEPGTMDSVR Unmodified 1614.8287 0.8287075 3030;4044;1922;3006 Q5JP53;P07437;Q13509;A0A0B4J269;G3V5W4;G3V2R8;G3V3R4;G3V2N6;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 6 6 2 4 6 3 6 5 3 3 5 5 6 129.17 129.17 1;2;3 8.3956E-234 117851 QUIQUE_C1218_190116_001 310.85 266.54 234160000000 21095000000 20605000000 18192000000 18080000000 20477000000 18693000000 21693000000 18365000000 16962000000 6021700000 17908000000 16778000000 19291000000 1965 1922;3006;3030;4044 1824 18321;18322;18323;18324;18325;18326;18327;18328;18329;18330;18331;18332;18333;18334;18335;18336;18337;18338;18339;18340;18341;18342;18343;18344;18345;18346;18347;18348;18349;18350;18351;18352;18353;18354;18355;18356;18357;18358;18359;18360;18361;18362;18363;18364;18365;18366;18367;18368;18369;18370;18371;18372;18373;18374;18375;18376;18377;18378;18379;18380 23444;23445;23446;23447;23448;23449;23450;23451;23452;23453;23454;23455;23456;23457;23458;23459;23460;23461;23462;23463;23464;23465;23466;23467;23468;23469;23470;23471;23472;23473;23474;23475;23476;23477;23478;23479;23480;23481;23482;23483;23484;23485;23486;23487;23488;23489;23490;23491;23492;23493;23494;23495;23496;23497;23498;23499;23500;23501;23502;23503;23504;23505;23506;23507;23508;23509;23510;23511;23512;23513;23514;23515;23516;23517;23518;23519;23520;23521;23522;23523;23524;23525;23526;23527;23528;23529;23530;23531;23532;23533;23534;23535;23536;23537;23538;23539;23540;23541;23542;23543;23544;23545;23546;23547;23548 23453 101 AILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAK Unmodified 4394.1542 0.15423918 3030;4044;1922 Q5JP53;P07437;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 2 1 167.25 167.25 4 2.1073E-16 174666 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.422 69.646 105670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105670000 0 0 1966 1922;3030;4044 1825 18381 23549 23549 1 AILVVFANK Unmodified 973.59605 0.59605244 2426 P40616;B4DZG7;F8VYN9 ARL1 ADP-ribosylation factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.729 81.729 2 0.019849 82973 QUIQUE_C1277_190116_001 63.306 42.648 397260000 25129000 27984000 34169000 28015000 25693000 21617000 36341000 32310000 41891000 16593000 41816000 30541000 35159000 1967 2426 1826 18382;18383;18384;18385;18386;18387;18388;18389;18390;18391;18392;18393;18394 23550;23551;23552;23553;23554;23555;23556;23557;23558;23559;23560;23561;23562 23551 12 AIMAHMTVEEIYK Unmodified 1534.7524 0.75237144 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A0A140T9C3;A0A140T959;A2AB11;A0A140T9B1;A0A140T957;A0A140T910 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 75.068 75.068 3 0.046244 75861 QUIQUE_C1218_190116_001 32.734 20.758 23904000 23904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1968 1673 1827 18395 23563 23563 1 AIMAHMTVEEIYKDR Unmodified 1805.8804 0.8804255 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A0A140T9C3;A0A140T959;A2AB11;A0A140T9B1;A0A140T957;A0A140T910 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 1 1 69.575 69.575 3 0.070925 70648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 24.832 18.395 99715000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99715000 0 0 1969 1673 1828 18396 23564 23564 1 AIMAQLPQEEK Unmodified 1256.6435 0.64347291 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.609 53.609 2 0.00037933 51180 QUIQUE_C1563_190116_001 117.01 81.362 1138200000 93819000 82578000 92485000 156400000 72575000 117580000 87126000 88225000 79704000 41755000 81385000 67495000 77125000 1970 2250 1829 18397;18398;18399;18400;18401;18402;18403;18404;18405;18406;18407;18408;18409 23565;23566;23567;23568;23569;23570;23571;23572;23573;23574;23575;23576;23577;23578;23579;23580;23581 23572 17 AIMAQLPQEEK Oxidation (M) 1272.6384 0.63838754 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 1 0 1 39.286 39.286 2 0.043767 36145 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.243 47.368 68041000 0 0 0 0 0 0 0 0 68041000 0 0 0 0 1971 2250 1829 18410 23582 23582 0 AIMKDPDDHTVCHLLFANQTEK Unmodified 2582.2257 0.22574255 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 2 76.644 76.644 3;4 1.1535E-14 78228 QUIQUE_C1218_190116_001 113.73 100.14 1329200000 53237000 229590000 284760000 249850000 0 61941000 61306000 67948000 0 50273000 72888000 197410000 0 1972 1778 1830 18411;18412;18413;18414;18415;18416;18417;18418;18419;18420;18421;18422;18423;18424 23583;23584;23585;23586;23587;23588;23589;23590;23591;23592;23593;23594;23595;23596;23597;23598;23599 23583 15 AIMTYVSCFYHAFSGAQK Unmodified 2079.9547 0.95465307 1313 K7EJH8 ACTN4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 139.61 139.61 2;3 6.4214E-11 146085 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.47 123.58 1152800000 20059000 0 62122000 53570000 62558000 38767000 94660000 130840000 128140000 16161000 207940000 167280000 170670000 1973 1313 1831 18425;18426;18427;18428;18429;18430;18431;18432;18433;18434;18435;18436;18437;18438;18439 23600;23601;23602;23603;23604;23605;23606;23607;23608;23609;23610;23611;23612;23613;23614;23615;23616 23611 14 AIMTYVSSFYHAFSGAQK Unmodified 2006.956 0.95603328 1544;2047;1242 H9KV75;G3V2W4;O43707;P12814;G3V2N5 ACTN1;ACTN4 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.67 137.67 3 0.00016417 142354 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.942 67.11 1720200000 69898000 122730000 89238000 111520000 141120000 0 124530000 151590000 186020000 50069000 187300000 253540000 232630000 1974 1242;1544;2047 1832 18440;18441;18442;18443;18444;18445;18446;18447;18448;18449;18450;18451 23617;23618;23619;23620;23621;23622;23623;23624;23625;23626;23627;23628;23629;23630;23631 23627 15 AINCATSGVVGLVNCLR Unmodified 1802.9131 0.91312261 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 118.4 118.4 2;3 9.2547E-07 123496 QUIQUE_C1576_190116_001 138.24 122.7 1322000000 80906000 154250000 0 0 144690000 0 154820000 137610000 113050000 0 180110000 199400000 157180000 1975 2524 1833 18452;18453;18454;18455;18456;18457;18458;18459;18460;18461;18462;18463;18464;18465;18466;18467;18468 23632;23633;23634;23635;23636;23637;23638;23639;23640;23641;23642;23643;23644;23645;23646;23647;23648;23649;23650;23651;23652 23640 18 AINCPEDIVFPALDILR Unmodified 1955.0186 0.018633537 4541 Q9Y263 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 163.27 163.27 2 0.00065042 169145 QUIQUE_C1576_190116_001 80.469 63.695 484800000 0 47332000 49762000 52631000 44555000 24566000 44043000 0 29253000 11454000 0 84358000 96847000 1976 4541 1834 18469;18470;18471;18472;18473;18474;18475;18476;18477;18478;18479 23653;23654;23655;23656;23657;23658;23659;23660;23661;23662;23663 23658 9 AINEAYKEDYHK Unmodified 1479.6994 0.69940789 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 3 3 3 2 3 3 2 3 3 2 3 3 2 17.831 17.831 2;3;4 9.7238E-14 10517 QUIQUE_C1218_190116_001 196.11 179.92 24960000000 2090200000 1672800000 2112800000 1353800000 2957900000 1215700000 2032000000 2236300000 2215500000 470320000 3004700000 1732000000 1866200000 1977 845;1936 1835 18480;18481;18482;18483;18484;18485;18486;18487;18488;18489;18490;18491;18492;18493;18494;18495;18496;18497;18498;18499;18500;18501;18502;18503;18504;18505;18506;18507;18508;18509;18510;18511;18512;18513;18514 23664;23665;23666;23667;23668;23669;23670;23671;23672;23673;23674;23675;23676;23677;23678;23679;23680;23681;23682;23683;23684;23685;23686;23687;23688;23689;23690;23691;23692;23693;23694;23695;23696;23697;23698;23699 23666 26 AINIADELPR Unmodified 1110.6033 0.60332266 3651 Q8NFV4 ABHD11 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 84.723 84.723 2 0.0071629 85405 QUIQUE_C1563_190116_001 73.573 53.013 71863000 0 0 0 0 0 13664000 0 0 35270000 0 0 0 22930000 1978 3651 1836 18515;18516;18517;18518 23700;23701;23702;23703 23700 4 AINLLFDIAR Unmodified 1144.6604 0.66044361 3479 Q7Z7L7 ZER1 Protein zer-1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.16 130.16 2 0.0031972 136074 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.676 50.38 67107000 12116000 0 0 10634000 11710000 0 0 0 10737000 0 21910000 0 0 1979 3479 1837 18519;18520;18521;18522;18523;18524;18525;18526;18527;18528 23704;23705;23706;23707;23708;23709;23710;23711;23712;23713 23713 10 AINLQMFHK Unmodified 1100.5801 0.5800848 3946 Q96T51;H0YA47;H0YAC8 RUFY1 RUN and FYVE domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 61.163 61.163 3 0.0039205 60129 QUIQUE_C1368_190116_001 59.35 34.111 123330000 0 0 20100000 0 19701000 0 0 14358000 0 0 26731000 18074000 24369000 1980 3946 1838 18529;18530;18531;18532;18533;18534 23714;23715;23716;23717;23718;23719 23714 6 AINPINTFTK Unmodified 1117.6132 0.61315906 2912 Q07960 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.477 67.477 2 0.00091451 67296 QUIQUE_C1277_190116_001 120.15 85.347 2791000000 237830000 240420000 244960000 237380000 259720000 168760000 243240000 0 226450000 88575000 284640000 258210000 300840000 1981 2912 1839 18535;18536;18537;18538;18539;18540;18541;18542;18543;18544;18545;18546 23720;23721;23722;23723;23724;23725;23726;23727;23728;23729;23730;23731;23732;23733 23722 11 AINQGGLTSVAVR Unmodified 1284.715 0.71499837 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1;G3V3U4 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.929 52.929 2 0.00041511 50645 QUIQUE_C1403_190116_001 96.113 68.859 7588000000 607640000 652310000 658640000 650860000 575990000 556140000 467900000 550590000 741760000 236000000 665330000 683450000 541430000 1982 1091 1840 18547;18548;18549;18550;18551;18552;18553;18554;18555;18556;18557;18558;18559 23734;23735;23736;23737;23738;23739;23740;23741;23742;23743;23744;23745;23746;23747 23738 13 AINQIAAALFTIHK Unmodified 1509.8667 0.86674799 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 117.11 117.11 2;3 3.757E-05 114715 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.08 90.413 2174100000 147990000 177850000 183290000 173470000 123280000 114230000 183370000 221800000 181080000 86364000 208070000 204370000 168940000 1983 4551 1841 18560;18561;18562;18563;18564;18565;18566;18567;18568;18569;18570;18571;18572;18573;18574 23748;23749;23750;23751;23752;23753;23754;23755;23756;23757;23758;23759;23760;23761;23762;23763;23764;23765;23766;23767;23768;23769;23770;23771;23772;23773 23765 25 AINQQTGAFVEISR Unmodified 1532.7947 0.79470526 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R3J3 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 70.573 70.573 2 3.6102E-47 71361 QUIQUE_C1218_190116_001 194.5 137.77 1202400000 71002000 79290000 57479000 67745000 67108000 41332000 51459000 0 214430000 29989000 245800000 208440000 68290000 1984 3770 1842 18575;18576;18577;18578;18579;18580;18581;18582;18583;18584;18585;18586;18587;18588;18589 23774;23775;23776;23777;23778;23779;23780;23781;23782;23783;23784;23785;23786;23787;23788;23789;23790;23791 23774 18 AINSCHTSSLATPEDKEQAQQMNQK Unmodified 2815.2865 0.28650491 1812 Q5I0G2;P01236;A6XMH3 PRL Prolactin yes no 0 0 1 1 29.28 29.28 4 0.055831 23750 QUIQUE_C1218_190116_001 26.849 19.403 36592000 36592000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1985 1812 1843 18590 23792 23792 0 AINSSGLAHVENEEQYTQALEK Unmodified 2430.1663 0.16629665 1509 O43150 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 81.957 81.957 3 1.0517E-07 84741 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.045 58.053 41977000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41977000 0 0 1986 1509 1844 18591 23793 23793 1 AINTLNGLR Unmodified 970.55598 0.55597854 3152;160 Q15717;M0QZR9;A0A0A0MRX1;Q12926;B1AM48 ELAVL1;ELAVL2 ELAV-like protein 1;ELAV-like protein;ELAV-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 43.378 43.378 2 0.0070525 40011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.671 43.453 131120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22859000 108260000 0 0 1987 3152;160 1845 18592;18593 23794;23795 23795 2 AINTQEAPVK Unmodified 1069.5768 0.57677356 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.854 20.854 2 0.005136 14077 QUIQUE_C1218_190116_001 78.516 33.795 200220000 52106000 0 0 0 0 45090000 50810000 32497000 0 19718000 0 0 0 1988 1613 1846 18594;18595;18596;18597;18598;18599 23796;23797;23798;23799;23800;23801 23796 6 AINVFVSANR Unmodified 1089.5931 0.59309232 4035 Q9BUL8;C9J363;C9J5C3 PDCD10 Programmed cell death protein 10 yes no 0 0 0 1 1 59.322 59.322 2 0.00592 59153 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.825 35.823 37607000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37607000 0 0 1989 4035 1847 18600;18601 23802;23803 23803 2 AINVLLEGNPDTHSWEMVGK Unmodified 2209.0838 0.08375299 3047 Q14157;F8W726;Q5VU77;Q5VU81;Q5VU80;Q5VU79;Q5VU78 UBAP2L Ubiquitin-associated protein 2-like yes no 0 0 0 1 113.25 113.25 3 0.020676 117280 QUIQUE_C1218_190116_001 30.464 22.626 49619000 49619000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1990 3047 1848 18602 23804 23804 1 AIPDLTAPVAAVQAAVSNLVR Unmodified 2075.1739 0.17388863 2135 P18206;A0A096LPE1 VCL Vinculin yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 170.63 170.63 2;3 6.9419E-67 175560 QUIQUE_C1368_190116_001 117.48 111.36 7824100000 657890000 529960000 402220000 602030000 844720000 919780000 627380000 868340000 717120000 299440000 446610000 278090000 630490000 1991 2135 1849 18603;18604;18605;18606;18607;18608;18609;18610;18611;18612;18613;18614;18615;18616;18617;18618;18619;18620;18621;18622;18623;18624;18625;18626;18627;18628 23805;23806;23807;23808;23809;23810;23811;23812;23813;23814;23815;23816;23817;23818;23819;23820;23821;23822;23823;23824;23825;23826;23827;23828;23829;23830;23831;23832;23833;23834 23812 25 AIPLFGNSLKPDSLR Unmodified 1626.9093 0.90934108 1706 O95154 AKR7A3 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 3 yes yes 0 0 1 1 1 2 97.184 97.184 2;3 0.0069485 101155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.82 65.662 194720000 0 0 0 21057000 0 0 0 0 0 0 37696000 135960000 0 1992 1706 1850 18629;18630;18631;18632 23835;23836;23837;23838 23836 4 AIPLVLVSGNHDIGNTPTAETVEEFCR Unmodified 2938.4495 0.44947114 4001 Q9BRF8 CPPED1 Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 128.68 128.68 3;4 2.7184E-08 132514 QUIQUE_C1403_190116_001 60.139 54.786 2064300000 148550000 176270000 185480000 258670000 148610000 129670000 197960000 118030000 203300000 0 154260000 170190000 173340000 1993 4001 1851 18633;18634;18635;18636;18637;18638;18639;18640;18641;18642;18643;18644;18645 23839;23840;23841;23842;23843;23844;23845;23846;23847;23848;23849;23850;23851 23842 13 AIPNQGEILVIR Unmodified 1321.7718 0.77178497 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.987 86.987 2 0.003535 89975 QUIQUE_C1438_190116_001 105.4 85.067 337360000 0 0 49910000 0 42845000 39249000 43092000 37719000 43195000 0 48856000 32497000 0 1994 2569 1852 18646;18647;18648;18649;18650;18651;18652;18653 23852;23853;23854;23855;23856;23857;23858;23859 23853 3 AIPVSPSAVEEDEDEDGHTVVATAR Unmodified 2593.2144 0.21436905 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7;H0Y3R8 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.835 80.835 3 4.2636E-58 81537 QUIQUE_C1403_190116_001 158.37 151.5 323770000 0 0 0 84897000 0 0 62605000 61903000 0 37470000 0 76892000 0 1995 1074 1853 18654;18655;18656;18657;18658;18659 23860;23861;23862;23863;23864;23865 23860 3 AIQAYGMKPHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAK Oxidation (M) 4235.1031 0.10311481 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 1 1 2 2 1 1 2 161.89 161.89 4 5.8425E-100 168984 QUIQUE_DMIX7_190116_001 152.3 143.31 892620000 0 0 0 0 0 0 0 279630000 124600000 0 62869000 87422000 338100000 1996 3137;908 1854 18660;18661;18662;18663;18664;18665;18666;18667 23866;23867;23868;23869;23870;23871;23872;23873 23871 556;557 8 AIQAYGMKPHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAK Unmodified 4219.1082 0.10820019 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 1 1 2 1 166.62 166.62 4 7.3021E-184 168542 QUIQUE_DMIX1_190116_001 200.58 194.25 1415100000 0 0 0 0 0 0 0 317260000 482630000 0 615210000 0 0 1997 3137;908 1854 18668;18669;18670;18671 23874;23875;23876;23877 23874 4 AIQAYGMKPHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAK 2 Oxidation (M) 4251.098 0.09802943 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 2 1 1 155.98 155.98 4 7.8141E-10 150968 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.16 56.772 31788000 0 0 0 0 0 0 0 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protein yes no 0 0 0 1 1 1 129.2 129.2 2 0.00011328 133581 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.43 66.551 128480000 56557000 0 0 0 0 0 0 0 38870000 0 0 0 33051000 2001 4119 1857 18687;18688;18689 23894;23895;23896 23895 1 AIQDTNNLKR Unmodified 1171.6309 0.63093439 1309 J9JIC5;Q9HAS0 C17orf75 Protein Njmu-R1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 14.35 14.35 3 0.0083128 6581 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.49 38.283 60842000 8540400 8329800 0 0 0 0 0 18766000 25206000 0 0 0 0 2002 1309 1858 18690;18691;18692;18693 23897;23898;23899;23900 23900 4 AIQEWLK Unmodified 886.49125 0.49125301 3226 Q3LXA3;H0YCY6;I3L252 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 63.387 63.387 2 0.039576 63008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.614 35.372 255450000 35724000 0 0 0 54252000 0 0 61506000 0 0 56479000 47490000 0 2003 3226 1859 18694;18695;18696;18697;18698 23901;23902;23903;23904;23905;23906 23904 6 AIQGGTSHHLGQNFSK Unmodified 1680.8332 0.83321603 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 3 2 3 2 3 17.186 17.186 2;3;4 2.3352E-66 10198 QUIQUE_C1218_190116_001 202.25 166.59 3613000000 365150000 177710000 406750000 183240000 261670000 271690000 260660000 258320000 283350000 123630000 385490000 205740000 429570000 2004 1929 1860 18699;18700;18701;18702;18703;18704;18705;18706;18707;18708;18709;18710;18711;18712;18713;18714;18715;18716;18717;18718;18719;18720;18721;18722;18723;18724;18725;18726;18727;18728;18729 23907;23908;23909;23910;23911;23912;23913;23914;23915;23916;23917;23918;23919;23920;23921;23922;23923;23924;23925;23926;23927;23928;23929;23930;23931;23932;23933;23934;23935;23936;23937 23909 30 AIQILNEGASSEK Unmodified 1358.7042 0.70415892 4325 Q9NXC5 MIOS WD repeat-containing protein mio yes yes 0 0 0 1 51.619 51.619 2 0.033417 46743 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.056 31.803 0 0 0 0 0 0 0 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53.62 2 0.0070203 48644 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 54.027 29524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29524000 0 0 0 2008 1516 1864 18744;18745;18746 23953;23954;23955 23954 3 AIQLNPSYIR Unmodified 1173.6506 0.6506072 3962 Q99614;H0YB37 TTC1 Tetratricopeptide repeat protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 69.897 69.897 2 0.0052305 70785 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.192 44.549 101610000 0 0 0 0 45138000 0 0 0 0 0 27231000 0 29244000 2009 3962 1865 18747;18748;18749;18750;18751;18752 23956;23957;23958;23959;23960;23961;23962 23959 7 AIQLSGAEQLEALK Unmodified 1469.809 0.80895834 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 114.37 114.37 2 0.00076559 99241 QUIQUE_C1368_190116_001 87.667 56.173 136730000 0 0 0 0 0 0 136730000 0 0 0 0 0 0 2010 824 1866 18753;18754;18755 23963;23964;23965 23963 2 AIQLTYNPDESSKPNMIDAATLK Unmodified 2519.2578 0.25775419 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 99.139 99.139 2;3 5.5104E-17 101327 QUIQUE_C1403_190116_001 122.93 105.01 985420000 120090000 30476000 147710000 324490000 0 0 221580000 0 141070000 0 0 0 0 2011 710 1867 18756;18757;18758;18759;18760;18761;18762 23966;23967;23968;23969;23970;23971;23972;23973;23974 23971 9 AIQLTYNPDESSKPNMIDAATLK Oxidation (M) 2535.2527 0.25266881 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.269 84.269 3 1.3203E-10 86530 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.35 82.817 1012700000 0 26124000 67640000 171080000 105200000 0 60464000 90941000 98593000 100540000 151800000 0 140280000 2012 710 1867 18763;18764;18765;18766;18767;18768;18769;18770;18771;18772 23975;23976;23977;23978;23979;23980;23981;23982;23983;23984;23985;23986 23985 430 12 AIQTDFVQYQPDLDTILEK Unmodified 2236.1263 0.12632931 486 A0A3B3IRY9;O15079 SNPH Syntaphilin yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 144.26 144.26 2;3 4.2122E-36 150037 QUIQUE_C1218_190116_001 154.65 121.46 445950000 36733000 31909000 101330000 21686000 59449000 71241000 30133000 0 35768000 12672000 0 45028000 0 2013 486 1868 18773;18774;18775;18776;18777;18778;18779;18780;18781;18782;18783;18784;18785 23987;23988;23989;23990;23991;23992;23993;23994;23995;23996;23997;23998;23999 23987 12 AIQVFLLGGSR Unmodified 1159.6713 0.67134264 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 104.62 104.62 2 0.0045096 107827 QUIQUE_C1277_190116_001 90.15 61.001 24456000 0 24456000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2014 1492 1869 18786 24000 24000 0 AIRPQIDLK Unmodified 1052.6342 0.63422886 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 32.814 32.814 3 0.043832 28450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.819 25.355 109650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59721000 0 49927000 2015 2813 1870 18787;18788 24001;24002 24001 2 AISAANLHLR Unmodified 1064.6091 0.60907674 3381 Q6P2Q9 PRPF8 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 yes yes 0 0 0 1 1 38.923 38.923 3 0.0063958 35247 QUIQUE_C1576_190116_001 50.834 20.442 19425000 0 0 0 0 0 0 19425000 0 0 0 0 0 0 2016 3381 1871 18789;18790 24003;24004 24004 2 AISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLER Oxidation (M) 3377.6418 0.64178171 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 169.09 169.09 3 3.607E-25 176496 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.149 82.988 133690000 0 0 0 0 0 0 0 0 41470000 0 66514000 0 25705000 2017 3499 1872 18791;18792;18793 24005;24006;24007;24008 24006 2674 4 AISCMGQIICNLGDNLGSDLPNTLQIFLER Unmodified 3361.6469 0.64686709 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 0 1 173.98 173.98 3 2.4905E-19 181172 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.479 60.663 43139000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43139000 0 0 2018 3499 1872 18794 24009 24009 1 AISEELDHALNDMTSL Unmodified 1757.8142 0.81417965 435 A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.96 144.96 2 0.00019656 149777 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.93 0 636240000 51726000 66634000 68105000 0 69318000 61912000 0 65317000 71235000 0 59117000 63110000 59761000 2019 435 1873 18795;18796;18797;18798;18799;18800;18801;18802;18803;18804 24010;24011;24012;24013;24014;24015;24016;24017;24018;24019;24020 24017 10 AISEPNFSVAYANMCR Oxidation (M) 1844.8186 0.81855352 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 1 0 1 86.678 86.678 2 0.027577 87459 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.198 45.685 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2020 922 1874 18805 24021 24021 1 AISEPNFSVAYANMCR Unmodified 1828.8236 0.8236389 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 104.03 104.03 2 0.052079 109166 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.681 21.427 18820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18820000 0 0 2021 922 1874 18806 24022 24022 1 AISESGVALTSVLVK Unmodified 1472.845 0.84500949 2205 P23141;Q9UKY3 CES1;CES1P1 Liver carboxylesterase 1;Putative inactive carboxylesterase 4 yes no 0 0 0 1 102.17 102.17 2 0.018255 104746 QUIQUE_C1403_190116_001 47.815 26.945 32051000 0 0 0 32051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2022 2205 1875 18807 24023 24023 1 AISFVGSNK Unmodified 921.49198 0.4919813 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 33.692 33.692 1;2 3.8663E-18 28429 QUIQUE_C1563_190116_001 227.62 113.19 9786400000 848790000 877580000 955040000 801470000 1033000000 1032800000 957130000 846460000 0 484420000 0 973740000 975990000 2023 2870 1876 18808;18809;18810;18811;18812;18813;18814;18815;18816;18817;18818;18819 24024;24025;24026;24027;24028;24029;24030;24031;24032;24033;24034;24035;24036;24037;24038;24039;24040 24032 15 AISGLANFLVSEALSNALK Unmodified 1917.0571 0.057127534 4470 Q9UKA4 AKAP11 A-kinase anchor protein 11 yes yes 0 0 0 1 168.88 168.88 3 0.00016877 170795 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.521 48.837 12328000 0 0 0 0 0 0 0 12328000 0 0 0 0 0 2024 4470 1877 18820 24041 24041 1 AISGLTIDGHAVGAK Unmodified 1408.7674 0.76742787 4663 Q9Y6R7;A0A286YF91 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 60.094 60.094 3 0.017671 55629 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.897 29.301 24929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24929000 0 0 0 2025 4663 1878 18821 24042 24042 1 AISHEHSPSDLEAHFVPLVK Unmodified 2212.1277 0.12766671 2309 P30153;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 3 2 4 3 3 4 3 3 3 3 3 4 69.657 69.657 2;3;4;5 3.1375E-76 70141 QUIQUE_C1438_190116_001 193.9 179.13 8768300000 669990000 669520000 662140000 767040000 807030000 615740000 812500000 650180000 660220000 327650000 748220000 501740000 876280000 2026 2309 1879 18822;18823;18824;18825;18826;18827;18828;18829;18830;18831;18832;18833;18834;18835;18836;18837;18838;18839;18840;18841;18842;18843;18844;18845;18846;18847;18848;18849;18850;18851;18852;18853;18854;18855;18856;18857;18858;18859;18860;18861 24043;24044;24045;24046;24047;24048;24049;24050;24051;24052;24053;24054;24055;24056;24057;24058;24059;24060;24061;24062;24063;24064;24065;24066;24067;24068;24069;24070;24071;24072;24073;24074;24075;24076;24077;24078;24079;24080;24081;24082;24083;24084;24085;24086;24087;24088;24089;24090;24091;24092;24093;24094;24095;24096;24097;24098;24099 24060 54 AISKDHLYGTLDPNTR Unmodified 1799.9166 0.91661131 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 43.716 43.716 3 0.022304 40362 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.871 27.176 60892000 0 0 0 0 0 0 0 60892000 0 0 0 0 0 2027 3053 1880 18862 24100 24100 0 AISPDKDNFYFDVK Unmodified 1657.7988 0.79878758 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 82.442 82.442 2;3 0.0031232 83545 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.911 69.046 192840000 143070000 0 0 0 0 0 0 0 0 49766000 0 0 0 2028 2993 1881 18863;18864;18865 24101;24102;24103 24103 3 AISPDKDNFYFDVKDDFDFGTMGHVIR Unmodified 3148.46 0.46003582 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 132.32 132.32 5 5.7153E-06 138842 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.259 48.356 120950000 0 0 0 0 0 0 0 0 32857000 0 53632000 34460000 0 2029 2993 1882 18866;18867;18868 24104;24105;24106 24105 3 AISPTSATSSGR Unmodified 1133.5677 0.56766543 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.459 18.459 2 0.00023021 10882 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.973 60.327 695770000 70743000 81596000 66384000 70704000 79365000 68297000 82397000 40450000 37957000 17022000 0 33348000 47503000 2030 4607 1883 18869;18870;18871;18872;18873;18874;18875;18876;18877;18878;18879;18880;18881 24107;24108;24109;24110;24111;24112;24113;24114;24115;24116;24117;24118;24119;24120 24118 13 AISQGHQAFLLEGDSSSR Unmodified 1901.9232 0.92315325 1416 O00534;B4DHS6 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 55.169 55.169 2;3 0.0002403 53681 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.451 78.221 193020000 0 0 53002000 0 0 46696000 0 48075000 45251000 0 0 0 0 2031 1416 1884 18882;18883;18884;18885;18886;18887 24121;24122;24123;24124;24125;24126 24126 5 AISSASSPQSPGDALR Unmodified 1542.7638 0.76379906 3898 Q96KR1 ZFR Zinc finger RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 42.913 42.913 2 0.022887 39501 QUIQUE_C1403_190116_001 63.727 37.213 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2032 3898 1885 18888 24127 24127 1 AISSDMFFGR Unmodified 1129.5226 0.5226295 268 A0A0D9SF70;G5E9L0;Q8N6H7;E9PMU9;H0YDN9 ARFGAP2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 95.54 95.54 2 0.028173 98818 QUIQUE_C1576_190116_001 55.112 36.336 56925000 0 0 0 22674000 0 0 17499000 0 0 0 0 0 16752000 2033 268 1886 18889;18890;18891 24128;24129;24130 24129 3 AISSPTVSR Unmodified 916.49779 0.49779495 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.188 20.188 2 0.00046275 12896 QUIQUE_C1277_190116_001 116.73 34.942 5465900000 715120000 870590000 771990000 682170000 629380000 0 625090000 0 0 252460000 919040000 0 0 2034 1687 1887 18892;18893;18894;18895;18896;18897;18898;18899;18900 24131;24132;24133;24134;24135;24136;24137;24138;24139 24132 4 AISSSAISR Unmodified 890.48214 0.48214489 1068 F8WJN3;Q16630 CPSF6 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 19.395 19.395 2 0.01031 12396 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.301 40.298 69828000 0 0 0 0 46128000 0 0 0 23700000 0 0 0 0 2035 1068 1888 18901;18902 24140;24141 24141 2 AITEASPAH Unmodified 895.43995 0.43994572 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 1 15.808 15.808 2 0.0068332 7891 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.287 49.772 21052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21052000 0 0 0 2036 4184 1889 18903 24142 24142 1 AITGIQAFTASK Unmodified 1206.6608 0.66083754 3771 Q92947 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.606 70.606 2 0.00048287 70943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.55 88.772 720250000 35048000 57479000 57096000 46023000 84703000 0 0 109250000 103530000 0 0 115950000 111170000 2037 3771 1890 18904;18905;18906;18907;18908;18909;18910;18911;18912 24143;24144;24145;24146;24147;24148;24149;24150;24151 24148 9 AITHLNNNFMFGQK Unmodified 1633.8035 0.8034958 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 0 0 1 1 70.827 70.827 3 0.0013476 67975 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.886 72.354 300840000 0 0 211180000 0 0 0 0 0 0 89656000 0 0 0 2038 2082 1891 18913;18914 24152;24153 24153 0 AITHLNNNFMFGQK Oxidation (M) 1649.7984 0.79841043 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 1 0 2 1 1 58.302 58.302 2;3 0.00063088 56346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.327 60.618 141500000 0 0 0 0 0 0 0 75398000 26553000 39548000 0 0 0 2039 2082 1891 18915;18916;18917;18918 24154;24155;24156;24157 24154 1411 4 AITIAGIPQSIIECVK Unmodified 1711.9542 0.95424237 3131;1044 F8VZX2;H3BRU6;F8VXH9;Q15366 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 138.17 138.17 2;3 2.618E-19 140743 QUIQUE_C1563_190116_001 147.72 123.37 7988900000 532240000 597820000 684440000 618170000 648510000 596730000 546970000 575160000 773770000 198460000 763370000 724060000 729220000 2040 1044;3131 1892 18919;18920;18921;18922;18923;18924;18925;18926;18927;18928;18929;18930;18931;18932;18933;18934;18935;18936;18937 24158;24159;24160;24161;24162;24163;24164;24165;24166;24167;24168;24169;24170;24171;24172;24173;24174;24175;24176;24177;24178;24179;24180;24181;24182;24183;24184;24185;24186;24187;24188;24189;24190 24172 33 AITIAGR Unmodified 700.42317 0.42317345 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.824 22.824 2 0.020606 16263 QUIQUE_C1218_190116_001 107.65 57.116 1096200000 41568000 0 0 0 0 91810000 0 357650000 0 605170000 0 0 0 2041 3050 1893 18938;18939;18940;18941 24191;24192;24193;24194 24191 2 AITIAGVPQSVTECVK Unmodified 1671.8866 0.88655673 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 94.211 94.211 2 2.9458E-24 96367 QUIQUE_C1277_190116_001 151.26 151.26 9606200000 712830000 698270000 769370000 726260000 717210000 637870000 747980000 738180000 962540000 349760000 902470000 821900000 821510000 2042 3130 1894 18942;18943;18944;18945;18946;18947;18948;18949;18950;18951;18952;18953;18954;18955 24195;24196;24197;24198;24199;24200;24201;24202;24203;24204;24205;24206;24207;24208;24209;24210;24211;24212;24213;24214;24215;24216;24217;24218 24196 24 AITIANQTNCPLYITK Unmodified 1819.9502 0.95021962 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 3 2 3 3 2 3 4 3 4 3 3 4 4 88.937 88.937 2;3 4.5296E-66 90923 QUIQUE_C1218_190116_001 246.26 228.52 111070000000 9881300000 11321000000 8367200000 9752100000 10420000000 6653300000 9450900000 6923400000 7079900000 6603200000 9368100000 7793300000 7454500000 2043 365 1895 18956;18957;18958;18959;18960;18961;18962;18963;18964;18965;18966;18967;18968;18969;18970;18971;18972;18973;18974;18975;18976;18977;18978;18979;18980;18981;18982;18983;18984;18985;18986;18987;18988;18989;18990;18991;18992;18993;18994;18995;18996 24219;24220;24221;24222;24223;24224;24225;24226;24227;24228;24229;24230;24231;24232;24233;24234;24235;24236;24237;24238;24239;24240;24241;24242;24243;24244;24245;24246;24247;24248;24249;24250;24251;24252;24253;24254;24255;24256;24257;24258;24259;24260;24261;24262;24263;24264;24265;24266;24267;24268;24269;24270;24271;24272;24273;24274;24275;24276;24277;24278;24279 24220 57 AITIASQTNCPLYVTK Unmodified 1778.9237 0.92367052 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 3 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 81.555 81.555 2;3 7.4859E-36 82909 QUIQUE_C1403_190116_001 215.72 180.72 23009000000 1438200000 1483600000 1982000000 2066900000 1851700000 1460000000 2038700000 1407700000 2141800000 782280000 1816200000 1904100000 2635700000 2044 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QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.07 122.26 1169100000 109980000 0 61222000 93655000 168710000 112590000 69311000 87390000 120480000 0 97746000 87605000 160460000 2047 2880 1899 19017;19018;19019;19020;19021;19022;19023;19024;19025;19026;19027;19028 24312;24313;24314;24315;24316;24317;24318;24319;24320;24321;24322;24323;24324 24320 13 AITSAYYR Unmodified 943.47633 0.47633123 3168 Q15907;H3BMH2;H3BSC1;P62491 RAB11B;RAB11A Ras-related protein Rab-11B;Ras-related protein Rab-11A no no 0 0 0 1 1 1 31.743 31.743 2 0.014923 26784 QUIQUE_C1368_190116_001 85.359 71.688 351340000 0 0 351340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2048 3168 1900 19029;19030;19031 24325;24326;24327 24326 3 AITSGGITYQDQPWHADCFVCVTCSK Unmodified 3000.3204 0.32044758 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 111.79 111.79 3 7.7286E-70 114761 QUIQUE_DMIX7_190116_001 159.73 153.89 845490000 148630000 0 0 0 0 0 0 0 0 86537000 203480000 262800000 144050000 2049 3283 1901 19032;19033;19034;19035;19036;19037;19038 24328;24329;24330;24331;24332;24333;24334;24335;24336;24337;24338;24339 24336 12 AITTGLQEYVEAVSFQHFIK Unmodified 2280.179 0.17903358 3961 Q99598;C4P0D6;C4P0D8;Q5VVQ1 TSNAX;DISC1 Translin-associated protein X yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 146.4 146.4 2;3 3.0973E-30 152506 QUIQUE_C1218_190116_001 123.41 104.62 2609200000 164060000 165740000 0 355290000 220320000 230610000 154440000 276430000 251580000 74199000 262590000 175490000 278480000 2050 3961 1902 19039;19040;19041;19042;19043;19044;19045;19046;19047;19048;19049;19050;19051;19052;19053 24340;24341;24342;24343;24344;24345;24346;24347;24348;24349;24350;24351;24352;24353;24354;24355;24356;24357;24358;24359 24341 20 AITTSLTTK Unmodified 934.53351 0.53351176 4334 Q9NYU2;F8WCI2;F8WCE6 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 27.22 27.22 2 0.048831 21268 QUIQUE_C1218_190116_001 51.066 22.538 31930000 31930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2051 4334 1903 19054 24360 24360 1 AITVFSPDGHLFQVEYAQEAVK Unmodified 2448.2325 0.23252572 1448 O14818;Q8TAA3;F5GY34 PSMA7;PSMA8 Proteasome subunit alpha type-7;Proteasome subunit alpha type-7-like yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 2 127.53 127.53 2;3 8.7229E-77 133324 QUIQUE_DMIX5_190116_001 220.61 192.32 4961300000 423960000 514530000 580320000 518020000 374080000 388780000 369730000 241040000 319840000 148320000 398010000 282060000 402650000 2052 1448 1904 19055;19056;19057;19058;19059;19060;19061;19062;19063;19064;19065;19066;19067;19068;19069;19070;19071;19072;19073;19074;19075 24361;24362;24363;24364;24365;24366;24367;24368;24369;24370;24371;24372;24373;24374;24375;24376;24377;24378;24379;24380;24381;24382;24383;24384;24385;24386;24387;24388;24389;24390;24391 24386 31 AITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKK Unmodified 2576.3275 0.32748873 1448 O14818;Q8TAA3;F5GY34 PSMA7;PSMA8 Proteasome subunit alpha type-7;Proteasome subunit alpha type-7-like yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 110.41 110.41 3;4 1.8837E-12 113474 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.19 87.633 1901800000 53289000 63376000 62398000 52440000 78274000 36835000 66972000 301960000 233100000 0 448380000 263440000 241380000 2053 1448 1905 19076;19077;19078;19079;19080;19081;19082;19083;19084;19085;19086;19087;19088;19089;19090;19091 24392;24393;24394;24395;24396;24397;24398;24399;24400;24401;24402;24403;24404;24405;24406;24407;24408;24409;24410;24411;24412;24413 24409 21 AIVAGDQNVEYK Unmodified 1305.6565 0.65648044 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0;A0A0D9SG53 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.207 40.207 2 4.5713E-06 37036 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.33 118.06 10230000000 1087600000 846960000 817420000 585210000 675310000 478680000 677890000 790010000 901140000 485450000 1027400000 1041200000 815600000 2054 3283 1906 19092;19093;19094;19095;19096;19097;19098;19099;19100;19101;19102;19103;19104;19105 24414;24415;24416;24417;24418;24419;24420;24421;24422;24423;24424;24425;24426;24427;24428;24429;24430;24431 24429 14 AIVAIENPADVSVISSR Unmodified 1739.9418 0.94176342 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 106.34 106.34 2;3 5.4908E-38 110797 QUIQUE_C1438_190116_001 165.7 144.66 6203200000 468890000 536160000 669900000 491800000 521920000 445970000 505990000 417100000 437560000 189460000 565100000 494600000 458710000 2055 225 1907 19106;19107;19108;19109;19110;19111;19112;19113;19114;19115;19116;19117;19118;19119;19120;19121;19122;19123;19124;19125 24432;24433;24434;24435;24436;24437;24438;24439;24440;24441;24442;24443;24444;24445;24446;24447;24448;24449;24450;24451;24452;24453;24454;24455;24456;24457;24458;24459;24460;24461;24462;24463;24464;24465;24466;24467 24443 36 AIVDALPPPCESACTVPTDVDK Unmodified 2354.1134 0.11339814 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 99.103 99.103 2;3 1.7538E-07 102121 QUIQUE_C1368_190116_001 77.681 61.584 654540000 182550000 0 132440000 114730000 113340000 0 111470000 0 0 0 0 0 0 2056 3120 1908 19126;19127;19128;19129;19130;19131;19132;19133;19134;19135 24468;24469;24470;24471;24472;24473;24474;24475;24476;24477;24478;24479;24480;24481;24482 24475 15 AIVDALPPPCESACTVPTDVDKWFHHQK Unmodified 3217.5325 0.53248926 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 1 2 2 2 3 3 2 1 1 1 1 114.45 114.45 3;4;5 1.5251E-15 118746 QUIQUE_C1368_190116_001 81.888 75.985 3261400000 356590000 337250000 395590000 359740000 642470000 0 474100000 61346000 0 0 137910000 149440000 346990000 2057 3120 1909 19136;19137;19138;19139;19140;19141;19142;19143;19144;19145;19146;19147;19148;19149;19150;19151;19152;19153 24483;24484;24485;24486;24487;24488;24489;24490;24491;24492;24493;24494;24495;24496;24497;24498;24499;24500;24501;24502;24503;24504;24505;24506;24507;24508;24509 24491 25 AIVDCGFEHPSEVQHECIPQAILGMDVLCQAK Unmodified 3650.699 0.69897902 3027 Q13838;Q5STU3;F6WLT2;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;F6R6M7;A0A0G2JHN7;F6U6E2;F6S2B7;F6QYI9;A0A0G2JJL7;K7EN69;K7ENP6;K7EL56;K7EIL8;F6SXL5 DDX39B;DDX39A Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 133.92 133.92 3;4 2.0737E-55 139685 QUIQUE_C1218_190116_001 138.9 134.22 2905700000 259550000 542620000 300050000 615690000 159480000 210070000 203300000 0 87320000 0 96847000 193530000 237190000 2058 3027 1910 19154;19155;19156;19157;19158;19159;19160;19161;19162;19163;19164;19165;19166;19167;19168;19169;19170 24510;24511;24512;24513;24514;24515;24516;24517;24518;24519;24520;24521;24522;24523;24524;24525;24526;24527;24528;24529;24530;24531;24532;24533;24534;24535 24511 25 AIVDCIISIIEENSESK Unmodified 1918.9558 0.95575851 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 170.15 170.15 2;3 2.6089E-23 174036 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.63 104.25 997980000 91813000 94543000 68553000 52822000 127090000 11849000 41253000 67370000 167720000 42527000 90612000 87087000 54738000 2059 4645 1911 19171;19172;19173;19174;19175;19176;19177;19178;19179;19180;19181;19182;19183;19184;19185;19186;19187;19188 24536;24537;24538;24539;24540;24541;24542;24543;24544;24545;24546;24547;24548;24549;24550;24551;24552;24553;24554;24555 24553 19 AIVDCIISIVEENPESK Unmodified 1914.9608 0.96084389 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 158.44 158.44 2;3 0.00021459 163005 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.077 41.285 94680000 0 0 0 0 0 29553000 0 0 0 7441800 26441000 16733000 14511000 2060 4396 1912 19189;19190;19191;19192;19193;19194;19195 24556;24557;24558;24559;24560;24561;24562 24561 7 AIVDVHFDPTTAFR Unmodified 1587.8045 0.80454166 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.15 113.15 3 5.7305E-05 115682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.09 83.144 388750000 19567000 0 0 0 36250000 23518000 22246000 62308000 65478000 0 64813000 51077000 43490000 2061 1408 1913 19196;19197;19198;19199;19200;19201;19202;19203;19204 24563;24564;24565;24566;24567;24568;24569;24570;24571;24572;24573;24574 24568 12 AIVFEIMEAGEPTGPILGAEALPGGLR Unmodified 2707.4255 0.42548822 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 2 1 164 164 3 1.6568E-09 166120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.423 57.977 340690000 0 0 0 0 0 0 0 143760000 0 0 0 100190000 96730000 2062 921 1914 19205;19206;19207;19208 24575;24576;24577;24578 24575 4 AIVLAAIFR Unmodified 972.61204 0.61203685 1211 H7BXY3;Q7L2E3 DHX30 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 118.11 118.11 2 0.01186 121885 QUIQUE_C1277_190116_001 72.138 46.402 4677600 0 4677600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2063 1211 1915 19209;19210;19211 24579;24580;24581 24579 3 AIVNVIGMHK Unmodified 1080.6114 0.61138492 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 46.192 46.192 2;3 0.0055939 43603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.706 38.843 113250000 20966000 16314000 0 0 0 0 0 28439000 15129000 0 32399000 0 0 2064 1644 1916 19212;19213;19214;19215;19216;19217 24582;24583;24584;24585;24586;24587 24584 6 AIVPILLDANVSTYDK Unmodified 1730.9455 0.94545182 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 130.99 130.99 2;3 1.1515E-06 137001 QUIQUE_C1218_190116_001 120.57 95.137 22750000000 2872800000 2606800000 2114600000 1808700000 1991600000 1330900000 2078900000 907060000 1058600000 1188800000 1811500000 1681400000 1298000000 2065 273;342 1917 19218;19219;19220;19221;19222;19223;19224;19225;19226;19227;19228;19229;19230;19231;19232;19233;19234;19235;19236;19237;19238;19239;19240;19241;19242 24588;24589;24590;24591;24592;24593;24594;24595;24596;24597;24598;24599;24600;24601;24602;24603;24604;24605;24606;24607;24608;24609;24610;24611;24612;24613;24614;24615;24616;24617;24618;24619;24620;24621;24622;24623;24624;24625;24626 24589 39 AIVPILLDANVSTYDKIR Unmodified 2000.1306 0.13062683 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 2 2 124.05 124.05 3 1.8088E-08 130356 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.04 101.44 487990000 0 0 0 0 0 0 0 0 91233000 0 242860000 153890000 0 2066 273;342 1918 19243;19244;19245;19246;19247;19248;19249 24627;24628;24629;24630;24631;24632;24633;24634 24632 7 AIVPLEAR Unmodified 867.5178 0.51780212 1445 O14776;G3V220 TCERG1 Transcription elongation regulator 1 yes no 0 0 0 1 46.115 46.115 2 0.063544 43417 QUIQUE_C1576_190116_001 52.403 27.771 15236000 0 0 0 0 0 0 15236000 0 0 0 0 0 0 2067 1445 1919 19250 24635 24635 1 AIVQDQGCLPGLILFMDHPNPPVVHSALLALR Unmodified 3490.8581 0.85812092 4310 Q9NVT9;E5RJ86;E9PR92;E5RHK3 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 155.71 155.71 4 7.148E-14 161076 QUIQUE_C1368_190116_001 68.516 66.703 1120500000 47846000 0 75908000 77627000 79314000 53426000 179590000 0 113630000 0 135940000 124240000 232980000 2068 4310 1920 19251;19252;19253;19254;19255;19256;19257;19258;19259;19260;19261 24636;24637;24638;24639;24640;24641;24642;24643;24644;24645;24646 24637 10 AIVQLVNER Unmodified 1040.5978 0.59784335 3110 Q15102;M0R389 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.636 52.636 2 0.0013568 49911 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.44 36.456 2614400000 607820000 0 0 0 197450000 0 157920000 580930000 339670000 91956000 167640000 248730000 222320000 2069 3110 1921 19262;19263;19264;19265;19266;19267;19268;19269;19270 24647;24648;24649;24650;24651;24652;24653;24654;24655;24656;24657;24658;24659;24660;24661 24661 13 AIVQQWLEYR Unmodified 1304.6877 0.68772099 1523 O43324;D6RBD7;C9J1V9;H0YAL7;D6RCQ0 EEF1E1;EEF1E1-BLOC1S5 Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.89 105.89 2 0.00033435 108845 QUIQUE_C1277_190116_001 133.86 94.841 543620000 57112000 59581000 64603000 61532000 0 54381000 64928000 50659000 0 26959000 103870000 0 0 2070 1523 1922 19271;19272;19273;19274;19275;19276;19277;19278;19279;19280;19281 24662;24663;24664;24665;24666;24667;24668;24669;24670;24671;24672;24673 24663 12 AIVSILNYVIYK Unmodified 1394.8173 0.81733818 3550 Q8IXQ6 PARP9 Poly [ADP-ribose] polymerase 9 yes yes 0 0 0 1 1 1 145.05 145.05 2 0.016673 152225 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.084 38.413 39872000 0 0 0 0 0 0 0 13842000 0 0 26030000 0 0 2071 3550 1923 19282;19283;19284 24674;24675;24676 24676 3 AIVTSEQSGETELK Unmodified 1490.7464 0.74641766 4717 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.25 20.25 3 0.0057593 13396 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.594 13.87 4483000000 0 540340000 436310000 0 0 241150000 0 490980000 659690000 0 797410000 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A0A087X2H1;Q9ULT8;H0YJD4 HECTD1 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 yes no 0 0 0 1 70.443 70.443 2 0.06398 71695 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.299 24.192 10985000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10985000 0 0 2075 123 1927 19309 24703 24703 1 AIWAALQTQTSNAAK Unmodified 1572.826 0.82600539 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 84.686 84.686 2 0.006127 87004 QUIQUE_C1218_190116_001 93.345 78.655 119470000 35339000 0 0 0 0 0 0 30340000 38186000 15602000 0 0 0 2076 4334 1928 19310;19311;19312;19313 24704;24705;24706;24707 24704 2 AIWGYCDQLK Unmodified 1252.591 0.59104341 3915 Q96P70 IPO9 Importin-9 yes yes 0 0 0 1 85.373 85.373 2 0.044864 86884 QUIQUE_C1277_190116_001 49.536 35.329 26776000 0 26776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2077 3915 1929 19314 24708 24708 1 AIWHAFTALDQDHSGK Unmodified 1795.8642 0.86418181 4425 Q9UH65;E7EMB1;E9PJK8 SWAP70 Switch-associated protein 70 yes no 0 0 0 1 1 71.179 71.179 3 0.0035605 70308 QUIQUE_C1563_190116_001 31.319 17.603 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Unmodified 1097.5869 0.58694431 4306 Q9NVH1;B1AK20;Q5TH61 DNAJC11 DnaJ homolog subfamily C member 11 yes no 0 0 1 1 1 47.452 47.452 3 0.0076297 44356 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.729 36.895 24590000 0 0 0 0 0 0 0 24590000 0 0 0 0 0 2083 4306 1935 19363;19364 24762;24763 24762 2 AIYDTPCIQAESEK Unmodified 1623.745 0.74503745 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.255 67.255 2 1.0362E-06 66651 QUIQUE_C1403_190116_001 145.55 124.68 747020000 71178000 81398000 86563000 90701000 69603000 55166000 90989000 0 32055000 29073000 47551000 41446000 51300000 2084 1389 1936 19365;19366;19367;19368;19369;19370;19371;19372;19373;19374;19375;19376 24764;24765;24766;24767;24768;24769;24770;24771;24772;24773;24774;24775;24776;24777 24768 13 AIYFDGDFGQIVR Unmodified 1499.7409 0.74087877 3932 Q96RP9;C9IZ01;F8WAU4 GFM1 Elongation factor G, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 126.85 126.85 2 0.026807 131458 QUIQUE_C1218_190116_001 58.37 21.258 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21.309 21.309 3 0.030483 14313 QUIQUE_C1218_190116_001 35.35 21.946 21840000 21840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2093 2953 1945 19431 24834 24834 1 AKDELSAQAEVK Unmodified 1287.667 0.66704513 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 19.095 19.095 2 0.045282 11419 QUIQUE_C1277_190116_001 68.676 42.571 101970000 0 101970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2094 1472 1946 19432 24835 24835 1 AKDELSAQAEVKK Unmodified 1415.762 0.76200815 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 12.849 12.849 3 0.0015786 4932 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.01 43.443 86960000 0 0 0 0 0 0 0 10073000 13113000 0 0 60539000 3234900 2095 1472 1947 19433;19434;19435;19436 24836;24837;24838;24839 24838 3 AKDEQSAVSMLK Oxidation (M) 1321.6548 0.65476588 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 19.217 19.217 2;3 4.6953E-13 11621 QUIQUE_C1368_190116_001 163.59 132.06 9808200000 430660000 1150600000 855580000 560140000 867850000 642670000 670010000 919170000 563600000 636190000 757220000 1062000000 692510000 2096 2851 1948 19437;19438;19439;19440;19441;19442;19443;19444;19445;19446;19447;19448;19449;19450;19451;19452;19453;19454;19455;19456;19457 24840;24841;24842;24843;24844;24845;24846;24847;24848;24849;24850;24851;24852;24853;24854;24855;24856;24857;24858;24859;24860 24843 2279 18 AKDEQSAVSMLK Unmodified 1305.6599 0.65985126 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 30.535 30.535 2;3 1.0908E-44 24548 QUIQUE_C1368_190116_001 201 148.06 7031000000 1057600000 989650000 1032500000 882140000 453870000 691540000 587240000 165040000 594980000 68444000 263500000 0 244600000 2097 2851 1948 19458;19459;19460;19461;19462;19463;19464;19465;19466;19467;19468;19469;19470;19471;19472;19473;19474;19475 24861;24862;24863;24864;24865;24866;24867;24868;24869;24870;24871;24872;24873;24874;24875;24876;24877;24878;24879 24867 19 AKDEQSAVSMLKK Oxidation (M) 1449.7497 0.7497289 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 2 1 1 1 5 2 2 1 14.089 14.089 2;3;4 3.1751E-05 6287 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.49 104.82 2344200000 0 0 0 11755000 0 0 0 284820000 976180000 0 268120000 529000000 274340000 2098 2851 1949 19476;19477;19478;19479;19480;19481;19482;19483;19484;19485;19486;19487;19488 24880;24881;24882;24883;24884;24885;24886;24887;24888;24889;24890;24891;24892 24884 2279 8 AKDGLVVFGK Unmodified 1032.5968 0.59678072 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 1 1 38.463 38.463 2 0.033668 35116 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.867 74.241 380420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 380420000 0 0 2099 2941 1950 19489 24893 24893 0 AKDHGLEVLGLVR Unmodified 1405.8041 0.80414773 3834 Q96DE0 NUDT16 U8 snoRNA-decapping enzyme yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.325 64.325 3 0.0030472 63841 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.277 52.024 524610000 35223000 54248000 53554000 0 43804000 44803000 35815000 71810000 73617000 19662000 0 54445000 37631000 2100 3834 1951 19490;19491;19492;19493;19494;19495;19496;19497;19498;19499;19500 24894;24895;24896;24897;24898;24899;24900;24901;24902;24903;24904;24905;24906;24907 24903 13 AKDINQEVYNFLATAGAK Unmodified 1952.0003 0.0003409361 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 125.56 125.56 2;3 6.6444E-29 129651 QUIQUE_DMIX8_190116_001 183 160.94 3108800000 98262000 0 110220000 0 0 0 135080000 545140000 491930000 37563000 694450000 346270000 649910000 2101 3975 1952 19501;19502;19503;19504;19505;19506;19507;19508;19509;19510;19511 24908;24909;24910;24911;24912;24913;24914;24915;24916;24917;24918;24919;24920 24920 9 AKDPFAHLPK Unmodified 1122.6186 0.61857879 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 26.019 26.019 3 0.0032386 21085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.486 46.345 2735700000 294510000 527610000 358360000 0 0 0 0 453150000 0 0 750090000 351950000 0 2102 2255 1953 19512;19513;19514;19515;19516;19517 24921;24922;24923;24924;24925;24926;24927;24928 24926 8 AKDQDILDLVGVLHDPETLLR Unmodified 2359.2747 0.27472488 483 F5H345;A0A3B3IRR1;A0A3F2YNY7;P08397 HMBS Porphobilinogen deaminase yes no 0 0 1 1 150.77 150.77 4 9.8644E-05 156543 QUIQUE_C1368_190116_001 63.056 48.596 45542000 0 0 45542000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2103 483 1954 19518 24929 24929 1 AKDQNESLDEEMFYK Unmodified 1845.8091 0.80909427 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 66.399 66.399 2;3 8.0288E-60 66361 QUIQUE_DMIX3_190116_001 231.06 206.21 289790000 0 42897000 29842000 0 0 0 21215000 38660000 46872000 0 91957000 18344000 0 2104 3800 1955 19519;19520;19521;19522;19523;19524;19525;19526;19527 24930;24931;24932;24933;24934;24935;24936;24937;24938 24935 9 AKEALELTDTGLLSGSEER Unmodified 2018.0168 0.016778861 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 1 86.562 86.562 3 0.06071 89893 QUIQUE_DMIX5_190116_001 30.288 15.594 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24942;24943;24944;24945;24946;24947;24948;24949;24950;24951;24952;24953;24954;24955;24956;24957;24958;24959;24960;24961;24962;24963;24964;24965;24966;24967;24968;24969;24970 24947 26 AKEEQQDDTVYMGK Unmodified 1640.7352 0.73520105 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 21.334 21.334 2;3 2.5516E-149 14260 QUIQUE_DMIX5_190116_001 262.11 241.28 402090000 51282000 49214000 66487000 0 0 0 39808000 0 49324000 0 74466000 0 71505000 2108 890;3052 1959 19553;19554;19555;19556;19557;19558;19559;19560;19561;19562;19563;19564 24971;24972;24973;24974;24975;24976;24977;24978;24979;24980;24981;24982;24983 24981 12 AKEEQQDDTVYMGK Oxidation (M) 1656.7301 0.73011567 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 1 1 1 1 1 1 2 2 14.793 14.793 2;3 2.1629E-27 7155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.61 159.91 343920000 0 0 0 0 0 34415000 0 29691000 52799000 21569000 126140000 0 79310000 2109 890;3052 1959 19565;19566;19567;19568;19569;19570;19571;19572 24984;24985;24986;24987;24988;24989;24990;24991 24988 525 8 AKEFTNVYIK Unmodified 1211.655 0.65502388 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;H0YBN4;B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;H0YCC8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 36.4 36.4 2 0.003841 32170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.29 55.322 309750000 0 0 0 37280000 0 0 38942000 48654000 71474000 0 113400000 0 0 2110 2031;596 1960 19573;19574;19575;19576;19577 24992;24993;24994;24995;24996 24995 4 AKEILQEEEDLAEIVQLVGK Unmodified 2253.2104 0.21039329 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 3 2 154.19 154.19 2;3 3.2341E-100 161287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 240.29 221.46 7071400000 302060000 464580000 367890000 277460000 557580000 250630000 432830000 714580000 902340000 67222000 1148600000 838720000 746850000 2111 2414 1961 19578;19579;19580;19581;19582;19583;19584;19585;19586;19587;19588;19589;19590;19591;19592;19593;19594;19595;19596;19597;19598;19599 24997;24998;24999;25000;25001;25002;25003;25004;25005;25006;25007;25008;25009;25010;25011;25012;25013;25014;25015;25016;25017;25018;25019;25020;25021;25022;25023;25024;25025;25026;25027;25028;25029;25030;25031;25032 25023 36 AKELDPTNMTYITNQAAVYFEK Unmodified 2546.2363 0.23629047 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 1 1 133.12 133.12 3 0.010865 139983 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.79 28.758 52365000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52365000 0 0 2112 2343 1962 19600 25033 25033 1 AKELNVMFIETSAK Unmodified 1579.828 0.82797922 2167 P20340 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes yes 0 0 1 1 76.581 76.581 3 0.0016708 76487 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.657 44.029 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2113 2167 1963 19601 25034 25034 1 AKEPTKLADVYQAELR Unmodified 1830.984 0.98396259 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 1 55.528 55.528 2 9.3612E-16 54818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.27 141.64 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2114 389;395;1336 1964 19602 25035 25035 1 AKEVLEEISCYPENNDAK Unmodified 2107.9732 0.97319949 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 1 1 1 1 1 1 67.901 67.901 3 0.0060868 67816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.965 40.846 182260000 0 0 33269000 0 0 0 0 32365000 43790000 0 35933000 0 36903000 2115 472;1460 1965 19603;19604;19605;19606;19607 25036;25037;25038;25039;25040 25038 4 AKFDGIFESLLPINGLLSGDK Unmodified 2233.1994 0.19943467 4394 Q9UBC2;M0R165 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.31 163.31 3 0.0015867 167770 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.645 42.826 279830000 17679000 33186000 25932000 18243000 24450000 7906500 0 60223000 92209000 0 0 0 0 2116 4394 1966 19608;19609;19610;19611;19612;19613;19614;19615 25041;25042;25043;25044;25045;25046;25047;25048 25048 8 AKFEELNMDLFR Unmodified 1511.7442 0.74424959 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.56 107.56 3 0.00035433 111009 QUIQUE_C1368_190116_001 100.04 85.351 2626700000 207470000 231700000 207480000 199300000 227280000 231070000 255890000 171250000 213600000 72244000 354110000 255280000 0 2117 2007 1967 19616;19617;19618;19619;19620;19621;19622;19623;19624;19625;19626;19627 25049;25050;25051;25052;25053;25054;25055;25056;25057;25058;25059;25060;25061;25062 25052 13 AKFEELNMDLFR Oxidation (M) 1527.7392 0.73916421 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 1 1 1 85.34 85.34 3 0.044887 85674 QUIQUE_C1563_190116_001 45.28 29.142 31963000 0 0 0 0 0 31963000 0 0 0 0 0 0 0 2118 2007 1967 19628 25063 25063 1286 1 AKFPEHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIK Oxidation (M) 3327.7095 0.70945057 2405 P36959 GMPR GMP reductase 1 yes yes 0 1 1 1 160.31 160.31 4 1.6581E-05 162830 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175450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.183 52.883 235020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 169190000 65825000 0 2122 612 1970 19637;19638;19639 25072;25073;25074 25072 3 AKGQALPDVVAK Unmodified 1195.6925 0.69247202 1665 O75891;C9IZ36;C9JYZ6;C9JY00;D6RFJ7 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 25.857 25.857 2 0.033508 19756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.214 44.635 30511000 0 0 0 0 0 0 0 30511000 0 0 0 0 0 2123 1665 1971 19640 25075 25075 1 AKIELLGSYDPQK Unmodified 1460.7875 0.78749461 2231 P24666 ACP1 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase yes yes 0 0 1 1 66.467 66.467 3 0.043968 66075 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.343 31.765 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2124 2231 1972 19641 25076 25076 1 AKIMLDNMR Oxidation (M) 1106.5576 0.55763479 2937 Q0VDG4 SCRN3 Secernin-3 yes yes 0 1 1 1 93.302 93.302 1 0.044315 95237 QUIQUE_C1403_190116_001 55.902 15.4 47463000 0 0 0 47463000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2125 2937 1973 19642 25077 25077 1 AKLDENSAFLQFNWK Unmodified 1809.905 0.90498399 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A1B0GV13;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 111.66 111.66 2;3 2.2246E-17 116477 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.84 146.39 329030000 0 0 0 0 0 0 0 109850000 0 30971000 188220000 0 0 2126 267;275;3025 1974 19643;19644;19645 25078;25079;25080;25081 25081 4 AKLEEQAQQIR Unmodified 1312.7099 0.709913 1822 P02649 APOE Apolipoprotein E yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 20.819 20.819 2;3 1.3313E-07 13562 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.58 137.05 5980800000 324730000 359580000 393380000 232100000 401070000 336470000 386660000 439270000 1173800000 0 796520000 552870000 584370000 2127 1822 1975 19646;19647;19648;19649;19650;19651;19652;19653;19654;19655;19656;19657;19658;19659;19660;19661;19662;19663;19664;19665;19666;19667;19668 25082;25083;25084;25085;25086;25087;25088;25089;25090;25091;25092;25093;25094;25095;25096;25097;25098;25099;25100;25101;25102;25103;25104 25099 15 AKLEETITQAR Unmodified 1258.6881 0.68811492 2640 P54289;H0Y715 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.747 27.747 2 0.0033848 21549 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.74 74.394 592170000 0 117370000 90951000 0 0 0 0 94888000 85331000 0 104690000 98936000 0 2128 2640 1976 19669;19670;19671;19672;19673;19674;19675;19676 25105;25106;25107;25108;25109;25110;25111;25112;25113;25114 25111 9 AKLEQLFQDEVAK Unmodified 1517.809 0.80895834 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 80.688 80.688 2;3 7.2351E-12 82375 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.98 151.28 6551100000 122740000 165930000 410290000 86189000 433770000 92335000 393100000 1129800000 1086800000 0 1061000000 847000000 722130000 2129 3117 1977 19677;19678;19679;19680;19681;19682;19683;19684;19685;19686;19687;19688;19689;19690;19691;19692;19693;19694;19695;19696;19697 25115;25116;25117;25118;25119;25120;25121;25122;25123;25124;25125;25126;25127;25128;25129;25130;25131;25132;25133;25134;25135;25136;25137;25138;25139 25128 24 AKNEILDEVISLSQVTPK Unmodified 1983.0888 0.088821592 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 135.77 135.77 2;3 1.6122E-22 140527 QUIQUE_C1368_190116_001 173.36 162.88 4204200000 272700000 302240000 282730000 246740000 402700000 178060000 387390000 235270000 375990000 110610000 593030000 370020000 446690000 2130 831;1569 1978 19698;19699;19700;19701;19702;19703;19704;19705;19706;19707;19708;19709;19710;19711;19712;19713;19714;19715;19716;19717;19718;19719;19720;19721;19722;19723 25140;25141;25142;25143;25144;25145;25146;25147;25148;25149;25150;25151;25152;25153;25154;25155;25156;25157;25158;25159;25160;25161;25162;25163;25164;25165;25166;25167;25168;25169;25170;25171;25172 25147 33 AKPAEAPAAAAPK Unmodified 1191.6612 0.66117189 2404 P36957;Q86SW4 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 10.458 10.458 3 0.0010272 3206 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.089 47.61 736310000 53261000 0 0 74481000 0 0 13676000 0 116480000 219420000 0 230110000 28882000 2131 2404 1979 19724;19725;19726;19727;19728;19729;19730 25173;25174;25175;25176;25177;25178;25179 25177 5 AKPLTDQEK Acetyl (Protein N-term) 1070.5608 0.56078914 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 1 0 1 1 19.716 19.716 2 0.046268 12245 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.691 45.489 19599000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19599000 0 0 0 2132 948 1980 19731 25180 25180 1 AKPLTDSEKR Acetyl (Protein N-term) 1185.6354 0.63535107 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 1 0 2 1 1 1 1 1 14.105 14.105 3 0.0017567 6262 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.75 62.122 1666500000 0 0 0 0 11889000 313750000 0 679040000 374510000 0 0 287300000 0 2133 2016 1981 19732;19733;19734;19735;19736 25181;25182;25183;25184;25185 25185 2 AKPSAPVVSGPAAR Unmodified 1306.7357 0.73573382 2803 P78324;Q5TFQ8 SIRPA;SIRPB1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1;Signal-regulatory protein beta-1 isoform 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 19.198 19.198 2;3 0.0043899 11771 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.692 67.862 2824100000 205460000 635660000 282680000 0 0 201460000 963850000 0 0 301720000 233300000 0 0 2134 2803 1982 19737;19738;19739;19740;19741;19742;19743;19744;19745 25186;25187;25188;25189;25190;25191;25192;25193;25194 25192 5 AKPSPAPPSTTTAPDASGPQK Unmodified 2005.0116 0.011633904 2429 P40855;Q5QNY5;B7Z8B3;E9PS71 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 21.908 21.908 3 5.3222E-12 15413 QUIQUE_C1218_190116_001 79.942 71.472 282510000 66210000 0 0 44237000 0 54319000 73626000 0 0 0 0 44116000 0 2135 2429 1983 19746;19747;19748;19749;19750 25195;25196;25197;25198;25199 25195 5 AKPYEGSILEADCDILIPAASEK Unmodified 2489.236 0.23595611 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 114.21 114.21 2;3 2.9698E-99 118282 QUIQUE_C1368_190116_001 216.3 203.38 41447000000 3613700000 3219100000 4621400000 3808000000 3986800000 3682800000 3497900000 2026500000 2068500000 1135800000 3650600000 2914500000 3221400000 2136 1777 1984 19751;19752;19753;19754;19755;19756;19757;19758;19759;19760;19761;19762;19763;19764;19765;19766;19767;19768;19769;19770;19771;19772;19773;19774;19775;19776 25200;25201;25202;25203;25204;25205;25206;25207;25208;25209;25210;25211;25212;25213;25214;25215;25216;25217;25218;25219;25220;25221;25222;25223;25224;25225;25226;25227;25228;25229;25230;25231;25232;25233;25234;25235;25236;25237;25238;25239;25240;25241;25242;25243;25244;25245;25246;25247;25248;25249 25212 50 AKTDHGAEIVYK Unmodified 1330.6881 0.68811492 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 13.323 13.323 2;3 1.6614E-05 6005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.45 95.85 1123100000 0 8281200 0 3914100 0 773520 0 831270000 102500000 9464900 0 128020000 38844000 2137 291;1247 1985 19777;19778;19779;19780;19781;19782;19783;19784;19785;19786;19787 25250;25251;25252;25253;25254;25255;25256;25257;25258;25259;25260;25261;25262 25255 12 AKVDFILLK Unmodified 1045.6536 0.65356732 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 1 1 73.053 73.053 2 0.0035473 73790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.11 75.55 613970000 0 0 0 0 0 0 0 251340000 153540000 0 0 209080000 0 2138 3753 1986 19788;19789;19790 25263;25264;25265 25263 3 AKWDAWNALGSLPK Unmodified 1555.8147 0.81471242 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63;F8W6J1 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 112.3 112.3 3 0.042915 114597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.008 40.903 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2139 236 1987 19791 25266 25266 1 AKWDAWNELK Unmodified 1259.6299 0.62987176 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 72.869 72.869 2;3 0.0053012 73228 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.82 82.826 1979600000 0 0 0 0 145050000 0 0 251110000 717630000 0 0 293280000 572540000 2140 1914 1988 19792;19793;19794;19795;19796;19797 25267;25268;25269;25270;25271;25272 25269 4 AKWEAWNLK Unmodified 1144.6029 0.60292873 3608 Q8N6N7 ACBD7 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 7 yes yes 0 0 1 1 1 57.919 57.919 3 0.01241 57567 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.089 39.907 16807000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16807000 0 0 2141 3608 1989 19798;19799 25273;25274 25274 2 AKWEMPFDPQDTHQSR Unmodified 1971.8897 0.88974463 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 1 2 2 2 67.066 67.066 2;3;4 0.00074778 67632 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.883 45.043 207300000 0 0 0 0 0 0 0 48209000 0 0 55376000 0 103710000 2142 1800 1990 19800;19801;19802;19803;19804;19805 25275;25276;25277;25278;25279;25280 25277 6 AKWYPEVR Unmodified 1047.5502 0.55016488 2776 P63000 RAC1 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 no no 0 0 1 1 34.628 34.628 3 0.041527 30299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.603 33.446 45462000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45462000 0 0 2143 2776 1991 19806 25281 25281 1 AKYPDYEVTWANDGY Unmodified 1790.7788 0.77878042 4277 Q9NRX4 PHPT1 14 kDa phosphohistidine phosphatase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 106.59 106.59 2 5.6069E-08 109664 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.42 115.06 568630000 0 81893000 89055000 44741000 97761000 58262000 0 0 196920000 0 0 0 0 2144 4277 1992 19807;19808;19809;19810;19811;19812;19813 25282;25283;25284;25285;25286;25287;25288 25287 6 ALAAAAAAAAAGVSQAAVLGFLQEHGGK Acetyl (Protein N-term) 2562.3554 0.35543482 3214 Q2M3V2 SOWAHA Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHA yes yes 1 0 0 1 1 1 175.02 175.02 3 1.1211E-12 180718 QUIQUE_C1438_190116_001 69.639 63.296 14746000 0 0 0 0 6878900 0 0 7866700 0 0 0 0 0 2145 3214 1993 19814;19815;19816 25289;25290;25291 25290 3 ALAAAGYDVEK Unmodified 1106.5608 0.56078914 1996 P22492;P16403;Q02539;P10412;P16402 HIST1H1T;HIST1H1C;HIST1H1A;HIST1H1E;HIST1H1D Histone H1t;Histone H1.2;Histone H1.1;Histone H1.4;Histone H1.3 yes no 0 0 0 1 1 1 41.263 41.263 2 0.0010651 36920 QUIQUE_C1563_190116_001 105.4 66.374 168070000 0 24525000 0 0 0 110580000 0 0 0 32972000 0 0 0 2146 1996 1994 19817;19818;19819 25292;25293;25294 25293 2 ALAAELNQLR Unmodified 1097.6193 0.61930707 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 8 14 16 14 10 15 11 13 14 11 12 11 14 118.26 118.26 1;2;3 1.9722E-39 69747 QUIQUE_C1576_190116_001 219.72 182.16 782140000000 55117000000 59865000000 65252000000 64491000000 57984000000 64166000000 58055000000 62214000000 57396000000 53661000000 56902000000 62593000000 64445000000 2147 389;395;1336 1995 19820;19821;19822;19823;19824;19825;19826;19827;19828;19829;19830;19831;19832;19833;19834;19835;19836;19837;19838;19839;19840;19841;19842;19843;19844;19845;19846;19847;19848;19849;19850;19851;19852;19853;19854;19855;19856;19857;19858;19859;19860;19861;19862;19863;19864;19865;19866;19867;19868;19869;19870;19871;19872;19873;19874;19875;19876;19877;19878;19879;19880;19881;19882;19883;19884;19885;19886;19887;19888;19889;19890;19891;19892;19893;19894;19895;19896;19897;19898;19899;19900;19901;19902;19903;19904;19905;19906;19907;19908;19909;19910;19911;19912;19913;19914;19915;19916;19917;19918;19919;19920;19921;19922;19923;19924;19925;19926;19927;19928;19929;19930;19931;19932;19933;19934;19935;19936;19937;19938;19939;19940;19941;19942;19943;19944;19945;19946;19947;19948;19949;19950;19951;19952;19953;19954;19955;19956;19957;19958;19959;19960;19961;19962;19963;19964;19965;19966;19967;19968;19969;19970;19971;19972;19973;19974;19975;19976;19977;19978;19979;19980;19981;19982 25295;25296;25297;25298;25299;25300;25301;25302;25303;25304;25305;25306;25307;25308;25309;25310;25311;25312;25313;25314;25315;25316;25317;25318;25319;25320;25321;25322;25323;25324;25325;25326;25327;25328;25329;25330;25331;25332;25333;25334;25335;25336;25337;25338;25339;25340;25341;25342;25343;25344;25345;25346;25347;25348;25349;25350;25351;25352;25353;25354;25355;25356;25357;25358;25359;25360;25361;25362;25363;25364;25365;25366;25367;25368;25369;25370;25371;25372;25373;25374;25375;25376;25377;25378;25379;25380;25381;25382;25383;25384;25385;25386;25387;25388;25389;25390;25391;25392;25393;25394;25395;25396;25397;25398;25399;25400;25401;25402;25403;25404;25405;25406;25407;25408;25409;25410;25411;25412;25413;25414;25415;25416;25417;25418;25419;25420;25421;25422;25423;25424;25425;25426;25427;25428;25429;25430;25431;25432;25433;25434;25435;25436;25437;25438;25439;25440;25441;25442;25443;25444;25445;25446;25447;25448;25449;25450;25451;25452;25453;25454;25455;25456;25457;25458;25459;25460;25461;25462;25463;25464;25465;25466;25467;25468;25469;25470;25471;25472;25473;25474;25475;25476;25477;25478;25479;25480;25481;25482;25483;25484;25485;25486;25487;25488;25489;25490;25491;25492;25493;25494;25495;25496;25497;25498;25499;25500;25501;25502;25503;25504;25505;25506;25507;25508;25509;25510;25511;25512;25513;25514;25515;25516;25517;25518;25519;25520;25521;25522;25523;25524;25525;25526;25527;25528;25529;25530;25531;25532;25533;25534;25535;25536;25537;25538;25539;25540;25541;25542;25543;25544;25545;25546;25547;25548;25549;25550;25551;25552;25553;25554;25555;25556;25557;25558;25559;25560;25561;25562;25563;25564;25565;25566;25567;25568;25569;25570;25571;25572;25573;25574;25575;25576;25577;25578;25579;25580;25581;25582;25583;25584;25585;25586;25587;25588;25589;25590;25591;25592;25593;25594;25595;25596;25597;25598;25599;25600;25601;25602;25603;25604;25605;25606;25607;25608;25609;25610;25611;25612;25613;25614;25615;25616;25617;25618;25619;25620;25621 25447 302 ALAAFLK Unmodified 732.45341 0.45341094 2417 P39019;M0R2L9;M0QXK4;M0QYF7;M0R140 RPS19 40S ribosomal protein S19 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61.109 61.109 2 0.043299 60767 QUIQUE_C1277_190116_001 80.377 21.717 341430000 0 61397000 0 0 0 0 0 0 89389000 0 66238000 54604000 69802000 2148 2417 1996 19983;19984;19985;19986;19987 25622;25623;25624;25625;25626;25627 25622 6 ALAAGGVGSIVR Unmodified 1069.6244 0.62439245 1503 O15511 ARPC5 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.57 54.57 2 0.0041263 52516 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.1 35.292 3470600000 0 0 417600000 375170000 371420000 0 360720000 307250000 336830000 152680000 402460000 308770000 437660000 2149 1503 1997 19988;19989;19990;19991;19992;19993;19994;19995;19996;19997 25628;25629;25630;25631;25632;25633;25634;25635;25636;25637 25633 10 ALAAPAAEEKEEAR Unmodified 1454.7365 0.73652168 2859 Q01650 SLC7A5 Large neutral amino acids transporter small subunit 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 19.828 19.828 2;3 0.00025235 12685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.234 60.215 539660000 0 0 44404000 127030000 0 0 0 0 154610000 0 117950000 0 95657000 2150 2859 1998 19998;19999;20000;20001;20002;20003;20004 25638;25639;25640;25641;25642;25643;25644 25643 7 ALAAQLPVLPR Unmodified 1147.7077 0.70772815 3860 Q96GK7;C9JGM0 FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.29 90.29 2 0.00043381 92593 QUIQUE_C1368_190116_001 134.15 98.794 774650000 72270000 75763000 84884000 60698000 66089000 74159000 73544000 0 61078000 33845000 62097000 40391000 69832000 2151 3860 1999 20005;20006;20007;20008;20009;20010;20011;20012;20013;20014;20015;20016 25645;25646;25647;25648;25649;25650;25651;25652;25653;25654;25655;25656;25657;25658;25659;25660;25661;25662;25663 25649 15 ALAAQLPVLPWSEVTFLAPVTWPDK Unmodified 2748.4891 0.48907475 3380 Q6P2I3 FAHD2B Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 172.17 172.17 2;3 3.0724E-17 176708 QUIQUE_C1218_190116_001 96.303 89.509 913900000 51792000 71545000 54180000 47491000 75767000 82426000 34008000 72210000 127900000 21976000 189380000 22296000 62935000 2152 3380 2000 20017;20018;20019;20020;20021;20022;20023;20024;20025;20026;20027;20028;20029;20030;20031;20032;20033;20034;20035;20036;20037 25664;25665;25666;25667;25668;25669;25670;25671;25672;25673;25674;25675;25676;25677;25678;25679;25680;25681;25682;25683;25684;25685;25686 25665 23 ALAASALPAQGSR Unmodified 1211.6622 0.66223452 1227 H7C0V0;Q8WWC4 C2orf47 Uncharacterized protein C2orf47, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 71.299 71.299 2 0.02259 72236 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.805 15.509 375040000 0 0 39584000 0 113900000 0 58229000 0 0 0 61211000 0 102120000 2153 1227 2001 20038;20039;20040;20041;20042 25687;25688;25689;25690;25691;25692 25691 6 ALAAVLLQALDR Unmodified 1252.7503 0.75032125 1493 O15240;Q05BJ3 VGF Neurosecretory protein VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes no 0 0 0 1 142.8 142.8 2 0.0044113 147779 QUIQUE_C1218_190116_001 69.276 42.892 26685000 26685000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2154 1493 2002 20043 25693 25693 1 ALAAVLLQALDRPASPPAPSGSQQGPEEEAAEALLTETVR Unmodified 4053.1019 0.10185248 1493 O15240;Q05BJ3 VGF Neurosecretory protein VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes no 0 0 1 1 1 164.67 164.67 4 0.00021859 167789 QUIQUE_C1403_190116_001 34.91 33.489 101190000 51785000 0 0 49400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2155 1493 2003 20044;20045 25694;25695 25695 1 ALADDVVGSVLDCFSFQETDK Unmodified 2315.0627 0.062742776 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 2 166.55 166.55 2;3 1.0067E-06 170380 QUIQUE_C1277_190116_001 84.566 77.685 56917000 0 15929000 0 0 21211000 0 0 0 0 0 0 19776000 0 2156 1283 2004 20046;20047;20048;20049 25696;25697;25698;25699 25696 4 ALADEREAVQK Unmodified 1228.6412 0.64116473 2851;1472;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;O15020;A4QPE4;E9PJZ2;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 0 1 1 1 1 18.267 18.267 2 0.04816 11241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.157 14.454 352120000 0 0 0 0 0 0 0 230100000 0 0 54191000 0 67820000 2157 2851;1472;754 2005 20050;20051;20052 25700;25701;25702 25700 3 ALADEREAVQKK Unmodified 1356.7361 0.73612775 2851;1472;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;O15020;A4QPE4;E9PJZ2;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 0 2 1 1 13.194 13.194 3 0.011994 5737 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.962 42.708 250040000 0 0 0 0 0 0 0 155370000 0 0 0 94664000 0 2158 2851;1472;754 2006 20053;20054 25703;25704 25703 2 ALADLVHSHIQSNELCSK Unmodified 2021 2.33601E-05 2203 P22830 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 73.482 73.482 3 0.0017653 70169 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.185 44.322 250230000 93662000 88510000 0 0 0 0 0 44496000 0 23560000 0 0 0 2159 2203 2007 20055;20056;20057;20058 25705;25706;25707;25708 25708 2 ALADSTR Acetyl (Protein N-term) 774.38718 0.38718187 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 1 0 0 1 1 1 31.068 31.068 1 0.03666 26473 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.92 98.996 768980000 0 0 0 0 304930000 0 0 213570000 250490000 0 0 0 0 2160 3827 2008 20059;20060;20061 25709;25710;25711 25710 2 ALADVATVLGR Unmodified 1084.6241 0.6240581 3731 Q92542;H0Y6T7 NCSTN Nicastrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 93.33 93.33 2 0.0013784 96511 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.744 40.064 191080000 0 0 0 0 39459000 0 0 63562000 0 14856000 73198000 0 0 2161 3731 2009 20062;20063;20064;20065 25712;25713;25714;25715 25715 4 ALADYIR Unmodified 820.4443 0.44430282 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 62.729 62.729 2 0.023795 63905 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156070000 2164 3993 2012 20080;20081;20082;20083;20084;20085;20086;20087;20088;20089;20090;20091;20092;20093;20094;20095;20096;20097;20098;20099;20100;20101;20102 25734;25735;25736;25737;25738;25739;25740;25741;25742;25743;25744;25745;25746;25747;25748;25749;25750;25751;25752;25753;25754;25755;25756;25757;25758 25736 24 ALAEEWGCPFMETSAK Unmodified 1825.8015 0.80150647 1991 P10114 RAP2A Ras-related protein Rap-2a yes yes 0 0 0 1 1 1 1 114.57 114.57 2 0.0017374 119431 QUIQUE_C1218_190116_001 62.528 48.067 51949000 0 51949000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2165 1991 2013 20103;20104;20105;20106 25759;25760;25761;25762 25759 4 ALAEEWSCPFMETSAK Unmodified 1855.8121 0.81207116 2720 P61225 RAP2B Ras-related protein Rap-2b yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.24 115.24 2 2.8424E-14 120184 QUIQUE_C1218_190116_001 130.56 118 256260000 39151000 0 55892000 57948000 0 0 51674000 0 22815000 0 0 28783000 0 2166 2720 2014 20107;20108;20109;20110;20111;20112;20113;20114 25763;25764;25765;25766;25767;25768;25769;25770 25763 7 ALAEGGSILSR Unmodified 1072.5877 0.58767259 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.438 51.438 2 0.00075106 49514 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.62 44.446 1219000000 141700000 127940000 118000000 88531000 217840000 0 115960000 106120000 0 0 175770000 127140000 0 2167 2665 2015 20115;20116;20117;20118;20119;20120;20121;20122;20123 25771;25772;25773;25774;25775;25776;25777;25778;25779;25780 25779 10 ALAEGVLLR Unmodified 940.57057 0.57056597 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8YF34;A0A2R8Y2X9;A0A2R8Y6Y6;A0A2R8Y4V9;A0A2R8Y790;A0A2R8Y446;A0A0S2Z4J7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.405 65.405 2 0.00054276 65424 QUIQUE_C1438_190116_001 131.04 81.678 3406600000 282620000 282830000 293570000 258340000 282730000 0 272610000 283710000 285880000 115310000 386120000 292090000 370750000 2168 2513 2016 20124;20125;20126;20127;20128;20129;20130;20131;20132;20133;20134;20135 25781;25782;25783;25784;25785;25786;25787;25788;25789;25790;25791;25792;25793;25794 25787 14 ALAELFGLLVK Unmodified 1172.7169 0.71689585 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 154.19 154.19 2 0.0049122 160999 QUIQUE_C1438_190116_001 88.948 71.708 183040000 0 0 0 0 29278000 0 0 31850000 31430000 12678000 34516000 43289000 0 2169 3471 2017 20136;20137;20138;20139;20140;20141 25795;25796;25797;25798;25799;25800;25801 25795 6 ALAESWNAAFLESSAK Unmodified 1693.8312 0.83115034 3133 Q15382;C9J931 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.92 114.92 2 4.4075E-19 118244 QUIQUE_C1277_190116_001 146.5 121.07 1276800000 135060000 150870000 173000000 150090000 145350000 116310000 146380000 0 0 75575000 184160000 0 0 2170 3133 2018 20142;20143;20144;20145;20146;20147;20148;20149;20150 25802;25803;25804;25805;25806;25807;25808;25809;25810;25811;25812;25813 25804 12 ALAFHPIEPVLITASEDHTLK Unmodified 2301.2369 0.23688281 1556 O43815 STRN 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2409 P37837;F2Z393 TALDO1 Transaldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.27 102.27 2 1.395E-06 105313 QUIQUE_C1368_190116_001 129.7 101.3 10048000000 713840000 829520000 793060000 681150000 969210000 723070000 805150000 702720000 749260000 258640000 973510000 857980000 990910000 2173 2409 2021 20179;20180;20181;20182;20183;20184;20185;20186;20187;20188;20189;20190;20191 25843;25844;25845;25846;25847;25848;25849;25850;25851;25852;25853;25854;25855;25856;25857 25846 15 ALAGVTYAAK Unmodified 963.53893 0.53893149 4531 Q9UQB8;I3L4C2;I3L327;I3L0M4;I3L3J7;I3L3C5 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.391 33.391 2 0.01897 28257 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.589 41.859 493600000 0 0 0 0 0 120100000 0 87771000 0 0 170860000 114870000 0 2174 4531 2022 20192;20193;20194;20195 25858;25859;25860;25861 25860 4 ALAHLLEAER Unmodified 1121.6193 0.61930707 4434 Q9UHG2 PCSK1N ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN yes yes 0 0 0 1 40.375 40.375 2 0.048195 37038 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.423 31.647 36754000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36754000 2175 4434 2023 20196 25862 25862 1 ALAIEEFCK Unmodified 1079.5321 0.53213155 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 74.68 74.68 2 0.0019615 74021 QUIQUE_C1563_190116_001 98.299 80.914 1493800000 269300000 203050000 208050000 132400000 0 207220000 167330000 0 0 102060000 204400000 0 0 2176 4297 2024 20197;20198;20199;20200;20201;20202;20203;20204;20205;20206;20207 25863;25864;25865;25866;25867;25868;25869;25870;25871;25872;25873 25868 9 ALAIMCR Unmodified 833.42516 0.42516406 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;E9PN18;E9PMU7;E9PL19 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 40.796 40.796 2 0.047935 36733 QUIQUE_C1563_190116_001 76.347 47.819 28049000 0 0 0 0 0 28049000 0 0 0 0 0 0 0 2177 295 2025 20208 25874 25874 1 ALAIYEGQLGPDNPNVAR Unmodified 1896.9694 0.96937516 4286 Q9NSK0;H7C4M1 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 0 0 0 1 1 92.248 92.248 2 3.1758E-24 94591 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.78 139.27 53128000 0 0 0 0 0 0 0 0 29685000 0 0 23442000 0 2178 4286 2026 20209;20210 25875;25876 25875 2 ALALAALAAVEPACGSR Acetyl (Protein N-term) 1681.8821 0.88214006 4018 Q9BT67 NDFIP1 NEDD4 family-interacting protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 172.95 172.95 2 4.5618E-17 175682 QUIQUE_C1403_190116_001 135.66 108.99 36466000 10224000 8024300 4545000 5063000 0 8609500 0 0 0 0 0 0 0 2179 4018 2027 20211;20212;20213;20214;20215 25877;25878;25879;25880;25881 25880 4 ALALAPGPPTR Unmodified 1062.6186 0.61857879 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.354 50.354 2 0.000512 47350 QUIQUE_C1563_190116_001 112.84 96.369 1410100000 159610000 0 71883000 141540000 148870000 89578000 80942000 192310000 109580000 0 187380000 82259000 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27290000 28084000 24393000 2182 4484 2030 20238;20239;20240;20241;20242;20243;20244;20245;20246;20247;20248;20249;20250 25911;25912;25913;25914;25915;25916;25917;25918;25919;25920;25921;25922;25923 25923 13 ALAMLRDWCRWMGANAER Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2264.0401 0.040130811 301 A0A0J9YXH5;A0A0J9YXQ4 yes no 1 1 2 1 1 1 1 42.028 42.028 2 0.0076518 38489 QUIQUE_C1277_190116_001 48.004 25.958 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2183 301 2031 20251;20252;20253;20254 25924;25925;25926;25927 25924 224;225 4 ALANIHSQLLGLER Unmodified 1533.8627 0.86272524 4154 Q9H313;A0A0G2JPK6 TTYH1 Protein tweety homolog 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 78.905 78.905 2;3 5.255E-22 79865 QUIQUE_C1277_190116_001 184.87 147.31 4173100000 323550000 379290000 340180000 269440000 282930000 262400000 449240000 381930000 455150000 141930000 291920000 323960000 271140000 2184 4154 2032 20255;20256;20257;20258;20259;20260;20261;20262;20263;20264;20265;20266;20267;20268;20269;20270;20271;20272;20273;20274;20275;20276;20277;20278;20279;20280 25928;25929;25930;25931;25932;25933;25934;25935;25936;25937;25938;25939;25940;25941;25942;25943;25944;25945;25946;25947;25948;25949;25950;25951;25952;25953;25954;25955;25956;25957;25958;25959;25960 25933 31 ALANMHESLEWLASR Unmodified 1726.8461 0.8460889 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 1 108.52 108.52 3 0.0079142 112331 QUIQUE_C1218_190116_001 42.338 31.076 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2185 3797 2033 20281 25961 25961 1 ALANSLACQGK Unmodified 1131.5706 0.57064232 1851 P04075;J3KPS3;H3BR68 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 26.312 26.312 2 1.6144E-30 21010 QUIQUE_C1218_190116_001 194.9 140.69 122210000000 11424000000 12049000000 10319000000 9758600000 11052000000 8892600000 12365000000 7072500000 6875300000 3121900000 10811000000 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269030000 0 22153000 0 0 0 0 0 34466000 48654000 0 50051000 48011000 65693000 2190 2476 2038 20327;20328;20329;20330;20331;20332 26020;26021;26022;26023;26024;26025;26026;26027;26028 26028 9 ALAPTWEQLALGLEHSETVK Unmodified 2192.1477 0.14773345 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.37 137.37 3 1.0945E-06 142088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.028 80.807 868260000 0 111820000 0 0 118430000 123880000 0 79395000 123840000 60511000 147120000 0 103260000 2191 3627 2039 20333;20334;20335;20336;20337;20338;20339;20340 26029;26030;26031;26032;26033;26034;26035;26036;26037 26034 9 ALAQEDQGAGEVER Unmodified 1471.6903 0.69029976 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.594 28.594 2 1.042E-36 22481 QUIQUE_C1368_190116_001 180.97 157.65 1615000000 169800000 166560000 147320000 0 137830000 117290000 137130000 102940000 100570000 42997000 184180000 150890000 157470000 2192 1472 2040 20341;20342;20343;20344;20345;20346;20347;20348;20349;20350;20351;20352 26038;26039;26040;26041;26042;26043;26044;26045;26046;26047;26048;26049;26050 26040 13 ALAQGPWWAR Unmodified 1154.5985 0.59851205 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.358 89.358 2 6.859E-05 91185 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.98 120.46 4351600000 0 228010000 524790000 350570000 327830000 332520000 393080000 0 565680000 139380000 552520000 348290000 588940000 2193 2578 2041 20353;20354;20355;20356;20357;20358;20359;20360;20361;20362;20363 26051;26052;26053;26054;26055;26056;26057;26058;26059;26060;26061;26062;26063;26064;26065 26065 14 ALAQNGSLGEGIHEPGGPR Unmodified 1858.9286 0.92857298 1498 O15354 GPR37 Prosaposin receptor GPR37 yes yes 0 0 0 1 16.753 16.753 3 0.036889 9128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 17.577 7.2007 170010000 0 0 0 0 0 0 0 170010000 0 0 0 0 0 2194 1498 2042 20364 26066 26066 1 ALAQYLVVVSK Unmodified 1189.7071 0.70705945 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 1 94.839 94.839 2 0.029642 97251 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.445 34.774 20534000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20534000 0 2195 2456 2043 20365;20366 26067;26068 26068 2 ALASILLQDHIR Unmodified 1348.7827 0.78268401 3355 Q6DD88;F5H6I7;F5GWF8 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 85.337 85.337 2;3 2.6351E-05 87387 QUIQUE_C1576_190116_001 100.93 83.122 757840000 43345000 39560000 82699000 72329000 68422000 36119000 48370000 31173000 102990000 21715000 108750000 66352000 36029000 2196 3355 2044 20367;20368;20369;20370;20371;20372;20373;20374;20375;20376;20377;20378;20379;20380;20381;20382;20383;20384;20385;20386;20387;20388 26069;26070;26071;26072;26073;26074;26075;26076;26077;26078;26079;26080;26081;26082;26083;26084;26085;26086;26087;26088;26089;26090;26091;26092;26093;26094;26095 26082 27 ALASLMTYK Oxidation (M) 1012.5263 0.52631789 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 42.838 42.838 1;2 0.0011735 39278 QUIQUE_C1368_190116_001 107.9 96.174 4808100000 388690000 336030000 303140000 250710000 338710000 216790000 232430000 537960000 413710000 285420000 603530000 504080000 396900000 2197 1777 2045 20389;20390;20391;20392;20393;20394;20395;20396;20397;20398;20399;20400;20401;20402;20403 26096;26097;26098;26099;26100;26101;26102;26103;26104;26105;26106;26107;26108;26109;26110;26111;26112;26113;26114;26115;26116;26117;26118;26119;26120 26099 970 24 ALASLMTYK Unmodified 996.5314 0.53140327 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 2 68.904 68.904 1;2 2.0477E-08 66258 QUIQUE_DMIX4_190116_001 201.97 113.03 28206000000 2115200000 1662800000 2916800000 1998900000 1871900000 1793600000 1833500000 2100200000 2734700000 840570000 3431900000 2276300000 2630000000 2198 1777 2045 20404;20405;20406;20407;20408;20409;20410;20411;20412;20413;20414;20415;20416;20417;20418;20419;20420 26121;26122;26123;26124;26125;26126;26127;26128;26129;26130;26131;26132;26133;26134;26135;26136;26137;26138;26139;26140;26141;26142;26143;26144;26145;26146;26147;26148 26141 25 ALASPEQLAQLPSSGVPR Unmodified 1819.9792 0.97921156 1220;4597 H7BZ77;Q9Y3Q8 TSC22D4 TSC22 domain family protein 4 no no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 2 1 1 1 102.5 102.5 2;3 4.7105E-31 105288 QUIQUE_C1277_190116_001 155.14 140.36 594830000 0 41309000 26397000 68340000 44465000 80277000 48494000 65091000 70714000 0 36068000 40928000 72744000 2199 1220;4597 2046 20421;20422;20423;20424;20425;20426;20427;20428;20429;20430;20431;20432;20433;20434;20435 26149;26150;26151;26152;26153;26154;26155;26156;26157;26158;26159;26160;26161;26162;26163;26164;26165;26166 26149 18 ALASQLQDSLK Unmodified 1172.6401 0.6401021 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 63.414 63.414 2 0.0011964 60162 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.52 73.586 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20454;20455;20456;20457;20458;20459;20460;20461 26187;26188;26189;26190;26191;26192;26193;26194 26190 8 ALAVSDLNR Unmodified 957.52434 0.52434406 2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 42.538 42.538 2 0.0086009 37012 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.324 43.516 182330000 0 0 0 0 0 0 0 117960000 0 64364000 0 0 0 2203 2026 2050 20462;20463 26195;26196 26196 2 ALAYDKLEK Unmodified 1049.5757 0.57571092 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 27.833 27.833 2 0.031466 22181 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.136 20.629 34982000 0 0 0 0 0 0 0 34982000 0 0 0 0 0 2204 2379 2051 20464 26197;26198 26198 2 ALAYFEQLK Unmodified 1081.5808 0.5807963 1534 O43592;F8WDU6;F5GYW6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.254 84.254 2 0.016045 85629 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.485 51.538 488050000 48437000 54555000 0 0 60473000 0 52540000 65857000 71824000 0 77986000 56380000 0 2205 1534 2052 20465;20466;20467;20468;20469;20470;20471;20472 26199;26200;26201;26202;26203;26204;26205;26206;26207 26207 8 ALCADLSPR Unmodified 1001.4964 0.49641475 4259 Q9NQW7;Q5T6H7;Q5T6H2 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.49 41.49 2 0.0075799 36644 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.191 46.298 848040000 100570000 105220000 100000000 113910000 0 0 96170000 72543000 0 56700000 115360000 87566000 0 2206 4259 2053 20473;20474;20475;20476;20477;20478;20479;20480;20481 26208;26209;26210;26211;26212;26213;26214;26215;26216;26217 26215 8 ALCAEADRLQQSHPLSATQIQVK Unmodified 2563.3177 0.3176691 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 3 2 2 2 2 70.355 70.355 2;3;4 1.3711E-17 70321 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.31 108.36 7135000000 0 0 0 0 234980000 0 57581000 2550800000 1241800000 0 977690000 1079500000 992630000 2207 267;275;3025 2054 20482;20483;20484;20485;20486;20487;20488;20489;20490;20491;20492;20493;20494;20495 26218;26219;26220;26221;26222;26223;26224;26225;26226;26227;26228;26229;26230;26231 26225 13 ALCDNVDTR Unmodified 1062.4764 0.47640759 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.253 23.253 2 0.012404 17154 QUIQUE_C1218_190116_001 71.379 44.417 737730000 64381000 78572000 0 87499000 85072000 52439000 0 0 76234000 0 98070000 90713000 104750000 2208 617 2055 20496;20497;20498;20499;20500;20501;20502;20503;20504 26232;26233;26234;26235;26236;26237;26238;26239;26240 26232 7 ALCEAAGCGSALLWPR Acetyl (Protein N-term) 1772.8338 0.83380965 3215 Q2TAA2;F8WF34 IAH1 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog yes no 1 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 154.22 154.22 2 1.0081E-07 161281 QUIQUE_C1438_190116_001 127.37 113.47 299570000 37857000 49124000 38896000 31014000 39486000 37409000 38025000 0 0 0 0 0 27755000 2209 3215 2056 20505;20506;20507;20508;20509;20510;20511;20512;20513;20514 26241;26242;26243;26244;26245;26246;26247;26248;26249;26250;26251 26247 9 ALCGFTEAAAQAAYLVGVSDPNSQAGQQGLVEPTQFAR Unmodified 3921.8956 0.89556487 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 162 162 3;4 1.6063E-10 165689 QUIQUE_C1403_190116_001 59.954 52.149 167780000 0 0 51654000 47102000 57342000 0 0 0 0 11679000 0 0 0 2210 4600 2057 20515;20516;20517;20518;20519;20520;20521 26252;26253;26254;26255;26256;26257;26258;26259;26260 26254 8 ALCGLDESK Unmodified 991.46445 0.46444592 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.928 27.928 2 0.00058153 22023 QUIQUE_C1403_190116_001 111.74 70.237 932990000 0 66339000 96242000 67073000 57740000 80929000 83664000 62008000 0 171490000 86112000 88746000 72649000 2211 1324 2058 20522;20523;20524;20525;20526;20527;20528;20529;20530;20531;20532;20533 26261;26262;26263;26264;26265;26266;26267;26268;26269;26270;26271;26272 26263 12 ALCGLTEAAAQAAYLVGISDPNSQAGHQGLVDPIQFAR Unmodified 3908.9479 0.9479348 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 2 2 164.28 164.28 3;4 3.361E-64 167909 QUIQUE_C1403_190116_001 116.59 112.52 806470000 16979000 38270000 63471000 77508000 86442000 0 94687000 18851000 25093000 0 199860000 0 185310000 2212 4606 2059 20534;20535;20536;20537;20538;20539;20540;20541;20542;20543;20544;20545;20546;20547 26273;26274;26275;26276;26277;26278;26279;26280;26281;26282;26283;26284;26285;26286;26287;26288;26289;26290 26277 17 ALCLDLLELSTTNEIFK Unmodified 1979.0285 0.028529521 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 0 0 1 1 1 161.95 161.95 2 2.1002E-12 166713 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.34 93.469 30070000 0 0 0 0 0 0 0 0 30070000 0 0 0 0 2213 2486 2060 20548;20549;20550 26291;26292;26293 26293 2 ALCLDLLSLSAACDALDQHNLK Unmodified 2440.209 0.20902986 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304;F5GZY3 DMD Dystrophin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 145.96 145.96 3 6.6786E-08 150849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.36 74.343 744680000 0 0 0 0 0 136750000 0 135240000 145060000 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26324;26325;26326;26327;26328;26329;26330;26331;26332;26333;26334;26335;26336 26327 13 ALCYVISGQDQR Unmodified 1408.6769 0.67689831 3348 Q66K74;M0R1M7 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.862 57.862 2 0.00040656 56533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.8 91.931 387850000 58158000 49006000 65648000 0 0 53766000 58907000 41215000 61148000 0 0 0 0 2220 3348 2067 20594;20595;20596;20597;20598;20599;20600;20601;20602 26337;26338;26339;26340;26341;26342;26343;26344;26345;26346;26347 26345 10 ALDAAFYK Unmodified 897.45962 0.45961853 1992 P10155;G5E9R9 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.257 55.257 2 0.0084554 53568 QUIQUE_C1368_190116_001 94.262 53.576 287780000 0 0 82706000 0 58888000 0 70192000 0 0 0 75998000 0 0 2221 1992 2068 20603;20604;20605;20606 26348;26349;26350;26351;26352;26353;26354 26348 7 ALDDFVLGSAR Unmodified 1162.5982 0.59823728 1596 O60831;A6NP52 PRAF2 PRA1 family protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 99.813 99.813 2 0.00044225 96738 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.05 75.874 424860000 116530000 101890000 0 76432000 0 0 0 97182000 0 32828000 0 0 0 2222 1596 2069 20607;20608;20609;20610;20611;20612;20613;20614;20615;20616;20617;20618;20619 26355;26356;26357;26358;26359;26360;26361;26362;26363;26364;26365;26366;26367;26368 26364 14 ALDDILNLK Unmodified 1013.5757 0.57571092 1457 O14920;G3V105;E5RGW5 IKBKB Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 109.85 109.85 2 0.018595 115019 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.207 44.504 36674000 0 0 0 0 0 10806000 0 13048000 0 0 12820000 0 0 2223 1457 2070 20620;20621;20622;20623 26369;26370;26371;26372 26372 4 ALDDMISTLK Unmodified 1105.5689 0.56891099 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;E9PM09;Q5SZX9;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 98.212 98.212 2 0.0045032 100469 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.688 47.138 820280000 174840000 184090000 0 0 115680000 173530000 0 0 100370000 71772000 0 0 0 2224 2527;3303 2071 20624;20625;20626;20627;20628;20629;20630;20631;20632;20633 26373;26374;26375;26376;26377;26378;26379;26380;26381;26382;26383 26380 9 ALDDMISTLKK Unmodified 1233.6639 0.663874 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;E9PM09;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 1 1 1 1 73.718 73.718 3 0.0042391 73965 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.003 45.485 213640000 0 48044000 0 0 0 0 0 90712000 74884000 0 0 0 0 2225 2527;3303 2072 20634;20635;20636 26384;26385;26386 26385 3 ALDEGIPITSASYYATVTLDQVR Unmodified 2482.2591 0.2591344 3318 Q5T6V5 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.74 151.74 2 8.4848E-11 156755 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.5 99.782 146180000 0 0 0 0 52463000 0 0 0 35584000 22171000 0 0 35959000 2226 3318 2073 20637;20638;20639;20640 26387;26388;26389;26390 26388 4 ALDELFEAIEQK Unmodified 1404.7137 0.71366097 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.53 138.53 2 5.0172E-06 141739 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.86 108.74 429300000 0 40480000 37987000 42557000 67989000 35099000 39430000 37509000 41954000 0 54403000 0 31893000 2227 3210 2074 20641;20642;20643;20644;20645;20646;20647;20648;20649;20650 26391;26392;26393;26394;26395;26396;26397;26398;26399;26400;26401;26402;26403 26399 13 ALDELMDGDIIVFQK Unmodified 1705.8597 0.85967328 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 143.21 143.21 2 0.025365 146034 QUIQUE_C1563_190116_001 45.764 27.956 140020000 0 0 52814000 39721000 0 47482000 0 0 0 0 0 0 0 2228 3778 2075 20651;20652;20653 26404;26405;26406 26406 3 ALDEYYDK Unmodified 1015.4498 0.44984171 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 40.196 40.196 2 0.016365 36505 QUIQUE_C1563_190116_001 83.265 72.437 1088000000 0 0 287550000 0 0 438570000 361880000 0 0 0 0 0 0 2229 2414 2076 20654;20655;20656 26407;26408;26409 26408 3 ALDEYYDKHFTEFVPLR Unmodified 2142.0422 0.042205751 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 3 3 3 3 3 2 4 3 3 2 3 4 3 109.26 109.26 2;3;4 4.4622E-62 112097 QUIQUE_DMIX7_190116_001 185.87 163.15 16553000000 594010000 1208000000 1017800000 703870000 1307400000 506430000 1255000000 1511500000 1784300000 216060000 2458700000 1942300000 2048100000 2230 2414 2077 20657;20658;20659;20660;20661;20662;20663;20664;20665;20666;20667;20668;20669;20670;20671;20672;20673;20674;20675;20676;20677;20678;20679;20680;20681;20682;20683;20684;20685;20686;20687;20688;20689;20690;20691;20692;20693;20694;20695 26410;26411;26412;26413;26414;26415;26416;26417;26418;26419;26420;26421;26422;26423;26424;26425;26426;26427;26428;26429;26430;26431;26432;26433;26434;26435;26436;26437;26438;26439;26440;26441;26442;26443;26444;26445;26446;26447;26448;26449;26450;26451;26452;26453;26454;26455;26456;26457;26458;26459;26460;26461;26462;26463;26464;26465;26466;26467;26468;26469;26470;26471;26472 26465 62 ALDFAVGEYNK Unmodified 1225.5979 0.59790293 1804 P01034 CST3 Cystatin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.271 80.271 2 0.0021728 81049 QUIQUE_C1277_190116_001 79.986 40.439 1897400000 159750000 158010000 217380000 144800000 232770000 162710000 165110000 199130000 0 84337000 169650000 203740000 0 2231 1804 2078 20696;20697;20698;20699;20700;20701;20702;20703;20704;20705;20706 26473;26474;26475;26476;26477;26478;26479;26480;26481;26482;26483;26484;26485;26486 26474 12 ALDFDISETR Unmodified 1165.5615 0.56151742 500 A0A3B3ITH3;Q9P2X3;J3KT25;J3QRS6 IMPACT Protein IMPACT yes no 0 0 0 1 1 1 84.639 84.639 2 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171.43 3 9.2631E-09 175952 QUIQUE_C1218_190116_001 67.239 59.706 113230000 15184000 19032000 0 0 0 0 13038000 10028000 0 0 33069000 22879000 0 2234 1083 2081 20723;20724;20725;20726;20727;20728 26512;26513;26514;26515;26516;26517 26512 4 ALDGAFTEENR Unmodified 1221.5626 0.56258006 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.287 48.287 2 2.2426E-06 45513 QUIQUE_C1403_190116_001 155.84 119.45 1641400000 126250000 0 217380000 209460000 214850000 135980000 0 121930000 184810000 0 233430000 197280000 0 2235 4600 2082 20729;20730;20731;20732;20733;20734;20735;20736;20737 26518;26519;26520;26521;26522;26523;26524;26525;26526;26527 26520 5 ALDGDFSEDNR Unmodified 1237.5211 0.52110917 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 43.716 43.716 2 0.025332 40791 QUIQUE_C1368_190116_001 59.067 47.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2236 4606 2083 20738;20739 26528;26529 26528 2 ALDGDFSEDNRNK Unmodified 1479.659 0.65899964 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 1 1 26.878 26.878 3 0.062964 21017 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.013 30.634 34178000 0 0 0 0 0 0 0 34178000 0 0 0 0 0 2237 4606 2084 20740 26530 26530 1 ALDGPEQMELEEGK Acetyl (Protein N-term) 1586.7134 0.71340297 2743 P62195;J3QQM1;J3QSE0;J3KTQ9 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 109.33 109.33 2 0.00027537 112194 QUIQUE_C1403_190116_001 105.03 86.287 108280000 0 0 0 37560000 0 30000000 40717000 0 0 0 0 0 0 2238 2743 2085 20741;20742;20743;20744;20745 26531;26532;26533;26534;26535;26536 26531 6 ALDIAENEMPGLMR Unmodified 1558.7483 0.74834869 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.47 111.47 2 0.00011616 116706 QUIQUE_C1218_190116_001 112.83 95.808 1097500000 131720000 134700000 125240000 120940000 79534000 95670000 108070000 0 0 0 154060000 0 147520000 2239 2219 2086 20746;20747;20748;20749;20750;20751;20752;20753;20754 26537;26538;26539;26540;26541;26542;26543;26544;26545;26546;26547;26548 26537 12 ALDIAENEMPGLMR 2 Oxidation (M) 1590.7382 0.73817794 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 2 0 1 68.497 68.497 2 0.0011295 64195 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.017 66.35 35731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35731000 0 0 0 2240 2219 2086 20755 26549 26549 1581;1582 1 ALDIDLDKPLADSEK Unmodified 1641.8461 0.8461317 1437;437 A0A2R8Y611;O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 1 1 1 2 83.166 83.166 2;3 0.00069699 83411 QUIQUE_C1563_190116_001 63.682 49.599 35424000 0 0 0 0 0 35424000 0 0 0 0 0 0 0 2241 437;1437 2087 20756;20757;20758;20759 26550;26551;26552;26553 26552 4 ALDLDPENDSYK Unmodified 1378.6252 0.62523989 3843 Q96EQ0;D6RFW1 SGTB Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 70.925 70.925 2 0.0053377 70141 QUIQUE_C1563_190116_001 66.595 56.072 327450000 0 66254000 0 66520000 74082000 64571000 0 0 56023000 0 0 0 0 2242 3843 2088 20760;20761;20762;20763;20764 26554;26555;26556;26557;26558 26557 5 ALDLDSSCK Unmodified 1007.4594 0.45936054 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.284 29.284 2 0.0011864 23245 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.04 58.193 3095500000 306440000 355830000 321120000 311480000 332060000 307750000 381450000 109290000 122260000 89503000 0 219660000 238710000 2243 2343 2089 20765;20766;20767;20768;20769;20770;20771;20772;20773;20774;20775;20776 26559;26560;26561;26562;26563;26564;26565;26566;26567;26568;26569;26570;26571;26572;26573;26574 26571 15 ALDLESLSLLGFVYK Unmodified 1666.9182 0.91817444 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.51 167.51 2 8.8957E-44 172421 QUIQUE_C1368_190116_001 180.88 160.1 1414700000 71582000 55120000 310780000 42493000 46828000 0 49909000 93891000 104540000 16173000 488970000 73392000 60975000 2244 1975 2090 20777;20778;20779;20780;20781;20782;20783;20784;20785;20786;20787;20788 26575;26576;26577;26578;26579;26580;26581;26582;26583;26584;26585;26586 26577 12 ALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAK Unmodified 2636.3585 0.35851409 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 171.06 171.06 2;3 2.1216E-24 174083 QUIQUE_C1403_190116_001 127.28 123.55 4268300000 222140000 593020000 1075700000 140310000 351970000 93345000 449090000 186280000 189320000 42186000 517980000 382470000 24420000 2245 3109 2091 20789;20790;20791;20792;20793;20794;20795;20796;20797;20798;20799;20800;20801;20802;20803;20804;20805;20806;20807;20808;20809;20810 26587;26588;26589;26590;26591;26592;26593;26594;26595;26596;26597;26598;26599;26600;26601;26602;26603;26604;26605;26606;26607;26608 26593 22 ALDLFSDNAPPPELLEIINEDIAKR Unmodified 2792.4596 0.45962512 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 1 1 1 1 166.24 166.24 3 1.5825E-10 170742 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.539 63.343 479210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 151090000 222830000 105290000 2246 3109 2092 20811;20812;20813 26609;26610;26611 26611 3 ALDLGTFTGYSALALALALPADGR Unmodified 2376.2689 0.26891122 3501 Q86VU5;R4GNF4 COMTD1 Catechol O-methyltransferase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 172.75 172.75 3 0.00080268 177137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 27.946 19.451 17024000 0 0 0 0 0 0 0 0 17024000 0 0 0 0 2247 3501 2093 20814 26612 26612 1 ALDLLDK Unmodified 786.44872 0.4487195 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.124 58.124 2 0.011331 56886 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.85 50.114 11106000000 848950000 798590000 866300000 880000000 818860000 734610000 851880000 933760000 889720000 416090000 1053900000 985230000 1028500000 2248 2281 2094 20815;20816;20817;20818;20819;20820;20821;20822;20823;20824;20825;20826;20827 26613;26614;26615;26616;26617;26618;26619;26620;26621;26622;26623;26624;26625;26626;26627 26621 15 ALDLLDR Unmodified 814.45487 0.45486751 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;E9PQW4;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.91 65.91 2 0.020675 64976 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.43 0 1530400000 0 0 218350000 0 0 0 217650000 235420000 0 94412000 290490000 216410000 257690000 2249 897;2263 2095 20828;20829;20830;20831;20832;20833;20834 26628;26629;26630;26631;26632;26633;26634;26635 26635 8 ALDLLYGMVSK Unmodified 1208.6475 0.64749566 1437;437 A0A2R8Y611;O14617;A0A2R8Y4J3 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 121.15 121.15 2 0.00071972 126325 QUIQUE_C1218_190116_001 96.89 75.988 219930000 44949000 48946000 38748000 35811000 0 0 31949000 19524000 0 0 0 0 0 2250 437;1437 2096 20835;20836;20837;20838;20839;20840 26636;26637;26638;26639;26640;26641;26642 26636 6 ALDLNLK Unmodified 785.4647 0.46470391 2085 P14927;B7Z2R2;E5RHG9 UQCRB Cytochrome b-c1 complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.672 54.672 2 0.019227 52724 QUIQUE_C1403_190116_001 113.08 9.7992 4417000000 617100000 547700000 533140000 240370000 396760000 363140000 502260000 0 392770000 0 438310000 385440000 0 2251 2085 2097 20841;20842;20843;20844;20845;20846;20847;20848;20849;20850 26643;26644;26645;26646;26647;26648;26649;26650;26651;26652;26653;26654;26655 26648 13 ALDLPSSGEGLAFFTFPNIASATK Unmodified 2453.2478 0.24784143 582 B1AHA8;P09601 HMOX1 Heme oxygenase 1 yes no 0 0 0 2 2 165.11 165.11 2;3 2.5886E-08 170044 QUIQUE_C1368_190116_001 93.754 86.346 93868000 0 0 64344000 29524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2252 582 2098 20851;20852;20853;20854 26656;26657;26658;26659 26657 4 ALDLSLYLK Unmodified 1034.6012 0.60119739 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 117.43 117.43 2 0.023183 123351 QUIQUE_C1438_190116_001 60.91 36.091 58424000 0 0 16986000 0 22953000 0 0 0 18485000 0 0 0 0 2253 4336 2099 20855;20856;20857;20858 26660;26661;26662;26663 26661 2 ALDQASEEIWNDFR Unmodified 1692.7744 0.77436375 2570 P50579;F8VRR3;F8VQZ7;G3V1U3;F8VZX9;F8VY03 METAP2 Methionine aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 133.39 133.39 2 0.01431 138953 QUIQUE_C1576_190116_001 62.466 44.657 53084000 0 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20864;20865;20866;20867;20868;20869;20870;20871;20872;20873 26670;26671;26672;26673;26674;26675;26676;26677;26678;26679 26675 9 ALDTLLEQTPKEDDEHQVIIK Unmodified 2434.2591 0.2591344 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.133 86.133 4 0.0032101 87695 QUIQUE_DMIX7_190116_001 26.361 22.466 273130000 0 0 0 0 0 0 30107000 46355000 47899000 0 64922000 41900000 41950000 2258 3684 2104 20874;20875;20876;20877;20878;20879 26680;26681;26682;26683;26684;26685 26684 6 ALDTMNFDVIK Oxidation (M) 1281.6275 0.6274885 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YBN4;E5RGH3;E5RJB9;E5RH24;B1ANR0;Q13310;B1ANR1;H0YEQ8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.604 83.604 2 0.0027366 80886 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.148 52.455 348980000 20900000 43201000 37763000 30749000 34562000 0 0 37409000 41399000 25566000 41665000 35762000 0 2259 2031;596 2105 20880;20881;20882;20883;20884;20885;20886;20887;20888;20889 26686;26687;26688;26689;26690;26691;26692;26693;26694;26695 26693 391 9 ALDTMNFDVIK Unmodified 1265.6326 0.63257388 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YBN4;E5RGH3;E5RJB9;E5RH24;B1ANR0;Q13310;B1ANR1;H0YEQ8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 104.79 104.79 2 0.0005713 108108 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.02 65.928 385860000 0 0 0 0 0 0 0 95410000 0 0 154280000 0 136170000 2260 2031;596 2105 20890;20891;20892 26696;26697;26698;26699 26699 4 ALDTVLFGPPLLTR Unmodified 1511.8712 0.87116466 940 E9PIQ8;G0XQ39;Q13586;E9PNJ4 STIM1 Stromal interaction molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.98 143.98 2 0.00024223 148437 QUIQUE_C1277_190116_001 91.937 67.646 203390000 22805000 17887000 18403000 24946000 18932000 16777000 14001000 11148000 17120000 0 28265000 0 13105000 2261 940 2106 20893;20894;20895;20896;20897;20898;20899;20900;20901;20902;20903 26700;26701;26702;26703;26704;26705;26706;26707;26708;26709;26710 26701 9 ALDVGSGSGILTACFAR Unmodified 1693.8458 0.84575455 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;A0A3F2YNX8;C9J0F2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 2 3 2 1 3 2 2 2 1 2 2 2 2 116.94 116.94 2;3 1.9745E-88 119646 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.8 187.94 8512700000 595600000 692640000 650470000 547140000 735120000 489910000 821900000 622950000 651300000 273320000 845760000 749630000 836980000 2262 150 2107 20904;20905;20906;20907;20908;20909;20910;20911;20912;20913;20914;20915;20916;20917;20918;20919;20920;20921;20922;20923;20924;20925;20926;20927;20928;20929 26711;26712;26713;26714;26715;26716;26717;26718;26719;26720;26721;26722;26723;26724;26725;26726;26727;26728;26729;26730;26731;26732;26733;26734;26735;26736;26737;26738;26739;26740;26741;26742;26743;26744;26745;26746;26747 26734 35 ALDVMVSTFHK Unmodified 1246.638 0.63799361 2251 P26447 S100A4 Protein S100-A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 65.044 65.044 2;3 0.00072437 64885 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.65 59.342 883070000 53356000 45929000 35457000 0 45725000 0 0 204440000 230820000 0 100820000 73530000 92990000 2263 2251 2108 20930;20931;20932;20933;20934;20935;20936;20937;20938;20939;20940 26748;26749;26750;26751;26752;26753;26754;26755;26756;26757;26758;26759;26760;26761;26762;26763 26759 16 ALDVNVALR Unmodified 969.56073 0.56072956 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.488 67.488 2 0.00020159 67012 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.28 66.241 2007700000 168820000 143290000 190340000 59148000 125850000 95724000 83474000 195630000 237500000 80527000 180590000 259410000 187380000 2264 1961 2109 20941;20942;20943;20944;20945;20946;20947;20948;20949;20950;20951;20952;20953 26764;26765;26766;26767;26768;26769;26770;26771;26772;26773;26774;26775;26776;26777;26778;26779;26780;26781;26782;26783;26784;26785 26774 20 ALDVNVALRK Unmodified 1097.6557 0.65569258 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 41.266 41.266 3 0.0014431 38520 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.489 53.047 121330000 0 0 0 0 0 0 0 0 56466000 0 0 0 64867000 2265 1961 2110 20954;20955;20956;20957;20958 26786;26787;26788;26789;26790;26791 26788 6 ALDVSASDDEIAR Unmodified 1360.647 0.64703797 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 57.843 57.843 2 0.00058053 56125 QUIQUE_C1403_190116_001 117.99 48.174 1808100000 138080000 133240000 159490000 171650000 181520000 143180000 174490000 151740000 143830000 101340000 170070000 0 139430000 2266 727 2111 20959;20960;20961;20962;20963;20964;20965;20966;20967;20968;20969;20970;20971;20972 26792;26793;26794;26795;26796;26797;26798;26799;26800;26801;26802;26803;26804;26805;26806;26807 26795 16 ALDVTVPEK Unmodified 970.53351 0.53351176 156 A0A0C4DG97;A0A0A0MRS5;F8W946;Q9BXM9;Q8N450 FSD1L FSD1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.386 45.386 2 0.01718 42674 QUIQUE_C1218_190116_001 65.224 38.622 108890000 44805000 34722000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29362000 0 2267 156 2112 20973;20974;20975;20976 26808;26809;26810;26811 26808 4 ALDYCHSMGIMHR Unmodified 1589.6901 0.69012231 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YFU2;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;A0A2R8YDY7;V9GYW6 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.829 49.829 4 0.00024823 47848 QUIQUE_C1576_190116_001 66.498 57.677 164190000 35260000 27102000 25644000 25032000 0 0 27907000 0 0 0 0 0 23248000 2268 456 2113 20977;20978;20979;20980;20981;20982 26812;26813;26814;26815;26816;26817 26816 5 ALDYIASK Unmodified 879.47018 0.47018322 2381 P35609 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 34.866 34.866 2 0.015577 30129 QUIQUE_C1277_190116_001 84.498 33.6 168370000 0 62933000 0 0 34845000 0 0 0 0 23990000 46603000 0 0 2269 2381 2114 20983;20984;20985;20986 26818;26819;26820;26821;26822;26823 26818 6 ALDYYMLR Unmodified 1043.511 0.51100218 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.486 87.486 2 0.0036655 88860 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.56 68.211 279690000 34510000 0 61462000 0 0 0 0 40245000 0 18241000 0 66095000 59138000 2270 4600 2115 20987;20988;20989;20990;20991;20992 26824;26825;26826;26827;26828;26829 26826 4 ALEAAHGPGQANQEIAAMIDTEFAK Unmodified 2582.2435 0.24350111 3155 Q15750 TAB1 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 126.66 126.66 3 4.2062E-14 130822 QUIQUE_C1403_190116_001 86.08 72.349 198360000 0 0 33873000 44904000 0 0 38624000 0 0 0 38735000 42220000 0 2271 3155 2116 20993;20994;20995;20996;20997;20998 26830;26831;26832;26833;26834;26835 26831 6 ALEAAQIIIDVLQLPMSK Oxidation (M) 1968.0965 0.096549507 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 1 0 2 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 170.62 170.62 2;3 4.1258E-13 164311 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.34 108.08 477740000 72812000 22208000 14090000 46970000 60652000 0 37000000 60515000 50783000 21493000 45680000 0 45532000 2272 2924 2117 20999;21000;21001;21002;21003;21004;21005;21006;21007;21008;21009;21010;21011;21012;21013;21014;21015;21016 26836;26837;26838;26839;26840;26841;26842;26843;26844;26845;26846;26847;26848;26849;26850;26851;26852;26853;26854;26855;26856 26850 2397 20 ALEAAQIIIDVLQLPMSK Unmodified 1952.1016 0.10163489 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 2 173.96 173.96 2;3 4.3121E-39 178579 QUIQUE_C1368_190116_001 166.9 154.85 644520000 22329000 12347000 45857000 19276000 61161000 4928300 43071000 68073000 71151000 13945000 79191000 42009000 161180000 2273 2924 2117 21017;21018;21019;21020;21021;21022;21023;21024;21025;21026;21027;21028;21029;21030;21031;21032;21033;21034;21035 26857;26858;26859;26860;26861;26862;26863;26864;26865;26866;26867;26868;26869;26870;26871;26872;26873;26874;26875;26876 26859 19 ALEAAQIIIDVLQLPMSKEELVEESQTK Unmodified 3124.6577 0.65773258 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 0 1 1 169.72 169.72 3 5.0506E-24 171572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.614 94.013 18643000 0 0 0 0 0 0 0 18643000 0 0 0 0 0 2274 2924 2118 21036 26877 26877 1 ALEAELAALR Unmodified 1055.5975 0.597509 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.247 89.247 2 7.3165E-18 87301 QUIQUE_DMIX4_190116_001 182.39 123.18 16282000000 1690000000 1533000000 1352200000 874180000 1231500000 955550000 1730900000 1026900000 1113200000 388490000 1746400000 1150100000 1490100000 2275 3176 2119 21037;21038;21039;21040;21041;21042;21043;21044;21045;21046;21047;21048;21049 26878;26879;26880;26881;26882;26883;26884;26885;26886;26887;26888;26889;26890;26891;26892;26893;26894;26895;26896;26897;26898;26899;26900;26901;26902;26903;26904;26905;26906 26897 29 ALEAFDLDPAQWGVNVQPYSGSPANLAVYTALLQPHDR Unmodified 4123.0439 0.04394367 2360 P34897;G3V5L0;G3V4W5;G3V540;G3V241;G3V3Y8;G3V4T0;G3V4X0;G3V2W0;G3V2E4 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 168.31 168.31 3;4 7.8032E-11 172811 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.942 57.216 77668000 0 0 0 0 0 0 0 34111000 43557000 0 0 0 0 2276 2360 2120 21050;21051 26907;26908 26908 2 ALEAFETFK Unmodified 1054.5335 0.53351176 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.863 82.863 2 0.0023457 80358 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.302 65.88 1027900000 126570000 126320000 117040000 0 0 115710000 157620000 41900000 78847000 67277000 83734000 0 112850000 2277 2848 2121 21052;21053;21054;21055;21056;21057;21058;21059;21060;21061 26909;26910;26911;26912;26913;26914;26915;26916;26917;26918;26919;26920 26918 10 ALEAFETFKK Unmodified 1182.6285 0.62847478 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 54.911 54.911 2;3 0.00078446 54471 QUIQUE_C1218_190116_001 86.882 55.011 1386600000 61958000 43473000 0 40028000 113970000 35594000 140390000 175780000 220990000 0 167850000 158150000 228460000 2278 2848 2122 21062;21063;21064;21065;21066;21067;21068;21069;21070;21071;21072;21073;21074;21075;21076;21077;21078;21079;21080 26921;26922;26923;26924;26925;26926;26927;26928;26929;26930;26931;26932;26933;26934;26935;26936;26937;26938;26939;26940;26941;26942;26943;26944 26922 21 ALEALVAK Unmodified 813.496 0.49600404 2076 P14550 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.367 40.367 2 0.01188 36688 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.369 40.609 3016900000 245500000 207630000 158800000 239040000 261830000 239140000 245160000 212850000 201020000 121470000 302690000 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N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.28 56.28 2 0.0099549 54044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.906 27.13 6200100000 614940000 545520000 724160000 0 0 0 0 579700000 2817000000 395620000 0 523200000 0 2282 2412 2126 21105;21106;21107;21108;21109;21110;21111 26970;26971;26972;26973;26974;26975;26976 26973 7 ALECMQVCK Unmodified 1137.4981 0.49807101 3858 Q96GA7;H0YID3;H0YIA2 SDSL Serine dehydratase-like yes no 0 0 0 1 1 35.747 35.747 2 0.040467 31985 QUIQUE_C1576_190116_001 81.784 75.471 57251000 0 0 0 0 0 0 34045000 0 0 0 0 0 23206000 2283 3858 2127 21112;21113 26977;26978 26977 1 ALEDFADNIK Unmodified 1134.5557 0.55570376 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 80.718 80.718 2 0.0056282 77433 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.827 43.986 73112000 0 0 0 0 0 28758000 25423000 0 0 18931000 0 0 0 2284 173 2128 21114;21115;21116;21117;21118 26979;26980;26981;26982;26983 26983 5 ALEDLAQELEK Unmodified 1257.6452 0.64524705 2021 P11277 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27006;27007;27008;27009;27010;27011;27012;27013;27014;27015;27016;27017;27018 27015 7 ALEEDIENHATDVHQAVK Unmodified 2017.9705 0.97049737 1187 H3BPE1;H3BQK9;A0A0A6YYJ5 MACF1 yes no 0 0 0 1 1 59.009 59.009 3 0.014941 58110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.136 24.818 85104000 0 0 0 0 0 0 0 35744000 0 0 49359000 0 0 2291 1187 2135 21150;21151 27019;27020 27020 2 ALEEEEKYEDEEEK Unmodified 1768.7527 0.75268483 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 1 1 34.281 34.281 3 0.014928 28299 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.467 43.093 14868000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14868000 0 0 0 2292 3862 2136 21152 27021 27021 1 ALEEEQEAREELER Unmodified 1729.8119 0.81187146 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 1 55.169 55.169 3 0.025464 53570 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.457 35.891 109150000 0 0 0 0 47467000 0 0 0 0 0 0 0 61680000 2293 3459 2137 21153;21154 27022;27023 27023 2 ALEEETKNHEAQIQDMR Oxidation (M) 2056.9484 0.94838172 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 1 1 1 25.713 25.713 3 0.023891 19936 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27031;27032;27033;27034;27035;27036;27037;27038;27039;27040;27041;27042;27043;27044;27045;27046;27047;27048;27049;27050;27051 27043 18 ALEEKPNNPEFSSGLAIAMYHLDNHPEK Oxidation (M) 3166.503 0.50296327 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 1 1 1 86.272 86.272 4 0.00036622 89219 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.562 35.401 90769000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90769000 0 0 2297 1452 2140 21177 27052 27052 808 1 ALEELATK Unmodified 873.48075 0.48074791 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.892 29.892 2 0.00077091 24395 QUIQUE_C1277_190116_001 149.4 80.225 12433000000 1542700000 970040000 1551800000 1169300000 1410100000 995130000 1440900000 0 1308500000 578950000 0 0 1465200000 2298 4050 2141 21178;21179;21180;21181;21182;21183;21184;21185;21186;21187 27053;27054;27055;27056;27057;27058;27059;27060;27061;27062;27063;27064 27054 11 ALEELATKR Unmodified 1029.5819 0.58185894 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 1 1 22.261 22.261 2 0.029128 15799 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.639 51.244 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2299 4050 2142 21188 27065 27065 1 ALEENNNFSK Unmodified 1164.5411 0.54111633 838 E5RGX5;Q93045 STMN2 Stathmin;Stathmin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 21.792 21.792 2 2.3391E-12 14356 QUIQUE_C1403_190116_001 167.33 0 3573700000 44283000 426220000 258500000 337440000 0 251070000 326620000 229550000 254540000 215880000 591780000 318090000 319750000 2300 838 2143 21189;21190;21191;21192;21193;21194;21195;21196;21197;21198;21199;21200;21201;21202 27066;27067;27068;27069;27070;27071;27072;27073;27074;27075;27076;27077;27078;27079;27080;27081 27070 16 ALEENNNFSR Unmodified 1192.5473 0.54726434 296 A0A0J9YW36;Q9NZ72 STMN3 Stathmin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.27 27.27 2 0.00076103 21903 QUIQUE_C1218_190116_001 106.6 96.368 182460000 58339000 51616000 0 41260000 0 0 0 0 0 0 0 31246000 0 2301 296 2144 21203;21204;21205;21206;21207 27082;27083;27084;27085;27086 27082 4 ALEEPAVDMLHTVTDMVR Unmodified 2025.9863 0.98634713 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 142.2 142.2 2;3 2.7616E-31 148883 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.48 129.64 1600300000 29613000 47181000 369910000 19833000 55687000 0 129770000 131130000 68082000 0 665780000 23273000 60029000 2302 2168 2145 21208;21209;21210;21211;21212;21213;21214;21215;21216;21217;21218;21219;21220;21221;21222;21223 27087;27088;27089;27090;27091;27092;27093;27094;27095;27096;27097;27098;27099;27100;27101;27102;27103 27099 17 ALEEPAVDMLHTVTDMVR Oxidation (M) 2041.9813 0.98126175 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 1 0 2 113.06 113.06 3 7.579E-05 110365 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.317 71.218 98692000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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ALEETMAFTTQALASVAYQVGNLAGHTLR Unmodified 3062.5495 0.54951953 4383 Q9P2A4 ABI3 ABI gene family member 3 yes yes 0 0 0 1 172.19 172.19 3 2.617E-66 173776 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.68 146.47 53860000 0 0 0 0 0 0 0 53860000 0 0 0 0 0 2306 4383 2148 21246 27133 27133 1 ALEEVPIHIEDPPFPSLR Unmodified 2058.0786 0.078591257 3341 Q5VZK9;A0A0U1RQQ1 LRRC16A Leucine-rich repeat-containing protein 16A yes no 0 0 0 1 127.86 127.86 3 0.039231 131491 QUIQUE_C1403_190116_001 28.355 19.536 25993000 0 0 0 25993000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2307 3341 2149 21247 27134 27134 1 ALEFAPACHR Unmodified 1170.5604 0.56041199 3963 Q99615;K7EPP7;K7ESP1;K7EIH8;K7ER44 DNAJC7 DnaJ homolog subfamily C member 7 yes no 0 0 0 1 1 32.377 32.377 3 0.042544 27063 QUIQUE_C1563_190116_001 37.344 26.734 54012000 0 0 0 0 0 24295000 29717000 0 0 0 0 0 0 2308 3963 2150 21248;21249 27135;27136 27135 2 ALEFVAR Unmodified 804.44939 0.4493882 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.599 46.599 2 0.01933 44195 QUIQUE_C1438_190116_001 114.54 57.087 1435300000 89304000 67299000 101420000 137380000 204070000 215660000 91378000 87925000 99909000 75629000 0 122130000 143190000 2309 2037 2151 21250;21251;21252;21253;21254;21255;21256;21257;21258;21259;21260;21261 27137;27138;27139;27140;27141;27142;27143;27144;27145;27146;27147;27148;27149;27150;27151;27152 27141 16 ALEHAFQLEHIMDLTR Unmodified 1922.9673 0.96726667 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 3 1 4 2 3 108.77 108.77 2;3;4 9.9255E-25 112359 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.19 116.53 1745500000 0 74446000 256800000 124400000 48704000 40247000 167530000 52072000 266750000 18615000 273440000 162590000 259880000 2310 3053 2152 21262;21263;21264;21265;21266;21267;21268;21269;21270;21271;21272;21273;21274;21275;21276;21277;21278;21279;21280;21281;21282;21283;21284;21285;21286;21287 27153;27154;27155;27156;27157;27158;27159;27160;27161;27162;27163;27164;27165;27166;27167;27168;27169;27170;27171;27172;27173;27174;27175;27176;27177;27178;27179;27180;27181;27182 27167 29 ALEHFPMLQK Unmodified 1212.6325 0.6325143 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 60.341 60.341 2;3 0.00022736 60118 QUIQUE_C1218_190116_001 111.46 99.589 269550000 32274000 0 64364000 40452000 25302000 44597000 0 18499000 0 12052000 0 0 32008000 2311 2463 2153 21288;21289;21290;21291;21292;21293;21294;21295;21296;21297 27183;27184;27185;27186;27187;27188;27189;27190;27191;27192;27193;27194;27195;27196;27197 27183 15 ALEHFTDLYDIK Unmodified 1463.7296 0.72964538 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 3 3 2 3 3 2 2 2 2 2 2 1 92.346 92.346 2;3 3.4803E-14 90061 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.64 121.9 17216000000 2475500000 2277500000 1010900000 1100200000 1915700000 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21327;21328;21329;21330;21331;21332;21333;21334;21335;21336;21337;21338;21339;21340;21341;21342;21343;21344;21345;21346;21347;21348;21349;21350;21351;21352;21353;21354;21355;21356 27245;27246;27247;27248;27249;27250;27251;27252;27253;27254;27255;27256;27257;27258;27259;27260;27261;27262;27263;27264;27265;27266;27267;27268;27269;27270;27271;27272;27273;27274;27275;27276;27277;27278;27279;27280;27281;27282;27283;27284;27285;27286;27287;27288;27289;27290;27291;27292;27293;27294;27295;27296;27297;27298;27299;27300;27301;27302 27296 55 ALEHSALAINHK Unmodified 1302.7044 0.70443369 476;4267 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;B4E1E0;A0A3B3ITB8;A0A3B3ISY3;Q9NRF8 CTPS1;CTPS2 CTP synthase 1;CTP synthase;CTP synthase 2 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 2 2 1 2 17.464 17.464 2;3 4.1223E-07 10530 QUIQUE_C1218_190116_001 167.93 149.26 1018100000 20230000 96140000 97692000 86957000 11131000 67334000 109930000 88831000 97147000 0 101150000 74637000 166970000 2314 476;4267 2156 21357;21358;21359;21360;21361;21362;21363;21364;21365;21366;21367;21368;21369;21370;21371;21372;21373;21374 27303;27304;27305;27306;27307;27308;27309;27310;27311;27312;27313;27314;27315;27316;27317;27318;27319;27320;27321 27303 16 ALEIADFSGNPLSR Unmodified 1488.7573 0.75725712 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 1 116.06 116.06 2 0.013182 120501 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.267 30.853 36726000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36726000 2315 289 2157 21375;21376 27322;27323 27323 1 ALEICQQR Unmodified 1016.5073 0.50731378 2541 P49754 VPS41 Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog yes yes 0 0 0 1 27.11 27.11 2 0.058687 21259 QUIQUE_C1576_190116_001 53.554 3.4278 35321000 0 0 0 0 0 0 35321000 0 0 0 0 0 0 2316 2541 2158 21377 27324 27324 1 ALEIFAYALQYFK Unmodified 1575.8337 0.83371653 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 1 169.56 169.56 2;3 0.00011418 176856 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ALEILQEEDLIDEDDIPVR Unmodified 2224.1111 0.11107318 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.78 145.78 2 1.0514E-86 153011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.35 183.49 477800000 36465000 52976000 0 0 89607000 31978000 0 46330000 0 33245000 75270000 74095000 37829000 2319 290;327;328 2161 21407;21408;21409;21410;21411;21412;21413;21414;21415 27369;27370;27371;27372;27373;27374;27375;27376;27377 27375 7 ALEIPGEELPGVCSAR Unmodified 1696.8454 0.8454202 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3;J3QKZ8 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 104.15 104.15 2 0.048731 107398 QUIQUE_C1218_190116_001 51.013 13.67 42890000 42890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2320 2198 2162 21416 27378 27378 1 ALEIQPGFIR Unmodified 1142.6448 0.64479354 3552 Q8IYB4 PEX5L PEX5-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.076 89.076 2 0.0039027 90982 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.253 37.272 182870000 0 31800000 29714000 0 0 0 0 25979000 0 0 19514000 35736000 40128000 2321 3552 2163 21417;21418;21419;21420;21421;21422 27379;27380;27381;27382;27383;27384 27383 3 ALEIYATR Unmodified 935.50763 0.50763136 4116 Q9H0B6;A8MZ87 KLC2 Kinesin light chain 2 yes no 0 0 0 1 1 45.475 45.475 2 0.053534 42195 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.776 25.675 79052000 0 0 0 0 0 0 34739000 0 0 0 0 0 44312000 2322 4116 2164 21423;21424 27385;27386 27386 2 ALEIYQTK Unmodified 964.52295 0.52294707 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.844 38.844 2 0.009742 35535 QUIQUE_C1218_190116_001 92.187 43.683 819380000 99769000 0 101560000 83996000 98599000 91626000 96970000 0 0 49486000 104570000 92802000 0 2323 1050 2165 21425;21426;21427;21428;21429;21430;21431;21432;21433 27387;27388;27389;27390;27391;27392;27393;27394;27395;27396;27397;27398 27387 11 ALELCEILAK Unmodified 1158.6318 0.63184559 2525 P49354;B3KVN2 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 107.94 107.94 2 0.015545 109909 QUIQUE_C1563_190116_001 85.731 60.808 102920000 0 0 0 0 0 102920000 0 0 0 0 0 0 0 2324 2525 2166 21434 27399 27399 0 ALELDGQSVK Unmodified 1058.5608 0.56078914 4509 Q9UNE7;H3BS86 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 1 1 46.124 46.124 2 0.011915 42814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.621 12.653 114190000 0 0 0 0 0 0 0 81959000 0 32230000 0 0 0 2325 4509 2167 21435;21436 27400;27401 27400 2 ALELDPDNETYK Unmodified 1406.6565 0.65654002 1551 O43765 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.917 65.917 2 0.0004795 64875 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.83 94.377 992760000 168020000 0 0 0 167660000 0 137670000 118820000 137470000 0 125900000 0 137210000 2326 1551 2168 21437;21438;21439;21440;21441;21442;21443;21444 27402;27403;27404;27405;27406;27407;27408;27409;27410;27411;27412 27412 11 ALELDPNLYR Unmodified 1202.6295 0.62953741 2379;2385 P35749;P35580 MYH11;MYH10 Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 92.288 92.288 2 0.0021892 93653 QUIQUE_C1277_190116_001 91.318 64.064 362360000 0 211770000 0 0 0 0 0 98030000 0 52554000 0 0 0 2327 2385;2379 2169 21445;21446;21447 27413;27414;27415;27416 27414 4 ALELDQER Unmodified 972.48762 0.4876242 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.235 32.235 2 0.0036109 27150 QUIQUE_C1277_190116_001 114.6 66.099 1607000000 0 198920000 0 217680000 166430000 184550000 213240000 0 244570000 139630000 241990000 0 0 2328 434 2170 21448;21449;21450;21451;21452;21453;21454;21455;21456 27417;27418;27419;27420;27421;27422;27423;27424;27425 27417 7 ALELDSNLYR Unmodified 1192.6088 0.60880197 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 79.867 79.867 2 0.0001484 79891 QUIQUE_C1403_190116_001 122.19 89.347 635650000 173140000 0 0 194950000 0 175680000 0 0 0 91883000 0 0 0 2329 2378 2171 21457;21458;21459;21460 27426;27427;27428;27429;27430;27431;27432 27427 7 ALELDSNNEK Unmodified 1131.5408 0.54078198 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.415 25.415 2 0.0001513 19467 QUIQUE_C1218_190116_001 120.87 88.726 2188200000 200500000 164710000 169450000 198850000 218270000 211810000 226050000 0 142810000 0 267170000 199660000 188930000 2330 2876 2172 21461;21462;21463;21464;21465;21466;21467;21468;21469;21470;21471;21472 27433;27434;27435;27436;27437;27438;27439;27440;27441;27442;27443;27444;27445 27433 12 ALELENDR Unmodified 958.47197 0.47197413 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.316 29.316 2 0.0039847 24591 QUIQUE_C1218_190116_001 110.81 63.741 3583600000 400670000 431080000 395640000 291890000 375290000 361360000 334200000 160600000 0 161090000 366560000 305240000 0 2331 2886 2173 21473;21474;21475;21476;21477;21478;21479;21480;21481;21482;21483 27446;27447;27448;27449;27450;27451;27452;27453;27454;27455;27456 27446 8 ALELENDRLLLK Unmodified 1425.8191 0.81912909 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 82.062 82.062 2;3 7.6325E-06 83306 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.36 98.577 569190000 0 0 0 0 0 0 0 238260000 129450000 0 63643000 59314000 78513000 2332 2886 2174 21484;21485;21486;21487;21488;21489;21490 27457;27458;27459;27460;27461;27462;27463;27464;27465 27458 9 ALELEQER Unmodified 986.50327 0.50327426 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 31.958 31.958 2 0.0026609 26755 QUIQUE_C1563_190116_001 135.35 0 8561400000 0 0 0 0 1513400000 1315000000 0 1588200000 0 0 2025200000 0 2119500000 2333 2248 2175 21491;21492;21493;21494;21495;21496 27466;27467;27468;27469;27470;27471 27468 5 ALELEQERK Unmodified 1114.5982 0.59823728 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 18.129 18.129 3 0.045197 10869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.696 9.0379 45259000 0 0 0 0 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64.954 64.954 2 0.017221 64875 QUIQUE_C1576_190116_001 56.258 45.107 75064000 0 0 0 35681000 0 0 39383000 0 0 0 0 0 0 2344 3962 2185 21567;21568 27570;27571 27571 1 ALENDPDCR Unmodified 1088.4557 0.45567214 2066;181 A0A0A0MSQ0;P13797;U3KQI3;P13796;Q5TBN3 PLS3;LCP1 Plastin-3;Plastin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.369 16.369 2 0.0013568 9196 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.44 100.32 1113700000 60608000 113870000 72945000 190470000 50433000 74640000 41151000 112410000 110500000 87388000 27850000 120890000 50595000 2345 181;2066 2186 21569;21570;21571;21572;21573;21574;21575;21576;21577;21578;21579;21580;21581 27572;27573;27574;27575;27576;27577;27578;27579;27580;27581;27582;27583;27584;27585;27586 27581 15 ALENPDTASLLGR Unmodified 1355.7045 0.70449327 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 78.096 78.096 2 0.0014139 79782 QUIQUE_C1218_190116_001 129.89 92.161 215150000 50795000 69999000 0 0 0 0 0 0 0 0 94358000 0 0 2346 4161 2187 21582;21583;21584 27587;27588;27589 27587 1 ALENSSLMK Oxidation (M) 1007.4957 0.49574604 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 18.991 18.991 2 0.06437 12003 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.554 20.245 39721000 0 0 0 0 0 0 0 39721000 0 0 0 0 0 2347 62 2188 21585 27590 27590 1 ALENVLSGKA Unmodified 1000.5553 0.55530983 1542 O43678 NDUFA2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 yes yes 0 0 1 1 53.444 53.444 2 0.032036 52032 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.433 4.6585 58557000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58557000 2348 1542 2189 21586 27591 27591 1 ALEPQGLLLYNGNAR Unmodified 1627.8682 0.86820455 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 2 1 101.94 101.94 2;3 0.025094 105943 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.167 48.848 90486000 0 0 0 0 0 0 0 42346000 0 0 48141000 0 0 2349 1408 2190 21587;21588;21589 27592;27593;27594 27594 2 ALEQFATVVEAK Unmodified 1304.6976 0.69761697 2539 P49748;G3V1M7;J3QRJ8;K7EMF8 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.909 85.909 2 9.3912E-06 88734 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.28 91.239 3032200000 248120000 202380000 281220000 193400000 189040000 226720000 223680000 214440000 338850000 123480000 309840000 226610000 254390000 2350 2539 2191 21590;21591;21592;21593;21594;21595;21596;21597;21598;21599;21600;21601;21602 27595;27596;27597;27598;27599;27600;27601;27602;27603;27604;27605;27606;27607;27608;27609;27610;27611;27612;27613 27610 18 ALEQKPDDAQYYCQR Unmodified 1883.8472 0.84721111 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 1 1 2 2 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 35.522 35.522 2;3 7.5329E-19 30801 QUIQUE_C1563_190116_001 146.96 137.79 1785600000 88427000 164020000 139720000 155220000 158740000 176300000 163260000 126310000 121470000 48568000 166330000 113120000 164160000 2351 4572 2192 21603;21604;21605;21606;21607;21608;21609;21610;21611;21612;21613;21614;21615;21616;21617;21618;21619;21620;21621;21622;21623;21624;21625;21626;21627 27614;27615;27616;27617;27618;27619;27620;27621;27622;27623;27624;27625;27626;27627;27628;27629;27630;27631;27632;27633;27634;27635;27636;27637;27638;27639;27640 27626 26 ALEQLLTELDDFLK Unmodified 1646.8767 0.87670355 3595 Q8N4X5 AFAP1L2 Actin filament-associated protein 1-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 172.89 172.89 2 0.00019577 177203 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.55 87.59 45813000 0 0 0 0 0 0 0 0 25118000 0 20695000 0 0 2352 3595 2193 21628;21629 27641;27642 27641 2 ALEQQMESHR Unmodified 1227.5666 0.56661958 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 18.365 18.365 2;3 0.0027159 10791 QUIQUE_C1368_190116_001 88.37 56.528 237970000 79714000 31074000 21602000 21600000 14063000 20186000 26919000 0 0 0 0 0 22813000 2353 1568 2194 21630;21631;21632;21633;21634;21635;21636;21637;21638 27643;27644;27645;27646;27647;27648;27649;27650;27651 27646 8 ALEQQVEEMK Oxidation (M) 1219.5755 0.57545293 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 26.027 26.027 2 0.0018369 19841 QUIQUE_C1403_190116_001 96.311 61.38 89963000 16016000 13083000 17092000 23258000 20514000 0 0 0 0 0 0 0 0 2354 2378 2195 21639;21640;21641;21642;21643 27652;27653;27654;27655;27656 27655 1776 5 ALEQQVEEMK Unmodified 1203.5805 0.58053831 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 49.332 49.332 2 0.0088414 47917 QUIQUE_C1218_190116_001 109.71 68.266 599170000 131530000 0 210960000 256690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2355 2378 2195 21644;21645;21646;21647;21648 27657;27658;27659;27660;27661 27657 3 ALEQQVEEMKTQLEELEDELQATEDAK Unmodified 3146.4813 0.48128436 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 166.93 166.93 3 2.8368E-44 170689 QUIQUE_DMIX7_190116_001 131.57 124.53 74576000 0 0 0 0 0 0 0 74576000 0 0 0 0 0 2356 2378 2196 21649;21650 27662;27663;27664 27664 3 ALEQQVEEMR Unmodified 1231.5867 0.58668632 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 55.014 55.014 2 0.00022711 52678 QUIQUE_C1403_190116_001 135.79 102.95 603140000 96698000 107820000 107270000 100240000 0 60518000 92350000 0 0 38235000 0 0 0 2357 2379 2197 21651;21652;21653;21654;21655;21656;21657 27665;27666;27667;27668;27669;27670;27671 27668 7 ALESDMAPVLIMATNR Unmodified 1730.8695 0.86952646 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 3 1 1 1 1 128.32 128.32 2;3 7.7845E-07 132141 QUIQUE_C1403_190116_001 133.71 108.27 640370000 19684000 19810000 117220000 89023000 73877000 52352000 102440000 0 22769000 22051000 25648000 0 95504000 2358 4536 2198 21658;21659;21660;21661;21662;21663;21664;21665;21666;21667;21668;21669;21670;21671;21672 27672;27673;27674;27675;27676;27677;27678;27679;27680;27681;27682;27683;27684;27685;27686;27687;27688 27677 16 ALESDMAPVLIMATNR Oxidation (M) 1746.8644 0.86444108 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 1 0 1 99.105 99.105 2 0.039851 101717 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27694;27695;27696;27697;27698;27699 27694 6 ALESPERPFLAILGGAK Unmodified 1767.9883 0.98831969 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 117.72 117.72 2;3 5.41E-52 121604 QUIQUE_C1277_190116_001 196.11 155.96 58018000000 4413900000 4871600000 5444500000 4386800000 4630400000 3691900000 4035000000 4442500000 4848100000 1697100000 5465200000 4793800000 5297300000 2363 1790 2202 21684;21685;21686;21687;21688;21689;21690;21691;21692;21693;21694;21695;21696;21697;21698;21699;21700;21701;21702;21703;21704;21705;21706;21707;21708;21709 27700;27701;27702;27703;27704;27705;27706;27707;27708;27709;27710;27711;27712;27713;27714;27715;27716;27717;27718;27719;27720;27721;27722;27723;27724;27725;27726;27727;27728;27729;27730;27731;27732;27733;27734;27735;27736;27737;27738;27739;27740;27741;27742;27743;27744;27745;27746;27747;27748;27749;27750;27751;27752;27753;27754;27755;27756;27757;27758;27759;27760;27761;27762;27763;27764;27765;27766;27767;27768;27769;27770;27771;27772;27773;27774;27775;27776;27777;27778 27710 79 ALESSEELLETANQTLQAMDSEDFPQAAK Unmodified 3165.466 0.46596864 4024 Q9BTV5;M0R366;M0R2F6 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 166.39 166.39 3 0.00012433 170832 QUIQUE_C1218_190116_001 43.681 41.124 45988000 45988000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2364 4024 2203 21710 27779 27779 1 ALESSIAPIVIFASNR Unmodified 1686.9305 0.93047046 4542 Q9Y265;E7ETR0;H7C4G5;J3QLR1;H7C4I3 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 136.55 136.55 2;3 4.1601E-30 139488 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Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.74 131.74 2 2.593E-06 136225 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.24 133.37 1417000000 99652000 100020000 107700000 124140000 137820000 113970000 118260000 134100000 120090000 0 128820000 90411000 142010000 2367 4288 2206 21741;21742;21743;21744;21745;21746;21747;21748;21749;21750;21751;21752 27814;27815;27816;27817;27818;27819;27820;27821;27822;27823;27824;27825;27826;27827 27824 14 ALEVEECR Unmodified 1004.4597 0.45969489 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 25.068 25.068 2 0.030357 18764 QUIQUE_C1438_190116_001 67.032 41.093 178160000 0 0 57011000 0 100690000 0 0 0 0 20462000 0 0 0 2368 2834 2207 21753;21754;21755 27828;27829;27830;27831;27832 27829 5 ALEVFPEFAAAHSNLASVLQQQGK Unmodified 2554.318 0.31798668 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.84 137.84 3 6.3853E-12 142024 QUIQUE_C1277_190116_001 91.729 79.941 881390000 71318000 71362000 82181000 56848000 64526000 60212000 65595000 65575000 78947000 23484000 91648000 65026000 84672000 2369 1497 2208 21756;21757;21758;21759;21760;21761;21762;21763;21764;21765;21766;21767;21768 27833;27834;27835;27836;27837;27838;27839;27840;27841;27842;27843;27844;27845;27846;27847;27848;27849 27835 16 ALEVIKPAHILQEKEEQHQLAVTAYLK Unmodified 3098.7128 0.71282011 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 2 1 1 1 1 91.767 91.767 4;5 0.0031797 93534 QUIQUE_DMIX8_190116_001 32.708 26.678 220010000 0 0 30218000 0 0 0 0 39005000 69217000 0 0 0 81571000 2370 3046 2209 21769;21770;21771;21772 27850;27851;27852;27853 27853 4 ALEYACGIK Unmodified 1023.5059 0.5059168 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 42.757 42.757 2 0.0032955 39391 QUIQUE_C1368_190116_001 91.626 28.912 586350000 0 0 286440000 0 0 0 299910000 0 0 0 0 0 0 2371 4111 2210 21773;21774 27854;27855;27856 27854 3 ALEYFTCALQHR Unmodified 1507.7242 0.72418285 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 82.188 82.188 3 0.044559 82477 QUIQUE_C1563_190116_001 35.523 27.612 7328600 0 0 0 0 0 7328600 0 0 0 0 0 0 0 2372 3391 2211 21775 27857 27857 0 ALEYIENLR Unmodified 1119.5924 0.59242362 2056 P13521;C9JDT0;C9JQI2 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes no 0 0 0 1 80.186 80.186 2 0.028741 82736 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.169 38.008 30703000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30703000 0 0 2373 2056 2212 21776 27858 27858 1 ALEYTIYNQELNETR Unmodified 1855.8952 0.89520716 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.365 94.365 2 2.7048E-24 95796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 183.08 168.66 166380000 0 0 0 34906000 0 28531000 26815000 31067000 0 16757000 0 28304000 0 2374 4532 2213 21777;21778;21779;21780;21781;21782;21783 27859;27860;27861;27862;27863;27864;27865 27863 7 ALFAISCLVR Unmodified 1148.6376 0.63759967 4350 Q9NZL4;K7EN20 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.05 119.05 2 0.00988 116830 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.598 49.078 466480000 0 52372000 42044000 0 54928000 0 0 0 63109000 29454000 81604000 70382000 72590000 2375 4350 2214 21784;21785;21786;21787;21788;21789;21790;21791 27866;27867;27868;27869;27870;27871;27872;27873;27874;27875 27871 10 ALFARPDLLLLDEPTNMLDVR Unmodified 2411.2883 0.28826646 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 154.09 154.09 3 0.00092415 158375 QUIQUE_C1277_190116_001 54.582 47.221 113490000 0 22738000 0 31938000 0 0 0 20402000 0 0 0 38408000 0 2376 4299 2215 21792;21793;21794;21795 27876;27877;27878;27879 27876 4 ALFAVPK Unmodified 744.45341 0.45341094 1554 O43809;H3BND3 NUDT21 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 59.88 59.88 2 0.05526 58282 QUIQUE_C1403_190116_001 72.021 29.302 274170000 0 78595000 0 63851000 0 0 0 0 58949000 0 0 72771000 0 2377 1554 2216 21796;21797;21798;21799 27880;27881;27882;27883 27881 4 ALFDFLK Unmodified 852.47454 0.47454032 332;2639 A0A1B0GWF9;A0A1B0GUK4;A0A1B0GVB2;A0A1B0GTS4;A0A1B0GU53;E7EN11;A0A1B0GTF6;A0A1B0GTA9;A0A1B0GTN8;H0Y476;A0A1C7CYX2;A0A1B0GTX2;O00305;A0A1B0GTP5;A0A1B0GUI8;Q02641;F8VU10;P54284;F8VNV8;F8VUW8 CACNB4;CACNB1;CACNB3 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4;Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1;Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 no no 0 0 0 1 1 1 129.6 129.6 2 0.053305 134536 QUIQUE_C1218_190116_001 73.039 34.668 106220000 48208000 0 0 33790000 0 0 0 24221000 0 0 0 0 0 2378 332;2639 2217 21800;21801;21802 27884;27885;27886 27884 3 ALFDFNGNDEEDLPFK Unmodified 1869.8421 0.84210896 2479 P46108 CRK Adapter molecule crk yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.61 144.61 2 1.4133E-10 149558 QUIQUE_DMIX8_190116_001 155.48 146.16 946270000 77271000 75393000 78695000 73737000 70969000 80226000 72952000 79844000 77127000 29294000 92218000 64429000 74112000 2379 2479 2218 21803;21804;21805;21806;21807;21808;21809;21810;21811;21812;21813;21814;21815 27887;27888;27889;27890;27891;27892;27893;27894;27895;27896;27897;27898;27899;27900;27901;27902;27903;27904 27904 17 ALFDFNGNDEEDLPFKK Unmodified 1997.9371 0.93707198 2479 P46108 CRK Adapter molecule crk yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 119.83 119.83 2;3 1.5962E-06 125490 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.24 94.056 912860000 46712000 54152000 45894000 52466000 53346000 51377000 61988000 84479000 122370000 27288000 141640000 75152000 96003000 2380 2479 2219 21816;21817;21818;21819;21820;21821;21822;21823;21824;21825;21826;21827;21828;21829;21830;21831 27905;27906;27907;27908;27909;27910;27911;27912;27913;27914;27915;27916;27917;27918;27919;27920 27916 13 ALFDYDKTK Unmodified 1099.555 0.55497548 487;2954 Q12959;A0A0C4DFT3;E7EQD7;B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19 DLG1;DLG4 Disks large homolog 1;Disks large homolog 4 no no 0 0 1 1 1 1 40.055 40.055 3 0.010151 36926 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.397 54.459 25877000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25877000 0 0 2381 2954;487 2220 21832;21833;21834 27921;27922;27923 27922 3 ALFEEVPELLTEAEK Unmodified 1716.8822 0.88218286 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 148.59 148.59 2;3 1.5234E-06 144657 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.32 118.42 2618000000 202020000 183710000 284640000 274810000 285260000 337140000 238830000 78831000 166430000 127090000 161100000 112220000 165870000 2382 2339 2221 21835;21836;21837;21838;21839;21840;21841;21842;21843;21844;21845;21846;21847;21848;21849;21850;21851;21852;21853;21854;21855;21856;21857;21858 27924;27925;27926;27927;27928;27929;27930;27931;27932;27933;27934;27935;27936;27937;27938;27939;27940;27941;27942;27943;27944;27945;27946;27947;27948;27949;27950;27951;27952;27953;27954;27955;27956;27957 27948 33 ALFEEVPELLTEAEKK Unmodified 1844.9771 0.97714588 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.18 133.18 3 2.1175E-07 137922 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.751 89.023 2196100000 111150000 109170000 182260000 101680000 163810000 89615000 175890000 229220000 237460000 57595000 255860000 217570000 264780000 2383 2339 2222 21859;21860;21861;21862;21863;21864;21865;21866;21867;21868;21869;21870;21871 27958;27959;27960;27961;27962;27963;27964;27965;27966;27967;27968;27969;27970;27971;27972;27973;27974;27975;27976;27977;27978;27979;27980;27981;27982;27983 27975 26 ALFLETEQLK Unmodified 1190.6547 0.65468953 3023 Q13740;F5GXJ9 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 88.545 88.545 2 0.0015444 85351 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.367 73.98 291550000 138550000 95021000 0 0 0 0 0 0 0 57979000 0 0 0 2384 3023 2223 21872;21873;21874 27984;27985;27986;27987 27987 4 ALFLETEQLKK Unmodified 1318.7497 0.74965254 3023 Q13740;F5GXJ9 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 59.823 59.823 2;3 0.00016822 59334 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.189 68.356 1115200000 0 114880000 77465000 85856000 134810000 0 158260000 96237000 104500000 36971000 159400000 44780000 102020000 2385 3023 2224 21875;21876;21877;21878;21879;21880;21881;21882;21883;21884;21885;21886;21887;21888;21889 27988;27989;27990;27991;27992;27993;27994;27995;27996;27997;27998;27999;28000;28001;28002;28003 27997 16 ALFLIPR Unmodified 828.52216 0.52215921 4473;3590;263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;Q8N4C8;I3L2I2;Q9UKE5;C9J338 MAP4K4;MINK1;TNIK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4;Misshapen-like kinase 1;TRAF2 and NCK-interacting protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.672 91.672 2 0.009917 93861 QUIQUE_C1368_190116_001 143.22 45.195 1236200000 108770000 114290000 93147000 102200000 35475000 80270000 116610000 78014000 117100000 49440000 109770000 116870000 114220000 2386 263;3590;4473 2225 21890;21891;21892;21893;21894;21895;21896;21897;21898;21899;21900;21901;21902 28004;28005;28006;28007;28008;28009;28010;28011;28012;28013;28014;28015;28016;28017;28018;28019;28020;28021;28022;28023;28024;28025 28009 22 ALFLYSR Unmodified 868.48069 0.48068833 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 70.925 70.925 2 0.01962 72154 QUIQUE_C1218_190116_001 118.69 50.288 314450000 43445000 55584000 0 32357000 0 0 0 43890000 52469000 0 86709000 0 0 2387 1909 2226 21903;21904;21905;21906;21907;21908 28026;28027;28028;28029;28030;28031 28026 4 ALFLYTSHLR Unmodified 1219.6713 0.67134264 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.642 67.642 3 0.0045919 67501 QUIQUE_C1368_190116_001 63.216 50.6 207500000 0 19000000 43616000 0 30423000 0 0 0 34302000 0 35465000 20770000 23922000 2388 1750 2227 21909;21910;21911;21912;21913;21914;21915 28032;28033;28034;28035;28036;28037;28038 28033 6 ALFQDIK Unmodified 833.4647 0.46470391 1840 P02792 FTL Ferritin light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.005 56.005 2 0.019482 54790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.28 25.192 8962700000 614940000 545520000 724160000 606860000 610950000 745230000 0 579700000 2817000000 395620000 0 523200000 799550000 2389 1840 2228 21916;21917;21918;21919;21920;21921;21922;21923;21924;21925;21926 28039;28040;28041;28042;28043;28044;28045;28046;28047;28048;28049;28050;28051;28052;28053;28054;28055 28049 17 ALFVSEEEKK Unmodified 1178.6183 0.61830402 630 E7ETN3;B4E1Z4;P00751;H7C5H1 CFB Complement factor B;Complement factor B Ba fragment;Complement factor B Bb fragment yes no 0 0 1 1 24.408 24.408 2 0.013945 18303 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21967;21968;21969;21970;21971;21972;21973;21974;21975;21976;21977 28103;28104;28105;28106;28107;28108;28109;28110;28111;28112;28113;28114;28115;28116 28107 13 ALGAQDLTEAEGWHFFCFQGEATR Unmodified 2740.234 0.23399905 3848 Q96F10;I3L0W4 SAT2 Diamine acetyltransferase 2 yes no 0 0 0 1 1 142.35 142.35 3 0.0032313 149635 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.813 39.657 60050000 0 0 0 0 0 0 0 0 22502000 0 37548000 0 0 2395 3848 2234 21978;21979 28117;28118 28118 0 ALGDFDYK Unmodified 927.4338 0.43379771 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 0 1 62.305 62.305 2 0.046015 60632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.721 39.451 46397000 0 0 0 0 0 0 0 46397000 0 0 0 0 0 2396 2387 2235 21980 28119 28119 1 ALGDLISATK Unmodified 987.56006 0.56006086 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.423 72.423 2 0.0018689 72470 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.111 52.871 1236000000 103990000 101790000 147160000 0 138010000 99159000 0 122270000 122140000 74884000 118790000 112720000 95104000 2397 4600 2236 21981;21982;21983;21984;21985;21986;21987;21988;21989;21990;21991 28120;28121;28122;28123;28124;28125;28126;28127;28128;28129;28130;28131 28131 9 ALGEPITLFGEGPAER Unmodified 1655.8519 0.85188578 1512 O43172 PRPF4 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 yes yes 0 0 0 1 1 1 116.83 116.83 2 0.0006201 120995 QUIQUE_C1277_190116_001 75.088 60.853 111000000 0 35706000 36200000 0 39091000 0 0 0 0 0 0 0 0 2398 1512 2237 21992;21993;21994 28132;28133;28134 28132 3 ALGEYLER Unmodified 949.4869 0.48689592 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 52.81 52.81 2 0.0095269 51261 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.47 73.74 674400000 0 0 119460000 0 0 0 0 0 145930000 0 154030000 144800000 110180000 2399 3053 2238 21995;21996;21997;21998;21999 28135;28136;28137;28138;28139;28140 28137 6 ALGFPEGLVIQAYFACEK Unmodified 2012.0077 0.0077344999 2647 P54727 RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog B yes yes 0 0 0 1 159.17 159.17 2 0.05114 163691 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22011;22012;22013;22014;22015;22016;22017;22018;22019;22020;22021;22022;22023 28154;28155;28156;28157;28158;28159;28160;28161;28162;28163;28164;28165;28166;28167;28168;28169;28170;28171;28172;28173;28174;28175 28156 22 ALGGDLAPVPSSPQPK Unmodified 1532.8199 0.81985737 4665 Q9Y6V0 PCLO Protein piccolo yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 66.032 66.032 2 0.00095309 65393 QUIQUE_C1403_190116_001 71.153 56.692 140900000 27049000 0 20606000 19340000 25846000 0 0 30712000 0 0 0 17350000 0 2403 4665 2242 22024;22025;22026;22027;22028;22029 28176;28177;28178;28179;28180;28181;28182 28179 7 ALGHLDLSGNR Unmodified 1151.6047 0.60471964 1832 P02750 LRG1 Leucine-rich alpha-2-glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 36.258 36.258 3 0.029425 32448 QUIQUE_C1438_190116_001 30.205 2.8764 55997000 0 0 0 0 55997000 0 0 0 0 0 0 0 0 2404 1832 2243 22030;22031 28183;28184 28183 2 ALGIGVYPVR Unmodified 1043.6128 0.61276513 1418 O00562 PITPNM1 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 77.848 77.848 2 0.038131 78878 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.895 44.562 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2405 1418 2244 22032;22033 28185;28186 28185 2 ALGISPFHEHAEVVFTANDSGPR Unmodified 2450.1979 0.19787154 1836 P02766;A0A087WV45 TTR Transthyretin yes no 0 0 0 2 2 1 3 2 1 1 1 1 2 2 1 1 86.326 86.326 3;4 9.4862E-13 88372 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.27 87.174 848370000 79014000 35075000 55329000 100650000 90405000 65455000 78732000 48290000 41005000 58029000 83607000 68535000 44245000 2406 1836 2245 22034;22035;22036;22037;22038;22039;22040;22041;22042;22043;22044;22045;22046;22047;22048;22049;22050;22051;22052;22053 28187;28188;28189;28190;28191;28192;28193;28194;28195;28196;28197;28198;28199;28200;28201;28202;28203;28204;28205;28206;28207;28208;28209 28207 20 ALGLASGELAAR Unmodified 1127.6299 0.62987176 3725 Q8WZA9 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.156 63.156 2 9.0021E-05 60012 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.73 69.878 565370000 68014000 0 0 60156000 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ALGLNENDYK Unmodified 1135.551 0.55095274 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.741 49.741 2 0.00041584 47317 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.95 88.424 645990000 57250000 60647000 46122000 71281000 42224000 52124000 0 57247000 74367000 29449000 71649000 83632000 0 2411 153 2250 22093;22094;22095;22096;22097;22098;22099;22100;22101;22102;22103;22104 28257;28258;28259;28260;28261;28262;28263;28264;28265;28266;28267;28268;28269 28269 12 ALGLSALLLR Unmodified 1025.6597 0.65971533 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 124.27 124.27 2 0.03533 129062 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.679 31.067 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2412 934 2251 22105;22106 28270;28271 28270 2 ALGLVIR Unmodified 740.49086 0.49085908 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 59.542 59.542 2 0.067719 57841 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.939 12.995 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2413 3740 2252 22107 28272 28272 1 ALGNICYDSHEGR Unmodified 1490.6572 0.6572255 2605 P52306;D6RHH8 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 35.388 35.388 2;3 9.2559E-10 31150 QUIQUE_C1438_190116_001 141.88 134.75 1743100000 142180000 172710000 152180000 148550000 177550000 147280000 219660000 76299000 105430000 24068000 86138000 133200000 157890000 2414 2605 2253 22108;22109;22110;22111;22112;22113;22114;22115;22116;22117;22118;22119;22120;22121;22122;22123;22124;22125;22126;22127;22128;22129;22130;22131;22132 28273;28274;28275;28276;28277;28278;28279;28280;28281;28282;28283;28284;28285;28286;28287;28288;28289;28290;28291;28292;28293;28294;28295;28296;28297;28298 28283 25 ALGNICYDSHSLQAQLINMGVIPTLVK Unmodified 2954.5358 0.53578373 827 D6RHZ7 RAP1GDS1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 154.98 154.98 3 2.4924E-37 159221 QUIQUE_C1277_190116_001 128.97 126.34 1917000000 0 195590000 148590000 125310000 152410000 169490000 163310000 105610000 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28316;28317;28318;28319;28320;28321;28322;28323;28324;28325;28326;28327;28328;28329;28330;28331;28332;28333;28334;28335;28336;28337;28338;28339 28338 24 ALGPVESLQGHLR Unmodified 1375.7572 0.75719754 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 62.71 62.71 2;3 0.00016672 62881 QUIQUE_C1218_190116_001 72.496 62.708 2129000000 220160000 227440000 266690000 298310000 0 191970000 234940000 0 152170000 115280000 0 221560000 200500000 2418 57 2257 22162;22163;22164;22165;22166;22167;22168;22169;22170;22171;22172;22173;22174 28340;28341;28342;28343;28344;28345;28346;28347;28348;28349;28350;28351;28352;28353;28354;28355;28356;28357;28358;28359;28360;28361 28341 22 ALGPVESLQGHLRDPTK Unmodified 1816.9795 0.97954591 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 1 1 1 1 65.136 65.136 3;4 0.00095583 65001 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.09 48.169 165430000 0 0 0 0 0 0 0 69910000 0 0 0 59456000 36066000 2419 57 2258 22175;22176;22177 28362;28363;28364;28365 28363 3 ALGQAASDNSGPEDAKR Unmodified 1685.7969 0.7968901 101 A0A0G2JN29;A0A087X117;Q15155;A0A0G2JP90;A0A087WW46;H3BUC9 NOMO1 Nodal modulator 1 yes no 0 0 1 1 23.087 23.087 3 0.032292 16482 QUIQUE_C1368_190116_001 24.287 17.298 167390000 0 0 167390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2420 101 2259 22178 28366 28366 1 ALGQNPTNAEVLK Unmodified 1353.7252 0.72522871 1048;2080 P14649;F8W1I5;F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;F8VPF3 MYL6B;MYL6 Myosin light chain 6B;Myosin light polypeptide 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.378 46.378 2 0.0015222 44200 QUIQUE_C1438_190116_001 79.201 50.115 9159800000 870890000 984160000 975070000 687500000 904840000 639670000 843920000 414140000 587440000 146480000 788700000 623840000 693170000 2421 2080;1048 2260 22179;22180;22181;22182;22183;22184;22185;22186;22187;22188;22189;22190;22191 28367;28368;28369;28370;28371;28372;28373;28374;28375;28376;28377;28378;28379 28371 2 ALGSDHCPITLYLAL Unmodified 1642.8389 0.83887826 2266 P27695 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 143.34 143.34 2 0.029374 149119 QUIQUE_C1576_190116_001 44.863 23.993 407350000 0 0 0 0 0 0 150810000 89341000 167200000 0 0 0 0 2422 2266 2261 22192;22193;22194 28380;28381;28382 28380 3 ALGSDLDSSLASLVGNLGISGTTTK Unmodified 2376.2384 0.23839896 907 E9PDG8;O60641;H0YBT2 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 3 2 165.36 165.36 2;3 0 167091 QUIQUE_C1563_190116_001 321.81 300.06 6334900000 777040000 1284700000 0 874720000 152750000 275820000 138640000 545290000 386640000 32794000 482160000 348920000 1035500000 2423 907 2262 22195;22196;22197;22198;22199;22200;22201;22202;22203;22204;22205;22206;22207;22208;22209;22210;22211;22212;22213;22214;22215;22216;22217;22218 28383;28384;28385;28386;28387;28388;28389;28390;28391;28392;28393;28394;28395;28396;28397;28398;28399;28400;28401;28402;28403;28404;28405;28406;28407;28408 28392 24 ALGSILAYLTDAK Unmodified 1334.7446 0.74456717 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 1 146.11 146.11 2 0.0016289 149226 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.616 76.176 42159000 0 0 0 0 0 0 0 20263000 0 0 0 21896000 0 2424 4488 2263 22219;22220 28409;28410 28409 2 ALGSVGPVDLLVNNAAVALLQPFLEVTK Unmodified 2847.611 0.6109808 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3KRZ4;J3KSZ5 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 1 1 3 2 2 1 179.7 179.7 2;3 4.2952E-144 183272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 199.85 197.21 1438500000 7735900 0 0 0 0 0 0 182190000 204990000 0 772560000 149960000 121050000 2425 3464 2264 22221;22222;22223;22224;22225;22226;22227;22228;22229;22230 28411;28412;28413;28414;28415;28416;28417;28418;28419;28420;28421;28422;28423;28424;28425;28426 28416 14 ALGTEVIQLFPEK Unmodified 1443.7973 0.79733102 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 123 123 2 0.00016885 128428 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.48 117.2 1780300000 149130000 133140000 148850000 134330000 128970000 136690000 141000000 108970000 136810000 66188000 206530000 130880000 158860000 2426 1756 2265 22231;22232;22233;22234;22235;22236;22237;22238;22239;22240;22241;22242;22243;22244 28427;28428;28429;28430;28431;28432;28433;28434;28435;28436;28437;28438;28439;28440;28441;28442;28443;28444 28442 17 ALGTLVSHVTLR Unmodified 1265.7456 0.74557022 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 64.997 64.997 3 0.063235 65569 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.55 11.741 15085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15085000 0 0 2427 3740 2266 22245 28445 28445 1 ALGVALLACFCSDPELAAHPQVLNK Unmodified 2693.3669 0.36692748 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 139.24 139.24 2;3;4 7.8954E-58 142614 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.02 146.81 5179800000 331390000 583940000 324320000 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28469;28470;28471;28472;28473;28474;28475;28476;28477;28478;28479;28480;28481;28482;28483;28484;28485;28486;28487;28488;28489;28490;28491;28492;28493;28494;28495;28496;28497;28498;28499 28475 31 ALGVGFATR Unmodified 890.4974 0.49740102 1505 O15540 FABP7 Fatty acid-binding protein, brain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.781 52.781 2 0.00047712 51390 QUIQUE_C1438_190116_001 126.52 76.395 13237000000 0 1391300000 1360400000 942870000 1211700000 1676200000 908000000 0 1161800000 560810000 1393600000 1232800000 1397500000 2430 1505 2269 22281;22282;22283;22284;22285;22286;22287;22288;22289;22290;22291 28500;28501;28502;28503;28504;28505;28506;28507;28508;28509;28510;28511;28512 28503 10 ALGVLAQLIWSR Unmodified 1325.782 0.78195573 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;H0YIC4 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 148.99 148.99 2;3 7.4941E-28 153519 QUIQUE_C1403_190116_001 179.8 124.82 6130000000 473250000 464930000 413100000 225160000 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162540000 149130000 118600000 172100000 189070000 184610000 59824000 245870000 154290000 258170000 2433 2292 2271 22316;22317;22318;22319;22320;22321;22322;22323;22324;22325;22326 28550;28551;28552;28553;28554;28555;28556;28557;28558;28559;28560 28551 8 ALGWAAVYLSTCK Unmodified 1438.7279 0.72787125 185 A0A0G2JKZ1;A0A0A0MSV9;O15533;A2AB90;A0A0G2JH37;A0A0A0MT98 TAPBP Tapasin yes no 0 0 0 1 118.72 118.72 2 0.0088665 121271 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.641 50.333 30308000 0 0 0 0 0 0 0 30308000 0 0 0 0 0 2434 185 2272 22327 28561 28561 1 ALGYFAVVTGK Unmodified 1124.623 0.62299547 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.721 93.721 2 0.012997 95024 QUIQUE_C1563_190116_001 59.908 21.821 1212600000 157830000 140090000 111220000 0 0 89943000 0 123020000 151630000 0 161170000 129920000 147770000 2435 831;1569 2273 22328;22329;22330;22331;22332;22333;22334;22335;22336 28562;28563;28564;28565;28566;28567;28568;28569;28570 28565 4 ALHDEEATIIHHYAFSENPTVFK Unmodified 2668.2922 0.29216586 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 97.044 97.044 3;4 2.2723E-06 101091 QUIQUE_C1218_190116_001 69.27 58.586 373820000 130890000 0 65875000 0 0 14932000 0 0 0 0 93676000 68451000 0 2436 3419 2274 22337;22338;22339;22340;22341;22342 28571;28572;28573;28574;28575;28576 28572 6 ALHFGEFLNTTCK Unmodified 1536.7395 0.73949856 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.178 83.178 3 0.020622 84588 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.878 27.252 96928000 0 18283000 26862000 15400000 0 0 0 18048000 18335000 0 0 0 0 2437 934 2275 22343;22344;22345;22346;22347 28577;28578;28579;28580;28581 28581 3 ALHFVFK Unmodified 860.49086 0.49085908 4220 Q9HC38;I3L3Q4;I3NI27;I3NI24;I3L2C2;I3L1F4;I3L277 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.502 49.502 2 0.037484 48954 QUIQUE_C1218_190116_001 85.306 55.465 1034000000 143650000 135710000 102200000 81073000 0 71514000 0 102070000 108870000 0 96413000 94177000 98301000 2438 4220 2276 22348;22349;22350;22351;22352;22353;22354;22355;22356;22357 28582;28583;28584;28585;28586;28587;28588;28589;28590;28591;28592 28582 11 ALHHGIDLEK Unmodified 1131.6037 0.60365701 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 15.731 15.731 2;3 5.0201E-05 8632 QUIQUE_C1218_190116_001 115.78 88.892 4151700000 361140000 427870000 449760000 420870000 370940000 399510000 372540000 368310000 374630000 0 66015000 0 540140000 2439 2083 2277 22358;22359;22360;22361;22362;22363;22364;22365;22366;22367;22368;22369;22370 28593;28594;28595;28596;28597;28598;28599;28600;28601;28602;28603;28604;28605;28606;28607 28593 13 ALHLGNNVLQSLPSR Unmodified 1617.8951 0.895088 3539 Q8IWT6 LRRC8A Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A yes yes 0 0 0 1 81.12 81.12 3 0.042708 81744 QUIQUE_C1403_190116_001 41.378 34.649 45306000 0 0 0 45306000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2440 3539 2278 22371 28608 28608 0 ALHLLEEYR Unmodified 1142.6084 0.60840804 2954 Q12959;A0A0C4DFT3;E7EQD7;B4E2H8;C9JUA9;C9JN61;C9JCP6;A8MUT6;C9J110;F2Z2L0 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.105 58.105 3 0.00014865 57360 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.38 89.361 293530000 28369000 27435000 19663000 25269000 26046000 19693000 0 28298000 30458000 8322500 22843000 26517000 30620000 2441 2954 2279 22372;22373;22374;22375;22376;22377;22378;22379;22380;22381;22382;22383 28609;28610;28611;28612;28613;28614;28615;28616;28617;28618;28619;28620;28621 28615 13 ALHLVEDLR Unmodified 1064.5978 0.59784335 3504 Q86W92;A0A0A0MTP2;F5H6Q7;F5H0E0;F5H495 PPFIBP1 Liprin-beta-1 yes no 0 0 0 1 1 41.287 41.287 2;3 0.0076395 49234 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.418 19.164 40703000 0 0 0 0 0 30723000 0 0 0 9980500 0 0 0 2442 3504 2280 22384;22385 28622;28623 28623 1 ALHNLAQQAPEFSATQVFPR Unmodified 2224.1389 0.1389001 1283 J3KR97;Q9BTW9;I3L439;I3L163;I3L0V3;I3L500;I3L143;I3L4D2;I3L3H4;I3L131 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 96.848 96.848 3 2.5675E-09 99172 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.57 94.783 994220000 78840000 0 0 90124000 77569000 0 69567000 77861000 72444000 0 70337000 96145000 361340000 2443 1283 2281 22386;22387;22388;22389;22390;22391;22392;22393;22394;22395 28624;28625;28626;28627;28628;28629;28630;28631;28632;28633;28634;28635;28636;28637 28631 13 ALHPEEDPEGR Unmodified 1248.5735 0.57347909 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 16.651 16.651 2;3 0.00013868 8938 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.831 72.307 1611200000 98471000 119650000 131110000 66906000 139380000 106400000 206530000 143580000 168770000 31506000 66414000 135430000 197070000 2444 3862 2282 22396;22397;22398;22399;22400;22401;22402;22403;22404;22405;22406;22407;22408;22409;22410;22411;22412;22413;22414 28638;28639;28640;28641;28642;28643;28644;28645;28646;28647;28648;28649;28650;28651;28652;28653;28654;28655;28656;28657;28658 28652 18 ALHPLWESVDLVPGGDR Unmodified 1859.953 0.95299681 4553 Q9Y2D0;C9IZP3;C9JA11 CA5B Carbonic anhydrase 5B, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 116.37 116.37 3 8.078E-05 120749 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.975 44.06 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2445 4553 2283 22415;22416 28659;28660 28660 2 ALHRLILPSEK Unmodified 1275.7663 0.76630566 523 A3KMH1 VWA8 von Willebrand factor A domain-containing protein 8 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 14.374 14.374 3 0.056178 6610 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.478 18.981 686290000 0 0 0 0 0 0 0 0 179030000 0 202620000 175490000 129150000 2446 523 2284 22417;22418;22419;22420 28661;28662;28663;28664 28662 4 ALHSDRPPSASQPR Unmodified 1517.7699 0.76988749 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 10.41 10.41 4 1.3761E-07 2705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.95 104.73 59310000 19791000 6615000 0 0 0 0 0 22902000 0 10002000 0 0 0 2447 1416 2285 22421;22422;22423;22424 28665;28666;28667;28668 28667 4 ALHSLLLR Unmodified 921.57599 0.5759857 3110 Q15102;M0R1K3 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 39.882 39.882 2 0.015597 36851 QUIQUE_C1218_190116_001 112.59 61.738 651280000 144570000 129050000 0 0 0 0 0 123780000 129330000 0 124560000 0 0 2448 3110 2286 22425;22426;22427;22428;22429 28669;28670;28671;28672;28673;28674 28669 2 ALHSPQYIFGDFSPDEFNQFFVTPR Acetyl (Protein N-term) 3000.4083 0.40825825 3082 Q14694;H3BNA1;H3BNL0;Q68D90;H3BVF1 USP10;DKFZp686E14181 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 yes no 1 0 0 1 1 170.2 170.2 3 6.5098E-20 172018 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.06 101.29 36643000 0 0 0 0 0 0 0 17332000 0 0 0 0 19312000 2449 3082 2287 22430;22431 28675;28676 28675 2 ALHSVLQAVPLNELR Unmodified 1658.9468 0.94678922 3177 Q16401;F2Z3J2 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 3 2 2 94.928 94.928 2;3 2.2565E-54 97587 QUIQUE_C1277_190116_001 194.39 145.04 1153900000 100600000 84987000 97075000 89426000 112760000 66441000 62282000 75735000 55389000 27849000 163910000 114780000 102660000 2450 3177 2288 22432;22433;22434;22435;22436;22437;22438;22439;22440;22441;22442;22443;22444;22445;22446;22447;22448;22449;22450;22451;22452;22453;22454;22455 28677;28678;28679;28680;28681;28682;28683;28684;28685;28686;28687;28688;28689;28690;28691;28692;28693;28694;28695;28696;28697;28698;28699;28700;28701;28702;28703;28704 28680 27 ALIAAQYSGAQVR Unmodified 1346.7306 0.73064844 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.896 57.896 2 7.2767E-06 56767 QUIQUE_C1576_190116_001 107.79 48.438 11375000000 854300000 967390000 1019100000 1030200000 991380000 848410000 0 1024000000 901960000 356250000 1432500000 1127800000 821890000 2451 2255 2289 22456;22457;22458;22459;22460;22461;22462;22463;22464;22465;22466;22467;22468 28705;28706;28707;28708;28709;28710;28711;28712;28713;28714;28715;28716;28717;28718;28719;28720;28721;28722;28723 28713 19 ALIADSGLK Unmodified 886.51238 0.51238239 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;A0A0U1RQL1 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.11 42.11 2 0.00073327 39006 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.31 45.506 2794000000 0 0 408680000 323380000 0 435010000 0 252940000 385730000 0 536930000 0 451300000 2452 445 2290 22469;22470;22471;22472;22473;22474;22475 28724;28725;28726;28727;28728;28729;28730;28731 28729 7 ALIAGGGAPEIELALR Unmodified 1549.8828 0.88279198 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.87 120.87 2;3 1.6814E-07 123697 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.17 77.743 3809000000 0 535690000 0 586860000 0 578740000 557510000 602820000 0 411930000 0 0 535450000 2453 2573 2291 22476;22477;22478;22479;22480;22481;22482;22483 28732;28733;28734;28735;28736;28737;28738;28739 28737 3 ALIAQLPSPAIDHEQLR Unmodified 1871.0265 0.026496107 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.708 91.708 3 3.4831E-10 94238 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.39 90.107 36932000 0 0 0 0 0 0 0 36932000 0 0 0 0 0 2454 1187 2292 22484;22485;22486;22487 28740;28741;28742;28743 28742 4 ALIDPSSGLPNR Unmodified 1238.6619 0.66190017 3288 Q5QPM7;Q92530;F5H4Z3;H0Y555 PSMF1 Proteasome inhibitor PI31 subunit yes no 0 0 0 1 1 70.636 70.636 2 0.0024665 66803 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.087 70.186 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2455 3288 2293 22488;22489 28744;28745 28745 2 ALIEILATR Unmodified 998.61243 0.61243078 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 96.776 96.776 1;2 4.3078E-05 101117 QUIQUE_C1218_190116_001 147.19 25.566 12117000000 907590000 747430000 915510000 763920000 976500000 867990000 955030000 756560000 1194000000 522470000 1512300000 1134200000 863690000 2456 845;1936 2294 22490;22491;22492;22493;22494;22495;22496;22497;22498;22499;22500;22501;22502;22503 28746;28747;28748;28749;28750;28751;28752;28753;28754;28755;28756;28757;28758;28759;28760;28761;28762;28763;28764;28765;28766;28767;28768;28769;28770 28747 24 ALIESYQNLTR Unmodified 1306.6881 0.68811492 157 B6VEX4;A0A0A0MRT6;Q8IZP0 ABI1 Abl interactor 1 yes no 0 0 0 1 76.944 76.944 2 0.031344 73062 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.841 45.054 71371000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71371000 0 0 0 2457 157 2295 22504 28771 28771 1 ALIEVLQPLIAEHQAR Unmodified 1800.0258 0.025767826 2213 P23381 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 3 117.96 117.96 2;3 4.2983E-10 121869 QUIQUE_C1368_190116_001 158.4 147.19 9404500000 523060000 610280000 1711500000 926370000 797080000 579550000 567260000 500020000 499170000 265060000 1134100000 559740000 731250000 2458 2213 2296 22505;22506;22507;22508;22509;22510;22511;22512;22513;22514;22515;22516;22517;22518;22519;22520;22521;22522;22523;22524;22525;22526;22527;22528;22529;22530 28772;28773;28774;28775;28776;28777;28778;28779;28780;28781;28782;28783;28784;28785;28786;28787;28788;28789;28790;28791;28792;28793;28794;28795;28796;28797;28798;28799;28800;28801;28802;28803;28804;28805;28806;28807;28808;28809;28810;28811;28812;28813;28814;28815 28782 43 ALIFVSHGAGEHSGR Unmodified 1536.7797 0.77972389 217 A0A0C4DFN3;Q99685;A0A3B3ITT3;C9JAM4 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 24.491 24.491 2;3 0.00015216 18306 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.222 59.478 2935300000 310070000 228310000 478380000 251500000 212130000 205340000 165130000 202430000 266940000 88353000 305930000 42581000 178240000 2459 217 2297 22531;22532;22533;22534;22535;22536;22537;22538;22539;22540;22541;22542;22543;22544;22545;22546 28816;28817;28818;28819;28820;28821;28822;28823;28824;28825;28826;28827;28828;28829;28830;28831;28832;28833;28834;28835;28836;28837 28830 21 ALIFVSHGAGEHSGRYEELAR Unmodified 2298.1505 0.15052742 217 A0A0C4DFN3;Q99685;A0A3B3ITT3;C9JAM4 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 1 1 1 51.161 51.161 4 0.00085843 49415 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.425 36.998 76744000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38579000 38164000 0 2460 217 2298 22547;22548 28838;28839 28839 2 ALIGATNPADAPPGTIR Unmodified 1633.8788 0.87876924 2979 Q13232;H3BPR2 NME3 Nucleoside diphosphate kinase 3;Nucleoside diphosphate kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 72.415 72.415 2 3.9645E-13 72286 QUIQUE_DMIX7_190116_001 129.34 105.74 256990000 0 51076000 0 46938000 0 46941000 0 48846000 0 0 0 63184000 0 2461 2979 2299 22549;22550;22551;22552;22553 28840;28841;28842;28843;28844;28845 28845 6 ALILVGGYGTR Unmodified 1118.6448 0.64479354 4628 Q9Y5P6 GMPPB Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta yes yes 0 0 0 1 80.94 80.94 2 0.015195 81029 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22650;22651;22652;22653;22654;22655;22656;22657;22658;22659;22660;22661;22662;22663;22664;22665;22666;22667;22668 28970;28971;28972;28973;28974;28975;28976;28977;28978;28979;28980;28981;28982;28983;28984;28985;28986;28987;28988;28989;28990;28991;28992 28986 22 ALKEEIGNVQLEK Unmodified 1469.809 0.80895834 3490 Q86UP2;G3V4Y7;H0YJZ8;G3V5G2 KTN1 Kinectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.224 51.224 2 1.1945E-06 49460 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.76 98.338 198800000 19722000 41574000 34939000 0 0 0 30419000 0 0 0 47408000 0 24735000 2473 3490 2310 22669;22670;22671;22672;22673;22674;22675 28993;28994;28995;28996;28997;28998;28999 28998 6 ALKHELAFK Unmodified 1055.6128 0.61276513 3433 Q7L099;H0Y8I0 RUFY3 Protein RUFY3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 17.74 17.74 3 0.026005 10039 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.731 59.626 337720000 0 0 0 0 0 0 0 153460000 69857000 0 41143000 73261000 0 2474 3433 2311 22676;22677;22678;22679 29000;29001;29002;29003 29003 1 ALLADAQLMLDHLK Unmodified 1550.849 0.84904901 271 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29069;29070;29071;29072;29073;29074;29075;29076;29077;29078;29079;29080;29081;29082 29073 2 ALLALPIR Unmodified 865.57492 0.57492306 555 A6ZKI3 FAM127A Protein FAM127A yes yes 0 0 0 1 2 1 93.029 93.029 2 0.021335 95911 QUIQUE_C1576_190116_001 75.311 50.312 8403600 0 0 0 0 0 0 8403600 0 0 0 0 0 0 2482 555 2319 22741;22742;22743;22744 29083;29084;29085;29086 29086 4 ALLALPIRPATR Unmodified 1290.8136 0.81359021 555 A6ZKI3 FAM127A Protein FAM127A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 73.626 73.626 3 0.001543 74504 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.695 69.463 31304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31304000 2483 555 2320 22745;22746;22747;22748;22749 29087;29088;29089;29090;29091;29092 29091 6 ALLANALTSALR Unmodified 1212.719 0.71902112 2683 P57088;D6RAA6 TMEM33 Transmembrane protein 33 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.07 110.07 2 1.906E-05 113062 QUIQUE_DMIX8_190116_001 129.83 78.947 1186500000 69260000 60858000 63215000 58062000 67906000 52699000 105610000 105660000 130910000 33234000 149160000 124760000 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1802 2323 22773;22774;22775;22776;22777;22778;22779;22780;22781;22782;22783;22784;22785;22786;22787;22788;22789;22790 29118;29119;29120;29121;29122;29123;29124;29125;29126;29127;29128;29129;29130;29131;29132;29133;29134;29135;29136 29126 19 ALLCYNR Acetyl (Protein N-term) 950.46439 0.46438634 4430 Q9UHD1;E9PPQ5;E9PIZ4;E9PSD5;E9PL00;E9PIF7 CHORDC1 Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.105 93.105 2 0.014715 95453 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.26 74.333 209840000 27106000 35169000 21942000 0 0 25215000 0 0 0 0 28538000 35992000 35882000 2487 4430 2324 22791;22792;22793;22794;22795;22796;22797 29137;29138;29139;29140;29141;29142;29143;29144;29145 29145 9 ALLDASETTSTR Unmodified 1263.6307 0.63065962 3059 Q14258;A0A3B3IUA7 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 42.977 42.977 2 0.00052982 40033 QUIQUE_C1218_190116_001 103.7 70.86 224590000 57543000 0 0 37510000 0 0 55260000 33228000 41047000 0 0 0 0 2488 3059 2325 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16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.43 155.43 3 1.0019E-37 158135 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.62 133.04 1042400000 0 53316000 92033000 112010000 53083000 43410000 82944000 104150000 126940000 22336000 100450000 97588000 154120000 2493 16;1475 2330 22851;22852;22853;22854;22855;22856;22857;22858;22859;22860;22861;22862 29208;29209;29210;29211;29212;29213;29214;29215;29216;29217;29218;29219;29220;29221;29222;29223 29216 16 ALLEGESNPEIVIWAEHVENMPSEFR Oxidation (M) 3011.4335 0.43348672 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 1 0 1 143.3 143.3 3 0.00032408 146179 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.099 36.735 45956000 0 0 0 0 0 0 0 45956000 0 0 0 0 0 2494 16;1475 2330 22863 29224 29224 10 1 ALLELQEYFGSLAA Unmodified 1523.7872 0.78716026 4070 Q9BY32 ITPA Inosine triphosphate pyrophosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 169.73 169.73 2 9.7973E-07 174221 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.26 107.84 405030000 0 32051000 58394000 0 0 0 0 71934000 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1 1 1 1 1 131.69 131.69 2 0.00043526 137735 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.04 128.27 302450000 10418000 17158000 27038000 0 0 16936000 22400000 34988000 33062000 0 62656000 44603000 33189000 2497 1187 2333 22893;22894;22895;22896;22897;22898;22899;22900;22901;22902;22903;22904 29264;29265;29266;29267;29268;29269;29270;29271;29272;29273;29274;29275;29276;29277;29278 29275 15 ALLENLLQNIQSK Unmodified 1482.8406 0.84059282 829 E9PCZ3;D6RJC3;E7EQN9;O15327 INPP4B Type II inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.19 138.19 2 0.00031336 143990 QUIQUE_C1218_190116_001 110.84 78.107 112480000 19548000 23375000 20756000 25664000 23136000 0 0 0 0 0 0 0 0 2498 829 2334 22905;22906;22907;22908;22909;22910 29279;29280;29281;29282;29283;29284 29279 6 ALLEVICTLHK Unmodified 1295.7271 0.72714296 1026 F6VCX5;Q16816;C9JME8;C9J2Q6 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 86.383 86.383 3 0.01755 87626 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2341 22964;22965;22966;22967;22968;22969;22970;22971;22972;22973;22974;22975;22976 29351;29352;29353;29354;29355;29356;29357;29358;29359;29360;29361;29362;29363;29364;29365;29366;29367;29368;29369;29370;29371;29372;29373;29374;29375;29376;29377;29378 29369 28 ALLGPAPEDEDERPEAEDGPGAGDHALGLPAEVVEPEGPVAQR Unmodified 4356.0782 0.078216504 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GTE6;A0A0D9SFK7;A0A1B0GUH6;A0A1B0GVY9;A0A1B0GU96 KIAA1279;KIF1BP KIF1-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 115.47 115.47 4 5.313E-33 120729 QUIQUE_C1438_190116_001 87.753 80.615 409460000 0 0 62953000 74674000 83062000 0 103150000 0 0 42774000 0 42847000 0 2506 348 2342 22977;22978;22979;22980;22981;22982 29379;29380;29381;29382;29383;29384;29385;29386;29387 29383 8 ALLGYADNQCK Unmodified 1251.5918 0.59177169 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.109 47.109 2 4.1219E-05 44321 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.1 127.87 3008700000 278440000 0 300720000 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3512.6504 0.6503948 2804 P78333;A0A087WX91 GPC5 Glypican-5;Secreted glypican-5 yes no 0 0 2 1 129.19 129.19 5 0.066024 133915 QUIQUE_DMIX8_190116_001 16.801 11.257 110760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 110760000 2513 2804 2349 23014 29421;29422 29421 2 ALLLDALR Unmodified 883.5491 0.54910224 1354 K7ESN3;Q8N2G8 GHDC GH3 domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.08 98.08 2 0.018116 101133 QUIQUE_C1368_190116_001 80.462 7.4235 48394000 0 0 15640000 0 0 13473000 0 0 0 0 19281000 0 0 2514 1354 2350 23015;23016;23017;23018;23019;23020;23021;23022;23023 29423;29424;29425;29426;29427;29428;29429;29430;29431 29425 9 ALLLGLACNHNLK Unmodified 1435.797 0.79695386 3341 Q5VZK9;A0A0U1RQQ1 LRRC16A Leucine-rich repeat-containing protein 16A yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.345 71.345 3 0.0083571 71527 QUIQUE_C1368_190116_001 47.724 37.925 53876000 0 29939000 23937000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2515 3341 2351 23024;23025;23026;23027 29432;29433;29434;29435 29434 4 ALLLLCGEDD Unmodified 1117.5325 0.53252548 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 2 127.01 127.01 1;2 0.0014525 131745 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.473 85.752 4333300000 0 0 194690000 333850000 618640000 276660000 293540000 602600000 202130000 207570000 589710000 347830000 666090000 2516 1954 2352 23028;23029;23030;23031;23032;23033;23034;23035;23036;23037;23038;23039;23040;23041;23042;23043 29436;29437;29438;29439;29440;29441;29442;29443;29444;29445;29446;29447;29448;29449;29450;29451;29452;29453;29454;29455;29456;29457 29446 16 ALLLPDYYLVTVMLSGIK Unmodified 2008.1319 0.13187238 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 174.11 174.11 2;3 0.00019205 181254 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.82 60.001 154100000 0 0 0 0 0 0 0 0 32029000 0 96264000 25804000 0 2517 3432 2353 23044;23045;23046;23047 29458;29459;29460;29461 29459 3 ALLLSTYIK Unmodified 1020.6219 0.62193284 1749;1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1;O95782 AP2A2;AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-2;AP-2 complex subunit alpha-1 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.752 96.752 1;2 0.0010141 98763 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.66 79.152 5059900000 379810000 404160000 372800000 326330000 403020000 252730000 437730000 359350000 400590000 145410000 618580000 505390000 454010000 2518 1701;1749 2354 23048;23049;23050;23051;23052;23053;23054;23055;23056;23057;23058;23059;23060;23061 29462;29463;29464;29465;29466;29467;29468;29469;29470;29471;29472;29473;29474;29475;29476;29477 29477 15 ALLLVGDVAQAADVAIEHR Unmodified 1960.0742 0.074174581 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.96 136.96 3 5.7668E-08 143383 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.16 96.056 502240000 46657000 57471000 36781000 49743000 58026000 33751000 51530000 0 27422000 23523000 41457000 37992000 37889000 2519 4140 2355 23062;23063;23064;23065;23066;23067;23068;23069;23070;23071;23072;23073 29478;29479;29480;29481;29482;29483;29484;29485;29486;29487;29488;29489 29487 12 ALLNNSHYYHMAHGK Oxidation (M) 1770.826 0.82602216 1971 P09622;E9PEX6;F8WDM5;A0A1W2PR83;F2Z2E3 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 1 0 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 15.571 15.571 3;4 1.9854E-05 8428 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.207 78.469 2566500000 197940000 109010000 258680000 0 164030000 77848000 0 297620000 418200000 177010000 454070000 0 412140000 2520 1971 2356 23074;23075;23076;23077;23078;23079;23080;23081;23082;23083;23084;23085;23086;23087;23088;23089;23090 29490;29491;29492;29493;29494;29495;29496;29497;29498;29499;29500;29501;29502;29503;29504;29505;29506 29498 1240 16 ALLNNSHYYHMAHGK Unmodified 1754.8311 0.83110754 1971 P09622;E9PEX6;F8WDM5;A0A1W2PR83;F2Z2E3 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 3 3 2 2 2 3 4 2 3 21.986 21.986 2;3;4;5 5.6655E-79 15804 QUIQUE_C1218_190116_001 206.69 181.25 4093900000 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29538;29539;29540;29541;29542;29543;29544;29545;29546;29547;29548;29549;29550;29551;29552;29553;29554;29555;29556;29557 29554 20 ALLPHVLCK Unmodified 1049.6056 0.60557126 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.381 49.381 3 0.0046162 48726 QUIQUE_C1218_190116_001 57.96 42.298 781160000 64006000 67375000 82045000 59631000 70013000 55719000 77693000 76491000 0 0 81373000 73997000 72820000 2523 3208 2358 23132;23133;23134;23135;23136;23137;23138;23139;23140;23141;23142;23143 29558;29559;29560;29561;29562;29563;29564;29565;29566;29567;29568;29569;29570;29571;29572;29573;29574;29575;29576;29577;29578;29579 29559 22 ALLPILQWHK Unmodified 1217.7285 0.72846359 4365 Q9P0J1;E5RIV4 PDP1 [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.99 106.99 3 0.0042903 109743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.04 36.027 294890000 20338000 14189000 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29596;29597;29598;29599;29600;29601;29602;29603;29604;29605;29606;29607;29608 29598 3 ALLQEQFR Unmodified 1003.5451 0.5450795 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 0 1 1 55.938 55.938 2 0.033344 55610 QUIQUE_C1438_190116_001 64.757 28.056 43190000 0 0 0 0 19411000 0 0 0 0 0 23779000 0 0 2527 4299 2362 23171;23172 29609;29610 29609 2 ALLQLWQR Unmodified 1026.5974 0.59744942 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.139 99.139 2 0.0032345 102684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.72 86.702 76734000 16728000 31225000 0 0 0 0 0 0 0 0 28782000 0 0 2528 228 2363 23173;23174;23175;23176;23177;23178 29611;29612;29613;29614;29615;29616;29617 29617 7 ALLQMVQQFAVDFEK Oxidation (M) 1781.9022 0.9022068 2893;269;4528;840 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM1;DNM3 Dynamin-1;Dynamin-3 no no 0 1 0 2 3 4 2 3 3 3 1 2 2 2 1 152.66 152.66 2;3 9.2117E-36 157559 QUIQUE_DMIX7_190116_001 174.84 140.88 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23207;23208;23209;23210;23211;23212;23213;23214;23215;23216;23217;23218;23219;23220;23221;23222;23223;23224;23225;23226;23227;23228;23229;23230;23231;23232;23233;23234;23235;23236 29652;29653;29654;29655;29656;29657;29658;29659;29660;29661;29662;29663;29664;29665;29666;29667;29668;29669;29670;29671;29672;29673;29674;29675;29676;29677;29678;29679;29680;29681;29682;29683;29684;29685;29686;29687;29688 29673 35 ALLQMVQQFAVDFEKR Unmodified 1922.0084 0.0084032019 2893;269;4528;840 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM1;DNM3 Dynamin-1;Dynamin-3 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.23 158.23 3 1.1437E-44 165075 QUIQUE_DMIX5_190116_001 176.23 164.76 847750000 0 0 0 0 0 0 28694000 154920000 133410000 0 201410000 226130000 103190000 2531 269;2893;840;4528 2365 23237;23238;23239;23240;23241;23242 29689;29690;29691;29692;29693;29694;29695;29696;29697;29698;29699 29695 11 ALLQMVQQFAVDFEKR Oxidation (M) 1938.0033 0.003317824 2893;269;4528;840 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0 0 1 1 1 21.82 21.82 3 0.012314 15232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.61 20.491 29409000 0 0 0 0 0 0 0 29409000 0 0 0 0 0 2535 4428 2368 23253;23254 29710;29711 29710 2 ALLQSVR Unmodified 785.47594 0.4759373 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 30.087 30.087 2 0.062217 24530 QUIQUE_C1576_190116_001 68.398 10.946 79087000 0 0 0 0 0 0 79087000 0 0 0 0 0 0 2536 3452 2369 23255 29712 29712 1 ALLSAPWYLNR Unmodified 1302.7085 0.70845643 1185 H3BS10;H3BP20;P06865 HEXA Beta-hexosaminidase;Beta-hexosaminidase subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.22 117.22 2 0.00019138 120729 QUIQUE_DMIX7_190116_001 124.98 84.632 470490000 29096000 32307000 43777000 33468000 33291000 24643000 34288000 34752000 31726000 15582000 58708000 38524000 60327000 2537 1185 2370 23256;23257;23258;23259;23260;23261;23262;23263;23264;23265;23266;23267;23268 29713;29714;29715;29716;29717;29718;29719;29720;29721;29722;29723;29724;29725;29726;29727;29728 29727 15 ALLSNIEK Unmodified 886.51238 0.51238239 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 42.271 42.271 2 0.032564 37883 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.252 18.258 2012500000 0 320380000 0 0 313570000 0 424760000 0 0 116850000 0 385680000 451300000 2538 4268 2371 23269;23270;23271;23272;23273;23274 29729;29730;29731;29732;29733;29734 29734 6 ALLSQAEGSLFQPMGK Oxidation (M) 1691.8553 0.8552566 4693 yes no 0 1 0 1 135.13 135.13 2 0.043448 140045 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.283 25.744 129140000 0 0 0 0 0 0 0 0 129140000 0 0 0 0 + 2539 4693 2372 23275 29735 29735 1 ALLSTMHTVLWAGETK Unmodified 1756.9182 0.91819121 1607 O75061 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 1 2 101.55 101.55 2;3 1.8178E-07 104401 QUIQUE_C1277_190116_001 114.59 77.494 841880000 123580000 143410000 67879000 98214000 61599000 78383000 69748000 0 0 12754000 93186000 50305000 42826000 2540 1607 2373 23276;23277;23278;23279;23280;23281;23282;23283;23284;23285;23286;23287;23288;23289;23290;23291;23292;23293;23294;23295 29736;29737;29738;29739;29740;29741;29742;29743;29744;29745;29746;29747;29748;29749;29750;29751;29752;29753;29754;29755;29756;29757;29758 29739 22 ALLSYDGLNQR Unmodified 1248.6463 0.64625011 4499 Q9UM22 EPDR1 Mammalian ependymin-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.649 76.649 2 8.0024E-30 74096 QUIQUE_DMIX4_190116_001 190.51 125.26 1509000000 142130000 131430000 135530000 91325000 124970000 91271000 131860000 84454000 111440000 72233000 149210000 111730000 131380000 2541 4499 2374 23296;23297;23298;23299;23300;23301;23302;23303;23304;23305;23306;23307;23308 29759;29760;29761;29762;29763;29764;29765;29766;29767;29768;29769;29770;29771;29772;29773;29774;29775 29769 17 ALLSYPLPFFAAVEVLEK Unmodified 2006.1129 0.1128515 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 172.11 172.11 2;3 0.00011439 179294 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29792;29793;29794;29795;29796;29797;29798;29799;29800;29801;29802;29803;29804;29805;29806;29807;29808;29809;29810;29811;29812;29813;29814;29815;29816;29817;29818;29819;29820;29821;29822;29823;29824;29825;29826;29827;29828;29829;29830;29831;29832;29833;29834;29835;29836;29837;29838;29839;29840 29818 48 ALLTLADGR Unmodified 928.53418 0.53418046 2045 P12429;D6RA82 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.473 63.473 2 0.0050026 62061 QUIQUE_C1563_190116_001 87.696 31.15 332820000 0 70436000 54678000 0 51298000 46272000 47765000 0 0 22588000 0 0 39786000 2544 2045 2377 23355;23356;23357;23358;23359;23360;23361 29841;29842;29843;29844;29845;29846;29847;29848 29845 6 ALLTPVAIAAGR Unmodified 1151.7026 0.70264277 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.741 87.741 2 0.00028992 88944 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.05 91.128 4614700000 487260000 374600000 305240000 418170000 421910000 295150000 387460000 310620000 322930000 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26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.23 122.23 2 0.00051689 126056 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.692 66.293 177580000 0 31567000 20615000 0 0 0 0 52478000 34461000 0 19162000 19296000 0 2547 1388 2380 23395;23396;23397;23398;23399;23400 29898;29899;29900;29901;29902;29903 29903 6 ALLVTASQCQQPAENK Unmodified 1756.8778 0.87778296 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 2 2 3 1 1 2 2 1 1 2 3 1 1 44.566 44.566 2;3 1.2446E-146 41123 QUIQUE_C1277_190116_001 244.95 231.15 4317100000 670100000 644570000 509460000 71003000 491880000 383360000 309820000 212240000 133120000 199620000 281850000 231800000 178330000 2548 2857;3307 2381 23401;23402;23403;23404;23405;23406;23407;23408;23409;23410;23411;23412;23413;23414;23415;23416;23417;23418;23419;23420;23421;23422 29904;29905;29906;29907;29908;29909;29910;29911;29912;29913;29914;29915;29916;29917;29918;29919;29920;29921;29922;29923;29924;29925;29926;29927;29928 29906 22 ALLVTGIPEGLEQADVEAVLQPTLLPLGTFR Unmodified 3259.8068 0.80678008 4491 Q9ULN7 PNMAL2 PNMA-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 172.47 172.47 3 0.01737 177465 QUIQUE_C1576_190116_001 29.028 23.368 28830000 0 0 0 0 0 0 28830000 0 0 0 0 0 0 2549 4491 2382 23423 29929 29929 0 ALLYLCGGDD Unmodified 1095.4907 0.49066067 1920 P07355;A6NMY6 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.66 112.66 2 0.0043259 115814 QUIQUE_C1403_190116_001 81.297 77.362 414500000 27425000 45200000 0 82460000 0 0 36803000 33096000 44587000 31248000 33753000 33418000 46510000 2550 1920 2383 23424;23425;23426;23427;23428;23429;23430;23431;23432;23433;23434 29930;29931;29932;29933;29934;29935;29936;29937;29938;29939;29940;29941 29932 11 ALMDEVVK Oxidation (M) 919.46847 0.46846866 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 1 2 27.007 27.007 2 0.022232 20839 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.451 51.197 4843400000 691650000 768310000 0 0 0 359940000 0 486980000 808730000 283690000 641500000 802580000 0 2551 1790 2384 23435;23436;23437;23438;23439;23440;23441;23442;23443;23444;23445;23446 29942;29943;29944;29945;29946;29947;29948;29949;29950;29951;29952;29953;29954;29955 29949 14 ALMDEVVK Unmodified 903.47355 0.47355404 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 56.806 56.806 1;2 0.018737 55750 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.469 42.375 16016000000 2220100000 1955400000 2236200000 1862100000 0 0 1479800000 1540800000 1298000000 0 1984400000 1439200000 0 2552 1790 2384 23447;23448;23449;23450;23451;23452;23453;23454;23455;23456 29956;29957;29958;29959;29960;29961;29962;29963;29964;29965;29966;29967;29968;29969;29970 29963 14 ALMDSLGPEWR Unmodified 1273.6125 0.61250714 3158 Q15785 TOMM34 Mitochondrial import receptor subunit TOM34 yes yes 0 0 0 1 1 1 108.59 108.59 2 0.0049661 111453 QUIQUE_C1403_190116_001 70.1 60.886 83659000 0 27509000 0 26286000 0 29864000 0 0 0 0 0 0 0 2553 3158 2385 23457;23458;23459 29971;29972;29973 29972 3 ALMEEFFR Unmodified 1041.4954 0.49535211 614 B4DK72;Q01064 PDE1B Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.87 109.87 2 0.0036323 113980 QUIQUE_C1576_190116_001 116.54 85.824 344020000 34439000 33514000 27600000 30436000 23060000 21431000 37389000 31731000 23642000 10569000 0 35978000 34234000 2554 614 2386 23460;23461;23462;23463;23464;23465;23466;23467;23468;23469;23470;23471 29974;29975;29976;29977;29978;29979;29980;29981;29982;29983;29984;29985;29986 29981 13 ALMEGYGLVGLPLVR Unmodified 1586.8854 0.88543452 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 142.96 142.96 2 0.012592 147483 QUIQUE_C1277_190116_001 73.887 56.861 12671000 0 12671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2555 4519 2387 23472;23473 29987;29988 29987 2 ALMGLYHGQVLCK Oxidation (M) 1504.753 0.75304014 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 53.29 53.29 3 0.0065262 50936 QUIQUE_C1403_190116_001 50.207 27.976 239870000 0 31646000 59197000 44824000 0 29184000 0 0 46258000 28759000 0 0 0 2556 1153 2388 23474;23475;23476;23477;23478;23479;23480;23481;23482 29989;29990;29991;29992;29993;29994;29995;29996;29997 29991 668 8 ALMGLYHGQVLCK Unmodified 1488.7581 0.75812552 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 3 1 2 2 2 69.399 69.399 2;3 5.6787E-13 69565 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.84 128.1 1720300000 0 235560000 173500000 99293000 74906000 78343000 202530000 67110000 173690000 63424000 181220000 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23503;23504;23505;23506;23507;23508;23509;23510;23511;23512;23513;23514;23515;23516;23517;23518;23519;23520;23521;23522;23523;23524;23525;23526;23527;23528;23529;23530;23531;23532;23533;23534;23535;23536;23537;23538;23539;23540;23541;23542;23543;23544;23545;23546;23547;23548;23549;23550 30029;30030;30031;30032;30033;30034;30035;30036;30037;30038;30039;30040;30041;30042;30043;30044;30045;30046;30047;30048;30049;30050;30051;30052;30053;30054;30055;30056;30057;30058;30059;30060;30061;30062;30063;30064;30065;30066;30067;30068;30069;30070;30071;30072;30073;30074;30075;30076;30077 30039 1274;1275 46 ALMLQGVDLLADAVAVTMGPK Unmodified 2112.1323 0.13228309 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4;C9JL25;C9JCQ4;C9JL19;C9J0S9 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 5 2 4 2 2 2 2 2 2 3 2 172.71 172.71 2;3 3.8741E-128 176003 QUIQUE_C1277_190116_001 265.99 255.64 20169000000 480250000 2533500000 2599000000 315490000 1425300000 2089200000 2710600000 270950000 672390000 80601000 956420000 2617600000 3417500000 2559 2004 2389 23551;23552;23553;23554;23555;23556;23557;23558;23559;23560;23561;23562;23563;23564;23565;23566;23567;23568;23569;23570;23571;23572;23573;23574;23575;23576;23577;23578;23579;23580;23581;23582;23583;23584 30078;30079;30080;30081;30082;30083;30084;30085;30086;30087;30088;30089;30090;30091;30092;30093;30094;30095;30096;30097;30098;30099;30100;30101;30102;30103;30104;30105;30106;30107;30108;30109;30110;30111;30112;30113;30114;30115;30116;30117;30118;30119;30120;30121;30122;30123;30124 30085 45 ALMLQGVDLLADAVAVTMGPK 2 Oxidation (M) 2144.1221 0.12211233 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4;C9JL25;C9JCQ4;C9JL19;C9J0S9 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 2 0 1 2 2 1 2 160.81 160.81 2;3 9.5457E-07 163171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.379 87.779 1272600000 286040000 301800000 0 255580000 0 0 0 116050000 0 313150000 0 0 0 2560 2004 2389 23585;23586;23587;23588;23589;23590;23591;23592 30125;30126;30127;30128;30129;30130;30131;30132 30130 1274;1275 0 ALMQSLNMLVQTEGK Unmodified 1661.8481 0.84806274 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 123.02 123.02 2 5.7207E-05 127577 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.858 79.242 91475000 0 0 0 0 0 0 0 0 91475000 0 0 0 0 2561 1741 2390 23593;23594 30133;30134 30133 2 ALMQVVDFLSR Unmodified 1277.6802 0.68019277 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 137.61 137.61 2 1.3401E-12 142636 QUIQUE_C1368_190116_001 164.46 135.31 1085500000 143610000 118270000 117050000 103780000 0 103830000 0 93415000 105760000 31443000 139770000 128590000 0 2562 4106 2391 23595;23596;23597;23598;23599;23600;23601;23602;23603;23604;23605;23606;23607 30135;30136;30137;30138;30139;30140;30141;30142;30143;30144;30145;30146;30147;30148;30149;30150;30151;30152;30153 30139 18 ALMQVVDFLSR Oxidation (M) 1293.6751 0.67510739 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 1 0 1 118.23 118.23 2 0.017086 115075 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30157;30158;30159;30160;30161;30162;30163;30164;30165;30166;30167;30168;30169;30170;30171;30172;30173;30174;30175;30176;30177;30178;30179;30180;30181;30182;30183;30184;30185;30186;30187 30180 28 ALNALNNLSVNVENQIK Unmodified 1853.0007 0.0006752871 3578 Q8N2F6;A0A0J9YWR7;A0A0J9YXE4;H7C2M7;C9J5N7;A0A0J9YXV5;H7BXQ8;A0A0J9YY38 ARMC10 Armadillo repeat-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 114.35 114.35 2 0.0017103 118363 QUIQUE_C1218_190116_001 81.494 55.482 25272000 25272000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2566 3578 2394 23639 30188 30188 1 ALNATFR Unmodified 791.42899 0.42898711 1715 O95219 SNX4 Sorting nexin-4 yes yes 0 0 0 1 1 28.49 28.49 2 0.026207 22393 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.401 33.279 61729000 0 0 0 0 0 0 0 27573000 0 0 34157000 0 0 2567 1715 2395 23640;23641 30189;30190 30190 2 ALNEACESVIQTACK Unmodified 1692.7811 0.78110538 3765 Q92896;H3BM42 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes no 0 0 0 1 1 62.776 62.776 2 0.00010147 62236 QUIQUE_C1277_190116_001 101.53 67.657 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 105.75 105.75 3 0.029241 108909 QUIQUE_C1277_190116_001 31.41 21.352 27208000 0 27208000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2578 2554 2406 23715 30275 30275 1 ALNRPPTYPTK Unmodified 1256.6877 0.68772099 2653 P55010;H0YLZ1;H0YN40;H0YMJ8;H0YM54;H0YK11 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 21.568 21.568 2;3 0.0018288 15179 QUIQUE_C1218_190116_001 66.262 21.126 534350000 136350000 0 40853000 58405000 0 0 0 35966000 35282000 0 138830000 0 88674000 2579 2653 2407 23716;23717;23718;23719;23720;23721;23722;23723;23724;23725;23726;23727;23728;23729 30276;30277;30278;30279;30280;30281;30282;30283;30284;30285;30286;30287;30288;30289;30290 30276 15 ALNSIIDVYHK Unmodified 1271.6874 0.68738664 1876 P05109 S100A8 Protein S100-A8;Protein S100-A8, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 67.909 67.909 2;3 0.00023902 67780 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.744 68.232 1314200000 69088000 124560000 135630000 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Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 2 77.891 77.891 2;3 3.4794E-44 78612 QUIQUE_DMIX3_190116_001 200.82 186.56 3765500000 0 0 204320000 183610000 81852000 0 365460000 730630000 79019000 84879000 794800000 602850000 638040000 2586 2197 2414 23809;23810;23811;23812;23813;23814;23815;23816;23817;23818;23819;23820;23821;23822;23823;23824;23825;23826;23827 30386;30387;30388;30389;30390;30391;30392;30393;30394;30395;30396;30397;30398;30399;30400;30401;30402;30403;30404;30405;30406;30407;30408 30400 21 ALPCIVDVR Unmodified 1041.5641 0.56410038 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 77.143 77.143 2 0.023842 78274 QUIQUE_C1368_190116_001 60.436 45.661 169760000 0 0 169760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2587 3421 2415 23828 30409 30409 1 ALPCIVDVRDEQQISAAVEK Unmodified 2240.1471 0.14708153 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.45 105.45 3 4.8558E-07 108216 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FAM126B Protein FAM126B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.027 87.027 3 2.0289E-07 89003 QUIQUE_C1277_190116_001 91.657 79.739 500720000 38441000 54062000 36213000 40159000 37649000 33737000 44242000 36729000 35336000 0 48763000 50194000 45198000 2591 3551 2418 23842;23843;23844;23845;23846;23847;23848;23849;23850;23851;23852;23853 30423;30424;30425;30426;30427;30428;30429;30430;30431;30432;30433;30434 30424 12 ALPEFFNGK Unmodified 1021.5233 0.52328142 1039 F8VXC8;Q8TAQ2;Q92922 SMARCC2;SMARCC1 SWI/SNF complex subunit SMARCC2;SWI/SNF complex subunit SMARCC1 yes no 0 0 0 1 1 82.175 82.175 2 0.014262 83896 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 54.63 185200000 0 0 0 0 0 0 0 77810000 0 0 107390000 0 0 2592 1039 2419 23854;23855 30435;30436 30435 2 ALPELQQALSALK Unmodified 1380.7977 0.79766537 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 131.03 131.03 2 0.013365 135087 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.93 47.79 94050000 0 0 0 0 0 0 31291000 0 26180000 0 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23866;23867;23868;23869;23870;23871;23872;23873;23874;23875;23876;23877;23878;23879;23880;23881;23882;23883;23884;23885;23886;23887;23888;23889;23890;23891;23892;23893;23894;23895;23896;23897;23898;23899;23900;23901 30448;30449;30450;30451;30452;30453;30454;30455;30456;30457;30458;30459;30460;30461;30462;30463;30464;30465;30466;30467;30468;30469;30470;30471;30472;30473;30474;30475;30476;30477;30478;30479;30480;30481;30482;30483;30484;30485;30486;30487;30488;30489;30490;30491;30492;30493;30494;30495;30496;30497;30498;30499;30500;30501;30502;30503;30504;30505;30506;30507;30508;30509;30510;30511;30512;30513;30514;30515;30516;30517;30518;30519;30520;30521;30522;30523;30524;30525;30526;30527;30528;30529;30530;30531;30532;30533;30534;30535;30536;30537;30538;30539;30540;30541;30542;30543;30544;30545;30546;30547;30548;30549;30550;30551;30552;30553;30554;30555;30556;30557;30558;30559;30560;30561;30562;30563;30564;30565;30566;30567;30568;30569;30570;30571;30572;30573;30574;30575;30576 30546 129 ALPEVHYHLGQK Unmodified 1390.7357 0.73573382 1932 P07902 GALT Galactose-1-phosphate uridylyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.124 38.124 3 0.00028015 33847 QUIQUE_C1277_190116_001 74.962 42.803 199440000 0 32026000 0 25316000 0 29419000 32394000 27585000 28224000 0 0 24471000 0 2596 1932 2423 23902;23903;23904;23905;23906;23907;23908;23909;23910 30577;30578;30579;30580;30581;30582;30583;30584;30585 30578 9 ALPFWNEEIVPQIK Unmodified 1682.9032 0.90319307 2139;2090 P15259;P18669;Q8N0Y7 PGAM2;PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 2;Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 142.92 142.92 2;3 2.1721E-17 147112 QUIQUE_C1277_190116_001 150.1 127.46 114720000000 8314000000 8311800000 10002000000 8218100000 8483000000 8659600000 8483700000 8519000000 10321000000 2862900000 12512000000 9609400000 10428000000 2597 2090;2139 2424 23911;23912;23913;23914;23915;23916;23917;23918;23919;23920;23921;23922;23923;23924;23925;23926;23927;23928;23929;23930;23931;23932;23933;23934;23935;23936;23937;23938 30586;30587;30588;30589;30590;30591;30592;30593;30594;30595;30596;30597;30598;30599;30600;30601;30602;30603;30604;30605;30606;30607;30608;30609;30610;30611;30612;30613;30614;30615;30616;30617;30618;30619;30620;30621;30622;30623;30624;30625;30626;30627;30628;30629;30630;30631;30632;30633;30634;30635;30636;30637;30638;30639;30640;30641 30591 55 ALPGQLKPFETLLSQNQGGK Unmodified 2125.1532 0.15315318 1957 P09211;A0A087X243 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 3 2 114.95 114.95 2;3;4 8.6612E-153 118934 QUIQUE_DMIX3_190116_001 261.27 245.73 79366000000 5898100000 5275500000 7091000000 5876700000 5905200000 5569000000 5434700000 6907800000 7796600000 2750400000 6837000000 5991800000 8032200000 2598 1957 2425 23939;23940;23941;23942;23943;23944;23945;23946;23947;23948;23949;23950;23951;23952;23953;23954;23955;23956;23957;23958;23959;23960;23961;23962;23963;23964;23965;23966;23967 30642;30643;30644;30645;30646;30647;30648;30649;30650;30651;30652;30653;30654;30655;30656;30657;30658;30659;30660;30661;30662;30663;30664;30665;30666;30667;30668;30669;30670;30671;30672;30673;30674;30675;30676;30677;30678;30679;30680;30681;30682;30683;30684;30685;30686;30687;30688;30689;30690;30691;30692;30693;30694;30695;30696;30697;30698;30699;30700;30701;30702;30703;30704;30705;30706;30707;30708 30687 67 ALPIGISFVK Unmodified 1043.6379 0.63791725 866 E7ESC9;Q8IZU2;H0YAG1 WDR17 WD repeat-containing protein 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.2 106.2 2 0.016524 107889 QUIQUE_C1563_190116_001 62.546 43.069 207130000 26922000 0 0 17876000 0 12677000 17868000 25167000 0 6777900 30280000 34720000 34842000 2599 866 2426 23968;23969;23970;23971;23972;23973;23974;23975;23976 30709;30710;30711;30712;30713;30714;30715;30716;30717;30718;30719 30712 11 ALPIIVK Acetyl (Protein N-term) 794.52658 0.52657589 3709 Q8WVY7 UBLCP1 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 yes yes 1 0 0 1 116.41 116.41 2 0.052963 120580 QUIQUE_C1218_190116_001 53.71 53.71 8954600 8954600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2600 3709 2427 23977 30720 30720 1 ALPLALVLHELGAGR Unmodified 1528.9089 0.90894715 2157 P19971;C9JGI3;A0A1W2PQK0 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 2 1 3 1 1 3 1 1 2 2 2 1 1 142.94 142.94 2;3 3.7088E-07 147642 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.15 89.876 1878700000 65801000 53998000 500130000 140930000 204650000 74129000 77788000 86136000 137380000 56212000 384770000 48056000 48735000 2601 2157 2428 23978;23979;23980;23981;23982;23983;23984;23985;23986;23987;23988;23989;23990;23991;23992;23993;23994;23995;23996;23997;23998 30721;30722;30723;30724;30725;30726;30727;30728;30729;30730;30731;30732;30733;30734;30735;30736;30737;30738;30739;30740;30741;30742;30743;30744;30745;30746;30747;30748;30749;30750;30751;30752 30752 30 ALPLEAEVAPVKDMAQLPETEIAPAK Oxidation (M) 2746.4463 0.44628324 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 1 1 1 107.63 107.63 3 3.6511E-07 111450 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.738 45.06 47168000 0 0 0 0 0 0 0 0 47168000 0 0 0 0 2602 880 2429 23999 30753 30753 521 1 ALPLIVGAQLIHADK Unmodified 1557.9243 0.92426287 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;B0QZK8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 no no 0 0 0 1 106.77 106.77 3 0.013817 111861 QUIQUE_C1438_190116_001 40.857 27.178 25418000 0 0 0 0 25418000 0 0 0 0 0 0 0 0 2603 3297 2430 24000 30754;30755 30754 2 ALPLLFNLIK Unmodified 1140.7271 0.72706661 3491 Q86UT6 NLRX1 NLR family member X1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.73 150.73 2 0.023235 155363 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.177 46.763 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F8W1R0;B7Z493;E9PJX4;F8VWL3;Q96M96 FGD4 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.501 57.501 3 0.002319 55915 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.568 37.513 66416000 0 0 0 0 0 0 0 0 28579000 0 0 0 37838000 2625 656 2452 24150;24151;24152;24153;24154;24155 30967;30968;30969;30970;30971;30972 30972 6 ALQETPTSVLLHHQIGLCYK Unmodified 2307.2045 0.20453683 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 89.701 89.701 3 2.0401E-05 90663 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.168 65.365 107270000 0 0 0 61552000 0 0 0 28347000 0 17375000 0 0 0 2626 1975 2453 24156;24157;24158;24159 30973;30974;30975;30976 30975 3 ALQFLEEVK Unmodified 1075.5914 0.59136099 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 89.449 89.449 1;2 0.00042731 91564 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.29 90.142 5272400000 380610000 427960000 420400000 401700000 410610000 376170000 490820000 351030000 373240000 186690000 537970000 436310000 478880000 2627 2424 2454 24160;24161;24162;24163;24164;24165;24166;24167;24168;24169;24170;24171;24172;24173;24174 30977;30978;30979;30980;30981;30982;30983;30984;30985;30986;30987;30988;30989;30990;30991;30992;30993;30994;30995;30996;30997;30998;30999;31000;31001;31002 30991 25 ALQGASQIIAEIR Unmodified 1368.7725 0.77251325 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 102.3 102.3 2;3 1.7012E-12 105395 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.96 89.522 2514900000 217770000 179360000 143390000 183340000 199930000 198800000 192150000 200630000 186400000 70152000 230920000 197170000 314820000 2628 1108;1404 2455 24175;24176;24177;24178;24179;24180;24181;24182;24183;24184;24185;24186;24187;24188;24189;24190;24191;24192;24193 31003;31004;31005;31006;31007;31008;31009;31010;31011;31012;31013;31014;31015;31016;31017;31018;31019;31020;31021;31022;31023;31024;31025;31026;31027;31028 31020 26 ALQGQISSQQVAVEK Unmodified 1584.8471 0.84713476 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 47.344 47.344 2 0.00059048 42124 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.479 59.225 12901000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12901000 0 0 0 2629 2882 2456 24194 31029 31029 1 ALQHMTDFAIQFNK Oxidation (M) 1678.8137 0.81372614 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.385 67.385 3 0.00034449 66174 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.078 65.464 477020000 62271000 65540000 0 0 73405000 0 0 67652000 0 60382000 0 87620000 60149000 2630 2777 2457 24195;24196;24197;24198;24199;24200;24201;24202;24203 31030;31031;31032;31033;31034;31035;31036;31037;31038 31038 2214 7 ALQHMTDFAIQFNK Unmodified 1662.8188 0.81881152 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 90.261 90.261 2;3 1.6267E-12 92246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109 104.93 4705500000 513840000 488640000 264760000 256540000 460200000 235080000 347960000 337820000 327510000 112970000 506180000 351060000 502920000 2631 2777 2457 24204;24205;24206;24207;24208;24209;24210;24211;24212;24213;24214;24215;24216;24217;24218;24219;24220;24221;24222;24223;24224;24225;24226 31039;31040;31041;31042;31043;31044;31045;31046;31047;31048;31049;31050;31051;31052;31053;31054;31055;31056;31057;31058;31059;31060;31061;31062;31063;31064;31065;31066;31067;31068 31058 24 ALQHSYLHKDEGNPE Unmodified 1736.8118 0.81181188 2029 P11802;F8VZ13 CDK4 Cyclin-dependent kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 17.925 17.925 3 3.6953E-05 10950 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.022 65.313 65080000 0 0 0 19561000 0 0 0 24545000 20974000 0 0 0 0 2632 2029 2458 24227;24228;24229 31069;31070;31071 31070 3 ALQIPEVYLR Unmodified 1200.6867 0.68665836 1057 F8W9S7;Q14C86 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 106.29 106.29 2 0.023023 109501 QUIQUE_C1277_190116_001 69.812 40.436 78985000 18101000 23393000 0 0 0 0 17664000 0 0 0 0 0 19827000 2633 1057 2459 24230;24231;24232;24233 31072;31073;31074;31075 31073 4 ALQLEEER Unmodified 986.50327 0.50327426 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 32.183 32.183 2 0.0054547 26889 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.39 13.484 8248600000 0 0 0 1820600000 0 0 1553400000 0 2316700000 902530000 0 1655300000 0 2634 859 2460 24234;24235;24236;24237;24238 31076;31077;31078;31079;31080;31081 31078 5 ALQLEEERK Unmodified 1114.5982 0.59823728 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.585 18.585 2;3 0.00074595 11397 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.71 7.3503 351160000 0 55870000 0 0 26618000 29756000 0 83433000 75588000 0 0 79893000 0 2635 859 2461 24239;24240;24241;24242;24243;24244;24245 31082;31083;31084;31085;31086;31087;31088;31089 31087 6 ALQLLDEVLHTMPIADPQPLD Unmodified 2328.2035 0.20353377 1312 K7EIU8;Q13485 SMAD4 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 169.67 169.67 2;3 0.0020971 173138 QUIQUE_C1277_190116_001 36.253 27.434 33885000 22435000 0 0 0 0 0 0 11449000 0 0 0 0 0 2636 1312 2462 24246;24247;24248 31090;31091;31092 31091 3 ALQLLHCFPLDIR Unmodified 1594.8654 0.86536778 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 3 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 123.02 123.02 2;3 0.00011916 126896 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.565 65.215 1209700000 107310000 128840000 31261000 93050000 106770000 88760000 101510000 63252000 107080000 14136000 114500000 119820000 133390000 2637 514 2463 24249;24250;24251;24252;24253;24254;24255;24256;24257;24258;24259;24260;24261;24262;24263;24264;24265;24266;24267;24268;24269;24270;24271;24272 31093;31094;31095;31096;31097;31098;31099;31100;31101;31102;31103;31104;31105;31106;31107;31108;31109;31110;31111;31112;31113;31114;31115;31116;31117;31118;31119;31120;31121;31122 31110 30 ALQNAVTTFVNR Unmodified 1332.715 0.71499837 1464 O14964 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.084 79.084 2 1.6672E-05 76299 QUIQUE_DMIX4_190116_001 159.79 104.26 1342200000 0 115510000 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vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.129 47.129 2 4.031E-07 44098 QUIQUE_C1368_190116_001 123.51 107.93 1288300000 0 138630000 179900000 145270000 175520000 0 140330000 51167000 77863000 72381000 148490000 71849000 86871000 2640 3086 2466 24304;24305;24306;24307;24308;24309;24310;24311;24312;24313;24314 31163;31164;31165;31166;31167;31168;31169;31170;31171;31172;31173 31164 7 ALQPLEEGEDEEKVSHQAGDHWLIR Unmodified 2885.3944 0.3943991 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 1 2 83.516 83.516 4;5 1.9839E-46 86446 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.99 139.23 209930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 209930000 0 0 2641 3086 2467 24315;24316 31174;31175 31175 2 ALQQEQEIEQR Unmodified 1370.679 0.6790068 317 A0A0U1RR30;A0A0U1RRM1;Q8WXI9;Q86YP4 GATAD2B;GATAD2A Transcriptional repressor p66-beta;Transcriptional repressor p66-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 29.66 29.66 2 8.9349E-06 24461 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.17 114.1 99926000 0 0 0 38987000 0 0 0 0 35164000 0 0 25774000 0 2642 317 2468 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31189;31190;31191;31192;31193;31194;31195;31196;31197;31198;31199;31200;31201;31202;31203;31204;31205;31206;31207;31208;31209;31210;31211;31212;31213;31214;31215;31216 31201 28 ALQSGQCAGAALDVFTEEPPRDR Unmodified 2487.1812 0.1812352 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YF78 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 2 2 3 1 1 1 1 1 1 1 2 93.004 93.004 3 2.462E-160 94585 QUIQUE_C1368_190116_001 185.61 183.45 2419300000 113030000 218650000 294570000 181460000 222900000 141540000 209340000 128510000 147280000 64343000 189360000 181770000 326480000 2645 404 2471 24351;24352;24353;24354;24355;24356;24357;24358;24359;24360;24361;24362;24363;24364;24365;24366;24367;24368;24369;24370 31217;31218;31219;31220;31221;31222;31223;31224;31225;31226;31227;31228;31229;31230;31231;31232;31233;31234;31235;31236;31237;31238;31239;31240;31241;31242;31243;31244;31245;31246;31247;31248;31249;31250;31251;31252;31253;31254;31255;31256;31257;31258;31259;31260;31261;31262;31263;31264;31265;31266;31267;31268;31269 31226 50 ALQSLACGKPTQR Unmodified 1428.7507 0.75073195 3017 Q13618;A0A087WTG3 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 21.78 21.78 2;3 0.0045954 15302 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.088 23.574 196040000 45739000 0 0 27772000 0 0 0 51092000 0 20092000 51344000 0 0 2646 3017 2472 24371;24372;24373;24374;24375 31270;31271;31272;31273;31274;31275 31273 5 ALQSNHFELSLR Unmodified 1413.7365 0.7364621 1408 O00468;A0A087X208;H0Y5U1 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.009 64.009 3 0.0036418 63469 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.28 30.835 235950000 0 0 35073000 0 0 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31447;31448;31449;31450;31451;31452;31453;31454;31455;31456;31457;31458;31459;31460;31461;31462;31463;31464;31465;31466;31467;31468;31469;31470;31471;31472;31473;31474;31475;31476;31477;31478;31479;31480;31481;31482;31483;31484;31485;31486;31487;31488;31489;31490;31491;31492;31493;31494;31495;31496;31497;31498;31499;31500;31501;31502 31495 1063 54 ALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHACTQK Unmodified 3130.5692 0.56920912 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BU78 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 4 4 4 4 3 4 3 4 2 1 3 4 4 73.994 73.994 3;4;5;6 5.0267E-78 75052 QUIQUE_C1277_190116_001 163.46 157.8 36501000000 2168600000 4210100000 4144100000 3009900000 3184600000 1616300000 3878200000 2542700000 1416100000 0 3380700000 2948800000 4000400000 2669 1851 2491 24566;24567;24568;24569;24570;24571;24572;24573;24574;24575;24576;24577;24578;24579;24580;24581;24582;24583;24584;24585;24586;24587;24588;24589;24590;24591;24592;24593;24594;24595;24596;24597;24598;24599;24600;24601;24602;24603;24604;24605;24606;24607;24608;24609 31503;31504;31505;31506;31507;31508;31509;31510;31511;31512;31513;31514;31515;31516;31517;31518;31519;31520;31521;31522;31523;31524;31525;31526;31527;31528;31529;31530;31531;31532;31533;31534;31535;31536;31537;31538;31539;31540;31541;31542;31543;31544;31545;31546;31547;31548;31549;31550;31551;31552;31553;31554;31555;31556;31557;31558;31559;31560;31561;31562;31563;31564;31565;31566;31567;31568 31512 63 ALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIK Oxidation (M) 3113.579 0.57904552 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 1 1 2 3 2 3 2 1 2 3 2 1 2 3 5 68.682 68.682 3;5 1.3905E-55 68153 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.44 142.07 8050300000 539270000 437150000 529810000 465760000 467530000 296520000 574740000 691180000 559610000 253690000 741820000 796790000 1696500000 2670 1978 2492 24610;24611;24612;24613;24614;24615;24616;24617;24618;24619;24620;24621;24622;24623;24624;24625;24626;24627;24628;24629;24630;24631;24632;24633;24634;24635;24636;24637;24638;24639;24640 31569;31570;31571;31572;31573;31574;31575;31576;31577;31578;31579;31580;31581;31582;31583;31584;31585;31586;31587;31588;31589;31590;31591;31592;31593;31594;31595;31596;31597;31598;31599;31600;31601;31602;31603;31604;31605 31590 1253 35 ALSDHHVYLEGTLLKPNMVTPGHACPIK Unmodified 3097.5841 0.5841309 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 4 4 3 4 4 3 4 4 1 3 4 3 78.61 78.61 3;4;5;6 2.6908E-126 79743 QUIQUE_C1368_190116_001 190.19 171.41 32828000000 1135900000 2942900000 2973500000 2038000000 3208400000 1857900000 2822700000 2714700000 2785400000 119040000 3302400000 3384900000 3541900000 2671 1978 2492 24641;24642;24643;24644;24645;24646;24647;24648;24649;24650;24651;24652;24653;24654;24655;24656;24657;24658;24659;24660;24661;24662;24663;24664;24665;24666;24667;24668;24669;24670;24671;24672;24673;24674;24675;24676;24677;24678;24679;24680;24681;24682;24683 31606;31607;31608;31609;31610;31611;31612;31613;31614;31615;31616;31617;31618;31619;31620;31621;31622;31623;31624;31625;31626;31627;31628;31629;31630;31631;31632;31633;31634;31635;31636;31637;31638;31639;31640;31641;31642;31643;31644;31645;31646;31647;31648;31649;31650;31651;31652;31653;31654;31655;31656;31657;31658;31659;31660;31661;31662;31663;31664;31665;31666 31617 55 ALSDLISATK Unmodified 1017.5706 0.57062555 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 78.836 78.836 2 0.0055218 80120 QUIQUE_C1277_190116_001 77.192 31.063 488120000 0 76194000 85502000 0 0 55698000 72430000 0 64842000 0 0 54167000 79283000 2672 4606 2493 24684;24685;24686;24687;24688;24689;24690 31667;31668;31669;31670;31671;31672;31673 31667 4 ALSEALTELGYK Unmodified 1293.6816 0.68163256 2359 P34896 SHMT1 Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.17 100.17 2 8.7313E-07 104260 QUIQUE_C1218_190116_001 166.19 136.38 545280000 35886000 28561000 51649000 42344000 35226000 32198000 57419000 39787000 43260000 19114000 64029000 53793000 42016000 2673 2359 2494 24691;24692;24693;24694;24695;24696;24697;24698;24699;24700;24701;24702;24703 31674;31675;31676;31677;31678;31679;31680;31681;31682;31683;31684;31685;31686;31687 31674 14 ALSEEQEEQAAR Unmodified 1359.6266 0.62663688 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 21.435 21.435 2 1.0539E-65 14270 QUIQUE_C1368_190116_001 219.8 199.28 1244300000 120290000 123600000 123190000 94931000 97075000 0 116390000 73426000 110880000 58772000 111100000 117180000 97448000 2674 4522 2495 24704;24705;24706;24707;24708;24709;24710;24711;24712;24713;24714;24715;24716;24717 31688;31689;31690;31691;31692;31693;31694;31695;31696;31697;31698;31699;31700;31701 31690 14 ALSEIAGMTLPYDTLDQVR Unmodified 2092.0511 0.051055878 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 142.25 142.25 2;3 9.9653E-75 146676 QUIQUE_DMIX7_190116_001 243.88 213.55 3080300000 271730000 239470000 247870000 211890000 198300000 247460000 265630000 64659000 234890000 62961000 440790000 341310000 253340000 2675 2280 2496 24718;24719;24720;24721;24722;24723;24724;24725;24726;24727;24728;24729;24730;24731;24732;24733;24734;24735;24736;24737;24738;24739 31702;31703;31704;31705;31706;31707;31708;31709;31710;31711;31712;31713;31714;31715;31716;31717;31718;31719;31720;31721;31722;31723;31724;31725;31726;31727;31728 31725 24 ALSEIAGMTLPYDTLDQVR Oxidation (M) 2108.046 0.0459705 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 123.5 123.5 2 8.7767E-05 127512 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24810;24811;24812;24813;24814;24815;24816;24817;24818;24819;24820;24821;24822;24823;24824;24825;24826;24827;24828;24829;24830;24831;24832;24833;24834;24835 31809;31810;31811;31812;31813;31814;31815;31816;31817;31818;31819;31820;31821;31822;31823;31824;31825;31826;31827;31828;31829;31830;31831;31832;31833;31834;31835;31836;31837;31838;31839;31840 31828 32 ALSSEGKPYVTKEELYQNLTR Unmodified 2425.2489 0.24890406 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 1 1 3 3 3 3 3 73.841 73.841 2;3;4 1.7161E-42 74324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.49 160.27 9281800000 0 61749000 62483000 0 0 0 45796000 2237500000 1775100000 0 1785100000 1659600000 1654500000 2689 267;275;3025 2509 24836;24837;24838;24839;24840;24841;24842;24843;24844;24845;24846;24847;24848;24849;24850;24851;24852;24853 31841;31842;31843;31844;31845;31846;31847;31848;31849;31850;31851;31852;31853;31854;31855;31856;31857;31858;31859;31860;31861 31844 20 ALSSEWKPEIR Unmodified 1314.6932 0.6932003 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 1 3 3 4 4 4 3 5 3 7 3 5 5 8 53.452 53.452 2;3 0.00034887 52143 QUIQUE_C1218_190116_001 105.46 78.032 12158000000 1105600000 891170000 728240000 864760000 741190000 520190000 1025600000 621260000 1177600000 547260000 1411500000 676290000 1847000000 2690 1218;28;112;2057 2510 24854;24855;24856;24857;24858;24859;24860;24861;24862;24863;24864;24865;24866;24867;24868;24869;24870;24871;24872;24873;24874;24875;24876;24877;24878;24879;24880;24881;24882;24883;24884;24885;24886;24887;24888;24889;24890;24891;24892;24893;24894;24895;24896;24897;24898;24899;24900;24901;24902;24903;24904;24905;24906;24907;24908;24909;24910 31862;31863;31864;31865;31866;31867;31868;31869;31870;31871;31872;31873;31874;31875;31876;31877;31878;31879;31880;31881;31882;31883;31884;31885;31886;31887;31888;31889;31890;31891;31892;31893;31894;31895;31896;31897;31898;31899;31900;31901;31902;31903;31904;31905;31906;31907;31908;31909;31910;31911;31912;31913;31914;31915;31916;31917;31918;31919;31920;31921;31922;31923;31924;31925;31926;31927;31928;31929;31930;31931;31932;31933;31934;31935;31936;31937;31938;31939;31940;31941;31942;31943;31944;31945;31946;31947;31948;31949 31863 83 ALSTDCTPSGDLSPLSR Unmodified 1775.836 0.83597772 1036 J3KNM6;F8VVT9;Q99490 AGAP2 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 77.809 77.809 2 8.0397E-10 78659 QUIQUE_C1403_190116_001 113.99 97.734 75457000 0 0 41261000 34196000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2691 1036 2511 24911;24912 31950;31951 31951 2 ALSTDPAAPNLK Unmodified 1196.6401 0.6401021 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.984 43.984 2 0.00070335 41150 QUIQUE_C1438_190116_001 112.11 87.952 1533500000 116130000 0 165160000 0 184820000 0 182570000 104020000 111730000 83817000 275810000 139940000 169500000 2692 4600 2512 24913;24914;24915;24916;24917;24918;24919;24920;24921;24922 31952;31953;31954;31955;31956;31957;31958;31959;31960;31961 31954 10 ALSTDSVER Unmodified 976.48254 0.48253882 3112 Q15119 PDK2 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 21.458 21.458 2 0.053322 14340 QUIQUE_C1368_190116_001 61.962 35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2693 3112 2513 24923;24924 31962;31963 31962 2 ALSTMDLQK Unmodified 1005.5165 0.51648149 1032 F8VUA2;F8VVT7;Q9HD42;F5H875 CHMP1A Charged multivesicular body protein 1a yes no 0 0 0 1 1 1 39.841 39.841 2 0.0087437 36319 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.923 43.03 88613000 0 0 0 0 0 36943000 0 0 51670000 0 0 0 0 2694 1032 2514 24925;24926;24927 31964;31965;31966 31965 3 ALSVGNIDDALQCYSEAIK Unmodified 2065.999 0.99902031 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 144.79 144.79 2;3 2.513E-64 149147 QUIQUE_DMIX7_190116_001 223.06 210.3 9083500000 672100000 799040000 752630000 551960000 936850000 663060000 861750000 485770000 615170000 366990000 766030000 774660000 837470000 2695 2343 2515 24928;24929;24930;24931;24932;24933;24934;24935;24936;24937;24938;24939;24940;24941;24942;24943;24944;24945;24946;24947;24948;24949;24950;24951 31967;31968;31969;31970;31971;31972;31973;31974;31975;31976;31977;31978;31979;31980;31981;31982;31983;31984;31985;31986;31987;31988;31989;31990;31991;31992;31993;31994;31995 31990 26 ALSYLYEK Unmodified 985.51205 0.51204804 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 0 1 53.791 53.791 2 0.023483 52112 QUIQUE_C1218_190116_001 73.26 39.257 56473000 56473000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2696 3422 2516 24952 31996 31996 1 ALTAEIVK Unmodified 843.50657 0.50656873 1324 K7EKE6;P36776 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 37.12 37.12 2 0.018737 33649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.469 23.347 286050000 0 0 0 0 0 0 0 78699000 91593000 0 115760000 0 0 2697 1324 2517 24953;24954;24955 31997;31998;31999 31997 3 ALTAHLYSLLQTQHALGDAFADLSQK Unmodified 2811.4555 0.45554279 106 A0A087X1E4;P53365;E9PRV8 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 142.6 142.6 4 1.0564E-05 147252 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.209 49.764 195740000 42647000 29693000 60472000 0 0 0 0 0 62927000 0 0 0 0 2698 106 2518 24956;24957;24958;24959 32000;32001;32002;32003 32003 4 ALTALFK Unmodified 762.46398 0.46397563 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.896 65.896 2 0.01933 65756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.54 68.188 796030000 76196000 84951000 0 72874000 80286000 68571000 91844000 76025000 68072000 0 0 74961000 102250000 2699 4392 2519 24960;24961;24962;24963;24964;24965;24966;24967;24968;24969 32004;32005;32006;32007;32008;32009;32010;32011;32012;32013;32014;32015;32016;32017;32018;32019;32020 32014 17 ALTALLK Unmodified 728.47963 0.47962569 698 C9J5N1;Q9BTE6;K7EQ85 PTGES3L-AARSD1;AARSD1 Alanyl-tRNA editing protein Aarsd1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 52.929 52.929 2 0.023536 50546 QUIQUE_C1368_190116_001 99.919 0 84466000 0 21857000 21661000 24028000 0 16920000 0 0 0 0 0 0 0 2700 698 2520 24970;24971;24972;24973 32021;32022;32023;32024;32025 32022 5 ALTDAGCNLNPLQYIK Unmodified 1789.9033 0.90326943 3708 Q8WVM8 SCFD1 Sec1 family domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 130.24 130.24 2 0.00079438 136312 QUIQUE_C1438_190116_001 94.616 81.985 166040000 0 0 0 0 82263000 83773000 0 0 0 0 0 0 0 2701 3708 2521 24974;24975 32026;32027 32026 2 ALTDFFR Unmodified 868.4443 0.44430282 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676 GCA Grancalcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.46 102.46 2 0.0083582 105578 QUIQUE_C1368_190116_001 153.61 85.58 504820000 65995000 55107000 86827000 0 72479000 63352000 69501000 59873000 0 31687000 0 0 0 2702 1210 2522 24976;24977;24978;24979;24980;24981;24982;24983 32028;32029;32030;32031;32032;32033;32034;32035;32036;32037 32032 10 ALTDKVTDLLGGLFSK Unmodified 1676.9349 0.93488713 1535 O43615;M0QXU7 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 1 1 152.79 152.79 3 0.0019523 155521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.495 49.58 32508000 0 0 0 0 0 0 0 32508000 0 0 0 0 0 2703 1535 2523 24984 32038 32038 1 ALTDMPQMR Unmodified 1061.4998 0.49978556 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.342 60.342 2 0.017141 58804 QUIQUE_C1277_190116_001 65.252 39.147 313780000 61984000 62731000 0 57061000 0 0 0 0 0 25218000 0 0 106790000 2704 1823 2524 24985;24986;24987;24988;24989 32039;32040;32041;32042;32043;32044 32040 6 ALTDSFR Unmodified 808.40792 0.40791731 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.715 41.715 2 3.1953E-05 37670 QUIQUE_C1403_190116_001 175.93 121.4 8045200000 880270000 777580000 0 785720000 0 974320000 0 788230000 1230200000 394800000 1238200000 975920000 0 2705 685 2525 24990;24991;24992;24993;24994;24995;24996;24997;24998 32045;32046;32047;32048;32049;32050;32051;32052;32053;32054;32055 32049 10 ALTFLLLQPPSPK Unmodified 1423.8439 0.84388728 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.52 134.52 2 0.00046408 138715 QUIQUE_C1277_190116_001 98.254 83.437 120850000 24155000 24326000 13819000 16247000 0 0 0 0 15626000 0 0 26677000 0 2706 4604 2526 24999;25000;25001;25002;25003;25004;25005;25006 32056;32057;32058;32059;32060;32061;32062;32063 32057 6 ALTGGIAHLFK Unmodified 1126.6499 0.64987892 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 3 2 1 2 2 2 3 2 2 2 2 71.963 71.963 2;3 0.00027842 72756 QUIQUE_C1438_190116_001 77.379 57.617 7181300000 886600000 634650000 873030000 553280000 287060000 479940000 532280000 595260000 533160000 271730000 545920000 524940000 463430000 2707 1971 2527 25007;25008;25009;25010;25011;25012;25013;25014;25015;25016;25017;25018;25019;25020;25021;25022;25023;25024;25025;25026;25027;25028;25029;25030;25031;25032;25033 32064;32065;32066;32067;32068;32069;32070;32071;32072;32073;32074;32075;32076;32077;32078;32079;32080;32081;32082;32083;32084;32085;32086;32087;32088;32089;32090;32091;32092;32093;32094;32095;32096;32097 32074 33 ALTGHLEEVVLALLK Unmodified 1604.9501 0.95014327 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 2 4 3 5 3 4 4 3 3 2 4 4 3 155.63 155.63 2;3 8.2376E-130 160568 QUIQUE_DMIX8_190116_001 290.61 239.18 19173000000 564560000 1234000000 1201000000 953950000 1094600000 2034600000 1375800000 590970000 3925000000 72303000 2920700000 784850000 2420700000 2708 1853 2528 25034;25035;25036;25037;25038;25039;25040;25041;25042;25043;25044;25045;25046;25047;25048;25049;25050;25051;25052;25053;25054;25055;25056;25057;25058;25059;25060;25061;25062;25063;25064;25065;25066;25067;25068;25069;25070;25071;25072;25073;25074;25075;25076;25077 32098;32099;32100;32101;32102;32103;32104;32105;32106;32107;32108;32109;32110;32111;32112;32113;32114;32115;32116;32117;32118;32119;32120;32121;32122;32123;32124;32125;32126;32127;32128;32129;32130;32131;32132;32133;32134;32135;32136;32137;32138;32139;32140;32141;32142;32143;32144;32145;32146;32147 32147 41 ALTGSEDYLLLACDGFFDVVPHQEVVGLVQSHLTR Unmodified 3884.9407 0.94072415 2535 P49593;B5MCT7 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 162.24 162.24 4 1.9465E-75 167007 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.75 139.28 443640000 0 0 0 0 0 0 64614000 0 92866000 0 99173000 77618000 109370000 2709 2535 2529 25078;25079;25080;25081;25082 32148;32149;32150;32151;32152 32149 5 ALTHIDHSLSR Unmodified 1248.6575 0.65748349 2677 P56192;F5H2V6 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 1 19.286 19.286 2;3 0.00014626 12447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.9 89.946 1313600000 123010000 125190000 145900000 128090000 88407000 132460000 86700000 107320000 69535000 32177000 115740000 76878000 82161000 2710 2677 2530 25083;25084;25085;25086;25087;25088;25089;25090;25091;25092;25093;25094;25095;25096;25097;25098;25099;25100;25101 32153;32154;32155;32156;32157;32158;32159;32160;32161;32162;32163;32164;32165;32166;32167;32168;32169;32170;32171 32164 15 ALTLDQWLEQHK Unmodified 1480.7674 0.76742787 4218 Q9HBL8;I3L1Y8;I3L3Z0 NMRAL1 NmrA-like family domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 98.276 98.276 2;3 0.00015696 102174 QUIQUE_C1438_190116_001 85.845 65.005 576240000 65869000 76546000 26726000 53877000 80752000 63342000 23611000 0 45171000 0 37593000 44326000 58433000 2711 4218 2531 25102;25103;25104;25105;25106;25107;25108;25109;25110;25111;25112;25113;25114;25115;25116;25117 32172;32173;32174;32175;32176;32177;32178;32179;32180;32181;32182;32183;32184;32185;32186;32187 32179 15 ALTLFDTDEYRPPVWK Acetyl (Protein N-term) 1991.9993 0.9992783 2095 P15882;F8WCQ9;F8WAY4 CHN1 N-chimaerin yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.79 155.79 2 8.735E-30 160533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.68 165.9 697130000 50383000 46519000 51557000 38996000 58954000 48340000 76999000 59490000 49059000 20489000 72993000 53886000 69468000 2712 2095 2532 25118;25119;25120;25121;25122;25123;25124;25125;25126;25127;25128;25129;25130 32188;32189;32190;32191;32192;32193;32194;32195;32196;32197;32198;32199;32200;32201 32196 13 ALTLGALTLPLAR Unmodified 1308.8129 0.8129215 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.12 137.12 2 0.00032838 141527 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.38 92.562 863640000 50289000 58986000 62145000 82396000 78466000 48592000 73913000 82968000 63469000 27572000 70835000 70368000 93643000 2713 4014 2533 25131;25132;25133;25134;25135;25136;25137;25138;25139;25140;25141;25142;25143 32202;32203;32204;32205;32206;32207;32208;32209;32210;32211;32212;32213;32214 32214 12 ALTLGLAK Unmodified 785.50109 0.50108942 4034 Q9BUH6 C9orf142 Protein PAXX yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 52.733 52.733 2 0.0035944 50461 QUIQUE_C1277_190116_001 113.1 11.411 463420000 156130000 139640000 95272000 0 0 0 0 0 0 0 0 72372000 0 2714 4034 2534 25144;25145;25146;25147;25148 32215;32216;32217;32218;32219 32216 5 ALTLIAGSPLK Unmodified 1082.6699 0.66994566 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.548 85.548 2 3.1964E-05 87231 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.98 124.46 4892500000 444150000 431210000 322050000 330480000 490050000 318180000 361240000 382620000 382250000 165170000 485290000 380680000 399130000 2715 3499 2535 25149;25150;25151;25152;25153;25154;25155;25156;25157;25158;25159;25160;25161 32220;32221;32222;32223;32224;32225;32226;32227;32228;32229;32230;32231;32232;32233;32234;32235;32236;32237;32238;32239;32240;32241;32242;32243 32241 24 ALTLPGSSENEYIMK Unmodified 1651.8127 0.81272309 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 96.346 96.346 2 0.00059302 99836 QUIQUE_C1576_190116_001 75.416 62.296 215400000 0 0 0 0 0 62877000 74031000 0 78490000 0 0 0 0 2716 2657 2536 25162;25163;25164 32244;32245;32246 32245 2 ALTLQDLDNIWAAQAGK Unmodified 1826.9527 0.95266246 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 150.94 150.94 2 0.0026993 155818 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.189 74.931 142640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82499000 60144000 0 2717 1414;3777 2537 25165;25166 32247;32248 32248 0 ALTPQCGSGEDLYILTGTVPSDYR Unmodified 2612.2428 0.24283241 1699 O94919 ENDOD1 Endonuclease domain-containing 1 protein yes yes 0 0 0 1 134.57 134.57 3 0.0061548 130925 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.6 29.058 17804000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17804000 0 0 0 2718 1699 2538 25167 32249 32249 1 ALTPQTAETDAIR Unmodified 1385.7151 0.71505795 564 A8MUM1;Q53HC9;C9J0U9;D3YTH5;F8WDS8;F8WDX0;F8WB12 TSSC1 Protein TSSC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.955 53.955 2 0.00046337 52086 QUIQUE_C1403_190116_001 110.38 77.541 907110000 83935000 76326000 109950000 80132000 98838000 83584000 0 66574000 96773000 28659000 0 83922000 98417000 2719 564 2539 25168;25169;25170;25171;25172;25173;25174;25175;25176;25177;25178 32250;32251;32252;32253;32254;32255;32256;32257;32258;32259;32260 32253 10 ALTQPLGLLR Unmodified 1080.6655 0.66552898 3941 Q96S97;C9JZL8;C9J5M0;C9JC07;C9JJV6 MYADM Myeloid-associated differentiation marker yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.682 90.682 2 0.0054954 88308 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.282 39.555 1698500000 156360000 148450000 196340000 165380000 0 0 0 0 109030000 55649000 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39.874 2 0.01082 35646 QUIQUE_C1403_190116_001 68.224 46.092 5314200000 0 0 0 1301400000 0 1137800000 0 0 0 753040000 0 0 2121900000 2723 2248 2543 25200;25201;25202;25203 32285;32286;32287;32288 32285 3 ALTSFER Unmodified 822.42357 0.42356738 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.689 32.689 2 0.019682 27525 QUIQUE_C1403_190116_001 110.63 65.66 3045600000 327820000 279750000 488750000 333420000 259830000 295370000 0 214350000 362600000 171920000 0 0 311810000 2724 1153 2544 25204;25205;25206;25207;25208;25209;25210;25211;25212;25213 32289;32290;32291;32292;32293;32294;32295;32296;32297;32298 32292 10 ALTSFLPAPTQLSQDQLEAEEK Acetyl (Protein N-term) 2457.2275 0.22749992 1081 G3V5R3;G3V3A4;Q13573 SNW1 SNW domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 163.84 163.84 3 0.0002427 165818 QUIQUE_C1563_190116_001 47.808 41.343 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32310;32311;32312;32313;32314;32315;32316;32317;32318;32319;32320;32321;32322;32323;32324;32325;32326;32327;32328 32322 17 ALTVPELTQQMFDAK Oxidation (M) 1706.8549 0.85492225 2797;1862;3006 P04350;P68371;Q13509;A0A0B4J269 TUBB4A;TUBB4B;TUBB3 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain no no 0 1 0 4 4 3 4 3 4 6 4 5 3 3 3 3 101.02 101.02 2;3 6.6385E-13 101747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.01 28.633 23347000000 1221700000 2605700000 1372800000 1876200000 1262200000 1981200000 1185800000 2609100000 2771600000 1210500000 1833400000 1679400000 1737400000 2728 1862;2797;3006 2548 25238;25239;25240;25241;25242;25243;25244;25245;25246;25247;25248;25249;25250;25251;25252;25253;25254;25255;25256;25257;25258;25259;25260;25261;25262;25263;25264;25265;25266;25267;25268;25269;25270;25271;25272;25273;25274;25275;25276;25277;25278;25279;25280;25281;25282;25283;25284;25285;25286 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TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 2 3 1 3 2 1 2 2 2 1 2 1 1 126.81 126.81 2;3 5.7287E-36 134000 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.95 29.579 49962000000 8390800000 703620000 578950000 7382200000 588900000 711540000 8372300000 7537700000 5355300000 1829500000 7570500000 455460000 485430000 2732 3030;4044 2550 25340;25341;25342;25343;25344;25345;25346;25347;25348;25349;25350;25351;25352;25353;25354;25355;25356;25357;25358;25359;25360;25361;25362 32562;32563;32564;32565;32566;32567;32568;32569;32570;32571;32572;32573;32574;32575;32576;32577;32578;32579;32580;32581;32582;32583;32584;32585;32586;32587;32588;32589;32590;32591;32592;32593;32594;32595;32596;32597;32598;32599;32600;32601;32602;32603;32604;32605 32591 44 ALTVPELTQQVFDAK Unmodified 1658.8879 0.88793694 1922 Q5JP53;P07437;Q5ST81 TUBB Tubulin beta chain yes no 0 0 0 2 2 3 3 3 2 2 2 2 2 3 2 2 129.61 129.61 2;3 3.802E-66 132976 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159 139.33 61712000000 5295000000 4408700000 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32606;32607;32608;32609;32610;32611;32612;32613;32614;32615;32616;32617;32618;32619;32620;32621;32622;32623;32624;32625;32626;32627;32628;32629;32630;32631;32632;32633;32634;32635;32636;32637;32638;32639;32640;32641;32642;32643;32644;32645;32646;32647;32648;32649;32650;32651;32652;32653;32654;32655;32656;32657;32658;32659;32660;32661;32662;32663;32664;32665;32666;32667;32668;32669;32670;32671;32672;32673;32674;32675;32676;32677;32678;32679;32680;32681;32682;32683;32684;32685;32686;32687;32688;32689;32690;32691;32692;32693;32694;32695;32696;32697;32698;32699;32700;32701;32702;32703;32704;32705;32706;32707;32708;32709;32710;32711;32712;32713;32714;32715;32716;32717;32718;32719;32720;32721;32722;32723 32674 118 ALVADSHPESER Unmodified 1309.6262 0.62624295 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 16.854 16.854 2;3 1.5362E-37 9200 QUIQUE_C1563_190116_001 192.12 168.76 38367000000 3148000000 3807900000 3028900000 3116200000 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32792;32793;32794;32795;32796;32797;32798;32799;32800;32801;32802;32803;32804;32805;32806;32807;32808;32809;32810;32811;32812;32813;32814;32815;32816;32817;32818;32819;32820;32821;32822;32823;32824;32825;32826;32827;32828;32829;32830;32831;32832;32833;32834;32835;32836;32837;32838;32839;32840;32841;32842 32841 51 ALVDHHDAEVK Unmodified 1232.6149 0.61494998 3578 Q8N2F6;A0A0J9YWR7;A0A0J9YXE4;H7C2M7 ARMC10 Armadillo repeat-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 1 12.39 12.39 3 0.0028888 4668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.693 35.75 9707700 0 0 0 0 0 0 0 8545000 0 1162800 0 0 0 2740 3578 2558 25488;25489 32843;32844 32843 2 ALVDTGCLYNLISLACVDR Unmodified 2152.0657 0.065660084 4248 Q9NQ35;B7Z3Y4;E9PIW3 NRIP3 Nuclear receptor-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 164.74 164.74 2 4.6272E-06 166963 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.36 79.8 72618000 0 40651000 0 0 0 0 0 31966000 0 0 0 0 0 2741 4248 2559 25490;25491 32845;32846 32846 2 ALVEEALAQR Unmodified 1098.6033 0.60332266 4210 Q9HB07;F8VR84;F8VQQ3 C12orf10 UPF0160 protein MYG1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.457 62.457 2 1.9961E-05 61608 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.04 99.463 1148500000 104870000 158180000 0 154420000 0 0 0 157540000 177100000 48450000 202250000 145720000 0 2742 4210 2560 25492;25493;25494;25495;25496;25497;25498;25499;25500 32847;32848;32849;32850;32851;32852;32853;32854;32855;32856 32850 10 ALVEFTNSPDCLSK Unmodified 1579.7552 0.75520821 4447 Q9UIA9;E7ESC6;H0YBE1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 83.785 83.785 2 1.8277E-07 85411 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.89 120.03 153010000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76794000 0 76219000 2743 4447 2561 25501;25502;25503;25504;25505;25506;25507 32857;32858;32859;32860;32861;32862;32863 32859 7 ALVELLR Unmodified 812.51199 0.51198846 3773 V9GYM8;Q92974 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 75.398 75.398 2 0.042144 75989 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.381 9.4319 77205000 0 0 0 0 0 28702000 0 0 0 0 0 27498000 21006000 2744 3773 2562 25508;25509;25510 32864;32865;32866 32865 3 ALVEMQDVVAELLR Unmodified 1584.8545 0.85452832 4097 Q9C0H2 TTYH3 Protein tweety homolog 3 yes yes 0 0 0 1 164.67 164.67 2 8.6003E-11 167799 QUIQUE_C1403_190116_001 137.89 108.42 15305000 0 0 0 15305000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2745 4097 2563 25511 32867;32868 32868 2 ALVENCLVPDLWIR Unmodified 1696.8971 0.89706184 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 144.93 144.93 2 0.0038583 150093 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.153 49.344 114810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57409000 57397000 2746 3098 2564 25512;25513 32869;32870 32870 2 ALVFQPVAELK Unmodified 1213.7071 0.70705945 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.894 98.894 2 0.00043691 103161 QUIQUE_C1218_190116_001 103.55 90.092 8676300000 1067700000 987330000 951580000 885410000 702630000 727720000 754450000 249080000 416720000 439810000 621080000 388680000 484060000 2747 452 2565 25514;25515;25516;25517;25518;25519;25520;25521;25522;25523;25524;25525;25526 32871;32872;32873;32874;32875;32876;32877;32878;32879;32880;32881;32882;32883;32884;32885;32886;32887;32888;32889;32890 32873 20 ALVFQPVAELKDQTDFEHR Unmodified 2242.1382 0.1382314 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 1 1 3 2 2 2 2 2 3 2 1 3 2 2 99.612 99.612 2;3;4 5.7283E-15 102017 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.68 101.94 4649100000 37471000 224770000 190060000 156760000 317760000 92923000 329920000 668920000 667300000 31575000 692710000 575590000 663390000 2748 452 2566 25527;25528;25529;25530;25531;25532;25533;25534;25535;25536;25537;25538;25539;25540;25541;25542;25543;25544;25545;25546;25547;25548;25549;25550;25551;25552;25553 32891;32892;32893;32894;32895;32896;32897;32898;32899;32900;32901;32902;32903;32904;32905;32906;32907;32908;32909;32910;32911;32912;32913;32914;32915;32916;32917;32918;32919;32920;32921;32922;32923;32924;32925 32910 33 ALVFVYGTLK Acetyl (Protein N-term) 1151.659 0.65904662 4048 Q9BVM4;M0R0M3;M0R217 GGACT Gamma-glutamylaminecyclotransferase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.94 165.94 2 0.0018247 170176 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.02 90.429 325980000 29982000 14376000 22130000 19168000 23532000 21343000 23309000 31402000 42310000 12675000 33817000 23477000 28460000 2749 4048 2567 25554;25555;25556;25557;25558;25559;25560;25561;25562;25563;25564;25565;25566 32926;32927;32928;32929;32930;32931;32932;32933;32934;32935;32936;32937;32938;32939 32939 13 ALVGDEVELPCR Unmodified 1356.6708 0.6707503 743 C9JTE0;Q16653;A0A0G2JHM8;Q5SSB8;A0A0G2JIQ0;A0A140T9L1;A0A0G2JJE4;A0A0G2JI49;A0A0G2JIU9;A0A0G2JHA9;A0A0G2JKI0;H0Y8A0 MOG Myelin-oligodendrocyte glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.192 80.192 2 1.0071E-24 81446 QUIQUE_C1368_190116_001 195.79 182.83 4027600000 289830000 271570000 523310000 229210000 306650000 182320000 702220000 204390000 107390000 140090000 528670000 158850000 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52.202 2825600000 276450000 0 407790000 186930000 0 0 0 470400000 553570000 0 0 371010000 559420000 2755 1099 2573 25606;25607;25608;25609;25610;25611;25612;25613 32988;32989;32990;32991;32992;32993;32994;32995 32989 7 ALVIVMGK Oxidation (M) 845.50446 0.50446024 1099 G5E9Q6;C9J0J7 PFN2 Profilin yes no 0 1 0 1 1 34.733 34.733 2 0.043361 30143 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.714 34.399 77348000 0 0 0 0 0 0 0 45245000 0 32103000 0 0 0 2756 1099 2573 25614;25615 32996;32997;32998 32997 3 ALVLAQIR Unmodified 882.56509 0.56508666 1707 O95163;F5H2T0 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 62.594 62.594 2 0.040044 61332 QUIQUE_C1277_190116_001 86.512 47.72 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2757 1707 2574 25616;25617;25618 32999;33000;33001 33000 3 ALVLDCHYPEDEVGQEDEAESDIFSIR Unmodified 3135.3979 0.39788908 2906 Q07021;I3L3Q7;I3L3B0 C1QBP Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 3 136.63 136.63 3 6.8088E-65 142139 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34364000 31814000 23434000 37292000 0 0 0 16124000 0 0 0 17924000 0 2766 2109 2582 25711;25712;25713;25714;25715;25716;25717;25718;25719;25720;25721 33131;33132;33133;33134;33135;33136;33137;33138;33139;33140;33141;33142;33143 33134 13 ALVQCVHSVYIPNK Unmodified 1626.8552 0.85519702 321 A0A0U1RRL8;Q8TB22 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 59.153 59.153 3 0.041854 58183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 23.398 16.107 48892000 0 0 0 0 0 0 0 0 48892000 0 0 0 0 2767 321 2583 25722 33144 33144 1 ALVQQGLK Unmodified 855.5178 0.51780212 3407 Q6UWP2;A0A087WYV4 DHRS11 Dehydrogenase/reductase SDR family member 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.915 22.915 2 0.053491 16153 QUIQUE_C1403_190116_001 54.787 22.722 149490000 0 0 0 31993000 0 33652000 41317000 0 0 0 0 42528000 0 2768 3407 2584 25723;25724;25725;25726 33145;33146;33147;33148 33145 4 ALVQSLLAK Unmodified 941.59097 0.59096706 4321 Q9NX46 ADPRHL2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 yes yes 0 0 0 1 71.752 71.752 2 0.0014131 67655 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.91 68.101 33129000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33129000 0 0 0 2769 4321 2585 25727 33149 33149 1 ALVQTEDHLLLFLQQLAGK Unmodified 2136.1943 0.19428972 3611 Q8N766 EMC1 ER membrane protein complex subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 162.03 162.03 3 2.3197E-07 166103 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.035 82.781 357640000 29348000 53275000 44713000 20437000 72659000 0 0 0 69769000 0 67438000 0 0 2770 3611 2586 25728;25729;25730;25731;25732;25733;25734;25735 33150;33151;33152;33153;33154;33155;33156;33157 33157 7 ALVSAQWVAEALR Unmodified 1412.7776 0.77759863 2238 P25325;B1AH49 MPST 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase;Sulfurtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 132.05 132.05 2 5.0753E-05 138034 QUIQUE_C1438_190116_001 114.89 85.732 787900000 97231000 122100000 122800000 132530000 140450000 107740000 0 0 0 65045000 0 0 0 2771 2238 2587 25736;25737;25738;25739;25740;25741;25742 33158;33159;33160;33161;33162;33163;33164 33162 4 ALVSEEGEGKNPVDYIQGLLDLK Unmodified 2486.2904 0.29043453 3017 Q13618 CUL3 Cullin-3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 154.88 154.88 3 0.00029192 162233 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.106 34.907 1105100000 58566000 75946000 0 49827000 0 0 82126000 71639000 118990000 0 386900000 165310000 95819000 2772 3017 2588 25743;25744;25745;25746;25747;25748;25749;25750;25751;25752;25753 33165;33166;33167;33168;33169;33170;33171;33172;33173;33174;33175 33173 9 ALVSEWKEPQAK Unmodified 1384.7351 0.73506511 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 2 42.276 42.276 2;3 0.0058654 37657 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.89 69.775 248280000 0 0 0 0 0 0 0 34432000 0 19182000 0 0 194670000 2773 3179 2589 25754;25755;25756;25757 33176;33177;33178;33179;33180 33179 5 ALVSGKPAESSAVAATEK Unmodified 1714.9101 0.91012895 1711 O95182 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.292 29.292 2 1.1126E-22 24615 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.86 149.89 656080000 53361000 53456000 40648000 47321000 60604000 31712000 72886000 45172000 49139000 0 82065000 73896000 45824000 2774 1711 2590 25758;25759;25760;25761;25762;25763;25764;25765;25766;25767;25768;25769 33181;33182;33183;33184;33185;33186;33187;33188;33189;33190;33191;33192 33188 12 ALVSGKPAESSAVAATEKK Unmodified 1843.0051 0.005091963 1711 O95182 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 2 1 22.236 22.236 3 0.020926 15664 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.461 42.483 42970000 0 0 0 0 0 0 0 42970000 0 0 0 0 0 2775 1711 2591 25770 33193 33193 1 ALVSHNGSLINVGSLLQR Unmodified 1877.0483 0.048294182 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.49 101.49 3 0.0043155 104732 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.577 35.207 286720000 0 33334000 0 32858000 28332000 0 0 32376000 40540000 0 41169000 43746000 34360000 2776 3571 2592 25771;25772;25773;25774;25775;25776;25777;25778 33194;33195;33196;33197;33198;33199;33200;33201 33198 5 ALVSQCNLYMAAR Oxidation (M) 1511.7225 0.72246829 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 1 0 1 1 63.704 63.704 2 0.00060411 62459 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.108 70.346 22662000 0 0 0 0 0 0 0 22662000 0 0 0 0 0 2777 617 2593 25779;25780 33202;33203 33202 403 2 ALVSQCNLYMAAR Unmodified 1495.7276 0.72755367 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 76.292 76.292 2 0.068403 77075 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.244 17.664 30703000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30703000 0 2778 617 2593 25781 33204 33204 1 ALVSVVNSFHEK Unmodified 1328.7089 0.70885036 228 A0A0C4DG40;Q8NF91 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 56.75 56.75 3 0.067501 56261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 19.496 3.88 31712000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31712000 0 0 2779 228 2594 25782 33205 33205 1 ALVTGYFMQVAHLER Unmodified 1733.8923 0.89231081 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.04 117.04 3 0.00011631 122489 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.358 57.525 181340000 0 0 0 0 25776000 0 48754000 0 0 0 53136000 53676000 0 2780 1506 2595 25783;25784;25785;25786;25787;25788;25789 33206;33207;33208;33209;33210;33211;33212;33213 33210 8 ALVTTHHLMVHGNER Oxidation (M) 1729.8682 0.86822133 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 1 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 2 3 15.193 15.193 2;3;4 3.1879E-06 6959 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.45 82.089 5528500000 479170000 453150000 426950000 585890000 45931000 169170000 56336000 132510000 594550000 67126000 787090000 906020000 824590000 2781 907 2596 25790;25791;25792;25793;25794;25795;25796;25797;25798;25799;25800;25801;25802;25803;25804;25805;25806;25807;25808;25809;25810;25811 33214;33215;33216;33217;33218;33219;33220;33221;33222;33223;33224;33225;33226;33227;33228;33229;33230;33231;33232;33233;33234;33235;33236;33237 33236 551 24 ALVTTHHLMVHGNER Unmodified 1713.8733 0.8733067 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 3 1 2 1 1 1 18.791 18.791 2;3;4 2.1077E-35 11271 QUIQUE_C1403_190116_001 205.8 167.78 8023400000 926820000 1354800000 927180000 727510000 664730000 717120000 1001200000 0 323010000 114970000 478120000 400090000 387910000 2782 907 2596 25812;25813;25814;25815;25816;25817;25818;25819;25820;25821;25822;25823;25824;25825;25826;25827;25828;25829;25830;25831;25832;25833 33238;33239;33240;33241;33242;33243;33244;33245;33246;33247;33248;33249;33250;33251;33252;33253;33254;33255;33256;33257;33258;33259 33245 19 ALVVEMSR Unmodified 903.48479 0.48478743 3919 Q96PK6;A0A0A6YYI9;F8WDX3;A0A0A0MSL8;B8ZZ74 RBM14;RBM14-RBM4 RNA-binding protein 14 yes no 0 0 0 1 1 1 43.976 43.976 2 0.025599 41707 QUIQUE_C1218_190116_001 71.342 29.84 111570000 40354000 0 38586000 0 0 32631000 0 0 0 0 0 0 0 2783 3919 2597 25834;25835;25836 33260;33261;33262 33260 3 ALWADSGIQNAYDR Unmodified 1578.7427 0.74266969 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.029 94.029 2 1.8649E-18 96107 QUIQUE_C1368_190116_001 158.05 135.96 2400500000 170480000 164930000 239210000 176660000 128210000 179720000 212420000 168960000 215920000 85597000 276490000 175850000 206040000 2784 3063 2598 25837;25838;25839;25840;25841;25842;25843;25844;25845;25846;25847;25848;25849 33263;33264;33265;33266;33267;33268;33269;33270;33271;33272;33273;33274;33275;33276 33265 14 ALWCSEDK Unmodified 1007.4382 0.43823117 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 38.147 38.147 2 0.030086 34107 QUIQUE_C1576_190116_001 67.277 56.163 61179000 0 0 0 0 0 0 61179000 0 0 0 0 0 0 2785 4592 2599 25850 33277 33277 1 ALWEDEGVR Unmodified 1073.5142 0.5141733 2778 P63092;Q5JWF2;S4R3E3;Q5JWE9;H0Y7F4;S4R3V9 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 63.103 63.103 2 0.00164 61820 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.64 58.52 1942000000 152770000 144330000 165310000 170960000 166820000 152490000 184880000 177300000 141870000 80918000 155350000 120460000 128570000 2786 2778 2600 25851;25852;25853;25854;25855;25856;25857;25858;25859;25860;25861;25862;25863;25864 33278;33279;33280;33281;33282;33283;33284;33285;33286;33287;33288;33289;33290;33291;33292;33293;33294;33295;33296 33296 19 ALWEETSFQLDR Unmodified 1493.7151 0.71505795 1477 O15067;H0YGH1 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 115 115 2 0.010013 118769 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.977 43.862 57675000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24646000 33029000 2787 1477 2601 25865;25866 33297;33298 33297 2 ALWFDLQQR Unmodified 1175.6087 0.60874239 3468 Q7Z6G3 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.7 114.7 2 0.0018516 119754 QUIQUE_C1218_190116_001 114.43 81.168 310590000 32617000 0 0 0 0 41801000 48725000 0 22627000 20192000 40910000 57023000 46694000 2788 3468 2602 25867;25868;25869;25870;25871;25872;25873;25874;25875;25876;25877 33299;33300;33301;33302;33303;33304;33305;33306;33307;33308;33309;33310;33311;33312;33313;33314 33299 16 ALWFQGR Unmodified 876.46062 0.46062159 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.849 74.849 2 0.023734 75035 QUIQUE_C1368_190116_001 99.511 60.292 1577200000 152820000 143240000 101080000 104310000 151190000 99519000 130210000 126220000 107120000 80645000 114760000 129550000 136580000 2789 307 2603 25878;25879;25880;25881;25882;25883;25884;25885;25886;25887;25888;25889;25890 33315;33316;33317;33318;33319;33320;33321;33322;33323;33324;33325;33326;33327;33328;33329 33317 15 ALWLAENQAQPMLR Unmodified 1639.8504 0.850446 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 107.46 107.46 2 0.040671 112906 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.82 48.596 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2790 289 2604 25891 33330 33330 1 ALYAIPGLDYVSHEDILPYTSTDQVPIQHELFER Unmodified 3928.9523 0.9523347 4565 Q9Y2S7;B4DEM9 POLDIP2 Polymerase delta-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 154.21 154.21 4 7.691E-06 156697 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.325 41.251 91446000 0 0 0 44701000 0 0 0 46746000 0 0 0 0 0 2791 4565 2605 25892;25893 33331;33332 33332 2 ALYDFEPENEGELGFK Unmodified 1856.8469 0.84685999 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 126.12 126.12 2;3 3.0302E-29 130400 QUIQUE_C1403_190116_001 159.44 150.01 9046600000 913180000 849780000 679390000 743070000 535040000 605310000 673530000 640820000 599640000 301960000 846210000 771570000 887130000 2792 3982 2606 25894;25895;25896;25897;25898;25899;25900;25901;25902;25903;25904;25905;25906;25907;25908 33333;33334;33335;33336;33337;33338;33339;33340;33341;33342;33343;33344;33345;33346;33347;33348;33349;33350;33351;33352;33353;33354;33355;33356;33357;33358;33359;33360 33341 27 ALYDNVAESPDELSFR Unmodified 1824.853 0.853008 416 A0A2R8Y5E4;A0A2R8YFK2;A0A2R8Y6M6;A0A2R8Y4C2;A0A2R8YFS8;A0A2R8Y8C4;A0A2R8Y5C9;A0A2R8Y596;P56945 BCAR1 Breast cancer anti-estrogen resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 112.21 112.21 2 0.00011014 115562 QUIQUE_C1403_190116_001 78.964 62.434 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2793 416 2607 25909;25910;25911 33361;33362;33363 33361 3 ALYDTFSAFGNILSCK Unmodified 1805.8658 0.86582129 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E5RGH3;E5RJB9;B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;B1ANR1;H0YEQ8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 155.04 155.04 2;3 1.0127E-66 161307 QUIQUE_C1576_190116_001 215.53 196.4 2265300000 142730000 196590000 319790000 156280000 209550000 112180000 184790000 154700000 28534000 62220000 255000000 257470000 185440000 2794 2031;596 2608 25912;25913;25914;25915;25916;25917;25918;25919;25920;25921;25922;25923;25924;25925;25926;25927;25928;25929;25930;25931;25932 33364;33365;33366;33367;33368;33369;33370;33371;33372;33373;33374;33375;33376;33377;33378;33379;33380;33381;33382;33383;33384;33385;33386 33377 21 ALYDYAGQEADELSFR Unmodified 1846.8374 0.83735793 241 A0A0C4DGG1;Q9UKS6 PACSIN3 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 yes no 0 0 0 1 120.62 120.62 2 0.005345 124882 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.705 54.981 45087000 0 0 0 0 0 0 0 0 45087000 0 0 0 0 2795 241 2609 25933 33387 33387 1 ALYDYDGQEQDELSFK Unmodified 1919.8425 0.84250289 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 2 1 2 3 2 1 2 2 2 107.66 107.66 2 2.1517E-95 109640 QUIQUE_C1563_190116_001 270.74 248.68 4861300000 409260000 504730000 397410000 508580000 380120000 330950000 358860000 473560000 261250000 157250000 305860000 338850000 434610000 2796 4069 2610 25934;25935;25936;25937;25938;25939;25940;25941;25942;25943;25944;25945;25946;25947;25948;25949;25950;25951;25952;25953;25954;25955;25956 33388;33389;33390;33391;33392;33393;33394;33395;33396;33397;33398;33399;33400;33401;33402;33403;33404;33405;33406;33407;33408;33409;33410;33411;33412;33413;33414;33415;33416;33417;33418;33419;33420;33421;33422;33423;33424;33425;33426;33427;33428;33429;33430;33431;33432 33406 44 ALYDYEGQEHDELSFK Unmodified 1942.8585 0.85848731 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22;H0Y923 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 87.76 87.76 2;3 1.6707E-09 88989 QUIQUE_C1403_190116_001 136.27 125.62 322930000 59187000 72042000 0 28169000 87819000 75709000 0 0 0 0 0 0 0 2797 4510 2611 25957;25958;25959;25960;25961 33433;33434;33435;33436;33437 33435 3 ALYEAGER Unmodified 907.43995 0.43994572 1853 P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.257 22.257 2 0.0073368 15788 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.418 48.828 2861900000 0 0 392400000 420220000 0 343230000 400750000 198350000 393790000 239880000 0 0 473250000 2798 1853 2612 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Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.64 105.64 2 1.4928E-17 108545 QUIQUE_DMIX8_190116_001 184.87 149.19 1525900000 117070000 125880000 126900000 125140000 0 93412000 0 141780000 147970000 80240000 231860000 184480000 151140000 2808 2970;2974 2622 26045;26046;26047;26048;26049;26050;26051;26052;26053;26054;26055 33537;33538;33539;33540;33541;33542;33543;33544;33545;33546;33547;33548;33549 33549 13 ALYLIATNGTPELQNPER Unmodified 1999.0375 0.037454724 120 A0A087X294;O75914 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.37 107.37 2 2.082E-19 112544 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.34 116.14 312260000 0 36587000 0 0 30417000 0 35930000 35646000 35703000 0 47863000 43382000 46732000 2809 120 2623 26056;26057;26058;26059;26060;26061;26062;26063;26064 33550;33551;33552;33553;33554;33555;33556;33557;33558 33556 7 ALYLQYTDETFR Unmodified 1518.7355 0.73545904 1784 P00450;E9PFZ2;D6RE86 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 103.52 103.52 2 1.8951E-05 107498 QUIQUE_C1218_190116_001 152.28 116.77 310540000 62798000 0 0 0 0 64488000 0 0 0 70545000 112710000 0 0 2810 1784 2624 26065;26066;26067;26068;26069 33559;33560;33561;33562;33563 33559 5 ALYNQYIHFK Unmodified 1295.6663 0.66625727 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 75.201 75.201 3 0.0016278 75596 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.435 54.08 48316000 0 0 19690000 0 0 0 0 28627000 0 0 0 0 0 2811 1187 2625 26070;26071;26072;26073;26074;26075 33564;33565;33566;33567;33568;33569 33566 6 ALYNQYLQFK Unmodified 1286.6659 0.66592292 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 99.604 99.604 2 0.0067837 102280 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.127 62.906 16564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16564000 0 2812 2882 2626 26076 33570 33570 1 ALYPFESR Unmodified 981.49198 0.4919813 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000001528;H7C429 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 67.839 67.839 2 0.035359 67920 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.48 44.749 24866000 0 0 0 0 0 0 0 0 24866000 0 0 0 0 + 2813 3161 2627 26077 33571 33571 1 ALYPVIPR Unmodified 927.55419 0.55418762 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 69.91 69.91 2 0.02493 69038 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.949 53.265 46107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16965000 0 0 29142000 2814 3675 2628 26078;26079;26080;26081;26082;26083;26084 33572;33573;33574;33575;33576;33577;33578 33578 7 ALYTFEPR Unmodified 995.50763 0.50763136 3763 Q92882 OSTF1 Osteoclast-stimulating factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 64.042 64.042 2 0.021461 61070 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.109 31.301 177730000 0 0 0 0 0 0 0 62218000 0 27702000 51214000 0 36593000 2815 3763 2629 26085;26086;26087;26088 33579;33580;33581;33582 33580 4 ALYYDLISSPDIHGTYK Unmodified 1954.9676 0.96764382 2403 P36955;I3L4Z0;I3L2R7 SERPINF1 Pigment epithelium-derived factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.34 105.34 3 0.00024821 109957 QUIQUE_C1218_190116_001 48.623 42.779 254250000 35938000 0 62233000 27056000 0 0 0 30381000 26979000 0 42920000 28742000 0 2816 2403 2630 26089;26090;26091;26092;26093;26094;26095 33583;33584;33585;33586;33587;33588;33589 33583 7 ALYYLQIHPQELR Unmodified 1642.8831 0.88312633 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 1 90.754 90.754 2;3 0.00046303 94237 QUIQUE_C1218_190116_001 106.29 81.999 1489000000 135380000 0 117160000 93158000 169160000 49618000 213440000 41809000 0 76309000 282130000 158150000 152630000 2817 3179 2631 26096;26097;26098;26099;26100;26101;26102;26103;26104;26105;26106;26107;26108;26109;26110;26111;26112 33590;33591;33592;33593;33594;33595;33596;33597;33598;33599;33600;33601;33602;33603;33604;33605;33606 33591 15 AMAAEAEASR Unmodified 1005.4549 0.45494386 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 0 0 1 1 15.677 15.677 2 0.0034764 8061 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.213 63.512 50220000 0 0 0 0 0 0 0 50220000 0 0 0 0 0 2818 2258 2632 26113;26114 33607;33608 33608 2 AMADELSEK Unmodified 992.44846 0.4484615 2884 Q03135;E9PCT5 CAV1 Caveolin-1;Caveolin yes no 0 0 0 1 1 29.432 29.432 2 0.013527 23713 QUIQUE_C1403_190116_001 69.812 49.89 34845000 0 0 0 34845000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2819 2884 2633 26115;26116 33609;33610 33609 2 AMADPEVQQIMSDPAMR Unmodified 1888.8481 0.84813909 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.83 106.83 2;3 1.7719E-16 104248 QUIQUE_DMIX4_190116_001 160.69 142.42 1597200000 131120000 151410000 143560000 162490000 117390000 104700000 128190000 98937000 92054000 38086000 174640000 126390000 128280000 2820 2343 2634 26117;26118;26119;26120;26121;26122;26123;26124;26125;26126;26127;26128;26129;26130;26131 33611;33612;33613;33614;33615;33616;33617;33618;33619;33620;33621;33622;33623;33624;33625;33626;33627;33628;33629;33630;33631;33632 33627 22 AMADPEVQQIMSDPAMR Oxidation (M) 1904.8431 0.84305371 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 94.358 94.358 2 1.4594E-12 96298 QUIQUE_C1277_190116_001 126.1 107.83 76201000 0 35344000 0 0 0 24217000 0 0 0 16639000 0 0 0 2821 2343 2634 26132;26133;26134;26135 33633;33634;33635;33636 33633 1747 3 AMAGSVLLDKR Unmodified 1159.6383 0.63832796 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 1 1 37.086 37.086 2 0.035486 33115 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.349 44.965 34916000 0 0 0 0 0 0 0 0 34916000 0 0 0 0 2822 882 2635 26136 33637 33637 0 AMAVLTDHPYASLTLPDDAAADCLFLRPGLPGVPPFLLHR Oxidation (M) 4343.2235 0.22350472 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 1 1 1 2 1 1 1 1 155.71 155.71 4;5 7.4772E-43 161115 QUIQUE_C1218_190116_001 94.642 90.489 1655000000 57256000 0 0 1057400000 0 0 111790000 0 0 53834000 0 180330000 194370000 2823 1762 2636 26137;26138;26139;26140;26141;26142;26143 33638;33639;33640;33641;33642;33643;33644;33645 33638 962 7 AMAVLTDHPYASLTLPDDAAADCLFLRPGLPGVPPFLLHR Unmodified 4327.2286 0.22859009 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 1 1 2 3 2 1 1 2 3 3 2 3 3 158.59 158.59 4;5 3.8034E-143 162677 QUIQUE_C1277_190116_001 175.38 168.24 4852000000 106150000 947800000 541950000 354430000 223100000 111400000 352330000 247120000 363080000 0 493340000 665970000 445360000 2824 1762 2636 26144;26145;26146;26147;26148;26149;26150;26151;26152;26153;26154;26155;26156;26157;26158;26159;26160;26161;26162;26163;26164;26165;26166;26167;26168;26169 33646;33647;33648;33649;33650;33651;33652;33653;33654;33655;33656;33657;33658;33659;33660;33661;33662;33663;33664;33665;33666;33667;33668;33669;33670;33671;33672;33673;33674;33675;33676;33677;33678;33679;33680;33681 33648 34 AMDDSSVTEHQK Unmodified 1346.5772 0.57724384 2462 P43155;H0Y4Z7 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 14.262 14.262 2;3 0.00012073 5919 QUIQUE_C1563_190116_001 120.76 111.42 1016700000 218280000 96009000 130750000 97905000 29910000 240450000 0 17125000 45711000 23196000 60931000 30094000 26364000 2825 2462 2637 26170;26171;26172;26173;26174;26175;26176;26177;26178;26179;26180;26181;26182;26183;26184 33682;33683;33684;33685;33686;33687;33688;33689;33690;33691;33692;33693;33694;33695;33696 33690 13 AMDEIQPDLR Unmodified 1186.5652 0.56522259 4467 Q9UK41;E9PQR7;E9PM90 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.078 60.078 2 0.0001715 58528 QUIQUE_C1368_190116_001 120.15 101.37 528330000 45681000 47984000 72701000 49378000 52519000 47201000 63706000 40846000 54727000 0 0 53588000 0 2826 4467 2638 26185;26186;26187;26188;26189;26190;26191;26192;26193;26194 33697;33698;33699;33700;33701;33702;33703;33704;33705;33706;33707;33708 33700 11 AMDFNGILTIR Unmodified 1249.6489 0.64889264 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 124.83 124.83 2 0.0064878 127548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.15 67.079 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2827 2834 2639 26195;26196;26197 33709;33710;33711 33710 3 AMDIGGTSDPYVK Unmodified 1352.6282 0.62821678 1532 O43581 SYT7 Synaptotagmin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 63.224 63.224 2 0.010613 62997 QUIQUE_C1218_190116_001 70.977 51.19 68759000 34224000 34535000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2828 1532 2640 26198;26199;26200 33712;33713;33714 33712 2 AMDLDQDVLSALAEVEQLSK Oxidation (M) 2190.0726 0.072579181 1093 G3XAI2;P07942 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 1 0 1 172.27 172.27 2 1.794E-05 178272 QUIQUE_C1438_190116_001 77.42 65.362 20774000 0 0 0 0 20774000 0 0 0 0 0 0 0 0 2829 1093 2641 26201 33715 33715 633 1 AMDLHAVLAELPR Unmodified 1434.7653 0.76531938 4287 Q9NSY0 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 126.37 126.37 3 0.002086 131214 QUIQUE_C1368_190116_001 70.438 63.231 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2830 4287 2642 26202;26203 33716;33717 33716 2 AMDLHAVLAELPRPR Unmodified 1687.9192 0.91919426 4287 Q9NSY0 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.67 113.67 4 8.297E-05 116901 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.769 70.221 153950000 0 12788000 0 0 13627000 0 25864000 24197000 20550000 0 25667000 0 31254000 2831 4287 2643 26204;26205;26206;26207;26208;26209;26210 33718;33719;33720;33721;33722;33723;33724;33725;33726;33727 33723 8 AMDLVQEEFLQR Unmodified 1477.7235 0.72351415 4210 Q9HB07;F8VR84;F8VQQ3 C12orf10 UPF0160 protein MYG1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 109.53 109.53 2 0.0018476 112272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.2 50.779 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2832 4210 2644 26211;26212;26213;26214;26215;26216;26217 33728;33729;33730;33731;33732;33733;33734 33731 7 AMDNVTVR Unmodified 904.44365 0.44365089 4372;3092 Q14982;Q9P121;F8VTR5 OPCML;NTM Opioid-binding protein/cell adhesion molecule;Neurotrimin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.167 22.167 2 0.019703 15076 QUIQUE_C1368_190116_001 77.923 33.156 786250000 129320000 132400000 143440000 0 87501000 0 106880000 0 73980000 0 112730000 0 0 2833 3092;4372 2645 26218;26219;26220;26221;26222;26223;26224 33735;33736;33737;33738;33739;33740;33741 33737 7 AMDPQDLQNTEVPIATTAK Unmodified 2041.999 0.99902031 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 91.226 91.226 2 1.7401E-08 93626 QUIQUE_C1218_190116_001 111.74 98.76 24967000 24967000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2834 4148 2646 26225 33742 33742 1 AMDQEITVNPQFVQK Oxidation (M) 1762.856 0.85598488 4514 Q9UNS2;H7C3P9 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 72.926 72.926 2 1.3691E-05 73046 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.55 80.424 93311000 30950000 0 0 0 0 0 0 0 25712000 10916000 0 25733000 0 2835 4514 2647 26226;26227;26228;26229 33743;33744;33745;33746 33744 2987 4 AMDQEITVNPQFVQK Unmodified 1746.8611 0.86107026 4514 Q9UNS2;H7C3P9 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.205 85.205 2 1.4712E-12 86295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.83 116.93 981480000 105170000 118390000 0 104800000 77010000 74088000 78878000 78841000 62681000 25156000 96606000 87537000 72332000 2836 4514 2647 26230;26231;26232;26233;26234;26235;26236;26237;26238;26239;26240;26241 33747;33748;33749;33750;33751;33752;33753;33754;33755;33756;33757;33758 33753 12 AMDSDWFAENYMGR Oxidation (M) 1707.6657 0.66574127 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 107.29 107.29 2 0.00024021 108537 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.465 89.765 492180000 0 37559000 105440000 35213000 38756000 0 30523000 39315000 46152000 21662000 95423000 0 42142000 2837 2660 2648 26242;26243;26244;26245;26246;26247;26248;26249;26250;26251;26252;26253;26254 33759;33760;33761;33762;33763;33764;33765;33766;33767;33768;33769;33770;33771;33772;33773 33766 2106;2107 15 AMDSDWFAENYMGR Unmodified 1691.6708 0.67082665 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.54 126.54 2 1.7495E-35 131169 QUIQUE_C1368_190116_001 185.77 183.62 1140800000 87601000 80704000 140860000 102250000 43940000 57200000 85421000 81745000 97142000 18122000 115730000 119000000 111090000 2838 2660 2648 26255;26256;26257;26258;26259;26260;26261;26262;26263;26264;26265;26266;26267 33774;33775;33776;33777;33778;33779;33780;33781;33782;33783;33784;33785;33786 33776 7 AMDSDWFAENYMGR 2 Oxidation (M) 1723.6607 0.6606559 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 2 0 1 91.808 91.808 2 0.0012057 88456 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.862 79.161 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2839 2660 2648 26268 33787 33787 2106;2107 1 AMDTLGIEYGDK Unmodified 1311.6017 0.60166768 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.686 76.686 2 0.00014489 78686 QUIQUE_C1218_190116_001 120.09 110.14 3247500000 676060000 422330000 358420000 379850000 187270000 401400000 254190000 0 114130000 186230000 94284000 77145000 96143000 2840 1963 2649 26269;26270;26271;26272;26273;26274;26275;26276;26277;26278;26279;26280 33788;33789;33790;33791;33792;33793;33794;33795;33796;33797;33798;33799;33800;33801;33802;33803;33804;33805 33790 14 AMDTLGIEYGDK Oxidation (M) 1327.5966 0.5965823 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 1 0 1 1 1 60.417 60.417 2 0.0041343 56348 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.298 73.706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2841 1963 2649 26281;26282;26283 33806;33807;33808 33808 1226 3 AMDTLGIEYGDKER Oxidation (M) 1612.7403 0.74028642 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 45.107 45.107 2;3 1.4811E-35 42765 QUIQUE_C1218_190116_001 178.81 153.96 3870300000 253680000 414190000 460110000 278740000 372610000 248340000 332650000 102730000 306570000 130010000 396590000 195580000 378450000 2842 1963 2650 26284;26285;26286;26287;26288;26289;26290;26291;26292;26293;26294;26295;26296;26297;26298;26299;26300;26301;26302;26303;26304;26305;26306;26307;26308;26309 33809;33810;33811;33812;33813;33814;33815;33816;33817;33818;33819;33820;33821;33822;33823;33824;33825;33826;33827;33828;33829;33830;33831;33832;33833;33834;33835;33836 33810 1226 22 AMDTLGIEYGDKER Unmodified 1596.7454 0.7453718 1963 P09471;A0A1W2PP87;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 59.48 59.48 2;3 8.5212E-86 58316 QUIQUE_DMIX5_190116_001 217.83 182.28 27785000000 2130400000 2571500000 3073900000 2170900000 1937800000 1249700000 2557200000 1728000000 2318500000 487310000 3055500000 1745600000 2758500000 2843 1963 2650 26310;26311;26312;26313;26314;26315;26316;26317;26318;26319;26320;26321;26322;26323;26324;26325;26326;26327;26328;26329;26330;26331;26332;26333;26334;26335;26336 33837;33838;33839;33840;33841;33842;33843;33844;33845;33846;33847;33848;33849;33850;33851;33852;33853;33854;33855;33856;33857;33858;33859;33860;33861;33862;33863;33864;33865;33866;33867;33868;33869;33870;33871;33872;33873;33874;33875;33876;33877;33878 33868 42 AMDYDLLLR Unmodified 1108.5587 0.55868065 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 107.75 107.75 2 0.015924 111937 QUIQUE_C1368_190116_001 95.909 37.742 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2844 2665 2651 26337 33879 33879 1 AMEAEAAGLR Unmodified 1017.4913 0.49132937 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 32.64 32.64 2 0.0042528 27616 QUIQUE_C1218_190116_001 81.548 62.033 89949000 38589000 0 0 0 0 0 0 0 0 12812000 38549000 0 0 2845 3459 2652 26338;26339;26340 33880;33881;33882 33880 3 AMEALATAEQACK Unmodified 1392.6377 0.63773561 51 F8W7S5;A0A087WVV2;Q9P2E9 RRBP1 Ribosome-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 52.364 52.364 2 0.058952 50521 QUIQUE_C1368_190116_001 61.815 45.482 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2846 51 2653 26341 33883 33883 1 AMEAVAAQGK Unmodified 974.48552 0.48551571 2139;2090 P15259;P18669 PGAM2;PGAM1 Phosphoglycerate mutase 2;Phosphoglycerate mutase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 16.319 16.319 2 0.00073468 8322 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.01 59.092 605730000 0 12540000 0 0 0 10401000 0 33505000 0 549280000 0 0 0 2847 2090;2139 2654 26342;26343;26344;26345 33884;33885;33886;33887 33887 4 AMEFVDVTESNAR Unmodified 1467.6664 0.6663932 3622 Q8NB37;E9PLI5;E9PQD8 PDDC1 Parkinson disease 7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.027 78.027 2 0.00038335 78575 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.4 79.001 330590000 41508000 0 0 32819000 29316000 0 30605000 40777000 0 23222000 49478000 40851000 42018000 2848 3622 2655 26346;26347;26348;26349;26350;26351;26352;26353;26354 33888;33889;33890;33891;33892;33893;33894;33895;33896 33896 8 AMENGEIDQASEEK Unmodified 1549.6566 0.65661638 4066 Q9BXW6;J3QSB8 OSBPL1A Oxysterol-binding protein-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 31.344 31.344 2 0.00030084 25944 QUIQUE_C1277_190116_001 105.2 67.476 26032000 0 26032000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2849 4066 2656 26355;26356 33897;33898 33897 2 AMETYEQQLQEK Unmodified 1496.6817 0.68170891 4718 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 30.316 30.316 2 0.00047565 24608 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108.15 33.88 1086200000 176520000 125110000 88876000 77665000 0 79906000 103370000 124130000 94547000 0 69638000 68101000 78352000 + 2850 4718 2657 26357;26358;26359;26360;26361;26362;26363;26364;26365;26366;26367;26368;26369;26370;26371 33899;33900;33901;33902;33903;33904;33905;33906;33907;33908;33909;33910;33911;33912;33913 33912 8 AMEVDERPTEQYSDIGGLDK Unmodified 2252.0267 0.026691621 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 78.183 78.183 2;3 9.6767E-57 79966 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.22 166.53 1788900000 163950000 185020000 219640000 149520000 118620000 113870000 135150000 180590000 151340000 61865000 187560000 0 121790000 2851 4672 2658 26372;26373;26374;26375;26376;26377;26378;26379;26380;26381;26382;26383;26384;26385;26386;26387;26388;26389;26390;26391 33914;33915;33916;33917;33918;33919;33920;33921;33922;33923;33924;33925;33926;33927;33928;33929;33930;33931;33932;33933 33932 17 AMEWITAK Unmodified 948.47389 0.47388839 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 63.057 63.057 2 0.013835 61989 QUIQUE_C1368_190116_001 86.794 68.758 1065400000 203630000 166330000 143420000 157560000 93119000 96154000 0 111820000 93406000 0 0 0 0 2852 2861 2659 26392;26393;26394;26395;26396;26397;26398;26399 33934;33935;33936;33937;33938;33939;33940;33941;33942;33943;33944 33937 11 AMEWITAK Oxidation (M) 964.4688 0.46880301 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 1 0 1 38.371 38.371 2 0.043626 34392 QUIQUE_C1403_190116_001 62.573 41.273 47861000 0 0 0 47861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2853 2861 2659 26400 33945 33945 1 AMFEQMR Acetyl (Protein N-term) 953.40991 0.40990792 4404 Q9UBQ5;K7ES31;K7EQM4;A0A087WVB9;K7ERF1 EIF3K Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K yes no 1 0 0 1 1 1 1 107.14 107.14 2 0.030732 111230 QUIQUE_C1218_190116_001 68.485 53.821 49303000 20225000 14916000 0 14161000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2854 4404 2660 26401;26402;26403;26404 33946;33947;33948;33949 33946 4 AMFINYEQVNMGDR Unmodified 1686.7494 0.74941132 4448 Q9UIC8;I3L4A2;I3L2E3;I3L537 LCMT1 Leucine carboxyl methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.08 102.08 2 3.7108E-14 105961 QUIQUE_C1576_190116_001 145.46 120.6 514210000 45010000 39197000 49047000 57534000 0 60687000 82191000 0 0 36030000 75815000 0 68700000 2855 4448 2661 26405;26406;26407;26408;26409;26410;26411;26412;26413;26414 33950;33951;33952;33953;33954;33955;33956;33957;33958;33959;33960;33961;33962;33963;33964 33960 14 AMGAAQVVVTDLSATR Unmodified 1588.8243 0.82429083 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 101.01 101.01 2;3 9.409E-10 105146 QUIQUE_C1218_190116_001 135.6 119.35 1974400000 152080000 136910000 193210000 136840000 187140000 28546000 49231000 146830000 200000000 72987000 234520000 182910000 253150000 2856 2848 2662 26415;26416;26417;26418;26419;26420;26421;26422;26423;26424;26425;26426;26427;26428;26429;26430;26431;26432;26433;26434;26435;26436;26437;26438 33965;33966;33967;33968;33969;33970;33971;33972;33973;33974;33975;33976;33977;33978;33979;33980;33981;33982;33983;33984;33985;33986;33987;33988;33989;33990;33991;33992;33993 33967 28 AMGAAQVVVTDLSATR Oxidation (M) 1604.8192 0.81920545 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 3 1 84.802 84.802 2;3 8.6384E-14 82681 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.94 122.3 156970000 0 0 33792000 0 0 21765000 0 40467000 0 60950000 0 0 0 2857 2848 2662 26439;26440;26441;26442;26443;26444;26445 33994;33995;33996;33997;33998;33999;34000;34001 34000 2274 8 AMGEQAVALAR Unmodified 1115.5757 0.5757277 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 49.473 49.473 2 0.00043965 45463 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.8 67.409 93223000 0 0 0 0 0 67288000 0 0 0 25935000 0 0 0 2858 1881 2663 26446;26447 34002;34003 34003 1 AMGGGIVDLKECLER Unmodified 1646.812 0.81201158 2531 P49441 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes yes 0 0 1 1 85.892 85.892 3 0.0072001 86479 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.695 42.038 28050000 0 0 0 0 0 0 0 28050000 0 0 0 0 0 2859 2531 2664 26448 34004 34004 1 AMGIGWWVR Unmodified 1074.5433 0.54330536 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.74 116.74 2 0.00041907 120726 QUIQUE_C1277_190116_001 119.89 76.641 40877000 0 15695000 0 0 0 0 0 12616000 0 0 12565000 0 0 2860 3684 2665 26449;26450;26451;26452;26453;26454 34005;34006;34007;34008;34009;34010 34005 6 AMGIMNSFVNDIFER 2 Oxidation (M) 1774.8018 0.80184082 1910;1593 Q8N257;Q16778;P33778;P23527;P06899;U3KQK0;Q99880;Q99879;Q99877;Q93079;Q5QNW6;P62807;P58876;P57053;O60814 HIST3H2BB;HIST2H2BE;HIST1H2BB;HIST1H2BO;HIST1H2BJ;HIST1H2BN;HIST1H2BL;HIST1H2BM;HIST1H2BH;HIST2H2BF;HIST1H2BC;HIST1H2BD;H2BFS;HIST1H2BK Histone H2B type 3-B;Histone H2B type 2-E;Histone H2B type 1-B;Histone H2B type 1-O;Histone H2B type 1-J;Histone H2B;Histone H2B type 1-L;Histone H2B type 1-M;Histone H2B type 1-N;Histone H2B type 1-H;Histone H2B type 2-F;Histone H2B type 1-C/E/F/G/I;Histone H2B type 1-D;Histone H2B type F-S;Histone H2B type 1-K no no 0 2 0 1 2 3 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 125.63 125.63 2 9.2229E-36 131359 QUIQUE_C1218_190116_001 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1-N;Histone H2B type 1-H;Histone H2B type 2-F;Histone H2B type 1-C/E/F/G/I;Histone H2B type 1-D;Histone H2B type F-S;Histone H2B type 1-K no no 0 1 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 142.75 142.75 2;3 2.9926E-94 152537 QUIQUE_DMIX3_190116_001 217.14 192.84 10182000000 1120500000 1116400000 702180000 650440000 938500000 876690000 854020000 632950000 940200000 137590000 848350000 715420000 649300000 2862 1910;1593 2666 26475;26476;26477;26478;26479;26480;26481;26482;26483;26484;26485;26486;26487;26488;26489;26490;26491;26492;26493;26494;26495;26496;26497;26498;26499;26500 34046;34047;34048;34049;34050;34051;34052;34053;34054;34055;34056;34057;34058;34059;34060;34061;34062;34063;34064;34065;34066;34067;34068;34069;34070;34071;34072;34073;34074;34075;34076;34077;34078;34079;34080;34081;34082;34083;34084;34085;34086;34087;34088;34089;34090;34091;34092;34093;34094;34095;34096;34097;34098;34099;34100;34101 34087 870;871 56 AMGIMNSFVNDIFER Unmodified 1742.812 0.81201158 1910;1593 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family member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 39.392 39.392 3 0.00017924 35332 QUIQUE_C1563_190116_001 49.721 44.719 77157000 0 0 0 0 0 49398000 0 0 0 0 0 27759000 0 2870 299 2670 26567;26568;26569;26570 34195;34196;34197;34198 34196 4 AMIAGLALLR Unmodified 1027.6212 0.62122133 3609 Q8N6R0 METTL13 Methyltransferase-like protein 13 yes yes 0 0 0 1 112.22 112.22 2 0.029687 116672 QUIQUE_C1368_190116_001 65.252 46.447 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2871 3609 2671 26571 34199 34199 1 AMIEVINHK Unmodified 1053.5641 0.56410038 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 29.572 29.572 2 0.011332 24696 QUIQUE_C1218_190116_001 72.875 26.859 165560000 54981000 0 54075000 56507000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2872 2285 2672 26572;26573;26574 34200;34201;34202 34200 2 AMINLHIQK Unmodified 1066.5957 0.59573486 4338 Q9NZ45 CISD1 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 3 2 2 1 2 43.377 43.377 2;3 0.00010067 40007 QUIQUE_C1368_190116_001 143.85 116.73 2251400000 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co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 15.612 15.612 2 0.01906 7935 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.258 73.991 43585000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21112000 0 22472000 2875 3181 2675 26604;26605 34241;34242 34241 2 AMLDQLMGTSR Unmodified 1221.5846 0.58457783 4580 Q9Y383;V9GZ75;F8WEU3 LUC7L2;C7orf55-LUC7L2 Putative RNA-binding protein Luc7-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 95.626 95.626 2 0.0039565 98149 QUIQUE_C1277_190116_001 72.607 46.165 100680000 0 19987000 0 21790000 0 27773000 0 0 0 0 31130000 0 0 2876 4580 2676 26606;26607;26608;26609 34243;34244;34245;34246 34243 4 AMLESIGVPLEK Unmodified 1285.6952 0.69517413 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.753 97.753 2 0.00053566 100659 QUIQUE_C1368_190116_001 103.22 59.413 933790000 107560000 126390000 114690000 102640000 0 0 60146000 91272000 87079000 0 140160000 103850000 0 2877 2641 2677 26610;26611;26612;26613;26614;26615;26616;26617;26618 34247;34248;34249;34250;34251;34252;34253;34254;34255;34256;34257;34258 34251 10 AMLHLQWPYK Unmodified 1285.6641 0.66414878 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 88.561 88.561 3 0.029104 91962 QUIQUE_C1218_190116_001 40.386 29.461 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2878 1909 2678 26619;26620 34259;34260 34259 2 AMLNNVVRPR Unmodified 1168.6499 0.6498957 936 E9PI87;Q9BUP3 HTATIP2 Oxidoreductase HTATIP2 yes no 0 0 1 1 29.118 29.118 3 0.014582 23781 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.318 32.724 34424000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34424000 2879 936 2679 26621 34261 34261 1 AMLPPNSFQGK Unmodified 1188.5961 0.59612879 3190 Q16698;E5RJG7;E5RFV2;E5RID6 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 55.855 55.855 2 0.012129 53276 QUIQUE_C1563_190116_001 60.717 37.397 42163000 0 0 0 0 0 23918000 0 18245000 0 0 0 0 0 2880 3190 2680 26622;26623;26624 34262;34263;34264 34263 3 AMLQLLQDK Unmodified 1058.5794 0.57941609 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 81.6 81.6 2 0.02689 82464 QUIQUE_C1277_190116_001 69.628 27.231 79439000 0 79439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2881 2168 2681 26625 34265 34265 1 AMLQLLQDKDTYSWLLK Unmodified 2065.0918 0.09179848 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 144.32 144.32 2;3 7.237E-88 151378 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.23 196.57 1503500000 0 35998000 214000000 0 31289000 0 57577000 143380000 99570000 0 789530000 43507000 88617000 2882 2168 2682 26626;26627;26628;26629;26630;26631;26632;26633;26634;26635 34266;34267;34268;34269;34270;34271;34272;34273;34274;34275;34276 34273 10 AMLSANIR Unmodified 874.46947 0.46947171 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 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1072.5488 0.54878467 2455 P42785;E9PIG4;E9PNF7;E9PQB5;E9PL85;E9PQN3;E9PKN6;E9PLY4;E9PNJ1;E9PL49;E9PR42 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.566 45.566 3 0.0024711 43177 QUIQUE_C1277_190116_001 66.568 49.1 391710000 0 45878000 32769000 31638000 32453000 0 47123000 30345000 53806000 0 38245000 41503000 37948000 2886 2455 2685 26651;26652;26653;26654;26655;26656;26657;26658;26659;26660 34292;34293;34294;34295;34296;34297;34298;34299;34300;34301;34302;34303;34304 34293 13 AMLWLSEK Unmodified 976.50519 0.50518852 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 83.683 83.683 2 0.0057328 86244 QUIQUE_C1218_190116_001 104.37 73.076 517750000 121510000 116490000 0 0 0 59489000 110540000 0 0 0 0 109720000 0 2887 2129 2686 26661;26662;26663;26664;26665 34305;34306;34307;34308;34309;34310 34305 6 AMMVFPR Acetyl (Protein N-term) 892.42992 0.42991509 4116 Q9H0B6;A8MX29;E9PQ02;E9PP09;C9JHT2;E9PM83;E9PI24 KLC2 Kinesin light chain 2 yes no 1 0 0 1 1 1 126.49 126.49 2 0.039458 130123 QUIQUE_C1403_190116_001 66.994 38.465 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2888 4116 2687 26666;26667;26668 34311;34312;34313 34312 3 AMNLHVGNLR Unmodified 1123.592 0.59204647 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 40.072 40.072 3 0.015191 35913 QUIQUE_C1368_190116_001 47.187 34.231 156080000 0 0 56947000 0 0 34001000 0 0 38106000 0 0 27028000 0 2889 4161 2688 26669;26670;26671;26672 34314;34315;34316;34317 34314 4 AMNWMSGK Unmodified 923.39934 0.39934324 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 46.727 46.727 2 0.03109 43626 QUIQUE_C1576_190116_001 104.37 61.319 180420000 0 0 0 0 0 0 95958000 84464000 0 0 0 0 0 2890 452 2689 26673;26674 34318;34319 34318 1 AMQHAEVYYK Unmodified 1238.5754 0.57539335 4045 Q9BVG4;A6NDF3 PBDC1 Protein PBDC1 yes no 0 0 0 1 1 20.372 20.372 2 0.012302 13629 QUIQUE_C1218_190116_001 66.056 41.237 52849000 22972000 0 0 29877000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2891 4045 2690 26675;26676 34320;34321 34320 2 AMSDDTVTAVCCTLHEVITK Unmodified 2250.033 0.033039327 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.26 129.26 3 1.1658E-06 133665 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.565 80.378 525160000 0 71300000 112640000 66868000 55693000 103660000 68472000 0 0 0 0 0 46530000 2892 855;928 2691 26677;26678;26679;26680;26681;26682;26683 34322;34323;34324;34325;34326;34327;34328;34329;34330 34330 9 AMSDDTVTAVCCTLHEVITK Oxidation (M) 2266.028 0.027953949 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 1 0 1 117.62 117.62 3 0.0012857 114390 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.883 46.356 13879000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13879000 0 0 0 2893 855;928 2691 26684 34331 34331 508 1 AMSDLELR Unmodified 933.45897 0.45896661 1810 P01185 AVP Vasopressin-neurophysin 2-copeptin;Arg-vasopressin;Neurophysin 2;Copeptin yes yes 0 0 0 1 52.857 52.857 2 0.05185 51058 QUIQUE_C1218_190116_001 72.485 35.464 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2894 1810 2692 26685 34332 34332 1 AMSFEWPWQYR Acetyl (Protein N-term) 1541.6762 0.67617003 4002 Q9BRG1;K7EP45 VPS25 Vacuolar protein-sorting-associated protein 25 yes no 1 0 0 1 1 1 1 170.55 170.55 2 0.0007667 175417 QUIQUE_C1368_190116_001 101.54 90.712 32157000 0 7555300 4890000 0 0 0 0 0 0 0 12440000 0 7271000 2895 4002 2693 26686;26687;26688;26689 34333;34334;34335;34336 34334 4 AMSLLQDWCR Acetyl (Protein N-term) 1320.5955 0.59547686 4491 Q9ULN7 PNMAL2 PNMA-like protein 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 162.21 162.21 2 0.00085012 164197 QUIQUE_C1563_190116_001 105.78 45.985 78025000 10019000 0 0 0 15919000 13530000 16855000 0 0 0 0 9973300 11729000 2896 4491 2694 26690;26691;26692;26693;26694;26695;26696 34337;34338;34339;34340;34341;34342;34343 34339 7 AMSQDGASQFQEVIR Unmodified 1665.7781 0.77806891 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7;C9J6Q0 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.819 77.819 2 2.2664E-94 78441 QUIQUE_C1277_190116_001 217.83 191.15 478610000 51816000 44084000 45043000 0 57105000 0 40350000 66234000 0 36237000 81744000 0 56001000 2897 3202 2695 26697;26698;26699;26700;26701;26702;26703;26704;26705 34344;34345;34346;34347;34348;34349;34350;34351;34352;34353;34354 34346 11 AMSRPILYSNWLSK Oxidation (M) 1680.8658 0.86576171 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 1 1 82.936 82.936 3 0.006565 83476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.165 56.361 72564000 0 0 0 0 0 0 0 72564000 0 0 0 0 0 2898 3053 2696 26706 34355 34355 2494 1 AMSTTSISSPQPGK Unmodified 1390.6762 0.67622961 4460;605 B4DDD6;Q9UJU6;H0Y5J4 DBNL Drebrin-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.263 32.263 2 0.0004449 26588 QUIQUE_C1368_190116_001 101.95 88.185 363090000 75002000 60521000 62814000 104180000 0 0 0 60573000 0 0 0 0 0 2899 605;4460 2697 26707;26708;26709;26710;26711;26712 34356;34357;34358;34359;34360;34361 34358 6 AMSTTSISSPQPGK Oxidation (M) 1406.6711 0.67114423 4460;605 B4DDD6;Q9UJU6;H0Y5J4 DBNL Drebrin-like protein no no 0 1 0 1 1 20.802 20.802 2 0.0014154 13783 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.64 62.974 34130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34130000 2900 605;4460 2697 26713;26714 34362;34363 34363 395 2 AMSVEQLTDVLMNEILHGADGTSIK Unmodified 2671.3197 0.31970252 3812 Q96BW5 PTER Phosphotriesterase-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 170.7 170.7 3 3.8172E-57 172272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.05 139.54 998430000 34951000 0 0 0 41187000 0 106540000 350050000 126030000 0 142560000 0 197110000 2901 3812 2698 26715;26716;26717;26718;26719;26720;26721 34364;34365;34366;34367;34368;34369;34370 34367 7 AMSVEQLTDVLMNEILHGADGTSIK Oxidation (M) 2687.3146 0.31461714 3812 Q96BW5 PTER Phosphotriesterase-related protein yes yes 0 1 0 1 1 1 167.26 167.26 3 4.0637E-09 171104 QUIQUE_C1277_190116_001 69.981 62.787 192610000 0 67062000 31225000 0 0 0 0 0 94328000 0 0 0 0 2902 3812 2698 26722;26723;26724 34371;34372;34373 34371 2743 2 AMTEPSALIEK Oxidation (M) 1204.6009 0.6009394 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 40.247 40.247 2 0.0030206 36813 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.662 55.515 245830000 0 0 0 0 0 0 0 97624000 0 0 70455000 0 77751000 2903 2009 2699 26725;26726;26727 34374;34375;34376 34375 1289 3 AMTFHGHGFLR Unmodified 1272.6186 0.61859557 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 37.622 37.622 3 0.01068 33673 QUIQUE_C1277_190116_001 38.783 23.153 44191000 0 23627000 20564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2904 1492 2700 26728;26729 34377;34378 34377 2 AMTGVEQWPYR Unmodified 1336.6234 0.62340617 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.86 78.86 2 0.00040997 80035 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.05 88.279 1096900000 81114000 0 294780000 0 0 121940000 132940000 58697000 68858000 22331000 136820000 88377000 91021000 2905 2527 2701 26730;26731;26732;26733;26734;26735;26736;26737;26738;26739;26740;26741;26742;26743;26744 34379;34380;34381;34382;34383;34384;34385;34386;34387;34388;34389;34390;34391;34392;34393;34394;34395;34396;34397;34398;34399;34400;34401;34402 34396 23 AMTGVEQWPYR Oxidation (M) 1352.6183 0.6183208 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 62.682 62.682 2 0.00027361 62800 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.85 98.529 64805000 0 0 0 0 0 0 0 0 27922000 0 36883000 0 0 2906 2527 2701 26745;26746;26747;26748;26749;26750 34403;34404;34405;34406;34407;34408 34405 1959 6 AMTHVINQGMAMYWGTSR Unmodified 2052.9332 0.93320612 2985 Q13303;Q5TG80;Q5TG81 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 no no 0 0 0 1 1 1 96.271 96.271 3 0.0019447 98714 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.348 41.427 77558000 15922000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32726000 0 28910000 2907 2985 2702 26751;26752;26753 34409;34410;34411 34411 2 AMTLLEDWCR Acetyl (Protein N-term) 1335.5951 0.59514251 3636 Q8ND90 PNMA1 Paraneoplastic antigen Ma1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.84 167.84 2 0.00018193 174991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.65 134.5 116580000 18816000 14100000 0 11767000 10873000 10796000 10570000 0 0 2888900 18152000 0 18618000 2908 3636 2703 26754;26755;26756;26757;26758;26759;26760;26761;26762;26763 34412;34413;34414;34415;34416;34417;34418;34419;34420;34421;34422 34421 11 AMTLMEYLIK Unmodified 1211.6294 0.62940275 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 134.99 134.99 2 0.017191 139744 QUIQUE_C1277_190116_001 84.476 75.262 1144300000 112180000 111680000 98574000 86211000 0 73482000 98547000 104280000 81441000 0 128920000 116810000 132140000 2909 4654 2704 26764;26765;26766;26767;26768;26769;26770;26771;26772;26773;26774;26775 34423;34424;34425;34426;34427;34428;34429;34430;34431;34432;34433;34434;34435 34424 12 AMTLQEAEAFVGAER Oxidation (M) 1637.7719 0.7719209 1473 O15031;H0Y6J7 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 1 0 1 100 100 2 2.3262E-05 103547 QUIQUE_C1368_190116_001 96.103 79.849 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2910 1473 2705 26776 34436 34436 818 1 AMTLQEAEAFVGAER Unmodified 1621.777 0.77700628 1473 O15031;H0Y6J7 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 0 1 1 123.93 123.93 3 0.0040469 128869 QUIQUE_C1368_190116_001 58.461 39.067 23751000 0 0 0 0 23751000 0 0 0 0 0 0 0 0 2911 1473 2705 26777;26778 34437;34438 34437 2 AMTPEQEETASLLSSVTQGMESAYVSPSGYR Unmodified 3305.5068 0.5067876 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 165.51 165.51 3 4.8794E-06 168556 QUIQUE_C1403_190116_001 50.492 44.698 27727000 0 0 0 27727000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2912 3125 2706 26779 34439 34439 1 AMTTGAIAAMLSTILYSR Oxidation (M) 1885.9642 0.96415513 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 1 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.9 166.9 2;3 2.072E-38 171923 QUIQUE_C1218_190116_001 163.27 141.04 1692900000 102500000 45289000 58111000 75021000 72080000 110190000 145170000 137490000 167080000 91325000 288500000 232110000 168050000 2913 2169 2707 26780;26781;26782;26783;26784;26785;26786;26787;26788;26789;26790;26791;26792;26793;26794;26795;26796;26797;26798;26799;26800;26801;26802;26803;26804 34440;34441;34442;34443;34444;34445;34446;34447;34448;34449;34450;34451;34452;34453;34454;34455;34456;34457;34458;34459;34460;34461;34462;34463;34464;34465;34466;34467;34468;34469;34470 34441 1518 31 AMTTGAIAAMLSTILYSR Unmodified 1869.9692 0.9692405 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 170.48 170.48 2;3 1.2279E-63 174765 QUIQUE_DMIX3_190116_001 234.82 203.93 2207400000 110980000 176900000 115860000 132090000 140340000 27275000 133820000 309320000 157910000 11456000 355630000 362360000 173420000 2914 2169 2707 26805;26806;26807;26808;26809;26810;26811;26812;26813;26814;26815;26816;26817;26818;26819;26820;26821;26822;26823;26824;26825;26826;26827;26828 34471;34472;34473;34474;34475;34476;34477;34478;34479;34480;34481;34482;34483;34484;34485;34486;34487;34488;34489;34490;34491;34492;34493;34494;34495 34488 24 AMVALIDVFHQYSGR Oxidation (M) 1721.8559 0.85592531 1860 P04271;A8MRB1 S100B Protein S100-B yes no 0 1 0 3 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 113.77 113.77 2;3 1.84E-12 117208 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.37 116.68 8256300000 287180000 617800000 359880000 56593000 392260000 251750000 389050000 792070000 1494600000 357390000 1143700000 791190000 1322800000 2915 1860 2708 26829;26830;26831;26832;26833;26834;26835;26836;26837;26838;26839;26840;26841;26842;26843;26844;26845;26846;26847;26848;26849;26850;26851;26852;26853 34496;34497;34498;34499;34500;34501;34502;34503;34504;34505;34506;34507;34508;34509;34510;34511;34512;34513;34514;34515;34516;34517;34518;34519;34520;34521;34522;34523;34524;34525;34526;34527;34528;34529;34530;34531;34532;34533;34534;34535;34536;34537;34538;34539;34540 34524 1074 45 AMVALIDVFHQYSGR Unmodified 1705.861 0.86101068 1860 P04271;A8MRB1 S100B Protein S100-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 129.77 129.77 2;3 1.4561E-09 133977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.71 115.16 27682000000 439640000 842690000 698140000 0 507120000 426340000 853500000 2980000000 4950300000 801790000 5672400000 2963500000 6546200000 2916 1860 2708 26854;26855;26856;26857;26858;26859;26860;26861;26862;26863;26864;26865;26866;26867;26868;26869 34541;34542;34543;34544;34545;34546;34547;34548;34549;34550;34551;34552;34553;34554;34555;34556;34557;34558;34559;34560;34561;34562;34563;34564;34565;34566;34567;34568;34569;34570;34571;34572;34573;34574 34560 34 AMVASGSELGK Unmodified 1048.5223 0.52229515 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;G3V213 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 26.613 26.613 2 0.0039565 20323 QUIQUE_C1368_190116_001 72.607 38.81 456310000 0 80132000 119510000 109620000 40384000 0 57064000 0 0 14984000 0 0 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P35580;E7ERA5 MYH10 Myosin-10 yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 16.155 16.155 2;3 0.0036189 8277 QUIQUE_C1576_190116_001 77.533 52.06 191000000 0 0 56864000 17588000 0 0 56178000 22572000 0 0 37800000 0 0 2920 2379 2712 26888;26889;26890;26891;26892;26893;26894;26895 34593;34594;34595;34596;34597;34598;34599;34600 34596 7 AMVSEFLK Acetyl (Protein N-term) 965.4892 0.4892041 1853 P04083;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 143.36 143.36 1;2 0.011401 147613 QUIQUE_C1403_190116_001 136.16 76.95 832920000 34331000 0 114230000 141580000 0 126460000 44188000 0 115520000 0 0 39924000 216680000 2921 1853 2713 26896;26897;26898;26899;26900;26901;26902;26903 34601;34602;34603;34604;34605;34606;34607;34608;34609 34603 8 AMVSEFLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 981.48412 0.48411873 1853 P04083;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 110.24 110.24 2 0.0036512 114000 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.626 48.503 95229000 0 0 10961000 0 13056000 14371000 0 0 30689000 0 0 0 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34620;34621;34622;34623;34624 34621 0 AMYPDYFAK Unmodified 1104.495 0.49501776 4658 Q9Y6M9;E9PH64;A0A3B3IT57;E7EWZ0;E9PF49 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 78.87 78.87 2 0.019489 79765 QUIQUE_C1368_190116_001 63.565 54.62 440350000 0 0 100880000 71470000 41134000 73322000 0 55427000 0 0 98112000 0 0 2926 4658 2717 26917;26918;26919;26920;26921;26922 34625;34626;34627;34628;34629;34630;34631 34626 7 AMYQYRPQNEDELELR Unmodified 2053.9527 0.95273882 1580 O60504;H0YAZ3 SORBS3 Vinexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 74.19 74.19 3 0.0048462 74368 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.004 44.216 102520000 0 31180000 0 0 0 32808000 0 38534000 0 0 0 0 0 2927 1580 2718 26923;26924;26925;26926 34632;34633;34634;34635 34635 4 ANAAAYLQHLCFENEGVK Unmodified 2033.9629 0.96290957 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 96.1 96.1 3 5.1037E-05 97324 QUIQUE_C1563_190116_001 87.16 70.494 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26946;26947;26948;26949;26950;26951;26952;26953;26954;26955 34655;34656;34657;34658;34659;34660;34661;34662;34663;34664 34662 10 ANALLIR Unmodified 769.48102 0.48102268 2294 P29992 GNA11 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 yes yes 0 0 0 1 1 37.138 37.138 2 0.022056 33872 QUIQUE_C1218_190116_001 102.98 56.629 206950000 94346000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112610000 0 0 2931 2294 2722 26956;26957 34665;34666 34665 2 ANAQAAALYK Unmodified 1019.54 0.53999412 2421 P40121;E7ENU9;H7C0X8 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.519 23.519 2 0.0053752 16384 QUIQUE_C1403_190116_001 109.86 76.424 724220000 0 0 0 0 0 0 0 450110000 0 274110000 0 0 0 2932 2421 2723 26958;26959;26960;26961;26962;26963;26964;26965;26966 34667;34668;34669;34670;34671;34672;34673;34674;34675 34669 9 ANATEFGLASGVFTR Unmodified 1539.7682 0.76815616 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 108.37 108.37 2;3 8.7593E-13 112057 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63.111 1263400000 0 207800000 0 163640000 0 206940000 298370000 44808000 325380000 16420000 0 0 0 2935 3169 2726 26987;26988;26989;26990;26991;26992;26993 34697;34698;34699;34700;34701;34702;34703 34697 6 ANCPYIVQFGSTDDPFLPWK Unmodified 2354.1042 0.10415408 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.81 156.81 2;3 1.1554E-17 163864 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.18 135.74 622800000 23623000 74554000 58955000 30941000 40269000 24465000 0 55073000 86250000 0 91818000 62418000 74434000 2936 1663 2727 26994;26995;26996;26997;26998;26999;27000;27001;27002;27003;27004;27005 34704;34705;34706;34707;34708;34709;34710;34711;34712;34713;34714;34715 34713 11 ANCSDNEFTQALTAAIPPESLTR Unmodified 2505.1806 0.1805665 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 1 1 3 2 2 140.15 140.15 2;3 6.0552E-102 144767 QUIQUE_C1277_190116_001 195.89 191.34 1549900000 135950000 145660000 149220000 130340000 121010000 114330000 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RRAGC Ras-related GTP-binding protein C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 46.234 46.234 2 0.00059909 43275 QUIQUE_C1277_190116_001 91.937 74.706 527650000 86410000 80097000 0 63795000 61644000 58426000 0 72856000 57837000 0 0 0 46581000 2939 4213 2730 27043;27044;27045;27046;27047;27048;27049;27050 34768;34769;34770;34771;34772;34773;34774;34775;34776 34769 9 ANDDLLSEFPDK Unmodified 1362.6303 0.63032527 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 96.492 96.492 2 0.00051818 97744 QUIQUE_C1563_190116_001 117.14 87.966 371840000 0 97755000 0 67374000 0 64411000 99944000 0 0 0 42354000 0 0 2940 487 2731 27051;27052;27053;27054;27055 34777;34778;34779;34780;34781 34779 4 ANDGEGGDEEAGTEEAVPR Unmodified 1901.7875 0.78750721 4160 Q9H3Q1 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.261 38.261 2 3.9006E-115 34262 QUIQUE_DMIX1_190116_001 263.83 240.91 765290000 49751000 54090000 52230000 68875000 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ANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPR Unmodified 3449.6211 0.62112135 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 2 4 2 1 3 3 3 1 3 3 2 126.82 126.82 3;4;5 1.6322E-87 131178 QUIQUE_C1368_190116_001 159.75 149.87 5584000000 159310000 608720000 381610000 539410000 281100000 189000000 854910000 330380000 263860000 76958000 820100000 631980000 446610000 2951 2302 2742 27170;27171;27172;27173;27174;27175;27176;27177;27178;27179;27180;27181;27182;27183;27184;27185;27186;27187;27188;27189;27190;27191;27192;27193;27194;27195;27196;27197;27198;27199;27200;27201 34959;34960;34961;34962;34963;34964;34965;34966;34967;34968;34969;34970;34971;34972;34973;34974;34975;34976;34977;34978;34979;34980;34981;34982;34983;34984;34985;34986;34987;34988;34989;34990;34991;34992;34993;34994;34995;34996;34997;34998;34999;35000;35001;35002;35003;35004;35005;35006;35007;35008;35009;35010;35011;35012;35013;35014 34970 51 ANEGTVGVSAATER Unmodified 1360.6583 0.65827136 1882 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protein yes yes 0 0 0 1 1 48.876 48.876 2 0.00086693 46718 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.277 49.497 70031000 0 0 24724000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45307000 2963 3812 2754 27257;27258 35073;35074 35074 2 ANGMELDGR Unmodified 961.42873 0.42872911 2775;3014 Q13595;P62995;H7BXF3 TRA2A;TRA2B Transformer-2 protein homolog alpha;Transformer-2 protein homolog beta no no 0 0 0 1 24.96 24.96 2 0.053702 18371 QUIQUE_C1403_190116_001 49.715 28.415 50233000 0 0 0 50233000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2964 3014;2775 2755 27259 35075 35075 1 ANHEEVLAAGK Unmodified 1137.5778 0.57783619 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 0 0 2 13.794 13.794 2;3 0.0012381 5811 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.942 60.941 69474000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69474000 0 0 0 2965 1786 2756 27260;27261 35076;35077 35077 2 ANHFFTVTDPR Unmodified 1303.6309 0.63093439 4195 Q9H9B4;D6RFI0;S4R2X2;D6RDG7;D6RAE9 SFXN1 Sideroflexin-1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 51.477 51.477 2;3 0.00047493 49633 QUIQUE_C1576_190116_001 115.82 86.738 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812.45045 0.45045083 2711 P61086;D6RDM7;D6RFX1 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes no 1 0 0 1 2 1 1 44.307 44.307 2 0.022113 40786 QUIQUE_C1403_190116_001 89.903 65.931 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2973 2711 2764 27286;27287;27288;27289;27290 35106;35107;35108;35109;35110 35109 5 ANIGDAQAMGQRPITFLR Unmodified 1958.0156 0.015613845 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.078 89.078 3 3.2804E-05 92020 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.979 54.095 479620000 0 19485000 0 28224000 34807000 0 29414000 88233000 72473000 0 86148000 62635000 58203000 2974 2226 2765 27291;27292;27293;27294;27295;27296;27297;27298;27299 35111;35112;35113;35114;35115;35116;35117;35118;35119 35117 9 ANILYAWAR Unmodified 1076.5767 0.57671398 2140 P19021 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 97.018 97.018 2 0.028377 98726 QUIQUE_C1403_190116_001 57.177 28.028 91339000 0 27144000 0 19533000 0 0 33143000 0 0 11519000 0 0 0 2975 2140 2766 27300;27301;27302;27303 35120;35121;35122;35123;35124;35125 35122 6 ANINVENAFFTLAR Unmodified 1578.8154 0.8154407 2704 P61006 RAB8A Ras-related protein Rab-8A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.36 135.36 2 2.9485E-10 139594 QUIQUE_C1403_190116_001 132.32 116.43 920080000 0 68273000 99966000 99767000 71183000 0 96166000 89293000 0 47543000 155080000 87718000 105100000 2976 2704 2767 27304;27305;27306;27307;27308;27309;27310;27311;27312;27313 35126;35127;35128;35129;35130;35131;35132;35133;35134;35135;35136;35137 35128 11 ANIPIMDTGENPEVPFPR Unmodified 1995.9724 0.97241163 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EM24;K7EN36;K7ELZ6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 121.86 121.86 2;3 2.2466E-89 127401 QUIQUE_C1218_190116_001 208.27 179.51 1097600000 80230000 97737000 95375000 85910000 73855000 77200000 67362000 59022000 92628000 25536000 116510000 70377000 155890000 2977 3780 2768 27314;27315;27316;27317;27318;27319;27320;27321;27322;27323;27324;27325;27326;27327;27328 35138;35139;35140;35141;35142;35143;35144;35145;35146;35147;35148;35149;35150;35151;35152;35153;35154 35139 16 ANIPIMDTGENPEVPFPR Oxidation (M) 2011.9673 0.96732625 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EM24;K7EN36;K7ELZ6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 1 0 1 102.29 102.29 2 7.0817E-07 104075 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.76 91.201 35526000 0 0 0 0 0 0 0 35526000 0 0 0 0 0 2978 3780 2768 27329 35155 35155 2730 1 ANIQAVSLK Unmodified 942.54983 0.54983053 1537 O43633;M0R1L7;M0R1T5 CHMP2A Charged multivesicular body protein 2a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.24 36.24 2 0.0071923 31992 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.279 15.286 1253000000 119010000 99505000 83296000 132090000 0 94585000 96262000 97476000 124650000 47644000 129000000 110570000 118870000 2979 1537 2769 27330;27331;27332;27333;27334;27335;27336;27337;27338;27339;27340;27341 35156;35157;35158;35159;35160;35161;35162;35163;35164;35165;35166;35167 35166 10 ANITAIR Unmodified 757.44464 0.44463717 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.307 22.307 2 0.012374 15705 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.83 69.798 1607300000 0 228580000 52860000 129930000 46618000 187040000 42933000 258270000 163410000 230370000 0 217590000 49706000 2980 2527 2770 27342;27343;27344;27345;27346;27347;27348;27349;27350;27351;27352 35168;35169;35170;35171;35172;35173;35174;35175;35176;35177;35178;35179;35180;35181;35182 35178 14 ANIVAYHDSIMNPDYNVEFFR Unmodified 2514.1638 0.16379422 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.84 126.84 3 1.6343E-10 129761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.847 75.692 565650000 79098000 73804000 47347000 57835000 57108000 40103000 0 49263000 44366000 0 66902000 0 49822000 2981 4408 2771 27353;27354;27355;27356;27357;27358;27359;27360;27361;27362 35183;35184;35185;35186;35187;35188;35189;35190;35191;35192;35193 35189 10 ANIVAYHDSIMNPDYNVEFFR Oxidation (M) 2530.1587 0.15870885 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 1 0 1 114.3 114.3 3 1.5884E-05 111045 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.592 64.869 20466000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20466000 0 0 0 2982 4408 2771 27363 35194 35194 2936 1 ANIVHLMLSSPEQIQK Unmodified 1806.9662 0.96620404 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 92.334 92.334 2;3 0.00032399 95259 QUIQUE_C1438_190116_001 43.904 36.312 82641000 17520000 0 0 0 65120000 0 0 0 0 0 0 0 0 2983 2657 2772 27364;27365 35195;35196;35197 35196 2 ANIWLVR Unmodified 870.50757 0.50757178 3351 Q68D91 MBLAC2 Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 75.082 75.082 2 0.024075 76496 QUIQUE_C1218_190116_001 98.807 58.359 65759000 31763000 33996000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2984 3351 2773 27366;27367 35198;35199 35198 2 ANLEAFTVDKDITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER Unmodified 3619.837 0.83697059 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 138.76 138.76 3;4 5.224E-45 145337 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.98 101.41 1587200000 0 0 0 139740000 200460000 22348000 178670000 190510000 163540000 0 230410000 159550000 302020000 2985 2355 2774 27368;27369;27370;27371;27372;27373;27374;27375;27376;27377;27378;27379;27380;27381;27382;27383;27384 35200;35201;35202;35203;35204;35205;35206;35207;35208;35209;35210;35211;35212;35213;35214;35215;35216;35217;35218;35219 35212 17 ANLEIMTK Unmodified 918.48445 0.48445308 288 A0A0G2JMH6;P01903;Q30118;A0A0G2JH46 HLA-DRA HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain yes no 0 0 0 1 1 40.077 40.077 2 0.027186 36578 QUIQUE_C1277_190116_001 69.905 42.65 133070000 0 56173000 0 0 0 0 0 0 0 0 76899000 0 0 2986 288 2775 27385;27386 35220;35221 35220 2 ANLENPIR Unmodified 925.49813 0.49812931 1399 O00330;H0YD97 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.452 33.452 2 0.020103 28020 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.282 43.844 510600000 99815000 0 0 100470000 0 0 0 76632000 120700000 0 0 0 112990000 2987 1399 2776 27387;27388;27389;27390;27391 35222;35223;35224;35225;35226;35227 35226 6 ANLINNIFELAGLGK Unmodified 1585.8828 0.88279198 4451 Q9UIQ6 LNPEP Leucyl-cystinyl aminopeptidase;Leucyl-cystinyl aminopeptidase, pregnancy serum form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 166.48 166.48 2 1.267E-06 172829 QUIQUE_C1438_190116_001 116.87 93.269 215530000 0 34789000 0 0 34015000 0 0 18253000 20887000 0 34948000 50376000 22265000 2988 4451 2777 27392;27393;27394;27395;27396;27397;27398 35228;35229;35230;35231;35232;35233;35234 35229 7 ANLIVLGAVPR Unmodified 1121.6921 0.69207809 1102 G5E9V7;G5E9V6;Q8IUR7;B7Z637;C9J8P8;C9JAA7;C9JBY2 ARMC8 Armadillo repeat-containing protein 8 yes no 0 0 0 1 1 90.976 90.976 2 0.017395 95497 QUIQUE_C1218_190116_001 76.064 53.484 14827000 0 0 14827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2989 1102 2778 27399;27400 35235;35236 35235 2 ANLLEIAPHLSAPLPIMLPVYK Oxidation (M) 2415.36 0.35997484 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.42 151.42 3 3.1838E-08 156106 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.776 77.412 1330700000 66996000 118130000 152330000 108350000 86315000 113910000 0 91574000 133840000 89750000 241680000 127820000 0 2990 2463 2779 27401;27402;27403;27404;27405;27406;27407;27408;27409;27410;27411 35237;35238;35239;35240;35241;35242;35243;35244;35245;35246;35247;35248 35244 1892 12 ANLLEIAPHLSAPLPIMLPVYK Unmodified 2399.3651 0.36506021 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 156.96 156.96 2;3 1.9071E-45 161325 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.8 146.36 4728600000 210580000 494610000 572320000 413280000 235300000 529730000 317220000 196160000 318030000 98777000 441980000 455820000 444820000 2991 2463 2779 27412;27413;27414;27415;27416;27417;27418;27419;27420;27421;27422;27423;27424;27425;27426;27427;27428;27429;27430;27431;27432 35249;35250;35251;35252;35253;35254;35255;35256;35257;35258;35259;35260;35261;35262;35263;35264;35265;35266;35267;35268;35269;35270;35271;35272 35270 24 ANLLNNEAHAITMQVTK Unmodified 1866.9622 0.96218129 2477 P46063 RECQL ATP-dependent DNA helicase Q1 yes yes 0 0 0 1 86.34 86.34 3 0.05039 82888 QUIQUE_DMIX4_190116_001 27.838 16.577 16819000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16819000 0 0 0 2992 2477 2780 27433 35273 35273 1 ANLNALDR Unmodified 885.46683 0.46682918 526;3401;1984 A5A3E0;A0A0G2JRD4;Q495V5;A0A0D9SFE8;A0A0G2JQ08;A0A087WXQ7;A6NC16;D7UEQ8;A0A0G2JQB7;A0A0C4DH93;A0A087X187;A0A087X092;A0A087X067;A0A087WTB9;A0A0A6YYL3;A0A0G2JMU2;Q6S8J7;Q6S5H5;A6NI47;B2RU33;H3BUK9;Q6S545;A0JP26;P0CG39;Q6S8J3 POTEF;POTEB;POTEI;POTEC;POTEB3;POTEG;POTEE;POTEH;POTEA;POTEM;POTEB2;POTEJ POTE ankyrin domain family member F;POTE ankyrin domain family member A;POTE ankyrin domain family member G;Putative POTE ankyrin domain family member M;POTE ankyrin domain family member C;POTE ankyrin domain family member B2;POTE ankyrin domain family member H;POTE ankyrin domain family member B3;POTE ankyrin domain family member J;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 25.752 25.752 2 0.009742 19664 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.187 52.084 4691100000 900750000 0 764060000 0 916520000 682940000 0 0 494850000 374960000 0 557030000 0 2993 526;1984;3401 2781 27434;27435;27436;27437;27438;27439;27440 35274;35275;35276;35277;35278;35279;35280 35279 7 ANLNYIGLDGNIGCLVNGAGLAMATMDIIK Unmodified 3091.5504 0.55044751 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 172.36 172.36 3 3.4285E-54 176205 QUIQUE_DMIX7_190116_001 136.16 127.54 269300000 0 0 0 0 0 0 0 0 49872000 0 121180000 98246000 0 2994 445 2782 27441;27442;27443 35281;35282;35283 35283 3 ANLPQSFQVDTSK Unmodified 1433.7151 0.71505795 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.016 65.016 2 3.0551E-24 64016 QUIQUE_C1368_190116_001 176.48 148.28 1576100000 90386000 129970000 158930000 165050000 196890000 120890000 137150000 178230000 0 87818000 154800000 155980000 0 2995 2178 2783 27444;27445;27446;27447;27448;27449;27450;27451;27452;27453;27454 35284;35285;35286;35287;35288;35289;35290;35291;35292;35293;35294;35295 35287 12 ANLQAALQVLELHHSK Unmodified 1770.9741 0.97406661 3888 Q96JC1 VPS39 Vam6/Vps39-like protein yes yes 0 0 0 1 87.125 87.125 3 0.016898 90541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.053 36.948 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2996 3888 2784 27455 35296 35296 1 ANLQIDQINTDLNLER Unmodified 1868.9592 0.9592044 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.72 113.72 2 1.8046E-81 116211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 259.23 242.29 1983900000 177790000 142180000 189200000 203780000 221820000 134400000 153390000 150710000 181270000 81207000 192380000 0 155790000 2997 2378 2785 27456;27457;27458;27459;27460;27461;27462;27463;27464;27465;27466;27467 35297;35298;35299;35300;35301;35302;35303;35304;35305;35306;35307;35308;35309 35304 13 ANLSLLR Unmodified 785.47594 0.4759373 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.356 48.356 2 0.011709 46303 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.48 19.258 2453600000 202430000 238170000 215610000 183030000 200710000 178460000 173490000 175950000 211820000 0 247610000 227390000 198940000 2998 2208 2786 27468;27469;27470;27471;27472;27473;27474;27475;27476;27477;27478;27479 35310;35311;35312;35313;35314;35315;35316;35317;35318;35319;35320;35321;35322;35323;35324;35325 35318 15 ANMQGLVER Acetyl (Protein N-term) 1058.5179 0.51787847 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385;F8WDB9;F8WEW0 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 83.161 83.161 2 0.0022361 79943 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.819 62.217 191600000 47613000 0 0 0 0 0 35068000 21541000 0 15015000 0 28634000 43732000 2999 2422 2787 27480;27481;27482;27483;27484;27485 35326;35327;35328;35329;35330;35331 35329 6 ANNIDYTVHSVR Unmodified 1387.6844 0.68442653 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 32.331 32.331 2;3 0.002452 27324 QUIQUE_C1218_190116_001 74.944 48.901 299250000 90765000 84790000 0 17422000 33349000 0 27425000 22110000 0 0 0 23385000 0 3000 2285 2788 27486;27487;27488;27489;27490;27491;27492;27493;27494;27495 35332;35333;35334;35335;35336;35337;35338;35339;35340;35341;35342 35333 11 ANNSTYGLAAAVFTK Unmodified 1526.7729 0.77290718 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.924 97.924 2 2.4288E-06 100800 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.51 104.86 10462000000 0 1195700000 1638400000 0 1073500000 0 0 1193500000 1024100000 0 1503900000 1275400000 1557600000 3001 1875 2789 27496;27497;27498;27499;27500;27501;27502;27503 35343;35344;35345;35346;35347;35348;35349;35350;35351 35348 9 ANNTFYGLSAGVFTK Unmodified 1588.7886 0.78855725 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 114.42 114.42 2 1.4896E-05 119305 QUIQUE_C1218_190116_001 113.24 98.56 2921100000 423650000 0 0 663840000 0 560320000 501100000 0 0 0 772180000 0 0 3002 1776 2790 27504;27505;27506;27507;27508 35352;35353;35354;35355;35356 35352 3 ANNYNEAVYLVR Unmodified 1424.7048 0.70482762 2934 Q09161 NCBP1 Nuclear cap-binding protein subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.859 73.859 2 0.00076734 73869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.496 39.515 131230000 0 0 0 0 0 0 0 40071000 0 0 0 0 91158000 3003 2934 2791 27509;27510;27511;27512;27513;27514 35357;35358;35359;35360;35361;35362 35362 6 ANPDLPILIR Unmodified 1120.6604 0.66044361 1542 O43678 NDUFA2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 95.352 95.352 2 0.00325 97966 QUIQUE_C1277_190116_001 85.38 68.869 452660000 81417000 102020000 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1090.5924 0.59236404 3347 Q66K14;E5RIN2 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 0 1 1 1 100.15 100.15 2 0.019983 104554 QUIQUE_C1438_190116_001 63.21 39.007 72329000 0 0 0 0 33913000 0 38416000 0 0 0 0 0 0 3007 3347 2795 27538;27539;27540 35390;35391;35392 35390 3 ANPGAWILR Unmodified 996.5505 0.55049923 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 no no 0 0 0 1 77.522 77.522 2 0.065724 78863 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.813 28.082 24538000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24538000 3008 4334 2796 27541 35393 35393 1 ANPQVGVAFPHIK Unmodified 1376.7565 0.75646926 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 2 3 1 63.108 63.108 2;3 0.0006437 62499 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.03 54.399 1014500000 63536000 169830000 113070000 77400000 0 0 54039000 163360000 0 0 324450000 0 48793000 3009 2051 2797 27542;27543;27544;27545;27546;27547;27548;27549;27550;27551;27552;27553;27554;27555;27556;27557 35394;35395;35396;35397;35398;35399;35400;35401;35402;35403;35404;35405;35406;35407;35408;35409;35410;35411;35412 35406 18 ANPTQLNTVEFLWDPAK Unmodified 1942.9789 0.97887721 2945 Q12800;F8VWL0;F8VX55 TFCP2 Alpha-globin transcription factor CP2 yes no 0 0 0 1 1 138.49 138.49 2 0.00048004 142556 QUIQUE_C1403_190116_001 94.728 78.59 78983000 0 0 0 38926000 0 0 0 0 0 0 0 0 40057000 3010 2945 2798 27558;27559 35413;35414 35413 1 ANPTVTLFPPSSEELQANK Unmodified 2042.032 0.032034995 209 A0A0B4J231;B9A064;P0CG04 IGLL5;IGLC1 Immunoglobulin lambda-like polypeptide 5;Ig lambda-1 chain C regions yes no 0 0 0 1 1 101.31 101.31 2 2.4582E-06 104981 QUIQUE_C1438_190116_001 94.781 72.726 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3011 209 2799 27560;27561 35415;35416 35416 2 ANPVFDYQLYFQEPGVAEAELEQNLSR Unmodified 3126.4934 0.49344444 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 166.35 166.35 3 1.1141E-26 173712 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35485 2 ANSVTVDGQGLQVTPVPGTHPLLVFVNPK Unmodified 2983.6131 0.61310607 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.45 129.45 3 1.5419E-19 133501 QUIQUE_C1277_190116_001 89.723 87.138 443890000 54420000 47764000 0 40165000 53993000 47702000 41713000 40154000 0 23512000 46660000 47807000 0 3027 636 2815 27626;27627;27628;27629;27630;27631;27632;27633;27634;27635 35488;35489;35490;35491;35492;35493;35494;35495;35496;35497;35498;35499 35490 12 ANSVTWNPHK Unmodified 1152.5676 0.56760585 2894;3950 Q05329;A0A3B3IU09;Q99259 GAD2;GAD1 Glutamate decarboxylase 2;Glutamate decarboxylase 1 no no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 19.293 19.293 2;3 0.00076103 12113 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.6 71.243 3553700000 416990000 275500000 337870000 364370000 334460000 0 395180000 261400000 224950000 38131000 226730000 464250000 213850000 3028 2894;3950 2816 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0.91482039 4170 Q9H4A6 GOLPH3 Golgi phosphoprotein 3 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 2 2 169.99 169.99 2;3 1.0256E-24 177183 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.78 100.44 511150000 25418000 37532000 44380000 28446000 25968000 16004000 67740000 36575000 50222000 8018400 35962000 56316000 78571000 3030 4170 2818 27675;27676;27677;27678;27679;27680;27681;27682;27683;27684;27685;27686;27687;27688;27689;27690;27691;27692;27693 35550;35551;35552;35553;35554;35555;35556;35557;35558;35559;35560;35561;35562;35563;35564;35565;35566;35567;35568;35569 35565 20 ANTVYGLGFSSEHHLSK Unmodified 1845.901 0.90096124 3523 Q86YM7 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 49.914 49.914 3 0.006376 47334 QUIQUE_C1403_190116_001 32.565 20.542 88117000 0 47220000 0 40897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3031 3523 2819 27694;27695 35570;35571;35572 35572 3 ANVAVVSGAPLQGLVAR Unmodified 1620.9311 0.93113916 1105 G5EA09 SDCBP yes yes 0 0 0 1 101.25 101.25 2 0.00089897 102741 QUIQUE_C1563_190116_001 85.288 70.609 31950000 0 0 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139.52 139.52 2 0.0005192 144268 QUIQUE_C1277_190116_001 95.573 78.735 569450000 35002000 41272000 42395000 34171000 45961000 41040000 39440000 55670000 56292000 20215000 51511000 42170000 64309000 3035 1534 2823 27712;27713;27714;27715;27716;27717;27718;27719;27720;27721;27722;27723;27724 35590;35591;35592;35593;35594;35595;35596;35597;35598;35599;35600;35601;35602;35603;35604;35605 35592 15 ANVIHATVTSVTLHSTEGK Unmodified 1964.0327 0.032703697 3625 Q8NBM8;E7EVZ5 PCYOX1L Prenylcysteine oxidase-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.587 47.587 3 4.5516E-06 45206 QUIQUE_C1277_190116_001 97.271 83.439 161520000 31079000 31524000 0 27902000 0 0 35974000 0 0 0 35045000 0 0 3036 3625 2824 27725;27726;27727;27728;27729 35606;35607;35608;35609;35610;35611 35608 6 ANVINEIMSTER Unmodified 1375.6766 0.67656396 202 A0A1B0GTF0;A0A1B0GVC4;A0A1B0GV82;A0A1B0GVV2;A0A0A6YYB3;B1AMR4;A0A1B0GTC2;B1AMR3;A0A1B0GV84;A0A1B0GWI5;A0A0A6YYF8;O43307;A0A096LNQ4;A0A096LNK4;A0A096LP05;A0A096LPE7;A0A096LPI8 ARHGEF9 Rho guanine nucleotide exchange factor 9 yes no 0 0 0 1 1 1 99.505 99.505 2 0.010547 103102 QUIQUE_C1576_190116_001 65.5 53.212 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3037 202 2825 27730;27731;27732 35612;35613;35614 35613 3 ANVNEILDFFHGYR Unmodified 1693.8213 0.82125436 680 B9ZVT1;Q8IXT5 RBM12B RNA-binding protein 12B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.1 137.1 3 4.5106E-05 142227 QUIQUE_C1368_190116_001 100.19 92.779 356100000 30832000 38421000 27438000 19959000 35873000 21624000 20806000 28962000 34999000 7300600 38286000 20946000 30657000 3038 680 2826 27733;27734;27735;27736;27737;27738;27739;27740;27741;27742;27743;27744;27745 35615;35616;35617;35618;35619;35620;35621;35622;35623;35624;35625;35626;35627 35617 13 ANVPWAEVCEK Acetyl (Protein N-term) 1343.618 0.61798644 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GTE6;A0A0D9SFK7;A0A1B0GVY9 KIAA1279;KIF1BP KIF1-binding protein yes no 1 0 0 1 1 115.27 115.27 2 0.036295 119438 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.336 20.486 20591000 0 0 0 0 0 0 0 0 20591000 0 0 0 0 3039 348 2827 27746;27747 35628;35629 35629 2 ANWEAQQR Unmodified 1001.4679 0.46789181 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 0 1 1 18.853 18.853 2 0.016589 11860 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 84.914 879970000 0 0 0 0 0 0 0 168380000 0 711590000 0 0 0 3040 3171 2828 27748;27749 35630;35631 35630 1 ANWYFLLAR Unmodified 1152.608 0.60801411 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.84 132.84 2 0.00011147 137688 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.23 124.13 918700000 0 66500000 109510000 0 68823000 52309000 91135000 117510000 133960000 0 159530000 119420000 0 3041 666 2829 27750;27751;27752;27753;27754;27755;27756;27757;27758 35632;35633;35634;35635;35636;35637;35638;35639;35640;35641 35639 7 ANYDVLESQK Unmodified 1165.5615 0.56151742 1390 O00233;J3KN29;F5H5V4;F5GX23;F5H7X1 PSMD9 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9 yes no 0 0 0 1 46.734 46.734 2 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35646;35647;35648;35649;35650;35651;35652;35653;35654;35655;35656;35657;35658;35659;35660;35661;35662;35663;35664;35665;35666;35667;35668;35669;35670;35671;35672;35673 35661 25 ANYLSQALQAGTVWVNCYDVFGAQSPFGGYK Unmodified 3410.603 0.60301167 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 3 1 1 170.96 170.96 2;3 7.8917E-178 178166 QUIQUE_DMIX5_190116_001 207.97 204.1 2038000000 0 0 0 0 55856000 0 222300000 80920000 528390000 0 619650000 339410000 191440000 3045 1875 2833 27789;27790;27791;27792;27793;27794;27795;27796;27797;27798 35674;35675;35676;35677;35678;35679;35680;35681;35682;35683 35679 10 ANYWWLR Unmodified 1007.4977 0.49773538 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.6 102.6 2 0.0058587 105566 QUIQUE_C1368_190116_001 159.75 131.58 1757700000 104350000 114260000 148850000 115360000 125930000 117330000 154990000 126330000 141370000 81703000 182000000 154470000 190760000 3046 2339 2834 27799;27800;27801;27802;27803;27804;27805;27806;27807;27808;27809;27810;27811 35684;35685;35686;35687;35688;35689;35690;35691;35692;35693;35694;35695;35696;35697;35698;35699;35700;35701 35687 13 APAEILNGK Unmodified 911.50763 0.50763136 2027 P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 27.463 27.463 2 0.000347 21570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.77 88.721 91155000 0 0 0 0 0 0 0 71202000 0 19954000 0 0 0 3047 2027 2835 27812;27813 35702;35703 35702 2 APALGGSFAGLEPMGLLWALEPEKPLVR Oxidation (M) 2934.5677 0.56773578 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 157.93 157.93 3 1.8805E-23 162667 QUIQUE_DMIX8_190116_001 94.389 89.233 769240000 67967000 49514000 103910000 0 135710000 69588000 0 159710000 0 0 91937000 0 90899000 3048 98;3487 2836 27814;27815;27816;27817;27818;27819;27820;27821;27822 35704;35705;35706;35707;35708;35709;35710;35711;35712;35713;35714 35714 70 10 APALGGSFAGLEPMGLLWALEPEKPLVR Unmodified 2918.5728 0.57282116 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.78 166.78 3 1.0968E-94 171745 QUIQUE_C1368_190116_001 177.38 171.6 2906700000 255460000 226370000 849120000 292470000 223800000 415870000 0 0 410970000 232660000 0 0 0 3049 98;3487 2836 27823;27824;27825;27826;27827;27828;27829;27830 35715;35716;35717;35718;35719;35720;35721;35722;35723 35717 9 APAPAPPGTVTQVDVR Unmodified 1574.8417 0.84165545 424 A0A2R8Y4W2;A0A2R8YE63;Q12929;H0YFG1 EPS8 Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.079 57.079 2 0.00047462 56271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.014 69.257 202960000 0 0 0 0 0 33887000 0 34382000 35361000 0 34252000 27479000 37600000 3050 424 2837 27831;27832;27833;27834;27835;27836 35724;35725;35726;35727;35728;35729 35727 6 APAPEAEDEEVAR Unmodified 1382.6314 0.6313879 3626 Q8NBN7 RDH13 Retinol dehydrogenase 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.065 28.065 2 0.0012978 22022 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.706 64.035 222910000 39449000 47285000 36398000 0 0 0 0 0 59127000 0 40652000 0 0 3051 3626 2838 27837;27838;27839;27840;27841;27842 35730;35731;35732;35733;35734;35735 35735 6 APAPQPPSLPDR Unmodified 1244.6513 0.65133548 3585 Q8N3V7 SYNPO Synaptopodin yes yes 0 0 0 1 50.968 50.968 2 0.0148 48628 QUIQUE_C1403_190116_001 61.765 15.124 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3052 3585 2839 27843 35736 35736 1 APASEEEFQFLR Unmodified 1422.6779 0.67794416 2290 P29590;H3BT57 PML Protein PML yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 95.64 95.64 2 3.0144E-06 97973 QUIQUE_C1403_190116_001 137.95 104.58 425310000 0 0 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27858;27859;27860;27861;27862;27863;27864;27865;27866;27867;27868;27869;27870;27871 35751;35752;35753;35754;35755;35756;35757;35758;35759;35760;35761;35762;35763;35764;35765;35766 35751 12 APAVTEATPLK Unmodified 1096.6128 0.61282471 2953 Q12955;A0A087WTF3 ANK3 Ankyrin-3 yes no 0 0 0 1 65.279 65.279 2 0.039632 64807 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.574 11.364 36518000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36518000 0 3056 2953 2843 27872 35767 35767 1 APCFPVESKEEEQIEK Unmodified 1918.8982 0.89824363 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 2 57.503 57.503 3 0.00023128 55342 QUIQUE_C1563_190116_001 70.038 56.808 119570000 0 0 0 0 0 63375000 0 0 0 0 56198000 0 0 3057 2009 2844 27873;27874;27875;27876 35768;35769;35770;35771 35768 4 APDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQERPIR Unmodified 3954.9139 0.91387425 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 1 1 132.48 132.48 4 0.00017176 137920 QUIQUE_C1368_190116_001 37.238 32.661 32633000 0 0 32633000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3058 1824 2845 27877 35772 35772 1 APDEETLIALLAHAK Unmodified 1590.8617 0.86172219 1278 J3KQ48;Q9Y3E5 PTRH2 Peptidyl-tRNA hydrolase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 128.92 128.92 3 0.002911 132304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.196 52.966 152510000 0 29959000 19651000 33028000 0 15547000 0 0 0 0 0 20760000 33561000 3059 1278 2846 27878;27879;27880;27881;27882;27883;27884;27885;27886;27887;27888 35773;35774;35775;35776;35777;35778;35779;35780;35781;35782;35783 35779 7 APDELHYTYLDTFGRPVIVAYK Unmodified 2567.306 0.30602501 1868 P04843;B7Z4L4 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 1 1 2 1 114.38 114.38 3;4 7.1138E-05 119933 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.826 50.252 202610000 0 0 0 35066000 0 0 0 0 0 0 121680000 0 45861000 3060 1868 2847 27889;27890;27891;27892 35784;35785;35786;35787;35788 35787 5 APDFLPLLNK Unmodified 1126.6386 0.63864553 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 119.9 119.9 2 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35806;35807;35808;35809;35810;35811;35812;35813;35814;35815;35816;35817;35818;35819;35820;35821;35822;35823;35824;35825;35826;35827;35828;35829;35830;35831;35832;35833;35834;35835;35836;35837;35838;35839;35840;35841;35842;35843;35844;35845;35846;35847;35848;35849 35843 44 APDVAPEEVDESK Unmodified 1384.6358 0.63580458 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 37 37 2 0.002538 32950 QUIQUE_C1218_190116_001 73.951 57.749 63448000 29647000 0 0 0 0 33800000 0 0 0 0 0 0 0 3063 800 2850 27916;27917;27918;27919;27920 35850;35851;35852;35853;35854 35850 5 APDVTTLPR Unmodified 968.5291 0.52909508 3731 Q92542;H0Y6T7;H0Y3Z4;Q5T205 NCSTN Nicastrin yes no 0 0 0 1 42.071 42.071 2 0.027329 38678 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.931 33.776 48972000 0 0 0 0 0 0 0 0 48972000 0 0 0 0 3064 3731 2851 27921 35855 35855 1 APDVVIGADTIVTVGGLILEKPVDK Unmodified 2518.4258 0.4258058 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 155.8 155.8 3 1.1482E-69 159860 QUIQUE_C1277_190116_001 131.37 128.65 754240000 37764000 106450000 81369000 103710000 68812000 20677000 47118000 30198000 54792000 39360000 0 102590000 61402000 3065 1741 2852 27922;27923;27924;27925;27926;27927;27928;27929;27930;27931;27932;27933;27934;27935;27936 35856;35857;35858;35859;35860;35861;35862;35863;35864;35865;35866;35867;35868;35869;35870;35871;35872;35873 35857 17 APDWVDAEECHR Unmodified 1483.615 0.61502633 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 0 1 47.259 47.259 2 0.028905 44907 QUIQUE_C1576_190116_001 55.353 44.188 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3066 1464 2853 27937 35874 35874 1 APEAWDYGQGFVNEEMIR Oxidation (M) 2126.9368 0.9367544 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 118.68 118.68 2 2.7567E-17 115851 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.97 120.34 237620000 30507000 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Q9Y5Z4;Q5THN1 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 54.499 54.499 2 8.0732E-13 52709 QUIQUE_C1368_190116_001 135.6 115.84 987890000 0 0 307030000 0 0 0 339680000 341180000 0 0 0 0 0 3069 4638 2855 27965;27966;27967 35912;35913;35914 35912 3 APEDTVAEMK Unmodified 1089.5012 0.50122535 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.944 33.944 2 0.017857 28371 QUIQUE_C1368_190116_001 61.48 46.232 439900000 75217000 76344000 69242000 69283000 0 98413000 0 0 0 0 51399000 0 0 3070 921 2856 27968;27969;27970;27971;27972;27973 35915;35916;35917;35918;35919;35920 35917 2 APEDTVAEMK Oxidation (M) 1105.4961 0.49613997 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 1 0 1 1 17.046 17.046 2 0.0053401 9203 QUIQUE_C1563_190116_001 80.688 71.172 130030000 0 61185000 0 0 0 68847000 0 0 0 0 0 0 0 3071 921 2856 27974;27975 35921;35922 35922 570 2 APEEFELLSK Unmodified 1161.5918 0.59175492 4307 Q9NVH6 TMLHE Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 83.644 83.644 2 0.0054514 85819 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.55 70.418 294990000 0 0 70584000 0 0 0 0 0 80411000 0 68659000 0 75341000 3072 4307 2857 27976;27977;27978;27979 35923;35924;35925;35926 35924 2 APEGEETEFYVSPEDLEAQLQSDER Unmodified 2867.2621 0.2621071 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 0 2 2 1 3 1 1 2 1 2 1 2 2 1 145.4 145.4 2;3 1.596E-83 149588 QUIQUE_C1403_190116_001 231.71 226.17 961580000 127390000 85864000 0 112670000 31171000 49019000 92054000 31929000 141390000 27364000 149470000 113260000 0 3073 4162 2858 27980;27981;27982;27983;27984;27985;27986;27987;27988;27989;27990;27991;27992;27993;27994;27995;27996;27997;27998;27999;28000 35927;35928;35929;35930;35931;35932;35933;35934;35935;35936;35937;35938;35939;35940;35941;35942;35943;35944;35945;35946;35947;35948;35949;35950;35951 35934 21 APEIMLNSK Oxidation (M) 1017.5165 0.51648149 2281;2263 P27361;E9PQW4;E9PJF0;B3KR49;P28482 MAPK3;MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase;Mitogen-activated protein kinase 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.408 31.408 2 0.00052691 25790 QUIQUE_C1368_190116_001 118.06 79.096 2351600000 176810000 193210000 198550000 174750000 132250000 174360000 166060000 0 0 194670000 356630000 289470000 294860000 3074 2263;2281 2859 28001;28002;28003;28004;28005;28006;28007;28008;28009;28010;28011;28012 35952;35953;35954;35955;35956;35957;35958;35959;35960;35961;35962;35963;35964;35965 35954 1632 13 APEIMLNSK Unmodified 1001.5216 0.52156686 2281;2263 P27361;E9PQW4;E9PJF0;B3KR49;P28482 MAPK3;MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase;Mitogen-activated protein kinase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.128 40.128 2 0.00030436 36455 QUIQUE_C1576_190116_001 136.8 111.98 6564900000 493600000 573180000 662730000 607820000 469630000 483570000 485310000 451570000 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28030;28031;28032;28033;28034;28035;28036;28037;28038;28039;28040;28041;28042;28043;28044;28045;28046 35983;35984;35985;35986;35987;35988;35989;35990;35991;35992;35993;35994;35995;35996;35997;35998;35999;36000;36001;36002;36003;36004;36005 36005 22 APELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQK Unmodified 3148.6809 0.68085128 2716 P61163;R4GMT0 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 3 2 3 5 1 2 165.59 165.59 3;4 2.0668E-194 170473 QUIQUE_C1368_190116_001 226.89 187.01 6238800000 143230000 711630000 639300000 237940000 140790000 369730000 890990000 364420000 665460000 0 1462000000 254730000 358650000 3078 2716 2862 28047;28048;28049;28050;28051;28052;28053;28054;28055;28056;28057;28058;28059;28060;28061;28062;28063;28064;28065;28066;28067;28068;28069;28070;28071 36006;36007;36008;36009;36010;36011;36012;36013;36014;36015;36016;36017;36018;36019;36020;36021;36022;36023;36024;36025;36026;36027;36028;36029;36030;36031;36032;36033;36034 36011 28 APEMVNLYSGK Unmodified 1207.5907 0.59070906 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.138 64.138 2 0.0026838 64041 QUIQUE_C1576_190116_001 76.815 35.933 229570000 54956000 0 51370000 0 0 0 53171000 0 34465000 0 0 0 35603000 3079 3212 2863 28072;28073;28074;28075;28076;28077 36035;36036;36037;36038;36039;36040 36038 6 APEPGPAGDGGPGAPAR Unmodified 1472.7008 0.70080487 3930 Q96RF0 SNX18 Sorting nexin-18 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 25.648 25.648 2 4.9965E-07 19765 QUIQUE_C1576_190116_001 108.56 83.005 325710000 0 0 59294000 67202000 0 0 54229000 38741000 0 19203000 0 0 87043000 3080 3930 2864 28078;28079;28080;28081;28082;28083;28084;28085 36041;36042;36043;36044;36045;36046;36047;36048;36049;36050 36046 8 APEPHVEEDDDDELDSK Unmodified 1938.7967 0.79667491 2607 P52566;F5H3P3;F5H6Q0;F5H2R5 ARHGDIB Rho GDP-dissociation inhibitor 2 yes no 0 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 1 1 2 1 1 38.577 38.577 2;3 4.6945E-45 33978 QUIQUE_C1368_190116_001 190.27 175.58 1228500000 61652000 123740000 196180000 200710000 130020000 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29862000 0 0 0 3083 2817 2867 28109;28110;28111;28112;28113;28114;28115;28116;28117 36084;36085;36086;36087;36088;36089;36090;36091;36092;36093;36094;36095 36087 12 APEQSSTAAAQSASATDTATPGAADR Unmodified 2432.1052 0.10515295 872 E7ETR1 CAMKV yes yes 0 0 0 1 39.097 39.097 3 0.0034972 35205 QUIQUE_C1218_190116_001 32.065 23.675 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3084 872 2868 28118 36096 36096 1 APESDTGDEDQDQER Unmodified 1690.6554 0.6554304 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.995 14.995 2 0 7466 QUIQUE_C1218_190116_001 326.43 323.7 983110000 67560000 126380000 118560000 98589000 93116000 76831000 93371000 32293000 46168000 34235000 74487000 48754000 72767000 3085 4172;346 2869 28119;28120;28121;28122;28123;28124;28125;28126;28127;28128;28129;28130;28131 36097;36098;36099;36100;36101;36102;36103;36104;36105;36106;36107;36108;36109;36110 36097 14 APESDTGDEDQDQERDTVFLK Unmodified 2394.0459 0.045906738 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 1 1 1 59.835 59.835 3 3.9954E-06 59579 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.122 45.028 87951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42493000 45458000 0 3086 4172;346 2870 28132;28133 36111;36112 36111 2 APEVILGMGYK Unmodified 1176.6213 0.62128091 397;2473 D6RJF9;A0A286YFI3;A0A286YFC0;A8MWW6;A0A286YFJ6;A0A286YFJ4;A0A286YEN5;A0A286YF85;A0A286YFA6;A0A286YF62;A0A286YEW9;P53779;A0A286YFN2;A0A286YFB6;A0A286YFM6;A0A286YEQ0;A0A286YEQ7;A0A286YEX7;A0A1P0B7D2;A0A286YFD7;A0A286YES9;A0A286YF97;A0A286YF02;A0A286YEV3;A0A286YES0;A0A286YF35;A0A286YF19;A0A286YF83;A0A286YEY0;A0A286YEV8;Q499Y8;P45983;A0A286YFE2;D6RCB1;A0A1W2PRF2;D7R525;A0A1W2PPZ3;P45984;J3KNK1 MAPK10;MAPK8;MAPK9 Mitogen-activated protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 0 0 1 83.963 83.963 2 0.0027955 85690 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 65.258 66507000 66507000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3087 397;2473 2871 28134 36113 36113 0 APEVILGMGYK Oxidation (M) 1192.6162 0.61619553 397;2473 D6RJF9;A0A286YFI3;A0A286YFC0;A8MWW6;A0A286YFJ6;A0A286YFJ4;A0A286YEN5;A0A286YF85;A0A286YFA6;A0A286YF62;A0A286YEW9;P53779;A0A286YFN2;A0A286YFB6;A0A286YFM6;A0A286YEQ0;A0A286YEQ7;A0A286YEX7;A0A1P0B7D2;A0A286YFD7;A0A286YES9;A0A286YF97;A0A286YF02;A0A286YEV3;A0A286YES0;A0A286YF35;A0A286YF19;A0A286YF83;A0A286YEY0;A0A286YEV8;Q499Y8;P45983;A0A286YFE2;D6RCB1;A0A1W2PRF2;D7R525;A0A1W2PPZ3;P45984;J3KNK1 MAPK10;MAPK8;MAPK9 Mitogen-activated protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 1 0 1 1 1 59.411 59.411 2 0.01204 58320 QUIQUE_C1368_190116_001 62.558 40.472 79668000 0 0 30547000 0 0 24078000 0 0 0 0 25043000 0 0 3088 397;2473 2871 28135;28136;28137 36114;36115;36116 36114 283 3 APEVNLNAPDVDVHGPDWNLK Unmodified 2299.1233 0.12330962 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 107.4 107.4 3 3.325E-05 110849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.318 39.377 115150000 0 0 0 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36159;36160;36161;36162;36163;36164;36165;36166;36167;36168;36169;36170;36171;36172;36173;36174;36175;36176;36177;36178;36179;36180 36173 22 APFAAHGYGAFLTLSILDR Unmodified 2019.0578 0.057796236 2538 P49721;A0A087WVV1 PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 140.88 140.88 3 0.001187 145634 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.083 27.373 425840000 41163000 40849000 46438000 0 0 0 35974000 0 131460000 0 129960000 0 0 3094 2538 2877 28193;28194;28195;28196;28197;28198 36181;36182;36183;36184;36185;36186 36185 5 APFAAPSPFAELVLPPQQ Unmodified 1878.988 0.98798534 2157 P19971 TYMP Thymidine phosphorylase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 1 164.93 164.93 2;3 2.9367E-05 169934 QUIQUE_C1368_190116_001 97.734 83.476 189770000 0 17287000 64825000 67985000 0 0 0 39668000 0 0 0 0 0 3095 2157 2878 28199;28200;28201;28202;28203;28204;28205;28206 36187;36188;36189;36190;36191;36192;36193;36194;36195 36188 9 APFDLFENK Unmodified 1079.5288 0.52876073 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.43 100.43 2 6.3921E-08 104546 QUIQUE_C1438_190116_001 166.68 136.17 1860200000 218680000 160460000 138460000 170870000 177490000 206020000 194250000 0 133210000 81676000 139570000 103040000 136440000 3096 1938 2879 28207;28208;28209;28210;28211;28212;28213;28214;28215;28216;28217;28218 36196;36197;36198;36199;36200;36201;36202;36203;36204;36205;36206;36207;36208 36200 13 APFDLFENKK Unmodified 1207.6237 0.62372375 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 69.687 69.687 2;3 4.7286E-05 69890 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.52 83.778 740370000 75579000 60995000 0 57561000 138270000 75807000 72098000 40608000 41085000 29867000 59734000 47162000 41601000 3097 1938 2880 28219;28220;28221;28222;28223;28224;28225;28226;28227;28228;28229;28230;28231;28232;28233 36209;36210;36211;36212;36213;36214;36215;36216;36217;36218;36219;36220;36221;36222;36223;36224;36225 36220 17 APFDLFENR Unmodified 1107.5349 0.53490874 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.51 104.51 2 6.9455E-34 107572 QUIQUE_DMIX3_190116_001 210.26 188.96 9190400000 834740000 797550000 640680000 734450000 776980000 999180000 939610000 431340000 554210000 407340000 836180000 549630000 688520000 3098 1931 2881 28234;28235;28236;28237;28238;28239;28240;28241;28242;28243;28244;28245;28246 36226;36227;36228;36229;36230;36231;36232;36233;36234;36235;36236;36237;36238;36239;36240;36241;36242;36243;36244;36245;36246;36247;36248;36249;36250;36251;36252;36253;36254;36255 36246 30 APFDLFENRK Unmodified 1235.6299 0.62987176 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 73.511 73.511 2;3 0.0030809 71043 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.92 50.783 1044600000 0 61125000 37202000 52916000 101600000 37013000 110440000 174850000 93874000 34073000 128960000 88879000 123640000 3099 1931 2882 28247;28248;28249;28250;28251;28252;28253;28254;28255;28256;28257;28258;28259 36256;36257;36258;36259;36260;36261;36262;36263;36264;36265;36266;36267;36268;36269;36270 36266 15 APFLGIPR Unmodified 869.51232 0.51232281 182 E7EUA2;A6NHU9;A0A0A0MSQ6;Q9UPX8;H7C1X5;E7EX50;H0Y7S5;B7ZKU9 SHANK2 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 yes no 0 0 0 1 1 73.832 73.832 2 0.046296 74346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.847 35.344 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3100 182 2883 28260;28261 36271;36272 36272 2 APFQIIR Unmodified 843.49667 0.49667274 3812 Q96BW5;A0A0A0MSI3 PTER Phosphotriesterase-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.849 59.849 2 0.019338 58731 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.67 89.669 441020000 47092000 64738000 59045000 63720000 0 0 0 0 59283000 0 97555000 49584000 0 3101 3812 2884 28262;28263;28264;28265;28266;28267;28268 36273;36274;36275;36276;36277;36278;36279;36280 36279 8 APGAAAPSSGPGPCAAAR Unmodified 1564.7416 0.74162383 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.71 24.71 2 0.00023061 18549 QUIQUE_C1403_190116_001 106.01 88.571 204630000 0 23965000 0 23638000 23073000 0 41675000 0 0 0 37472000 0 54802000 3102 3676 2885 28269;28270;28271;28272;28273;28274 36281;36282;36283;36284;36285;36286 36282 6 APGAEEYAQQDVLK Unmodified 1517.7362 0.73618733 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.254 61.254 2 2.6301E-101 59945 QUIQUE_C1277_190116_001 231.54 204.21 26292000000 3023300000 2546800000 3058000000 2430200000 2225400000 2127400000 3180700000 975080000 1264700000 873310000 2105800000 952630000 1528200000 3103 1969 2886 28275;28276;28277;28278;28279;28280;28281;28282;28283;28284;28285;28286;28287 36287;36288;36289;36290;36291;36292;36293;36294;36295;36296;36297;36298;36299;36300;36301;36302;36303;36304;36305;36306;36307 36289 21 APGAEEYAQQDVLKK Unmodified 1645.8312 0.83115034 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 43.626 43.626 2;3 5.3479E-61 40664 QUIQUE_C1277_190116_001 198.29 198.29 23004000000 1092800000 1589200000 1814600000 1265300000 1253400000 549910000 2555700000 2575600000 1907800000 436800000 3770200000 1844000000 2348700000 3104 1969 2887 28288;28289;28290;28291;28292;28293;28294;28295;28296;28297;28298;28299;28300;28301;28302;28303;28304;28305;28306;28307;28308;28309;28310;28311 36308;36309;36310;36311;36312;36313;36314;36315;36316;36317;36318;36319;36320;36321;36322;36323;36324;36325;36326;36327;36328;36329;36330;36331;36332;36333;36334 36311 21 APGAGLGQDR Unmodified 940.47264 0.47264284 2561 P50402;Q5HY57 EMD Emerin yes no 0 0 0 1 16.832 16.832 2 0.0040375 9052 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.287 55.157 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29816000 47813000 0 34782000 44199000 42637000 3107 4449 2890 28331;28332;28333;28334;28335;28336;28337;28338;28339;28340;28341;28342 36358;36359;36360;36361;36362;36363;36364;36365;36366;36367;36368;36369 36369 11 APGDEEAQVENLITANATEPQK Unmodified 2324.1132 0.11319844 4122 Q9H0Q3 FXYD6 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 119.1 119.1 2;3 0 123659 QUIQUE_C1368_190116_001 280.5 272.11 2775000000 309850000 287680000 354640000 170820000 326660000 275680000 451500000 75359000 76335000 30294000 94966000 189290000 131910000 3108 4122 2891 28343;28344;28345;28346;28347;28348;28349;28350;28351;28352;28353;28354;28355;28356;28357;28358;28359;28360;28361;28362;28363 36370;36371;36372;36373;36374;36375;36376;36377;36378;36379;36380;36381;36382;36383;36384;36385;36386;36387;36388;36389;36390;36391;36392;36393;36394;36395;36396;36397;36398;36399;36400;36401 36378 28 APGDEEAQVENLITANATEPQKAEN Unmodified 2638.2358 0.23583277 4122 Q9H0Q3 FXYD6 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 120.53 120.53 2;3 2.8517E-10 123267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.098 63.323 378930000 0 0 0 0 0 0 0 58412000 88392000 0 61462000 69946000 100720000 3109 4122 2892 28364;28365;28366;28367;28368;28369 36402;36403;36404;36405;36406;36407;36408 36402 7 APGDQAWTQALPSVIK Unmodified 1680.8835 0.88352026 3457;1140 H0YB09;H0YB62;H0YB11;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.5 119.5 2 9.5542E-14 124743 QUIQUE_C1218_190116_001 164.81 147.44 982630000 242660000 141730000 192860000 0 0 155510000 164970000 0 0 84892000 0 0 0 3110 1140;3457 2893 28370;28371;28372;28373;28374;28375 36409;36410;36411;36412;36413;36414;36415;36416 36409 8 APGDQAWTQALPSVIKEEK Unmodified 2067.0637 0.063669474 3457 Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.3 103.3 3 0.00031048 108070 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.655 63.994 1350000000 97987000 140690000 123700000 0 157070000 0 0 152860000 162710000 0 257340000 161690000 95951000 3111 3457 2894 28376;28377;28378;28379;28380;28381;28382;28383;28384 36417;36418;36419;36420;36421;36422;36423;36424;36425;36426;36427;36428 36424 11 APGEQTVPALNLQNAFR Unmodified 1824.9482 0.94824579 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.38 113.38 2 0.0099924 118369 QUIQUE_C1218_190116_001 66.538 30.892 430570000 67359000 63995000 0 62423000 60920000 0 60984000 0 0 0 47095000 30383000 37407000 3112 4620 2895 28385;28386;28387;28388;28389;28390;28391;28392 36429;36430;36431;36432;36433;36434;36435;36436 36429 2 APGFAHLAGLDK Unmodified 1195.635 0.63495714 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 61.142 61.142 2;3 9.7547E-17 61283 QUIQUE_C1218_190116_001 185.14 149.23 5387200000 661570000 536580000 512270000 353810000 403970000 377970000 491140000 317930000 449400000 124230000 525960000 483430000 148910000 3113 1620 2896 28393;28394;28395;28396;28397;28398;28399;28400;28401;28402;28403;28404;28405;28406;28407;28408;28409;28410;28411;28412;28413;28414;28415;28416;28417 36437;36438;36439;36440;36441;36442;36443;36444;36445;36446;36447;36448;36449;36450;36451;36452;36453;36454;36455;36456;36457;36458;36459;36460;36461;36462 36438 15 APGFAQMLK Unmodified 961.50552 0.50552287 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.314 69.314 2 0.00039966 69458 QUIQUE_C1277_190116_001 121.29 94.155 1216300000 156760000 140670000 147250000 113330000 140610000 108080000 142470000 145870000 0 0 0 0 121260000 3114 2572 2897 28418;28419;28420;28421;28422;28423;28424;28425;28426;28427 36463;36464;36465;36466;36467;36468;36469;36470;36471;36472;36473;36474 36464 10 APGFAQMLK Oxidation (M) 977.50044 0.50043749 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 37.797 37.797 2 0.036653 32541 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.503 73.871 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36483;36484;36485;36486;36487 36484 5 APGIIPR Unmodified 722.44391 0.44390889 2243;1351 K7ERX7;P25705;K7EK77;K7ENJ4;K7EJP1 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.569 29.569 2 0.019338 23989 QUIQUE_C1563_190116_001 114.67 30.058 17024000000 1649800000 1327400000 1291200000 1003900000 1121300000 1345100000 1249100000 1302700000 1427800000 578310000 1782300000 1548000000 1397000000 3119 1351;2243 2901 28440;28441;28442;28443;28444;28445;28446;28447;28448;28449;28450;28451;28452 36488;36489;36490;36491;36492;36493;36494;36495;36496;36497;36498;36499;36500;36501;36502 36493 15 APGLAAADAADAAR Unmodified 1239.6208 0.62076364 277 A0A0E3D6M1;A0A0D9SGI1;Q86UL8 MAGI2 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 42.853 42.853 2 0.0066398 39425 QUIQUE_C1403_190116_001 61.344 39.213 33547000 0 0 0 33547000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3120 277 2902 28453 36503 36503 1 APGLGVLSPSGEER Unmodified 1367.7045 0.70449327 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 66.85 66.85 2 0.034367 66938 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.906 50.227 36096000 0 0 0 0 0 0 0 0 36096000 0 0 0 0 3121 3154 2903 28454 36504;36505 36505 2 APGPGLAQGLPQLHSLVLR Unmodified 1923.1054 0.10541513 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 112.16 112.16 3 4.5678E-64 115859 QUIQUE_C1277_190116_001 181.41 174.84 1635700000 108550000 117270000 188370000 153350000 82969000 126410000 124560000 116210000 135020000 78221000 159950000 143430000 101370000 3122 3576 2904 28455;28456;28457;28458;28459;28460;28461;28462;28463;28464;28465;28466;28467;28468;28469;28470 36506;36507;36508;36509;36510;36511;36512;36513;36514;36515;36516;36517;36518;36519;36520;36521;36522;36523;36524;36525;36526;36527;36528;36529;36530;36531;36532;36533;36534;36535;36536 36509 30 APGPWDPLASAAGLKEGGK Unmodified 1820.9421 0.94209778 1616 O75190;E9PH18 DNAJB6 DnaJ homolog subfamily B member 6 yes no 0 0 1 1 61.766 61.766 4 0.036599 61186 QUIQUE_C1218_190116_001 22.221 12.09 34695000 34695000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3123 1616 2905 28471 36537 36537 0 APGQLALFSVSDK Unmodified 1331.7085 0.70851601 2339 P31939;F8WEF0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.154 97.154 2 0.0015544 101072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.943 71.437 843510000 0 139450000 0 0 0 126430000 0 0 146590000 113680000 172570000 144780000 0 3124 2339 2906 28472;28473;28474;28475;28476;28477;28478;28479;28480;28481;28482 36538;36539;36540;36541;36542;36543;36544;36545;36546;36547;36548;36549;36550 36547 13 APGTVLSQEEVEGELAELAMGFLGSR Oxidation (M) 2705.3218 0.32181101 2535 P49593;A8MX49 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 172.29 172.29 3 1.2992E-30 176911 QUIQUE_C1368_190116_001 130.15 122.79 154950000 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Q9Y6R7;A0A087WXI2;A0A087WUZ2 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 132.32 132.32 2 0.00062777 128648 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.298 81.757 8564900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8564900 0 0 0 3128 4663 2909 28504 36572 36572 1 APHLAYLR Unmodified 939.52904 0.5290355 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 31.369 31.369 2 0.0085572 25272 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.883 57.839 182470000 0 0 0 0 0 0 0 73774000 0 34679000 0 74019000 0 3129 4054 2910 28505;28506;28507 36573;36574;36575 36575 3 APHLQLIEGK Unmodified 1104.6291 0.62914348 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 39.289 39.289 2;3 5.2124E-05 35580 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.03 119.27 3993200000 132580000 348240000 0 614250000 320700000 214300000 171130000 475940000 576340000 190820000 158890000 213730000 576280000 3130 933;1529 2911 28508;28509;28510;28511;28512;28513;28514;28515;28516;28517;28518;28519;28520;28521;28522;28523;28524;28525;28526 36576;36577;36578;36579;36580;36581;36582;36583;36584;36585;36586;36587;36588;36589;36590;36591;36592;36593;36594;36595;36596;36597 36589 20 APHWTSAPLTEASAHSHPPEIK Unmodified 2363.1658 0.16584314 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 2 1 3 3 2 54.683 54.683 3;4;5 1.2707E-36 53032 QUIQUE_C1277_190116_001 141.97 133.98 9131700000 1311700000 861430000 778290000 1168400000 1166100000 637770000 436660000 427310000 210210000 89796000 753560000 470450000 820030000 3131 2009 2912 28527;28528;28529;28530;28531;28532;28533;28534;28535;28536;28537;28538;28539;28540;28541;28542;28543;28544;28545;28546;28547;28548;28549;28550;28551;28552;28553;28554;28555;28556;28557;28558;28559;28560;28561 36598;36599;36600;36601;36602;36603;36604;36605;36606;36607;36608;36609;36610;36611;36612;36613;36614;36615;36616;36617;36618;36619;36620;36621;36622;36623;36624;36625;36626;36627;36628;36629;36630;36631;36632;36633;36634;36635;36636;36637;36638;36639;36640;36641;36642;36643;36644 36602 45 APHWTSAPLTEASAHSHPPEIKDQGGAGEGLVR Unmodified 3402.6705 0.67051438 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 2 2 68.141 68.141 4;5 2.3336E-65 67944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.8 126.64 558610000 0 0 0 0 0 0 0 340700000 217910000 0 0 0 0 3132 2009 2913 28562;28563;28564;28565 36645;36646;36647;36648 36646 3 APIDHGLEQLETWFTAGAK Unmodified 2083.0375 0.037454724 2610 P52630;B4DLC8 STAT2 Signal transducer and activator of transcription 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 152.16 152.16 3 9.6126E-23 155387 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.203 67.906 39914000 0 0 24673000 0 15241000 0 0 0 0 0 0 0 0 3133 2610 2914 28566;28567;28568;28569;28570 36649;36650;36651;36652;36653;36654 36654 5 APIFTSEQGEK Unmodified 1205.5928 0.59281755 2108 P16333;C9JAB9 NCK1 Cytoplasmic protein NCK1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 32.845 32.845 2 0.0010685 27879 QUIQUE_C1563_190116_001 90.601 71.497 148350000 29764000 40367000 40582000 0 0 37637000 0 0 0 0 0 0 0 3134 2108 2915 28571;28572;28573;28574 36655;36656;36657;36658 36658 3 APIIAVTR Unmodified 839.52289 0.52288749 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.788 37.788 1;2 0.00055683 34719 QUIQUE_C1218_190116_001 154.01 111.24 77410000000 7520100000 6256500000 6909700000 6337600000 4435800000 5037400000 5736500000 5647100000 5883100000 2812000000 7639000000 6273300000 6922400000 3135 1203;2077 2916 28575;28576;28577;28578;28579;28580;28581;28582;28583;28584;28585;28586;28587;28588 36659;36660;36661;36662;36663;36664;36665;36666;36667;36668;36669;36670;36671;36672;36673;36674;36675;36676;36677;36678;36679;36680;36681;36682;36683 36660 24 APIISGVTK Unmodified 884.53312 0.53311783 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 33.659 33.659 1;2 0.00046932 29799 QUIQUE_C1218_190116_001 116.25 34.954 9936200000 1028200000 1645200000 783330000 669040000 1131100000 589280000 656250000 684850000 559070000 510000000 883660000 0 796220000 3136 1687 2917 28589;28590;28591;28592;28593;28594;28595;28596;28597;28598;28599;28600;28601;28602 36684;36685;36686;36687;36688;36689;36690;36691;36692;36693;36694;36695;36696;36697;36698;36699;36700;36701 36686 14 APILIATDVASR Unmodified 1225.703 0.7030367 381;1290 J3KTA4;P17844;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841;A0A0U1RQJ0 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.419 74.419 2 0.00051557 74576 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.06 90.155 4750300000 537990000 436650000 394750000 296110000 423690000 343050000 254080000 413460000 348690000 191130000 408670000 426880000 275170000 3137 1290;381 2918 28603;28604;28605;28606;28607;28608;28609;28610;28611;28612;28613;28614;28615;28616 36702;36703;36704;36705;36706;36707;36708;36709;36710;36711;36712;36713;36714;36715;36716;36717;36718;36719;36720;36721;36722;36723;36724;36725;36726;36727;36728 36726 26 APIQWEER Unmodified 1027.5087 0.50869399 2558 P50213;H0YL72;H0YLI6;H0YKD0;H0YM64 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.226 45.226 2 0.0036515 42330 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.84 96.554 8347700000 828990000 744150000 741850000 591870000 849260000 0 881450000 465960000 818710000 0 840260000 742340000 842890000 3138 2558 2919 28617;28618;28619;28620;28621;28622;28623;28624;28625;28626;28627 36729;36730;36731;36732;36733;36734;36735;36736;36737;36738;36739;36740 36738 12 APIRPDIVNFVHTNLR Unmodified 1861.0323 0.032250187 2399 P36578;H3BTP7;H3BU31 RPL4 60S ribosomal protein L4 yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 89.337 89.337 3;4 0.00046799 92873 QUIQUE_C1218_190116_001 74.12 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1188 2921 28651;28652;28653;28654;28655;28656 36764;36765;36766;36767;36768;36769 36769 681 6 APKPEDIDEEDDDVPDLVENFDEASKNEAN Unmodified 3358.4485 0.4484639 3894 Q96K17 BTF3L4 Transcription factor BTF3 homolog 4 yes yes 0 0 2 1 1 128.68 128.68 3 1.9913E-07 131579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.087 56.181 103020000 0 0 0 0 0 0 0 47863000 55157000 0 0 0 0 3142 3894 2922 28657;28658 36770;36771 36770 2 APLAEEWDNMTMK Oxidation (M) 1550.6745 0.67451505 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.04 90.04 2 0.0017242 87529 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.659 61.795 543480000 49629000 65680000 83208000 50651000 44861000 62127000 0 0 71082000 29303000 49044000 0 37897000 3143 2261 2923 28659;28660;28661;28662;28663;28664;28665;28666;28667;28668;28669 36772;36773;36774;36775;36776;36777;36778;36779;36780;36781;36782 36780 1621;1622 9 APLAEEWDNMTMK Unmodified 1534.6796 0.67960042 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.97 101.97 2 0.00022717 103992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.69 91.836 5344400000 376260000 416790000 469860000 423210000 255750000 372560000 339710000 489340000 486650000 159010000 642220000 434890000 478130000 3144 2261 2923 28670;28671;28672;28673;28674;28675;28676;28677;28678;28679;28680;28681;28682 36783;36784;36785;36786;36787;36788;36789;36790;36791;36792;36793;36794;36795;36796;36797;36798 36790 15 APLAEEWDNMTMK 2 Oxidation (M) 1566.6694 0.66942967 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 2 0 1 1 1 1 1 60.402 60.402 2 0.0028692 59861 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.197 61.039 166770000 0 28103000 43842000 0 0 0 0 0 0 24276000 46954000 0 23591000 3145 2261 2923 28683;28684;28685;28686;28687 36799;36800;36801;36802;36803 36802 1621;1622 5 APLALFGHTLVASLEDMK Oxidation (M) 1928.0077 0.0077344999 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 1 0 1 1 131.41 131.41 3 0.0013379 136796 QUIQUE_C1218_190116_001 53.773 37.28 88657000 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activator complex subunit 2 yes no 0 0 2 1 1 83.001 83.001 4 0.022241 85521 QUIQUE_DMIX5_190116_001 18.298 15.029 145770000 0 48809000 0 0 0 0 0 0 0 0 96959000 0 0 3149 114 2926 28704;28705 36822;36823 36823 2 APLDIPVPDPVK Unmodified 1259.7125 0.71253876 2901 Q06323 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 102.19 102.19 2 7.1407E-07 105345 QUIQUE_C1368_190116_001 141.93 113.53 1081400000 117690000 75783000 158920000 127780000 110410000 97994000 77984000 38289000 50466000 63340000 61810000 37662000 63245000 3150 2901 2927 28706;28707;28708;28709;28710;28711;28712;28713;28714;28715;28716;28717;28718;28719 36824;36825;36826;36827;36828;36829;36830;36831;36832;36833;36834;36835;36836;36837;36838;36839;36840;36841;36842;36843;36844;36845;36846;36847;36848 36828 25 APLDIPVPDPVKEK Unmodified 1516.8501 0.85009487 2901 Q06323 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.088 83.088 3 0.00018682 85063 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.506 60.04 768070000 40209000 69548000 100540000 81422000 0 0 0 0 142150000 23102000 177850000 0 133240000 3151 2901 2928 28720;28721;28722;28723;28724;28725;28726;28727 36849;36850;36851;36852;36853;36854;36855;36856;36857;36858;36859;36860 36857 12 APLDLDK Acetyl (Protein N-term) 812.42798 0.42798405 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 1 0 0 1 100.38 100.38 2 0.057358 101868 QUIQUE_C1563_190116_001 57.463 39.697 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3152 1421 2929 28728 36861 36861 1 APLDLDKYVEIAR Unmodified 1501.814 0.81404372 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 104.8 104.8 3 4.7803E-05 107128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.31 82.68 365070000 0 0 0 0 0 0 0 66811000 82433000 0 0 108030000 107800000 3153 1421 2930 28729;28730;28731;28732;28733;28734 36862;36863;36864;36865;36866;36867 36864 6 APLEITEYPCVEVR Unmodified 1674.8287 0.8287075 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 102.16 102.16 2 0.00029414 106364 QUIQUE_C1218_190116_001 99.522 68.028 427430000 71203000 47746000 99926000 55324000 0 0 109490000 0 0 0 43735000 0 0 3154 1255;2856 2931 28735;28736;28737;28738;28739;28740;28741;28742 36868;36869;36870;36871;36872;36873;36874;36875;36876 36868 7 APLEVAQEH Unmodified 992.49271 0.49270958 1695 O94903 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.634 26.634 2 0.00054298 20407 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.03 106.18 2487600000 173650000 178040000 166060000 222680000 192310000 242000000 160030000 212160000 267960000 0 225060000 192000000 255660000 3155 1695 2932 28743;28744;28745;28746;28747;28748;28749;28750;28751;28752;28753;28754 36877;36878;36879;36880;36881;36882;36883;36884;36885;36886;36887;36888;36889 36887 11 APLGNPVQGR Unmodified 1007.5512 0.55122751 4711 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 17.008 17.008 2 0.00065526 9200 QUIQUE_C1277_190116_001 108.24 58.879 325120000 0 119300000 36106000 53370000 33958000 49483000 32903000 0 0 0 0 0 0 + 3156 4711 2933 28755;28756;28757;28758;28759;28760;28761 36890;36891;36892;36893;36894;36895;36896 36890 6 APLHFPIPVIR Unmodified 1258.755 0.75501269 3814 Q96BY7 ATG2B Autophagy-related protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 95.663 95.663 3 0.027108 98672 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.598 35.911 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3157 3814 2934 28762 36897 36897 1 APLPLGHIK Unmodified 944.58074 0.58073672 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 31.249 31.249 2 0.024045 25843 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.262 56.616 196030000 0 0 0 0 0 0 0 64525000 0 38875000 92633000 0 0 3158 1977 2935 28763;28764;28765 36898;36899;36900 36899 2 APLQVAVLGPTGVAEPVEVR Unmodified 2001.1259 0.1258758 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.16 117.16 2 1.3851E-05 122546 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.069 85.656 738400000 48981000 22581000 55173000 86447000 0 0 127370000 37938000 67328000 68485000 66123000 56727000 101250000 3159 3061 2936 28766;28767;28768;28769;28770;28771;28772;28773;28774;28775;28776 36901;36902;36903;36904;36905;36906;36907;36908;36909;36910;36911 36909 9 APLSQLYFCR Unmodified 1253.6227 0.62267789 4461 Q9UJW0;E5RI97 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 0 0 0 1 2 2 2 3 1 1 3 1 1 87.926 87.926 2 0.00025977 89634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.04 84.716 301900000 0 0 0 0 0 0 0 89517000 61301000 0 0 74145000 76933000 3160 4461 2937 28777;28778;28779;28780;28781;28782;28783;28784;28785;28786;28787;28788;28789;28790;28791;28792;28793 36912;36913;36914;36915;36916;36917;36918;36919;36920;36921;36922;36923;36924;36925;36926;36927;36928;36929 36922 17 APLVCLPVFVSR Unmodified 1356.7588 0.75877744 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PJU8;A0A1W2PRB8 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.23 126.23 2 0.00053092 132098 QUIQUE_C1218_190116_001 123.86 106.84 2167000000 135650000 147970000 287600000 223020000 270560000 168790000 216870000 0 0 70305000 226680000 192280000 227280000 3161 4127 2938 28794;28795;28796;28797;28798;28799;28800;28801;28802;28803;28804 36930;36931;36932;36933;36934;36935;36936;36937;36938;36939;36940;36941;36942;36943;36944;36945;36946 36931 17 APLVLKD Unmodified 754.45889 0.45889025 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.577 31.577 2 0.025681 25901 QUIQUE_C1563_190116_001 132.96 93.742 21033000000 3085200000 0 2960900000 0 2948000000 2763000000 0 2616100000 0 0 3618600000 3041100000 0 3162 3956 2939 28805;28806;28807;28808;28809;28810;28811 36947;36948;36949;36950;36951;36952;36953;36954 36950 8 APLVPPGSPVVNALFR Unmodified 1632.9352 0.9351619 4245 Q9NPH2;J3QS51 ISYNA1 Inositol-3-phosphate synthase 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 132.68 132.68 2;3 0.00042686 137383 QUIQUE_C1277_190116_001 107.06 101.02 1306900000 85028000 89430000 82838000 114870000 155450000 0 102330000 91455000 108330000 64092000 133280000 141330000 138420000 3163 4245 2940 28812;28813;28814;28815;28816;28817;28818;28819;28820;28821;28822;28823;28824;28825;28826;28827;28828;28829;28830 36955;36956;36957;36958;36959;36960;36961;36962;36963;36964;36965;36966;36967;36968;36969;36970;36971;36972;36973;36974;36975;36976;36977;36978 36958 24 APMAAQGMVETR Unmodified 1260.5955 0.59547686 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.768 38.768 2 6.9739E-14 35665 QUIQUE_C1218_190116_001 161.17 141.39 1032900000 82471000 96648000 92136000 94937000 53052000 95799000 79866000 77448000 93767000 0 115780000 73288000 77736000 3164 3063 2941 28831;28832;28833;28834;28835;28836;28837;28838;28839;28840;28841;28842 36979;36980;36981;36982;36983;36984;36985;36986;36987;36988;36989;36990;36991;36992;36993;36994;36995;36996;36997 36980 18 APMAAQGMVETR 2 Oxidation (M) 1292.5853 0.58530611 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 2 0 1 1 1 1 1 1 15.272 15.272 2 0.00065941 7440 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.21 80.749 103250000 0 0 24520000 0 0 11514000 0 0 29924000 17436000 19855000 0 0 3165 3063 2941 28843;28844;28845;28846;28847;28848 36998;36999;37000;37001;37002;37003 37002 2517;2518 6 APMVNPTLGVHEADLLK Oxidation (M) 1819.9502 0.95021962 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 82.915 82.915 2;3 2.6798E-05 84784 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.226 73.472 761020000 70263000 56445000 0 0 0 0 0 107040000 187650000 72858000 146870000 0 119890000 3166 2993 2942 28849;28850;28851;28852;28853;28854;28855;28856 37004;37005;37006;37007;37008;37009;37010;37011 37009 2442 8 APMVNPTLGVHEADLLK Unmodified 1803.9553 0.955305 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 92.077 92.077 2;3 1.241E-05 94347 QUIQUE_C1368_190116_001 94.007 90.174 1600000000 218860000 0 210450000 157320000 0 178890000 200160000 0 209370000 0 219310000 205620000 0 3167 2993 2942 28857;28858;28859;28860;28861;28862;28863;28864;28865;28866;28867;28868 37012;37013;37014;37015;37016;37017;37018;37019;37020;37021;37022;37023;37024 37015 12 APNDFKLQDFNVGDYIEAVLDR Unmodified 2538.2391 0.23906766 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 1 1 167.65 167.65 3 4.8196E-05 169588 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.37 52.161 64180000 0 0 0 0 0 0 0 64180000 0 0 0 0 0 3168 2016 2943 28869 37025 37025 1 APNDFNLK Unmodified 917.46068 0.46068117 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 35.489 35.489 2 0.019817 31736 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.741 38.095 777030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195020000 326330000 255680000 3169 2017 2944 28870;28871;28872;28873 37026;37027;37028;37029 37028 4 APNTPDILEIEFK Unmodified 1485.7715 0.7715102 1797 P00966 ASS1 Argininosuccinate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 122.09 122.09 2 0.0021576 125999 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.35 83.081 349470000 0 0 0 0 0 167590000 0 0 0 102680000 0 0 79200000 3170 1797 2945 28874;28875;28876;28877 37030;37031;37032;37033 37033 2 APNTPDILEIEFKK Unmodified 1613.8665 0.86647322 1797 P00966 ASS1 Argininosuccinate synthase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 93.999 93.999 2;3 4.2183E-18 91806 QUIQUE_DMIX4_190116_001 130.95 120.01 2198300000 41854000 139180000 112430000 104120000 136620000 76025000 134490000 340670000 257010000 61866000 358920000 192980000 242180000 3171 1797 2946 28878;28879;28880;28881;28882;28883;28884;28885;28886;28887;28888;28889;28890;28891;28892;28893 37034;37035;37036;37037;37038;37039;37040;37041;37042;37043;37044;37045;37046;37047;37048;37049;37050;37051;37052;37053;37054;37055;37056;37057;37058;37059;37060 37052 27 APNYPTEGNHR Unmodified 1254.5741 0.5741478 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734;B8ZZI0 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 13.711 13.711 2;3 0.00013104 5577 QUIQUE_C1403_190116_001 84.507 67.14 296500000 30564000 56063000 18703000 12975000 10152000 2938000 18253000 57174000 25616000 0 12976000 18575000 32512000 3172 4106 2947 28894;28895;28896;28897;28898;28899;28900;28901;28902;28903;28904;28905;28906;28907;28908 37061;37062;37063;37064;37065;37066;37067;37068;37069;37070;37071;37072;37073;37074;37075;37076 37065 15 APPAPGPASGGSGEVDELFDVK Unmodified 2096.0062 0.006214175 1359 M0QXB4;O14579;M0R061 COPE Coatomer subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 110.45 110.45 2 3.2524E-36 114020 QUIQUE_C1403_190116_001 144.68 134.89 174700000 0 0 0 30449000 33685000 0 0 0 0 0 44054000 31167000 35343000 3173 1359 2948 28909;28910;28911;28912;28913;28914 37077;37078;37079;37080;37081;37082 37077 6 APPASKPTPAPVPTPTGAASPLAAAAAPATEAPQAK Unmodified 3272.7405 0.74049143 265 A0A0D9SF30 NCAM1 yes yes 0 0 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 81.856 81.856 3;4 3.4271E-144 83210 QUIQUE_C1368_190116_001 184.49 165.11 3469200000 214200000 100430000 157220000 343960000 407200000 188420000 292570000 257230000 408420000 38560000 210590000 210730000 639640000 3174 265 2949 28915;28916;28917;28918;28919;28920;28921;28922;28923;28924;28925;28926;28927;28928;28929;28930;28931;28932;28933;28934;28935;28936 37083;37084;37085;37086;37087;37088;37089;37090;37091;37092;37093;37094;37095;37096;37097;37098;37099;37100;37101;37102;37103;37104;37105;37106;37107;37108;37109;37110;37111;37112;37113;37114;37115;37116;37117;37118;37119;37120;37121;37122 37089 40 APPEPADSLTEACK Unmodified 1484.6817 0.68170891 1394 O00291 HIP1 Huntingtin-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 48.226 48.226 2 0.015929 46082 QUIQUE_C1576_190116_001 52.391 39.271 42621000 0 0 0 0 0 0 42621000 0 0 0 0 0 0 3175 1394 2950 28937 37123 37123 1 APPGCLTPER Unmodified 1096.5335 0.53352853 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;H0YB62;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 26.271 26.271 2 0.0029057 20299 QUIQUE_C1576_190116_001 87.308 66.787 230160000 0 0 0 0 105890000 0 60302000 0 0 0 63971000 0 0 3176 1140;3457 2951 28938;28939;28940 37124;37125;37126 37125 3 APPGFLGSLVPVVVETLGDAYPELQR Unmodified 2723.4534 0.45341753 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 174.22 174.22 3 7.6182E-15 181332 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.475 87.89 79716000 0 13306000 0 0 0 0 0 0 33173000 0 33237000 0 0 3177 3278 2952 28941;28942;28943 37127;37128;37129;37130 37129 4 APPHELTEEEK Unmodified 1278.6092 0.6091959 2992;858 E7EQL5;E7EV09;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 16.173 16.173 2;3 0.00014696 9037 QUIQUE_C1368_190116_001 93.345 52.228 1865900000 182220000 172270000 179300000 183250000 190890000 111540000 199390000 0 152180000 66232000 174810000 128430000 125350000 3178 858;2992 2953 28944;28945;28946;28947;28948;28949;28950;28951;28952;28953;28954;28955;28956;28957;28958 37131;37132;37133;37134;37135;37136;37137;37138;37139;37140;37141;37142;37143;37144;37145;37146;37147 37134 16 APPHELTEEEKQQILHSEEFLSFFDHSTR Unmodified 3480.6586 0.65861229 2992;858 E7EQL5;E7EV09;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 1 1 2 2 4 1 2 125.77 125.77 4;5 2.6987E-32 129263 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.15 114.99 1123900000 0 51778000 0 0 0 0 149760000 182370000 389860000 0 0 120510000 229620000 3179 858;2992 2954 28959;28960;28961;28962;28963;28964;28965;28966;28967;28968;28969;28970 37148;37149;37150;37151;37152;37153;37154;37155;37156;37157;37158;37159;37160;37161;37162;37163 37153 15 APPILPPHLLQVILNK Unmodified 1762.0869 0.086911519 4599 Q9Y478;F5H610;F5H2X8 PRKAB1 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 2 1 136.91 136.91 3 7.4505E-07 143060 QUIQUE_C1438_190116_001 83.729 83.642 385750000 26631000 49482000 54012000 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149021 QUIQUE_C1403_190116_001 54.559 47.836 43896000 0 0 0 43896000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3183 917 2958 28987 37180;37181 37181 2 APPPSLTDCIGTVDSR Unmodified 1684.809 0.80903469 4359 Q9NZZ3 CHMP5 Charged multivesicular body protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 79.057 79.057 2 3.2247E-07 79700 QUIQUE_DMIX8_190116_001 117.98 101.03 162560000 43408000 33441000 0 43244000 0 0 0 0 0 0 0 0 42470000 3184 4359 2959 28988;28989;28990;28991;28992;28993;28994;28995 37182;37183;37184;37185;37186;37187;37188;37189;37190 37190 8 APPQTHLPSGASSGTGSASATHGGGSPPGTR Unmodified 2784.3175 0.31754576 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;F6S6P2;X6REW1;A0A0G2JJM1;F6UR09;F6U1F2;F6XTU0;A0A0G2JJR8;A0A1B0GX79;F6WML8;F6VEM6;F6X9W3;F6U341;F6TC96 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.015 26.015 4 7.8975E-31 17701 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.242 87.735 514610000 56250000 65243000 0 64409000 57372000 0 64070000 54626000 44632000 0 0 0 108010000 3185 7 2960 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37293;37294;37295;37296;37297;37298;37299;37300;37301;37302;37303 37303 11 APQITTPVK Unmodified 953.55458 0.55458155 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 28.553 28.553 2 0.06278 23233 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.198 26.539 21894000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21894000 0 0 3194 3199 2968 29074 37304 37304 1 APQLHLEYR Unmodified 1125.5931 0.59309232 4657 Q9Y6M4;P78368;A0A0U1RQK2;A0A0U1RR14;A0A087WXD7;A0A087WWF5;K7ESB6;U3KQA5;A0A0U1RQT7;Q8IXA3;A0A0U1RQY7;U3KQB3;Q9HCP0 CSNK1G3;CSNK1G2;hCG_2004507;CSNK1G1 Casein kinase I isoform gamma-3;Casein kinase I isoform gamma-2;Casein kinase I isoform gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 40.132 40.132 3 0.0036372 36563 QUIQUE_C1277_190116_001 71.349 48.82 245220000 42109000 21632000 0 33565000 33099000 29715000 29018000 0 0 0 0 23598000 32488000 3195 4657 2969 29075;29076;29077;29078;29079;29080;29081;29082 37305;37306;37307;37308;37309;37310;37311;37312;37313;37314 37306 8 APQLVGQFIAR Unmodified 1198.6822 0.68224168 3247 Q53EL6 PDCD4 Programmed cell death protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 83.854 83.854 2 0.0055601 80872 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.625 43.066 163730000 41829000 0 0 34666000 0 0 0 40776000 27592000 18866000 0 0 0 3196 3247 2970 29083;29084;29085;29086;29087 37315;37316;37317;37318;37319 37319 3 APQSLASSNSAQAR Unmodified 1386.6852 0.68515481 363 H3BLV5;A0A1B0GWD1;A8K340;O43602 DCX Neuronal migration protein doublecortin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.653 17.653 2 6.2629E-29 10474 QUIQUE_C1218_190116_001 174.77 150.68 543460000 57179000 36957000 42429000 59325000 44261000 63546000 39597000 70240000 43390000 0 45193000 41345000 0 3197 363 2971 29088;29089;29090;29091;29092;29093;29094;29095;29096;29097;29098 37320;37321;37322;37323;37324;37325;37326;37327;37328;37329;37330;37331 37320 12 APSDLYQIILK Unmodified 1259.7125 0.71253876 1921 P07384;E9PL37 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 119.73 119.73 2 1.8019E-05 122953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.75 91.336 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37374;37375;37376;37377;37378;37379;37380;37381;37382 37379 9 APSTWLTAYVVK Unmodified 1334.7234 0.72343779 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.52 111.52 2 0.0004402 109463 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.06 85.498 628670000 67121000 62788000 57871000 0 106600000 55162000 47119000 0 0 145860000 86146000 0 0 3203 1803 2977 29141;29142;29143;29144;29145;29146;29147;29148;29149 37383;37384;37385;37386;37387;37388;37389;37390;37391;37392;37393 37391 11 APSTYGGGLSVSSSR Unmodified 1424.6896 0.68957148 763 CON__P02533;P02533 KRT14 Keratin, type I cytoskeletal 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.675 42.675 2 4.8338E-05 39120 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.216 65.366 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1 1 1 1 1 1 1 1 50.267 50.267 2 7.4706E-05 48584 QUIQUE_C1438_190116_001 119.22 90.825 912590000 76316000 78586000 99388000 82687000 89698000 71242000 0 76555000 98427000 28142000 117940000 0 93607000 3207 1047 2981 29161;29162;29163;29164;29165;29166;29167;29168;29169;29170;29171;29172 37406;37407;37408;37409;37410;37411;37412;37413;37414;37415;37416;37417;37418;37419;37420 37412 15 APSWEASAPPPPR Unmodified 1361.6728 0.67279921 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 53.678 53.678 2 0.00059136 52355 QUIQUE_C1218_190116_001 113.44 96.675 258340000 68616000 0 67863000 63935000 57927000 0 0 0 0 0 0 0 0 3208 3452 2982 29173;29174;29175;29176;29177 37421;37422;37423;37424;37425 37421 4 APSWFDTGLSEMR Oxidation (M) 1511.6715 0.67147858 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;E9PS12 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.72 101.72 2 0.00057529 104504 QUIQUE_C1403_190116_001 90.685 80.399 3642700000 189270000 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37440;37441;37442;37443;37444;37445;37446;37447;37448;37449;37450;37451;37452;37453;37454;37455;37456;37457;37458;37459;37460;37461;37462;37463;37464;37465;37466;37467;37468;37469;37470;37471;37472;37473;37474;37475;37476 37468 36 APSWFDTGLSEMRLEK Oxidation (M) 1881.8931 0.89309867 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;E9PS12 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 1 1 1 96.095 96.095 3 0.0369 97237 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.962 35.302 81882000 0 0 0 0 0 0 0 81882000 0 0 0 0 0 3211 977 2984 29206 37477 37477 591 1 APSYLEISSMR Unmodified 1252.6122 0.61217279 2805 P78347 GTF2I General transcription factor II-I yes yes 0 0 0 1 83.317 83.317 2 0.016843 79249 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.404 40.071 125860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 125860000 0 0 0 3212 2805 2985 29207 37478 37478 1 APTADEIHVTVGEAR Unmodified 1564.7845 0.7845345 1877 P05129;M0R0I9 PRKCG Protein kinase C gamma type yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 48.795 48.795 2;3 7.506E-06 46396 QUIQUE_C1576_190116_001 96.82 84.243 1162600000 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29243;29244;29245;29246;29247;29248;29249;29250;29251;29252;29253;29254;29255;29256;29257;29258;29259;29260;29261;29262;29263;29264;29265;29266;29267;29268;29269;29270;29271;29272;29273;29274;29275;29276 37518;37519;37520;37521;37522;37523;37524;37525;37526;37527;37528;37529;37530;37531;37532;37533;37534;37535;37536;37537;37538;37539;37540;37541;37542;37543;37544;37545;37546;37547;37548;37549;37550;37551;37552;37553;37554;37555;37556;37557;37558;37559;37560;37561;37562;37563;37564;37565;37566;37567;37568;37569;37570;37571;37572;37573;37574;37575;37576;37577;37578;37579;37580;37581;37582;37583;37584;37585;37586;37587;37588;37589;37590;37591;37592;37593;37594;37595;37596;37597;37598;37599;37600;37601;37602;37603 37530 86 APVDDVTLDYLTALHVAAHCGHYR Unmodified 2693.302 0.30201904 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 3 2 2 3 3 2 3 2 3 2 3 3 3 116.59 116.59 3;4;5 4.004E-75 120282 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.04 142.75 4540700000 366210000 377710000 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29334;29335;29336;29337;29338;29339;29340;29341;29342;29343;29344;29345;29346;29347;29348;29349;29350;29351;29352;29353;29354;29355;29356;29357;29358;29359;29360 37691;37692;37693;37694;37695;37696;37697;37698;37699;37700;37701;37702;37703;37704;37705;37706;37707;37708;37709;37710;37711;37712;37713;37714;37715;37716;37717;37718;37719;37720;37721;37722;37723;37724;37725;37726 37691 36 APVDITGQFEK Unmodified 1203.6136 0.61355299 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 69.08 69.08 2 0.00046475 68450 QUIQUE_C1277_190116_001 106.16 68.439 410140000 139790000 116580000 0 0 0 0 0 95553000 0 58217000 0 0 0 3221 617 2992 29361;29362;29363;29364;29365 37727;37728;37729;37730;37731 37728 5 APVGEVENYVIVLTHFAVAGETILVDGVSEEFR Unmodified 3558.8246 0.82461499 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 180.84 180.84 4 1.643E-10 183852 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.096 59.191 47472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33294000 14178000 0 3222 3753 2993 29366;29367 37732;37733;37734 37734 3 APVGSAPGTSFLGSEPAR Unmodified 1699.8529 0.85294842 3296 Q5SRE7 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.359 74.359 2 4.6381E-31 76445 QUIQUE_C1218_190116_001 187.11 170.86 1585600000 182070000 114410000 70827000 75153000 146410000 88386000 117500000 126720000 150770000 74722000 165340000 106720000 166580000 3223 3296 2994 29368;29369;29370;29371;29372;29373;29374;29375;29376;29377;29378;29379;29380;29381;29382 37735;37736;37737;37738;37739;37740;37741;37742;37743;37744;37745;37746;37747;37748;37749;37750;37751;37752;37753 37736 17 APVGSVVSVPSQSSASSDK Unmodified 1787.8901 0.89012178 2608 P52594 AGFG1 Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.694 49.694 2 5.5206E-36 47138 QUIQUE_C1277_190116_001 197.19 182.93 577450000 50816000 43481000 48429000 67765000 58410000 68931000 36192000 20044000 33260000 26727000 32673000 38078000 52645000 3224 2608 2995 29383;29384;29385;29386;29387;29388;29389;29390;29391;29392;29393;29394;29395 37754;37755;37756;37757;37758;37759;37760;37761;37762;37763;37764;37765;37766 37755 13 APVIIIPQSSVSPNAVIADLGLIR Unmodified 2442.421 0.42099519 3428 Q709C8;A0A3B3IT88 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.11 166.11 3 2.0908E-11 170193 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.762 77.486 405740000 0 26932000 59505000 0 30911000 0 22638000 41356000 40149000 23284000 44769000 73465000 42734000 3225 3428 2996 29396;29397;29398;29399;29400;29401;29402;29403;29404;29405 37767;37768;37769;37770;37771;37772;37773;37774;37775;37776 37775 10 APVILGSPDDVLEFLK Unmodified 1711.9396 0.93963816 1962 P09467;A0A3B3IUC7 FBP1 Fructose-1,6-bisphosphatase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.92 158.92 2 4.8058E-05 162764 QUIQUE_C1403_190116_001 120.55 85.663 291270000 0 0 62101000 59769000 0 41380000 38227000 28101000 48176000 13512000 0 0 0 3226 1962 2997 29406;29407;29408;29409;29410;29411;29412 37777;37778;37779;37780;37781;37782;37783;37784 37779 6 APVIRPGGTLGLSEAADSDAHLFQDSTEPR Unmodified 3106.532 0.53195521 4093 Q9C0C2 TNKS1BP1 182 kDa tankyrase-1-binding protein yes yes 0 0 1 1 104.81 104.81 4 0.063601 106859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 16.966 10.167 30779000 0 0 0 0 0 0 0 30779000 0 0 0 0 0 3227 4093 2998 29413 37785 37785 1 APVIWDNIHANDYDQK Unmodified 1897.8959 0.89587586 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 0 0 1 1 1 79.777 79.777 3 0.0043133 80512 QUIQUE_C1403_190116_001 32.746 21.371 147110000 0 56641000 0 42172000 0 48301000 0 0 0 0 0 0 0 3228 1579 2999 29414;29415;29416 37786;37787;37788 37787 3 APVKPGIPYK Unmodified 1068.6332 0.63316622 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 23.956 23.956 3 0.0019958 16980 QUIQUE_C1368_190116_001 70.908 51.814 137420000 76999000 0 60425000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3229 2993 3000 29417;29418 37789;37790 37790 2 APVLFNK Unmodified 787.45922 0.4592246 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 35.511 35.511 2 0.020857 30634 QUIQUE_C1403_190116_001 106.84 76.774 468680000 99529000 0 0 81756000 0 0 0 85438000 122400000 0 0 0 79557000 3230 2993 3001 29419;29420;29421;29422;29423 37791;37792;37793;37794;37795;37796 37792 6 APVLLSSLDR Unmodified 1069.6132 0.61315906 4384 Q9P2B2 PTGFRN Prostaglandin F2 receptor negative regulator yes yes 0 0 0 1 77.731 77.731 2 0.063897 77724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.756 29.602 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3231 4384 3002 29424 37797 37797 1 APVLPVGTELPAGTLPSEQLPPFPGPSLTQSQQPLEDLDAQLR Unmodified 4503.3537 0.35371007 988 F5GWT4;Q9H4A3 WNK1 Serine/threonine-protein kinase WNK1 yes no 0 0 0 1 1 166.59 166.59 4 5.9964E-05 169707 QUIQUE_C1403_190116_001 43.951 41.71 46037000 0 0 0 25895000 0 20142000 0 0 0 0 0 0 0 3232 988 3003 29425;29426 37798;37799 37798 2 APVLSDSSCK Unmodified 1062.5016 0.5015597 761 CON__P00761 yes yes 0 0 0 1 1 19.07 19.07 2 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2312;1995;2316;2318;377;2315;2317;2314 A0A1W2PPR8;P01889;F6U0H7;P10316;P30453;P30457;A0A140T8W8;A0A1W2PR61;A0A1W2PPF8;A0A140T8Y4;A0A0G2JPD3;P30450;P18462;P16190;P30461;P30479;P30480;P30462;P30481;A0A140T9Y5;A0A140T997;A0A140TA14;A0A140TA11;P30685;P30491;P30498;P30490;P18464 HLA-B;HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-13 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.67 113.67 2 3.9346E-22 117293 QUIQUE_C1368_190116_001 180.97 168.7 2059800000 185100000 98439000 216340000 155380000 114080000 84905000 91674000 84033000 141690000 52048000 500100000 120540000 215520000 3246 377;1995;2312;2314;2315;2316;2317;2318 3017 29558;29559;29560;29561;29562;29563;29564;29565;29566;29567;29568;29569;29570 37987;37988;37989;37990;37991;37992;37993;37994;37995;37996;37997;37998;37999;38000;38001;38002 37990 16 APWIEQERPEYWDQETR Unmodified 2232.0236 0.023595574 2104 P16188 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain no no 0 0 1 1 1 1 1 1 92.833 92.833 3 3.0821E-23 94460 QUIQUE_C1403_190116_001 123.03 113.62 479250000 0 61042000 151520000 167000000 0 57477000 0 42209000 0 0 0 0 0 3247 2104 3018 29571;29572;29573;29574;29575 38003;38004;38005;38006;38007 38005 5 APWVEQEGPEYWDR Unmodified 1760.7794 0.77944912 325 O19617;A0A140T921;A0A140T9H5;A0A140T9U8;A2AEA2;P10321;A0A140TA05;A0A140T9L3;A0A140T9E1;A0A140T942;F8W9Z8;A0A140TA12;A0A140T9Z7;A0A140TA19;A0A140T9S7;A0A140T9Q4 HLA-C HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 104.5 104.5 2 1.2038E-14 108471 QUIQUE_C1218_190116_001 148.18 135.97 204650000 54462000 0 0 0 0 24311000 47081000 0 0 14388000 64407000 0 0 3248 325 3019 29576;29577;29578;29579;29580 38008;38009;38010;38011;38012 38008 5 APYFSGSSTFSPTILSSDKETIEIIDLAK Unmodified 3116.5805 0.58052812 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 1 1 1 151.36 151.36 3 7.5226E-05 153607 QUIQUE_C1563_190116_001 37.344 31.858 153600000 0 0 0 0 0 65884000 87719000 0 0 0 0 0 0 3249 356 3020 29581;29582 38013;38014 38013 2 AQAALAVNISAAR Unmodified 1254.7044 0.70443369 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 60.111 60.111 2 0.0292 58864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.08 54.552 74283000 0 37496000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36787000 0 3250 2424 3021 29583;29584;29585 38015;38016;38017 38016 3 AQAALQAVNSVQSGNLALAASAAAVDAGMAMAGQSPVLR Unmodified 3679.8774 0.87741239 322 A0A0U1RRM4;P26599;A6NLN1;A0A087WU68 PTBP1 Polypyrimidine tract-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1 1 168.97 168.97 3;4 1.3764E-129 173312 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.1 168.83 941890000 85958000 58024000 70909000 59015000 37835000 87982000 0 138020000 80640000 0 228850000 46933000 47728000 3251 322 3022 29586;29587;29588;29589;29590;29591;29592;29593;29594;29595;29596;29597;29598;29599;29600;29601;29602 38018;38019;38020;38021;38022;38023;38024;38025;38026;38027;38028;38029;38030;38031;38032;38033;38034 38030 17 AQAALVEFVEDVNHAAIPR Unmodified 2049.0643 0.064338176 4491 Q9ULN7 PNMAL2 PNMA-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 137.96 137.96 3 8.4511E-05 134044 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1491100000 1034900000 3254 3117 3025 29620;29621;29622;29623;29624;29625;29626;29627;29628;29629;29630;29631;29632;29633;29634;29635;29636;29637;29638;29639;29640;29641;29642;29643;29644;29645 38059;38060;38061;38062;38063;38064;38065;38066;38067;38068;38069;38070;38071;38072;38073;38074;38075;38076;38077;38078;38079;38080;38081;38082;38083;38084;38085;38086;38087;38088;38089;38090;38091;38092;38093;38094;38095;38096;38097;38098 38065 40 AQAELENVSGALNEAESK Unmodified 1858.8909 0.89085007 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.749 85.749 2 2.8136E-122 87363 QUIQUE_DMIX3_190116_001 229.9 203.19 912140000 77781000 74401000 81903000 72057000 86954000 71600000 80482000 59408000 61912000 31124000 84334000 71937000 58248000 3255 3459 3026 29646;29647;29648;29649;29650;29651;29652;29653;29654;29655;29656;29657;29658 38099;38100;38101;38102;38103;38104;38105;38106;38107;38108;38109;38110;38111 38107 13 AQAELNALK Unmodified 956.5291 0.52909508 1009 F5H442;Q99816 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 0 0 0 1 30.273 30.273 2 0.042881 23863 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.716 13.924 23864000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23864000 0 0 0 3256 1009 3027 29659 38112 38112 1 AQAELVGTADEATR Unmodified 1430.7001 0.70013617 2303 P30049 ATP5D ATP synthase subunit delta, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 41.361 41.361 2 3.5132E-22 36891 QUIQUE_C1368_190116_001 161.94 59.882 6713900000 831660000 650190000 535320000 447260000 528910000 581560000 549430000 296430000 432100000 202250000 539940000 458120000 660700000 3257 2303 3028 29660;29661;29662;29663;29664;29665;29666;29667;29668;29669;29670;29671;29672;29673;29674;29675;29676 38113;38114;38115;38116;38117;38118;38119;38120;38121;38122;38123;38124;38125;38126;38127;38128;38129;38130;38131;38132;38133;38134;38135;38136;38137;38138;38139;38140;38141;38142;38143;38144 38122 32 AQAEVEGLGK Unmodified 1000.5189 0.51892433 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.832 23.832 2 0.00057519 17987 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.48 81.372 4386900000 409000000 382300000 0 208540000 374350000 208790000 0 540480000 523340000 429800000 604110000 432430000 273760000 3258 3117 3029 29677;29678;29679;29680;29681;29682;29683;29684;29685;29686;29687 38145;38146;38147;38148;38149;38150;38151;38152;38153;38154;38155;38156;38157;38158;38159;38160;38161 38153 15 AQAGEGVRPSPMQLELR Oxidation (M) 1853.9418 0.9417802 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 49.192 49.192 3 0.00069258 45988 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.558 50.821 1567500000 60229000 128300000 112170000 108170000 108810000 97728000 0 189520000 186180000 222810000 0 194810000 158770000 3259 1423 3030 29688;29689;29690;29691;29692;29693;29694;29695;29696;29697;29698;29699 38162;38163;38164;38165;38166;38167;38168;38169;38170;38171;38172;38173;38174;38175 38172 793 14 AQAGEGVRPSPMQLELR Unmodified 1837.9469 0.94686558 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 63.502 63.502 2;3 3.1581E-09 62285 QUIQUE_C1368_190116_001 117.03 68.288 4934100000 399550000 409740000 368960000 479950000 205890000 389050000 251310000 557280000 465420000 104160000 450000000 445910000 406910000 3260 1423 3030 29700;29701;29702;29703;29704;29705;29706;29707;29708;29709;29710;29711;29712;29713;29714;29715;29716;29717;29718;29719;29720;29721;29722 38176;38177;38178;38179;38180;38181;38182;38183;38184;38185;38186;38187;38188;38189;38190;38191;38192;38193;38194;38195;38196;38197;38198;38199;38200;38201;38202;38203;38204;38205;38206;38207;38208;38209 38185 33 AQAGVVGEVTQVLCAAGGALELPELR Acetyl (Protein N-term) 2649.3796 0.37960066 1100 G5E9U9;Q9H0J9 PARP12 Poly [ADP-ribose] polymerase 12 yes no 1 0 0 1 180.11 180.11 3 2.3122E-05 186781 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.237 58.962 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3261 1100 3031 29723 38210 38210 1 AQALAIETEAELQR Unmodified 1541.8049 0.80493559 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 79.72 79.72 2 0.000164 80703 QUIQUE_C1576_190116_001 110.66 85.808 256960000 27880000 44826000 0 43795000 0 30861000 42201000 33732000 0 33665000 0 0 0 3262 3086 3032 29724;29725;29726;29727;29728;29729;29730;29731;29732;29733;29734;29735 38211;38212;38213;38214;38215;38216;38217;38218;38219;38220;38221;38222;38223 38217 13 AQALLADVDTLLFDCDGVLWR Unmodified 2390.194 0.19403172 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 171.99 171.99 2 8.7306E-08 177104 QUIQUE_C1576_190116_001 98.694 85.575 231650000 0 0 0 0 0 0 87354000 0 0 0 144300000 0 0 3263 531 3033 29736;29737 38224;38225 38224 2 AQALQEECGYLR Unmodified 1436.6718 0.67181293 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.882 55.882 2 0.00051794 53808 QUIQUE_C1403_190116_001 116.52 99.492 1110100000 182640000 151930000 148010000 74457000 0 122480000 197470000 52974000 0 0 104780000 75365000 0 3264 2033 3034 29738;29739;29740;29741;29742;29743;29744;29745;29746;29747 38226;38227;38228;38229;38230;38231;38232;38233;38234;38235;38236;38237 38231 12 AQALSEEEFQR Acetyl (Protein N-term) 1348.6259 0.62590859 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 94.938 94.938 2 0.00052617 96527 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.696 67.267 200980000 0 0 0 0 0 0 0 36968000 31340000 0 45016000 45535000 42118000 3265 3241 3035 29748;29749;29750;29751;29752 38238;38239;38240;38241;38242;38243 38238 6 AQALVQYLEEPLTQVAAS Unmodified 1930.0048 0.004757612 4563 Q9Y2Q5 LAMTOR2 Ragulator complex protein LAMTOR2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.35 160.35 2;3 0.0020265 162643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.479 62.711 635970000 35844000 70419000 36966000 0 0 38939000 37373000 58730000 70920000 17443000 70334000 118960000 80049000 3266 4563 3036 29753;29754;29755;29756;29757;29758;29759;29760;29761;29762;29763;29764 38244;38245;38246;38247;38248;38249;38250;38251;38252;38253;38254;38255 38250 12 AQAQELQEEEERPGAGAASPR Unmodified 2223.0516 0.051601238 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.887 35.887 3 3.7785E-14 31987 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.84 90.377 164130000 41064000 0 21710000 25648000 29002000 25367000 0 21339000 0 0 0 0 0 3267 4519 3037 29765;29766;29767;29768;29769;29770 38256;38257;38258;38259;38260;38261 38261 6 AQAQPIQLTDLYPGMTYTLR Unmodified 2279.162 0.16200331 1691 O94856;H7C073 NFASC Neurofascin yes no 0 0 0 1 140.94 140.94 2 2.1427E-06 148320 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.063 79.436 49923000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49923000 0 0 3268 1691 3038 29771 38262 38262 1 AQASEILLEELQQGLSQAK Unmodified 2055.0848 0.084798847 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 153.06 153.06 2;3 1.247E-46 155686 QUIQUE_C1563_190116_001 127.59 99.872 1225900000 79325000 102140000 81966000 61552000 91234000 68325000 154610000 68571000 95657000 39530000 151720000 163590000 67717000 3269 3125 3039 29772;29773;29774;29775;29776;29777;29778;29779;29780;29781;29782;29783;29784;29785;29786;29787 38263;38264;38265;38266;38267;38268;38269;38270;38271;38272;38273;38274;38275;38276;38277;38278;38279;38280;38281;38282;38283;38284 38270 22 AQASSIPVGSR Unmodified 1071.5673 0.5672715 3951 Q99426;K7EP07;K7EK42 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.336 21.336 2 0.00032535 14220 QUIQUE_C1368_190116_001 118.71 54.447 2317500000 369430000 350460000 388290000 300230000 0 351410000 346250000 0 0 211420000 0 0 0 3270 3951 3040 29788;29789;29790;29791;29792;29793;29794 38285;38286;38287;38288;38289;38290;38291;38292;38293 38288 7 AQATISVLQKPR Unmodified 1310.767 0.76703394 4641 Q9Y639;Q9UFM8;H3BQ94 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.309 32.309 2;3 0.017282 26516 QUIQUE_C1368_190116_001 45.911 37.606 774640000 102790000 77785000 218590000 0 70444000 0 0 0 115910000 59691000 0 129430000 0 3271 4641 3041 29795;29796;29797;29798;29799;29800;29801 38294;38295;38296;38297;38298;38299;38300;38301 38297 5 AQATPDHVLFMLLNAK Unmodified 1767.9342 0.93417563 4380 Q9P265 DIP2B Disco-interacting protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 135.54 135.54 3 0.00033319 138958 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.972 59.314 81841000 0 0 0 0 0 0 0 17954000 15278000 0 12911000 22238000 13460000 3272 4380 3042 29802;29803;29804;29805;29806 38302;38303;38304;38305;38306 38302 5 AQATQLLEGLVQELQK Unmodified 1767.9731 0.97306355 1320 K7EK35;P42229;C9JVV6 STAT5A Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A yes no 0 0 0 1 156.78 156.78 3 0.00071944 159477 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.813 57.758 14922000 0 0 0 0 0 0 0 14922000 0 0 0 0 0 3273 1320 3043 29807 38307 38307 1 AQAVHPGYGFLSENK Unmodified 1616.7947 0.79470526 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 2 51.645 51.645 2;3 1.087E-43 50446 QUIQUE_C1218_190116_001 179.59 157.11 684170000 49452000 0 56665000 181360000 0 108830000 187870000 0 26861000 40157000 0 32987000 0 3274 1881 3044 29808;29809;29810;29811;29812;29813;29814;29815;29816;29817;29818;29819 38308;38309;38310;38311;38312;38313;38314;38315;38316;38317;38318;38319 38308 11 AQAVHPGYGFLSENKEFAR Unmodified 2120.0439 0.043937085 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 65.895 65.895 3 0.0013249 64800 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.414 47.664 32116000 0 0 0 0 0 0 0 32116000 0 0 0 0 0 3275 1881 3045 29820;29821 38320;38321 38320 2 AQAVLEEDHYGMEDVK Unmodified 1832.8251 0.82507869 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61.039 61.039 2;3 1.9177E-14 59744 QUIQUE_C1368_190116_001 139.86 120.9 145930000 24807000 22539000 33594000 0 64989000 0 0 0 0 0 0 0 0 3276 1324 3046 29822;29823;29824;29825;29826 38322;38323;38324;38325;38326 38324 5 AQAVLEEDHYGMEDVK Oxidation (M) 1848.82 0.81999331 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 1 1 42.284 42.284 2;3 0.0032634 39009 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.559 43.286 168380000 0 0 0 0 0 0 0 0 57917000 31599000 0 32568000 46294000 3277 1324 3046 29827;29828;29829;29830;29831 38327;38328;38329;38330;38331 38327 749 5 AQAVLQAVTAVQTANTPLSGTTVSESAVTPAQSPVLR Unmodified 3662.9479 0.94791802 4471 Q9UKA9 PTBP2 Polypyrimidine tract-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 136.09 136.09 3;4 1.2679E-54 141721 QUIQUE_C1218_190116_001 109.09 100.55 317800000 27850000 0 0 37576000 0 33808000 0 103290000 32883000 0 0 82389000 0 3278 4471 3047 29832;29833;29834;29835;29836;29837;29838;29839 38332;38333;38334;38335;38336;38337;38338;38339;38340;38341;38342 38332 11 AQAVLQQYQHLPSFR Unmodified 1784.9322 0.93220179 4449 Q9UID3;E9PJ36;E9PKX7;E9PRV0 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.28 83.28 3 0.00030341 85998 QUIQUE_C1218_190116_001 69.261 62.691 417000000 54104000 52653000 0 47136000 56505000 32348000 47895000 46691000 33716000 0 0 0 45950000 3279 4449 3048 29840;29841;29842;29843;29844;29845;29846;29847;29848;29849 38343;38344;38345;38346;38347;38348;38349;38350;38351;38352 38343 6 AQAVSEDAGGNEGR Unmodified 1359.6015 0.60148476 2674 P55884;C9JZG1 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.433 14.433 2 2.353E-10 6629 QUIQUE_C1438_190116_001 133.91 121.68 1518700000 133320000 103150000 129800000 107320000 144680000 102580000 138150000 83805000 159010000 27422000 150640000 107290000 131480000 3280 2674 3049 29850;29851;29852;29853;29854;29855;29856;29857;29858;29859;29860;29861;29862 38353;38354;38355;38356;38357;38358;38359;38360;38361;38362;38363;38364;38365;38366 38358 12 AQAVTQPVPLANKPVPAQSTFPSK Unmodified 2475.3486 0.34855853 2540 P49750;H0YIQ2 YLPM1 YLP motif-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 68.915 68.915 3 0.00014705 68144 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.25 43.37 36396000 0 0 0 0 0 0 0 36396000 0 0 0 0 0 3281 2540 3050 29863 38367;38368 38367 2 AQAWCYSK Unmodified 1012.4437 0.44365089 2576 P51149;C9J592;C9J8S3;C9J4V0;C9IZZ0 RAB7A Ras-related protein Rab-7a yes no 0 0 0 1 31.169 31.169 2 0.045999 25619 QUIQUE_C1277_190116_001 98.299 87.23 141880000 0 141880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3282 2576 3051 29864 38369 38369 0 AQCEDDLAEK Unmodified 1177.4921 0.49211723 2944 Q12797;A0A087WW51 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes no 0 0 0 1 1 1 18.082 18.082 2 0.01651 10309 QUIQUE_C1277_190116_001 62.558 51.195 41018000 16088000 10609000 0 14320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3283 2944 3052 29865;29866;29867 38370;38371;38372 38371 3 AQCGGGLLGVR Unmodified 1086.5604 0.56041199 912;826 E9PF17;P13611;Q86W61;D6RGZ6 VCAN Versican core protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.012 44.012 2 8.2848E-05 41231 QUIQUE_C1438_190116_001 134.15 112.47 20260000000 1043900000 1033000000 1775100000 572470000 1587400000 898490000 3200000000 1157600000 1358800000 651730000 2081000000 2669100000 2231900000 3284 912;826 3053 29868;29869;29870;29871;29872;29873;29874;29875;29876;29877;29878;29879;29880 38373;38374;38375;38376;38377;38378;38379;38380;38381;38382;38383;38384;38385;38386;38387;38388;38389;38390;38391;38392;38393;38394;38395;38396;38397;38398;38399;38400;38401;38402;38403;38404;38405;38406;38407;38408;38409;38410;38411 38385 39 AQCPIVER Unmodified 971.48585 0.48585006 1370 M0R0F0;M0R0R2;P46782 RPS5 40S ribosomal protein S5;40S ribosomal protein S5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 20.105 20.105 2 0.022385 13235 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.255 56.869 133220000 0 0 0 0 0 0 0 0 133220000 0 0 0 0 3285 1370 3054 29881 38412 38412 1 AQDAPLSLLQTQGGR Unmodified 1553.8162 0.81616898 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 87.03 87.03 2 0.00017988 89456 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.31 83.864 71503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71503000 3286 2515 3055 29882 38413 38413 1 AQDEGLLSDVVPFK Unmodified 1516.7773 0.77732386 2660 P55084;F5GZQ3 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.72 128.72 2 0.00022607 133385 QUIQUE_C1368_190116_001 112.13 94.689 1289600000 152610000 141730000 248950000 191270000 0 144470000 129430000 0 91056000 90815000 0 0 99235000 3287 2660 3056 29883;29884;29885;29886;29887;29888;29889;29890;29891 38414;38415;38416;38417;38418;38419;38420;38421;38422 38416 4 AQDEGLLSDVVPFKVPGK Unmodified 1898.0149 0.014928368 2660 P55084;F5GZQ3 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 1 1 1 1 122.26 122.26 3 0.0047975 125532 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.604 39.945 277790000 0 0 63475000 0 0 0 0 72061000 0 0 142250000 0 0 3288 2660 3057 29892;29893;29894 38423;38424;38425 38424 3 AQDEIPALSVSRPQTGLSFLGPEPEDLEDLYSR Unmodified 3628.7897 0.78968604 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.17 153.17 3 3.693E-21 160287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.554 77.785 918220000 34116000 60550000 74369000 82457000 74348000 41343000 0 0 119730000 14772000 123340000 100410000 192790000 3289 2466 3058 29895;29896;29897;29898;29899;29900;29901;29902;29903;29904;29905 38426;38427;38428;38429;38430;38431;38432;38433;38434;38435;38436;38437 38435 12 AQDGSHPLSLQDLIEK Unmodified 1749.8897 0.88972785 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 96.367 96.367 2;3 8.2518E-06 97994 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.73 68.204 182700000 23772000 39754000 0 0 0 0 0 89415000 0 29754000 0 0 0 3290 821 3059 29906;29907;29908;29909;29910;29911 38438;38439;38440;38441;38442;38443;38444 38443 7 AQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTK Unmodified 2620.2902 0.29017653 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 1 1 1 2 2 1 1 156.16 156.16 2;3 1.5204E-19 160220 QUIQUE_C1277_190116_001 144.72 128.53 978210000 122410000 102120000 123480000 95837000 87418000 95993000 24166000 70899000 68541000 69956000 0 52877000 64521000 3291 2573 3060 29912;29913;29914;29915;29916;29917;29918;29919;29920;29921;29922;29923;29924;29925;29926;29927;29928;29929;29930;29931 38445;38446;38447;38448;38449;38450;38451;38452;38453;38454;38455;38456;38457;38458;38459;38460;38461;38462;38463;38464;38465;38466;38467 38450 22 AQDIQCGLQSR Unmodified 1274.6037 0.60373336 3707 Q8WVJ2;E5RFP0 NUDCD2 NudC domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.21 29.21 2 3.231E-06 23951 QUIQUE_C1576_190116_001 147.95 96.881 1064100000 67213000 65762000 125760000 77600000 85009000 91954000 112050000 59608000 62998000 26026000 108230000 98171000 83694000 3292 3707 3061 29932;29933;29934;29935;29936;29937;29938;29939;29940;29941;29942;29943;29944 38468;38469;38470;38471;38472;38473;38474;38475;38476;38477;38478;38479;38480;38481 38475 14 AQDITLPHLCSVLLAFAR Unmodified 2024.0877 0.087716155 3790 Q969Z0;H7C4R5 TBRG4 Protein TBRG4 yes no 0 0 0 1 1 153.14 153.14 3 9.6196E-05 160766 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.012 61.889 16470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16470000 0 0 3293 3790 3062 29945;29946 38482;38483 38482 2 AQDLSNLENTVAALK Unmodified 1585.8312 0.83115034 4249 Q9NQ48;H7C488 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 118.27 118.27 2 0.01187 115021 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.328 40.438 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3294 4249 3063 29947 38484 38484 1 AQDPSEVLTMLTNETGFEISSSDATVK Unmodified 2869.3539 0.353899 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 0 2 1 1 163.94 163.94 2;3 3.8823E-19 169012 QUIQUE_C1218_190116_001 91.767 83.148 172200000 116420000 0 30663000 0 0 0 0 0 0 25120000 0 0 0 3295 626 3064 29948;29949;29950;29951 38485;38486;38487;38488 38486 4 AQDQGEKENPMR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1459.6362 0.6361557 2771 P62913 RPL11 60S ribosomal protein L11 yes yes 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.58 14.58 2 0.00061116 6551 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.752 89.564 293150000 0 16876000 18877000 9582000 0 0 24552000 31571000 46393000 0 67583000 33571000 44144000 3296 2771 3065 29952;29953;29954;29955;29956;29957;29958;29959;29960 38489;38490;38491;38492;38493;38494;38495;38496;38497 38497 2202 7 AQDQGEKENPMR Acetyl (Protein N-term) 1443.6412 0.64124108 2771 P62913 RPL11 60S ribosomal protein L11 yes yes 1 0 1 1 2 1 1 26.032 26.032 2 0.002426 19357 QUIQUE_C1277_190116_001 123.8 109.8 51896000 0 0 0 0 0 0 0 51896000 0 0 0 0 0 3297 2771 3065 29961;29962;29963;29964;29965 38498;38499;38500;38501;38502 38498 4 AQDVDATNPNYEIMCMIR Unmodified 2139.9387 0.93874501 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 125.86 125.86 2 9.5438E-07 131466 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.71 112.02 54797000 0 0 0 0 0 0 54797000 0 0 0 0 0 0 3298 1377 3066 29966;29967;29968;29969 38503;38504;38505;38506 38504 4 AQEAAATQLGLK Unmodified 1199.651 0.65100113 2559 P50336;H0YFP3;F5GZT7;A0A1W2PPA5;A0A1W2PQM0;F5H825;H0YFE1 PPOX Protoporphyrinogen oxidase yes no 0 0 0 1 39.725 39.725 2 0.0023335 36178 QUIQUE_C1368_190116_001 81.017 28.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3299 2559 3067 29970 38507 38507 1 AQEACGPLEMDSALSVVQNLEK Unmodified 2388.1301 0.13011083 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 148.65 148.65 2;3 9.3273E-45 151501 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.95 142.69 957430000 76336000 70309000 126090000 45112000 120580000 70291000 73931000 68882000 35436000 11669000 99540000 75733000 83516000 3300 4600 3068 29971;29972;29973;29974;29975;29976;29977;29978;29979;29980;29981;29982;29983;29984;29985;29986;29987;29988;29989;29990;29991;29992;29993 38508;38509;38510;38511;38512;38513;38514;38515;38516;38517;38518;38519;38520;38521;38522;38523;38524;38525;38526;38527;38528;38529;38530;38531;38532;38533;38534;38535;38536 38527 28 AQEADAGPAPWAASSAAACELVLTTMHR Unmodified 2881.3487 0.34871124 340 A0A1B0GTL5;Q9BXF6 RAB11FIP5 Rab11 family-interacting protein 5 yes no 0 0 0 1 143.92 143.92 3 0.0069429 148476 QUIQUE_C1277_190116_001 34.861 28.699 48113000 0 48113000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3301 340 3069 29994 38537 38537 0 AQEAEENYVIK Unmodified 1292.6248 0.62484596 3820 Q96CN4 EVI5L EVI5-like protein yes yes 0 0 0 1 37.833 37.833 2 0.051056 34371 QUIQUE_C1438_190116_001 67.414 45.668 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3302 3820 3070 29995 38538 38538 1 AQEAEQLLR Unmodified 1056.5564 0.55637247 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 39.101 39.101 2 0.010536 34899 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.265 19.7 94280000 0 0 0 0 0 0 0 94280000 0 0 0 0 0 3303 2665 3071 29996;29997 38539;38540 38540 2 AQEALDAVSTLEEGHAQYLTSLADASALVAALTR Unmodified 3484.7686 0.76855667 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 170.56 170.56 3;4 5.6306E-150 174929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.08 185.15 918990000 0 22996000 0 0 36077000 0 132980000 168980000 261700000 0 45840000 0 250420000 3304 1613 3072 29998;29999;30000;30001;30002;30003;30004;30005;30006;30007 38541;38542;38543;38544;38545;38546;38547;38548;38549;38550 38546 9 AQEALLQLSQVLSLMETVK Unmodified 2100.15 0.15004164 1586 O60664 PLIN3 Perilipin-3 yes yes 0 0 0 1 2 2 170.64 170.64 2;3 5.648E-29 175476 QUIQUE_C1368_190116_001 145.88 137.02 374150000 0 0 26935000 0 135540000 0 0 0 0 0 0 0 211680000 3305 1586 3073 30008;30009;30010;30011;30012 38551;38552;38553;38554;38555 38551 5 AQEAPGQAEPPAAAEVQGAGNENEPR Unmodified 2587.1899 0.18988563 1441 O14745;J3QRP6 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes no 0 0 0 2 3 2 3 2 2 2 2 2 2 3 3 2 56.74 56.74 2;3 4.9371E-143 54821 QUIQUE_C1277_190116_001 270.42 253.75 3141900000 171640000 227530000 209720000 269670000 206810000 227420000 136540000 227030000 296110000 97579000 247690000 322180000 501960000 3306 1441 3074 30013;30014;30015;30016;30017;30018;30019;30020;30021;30022;30023;30024;30025;30026;30027;30028;30029;30030;30031;30032;30033;30034;30035;30036;30037;30038;30039;30040;30041;30042 38556;38557;38558;38559;38560;38561;38562;38563;38564;38565;38566;38567;38568;38569;38570;38571;38572;38573;38574;38575;38576;38577;38578;38579;38580;38581;38582;38583;38584;38585;38586;38587;38588;38589;38590;38591;38592;38593;38594;38595;38596;38597;38598;38599;38600;38601 38560 46 AQEDFFQK Unmodified 1011.4662 0.46616048 1718 O95278 EPM2A Laforin yes yes 0 0 0 1 1 44.142 44.142 2 0.033344 41010 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.757 44.203 90598000 0 0 0 0 0 0 54832000 0 0 0 0 35766000 0 3307 1718 3075 30043;30044 38602;38603 38603 2 AQEEAERLEADR Unmodified 1415.6641 0.66408501 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 21.191 21.191 2;3 1.0213E-08 13725 QUIQUE_C1277_190116_001 152.07 114.72 3324800000 0 219350000 42634000 199160000 211450000 0 89450000 672390000 706560000 0 528010000 191760000 464020000 3308 859 3076 30045;30046;30047;30048;30049;30050;30051;30052;30053;30054;30055;30056;30057;30058;30059;30060;30061 38604;38605;38606;38607;38608;38609;38610;38611;38612;38613;38614;38615;38616;38617;38618;38619;38620;38621 38606 17 AQEEWTTGAWK Unmodified 1305.599 0.59896556 3658 Q8TAC9;H3BMY4 SCAMP5 Secretory carrier-associated membrane protein 5 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 68.871 68.871 2 0.00036987 69519 QUIQUE_C1438_190116_001 117.31 109.7 1370100000 109960000 121420000 123290000 137600000 90330000 101340000 120710000 117420000 116830000 0 125550000 116410000 89236000 3309 3658 3077 30062;30063;30064;30065;30066;30067;30068;30069;30070;30071;30072;30073;30074;30075 38622;38623;38624;38625;38626;38627;38628;38629;38630;38631;38632;38633;38634;38635;38636 38627 14 AQEFVNCK Acetyl (Protein N-term) 1036.4648 0.46478027 2386 P35754 GLRX Glutaredoxin-1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.25 65.25 2 0.0093888 65548 QUIQUE_C1218_190116_001 79.116 62.659 184380000 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Q9HCC0;D6RDF7;D6R9R1;A0A0G2JM88 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 19.596 19.596 2 0.011606 11991 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.492 48.917 302520000 138570000 0 0 0 0 0 109640000 0 0 0 0 0 54317000 3313 4223 3081 30097;30098;30099 38659;38660;38661 38661 2 AQEILSQLPIK Unmodified 1238.7234 0.72343779 2386 P35754 GLRX Glutaredoxin-1 yes yes 0 0 0 1 90.091 90.091 2 0.055483 93862 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.092 35.831 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3314 2386 3082 30100 38662 38662 1 AQEINHLFGPK Unmodified 1252.6564 0.65642086 2468 P45381 ASPA Aspartoacylase yes yes 0 0 0 1 1 1 44.34 44.34 3 0.00056012 41102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.979 55.744 108400000 0 33808000 0 0 0 0 0 45020000 0 29578000 0 0 0 3315 2468 3083 30101;30102;30103 38663;38664;38665 38664 3 AQELDALDNSHPIEVSVGHPSEVDEIFDAISYSK Unmodified 3710.7588 0.75877985 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2;E9PJ74;E9PRQ5 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 144.96 144.96 3;4 0 152273 QUIQUE_DMIX5_190116_001 269.65 256.74 2232800000 153300000 132790000 256220000 0 331970000 453740000 192590000 218230000 141840000 0 209240000 142850000 0 3316 959 3084 30104;30105;30106;30107;30108;30109;30110;30111;30112;30113;30114;30115 38666;38667;38668;38669;38670;38671;38672;38673;38674;38675;38676;38677;38678;38679;38680;38681;38682 38680 17 AQELGHSQSALASAQR Unmodified 1652.823 0.82304527 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 22.062 22.062 2 3.2858E-54 15340 QUIQUE_C1368_190116_001 188.92 170.17 33848000 0 0 33848000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3317 3091 3085 30116 38683 38683 1 AQELGLAPDMFFCLR Unmodified 1766.8484 0.84839709 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 152.31 152.31 2;3 3.2315E-06 157276 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.39 99.412 404850000 0 0 100590000 0 0 0 0 93393000 0 24295000 122870000 0 63703000 3318 2226 3086 30117;30118;30119;30120;30121;30122 38684;38685;38686;38687;38688;38689;38690 38690 7 AQELQQTGVLGAFESSFWHMQEK Unmodified 2650.2486 0.24858649 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.53 149.53 3 8.3727E-18 155978 QUIQUE_C1438_190116_001 112.85 104.98 967280000 110870000 149920000 111510000 96309000 157270000 55566000 67725000 0 110600000 22298000 0 85215000 0 3319 2665 3087 30123;30124;30125;30126;30127;30128;30129;30130;30131;30132 38691;38692;38693;38694;38695;38696;38697;38698;38699;38700;38701 38695 10 AQELSALLGCEVDADQVILSHSPMK Unmodified 2710.3306 0.33060156 4067 Q9BXW7 CECR5 Cat eye syndrome critical region protein 5 yes yes 0 0 0 1 143.71 143.71 3 0.0035979 146715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.835 26.723 28522000 0 0 0 0 0 0 0 28522000 0 0 0 0 0 3320 4067 3088 30133 38702 38702 1 AQEPLQDQGQR Unmodified 1268.6109 0.61092723 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2;A0A0G2JN53 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.062 18.062 2 0.00025295 10307 QUIQUE_C1277_190116_001 120.99 83.924 153010000 37748000 27240000 20060000 33266000 0 0 0 0 18653000 0 0 16039000 0 3321 4519 3089 30134;30135;30136;30137;30138;30139;30140;30141 38703;38704;38705;38706;38707;38708;38709;38710;38711 38705 6 AQESVGIYEVTHQFVK Unmodified 1833.9261 0.92611336 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 94.132 94.132 2;3 3.4899E-54 96318 QUIQUE_DMIX3_190116_001 188.48 171.11 2596800000 232240000 202750000 334470000 67777000 184030000 197220000 0 195280000 307120000 82784000 251550000 258020000 283540000 3322 4315 3090 30142;30143;30144;30145;30146;30147;30148;30149;30150;30151;30152;30153;30154;30155;30156;30157;30158;30159 38712;38713;38714;38715;38716;38717;38718;38719;38720;38721;38722;38723;38724;38725;38726;38727;38728;38729;38730;38731;38732;38733 38727 22 AQFAEATQR Unmodified 1020.4989 0.49885759 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.395 19.395 2 0.0034294 12238 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.318 47.504 897350000 85384000 105810000 95992000 85727000 82231000 0 92917000 0 88677000 0 90239000 86731000 83642000 3323 1692 3091 30160;30161;30162;30163;30164;30165;30166;30167;30168;30169 38734;38735;38736;38737;38738;38739;38740;38741;38742;38743 38742 9 AQFAQPEILIGTIPGAGGTQR Unmodified 2124.1328 0.13275209 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 125.83 125.83 2;3 2.0824E-53 132044 QUIQUE_C1438_190116_001 210.34 193.12 11073000000 920000000 822830000 1211000000 682830000 868470000 717950000 829220000 604400000 835850000 296740000 1148800000 928190000 1207000000 3324 2305 3092 30170;30171;30172;30173;30174;30175;30176;30177;30178;30179;30180;30181;30182;30183;30184;30185;30186;30187;30188;30189;30190;30191;30192;30193;30194;30195;30196 38744;38745;38746;38747;38748;38749;38750;38751;38752;38753;38754;38755;38756;38757;38758;38759;38760;38761;38762;38763;38764;38765;38766;38767;38768;38769;38770;38771;38772;38773;38774;38775;38776;38777;38778;38779;38780;38781;38782;38783;38784;38785;38786;38787;38788;38789;38790 38760 46 AQFEGIVTDLIR Unmodified 1360.7351 0.73506511 2415 P38646;H0YBG6 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 128.89 128.89 2;3 2.9925E-06 134039 QUIQUE_C1368_190116_001 137.98 110.23 13603000000 1290100000 964530000 1307300000 835230000 1142700000 1052300000 1195900000 802930000 1032600000 525370000 1274400000 1095500000 1084100000 3325 2415 3093 30197;30198;30199;30200;30201;30202;30203;30204;30205;30206;30207;30208;30209;30210;30211;30212;30213;30214;30215;30216;30217;30218;30219;30220;30221 38791;38792;38793;38794;38795;38796;38797;38798;38799;38800;38801;38802;38803;38804;38805;38806;38807;38808;38809;38810;38811;38812;38813;38814;38815;38816;38817;38818;38819;38820;38821;38822;38823;38824;38825;38826;38827;38828;38829;38830;38831;38832;38833;38834;38835;38836;38837;38838;38839 38800 49 AQFEQLCASLLAR Unmodified 1505.766 0.76604767 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.61 110.61 2 0.00074528 113688 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.507 60.126 1349100000 0 209250000 205320000 0 211920000 0 0 174090000 0 0 334570000 0 213940000 3326 1748 3094 30222;30223;30224;30225;30226;30227 38840;38841;38842;38843;38844;38845 38843 5 AQFEQLK Unmodified 862.45487 0.45486751 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 26.502 26.502 1;2 1.707E-07 20303 QUIQUE_C1438_190116_001 215.07 35.097 1158400000 0 0 0 0 79390000 0 0 0 723280000 355740000 0 0 0 3327 3117 3095 30228;30229;30230 38846;38847;38848 38846 2 AQFEQLKDGK Unmodified 1162.5982 0.59823728 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 1 20.441 20.441 2;3 2.2871E-13 13793 QUIQUE_DMIX1_190116_001 173.37 145.29 1400800000 0 0 0 0 0 0 0 863250000 0 0 537520000 0 0 3328 3117 3096 30231;30232;30233 38849;38850;38851 38849 2 AQFETLQQLVQHYSER Unmodified 1975.9752 0.97518882 1898 P06241 FYN Tyrosine-protein kinase Fyn yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 125.31 125.31 2;3 1.0304E-13 130503 QUIQUE_C1576_190116_001 134.14 114.05 881330000 0 91824000 109200000 57613000 58442000 69026000 96209000 77642000 67204000 36779000 92252000 51029000 74107000 3329 1898 3097 30234;30235;30236;30237;30238;30239;30240;30241;30242;30243;30244;30245;30246;30247;30248;30249;30250 38852;38853;38854;38855;38856;38857;38858;38859;38860;38861;38862;38863;38864;38865;38866;38867;38868 38860 16 AQFEYDPAKDDLIPCK Unmodified 1908.8928 0.89276432 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 1 1 1 1 1 87.299 87.299 2 0.0049658 89695 QUIQUE_C1576_190116_001 73.435 55.167 164100000 39454000 0 40545000 0 0 0 52131000 0 0 0 0 31966000 0 3330 472;1460 3098 30251;30252;30253;30254 38869;38870;38871;38872 38871 4 AQFFLGTTNK Unmodified 1125.5819 0.58185894 4310 Q9NVT9;E5RJ86 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 62.868 62.868 2 0.013795 63151 QUIQUE_C1218_190116_001 78.149 53.946 138200000 54609000 0 0 0 83596000 0 0 0 0 0 0 0 0 3331 4310 3099 30255;30256 38873;38874 38873 2 AQFFLGTTNKR Unmodified 1281.683 0.68296996 4310 Q9NVT9;E5RJ86 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 39.808 39.808 3 0.019277 35842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.94 21.562 24979000 0 0 0 0 0 0 0 24979000 0 0 0 0 0 3332 4310 3100 30257 38875 38875 1 AQFLVEK Unmodified 833.4647 0.46470391 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 34.645 34.645 2 0.01947 29213 QUIQUE_C1563_190116_001 116.54 49.549 832950000 0 0 0 0 0 364330000 0 0 338630000 129990000 0 0 0 3333 1272 3101 30258;30259;30260 38876;38877;38878 38876 3 AQFSVAGVHTVPGSPQAR Unmodified 1807.9329 0.93293007 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7;H0Y4U1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.994 56.994 3 0.00010057 56164 QUIQUE_C1218_190116_001 70.335 58.189 161520000 31831000 35459000 0 0 50033000 27109000 0 0 0 17087000 0 0 0 3334 422 3102 30261;30262;30263;30264;30265 38879;38880;38881;38882;38883 38879 4 AQGFTEDTIVFLPQTDK Unmodified 1908.9469 0.94690838 2436 P41222 PTGDS Prostaglandin-H2 D-isomerase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 123.34 123.34 2;3 5.3994E-30 128409 QUIQUE_C1218_190116_001 188.19 179.68 9386400000 469360000 813610000 1075000000 780700000 988800000 515990000 930240000 752620000 641530000 386280000 633510000 733410000 665370000 3335 2436 3103 30266;30267;30268;30269;30270;30271;30272;30273;30274;30275;30276;30277;30278;30279;30280;30281;30282;30283;30284;30285 38884;38885;38886;38887;38888;38889;38890;38891;38892;38893;38894;38895;38896;38897;38898;38899;38900;38901;38902;38903;38904;38905;38906;38907;38908;38909;38910;38911;38912;38913;38914;38915;38916;38917 38884 31 AQGGSSDSSLALHER Unmodified 1513.7121 0.71209784 2919 Q08378 GOLGA3 Golgin subfamily A member 3 yes yes 0 0 0 1 1 19.861 19.861 3 0.030121 12432 QUIQUE_C1277_190116_001 25.957 14.164 57677000 0 22120000 0 0 35557000 0 0 0 0 0 0 0 0 3336 2919 3104 30286;30287 38918;38919 38918 2 AQGIAQGAIR Unmodified 983.55123 0.55122751 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.966 22.966 2 0.00014671 16148 QUIQUE_C1576_190116_001 122.13 66.598 1408200000 154290000 135710000 120990000 85527000 208940000 85196000 128420000 112300000 130400000 0 0 121390000 125070000 3337 2665 3105 30288;30289;30290;30291;30292;30293;30294;30295;30296;30297;30298 38920;38921;38922;38923;38924;38925;38926;38927;38928;38929;38930 38926 10 AQGLIEVER Acetyl (Protein N-term) 1055.5611 0.56112349 4028 Q9BU02;G3V5B9;G3V5Q5 THTPA Thiamine-triphosphatase yes no 1 0 0 1 1 1 1 95.343 95.343 2 0.0083882 97770 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.679 25.613 9453600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9453600 0 0 0 3338 4028 3106 30299;30300;30301;30302 38931;38932;38933;38934 38934 4 AQGMPEGGGALAEGFQVR Unmodified 1773.8468 0.84681718 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 0 1 92.643 92.643 2 0.014297 95200 QUIQUE_C1218_190116_001 62.287 39.061 31706000 31706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3339 1705 3107 30303 38935 38935 1 AQGPAASAEEPKPVEAPAANSDQTVTVK Unmodified 2762.3723 0.37226668 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 51.089 51.089 3 1.1029E-45 49091 QUIQUE_C1218_190116_001 139.93 129.95 351200000 131170000 0 0 130000000 0 90035000 0 0 0 0 0 0 0 3340 2817 3108 30304;30305;30306 38936;38937;38938;38939 38936 4 AQGPAASAEEPKPVEAPAANSDQTVTVKE Unmodified 2891.4149 0.41485977 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.565 54.565 3 5.734E-108 52470 QUIQUE_C1403_190116_001 177.78 163.72 2169600000 190070000 255010000 225530000 250950000 395060000 197460000 252010000 42415000 33234000 25366000 113160000 65708000 123650000 3341 2817 3109 30307;30308;30309;30310;30311;30312;30313;30314;30315;30316;30317;30318;30319 38940;38941;38942;38943;38944;38945;38946;38947;38948;38949;38950;38951;38952 38943 13 AQGPAGQEADGPR Unmodified 1252.5796 0.5796271 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.604 14.604 2 2.3066E-31 6838 QUIQUE_C1438_190116_001 180.15 164.94 446320000 48940000 35029000 45305000 44294000 53197000 49317000 36494000 0 30197000 0 42608000 22034000 38905000 3342 4517 3110 30320;30321;30322;30323;30324;30325;30326;30327;30328;30329;30330;30331 38953;38954;38955;38956;38957;38958;38959;38960;38961;38962;38963;38964;38965;38966 38958 12 AQGPDGGLTASTYSYLGGFDSSSNVLAGQLR Unmodified 3088.4738 0.47377163 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 147.95 147.95 3 9.4107E-31 150818 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.123 91.145 301060000 0 0 0 33976000 0 0 0 68580000 57303000 0 49663000 46059000 45483000 3343 3418 3111 30332;30333;30334;30335;30336;30337;30338 38967;38968;38969;38970;38971;38972;38973;38974;38975;38976 38968 10 AQGPPKPNTDEGGAVLPSCADLFVYYK Unmodified 2893.3956 0.39564465 3331 Q5VIR6;F6VX93;E7EVT8 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 1 1 118.29 118.29 3 0.031755 124525 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.562 30.457 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3344 3331 3112 30339 38977 38977 1 AQGPQQQPGSEGPSYAK Unmodified 1728.8067 0.80672651 3231 Q3ZCQ8;M0R003;M0R1Y4;M0R047;M0QXC3;M0R2Z3;M0R303;M0R2D2 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.947 22.947 2 5.8786E-30 15975 QUIQUE_C1368_190116_001 184.34 166.94 617640000 35590000 41357000 46207000 55871000 39569000 29861000 70682000 30310000 63683000 18716000 75418000 43658000 66717000 3345 3231 3113 30340;30341;30342;30343;30344;30345;30346;30347;30348;30349;30350;30351;30352 38978;38979;38980;38981;38982;38983;38984;38985;38986;38987;38988;38989;38990 38980 13 AQGSTDYFLSSGDK Unmodified 1474.6576 0.65760265 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.834 59.834 2 0.00010445 58332 QUIQUE_C1368_190116_001 132.76 118.35 1154900000 0 104550000 105670000 84219000 100630000 0 116890000 50000000 128450000 63930000 120570000 82569000 197450000 3346 3296 3114 30353;30354;30355;30356;30357;30358;30359;30360;30361;30362;30363 38991;38992;38993;38994;38995;38996;38997;38998;38999;39000;39001 38992 11 AQGSTDYFLSSGDKIR Unmodified 1743.8428 0.84277766 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 62.225 62.225 2 0.00010177 61862 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.66 86.283 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3347 3296 3115 30364 39002 39002 1 AQGSVAFDYR Unmodified 1112.5251 0.52507234 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 48.419 48.419 2 0.032903 45790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.216 27.967 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3348 1472 3116 30365;30366 39003;39004 39004 2 AQGVLAAQAR Unmodified 983.55123 0.55122751 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 20.065 20.065 2 0.0074125 12662 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.208 36.812 135560000 62634000 45636000 0 0 0 0 0 0 0 27288000 0 0 0 3349 2665 3117 30367;30368;30369 39005;39006;39007;39008 39008 4 AQGVLFDCDGVLWNGER Unmodified 1934.8945 0.89449566 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.49 128.49 2 1.5962E-12 131233 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.5 138.25 1447300000 118750000 129670000 97105000 97334000 116490000 107040000 162410000 113080000 0 47346000 160080000 161250000 136690000 3350 3859 3118 30370;30371;30372;30373;30374;30375;30376;30377;30378;30379;30380;30381;30382 39009;39010;39011;39012;39013;39014;39015;39016;39017;39018;39019;39020;39021;39022;39023;39024;39025;39026;39027 39020 19 AQGVVGPGPHEEQRPYPQGLPGR Unmodified 2425.2251 0.22508935 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 47.385 47.385 3;4 1.3579E-12 44605 QUIQUE_C1218_190116_001 102.48 69.076 1279000000 322500000 91809000 86360000 126900000 85094000 97866000 114000000 43607000 56795000 0 92984000 66142000 94942000 3351 4517 3119 30383;30384;30385;30386;30387;30388;30389;30390;30391;30392;30393;30394;30395;30396;30397 39028;39029;39030;39031;39032;39033;39034;39035;39036;39037;39038;39039;39040;39041;39042;39043;39044;39045;39046 39029 19 AQHEDQVEQYK Unmodified 1373.6212 0.62115757 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 14.645 14.645 2;3 5.2155E-09 6892 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.97 136.4 2098900000 312680000 255310000 313330000 251370000 412850000 0 264210000 0 24738000 88917000 125350000 15188000 35004000 3352 1819;3223 3120 30398;30399;30400;30401;30402;30403;30404;30405;30406;30407;30408;30409;30410;30411;30412;30413;30414;30415;30416 39047;39048;39049;39050;39051;39052;39053;39054;39055;39056;39057;39058;39059;39060;39061;39062;39063;39064;39065 39063 16 AQHEQYVAEAEEK Unmodified 1530.6951 0.69505079 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 1 19.312 19.312 2;3 6.5764E-53 12458 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.29 156.29 1593900000 133850000 176970000 167130000 172530000 121670000 183280000 218560000 39510000 41186000 64135000 64563000 152530000 57948000 3353 4414 3121 30417;30418;30419;30420;30421;30422;30423;30424;30425;30426;30427;30428;30429;30430;30431;30432;30433;30434;30435;30436;30437;30438 39066;39067;39068;39069;39070;39071;39072;39073;39074;39075;39076;39077;39078;39079;39080;39081;39082;39083;39084;39085;39086;39087;39088 39081 23 AQHIVPCTISQLLSATLVDEVFR Unmodified 2596.3683 0.36830769 2097 P15927;Q5TEJ7 RPA2 Replication protein A 32 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 166.08 166.08 3 6.9159E-18 173046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.37 107.81 1276600000 0 185630000 0 119440000 0 0 185990000 116020000 91985000 0 111670000 274700000 191120000 3354 2097 3122 30439;30440;30441;30442;30443;30444;30445;30446;30447 39089;39090;39091;39092;39093;39094;39095;39096;39097 39095 7 AQHQDPGLGGTQEGAR Unmodified 1620.7604 0.76044502 2242 P25686 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 2 2 2 15.122 15.122 2;3 1.116E-07 7738 QUIQUE_C1218_190116_001 117.31 98.064 1269200000 144490000 112300000 148270000 0 162360000 23133000 161100000 15183000 55010000 0 175400000 113780000 158210000 3355 2242 3123 30448;30449;30450;30451;30452;30453;30454;30455;30456;30457;30458;30459;30460;30461;30462;30463;30464 39098;39099;39100;39101;39102;39103;39104;39105;39106;39107;39108;39109;39110;39111;39112;39113;39114;39115;39116;39117 39099 19 AQHQLGEFK Unmodified 1056.5352 0.53524309 3574 Q8N1F7;H3BVG0;H3BPA9 NUP93 Nuclear pore complex protein Nup93 yes no 0 0 0 1 17.911 17.911 3 0.0557 10182 QUIQUE_DMIX4_190116_001 28.956 4.0335 10326000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10326000 0 0 0 3356 3574 3124 30465 39118 39118 1 AQHSWFCK Unmodified 1062.4705 0.47053435 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 24.532 24.532 3 0.04821 18301 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.263 24.048 23473000 0 0 0 0 0 0 0 23473000 0 0 0 0 0 3357 4522 3125 30466 39119 39119 1 AQHTHDAITEAAQLMK Unmodified 1763.8625 0.86246725 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.99 57.99 2 4.394E-05 56088 QUIQUE_C1368_190116_001 97.631 79.822 47721000 16542000 0 13903000 17276000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3358 4606 3126 30467;30468;30469;30470 39120;39121;39122;39123 39121 4 AQHVFQHAVPQEGKPITNQK Unmodified 2256.1763 0.17634824 3028 Q13867;K7ES02;J3KS79;K7ENH5 BLMH Bleomycin hydrolase yes no 0 0 1 1 1 22.088 22.088 3;4 2.3438E-06 15784 QUIQUE_C1218_190116_001 73.688 55.63 166390000 54104000 0 0 0 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59.225 59.225 2;3 1.9361E-05 58589 QUIQUE_C1576_190116_001 116.63 102.67 27402000000 2110500000 2401500000 2769800000 2308700000 2599700000 1787900000 2739400000 1587500000 2052900000 0 2709500000 1820800000 2513900000 3362 282 3130 30483;30484;30485;30486;30487;30488;30489;30490;30491;30492;30493;30494;30495;30496;30497;30498;30499;30500;30501;30502;30503;30504;30505;30506;30507 39138;39139;39140;39141;39142;39143;39144;39145;39146;39147;39148;39149;39150;39151;39152;39153;39154;39155;39156;39157;39158;39159;39160;39161;39162;39163;39164;39165;39166;39167;39168;39169;39170;39171;39172;39173;39174;39175 39156 38 AQIHEQNPSVEVVYYNK Unmodified 2016.9905 0.99050453 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 55.294 55.294 2;3 3.2999E-55 54329 QUIQUE_C1218_190116_001 222.1 194.67 2771100000 244560000 290760000 297550000 194610000 143810000 167920000 171140000 228590000 218070000 90964000 237090000 211050000 275000000 3363 163 3131 30508;30509;30510;30511;30512;30513;30514;30515;30516;30517;30518;30519;30520;30521;30522;30523;30524;30525;30526;30527;30528;30529 39176;39177;39178;39179;39180;39181;39182;39183;39184;39185;39186;39187;39188;39189;39190;39191;39192;39193;39194;39195;39196;39197;39198;39199 39177 21 AQIHGGILR Unmodified 963.5614 0.56139826 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 19.67 19.67 2 0.058457 12737 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.492 44.788 57449000 0 0 0 0 0 0 0 57449000 0 0 0 0 0 3364 2834 3132 30530 39200 39200 0 AQIHQFREDSLDSVLFLK Unmodified 2145.1219 0.12185306 1310 K4DI93;Q13620;A6NE76 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 1 1 1 106.36 106.36 4 3.2943E-05 108801 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.522 64.85 57276000 0 0 0 0 0 0 0 24357000 0 0 0 32920000 0 3365 1310 3133 30531;30532 39201;39202 39201 2 AQIIELLCIVEALKK Unmodified 1740.0219 0.021928001 4623 Q9Y5K6 CD2AP CD2-associated protein yes yes 0 0 1 1 1 1 154.91 154.91 3 1.9161E-06 159477 QUIQUE_DMIX7_190116_001 106.52 94.239 50186000 0 0 0 0 0 0 0 13392000 0 0 0 27099000 9694600 3366 4623 3134 30533;30534;30535 39203;39204;39205 39204 3 AQIINDAFNLASAHK Unmodified 1611.8369 0.83690442 2088 P15144 ANPEP Aminopeptidase N yes yes 0 0 0 1 88.328 88.328 3 0.0012687 89831 QUIQUE_C1403_190116_001 54.402 48.497 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3367 2088 3135 30536 39206 39206 1 AQILPIR Acetyl (Protein N-term) 851.52289 0.52288749 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KSQ2;J3QL20 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.33 106.33 2 0.009678 109989 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.56 74.495 3793000000 366950000 306930000 234960000 276210000 369990000 269370000 293210000 231550000 279240000 123120000 367210000 335930000 338340000 3368 50 3136 30537;30538;30539;30540;30541;30542;30543;30544;30545;30546;30547;30548;30549 39207;39208;39209;39210;39211;39212;39213;39214;39215;39216;39217;39218;39219;39220;39221;39222;39223;39224;39225;39226;39227;39228;39229;39230;39231;39232 39224 26 AQILVADTWSVLEGK Unmodified 1628.8774 0.87737225 3318 Q5T6V5;Q5T6V7 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 135.9 135.9 2 0.0014676 141461 QUIQUE_C1218_190116_001 69.602 38.171 201900000 46016000 35726000 0 0 0 40184000 0 41798000 0 0 0 0 38179000 3369 3318 3137 30550;30551;30552;30553;30554 39233;39234;39235;39236;39237;39238 39233 6 AQIMNVSWSADHR Unmodified 1513.7096 0.70959542 2014 P11182 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 3 2 60.133 60.133 2;3 0.0030455 59144 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.531 52.228 863200000 216740000 73020000 99287000 23629000 0 0 0 0 128970000 0 102800000 109870000 108880000 3370 2014 3138 30555;30556;30557;30558;30559;30560;30561;30562;30563;30564;30565;30566;30567;30568 39239;39240;39241;39242;39243;39244;39245;39246;39247;39248;39249;39250;39251;39252 39246 14 AQIQQFHSQIAAQTSASVLAEELHK Unmodified 2734.4038 0.40384158 3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 93.833 93.833 3;4 1.0559E-07 96376 QUIQUE_C1403_190116_001 61.039 54.811 1074100000 0 91131000 106670000 83748000 172280000 0 0 60467000 128450000 51254000 203410000 0 176680000 3371 3490 3139 30569;30570;30571;30572;30573;30574;30575;30576;30577;30578;30579;30580 39253;39254;39255;39256;39257;39258;39259;39260;39261;39262;39263;39264;39265;39266 39257 13 AQIWDTAGQER Unmodified 1273.6051 0.60511357 3168 Q15907;H3BMH2;H3BSC1;P62491 RAB11B;RAB11A Ras-related protein Rab-11B;Ras-related protein Rab-11A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.327 53.327 2 0.00011143 52022 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.44 117.67 1837500000 0 0 215120000 0 182490000 0 230010000 0 176230000 236440000 345460000 182040000 269670000 3372 3168 3140 30581;30582;30583;30584;30585;30586;30587;30588 39267;39268;39269;39270;39271;39272;39273;39274;39275;39276;39277;39278 39274 12 AQKDEEKMEIQEIQLK Unmodified 1958.9983 0.99829203 1019;3424;1164 Q6ZN40;F5H7S3;B7Z596;H0YL42;H0YK20;H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 0 0 2 1 1 54.243 54.243 3 0.048171 52378 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.223 32.729 288070000 0 0 0 0 0 0 0 147820000 0 0 140250000 0 0 3373 3424;1019;1164 3141 30589;30590 39279;39280 39280 2 AQLAAITLIIGTFER Unmodified 1615.9297 0.92974218 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.84 166.84 2;3 1.4145E-19 170553 QUIQUE_C1277_190116_001 148.41 113.97 1814600000 130880000 116130000 64543000 85216000 96875000 97175000 249590000 118010000 214920000 76248000 232070000 245740000 87254000 3374 3926 3142 30591;30592;30593;30594;30595;30596;30597;30598;30599;30600;30601;30602;30603;30604;30605;30606;30607;30608;30609;30610;30611;30612;30613;30614;30615;30616 39281;39282;39283;39284;39285;39286;39287;39288;39289;39290;39291;39292;39293;39294;39295;39296;39297;39298;39299;39300;39301;39302;39303;39304;39305;39306;39307 39283 26 AQLADSFHLQQFFR Unmodified 1706.8529 0.85288884 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 4 2 2 4 3 2 2 2 3 2 2 3 3 122.56 122.56 2;3 1.2418E-115 126780 QUIQUE_C1368_190116_001 237.93 224.98 51110000000 2874600000 4410700000 4578000000 3855800000 4303300000 3144800000 4248200000 2759000000 4944100000 877820000 5600700000 4076400000 5437100000 3375 267;275;3025 3143 30617;30618;30619;30620;30621;30622;30623;30624;30625;30626;30627;30628;30629;30630;30631;30632;30633;30634;30635;30636;30637;30638;30639;30640;30641;30642;30643;30644;30645;30646;30647;30648;30649;30650 39308;39309;39310;39311;39312;39313;39314;39315;39316;39317;39318;39319;39320;39321;39322;39323;39324;39325;39326;39327;39328;39329;39330;39331;39332;39333;39334;39335;39336;39337;39338;39339;39340;39341;39342;39343;39344;39345;39346;39347;39348;39349;39350;39351;39352;39353;39354;39355;39356;39357;39358;39359;39360;39361;39362;39363;39364;39365;39366;39367;39368;39369;39370;39371;39372;39373;39374;39375;39376;39377;39378;39379;39380;39381;39382;39383;39384;39385;39386;39387;39388;39389;39390;39391;39392 39325 85 AQLDAAVTFGPSQVAR Unmodified 1629.8475 0.84746911 224 A0A0C4DFZ2;P15289 ARSA Arylsulfatase A;Arylsulfatase A component B;Arylsulfatase A component C yes no 0 0 0 1 1 1 1 87.177 87.177 2 0.0013622 88765 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.431 56.577 394610000 0 165450000 0 193660000 0 0 0 0 0 0 0 35502000 0 3376 224 3144 30651;30652;30653;30654 39393;39394;39395;39396 39396 2 AQLDYVDLYLIHSPMSLKPGEELSPTDENGK Unmodified 3458.6916 0.6915519 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;S4R3D5 AKR1C3 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39400;39401;39402;39403;39404;39405;39406;39407;39408;39409;39410;39411;39412;39413;39414;39415;39416 39404 17 AQLEEASSAR Unmodified 1060.5149 0.51490158 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 15.773 15.773 2 0.00019822 8645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.21 97.464 3287900000 0 530940000 0 158730000 0 251120000 0 1149600000 0 845320000 0 352170000 0 3380 3176 3147 30672;30673;30674;30675;30676;30677 39417;39418;39419;39420;39421;39422;39423 39421 6 AQLEGHAVQSTLQSEEWFR Unmodified 2215.0658 0.065794739 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 97.827 97.827 2;3 3.5645E-75 102020 QUIQUE_C1438_190116_001 152.01 137.76 2523400000 222450000 229470000 217090000 158840000 207360000 185350000 71831000 229980000 170090000 94937000 253350000 165100000 317570000 3381 2033 3148 30678;30679;30680;30681;30682;30683;30684;30685;30686;30687;30688;30689;30690;30691;30692;30693;30694;30695;30696;30697;30698;30699;30700;30701;30702 39424;39425;39426;39427;39428;39429;39430;39431;39432;39433;39434;39435;39436;39437;39438;39439;39440;39441;39442;39443;39444;39445;39446;39447;39448;39449;39450;39451 39432 26 AQLELFSQPLLVANAMK Unmodified 1872.0179 0.017905256 3551 Q8IXS8 FAM126B Protein FAM126B yes yes 0 0 0 1 146.58 146.58 2 0.010468 151106 QUIQUE_C1277_190116_001 75.479 60.091 24637000 0 24637000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3382 3551 3149 30703 39452 39452 0 AQLEPVASPAK Unmodified 1109.6081 0.60807369 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.503 28.503 2 4.7677E-06 22928 QUIQUE_C1277_190116_001 147.2 104.6 7713500000 548450000 591470000 689910000 271560000 489790000 284240000 561750000 745120000 859880000 363980000 1081500000 719060000 506790000 3383 3117 3150 30704;30705;30706;30707;30708;30709;30710;30711;30712;30713;30714;30715;30716 39453;39454;39455;39456;39457;39458;39459;39460;39461;39462;39463;39464;39465;39466;39467;39468;39469;39470;39471 39456 19 AQLEQGEPVLETPVESQQHEIESR Unmodified 2732.3253 0.32531648 2610 P52630;B4DLC8 STAT2 Signal transducer and activator of transcription 2 yes no 0 0 0 1 77.636 77.636 3 0.015867 79151 QUIQUE_C1368_190116_001 35.016 25.168 38036000 0 0 38036000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3384 2610 3151 30717 39472 39472 0 AQLEQGGVGIR Unmodified 1126.6095 0.60947067 3378 Q6P1N0;K7EMP1 CC2D1A Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A yes no 0 0 0 1 35.679 35.679 2 0.020525 31730 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.828 30.142 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3385 3378 3152 30718 39473 39473 1 AQLEQSVEENK Unmodified 1273.615 0.61500956 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 23.286 23.286 2 0.027782 16781 QUIQUE_C1368_190116_001 76.815 49.684 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3386 800 3153 30719 39474 39474 1 AQLEQSVEENKER Unmodified 1558.7587 0.75871368 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 19.662 19.662 2;3 5.7714E-20 11977 QUIQUE_C1277_190116_001 167.12 141.07 539610000 100700000 138470000 0 138210000 0 0 0 0 0 0 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39559;39560;39561;39562;39563;39564;39565;39566;39567;39568;39569;39570;39571;39572;39573;39574;39575;39576;39577;39578;39579;39580;39581;39582;39583;39584;39585;39586;39587;39588;39589;39590;39591;39592;39593;39594;39595;39596;39597;39598;39599;39600;39601;39602;39603;39604;39605;39606;39607 39567 45 AQLHDTNMELTDLK Unmodified 1627.7876 0.78757097 1467 O14974;H0YIS3;H0YIM2;A0A0U1RQZ1 PPP1R12A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 58.271 58.271 2;3 0.006525 56744 QUIQUE_C1403_190116_001 34.382 23.277 282950000 0 46428000 46206000 70147000 34631000 0 36165000 0 19571000 0 0 29806000 0 3397 1467 3164 30831;30832;30833;30834;30835;30836;30837;30838 39608;39609;39610;39611;39612;39613;39614;39615 39610 8 AQLHGASEEPGHFSLTNAASTHTTNEGIFSPTPGELGFSSFHR Unmodified 4523.1167 0.1166677 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 105.83 105.83 4;5;6 2.3748E-24 108932 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39634;39635;39636;39637;39638;39639;39640;39641;39642;39643;39644 39636 11 AQLLQPTLEINPR Unmodified 1491.8409 0.84092717 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.978 92.978 2 1.4868E-07 96110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.32 124.09 1792500000 182850000 116630000 170280000 129640000 139710000 132250000 167190000 75122000 161040000 75315000 153190000 129620000 159610000 3401 2952 3168 30862;30863;30864;30865;30866;30867;30868;30869;30870;30871;30872;30873;30874 39645;39646;39647;39648;39649;39650;39651;39652;39653;39654;39655;39656;39657 39655 13 AQLLVVGSPGPVPR Unmodified 1388.814 0.81398414 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.283 82.283 2 0.00031586 85104 QUIQUE_C1218_190116_001 100.72 89.008 2373100000 228490000 201820000 224960000 160410000 226720000 106470000 234330000 155230000 156230000 93596000 179510000 158850000 246500000 3402 2345 3169 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RAD21 Double-strand-break repair protein rad21 homolog yes yes 0 0 0 1 146.57 146.57 2 0.0050162 151674 QUIQUE_C1218_190116_001 50.305 40.772 16633000 16633000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3407 1561 3173 30920 39719 39719 1 AQLSTILEEEK Unmodified 1259.6609 0.66089712 865 H0YBP1;E7ESA6;Q05397;E9PEI4;H0YB16;H0YBZ1 PTK2 Focal adhesion kinase 1 yes no 0 0 0 1 73.641 73.641 2 0.039667 74403 QUIQUE_C1218_190116_001 47.561 36.397 32699000 32699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3408 865 3174 30921 39720 39720 1 AQMASAGQGKEEAVK Unmodified 1503.7351 0.73514147 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 11.564 11.564 3 0.00038405 4101 QUIQUE_C1438_190116_001 65.113 52.845 63265000 0 0 5516500 0 12068000 0 7367500 0 7707900 0 21514000 0 9090800 3409 3459 3175 30922;30923;30924;30925;30926;30927 39721;39722;39723;39724;39725;39726;39727;39728;39729;39730 39725 9 AQMKNPILER Oxidation (M) 1214.6441 0.64414162 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A096LP33;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 1 1 1 1 1 18.853 18.853 3 0.011902 11552 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.19 49.164 306980000 0 0 0 0 0 0 0 0 39757000 0 174750000 92472000 0 3410 273;342 3176 30928;30929;30930 39731;39732;39733 39732 199 3 AQMQTVPNAGHWIHADRPQDFIAAIR Unmodified 2942.4722 0.47221269 3651 Q8NFV4 ABHD11 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 1 1 107.47 107.47 5 0.025469 111291 QUIQUE_C1277_190116_001 24.096 17.591 83694000 0 38209000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45486000 3411 3651 3177 30931;30932 39734;39735 39734 2 AQMVQEDLEK Oxidation (M) 1205.5598 0.55980286 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 22.789 22.789 2 0.0011361 15802 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.55 78.728 1030800000 51532000 68934000 91586000 0 93085000 0 77393000 53203000 124190000 143130000 123250000 89686000 114830000 3412 2248 3178 30933;30934;30935;30936;30937;30938;30939;30940;30941;30942;30943;30944;30945;30946;30947 39736;39737;39738;39739;39740;39741;39742;39743;39744;39745;39746;39747;39748;39749;39750 39748 1603 13 AQMVQEDLEK Unmodified 1189.5649 0.56488824 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.801 34.801 2 0.00035401 29365 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.71 96.467 5630100000 346680000 431170000 351270000 582310000 348320000 331050000 384710000 463150000 584500000 304730000 534600000 405570000 562060000 3413 2248 3178 30948;30949;30950;30951;30952;30953;30954;30955;30956;30957;30958;30959;30960;30961 39751;39752;39753;39754;39755;39756;39757;39758;39759;39760;39761;39762;39763;39764;39765 39762 13 AQNAIAGEGMGISHELITLEISSR Unmodified 2496.2642 0.26423655 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 131.49 131.49 3 1.9448E-18 138068 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.88 99.69 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31022;31023;31024;31025;31026;31027;31028;31029;31030;31031;31032 39833;39834;39835;39836;39837;39838;39839;39840;39841;39842;39843;39844;39845;39846;39847 39836 14 AQPAQPADEPAEKADEPMEH Unmodified 2159.943 0.94296199 2244 P25786;F5GX11 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 32.584 32.584 3 9.2625E-05 27698 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.938 46.586 291120000 0 0 0 0 0 0 0 0 62298000 0 75508000 68357000 84952000 3425 2244 3190 31033;31034;31035;31036 39848;39849;39850;39851;39852 39850 4 AQPARPPPPAQPGEIGEAIAK Unmodified 2094.1222 0.12218741 1693 O94875 SORBS2 Sorbin and SH3 domain-containing protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.198 55.198 3 1.5671E-06 51603 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.952 55.324 376340000 47060000 81888000 36062000 0 62538000 0 0 0 38350000 25501000 0 50999000 33941000 3426 1693 3191 31037;31038;31039;31040;31041;31042;31043;31044 39853;39854;39855;39856;39857;39858;39859;39860;39861 39859 9 AQPSVSLGAAYR Unmodified 1218.6357 0.63568542 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 53.565 53.565 2 0.0080519 50884 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.162 1.5551 259230000 0 0 0 0 0 0 0 259230000 0 0 0 0 0 3427 3919 3192 31045 39862 39862 1 AQPSVSLGAPYR Unmodified 1244.6513 0.65133548 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 55.887 55.887 2 0.0017775 54062 QUIQUE_C1403_190116_001 79.148 44.895 109180000 52823000 0 0 56353000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3428 3919 3193 31046;31047 39863;39864 39864 1 AQPSVVLSAAHTVAAR Unmodified 1576.8685 0.8685389 475 A0A384DVU0;Q8IY17 PNPLA6 Neuropathy target esterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.094 57.094 3 0.0005729 55053 QUIQUE_C1368_190116_001 47.223 36.738 102500000 17129000 22349000 37081000 0 0 25938000 0 0 0 0 0 0 0 3429 475 3194 31048;31049;31050;31051 39865;39866;39867;39868 39867 4 AQPTPSSSATQSKPTPVKPNYALK Unmodified 2497.3177 0.31765233 2733 P61964;V9GYQ5;V9GZ59 WDR5 WD repeat-containing protein 5 yes no 0 0 2 1 32.671 32.671 4 0.0011159 27744 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.256 33.494 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39871;39872;39873;39874;39875;39876;39877;39878;39879;39880;39881;39882;39883;39884;39885;39886;39887;39888;39889;39890;39891;39892;39893;39894;39895;39896;39897;39898;39899;39900;39901;39902;39903;39904;39905;39906;39907;39908;39909;39910;39911;39912;39913;39914;39915;39916;39917;39918;39919 39879 49 AQPVSCFTHLVQANVR Unmodified 1825.9257 0.92573621 715 C9JE82;C9JVC9;Q9NY47 CACNA2D2 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 86.084 86.084 3 0.02065 88027 QUIQUE_C1277_190116_001 46.319 34.295 115530000 0 23358000 30800000 0 27551000 0 33820000 0 0 0 0 0 0 3433 715 3198 31079;31080;31081;31082 39920;39921;39922;39923 39920 3 AQPYDPNFYDETYDYGGFTMMFDDRR Unmodified 3213.3121 0.31205096 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 1 1 152.29 152.29 3 2.1115E-09 155105 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.052 68.941 22147000 0 0 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Core-binding factor subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.664 86.664 2 3.8835E-19 88258 QUIQUE_C1403_190116_001 183.89 168.69 287200000 0 0 55690000 28879000 0 36280000 0 47809000 51191000 0 0 0 67345000 3440 1284 3205 31105;31106;31107;31108;31109;31110 39948;39949;39950;39951;39952;39953 39949 5 AQQEFAAGVFSNPAVR Unmodified 1690.8427 0.84271808 1449 O14828 SCAMP3 Secretory carrier-associated membrane protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 92.05 92.05 2 1.6889E-06 93864 QUIQUE_DMIX8_190116_001 141.37 101.22 275740000 85596000 0 0 78804000 0 0 0 0 0 0 0 0 111340000 3441 1449 3206 31111;31112;31113 39954;39955;39956 39956 2 AQQEFATGVMSNK Unmodified 1409.6609 0.66091389 1483 O15126;A0A087WXB0;A0A087WU14 SCAMP1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.169 45.169 2 0.00031147 42896 QUIQUE_C1277_190116_001 97.452 61.544 162050000 0 0 0 65948000 46144000 49954000 0 0 0 0 0 0 0 3442 1483 3207 31114;31115;31116;31117 39957;39958;39959;39960 39957 4 AQQEHQSLLEK Unmodified 1309.6626 0.66262845 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 1 1 15.092 15.092 2;3 0.00037181 7445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.25 60.688 38177000 0 0 0 0 0 0 0 10804000 0 27374000 0 0 0 3443 88 3208 31118;31119 39961;39962 39961 2 AQQELEEQTR Unmodified 1230.584 0.58404378 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.18 17.18 2 1.794E-07 9752 QUIQUE_C1438_190116_001 152.34 136.46 5231800000 605890000 416170000 538190000 614770000 355200000 427860000 470930000 146380000 321350000 306420000 364550000 264200000 399840000 3444 2248 3209 31120;31121;31122;31123;31124;31125;31126;31127;31128;31129;31130;31131;31132 39963;39964;39965;39966;39967;39968;39969;39970;39971;39972;39973;39974;39975 39967 12 AQQELEEQTRR Unmodified 1386.6852 0.68515481 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 13.472 13.472 2;3 2.8154E-30 5377 QUIQUE_C1403_190116_001 162.38 127.18 1334000000 0 32771000 206750000 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39988;39989;39990;39991;39992;39993;39994;39995;39996;39997;39998;39999;40000;40001;40002 39990 15 AQQEVLQALEPQVDYLR Unmodified 1999.0375 0.037454724 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 2 1 126.93 126.93 2;3 0.00015482 130024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.466 54.377 116800000 0 0 0 0 0 0 0 24652000 0 0 65797000 26351000 0 3448 1187 3213 31155;31156;31157;31158 40003;40004;40005;40006 40003 4 AQQLAEVEVK Unmodified 1113.603 0.60298831 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.909 35.909 2 0.0016283 32237 QUIQUE_C1218_190116_001 95.358 65.173 671960000 69664000 83265000 91069000 105980000 90002000 77054000 0 23031000 0 51648000 80250000 0 0 3449 3086 3214 31159;31160;31161;31162;31163;31164;31165;31166;31167 40007;40008;40009;40010;40011;40012;40013;40014;40015 40007 6 AQQLAEVEVKK Unmodified 1241.698 0.69795133 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 1 20.741 20.741 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31219 40077 40077 1 AQQTPTEEDNEDLK Unmodified 1616.7166 0.71657409 947 E9PJP2;Q5TF21 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 0 1 1 24.394 24.394 2 1.2118E-10 18096 QUIQUE_C1218_190116_001 136.96 106.34 36222000 36222000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3458 947 3223 31220;31221 40078;40079 40078 2 AQQVAVQEQEIAR Unmodified 1468.7634 0.76340513 1673 O75955;A0A140T9R1;A0A140T9X0;A2AB09;A0A140T9W4;A0A140T907 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.836 37.836 2 3.0551E-24 34228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.48 149 1876300000 171110000 149360000 213890000 137320000 140770000 132840000 205880000 91982000 117430000 66014000 171580000 127280000 150790000 3459 1673 3224 31222;31223;31224;31225;31226;31227;31228;31229;31230;31231;31232;31233;31234 40080;40081;40082;40083;40084;40085;40086;40087;40088;40089;40090;40091;40092 40087 12 AQQVLHLQVLQLQQEK Unmodified 1902.0687 0.068695273 4539 Q9Y250 LZTS1 Leucine zipper putative tumor suppressor 1 yes yes 0 0 0 1 85.613 85.613 3 0.015964 86952 QUIQUE_C1403_190116_001 26.307 24.022 27019000 0 0 0 27019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3460 4539 3225 31235 40093 40093 1 AQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTK Unmodified 3687.8283 0.82832016 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 3 2 4 3 3 170.11 170.11 3;4 1.3476E-76 174256 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.4 144.54 7807300000 62697000 82339000 192450000 25873000 314010000 231870000 483260000 493450000 1883200000 39049000 2228500000 902340000 868350000 3461 4560 3226 31236;31237;31238;31239;31240;31241;31242;31243;31244;31245;31246;31247;31248;31249;31250;31251;31252;31253;31254;31255;31256;31257;31258;31259;31260;31261;31262;31263 40094;40095;40096;40097;40098;40099;40100;40101;40102;40103;40104;40105;40106;40107;40108;40109;40110;40111;40112;40113;40114;40115;40116;40117;40118;40119;40120;40121;40122;40123 40108 27 AQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTK Oxidation (M) 3703.8232 0.82323478 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 1 0 1 1 2 2 1 165.97 165.97 3;4 5.6572E-46 160204 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.9 100.79 1095900000 0 0 0 0 0 80294000 0 196450000 445710000 195350000 0 178090000 0 3462 4560 3226 31264;31265;31266;31267;31268;31269;31270 40124;40125;40126;40127;40128;40129;40130 40129 3010 7 AQQVQAPVELYSDWLTVGHVDEFMSFVPIPGTKK Unmodified 3815.9233 0.92328317 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 166.52 166.52 4 1.7055E-51 168530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.76 110.61 236790000 0 0 0 0 0 0 0 236790000 0 0 0 0 0 3463 4560 3227 31271 40131 40131 1 AQQVSQGLDVLTAK Unmodified 1456.7886 0.78855725 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.233 71.233 2 1.9161E-16 71387 QUIQUE_DMIX3_190116_001 152.85 131.86 4153000000 276030000 316840000 338740000 334310000 425760000 271130000 402280000 305310000 342210000 137800000 344430000 260430000 397740000 3464 2135 3228 31272;31273;31274;31275;31276;31277;31278;31279;31280;31281;31282;31283;31284 40132;40133;40134;40135;40136;40137;40138;40139;40140;40141;40142;40143;40144;40145;40146;40147 40143 8 AQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEK 2 Oxidation (M) 3309.3464 0.34644713 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 156.01 156.01 3 4.5127E-12 161335 QUIQUE_C1368_190116_001 67.586 65.796 148140000 27789000 37690000 30056000 15642000 0 24471000 0 0 0 12494000 0 0 0 3465 2851 3229 31285;31286;31287;31288;31289;31290 40148;40149;40150;40151;40152;40153 40150 2280;2281 4 AQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEK Oxidation (M) 3293.3515 0.35153251 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 163.89 163.89 3 4.0781E-19 168220 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.541 89.177 175140000 0 19114000 0 0 0 0 0 33359000 46581000 0 0 45125000 30965000 3466 2851 3229 31291;31292;31293;31294;31295 40154;40155;40156;40157;40158 40157 2280;2281 3 AQQYYFDAAEAEAWMSEQELYMMSEEK Unmodified 3277.3566 0.35661789 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 167.7 167.7 3 3.9005E-08 171992 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.691 57.383 32413000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32413000 3467 2851 3229 31296 40159 40159 1 AQSDGIWGEHEIDYILLVR Unmodified 2213.1117 0.1116823 3032 Q13907 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.41 146.41 3 7.936E-08 151415 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.85 95.372 347760000 0 34128000 0 0 0 0 41571000 51319000 66123000 0 63118000 55505000 35992000 3468 3032 3230 31297;31298;31299;31300;31301;31302;31303;31304 40160;40161;40162;40163;40164;40165;40166;40167;40168 40165 9 AQSHSFPNYGLSHGLTSR Unmodified 1957.9395 0.93947201 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 48.936 48.936 3;4 0.00077783 46375 QUIQUE_C1403_190116_001 53.327 48.619 836460000 75515000 77702000 161310000 91363000 48502000 29342000 52191000 0 0 19402000 116090000 36956000 128080000 3469 4012 3231 31305;31306;31307;31308;31309;31310;31311;31312;31313;31314;31315;31316;31317;31318;31319;31320;31321 40169;40170;40171;40172;40173;40174;40175;40176;40177;40178;40179;40180;40181;40182;40183;40184;40185 40175 15 AQSINITELNLPQLEMLK Acetyl (Protein N-term) 2096.1187 0.11874151 3955 Q99471;H3BMQ1;F8VNW6;F8VQZ2 PFDN5 Prefoldin subunit 5 yes no 1 0 0 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 169.23 169.23 2;3 4.8893E-20 173329 QUIQUE_DMIX8_190116_001 170.56 154.21 1089400000 89638000 115530000 76835000 56530000 55460000 83114000 121230000 81132000 113590000 10338000 77019000 79524000 129450000 3470 3955 3232 31322;31323;31324;31325;31326;31327;31328;31329;31330;31331;31332;31333;31334;31335;31336;31337;31338 40186;40187;40188;40189;40190;40191;40192;40193;40194;40195;40196;40197;40198;40199;40200;40201;40202 40202 17 AQSLEPYGTGLR Unmodified 1290.6568 0.65681479 3346 Q63ZY3;K7ERU2 KANK2 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 57.935 57.935 2 0.027445 55586 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.297 27.254 181710000 0 0 0 0 0 0 0 181710000 0 0 0 0 0 3471 3346 3233 31339 40203 40203 1 AQSLLSTDR Unmodified 989.51417 0.5141733 1388 O00231;J3QRY4 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 29.771 29.771 2 0.0029423 25008 QUIQUE_C1218_190116_001 92.439 39.273 1013700000 106080000 82443000 114380000 91526000 97024000 108040000 86279000 54482000 73812000 0 0 85140000 114460000 3472 1388 3234 31340;31341;31342;31343;31344;31345;31346;31347;31348;31349;31350;31351;31352;31353 40204;40205;40206;40207;40208;40209;40210;40211;40212;40213;40214;40215;40216;40217;40218 40205 15 AQSQLLVPEQK Unmodified 1239.6823 0.68230126 2862 Q01968 OCRL Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1 yes yes 0 0 0 1 40.111 40.111 2 0.029621 36292 QUIQUE_C1403_190116_001 59.645 49.414 25228000 0 0 0 25228000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3473 2862 3235 31354 40219 40219 1 AQSSQDAVSSMNLFDLGGQYLR Unmodified 2386.1223 0.12232334 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;H0YCP8 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 149.88 149.88 2;3 6.2896E-88 154598 QUIQUE_DMIX3_190116_001 193.96 170.95 442060000 26497000 28778000 31692000 33208000 29003000 43677000 22907000 60684000 43745000 9506900 44591000 33611000 34160000 3474 295 3236 31355;31356;31357;31358;31359;31360;31361;31362;31363;31364;31365;31366;31367;31368;31369;31370;31371 40220;40221;40222;40223;40224;40225;40226;40227;40228;40229;40230;40231;40232;40233;40234;40235;40236;40237 40233 16 AQSTDSLGTSGSLQSK Unmodified 1565.7533 0.75329395 3125 Q15276;I3L456 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 0 1 29.748 29.748 2 0.0044445 24541 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.212 41.074 42526000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42526000 3475 3125 3237 31372 40238 40238 1 AQTEGINISEEALNHLGEIGTK Unmodified 2323.1656 0.16556836 4542 Q9Y265;H7C4G5;J3QLR1 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 114.75 114.75 2;3 5.0241E-100 118698 QUIQUE_C1368_190116_001 235.16 222.04 3033600000 226090000 254390000 351240000 206940000 242960000 232510000 261040000 226950000 226520000 128500000 255950000 206970000 213520000 3476 4542 3238 31373;31374;31375;31376;31377;31378;31379;31380;31381;31382;31383;31384;31385;31386;31387;31388;31389;31390 40239;40240;40241;40242;40243;40244;40245;40246;40247;40248;40249;40250;40251;40252;40253;40254;40255;40256;40257;40258;40259;40260;40261;40262;40263;40264 40244 26 AQTEWNTGTWR Unmodified 1348.616 0.61601261 3783 Q969E2 SCAMP4 Secretory carrier-associated membrane protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.772 63.772 2 1.9546E-46 63481 QUIQUE_DMIX1_190116_001 210.6 168.49 985130000 104980000 79301000 99997000 95937000 58770000 0 92367000 111130000 99838000 0 89377000 77858000 75569000 3477 3783 3239 31391;31392;31393;31394;31395;31396;31397;31398;31399;31400;31401 40265;40266;40267;40268;40269;40270;40271;40272;40273;40274;40275;40276 40271 12 AQTGSGGADPTTDVSGQS Unmodified 1634.702 0.70198666 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 32.671 32.671 2 0.043788 27547 QUIQUE_C1277_190116_001 43.798 33.566 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3478 310;830 3240 31402 40277 40277 1 AQTLPTSVVTITSESSPGK Unmodified 1901.9946 0.99458686 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 86.792 86.792 2;3 1.1181E-16 87430 QUIQUE_C1563_190116_001 136.17 130.22 9099000000 1157000000 972570000 716270000 1049500000 1255600000 943830000 775950000 420910000 159310000 529640000 491380000 468560000 158520000 3479 2851 3241 31403;31404;31405;31406;31407;31408;31409;31410;31411;31412;31413;31414;31415;31416;31417;31418;31419;31420;31421;31422;31423;31424;31425 40278;40279;40280;40281;40282;40283;40284;40285;40286;40287;40288;40289;40290;40291;40292;40293;40294;40295;40296;40297;40298;40299;40300;40301;40302;40303;40304;40305;40306;40307 40292 26 AQTLPTSVVTITSESSPGKR Unmodified 2058.0957 0.095697884 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 69.917 69.917 2;3 9.2034E-18 69951 QUIQUE_C1277_190116_001 153.09 124.47 10574000000 241610000 548810000 309200000 490480000 919150000 251500000 502860000 1493000000 1541800000 138540000 1525700000 1131600000 1480000000 3480 2851 3242 31426;31427;31428;31429;31430;31431;31432;31433;31434;31435;31436;31437;31438;31439;31440;31441;31442;31443;31444;31445;31446;31447;31448;31449;31450 40308;40309;40310;40311;40312;40313;40314;40315;40316;40317;40318;40319;40320;40321;40322;40323;40324;40325;40326;40327;40328;40329;40330;40331;40332;40333;40334;40335;40336;40337;40338;40339;40340;40341;40342;40343;40344;40345;40346;40347 40312 37 AQTPIEEFTPTPAFPALQYLESVDEGGVAWR Unmodified 3418.6721 0.67213709 1243 H9KV90;Q9Y566 SHANK1 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 1 yes no 0 0 0 1 1 171.14 171.14 3 9.5205E-06 176419 QUIQUE_C1576_190116_001 47.159 42.582 44680000 0 0 26716000 0 0 0 17964000 0 0 0 0 0 0 3481 1243 3243 31451;31452 40348;40349;40350 40350 2 AQTYELQESNVQLK Unmodified 1649.8261 0.82606496 646 E7EW69;B5ME97;Q9P0V9;E7EX04 SEPT10 Septin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.598 65.598 2 1.6572E-17 65269 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.44 151.4 1813200000 147890000 0 230470000 0 0 129300000 271960000 109250000 184160000 81220000 263450000 0 395520000 3482 646 3244 31453;31454;31455;31456;31457;31458;31459;31460;31461 40351;40352;40353;40354;40355;40356;40357;40358;40359 40356 9 AQVADVVVSR Unmodified 1042.5771 0.57710791 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 38.189 38.189 2 0.03223 34161 QUIQUE_C1218_190116_001 53.756 21.436 348710000 138820000 0 0 0 0 0 0 126560000 0 83330000 0 0 0 3483 2524 3245 31462;31463;31464 40360;40361;40362 40360 3 AQVARPGGDTIFGK Unmodified 1415.7521 0.75211216 2546 P49773;D6REP8;D6RE99;D6RD60;D6RC06 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 41.035 41.035 2;3 6.3566E-06 38429 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.33 87.523 2201300000 0 71267000 60528000 0 92784000 0 62333000 872310000 211690000 0 283490000 236970000 309890000 3484 2546 3246 31465;31466;31467;31468;31469;31470;31471;31472;31473;31474;31475 40363;40364;40365;40366;40367;40368;40369;40370;40371;40372;40373;40374;40375 40370 12 AQVDSSFLSLYDSHVAK Unmodified 1865.9159 0.9159426 3578 Q8N2F6;A0A0J9YWR7;A0A0J9YXE4 ARMC10 Armadillo repeat-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 3 1 1 1 100.52 100.52 2;3 3.3759E-10 103627 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.992 79.412 291480000 0 0 0 74654000 0 0 62188000 0 0 0 66360000 88279000 0 3485 3578 3247 31476;31477;31478;31479;31480;31481;31482;31483;31484;31485;31486;31487;31488;31489;31490 40376;40377;40378;40379;40380;40381;40382;40383;40384;40385;40386;40387;40388;40389;40390;40391;40392 40387 17 AQVEGLTCSHCR Unmodified 1416.6238 0.62381688 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 18.067 18.067 3 0.00026254 10555 QUIQUE_C1438_190116_001 85.845 65.749 210320000 0 56542000 0 23387000 39869000 23863000 32323000 0 0 0 19172000 15169000 0 3486 2834 3248 31491;31492;31493;31494;31495;31496;31497 40393;40394;40395;40396;40397;40398;40399 40395 7 AQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPK Unmodified 2352.1883 0.18827764 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 138.85 138.85 2;3 5.7525E-130 143316 QUIQUE_DMIX3_190116_001 222.45 207.66 2351400000 303590000 81532000 218940000 65200000 188450000 199170000 211590000 135930000 256880000 103800000 223240000 143610000 219430000 3487 2421 3249 31498;31499;31500;31501;31502;31503;31504;31505;31506;31507;31508;31509;31510;31511;31512;31513;31514;31515;31516;31517;31518;31519;31520;31521;31522;31523 40400;40401;40402;40403;40404;40405;40406;40407;40408;40409;40410;40411;40412;40413;40414;40415;40416;40417;40418;40419;40420;40421;40422;40423;40424;40425;40426;40427;40428;40429;40430;40431;40432;40433;40434;40435;40436;40437;40438;40439;40440;40441;40442;40443;40444 40425 45 AQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPALK Unmodified 2761.4572 0.45718228 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 129.77 129.77 3 1.2862E-36 133344 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.37 125.21 1231800000 0 0 0 0 0 0 0 208500000 219280000 0 437760000 165670000 200610000 3488 2421 3250 31524;31525;31526;31527;31528 40445;40446;40447;40448;40449;40450;40451;40452;40453;40454 40445 10 AQVEIVTDGEEPAEMIQVLGPKPALK Oxidation (M) 2777.4521 0.4520969 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 1 1 1 105.5 105.5 3 0.00010888 110696 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.807 41.966 140940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 140940000 0 0 3489 2421 3250 31529 40455;40456 40455 1839 2 AQVEQELTTLR Unmodified 1286.683 0.68302954 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.07 65.07 2 2.3786E-12 64739 QUIQUE_DMIX5_190116_001 161.63 138.89 8656600000 590090000 577930000 715330000 218190000 515850000 253730000 524940000 1065200000 1118700000 504160000 1107900000 869050000 595500000 3490 3117 3251 31530;31531;31532;31533;31534;31535;31536;31537;31538;31539;31540;31541;31542 40457;40458;40459;40460;40461;40462;40463;40464;40465;40466;40467;40468;40469;40470;40471;40472;40473;40474;40475 40472 17 AQVIDLQAEGYWEELLDTTQPAIVVK Unmodified 2928.5121 0.51205462 405 A0A286YF37;Q9UK22 FBXO2 F-box only protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 1 168.03 168.03 2;3 1.0954E-56 174244 QUIQUE_C1438_190116_001 195.27 189.15 1636700000 66044000 58716000 51258000 38130000 155260000 255880000 180670000 184010000 197370000 27639000 161230000 117080000 143380000 3491 405 3252 31543;31544;31545;31546;31547;31548;31549;31550;31551;31552;31553;31554;31555;31556;31557;31558;31559;31560;31561 40476;40477;40478;40479;40480;40481;40482;40483;40484;40485;40486;40487;40488;40489;40490;40491;40492;40493;40494;40495 40481 20 AQVLGHVEQLK Unmodified 1220.6877 0.68772099 3492 Q86UU1 PHLDB1 Pleckstrin homology-like domain family B member 1 yes yes 0 0 0 1 33.372 33.372 2 0.055665 28257 QUIQUE_C1563_190116_001 44.945 29.283 24237000 0 0 0 0 0 24237000 0 0 0 0 0 0 0 3492 3492 3253 31562 40496 40496 1 AQVLQLVAELEETR Unmodified 1597.8675 0.86753585 3893 Q96JN2;C9JE17;C9JU31;C9J884;C9IYI5 CCDC136 Coiled-coil domain-containing protein 136 yes no 0 0 0 1 1 1 1 144.69 144.69 3 6.3531E-05 148678 QUIQUE_C1277_190116_001 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31573;31574;31575;31576;31577;31578;31579;31580;31581;31582;31583;31584;31585;31586;31587;31588;31589;31590;31591;31592;31593;31594;31595;31596;31597;31598;31599;31600;31601;31602;31603;31604;31605;31606;31607 40507;40508;40509;40510;40511;40512;40513;40514;40515;40516;40517;40518;40519;40520;40521;40522;40523;40524;40525;40526;40527;40528;40529;40530;40531;40532;40533;40534;40535;40536;40537;40538;40539;40540;40541;40542;40543;40544 40513 34 AQVSLLIR Unmodified 898.56 0.56000128 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7;F5H3X6 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.28 61.28 2 2.4839E-06 61679 QUIQUE_C1218_190116_001 173.93 106.9 2364100000 245430000 217750000 231720000 179890000 189430000 183680000 182550000 191380000 142330000 76937000 200510000 187230000 135290000 3496 1272 3257 31608;31609;31610;31611;31612;31613;31614;31615;31616;31617;31618;31619;31620 40545;40546;40547;40548;40549;40550;40551;40552;40553;40554;40555;40556;40557;40558;40559 40545 15 AQVSPTASDMLHMR Unmodified 1542.7283 0.72828195 3412 Q6UXB8 PI16 Peptidase inhibitor 16 yes yes 0 0 0 1 62.146 62.146 3 0.03074 60701 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.037 34.677 26040000 0 0 0 0 0 0 0 26040000 0 0 0 0 0 3497 3412 3258 31621 40560 40560 0 AQVTSLLGELQESQSR Unmodified 1744.8955 0.89554151 44 A0A087X0G7;A0A087WUW6;A0A087X1B1;Q9Y6K9;A0A087WV30;C9JH59;C9J2V2;C9JN51 IKBKG NF-kappa-B essential modulator yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.16 109.16 2 0.00037413 111306 QUIQUE_C1563_190116_001 100.55 59.31 229350000 0 39129000 54051000 0 36157000 31808000 0 31480000 0 0 0 36724000 0 3498 44 3259 31622;31623;31624;31625;31626;31627 40561;40562;40563;40564;40565;40566 40564 6 AQVWLEQVCAHLGLGVQEPHPGER Unmodified 2709.3446 0.34455256 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 118.25 118.25 4 0.0042424 121424 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.682 31.473 152780000 0 0 53398000 30579000 0 0 0 68804000 0 0 0 0 0 3499 3418 3260 31628;31629;31630 40567;40568;40569 40569 2 AQWGENLQVTLIPTHDTEVTR Unmodified 2407.2132 0.21318726 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 108.76 108.76 2;3 2.4404E-16 111245 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.05 129.94 3003700000 210390000 294540000 226390000 251300000 190280000 206980000 287790000 235070000 178170000 97245000 347660000 244730000 233150000 3500 921 3261 31631;31632;31633;31634;31635;31636;31637;31638;31639;31640;31641;31642;31643;31644;31645 40570;40571;40572;40573;40574;40575;40576;40577;40578;40579;40580;40581;40582;40583;40584;40585;40586;40587;40588;40589;40590 40582 21 AQWGSNMQVTLIPTHDSEVMR Oxidation (M) 2415.1311 0.13111389 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 1 94.11 94.11 3 1.4121E-06 99226 QUIQUE_C1218_190116_001 76.704 70.144 887990000 106770000 160930000 140020000 221120000 95110000 0 0 0 102200000 61841000 0 0 0 3501 2483 3262 31646;31647;31648;31649;31650;31651;31652;31653 40591;40592;40593;40594;40595;40596;40597;40598 40591 1904;1905 8 AQWGSNMQVTLIPTHDSEVMR Unmodified 2399.1362 0.13619927 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 105.6 105.6 2;3 1.1657E-185 108789 QUIQUE_C1368_190116_001 244.05 219.12 1938900000 489790000 47249000 56775000 519040000 34416000 438470000 46769000 0 45311000 88020000 75765000 45908000 51362000 3502 2483 3262 31654;31655;31656;31657;31658;31659;31660;31661;31662;31663;31664;31665;31666;31667;31668;31669 40599;40600;40601;40602;40603;40604;40605;40606;40607;40608;40609;40610;40611;40612;40613;40614;40615 40602 16 AQWNQLQQLDTR Acetyl (Protein N-term) 1541.7587 0.7586541 2427 P40763 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 122.77 122.77 2 0.0013364 128993 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.477 78.505 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3503 2427 3263 31670;31671;31672 40616;40617;40618 40617 3 AQYEDIANR Unmodified 1078.5043 0.5043369 792;772 CON__P05787;P05787;F8VUG2;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2 KRT8 Keratin, type II cytoskeletal 8 no no 0 0 0 1 29.784 29.784 2 0.04263 24707 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.786 31.015 36638000 0 0 0 0 0 0 0 0 36638000 0 0 0 0 + 3504 772;792 3264 31673 40619 40619 1 AQYEDIAQK Unmodified 1064.5138 0.51383895 1859 P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.11 25.11 2 0.00038656 19045 QUIQUE_DMIX7_190116_001 134.81 104.31 10052000000 510440000 0 322310000 0 1055200000 517120000 562420000 897740000 796730000 1350100000 1345900000 926270000 1767600000 + 3505 1859 3265 31674;31675;31676;31677;31678;31679;31680;31681;31682;31683;31684 40620;40621;40622;40623;40624;40625;40626;40627;40628;40629;40630;40631;40632;40633;40634 40632 14 AQYEDIAQR Unmodified 1092.52 0.51998696 775 CON__P12035;P12035 KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 0 0 1 28.148 28.148 2 0.021021 22272 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.464 5.7432 123350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 123350000 0 + 3506 775 3266 31685 40635 40635 1 AQYEEIANR Unmodified 1092.52 0.51998696 778 CON__P13647;P13647;H0YI76;H0YIN9 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 28.078 28.078 2 0.032733 22433 QUIQUE_C1438_190116_001 55.531 10.449 413100000 0 0 0 0 66298000 0 52289000 78259000 77741000 0 138520000 0 0 + 3507 778 3267 31686;31687;31688;31689;31690 40636;40637;40638;40639;40640 40636 5 AQYEEIAQR Unmodified 1106.5356 0.53563702 781;782;764;779 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__P19013;P19013 KRT2;KRT6C;KRT6A;KRT4 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.014 29.014 2 0.00040546 23571 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.18 86.296 3145900000 0 0 0 0 0 0 0 329100000 0 615930000 756150000 698460000 746260000 + 3508 781;782;764;779 3268 31691;31692;31693;31694;31695 40641;40642;40643;40644;40645 40642 4 AQYEQTLAELHR Unmodified 1457.7263 0.72629134 241 A0A0C4DGG1;Q9UKS6;E9PIY1 PACSIN3 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.203 56.203 3 0.0079964 54635 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.73 31.03 525330000 0 51231000 56625000 47339000 0 51077000 60903000 50204000 53394000 28680000 65606000 0 60273000 3509 241 3269 31696;31697;31698;31699;31700;31701;31702;31703;31704;31705 40646;40647;40648;40649;40650;40651;40652;40653;40654;40655;40656;40657 40653 10 AQYESLAAK Unmodified 979.49746 0.4974606 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 23.06 23.06 2 0.0070365 16546 QUIQUE_C1368_190116_001 82.716 0 6988700000 1211200000 940520000 802660000 678450000 886880000 733620000 0 868490000 711800000 92202000 62914000 0 0 3510 3176 3270 31706;31707;31708;31709;31710;31711;31712;31713;31714;31715;31716;31717 40658;40659;40660;40661;40662;40663;40664;40665;40666;40667;40668;40669 40661 11 AQYPIADLVK Unmodified 1116.6179 0.61791009 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 83.311 83.311 2 0.049902 85081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.853 25.113 268560000 0 0 116130000 0 0 0 0 48143000 0 0 0 104290000 0 3511 2993 3271 31718;31719;31720 40670;40671;40672 40671 3 AQYYLPDGSTIEIGPSR Unmodified 1865.9159 0.9159426 2716 P61163;R4GMT0 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 0 2 3 2 1 3 3 1 2 4 2 1 1 1 128.32 128.32 2;3 6.0453E-18 132802 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.51 111.09 2612200000 512840000 423360000 432300000 421240000 18552000 377900000 380090000 17603000 28278000 0 0 0 0 3512 2716 3272 31721;31722;31723;31724;31725;31726;31727;31728;31729;31730;31731;31732;31733;31734;31735;31736;31737;31738;31739;31740;31741;31742;31743;31744;31745;31746 40673;40674;40675;40676;40677;40678;40679;40680;40681;40682;40683;40684;40685;40686;40687;40688;40689;40690;40691;40692;40693;40694;40695;40696;40697;40698;40699;40700;40701;40702;40703;40704;40705;40706;40707;40708;40709;40710;40711;40712;40713 40707 39 ARDDLITDLLNEAK Unmodified 1585.8312 0.83115034 2397 P36543;C9J8H1 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 129.86 129.86 2;3 6.9541E-37 134353 QUIQUE_C1277_190116_001 150.11 123.99 25196000000 782640000 2482000000 2137400000 1642700000 2045200000 2463600000 2088100000 1366900000 1795700000 864060000 2836100000 2927200000 1764500000 3513 2397 3273 31747;31748;31749;31750;31751;31752;31753;31754;31755;31756;31757;31758;31759;31760;31761;31762;31763;31764;31765;31766;31767;31768;31769;31770;31771 40714;40715;40716;40717;40718;40719;40720;40721;40722;40723;40724;40725;40726;40727;40728;40729;40730;40731;40732;40733;40734;40735;40736;40737;40738;40739;40740;40741;40742;40743;40744;40745;40746;40747;40748;40749;40750;40751;40752;40753;40754 40717 41 ARDPHSGHFVALK Unmodified 1433.7528 0.75278086 2029 P11802;F8VYH9;F8VTV8;F8VWX7;F8VYY1;Q96BE9;F8W1L8 CDK4 Cyclin-dependent kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 13.478 13.478 4 0.0015824 5341 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.108 43.478 57442000 0 0 0 0 9616800 0 0 0 0 0 18632000 0 29193000 3514 2029 3274 31772;31773;31774 40755;40756;40757;40758 40758 4 ARDYDAMGSQTK Unmodified 1341.5983 0.59831364 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 1 1 15.343 15.343 2 0.0035975 7791 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.56 49.888 11602000 0 0 0 0 0 0 0 11602000 0 0 0 0 0 3515 4536 3275 31775 40759 40759 1 AREEAERELER Unmodified 1386.6852 0.68515481 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 2 1 3 1 1 13.115 13.115 2;3 1.0817E-08 4978 QUIQUE_DMIX7_190116_001 144.57 108.16 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40847;40848;40849;40850;40851;40852;40853;40854;40855;40856;40857;40858;40859;40860;40861;40862;40863;40864;40865;40866;40867;40868;40869;40870;40871;40872;40873;40874;40875;40876;40877;40878;40879;40880;40881;40882;40883;40884;40885;40886;40887;40888;40889;40890;40891 40871 45 ARFPAFEL Unmodified 949.50215 0.50215205 1555 O43813 LANCL1 LanC-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 105.81 105.81 2 0.050351 107974 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.071 85.166 96039000 0 0 0 0 0 0 0 96039000 0 0 0 0 0 3524 1555 3284 31872 40892 40892 1 ARLEDALLR Unmodified 1055.6087 0.60874239 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.302 49.302 2;3 0.0051793 47512 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.414 43.891 209730000 0 0 11539000 0 16218000 0 28049000 29971000 32066000 0 39576000 22290000 30017000 3525 16;1475 3285 31873;31874;31875;31876;31877;31878;31879;31880 40893;40894;40895;40896;40897;40898;40899;40900 40896 8 ARLEIEPEWAYGK Unmodified 1560.7936 0.79364262 2846 Q00688 FKBP3 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ARPEFTLPVHFYGHVEHTSQGAK Unmodified 2607.2983 0.29825429 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 1 1 4 2 3 2 3 2 3 3 4 1 2 1 60.313 60.313 3;4;5;6 5.378E-113 59864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 197.4 185.09 4944900000 100570000 684640000 309920000 613760000 232630000 426490000 319060000 409660000 776330000 431780000 204390000 371440000 64259000 3531 2017 3291 31916;31917;31918;31919;31920;31921;31922;31923;31924;31925;31926;31927;31928;31929;31930;31931;31932;31933;31934;31935;31936;31937;31938;31939;31940;31941;31942;31943;31944;31945;31946 40939;40940;40941;40942;40943;40944;40945;40946;40947;40948;40949;40950;40951;40952;40953;40954;40955;40956;40957;40958;40959;40960;40961;40962;40963;40964;40965;40966;40967;40968;40969;40970;40971;40972;40973;40974;40975;40976 40961 36 ARPEYMLPVHFYGR Oxidation (M) 1750.8613 0.86134503 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 70.405 70.405 3;4 0.00014046 68247 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31968;31969;31970;31971;31972;31973;31974;31975;31976;31977;31978;31979;31980;31981;31982;31983;31984;31985;31986;31987;31988;31989;31990;31991;31992;31993;31994;31995;31996;31997;31998;31999 41002;41003;41004;41005;41006;41007;41008;41009;41010;41011;41012;41013;41014;41015;41016;41017;41018;41019;41020;41021;41022;41023;41024;41025;41026;41027;41028;41029;41030;41031;41032;41033;41034;41035;41036;41037;41038;41039;41040;41041;41042;41043;41044;41045 41009 41 ARPFPDGLAEDIDKGEVSAR Unmodified 2142.0705 0.070545766 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 2 2 3 1 1 3 2 1 2 3 2 2 1 2 82.763 82.763 3;4 1.4717E-31 83936 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.29 111.58 1143400000 146360000 88584000 155620000 0 0 0 202670000 138880000 0 94327000 0 178070000 138910000 3534 2058 3293 32000;32001;32002;32003;32004;32005;32006;32007;32008;32009;32010;32011;32012;32013;32014;32015;32016;32017;32018;32019;32020;32021;32022;32023;32024 41046;41047;41048;41049;41050;41051;41052;41053;41054;41055;41056;41057;41058;41059;41060;41061;41062;41063;41064;41065;41066;41067;41068;41069;41070;41071;41072;41073;41074;41075;41076 41066 29 ARPGEITGYMATVPGLLK Unmodified 1873.0132 0.013154229 3941 Q96S97;C9JZL8;C9J5M0;C9JC07 MYADM Myeloid-associated differentiation marker yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 108.17 108.17 3 0.0023133 111827 QUIQUE_C1277_190116_001 55.688 49.271 283430000 0 40635000 41272000 47894000 0 0 59628000 0 0 0 57863000 36140000 0 3535 3941 3294 32025;32026;32027;32028;32029;32030 41077;41078;41079;41080;41081;41082;41083;41084 41077 8 ARPILHVSHEVSIAPR Unmodified 1781.006 0.0060354365 1266;3022 J3KNV4;Q13683 ITGA7 Integrin alpha-7;Integrin alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form no no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 1 2 2 2 1 32.227 32.227 3;4 1.3065E-09 26464 QUIQUE_C1368_190116_001 100.4 85.243 1524200000 252110000 58210000 349800000 115930000 101780000 60601000 105740000 54880000 125770000 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11 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 97.305 97.305 2;3 7.7142E-09 94826 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.48 99.471 1947400000 158850000 272510000 288940000 303010000 159760000 217960000 207680000 0 0 90782000 67305000 82067000 98519000 3539 1688 3298 32052;32053;32054;32055;32056;32057;32058;32059;32060;32061;32062;32063;32064;32065 41109;41110;41111;41112;41113;41114;41115;41116;41117;41118;41119;41120;41121;41122;41123;41124;41125;41126;41127 41124 19 ARPSDQVFCYNPATDSWSAVRPLR Unmodified 2792.3453 0.34528084 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 99.321 99.321 3;4 1.799E-142 103230 QUIQUE_DMIX5_190116_001 216.65 204.8 5943000000 118730000 192460000 420140000 76560000 411420000 91670000 505060000 488950000 911990000 132530000 962970000 878830000 751710000 3540 1688 3299 32066;32067;32068;32069;32070;32071;32072;32073;32074;32075;32076;32077;32078;32079;32080;32081;32082;32083;32084;32085;32086 41128;41129;41130;41131;41132;41133;41134;41135;41136;41137;41138;41139;41140;41141;41142;41143;41144;41145;41146;41147;41148;41149;41150;41151;41152;41153;41154;41155;41156;41157;41158;41159;41160 41154 32 ARPTDYPTQEQQLHFIR Unmodified 2099.0548 0.054836123 4540 Q9Y259 CHKB Choline/ethanolamine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.684 59.684 3 2.8716E-05 58830 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.514 62.435 479650000 24120000 46000000 53426000 49591000 32321000 21097000 39240000 48170000 0 17079000 47403000 42429000 58770000 3541 4540 3300 32087;32088;32089;32090;32091;32092;32093;32094;32095;32096;32097;32098 41161;41162;41163;41164;41165;41166;41167;41168;41169;41170;41171;41172 41168 12 ARQEELYSELQAR Unmodified 1591.7954 0.79543354 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 3 3 2 2 2 3 2 2 2 1 3 2 2 52.641 52.641 2;3 6.9688E-23 50414 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.21 128.05 5443000000 398370000 531840000 506510000 90351000 166300000 166650000 462500000 732990000 1057700000 205330000 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3303 32134;32135 41210;41211 41210 2 ARVDHGAEIITQSPGR Unmodified 1705.886 0.88597988 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 2 25.837 25.837 3;4 0.019016 19792 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.365 16.2 107050000 0 0 0 0 0 0 0 107050000 0 0 0 0 0 3545 2009 3304 32136;32137 41212;41213 41213 2 ARYEAANWK Unmodified 1107.5461 0.54614213 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 1 1 20.231 20.231 3 0.04748 13424 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.153 45.46 53803000 0 0 0 0 0 0 0 53803000 0 0 0 0 0 3546 1091 3305 32138 41214 41214 0 ASAAFSSVGSVITK Unmodified 1323.7034 0.70343063 2667 P55327;H0YC42 TPD52 Tumor protein D52 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.735 71.735 2 0.00016653 71385 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.4 75.511 1487900000 111980000 145620000 105540000 145190000 0 109610000 145190000 127570000 107780000 65193000 106140000 109300000 208800000 3547 2667 3306 32139;32140;32141;32142;32143;32144;32145;32146;32147;32148;32149;32150 41215;41216;41217;41218;41219;41220;41221;41222;41223;41224;41225;41226 41226 7 ASAAPKPEPVPVQK Unmodified 1417.7929 0.79291434 3865 Q96HC4;H0YBI4;A0A0D9SFR4;H0Y929 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 19.173 19.173 2;3 0.0016781 11749 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.417 79.788 2751500000 275160000 346380000 410760000 396220000 58878000 90902000 61372000 69797000 454690000 0 348820000 238500000 0 3548 3865 3307 32151;32152;32153;32154;32155;32156;32157;32158;32159;32160;32161;32162;32163;32164;32165;32166;32167;32168 41227;41228;41229;41230;41231;41232;41233;41234;41235;41236;41237;41238;41239;41240;41241;41242;41243;41244 41242 18 ASAATTAILIAR Unmodified 1157.6768 0.67682195 1911 P07093 SERPINE2 Glia-derived nexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 62.218 62.218 2 0.0050825 61457 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.334 43.905 176570000 0 0 0 31220000 0 0 0 0 48097000 0 0 55560000 41689000 3549 1911 3308 32169;32170;32171;32172 41245;41246;41247;41248 41247 2 ASADLMSYCEEHAR Unmodified 1638.6766 0.67664031 4399 Q9UBI6 GNG12 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 47.153 47.153 3 0.0025582 44888 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.414 54.655 196580000 0 25743000 0 0 0 0 0 39118000 60521000 0 32365000 38831000 0 3550 4399 3309 32173;32174;32175;32176;32177 41249;41250;41251;41252;41253 41250 5 ASAELALGENSEVLK Unmodified 1529.7937 0.7937022 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 1 3 2 2 1 5 4 1 4 2 2 79.569 79.569 2 6.4675E-29 79162 QUIQUE_C1368_190116_001 161.99 127.27 3960000000 0 0 434810000 403900000 363700000 500090000 373660000 524080000 0 351950000 451530000 70321000 485920000 3551 1788 3310 32178;32179;32180;32181;32182;32183;32184;32185;32186;32187;32188;32189;32190;32191;32192;32193;32194;32195;32196;32197;32198;32199;32200;32201;32202;32203;32204;32205;32206;32207;32208;32209 41254;41255;41256;41257;41258;41259;41260;41261;41262;41263;41264;41265;41266;41267;41268;41269;41270;41271;41272;41273;41274;41275;41276;41277;41278;41279;41280;41281;41282;41283;41284;41285;41286;41287;41288;41289;41290;41291;41292;41293;41294;41295;41296;41297 41259 43 ASAELIEEEVAK Unmodified 1287.6558 0.65581174 2035 P12081;B4DDD8;E7ETE2;B4E1C5;D6RF05;A0A2R8YCI2;A0A2R8YFR1 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 68.047 68.047 2 0.001806 66924 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.04 70.027 158880000 0 0 0 0 0 0 0 105050000 0 53829000 0 0 0 3552 2035 3311 32210;32211 41298;41299 41298 1 ASAETVDPASLWEY Unmodified 1537.6937 0.69365381 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.43 146.43 2 3.7203E-12 150701 QUIQUE_C1403_190116_001 176.38 166.43 2063600000 246030000 206570000 142230000 189650000 188910000 148210000 166020000 197380000 179020000 0 195400000 0 204140000 3553 3187 3312 32212;32213;32214;32215;32216;32217;32218;32219;32220;32221;32222 41300;41301;41302;41303;41304;41305;41306;41307;41308;41309;41310 41303 4 ASAFALQEQPVVNAVIDDTTK Unmodified 2216.1325 0.13247732 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 136.09 136.09 3 0.017409 131931 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.576 20.931 98121000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98121000 0 0 0 3554 2404 3313 32223 41311 41311 1 ASAFNSWFENAEEDLTDPVR Unmodified 2297.0237 0.023655153 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 159.35 159.35 2;3 6.5146E-243 165405 QUIQUE_C1576_190116_001 335.07 314.49 10958000000 593270000 812610000 904510000 696290000 781390000 471220000 722550000 858250000 1195300000 209860000 1302700000 1191800000 1218600000 3555 267;275;3025 3314 32224;32225;32226;32227;32228;32229;32230;32231;32232;32233;32234;32235;32236;32237;32238;32239;32240;32241;32242;32243;32244;32245;32246;32247;32248 41312;41313;41314;41315;41316;41317;41318;41319;41320;41321;41322;41323;41324;41325;41326;41327;41328;41329;41330;41331;41332;41333;41334;41335;41336;41337;41338;41339;41340;41341;41342;41343;41344;41345;41346;41347;41348;41349;41350;41351;41352;41353;41354;41355;41356;41357;41358 41333 47 ASAGHAVSIAQDDAGADDWETDPDFVNDVSEK Unmodified 3331.4389 0.43890227 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 111.17 111.17 3 5.2397E-41 113572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.77 113.32 359930000 61645000 74127000 0 0 62929000 0 0 70308000 23972000 0 0 0 66944000 3556 3056 3315 32249;32250;32251;32252;32253;32254 41359;41360;41361;41362;41363;41364;41365;41366 41362 8 ASAGLLGAHAAAITAYALTLTK Unmodified 2084.163 0.16298959 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 137.01 137.01 2;3 4.4993E-24 141754 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.58 121.31 1103200000 24521000 66108000 28960000 36759000 120190000 0 87560000 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123.3 785810000 38789000 52986000 0 0 101380000 0 0 39549000 103000000 0 207390000 95042000 147660000 3559 2272 3318 32280;32281;32282;32283;32284;32285;32286;32287;32288 41399;41400;41401;41402;41403;41404;41405;41406;41407;41408 41405 9 ASAHAITGPPTELITSEVTAR Unmodified 2121.1066 0.10659692 2897 Q05707;J3QT83;Q4G0W3;H0YBB2 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 89.924 89.924 3 8.2433E-54 91001 QUIQUE_C1403_190116_001 134.29 117.6 725580000 122250000 160080000 0 169840000 163040000 0 110370000 0 0 0 0 0 0 3560 2897 3319 32289;32290;32291;32292;32293 41409;41410;41411;41412;41413;41414 41412 6 ASALEQFVNSVR Acetyl (Protein N-term) 1361.6939 0.69392858 4514 Q9UNS2;C9JLV5;J3QKR0;J3KTQ1;J3QL22;J3QS85 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.45 165.45 2 2.622E-93 169965 QUIQUE_DMIX3_190116_001 239.31 137.67 3042700000 307070000 211650000 236610000 243910000 264060000 215800000 231810000 255460000 230240000 86312000 238440000 266080000 255230000 3561 4514 3320 32294;32295;32296;32297;32298;32299;32300;32301;32302;32303;32304;32305;32306 41415;41416;41417;41418;41419;41420;41421;41422;41423;41424;41425;41426;41427;41428;41429 41424 13 ASALIDRPAPYFER Unmodified 1604.8311 0.83109076 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3KT37;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 3 69.254 69.254 2;3 1.9016E-23 66440 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.46 117.27 5016000000 592630000 417080000 363800000 286590000 324250000 368250000 377780000 404940000 390480000 199240000 429610000 324730000 536660000 3562 143;560;4559 3321 32307;32308;32309;32310;32311;32312;32313;32314;32315;32316;32317;32318;32319;32320;32321;32322;32323;32324;32325;32326;32327;32328;32329;32330;32331;32332 41430;41431;41432;41433;41434;41435;41436;41437;41438;41439;41440;41441;41442;41443;41444;41445;41446;41447;41448;41449;41450;41451;41452;41453;41454;41455;41456;41457;41458;41459;41460;41461;41462 41451 26 ASALQDMMR Unmodified 1021.4685 0.46848544 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 1 60.542 60.542 2 0.025354 59279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.35 43.911 35674000 0 0 0 17509000 0 0 0 18165000 0 0 0 0 0 3563 1534 3322 32333;32334 41463;41464 41464 2 ASALVFFSCR Unmodified 1156.5699 0.56991404 2116 P17050 NAGA Alpha-N-acetylgalactosaminidase yes yes 0 0 0 1 1 1 98.241 98.241 2 0.0076035 95897 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.928 58.152 60454000 0 0 0 0 0 0 0 0 24480000 11515000 0 24459000 0 3564 2116 3323 32335;32336;32337 41465;41466;41467;41468 41466 4 ASANMDLMR Oxidation (M) 1023.4477 0.44774999 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 1 0 1 21.277 21.277 2 0.046324 14466 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.775 34.992 44036000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44036000 0 0 3565 2282 3324 32338 41469 41469 1 ASANMDLMR Unmodified 1007.4528 0.45283537 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 40.291 40.291 2 0.048856 37429 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.059 34.504 135530000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 135530000 0 0 3566 2282 3324 32339 41470 41470 1 ASAPAAAAAAAAAAAAAAAALAAAAGGGR Unmodified 2205.1614 0.16142646 1571 O60346 PHLPP1 PH domain leucine-rich repeat-containing protein phosphatase 1 yes yes 0 0 0 1 169.01 169.01 3 4.323E-06 171844 QUIQUE_C1403_190116_001 53.998 46.3 14524000 0 0 0 14524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3567 1571 3325 32340 41471 41471 1 ASAPESGLLSK Unmodified 1058.5608 0.56078914 3821 Q96CN7 ISOC1 Isochorismatase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.25 35.25 2 0.00045796 30872 QUIQUE_C1438_190116_001 105.52 64.746 1206800000 125670000 125070000 94638000 114040000 123680000 73938000 107910000 81925000 109810000 0 128380000 121760000 0 3568 3821 3326 32341;32342;32343;32344;32345;32346;32347;32348;32349;32350;32351 41472;41473;41474;41475;41476;41477;41478;41479;41480;41481;41482 41476 11 ASAPLPGLSAPGR Unmodified 1192.6564 0.65642086 1433 O14558;A0A1X7SC65;K7EP04 HSPB6 Heat shock protein beta-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 61.208 61.208 2 0.0098246 60415 QUIQUE_C1368_190116_001 59.198 41.213 250070000 0 0 61406000 0 0 107280000 0 0 0 0 0 0 81384000 3569 1433 3327 32352;32353;32354;32355 41483;41484;41485;41486 41483 3 ASAPSPNAQVACDHCLK Unmodified 1824.8247 0.82470153 3059 Q14258;A0A3B3IUA7 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.44 29.44 3 0.00012351 23684 QUIQUE_C1277_190116_001 80.738 71.333 215490000 0 28967000 62749000 0 42257000 0 58521000 22999000 0 0 0 0 0 3570 3059 3328 32356;32357;32358;32359;32360 41487;41488;41489;41490;41491 41487 5 ASAQQENSSTCIGSAIK Unmodified 1750.8156 0.81557663 4329 Q9NXV6 CDKN2AIP CDKN2A-interacting protein yes yes 0 0 0 1 35.05 35.05 2 0.0046762 30366 QUIQUE_C1403_190116_001 55.105 31.729 24645000 0 0 0 24645000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3571 4329 3329 32361 41492 41492 1 ASASAPAPASATEILLTPAR Unmodified 1894.016 0.015991 4260 Q9NQX7;C9JG41 ITM2C Integral membrane protein 2C;CT-BRI3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.567 98.567 2 8.0005E-07 102416 QUIQUE_C1218_190116_001 98.943 90.214 144770000 29818000 29017000 27433000 33128000 0 25373000 0 0 0 0 0 0 0 3572 4260 3330 32362;32363;32364;32365;32366 41493;41494;41495;41496;41497 41493 4 ASASDGSSFVVAR Unmodified 1252.6048 0.60477922 4173 Q9H4G4;Q5VZR0;A0A087WUM5 GLIPR2 Golgi-associated plant pathogenesis-related protein 1 yes no 0 0 0 1 41.421 41.421 2 0.00045944 37975 QUIQUE_C1368_190116_001 106.4 78.001 81193000 0 0 81193000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3573 4173 3331 32367 41498;41499 41499 2 ASASGAMAK Acetyl (Protein N-term) 834.39055 0.39055269 4369 Q9P0L0;J3QKM9 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes no 1 0 0 1 1 1 22.026 22.026 1 0.0044999 15088 QUIQUE_C1403_190116_001 143.73 80.587 450840000 0 172700000 0 132660000 0 0 0 0 0 0 145480000 0 0 3574 4369 3332 32368;32369;32370 41500;41501;41502 41501 0 ASASGSGAQVGGPISSGSSASSVTVTR Unmodified 2364.1517 0.15170921 1819 P02545;A0A0C4DGC5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 2 55.871 55.871 2;3 8.7213E-126 54109 QUIQUE_C1277_190116_001 188.6 137.58 1423400000 130920000 137490000 147870000 191160000 217480000 110560000 43991000 44299000 54502000 87574000 76657000 55358000 125570000 3575 1819 3333 32371;32372;32373;32374;32375;32376;32377;32378;32379;32380;32381;32382;32383;32384;32385;32386;32387;32388;32389;32390;32391 41503;41504;41505;41506;41507;41508;41509;41510;41511;41512;41513;41514;41515;41516;41517;41518;41519;41520;41521;41522;41523;41524 41506 21 ASASTQPAALSAEQAK Acetyl (Protein N-term) 1571.7791 0.77911477 992 F5GXW5;U3KQ07;Q99622 C12orf57 Protein C10 yes no 1 0 0 1 57.689 57.689 2 0.015963 56961 QUIQUE_C1576_190116_001 42.446 17.592 26816000 0 0 0 0 0 0 26816000 0 0 0 0 0 0 3576 992 3334 32392 41525 41525 1 ASASYHISNLLEK Acetyl (Protein N-term) 1473.7464 0.74635808 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.526 94.526 2 1.3714E-31 97639 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.46 144.46 5266700000 720260000 0 601620000 569070000 0 496340000 0 545500000 606720000 276760000 728050000 722330000 0 3577 3499 3335 32393;32394;32395;32396;32397;32398;32399;32400;32401;32402;32403;32404 41526;41527;41528;41529;41530;41531;41532;41533;41534;41535;41536;41537;41538;41539;41540;41541 41539 16 ASATGMIIMDGVEVPEENVLPGASSLGGPFGCLNNAR Unmodified 3729.7801 0.78006611 3771 Q92947 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 160.71 160.71 3 0.010027 165495 QUIQUE_DMIX8_190116_001 25.063 10.132 23304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23304000 3578 3771 3336 32405 41542 41542 1 ASAVSPANLPAVLLQPR Acetyl (Protein N-term) 1744.9836 0.98356866 533 A6NEM2;P51610 HCFC1 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 156.27 156.27 3 3.1945E-07 160344 QUIQUE_C1277_190116_001 74.296 70.392 61019000 12447000 20427000 15659000 12486000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3579 533 3337 32406;32407;32408;32409;32410 41543;41544;41545;41546;41547;41548 41545 6 ASAYVFASPGCK Unmodified 1256.586 0.58595803 1761 O95861;A6NF51 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.651 51.651 2 0.0045896 48067 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.76 48.973 417330000 0 99696000 0 89879000 0 86160000 0 0 0 21366000 0 0 120230000 3580 1761 3338 32411;32412;32413;32414;32415 41549;41550;41551;41552;41553 41552 5 ASCLYGQLPK Unmodified 1135.5696 0.56957969 1957 P09211;A8MX94;A0A087X2E9 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.117 53.117 2 0.00024951 51427 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.4 82.103 37676000000 2842800000 3495300000 4182500000 0 3993500000 3536700000 3309700000 3475100000 4543400000 1251100000 3242900000 3802900000 0 3581 1957 3339 32416;32417;32418;32419;32420;32421;32422;32423;32424;32425;32426 41554;41555;41556;41557;41558;41559;41560;41561;41562;41563;41564;41565;41566;41567;41568;41569;41570;41571;41572;41573 41566 20 ASCQPQPLER Unmodified 1184.5608 0.56080592 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;A0A2R8YG95;E7ET92;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0;A0A2R8YG53 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 19.961 19.961 2 0.0015474 12919 QUIQUE_C1438_190116_001 96.331 78.296 247100000 0 0 0 0 77506000 77853000 91744000 0 0 0 0 0 0 3582 454 3340 32427;32428;32429 41574;41575;41576 41574 1 ASDCEPALNQAEGR Acetyl (Protein N-term) 1558.6682 0.66818411 697 C9J5H8 NCDN yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 63.414 63.414 2 4.1761E-06 59371 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.02 104.39 680710000 0 0 0 0 213350000 0 182440000 0 0 36419000 133750000 0 114740000 3583 697 3341 32430;32431;32432;32433;32434;32435 41577;41578;41579;41580;41581;41582 41580 6 ASDESVLSMHK Unmodified 1202.5601 0.56013721 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.269 27.269 2;3 0.016455 20969 QUIQUE_C1368_190116_001 35.523 1.4363 128690000 0 0 29622000 30945000 0 32750000 0 35378000 0 0 0 0 0 3584 2361 3342 32436;32437;32438;32439;32440 41583;41584;41585;41586;41587;41588 41585 6 ASDLAGSVDTGSAGSVK Unmodified 1520.7318 0.73183023 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 42.298 42.298 2 0.00056851 38753 QUIQUE_C1403_190116_001 74.537 37.473 39521000 0 0 0 25133000 0 0 14387000 0 0 0 0 0 0 3585 3718 3343 32441;32442 41589;41590 41589 2 ASDMLYFK Unmodified 973.4579 0.45790397 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 69.227 69.227 2 0.031896 69132 QUIQUE_C1277_190116_001 65.676 49.509 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41612;41613;41614;41615;41616;41617;41618;41619 41614 7 ASDYLVDLIAFLR Unmodified 1494.8082 0.80823006 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4;J3QT38 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 170.8 170.8 2;3 9.7295E-05 175234 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.4 109.71 67557000 0 0 0 0 16376000 0 0 17639000 14655000 0 0 0 18887000 3589 318 3347 32470;32471;32472;32473;32474;32475 41620;41621;41622;41623;41624;41625;41626 41624 6 ASEAASPLPDSPGDK Unmodified 1440.6733 0.67325272 3350 Q68CZ2 TNS3 Tensin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 37.455 37.455 2 3.6956E-09 32608 QUIQUE_DMIX8_190116_001 108.98 95.55 50698000 0 0 0 0 0 25428000 0 0 0 25270000 0 0 0 3590 3350 3348 32476;32477;32478;32479;32480 41627;41628;41629;41630;41631;41632 41632 6 ASEAGEVPFNHEILR Unmodified 1667.8267 0.82673367 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 66.14 66.14 2;3 2.9055E-18 66573 QUIQUE_C1438_190116_001 153.63 130.02 2145700000 73581000 295890000 96971000 274200000 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1 104.97 104.97 2 1.2807E-64 107535 QUIQUE_DMIX1_190116_001 245.58 214.16 925760000 0 0 0 0 0 0 0 165680000 117810000 0 280350000 181750000 180170000 3594 4212 3352 32502;32503;32504;32505;32506 41654;41655;41656;41657;41658;41659 41655 6 ASEGASSESLLSVPGQK Unmodified 1645.8159 0.81589421 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 67.476 67.476 2 0.00040719 66337 QUIQUE_C1563_190116_001 103.88 85.256 75835000 0 0 0 0 0 23272000 52562000 0 0 0 0 0 0 3595 3684 3353 32507;32508 41660;41661 41660 2 ASEGPAFFPGR Unmodified 1134.5458 0.54580778 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.638 65.638 2 0.0004904 62728 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.72 63.561 1485200000 181220000 201590000 0 144340000 171180000 141790000 0 0 117990000 78474000 249570000 199020000 0 3596 4284 3354 32509;32510;32511;32512;32513;32514;32515;32516;32517 41662;41663;41664;41665;41666;41667;41668;41669;41670;41671;41672;41673 41669 12 ASEGTNIPSPVVR Acetyl (Protein N-term) 1367.7045 0.70449327 4091 Q9C040;A0A0J9YX34;A0A0J9YW70;C9JVI3;A0A0J9YXY2 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 81.842 81.842 2 0.020764 82694 QUIQUE_C1403_190116_001 59.84 30.753 95603000 23284000 45234000 0 27085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3597 4091 3355 32518;32519;32520;32521 41674;41675;41676;41677 41676 3 ASEHAADIQMVNFDYHQMVK Unmodified 2333.0569 0.056886312 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2 89.701 89.701 3;4 1.5311E-06 92963 QUIQUE_C1218_190116_001 84.493 80.141 803130000 105080000 135520000 84449000 72579000 45851000 35353000 109180000 33261000 23152000 9073200 73152000 76484000 0 3598 723 3356 32522;32523;32524;32525;32526;32527;32528;32529;32530;32531;32532;32533;32534;32535;32536;32537;32538 41678;41679;41680;41681;41682;41683;41684;41685;41686;41687;41688;41689;41690;41691;41692;41693;41694;41695;41696;41697 41678 19 ASEKPLAAVTCTAPVNIAVIK Acetyl (Protein N-term) 2194.2031 0.20313984 2626 P53602;H3BP35;H3BRZ1;H3BVC4;H3BQ47 MVD Diphosphomevalonate decarboxylase yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.45 119.45 2 4.0477E-19 122306 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.79 142.33 391180000 25694000 0 28896000 24391000 47167000 27510000 55512000 30131000 34772000 0 41417000 32607000 43085000 3599 2626 3357 32539;32540;32541;32542;32543;32544;32545;32546;32547;32548;32549 41698;41699;41700;41701;41702;41703;41704;41705;41706;41707;41708 41704 11 ASELDKDTASTIILLASSEMTK Unmodified 2323.1829 0.18285791 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 1 1 145.92 145.92 3 0.01846 150512 QUIQUE_C1277_190116_001 33.187 25.29 26927000 0 26927000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3600 934 3358 32550 41709 41709 1 ASENAIVWK Unmodified 1016.5291 0.52909508 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;H7C4C3 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.871 45.871 2 0.00048535 42546 QUIQUE_C1563_190116_001 127.02 92.197 2288300000 226330000 219670000 222560000 204130000 164980000 146650000 219080000 0 178430000 68643000 233100000 200380000 204380000 3601 71 3359 32551;32552;32553;32554;32555;32556;32557;32558;32559;32560;32561;32562 41710;41711;41712;41713;41714;41715;41716;41717;41718;41719;41720;41721;41722 41715 9 ASENLRQEGVR Unmodified 1257.6426 0.64256171 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 14.056 14.056 3 0.062576 6068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.783 20.709 31703000 0 0 0 0 0 0 0 31703000 0 0 0 0 0 3602 2037 3360 32563 41723 41723 1 ASEPDKNPTAVEGLGSEPDNLVITWKPLNGFESNGPGLQYK Unmodified 4368.155 0.15501026 756 C9JYY6;Q92823;F8W775 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 2 1 140.77 140.77 4 0.0037555 143886 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.1 25.395 100860000 0 0 0 0 0 0 0 100860000 0 0 0 0 0 3603 756 3361 32564 41724 41724 1 ASEQIYGTPSSSPYECLR Unmodified 2043.9208 0.92076999 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.753 81.753 2 1.313E-53 83234 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.61 167.41 1015600000 0 0 202400000 147410000 179320000 149910000 0 0 157320000 0 0 0 179200000 3604 890;3052 3362 32565;32566;32567;32568;32569;32570 41725;41726;41727;41728;41729;41730 41729 6 ASEQVLSLVAQFQK Unmodified 1546.8355 0.83550744 1754 O95822 MLYCD Malonyl-CoA decarboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 124.38 124.38 2 0.00091471 128076 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.397 62.526 95822000 0 36199000 0 21735000 0 0 16930000 20959000 0 0 0 0 0 3605 1754 3363 32571;32572;32573;32574;32575;32576;32577;32578 41731;41732;41733;41734;41735;41736;41737;41738 41738 8 ASERAEMMELNDR 2 Oxidation (M) 1582.6716 0.67155493 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 2 1 2 1 1 15.681 15.681 2;3 0.0024709 8299 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.615 67.827 390640000 0 0 0 0 0 0 0 272810000 0 0 67078000 0 50750000 3606 389;395;1336 3364 32579;32580;32581;32582 41739;41740;41741;41742 41739 274;275 4 ASERAEMMELNDR Unmodified 1550.6817 0.68172569 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 1 37.85 37.85 3 0.0048317 34405 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.03 40.563 85321000 0 0 0 0 0 0 0 53957000 0 0 31363000 0 0 3607 389;395;1336 3364 32583;32584 41743;41744 41743 2 ASESSKPWPDATYGTGSASR Unmodified 2053.9341 0.93411186 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 46.026 46.026 3 8.5761E-05 43724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.001 60.72 185470000 0 0 0 0 0 0 0 51988000 51216000 0 0 33006000 49261000 3608 504 3365 32585;32586;32587;32588 41745;41746;41747;41748 41745 3 ASEVQLHLYGQHYR Unmodified 1699.8431 0.84305243 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 40.789 40.789 4 0.001964 38300 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.761 35.584 291510000 0 0 157300000 0 0 0 0 134210000 0 0 0 0 0 3609 4626 3366 32589;32590 41749;41750 41750 2 ASEWVQQVSGLMDGK Unmodified 1633.777 0.77700628 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 124.18 124.18 2 8.5524E-24 128983 QUIQUE_C1218_190116_001 184.55 154.78 648990000 286190000 0 0 0 0 0 0 284640000 0 78167000 0 0 0 3610 2533 3367 32591;32592;32593 41751;41752;41753 41751 3 ASEWVQQVSGLMDGK Oxidation (M) 1649.7719 0.7719209 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 1 1 88.093 88.093 2 0.00014096 89373 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.189 73.599 183180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72071000 48111000 62994000 3611 2533 3367 32594;32595;32596 41754;41755;41756;41757 41757 1974 4 ASFANEDGQVSPGSLLLAGAIAGMPAASLVTPADVIK Unmodified 3537.8389 0.83888484 4459 Q9UJS0 SLC25A13 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.23 170.23 3 1.039E-87 173238 QUIQUE_C1403_190116_001 140.54 137.19 524460000 49999000 33317000 0 71897000 30595000 37365000 0 0 64612000 6817000 82749000 56862000 90243000 3612 4459 3368 32597;32598;32599;32600;32601;32602;32603;32604;32605;32606 41758;41759;41760;41761;41762;41763;41764;41765;41766;41767;41768;41769 41760 12 ASFATPYGYAMETAK Unmodified 1606.7337 0.73374448 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.727 91.727 2 1.1005E-05 93920 QUIQUE_C1277_190116_001 101.56 73.351 501990000 38481000 64145000 0 57236000 50034000 40939000 32940000 43487000 81054000 0 0 47380000 46298000 3613 1741 3369 32607;32608;32609;32610;32611;32612;32613;32614;32615;32616 41770;41771;41772;41773;41774;41775;41776;41777;41778;41779;41780 41771 9 ASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMK Oxidation (M) 3331.5343 0.53432298 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 170.73 170.73 3 1.4031E-44 174582 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.28 123.99 625330000 0 0 0 0 0 0 58235000 0 60399000 0 260720000 245970000 0 3614 2051 3370 32617;32618;32619;32620 41781;41782;41783;41784 41784 1365 4 ASFEEASNQLINHIEQFLDTNETPYFMK Unmodified 3315.5394 0.53940836 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 172.27 172.27 3 9.7863E-127 176034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 191.18 178.83 680550000 0 0 0 0 0 0 117580000 0 58841000 0 237010000 267120000 0 3615 2051 3370 32621;32622;32623;32624 41785;41786;41787;41788 41788 4 ASFENNCEIGCFAK Unmodified 1645.6865 0.68647672 2681 P56537;B7ZBH1;F8WD20;A0A0B4J1Y7 EIF6 Eukaryotic translation initiation factor 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.098 74.098 2 3.3379E-10 71611 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.28 121.33 608370000 57939000 70191000 51567000 62251000 43905000 39848000 32146000 56840000 34841000 33156000 42172000 40954000 42557000 3616 2681 3371 32625;32626;32627;32628;32629;32630;32631;32632;32633;32634;32635;32636;32637 41789;41790;41791;41792;41793;41794;41795;41796;41797;41798;41799;41800;41801;41802 41799 13 ASFETLPNISDLCLR Unmodified 1734.8611 0.86107026 4112 Q9H019;C9JF50;E9PLU1;E9PRK5;E9PRW1;E9PSD6 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.78 136.78 2 0.00010218 141800 QUIQUE_C1368_190116_001 115.33 101.93 614620000 65844000 58418000 67225000 59486000 59144000 0 69835000 0 55216000 0 52372000 55970000 71111000 3617 4112 3372 32638;32639;32640;32641;32642;32643;32644;32645;32646;32647 41803;41804;41805;41806;41807;41808;41809;41810;41811;41812 41805 10 ASFHELYNMYK Unmodified 1401.6387 0.63872189 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 74.764 74.764 3 0.025955 74421 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.243 34.111 16497000 0 0 0 0 0 0 0 16497000 0 0 0 0 0 3618 153 3373 32648 41813 41813 1 ASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAK Unmodified 2805.4115 0.41149441 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 2 3 3 2 2 1 1 1 1 2 1 2 169.39 169.39 2;3 1.5314E-32 172837 QUIQUE_C1277_190116_001 121.3 104.64 1253500000 64562000 119920000 117710000 84399000 189050000 110730000 119730000 0 64845000 6510100 124580000 119590000 131820000 3619 1005;2027 3374 32649;32650;32651;32652;32653;32654;32655;32656;32657;32658;32659;32660;32661;32662;32663;32664;32665;32666;32667;32668;32669 41814;41815;41816;41817;41818;41819;41820;41821;41822;41823;41824;41825;41826;41827;41828;41829;41830;41831;41832;41833;41834;41835;41836;41837 41816 23 ASFITPVPGGVGPMTVAMLMQSTVESAK Oxidation (M) 2821.4064 0.40640904 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 1 0 1 1 1 1 165.96 165.96 3 2.6397E-15 167920 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.558 74.351 158530000 0 0 0 0 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0.44642809 2047;1242;2381 H9KV75;H7C5W8;H0YJW3;H0YJ11;P12814;P35609;F6THM6 ACTN1;ACTN2 Alpha-actinin-1;Alpha-actinin-2 no no 0 0 0 1 20.323 20.323 2 0.039539 13090 QUIQUE_C1277_190116_001 60.828 34.657 183520000 0 183520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3623 1242;2047;2381 3377 32690 41858 41858 1 ASFPQGPIGGANR Unmodified 1270.6418 0.64183343 109 A0A087X1K9;E5RGR0;O75608 LYPLA1 Acyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 52.001 52.001 2 0.0044235 50307 QUIQUE_C1218_190116_001 89.047 66.81 436340000 87132000 93472000 0 0 0 0 68289000 87625000 0 30568000 0 69252000 0 3624 109 3378 32691;32692;32693;32694;32695;32696 41859;41860;41861;41862;41863;41864;41865 41859 7 ASFSAVPVLANPAATSGCR Unmodified 1874.9309 0.93088116 3866 Q96HD9 ACY3 N-acyl-aromatic-L-amino acid amidohydrolase (carboxylate-forming) yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.414 95.414 2 4.1632E-22 97904 QUIQUE_C1277_190116_001 132.86 119.66 226450000 34265000 33254000 0 21232000 0 0 0 0 0 0 33501000 49741000 54461000 3625 3866 3379 32697;32698;32699;32700;32701;32702;32703 41866;41867;41868;41869;41870;41871;41872 41867 7 ASFSHDFTYLVSGSEDKYVYIWSTYHDLSK Unmodified 3544.6463 0.64631627 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 1 1 146.25 146.25 4 0.038725 150938 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.689 14.53 61283000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61283000 0 3626 3277 3380 32704 41873 41873 1 ASFTNSELHR Unmodified 1160.5574 0.5574351 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.928 21.928 3 0.0033132 15504 QUIQUE_C1218_190116_001 53.597 32.727 410500000 55880000 0 47907000 34432000 40610000 52205000 41096000 41631000 0 21286000 0 45282000 30175000 3627 4161 3381 32705;32706;32707;32708;32709;32710;32711;32712;32713;32714 41874;41875;41876;41877;41878;41879;41880;41881;41882;41883 41874 10 ASFVTEVLAHSGR Acetyl (Protein N-term) 1414.7205 0.72047768 1518 O43264;F5H3C1 ZW10 Centromere/kinetochore protein zw10 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.69 142.69 2 2.9706E-53 148621 QUIQUE_C1218_190116_001 202.56 182.26 507210000 44437000 47454000 31416000 42849000 40149000 43377000 38357000 32513000 0 21008000 69246000 50480000 45925000 3628 1518 3382 32715;32716;32717;32718;32719;32720;32721;32722;32723;32724;32725;32726 41884;41885;41886;41887;41888;41889;41890;41891;41892;41893;41894;41895;41896 41884 12 ASFWLGELQR Unmodified 1205.6193 0.61930707 4625 Q9Y5L0;C9J7E5 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 1 111.33 111.33 2 0.04206 113531 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.473 37.095 24784000 0 0 0 0 0 0 0 24784000 0 0 0 0 0 3629 4625 3383 32727 41897 41897 1 ASGADSKGDDLSTAILK Acetyl (Protein N-term) 1689.8421 0.84210896 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 1 0 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 81.475 81.475 2;3 7.6417E-122 82434 QUIQUE_DMIX1_190116_001 232.53 202.99 6579200000 214410000 388060000 346760000 274360000 512760000 173890000 418630000 834030000 799840000 71932000 851490000 794200000 898850000 3630 2658 3384 32728;32729;32730;32731;32732;32733;32734;32735;32736;32737;32738;32739;32740;32741;32742;32743;32744;32745;32746;32747 41898;41899;41900;41901;41902;41903;41904;41905;41906;41907;41908;41909;41910;41911;41912;41913;41914;41915;41916;41917;41918 41908 17 ASGAPAAADGFQNVFTGR Unmodified 1735.8278 0.8277963 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 97.073 97.073 2 0.0041598 101439 QUIQUE_C1438_190116_001 78.615 61.02 144280000 0 0 0 0 49468000 0 0 0 0 0 50284000 44527000 0 3631 4340 3385 32748;32749;32750 41919;41920;41921 41919 3 ASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQER Oxidation (M) 3579.725 0.72503688 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 1 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 169.79 169.79 3;4 9.6954E-58 174562 QUIQUE_C1368_190116_001 127.64 116.26 1383200000 106360000 117220000 280620000 0 93729000 119440000 309700000 0 248060000 0 56158000 51890000 0 3632 2132 3386 32751;32752;32753;32754;32755;32756;32757;32758;32759;32760;32761;32762;32763;32764;32765 41922;41923;41924;41925;41926;41927;41928;41929;41930;41931;41932;41933;41934;41935;41936 41926 1467 15 ASGATILSTLANLEGEETFEAAMLGQAEEVVQER Unmodified 3563.7301 0.73012225 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 2 3 2 174.13 174.13 3;4 2.5857E-65 181122 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.94 128.56 748200000 0 0 0 0 0 0 0 38941000 57769000 0 554000000 97491000 0 3633 2132 3386 32766;32767;32768;32769;32770;32771;32772;32773 41937;41938;41939;41940;41941;41942;41943;41944 41940 8 ASGEHSPGSGAAR Acetyl (Protein N-term) 1224.5483 0.54832698 4169 Q9H4A4;A6NKB8 RNPEP Aminopeptidase B yes no 1 0 0 1 11.182 11.182 2 0.0045684 3389 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.102 44.44 31387000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31387000 0 0 0 3634 4169 3387 32774 41945 41945 1 ASGELMTVAR Unmodified 1033.5226 0.5226295 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 37.179 37.179 2 0.00065106 32575 QUIQUE_C1277_190116_001 108.3 67.278 183400000 0 49195000 70129000 0 0 0 0 40052000 0 24021000 0 0 0 3635 438;2509 3388 32775;32776;32777;32778 41946;41947;41948;41949 41946 3 ASGELMTVAR Oxidation (M) 1049.5175 0.51754412 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 1 0 1 20.977 20.977 2 0.0059869 14326 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.816 44.859 71952000 0 0 0 0 0 0 0 0 71952000 0 0 0 0 3636 438;2509 3388 32779 41950 41950 314 1 ASGEMASAQYITAALR Unmodified 1638.8036 0.80355538 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.52 104.52 2 5.7832E-05 106617 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.36 112.47 689240000 77874000 85780000 79275000 91262000 0 90099000 59175000 93267000 76073000 36437000 0 0 0 3637 2642 3389 32780;32781;32782;32783;32784;32785;32786;32787;32788 41951;41952;41953;41954;41955;41956;41957;41958;41959;41960;41961 41959 10 ASGEMASAQYITAALR Oxidation (M) 1654.7985 0.79847001 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 1 0 1 87.639 87.639 2 0.013265 89634 QUIQUE_C1277_190116_001 50.222 33.197 71511000 0 71511000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3638 2642 3389 32789 41962 41962 2080 1 ASGGTSEFITGK Unmodified 1153.5615 0.56151742 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 34.075 34.075 2 0.00029247 29290 QUIQUE_C1438_190116_001 118.4 85.025 211540000 58971000 0 0 0 45039000 34602000 0 34384000 0 38545000 0 0 0 3639 1416 3390 32790;32791;32792;32793;32794;32795;32796;32797;32798;32799;32800;32801 41963;41964;41965;41966;41967;41968;41969;41970;41971;41972;41973;41974 41966 10 ASGIYYVPK Unmodified 996.52803 0.52803245 3466 Q7Z5R6;C9J164;C9K0J5;Q70E73 APBB1IP;RAPH1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1-interacting protein;Ras-associated and pleckstrin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 45.162 45.162 2 0.060793 42360 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.749 22.758 39396000 0 0 0 0 0 0 0 0 39396000 0 0 0 0 3640 3466 3391 32802 41975 41975 1 ASGLEIALDLHGMIK Oxidation (M) 1582.8389 0.83887826 4733 yes yes 0 1 0 1 1 1 68.931 68.931 2 0.007659 68708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.404 15.908 146710000 0 36034000 0 0 0 0 0 49524000 61152000 0 0 0 0 + 3641 4733 3392 32803;32804;32805 41976;41977;41978 41977 3095 2 ASGPGLNASGIPASLPVEFTIDAR Unmodified 2339.2121 0.21212463 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 2 143 143 2;3 2.1088E-35 147607 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.83 109.73 39070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39070000 0 0 0 3642 3061 3393 32806;32807;32808 41979;41980;41981 41979 3 ASGPGLNTTGVPASLPVEFTIDAK Unmodified 2341.2165 0.2165413 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 135.2 135.2 2;3 8.1598E-31 141701 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.05 155.21 974120000 0 69977000 61688000 86840000 157180000 36409000 51678000 147820000 74027000 34493000 100130000 99447000 54430000 3643 2178 3394 32809;32810;32811;32812;32813;32814;32815;32816;32817;32818;32819;32820;32821;32822;32823 41982;41983;41984;41985;41986;41987;41988;41989;41990;41991;41992;41993;41994;41995;41996;41997;41998;41999 41997 18 ASGPIDHYR Unmodified 1014.4883 0.4882929 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 16.048 16.048 2 0.0066803 8201 QUIQUE_DMIX4_190116_001 139.97 107.36 69910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69910000 0 0 0 3644 3753 3395 32824 42000 42000 0 ASGQAFELILSPR Unmodified 1387.746 0.74596415 2115 P16949;A2A2D0 STMN1 Stathmin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 109.28 109.28 2;3 6.7271E-24 112995 QUIQUE_C1368_190116_001 143.98 129.41 12156000000 1164300000 1512400000 965470000 873700000 1174300000 640010000 1010300000 541420000 809620000 342820000 1190200000 929210000 1002100000 3645 2115 3396 32825;32826;32827;32828;32829;32830;32831;32832;32833;32834;32835;32836;32837;32838;32839;32840;32841;32842;32843;32844;32845;32846;32847;32848;32849;32850;32851 42001;42002;42003;42004;42005;42006;42007;42008;42009;42010;42011;42012;42013;42014;42015;42016;42017;42018;42019;42020;42021;42022;42023;42024;42025;42026;42027;42028;42029;42030;42031;42032;42033;42034;42035;42036;42037;42038;42039;42040;42041;42042;42043;42044;42045;42046;42047;42048;42049;42050;42051;42052;42053;42054 42010 54 ASGTNDKPGGPHYILR Unmodified 1681.8536 0.85361712 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 3 3 3 2 3 3 3 3 3 2 3 21.044 21.044 2;3;4 3.1321E-79 14262 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.59 187.73 11508000000 393360000 522400000 1654800000 1144300000 901950000 598590000 1095200000 788950000 835770000 246850000 1548600000 567050000 1210300000 3646 2295 3397 32852;32853;32854;32855;32856;32857;32858;32859;32860;32861;32862;32863;32864;32865;32866;32867;32868;32869;32870;32871;32872;32873;32874;32875;32876;32877;32878;32879;32880;32881;32882;32883;32884;32885;32886 42055;42056;42057;42058;42059;42060;42061;42062;42063;42064;42065;42066;42067;42068;42069;42070;42071;42072;42073;42074;42075;42076;42077;42078;42079;42080;42081;42082;42083;42084;42085;42086;42087;42088;42089;42090;42091;42092 42081 29 ASGTTTTAVK Acetyl (Protein N-term) 977.50294 0.50293991 2966 Q13126;J3QSB7;F2Z2F3;F8WES2 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 1 0 0 1 1 21.369 21.369 1;2 0.00094453 14659 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.71 60.184 38477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38477000 0 3647 2966 3398 32887;32888 42093;42094 42094 2 ASGVAVSDGVIK Acetyl (Protein N-term) 1143.6136 0.61355299 2220 P23528;E9PP50;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 1 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 80.001 80.001 2 4.172E-05 82520 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.82 98.022 41169000000 4778900000 4713700000 0 0 0 0 3794300000 5006000000 5331900000 2439800000 5267400000 4779700000 5057800000 3648 2220 3399 32889;32890;32891;32892;32893;32894;32895;32896;32897;32898;32899;32900;32901;32902;32903;32904;32905 42095;42096;42097;42098;42099;42100;42101;42102;42103;42104;42105;42106;42107;42108;42109;42110;42111;42112;42113;42114;42115;42116;42117;42118;42119;42120;42121;42122;42123;42124;42125 42113 30 ASGVCIDSEFFLTTASGVSVLPQNR Unmodified 2654.301 0.30101599 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 4 6 12 4 3 176.14 176.14 3 0.00048241 181091 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.454 35.502 395710000 14200000 3892100 12537000 0 8483700 0 0 28044000 70007000 0 168200000 71434000 18911000 3649 2941 3400 32906;32907;32908;32909;32910;32911;32912;32913;32914;32915;32916;32917;32918;32919;32920;32921;32922;32923;32924;32925;32926;32927;32928;32929;32930;32931;32932;32933;32934;32935;32936;32937;32938;32939;32940;32941 42126;42127;42128;42129;42130;42131;42132;42133;42134;42135;42136;42137;42138;42139;42140;42141;42142;42143;42144;42145;42146;42147;42148;42149;42150;42151;42152;42153;42154;42155;42156;42157;42158;42159;42160;42161;42162 42139 31 ASGVEGADVVK Unmodified 1030.5295 0.52948901 2146 P19367;B1AR63 HK1 Hexokinase-1;Hexokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.614 23.614 2 0.000179 17671 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.97 82.2 17324000000 1857800000 1640300000 1495400000 1544100000 1195600000 1183800000 1535900000 1123200000 1063200000 661960000 1454000000 1321300000 1247800000 3650 2146 3401 32942;32943;32944;32945;32946;32947;32948;32949;32950;32951;32952;32953;32954 42163;42164;42165;42166;42167;42168;42169;42170;42171;42172;42173;42174;42175;42176;42177;42178 42173 11 ASGVQVADEVCR Acetyl (Protein N-term) 1331.614 0.6139637 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 77.18 77.18 2 3.0349E-20 78676 QUIQUE_C1218_190116_001 169.37 149.59 6828200000 541850000 580030000 585170000 0 522040000 0 634160000 780440000 682280000 356320000 648900000 617790000 879180000 3651 2702 3402 32955;32956;32957;32958;32959;32960;32961;32962;32963;32964;32965;32966;32967;32968;32969;32970 42179;42180;42181;42182;42183;42184;42185;42186;42187;42188;42189;42190;42191;42192;42193;42194;42195;42196;42197;42198;42199;42200;42201;42202;42203;42204;42205;42206 42180 28 ASGVTVNDEVIK Acetyl (Protein N-term) 1272.6561 0.65614609 4546 Q9Y281;F8WDN3;G3V2U0 CFL2 Cofilin-2 yes no 1 0 0 1 1 81.783 81.783 2 0.00037555 84022 QUIQUE_C1576_190116_001 88.681 42.522 359770000 0 0 0 0 0 0 158460000 0 0 0 201310000 0 0 3652 4546 3403 32971;32972 42207;42208 42207 2 ASGYFTRPWQWEK Unmodified 1654.7892 0.78922595 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 2 86.949 86.949 2;3 6.1407E-07 88523 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.24 92.239 1654500000 44306000 146800000 73672000 67139000 118280000 51376000 128860000 242450000 241300000 0 169360000 115230000 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2256.1936 0.19363779 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 1 139.37 139.37 3 0.0072366 142254 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.249 21.43 66718000 0 0 0 0 0 0 0 66718000 0 0 0 0 0 3660 2179 3411 33046 42301 42301 1 ASIHEAWTDGK Unmodified 1213.5728 0.57275081 1544;2047;1242 H9KV75;O43707;P12814 ACTN1;ACTN4 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 1 1 27.231 27.231 2;3 1.4811E-13 21520 QUIQUE_DMIX7_190116_001 167.69 118.34 5210300000 474200000 561780000 558100000 404990000 626510000 283050000 645980000 231190000 243590000 214340000 583990000 172230000 210320000 3661 1242;1544;2047 3412 33047;33048;33049;33050;33051;33052;33053;33054;33055;33056;33057;33058;33059;33060;33061;33062;33063;33064;33065;33066;33067;33068 42302;42303;42304;42305;42306;42307;42308;42309;42310;42311;42312;42313;42314;42315;42316;42317;42318;42319;42320;42321;42322;42323;42324;42325;42326;42327;42328;42329;42330;42331 42329 28 ASILDEYENSLSR Acetyl (Protein N-term) 1537.726 0.72601657 4378 Q9P253;H0YMC9;H0YLM6 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.15 155.15 2 0.0002069 159883 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.229 46.929 365860000 28879000 26714000 35078000 31459000 45039000 35679000 31453000 28684000 29058000 11457000 31518000 0 30845000 3662 4378 3413 33069;33070;33071;33072;33073;33074;33075;33076;33077;33078;33079;33080 42332;42333;42334;42335;42336;42337;42338;42339;42340;42341;42342;42343;42344 42341 13 ASILNTWISLK Unmodified 1244.7129 0.71287311 2195 P22234;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 129.76 129.76 2 1.4578E-05 135847 QUIQUE_C1438_190116_001 142.43 125.04 3875100000 298860000 257470000 281290000 209550000 265670000 276070000 269230000 368310000 402210000 151170000 450450000 312990000 331800000 3663 2195 3414 33081;33082;33083;33084;33085;33086;33087;33088;33089;33090;33091;33092;33093;33094 42345;42346;42347;42348;42349;42350;42351;42352;42353;42354;42355;42356;42357;42358;42359;42360;42361;42362;42363;42364;42365;42366;42367;42368;42369;42370;42371;42372;42373;42374;42375 42355 31 ASILWLIGENCER Unmodified 1559.7766 0.77661235 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 134.05 134.05 2 0.0012514 140432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.017 70.645 113390000 0 0 0 0 0 0 0 27285000 43665000 13606000 28834000 0 0 3664 1386 3415 33095;33096;33097;33098;33099 42376;42377;42378;42379;42380 42380 5 ASILWLIGEYCEHVPR Unmodified 1941.9771 0.97710307 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.42 144.42 3 1.0464E-06 148836 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.966 75.035 655740000 27406000 52986000 40641000 25497000 43450000 38115000 56702000 58005000 64317000 0 82813000 111230000 54575000 3665 2990 3416 33100;33101;33102;33103;33104;33105;33106;33107;33108;33109;33110;33111 42381;42382;42383;42384;42385;42386;42387;42388;42389;42390;42391;42392;42393;42394;42395;42396;42397;42398;42399;42400 42397 18 ASIPFSVVGSNQLIEAK Unmodified 1758.9516 0.95159983 640;3097 B5MCX3;H7C2Y0;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 117.42 117.42 2;3 4.3948E-32 120179 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.47 108.21 26309000000 1390000000 1647700000 1981900000 1557300000 1978700000 1580700000 1697200000 2417400000 2702600000 603920000 3428700000 2216200000 3106100000 3666 640;3097 3417 33112;33113;33114;33115;33116;33117;33118;33119;33120;33121;33122;33123;33124;33125;33126;33127;33128;33129;33130;33131;33132;33133;33134;33135 42401;42402;42403;42404;42405;42406;42407;42408;42409;42410;42411;42412;42413;42414;42415;42416;42417;42418;42419;42420;42421;42422;42423;42424;42425;42426;42427;42428;42429;42430;42431;42432;42433;42434;42435;42436;42437;42438 42425 35 ASITALEAK Unmodified 902.5073 0.50729701 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 33.839 33.839 2 0.060033 28910 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.96 10.148 242260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 242260000 0 3667 2378 3418 33136 42439 42439 1 ASITPGTILIILTGR Unmodified 1524.9239 0.92392852 2878 Q02878;F8VR69;F8VZ45;U3KQR5 RPL6 60S ribosomal protein L6 yes no 0 0 0 1 1 162.85 162.85 2 0.0013607 166359 QUIQUE_C1403_190116_001 73.848 33.259 24271000 0 0 14578000 9693800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3668 2878 3419 33137;33138 42440;42441 42441 2 ASIVDDIHSTFDELQK Unmodified 1816.8843 0.88430813 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.06 132.06 3 1.3919E-07 137949 QUIQUE_C1218_190116_001 100.43 83.547 1926700000 167540000 186670000 0 158570000 126550000 354720000 0 166680000 212220000 111590000 198870000 0 243280000 3669 4091 3420 33139;33140;33141;33142;33143;33144;33145;33146;33147;33148 42442;42443;42444;42445;42446;42447;42448;42449;42450;42451;42452;42453 42442 8 ASIWVGHR Acetyl (Protein N-term) 966.50355 0.50354903 2045 P12429;D6RFG5;D6RCA8;D6RAZ8 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 65.82 65.82 2 0.013482 64680 QUIQUE_C1563_190116_001 94.662 56.424 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3670 2045 3421 33149;33150;33151;33152;33153 42454;42455;42456;42457;42458 42455 5 ASLAAVHLFTAK Unmodified 1227.6976 0.69755739 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.414 66.414 2 0.0034978 68803 QUIQUE_C1218_190116_001 79.659 56.23 55508000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25466000 0 30042000 3671 4449 3422 33154;33155;33156;33157;33158;33159;33160 42459;42460;42461;42462;42463;42464;42465 42459 6 ASLAETDKITLEVAK Unmodified 1587.872 0.87195252 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 2 3 1 3 2 2 1 2 3 2 2 2 2 68.289 68.289 2;3 3.6171E-06 69839 QUIQUE_C1218_190116_001 120.87 99.873 1812100000 206630000 255370000 59656000 177640000 61883000 160390000 59409000 0 219050000 112730000 212850000 227080000 59433000 3672 2414 3423 33161;33162;33163;33164;33165;33166;33167;33168;33169;33170;33171;33172;33173;33174;33175;33176;33177;33178;33179;33180;33181;33182;33183;33184;33185;33186;33187 42466;42467;42468;42469;42470;42471;42472;42473;42474;42475;42476;42477;42478;42479;42480;42481;42482;42483;42484;42485;42486;42487;42488;42489;42490;42491;42492;42493;42494;42495;42496;42497 42469 30 ASLASLPPLHVAK Unmodified 1302.766 0.76597131 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.071 65.071 3 0.00057543 64977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.157 32.748 1620500000 222620000 198890000 181430000 0 158930000 0 157340000 185580000 176250000 0 0 144740000 194750000 3673 890;3052 3424 33188;33189;33190;33191;33192;33193;33194;33195;33196 42498;42499;42500;42501;42502;42503;42504;42505;42506;42507;42508;42509;42510;42511;42512 42509 15 ASLDRPFTNLESAFYSIVGLSSLGAQVPDAK Unmodified 3252.6667 0.66665778 1869 P04844;Q5JYR7 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 169.97 169.97 3 1.7767E-87 174351 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.32 150.42 650070000 0 0 0 0 34581000 0 0 35334000 220070000 0 257880000 102210000 0 3674 1869 3425 33197;33198;33199;33200;33201 42513;42514;42515;42516;42517 42515 5 ASLEAAIADAEQR Unmodified 1343.6681 0.66810776 772 CON__P05787;P05787;CON__H-INV:HIT000292931 KRT8 Keratin, type II cytoskeletal 8 yes no 0 0 0 2 1 89.688 89.688 2;3 0.027222 92581 QUIQUE_C1218_190116_001 53.569 23.825 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 3675 772 3426 33202;33203;33204 42518;42519;42520 42519 3 ASLENSLEETK Unmodified 1219.5932 0.59321148 763;774;789 CON__P02533;P02533;CON__P08779;P08779;K7ENW6;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8 KRT14;KRT16 Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.456 45.456 2 9.2584E-05 40027 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.23 92.959 71309000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71309000 0 0 0 + 3676 763;774;789 3427 33205;33206;33207;33208;33209;33210 42521;42522;42523;42524;42525;42526 42524 6 ASLENSLEETKGR Unmodified 1432.7158 0.71578623 763;774;789 CON__P02533;P02533;CON__P08779;P08779;K7ENW6;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8 KRT14;KRT16 Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16 no no 0 0 1 1 33.341 33.341 3 0.04457 28412 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.604 22.998 29034000 0 0 0 0 0 0 0 29034000 0 0 0 0 0 + 3677 763;774;789 3428 33211 42527 42527 1 ASLESWWQNPVPGLR Unmodified 1738.8791 0.87910359 4655 Q9Y6K5;F8VWK9;F8VS35 OAS3 2'-5'-oligoadenylate synthase 3 yes no 0 0 0 1 1 140.36 140.36 2 1.604E-05 147565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.442 79.779 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3678 4655 3429 33212;33213 42528;42529 42529 2 ASLGLADHR Unmodified 938.49338 0.49337828 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.059 19.059 2 0.0078478 11577 QUIQUE_C1563_190116_001 80.438 42.88 704820000 103330000 0 0 102730000 72498000 75034000 0 0 94062000 0 68094000 105980000 83094000 3679 4551 3430 33214;33215;33216;33217;33218;33219;33220;33221 42530;42531;42532;42533;42534;42535;42536;42537;42538;42539;42540 42534 11 ASLHALVGSPIIWGGEPR Unmodified 1859.0054 0.0053667345 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 106.72 106.72 2;3 2.7316E-13 111255 QUIQUE_C1218_190116_001 152.99 121.76 2687400000 234440000 140920000 286500000 194430000 277700000 240020000 194280000 396520000 178110000 125860000 202510000 99336000 116750000 3680 98;3487 3431 33222;33223;33224;33225;33226;33227;33228;33229;33230;33231;33232;33233;33234;33235;33236;33237;33238;33239;33240;33241;33242;33243;33244;33245;33246;33247;33248;33249 42541;42542;42543;42544;42545;42546;42547;42548;42549;42550;42551;42552;42553;42554;42555;42556;42557;42558;42559;42560;42561;42562;42563;42564;42565;42566;42567;42568;42569;42570;42571;42572;42573;42574;42575 42541 34 ASLHGGEPTTIIR Unmodified 1350.7256 0.72556306 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 32.113 32.113 2;3 5.1879E-06 27250 QUIQUE_C1218_190116_001 126.03 94.265 1163700000 122890000 0 0 0 267650000 0 0 40549000 170540000 13228000 294680000 111910000 142250000 3681 2075 3432 33250;33251;33252;33253;33254;33255;33256;33257;33258;33259 42576;42577;42578;42579;42580;42581;42582;42583;42584;42585;42586;42587 42577 8 ASLINNAFQLVSIGK Unmodified 1573.8828 0.88279198 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 140.34 140.34 2 0.0015102 144691 QUIQUE_C1277_190116_001 88.021 64.701 532600000 0 56884000 111220000 135880000 78858000 50455000 0 0 0 18725000 0 0 80584000 3682 4336 3433 33260;33261;33262;33263;33264;33265;33266 42588;42589;42590;42591;42592;42593;42594 42588 7 ASLLHSMPTHSSPR Oxidation (M) 1535.7515 0.75146023 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 1 0 1 14.067 14.067 4 0.015118 6334 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.751 29.138 21676000 0 0 0 0 0 0 0 21676000 0 0 0 0 0 3683 310;830 3434 33267 42595 42595 1 ASLLHSMPTHSSPR Unmodified 1519.7565 0.75654561 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 23.182 23.182 4 0.049734 16677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.524 1.4244 28021000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28021000 0 0 3684 310;830 3434 33268 42596 42596 1 ASLLQNESTNEQLQIHYK Unmodified 2115.0596 0.059646729 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 75.143 75.143 3 1.2207E-22 75398 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.63 112.31 724900000 68176000 0 42228000 78176000 96507000 0 71691000 0 104960000 76712000 0 86012000 100440000 3685 824 3435 33269;33270;33271;33272;33273;33274;33275;33276;33277;33278;33279;33280;33281;33282 42597;42598;42599;42600;42601;42602;42603;42604;42605;42606;42607;42608;42609;42610;42611;42612 42604 16 ASLLQSDR Acetyl (Protein N-term) 930.47706 0.47705951 4461 Q9UJW0;E5RI97 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 1 0 0 1 1 1 1 78.351 78.351 2 0.0017818 79022 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.41 59.857 188610000 23392000 0 0 0 0 0 84420000 0 0 0 42967000 0 37828000 3686 4461 3436 33283;33284;33285;33286 42613;42614;42615;42616;42617 42617 5 ASLMNDDFEK Unmodified 1168.507 0.50703901 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22;B0QYG7;B0QYG8 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 57.391 57.391 2 0.012394 56091 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.263 68.799 168430000 0 0 64640000 59794000 0 0 0 0 0 0 0 0 44001000 3687 4510 3437 33287;33288;33289 42618;42619;42620 42620 0 ASLNGADIYSGCCTLK Unmodified 1728.7811 0.78110538 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4;M0R1W6;B4DVF8 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.842 74.842 2 1.7934E-05 75265 QUIQUE_C1277_190116_001 120.14 94.093 831290000 0 118630000 0 0 82204000 79316000 104520000 66418000 64678000 45682000 96074000 89453000 84311000 3688 2082 3438 33290;33291;33292;33293;33294;33295;33296;33297;33298;33299;33300;33301 42621;42622;42623;42624;42625;42626;42627;42628;42629;42630;42631;42632;42633 42622 13 ASLPTGEGSISHEEQK Unmodified 1668.7955 0.79549312 1308 J3QTA6;Q9BRQ6;H0Y922;J3QTB2 CHCHD6 MICOS complex subunit MIC25 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 29.144 29.144 2;3 5.5071E-07 23142 QUIQUE_C1277_190116_001 138.89 117.9 1605100000 196240000 162040000 139040000 132130000 151320000 21086000 99324000 82688000 132570000 33934000 170240000 143760000 140750000 3689 1308 3439 33302;33303;33304;33305;33306;33307;33308;33309;33310;33311;33312;33313;33314;33315;33316;33317;33318;33319;33320;33321;33322;33323;33324 42634;42635;42636;42637;42638;42639;42640;42641;42642;42643;42644;42645;42646;42647;42648;42649;42650;42651;42652;42653;42654;42655;42656;42657;42658;42659;42660;42661 42637 26 ASLPTLGFTHFQPAQLTTVGK Unmodified 2213.1845 0.18445331 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A0A6YY92;A0A096LNY6;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY5 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 120.89 120.89 3 1.5448E-08 124983 QUIQUE_C1277_190116_001 82.975 69.549 468270000 0 47733000 37718000 52501000 45469000 0 39575000 53479000 56945000 18157000 0 48117000 68578000 3690 338 3440 33325;33326;33327;33328;33329;33330;33331;33332;33333;33334;33335;33336 42662;42663;42664;42665;42666;42667;42668;42669;42670;42671;42672;42673;42674 42664 11 ASLQVQLDAVNKR Unmodified 1440.8049 0.80487601 4091 Q9C040;A0A0J9YX34;C9J084 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.8 49.8 3 0.0004662 47838 QUIQUE_C1277_190116_001 77.527 49.863 862290000 82731000 89059000 71723000 0 137480000 0 90120000 51679000 79912000 0 78937000 85831000 94821000 3691 4091 3441 33337;33338;33339;33340;33341;33342;33343;33344;33345;33346 42675;42676;42677;42678;42679;42680;42681;42682;42683;42684;42685 42676 11 ASLSGLASALESYR Acetyl (Protein N-term) 1465.7413 0.7412727 3864 Q96HA9 PEX11G Peroxisomal membrane protein 11C yes yes 1 0 0 1 165.03 165.03 2 3.6349E-07 170317 QUIQUE_C1368_190116_001 124.42 93.001 14931000 0 0 14931000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3692 3864 3442 33347 42686 42686 1 ASLSLAPVNIFK Acetyl (Protein N-term) 1300.7391 0.73908786 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 158.12 158.12 2 1.5309E-07 164252 QUIQUE_C1576_190116_001 146.23 123.99 6828200000 509990000 540950000 613940000 518440000 608630000 523160000 576980000 523680000 511220000 226120000 554970000 541270000 578900000 3693 2810 3443 33348;33349;33350;33351;33352;33353;33354;33355;33356;33357;33358;33359;33360;33361;33362;33363 42687;42688;42689;42690;42691;42692;42693;42694;42695;42696;42697;42698;42699;42700;42701;42702;42703;42704;42705;42706;42707 42697 21 ASLSLSHAR Unmodified 940.50903 0.50902834 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 15.592 15.592 2 0.0066803 7639 QUIQUE_DMIX4_190116_001 139.97 90.912 94471000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94471000 0 0 0 3694 1140;3457 3444 33364 42708 42708 0 ASLSPVIYDSLTGLMTSLVAVELEK Unmodified 2635.403 0.40302144 164 A0A0A0MS45;J3KNI1;Q9H9E3 COG4 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 177.07 177.07 3 3.8142E-05 184028 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.25 45.283 14894000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14894000 0 0 3695 164 3445 33365 42709;42710 42709 2 ASLTLFCPEEGDWK Unmodified 1651.7552 0.75520821 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.76 119.76 2 1.2134E-07 125361 QUIQUE_C1218_190116_001 129.82 110.58 7372400000 501370000 669620000 681080000 0 604440000 0 872720000 564070000 670600000 256330000 865310000 814910000 871920000 3696 2483 3446 33366;33367;33368;33369;33370;33371;33372;33373;33374;33375;33376 42711;42712;42713;42714;42715;42716;42717;42718;42719;42720;42721;42722 42711 12 ASLTLTLLR Unmodified 986.61243 0.61243078 4500 Q9UMF0;K7EIL3 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.25 95.25 2 1.2836E-06 97586 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.88 120.63 865110000 74818000 89395000 61091000 40690000 83860000 65738000 78363000 57746000 49617000 23254000 91891000 96121000 52528000 3697 4500 3447 33377;33378;33379;33380;33381;33382;33383;33384;33385;33386;33387;33388;33389 42723;42724;42725;42726;42727;42728;42729;42730;42731;42732;42733;42734;42735;42736;42737;42738;42739;42740;42741 42740 19 ASLYHEFPGLDK Unmodified 1375.6772 0.67721588 3562 Q8IZD9 DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 3 yes yes 0 0 0 1 72.057 72.057 3 0.024503 72113 QUIQUE_C1277_190116_001 31.526 21.738 17114000 0 17114000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3698 3562 3448 33390 42742 42742 1 ASLYNAVTIEDVQK Unmodified 1549.7988 0.79878758 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 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79826000 60879000 77528000 37683000 59812000 20187000 114560000 55599000 80488000 3700 3780 3450 33419;33420;33421;33422;33423;33424;33425;33426;33427;33428;33429;33430;33431;33432;33433 42781;42782;42783;42784;42785;42786;42787;42788;42789;42790;42791;42792;42793;42794;42795;42796;42797;42798;42799;42800;42801 42784 21 ASMAAAIAASR Acetyl (Protein N-term) 1060.5335 0.53352853 4163 Q9H425 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes yes 1 0 0 1 1 1 105.31 105.31 2 0.0022733 108108 QUIQUE_C1403_190116_001 74.533 48.091 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3701 4163 3451 33434;33435;33436 42802;42803;42804 42802 3 ASMGTLAFDEYGRPFLIIK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2186.1082 0.10817683 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.6 150.6 2 7.1699E-46 157134 QUIQUE_C1438_190116_001 166.48 152.89 1470500000 105740000 147760000 120660000 104290000 130090000 0 127680000 113680000 144570000 43239000 148020000 133970000 150770000 3702 2514 3452 33437;33438;33439;33440;33441;33442;33443;33444;33445;33446;33447;33448;33449 42805;42806;42807;42808;42809;42810;42811;42812;42813;42814;42815;42816;42817 42809 1939 13 ASMGTLAFDEYGRPFLIIK Acetyl (Protein N-term) 2170.1133 0.1132622 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 2 162.32 162.32 2;3 1.9588E-115 169402 QUIQUE_DMIX5_190116_001 251.68 231.01 4235900000 326770000 451980000 436780000 281680000 268240000 140190000 396240000 286190000 0 42967000 729970000 385010000 489860000 3703 2514 3452 33450;33451;33452;33453;33454;33455;33456;33457;33458;33459;33460;33461;33462;33463;33464;33465;33466;33467;33468 42818;42819;42820;42821;42822;42823;42824;42825;42826;42827;42828;42829;42830;42831;42832;42833;42834;42835;42836;42837;42838 42834 20 ASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2700.3218 0.32175143 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 1 2 1 136.55 136.55 3 7.9939E-08 139623 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.112 63.371 50609000 0 0 0 0 0 0 0 50609000 0 0 0 0 0 3704 2514 3453 33469 42839 42839 1939 1 ASMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDR Acetyl (Protein N-term) 2684.3268 0.32683681 2514 P48643;E7ENZ3;D6RIZ7 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 1 0 2 1 149.82 149.82 3 6.3536E-23 152727 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.02 114.6 74761000 0 0 0 0 0 0 0 74761000 0 0 0 0 0 3705 2514 3453 33470 42840 42840 1 ASMHPVTAMLVGK Unmodified 1340.6945 0.69446263 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 1 55.995 55.995 2;3 0.0001487 55226 QUIQUE_C1218_190116_001 72.327 59.142 591360000 122050000 138050000 34484000 126670000 0 90002000 0 0 0 30322000 49778000 0 0 3706 1977 3454 33471;33472;33473;33474;33475;33476;33477;33478;33479;33480;33481;33482 42841;42842;42843;42844;42845;42846;42847;42848;42849;42850;42851;42852;42853;42854 42841 10 ASMMYLENGTPDTAAMALER Unmodified 2170.9697 0.96971079 3973 Q99747;J3KTJ6 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 117.36 117.36 2;3 3.1356E-12 121182 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.1 122 403670000 11711000 36448000 33818000 40174000 0 0 50040000 76149000 38814000 10464000 0 52463000 53584000 3707 3973 3455 33483;33484;33485;33486;33487;33488;33489;33490;33491;33492;33493 42855;42856;42857;42858;42859;42860;42861;42862;42863;42864;42865 42862 10 ASNAMMNNNDLVR Unmodified 1448.65 0.65003163 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 46.792 46.792 2 0.00065059 44418 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.9 84.027 67197000 0 0 0 0 0 0 0 27764000 0 0 39432000 0 0 3708 2279 3456 33494;33495;33496;33497 42866;42867;42868;42869 42868 4 ASNAMMNNNDLVR 2 Oxidation (M) 1480.6399 0.63986087 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 2 0 1 18.47 18.47 2 0.0056131 11145 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.451 54.079 18019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18019000 0 0 3709 2279 3456 33498 42870 42870 1647;1648 1 ASNGDAWVEAHGK Unmodified 1340.6109 0.61092723 2415 P38646;A0A3B3ITI4;D6RJI2 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 21.456 21.456 2;3 9.39E-08 14698 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.09 147.32 2600200000 329340000 295730000 261310000 157920000 256890000 136000000 200230000 99490000 127410000 253500000 114190000 104390000 263840000 3710 2415 3457 33499;33500;33501;33502;33503;33504;33505;33506;33507;33508;33509;33510;33511;33512;33513;33514;33515;33516;33517;33518 42871;42872;42873;42874;42875;42876;42877;42878;42879;42880;42881;42882;42883;42884;42885;42886;42887;42888;42889;42890;42891 42885 18 ASNPFLPGGGPATGPSVTNPFQPAPPATLTLNQLR Unmodified 3484.8103 0.81030233 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 0 1 153.66 153.66 3 0.015418 156333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.79 19.665 69196000 0 0 0 0 0 0 0 69196000 0 0 0 0 0 3711 4654 3458 33519 42892 42892 1 ASNTADTLFQEVLGR Unmodified 1620.8107 0.81074925 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 137.8 137.8 2 0.0019267 141679 QUIQUE_C1403_190116_001 83.617 65.753 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3712 3896 3459 33520 42893 42893 1 ASNTAEVFFDGVR Unmodified 1411.6732 0.67319314 2539 P49748 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.748 92.748 2 1.6053E-12 95246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.46 131.71 2721000000 213960000 141670000 257120000 147060000 168760000 191670000 206930000 228460000 291310000 102660000 305710000 216640000 249010000 3713 2539 3460 33521;33522;33523;33524;33525;33526;33527;33528;33529;33530;33531;33532;33533 42894;42895;42896;42897;42898;42899;42900;42901;42902;42903;42904;42905;42906;42907;42908;42909;42910 42904 17 ASPAAAEEVVPEWASCLK Unmodified 1913.9193 0.91931342 3585 Q8N3V7 SYNPO Synaptopodin yes yes 0 0 0 1 118.9 118.9 2 1.7552E-05 121312 QUIQUE_C1563_190116_001 125.61 110.74 33813000 0 0 0 0 0 33813000 0 0 0 0 0 0 0 3714 3585 3461 33534 42911 42911 1 ASPAPGSGHPEGPGAHLDMNSLDR Unmodified 2369.0819 0.081855509 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 51.974 51.974 3 6.4884E-15 50678 QUIQUE_C1218_190116_001 88.168 70.592 134010000 63780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70233000 0 0 3715 1689 3462 33535;33536;33537;33538 42912;42913;42914;42915 42912 3 ASPATQPPPLLPPSATGPDATVGGPAPTPLLPPSATASVK Unmodified 3725.988 0.98799192 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 133.68 133.68 3 1.6237E-05 137980 QUIQUE_C1277_190116_001 46.714 37.333 37460000 0 37460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3716 2908 3463 33539 42916 42916 1 ASPDGLCQVSLQQGR Unmodified 1614.7784 0.77840327 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.919 60.919 2 7.283E-06 57146 QUIQUE_DMIX4_190116_001 129.84 117.26 203060000 0 0 0 0 45794000 0 0 33195000 58687000 28977000 0 0 36406000 3717 1492 3464 33540;33541;33542;33543;33544 42917;42918;42919;42920;42921 42920 5 ASPDGYDCYFDNVGGEFSNTVIGQMK Unmodified 2870.2164 0.21635966 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 151.17 151.17 2;3 1.2873E-19 156632 QUIQUE_C1218_190116_001 139.04 133.26 169430000 20479000 0 20980000 61050000 0 66920000 0 0 0 0 0 0 0 3718 3089 3465 33545;33546;33547;33548 42922;42923;42924;42925 42922 4 ASPDLVPMGEWTAR Unmodified 1528.7344 0.73441319 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.28 106.28 2 0.0064442 110359 QUIQUE_C1576_190116_001 90.653 80.998 1289600000 134200000 155890000 127070000 0 100520000 91720000 146210000 118330000 102870000 0 175560000 137260000 0 3719 1749 3466 33549;33550;33551;33552;33553;33554;33555;33556;33557;33558 42926;42927;42928;42929;42930;42931;42932;42933;42934;42935;42936;42937;42938 42932 10 ASPDLVPMGEWTAR Oxidation (M) 1544.7293 0.72932781 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 1 0 1 1 85.344 85.344 2 0.021713 87495 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.435 45.806 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3720 1749 3466 33559;33560 42939;42940 42939 2 ASPDQNASTHTPQSSVK Unmodified 1753.8231 0.82310485 3078 Q14677;H0YD52 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.047 14.047 3 2.2215E-05 6189 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.367 76.676 369910000 46129000 32724000 52393000 27400000 35418000 58395000 0 0 57748000 0 22586000 37117000 0 3721 3078 3467 33561;33562;33563;33564;33565;33566;33567;33568;33569 42941;42942;42943;42944;42945;42946;42947;42948;42949 42949 9 ASPDWGYDDKNGPEQWSK Acetyl (Protein N-term) 2120.9076 0.90756276 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RIF9;E5RG43;E5RFL2;E5RGU8;E5RII2;E5RHS7 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 101.26 101.26 2 1.9534E-140 104510 QUIQUE_DMIX7_190116_001 270.8 231.8 755440000 0 0 36905000 0 106290000 0 0 0 0 0 282280000 187110000 142860000 3722 1795 3468 33570;33571;33572;33573;33574 42950;42951;42952;42953;42954;42955;42956;42957 42956 7 ASPFLLQYIQEEIPDYR Unmodified 2081.047 0.046956778 1565 O60256;E7EPA1;C9JJS3;C9K0K7;I3L0S1 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 3 1 1 1 1 1 161.13 161.13 2;3 1.5624E-16 164964 QUIQUE_C1403_190116_001 168.61 154.16 741900000 58959000 83698000 0 74201000 52736000 0 0 60578000 57853000 0 60186000 293680000 0 3723 1565 3469 33575;33576;33577;33578;33579;33580;33581;33582;33583;33584;33585;33586 42958;42959;42960;42961;42962;42963;42964;42965;42966;42967;42968;42969;42970;42971;42972 42962 15 ASPFLLQYIQEEIPNYR Unmodified 2080.0629 0.062941193 3071 Q14558;B4DP31;C9J168;C9JUN4 PRPSAP1 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 2 2 1 158.91 158.91 2;3 8.7783E-10 165027 QUIQUE_C1576_190116_001 141.58 105.84 899370000 64901000 95229000 24512000 85041000 97849000 32514000 47063000 88313000 81663000 14352000 117160000 99751000 51014000 3724 3071 3470 33587;33588;33589;33590;33591;33592;33593;33594;33595;33596;33597;33598;33599;33600;33601;33602;33603;33604;33605;33606 42973;42974;42975;42976;42977;42978;42979;42980;42981;42982;42983;42984;42985;42986;42987;42988;42989;42990;42991;42992;42993;42994;42995;42996;42997 42984 23 ASPFPVYK Unmodified 907.48035 0.48035398 2948 Q12860;F8VUI9;F8VUI8 CNTN1 Contactin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 52.528 52.528 2 0.039647 50038 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.76 38.629 812560000 0 0 0 354540000 0 0 0 0 331300000 126720000 0 0 0 3725 2948 3471 33607;33608;33609 42998;42999;43000 42999 3 ASPGSGFWSFGSEDGSGDSENPGTAR Acetyl (Protein N-term) 2600.0688 0.068767445 2894 Q05329;Q5VZ31 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 1 0 0 2 145.42 145.42 2;3 2.2837E-14 150441 QUIQUE_C1218_190116_001 124.84 113.9 57958000 57958000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3726 2894 3472 33610;33611 43001;43002 43002 2 ASPLLPANHVTMAK Unmodified 1448.781 0.78096945 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 44.631 44.631 3 0.0042259 41358 QUIQUE_C1277_190116_001 53.3 41.242 38812000 0 38812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3727 4285 3473 33612 43003 43003 1 ASPNSDDTVLSPQELQK Unmodified 1827.885 0.88503641 4424 Q9UH62 ARMCX3 Armadillo repeat-containing X-linked protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.129 66.129 2 6.5968E-07 66664 QUIQUE_C1218_190116_001 107.37 91.482 105650000 20590000 0 24495000 25327000 0 35237000 0 0 0 0 0 0 0 3728 4424 3474 33613;33614;33615;33616 43004;43005;43006;43007 43004 4 ASPSEVVFLDDIGANLKPAR Unmodified 2098.1059 0.10586864 2361 P34913;E5RFU2 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 125.01 125.01 2;3 5.1242E-06 128800 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.213 80.098 1424600000 106190000 116700000 152170000 140270000 83722000 108290000 75279000 139210000 130510000 67999000 15511000 161380000 127400000 3729 2361 3475 33617;33618;33619;33620;33621;33622;33623;33624;33625;33626;33627;33628;33629;33630;33631;33632;33633 43008;43009;43010;43011;43012;43013;43014;43015;43016;43017;43018;43019;43020;43021;43022;43023;43024;43025;43026 43024 17 ASPSPTDPVVPAVPIGPPPAGFR Unmodified 2225.1845 0.18445331 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 122.13 122.13 2;3 1.7827E-10 126683 QUIQUE_C1368_190116_001 121.18 110.61 1660300000 192820000 122530000 164510000 145190000 78927000 134730000 137410000 120710000 162030000 53894000 193890000 63479000 90142000 3730 2026 3476 33634;33635;33636;33637;33638;33639;33640;33641;33642;33643;33644;33645;33646;33647;33648;33649;33650;33651;33652;33653;33654;33655;33656;33657;33658;33659;33660;33661 43027;43028;43029;43030;43031;43032;43033;43034;43035;43036;43037;43038;43039;43040;43041;43042;43043;43044;43045;43046;43047;43048;43049;43050;43051;43052;43053;43054;43055;43056;43057;43058;43059;43060;43061;43062;43063;43064;43065;43066;43067 43036 40 ASPSTAGETPSGVK Unmodified 1287.6307 0.63065962 26 A0A087WTA5;E7ERK9;Q9UI10;A0A087WW69;F8W8L6 EIF2B4 Translation initiation factor eIF-2B subunit delta yes no 0 0 0 1 18.348 18.348 2 0.018189 10751 QUIQUE_C1403_190116_001 51.013 28.232 16834000 0 0 0 16834000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3731 26 3477 33662 43068 43068 1 ASPTSTEEEQVMLR Unmodified 1576.7403 0.74028642 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 0 1 57.577 57.577 2 0.045624 55570 QUIQUE_C1563_190116_001 42.976 28.286 26883000 0 0 0 0 0 26883000 0 0 0 0 0 0 0 3732 3916 3478 33663 43069 43069 1 ASPYPVILSLENHCTLEQQR Unmodified 2354.1689 0.1688796 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.85 105.85 3 2.252E-24 109252 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.4 113.72 2015100000 158800000 146950000 239740000 154430000 0 172960000 169410000 117220000 160330000 129310000 188330000 137640000 239950000 3733 2578 3479 33664;33665;33666;33667;33668;33669;33670;33671;33672;33673;33674;33675 43070;43071;43072;43073;43074;43075;43076;43077;43078;43079;43080;43081;43082;43083;43084;43085;43086;43087;43088;43089;43090;43091;43092 43084 23 ASQKPQPNFPSPEYMIFDHEFTK Unmodified 2737.2846 0.28463764 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 1 1 111.04 111.04 3 0.0027864 114524 QUIQUE_C1277_190116_001 40.098 32.565 30319000 0 30319000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3734 1591 3480 33676 43093 43093 1 ASQLFSEK Unmodified 908.46035 0.46034682 3983 Q99963;H3BRH8 SH3GL3 Endophilin-A3 yes no 0 0 0 1 1 1 27.447 27.447 2 0.0078889 22129 QUIQUE_C1218_190116_001 96.367 44.737 134850000 45365000 0 0 0 0 0 0 27256000 0 0 0 0 62228000 3735 3983 3481 33677;33678;33679 43094;43095;43096 43094 3 ASQMIVSYDEHEVNNTFK Unmodified 2110.963 0.96296915 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.54 76.54 3 4.0615E-05 77868 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.049 82.321 470600000 54288000 51330000 33070000 48280000 34698000 37366000 37670000 36533000 45327000 0 41738000 50304000 0 3736 354 3482 33680;33681;33682;33683;33684;33685;33686;33687;33688;33689;33690;33691 43097;43098;43099;43100;43101;43102;43103;43104;43105;43106;43107;43108;43109;43110 43108 13 ASQQINALR Unmodified 999.54614 0.54614213 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YIM7 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.895 21.895 2 0.0053254 14662 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.953 61.217 932190000 77092000 0 104480000 96250000 0 81078000 102020000 63513000 74752000 38068000 107350000 120310000 67274000 3737 356 3483 33692;33693;33694;33695;33696;33697;33698;33699;33700;33701;33702 43111;43112;43113;43114;43115;43116;43117;43118;43119;43120;43121 43121 11 ASQSQGIQQLLQAEK Acetyl (Protein N-term) 1669.8635 0.8635131 1624;1740 O75348;O95670;F2Z307 ATP6V1G1;ATP6V1G2;ATP6V1G2-DDX39B V-type proton ATPase subunit G 1;V-type proton ATPase subunit G 2 no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.14 122.14 2 3.5761E-66 126410 QUIQUE_DMIX8_190116_001 202.18 167.37 6365800000 752060000 722340000 703260000 566680000 511430000 519180000 592200000 205380000 303220000 143660000 484870000 413400000 448120000 3738 1624;1740 3484 33703;33704;33705;33706;33707;33708;33709;33710;33711;33712;33713;33714;33715 43122;43123;43124;43125;43126;43127;43128;43129;43130;43131;43132;43133;43134;43135;43136;43137;43138;43139;43140;43141 43141 20 ASRDEIFAQSK Unmodified 1250.6255 0.62551466 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 21.914 21.914 3 0.053368 15581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.295 16.02 102030000 0 0 0 0 0 0 0 49347000 52680000 0 0 0 0 3739 2379 3485 33716;33717 43142;43143 43142 2 ASREEILAQAK Unmodified 1214.6619 0.66190017 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 21.002 21.002 3 0.043925 14130 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.999 17.409 83472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83472000 0 0 3740 2378 3486 33718 43144 43144 1 ASSAAGCVVIVGSGVIGR Acetyl (Protein N-term) 1700.888 0.88795372 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A2R8Y4K2;A0A2R8Y7B4;A0A2R8Y5S5 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 1 0 0 1 1 3 1 2 2 1 132.14 132.14 2 1.2282E-23 128193 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.98 125.23 276840000 0 113540000 0 92467000 0 30032000 0 0 0 40801000 0 0 0 3741 4564 3487 33719;33720;33721;33722;33723;33724;33725;33726;33727;33728;33729 43145;43146;43147;43148;43149;43150;43151;43152;43153;43154;43155;43156 43154 12 ASSAASSEHFEK Acetyl (Protein N-term) 1291.5681 0.56805936 1088 J3KMW2;G3V5I2;Q9UEU0 VTI1B Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.08 28.08 2 0.00058267 21645 QUIQUE_C1403_190116_001 86.014 69.474 66511000 0 0 0 0 0 0 0 30602000 0 12911000 0 22998000 0 3742 1088 3488 33730;33731;33732;33733;33734;33735;33736;33737 43157;43158;43159;43160;43161;43162;43163;43164 43158 8 ASSAQSGGSSGGPAVPTVQR Acetyl (Protein N-term) 1841.8868 0.88676774 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.053 60.053 2 4.0241E-47 58895 QUIQUE_C1277_190116_001 161.84 140.98 257970000 0 33014000 42660000 41492000 0 0 34230000 30945000 39569000 0 0 36063000 0 3743 3432 3489 33738;33739;33740;33741;33742;33743;33744 43165;43166;43167;43168;43169;43170;43171;43172 43165 8 ASSDIQVK Acetyl (Protein N-term) 888.45526 0.45526144 2115 P16949;A2A2D0 STMN1 Stathmin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.487 39.487 1;2 0.010604 34275 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.189 52.153 2065300000 0 340290000 182810000 211610000 0 188450000 220050000 189700000 178480000 115350000 251930000 0 186670000 3744 2115 3490 33745;33746;33747;33748;33749;33750;33751;33752;33753;33754;33755 43173;43174;43175;43176;43177;43178;43179;43180;43181;43182;43183 43181 10 ASSDVMLNGFGGDAPTLR Unmodified 1806.857 0.85704752 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 107.66 107.66 2 2.4468E-17 110834 QUIQUE_C1277_190116_001 132.59 105.91 61936000 0 36571000 0 0 0 25365000 0 0 0 0 0 0 0 3745 902;1255;2856;1134 3491 33756;33757;33758 43184;43185;43186 43184 3 ASSEDAGPSPQTR Unmodified 1301.5848 0.58477206 3314 Q5T5P2 KIAA1217 Sickle tail protein homolog yes yes 0 0 0 1 13.887 13.887 2 0.0023312 5881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.53 57.504 26904000 0 0 0 0 0 0 0 26904000 0 0 0 0 0 3746 3314 3492 33759 43187 43187 1 ASSEGGTAAGAGLDSLHK Unmodified 1627.7802 0.7801774 369;1485 A0A1W2PNV4;O15143;C9JEY1;C9K057 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.613 32.613 2;3 0.00046596 26758 QUIQUE_C1368_190116_001 98.592 83.021 949860000 87760000 74601000 87223000 124610000 102530000 90947000 102710000 78955000 0 0 88687000 0 111840000 3747 369;1485 3493 33760;33761;33762;33763;33764;33765;33766;33767;33768;33769;33770 43188;43189;43190;43191;43192;43193;43194;43195;43196;43197;43198 43191 7 ASSFAGYVGMLTGFK Unmodified 1534.749 0.74900062 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GUJ3 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 146.22 146.22 2 0.00064687 150500 QUIQUE_C1277_190116_001 86.814 77.86 144820000 27907000 35268000 27859000 20766000 0 33022000 0 0 0 0 0 0 0 3748 341 3494 33771;33772;33773;33774;33775 43199;43200;43201;43202;43203 43200 5 ASSFAGYVGMLTGFKPGLFSLTLNER Unmodified 2762.4102 0.41017251 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 164.6 164.6 3 2.7468E-17 169269 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.887 89.855 291970000 0 0 0 0 0 0 0 28426000 59482000 0 100670000 103400000 0 3749 341 3495 33776;33777;33778;33779 43204;43205;43206;43207 43205 4 ASSGLLYPLER Unmodified 1204.6452 0.64518747 2927 Q08945 SSRP1 FACT complex subunit SSRP1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.877 84.877 2 0.002477 87224 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.098 53.175 227690000 33121000 31779000 0 0 39815000 25787000 0 0 34393000 0 36717000 26080000 0 3750 2927 3496 33780;33781;33782;33783;33784;33785;33786 43208;43209;43210;43211;43212;43213;43214 43213 4 ASSGSSPNQASKPGATLASQPRPPVQGR Unmodified 2732.3954 0.39540215 1471 O14994;A0A0A0MR68 SYN3 Synapsin-3 yes no 0 0 2 1 30.178 30.178 4 8.8175E-24 24794 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.366 87.339 72472000 0 0 0 0 0 0 0 72472000 0 0 0 0 0 3751 1471 3497 33787 43215 43215 1 ASSHSTDLMEAMAMGSVEASYK Unmodified 2301.9916 0.99156844 1203 H3BTN5 PKM Pyruvate kinase no no 0 0 0 5 5 3 2 2 2 2 3 1 1 4 3 4 112.77 112.77 2;3 9.8745E-188 117165 QUIQUE_C1218_190116_001 286.93 265.09 3665500000 434280000 513910000 372590000 284480000 197600000 215260000 233500000 320630000 145570000 105580000 268820000 241290000 332050000 3752 1203 3498 33788;33789;33790;33791;33792;33793;33794;33795;33796;33797;33798;33799;33800;33801;33802;33803;33804;33805;33806;33807;33808;33809;33810;33811;33812;33813;33814;33815;33816;33817;33818;33819;33820;33821;33822;33823;33824 43216;43217;43218;43219;43220;43221;43222;43223;43224;43225;43226;43227;43228;43229;43230;43231;43232;43233;43234;43235;43236;43237;43238;43239;43240;43241;43242;43243;43244;43245;43246;43247;43248;43249;43250;43251;43252;43253;43254;43255;43256;43257;43258;43259;43260;43261;43262;43263;43264;43265;43266;43267;43268;43269;43270 43216 52 ASSHSTDLMEAMAMGSVEASYK Oxidation (M) 2317.9865 0.98648306 1203 H3BTN5 PKM Pyruvate kinase no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.902 88.902 3 8.8532E-08 90630 QUIQUE_C1277_190116_001 95.206 89.214 723060000 0 110240000 66840000 59490000 53052000 49973000 48531000 42854000 49149000 37072000 60816000 65192000 79848000 3753 1203 3498 33825;33826;33827;33828;33829;33830;33831;33832;33833;33834;33835;33836 43271;43272;43273;43274;43275;43276;43277;43278;43279;43280;43281;43282;43283;43284;43285 43271 691 10 ASSIIDELFQDR Unmodified 1392.6885 0.68850885 2005 P10909;H0YLK8;E7ERK6;H0YC35 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain;Clusterin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 138.34 138.34 2 3.4162E-12 143404 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.61 155.87 4611200000 0 416950000 384160000 463240000 0 361170000 467430000 347000000 498590000 238960000 489980000 476870000 466860000 3754 2005 3499 33837;33838;33839;33840;33841;33842;33843;33844;33845;33846;33847;33848 43286;43287;43288;43289;43290;43291;43292;43293;43294;43295;43296;43297;43298;43299;43300;43301;43302 43294 16 ASSLIEEAK Unmodified 946.49713 0.49712625 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 27.378 27.378 2 0.00055943 20966 QUIQUE_C1277_190116_001 111.95 54.666 273700000 53700000 62806000 0 89284000 0 0 0 33696000 0 34212000 0 0 0 3755 4600 3500 33849;33850;33851;33852;33853 43303;43304;43305;43306;43307;43308 43304 6 ASSLIEEAKK Unmodified 1074.5921 0.59208927 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 2 1 17.946 17.946 2;3 0.0063707 10649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.639 14.973 92466000 0 0 0 0 0 0 0 84193000 0 8273400 0 0 0 3756 4600 3501 33854;33855;33856 43309;43310;43311 43309 3 ASSLISLLK Unmodified 930.57498 0.57498264 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;E9PKF8 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.002 94.002 2 0.0035378 96003 QUIQUE_C1403_190116_001 91.069 40.437 538510000 48771000 50932000 46044000 33891000 45996000 0 50130000 51284000 44968000 0 62911000 48756000 54831000 3757 798 3502 33857;33858;33859;33860;33861;33862;33863;33864;33865;33866;33867 43312;43313;43314;43315;43316;43317;43318;43319;43320;43321;43322;43323;43324;43325;43326 43316 15 ASSLNENVDHSALLK Unmodified 1596.8107 0.81074925 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 45.869 45.869 2;3 6.2744E-06 43233 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.33 90.489 457930000 69814000 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33885;33886;33887;33888;33889;33890;33891;33892;33893;33894;33895;33896;33897;33898;33899;33900;33901;33902;33903;33904;33905;33906;33907 43346;43347;43348;43349;43350;43351;43352;43353;43354;43355;43356;43357;43358;43359;43360;43361;43362;43363;43364;43365;43366;43367;43368;43369;43370;43371;43372;43373;43374;43375;43376;43377 43348 748 29 ASSNMHEAEEWYR Unmodified 1608.6627 0.66270481 1322 K7EKD1 GFAP yes yes 0 0 0 2 3 3 3 2 2 2 2 3 2 2 3 2 49.843 49.843 2;3 1.1182E-52 42793 QUIQUE_DMIX4_190116_001 234.63 227.78 45609000000 4928400000 3984300000 5853800000 5249500000 1597800000 6327000000 4946400000 625110000 2233600000 2332300000 3062000000 1715600000 2753700000 3761 1322 3504 33908;33909;33910;33911;33912;33913;33914;33915;33916;33917;33918;33919;33920;33921;33922;33923;33924;33925;33926;33927;33928;33929;33930;33931;33932;33933;33934;33935;33936;33937;33938 43378;43379;43380;43381;43382;43383;43384;43385;43386;43387;43388;43389;43390;43391;43392;43393;43394;43395;43396;43397;43398;43399;43400;43401;43402;43403;43404;43405;43406;43407;43408;43409;43410;43411;43412;43413;43414;43415;43416;43417;43418;43419;43420 43410 37 ASSNTVLMR Acetyl (Protein N-term) 1019.507 0.50697943 1761 O95861;A6NF51;F8VVW8;F8VZG4;F8W1J0 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.975 61.975 2 0.00022793 60866 QUIQUE_C1368_190116_001 125.5 86.535 241460000 0 0 43876000 0 0 0 36640000 32388000 31824000 12906000 0 37172000 46656000 3762 1761 3505 33939;33940;33941;33942;33943;33944;33945;33946;33947;33948;33949 43421;43422;43423;43424;43425;43426;43427;43428;43429;43430;43431 43423 11 ASSQVNVEGQSR Unmodified 1260.6058 0.60584185 1540 O43665 RGS10 Regulator of G-protein signaling 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.508 15.508 2 0.0022135 7486 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.332 46.859 181100000 0 0 0 0 51711000 0 0 27246000 52763000 0 0 0 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43455;43456;43457;43458;43459;43460;43461 43455 7 ASSSILIDESEPTTNIQIR Unmodified 2073.059 0.058978027 4516 Q9UNZ2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.63 101.63 2 5.081E-55 105848 QUIQUE_DMIX5_190116_001 225.33 209.58 914790000 47769000 62067000 117150000 46067000 56518000 107680000 50933000 105160000 0 23862000 120660000 109020000 67902000 3766 4516 3509 33979;33980;33981;33982;33983;33984;33985;33986;33987;33988;33989;33990;33991 43462;43463;43464;43465;43466;43467;43468;43469;43470;43471;43472;43473;43474;43475 43473 13 ASSSTVPLGFHYETK Acetyl (Protein N-term) 1664.8046 0.80460124 4062 Q9BXK5;E9PDD6;F2Z2C3;A0A087WW80;A0A0A0MR90;F6VJB4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 1 0 0 1 89.18 89.18 2 0.017613 91462 QUIQUE_C1218_190116_001 46.063 30.173 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3767 4062 3510 33992 43476 43476 1 ASSTCPLTFENVK Unmodified 1452.6919 0.69187967 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 64.114 64.114 2 0.018552 64138 QUIQUE_C1438_190116_001 69.346 51.034 239410000 0 0 0 112320000 127090000 0 0 0 0 0 0 0 0 3768 2470 3511 33993;33994 43477;43478 43478 1 ASSTPSSETQEEFVDDFR Unmodified 2030.8705 0.87050855 2322 P30622;J3KP58;F5H6A0;F5H1T5;F5H367;F5H270 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 94.856 94.856 2 3.1108E-23 96190 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.57 128.32 25614000 0 0 0 0 0 0 0 25614000 0 0 0 0 0 3769 2322 3512 33995 43479 43479 1 ASSTSPVEISEWLDQK Unmodified 1775.8578 0.85775902 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12;H0YKF0 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 119.93 119.93 2;3 3.0257E-13 123523 QUIQUE_C1277_190116_001 134.99 117.78 3963000000 322440000 334660000 374690000 333880000 390220000 379450000 340370000 323240000 340140000 139550000 0 331480000 352860000 3770 2067 3513 33996;33997;33998;33999;34000;34001;34002;34003;34004;34005;34006;34007;34008;34009;34010;34011;34012 43480;43481;43482;43483;43484;43485;43486;43487;43488;43489;43490;43491;43492;43493;43494;43495;43496;43497;43498;43499 43481 18 ASSVIFGLK Unmodified 920.53312 0.53311783 4117 Q9H0C8;F8SNU6 ILKAP;ILKAP2 Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.648 70.648 2 0.010766 70017 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.665 11.006 85576000 14451000 19033000 0 0 0 0 0 20768000 15973000 0 0 15353000 0 3771 4117 3514 34013;34014;34015;34016;34017;34018;34019;34020;34021;34022 43500;43501;43502;43503;43504;43505;43506;43507;43508;43509;43510;43511 43510 12 ASSVTTFTGEPNTCPR Unmodified 1723.7835 0.78354822 2618 P52943;H0YFA4 CRIP2 Cysteine-rich protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.431 51.431 2 2.328E-149 49894 QUIQUE_DMIX1_190116_001 251.81 210.1 2601800000 185680000 250510000 132700000 229910000 224530000 183980000 147880000 272980000 267770000 70134000 214420000 216770000 204520000 3772 2618 3515 34023;34024;34025;34026;34027;34028;34029;34030;34031;34032;34033;34034;34035 43512;43513;43514;43515;43516;43517;43518;43519;43520;43521;43522;43523;43524;43525;43526;43527;43528;43529;43530;43531;43532;43533;43534;43535;43536 43526 25 ASSVVVSGTPIR Unmodified 1171.6561 0.65608651 2114 P16930 FAH Fumarylacetoacetase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.059 41.059 2 8.9542E-07 37560 QUIQUE_C1576_190116_001 140.17 93.744 1494900000 104410000 93580000 124520000 155520000 116170000 85663000 69625000 159030000 157480000 66743000 152160000 107170000 102850000 3773 2114 3516 34036;34037;34038;34039;34040;34041;34042;34043;34044;34045;34046;34047;34048 43537;43538;43539;43540;43541;43542;43543;43544;43545;43546;43547;43548;43549;43550;43551;43552 43546 15 ASSYFDPVPLGTHLTVQVR Unmodified 2086.0847 0.084739267 4735 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 123.31 123.31 2 0.0029381 128651 QUIQUE_C1218_190116_001 55.261 42.061 324760000 71491000 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10486000 0 0 54866000 8477800 37387000 0 60547000 3776 2458;417 3519 34067;34068;34069;34070;34071;34072;34073 43571;43572;43573;43574;43575;43576;43577 43576 296 7 ASTEGANNMPK Acetyl (Protein N-term) 1160.5132 0.51318702 2458;417 P43004;A0A2R8YFE3;A0A2U3U0E3;A0A2R8YG01;A0A163QEF0;H0YEK4;A0A2R8Y6B8;C9J9N5;A0A2R8YH93;A0A2R8Y4D1 SLC1A2 Excitatory amino acid transporter 2;Amino acid transporter no no 1 0 0 1 34.441 34.441 2 0.056716 29684 QUIQUE_C1403_190116_001 47.187 32.98 57052000 0 0 0 57052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3777 2458;417 3519 34074 43578 43578 1 ASTEQAPELENLTVTEVGWDGLR Unmodified 2514.2238 0.22381152 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 140.89 140.89 2 1.1011E-17 144039 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.48 137.77 713060000 0 0 51375000 31792000 0 46461000 36104000 96581000 165000000 0 97087000 96468000 92198000 3778 2233 3520 34075;34076;34077;34078;34079;34080;34081;34082;34083;34084 43579;43580;43581;43582;43583;43584;43585;43586;43587;43588;43589;43590;43591;43592;43593 43585 14 ASTEVGEMAK Unmodified 1021.475 0.4750106 2259 P27144 AK4 Adenylate kinase 4, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 18.956 18.956 2 0.029339 11316 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.722 24.11 130160000 0 0 0 0 0 0 0 98118000 0 32045000 0 0 0 3779 2259 3521 34085;34086 43594;43595 43595 2 ASTGSQASDIDEIFGFFNDGEPPTK Acetyl (Protein N-term) 2671.1926 0.19257097 962 E9PMJ2;J3KP39;Q9BPY3;G3V179;E9PMW3;E9PIM5 FAM118B Protein FAM118B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 172.52 172.52 3 9.7028E-18 173968 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.62 94.117 166700000 14031000 24994000 18637000 13493000 26638000 0 0 34073000 34832000 0 0 0 0 3780 962 3522 34087;34088;34089;34090;34091;34092;34093 43596;43597;43598;43599;43600;43601;43602 43601 7 ASTHETWAYGK Unmodified 1249.5728 0.57275081 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 20.857 20.857 2;3 0.0018647 14011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.52 102.22 112760000 0 0 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34115;34116;34117;34118;34119;34120;34121;34122;34123;34124;34125;34126;34127 43626;43627;43628;43629;43630;43631;43632;43633;43634;43635;43636;43637;43638;43639;43640;43641;43642;43643 43638 16 ASTPAILFLDEIDSILGAR Unmodified 2001.0783 0.078256906 4049 Q9BVQ7;H0YCA5 SPATA5L1 Spermatogenesis-associated protein 5-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 176.58 176.58 2 0.0035841 180037 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.276 33.488 17792000 0 0 0 0 0 0 0 0 9871400 0 0 7920700 0 3787 4049 3529 34128;34129 43644;43645 43645 2 ASTPNGYDNGIIWATWK Unmodified 1892.9057 0.90571227 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 124.52 124.52 2 9.7641E-18 128551 QUIQUE_C1368_190116_001 122.45 106.56 1097700000 0 75762000 0 130330000 90055000 0 69709000 84791000 0 0 557760000 0 89258000 3788 710 3530 34130;34131;34132;34133;34134;34135;34136;34137;34138;34139 43646;43647;43648;43649;43650;43651;43652;43653;43654;43655;43656;43657;43658 43647 13 ASTTLDIK Unmodified 847.4651 0.46509784 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.7 24.7 2 0.0392 18495 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.752 48.45 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3789 2483 3531 34140;34141;34142;34143;34144 43659;43660;43661;43662;43663 43662 5 ASTTLDIKDSISAVSSEK Unmodified 1850.9473 0.94730231 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 81.942 81.942 3 0.0053232 83285 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.528 39.997 251630000 0 0 0 0 0 0 0 111030000 57785000 0 0 25840000 56977000 3790 2483 3532 34145;34146;34147;34148;34149 43664;43665;43666;43667;43668;43669 43665 5 ASTVVAVGLTIAAAGFAGR Acetyl (Protein N-term) 1772.9785 0.97848328 3831 Q96DA6;G5E9V2;F2Z3A7 DNAJC19 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 180.38 180.38 2 1.3708E-11 183281 QUIQUE_DMIX7_190116_001 150.21 128.02 48960000 0 5354900 0 0 3955800 0 3900400 6369800 5522900 0 11196000 7208000 5452300 3791 3831 3533 34150;34151;34152;34153;34154;34155;34156;34157;34158;34159;34160;34161 43670;43671;43672;43673;43674;43675;43676;43677;43678;43679;43680;43681;43682 43681 13 ASVCAEAYNPDEEEDDAESR Unmodified 2255.8761 0.87606422 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 58.966 58.966 2 9.4865E-06 56997 QUIQUE_C1563_190116_001 109.83 106.87 22655000 0 0 0 0 0 22655000 0 0 0 0 0 0 0 3792 2331 3534 34162 43683 43683 1 ASVDELFAEIVR Unmodified 1347.7034 0.70343063 2720 P61225 RAP2B Ras-related protein Rap-2b yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.55 147.55 2 5.3713E-10 151802 QUIQUE_DMIX7_190116_001 156.48 129.37 2165900000 185910000 0 157860000 181740000 190740000 0 535690000 221510000 202030000 54304000 227700000 104890000 103510000 3793 2720 3535 34163;34164;34165;34166;34167;34168;34169;34170;34171;34172;34173 43684;43685;43686;43687;43688;43689;43690;43691;43692;43693;43694;43695;43696;43697;43698 43694 13 ASVDGWFK Unmodified 908.43922 0.43921744 1894 P05771;I3L1Z0 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.919 73.919 2 0.025599 74492 QUIQUE_C1368_190116_001 71.342 43.124 203710000 0 0 36384000 0 0 0 75034000 37974000 0 0 54316000 0 0 3794 1894 3536 34174;34175;34176;34177 43699;43700;43701;43702 43699 4 ASVETSPLLR Unmodified 1071.5924 0.59242362 2626 P53602;H3BP35 MVD Diphosphomevalonate decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 48.967 48.967 2 0.011915 46347 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.621 22.174 516000000 103550000 126560000 0 0 0 0 0 146240000 0 0 139640000 0 0 3795 2626 3537 34178;34179;34180;34181;34182 43703;43704;43705;43706;43707 43707 5 ASVFSNLR Unmodified 892.47667 0.47666558 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 49.006 49.006 2 0.0455 46951 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.047 9.1988 18232000 0 0 0 0 0 0 0 0 18232000 0 0 0 0 3796 4340 3538 34183 43708 43708 1 ASVGQDSPEPR Unmodified 1141.5364 0.53636531 3411 Q6UX71 PLXDC2 Plexin domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 16.189 16.189 2 0.066896 8385 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.282 28.641 28656000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28656000 3797 3411 3539 34184 43709 43709 1 ASVHTLSGHTNAVATVR Unmodified 1719.9016 0.90162994 1539 O43660;H0YA24 PLRG1 Pleiotropic regulator 1 yes no 0 0 0 1 20.249 20.249 3 0.030459 12913 QUIQUE_C1277_190116_001 40.602 32.218 23086000 0 23086000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3798 1539 3540 34185 43710 43710 0 ASVILAGLGFTPK Unmodified 1272.7442 0.74417324 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 114.67 114.67 2 0.010787 118546 QUIQUE_C1368_190116_001 63.32 39.892 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3799 4299 3541 34186;34187;34188 43711;43712;43713 43712 3 ASVITQVFHVPLEER Unmodified 1723.9257 0.92571943 2 A0A024R4E5;Q00341;C9JIZ1;C9J5E5;C9JT62;C9JHS7;C9JK79;C9JHZ8;C9JES8;C9JZI8 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 106.48 106.48 2;3 0.0012399 110159 QUIQUE_C1403_190116_001 75.088 49.651 214560000 0 0 0 0 58428000 0 0 0 0 0 56560000 43105000 56470000 3800 2 3542 34189;34190;34191;34192;34193;34194 43714;43715;43716;43717;43718;43719 43714 6 ASVLDTSMSAGSGSPSK Unmodified 1580.7352 0.73520105 4520 Q9UPQ0;D6RD46;E7EPK0;E9PDJ9;H0Y8P3;G5EA03 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 51.36 51.36 2 8.1497E-13 49031 QUIQUE_C1403_190116_001 127.71 93.754 17628000 0 0 0 17628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3801 4520 3543 34195 43720 43720 1 ASVLFDTMQHHLALNR Unmodified 1851.9414 0.94138627 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 3 1 1 2 1 1 3 1 3 2 2 85.549 85.549 2;3;4 8.2266E-25 87405 QUIQUE_C1368_190116_001 156.69 121.27 3491300000 115400000 108230000 510880000 89144000 124000000 131990000 124250000 170960000 417790000 24220000 666880000 349020000 658540000 3802 2483 3544 34196;34197;34198;34199;34200;34201;34202;34203;34204;34205;34206;34207;34208;34209;34210;34211;34212;34213;34214;34215;34216;34217 43721;43722;43723;43724;43725;43726;43727;43728;43729;43730;43731;43732;43733;43734;43735;43736;43737;43738;43739;43740;43741;43742;43743;43744;43745;43746;43747;43748;43749;43750;43751;43752 43727 32 ASVLFDTMQHHLALNR Oxidation (M) 1867.9363 0.93630089 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 1 1 60.112 60.112 3 0.00013339 59432 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.652 62.583 203750000 0 0 0 0 0 0 0 0 87876000 43219000 0 0 72654000 3803 2483 3544 34218;34219;34220 43753;43754;43755 43753 1906 3 ASVMLFMK Unmodified 925.47653 0.47653093 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 0 1 83.531 83.531 2 0.063544 86473 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.403 35.439 27152000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27152000 0 0 3804 1676 3545 34221 43756 43756 1 ASVMVYDDTSKK Unmodified 1342.6439 0.64386684 4441 Q9UI08;G3V3G2;G3V535;A0A087WYI2 EVL Ena/VASP-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 23.522 23.522 2 0.0034286 17077 QUIQUE_C1403_190116_001 75.652 45.843 110980000 0 19302000 0 28305000 0 0 0 0 0 0 32515000 0 30858000 3805 4441 3546 34222;34223;34224;34225;34226 43757;43758;43759;43760;43761 43758 5 ASVPDGFLSELTQQLAQATGK Unmodified 2160.1063 0.10626257 2070 P14174 MIF Macrophage migration inhibitory factor yes yes 0 0 0 1 1 165.72 165.72 2 0.00033325 172278 QUIQUE_C1438_190116_001 62.861 47.316 114550000 0 0 0 0 66192000 48359000 0 0 0 0 0 0 0 3806 2070 3547 34227;34228 43762;43763 43762 2 ASVPPVPGKPR Unmodified 1103.6451 0.64512789 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 20.976 20.976 3 0.0091484 14023 QUIQUE_C1438_190116_001 48.44 35.087 70611000 0 0 0 0 23339000 0 0 26069000 0 0 0 0 21203000 3807 3718 3548 34229;34230;34231 43764;43765;43766;43767;43768 43764 5 ASVPTIQDQASAMQLSQCAK Unmodified 2133.0194 0.019438173 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.384 87.384 2 1.7407E-29 90455 QUIQUE_C1218_190116_001 140.82 128.03 289190000 26517000 29657000 0 44837000 27694000 33301000 25020000 29398000 0 0 0 29274000 43496000 3808 4600 3549 34232;34233;34234;34235;34236;34237;34238;34239;34240 43769;43770;43771;43772;43773;43774;43775;43776;43777;43778 43769 10 ASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDK Acetyl (Protein N-term) 2919.4059 0.40593457 1886 P05386 RPLP1 60S acidic ribosomal protein P1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.66 172.66 3 1.479E-99 175940 QUIQUE_C1277_190116_001 184.47 152.39 540720000 51872000 59798000 56671000 21375000 71144000 0 94219000 13089000 42138000 3388900 67701000 0 59319000 3809 1886 3550 34241;34242;34243;34244;34245;34246;34247;34248;34249;34250;34251;34252 43779;43780;43781;43782;43783;43784;43785;43786;43787;43788;43789;43790 43780 12 ASVSELACIYSALILHDDEVTVTEDKINALIK Acetyl (Protein N-term) 3571.8331 0.83313076 1886 P05386 RPLP1 60S acidic ribosomal protein P1 yes yes 1 0 1 1 1 2 1 1 171.78 171.78 3;4 5.6662E-215 176080 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86310000 133910000 3812 2483 3552 34265;34266;34267;34268;34269;34270;34271;34272;34273;34274;34275;34276;34277 43804;43805;43806;43807;43808;43809;43810;43811;43812;43813;43814;43815;43816 43811 13 ASVSQVEADLK Unmodified 1145.5928 0.59281755 2907 Q07065 CKAP4 Cytoskeleton-associated protein 4 yes yes 0 0 0 1 57.745 57.745 2 0.025311 53077 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.124 27.387 14349000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14349000 0 0 0 3813 2907 3553 34278 43817 43817 1 ASVSSATFSGHGAR Acetyl (Protein N-term) 1375.648 0.64804102 3461 Q7Z4H3;V9GYS5;V9GZ04 HDDC2 HD domain-containing protein 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 45.286 45.286 2 1.3903E-05 40478 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.53 71.105 246730000 75036000 29912000 0 0 0 0 0 96841000 0 44940000 0 0 0 3814 3461 3554 34279;34280;34281;34282 43818;43819;43820;43821 43821 4 ASVTVGGEQISAIGR Unmodified 1443.7682 0.76815616 3688 Q8TEA8;A0A2R8YCT7;A0A2R8Y6X2 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.755 71.755 2 0.00020344 73055 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VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes no 0 0 0 1 58.896 58.896 2 0.052818 57654 QUIQUE_C1218_190116_001 49.96 34.298 45390000 45390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3818 1493 3558 34298 43838 43838 1 ASWSSLSMDEK Oxidation (M) 1255.5391 0.53906742 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9;Q86WV2 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 49.175 49.175 2 0.0019051 47010 QUIQUE_C1218_190116_001 83.499 72.136 210240000 85579000 0 0 0 0 80297000 0 0 0 44362000 0 0 0 3819 2052 3559 34299;34300;34301 43839;43840;43841 43839 1372 1 ASWSSLSMDEK Unmodified 1239.5442 0.5441528 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9;Q86WV2 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.991 67.991 2 0.0034399 64883 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.048 89.516 1275900000 0 0 0 0 0 0 297270000 112120000 0 106150000 462270000 0 298080000 3820 2052 3559 34302;34303;34304;34305;34306 43842;43843;43844;43845;43846 43844 1 ASWSSLSMDEKVELYR Oxidation (M) 1915.8986 0.89857798 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 1 1 1 1 86.811 86.811 3 0.00065795 88026 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.428 68.465 205600000 0 0 0 0 0 0 0 90390000 115210000 0 0 0 0 3821 2052 3560 34307;34308 43847;43848 43847 1372 2 ASWSSLSMDEKVELYR Unmodified 1899.9037 0.90366336 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 99.1 99.1 3 0.00040647 101730 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.463 65.541 106550000 0 0 0 0 0 0 0 56481000 50067000 0 0 0 0 3822 2052 3560 34309;34310;34311 43849;43850;43851;43852 43851 4 ASWTWGPEGQGAILLVNCDR Unmodified 2229.0637 0.063686249 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 2 1 2 2 2 1 1 2 140.01 140.01 2;3 7.7793E-76 145777 QUIQUE_C1218_190116_001 194.48 186.09 4970500000 453500000 268390000 545990000 634130000 276200000 478690000 219770000 361160000 447470000 252700000 296600000 239800000 496100000 3823 4560 3561 34312;34313;34314;34315;34316;34317;34318;34319;34320;34321;34322;34323;34324;34325;34326;34327;34328;34329;34330;34331;34332;34333;34334 43853;43854;43855;43856;43857;43858;43859;43860;43861;43862;43863;43864;43865;43866;43867;43868;43869;43870;43871;43872;43873;43874;43875;43876;43877;43878;43879;43880;43881;43882;43883 43854 29 ASWTWGPEGQGAILLVNCDRETPWLPK Unmodified 3080.5178 0.51782548 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 149.53 149.53 3 1.037E-25 152310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.95 92.976 72215000 0 0 0 0 0 0 0 72215000 0 0 0 0 0 3824 4560 3562 34335 43884 43884 1 ASYAAGPASNYADPYR Unmodified 1672.7481 0.74814899 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 65.308 65.308 2 0.040724 64517 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.224 51.269 79195000 0 0 0 0 0 0 0 49082000 0 0 0 30112000 0 3825 855;928 3563 34336;34337 43885;43886 43886 1 ASYAQQPAESR Unmodified 1206.5629 0.56291441 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.407 16.407 2 1.506E-05 8457 QUIQUE_C1403_190116_001 171.33 146.19 2386300000 130650000 238770000 221280000 123120000 320120000 98112000 148890000 188350000 199250000 64240000 309290000 196810000 147450000 3826 2834 3564 34338;34339;34340;34341;34342;34343;34344;34345;34346;34347;34348;34349;34350 43887;43888;43889;43890;43891;43892;43893;43894;43895;43896;43897;43898;43899 43890 13 ASYAVSETIPK Unmodified 1164.6027 0.60265396 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.496 49.496 2 0.012829 46504 QUIQUE_C1403_190116_001 60.064 44.422 594150000 111660000 0 0 107520000 0 0 0 88433000 93683000 51883000 0 0 140970000 3827 4259 3565 34351;34352;34353;34354;34355;34356 43900;43901;43902;43903;43904;43905;43906 43901 6 ASYDVSDSGQLEHVQPWSV Unmodified 2102.9545 0.95451296 2861 Q01813;B1APP8 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.56 117.56 2 5.5289E-11 121569 QUIQUE_C1403_190116_001 152.88 145.3 2805900000 250920000 236280000 218350000 246270000 182040000 131160000 208580000 251630000 212160000 95348000 265070000 262360000 245780000 3828 2861 3566 34357;34358;34359;34360;34361;34362;34363;34364;34365;34366;34367;34368;34369 43907;43908;43909;43910;43911;43912;43913;43914;43915;43916;43917;43918;43919;43920;43921;43922;43923;43924;43925 43913 18 ASYFICHDQETIK Unmodified 1610.7399 0.73989249 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 48.974 48.974 2;3 0.00032845 45644 QUIQUE_C1563_190116_001 88.596 78.364 118480000 0 21564000 22181000 22726000 0 28680000 0 0 0 23330000 0 0 0 3829 3857 3567 34370;34371;34372;34373;34374 43926;43927;43928;43929;43930;43931 43929 6 ASYFICHDQETIKK Unmodified 1738.8349 0.83485551 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 31.991 31.991 3;4 0.00014465 27745 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.692 71.331 395000000 0 0 0 0 61691000 0 0 79196000 75951000 29354000 0 59466000 89341000 3830 3857 3568 34375;34376;34377;34378;34379;34380;34381 43932;43933;43934;43935;43936;43937;43938 43934 5 ASYGHSMVVDPWGTVVAR Unmodified 1930.936 0.93596654 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 96.021 96.021 2;3 5.4661E-14 98010 QUIQUE_C1277_190116_001 111.39 79.326 291080000 71654000 0 20827000 36561000 25355000 104930000 0 0 0 31756000 0 0 0 3831 3515 3569 34382;34383;34384;34385;34386;34387;34388;34389;34390;34391;34392;34393 43939;43940;43941;43942;43943;43944;43945;43946;43947;43948;43949;43950 43941 12 ASYGVEDPEYAVTQLAQTTMR Unmodified 2329.0896 0.089626228 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.53 140.53 2 1.7005E-13 144831 QUIQUE_C1277_190116_001 116.43 102.4 365370000 45008000 56488000 55244000 31251000 0 41038000 54311000 38122000 0 0 43904000 0 0 3832 4466 3570 34394;34395;34396;34397;34398;34399;34400;34401;34402 43951;43952;43953;43954;43955;43956;43957;43958;43959;43960 43953 9 ASYIIVPQDGIFSPTSNLLLLDLGHLK Unmodified 2923.6059 0.60589543 3931 Q96RL7 VPS13A Vacuolar protein sorting-associated protein 13A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 166.18 166.18 3 1.9158E-12 171109 QUIQUE_C1218_190116_001 63.361 62.181 167110000 35704000 54163000 0 0 35346000 0 0 0 0 0 41899000 0 0 3833 3931 3571 34403;34404;34405;34406 43961;43962;43963;43964 43961 4 ASYILMEK Unmodified 953.4892 0.4892041 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 52.839 52.839 2 0.025559 51385 QUIQUE_C1438_190116_001 71.379 26.298 399890000 0 116000000 0 0 98598000 92241000 0 0 0 0 0 93050000 0 3834 2513 3572 34407;34408;34409;34410;34411 43965;43966;43967;43968;43969;43970 43967 6 ASYLDCIR Unmodified 996.46987 0.46986564 1838 P02787;F8WCI6;C9JB55;F8WEK9 TF Serotransferrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.069 62.069 2 0.0065653 61916 QUIQUE_C1576_190116_001 101.28 62.322 1566300000 0 0 163770000 0 522820000 0 148770000 0 158480000 63678000 157070000 156780000 194960000 3835 1838 3573 34412;34413;34414;34415;34416;34417;34418;34419 43971;43972;43973;43974;43975;43976;43977;43978;43979;43980 43974 10 ASYLEIYQEEIRDLLSK Unmodified 2069.0681 0.06808615 1476 O15066;F8WAR6;F8WER6;O14782 KIF3B;KIF3C Kinesin-like protein KIF3B;Kinesin-like protein KIF3B, N-terminally processed;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3C yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.95 159.95 3 1.7598E-05 164629 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.579 84.916 203810000 0 0 16796000 0 19667000 0 17843000 24700000 26258000 0 37949000 27830000 32771000 3836 1476 3574 34420;34421;34422;34423;34424;34425;34426;34427 43981;43982;43983;43984;43985;43986;43987;43988;43989 43989 9 ASYSGVSLFSNPVQYWEIQPSTFR Unmodified 2762.334 0.33403068 1923 P07585;H0YI87 DCN Decorin yes no 0 0 0 2 2 1 160.85 160.85 2;3 3.2066E-06 164475 QUIQUE_C1403_190116_001 87.148 75.887 151780000 0 0 45212000 74770000 0 0 0 31802000 0 0 0 0 0 3837 1923 3575 34428;34429;34430;34431;34432 43990;43991;43992;43993;43994 43992 4 ASYSSQHGHLGPELR Unmodified 1637.791 0.79101686 855;928;813 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5;D6RC65 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 21.819 21.819 3;4 0.00045131 15135 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.169 44.119 1020300000 138400000 39238000 126740000 133390000 74479000 122500000 105590000 0 90283000 0 53038000 49912000 86706000 3838 855;928;813 3576 34433;34434;34435;34436;34437;34438;34439;34440;34441;34442;34443;34444;34445;34446;34447;34448 43995;43996;43997;43998;43999;44000;44001;44002;44003;44004;44005;44006;44007;44008;44009;44010;44011;44012 44008 17 ASYVAPLTAQPATYR Unmodified 1607.8308 0.83075641 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.521 71.521 2 1.3964E-05 71565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.067 63.57 1139400000 64322000 91482000 110590000 127630000 82235000 100810000 74027000 105630000 89854000 0 113670000 78831000 100320000 3839 3919 3577 34449;34450;34451;34452;34453;34454;34455;34456;34457;34458;34459;34460 44013;44014;44015;44016;44017;44018;44019;44020;44021;44022;44023;44024 44020 10 ASYVAWGHSTVVNPWGEVLAK Unmodified 2270.1484 0.14840216 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 121.96 121.96 2;3 7.1289E-99 125947 QUIQUE_C1277_190116_001 202.63 172.19 2463900000 219420000 196520000 201810000 161050000 230340000 111620000 254160000 193340000 249760000 66483000 236760000 46272000 296390000 3840 4256 3578 34461;34462;34463;34464;34465;34466;34467;34468;34469;34470;34471;34472;34473;34474;34475;34476;34477;34478;34479;34480;34481;34482;34483 44025;44026;44027;44028;44029;44030;44031;44032;44033;44034;44035;44036;44037;44038;44039;44040;44041;44042;44043;44044;44045;44046;44047;44048;44049;44050;44051;44052 44028 27 ASYYEILDVPR Acetyl (Protein N-term) 1366.6769 0.67688153 2242 P25686;C9JRD2;C9JXB9;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.13 147.13 2 0.00022692 151210 QUIQUE_C1277_190116_001 119.68 80.376 654050000 54894000 54358000 42561000 46780000 55730000 55860000 60997000 34927000 44213000 21157000 62202000 62950000 57420000 3841 2242 3579 34484;34485;34486;34487;34488;34489;34490;34491;34492;34493;34494;34495;34496;34497 44053;44054;44055;44056;44057;44058;44059;44060;44061;44062;44063;44064;44065;44066;44067;44068;44069;44070;44071;44072;44073;44074;44075;44076 44055 24 ASYYEISVDDGPWEK Unmodified 1757.7784 0.77844607 3235 Q4G0N4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.52 113.52 2 1.9678E-06 116868 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.24 105.29 524760000 54258000 41856000 61219000 45641000 0 39518000 48990000 62142000 86528000 22151000 0 62453000 0 3842 3235 3580 34498;34499;34500;34501;34502;34503;34504;34505;34506;34507 44077;44078;44079;44080;44081;44082;44083;44084;44085;44086 44084 7 ASYYVVSGNDPANGEPSR Unmodified 1881.8493 0.8493196 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.386 58.386 2 1.8833E-45 57834 QUIQUE_DMIX5_190116_001 174.39 166.29 815100000 44432000 67029000 78346000 62458000 58783000 46844000 74424000 70487000 64745000 26466000 80501000 74862000 65726000 3843 921 3581 34508;34509;34510;34511;34512;34513;34514;34515;34516;34517;34518;34519;34520 44087;44088;44089;44090;44091;44092;44093;44094;44095;44096;44097;44098;44099;44100;44101;44102;44103;44104;44105;44106 44102 20 ATAAETSASEPEAESK Acetyl (Protein N-term) 1619.7162 0.71623974 3098 Q15020;F8VV04;F8W667 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 1 0 0 1 1 43.901 43.901 2 6.1155E-113 40544 QUIQUE_DMIX1_190116_001 267.75 227.16 39049000 0 0 0 0 0 0 0 39049000 0 0 0 0 0 3844 3098 3582 34521;34522 44107;44108 44108 2 ATAAFILANEHNVALFK Unmodified 1828.9836 0.98356866 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 2 106.12 106.12 2;3 2.2104E-08 110711 QUIQUE_C1438_190116_001 109.48 100.07 2918200000 191210000 260140000 169890000 180520000 238210000 161860000 237470000 270040000 400260000 62004000 0 334950000 411690000 3845 1403 3583 34523;34524;34525;34526;34527;34528;34529;34530;34531;34532;34533;34534;34535;34536;34537;34538;34539;34540;34541;34542 44109;44110;44111;44112;44113;44114;44115;44116;44117;44118;44119;44120;44121;44122;44123;44124;44125;44126;44127;44128;44129;44130 44116 19 ATAAFSNVGTAISK Unmodified 1336.6987 0.69867961 970 E9PPQ1;J3KNE7;Q16890;E9PNK6 TPD52L1 Tumor protein D53 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.037 57.037 2 0.00025602 55591 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.54 76.187 1628300000 0 137590000 142190000 136070000 148600000 167110000 120140000 104230000 101580000 51052000 147050000 109370000 263340000 3846 970 3584 34543;34544;34545;34546;34547;34548;34549;34550;34551;34552;34553;34554 44131;44132;44133;44134;44135;44136;44137;44138;44139;44140;44141;44142;44143 44139 13 ATAAPAGAPPQPQDLEFTK Unmodified 1908.9581 0.95814177 2202 P22695;H3BRG4;H3BSJ9;H3BUE4;H3BUI9 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 78.752 78.752 2 5.2312E-74 81487 QUIQUE_DMIX5_190116_001 192.14 174.4 4990600000 525320000 513620000 495350000 310720000 358450000 322710000 399010000 353740000 437740000 141250000 429470000 358680000 344560000 3847 2202 3585 34555;34556;34557;34558;34559;34560;34561;34562;34563;34564;34565;34566;34567;34568 44144;44145;44146;44147;44148;44149;44150;44151;44152;44153;44154;44155;44156;44157;44158;44159;44160;44161;44162;44163;44164;44165;44166;44167;44168;44169;44170;44171;44172;44173;44174;44175;44176;44177;44178;44179;44180;44181;44182;44183;44184;44185;44186 44180 43 ATAAPAGAPPQPQDLEFTKLPNGLVIASLENYSPVSR Unmodified 3818.9843 0.98430353 2202 P22695;H3BRG4;H3BSJ9;H3BUE4;H3BUI9 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 151.06 151.06 3;4 2.1552E-41 157083 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.915 85.44 222100000 0 0 0 0 0 0 0 90278000 46107000 0 85713000 0 0 3848 2202 3586 34569;34570;34571;34572;34573 44187;44188;44189;44190;44191;44192;44193 44193 4 ATAAVLR Acetyl (Protein N-term) 742.43374 0.43373813 180 A0A0A0MSM0 HSPH1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.335 40.335 2 0.03215 36773 QUIQUE_C1277_190116_001 66.994 20.642 2465700000 284880000 244740000 186650000 0 294780000 121800000 0 378660000 278830000 0 450920000 0 224450000 3849 180 3587 34574;34575;34576;34577;34578;34579;34580;34581;34582 44194;44195;44196;44197;44198;44199;44200;44201;44202;44203;44204;44205;44206;44207 44195 14 ATAAYEQLK Acetyl (Protein N-term) 1035.5237 0.52367535 4293 Q9NTJ5;F8WCQ2 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 1 0 0 1 74.85 74.85 2 0.019846 70993 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.074 43.871 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3850 4293 3588 34583 44208 44208 1 ATACQMLVYYAK Unmodified 1417.6734 0.67339283 1582 O60518 RANBP6 Ran-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 91.325 91.325 2 0.012786 93734 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.534 43.927 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3851 1582 3589 34584 44209 44209 1 ATADDELSFK Unmodified 1095.5084 0.50841922 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.592 50.592 2 0.00014691 47699 QUIQUE_C1563_190116_001 122.13 103.35 2360300000 0 226070000 258610000 238940000 205350000 209580000 209850000 163170000 161240000 94620000 225880000 164600000 202410000 3852 2774 3590 34585;34586;34587;34588;34589;34590;34591;34592;34593;34594;34595;34596 44210;44211;44212;44213;44214;44215;44216;44217;44218;44219;44220;44221;44222 44214 13 ATADDELSFKR Unmodified 1251.6095 0.60953025 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 33.793 33.793 2;3 0.002075 29285 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synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.57 101.57 2 1.5369E-08 98480 QUIQUE_DMIX4_190116_001 157.68 103.07 3787200000 315020000 261310000 301940000 338860000 370270000 340660000 270960000 246910000 281600000 172330000 295180000 274720000 317440000 3855 2195 3593 34620;34621;34622;34623;34624;34625;34626;34627;34628;34629;34630;34631;34632 44248;44249;44250;44251;44252;44253;44254;44255;44256;44257;44258;44259;44260;44261;44262;44263;44264;44265 44261 18 ATAEVLNIGKK Acetyl (Protein N-term) 1184.6765 0.6764876 2195 P22234;E9PBS1 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 1 0 1 1 1 1 2 1 1 69.948 69.948 2 1.7625E-06 70626 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.34 129.6 2053300000 0 0 0 0 49836000 0 0 616030000 289220000 0 453860000 357740000 286650000 3856 2195 3594 34633;34634;34635;34636;34637;34638;34639 44266;44267;44268;44269;44270;44271;44272 44270 4 ATAFNEQVDK Unmodified 1121.5353 0.53530267 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.658 25.658 2 0.0066736 20122 QUIQUE_C1218_190116_001 100.02 79.392 453170000 80170000 97579000 79389000 95827000 100200000 0 0 0 0 0 0 0 0 3857 2265 3595 34640;34641;34642;34643;34644 44273;44274;44275;44276;44277 44273 2 ATAFNEQVDKFFPLIEVNK Unmodified 2209.1419 0.1419198 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 139.78 139.78 3 0.0011117 144728 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.252 50.206 105420000 0 0 0 0 0 0 0 0 32622000 0 0 36005000 36787000 3858 2265 3596 34645;34646;34647;34648 44278;44279;44280;44281 44279 3 ATAGAYIASQTVK Unmodified 1279.6772 0.67721588 2276 P28074;H0YJM8 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 3 2 40.69 40.69 2 1.5825E-13 36428 QUIQUE_C1563_190116_001 157.97 138.35 2067000000 84166000 76216000 211130000 118050000 201420000 85215000 162820000 81805000 132630000 83847000 317550000 204120000 308050000 3859 2276 3597 34649;34650;34651;34652;34653;34654;34655;34656;34657;34658;34659;34660;34661;34662;34663;34664;34665;34666;34667;34668;34669 44282;44283;44284;44285;44286;44287;44288;44289;44290;44291;44292;44293;44294;44295;44296;44297;44298;44299;44300;44301;44302;44303 44289 19 ATAGAYIASQTVKK Unmodified 1407.7722 0.7721789 2276 P28074;H0YJM8 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes no 0 0 1 1 27.013 27.013 2 0.0010642 21269 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.266 52.932 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3860 2276 3598 34670 44304 44304 1 ATAGDTHLGGEDFDNR Unmodified 1674.7234 0.72339081 282;2362;2117 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;Q53FA3;P34931;P17066;P48741 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L;HSPA6;HSPA7 Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like;Heat shock 70 kDa protein 6;Putative heat shock 70 kDa protein 7 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 37.001 37.001 2;3 3.0543E-66 32760 QUIQUE_C1277_190116_001 211.26 205.02 34636000000 2519900000 2886200000 1784400000 3117300000 3331100000 2009000000 3335000000 2280400000 3004400000 1803300000 3107600000 2420600000 3036700000 3861 282;2362;2117 3599 34671;34672;34673;34674;34675;34676;34677;34678;34679;34680;34681;34682;34683;34684;34685;34686;34687;34688;34689;34690;34691;34692;34693;34694;34695;34696 44305;44306;44307;44308;44309;44310;44311;44312;44313;44314;44315;44316;44317;44318;44319;44320;44321;44322;44323;44324;44325;44326;44327;44328;44329;44330;44331;44332;44333;44334;44335;44336;44337 44310 32 ATAIDIATSK Unmodified 989.53933 0.53932542 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 36.593 36.593 1;2 0.0012683 32303 QUIQUE_C1277_190116_001 99.688 71.469 3024300000 313170000 282360000 292880000 286850000 189180000 263420000 330410000 0 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factor 1-delta no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 17.527 17.527 2;3 4.1766E-08 10436 QUIQUE_C1218_190116_001 137.89 111.96 2110600000 241210000 163220000 142560000 165430000 189220000 182580000 112630000 183820000 171190000 0 192480000 122090000 244210000 3867 958;979;2291 3604 34735;34736;34737;34738;34739;34740;34741;34742;34743;34744;34745;34746;34747;34748;34749;34750;34751;34752;34753;34754;34755;34756;34757;34758 44380;44381;44382;44383;44384;44385;44386;44387;44388;44389;44390;44391;44392;44393;44394;44395;44396;44397;44398;44399;44400;44401;44402;44403;44404 44381 24 ATAPVPTVGEGYGYGHESELSQASAAAR Unmodified 2775.31 0.31000077 4055 Q9BWF3;E9PB51 RBM4 RNA-binding protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.711 79.711 3 8.5609E-78 80730 QUIQUE_C1368_190116_001 119.85 112.82 541450000 0 58828000 60202000 70802000 44411000 51998000 43496000 48062000 49331000 25139000 52817000 36367000 0 3868 4055 3605 34759;34760;34761;34762;34763;34764;34765;34766;34767;34768;34769 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type;Proteasome subunit beta type yes no 0 1 0 1 1 53.714 53.714 2 0.0042365 51717 QUIQUE_C1368_190116_001 59.67 44.98 72211000 0 0 44806000 0 0 0 0 0 0 0 0 27406000 0 3884 2246 3618 34937;34938 44677;44678 44677 1601 2 ATCISPGVVETQFAFK Unmodified 1753.8709 0.87090667 3407 Q6UWP2;A0A087WZN3 DHRS11 Dehydrogenase/reductase SDR family member 11 yes no 0 0 0 1 1 110.73 110.73 2 0.0013469 115439 QUIQUE_C1438_190116_001 65.234 54.482 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3885 3407 3619 34939;34940 44679;44680 44680 2 ATDAEADVASLNR Unmodified 1331.6317 0.63172225 3424;557;3325 Q6ZN40;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951 TPM1;TPM2b;TPM2 Tropomyosin beta chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.162 49.162 2 2.7567E-07 46823 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.63 134.43 1121300000 134700000 207320000 132580000 97207000 195540000 82434000 90194000 0 38424000 41314000 49635000 0 51963000 + 3886 3424;557;3325 3620 34941;34942;34943;34944;34945;34946;34947;34948;34949;34950;34951;34952 44681;44682;44683;44684;44685;44686;44687;44688;44689;44690;44691;44692 44689 11 ATDAMAHVAGFTVAHDVSAR Oxidation (M) 2041.964 0.9639722 3860;3380 Q6P2I3;Q96GK7 FAHD2B;FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B;Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A no no 0 1 0 1 1 1 1 1 47.309 47.309 3 2.1897E-05 44650 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.801 68.251 228940000 79878000 42498000 0 34073000 33321000 0 0 0 39170000 0 0 0 0 3887 3380;3860 3621 34953;34954;34955;34956;34957 44693;44694;44695;44696;44697;44698 44698 2649 4 ATDAMAHVAGFTVAHDVSAR Unmodified 2025.9691 0.96905758 3860;3380 Q6P2I3;Q96GK7 FAHD2B;FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B;Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 66.267 66.267 3;4 4.686E-38 65975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.6 145.51 2486000000 174860000 227090000 255740000 227430000 178200000 301110000 120430000 109420000 139140000 94922000 235600000 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2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 78.684 78.684 2;3 7.7966E-37 79447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 182.41 157.57 15452000000 1477900000 1562900000 1446100000 1303100000 1118400000 1195000000 1581100000 877820000 814180000 401990000 1326600000 1296300000 1051100000 3890 2146 3623 34993;34994;34995;34996;34997;34998;34999;35000;35001;35002;35003;35004;35005;35006;35007;35008;35009;35010;35011;35012;35013;35014;35015;35016;35017;35018 44748;44749;44750;44751;44752;44753;44754;44755;44756;44757;44758;44759;44760;44761;44762;44763;44764;44765;44766;44767;44768;44769;44770;44771;44772;44773;44774;44775;44776;44777;44778;44779;44780;44781;44782;44783;44784;44785;44786;44787;44788 44771 41 ATDETDRDIIREPLTELK Unmodified 2114.0855 0.085527128 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 2 2 75.222 75.222 3;4 0.039386 76072 QUIQUE_DMIX3_190116_001 24.594 15.993 29913000 0 0 0 0 0 0 0 0 29913000 0 0 0 0 3891 1187 3624 35019;35020 44789;44790 44789 2 ATDFVADR Unmodified 893.4243 0.42429566 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.79 25.79 2 0.00033036 20093 QUIQUE_C1218_190116_001 159.04 109.68 17038000000 1289200000 1290900000 1500900000 1292100000 1231600000 1259000000 1280800000 1067300000 1491900000 472680000 2017200000 1449300000 1395400000 3892 2518 3625 35021;35022;35023;35024;35025;35026;35027;35028;35029;35030;35031;35032;35033 44791;44792;44793;44794;44795;44796;44797;44798;44799;44800;44801;44802;44803;44804 44791 13 ATDFVVPGPGK Unmodified 1086.571 0.5709599 1662 O75874;C9J4N6 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.425 55.425 2 0.0059934 55099 QUIQUE_C1218_190116_001 85.731 65.21 2246200000 161090000 183990000 202720000 208440000 188080000 184860000 182930000 0 190100000 105310000 212510000 192500000 233660000 3893 1662 3626 35034;35035;35036;35037;35038;35039;35040;35041;35042;35043;35044;35045 44805;44806;44807;44808;44809;44810;44811;44812;44813;44814;44815;44816 44805 9 ATDKDITGTLSNPEVFNYGVETHEAYK Unmodified 2998.4196 0.4196108 2099 P16083;Q5TD07;Q5TD05 NQO2 Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase [quinone] yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 96.629 96.629 3 4.8327E-27 99270 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.55 86.879 423170000 0 73752000 0 0 91936000 0 0 0 80626000 0 0 81084000 95769000 3894 2099 3627 35046;35047;35048;35049;35050 44817;44818;44819;44820;44821;44822 44819 6 ATDLGGTSQAGTSQR Unmodified 1448.6855 0.68554874 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.568 18.568 2 1.5996E-35 11295 QUIQUE_C1218_190116_001 172.13 150.76 466990000 46365000 37626000 37909000 46005000 36762000 39765000 39745000 50917000 37887000 11301000 50878000 31833000 0 3895 3453 3628 35051;35052;35053;35054;35055;35056;35057;35058;35059;35060;35061;35062;35063 44823;44824;44825;44826;44827;44828;44829;44830;44831;44832;44833;44834;44835 44823 13 ATDLRPIYISVQPPSLHVLEQR Unmodified 2531.386 0.38600667 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH2;B1ANG9;B1ANH3 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 2 115.3 115.3 3;4 3.0863E-08 120340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.09 81.138 4687500000 136780000 628640000 740790000 151830000 477730000 228350000 209370000 133140000 150540000 198570000 219620000 453450000 958720000 3896 3194 3629 35064;35065;35066;35067;35068;35069;35070;35071;35072;35073;35074;35075;35076;35077;35078;35079;35080;35081;35082 44836;44837;44838;44839;44840;44841;44842;44843;44844;44845;44846;44847;44848;44849;44850;44851;44852;44853;44854;44855;44856;44857 44851 19 ATDQVVALACAFNK Unmodified 1506.7501 0.75006325 1402 O00408;E9PEF1;H0YFL1;H0YG13 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 101.53 101.53 2 0.043916 104654 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.415 48.725 113880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47495000 66381000 3897 1402 3630 35083;35084 44858;44859 44859 2 ATDSSDPLKPYQDFIIDSR Unmodified 2167.0433 0.043327963 3923 Q96Q11 TRNT1 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 121.2 121.2 3 0.0059726 126323 QUIQUE_C1218_190116_001 58.997 50.908 78096000 28831000 0 0 26123000 0 23142000 0 0 0 0 0 0 0 3898 3923 3631 35085;35086;35087 44860;44861;44862 44860 2 ATDSWALAVDEQEAAAESLSNLHLK Acetyl (Protein N-term) 2710.3086 0.30860379 1021 F6QDS0;H3BTX1 DDX19A;DDX19B no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 164.82 164.82 3 6.5063E-18 169843 QUIQUE_C1368_190116_001 101.41 95.189 181510000 0 23515000 28105000 44586000 24436000 27026000 0 0 0 11098000 0 0 22744000 3899 1021 3632 35088;35089;35090;35091;35092;35093;35094 44863;44864;44865;44866;44867;44868;44869 44864 7 ATDTSQGELVHPK Acetyl (Protein N-term) 1423.6943 0.69432251 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;B0QZK8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 no no 1 0 0 1 36.546 36.546 2 0.0009366 32981 QUIQUE_C1438_190116_001 96.113 80.963 23138000 0 0 0 0 23138000 0 0 0 0 0 0 0 0 3900 3297 3633 35095 44870 44870 1 ATDVMIAGK Unmodified 904.4688 0.46880301 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.909 25.909 2 0.0053778 19624 QUIQUE_C1368_190116_001 86.833 55.543 1757900000 172000000 160370000 203670000 163080000 128340000 139280000 150690000 0 155100000 0 184810000 128860000 171670000 3901 2219 3634 35096;35097;35098;35099;35100;35101;35102;35103;35104;35105;35106 44871;44872;44873;44874;44875;44876;44877;44878;44879;44880;44881 44873 8 ATEDEGSEQKIPEATNR Unmodified 1873.8654 0.8653636 1798 P01008;Q8TCE1 SERPINC1 Antithrombin-III yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 23.076 23.076 2;3 2.2117E-12 16489 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.56 111.02 281060000 26546000 46046000 36346000 0 60602000 0 0 0 0 0 56807000 0 54716000 3902 1798 3635 35107;35108;35109;35110;35111;35112;35113 44882;44883;44884;44885;44886;44887;44888 44887 6 ATEDGTPYDPYK Unmodified 1355.5881 0.5881261 2192 P22059 OSBP Oxysterol-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 44.996 44.996 2 0.0045747 42250 QUIQUE_C1368_190116_001 84.817 78.513 44690000 0 0 44690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3903 2192 3636 35114 44889 44889 0 ATEEFIIR Acetyl (Protein N-term) 1019.5288 0.52876073 3086 Q14764;H3BQK6;H3BRL2;H3BUK7;H3BNF6;H3BP76;H3BPZ2;H3BNF2;H3BUP3;H3BQE7 MVP Major vault protein yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.27 110.27 2 0.0002037 113405 QUIQUE_C1277_190116_001 157.21 124.37 355520000 27349000 38241000 55556000 50013000 0 37311000 0 34636000 0 24534000 41465000 0 46411000 3904 3086 3637 35115;35116;35117;35118;35119;35120;35121;35122;35123;35124;35125;35126 44890;44891;44892;44893;44894;44895;44896;44897;44898;44899;44900;44901 44892 12 ATEEKKPETEAAR Acetyl (Protein N-term) 1500.742 0.74200098 2733 P61964;V9GYQ5;V9GZ59 WDR5 WD repeat-containing protein 5 yes no 1 0 2 1 1 1 1 11.778 11.778 3 7.8996E-08 4126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.22 96.102 72921000 0 0 0 0 0 0 0 0 10801000 0 23954000 28325000 9841400 3905 2733 3638 35127;35128;35129;35130 44902;44903;44904;44905 44902 1 ATEGLHENETLASLK Acetyl (Protein N-term) 1653.821 0.82097959 1173 H0YNW7;Q96F32 GNB5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.041 80.041 2 9.8435E-112 81119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 249.66 205.34 2126000000 167530000 197490000 173020000 167320000 164380000 158790000 173240000 201560000 157470000 0 202140000 178690000 184370000 3906 1173 3639 35131;35132;35133;35134;35135;35136;35137;35138;35139;35140;35141;35142 44906;44907;44908;44909;44910;44911;44912;44913;44914;44915;44916;44917;44918 44915 13 ATEGMILTNHDHQIR Acetyl (Protein N-term) 1776.8577 0.85771622 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;G3V4R0;G3V355;G3V4D2 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 1 0 0 1 1 1 62.458 62.458 3 0.0012859 61642 QUIQUE_C1277_190116_001 77.204 67.674 263950000 85412000 101260000 0 0 0 0 0 0 77277000 0 0 0 0 3907 998 3640 35143;35144;35145 44919;44920;44921 44920 0 ATEGMVVADK Unmodified 1019.4957 0.49574604 3952 Q99436;Q5TBG5 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.285 22.285 2 0.0016837 15533 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.692 71.263 1301200000 0 0 152200000 143080000 134170000 130850000 115670000 104800000 129450000 46305000 155590000 0 189110000 3908 3952 3641 35146;35147;35148;35149;35150;35151;35152;35153;35154;35155 44922;44923;44924;44925;44926;44927;44928;44929;44930;44931;44932 44930 11 ATEGMVVADKNCSK Unmodified 1508.6963 0.69631312 3952 Q99436;Q5TBG5 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 15.828 15.828 2;3 1.3257E-27 8548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.67 144.54 233220000 0 0 0 0 0 0 0 84239000 31119000 0 68912000 48952000 0 3909 3952 3642 35156;35157;35158;35159;35160;35161;35162;35163 44933;44934;44935;44936;44937;44938;44939;44940;44941 44935 9 ATEHLSTLSEK Unmodified 1214.6143 0.61428128 1821 P02647;F8W696 APOA1 Apolipoprotein A-I;Proapolipoprotein A-I;Truncated apolipoprotein A-I yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 2 2 17.178 17.178 2;3 1.8345E-84 9750 QUIQUE_C1438_190116_001 241.13 170.87 4308800000 0 161780000 138050000 499470000 1501800000 351000000 131900000 0 437490000 99935000 534160000 453150000 0 3910 1821 3643 35164;35165;35166;35167;35168;35169;35170;35171;35172;35173;35174;35175;35176;35177;35178 44942;44943;44944;44945;44946;44947;44948;44949;44950;44951;44952;44953;44954;44955;44956;44957;44958 44946 14 ATEILNLLLK Unmodified 1126.6962 0.69616041 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.39 130.39 2 0.00019641 135857 QUIQUE_C1576_190116_001 119.27 94.352 965140000 101570000 109590000 77405000 72804000 0 0 83542000 100210000 69250000 50912000 95149000 95759000 108950000 3911 1568 3644 35179;35180;35181;35182;35183;35184;35185;35186;35187;35188;35189 44959;44960;44961;44962;44963;44964;44965;44966;44967;44968;44969;44970;44971;44972 44965 12 ATELEYESVLCVKPDVSVYR Acetyl (Protein N-term) 2398.1726 0.17262758 387 F5GYH1;A0A1W2PRM0;A0A1W2PRL5;A0A1W2PR09;Q8NC96;A0A1W2PR27;A0A1W2PPF5;A0A1W2PRQ7;A0A1W2PNT6 NECAP1 Adaptin ear-binding coat-associated protein 1 yes no 1 0 1 1 2 2 1 2 1 1 141.45 141.45 2;3 2.5821E-38 145557 QUIQUE_C1403_190116_001 152.99 133.15 223240000 38964000 85003000 0 32822000 0 0 29441000 0 0 0 0 37014000 0 3912 387 3645 35190;35191;35192;35193;35194;35195;35196;35197;35198;35199 44973;44974;44975;44976;44977;44978;44979;44980;44981;44982 44977 9 ATELKLEATQDMTPSSK Oxidation (M) 1864.9088 0.90880832 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 1 2 36.062 36.062 2;3 1.6687E-36 31590 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.04 148.27 76856000 0 0 0 0 0 0 0 76856000 0 0 0 0 0 3913 2009 3646 35200;35201 44983;44984 44984 1292 2 ATELKLEATQDMTPSSK Unmodified 1848.9139 0.91389369 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 54.296 54.296 3 0.00017307 52110 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.419 77.042 58874000 0 0 0 0 0 0 0 58874000 0 0 0 0 0 3914 2009 3646 35202 44985 44985 1 ATEMLIFGK Unmodified 1008.5314 0.53140327 236 A0A0C4DGA2;O75521 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.673 84.673 2 0.0017546 84950 QUIQUE_C1563_190116_001 100.45 83.675 716030000 103040000 0 0 0 68306000 67471000 0 65667000 86586000 30740000 106420000 83798000 104000000 3915 236 3647 35203;35204;35205;35206;35207;35208;35209;35210;35211 44986;44987;44988;44989;44990;44991;44992;44993;44994 44988 6 ATENDIANFFSPLNPIR Unmodified 1917.9585 0.95847612 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 151.92 151.92 2;3 6.7709E-76 156962 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.18 131.69 7320700000 496900000 498910000 574200000 432310000 653490000 501500000 539390000 596730000 692270000 198140000 800060000 758730000 578110000 3916 2340 3648 35212;35213;35214;35215;35216;35217;35218;35219;35220;35221;35222;35223;35224;35225;35226;35227;35228;35229 44995;44996;44997;44998;44999;45000;45001;45002;45003;45004;45005;45006;45007;45008;45009;45010;45011;45012;45013;45014;45015;45016;45017;45018;45019;45020;45021;45022;45023;45024;45025 45011 30 ATENDIYNFFSPLNPMR Unmodified 2027.9411 0.9411115 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 156.68 156.68 2;3 1.812E-75 159356 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.7 140.41 3187900000 323360000 294910000 305460000 220270000 216200000 177920000 247760000 247410000 221670000 46630000 410360000 286940000 188990000 3917 2672 3649 35230;35231;35232;35233;35234;35235;35236;35237;35238;35239;35240;35241;35242;35243;35244;35245;35246;35247;35248;35249;35250;35251;35252;35253;35254 45026;45027;45028;45029;45030;45031;45032;45033;45034;45035;45036;45037;45038;45039;45040;45041;45042;45043;45044;45045;45046;45047;45048;45049;45050;45051;45052;45053;45054;45055;45056;45057;45058 45046 33 ATENDIYNFFSPLNPMR Oxidation (M) 2043.936 0.93602612 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.98 145.98 2 6.791E-05 148778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.756 82.194 528540000 0 63482000 17013000 45098000 0 48012000 33871000 53304000 52017000 35994000 69738000 47886000 62126000 3918 2672 3649 35255;35256;35257;35258;35259;35260;35261;35262;35263;35264;35265;35266;35267 45059;45060;45061;45062;45063;45064;45065;45066;45067;45068;45069;45070;45071;45072;45073 45067 2112 14 ATENDIYNFFSPLNPVR Unmodified 1995.969 0.96904081 2609;905 P52597;E9PCY7;G8JLB6;P31943;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7 HNRNPF;HNRNPH1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 2 1 2 152.5 152.5 2;3 1.5286E-88 158151 QUIQUE_C1368_190116_001 257.95 235.23 8027800000 646280000 795610000 749820000 651320000 708770000 632210000 477530000 621630000 727880000 235280000 763030000 428940000 589450000 3919 2609;905 3650 35268;35269;35270;35271;35272;35273;35274;35275;35276;35277;35278;35279;35280;35281;35282;35283;35284;35285;35286;35287;35288;35289;35290;35291;35292 45074;45075;45076;45077;45078;45079;45080;45081;45082;45083;45084;45085;45086;45087;45088;45089;45090;45091;45092;45093;45094;45095;45096;45097;45098;45099;45100;45101;45102;45103;45104;45105;45106;45107;45108;45109;45110 45083 35 ATENTVNPCPDDTLISFLPLAHMFER Unmodified 2987.4157 0.41572817 2354 P33121;E7EPM6;B7Z3Z9;D6RER0 ACSL1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 166.96 166.96 3 8.5913E-20 170055 QUIQUE_C1403_190116_001 103.53 97.651 178570000 0 43200000 0 58072000 22393000 0 54909000 0 0 0 0 0 0 3920 2354 3651 35293;35294;35295;35296 45111;45112;45113;45114 45112 4 ATEPVIAFYEK Unmodified 1266.6496 0.64960415 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 2 82.76 82.76 1;2 1.4315E-15 79869 QUIQUE_DMIX4_190116_001 183.67 139.87 8658300000 0 0 0 0 7627300000 0 165840000 0 0 865100000 0 0 0 3921 1791 3652 35297;35298;35299;35300 45115;45116;45117;45118;45119 45119 3 ATEPVIAFYEKR Unmodified 1422.7507 0.75071518 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 63.986 63.986 2;3 4.7438E-07 64024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.11 125.11 799700000 0 0 0 0 0 0 0 319140000 177260000 0 72780000 142980000 87544000 3922 1791 3653 35301;35302;35303;35304;35305;35306;35307;35308;35309 45120;45121;45122;45123;45124;45125;45126;45127;45128;45129;45130;45131;45132;45133;45134;45135;45136;45137 45125 18 ATEQYYAMK Unmodified 1103.4957 0.49574604 167 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1 PRKACB cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.137 32.137 2 0.0016745 26955 QUIQUE_C1277_190116_001 101.28 83.59 815480000 121620000 160890000 112680000 100660000 0 0 94755000 95404000 91886000 37595000 0 0 0 3923 167 3654 35310;35311;35312;35313;35314;35315;35316;35317 45138;45139;45140;45141;45142;45143;45144;45145;45146 45140 7 ATESGAQSAPLPMEGVDISPK Unmodified 2084.0096 0.0095849934 2876 Q02790;F5H120 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.248 92.248 2 1.1559E-08 94428 QUIQUE_C1368_190116_001 131.24 115.65 917700000 65391000 93412000 67198000 94179000 58835000 62680000 81570000 70157000 59733000 25210000 86693000 72160000 80484000 3924 2876 3655 35318;35319;35320;35321;35322;35323;35324;35325;35326;35327;35328;35329;35330 45147;45148;45149;45150;45151;45152;45153;45154;45155;45156;45157;45158;45159;45160;45161 45149 14 ATESGAQSAPLPMEGVDISPK Oxidation (M) 2100.0045 0.0044996155 2876 Q02790;F5H120 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.323 71.323 2 6.6834E-19 72538 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ATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNDIYQWCGSSSNR Unmodified 4036.7632 0.76323007 788 CON__Q3SX14 yes yes 0 0 0 1 164.97 164.97 3 1.0531E-07 172308 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.033 51.686 100840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100840000 0 0 + 3928 788 3658 35349 45180 45180 1 ATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNR Unmodified 4036.7857 0.78569685 166;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 161.08 161.08 3 3.5789E-257 163363 QUIQUE_DMIX1_190116_001 241.41 238.29 1668900000 30562000 0 82629000 64362000 93639000 32772000 141520000 179520000 285970000 13483000 220350000 338690000 185430000 3929 166;3305;311 3659 35350;35351;35352;35353;35354;35355;35356;35357;35358;35359;35360;35361;35362 45181;45182;45183;45184;45185;45186;45187;45188;45189;45190;45191;45192;45193;45194 45188 14 ATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNRYER Unmodified 4484.9927 0.99272951 166;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 1 1 1 1 153.65 153.65 4 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35411;35412;35413;35414;35415;35416;35417;35418;35419;35420;35421;35422;35423 45258;45259;45260;45261;45262;45263;45264;45265;45266;45267;45268;45269;45270;45271;45272 45270 15 ATFMVGSYGPRPEEYEFLTPVEEAPK Oxidation (M) 2959.395 0.39497595 2607 P52566;H0YGX7 ARHGDIB Rho GDP-dissociation inhibitor 2 yes no 0 1 1 1 127.08 127.08 3 2.3201E-07 129767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.814 54.381 59073000 0 0 0 0 0 0 0 59073000 0 0 0 0 0 3937 2607 3666 35424 45273 45273 2067 1 ATFQTPDFIVPLTDLR Unmodified 1832.9672 0.96724989 1854 P04114 APOB Apolipoprotein B-100;Apolipoprotein B-48 yes yes 0 0 0 1 1 151.08 151.08 2 0.0019938 153515 QUIQUE_C1563_190116_001 64.121 44.99 30345000 0 0 0 0 0 21735000 0 0 0 8610000 0 0 0 3938 1854 3667 35425;35426 45274;45275;45276 45274 3 ATFSEFAAK Unmodified 970.476 0.47599688 1445 O14776;G3V220 TCERG1 Transcription elongation regulator 1 yes no 0 0 0 1 47.24 47.24 2 0.052818 44728 QUIQUE_C1368_190116_001 49.96 30.446 35349000 0 0 35349000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3939 1445 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35443;35444;35445;35446;35447;35448;35449 45307;45308;45309;45310;45311;45312;45313;45314;45315 45310 9 ATFSSVPLAASISAVSLEVAQPGPSNRPR Unmodified 2908.5407 0.54066941 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 1 134.34 134.34 3 1.7447E-14 140935 QUIQUE_C1438_190116_001 78.991 69.28 192990000 0 40592000 59027000 0 93376000 0 0 0 0 0 0 0 0 3942 2834 3671 35450;35451;35452 45316;45317;45318 45318 1 ATFYLLIGNANAAKPDLDK Unmodified 2034.0786 0.078591257 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 107.68 107.68 2;3 1.1406E-05 112707 QUIQUE_C1218_190116_001 119.32 87.676 775880000 106740000 0 36543000 0 0 0 42468000 0 45316000 69646000 312010000 0 163160000 3943 1689 3672 35453;35454;35455;35456;35457;35458;35459;35460;35461;35462 45319;45320;45321;45322;45323;45324;45325;45326;45327;45328;45329;45330 45321 11 ATFYLNVLEQK Unmodified 1324.7027 0.70270235 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.82 108.82 2 0.0056344 106223 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.974 60.187 340740000 34197000 43876000 31986000 29267000 37718000 0 45112000 41426000 0 15279000 0 61882000 0 3944 4645 3673 35463;35464;35465;35466;35467;35468;35469;35470;35471 45331;45332;45333;45334;45335;45336;45337;45338;45339;45340 45338 9 ATFYLNVLQQR Unmodified 1351.7248 0.72483478 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 1 107.21 107.21 2 0.013011 111713 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.621 42.591 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3945 4396 3674 35472;35473 45341;45342 45342 2 ATGEADVEFVTHEDAVAAMSK Unmodified 2176.9947 0.99466321 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.288 92.288 3 9.7578E-11 94492 QUIQUE_C1368_190116_001 93.73 51.607 313860000 0 56964000 53087000 0 37255000 0 0 32271000 49696000 29093000 0 0 55497000 3946 2340 3675 35474;35475;35476;35477;35478;35479;35480 45343;45344;45345;45346;45347;45348;45349;45350;45351;45352 45346 10 ATGEADVEFVTHEDAVAAMSK Oxidation (M) 2192.9896 0.98957783 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 1 0 1 75.72 75.72 3 3.3753E-05 71551 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.227 55.332 22741000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22741000 0 0 0 3947 2340 3675 35481 45353 45353 1740 1 ATGEESTQAEISCESPFLAK Unmodified 2153.9787 0.9786788 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 88.148 88.148 2 1.7356E-101 89940 QUIQUE_C1277_190116_001 250.52 240.4 482670000 106810000 83168000 0 75138000 65850000 96327000 0 0 0 0 0 0 55379000 3948 2009 3676 35482;35483;35484;35485;35486;35487 45354;45355;45356;45357;45358;45359;45360;45361 45355 7 ATGGGYESDDAYHNAELFFLDIHNIHVMR Unmodified 3291.5044 0.50436026 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 0 0 1 1 139.37 139.37 5 6.1632E-05 143976 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.555 39.55 68222000 0 0 0 0 0 0 0 0 34740000 0 0 33482000 0 3949 3003 3677 35488;35489 45362;45363 45363 1 ATGGPYGSLGVDYEFEK Unmodified 1788.8206 0.82064524 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.68 101.68 2 3.7217E-30 104300 QUIQUE_C1277_190116_001 154.23 137.1 726980000 107980000 114200000 95668000 67431000 56059000 64048000 83584000 42640000 0 0 55335000 0 40041000 3950 335;1521 3678 35490;35491;35492;35493;35494;35495;35496;35497;35498;35499;35500 45364;45365;45366;45367;45368;45369;45370;45371;45372;45373;45374;45375;45376;45377 45366 13 ATGILLYGLASR Unmodified 1233.7081 0.70812208 2496 P47897;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RRI9;A0A0U1RQE9;A0A0U1RQU2;A0A0U1RQL2;F2Z2V6 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.59 104.59 2 0.00094349 107218 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.43 78.875 463370000 33110000 0 47842000 36639000 43546000 28357000 30227000 42458000 55182000 17286000 71139000 0 57585000 3951 2496 3679 35501;35502;35503;35504;35505;35506;35507;35508;35509;35510;35511 45378;45379;45380;45381;45382;45383;45384;45385;45386;45387;45388 45388 11 ATGMFLQYTVPGTEGVTQLK Unmodified 2140.0874 0.087441384 3988 Q9BQ24 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 128.94 128.94 2 1.0104E-37 133494 QUIQUE_DMIX3_190116_001 205.3 191.33 276670000 0 0 0 0 0 0 0 59871000 50366000 0 55025000 61509000 49896000 3952 3988 3680 35512;35513;35514;35515;35516 45389;45390;45391;45392;45393 45390 5 ATGPAAPPPR Unmodified 933.50321 0.50321468 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 13.774 13.774 2 4.5271E-05 5755 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.89 123.23 25418000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25418000 0 0 0 3953 16;1475 3681 35517 45394;45395;45396;45397 45395 4 ATGPAPGPTGER Unmodified 1109.5465 0.54653606 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.013 15.013 2 0.0010478 7028 QUIQUE_C1438_190116_001 83.862 65.086 1161200000 433280000 0 255730000 0 265210000 0 206980000 0 0 0 0 0 0 3954 3889 3682 35518;35519;35520;35521 45398;45399;45400;45401 45400 4 ATGPAPGPTGEREPAAGPGR Unmodified 1844.9129 0.91292291 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 21.399 21.399 2;3 7.178E-38 14579 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.13 123.34 2414000000 280930000 42789000 175800000 289050000 299210000 202820000 169070000 234850000 155120000 57757000 0 184520000 322120000 3955 3889 3683 35522;35523;35524;35525;35526;35527;35528;35529;35530;35531;35532;35533;35534;35535;35536;35537;35538;35539;35540 45402;45403;45404;45405;45406;45407;45408;45409;45410;45411;45412;45413;45414;45415;45416;45417;45418;45419;45420;45421;45422;45423;45424;45425;45426;45427 45421 25 ATGPLEAQALVK Unmodified 1196.6765 0.6764876 3398 Q6PL24 TMED8 Protein TMED8 yes yes 0 0 0 1 60.752 60.752 2 0.00075829 60888 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.681 67.81 37334000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37334000 0 0 3956 3398 3684 35541 45428 45428 1 ATGQSFSQGTTSR Unmodified 1326.6164 0.61640654 855 E7EPC8;Q9UQB3;D6RF55 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.126 17.126 2 1.0022E-23 9329 QUIQUE_C1563_190116_001 174.4 154.64 1126100000 0 0 90438000 126270000 97832000 119550000 92922000 107550000 135160000 0 103590000 82671000 170140000 3957 855 3685 35542;35543;35544;35545;35546;35547;35548;35549;35550;35551 45429;45430;45431;45432;45433;45434;45435;45436;45437;45438 45432 7 ATGQSHKPVPPTQVQK Unmodified 1701.9162 0.91621738 4494;981;1154 F1T0E5;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 10.359 10.359 3;4 2.6308E-38 2637 QUIQUE_DMIX7_190116_001 137.32 115.48 273890000 26524000 143940000 0 17034000 19764000 0 10634000 0 13873000 5484900 0 19674000 16961000 3958 981;1154;4494 3686 35552;35553;35554;35555;35556;35557;35558;35559;35560;35561;35562 45439;45440;45441;45442;45443;45444;45445;45446;45447;45448;45449 45448 10 ATGVNVNISDLK Unmodified 1229.6616 0.66156582 1291 J3KTA9;J3QQN7;Q8N9F7 GDPD1 Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 69.052 69.052 2 0.010257 68715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.342 28.964 66773000 0 0 0 0 0 38249000 0 28524000 0 0 0 0 0 3959 1291 3687 35563;35564 45450;45451 45451 1 ATGYLELSNWPEVAPDPSVR Unmodified 2200.08 0.08004782 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 136.77 136.77 2 0.0048482 139311 QUIQUE_C1563_190116_001 68.513 55.746 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3960 1386 3688 35565;35566 45452;45453 45453 2 ATGYQELPDWPEEAPDPSVR Unmodified 2256.0335 0.033491558 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.05 116.05 2 6.9537E-06 119845 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.943 85.743 506310000 52498000 56325000 58117000 44092000 59111000 56338000 35906000 49193000 0 0 0 38432000 56300000 3961 2990 3689 35567;35568;35569;35570;35571;35572;35573;35574;35575;35576 45454;45455;45456;45457;45458;45459;45460;45461;45462;45463;45464 45464 11 ATIAGGGVIPHIHK Unmodified 1369.783 0.78301836 1979 Q71UI9;P0C0S5 H2AFV;H2AFZ Histone H2A.V;Histone H2A.Z yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.547 36.547 3 0.00086881 32152 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.76 52.547 431550000 86625000 104030000 0 0 0 0 0 69538000 105240000 0 0 66116000 0 3962 1979 3690 35577;35578;35579;35580;35581 45465;45466;45467;45468;45469 45468 4 ATIEGYYQK Unmodified 1071.5237 0.52367535 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;D6RIS6 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 36.193 36.193 2 0.013967 31382 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.198 51.35 767850000 0 0 0 0 0 100640000 104740000 106300000 121410000 66357000 126270000 0 142140000 3963 1728 3691 35582;35583;35584;35585;35586;35587;35588 45470;45471;45472;45473;45474;45475;45476 45476 7 ATIELCSTHANDASALR Unmodified 1828.8738 0.87376021 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 51.849 51.849 2;3 5.3965E-17 49761 QUIQUE_C1277_190116_001 105.39 94.731 642690000 81969000 106560000 55462000 93856000 0 0 80667000 48899000 0 40812000 58192000 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35609;35610;35611;35612;35613;35614;35615;35616;35617;35618;35619;35620 45497;45498;45499;45500;45501;45502;45503;45504;45505;45506;45507;45508 45499 12 ATIGLIR Unmodified 742.47012 0.47012364 2084 P14923 JUP Junction plakoglobin yes yes 0 0 0 1 43.651 43.651 2 0.056495 38283 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.378 5.4805 17548000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17548000 0 0 0 3967 2084 3695 35621 45509 45509 1 ATILCTSYVQFK Unmodified 1429.7275 0.72753689 2373 P35244;B5MC59 RPA3 Replication protein A 14 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 95.653 95.653 2 0.0040231 93124 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.399 58.909 240820000 0 0 0 0 0 44707000 0 30349000 0 23377000 84486000 0 57899000 3968 2373 3696 35622;35623;35624;35625;35626 45510;45511;45512;45513;45514 45512 3 ATILYATETGK Unmodified 1166.6183 0.61830402 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 44.98 44.98 2 0.0012887 41637 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.149 67.362 39001000 0 0 0 0 0 0 0 39001000 0 0 0 0 0 3969 699 3697 35627;35628;35629;35630 45515;45516;45517;45518 45517 4 ATIQGVLR Unmodified 856.51305 0.51305109 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.68 38.68 2 0.0040378 35586 QUIQUE_C1218_190116_001 110.61 69.691 1634400000 154930000 189400000 0 170160000 167170000 130940000 169360000 0 172960000 55497000 217240000 206700000 0 3970 1749 3698 35631;35632;35633;35634;35635;35636;35637;35638;35639;35640 45519;45520;45521;45522;45523;45524;45525;45526;45527;45528;45529;45530;45531 45519 9 ATIRPVFDPSK Unmodified 1229.6768 0.67682195 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 42.002 42.002 3 0.032808 36452 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.383 19.602 44882000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44882000 0 0 0 3971 3061 3699 35641 45532 45532 1 ATISALEAK Unmodified 902.5073 0.50729701 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 31.64 31.64 2 0.026913 25856 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.23 25.418 117120000 0 86600000 0 0 0 0 0 0 0 30520000 0 0 0 3972 2379 3700 35642;35643 45533;45534 45534 1 ATISNDGATILK Unmodified 1202.6507 0.65066678 3977 Q99832;F8WAM2 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.387 48.387 2 4.0176E-07 46752 QUIQUE_C1218_190116_001 145.25 94.641 4847200000 294880000 374050000 453790000 335640000 404600000 335360000 437110000 283170000 342920000 150580000 515730000 399180000 520240000 3973 3977 3701 35644;35645;35646;35647;35648;35649;35650;35651;35652;35653;35654;35655;35656 45535;45536;45537;45538;45539;45540;45541;45542;45543;45544;45545;45546;45547;45548 45535 11 ATITCTR Acetyl (Protein N-term) 863.4171 0.41710179 4533 Q9UQM7;D6RFJ0 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes no 1 0 0 1 1 1 34.223 34.223 2 0.033329 29608 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.715 48.678 346630000 0 0 0 0 346630000 0 0 0 0 0 0 0 0 3974 4533 3702 35657;35658;35659 45549;45550;45551 45551 2 ATIVSLEDFEQR Unmodified 1406.7042 0.70415892 544 A6NIZ0;Q9GZM8;J3KRK9;J3QL85 NDEL1 Nuclear distribution protein nudE-like 1 yes no 0 0 0 1 106 106 2 0.04706 109797 QUIQUE_C1218_190116_001 54.471 37.24 26009000 26009000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3975 544 3703 35660 45552 45552 1 ATLADIVEQLQEK Unmodified 1456.7773 0.77732386 754 C9JY79;Q9H254 SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 140.08 140.08 2 0.010241 145440 QUIQUE_C1368_190116_001 63.944 37.898 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3976 754 3704 35661;35662;35663;35664 45553;45554;45555;45556 45554 4 ATLELTHNWGTEDDETQSYHNGNSDPR Unmodified 3086.3238 0.32381293 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 67.868 67.868 3;4 7.8296E-19 68378 QUIQUE_C1438_190116_001 89.829 83.031 733750000 39097000 71451000 0 44044000 180880000 0 57988000 36110000 0 193780000 65327000 45077000 0 3977 2888 3705 35665;35666;35667;35668;35669;35670;35671;35672;35673;35674;35675;35676;35677 45557;45558;45559;45560;45561;45562;45563;45564;45565;45566;45567;45568;45569;45570;45571 45563 15 ATLEMVNHEK Unmodified 1170.5703 0.57030797 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 19.712 19.712 2;3 0.0023157 12581 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.478 64.553 5492000000 575940000 1254600000 296510000 368180000 414140000 377180000 753470000 219060000 300970000 147290000 0 514530000 270100000 3978 869 3706 35678;35679;35680;35681;35682;35683;35684;35685;35686;35687;35688;35689;35690;35691;35692 45572;45573;45574;45575;45576;45577;45578;45579;45580;45581;45582;45583;45584;45585;45586 45583 4 ATLEMVNHEK Oxidation (M) 1186.5652 0.56522259 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 1 0 1 12.222 12.222 3 0.0067168 4467 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.359 44.146 2149200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2149200 0 0 0 3979 869 3706 35693 45587 45587 517 1 ATLENITNLRPVGEDFR Unmodified 1944.0065 0.0064889465 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 1 99.397 99.397 2;3 6.6317E-11 103513 QUIQUE_C1438_190116_001 120.66 112.01 3975900000 313860000 0 387440000 381620000 322550000 261530000 331000000 370870000 492200000 115720000 358010000 360880000 280160000 3980 4315 3707 35694;35695;35696;35697;35698;35699;35700;35701;35702;35703;35704;35705;35706;35707;35708;35709;35710;35711;35712 45588;45589;45590;45591;45592;45593;45594;45595;45596;45597;45598;45599;45600;45601;45602;45603;45604;45605;45606;45607;45608;45609;45610 45594 23 ATLITITNNIGSIAR Unmodified 1556.8886 0.88860564 461 A0A2R8YF29;Q9BZ23;V9GYH1 PANK2 Pantothenate kinase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 113.89 113.89 2 0.012035 117048 QUIQUE_C1403_190116_001 52.344 45.96 18842000 0 0 0 18842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3981 461 3708 35713 45611 45611 1 ATLKDQLIYNLLK Acetyl (Protein N-term) 1573.9079 0.9079441 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8;F5GZQ4;F5H8H6;F5GXC7;F5GWW2;F5GXU1 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 147.77 147.77 2 1.5746E-09 150864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.01 106.86 5454100000 0 0 0 0 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Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform yes yes 0 0 0 1 1 132.04 132.04 2 0.0080661 137115 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.674 34.688 102010000 0 0 56562000 0 0 0 0 0 45451000 0 0 0 0 3985 3118 3712 35727;35728 45626;45627 45627 2 ATLPDADKER Unmodified 1114.5619 0.56185177 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 15.972 15.972 3 0.0005155 8792 QUIQUE_C1218_190116_001 90.827 69.363 935040000 144340000 173910000 98803000 123910000 163590000 0 133960000 0 0 0 96533000 0 0 3986 1242;2047 3713 35729;35730;35731;35732;35733;35734;35735 45628;45629;45630;45631;45632;45633;45634;45635;45636 45628 8 ATLPSPDK Unmodified 827.43888 0.43888309 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 20.14 20.14 2 0.056538 12762 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.984 53.437 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3987 2197 3714 35736 45637 45637 1 ATLPSPDKLPGFK Unmodified 1369.7606 0.76055158 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 3 3 2 3 2 2 74.966 74.966 2;3 0.00071134 76069 QUIQUE_C1277_190116_001 64.224 58.038 3540200000 208320000 233140000 65814000 205980000 318700000 170050000 240850000 456290000 422800000 152270000 461480000 306540000 297980000 3988 2197 3715 35737;35738;35739;35740;35741;35742;35743;35744;35745;35746;35747;35748;35749;35750;35751;35752;35753;35754;35755;35756;35757;35758;35759;35760;35761;35762;35763 45638;45639;45640;45641;45642;45643;45644;45645;45646;45647;45648;45649;45650;45651;45652;45653;45654;45655;45656;45657;45658;45659;45660;45661;45662;45663;45664;45665;45666;45667;45668;45669;45670;45671;45672;45673;45674;45675;45676;45677;45678;45679;45680;45681;45682;45683;45684;45685;45686 45642 48 ATLPVFDKEELLECIQQLVK Unmodified 2372.2661 0.26613403 2644 P54687;F5H2F2;A0A087WYF2 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 162.73 162.73 2;3 2.4508E-22 166728 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63.885 63.885 2 0.003669 63304 QUIQUE_C1277_190116_001 124.83 37.551 1635000000 168920000 173670000 117150000 93269000 148000000 98575000 142990000 97470000 118470000 0 178180000 143760000 154590000 3991 981;4494;1236 3718 35781;35782;35783;35784;35785;35786;35787;35788;35789;35790;35791;35792 45705;45706;45707;45708;45709;45710;45711;45712;45713;45714;45715;45716;45717;45718;45719 45707 14 ATLSSTSGLDLMSESGEGEISPQR Unmodified 2451.1435 0.14351229 193 A0A0A0MTE2;E9PMT2;F8WD26;J3KP06;Q8WWI1;H0Y424;E9PMS6;E9PMP7;H0YDG6 LMO7 LIM domain only protein 7 yes no 0 0 0 1 46.918 46.918 3 0.060156 44010 QUIQUE_C1403_190116_001 19.549 2.7972 29536000 0 0 0 29536000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3992 193 3719 35793 45720 45720 1 ATLTDLVPGTEYGVGISAVMNSQQSVPATMNAR Unmodified 3377.6595 0.65954027 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 151.91 151.91 3 2.0363E-40 154902 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.91 91.652 134620000 0 0 0 0 0 0 0 47807000 37676000 0 0 49142000 0 3993 3753 3720 35794;35795;35796 45721;45722;45723 45721 3 ATLTLAMADWLR Unmodified 1360.7173 0.71730656 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 142.28 142.28 2 0.00060022 145592 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.86 78.749 104050000 0 0 0 0 0 0 0 29934000 38557000 0 0 0 35554000 3994 16;1475 3721 35797;35798;35799;35800;35801;35802;35803 45724;45725;45726;45727;45728;45729;45730 45727 7 ATLTQMLNVIFAR Unmodified 1476.8123 0.81226958 4652 Q9Y6D6 ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 164.6 164.6 2 0.0037285 168977 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.31 64.331 73826000 0 0 0 0 0 0 0 8189500 13271000 0 17532000 15891000 18944000 3995 4652 3722 35804;35805;35806;35807;35808 45731;45732;45733;45734;45735 45735 3 ATLTQMLNVIFTR Unmodified 1506.8228 0.82283426 4651 Q9Y6D5 ARFGEF2 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 162.35 162.35 2 0.00043246 166301 QUIQUE_C1277_190116_001 91.936 74.072 121170000 12454000 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45772;45773;45774;45775;45776;45777;45778;45779;45780;45781;45782;45783;45784;45785;45786;45787;45788;45789;45790;45791;45792;45793;45794;45795;45796;45797;45798;45799 45772 25 ATLYVTAIEDR Unmodified 1250.6507 0.65066678 953 E9PKG1;Q99873;E9PQ98;E9PIX6;H0YDE4;E9PNR9 PRMT1 Protein arginine N-methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 76.911 76.911 2 0.00046475 76948 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.16 92.442 213060000 0 110940000 0 0 0 0 0 102120000 0 0 0 0 0 4001 953 3728 35857;35858;35859;35860;35861;35862 45800;45801;45802;45803;45804;45805;45806 45805 7 ATMCNLLAYLK Unmodified 1296.657 0.65701449 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 128.3 128.3 2 0.0008802 134442 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.551 73.764 130710000 0 0 38882000 0 0 0 18541000 19153000 0 0 54133000 0 0 4002 119 3729 35863;35864;35865;35866 45807;45808;45809;45810 45810 4 ATMILTVGGTAYAIYELAVASFPK Oxidation (M) 2502.308 0.30799885 1109 H0UI06;P14406;D6R9C3 COX7A2 Cytochrome c oxidase subunit 7A2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 174.38 174.38 3 0.00027734 178008 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.061 44.947 17201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17201000 0 4003 1109 3730 35867 45811 45811 646 0 ATMYNLLAYIK Oxidation (M) 1315.6846 0.68460945 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 1 0 1 1 116.71 116.71 2 0.026915 122432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.735 49.631 33667000 0 0 33667000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4004 1452 3731 35868;35869 45812;45813 45813 2 ATMYNLLAYIK Unmodified 1299.6897 0.68969482 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 136.22 136.22 2 0.0035971 140526 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.069 78.492 618320000 0 0 0 0 55573000 26064000 0 87862000 91579000 0 305890000 51353000 0 4005 1452 3731 35870;35871;35872;35873;35874;35875 45814;45815;45816;45817;45818;45819 45819 6 ATNDEIFSILK Unmodified 1249.6554 0.65541781 2934 Q09161 NCBP1 Nuclear cap-binding protein subunit 1 yes yes 0 0 0 1 114.06 114.06 2 0.026172 118104 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.79 35.693 37702000 0 0 0 0 0 0 0 0 37702000 0 0 0 0 4006 2934 3732 35876 45820 45820 1 ATNFLAHEK Acetyl (Protein N-term) 1071.5349 0.53490874 2291;958 E9PL71;E9PN91;E9PKK3;E9PNW6;E9PJD0;P29692;E9PQZ1;E9PK01;E9PPR1;E9PL12;E9PQ49;E9PI39;E9PMW7;E9PK06;E9PK72 EEF1D Elongation factor 1-delta no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.259 57.259 2 0.00029495 55906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.61 89.115 3101500000 233280000 248920000 0 341830000 309360000 247560000 224110000 300280000 337240000 119340000 333380000 0 406150000 4007 958;2291 3733 35877;35878;35879;35880;35881;35882;35883;35884;35885;35886;35887;35888 45821;45822;45823;45824;45825;45826;45827;45828;45829;45830;45831;45832;45833;45834;45835;45836 45833 15 ATNIEQIFR Acetyl (Protein N-term) 1132.5877 0.58767259 2138 P18583;J3QSZ5 SON Protein SON yes no 1 0 0 1 1 136.21 136.21 2 0.018629 142490 QUIQUE_C1438_190116_001 60.91 46.753 13085000 0 0 0 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45890;45891;45892;45893;45894;45895;45896;45897;45898 45891 7 ATNWGSLLQDK Acetyl (Protein N-term) 1273.6303 0.63026569 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8YF34;A0A2R8Y2X9;A0A2R8Y6Y6;A0A2R8Y4V9;A0A2R8Y790;A0A2R8Y446;A0A0S2Z4J7;A0A2R8Y2F2 GSS Glutathione synthetase yes no 1 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 135.25 135.25 1;2 0.00057026 141128 QUIQUE_C1218_190116_001 111.61 75.211 816280000 88519000 116540000 0 83143000 0 103020000 88523000 0 0 58918000 146690000 0 130930000 4016 2513 3741 35937;35938;35939;35940;35941;35942;35943;35944;35945;35946;35947 45899;45900;45901;45902;45903;45904;45905;45906;45907;45908;45909;45910 45899 9 ATNWGSLLQDKQQLEELAR Acetyl (Protein N-term) 2241.139 0.13895968 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8YF34;A0A2R8Y2X9;A0A2R8Y6Y6;A0A2R8Y4V9;A0A2R8Y790;A0A2R8Y446;A0A0S2Z4J7;A0A2R8Y2F2 GSS Glutathione synthetase yes no 1 0 1 1 148.37 148.37 2 6.1678E-100 151159 QUIQUE_DMIX1_190116_001 212.87 191.92 53942000 0 0 0 0 0 0 0 53942000 0 0 0 0 0 4017 2513 3742 35948 45911 45911 1 ATPATAPGTSPR Unmodified 1125.5778 0.57783619 3913 Q96P47;H0Y873 AGAP3 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 15.677 15.677 2 0.0020815 7960 QUIQUE_C1218_190116_001 93.096 72.225 44675000 24452000 0 0 0 0 0 0 20223000 0 0 0 0 0 4018 3913 3743 35949;35950;35951;35952;35953 45912;45913;45914;45915;45916 45912 5 ATPATEESTVPTTQSSAMLATK Unmodified 2221.0784 0.07839284 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.734 66.734 2 5.427E-08 66377 QUIQUE_C1277_190116_001 125.75 111.5 265290000 41110000 37723000 49669000 50991000 34122000 23362000 0 28317000 0 0 0 0 0 4019 872;3632 3744 35954;35955;35956;35957;35958;35959;35960 45917;45918;45919;45920;45921;45922;45923 45918 7 ATPEQYQILK Unmodified 1189.6343 0.63428844 2073 P14324;A0A087X090 FDPS Farnesyl pyrophosphate synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.817 53.817 2 0.001716 51307 QUIQUE_C1563_190116_001 94.302 67.918 3958800000 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4052 3747 35977;35978;35979;35980;35981;35982;35983;35984;35985;35986;35987;35988 45942;45943;45944;45945;45946;45947;45948;45949;45950;45951;45952;45953;45954;45955 45951 14 ATPMPSRPSTTPFIDK Unmodified 1744.8818 0.8818057 880;1058 E7EVA0;P27816;B5MEG9;F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 57.437 57.437 2 1.4745E-18 55044 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.96 124.11 224410000 0 0 0 0 27109000 0 0 36293000 50685000 0 37164000 0 73160000 4023 880;1058 3748 35989;35990;35991;35992;35993 45956;45957;45958;45959;45960 45960 5 ATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLK Unmodified 3814.8036 0.80362155 4142 Q9H299 SH3BGRL3 SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3 yes yes 0 0 0 1 173.54 173.54 3 1.1576E-15 177777 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.625 72.078 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4024 4142 3749 35994 45961 45961 1 ATPQHTVSFTCESHGFSPR Unmodified 2144.9698 0.96978586 2803 P78324;Q5TFQ8 SIRPA;SIRPB1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1;Signal-regulatory protein beta-1 isoform 3 yes no 0 0 0 2 2 4 3 2 3 2 3 3 2 3 2 4 43.518 43.518 2;3;4 1.7344E-46 40790 QUIQUE_C1438_190116_001 143.39 133.01 4168000000 310100000 470620000 649890000 482370000 349540000 285450000 371970000 0 239540000 138630000 433670000 214830000 221430000 4025 2803 3750 35995;35996;35997;35998;35999;36000;36001;36002;36003;36004;36005;36006;36007;36008;36009;36010;36011;36012;36013;36014;36015;36016;36017;36018;36019;36020;36021;36022;36023;36024;36025;36026;36027;36028;36029 45962;45963;45964;45965;45966;45967;45968;45969;45970;45971;45972;45973;45974;45975;45976;45977;45978;45979;45980;45981;45982;45983;45984;45985;45986;45987;45988;45989;45990;45991;45992;45993;45994;45995;45996;45997;45998;45999;46000;46001;46002;46003;46004;46005;46006 45981 44 ATPSENLVPSSAR Unmodified 1327.6732 0.67319314 3605 Q8N684;F5H669;F5H6M0;F5H047 CPSF7 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 41.68 41.68 2 0.016168 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3756 36043;36044;36045;36046;36047;36048;36049;36050;36051;36052;36053;36054;36055;36056;36057;36058;36059 46022;46023;46024;46025;46026;46027;46028;46029;46030;46031;46032;46033;46034;46035;46036;46037;46038;46039;46040 46025 18 ATQPETTEEVTDLKR Unmodified 1716.853 0.853008 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 35.561 35.561 2;3 0.0013427 31206 QUIQUE_C1277_190116_001 89.548 73.657 141720000 0 18360000 0 0 0 0 0 0 0 0 97373000 25986000 0 4032 515 3757 36060;36061;36062 46041;46042;46043 46041 3 ATQQAEQLSNELATER Unmodified 1787.865 0.86496967 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 65.593 65.593 2 4.7655E-165 64948 QUIQUE_C1277_190116_001 253.42 229.67 117830000 0 62324000 40507000 0 0 0 0 0 0 14995000 0 0 0 4033 2385 3758 36063;36064;36065 46044;46045;46046;46047 46045 4 ATQQPFDVSAFNASYSDSGLFGIYTISQATAAGDVIK Unmodified 3839.853 0.85301458 2202 P22695;H3BRG4 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 3 3 2 169.65 169.65 3 1.4474E-32 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46078;46079;46080;46081;46082;46083;46084;46085;46086;46087;46088;46089;46090;46091;46092;46093;46094;46095;46096;46097;46098;46099;46100;46101;46102;46103;46104;46105;46106;46107;46108 46105 25 ATSEIFHSQSFLATGSNLR Unmodified 2065.0229 0.022867292 646 E7EW69;B5ME97;Q9P0V9;E7EX04 SEPT10 Septin-10 yes no 0 0 0 1 1 2 1 87.244 87.244 2;3 1.6025E-36 89208 QUIQUE_C1403_190116_001 189.09 173.89 234050000 0 0 0 20078000 26185000 0 0 0 98610000 0 0 0 89178000 4043 646 3768 36122;36123;36124;36125;36126 46109;46110;46111;46112;46113 46109 5 ATSETLAADPTPAATIVHFK Unmodified 2040.0528 0.052770437 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7;H0Y4U1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 85.413 85.413 3 0.012815 88497 QUIQUE_C1438_190116_001 26.742 21.763 196810000 0 0 0 0 63747000 59597000 0 0 0 0 0 0 73468000 4044 422 3769 36127;36128;36129 46114;46115;46116 46114 1 ATSFLLALEPELEAR Unmodified 1658.8879 0.88793694 1868 P04843;F8WF32 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.19 145.19 2 9.3278E-06 151019 QUIQUE_C1218_190116_001 104.07 89.912 561260000 46136000 53721000 40266000 50678000 53854000 39755000 54436000 49698000 70863000 20152000 81700000 0 0 4045 1868 3770 36130;36131;36132;36133;36134;36135;36136;36137;36138;36139;36140 46117;46118;46119;46120;46121;46122;46123;46124;46125;46126;46127 46117 9 ATSHVGEIEQELALAR Unmodified 1722.8901 0.89006221 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 1 84.762 84.762 2 0.01304 87719 QUIQUE_C1438_190116_001 52.576 44.063 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4046 2322 3771 36141;36142 46128;46129 46128 2 ATSIDPNTYITWIDK Unmodified 1736.8621 0.86211612 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 133.08 133.08 2 0.00047674 139885 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.362 73.617 81357000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 81357000 0 0 4047 3053 3772 36143 46130 46130 1 ATSISTQLPDDPAK Unmodified 1442.7253 0.72528829 4461 Q9UJW0;E5RGG1;H9KVE0 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 56.491 56.491 2 0.00064214 55041 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.24 84.46 407190000 0 0 94324000 0 0 0 0 0 64150000 38003000 110690000 0 100020000 4048 4461 3773 36144;36145;36146;36147;36148;36149;36150;36151 46131;46132;46133;46134;46135;46136;46137;46138;46139 46133 9 ATSITVTGSGSCR Unmodified 1295.614 0.6139637 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.889 22.889 2 0.00041967 16890 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.39 113.51 388810000 56728000 38368000 29358000 36723000 49440000 40930000 33730000 32991000 0 21631000 0 0 48908000 4049 3043 3774 36152;36153;36154;36155;36156;36157;36158;36159;36160;36161;36162 46140;46141;46142;46143;46144;46145;46146;46147;46148;46149;46150;46151 46148 8 ATSLGSNTYNR Acetyl (Protein N-term) 1224.5735 0.57347909 844 E5RJW4;Q9NW64 RBM22 Pre-mRNA-splicing factor RBM22 yes no 1 0 0 1 55.393 55.393 2 0.0088076 53243 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.345 57.565 19931000 0 0 0 0 0 0 0 19931000 0 0 0 0 0 4050 844 3775 36163 46152 46152 0 ATSNLTQENMPTLFVESVLEVHGK Unmodified 2643.3214 0.32141708 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 148.88 148.88 3 0.0036545 154226 QUIQUE_C1218_190116_001 34.723 32.216 101880000 67081000 0 0 0 0 34798000 0 0 0 0 0 0 0 4051 196 3776 36164;36165 46153;46154 46153 2 ATSNVFAMFDQSQIQEFK Unmodified 2089.9779 0.97789093 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 2 2 2 2 2 143.59 143.59 2;3 1.1144E-75 149323 QUIQUE_C1368_190116_001 198.37 191.24 3001900000 260090000 362250000 342300000 0 238100000 173730000 241830000 158290000 268250000 60962000 316110000 276800000 303230000 4052 1303;2234 3777 36166;36167;36168;36169;36170;36171;36172;36173;36174;36175;36176;36177;36178;36179;36180;36181;36182;36183;36184;36185 46155;46156;46157;46158;46159;46160;46161;46162;46163;46164;46165;46166;46167;46168;46169;46170;46171;46172;46173;46174;46175;46176;46177 46160 21 ATSNVFAMFDQSQIQEFK Oxidation (M) 2105.9728 0.97280556 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 126.35 126.35 2 1.2647E-53 131031 QUIQUE_C1368_190116_001 181.76 170.32 207220000 0 70476000 54044000 36265000 46438000 0 0 0 0 0 0 0 0 4053 1303;2234 3777 36186;36187;36188;36189;36190 46178;46179;46180;46181;46182 46179 742 4 ATSSSSGSLSATGR Unmodified 1267.6004 0.60042213 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 14.571 14.571 2 3.1347E-10 6387 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.83 101.66 267600000 0 13723000 0 0 0 0 0 90067000 0 163810000 0 0 0 4054 2886 3778 36191;36192;36193;36194;36195 46183;46184;46185;46186;46187;46188 46186 5 ATSTATSGFAGAIGQK Unmodified 1466.7365 0.73652168 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.657 49.657 2 2.537E-44 46697 QUIQUE_C1368_190116_001 181.68 146.03 1665300000 0 192150000 231980000 156990000 160120000 0 166470000 139480000 0 69638000 187610000 193950000 166910000 4055 455 3779 36196;36197;36198;36199;36200;36201;36202;36203;36204;36205 46189;46190;46191;46192;46193;46194;46195;46196;46197;46198;46199;46200;46201 46192 13 ATSVALTWSR Unmodified 1090.5771 0.57710791 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.356 63.356 2 0.00036904 62352 QUIQUE_C1403_190116_001 113.18 82.564 1406500000 209580000 248960000 0 171920000 252000000 0 231630000 0 135660000 0 156720000 0 0 4056 2948 3780 36206;36207;36208;36209;36210;36211;36212 46202;46203;46204;46205;46206;46207;46208;46209;46210;46211;46212 46206 11 ATSVPGPAQAAAPPEVGR Unmodified 1674.8689 0.86893283 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 57.068 57.068 2 0.00020308 55075 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.84 94.305 39563000 0 0 0 0 0 0 0 39563000 0 0 0 0 0 4057 4517 3781 36213 46213 46213 1 ATTAALLLEAQAATGFLVDPVR Unmodified 2227.2212 0.22123275 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 7 10 14 5 10 3 11 19 16 4 29 22 8 171.6 171.6 2;3 7.0874E-100 172288 QUIQUE_C1368_190116_001 249.13 203.87 9840300000 438580000 486450000 1032400000 215940000 618710000 216490000 905470000 751010000 957110000 661320000 1618700000 1411700000 526490000 4058 3117 3782 36214;36215;36216;36217;36218;36219;36220;36221;36222;36223;36224;36225;36226;36227;36228;36229;36230;36231;36232;36233;36234;36235;36236;36237;36238;36239;36240;36241;36242;36243;36244;36245;36246;36247;36248;36249;36250;36251;36252;36253;36254;36255;36256;36257;36258;36259;36260;36261;36262;36263;36264;36265;36266;36267;36268;36269;36270;36271;36272;36273;36274;36275;36276;36277;36278;36279;36280;36281;36282;36283;36284;36285;36286;36287;36288;36289;36290;36291;36292;36293;36294;36295;36296;36297;36298;36299;36300;36301;36302;36303;36304;36305;36306;36307;36308;36309;36310;36311;36312;36313;36314;36315;36316;36317;36318;36319;36320;36321;36322;36323;36324;36325;36326;36327;36328;36329;36330;36331;36332;36333;36334;36335;36336;36337;36338;36339;36340;36341;36342;36343;36344;36345;36346;36347;36348;36349;36350;36351;36352;36353;36354;36355;36356;36357;36358;36359;36360;36361;36362;36363;36364;36365;36366;36367;36368;36369;36370;36371 46214;46215;46216;46217;46218;46219;46220;46221;46222;46223;46224;46225;46226;46227;46228;46229;46230;46231;46232;46233;46234;46235;46236;46237;46238;46239;46240;46241;46242;46243;46244;46245;46246;46247;46248;46249;46250;46251;46252;46253;46254;46255;46256;46257;46258;46259;46260;46261;46262;46263;46264;46265;46266;46267;46268;46269;46270;46271;46272;46273;46274;46275;46276;46277;46278;46279;46280;46281;46282;46283;46284;46285;46286;46287;46288;46289;46290;46291;46292;46293;46294;46295;46296;46297;46298;46299;46300;46301;46302;46303;46304;46305;46306;46307;46308;46309;46310;46311;46312;46313;46314;46315;46316;46317;46318;46319;46320;46321;46322;46323;46324;46325;46326;46327;46328;46329;46330;46331;46332;46333;46334;46335;46336;46337;46338;46339;46340;46341;46342;46343;46344;46345;46346;46347;46348;46349;46350;46351;46352;46353;46354;46355;46356;46357;46358;46359;46360;46361;46362;46363;46364;46365;46366;46367;46368;46369;46370;46371;46372;46373;46374;46375;46376;46377;46378;46379;46380;46381;46382;46383;46384;46385;46386;46387;46388;46389;46390;46391;46392;46393;46394;46395;46396;46397;46398;46399;46400;46401;46402;46403;46404;46405;46406;46407;46408 46239 171 ATTAELFEEPFVADEYIER Acetyl (Protein N-term) 2271.0583 0.058309325 174 A0A0A0MSI8;O00471;F8W9B8;G3V377 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 1 0 0 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 169.66 169.66 2;3 6.393E-64 174504 QUIQUE_C1368_190116_001 182.33 168.92 289730000 35278000 35883000 21855000 23780000 42774000 21535000 0 29122000 14080000 10470000 0 18024000 36925000 4059 174 3783 36372;36373;36374;36375;36376;36377;36378;36379;36380;36381;36382;36383;36384;36385;36386;36387;36388;36389 46409;46410;46411;46412;46413;46414;46415;46416;46417;46418;46419;46420;46421;46422;46423;46424;46425;46426;46427 46413 18 ATTATCTR Acetyl (Protein N-term) 922.41783 0.41783007 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 1 0 0 1 18.416 18.416 2 0.01953 11007 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.895 44.384 91304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91304000 0 4060 412;3299 3784 36390 46428;46429 46429 2 ATTATMATSGSAR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1282.5823 0.58232922 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 1 1 0 1 26.762 26.762 2 0.033813 20828 QUIQUE_C1368_190116_001 67.385 40.596 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4061 2416 3785 36391 46430 46430 1 ATTATMATSGSAR Acetyl (Protein N-term) 1266.5874 0.5874146 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 1 0 0 1 1 1 42.205 42.205 2 3.6138E-05 39493 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.63 105.37 51981000 0 0 0 0 0 20911000 0 0 0 0 0 0 31071000 4062 2416 3785 36392;36393;36394 46431;46432;46433 46432 2 ATTLSNAVSSLASTGLSLTK Unmodified 1921.0368 0.036786022 3002 Q13492 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.93 142.93 2 3.1112E-13 147596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.59 129.58 1380400000 90422000 112250000 97374000 111890000 145140000 102450000 0 108090000 135050000 60474000 161380000 140150000 115710000 4063 3002 3786 36395;36396;36397;36398;36399;36400;36401;36402;36403;36404;36405;36406 46434;46435;46436;46437;46438;46439;46440;46441;46442;46443;46444;46445;46446;46447 46442 14 ATTPASTANSDVATIPTDTPLKEENEGFVK Unmodified 3103.5197 0.51971877 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.996 92.996 3 2.4937E-30 94488 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.29 92.195 233320000 48543000 0 0 49861000 0 43796000 0 48822000 0 0 0 0 42297000 4064 1567 3787 36407;36408;36409;36410;36411;36412 46448;46449;46450;46451;46452;46453 46451 6 ATTPVNIDSQAQLADDVLR Unmodified 2026.0331 0.033097627 1458 O14924 RGS12 Regulator of G-protein signaling 12 yes yes 0 0 0 1 114.82 114.82 2 0.00017469 118879 QUIQUE_C1218_190116_001 89.466 65.79 19592000 19592000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4065 1458 3788 36413 46454 46454 1 ATTVSTQR Acetyl (Protein N-term) 904.46141 0.46140945 4119 Q9H0E2;F2Z2Y8;E9PP67;E9PQ25;E9PNS3 TOLLIP Toll-interacting protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 23.551 23.551 1;2 0.0018228 17144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.92 88.451 521270000 0 0 0 0 88732000 0 0 97309000 150700000 0 184530000 0 0 4066 4119 3789 36414;36415;36416;36417 46455;46456;46457;46458 46458 2 ATTVTCTR Acetyl (Protein N-term) 950.44913 0.4491302 3010 Q13554;H7BXS4;E9PBE8;E7ETC9;E7ERS6 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.183 29.183 2 0.001825 23519 QUIQUE_C1277_190116_001 121.31 97.114 3832600000 568110000 660850000 296990000 357100000 491660000 256490000 453330000 160380000 188270000 0 0 399390000 0 4067 3010 3790 36418;36419;36420;36421;36422;36423;36424;36425;36426;36427 46459;46460;46461;46462;46463;46464;46465;46466;46467;46468 46460 7 ATVAAFAASEGHSHPR Unmodified 1607.7805 0.78045218 1456;4298 O14910;H0YIA8;H0YI92;Q9NUP9 LIN7A;LIN7C Protein lin-7 homolog A;Protein lin-7 homolog C no no 0 0 0 3 3 1 3 2 1 3 3 3 1 3 3 3 22.031 22.031 2;3;4 2.1156E-24 14881 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.38 119 8059600000 714890000 513400000 534480000 505750000 611860000 418710000 749770000 611790000 876220000 44679000 773760000 721070000 983200000 4068 1456;4298 3791 36428;36429;36430;36431;36432;36433;36434;36435;36436;36437;36438;36439;36440;36441;36442;36443;36444;36445;36446;36447;36448;36449;36450;36451;36452;36453;36454;36455;36456;36457;36458;36459 46469;46470;46471;46472;46473;46474;46475;46476;46477;46478;46479;46480;46481;46482;46483;46484;46485;46486;46487;46488;46489;46490;46491;46492;46493;46494;46495;46496;46497;46498;46499;46500;46501;46502;46503;46504 46496 35 ATVAAFTASEGHAHPR Unmodified 1621.7961 0.79610224 4204 Q9HAP6 LIN7B Protein lin-7 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 20.95 20.95 3 0.0008842 13882 QUIQUE_C1403_190116_001 61.226 40.273 77297000 0 29838000 0 47459000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4069 4204 3792 36460;36461 46505;46506 46506 2 ATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDR Acetyl (Protein N-term) 2165.1077 0.10765955 1096 G5E9A6 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes yes 1 0 0 1 1 1 165.85 165.85 3 5.0614E-07 169643 QUIQUE_C1277_190116_001 68.88 54.408 53913000 0 20435000 17464000 16013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4070 1096 3793 36462;36463;36464 46507;46508;46509 46507 3 ATVAANPAAAAAAVAAAAAVTEDREPQHEELPGLDSQWR Acetyl (Protein N-term) 3966.946 0.94602054 1096 G5E9A6 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.75 157.75 4 6.1703E-70 163922 QUIQUE_C1576_190116_001 129.61 124.6 1474000000 91377000 142670000 128680000 140290000 168900000 80513000 116620000 123840000 104510000 28288000 100950000 124740000 122650000 4071 1096 3794 36465;36466;36467;36468;36469;36470;36471;36472;36473;36474;36475;36476;36477 46510;46511;46512;46513;46514;46515;46516;46517;46518;46519;46520;46521;46522;46523 46517 13 ATVAEWK Unmodified 803.41775 0.41775372 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 25.766 25.766 2 0.060724 19852 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.176 17.388 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4 ATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIK Acetyl (Protein N-term) 3948.8389 0.83888066 1904 P06730;D6RFJ3 EIF4E Eukaryotic translation initiation factor 4E yes no 1 0 1 1 1 1 91.015 91.015 3 4.1869E-15 94052 QUIQUE_C1218_190116_001 73.797 68.841 178150000 48665000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75390000 54090000 4075 1904 3798 36497;36498;36499 46547;46548;46549 46547 3 ATVEQLMFEEK Unmodified 1323.6381 0.63805318 3125 Q15276;K7ENJ9 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.81 94.81 2 0.00048589 95906 QUIQUE_C1563_190116_001 108.15 82.573 38808000 0 0 0 0 0 38808000 0 0 0 0 0 0 0 4076 3125 3799 36500;36501;36502;36503;36504 46550;46551;46552;46553;46554 46552 5 ATVGILITTIASK Unmodified 1286.781 0.78095267 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 107.74 107.74 2 0.022659 111738 QUIQUE_C1368_190116_001 64.266 52.418 226340000 0 0 52151000 0 52670000 56808000 0 0 0 0 64713000 0 0 4077 3772 3800 36505;36506;36507;36508 46555;46556;46557;46558 46555 0 ATVGLIR Unmodified 728.45447 0.45447358 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y6G0;A0A2R8Y815 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.453 30.453 2 0.019355 25919 QUIQUE_C1218_190116_001 111.69 53.027 2514200000 259930000 264600000 197090000 237490000 0 231300000 0 236110000 278850000 94350000 212190000 236810000 265500000 4078 425 3801 36509;36510;36511;36512;36513;36514;36515;36516;36517;36518;36519 46559;46560;46561;46562;46563;46564;46565;46566;46567;46568;46569;46570;46571 46559 13 ATVLNYLPK Unmodified 1017.5859 0.58588168 1802 P01023;P20742;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000024146 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 82.83 82.83 2 0.010434 85914 QUIQUE_C1438_190116_001 74.127 33.776 453090000 82911000 67766000 0 0 86405000 0 0 0 0 0 107030000 0 108970000 4079 1802 3802 36520;36521;36522;36523;36524 46572;46573;46574;46575;46576 46574 5 ATVLQNQLDESQQER Unmodified 1757.8544 0.85440498 4376 Q9P1Z2;F8VQE3 CALCOCO1 Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.677 55.677 2 1.4979E-09 53376 QUIQUE_C1403_190116_001 152.14 121.27 96051000 27749000 0 0 30435000 0 24623000 0 0 0 13243000 0 0 0 4080 4376 3803 36525;36526;36527;36528 46577;46578;46579;46580 46578 4 ATVMAATAAER Acetyl (Protein N-term) 1132.5547 0.55465791 4101 Q9GZN7;K7EPS3;K7EPN1;K7ERP1;K7EMJ5;K7EL91 ROGDI Protein rogdi homolog yes no 1 0 0 1 78.197 78.197 2 0.0083418 79584 QUIQUE_C1368_190116_001 56.404 38.18 30940000 0 0 30940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4081 4101 3804 36529 46581 46581 1 ATVMDVKPVDYR Unmodified 1392.7071 0.7071358 2265 P27694;I3L4R8 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 53.108 53.108 3 0.036015 51421 QUIQUE_C1368_190116_001 43.991 29.43 73391000 0 0 73391000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4082 2265 3805 36530 46582 46582 1 ATVMLYDDGNKR Unmodified 1381.666 0.66599927 2568 P50552;K7ENR7;K7ENL7;K7EIG8 VASP Vasodilator-stimulated phosphoprotein yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 31.633 31.633 2;3 0.0027412 26381 QUIQUE_C1403_190116_001 78.655 31.764 209540000 0 49047000 33267000 67187000 0 0 26599000 0 0 0 33440000 0 0 4083 2568 3806 36531;36532;36533;36534;36535;36536;36537;36538;36539;36540;36541;36542;36543;36544 46583;46584;46585;46586;46587;46588;46589;46590;46591;46592;46593;46594;46595;46596 46586 14 ATVNLLGEEK Unmodified 1072.5764 0.57643921 2847 Q00765 REEP5 Receptor expression-enhancing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.535 50.535 2 0.00032216 46610 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.27 94.181 1181700000 228910000 0 0 134680000 0 122240000 95542000 83067000 126920000 79456000 120240000 98442000 92187000 4084 2847 3807 36545;36546;36547;36548;36549;36550;36551;36552;36553;36554 46597;46598;46599;46600;46601;46602;46603;46604;46605;46606 46603 8 ATVNLLGEEKK Unmodified 1200.6714 0.67140222 2847 Q00765 REEP5 Receptor expression-enhancing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 28.546 28.546 3 0.022843 22889 QUIQUE_DMIX8_190116_001 29.264 1.7826 152140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82013000 0 70129000 4085 2847 3808 36555;36556 46607;46608 46608 2 ATVPAGEGVSLEEAK Unmodified 1456.7409 0.74093835 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.572 54.572 2 1.4816E-05 50235 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.97 87.433 1966800000 491330000 400440000 0 0 0 0 0 438200000 0 83283000 553520000 0 0 4086 2530 3809 36557;36558;36559;36560;36561 46609;46610;46611;46612;46613;46614 46613 6 ATVPIYATGVLTCYIQEEDRK Unmodified 2426.2152 0.21516109 426 A0A2R8Y566;Q9P260;A0A075B785;A0A075B768 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 1 1 1 127.98 127.98 3 9.5937E-05 132165 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.03 43.843 106620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53270000 53354000 4087 426 3810 36562;36563 46615;46616 46615 2 ATVQQLEGR Acetyl (Protein N-term) 1042.5407 0.5407224 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 68.993 68.993 1;2 1.5657E-09 69079 QUIQUE_C1277_190116_001 171.73 90.099 14942000000 1242600000 1073900000 787380000 1145300000 726410000 962010000 833250000 1693100000 2593400000 1079100000 1165700000 782880000 856810000 4088 2855 3811 36564;36565;36566;36567;36568;36569;36570;36571;36572;36573;36574;36575;36576;36577 46617;46618;46619;46620;46621;46622;46623;46624;46625;46626;46627;46628;46629;46630;46631;46632;46633;46634;46635;46636;46637;46638;46639;46640;46641;46642;46643;46644;46645;46646;46647;46648;46649;46650;46651 46620 35 ATVSAPFGK Unmodified 876.47052 0.47051757 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.312 34.312 2 0.00098961 29398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.9 87.27 3483600000 269450000 241370000 253860000 109290000 321400000 117050000 240140000 404430000 314420000 303080000 441450000 286980000 180710000 4089 3117 3812 36578;36579;36580;36581;36582;36583;36584;36585;36586;36587;36588;36589;36590 46652;46653;46654;46655;46656;46657;46658;46659;46660;46661;46662;46663;46664;46665;46666;46667;46668;46669;46670;46671;46672;46673;46674;46675;46676 46671 25 ATVTATTK Acetyl (Protein N-term) 833.44945 0.44944778 4536 Q9Y230;X6R2L4;M0R0Z0;M0QXZ7 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 1 0 0 1 23.022 23.022 1 0.012874 15971 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.98 85.192 34479000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34479000 0 0 0 4090 4536 3813 36591 46677 46677 0 ATVTPSPVK Unmodified 898.51238 0.51238239 4130 Q9H1E3 NUCKS1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 17.946 17.946 2 0.00043526 10240 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.98 94.834 312670000 21495000 37737000 0 14845000 0 0 0 0 52687000 148090000 0 37817000 0 4091 4130 3814 36592;36593;36594;36595;36596;36597 46678;46679;46680;46681;46682;46683 46682 6 ATVVVEATEPEPSGSIANPAASTSPSLSHR Acetyl (Protein N-term) 3003.4785 0.47852266 2483 P46821;D6RA32;D6RGJ3;D6RCL2 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 1 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 1 2 111.93 111.93 2;3 2.0653E-148 114938 QUIQUE_C1277_190116_001 223.36 206.68 1529900000 78167000 70828000 57655000 221120000 80271000 312960000 99780000 0 101680000 284310000 124680000 98421000 0 4092 2483 3815 36598;36599;36600;36601;36602;36603;36604;36605;36606;36607;36608;36609;36610;36611;36612;36613;36614;36615 46684;46685;46686;46687;46688;46689;46690;46691;46692;46693;46694;46695;46696;46697;46698;46699;46700;46701;46702;46703;46704;46705;46706;46707;46708 46686 25 ATVVYQGER Unmodified 1021.5193 0.51925868 1831 P02749 APOH Beta-2-glycoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.863 20.863 2 0.0013972 13442 QUIQUE_C1277_190116_001 104.06 74.907 680200000 109030000 124590000 102210000 0 80055000 66027000 61350000 0 0 43712000 0 0 93232000 4093 1831 3816 36616;36617;36618;36619;36620;36621;36622;36623;36624 46709;46710;46711;46712;46713;46714;46715;46716;46717 46710 9 ATVWDEAEQDGIGEEVLK Acetyl (Protein N-term) 2029.948 0.94803059 4672 R4GNH3;E9PN50 PSMC3 yes no 1 0 0 1 156.42 156.42 2 0.0012358 151220 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.69 67.262 27687000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27687000 0 0 0 4094 4672 3817 36625 46718 46718 1 ATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIER Unmodified 3203.6907 0.69068769 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 157.57 157.57 3 1.3158E-26 162948 QUIQUE_C1368_190116_001 104.3 99.245 173800000 23730000 0 33338000 0 0 0 0 0 0 10814000 47959000 57954000 0 4095 4278 3818 36626;36627;36628;36629;36630 46719;46720;46721;46722;46723;46724 46720 6 ATWLHQALR Unmodified 1094.5985 0.59851205 2989 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 40.317 40.317 2;3 0.00040425 37769 QUIQUE_C1218_190116_001 88.948 62.903 4645400000 368360000 443340000 567740000 492360000 405080000 420740000 475480000 63942000 401040000 0 225810000 391560000 389920000 4096 2989 3819 36631;36632;36633;36634;36635;36636;36637;36638;36639;36640;36641;36642;36643;36644;36645;36646;36647;36648;36649;36650;36651;36652;36653 46725;46726;46727;46728;46729;46730;46731;46732;46733;46734;46735;46736;46737;46738;46739;46740;46741;46742;46743;46744;46745;46746;46747;46748;46749;46750;46751;46752 46726 25 ATWTEVVHINR Unmodified 1324.6888 0.68878362 168 A0A0A0MS69;Q14123 PDE1C Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C yes no 0 0 0 1 66.778 66.778 3 0.050908 66397 QUIQUE_C1277_190116_001 38.021 22.131 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4097 168 3820 36654 46753 46753 1 ATYFGSIVLLSPAVIDSPLK Unmodified 2090.1663 0.16634363 2656 P55058 PLTP Phospholipid transfer protein yes yes 0 0 0 1 161.33 161.33 2 0.0013044 164561 QUIQUE_C1403_190116_001 57.328 52.15 18252000 0 0 0 18252000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4098 2656 3821 36655 46754 46754 1 ATYFLAGLGLGPGR Unmodified 1391.7561 0.75613491 528 A5YM72 CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 128.46 128.46 2 0.00023285 132213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.239 76.979 55001000 22308000 0 0 0 0 0 0 0 32693000 0 0 0 0 4099 528 3822 36656;36657;36658;36659;36660;36661;36662;36663 46755;46756;46757;46758;46759;46760;46761;46762 46760 8 ATYIHNCLK Unmodified 1118.5543 0.55426398 70 A0A087WY55;Q9NP79;Q5TGM0 VTA1 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.386 19.386 3 0.006761 12291 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.35 46.23 1283600000 173090000 222270000 0 158160000 164930000 0 0 0 126230000 61623000 168110000 0 209220000 4100 70 3823 36664;36665;36666;36667;36668;36669;36670;36671 46763;46764;46765;46766;46767;46768;46769;46770 46768 5 ATYLDDLR Unmodified 965.48181 0.48181054 3750 Q92696;H0YLG7;H0YMG5;H0YKZ8 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 68.498 68.498 2 0.028069 68466 QUIQUE_C1218_190116_001 69.105 53.473 49427000 49427000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4101 3750 3824 36672 46771 46771 1 ATYLEFIQQNEER Acetyl (Protein N-term) 1681.7948 0.79476484 463 A0A2R8YFH5;Q15437;Q5QPE2;A0A2R8YF30;A0A2R8Y633;A0A2R8Y7S7 SEC23B Protein transport protein Sec23B yes no 1 0 0 1 1 1 153.36 153.36 2 2.7151E-06 157614 QUIQUE_C1277_190116_001 125.74 109.54 49145000 0 49145000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4102 463 3825 36673;36674;36675 46772;46773;46774;46775 46772 4 AVAAAAAAAGPAGAGGGR Acetyl (Protein N-term) 1407.7219 0.72187466 3029 Q13884;A0A3B3ITC2;E5RIX7 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 1 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 81.865 81.865 2 2.2205E-06 83465 QUIQUE_DMIX8_190116_001 131.28 107.43 1784700000 170240000 150120000 136840000 130110000 116270000 99934000 0 137960000 113320000 62312000 223300000 223990000 220370000 4103 3029 3826 36676;36677;36678;36679;36680;36681;36682;36683;36684;36685;36686;36687;36688;36689 46776;46777;46778;46779;46780;46781;46782;46783;46784;46785;46786;46787;46788;46789;46790;46791;46792;46793;46794;46795;46796;46797;46798 46798 23 AVAAEAQDTATR Unmodified 1202.5891 0.58912916 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.447 16.447 2 0.00052762 8387 QUIQUE_C1277_190116_001 121.83 90.458 912130000 80128000 136180000 0 54464000 123980000 45226000 84484000 0 102940000 35175000 184820000 64730000 0 4104 1492 3827 36690;36691;36692;36693;36694;36695;36696;36697;36698;36699 46799;46800;46801;46802;46803;46804;46805;46806;46807;46808;46809 46801 7 AVAALLTIPEAEK Unmodified 1324.7602 0.76021723 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.046 96.046 2 3.4534E-05 99477 QUIQUE_C1576_190116_001 120.68 103.25 5882600000 585020000 514940000 439270000 424460000 562700000 441540000 496150000 324480000 364490000 226910000 486300000 480460000 535830000 4105 3499 3828 36700;36701;36702;36703;36704;36705;36706;36707;36708;36709;36710;36711;36712;36713 46810;46811;46812;46813;46814;46815;46816;46817;46818;46819;46820;46821;46822;46823;46824;46825;46826;46827;46828 46818 19 AVAALLTIPEAEKSPLMSEFQSQISSNPELAAIFESIQK Oxidation (M) 4203.1661 0.16609222 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 1 1 1 2 2 168.25 168.25 3;4 5.3177E-32 170304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.507 82.273 376860000 0 0 0 0 0 0 0 84305000 0 0 196790000 0 95771000 4106 3499 3829 36714;36715;36716;36717;36718 46829;46830;46831;46832;46833 46829 2675 5 AVADLALIPDVDIDSDGVFK Acetyl (Protein N-term) 2114.0783 0.078316486 4277 Q9NRX4 PHPT1 14 kDa phosphohistidine phosphatase yes yes 1 0 0 2 3 2 3 2 2 3 2 2 2 3 3 174.73 174.73 2;3 9.0099E-24 177450 QUIQUE_C1277_190116_001 161.63 140.77 8884900000 529630000 415000000 0 169490000 761040000 265400000 691760000 1007300000 1290700000 133750000 1502000000 1008700000 1110200000 4107 4277 3830 36719;36720;36721;36722;36723;36724;36725;36726;36727;36728;36729;36730;36731;36732;36733;36734;36735;36736;36737;36738;36739;36740;36741;36742;36743;36744;36745;36746;36747 46834;46835;46836;46837;46838;46839;46840;46841;46842;46843;46844;46845;46846;46847;46848;46849;46850;46851;46852;46853;46854;46855;46856;46857;46858;46859;46860;46861;46862;46863;46864;46865;46866 46838 33 AVADQCPDSACK Unmodified 1320.5438 0.54383522 2250 P26232;A0A0A0MRI5 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.028 15.028 2 1.7597E-09 7401 QUIQUE_C1218_190116_001 151.22 147.1 1721000000 151350000 233110000 234730000 170930000 168020000 0 273290000 33158000 60618000 29477000 140440000 95947000 129970000 4108 2250 3831 36748;36749;36750;36751;36752;36753;36754;36755;36756;36757;36758;36759 46867;46868;46869;46870;46871;46872;46873;46874;46875;46876;46877;46878 46867 12 AVADTGSEDQGPGTGELTAVHK Unmodified 2139.008 0.008005089 1126 H0Y6F5;Q9H4I2 ZHX3 Zinc fingers and homeoboxes protein 3 yes no 0 0 0 1 1 46.873 46.873 3 0.00052192 43166 QUIQUE_C1563_190116_001 32.695 27.026 98918000 17358000 0 0 0 0 81560000 0 0 0 0 0 0 0 4109 1126 3832 36760;36761 46879;46880 46880 2 AVAEAVETGEEDVIMEALR Unmodified 2030.983 0.98303589 4247 Q9NPQ8;E9PSI0;E9PI04;E9PLE5 RIC8A Synembryn-A yes no 0 0 0 1 1 2 1 145.75 145.75 2;3 4.9325E-10 148567 QUIQUE_C1563_190116_001 126.63 104.59 111890000 0 0 0 0 0 29058000 0 0 0 0 0 0 82835000 4110 4247 3833 36762;36763;36764;36765;36766 46881;46882;46883;46884;46885 46884 4 AVAEIEEMCNILK Unmodified 1518.7422 0.74220068 2563 P50440;H0YMX4 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 118.65 118.65 2 3.4534E-05 121936 QUIQUE_C1403_190116_001 120.68 102.37 764100000 0 193890000 0 168910000 0 0 0 97469000 248960000 54867000 0 0 0 4111 2563 3834 36767;36768;36769;36770;36771 46886;46887;46888;46889;46890;46891;46892;46893;46894 46887 9 AVAENQPFLIEAMTYR Unmodified 1851.9189 0.91891949 1012 F5H5P2;P12694;F5GXU9 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.86 130.86 2 1.31E-23 134645 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.02 130.16 1063500000 83662000 91827000 105330000 78185000 82097000 0 83053000 108300000 87847000 29539000 100070000 110590000 102970000 4112 1012 3835 36772;36773;36774;36775;36776;36777;36778;36779;36780;36781;36782;36783 46895;46896;46897;46898;46899;46900;46901;46902;46903;46904;46905;46906;46907;46908;46909;46910;46911;46912 46911 16 AVAEQIPLLVQGVR Unmodified 1491.8773 0.87731267 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 3 2 2 2 3 3 3 2 2 3 3 3 2 109.7 109.7 2;3 7.6912E-14 114777 QUIQUE_C1438_190116_001 161.17 143.31 1508600000 93275000 106180000 154010000 143670000 155640000 75330000 107900000 128510000 126290000 54144000 122350000 122820000 118480000 4113 4600 3836 36784;36785;36786;36787;36788;36789;36790;36791;36792;36793;36794;36795;36796;36797;36798;36799;36800;36801;36802;36803;36804;36805;36806;36807;36808;36809;36810;36811;36812;36813;36814;36815;36816 46913;46914;46915;46916;46917;46918;46919;46920;46921;46922;46923;46924;46925;46926;46927;46928;46929;46930;46931;46932;46933;46934;46935;46936;46937;46938;46939;46940;46941;46942;46943;46944;46945;46946;46947;46948;46949;46950;46951 46927 39 AVAFFLESIAMHDIIAAEK Unmodified 2075.0761 0.076148416 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 158.16 158.16 3 0.0031761 162936 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.916 36.681 13465000 0 0 0 0 0 0 0 0 13465000 0 0 0 0 4114 2813 3837 36817 46952 46952 1 AVAFHPAGGLYAVGSNSK Unmodified 1744.8897 0.88966827 145 A0A0A0MRE6;O94967 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.987 60.987 2;3 4.7815E-05 59596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.38 99.167 494770000 93807000 93293000 0 79538000 0 0 88717000 77437000 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46961;46962;46963;46964;46965;46966;46967;46968;46969;46970;46971;46972;46973;46974;46975;46976;46977;46978;46979;46980;46981;46982;46983;46984;46985;46986;46987;46988;46989;46990;46991;46992;46993;46994;46995;46996;46997;46998;46999;47000;47001;47002;47003;47004;47005;47006;47007;47008;47009;47010;47011;47012;47013;47014;47015;47016;47017;47018;47019;47020;47021;47022;47023;47024;47025 46999 65 AVAFSPVTELK Unmodified 1160.6441 0.64412484 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 1 1 1 77.89 77.89 2 0.001374 78941 QUIQUE_C1403_190116_001 90.15 59.965 337730000 0 0 0 166540000 112130000 0 0 0 0 0 0 0 59059000 4117 2129 3840 36863;36864;36865 47026;47027;47028 47026 3 AVAFSPVTELKK Unmodified 1288.7391 0.73908786 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 53.206 53.206 2;3 0.0010921 50862 QUIQUE_C1368_190116_001 56.205 43.991 2926000000 180180000 263890000 328340000 274190000 286420000 28129000 331400000 231580000 60525000 50152000 422260000 264040000 204900000 4118 2129 3841 36866;36867;36868;36869;36870;36871;36872;36873;36874;36875;36876;36877;36878;36879;36880;36881;36882;36883;36884;36885;36886 47029;47030;47031;47032;47033;47034;47035;47036;47037;47038;47039;47040;47041;47042;47043;47044;47045;47046;47047;47048;47049;47050;47051;47052;47053;47054 47035 26 AVAGDASESALLK Unmodified 1230.6456 0.6455814 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.197 49.197 2 0.00016949 46847 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.78 69.356 1505700000 0 123580000 226730000 163140000 118990000 0 163380000 112650000 143650000 49102000 152960000 83279000 168200000 4119 1872 3842 36887;36888;36889;36890;36891;36892;36893;36894;36895;36896;36897 47055;47056;47057;47058;47059;47060;47061;47062;47063;47064;47065 47061 10 AVAGEFSEPVTLETPAFMFR Unmodified 2198.0718 0.07179132 4024 Q9BTV5;M0R366 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.16 149.16 2 2.0096E-12 152087 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.19 95.235 428800000 36646000 48973000 57651000 30200000 38410000 27773000 37834000 32272000 26155000 0 33608000 26880000 32400000 4120 4024 3843 36898;36899;36900;36901;36902;36903;36904;36905;36906;36907;36908;36909 47066;47067;47068;47069;47070;47071;47072;47073;47074;47075;47076;47077;47078 47073 13 AVAGEYSDPVTLETK Unmodified 1578.7777 0.77771779 156 A0A0C4DG97;A0A0A0MRS5;F8W946;Q9BXM9;Q8N450;C9JD05 FSD1L FSD1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 69.871 69.871 2 9.7394E-07 69980 QUIQUE_C1218_190116_001 117.98 89.962 218490000 109830000 0 0 0 0 0 0 62892000 0 45769000 0 0 0 4121 156 3844 36910;36911;36912;36913;36914;36915;36916;36917;36918;36919 47079;47080;47081;47082;47083;47084;47085;47086;47087;47088 47079 10 AVAGLPSGSAGPSPAPSPAR Unmodified 1745.906 0.90604662 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.837 54.837 2 5.8635E-24 53975 QUIQUE_C1218_190116_001 137.46 104.51 469940000 44290000 34859000 31940000 61443000 35900000 34226000 0 49237000 40872000 0 38466000 40220000 58490000 4122 3718 3845 36920;36921;36922;36923;36924;36925;36926;36927;36928;36929;36930 47089;47090;47091;47092;47093;47094;47095;47096;47097;47098;47099;47100 47089 12 AVAGNISDPGLQK Unmodified 1268.6725 0.67246486 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.686 39.686 2 0.00024419 35344 QUIQUE_C1277_190116_001 143.4 104.62 1780900000 0 350020000 0 382000000 0 0 0 241320000 338220000 172340000 0 296990000 0 4123 2135 3846 36931;36932;36933;36934;36935;36936 47101;47102;47103;47104;47105;47106 47101 6 AVAGVMITASHNR Unmodified 1325.6874 0.68740341 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 1 28.349 28.349 2;3 0.00026377 22107 QUIQUE_C1563_190116_001 112.36 86.798 439430000 67064000 71395000 0 76260000 0 99619000 0 0 46145000 32279000 0 46672000 0 4124 3390 3847 36937;36938;36939;36940;36941;36942;36943;36944;36945;36946;36947;36948;36949 47107;47108;47109;47110;47111;47112;47113;47114;47115;47116;47117;47118;47119 47114 12 AVAHHTDCTFIR Unmodified 1426.6776 0.67756701 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1;J3KRP2;J3QLH6;J3QRW1;J3QRR3 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 1 3 3 2 3 1 3 2 3 1 3 1 3 16.529 16.529 2;3;4 0.00015324 8644 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.214 89.67 2772100000 16798000 321730000 250230000 262210000 258940000 123280000 330020000 121780000 211540000 26926000 363360000 161910000 323340000 4125 2743 3848 36950;36951;36952;36953;36954;36955;36956;36957;36958;36959;36960;36961;36962;36963;36964;36965;36966;36967;36968;36969;36970;36971;36972;36973;36974;36975;36976;36977;36978 47120;47121;47122;47123;47124;47125;47126;47127;47128;47129;47130;47131;47132;47133;47134;47135;47136;47137;47138;47139;47140;47141;47142;47143;47144;47145;47146;47147;47148 47148 28 AVAHHTTAAFIR Unmodified 1293.6942 0.69420335 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 14.866 14.866 2;3 1.5328E-06 7103 QUIQUE_C1403_190116_001 125.23 106.13 1696700000 199230000 271000000 238370000 276470000 19082000 276300000 18424000 0 0 43909000 34068000 22687000 297120000 4126 2466 3849 36979;36980;36981;36982;36983;36984;36985;36986;36987;36988;36989;36990;36991;36992;36993;36994 47149;47150;47151;47152;47153;47154;47155;47156;47157;47158;47159;47160;47161;47162;47163;47164;47165 47156 13 AVAIDLPGLGHSK Unmodified 1276.7139 0.71393574 3881 Q96IU4;B4DQI4 ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 3 1 3 2 1 69.53 69.53 2;3 4.3561E-06 69639 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.99 87.554 1340800000 107780000 37521000 46247000 53448000 156360000 135370000 89575000 70126000 190470000 45977000 157090000 160000000 90835000 4127 3881 3850 36995;36996;36997;36998;36999;37000;37001;37002;37003;37004;37005;37006;37007;37008;37009;37010;37011;37012;37013;37014;37015 47166;47167;47168;47169;47170;47171;47172;47173;47174;47175;47176;47177;47178;47179;47180;47181;47182;47183;47184;47185;47186;47187;47188;47189;47190;47191;47192;47193;47194;47195 47184 29 AVAIETQPAQGELDAVAR Unmodified 1837.9534 0.95339074 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 3 1 2 2 3 2 1 2 2 1 1 1 1 83.954 83.954 2;3 9.4213E-182 86684 QUIQUE_C1438_190116_001 253.88 215.89 1642200000 178770000 112520000 134360000 133220000 193990000 106610000 108300000 136490000 130410000 7761000 134060000 117430000 148310000 4128 3889 3851 37016;37017;37018;37019;37020;37021;37022;37023;37024;37025;37026;37027;37028;37029;37030;37031;37032;37033;37034;37035;37036;37037 47196;47197;47198;47199;47200;47201;47202;47203;47204;47205;47206;47207;47208;47209;47210;47211;47212;47213;47214;47215;47216;47217;47218;47219;47220;47221;47222;47223;47224;47225;47226;47227;47228;47229;47230;47231;47232;47233;47234;47235;47236;47237;47238;47239 47214 42 AVALDEAISQSTQFHDKIDQILESLER Unmodified 3055.5462 0.5462083 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 1 1 1 164.18 164.18 4 6.7897E-16 168327 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.966 82.044 165330000 0 0 0 0 0 0 0 0 57774000 0 0 107550000 0 4129 2882 3852 37038;37039 47240;47241 47241 1 AVALDSDNISLK Unmodified 1244.6612 0.66123147 149 A0A0A0MRJ3;Q8NEY1;H0Y6F6 NAV1 Neuron navigator 1 yes no 0 0 0 1 68.914 68.914 2 0.057369 69141 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.472 11.742 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4130 149 3853 37040 47242 47242 1 AVAMLWK Unmodified 817.45203 0.45203074 1428 O14521 SDHD Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 66.55 66.55 2 0.05526 66140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.021 45.225 78751000 0 0 0 0 0 0 0 25539000 28170000 0 0 25042000 0 4131 1428 3854 37041;37042;37043 47243;47244;47245 47244 3 AVANAAAMLVLK Unmodified 1170.6795 0.67946449 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.535 90.535 2 0.0026367 87981 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.01 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A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8YF45 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.618 34.618 2 1.4723E-12 29727 QUIQUE_C1403_190116_001 151.15 129.06 731870000 0 0 0 170400000 154860000 183270000 0 0 0 0 223340000 0 0 4136 455 3858 37094;37095;37096;37097 47314;47315;47316;47317 47314 3 AVAQALEVIPR Unmodified 1165.6819 0.68190733 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.338 78.338 2 0.0073643 80126 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.157 47.338 3545300000 0 431790000 386500000 325650000 346420000 311490000 423190000 0 297340000 195450000 476770000 350650000 0 4137 2527 3859 37098;37099;37100;37101;37102;37103;37104;37105;37106;37107 47318;47319;47320;47321;47322;47323;47324;47325;47326;47327 47326 9 AVASAAAALVLK Unmodified 1083.6652 0.66519463 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.078 77.078 2 0.0036065 77778 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AVCMLSNTTAIAEAWAR Unmodified 1863.8971 0.89713819 2795;3430;2796;1990;688 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;P68366;Q71U36;C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA3E;TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA8 Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 0 0 88 88 116 69 94 71 119 87 105 15 117 119 117 161.72 161.72 2;3 3.0916E-201 136960 QUIQUE_DMIX3_190116_001 262.56 246.42 187600000000 14642000000 17963000000 16399000000 15826000000 16241000000 12677000000 22482000000 10210000000 10903000000 3341400000 15758000000 13728000000 17429000000 4150 1990;2795;2796;3430;688 3871 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48577 1449 AVCMLSNTTAVAEAWAR Unmodified 1849.8815 0.88148813 3992 Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA1C Tubulin alpha-1C chain yes no 0 0 0 1 119.52 119.52 2 0.0063181 123907 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.326 58.058 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4151 3992 3872 38499 49196 49196 1 AVCVEAGMIALR Unmodified 1288.6632 0.6631625 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.771 91.771 2 0.00099347 93529 QUIQUE_C1277_190116_001 84.213 61.473 436000000 62333000 66051000 71097000 65471000 0 68839000 0 78747000 0 23466000 0 0 0 4152 4672 3873 38500;38501;38502;38503;38504;38505;38506 49197;49198;49199;49200;49201;49202;49203;49204;49205 49199 8 AVDAGLNVMPYIK Unmodified 1389.7326 0.73262227 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.24 106.24 2 0.00041285 109311 QUIQUE_C1277_190116_001 96.015 69.342 141960000 14296000 32894000 24162000 23841000 0 0 0 0 0 18622000 0 0 28145000 4153 2180 3874 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49254;49255;49256;49257;49258;49259;49260;49261;49262;49263;49264 49255 11 AVDEAVILLQEIGVLDQR Unmodified 1980.0892 0.089155943 1211 H7BXY3;Q7L2E3 DHX30 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 168.27 168.27 3 6.6059E-24 170086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.29 99.099 115930000 21562000 0 53812000 15532000 0 9235400 0 15792000 0 0 0 0 0 4158 1211 3879 38560;38561;38562;38563;38564 49265;49266;49267;49268;49269 49269 5 AVDEDPENQTLR Unmodified 1385.6423 0.64228694 3758 Q92845 KIFAP3 Kinesin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.337 35.337 2 0.00017831 30570 QUIQUE_C1368_190116_001 102.52 81.653 99029000 0 35061000 0 33643000 0 30325000 0 0 0 0 0 0 0 4159 3758 3880 38565;38566;38567;38568;38569;38570;38571;38572 49270;49271;49272;49273;49274;49275;49276;49277 49271 8 AVDFQEAQSYADDNSLLFMETSAK Unmodified 2679.201 0.20102717 2166 P20339 RAB5A Ras-related protein Rab-5A yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 144.51 144.51 3 1.5455E-06 147395 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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49511;49512;49513;49514;49515;49516;49517;49518;49519;49520;49521;49522;49523;49524;49525 49511 13 AVDQSVLLMKPDAELSASSVYNLLPEK Unmodified 2916.5154 0.51542544 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 145.2 145.2 3 1.1286E-12 151570 QUIQUE_C1438_190116_001 73.676 62.045 1208000000 80014000 110980000 129360000 103150000 146470000 47683000 68270000 0 81174000 30911000 131950000 64209000 213820000 4177 1802 3896 38761;38762;38763;38764;38765;38766;38767;38768;38769;38770;38771;38772;38773 49526;49527;49528;49529;49530;49531;49532;49533;49534;49535;49536;49537;49538;49539;49540 49530 11 AVDRPMLPQEYAVEAHFK Unmodified 2100.0462 0.046245271 1129 H0Y7Q1;O75689;A0A087WTN6;H7C324;A0A3B3ISA7 ADAP1 Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 80.643 80.643 4 0.0026667 83049 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.429 27.824 31958000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31958000 0 0 4178 1129 3897 38774 49541 49541 1 AVDSFETQR Unmodified 1051.4934 0.49343786 139 A0A0A0MR09;P43378;H3BQT6 PTPN9 Protein-tyrosine-phosphatase;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9 yes no 0 0 0 1 26.431 26.431 2 0.033312 20568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.37 31.846 52520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52520000 0 0 4179 139 3898 38775 49542 49542 1 AVDSLVPIGR Unmodified 1025.5869 0.58694431 2243;1351 K7ERX7;P25705;K7EK77;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.387 70.387 2 1.2824E-11 70653 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.77 84.659 46623000000 4139600000 3766700000 4011400000 3016100000 3277800000 3648400000 3809900000 2995700000 3776900000 1269000000 5159900000 3798600000 3952900000 4180 1351;2243 3899 38776;38777;38778;38779;38780;38781;38782;38783;38784;38785;38786;38787;38788 49543;49544;49545;49546;49547;49548;49549;49550;49551;49552;49553;49554;49555;49556;49557;49558;49559;49560;49561;49562;49563;49564;49565 49557 23 AVDSLVPIGRG Unmodified 1082.6084 0.60840804 1351 K7ERX7 ATP5A1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 62.395 62.395 2 0.0060925 61945 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.709 52.981 289880000 0 0 0 0 79138000 41147000 0 0 98100000 0 0 71496000 0 4181 1351 3900 38789;38790;38791;38792;38793 49566;49567;49568;49569;49570;49571 49571 5 AVDTDMIILPCLSR Unmodified 1602.8109 0.81094895 1508 O43149 ZZEF1 Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 19.925 19.925 3 0.063055 12575 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.297 18.497 257630000 0 0 0 0 0 0 82335000 0 0 0 0 0 175300000 4182 1508 3901 38794;38795 49572;49573 49573 2 AVDTICSFLK Unmodified 1152.5849 0.5848954 4655 Q9Y6K5 OAS3 2'-5'-oligoadenylate synthase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 93.763 93.763 2 0.012865 95862 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.474 40.384 126870000 0 0 43358000 0 0 0 0 31897000 0 0 51616000 0 0 4183 4655 3902 38796;38797;38798 49574;49575;49576 49575 2 AVDTLAYLSDGDAR Unmodified 1465.7049 0.7048872 3938 Q96S55 WRNIP1 ATPase WRNIP1 yes yes 0 0 0 1 88.774 88.774 2 0.010107 91030 QUIQUE_C1218_190116_001 70.488 43.374 0 0 0 0 0 0 0 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49598;49599;49600;49601;49602;49603;49604;49605;49606;49607;49608;49609;49610;49611;49612;49613;49614;49615;49616;49617;49618;49619;49620;49621;49622;49623;49624;49625;49626;49627;49628;49629;49630;49631;49632;49633;49634;49635;49636;49637;49638;49639;49640;49641;49642;49643;49644;49645;49646;49647;49648 49642 51 AVEDFLR Unmodified 848.43922 0.43921744 3276 Q5JRX3;A0A0A0MRX9;H0Y7L7;B1APQ1 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes no 0 0 0 1 66.069 66.069 2 0.057767 65481 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.716 32.345 25063000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25063000 0 4189 3276 3907 38843 49649 49649 1 AVEDIHGLFSLSK Unmodified 1414.7456 0.7456298 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 93.882 93.882 2;3 2.1383E-09 96109 QUIQUE_C1368_190116_001 116.51 94.961 1080300000 101490000 161130000 116290000 66993000 53285000 55698000 107200000 108060000 67640000 27768000 65934000 93833000 55022000 4190 3046 3908 38844;38845;38846;38847;38848;38849;38850;38851;38852;38853;38854;38855;38856;38857;38858;38859;38860;38861;38862 49650;49651;49652;49653;49654;49655;49656;49657;49658;49659;49660;49661;49662;49663;49664;49665;49666;49667;49668;49669;49670;49671;49672 49656 23 AVEDVRPPHK Unmodified 1146.6146 0.61455605 263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62;H7C0P6 MAP4K4 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 yes no 0 0 1 1 12.699 12.699 3 0.012754 4776 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.013 38.54 5562400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5562400 0 4191 263 3909 38863 49673 49673 1 AVEEEDKMTPEQLAIK Unmodified 1829.9081 0.90808003 1411 O00487 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 61.957 61.957 2 8.7095E-18 61977 QUIQUE_C1218_190116_001 173.72 140.66 205330000 27327000 0 33964000 0 0 0 0 29658000 0 0 45321000 69062000 0 4192 1411 3910 38864;38865;38866;38867;38868;38869;38870;38871;38872 49674;49675;49676;49677;49678;49679;49680;49681;49682 49674 9 AVEELLECLDLEK Unmodified 1559.7753 0.77527495 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.08 138.08 2 8.9062E-06 143602 QUIQUE_C1218_190116_001 122.42 96.8 210760000 26439000 42280000 0 51622000 0 59661000 30759000 0 0 0 0 0 0 4193 271 3911 38873;38874;38875;38876;38877;38878;38879 49683;49684;49685;49686;49687;49688;49689 49683 6 AVEELQSIIK Acetyl (Protein N-term) 1170.6496 0.64960415 3775 Q92990 GLMN Glomulin yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.09 148.09 2 0.00069627 152873 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.033 69.815 177320000 14264000 17626000 13018000 13536000 15910000 13168000 15728000 12151000 11807000 7331900 12540000 12140000 18098000 4194 3775 3912 38880;38881;38882;38883;38884;38885;38886;38887;38888;38889;38890;38891;38892 49690;49691;49692;49693;49694;49695;49696;49697;49698;49699;49700;49701;49702 49702 13 AVEEPLNAFK Unmodified 1116.5815 0.58152458 2925 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38909;38910;38911;38912;38913 49719;49720;49721;49722;49723;49724 49719 6 AVEIYASVAQLSPLDSETLENEANNIK Unmodified 2917.4557 0.45566195 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 148.57 148.57 3 4.0163E-24 144378 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.387 96.39 201070000 0 0 21977000 0 0 0 0 46488000 0 25213000 50463000 56930000 0 4202 2008 3920 38914;38915;38916;38917;38918 49725;49726;49727;49728;49729;49730 49728 6 AVELAANTK Unmodified 915.50255 0.50254598 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 1 1 18.338 18.338 2 0.01218 10892 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.692 35.297 91684000 0 0 18305000 0 0 0 0 0 0 52679000 20700000 0 0 4203 2288 3921 38919;38920;38921 49731;49732;49733 49733 3 AVELLGDIVQNCSLEDSQIEK Unmodified 2359.1577 0.15770579 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 132.56 132.56 2;3 2.2524E-208 136401 QUIQUE_C1403_190116_001 254.1 234.9 7337600000 777770000 691360000 773630000 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49788;49789;49790;49791;49792;49793;49794;49795;49796;49797;49798;49799;49800;49801 49798 12 AVENYLIQMAR Unmodified 1306.6704 0.67035637 1344 K7EQA1;O14737 PDCD5 Programmed cell death protein 5 yes no 0 0 0 1 98.146 98.146 2 0.0017272 101868 QUIQUE_C1576_190116_001 82.75 54.868 166600000 0 0 0 0 0 0 166600000 0 0 0 0 0 0 4209 1344 3927 38974 49802 49802 1 AVESLKPSIETLSTDLHTIK Unmodified 2181.1893 0.18926392 1509 O43150;A0A286YFG8 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 96.573 96.573 4 0.053741 99578 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.548 16.459 92821000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45240000 0 47581000 4210 1509 3928 38975;38976 49803;49804 49804 2 AVESSKPLSNAQPSGPLKPVGNAK Unmodified 2375.2809 0.28087289 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 2 1 32.452 32.452 4 0.045749 28039 QUIQUE_DMIX3_190116_001 25.52 22.597 52584000 0 0 0 0 0 0 0 0 52584000 0 0 0 0 4211 3154 3929 38977 49805 49805 1 AVETLLDLIMK Unmodified 1244.705 0.70501054 1385 O00194 RAB27B Ras-related protein Rab-27B yes yes 0 0 0 1 1 157.69 157.69 2 0.032459 161890 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.49 29.75 107060000 68973000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38082000 4212 1385 3930 38978;38979 49806;49807;49808 49807 2 AVETPPLSSVNLLEGLSR Unmodified 1881.0207 0.020742027 1057 F8W9S7;Q14C86;B0QZ65;A0A0A0MQV8;B4DGD8;H0Y4E7;H0Y7I9;C9IZ08 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 138.46 138.46 2 0.019578 143097 QUIQUE_C1277_190116_001 56.956 42.394 21924000 0 21924000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4213 1057 3931 38980 49809 49809 1 AVEVACYVCK Unmodified 1197.5522 0.55221507 2474 P45985 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.711 52.711 2 0.0023978 50487 QUIQUE_C1368_190116_001 106.04 92.463 674790000 81001000 129240000 67390000 0 73753000 0 73837000 0 43725000 33027000 53049000 72331000 47438000 4214 2474 3932 38981;38982;38983;38984;38985;38986;38987;38988;38989;38990;38991 49810;49811;49812;49813;49814;49815;49816;49817;49818;49819;49820;49821;49822;49823 49814 14 AVEVAWETLQEEFSR Unmodified 1792.8632 0.86317875 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 141.87 141.87 2;3 9.5185E-14 146224 QUIQUE_C1277_190116_001 162.6 129.19 2289300000 212700000 216950000 260660000 221110000 205800000 215510000 36108000 0 193150000 9797200 218540000 254730000 244220000 4215 831;1569 3933 38992;38993;38994;38995;38996;38997;38998;38999;39000;39001;39002;39003;39004;39005;39006;39007;39008;39009;39010;39011;39012 49824;49825;49826;49827;49828;49829;49830;49831;49832;49833;49834;49835;49836;49837;49838;49839;49840;49841;49842;49843;49844;49845;49846;49847 49826 23 AVEVDPSLLLHMLE Unmodified 1564.8171 0.81708018 2814 P78560 CRADD Death domain-containing protein CRADD yes yes 0 0 0 1 1 166.76 166.76 2 0.0074874 172973 QUIQUE_C1438_190116_001 59.757 41.446 75458000 0 0 0 0 41341000 0 0 34116000 0 0 0 0 0 4216 2814 3934 39013;39014 49848;49849 49848 2 AVEVLPK Unmodified 754.45889 0.45889025 166 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396 GSN Gelsolin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.634 27.634 2 0.039849 21901 QUIQUE_C1576_190116_001 83.377 18.114 7839400000 764400000 592330000 649250000 588530000 671740000 0 560760000 901840000 725300000 459430000 757980000 594260000 573600000 4217 166 3935 39015;39016;39017;39018;39019;39020;39021;39022;39023;39024;39025;39026 49850;49851;49852;49853;49854;49855;49856;49857;49858;49859;49860;49861;49862;49863;49864;49865 49857 16 AVEVQGPSLESGDHGK Unmodified 1608.7744 0.77436375 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 31.218 31.218 2;3 5.0437E-19 25515 QUIQUE_C1368_190116_001 146.07 116.3 937430000 87032000 138770000 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50205;50206;50207;50208;50209;50210;50211;50212;50213;50214;50215;50216;50217;50218;50219;50220;50221;50222;50223;50224;50225;50226;50227;50228;50229;50230;50231;50232;50233;50234;50235;50236;50237;50238;50239;50240;50241;50242;50243;50244;50245;50246;50247;50248;50249;50250;50251;50252;50253;50254;50255;50256;50257;50258;50259;50260;50261;50262;50263;50264;50265;50266;50267;50268;50269;50270;50271;50272;50273;50274;50275;50276;50277;50278;50279;50280;50281;50282;50283;50284;50285;50286;50287;50288;50289;50290;50291;50292;50293;50294;50295;50296;50297;50298;50299;50300;50301;50302;50303;50304;50305;50306;50307;50308;50309;50310;50311;50312;50313;50314;50315;50316;50317;50318;50319;50320;50321;50322;50323;50324;50325;50326;50327;50328;50329;50330;50331;50332;50333;50334;50335;50336;50337;50338;50339;50340;50341;50342;50343;50344;50345;50346;50347;50348;50349;50350;50351;50352;50353;50354;50355;50356;50357;50358;50359;50360;50361;50362;50363;50364;50365;50366;50367;50368;50369;50370;50371;50372;50373;50374;50375;50376;50377;50378;50379;50380;50381;50382;50383;50384;50385;50386;50387;50388;50389;50390;50391;50392;50393;50394;50395;50396;50397;50398;50399;50400;50401;50402;50403;50404;50405;50406;50407;50408;50409;50410;50411;50412;50413;50414;50415;50416;50417 50417 207 AVFVLSCLLK Unmodified 1148.6628 0.66275179 3695 Q8WU76;A0A087WUD7 SCFD2 Sec1 family domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 130.81 130.81 2 0.047085 135696 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.794 32.461 12203000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12203000 4239 3695 3957 39344;39345 50418;50419 50419 2 AVFVPDIYSR Unmodified 1165.6132 0.61315906 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.78 92.78 2 0.0046555 94961 QUIQUE_C1277_190116_001 80.165 59.645 488730000 39425000 47683000 48077000 53706000 41737000 42770000 42479000 51069000 54549000 0 67241000 0 0 4240 1692 3958 39346;39347;39348;39349;39350;39351;39352;39353;39354;39355 50420;50421;50422;50423;50424;50425;50426;50427;50428;50429;50430;50431 50422 12 AVFVSEGK Unmodified 835.44397 0.44396847 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 22.224 22.224 2 0.047991 15266 QUIQUE_C1277_190116_001 56.091 21.013 138850000 0 138850000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4241 2327 3959 39356 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50653;50654;50655;50656;50657;50658;50659;50660;50661;50662;50663;50664;50665 50660 11 AVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPK Unmodified 3545.8586 0.85857443 1587 O60684;O15131;Q5TFJ7 KPNA6;KPNA5 Importin subunit alpha-7;Importin subunit alpha-6 yes no 0 0 0 1 1 168.22 168.22 3 9.6784E-15 173546 QUIQUE_C1576_190116_001 70.98 60.819 235970000 0 0 0 0 0 0 149560000 0 0 0 0 86415000 0 4264 1587 3982 39561;39562 50666;50667 50666 2 AVGNIVTGTDEQTQVVLNCDALSHFPALLTHPK Unmodified 3544.7984 0.79841701 1420 O00629;H7C4F6 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.74 136.74 4 1.137E-51 141229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.5 114.64 2493900000 0 386230000 389920000 286530000 219180000 271210000 289260000 0 135620000 0 180640000 145170000 190150000 4265 1420 3983 39563;39564;39565;39566;39567;39568;39569;39570;39571;39572 50668;50669;50670;50671;50672;50673;50674;50675;50676;50677;50678;50679;50680;50681;50682 50680 14 AVGNIVTGTDEQTQVVLNCDVLSHFPNLLSHPK Unmodified 3601.8199 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AVHAHVNLGYTK Unmodified 1308.6939 0.693869 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 17.825 17.825 2;3 8.7166E-14 10227 QUIQUE_C1277_190116_001 155.15 128.36 5745000000 655570000 437850000 460320000 444810000 678800000 318620000 507780000 286000000 529420000 152070000 483560000 38045000 752150000 4276 4419 3993 39634;39635;39636;39637;39638;39639;39640;39641;39642;39643;39644;39645;39646;39647;39648;39649;39650;39651;39652;39653;39654;39655;39656;39657;39658 50755;50756;50757;50758;50759;50760;50761;50762;50763;50764;50765;50766;50767;50768;50769;50770;50771;50772;50773;50774;50775;50776;50777;50778;50779;50780;50781;50782;50783 50759 26 AVHLQGHEGPVYAVHAVYQR Unmodified 2230.1396 0.13956881 3363 Q6IA86 ELP2 Elongator complex protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 46.223 46.223 4 0.0013828 43830 QUIQUE_C1576_190116_001 49.425 39.911 115670000 0 0 32408000 0 0 0 47187000 0 0 0 0 36075000 0 4277 3363 3994 39659;39660;39661 50784;50785;50786;50787 50785 4 AVHSNPGDPALWSLLSR Unmodified 1818.9377 0.9376811 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 110.75 110.75 3 0.0035463 107637 QUIQUE_DMIX4_190116_001 39.338 23.032 12174000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12174000 0 0 0 4278 3391 3995 39662 50788 50788 1 AVHTNYHAALR Unmodified 1251.6473 0.64725316 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 12.661 12.661 3 0.00054735 5067 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.865 58.014 4187600 0 0 0 0 0 0 0 4187600 0 0 0 0 0 4279 4304 3996 39663 50789 50789 1 AVIDLNNR Unmodified 913.49813 0.49812931 1987 P0DN76;Q01081 U2AF1 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 38.507 38.507 2 0.049678 34050 QUIQUE_C1277_190116_001 74.191 46.704 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4280 1987 3997 39664;39665 50790;50791 50791 2 AVIDQCNHDNILR Unmodified 1566.7573 0.75727389 2122;868 E7ESP4;E9PB77;E7EMF1;P17301 ITGA2 Integrin alpha-2 no no 0 0 0 1 42.058 42.058 3 0.00090166 38965 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.139 48.514 50680000 0 0 0 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dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 87.211 87.211 2 5.4077E-14 88764 QUIQUE_C1368_190116_001 143.61 118.76 675500000 138000000 0 147900000 122840000 102070000 122530000 0 0 0 42169000 0 0 0 4286 4477 4003 39713;39714;39715;39716;39717;39718 50851;50852;50853;50854;50855;50856 50852 6 AVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIR Unmodified 2272.2249 0.22493792 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 0 0 5 2 1 2 1 2 1 1 2 3 2 1 140.33 140.33 2;3 1.5856E-11 144388 QUIQUE_C1403_190116_001 131.72 105.59 1158600000 165520000 94780000 67507000 92747000 0 0 119000000 36331000 90835000 62724000 181820000 151280000 96063000 4287 2881 4004 39719;39720;39721;39722;39723;39724;39725;39726;39727;39728;39729;39730;39731;39732;39733;39734;39735;39736;39737;39738;39739;39740;39741 50857;50858;50859;50860;50861;50862;50863;50864;50865;50866;50867;50868;50869;50870;50871;50872;50873;50874;50875;50876;50877;50878;50879;50880;50881;50882;50883;50884 50866 27 AVIGMTAGATGAFVGTPAEVALIR Oxidation (M) 2288.2199 0.21985254 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 1 0 1 1 127.78 127.78 3 5.7948E-05 132927 QUIQUE_C1368_190116_001 49.577 42.004 90558000 0 0 52929000 0 0 0 0 0 37629000 0 0 0 0 4288 2881 4004 39742;39743 50885;50886 50885 2361 2 AVIGSTYMLTQDEVLWEK Unmodified 2082.0343 0.034343181 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 137.34 137.34 2 0.00028235 141091 QUIQUE_C1403_190116_001 80.905 70.056 31017000 0 0 0 31017000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4289 3086 4005 39744 50887 50887 1 AVIHYRDDETMYVESK Oxidation (M) 1970.9044 0.90439164 1486 O15144 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes yes 0 1 1 1 39.555 39.555 3 0.040424 35629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.008 29.843 28792000 0 0 0 0 0 0 0 28792000 0 0 0 0 0 4290 1486 4006 39745 50888 50888 1 AVILELK Unmodified 784.50584 0.50584045 2615 P52888;K7EP46 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 59.233 59.233 2 0.060724 57385 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68248 QUIQUE_C1403_190116_001 56.122 48.752 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4297 4307 4012 39769;39770;39771 50918;50919;50920 50918 3 AVIQHFQEK Unmodified 1098.5822 0.58219329 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067;H7C0V9;H7C2L2 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 17.758 17.758 2;3 6.1063E-07 10765 QUIQUE_C1218_190116_001 158.07 112.06 888180000 141740000 89418000 47550000 75708000 57372000 0 65962000 95108000 92275000 42641000 15954000 71989000 92462000 4298 147 4013 39772;39773;39774;39775;39776;39777;39778;39779;39780;39781;39782;39783;39784;39785;39786;39787;39788;39789;39790;39791;39792;39793 50921;50922;50923;50924;50925;50926;50927;50928;50929;50930;50931;50932;50933;50934;50935;50936;50937;50938;50939;50940;50941;50942;50943;50944 50922 24 AVIQVSQIVAR Unmodified 1182.7085 0.70845643 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3KRZ4;J3KSZ5;J3QS45 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.043 73.043 2 0.00074751 73309 QUIQUE_C1403_190116_001 138.1 58.501 4022100000 343330000 313030000 403070000 294540000 306000000 308560000 321560000 294600000 299470000 127470000 359090000 337500000 313870000 4299 3464 4014 39794;39795;39796;39797;39798;39799;39800;39801;39802;39803;39804;39805;39806 50945;50946;50947;50948;50949;50950;50951;50952;50953;50954;50955;50956;50957;50958 50948 6 AVITSLLDQIPEMFADTR Unmodified 2019.0347 0.034677532 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 168.96 168.96 2;3 3.0245E-45 170443 QUIQUE_C1563_190116_001 172.57 148.9 919800000 63441000 0 20677000 31941000 39304000 185980000 194790000 87554000 59600000 0 70439000 75128000 90941000 4300 2636 4015 39807;39808;39809;39810;39811;39812;39813;39814;39815;39816;39817;39818;39819;39820 50959;50960;50961;50962;50963;50964;50965;50966;50967;50968;50969;50970;50971;50972;50973 50965 14 AVITVQR Unmodified 785.47594 0.4759373 1093 G3XAI2;P07942;E7EPA6 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 22.257 22.257 2 0.060883 14893 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.093 2.0582 601080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 601080000 0 0 0 4301 1093 4016 39821 50974 50974 1 AVITVQRPGR Unmodified 1095.6513 0.6512759 1093 G3XAI2;P07942;E7EPA6 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 21.604 21.604 3 0.067318 14712 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.715 11.374 19989000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19989000 0 0 4302 1093 4017 39822 50975 50975 1 AVIVIQDIFGWQLPNTR Unmodified 1969.0785 0.078531678 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 0 0 2 2 2 3 1 1 163.38 163.38 2;3 3.4605E-24 167775 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.59 140.04 594240000 0 0 0 0 0 0 85109000 138010000 126840000 0 141830000 102450000 0 4303 3835 4018 39823;39824;39825;39826;39827;39828;39829;39830;39831;39832;39833 50976;50977;50978;50979;50980;50981;50982;50983;50984;50985;50986;50987;50988 50988 12 AVIVLVENFYK Unmodified 1293.7333 0.7332742 3855 Q96FQ6 S100A16 Protein S100-A16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.18 120.18 2 0.00040416 124071 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.9 93.751 842510000 33400000 55762000 83891000 31855000 58160000 41890000 63943000 84456000 110410000 23178000 95102000 89434000 71031000 4304 3855 4019 39834;39835;39836;39837;39838;39839;39840;39841;39842;39843;39844;39845;39846 50989;50990;50991;50992;50993;50994;50995;50996;50997;50998;50999;51000;51001;51002;51003;51004;51005 50999 17 AVIVPGNGGGDVTTHGWYGWVK Unmodified 2269.128 0.12800107 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 108.83 108.83 3 8.6421E-06 113764 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.784 56.965 686760000 0 71290000 75920000 71333000 73439000 0 72482000 0 126910000 0 103190000 0 92196000 4305 1663 4020 39847;39848;39849;39850;39851;39852;39853;39854 51006;51007;51008;51009;51010;51011;51012;51013 51012 8 AVKSEANATQLLR Unmodified 1399.7783 0.77832691 115 A0A087X211;Q8TCG1;F8WF26;F8WAX6 KIAA1524 Protein CIP2A yes no 0 0 1 1 62.335 62.335 3 0.066133 62384 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.327 8.5867 62494000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62494000 0 0 4306 115 4021 39855 51014 51014 1 AVLAELPQQVVQYFK Unmodified 1731.956 0.95595693 3853 Q96FN4 CPNE2 Copine-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 147.45 147.45 2 0.0085278 143418 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.499 59.08 177490000 0 0 0 31269000 0 30843000 0 0 58772000 11758000 0 0 44849000 4307 3853 4022 39856;39857;39858;39859;39860 51015;51016;51017;51018;51019 51018 3 AVLAESYER Unmodified 1036.5189 0.51892433 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.454 34.454 2 0.0010141 29839 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.66 63.218 1703900000 120350000 137040000 122930000 144990000 0 120510000 131490000 138680000 143060000 78354000 224690000 150730000 191070000 4308 2180 4023 39861;39862;39863;39864;39865;39866;39867;39868;39869;39870;39871;39872 51020;51021;51022;51023;51024;51025;51026;51027;51028;51029;51030;51031;51032;51033;51034;51035 51032 13 AVLAHVDVQTLSSQLAVTVGPGER Unmodified 2446.318 0.31798668 3787 Q969P0 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.8 123.8 3 7.1639E-12 127778 QUIQUE_C1277_190116_001 63.376 51.41 582110000 56097000 51743000 89175000 0 73255000 0 88991000 0 82783000 62633000 0 0 77433000 4309 3787 4024 39873;39874;39875;39876;39877;39878;39879;39880 51036;51037;51038;51039;51040;51041;51042;51043 51037 7 AVLAPLIALVYSVPR Unmodified 1580.9654 0.9653994 4577 Q9Y320;E9PSF0;E9PRL5;H3BSU7;E9PLR1;G3V155 TMX2;TMX2-CTNND1 Thioredoxin-related transmembrane protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 166.65 166.65 2;3 3.2859E-13 171006 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.03 98.866 57769000 0 8366400 0 12818000 0 0 0 23877000 12708000 0 0 0 0 4310 4577 4025 39881;39882;39883;39884;39885 51044;51045;51046;51047;51048 51048 4 AVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDVIR Oxidation (M) 3285.5242 0.524169 2582 P51553 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 112.07 112.07 3 3.1733E-54 116068 QUIQUE_C1218_190116_001 133.44 125.58 47612000 47612000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4311 2582 4026 39886 51049 51049 2030 1 AVLASMDNENMHTPDIGGQGTTSEAIQDVIR Unmodified 3269.5293 0.52925438 2582 P51553 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.77 120.77 3 1.4301E-102 126211 QUIQUE_C1218_190116_001 172.06 166.09 794260000 102400000 78251000 72023000 68660000 45715000 0 98608000 0 58566000 27178000 62962000 99479000 80419000 4312 2582 4026 39887;39888;39889;39890;39891;39892;39893;39894;39895;39896;39897 51050;51051;51052;51053;51054;51055;51056;51057;51058;51059;51060;51061;51062;51063 51051 14 AVLCPPPVK Unmodified 979.55247 0.55247306 2776 P63000 RAC1 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 38.55 38.55 2 0.0048582 34163 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.029 59.517 3365700000 280360000 329930000 393880000 367410000 265910000 328390000 390780000 222090000 242790000 82071000 268770000 193340000 0 4313 2776 4027 39898;39899;39900;39901;39902;39903;39904;39905;39906;39907;39908;39909;39910;39911;39912;39913;39914;39915 51064;51065;51066;51067;51068;51069;51070;51071;51072;51073;51074;51075;51076;51077;51078;51079;51080;51081;51082;51083;51084;51085;51086;51087;51088;51089;51090;51091;51092;51093;51094;51095;51096;51097;51098;51099;51100 51089 37 AVLCPPPVKK Unmodified 1107.6474 0.64743608 2776 P63000 RAC1 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 no no 0 0 1 1 21.431 21.431 3 0.044293 14618 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.567 26.354 69110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69110000 0 0 4314 2776 4028 39916 51101 51101 0 AVLDALLASK Unmodified 999.59645 0.59644637 3348 Q66K74;M0R1M7 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 97.17 97.17 2 0.014657 100188 QUIQUE_C1368_190116_001 64.04 31.2 448180000 0 62556000 77241000 49035000 0 0 0 53849000 0 0 88526000 63865000 53105000 4315 3348 4029 39917;39918;39919;39920;39921;39922;39923 51102;51103;51104;51105;51106;51107;51108 51103 7 AVLDALLEGK Unmodified 1027.5914 0.59136099 2483;921 E9PGC8;P78559;P46821 MAP1A;MAP1B Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2;Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.83 104.83 2 0.00095808 108270 QUIQUE_C1368_190116_001 103.55 73.973 19029000000 1345600000 1324500000 1843500000 1327400000 1159800000 1457800000 1765500000 1161700000 1362400000 623220000 1793600000 1974600000 1889300000 4316 921;2483 4030 39924;39925;39926;39927;39928;39929;39930;39931;39932;39933;39934;39935;39936 51109;51110;51111;51112;51113;51114;51115;51116;51117;51118;51119;51120;51121;51122;51123;51124;51125;51126;51127;51128;51129;51130;51131;51132;51133;51134;51135;51136;51137;51138;51139;51140 51114 32 AVLDLVDQCPK Unmodified 1256.6435 0.64347291 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.063 79.063 2 0.000395 79879 QUIQUE_C1368_190116_001 116.52 85.149 565250000 73021000 0 77436000 0 42043000 0 37553000 47240000 64755000 23532000 109770000 30704000 59193000 4317 3269 4031 39937;39938;39939;39940;39941;39942;39943;39944;39945;39946 51141;51142;51143;51144;51145;51146;51147;51148;51149;51150;51151 51142 11 AVLDPQGLMNPGK Unmodified 1338.6966 0.69657112 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 87.31 87.31 2 0.00038801 90133 QUIQUE_C1218_190116_001 108.57 80.688 196690000 41907000 0 90737000 0 0 64042000 0 0 0 0 0 0 0 4318 3511 4032 39947;39948;39949;39950 51152;51153;51154;51155 51152 3 AVLDSTNADGISALHQACIDENLEVVR Unmodified 2909.4189 0.41889929 1327 K7EL81;Q9BZL4 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 1 118.91 118.91 3 1.6362E-05 122542 QUIQUE_C1277_190116_001 50.055 43.103 70883000 0 35176000 0 0 0 0 35707000 0 0 0 0 0 0 4319 1327 4033 39951;39952 51156;51157;51158 51156 3 AVLDVFEEGTEASAATAVK Unmodified 1906.9524 0.95238769 1800 P01011;G3V3A0 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 2 2 3 1 1 1 1 1 1 2 3 1 1 119.74 119.74 2;3 2.0553E-45 124866 QUIQUE_C1576_190116_001 200.13 170.19 2409700000 125340000 200730000 427060000 141220000 198770000 71893000 160230000 119630000 61266000 205880000 452690000 57969000 187060000 4320 1800 4034 39953;39954;39955;39956;39957;39958;39959;39960;39961;39962;39963;39964;39965;39966;39967;39968;39969;39970;39971;39972 51159;51160;51161;51162;51163;51164;51165;51166;51167;51168;51169;51170;51171;51172;51173;51174;51175;51176;51177;51178;51179;51180;51181;51182;51183;51184;51185;51186;51187 51175 27 AVLEALGSCLNNK Unmodified 1387.7129 0.71294946 2359 P34896;J3KRZ5;J3KRK5 SHMT1 Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.619 81.619 2 5.5258E-06 83751 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.7 82.256 223710000 0 0 0 0 0 0 0 0 43066000 15942000 59532000 57478000 47687000 4321 2359 4035 39973;39974;39975;39976;39977;39978;39979 51188;51189;51190;51191;51192;51193;51194 51192 6 AVLEECTSFIPEAR Unmodified 1620.7818 0.78175731 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.149 95.149 2 0.00042969 97465 QUIQUE_C1368_190116_001 108.35 90.289 600800000 69867000 0 97213000 46392000 0 59195000 62380000 60767000 0 0 129830000 0 75163000 4322 3269 4036 39980;39981;39982;39983;39984;39985;39986;39987;39988 51195;51196;51197;51198;51199;51200;51201;51202;51203;51204 51196 10 AVLENALR Unmodified 884.50797 0.50796571 3764 Q92890;C9IZG3;C9JNP9 UFD1L Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.504 39.504 2 0.0092599 36584 QUIQUE_C1218_190116_001 92.822 32.023 524470000 102090000 83117000 0 125520000 91481000 0 0 0 58653000 63609000 0 0 0 4323 3764 4037 39989;39990;39991;39992;39993;39994 51205;51206;51207;51208;51209;51210 51205 6 AVLENNLGAAVLR Unmodified 1338.7619 0.76194857 4351 Q9NZL9;H7C0X7 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.249 86.249 2 2.6574E-09 88009 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.91 109.61 1977300000 143350000 203270000 196450000 151140000 0 137380000 163880000 126960000 177520000 72328000 217650000 188100000 199310000 4324 4351 4038 39995;39996;39997;39998;39999;40000;40001;40002;40003;40004;40005;40006 51211;51212;51213;51214;51215;51216;51217;51218;51219;51220;51221;51222 51218 0 AVLEPIQSTSLIGTLTR Unmodified 1798.02 0.020013746 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.74 129.74 2 3.8611E-11 135395 QUIQUE_C1218_190116_001 121.24 103.43 490550000 32123000 35684000 25626000 39845000 40376000 41935000 29659000 44131000 46659000 11649000 46945000 35438000 60476000 4325 3423 4039 40007;40008;40009;40010;40011;40012;40013;40014;40015;40016;40017;40018;40019 51223;51224;51225;51226;51227;51228;51229;51230;51231;51232;51233;51234;51235 51223 13 AVLEQEETAAASR Unmodified 1373.6787 0.67867245 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.532 37.532 2 1.809E-05 34250 QUIQUE_C1576_190116_001 140.3 122.44 7972700000 664810000 647560000 818690000 697470000 518790000 737640000 783770000 561170000 463920000 204250000 599580000 513660000 761380000 4326 143;560;4559 4040 40020;40021;40022;40023;40024;40025;40026;40027;40028;40029;40030;40031;40032 51236;51237;51238;51239;51240;51241;51242;51243;51244;51245;51246;51247;51248;51249;51250;51251;51252;51253;51254;51255;51256;51257 51248 22 AVLEQFGFPLTGTEAR Unmodified 1734.8941 0.89408495 4552 Q9Y2C4;H7C0W6;F8WE28;F8WE38 EXOG Nuclease EXOG, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 128.46 128.46 2 1.198E-06 134004 QUIQUE_C1218_190116_001 111.31 78.984 156990000 45557000 0 0 0 0 0 0 31212000 0 0 0 39431000 40790000 4327 4552 4041 40033;40034;40035;40036;40037 51258;51259;51260;51261;51262;51263 51259 6 AVLEQFLSFAK Unmodified 1251.6863 0.68632401 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.27 135.27 2 0.0018206 140397 QUIQUE_C1368_190116_001 96.331 81.18 247290000 21500000 24071000 18045000 0 25777000 0 0 31438000 29111000 0 32359000 36705000 28286000 4328 264 4042 40038;40039;40040;40041;40042;40043;40044;40045;40046;40047;40048 51264;51265;51266;51267;51268;51269;51270;51271;51272;51273;51274;51275 51266 11 AVLFCLSDDKR Unmodified 1322.6653 0.66527099 4546 Q9Y281;F8WDN3 CFL2 Cofilin-2 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 3 2 2 2 61.344 61.344 2;3 0.00022028 60778 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.36 89.213 3446300000 253820000 285760000 317120000 78809000 330070000 175840000 337000000 119820000 233880000 107760000 408850000 326940000 470600000 4329 4546 4043 40049;40050;40051;40052;40053;40054;40055;40056;40057;40058;40059;40060;40061;40062;40063;40064;40065;40066;40067;40068;40069;40070;40071 51276;51277;51278;51279;51280;51281;51282;51283;51284;51285;51286;51287;51288;51289;51290;51291;51292;51293;51294;51295;51296;51297;51298;51299;51300;51301 51295 24 AVLFCLSEDK Unmodified 1180.5798 0.57981002 2220 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;E9PLJ3;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.277 84.277 2 2.5411E-07 86816 QUIQUE_C1218_190116_001 149.65 130.87 2546200000 349800000 174250000 273570000 267320000 282360000 371650000 221450000 106290000 136940000 133130000 0 103370000 126030000 4330 2220 4044 40072;40073;40074;40075;40076;40077;40078;40079;40080;40081;40082;40083;40084 51302;51303;51304;51305;51306;51307;51308;51309;51310;51311;51312;51313;51314;51315;51316 51302 15 AVLFCLSEDKK Unmodified 1308.6748 0.67477304 2220 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;E9PLJ3;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 1 2 2 3 3 2 2 2 3 3 2 3 2 2 56.309 56.309 2;3 5.323E-08 54436 QUIQUE_C1403_190116_001 149.82 120.01 36441000000 2421500000 2700500000 2909800000 2370400000 2782800000 2102400000 3001200000 2907000000 2946100000 1656800000 3861300000 2953200000 3827700000 4331 2220 4045 40085;40086;40087;40088;40089;40090;40091;40092;40093;40094;40095;40096;40097;40098;40099;40100;40101;40102;40103;40104;40105;40106;40107;40108;40109;40110;40111;40112;40113;40114;40115 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4339 2209;4270 4053 40187 51460 51460 0 AVLLEALGSPSEDVR Unmodified 1554.8253 0.82533668 1614 O75155 CAND2 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 102.59 102.59 2 0.0016503 105313 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.44 42.322 97768000 0 26134000 0 0 15824000 0 0 0 0 0 23507000 32303000 0 4340 1614 4054 40188;40189;40190;40191 51461;51462;51463;51464 51464 4 AVLLGPPGAGK Unmodified 978.58622 0.58621603 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;F8VY04;G3V213;F8VPP1 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.794 45.794 2 0.021177 43431 QUIQUE_C1438_190116_001 60.59 22.352 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4341 1047 4055 40192;40193;40194;40195;40196;40197;40198 51465;51466;51467;51468;51469;51470;51471 51468 7 AVLLLEHVER Unmodified 1177.6819 0.68190733 4476;703 Q9UKU0;E7ERD7;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 57.087 57.087 2;3 0.018569 57045 QUIQUE_C1218_190116_001 60.91 39.462 566620000 123860000 0 102050000 62339000 0 0 0 44770000 31648000 0 101660000 0 100290000 4342 4476;703 4056 40199;40200;40201;40202;40203;40204;40205;40206;40207;40208;40209 51472;51473;51474;51475;51476;51477;51478;51479;51480;51481;51482 51472 8 AVLLSLAEEDY Unmodified 1221.6129 0.61288429 1026 F6VCX5;Q16816 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 0 1 136.68 136.68 2 0.02252 139597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.205 40.486 25715000 0 0 0 0 0 0 0 25715000 0 0 0 0 0 4343 1026 4057 40210 51483 51483 1 AVLLTGEQGTAK Unmodified 1186.6558 0.65575216 1130 H0Y7V4;A0A075B6F3;Q96JB1 DNAH8 Dynein heavy chain 8, axonemal yes no 0 0 0 1 117.87 117.87 2 0.049285 122130 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.753 12.398 14991000 0 0 0 0 0 0 0 0 14991000 0 0 0 0 4344 1130 4058 40211 51484 51484 1 AVLNLLFSPR Unmodified 1128.6655 0.66552898 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 119.96 119.96 2 0.0015231 123637 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.624 70.021 184890000 0 0 0 30852000 38737000 0 29720000 0 0 0 38690000 46887000 0 4345 1913 4059 40212;40213;40214;40215;40216 51485;51486;51487;51488;51489 51489 5 AVLNLLR Unmodified 797.51232 0.51232281 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 69.534 69.534 2 0.019666 69669 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.05 39.702 24492000 0 0 0 0 0 0 0 0 24492000 0 0 0 0 4346 3777 4060 40217 51490 51490 1 AVLNPLCQVDYR Unmodified 1446.7289 0.72893388 1007;463 F5H365;Q15436;G3V4V1;G3V1W4;G3V3G5;G3V2R6;A0A2R8YFH5;Q15437;Q5QPE2 SEC23A;SEC23B Protein transport protein Sec23A;Protein transport protein Sec23B no no 0 0 0 1 91.485 91.485 2 0.00055081 94016 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.24 69.768 95588000 0 0 0 0 0 0 0 0 95588000 0 0 0 0 4347 1007;463 4061 40218 51491;51492 51491 2 AVLNPTPIKR Unmodified 1107.6764 0.67642802 2830 P84095 RHOG Rho-related GTP-binding protein RhoG yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 24.785 24.785 2;3 0.0023637 18763 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.908 57.099 631900000 0 0 31954000 0 0 0 42976000 61207000 105640000 14772000 165200000 14564000 195590000 4348 2830 4062 40219;40220;40221;40222;40223;40224;40225;40226;40227;40228;40229;40230 51493;51494;51495;51496;51497;51498;51499;51500;51501;51502;51503;51504;51505 51497 12 AVLPLLDAQQPCYLLYR Unmodified 2032.0816 0.081568145 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 2 148.23 148.23 2;3 4.6554E-30 155296 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.48 173.26 1479400000 79183000 127730000 141040000 158050000 154820000 39341000 92270000 88459000 94657000 40340000 182430000 119680000 161440000 4349 3365 4063 40231;40232;40233;40234;40235;40236;40237;40238;40239;40240;40241;40242;40243;40244;40245;40246;40247;40248;40249;40250;40251;40252 51506;51507;51508;51509;51510;51511;51512;51513;51514;51515;51516;51517;51518;51519;51520;51521;51522;51523;51524;51525;51526;51527;51528;51529;51530;51531 51527 25 AVLPVAESFGFADEIR Unmodified 1719.8832 0.88318591 3454 Q7Z2Z2 EFTUD1 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 138.23 138.23 2 0.018159 145477 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.159 34.427 30731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30731000 0 0 4350 3454 4064 40253 51532 51532 1 AVLQEFGR Unmodified 918.49232 0.49231565 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJE4 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 0 1 50.095 50.095 2 0.045132 47626 QUIQUE_C1403_190116_001 57.281 23.543 81121000 0 0 0 81121000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4351 4581 4065 40254 51533 51533 1 AVLQWTK Unmodified 844.48069 0.48068833 3867 Q96HE7;G3V3E6;G3V5B3 ERO1L ERO1-like protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 47.346 47.346 2 0.030434 44795 QUIQUE_C1277_190116_001 90.706 45.733 200780000 58927000 52398000 47000000 0 0 0 0 0 0 0 0 42457000 0 4352 3867 4066 40255;40256;40257;40258 51534;51535;51536;51537 51535 4 AVLSAEQLRDEEVHAGLGELLR Unmodified 2404.271 0.27103649 2565 P50454;E9PR70;E9PPV6;E9PJH8;E9PIG2;E9PRS3;E9PNX1;E9PK86;E9PMI5;E9PQ34 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 115.23 115.23 3;4 3.9108E-07 119147 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.847 74.279 291350000 0 0 0 30271000 102260000 0 0 55682000 36071000 0 42472000 0 24596000 4353 2565 4067 40259;40260;40261;40262;40263;40264;40265;40266 51538;51539;51540;51541;51542;51543;51544;51545 51543 8 AVLSLYASGR Unmodified 1035.5713 0.57129425 1333 K7EM38 ACTG1 yes yes 0 0 0 1 59.943 59.943 2 0.025539 59232 QUIQUE_C1368_190116_001 78.113 38.015 33298000 0 0 33298000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4354 1333 4068 40267 51546 51546 0 AVLTIDEK Unmodified 887.4964 0.49639797 1799;4 A0A024R6I7;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.74 36.74 2 0.008111 32461 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.541 45.517 5232100000 794270000 0 771280000 0 1029100000 0 680500000 0 0 412180000 735340000 0 809380000 4355 4;1799 4069 40268;40269;40270;40271;40272;40273;40274;40275 51547;51548;51549;51550;51551;51552;51553;51554;51555;51556;51557;51558 51553 12 AVLTPNHVEFSR Unmodified 1368.715 0.71499837 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 46.226 46.226 2;3 0.00048854 43966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.16 70.359 2837800000 151790000 224330000 223260000 190120000 229480000 120680000 242440000 223320000 239220000 48147000 308630000 270950000 365480000 4356 3533 4070 40276;40277;40278;40279;40280;40281;40282;40283;40284;40285;40286;40287;40288;40289;40290;40291;40292;40293;40294;40295;40296;40297;40298 51559;51560;51561;51562;51563;51564;51565;51566;51567;51568;51569;51570;51571;51572;51573;51574;51575;51576;51577;51578;51579;51580;51581;51582;51583;51584;51585;51586 51574 27 AVLVALK Unmodified 712.48471 0.48471107 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 41.454 41.454 2 0.05526 38826 QUIQUE_C1438_190116_001 72.021 7.4579 32618000 0 0 0 0 32618000 0 0 0 0 0 0 0 0 4357 2254 4071 40299 51587 51587 1 AVLVDLEPGTMDSVR Oxidation (M) 1616.808 0.80797206 2797;1862;3230;1363 P04350;M0QY85;M0R278;M0R0X0;M0QX14;M0QZL7;A0A075B724;P68371;Q3ZCM7;M0QY37 TUBB4A;TUBB8;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-8 chain no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.335 86.335 2 8.1122E-06 87655 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.06 97.568 48143000000 2873000000 3954900000 3514000000 2870900000 3134500000 0 3110600000 4250300000 4835700000 3821100000 5733000000 4491400000 5554100000 4358 1862;2797;3230;1363 4072 40300;40301;40302;40303;40304;40305;40306;40307;40308;40309;40310;40311 51588;51589;51590;51591;51592;51593;51594;51595;51596;51597;51598;51599;51600;51601 51596 764 14 AVLVDLEPGTMDSVR Unmodified 1600.8131 0.81305744 2797;1862;3230;1363 P04350;M0QY85;M0R278;M0R0X0;M0QX14;M0QZL7;A0A075B724;P68371;Q3ZCM7;M0QY37 TUBB4A;TUBB8;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-8 chain no no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 4 104.51 104.51 2;3 4.1228E-18 107892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.24 99.127 118710000000 11371000000 12474000000 10019000000 9809600000 9801600000 9564100000 12167000000 9349800000 9559300000 2945500000 11941000000 9515500000 189840000 4359 1862;2797;3230;1363 4072 40312;40313;40314;40315;40316;40317;40318;40319;40320;40321;40322;40323;40324;40325;40326;40327;40328;40329;40330;40331;40332;40333;40334;40335;40336;40337;40338;40339;40340;40341;40342;40343;40344;40345;40346;40347;40348;40349;40350 51602;51603;51604;51605;51606;51607;51608;51609;51610;51611;51612;51613;51614;51615;51616;51617;51618;51619;51620;51621;51622;51623;51624;51625;51626;51627;51628;51629;51630;51631;51632;51633;51634;51635;51636;51637;51638;51639;51640;51641;51642;51643;51644;51645;51646;51647;51648;51649;51650;51651;51652;51653;51654;51655;51656;51657;51658;51659;51660;51661;51662;51663;51664 51642 62 AVLVDLSGTLHIEDAAVPGAQEALKR Unmodified 2672.4497 0.44972914 4123 Q9H0R4;K7ER15;K7EQD2;K7EMY7;A0A1B0GXB1;K7EJQ8;K7EKX8 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 121.64 121.64 3;4 0.0034924 126412 QUIQUE_DMIX8_190116_001 29.47 22.254 459640000 0 0 0 0 0 0 0 42200000 113850000 0 0 110050000 193540000 4360 4123 4073 40351;40352;40353;40354;40355 51665;51666;51667;51668;51669;51670 51669 6 AVLVGYDEHFSFAK Unmodified 1581.7827 0.78274359 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 3 3 2 2 1 2 3 5 2 2 2 2 2 90.534 90.534 2;3 7.662E-05 92503 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.944 80.467 2148100000 218860000 202580000 176140000 90566000 116970000 159190000 206210000 195200000 164650000 51351000 195840000 177450000 193130000 4361 3859 4074 40356;40357;40358;40359;40360;40361;40362;40363;40364;40365;40366;40367;40368;40369;40370;40371;40372;40373;40374;40375;40376;40377;40378;40379;40380;40381;40382;40383;40384;40385;40386 51671;51672;51673;51674;51675;51676;51677;51678;51679;51680;51681;51682;51683;51684;51685;51686;51687;51688;51689;51690;51691;51692;51693;51694;51695;51696;51697;51698;51699;51700;51701;51702;51703;51704;51705;51706 51695 30 AVLWVSADGLR Unmodified 1185.6506 0.6506072 2544 P49757;G3V3R1;G3V3M5 NUMB Protein numb homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 100.3 100.3 2 0.002534 102190 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.358 53.929 128600000 24262000 0 0 25577000 0 0 0 23588000 0 0 27559000 27610000 0 4362 2544 4075 40387;40388;40389;40390;40391;40392;40393;40394 51707;51708;51709;51710;51711;51712;51713;51714 51711 8 AVLYNYR Unmodified 897.47085 0.47085192 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 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51716;51717;51718;51719;51720;51721;51722;51723;51724;51725;51726;51727;51728;51729;51730;51731;51732;51733;51734;51735;51736;51737;51738;51739;51740;51741;51742;51743;51744;51745;51746;51747;51748;51749;51750;51751;51752;51753;51754;51755;51756;51757;51758;51759;51760;51761;51762;51763;51764;51765;51766 51720 456 51 AVMDDFAAFVEK Unmodified 1341.6275 0.6274885 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 1 2 3 131.62 131.62 2;3 0.00012363 135221 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.68 111.34 52375000000 4526900000 5296400000 2252500000 5721100000 7028000000 4053700000 3348300000 1196500000 3479600000 962670000 4307700000 4356400000 5845500000 + 4365 769 4077 40422;40423;40424;40425;40426;40427;40428;40429;40430;40431;40432;40433;40434;40435;40436;40437;40438;40439;40440;40441;40442;40443;40444;40445;40446;40447;40448 51767;51768;51769;51770;51771;51772;51773;51774;51775;51776;51777;51778;51779;51780;51781;51782;51783;51784;51785;51786;51787;51788;51789;51790;51791;51792;51793;51794;51795;51796;51797;51798;51799;51800;51801;51802;51803;51804;51805;51806;51807;51808;51809;51810;51811;51812;51813 51804 45 AVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAK Oxidation (M) 2740.4357 0.43571855 2250 P26232;B9A010 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.57 167.57 3 8.9558E-24 169489 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.43 110.93 2119300000 150450000 178430000 240310000 149260000 0 52702000 157120000 243590000 227030000 0 332840000 156020000 231500000 4366 2250 4078 40449;40450;40451;40452;40453;40454;40455;40456;40457;40458;40459;40460 51814;51815;51816;51817;51818;51819;51820;51821;51822;51823;51824;51825 51821 1609 11 AVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAK Unmodified 2724.4408 0.44080393 2250 P26232;B9A010 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 169.9 169.9 2;3 1.2806E-195 175218 QUIQUE_C1576_190116_001 236.02 231.98 4275100000 0 311410000 232300000 107600000 185700000 348350000 687310000 255540000 687050000 65659000 492730000 492030000 409440000 4367 2250 4078 40461;40462;40463;40464;40465;40466;40467;40468;40469;40470;40471;40472;40473;40474 51826;51827;51828;51829;51830;51831;51832;51833;51834;51835;51836;51837;51838;51839 51832 14 AVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAK Unmodified 2710.4252 0.42515387 2369 P35221;G3XAM7;E5RFK9;E5RFM5;E5RJP7;E5RGD2;E5RFG3;A0A087WZL6;E5RGU3;E5RHJ5;E5RGG4;E5RJ43;E5RGS1 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.67 168.67 3 2.9296E-29 170561 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.19 120.67 1293600000 74918000 72879000 0 160700000 112640000 0 136570000 214910000 113350000 21220000 143760000 129310000 113330000 4368 2369 4079 40475;40476;40477;40478;40479;40480;40481;40482;40483;40484;40485 51840;51841;51842;51843;51844;51845;51846;51847;51848;51849;51850 51845 10 AVMDHVSDSFLETNVPLLVLIEAAK Oxidation (M) 2726.4201 0.42006849 2369 P35221;G3XAM7;E5RFK9;E5RFM5;E5RJP7;E5RGD2;E5RFG3;A0A087WZL6;E5RGU3;E5RHJ5;E5RGG4;E5RJ43;E5RGS1 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 1 0 1 1 1 166.27 166.27 3 1.5608E-17 168354 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.387 92.738 192210000 0 0 0 0 0 0 0 52822000 0 0 81004000 58387000 0 4369 2369 4079 40486;40487;40488 51851;51852;51853 51851 1768 3 AVMEIMTK Unmodified 921.46636 0.46636017 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.001 46.001 2 0.0095269 42850 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.47 60.535 2951100000 291760000 330130000 306170000 287030000 0 237860000 311740000 215320000 224280000 71947000 0 279070000 395760000 4370 3982 4080 40489;40490;40491;40492;40493;40494;40495;40496;40497;40498;40499;40500;40501 51854;51855;51856;51857;51858;51859;51860;51861;51862;51863;51864;51865;51866 51862 13 AVMEQANLQR Unmodified 1158.5815 0.58154136 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 30.218 30.218 2 0.00053379 24864 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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40568;40569;40570;40571;40572;40573;40574;40575;40576;40577;40578;40579;40580;40581;40582;40583;40584 51945;51946;51947;51948;51949;51950;51951;51952;51953;51954;51955;51956;51957;51958;51959;51960;51961;51962;51963 51947 3017 19 AVMVSNILLINK Unmodified 1313.7741 0.77409316 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;H0YDZ7;Q5SZC3 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.3 108.3 2 0.0001339 113097 QUIQUE_C1438_190116_001 130.96 103.22 5040700000 379160000 464100000 504210000 412540000 318130000 319520000 455970000 411760000 326280000 130000000 439740000 419230000 460050000 4378 4567 4086 40585;40586;40587;40588;40589;40590;40591;40592;40593;40594;40595;40596;40597 51964;51965;51966;51967;51968;51969;51970;51971;51972;51973;51974;51975;51976 51968 5 AVNPFLADVDK Unmodified 1187.6186 0.61863837 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 85.247 85.247 2 0.043288 86697 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.49 29.418 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4379 3037 4087 40598 51977 51977 1 AVNPFLADVDKLK Unmodified 1428.7977 0.79766537 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.672 95.672 3 0.00097037 97960 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.891 45.562 186930000 0 0 0 0 21028000 0 12047000 26217000 26084000 0 37600000 29390000 34558000 4380 3037 4088 40599;40600;40601;40602;40603;40604;40605 51978;51979;51980;51981;51982;51983;51984 51980 7 AVNTAPVPGQTPHDESDRR Unmodified 2045.9879 0.98787877 1532 O43581;F5H8G7 SYT7 Synaptotagmin-7 yes no 0 0 1 1 1 1 1 19.75 19.75 3;4 5.0181E-05 12124 QUIQUE_C1277_190116_001 75.548 59.606 243910000 50838000 41326000 91572000 60172000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4381 1532 4089 40606;40607;40608;40609 51985;51986;51987;51988 51986 3 AVNTAQGLFQR Unmodified 1203.636 0.63601977 1549 O43752 STX6 Syntaxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 54.664 54.664 2 0.011417 52361 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.136 38.938 144520000 36342000 0 0 0 36406000 31733000 40036000 0 0 0 0 0 0 4382 1549 4090 40610;40611;40612;40613;40614 51989;51990;51991;51992;51993 51993 4 AVNTQALSGAGILR Unmodified 1369.7678 0.76776223 1590 O60749 SNX2 Sorting nexin-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.739 76.739 2 2.7074E-10 78753 QUIQUE_C1218_190116_001 164.65 140.56 1462600000 80206000 97889000 104900000 127330000 115700000 109340000 95106000 159380000 125770000 80947000 115360000 103640000 147100000 4383 1590 4091 40615;40616;40617;40618;40619;40620;40621;40622;40623;40624;40625;40626;40627;40628 51994;51995;51996;51997;51998;51999;52000;52001;52002;52003;52004;52005;52006;52007;52008;52009 51995 16 AVNVAFLGCPGFAEVLQTFSTCK Unmodified 2515.224 0.22395164 3588 Q8N465;B5MCV2 D2HGDH D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 167.27 167.27 3 7.795E-06 169243 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.913 34.613 56963000 0 0 0 0 0 23232000 0 33731000 0 0 0 0 0 4384 3588 4092 40629;40630;40631 52010;52011;52012 52012 2 AVNVYSTSITQETMSR Acetyl (Protein N-term) 1827.8673 0.86727785 1349 K7ERD8;M0QX52;K7ENB3 MAPRE2 yes no 1 0 0 1 1 118.16 118.16 2 0.00070728 121737 QUIQUE_C1277_190116_001 73.881 57.262 117740000 0 44182000 0 0 0 0 0 0 0 0 73554000 0 0 4385 1349 4093 40632;40633 52013;52014 52013 2 AVNVYSTSITQETMSR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1843.8622 0.86219247 1349 K7ERD8;M0QX52;K7ENB3 MAPRE2 yes no 1 1 0 1 1 1 104.1 104.1 2 9.5598E-07 107640 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.53 93.85 101050000 0 0 0 0 0 0 0 0 48431000 0 52617000 0 0 4386 1349 4093 40634;40635;40636 52015;52016;52017 52015 755 2 AVNVYSTSVTSDNLSR Acetyl (Protein N-term) 1753.8483 0.84825697 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 2 1 2 104.43 104.43 2 6.2745E-30 108115 QUIQUE_C1218_190116_001 164.48 144.19 1354300000 166460000 165560000 189830000 212150000 0 276290000 0 226170000 0 117830000 0 0 0 4387 3150 4094 40637;40638;40639;40640;40641;40642;40643;40644;40645 52018;52019;52020;52021;52022;52023;52024;52025;52026;52027;52028 52018 11 AVNVYSTSVTSENLSR Acetyl (Protein N-term) 1767.8639 0.86390703 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 1 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 105.26 105.26 2 4.1828E-36 108142 QUIQUE_DMIX8_190116_001 168.98 150.88 2603600000 194300000 256460000 128670000 154840000 151370000 131180000 153170000 183790000 355400000 101020000 283510000 299630000 210310000 4388 4524 4095 40646;40647;40648;40649;40650;40651;40652;40653;40654;40655;40656;40657;40658;40659;40660;40661;40662;40663;40664 52029;52030;52031;52032;52033;52034;52035;52036;52037;52038;52039;52040;52041;52042;52043;52044;52045;52046;52047;52048;52049;52050;52051;52052;52053;52054;52055;52056;52057;52058 52057 30 AVNYFSK Unmodified 827.41775 0.41775372 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 29.408 29.408 2 0.034902 24044 QUIQUE_C1576_190116_001 87.284 36.745 3031900000 0 0 0 0 0 0 864460000 0 0 0 1103500000 0 1064000000 4389 50 4096 40665;40666;40667 52059;52060;52061 52059 3 AVPAALILR Acetyl (Protein N-term) 964.60695 0.60695147 812 D6RC04;Q9Y6G5 COMMD10 COMM domain-containing protein 10 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.93 137.93 2 0.0058737 144261 QUIQUE_C1438_190116_001 72.138 61.322 285020000 26482000 26868000 18650000 0 26545000 24283000 26059000 19682000 24741000 7790900 19172000 31721000 33025000 4390 812 4097 40668;40669;40670;40671;40672;40673;40674;40675;40676;40677;40678;40679 52062;52063;52064;52065;52066;52067;52068;52069;52070;52071;52072;52073 52065 11 AVPAVLGSAGLVFLVGEVVPAAVSGR Unmodified 2434.3948 0.39478044 3642 Q8NE01 CNNM3 Metal transporter CNNM3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.13 172.13 3 1.251E-08 175504 QUIQUE_C1277_190116_001 65.213 61.939 135830000 10920000 14430000 8029300 19742000 11478000 0 0 15109000 19227000 6027500 0 30871000 0 4391 3642 4098 40680;40681;40682;40683;40684;40685;40686;40687;40688 52074;52075;52076;52077;52078;52079;52080;52081;52082;52083 52075 10 AVPEGFVIPR Unmodified 1083.6077 0.60767975 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.458 81.458 2 0.0033951 83374 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.568 57.314 747200000 55010000 46208000 83712000 100480000 56531000 74639000 57367000 51625000 0 30861000 89570000 0 101190000 4392 2465 4099 40689;40690;40691;40692;40693;40694;40695;40696;40697;40698;40699;40700;40701 52084;52085;52086;52087;52088;52089;52090;52091;52092;52093;52094;52095;52096;52097;52098;52099;52100;52101;52102 52098 19 AVPETRPNHTIYINNLNEK Acetyl (Protein N-term) 2264.1549 0.1549441 1373 M0R268;P09012;M0R0G9;M0QXK2;M0R221;M0R2B8 SNRPA U1 small nuclear ribonucleoprotein A yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.477 67.477 3 2.8727E-06 67657 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.33 92.852 1264100000 113670000 0 113220000 0 118920000 52915000 115480000 0 180710000 50362000 215350000 153470000 150000000 4393 1373 4100 40702;40703;40704;40705;40706;40707;40708;40709;40710;40711 52103;52104;52105;52106;52107;52108;52109;52110;52111;52112 52110 10 AVPFMEVSSLGVTTFSLCALGIDR Unmodified 2569.292 0.29203121 1599 O60883 GPR37L1 Prosaposin receptor GPR37L1 yes yes 0 0 0 1 1 170.18 170.18 3 0.0021714 178144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.576 16.279 74093000 0 0 0 0 0 0 0 28928000 0 0 45165000 0 0 4394 1599 4101 40712;40713 52113;52114 52114 2 AVPFQNAILNVK Unmodified 1312.7503 0.75032125 45 A0A087WUW9;Q9NXU5;A0A0B4J222 ARL15 ADP-ribosylation factor-like protein 15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.27 100.27 2 7.8345E-07 104659 QUIQUE_C1218_190116_001 141.2 109.77 358400000 33027000 44113000 38397000 37507000 43328000 40465000 42356000 0 0 0 44129000 0 35073000 4395 45 4102 40714;40715;40716;40717;40718;40719;40720;40721;40722;40723;40724;40725 52115;52116;52117;52118;52119;52120;52121;52122;52123;52124;52125;52126 52115 12 AVPGAPELLER Unmodified 1150.6346 0.63462279 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.925 72.925 2 0.029666 73406 QUIQUE_C1277_190116_001 51.436 33.527 1379000000 279160000 299590000 0 0 221310000 0 0 0 0 69997000 286860000 222130000 0 4396 3859 4103 40726;40727;40728;40729;40730;40731 52127;52128;52129;52130;52131;52132 52128 5 AVPGGAGDASVLPSLPR Unmodified 1562.8417 0.84165545 3949 Q96TC7;H0YLG5;H0YNE5 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.281 92.281 2 0.000874 94206 QUIQUE_C1368_190116_001 86.467 69.442 337620000 46411000 30895000 47050000 54287000 38385000 0 0 39930000 60873000 19785000 0 0 0 4397 3949 4104 40732;40733;40734;40735;40736;40737;40738;40739 52133;52134;52135;52136;52137;52138;52139;52140;52141;52142 52136 9 AVPKEDIYSGGGGGGSR Unmodified 1605.7747 0.7746981 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 1 1 23.743 23.743 3 8.7147E-05 17407 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.081 53.262 75599000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75599000 0 4398 2969 4105 40740 52143 52143 1 AVPLALALISVSNPR Unmodified 1519.9086 0.9086128 2976 Q13200;H7C1H2 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 139.25 139.25 2;3 2.7696E-06 144491 QUIQUE_C1368_190116_001 81.632 76.783 1980100000 156930000 180190000 160770000 153570000 220220000 129420000 187870000 204920000 181110000 71361000 60333000 54397000 219010000 4399 2976 4106 40741;40742;40743;40744;40745;40746;40747;40748;40749;40750;40751;40752;40753;40754;40755;40756;40757;40758;40759;40760;40761;40762;40763;40764 52144;52145;52146;52147;52148;52149;52150;52151;52152;52153;52154;52155;52156;52157;52158;52159;52160;52161;52162;52163;52164;52165;52166;52167;52168;52169;52170;52171;52172;52173;52174;52175;52176;52177;52178;52179;52180 52151 34 AVPLAVPLGQTEVFQALQR Unmodified 2036.1419 0.14186022 3503 Q86W42 THOC6 THO complex subunit 6 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 143.37 143.37 2;3 0.00047834 150709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.434 53.724 47045000 0 0 0 0 0 0 0 0 10842000 0 21404000 14799000 0 4400 3503 4107 40765;40766;40767 52181;52182;52183 52182 2 AVPLIHQEGNR Unmodified 1232.6626 0.66256887 1381 O00170;E9PMH2;V9GYQ3 AIP AH receptor-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.935 21.935 2;3 0.00040373 14364 QUIQUE_C1277_190116_001 72.652 52.89 331040000 57739000 53457000 51074000 47494000 0 0 0 47578000 0 27207000 46493000 0 0 4401 1381 4108 40768;40769;40770;40771;40772;40773;40774;40775;40776;40777;40778 52184;52185;52186;52187;52188;52189;52190;52191;52192;52193;52194 52185 10 AVPLPMTVR Oxidation (M) 998.55829 0.55828672 3850;3734 Q92561;E5RHN5;Q96FC7 PHYHIP;PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein;Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like no no 0 1 0 1 42.745 42.745 2 0.02802 39418 QUIQUE_C1277_190116_001 60.59 27.749 52504000 0 52504000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4402 3734;3850 4109 40779 52195 52195 1 AVPLPMTVR Unmodified 982.56337 0.5633721 3850;3734 Q92561;E5RHN5;Q96FC7 PHYHIP;PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein;Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like no no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.257 64.257 2 0.036508 63644 QUIQUE_C1277_190116_001 84.568 67.641 1189500000 0 243250000 233000000 0 0 0 280410000 0 0 49554000 383320000 0 0 4403 3734;3850 4109 40780;40781;40782;40783;40784 52196;52197;52198;52199;52200 52196 3 AVPPTYADLGK Acetyl (Protein N-term) 1172.6077 0.60773933 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 1 0 0 2 3 3 2 4 3 3 2 4 1 3 3 3 97.79 97.79 1;2 0.00036958 99816 QUIQUE_C1368_190116_001 96.331 68.157 4059700000 293870000 377260000 234610000 303330000 314400000 314630000 261400000 235320000 371790000 97194000 472500000 344580000 438780000 4404 726;2185 4110 40785;40786;40787;40788;40789;40790;40791;40792;40793;40794;40795;40796;40797;40798;40799;40800;40801;40802;40803;40804;40805;40806;40807;40808;40809;40810;40811;40812;40813;40814;40815;40816;40817;40818;40819;40820 52201;52202;52203;52204;52205;52206;52207;52208;52209;52210;52211;52212;52213;52214;52215;52216;52217;52218;52219;52220;52221;52222;52223;52224;52225;52226;52227;52228;52229;52230;52231;52232;52233;52234;52235;52236;52237;52238;52239;52240;52241;52242;52243;52244;52245;52246;52247;52248;52249;52250;52251;52252;52253;52254;52255;52256;52257;52258;52259;52260;52261;52262;52263;52264;52265;52266;52267;52268;52269;52270;52271;52272;52273;52274;52275;52276;52277 52213 70 AVPREELFVTSK Unmodified 1374.7507 0.75071518 2076 P14550;Q5T621;V9GYG2;V9GYP9 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes no 0 0 1 1 2 2 2 46.919 46.919 2;3 0.01157 44615 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.201 46.471 379040000 0 0 0 0 0 0 0 0 46345000 0 64442000 125220000 143040000 4405 2076 4111 40821;40822;40823;40824;40825;40826;40827 52278;52279;52280;52281;52282;52283;52284;52285 52279 8 AVPSWFVR Unmodified 960.51814 0.51813647 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 84.975 84.975 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52289;52290;52291;52292;52293;52294;52295;52296;52297;52298;52299;52300;52301;52302;52303;52304;52305;52306 52291 18 AVQEIMQEK Unmodified 1074.5379 0.53794521 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.846 29.846 2 0.004515 23896 QUIQUE_C1368_190116_001 88.819 23.567 432710000 104290000 0 132680000 93968000 0 101770000 0 0 0 0 0 0 0 4409 2194 4115 40847;40848;40849;40850;40851 52307;52308;52309;52310;52311;52312 52308 6 AVQELWLR Unmodified 1013.5658 0.56581494 2443 P42126;Q96DC0;H3BS70 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.834 78.834 2 0.00089185 80174 QUIQUE_C1576_190116_001 148.07 85.354 1583500000 0 117080000 155800000 111920000 149690000 128360000 137650000 120010000 103040000 44096000 190500000 167410000 157970000 4410 2443 4116 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Gamma-soluble NSF attachment protein yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 100.96 100.96 2;3 6.1356E-161 103892 QUIQUE_C1368_190116_001 247.88 231.74 4260600000 258160000 361020000 347650000 230110000 299470000 278490000 349660000 296760000 353300000 131140000 456180000 410740000 487940000 4415 3973 4121 40898;40899;40900;40901;40902;40903;40904;40905;40906;40907;40908;40909;40910;40911;40912;40913;40914;40915;40916;40917;40918;40919;40920 52361;52362;52363;52364;52365;52366;52367;52368;52369;52370;52371;52372;52373;52374;52375;52376;52377;52378;52379;52380;52381;52382;52383;52384;52385;52386;52387;52388;52389 52365 29 AVQMGMSSVFFNK Unmodified 1444.6843 0.68429187 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 104.89 104.89 2 1.3825E-07 107264 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.88 94.572 1457500000 0 93792000 209790000 121950000 0 203000000 160190000 117540000 104060000 33005000 157980000 111320000 144910000 4416 1665 4122 40921;40922;40923;40924;40925;40926;40927;40928;40929;40930;40931;40932;40933 52390;52391;52392;52393;52394;52395;52396;52397;52398;52399;52400;52401;52402;52403 52397 14 AVQNPPEGTAEDQK Unmodified 1482.6951 0.69505079 1402 O00408;E9PEF1 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.876 16.876 2 2.1872E-17 8790 QUIQUE_C1403_190116_001 150.04 142.4 602380000 74513000 69499000 63804000 61298000 38238000 44279000 55420000 20643000 27405000 15761000 57503000 30144000 43871000 4417 1402 4123 40934;40935;40936;40937;40938;40939;40940;40941;40942;40943;40944;40945;40946 52404;52405;52406;52407;52408;52409;52410;52411;52412;52413;52414;52415;52416;52417;52418 52407 15 AVQQPDGLAVLGIFLK Unmodified 1667.961 0.9610423 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 0 0 2 3 3 2 3 2 2 2 2 3 2 2 2 160.65 160.65 2;3 9.273E-37 166598 QUIQUE_C1438_190116_001 139.58 128.99 26061000000 1224600000 2146500000 1680700000 1411100000 2454100000 1367000000 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2 0.00053008 139172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.27 96.846 28914000 0 0 0 0 0 0 0 0 28914000 0 0 0 0 4420 2900 4126 40980 52463 52463 1 AVQTQQPCSVR Unmodified 1272.6245 0.62446881 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;H0Y493;H0Y7J9 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 1 16.913 16.913 2 0.0018561 9987 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.95 62.174 53186000 0 0 0 0 0 0 0 11403000 0 0 21049000 0 20734000 4421 1056 4127 40981;40982;40983 52464;52465;52466 52464 3 AVQTSIATAYR Unmodified 1179.6248 0.62478638 108 A0A087X1H5;Q15057;A0A0U1RQT1;H7C3Q8 ACAP2 Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 41.587 41.587 2 0.039277 38789 QUIQUE_C1438_190116_001 62.869 32.132 32613000 0 0 0 0 32613000 0 0 0 0 0 0 0 0 4422 108 4128 40984 52467 52467 1 AVQVHQDTLR Unmodified 1165.6204 0.62036971 4482 Q9UL18;Q5TA58;Q9UKV8 AGO1;AGO2 Protein argonaute-1;Protein argonaute;Protein argonaute-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 16.041 16.041 3 0.0032134 8200 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0.032034995 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26;H0Y9E4 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 108.4 108.4 3 0.0043949 113143 QUIQUE_C1438_190116_001 43.116 33.7 346300000 43447000 52656000 0 0 60227000 0 0 76471000 51346000 0 0 0 62156000 4426 4304 4132 41000;41001;41002;41003;41004;41005;41006 52485;52486;52487;52488;52489;52490;52491 52487 5 AVSDASAGDYGSAIETLVTAISLIK Unmodified 2451.2745 0.27445011 1068 F8WJN3;Q16630 CPSF6 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 175.8 175.8 2;3 1.3041E-56 177058 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.07 188.78 1724500000 76512000 127700000 290650000 117260000 213070000 0 133630000 146830000 173010000 14371000 351680000 0 79820000 4427 1068 4133 41007;41008;41009;41010;41011;41012;41013;41014;41015;41016;41017;41018;41019;41020;41021;41022;41023;41024;41025;41026 52492;52493;52494;52495;52496;52497;52498;52499;52500;52501;52502;52503;52504;52505;52506;52507;52508;52509;52510;52511;52512;52513;52514 52506 22 AVSDWIDEQEK Unmodified 1318.6041 0.60411052 2951 Q12906;K7EKJ9;K7ER69;K7EJ09;K7ERM6;K7ENK6;K7EM82;K7EQ75 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 75.759 75.759 2 0.004812 72933 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.247 64.472 962940000 0 178510000 138150000 157230000 109440000 161270000 0 113740000 0 59465000 0 0 45133000 4428 2951 4134 41027;41028;41029;41030;41031;41032;41033;41034 52515;52516;52517;52518;52519;52520;52521;52522 52521 6 AVSESQLK Acetyl (Protein N-term) 902.47091 0.4709115 1009 F5H442;Q99816 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 42.213 42.213 1;2 0.00042585 39577 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.53 92.395 127780000 0 0 35319000 0 0 33461000 0 0 0 0 32916000 0 26079000 4429 1009 4135 41035;41036;41037;41038 52523;52524;52525;52526 52525 4 AVSETPAVPPVSEDEDDDDDDATPPPVIAPRPEHTK Unmodified 3807.7599 0.75990206 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCM0 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 1 1 80.088 80.088 4 0.027718 81029 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.731 16.507 42201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42201000 0 4430 2970 4136 41039 52527 52527 1 AVSGASAGDYSDAIETLLTAIAVIK Unmodified 2435.2795 0.27953549 3605 Q8N684;F5H669 CPSF7 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 176.56 176.56 2;3 1.7763E-19 180876 QUIQUE_C1368_190116_001 104.52 97.064 787490000 31151000 44323000 39684000 17784000 0 0 62503000 59181000 180470000 0 152840000 106740000 92815000 4431 3605 4137 41040;41041;41042;41043;41044;41045;41046;41047;41048;41049;41050;41051;41052 52528;52529;52530;52531;52532;52533;52534;52535;52536;52537;52538;52539;52540;52541;52542 52532 14 AVSHLVTWQDGR Unmodified 1367.6946 0.69459728 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 43.05 43.05 2;3 0.0039649 40125 QUIQUE_C1438_190116_001 56.493 41.806 364790000 0 0 28664000 32049000 46544000 0 0 34059000 42148000 21526000 76494000 25152000 58150000 4432 212 4138 41053;41054;41055;41056;41057;41058;41059;41060;41061;41062;41063;41064 52543;52544;52545;52546;52547;52548;52549;52550;52551;52552;52553;52554 52546 10 AVSHSLNNCVNCLPGQK Unmodified 1896.8934 0.8934498 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 38.875 38.875 3 8.8101E-05 34945 QUIQUE_C1403_190116_001 63.31 55.901 472560000 0 0 58453000 37531000 57135000 0 67433000 79620000 51505000 0 0 49903000 70983000 4433 4606 4139 41065;41066;41067;41068;41069;41070;41071;41072 52555;52556;52557;52558;52559;52560;52561;52562 52556 8 AVSILGDEVFR Unmodified 1204.6452 0.64518747 3428 Q709C8;A0A3B3IT88 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 1 106.45 106.45 2 0.012341 108891 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.518 18.944 47344000 0 0 0 0 0 0 0 21578000 25766000 0 0 0 0 4434 3428 4140 41073;41074 52563;52564 52563 2 AVSIQTGYLIQSTGPK Unmodified 1661.8988 0.89883598 1002 F5H8G1;F5H1Z6;F5H8H3;Q9Y365;F5GY11;H0YGA9;H0YFF3;H0YH17;H0YGN8 STARD10 PCTP-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 86.338 86.338 2 0.011334 87004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.924 42.62 73500000 24683000 29472000 0 0 0 0 0 19344000 0 0 0 0 0 4435 1002 4141 41075;41076;41077 52565;52566;52567 52567 3 AVSISTEPPTYLR Unmodified 1432.7562 0.75619449 294 A0A0U1RQQ2;A0A0U1RRB8;A0A2R8YEE8;A0A0G2JSE9;C9JTA6;A0A2R8Y5N5;G5E975;Q12824 SMARCB1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.208 78.208 2 0.00043576 80042 QUIQUE_C1218_190116_001 111.06 67.545 369490000 48728000 32846000 43209000 31581000 34638000 34823000 0 37051000 27021000 11759000 32874000 34958000 0 4436 294 4142 41078;41079;41080;41081;41082;41083;41084;41085;41086;41087;41088;41089;41090;41091 52568;52569;52570;52571;52572;52573;52574;52575;52576;52577;52578;52579;52580;52581;52582;52583;52584 52568 17 AVSLINAIDTGR Unmodified 1228.6776 0.67755023 812 D6RC04;Q9Y6G5;D6RJ90 COMMD10 COMM domain-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 87.766 87.766 2 0.017391 88442 QUIQUE_C1563_190116_001 60.547 29.244 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4437 812 4143 41092 52585 52585 1 AVSLVTDSTSTFLSQTTYALIEAITEYTK Unmodified 3152.6017 0.60165749 4261 Q9NR28;A0A024RBT2;H7BZK7;A0A2U3TZH2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 181.32 181.32 3 2.6057E-13 187910 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.425 66.459 146090000 0 0 0 0 0 0 0 0 12504000 0 133590000 0 0 4438 4261 4144 41093;41094 52586;52587 52587 1 AVSNPFQQR Unmodified 1045.5305 0.53049207 4154 Q9H313;A0A0G2JPK6 TTYH1 Protein tweety homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 40.553 40.553 2 0.0032955 37163 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.626 63.52 104860000 0 0 0 0 0 0 0 0 104860000 0 0 0 0 4439 4154 4145 41095;41096;41097;41098;41099;41100 52588;52589;52590;52591;52592;52593 52593 6 AVSPENMVTFSENHGVVIQPAYK Oxidation (M) 2532.2319 0.23187379 2434 U3KQG5;P41217;F8WC99 CD200 OX-2 membrane glycoprotein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.327 83.327 3 3.2053E-11 86203 QUIQUE_C1218_190116_001 90.968 77.696 558530000 50724000 56580000 67655000 49383000 67445000 0 64552000 41648000 48992000 0 73709000 37843000 0 4440 2434 4146 41101;41102;41103;41104;41105;41106;41107;41108;41109;41110 52594;52595;52596;52597;52598;52599;52600;52601;52602;52603;52604 52595 1856 10 AVSPENMVTFSENHGVVIQPAYK Unmodified 2516.237 0.23695917 2434 U3KQG5;P41217;F8WC99 CD200 OX-2 membrane glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 107.85 107.85 2;3 3.9353E-18 111198 QUIQUE_C1368_190116_001 117.48 95.613 2674000000 219360000 275450000 265950000 290940000 207490000 225920000 295350000 123350000 146880000 80604000 221710000 120210000 200740000 4441 2434 4146 41111;41112;41113;41114;41115;41116;41117;41118;41119;41120;41121;41122;41123;41124 52605;52606;52607;52608;52609;52610;52611;52612;52613;52614;52615;52616;52617;52618;52619;52620;52621;52622;52623;52624;52625;52626 52611 22 AVSPLLLTTTNSSEGLSMGNYIGLINR Unmodified 2820.4691 0.46914395 2149 P19525;C9JZT2 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes no 0 0 0 1 158.06 158.06 3 0.0023976 163012 QUIQUE_C1218_190116_001 34.218 14.142 49229000 49229000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4442 2149 4147 41125 52627 52627 1 AVSPLPYLR Unmodified 1014.5862 0.58621603 1861 P04275 VWF von Willebrand factor;von Willebrand antigen 2 yes yes 0 0 0 1 1 78.645 78.645 2 0.02075 79071 QUIQUE_C1277_190116_001 62.659 33.282 31880000 15626000 16254000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4443 1861 4148 41126;41127 52628;52629 52629 2 AVSQVLDSLEEIHALTDCSEK Unmodified 2343.1264 0.12640567 1460 O14936;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 137.26 137.26 3 0.0030413 141131 QUIQUE_C1403_190116_001 42.618 37.548 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4444 1460 4149 41128 52630 52630 1 AVSSAIAQLLGEVAQGNENYAGIAAR Unmodified 2572.3245 0.32452862 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 3 2 2 1 1 2 2 2 1 1 161.6 161.6 2;3 3.4977E-114 167230 QUIQUE_C1218_190116_001 190.19 187.43 2727300000 170250000 161410000 355080000 218360000 296360000 163980000 118470000 272940000 287200000 0 364980000 169490000 148790000 4445 4600 4150 41129;41130;41131;41132;41133;41134;41135;41136;41137;41138;41139;41140;41141;41142;41143;41144;41145;41146;41147 52631;52632;52633;52634;52635;52636;52637;52638;52639;52640;52641;52642;52643;52644;52645;52646;52647;52648;52649;52650;52651;52652;52653;52654;52655;52656 52632 25 AVSSQMIGK Unmodified 919.4797 0.47970205 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;A0A2R8Y5P6;A0A2R8Y6E6;A0A0U1RQF8 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.917 20.917 2 0.011065 13416 QUIQUE_C1277_190116_001 73.248 47.076 1191400000 312990000 282820000 227430000 0 145980000 0 222210000 0 0 0 0 0 0 4446 445 4151 41148;41149;41150;41151;41152 52657;52658;52659;52660;52661 52658 5 AVSSTELSALENICK Unmodified 1620.8029 0.80288668 521 A2RTX5;B7ZLP8 TARSL2 Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 99.603 99.603 2 0.001414 102808 QUIQUE_C1368_190116_001 71.085 56.927 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4447 521 4152 41153;41154 52662;52663 52662 2 AVSTCAHLFWSGR Unmodified 1490.7089 0.70886714 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 65.628 65.628 2;3 1.031E-07 65344 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.75 112.66 1058300000 0 120560000 90262000 109870000 0 0 120530000 104110000 116410000 42792000 150480000 95910000 107350000 4448 3926 4153 41155;41156;41157;41158;41159;41160;41161;41162;41163;41164;41165;41166 52664;52665;52666;52667;52668;52669;52670;52671;52672;52673;52674;52675;52676;52677 52672 14 AVSTGVK Acetyl (Protein N-term) 702.3912 0.39120462 3164 Q15819 UBE2V2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 24.292 24.292 1 0.052701 17757 QUIQUE_C1277_190116_001 132.09 36.137 817760000 0 316780000 0 0 0 0 0 410520000 0 0 0 0 90464000 4449 3164 4154 41167;41168;41169 52678;52679;52680 52678 1 AVSTGVQAGIPMPCFTTALSFYDGYR Oxidation (M) 2824.32 0.32003687 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 1 0 1 1 150.04 150.04 3 0.00029578 156789 QUIQUE_C1438_190116_001 53.475 47.38 8074500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8074500 0 0 0 4450 2602 4155 41170;41171 52681;52682 52681 2051 2 AVSTGVQAGIPMPCFTTALSFYDGYR Unmodified 2808.3251 0.32512225 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 2 160.9 160.9 2 3.6401E-14 168452 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.27 104.05 87173000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87173000 0 0 4451 2602 4155 41172;41173 52683;52684 52683 2 AVSTHQITQLEGDRR Unmodified 1709.8809 0.8808945 4511 Q9UNK0;I3L305 STX8 Syntaxin-8 yes no 0 0 1 1 28.234 28.234 3 0.031433 22564 QUIQUE_DMIX8_190116_001 34.444 24.247 55035000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55035000 4452 4511 4156 41174 52685 52685 1 AVSTLIDSLKK Unmodified 1173.6969 0.69688869 407 A0A286YFF8;Q7Z3U7 MON2 Protein MON2 homolog yes no 0 0 1 1 59.546 59.546 3 0.036742 57848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.544 18.645 12686000 0 0 0 0 0 0 0 12686000 0 0 0 0 0 4453 407 4157 41175 52686 52686 1 AVSVTPIRDTK Acetyl (Protein N-term) 1227.6823 0.68230126 133 C9JP00;A0A0A0MQX8;Q9NR56 MBNL1 Muscleblind-like protein 1 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 49.074 49.074 2 0.0010429 46906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.29 70.514 151760000 0 0 0 0 0 0 0 32014000 16838000 0 46818000 25090000 30997000 4454 133 4158 41176;41177;41178;41179;41180 52687;52688;52689;52690;52691;52692 52688 5 AVTAADMEAR Unmodified 1033.4862 0.48624399 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.955 25.955 2 0.0085022 19757 QUIQUE_C1563_190116_001 71.614 37.525 215530000 0 0 0 61016000 0 44304000 48355000 0 0 13860000 0 0 47990000 4455 877 4159 41181;41182;41183;41184;41185 52693;52694;52695;52696;52697 52694 4 AVTAMGILNTIDTLLSVVEDHK Unmodified 2339.2406 0.24064756 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 176.34 176.34 3 1.9662E-05 183327 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.89 49.81 132170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 132170000 0 0 4456 1727 4160 41186 52698 52698 1 AVTAMGILNTIDTLLSVVEDHK Oxidation (M) 2355.2356 0.23556218 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 1 0 1 174.24 174.24 3 1.2397E-05 178050 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.405 65.412 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4457 1727 4160 41187 52699 52699 942 1 AVTAYSPEDEKKGEK Unmodified 1650.8101 0.81008055 1566 O60268;H3BMU3;H3BNA7 KIAA0513 Uncharacterized protein KIAA0513 yes no 0 0 2 2 2 1 2 2 2 13.291 13.291 3;4 5.2797E-08 5685 QUIQUE_C1576_190116_001 122.34 101.04 910120000 0 0 0 0 125260000 0 51940000 118380000 0 0 103400000 208480000 302670000 4458 1566 4161 41188;41189;41190;41191;41192;41193;41194;41195;41196;41197;41198 52700;52701;52702;52703;52704;52705;52706;52707;52708;52709;52710;52711 52702 11 AVTDLLGR Unmodified 843.48142 0.48141661 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.466 62.466 2 0.020384 61902 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.833 30.031 245680000 0 31333000 25199000 24557000 0 23359000 23437000 0 34943000 19169000 35484000 28198000 0 4459 1401 4162 41199;41200;41201;41202;41203;41204;41205;41206;41207;41208 52712;52713;52714;52715;52716;52717;52718;52719;52720;52721;52722;52723 52720 12 AVTDSINQLITMCTQQAPGQK Unmodified 2303.125 0.12496588 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 129.07 129.07 2 7.3986E-31 133119 QUIQUE_C1403_190116_001 135.24 109.12 88991000 0 0 0 43396000 0 0 0 0 0 0 45595000 0 0 4460 4600 4163 41209;41210 52724;52725 52724 1 AVTEGAQAVEEPSIC Unmodified 1559.7137 0.71373732 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 78.818 78.818 2 3.0889E-09 81007 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.38 103.25 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4461 2280 4164 41211;41212;41213;41214 52726;52727;52728;52729 52727 4 AVTEILQDIQYK Unmodified 1419.7609 0.76094551 2368 P35219 CA8 Carbonic anhydrase-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.95 105.95 2 0.00052228 111079 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.78 89.739 148960000 0 0 28035000 0 24941000 0 33866000 0 0 0 35106000 0 27008000 4462 2368 4165 41215;41216;41217;41218;41219;41220;41221 52730;52731;52732;52733;52734;52735;52736 52735 7 AVTELGRPDAEYWNSQK Unmodified 1962.9436 0.94355434 3211;1816;2065 P13760;Q30167;Q29974;P04229;Q30154;Q5Y7A7;P01912 HLA-DRB1;HLA-DRB5 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-4 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-10 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-16 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-1 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-13 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-3 chain no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 67.772 67.772 2;3 4.8088E-37 68541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.88 127.2 518450000 0 0 84184000 0 0 44317000 44275000 0 120270000 0 163920000 0 61481000 4463 2065;3211;1816 4166 41222;41223;41224;41225;41226;41227;41228 52737;52738;52739;52740;52741;52742;52743 52742 7 AVTELGRPVAESWNSQK Unmodified 1870.9537 0.95372509 2815 P79483;A0A140T958;Q9TQE0;P13761 HLA-DRB3;HLA-DRB1 HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-9 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-7 beta chain no no 0 0 1 1 1 59.084 59.084 2;3 5.6807E-17 56569 QUIQUE_C1403_190116_001 119.87 90.891 57793000 0 0 0 0 0 0 0 57793000 0 0 0 0 0 4464 2815 4167 41229;41230 52744;52745 52744 1 AVTELNEPLSNEDR Unmodified 1585.7584 0.75837933 2891 Q04917 YWHAH 14-3-3 protein eta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.033 57.033 2 1.521E-58 56445 QUIQUE_C1218_190116_001 202.65 185.63 25990000000 2162900000 2439400000 2174500000 1796600000 1958800000 2179400000 2207600000 1222900000 1661200000 863900000 2668900000 1933500000 2720300000 4465 2891 4168 41231;41232;41233;41234;41235;41236;41237;41238;41239;41240;41241;41242;41243 52746;52747;52748;52749;52750;52751;52752;52753;52754;52755;52756;52757;52758;52759;52760;52761;52762 52746 15 AVTELNEPLSNEDRNLLSVAYK Unmodified 2474.2653 0.26528241 2891 Q04917 YWHAH 14-3-3 protein eta yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 108.57 108.57 2;3 9.8027E-65 111151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 184 163.89 1245400000 0 0 0 0 0 0 0 595120000 156630000 0 168570000 174020000 151050000 4466 2891 4169 41244;41245;41246;41247;41248;41249 52763;52764;52765;52766;52767;52768 52764 5 AVTEQGAELSNEER Unmodified 1531.7114 0.71142914 2262 P27348;E9PG15 YWHAQ 14-3-3 protein theta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.544 31.544 2 7.0373E-35 26742 QUIQUE_C1576_190116_001 178.81 152.14 45173000000 4840500000 4234000000 3639500000 3292500000 3470800000 3441600000 3247200000 2918600000 3539500000 1321500000 4273700000 3352800000 3601200000 4467 2262 4170 41250;41251;41252;41253;41254;41255;41256;41257;41258;41259;41260;41261;41262 52769;52770;52771;52772;52773;52774;52775;52776;52777;52778;52779;52780;52781;52782;52783;52784;52785;52786 52775 17 AVTEQGHELSNEER Unmodified 1597.7332 0.73322721 2341 P31946;Q4VY20;Q4VY19;A0A0J9YWE8;A0A0J9YWZ2 YWHAB 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 18.532 18.532 2;3 1.1028E-240 11240 QUIQUE_C1438_190116_001 289.37 257.77 100280000000 7134700000 9182500000 8950300000 9043500000 6967500000 8388800000 11158000000 5268600000 6242500000 3443000000 10681000000 6081400000 7742200000 4468 2341 4171 41263;41264;41265;41266;41267;41268;41269;41270;41271;41272;41273;41274;41275;41276;41277;41278;41279;41280;41281;41282;41283;41284;41285;41286;41287 52787;52788;52789;52790;52791;52792;52793;52794;52795;52796;52797;52798;52799;52800;52801;52802;52803;52804;52805;52806;52807;52808;52809;52810;52811;52812;52813 52796 26 AVTESINQLITLCTQQAPGQK Unmodified 2299.1842 0.18419532 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.24 121.24 2 2.0089E-53 126492 QUIQUE_C1576_190116_001 218.11 196.06 67976000 0 0 0 0 0 0 39127000 0 0 0 0 0 28849000 4469 4606 4172 41288;41289;41290;41291 52814;52815;52816;52817 52815 4 AVTEVLAR Unmodified 857.49707 0.49706667 3981 Q99961;M0R0I3;M0QYE0;M0R2K6 SH3GL1 Endophilin-A2 yes no 0 0 0 1 31.175 31.175 2 0.039586 25963 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.799 11.44 97501000 0 0 0 0 0 0 0 97501000 0 0 0 0 0 4470 3981 4173 41292 52818 52818 1 AVTGTHTLALAAK Unmodified 1252.7139 0.71393574 2545 P49770;H0YK01 EIF2B2 Translation initiation factor eIF-2B subunit beta yes no 0 0 0 1 1 25.793 25.793 2 0.0027612 19903 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.327 37.889 27521000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27521000 0 0 4471 2545 4174 41293;41294 52819;52820 52820 2 AVTGWLESLR Acetyl (Protein N-term) 1172.619 0.61897272 3274 Q5JQQ4;Q9BVM2 DPCD Protein DPCD yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.94 162.94 2 1.3058E-12 167127 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52843;52844;52845;52846;52847;52848;52849 52845 2557 7 AVTGYKDPYTGQQISLFQAMQK Unmodified 2473.2311 0.23114551 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 110.46 110.46 2;3 4.2813E-99 115455 QUIQUE_DMIX5_190116_001 207.39 188.07 1791400000 0 0 0 0 0 0 0 498700000 212340000 0 517570000 329360000 233420000 4475 3117 4177 41320;41321;41322;41323;41324;41325;41326;41327;41328 52850;52851;52852;52853;52854;52855;52856;52857;52858;52859;52860;52861 52858 12 AVTGYRDPYSGSTISLFQAMQK Unmodified 2419.1842 0.18419532 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 116.25 116.25 3 0.00027654 118726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.692 26.616 47623000 0 0 0 0 0 0 0 47623000 0 0 0 0 0 4476 3117 4178 41329 52862 52862 1 AVTGYRDPYTEQTISLFQAMK Unmodified 2418.1889 0.18894634 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 125.15 125.15 2;3 9.2235E-86 128269 QUIQUE_DMIX1_190116_001 211.7 182.01 1284900000 0 34917000 0 0 0 0 0 325460000 213010000 0 505780000 205770000 0 4477 3117 4179 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41363;41364;41365;41366;41367;41368;41369;41370;41371;41372 52901;52902;52903;52904;52905;52906;52907;52908;52909;52910;52911;52912;52913;52914 52908 14 AVTISGTPDAIIQCVK Unmodified 1671.8866 0.88655673 916 E9PFP8;P57721;J3QT27 PCBP3 Poly(rC)-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.38 100.38 2 8.1415E-25 104310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.71 132.37 1572500000 138490000 179620000 145460000 142270000 0 119650000 102820000 150760000 152660000 38750000 152720000 120870000 128450000 4483 916 4184 41373;41374;41375;41376;41377;41378;41379;41380;41381;41382;41383;41384 52915;52916;52917;52918;52919;52920;52921;52922;52923;52924;52925;52926;52927;52928 52926 14 AVTKDEDEWKELEQK Unmodified 1846.8949 0.89487281 4479 Q9UKY7 CDV3 Protein CDV3 homolog yes yes 0 0 2 1 47.81 47.81 3 0.0025711 44767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.158 50.4 53029000 0 0 0 0 0 0 0 53029000 0 0 0 0 0 4484 4479 4185 41385 52929 52929 1 AVTLDKDAYYR Acetyl (Protein N-term) 1355.6721 0.67213051 4620 Q9Y5B9;G3V5A4;G3V401;G3V2X0 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes no 1 0 1 3 1 1 1 75.19 75.19 2 0.0026382 75433 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.01 87.244 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4485 4620 4186 41386;41387;41388;41389;41390;41391 52930;52931;52932;52933;52934;52935 52933 6 AVTLDPNFLDAYINLGNVLK Unmodified 2189.1732 0.17321992 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 169.79 169.79 2;3 3.2652E-12 174258 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.46 120.22 314720000 0 0 0 0 46093000 0 56436000 0 52278000 5612900 92329000 61972000 0 4486 1497 4187 41392;41393;41394;41395;41396;41397;41398 52936;52937;52938;52939;52940;52941;52942 52938 7 AVTLECVSAGEPR Unmodified 1387.6766 0.67656396 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 57.914 57.914 2 0.01239 56124 QUIQUE_C1277_190116_001 69.01 48.707 25675000 0 18621000 0 0 0 0 0 0 0 7053400 0 0 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4190 41418;41419;41420;41421;41422;41423;41424;41425 52965;52966;52967;52968;52969;52970;52971;52972;52973;52974;52975;52976 52969 12 AVTLNPDNSYIK Unmodified 1333.6878 0.68778057 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.53 63.53 2 0.0018462 62592 QUIQUE_C1368_190116_001 89.679 71.814 209210000 28311000 0 37238000 0 0 0 48776000 0 0 0 61118000 33764000 0 4490 2986 4191 41426;41427;41428;41429;41430;41431;41432;41433;41434 52977;52978;52979;52980;52981;52982;52983;52984;52985 52978 8 AVTLSALIYCLR Unmodified 1378.7643 0.76425675 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 140.17 140.17 2 0.0059821 143630 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.347 44.477 146880000 0 0 17149000 0 0 0 0 25130000 31237000 0 23243000 29398000 20722000 4491 1450 4192 41435;41436;41437;41438;41439;41440;41441 52986;52987;52988;52989;52990;52991;52992 52988 7 AVTNEPEEEELATLSEEEIAMAVTAWEK Unmodified 3118.454 0.45400697 2677 P56192;H0YHV5 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.87 172.87 3 2.8751E-31 177083 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.34 109.51 265450000 0 5247800 14087000 0 12456000 0 21565000 20926000 82673000 0 70985000 0 37508000 4492 2677 4193 41442;41443;41444;41445;41446;41447;41448;41449 52993;52994;52995;52996;52997;52998;52999;53000;53001;53002;53003 53000 11 AVTNEPEEEELATLSEEEIAMAVTAWEK Oxidation (M) 3134.4489 0.4489216 2677 P56192;H0YHV5 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 1 0 1 171.72 171.72 3 5.5691E-06 176518 QUIQUE_C1368_190116_001 53.705 51.166 18780000 0 0 18780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4493 2677 4193 41450 53004 53004 2119 1 AVTPAPPIK Unmodified 892.5382 0.53820321 1711 O95182;M0R0N0 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.502 29.502 2 0.029255 24910 QUIQUE_C1218_190116_001 56.547 30.608 300500000 82198000 54171000 48554000 51715000 0 63861000 0 0 0 0 0 0 0 4494 1711 4194 41451;41452;41453;41454;41455 53005;53006;53007;53008;53009 53005 5 AVTPAPPIKR Unmodified 1048.6393 0.63931423 1711 O95182;M0R0N0 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.524 19.524 3 0.0004088 12056 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 61.972 456100000 29314000 55270000 46637000 44792000 29082000 29317000 45600000 0 29225000 10358000 57164000 41577000 37760000 4495 1711 4195 41456;41457;41458;41459;41460;41461;41462;41463;41464;41465;41466;41467;41468 53010;53011;53012;53013;53014;53015;53016;53017;53018;53019;53020;53021;53022 53020 13 AVTPPMPLLTPATPGGLPPAAAVAAAAATAK Unmodified 2793.5463 0.54627206 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;H0YCP8 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 153.34 153.34 3 0.029361 155709 QUIQUE_C1563_190116_001 20.82 9.1881 509040000 0 0 87283000 93292000 100850000 72852000 0 0 0 26796000 0 0 127980000 4496 295 4196 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MAGUK p55 subfamily member 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.98 29.98 2 0.012875 24605 QUIQUE_C1277_190116_001 65.465 25.802 311850000 0 59993000 55969000 0 49666000 0 73672000 0 72551000 0 0 0 0 4500 4358 4200 41481;41482;41483;41484;41485 53036;53037;53038;53039;53040 53036 5 AVVETVDNLLRPEALESWK Unmodified 2168.1477 0.14773345 1698 O94910;K7ESH3 LPHN1;ADGRL1 Latrophilin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.56 135.56 3 0.00024527 132122 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.335 30.95 173550000 31308000 0 39086000 27717000 35213000 0 30609000 0 0 9620200 0 0 0 4501 1698 4201 41486;41487;41488;41489;41490;41491 53041;53042;53043;53044;53045;53046;53047 53047 6 AVVFLEPQWYR Unmodified 1406.7347 0.73467118 383 C9JC71;A0A1W2PQB1;H0Y755;M9MML0;P08637 FCGR3A Low affinity immunoglobulin gamma Fc region receptor III-A yes no 0 0 0 1 1 1 123.79 123.79 2 6.5129E-05 128642 QUIQUE_C1368_190116_001 135.83 102.61 105690000 0 0 32720000 41177000 0 0 0 0 0 0 31795000 0 0 4502 383 4202 41492;41493;41494 53048;53049;53050;53051 53048 4 AVVGEEALTSDDLLYLEFLQK Unmodified 2352.2101 0.21005894 2175 P21281;H0YC45 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 3 4 4 2 2 3 2 3 2 2 6 4 4 162.84 162.84 2;3 3.3113E-53 166073 QUIQUE_C1277_190116_001 163.27 153.74 3830700000 282530000 314290000 249660000 143850000 250310000 186610000 283520000 331010000 290420000 77942000 436320000 509860000 474400000 4503 2175 4203 41495;41496;41497;41498;41499;41500;41501;41502;41503;41504;41505;41506;41507;41508;41509;41510;41511;41512;41513;41514;41515;41516;41517;41518;41519;41520;41521;41522;41523;41524;41525;41526;41527;41528;41529;41530;41531;41532;41533;41534;41535 53052;53053;53054;53055;53056;53057;53058;53059;53060;53061;53062;53063;53064;53065;53066;53067;53068;53069;53070;53071;53072;53073;53074;53075;53076;53077;53078;53079;53080;53081;53082;53083;53084;53085;53086;53087;53088;53089;53090;53091;53092;53093;53094;53095;53096;53097;53098;53099;53100;53101;53102;53103;53104;53105;53106 53056 50 AVVGGSHVSTAAVVR Unmodified 1408.7787 0.77866126 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 2 1 1 25.858 25.858 2;3 0.00038671 19786 QUIQUE_C1277_190116_001 89.805 61.406 476420000 60259000 82297000 0 20358000 20103000 89713000 0 44406000 69017000 0 34922000 0 55342000 4504 3511 4204 41536;41537;41538;41539;41540;41541;41542;41543;41544;41545;41546;41547;41548;41549;41550 53107;53108;53109;53110;53111;53112;53113;53114;53115;53116;53117;53118;53119;53120;53121 53110 13 AVVGYEDGTIR Unmodified 1178.5932 0.5931519 716 C9JG97;C9JEH3;Q13685;C9JTS3 AAMP Angio-associated migratory cell protein yes no 0 0 0 1 1 48.097 48.097 2 0.028266 46021 QUIQUE_C1576_190116_001 60.045 37.914 100560000 0 0 0 0 0 0 48318000 0 0 0 52239000 0 0 4505 716 4205 41551;41552 53122;53123;53124 53122 3 AVVHGILMGVPVPFPIPEPDGCK Unmodified 2428.2647 0.26469424 850 J3KMY5;G3V3E8;E7EMS2;G3V3D1;P61916;G3V2V8;H0YIZ1 NPC2 Epididymal secretory protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 146.16 146.16 3 0.00012142 151232 QUIQUE_DMIX8_190116_001 49.528 45.724 336400000 0 0 72222000 98306000 41776000 61298000 0 0 0 0 0 30122000 32680000 4506 850 4206 41553;41554;41555;41556;41557;41558 53125;53126;53127;53128;53129;53130;53131;53132 53132 8 AVVHTHLLNPEWLVNYFGSLSVEDSLECLR Unmodified 3496.7449 0.74492488 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 1 1 165.32 165.32 3;4 6.3591E-49 172688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.87 123.21 1035600000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 670710000 313870000 51012000 4507 50 4207 41559;41560;41561;41562 53133;53134;53135;53136;53137;53138 53134 6 AVVIVDDR Unmodified 885.49198 0.4919813 3122;2208 P23246;Q15233;H7C367;C9IZL7 SFPQ;NONO Splicing factor, proline- and glutamine-rich;Non-POU domain-containing octamer-binding protein no no 0 0 0 1 1 1 31.53 31.53 2 0.046027 26158 QUIQUE_C1277_190116_001 77.058 35.556 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4508 2208;3122 4208 41563;41564;41565 53139;53140;53141 53140 3 AVVLAANHFGR Unmodified 1153.6356 0.63562584 2993 Q13423;E9PCX7;D6RAI5 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 1 2 36.69 36.69 2;3 8.9846E-05 32231 QUIQUE_C1277_190116_001 98.048 82.419 2209800000 130670000 79168000 229010000 108520000 70663000 103000000 196590000 157210000 289390000 79214000 342600000 133630000 290190000 4509 2993 4209 41566;41567;41568;41569;41570;41571;41572;41573;41574;41575;41576;41577;41578;41579;41580;41581;41582;41583;41584;41585 53142;53143;53144;53145;53146;53147;53148;53149;53150;53151;53152;53153;53154;53155;53156;53157;53158;53159;53160;53161;53162;53163 53144 16 AVVLAGFGGLNK Unmodified 1144.6604 0.66044361 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.127 88.127 2 2.9048E-05 91251 QUIQUE_C1218_190116_001 128.69 101.43 2114400000 216090000 188250000 131180000 133660000 195230000 115960000 158830000 135970000 156800000 96258000 177480000 178650000 230030000 4510 4226 4210 41586;41587;41588;41589;41590;41591;41592;41593;41594;41595;41596;41597;41598 53164;53165;53166;53167;53168;53169;53170;53171;53172;53173;53174;53175;53176;53177;53178;53179 53165 13 AVVLSHYIHNLSSEMFSEFDK Unmodified 2452.1733 0.17329628 1812 Q5I0G2;P01236 PRL Prolactin yes no 0 0 0 1 139.8 139.8 3 0.00076804 144726 QUIQUE_C1218_190116_001 50.916 37.044 35028000 35028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4511 1812 4211 41599 53180 53180 1 AVVLSHYIHNLSSEMFSEFDKR Unmodified 2608.2744 0.27440731 1812 Q5I0G2;P01236 PRL Prolactin yes no 0 0 1 1 131.14 131.14 4 3.8836E-05 135750 QUIQUE_C1218_190116_001 64.422 56.333 45781000 45781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4512 1812 4212 41600 53181 53181 0 AVVMDLLR Unmodified 915.52117 0.52117293 2964 Q13085 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 90.337 90.337 2 0.033344 91092 QUIQUE_C1563_190116_001 64.757 28.572 22468000 0 11517000 0 0 0 10951000 0 0 0 0 0 0 0 4513 2964 4213 41601;41602;41603 53182;53183;53184 53184 3 AVVMLEYVER Unmodified 1207.6271 0.62709457 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5;Q5T2B7 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.933 92.933 2 0.011867 95034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.692 41.133 290230000 0 35797000 0 35084000 28803000 32104000 47923000 0 0 28269000 0 82247000 0 4514 196 4214 41604;41605;41606;41607;41608;41609;41610 53185;53186;53187;53188;53189;53190;53191 53191 4 AVVMTPVPLFSK Unmodified 1287.7261 0.72608033 1469 O14976 GAK Cyclin-G-associated kinase yes yes 0 0 0 1 108.93 108.93 2 0.013702 113195 QUIQUE_C1368_190116_001 56.404 35.884 15496000 0 0 15496000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4515 1469 4215 41611 53192 53192 1 AVVNDATIFK Unmodified 1076.5866 0.58660996 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 62.36 62.36 2 0.024022 61783 QUIQUE_C1403_190116_001 67.897 34.347 83409000 0 0 0 42391000 0 0 0 0 0 0 0 0 41018000 4516 3779 4216 41612;41613 53193;53194 53193 2 AVVNIFLVAK Unmodified 1072.6645 0.66446635 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.78 106.78 2 0.017645 110861 QUIQUE_C1576_190116_001 72.485 61.416 293730000 0 48969000 47235000 34901000 0 30628000 43524000 47781000 40693000 0 0 0 0 4517 4176 4217 41614;41615;41616;41617;41618;41619;41620 53195;53196;53197;53198;53199;53200;53201;53202 53200 8 AVVPASLSGQDVGSFAYLTIK Acetyl (Protein N-term) 2164.1416 0.14158544 4192 Q9H993 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes yes 1 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 165.03 165.03 2;3 2.5501E-05 168686 QUIQUE_C1277_190116_001 98.943 85.758 589890000 40982000 85398000 39700000 46500000 63334000 39362000 0 59665000 51175000 0 84759000 79009000 0 4518 4192 4218 41621;41622;41623;41624;41625;41626;41627;41628;41629;41630;41631 53203;53204;53205;53206;53207;53208;53209;53210;53211;53212;53213 53204 9 AVVPASLSGQDVGSFAYLTIKDR Acetyl (Protein N-term) 2435.2696 0.2696395 4192 Q9H993 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes yes 1 0 1 1 149.49 149.49 3 0.0017619 152284 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.784 39.327 9699500 0 0 0 0 0 0 0 9699500 0 0 0 0 0 4519 4192 4219 41632 53214 53214 1 AVVPEMEKR Unmodified 1057.559 0.559015 4027 Q9BTZ2;P0CG22;A0A087WXI8;H0YN69;Q6PKH6;H0YLE1;H0YKN3;A0A087WSZ6 DHRS4;DHRS4L1;DHRS4L2 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4;Putative dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 1;Dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 2 yes no 0 0 1 1 20.365 20.365 3 0.051945 13435 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.567 16.87 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4520 4027 4220 41633 53215 53215 1 AVVPGPAEHPLQYNYTFWYSR Unmodified 2494.207 0.20697967 674 C9JEL3;B9A044;B8ZZ50;O60573 EIF4E2 Eukaryotic translation initiation factor 4E type 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 120 120 3 0.0065669 124784 QUIQUE_C1368_190116_001 36.454 24.832 196680000 0 0 41791000 0 0 0 0 0 49761000 0 55587000 49537000 0 4521 674 4221 41634;41635;41636;41637 53216;53217;53218;53219 53216 4 AVVQLKPR Unmodified 909.57599 0.5759857 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 17.123 17.123 2 0.043309 9735 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.07 73.298 149700000 0 0 0 0 0 0 0 149700000 0 0 0 0 0 4522 3117 4222 41638 53220 53220 0 AVVQVFEGTSGIDAK Unmodified 1519.7882 0.7882229 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 1 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 83.054 83.054 2;3 3.8448E-112 84960 QUIQUE_DMIX5_190116_001 232.14 208.16 17148000000 1421800000 1684400000 1525800000 1216400000 1323800000 1308200000 1411100000 1048500000 1133300000 648910000 1614400000 1330200000 1480700000 4523 2175 4223 41639;41640;41641;41642;41643;41644;41645;41646;41647;41648;41649;41650;41651;41652;41653;41654;41655;41656;41657;41658;41659;41660;41661 53221;53222;53223;53224;53225;53226;53227;53228;53229;53230;53231;53232;53233;53234;53235;53236;53237;53238;53239;53240;53241;53242;53243;53244;53245;53246;53247;53248;53249;53250;53251;53252;53253;53254;53255;53256;53257;53258;53259;53260;53261 53253 36 AVVQVFEGTSGIDAKK Unmodified 1647.8832 0.88318591 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 1 1 61.665 61.665 2 0.0015429 60038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.089 53.147 17595000 0 0 0 0 0 0 0 17595000 0 0 0 0 0 4524 2175 4224 41662 53262 53262 1 AVVTGKMDENQFVAVTSTNAAK Oxidation (M) 2296.1369 0.13691077 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 1 1 1 55.479 55.479 3 2.2507E-05 53145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.864 64.576 98460000 0 0 0 0 0 0 0 98460000 0 0 0 0 0 4525 365 4225 41663 53263 53263 255 1 AVVTHSSGNHGQALTYAAK Unmodified 1910.9599 0.9598731 4104 Q9GZT4;I3L4B4;I3L3N0 SRR Serine racemase yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 1 17.62 17.62 2;3;4 4.6384E-56 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PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 100.24 100.24 3 0.00053987 102313 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.262 63.635 60656000 0 38427000 0 0 0 0 0 22229000 0 0 0 0 0 4528 531 4228 41696;41697;41698;41699;41700;41701;41702;41703 53299;53300;53301;53302;53303;53304;53305;53306;53307 53307 9 AVVVHAGEDDLGR Unmodified 1336.6735 0.67352749 1942 P08294 SOD3 Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 30.39 30.39 3 0.013112 24981 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.457 30.447 447330000 0 0 0 0 0 98578000 0 0 104120000 50920000 0 84614000 109090000 4529 1942 4229 41704;41705;41706;41707;41708 53308;53309;53310;53311;53312 53311 2 AVVVNAAQLASYSQSK Unmodified 1634.8628 0.86278482 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 80.395 80.395 2;3 5.2972E-37 80965 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.87 155.09 4726700000 362840000 311120000 488400000 367610000 202720000 343810000 321490000 436470000 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53431;53432;53433;53434;53435;53436;53437;53438;53439;53440;53441;53442;53443;53444;53445;53446;53447;53448;53449;53450;53451;53452;53453;53454;53455;53456;53457;53458;53459;53460;53461;53462 53456 32 AVWIQAQQLQGEALHQMQALYGQHFPIEVR Acetyl (Protein N-term) 3530.7881 0.7881271 2592 P51692;C9J4I3 STAT5B Signal transducer and activator of transcription 5B yes no 1 0 0 1 1 169.42 169.42 4 8.6757E-26 176771 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.632 83.794 133870000 0 0 0 0 0 0 0 0 39288000 0 94586000 0 0 4538 2592 4237 41823;41824 53463;53464 53464 2 AVWLPAMK Oxidation (M) 930.49971 0.49970921 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 53.861 53.861 2 0.053419 52995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.335 31.885 147410000 0 0 0 0 0 0 0 44039000 0 0 51053000 0 52315000 4539 2938 4238 41825;41826;41827 53465;53466;53467 53465 3 AVWLPAMK Unmodified 914.50479 0.50479459 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 84.121 84.121 2 0.053491 80993 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.787 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53497;53498;53499;53500 53499 4 AVYDTNPAK Unmodified 977.48181 0.48181054 4344 Q9NZD2;F5H0U5 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 1 1 20.981 20.981 2 0.046681 14031 QUIQUE_C1403_190116_001 51.662 28.353 145780000 0 46421000 0 29138000 0 0 0 0 0 0 70219000 0 0 4543 4344 4241 41845;41846;41847 53501;53502;53503 53502 2 AVYEAVLR Unmodified 919.51272 0.51271674 2049 P12955;K7ES25 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes no 0 0 0 1 1 51.914 51.914 2 0.016541 50026 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.65 72.471 340510000 0 0 0 0 158810000 0 0 181700000 0 0 0 0 0 4544 2049 4242 41848;41849 53504;53505 53505 1 AVYEDRPPGSVVPTSAAEASR Unmodified 2158.0655 0.065460388 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.695 57.695 3 9.1954E-10 56329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.44 94.879 362560000 34828000 41328000 0 48217000 36183000 0 0 40634000 39522000 15257000 52697000 53890000 0 4545 4137 4243 41850;41851;41852;41853;41854;41855;41856;41857;41858 53506;53507;53508;53509;53510;53511;53512;53513;53514 53510 9 AVYIFAK Unmodified 810.46398 0.46397563 2323;1983 Q6ICJ4;P0CG30;A0A087WY67;P0CG29;P30711;A0A0G2JRQ5;A0A0G2JQD2;A0A0G2JQM0;A0A0G2JRN4;A0A0G2JMS2;A0A0G2JQD8;A0A0G2JRG0;A0A1B0GXB6;A0A0G2JRJ5 Em:AP000351.3;GSTT2B;GSTT2;GSTT1 Glutathione S-transferase theta-2B;Glutathione S-transferase theta-2;Glutathione S-transferase theta-1 no no 0 0 0 1 1 1 54.343 54.343 2 0.046099 49838 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.944 33.413 500770000 0 0 0 188030000 0 0 0 227690000 0 85044000 0 0 0 4546 1983;2323 4244 41859;41860;41861 53515;53516;53517 53517 3 AVYSIQNEK Unmodified 1050.5346 0.53457439 931 E9PHR9;Q9NRQ2;C9J6E1 PLSCR4 Phospholipid scramblase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 26.355 26.355 2 0.00047694 20500 QUIQUE_C1438_190116_001 133.9 97.506 706940000 0 0 138510000 0 104430000 0 104760000 55812000 0 0 195520000 0 107900000 4547 931 4245 41862;41863;41864;41865;41866;41867 53518;53519;53520;53521;53522;53523 53519 6 AVYSIQNEKK Unmodified 1178.6295 0.62953741 931 E9PHR9;Q9NRQ2;C9J6E1 PLSCR4 Phospholipid scramblase 4 yes no 0 0 1 1 16.718 16.718 3 0.05864 9263 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.755 21.401 23209000 0 0 0 0 0 0 0 23209000 0 0 0 0 0 4548 931 4246 41868 53524 53524 1 AVYSTNCPVWEEAFR Unmodified 1827.825 0.82501911 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 118.1 118.1 2 0.013696 121882 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.135 33.767 34861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34861000 0 4549 4014 4247 41869 53525 53525 1 AVYTLTSLYR Unmodified 1185.6394 0.63937381 4261 Q9NR28;A0A024RBT2;H7BZK7;A0A2U3TZH2;H7BZQ7 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 90.367 90.367 2 0.0015903 92178 QUIQUE_C1403_190116_001 95.815 17.481 1398700000 0 319460000 301780000 150360000 0 0 245900000 0 0 0 0 0 381210000 4550 4261 4248 41870;41871;41872;41873;41874;41875 53526;53527;53528;53529;53530;53531 53528 6 AVYTQDCPLAAAK Unmodified 1406.6864 0.68640036 2533 P49588;H3BPK7 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.143 51.143 2 0.00037383 49329 QUIQUE_C1403_190116_001 94.309 73.609 2896300000 0 0 0 328530000 393530000 325680000 363550000 0 339470000 0 432580000 297950000 414990000 4551 2533 4249 41876;41877;41878;41879;41880;41881;41882;41883 53532;53533;53534;53535;53536;53537;53538;53539;53540 53532 9 AWALDVAELHR Unmodified 1279.6673 0.6673199 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 89.053 89.053 2;3 1.6392E-09 90695 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.11 125.9 998590000 40095000 78852000 92937000 70638000 71436000 59486000 63880000 108140000 97712000 41656000 110730000 73700000 89332000 4552 2226 4250 41884;41885;41886;41887;41888;41889;41890;41891;41892;41893;41894;41895;41896;41897 53541;53542;53543;53544;53545;53546;53547;53548;53549;53550;53551;53552;53553;53554;53555;53556;53557;53558 53550 18 AWALGQGLECFETSVK Unmodified 1794.8611 0.86107026 4053 Q9BW83 IFT27 Intraflagellar transport protein 27 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.84 134.84 2 1.9568E-06 139378 QUIQUE_C1277_190116_001 134.99 117.52 291870000 0 45923000 51509000 31645000 0 0 0 48069000 0 0 58489000 56239000 0 4553 4053 4251 41898;41899;41900;41901;41902;41903;41904;41905 53559;53560;53561;53562;53563;53564;53565;53566 53559 7 AWCQVAQK Unmodified 989.47529 0.47528537 2894 Q05329;Q5VZ31 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.019 23.019 2 0.0093583 16352 QUIQUE_C1438_190116_001 92.692 53.03 796630000 206530000 0 0 117900000 112830000 116800000 0 99618000 0 33121000 0 0 109830000 4554 2894 4252 41906;41907;41908;41909;41910;41911;41912;41913;41914;41915 53567;53568;53569;53570;53571;53572;53573;53574;53575;53576 53569 10 AWDDFFPGSDR Unmodified 1311.552 0.55201537 1667 O75915;F8WF90;C9JQU6;F8WF33 ARL6IP5 PRA1 family protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.27 123.27 2 0.00082046 125852 QUIQUE_C1563_190116_001 111.61 103.68 1710300000 157040000 147630000 156030000 133650000 121980000 133090000 134170000 129430000 123840000 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cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 88.247 88.247 2 0.03223 89585 QUIQUE_C1403_190116_001 53.756 25.548 59775000 0 0 0 32908000 0 26866000 0 0 0 0 0 0 0 4557 2998 4255 41942;41943 53609;53610 53609 2 AWDVLLDHIQSAALSK Unmodified 1765.9363 0.93628412 407 A0A286YFF8;Q7Z3U7 MON2 Protein MON2 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 129.39 129.39 3 7.3151E-05 132274 QUIQUE_C1563_190116_001 87.647 73.782 294470000 22625000 34083000 26572000 31172000 24937000 21703000 20774000 0 26991000 11160000 46497000 0 27956000 4558 407 4256 41944;41945;41946;41947;41948;41949;41950;41951;41952;41953;41954;41955;41956 53611;53612;53613;53614;53615;53616;53617;53618;53619;53620;53621;53622;53623 53616 11 AWDVTVR Unmodified 845.43955 0.43955179 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 49.872 49.872 2 0.019688 47836 QUIQUE_C1277_190116_001 110.61 59.646 589580000 0 142310000 187760000 0 0 0 0 0 0 0 0 259500000 0 4559 2017 4257 41957;41958;41959 53624;53625;53626 53624 3 AWEDAEKDCR Unmodified 1278.5299 0.52989972 1436 O14594;K7EKF8 NCAN Neurocan core protein yes no 0 0 1 1 21.756 21.756 2 0.058011 14998 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.867 84.299 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4560 1436 4258 41960 53627 53627 1 AWEEYYK Unmodified 987.4338 0.43379771 3770;909 E9PEB5;Q96AE4;Q92945;A0A087WTP3;M0R0C6;M0R3J3;M0R251;M0QYG1;M0R263 FUBP1;KHSRP Far upstream element-binding protein 1;Far upstream element-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 55.252 55.252 2 0.024915 53472 QUIQUE_C1403_190116_001 97.071 86.886 404330000 0 0 0 156710000 123640000 0 0 0 0 0 80645000 43327000 0 4561 909;3770 4259 41961;41962;41963;41964 53628;53629;53630;53631;53632 53628 5 AWEEYYKK Unmodified 1115.5288 0.52876073 3770;909 E9PEB5;Q96AE4;Q92945;A0A087WTP3;M0R0C6;M0R3J3;M0R251;M0QYG1;M0R263 FUBP1;KHSRP Far upstream element-binding protein 1;Far upstream element-binding protein 2 no no 0 0 1 1 1 33.967 33.967 2;3 0.052578 29349 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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2723 P61328;C9JUK8;C9JEN8;Q92915 FGF12;FGF14 Fibroblast growth factor 12;Fibroblast growth factor;Fibroblast growth factor 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.98 102.98 2 0.015866 106967 QUIQUE_C1438_190116_001 84.064 63.204 359110000 43606000 39421000 0 40234000 34118000 36523000 59003000 33661000 18831000 0 0 0 53713000 4565 2723 4263 41983;41984;41985;41986;41987;41988;41989;41990;41991 53654;53655;53656;53657;53658;53659;53660;53661;53662 53657 9 AWFVSLDGKPVAQVR Unmodified 1671.9097 0.90967544 3386 Q6P995 FAM171B Protein FAM171B yes yes 0 0 1 1 1 95.446 95.446 3 0.012222 97625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.774 35.391 56307000 0 0 0 0 0 0 0 25892000 0 0 0 0 30415000 4566 3386 4264 41992;41993 53663;53664 53663 2 AWFVSLDGR Unmodified 1049.5294 0.52942943 3334 Q5VUB5 FAM171A1 Protein FAM171A1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.49 108.49 2 0.0077234 111993 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.093 71.694 77478000 0 0 0 17404000 16664000 0 0 0 26616000 0 0 16794000 0 4567 3334 4265 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53765;53766;53767;53768;53769;53770;53771;53772;53773;53774 53770 6 AWGPGLETGQVGK Unmodified 1298.6619 0.66190017 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.453 65.453 2 4.1939E-05 64172 QUIQUE_C1563_190116_001 116.3 85.231 911180000 51216000 17848000 68355000 96918000 64021000 54884000 147660000 0 71051000 74686000 59115000 46976000 158450000 4573 3061 4270 42085;42086;42087;42088;42089;42090;42091;42092;42093;42094;42095;42096 53775;53776;53777;53778;53779;53780;53781;53782;53783;53784;53785;53786;53787 53780 9 AWGPGLHGGIVGR Unmodified 1275.6836 0.68363867 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.69 56.69 3 0.0016807 55113 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.252 43.819 294880000 0 0 0 0 0 0 0 38119000 45190000 21910000 65186000 61375000 63101000 4574 1628 4271 42097;42098;42099;42100;42101;42102 53788;53789;53790;53791;53792;53793;53794;53795 53789 8 AWGPTSQDTIR Unmodified 1230.5993 0.59929991 4088 Q9BZV1;K7EP32;K7EJ02 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 50.695 50.695 2 0.0026439 47053 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.688 52.29 287270000 0 0 0 0 0 0 0 79674000 43875000 33668000 69654000 0 60401000 4575 4088 4272 42103;42104;42105;42106;42107 53796;53797;53798;53799;53800;53801 53798 2 AWHGGCLALAELGR Unmodified 1509.7511 0.7510663 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.521 82.521 2;3 9.7357E-05 83983 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.324 69.811 478560000 20039000 52945000 51130000 44049000 49834000 31292000 49239000 30458000 38996000 0 31313000 38070000 41199000 4576 1283 4273 42108;42109;42110;42111;42112;42113;42114;42115;42116;42117;42118;42119;42120 53802;53803;53804;53805;53806;53807;53808;53809;53810;53811;53812;53813;53814;53815;53816;53817;53818 53814 17 AWLTEKEEALNK Unmodified 1430.7405 0.74054442 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 50.969 50.969 2;3 0.022198 48837 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.712 30.345 125640000 0 0 32104000 0 0 0 0 33401000 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53835;53836;53837;53838;53839;53840;53841;53842 53838 8 AWNAVCPLVVR Unmodified 1283.6809 0.68086147 4121 Q9H0Q0;C9IYV6 FAM49A Protein FAM49A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.565 93.565 2 0.00045843 95334 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.47 72.658 1135000000 73641000 97914000 90070000 89986000 83956000 100770000 112790000 80193000 91358000 21276000 111080000 82914000 99045000 4580 4121 4277 42143;42144;42145;42146;42147;42148;42149;42150;42151;42152;42153;42154;42155 53843;53844;53845;53846;53847;53848;53849;53850;53851;53852;53853;53854;53855;53856;53857;53858 53857 16 AWNAYPYCR Unmodified 1199.5182 0.51821282 2842;2519 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459;I3L4C0;I3L2X8;I3L3W1;I3L471;I3L4U7;P48739;A0A0A0MSW4;B3KYB6;B3KYB7 PITPNA;PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform;Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.174 61.174 2 0.0029423 61138 QUIQUE_C1218_190116_001 105.12 90.45 3735300000 199820000 297690000 267090000 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1001.5294 0.52942943 2846 Q00688;G3V5F2 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 67.94 67.94 2 0.0036122 67802 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 87.759 851580000 106900000 125950000 0 0 0 84874000 128920000 111680000 0 28443000 0 119540000 145280000 4590 2846 4287 42250;42251;42252;42253;42254;42255;42256;42257 53962;53963;53964;53965;53966;53967;53968;53969 53966 7 AWVWNTHADFADECPKPELLAIR Unmodified 2738.3275 0.32750551 2464 P43487;F6WQW2;C9JXG8;C9JJ34;C9JGV6 RANBP1 Ran-specific GTPase-activating protein yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 124.8 124.8 3;4 4.2925E-23 128103 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.43 108.67 408560000 0 80355000 0 72517000 78569000 0 0 65959000 0 0 111150000 0 0 4591 2464 4288 42258;42259;42260;42261;42262;42263;42264;42265;42266;42267 53970;53971;53972;53973;53974;53975;53976;53977;53978;53979;53980 53977 10 AYAACQDALWALDSLGQVFIR Unmodified 2367.1682 0.16815132 1474 O15040 TECPR2 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 171.35 171.35 3 1.3747E-06 176401 QUIQUE_C1576_190116_001 55.763 52.962 18220000 0 0 0 0 0 0 18220000 0 0 0 0 0 0 4592 1474 4289 42268 53981 53981 1 AYAAGFGDR Unmodified 926.42463 0.42463001 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 31.213 31.213 2 0.013518 25988 QUIQUE_C1576_190116_001 69.825 43.716 761060000 0 0 0 0 0 92969000 63349000 0 243910000 75365000 146850000 138610000 0 4593 2233 4290 42269;42270;42271;42272;42273;42274 53982;53983;53984;53985;53986;53987 53983 5 AYAAGFGDRR Unmodified 1082.5257 0.52574104 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 1 1 2 1 1 19.978 19.978 2;3 0.00069991 13042 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.681 69.438 571430000 0 0 0 0 0 0 0 79983000 338440000 0 62020000 90980000 0 4594 2233 4291 42275;42276;42277;42278;42279 53988;53989;53990;53991;53992 53989 5 AYAALAALEK Unmodified 1019.5651 0.56514624 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 71.267 71.267 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51.624 2 0.019227 50720 QUIQUE_C1218_190116_001 113.08 77.59 833890000 68320000 0 50503000 41057000 0 45336000 69223000 124770000 121810000 0 190070000 0 122800000 4598 1973 4295 42292;42293;42294;42295;42296;42297;42298;42299;42300 54005;54006;54007;54008;54009;54010;54011;54012;54013 54005 9 AYAEALKENSYVK Unmodified 1484.7511 0.75110911 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 1 2 42.883 42.883 2;3 0.0083619 39313 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.834 64.163 72992000 0 0 0 0 0 0 0 72992000 0 0 0 0 0 4599 2279 4296 42301;42302 54014;54015 54014 2 AYAEELASR Unmodified 1008.4876 0.4876242 3227 Q3SXM5;H3BQI7;H3BT52 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 32.786 32.786 2 0.020627 28416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.75 52.331 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4600 3227 4297 42303;42304;42305 54016;54017;54018 54016 3 AYAGDKAEEIGR Unmodified 1278.6204 0.62042929 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 19.94 19.94 2;3 0.00034497 12778 QUIQUE_C1576_190116_001 88.021 68.778 921760000 33906000 36023000 34380000 63325000 35991000 0 37710000 130740000 124090000 0 166020000 147590000 111990000 4601 1472 4298 42306;42307;42308;42309;42310;42311;42312;42313;42314;42315;42316;42317;42318;42319;42320;42321;42322;42323 54019;54020;54021;54022;54023;54024;54025;54026;54027;54028;54029;54030;54031;54032;54033;54034;54035;54036 54025 17 AYALAFAER Unmodified 1010.5185 0.5185304 455 A0A2R8YD50;P51659;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8YF45;A0A2R8YEG2 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.398 69.398 2 0.00045846 69206 QUIQUE_C1368_190116_001 117.04 75.534 1591000000 136650000 138830000 139720000 116700000 139450000 116360000 125610000 89313000 115190000 0 196720000 155820000 120680000 4602 455 4299 42324;42325;42326;42327;42328;42329;42330;42331;42332;42333;42334;42335 54037;54038;54039;54040;54041;54042;54043;54044;54045;54046;54047;54048;54049;54050;54051;54052;54053 54041 17 AYAPGGPAYQPVVEAFGTDILHK Unmodified 2400.2114 0.21139634 2963 Q13057 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.96 131.96 3 6.9995E-06 136130 QUIQUE_C1277_190116_001 62.303 54.591 1569500000 136050000 174940000 221670000 0 0 144850000 178280000 143670000 164230000 69710000 133570000 0 202510000 4603 2963 4300 42336;42337;42338;42339;42340;42341;42342;42343;42344;42345 54054;54055;54056;54057;54058;54059;54060;54061;54062;54063;54064;54065 54056 11 AYAQGISR Unmodified 864.44537 0.44536545 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 18.218 18.218 2 0.0036031 11038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.89 44.506 1263900000 0 119690000 0 49337000 0 0 0 583200000 78745000 347120000 0 85843000 0 4604 612 4301 42346;42347;42348;42349;42350;42351;42352 54066;54067;54068;54069;54070;54071;54072 54069 6 AYAQQLTEWAR Unmodified 1335.6571 0.65714914 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22;B0QYG7;B0QYG8 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.955 84.955 2 5.8078E-06 85881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.69 102.89 854530000 128330000 142040000 0 0 0 137900000 0 153620000 0 92441000 200210000 0 0 4605 4510 4302 42353;42354;42355;42356;42357;42358 54073;54074;54075;54076;54077;54078 54076 6 AYAVVCDCK Unmodified 1084.4682 0.46815109 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 25.594 25.594 2 0.043726 20385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.482 36.338 51794000 0 0 0 0 0 0 0 16780000 0 0 0 0 35014000 4606 4631 4303 42359;42360 54079;54080 54079 2 AYAYLFK Acetyl (Protein N-term) 916.46945 0.46945494 2707 P61019;E9PKL7 RAB2A Ras-related protein Rab-2A yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 138.84 138.84 1;2 0.021444 143342 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.377 35.766 1330100000 59524000 85073000 75680000 181860000 69794000 165120000 77082000 55910000 74066000 38968000 114340000 75303000 257340000 4607 2707 4304 42361;42362;42363;42364;42365;42366;42367;42368;42369;42370;42371;42372;42373;42374;42375;42376 54081;54082;54083;54084;54085;54086;54087;54088;54089;54090;54091;54092;54093;54094;54095;54096;54097 54096 14 AYCHILLGNYCVAVADAK Unmodified 2036.9812 0.98120217 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 94.911 94.911 3 3.47E-06 96702 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.786 65.502 188170000 0 0 0 76793000 0 0 0 0 0 36037000 0 0 75344000 4608 4572 4305 42377;42378;42379 54098;54099;54100;54101;54102 54100 5 AYDATHLVK Unmodified 1016.5291 0.52909508 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.291 26.291 2 0.004459 20167 QUIQUE_C1277_190116_001 88.948 63.009 9347000000 716580000 770470000 765400000 779810000 434850000 643240000 843050000 786350000 921210000 223250000 1002400000 565510000 894810000 4609 2003 4306 42380;42381;42382;42383;42384;42385;42386;42387;42388;42389;42390;42391;42392 54103;54104;54105;54106;54107;54108;54109;54110;54111;54112;54113;54114;54115 54104 10 AYDAVQLFALTGPAESK Unmodified 1779.9043 0.90431529 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 130.4 130.4 2;3 7.5333E-53 135136 QUIQUE_C1368_190116_001 185.87 163.15 2317400000 210920000 209060000 273900000 193510000 155040000 232140000 223130000 107970000 148040000 49013000 213280000 125260000 176170000 4610 2142 4307 42393;42394;42395;42396;42397;42398;42399;42400;42401;42402;42403;42404;42405;42406;42407;42408;42409;42410;42411;42412;42413 54116;54117;54118;54119;54120;54121;54122;54123;54124;54125;54126;54127;54128;54129;54130;54131;54132;54133;54134;54135;54136;54137;54138;54139;54140;54141;54142;54143 54122 27 AYDAVQLFALTGPAESKGEITPELLGVMR Unmodified 3075.5951 0.59507274 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 1 1 156.33 156.33 3 2.1177E-17 161380 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.615 84.24 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4611 2142 4308 42414 54144 54144 1 AYDDLLDEFMQAVTDK Oxidation (M) 1888.8401 0.84006005 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 158.08 158.08 2 2.3505E-07 163187 QUIQUE_C1368_190116_001 119.39 97.991 272160000 35615000 47113000 45509000 27685000 34501000 39081000 31399000 0 0 11255000 0 0 0 4612 3198 4309 42415;42416;42417;42418;42419;42420;42421;42422 54145;54146;54147;54148;54149;54150;54151;54152;54153 54147 2625 9 AYDDLLDEFMQAVTDK Unmodified 1872.8451 0.84514543 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 172.66 172.66 2;3 8.0573E-95 177091 QUIQUE_C1218_190116_001 255.23 230.38 3231200000 251760000 350860000 354940000 137410000 236970000 130020000 248800000 157150000 266630000 42263000 396520000 372030000 285880000 4613 3198 4309 42423;42424;42425;42426;42427;42428;42429;42430;42431;42432;42433;42434;42435;42436;42437;42438;42439;42440;42441;42442;42443;42444;42445;42446;42447;42448 54154;54155;54156;54157;54158;54159;54160;54161;54162;54163;54164;54165;54166;54167;54168;54169;54170;54171;54172;54173;54174;54175;54176;54177;54178;54179;54180;54181;54182 54156 29 AYDIYSR Unmodified 886.41848 0.418482 3192 Q16740;M0QYV5 CLPP ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial;ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit yes no 0 0 0 1 37.415 37.415 2 0.056653 33040 QUIQUE_C1277_190116_001 71.296 15.791 59626000 0 59626000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4614 3192 4310 42449 54183 54183 1 AYDPDYER Unmodified 1027.4247 0.42468959 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 25.197 25.197 2 0.018957 19212 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.116 60.385 268950000 0 55643000 0 0 0 0 0 98745000 87177000 27381000 0 0 0 4615 345 4311 42450;42451;42452;42453 54184;54185;54186;54187 54185 4 AYEDQTKPVLEYYQK Unmodified 1873.9098 0.90979459 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 64.431 64.431 2;3 2.9721E-28 64016 QUIQUE_C1576_190116_001 184.31 133.96 3790100000 391350000 432470000 470990000 492880000 0 514340000 81818000 80228000 525460000 158870000 108100000 96073000 437550000 4616 4450 4312 42454;42455;42456;42457;42458;42459;42460;42461;42462;42463;42464;42465;42466;42467;42468;42469;42470;42471;42472;42473 54188;54189;54190;54191;54192;54193;54194;54195;54196;54197;54198;54199;54200;54201;54202;54203;54204;54205;54206;54207;54208;54209 54198 20 AYEFAER Unmodified 884.40283 0.40283194 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.845 32.845 2 0.021961 27997 QUIQUE_C1576_190116_001 103.29 31.265 9967300000 1308500000 0 0 1265700000 0 1091200000 1673400000 1062000000 0 430830000 1799100000 1336600000 0 4617 50;2631 4313 42474;42475;42476;42477;42478;42479;42480;42481 54210;54211;54212;54213;54214;54215;54216;54217 54213 8 AYELALYLR Unmodified 1110.6073 0.6073454 1099 G5E9Q6;C9J0J7 PFN2 Profilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 106.73 106.73 2 9.6027E-05 111235 QUIQUE_DMIX5_190116_001 165.11 131.56 3367900000 123650000 162040000 217160000 82810000 189670000 260960000 305730000 323040000 501930000 121960000 355320000 358480000 365200000 4618 1099 4314 42482;42483;42484;42485;42486;42487;42488;42489;42490;42491;42492;42493;42494;42495 54218;54219;54220;54221;54222;54223;54224;54225;54226;54227;54228;54229;54230;54231;54232;54233;54234;54235;54236;54237;54238;54239;54240;54241;54242;54243;54244 54237 26 AYELEQSVVK Unmodified 1164.6027 0.60265396 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 1 54.745 54.745 2 0.011915 53298 QUIQUE_C1368_190116_001 66.621 43.193 100660000 0 0 38052000 0 0 0 0 0 0 0 62608000 0 0 4619 550 4315 42496;42497 54245;54246 54245 2 AYEMALK Unmodified 824.41023 0.4102255 4344 Q9NZD2;F5H0U5;H0YFS9 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 35.804 35.804 2 0.067021 31551 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.897 8.4448 24776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24776000 4620 4344 4316 42498 54247 54247 1 AYEPQELKPFVTAISSALVIAAVFDR Unmodified 2834.5218 0.52183145 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 1 1 174.12 174.12 3 1.2667E-36 178300 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.47 94.673 21775000 0 0 0 0 0 0 0 0 21775000 0 0 0 0 4621 1283 4317 42499 54248;54249 54249 2 AYEQAGMMLK Unmodified 1140.5308 0.53075134 3973 Q99747;J3KTJ6 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 51.766 51.766 2 0.016321 49832 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.064 40.617 0 0 0 0 0 0 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AYFAVFDGHGGVDAAR Unmodified 1651.7743 0.77430417 2535 P49593;A8MX49;B5MCT7;C9J2F3 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.613 84.613 3 0.00025572 82326 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.265 52.468 244680000 35411000 0 32145000 35849000 34747000 0 0 0 28576000 43448000 0 0 34505000 4626 2535 4322 42512;42513;42514;42515;42516;42517;42518 54262;54263;54264;54265;54266;54267;54268 54267 7 AYFHLLNQIAPK Unmodified 1413.7769 0.77687035 181;3076 A0A0A0MSQ0;P13797;H7C4N2;C9JAM8;Q14651 PLS3;PLS1 Plastin-3;Plastin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 86.59 86.59 2;3 0.00037219 86108 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.417 74.688 859560000 60446000 69218000 72747000 65321000 54901000 51867000 58577000 0 87834000 35259000 128480000 63184000 111720000 4627 181;3076 4323 42519;42520;42521;42522;42523;42524;42525;42526;42527;42528;42529;42530;42531;42532;42533 54269;54270;54271;54272;54273;54274;54275;54276;54277;54278;54279;54280;54281;54282;54283 54278 10 AYFLDGSLLK Unmodified 1125.607 0.60701105 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 112.81 112.81 2 0.022257 115390 QUIQUE_C1563_190116_001 57.96 34.005 63140000 0 0 0 0 0 6872800 0 0 0 0 26987000 11602000 17678000 4628 1820 4324 42534;42535;42536;42537 54284;54285;54286;54287 54284 4 AYFQQYGCTFTAVIPTNVFGPHDNFNIEDGHVLPGLIHK Unmodified 4416.1426 0.14261186 3020 Q13630;E9PKL9;E9PP14;A0A0J9YX13 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes no 0 0 0 2 149.7 149.7 4;5 2.3931E-05 152561 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.32 42.615 131140000 0 0 0 0 0 0 0 131140000 0 0 0 0 0 4629 3020 4325 42538;42539 54288;54289 54289 2 AYGAGLLSSYGELLHCLSEEPEIR Unmodified 2663.2901 0.29011695 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 159.76 159.76 3 4.6834E-24 166377 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.884 79.895 385690000 0 0 50511000 38476000 0 0 0 0 48782000 0 96150000 84781000 66987000 4630 1913 4326 42540;42541;42542;42543;42544;42545;42546 54290;54291;54292;54293;54294;54295;54296 54293 6 AYGELPEHAK Unmodified 1113.5455 0.54547343 2494 P47813;X6RAC9;O14602;A6NJH9 EIF1AX;EIF1AY Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal;Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.646 19.646 2;3 0.0026604 12194 QUIQUE_C1563_190116_001 101.64 65.763 512700000 0 150290000 0 0 114900000 132170000 115340000 0 0 0 0 0 0 4631 2494 4327 42547;42548;42549;42550 54297;54298;54299;54300 54299 4 AYGENIGYSEK Unmodified 1229.5564 0.55643205 1873 P05026 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.295 38.295 2 0.00043198 34520 QUIQUE_C1438_190116_001 123.35 93.188 15874000000 1442500000 1637400000 1581400000 1490800000 1102000000 1147300000 1505200000 1008000000 993520000 466480000 1201300000 1069700000 1228300000 4632 1873 4328 42551;42552;42553;42554;42555;42556;42557;42558;42559;42560;42561;42562;42563 54301;54302;54303;54304;54305;54306;54307;54308;54309;54310;54311;54312;54313;54314;54315;54316;54317;54318;54319;54320;54321;54322 54307 21 AYGENIGYSEKDR Unmodified 1500.6845 0.68448611 1873 P05026 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 29.539 29.539 2;3 0.00026641 24094 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.417 81.16 3211700000 28439000 50420000 45645000 0 104890000 0 0 642580000 290660000 0 1034300000 617980000 396750000 4633 1873 4329 42564;42565;42566;42567;42568;42569;42570;42571;42572;42573;42574;42575;42576 54323;54324;54325;54326;54327;54328;54329;54330;54331;54332;54333;54334;54335;54336;54337 54336 13 AYGLLVATTSR Unmodified 1150.6346 0.63462279 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN3 Neurexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 68.845 68.845 2 0.016207 68688 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.916 42.503 193920000 0 0 0 0 0 41556000 0 30313000 44814000 12463000 64770000 0 0 4634 319 4330 42577;42578;42579;42580;42581 54338;54339;54340;54341;54342 54339 5 AYGPGIEPTGNMVK Oxidation (M) 1448.697 0.69696505 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 1 0 1 1 2 1 43.927 43.927 2 0.0056895 41005 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.792 42.453 254070000 0 0 0 0 0 0 0 49808000 0 37999000 98455000 67809000 0 4635 2178 4331 42582;42583;42584;42585;42586 54343;54344;54345;54346;54347 54346 1532 5 AYGQQLTDWAK Unmodified 1279.6197 0.619701 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.037 80.037 2 7.1778E-31 82229 QUIQUE_C1218_190116_001 203.29 164.14 7587100000 651000000 732380000 666390000 487980000 558600000 435770000 668880000 601550000 567070000 194380000 732460000 630820000 659780000 4636 4069 4332 42587;42588;42589;42590;42591;42592;42593;42594;42595;42596;42597;42598;42599 54348;54349;54350;54351;54352;54353;54354;54355;54356;54357;54358;54359;54360;54361;54362;54363;54364;54365;54366;54367;54368;54369;54370;54371;54372;54373;54374;54375 54350 28 AYGTGFVGCLR Unmodified 1199.5757 0.5757277 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.588 73.588 2 0.013991 74845 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.981 34.826 92706000 0 0 0 0 0 0 0 0 45069000 0 47637000 0 0 4637 1408 4333 42600;42601;42602;42603 54376;54377;54378;54379 54378 4 AYHEQLSVAEITNACFEPANQMVK Oxidation (M) 2765.2789 0.27890034 2795;3430;2796;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;C9JDS9;P68366;Q71U36 TUBA3E;TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain no no 0 1 0 11 8 10 8 6 4 7 7 2 5 9 10 7 103.75 103.75 2;3 0 101869 QUIQUE_C1277_190116_001 292.45 267.65 31954000000 2588000000 3568100000 3336300000 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54380;54381;54382;54383;54384;54385;54386;54387;54388;54389;54390;54391;54392;54393;54394;54395;54396;54397;54398;54399;54400;54401;54402;54403;54404;54405;54406;54407;54408;54409;54410;54411;54412;54413;54414;54415;54416;54417;54418;54419;54420;54421;54422;54423;54424;54425;54426;54427;54428;54429;54430;54431;54432;54433;54434;54435;54436;54437;54438;54439;54440;54441;54442;54443;54444;54445;54446;54447;54448;54449;54450;54451;54452;54453;54454;54455;54456;54457;54458;54459;54460;54461;54462;54463;54464;54465;54466;54467;54468;54469;54470;54471;54472;54473;54474;54475;54476;54477;54478;54479;54480;54481;54482;54483;54484;54485;54486;54487;54488;54489;54490;54491;54492;54493;54494;54495;54496;54497;54498;54499;54500;54501;54502;54503;54504;54505;54506;54507;54508;54509;54510;54511;54512;54513;54514;54515;54516;54517;54518;54519;54520;54521;54522;54523;54524;54525;54526 54403 1259 133 AYHEQLSVAEITNACFEPANQMVK Unmodified 2749.284 0.28398571 2795;3430;2796;1990 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54527 267 AYHEQLSVAEITSSCFEPNSQMVK Oxidation (M) 2770.2578 0.25783054 688 C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 96.33 96.33 3 5.6244E-15 98724 QUIQUE_C1277_190116_001 108.64 101.45 247040000 0 82757000 0 0 60734000 0 69557000 0 0 33989000 0 0 0 4640 688 4335 42892;42893;42894;42895;42896 54826;54827;54828;54829;54830;54831 54827 424 5 AYHEQLSVAEITSSCFEPNSQMVK Unmodified 2754.2629 0.26291592 688 C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 0 0 1 1 106.53 106.53 3 1.1373E-07 108992 QUIQUE_C1277_190116_001 73.994 61.798 314670000 0 278620000 0 0 0 0 0 0 0 36055000 0 0 0 4641 688 4335 42897;42898 54832;54833 54832 2 AYHEQLTVAEITNACFEPANQMVK Oxidation (M) 2779.2946 0.2945504 3992 Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA1C Tubulin alpha-1C chain yes no 0 1 0 2 1 2 2 2 3 3 2 1 4 2 102.16 102.16 2;3 5.1938E-24 103221 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.71 120.79 24544000000 1325600000 121660000 0 1110700000 936550000 1219700000 0 5925600000 5257300000 3603300000 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42923;42924;42925;42926;42927;42928;42929;42930;42931;42932;42933;42934;42935;42936;42937;42938;42939;42940;42941;42942;42943;42944;42945;42946;42947;42948;42949;42950;42951;42952;42953;42954;42955;42956;42957;42958;42959;42960;42961;42962;42963;42964;42965;42966;42967;42968;42969;42970;42971;42972;42973;42974;42975;42976;42977;42978;42979;42980;42981;42982;42983;42984;42985;42986;42987;42988;42989;42990;42991;42992;42993;42994;42995;42996;42997;42998;42999;43000;43001;43002;43003;43004;43005;43006;43007;43008;43009;43010;43011;43012;43013;43014;43015;43016;43017;43018;43019;43020;43021;43022;43023;43024;43025;43026;43027;43028 54870;54871;54872;54873;54874;54875;54876;54877;54878;54879;54880;54881;54882;54883;54884;54885;54886;54887;54888;54889;54890;54891;54892;54893;54894;54895;54896;54897;54898;54899;54900;54901;54902;54903;54904;54905;54906;54907;54908;54909;54910;54911;54912;54913;54914;54915;54916;54917;54918;54919;54920;54921;54922;54923;54924;54925;54926;54927;54928;54929;54930;54931;54932;54933;54934;54935;54936;54937;54938;54939;54940;54941;54942;54943;54944;54945;54946;54947;54948;54949;54950;54951;54952;54953;54954;54955;54956;54957;54958;54959;54960;54961;54962;54963;54964;54965;54966;54967;54968;54969;54970;54971;54972;54973;54974;54975;54976;54977;54978;54979;54980;54981;54982;54983;54984;54985;54986;54987;54988;54989;54990;54991;54992;54993;54994;54995;54996;54997;54998;54999;55000;55001;55002;55003;55004;55005;55006;55007;55008;55009;55010;55011;55012;55013;55014;55015;55016;55017;55018;55019;55020;55021;55022;55023;55024;55025;55026;55027;55028;55029;55030;55031;55032;55033;55034;55035;55036;55037;55038;55039;55040;55041;55042;55043;55044;55045;55046;55047;55048;55049;55050;55051;55052;55053;55054;55055;55056;55057;55058;55059;55060;55061;55062;55063;55064;55065;55066;55067;55068;55069;55070;55071;55072 54985 198 AYHLQDDGTQTVR Unmodified 1502.7114 0.71136956 3838 Q96DZ1 ERLEC1 Endoplasmic reticulum lectin 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 26.991 26.991 2;3 0.00047709 21139 QUIQUE_C1277_190116_001 105.86 73.929 88030000 0 29771000 0 24210000 0 0 0 0 0 0 0 0 34050000 4644 3838 4337 43029;43030;43031;43032 55073;55074;55075;55076 55073 4 AYHSFLVEPISCHAWNK Acetyl (Protein N-term) 2099.9887 0.98873039 1485 O15143;C9JEY1;C9K057;C9JBJ7;C9J4Z7;F8VXW2;C9JQM8;C9JFG9;C9J6C8;C9JTT6;C9JM51;F8WEB3 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 110.03 110.03 3 1.9728E-07 113016 QUIQUE_C1277_190116_001 106.6 88.307 487550000 63256000 67750000 137450000 109440000 0 0 0 72654000 0 36999000 0 0 0 4645 1485 4338 43033;43034;43035;43036;43037;43038 55077;55078;55079;55080;55081;55082;55083 55078 7 AYIAAQGPLK Unmodified 1030.5811 0.58113065 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 42.369 42.369 2 0.042203 39401 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.69 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tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 135.83 135.83 2 3.2241E-13 141711 QUIQUE_C1218_190116_001 122.97 102.11 299290000 34387000 40564000 50466000 39741000 0 0 0 0 0 22456000 57347000 0 54324000 4649 987;2987 4342 43050;43051;43052;43053;43054;43055;43056;43057;43058;43059 55096;55097;55098;55099;55100;55101;55102;55103;55104;55105;55106;55107 55097 10 AYICAHPLDR Unmodified 1214.5866 0.58662674 4186 Q9H845;H0Y8Z9 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 33.372 33.372 3 0.0086884 28895 QUIQUE_C1403_190116_001 48.004 30.978 61295000 0 0 0 34477000 0 0 0 0 0 0 0 0 26818000 4650 4186 4343 43060;43061;43062 55108;55109;55110 55108 3 AYIDSFR Unmodified 870.42357 0.42356738 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 55.405 55.405 2 0.020194 53462 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.98 9.5988 324540000 0 0 0 0 0 146440000 0 178110000 0 0 0 0 0 4651 2083 4344 43063;43064 55111;55112 55112 2 AYIFIDEAHITQALIWLSQR Unmodified 2387.2638 0.26376627 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 169.31 169.31 3 0.0013598 176581 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.938 47.344 130060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 130060000 0 0 4652 1802 4345 43065 55113 55113 1 AYIGFIQSLAQFLGADASR Unmodified 2027.0476 0.04762548 2662 P55160 NCKAP1L Nck-associated protein 1-like yes yes 0 0 0 1 172.37 172.37 3 0.00023472 179665 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.094 39.44 25006000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25006000 0 0 4653 2662 4346 43066 55114 55114 1 AYILNLVK Unmodified 932.5695 0.56950333 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.694 85.694 2 0.0036845 87351 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.15 85.126 3707800000 331230000 322600000 0 280350000 354060000 283280000 342340000 291440000 283560000 133720000 412560000 302730000 369970000 4654 2573 4347 43067;43068;43069;43070;43071;43072;43073;43074;43075;43076;43077;43078 55115;55116;55117;55118;55119;55120;55121;55122;55123;55124;55125;55126;55127 55122 9 AYINKVEELK Unmodified 1205.6656 0.66558856 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 1 1 2 1 2 37.921 37.921 2;3 0.019946 33901 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.539 38.533 968880000 0 0 0 0 0 0 0 0 145600000 0 405190000 145120000 272960000 4655 1914 4348 43079;43080;43081;43082;43083;43084 55128;55129;55130;55131;55132;55133 55132 3 AYINKVEELKK Unmodified 1333.7606 0.76055158 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 2 1 1 1 25.257 25.257 2;3 0.013021 20146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.531 58.178 481480000 0 0 0 0 0 0 0 307280000 148890000 0 25309000 0 0 4656 1914 4349 43085;43086;43087 55134;55135;55136 55134 1 AYIQEFQEFSK Unmodified 1388.6612 0.66123147 3410 Q6UWY5 OLFML1 Olfactomedin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 93.065 93.065 2 0.0023415 95321 QUIQUE_C1403_190116_001 78.939 49.777 123140000 0 0 0 70483000 52661000 0 0 0 0 0 0 0 0 4657 3410 4350 43088;43089 55137;55138 55137 2 AYIQENLELVEK Unmodified 1447.7559 0.75586013 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.349 87.349 2 7.3426E-05 84760 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.63 71.347 342870000 0 0 50626000 39975000 0 55728000 61227000 66486000 33499000 35332000 0 0 0 4658 1005;2027 4351 43090;43091;43092;43093;43094;43095;43096;43097;43098;43099 55139;55140;55141;55142;55143;55144;55145;55146;55147;55148 55146 10 AYIVEWR Unmodified 935.4865 0.48650199 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.052 74.052 2 0.039576 74251 QUIQUE_C1368_190116_001 83.614 46.594 102650000 25893000 26888000 28942000 0 0 0 0 0 20927000 0 0 0 0 4659 3779 4352 43100;43101;43102;43103 55149;55150;55151;55152 55151 4 AYIVQLQIEDLTR Unmodified 1560.8512 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43128 55178 55178 1 AYLEGTCVEWLR Unmodified 1495.7129 0.71294946 2312;1995;324;2104;2316;2315;325 A0A140T955;A0A140T933;A0A1W2PRT9;A0A140T9I0;A0A140T9X5;A0A140T913;P01892;A0A1W2PPQ2;P10316;P16188;P30453;P16190;P30479;P30480;P30462;O19617;A0A140T921;A0A140T9H5;A0A140T9U8;A2AEA2;P10321;A0A140TA05;A0A1W2PRU9;A0A140T9L3;A0A140T9E1;A0A140T942;A0A140TA19;A0A140T9S7;A0A140T9Q4 HLA-A;HLA-B;HLA-C HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.02 111.02 2 7.1163E-05 114355 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.88 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43142;43143;43144;43145;43146;43147;43148;43149;43150;43151;43152 55194;55195;55196;55197;55198;55199;55200;55201;55202;55203;55204;55205;55206 55199 13 AYLNQTVTEFK Unmodified 1312.6663 0.66631685 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 71.966 71.966 2 0.0014573 71888 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.07 82.796 631110000 0 0 0 0 0 0 0 115160000 140660000 0 0 196520000 178760000 4672 3895 4365 43153;43154;43155;43156 55207;55208;55209;55210 55208 4 AYLPVNESFGFTADLR Unmodified 1798.889 0.88899957 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 3 2 3 1 2 2 2 134.88 134.88 2;3 1.1652E-13 138134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.11 156.49 1553000000 149060000 180290000 157370000 135370000 61198000 137470000 17376000 274590000 343730000 65537000 0 30981000 0 4673 2058 4366 43157;43158;43159;43160;43161;43162;43163;43164;43165;43166;43167;43168;43169;43170;43171;43172;43173;43174;43175;43176;43177;43178;43179;43180;43181 55211;55212;55213;55214;55215;55216;55217;55218;55219;55220;55221;55222;55223;55224;55225;55226;55227;55228;55229;55230;55231;55232;55233;55234;55235;55236;55237;55238;55239;55240;55241;55242;55243;55244;55245 55233 31 AYLQQLR Unmodified 890.4974 0.49740102 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 38.832 38.832 2 0.029928 34904 QUIQUE_C1277_190116_001 91.093 54.065 2745000000 0 461020000 517160000 0 379120000 0 531440000 0 364920000 0 491350000 0 0 4674 1487 4367 43182;43183;43184;43185;43186;43187 55246;55247;55248;55249;55250;55251;55252;55253 55246 8 AYLSIWTELQAYIK Unmodified 1697.9029 0.90285872 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 1 166.67 166.67 2 0.0097593 168682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.893 53.994 8769900 0 0 0 0 0 0 0 8769900 0 0 0 0 0 4675 2857;3307 4368 43188 55254 55254 0 AYLSSGGGFPEGPEPR Unmodified 1619.758 0.7579854 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 76.104 76.104 2 0.00079898 76927 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.03 51.166 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4676 730 4369 43189;43190 55255;55256 55256 2 AYLTEENGQIAVFDATNTTR Unmodified 2213.06 0.060040659 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 108.04 108.04 2;3 8.9649E-174 110335 QUIQUE_DMIX1_190116_001 243.78 223.4 358100000 41644000 47560000 0 45647000 0 0 0 97033000 104750000 21463000 0 0 0 4677 1594 4370 43191;43192;43193;43194;43195;43196;43197;43198 55257;55258;55259;55260;55261;55262;55263;55264;55265;55266 55261 9 AYLTVLADQATPTNR Unmodified 1632.8471 0.84713476 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.777 86.777 2 6.0218E-112 89850 QUIQUE_C1218_190116_001 231.54 212.79 975540000 106730000 97934000 94640000 83130000 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Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 2 132.99 132.99 2;3 2.2001E-20 139864 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.5 155.08 71106000 0 0 0 0 0 0 0 0 29796000 0 41309000 0 0 4680 831;1569 4373 43224;43225;43226 55298;55299;55300 55299 3 AYNHHIQELQR Unmodified 1407.7007 0.70074529 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.09 16.09 3 1.6792E-05 9008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.55 94.315 424540000 40521000 45507000 50473000 0 0 48319000 65279000 38843000 0 17197000 64602000 0 53800000 4681 4378 4374 43227;43228;43229;43230;43231;43232;43233;43234;43235 55301;55302;55303;55304;55305;55306;55307;55308;55309;55310 55307 10 AYNHYFDLIIINDNLDK Unmodified 2080.0266 0.026555687 4358 Q9NZW5;B8ZZG1 MPP6 MAGUK p55 subfamily member 6 yes no 0 0 0 1 132.48 132.48 3 0.018681 137984 QUIQUE_C1576_190116_001 45.704 31.663 37284000 0 0 0 0 0 0 37284000 0 0 0 0 0 0 4682 4358 4375 43236 55311 55311 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55325;55326;55327;55328;55329;55330;55331;55332;55333;55334 55331 8 AYPDVAALSDGYWVVSNR Unmodified 1981.9534 0.95339074 467 A0A2R8YGD1;O14773;A0A2R8Y7U1;A0A2R8YD45 TPP1 Tripeptidyl-peptidase 1 yes no 0 0 0 2 2 4 1 2 1 2 2 2 2 2 2 3 139.23 139.23 2;3 3.8704E-31 144618 QUIQUE_C1368_190116_001 182.33 159.75 6947500000 293930000 757360000 711840000 185940000 491670000 343280000 521140000 596940000 590950000 202590000 843140000 595000000 813730000 4685 467 4378 43257;43258;43259;43260;43261;43262;43263;43264;43265;43266;43267;43268;43269;43270;43271;43272;43273;43274;43275;43276;43277;43278;43279;43280;43281;43282;43283 55335;55336;55337;55338;55339;55340;55341;55342;55343;55344;55345;55346;55347;55348;55349;55350;55351;55352;55353;55354;55355;55356;55357;55358;55359;55360;55361;55362;55363;55364;55365;55366;55367;55368;55369;55370;55371;55372;55373;55374;55375;55376;55377;55378 55342 43 AYPGYYFTGDGAYR Unmodified 1599.6994 0.69940789 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 93.302 93.302 2 8.7051E-05 94519 QUIQUE_C1277_190116_001 99.283 77.29 60775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60775000 0 0 0 4686 4296 4379 43284;43285 55379;55380 55379 2 AYPHFCAFGHAVDTLLEELGGER Unmodified 2588.2118 0.21180705 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 154.3 154.3 4 1.5733E-07 161880 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.776 70.876 95304000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95304000 0 0 4687 699 4380 43286 55381 55381 1 AYPLADAHLTK Unmodified 1198.6346 0.63462279 2670 P55769 NHP2L1 NHP2-like protein 1;NHP2-like protein 1, N-terminally processed no no 0 0 0 1 2 1 41.654 41.654 3 0.0074089 39101 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.48 28.127 83559000 0 0 36075000 0 0 0 0 24949000 0 0 0 22535000 0 4688 2670 4381 43287;43288;43289;43290 55382;55383;55384;55385;55386 55384 5 AYQAEVDKLR Unmodified 1191.6248 0.62478638 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 29.991 29.991 2;3 0.0066736 24690 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43331;43332 55429;55430 55430 2 AYSDPSTGEPATYGELQQR Unmodified 2068.9338 0.93377751 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 66.655 66.655 2;3 1.8666E-132 66721 QUIQUE_C1277_190116_001 295.62 288.01 5230200000 331160000 363640000 350610000 158910000 354270000 205880000 299390000 662410000 661710000 279830000 769240000 517410000 275770000 4698 3117 4391 43333;43334;43335;43336;43337;43338;43339;43340;43341;43342;43343;43344;43345;43346;43347;43348;43349 55431;55432;55433;55434;55435;55436;55437;55438;55439;55440;55441;55442;55443;55444;55445;55446;55447;55448;55449;55450;55451;55452;55453;55454;55455;55456;55457;55458;55459 55434 28 AYSEAHEISKEHMQPTHPIR Oxidation (M) 2376.1281 0.12807742 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 1 1 2 17.662 17.662 3;5 7.9889E-09 10276 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.94 84.043 203280000 0 0 0 0 0 0 0 203280000 0 0 0 0 0 4699 2736 4392 43350;43351 55460;55461 55461 2170 2 AYSEAHEISKEHMQPTHPIR Unmodified 2360.1332 0.1331628 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 22.117 22.117 5 0.00096056 15994 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.298 44.586 481370000 0 0 0 0 0 0 0 260980000 67676000 0 49005000 103710000 0 4700 2736 4392 43352;43353;43354;43355 55462;55463;55464;55465 55462 4 AYSEALAAFGNGALFVEK Unmodified 1856.9309 0.93086439 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.64 138.64 2;3 0.00053522 144745 QUIQUE_C1438_190116_001 71.513 58.313 5071000000 1711100000 0 23841000 71947000 1848900000 1387200000 0 18306000 0 0 0 9624300 0 4701 2026 4393 43356;43357;43358;43359;43360;43361;43362 55466;55467;55468;55469;55470;55471;55472;55473 55469 8 AYSFAMGCWPK Unmodified 1316.5682 0.56819948 1120 H0Y4B0;O43414;A0A3B3ISV9;F6QUN3 ERI3 ERI1 exoribonuclease 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104 104 2 0.00080473 106544 QUIQUE_C1403_190116_001 95.099 79.891 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no 0 0 0 1 1 69.808 69.808 3 0.0057593 68608 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.785 30.017 104060000 0 0 0 0 0 0 0 104060000 0 0 0 0 0 4705 177 4396 43378;43379 55492;55493 55492 2 AYSNWPTYPQLYVK Unmodified 1728.8512 0.8511575 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 114.43 114.43 2 0.0036853 117873 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.726 58.038 332970000 40328000 46405000 0 36848000 0 0 0 0 0 0 117780000 35793000 55815000 4706 1676 4397 43380;43381;43382;43383;43384;43385;43386;43387;43388;43389 55494;55495;55496;55497;55498;55499;55500;55501;55502;55503 55502 8 AYSPELIVHPVLDSPNAVHEVEK Unmodified 2542.3068 0.30675329 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 3 1 1 2 90.992 90.992 3;4 3.2052E-14 93126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.74 93.157 3425900000 135350000 142810000 281460000 363220000 381970000 333800000 448920000 128280000 383760000 162190000 166090000 106040000 391980000 4707 3533 4398 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2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.71 123.71 2 3.2743E-22 128331 QUIQUE_C1368_190116_001 162.36 129.84 1286100000 150880000 157400000 188770000 0 152210000 142690000 0 0 186070000 0 170460000 137570000 0 4719 2026 4410 43485;43486;43487;43488;43489;43490;43491;43492 55610;55611;55612;55613;55614;55615;55616;55617;55618 55612 8 AYVLGSPALAAELEAVGVASVGVGPEPLQGEGPGDWLHAPLEPDVR Unmodified 4589.3442 0.34420802 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 169.62 169.62 4 1.8785E-11 173784 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.69 49.432 103960000 0 0 0 0 0 0 0 23017000 33412000 0 0 0 47533000 4720 531 4411 43493;43494;43495 55619;55620;55621 55621 3 AYVQAMVETVNNLLQPQALNAWR Unmodified 2628.3482 0.34824095 849 E7EMR3;E7ES20;E7ENK1;E7ESV6;E7EUP0;E7EX52;E7EN28;E9PBG4;E7EW95;E7EVD6;E7ETE3;E7EUW2 ADGRL3 yes no 0 0 0 1 1 168.7 168.7 3 7.112E-12 170708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.379 84.183 84296000 0 0 0 0 0 0 0 34881000 0 0 0 0 49414000 4721 849 4412 43496;43497 55622;55623 55622 2 AYVSTLMGVPGR Unmodified 1249.6489 0.64889264 1396 O00303 EIF3F Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.817 81.817 2 0.00082269 82993 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.61 72.039 278200000 0 16380000 0 31052000 0 24545000 45959000 0 0 0 64040000 45838000 50392000 4722 1396 4413 43498;43499;43500;43501;43502;43503;43504;43505;43506;43507 55624;55625;55626;55627;55628;55629;55630;55631;55632;55633 55632 10 AYVVLGQFLVLK Unmodified 1348.8119 0.81185887 1643 O75531 BANF1 Barrier-to-autointegration factor;Barrier-to-autointegration factor, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 142.99 142.99 2 0.00053513 147465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.64 87.345 450860000 39588000 48932000 0 0 31495000 29420000 0 44768000 53800000 21637000 68397000 61338000 51485000 4723 1643 4414 43508;43509;43510;43511;43512;43513;43514;43515;43516;43517;43518;43519;43520;43521;43522 55634;55635;55636;55637;55638;55639;55640;55641;55642;55643;55644;55645;55646;55647;55648;55649;55650;55651;55652;55653 55643 20 AYWQVHLDQVEVASGLTLCK Unmodified 2316.1573 0.15725228 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 1 5 3 2 2 2 2 2 1 1 2 2 130.55 130.55 2;3 3.4629E-56 136545 QUIQUE_C1438_190116_001 169.92 151.51 1529800000 129440000 47446000 238030000 135450000 223420000 102330000 186050000 0 0 67788000 141660000 145070000 113170000 4724 358 4415 43523;43524;43525;43526;43527;43528;43529;43530;43531;43532;43533;43534;43535;43536;43537;43538;43539;43540;43541;43542;43543;43544;43545;43546;43547 55654;55655;55656;55657;55658;55659;55660;55661;55662;55663;55664;55665;55666;55667;55668;55669;55670;55671;55672;55673;55674;55675;55676;55677;55678;55679;55680;55681;55682;55683;55684;55685 55668 29 AYYEFREEAYHSR Unmodified 1719.7641 0.76413341 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 1 1 42.209 42.209 3 0.0047899 38540 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.185 47.245 56542000 0 0 0 0 0 0 0 56542000 0 0 0 0 0 4725 3208 4416 43548 55686 55686 1 AYYENSPQQVFSTEFEVK Unmodified 2164.9953 0.99531514 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.79 119.79 2 4.4749E-07 125300 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.37 127.69 280350000 0 41980000 0 0 79954000 0 0 0 32025000 23779000 51889000 0 50728000 4726 1803 4417 43549;43550;43551;43552;43553;43554 55687;55688;55689;55690;55691;55692 55691 6 AYYHLLEQVAPK Unmodified 1430.7558 0.75580056 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 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39579000 179590000 136150000 146500000 4745 2600 4436 43691;43692;43693;43694;43695;43696;43697;43698;43699;43700;43701;43702;43703 55859;55860;55861;55862;55863;55864;55865;55866;55867;55868;55869;55870;55871;55872;55873;55874;55875;55876;55877;55878;55879;55880;55881;55882 55861 24 CALGVFR Unmodified 821.42179 0.42179324 2976 Q13200;C9JPC0 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 53.227 53.227 2 0.0098755 50664 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.24 78.483 108120000 60619000 0 0 0 0 0 0 47497000 0 0 0 0 0 4746 2976 4437 43704;43705 55883;55884 55884 2 CALGWDHQEK Unmodified 1242.5452 0.54515585 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 26.281 26.281 2;3 0.0065151 21121 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.35 36.774 155530000 0 0 0 37680000 0 0 0 34306000 0 10738000 0 0 72807000 4747 3056 4438 43706;43707;43708;43709 55885;55886;55887;55888 55886 3 CALLAAQANK Unmodified 1058.5543 0.55426398 4390 Q9P2R3;I3L3P8 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes no 0 0 0 1 1 27.316 27.316 2 0.0067527 21331 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.47 46.045 111480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16797000 0 0 94687000 4748 4390 4439 43710;43711 55889;55890 55889 1 CALSSVDIYR Unmodified 1182.5703 0.57030797 4576 Q9Y316 MEMO1 Protein MEMO1 yes yes 0 0 0 1 1 68.166 68.166 2 0.029731 68557 QUIQUE_C1576_190116_001 65.224 30.972 19633000 0 0 0 0 0 19633000 0 0 0 0 0 0 0 4749 4576 4440 43712;43713 55891;55892 55892 2 CAMTALSSK Unmodified 967.44669 0.44668736 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 22.899 22.899 2 0.014899 16053 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.897 43.265 478510000 0 0 0 0 0 0 139730000 0 83155000 0 126980000 0 128650000 4750 3977 4441 43714;43715;43716;43717 55893;55894;55895;55896 55896 4 CANLFEALVGTLK Unmodified 1434.7541 0.754086 4373 Q9P1F3 ABRACL Costars family protein ABRACL yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 156.46 156.46 2 0.00036659 159235 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.67 120.38 231030000 0 58660000 0 0 54074000 20814000 0 36371000 0 14181000 0 46933000 0 4751 4373 4442 43718;43719;43720;43721;43722;43723 55897;55898;55899;55900;55901;55902;55903 55901 7 CASIPDIMEQLQFIGVK Unmodified 1947.9798 0.97980519 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 162.01 162.01 2 0.054529 167492 QUIQUE_C1368_190116_001 46.592 30.06 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4752 3405 4443 43724 55904 55904 1 CASPLVLLEFQCPTPQICVEK Unmodified 2488.2164 0.21642342 3535 Q8IWA5;K7EPV6;K7ESF5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 147.46 147.46 3 1.1757E-06 151686 QUIQUE_C1277_190116_001 78.794 70.991 171030000 63599000 60837000 0 0 0 0 0 0 0 0 46590000 0 0 4753 3535 4444 43725;43726;43727 55905;55906;55907;55908 55907 4 CASQAGMTAYGTR Unmodified 1372.5864 0.58636874 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 0 1 1 1 27.205 27.205 2 0.0054618 21579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.343 94.892 117680000 0 37289000 0 0 0 0 0 69699000 0 10692000 0 0 0 4754 3137;908 4445 43728;43729;43730 55909;55910;55911 55910 2 CASQAGMTAYGTR Oxidation (M) 1388.5813 0.58128336 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 1 0 1 1 1 16.207 16.207 2 0.0021835 8353 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.062 7.3418 58345000 0 0 0 0 22226000 0 0 0 0 7973600 0 0 28145000 4755 3137;908 4445 43731;43732;43733 55912;55913;55914 55914 558 3 CATCSQPILDR Unmodified 1319.5962 0.59620515 3149 Q15654;H7BZE2 TRIP6 Thyroid receptor-interacting protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.312 32.312 2 0.00047451 27376 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.08 96.555 255560000 0 0 0 39281000 40306000 39035000 41048000 20932000 26558000 0 26080000 22317000 0 4756 3149 4446 43734;43735;43736;43737;43738;43739;43740;43741 55915;55916;55917;55918;55919;55920;55921;55922 55921 8 CATITPDEAR Unmodified 1132.5183 0.5182724 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.125 23.125 2 9.3413E-12 17007 QUIQUE_C1218_190116_001 164.96 150.8 8271900000 878530000 1049800000 1208400000 0 0 817680000 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P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 31.066 31.066 2 0.00067899 25887 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.1 116.54 358650000 0 0 0 0 0 0 0 47503000 83881000 0 99741000 0 127530000 4760 1853 4450 43764;43765;43766;43767 55946;55947;55948;55949 55948 3 CATSSQPLAAR Unmodified 1160.5608 0.56080592 3031 Q13905;H0Y6R4 RAPGEF1 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 yes no 0 0 0 1 1 17.881 17.881 2 0.030053 10299 QUIQUE_C1576_190116_001 62.463 51.103 20412000 0 0 0 0 0 0 11016000 0 0 0 0 9395900 0 4761 3031 4451 43768;43769 55950;55951 55950 2 CAVVDVPFGGAK Unmodified 1218.6067 0.60669348 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.598 73.598 2 0.00011368 74380 QUIQUE_C1277_190116_001 142.92 91.068 31023000000 2341600000 2205800000 3212400000 2366600000 2513400000 2107500000 2432100000 2292400000 2228200000 808160000 3086100000 2648600000 2780700000 4762 1777 4452 43770;43771;43772;43773;43774;43775;43776;43777;43778;43779;43780;43781;43782 55952;55953;55954;55955;55956;55957;55958;55959;55960;55961;55962;55963;55964;55965;55966;55967;55968;55969;55970;55971;55972;55973;55974;55975;55976;55977;55978 55956 27 CAWCGGQSR Unmodified 1080.4229 0.42293223 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 19.385 19.385 2 0.045989 12445 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.854 37.016 14892000 0 0 0 0 0 0 0 0 14892000 0 0 0 0 4763 1473 4453 43783 55979 55979 1 CAYEVSQAHK Unmodified 1191.5343 0.53425682 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 2 13.624 13.624 2;3 0.0010822 5667 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.456 68.305 11109000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11109000 0 0 0 4764 1384 4454 43784;43785 55980;55981 55980 2 CAYEVTQANGK Unmodified 1239.5554 0.55538619 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9;A0A096LP52 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.421 21.421 2 9.7206E-84 14893 QUIQUE_C1218_190116_001 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+ 4767 769 4457 43800;43801;43802;43803;43804;43805;43806;43807;43808;43809;43810;43811;43812;43813;43814;43815;43816;43817;43818;43819;43820;43821;43822;43823;43824 55998;55999;56000;56001;56002;56003;56004;56005;56006;56007;56008;56009;56010;56011;56012;56013;56014;56015;56016;56017;56018;56019;56020;56021;56022;56023;56024;56025;56026;56027;56028;56029;56030;56031;56032;56033 56006 36 CCAADDKEACFAVEGPK Unmodified 1926.791 0.79101814 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 46.221 46.221 3 0.010578 40956 QUIQUE_DMIX4_190116_001 38.696 36.627 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 4768 770 4458 43825 56034 56034 1 CCESASEDCMAK Unmodified 1446.4884 0.48837053 822 D6RF35;P02774;D6RBJ7 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 1 17.265 17.265 2 0.003732 9289 QUIQUE_C1277_190116_001 83 83 12016000 0 12016000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4769 822 4459 43826 56035 56035 1 CCMPYTPICIAK Unmodified 1512.6597 0.65973338 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.915 86.915 2 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60.884 1;2 5.0993E-09 59245 QUIQUE_C1563_190116_001 163.38 143.61 11670000000 1067300000 970850000 1392800000 1119700000 803220000 760190000 830590000 938920000 759860000 440260000 792990000 904560000 889160000 4773 2077 4463 43838;43839;43840;43841;43842;43843;43844;43845;43846;43847;43848;43849;43850;43851;43852;43853 56047;56048;56049;56050;56051;56052;56053;56054;56055;56056;56057;56058;56059;56060;56061;56062 56054 12 CCTESLVNR Unmodified 1137.4907 0.49067744 769;770 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2;CON__P02769 ALB Serum albumin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.876 23.876 2 9.6555E-05 17512 QUIQUE_C1438_190116_001 162.5 146.3 14819000000 0 2566400000 0 2871700000 4417900000 0 2087800000 0 0 0 900850000 1974300000 0 + 4774 769;770 4464 43854;43855;43856;43857;43858;43859 56063;56064;56065;56066;56067;56068 56065 4 CCVECPPCPAPPVAGPSVFLFPPKPK Unmodified 2907.3944 0.39440456 402 A0A286YEY4;P01859 IGHG2 Ig gamma-2 chain C region yes no 0 0 1 1 117.36 117.36 3 5.9969E-08 124108 QUIQUE_C1438_190116_001 64.152 61.271 51637000 0 0 0 0 51637000 0 0 0 0 0 0 0 0 4775 402 4465 43860 56069;56070;56071 56071 3 CCWDEPVR Unmodified 1120.443 0.44299897 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 46.452 46.452 2 0.030357 42862 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.032 59.385 141420000 40284000 0 0 0 0 0 0 55933000 0 0 0 0 45207000 4776 98;3487 4466 43861;43862;43863 56072;56073;56074 56074 3 CDAGWLADGSVR Unmodified 1305.5772 0.57718426 2006 P10915 HAPLN1 Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.918 72.918 2 0.00019845 73148 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.6 106.75 983160000 94984000 136190000 0 103210000 80675000 70434000 194590000 0 0 34562000 55348000 140480000 72691000 4777 2006 4467 43864;43865;43866;43867;43868;43869;43870;43871;43872;43873 56075;56076;56077;56078;56079;56080;56081;56082;56083;56084;56085;56086 56084 8 CDAISVLEK Unmodified 1033.5114 0.51139611 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.745 59.745 2 0.025628 58952 QUIQUE_C1277_190116_001 59.153 41.244 354460000 0 66764000 68232000 64509000 50511000 42095000 62348000 0 0 0 0 0 0 4778 4653 4468 43874;43875;43876;43877;43878;43879 56087;56088;56089;56090;56091;56092 56087 5 CDAVSVLEK Unmodified 1019.4957 0.49574604 1515 O43237;B4E2E0 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 45.799 45.799 2 0.015763 42555 QUIQUE_C1277_190116_001 66.692 36.885 124520000 0 124520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4779 1515 4469 43880;43881 56093;56094 56093 2 CDAVSVLEKEHDYRDEHLDFIQSHLR Unmodified 3210.5153 0.51525929 1515 O43237;B4E2E0 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 2 1 1 2 92.222 92.222 4;5 5.9919E-11 94672 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.445 69.266 224930000 0 0 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56100;56101;56102;56103;56104;56105;56106;56107;56108;56109;56110;56111 56103 12 CDDSVGYFVEPCIVESK Unmodified 2002.8652 0.86522894 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 116.31 116.31 2 1.5044E-12 120040 QUIQUE_C1368_190116_001 125.03 112.23 471950000 39776000 58774000 126400000 72657000 46476000 68550000 59317000 0 0 0 0 0 0 4783 2295 4473 43898;43899;43900;43901;43902;43903;43904 56112;56113;56114;56115;56116;56117;56118 56114 7 CDENILWLDYK Unmodified 1467.6704 0.67041595 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 2 2 3 1 1 1 1 1 2 2 2 3 1 127.6 127.6 2 2.7453E-06 126946 QUIQUE_C1218_190116_001 169.37 158.85 25136000000 1835600000 2656800000 2275400000 2036400000 1591400000 1378200000 2233900000 2101500000 1690200000 758690000 2252100000 2513000000 1812600000 4784 1203;2077 4474 43905;43906;43907;43908;43909;43910;43911;43912;43913;43914;43915;43916;43917;43918;43919;43920;43921;43922;43923;43924;43925;43926 56119;56120;56121;56122;56123;56124;56125;56126;56127;56128;56129;56130;56131;56132;56133;56134;56135;56136;56137;56138;56139;56140;56141;56142;56143;56144;56145;56146;56147;56148;56149;56150;56151;56152;56153;56154;56155;56156;56157;56158;56159;56160;56161;56162;56163;56164;56165;56166 56120 47 CDEPILSNR Unmodified 1102.5077 0.50770771 2307 P30086 PEBP1 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.352 33.352 1;2 1.7556E-07 28494 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.99 95.07 52396000000 3575500000 5669900000 4616600000 5326100000 4012800000 4333100000 4229700000 2744900000 4266100000 1651400000 3918900000 4537400000 3513400000 4785 2307 4475 43927;43928;43929;43930;43931;43932;43933;43934;43935;43936;43937;43938;43939;43940 56167;56168;56169;56170;56171;56172;56173;56174;56175;56176;56177;56178;56179;56180;56181;56182;56183;56184;56185;56186;56187;56188;56189;56190;56191 56186 24 CDEPLSILVR Unmodified 1200.6173 0.61725816 1880 P05161;A0A096LNZ9;A0A096LPJ4 ISG15 Ubiquitin-like protein ISG15 yes no 0 0 0 1 100.49 100.49 2 0.045074 105210 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.916 36.014 35788000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35788000 0 0 4786 1880 4476 43941 56192 56192 1 CDEWSVNSVGK Unmodified 1279.5503 0.55030081 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.797 55.797 2 0.00078221 53537 QUIQUE_C1403_190116_001 95.573 83.726 503880000 0 90507000 0 94839000 195670000 51849000 50449000 0 0 20567000 0 0 0 4787 1838 4477 43942;43943;43944;43945;43946;43947;43948;43949 56193;56194;56195;56196;56197;56198;56199;56200;56201;56202 56195 8 CDFPIMK Unmodified 909.40885 0.40884529 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.442 61.442 2 0.017367 60915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 0 1 2 13.53 13.53 2;3 0.00062416 5441 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.636 89.123 79511000 0 0 0 0 0 0 0 28756000 0 50755000 0 0 0 4803 2121 4491 44056;44057;44058 56326;56327;56328 56327 3 CDTCMMNVHK Unmodified 1294.4927 0.49266805 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.102 20.102 3 0.0064702 12935 QUIQUE_C1576_190116_001 58.083 54.954 244380000 49919000 61529000 28592000 39229000 26205000 0 38909000 0 0 0 0 0 0 4804 1894 4492 44059;44060;44061;44062;44063;44064 56329;56330;56331;56332;56333;56334 56334 6 CDVIAQGIVMAVK Unmodified 1402.7312 0.73124206 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;A0A0U1RQL1 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.47 105.47 2 0.00020488 109722 QUIQUE_C1576_190116_001 114.5 92.751 1558800000 0 167550000 195280000 0 0 202750000 205050000 106650000 124580000 54982000 178270000 155210000 168420000 4805 445 4493 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44154;44155;44156;44157;44158;44159;44160;44161;44162;44163 56441;56442;56443;56444;56445;56446;56447;56448;56449;56450;56451;56452;56453 56445 13 CEASGKPEVQFR Unmodified 1406.6612 0.66124824 2345 P32004;E7EVM4;E7EPI4;E9PHJ4;E7EMY4 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 23.204 23.204 2;3 0.00055861 16323 QUIQUE_C1277_190116_001 122.26 77.121 677910000 84359000 151330000 29768000 133370000 21868000 0 142560000 47376000 0 37008000 0 0 30263000 4815 2345 4502 44164;44165;44166;44167;44168;44169;44170;44171;44172;44173;44174;44175;44176;44177 56454;56455;56456;56457;56458;56459;56460;56461;56462;56463;56464;56465;56466;56467;56468;56469 56457 11 CEASNIVGK Unmodified 976.46478 0.46478027 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.43 19.43 2 0.00042581 12145 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.86 94.2 2124800000 200160000 350020000 0 294060000 206590000 233220000 260940000 81788000 115740000 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44207;44208;44209;44210;44211;44212;44213;44214;44215;44216;44217;44218;44219;44220;44221;44222;44223;44224;44225;44226;44227;44228;44229;44230;44231;44232 56507;56508;56509;56510;56511;56512;56513;56514;56515;56516;56517;56518;56519;56520;56521;56522;56523;56524;56525;56526;56527;56528;56529;56530;56531;56532;56533;56534;56535;56536;56537;56538;56539;56540;56541;56542;56543 56514 35 CEFQDAYVLLSEKK Unmodified 1728.8393 0.83927219 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 97.05 97.05 2;3 0.00052867 99036 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.859 48.482 823440000 0 0 0 0 0 0 0 244600000 48072000 0 116190000 259530000 155040000 4822 2004 4509 44233;44234;44235;44236;44237;44238;44239 56544;56545;56546;56547;56548;56549;56550;56551;56552;56553 56544 10 CEFVMEVTNK Unmodified 1255.5577 0.55769437 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.768 65.768 2 0.0039027 65157 QUIQUE_C1277_190116_001 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TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.516 65.516 2 0.0012367 65216 QUIQUE_C1277_190116_001 105.57 91.849 242210000 0 35437000 0 39989000 26547000 31282000 0 0 20558000 12610000 43869000 0 31916000 4828 4550 4515 44280;44281;44282;44283;44284;44285;44286;44287 56600;56601;56602;56603;56604;56605;56606;56607;56608 56600 9 CELLSDDSLAVSSPR Unmodified 1647.7774 0.77740021 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 88.665 88.665 2 1.1632E-09 91065 QUIQUE_C1576_190116_001 114.82 89.52 173450000 50013000 54939000 0 68498000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4829 727 4516 44288;44289;44290;44291;44292;44293;44294 56609;56610;56611;56612;56613;56614;56615 56613 7 CELLYEGPPDDEAAMGIK Unmodified 2006.8965 0.89652907 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110 110 2 3.2628E-38 113146 QUIQUE_C1277_190116_001 159.08 153.24 527050000 56168000 79725000 71124000 78528000 47356000 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56630;56631;56632;56633 56630 4 CEQSLLKEPQK Unmodified 1358.6864 0.68640036 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 22.579 22.579 2 2.5386E-07 15822 QUIQUE_DMIX7_190116_001 152.67 127.83 110220000 0 0 0 0 0 0 0 18427000 0 0 44163000 47633000 0 4834 4393 4520 44310;44311;44312;44313;44314 56634;56635;56636;56637;56638 56637 5 CEQVQPGYFR Unmodified 1282.5765 0.57645598 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 47.766 47.766 2 0.015945 45043 QUIQUE_C1438_190116_001 80.438 64.856 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4835 2665 4521 44315;44316 56639;56640 56639 2 CESAPGCGVWQR Unmodified 1405.5867 0.58670309 2269 P27824;D6RGY2 CANX Calnexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.914 45.914 2 0.00011264 43198 QUIQUE_C1277_190116_001 120.99 93.246 341940000 47693000 49469000 65100000 104330000 19079000 56259000 0 0 0 0 0 0 0 4836 2269 4522 44317;44318;44319;44320;44321;44322 56641;56642;56643;56644;56645;56646 56642 3 CESAPGCGVWQRPVIDNPNYK Unmodified 2446.1158 0.11579817 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.224 75.224 3 1.9621E-07 75914 QUIQUE_C1403_190116_001 92.492 84.688 416560000 0 0 68660000 99763000 0 59077000 81843000 0 0 0 46473000 0 60740000 4837 2269 4523 44323;44324;44325;44326;44327;44328 56647;56648;56649;56650;56651;56652;56653;56654;56655;56656 56650 10 CESQSTLDPGAGEAR Unmodified 1576.6787 0.6787488 3163 Q15818 NPTX1 Neuronal pentraxin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 28.313 28.313 2 1.2468E-08 23083 QUIQUE_C1218_190116_001 147.71 131.07 188610000 29205000 47209000 34308000 0 0 0 39223000 0 0 0 0 38664000 0 4838 3163 4524 44329;44330;44331;44332;44333 56657;56658;56659;56660;56661 56657 5 CETNVAPNCGVDAR Unmodified 1561.6613 0.6613246 2868 Q02156;E9PBI2 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes no 0 0 0 1 28.261 28.261 2 0.00182 22410 QUIQUE_C1277_190116_001 73.9 57.647 29806000 0 29806000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4839 2868 4525 44334 56662 56662 1 CEVLQYSAR Unmodified 1124.5284 0.52844316 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;H7C2W5;H7C1Y7;H7C2X4 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 40.372 40.372 2 0.0047102 36743 QUIQUE_C1576_190116_001 88.37 65.878 835100000 195830000 272570000 0 0 151170000 0 215520000 0 0 0 0 0 0 4840 64 4526 44335;44336;44337;44338 56663;56664;56665;56666;56667 56667 5 CEVNGAGAHPLFAFLR Unmodified 1757.8672 0.86715869 41 A0A087WUQ6;P07203;A0A2R8Y6B6 GPX1 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.09 103.09 3 2.0523E-05 106293 QUIQUE_C1368_190116_001 94.09 86.799 880050000 0 72791000 72707000 73434000 64839000 69487000 0 66550000 76211000 34215000 108100000 138430000 103290000 4841 41 4527 44339;44340;44341;44342;44343;44344;44345;44346;44347;44348;44349 56668;56669;56670;56671;56672;56673;56674;56675;56676;56677;56678 56669 10 CEVQHGIDDSSDAVEVK Unmodified 1886.8316 0.83162063 3862 Q96GW7;Q5T3I6;Q5T3I7;V9GY88 BCAN Brevican core protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 40.531 40.531 2;3 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44391;44392;44393 56724;56725;56726 56725 3 CFEKNEAIQAAHDAVAQEGQCR Unmodified 2531.1282 0.12815377 1976 P09936;D6R956;D6R974 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 2 2 69.455 69.455 3;4 1.7814E-11 69635 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.221 74.168 626690000 0 0 0 0 0 0 0 99278000 0 0 105440000 246330000 175640000 4847 1976 4532 44394;44395;44396;44397;44398;44399 56727;56728;56729;56730;56731;56732;56733 56727 5 CFGFVTYSNVEEADAAMAASPHAVDGNTVELK Unmodified 3399.5388 0.53875643 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 0 1 134.38 134.38 3 1.4916E-64 139283 QUIQUE_C1218_190116_001 146.78 135.42 44484000 44484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4848 2969 4533 44400 56734;56735 56734 2 CFGGLQK Unmodified 808.39016 0.39015876 2003 P10768 ESD S-formylglutathione hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 23.74 23.74 2 0.024501 16805 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.926 77.578 697180000 0 0 0 0 0 0 0 352360000 0 0 0 0 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16 CFPAIHAYK Unmodified 1105.5379 0.53788563 3535 Q8IWA5;K7EPV6;K7ESF5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 39.836 39.836 3 0.030931 35244 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.876 31.589 442240000 0 0 0 131350000 118660000 129620000 0 0 0 62620000 0 0 0 4855 3535 4540 44433;44434;44435;44436 56772;56773;56774;56775 56775 1 CFSCDQFIEGEVVSALGK Unmodified 2044.9234 0.92341252 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 144.81 144.81 2;3 1.2929E-07 148931 QUIQUE_C1277_190116_001 110.44 102.57 212240000 19410000 35742000 23262000 40163000 0 0 35472000 18583000 24003000 15610000 0 0 0 4856 3362 4541 44437;44438;44439;44440;44441;44442;44443;44444;44445;44446;44447 56776;56777;56778;56779;56780;56781;56782;56783;56784;56785;56786;56787 56777 9 CFSEENHEPLR Unmodified 1416.6092 0.60921267 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 25.695 25.695 2;3 0.00010289 19586 QUIQUE_DMIX4_190116_001 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56883;56884;56885;56886;56887;56888;56889;56890;56891;56892;56893;56894;56895;56896;56897;56898;56899;56900;56901;56902;56903;56904;56905;56906 56903 24 CGASYAQVMR Unmodified 1141.5008 0.5008482 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A0U1RQX0;A0A096LPH4;A0A096LPB7;A0A096LP96 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.292 36.292 2 0.0084486 31969 QUIQUE_C1576_190116_001 71.692 55.489 107600000 25411000 0 33536000 17082000 0 0 31568000 0 0 0 0 0 0 4865 330 4550 44554;44555;44556;44557;44558 56907;56908;56909;56910;56911 56911 5 CGDGAFLLTTTPR Unmodified 1407.6816 0.68164933 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 83.074 83.074 2 3.918E-05 84962 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.22 94.444 132660000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60213000 0 72447000 4866 3719 4551 44559;44560;44561;44562;44563 56912;56913;56914;56915;56916 56915 5 CGDLEEELK Unmodified 1091.4805 0.48048991 435;2791;3325 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yes 0 0 0 1 1 45.704 45.704 2 0.026319 43005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.69 53.985 178060000 0 0 0 0 98016000 0 0 80046000 0 0 0 0 0 4869 2596 4554 44576;44577 56929;56930 56930 2 CGDSVYAAEK Unmodified 1098.4652 0.4651742 3178 Q16527;F8VQR7;F8VW96 CSRP2 Cysteine and glycine-rich protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 19.245 19.245 2 0.0025891 11611 QUIQUE_C1277_190116_001 89.08 62.665 99500000 0 42450000 0 0 0 26932000 0 30117000 0 0 0 0 0 4870 3178 4555 44578;44579;44580 56931;56932;56933 56931 3 CGEDYKLHFIFR Unmodified 1583.7555 0.75548298 2269;1466 P27824;D6RGY2;D6RFL1;H0Y9H1;O14967 CANX;CLGN Calnexin;Calmegin no no 0 0 1 1 80.527 80.527 4 0.00019713 80818 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.014 68.541 25756000 0 0 0 0 0 0 0 25756000 0 0 0 0 0 4871 2269;1466 4556 44581 56934 56934 1 CGEEIAVQFVDMVK Unmodified 1623.7637 0.7636644 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YF78 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 2 2 3 4 1 2 2 3 144.28 144.28 2;3 7.3115E-07 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carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 155.49 155.49 2 3.2695E-09 160667 QUIQUE_C1218_190116_001 141.13 128.98 104430000 29104000 0 0 33987000 0 0 41339000 0 0 0 0 0 0 4877 2195 4561 44623;44624;44625 56986;56987;56988 56986 3 CGETGHVAINCSK Unmodified 1431.6235 0.62348253 2756 P62633 CNBP Cellular nucleic acid-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 2 14.667 14.667 2;3 6.3586E-10 6406 QUIQUE_DMIX8_190116_001 154.66 133.66 776340000 18838000 26300000 0 127580000 160820000 0 76738000 21845000 42472000 0 0 123170000 178570000 4878 2756 4562 44626;44627;44628;44629;44630;44631;44632;44633;44634;44635;44636;44637;44638 56989;56990;56991;56992;56993;56994;56995;56996;56997;56998;56999;57000;57001;57002;57003;57004 57004 15 CGFAGETGPR Unmodified 1050.4553 0.45527821 4337 Q9NZ32;V9GYX7;G3V2Q5;G3V5Y4;F6S9Y6;G3V524 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.01 25.01 2 0.0015491 18583 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.311 83.484 486710000 28938000 61864000 28723000 48379000 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168.18 168.18 3 3.0332E-75 174688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.8 151.69 826870000 47261000 80030000 97514000 47884000 77435000 45125000 82668000 45828000 84212000 0 66235000 94399000 58281000 4887 4418 4571 44690;44691;44692;44693;44694;44695;44696;44697;44698;44699;44700;44701;44702;44703 57062;57063;57064;57065;57066;57067;57068;57069;57070;57071;57072;57073;57074;57075;57076;57077;57078 57075 17 CGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEK Unmodified 3452.681 0.68098722 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 3 2 1 2 2 2 1 2 157.7 157.7 3;4 7.8239E-103 163282 QUIQUE_C1218_190116_001 173.98 163.92 17653000000 608040000 2546700000 2109500000 1547400000 1733700000 889170000 2019900000 824130000 424560000 643430000 1412500000 1140800000 1753500000 4888 854 4572 44704;44705;44706;44707;44708;44709;44710;44711;44712;44713;44714;44715;44716;44717;44718;44719;44720;44721;44722;44723;44724;44725 57079;57080;57081;57082;57083;57084;57085;57086;57087;57088;57089;57090;57091;57092;57093;57094;57095;57096;57097;57098;57099;57100;57101;57102;57103;57104;57105;57106;57107;57108 57079 29 CGLLPISPEALSLGEVAYHDYHGILVDEEEKVLIQK Unmodified 4034.0711 0.071069623 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 1 1 1 1 162.17 162.17 5 3.8204E-54 166341 QUIQUE_DMIX7_190116_001 104.31 96.441 392580000 0 0 0 0 0 0 0 126730000 49989000 0 0 215870000 0 4889 854 4573 44726;44727;44728 57109;57110;57111 57111 3 CGLQFLGNIASR Unmodified 1334.6765 0.67650438 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.58 103.58 2 7.4889E-13 105880 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.79 138.49 481360000 57856000 74320000 69554000 0 0 56629000 0 83636000 82094000 0 0 57272000 0 4890 4392 4574 44729;44730;44731;44732;44733;44734;44735 57112;57113;57114;57115;57116;57117;57118;57119;57120;57121;57122 57118 10 CGLVLSWK Unmodified 961.50552 0.50552287 2543 P49756;E9PQU5;E9PSE8 RBM25 RNA-binding protein 25 yes no 0 0 0 1 1 87.365 87.365 2 0.031416 89397 QUIQUE_C1218_190116_001 66.073 44.526 11719000 11719000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4891 2543 4575 44736;44737 57123;57124 57123 2 CGMTTVLTLTGVSR Unmodified 1494.7534 0.75343407 3859 Q96GD0;Q6ZT62;B1AHD3 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.53 107.53 2 4.1562E-05 109848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.86 96.65 558190000 100180000 129800000 0 75738000 0 84055000 90459000 77958000 0 0 0 0 0 4892 3859 4576 44738;44739;44740;44741;44742;44743 57125;57126;57127;57128;57129;57130;57131;57132;57133 57133 8 CGMTTVLTLTGVSR Oxidation (M) 1510.7483 0.74834869 3859 Q96GD0;Q6ZT62;B1AHD3 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes no 0 1 0 1 1 1 80.68 80.68 2 0.0046804 82799 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.062 62.764 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4893 3859 4576 44744;44745;44746 57134;57135;57136 57136 2752 3 CGNCGEISDKWQYIR Unmodified 1884.8247 0.82470153 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 1 1 69.158 69.158 3 0.0088674 68304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.675 58.094 42810000 0 0 0 0 0 0 0 42810000 0 0 0 0 0 4894 4315 4577 44747 57137 57137 0 CGNCGPGYSTPLEAMK Unmodified 1740.727 0.72696132 2978 Q13228;A6PVX1;H0Y532;F2Z2W8;F8WCR4;F8WBA9 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 70.015 70.015 2 6.0913E-07 71049 QUIQUE_C1438_190116_001 114.72 108.06 263370000 0 33913000 49780000 45511000 28881000 35288000 37110000 0 0 0 0 0 32890000 4895 2978 4578 44748;44749;44750;44751;44752;44753;44754 57138;57139;57140;57141;57142;57143;57144 57141 7 CGNIASIMVFK Unmodified 1238.6151 0.61514967 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.52 101.52 2 0.0011688 106172 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.029 76.793 233190000 0 0 0 38487000 28564000 0 0 0 32160000 0 45944000 40196000 47843000 4896 1421 4579 44755;44756;44757;44758;44759;44760;44761;44762;44763 57145;57146;57147;57148;57149;57150;57151;57152;57153 57151 9 CGNQAAIMELDDTLK Unmodified 1677.7702 0.77020634 2758;2789 P62714;H0YC23;H0YBN9;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 99.212 99.212 2 1.7387E-06 101919 QUIQUE_C1277_190116_001 147.26 130.63 1663200000 205760000 287270000 263280000 252940000 0 0 250070000 0 95558000 0 0 171180000 137170000 4897 2758;2789 4580 44764;44765;44766;44767;44768;44769;44770;44771 57154;57155;57156;57157;57158;57159;57160;57161;57162 57155 9 CGNVAAILELDEHLQK Unmodified 1808.9091 0.90908309 2693 P60510;H3BTA2 PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 102.04 102.04 3 0.05004 104894 QUIQUE_C1277_190116_001 15.78 5.5835 19151000 0 19151000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4898 2693 4581 44772 57163 57163 1 CGNVNFAR Unmodified 936.42358 0.42358415 1714 O95218 ZRANB2 Zinc finger Ran-binding domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 21.253 21.253 2 0.045115 14652 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.21 84.507 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4899 1714 4582 44773 57164 57164 1 CGPASVQAIK Unmodified 1029.5277 0.52771487 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 0 1 1 25.095 25.095 2 0.035995 18414 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.157 46.7 23898000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23898000 0 0 0 4900 1785 4583 44774;44775 57165;57166 57165 1 CGPLIDLCR Unmodified 1102.5263 0.52633467 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.843 71.843 2 0.0068239 72337 QUIQUE_C1277_190116_001 83.313 64.219 199750000 0 52183000 0 0 23397000 21819000 33767000 0 0 0 18053000 25416000 25115000 4901 2253 4584 44776;44777;44778;44779;44780;44781;44782;44783;44784 57167;57168;57169;57170;57171;57172;57173;57174;57175 57167 9 CGPMVLDALIK Unmodified 1215.6356 0.63555076 2187 P21912;A0A087WWT1 SDHB Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.64 113.64 2 0.0009083 116514 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.111 69.682 1323600000 123430000 156860000 147140000 110800000 87811000 93898000 119770000 86181000 104170000 0 175280000 0 118300000 4902 2187 4585 44785;44786;44787;44788;44789;44790;44791;44792;44793;44794;44795;44796 57176;57177;57178;57179;57180;57181;57182;57183;57184;57185;57186;57187;57188 57184 11 CGSGIVGAVVK Unmodified 1045.559 0.559015 76 A0A2U3TZH4;A0A087WYF8;Q53GG5 PDLIM3 PDZ and LIM domain protein 3 yes no 0 0 0 1 45.25 45.25 2 0.03983 42006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.756 36.517 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4903 76 4586 44797 57189 57189 1 CGSLGNIHHKPGGGQVEVK Unmodified 1972.9901 0.99012738 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 1 2 3 2 3 2 2 2 3 3 2 3 3 2 15.258 15.258 2;3;4 3.5885E-73 8224 QUIQUE_DMIX1_190116_001 218.4 146.84 16328000000 738550000 895720000 804460000 2415600000 946520000 401410000 853810000 2401600000 1887600000 387760000 932610000 3214300000 447720000 4904 291;1247 4587 44798;44799;44800;44801;44802;44803;44804;44805;44806;44807;44808;44809;44810;44811;44812;44813;44814;44815;44816;44817;44818;44819;44820;44821;44822;44823;44824;44825;44826;44827;44828;44829 57190;57191;57192;57193;57194;57195;57196;57197;57198;57199;57200;57201;57202;57203;57204;57205;57206;57207;57208;57209;57210;57211;57212;57213;57214;57215;57216;57217;57218;57219;57220;57221;57222 57209 32 CGTTGVVTFIR Unmodified 1209.6176 0.61759251 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.853 69.853 2 0.00065025 70070 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.65 90.75 881810000 105130000 0 98326000 98714000 0 97612000 103280000 87873000 0 27164000 102450000 92386000 68876000 4905 3722 4588 44830;44831;44832;44833;44834;44835;44836;44837;44838;44839;44840;44841 57223;57224;57225;57226;57227;57228;57229;57230;57231;57232;57233;57234;57235;57236 57233 14 CGVALSTPGGAR Unmodified 1144.5659 0.56589129 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 33.679 33.679 2 0.01104 28636 QUIQUE_C1403_190116_001 59.426 8.953 67469000 0 0 0 67469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4906 725 4589 44842 57237 57237 1 CGVPFTDLLDAAK Unmodified 1405.6912 0.69115139 2854 Q01433;H0Y360 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 2 129.39 129.39 2 0.0079164 132275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.595 50.589 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4907 2854 4590 44843;44844 57238;57239 57239 2 CGWLDLVLLK Unmodified 1215.6686 0.66856545 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.12 158.12 2 0.0039997 163014 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.502 70.683 115710000 0 17350000 9477400 16385000 13111000 0 0 10258000 11496000 6292700 13824000 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45028;45029;45030;45031;45032;45033;45034;45035;45036;45037;45038;45039;45040;45041;45042;45043;45044;45045;45046;45047;45048;45049;45050;45051;45052;45053;45054;45055;45056;45057;45058 57453;57454;57455;57456;57457;57458;57459;57460;57461;57462;57463;57464;57465;57466;57467;57468;57469;57470;57471;57472;57473;57474;57475;57476;57477;57478;57479;57480;57481;57482;57483;57484;57485;57486;57487;57488;57489;57490;57491;57492;57493;57494;57495 57454 38 CIAYPFNAK Unmodified 1082.5219 0.52190122 4494;981 F1T0E5;C9IYE1;A0A087X1P3;Q86UW7;Q9ULU8 CADPS;CADPS2 Calcium-dependent secretion activator 2;Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 61.573 61.573 2 0.027289 60954 QUIQUE_C1277_190116_001 68.7 46.569 198650000 43495000 42269000 45306000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67576000 4928 981;4494 4611 45059;45060;45061;45062 57496;57497;57498;57499 57497 4 CICSQLSLTTK Unmodified 1309.637 0.63700733 2941 Q12765;C9K052 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 57.891 57.891 2 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Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.273 83.273 2 0.00052034 85747 QUIQUE_C1218_190116_001 96.009 82.889 1431500000 75710000 87904000 275530000 156410000 119440000 120400000 150860000 89384000 0 0 0 179800000 176020000 4931 3181 4614 45087;45088;45089;45090;45091;45092;45093;45094;45095;45096;45097 57529;57530;57531;57532;57533;57534;57535;57536;57537;57538;57539;57540 57529 8 CIEECVEPWNGSWNDNLVDTSPLK Unmodified 2861.2636 0.2636442 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 142.95 142.95 3 3.1464E-06 147159 QUIQUE_C1277_190116_001 56.681 53.8 78350000 0 39541000 0 38810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4932 3390 4615 45098;45099;45100 57541;57542;57543 57542 3 CIELCCGSVK Unmodified 1224.5301 0.53009941 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 42.634 42.634 2 0.013818 38746 QUIQUE_C1368_190116_001 64.711 44.505 183020000 0 0 33327000 0 0 0 42998000 32321000 0 0 0 27651000 46725000 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45118;45119;45120;45121;45122;45123;45124;45125 57563;57564;57565;57566;57567;57568;57569;57570;57571;57572;57573 57569 11 CIESLIAVFQK Unmodified 1306.6955 0.69550848 2344 P31949 S100A11 Protein S100-A11;Protein S100-A11, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.67 129.67 2 0.0003229 127027 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.75 110.19 1178700000 0 115650000 177120000 95278000 106370000 57690000 93011000 0 89325000 60541000 162410000 100030000 121280000 4936 2344 4619 45126;45127;45128;45129;45130;45131;45132;45133;45134;45135;45136 57574;57575;57576;57577;57578;57579;57580;57581;57582;57583;57584;57585;57586 57583 9 CIEVMGDGCLNNEHFEELGGILK Unmodified 2633.1924 0.19239352 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 130.66 130.66 3 0.025988 134273 QUIQUE_C1403_190116_001 26.13 18.327 76976000 0 0 0 76976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4937 1403 4620 45137 57587 57587 1 CIFYDTEHLK Unmodified 1324.6122 0.61217279 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 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57594;57595;57596;57597;57598;57599;57600;57601;57602;57603;57604;57605;57606;57607;57608;57609;57610;57611;57612;57613;57614;57615;57616;57617;57618;57619;57620;57621;57622;57623;57624;57625;57626;57627;57628;57629;57630;57631;57632;57633;57634;57635;57636;57637;57638;57639;57640;57641;57642;57643;57644;57645;57646;57647;57648;57649;57650;57651;57652;57653;57654;57655;57656;57657;57658;57659;57660;57661;57662 57594 64 CIGGVIFFHETLYQKDDNGVPFVR Unmodified 2810.385 0.38502039 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 3 125.84 125.84 3;4 4.6046E-18 128799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.54 102.69 258960000 0 0 0 0 0 0 0 258960000 0 0 0 0 0 4940 1978 4623 45189;45190;45191 57663;57664;57665 57664 3 CIHKPTSQEYAVK Unmodified 1559.7766 0.77661235 1026 F6VCX5;Q16816;F8WD25 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 15.175 15.175 3 3.2953E-05 6447 QUIQUE_C1563_190116_001 94.023 74.181 200260000 0 0 0 39153000 0 0 33643000 29561000 36696000 0 28303000 0 32899000 4941 1026 4624 45192;45193;45194;45195;45196;45197;45198 57666;57667;57668;57669;57670;57671;57672 57667 7 CIIEVLSNALSK Unmodified 1345.7275 0.72753689 1874 P05060;A0A0A0MT66 CHGB Secretogranin-1;PE-11;GAWK peptide;CCB peptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.37 130.37 2 0.0023187 135090 QUIQUE_C1368_190116_001 75.652 35.585 215970000 40932000 36468000 22226000 0 19603000 31750000 30776000 0 0 0 34218000 0 0 4942 1874 4625 45199;45200;45201;45202;45203;45204;45205;45206 57673;57674;57675;57676;57677;57678;57679;57680 57675 6 CIIHLHTPATAAVSAMK Unmodified 1819.9437 0.94369446 2382 P35612;C9JTM0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 3 1 1 2 1 60.563 60.563 2;3;4 4.6597E-45 60904 QUIQUE_C1218_190116_001 178.71 155.04 1418500000 124880000 211370000 157420000 136860000 126800000 160740000 166800000 60567000 65268000 0 122870000 84907000 0 4943 2382 4626 45207;45208;45209;45210;45211;45212;45213;45214;45215;45216;45217;45218;45219;45220;45221;45222;45223;45224;45225;45226;45227 57681;57682;57683;57684;57685;57686;57687;57688;57689;57690;57691;57692;57693;57694;57695;57696;57697;57698;57699;57700;57701;57702;57703;57704;57705 57682 21 CIIPNHEK Unmodified 1009.5015 0.50150012 2378;2379;2385 P35579;P35749;P35580 MYH9;MYH11;MYH10 Myosin-9;Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 1 16.209 16.209 2 0.058803 8173 QUIQUE_C1277_190116_001 69.176 22.512 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4944 2378;2385;2379 4627 45228 57706 57706 1 CIIPSVIK Unmodified 928.54157 0.54157402 4337 Q9NZ32;V9GYX7;G3V2Q5;G3V5Y4;F6S9Y6;G3V524 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 75.061 75.061 2 0.02842 74766 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 49.15 15882000 0 0 0 0 0 0 0 15882000 0 0 0 0 0 4945 4337 4628 45229;45230;45231 57707;57708;57709 57708 3 CIIVEEGK Unmodified 946.47937 0.4793677 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.361 28.361 2 0.0036146 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Unmodified 1673.8294 0.82943578 3791 Q969Z3 MARC2 Mitochondrial amidoxime reducing component 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 96.935 96.935 2 0.00013614 100687 QUIQUE_C1218_190116_001 88.441 63.586 418250000 71413000 90301000 62139000 0 0 61003000 0 0 0 0 80702000 0 52697000 4952 3791 4635 45261;45262;45263;45264;45265;45266 57741;57742;57743;57744;57745;57746 57741 4 CILVITWIQHLIPK Unmodified 1733.0062 0.0062183574 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70;H0YKU2 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 164.92 164.92 3 6.487E-05 172003 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.105 87.46 188030000 0 0 0 14260000 0 0 0 31818000 0 6456600 101380000 21626000 12490000 4953 114 4636 45267;45268;45269;45270;45271;45272;45273 57747;57748;57749;57750;57751;57752;57753 57751 6 CIMFLEGHLK Unmodified 1246.6202 0.62023505 1512 O43172 PRPF4 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 yes yes 0 0 0 1 76.488 76.488 3 0.01146 77122 QUIQUE_C1277_190116_001 51.445 28.884 8144800 0 8144800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4954 1512 4637 45274 57754 57754 1 CIPALDSLTPANEDQK Unmodified 1770.8458 0.84581413 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 90.637 90.637 2 2.8456E-19 92281 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.53 161.8 4637500000 316470000 387490000 628350000 278930000 267600000 480300000 517390000 328720000 244050000 186490000 325750000 403120000 272890000 4955 2004 4638 45275;45276;45277;45278;45279;45280;45281;45282;45283;45284;45285;45286;45287;45288;45289;45290;45291 57755;57756;57757;57758;57759;57760;57761;57762;57763;57764;57765;57766;57767;57768;57769;57770;57771;57772;57773;57774;57775;57776;57777;57778;57779;57780;57781;57782 57770 28 CIPYAVLLEALALR Unmodified 1600.9011 0.90108458 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248;F5H4U8 COPS7A COP9 signalosome complex subunit 7a yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 167.49 167.49 2;3 1.3823E-22 171958 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.98 106.34 1717300000 26819000 21152000 335390000 97727000 116950000 0 123280000 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57812 5 CISEVQANNVVLGQYVGNPDGEGEATK Unmodified 2847.3345 0.33450096 2024 P11413;E7EUI8 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 105.05 105.05 3 9.3013E-16 107211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.435 78.262 138560000 0 0 47770000 0 0 41360000 0 49432000 0 0 0 0 0 4959 2024 4642 45324;45325;45326 57815;57816;57817 57817 2 CITDPQTGLCLLPLK Unmodified 1727.895 0.89501293 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 139.69 139.69 2 9.0359E-24 131031 QUIQUE_DMIX8_190116_001 151.15 126.8 4527600000 325810000 407290000 496590000 164720000 358490000 260980000 479400000 283770000 264080000 266470000 410790000 389500000 419710000 4960 3117 4643 45327;45328;45329;45330;45331;45332;45333;45334;45335;45336;45337;45338;45339;45340;45341;45342;45343;45344;45345;45346;45347 57818;57819;57820;57821;57822;57823;57824;57825;57826;57827;57828;57829;57830;57831;57832;57833;57834;57835;57836;57837;57838;57839;57840;57841;57842;57843;57844;57845;57846;57847;57848 57848 31 CIVNNVSAETVQTVR Unmodified 1688.8516 0.85156821 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.693 69.693 2 1.5516E-12 66356 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.37 87.857 76695000 0 0 0 0 0 0 0 26107000 0 13812000 0 0 36776000 4961 3565 4644 45348;45349;45350;45351;45352;45353 57849;57850;57851;57852;57853;57854 57853 6 CIVYYKEPFWR Unmodified 1559.7595 0.75950572 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 90.203 90.203 2;3 0.00076318 92008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.1 123.42 365460000 0 0 0 0 0 0 0 154920000 54369000 0 66086000 51139000 38938000 4962 2261 4645 45354;45355;45356;45357;45358;45359 57855;57856;57857;57858;57859;57860;57861 57855 7 CIWLNSQFR Unmodified 1222.5917 0.59171211 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 89.454 89.454 2 0.041258 91971 QUIQUE_C1576_190116_001 53.166 32.837 17440000 0 0 0 0 0 0 17440000 0 0 0 0 0 0 4963 3778 4646 45360;45361 57862;57863 57863 2 CIYNLLQSSSPAVK Unmodified 1578.8076 0.80757813 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.585 94.585 2 9.3401E-05 98201 QUIQUE_C1218_190116_001 138.25 111.13 270060000 37676000 52349000 31474000 35595000 0 0 26681000 36435000 0 0 0 49853000 0 4964 2629 4647 45362;45363;45364;45365;45366;45367;45368 57864;57865;57866;57867;57868;57869;57870 57864 7 CIYNTAGFYCDR Unmodified 1538.6282 0.62823356 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.408 78.408 2 0.00052207 80257 QUIQUE_C1218_190116_001 96.665 89.459 353600000 23333000 45329000 34683000 22903000 52171000 0 28549000 38240000 39227000 10035000 33197000 25931000 0 4965 2008 4648 45369;45370;45371;45372;45373;45374;45375;45376;45377;45378;45379;45380 57871;57872;57873;57874;57875;57876;57877;57878;57879;57880;57881;57882;57883 57871 13 CKAEHDQLLLNYAK Unmodified 1701.8508 0.85083993 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 1 1 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57887;57888;57889;57890;57891;57892;57893;57894;57895;57896;57897;57898;57899;57900;57901;57902;57903;57904;57905;57906;57907;57908;57909;57910;57911;57912;57913;57914;57915;57916;57917;57918;57919;57920;57921;57922;57923;57924;57925;57926;57927;57928;57929;57930;57931;57932;57933;57934;57935;57936;57937;57938;57939;57940;57941;57942;57943;57944;57945 57908 58 CKDGVVFGVEK Unmodified 1236.6173 0.61725816 2245 P25788 PSMA3 Proteasome subunit alpha type-3 yes yes 0 0 1 1 32.717 32.717 2 0.0031346 27967 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.29 85.032 44100000 0 0 0 0 0 0 0 44100000 0 0 0 0 0 4968 2245 4651 45417 57946 57946 1 CKDISSALR Unmodified 1048.5335 0.53352853 2055 P13489;E9PIM9;E9PMJ3;E9PLZ3;E9PIK5;E9PMN0;E9PMA9 RNH1 Ribonuclease inhibitor yes no 0 0 1 1 1 1 1 19.736 19.736 3 0.0059793 12490 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.157 48.617 227510000 0 0 0 0 0 0 0 78722000 0 0 61765000 40473000 46555000 4969 2055 4652 45418;45419;45420;45421 57947;57948;57949;57950 57948 4 CKDVLTGQEFDVR Unmodified 1565.7508 0.75079153 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 61.462 61.462 2;3 6.4555E-06 60134 QUIQUE_C1403_190116_001 130.1 116.98 590420000 35485000 56673000 47018000 146580000 0 0 94624000 96054000 0 7069000 0 0 106920000 4970 2463 4653 45422;45423;45424;45425;45426;45427;45428;45429;45430;45431;45432;45433 57951;57952;57953;57954;57955;57956;57957;57958;57959;57960;57961;57962;57963 57955 13 CKEENTIILQQLLPLR Unmodified 1967.0874 0.087381804 4078 Q9BYT8;E9PCB6 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 123.12 123.12 3 0.008724 126902 QUIQUE_C1277_190116_001 48.405 40.32 34515000 0 20893000 0 13622000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4971 4078 4654 45434;45435 57964;57965 57964 1 CKLEEMGFK Oxidation (M) 1156.5257 0.52566596 820;594 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 1 1 1 1 1 1 20.293 20.293 3 0.015452 13001 QUIQUE_C1563_190116_001 66.568 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57974;57975;57976;57977;57978;57979;57980;57981;57982;57983;57984;57985 57976 11 CLAAALIVLTESGR Unmodified 1472.8021 0.80209882 1203 H3BTN5 PKM Pyruvate kinase no no 0 0 0 6 7 5 4 4 5 4 5 6 3 5 9 4 146.31 146.31 2;3 6.122E-19 134018 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.54 111.28 13502000000 1244600000 1354300000 1203800000 948000000 998920000 934500000 1265000000 1008900000 885180000 465960000 895710000 1295000000 1001900000 4975 1203 4657 45456;45457;45458;45459;45460;45461;45462;45463;45464;45465;45466;45467;45468;45469;45470;45471;45472;45473;45474;45475;45476;45477;45478;45479;45480;45481;45482;45483;45484;45485;45486;45487;45488;45489;45490;45491;45492;45493;45494;45495;45496;45497;45498;45499;45500;45501;45502;45503;45504;45505;45506;45507;45508;45509;45510;45511;45512;45513;45514;45515;45516;45517;45518;45519;45520;45521;45522 57986;57987;57988;57989;57990;57991;57992;57993;57994;57995;57996;57997;57998;57999;58000;58001;58002;58003;58004;58005;58006;58007;58008;58009;58010;58011;58012;58013;58014;58015;58016;58017;58018;58019;58020;58021;58022;58023;58024;58025;58026;58027;58028;58029;58030;58031;58032;58033;58034;58035;58036;58037;58038;58039;58040;58041;58042;58043;58044;58045;58046;58047;58048;58049;58050;58051;58052;58053;58054;58055;58056;58057;58058;58059;58060;58061;58062;58063;58064;58065;58066;58067;58068;58069;58070;58071;58072;58073;58074;58075;58076;58077;58078;58079;58080;58081;58082;58083;58084;58085;58086;58087;58088;58089;58090;58091;58092;58093;58094;58095;58096;58097;58098;58099;58100;58101;58102;58103;58104;58105;58106;58107;58108;58109;58110;58111;58112;58113 58079 127 CLAAEDVVFIGPDTHAIQAMGDK Unmodified 2457.1668 0.16683069 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 121.1 121.1 3 8.8243E-05 126180 QUIQUE_C1218_190116_001 51.645 47.568 144010000 76301000 0 0 67707000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4976 1881 4658 45523;45524 58114;58115;58116 58115 3 CLAALTECAASGDGNILALAVDASR Unmodified 2518.2156 0.2155718 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 154.78 154.78 3 0.0024527 159568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.546 20.932 179520000 0 0 43912000 0 0 30690000 0 24778000 43528000 0 0 36617000 0 4977 2191 4659 45525;45526;45527;45528;45529 58117;58118;58119;58120;58121 58120 4 CLAENAVYLCDR Unmodified 1482.6595 0.65953368 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 70.954 70.954 2 0.012799 71557 QUIQUE_C1368_190116_001 72.2 54.381 17706000 0 0 17706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4978 1414;3777 4660 45530 58122 58122 0 CLAENSLGSAR Unmodified 1176.5557 0.55572054 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.043 30.043 2 0.0027056 24470 QUIQUE_C1277_190116_001 97.857 46.003 707420000 108470000 128560000 123430000 0 0 70852000 0 0 0 37429000 60542000 86609000 91536000 4979 2345 4661 45531;45532;45533;45534;45535;45536;45537;45538 58123;58124;58125;58126;58127;58128;58129;58130 58124 3 CLAFHDISPQAPTHFLVIPK Unmodified 2290.1932 0.19324386 2546 P49773;D6REP8;D6RE99;D6RD60 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes no 0 0 0 3 3 2 2 3 2 3 2 3 2 3 3 3 108.74 108.74 2;3;4 8.9307E-47 111953 QUIQUE_C1277_190116_001 198.78 169.44 17299000000 1640800000 1797900000 1416700000 1141300000 1550000000 953460000 1465200000 899980000 1203900000 389440000 1596500000 1551300000 1692800000 4980 2546 4662 45539;45540;45541;45542;45543;45544;45545;45546;45547;45548;45549;45550;45551;45552;45553;45554;45555;45556;45557;45558;45559;45560;45561;45562;45563;45564;45565;45566;45567;45568;45569;45570;45571;45572 58131;58132;58133;58134;58135;58136;58137;58138;58139;58140;58141;58142;58143;58144;58145;58146;58147;58148;58149;58150;58151;58152;58153;58154;58155;58156;58157;58158;58159;58160;58161;58162;58163;58164;58165;58166;58167;58168;58169;58170;58171;58172;58173;58174;58175;58176;58177;58178;58179;58180;58181;58182;58183;58184;58185;58186;58187 58140 57 CLAMDVQAFER Unmodified 1338.606 0.60604155 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.939 95.939 2 0.0029289 98289 QUIQUE_C1403_190116_001 75.294 51.865 546540000 91789000 89492000 72586000 77553000 57440000 0 80083000 0 0 0 77597000 0 0 4981 2331 4663 45573;45574;45575;45576;45577;45578;45579 58188;58189;58190;58191;58192;58193;58194 58191 6 CLAPLEGAR Unmodified 985.5015 0.50150012 1858 P04217 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes yes 0 0 0 1 38.557 38.557 2 0.025868 35160 QUIQUE_C1438_190116_001 58.981 30.468 49526000 0 0 0 0 49526000 0 0 0 0 0 0 0 0 4982 1858 4664 45580 58195 58195 1 CLAPMMSEVIR Unmodified 1305.6243 0.62433415 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 95.695 95.695 2 0.0060595 98599 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.95 55.567 257920000 0 0 92635000 0 57487000 0 0 0 43565000 0 0 0 64237000 4983 1153 4665 45581;45582;45583;45584;45585;45586;45587;45588 58196;58197;58198;58199;58200;58201;58202;58203 58201 8 CLATGPGIASTVK Unmodified 1273.67 0.67002202 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 47.597 47.597 2 0.0045039 45230 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.488 51.246 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4984 1628 4666 45589;45590;45591;45592;45593;45594;45595;45596 58204;58205;58206;58207;58208;58209;58210;58211 58207 8 CLAYDFYPGK Unmodified 1232.5536 0.55359527 2237 P25311 AZGP1 Zinc-alpha-2-glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 87.727 87.727 2 0.0097252 90996 QUIQUE_C1438_190116_001 69.825 60.467 51853000 0 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Unmodified 1694.845 0.84502627 1965 P09488;E7EWW9 GSTM1 Glutathione S-transferase Mu 1 yes no 0 0 1 2 2 129.32 129.32 2;3 1.9679E-10 132591 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.96 107.99 1031900000 0 0 0 0 0 0 0 744950000 286950000 0 0 0 0 4990 1965 4672 45646;45647;45648;45649 58274;58275;58276;58277;58278;58279 58276 6 CLDAISSLLYLPPEQQTDDLLR Unmodified 2559.2891 0.28905432 3177 Q16401;Q4VXH0 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 163.57 163.57 3 3.3301E-09 157613 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.231 80.926 27041000 0 0 0 18441000 0 0 0 0 0 8600500 0 0 0 4991 3177 4673 45650;45651 58280;58281 58281 2 CLDAVVSTR Unmodified 1019.507 0.50697943 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 37.885 37.885 2 0.008597 32089 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.334 55.186 97212000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97212000 0 0 0 4992 3499 4674 45652 58282 58282 1 CLDEFPNLK Unmodified 1134.5379 0.53794521 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.908 77.908 2 5.3319E-10 78394 QUIQUE_DMIX3_190116_001 207.6 138.82 11578000000 520260000 785350000 737650000 609690000 894050000 1003700000 775450000 1723300000 995120000 596960000 820170000 1154800000 961560000 4993 2174 4675 45653;45654;45655;45656;45657;45658;45659;45660;45661;45662;45663;45664;45665 58283;58284;58285;58286;58287;58288;58289;58290;58291;58292;58293;58294;58295;58296;58297;58298;58299;58300;58301;58302;58303;58304;58305;58306;58307;58308;58309;58310;58311;58312 58303 30 CLDPVPHPINFGGPHNFVQVPGFPR Unmodified 2797.3911 0.39110882 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 123.25 123.25 4 0.042625 129431 QUIQUE_C1438_190116_001 20.757 13.302 52821000 0 0 0 0 52821000 0 0 0 0 0 0 0 0 4994 2807 4676 45666 58313 58313 1 CLDQQCELR Unmodified 1220.5278 0.52779123 17 A0A075B7B5;B7ZM87;O75044;A0A286YEY3;P0DMP2;P0DJJ0;A0A075B7C8;A0A075B743 SRGAP2;SRGAP2B;SRGAP2C SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2;SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B;SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.145 29.145 2 0.013527 23063 QUIQUE_C1563_190116_001 69.812 51.5 83741000 24614000 36732000 0 0 0 22395000 0 0 0 0 0 0 0 4995 17 4677 45667;45668;45669;45670;45671;45672 58314;58315;58316;58317;58318;58319 58318 6 CLDYVLEELK Unmodified 1280.6322 0.63223953 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 114.86 114.86 2 0.0017727 118876 QUIQUE_C1368_190116_001 93.649 63.482 138490000 0 0 85610000 52884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4996 62 4678 45673;45674 58320;58321 58320 2 CLDYVLEELKHNAK Unmodified 1730.8662 0.86615564 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 86.228 86.228 4 0.022281 87011 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.793 28.263 16502000 0 0 0 0 0 0 0 16502000 0 0 0 0 0 4997 62 4679 45675 58322 58322 1 CLEEFELLGK Unmodified 1236.606 0.60602477 645 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58378;58379;58380;58381;58382;58383;58384;58385;58386;58387;58388;58389;58390 58381 13 CLELFSELAEDK Unmodified 1452.6806 0.68064628 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 0 1 126.05 126.05 2 0.040344 130674 QUIQUE_C1218_190116_001 64.103 25.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5007 1938 4689 45735 58391 58391 1 CLELFSELAEDKENYK Unmodified 1986.9245 0.92445838 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 109.5 109.5 2;3 2.1269E-62 113743 QUIQUE_C1576_190116_001 229.54 190.91 2160000000 181000000 294970000 215530000 228080000 241500000 247530000 215250000 57067000 87195000 79556000 125600000 100390000 86299000 5008 1938 4690 45736;45737;45738;45739;45740;45741;45742;45743;45744;45745;45746;45747;45748;45749;45750;45751;45752;45753;45754;45755 58392;58393;58394;58395;58396;58397;58398;58399;58400;58401;58402;58403;58404;58405;58406;58407;58408;58409;58410;58411;58412;58413;58414;58415;58416 58409 23 CLELFSELAEDKENYKK Unmodified 2115.0194 0.019421398 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 2 1 2 2 3 3 2 3 2 3 2 3 3 3 89.287 89.287 2;3;4 1.7327E-28 91960 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.93 157.01 5961100000 184950000 587980000 315500000 396380000 416600000 343160000 491160000 556690000 500080000 227400000 661830000 667320000 612040000 5009 1938 4691 45756;45757;45758;45759;45760;45761;45762;45763;45764;45765;45766;45767;45768;45769;45770;45771;45772;45773;45774;45775;45776;45777;45778;45779;45780;45781;45782;45783;45784;45785;45786;45787 58417;58418;58419;58420;58421;58422;58423;58424;58425;58426;58427;58428;58429;58430;58431;58432;58433;58434;58435;58436;58437;58438;58439;58440;58441;58442;58443;58444;58445;58446;58447;58448;58449;58450 58443 28 CLELFTELAEDK Unmodified 1466.6963 0.69629635 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.08 129.08 2 0.00023168 125889 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.67 73.364 234940000 46870000 48394000 39663000 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2;PAK-2p27;PAK-2p34 no no 0 1 1 1 17.878 17.878 3 0.0068167 10380 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.823 57.098 20289000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20289000 0 0 5016 2970;2974 4697 45860 58547 58547 2429 1 CLEQAALVNYSR Unmodified 1422.6925 0.69254837 4494;981;1236 F1T0E5;Q9ULU8;H7C4T6 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 68.424 68.424 2 0.012658 68884 QUIQUE_C1576_190116_001 57.532 44.44 187780000 0 0 92955000 0 0 0 94821000 0 0 0 0 0 0 5017 981;4494;1236 4698 45861;45862 58548;58549 58549 2 CLEVLQASDNAIESLDGVTNLPR Unmodified 2513.2432 0.24316676 3750 Q92696;H0YLG7;H0YMG5 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 152.95 152.95 3 6.8424E-05 157677 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.909 45.212 48722000 0 0 0 29350000 0 0 0 0 0 0 0 0 19371000 5018 3750 4699 45863;45864;45865 58550;58551;58552 58552 3 CLFAMPETAIGLFPDVGGGYFLPR Oxidation (M) 2643.2866 0.2865519 3373 Q6NVY1;B8ZZZ0 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 1 1 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CLHMFLQEEAIDR Unmodified 1660.7701 0.77014677 95 A0A087X0R6;Q9UMY4 SNX12 Sorting nexin-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.505 82.505 3 0.00037269 83977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.871 63.617 273360000 0 56773000 24953000 48566000 0 0 0 40469000 41463000 0 0 25917000 35218000 5030 95 4710 45930;45931;45932;45933;45934;45935;45936 58623;58624;58625;58626;58627;58628;58629 58627 3 CLHPCVISR Unmodified 1140.5532 0.55321812 1949;587 P08603;B1AKG0;Q03591 CFH;CFHR1 Complement factor H;Complement factor H-related protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 20.955 20.955 3 0.016033 14241 QUIQUE_C1438_190116_001 44.318 11.997 68050000 0 0 0 0 28829000 0 0 0 0 0 18512000 0 20709000 5031 1949;587 4711 45937;45938;45939 58630;58631;58632 58630 3 CLHPLANETFVAK Unmodified 1498.7602 0.76023401 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0;A0A0D9SG53 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 49.433 49.433 2;3 2.9826E-13 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58897;58898;58899;58900;58901;58902;58903;58904;58905;58906;58907;58908;58909;58910;58911;58912;58913;58914;58915;58916;58917;58918;58919;58920;58921;58922;58923;58924 58903 25 CLVDASDTSQGR Unmodified 1307.5776 0.57757819 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 31.182 31.182 2 0.010781 26184 QUIQUE_C1576_190116_001 80.706 53.591 48933000 22707000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26225000 5061 3402 4741 46186;46187;46188 58925;58926;58927 58926 3 CLVFSLIGLHFK Unmodified 1432.7901 0.79007757 3798 Q96A72 MAGOHB Protein mago nashi homolog 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.26 137.26 3 0.00036867 142560 QUIQUE_C1576_190116_001 82.494 78.704 131030000 10233000 23213000 0 8004300 0 0 33783000 21207000 25771000 8814500 0 0 0 5062 3798 4742 46189;46190;46191;46192;46193;46194;46195;46196;46197 58928;58929;58930;58931;58932;58933;58934;58935;58936 58932 9 CLVGEFVSDALLVPDK Unmodified 1760.9019 0.90187244 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067;H7C0V9 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 150.08 150.08 2 1.615E-05 154496 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.39 76.535 279510000 0 39021000 0 0 54429000 33682000 64781000 28949000 0 12091000 0 46559000 0 5063 147 4743 46198;46199;46200;46201;46202;46203;46204 58937;58938;58939;58940;58941;58942;58943 58943 7 CLVLTGFGGYDK Unmodified 1328.6435 0.64347291 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.57 98.57 2 0.00050608 96432 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.75 107.88 3367400000 273240000 383900000 319550000 353960000 308220000 232790000 0 259360000 248750000 117460000 239390000 292110000 338680000 5064 3958 4744 46205;46206;46207;46208;46209;46210;46211;46212;46213;46214;46215;46216 58944;58945;58946;58947;58948;58949;58950;58951;58952;58953;58954;58955;58956;58957 58954 12 CLVMDVQAFER Unmodified 1366.6373 0.63734168 2069 P13861;H7C330 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.56 106.56 2 0.00019842 111268 QUIQUE_DMIX5_190116_001 144.77 88.339 980890000 63131000 86510000 72794000 85988000 70451000 74429000 79533000 87078000 79362000 35673000 95595000 91338000 59004000 5065 2069 4745 46217;46218;46219;46220;46221;46222;46223;46224;46225;46226;46227;46228;46229 58958;58959;58960;58961;58962;58963;58964;58965;58966;58967;58968;58969;58970 58968 10 CLYASVLTAQPR Unmodified 1377.7075 0.70747015 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.758 79.758 2 1.5134E-09 80544 QUIQUE_C1403_190116_001 152.28 102.86 3252800000 226440000 296830000 304440000 291060000 280160000 211020000 243880000 300280000 215600000 105480000 264460000 227320000 285810000 5066 2058 4746 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yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.335 76.335 2 0.0002529 77041 QUIQUE_C1368_190116_001 108.7 90.257 758110000 0 84295000 77805000 60109000 80097000 61394000 0 82311000 60851000 59410000 57697000 72325000 61810000 5069 2870 4749 46251;46252;46253;46254;46255;46256;46257;46258;46259;46260;46261;46262;46263 58995;58996;58997;58998;58999;59000;59001;59002;59003;59004;59005;59006;59007;59008;59009;59010;59011 58998 2345 17 CMALSTAVLVGEAK Unmodified 1448.7367 0.73672137 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.845 94.845 2 0.0023413 96675 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.187 77.663 2594300000 282160000 307520000 319490000 0 274490000 0 311430000 195200000 160490000 81931000 187470000 229210000 244870000 5070 2870 4749 46264;46265;46266;46267;46268;46269;46270;46271;46272;46273;46274 59012;59013;59014;59015;59016;59017;59018;59019;59020;59021;59022;59023;59024 59024 10 CMALSTAVLVGEAKK Unmodified 1576.8317 0.83168439 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 1 73.67 73.67 3 0.046889 73232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 21.458 0.99532 54203000 0 0 0 0 0 0 0 54203000 0 0 0 0 0 5071 2870 4750 46275 59025 59025 1 CMELISLPLANK Unmodified 1387.7203 0.72034303 4133 Q9H1K0 RBSN Rabenosyn-5 yes yes 0 0 0 1 117.7 117.7 2 0.016274 121462 QUIQUE_C1277_190116_001 69.276 53.396 19737000 0 19737000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5072 4133 4751 46276 59026 59026 0 CMMAQYNR Unmodified 1072.4252 0.42524041 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.232 27.232 2 0.025651 22044 QUIQUE_C1218_190116_001 84.064 74.67 246480000 49662000 57534000 0 0 0 45840000 40118000 0 0 0 53322000 0 0 5073 2343 4752 46277;46278;46279;46280;46281;46282 59027;59028;59029;59030;59031;59032 59027 6 CMPTFQFFK Unmodified 1204.5409 0.5409221 1999 P10599 TXN Thioredoxin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.63 116.63 2 0.026145 120450 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kDa protein no no 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 3 4 1 3 3 3 94.589 94.589 3;4;5 2.7356E-143 96670 QUIQUE_DMIX3_190116_001 215.48 205.68 13561000000 184350000 902830000 263860000 427570000 699140000 214710000 654010000 1586200000 1473300000 94043000 2233400000 2720500000 2106600000 5083 558;2010 4761 46358;46359;46360;46361;46362;46363;46364;46365;46366;46367;46368;46369;46370;46371;46372;46373;46374;46375;46376;46377;46378;46379;46380;46381;46382;46383;46384;46385;46386;46387;46388;46389 59131;59132;59133;59134;59135;59136;59137;59138;59139;59140;59141;59142;59143;59144;59145;59146;59147;59148;59149;59150;59151;59152;59153;59154;59155;59156;59157;59158;59159;59160;59161;59162;59163;59164;59165;59166;59167;59168;59169;59170;59171;59172;59173;59174;59175;59176;59177 59155 47 CNENYTTDFIFNLYSEEGK Unmodified 2343.0001 0.0001425191 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;H0YIS9 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 149.17 149.17 2;3 2.8686E-45 152083 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20 CNGVLEGIR Unmodified 1016.5073 0.50731378 2378;2379;3459;2385 P35579;A0A087X0T3;P13535;Q9Y623;P12882;A7E2Y1;P35749;Q7Z406;M0QY43;P35580 MYH9;MYH7B;MYH8;MYH4;MYH1;MYH11;MYH14;MYH10 Myosin-9;Myosin-8;Myosin-4;Myosin-1;Myosin-7B;Myosin-11;Myosin-14;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.335 45.335 2 0.0005012 41673 QUIQUE_C1277_190116_001 113.94 89.124 200740000 0 111380000 0 0 0 0 0 89360000 0 0 0 0 0 5086 2378;2385;3459;2379 4764 46422;46423;46424;46425;46426;46427 59217;59218;59219;59220;59221;59222;59223;59224;59225 59218 9 CNINNFIFHK Unmodified 1305.6288 0.6288259 2896 Q05655 PRKCD Protein kinase C delta type;Protein kinase C delta type regulatory subunit;Protein kinase C delta type catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 68.17 68.17 3 0.033831 68483 QUIQUE_C1576_190116_001 30.392 18.179 17417000 0 0 0 0 0 0 17417000 0 0 0 0 0 0 5087 2896 4765 46428 59226 59226 1 CNLEAAFFEGHFLK Unmodified 1681.7923 0.79226242 3343 Q5W0V3 FAM160B1 Protein FAM160B1 yes yes 0 0 0 1 122 122 3 0.0073333 125948 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junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.747 28.747 2 1.8477E-65 22491 QUIQUE_DMIX8_190116_001 197.3 195.47 962840000 76924000 97345000 118250000 112810000 64281000 99274000 169000000 29048000 39912000 0 43529000 43920000 68540000 5094 2123 4772 46456;46457;46458;46459;46460;46461;46462;46463;46464;46465;46466;46467 59258;59259;59260;59261;59262;59263;59264;59265;59266;59267;59268;59269 59269 12 CNVSFLLSEDGSGK Unmodified 1511.6926 0.69260795 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 88.626 88.626 2 4.7189E-58 90281 QUIQUE_DMIX3_190116_001 197.07 179.64 2851200000 230440000 294590000 226940000 233050000 200250000 173510000 229620000 248900000 169560000 95538000 223740000 304830000 220200000 5095 2146 4773 46468;46469;46470;46471;46472;46473;46474;46475;46476;46477;46478;46479;46480;46481;46482;46483 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ankyrin domain family member J;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 0 1 1 1 1 2 3 2 129.3 129.3 3;4 2.7977E-06 143076 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.171 50.619 725460000 0 0 0 0 75912000 0 0 47711000 176360000 30849000 110030000 163120000 121490000 5102 526;1984;3401 4780 46538;46539;46540;46541;46542;46543;46544;46545;46546;46547;46548 59361;59362;59363;59364;59365;59366;59367;59368;59369;59370;59371 59369 9 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTF Unmodified 2657.16 0.16003075 458 A0A2R8YEA7 yes yes 0 0 0 1 2 1 155.18 155.18 2;3 6.6258E-06 158729 QUIQUE_C1403_190116_001 62.684 60.142 109800000 39757000 0 0 45461000 0 24578000 0 0 0 0 0 0 0 5103 458 4781 46549;46550;46551;46552 59372;59373;59374;59375 59373 4 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK 2 Oxidation (M) 3262.4443 0.44432746 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 2 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.54 130.54 2;3 4.5325E-24 133896 QUIQUE_C1368_190116_001 98.98 94.768 12279000000 788570000 1410500000 1366900000 1194400000 868520000 1331900000 941180000 667560000 605750000 915410000 573820000 749650000 865010000 5104 447;2696;2788 4782 46553;46554;46555;46556;46557;46558;46559;46560;46561;46562;46563;46564;46565;46566;46567 59376;59377;59378;59379;59380;59381;59382;59383;59384;59385;59386;59387;59388;59389;59390;59391;59392;59393;59394;59395;59396;59397 59381 316;317 22 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK Oxidation (M) 3246.4494 0.44941284 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 1 0 9 8 6 5 7 7 7 5 7 3 6 3 5 140.14 140.14 2;3;4 2.1926E-65 144266 QUIQUE_C1368_190116_001 155.56 153.36 83452000000 6442100000 10294000000 9094200000 7323100000 6465800000 7084900000 7035200000 4573200000 4524600000 2247400000 5667300000 5390900000 7309100000 5105 447;2696;2788 4782 46568;46569;46570;46571;46572;46573;46574;46575;46576;46577;46578;46579;46580;46581;46582;46583;46584;46585;46586;46587;46588;46589;46590;46591;46592;46593;46594;46595;46596;46597;46598;46599;46600;46601;46602;46603;46604;46605;46606;46607;46608;46609;46610;46611;46612;46613;46614;46615;46616;46617;46618;46619;46620;46621;46622;46623;46624;46625;46626;46627;46628;46629;46630;46631;46632;46633;46634;46635;46636;46637;46638;46639;46640;46641;46642;46643;46644;46645 59398;59399;59400;59401;59402;59403;59404;59405;59406;59407;59408;59409;59410;59411;59412;59413;59414;59415;59416;59417;59418;59419;59420;59421;59422;59423;59424;59425;59426;59427;59428;59429;59430;59431;59432;59433;59434;59435;59436;59437;59438;59439;59440;59441;59442;59443;59444;59445;59446;59447;59448;59449;59450;59451;59452;59453;59454;59455;59456;59457;59458;59459;59460;59461;59462;59463;59464;59465;59466;59467;59468;59469;59470;59471;59472;59473;59474;59475;59476;59477;59478;59479;59480;59481;59482;59483;59484;59485;59486;59487;59488;59489;59490;59491;59492;59493;59494;59495;59496;59497;59498;59499;59500;59501;59502;59503;59504;59505;59506;59507 59424 316;317 107 CPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK Unmodified 3230.4545 0.45449822 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 0 4 5 7 6 5 5 8 4 3 3 8 10 8 151.61 151.61 2;3;4 1.1987E-108 151614 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144527 QUIQUE_C1277_190116_001 151.65 143.78 2235400000 255210000 504200000 144430000 242630000 248020000 46220000 150010000 69489000 108440000 40307000 96052000 277970000 52433000 5107 2759;2792 4783 46722;46723;46724;46725;46726;46727;46728;46729;46730;46731;46732;46733;46734;46735;46736 59621;59622;59623;59624;59625;59626;59627;59628;59629;59630;59631;59632;59633;59634;59635;59636;59637;59638;59639;59640;59641;59642;59643;59644;59645 59624 24 CPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMK Oxidation (M) 3203.4614 0.46135773 2792;2759 P62736;P63267;P68032;P68133 ACTA2;ACTG2;ACTC1;ACTA1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 1 0 1 1 2 1 1 130.33 130.33 3 2.3183E-31 134523 QUIQUE_C1277_190116_001 117.08 103.35 315630000 0 148990000 0 32044000 70741000 0 0 0 30034000 0 0 33821000 0 5108 2759;2792 4783 46737;46738;46739;46740;46741;46742 59646;59647;59648;59649;59650;59651;59652;59653 59646 2186;2187 8 CPFGGAFALAAGLR Unmodified 1406.7129 0.71288988 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2;H0YF31 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 130.31 130.31 2 0.06096 135275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.937 27.649 49065000 0 0 0 0 0 0 0 0 49065000 0 0 0 0 5109 3418 4784 46743 59654 59654 1 CPFIDDFILALHR Unmodified 1615.8181 0.81808324 1269 J3KPJ3;Q8N5S9 CAMKK1 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.99 148.99 3 1.6623E-13 153516 QUIQUE_C1277_190116_001 128.28 119 174860000 13622000 20427000 12801000 10600000 11674000 10252000 16590000 8447900 16801000 4146000 15223000 18503000 15768000 5110 1269 4785 46744;46745;46746;46747;46748;46749;46750;46751;46752;46753;46754;46755;46756 59655;59656;59657;59658;59659;59660;59661;59662;59663;59664;59665;59666;59667 59656 12 CPFYAAEQDK Unmodified 1227.523 0.52302343 2319 P30519;A0A087WT44;I3L1Y2 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 1 38.046 38.046 2 0.018191 33781 QUIQUE_C1277_190116_001 74.173 19.396 112240000 0 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CPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDR Oxidation (M) 4161.9677 0.96768396 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 166.4 166.4 4 5.5768E-88 170661 QUIQUE_DMIX8_190116_001 144.2 135.51 692770000 0 54575000 0 0 64765000 0 0 0 124950000 0 0 152890000 295590000 5114 2197 4789 46776;46777;46778;46779;46780;46781 59689;59690;59691;59692;59693;59694 59693 1543 4 CPHPLTFDVNNPLHLDYVMAAANLFAQTYGLTGSQDR Unmodified 4145.9728 0.97276934 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 169.23 169.23 4 7.5299E-88 173190 QUIQUE_DMIX7_190116_001 141.9 134.03 1245400000 0 0 0 0 0 0 242090000 0 261970000 0 424050000 317280000 0 5115 2197 4789 46782;46783;46784;46785;46786 59695;59696;59697;59698;59699;59700 59700 6 CPHVTEHIPR Unmodified 1244.6084 0.60842481 2507 P48449;A0A0G2JQD0 LSS Lanosterol synthase yes no 0 0 0 1 1 16.113 16.113 3 0.0094165 8354 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.303 27.582 15296000 0 0 0 0 0 0 15296000 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1 1 2 1 2 1 1 65.465 65.465 2;3 0.0038748 65476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.302 70.213 1553900000 266730000 150960000 212260000 105920000 99115000 76138000 190910000 108980000 224380000 39197000 79264000 0 0 5121 4281 4795 46825;46826;46827;46828;46829;46830;46831;46832;46833;46834;46835;46836;46837;46838;46839 59758;59759;59760;59761;59762;59763;59764;59765;59766;59767;59768;59769;59770;59771;59772;59773 59769 9 CPLNYFACPSGR Unmodified 1440.6278 0.62783962 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 77.634 77.634 2 0.0020804 77469 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.192 67.759 29367000 0 0 0 0 0 0 0 29367000 0 0 0 0 0 5122 2911 4796 46840 59774 59774 1 CPLPRPWALTFSYGR Unmodified 1819.9192 0.91919426 1978 P09972;A8MVZ9 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 1 113.57 113.57 3 7.7411E-06 119023 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.45 94.55 714450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 714450000 0 0 5123 1978 4797 46841;46842;46843 59775;59776;59777;59778 59776 4 CPLQDFLR Unmodified 1047.5172 0.51715019 932 E9PHY0;P11117;B7Z7D2;E9PQY3 ACP2 Lysosomal acid phosphatase yes no 0 0 0 1 90.468 90.468 2 0.065856 92420 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.854 45.03 27482000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27482000 0 5124 932 4798 46844 59779 59779 1 CPNLTHLNLSGNK Unmodified 1466.73 0.72999651 1170 H0YN26;P39687 ANP32A Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A yes no 0 0 0 2 2 1 2 3 2 2 2 1 1 2 2 2 44.329 44.329 2;3 4.2323E-283 41140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 341.35 282.92 2233200000 331370000 325850000 0 211910000 196980000 0 101340000 275450000 68297000 86612000 277520000 103230000 254650000 5125 1170 4799 46845;46846;46847;46848;46849;46850;46851;46852;46853;46854;46855;46856;46857;46858;46859;46860;46861;46862;46863;46864;46865;46866;46867;46868 59780;59781;59782;59783;59784;59785;59786;59787;59788;59789;59790;59791;59792;59793;59794;59795;59796;59797;59798;59799;59800;59801;59802;59803;59804;59805;59806;59807;59808 59799 29 CPNPEEGESVLELSLR Unmodified 1827.8673 0.86727785 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 110.4 110.4 2 1.1708E-18 113942 QUIQUE_C1368_190116_001 163.51 152.29 552490000 72723000 97409000 70843000 57498000 68228000 53507000 77467000 0 0 0 0 54818000 0 5126 3390 4800 46869;46870;46871;46872;46873;46874;46875;46876 59809;59810;59811;59812;59813;59814;59815;59816;59817;59818 59813 10 CPNPPVQENFDVNK Unmodified 1656.7566 0.75660519 719 C9JF17;P05090;C9JX71;F8WBT9 APOD Apolipoprotein D yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 57.16 57.16 2 3.9346E-22 56631 QUIQUE_C1576_190116_001 193.96 176.53 1091200000 87934000 0 324920000 0 0 0 200750000 0 0 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Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 14.566 14.566 3 0.00035239 6331 QUIQUE_C1563_190116_001 65.329 52.144 149950000 0 0 0 26701000 0 28392000 34201000 0 0 0 28630000 0 32028000 5130 2524 4803 46897;46898;46899;46900;46901;46902 59844;59845;59846;59847;59848;59849;59850 59846 7 CPQIVIAFYEER Unmodified 1523.7442 0.74424959 2975;2471 Q13185;P45973 CBX3;CBX5 Chromobox protein homolog 3;Chromobox protein homolog 5 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 2 113.08 113.08 2 9.0049E-07 115091 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.16 119.83 101980000 19856000 20524000 0 0 0 0 0 34931000 0 26671000 0 0 0 5131 2975;2471 4804 46903;46904;46905;46906;46907;46908;46909;46910;46911;46912;46913;46914;46915 59851;59852;59853;59854;59855;59856;59857;59858;59859;59860;59861;59862;59863 59858 13 CPSIAAAIAAVNALHGR Unmodified 1690.8937 0.8937078 3069 Q14498 RBM39 RNA-binding protein 39 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.36 120.36 3 3.2282E-21 123623 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.34 130.99 345500000 27788000 35375000 45367000 0 41198000 28963000 29370000 0 0 0 58599000 38773000 40070000 5132 3069 4805 46916;46917;46918;46919;46920;46921;46922;46923;46924;46925 59864;59865;59866;59867;59868;59869;59870;59871;59872;59873;59874 59871 11 CPSIILHDR Unmodified 1109.5652 0.56516301 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 27.058 27.058 2 0.009134 20909 QUIQUE_C1563_190116_001 76.827 57.35 141560000 0 27130000 0 26692000 27171000 25219000 0 0 0 0 35344000 0 0 5133 4435 4806 46926;46927;46928;46929;46930;46931;46932 59875;59876;59877;59878;59879;59880;59881 59879 7 CPSPPMINLISVGGQHQGVFGLPR Unmodified 2560.3043 0.30426765 406 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regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 19.098 19.098 3 0.00015238 11593 QUIQUE_C1563_190116_001 77.204 65.289 163870000 0 0 0 46899000 0 55502000 61467000 0 0 0 0 0 0 5136 2510 4808 46947;46948;46949 59906;59907;59908 59907 3 CPTDELSLTNCAVVNEK Unmodified 1948.887 0.88702702 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3;I3L338;I3L4Q9 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 85.671 85.671 2;3 2.3464E-121 88317 QUIQUE_C1438_190116_001 273.27 259.59 1519600000 189420000 239590000 177600000 174050000 141150000 163330000 259950000 0 0 33730000 0 68588000 72235000 5137 1245 4809 46950;46951;46952;46953;46954;46955;46956;46957;46958;46959;46960;46961;46962 59909;59910;59911;59912;59913;59914;59915;59916;59917;59918;59919;59920;59921;59922;59923;59924;59925 59917 17 CPTDELSLTNCAVVNEKDFQSGQHVIVR Unmodified 3215.5339 0.53394582 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3;I3L338;I3L4Q9 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 100.2 100.2 4 0.0036048 103389 QUIQUE_DMIX8_190116_001 30.206 24.486 103880000 0 0 0 0 0 0 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growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.676 65.676 2 0.0095136 65715 QUIQUE_C1576_190116_001 61.213 50.061 264480000 0 0 0 0 34404000 0 28053000 34820000 36706000 0 44636000 37898000 47962000 5153 4394 4823 47097;47098;47099;47100;47101;47102;47103 60092;60093;60094;60095;60096;60097;60098 60093 7 CQEENYLPSPCQSGQK Unmodified 1923.8091 0.80911105 1810 P01185;P01178 AVP;OXT Vasopressin-neurophysin 2-copeptin;Arg-vasopressin;Neurophysin 2;Copeptin;Oxytocin-neurophysin 1;Oxytocin;Neurophysin 1 yes no 0 0 0 1 54.057 54.057 2 4.7113E-19 52107 QUIQUE_C1218_190116_001 182.55 162.89 34632000 34632000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5154 1810 4824 47104 60099 60099 1 CQEVINWLDR Unmodified 1331.6292 0.62921983 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 110.1 110.1 2 3.4084E-39 100872 QUIQUE_C1368_190116_001 207.68 187.16 6156700000 0 546690000 538480000 470850000 482840000 385030000 487630000 363410000 593200000 320030000 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60251;60252;60253;60254;60255;60256;60257;60258;60259;60260;60261;60262;60263;60264;60265 60261 13 CQQEGLVPEGGVEEERDHWQQFYFLSK Unmodified 3294.504 0.5040259 405 A0A286YF37;Q9UK22 FBXO2 F-box only protein 2 yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 3 1 1 3 1 122.37 122.37 3;4 7.5105E-31 126745 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.05 113.09 5088500000 195890000 630650000 0 68963000 638420000 55444000 0 1771800000 142570000 121700000 1139200000 0 323840000 5169 405 4839 47235;47236;47237;47238;47239;47240;47241;47242;47243;47244;47245;47246;47247;47248;47249;47250 60266;60267;60268;60269;60270;60271;60272;60273;60274;60275;60276;60277;60278;60279;60280;60281;60282;60283;60284;60285;60286;60287 60279 22 CQQLAAYGILEK Unmodified 1392.7071 0.7071358 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.47 81.47 2 0.00053227 82367 QUIQUE_C1368_190116_001 114.83 98.165 1062500000 73727000 113300000 85407000 78774000 89461000 82821000 101500000 79456000 64590000 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47290;47291;47292;47293;47294;47295;47296 60333;60334;60335;60336;60337;60338;60339 60334 7 CQTYTSEYK Unmodified 1178.4914 0.49138895 3410 Q6UWY5 OLFML1 Olfactomedin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 20.381 20.381 2 0.015591 13224 QUIQUE_C1403_190116_001 103.87 87.361 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5176 3410 4846 47297 60340 60340 1 CQVFEETQIGGER Unmodified 1551.6988 0.69875596 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 1 1 62.269 62.269 2 0.0046404 61494 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.069 55.113 347580000 0 0 0 0 0 0 0 115690000 92999000 0 0 0 138890000 5177 3977 4847 47298;47299;47300 60341;60342;60343;60344 60342 4 CQVNSSVEER Unmodified 1206.5299 0.52989972 4258 Q9NQW6;H7C3S1;H7C1C2 ANLN Actin-binding protein anillin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.043 16.043 2 1.1968E-07 8293 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.49 128.75 136570000 16621000 27761000 0 0 0 0 35156000 0 0 0 34420000 22616000 0 5178 4258 4848 47301;47302;47303;47304;47305;47306 60345;60346;60347;60348;60349;60350;60351 60348 7 CRDDSFFGETSHNYHK Unmodified 1998.8279 0.82787265 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991;H0Y8T4 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 28.484 28.484 3;4 0.0058402 22960 QUIQUE_C1576_190116_001 52.569 48.183 526160000 0 143390000 51607000 53646000 117100000 0 160420000 0 0 0 0 0 0 5179 307 4849 47307;47308;47309;47310;47311;47312;47313;47314 60352;60353;60354;60355;60356;60357;60358;60359 60359 7 CRPDQLTGLSLLPLSEK Unmodified 1926.0244 0.024447197 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 113.07 113.07 2;3 2.5023E-67 116539 QUIQUE_DMIX8_190116_001 205.3 177.89 3577500000 208200000 341640000 236180000 111170000 228710000 107370000 266860000 372550000 413040000 150030000 515140000 348040000 278540000 5180 3117 4850 47315;47316;47317;47318;47319;47320;47321;47322;47323;47324;47325;47326;47327;47328;47329;47330;47331;47332;47333;47334;47335;47336;47337;47338;47339 60360;60361;60362;60363;60364;60365;60366;60367;60368;60369;60370;60371;60372;60373;60374;60375;60376;60377;60378;60379;60380;60381;60382;60383;60384;60385;60386;60387;60388;60389;60390;60391;60392;60393;60394;60395;60396;60397;60398;60399 60399 40 CSAAALDVLANVFR Unmodified 1505.766 0.76604767 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 3 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 148.15 148.15 2;3 1.3769E-28 152866 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.62 146.84 685830000 81380000 101190000 64815000 51083000 60726000 75405000 70803000 19668000 33200000 22661000 42529000 33516000 28858000 5181 1446 4851 47340;47341;47342;47343;47344;47345;47346;47347;47348;47349;47350;47351;47352;47353;47354;47355;47356;47357;47358 60400;60401;60402;60403;60404;60405;60406;60407;60408;60409;60410;60411;60412;60413;60414;60415;60416;60417;60418;60419;60420;60421 60416 22 CSAAALDVLANVYRDELLPHILPLLK Unmodified 2903.5943 0.59428488 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 168.21 168.21 3;4 3.4863E-24 172772 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.22 105.2 1063900000 0 0 0 0 242250000 0 0 51111000 574350000 0 119060000 77090000 0 5182 3772 4852 47359;47360;47361;47362;47363;47364 60422;60423;60424;60425;60426;60427 60424 6 CSACNVWR Unmodified 1051.4328 0.43276863 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 29.946 29.946 2 0.0073139 24225 QUIQUE_C1368_190116_001 98.503 84.995 78768000 0 25665000 28712000 24391000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5183 1645 4853 47365;47366;47367;47368;47369;47370;47371;47372 60428;60429;60430;60431;60432;60433;60434;60435 60430 8 CSALATQYMHCVNHAK Unmodified 1889.8335 0.83349208 741 C9JRZ6;Q9NX63 CHCHD3 MICOS complex subunit MIC19 yes no 0 0 0 1 1 36.668 36.668 3 0.00016654 32204 QUIQUE_C1277_190116_001 76.82 70.067 96151000 0 96151000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5184 741 4854 47373;47374 60436;60437 60436 2 CSALLQVIFSPLEEEVK Unmodified 1961.018 0.017964835 2350 P32455;Q9H0R5;H3BNS1 GBP1;GBP3 Interferon-induced guanylate-binding protein 1;Guanylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 2 164.09 164.09 2 0.01629 169417 QUIQUE_C1368_190116_001 74.769 60.863 135010000 0 0 135010000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5185 2350 4855 47375;47376 60438;60439 60438 0 CSATGSPTPTLEWTGGPGGQLPAK Unmodified 2369.1322 0.13215975 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 97.002 97.002 2 1.5813E-06 101250 QUIQUE_C1438_190116_001 111.12 97.152 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5186 2834 4856 47377 60440 60440 1 CSCCEMNVHR Unmodified 1351.489 0.48897966 1877 P05129;M0R0I9;H7BZ60;M0R0Z4 PRKCG Protein kinase C gamma type yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 14.501 14.501 2;3 5.4958E-06 6615 QUIQUE_C1368_190116_001 125.97 122.11 226400000 29147000 68974000 27329000 28468000 0 30457000 31070000 0 0 0 0 0 10953000 5187 1877 4857 47378;47379;47380;47381;47382;47383;47384;47385 60441;60442;60443;60444;60445;60446;60447;60448 60444 8 CSCHGHSEACEPETGACQGCQHHTEGPR Unmodified 3235.2131 0.21311552 2834 P98160;H0Y5A9 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 10.32 10.32 5 9.5691E-05 2795 QUIQUE_C1277_190116_001 44.3 42.27 2868600 0 2868600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5188 2834 4858 47386 60449 60449 1 CSDAAGYPHATHDLEGPPLDAYSIQGQHTISPLDLAK Unmodified 3944.8639 0.86393039 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 110.93 110.93 4;5 8.375E-05 114286 QUIQUE_C1277_190116_001 41.011 35.745 288700000 0 67875000 85343000 65704000 69780000 0 0 0 0 0 0 0 0 5189 3130 4859 47387;47388;47389;47390 60450;60451;60452;60453 60450 4 CSDFTEEICR Unmodified 1315.5173 0.51728612 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5;H0YM46 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.004 58.004 2 7.1856E-14 56638 QUIQUE_DMIX8_190116_001 169.12 155.54 3566100000 313090000 447840000 369090000 320940000 239290000 270810000 373090000 140010000 251840000 116940000 220350000 271150000 231630000 5190 2558 4860 47391;47392;47393;47394;47395;47396;47397;47398;47399;47400;47401;47402;47403;47404 60454;60455;60456;60457;60458;60459;60460;60461;60462;60463;60464;60465;60466;60467;60468;60469;60470 60470 17 CSDFTEEICRR Unmodified 1471.6184 0.61839715 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5;H0YM46 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 43.039 43.039 3 0.0041713 40222 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.241 55.954 107030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67674000 39354000 5191 2558 4861 47405;47406;47407 60471;60472;60473 60471 2 CSDIVFAR Unmodified 966.4593 0.45930096 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.132 46.132 2 0.0036515 44114 QUIQUE_C1218_190116_001 127.84 87.741 688210000 64123000 77217000 86516000 81257000 0 48581000 0 45147000 57877000 0 80041000 70470000 76983000 5192 3700 4862 47408;47409;47410;47411;47412;47413;47414;47415;47416;47417;47418 60474;60475;60476;60477;60478;60479;60480;60481;60482;60483;60484 60474 11 CSDSTLLSNLLEEMK Unmodified 1738.8117 0.81173681 1437;437 A0A2R8Y611;O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 1 155.9 155.9 2 8.5264E-06 161685 QUIQUE_C1576_190116_001 105.03 89.766 27358000 0 0 0 0 0 0 27358000 0 0 0 0 0 0 5193 437;1437 4863 47419 60485 60485 1 CSEGPGLCLAR Unmodified 1218.5485 0.54852667 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 46.809 46.809 2 0.00049474 44445 QUIQUE_C1438_190116_001 108.98 95.924 228500000 39850000 42784000 26170000 45164000 39685000 0 34849000 0 0 0 0 0 0 5194 3515 4864 47420;47421;47422;47423;47424;47425;47426;47427 60486;60487;60488;60489;60490;60491;60492;60493;60494 60490 7 CSEGSFLLTTFPR Unmodified 1513.7235 0.72351415 3122 Q15233;H7C367 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 3 1 1 2 1 1 1 1 118.65 118.65 2;3 6.4242E-120 121673 QUIQUE_C1218_190116_001 248.88 227.43 2188400000 229580000 341080000 265230000 253450000 149570000 175790000 151030000 78688000 128760000 68150000 127920000 123020000 96125000 5195 3122 4865 47428;47429;47430;47431;47432;47433;47434;47435;47436;47437;47438;47439;47440;47441;47442;47443;47444;47445;47446;47447 60495;60496;60497;60498;60499;60500;60501;60502;60503;60504;60505;60506;60507;60508;60509;60510;60511;60512;60513;60514;60515;60516;60517;60518;60519;60520;60521 60496 27 CSEGSFLLTTFPRPVTVEPMDQLDDEEGLPEK Unmodified 3635.7011 0.70113031 3122 Q15233;H7C367 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 146.31 146.31 3 1.6038E-54 149433 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.84 126.37 187220000 0 0 0 0 0 0 0 67962000 0 0 46314000 72940000 0 5196 3122 4866 47448;47449;47450 60522;60523;60524 60522 3 CSEGVFLLTTTPR Unmodified 1479.7392 0.73916421 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 96.826 96.826 2 2.1025E-17 94546 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.65 143.95 1038000000 0 269980000 0 0 168570000 0 0 0 167910000 95626000 0 211490000 124450000 5197 2208 4867 47451;47452;47453;47454;47455;47456 60525;60526;60527;60528;60529;60530;60531;60532 60529 7 CSEGVFLLTTTPRPVIVEPLEQLDDEDGLPEK Unmodified 3595.7967 0.79674526 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 1 1 1 151.98 151.98 3 2.0598E-75 154850 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.03 151.36 121200000 0 0 0 0 0 0 0 60489000 0 0 0 60713000 0 5198 2208 4868 47457;47458 60533;60534 60533 2 CSELEEELK Unmodified 1135.5067 0.50670466 1908 P06753 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 45.731 45.731 2 0.00043685 42244 QUIQUE_C1403_190116_001 124.08 93.576 1217900000 135210000 214330000 167300000 163010000 70507000 152190000 124940000 0 25026000 41845000 40119000 39243000 44162000 5199 1908 4869 47459;47460;47461;47462;47463;47464;47465;47466;47467;47468;47469;47470;47471 60535;60536;60537;60538;60539;60540;60541;60542;60543;60544;60545;60546;60547 60538 12 CSELEEELKNVTNNLK Unmodified 1918.9306 0.93060639 1908 P06753 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.89 114.89 3 0.00029089 118699 QUIQUE_C1277_190116_001 81.327 71.797 679980000 0 181620000 0 54396000 54723000 0 0 73583000 65005000 0 55610000 79630000 115420000 5200 1908 4870 47472;47473;47474;47475;47476;47477;47478;47479 60548;60549;60550;60551;60552;60553;60554;60555;60556 60548 7 CSENKLPAELQELPGLSHQYWSAPSDKEGYSGVGLLSR Unmodified 4202.0379 0.037872014 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 131.23 131.23 5 0.0014096 134070 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.372 26.45 47634000 0 0 0 0 0 0 0 47634000 0 0 0 0 0 5201 2266 4871 47480 60557 60557 1 CSEQVQDFTK Unmodified 1240.5394 0.53940177 3477 Q7Z7K0 CMC1 COX assembly mitochondrial protein homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 32.868 32.868 2 0.00072191 27746 QUIQUE_C1277_190116_001 107.21 97.424 72974000 18136000 23024000 0 0 0 14846000 0 0 0 0 0 16968000 0 5202 3477 4872 47481;47482;47483;47484;47485 60558;60559;60560;60561;60562 60559 5 CSESSTLLEK Unmodified 1152.5333 0.53325376 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 26.07 26.07 2 0.0036969 20065 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.456 56.202 33031000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33031000 5203 3596 4873 47486 60563 60563 1 CSGIASAAAAAVEAAR Unmodified 1474.7198 0.71982575 3124 Q15274;C9JCJ5 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 93.521 93.521 2;3 0.00096948 96788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.552 64.566 517910000 16748000 0 138820000 23033000 29362000 23103000 29023000 34443000 28890000 15370000 131560000 0 47557000 5204 3124 4874 47487;47488;47489;47490;47491;47492;47493;47494;47495;47496;47497;47498;47499 60564;60565;60566;60567;60568;60569;60570;60571;60572;60573;60574;60575;60576 60575 8 CSGPGLSPGMVR Unmodified 1216.5693 0.56926211 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 46.774 46.774 2 0.0099149 41927 QUIQUE_C1368_190116_001 66.056 48.96 9890400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9890400 0 0 0 5205 2178 4875 47500;47501;47502 60577;60578;60579 60577 3 CSILNYLK Unmodified 1009.5267 0.52665224 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 92.756 92.756 2 0.031742 94851 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.777 46.141 39795000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39795000 0 5206 438;2509 4876 47503;47504;47505 60580;60581;60582 60582 3 CSLICLCALQLVSALER Unmodified 2005.0159 0.01587312 3613 Q8N8D7;E5RIL3 NKAIN3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 167.93 167.93 3 0.00020621 172510 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.685 55 35143000 0 0 0 0 0 0 0 0 35143000 0 0 0 0 5207 3613 4877 47506 60583 60583 1 CSLNPEWNETFR Unmodified 1551.6776 0.67762659 1894 P05771;I3L1Z0 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 88.322 88.322 2 0.00047172 91104 QUIQUE_C1576_190116_001 108.47 88.708 145990000 0 0 0 0 0 0 38033000 0 0 0 67668000 40288000 0 5208 1894 4878 47507;47508;47509;47510;47511;47512 60584;60585;60586;60587;60588;60589 60586 4 CSLPAEEDSVLEK Unmodified 1475.6814 0.68137456 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.398 65.398 2 0.018515 64700 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.274 33.498 203140000 60083000 0 0 104380000 0 0 0 0 0 0 0 38675000 0 5209 880 4879 47513;47514;47515;47516 60590;60591;60592;60593 60592 4 CSLPATLSR Unmodified 1003.5121 0.51206481 4251 Q9NQ88;A0A0U1RQD1 TIGAR Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR yes no 0 0 0 1 1 1 41.889 41.889 2 0.0095368 38814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.696 8.3517 90802000 0 31383000 0 0 0 0 37049000 22370000 0 0 0 0 0 5210 4251 4880 47517;47518;47519 60594;60595;60596 60596 3 CSLPVSVGSSAHLSQGLR Unmodified 1853.9418 0.9417802 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 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1004.5325 0.5324659 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.171 25.171 2 0.0063617 18629 QUIQUE_C1403_190116_001 84.568 58.674 1245900000 95553000 70935000 190760000 103910000 107700000 63138000 0 153980000 146020000 32033000 117740000 0 164160000 5220 590 4890 47560;47561;47562;47563;47564;47565;47566;47567;47568;47569;47570 60638;60639;60640;60641;60642;60643;60644;60645;60646;60647;60648;60649;60650;60651;60652;60653;60654 60643 17 CSTSSLLEACTFR Unmodified 1530.6807 0.68066306 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.607 83.607 2 3.8166E-13 85188 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.77 160.91 1974100000 110650000 176990000 185190000 216090000 461730000 131620000 136900000 37094000 101030000 33428000 111810000 137770000 133860000 5221 1838 4891 47571;47572;47573;47574;47575;47576;47577;47578;47579;47580;47581;47582;47583 60655;60656;60657;60658;60659;60660;60661;60662;60663;60664;60665;60666;60667;60668;60669;60670;60671;60672 60665 18 CSVCEAPAIAIAVHSQDVSIPHCPAGWR Unmodified 3087.4477 0.44771377 1946 P08572;A0A3B3IS47 COL4A2 Collagen alpha-2(IV) chain;Canstatin yes no 0 0 0 1 108.97 108.97 4 0.033435 113094 QUIQUE_C1368_190116_001 21.052 15.844 67194000 0 0 67194000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5222 1946 4892 47584 60673 60673 1 CSVDFTR Unmodified 883.3858 0.38580166 1977 P09960;B4DEH5 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes no 0 0 0 1 1 29.678 29.678 2 0.039864 24447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.364 62.099 129500000 0 79684000 0 0 0 0 0 49812000 0 0 0 0 0 5223 1977 4893 47585;47586 60674;60675 60675 2 CSVFYGAPSK Unmodified 1114.5117 0.51173046 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 42.374 42.374 2 0.0042594 39673 QUIQUE_C1438_190116_001 81.525 49.17 92505000 0 0 0 0 57797000 0 0 0 0 0 0 34708000 0 5224 290;327;328 4894 47587;47588;47589 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subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 29.952 29.952 2 0.040078 24320 QUIQUE_C1403_190116_001 53.493 42.272 28212000 0 0 0 28212000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5232 2911 4901 47633 60727 60727 1 CTELNQAWSSLGK Unmodified 1492.698 0.69802768 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.695 87.695 2 2.0185E-31 90231 QUIQUE_DMIX5_190116_001 180.97 164.74 7642800000 496320000 892710000 558240000 712000000 791480000 445420000 797970000 452920000 425970000 218570000 691080000 610490000 549610000 5233 267;275;3025 4902 47634;47635;47636;47637;47638;47639;47640;47641;47642;47643;47644;47645;47646 60728;60729;60730;60731;60732;60733;60734;60735;60736;60737;60738;60739;60740;60741;60742;60743;60744;60745;60746;60747;60748;60749;60750;60751;60752 60748 25 CTESEEEEVTK Unmodified 1339.5449 0.54494066 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.835 17.835 2 3.5812E-13 10205 QUIQUE_C1576_190116_001 167.12 161.78 1024700000 106380000 131090000 110400000 112360000 102920000 83025000 111030000 31442000 29269000 20017000 63419000 56216000 67142000 5234 2642 4903 47647;47648;47649;47650;47651;47652;47653;47654;47655;47656;47657;47658;47659 60753;60754;60755;60756;60757;60758;60759;60760;60761;60762;60763;60764;60765;60766 60760 14 CTFFQILHHTCQR Unmodified 1746.8083 0.80826361 3653 Q8NFX7 STXBP6 Syntaxin-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 3 2 2 2 3 1 2 1 2 64.101 64.101 2;3;4 0.00010129 63411 QUIQUE_C1277_190116_001 109.84 97.822 1219800000 59165000 196030000 145930000 117940000 0 120000000 166660000 81909000 154340000 17574000 0 160280000 0 5235 3653 4904 47660;47661;47662;47663;47664;47665;47666;47667;47668;47669;47670;47671;47672;47673;47674;47675;47676;47677;47678 60767;60768;60769;60770;60771;60772;60773;60774;60775;60776;60777;60778;60779;60780;60781;60782;60783;60784;60785;60786;60787;60788 60768 22 CTGGEVGATSALAPK Unmodified 1417.6871 0.68712864 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.319 39.319 2 3.0585E-13 35888 QUIQUE_C1218_190116_001 138.45 125.49 1147600000 93158000 132450000 139740000 0 80756000 0 0 139570000 97708000 58076000 133670000 151110000 121350000 5236 2304 4905 47679;47680;47681;47682;47683;47684;47685;47686;47687;47688 60789;60790;60791;60792;60793;60794;60795;60796;60797;60798;60799;60800;60801;60802 60789 14 CTIEAGYPGVLSSR Unmodified 1508.7293 0.72932781 2042 P12271 RLBP1 Retinaldehyde-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 77.331 77.331 2 0.0063901 77987 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.395 38.797 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5237 2042 4906 47689 60803 60803 1 CTLACQQFR Unmodified 1182.5274 0.5273973 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.416 35.416 2 0.00039833 31026 QUIQUE_C1576_190116_001 121.74 106.37 462840000 36898000 31710000 46353000 48697000 45507000 18971000 54851000 23380000 27945000 0 31739000 33535000 63249000 5238 1654 4907 47690;47691;47692;47693;47694;47695;47696;47697;47698;47699;47700;47701 60804;60805;60806;60807;60808;60809;60810;60811;60812;60813;60814;60815 60810 11 CTLHPNDSLAMEGPLSR Unmodified 1896.8822 0.88221641 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 70.974 70.974 3 0.00021241 70888 QUIQUE_C1403_190116_001 56.407 40.008 66427000 0 0 42358000 24068000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5239 57 4908 47702;47703 60816;60817 60817 2 CTLPLTGK Unmodified 888.47389 0.47388839 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.757 34.757 2 0.0073084 31248 QUIQUE_C1218_190116_001 98.523 69.147 3225800000 321580000 316360000 302640000 258460000 270780000 310000000 340390000 289720000 343290000 136810000 0 0 335800000 5240 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60845 5 CTSCGVVAENYK Unmodified 1386.5908 0.59078542 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.833 28.833 2 0.00034857 24108 QUIQUE_C1218_190116_001 105.98 99.94 84314000 0 25940000 20161000 20375000 0 0 0 0 0 0 0 17839000 0 5243 4323 4912 47732;47733;47734;47735;47736;47737;47738;47739 60846;60847;60848;60849;60850;60851;60852;60853 60846 8 CTSNPAEIAMFLEPLDLPNKR Unmodified 2415.1927 0.19265151 3901 Q96LD8;H3BTK5 SENP8 Sentrin-specific protease 8 yes no 0 0 1 2 1 141.03 141.03 3 0.0017362 143905 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.03 48.535 48323000 0 0 0 0 0 0 0 48323000 0 0 0 0 0 5244 3901 4913 47740;47741;47742 60854;60855;60856 60856 2 CTTDHISAAGPWLK Unmodified 1555.7453 0.74531222 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 63.251 63.251 2;3 6.0361E-05 63532 QUIQUE_C1218_190116_001 91.62 87.99 3123800000 450670000 527390000 0 371360000 564620000 266580000 0 175490000 278560000 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49279000 37920000 53378000 37470000 33198000 23154000 52532000 92799000 50267000 5247 2524 4916 47754;47755;47756;47757;47758;47759;47760;47761;47762;47763;47764;47765;47766;47767;47768 60871;60872;60873;60874;60875;60876;60877;60878;60879;60880;60881;60882;60883;60884;60885;60886 60872 16 CTVGEITDALKK Unmodified 1333.6912 0.69115139 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 1 58.513 58.513 2;3 0.0052855 56960 QUIQUE_C1368_190116_001 74.849 48.731 75646000 0 0 0 0 0 0 0 0 22145000 0 0 53501000 0 5248 2191 4917 47769;47770;47771;47772 60887;60888;60889;60890 60887 3 CTVVSVPDSLLWR Unmodified 1530.7864 0.78644876 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.49 125.49 2 1.1171E-09 129772 QUIQUE_C1368_190116_001 140.3 121.69 1245400000 130340000 0 166850000 154320000 150680000 87955000 138430000 99783000 0 0 115000000 100990000 101060000 5249 3827 4918 47773;47774;47775;47776;47777;47778;47779;47780;47781;47782 60891;60892;60893;60894;60895;60896;60897;60898;60899;60900;60901;60902;60903;60904;60905;60906;60907 60893 17 CTYIEIDQVPETYAVVLSR Unmodified 2255.1144 0.11438442 2937 Q0VDG4;F8W0M9;C9JID8;H9KVC8;F8WBX0;C9JNS3 SCRN3 Secernin-3 yes no 0 0 0 1 47.994 47.994 5 0.057348 45538 QUIQUE_DMIX8_190116_001 13.037 5.4156 68351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68351000 5250 2937 4919 47783 60908 60908 1 CTYLVLDEADR Unmodified 1353.6235 0.62346575 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 80.735 80.735 2 5.9913E-05 82560 QUIQUE_C1218_190116_001 136.33 112.9 211880000 83579000 0 0 0 0 59632000 68673000 0 0 0 0 0 0 5251 381 4920 47784;47785;47786;47787;47788;47789;47790;47791;47792;47793 60909;60910;60911;60912;60913;60914;60915;60916;60917;60918 60909 10 CVAALAR Unmodified 759.40614 0.40614318 1379 O00154;K7EKP8;Q6ZUV0 ACOT7;ACOT7L Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase;Putative cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase-like yes no 0 0 0 1 19.712 19.712 2 0.022903 12719 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.23 55.478 53553000 0 0 0 0 0 0 0 53553000 0 0 0 0 0 5252 1379 4921 47794 60919 60919 1 CVALAIYYHIK Unmodified 1349.7166 0.71657828 3635 Q8ND76;R4GNF3 CCNY Cyclin-Y yes no 0 0 0 1 81.782 81.782 3 0.033977 82890 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.684 20.306 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5253 3635 4922 47795 60920 60920 1 CVANNQVETLEK Unmodified 1403.6715 0.67147858 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.682 34.682 2 8.5038E-07 30209 QUIQUE_C1576_190116_001 140.49 113.6 908740000 80106000 0 76532000 88732000 71058000 89462000 82731000 59183000 73796000 30170000 88892000 77949000 90131000 5254 2452 4923 47796;47797;47798;47799;47800;47801;47802;47803;47804;47805;47806;47807 60921;60922;60923;60924;60925;60926;60927;60928;60929;60930;60931;60932;60933 60926 13 CVCEQGFK Unmodified 1026.4263 0.42628627 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 20.269 20.269 2 0.020821 13028 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.134 62.132 218860000 0 0 0 0 0 0 0 85926000 102050000 30876000 0 0 0 5255 2233 4924 47808;47809;47810 60934;60935;60936 60936 3 CVDLVIQELINTVR Unmodified 1670.9025 0.90254115 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 162.92 162.92 2 0.027903 168390 QUIQUE_C1368_190116_001 60.598 42.701 9214700 0 0 9214700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5256 2569 4925 47811 60937 60937 0 CVDLVVSELATVIK Unmodified 1544.8484 0.84838031 1337 K7EMQ3 DNM2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.75 146.75 2 0.00024612 151170 QUIQUE_C1403_190116_001 102.4 87.727 345030000 0 35008000 66891000 62627000 40182000 36390000 63845000 14762000 0 0 25324000 0 0 5257 1337 4926 47812;47813;47814;47815;47816;47817;47818;47819 60938;60939;60940;60941;60942;60943;60944;60945;60946;60947 60941 10 CVDLYNQAQSK Unmodified 1324.6082 0.60815004 1597 O60861 GAS7 Growth arrest-specific protein 7 yes yes 0 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61000;61001;61002;61003;61004;61005;61006;61007;61008;61009;61010;61011;61012;61013;61014;61015;61016;61017;61018;61019;61020;61021;61022;61023;61024 61002 23 CVDMVVSELTATIR Oxidation (M) 1608.7851 0.78512813 1240 H7C5U0 DNM1 yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 125.98 125.98 2 3.3001E-10 129858 QUIQUE_C1277_190116_001 132.76 105.02 106660000 0 40720000 0 0 37330000 0 0 0 0 28612000 0 0 0 5262 1240 4929 47893;47894;47895;47896;47897;47898 61025;61026;61027;61028;61029;61030 61026 709 4 CVEDPETGLCLLPLTDK Unmodified 1958.9329 0.93291458 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 3 3 2 1 3 3 2 1 2 2 2 2 2 140.34 140.34 2;3 1.9637E-37 133104 QUIQUE_C1277_190116_001 159.52 148.57 3798100000 368400000 402790000 437380000 17734000 378430000 199340000 461550000 35402000 304840000 167080000 377430000 355870000 291800000 5263 3117 4930 47899;47900;47901;47902;47903;47904;47905;47906;47907;47908;47909;47910;47911;47912;47913;47914;47915;47916;47917;47918;47919;47920;47921;47922;47923;47924;47925;47926 61031;61032;61033;61034;61035;61036;61037;61038;61039;61040;61041;61042;61043;61044;61045;61046;61047;61048;61049;61050;61051;61052;61053;61054;61055;61056;61057;61058;61059;61060;61061;61062;61063 61035 32 CVEDPETGLR Unmodified 1174.5288 0.52883709 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 35.918 35.918 2 2.1363E-11 31535 QUIQUE_C1368_190116_001 160.88 146.72 3851400000 269380000 314930000 362230000 146930000 249730000 0 351280000 391680000 402300000 172440000 484710000 419950000 285870000 5264 3117 4931 47927;47928;47929;47930;47931;47932;47933;47934;47935;47936;47937;47938;47939 61064;61065;61066;61067;61068;61069;61070;61071;61072;61073;61074;61075;61076;61077;61078;61079;61080;61081;61082 61068 19 CVEELPEWNFDGSSTLQSEGSNSDMYLVPAAMFR Oxidation (M) 3881.6859 0.68589095 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 1 0 2 1 1 163.17 163.17 3 3.3711E-10 169428 QUIQUE_C1368_190116_001 61.112 56.206 75145000 0 39876000 25878000 0 0 9390600 0 0 0 0 0 0 0 5265 2086 4932 47940;47941;47942;47943 61083;61084;61085;61086 61085 1420;1421 3 CVEELPEWNFDGSSTLQSEGSNSDMYLVPAAMFR Unmodified 3865.691 0.69097633 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 167.5 167.5 3 1.5455E-46 174806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.77 104.87 291810000 0 23115000 34345000 0 0 0 0 0 0 0 150320000 84033000 0 5266 2086 4932 47944;47945;47946;47947 61087;61088;61089;61090 61089 4 CVELDCWK Unmodified 1108.4682 0.46815109 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.824 65.824 2 0.031416 66367 QUIQUE_C1218_190116_001 66.073 39.689 179000000 17407000 33291000 31415000 0 22767000 18505000 20230000 13861000 0 0 0 21525000 0 5267 4250 4933 47948;47949;47950;47951;47952;47953;47954;47955 61091;61092;61093;61094;61095;61096;61097;61098 61091 8 CVELGAYGQAVR Unmodified 1321.6449 0.6448699 4449 Q9UID3;E9PJ36;E9PKX7;E9PRV0 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes no 0 0 0 1 1 59.784 59.784 2 0.0091907 59106 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.692 16.879 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5268 4449 4934 47956;47957 61099;61100 61100 2 CVELVHEEMQR Unmodified 1428.649 0.648969 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 37.519 37.519 2;3 0.001104 33554 QUIQUE_C1218_190116_001 63.727 47.59 427190000 95614000 120250000 72365000 96540000 0 0 0 0 0 42426000 0 0 0 5269 1108;1404 4935 47958;47959;47960;47961;47962;47963;47964 61101;61102;61103;61104;61105;61106;61107 61101 7 CVELVHEEMQR Oxidation (M) 1444.6439 0.64388362 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 1 0 1 23.34 23.34 2 0.019363 16541 QUIQUE_C1277_190116_001 72.643 58.873 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5270 1108;1404 4935 47965 61108 61108 1 CVFELPAENDKPHDVEINK Unmodified 2253.0736 0.073582234 1719 O95292 VAPB Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C yes yes 0 0 1 1 73.653 73.653 3 0.0055836 74349 QUIQUE_C1218_190116_001 59.182 51.484 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5271 1719 4936 47966 61109 61109 1 CVFEMPNENDKLNDMEPSK Unmodified 2295.981 0.98100376 4369 Q9P0L0 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes yes 0 0 1 1 1 90.086 90.086 3 9.8774E-06 91665 QUIQUE_C1403_190116_001 77.39 73.439 64084000 0 31065000 0 33019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5272 4369 4937 47967;47968 61110;61111 61111 1 CVFNGNAGACR Unmodified 1224.5128 0.51280987 1550 O43761;Q96L30;H3BNA6 SYNGR3 Synaptogyrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 27.005 27.005 2 8.9197E-05 21971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 133.55 120.49 209940000 0 0 0 28534000 21471000 0 30745000 31002000 0 0 42311000 0 55882000 5273 1550 4938 47969;47970;47971;47972;47973;47974;47975;47976 61112;61113;61114;61115;61116;61117;61118;61119 61117 8 CVFSDHGLLTTVAYK Unmodified 1709.8447 0.84469192 2348 P32189;Q14409 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 93.078 93.078 3 0.0013469 96561 QUIQUE_C1218_190116_001 43.557 31.272 202450000 44611000 0 45138000 45073000 27019000 0 40605000 0 0 0 0 0 0 5274 2348 4939 47977;47978;47979;47980;47981 61120;61121;61122;61123;61124;61125 61120 6 CVGSGGATEGVLLPLAPPDPSPR Unmodified 2246.1365 0.13651684 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 116.54 116.54 2 1.0514E-112 120188 QUIQUE_C1277_190116_001 200.55 194.07 31228000 0 31228000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5275 4500 4940 47982 61126 61126 1 CVIALQEGDVDTLDR Unmodified 1702.8196 0.81959938 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.122 96.122 2 8.43E-30 98383 QUIQUE_C1277_190116_001 167.3 132.61 959880000 109830000 140100000 119200000 141110000 99188000 89811000 120810000 40215000 0 32235000 0 67380000 0 5276 2250 4941 47983;47984;47985;47986;47987;47988;47989;47990;47991;47992;47993 61127;61128;61129;61130;61131;61132;61133;61134;61135;61136;61137;61138 61128 12 CVIALQEK Unmodified 959.511 0.51100218 2369 P35221;G3XAM7 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 38.532 38.532 2 0.045295 34400 QUIQUE_C1368_190116_001 57.177 36.478 148170000 0 0 148170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5277 2369 4942 47994 61139 61139 1 CVICGGPGVSDAYYCK Unmodified 1804.7583 0.75826145 3450 Q7RTV0 PHF5A PHD finger-like domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 74.086 74.086 2 4.5634E-10 73803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.01 121 35570000 0 0 0 0 0 0 0 35570000 0 0 0 0 0 5278 3450 4943 47995 61140 61140 1 CVIFEIPGAPDDEAVR Unmodified 1786.856 0.85598488 3876 Q96I25 RBM17 Splicing factor 45 yes yes 0 0 0 1 1 122.61 122.61 2 0.00073827 126270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.451 35.49 57934000 0 0 57934000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5279 3876 4944 47996;47997 61141;61142 61142 2 CVIHIHTLATAAVSSMK Unmodified 1837.9543 0.95425914 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 2 3 3 2 1 1 2 1 3 2 2 2 1 71.952 71.952 2;3;4 7.0858E-53 72004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.15 177.7 2878600000 71746000 239360000 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1 1 2 1 1 85.863 85.863 2 0.00020621 86548 QUIQUE_C1563_190116_001 93.096 68.258 1093700000 81621000 82794000 197030000 134300000 76963000 77659000 78086000 46897000 63212000 33865000 72638000 74744000 73933000 5282 2463 4946 48029;48030;48031;48032;48033;48034;48035;48036;48037;48038;48039;48040;48041;48042;48043;48044;48045 61178;61179;61180;61181;61182;61183;61184;61185;61186;61187;61188;61189;61190;61191;61192;61193;61194;61195;61196;61197;61198;61199;61200 61189 21 CVLAEVPR Unmodified 942.49569 0.49568646 1745 O95741 CPNE6 Copine-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.046 48.046 2 0.0049318 45170 QUIQUE_C1277_190116_001 107.32 64.251 3126200000 420200000 628690000 470750000 0 481890000 0 0 0 0 190680000 0 454970000 479040000 5283 1745 4947 48046;48047;48048;48049;48050;48051;48052 61201;61202;61203;61204;61205;61206;61207;61208;61209 61202 8 CVLHFKPCGLFGK Unmodified 1561.7898 0.78976 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;E7ET92 OSBPL2 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synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.28 103.28 3 1.5252E-19 105266 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.61 85.538 1155500000 82519000 95361000 108310000 122560000 0 73789000 126100000 77852000 77599000 29592000 110630000 131180000 119980000 5286 2524 4950 48067;48068;48069;48070;48071;48072;48073;48074;48075;48076;48077;48078 61225;61226;61227;61228;61229;61230;61231;61232;61233;61234;61235;61236;61237;61238 61236 14 CVLNEGMPIYR Unmodified 1350.6424 0.64242706 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 80.376 80.376 2 0.0052386 82783 QUIQUE_C1438_190116_001 69.423 53.458 45987000 0 0 0 0 45987000 0 0 0 0 0 0 0 0 5287 2334 4951 48079;48080;48081;48082 61239;61240;61241;61242 61241 4 CVLNFKPCGLFGK Unmodified 1538.7738 0.77377558 4066 Q9BXW6;J3QSB8 OSBPL1A Oxysterol-binding 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CVSSPHFQVAER Unmodified 1415.6616 0.66158259 917;1163;3180;3119 Q15173;Q16537;E9PFR3;Q14738;H0Y8C4;H7C5Q9;H0YJ75;Q13362;Q96B13;H0YN84 PPP2R5B;PPP2R5E;PPP2R5D;PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform no no 0 0 0 1 1 31.995 31.995 2;3 0.0080138 26681 QUIQUE_C1368_190116_001 67.726 53.607 84648000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84648000 0 0 5301 3119;3180;917;1163 4964 48171;48172 61339;61340 61339 2 CVSTLLDLIQTK Unmodified 1389.7538 0.75375164 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01;Q10567;C9J1E7;H7C034 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 3 1 2 1 1 1 1 2 2 143.74 143.74 2;3 3.5409E-12 135654 QUIQUE_C1277_190116_001 164.64 145.38 7599000000 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61366 2 CVVHIHTPAGAAVSAMK Unmodified 1747.8862 0.88617958 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 45.612 45.612 2;3;4 5.5316E-104 43148 QUIQUE_C1277_190116_001 217.09 199.61 3197200000 288820000 446600000 196480000 322470000 454600000 270110000 243720000 191330000 165270000 81474000 116870000 213940000 205520000 5305 854 4968 48195;48196;48197;48198;48199;48200;48201;48202;48203;48204;48205;48206;48207;48208;48209;48210;48211;48212;48213;48214;48215;48216;48217 61368;61369;61370;61371;61372;61373;61374;61375;61376;61377;61378;61379;61380;61381;61382;61383;61384;61385;61386;61387;61388;61389;61390;61391;61392;61393;61394 61370 26 CVVHIHTPAGAAVSAMK Oxidation (M) 1763.8811 0.8810942 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 31.61 31.61 2;3 1.0048E-05 26832 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.055 86.216 210320000 0 0 0 0 0 0 0 75261000 0 57808000 77247000 0 0 5306 854 4968 48218;48219;48220;48221;48222;48223;48224 61395;61396;61397;61398;61399;61400;61401;61402 61396 500 7 CVVILPDSVR Unmodified 1156.6274 0.62742892 1988 P0DN79;P35520;H7C2H4 CBS Cystathionine beta-synthase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 76.824 76.824 2 0.004314 77657 QUIQUE_C1277_190116_001 94.302 80.096 455110000 0 59512000 66316000 0 0 54021000 81385000 0 0 30694000 48505000 54986000 59693000 5307 1988 4969 48225;48226;48227;48228;48229;48230;48231;48232;48233;48234;48235 61403;61404;61405;61406;61407;61408;61409;61410;61411;61412;61413 61403 8 CVVTGEDGSESEATVNVK Unmodified 1879.8469 0.84693634 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 2 2 3 2 1 1 1 1 1 1 1 1 49.397 49.397 2 2.2142E-141 47002 QUIQUE_C1218_190116_001 274.8 260.02 2183000000 94369000 244720000 213570000 285750000 241520000 161450000 194960000 101600000 117840000 88813000 124350000 119410000 194660000 5308 1218;28;2057 4970 48236;48237;48238;48239;48240;48241;48242;48243;48244;48245;48246;48247;48248;48249;48250;48251;48252;48253 61414;61415;61416;61417;61418;61419;61420;61421;61422;61423;61424;61425;61426;61427;61428;61429;61430;61431;61432;61433;61434;61435;61436;61437;61438;61439;61440;61441 61415 28 CVVVGDGAVGK Unmodified 1059.5383 0.53827956 2776;2701;2830;2118 P60953;Q5JYX0;A0A3B3IRV0;F8WET9;B1AH79;G3V4H1;G3V476;Q9H4E5;P17081;P63000;P15153;B1AH78;P84095 CDC42;RHOQ;RAC2;RHOJ;RAC1;RHOG Cell division control protein 42 homolog;Rho-related GTP-binding protein RhoJ;Rho-related GTP-binding protein RhoQ;Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1;Ras-related C3 botulinum toxin substrate 2;Rho-related GTP-binding protein RhoG no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.737 28.737 2 0.0027057 23123 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.679 44.324 8251700000 481100000 670210000 0 738900000 579610000 638260000 873010000 634190000 772300000 314980000 928600000 652430000 968100000 5309 2701;2118;2776;2830 4971 48254;48255;48256;48257;48258;48259;48260;48261;48262;48263;48264;48265;48266 61442;61443;61444;61445;61446;61447;61448;61449;61450;61451;61452;61453;61454 61450 12 CWAGSLWLFK Unmodified 1266.6219 0.62194961 3991 Q9BQA1 WDR77 Methylosome protein 50 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.89 141.89 2 0.0015158 148462 QUIQUE_C1438_190116_001 96.711 74.625 353720000 19185000 23598000 44861000 25593000 27749000 22834000 32024000 25275000 25030000 0 30063000 39760000 37747000 5310 3991 4972 48267;48268;48269;48270;48271;48272;48273;48274;48275;48276;48277;48278 61455;61456;61457;61458;61459;61460;61461;61462;61463;61464;61465;61466;61467 61459 13 CWEVQDSGQTIPK Unmodified 1546.7086 0.70859237 2811 P78406;E9PQ57;E9PPG9;B0QZ36;B0QZ37 RAE1 mRNA export factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.6 65.6 2 0.00023948 65022 QUIQUE_C1368_190116_001 137.98 117.11 509310000 0 62971000 52638000 49409000 43094000 40402000 57318000 0 31228000 17292000 40997000 47281000 66678000 5311 2811 4973 48279;48280;48281;48282;48283;48284;48285;48286;48287;48288;48289;48290 61468;61469;61470;61471;61472;61473;61474;61475;61476;61477;61478;61479;61480;61481 61469 13 CWFLAWNPAGTLLASCGGDR Unmodified 2251.0303 0.030277631 1682 O76071 CIAO1 Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1 yes yes 0 0 0 1 1 1 164.36 164.36 2 0.0035644 169698 QUIQUE_C1368_190116_001 70.412 65.317 14670000 0 0 14670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5312 1682 4974 48291;48292;48293 61482;61483;61484 61483 3 CWIFSCLNVMR Unmodified 1484.6727 0.67268133 3028 Q13867;K7ES02 BLMH Bleomycin hydrolase yes no 0 0 0 1 1 140.34 140.34 2 0.0058148 147640 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.993 56.503 22797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22797000 0 0 5313 3028 4975 48294;48295 61485;61486;61487 61485 3 CWYIHDLLK Unmodified 1246.6169 0.61686423 4588 Q9Y3C8 UFC1 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 93.545 93.545 2;3 0.00027211 95330 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.502 81.693 758310000 35410000 41975000 40980000 29778000 90044000 44866000 39814000 35982000 120640000 17795000 165850000 38048000 57140000 5314 4588 4976 48296;48297;48298;48299;48300;48301;48302;48303;48304;48305;48306;48307;48308;48309;48310;48311 61488;61489;61490;61491;61492;61493;61494;61495;61496;61497;61498;61499;61500;61501;61502;61503;61504;61505 61497 17 CYELCDTYPALLVVPYR Unmodified 2131.0118 0.0118336 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 0 0 1 1 1 155.13 155.13 2;3 0.022364 175513 QUIQUE_C1218_190116_001 43.628 30.861 82791000 10119000 0 27364000 0 0 0 0 0 0 0 0 45307000 0 5315 3003 4977 48312;48313;48314 61506;61507;61508 61506 3 CYEMASHLR Oxidation (M) 1181.4958 0.49576282 1926 P07737;K7EJ44;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 0 1 0 1 2 1 1 2 1 15.01 15.01 2;3 0.011922 7449 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.579 47.682 464150000 15084000 0 0 96971000 0 32938000 0 0 177600000 113530000 0 0 28035000 + 5316 1926 4978 48315;48316;48317;48318;48319;48320;48321;48322 61509;61510;61511;61512;61513;61514;61515;61516 61515 1153 7 CYEMASHLR Unmodified 1165.5008 0.5008482 1926 P07737;K7EJ44;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 0 2 2 3 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 25.662 25.662 2;3 0.00048658 19511 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.623 73.968 4476500000 205240000 430980000 296490000 237890000 300480000 223330000 277230000 473420000 191610000 212160000 623930000 218120000 785570000 + 5317 1926 4978 48323;48324;48325;48326;48327;48328;48329;48330;48331;48332;48333;48334;48335;48336;48337;48338;48339;48340;48341;48342;48343;48344;48345;48346;48347 61517;61518;61519;61520;61521;61522;61523;61524;61525;61526;61527;61528;61529;61530;61531;61532;61533;61534;61535;61536;61537;61538;61539;61540;61541;61542 61539 22 CYEMASHLRR Unmodified 1321.602 0.60195923 1926 P07737;K7EJ44;CON__P02584 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 1 1 19.658 19.658 3 0.025909 12660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.282 34.769 60197000 0 0 0 0 0 0 0 60197000 0 0 0 0 0 + 5318 1926 4979 48348 61543 61543 1 CYGLHAFIVPIR Unmodified 1444.7649 0.76492545 3107 Q15067 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 95.475 95.475 3 0.0006565 99214 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.143 62.398 154380000 0 0 0 0 35074000 0 0 0 0 0 32334000 42176000 44798000 5319 3107 4980 48349;48350;48351;48352 61544;61545;61546;61547 61545 4 CYLEDGASK Unmodified 1041.4437 0.44371047 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 24.166 24.166 2 0.023713 17251 QUIQUE_C1368_190116_001 78.334 62.672 47877000 0 0 0 0 47877000 0 0 0 0 0 0 0 0 5320 3455 4981 48353;48354;48355;48356;48357;48358;48359;48360 61548;61549;61550;61551;61552;61553;61554;61555 61548 7 CYLTMTQALEAR Unmodified 1455.685 0.68502015 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 92.283 92.283 2 0.000536 89534 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.97 81.645 76945000 0 0 0 0 56898000 0 0 0 0 20047000 0 0 0 5321 3053 4982 48361;48362;48363 61556;61557;61558 61558 3 CYQLPPGAR Unmodified 1060.5124 0.51239916 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.813 35.813 2 0.020983 31100 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.407 83.534 269500000 0 0 47246000 25578000 0 26839000 0 0 0 0 58124000 44659000 67049000 5322 2061 4983 48364;48365;48366;48367;48368;48369;48370;48371 61559;61560;61561;61562;61563;61564;61565;61566 61563 8 CYQSEFGR Unmodified 1045.4287 0.42872911 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 29.865 29.865 2 0.047236 24271 QUIQUE_C1576_190116_001 56.27 50.327 157350000 0 0 0 0 0 0 157350000 0 0 0 0 0 0 5323 2161 4984 48372 61567 61567 1 CYSAEVVTLWYRPPDVLFGAK Unmodified 2470.2355 0.2355026 2844 Q00535 CDK5 Cyclin-dependent-like kinase 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 147.38 147.38 3 0.0014727 151827 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.874 59.428 150730000 0 32409000 0 0 0 0 54257000 0 0 0 0 0 64060000 5324 2844 4985 48373;48374;48375;48376 61568;61569;61570;61571 61570 2 CYSCGEFGHIQK Unmodified 1484.6177 0.61766887 2756 P62633 CNBP Cellular nucleic acid-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 2 34.353 34.353 2;3 0.00050764 28962 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.52 99.218 581070000 22338000 0 0 28650000 22562000 0 0 98014000 101030000 19015000 59656000 121430000 108380000 5325 2756 4986 48377;48378;48379;48380;48381;48382;48383;48384;48385;48386;48387;48388;48389;48390 61572;61573;61574;61575;61576;61577;61578;61579;61580;61581;61582;61583;61584;61585;61586 61585 15 CYTQNIDTLER Unmodified 1411.6402 0.64017845 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.229 57.229 2 0.00045729 53544 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.86 104.59 3310900000 250670000 385320000 323230000 0 254970000 223440000 386670000 251840000 203800000 109230000 302100000 266530000 353120000 5326 3549 4987 48391;48392;48393;48394;48395;48396;48397;48398;48399;48400;48401;48402 61587;61588;61589;61590;61591;61592;61593;61594;61595;61596;61597;61598 61595 7 CYVDMSTVDADTVTELAQVIVSR Unmodified 2571.2197 0.21965412 1335 K7EMM8;Q49A26 GLYR1 Putative oxidoreductase GLYR1 yes no 0 0 0 1 169.04 169.04 3 3.7995E-12 170572 QUIQUE_C1563_190116_001 80.303 76.048 8504200 0 0 0 0 0 8504200 0 0 0 0 0 0 0 5327 1335 4988 48403 61599 61599 1 CYVLSQNLR Unmodified 1151.5757 0.5757277 2207 P23229;C9JXX7 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes no 0 0 0 1 1 52.724 52.724 2 0.020062 51227 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.064 56.552 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5328 2207 4989 48404;48405 61600;61601 61600 2 DAAAEYDELAEPQDFQDDPDIIAFR Unmodified 2853.2617 0.26171317 4461 Q9UJW0 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.7 155.7 3 2.0981E-23 160417 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.45 109.58 554200000 58857000 55547000 56811000 59402000 41175000 51454000 53800000 0 38762000 16977000 42485000 42785000 36139000 5329 4461 4990 48406;48407;48408;48409;48410;48411;48412;48413;48414;48415;48416;48417 61602;61603;61604;61605;61606;61607;61608;61609;61610;61611;61612;61613;61614 61609 12 DAAAPAEPQAQHTR Unmodified 1461.6961 0.69605384 1677 O76024 WFS1 Wolframin yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 14.254 14.254 2;3 1.4623E-05 5865 QUIQUE_C1563_190116_001 120.55 90.777 463650000 40860000 26373000 80834000 55589000 0 158000000 68720000 33279000 0 0 0 0 0 5330 1677 4991 48418;48419;48420;48421;48422;48423;48424;48425;48426;48427;48428;48429 61615;61616;61617;61618;61619;61620;61621;61622;61623;61624;61625;61626 61622 12 DAAAVLVSR Unmodified 900.50288 0.50288033 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 43.938 43.938 2 0.0094055 41561 QUIQUE_C1438_190116_001 76.064 38.506 35734000 0 0 0 0 35734000 0 0 0 0 0 0 0 0 5331 1283 4992 48430;48431;48432;48433;48434;48435 61627;61628;61629;61630;61631;61632;61633 61632 7 DAACYVCWAFAR Unmodified 1488.6278 0.62783962 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 129.44 129.44 2 0.022377 134125 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4999 48462 61660 61660 1 DAALATALGDKK Unmodified 1172.6401 0.6401021 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.216 35.216 2 0.00079031 31170 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.29 62.088 1626800000 104710000 108360000 135880000 128570000 136270000 106150000 143860000 115810000 133230000 44619000 206300000 126570000 136480000 5339 2171 5000 48463;48464;48465;48466;48467;48468;48469;48470;48471;48472;48473;48474;48475 61661;61662;61663;61664;61665;61666;61667;61668;61669;61670;61671;61672;61673;61674;61675;61676 61670 15 DAALAVAEAMADK Unmodified 1274.6177 0.61765209 2476 P46060;H0Y4Q3 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.87 105.87 2 0.0022781 108522 QUIQUE_C1403_190116_001 87.363 70.337 122140000 31301000 0 0 27715000 24945000 19201000 18975000 0 0 0 0 0 0 5340 2476 5001 48476;48477;48478;48479;48480;48481 61677;61678;61679;61680;61681;61682 61679 5 DAALAVAEAMADKAELEK Unmodified 1844.919 0.91897907 2476 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DAASLESQLQDTQELLQEETR Unmodified 2403.1401 0.14014147 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 2 3 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 152 152 2;3 1.0089E-75 157371 QUIQUE_C1368_190116_001 223.72 189.03 1744500000 43895000 128740000 221360000 140420000 249280000 120490000 63406000 152620000 121950000 74574000 191900000 235900000 0 5347 2379 5008 48506;48507;48508;48509;48510;48511;48512;48513;48514;48515;48516;48517;48518;48519;48520;48521;48522;48523;48524;48525;48526;48527;48528 61712;61713;61714;61715;61716;61717;61718;61719;61720;61721;61722;61723;61724;61725;61726;61727;61728;61729;61730;61731;61732;61733;61734;61735;61736;61737 61717 25 DAATIMQPYFTSNGLVTK Unmodified 1955.9663 0.96626362 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 131 131 2 8.4787E-25 133823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.6 91.342 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5348 3053 5009 48529 61738 61738 1 DAATVTQMHFLTGQGR Unmodified 1731.8363 0.8362525 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 78.909 78.909 2;3 2.4888E-06 80804 QUIQUE_C1438_190116_001 133.16 108.31 1753400000 83179000 106960000 151230000 120780000 190440000 107000000 227340000 0 113570000 48124000 148710000 233330000 222700000 5349 57 5010 48530;48531;48532;48533;48534;48535;48536;48537;48538;48539;48540;48541;48542;48543;48544;48545 61739;61740;61741;61742;61743;61744;61745;61746;61747;61748;61749;61750;61751;61752;61753;61754;61755 61744 15 DAATVTQMHFLTGQGR Oxidation (M) 1747.8312 0.83116712 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 1 0 1 1 53.756 53.756 3 0.0018894 52620 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.842 77.062 123030000 0 0 0 0 0 0 0 0 53759000 0 0 0 69269000 5350 57 5010 48546;48547 61756;61757 61756 45 1 DAAVMAFGCILEGPEPSQLKPLVIQAMPTLIELMKDPSVVVR Unmodified 4562.4025 0.40245664 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 2 1 173.18 173.18 4 0.023152 180330 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.929 16.971 38093000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38093000 0 0 5351 3090 5011 48548 61758 61758 1 DAAYCFMSDHYLEVLR Unmodified 1988.8761 0.8760684 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 132.46 132.46 2;3 2.4488E-29 136826 QUIQUE_DMIX8_190116_001 161.1 144.75 3619100000 259340000 383220000 313070000 252510000 235500000 286240000 306480000 228130000 291580000 77339000 330990000 316990000 337730000 5352 1688 5012 48549;48550;48551;48552;48553;48554;48555;48556;48557;48558;48559;48560;48561;48562;48563;48564;48565;48566;48567;48568;48569;48570;48571;48572;48573;48574;48575;48576 61759;61760;61761;61762;61763;61764;61765;61766;61767;61768;61769;61770;61771;61772;61773;61774;61775;61776;61777;61778;61779;61780;61781;61782;61783;61784;61785;61786;61787;61788;61789;61790;61791 61791 33 DAAYCFMSDHYLEVLREPAVFGR Unmodified 2745.2679 0.26794172 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 142.37 142.37 3;4 1.6616E-10 145656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.625 75.936 518400000 0 0 0 0 0 0 0 154290000 42391000 0 155960000 117550000 48204000 5353 1688 5013 48577;48578;48579;48580;48581;48582;48583;48584 61792;61793;61794;61795;61796;61797;61798;61799 61793 8 DACELESGTEPCVVR Unmodified 1720.7396 0.7396345 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 67.618 67.618 2 0.023938 68130 QUIQUE_C1218_190116_001 58.274 49.573 28611000 15350000 0 0 0 0 13262000 0 0 0 0 0 0 0 5354 4517 5014 48585;48586 61800;61801 61800 0 DACFTSLMNTLMTSLPALVQQQGR Oxidation (M) 2697.2924 0.29244191 4393 Q9UBB6;H7C2R2 NCDN Neurochondrin yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 168.67 168.67 2;3 1.3031E-13 172949 QUIQUE_C1218_190116_001 102.48 95.204 215460000 47351000 86143000 0 36179000 29960000 0 0 0 0 15823000 0 0 0 5355 4393 5015 48587;48588;48589;48590;48591;48592 61802;61803;61804;61805;61806;61807 61802 2928;2929 6 DACFTSLMNTLMTSLPALVQQQGR Unmodified 2681.2975 0.29752729 4393 Q9UBB6;H7C2R2 NCDN Neurochondrin yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 176.31 176.31 2;3 3.5652E-201 179839 QUIQUE_DMIX7_190116_001 246.5 231.71 3899800000 3978100 10680000 150740000 28895000 290840000 17594000 296640000 198960000 224030000 0 857170000 1599600000 220670000 5356 4393 5015 48593;48594;48595;48596;48597;48598;48599;48600;48601;48602;48603;48604;48605;48606;48607;48608;48609;48610 61808;61809;61810;61811;61812;61813;61814;61815;61816;61817;61818;61819;61820;61821;61822;61823;61824;61825;61826;61827 61825 20 DADDAVYELDGK Unmodified 1309.5674 0.56739066 2981 Q13243;B4DJK0;B4DUA4;G3V5K8 SRSF5 Serine/arginine-rich splicing factor 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 70.895 70.895 2 0.00030253 69628 QUIQUE_C1218_190116_001 115.7 79.756 107420000 30484000 40417000 0 0 0 0 19868000 0 0 16653000 0 0 0 5357 2981 5016 48611;48612;48613;48614;48615;48616;48617;48618 61828;61829;61830;61831;61832;61833;61834;61835 61828 8 DADDAVYELNGK Unmodified 1308.5834 0.58337508 2982;259 A0A0D9SEM4;Q08170;Q13247 SRSF4;SRSF6 Serine/arginine-rich splicing factor 4;Serine/arginine-rich splicing factor 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.924 65.924 2 8.9542E-07 65480 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.17 125.5 206530000 0 33570000 0 0 0 0 0 25627000 33899000 28628000 35911000 48897000 0 5358 259;2982 5017 48619;48620;48621;48622;48623;48624;48625;48626 61836;61837;61838;61839;61840;61841;61842;61843;61844 61844 9 DADETKEWIEEK Unmodified 1491.6729 0.67291837 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 53.956 53.956 2;3 6.9863E-37 52515 QUIQUE_DMIX3_190116_001 193.3 165.56 8840900000 0 183440000 0 0 859740000 106810000 296620000 1051900000 1461500000 39377000 1888100000 1200900000 1752500000 5359 267;275;3025 5018 48627;48628;48629;48630;48631;48632;48633;48634;48635;48636;48637;48638;48639;48640;48641;48642 61845;61846;61847;61848;61849;61850;61851;61852;61853;61854;61855;61856;61857;61858;61859;61860;61861;61862;61863;61864;61865;61866 61854 21 DADETKEWIEEKNQALNTDNYGHDLASVQALQR Unmodified 3800.7878 0.78778856 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 115.58 115.58 4 5.8881E-15 117959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.657 71.931 73465000 0 0 0 0 0 0 0 73465000 0 0 0 0 0 5360 267;275;3025 5019 48643 61867;61868 61868 2 DADIGVAEAER Unmodified 1144.536 0.53603095 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3;K7EKW9 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.412 43.412 2 0.0015447 40529 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.883 43.881 369500000 0 0 54843000 38161000 63419000 38800000 57821000 0 0 17207000 45076000 0 54174000 5361 3057 5020 48644;48645;48646;48647;48648;48649;48650;48651;48652 61869;61870;61871;61872;61873;61874;61875;61876;61877;61878 61877 7 DADLTDTAQTR Unmodified 1205.5524 0.5524093 3020 Q13630;E9PKL9;E9PP14;A0A0J9YX13;E9PLH9 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.954 28.954 2 8.4501E-05 23221 QUIQUE_C1563_190116_001 133.99 100.2 1265000000 78714000 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Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.749 14.749 2 1.1022E-17 7148 QUIQUE_C1218_190116_001 166.29 155.59 380470000 41124000 0 40399000 44717000 42523000 37201000 44172000 0 34995000 15744000 45962000 0 33635000 5365 2630 5024 48671;48672;48673;48674;48675;48676;48677;48678;48679;48680 61898;61899;61900;61901;61902;61903;61904;61905;61906;61907 61898 10 DADVQFLASVLPPDTDPAFFEHLR Unmodified 2699.3231 0.32313164 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2;H0YF31;H0YDA6 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 165.08 165.08 3 1.0498E-08 169447 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.717 73.263 679330000 0 0 109530000 0 0 39263000 129340000 78376000 107590000 0 0 108030000 107190000 5366 3418 5025 48681;48682;48683;48684;48685;48686;48687 61908;61909;61910;61911;61912;61913;61914 61914 7 DADVQNFVSFISK Unmodified 1468.7198 0.71980898 2443 P42126;Q96DC0;H3BS70 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.3 139.3 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28;Keratin, type I cytoskeletal 25;Keratin, type I cytoskeletal 27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.313 79.313 2 2.7656E-06 76180 QUIQUE_DMIX4_190116_001 151.04 120.87 2732700000 188380000 130060000 104980000 179830000 136220000 126590000 132020000 142280000 176640000 399980000 316730000 335410000 363600000 + 5369 776 5028 48707;48708;48709;48710;48711;48712;48713;48714;48715;48716;48717;48718;48719 61937;61938;61939;61940;61941;61942;61943;61944;61945;61946;61947;61948;61949;61950;61951;61952;61953 61947 16 DAEDAIYGR Unmodified 1008.4512 0.45123869 2980 Q13242;H0YIB4;S4R3G0 SRSF9 Serine/arginine-rich splicing factor 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.201 45.201 2 0.009538 42048 QUIQUE_C1218_190116_001 75.692 42.05 33500000 33500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5370 2980 5029 48720;48721;48722;48723 61954;61955;61956;61957 61954 4 DAEDALHNLDR Unmodified 1267.5793 0.57929275 1640 Q5JRI1;O75494 SRSF10 Serine/arginine-rich splicing factor 10 yes no 0 0 0 1 1 2 55.723 55.723 2;3 0.0016164 53754 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61987;61988;61989;61990;61991;61992;61993;61994;61995;61996;61997;61998;61999;62000;62001;62002;62003;62004;62005;62006;62007;62008;62009;62010;62011;62012;62013;62014;62015 61998 24 DAEEAISQTIDTIVDMIK Oxidation (M) 2006.9718 0.9718025 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 1 0 2 1 1 1 4 4 2 2 3 2 3 1 2 174.93 174.93 2;3 2.1872E-53 179070 QUIQUE_DMIX3_190116_001 178.15 168.86 1128000000 45171000 23892000 45029000 0 269330000 207530000 78746000 34475000 138810000 22793000 115530000 50797000 95870000 5376 96 5034 48776;48777;48778;48779;48780;48781;48782;48783;48784;48785;48786;48787;48788;48789;48790;48791;48792;48793;48794;48795;48796;48797;48798;48799;48800;48801;48802;48803 62016;62017;62018;62019;62020;62021;62022;62023;62024;62025;62026;62027;62028;62029;62030;62031;62032;62033;62034;62035;62036;62037;62038;62039;62040;62041;62042;62043;62044;62045;62046;62047 62039 67 30 DAEEAISQTIDTIVDMIK Unmodified 1990.9769 0.97688788 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 181.69 181.69 2;3 4.7976E-76 185023 QUIQUE_DMIX3_190116_001 202.32 176.85 1005400000 0 5846200 0 6161700 103740000 0 20687000 35996000 103100000 0 660270000 21671000 47942000 5377 96 5034 48804;48805;48806;48807;48808;48809;48810;48811;48812;48813 62048;62049;62050;62051;62052;62053;62054;62055;62056;62057 62053 9 DAEELEKWIQEK Unmodified 1516.7409 0.74093835 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFF6;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 104.3 104.3 2;3 0.00035869 105923 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.65 80.327 249460000 0 0 0 0 0 0 0 249460000 0 0 0 0 0 5378 267;275;3025 5035 48814;48815 62058;62059 62058 2 DAEEWFFTK Unmodified 1171.5186 0.51858998 763 CON__P02533;P02533;CON__Q6IFX2 KRT14 Keratin, type I cytoskeletal 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.69 119.69 2 0.020857 123289 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.582 52.508 158530000 0 0 0 11280000 0 14741000 0 31445000 0 33459000 29633000 37967000 0 + 5379 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108.66 931530000 58442000 78704000 132320000 75168000 123320000 105350000 161960000 0 0 0 0 0 196250000 5399 2465 5056 48954;48955;48956;48957;48958;48959;48960;48961 62242;62243;62244;62245;62246;62247;62248;62249;62250 62247 9 DAFLEQFR Unmodified 1024.4978 0.49779495 4270 Q9NRH3 TUBG2 Tubulin gamma-2 chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 97.319 97.319 2 0.0049318 100935 QUIQUE_C1218_190116_001 107.32 80.715 73535000 20349000 15769000 21127000 16289000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5400 4270 5057 48962;48963;48964;48965 62251;62252;62253;62254;62255 62251 5 DAFLGSFLYEYSR Unmodified 1566.7355 0.73545904 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 153.46 153.46 2 6.1134E-08 158386 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.36 146.76 2136900000 132590000 192930000 129830000 127390000 178580000 187800000 217270000 107850000 254730000 345780000 76567000 99157000 86473000 + 5401 770 5058 48966;48967;48968;48969;48970;48971;48972;48973;48974;48975;48976;48977;48978;48979 62256;62257;62258;62259;62260;62261;62262;62263;62264;62265;62266;62267;62268;62269;62270;62271;62272 62266 16 DAFLVFR Unmodified 866.46504 0.46503826 4651;4652 Q9Y6D5;Q9Y6D6 ARFGEF2;ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2;Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 107.64 107.64 2 0.026664 109458 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.593 71.356 55656000 15513000 0 0 0 0 0 16058000 16673000 0 7412600 0 0 0 5402 4651;4652 5059 48980;48981;48982;48983 62273;62274;62275;62276 62275 4 DAFPEAIIVKPSDIFGR Unmodified 1873.9938 0.993799 3197 Q16795;A0A3B3ISG8 NDUFA9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 141.51 141.51 3 0.00028435 145244 QUIQUE_C1403_190116_001 80.545 71.13 467390000 44708000 43590000 0 45220000 0 71911000 0 29802000 75940000 28372000 72445000 0 55407000 5403 3197 5060 48984;48985;48986;48987;48988;48989;48990;48991;48992;48993;48994 62277;62278;62279;62280;62281;62282;62283;62284;62285;62286;62287;62288 62280 10 DAFPVAGQK Unmodified 931.47633 0.47633123 2647;2646 P54725;K7ENJ0;K7ELW1;P54727;Q5W0S5;Q5W0S4 RAD23A;RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog A;UV excision repair protein RAD23 homolog B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.041 34.041 2 0.0086526 28753 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.178 55.687 1771900000 260080000 176030000 185620000 0 189820000 139400000 157190000 74814000 136380000 101550000 167980000 0 183070000 5404 2646;2647 5061 48995;48996;48997;48998;48999;49000;49001;49002;49003;49004;49005 62289;62290;62291;62292;62293;62294;62295;62296;62297;62298;62299;62300;62301;62302 62299 10 DAFQNAYLELGGLGER Unmodified 1751.8479 0.84786304 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.35 143.35 2 1.2615E-13 148866 QUIQUE_C1218_190116_001 138.02 120.99 213100000 50287000 0 71934000 42207000 0 0 48668000 0 0 0 0 0 0 5405 1872 5062 49006;49007;49008;49009 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Unmodified 1358.7558 0.75580056 3713 Q8WWI5 SLC44A1 Choline transporter-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.41 163.41 2 2.3838E-05 165498 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.28 101.98 506390000 37388000 43494000 37178000 41819000 44926000 29757000 47699000 43239000 47728000 14112000 45361000 31547000 42140000 5408 3713 5065 49027;49028;49029;49030;49031;49032;49033;49034;49035;49036;49037;49038;49039 62343;62344;62345;62346;62347;62348;62349;62350;62351;62352;62353;62354;62355;62356;62357 62351 15 DAGAPTYMYEFQYR Unmodified 1710.7348 0.73480712 2205 P23141 CES1 Liver carboxylesterase 1 yes yes 0 0 0 1 114.07 114.07 2 0.0038583 117128 QUIQUE_C1403_190116_001 67.153 49.786 21496000 0 0 0 21496000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5409 2205 5066 49040 62358 62358 1 DAGDKDKEQELSEEDK Unmodified 1834.8068 0.80684567 2976 Q13200;C9JPC0 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 17.139 17.139 3 1.5711E-18 9299 QUIQUE_C1563_190116_001 116.96 91.37 297910000 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1 93.81 93.81 2;3 1.2509E-15 97346 QUIQUE_C1218_190116_001 159.08 138.13 1480500000 40548000 161170000 183220000 143900000 192550000 106630000 87281000 188630000 182260000 18121000 60988000 61039000 54174000 5413 2178 5070 49060;49061;49062;49063;49064;49065;49066;49067;49068;49069;49070;49071;49072;49073;49074;49075;49076;49077;49078;49079 62379;62380;62381;62382;62383;62384;62385;62386;62387;62388;62389;62390;62391;62392;62393;62394;62395;62396;62397;62398 62379 20 DAGEGLLAVQITDQEGKPK Unmodified 1968.0164 0.016384931 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.822 86.822 3 5.9632E-05 88559 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.155 67.363 275870000 0 0 0 31463000 0 29179000 0 30884000 63741000 24033000 50093000 0 46477000 5414 1628 5071 49080;49081;49082;49083;49084;49085;49086 62399;62400;62401;62402;62403;62404;62405 62402 7 DAGEGLLTVQILDPEGKPK Unmodified 1979.0575 0.057521464 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 1 116.92 116.92 3 0.0033436 120563 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5076 49128 62455;62456 62455 2 DAGMAEAWLCSQEPLVR Unmodified 1931.887 0.88696744 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.95 138.95 2 3.5879E-10 143300 QUIQUE_C1277_190116_001 152.4 139.2 209330000 0 47830000 0 30645000 43780000 33430000 0 0 19773000 0 0 33877000 0 5420 1472 5077 49129;49130;49131;49132;49133;49134 62457;62458;62459;62460;62461;62462 62457 6 DAGMQLQGYR Oxidation (M) 1153.5186 0.51860675 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 1 1 35.554 35.554 2 0.00017191 31983 QUIQUE_C1218_190116_001 121.09 96.937 2243800000 112050000 237760000 139400000 90379000 96270000 192420000 97647000 205520000 251720000 166440000 336510000 159920000 157790000 5421 1788 5078 49135;49136;49137;49138;49139;49140;49141;49142;49143;49144;49145;49146;49147;49148;49149;49150;49151;49152;49153 62463;62464;62465;62466;62467;62468;62469;62470;62471;62472;62473;62474;62475;62476;62477;62478;62479;62480;62481;62482 62463 1001 19 DAGMQLQGYR Unmodified 1137.5237 0.52369213 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 52.78 52.78 2 0.00016294 50751 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.74 103.08 6128300000 0 860280000 776930000 576470000 0 571020000 642100000 548130000 608970000 0 801510000 742910000 0 5422 1788 5078 49154;49155;49156;49157;49158;49159;49160;49161;49162;49163 62483;62484;62485;62486;62487;62488;62489;62490;62491;62492;62493;62494;62495;62496 62491 12 DAGPLLISLK Unmodified 1025.6121 0.61209643 2327 P31146 CORO1A Coronin-1A yes yes 0 0 0 1 1 2 105.01 105.01 1;2 0.0076651 106699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.965 60.901 1140200000 0 0 0 0 0 0 480360000 429690000 0 230150000 0 0 0 5423 2327 5079 49164;49165;49166;49167 62497;62498;62499;62500 62498 2 DAGQCIDPYITVSVK Unmodified 1664.808 0.80797206 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 104.02 104.02 2 0.00038612 108249 QUIQUE_C1218_190116_001 80.522 66.558 125450000 47702000 0 63321000 0 0 0 0 0 0 14426000 0 0 0 5424 3807 5080 49168;49169;49170 62501;62502;62503 62501 3 DAGQISGLNVLR Unmodified 1241.6728 0.67279921 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 90.056 90.056 1;2 6.4888E-05 92426 QUIQUE_DMIX8_190116_001 154.85 105.43 1220200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 782800000 0 437390000 5425 2415 5081 49171;49172;49173;49174 62504;62505;62506;62507 62507 3 DAGTELTGHLVPHHDGLR Unmodified 1923.9551 0.95512208 4232 Q9HCU4 CELSR2 Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 54.444 54.444 3 0.00025489 53216 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.423 47.506 197540000 0 0 45479000 0 29885000 0 40924000 0 42148000 0 0 0 39106000 5426 4232 5082 49175;49176;49177;49178;49179 62508;62509;62510;62511;62512;62513 62512 4 DAGTIAGLNVLR Unmodified 1198.667 0.66698555 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.49 101.49 2 9.7811E-28 105540 QUIQUE_C1218_190116_001 177.7 145.77 45512000000 3260800000 3976900000 3357500000 3347400000 3601800000 3602700000 3713200000 2681100000 2974100000 2108900000 4672700000 3917600000 4297300000 5427 2010 5083 49180;49181;49182;49183;49184;49185;49186;49187;49188;49189;49190;49191;49192 62514;62515;62516;62517;62518;62519;62520;62521;62522;62523;62524;62525;62526;62527;62528;62529;62530;62531;62532;62533;62534;62535;62536;62537;62538;62539;62540;62541;62542;62543;62544;62545;62546;62547;62548;62549;62550;62551;62552 62515 39 DAGTIAGLNVMR Unmodified 1216.6234 0.62340617 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 90.498 90.498 2 6.0785E-20 92424 QUIQUE_C1277_190116_001 169.44 108.85 543360000 0 407350000 0 0 0 0 0 0 0 136020000 0 0 0 5428 2007 5084 49193;49194 62553;62554 62553 2 DAGTITGLNVLR Unmodified 1228.6776 0.67755023 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.907 97.907 2 8.2511E-07 95552 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.75 93.556 12556000000 875300000 919330000 955980000 738350000 912980000 798680000 900080000 964120000 1282400000 672330000 1232100000 1023500000 1281200000 5429 2643 5085 49195;49196;49197;49198;49199;49200;49201;49202;49203;49204;49205;49206;49207 62555;62556;62557;62558;62559;62560;62561;62562;62563;62564;62565;62566;62567;62568;62569;62570;62571;62572;62573;62574 62568 20 DAGVIAGLNVLR Unmodified 1196.6877 0.68772099 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.53 114.53 2 0.00028992 117022 QUIQUE_C1563_190116_001 116.05 96.689 19605000000 1274900000 1541700000 1567700000 1674700000 1669300000 1660200000 1647800000 1321400000 1468100000 1099200000 1531200000 1568300000 1580300000 5430 282;2362 5086 49208;49209;49210;49211;49212;49213;49214;49215;49216;49217;49218;49219;49220 62575;62576;62577;62578;62579;62580;62581;62582;62583;62584;62585;62586;62587;62588;62589;62590;62591;62592;62593;62594 62584 20 DAGYEFDICFTSVQK Unmodified 1778.7822 0.78215124 2139 P18669 PGAM1 Phosphoglycerate mutase 1 yes yes 0 0 0 7 1 3 5 1 7 10 12 22 15 9 145.42 145.42 2 1.443E-08 148851 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.68 110.34 2759400000 184690000 34392000 65733000 0 185320000 30518000 257050000 226290000 301130000 0 735600000 463070000 275560000 5431 2139 5087 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62595;62596;62597;62598;62599;62600;62601;62602;62603;62604;62605;62606;62607;62608;62609;62610;62611;62612;62613;62614;62615;62616;62617;62618;62619;62620;62621;62622;62623;62624;62625;62626;62627;62628;62629;62630;62631;62632;62633;62634;62635;62636;62637;62638;62639;62640;62641;62642;62643;62644;62645;62646;62647;62648;62649;62650;62651;62652;62653;62654;62655;62656;62657;62658;62659;62660;62661;62662;62663;62664;62665;62666;62667;62668;62669;62670;62671;62672;62673;62674;62675;62676;62677;62678;62679;62680;62681;62682;62683;62684;62685;62686;62687;62688;62689;62690;62691;62692;62693;62694 62636 82 DAGYGGISLAVEGPSK Unmodified 1519.7518 0.75183739 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 89.886 89.886 2 0.0032967 90479 QUIQUE_C1403_190116_001 60.448 47.468 439530000 0 0 0 187440000 0 0 252090000 0 0 0 0 0 0 5432 1628 5088 49313;49314 62695;62696 62695 1 DAGYGGLSLSIEGPSK Unmodified 1549.7624 0.76240208 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5C6 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 107.05 107.05 2 0.033533 109133 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.659 33.088 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5433 2178 5089 49315 62697 62697 1 DAHIPVVEEHVMGK Unmodified 1559.7766 0.77661235 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 3 1 3 1 1 1 1 53.199 53.199 2;3;4 2.7211E-07 51471 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.11 94.628 1290900000 220310000 166980000 89437000 222740000 107830000 172800000 62209000 174870000 0 24118000 0 49593000 0 5434 2009 5090 49316;49317;49318;49319;49320;49321;49322;49323;49324;49325;49326;49327;49328;49329;49330;49331;49332;49333;49334;49335;49336;49337 62698;62699;62700;62701;62702;62703;62704;62705;62706;62707;62708;62709;62710;62711;62712;62713;62714;62715;62716;62717;62718;62719;62720;62721;62722 62717 23 DAHIPVVEEHVMGK Oxidation (M) 1575.7715 0.77152697 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 1 0 1 1 1 37.185 37.185 3 0.0020421 33663 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.864 56.26 314540000 0 0 0 0 78116000 98039000 0 138390000 0 0 0 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24.305 24.305 2;3 0.00015166 17906 QUIQUE_C1438_190116_001 128.91 84.458 2206400000 238250000 132700000 187580000 189290000 243610000 82942000 212830000 111250000 201590000 29923000 250920000 138840000 186650000 5438 2026 5093 49351;49352;49353;49354;49355;49356;49357;49358;49359;49360;49361;49362;49363;49364;49365;49366;49367;49368;49369;49370;49371;49372;49373;49374 62737;62738;62739;62740;62741;62742;62743;62744;62745;62746;62747;62748;62749;62750;62751;62752;62753;62754;62755;62756;62757;62758;62759;62760;62761;62762;62763;62764;62765;62766 62748 29 DAIAALGLLQK Unmodified 1111.6601 0.66010926 527 A5YKK6;H3BMZ2 CNOT1 CCR4-NOT transcription complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 118.8 118.8 2 0.013575 124730 QUIQUE_C1438_190116_001 59.368 37.921 84415000 0 0 0 0 14629000 11399000 0 0 0 0 22826000 20646000 14915000 5439 527 5094 49375;49376;49377;49378;49379 62767;62768;62769;62770;62771 62767 4 DAIAQAVR Unmodified 842.46102 0.46101552 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 26.633 26.633 1;2 0.001666 20626 QUIQUE_C1438_190116_001 139.92 79.129 16321000000 1352600000 1247100000 1648700000 1479400000 1731800000 1420900000 1612800000 702180000 1290000000 730710000 1734700000 1177100000 192930000 5440 2288 5095 49380;49381;49382;49383;49384;49385;49386;49387;49388;49389;49390;49391;49392;49393;49394;49395;49396;49397;49398 62772;62773;62774;62775;62776;62777;62778;62779;62780;62781;62782;62783;62784;62785;62786;62787;62788;62789;62790 62778 9 DAIELNAANYTVWHFR Unmodified 1918.9326 0.93259572 2525 P49354;E9PQP6;H0YCW1 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 127.87 127.87 3 0.0023792 130616 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.169 42.054 155270000 0 28261000 0 22689000 0 23447000 0 39354000 26433000 15090000 0 0 0 5441 2525 5096 49399;49400;49401;49402;49403;49404 62791;62792;62793;62794;62795;62796 62794 6 DAIFIMTSNVASDEIAQHALQLR Unmodified 2542.285 0.28497199 474;436 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078;A0A2R8Y602 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog no no 0 0 0 1 1 149.89 149.89 3 8.3259E-05 152985 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.882 49.044 91377000 0 0 0 0 0 0 0 21993000 0 0 69384000 0 0 5442 474;436 5097 49405;49406 62797;62798 62797 1 DAIGEFIR Unmodified 919.47633 0.47633123 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A1B0GW70 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 86.935 86.935 2 0.02842 87693 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 38.283 59917000 0 0 0 0 0 31271000 0 18911000 0 9734800 0 0 0 5443 135 5098 49407;49408;49409 62799;62800;62801 62800 3 DAIGISLLK Unmodified 928.55933 0.55933258 3652 Q8NFW8 CMAS N-acylneuraminate cytidylyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.25 100.25 2 0.0089591 103078 QUIQUE_C1277_190116_001 77.318 31.345 600420000 54667000 65149000 65770000 52520000 48362000 59527000 61159000 49480000 42825000 28107000 72855000 0 0 5444 3652 5099 49410;49411;49412;49413;49414;49415;49416;49417;49418;49419;49420 62802;62803;62804;62805;62806;62807;62808;62809;62810;62811;62812 62803 11 DAIHFYNK Unmodified 1006.4872 0.48723027 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.791 35.791 2 0.0048568 30931 QUIQUE_C1563_190116_001 107.59 64.679 2351400000 282050000 284940000 284360000 274570000 216130000 267980000 279030000 0 150040000 140270000 0 0 171970000 5445 2343 5100 49421;49422;49423;49424;49425;49426;49427;49428;49429;49430 62813;62814;62815;62816;62817;62818;62819;62820;62821;62822;62823;62824;62825;62826;62827 62822 15 DAIKPNLMQTLEGTPVFVHAGPFANIAHGNSSIIADR Unmodified 3900.9945 0.99449106 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 1 2 140.84 140.84 4;5 0.0032382 145975 QUIQUE_DMIX8_190116_001 27.923 18.423 108280000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 108280000 5446 1005;2027 5101 49431;49432 62828;62829 62829 2 DAILDALENLTAEELK Unmodified 1756.9095 0.90946024 4497 Q9ULZ3;H3BP42 PYCARD Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 171.9 171.9 2;3 4.3363E-07 176244 QUIQUE_C1218_190116_001 116.71 100.85 72777000 14110000 0 0 24285000 14717000 0 0 0 0 5359300 14305000 0 0 5447 4497 5102 49433;49434;49435;49436;49437;49438 62830;62831;62832;62833;62834;62835 62830 5 DAILDALENLTAEELKK Unmodified 1885.0044 0.004423261 4497 Q9ULZ3;H3BP42 PYCARD Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 161.73 161.73 2;3 7.6458E-45 166826 QUIQUE_C1368_190116_001 143.14 113.16 582830000 33695000 24677000 92116000 57625000 40696000 46888000 23220000 56044000 44175000 34388000 80429000 48875000 0 5448 4497 5103 49439;49440;49441;49442;49443;49444;49445;49446;49447;49448;49449;49450;49451;49452;49453 62836;62837;62838;62839;62840;62841;62842;62843;62844;62845;62846;62847;62848;62849;62850;62851;62852 62839 16 DAINQGMDEELER Unmodified 1518.662 0.6620361 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.697 73.697 2 1.7012E-12 74556 QUIQUE_C1576_190116_001 149.96 133.74 1758300000 231460000 177610000 175200000 157020000 107380000 245170000 176380000 54941000 81982000 74482000 109640000 71758000 95280000 5449 2013 5104 49454;49455;49456;49457;49458;49459;49460;49461;49462;49463;49464;49465;49466 62853;62854;62855;62856;62857;62858;62859;62860;62861;62862;62863;62864;62865;62866;62867;62868 62861 16 DAINQGMDEELER Oxidation (M) 1534.657 0.65695073 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 46.62 46.62 2 0.0014738 43580 QUIQUE_C1368_190116_001 110.84 100.01 210280000 0 0 73923000 0 0 60234000 0 0 0 47219000 0 0 28900000 5450 2013 5104 49467;49468;49469;49470 62869;62870;62871;62872 62869 1313 3 DAINQGMDEELERDEK Unmodified 1890.8265 0.82653525 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 64.462 64.462 2;3 1.3514E-129 63910 QUIQUE_C1277_190116_001 240.42 204.71 1930500000 93875000 83996000 118520000 364400000 65492000 76314000 94497000 74276000 439420000 0 118640000 307160000 93919000 5451 2013 5105 49471;49472;49473;49474;49475;49476;49477;49478;49479;49480;49481;49482;49483;49484;49485;49486 62873;62874;62875;62876;62877;62878;62879;62880;62881;62882;62883;62884;62885;62886;62887;62888;62889;62890;62891;62892;62893 62875 21 DAINQGMDEELERDEK Oxidation (M) 1906.8214 0.82144987 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 1 1 1 38.595 38.595 2 1.4338E-08 34545 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.99 97.85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5452 2013 5105 49487;49488 62894;62895 62895 1313 2 DAIPENLPPLTADFAEDK Unmodified 1954.9524 0.95238769 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 134.81 134.81 2 4.969E-05 131112 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.023 77.886 69833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69833000 0 0 0 + 5453 770 5106 49489 62896;62897 62897 2 DAIPENLPPLTADFAEDKDVCK Unmodified 2457.1734 0.17335586 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 120.45 120.45 3 2.9262E-05 116864 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.295 61.286 392040000 104710000 0 0 67707000 66431000 0 0 0 0 153200000 0 0 0 + 5454 770 5107 49490;49491;49492;49493 62898;62899;62900;62901;62902;62903 62902 6 DAIQNPNDIQLQEK Unmodified 1624.8057 0.80566387 4121 Q9H0Q0;C9IYV6;C9JPE5 FAM49A Protein FAM49A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.895 63.895 2 9.1232E-37 62820 QUIQUE_DMIX1_190116_001 181.68 150.19 1706100000 95717000 150230000 109910000 118950000 116090000 134140000 166080000 112000000 122710000 53730000 211330000 153470000 161710000 5455 4121 5108 49494;49495;49496;49497;49498;49499;49500;49501;49502;49503;49504;49505;49506 62904;62905;62906;62907;62908;62909;62910;62911;62912;62913;62914;62915;62916;62917;62918;62919;62920 62912 16 DAISGIGTDEK Unmodified 1104.5299 0.52988294 1936 P08133;E5RK63;E5RI05;E5RJF5 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 41.009 41.009 2 1.5299E-12 37318 QUIQUE_C1563_190116_001 163.94 65.907 5981600000 502650000 434800000 838040000 534400000 552690000 556180000 591620000 0 498890000 501060000 0 448570000 522700000 5456 1936 5109 49507;49508;49509;49510;49511;49512;49513;49514;49515;49516;49517;49518;49519 62921;62922;62923;62924;62925;62926;62927;62928;62929;62930;62931;62932;62933;62934;62935;62936;62937;62938;62939 62934 18 DAIVTIVSAMSTIIPPVPLANPENQFR Unmodified 2892.5419 0.54191496 2413 P38405;K7EPE2 GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 176.66 176.66 3;4 1.6803E-18 183488 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.423 72.99 1046700000 29311000 0 67046000 36274000 129520000 104740000 71983000 63048000 136860000 0 147530000 185690000 74728000 5457 2413 5110 49520;49521;49522;49523;49524;49525;49526;49527;49528;49529;49530;49531;49532;49533;49534 62940;62941;62942;62943;62944;62945;62946;62947;62948;62949;62950;62951;62952;62953;62954;62955;62956 62952 16 DALDGPAAEAEPEHSFDGLR Unmodified 2095.9447 0.94467655 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 3 2 1 2 3 5 3 2 2 1 90.73 90.73 2;3 4.0567E-134 92421 QUIQUE_C1277_190116_001 228.25 212.31 2048800000 27142000 151210000 188060000 98355000 96737000 82786000 0 360660000 370060000 208350000 196490000 204690000 64285000 5458 3117 5111 49535;49536;49537;49538;49539;49540;49541;49542;49543;49544;49545;49546;49547;49548;49549;49550;49551;49552;49553;49554;49555;49556;49557;49558;49559;49560;49561 62957;62958;62959;62960;62961;62962;62963;62964;62965;62966;62967;62968;62969;62970;62971;62972;62973;62974;62975;62976;62977;62978;62979;62980;62981;62982;62983;62984;62985;62986;62987;62988;62989;62990;62991 62959 33 DALDGPAAEAEPEHSFDGLRR Unmodified 2252.0458 0.045787579 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 75.943 75.943 4 9.1332E-06 75916 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.086 66.506 307010000 0 0 0 0 0 0 0 182230000 124780000 0 0 0 0 5459 3117 5112 49562;49563 62992;62993;62994 62993 3 DALDQAQQVEK Unmodified 1243.6044 0.60444487 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 42.883 42.883 2 5.3108E-09 39962 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.96 121.51 541030000 0 0 57372000 73516000 81538000 54079000 88921000 0 0 38514000 78510000 68583000 0 5460 4414 5113 49564;49565;49566;49567;49568;49569;49570;49571 62995;62996;62997;62998;62999;63000;63001;63002 63001 6 DALECLEQAEEIIQQEHSDKEEVR Unmodified 2897.3349 0.33489489 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 133.27 133.27 4 0.0010644 138016 QUIQUE_C1368_190116_001 39.021 32.991 198900000 39829000 40767000 74756000 43552000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5461 2986 5114 49572;49573;49574;49575 63003;63004;63005;63006 63005 4 DALEIYK Unmodified 850.44363 0.44363412 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 55.833 55.833 2 0.052195 51273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.616 41.503 92731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92731000 0 0 0 5462 907 5115 49576 63007 63007 1 DALEIYKR Unmodified 1006.5447 0.54474515 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.362 37.362 2 0.01004 33007 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.45 13.498 1875200000 102250000 0 147880000 143440000 113150000 0 169000000 240900000 190220000 41347000 271690000 214340000 240930000 5463 907 5116 49577;49578;49579;49580;49581;49582;49583;49584;49585;49586;49587 63008;63009;63010;63011;63012;63013;63014;63015;63016;63017;63018 63016 9 DALEPGQR Unmodified 884.43519 0.4351947 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 18.885 18.885 2 0.043045 11248 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.604 6.8172 18900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18900000 0 0 0 5464 1928 5117 49588 63019 63019 1 DALFTILHDLRPQDR Unmodified 1808.9533 0.95333116 128 G5E9D8;A0A096LP62;C9J2H1;Q86UX2 ITIH5 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5 yes no 0 0 1 1 1 126.7 126.7 3 0.0048507 133092 QUIQUE_C1438_190116_001 70.98 60.125 19134000 0 0 0 0 19134000 0 0 0 0 0 0 0 0 5465 128 5118 49589;49590 63020;63021 63020 1 DALGAQNASGER Unmodified 1187.5531 0.553078 3877 Q96I59;E9PRK2 NARS2 Probable asparagine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 20.156 20.156 2 0.00061286 13046 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.656 68.968 66032000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29128000 0 36904000 5466 3877 5119 49591;49592 63022;63023 63023 2 DALLDQIR Unmodified 942.51345 0.51344502 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.511 75.511 2 0.020996 76526 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.854 24.956 141250000 0 0 0 38923000 0 30215000 0 0 42451000 0 0 0 29658000 5467 1401 5120 49593;49594;49595;49596 63024;63025;63026;63027 63026 4 DALLLIFANK Unmodified 1116.6543 0.6542956 2394 P36406 TRIM23 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.74 129.74 2 0.00018305 133805 QUIQUE_C1277_190116_001 143.61 0 484210000 36786000 37587000 46190000 30421000 30461000 51291000 39592000 44045000 48346000 22356000 31520000 28910000 36707000 5468 2394 5121 49597;49598;49599;49600;49601;49602;49603;49604;49605;49606;49607;49608;49609 63028;63029;63030;63031;63032;63033;63034;63035;63036;63037;63038;63039;63040;63041;63042;63043;63044;63045 63030 18 DALLLWCQMK Oxidation (M) 1292.6257 0.62571436 2851;1472;2021;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTB;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.42 107.42 2 0.0011142 110652 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.83 93.568 2091400000 126650000 185180000 129110000 134260000 180760000 100640000 0 192970000 260250000 97227000 231230000 221350000 231800000 5469 2851;2021;1472;754 5122 49610;49611;49612;49613;49614;49615;49616;49617;49618;49619;49620;49621 63046;63047;63048;63049;63050;63051;63052;63053;63054;63055;63056;63057;63058;63059;63060 63058 446 14 DALLLWCQMK Unmodified 1276.6308 0.63079974 2851;1472;2021;754 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4;C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN1;SPTB;SPTBN2;SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.89 127.89 2 9.158E-06 124974 QUIQUE_DMIX4_190116_001 148.38 129.11 6931500000 488800000 571320000 434640000 494670000 494500000 309250000 483400000 601120000 715290000 186790000 771890000 657920000 721910000 5470 2851;2021;1472;754 5122 49622;49623;49624;49625;49626;49627;49628;49629;49630;49631;49632;49633;49634 63061;63062;63063;63064;63065;63066;63067;63068;63069;63070;63071;63072;63073;63074;63075;63076;63077;63078;63079;63080 63074 20 DALLSALSIQNYHLECNETK Unmodified 2318.1213 0.12126071 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 1 125.5 125.5 2;3 4.0772E-117 128639 QUIQUE_DMIX1_190116_001 221.59 204.47 10947000000 687920000 933410000 948210000 728760000 1137300000 626240000 913890000 654550000 822220000 405770000 894640000 1200800000 992930000 5471 2851 5123 49635;49636;49637;49638;49639;49640;49641;49642;49643;49644;49645;49646;49647;49648;49649;49650;49651 63081;63082;63083;63084;63085;63086;63087;63088;63089;63090;63091;63092;63093;63094;63095;63096;63097;63098;63099;63100;63101;63102;63103;63104;63105 63091 25 DALNIETAIK Unmodified 1086.5921 0.59208927 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;A6NMY6;H0YKS4;H0YMM1;H0YKZ7;H0YLV6;H0YMT9;H0YKX9;H0YKL9;H0YMW4;H0YKV8;H0YMD9;H0YNB8;H0YKN4 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.939 81.939 1;2 0.00034896 83891 QUIQUE_C1218_190116_001 152.04 74.723 1269800000 68404000 0 83137000 0 0 69122000 101020000 342360000 0 605730000 0 0 0 5472 1920 5124 49652;49653;49654;49655;49656;49657 63106;63107;63108;63109;63110;63111;63112 63106 3 DALNLAQMQEQTLQLEQQSK Unmodified 2315.1427 0.14272443 1112 H0Y2W2;Q5T2N8;J3QSF3 ATAD3A;ATAD3C ATPase family AAA domain-containing protein 3C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 131.86 131.86 2;3 5.1963E-32 137315 QUIQUE_C1218_190116_001 168.1 155.94 137440000 0 0 0 0 0 0 26235000 0 36094000 29160000 45947000 0 0 5473 1112 5125 49658;49659;49660;49661;49662;49663 63113;63114;63115;63116;63117;63118 63113 6 DALQGFK Unmodified 777.4021 0.40210366 1948;1373 M0R268;P09012;P08579 SNRPA;SNRPB2 U1 small nuclear ribonucleoprotein A;U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' no no 0 0 0 1 41.746 41.746 2 0.050466 38141 QUIQUE_C1218_190116_001 74.517 42.938 81132000 81132000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5474 1373;1948 5126 49664 63119 63119 1 DALQVAQEMK Unmodified 1131.5594 0.55940893 753 C9JY26;Q9BZG1;C9JBG0;Q96PJ7;E7ES60;J3QLC6 RAB34 Ras-related protein Rab-34 yes no 0 0 0 1 1 66.575 66.575 2 0.018905 66702 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.607 49.826 50592000 0 0 0 0 0 0 0 0 20310000 0 30283000 0 0 5475 753 5127 49665;49666 63120;63121 63120 2 DALRPPLQNINSVQLK Unmodified 1805.0159 0.015931421 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 1 1 88.374 88.374 3 0.00032991 85162 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.347 69.008 19857000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19857000 0 0 0 5476 3037 5128 49667 63122 63122 1 DALSDFFEVESELGR Unmodified 1712.7893 0.78934511 3182 Q16566;D6REY7;D6RE65;D6RCD6 CAMK4 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV yes no 0 0 0 2 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 168.46 168.46 2;3 6.2777E-54 172053 QUIQUE_C1277_190116_001 191.53 177.37 742420000 59674000 83786000 87107000 0 60698000 57051000 68997000 45826000 79796000 15437000 0 122340000 61705000 5477 3182 5129 49668;49669;49670;49671;49672;49673;49674;49675;49676;49677;49678;49679;49680;49681 63123;63124;63125;63126;63127;63128;63129;63130;63131;63132;63133;63134;63135;63136;63137 63126 15 DALSDLALHFLNK Unmodified 1455.7722 0.7721789 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 150.97 150.97 2;3 1.5733E-28 157588 QUIQUE_C1438_190116_001 196.88 171.49 12952000000 864530000 1010900000 1026900000 957520000 1112300000 942230000 1119400000 917550000 989550000 279750000 1305800000 1025000000 1400600000 5478 2573 5130 49682;49683;49684;49685;49686;49687;49688;49689;49690;49691;49692;49693;49694;49695;49696;49697;49698;49699;49700;49701;49702;49703;49704;49705;49706;49707 63138;63139;63140;63141;63142;63143;63144;63145;63146;63147;63148;63149;63150;63151;63152;63153;63154;63155;63156;63157;63158;63159;63160;63161;63162;63163;63164;63165;63166;63167;63168;63169;63170;63171;63172;63173;63174;63175;63176;63177;63178 63152 34 DALSLEEILR Unmodified 1157.6292 0.62920306 2929 Q08AE8 SPIRE1 Protein spire homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 25.05 25.05 3 0.058769 18471 QUIQUE_C1563_190116_001 26.673 12.466 7599300000 0 0 0 0 3321500000 4277800000 0 0 0 0 0 0 0 5479 2929 5131 49708;49709 63179;63180 63180 2 DALSSVQESQVAQQAR Unmodified 1715.8438 0.84384029 580 B0YIW2;P02656 APOC3 Apolipoprotein C-III yes no 0 0 0 1 1 65.302 65.302 2 4.9079E-130 66075 QUIQUE_C1438_190116_001 237.53 204.8 191800000 0 0 0 0 110420000 0 0 0 0 0 81387000 0 0 5480 580 5132 49710;49711 63181;63182;63183 63181 3 DALVNAVIDSLSAYR Unmodified 1605.8362 0.83623572 1733 O95486 SEC24A Protein transport protein Sec24A yes yes 0 0 0 1 1 1 167.31 167.31 2 3.1296E-13 172357 QUIQUE_C1368_190116_001 126.1 112.75 69755000 0 0 23405000 0 0 0 33623000 0 0 12727000 0 0 0 5481 1733 5133 49712;49713;49714 63184;63185;63186;63187 63184 3 DALVNAVVDSLSAYGSTVSNLQHSALMAPSSLK Unmodified 3344.6922 0.69222061 1734 O95487 SEC24B Protein transport protein Sec24B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 170.69 170.69 3;4 2.7619E-29 172227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.129 78.518 133520000 7441600 0 0 10558000 0 0 50771000 64750000 0 0 0 0 0 5482 1734 5134 49715;49716;49717;49718 63188;63189;63190;63191 63191 4 DALVNAVVDSLSAYGSTVSNLQHSALMAPSSLK Oxidation (M) 3360.6871 0.68713523 1734 O95487 SEC24B Protein transport protein Sec24B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 168.79 168.79 3 9.7153E-75 170677 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.37 130.31 285180000 0 0 0 0 0 0 0 63686000 112710000 12700000 46083000 50006000 0 5483 1734 5134 49719;49720;49721;49722;49723 63192;63193;63194;63195;63196 63192 946 5 DALVSGALESTK Unmodified 1189.619 0.6190323 2020 P11274 BCR Breakpoint cluster region protein yes yes 0 0 0 1 63.019 63.019 2 0.064252 62802 QUIQUE_C1576_190116_001 48.561 28.774 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5484 2020 5135 49724 63197 63197 1 DAMPSDANLNSINK Unmodified 1488.6879 0.68785692 2915 Q08209;E7ETC2 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.122 64.122 2 0.00027408 62677 QUIQUE_C1563_190116_001 90.913 73.477 541260000 0 0 67990000 157790000 0 81248000 0 118470000 0 0 0 0 115760000 5485 2915 5136 49725;49726;49727;49728;49729;49730;49731;49732 63198;63199;63200;63201;63202;63203;63204;63205;63206;63207;63208 63203 11 DAMQSFMMPFYLMK Unmodified 1738.7591 0.75911307 537 K7EIJ0;K7ENL2;A6NG10;K7EMC9;Q969T9 WBP2 WW domain-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 168.12 168.12 2 1.5618E-10 170064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.02 116.78 127700000 0 0 0 0 0 0 0 68206000 0 0 0 0 59495000 5486 537 5137 49733;49734 63209;63210 63209 2 DAMQYASESK Oxidation (M) 1144.4707 0.47065351 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 16.348 16.348 2 0.0026072 8485 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.265 76.73 610130000 40380000 123690000 23946000 60137000 0 0 0 0 114020000 101870000 19387000 126700000 0 5487 50;1314 5138 49735;49736;49737;49738;49739;49740;49741;49742 63211;63212;63213;63214;63215;63216;63217;63218 63218 28 8 DAMQYASESK Unmodified 1128.4757 0.47573888 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.323 30.323 2 2.2724E-05 24879 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.69 125.17 5960500000 552570000 529560000 504800000 620970000 465480000 462830000 602540000 339970000 383890000 176330000 455820000 376720000 489050000 5488 50;1314 5138 49743;49744;49745;49746;49747;49748;49749;49750;49751;49752;49753;49754;49755 63219;63220;63221;63222;63223;63224;63225;63226;63227;63228;63229;63230;63231;63232;63233;63234;63235;63236 63231 15 DAMTAQNTGISTLYR Unmodified 1640.7828 0.78281994 855 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 85.864 85.864 2 1.0921E-05 87064 QUIQUE_C1403_190116_001 101.71 84.798 358370000 88818000 71332000 0 57951000 0 0 0 0 76327000 0 0 0 63942000 5489 855 5139 49756;49757;49758;49759;49760 63237;63238;63239;63240;63241 63239 5 DANLYISGLPR Unmodified 1217.6404 0.64043645 3152 Q15717;M0QZR9;M0R055 ELAVL1 ELAV-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.229 96.229 2 0.00020843 98831 QUIQUE_C1277_190116_001 123.63 102.72 1401600000 123830000 120500000 147570000 95768000 98374000 107400000 102150000 105090000 99809000 47816000 146500000 113640000 93196000 5490 3152 5140 49761;49762;49763;49764;49765;49766;49767;49768;49769;49770;49771;49772;49773 63242;63243;63244;63245;63246;63247;63248;63249;63250;63251;63252;63253;63254;63255 63243 13 DANNGNLQLR Unmodified 1113.5527 0.55268407 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.5 31.5 2 0.00013216 25784 QUIQUE_C1368_190116_001 121.62 95.882 697690000 81533000 96588000 101220000 0 0 0 77229000 98595000 103580000 43695000 0 95245000 0 5491 1890 5141 49774;49775;49776;49777;49778;49779;49780;49781 63256;63257;63258;63259;63260;63261;63262;63263 63258 5 DANTQVHTLR Unmodified 1153.584 0.5839842 3921 Q96PY5 FMNL2 Formin-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 16.143 16.143 2;3 0.0065521 8075 QUIQUE_C1277_190116_001 54.094 47.075 113890000 0 40705000 0 54400000 0 0 0 0 0 18789000 0 0 0 5492 3921 5142 49782;49783;49784;49785;49786 63264;63265;63266;63267;63268;63269 63265 6 DAPELGYAK Unmodified 962.47091 0.4709115 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 39.602 39.602 2 0.042881 35649 QUIQUE_C1403_190116_001 52.716 25.191 38525000 0 0 0 38525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5493 3660 5143 49787 63270 63270 1 DAPQDFHPDR Unmodified 1196.521 0.52104959 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 23.57 23.57 3 0.019194 16203 QUIQUE_C1277_190116_001 37.968 29.436 74748000 29197000 45551000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5494 2178 5144 49788;49789 63271;63272 63272 2 DAPSGIGSIFLSASELEDGSEEMGQGAVSSSPR Unmodified 3266.4885 0.488495 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 162.26 162.26 3 3.5235E-21 169486 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.418 75.206 184180000 0 0 58076000 30701000 0 0 0 0 0 0 95404000 0 0 5495 1452 5145 49790;49791;49792 63273;63274;63275 63275 3 DAPWTASSSEK Unmodified 1177.5251 0.52513192 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394;H7C3D0 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 36.852 36.852 2 0.048316 32851 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.033 24.733 26001000 0 0 0 0 0 0 0 0 26001000 0 0 0 0 5496 2 5146 49793 63276 63276 1 DAQELYAAGENR Unmodified 1335.6055 0.6055075 2574 P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.957 47.957 2 4.7505E-19 45195 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49807;49808;49809;49810;49811;49812;49813;49814;49815;49816;49817;49818;49819;49820;49821;49822 63290;63291;63292;63293;63294;63295;63296;63297;63298;63299;63300;63301;63302;63303;63304;63305 63303 16 DAQIFIQK Unmodified 961.52328 0.52328142 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 51.403 51.403 2 0.0077002 49025 QUIQUE_C1368_190116_001 97.068 22.652 751100000 89340000 129770000 119450000 88129000 129650000 93024000 101740000 0 0 0 0 0 0 5500 1849 5150 49823;49824;49825;49826;49827;49828;49829 63306;63307;63308;63309;63310;63311;63312;63313 63309 8 DAQIGWIQTVEDLHER Unmodified 1908.933 0.93298965 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 124.52 124.52 3 0.00089626 128258 QUIQUE_C1277_190116_001 50.787 46.946 186240000 40560000 30572000 0 37679000 55983000 0 0 0 0 21443000 0 0 0 5501 4148 5151 49830;49831;49832;49833;49834;49835 63314;63315;63316;63317;63318;63319;63320 63315 6 DAQQSSSPAADNLR Unmodified 1458.6699 0.66989867 3044 Q14139;B7Z7P0 UBE4A Ubiquitin conjugation factor E4 A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.928 24.928 2 4.9088E-07 18192 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.09 121.37 224530000 36927000 0 41603000 0 53654000 0 0 0 0 15009000 0 24543000 52791000 5502 3044 5152 49836;49837;49838;49839;49840;49841 63321;63322;63323;63324;63325;63326;63327 63327 7 DAQVVQVVLDGLSNILK Unmodified 1810.02 0.020013746 1420 O00629;H7C4F6 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 176.01 176.01 2;3 2.2916E-17 182809 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.34 125.23 4174900000 201440000 163250000 217200000 49177000 229180000 463980000 386050000 250400000 688280000 11285000 473540000 561360000 479720000 5503 1420 5153 49842;49843;49844;49845;49846;49847;49848;49849;49850;49851;49852;49853;49854;49855;49856;49857;49858;49859;49860;49861;49862;49863;49864;49865;49866 63328;63329;63330;63331;63332;63333;63334;63335;63336;63337;63338;63339;63340;63341;63342;63343;63344;63345;63346;63347;63348;63349;63350;63351;63352;63353;63354;63355;63356 63351 27 DASDDLDDLNFFNQK Unmodified 1755.7588 0.75877326 2160 P20042 EIF2S2 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.71 142.71 2 3.3939E-18 145515 QUIQUE_DMIX1_190116_001 183.57 166.99 487780000 33599000 43143000 27285000 45125000 41888000 34684000 40325000 33984000 56475000 9141600 32122000 47148000 42859000 5504 2160 5154 49867;49868;49869;49870;49871;49872;49873;49874;49875;49876;49877;49878;49879 63357;63358;63359;63360;63361;63362;63363;63364;63365;63366;63367;63368;63369;63370;63371;63372 63367 15 DASDQNFDYMFK Unmodified 1479.5976 0.59764493 2164 P20337 RAB3B Ras-related protein Rab-3B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 109.97 109.97 2 0.00017399 113782 QUIQUE_C1368_190116_001 125.75 96.274 783600000 0 115520000 115780000 97525000 0 87421000 0 0 92230000 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63403;63404;63405;63406;63407;63408;63409;63410;63411;63412;63413 63404 11 DASIFQWR Unmodified 1021.4981 0.49812931 648 G3V195;B7WPE2;Q32P44;H7C355 EML3 Echinoderm microtubule-associated protein-like 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.66 107.66 2 0.015753 112898 QUIQUE_C1438_190116_001 84.244 60.815 15919000 0 0 0 0 15919000 0 0 0 0 0 0 0 0 5511 648 5160 49916;49917;49918;49919;49920;49921 63414;63415;63416;63417;63418;63419 63416 6 DASIVGFFDDSFSEAHSEFLK Unmodified 2347.0645 0.064457335 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 3 3 3 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 161.11 161.11 2;3 8.0289E-65 165139 QUIQUE_C1277_190116_001 168.2 159.18 6451600000 834920000 751720000 826420000 518720000 680260000 67930000 700610000 236640000 327220000 246100000 369840000 495810000 395440000 5512 2308 5161 49922;49923;49924;49925;49926;49927;49928;49929;49930;49931;49932;49933;49934;49935;49936;49937;49938;49939;49940;49941;49942;49943;49944;49945;49946 63420;63421;63422;63423;63424;63425;63426;63427;63428;63429;63430;63431;63432;63433;63434;63435;63436;63437;63438;63439;63440;63441;63442;63443;63444;63445;63446;63447;63448;63449;63450;63451;63452;63453;63454;63455 63425 30 DASLMVTNDGATILK Unmodified 1547.7865 0.78650834 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 103.21 103.21 2 5.5658E-14 105213 QUIQUE_C1368_190116_001 142.08 118.77 54524000 54524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5513 2810 5162 49947;49948;49949;49950;49951;49952;49953;49954;49955;49956;49957 63456;63457;63458;63459;63460;63461;63462;63463;63464;63465;63466 63460 11 DASLMVTNDGATILK Oxidation (M) 1563.7814 0.78142296 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 87.756 87.756 2 0.00040242 84374 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.676 75.573 70230000 0 0 0 0 0 0 0 37741000 0 32489000 0 0 0 5514 2810 5162 49958;49959;49960 63467;63468;63469 63469 2256 3 DASLVFK Unmodified 778.4225 0.42250475 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 53.128 53.128 2 0.039849 51417 QUIQUE_C1368_190116_001 83.377 17.705 31647000 0 0 31647000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5515 2718 5163 49961 63470;63471 63470 2 DASLVVTTSGDHK Unmodified 1328.6572 0.65720872 716 C9JG97;C9JEH3;Q13685;H7C0R2 AAMP Angio-associated migratory cell protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.604 26.604 2 4.2689E-10 20504 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.99 110.48 412650000 34591000 35751000 32315000 23860000 32042000 36981000 49104000 26956000 25155000 17944000 36578000 24596000 36774000 5516 716 5164 49962;49963;49964;49965;49966;49967;49968;49969;49970;49971;49972;49973;49974 63472;63473;63474;63475;63476;63477;63478;63479;63480;63481;63482;63483;63484;63485 63483 14 DASSQGFLPHFQHFATQAIHVGQDPEQWTSR Unmodified 3521.6501 0.65011329 2352 P32929 CTH Cystathionine gamma-lyase yes yes 0 0 0 1 130.31 130.31 4 0.065952 135161 QUIQUE_DMIX8_190116_001 14.978 10.874 67066000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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5520 2851 5168 49978;49979;49980;49981;49982;49983;49984;49985;49986;49987;49988;49989;49990;49991;49992;49993;49994;49995;49996;49997;49998;49999;50000;50001;50002;50003;50004;50005;50006 63489;63490;63491;63492;63493;63494;63495;63496;63497;63498;63499;63500;63501;63502;63503;63504;63505;63506;63507;63508;63509;63510;63511;63512;63513;63514;63515;63516;63517;63518;63519;63520;63521;63522;63523;63524;63525;63526;63527;63528;63529;63530;63531;63532;63533;63534;63535;63536;63537;63538;63539;63540;63541;63542;63543;63544;63545;63546;63547;63548 63493 60 DASVPLIDVTNLPTPR Unmodified 1706.9203 0.9202997 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 2 1 133 133 2 0.0069105 137869 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.343 37.711 39767000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39767000 5521 3797 5169 50007;50008;50009 63549;63550;63551 63551 3 DATHDEAVQALK Unmodified 1296.631 0.63099397 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 29.733 29.733 2;3 6.9669E-07 24183 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974.50327 0.50327426 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.274 53.274 2 0.00011524 51896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.01 96.016 3547700000 329360000 245860000 375620000 256060000 213700000 282960000 232390000 253570000 296610000 195080000 340570000 240840000 285100000 5525 1153 5173 50031;50032;50033;50034;50035;50036;50037;50038;50039;50040;50041;50042;50043 63574;63575;63576;63577;63578;63579;63580;63581;63582;63583;63584;63585;63586;63587;63588;63589;63590;63591 63589 18 DATNVAAAFEEAVR Unmodified 1462.7052 0.70522155 2577 P51151 RAB9A Ras-related protein Rab-9A yes yes 0 0 0 1 125.83 125.83 2 0.00081981 132411 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.114 72.761 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5526 2577 5174 50044 63592 63592 1 DATNVGDEGGFAPNILENK Unmodified 1959.9174 0.91739917 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 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63716;63717;63718;63719;63720;63721;63722;63723 63721 8 DAVALCELFNWLEK Unmodified 1706.8338 0.83379288 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 172.12 172.12 2;3 7.8592E-29 175540 QUIQUE_C1277_190116_001 174.1 155.35 1316900000 0 104050000 37632000 114760000 76563000 60602000 107740000 79197000 168800000 21358000 255980000 203500000 86660000 5532 4259 5180 50130;50131;50132;50133;50134;50135;50136;50137;50138;50139;50140;50141;50142;50143;50144;50145;50146 63724;63725;63726;63727;63728;63729;63730;63731;63732;63733;63734;63735;63736;63737;63738;63739;63740 63725 16 DAVDWVHYK Unmodified 1131.5349 0.53490874 2552 P49902;Q5JUV4;Q5JUV3 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.384 65.384 2;3 0.016045 64588 QUIQUE_C1403_190116_001 67.169 40.039 516360000 89800000 52183000 0 41564000 43276000 26558000 44630000 55147000 0 13090000 61416000 0 88696000 5533 2552 5181 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63789;63790;63791;63792;63793;63794;63795;63796;63797 63790 9 DAVLLLFANK Unmodified 1102.6386 0.63864553 2134 P18085;C9JAK5;C9JPM4;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.42 128.42 2 0.0021417 130704 QUIQUE_C1563_190116_001 105.57 89.274 1304500000 122220000 114740000 150620000 111650000 0 137590000 130530000 40695000 126320000 69826000 129610000 71854000 98886000 5538 2134 5186 50198;50199;50200;50201;50202;50203;50204;50205;50206;50207;50208;50209 63798;63799;63800;63801;63802;63803;63804;63805;63806;63807;63808;63809;63810;63811;63812;63813 63804 16 DAVLLVFANK Unmodified 1088.623 0.62299547 2827;2828 P84085;C9J1Z8;P84077;P61204;F5H423 ARF5;ARF1;ARF3 ADP-ribosylation factor 5;ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3 no no 0 0 0 1 2 1 1 2 3 2 1 2 1 3 2 2 112.27 112.27 2 4.7495E-05 117980 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.61 109.52 8005600000 842280000 758470000 645620000 682420000 536190000 619910000 693310000 402110000 507420000 699190000 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Proteasome subunit beta type-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 127.88 127.88 2;3 8.4105E-06 131927 QUIQUE_C1277_190116_001 116.71 99.8 2011600000 204900000 231240000 187950000 191240000 174020000 188160000 83371000 150140000 119290000 84513000 151720000 109940000 135140000 5541 2537 5189 50237;50238;50239;50240;50241;50242;50243;50244;50245;50246;50247;50248;50249;50250;50251;50252;50253;50254;50255;50256;50257;50258;50259;50260;50261 63880;63881;63882;63883;63884;63885;63886;63887;63888;63889;63890;63891;63892;63893;63894;63895;63896;63897;63898;63899;63900;63901;63902;63903;63904;63905;63906;63907;63908;63909;63910;63911;63912 63883 32 DAVSGMGVIVHIIEK Oxidation (M) 1582.8389 0.83887826 2537 P49720 PSMB3 Proteasome subunit beta type-3 yes yes 0 1 0 2 1 1 1 87.851 87.851 3 0.0010414 89026 QUIQUE_C1368_190116_001 62.055 51.774 155430000 0 81872000 31409000 0 19761000 0 0 0 0 22386000 0 0 0 5542 2537 5189 50262;50263;50264;50265;50266 63913;63914;63915;63916;63917 63915 1984 5 DAVSGMGVIVHIIEKDK Unmodified 1809.9659 0.96586969 2537 P49720 PSMB3 Proteasome subunit beta type-3 yes yes 0 0 1 1 121.64 121.64 3 0.0006253 124235 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.809 55.694 100510000 0 0 0 0 0 0 0 100510000 0 0 0 0 0 5543 2537 5190 50267 63918 63918 1 DAVSNTTNQLESK Unmodified 1405.6685 0.66850169 3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.964 45.964 2 4.5224E-08 43308 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.64 136.47 819290000 72417000 95919000 83100000 72130000 97696000 85698000 83482000 50203000 84540000 0 0 94102000 0 5544 3490 5191 50268;50269;50270;50271;50272;50273;50274;50275;50276;50277;50278 63919;63920;63921;63922;63923;63924;63925;63926;63927;63928;63929;63930;63931 63927 13 DAVTYTEHAK Unmodified 1133.5353 0.53530267 2762 P62805 HIST1H4A Histone H4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 16.188 16.188 2;3 0.0001513 8288 QUIQUE_C1277_190116_001 120.87 84.108 2945600000 120860000 296290000 0 0 0 141930000 0 513220000 712660000 659350000 0 501320000 0 5545 2762 5192 50279;50280;50281;50282;50283;50284;50285;50286 63932;63933;63934;63935;63936;63937;63938;63939;63940 63933 8 DAVTYTEHAKR Unmodified 1289.6364 0.6364137 2762 P62805 HIST1H4A Histone H4 yes yes 0 0 1 1 12.771 12.771 3 0.053013 4990 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.995 26.676 1360900 0 0 0 0 0 0 0 1360900 0 0 0 0 0 5546 2762 5193 50287 63941 63941 1 DAVVQHSQLAAAVENLK Unmodified 1791.9479 0.94791144 1585 O60645;D6RB59 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 86.596 86.596 2;3 6.8656E-13 88003 QUIQUE_C1403_190116_001 99.021 89.616 500840000 42999000 51012000 41459000 56586000 45997000 37443000 75327000 0 0 26569000 43371000 43489000 36592000 5547 1585 5194 50288;50289;50290;50291;50292;50293;50294;50295;50296;50297;50298;50299;50300 63942;63943;63944;63945;63946;63947;63948;63949;63950;63951;63952;63953;63954;63955 63945 14 DAVVYPILVEFTR Unmodified 1520.8239 0.82388012 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 157.32 157.32 2;3 8.814E-06 152109 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.51 109.13 985240000 108970000 112350000 103180000 110460000 0 93695000 92845000 56363000 92893000 31914000 0 91174000 91400000 5548 89 5195 50301;50302;50303;50304;50305;50306;50307;50308;50309;50310;50311;50312;50313;50314;50315;50316;50317;50318;50319;50320 63956;63957;63958;63959;63960;63961;63962;63963;63964;63965;63966;63967;63968;63969;63970;63971;63972;63973;63974;63975;63976;63977;63978;63979 63975 24 DAWEIPR Unmodified 885.43447 0.43446642 1305;2048;1934 J3QRU1;P07947;P12931;P07948;H0Y3C5;J3KPD6;F6SF04;P08631 YES1;SRC;LYN;HCK Non-specific protein-tyrosine kinase;Tyrosine-protein kinase Yes;Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src;Tyrosine-protein kinase Lyn;Tyrosine-protein kinase HCK no no 0 0 0 1 75.177 75.177 2 0.053305 75324 QUIQUE_C1277_190116_001 73.039 49.067 58886000 0 58886000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5549 1305;2048;1934 5196 50321 63980;63981 63980 2 DAWVQAIESQILASLQSCESSK Unmodified 2449.1795 0.17950387 876;4521 E7EUN2;A0A087X1U1;F5GXM9;H7C0A7;Q9UPQ3 AGAP1 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 173.39 173.39 3 0.0002125 178396 QUIQUE_C1576_190116_001 50.055 46.899 25313000 0 0 0 0 0 0 8460700 0 0 0 0 16853000 0 5550 876;4521 5197 50322;50323 63982;63983 63982 2 DAWWAEIR Unmodified 1045.4981 0.49812931 3524 Q86YS7;H0YGU7 C2CD5 C2 domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 119.48 119.48 2 0.037693 124049 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.999 32.426 12928000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12928000 5551 3524 5198 50324 63984 63984 1 DAYCSEVK Unmodified 970.4066 0.40659669 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 19.999 19.999 2 0.022385 13137 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.255 38.761 315780000 0 0 0 0 0 0 0 202220000 113560000 0 0 0 0 5552 2483 5199 50325;50326 63985;63986 63985 2 DAYELQEVIGSGATAVVQAALCK Unmodified 2392.1944 0.19442565 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 170.76 170.76 3 0.0016017 175081 QUIQUE_C1218_190116_001 37.817 35.909 26022000 26022000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5553 4417 5200 50327 63987 63987 1 DAYELQEVIGSGATAVVQAALCKPR Unmodified 2645.3483 0.34830053 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 1 2 3 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 162.84 162.84 2;3;4 1.0295E-36 166836 QUIQUE_C1403_190116_001 137.16 129.88 2106300000 144960000 187300000 173540000 149420000 149610000 127080000 187190000 147250000 202040000 5408600 206700000 158020000 267790000 5554 4417 5201 50328;50329;50330;50331;50332;50333;50334;50335;50336;50337;50338;50339;50340;50341;50342;50343;50344;50345;50346;50347;50348;50349;50350 63988;63989;63990;63991;63992;63993;63994;63995;63996;63997;63998;63999;64000;64001;64002;64003;64004;64005;64006;64007;64008;64009;64010;64011;64012;64013;64014 63999 25 DAYQVILDGVK Unmodified 1219.6449 0.64485312 1073 G3V1C3;Q9BZZ5;E9PQK6 API5 Apoptosis inhibitor 5 yes no 0 0 0 1 111.11 111.11 2 0.0074138 107956 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.499 40.687 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5555 1073 5202 50351 64015 64015 1 DAYSGGAVNLYHVR Unmodified 1520.7372 0.73719038 2276 P28074 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 62.714 62.714 2;3 2.8072E-05 62524 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.53 100.86 2299200000 0 146490000 154120000 0 327940000 174200000 152430000 265130000 203350000 70953000 283080000 242320000 279230000 5556 2276 5203 50352;50353;50354;50355;50356;50357;50358;50359;50360;50361;50362;50363;50364;50365;50366;50367;50368;50369 64016;64017;64018;64019;64020;64021;64022;64023;64024;64025;64026;64027;64028;64029;64030;64031;64032;64033;64034;64035 64030 19 DCALSPDELKDLFK Unmodified 1649.7971 0.79707302 3548 Q8IXI2;H7BXZ6 RHOT1 Mitochondrial Rho GTPase 1;Mitochondrial Rho GTPase yes no 0 0 1 1 129.35 129.35 3 0.046065 135848 QUIQUE_C1438_190116_001 38.376 27.431 20400000 0 0 0 0 20400000 0 0 0 0 0 0 0 0 5557 3548 5204 50370 64036 64036 0 DCAVIVTQK Unmodified 1032.5274 0.52738052 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1;G3V3U4 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.361 28.361 2 0.0018648 22550 QUIQUE_C1277_190116_001 99.305 81.61 554840000 0 83933000 122170000 80343000 63587000 86074000 69244000 0 49491000 0 0 0 0 5558 1091 5205 50371;50372;50373;50374;50375;50376;50377 64037;64038;64039;64040;64041;64042;64043;64044 64037 8 DCDLQEDACYNCGR Unmodified 1774.6345 0.6345175 2756 P62633 CNBP Cellular nucleic acid-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 53.323 53.323 2 9.1043E-05 51226 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.2 132.94 180300000 24951000 41377000 0 39464000 0 0 0 36064000 0 0 0 0 38448000 5559 2756 5206 50378;50379;50380;50381;50382;50383 64045;64046;64047;64048;64049;64050;64051 64049 7 DCEDPNPLIR Unmodified 1227.5554 0.55538619 2777;2938 P63010;A0A087WU93;A0A087WZQ6;K7ERB2;K7EN71;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.855 57.855 2 2.5224E-07 55995 QUIQUE_C1563_190116_001 159.04 151.82 5121300000 465560000 584890000 498430000 503880000 541740000 416860000 557130000 197070000 0 0 460260000 424230000 471300000 5560 2777;2938 5207 50384;50385;50386;50387;50388;50389;50390;50391;50392;50393;50394;50395 64052;64053;64054;64055;64056;64057;64058;64059;64060;64061;64062;64063;64064;64065 64058 14 DCEECIQLEPTFIK Unmodified 1780.8012 0.80117212 2343 P31948;H0YGI8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.63 116.63 2 3.1862E-07 120180 QUIQUE_C1277_190116_001 128.08 116.6 1507400000 248180000 268690000 262930000 0 0 247580000 288990000 0 0 0 87997000 0 103050000 5561 2343 5208 50396;50397;50398;50399;50400;50401;50402;50403 64066;64067;64068;64069;64070;64071;64072;64073;64074 64067 9 DCEQAENWMAAR Oxidation (M) 1495.582 0.58201164 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.464 46.464 2 3.6907E-06 43575 QUIQUE_C1368_190116_001 137.85 132.31 1367300000 68422000 125870000 100280000 104920000 80511000 76143000 105410000 96245000 117750000 57834000 152120000 141600000 140200000 5562 267;275;3025 5209 50404;50405;50406;50407;50408;50409;50410;50411;50412;50413;50414;50415;50416 64075;64076;64077;64078;64079;64080;64081;64082;64083;64084;64085;64086;64087;64088;64089;64090;64091;64092;64093;64094;64095;64096;64097;64098;64099;64100;64101 64079 155 27 DCEQAENWMAAR Unmodified 1479.5871 0.58709702 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.93 73.93 2 3.6435E-37 75674 QUIQUE_C1218_190116_001 186.78 177.81 5943200000 376560000 592590000 718080000 469840000 523540000 430580000 625550000 237180000 330950000 121050000 597770000 413640000 505860000 5563 267;275;3025 5209 50417;50418;50419;50420;50421;50422;50423;50424;50425;50426;50427;50428;50429 64102;64103;64104;64105;64106;64107;64108;64109;64110;64111;64112;64113;64114;64115;64116;64117;64118 64103 17 DCEVVMMIGLPGAGK Unmodified 1575.7459 0.74590585 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7;A0A1W2PQD4 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 132.67 132.67 2 1.3992E-05 137434 QUIQUE_C1368_190116_001 96.015 87.615 183090000 24046000 37399000 29426000 0 0 37855000 54363000 0 0 0 0 0 0 5564 2849 5210 50430;50431;50432;50433;50434;50435 64119;64120;64121;64122;64123;64124 64121 6 DCFGCLR Unmodified 926.37386 0.37385677 1643 O75531 BANF1 Barrier-to-autointegration factor;Barrier-to-autointegration factor, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 48.684 48.684 2 0.054113 46311 QUIQUE_C1368_190116_001 72.618 62.868 45616000 0 0 45616000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5565 1643 5211 50436 64125 64125 1 DCFIIYQGHHGDVGAPIADVILPGAAYTEK Unmodified 3226.5757 0.57573428 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 1 2 133.76 133.76 3;4 1.075E-30 138370 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.37 93.262 2607200000 451680000 154120000 186150000 133220000 300940000 331670000 114660000 0 212670000 0 320070000 148170000 253900000 5566 2280 5212 50437;50438;50439;50440;50441;50442;50443;50444;50445;50446;50447;50448;50449;50450;50451;50452;50453;50454 64126;64127;64128;64129;64130;64131;64132;64133;64134;64135;64136;64137;64138;64139;64140;64141;64142;64143;64144;64145;64146;64147;64148;64149;64150 64140 22 DCFTCSNCK Unmodified 1190.4155 0.41546359 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.094 20.094 2 0.00045761 12757 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.1 113.73 2618800000 362690000 574380000 0 311010000 0 280480000 0 0 0 152270000 434850000 503140000 0 5567 3283 5213 50455;50456;50457;50458;50459;50460;50461 64151;64152;64153;64154;64155;64156;64157 64155 2 DCGATWVVLGHSER Unmodified 1585.7307 0.73072479 2688 P60174;U3KPZ0;U3KQF3;U3KPS5 TPI1 Triosephosphate isomerase yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 3 2 3 2 3 2 2 73.609 73.609 2;3 2.7035E-241 75081 QUIQUE_C1368_190116_001 296.14 261.6 65497000000 4883100000 5949700000 6094800000 5226100000 4279000000 4389700000 5711400000 4718100000 4397400000 2243500000 6385200000 4567500000 6651300000 5568 2688 5214 50462;50463;50464;50465;50466;50467;50468;50469;50470;50471;50472;50473;50474;50475;50476;50477;50478;50479;50480;50481;50482;50483;50484;50485;50486;50487;50488;50489;50490;50491 64158;64159;64160;64161;64162;64163;64164;64165;64166;64167;64168;64169;64170;64171;64172;64173;64174;64175;64176;64177;64178;64179;64180;64181;64182;64183;64184;64185;64186;64187;64188;64189;64190;64191;64192;64193;64194;64195;64196;64197;64198;64199;64200;64201;64202;64203;64204;64205;64206;64207;64208;64209;64210;64211;64212;64213;64214;64215;64216;64217;64218;64219;64220;64221;64222 64175 65 DCGEATAQWITSFLK Unmodified 1725.8032 0.80322103 3332 Q5VT66;H7BYZ9 MARC1 Mitochondrial amidoxime-reducing component 1 yes no 0 0 0 1 162.41 162.41 2 0.02012 164428 QUIQUE_C1563_190116_001 60.301 49.082 9730200 0 0 0 0 0 9730200 0 0 0 0 0 0 0 5569 3332 5215 50492 64223 64223 0 DCGFLSQALSFR Unmodified 1399.6554 0.65543458 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.05 140.05 2 3.4762E-05 145665 QUIQUE_C1218_190116_001 128.03 117.95 941320000 104420000 105330000 93586000 77400000 87055000 69860000 119790000 51059000 72672000 35955000 124190000 0 0 5570 487 5216 50493;50494;50495;50496;50497;50498;50499;50500;50501;50502;50503 64224;64225;64226;64227;64228;64229;64230;64231;64232;64233;64234;64235 64224 10 DCGGAAAVLGAFR Unmodified 1263.603 0.60300508 3639 Q8NDH3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes yes 0 0 0 1 1 1 108.28 108.28 2 0.00043576 112114 QUIQUE_C1368_190116_001 111.06 100.35 79500000 0 0 46672000 0 0 0 32828000 0 0 0 0 0 0 5571 3639 5217 50504;50505;50506 64236;64237;64238 64236 3 DCGSVDGVIK Unmodified 1048.4859 0.48590964 850 J3KMY5;G3V3E8;E7EMS2;G3V3D1;P61916;G3V2V8 NPC2 Epididymal secretory protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 39.355 39.355 2 0.048195 35927 QUIQUE_C1218_190116_001 48.423 31.46 124670000 49164000 0 0 75502000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5572 850 5218 50507;50508;50509 64239;64240;64241 64239 3 DCHHLGIQNNFDYK Unmodified 1759.7737 0.77365224 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 50.022 50.022 3 0.019327 47006 QUIQUE_C1563_190116_001 38.933 32.352 82831000 0 0 0 0 0 82831000 0 0 0 0 0 0 0 5573 4598 5219 50510 64242 64242 1 DCHHLGIQNNFDYKR Unmodified 1915.8748 0.87476327 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 1 1 38.681 38.681 4 0.060152 34517 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.431 16.527 62126000 0 0 0 0 0 0 0 62126000 0 0 0 0 0 5574 4598 5220 50511 64243 64243 1 DCLCQLCAQPMSSSPK Oxidation (M) 1896.7838 0.78382427 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 1 0 1 56.9 56.9 2 0.014174 55738 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.483 37.05 35736000 0 0 0 0 0 0 0 0 35736000 0 0 0 0 5575 151 5221 50512 64244 64244 1 DCLINAAK Unmodified 903.4484 0.44840192 2132 P17987;E7ERF2;F5H136;F5H7Y1 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.431 32.431 2 0.0058019 27727 QUIQUE_C1218_190116_001 104.11 76.974 1487200000 235610000 0 316510000 240960000 0 242960000 264760000 108360000 0 78064000 0 0 0 5576 2132 5222 50513;50514;50515;50516;50517;50518;50519;50520 64245;64246;64247;64248;64249;64250;64251;64252;64253 64245 9 DCLIPMGITSENVAER Unmodified 1803.8495 0.8495193 1956 P09110;C9JDE9;H0Y4D4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 115.08 115.08 2 0.0047683 119067 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.602 54.062 663600000 0 0 0 113510000 0 100970000 125040000 0 90231000 0 106180000 0 127680000 5577 1956 5223 50521;50522;50523;50524;50525;50526 64254;64255;64256;64257;64258;64259 64259 4 DCLLELIEQK Unmodified 1259.6431 0.64313856 3318 Q5T6V5;Q5T6V7 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.41 131.41 2 0.00091605 137775 QUIQUE_C1438_190116_001 104.2 89.991 969350000 68454000 51463000 92458000 66101000 82119000 77635000 0 76072000 125350000 40706000 108920000 71289000 108790000 5578 3318 5224 50527;50528;50529;50530;50531;50532;50533;50534;50535;50536;50537;50538 64260;64261;64262;64263;64264;64265;64266;64267;64268;64269;64270;64271;64272 64265 10 DCLPELK Unmodified 873.4266 0.42660385 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 50.853 50.853 2 0.035909 48833 QUIQUE_C1403_190116_001 86.512 60.686 311010000 0 0 0 72932000 85572000 72178000 0 0 80330000 0 0 0 0 5579 1108;1404 5225 50539;50540;50541;50542 64273;64274;64275;64276;64277 64273 5 DCLTESNLIK Unmodified 1191.5805 0.58053831 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 66.141 66.141 2 0.028317 66984 QUIQUE_C1438_190116_001 55.064 17.336 98065000 0 0 0 0 98065000 0 0 0 0 0 0 0 0 5580 2190 5226 50543 64278 64278 1 DCLTPVMAVNMLTQQEVPVVILAK Unmodified 2668.4002 0.40020145 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 169.26 169.26 3 9.1965E-15 174163 QUIQUE_C1368_190116_001 106.69 100.7 73638000 0 0 27145000 22814000 23679000 0 0 0 0 0 0 0 0 5581 3100 5227 50544;50545;50546 64279;64280;64281 64279 3 DCLVLESFK Unmodified 1109.5427 0.54269624 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 98.018 98.018 2 0.022113 100452 QUIQUE_C1277_190116_001 61.679 14.105 58579000 0 58579000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5582 1570 5228 50547;50548;50549 64282;64283;64284 64282 3 DCLYEVFDDLESK Unmodified 1631.7025 0.70250394 962 E9PMJ2;J3KP39;Q9BPY3;E9PMW3 FAM118B Protein FAM118B yes no 0 0 0 1 1 1 1 145.42 145.42 2 0.00066294 149637 QUIQUE_C1277_190116_001 86.463 71.49 71116000 18808000 30887000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21421000 5583 962 5229 50550;50551;50552;50553 64285;64286;64287;64288 64286 4 DCPDPCIGW Unmodified 1118.4161 0.41611551 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 115.96 115.96 2 0.052219 118997 QUIQUE_C1403_190116_001 50.127 48.662 15154000 0 0 0 15154000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5584 341 5230 50554 64289 64289 1 DCPDSAEEYER Unmodified 1369.5092 0.50922386 3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 31.233 31.233 2 0.016638 26167 QUIQUE_C1277_190116_001 63.184 56.593 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5585 292;3442 5231 50555;50556 64290;64291 64290 2 DCPGTAEEYER Unmodified 1325.5194 0.51939461 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.803 29.803 2 0.0041614 23780 QUIQUE_C1368_190116_001 87.149 56.585 20996000 0 0 0 0 0 0 20996000 0 0 0 0 0 0 5586 882 5232 50557;50558;50559;50560;50561;50562;50563 64292;64293;64294;64295;64296;64297;64298 64292 7 DCPSGHLSMEEFKK Unmodified 1663.7334 0.73342691 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1;E5RJJ6;E5RGZ0;E5RI95;A0A1B0GXG3;E5RHE8;E5RI78;E5RHC8;E5RIG4;E5RIA5;E5RK89;E5RFL9;E5RJT1;E5RIX3 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.517 42.517 3 8.4458E-05 38570 QUIQUE_C1403_190116_001 73.022 68.631 352770000 56887000 68653000 0 58803000 48446000 0 0 27543000 0 14408000 39522000 38511000 0 5587 2726 5233 50564;50565;50566;50567;50568;50569;50570;50571 64299;64300;64301;64302;64303;64304;64305;64306 64301 8 DCPSGILNLEEFQQLYIK Unmodified 2166.0667 0.066705942 4498 Q9UM19;B4DGW9 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 161.27 161.27 2;3 6.9435E-105 165266 QUIQUE_C1277_190116_001 218.5 202.15 1774600000 143420000 191350000 117050000 105110000 112060000 129410000 165790000 127380000 139370000 43695000 129820000 223390000 146780000 5588 4498 5234 50572;50573;50574;50575;50576;50577;50578;50579;50580;50581;50582;50583;50584;50585;50586;50587;50588;50589;50590;50591;50592;50593;50594;50595 64307;64308;64309;64310;64311;64312;64313;64314;64315;64316;64317;64318;64319;64320;64321;64322;64323;64324;64325;64326;64327;64328;64329;64330;64331;64332;64333;64334;64335;64336;64337;64338 64313 30 DCPSGQLDAAGFQK Unmodified 1492.6616 0.66164217 2741 P62166 NCS1 Neuronal calcium sensor 1 yes yes 0 0 0 1 1 59.583 59.583 2 0.0068765 58507 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Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.025 87.025 3 0.0057308 88585 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.823 41.453 568840000 88637000 76296000 69173000 0 49588000 0 89833000 0 0 0 61091000 62210000 72013000 5592 2826 5238 50613;50614;50615;50616;50617;50618;50619;50620 64360;64361;64362;64363;64364;64365;64366;64367 64367 8 DCPVPLPGDGDLLVR Unmodified 1621.8134 0.81339179 3592 Q8N4Q0 ZADH2 Zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 122.4 122.4 2 0.0034028 126740 QUIQUE_C1218_190116_001 62.89 47.918 86057000 86057000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5593 3592 5239 50621 64368 64368 1 DCPVSSYNEWDPLEEVIVGR Unmodified 2363.074 0.073976164 2563 P50440;H0YKW9 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 163.09 163.09 2;3 3.0189E-18 170359 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.75 143.19 1000500000 63996000 144740000 106550000 98855000 0 145230000 0 40508000 66922000 15093000 120040000 198580000 0 5594 2563 5240 50622;50623;50624;50625;50626;50627;50628;50629;50630;50631;50632;50633;50634;50635;50636 64369;64370;64371;64372;64373;64374;64375;64376;64377;64378;64379;64380;64381;64382;64383;64384 64381 15 DCPYMCAYK Unmodified 1206.4508 0.45078646 2842 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.596 54.596 2 0.041244 52717 QUIQUE_C1368_190116_001 53.17 47.873 252070000 0 62111000 59032000 60137000 0 0 70790000 0 0 0 0 0 0 5595 2842 5241 50637;50638;50639;50640 64385;64386;64387;64388 64386 4 DCQEASGHLESR Unmodified 1387.5786 0.57864083 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 14.685 14.685 2;3 0.0050221 6374 QUIQUE_C1563_190116_001 71.241 58.104 74188000 0 28006000 0 0 0 46182000 0 0 0 0 0 0 0 5596 1058 5242 50641;50642;50643 64389;64390;64391 64391 2 DCQLNAHKDHQYQFLEDAVR Unmodified 2486.1397 0.13970474 2983 Q13263;M0R3C0;M0R2I3 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 1 1 1 1 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ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 119.38 119.38 2 0.011256 122725 QUIQUE_C1403_190116_001 73.499 63.844 119420000 38420000 0 0 46410000 0 0 0 21140000 0 13446000 0 0 0 5600 2283 5246 50659;50660;50661;50662 64407;64408;64409;64410 64408 2 DCTALLHLFHAAVQR Unmodified 1750.8937 0.8937078 3647 Q8NFF5;Q5T196 FLAD1 FAD synthase;Molybdenum cofactor biosynthesis protein-like region;FAD synthase region yes no 0 0 0 1 1 1 1 115.98 115.98 3 0.0013334 113346 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.401 49.916 96395000 26693000 27096000 0 0 0 31710000 0 0 0 10897000 0 0 0 5601 3647 5247 50663;50664;50665;50666 64411;64412;64413;64414 64414 3 DCTPIEYPKPDGQISFDLLSSVALSGTNHEHDQPAHLTLR Unmodified 4458.155 0.15502704 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 135.21 135.21 5 0.010409 140026 QUIQUE_C1218_190116_001 21.665 17.552 33165000 33165000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5602 3169 5248 50667 64415 64415 1 DCTVEMPILK Unmodified 1204.5832 0.58318084 2989;2682 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1;E7EUB3;Q5SQP8;P56545 CTBP1;CTBP2 C-terminal-binding protein 1;C-terminal-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.066 91.066 2 0.017608 94448 QUIQUE_C1438_190116_001 61.679 48.031 652800000 0 76133000 68586000 86513000 49363000 59584000 58364000 0 61362000 0 74868000 60276000 57749000 5603 2989;2682 5249 50668;50669;50670;50671;50672;50673;50674;50675;50676;50677 64416;64417;64418;64419;64420;64421;64422;64423;64424;64425;64426;64427 64420 12 DCVGPEVEK Unmodified 1031.4594 0.45936054 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.253 23.253 2 0.0062856 16610 QUIQUE_C1277_190116_001 84.743 69.111 13917000000 2126300000 2186200000 0 2039300000 0 1710200000 2033900000 1197800000 0 695310000 1928400000 0 0 5604 1790 5250 50678;50679;50680;50681;50682;50683;50684;50685 64428;64429;64430;64431;64432;64433;64434;64435 64429 7 DCVSPSEYTAACSR Unmodified 1601.645 0.64500583 4467 Q9UK41;E9PQR7 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.099 48.099 2 1.1917E-07 45671 QUIQUE_C1218_190116_001 129.84 126.8 308640000 30862000 33099000 42036000 0 0 0 52807000 30513000 35229000 0 39508000 0 44582000 5605 4467 5251 50686;50687;50688;50689;50690;50691;50692;50693;50694 64436;64437;64438;64439;64440;64441;64442;64443;64444;64445 64436 10 DDAGIRAVCQR Unmodified 1259.6041 0.60406772 4299 Q9NUQ8;F8WCU6 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes no 0 0 1 1 31.841 31.841 3 0.0070325 26534 QUIQUE_C1218_190116_001 51.927 34.901 92148000 92148000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5606 4299 5252 50695 64446 64446 1 DDAGWSPLHIAASAGR Unmodified 1622.7801 0.78011783 1660 O75832 PSMD10 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 10 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 95.545 95.545 2;3 0.00018369 97675 QUIQUE_C1403_190116_001 59.872 50.552 287630000 76776000 26156000 34499000 24181000 25314000 64095000 36604000 0 0 0 0 0 0 5607 1660 5253 50696;50697;50698;50699;50700;50701;50702;50703 64447;64448;64449;64450;64451;64452;64453;64454;64455;64456 64452 9 DDALAWK Unmodified 817.39702 0.39701828 995 F5GZH3;F5H866;F5GZ38;F5H1B8;Q9UF11;F5H3M1;F5GYU9;F5H114;F5H0R6;F5GY87 PLEKHB1 Pleckstrin homology domain-containing family B member 1 yes no 0 0 0 1 55.783 55.783 2 0.036465 50937 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.086 52.348 12397000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12397000 0 0 0 5608 995 5254 50704 64457 64457 1 DDAMLLK Unmodified 804.40514 0.40514012 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.942 47.942 2 0.023465 45548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.07 68.763 4600400000 534890000 411530000 523050000 422310000 285200000 437210000 425870000 173440000 267370000 186340000 354700000 267690000 310800000 5609 2004 5255 50705;50706;50707;50708;50709;50710;50711;50712;50713;50714;50715;50716;50717 64458;64459;64460;64461;64462;64463;64464;64465;64466;64467;64468;64469;64470;64471;64472;64473;64474;64475 64466 18 DDANNDPQWSEEQLIAAK Unmodified 2042.9181 0.91812745 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.48 101.48 2 5.3429E-39 105342 QUIQUE_C1576_190116_001 166.62 152.06 567320000 127240000 97927000 0 0 46433000 96128000 80595000 0 0 0 67196000 51804000 0 5610 2195 5256 50718;50719;50720;50721;50722;50723;50724;50725;50726 64476;64477;64478;64479;64480;64481;64482;64483;64484;64485;64486 64483 11 DDASMPLPFDLTDIVSELR Oxidation (M) 2149.0249 0.024900707 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUY7 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 1 0 1 1 1 1 172.83 172.83 2 3.1566E-11 177853 QUIQUE_C1576_190116_001 118.37 108.83 58536000 11593000 26252000 0 10298000 0 0 10393000 0 0 0 0 0 0 5611 334 5257 50727;50728;50729;50730 64487;64488;64489;64490 64490 231 4 DDASMPLPFDLTDIVSELR Unmodified 2133.03 0.029986085 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUY7 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 175.62 175.62 2;3 8.079E-17 178672 QUIQUE_C1277_190116_001 128.9 120.8 179400000 10994000 14254000 0 6060200 15512000 56238000 14232000 9115100 7793300 0 40550000 0 4652200 5612 334 5257 50731;50732;50733;50734;50735;50736;50737;50738;50739;50740;50741;50742 64491;64492;64493;64494;64495;64496;64497;64498;64499;64500;64501;64502;64503;64504 64493 14 DDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR Unmodified 2726.3698 0.36976425 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.9 170.9 3 1.3724E-31 173560 QUIQUE_C1403_190116_001 135.1 122.29 1838400000 75709000 135490000 287440000 35941000 132330000 0 249200000 110890000 93178000 10546000 218400000 319430000 169840000 5613 1548 5258 50743;50744;50745;50746;50747;50748;50749;50750;50751;50752;50753;50754 64505;64506;64507;64508;64509;64510;64511;64512;64513;64514;64515;64516 64508 12 DDAVPNLIQLITNSVEMHAYTVQR Oxidation (M) 2742.3647 0.36467888 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 169.74 169.74 3 1.9276E-13 173864 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.21 89.411 490740000 0 62313000 0 0 54408000 0 78555000 91515000 0 0 76102000 62600000 65243000 5614 1548 5258 50755;50756;50757;50758;50759;50760;50761 64517;64518;64519;64520;64521;64522;64523 64523 843 7 DDDAETGLTDGEEKEEPK Unmodified 1976.8335 0.83345435 2182 P21579;C9JX50 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 1 1 40.78 40.78 3 0.0001368 35224 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.013 72.891 21514000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21514000 0 0 0 5615 2182 5259 50762 64524;64525 64525 2 DDDAETGLTDGEEKEEPKEEEK Unmodified 2492.0562 0.056196653 2182 P21579;C9JX50 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 35.853 35.853 3;4 5.6085E-54 30962 QUIQUE_C1368_190116_001 164.98 157.36 648550000 147000000 99259000 101880000 99905000 44851000 117750000 37890000 0 0 0 0 0 0 5616 2182 5260 50763;50764;50765;50766;50767;50768;50769;50770;50771;50772;50773;50774 64526;64527;64528;64529;64530;64531;64532;64533;64534;64535;64536;64537;64538;64539;64540 64531 15 DDDDVVIGK Unmodified 974.45566 0.45565537 1486 O15144 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 37.641 37.641 2 0.027619 33102 QUIQUE_C1563_190116_001 57.722 32.799 30149000 0 0 0 0 0 30149000 0 0 0 0 0 0 0 5617 1486 5261 50775;50776;50777 64541;64542;64543 64542 3 DDDFLGGAECSLGQIVSSQVLTLPLMLKPGKPAGR Unmodified 3668.8906 0.89060284 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;A6PVH9;E7ENH5;Q5JX45;Q5JX56;Q5JX58;Q5JX59;Q5JX60;Q5JX44;Q5JX54;Q5JX55;Q5JX61;Q5JX52;Q5JX57;E7EV27 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 2 1 1 1 168.84 168.84 4 2.8832E-21 174940 QUIQUE_C1438_190116_001 77.733 76.008 169030000 0 0 0 38340000 59485000 0 71206000 0 0 0 0 0 0 5618 579 5262 50778;50779;50780 64544;64545;64546 64545 3 DDDIAALVVDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1836.787 0.78697862 2696;447 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;P60709 ACTB Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed no no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 135.34 135.34 2 2.1831E-63 139616 QUIQUE_C1403_190116_001 188.91 181.64 9509300000 662910000 898620000 978710000 894060000 870450000 816840000 742210000 439940000 441800000 481440000 793650000 789490000 699170000 5619 447;2696 5263 50781;50782;50783;50784;50785;50786;50787;50788;50789;50790;50791;50792;50793;50794 64547;64548;64549;64550;64551;64552;64553;64554;64555;64556;64557;64558;64559;64560;64561;64562;64563;64564;64565;64566;64567;64568;64569;64570;64571;64572;64573;64574;64575;64576;64577;64578;64579;64580 64556 318 33 DDDIAALVVDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term) 1820.7921 0.792064 2696;447 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;P60709 ACTB Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed no no 1 0 0 2 2 3 4 3 4 3 1 1 2 2 1 2 146.28 146.28 2 4.8169E-224 152432 QUIQUE_C1218_190116_001 276.95 262.27 30765000000 3088600000 3423500000 3403500000 3923200000 2592800000 3085100000 2720200000 1282900000 896100000 552520000 1663900000 2018900000 2113800000 5620 447;2696 5263 50795;50796;50797;50798;50799;50800;50801;50802;50803;50804;50805;50806;50807;50808;50809;50810;50811;50812;50813;50814;50815;50816;50817;50818;50819;50820;50821;50822;50823;50824 64581;64582;64583;64584;64585;64586;64587;64588;64589;64590;64591;64592;64593;64594;64595;64596;64597;64598;64599;64600;64601;64602;64603;64604;64605;64606;64607;64608;64609;64610;64611;64612;64613;64614;64615;64616;64617;64618;64619;64620;64621;64622;64623;64624;64625;64626;64627;64628;64629;64630 64583 42 DDDIEEGDLPEHK Unmodified 1510.6423 0.64234652 3083 Q14696 MESDC2 LDLR chaperone MESD yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 42.62 42.62 2;3 0.00031095 38432 QUIQUE_C1563_190116_001 97.456 87.801 141070000 28827000 28120000 0 29036000 0 55089000 0 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50850;50851;50852;50853;50854;50855;50856;50857;50858;50859;50860;50861;50862;50863;50864;50865;50866;50867;50868;50869;50870;50871;50872;50873;50874;50875 64657;64658;64659;64660;64661;64662;64663;64664;64665;64666;64667;64668;64669;64670;64671;64672;64673;64674;64675;64676;64677;64678;64679;64680;64681;64682;64683;64684;64685 64670 28 DDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSR Oxidation (M) 3780.7021 0.7020696 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 139.92 139.92 4 2.5337E-47 142728 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.56 107.53 512810000 83692000 142790000 0 0 0 0 0 98330000 0 48585000 0 139420000 0 5627 2851 5269 50876;50877;50878;50879;50880 64686;64687;64688;64689;64690 64688 2282 5 DDEEMNTWIQAISSAISSDKHEVSASTQSTPASSR Unmodified 3764.7072 0.70715498 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 155.04 155.04 3;4 1.5756E-149 162037 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.4 186.99 5919400000 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Unmodified 2046.9858 0.98581308 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 141.15 141.15 3 5.3307E-05 146100 QUIQUE_C1218_190116_001 76.539 73.011 32976000 32976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5630 4631 5271 50914 64732 64732 1 DDEFTHLYTLIVRPDNTYEVK Unmodified 2567.2544 0.25438337 2268 P27797;K7EJB9 CALR Calreticulin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 140.94 140.94 4 8.2629E-05 143536 QUIQUE_C1563_190116_001 63.857 54.836 112870000 29057000 0 21553000 18948000 0 33530000 0 0 0 9777200 0 0 0 5631 2268 5272 50915;50916;50917;50918;50919 64733;64734;64735;64736;64737 64736 5 DDEGFIIR Unmodified 963.46616 0.46616048 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 74.783 74.783 2 0.053305 75807 QUIQUE_C1368_190116_001 71.342 40.73 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5632 153 5273 50920 64738 64738 1 DDELYILTNVGEPTEFK Unmodified 1981.9521 0.95205334 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 0 1 146.64 146.64 2 0.029448 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[ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 25.041 25.041 2 0.016846 18877 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.47 100.54 165710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 165710000 0 5644 2187 5284 50976 64798 64798 1 DDFTEFGK Unmodified 957.40798 0.40797689 1658 O75822;H0YGJ7;H0YLP3 EIF3J Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J yes no 0 0 0 1 1 67.022 67.022 2 0.063544 63122 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.403 45.901 95526000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36432000 59094000 0 0 5645 1658 5285 50977;50978 64799;64800 64799 2 DDGCYRGEPSWFHR Unmodified 1780.7376 0.73760108 4444 Q9UI15;C9J5W6 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 0 1 1 61.688 61.688 3 0.0068529 60060 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.841 49.404 62384000 0 0 0 0 0 0 0 62384000 0 0 0 0 0 5646 4444 5286 50979 64801 64801 1 DDGEEEFAGAK Unmodified 1166.4728 0.472762 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119;A0A087X2B6 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 37.478 37.478 2 0.048528 33232 QUIQUE_C1403_190116_001 46.001 35.736 20358000 0 0 0 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64940;64941;64942;64943;64944;64945;64946;64947;64948;64949;64950;64951;64952;64953;64954;64955;64956;64957;64958;64959 64944 16 DDIENMVK Unmodified 962.4379 0.43789681 2415 P38646;H0Y8S0 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.137 55.137 2 0.0036515 54304 QUIQUE_C1218_190116_001 127.84 78.485 1331200000 205850000 150080000 176740000 145190000 96061000 173170000 0 0 77325000 87041000 71369000 57173000 91158000 5659 2415 5299 51079;51080;51081;51082;51083;51084;51085;51086;51087;51088;51089 64960;64961;64962;64963;64964;64965;64966;64967;64968;64969;64970;64971 64960 11 DDIGIILINQYIAEMVR Oxidation (M) 1991.0398 0.03976291 3204 Q16864 ATP6V1F V-type proton ATPase subunit F yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 167.71 167.71 2;3 7.0544E-11 169424 QUIQUE_C1563_190116_001 121.04 107.61 59956000 0 27571000 18450000 0 0 13935000 0 0 0 0 0 0 0 5660 3204 5300 51090;51091;51092;51093;51094 64972;64973;64974;64975;64976 64975 2630 5 DDIGIILINQYIAEMVR Unmodified 1975.0448 0.044848288 3204 Q16864 ATP6V1F V-type proton ATPase subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 175.48 175.48 2;3 6.0482E-38 179179 QUIQUE_DMIX8_190116_001 204.48 154.55 286500000 0 19004000 11194000 0 21446000 7496300 0 43751000 63817000 0 19966000 58989000 40834000 5661 3204 5300 51095;51096;51097;51098;51099;51100;51101;51102;51103;51104;51105 64977;64978;64979;64980;64981;64982;64983;64984;64985;64986;64987;64988 64988 12 DDIIENAPTTHTEEYSGEEK Unmodified 2276.9921 0.99208025 1440 O14744;H0YJX6;G3V580;G3V2X6;G3V5L5 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 2 58.944 58.944 2;3 1.7115E-29 57168 QUIQUE_C1277_190116_001 163.23 141.19 212020000 23533000 25465000 0 95096000 0 0 0 0 0 67923000 0 0 0 5662 1440 5301 51106;51107;51108;51109;51110 64989;64990;64991;64992;64993 64990 5 DDILNGSHPVSFDK Unmodified 1542.7314 0.7314363 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 69.544 69.544 2 0.00086416 68956 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65009;65010;65011;65012;65013;65014;65015;65016;65017;65018;65019 65011 10 DDKASYVAWGHSTVVNPWGEVLAK Unmodified 2628.2973 0.29725124 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 1 2 1 123.17 123.17 3;4 3.1251E-09 126346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.504 85.515 85530000 0 0 0 0 0 0 0 46923000 0 0 0 0 38607000 5666 4256 5305 51133;51134;51135 65020;65021;65022 65021 3 DDKHGSYEDAVHSGALND Unmodified 1928.8137 0.81366238 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 39.424 39.424 2;3 1.6356E-22 35299 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.93 118.4 791110000 60531000 0 84225000 24549000 30880000 0 27578000 158010000 36004000 0 61837000 44251000 263240000 5667 2132 5306 51136;51137;51138;51139;51140;51141;51142;51143;51144;51145;51146;51147 65023;65024;65025;65026;65027;65028;65029;65030;65031;65032;65033;65034 65034 12 DDKNTMTDSTILLEDVQK Unmodified 2064.9885 0.9885152 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;O95317 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 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65065;65066;65067;65068;65069;65070;65071;65072;65073;65074;65075;65076;65077;65078;65079;65080;65081;65082;65083;65084;65085;65086;65087;65088;65089;65090;65091;65092;65093;65094;65095;65096;65097;65098;65099;65100;65101;65102;65103;65104;65105;65106;65107;65108;65109;65110;65111;65112;65113;65114;65115;65116;65117;65118 65118 53 DDLNSQLQESLR Unmodified 1416.6845 0.68448611 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 85.586 85.586 2 0.0018371 85960 QUIQUE_C1563_190116_001 90.685 65.831 139630000 48778000 0 0 49020000 0 41828000 0 0 0 0 0 0 0 5673 3241 5312 51199;51200;51201;51202 65119;65120;65121;65122;65123 65122 5 DDLQNGLLSTCR Unmodified 1390.6511 0.65107749 4206 Q9HAU0;A0JP02;B4DJX4;H0YGJ6 PLEKHA5 Pleckstrin homology domain-containing family A member 5 yes no 0 0 0 1 77.33 77.33 2 0.034511 77311 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.228 63.438 13226000 0 0 0 0 0 0 0 13226000 0 0 0 0 0 5674 4206 5313 51203 65124 65124 0 DDLSFAGYQK Unmodified 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O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.049 48.049 2 0.00035401 45843 QUIQUE_C1218_190116_001 113.71 92.406 566980000 76294000 87263000 0 80602000 81558000 67468000 0 0 80296000 0 0 93497000 0 5693 150 5331 51345;51346;51347;51348;51349;51350;51351 65326;65327;65328;65329;65330;65331;65332;65333 65326 8 DDPVTNLNNAFEVAEK Unmodified 1774.8374 0.83735793 1544;1313 O43707;K7EJH8 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.96 122.96 2 2.7334E-24 125604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.05 160.65 619240000 58354000 91187000 101790000 71528000 95979000 61516000 67417000 71476000 0 0 0 0 0 5694 1544;1313 5332 51352;51353;51354;51355;51356;51357;51358;51359;51360 65334;65335;65336;65337;65338;65339;65340;65341;65342;65343;65344;65345 65344 12 DDQFLLDGQLLPDNFIAACTEK Unmodified 2522.1999 0.19990496 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 165.23 165.23 2;3 3.2357E-66 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65399 1 DDSYKPIVEYIDAQFEAYLQEELK Unmodified 2905.3909 0.39093643 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 1 1 1 174.12 174.12 3 2.6198E-18 181203 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.44 110.65 212550000 0 0 0 0 0 0 44179000 0 0 0 168370000 0 0 5710 820 5348 51409;51410 65400;65401 65401 2 DDTDDEIAK Unmodified 1020.4247 0.42474917 2269 P27824;H0Y9Q7;D6RDP7;D6RB85;D6RAU8;D6RAQ8 CANX Calnexin yes no 0 0 0 1 20.128 20.128 2 0.027329 12749 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.931 13.814 12393000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12393000 0 0 0 5711 2269 5349 51411 65402 65402 1 DDTIYEDEDVK Unmodified 1340.562 0.56197093 2085 P14927;B7Z2R2;E5RHG9 UQCRB Cytochrome b-c1 complex subunit 7 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 53.039 53.039 2 0.0011193 51072 QUIQUE_C1368_190116_001 107.21 87.419 826870000 277520000 216460000 89922000 0 76052000 43961000 93749000 0 0 0 29212000 0 0 5712 2085 5350 51412;51413;51414;51415;51416;51417;51418;51419;51420 65403;65404;65405;65406;65407;65408;65409;65410;65411;65412;65413 65407 10 DDTIYEDEDVKEAIR Unmodified 1809.8269 0.82685283 2085 P14927;B7Z2R2;E5RHG9 UQCRB Cytochrome b-c1 complex subunit 7 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 3 1 2 1 2 2 1 74.219 74.219 2;3 3.774E-29 74492 QUIQUE_C1277_190116_001 199.43 185.27 2073000000 237310000 284040000 179710000 162980000 89331000 169570000 277980000 59519000 217720000 23331000 187270000 103810000 80444000 5713 2085 5351 51421;51422;51423;51424;51425;51426;51427;51428;51429;51430;51431;51432;51433;51434;51435;51436;51437;51438;51439;51440;51441;51442;51443 65414;65415;65416;65417;65418;65419;65420;65421;65422;65423;65424;65425;65426;65427;65428;65429;65430;65431;65432;65433;65434;65435;65436;65437;65438 65416 24 DDTVCLAK Unmodified 920.42733 0.42733213 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.642 27.642 2 0.016172 21845 QUIQUE_C1438_190116_001 124.34 76.6 296320000 62470000 0 0 0 233850000 0 0 0 0 0 0 0 0 5714 1838 5352 51444;51445;51446;51447;51448;51449 65439;65440;65441;65442;65443;65444 65443 5 DDVALEGVSHFFR Unmodified 1490.7154 0.7153923 1840 P02792 FTL Ferritin light chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 117.57 117.57 2;3 1.3901E-88 121582 QUIQUE_C1403_190116_001 227.27 198.57 9547500000 561180000 631790000 939390000 651380000 579760000 884040000 693310000 329880000 2622200000 408680000 405300000 293760000 546810000 5715 1840 5353 51450;51451;51452;51453;51454;51455;51456;51457;51458;51459;51460;51461;51462;51463;51464;51465;51466;51467;51468;51469;51470;51471;51472;51473;51474;51475 65445;65446;65447;65448;65449;65450;65451;65452;65453;65454;65455;65456;65457;65458;65459;65460;65461;65462;65463;65464;65465;65466;65467;65468;65469;65470;65471;65472;65473;65474;65475;65476;65477;65478;65479;65480;65481;65482;65483;65484;65485;65486;65487;65488;65489;65490;65491;65492;65493;65494;65495;65496 65460 52 DDVAQTDLLQIDPNFGSK Unmodified 1974.9535 0.95345032 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5H0E2 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 134.61 134.61 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DDVFLSVPCILGQNGISDLVK Unmodified 2288.1722 0.17223365 1775 P00338 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes yes 0 0 0 1 1 1 168.26 168.26 2 4.2687E-06 169944 QUIQUE_C1563_190116_001 102.38 81.077 596450000 0 0 0 0 0 258910000 0 0 0 62947000 274600000 0 0 5719 1775 5357 51494;51495;51496 65516;65517;65518 65516 3 DDVIQICGPADGIR Unmodified 1527.7351 0.73514147 2945 Q12800;F8VWL0 TFCP2 Alpha-globin transcription factor CP2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.467 95.467 2 0.00012519 99280 QUIQUE_C1218_190116_001 98.353 8.8056 102180000 0 0 0 0 48668000 27988000 0 0 25528000 0 0 0 0 5720 2945 5358 51497;51498;51499;51500;51501;51502;51503 65519;65520;65521;65522;65523;65524;65525 65519 7 DDVPFFGPPLPDPAVFR Unmodified 1884.941 0.94103514 985 F2Z357;J3KPC5;P47736;A0A0A0MQY8;X6R8W7 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.11 163.11 2 8.036E-05 167126 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.191 70.341 1186400000 99118000 114900000 103970000 98593000 134860000 84174000 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subunit alpha-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.765 20.765 2 0.002311 13558 QUIQUE_C1403_190116_001 94.662 42.026 1921500000 282150000 390020000 306820000 294580000 260600000 0 0 114130000 166040000 107120000 0 0 0 5724 1701;1749 5362 51525;51526;51527;51528;51529;51530;51531;51532 65548;65549;65550;65551;65552;65553;65554;65555;65556 65552 9 DDWLEWLR Unmodified 1131.5349 0.53490874 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 157.93 157.93 2 0.027492 164187 QUIQUE_C1576_190116_001 79.451 56.711 35192000 0 0 8196700 0 8970600 0 7941900 0 0 0 10083000 0 0 5725 2447 5363 51533;51534;51535;51536;51537 65557;65558;65559;65560;65561 65560 5 DDYELIDVLVNNAK Unmodified 1619.8043 0.80426689 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 1 157.5 157.5 2 0.002361 162837 QUIQUE_C1218_190116_001 75.229 62.273 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5726 3391 5364 51538;51539 65562;65563 65562 2 DDYELQEVIGSGATAVVQAAYCAPK Unmodified 2654.2534 0.25339709 1746 O95747;C9JIG9;F8WBK9 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes no 0 0 0 1 166.67 166.67 3 3.6424E-05 160698 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.577 42.546 6374900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6374900 0 0 0 5727 1746 5365 51540 65564 65564 1 DDYVHEFCR Unmodified 1239.4979 0.49787131 3012 Q13564 NAE1 NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 55.593 55.593 2;3 0.0014209 53218 QUIQUE_C1563_190116_001 103.83 96.71 410020000 0 49686000 90247000 61971000 38554000 40717000 46865000 0 27301000 13779000 0 0 40902000 5728 3012 5366 51541;51542;51543;51544;51545;51546;51547;51548;51549;51550 65565;65566;65567;65568;65569;65570;65571;65572;65573;65574 65570 10 DEAAYGELR Unmodified 1022.4669 0.46688876 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.544 41.544 2 0.0014496 38542 QUIQUE_C1438_190116_001 103.56 76.038 917640000 120950000 122000000 0 0 121990000 126630000 0 0 92891000 68057000 108040000 76285000 80808000 5729 114 5367 51551;51552;51553;51554;51555;51556;51557;51558;51559 65575;65576;65577;65578;65579;65580;65581;65582;65583 65577 8 DEAEMSSWLR Unmodified 1222.5288 0.52883709 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 100.34 100.34 2 0.057273 101651 QUIQUE_C1563_190116_001 46.462 26.675 21949000 0 0 0 0 0 21949000 0 0 0 0 0 0 0 5730 1472 5368 51560 65584 65584 1 DEAFDPFDK Unmodified 1082.4557 0.45565537 2143 P19174;V9GY63 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 95.672 95.672 2 0.040078 98743 QUIQUE_C1218_190116_001 53.493 43.31 34918000 17006000 17912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5731 2143 5369 51561;51562 65585;65586 65585 2 DEAFPPVPQSLGYK Unmodified 1546.7668 0.76675917 1921 P07384;E9PRM1;E9PJJ3;E9PLC9;E9PMC6;E9PJA6;E9PSA6;E9PQB3 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit no no 0 0 0 2 1 3 2 3 1 1 106.77 106.77 2 0.0066347 108668 QUIQUE_C1563_190116_001 61.353 43.489 376610000 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Kynurenine--oxoglutarate transaminase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.093 46.093 2 0.0023813 43753 QUIQUE_C1218_190116_001 91.584 71.797 99939000 21415000 18981000 0 20650000 14158000 24735000 0 0 0 0 0 0 0 5737 660 5375 51607;51608;51609;51610;51611 65637;65638;65639;65640;65641 65637 5 DEAWVLETIGK Unmodified 1259.6398 0.63976774 2941 Q12765;C9K052 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.34 126.34 2 1.3331E-05 131215 QUIQUE_C1368_190116_001 143.03 134.81 4693400000 0 464340000 634590000 583990000 480350000 919140000 559970000 0 329550000 0 227340000 193210000 300900000 5738 2941 5376 51612;51613;51614;51615;51616;51617;51618;51619;51620;51621;51622;51623;51624;51625;51626 65642;65643;65644;65645;65646;65647;65648;65649;65650;65651;65652;65653;65654;65655;65656;65657;65658;65659;65660;65661;65662;65663;65664;65665;65666;65667;65668;65669;65670;65671 65649 30 DECSFHIFYQLLGGAGEQLK Unmodified 2311.0943 0.094317676 3459 Q7Z406;M0QY43;A0A2R8Y4C3 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 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2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 150.08 150.08 3;4 2.7207E-10 154283 QUIQUE_C1277_190116_001 112.8 106.98 843940000 78079000 70631000 71643000 59248000 108570000 64563000 90576000 61805000 59999000 33051000 24049000 68712000 53006000 5742 2808 5379 51635;51636;51637;51638;51639;51640;51641;51642;51643;51644;51645;51646;51647;51648;51649;51650;51651;51652;51653;51654;51655;51656;51657 65681;65682;65683;65684;65685;65686;65687;65688;65689;65690;65691;65692;65693;65694;65695;65696;65697;65698;65699;65700;65701;65702;65703;65704;65705;65706;65707;65708;65709;65710;65711 65683 29 DEDILQVLQFTK Unmodified 1447.7559 0.75586013 3315 Q5T5U3;E7ESW5 ARHGAP21 Rho GTPase-activating protein 21 yes no 0 0 0 1 152.93 152.93 2 0.0038816 148089 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.808 61.85 14865000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14865000 0 0 0 5743 3315 5380 51658 65712 65712 1 DEDKDKVGNVEYFGLGNSPGFPLQYYPYYGK Unmodified 3558.662 0.66196633 1873 P05026 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65723;65724;65725;65726;65727;65728;65729;65730;65731;65732 65729 9 DEEEEMMEVSLDATK Unmodified 1754.7226 0.72264703 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 119.75 119.75 2 0.0092905 116625 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.343 47.653 14776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14776000 0 0 0 5747 3753 5384 51674 65733 65733 1 DEEEEMMEVSLDATKR Unmodified 1910.8238 0.82375806 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 1 1 1 101.22 101.22 3 0.0017684 103191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.463 44.034 197860000 0 0 0 0 0 0 0 72012000 34421000 0 37882000 53549000 0 5748 3753 5385 51675;51676;51677;51678 65734;65735;65736;65737 65734 3 DEEFPEQK Unmodified 1020.44 0.4400053 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 28.131 28.131 2 0.04088 22810 QUIQUE_C1218_190116_001 83.753 56.048 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5749 2135 5386 51679;51680;51681;51682 65738;65739;65740;65741 65738 4 DEEKMELQEIQLK Unmodified 1631.8076 0.80763771 63;1260;1908 J3KN67;P06753;A0A087WWU8 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain no no 0 0 1 1 1 77.183 77.183 2 0.0012916 78390 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.76 0 83561000 0 0 43643000 0 0 0 0 0 39918000 0 0 0 0 5750 1260;1908;63 5387 51683;51684 65742;65743;65744 65744 3 DEELEEIKK Unmodified 1131.5659 0.5659341 3966 Q99653;H0YNG9;H0YKE7;F5GX29;H0YLX1 CHP1 Calcineurin B homologous protein 1 yes no 0 0 1 1 1 26.187 26.187 2 0.003264 20035 QUIQUE_C1218_190116_001 95.741 50.66 28131000 28131000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5751 3966 5388 51685;51686 65745;65746 65745 2 DEELSCTVVELK Unmodified 1420.6756 0.6755609 1800 P01011;G3V3A0;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 1 1 87.943 87.943 2 1.3913E-05 90626 QUIQUE_C1218_190116_001 130.41 93.856 265410000 69985000 71448000 0 123970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5752 1800 5389 51687;51688;51689 65747;65748;65749 65747 3 DEEVHAGLGELLR Unmodified 1436.726 0.72595699 2565 P50454;E9PR70;E9PPV6;E9PJH8;E9PIG2;E9PRS3;E9PNX1;E9PK86;E9PMI5;E9PQ34 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 86.447 86.447 3 0.0058778 83037 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Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 29.161 29.161 3 0.036212 23593 QUIQUE_C1368_190116_001 39.547 15.325 27323000 0 0 27323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5773 3357 5410 51814 65919 65919 1 DELADEIANSSGK Unmodified 1347.6154 0.61540349 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 69.956 69.956 2 0.051836 65720 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.262 54.037 43582000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43582000 0 0 0 5774 2378 5411 51815 65920 65920 0 DELADEITNSASGK Unmodified 1448.6631 0.66308196 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 79.04 79.04 2 0.0054243 80576 QUIQUE_C1368_190116_001 67.252 46.418 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5775 2379 5412 51816 65921 65921 1 DELELELAENRK Unmodified 1457.7362 0.73618733 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 1 1 124.85 124.85 3 0.00013735 129388 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.9 10.174 30426000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30426000 5776 3091 5413 51817 65922 65922 1 DELEVIHLIEEHR Unmodified 1630.8315 0.83148469 1992 P10155 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 113.4 113.4 3 4.1045E-06 116412 QUIQUE_C1277_190116_001 109.22 88.758 35852000 0 27422000 0 0 0 0 0 0 0 8430200 0 0 0 5777 1992 5414 51818;51819;51820;51821;51822 65923;65924;65925;65926;65927 65924 4 DELFALEQSCAQVVLQAANER Unmodified 2390.1536 0.15362347 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 157.86 157.86 3 0.00020882 152729 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.009 52.656 11100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11100000 0 0 0 5778 3187 5415 51823 65928 65928 1 DELFTDDK Unmodified 981.42911 0.42910627 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 47.461 47.461 2 0.056943 45044 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.968 31.346 18003000 0 0 0 0 0 0 0 0 18003000 0 0 0 0 5779 2223 5416 51824 65929 65929 1 DELGDYLKPK Unmodified 1176.6027 0.60265396 4151 Q9H2W6 MRPL46 39S ribosomal protein L46, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 65.132 65.132 3 0.032444 64933 QUIQUE_C1218_190116_001 48.284 44.094 29939000 15738000 0 0 0 0 0 0 14201000 0 0 0 0 0 5780 4151 5417 51825;51826 65930;65931 65930 2 DELHIVEAEAMNYEGSPIK Oxidation (M) 2160.0045 0.0044996155 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 119.87 119.87 2;3 4.6504E-05 123630 QUIQUE_C1403_190116_001 78.021 72.917 332450000 52455000 47393000 25513000 32984000 67555000 74124000 0 0 0 32422000 0 0 0 5781 1907 5418 51827;51828;51829;51830;51831;51832;51833;51834;51835 65932;65933;65934;65935;65936;65937;65938;65939;65940 65935 1126 8 DELHIVEAEAMNYEGSPIK Unmodified 2144.0096 0.0095849934 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 4 2 2 2 2 129.31 129.31 2;3 2.0504E-152 134785 QUIQUE_C1218_190116_001 241.41 221.57 2942000000 376180000 378380000 267910000 325860000 165460000 335110000 240280000 64660000 145980000 149530000 157380000 130860000 204400000 5782 1907 5418 51836;51837;51838;51839;51840;51841;51842;51843;51844;51845;51846;51847;51848;51849;51850;51851;51852;51853;51854;51855;51856;51857;51858;51859;51860;51861 65941;65942;65943;65944;65945;65946;65947;65948;65949;65950;65951;65952;65953;65954;65955;65956;65957;65958;65959;65960;65961;65962;65963;65964;65965;65966;65967;65968;65969;65970;65971;65972;65973;65974;65975;65976;65977;65978;65979;65980;65981 65941 40 DELILEGNDIELVSNSAALIQQATTVK Unmodified 2883.5077 0.50769752 2353 P32969;D6RAN4;A0A2R8Y5Y7;H0Y9V9;H0Y9R4 RPL9 60S ribosomal protein L9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 169.27 169.27 3 1.1981E-53 173860 QUIQUE_C1218_190116_001 141.5 128.83 488440000 58674000 88920000 75433000 68604000 0 82120000 88604000 0 0 26084000 0 0 0 5783 2353 5419 51862;51863;51864;51865;51866;51867;51868 65982;65983;65984;65985;65986;65987;65988 65982 7 DELLFPSWEALFSGSEGPLKPGAR Unmodified 2602.3068 0.30675329 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.24 165.24 3 9.4782E-15 169147 QUIQUE_C1277_190116_001 109.75 102.48 576010000 82629000 71730000 70481000 53651000 90964000 34388000 46126000 0 0 21140000 50207000 19979000 34712000 5784 2419 5420 51869;51870;51871;51872;51873;51874;51875;51876;51877;51878;51879 65989;65990;65991;65992;65993;65994;65995;65996;65997;65998;65999;66000;66001;66002 65991 14 DELLPHILPLLK Unmodified 1399.8439 0.84388728 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 139.77 139.77 2;3 0.00055718 143692 QUIQUE_C1403_190116_001 63.408 53.083 312310000 50045000 32307000 29065000 61087000 21569000 30528000 31942000 0 22601000 14973000 0 0 18197000 5785 3772 5421 51880;51881;51882;51883;51884;51885;51886;51887;51888;51889;51890;51891;51892;51893 66003;66004;66005;66006;66007;66008;66009;66010;66011;66012;66013;66014;66015;66016;66017;66018;66019;66020;66021 66010 18 DELLQVLR Unmodified 984.5604 0.56039521 3966 Q99653 CHP1 Calcineurin B homologous protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.344 97.344 2 0.0038569 101295 QUIQUE_C1438_190116_001 111.28 75.093 224380000 33730000 0 21977000 28303000 19652000 26427000 28687000 0 0 9798700 16509000 18012000 21284000 5786 3966 5422 51894;51895;51896;51897;51898;51899;51900;51901;51902;51903 66022;66023;66024;66025;66026;66027;66028;66029;66030;66031;66032 66026 10 DELQEGLR Unmodified 958.47197 0.47197413 610 B4DHR0;Q9H5N1 RABEP2 Rab GTPase-binding effector protein 2 yes no 0 0 0 1 29.947 29.947 2 0.063544 24196 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.403 7.0674 161090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 161090000 0 0 0 5787 610 5423 51904 66033 66033 1 DELRETLK Unmodified 1002.5346 0.53457439 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 23.134 23.134 2 0.035441 16889 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.52 32.261 481170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 262330000 0 218840000 5788 2533 5424 51905;51906 66034;66035 66034 2 DELWLVMK Unmodified 1032.5314 0.53140327 1746;4417 O95747;C9JIG9;F8WBK9;Q9UEW8 OXSR1;STK39 Serine/threonine-protein kinase OSR1;STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 121.04 121.04 2 0.0099549 123351 QUIQUE_C1563_190116_001 91.906 46.188 154340000 29452000 0 32740000 19847000 27469000 28596000 0 0 0 16239000 0 0 0 5789 1746;4417 5425 51907;51908;51909;51910;51911;51912;51913;51914;51915 66036;66037;66038;66039;66040;66041;66042;66043;66044;66045;66046;66047;66048;66049;66050;66051;66052 66046 17 DENATLDGGDVLFTGR Unmodified 1678.7798 0.77984305 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 111.59 111.59 2;3 1.6445E-79 114927 QUIQUE_C1277_190116_001 207.66 173.7 7445800000 1416700000 461630000 733920000 718410000 542580000 716200000 480740000 186430000 280690000 741690000 579760000 298760000 288260000 5790 1684 5426 51916;51917;51918;51919;51920;51921;51922;51923;51924;51925;51926;51927;51928;51929;51930;51931 66053;66054;66055;66056;66057;66058;66059;66060;66061;66062;66063;66064;66065;66066;66067;66068;66069;66070;66071;66072;66073;66074;66075;66076;66077;66078;66079;66080;66081;66082;66083;66084;66085 66056 33 DENHPNLIR Unmodified 1106.5469 0.54687041 4344 Q9NZD2;F5H0U5;H0YFS9 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 21.791 21.791 3 0.0010391 14278 QUIQUE_C1277_190116_001 79.906 59.603 265050000 54164000 43690000 0 36279000 0 28556000 47693000 35241000 0 19431000 0 0 0 5791 4344 5427 51932;51933;51934;51935;51936;51937;51938;51939;51940 66086;66087;66088;66089;66090;66091;66092;66093;66094;66095 66087 9 DENQSINHQMAQEDAQR Oxidation (M) 2028.8555 0.85554397 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.05 18.05 3 6.2056E-13 10394 QUIQUE_C1403_190116_001 122.1 113.61 564950000 80491000 55748000 52410000 56727000 55158000 53840000 0 25752000 37966000 43733000 46026000 28027000 29072000 5792 2161 5428 51941;51942;51943;51944;51945;51946;51947;51948;51949;51950;51951;51952 66096;66097;66098;66099;66100;66101;66102;66103;66104;66105;66106;66107;66108 66100 1503 12 DENQSINHQMAQEDAQR Unmodified 2012.8606 0.86062935 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 29.984 29.984 2;3 1.3638E-223 24101 QUIQUE_C1368_190116_001 275.83 250.98 1445500000 187480000 143960000 179080000 170700000 62826000 159350000 167330000 56100000 61059000 65338000 72985000 53376000 65883000 5793 2161 5428 51953;51954;51955;51956;51957;51958;51959;51960;51961;51962;51963;51964;51965;51966;51967;51968;51969;51970;51971;51972 66109;66110;66111;66112;66113;66114;66115;66116;66117;66118;66119;66120;66121;66122;66123;66124;66125;66126;66127;66128;66129;66130 66115 21 DENSDYTLFNLIPVGLR Unmodified 1964.9844 0.98435652 2723 P61328;C9JIN3;C9JUK8 FGF12 Fibroblast growth factor 12;Fibroblast growth factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 170.63 170.63 2;3 6.6257E-17 175363 QUIQUE_C1368_190116_001 136.93 127.4 206210000 16155000 9514800 36556000 0 38646000 8462700 66555000 0 0 9172200 0 0 21149000 5794 2723 5429 51973;51974;51975;51976;51977;51978;51979;51980;51981 66131;66132;66133;66134;66135;66136;66137;66138;66139 66133 9 DENSVELTMAEGPYK Unmodified 1681.7505 0.75051676 3084;956 E9PKU7;E9PNH1;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.028 95.028 2 2.4021E-18 98112 QUIQUE_C1218_190116_001 144.1 125.84 952160000 92945000 94555000 96482000 99924000 80799000 98545000 99712000 40610000 56473000 42943000 83784000 65391000 0 5795 956;3084 5430 51982;51983;51984;51985;51986;51987;51988;51989;51990;51991;51992;51993 66140;66141;66142;66143;66144;66145;66146;66147;66148;66149;66150;66151;66152;66153;66154;66155;66156;66157;66158 66140 18 DENSVELTMAEGPYK Oxidation (M) 1697.7454 0.74543138 3084;956 E9PKU7;E9PNH1;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 1 0 1 70.012 70.012 2 0.00068384 71277 QUIQUE_C1438_190116_001 75.819 58.383 29813000 0 0 0 0 29813000 0 0 0 0 0 0 0 0 5796 956;3084 5430 51994 66159 66159 579 1 DENYYQLEELAFR Unmodified 1688.7682 0.76821574 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 139.57 139.57 2;3 0.00037681 135963 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.258 83.37 93515000 0 0 0 0 31075000 0 0 0 0 18239000 44201000 0 0 5797 1187 5431 51995;51996;51997;51998;51999 66160;66161;66162;66163;66164;66165 66163 6 DEPDWESLIFLAR Unmodified 1589.7726 0.77257283 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 167.98 167.98 2 0.00036954 175142 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.78 97.917 250490000 63071000 0 0 0 0 56809000 0 0 25973000 0 42026000 37668000 24938000 5798 2554 5432 52000;52001;52002;52003;52004;52005;52006 66166;66167;66168;66169;66170;66171;66172 66170 7 DEPGAWEETFK Unmodified 1307.567 0.56699673 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 1 89.217 89.217 2 0.052275 91499 QUIQUE_C1368_190116_001 51.436 33.124 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5799 956;3084 5433 52007;52008 66173;66174 66173 2 DEPSVAAMVYPFTGDHK Unmodified 1862.8509 0.85089951 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 116.25 116.25 2;3 0.00568 119892 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.567 33.933 288850000 0 0 0 41595000 0 0 0 73415000 65181000 0 76704000 31954000 0 5800 2623 5434 52009;52010;52011;52012;52013;52014;52015;52016 66175;66176;66177;66178;66179;66180;66181;66182;66183;66184 66184 9 DEQDGASAETEPWAAAVPPEWVPIIQQDIQSQR Unmodified 3660.7332 0.7332338 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;H0Y710 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 170.56 170.56 3 0.018883 173197 QUIQUE_C1403_190116_001 22.773 17.717 15351000 0 0 0 15351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5801 7 5435 52017 66185 66185 1 DEQFEEYVQNFK Unmodified 1574.6889 0.68890278 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 117.44 117.44 2 0.0006885 114456 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52034;52035;52036;52037;52038;52039;52040;52041;52042;52043 66203;66204;66205;66206;66207;66208;66209;66210;66211;66212;66213;66214 66214 12 DEQGFGGAFPAR Unmodified 1250.568 0.56799978 3801 Q96AG3 SLC25A46 Solute carrier family 25 member 46 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.977 71.977 2 0.00068644 72137 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.15 69.525 227180000 0 0 0 41756000 0 46197000 0 0 45651000 0 46583000 0 46995000 5805 3801 5439 52044;52045;52046;52047;52048 66215;66216;66217;66218;66219;66220 66220 4 DEQLESLFQR Unmodified 1263.6095 0.60953025 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 106.85 106.85 2 0.0078433 103636 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.81 70.154 48927000 0 0 0 0 0 0 31946000 0 0 16981000 0 0 0 5806 1883 5440 52049;52050;52051;52052;52053 66221;66222;66223;66224;66225 66225 3 DEQLLTNVLETLR Unmodified 1542.8253 0.82533668 4388 Q9P2I0 CPSF2 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 yes yes 0 0 0 1 157.23 157.23 2 0.0018865 160855 QUIQUE_C1403_190116_001 93.345 69.359 28279000 0 0 0 28279000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5807 4388 5441 52054 66226 66226 1 DEQQISAAVEK Unmodified 1216.5935 0.59354583 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.183 37.183 2 0.0001167 32741 QUIQUE_C1403_190116_001 130.94 56.813 1200200000 149540000 109180000 190850000 172060000 58387000 159600000 120200000 0 0 0 111170000 61171000 68062000 5808 3421 5442 52055;52056;52057;52058;52059;52060;52061;52062;52063;52064 66227;66228;66229;66230;66231;66232;66233;66234;66235;66236;66237;66238;66239;66240;66241;66242;66243 66231 17 DEQSAVSMLK Oxidation (M) 1122.5227 0.52268908 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 36.759 36.759 2 0.019578 31221 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.558 35.033 214700000 50730000 34016000 0 0 0 0 0 0 27733000 74379000 0 27841000 0 5809 2851 5443 52065;52066;52067;52068;52069;52070 66244;66245;66246;66247;66248;66249 66247 2279 5 DEQSAVSMLK Unmodified 1106.5278 0.52777445 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.411 58.411 2 0.00048526 57907 QUIQUE_C1218_190116_001 110.87 45.834 400150000 64788000 70058000 71008000 50737000 45676000 44488000 53393000 0 0 0 0 0 0 5810 2851 5443 52071;52072;52073;52074;52075;52076;52077;52078;52079 66250;66251;66252;66253;66254;66255;66256;66257;66258 66250 8 DEQYLFLVR Unmodified 1181.6081 0.60807369 3747 Q92673;E9PKB0;E9PS32;E9PP43;E9PPB3 SORL1 Sortilin-related receptor yes no 0 0 0 1 1 117.74 117.74 2 0.023501 122111 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.682 37.611 18608000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18608000 5811 3747 5444 52080;52081 66259;66260 66260 2 DEREDITHTYK Unmodified 1405.6474 0.64737232 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 21.861 21.861 2;3 0.0051516 14807 QUIQUE_C1368_190116_001 64.827 52.558 379260000 35829000 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66275;66276;66277;66278;66279;66280;66281;66282;66283;66284;66285;66286;66287 66278 13 DESGSPESIR Unmodified 1075.4782 0.47818172 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.94 21.94 2 0.0029074 15257 QUIQUE_C1576_190116_001 99.802 45.253 167010000 0 39315000 0 27285000 0 28614000 42768000 0 0 0 0 29031000 0 5815 982 5448 52109;52110;52111;52112;52113;52114 66288;66289;66290;66291;66292;66293 66291 6 DESKEPIVEVR Unmodified 1299.667 0.66704513 2057;28;265 A0A0D9SF30;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 31.828 31.828 2;3 4.6295E-05 26725 QUIQUE_C1403_190116_001 113.38 91.708 9900200000 714080000 1111900000 925390000 804590000 820670000 543930000 883030000 330710000 984710000 373380000 894900000 309900000 1203100000 5816 265;28;2057 5449 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transcripts 1 yes yes 0 0 1 1 1 21.955 21.955 2 0.0019567 14842 QUIQUE_C1368_190116_001 92.943 56.25 43848000 0 0 0 0 0 0 43848000 0 0 0 0 0 0 5819 3766 5452 52142;52143 66323;66324 66323 2 DETMSPSTAFQVK Unmodified 1439.6602 0.66024519 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 78.505 78.505 2 0.00041643 79383 QUIQUE_C1218_190116_001 96.171 48.569 61588000 61588000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5820 2948 5453 52144;52145 66325;66326;66327 66326 3 DETNYGIPQR Unmodified 1191.552 0.55201537 2787 P63244;D6RAC2;D6REE5;D6RHH4;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;D6RBD0;D6RFZ9;D6RAU2;E9PD14;D6RGK8;D6R909 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48 48 2 0.00022828 45952 QUIQUE_C1218_190116_001 124.98 102.24 4374200000 302490000 342150000 456400000 391860000 359420000 335300000 409400000 257580000 289190000 147790000 435620000 313370000 333670000 5821 2787 5454 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66375;66376;66377;66378;66379;66380 66377 6 DEVLYVFPSDFCR Unmodified 1645.7446 0.74464352 394 A0A1W2PS43;Q14108;A0A1W2PPX5;A0A1W2PQR6;A0A1W2PQB7;A0A1W2PRS1;A0A1W2PRF6 SCARB2 Lysosome membrane protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.29 139.29 2 1.7454E-07 143514 QUIQUE_C1277_190116_001 130.94 116.27 1120700000 116830000 99095000 91537000 95211000 99306000 80715000 101220000 50865000 94091000 41552000 99318000 60342000 90607000 5831 394 5464 52194;52195;52196;52197;52198;52199;52200;52201;52202;52203;52204;52205;52206 66381;66382;66383;66384;66385;66386;66387;66388;66389;66390;66391;66392;66393;66394 66382 12 DEVPYLR Unmodified 890.44978 0.44978213 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 1 58.924 58.924 2 0.048432 57942 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.915 39.328 23886000 0 0 0 0 0 0 0 0 23886000 0 0 0 0 5832 2282 5465 52207 66395 66395 1 DEVQEVVFVPAGTHTPGSR Unmodified 2023.9963 0.99631819 1297 J3QL71;Q96FV2;J3QRJ1;J3QR84;J3KT79;J3KS57 SCRN2 Secernin-2 yes no 0 0 0 2 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52230;52231;52232;52233;52234;52235;52236;52237;52238;52239;52240;52241;52242;52243;52244;52245;52246;52247;52248;52249;52250;52251;52252;52253;52254;52255;52256;52257;52258;52259;52260;52261;52262;52263;52264;52265;52266;52267;52268;52269;52270;52271;52272;52273;52274;52275;52276;52277;52278;52279;52280;52281;52282;52283;52284;52285;52286;52287;52288;52289;52290;52291;52292;52293;52294 66420;66421;66422;66423;66424;66425;66426;66427;66428;66429;66430;66431;66432;66433;66434;66435;66436;66437;66438;66439;66440;66441;66442;66443;66444;66445;66446;66447;66448;66449;66450;66451;66452;66453;66454;66455;66456;66457;66458;66459;66460;66461;66462;66463;66464;66465;66466;66467;66468;66469;66470;66471;66472;66473;66474;66475;66476;66477;66478;66479;66480;66481;66482;66483;66484;66485;66486;66487;66488;66489;66490;66491;66492;66493;66494;66495;66496;66497;66498;66499;66500;66501;66502;66503;66504;66505;66506;66507;66508;66509;66510;66511;66512;66513;66514;66515;66516;66517;66518;66519;66520;66521;66522;66523;66524;66525;66526;66527;66528 66438 100 DEVQNAVQR Unmodified 1057.5152 0.51523593 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 22.438 22.438 2 0.035319 15655 QUIQUE_C1218_190116_001 69.998 45.844 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5835 2037 5468 52295 66529 66529 1 DEWGLVAPISPGPLTPMR Unmodified 1934.9924 0.99241879 2009 P11137;E7EV03 MAP2 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DEYDDLSDLNAVQMESVR Unmodified 2097.9161 0.91607854 1488 O15173;U3KQM0 PGRMC2 Membrane-associated progesterone receptor component 2 yes no 0 0 0 1 1 130.81 130.81 2 0.002841 135692 QUIQUE_C1218_190116_001 75.764 65.976 63917000 39293000 0 0 24623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5838 1488 5471 52325;52326 66569;66570 66569 1 DFAAEVVHPGDLK Unmodified 1396.6987 0.69867961 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 1 77.74 77.74 2;3 3.5783E-07 79543 QUIQUE_C1218_190116_001 152.7 124.95 1160200000 214880000 250060000 96668000 207830000 196440000 0 0 0 0 29046000 0 67325000 98000000 5839 2641 5472 52327;52328;52329;52330;52331;52332;52333;52334;52335;52336;52337;52338;52339;52340;52341 66571;66572;66573;66574;66575;66576;66577;66578;66579;66580;66581;66582;66583;66584;66585;66586 66572 12 DFAAVEEVAPAKPPR Unmodified 1595.8308 0.83075641 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 1 1 69.757 69.757 3 0.02527 69094 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.277 58.828 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5840 3277 5473 52342 66587 66587 1 DFADIPNLR Unmodified 1059.5349 0.53490874 2172 P20774;Q5TBF5 OGN Mimecan yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.419 99.419 2 0.0020096 101522 QUIQUE_C1403_190116_001 97.798 64.06 1020800000 93656000 0 0 255660000 298670000 0 248770000 0 0 60786000 63213000 0 0 5841 2172 5474 52343;52344;52345;52346;52347;52348;52349 66588;66589;66590;66591;66592;66593;66594;66595;66596;66597 66590 10 DFAIDIIK Unmodified 933.51713 0.51713341 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 111.68 111.68 2 0.03977 116297 QUIQUE_C1576_190116_001 60.682 27.166 289660000 0 0 35773000 0 82204000 27499000 48798000 41880000 0 17563000 0 35940000 0 5842 3120 5475 52350;52351;52352;52353;52354;52355;52356 66598;66599;66600;66601;66602;66603;66604;66605 66602 8 DFALLSLQVPLK Unmodified 1342.786 0.78603805 290;327;328 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QUIQUE_C1218_190116_001 46.41 35.152 28728000 0 28728000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5853 3393 5486 52451;52452 66709;66710 66709 2 DFDPAVTEYIQR Unmodified 1452.6885 0.68850885 1962 P09467;A0A3B3IUC7;Q5VZC3 FBP1 Fructose-1,6-bisphosphatase 1 yes no 0 0 0 1 1 106.99 106.99 2 0.0016085 110193 QUIQUE_C1403_190116_001 80.24 62.376 78451000 0 0 0 37509000 0 0 0 0 0 0 40942000 0 0 5854 1962 5487 52453;52454 66711;66712 66711 2 DFDTALK Unmodified 808.39668 0.39668393 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 47.365 47.365 2 0.030069 45032 QUIQUE_C1368_190116_001 90.986 55.88 862740000 0 0 223550000 0 0 0 0 0 0 0 230370000 199060000 209760000 5855 2343 5488 52455;52456;52457;52458 66713;66714;66715;66716;66717 66713 5 DFEELKAEEVDVTK Unmodified 1650.7988 0.79884716 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 83.221 83.221 2;3 6.0207E-58 85687 QUIQUE_C1438_190116_001 203.7 176.59 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DFEGCSVLR Unmodified 1081.4862 0.48624399 4161 Q9H3S7;C9JD91 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes no 0 0 0 1 1 1 64.705 64.705 2 0.012317 64617 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.501 53.466 39333000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39333000 5859 4161 5492 52481;52482;52483 66752;66753;66754 66754 3 DFEIIDNHDYSYTVK Unmodified 1857.8421 0.84210896 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 2 100.23 100.23 2;3 0.0014064 96898 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.862 52.214 62820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62820000 0 0 0 5860 3061 5493 52484;52485;52486 66755;66756;66757 66756 3 DFENSMNQVK Unmodified 1210.5288 0.52883709 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63;F8W6J1 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 52.278 52.278 2 0.0093574 50023 QUIQUE_C1218_190116_001 88.294 60.412 61997000 47025000 0 0 0 0 0 0 0 0 14973000 0 0 0 5861 236 5494 52487;52488;52489 66758;66759;66760 66758 2 DFENSMNQVK Oxidation (M) 1226.5238 0.52375171 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63;F8W6J1 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 23.735 23.735 2 0.033938 17213 QUIQUE_C1218_190116_001 93.162 64.076 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5862 236 5494 52490 66761 66761 1 DFEPSLGPVCPFR Unmodified 1519.7129 0.71294946 1923 P07585;F8VX58;F8VXZ8;F8VUF6;F8VWU0;F8VNW0;F8VU58;F8VSI3;F8VNV6 DCN Decorin yes no 0 0 0 1 1 1 125.88 125.88 2 0.028033 131264 QUIQUE_C1438_190116_001 37.556 28.975 161380000 37570000 0 0 67499000 56311000 0 0 0 0 0 0 0 0 5863 1923 5495 52491;52492;52493 66762;66763;66764 66764 3 DFEQPLAISR Unmodified 1174.5982 0.59823728 1378 O00151 PDLIM1 PDZ and LIM domain protein 1 yes yes 0 0 0 1 17.461 17.461 3 0.060986 9784 QUIQUE_C1438_190116_001 24.838 8.167 1070100000 0 0 0 0 1070100000 0 0 0 0 0 0 0 0 5864 1378 5496 52494 66765 66765 1 DFESHITSYK Unmodified 1225.5615 0.56151742 645 Q99613;B5ME19;H3BPE3 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 49.641 49.641 2;3 0.0012409 47325 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.02 83.477 354950000 90300000 57026000 0 50569000 0 32019000 0 49258000 20450000 11509000 0 43817000 0 5865 645 5497 52495;52496;52497;52498;52499;52500;52501;52502;52503;52504 66766;66767;66768;66769;66770;66771;66772;66773;66774;66775;66776;66777 66772 10 DFFHGLR Unmodified 890.43989 0.43988615 4295 Q9NTZ6 RBM12 RNA-binding protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 63.969 63.969 2 0.025454 63756 QUIQUE_C1277_190116_001 95.957 44.17 79934000 0 21151000 20321000 17346000 21115000 0 0 0 0 0 0 0 0 5866 4295 5498 52505;52506;52507;52508;52509 66778;66779;66780;66781;66782;66783 66778 6 DFFLANASR Unmodified 1039.5087 0.50869399 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 85.227 85.227 1;2 0.00046545 86967 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.81 112.04 1829400000 0 158940000 175240000 186960000 162590000 123880000 167710000 23995000 193540000 83005000 203890000 171550000 178060000 5867 1921 5499 52510;52511;52512;52513;52514;52515;52516;52517;52518;52519;52520;52521;52522 66784;66785;66786;66787;66788;66789;66790;66791;66792;66793;66794;66795;66796;66797;66798;66799 66798 15 DFFNYLPLSSQDPAPVR Unmodified 1964.9632 0.96322715 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3;E7ENC1 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.86 147.86 2;3 2.3707E-05 153617 QUIQUE_C1218_190116_001 71.601 30.877 475640000 58901000 0 225850000 0 0 0 0 49737000 0 24826000 68215000 0 48113000 5868 739 5500 52523;52524;52525;52526;52527;52528 66800;66801;66802;66803;66804;66805;66806 66800 7 DFFQSYGNVVELR Unmodified 1572.7573 0.75725712 2984 Q13283 G3BP1 Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 135.66 135.66 2 0.0005113 139889 QUIQUE_C1277_190116_001 104.82 93.918 109640000 0 41753000 0 0 0 0 0 0 0 23026000 44858000 0 0 5869 2984 5501 52529;52530;52531 66807;66808;66809 66807 3 DFFSLPLPLAPEFIR Unmodified 1760.9501 0.95014327 4092 Q9C0B6 BRINP2 BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 172.71 172.71 2 0.0013216 175989 QUIQUE_C1277_190116_001 88.187 77.577 70603000 16400000 17712000 0 0 0 0 13985000 7796500 0 0 0 14709000 0 5870 4092 5502 52532;52533;52534;52535;52536 66810;66811;66812;66813;66814 66811 5 DFFSMKPEWENLNQSNVR Unmodified 2240.0321 0.03205177 4152 Q9H2X9 SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 126.11 126.11 3 1.3743E-10 130018 QUIQUE_C1277_190116_001 99.891 85.419 164430000 28590000 51288000 0 25260000 0 0 24533000 0 0 0 34758000 0 0 5871 4152 5503 52537;52538;52539;52540;52541 66815;66816;66817;66818;66819 66816 3 DFFTSGSPEETAFR Unmodified 1589.6998 0.69980182 1569 O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4;A0A2R8Y5G3;C9JY58 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 112.95 112.95 2 0.0005593 115173 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.2 91.298 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5872 1569 5504 52542;52543;52544;52545;52546;52547 66820;66821;66822;66823;66824;66825 66825 6 DFGGVTNGKPEDK Unmodified 1362.6416 0.64155866 4186 Q9H845;H0Y8Z9 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 24.718 24.718 2 0.0045144 18720 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.813 60.574 24686000 0 0 0 0 0 0 0 0 24686000 0 0 0 0 5873 4186 5505 52548;52549 66826;66827 66827 2 DFGLWTTPAGPK Unmodified 1288.6452 0.64518747 4197 Q9H9H5;C9JPF8;H7BZQ6 MAP6D1 MAP6 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 114.57 114.57 2 0.0043205 111661 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.977 50.648 148760000 0 0 0 49297000 0 29651000 46163000 23645000 0 0 0 0 0 5874 4197 5506 52550;52551;52552;52553;52554 66828;66829;66830;66831;66832 66832 5 DFGNYLFNFASAATK Unmodified 1664.7835 0.78347187 3796 Q96A49 SYAP1 Synapse-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.92 159.92 2 1.3522E-12 163674 QUIQUE_C1403_190116_001 132.5 115.03 528350000 27260000 31010000 41434000 44986000 60971000 53319000 32005000 44420000 44774000 17483000 43334000 37480000 49869000 5875 3796 5507 52555;52556;52557;52558;52559;52560;52561;52562;52563;52564;52565;52566;52567 66833;66834;66835;66836;66837;66838;66839;66840;66841;66842;66843;66844;66845;66846;66847;66848 66837 16 DFGSFDK Unmodified 814.34973 0.34973373 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5;G8JLJ2 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.862 50.862 1;2 0.0021747 49643 QUIQUE_C1218_190116_001 197.65 126.29 8961800000 1016000000 707190000 1123400000 717170000 621790000 900470000 770200000 320890000 567800000 437250000 642930000 493820000 642820000 5876 1855 5508 52568;52569;52570;52571;52572;52573;52574;52575;52576;52577;52578;52579;52580;52581 66849;66850;66851;66852;66853;66854;66855;66856;66857;66858;66859;66860;66861;66862;66863;66864 66850 15 DFGSFDKFK Unmodified 1089.5131 0.51311067 1855 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transmembrane protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 127.33 127.33 3 0.00029379 130427 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.191 83.866 120160000 0 0 0 16576000 0 0 0 23900000 25779000 0 20286000 15879000 17744000 5892 4158 5524 52721;52722;52723;52724;52725;52726;52727 67029;67030;67031;67032;67033;67034;67035;67036 67031 8 DFINSELLAQLYSSEDQNTLMEESAEQAQR Unmodified 3458.5784 0.57837264 4528 Q9UQ16;H0YBC6 DNM3 Dynamin-3 yes no 0 0 0 1 166.54 166.54 3 0.018252 171123 QUIQUE_C1218_190116_001 24.454 22.251 39649000 39649000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5893 4528 5525 52728 67037 67037 1 DFISLGLQDGHLVFR Unmodified 1715.8995 0.89950468 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 145.2 145.2 3 0.00079354 149084 QUIQUE_C1403_190116_001 65.805 46.747 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5894 2834 5526 52729 67038 67038 1 DFISNLLK Unmodified 948.52803 0.52803245 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.23 134.23 2 0.0084554 140538 QUIQUE_C1438_190116_001 94.262 56.024 637460000 52292000 0 61323000 54824000 56879000 0 59826000 62683000 68517000 30916000 49265000 74938000 65999000 5895 3154 5527 52730;52731;52732;52733;52734;52735;52736;52737;52738;52739;52740 67039;67040;67041;67042;67043;67044;67045;67046;67047;67048;67049 67042 11 DFITGEVISALGR Unmodified 1376.73 0.72997974 237 A0A0C4DGA7;O94929;D6RHE7 ABLIM3 Actin-binding LIM protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 148.08 148.08 2 0.0010792 154234 QUIQUE_C1576_190116_001 82.171 65.5 48049000 0 0 0 0 18392000 0 15180000 14477000 0 0 0 0 0 5896 237 5528 52741;52742;52743;52744 67050;67051;67052;67053 67052 4 DFIWGVIGK Unmodified 1033.5597 0.55966693 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.26 134.26 2 0.0043079 138393 QUIQUE_C1403_190116_001 89.296 70.513 248210000 29060000 35359000 25209000 30294000 0 23698000 0 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67077;67078;67079;67080;67081;67082;67083;67084 67080 2 DFKPGDLIFAK Unmodified 1249.6707 0.67067394 1637 O75475 PSIP1 PC4 and SFRS1-interacting protein yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 2 102.8 102.8 2;3 0.00014137 105644 QUIQUE_C1368_190116_001 103.08 87.544 2231800000 248480000 151110000 250850000 189220000 116170000 165190000 236810000 176220000 104130000 36909000 138940000 161740000 256060000 5900 1637 5532 52773;52774;52775;52776;52777;52778;52779;52780;52781;52782;52783;52784;52785;52786;52787;52788;52789;52790;52791;52792 67085;67086;67087;67088;67089;67090;67091;67092;67093;67094;67095;67096;67097;67098;67099;67100;67101;67102;67103;67104;67105;67106;67107;67108;67109;67110;67111;67112;67113;67114 67091 29 DFLAGGIAAAISK Unmodified 1232.6765 0.6764876 2039 P12236 SLC25A6 ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 3 3 2 126.45 126.45 2 0.00043768 130566 QUIQUE_C1277_190116_001 111.52 92.254 3648100000 267640000 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144751 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.85 70.782 47281000 0 0 0 0 0 0 0 0 18048000 0 0 0 29233000 5965 4560 5590 53371;53372;53373 67933;67934;67935 67933 2 DFQALNPMK Unmodified 1062.5168 0.51681584 216;1545 A0A0C4DFM0;G3V5T0;G3V4T6;A0A0A0MR33;O43708 GSTZ1 Maleylacetoacetate isomerase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.416 83.416 2 0.01031 83559 QUIQUE_C1563_190116_001 74.301 46.565 138550000 28877000 0 0 0 0 25963000 30532000 0 0 0 0 21062000 32115000 5966 216;1545 5591 53374;53375;53376;53377;53378 67936;67937;67938;67939;67940;67941;67942 67938 6 DFQDYMEPEEGCQGSPQR Unmodified 2171.8524 0.85243242 1515 O43237;B4E2E0;H3BUM4 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 91.215 91.215 2 7.0206E-20 92567 QUIQUE_C1403_190116_001 163.27 158.19 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5967 1515 5592 53379;53380 67943;67944 67944 2 DFQEYVEPGEDFPASPQR Unmodified 2109.928 0.92796385 4653 Q9Y6G9;E9PHI6;C9JGM7 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 114.47 114.47 2 2.921E-17 118509 QUIQUE_C1368_190116_001 160.27 152.55 86455000 0 0 46628000 0 0 39827000 0 0 0 0 0 0 0 5968 4653 5593 53381;53382;53383;53384;53385 67945;67946;67947;67948;67949 67946 4 DFQIQVQPVR Unmodified 1228.6564 0.65642086 1158 H0YI08;Q9Y6F6 MRVI1 Protein MRVI1 yes no 0 0 0 1 1 1 83.503 83.503 2 0.0047113 85004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.439 64.265 47644000 0 0 0 21880000 0 0 0 0 25764000 0 0 0 0 5969 1158 5594 53386;53387;53388 67950;67951;67952 67951 3 DFQPVLHLVALNSPLSGGMR Unmodified 2150.1306 0.1306436 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.8 144.8 3 3.8053E-57 151543 QUIQUE_C1438_190116_001 143.04 134.82 650880000 53267000 74700000 36770000 54394000 118150000 28592000 47807000 0 46269000 19606000 57915000 52393000 61016000 5970 2419 5595 53389;53390;53391;53392;53393;53394;53395;53396;53397;53398;53399;53400 67953;67954;67955;67956;67957;67958;67959;67960;67961;67962;67963;67964;67965;67966;67967;67968;67969 67959 17 DFQQYLPLVIEPLIK Unmodified 1815.0182 0.018222832 1582 O60518 RANBP6 Ran-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 168.98 168.98 2;3 2.8969E-06 170796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.39 87.752 464050000 30980000 41057000 169510000 0 0 0 0 37896000 40445000 0 98693000 45468000 0 5971 1582 5596 53401;53402;53403;53404;53405;53406;53407;53408;53409;53410;53411 67970;67971;67972;67973;67974;67975;67976;67977;67978;67979;67980 67976 11 DFQSGQHVIVR Unmodified 1284.6575 0.65748349 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3;I3L338;I3L4Q9 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.525 34.525 2 3.3747E-13 29812 QUIQUE_C1403_190116_001 167.67 156.08 7547100000 770230000 955800000 574850000 720280000 657550000 486520000 884910000 0 387340000 277460000 682300000 522560000 627300000 5972 1245 5597 53412;53413;53414;53415;53416;53417;53418;53419;53420;53421;53422;53423 67981;67982;67983;67984;67985;67986;67987;67988;67989;67990;67991;67992;67993;67994 67986 11 DFQWTDNTGLQFENWR Unmodified 2055.9075 0.90750318 1436 O14594;K7EKF8 NCAN Neurocan core protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 150.23 150.23 2;3 2.3261E-44 157505 QUIQUE_DMIX5_190116_001 218.01 207.4 651500000 65726000 39763000 46925000 29094000 56516000 21956000 74151000 48692000 83177000 0 66197000 73165000 46135000 5973 1436 5598 53424;53425;53426;53427;53428;53429;53430;53431;53432;53433;53434;53435;53436;53437;53438 67995;67996;67997;67998;67999;68000;68001;68002;68003;68004;68005;68006;68007;68008;68009;68010;68011;68012;68013;68014 68010 19 DFQYNEEEMK Unmodified 1331.534 0.53398204 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.835 59.835 2 0.0018689 57887 QUIQUE_C1563_190116_001 93.111 86.493 370910000 58442000 74149000 70580000 58629000 32181000 56367000 0 0 0 20559000 0 0 0 5974 2176 5599 53439;53440;53441;53442;53443;53444;53445 68015;68016;68017;68018;68019;68020;68021;68022;68023 68020 9 DFQYNEEEMKADKEEMNR Unmodified 2304.9627 0.96271116 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 57.227 57.227 3;4 6.8578E-23 54740 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.62 135.81 970130000 0 98377000 51800000 69486000 0 0 31193000 122430000 81929000 0 102840000 99371000 312700000 5975 2176 5600 53446;53447;53448;53449;53450;53451;53452;53453;53454;53455;53456;53457;53458;53459;53460 68024;68025;68026;68027;68028;68029;68030;68031;68032;68033;68034;68035;68036;68037;68038 68037 13 DFQYVDRDGKDQGVNVR Unmodified 2009.9555 0.95551601 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 2 1 1 46.717 46.717 3 0.0014301 44348 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.12 59.167 144270000 0 0 0 0 0 0 0 86065000 0 0 0 0 58207000 5976 4654 5601 53461;53462 68039;68040;68041 68039 3 DFSAFINLVEFCR Unmodified 1616.7657 0.76571331 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 169.31 169.31 2 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69.201 50144000 0 0 0 34415000 0 0 0 0 0 15729000 0 0 0 5979 2566 5604 53490;53491 68073;68074;68075 68073 3 DFSELEPDKFQNK Unmodified 1595.7468 0.74675201 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 0 0 1 1 1 77.5 77.5 2 0.0074116 78663 QUIQUE_C1368_190116_001 91.584 73.272 23423000 0 0 23423000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5980 948 5605 53492;53493 68076;68077 68076 1 DFSGNASCHPPEAK Unmodified 1515.6412 0.64124108 1514 O43236;J3QLA8;J3QRS4 SEPT4 Septin-4 yes no 0 0 0 1 21.759 21.759 2 0.034987 14766 QUIQUE_C1277_190116_001 52.495 43.647 25657000 0 25657000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5981 1514 5606 53494 68078 68078 1 DFSGTSDPFVK Unmodified 1198.5506 0.55061839 1532 O43581 SYT7 Synaptotagmin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.153 81.153 2 0.0023707 81820 QUIQUE_C1403_190116_001 103.55 89.967 372820000 53932000 60234000 69737000 56799000 0 47741000 57305000 0 0 27071000 0 0 0 5982 1532 5607 53495;53496;53497;53498;53499;53500;53501 68079;68080;68081;68082;68083;68084;68085 68082 3 DFSHPCTWQVLDGAEDTLR Unmodified 2246.0062 0.00623095 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 130.06 130.06 3 0.026027 135003 QUIQUE_C1368_190116_001 30.534 26.871 59660000 0 0 38125000 0 0 21535000 0 0 0 0 0 0 0 5983 4012 5608 53502;53503 68086;68087 68086 1 DFSISGGELGPTMK Unmodified 1437.681 0.68098063 3861 Q96GR2;F5H4U6 ACSBG1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.46 103.46 2 0.00044374 106110 QUIQUE_C1277_190116_001 104.79 67.604 216250000 31121000 32299000 37261000 0 0 34620000 0 37528000 31339000 12085000 0 0 0 5984 3861 5609 53504;53505;53506;53507;53508;53509;53510 68088;68089;68090;68091;68092;68093;68094 68089 7 DFSISGGELGPTMK Oxidation (M) 1453.6759 0.67589525 3861 Q96GR2;F5H4U6 ACSBG1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 yes no 0 1 0 1 1 1 86.13 86.13 2 0.0037359 88211 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.184 74.568 121100000 0 0 0 0 0 0 0 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68114;68115;68116;68117;68118;68119;68120;68121 68120 8 DFSPSGIFGAFQR Unmodified 1427.6834 0.68336389 729 C9JJT5;C9JU26;G3V325;P56134 ATP5J2-PTCD1;ATP5J2 ATP synthase subunit f, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.46 146.46 2 4.3023E-08 151568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.95 130.31 3520000000 254320000 240780000 289920000 155680000 123570000 204040000 220500000 377670000 414460000 99877000 476470000 347880000 314850000 5988 729 5612 53534;53535;53536;53537;53538;53539;53540;53541;53542;53543;53544;53545;53546;53547 68122;68123;68124;68125;68126;68127;68128;68129;68130;68131;68132;68133;68134;68135;68136;68137;68138;68139;68140;68141;68142;68143;68144;68145;68146 68137 25 DFSPVPWSQYFESMEDVEVENETGKDTFR Unmodified 3467.514 0.51398147 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 164.99 164.99 3 3.5012E-31 170738 QUIQUE_C1576_190116_001 112.99 108.09 260600000 0 0 0 0 40280000 0 36709000 0 48983000 0 0 63763000 70865000 5989 4617 5613 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0.29930143 2897 Q05707;A0A0A0MQT7 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 146.9 146.9 3 0.00028186 150808 QUIQUE_C1403_190116_001 44.632 41.946 41138000 0 0 0 41138000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5992 2897 5616 53573 68174 68174 1 DFSSVFQFLR Unmodified 1244.619 0.61897272 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 161.66 161.66 2 0.00010962 166035 QUIQUE_DMIX7_190116_001 139.19 89.373 625860000 0 0 153520000 0 0 137140000 0 0 115720000 0 126810000 92676000 0 5993 2338 5617 53574;53575;53576;53577;53578;53579 68175;68176;68177;68178;68179;68180 68180 6 DFSSVFQFLREEETF Unmodified 1879.8628 0.8628444 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.26 172.26 2 1.9702E-110 173809 QUIQUE_DMIX1_190116_001 224.82 211.83 353470000 0 0 0 0 16081000 0 22653000 46913000 80067000 0 71255000 87046000 29451000 5994 2338 5618 53580;53581;53582;53583;53584;53585;53586 68181;68182;68183;68184;68185;68186;68187 68183 6 DFSVFFQK Unmodified 1016.4967 0.49673232 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.43 121.43 2 0.0040378 125100 QUIQUE_C1277_190116_001 110.61 96.94 574380000 61217000 39326000 58861000 37188000 29104000 40922000 39383000 39883000 0 27050000 75539000 69769000 56133000 5995 1713 5619 53587;53588;53589;53590;53591;53592;53593;53594;53595;53596;53597;53598;53599 68188;68189;68190;68191;68192;68193;68194;68195;68196;68197;68198;68199;68200;68201 68189 14 DFSWSPGGNIIAFWVPEDKDIPAR Unmodified 2716.3286 0.32855137 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 164.5 164.5 3 0.0011353 169130 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.523 30.335 182250000 0 0 0 0 0 0 0 0 44022000 0 48579000 59712000 29937000 5996 2674 5620 53600;53601;53602;53603 68202;68203;68204;68205 68202 3 DFTATDLSEFAAK Unmodified 1414.6616 0.6616254 2453 P42765;A0A0B4J2A4 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 116.99 116.99 2 1.5411E-52 119465 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.25 162.95 6545100000 450310000 470820000 660200000 451650000 482390000 512960000 546590000 528790000 476200000 206310000 682000000 462400000 614470000 5997 2453 5621 53604;53605;53606;53607;53608;53609;53610;53611;53612;53613;53614;53615;53616;53617;53618;53619 68206;68207;68208;68209;68210;68211;68212;68213;68214;68215;68216;68217;68218;68219;68220;68221;68222;68223 68215 18 DFTATFGPLDSLNTR Unmodified 1653.7999 0.79985021 2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.29 137.29 2 6.051E-09 142748 QUIQUE_C1368_190116_001 138.45 129.02 2351700000 180290000 188910000 226860000 159790000 205040000 176000000 177920000 157920000 201170000 75077000 252410000 160500000 189780000 5998 2026 5622 53620;53621;53622;53623;53624;53625;53626;53627;53628;53629;53630;53631;53632 68224;68225;68226;68227;68228;68229;68230;68231;68232;68233;68234;68235;68236;68237;68238;68239;68240;68241;68242;68243;68244;68245;68246;68247 68229 24 DFTCVHQALK Unmodified 1217.5863 0.58629239 1879 P05155;H9KV48;E9PGN7 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 39.183 39.183 2;3 0.00023561 35846 QUIQUE_C1438_190116_001 117.89 88.741 684350000 41728000 71296000 82832000 28627000 165470000 38178000 43124000 0 0 29333000 144280000 0 39478000 5999 1879 5623 53633;53634;53635;53636;53637;53638;53639;53640;53641;53642;53643;53644;53645;53646 68248;68249;68250;68251;68252;68253;68254;68255;68256;68257;68258;68259;68260;68261;68262;68263 68255 15 DFTDIQQDFLPWK Unmodified 1651.7882 0.7882229 870 E7ESY4;Q13330;H0Y4T7 MTA1 Metastasis-associated protein MTA1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 159.53 159.53 2 4.1066E-05 163685 QUIQUE_C1277_190116_001 130.98 117.89 29218000 0 0 24508000 0 0 0 0 0 0 4709800 0 0 0 6000 870 5624 53647;53648;53649;53650 68264;68265;68266;68267;68268 68264 4 DFTENPCLR Unmodified 1150.5077 0.50770771 1407 O00451 GFRA2 GDNF family receptor alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 56.054 56.054 2 0.015343 54722 QUIQUE_C1576_190116_001 67.277 47.641 50992000 23755000 0 0 0 0 0 27237000 0 0 0 0 0 0 6001 1407 5625 53651;53652 68269;68270;68271 68271 3 DFTLEPLR Unmodified 989.5182 0.51819605 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;H0Y7R3;H0Y493;H0Y7J9 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.56 100.56 2 0.031344 103668 QUIQUE_C1368_190116_001 66.138 14.12 338570000 0 0 66224000 0 91662000 0 72938000 107740000 0 0 0 0 0 6002 1056 5626 53653;53654;53655;53656 68272;68273;68274;68275 68272 4 DFTPAELR Unmodified 947.47125 0.47124585 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.238 65.238 2 0.0067895 65984 QUIQUE_C1218_190116_001 100.45 74.714 3209500000 389180000 339630000 259470000 309900000 308870000 241160000 313180000 138220000 213330000 120940000 0 288470000 287180000 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68303;68304;68305;68306;68307;68308;68309;68310;68311;68312;68313 68305 11 DFTPVCTTELGR Unmodified 1394.65 0.65001485 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 82.78 82.78 2 2.2479E-06 83959 QUIQUE_C1277_190116_001 147.95 132.33 66916000000 4035400000 4893000000 5128200000 5640700000 4635700000 5142500000 4914500000 5169600000 6237500000 2601200000 6156200000 5194900000 7167100000 6006 2298 5630 53685;53686;53687;53688;53689;53690;53691;53692;53693;53694;53695;53696;53697;53698 68314;68315;68316;68317;68318;68319;68320;68321;68322;68323;68324;68325;68326;68327;68328;68329;68330;68331;68332;68333;68334;68335;68336 68316 23 DFTSEQIDEILQNHTEIVFAR Unmodified 2504.2183 0.21833222 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 152.76 152.76 3 1.5537E-07 157769 QUIQUE_C1368_190116_001 89.859 60.018 689800000 101370000 91815000 132710000 108550000 0 92405000 162950000 0 0 0 0 0 0 6007 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Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 73.156 73.156 2;3 0 74302 QUIQUE_C1218_190116_001 309.86 268.86 2240900000 351760000 393780000 262420000 299580000 101450000 307070000 151550000 46845000 58912000 67187000 132490000 67813000 0 6010 3055 5633 53716;53717;53718;53719;53720;53721;53722;53723;53724;53725;53726;53727;53728;53729;53730;53731;53732;53733 68360;68361;68362;68363;68364;68365;68366;68367;68368;68369;68370;68371;68372;68373;68374;68375;68376;68377;68378 68361 19 DFTVSALHGDMDQKER Unmodified 1847.8472 0.84721111 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 59.322 59.322 3 7.985E-06 58648 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.96 92.034 476130000 0 0 0 0 0 0 0 176360000 83891000 0 57142000 74381000 84363000 6011 3055 5634 53734;53735;53736;53737;53738 68379;68380;68381;68382;68383 68379 5 DFTVSALHGDMDQKER Oxidation (M) 1863.8421 0.84212573 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 1 1 1 43.136 43.136 3 0.047804 39517 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.493 18.166 107240000 0 0 0 0 0 0 0 107240000 0 0 0 0 0 6012 3055 5634 53739 68384 68384 2512 0 DFTVSAMHGDMDQK Unmodified 1580.6599 0.65992761 2697 P60842;J3KT12;J3KSZ0;J3QL52 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 62.242 62.242 2;3 1.4627E-36 61237 QUIQUE_C1368_190116_001 178.65 142.71 479720000 37793000 74473000 85627000 94189000 42547000 65464000 34449000 0 0 0 45178000 0 0 6013 2697 5635 53740;53741;53742;53743;53744;53745;53746;53747;53748;53749;53750;53751 68385;68386;68387;68388;68389;68390;68391;68392;68393;68394;68395;68396 68389 12 DFTVSAMHGDMDQKER Unmodified 1865.8036 0.80363174 2697 P60842;J3KT12;J3KSZ0;J3QL52 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 1 1 50.664 50.664 3 0.024192 47949 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68404;68405;68406;68407;68408;68409;68410;68411;68412 68409 9 DFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLK Unmodified 2710.3742 0.37416416 2528 P49407;E9PM35 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 2 2 166.44 166.44 2;3 1.6616E-87 170904 QUIQUE_DMIX3_190116_001 223.06 212.27 5918300000 25160000 508250000 518030000 351150000 37265000 458500000 46245000 865270000 781800000 151030000 1071900000 0 1103700000 6017 2528 5638 53767;53768;53769;53770;53771;53772;53773;53774;53775;53776;53777;53778;53779;53780;53781;53782;53783;53784;53785 68413;68414;68415;68416;68417;68418;68419;68420;68421;68422;68423;68424;68425;68426;68427;68428;68429;68430;68431 68425 19 DFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLK Unmodified 2711.3694 0.36941313 2347 P32121;K7ENA6;I3L412 ARRB2 Beta-arrestin-2 yes no 0 0 1 1 145.84 145.84 3 0.032541 151610 QUIQUE_C1576_190116_001 27.563 20.685 19026000 0 0 0 0 0 0 19026000 0 0 0 0 0 0 6018 2347 5639 53786 68432 68432 1 DFVEALK Unmodified 820.43307 0.43306943 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 65.945 65.945 2 0.057389 65931 QUIQUE_C1576_190116_001 70.912 37.555 64646000 0 0 0 0 0 26636000 19460000 0 0 0 0 18550000 0 6019 3511 5640 53787;53788;53789 68433;68434;68435 68434 3 DFVEAPSQMLENWVWEQEPLLR Unmodified 2715.3003 0.30028771 2615 P52888;K7EP46;K7EL02;K7EIK4;K7EMU4;K7EL32 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 173.21 173.21 3 1.3095E-05 177422 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.203 57.554 152780000 0 0 6523800 0 0 0 23255000 0 34275000 0 50869000 22665000 15194000 6020 2615 5641 53790;53791;53792;53793;53794;53795;53796;53797 68436;68437;68438;68439;68440;68441;68442;68443 68439 5 DFVEAPSQMLENWVWEQEPLLR Oxidation (M) 2731.2952 0.29520233 2615 P52888;K7EP46;K7EL02;K7EIK4;K7EMU4;K7EL32 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 1 0 1 1 1 168.79 168.79 3 0.00026874 173087 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.392 43.994 101930000 0 0 0 0 0 0 0 41671000 33752000 0 0 0 26510000 6021 2615 5641 53798;53799;53800 68444;68445;68446 68446 2069 2 DFVLVPQMSQHMEDWIPHLK Unmodified 2449.1923 0.19225758 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 149.76 149.76 3;4 0.0010324 154570 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.819 43.111 234550000 0 0 72906000 41659000 0 12584000 43889000 0 22023000 0 0 24279000 17214000 6022 2361 5642 53801;53802;53803;53804;53805;53806;53807;53808;53809 68447;68448;68449;68450;68451;68452;68453;68454;68455;68456;68457 68454 9 DFVNMMLGK Unmodified 1053.4987 0.49872293 3995 Q9BQI0;A6PVM9 AIF1L Allograft inflammatory factor 1-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 124.05 124.05 2 0.025644 126593 QUIQUE_C1563_190116_001 86.953 66.399 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6023 3995 5643 53810;53811;53812;53813;53814 68458;68459;68460;68461;68462 68461 5 DFVNYLVR Unmodified 1024.5342 0.53418046 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 106.09 106.09 2 0.0036731 103613 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.12 87.103 1567200000 130800000 156790000 150440000 112620000 134180000 108380000 117430000 126370000 102850000 45815000 153290000 128910000 99358000 6024 2916 5644 53815;53816;53817;53818;53819;53820;53821;53822;53823;53824;53825;53826;53827;53828 68463;68464;68465;68466;68467;68468;68469;68470;68471;68472;68473;68474;68475;68476;68477;68478;68479;68480;68481 68478 17 DFVPFITK Acetyl (Protein N-term) 1007.5328 0.53278348 428 A0A2R8Y5F1;A0A2R8YGU4;X5D2U8;H3BMQ0;A0A2R8YDZ2;A0A2R8Y7X5;A0A2R8YDR3;A0A2R8Y7C8;A0A2R8YGD6;P49815;A0A2R8Y6C9;I3L3B1 TSC2 Tuberin yes no 1 0 0 1 18.379 18.379 2 0.063365 11049 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.892 6.0201 19618000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19618000 0 0 6025 428 5645 53829 68482 68482 1 DFVSEAYLLTLGK Unmodified 1454.7657 0.76569654 882 E7EVJ5;Q96F07;A0A087WWZ1;A0A087WTQ3;A0A087WVE1 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 155.57 155.57 2 1.5825E-13 162522 QUIQUE_C1368_190116_001 157.97 0 2030300000 149170000 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2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 167.71 167.71 3 1.6078E-17 174888 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.11 92.606 396050000 22508000 70884000 0 20508000 0 0 0 76282000 48956000 11489000 145420000 0 0 6028 2638 5648 53865;53866;53867;53868;53869;53870;53871 68525;68526;68527;68528;68529;68530;68531 68531 7 DFVTEALQSR Unmodified 1164.5775 0.57750184 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.31 105.31 2 2.2724E-05 107979 QUIQUE_C1403_190116_001 146.69 113.43 1060900000 69890000 110650000 107400000 79767000 77649000 117600000 97244000 50425000 78623000 46298000 68510000 68851000 87955000 6029 3116 5649 53872;53873;53874;53875;53876;53877;53878;53879;53880;53881;53882;53883;53884 68532;68533;68534;68535;68536;68537;68538;68539;68540;68541;68542;68543;68544;68545;68546;68547 68535 16 DFWEQEVR Unmodified 1107.4985 0.49852324 3200 Q16822;H0YML5 PCK2 Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial yes no 0 0 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68633;68634;68635;68636;68637;68638;68639;68640;68641;68642;68643;68644;68645;68646;68647;68648;68649;68650;68651;68652;68653 68652 14 DFYMTDSISR Unmodified 1233.5336 0.53358811 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.167 87.167 2 0.020063 87855 QUIQUE_C1563_190116_001 82.287 58.132 930930000 140010000 96900000 117500000 0 61981000 104450000 104420000 0 104830000 0 77509000 68744000 54591000 6036 2280 5656 53961;53962;53963;53964;53965;53966;53967;53968;53969;53970 68654;68655;68656;68657;68658;68659;68660;68661;68662;68663 68658 7 DFYMTDSISR Oxidation (M) 1249.5285 0.52850274 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 63.785 63.785 2 0.020862 63839 QUIQUE_C1576_190116_001 61.691 49.844 158620000 0 32946000 53768000 0 0 0 34213000 0 0 0 0 37695000 0 6037 2280 5656 53971;53972;53973;53974 68664;68665;68666;68667;68668 68667 5 DFYQFTFNFAK Unmodified 1426.6558 0.65575216 749 C9JVE2;Q96GG9 DCUN1D1 DCN1-like protein;DCN1-like protein 1 yes no 0 0 0 2 1 148.67 148.67 2 0.00044387 153945 QUIQUE_C1218_190116_001 104.2 98.66 18890000 8226900 0 0 0 0 0 10663000 0 0 0 0 0 0 6038 749 5657 53975;53976;53977 68669;68670;68671 68669 2 DGADFAKWR Unmodified 1064.5039 0.50394296 1851;1978 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8;H3BU78;P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;K7EKH5 ALDOA;ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase;Fructose-bisphosphate aldolase C no no 0 0 1 2 53.456 53.456 2;3 0.0092138 51082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.65 49.019 44947000 0 0 0 0 0 0 0 44947000 0 0 0 0 0 6039 1851;1978 5658 53978;53979 68672;68673 68673 2 DGADIHSDLFISIAQALLGGTAR Unmodified 2340.2074 0.2073736 3845 Q96EY1 DNAJA3 DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.56 173.56 3 5.0947E-51 177757 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.51 113.57 446110000 32422000 26163000 21998000 8776500 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antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-13 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain;HLA 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histocompatibility antigen, A-80 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 69.809 69.809 2;3 5.3044E-223 69691 QUIQUE_C1368_190116_001 298.33 279.49 2792800000 174440000 120150000 380800000 235160000 258860000 89630000 179960000 111580000 180240000 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yes 0 0 0 1 151.38 151.38 2 0.011377 155896 QUIQUE_C1277_190116_001 58.172 54.851 12085000 0 12085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6090 1492 5705 54423 69233 69233 1 DGFFGLSISDR Unmodified 1212.5775 0.57750184 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 134.86 134.86 2 0.019301 140125 QUIQUE_C1218_190116_001 64.297 43.968 78824000 18600000 14776000 0 11987000 0 0 0 24909000 0 8551800 0 0 0 6091 2665 5706 54424;54425;54426;54427;54428 69234;69235;69236;69237;69238 69234 5 DGFFGNPR Unmodified 908.41407 0.41406533 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 0 1 1 58.413 58.413 2 0.0076993 58393 QUIQUE_C1438_190116_001 97.071 77.225 349600000 0 0 164840000 0 184770000 0 0 0 0 0 0 0 0 6092 352 5707 54429;54430 69239;69240 69240 1 DGFIDKEDLHDMLASLGK Oxidation (M) 2018.9619 0.96190652 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 1 1 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69246;69247;69248;69249;69250;69251;69252;69253;69254;69255;69256;69257;69258;69259;69260;69261;69262;69263;69264;69265;69266;69267;69268;69269;69270;69271;69272;69273;69274;69275;69276;69277;69278;69279;69280;69281;69282;69283;69284;69285 69279 36 DGFIDLMELK Unmodified 1179.5846 0.58456105 3815;4036 Q96C19;H0Y4Y4;Q9BUP0;A0A087X1Z2 EFHD2;EFHD1 EF-hand domain-containing protein D2;EF-hand domain-containing protein D1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 147.79 147.79 2 0.0034764 152482 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.213 68.069 716480000 0 108910000 145560000 143070000 0 92433000 0 97475000 85675000 43358000 0 0 0 6095 3815;4036 5709 54470;54471;54472;54473;54474;54475;54476 69286;69287;69288;69289;69290;69291;69292 69291 7 DGFLADQLDPIYVAYNM Oxidation (M) 1959.8924 0.89242997 315;3080 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4;Q14689 DIP2C;DIP2A Disco-interacting protein 2 homolog C;Disco-interacting protein 2 homolog A no no 0 1 0 1 170.84 170.84 2 0.00040463 172581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.479 71.471 9882600 0 0 0 0 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69296;69297;69298;69299;69300;69301;69302;69303;69304;69305;69306;69307;69308;69309;69310;69311;69312 69305 16 DGFLMYLLSADGSAFSLAHR Oxidation (M) 2186.0466 0.046639202 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.64 164.64 2;3 6.4259E-08 169686 QUIQUE_C1368_190116_001 101.38 95.854 637970000 0 53632000 46205000 41354000 58903000 0 87777000 40254000 84857000 27912000 64701000 79295000 53075000 6099 2578 5711 54496;54497;54498;54499;54500;54501;54502;54503;54504;54505;54506;54507 69313;69314;69315;69316;69317;69318;69319;69320;69321;69322;69323;69324;69325 69314 2027 10 DGFNPADVEAGLYGSHLYVWDWQR Unmodified 2794.2776 0.27757843 2978 Q13228;A6PVX1;H0Y532 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.67 159.67 3 1.1724E-14 164057 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.16 98.651 1577500000 66203000 0 218320000 116160000 0 0 0 0 573970000 48735000 0 0 554140000 6100 2978 5712 54508;54509;54510;54511;54512;54513;54514 69326;69327;69328;69329;69330;69331;69332;69333;69334 69330 9 DGFPSGTPALNAK Unmodified 1273.6303 0.63026569 2974 Q13177 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes yes 0 0 0 1 68.126 68.126 2 0.0052395 63745 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.807 68.567 21830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21830000 0 0 0 6101 2974 5713 54515 69335 69335 1 DGFQGCLASVDLNGR Unmodified 1607.7362 0.7362041 319;1097 G5E9G7;Q9P2S2;A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN2;NRXN3 Neurexin-2;Neurexin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 104.23 104.23 2 0.00054818 106986 QUIQUE_C1277_190116_001 76.522 60.269 136730000 31860000 33173000 0 0 0 0 0 0 0 10462000 61233000 0 0 6102 1097;319 5714 54516;54517;54518;54519;54520 69336;69337;69338;69339;69340 69337 4 DGFVMGEGAAVLVLEEYEHAVQR Unmodified 2518.2162 0.21622373 4313 Q9NWU1 OXSM 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 166.83 166.83 3 0.0048742 172048 QUIQUE_C1368_190116_001 39.288 36.322 32823000 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42.191 2 0.042768 39260 QUIQUE_C1218_190116_001 80.165 69.292 232630000 50133000 86967000 0 0 0 0 0 0 0 13356000 0 0 82178000 6108 1924 5720 54560;54561;54562;54563 69387;69388;69389;69390 69387 2 DGGIPADPNNVFLSTGASDAIVTVLK Unmodified 2570.3228 0.32279729 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 162.07 162.07 2;3 1.031E-10 164270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.165 87.22 398560000 0 51910000 0 59062000 53422000 45073000 0 116930000 72159000 0 0 0 0 6109 2226 5721 54564;54565;54566;54567;54568;54569;54570 69391;69392;69393;69394;69395;69396;69397;69398 69397 8 DGGLICTSCR Unmodified 1137.4907 0.49067744 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.23 38.23 2 0.0078732 34256 QUIQUE_C1368_190116_001 125.04 109.38 868460000 0 0 217110000 252510000 192460000 0 0 0 93084000 113290000 0 0 0 6110 2327 5722 54571;54572;54573;54574;54575 69399;69400;69401;69402;69403 69399 2 DGGNPFAEPSELDNPFQDPAVIQHRPSR Unmodified 3089.4591 0.45912462 1449 O14828 SCAMP3 Secretory carrier-associated membrane protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 114.91 114.91 4 0.021485 117783 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.054 13.53 78116000 0 0 0 0 0 0 0 31394000 0 0 46722000 0 0 6111 1449 5723 54576;54577 69404;69405 69404 2 DGGNQEVEIAR Unmodified 1186.5578 0.55782903 2069 P13861;H7C330 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.472 30.472 2 3.2247E-06 25227 QUIQUE_C1403_190116_001 177.06 162.91 1301300000 150870000 156510000 130710000 132580000 115420000 0 0 86311000 118830000 69617000 123940000 93702000 122800000 6112 2069 5724 54578;54579;54580;54581;54582;54583;54584;54585;54586;54587;54588 69406;69407;69408;69409;69410;69411;69412;69413;69414;69415;69416;69417 69409 10 DGGSEDQVEDPALSEPGEEPQRPSPSEPGT Unmodified 3092.333 0.33304021 4412 Q9UD71;J3KT77 PPP1R1B Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B yes no 0 0 1 1 2 1 84.016 84.016 2;3 1.7061E-36 85094 QUIQUE_C1403_190116_001 111.4 108.77 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2400.1306 0.13057984 3396 Q6PJG6 BRAT1 BRCA1-associated ATM activator 1 yes yes 0 0 0 1 1 163.2 163.2 3 4.6671E-06 166920 QUIQUE_C1277_190116_001 64.68 55.86 23899000 7978800 15920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6116 3396 5728 54609;54610 69440;69441 69441 1 DGHDQHVLELEAK Unmodified 1489.7161 0.71612058 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 30.923 30.923 2;3 0.0023444 25113 QUIQUE_C1403_190116_001 57.796 34.807 128240000 0 0 0 34669000 0 42235000 0 31186000 0 20151000 0 0 0 6117 2322 5729 54611;54612;54613;54614;54615 69442;69443;69444;69445;69446 69442 5 DGHGEAIMFK Unmodified 1103.507 0.50697943 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 36.295 36.295 2;3 0.00023783 31562 QUIQUE_C1403_190116_001 117.81 100.57 5362400000 537970000 128690000 550260000 656030000 354700000 518830000 632090000 290110000 199790000 188380000 474960000 294110000 536500000 6118 4560 5730 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Unmodified 1286.6904 0.69042311 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.47 128.47 2 0.0002247 131599 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.33 75.131 4574300000 310710000 301250000 420500000 391190000 429260000 453280000 318010000 422980000 473040000 195230000 455690000 403120000 0 6132 3137;908 5743 54758;54759;54760;54761;54762;54763;54764;54765;54766;54767;54768;54769 69603;69604;69605;69606;69607;69608;69609;69610;69611;69612;69613;69614;69615 69610 12 DGIISDIFDK Unmodified 1121.5605 0.56045479 2149 P19525 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 131.9 131.9 2 0.033515 128211 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.327 34.551 29211000 0 0 0 0 0 17962000 0 0 0 11249000 0 0 0 6133 2149 5744 54770;54771 69616;69617 69617 2 DGIISDIFDKK Unmodified 1249.6554 0.65541781 2149 P19525 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 104.2 104.2 2;3 0.021512 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69792 32 DGLALGPGPFVTALEYATDTK Unmodified 2135.0787 0.078650837 4123 Q9H0R4;K7ER15 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 2 3 1 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 169.83 169.83 2;3 1.7925E-26 174189 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.65 122.61 4452600000 284740000 313150000 495610000 214630000 291520000 160550000 492340000 351800000 581650000 82746000 427580000 366230000 390070000 6149 4123 5759 54937;54938;54939;54940;54941;54942;54943;54944;54945;54946;54947;54948;54949;54950;54951;54952;54953;54954;54955;54956;54957;54958;54959;54960;54961;54962;54963;54964 69819;69820;69821;69822;69823;69824;69825;69826;69827;69828;69829;69830;69831;69832;69833;69834;69835;69836;69837;69838;69839;69840;69841;69842;69843;69844;69845;69846;69847;69848;69849;69850;69851;69852;69853;69854;69855;69856;69857 69845 36 DGLAQELANEIR Unmodified 1327.6732 0.67319314 179 A0A0A0MSK6;Q13017 ARHGAP5 Rho GTPase-activating protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 120.46 120.46 2 0.0010001 117076 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synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 116.78 116.78 3 0.00030222 121706 QUIQUE_C1218_190116_001 67.995 60.003 752120000 143630000 0 0 0 0 0 248840000 0 149310000 0 0 210350000 0 6160 2524 5770 55073;55074;55075;55076;55077 69995;69996;69997;69998;69999 69995 5 DGLLPENTFIVGYAR Unmodified 1663.857 0.85697116 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.49 139.49 2 4.4995E-09 145229 QUIQUE_C1218_190116_001 128.01 102.58 2508600000 135400000 182560000 220810000 170260000 191430000 161540000 203120000 249710000 200890000 78666000 263660000 201520000 249040000 6161 2024 5771 55078;55079;55080;55081;55082;55083;55084;55085;55086;55087;55088;55089;55090 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2;3 0.00015299 22732 QUIQUE_C1368_190116_001 83.314 76.837 541290000 53564000 68851000 71740000 100900000 44440000 54222000 78816000 0 38650000 30113000 0 0 0 6192 1021 5798 55369;55370;55371;55372;55373;55374;55375;55376;55377;55378;55379;55380;55381;55382 70366;70367;70368;70369;70370;70371;70372;70373;70374;70375;70376;70377;70378;70379 70369 13 DGNPFYFTDHR Unmodified 1367.5895 0.58946351 92 A0A087X0M8;O00533;C9J905;C9JH37;C9JW79 CHL1 Neural cell adhesion molecule L1-like protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.999 72.999 3 0.010259 72502 QUIQUE_C1563_190116_001 41.401 35.558 212810000 0 0 40603000 37523000 0 32147000 0 0 46291000 0 0 29009000 27233000 6193 92 5799 55383;55384;55385;55386;55387;55388 70380;70381;70382;70383;70384;70385 70382 5 DGNVLLHEMQIQHPTASLIAK Oxidation (M) 2330.2053 0.20526511 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 76.556 76.556 3;4 1.7027E-07 77125 QUIQUE_C1277_190116_001 88.872 68.959 464080000 55734000 61611000 65609000 0 0 0 0 58802000 81439000 53531000 87357000 0 0 6194 2424 5800 55389;55390;55391;55392;55393;55394;55395 70386;70387;70388;70389;70390;70391;70392;70393;70394;70395 70388 1850 10 DGNVLLHEMQIQHPTASLIAK Unmodified 2314.2104 0.21035049 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 3 2 2 2 3 1 2 99.734 99.734 2;3;4 2.2722E-43 103581 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.18 150.26 4137700000 468770000 0 282560000 141380000 230620000 0 669820000 328620000 323470000 198900000 620050000 276100000 597380000 6195 2424 5800 55396;55397;55398;55399;55400;55401;55402;55403;55404;55405;55406;55407;55408;55409;55410;55411;55412;55413;55414;55415;55416 70396;70397;70398;70399;70400;70401;70402;70403;70404;70405;70406;70407;70408;70409;70410;70411;70412;70413;70414;70415;70416;70417;70418;70419;70420;70421 70416 25 DGPGETDAFGNSEGK Unmodified 1479.6114 0.61138074 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.774 40.774 2 2.25E-79 37181 QUIQUE_DMIX3_190116_001 211.46 195.83 914830000 127180000 87550000 91312000 0 84235000 65123000 0 66957000 55976000 57847000 109260000 77331000 92058000 6196 1700 5801 55417;55418;55419;55420;55421;55422;55423;55424;55425;55426;55427 70422;70423;70424;70425;70426;70427;70428;70429;70430;70431;70432 70428 11 DGPGFYTTR Unmodified 1012.4614 0.46140945 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.417 44.417 2 0.00046764 41876 QUIQUE_C1218_190116_001 116.37 102.38 1394800000 150690000 124070000 150720000 119240000 0 123490000 105530000 136180000 0 109720000 124170000 133250000 117730000 6197 1153 5802 55428;55429;55430;55431;55432;55433;55434;55435;55436;55437;55438 70433;70434;70435;70436;70437;70438;70439;70440;70441;70442;70443;70444;70445 70433 10 DGPLNMILDDGGDLTNLIHTK Oxidation (M) 2267.1104 0.11036167 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 2 152.51 152.51 3 1.5137E-06 155498 QUIQUE_C1563_190116_001 76.015 62.183 419510000 47636000 57377000 0 0 0 91656000 0 39390000 0 63443000 120000000 0 0 6198 2219 5803 55439;55440;55441;55442;55443;55444;55445;55446 70446;70447;70448;70449;70450;70451;70452;70453 70449 1583 7 DGPLNMILDDGGDLTNLIHTK Unmodified 2251.1154 0.11544705 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 159.76 159.76 2;3 2.2762E-35 166702 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.83 134.29 4960500000 555430000 326160000 337370000 432870000 580590000 291820000 314850000 318150000 374460000 138250000 371760000 389710000 529120000 6199 2219 5803 55447;55448;55449;55450;55451;55452;55453;55454;55455;55456;55457;55458;55459;55460;55461;55462;55463 70454;70455;70456;70457;70458;70459;70460;70461;70462;70463;70464;70465;70466;70467;70468;70469;70470;70471;70472;70473;70474;70475;70476;70477;70478;70479 70476 26 DGPNALTPPPTTPEWVK Unmodified 1818.9152 0.91521432 590;1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2;B1AKY9;P50993 ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 103.19 103.19 2 4.3016E-10 106659 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.89 126.66 2678700000 155380000 160770000 320390000 205920000 199800000 156520000 268640000 200810000 252250000 59418000 301150000 145950000 251720000 6200 1371;590 5804 55464;55465;55466;55467;55468;55469;55470;55471;55472;55473;55474;55475;55476;55477 70480;70481;70482;70483;70484;70485;70486;70487;70488;70489;70490;70491;70492;70493;70494;70495;70496;70497;70498;70499;70500;70501;70502;70503;70504;70505;70506;70507 70500 28 DGPSAGCTIVTALLSLAMGR Oxidation (M) 2004.9972 0.99724617 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 0 1 3 2 1 1 1 2 1 2 2 1 1 174.6 174.6 2;3 1.1552E-37 178963 QUIQUE_C1368_190116_001 156.24 133.36 271670000 9727300 49203000 27513000 5595200 12223000 13788000 42562000 6110400 27382000 0 53221000 14790000 9557200 6201 1324 5805 55478;55479;55480;55481;55482;55483;55484;55485;55486;55487;55488;55489;55490;55491;55492;55493;55494;55495 70508;70509;70510;70511;70512;70513;70514;70515;70516;70517;70518;70519;70520;70521;70522;70523;70524;70525 70512 750 17 DGPSAGCTIVTALLSLAMGR Unmodified 1989.0023 0.002331546 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 178.7 178.7 2;3 4.8303E-65 183251 QUIQUE_C1576_190116_001 223.72 208.84 654600000 26914000 13512000 72136000 6734200 28749000 11106000 19406000 11802000 53648000 0 134740000 144100000 131740000 6202 1324 5805 55496;55497;55498;55499;55500;55501;55502;55503;55504;55505;55506;55507;55508;55509;55510;55511;55512 70526;70527;70528;70529;70530;70531;70532;70533;70534;70535;70536;70537;70538;70539;70540;70541;70542 70533 15 DGPSAGCTIVTALLSLAMGRPVR Oxidation (M) 2357.2195 0.21953496 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 1 1 168.8 168.8 3 8.0586E-06 170712 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.88 62.002 30385000 0 0 0 0 0 0 0 30385000 0 0 0 0 0 6203 1324 5806 55513 70543 70543 750 1 DGPSAGCTIVTALLSLAMGRPVR Unmodified 2341.2246 0.22462034 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 172.78 172.78 3 7.6045E-06 177129 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.467 52.007 169440000 0 0 0 0 0 0 0 44753000 44740000 0 79944000 0 0 6204 1324 5806 55514;55515;55516 70544;70545;70546 70545 3 DGPSLLVVEQVR Unmodified 1310.7194 0.71941505 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.62 101.62 2 0.010179 104598 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.434 48.387 903990000 0 0 114130000 53760000 76176000 78791000 110550000 50572000 61333000 0 133150000 116180000 109350000 6205 3576 5807 55517;55518;55519;55520;55521;55522;55523;55524;55525;55526 70547;70548;70549;70550;70551;70552;70553;70554;70555;70556;70557;70558 70553 12 DGPVGFADFVYK Unmodified 1313.6292 0.62920306 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.59 125.59 2 0.00064854 129726 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.52 88.32 859400000 59865000 59677000 61356000 69129000 84208000 69133000 77309000 86473000 57041000 31663000 104140000 0 99406000 6206 1534 5808 55527;55528;55529;55530;55531;55532;55533;55534;55535;55536;55537;55538 70559;70560;70561;70562;70563;70564;70565;70566;70567;70568;70569;70570;70571;70572 70572 14 DGPVRPQNAEEEKR Unmodified 1623.7965 0.79649617 3727 Q92504 SLC39A7 Zinc transporter SLC39A7 yes yes 0 0 2 2 1 1 10.537 10.537 3;4 0.00010374 2993 QUIQUE_C1368_190116_001 88.075 69.973 52695000 0 0 36085000 0 0 0 0 0 0 0 16610000 0 0 6207 3727 5809 55539;55540;55541;55542 70573;70574;70575;70576 70573 4 DGQAMLWDLNEGK Unmodified 1475.6715 0.67147858 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;H0Y8W2;D6REE5;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;H0Y8R5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.45 112.45 2 8.3494E-08 114731 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.8 122.13 1826200000 149080000 160010000 190690000 181440000 127670000 151730000 156130000 131630000 126120000 28801000 172580000 115670000 134650000 6208 2787 5810 55543;55544;55545;55546;55547;55548;55549;55550;55551;55552;55553;55554;55555 70577;70578;70579;70580;70581;70582;70583;70584;70585;70586;70587;70588;70589;70590;70591;70592;70593;70594;70595 70590 19 DGQAMLWDLNEGK Oxidation (M) 1491.6664 0.6663932 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;H0Y8W2;D6REE5;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;H0Y8R5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 1 93.977 93.977 2 0.027799 96085 QUIQUE_C1368_190116_001 62.924 55.195 33292000 0 0 0 0 0 33292000 0 0 0 0 0 0 0 6209 2787 5810 55556;55557 70596;70597 70596 2 DGQAVLENVSEGGK Unmodified 1401.6736 0.67358707 547 A6NKZ2;P51606 RENBP N-acylglucosamine 2-epimerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.471 58.471 2 0.00026667 56926 QUIQUE_C1277_190116_001 117.86 105.65 477970000 82053000 96125000 0 85910000 0 0 0 90065000 123820000 0 0 0 0 6210 547 5811 55558;55559;55560;55561;55562 70598;70599;70600;70601;70602 70599 4 DGQEAAFASYDR Unmodified 1328.5633 0.56330834 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.588 59.588 2 1.5011E-37 58114 QUIQUE_C1368_190116_001 192.21 187.24 4453400000 277470000 390420000 323970000 206150000 285230000 238840000 378010000 439230000 388420000 176440000 444660000 462500000 442100000 6211 3753 5812 55563;55564;55565;55566;55567;55568;55569;55570;55571;55572;55573;55574;55575 70603;70604;70605;70606;70607;70608;70609;70610;70611;70612;70613;70614;70615;70616;70617;70618;70619;70620;70621;70622;70623 70610 21 DGQLMTELFNR Unmodified 1322.6289 0.62888548 3557 Q8IYQ7 THNSL1 Threonine synthase-like 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.14 122.14 2 0.0065099 124356 QUIQUE_C1563_190116_001 79.148 57.776 87380000 29261000 0 23003000 18221000 0 16895000 0 0 0 0 0 0 0 6212 3557 5813 55576;55577;55578;55579;55580;55581 70624;70625;70626;70627;70628;70629 70628 5 DGQVINETSQHHDDLE Unmodified 1835.7922 0.79219865 1952 P08670 VIM Vimentin yes yes 0 0 0 5 7 4 10 7 4 4 7 8 6 4 6 5 38.734 38.734 2;3 2.9169E-80 34030 QUIQUE_C1368_190116_001 213.38 204.37 50635000000 1926800000 3355100000 2559400000 8548900000 3875200000 3727300000 2189300000 5610700000 5440000000 1765600000 3391700000 3524900000 4720500000 6213 1952 5814 55582;55583;55584;55585;55586;55587;55588;55589;55590;55591;55592;55593;55594;55595;55596;55597;55598;55599;55600;55601;55602;55603;55604;55605;55606;55607;55608;55609;55610;55611;55612;55613;55614;55615;55616;55617;55618;55619;55620;55621;55622;55623;55624;55625;55626;55627;55628;55629;55630;55631;55632;55633;55634;55635;55636;55637;55638;55639;55640;55641;55642;55643;55644;55645;55646;55647;55648;55649;55650;55651;55652;55653;55654;55655;55656;55657;55658 70630;70631;70632;70633;70634;70635;70636;70637;70638;70639;70640;70641;70642;70643;70644;70645;70646;70647;70648;70649;70650;70651;70652;70653;70654;70655;70656;70657;70658;70659;70660;70661;70662;70663;70664;70665;70666;70667;70668;70669;70670;70671;70672;70673;70674;70675;70676;70677;70678;70679;70680;70681;70682;70683;70684;70685;70686;70687;70688;70689;70690;70691;70692;70693;70694;70695;70696;70697;70698;70699;70700;70701;70702;70703;70704;70705;70706;70707;70708;70709;70710;70711;70712;70713;70714;70715;70716;70717;70718;70719;70720;70721;70722;70723;70724;70725;70726;70727;70728;70729;70730;70731;70732;70733;70734;70735 70650 101 DGRDHIIEVVGSSMPLIGDHQDEDK Unmodified 2761.2977 0.29772152 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 1 1 1 3 1 2 1 107.22 107.22 3;4 2.0705E-07 111037 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.922 53.571 397530000 0 0 0 0 40601000 0 0 44522000 76455000 0 57467000 79583000 98907000 6214 2125 5815 55659;55660;55661;55662;55663;55664;55665;55666;55667 70736;70737;70738;70739;70740;70741;70742;70743;70744;70745;70746 70740 11 DGRDHIIEVVGSSMPLIGDHQDEDKQLIVELVVNK Unmodified 3896.9942 0.99421629 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 2 2 2 1 145.51 145.51 4;5 2.6809E-10 150165 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.158 54.9 511930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 183850000 268450000 59627000 6215 2125 5816 55668;55669;55670;55671;55672 70747;70748;70749;70750;70751 70749 5 DGRLDLNDLAR Unmodified 1256.6473 0.64731274 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 1 1 68.535 68.535 3 0.0003066 67633 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.215 46.426 19988000 0 0 0 0 0 0 0 19988000 0 0 0 0 0 6216 1678 5817 55673 70752;70753 70752 2 DGSAFEDGLR Unmodified 1065.4727 0.47270242 2664 P55265;A0A3B3IRQ9;H0YCK3 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.809 57.809 2 0.014937 56636 QUIQUE_C1277_190116_001 63.816 38.079 57312000 0 22512000 0 0 0 0 0 0 0 0 34800000 0 0 6217 2664 5818 55674;55675;55676;55677;55678 70754;70755;70756;70757;70758 70754 5 DGSAMVYNLANALR Unmodified 1493.7297 0.72966216 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 137.49 137.49 2 2.1417E-15 141766 QUIQUE_DMIX7_190116_001 161.76 146.19 916870000 0 0 104760000 78161000 108030000 0 121110000 56977000 90747000 19466000 128360000 119770000 89483000 6218 3596 5819 55679;55680;55681;55682;55683;55684;55685;55686;55687;55688;55689 70759;70760;70761;70762;70763;70764;70765;70766;70767;70768;70769;70770;70771;70772;70773;70774;70775 70772 17 DGSAVEIVGLSK Unmodified 1173.6241 0.62411768 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 79.559 79.559 2 0.00089137 79977 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.958 55.394 136410000 0 0 0 0 0 0 0 59826000 0 0 76588000 0 0 6219 2377 5820 55690;55691;55692;55693;55694;55695 70776;70777;70778;70779;70780;70781 70778 6 DGSCGVAYVVQEPGDYEVSVK Unmodified 2257.0209 0.020877961 2178 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72.504 2 0.00025443 73896 QUIQUE_C1438_190116_001 79.283 59.293 113380000 0 0 0 47248000 0 25560000 0 0 0 0 40570000 0 0 6227 3047 5828 55755;55756;55757;55758;55759;55760;55761;55762 70846;70847;70848;70849;70850;70851;70852;70853 70849 7 DGSLFWQSPK Unmodified 1163.5611 0.56112349 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.026 94.026 2 0.01038 95915 QUIQUE_C1403_190116_001 93.166 73.379 213020000 39608000 43584000 29334000 57464000 0 0 43030000 0 0 0 0 0 0 6228 514 5829 55763;55764;55765;55766;55767 70854;70855;70856;70857;70858 70857 1 DGSLIVSSSYDGLCR Unmodified 1627.7512 0.75118546 2733 P61964 WDR5 WD repeat-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 98.397 98.397 2 0.0038681 100947 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.924 38.937 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6229 2733 5830 55768 70859 70859 1 DGSNIIYTAK Unmodified 1080.5451 0.54513908 4416 Q9UDY4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes yes 0 0 0 1 1 43.474 43.474 2 0.019651 39896 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domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 175.8 175.8 3 3.037E-05 179752 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.266 42.763 40639000 0 0 0 0 10841000 0 5171500 7351900 11753000 0 0 0 5521100 6233 3346 5834 55781;55782;55783;55784;55785 70874;70875;70876;70877;70878 70877 5 DGSTATCVLAVDNILYIANLGDSR Unmodified 2537.2432 0.24316676 4117 Q9H0C8;F8SNU7;H7C2I8 ILKAP;ILKAP3 Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C yes no 0 0 0 1 1 1 169.87 169.87 3 1.7943E-05 171591 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.728 49.066 50767000 0 0 0 7999100 12805000 0 0 29963000 0 0 0 0 0 6234 4117 5835 55786;55787;55788 70879;70880;70881 70881 3 DGSTAVHFEHSWGDGVAVLR Unmodified 2139.0134 0.013365238 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.034 94.034 3 0.00034016 95747 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.49 54.231 205890000 46561000 0 0 0 0 31542000 0 0 53455000 23580000 0 50749000 0 6235 2223 5836 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70902;70903;70904;70905;70906;70907;70908 70907 3 DGSVLGVTVTR Unmodified 1102.5982 0.59823728 315 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4 DIP2C Disco-interacting protein 2 homolog C yes no 0 0 0 1 72.089 72.089 2 0.037693 72595 QUIQUE_C1218_190116_001 54.539 36.554 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6238 315 5839 55814 70909 70909 1 DGSVLVPPALQSYLGTDR Unmodified 1886.9738 0.97379183 1358 M0QWZ7;Q9NP81;M0R2C6;M0R259;M0QX29 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 150.83 150.83 2 0.0023991 155251 QUIQUE_C1403_190116_001 65.395 26.993 116400000 0 0 0 40743000 0 30681000 0 44976000 0 0 0 0 0 6239 1358 5840 55815;55816;55817;55818;55819 70910;70911;70912;70913;70914 70911 4 DGSWFIQSLCAMLK Unmodified 1654.7847 0.7847342 2450 P42574 CASP3 Caspase-3;Caspase-3 subunit p17;Caspase-3 subunit p12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171.73 171.73 2 2.096E-22 175999 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.43 148.42 471670000 0 0 23053000 20990000 22603000 0 43926000 62998000 88180000 0 69492000 65597000 74827000 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71045;71046;71047;71048;71049;71050;71051;71052;71053;71054;71055;71056;71057;71058;71059;71060;71061;71062;71063;71064;71065;71066;71067;71068;71069;71070;71071;71072;71073;71074;71075;71076;71077;71078;71079;71080;71081;71082 71059 35 DGTVLCELINALYPEGQAPVKK Unmodified 2414.2515 0.2515466 2408 P37802;X6RJP6 TAGLN2 Transgelin-2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 2 4 4 161.82 161.82 2;3 3.9887E-37 165876 QUIQUE_C1403_190116_001 147.25 126.62 6166200000 154410000 266680000 814220000 334270000 438710000 124270000 355400000 553700000 395580000 128280000 580520000 1018300000 1001800000 6258 2408 5858 55971;55972;55973;55974;55975;55976;55977;55978;55979;55980;55981;55982;55983;55984;55985;55986;55987;55988;55989;55990;55991;55992;55993;55994;55995;55996 71083;71084;71085;71086;71087;71088;71089;71090;71091;71092;71093;71094;71095;71096;71097;71098;71099;71100;71101;71102;71103;71104;71105;71106;71107;71108;71109;71110;71111;71112;71113;71114;71115;71116;71117;71118;71119 71091 33 DGTVTAGNASGVADGAGAVIIASEDAVK Unmodified 2515.2402 0.24018987 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 134.6 134.6 2;3 3.4559E-108 139453 QUIQUE_C1368_190116_001 232.54 220.18 3728700000 294400000 279830000 401790000 343130000 288020000 434240000 269930000 255530000 279360000 133760000 257190000 239140000 252380000 6259 2453 5859 55997;55998;55999;56000;56001;56002;56003;56004;56005;56006;56007;56008;56009;56010;56011;56012;56013;56014;56015;56016;56017;56018;56019;56020;56021 71120;71121;71122;71123;71124;71125;71126;71127;71128;71129;71130;71131;71132;71133;71134;71135;71136;71137;71138;71139;71140;71141;71142;71143;71144;71145;71146;71147;71148;71149;71150;71151;71152;71153 71127 33 DGTVTAGNASGVADGAGAVIIASEDAVKK Unmodified 2643.3352 0.33515289 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 117.68 117.68 3 9.7223E-09 121728 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.89 56.096 572080000 0 0 0 0 0 0 0 0 211350000 0 360730000 0 0 6260 2453 5860 56022;56023;56024 71154;71155;71156 71155 3 DGVADVSIEDSVISLSGDHCIIGR Unmodified 2513.2068 0.20678125 1783 P00441;H7BYH4 SOD1 Superoxide dismutase [Cu-Zn] yes no 0 0 0 3 3 3 5 3 4 3 1 3 2 3 2 2 142.88 142.88 2;3 0 146828 QUIQUE_C1368_190116_001 391.91 362.89 22231000000 3431800000 2878700000 2557000000 2106600000 2631600000 2638200000 1893200000 508570000 933390000 751020000 583630000 529730000 787150000 6261 1783 5861 56025;56026;56027;56028;56029;56030;56031;56032;56033;56034;56035;56036;56037;56038;56039;56040;56041;56042;56043;56044;56045;56046;56047;56048;56049;56050;56051;56052;56053;56054;56055;56056;56057;56058;56059;56060;56061 71157;71158;71159;71160;71161;71162;71163;71164;71165;71166;71167;71168;71169;71170;71171;71172;71173;71174;71175;71176;71177;71178;71179;71180;71181;71182;71183;71184;71185;71186;71187;71188;71189;71190;71191;71192;71193;71194;71195;71196;71197;71198;71199;71200;71201;71202;71203;71204;71205;71206;71207;71208 71168 51 DGVAVITLPLGGSIK Unmodified 1438.8395 0.83953018 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.15 132.15 2 0.00041655 136036 QUIQUE_C1277_190116_001 96.103 89.8 329080000 38348000 57669000 32673000 26656000 31644000 33615000 29460000 30930000 27686000 20404000 0 0 0 6262 3684 5862 56062;56063;56064;56065;56066;56067;56068;56069;56070;56071 71209;71210;71211;71212;71213;71214;71215;71216;71217;71218;71219 71210 11 DGVCAQIEK Unmodified 1018.4753 0.47534495 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 27.815 27.815 2 0.009778 22279 QUIQUE_C1218_190116_001 75.043 38.023 265670000 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56087;56088;56089;56090;56091;56092;56093;56094;56095;56096;56097;56098 71236;71237;71238;71239;71240;71241;71242;71243;71244;71245;71246;71247;71248;71249 71237 14 DGVLLCQLLNNLR Unmodified 1526.8239 0.8238969 1146 H0YDG2;Q9UKW4 VAV3 Guanine nucleotide exchange factor VAV3 yes no 0 0 0 1 160.87 160.87 2 0.036214 168431 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.276 31.49 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6266 1146 5866 56099 71250 71250 1 DGVLTLANNVTPAK Unmodified 1411.7671 0.76709352 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.012 89.012 2 0.00068653 90620 QUIQUE_C1403_190116_001 117.25 88.524 1191800000 88715000 85109000 0 137540000 133540000 88315000 61184000 134260000 174710000 0 0 106370000 182040000 6267 880 5867 56100;56101;56102;56103;56104;56105;56106;56107;56108;56109 71251;71252;71253;71254;71255;71256;71257;71258;71259;71260;71261 71253 9 DGVLVDEFGLPQIPAS Unmodified 1655.8407 0.8406524 4359 Q9NZZ3 CHMP5 Charged multivesicular body protein 5 yes yes 0 0 0 1 168.88 168.88 2 0.042318 171875 QUIQUE_C1403_190116_001 39.785 33.401 38003000 0 0 0 38003000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6268 4359 5868 56110 71262 71262 1 DGVMFQIDQATK Unmodified 1351.6442 0.6442012 4499 Q9UM22 EPDR1 Mammalian ependymin-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 94.231 94.231 2 0.03547 96919 QUIQUE_C1218_190116_001 52.391 37.628 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6269 4499 5869 56111 71263 71263 1 DGVPGGPGETGK Unmodified 1069.504 0.50400254 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.955 20.955 2 0.0055242 14024 QUIQUE_C1438_190116_001 66.056 43.925 1006700000 0 114410000 0 189230000 246230000 329380000 0 127490000 0 0 0 0 0 6270 2037 5870 56112;56113;56114;56115;56116 71264;71265;71266;71267;71268 71266 2 DGVSAAVISAELASFLATK Unmodified 1848.9833 0.98329389 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 1 1 170.49 170.49 2;3 2.1809E-64 175248 QUIQUE_C1368_190116_001 243.49 232.54 1557300000 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56134;56135;56136;56137;56138;56139;56140;56141;56142;56143;56144;56145;56146 71287;71288;71289;71290;71291;71292;71293;71294;71295;71296;71297;71298;71299;71300;71301;71302;71303;71304;71305;71306;71307;71308;71309;71310;71311;71312;71313 71292 27 DGVVEITGKHEER Unmodified 1467.7318 0.73177065 1866 P04792 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes yes 0 0 1 3 2 2 2 2 20.225 20.225 2;3;4 0.0028793 13607 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.214 78.434 1490900000 0 0 0 0 0 0 0 366100000 319910000 0 206110000 242630000 356100000 6274 1866 5874 56147;56148;56149;56150;56151;56152;56153;56154;56155;56156;56157 71314;71315;71316;71317;71318;71319;71320;71321;71322;71323;71324;71325 71314 12 DGVWKPTLVILR Unmodified 1395.8238 0.82382054 369;3752 A0A1W2PNV4;E9PF58;Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 1 2 113.45 113.45 3 2.32E-05 121094 QUIQUE_C1277_190116_001 114.24 96.103 3235100000 346060000 344370000 370600000 291570000 312500000 244550000 416650000 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8 DGWQVEEADDWLR Unmodified 1617.7059 0.70594983 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 0 0 0 1 137.7 137.7 2 0.009162 141628 QUIQUE_C1403_190116_001 76.332 61.652 19243000 0 0 0 19243000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6286 948 5886 56229 71402 71402 1 DGWSLWYSEYR Unmodified 1460.6361 0.63607935 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.17 137.17 2 0.0012112 142124 QUIQUE_C1368_190116_001 88.364 74.772 1151800000 59916000 79268000 135520000 108900000 60565000 120190000 131320000 0 78961000 53877000 132250000 100710000 90341000 6287 2255 5887 56230;56231;56232;56233;56234;56235;56236;56237;56238;56239;56240;56241 71403;71404;71405;71406;71407;71408;71409;71410;71411;71412;71413;71414;71415;71416 71405 12 DGWSQYHFVASSSTIER Unmodified 1968.8966 0.89660415 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 2 91.015 91.015 2 0.00095802 92922 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.044 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71480;71481;71482;71483;71484;71485;71486;71487;71488;71489;71490;71491;71492;71493 71482 10 DGYISNGELFQVLK Unmodified 1581.8039 0.80387296 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3;A0A1B0GUC7;Q96LZ3 PPP3R1;PPP3R2 Calcineurin subunit B type 1;Calcineurin subunit B type 2 yes no 0 0 0 1 1 136.41 136.41 2 0.010268 141577 QUIQUE_C1218_190116_001 69.672 35.781 151440000 79249000 72190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6292 801 5892 56297;56298 71494;71495 71494 2 DGYLFQLLR Unmodified 1123.6026 0.60259438 1857 P04196 HRG Histidine-rich glycoprotein yes yes 0 0 0 1 142.16 142.16 2 0.030814 149056 QUIQUE_C1438_190116_001 72.789 51.842 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6293 1857 5893 56299 71496 71496 1 DGYNYTLSK Unmodified 1059.4873 0.48728985 2344 P31949 S100A11 Protein S100-A11;Protein S100-A11, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 47.61 47.61 2 0.018939 45368 QUIQUE_C1438_190116_001 63.961 39.94 348810000 0 0 0 0 121790000 0 0 117460000 0 0 0 109570000 0 6294 2344 5894 56300;56301;56302 71497;71498;71499 71497 3 DGYVEVSGK Unmodified 952.45018 0.45017606 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.137 28.137 2 0.014831 22167 QUIQUE_C1403_190116_001 67.993 7.4028 435400000 0 66839000 57976000 96378000 51389000 83823000 78994000 0 0 0 0 0 0 6295 4464 5895 56303;56304;56305;56306;56307;56308 71500;71501;71502;71503;71504;71505;71506 71503 7 DGYVEVSGKHEEK Unmodified 1475.6892 0.68923713 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 2 14.334 14.334 2;3;4 0.00031885 6632 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.861 74.135 606840000 0 20711000 23158000 15231000 42363000 0 39005000 61810000 146540000 0 64305000 53552000 140170000 6296 4464 5896 56309;56310;56311;56312;56313;56314;56315;56316;56317;56318;56319;56320;56321 71507;71508;71509;71510;71511;71512;71513;71514;71515;71516;71517;71518;71519;71520 71517 14 DGYWFLK Unmodified 927.44905 0.44905385 4554 Q9Y2H0;F8WF49;A0A0B4J2C2;A0A087X246 DLGAP4 Disks large-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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no no 0 0 0 1 1 1 1 19.649 19.649 3 0.0015703 12183 QUIQUE_C1403_190116_001 66.056 54.891 178580000 39495000 0 0 52545000 0 51955000 0 0 0 34584000 0 0 0 6301 1228;1544 5901 56365;56366;56367;56368 71588;71589;71590;71591;71592 71590 4 DHASIQMNVAEVDKVTGR Unmodified 1968.9687 0.96872323 2785 Q8WVC2;P63220;Q9BYK1 RPS21 40S ribosomal protein S21 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 70.26 70.26 3 1.6154E-05 70431 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.505 67.935 298700000 0 0 0 0 0 0 0 63914000 45378000 0 67122000 67118000 55170000 6302 2785 5902 56369;56370;56371;56372;56373 71593;71594;71595;71596;71597 71594 5 DHATLNDIFMNNVIVR Unmodified 1870.936 0.93596654 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 126.16 126.16 3 8.6308E-05 129788 QUIQUE_C1277_190116_001 62.104 51.469 82947000 19319000 21944000 0 21250000 0 0 0 0 20434000 0 0 0 0 6303 1520 5903 56374;56375;56376;56377;56378 71598;71599;71600;71601;71602 71599 5 DHAVDLIQK Unmodified 1037.5506 0.55055881 290;327;328 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72129;72130;72131;72132;72133;72134;72135;72136;72137;72138;72139;72140;72141;72142;72143;72144;72145;72146;72147;72148;72149;72150;72151;72152;72153;72154;72155;72156 72153 27 DHLLSVSLSGYINYLDR Unmodified 1964.0003 0.0003409361 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 5 5 1 150.64 150.64 3 0.00073008 156053 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.307 56.273 267560000 0 0 0 0 0 0 30191000 0 113650000 0 105240000 18483000 0 6336 1609 5932 56778;56779;56780;56781;56782;56783;56784;56785;56786;56787;56788;56789;56790 72157;72158;72159;72160;72161;72162;72163;72164;72165;72166;72167;72168;72169 72161 11 DHLNFYCTGSSLGNLILSVK Unmodified 2237.1151 0.11505312 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 146.31 146.31 3 0.00030502 151389 QUIQUE_C1218_190116_001 59.469 56.23 25096000 25096000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6337 354 5933 56791 72170 72170 1 DHLNHHHYVAAAFK Unmodified 1658.8066 0.80660735 4289 Q9NT99 LRRC4B Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes yes 0 0 0 1 15.568 15.568 4 0.0056021 7776 QUIQUE_C1576_190116_001 32.127 14.427 22217000 0 0 0 0 0 0 22217000 0 0 0 0 0 0 6338 4289 5934 56792 72171 72171 1 DHLPPPEEEPLVLMCGPPPMIQYACLPNLDHVGHPTER Unmodified 4355.0636 0.063574954 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 0 0 1 1 143.46 143.46 4 1.5598E-10 149350 QUIQUE_C1576_190116_001 59.158 54.925 112040000 0 0 0 0 0 57519000 54517000 0 0 0 0 0 0 6339 1778 5935 56793;56794 72172;72173 72173 2 DHLVTAYNHLFETK Unmodified 1686.8366 0.83657007 2846 Q00688 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 72.621 72.621 2;3 2.4811E-14 73781 QUIQUE_C1218_190116_001 140.27 129.22 835000000 178500000 117850000 97760000 143280000 0 100940000 96111000 0 37758000 62807000 0 0 0 6340 2846 5936 56795;56796;56797;56798;56799;56800;56801;56802;56803;56804 72174;72175;72176;72177;72178;72179;72180;72181;72182;72183;72184;72185;72186 72175 12 DHLYGTLDPNTR Unmodified 1400.6684 0.66844211 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 47.546 47.546 2;3 0.0013158 45310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.685 51.189 620350000 0 0 63490000 99350000 0 47818000 0 75517000 75539000 45670000 82150000 71124000 59690000 6341 3053 5937 56805;56806;56807;56808;56809;56810;56811;56812;56813;56814 72187;72188;72189;72190;72191;72192;72193;72194;72195;72196 72191 6 DHMLIPVSMSELEK Unmodified 1627.795 0.79496453 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 108.16 108.16 2;3 0.00011807 105704 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.756 75.969 2617600000 196810000 291460000 574360000 221770000 296270000 219820000 117320000 72479000 120870000 102480000 168480000 124980000 110490000 6342 1684 5938 56815;56816;56817;56818;56819;56820;56821;56822;56823;56824;56825;56826;56827;56828;56829;56830 72197;72198;72199;72200;72201;72202;72203;72204;72205;72206;72207;72208;72209;72210;72211;72212;72213;72214;72215;72216 72211 18 DHMLIPVSMSELEK Oxidation (M) 1643.7899 0.78987915 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 0 2 1 1 1 97.649 97.649 2;3 0.0074915 101499 QUIQUE_C1218_190116_001 72.817 58.911 106100000 26076000 29721000 29591000 0 0 20709000 0 0 0 0 0 0 0 6343 1684 5938 56831;56832;56833;56834;56835 72217;72218;72219;72220;72221 72217 921 2 DHPAFAPLYFPMELHR Unmodified 1939.9403 0.94032364 2319 P30519;A0A087WT44;I3L159;I3L1F5;I3L276;I3L4P8;A0A1B0GXH0;I3L463 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 1 120.87 120.87 3 0.00032428 123223 QUIQUE_C1563_190116_001 69.331 62.761 75665000 0 0 0 0 0 37886000 37779000 0 0 0 0 0 0 6344 2319 5939 56836;56837 72222;72223 72222 2 DHPALNYNIVSGPPSHK Unmodified 1844.9169 0.91694566 1496 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72586 12 DIASTPHELYR Unmodified 1300.6412 0.64116473 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 45.5 45.5 2;3 0.00020548 43113 QUIQUE_C1438_190116_001 123.86 101.08 4084500000 436330000 254010000 275430000 506010000 529970000 532980000 252040000 0 161530000 83519000 387890000 280940000 383870000 6381 2036 5976 57125;57126;57127;57128;57129;57130;57131;57132;57133;57134;57135;57136;57137;57138;57139;57140;57141;57142;57143;57144 72589;72590;72591;72592;72593;72594;72595;72596;72597;72598;72599;72600;72601;72602;72603;72604;72605;72606;72607;72608;72609;72610;72611 72598 19 DIATIVADK Unmodified 944.51786 0.51786169 4583 Q9Y3A5;A0A087X020 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.84 63.84 2 0.0094055 60127 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.064 35.961 425450000 55737000 0 79150000 0 0 0 0 0 65820000 38258000 0 85101000 101390000 6382 4583 5977 57145;57146;57147;57148;57149;57150 72612;72613;72614;72615;72616;72617;72618 72615 7 DIAWTEDSK Unmodified 1063.4822 0.48220447 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 52.321 52.321 2 0.025747 50742 QUIQUE_C1218_190116_001 67.897 34.101 78327000 57072000 0 0 21255000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6383 1609 5978 57151;57152 72619;72620 72619 2 DIAWTEDSKR Unmodified 1219.5833 0.5833155 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 33.86 33.86 2;3 3.641E-07 28459 QUIQUE_C1368_190116_001 149.94 101.65 2461300000 226330000 0 261090000 284230000 293160000 259810000 291490000 79443000 163820000 159590000 149270000 139720000 153370000 6384 1609 5979 57153;57154;57155;57156;57157;57158;57159;57160;57161;57162;57163;57164;57165;57166;57167;57168;57169;57170;57171 72621;72622;72623;72624;72625;72626;72627;72628;72629;72630;72631;72632;72633;72634;72635;72636;72637;72638;72639;72640;72641;72642;72643 72623 20 DIAYQLMHNIR Unmodified 1372.6922 0.69215444 1882 P05186 ALPL Alkaline phosphatase, tissue-nonspecific isozyme yes yes 0 0 0 1 2 1 1 96.38 96.38 2;3 0.0021332 98762 QUIQUE_C1403_190116_001 80.231 54.61 65330000 0 0 0 33996000 0 0 15986000 0 0 0 0 0 15348000 6385 1882 5980 57172;57173;57174;57175;57176 72644;72645;72646;72647;72648 72645 5 DICEEQVNSLPGSITK Unmodified 1788.8564 0.85637882 1803 P01024;M0R0Q9 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 88.314 88.314 2 0.021253 84844 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.809 43.276 23192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23192000 0 0 0 6386 1803 5981 57177 72649 72649 1 DICNDVLSLLEK Unmodified 1417.7123 0.71228076 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 0 4 3 3 2 3 3 2 3 2 3 3 1 2 160.6 160.6 1;2;3 1.7401E-37 165791 QUIQUE_C1368_190116_001 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199710000 0 0 0 204440000 0 162710000 6392 23 5987 57244;57245;57246;57247;57248;57249;57250;57251;57252;57253;57254;57255;57256;57257;57258;57259 72756;72757;72758;72759;72760;72761;72762;72763;72764;72765;72766;72767;72768;72769;72770;72771 72760 9 DIDGHMVNLDK Oxidation (M) 1271.5816 0.58160094 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969;K7EJ20;K7EKX7;K7ENB4;R4GNE4;A0A087X247 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 33.805 33.805 2 0.018435 28036 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.532 33.377 37939000 0 25916000 0 0 0 0 0 0 0 12023000 0 0 0 6393 23 5987 57260;57261;57262 72772;72773;72774 72773 3 DIDGHMVNLDKYR Unmodified 1574.7511 0.75112588 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969;K7EJ20;K7EKX7;K7ENB4;R4GNE4 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 61.398 61.398 2;4 5.7287E-05 60929 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.551 76.322 123810000 0 0 0 0 0 0 0 27996000 25472000 0 0 17045000 53294000 6394 23 5988 57263;57264;57265;57266 72775;72776;72777;72778 72775 4 DIDIEDLEELDPDFIMAK Unmodified 2119.9871 0.98711822 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.24 169.24 2 7.8972E-31 173281 QUIQUE_DMIX7_190116_001 187.44 170.5 333480000 0 32985000 24036000 15789000 32738000 18510000 22867000 35435000 48652000 2054000 0 67590000 32824000 6395 3046 5989 57267;57268;57269;57270;57271;57272;57273;57274;57275;57276;57277 72779;72780;72781;72782;72783;72784;72785;72786;72787;72788;72789;72790;72791 72789 11 DIDIHEVR Unmodified 995.50361 0.50360861 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.365 34.365 2 0.0054066 29529 QUIQUE_C1368_190116_001 105.57 60.957 2541100000 209280000 287550000 325730000 301570000 0 292860000 0 0 273010000 96371000 418280000 336490000 0 6396 2849 5990 57278;57279;57280;57281;57282;57283;57284;57285;57286 72792;72793;72794;72795;72796;72797;72798;72799;72800;72801 72795 9 DIDILIVR Unmodified 955.57023 0.57023162 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;E9PF84;H7C1W2 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 112.46 112.46 2 0.0051766 115566 QUIQUE_C1277_190116_001 106.42 33.376 373510000 61523000 60379000 45031000 35032000 38834000 47957000 64105000 0 20651000 0 0 0 0 6397 2582 5991 57287;57288;57289;57290;57291;57292;57293;57294;57295;57296;57297 72802;72803;72804;72805;72806;72807;72808;72809;72810;72811;72812 72803 11 DIDISSPEFK Unmodified 1149.5554 0.55536941 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.097 84.097 2 0.0058504 85312 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.064 45.879 979190000 50168000 75941000 102560000 75403000 98994000 0 149170000 99596000 58918000 31911000 90482000 67735000 78316000 6398 2935 5992 57298;57299;57300;57301;57302;57303;57304;57305;57306;57307;57308;57309 72813;72814;72815;72816;72817;72818;72819;72820;72821;72822;72823;72824;72825 72824 12 DIDNLVQR Unmodified 971.50361 0.50360861 2523 P49257 LMAN1 Protein ERGIC-53 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 56.496 56.496 2 0.023067 54485 QUIQUE_C1403_190116_001 73.637 43.001 69710000 0 0 0 28102000 27129000 0 0 0 0 14479000 0 0 0 6399 2523 5993 57310;57311;57312;57313 72826;72827;72828;72829 72826 4 DIDPQNDLTFLR Unmodified 1445.7151 0.71505795 4240 Q9NP97;Q8TF09;B1AKR6;H3BQI1 DYNLRB1;DYNLRB2 Dynein light chain roadblock-type 1;Dynein light chain roadblock-type 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.22 123.22 2 4.2751E-06 129490 QUIQUE_C1438_190116_001 136.63 115.17 2075200000 152450000 200200000 138670000 59378000 168620000 106670000 182470000 147380000 192740000 52886000 249800000 198900000 225050000 6400 4240 5994 57314;57315;57316;57317;57318;57319;57320;57321;57322;57323;57324;57325;57326 72830;72831;72832;72833;72834;72835;72836;72837;72838;72839;72840;72841;72842;72843;72844;72845;72846 72835 16 DIDSFVPSK Unmodified 1006.4971 0.49712625 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.323 72.323 2 0.0013972 72364 QUIQUE_C1277_190116_001 104.06 73.445 1475200000 154140000 121000000 139480000 112850000 96157000 0 160560000 98739000 111950000 75302000 155070000 113630000 136350000 6401 1997 5995 57327;57328;57329;57330;57331;57332;57333;57334;57335;57336;57337;57338 72847;72848;72849;72850;72851;72852;72853;72854;72855;72856;72857;72858;72859;72860;72861;72862;72863;72864 72849 18 DIEAMDPSILK Unmodified 1230.6166 0.61658946 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.78 102.78 2 0.00065522 105241 QUIQUE_C1403_190116_001 98.249 74.094 2979600000 476710000 450550000 303140000 277040000 211770000 230020000 359810000 205440000 0 122800000 342320000 0 0 6402 1245 5996 57339;57340;57341;57342;57343;57344;57345;57346;57347;57348;57349 72865;72866;72867;72868;72869;72870;72871;72872;72873;72874;72875;72876;72877;72878;72879;72880 72869 16 DIEAMDPSILK Oxidation (M) 1246.6115 0.61150408 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 0 1 73.265 73.265 2 0.0023182 68984 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.338 30.731 97971000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97971000 0 0 0 6403 1245 5996 57350 72881;72882 72881 720 2 DIEDELTTGLELVDSCIR Unmodified 2076.9885 0.9885152 855;928;813 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6RF55;D6RHE9;E9PHB5;D6RC65;D6RBA8 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 171.76 171.76 2;3 5.2191E-122 176460 QUIQUE_C1368_190116_001 227.06 196.62 1531700000 72249000 131530000 88460000 115350000 133460000 89661000 204290000 131920000 162250000 19195000 140340000 85561000 157480000 6404 855;928;813 5997 57351;57352;57353;57354;57355;57356;57357;57358;57359;57360;57361;57362;57363;57364;57365;57366;57367;57368;57369;57370;57371;57372;57373;57374 72883;72884;72885;72886;72887;72888;72889;72890;72891;72892;72893;72894;72895;72896;72897;72898;72899;72900;72901;72902;72903;72904;72905;72906;72907;72908;72909 72888 26 DIEDPEIVVQATVL Unmodified 1539.8032 0.80320426 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 161.71 161.71 2 0.008307 166759 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.223 42.633 321910000 0 0 36756000 0 84591000 0 0 64667000 107690000 28210000 0 0 0 6405 1423 5998 57375;57376;57377;57378;57379;57380;57381 72910;72911;72912;72913;72914;72915;72916;72917;72918 72915 8 DIEDVFYK Unmodified 1027.4862 0.48622722 1294 J3KTL2;Q07955;J3QQV5;J3KSW7 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.248 97.248 2 0.019858 99248 QUIQUE_C1277_190116_001 77.674 45.204 265880000 95259000 78935000 0 0 0 0 0 42183000 0 49502000 0 0 0 6406 1294 5999 57382;57383;57384;57385;57386 72919;72920;72921;72922;72923;72924 72920 6 DIEEASLVK Unmodified 1002.5233 0.523341 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 54.321 54.321 1;2 0.0023457 53407 QUIQUE_C1218_190116_001 94.302 27.62 4735800000 651590000 0 405080000 403740000 536860000 383440000 929380000 359750000 356810000 309600000 0 399600000 0 6407 869 6000 57387;57388;57389;57390;57391;57392;57393;57394;57395;57396;57397;57398 72925;72926;72927;72928;72929;72930;72931;72932;72933;72934;72935;72936;72937;72938 72925 13 DIEEGAIVNPGR Unmodified 1268.6361 0.63607935 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.898 61.898 2 0.00034217 60525 QUIQUE_C1277_190116_001 120.99 97.033 304510000 113850000 0 0 33935000 0 55393000 36576000 26889000 37865000 0 0 0 0 6408 2217 6001 57399;57400;57401;57402;57403;57404;57405;57406;57407;57408 72939;72940;72941;72942;72943;72944;72945;72946;72947;72948 72940 10 DIEEIIDELK Unmodified 1215.6234 0.62344898 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.53 151.53 2 1.618E-05 157583 QUIQUE_C1218_190116_001 147.51 103.37 4296400000 483440000 418810000 396870000 329300000 222690000 474780000 366130000 192740000 371260000 170620000 342630000 277320000 249810000 6409 856 6002 57409;57410;57411;57412;57413;57414;57415;57416;57417;57418;57419;57420;57421;57422 72949;72950;72951;72952;72953;72954;72955;72956;72957;72958;72959;72960;72961;72962;72963;72964;72965;72966;72967;72968;72969;72970;72971;72972;72973 72950 25 DIEIDDYNLPMQILK Unmodified 1818.9074 0.90735175 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 155.86 155.86 2 7.0515E-19 161177 QUIQUE_C1218_190116_001 147.91 118.57 213020000 71797000 53965000 0 49384000 0 37871000 0 0 0 0 0 0 0 6410 914 6003 57423;57424;57425;57426 72974;72975;72976;72977;72978 72974 5 DIEIIHEELQLK Unmodified 1478.7981 0.7980593 1276 J3KQ32;Q9NTK5 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 102.29 102.29 2 0.0013047 105523 QUIQUE_C1218_190116_001 100.69 63.495 23217000 23217000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6411 1276 6004 57427 72979 72979 1 DIEIVNVQDSEYVK Unmodified 1649.8148 0.81483158 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin yes no 0 0 0 1 54.85 54.85 3 0.049882 53854 QUIQUE_C1368_190116_001 31.526 24.117 44491000 0 0 44491000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6412 2882 6005 57428 72980 72980 0 DIELQIR Unmodified 885.49198 0.4919813 1108;1404 G8JLD5;F8VUJ9;O00429;F8VZ52;B4DDQ3;F8W1W3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.929 69.929 2 0.019819 69579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.68 25.727 417760000 0 82655000 0 0 85228000 60740000 60681000 48094000 0 0 0 0 80365000 6413 1108;1404 6006 57429;57430;57431;57432;57433;57434 72981;72982;72983;72984;72985;72986;72987;72988 72987 8 DIELTLR Unmodified 858.48108 0.48108226 4218 Q9HBL8;I3L1Y8;I3L3Z0 NMRAL1 NmrA-like family domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 76.919 76.919 2 0.055848 78051 QUIQUE_C1368_190116_001 71.715 14.612 34768000 0 0 20358000 0 0 0 0 0 0 0 0 14410000 0 6414 4218 6007 57435;57436 72989;72990 72989 2 DIELVMSQANVSR Unmodified 1460.7293 0.72932781 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3;F8W0W4 NACA Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form yes no 0 0 0 1 94.956 94.956 2 0.0005414 99083 QUIQUE_C1438_190116_001 103.91 7.6799 117790000 0 0 0 0 117790000 0 0 0 0 0 0 0 0 6415 892 6008 57437 72991;72992 72991 2 DIELVMSQANVSR Oxidation (M) 1476.7242 0.72424243 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3;F8W0W4 NACA Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form yes no 0 1 0 1 66.282 66.282 2 0.023406 65871 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.278 17.054 196810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 196810000 6416 892 6008 57438 72993 72993 1 DIENQYETQITQIEHEVSSSGQEVQSSAK Unmodified 3263.5066 0.5065879 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 142.09 142.09 3;4 0 148843 QUIQUE_C1438_190116_001 272.52 248.85 4231100000 37009000 0 80445000 215870000 628330000 121230000 213290000 567260000 350030000 389670000 553480000 492250000 582200000 + 6417 780 6009 57439;57440;57441;57442;57443;57444;57445;57446;57447;57448;57449;57450;57451;57452;57453;57454;57455;57456 72994;72995;72996;72997;72998;72999;73000;73001;73002;73003;73004;73005;73006;73007;73008;73009;73010;73011;73012;73013;73014 72998 21 DIENSTEIMLDR Unmodified 1434.6661 0.66605885 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 42.609 42.609 2 0.040838 37108 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.129 16.361 66506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 66506000 0 0 0 6418 636 6010 57457 73015 73015 1 DIEQASLAAVSQSLATR Unmodified 1758.9112 0.91119158 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 134.16 134.16 3 0.00012619 138545 QUIQUE_C1277_190116_001 57.936 50.344 238900000 0 36500000 49930000 38258000 0 0 0 0 0 24858000 39382000 0 49976000 6419 4606 6011 57458;57459;57460;57461;57462;57463 73016;73017;73018;73019;73020;73021;73022 73016 5 DIEQSIK Unmodified 831.4338 0.43379771 1968 P09525;Q6P452 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 27.396 27.396 2 0.062051 21583 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.485 13.72 121690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 121690000 6420 1968 6012 57464 73023 73023 1 DIEQVPQQPTYVQALFDFDPQEDGELGFR Unmodified 3380.5837 0.58371601 2774 P62993 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 170.66 170.66 3 3.0242E-36 177977 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.36 117.27 826640000 52082000 38601000 0 16994000 0 0 126320000 0 217420000 4704400 208310000 0 162210000 6421 2774 6013 57465;57466;57467;57468;57469;57470;57471;57472 73024;73025;73026;73027;73028;73029;73030;73031;73032;73033 73032 9 DIEQYYSTQIDEMPMNVADLI Unmodified 2487.1185 0.1185431 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 1 177.22 177.22 2;3 0.007677 184209 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.628 47.224 42516000 0 0 0 0 0 0 0 15088000 0 0 27428000 0 0 6422 2416 6014 57473;57474;57475 73034;73035;73036 73036 3 DIEREDIEFICK Unmodified 1565.7396 0.73955814 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.184 84.184 3 0.00015829 85218 QUIQUE_C1403_190116_001 97.463 67.774 2127400000 125030000 289420000 191360000 152330000 167180000 122620000 178800000 146850000 165740000 57240000 181440000 188980000 160400000 6423 2573 6015 57476;57477;57478;57479;57480;57481;57482;57483;57484;57485;57486;57487;57488;57489 73037;73038;73039;73040;73041;73042;73043;73044;73045;73046;73047;73048;73049;73050;73051;73052 73041 14 DIETFYNTSIEEMPLNVADLI Oxidation (M) 2442.1512 0.15122343 2697 P60842 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes yes 0 1 0 1 1 176.96 176.96 2 5.527E-06 183972 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.593 56.036 59345000 0 0 0 0 0 0 0 0 18829000 0 40516000 0 0 6424 2697 6016 57490;57491 73053;73054;73055;73056 73056 2125 4 DIETFYNTSIEEMPLNVADLI Unmodified 2426.1563 0.15630881 2697 P60842 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes yes 0 0 0 1 1 182.02 182.02 2 0.039982 184733 QUIQUE_DMIX8_190116_001 53.967 44.679 25371000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25371000 6425 2697 6016 57492;57493 73057;73058 73058 1 DIETFYNTTVEEMPMNVADLI Oxidation (M) 2460.1076 0.10764406 3055 Q14240 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes yes 0 1 0 1 1 1 1 2 2 1 175.17 175.17 2 0.0006487 178767 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.57 46.166 119040000 0 0 4638700 0 11160000 0 11316000 13880000 24038000 0 43488000 0 10525000 6426 3055 6017 57494;57495;57496;57497;57498;57499;57500;57501;57502 73059;73060;73061;73062;73063;73064;73065;73066;73067 73063 2513;2514 9 DIETFYNTTVEEMPMNVADLI Unmodified 2444.1127 0.11272944 3055 Q14240 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 180.4 180.4 2 0.024505 186972 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.088 49.728 107350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 107350000 0 0 6427 3055 6017 57503 73068 73068 0 DIFAMDDKSENEPIENEAAK Unmodified 2265.0107 0.010707205 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 86.027 86.027 3 0.0018168 87899 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.223 46.89 205050000 0 0 50893000 39233000 39828000 0 0 0 41887000 0 0 33210000 0 6428 3878 6018 57504;57505;57506;57507;57508 73069;73070;73071;73072;73073 73072 5 DIFGLLQAYADGVDLTEK Unmodified 1966.9888 0.9887732 1509 O43150 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.06 174.06 2 4.294E-07 175365 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.54 110.46 186690000 5565000 0 0 2799200 0 4814200 45971000 19565000 19565000 0 24775000 50034000 13598000 6429 1509 6019 57509;57510;57511;57512;57513;57514;57515;57516;57517;57518 73074;73075;73076;73077;73078;73079;73080;73081;73082;73083 73079 10 DIFPYSENK Unmodified 1111.5186 0.51858998 1637 O75475 PSIP1 PC4 and SFRS1-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.941 71.941 2 0.0063921 72973 QUIQUE_C1218_190116_001 84.498 58.761 584980000 120410000 116990000 86609000 69640000 0 63707000 0 31424000 45524000 0 0 50684000 0 6430 1637 6020 57519;57520;57521;57522;57523;57524;57525;57526 73084;73085;73086;73087;73088;73089;73090;73091 73084 7 DIFQEIFDK Unmodified 1153.5655 0.56554017 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 148.78 148.78 1;2 0.00041107 154921 QUIQUE_C1218_190116_001 122.52 86.07 6517600000 840730000 762030000 868650000 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73145 73145 1 DIFYKPFHGDIQCGGHAPGSSK Unmodified 2417.1223 0.12226376 1473 O15031;E2PU09 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 58.87 58.87 4 0.00017865 58559 QUIQUE_C1438_190116_001 32.896 25.536 245340000 0 0 59800000 46411000 63775000 0 75357000 0 0 0 0 0 0 6437 1473 6027 57561;57562;57563;57564 73146;73147;73148;73149 73148 4 DIGAIAQVHAENGDIIAEEQQR Unmodified 2376.167 0.16696535 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 4 4 6 7 5 8 6 7 8 2 16 7 9 108.3 108.3 2;3 0 96205 QUIQUE_C1277_190116_001 349.19 329.35 34333000000 2374400000 2572700000 2450300000 2427600000 2004600000 2833100000 2957300000 2751600000 2384600000 4185200000 2306500000 2034400000 3050400000 6438 365 6028 57565;57566;57567;57568;57569;57570;57571;57572;57573;57574;57575;57576;57577;57578;57579;57580;57581;57582;57583;57584;57585;57586;57587;57588;57589;57590;57591;57592;57593;57594;57595;57596;57597;57598;57599;57600;57601;57602;57603;57604;57605;57606;57607;57608;57609;57610;57611;57612;57613;57614;57615;57616;57617;57618;57619;57620;57621;57622;57623;57624;57625;57626;57627;57628;57629;57630;57631;57632;57633;57634;57635;57636;57637;57638;57639;57640;57641;57642;57643;57644;57645;57646;57647;57648;57649;57650;57651;57652;57653 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73167 198 DIGAIAR Unmodified 714.40244 0.40243801 3984 Q9BPU6;E7EWB4 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 29.998 29.998 2 0.019541 26126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.56 46.202 8282900000 0 854580000 827630000 0 1104600000 245030000 343200000 799410000 1478700000 416970000 0 1013600000 1199200000 6439 3984 6029 57654;57655;57656;57657;57658;57659;57660;57661;57662;57663;57664;57665;57666;57667;57668;57669;57670 73363;73364;73365;73366;73367;73368;73369;73370;73371;73372;73373;73374;73375;73376;73377;73378;73379;73380;73381;73382;73383 73374 21 DIGEGNLSTAAAAALAAAAVK Unmodified 1883.9953 0.99525556 1039 F8VXC8;Q8TAQ2 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 146.77 146.77 2;3 0.00014324 151380 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.812 80.279 598690000 0 56128000 0 53675000 76064000 0 0 103260000 59641000 18201000 61676000 109630000 60409000 6440 1039 6030 57671;57672;57673;57674;57675;57676;57677;57678;57679;57680;57681 73384;73385;73386;73387;73388;73389;73390;73391;73392;73393;73394 73393 10 DIGSALTR Unmodified 831.44503 0.4450311 67 A0A087WXN9;Q765P7 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 0 1 42.263 42.263 2 0.050353 38771 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.531 3.2994 51104000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51104000 0 6441 67 6031 57682 73395 73395 1 DIGYSDIMVLCVLK Unmodified 1624.8205 0.820451 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 157.28 157.28 2 0.0066893 161599 QUIQUE_C1277_190116_001 64.82 39.967 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6442 4268 6032 57683 73396 73396 1 DIHDDQDYLHSLGK Unmodified 1654.7587 0.75871368 1673 O75955;A0A140T9R1;A2AB12;A2AB10;A0A140T9X0;A2AB09;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A0A140T9C3;A0A140T959;A2AB11;A0A140T9B1;A0A140T957;A0A140T910 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 3 1 1 1 1 63.713 63.713 2;3 4.6785E-18 63847 QUIQUE_C1218_190116_001 126.16 112.41 1157200000 118580000 122920000 122390000 117430000 85495000 77325000 135100000 87982000 0 56393000 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93.324 2 0.037851 96128 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.973 40.071 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6447 442 6037 57736 73464 73464 1 DIIEHLNTSGAPADTSDPLQQICK Unmodified 2622.2595 0.2595451 1362 M0QXN5;P37198 NUP62 Nuclear pore glycoprotein p62 yes no 0 0 0 1 1 1 110.27 110.27 3 1.7165E-11 113272 QUIQUE_C1403_190116_001 86.557 74.935 108380000 0 0 0 63283000 0 45093000 0 0 0 0 0 0 0 6448 1362 6038 57737;57738;57739 73465;73466;73467 73466 3 DIIEYAELK Unmodified 1092.5703 0.5702912 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.502 97.502 2 0.014665 100042 QUIQUE_C1368_190116_001 68.224 25.354 230720000 62054000 61015000 54122000 53533000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6449 882 6039 57740;57741;57742;57743;57744;57745;57746;57747 73468;73469;73470;73471;73472;73473;73474;73475 73470 8 DIIFAIK Unmodified 818.49019 0.49019038 2013 P11177 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 96.396 96.396 2 0.046324 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motility protein 2 no no 0 0 1 1 77.894 77.894 3 0.0046289 77901 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.212 57.958 12890000 0 0 0 0 0 0 0 12890000 0 0 0 0 0 6453 3732;3280 6043 57753 73481 73481 1 DIIHFFR Unmodified 946.50249 0.5024864 1053 F8W7U8;P49959 MRE11A Double-strand break repair protein MRE11A yes no 0 0 0 1 92.229 92.229 2 0.050815 94726 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.335 24.296 16413000 0 0 0 0 0 0 0 0 16413000 0 0 0 0 6454 1053 6044 57754 73482 73482 1 DIILATDLAHHLR Unmodified 1486.8256 0.82561145 1402 O00408;E9PEF1;H7C009;C9JPD5 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 85.581 85.581 2;3 0.00016478 87356 QUIQUE_C1277_190116_001 90.793 63.463 1124700000 94507000 147150000 71280000 75319000 121610000 59325000 89428000 84941000 72311000 28875000 87770000 93241000 98936000 6455 1402 6045 57755;57756;57757;57758;57759;57760;57761;57762;57763;57764;57765;57766;57767;57768 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89.383 3 0.058253 91506 QUIQUE_DMIX3_190116_001 21.039 5.6522 11623000 0 0 0 0 0 0 0 0 11623000 0 0 0 0 6463 2964 6053 57855 73603 73603 1 DIIVLVTSLGK Unmodified 1156.7067 0.7067251 2459 P43007 SLC1A4 Neutral amino acid transporter A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 140.41 140.41 2 0.0010057 144553 QUIQUE_C1403_190116_001 91.584 74.198 93088000 13027000 15216000 17008000 14401000 11271000 9745200 0 0 12419000 0 0 0 0 6464 2459 6054 57856;57857;57858;57859;57860;57861;57862;57863 73604;73605;73606;73607;73608;73609;73610;73611;73612;73613 73608 10 DIKDTTVGTLSQR Unmodified 1432.7522 0.75217174 2589 P51665 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.157 50.157 2 0.0028212 47455 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.961 67.186 479710000 0 0 23270000 20766000 45619000 0 0 60934000 83123000 0 106140000 64738000 75118000 6465 2589 6055 57864;57865;57866;57867;57868;57869;57870;57871 73614;73615;73616;73617;73618;73619;73620;73621;73622 73622 9 DIKEHAFFR Unmodified 1161.5931 0.59309232 1894 P05771;I3L148 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 1 1 1 35.568 35.568 3 0.0098982 31632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.191 41.852 112630000 0 0 0 0 0 0 0 60920000 0 0 0 51710000 0 6466 1894 6056 57872;57873 73623;73624 73623 2 DIKPAATHHYLVVPK Unmodified 1687.941 0.94097556 4254 Q9NQE9 HINT3 Histidine triad nucleotide-binding protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 31.87 31.87 4 0.015317 26120 QUIQUE_C1277_190116_001 40.278 34.267 469170000 0 279590000 0 0 0 0 0 189580000 0 0 0 0 0 6467 4254 6057 57874;57875 73625;73626 73625 2 DIKPANVFITATGVVK Unmodified 1671.956 0.95595693 3686 Q8TDX7;Q5TBH0 NEK7;NEK6 Serine/threonine-protein kinase Nek7 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 105.42 105.42 3 0.0026256 110144 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.565 57.732 339240000 0 0 0 44714000 0 0 61044000 40411000 0 29463000 55477000 49875000 58254000 6468 3686 6058 57876;57877;57878;57879;57880;57881;57882 73627;73628;73629;73630;73631;73632;73633 73631 1 DIKPDNLLLDAK Unmodified 1353.7504 0.75038083 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MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 91.322 91.322 2;3 2.9808E-30 92927 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.21 164.06 5786900000 594700000 426200000 316370000 460200000 540820000 526970000 408620000 339860000 687650000 137070000 528820000 394950000 424660000 6473 2483 6063 57931;57932;57933;57934;57935;57936;57937;57938;57939;57940;57941;57942;57943;57944;57945;57946;57947;57948;57949;57950;57951;57952;57953;57954;57955;57956;57957 73694;73695;73696;73697;73698;73699;73700;73701;73702;73703;73704;73705;73706;73707;73708;73709;73710;73711;73712;73713;73714;73715;73716;73717;73718;73719;73720;73721;73722;73723;73724;73725;73726;73727;73728;73729;73730;73731 73717 37 DIKPQLELIEDEEKLK Unmodified 1939.0514 0.051373454 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 2 1 1 93.97 93.97 4 0.0008247 95971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.787 35.865 55097000 0 0 0 0 0 0 0 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73857;73858;73859;73860;73861;73862;73863;73864;73865;73866;73867;73868;73869;73870;73871;73872;73873;73874;73875;73876;73877;73878;73879;73880;73881;73882;73883;73884;73885;73886;73887;73888;73889 73867 33 DILGGIR Unmodified 742.43374 0.43373813 61 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YMB3;H0YLV5;H0YK13;H0YK71;H0YN22;H0YMW6 GMPR2 GMP reductase;GMP reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 65.229 65.229 2 0.045523 64702 QUIQUE_C1277_190116_001 78.445 28.325 346340000 0 62782000 79600000 0 68274000 0 64758000 0 0 0 0 70922000 0 6488 61 6078 58073;58074;58075;58076;58077 73890;73891;73892;73893;73894;73895 73890 6 DILIVVGNEIIEAPMAWR Oxidation (M) 2054.087 0.087047453 2563 P50440;H0YMX4 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 164.38 164.38 2 0.00063007 166282 QUIQUE_C1563_190116_001 85.288 64.335 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6489 2563 6079 58078 73896 73896 2011 1 DILLIGHR Unmodified 935.55525 0.55525025 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.322 56.322 2 0.026786 52828 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.268 46.958 416860000 0 0 93586000 0 87941000 0 95626000 0 0 32190000 107520000 0 0 6490 4474 6080 58079;58080;58081;58082;58083 73897;73898;73899;73900;73901 73900 5 DILLLPLQLPR Unmodified 1289.8071 0.80710784 967 E9PNR2;Q13671 RIN1 Ras and Rab interactor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.74 155.74 2 0.001148 162196 QUIQUE_C1438_190116_001 89.355 81.787 234530000 16871000 19199000 22795000 16082000 23352000 22734000 16901000 12736000 13292000 7055400 22307000 17961000 23244000 6491 967 6081 58084;58085;58086;58087;58088;58089;58090;58091;58092;58093;58094;58095;58096 73902;73903;73904;73905;73906;73907;73908;73909;73910;73911;73912;73913;73914 73906 13 DILLMLSDMDINAIAGTLK Unmodified 2046.0741 0.074099506 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 174.92 174.92 2 0.012228 180728 QUIQUE_C1438_190116_001 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74006;74007 74006 2 DIMEDTIEDK Unmodified 1207.5278 0.52783403 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 2 1 1 75.914 75.914 1;2 1.9862E-09 76969 QUIQUE_C1218_190116_001 179.8 120.82 471340000 363570000 0 0 0 0 0 0 0 0 63538000 0 0 44230000 6502 273;342 6092 58169;58170;58171;58172 74008;74009;74010;74011 74009 2 DIMEDTIEDKLDTK Unmodified 1664.7815 0.78148254 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 3 4 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 97.345 97.345 2;3 1.2807E-45 101836 QUIQUE_C1438_190116_001 187.85 157.24 16783000000 1530700000 1977300000 1539200000 1409600000 1135800000 1032100000 1447900000 876000000 962900000 530930000 1498800000 1489300000 1352300000 6503 273;342 6093 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74063;74064;74065;74066;74067;74068;74069;74070;74071;74072;74073;74074;74075;74076;74077;74078;74079 74065 200 12 DIMSIYKEPPPGMFVVPDTVDMTK Unmodified 2709.3104 0.31038339 4185 Q9H832;H0Y9X8 UBE2Z Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z yes no 0 0 1 1 149.61 149.61 3 4.3184E-06 152423 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.356 52.633 30681000 0 0 0 0 0 0 0 30681000 0 0 0 0 0 6505 4185 6094 58218 74080 74080 1 DINAVAASLR Unmodified 1028.5615 0.56145784 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;C9JFN4 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 77.852 77.852 2 0.015687 78248 QUIQUE_C1277_190116_001 63.216 27.859 301240000 61054000 57374000 0 75136000 0 0 0 67521000 0 40154000 0 0 0 6506 3437 6095 58219;58220;58221;58222;58223 74081;74082;74083;74084;74085 74082 4 DINAYNCEEPTEK Unmodified 1581.6617 0.66170175 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.727 44.727 2 6.7442E-19 40305 QUIQUE_DMIX4_190116_001 196.88 192.23 22355000000 1843200000 1255600000 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74137;74138;74139;74140;74141;74142;74143;74144;74145;74146;74147;74148;74149;74150;74151;74152 74144 2157 13 DINLASFIEQVAVSMT Unmodified 1736.8655 0.86548694 2724 P61457 PCBD1 Pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 190.72 190.72 2 1.8307E-07 189082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.84 105.49 69397000 0 0 0 0 0 0 0 12518000 56879000 0 0 0 0 6512 2724 6100 58272;58273 74153;74154 74153 1 DINQEVYNFLATAGAK Unmodified 1752.8683 0.86826413 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 160.39 160.39 2;3 5.2044E-66 165804 QUIQUE_C1218_190116_001 198.49 157.77 20439000000 2212600000 2069800000 1844400000 1459600000 1537800000 1342200000 1431900000 1118800000 1781000000 905630000 1454100000 1371600000 1909200000 6513 3975 6101 58274;58275;58276;58277;58278;58279;58280;58281;58282;58283;58284;58285;58286;58287;58288;58289;58290;58291;58292;58293;58294;58295;58296;58297;58298;58299 74155;74156;74157;74158;74159;74160;74161;74162;74163;74164;74165;74166;74167;74168;74169;74170;74171;74172;74173;74174;74175;74176;74177;74178;74179;74180;74181;74182;74183;74184;74185;74186;74187;74188;74189;74190;74191;74192;74193;74194;74195;74196;74197;74198;74199;74200;74201;74202;74203;74204;74205;74206;74207 74159 53 DINSVAGVLK Unmodified 1014.571 0.5709599 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 76.901 76.901 2 0.041293 78146 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.019 18.717 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6514 1520 6102 58300 74208 74208 1 DINTDFLLVVLR Unmodified 1416.7977 0.79766537 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 168.27 168.27 2;3 8.1081E-07 172965 QUIQUE_C1218_190116_001 169.93 119.89 1145500000 72563000 81189000 88564000 48399000 114420000 126260000 79202000 104700000 90861000 18946000 144800000 129090000 46467000 6515 2916 6103 58301;58302;58303;58304;58305;58306;58307;58308;58309;58310;58311;58312;58313;58314 74209;74210;74211;74212;74213;74214;74215;74216;74217;74218;74219;74220;74221;74222 74209 14 DINWDSSQWQPLIQDR Unmodified 1999.9388 0.93880331 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.22 143.22 2 6.4692E-07 147890 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.42 122.53 158630000 0 0 0 0 0 0 0 0 32563000 18358000 64205000 43507000 0 6516 3766 6104 58315;58316;58317;58318 74223;74224;74225;74226;74227 74227 5 DIPCIFR Unmodified 919.45857 0.45857268 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta no no 0 0 0 1 1 95.985 95.985 2 0.050081 99367 QUIQUE_C1576_190116_001 74.717 38.161 42917000 0 0 0 23252000 0 0 19665000 0 0 0 0 0 0 6517 4631 6105 58319;58320 74228;74229 74229 2 DIPDYLCGK Unmodified 1079.4957 0.49574604 4509 Q9UNE7;H3BTA3;H3BUD0 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 1 81.3 81.3 2 0.021668 82636 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.999 31.814 27056000 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1655 6108 58336;58337;58338;58339;58340;58341;58342;58343;58344;58345;58346;58347;58348;58349;58350;58351;58352;58353;58354;58355;58356;58357;58358;58359 74247;74248;74249;74250;74251;74252;74253;74254;74255;74256;74257;74258;74259;74260;74261;74262;74263;74264;74265;74266;74267;74268;74269;74270;74271;74272 74269 23 DIPIWGTLIQYIR Unmodified 1586.8821 0.8820637 3646 Q8NF37;A0A0G2JQ62 LPCAT1 Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 171.13 171.13 2 0.00044583 178400 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.456 73.074 51215000 0 0 0 0 0 0 0 0 16897000 0 34317000 0 0 6521 3646 6109 58360;58361 74273;74274 74274 2 DIPLGIR Unmodified 782.46504 0.46503826 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 1 68.538 68.538 2 0.037484 69125 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.306 23.309 64343000 0 0 0 28721000 0 0 0 0 0 0 35622000 0 0 6522 3660 6110 58362;58363 74275;74276;74277 74276 3 DIPLNQGCLAPVR Unmodified 1451.7555 0.75548298 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.293 85.293 2 0.00018312 87215 QUIQUE_C1368_190116_001 137.14 104.92 310360000 0 39051000 56072000 0 47717000 43680000 0 0 41492000 0 42651000 39699000 0 6523 1450 6111 58364;58365;58366;58367;58368;58369;58370 74278;74279;74280;74281;74282;74283;74284 74279 6 DIPNENEAQFQIR Unmodified 1572.7532 0.75323437 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.823 82.823 2 0.00015692 85810 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.43 115.91 671110000 0 0 0 0 0 0 0 107690000 106260000 58091000 137430000 131210000 130430000 6524 2938 6112 58371;58372;58373;58374;58375;58376 74285;74286;74287;74288;74289;74290;74291;74292;74293;74294;74295;74296;74297 74293 13 DIPNENELQFQIK Unmodified 1586.794 0.79403655 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.75 106.75 2 1.6257E-12 110104 QUIQUE_C1277_190116_001 150.35 124.97 3498100000 368370000 388710000 0 0 322440000 278390000 349400000 323200000 343350000 151660000 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74385;74386;74387;74388;74389;74390;74391;74392;74393;74394;74395;74396;74397;74398;74399;74400;74401;74402;74403;74404;74405;74406;74407;74408;74409;74410;74411 74407 27 DIQAQIDSIVELVCK Unmodified 1729.892 0.89203604 1162 H0YIE9;Q4G104;O94952 FBXO21 F-box only protein 21 yes no 0 0 0 1 1 1 170.2 170.2 3 0.0020632 173565 QUIQUE_C1277_190116_001 55.975 38.756 30827000 0 15495000 0 7899500 0 0 7432700 0 0 0 0 0 0 6534 1162 6122 58470;58471;58472 74412;74413;74414 74412 3 DIQDSLTVSNEVQTAK Unmodified 1746.8636 0.86357268 2492 P47755 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 82.686 82.686 2;3 5.5509E-66 83841 QUIQUE_C1403_190116_001 198.03 165.51 1235900000 82068000 106490000 189190000 109200000 81439000 98528000 105500000 63017000 61722000 103090000 77226000 77245000 81150000 6535 2492 6123 58473;58474;58475;58476;58477;58478;58479;58480;58481;58482;58483;58484;58485;58486;58487 74415;74416;74417;74418;74419;74420;74421;74422;74423;74424;74425;74426;74427;74428;74429;74430;74431;74432;74433;74434;74435;74436;74437;74438;74439;74440;74441;74442;74443 74424 29 DIQENDEEAVQVK Unmodified 1515.7053 0.70528113 1388 O00231;J3QRY4 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.74 46.74 2 0.00025066 43947 QUIQUE_C1218_190116_001 112.83 74.53 47029000 47029000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6536 1388 6124 58488;58489;58490;58491;58492 74444;74445;74446;74447;74448 74444 5 DIQGALHSYK Unmodified 1130.572 0.57202253 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 42.274 42.274 2 0.011083 36731 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.838 27.487 32273000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32273000 0 0 0 6537 3555 6125 58493 74449 74449 1 DIQHAVVNLDNSVVDLETLQALYENR Unmodified 2967.4938 0.49377879 4340 Q9NZ56;B0QZD5 FMN2 Formin-2 yes no 0 0 0 1 166.78 166.78 3 8.5117E-70 170618 QUIQUE_C1277_190116_001 158.88 146.68 79325000 0 79325000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6538 4340 6126 58494 74450 74450 1 DIQMPDGIR Oxidation (M) 1059.5019 0.50189405 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 1 37.386 37.386 2 0.021957 33027 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.265 26.619 77811000 0 0 0 0 0 0 0 0 46669000 31143000 0 0 0 6539 3053 6127 58495;58496 74451;74452 74451 2 DIQMPDGIR Unmodified 1043.507 0.50697943 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 74.244 74.244 2 0.016694 74895 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.302 47.235 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6540 3053 6127 58497;58498;58499;58500 74453;74454;74455;74456 74455 4 DIQMTQSPSSLSASVGDR Unmodified 1877.8789 0.87890517 411 A0A2Q2TTZ9 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 83.582 83.582 2;3 1.3419E-53 86569 QUIQUE_C1218_190116_001 180.48 139.76 578640000 39344000 115980000 76939000 55472000 47032000 27889000 0 36084000 0 30924000 78631000 0 70346000 6541 411 6128 58501;58502;58503;58504;58505;58506;58507;58508;58509;58510;58511 74457;74458;74459;74460;74461;74462;74463;74464;74465;74466;74467;74468;74469 74457 13 DIQMTQSPSSLSASVGDR Oxidation (M) 1893.8738 0.87381979 411 A0A2Q2TTZ9 yes yes 0 1 0 1 1 1 62.503 62.503 2 3.108E-13 60578 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.45 107.08 230150000 0 161180000 0 0 0 0 0 0 0 22767000 46201000 0 0 6542 411 6128 58512;58513;58514 74470;74471;74472 74471 293 3 DIQSLPR Unmodified 827.45012 0.45011648 4352;4175 Q9NZN3;Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4;C9JDQ8 EHD3;EHD1 EH domain-containing protein 3;EH domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 36.306 36.306 2 0.039576 31905 QUIQUE_C1277_190116_001 83.614 14.225 559900000 0 198970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 189590000 171340000 6543 4352;4175 6129 58515;58516;58517 74473;74474;74475;74476 74473 4 DIQTLLSR Unmodified 944.5291 0.52909508 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;F6S6P2;X6REW1;A0A0G2JJM1;F6UR09;F6U1F2;F6XTU0;A0A0G2JJR8;A0A1B0GX79;F6WML8;F6VEM6;F6X9W3;F6U341 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74481;74482;74483;74484;74485;74486;74487;74488;74489;74490;74491;74492;74493;74494;74495;74496;74497;74498;74499;74500;74501;74502;74503;74504;74505;74506;74507;74508;74509;74510;74511;74512;74513;74514;74515;74516;74517;74518;74519;74520;74521;74522;74523;74524;74525;74526;74527;74528;74529;74530;74531;74532;74533;74534;74535;74536;74537;74538;74539;74540;74541;74542;74543;74544;74545;74546;74547;74548;74549;74550;74551;74552;74553;74554;74555;74556;74557;74558;74559;74560;74561;74562;74563;74564;74565;74566;74567;74568;74569;74570;74571;74572;74573;74574;74575;74576;74577;74578;74579;74580;74581;74582;74583;74584;74585;74586;74587;74588;74589;74590;74591;74592;74593;74594;74595 74553 92 DIRFELLAR Unmodified 1131.64 0.64004252 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 1 1 93.709 93.709 3 0.054928 94943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.56 45.467 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6547 2389 6133 58627 74596 74596 1 DISCLNRDPAR Unmodified 1315.6303 0.63028247 3231 Q3ZCQ8;M0R003;M0R1Y4;M0R2Q2 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 1 1 29.159 29.159 3 0.063281 23806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.008 10.779 42091000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42091000 0 0 6548 3231 6134 58628 74597 74597 1 DISILQCHGDCDPLVPLMFGSLTVEK Unmodified 2943.418 0.41803636 109 A0A087X1K9;E5RGR0;O75608;B4DP64 LYPLA1 Acyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 163.54 163.54 3 1.2321E-07 168800 QUIQUE_C1218_190116_001 56.694 50.33 338700000 53719000 63273000 56311000 42631000 0 52161000 0 0 0 0 0 0 70604000 6549 109 6135 58629;58630;58631;58632;58633;58634 74598;74599;74600;74601;74602;74603;74604 74598 7 DISLSDYK Unmodified 939.45493 0.45492709 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.361 62.361 2 0.0036109 61831 QUIQUE_C1277_190116_001 114.6 21.34 48077000000 3155500000 3291900000 3924700000 3467500000 3394900000 3142000000 3829500000 3365700000 4509600000 1918000000 4817000000 3927700000 5333200000 6550 2904 6136 58635;58636;58637;58638;58639;58640;58641;58642;58643;58644;58645;58646;58647 74605;74606;74607;74608;74609;74610;74611;74612;74613;74614;74615;74616;74617;74618;74619;74620;74621;74622;74623;74624 74608 18 DISLSDYKGK Unmodified 1124.5714 0.57135383 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 1 1 40.383 40.383 2 0.025217 36703 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.442 57.993 251370000 0 0 0 0 0 0 0 251370000 0 0 0 0 0 6551 2904 6137 58648 74625 74625 0 DISNLEENDETR Unmodified 1433.627 0.62703081 4135 Q9H1V8 SLC6A17 Sodium-dependent neutral amino acid transporter SLC6A17 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.208 50.208 2 0.00036399 47274 QUIQUE_C1563_190116_001 136.02 104.09 351320000 0 31731000 39766000 34039000 38334000 33944000 41593000 30693000 0 0 54145000 47074000 0 6552 4135 6138 58649;58650;58651;58652;58653;58654;58655;58656;58657;58658 74626;74627;74628;74629;74630;74631;74632;74633;74634;74635 74630 8 DISPEEIDLKNEPWYK Unmodified 1974.9575 0.95747307 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 1 1 2 2 1 1 110.66 110.66 2;3 0.00030646 113250 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.79 96.037 349870000 0 0 0 0 46366000 0 0 95496000 100890000 0 0 48242000 58875000 6553 309;4058 6139 58659;58660;58661;58662;58663;58664;58665 74636;74637;74638;74639;74640;74641;74642 74638 6 DISPVLKDPASFR Unmodified 1443.7722 0.7721789 1928 P07741;H3BQZ9;H3BQB1;H3BQF1;H3BSW3 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 2 1 2 80.422 80.422 2;3 0.00028434 77526 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.591 76.495 1832800000 61009000 86868000 103630000 124730000 167290000 61451000 80247000 290050000 172380000 126750000 229790000 148780000 179860000 6554 1928 6140 58666;58667;58668;58669;58670;58671;58672;58673;58674;58675;58676;58677;58678;58679;58680;58681;58682;58683;58684;58685 74643;74644;74645;74646;74647;74648;74649;74650;74651;74652;74653;74654;74655;74656;74657;74658;74659;74660;74661;74662;74663;74664;74665 74658 23 DISQAYYTVYK Unmodified 1349.6503 0.65033243 2045 P12429;D6RA82;D6RFG5 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 88.46 88.46 2 0.035745 85209 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.56 44.329 51268000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51268000 0 0 0 6555 2045 6141 58686 74666 74666 1 DISSIGLK Unmodified 831.47018 0.47018322 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 56.833 56.833 1;2 0.028279 55864 QUIQUE_C1277_190116_001 68.915 11.451 1053500000 0 279480000 0 0 0 71882000 66428000 0 77712000 0 96966000 68548000 392480000 6556 3499 6142 58687;58688;58689;58690;58691;58692;58693;58694;58695;58696 74667;74668;74669;74670;74671;74672;74673;74674;74675;74676 74667 4 DISSITMFADYR Unmodified 1417.6548 0.65476588 3318 Q5T6V5;Q5T6V7 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.1 133.1 2 0.00051585 137307 QUIQUE_C1403_190116_001 94.297 67.182 367080000 30612000 34370000 39079000 33969000 39917000 34663000 0 49112000 0 15740000 38719000 0 50897000 6557 3318 6143 58697;58698;58699;58700;58701;58702;58703;58704;58705;58706;58707 74677;74678;74679;74680;74681;74682;74683;74684;74685;74686;74687;74688 74681 12 DISSTLIALADK Unmodified 1245.6816 0.68163256 870 E7ESY4;Q13330;H7C3F3 MTA1 Metastasis-associated protein MTA1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 139.7 139.7 2 0.0015731 144895 QUIQUE_C1368_190116_001 94.616 70.461 73853000 0 18615000 16159000 0 0 25044000 14035000 0 0 0 0 0 0 6558 870 6144 58708;58709;58710;58711;58712 74689;74690;74691;74692;74693 74690 5 DISTNYYASQK Unmodified 1288.5935 0.59354583 2079 P14625;H0YIV0 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.509 45.509 2 0.00065522 42788 QUIQUE_C1438_190116_001 98.249 87.098 2653300000 188520000 206460000 258210000 265710000 254560000 224210000 322150000 138080000 209960000 0 0 240350000 345070000 6559 2079 6145 58713;58714;58715;58716;58717;58718;58719;58720;58721;58722;58723 74694;74695;74696;74697;74698;74699;74700;74701;74702;74703;74704;74705;74706;74707;74708;74709;74710 74702 15 DISTTLNADEAVAR Unmodified 1474.7264 0.72635092 3738;1748;180 O95757;E9PDE8;D6RJ96;A0A0A0MSM0;Q92598 HSPA4L;HSPH1 Heat shock 70 kDa protein 4L;Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.197 81.197 2 2.0837E-17 81596 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.46 115.92 2004000000 173490000 193520000 147750000 187290000 144400000 172430000 179970000 151890000 136640000 107770000 137690000 144610000 126550000 6560 1748;180;3738 6146 58724;58725;58726;58727;58728;58729;58730;58731;58732;58733;58734;58735;58736;58737 74711;74712;74713;74714;74715;74716;74717;74718;74719;74720;74721;74722;74723;74724;74725;74726;74727;74728 74722 18 DITAALAAER Unmodified 1029.5455 0.54547343 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 72.417 72.417 1;2 0.00029303 72686 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.86 80.755 5052800000 441520000 439540000 437040000 432490000 419950000 347600000 440050000 330030000 299820000 218780000 466460000 345140000 434380000 6561 269;2893 6147 58738;58739;58740;58741;58742;58743;58744;58745;58746;58747;58748;58749;58750;58751;58752;58753;58754 74729;74730;74731;74732;74733;74734;74735;74736;74737;74738;74739;74740;74741;74742;74743;74744;74745;74746;74747;74748;74749;74750;74751;74752;74753;74754 74742 23 DITAEEEEEEVESLK Unmodified 1748.784 0.78398496 461 A0A2R8YF29;Q9BZ23;V9GYZ0 PANK2 Pantothenate kinase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 105.57 105.57 2 0.0031682 102392 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.234 56.279 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6562 461 6148 58755 74755 74755 1 DITDTLVAVTISEGAHHLDLR Unmodified 2275.1808 0.1808245 2455 P42785 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 147.96 147.96 3;4 1.5527E-53 152895 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.04 150.34 874780000 47317000 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1225.6091 0.60913632 4146 Q9H2H8;B8ZZ77;H7BZ14 PPIL3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 100.19 100.19 2 0.025974 103362 QUIQUE_C1218_190116_001 52.867 38.872 41560000 41560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6566 4146 6152 58777 74781 74781 1 DITLEASR Unmodified 903.46616 0.46616048 2781 P63151;E5RFR9 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 39.417 39.417 2 0.018737 35226 QUIQUE_C1277_190116_001 79.469 30.11 157390000 0 80283000 0 0 0 0 77105000 0 0 0 0 0 0 6567 2781 6153 58778;58779;58780 74782;74783;74784 74782 3 DITLTNDKPATAIGVIGNFTDAER Unmodified 2531.2867 0.28674613 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 131.11 131.11 3 1.563E-08 136164 QUIQUE_C1218_190116_001 80.683 73.913 218040000 61605000 0 0 52879000 0 38478000 30448000 0 0 34625000 0 0 0 6568 2355 6154 58781;58782;58783;58784;58785 74785;74786;74787;74788;74789 74785 5 DITPLQVVLPNTALHLK Unmodified 1871.088 0.088033731 3086 Q14764;H3BQK6;H3BRL2 MVP Major vault protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 1 132.29 132.29 2;3 6.6122E-13 137906 QUIQUE_C1576_190116_001 128.31 105.98 2492100000 128690000 174820000 277240000 205260000 358060000 153500000 243070000 135780000 156480000 101590000 279240000 88126000 190250000 6569 3086 6155 58786;58787;58788;58789;58790;58791;58792;58793;58794;58795;58796;58797;58798;58799;58800;58801;58802;58803;58804;58805;58806;58807;58808;58809;58810 74790;74791;74792;74793;74794;74795;74796;74797;74798;74799;74800;74801;74802;74803;74804;74805;74806;74807;74808;74809;74810;74811;74812;74813;74814;74815;74816;74817 74806 27 DITSDTSGDFR Unmodified 1212.5259 0.5258602 1853 P04083;Q5T3N1 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 56.837 56.837 2 0.00010744 55413 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.07 133.77 3962400000 166130000 0 403530000 456190000 190600000 400850000 418930000 234970000 414250000 233640000 341280000 182900000 519140000 6570 1853 6156 58811;58812;58813;58814;58815;58816;58817;58818;58819;58820;58821;58822;58823 74818;74819;74820;74821;74822;74823;74824;74825;74826;74827;74828;74829;74830;74831;74832;74833;74834 74827 17 DITSSIHFEAYR Unmodified 1437.6888 0.6888432 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 86.578 86.578 2;3 1.4594E-05 88926 QUIQUE_C1277_190116_001 106.49 90.736 3608700000 0 251110000 268320000 248890000 199220000 271330000 227190000 461680000 403320000 304440000 263200000 238120000 471880000 6571 4432 6157 58824;58825;58826;58827;58828;58829;58830;58831;58832;58833;58834;58835;58836;58837;58838;58839 74835;74836;74837;74838;74839;74840;74841;74842;74843;74844;74845;74846;74847;74848;74849;74850;74851;74852;74853;74854;74855;74856;74857;74858;74859;74860;74861;74862;74863;74864;74865;74866;74867;74868;74869;74870;74871;74872;74873;74874;74875;74876 74837 41 DITVLDLGCGK Unmodified 1189.6013 0.60127375 1507 O43148;K7EP06 RNMT mRNA cap guanine-N7 methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 102.87 102.87 2 0.002989 105283 QUIQUE_C1403_190116_001 94.692 69.916 65685000 24512000 0 0 23909000 0 17264000 0 0 0 0 0 0 0 6572 1507 6158 58840;58841;58842;58843 74877;74878;74879;74880;74881 74879 4 DITYFIQQLLR Unmodified 1408.7715 0.77145062 2714;4374 P61158;B4DXW1;Q9P1U1;A0A0A0MTI9;Q9C0K3;H7C4J1;C9IZN3 ACTR3;ACTR3B;ACTR3C Actin-related protein 3;Actin-related protein 3B;Actin-related protein 3C no no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 172.85 172.85 2;3 5.799E-08 166293 QUIQUE_DMIX4_190116_001 149.65 75.722 2741700000 695290000 18208000 459400000 586560000 0 344710000 0 38228000 23960000 519440000 29002000 20406000 6501700 6573 2714;4374 6159 58844;58845;58846;58847;58848;58849;58850;58851;58852;58853;58854;58855;58856;58857 74882;74883;74884;74885;74886;74887;74888;74889;74890;74891;74892;74893;74894;74895;74896;74897;74898 74893 17 DIVAAIQHNYK Unmodified 1270.667 0.66698555 3327 Q5TFE4;Q5QPD0 NT5DC1 5'-nucleotidase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.873 61.873 2 0.00023011 61017 QUIQUE_C1277_190116_001 144.09 119.93 524210000 69054000 48993000 50577000 52622000 58808000 0 75108000 24643000 0 11010000 67208000 0 66189000 6574 3327 6160 58858;58859;58860;58861;58862;58863;58864;58865;58866;58867 74899;74900;74901;74902;74903;74904;74905;74906;74907;74908 74900 8 DIVCYLSLLER Unmodified 1379.7119 0.71188683 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 1 1 155.3 155.3 2 0.0028642 149955 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.624 63.884 117920000 65668000 0 0 35002000 0 0 0 0 0 17255000 0 0 0 6575 636 6161 58868;58869;58870 74909;74910;74911;74912;74913 74912 5 DIVEAHYR Unmodified 1001.493 0.49304393 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.137 25.137 2 0.0006708 18617 QUIQUE_C1403_190116_001 151.51 95.5 39383000000 2252000000 2562600000 4296600000 2689400000 2098200000 2442600000 2113600000 2837400000 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mitochondrial yes yes 0 1 0 3 2 4 3 3 4 3 4 1 4 4 4 3 70.111 70.111 2;3 0.00011945 71468 QUIQUE_C1218_190116_001 118.28 83.558 7264500000 277290000 276810000 970220000 452110000 515490000 532810000 368390000 477190000 255640000 604060000 1183300000 734290000 616930000 6581 1777 6166 58915;58916;58917;58918;58919;58920;58921;58922;58923;58924;58925;58926;58927;58928;58929;58930;58931;58932;58933;58934;58935;58936;58937;58938;58939;58940;58941;58942;58943;58944;58945;58946;58947;58948;58949;58950;58951;58952;58953;58954;58955;58956 74970;74971;74972;74973;74974;74975;74976;74977;74978;74979;74980;74981;74982;74983;74984;74985;74986;74987;74988;74989;74990;74991;74992;74993;74994;74995;74996;74997;74998;74999;75000;75001;75002;75003;75004;75005;75006;75007;75008;75009;75010;75011;75012;75013;75014;75015;75016;75017 74971 971 47 DIVHSGLAYTMER Unmodified 1490.7188 0.71876312 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 84.688 84.688 2;3 9.757E-18 87772 QUIQUE_C1218_190116_001 126.34 116.02 29363000000 2754800000 2447900000 3313900000 2483000000 2455300000 2156300000 2364900000 1533800000 1874600000 782590000 3190700000 1872000000 2132800000 6582 1777 6166 58957;58958;58959;58960;58961;58962;58963;58964;58965;58966;58967;58968;58969;58970;58971;58972;58973;58974;58975;58976;58977;58978;58979;58980;58981;58982;58983 75018;75019;75020;75021;75022;75023;75024;75025;75026;75027;75028;75029;75030;75031;75032;75033;75034;75035;75036;75037;75038;75039;75040;75041;75042;75043;75044;75045;75046;75047;75048;75049;75050;75051;75052;75053;75054;75055;75056;75057;75058;75059;75060;75061;75062;75063;75064;75065;75066;75067;75068;75069;75070;75071;75072;75073;75074;75075;75076;75077;75078;75079;75080 75019 63 DIVINANPASPPLSLLVLHR Unmodified 2138.2212 0.22117317 2971 Q13155;A8MU58 AIMP2 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 yes no 0 0 0 1 2 3 1 1 1 1 1 1 1 142.19 142.19 3 5.694E-05 147243 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Unmodified 1499.8096 0.80962704 2889;2616 P52895;B4DK69;Q04828;H0Y804 AKR1C2;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C2;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 111.12 111.12 2;3 1.0022E-05 114221 QUIQUE_C1403_190116_001 107.18 92.969 159710000 0 35994000 0 0 23637000 24383000 23610000 0 0 52086000 0 0 0 6586 2616;2889 6170 59001;59002;59003;59004;59005;59006;59007;59008 75098;75099;75100;75101;75102;75103;75104;75105 75100 6 DIVLVAYSALGSQR Unmodified 1490.8093 0.80929269 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;A0A3B3IRI8 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1 member C3 yes no 0 0 0 1 130.75 130.75 2 4.1824E-05 126959 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.48 81.79 16000000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16000000 0 0 0 6587 183 6171 59009 75106;75107 75107 2 DIVNGLR Unmodified 785.43955 0.43955179 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 46.511 46.511 2 0.019915 41892 QUIQUE_DMIX4_190116_001 109.88 51.22 776860000 0 0 102520000 96446000 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75117;75118;75119;75120;75121;75122;75123;75124;75125;75126;75127;75128;75129;75130;75131;75132;75133;75134;75135;75136;75137;75138;75139;75140;75141;75142;75143;75144;75145;75146;75147;75148;75149;75150;75151;75152;75153;75154 75130 35 DIVNMLMHHDR Oxidation (M) 1395.6387 0.63873866 2016;2017 P11216;H0Y4Z6;P11217 PYGB;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 3 60.984 60.984 2;3 0.0015486 60370 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.44 57.535 374670000 0 0 88281000 0 0 63749000 40386000 32643000 0 149610000 0 0 0 6590 2016;2017 6173 59041;59042;59043;59044;59045;59046;59047;59048;59049;59050 75155;75156;75157;75158;75159;75160;75161;75162;75163;75164;75165 75164 1321;1322;1330;1331 9 DIVPGDIVEIAVGDKVPADIR Unmodified 2190.1896 0.18959827 2112 P16615 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 145.89 145.89 3 0.00013529 151006 QUIQUE_C1368_190116_001 64.87 44.78 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75174;75175;75176;75177;75178;75179;75180;75181;75182;75183;75184;75185;75186;75187;75188;75189;75190;75191;75192;75193;75194;75195;75196;75197;75198;75199;75200;75201;75202;75203;75204;75205 75187 32 DIVQFVPYR Unmodified 1135.6026 0.60259438 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;H0Y524 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.37 104.37 2 0.00042893 107480 QUIQUE_DMIX8_190116_001 119.17 85.623 909980000 45453000 63232000 94090000 81966000 84946000 0 88050000 33721000 88913000 55334000 113810000 67479000 92988000 6593 579 6176 59072;59073;59074;59075;59076;59077;59078;59079;59080;59081;59082;59083 75206;75207;75208;75209;75210;75211;75212;75213;75214;75215;75216;75217;75218;75219 75219 13 DIVSGLK Unmodified 730.4225 0.42250475 2607 P52566;F5H3P3;H0YGX7 ARHGDIB Rho GDP-dissociation inhibitor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 44.594 44.594 2 0.049128 41289 QUIQUE_C1403_190116_001 75.311 18.8 192550000 0 0 0 78532000 0 47835000 0 0 0 0 66180000 0 0 6594 2607 6177 59084;59085;59086 75220;75221;75222 75220 3 DIVTESNKFDLVSFIPLLR Unmodified 2205.2045 0.20452005 2930 Q08AM6 VAC14 Protein VAC14 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.34 166.34 3 1.8094E-07 172589 QUIQUE_C1438_190116_001 103.85 94.568 602950000 0 41257000 27562000 18661000 73381000 0 0 60367000 102760000 0 96059000 104680000 78221000 6595 2930 6178 59087;59088;59089;59090;59091;59092;59093;59094;59095 75223;75224;75225;75226;75227;75228;75229;75230;75231 75226 7 DIVTPVPQEEVK Unmodified 1352.7187 0.71874635 4494;981;1236 F1T0E5;H7C4P2;Q9ULU8;H7C4T6 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 66.431 66.431 2 0.0043953 65840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.162 54.375 1304600000 236870000 217860000 133010000 132230000 0 0 0 158090000 132300000 0 0 162920000 131300000 6596 981;4494;1236 6179 59096;59097;59098;59099;59100;59101;59102;59103 75232;75233;75234;75235;75236;75237;75238;75239;75240 75237 5 DIVTVANAVFVK Unmodified 1274.7234 0.72343779 1911 P07093;C9JN98 SERPINE2 Glia-derived nexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.39 126.39 2 0.02198 128803 QUIQUE_C1563_190116_001 52.725 43.542 98248000 27432000 15253000 23048000 15924000 0 16591000 0 0 0 0 0 0 0 6597 1911 6180 59104;59105;59106;59107;59108;59109;59110 75241;75242;75243;75244;75245;75246;75247 75245 5 DIVVLGVEK Unmodified 970.5699 0.56989727 1448 O14818 PSMA7 Proteasome subunit alpha type-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.695 77.695 2 0.0098665 78220 QUIQUE_C1277_190116_001 74.92 31.702 759000000 126620000 109080000 126340000 0 0 98838000 0 37285000 0 67196000 68493000 56418000 68737000 6598 1448 6181 59111;59112;59113;59114;59115;59116;59117;59118;59119 75248;75249;75250;75251;75252;75253;75254;75255;75256 75249 8 DIWDFLR Unmodified 963.48142 0.48141661 3647 Q8NFF5;Q5T190 FLAD1 FAD synthase;Molybdenum cofactor biosynthesis protein-like region;FAD synthase region yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 157.52 157.52 2 0.033008 161248 QUIQUE_C1403_190116_001 88.734 53.629 50641000 0 0 14998000 8721800 0 0 9203800 12602000 0 5116000 0 0 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kinase 2, mitochondrial;Pantothenate kinase 3;Pantothenate kinase 1 yes no 0 0 0 1 47.699 47.699 2 0.050487 45033 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.607 40.528 14926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14926000 0 6604 461 6187 59163 75306 75306 1 DIYKRMAGTAFDFENMK Unmodified 2035.9496 0.94956769 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 2 1 95.238 95.238 3 0.03977 97691 QUIQUE_C1277_190116_001 49.993 44.991 34826000 0 34826000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6605 2328 6188 59164 75307 75307 0 DKADFCIIHYAGK Unmodified 1536.7395 0.73949856 2378;2379 P35579;P35580 MYH9;MYH10 Myosin-9;Myosin-10 no no 0 0 1 1 1 1 2 60.215 60.215 2;3 0.0069462 59373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.32 38.214 313290000 97161000 104930000 0 0 0 0 0 83031000 0 0 28160000 0 0 6606 2378;2379 6189 59165;59166;59167;59168;59169 75308;75309;75310;75311;75312 75310 3 DKAEFILPNGQEVDLPISYLTSVSSLIVWHPANPAEK Unmodified 4077.1099 0.10989797 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 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75499;75500;75501;75502;75503;75504;75505 75504 6 DKELVASAGLDR Unmodified 1272.6674 0.66737948 3659 Q8TAF3;C9JC24 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes no 0 0 1 1 1 37.948 37.948 2 0.027853 33921 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.171 36.013 78703000 0 0 0 0 0 0 0 0 30397000 0 0 48306000 0 6624 3659 6207 59327;59328 75506;75507 75507 2 DKEPDTQDADEVKK Unmodified 1616.753 0.7529596 2946 Q12840;J3KNA1 KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 12.396 12.396 3 0.01356 5621 QUIQUE_C1563_190116_001 53.3 44.018 28057000 0 0 0 0 3633200 11863000 6308000 0 0 0 6251900 0 0 6625 2946 6208 59329;59330;59331;59332;59333;59334 75508;75509;75510;75511;75512;75513;75514 75511 7 DKEPDVLFVGDSMVQLMQQYEIWR Unmodified 2925.4041 0.40410085 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 1 171.73 171.73 3 5.4827E-13 175756 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.81 90.404 482100000 0 0 31140000 0 0 0 0 0 0 0 326680000 0 124270000 6626 2798 6209 59335;59336;59337 75515;75516;75517 75517 0 DKEPEVVFIGDSLVQLMHQCEIWR Unmodified 2927.431 0.4309843 3110 Q15102;M0R389;M0R1K3;M0QZT2;M0QXS6;M0R323 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 1 2 3 1 166.31 166.31 3;4 5.6337E-27 173126 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.45 119.07 3195900000 59392000 175770000 0 60002000 141310000 0 300290000 241570000 474700000 9905500 667050000 752100000 313850000 6627 3110 6210 59338;59339;59340;59341;59342;59343;59344;59345;59346;59347;59348;59349;59350;59351;59352;59353;59354;59355;59356 75518;75519;75520;75521;75522;75523;75524;75525;75526;75527;75528;75529;75530;75531;75532;75533;75534;75535;75536;75537;75538;75539 75533 16 DKESGICMDSGGFR Unmodified 1557.6552 0.65517659 1297 J3QL71;Q96FV2;J3QQM9 SCRN2 Secernin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 50.183 50.183 2;3 0.0015901 48245 QUIQUE_C1277_190116_001 93.766 82.276 88043000 0 29113000 29205000 0 0 0 0 0 0 0 29725000 0 0 6628 1297 6211 59357;59358;59359 75540;75541;75542 75540 1 DKETTENENTKFEVR Unmodified 1838.8646 0.86463532 1874 P05060;A0A0A0MT66 CHGB Secretogranin-1;PE-11;GAWK peptide;CCB peptide yes no 0 0 2 1 20.909 20.909 3 0.014845 14020 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.104 50.989 38604000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38604000 6629 1874 6212 59360 75543 75543 1 DKEVGNLYDMFHTR Unmodified 1723.7988 0.79880436 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.232 86.232 3 0.0030517 88562 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.022 68.903 553610000 36309000 62755000 119050000 71461000 0 0 69272000 59281000 44771000 0 90715000 0 0 6630 4598 6213 59361;59362;59363;59364;59365;59366;59367;59368 75544;75545;75546;75547;75548;75549;75550;75551;75552 75552 6 DKEVTALTSQTEMLR Unmodified 1720.8665 0.86654957 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 72.35 72.35 2;3 0.010893 73862 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.223 43.108 134590000 0 0 0 0 0 0 55125000 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0.8566434 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 1 1 170.45 170.45 3 3.3533E-07 172232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.867 48.996 44214000 0 0 0 0 0 0 0 44214000 0 0 0 0 0 6636 4330 6219 59417 75607 75607 1 DKFNECGHVLYADIK Unmodified 1807.8563 0.85631924 2603 P52272;A0A087X0X3 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 60.181 60.181 2;3 8.0673E-09 59368 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.1 101.47 1658200000 0 0 298910000 324290000 43901000 327970000 24393000 0 343960000 0 219760000 32371000 42639000 6637 2603 6220 59418;59419;59420;59421;59422;59423;59424;59425;59426;59427;59428;59429;59430;59431 75608;75609;75610;75611;75612;75613;75614;75615;75616;75617;75618;75619;75620;75621;75622 75621 12 DKFSFDLGKGEVIK Unmodified 1581.8403 0.84025847 2876 Q02790;F5H1U3 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 2 1 1 1 77.185 77.185 3 0.0040969 77466 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.813 44.189 105010000 0 0 0 0 0 0 0 58030000 0 0 0 46982000 0 6638 2876 6221 59432;59433;59434 75623;75624;75625;75626 75623 4 DKGDEEEEGEEKLEEK Unmodified 1891.8171 0.817076 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 26.523 26.523 2;3 1.0078E-183 20021 QUIQUE_C1403_190116_001 262.66 218.98 1333000000 193060000 172020000 135550000 267200000 46374000 154960000 153960000 70637000 0 62881000 38560000 37755000 0 6639 2269 6222 59435;59436;59437;59438;59439;59440;59441;59442;59443;59444;59445;59446;59447;59448;59449 75627;75628;75629;75630;75631;75632;75633;75634;75635;75636;75637;75638;75639;75640;75641;75642 75634 16 DKGEIAQAYIGLK Unmodified 1404.7613 0.76127986 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5;O95317;Q9UES5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 67.693 67.693 2;3 0.00097708 67679 QUIQUE_C1576_190116_001 128.01 109.04 371790000 43242000 57412000 40289000 0 45089000 0 40102000 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12 DKGVNSFMVYMAYK Oxidation (M) 1667.7687 0.76874978 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 85.705 85.705 3 0.00031426 86990 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.359 77.301 152060000 0 0 0 0 0 0 0 37186000 50763000 0 0 29006000 35101000 6643 3051 6225 59474;59475;59476;59477;59478 75672;75673;75674;75675;75676 75672 2483 5 DKHPDLPLAVYHVSGEFAMLWHGAQAGAFDLK Unmodified 3519.7398 0.73977992 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 1 1 154.54 154.54 4 0.0049979 160268 QUIQUE_C1576_190116_001 27.547 23.561 53777000 0 0 0 0 0 0 53777000 0 0 0 0 0 0 6644 2061 6226 59479 75677 75677 1 DKKPALGNHHDPAVPR Unmodified 1750.9227 0.92269974 3466 Q7Z5R6 APBB1IP Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1-interacting protein yes yes 0 0 2 1 1 10.323 10.323 4 0.0015112 2705 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.975 46.187 26289000 0 0 11350000 0 0 0 0 0 0 0 14939000 0 0 6645 3466 6227 59480;59481 75678;75679 75679 1 DKLCGPYEK Unmodified 1108.5223 0.52229515 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 1 1 1 1 1 1 18.91 18.91 2 0.0010857 11711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.14 101.12 412710000 68625000 121270000 0 75126000 0 0 0 98236000 0 49450000 0 0 0 6646 180;3738 6228 59482;59483;59484;59485;59486 75680;75681;75682;75683;75684 75683 5 DKLDQVSSEIK Unmodified 1260.6561 0.65614609 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 0 1 1 1 1 41.611 41.611 2 0.017433 38375 QUIQUE_C1576_190116_001 76.927 53.574 154210000 0 48915000 0 43075000 0 0 62224000 0 0 0 0 0 0 6647 3252 6229 59487;59488;59489 75685;75686;75687 75687 3 DKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCR Unmodified 3318.5901 0.59006372 4605 Q9Y4E8;H0YI26 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 1 1 169.03 169.03 3 4.1258E-08 173279 QUIQUE_DMIX8_190116_001 59.282 48.766 25358000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25358000 6648 4605 6230 59490 75688 75688 1 DKLDTVVEFPIR Unmodified 1430.7769 0.77692993 2965 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A0A087WTS0;P18283;H0YJK8 GPX2 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 137.05 137.05 3 0.0040932 139897 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.045 39.996 87156000 23037000 0 0 0 0 0 0 22593000 0 0 0 0 41526000 6654 30 6236 59525;59526;59527 75732;75733;75734 75733 2 DKLTELQLR Unmodified 1114.6346 0.63462279 3475 Q7Z7H5 TMED4 Transmembrane emp24 domain-containing protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.125 50.125 2;3 0.004475 48249 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.647 6.9681 111300000 0 0 24691000 0 16032000 0 0 40255000 18895000 0 0 0 11430000 6655 3475 6237 59528;59529;59530;59531;59532;59533 75735;75736;75737;75738;75739;75740 75738 6 DKLVGAIVYYDGQHNDAR Unmodified 2032.9967 0.99665254 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 67.767 67.767 3 0.0062033 67830 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.726 37.562 344090000 0 0 0 0 0 0 0 0 120150000 0 0 105490000 118460000 6656 2463 6238 59534;59535;59536 75741;75742;75743 75741 3 DKMMNGGHYTYSENR Oxidation (M) 1817.7461 0.74611686 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 16.681 16.681 3 4.3992E-05 8997 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.38 88.075 149000000 0 0 0 0 0 0 0 28052000 35770000 0 42347000 0 42832000 6657 3956 6239 59537;59538;59539;59540 75744;75745;75746;75747 75745 2789;2790 4 DKMMNGGHYTYSENR 2 Oxidation (M) 1833.741 0.74103148 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 2 1 1 1 1 2 11.406 11.406 3;4 6.2068E-06 3769 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.582 94.548 124550000 0 0 0 0 0 0 0 14523000 41092000 0 0 17420000 51512000 6658 3956 6239 59541;59542;59543;59544;59545 75748;75749;75750;75751;75752 75749 2789;2790 1 DKMMNGGHYTYSENRVEK 2 Oxidation (M) 2189.947 0.94700151 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 2 2 1 1 2 1 3 13.31 13.31 3;4;5 4.0483E-17 5863 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.26 127.44 698620000 0 0 0 0 0 0 0 57441000 82457000 0 275880000 32215000 250630000 6659 3956 6240 59546;59547;59548;59549;59550;59551;59552;59553 75753;75754;75755;75756;75757;75758;75759;75760;75761;75762 75753 2789;2790 10 DKMMNGGHYTYSENRVEK Oxidation (M) 2173.9521 0.95208689 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 2 2 2 1 17.669 17.669 3;4 1.244E-05 10499 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.165 89.877 254140000 0 0 0 0 0 0 0 162650000 49836000 0 0 41648000 0 6660 3956 6240 59554;59555;59556;59557;59558 75763;75764;75765;75766;75767 75763 2789;2790 4 DKMMNGGHYTYSENRVEK Unmodified 2157.9572 0.95717227 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 2 1 22.472 22.472 4 0.00018879 16035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.512 49.982 51708000 0 0 0 0 0 0 0 51708000 0 0 0 0 0 6661 3956 6240 59559 75768 75768 1 DKNEQAFEEVFQNANFR Unmodified 2084.9552 0.95518166 2265 P27694;I3L4R8 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 120.02 120.02 2;3 2.6077E-67 124253 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yes no 0 0 1 1 1 125.45 125.45 3 0.01599 130017 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.53 31.742 51754000 0 0 0 0 0 0 0 0 51754000 0 0 0 0 6672 4175 6251 59686;59687 75927;75928 75928 2 DKPVCVNTYGSYR Unmodified 1557.7246 0.72457678 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 1 1 1 37.795 37.795 2 0.021442 33520 QUIQUE_C1277_190116_001 82.171 54.842 48020000 0 25981000 0 0 0 0 22039000 0 0 0 0 0 0 6673 218 6252 59688;59689 75929;75930 75929 2 DKPVTVVQSIGTEVIGTLRPDYR Unmodified 2542.3755 0.37550156 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 134.93 134.93 3;4 1.832E-50 137957 QUIQUE_C1563_190116_001 151.82 144.94 20029000000 1145600000 1155800000 1575200000 1025400000 1345100000 1414300000 1610600000 1490100000 2638700000 1350700000 1915000000 1366300000 1996200000 6674 3093 6253 59690;59691;59692;59693;59694;59695;59696;59697;59698;59699;59700;59701;59702;59703;59704;59705;59706;59707;59708;59709;59710;59711;59712;59713;59714;59715 75931;75932;75933;75934;75935;75936;75937;75938;75939;75940;75941;75942;75943;75944;75945;75946;75947;75948;75949;75950;75951;75952;75953;75954;75955;75956;75957;75958;75959;75960;75961;75962;75963;75964;75965;75966;75967;75968;75969;75970;75971;75972;75973;75974 75951 43 DKPVYYALEGSVAIAGAVIR Unmodified 2091.1364 0.13644049 2348 P32189;Q14409 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 1 1 145.23 145.23 3 0.022105 150470 QUIQUE_C1218_190116_001 43.12 36.346 21864000 21864000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6675 2348 6254 59716 75975 75975 0 DKPYPDCPFLLLDVR Unmodified 1846.9288 0.9287559 4079 Q9BYV8;C9J9X8;C9JCX6;C9JXA0 CEP41 Centrosomal protein of 41 kDa yes no 0 0 1 1 134.29 134.29 3 0.046341 137247 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.892 36.299 12376000 0 0 0 0 0 0 0 12376000 0 0 0 0 0 6676 4079 6255 59717 75976 75976 0 DKQELEDFIK Unmodified 1263.6347 0.63468237 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 83.414 83.414 3 0.05166 87099 QUIQUE_C1368_190116_001 35.541 7.6275 283060000 0 0 124690000 0 0 0 0 0 0 0 158380000 0 0 6677 3125 6256 59718;59719 75977;75978 75977 2 DKQQQQLLNLR Unmodified 1382.763 0.7630112 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2;A0A1B0GW62;A0A0D9SGI7 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 1 1 1 1 46.291 46.291 2 0.0054911 42686 QUIQUE_C1403_190116_001 104.2 50.515 44894000 0 0 0 21397000 0 0 0 23497000 0 0 0 0 0 6678 4250 6257 59720;59721;59722 75979;75980;75981 75979 3 DKQWLEHVQQEDEHQRPR Unmodified 2357.1261 0.12610359 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 2 1 1 1 29.765 29.765 4;5 8.7806E-11 24087 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.094 86.615 164800000 0 0 0 0 0 0 0 39202000 0 0 55336000 0 70257000 + 6679 3161 6258 59723;59724;59725 75982;75983;75984 75983 3 DKRPEGYNLK Unmodified 1218.6357 0.63568542 2781;2839;4568 P63151;Q9Y2T4;Q00005 PPP2R2A;PPP2R2C;PPP2R2B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform no no 0 0 2 1 13.413 13.413 3 0.00092239 5410 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.94 81.52 64611000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64611000 0 0 0 6680 2781;4568;2839 6259 59726 75985;75986 75985 2 DKSDSDTEGLLFSR Unmodified 1568.7318 0.73183023 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.76 71.76 2 2.4461E-11 71956 QUIQUE_C1277_190116_001 160.48 145.21 783670000 57242000 88342000 90060000 75647000 75715000 71511000 102450000 0 94245000 16773000 0 0 111680000 6681 4172;346 6260 59727;59728;59729;59730;59731;59732;59733;59734;59735;59736 75987;75988;75989;75990;75991;75992;75993;75994;75995;75996 75988 9 DKSFLAMVVDIVQELK Unmodified 1833.991 0.9910218 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 175.21 175.21 2;3 2.2743E-19 182112 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.31 101.07 3427700000 8235800 47916000 0 0 33672000 45543000 0 155440000 475330000 0 488120000 1946000000 227480000 6682 1423 6261 59737;59738;59739;59740;59741;59742;59743;59744;59745;59746;59747 75997;75998;75999;76000;76001;76002;76003;76004;76005;76006;76007 76004 11 DKSFLAMVVDIVQELK Oxidation (M) 1849.9859 0.98593643 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 169.95 169.95 3 4.5276E-05 173363 QUIQUE_C1277_190116_001 97.291 86.824 1494200000 0 69486000 0 0 296620000 0 197280000 203440000 0 11600000 328430000 387340000 0 6683 1423 6261 59748;59749;59750;59751;59752;59753;59754;59755;59756;59757 76008;76009;76010;76011;76012;76013;76014;76015;76016;76017;76018 76008 794 11 DKSPNIQFEAFHVFK Unmodified 1805.9101 0.91006937 4199 Q9H9S4;Q5TAW7;B7ZBJ4 CAB39L Calcium-binding protein 39-like yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.098 95.098 3;4 6.7058E-07 97627 QUIQUE_C1368_190116_001 90.725 79.871 386780000 33880000 51179000 71606000 0 41430000 0 64401000 18714000 0 0 46964000 58606000 0 6684 4199 6262 59758;59759;59760;59761;59762;59763;59764;59765 76019;76020;76021;76022;76023;76024;76025;76026 76021 8 DKTEFSIIHYAGK Unmodified 1507.7671 0.76709352 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 58.706 58.706 3 0.0074016 57484 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.132 29.699 39127000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39127000 0 6685 2385 6263 59766 76027 76027 1 DKTEKPDTVQLLTVK Unmodified 1713.9513 0.95126548 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 2 1 1 47.976 47.976 2;3 0.014419 46060 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.574 64.656 150500000 0 0 0 0 0 0 0 128320000 0 0 0 0 22180000 6686 2880 6264 59767;59768 76028;76029 76028 1 DKTLEHKEVVEPK Unmodified 1550.8304 0.83042206 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 11.197 11.197 4 0.0030208 3642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.651 63.593 16648000 0 0 0 0 0 0 0 16648000 0 0 0 0 0 6687 921 6265 59769 76030 76030 0 DKTSPFELYQFFVR Unmodified 1775.8883 0.88827129 4573 Q9Y2Z4;H0YHS6 YARS2 Tyrosine--tRNA ligase, mitochondrial;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 149.66 149.66 2;3 7.0174E-05 154515 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.228 81.327 164050000 11647000 0 14490000 9158400 13579000 11902000 14962000 21048000 18981000 0 26412000 21867000 0 6688 4573 6266 59770;59771;59772;59773;59774;59775;59776;59777;59778;59779;59780 76031;76032;76033;76034;76035;76036;76037;76038;76039;76040;76041;76042 76039 8 DKTVVLGDLLIDDKDTVR Unmodified 2014.0946 0.094635252 3673 Q8TCD5;J3KRC4;J3KSY6 NT5C 5'(3')-deoxyribonucleotidase, cytosolic type yes no 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 2 98.413 98.413 3;4 2.3986E-17 102642 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.3 118.21 639490000 30035000 44452000 57765000 35808000 0 0 0 0 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76086;76087;76088;76089;76090;76091;76092;76093;76094;76095;76096;76097;76098;76099;76100;76101;76102;76103;76104;76105;76106;76107;76108;76109;76110;76111;76112;76113;76114;76115;76116;76117 76090 29 DKYENEDLIK Unmodified 1265.6139 0.61394692 3510 Q86WR0;Q0VGD4;G3V121;B7Z2L8 CCDC25 Coiled-coil domain-containing protein 25 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.395 35.395 2 0.0091822 31021 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.055 69.656 232080000 29547000 29864000 27078000 40551000 0 0 0 31687000 34195000 0 0 0 39156000 6697 3510 6275 59840;59841;59842;59843;59844;59845;59846 76118;76119;76120;76121;76122;76123;76124 76123 7 DKYEPAAVSEQGDKK Unmodified 1663.8053 0.80532952 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 16.348 16.348 2;3 3.2209E-08 8614 QUIQUE_C1438_190116_001 125.67 99.941 508840000 0 0 0 24445000 129510000 0 140360000 0 9963300 0 186930000 0 17635000 6698 1872 6276 59847;59848;59849;59850;59851;59852 76125;76126;76127;76128;76129;76130 76126 6 DKYPNLQVIGGNVVTAAQAK Unmodified 2085.1219 0.12185306 2040 P12268;H0Y4R1 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 100.65 100.65 2;3 0.00010169 104684 QUIQUE_C1218_190116_001 70.121 62.105 272280000 62211000 52938000 54426000 43728000 0 0 0 58975000 0 0 0 0 0 6699 2040 6277 59853;59854;59855;59856;59857;59858 76131;76132;76133;76134;76135;76136 76131 5 DKYVAEFLEWAK Unmodified 1497.7504 0.75038083 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 1 1 1 130.12 130.12 3 0.0068562 134734 QUIQUE_C1368_190116_001 58.098 48.047 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6700 4631 6278 59859;59860 76137;76138 76138 2 DKYVAEFLEWAKPFTQLVK Unmodified 2311.2253 0.22525549 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 2 1 162.68 162.68 3 0.049174 167019 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.138 37.24 101490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 101490000 0 6701 4631 6279 59861 76139 76139 1 DLAADPLNRR Unmodified 1139.6047 0.60471964 4310 Q9NVT9;E5RJ86;E9PR92;E5RHK3 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 38.616 38.616 3 0.047026 35093 QUIQUE_DMIX3_190116_001 27.481 1.4385 54267000 0 0 0 0 0 0 0 0 10561000 0 43706000 0 0 6702 4310 6280 59862;59863 76140;76141 76140 2 DLAAFDK Unmodified 778.38612 0.38611924 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 47.903 47.903 2 0.060724 44859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.176 16.493 73217000 0 0 0 0 0 0 0 73217000 0 0 0 0 0 6703 1977 6281 59864 76142 76142 1 DLAALEDK Unmodified 873.44436 0.4443624 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 48.69 48.69 1;2 0.011168 46880 QUIQUE_C1218_190116_001 90.308 48.08 5691300000 826830000 1311500000 326360000 1144500000 0 1008300000 267470000 185750000 138610000 481930000 0 0 0 6704 267;275;3025 6282 59865;59866;59867;59868;59869;59870;59871;59872;59873;59874;59875;59876;59877 76143;76144;76145;76146;76147;76148;76149;76150;76151;76152;76153;76154;76155;76156;76157;76158 76143 10 DLAALEDKVK Unmodified 1100.6077 0.60773933 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 59.961 59.961 2;3 0.008794 59018 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.314 21.439 1979600000 0 27018000 0 16169000 41769000 0 0 134370000 144580000 0 1615700000 0 0 6705 267;275;3025 6283 59878;59879;59880;59881;59882;59883;59884 76159;76160;76161;76162;76163;76164;76165 76162 7 DLAALGDK Unmodified 801.42323 0.42323303 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 39.045 39.045 1;2 0.017005 35487 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.241 10.945 3990600000 0 0 0 345990000 795130000 694780000 0 264120000 492980000 0 708130000 0 689450000 6706 267;275;3025 6284 59885;59886;59887;59888;59889;59890;59891 76166;76167;76168;76169;76170;76171;76172;76173 76170 7 DLAALGDKVNSLGETAER Unmodified 1857.9432 0.94321999 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 92.885 92.885 2;3 2.1357E-38 94260 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.26 126.98 6538100000 0 0 101280000 0 245770000 0 0 1378400000 819720000 0 1420700000 1158700000 1413500000 6707 267;275;3025 6285 59892;59893;59894;59895;59896;59897;59898;59899;59900;59901;59902 76174;76175;76176;76177;76178;76179;76180;76181;76182;76183;76184;76185;76186;76187;76188;76189;76190;76191 76176 17 DLADELALVDVIEDK Unmodified 1656.8458 0.84579735 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8;F5GZQ4 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 0 3 4 3 3 2 2 4 3 3 3 5 3 3 167.98 167.98 2;3 1.2269E-35 170384 QUIQUE_C1368_190116_001 191.26 166.4 28722000000 2946400000 3251400000 4412100000 2689900000 2278200000 2217100000 2150600000 955650000 1043600000 1261800000 2073900000 1782400000 1659300000 6708 1775 6286 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59944;59945;59946;59947;59948;59949;59950;59951;59952;59953;59954;59955;59956;59957;59958;59959 76244;76245;76246;76247;76248;76249;76250;76251;76252;76253;76254;76255;76256;76257;76258;76259 76259 14 DLADIAAFFR Unmodified 1137.5819 0.58185893 1674 O75962 TRIO Triple functional domain protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.76 161.76 2 0.000957 167033 QUIQUE_C1368_190116_001 103.56 69.767 102960000 0 15448000 11884000 13844000 0 0 0 10564000 12217000 3741700 18748000 16513000 0 6710 1674 6288 59960;59961;59962;59963;59964;59965;59966;59967;59968;59969;59970;59971;59972 76260;76261;76262;76263;76264;76265;76266;76267;76268;76269;76270;76271;76272 76263 11 DLADLAAYTALK Unmodified 1263.6711 0.67106787 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.31 131.31 2 0.0032982 135706 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.958 65.629 407190000 42041000 48028000 37778000 0 40714000 33734000 0 0 57965000 30120000 81714000 35098000 0 6711 1492 6289 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DLAGIIAIQR Unmodified 1068.6291 0.62914348 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.76 105.76 2 0.00037936 110413 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.27 80.913 235090000 26160000 28007000 15334000 12843000 18798000 12953000 15119000 14502000 16026000 7529000 34397000 17919000 15502000 6722 2021 6300 60050;60051;60052;60053;60054;60055;60056;60057;60058;60059;60060;60061;60062 76368;76369;76370;76371;76372;76373;76374;76375;76376;76377;76378;76379;76380;76381;76382 76380 15 DLAGSIIGK Unmodified 872.49673 0.49673232 2735 P61978;S4R359 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.89 71.89 1;2 0.0002938 72846 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.88 71.329 10685000000 975280000 954070000 893530000 927280000 881900000 756190000 742840000 673150000 819790000 356850000 986790000 781930000 934930000 6723 2735 6301 60063;60064;60065;60066;60067;60068;60069;60070;60071;60072;60073;60074;60075;60076;60077;60078;60079;60080;60081;60082;60083;60084;60085;60086;60087;60088 76383;76384;76385;76386;76387;76388;76389;76390;76391;76392;76393;76394;76395;76396;76397;76398;76399;76400;76401;76402;76403;76404;76405;76406;76407;76408;76409;76410 76406 15 DLAHQFTQVQR Unmodified 1341.6789 0.67894722 2283 P28907;H0Y950 CD38 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 1 56.917 56.917 2;3 0.00013412 54845 QUIQUE_C1368_190116_001 102.4 79.024 485510000 83412000 61060000 98168000 0 0 78586000 63642000 14912000 47784000 37948000 0 0 0 6724 2283 6302 60089;60090;60091;60092;60093;60094;60095;60096;60097;60098;60099;60100 76411;76412;76413;76414;76415;76416;76417;76418;76419;76420;76421;76422;76423;76424;76425 76415 11 DLAILQCHGELDPMVPVR Unmodified 2062.034 0.033966025 1726 O95372;Q5QPQ0;Q5QPQ1 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 123.75 123.75 3 0.00049355 126409 QUIQUE_C1563_190116_001 61.821 53.22 421840000 78252000 76892000 0 0 45280000 40756000 0 31095000 0 0 60556000 0 89008000 6725 1726 6303 60101;60102;60103;60104;60105;60106;60107;60108 76426;76427;76428;76429;76430;76431;76432;76433 76429 3 DLAILQCHGELDPMVPVR Oxidation (M) 2078.0289 0.028880648 1726 O95372;Q5QPQ0;Q5QPQ1 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 1 0 1 110.09 110.09 3 0.00029546 113137 QUIQUE_C1403_190116_001 64.52 54.94 28811000 0 0 0 28811000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6726 1726 6303 60109 76434;76435 76434 941 2 DLALAIR Unmodified 770.46504 0.46503826 2421 P40121;E7ENU9;B8ZZL6 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.186 69.186 2 0.019712 69115 QUIQUE_C1277_190116_001 110.54 0 1488400000 125430000 156250000 0 105700000 0 119750000 134150000 0 169960000 157550000 212720000 137900000 168960000 6727 2421 6304 60110;60111;60112;60113;60114;60115;60116;60117;60118;60119 76436;76437;76438;76439;76440;76441;76442;76443;76444;76445;76446;76447;76448;76449;76450;76451 76438 16 DLALGLVPGDR Unmodified 1124.619 0.61897272 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 104.31 104.31 2 0.0045129 101305 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.749 34.466 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6728 271 6305 60120;60121;60122 76452;76453;76454 76454 3 DLAMMIHDQGDLIDSIEANVESSEVHVER Unmodified 3251.5075 0.5074563 3521 Q86Y82 STX12 Syntaxin-12 yes yes 0 0 0 1 1 162.62 162.62 4 7.3437E-13 167112 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.951 61.985 55970000 0 0 0 0 0 0 14515000 0 41455000 0 0 0 0 6729 3521 6306 60123;60124 76455;76456 76456 2 DLAMMIHDQGDLIDSIEANVESSEVHVER Oxidation (M) 3267.5024 0.50237092 3521 Q86Y82 STX12 Syntaxin-12 yes yes 0 1 0 1 162.33 162.33 4 1.1648E-15 167170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.63 72.418 35649000 0 0 0 0 0 0 0 0 35649000 0 0 0 0 6730 3521 6306 60125 76457 76457 2681 1 DLAMVASDMMVLLK Unmodified 1535.7761 0.77614335 4211 Q9HB40;I3L4Z3 SCPEP1 Retinoid-inducible serine carboxypeptidase yes no 0 0 0 1 1 170.7 170.7 2 0.003589 173498 QUIQUE_C1403_190116_001 85.813 29.18 34912000 0 0 0 17355000 0 0 0 0 17556000 0 0 0 0 6731 4211 6307 60126;60127 76458;76459 76458 1 DLANDIMTLMSHTKPYIR Unmodified 2118.0602 0.060180776 1437 O14617;A0A2R8Y4J3 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 151.55 151.55 4 5.7596E-05 158788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.479 78.166 103280000 0 0 0 0 0 0 0 0 16454000 0 50609000 36222000 0 6732 1437 6308 60128;60129;60130 76460;76461;76462;76463 76461 3 DLAPIGIR Unmodified 853.50215 0.50215205 3969 Q99714 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.64 68.64 2 0.0076993 68632 QUIQUE_C1368_190116_001 97.071 21.802 3671600000 307760000 296740000 312340000 244630000 247920000 276220000 284610000 262090000 278210000 102630000 373050000 323300000 362100000 6733 3969 6309 60131;60132;60133;60134;60135;60136;60137;60138;60139;60140;60141;60142;60143 76464;76465;76466;76467;76468;76469;76470;76471;76472;76473;76474;76475;76476;76477;76478;76479 76466 16 DLAPPSEPSESFQEHTVDGENQIVFTHR Unmodified 3165.4639 0.46393523 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 97.403 97.403 4 0.00011153 99875 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.743 37.078 401200000 0 0 0 0 0 71235000 0 42324000 127690000 95270000 0 0 64672000 6734 2233 6310 60144;60145;60146;60147;60148;60149 76480;76481;76482;76483;76484;76485;76486;76487;76488 76484 9 DLAQAPDMQGGHAVLIASEEQFK Unmodified 2454.1849 0.1849236 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 109.46 109.46 2;3 1.268E-08 114447 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.05 115.64 1473300000 93663000 107960000 151990000 122850000 104620000 116610000 144520000 0 249100000 0 0 147160000 234870000 6735 57 6311 60150;60151;60152;60153;60154;60155;60156;60157;60158;60159;60160;60161 76489;76490;76491;76492;76493;76494;76495;76496;76497;76498;76499;76500;76501 76498 13 DLAQAPDMQGGHAVLIASEEQFK Oxidation (M) 2470.1798 0.17983822 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 93.265 93.265 3 1.7958E-08 96275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.949 69.821 330680000 0 0 43735000 0 0 0 0 0 130280000 44582000 56985000 0 55096000 6736 57 6311 60162;60163;60164;60165;60166;60167 76502;76503;76504;76505;76506;76507 76504 46 6 DLAQLAEQSSTAAELAHILQEPHFQSLLETHDSVASK Unmodified 4013.9971 0.99705306 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;E5RI47;A0A087WVY2;E5RK50;E5RJK0;E5RK44;E5RI32;E5RIU3 MPP2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 154.59 154.59 4;5 3.048E-70 157477 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.45 121.13 2866100000 0 184650000 0 89844000 50390000 0 129960000 1005500000 473500000 0 461050000 346980000 124200000 6737 159 6312 60168;60169;60170;60171;60172;60173;60174;60175;60176;60177;60178;60179 76508;76509;76510;76511;76512;76513;76514;76515;76516;76517;76518;76519 76513 8 DLAQYDAAHHEEFKR Unmodified 1828.8493 0.84926002 2877 Q02818;C9JKZ2;H7BZI1 NUCB1 Nucleobindin-1 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 31.123 31.123 3;4 0.0004418 25906 QUIQUE_C1277_190116_001 68.257 56.341 611390000 93192000 114490000 89072000 32769000 98359000 29806000 82570000 0 0 17289000 53839000 0 0 6738 2877 6313 60180;60181;60182;60183;60184;60185;60186;60187;60188;60189;60190;60191;60192;60193 76520;76521;76522;76523;76524;76525;76526;76527;76528;76529;76530;76531;76532;76533;76534 76523 15 DLARPGEITQSQAFDFEFTHVEKPYESYTGQNVK Unmodified 3930.8701 0.87006163 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 2 1 1 2 1 116.21 116.21 4;5 1.237E-29 120346 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.485 82.01 369280000 0 0 0 0 0 0 0 50553000 62298000 0 188330000 68100000 0 6739 3234 6314 60194;60195;60196;60197;60198 76535;76536;76537;76538;76539 76536 4 DLASGAVPTNLKPSK Unmodified 1496.8199 0.81985737 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 3 1 2 1 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S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 2 2 1 1 1 43.894 43.894 3 0.0018909 41434 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.05 59.161 187010000 0 0 0 0 0 0 0 71685000 0 0 0 65060000 50265000 6777 2329 6351 60501;60502;60503;60504;60505 76933;76934;76935;76936;76937 76933 5 DLDLVQTWNLEK Unmodified 1472.7511 0.75110911 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4;E9PLY5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 133.08 133.08 2 0.027675 139895 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.194 36.603 34258000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34258000 0 0 6778 1187 6352 60506 76938 76938 1 DLDPEVFQR Unmodified 1117.5404 0.54038805 3312 Q5T4S7;A0A0A0MSW0;X6RE05 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 1 80.649 80.649 2 0.064833 83271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.245 33.508 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6779 3312 6353 60507 76939 76939 1 DLDQASLAAVSQQLAPR Unmodified 1781.9272 0.92717599 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 127.46 127.46 2;3 3.0832E-44 132471 QUIQUE_C1368_190116_001 169.62 146.01 1203200000 121990000 77445000 105790000 97225000 90064000 73033000 70157000 118840000 112820000 47537000 107730000 75749000 104810000 6780 4600 6354 60508;60509;60510;60511;60512;60513;60514;60515;60516;60517;60518;60519;60520;60521;60522;60523;60524;60525 76940;76941;76942;76943;76944;76945;76946;76947;76948;76949;76950;76951;76952;76953;76954;76955;76956;76957;76958;76959 76945 18 DLDSGHVVCKAAR Unmodified 1426.6987 0.69869638 4692 yes no 0 0 1 1 42.917 42.917 3 0.058369 39973 QUIQUE_C1576_190116_001 28.806 4.9549 307940000 0 0 0 0 0 0 307940000 0 0 0 0 0 0 + 6781 4692 6355 60526 76960 76960 1 DLDSQTMMVLVNYIFFK 2 Oxidation (M) 2095.0006 0.0006002115 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 2 0 1 2 1 1 1 168.59 168.59 2;3 2.1949E-22 173570 QUIQUE_C1368_190116_001 143.79 118.94 117800000 0 21885000 42062000 0 20863000 0 28714000 0 0 4273700 0 0 0 6782 1800 6356 60527;60528;60529;60530;60531;60532 76961;76962;76963;76964;76965;76966;76967 76963 1023;1024 7 DLDSQTMMVLVNYIFFK Oxidation (M) 2079.0057 0.0056855894 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 1 0 1 1 1 1 176.93 176.93 2 8.3262E-07 183686 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.06 94.787 98458000 0 7480900 9223700 0 0 0 0 0 0 0 68471000 0 13282000 6783 1800 6356 60533;60534;60535;60536 76968;76969;76970;76971;76972;76973 76971 1023;1024 6 DLDSQTMMVLVNYIFFK Unmodified 2063.0108 0.010770967 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 2 1 179.83 179.83 2;3 1.186E-17 186444 QUIQUE_DMIX5_190116_001 172.92 151.29 87605000 0 0 0 0 0 0 0 8367900 0 0 70250000 8987500 0 6784 1800 6356 60537;60538;60539;60540 76974;76975;76976;76977;76978;76979 76976 6 DLDTGEEVTR Unmodified 1133.52 0.52004654 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.553 35.553 2 0.0077984 30625 QUIQUE_C1368_190116_001 72.643 34.557 490750000 49581000 53618000 63635000 49871000 53130000 67327000 71098000 0 37704000 0 0 44789000 0 6785 3049 6357 60541;60542;60543;60544;60545;60546;60547;60548;60549 76980;76981;76982;76983;76984;76985;76986;76987;76988 76982 7 DLDVAILVGSMPR Oxidation (M) 1400.7334 0.73335055 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 1 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 2 2 1 122.96 122.96 2;3 0.00032119 127187 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.13 94.899 3912000000 296870000 488300000 0 187510000 311310000 318850000 268740000 321220000 390940000 218770000 324700000 394060000 390760000 6786 720;2430;740 6358 60550;60551;60552;60553;60554;60555;60556;60557;60558;60559;60560;60561;60562;60563;60564;60565;60566;60567;60568;60569 76989;76990;76991;76992;76993;76994;76995;76996;76997;76998;76999;77000;77001;77002;77003;77004;77005;77006;77007;77008;77009;77010;77011;77012;77013;77014;77015;77016;77017;77018;77019;77020;77021;77022;77023;77024;77025;77026 77023 432 38 DLDVAILVGSMPR Unmodified 1384.7384 0.73843593 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 5 3 2 147.16 147.16 2;3 3.4898E-17 152783 QUIQUE_C1218_190116_001 162.38 133.42 8058000000 883050000 684890000 614170000 391420000 643140000 526160000 554890000 421870000 722390000 132010000 1039400000 918850000 525810000 6787 720;2430;740 6358 60570;60571;60572;60573;60574;60575;60576;60577;60578;60579;60580;60581;60582;60583;60584;60585;60586;60587;60588;60589;60590;60591;60592;60593;60594;60595;60596;60597;60598;60599 77027;77028;77029;77030;77031;77032;77033;77034;77035;77036;77037;77038;77039;77040;77041;77042;77043;77044;77045;77046;77047;77048;77049;77050;77051;77052;77053;77054;77055;77056;77057;77058;77059;77060;77061;77062;77063;77064;77065;77066;77067;77068;77069;77070;77071 77029 43 DLDVITIPSK Unmodified 1099.6125 0.61249036 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 93.822 93.822 2 0.006758 96494 QUIQUE_C1368_190116_001 74.165 48.226 458190000 70312000 0 81848000 0 49891000 0 85207000 0 0 0 56478000 48242000 66212000 6788 1377 6359 60600;60601;60602;60603;60604;60605;60606;60607 77072;77073;77074;77075;77076;77077;77078;77079;77080 77074 9 DLDVITIPSKDVVMVHEPK Unmodified 2134.1344 0.13439158 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 1 1 1 1 100.75 100.75 3 0.00046494 103759 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.83 58.228 130840000 0 0 0 0 0 0 0 52735000 35453000 0 42651000 0 0 6789 1377 6360 60608;60609;60610 77081;77082;77083 77082 3 DLDVVVVSVAGAFR Unmodified 1445.7878 0.78782897 3355 Q6DD88;F5H6I7;F5GWF8 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 0 1 155.03 155.03 2 0.016708 150134 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.404 43.789 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6790 3355 6361 60611 77084 77084 1 DLDYYGTLLK Unmodified 1199.6074 0.60740498 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 114.53 114.53 2 0.019683 117792 QUIQUE_C1403_190116_001 60.019 39.394 403640000 0 220570000 0 183070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6791 2938 6362 60612;60613 77085;77086;77087 77086 3 DLDYYGTLLKK Unmodified 1327.7024 0.702368 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 87.245 87.245 3 0.028443 88876 QUIQUE_DMIX7_190116_001 37.18 25.967 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6792 2938 6363 60614 77088 77088 1 DLEAAGAER Unmodified 930.44067 0.44067401 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 21.868 21.868 2 0.025868 14906 QUIQUE_C1218_190116_001 58.981 20.189 52284000 52284000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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77090;77091;77092;77093;77094;77095;77096;77097;77098;77099;77100;77101;77102;77103;77104;77105;77106;77107;77108;77109;77110;77111;77112;77113;77114;77115;77116;77117;77118;77119;77120;77121;77122;77123;77124;77125;77126;77127;77128;77129;77130;77131;77132;77133;77134;77135;77136;77137;77138;77139;77140;77141;77142;77143;77144;77145;77146;77147;77148;77149;77150;77151;77152;77153;77154;77155;77156;77157;77158;77159;77160;77161;77162;77163 77139 73 DLEAEHVEVEDTTLNR Unmodified 1868.8752 0.8752 4157 Q9H3K6;A0A087WZT3;H3BV85;H3BTW0;A0A0B4J295;H3BVE0 BOLA2;BOLA2B BolA-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 70.91 70.91 2;3 1.1836E-05 71077 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.508 68.08 472080000 0 54383000 0 0 65390000 39801000 52298000 0 83546000 0 97993000 78674000 0 6795 4157 6366 60653;60654;60655;60656;60657;60658;60659;60660 77164;77165;77166;77167;77168;77169;77170;77171 77171 4 DLEAHIDSANK Unmodified 1211.5782 0.57823012 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.915 26.915 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77183;77184;77185;77186;77187;77188;77189;77190;77191;77192;77193;77194;77195;77196;77197 77185 14 DLEALMFDR Unmodified 1108.5223 0.52229515 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 131.13 131.13 2 2.2774E-06 127729 QUIQUE_DMIX4_190116_001 152.63 82.363 4862900000 309210000 335810000 443160000 465270000 228020000 438250000 345770000 361970000 393590000 178990000 417100000 399010000 546710000 6799 2400 6370 60686;60687;60688;60689;60690;60691;60692;60693;60694;60695;60696;60697;60698;60699 77198;77199;77200;77201;77202;77203;77204;77205;77206;77207;77208;77209;77210;77211;77212;77213;77214;77215;77216;77217;77218;77219;77220;77221;77222;77223;77224 77218 27 DLEALMFDR Oxidation (M) 1124.5172 0.51720977 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.886 95.886 2 0.010894 97120 QUIQUE_C1563_190116_001 76.679 50.785 304380000 0 33352000 38198000 31195000 0 42131000 0 0 41151000 0 35517000 30466000 52368000 6800 2400 6370 60700;60701;60702;60703;60704;60705;60706;60707 77225;77226;77227;77228;77229;77230;77231;77232 77228 1804 8 DLEALVTDK Unmodified 1002.5233 0.523341 3115 Q15124 PGM5 Phosphoglucomutase-like protein 5 yes yes 0 0 0 1 85.216 85.216 2 0.03976 87456 QUIQUE_C1576_190116_001 68.016 20.273 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6801 3115 6371 60708 77233 77233 1 DLEAPEVQESYR Unmodified 1434.6627 0.66268803 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 69.558 69.558 2 0.00054247 68799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.096 55.904 25092000 0 0 0 0 0 0 0 25092000 0 0 0 0 0 6802 7 6372 60709;60710 77234;77235 77235 2 DLEAQIEAANK Unmodified 1200.5986 0.59863121 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 74.965 74.965 2 0.0013802 70957 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.716 11.447 33938000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33938000 0 0 0 6803 2379 6373 60711;60712 77236;77237;77238 77237 3 DLEASIAR Unmodified 873.4556 0.45559579 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 1 45.869 45.869 2 0.046189 42674 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.77 45.31 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6804 3053 6374 60713;60714;60715 77239;77240;77241 77240 3 DLECVTNLQEVAR Unmodified 1545.7457 0.74570615 4748 X6R5C5;X6R8A1;P10619;Q5JZH0 CTSA Carboxypeptidase;Lysosomal protective protein;Lysosomal protective protein 32 kDa chain;Lysosomal protective protein 20 kDa chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.792 94.792 2 3.1358E-06 96888 QUIQUE_C1403_190116_001 128.01 93.483 224070000 0 48261000 46408000 50445000 0 0 0 0 0 26988000 0 51966000 0 6805 4748 6375 60716;60717;60718;60719;60720 77242;77243;77244;77245;77246 77244 5 DLEDIVGGGEYKPDK Unmodified 1633.7835 0.78353145 313 A0A0U1RQT8;Q8TCZ2;H0Y4H3 CD99L2 CD99 antigen-like protein 2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 84.781 84.781 2;3 1.767E-35 87168 QUIQUE_C1218_190116_001 176.51 146.76 468940000 209740000 81516000 0 82492000 0 72092000 0 0 0 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493 A0A3B3ISS9;P01241;A0A087WUG6;H0YM39;P0DML3;P0DML2 GH1;CSH1;CSH2 Somatotropin;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 137.13 137.13 2;3 1.4786E-37 142017 QUIQUE_C1218_190116_001 192.26 155.57 2841300000 2594600000 0 0 118210000 18603000 0 109960000 0 0 0 0 0 0 6819 493 6388 60812;60813;60814;60815;60816 77349;77350;77351;77352;77353;77354 77349 6 DLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEK Unmodified 2829.359 0.35898438 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 175.7 175.7 3 5.8249E-54 180043 QUIQUE_C1368_190116_001 145.61 138.65 756730000 11417000 29546000 146840000 16019000 49826000 16312000 0 16240000 72213000 0 272240000 83186000 42889000 6820 3779 6389 60817;60818;60819;60820;60821;60822;60823;60824;60825;60826;60827 77355;77356;77357;77358;77359;77360;77361;77362;77363;77364;77365;77366;77367;77368;77369 77357 15 DLEEILYTLGLHLSR Unmodified 1770.9516 0.95159983 3545 Q8IX12;A0A0C4DGG8;H0YFJ7 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 169.53 169.53 2;3 3.3952E-06 175572 QUIQUE_C1438_190116_001 100.45 74.736 125290000 17724000 17576000 0 11119000 46196000 0 18895000 0 13781000 0 0 0 0 6821 3545 6390 60828;60829;60830;60831;60832;60833;60834;60835;60836 77370;77371;77372;77373;77374;77375;77376;77377;77378 77375 9 DLEEKLETLR Unmodified 1244.6612 0.66123147 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 78.956 78.956 2;3 0.0002526 79907 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.943 66.419 635580000 0 0 0 0 27469000 0 18278000 180630000 170380000 0 109750000 37517000 91558000 6822 890;3052 6391 60837;60838;60839;60840;60841;60842;60843;60844;60845;60846 77379;77380;77381;77382;77383;77384;77385;77386;77387;77388;77389 77381 10 DLEELEVILRD Unmodified 1342.698 0.6980109 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 151.16 151.16 2 0.0010642 156142 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.89 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77405;77406;77407;77408;77409;77410;77411;77412;77413;77414;77415;77416;77417;77418;77419;77420 77405 16 DLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERPQR Unmodified 2997.388 0.38797632 2244 P25786;F5GX11 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1 yes no 0 0 1 1 160.73 160.73 3 1.8712E-38 165198 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.87 121.49 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6826 2244 6395 60870 77421 77421 1 DLEGLSQR Unmodified 916.46141 0.46140945 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 39.809 39.809 2 0.026319 35752 QUIQUE_C1277_190116_001 70.69 24.027 356810000 0 91792000 0 158760000 0 0 0 106260000 0 0 0 0 0 6827 2378 6396 60871;60872;60873 77422;77423;77424 77422 1 DLEGQLSDLEQR Unmodified 1401.6736 0.67358707 3523 Q86YM7;Q86YM6 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 106.08 106.08 2 0.0095314 111119 QUIQUE_C1438_190116_001 82.261 46.816 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6828 3523 6397 60874 77425 77425 1 DLEGSDIDTR Unmodified 1119.5044 0.50439647 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.759 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1538.7075 0.70752973 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.99 153.99 2 0.00051669 159466 QUIQUE_C1218_190116_001 94.616 59.105 287510000 42258000 33648000 32133000 30448000 18410000 26128000 23173000 17727000 0 7981200 26919000 0 28679000 6842 4487 6411 60966;60967;60968;60969;60970;60971;60972;60973;60974;60975;60976 77542;77543;77544;77545;77546;77547;77548;77549;77550;77551;77552;77553;77554;77555;77556;77557 77542 15 DLEQLEHIHEQQCEVK Unmodified 2033.9477 0.94765344 4706 yes no 0 0 0 1 99.389 99.389 3 0.050751 101742 QUIQUE_C1403_190116_001 28.956 20.462 61167000 0 0 0 61167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 6843 4706 6412 60977 77558 77558 1 DLEQTDKAPEQK Unmodified 1400.6783 0.6783381 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 16.514 16.514 2;3 2.6088E-27 9477 QUIQUE_C1218_190116_001 183.03 137.43 1881200000 158580000 197350000 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77635;77636;77637;77638;77639;77640;77641;77642;77643;77644;77645 77644 11 DLEVVEGSAARFDCK Unmodified 1694.7934 0.79338463 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 1 1 1 1 1 165.78 165.78 3 0.0033414 170516 QUIQUE_C1218_190116_001 44.457 9.772 148780000 35421000 0 0 54630000 34648000 24085000 0 0 0 0 0 0 0 6853 3154 6422 61055;61056;61057;61058 77646;77647;77648;77649 77646 4 DLFAEGLLEFLR Unmodified 1421.7555 0.7554662 1721 O95295 SNAPIN SNARE-associated protein Snapin yes yes 0 0 0 1 173.5 173.5 2 0.011682 177613 QUIQUE_C1218_190116_001 71.349 52.078 5063500 5063500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6854 1721 6423 61059 77650 77650 1 DLFAEGLLEFLRPAVQQLDSHVHAVR Unmodified 2959.5668 0.56682458 1721 O95295 SNAPIN SNARE-associated protein Snapin yes yes 0 0 1 1 1 166.41 166.41 4 5.0891E-11 173662 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.717 72.556 91868000 0 0 0 0 0 0 0 0 64075000 0 27793000 0 0 6855 1721 6424 61060;61061 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1 DLFEDELVPLFEK Unmodified 1592.7974 0.7973906 1581 O60506;B7Z645;F6UXX1 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.22 166.22 2 0.00031027 170797 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.93 85.546 3172700000 0 305950000 812350000 277130000 297290000 0 253200000 0 270010000 90639000 235410000 311410000 319360000 6860 1581 6429 61100;61101;61102;61103;61104;61105;61106;61107;61108;61109 77736;77737;77738;77739;77740;77741;77742;77743;77744;77745;77746 77741 11 DLFELLVACVAK Unmodified 1376.7374 0.7373733 3328 Q5TH69 ARFGEF3 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 169.95 169.95 2 0.0018106 172928 QUIQUE_C1403_190116_001 78.934 49.461 10732000 0 0 4553700 3616100 0 0 0 0 0 2562200 0 0 0 6861 3328 6430 61110;61111;61112;61113 77747;77748;77749;77750 77748 4 DLFELLVACVAKPTETISR Unmodified 2161.1453 0.14529061 3328 Q5TH69 ARFGEF3 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3 yes yes 0 0 1 1 163.47 163.47 3 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1258.6459 0.64585618 3837 Q96DV4 MRPL38 39S ribosomal protein L38, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 88.066 88.066 3 0.00012292 89835 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.28 103.08 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6865 3837 6433 61133;61134;61135;61136 77770;77771;77772;77773 77773 4 DLFIDGR Unmodified 834.42357 0.42356738 319;1097 G5E9G7;Q9P2S2;A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN2;NRXN3 Neurexin-2;Neurexin-3 no no 0 0 0 1 72.295 72.295 2 0.050661 72185 QUIQUE_C1277_190116_001 74.415 16.169 41393000 0 41393000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6866 1097;319 6434 61137 77774 77774 1 DLFLQGAYDTVR Unmodified 1396.6987 0.69867961 4436 Q9UHL4 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.5 117.5 2 0.00032274 122792 QUIQUE_C1218_190116_001 134.68 114.91 1191000000 93693000 124030000 100480000 88105000 126870000 75313000 128400000 78556000 72019000 59372000 0 114930000 129190000 6867 4436 6435 61138;61139;61140;61141;61142;61143;61144;61145;61146;61147;61148;61149 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61443;61444;61445;61446;61447;61448;61449;61450;61451;61452;61453;61454;61455;61456;61457;61458 78145;78146;78147;78148;78149;78150;78151;78152;78153;78154;78155;78156;78157;78158;78159;78160;78161;78162;78163;78164;78165 78157 18 DLGIPKPFGPQVEEECCLEMHVR Unmodified 2739.2819 0.28187722 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 2 2 3 1 2 2 1 114.62 114.62 3;4 2.2804E-23 118144 QUIQUE_C1403_190116_001 122.3 115.11 1139900000 64059000 88250000 136850000 160640000 85553000 242170000 286800000 0 0 0 0 0 75600000 6903 4560 6471 61459;61460;61461;61462;61463;61464;61465;61466;61467;61468;61469;61470;61471;61472 78166;78167;78168;78169;78170;78171;78172;78173;78174;78175;78176;78177;78178;78179;78180;78181;78182;78183;78184;78185;78186;78187;78188;78189;78190 78173 24 DLGLAQDSATSTK Unmodified 1305.6412 0.64122431 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.301 44.301 2 1.685E-12 41652 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167.02 4 2.2711E-78 174430 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.69 132.1 328280000 0 0 0 0 76012000 0 0 0 86585000 0 165680000 0 0 6906 1501 6474 61499;61500;61501 78220;78221;78222;78223 78223 4 DLGMVTILVQDTDTALK Unmodified 1831.9601 0.96011561 2361 P34913;E5RFU2 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 164.32 164.32 2;3 1.2639E-44 169490 QUIQUE_C1218_190116_001 174.21 150.6 533750000 73346000 60191000 87795000 67766000 0 54776000 42846000 0 46047000 27807000 22884000 0 50291000 6907 2361 6475 61502;61503;61504;61505;61506;61507;61508;61509;61510;61511;61512;61513 78224;78225;78226;78227;78228;78229;78230;78231;78232;78233;78234;78235;78236;78237;78238;78239;78240;78241;78242 78225 18 DLGMVTILVQDTDTALKELEK Oxidation (M) 2347.2192 0.21924342 2361 P34913;E5RFU2 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 1 1 1 1 164.54 164.54 3 3.4752E-06 169272 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78280;78281;78282;78283;78284;78285;78286;78287;78288;78289;78290;78291;78292;78293;78294;78295;78296;78297;78298;78299;78300;78301;78302;78303;78304;78305;78306;78307;78308;78309;78310;78311;78312;78313;78314;78315;78316;78317 78280 37 DLGTQLAPIIQEFFSSEQYR Unmodified 2341.159 0.15902642 2488 P46952;C9IY88 HAAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 175.4 175.4 2;3 4.0811E-23 182375 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.47 135.26 421360000 13765000 24797000 10781000 5646400 30336000 5298200 32079000 58906000 94023000 2802600 65478000 54818000 22632000 6916 2488 6483 61568;61569;61570;61571;61572;61573;61574;61575;61576;61577;61578;61579;61580;61581;61582;61583;61584;61585;61586;61587 78318;78319;78320;78321;78322;78323;78324;78325;78326;78327;78328;78329;78330;78331;78332;78333;78334;78335;78336;78337;78338;78339;78340 78337 21 DLGVFIPAPMAQGMR Unmodified 1601.8058 0.80580399 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YCH5 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 140.69 140.69 2 0.063601 148163 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.37 39.238 50482000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50482000 0 0 6917 798 6484 61588 78341 78341 0 DLGVLGSFIHR Unmodified 1212.6615 0.66150624 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;F5H6Y0 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 116.82 116.82 2;3 0.00072437 121333 QUIQUE_C1218_190116_001 63.408 50.911 112960000 47335000 0 0 0 0 49985000 0 0 0 15641000 0 0 0 6918 462 6485 61589;61590;61591;61592;61593;61594;61595;61596;61597 78342;78343;78344;78345;78346;78347;78348;78349;78350 78342 9 DLGYIYFYQR Unmodified 1336.6452 0.64518747 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.96 123.96 2 1.2824E-11 128588 QUIQUE_C1368_190116_001 163.77 128.55 2305100000 222000000 278660000 234780000 162120000 204950000 149230000 202100000 178060000 206980000 71994000 131430000 146680000 116070000 6919 2472 6486 61598;61599;61600;61601;61602;61603;61604;61605;61606;61607;61608;61609;61610 78351;78352;78353;78354;78355;78356;78357;78358;78359;78360;78361;78362;78363;78364;78365;78366;78367;78368;78369;78370;78371;78372 78354 22 DLHDANTDLIGR Unmodified 1338.6528 0.65279205 2634 P53985;Q5T8R5;Q5T8R3 SLC16A1 Monocarboxylate transporter 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 51.495 51.495 2;3 0.00099347 47128 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 61.473 326790000 36107000 0 0 0 38033000 0 32502000 22741000 41472000 34421000 52593000 26297000 42623000 6920 2634 6487 61611;61612;61613;61614;61615;61616;61617;61618;61619;61620 78373;78374;78375;78376;78377;78378;78379;78380;78381;78382;78383 78378 11 DLHDQFQHQLK Unmodified 1407.6895 0.6895119 65 A0A087WXL6;B7Z879;A0A0G2JS92 VPS11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 35.826 35.826 2;3 0.00077457 31909 QUIQUE_C1218_190116_001 72.187 51.347 253120000 48161000 47588000 0 0 0 25916000 49960000 26539000 54955000 0 0 0 0 6921 65 6488 61621;61622;61623;61624;61625;61626;61627 78384;78385;78386;78387;78388;78389;78390 78384 7 DLHDQFQHQLR Unmodified 1435.6957 0.69565991 4141 Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 38.318 38.318 3 0.00013406 34439 QUIQUE_C1403_190116_001 84.188 62.959 60795000 0 0 24756000 36039000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6922 4141 6489 61628;61629;61630 78391;78392;78393 78392 3 DLHEEMNYITAIIEEQPK Unmodified 2172.0409 0.040885122 2525 P49354;E9PQP6;H0YCW1;E9PN85 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 161.07 161.07 2;3 1.8077E-14 166484 QUIQUE_C1218_190116_001 106.93 103.49 645070000 44556000 46809000 99082000 42006000 38293000 55385000 44712000 50630000 61671000 30698000 48549000 0 82676000 6923 2525 6490 61631;61632;61633;61634;61635;61636;61637;61638;61639;61640;61641;61642;61643 78394;78395;78396;78397;78398;78399;78400;78401;78402;78403;78404;78405;78406;78407;78408 78394 15 DLHESSFSLSGSQIDDHVPK Unmodified 2197.0287 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78631;78632;78633;78634;78635;78636;78637;78638;78639;78640;78641;78642;78643;78644;78645;78646;78647;78648;78649;78650;78651;78652;78653;78654;78655;78656;78657;78658;78659 78641 28 DLIALANTAGEVLLHR Unmodified 1704.9523 0.95226853 807 D6RFM7;D6RAP6;Q9UJX5 ANAPC4 Anaphase-promoting complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 158.08 158.08 3 6.3531E-05 163178 QUIQUE_C1218_190116_001 88.768 77.077 16347000 6844900 0 0 9502000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6939 807 6503 61855;61856 78660;78661 78660 2 DLIDDATNLVQLYHVLHPDGQSAQGAK Unmodified 2917.457 0.45699936 1101 G5E9W7;G5E9V5;P82650 MRPS22 28S ribosomal protein S22, mitochondrial yes no 0 0 0 1 155.61 155.61 4 0.00046987 159966 QUIQUE_C1277_190116_001 38.537 28.115 30731000 0 30731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6940 1101 6504 61857 78662 78662 1 DLIDLMTLWK Unmodified 1246.6631 0.66314572 4265 Q9NRD1;J3KQ72 FBXO6 F-box only protein 6 yes no 0 0 0 1 170.88 170.88 2 0.0031874 173562 QUIQUE_C1403_190116_001 85.731 61.576 9891800 0 0 0 9891800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6941 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0.72237516 2644 P54687;F5H2F2 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.09 121.09 2 0.0021883 124933 QUIQUE_C1403_190116_001 92.732 48.355 457600000 53695000 52999000 48856000 45790000 43329000 68275000 35975000 0 0 0 42700000 32000000 33978000 6965 2644 6527 62094;62095;62096;62097;62098;62099;62100;62101;62102;62103 78942;78943;78944;78945;78946;78947;78948;78949;78950;78951;78952;78953;78954 78945 13 DLIYTLYYWK Unmodified 1376.7016 0.70163972 2062 P13726 F3 Tissue factor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.96 150.96 2 0.00019686 158214 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.92 75.12 1272000000 41698000 74770000 109830000 93930000 61494000 41731000 103550000 109040000 194460000 34915000 152420000 136420000 117780000 6966 2062 6528 62104;62105;62106;62107;62108;62109;62110;62111;62112;62113;62114;62115;62116 78955;78956;78957;78958;78959;78960;78961;78962;78963;78964;78965;78966;78967;78968;78969;78970;78971;78972;78973 78969 19 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3 0.00036146 118106 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.746 66.93 59893000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38022000 0 21871000 6975 1026 6536 62150;62151 79010;79011 79010 2 DLKPENILLDDYGHIR Unmodified 1909.9898 0.98977625 2364 P34947 GRK5 G protein-coupled receptor kinase 5 yes yes 0 0 1 1 1 104.05 104.05 3 0.02665 107950 QUIQUE_DMIX8_190116_001 37.583 20.094 47686000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28912000 0 18774000 6976 2364 6537 62152;62153 79012;79013 79013 1 DLKPENILLDEEGHIK Unmodified 1861.9785 0.97854286 982;2594 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5;D6R910;P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17;A0A2R8Y7S9 RPS6KA2;RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2;Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 no no 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 92.161 92.161 3;4 9.6381E-05 94017 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.643 64.158 1606600000 177100000 226790000 36287000 141360000 176850000 120020000 167130000 128290000 146880000 18050000 118340000 0 149480000 6977 982;2594 6538 62154;62155;62156;62157;62158;62159;62160;62161;62162;62163;62164;62165;62166;62167;62168;62169;62170;62171;62172;62173;62174 79014;79015;79016;79017;79018;79019;79020;79021;79022;79023;79024;79025;79026;79027;79028;79029;79030;79031;79032;79033;79034;79035;79036;79037;79038;79039 79033 25 DLKPENILVTSGGTVK Unmodified 1669.9251 0.92505073 2029 P11802;F8VYH9;F8VTV8;F8VWX7;F8VZ51;F8VXD2;F8VZZ0 CDK4 Cyclin-dependent kinase 4 yes no 0 0 1 1 78.951 78.951 3 0.0074019 75308 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.765 25.626 12051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12051000 0 0 0 6978 2029 6539 62175 79040 79040 1 DLKPENLLIDHQGYIQVTDFGFAK Unmodified 2760.4123 0.412281 167 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1 PRKACB cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta no no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 139.24 139.24 3;4 1.0342E-06 142397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.239 59.963 2533800000 154670000 139190000 338800000 132930000 97764000 0 138620000 317700000 329880000 62045000 360630000 129010000 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type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 83.558 83.558 2;3 1.2877E-09 86154 QUIQUE_C1438_190116_001 150.49 133.76 53836000000 5548200000 6405800000 3706700000 4302400000 4342000000 3241400000 4688100000 3142500000 3230000000 1878900000 4737100000 4627600000 3985300000 6981 803;896;4533;412;3299;3010 6542 62204;62205;62206;62207;62208;62209;62210;62211;62212;62213;62214;62215;62216;62217;62218;62219;62220;62221;62222;62223;62224;62225;62226;62227;62228;62229;62230 79073;79074;79075;79076;79077;79078;79079;79080;79081;79082;79083;79084;79085;79086;79087;79088;79089;79090;79091;79092;79093;79094;79095;79096;79097;79098;79099;79100;79101;79102;79103;79104;79105;79106;79107;79108;79109;79110;79111;79112;79113;79114;79115;79116 79085 44 DLKPENLLLDEK Unmodified 1425.7715 0.7715102 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8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 37.734 37.734 2;3 0.0028872 33652 QUIQUE_C1403_190116_001 68.657 53.343 930110000 88412000 93089000 66227000 83552000 0 82885000 66671000 0 65797000 0 216820000 83454000 83203000 6992 397;2473 6553 62319;62320;62321;62322;62323;62324;62325;62326;62327;62328;62329 79218;79219;79220;79221;79222;79223;79224;79225;79226;79227;79228 79221 7 DLKPSNLLLNTTCDLK Unmodified 1843.9713 0.97134899 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 1 2 3 3 2 2 2 1 102.41 102.41 2;3 5.9351E-18 105100 QUIQUE_DMIX7_190116_001 150.05 0 20409000000 784050000 1846100000 2497800000 1705500000 1582500000 1211000000 1989900000 1450600000 1496800000 493240000 1850900000 2231600000 1268500000 6993 2281 6554 62330;62331;62332;62333;62334;62335;62336;62337;62338;62339;62340;62341;62342;62343;62344;62345;62346;62347;62348;62349;62350;62351;62352;62353;62354;62355;62356 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DDX3X;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.971 38.971 2 0.00061273 35016 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.658 70.063 240210000 0 30505000 31039000 39504000 31965000 30578000 0 0 0 0 26054000 20429000 30134000 7063 266;1504 6622 62949;62950;62951;62952;62953;62954;62955;62956;62957 80008;80009;80010;80011;80012;80013;80014;80015;80016 80016 9 DLMHGLITLMLDSR Unmodified 1613.8269 0.82693336 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 168.57 168.57 2;3 2.4983E-05 174819 QUIQUE_C1438_190116_001 105 93.957 102390000 0 9931500 0 5326600 11627000 0 0 0 0 0 36360000 39144000 0 7064 3037 6623 62958;62959;62960;62961;62962;62963 80017;80018;80019;80020;80021;80022 80019 6 DLMLMSHLQDNIQHADPPVQILYNR Unmodified 2960.4637 0.46368141 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 138.29 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1 2 1 147.85 147.85 2;3 1.1016E-09 152229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 110.38 95.114 1288800000 0 36017000 21446000 14980000 58252000 0 37224000 299560000 276740000 0 218300000 175510000 150730000 7075 845;1936 6629 63077;63078;63079;63080;63081;63082;63083;63084;63085;63086;63087;63088 80155;80156;80157;80158;80159;80160;80161;80162;80163;80164;80165;80166;80167;80168;80169 80168 15 DLMTDLKSEISGDLAR Oxidation (M) 1778.872 0.87202888 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 1 1 1 2 1 1 1 118.44 118.44 3 4.2774E-14 124142 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.63 114.07 441530000 0 0 0 0 0 0 0 100360000 151890000 0 70402000 48164000 70710000 7076 845;1936 6629 63089;63090;63091;63092;63093;63094 80170;80171;80172;80173;80174;80175;80176;80177 80174 493 7 DLMTLPIQNK Unmodified 1171.6271 0.62709457 2203 P22830;K7ELX4;K7EPN2;K7EKP7 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 95.3 95.3 2 0.011083 97851 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.838 50.326 42168000 0 0 0 0 0 0 0 0 42168000 0 0 0 0 7077 2203 6630 63095 80178 80178 1 DLMVGDEASELR Unmodified 1333.6184 0.61838038 2715 P61160 ACTR2 Actin-related protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.301 86.301 2 0.00065504 87491 QUIQUE_C1403_190116_001 99.568 71.826 2750600000 396910000 357300000 317260000 321380000 228650000 237390000 253980000 0 168180000 0 279300000 190240000 0 7078 2715 6631 63096;63097;63098;63099;63100;63101;63102;63103;63104;63105;63106 80179;80180;80181;80182;80183;80184;80185;80186;80187;80188;80189 80182 11 DLMVGDEASELR Oxidation (M) 1349.6133 0.613295 2715 P61160 ACTR2 Actin-related protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 73.067 73.067 2 0.0050775 69819 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.65 48.187 241070000 0 0 68167000 56467000 0 46625000 0 30700000 0 39106000 0 0 0 7079 2715 6631 63107;63108;63109;63110;63111 80190;80191;80192;80193;80194;80195 80195 2144 6 DLMVTASSETSISLIWTK Unmodified 1981.0078 0.0077940794 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 3 12 4 180.48 180.48 2 0.00025615 188450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.543 67.004 167580000 0 0 0 0 0 0 0 0 17891000 0 122730000 26958000 0 7080 3753 6632 63112;63113;63114;63115;63116;63117;63118;63119;63120;63121;63122;63123;63124;63125;63126;63127;63128;63129;63130 80196;80197;80198;80199;80200;80201;80202;80203;80204;80205;80206;80207;80208;80209;80210;80211;80212;80213;80214;80215;80216 80204 20 DLNAAEALQR Unmodified 1099.5622 0.56218613 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 59.591 59.591 2 0.00083867 55100 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.4 62.527 600970000 0 0 0 0 89098000 62211000 87091000 85215000 0 28303000 120140000 128910000 0 7081 1472 6633 63131;63132;63133;63134;63135;63136;63137;63138;63139;63140 80217;80218;80219;80220;80221;80222;80223;80224;80225;80226;80227 80223 9 DLNAVAFR Unmodified 904.47667 0.47666558 490 A0A3B3ISG5;P14735 IDE Insulin-degrading enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 65.312 65.312 2 0.040732 65030 QUIQUE_C1368_190116_001 84.244 14.811 14368000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14368000 0 0 7082 490 6634 63141;63142;63143 80228;80229;80230 80228 3 DLNCVPEIADTLGAVAK Unmodified 1784.8978 0.8978497 1440 O14744;G3V580;G3V2X6;G3V2L6;C9JSX3;G3V507;G3V2F5 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 1 139.92 139.92 2;3 0.00040512 144006 QUIQUE_C1403_190116_001 64.327 60.084 401640000 89930000 68879000 0 19012000 14534000 81214000 72053000 56018000 0 0 0 0 0 7083 1440 6635 63144;63145;63146;63147;63148;63149;63150;63151;63152;63153;63154;63155;63156;63157 80231;80232;80233;80234;80235;80236;80237;80238;80239;80240;80241;80242;80243;80244;80245;80246 80237 15 DLNGIDLTPVQDTPVASR Unmodified 1909.9745 0.97452012 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.18 113.18 2 2.838E-17 117133 QUIQUE_C1368_190116_001 175.6 159.07 628900000 0 0 84776000 56497000 30872000 54471000 56163000 50483000 60082000 23592000 66432000 74908000 70625000 7084 3807 6636 63158;63159;63160;63161;63162;63163;63164;63165;63166;63167;63168;63169 80247;80248;80249;80250;80251;80252;80253;80254;80255;80256;80257;80258 80248 9 DLNHICVINEHGK Unmodified 1547.7515 0.75146023 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 35.449 35.449 3 0.0094006 30776 QUIQUE_C1277_190116_001 40.315 32.064 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7085 4268 6637 63170 80259 80259 1 DLNHLLQQESGNR Unmodified 1522.7488 0.7488177 1479 O15083 ERC2 ERC protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 67.685 67.685 2;3 0.00049722 68820 QUIQUE_C1218_190116_001 105.25 55.884 205060000 36051000 46097000 74672000 0 0 0 0 17248000 0 0 30995000 0 0 7086 1479 6638 63171;63172;63173;63174;63175;63176 80260;80261;80262;80263;80264;80265;80266 80260 7 DLNHVCVISETGK Unmodified 1470.7137 0.71367774 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 47.834 47.834 2;3 4.6383E-41 44713 QUIQUE_C1368_190116_001 227.48 194.49 4270700000 212020000 523170000 456170000 430240000 244270000 203640000 499390000 168390000 157290000 148700000 435900000 252070000 539430000 7087 1787 6639 63177;63178;63179;63180;63181;63182;63183;63184;63185;63186;63187;63188;63189;63190;63191;63192;63193;63194;63195 80267;80268;80269;80270;80271;80272;80273;80274;80275;80276;80277;80278;80279;80280;80281;80282;80283;80284;80285;80286;80287;80288;80289;80290;80291;80292;80293 80273 26 DLNMDCIIAEIK Unmodified 1433.6894 0.68943683 100 A0A087X106;CON__O43790;CON__Q14533;O43790;Q14533;CON__P78386;P78386;F5GYI5 KRT81;KRT86;KRT85 Keratin, type II cuticular Hb6;Keratin, type II cuticular Hb1;Keratin, type II cuticular Hb5 yes no 0 0 0 1 146.2 146.2 2 0.039009 151332 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.641 38.648 30667000 0 0 0 0 0 0 0 0 30667000 0 0 0 0 + 7088 100 6640 63196 80294 80294 0 DLNPDVNVFQR Unmodified 1315.6521 0.65206377 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EM24;K7ELZ6;K7EQW2 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.16 94.16 2 0.00045793 95399 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.52 85.217 1971000000 160970000 130170000 177520000 0 166830000 116620000 154420000 171820000 168050000 81287000 229570000 164020000 249730000 7089 3780 6641 63197;63198;63199;63200;63201;63202;63203;63204;63205;63206;63207;63208 80295;80296;80297;80298;80299;80300;80301;80302;80303;80304;80305;80306;80307 80301 13 DLNQLFQQDSSSR Unmodified 1536.7168 0.71684887 1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2;K7EPP6;A0A0U1RQM4 ERC1 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.463 97.463 2 0.0043039 98820 QUIQUE_C1563_190116_001 69.01 54.038 31220000 0 0 0 0 0 31220000 0 0 0 0 0 0 0 7090 1107 6642 63209;63210;63211;63212 80308;80309;80310;80311 80308 4 DLNSDMDSILASLK Unmodified 1520.7392 0.73922379 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 166.15 166.15 2;3 1.025E-15 171028 QUIQUE_C1218_190116_001 149.38 113.05 4735800000 424500000 322520000 785290000 433000000 267250000 301710000 228930000 197600000 402530000 158280000 418540000 488810000 306840000 7091 1153 6643 63213;63214;63215;63216;63217;63218;63219;63220;63221;63222;63223;63224;63225;63226;63227;63228;63229;63230;63231;63232;63233;63234;63235;63236;63237;63238;63239 80312;80313;80314;80315;80316;80317;80318;80319;80320;80321;80322;80323;80324;80325;80326;80327;80328;80329;80330;80331;80332;80333;80334;80335;80336;80337;80338;80339;80340 80313 25 DLNSDMDSILASLK Oxidation (M) 1536.7341 0.73413841 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 2 124.38 124.38 2 0.003167 120924 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.085 49.621 73173000 0 0 0 0 0 0 0 31193000 0 41979000 0 0 0 7092 1153 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DLNTLAEDLLSSGTFNVDQIVK Unmodified 2391.2169 0.21693523 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 174.12 174.12 2 2.204E-34 181331 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.75 116.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7096 1820 6646 63295 80411 80411 1 DLNVISSLLK Unmodified 1100.6441 0.64412484 3315 Q5T5U3;A0A1B0GV73;A0A087WW76;A0A1B0GTZ9;Q5JSD8;H0Y468 ARHGAP21 Rho GTPase-activating protein 21 yes no 0 0 0 1 1 136.95 136.95 2 0.0034764 141897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.213 48.333 31931000 0 15874000 0 0 0 0 0 0 16057000 0 0 0 0 7097 3315 6647 63296;63297 80412;80413 80413 2 DLNVLTPTGF Unmodified 1075.555 0.55497548 24 A0A087WT18;Q96A73 KIAA1191 Putative monooxygenase p33MONOX yes no 0 0 0 1 1 149.39 149.39 2 0.035136 154427 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.786 38.783 11868000 0 0 0 0 5491500 0 0 0 6376400 0 0 0 0 7098 24 6648 63298;63299 80414;80415 80415 2 DLNYCFSGMSDHR Unmodified 1600.6399 0.63986087 905;2672 E9PCY7;G8JLB6;P31943;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7;P55795 HNRNPH1;HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 73.693 73.693 2;3 0.00070558 73993 QUIQUE_C1368_190116_001 89.805 74.793 3496700000 155250000 303340000 518130000 306250000 225910000 261240000 283430000 309430000 320530000 57561000 237540000 227000000 291110000 7099 905;2672 6649 63300;63301;63302;63303;63304;63305;63306;63307;63308;63309;63310;63311;63312;63313;63314;63315 80416;80417;80418;80419;80420;80421;80422;80423;80424;80425;80426;80427;80428;80429;80430;80431 80419 15 DLNYCFSGMSDHR Oxidation (M) 1616.6348 0.6347755 905;2672 E9PCY7;G8JLB6;P31943;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7;P55795 HNRNPH1;HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 no no 0 1 0 1 1 53.121 53.121 2 0.0017181 51991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.693 72.047 44638000 0 0 0 0 0 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80580;80581;80582;80583;80584;80585;80586;80587;80588;80589;80590;80591;80592;80593;80594;80595;80596;80597;80598;80599;80600;80601;80602;80603;80604;80605;80606;80607;80608;80609;80610;80611 80599 32 DLPNALDEK Unmodified 1013.5029 0.50293991 4308 Q9NVJ2 ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 53.449 53.449 2 0.0018516 50763 QUIQUE_C1563_190116_001 99.442 56.442 418900000 0 0 0 0 114340000 170810000 0 133750000 0 0 0 0 0 7117 4308 6666 63441;63442;63443;63444;63445;63446;63447 80612;80613;80614;80615;80616;80617;80618 80615 6 DLPPILLVR Unmodified 1034.6488 0.64881629 2654 P55011 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 127.05 127.05 2 0.0081474 131019 QUIQUE_C1403_190116_001 79.597 43.717 84149000 16650000 0 21369000 19984000 0 0 0 0 0 0 26146000 0 0 7118 2654 6667 63448;63449;63450;63451 80619;80620;80621;80622;80623 80622 5 DLPPVSGSIIWAK Unmodified 1381.7606 0.76055158 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes 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molecule L1 yes no 0 0 1 2 3 2 2 2 1 2 1 1 1 3 2 2 107.22 107.22 2;3 6.1451E-37 110428 QUIQUE_C1277_190116_001 163.99 145.37 1179900000 80500000 132450000 100700000 61641000 114660000 39197000 181680000 60192000 29529000 0 105600000 102190000 171570000 7133 2345 6682 63572;63573;63574;63575;63576;63577;63578;63579;63580;63581;63582;63583;63584;63585;63586;63587;63588;63589;63590;63591;63592;63593;63594;63595 80783;80784;80785;80786;80787;80788;80789;80790;80791;80792;80793;80794;80795;80796;80797;80798;80799;80800;80801;80802;80803;80804;80805;80806;80807;80808;80809;80810 80787 28 DLQEPEFSAK Unmodified 1162.5506 0.55061839 2555 P50135 HNMT Histamine N-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.745 58.745 2 0.0023978 57177 QUIQUE_C1277_190116_001 90.15 52.592 3237700000 247570000 260960000 327130000 283180000 0 333640000 318450000 438930000 0 0 430750000 0 597060000 7134 2555 6683 63596;63597;63598;63599;63600;63601;63602;63603;63604 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MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 173.2 173.2 2;3 1.7593E-265 175924 QUIQUE_C1403_190116_001 268.09 254.5 4044200000 347460000 394620000 73556000 261540000 353770000 308010000 369560000 555490000 452470000 47896000 511330000 175730000 192730000 7152 307 6699 63764;63765;63766;63767;63768;63769;63770;63771;63772;63773;63774;63775;63776;63777;63778;63779;63780;63781;63782;63783;63784;63785;63786;63787 81008;81009;81010;81011;81012;81013;81014;81015;81016;81017;81018;81019;81020;81021;81022;81023;81024;81025;81026;81027;81028;81029;81030;81031;81032;81033;81034 81016 25 DLSAGAVSAVQCIANPIK Unmodified 1812.9404 0.94038322 3438 Q7L266;A0A087WUG3;A0A087WZI5 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 128.24 128.24 2;3 1.4603E-75 133848 QUIQUE_C1218_190116_001 247.13 209.11 3811600000 314580000 276650000 446690000 351070000 386420000 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63811;63812;63813;63814;63815;63816;63817;63818;63819;63820;63821;63822;63823;63824;63825 81063;81064;81065;81066;81067;81068;81069;81070;81071;81072;81073;81074;81075;81076;81077;81078;81079;81080;81081 81078 14 DLSGLDAETLLK Unmodified 1273.6765 0.67654718 2287 P29350;F5H5H9;F5H1Z8;F5H0N8;F5H1V7;F5H4Z1;F5GXD4;U3KQS1 PTPN6 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.27 122.27 2 0.0018005 126339 QUIQUE_C1403_190116_001 85.958 63.218 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7160 2287 6707 63826;63827;63828;63829;63830;63831 81082;81083;81084;81085;81086;81087 81083 6 DLSHIGDAVVISCAK Unmodified 1583.7977 0.79774172 2032 P12004 PCNA Proliferating cell nuclear antigen yes yes 0 0 0 1 1 83.807 83.807 3 0.00053958 86931 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.403 41.712 87822000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39275000 0 48547000 7161 2032 6708 63832;63833 81088;81089;81090 81088 2 DLSIDDTSQIR Unmodified 1261.615 0.61500956 200 A0A0A0MTS7;A0A0A0MRA3;Q8WZ42 TTN Titin yes no 0 0 0 1 59.791 59.791 2 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81190;81191;81192;81193;81194;81195;81196;81197;81198;81199;81200;81201;81202;81203;81204;81205;81206;81207;81208;81209;81210;81211;81212;81213;81214;81215;81216;81217;81218;81219;81220;81221;81222;81223;81224;81225;81226;81227;81228 81227 37 DLSLSCTTQFLQYFLEK Unmodified 2092.0187 0.018693117 3522 Q86YJ6;C9JU10 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 172.42 172.42 2 1.5709E-16 173961 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.2 134.6 54872000 0 13195000 0 0 15074000 0 0 26603000 0 0 0 0 0 7171 3522 6718 63931;63932;63933 81229;81230;81231 81231 3 DLSQAPFSWPAGALVAQACHAATAALHTHR Unmodified 3154.5519 0.55191957 3360 Q6GMV3 PTRHD1 Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 149.65 149.65 4;5 1.7473E-47 152567 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.32 119.51 967450000 27779000 0 80852000 40514000 44704000 35701000 106230000 159440000 101330000 0 75389000 82407000 213110000 7172 3360 6719 63934;63935;63936;63937;63938;63939;63940;63941;63942;63943;63944;63945 81232;81233;81234;81235;81236;81237;81238;81239;81240;81241;81242;81243;81244;81245 81238 13 DLSQLQENLK Unmodified 1186.6194 0.61936665 3545 Q8IX12 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 77.595 77.595 2 0.0069483 77835 QUIQUE_C1403_190116_001 88.819 52.424 57034000 0 0 0 25588000 0 0 0 31446000 0 0 0 0 0 7173 3545 6720 63946;63947 81246;81247 81246 2 DLSQMLK Unmodified 833.43169 0.43168922 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.953 72.953 2 0.01933 73646 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.54 36.791 6422300000 759290000 781550000 608940000 598150000 397020000 463200000 601990000 275380000 315130000 203700000 515060000 474360000 428570000 7174 273;342 6721 63948;63949;63950;63951;63952;63953;63954;63955;63956;63957;63958;63959;63960 81248;81249;81250;81251;81252;81253;81254;81255;81256;81257;81258;81259;81260;81261;81262;81263 81256 16 DLSQMLKK Unmodified 961.52665 0.52665224 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 1 45.649 45.649 2 0.044952 42177 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.993 13.115 70054000 0 0 0 0 0 0 0 70054000 0 0 0 0 0 7175 273;342 6722 63961;63962 81264;81265 81264 2 DLSSAEAILALFPENFHQNLK Unmodified 2356.2063 0.20631097 4360 Q9P000;E9PJ95 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 162.08 162.08 2;3 1.6454E-06 168530 QUIQUE_C1438_190116_001 107.14 93.736 974850000 0 113760000 0 10535000 130970000 84308000 97913000 110110000 104780000 30457000 97677000 96331000 98011000 7176 4360 6723 63963;63964;63965;63966;63967;63968;63969;63970;63971;63972;63973;63974 81266;81267;81268;81269;81270;81271;81272;81273;81274;81275;81276;81277;81278 81269 12 DLSSHQLNEFLAQTLQR Unmodified 1999.0123 0.012302606 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 3 2 2 2 2 132.34 132.34 2;3 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A;Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member D;Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 77.746 77.746 2 0.012317 78790 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.501 0 518740000 31734000 26614000 0 27418000 0 114560000 83857000 46389000 21448000 43921000 0 122800000 0 7181 1170 6728 64015;64016;64017;64018;64019;64020;64021;64022;64023;64024 81341;81342;81343;81344;81345;81346;81347;81348;81349;81350;81351 81348 10 DLSTIEPLKK Unmodified 1142.6547 0.65468953 1170 H0YN26;P39687;O95626 ANP32A;ANP32D Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A;Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member D yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 49.151 49.151 2;3 0.02796 46806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.229 0 370970000 64790000 39065000 19759000 31055000 108480000 0 0 13033000 20748000 12602000 42681000 0 18758000 7182 1170 6729 64025;64026;64027;64028;64029;64030;64031;64032;64033;64034;64035 81352;81353;81354;81355;81356;81357;81358;81359;81360;81361;81362;81363 81362 11 DLSTPGLEK Unmodified 958.49713 0.49712625 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 43.679 43.679 2 0.0013568 40620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.44 53.539 1130800000 0 0 0 163000000 0 253120000 0 296550000 213530000 0 0 204560000 0 7183 2483 6730 64036;64037;64038;64039;64040;64041;64042 81364;81365;81366;81367;81368;81369;81370 81366 5 DLSTVEALQNLK Unmodified 1329.714 0.71399532 4022 Q9BTT0;E9PPH5 ANP32E Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.2 107.2 2 1.9436E-10 108960 QUIQUE_C1563_190116_001 157.96 116.51 994180000 128940000 90910000 0 85972000 109090000 112760000 93892000 53468000 96145000 45796000 95883000 81327000 0 7184 4022 6731 64043;64044;64045;64046;64047;64048;64049;64050;64051;64052;64053;64054 81371;81372;81373;81374;81375;81376;81377;81378;81379;81380;81381;81382;81383;81384;81385;81386;81387 81376 16 DLSVFEVDGNMSK Oxidation (M) 1455.6552 0.65515981 477 A0A3B3ISW3;A0A3B3ISF5;A0A3B3IT63;A0A3B3IS73;A0A3B3IRI4;A0A3B3IU93;A0A3B3IT19;A0A3B3ITI0;A0A3B3ISI1;Q8WYB5 KAT6B Histone acetyltransferase KAT6B yes no 0 1 0 1 1 160.44 160.44 3 0.010064 165076 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.915 16.108 145170000 0 0 0 0 0 0 0 76016000 69158000 0 0 0 0 7185 477 6732 64055;64056 81388;81389 81389 348 2 DLSYCLSGMYDHR Unmodified 1615.6759 0.67591203 2609 P52597 HNRNPF Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 90.057 90.057 2;3 0.00027988 91983 QUIQUE_C1368_190116_001 111.86 97.697 482150000 30908000 38408000 71188000 70629000 24026000 57529000 39338000 57187000 41231000 12274000 0 0 39436000 7186 2609 6733 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A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 0 0 5 3 4 2 2 3 3 4 3 4 2 4 5 114.51 114.51 1;2 0.0024467 113942 QUIQUE_C1563_190116_001 136.33 80.892 179220000000 15526000000 10013000000 17139000000 11154000000 9979500000 14432000000 17313000000 12184000000 15599000000 7954200000 12423000000 17090000000 18415000000 7188 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6735 64092;64093;64094;64095;64096;64097;64098;64099;64100;64101;64102;64103;64104;64105;64106;64107;64108;64109;64110;64111;64112;64113;64114;64115;64116;64117;64118;64119;64120;64121;64122;64123;64124;64125;64126;64127;64128;64129;64130;64131;64132;64133;64134;64135 81438;81439;81440;81441;81442;81443;81444;81445;81446;81447;81448;81449;81450;81451;81452;81453;81454;81455;81456;81457;81458;81459;81460;81461;81462;81463;81464;81465;81466;81467;81468;81469;81470;81471;81472;81473;81474;81475;81476;81477;81478;81479;81480;81481;81482;81483;81484;81485;81486;81487;81488;81489;81490;81491;81492;81493;81494;81495;81496;81497;81498;81499;81500;81501;81502;81503;81504;81505;81506;81507;81508;81509;81510;81511;81512;81513;81514;81515;81516;81517;81518;81519;81520;81521;81522;81523;81524;81525;81526;81527;81528;81529;81530;81531;81532;81533;81534 81480 88 DLTDYLMK Oxidation (M) 1013.4739 0.47394797 2788;2696;2792;447;2759;458;3261 A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 1 0 2 3 3 2 3 3 2 2 3 1 3 3 3 97.732 97.732 1;2 0.0048797 92611 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.34 136.64 29078000000 1843300000 3517200000 3389000000 2185800000 2708300000 2504300000 2081700000 1306700000 1893100000 1143600000 2670600000 1875500000 1958800000 7189 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6735 64136;64137;64138;64139;64140;64141;64142;64143;64144;64145;64146;64147;64148;64149;64150;64151;64152;64153;64154;64155;64156;64157;64158;64159;64160;64161;64162;64163;64164;64165;64166;64167;64168 81535;81536;81537;81538;81539;81540;81541;81542;81543;81544;81545;81546;81547;81548;81549;81550;81551;81552;81553;81554;81555;81556;81557;81558;81559;81560;81561;81562;81563;81564;81565;81566;81567;81568;81569;81570;81571;81572;81573;81574;81575;81576;81577;81578;81579;81580;81581;81582;81583;81584;81585;81586;81587;81588;81589;81590;81591;81592;81593;81594;81595;81596;81597;81598;81599 81588 319 60 DLTDYLMKILTER Unmodified 1609.8385 0.83854391 2788;2696;2792;447;2759;458;3261 A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 168.16 168.16 3 0.00032909 172222 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.42 66.345 434180000 56262000 0 96757000 23270000 118980000 0 0 0 29704000 0 49046000 60155000 0 7190 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6736 64169;64170;64171;64172;64173;64174;64175 81600;81601;81602;81603;81604;81605;81606 81606 7 DLTDYLMKILTER Oxidation (M) 1625.8335 0.83345853 2788;2696;2792;447;2759;458;3261 A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;P68032;P68133;Q562R1;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 1 1 1 156.97 156.97 3 0.0012131 162641 QUIQUE_C1368_190116_001 76.262 58.756 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7191 447;2696;2759;2788;2792;3261;458 6736 64176 81607 81607 319 1 DLTEFTQVVQHDTACTIAATASVVK Unmodified 2704.3378 0.33779542 4312 Q9NW68;F8W6C6;E9PNA9 BSDC1 BSD domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 161.9 161.9 3 0.055631 167401 QUIQUE_C1576_190116_001 19.714 6.9119 35398000 0 0 0 0 0 0 35398000 0 0 0 0 0 0 7192 4312 6737 64177 81608 81608 1 DLTEYLSR Unmodified 995.49238 0.49237523 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.323 90.323 2 0.0015347 93268 QUIQUE_C1576_190116_001 140.98 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1 1 1 1 1 1 55.509 55.509 2 1.7508E-06 54413 QUIQUE_C1576_190116_001 154.35 104.99 24399000000 1809300000 2247100000 2110400000 1931000000 2259700000 1876400000 2191000000 1685300000 1858300000 1014500000 1943900000 1880400000 1591600000 7197 267;275;3025 6742 64219;64220;64221;64222;64223;64224;64225;64226;64227;64228;64229;64230;64231 81673;81674;81675;81676;81677;81678;81679;81680;81681;81682;81683;81684;81685;81686;81687;81688;81689;81690;81691;81692;81693;81694 81683 22 DLTGVQNLRK Unmodified 1142.6408 0.6407708 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 32.554 32.554 2;3 0.0022889 28406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.906 47.823 919800000 0 0 0 0 0 0 0 248040000 189570000 0 149920000 151060000 181200000 7198 267;275;3025 6743 64232;64233;64234;64235;64236;64237;64238;64239;64240;64241 81695;81696;81697;81698;81699;81700;81701;81702;81703;81704 81696 9 DLTLAGR Unmodified 744.413 0.41300269 1 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reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 1 2 2 2 1 2 2 2 170.84 170.84 2;3 1.5335E-17 172371 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.37 143.99 6042400000 245820000 687870000 94136000 100880000 356870000 57841000 780950000 306010000 342700000 23943000 444030000 753520000 1847800000 7228 2524 6771 64498;64499;64500;64501;64502;64503;64504;64505;64506;64507;64508;64509;64510;64511;64512;64513;64514;64515;64516;64517;64518;64519;64520;64521;64522 82016;82017;82018;82019;82020;82021;82022;82023;82024;82025;82026;82027;82028;82029;82030;82031;82032;82033;82034;82035;82036;82037;82038;82039;82040;82041;82042 82031 27 DLVEMCR Unmodified 921.40482 0.40482255 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.666 48.666 2 0.02784 46213 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.692 56.105 533890000 89576000 114610000 0 102570000 77169000 0 93711000 56263000 0 0 0 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alpha-induced protein 8-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 76.298 76.298 3 0.00093578 78524 QUIQUE_C1218_190116_001 80.231 39.507 51483000 15427000 0 12928000 0 0 0 0 0 0 0 10351000 0 12777000 7232 339 6775 64543;64544;64545;64546;64547;64548;64549;64550;64551;64552;64553 82065;82066;82067;82068;82069;82070;82071;82072;82073;82074;82075 82065 11 DLVHTEGQLQNEEIVAHDGSATYLR Unmodified 2794.3522 0.35219994 4616 Q9Y547 HSPB11 Intraflagellar transport protein 25 homolog yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 3 2 2 95.338 95.338 3;4 4.999E-197 98965 QUIQUE_C1218_190116_001 241.65 224.39 1488600000 69067000 120050000 141070000 189980000 147550000 102660000 130110000 67782000 88441000 24997000 145680000 107930000 153300000 7233 4616 6776 64554;64555;64556;64557;64558;64559;64560;64561;64562;64563;64564;64565;64566;64567;64568;64569;64570;64571;64572;64573;64574;64575;64576 82076;82077;82078;82079;82080;82081;82082;82083;82084;82085;82086;82087;82088;82089;82090;82091;82092;82093;82094;82095;82096;82097;82098;82099;82100;82101;82102;82103 82076 27 DLVILLYETALLSSGFSLEDPQTHANR Unmodified 3001.5397 0.53966635 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 4 16 3 178.69 178.69 3;4 8.9833E-65 182383 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.47 136.88 773330000 0 0 0 0 0 0 0 6530600 72618000 0 579550000 114630000 0 7234 1931 6777 64577;64578;64579;64580;64581;64582;64583;64584;64585;64586;64587;64588;64589;64590;64591;64592;64593;64594;64595;64596;64597;64598;64599;64600 82104;82105;82106;82107;82108;82109;82110;82111;82112;82113;82114;82115;82116;82117;82118;82119;82120;82121;82122;82123;82124;82125;82126;82127;82128;82129 82110 22 DLVIVAANLQK Unmodified 1182.6972 0.69722304 1746 O95747 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes yes 0 0 0 1 1 91.51 91.51 2 0.016768 92647 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.434 21.626 69530000 0 0 0 0 0 0 0 30474000 0 0 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131513 QUIQUE_C1576_190116_001 120.15 93.462 66984000 0 0 0 0 0 38829000 28155000 0 0 0 0 0 0 7238 2867 6781 64615;64616 82146;82147;82148;82149 82148 4 DLVLLGEQFREEYK Unmodified 1737.8938 0.8937506 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.39 119.39 3 0.00021211 122381 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.507 59.373 207410000 0 0 17796000 12290000 17854000 0 20735000 23825000 27308000 10485000 29697000 20601000 26820000 7239 2867 6782 64617;64618;64619;64620;64621;64622;64623;64624;64625;64626 82150;82151;82152;82153;82154;82155;82156;82157;82158;82159;82160;82161;82162 82155 13 DLVLLSEIEVAQANDIISSTEISSAEK Unmodified 2873.4757 0.47572869 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 4 174.47 174.47 3 1.3192E-18 176291 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.196 82.089 61946000 0 0 0 0 0 0 0 0 61946000 0 0 0 0 7240 880 6783 64627;64628;64629;64630 82163;82164;82165;82166 82163 4 DLVLQGHHTR Unmodified 1174.6207 0.62070406 3563 Q8N0W3 FUK L-fucose kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 15.2 15.2 3 0.0010402 7063 QUIQUE_C1277_190116_001 82.417 39.109 194270000 30364000 52247000 0 34783000 0 51181000 0 0 0 0 0 25692000 0 7241 3563 6784 64631;64632;64633;64634;64635 82167;82168;82169;82170;82171;82172;82173;82174 82170 7 DLVLSGDLGSLYAMTQDK Unmodified 1924.9452 0.94519382 1473 O15031;E2PU09 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 155.81 155.81 2;3 0.00016814 158282 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.84 87.64 98252000 25017000 6191300 19023000 22887000 0 0 0 25133000 0 0 0 0 0 7242 1473 6785 64636;64637;64638;64639;64640 82175;82176;82177;82178;82179 82179 3 DLVLSPNHQYLYAMTEK Unmodified 2020.9928 0.99281272 4452 Q9UIW2 PLXNA1 Plexin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 103.92 103.92 3 0.00093262 106920 QUIQUE_DMIX8_190116_001 42.913 36.639 99020000 0 0 0 0 0 0 0 15212000 23729000 0 0 34549000 25531000 7243 4452 6786 64641;64642;64643;64644 82180;82181;82182;82183 82183 4 DLVLSVHNR Unmodified 1051.5774 0.57744226 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.606 36.606 2 0.023842 32161 QUIQUE_C1368_190116_001 60.436 41.706 89026000 0 29151000 34495000 0 0 25379000 0 0 0 0 0 0 0 7244 3098 6787 64645;64646;64647;64648;64649 82184;82185;82186;82187;82188 82185 5 DLVPDLSNFYAQYK Unmodified 1671.8144 0.81443765 2187 P21912;A0A087WWT1 SDHB Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 146.44 146.44 2 0.00028966 142050 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.93 75.144 2442600000 409150000 449180000 373760000 0 0 305770000 0 0 0 144080000 0 402700000 358000000 7245 2187 6788 64650;64651;64652;64653;64654;64655;64656 82189;82190;82191;82192;82193;82194;82195 82193 7 DLVPEPGAAAGLEVFTQK Unmodified 1840.9571 0.95707914 346 A0A1B0GTW6 yes yes 0 0 0 1 135.4 135.4 2 0.0055134 142404 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.891 34.314 42314000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42314000 0 0 7246 346 6789 64657 82196 82196 1 DLVQDPSLLGGTISAYK Unmodified 1775.9305 0.93053004 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 128.86 128.86 2;3 1.6963E-12 125395 QUIQUE_DMIX4_190116_001 155.08 127.75 2191700000 240770000 228000000 173620000 197160000 207610000 229250000 178280000 206390000 96267000 64802000 0 177200000 192350000 7247 998 6790 64658;64659;64660;64661;64662;64663;64664;64665;64666;64667;64668;64669;64670;64671;64672 82197;82198;82199;82200;82201;82202;82203;82204;82205;82206;82207;82208;82209;82210;82211;82212 82210 15 DLVSGLFSFSSCPFSR Unmodified 1804.8454 0.8454202 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.55 165.55 2 3.3439E-13 172720 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.2 125.11 1193200000 0 64525000 97535000 49238000 84212000 42653000 108180000 188890000 245500000 22161000 114850000 0 175450000 7248 4626 6791 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64725;64726;64727;64728;64729;64730;64731;64732;64733;64734;64735;64736;64737;64738;64739;64740;64741;64742;64743 82269;82270;82271;82272;82273;82274;82275;82276;82277;82278;82279;82280;82281;82282;82283;82284;82285;82286;82287 82285 17 DLVVAYGTTENSPVTFAHFPEDTVEQK Unmodified 2993.4294 0.4294472 3819 Q96CM8;E9PF16 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 130.12 130.12 3 1.6904E-24 135483 QUIQUE_C1218_190116_001 102.07 89.132 303430000 38880000 0 54789000 0 0 0 62959000 0 47240000 0 0 50695000 48872000 7253 3819 6795 64744;64745;64746;64747;64748;64749;64750 82288;82289;82290;82291;82292;82293;82294;82295 82288 8 DLVVGFVADGGLSVLPR Unmodified 1712.9461 0.94612052 1067 F8WEC6 SLC25A17 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 38.793 38.793 3 0.0004689 34676 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.408 22.577 159470000 0 0 0 0 0 0 0 41115000 0 0 0 44485000 73872000 7254 1067 6796 64751;64752;64753;64754;64755;64756 82296;82297;82298;82299;82300;82301 82299 6 DLVVLLFETALLSSGFSLEDPQTHSNR Unmodified 2987.524 0.52401629 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 0 2 178.46 178.46 3 2.1461E-05 185990 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.708 25.551 28737000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28737000 0 0 7255 1938 6797 64757;64758 82302;82303 82303 2 DLVVSYYQFHR Unmodified 1425.7041 0.70409934 3998 Q9BR01 SULT4A1 Sulfotransferase 4A1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 87.901 87.901 2;3 4.5797E-05 89692 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.76 115.71 1041800000 95979000 98976000 40678000 87257000 92315000 78752000 92430000 89820000 40670000 0 136610000 136140000 52219000 7256 3998 6798 64759;64760;64761;64762;64763;64764;64765;64766;64767;64768;64769;64770;64771;64772;64773;64774;64775;64776;64777;64778;64779;64780;64781;64782;64783 82304;82305;82306;82307;82308;82309;82310;82311;82312;82313;82314;82315;82316;82317;82318;82319;82320;82321;82322;82323;82324;82325;82326;82327;82328;82329;82330;82331;82332;82333;82334 82322 29 DLVWDWQQAASGVLVAVGR Unmodified 2069.0694 0.069423554 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 137.09 137.09 3 0.024329 142760 QUIQUE_C1368_190116_001 23.329 7.9073 77790000 0 0 77790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7257 934 6799 64784 82335 82335 1 DLYANNVLSGGTTMYPGIADR Oxidation (M) 2243.0528 0.052846792 2792;2759 P62736;P63267;P68032 ACTA2;ACTG2;ACTC1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1 no no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 118.27 118.27 2;3 3.0263E-76 122335 QUIQUE_C1368_190116_001 184.99 171.31 1103600000 72923000 179040000 70545000 66884000 139050000 30054000 56681000 56350000 138160000 139740000 0 116030000 38115000 7258 2759;2792 6800 64785;64786;64787;64788;64789;64790;64791;64792;64793;64794;64795;64796;64797;64798;64799 82336;82337;82338;82339;82340;82341;82342;82343;82344;82345;82346;82347;82348;82349;82350 82338 2188 15 DLYANNVLSGGTTMYPGIADR Unmodified 2227.0579 0.057932169 2792;2759 P62736;P63267;P68032 ACTA2;ACTG2;ACTC1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 1 131.04 131.04 2;3 9.5217E-186 137821 QUIQUE_C1438_190116_001 245.48 223.92 3552100000 372650000 850150000 232200000 313460000 511720000 106680000 160400000 188850000 217960000 0 166500000 339360000 92209000 7259 2759;2792 6800 64800;64801;64802;64803;64804;64805;64806;64807;64808;64809;64810;64811;64812;64813;64814;64815;64816;64817;64818;64819;64820;64821;64822 82351;82352;82353;82354;82355;82356;82357;82358;82359;82360;82361;82362;82363;82364;82365;82366;82367;82368;82369;82370;82371;82372;82373;82374;82375;82376;82377;82378;82379 82362 27 DLYANTVLSGGSTMYPGIADR Oxidation (M) 2216.0419 0.041947754 3261 Q562R1 ACTBL2 Beta-actin-like protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 166.65 166.65 2 0.012789 182937 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.001 37.97 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7260 3261 6801 64823;64824 82380;82381 82381 2642 2 DLYANTVLSGGSTMYPGIADRMQK Oxidation (M) 2603.236 0.23597289 3261 Q562R1 ACTBL2 Beta-actin-like protein 2 yes yes 0 1 1 1 140.46 140.46 2 0.015379 146184 QUIQUE_C1576_190116_001 61.212 49.046 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7261 3261 6802 64825 82382 82382 2642 1 DLYANTVLSGGTTMYPGIADR Oxidation (M) 2230.0576 0.057597819 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 1 0 5 8 7 5 4 4 5 6 11 6 13 8 9 125.08 125.08 2;3 0 127297 QUIQUE_C1218_190116_001 297.56 249.57 84781000000 5474900000 6725100000 6351400000 5898500000 5004900000 5692100000 4720400000 8293200000 7048200000 7106000000 8006500000 7254200000 7206100000 7262 447;2696;2788 6803 64826;64827;64828;64829;64830;64831;64832;64833;64834;64835;64836;64837;64838;64839;64840;64841;64842;64843;64844;64845;64846;64847;64848;64849;64850;64851;64852;64853;64854;64855;64856;64857;64858;64859;64860;64861;64862;64863;64864;64865;64866;64867;64868;64869;64870;64871;64872;64873;64874;64875;64876;64877;64878;64879;64880;64881;64882;64883;64884;64885;64886;64887;64888;64889;64890;64891;64892;64893;64894;64895;64896;64897;64898;64899;64900;64901;64902;64903;64904;64905;64906;64907;64908;64909;64910;64911;64912;64913;64914;64915;64916 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82385 320 171 DLYANTVLSGGTTMYPGIADR Unmodified 2214.0627 0.062683196 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 0 10 10 19 9 11 13 20 19 22 2 48 32 20 147.57 147.57 2;3 0 140369 QUIQUE_C1218_190116_001 367.6 302.96 108550000000 9600600000 11103000000 9555900000 10455000000 7551400000 9137500000 8630300000 9560400000 6965000000 3176800000 7798800000 7504600000 7507600000 7263 447;2696;2788 6803 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yes yes 0 0 0 1 1 1 22.065 22.065 2 0.025188 15052 QUIQUE_C1563_190116_001 71.715 38.744 22816000 0 0 0 0 0 22816000 0 0 0 0 0 0 0 7274 1405 6814 65209;65210;65211 83082;83083;83084 83084 3 DMAAFNERPIIFALSNPTSK Unmodified 2221.1201 0.1201385 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 133.52 133.52 2 6.5442E-37 138086 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.17 134.94 235830000 0 0 0 58010000 0 0 27641000 0 56967000 0 54018000 0 39197000 7275 2504 6815 65212;65213;65214;65215;65216 83085;83086;83087;83088;83089 83089 4 DMAAFNERPIIFALSNPTSK Oxidation (M) 2237.1151 0.11505312 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.9 120.9 3 9.0466E-06 124876 QUIQUE_DMIX8_190116_001 81.967 68.135 313220000 0 0 0 0 42152000 0 0 41946000 0 36218000 63330000 49464000 80109000 7276 2504 6815 65217;65218;65219;65220;65221;65222;65223 83090;83091;83092;83093;83094;83095;83096 83096 1931 7 DMAGLLKPTACTMLVSSLR Unmodified 2063.0577 0.057737935 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.83 132.83 3 2.0921E-16 137159 QUIQUE_DMIX8_190116_001 123.19 114.7 723080000 30584000 61262000 71123000 58037000 0 74747000 65179000 57539000 55636000 0 92121000 71267000 85583000 7277 2026 6816 65224;65225;65226;65227;65228;65229;65230;65231;65232;65233;65234 83097;83098;83099;83100;83101;83102;83103;83104;83105;83106;83107;83108 83108 10 DMAIATGGAVFGEEGLTLNLEDVQPHDLGK Unmodified 3096.5074 0.50737995 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 4 8 4 13 11 13 24 13 12 176.1 176.1 3 3.3899E-36 162654 QUIQUE_C1277_190116_001 108.32 99.467 1906200000 68996000 101880000 84546000 0 66441000 0 230740000 186320000 270840000 0 486380000 203400000 206690000 7278 2004 6817 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83109;83110;83111;83112;83113;83114;83115;83116;83117;83118;83119;83120;83121;83122;83123;83124;83125;83126;83127;83128;83129;83130;83131;83132;83133;83134;83135;83136;83137;83138;83139;83140;83141;83142;83143;83144;83145;83146;83147;83148;83149;83150;83151;83152;83153;83154;83155;83156;83157;83158;83159;83160;83161;83162;83163;83164;83165;83166;83167;83168;83169;83170;83171;83172;83173;83174;83175;83176;83177;83178;83179;83180;83181;83182;83183;83184;83185;83186;83187;83188;83189;83190;83191;83192;83193;83194;83195;83196;83197;83198;83199;83200;83201;83202;83203;83204;83205;83206;83207;83208;83209;83210;83211;83212;83213;83214;83215;83216;83217;83218;83219;83220;83221;83222;83223;83224 83114 106 DMANPTALLLSAVMMLR 3 Oxidation (M) 1893.9362 0.93622582 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 3 0 4 4 3 2 1 3 2 2 3 2 3 2 168.8 168.8 2;3 1.825E-05 170624 QUIQUE_C1563_190116_001 97.631 84.43 687960000 57441000 125540000 107160000 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65415;65416;65417;65418;65419;65420;65421;65422;65423;65424;65425;65426;65427;65428;65429;65430;65431;65432;65433;65434;65435;65436;65437;65438;65439;65440;65441;65442;65443;65444;65445;65446;65447;65448;65449;65450;65451;65452;65453;65454;65455;65456;65457;65458;65459 83303;83304;83305;83306;83307;83308;83309;83310;83311;83312;83313;83314;83315;83316;83317;83318;83319;83320;83321;83322;83323;83324;83325;83326;83327;83328;83329;83330;83331;83332;83333;83334;83335;83336;83337;83338;83339;83340;83341;83342;83343;83344;83345;83346;83347;83348;83349;83350;83351;83352;83353;83354 83348 1997;1998;1999 48 DMANPTALLLSAVMMLR Unmodified 1845.9515 0.95148195 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 178.77 178.77 2;3 1.0819E-22 179536 QUIQUE_DMIX1_190116_001 186.51 163.13 3470100000 192700000 78536000 290100000 36570000 108490000 23003000 179090000 134740000 351740000 0 762710000 914760000 397620000 7282 2558 6818 65460;65461;65462;65463;65464;65465;65466;65467;65468;65469;65470;65471;65472;65473;65474;65475;65476;65477;65478;65479;65480;65481 83355;83356;83357;83358;83359;83360;83361;83362;83363;83364;83365;83366;83367;83368;83369;83370;83371;83372;83373;83374;83375;83376;83377;83378;83379 83369 24 DMAQLPETEIAPAK Unmodified 1512.7494 0.74939455 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 83.628 83.628 2 0.0023114 84853 QUIQUE_C1277_190116_001 75.416 57.104 54246000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54246000 0 7283 880 6819 65482;65483;65484;65485 83380;83381;83382;83383 83380 4 DMAQLPETEIAPAK Oxidation (M) 1528.7443 0.74430917 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 1 0 1 64.966 64.966 2 0.054928 63614 QUIQUE_C1563_190116_001 53.08 27.142 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7284 880 6819 65486 83384 83384 521 1 DMASFHERPIIFALSNPTSK Unmodified 2260.131 0.13103753 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 105.82 105.82 3;4 1.1744E-37 109078 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.19 146.1 1639300000 134260000 165530000 66779000 38836000 129460000 39239000 147000000 154910000 91737000 0 226990000 206330000 238280000 7285 3198 6820 65487;65488;65489;65490;65491;65492;65493;65494;65495;65496;65497;65498;65499;65500;65501;65502;65503;65504;65505;65506 83385;83386;83387;83388;83389;83390;83391;83392;83393;83394;83395;83396;83397;83398;83399;83400;83401;83402;83403;83404;83405;83406;83407;83408;83409 83403 25 DMASFHERPIIFALSNPTSK Oxidation (M) 2276.126 0.12595216 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 1 1 1 94.007 94.007 3 0.00044334 95257 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.203 50.187 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7286 3198 6820 65507 83410 83410 2626 1 DMDDEESWIK Oxidation (M) 1282.5023 0.50234756 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.821 70.821 2 0.0002452 71212 QUIQUE_DMIX7_190116_001 124.23 119.62 1820100000 107230000 174250000 130320000 107890000 114000000 114460000 98517000 140670000 183610000 86594000 214950000 145130000 202460000 7287 267;275;3025 6821 65508;65509;65510;65511;65512;65513;65514;65515;65516;65517;65518;65519;65520 83411;83412;83413;83414;83415;83416;83417;83418;83419;83420;83421;83422;83423;83424;83425;83426;83427;83428;83429 83428 159 18 DMDDEESWIK Unmodified 1266.5074 0.50743294 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.875 89.875 2 0.0016836 91802 QUIQUE_C1403_190116_001 109.71 105.51 5301900000 464980000 609260000 511240000 483980000 351950000 439270000 418290000 369130000 374650000 135960000 421940000 365700000 355590000 7288 267;275;3025 6821 65521;65522;65523;65524;65525;65526;65527;65528;65529;65530;65531;65532;65533 83430;83431;83432;83433;83434;83435;83436;83437;83438;83439;83440;83441;83442;83443;83444;83445;83446;83447;83448 83437 15 DMDDEESWIKEK Oxidation (M) 1539.6399 0.63990368 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 1 53.581 53.581 2 0.0078779 51369 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.596 86.196 22482000 0 0 0 0 0 0 0 22482000 0 0 0 0 0 7289 267;275;3025 6822 65534 83449 83449 159 1 DMDDEESWIKEK Unmodified 1523.645 0.64498906 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 70.648 70.648 2 0.0023901 69781 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.63 105.96 69966000 0 0 0 0 0 0 0 69966000 0 0 0 0 0 7290 267;275;3025 6822 65535 83450;83451 83450 2 DMDIAGFTQK Unmodified 1124.5172 0.51720977 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 83.612 83.612 2 0.017413 86391 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.355 47.28 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7291 271 6823 65536;65537 83452;83453 83452 2 DMDKVETFLR Unmodified 1252.6122 0.61217279 493 A0A3B3ISS9;P01241;P01242;B1A4G9;A0A087WUG6;H0YM39;P0DML3;P0DML2;A0A087WXJ5;B1A4H2;A0A0B4J1R0;J3QT06;Q14406 GH1;GH2;CSH1;CSH2;CSHL1 Somatotropin;Growth hormone variant;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1;Chorionic somatomammotropin hormone-like 1 yes no 0 0 1 2 1 1 78.603 78.603 2;3 4.1445E-08 80417 QUIQUE_C1218_190116_001 158.57 107.45 1561700000 1511700000 0 0 30646000 0 0 19333000 0 0 0 0 0 0 7292 493 6824 65538;65539;65540;65541 83454;83455;83456;83457;83458;83459;83460 83457 7 DMDKVETFLR Oxidation (M) 1268.6071 0.60708741 493 A0A3B3ISS9;P01241;P01242;B1A4G9;A0A087WUG6;H0YM39;P0DML3;P0DML2;A0A087WXJ5;B1A4H2;A0A0B4J1R0;J3QT06;Q14406 GH1;GH2;CSH1;CSH2;CSHL1 Somatotropin;Growth hormone variant;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1;Chorionic somatomammotropin hormone-like 1 yes no 0 1 1 1 57.238 57.238 3 0.049597 55698 QUIQUE_C1218_190116_001 55.401 28.512 132720000 132720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7293 493 6824 65542 83461 83461 0 DMDLTEVITGTLWNLSSHDSIK Unmodified 2474.1999 0.19990496 759 C9JZR2;O60716 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.8 170.8 3 5.941E-15 174681 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.37 98.636 929420000 0 87119000 50857000 0 81631000 0 120170000 77625000 78712000 0 110100000 143610000 179590000 7294 759 6825 65543;65544;65545;65546;65547;65548;65549;65550;65551 83462;83463;83464;83465;83466;83467;83468;83469;83470;83471 83470 7 DMDLVEVNEAFAPQYLAVER Oxidation (M) 2324.0995 0.099462633 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 1 2 3 1 1 1 1 144.54 144.54 2;3 3.0955E-47 149667 QUIQUE_C1368_190116_001 166.09 152.06 864560000 76408000 92185000 107770000 61133000 94060000 89693000 50791000 50571000 83327000 15817000 63185000 40921000 38698000 7295 2453 6826 65552;65553;65554;65555;65556;65557;65558;65559;65560;65561;65562;65563;65564;65565;65566;65567;65568;65569;65570;65571;65572;65573 83472;83473;83474;83475;83476;83477;83478;83479;83480;83481;83482;83483;83484;83485;83486;83487;83488;83489;83490;83491;83492;83493;83494;83495;83496 83477 1875 23 DMDLVEVNEAFAPQYLAVER Unmodified 2308.1045 0.10454801 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 155.72 155.72 2;3 6.2998E-09 150626 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.14 120.58 256720000 0 0 0 0 0 0 0 160920000 0 95797000 0 0 0 7296 2453 6826 65574;65575;65576 83497;83498;83499;83500;83501;83502 83498 5 DMDLYSYR Unmodified 1061.4488 0.44879585 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 79.276 79.276 1;2 0.00029504 80228 QUIQUE_C1277_190116_001 160.03 134.2 4842200000 411010000 452980000 497340000 432240000 0 417530000 369120000 446440000 490100000 142370000 446900000 359830000 376340000 7297 2870 6827 65577;65578;65579;65580;65581;65582;65583;65584;65585;65586;65587;65588;65589;65590 83503;83504;83505;83506;83507;83508;83509;83510;83511;83512;83513;83514;83515;83516;83517;83518;83519;83520;83521;83522;83523 83506 19 DMDLYSYR Oxidation (M) 1077.4437 0.44371047 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.613 55.613 2 0.0042844 54320 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.78 107.56 884970000 0 90532000 88500000 87968000 66072000 75953000 54551000 0 110910000 0 113650000 89758000 107070000 7298 2870 6827 65591;65592;65593;65594;65595;65596;65597;65598;65599;65600;65601 83524;83525;83526;83527;83528;83529;83530;83531;83532;83533;83534;83535;83536;83537;83538;83539 83538 2346 16 DMEALLPLMNMVIYSIDK Unmodified 2095.0404 0.040356536 3794 Q96A33;A0A087WYW6 CCDC47 Coiled-coil domain-containing protein 47 yes no 0 0 0 1 1 1 180.33 180.33 2 0.00068449 183366 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.647 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kinase DCLK1 no no 0 0 1 1 49.624 49.624 3 0.054733 46563 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.424 26.288 40694000 0 0 0 0 0 0 0 40694000 0 0 0 0 0 7302 1478;3342 6830 65619 83557 83557 1 DMELEHFDERDK Oxidation (M) 1578.662 0.6620361 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 1 1 1 1 1 31.137 31.137 3 0.00539 26769 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.937 51.064 97530000 0 0 0 0 0 0 0 40272000 0 0 0 23807000 33452000 7303 1478;3342 6830 65620;65621;65622 83558;83559;83560 83558 822 2 DMELPTEK Unmodified 961.44265 0.44264784 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.491 48.491 2 0.016707 46061 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.716 56.607 233450000 36057000 0 0 37499000 0 0 0 46497000 54098000 0 31934000 27366000 0 7304 880 6831 65623;65624;65625;65626;65627;65628 83561;83562;83563;83564;83565;83566;83567 83566 6 DMESPTKLDVTLAK Unmodified 1546.7913 0.79125936 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 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11 DMFPGPYPR Oxidation (M) 1094.4855 0.48551571 1710 O95169;E9PQ68;K9J7I2;E9PIZ8 NDUFB8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial yes no 0 1 0 1 62.645 62.645 2 0.020681 58414 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.038 51.114 6070900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6070900 0 0 0 7311 1710 6836 65653 83594 83594 1 DMFQETMEAMR Unmodified 1387.557 0.55704245 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 125.59 125.59 2 8.9349E-06 129254 QUIQUE_C1403_190116_001 145.17 134.34 129610000 19554000 16647000 20536000 33352000 17206000 22317000 0 0 0 0 0 0 0 7312 2378 6837 65654;65655;65656;65657;65658;65659 83595;83596;83597;83598;83599;83600 83598 6 DMGEDLECLCQIMR Unmodified 1768.7252 0.72524676 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YCH5;H0YD77 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 154.02 154.02 2 0.00025673 159974 QUIQUE_C1576_190116_001 97.456 84.029 32906000 0 0 0 0 0 18339000 14567000 0 0 0 0 0 0 7313 798 6838 65660;65661 83601;83602 83602 2 DMGEMVTQGQTDAQYMFLR Oxidation (M) 2235.9599 0.95987438 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 3 4 3 4 3 1 1 2 3 3 2 4 2 128.21 128.21 2;3 1.0067E-85 133328 QUIQUE_DMIX3_190116_001 197.56 184.58 1359800000 127070000 147570000 117480000 31026000 122710000 34782000 29525000 108500000 145990000 84947000 132220000 174760000 103220000 7314 2851 6839 65662;65663;65664;65665;65666;65667;65668;65669;65670;65671;65672;65673;65674;65675;65676;65677;65678;65679;65680;65681;65682;65683;65684;65685;65686;65687;65688;65689;65690;65691;65692;65693;65694;65695;65696 83603;83604;83605;83606;83607;83608;83609;83610;83611;83612;83613;83614;83615;83616;83617;83618;83619;83620;83621;83622;83623;83624;83625;83626;83627;83628;83629;83630;83631;83632;83633;83634;83635;83636;83637;83638;83639;83640;83641 83629 2286;2287;2288 35 DMGEMVTQGQTDAQYMFLR Unmodified 2219.965 0.96495976 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 147.61 147.61 2;3 1.2137E-115 151871 QUIQUE_C1277_190116_001 278.41 270.5 4008900000 372500000 426210000 263210000 214680000 374200000 257110000 352330000 208970000 330130000 83634000 404330000 361400000 360170000 7315 2851 6839 65697;65698;65699;65700;65701;65702;65703;65704;65705;65706;65707;65708;65709;65710;65711;65712;65713;65714;65715;65716;65717;65718;65719 83642;83643;83644;83645;83646;83647;83648;83649;83650;83651;83652;83653;83654;83655;83656;83657;83658;83659;83660;83661;83662;83663;83664;83665;83666;83667;83668;83669;83670;83671 83646 22 DMGGYSTTTDFIK Oxidation (M) 1450.6286 0.62861071 86 A0A087WZN1;O43837;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 75.69 75.69 2 0.00045517 75223 QUIQUE_C1563_190116_001 108.7 97.867 651210000 63972000 61831000 52261000 44078000 0 40937000 0 43624000 78327000 58861000 68461000 79307000 59554000 7316 86 6840 65720;65721;65722;65723;65724;65725;65726;65727;65728;65729;65730;65731;65732;65733 83672;83673;83674;83675;83676;83677;83678;83679;83680;83681;83682;83683;83684;83685;83686 83678 58 15 DMGGYSTTTDFIK Unmodified 1434.6337 0.63369609 86 A0A087WZN1;O43837;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.189 92.189 2 0.00047041 93668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.83 106.35 864200000 0 0 0 103220000 69300000 91865000 0 84677000 125100000 0 140620000 118830000 130580000 7317 86 6840 65734;65735;65736;65737;65738;65739;65740;65741 83687;83688;83689;83690;83691;83692;83693;83694;83695;83696 83691 8 DMGTVVLGK Unmodified 918.48445 0.48445308 2089 P15170;H3BR35 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A no no 0 0 0 1 1 58.54 58.54 2 0.029012 57239 QUIQUE_C1403_190116_001 56.721 26.217 105910000 0 0 0 58451000 0 47460000 0 0 0 0 0 0 0 7318 2089 6841 65742;65743 83697;83698 83697 2 DMGYHVSMMADSTSR Unmodified 1686.68 0.68001113 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 3 1 2 2 2 3 1 1 1 2 1 66.016 66.016 2;3 0.00046036 65952 QUIQUE_C1576_190116_001 92.247 84.689 843190000 105570000 147130000 50784000 106090000 74500000 86160000 120430000 24411000 20483000 0 16998000 44572000 46072000 7319 2414 6842 65744;65745;65746;65747;65748;65749;65750;65751;65752;65753;65754;65755;65756;65757;65758;65759;65760;65761;65762;65763;65764 83699;83700;83701;83702;83703;83704;83705;83706;83707;83708;83709;83710;83711;83712;83713;83714;83715;83716;83717;83718;83719;83720 83713 21 DMGYHVSMMADSTSR Oxidation (M) 1702.6749 0.67492575 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 1 49.912 49.912 2 0.0033592 48471 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.121 60.104 46350000 0 0 22944000 0 0 0 0 0 0 0 23406000 0 0 7320 2414 6842 65765;65766 83721;83722 83722 1820 1 DMHYYQSCLEAILQNSPDAK Unmodified 2382.062 0.062031269 3441 Q7L523;Q5VZM0 RRAGA;RRAGB Ras-related GTP-binding protein A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.29 142.29 3 4.1824E-09 146691 QUIQUE_C1277_190116_001 102.98 95.356 294560000 26841000 35343000 32085000 27607000 37163000 27630000 39096000 0 38181000 0 30613000 0 0 7321 3441 6843 65767;65768;65769;65770;65771;65772;65773;65774;65775 83723;83724;83725;83726;83727;83728;83729;83730;83731 83724 9 DMIDLEANFEK Unmodified 1323.6017 0.60166768 3780 Q93050;K7EM24;K7EN36 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.2 117.2 2 0.0025929 122027 QUIQUE_C1218_190116_001 77.379 62.712 222150000 25752000 0 30846000 0 23627000 15987000 32608000 0 0 0 22277000 36232000 34821000 7322 3780 6844 65776;65777;65778;65779;65780;65781;65782;65783;65784;65785;65786 83732;83733;83734;83735;83736;83737;83738;83739;83740;83741;83742;83743 83732 10 DMIDLEANFEKIENELK Unmodified 2049.9929 0.9928723 3780 Q93050;K7EM24;K7EN36 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 158.96 158.96 3 2.0055E-10 166232 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.096 85.553 152640000 0 0 0 0 0 0 0 29710000 22234000 0 50882000 27121000 22694000 7323 3780 6845 65787;65788;65789;65790;65791 83744;83745;83746;83747;83748 83746 5 DMIDNLLSPDLIDGVLTR Unmodified 1999.0296 0.029592154 1911 P07093;C9JN98 SERPINE2 Glia-derived nexin yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 2 2 172.02 172.02 2;3 1.7172E-38 176287 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.33 167.51 541410000 43539000 25902000 0 0 41925000 0 20963000 44098000 116400000 0 52728000 138660000 57195000 7324 1911 6846 65792;65793;65794;65795;65796;65797;65798;65799;65800;65801;65802;65803;65804;65805;65806 83749;83750;83751;83752;83753;83754;83755;83756;83757;83758;83759;83760;83761;83762;83763;83764 83757 16 DMILNFAEQNSFK Unmodified 1555.7341 0.73407884 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.77 130.77 2 0.00040407 127411 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.63 87.115 303630000 0 0 0 0 0 0 0 111340000 0 30137000 0 69171000 92988000 7325 1594 6847 65807;65808;65809;65810;65811;65812;65813;65814 83765;83766;83767;83768;83769;83770;83771;83772;83773 83770 8 DMILNFAEQNSFK Oxidation (M) 1571.729 0.72899346 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 1 0 1 1 1 111.92 111.92 2 0.0036115 115454 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.531 56.393 52783000 0 0 0 0 0 0 0 0 34465000 18318000 0 0 0 7326 1594 6847 65815;65816;65817 83774;83775;83776;83777 83775 872 4 DMILQFISR Unmodified 1121.5903 0.59031513 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 133.3 133.3 2 0.004459 137350 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.948 56.107 310840000 51547000 0 51136000 0 0 45723000 0 0 51633000 0 0 65936000 44865000 7327 2569 6848 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activator of morphogenesis 2;Disheveled-associated activator of morphogenesis 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 124.57 124.57 2 0.041477 127097 QUIQUE_C1563_190116_001 81.784 23.617 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7330 305;4602 6851 65842;65843;65844;65845 83805;83806;83807;83808 83808 4 DMLFQVLALEEPNVR Unmodified 1772.9131 0.91310583 2375 P35270 SPR Sepiapterin reductase yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 2 159.9 159.9 2;3 2.4616E-24 162000 QUIQUE_C1563_190116_001 156.71 140.82 818300000 51665000 16042000 80619000 48590000 21773000 74752000 73724000 75290000 82935000 29292000 89280000 75910000 98431000 7331 2375 6852 65846;65847;65848;65849;65850;65851;65852;65853;65854;65855;65856;65857;65858;65859;65860;65861;65862;65863;65864;65865;65866;65867;65868;65869;65870 83809;83810;83811;83812;83813;83814;83815;83816;83817;83818;83819;83820;83821;83822;83823;83824;83825;83826;83827;83828;83829;83830;83831;83832;83833;83834;83835;83836;83837;83838 83820 29 DMLFQVLALEEPNVR Oxidation (M) 1788.908 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1295.7271 0.72714296 1606 O75052 NOS1AP Carboxyl-terminal PDZ ligand of neuronal nitric oxide synthase protein yes yes 0 0 0 1 1 107.2 107.2 3 0.014918 111851 QUIQUE_C1218_190116_001 44.847 28.983 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7340 1606 6859 65910;65911 83902;83903 83902 2 DMMELVQPSISGVDLDK Unmodified 1875.8958 0.89580079 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 141.25 141.25 2 1.3223E-37 146959 QUIQUE_C1218_190116_001 162.32 150.79 1024700000 217780000 202550000 221640000 0 0 237970000 0 0 93574000 51176000 0 0 0 7341 1678 6860 65912;65913;65914;65915;65916;65917 83904;83905;83906;83907;83908;83909;83910;83911;83912;83913;83914 83905 11 DMMELVQPSISGVDLDK Oxidation (M) 1891.8907 0.89071541 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 1 1 1 122.19 122.19 2 0.0018268 126817 QUIQUE_C1368_190116_001 63.76 44.102 87632000 0 29280000 29534000 0 0 28818000 0 0 0 0 0 0 0 7342 1678 6860 65918;65919;65920 83915;83916;83917 83916 910;911 3 DMMELVQPSISGVDLDKFR Oxidation (M) 2195.0602 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74.16 74.16 2 0.0032363 74166 QUIQUE_C1277_190116_001 90.913 72.601 55351000 33354000 0 0 0 0 21997000 0 0 0 0 0 0 0 7345 2914 6862 65945;65946;65947 83948;83949;83950 83949 3 DMNEVETQFK Unmodified 1239.5442 0.5441528 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 66.305 66.305 2 0.02484 66398 QUIQUE_C1368_190116_001 63.283 47.701 27904000 0 0 27904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7346 4336 6863 65948 83951 83951 1 DMNLTLEPEIMPAATDNR Unmodified 2029.9449 0.94487625 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 1 1 131.27 131.27 2 1.2827E-17 134133 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.97 141.72 103580000 0 0 34469000 0 0 35578000 0 33533000 0 0 0 0 0 7347 2885 6864 65949;65950;65951 83952;83953;83954 83954 3 DMNQVLDAYENK Oxidation (M) 1454.6348 0.63475872 2213 P23381;G3V277;G3V3H8;G3V3Y5;G3V423;G3V5U1;G3V456 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 66.106 66.106 2 0.0011307 65533 QUIQUE_C1403_190116_001 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yes no 0 0 2 1 124.76 124.76 4 0.0037745 131178 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.258 32.292 72552000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72552000 0 0 7350 2213 6866 65974 83980 83980 1 DMPIQAFLLYQEPVLGPVR Oxidation (M) 2201.1555 0.15546137 766 CON__P02666 yes yes 0 1 0 1 3 1 1 3 1 1 2 1 1 158.68 158.68 2;3 4.995E-36 162716 QUIQUE_C1277_190116_001 154.65 132.89 449540000 29731000 119480000 28498000 20085000 86263000 25206000 0 11128000 0 65369000 42546000 0 21232000 + 7351 766 6867 65975;65976;65977;65978;65979;65980;65981;65982;65983;65984;65985;65986;65987;65988;65989 83981;83982;83983;83984;83985;83986;83987;83988;83989;83990;83991;83992;83993;83994;83995;83996 83984 455 13 DMQGTEEEKAPLALFGHTLVASLEDMK Unmodified 2959.4307 0.43070953 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 3 157.68 157.68 3;4 4.8672E-20 160513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.446 82.36 2042700000 192840000 180820000 196880000 228880000 249720000 68447000 76218000 203620000 69598000 0 179550000 114390000 281740000 7352 2009 6868 65990;65991;65992;65993;65994;65995;65996;65997;65998;65999;66000;66001;66002;66003;66004;66005;66006;66007;66008;66009;66010;66011;66012 83997;83998;83999;84000;84001;84002;84003;84004;84005;84006;84007;84008;84009;84010;84011;84012;84013;84014;84015;84016;84017;84018;84019;84020;84021;84022;84023 84012 20 DMQGTEEEKAPLALFGHTLVASLEDMK Oxidation (M) 2975.4256 0.42562415 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 1 1 2 1 1 155.33 155.33 3;4 9.3572E-13 158146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.072 65.205 337500000 0 0 0 0 0 0 0 175830000 0 0 47817000 0 113850000 7353 2009 6868 66013;66014;66015;66016 84024;84025;84026;84027;84028 84026 1290;1294 4 DMQPSMESDMALVK Unmodified 1580.6885 0.68845055 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 98.435 98.435 2 0.01214 99919 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.7 41.346 74913000 33851000 17112000 0 0 0 0 0 23950000 0 0 0 0 0 7354 880 6869 66017;66018;66019;66020;66021 84029;84030;84031;84032;84033 84031 4 DMSGTMGFNEFK 2 Oxidation (M) 1394.5483 0.5482519 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.604 61.604 2 0.0017212 60401 QUIQUE_C1277_190116_001 82.417 80.018 461320000 50342000 60295000 0 57201000 0 0 47471000 0 58597000 48561000 50300000 44180000 44369000 7355 685 6870 66022;66023;66024;66025;66026;66027;66028;66029;66030 84034;84035;84036;84037;84038;84039;84040;84041;84042;84043;84044 84035 418;419 11 DMSGTMGFNEFK Oxidation (M) 1378.5533 0.55333728 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 81.237 81.237 2 0.0024765 79188 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.14 69.31 2012900000 234650000 253310000 313930000 237460000 0 235140000 193950000 40214000 211180000 141080000 151960000 0 0 7356 685 6870 66031;66032;66033;66034;66035;66036;66037;66038;66039;66040;66041;66042;66043;66044;66045;66046;66047;66048 84045;84046;84047;84048;84049;84050;84051;84052;84053;84054;84055;84056;84057;84058;84059;84060;84061;84062;84063 84059 418;419 17 DMSGTMGFNEFK Unmodified 1362.5584 0.55842266 685 C9J0K6;P30626;B4DHQ6 SRI Sorcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.41 102.41 2 3.416E-07 104127 QUIQUE_C1563_190116_001 145.89 140.92 3479400000 362380000 298580000 0 339700000 262380000 339150000 397600000 145430000 256900000 103620000 425490000 223130000 325060000 7357 685 6870 66049;66050;66051;66052;66053;66054;66055;66056;66057;66058;66059;66060 84064;84065;84066;84067;84068;84069;84070;84071;84072;84073;84074;84075;84076;84077;84078;84079 84068 13 DMSGTMGFNEFKELWAVLNGWR 2 Oxidation (M) 2619.1886 0.18862877 685 C9J0K6;P30626 SRI Sorcin yes no 0 2 1 1 170.4 170.4 3 1.7649E-09 174379 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.058 89.346 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7358 685 6871 66061 84080 84080 418;419 1 DMSIIQWK Unmodified 1019.511 0.51100218 631 B5MBZ0;Q9HC35 EML4 Echinoderm microtubule-associated protein-like 4 yes no 0 0 0 1 103.61 103.61 2 0.042928 107673 QUIQUE_C1368_190116_001 58.679 38.225 11689000 0 0 11689000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7359 631 6872 66062 84081 84081 1 DMSLYASLTSEK Unmodified 1343.6279 0.62788243 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 2 4 2 2 106.32 106.32 2 0.00042714 110890 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.13 90.043 215440000 26582000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 118610000 22227000 48016000 7360 2483 6873 66063;66064;66065;66066;66067;66068;66069;66070;66071;66072;66073;66074 84082;84083;84084;84085;84086;84087;84088;84089;84090;84091;84092;84093;84094 84086 12 DMSLYASLTSEK Oxidation (M) 1359.6228 0.62279705 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 86.583 86.583 2 0.00040975 88449 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.22 96.53 160760000 0 0 0 0 0 0 0 0 75569000 0 0 0 85195000 7361 2483 6873 66075;66076;66077;66078;66079 84095;84096;84097;84098;84099;84100;84101 84098 1908 7 DMSPLSETEMALGK Unmodified 1507.6898 0.68983076 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 117.26 117.26 2 0.0065997 120372 QUIQUE_C1403_190116_001 61.419 46.275 59634000 0 0 0 59634000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7362 880 6874 66080;66081 84102;84103 84102 2 DMSQMILR Unmodified 992.47832 0.47832184 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.305 84.305 2 0.012067 86052 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.123 67.858 2003400000 0 133180000 236900000 308330000 163990000 0 272080000 0 175230000 0 286180000 172910000 254560000 7363 4560 6875 66082;66083;66084;66085;66086;66087;66088;66089;66090 84104;84105;84106;84107;84108;84109;84110;84111;84112;84113;84114;84115;84116;84117 84110 14 DMSVVEGGLR Unmodified 1061.5175 0.51754412 3142 Q15477;H7C5N0 SKIV2L Helicase SKI2W yes no 0 0 0 1 66.898 66.898 2 0.041293 66369 QUIQUE_C1403_190116_001 60.019 28.79 0 0 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21900000 0 0 7367 590 6879 66099;66100;66101 84126;84127;84128 84126 381 3 DMTTGIVENK Unmodified 1106.5278 0.52777445 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 45.655 45.655 2 0.034228 43082 QUIQUE_C1438_190116_001 53.089 17.209 84144000 0 0 0 0 22486000 0 61658000 0 0 0 0 0 0 7368 2142 6880 66102;66103 84129;84130 84129 2 DMTVPILVSKPPVFTGK Unmodified 1828.0168 0.016842623 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.75 117.75 3 0.0016646 123688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.307 47.681 340570000 0 48491000 52225000 50880000 0 0 0 0 0 0 67894000 48498000 72579000 7369 2014 6881 66104;66105;66106;66107;66108;66109 84131;84132;84133;84134;84135;84136;84137;84138 84135 8 DMVGIAQTGSGK Oxidation (M) 1178.5601 0.56013721 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.267 23.267 2 0.00025939 16809 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.03 96.733 335100000 24653000 0 0 26271000 24584000 29849000 0 0 41949000 33272000 54824000 55455000 44242000 7370 381 6882 66110;66111;66112;66113;66114;66115;66116;66117;66118 84139;84140;84141;84142;84143;84144;84145;84146;84147;84148 84146 268 10 DMVGIAQTGSGK Unmodified 1162.5652 0.56522259 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 44.259 44.259 2 0.00047219 41380 QUIQUE_C1218_190116_001 108.43 82.695 219800000 84986000 78625000 0 0 0 0 0 56190000 0 0 0 0 0 7371 381 6882 66119;66120;66121 84149;84150;84151 84149 3 DMVGQVAITR Unmodified 1088.5648 0.56482866 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 61.511 61.511 2 0.0016837 60957 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.692 65.119 459040000 0 108070000 77458000 0 49904000 81625000 0 0 83005000 0 0 58969000 0 7372 903;2869 6883 66122;66123;66124;66125;66126;66127 84152;84153;84154;84155;84156;84157;84158 84158 7 DMVGQVAITR Oxidation (M) 1104.5597 0.55974328 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 1 0 1 1 40.739 40.739 2 0.024625 37154 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.153 42.642 108420000 0 0 0 0 0 0 0 47026000 0 61389000 0 0 0 7373 903;2869 6883 66128;66129 84159;84160 84159 2 DMVVDIQR Unmodified 974.48552 0.48551571 4543 Q9Y266 NUDC Nuclear migration protein nudC yes yes 0 0 0 1 1 1 1 59.184 59.184 2 0.020996 58193 QUIQUE_C1368_190116_001 75.854 55.572 316250000 0 0 78115000 0 0 0 68342000 0 0 0 81627000 0 88166000 7374 4543 6884 66130;66131;66132;66133 84161;84162;84163;84164 84161 4 DMVVQLIDDFK Unmodified 1321.6588 0.65878863 2808 P78362;C9J2M4;C9JWF7 SRPK2 SRSF protein kinase 2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 157.13 157.13 2 0.0023872 162459 QUIQUE_C1218_190116_001 78.655 55.227 50406000 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C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 48.232 48.232 2;3 4.8327E-31 45436 QUIQUE_DMIX5_190116_001 189.57 169.81 27563000000 701410000 926290000 1679700000 1250900000 1875600000 565610000 1685000000 4318800000 3777400000 168160000 3636500000 3681300000 3296300000 7380 1978 6890 66167;66168;66169;66170;66171;66172;66173;66174;66175;66176;66177;66178;66179;66180;66181;66182;66183;66184;66185;66186;66187;66188;66189 84225;84226;84227;84228;84229;84230;84231;84232;84233;84234;84235;84236;84237;84238;84239;84240;84241;84242;84243;84244;84245;84246;84247;84248;84249;84250;84251;84252;84253;84254;84255;84256 84248 30 DNALCENAR Unmodified 1061.456 0.45600649 272 A0A0D9SFU4;O95970;A0A1B0GUD3;A0A1B0GV33;A0A0D9SFH6;A0A0D9SFS5;A0A0D9SFE3;A0A1B0GTM5;A0A1B0GWB4 LGI1 Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 yes no 0 0 0 1 19.891 19.891 2 0.043052 12688 QUIQUE_C1576_190116_001 66.546 48.4 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7381 272 6891 66190 84257 84257 1 DNALLAQLIQDK Unmodified 1340.73 0.72997974 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 3 2 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 129.66 129.66 2;3 5.4551E-28 136108 QUIQUE_C1438_190116_001 181.68 150.19 19238000000 2805000000 2828100000 2076600000 2008900000 1401200000 1811000000 1753200000 157160000 499120000 1248100000 1086600000 803660000 759240000 7382 273;342 6892 66191;66192;66193;66194;66195;66196;66197;66198;66199;66200;66201;66202;66203;66204;66205;66206;66207;66208;66209 84258;84259;84260;84261;84262;84263;84264;84265;84266;84267;84268;84269;84270;84271;84272;84273;84274;84275;84276;84277;84278;84279;84280;84281;84282;84283;84284;84285;84286;84287;84288 84271 31 DNALLAQLIQDKLDAYK Unmodified 1931.0364 0.036392091 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 143.67 143.67 2;3 1.2066E-139 146823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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5 DNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDK Unmodified 3144.5285 0.52850932 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 2 1 141.84 141.84 3 9.7756E-15 147042 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.554 68.904 95402000 0 0 0 0 0 0 0 0 95402000 0 0 0 0 7385 273;342 6894 66239 84337;84338 84338 2 DNALLSAIEESR Unmodified 1316.6572 0.65720872 3574 Q8N1F7;H3BVG0;H3BM93;H3BNN5;H3BV11;H3BRI8 NUP93 Nuclear pore complex protein Nup93 yes no 0 0 0 1 119.32 119.32 2 0.011234 115782 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.198 40.418 14035000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14035000 0 0 0 7386 3574 6895 66240 84339 84339 1 DNAMLEYLK Unmodified 1095.527 0.52704617 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.569 99.569 2 0.0020253 101682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.635 70.11 3385000000 345660000 239870000 0 386420000 214390000 265180000 274850000 240460000 372000000 168060000 301390000 265450000 311230000 7387 859 6896 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P-component(1-203) yes yes 0 0 0 1 66.413 66.413 2 0.057322 67225 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.878 25.996 70157000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70157000 0 0 7400 1827 6908 66336 84446 84446 1 DNENVVNEYSSELEK Unmodified 1767.7799 0.77990263 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.592 94.592 2 2.8038E-44 97743 QUIQUE_C1218_190116_001 233 226.46 4026000000 255110000 359790000 296320000 554390000 492000000 114570000 494250000 106050000 108170000 229140000 505500000 125470000 385230000 7401 1824 6909 66337;66338;66339;66340;66341;66342;66343;66344;66345;66346;66347;66348;66349 84447;84448;84449;84450;84451;84452;84453;84454;84455;84456;84457;84458;84459;84460;84461;84462;84463;84464;84465 84447 19 DNETLAELK Unmodified 1031.5135 0.5135046 4333 Q9NYL9;H0YKU1;H0YNJ8 TMOD3 Tropomodulin-3 yes no 0 0 0 1 49.703 49.703 2 0.043333 47171 QUIQUE_C1277_190116_001 52.591 25.287 35733000 0 35733000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7402 4333 6910 66350 84466 84466 1 DNEVLLQIDKDVR Unmodified 1555.8206 0.82058566 4305 Q9NVG8 TBC1D13 TBC1 domain family member 13 yes yes 0 0 1 1 91.764 91.764 2 0.014817 94218 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.34 42.135 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7403 4305 6911 66351 84467 84467 1 DNFADVQVSVVDCPDLTKEPFTFPVK Unmodified 2966.4372 0.43717512 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PPB5;E9PIP1;E9PR95;E9PSC3;E9PLC5;E9PLB3 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 1 1 148.43 148.43 3 1.5683E-20 151350 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.58 104.78 33966000 0 0 0 0 0 0 0 33966000 0 0 0 0 0 7404 4127 6912 66352 84468 84468 1 DNFALIPEGTNGIEER Unmodified 1773.8533 0.85334235 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.99 111.99 2 4.3767E-09 114161 QUIQUE_C1563_190116_001 122.45 99.211 1851700000 151780000 133010000 136790000 149990000 131580000 132100000 147140000 131430000 145640000 117710000 182540000 163990000 127980000 7405 1430 6913 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84498;84499;84500 84500 3 DNFNVDEIFLK Unmodified 1352.6612 0.66123147 502 A0A3B3ITT1;Q6IQ22 RAB12 Ras-related protein Rab-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.51 137.51 2 0.00026011 142723 QUIQUE_C1368_190116_001 120.76 100.62 467640000 38424000 45353000 45776000 38334000 56262000 44882000 61207000 0 35887000 12318000 47704000 41489000 0 7408 502 6916 66380;66381;66382;66383;66384;66385;66386;66387;66388;66389;66390 84501;84502;84503;84504;84505;84506;84507;84508;84509;84510;84511;84512;84513 84504 12 DNFTAIPEGTNGVEER Unmodified 1747.8013 0.80130678 3051 Q14195;H0YBT4 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.2 78.2 2 1.8228E-07 75079 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.86 100 9241000000 575040000 578710000 731580000 755220000 0 479480000 641400000 821280000 1127600000 643910000 923110000 944030000 1019700000 7409 3051 6917 66391;66392;66393;66394;66395;66396;66397;66398;66399;66400;66401;66402 84514;84515;84516;84517;84518;84519;84520;84521;84522;84523;84524;84525 84522 5 DNFTLIPEGTNGTEER Unmodified 1791.8275 0.82752153 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 95.742 95.742 2;3 2.1605E-13 99335 QUIQUE_C1576_190116_001 161.1 145.9 52492000000 3752600000 3891300000 4107000000 3665600000 3577600000 3472500000 4396200000 3932400000 3748600000 2827300000 5104600000 4876100000 5139800000 7410 365 6918 66403;66404;66405;66406;66407;66408;66409;66410;66411;66412;66413;66414;66415;66416;66417;66418;66419;66420;66421;66422;66423;66424;66425;66426;66427 84526;84527;84528;84529;84530;84531;84532;84533;84534;84535;84536;84537;84538;84539;84540;84541;84542;84543;84544;84545;84546;84547;84548;84549;84550;84551;84552;84553;84554;84555;84556;84557;84558;84559;84560;84561;84562;84563;84564;84565;84566;84567;84568;84569 84546 44 DNFTLIPEGVNGIEER Unmodified 1801.8846 0.88464248 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 127.99 127.99 2;3 8.8568E-08 132021 QUIQUE_C1277_190116_001 118.2 93.643 13714000000 1226400000 1347800000 1233400000 1007300000 993070000 963100000 1098100000 1070500000 1295200000 633540000 1563800000 63704000 1218000000 7411 3050 6919 66428;66429;66430;66431;66432;66433;66434;66435;66436;66437;66438;66439;66440;66441;66442;66443;66444;66445;66446;66447;66448;66449;66450 84570;84571;84572;84573;84574;84575;84576;84577;84578;84579;84580;84581;84582;84583;84584;84585;84586;84587;84588;84589;84590;84591;84592;84593;84594;84595;84596;84597;84598;84599;84600;84601;84602;84603;84604 84576 35 DNFWEMGDTGPCGPCSEIHYDR Unmodified 2642.0261 0.026056469 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 116.27 116.27 3 2.1838E-11 119702 QUIQUE_C1277_190116_001 105.92 102.65 351280000 35610000 64655000 45928000 48982000 49812000 54342000 51947000 0 0 0 0 0 0 7412 2533 6920 66451;66452;66453;66454;66455;66456;66457 84605;84606;84607;84608;84609;84610;84611;84612;84613 84606 9 DNGDGTHTVHYTPATDGPYTVAVK Unmodified 2515.1615 0.16154562 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 2 2 1 61.608 61.608 3;4 2.9332E-06 61433 QUIQUE_C1576_190116_001 44.711 40.548 166620000 0 0 0 0 0 0 91489000 0 0 32707000 0 0 42429000 7413 3061 6921 66458;66459;66460;66461;66462 84614;84615;84616;84617;84618;84619 84615 6 DNGIRPSSLEQMAK Unmodified 1544.7617 0.76169057 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 59.246 59.246 2;3 2.5428E-05 57600 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.265 78.037 1094000000 100130000 49262000 128530000 133200000 41435000 64195000 0 151080000 149500000 51236000 0 134830000 90606000 7414 2660 6922 66463;66464;66465;66466;66467;66468;66469;66470;66471;66472;66473;66474;66475;66476;66477;66478;66479;66480 84620;84621;84622;84623;84624;84625;84626;84627;84628;84629;84630;84631;84632;84633;84634;84635;84636;84637;84638;84639;84640 84638 21 DNHFAIFIIPQGR Unmodified 1526.7994 0.7993967 3609 Q8N6R0 METTL13 Methyltransferase-like protein 13 yes yes 0 0 0 1 116.25 116.25 3 0.012766 119996 QUIQUE_DMIX7_190116_001 41.621 28.854 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7415 3609 6923 66481 84641 84641 1 DNHLAIER Unmodified 966.48829 0.4882929 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.491 20.491 2 0.014542 13160 QUIQUE_C1403_190116_001 85.862 35.735 799690000 84356000 142390000 0 124800000 0 107010000 116630000 0 0 0 111220000 0 113280000 7416 4172;346 6924 66482;66483;66484;66485;66486;66487;66488 84642;84643;84644;84645;84646;84647;84648 84644 7 DNHLLGTFDLTGIPPAPR Unmodified 1933.0058 0.005760665 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 4 1 2 5 2 3 4 3 5 1 2 3 2 128.3 128.3 2;3 7.2134E-08 132210 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.77 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6926 66526 84709 84709 1 DNHVVAAGGVEK Unmodified 1194.5993 0.59929991 3124 Q15274 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.791 15.791 2 0.00053101 7942 QUIQUE_C1403_190116_001 100.07 74.45 226710000 0 0 0 78308000 42098000 29566000 0 76743000 0 0 0 0 0 7419 3124 6927 66527;66528;66529;66530 84710;84711;84712;84713 84710 4 DNIACVILTFK Unmodified 1292.6799 0.67985842 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 138.65 138.65 2 0.00091167 134789 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.058 56.364 270190000 0 0 37794000 37552000 45003000 34296000 35299000 0 0 20571000 30299000 29370000 0 7420 2024 6928 66531;66532;66533;66534;66535;66536;66537;66538;66539;66540 84714;84715;84716;84717;84718;84719;84720;84721;84722;84723 84721 8 DNIACVILTFKEPFGTEGR Unmodified 2166.0779 0.07793933 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 143.87 143.87 3 2.5881E-06 147043 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.64 93.247 223740000 0 0 0 0 0 0 0 65034000 51329000 0 57429000 49952000 0 7421 2024 6929 66541;66542;66543;66544 84724;84725;84726;84727;84728 84724 5 DNIDITLQWLIQHSK Unmodified 1822.9577 0.95774784 3808;4308 Q96BM9;Q9NVJ2 ARL8A;ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8A;ADP-ribosylation factor-like protein 8B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.23 149.23 3 3.2214E-06 152207 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.2 85.921 269070000 33549000 25360000 30332000 15013000 26113000 26755000 32555000 11064000 22961000 0 27785000 17587000 0 7422 3808;4308 6930 66545;66546;66547;66548;66549;66550;66551;66552;66553;66554;66555;66556 84729;84730;84731;84732;84733;84734;84735;84736;84737;84738;84739;84740;84741 84737 13 DNIISDYDQIIDYVER Unmodified 1969.9269 0.92690122 3907 Q96MZ0;H0Y6A7;H0UIB3;Q5TE61;A0A087WWT8 GDAP1L1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 167.86 167.86 2;3 3.6235E-13 175045 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Unmodified 1324.7463 0.7462985 2762 P62805 HIST1H4A Histone H4 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 41.716 41.716 2;3 0.001045 38347 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.7 94.798 18944000000 1592400000 1539700000 454560000 547610000 1353100000 0 1600200000 2261400000 2550900000 381450000 2225000000 2281600000 2156500000 7428 2762 6936 66601;66602;66603;66604;66605;66606;66607;66608;66609;66610;66611;66612;66613;66614;66615;66616;66617;66618;66619;66620;66621 84789;84790;84791;84792;84793;84794;84795;84796;84797;84798;84799;84800;84801;84802;84803;84804;84805;84806;84807;84808;84809 84806 7 DNITNNTAAATVR Unmodified 1359.6743 0.67425577 407 A0A286YFF8;Q7Z3U7;F8VZV1 MON2 Protein MON2 homolog yes no 0 0 0 1 1 35.051 35.051 2 0.023846 30378 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.435 32.708 115800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26059000 89739000 7429 407 6937 66622;66623 84810;84811 84811 2 DNKIPSDLLDKEFLPILQEEPLPPLALVPFTEEEQR Unmodified 4172.1933 0.19329325 686 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85113 291 DNLAQQSFNMEQANYTIQSLK Unmodified 2442.1485 0.14853809 4359 Q9NZZ3 CHMP5 Charged multivesicular body protein 5 yes yes 0 0 0 1 132.45 132.45 2 8.2943E-65 136107 QUIQUE_C1403_190116_001 174.62 162.47 32488000 0 0 0 32488000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7436 4359 6943 66846 85204 85204 1 DNLEFFLAGIGR Unmodified 1350.6932 0.6932003 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.13 153.13 2 7.4933E-28 155542 QUIQUE_C1563_190116_001 179.81 165.04 1570800000 108230000 124310000 125430000 113530000 135680000 110010000 145590000 108180000 117200000 70858000 154960000 154630000 102140000 7437 2524 6944 66847;66848;66849;66850;66851;66852;66853;66854;66855;66856;66857;66858;66859 85205;85206;85207;85208;85209;85210;85211;85212;85213;85214;85215;85216;85217;85218;85219;85220;85221;85222 85212 17 DNLEWLAR Unmodified 1015.5087 0.50869399 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.105 91.105 2 0.014857 93681 QUIQUE_C1368_190116_001 129.56 90.772 356340000 0 0 90958000 78461000 0 0 0 0 75982000 0 0 0 110940000 7438 3954 6945 66860;66861;66862;66863 85223;85224;85225;85226 85223 1 DNLFEIITSSR Unmodified 1293.6565 0.65648044 83 A0A087WZ32;A0A087X038;A8K727;Q9HB19 PLEKHA2 Pleckstrin homology domain-containing family A member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.21 141.21 2 0.0019552 145973 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.335 8.9704 156160000 13973000 0 26623000 22026000 0 19112000 22286000 17740000 19890000 0 0 0 14512000 7439 83 6946 66864;66865;66866;66867;66868;66869;66870;66871;66872;66873 85227;85228;85229;85230;85231;85232;85233;85234;85235;85236 85234 10 DNLFEIVTTSR Unmodified 1293.6565 0.65648044 3290 Q5RGS4;Q9HB21 PLEKHA1 Pleckstrin homology domain-containing family A member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 124.41 124.41 2 0.0018061 130889 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.261 13.703 24907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24907000 0 0 7440 3290 6947 66874;66875;66876 85237;85238;85239 85239 3 DNLHAVFCLAENSVGPNATRPDDIHLLYSGK Unmodified 3422.6677 0.66773719 3639 Q8NDH3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 134.62 134.62 4 1.1161E-30 139296 QUIQUE_C1277_190116_001 95.244 85.616 312560000 0 59677000 79924000 54795000 48901000 0 0 0 0 0 69265000 0 0 7441 3639 6948 66877;66878;66879;66880;66881 85240;85241;85242;85243;85244;85245;85246 85240 7 DNLHQIDAVEGPAAFLDILAPPYDPDDGR Unmodified 3133.4993 0.4992581 3944 Q96SZ5 ADO 2-aminoethanethiol dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 168.26 168.26 3 1.1526E-15 169725 QUIQUE_C1563_190116_001 78.311 72.216 126970000 0 0 29737000 25616000 0 71619000 0 0 0 0 0 0 0 7442 3944 6949 66882;66883;66884 85247;85248;85249 85249 3 DNLIVPILEEEVQNSVSGESEA Unmodified 2370.1438 0.14382987 4746 S4R3N1;Q9Y3A3;B4DM50 HSPE1-MOB4;MOB4 MOB-like protein phocein yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 173.03 173.03 2;3 5.9986E-05 177694 QUIQUE_C1368_190116_001 81.632 74.903 521480000 71527000 88845000 47211000 54657000 82723000 0 0 44600000 60842000 0 0 0 71078000 7443 4746 6950 66885;66886;66887;66888;66889;66890;66891;66892;66893;66894;66895;66896;66897 85250;85251;85252;85253;85254;85255;85256;85257;85258;85259;85260;85261;85262 85254 2 DNLSYIEHIFEISR Unmodified 1734.8577 0.85769944 3114 Q15121 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 150.37 150.37 2;3 2.1349E-170 154542 QUIQUE_C1277_190116_001 265.22 241.37 9571100000 887540000 928800000 854230000 614360000 942750000 790490000 913870000 357930000 786240000 244050000 790430000 616870000 843570000 7444 3114 6951 66898;66899;66900;66901;66902;66903;66904;66905;66906;66907;66908;66909;66910;66911;66912;66913;66914;66915;66916;66917;66918;66919;66920;66921;66922;66923;66924 85263;85264;85265;85266;85267;85268;85269;85270;85271;85272;85273;85274;85275;85276;85277;85278;85279;85280;85281;85282;85283;85284;85285;85286;85287;85288;85289;85290;85291;85292;85293;85294;85295;85296;85297;85298;85299;85300 85269 38 DNLTLWTSDMQGDGEEQNK Oxidation (M) 2195.9277 0.92770586 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 93.324 93.324 2 3.1774E-172 96484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 242.79 231.85 1453400000 129800000 153960000 130530000 121780000 101570000 169730000 104350000 69419000 89612000 131870000 80043000 66580000 104140000 7445 2745 6952 66925;66926;66927;66928;66929;66930;66931;66932;66933;66934;66935;66936;66937;66938;66939 85301;85302;85303;85304;85305;85306;85307;85308;85309;85310;85311;85312;85313;85314;85315;85316;85317;85318;85319;85320;85321;85322;85323 85320 2175 23 DNLTLWTSDMQGDGEEQNK Unmodified 2179.9328 0.93279124 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 0 0 4 3 2 3 3 4 2 1 2 3 2 2 2 114.49 114.49 2;3 5.7355E-134 117092 QUIQUE_DMIX7_190116_001 280.9 265.87 6594900000 899830000 781100000 604980000 725140000 465930000 900070000 569980000 261590000 271800000 253480000 248250000 253170000 359560000 7446 2745 6952 66940;66941;66942;66943;66944;66945;66946;66947;66948;66949;66950;66951;66952;66953;66954;66955;66956;66957;66958;66959;66960;66961;66962;66963;66964;66965;66966;66967;66968;66969;66970;66971;66972 85324;85325;85326;85327;85328;85329;85330;85331;85332;85333;85334;85335;85336;85337;85338;85339;85340;85341;85342;85343;85344;85345;85346;85347;85348;85349;85350;85351;85352;85353;85354;85355;85356;85357;85358;85359;85360;85361;85362;85363;85364;85365;85366;85367;85368;85369;85370;85371;85372;85373 85369 49 DNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ Unmodified 3450.4641 0.46413074 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 140.79 140.79 2;3 6.9608E-53 143168 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.33 181.78 1937100000 103430000 136520000 96225000 108470000 99709000 90201000 124170000 270180000 171330000 0 216820000 321720000 198310000 7447 2745 6953 66973;66974;66975;66976;66977;66978;66979;66980;66981;66982;66983;66984;66985;66986;66987 85374;85375;85376;85377;85378;85379;85380;85381;85382;85383;85384;85385;85386;85387;85388;85389 85383 15 DNLTLWTSDMQGDGEEQNKEALQDVEDENQ Oxidation (M) 3466.459 0.45904536 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.48 129.48 3 2.2839E-24 131862 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.595 83.783 802230000 0 42955000 0 39129000 78871000 0 54898000 115290000 112880000 0 102780000 163160000 92259000 7448 2745 6953 66988;66989;66990;66991;66992;66993;66994;66995;66996 85390;85391;85392;85393;85394;85395;85396;85397;85398;85399;85400 85394 2175 11 DNLTLWTSDQQDDDGGEGNN Unmodified 2192.873 0.87302775 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 127.35 127.35 2 0.00031844 130353 QUIQUE_C1403_190116_001 100.69 92.179 802230000 61032000 70436000 0 48664000 78534000 75524000 86727000 58029000 37193000 0 119720000 91134000 75236000 7449 2736 6954 66997;66998;66999;67000;67001;67002;67003;67004;67005;67006;67007;67008 85401;85402;85403;85404;85405;85406;85407;85408;85409;85410;85411;85412;85413 85404 12 DNLTLWTSDTQGDEAEAGEGGEN Unmodified 2407.9888 0.98878579 2780 P63104;B0AZS6;B7Z2E6;H0YB80 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 132.04 132.04 2;3 2.017E-13 136438 QUIQUE_C1218_190116_001 149.3 148.96 417580000 47803000 0 0 74948000 41289000 70559000 46111000 0 24521000 0 0 68917000 43431000 7450 2780 6955 67009;67010;67011;67012;67013;67014;67015;67016;67017;67018;67019;67020 85414;85415;85416;85417;85418;85419;85420;85421;85422;85423;85424;85425;85426;85427 85414 14 DNLTLWTSENQGDEGDAGEGEN Unmodified 2349.9469 0.94692097 2341 P31946 YWHAB 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 126.43 126.43 2 2.702E-08 133621 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.22 123.9 525940000 0 61064000 33466000 45159000 52768000 41931000 46044000 38175000 35631000 0 45543000 63690000 62471000 7451 2341 6956 67021;67022;67023;67024;67025;67026;67027;67028;67029;67030;67031;67032 85428;85429;85430;85431;85432;85433;85434;85435;85436;85437;85438;85439;85440;85441;85442;85443 85439 14 DNMSVILICFPNAPK Oxidation (M) 1733.8481 0.84806274 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 126.92 126.92 2 0.0015748 131392 QUIQUE_C1368_190116_001 70.488 48.15 171030000 29125000 31436000 43317000 0 0 30733000 36415000 0 0 0 0 0 0 7452 2387 6957 67033;67034;67035;67036;67037 85444;85445;85446;85447;85448;85449 85447 1793 6 DNMSVILICFPNAPK Unmodified 1717.8531 0.85314811 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 141.13 141.13 2 3.5455E-13 146262 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dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 3 1 2 1 1 2 2 1 1 1 173.11 173.11 3 2.2567E-12 177571 QUIQUE_C1218_190116_001 68.207 61.254 1027400000 87662000 71351000 184570000 25691000 107850000 65531000 106800000 61814000 129310000 0 61900000 56998000 67932000 7458 2013 6962 67063;67064;67065;67066;67067;67068;67069;67070;67071;67072;67073;67074;67075;67076;67077;67078;67079;67080 85478;85479;85480;85481;85482;85483;85484;85485;85486;85487;85488;85489;85490;85491;85492;85493;85494;85495;85496;85497;85498 85478 1314 17 DNNPVVVLENELMYGVPFEFPPEAQSK Unmodified 3061.4743 0.47428891 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 3 2 1 2 3 2 1 2 3 176.04 176.04 3 2.788E-27 180038 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.01 99.107 1828200000 36848000 72097000 235450000 0 70626000 0 128430000 124850000 341410000 0 351620000 295800000 171100000 7459 2013 6962 67081;67082;67083;67084;67085;67086;67087;67088;67089;67090;67091;67092;67093;67094;67095;67096;67097;67098;67099;67100;67101 85499;85500;85501;85502;85503;85504;85505;85506;85507;85508;85509;85510;85511;85512;85513;85514;85515;85516;85517;85518;85519;85520;85521 85514 21 DNNQFASASLDR Unmodified 1336.6008 0.60075648 2380 P35606;D6R997 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 53.557 53.557 2 8.0965E-05 51757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.77 110.54 560360000 0 0 0 0 91750000 80757000 72677000 69092000 0 0 105350000 61857000 78878000 7460 2380 6963 67102;67103;67104;67105;67106;67107;67108 85522;85523;85524;85525;85526;85527;85528;85529 85525 7 DNPGVVTCLDEAR Unmodified 1444.6616 0.66164217 2197 P22314;Q5JRR9;Q5JRS0 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 3 1 1 1 1 1 1 1 69.364 69.364 2 1.4861E-07 68914 QUIQUE_C1403_190116_001 132.32 115.09 3588000000 0 404700000 348970000 377700000 483920000 358450000 465700000 147250000 89472000 126300000 249700000 222770000 313030000 7461 2197 6964 67109;67110;67111;67112;67113;67114;67115;67116;67117;67118;67119;67120;67121;67122;67123;67124 85530;85531;85532;85533;85534;85535;85536;85537;85538;85539;85540;85541;85542;85543;85544;85545;85546;85547;85548;85549;85550;85551;85552;85553 85535 22 DNPHFENGETSIVISDVLPGGPADGLLQENDR Unmodified 3404.6121 0.61205603 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;U3KQJ2;A0A3B3IU26;B1AN86 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 146.46 146.46 3 1.0458E-08 142470 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.783 49.816 63074000 0 0 0 0 0 0 0 0 50170000 12904000 0 0 0 7462 345 6965 67125;67126 85554;85555 85555 1 DNPHFQSGETSIVISDVLK Unmodified 2085.0378 0.037848654 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7;H0YKB1;H0YLT6 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 114.54 114.54 3 1.2126E-05 119512 QUIQUE_C1438_190116_001 65.954 57.135 307310000 71494000 0 0 0 67585000 0 0 67397000 0 44557000 0 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yes yes 0 0 0 1 79.396 79.396 2 0.044864 80728 QUIQUE_C1218_190116_001 49.536 35.888 16651000 16651000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7466 3802 6969 67147 85580 85580 1 DNPLNEGTDAAR Unmodified 1271.5742 0.57420737 637 B5MCD7;O43759 SYNGR1 Synaptogyrin-1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.315 38.315 2 0.00052969 35196 QUIQUE_C1218_190116_001 99.568 84.308 1471700000 113420000 146920000 132660000 111410000 143090000 96488000 145180000 104990000 109480000 0 143670000 114920000 109460000 7467 637 6970 67148;67149;67150;67151;67152;67153;67154;67155;67156;67157;67158;67159;67160 85581;85582;85583;85584;85585;85586;85587;85588;85589;85590;85591;85592;85593;85594;85595;85596;85597;85598;85599;85600;85601;85602 85581 19 DNQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTK Unmodified 3548.8304 0.83036907 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 1 1 137.14 137.14 4 0.0001555 141645 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.456 36.641 87876000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87876000 0 7468 1506 6971 67161 85603 85603 1 DNSGMIDKNELK Unmodified 1362.6449 0.64492948 1623 O75340;A0A024QZ42 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 31.388 31.388 2;3 0.00096031 25808 QUIQUE_C1563_190116_001 119.27 87.34 1040300000 148750000 161140000 90536000 92957000 133140000 89006000 106910000 30161000 53388000 0 61472000 0 72812000 7469 1623 6972 67162;67163;67164;67165;67166;67167;67168;67169;67170;67171;67172;67173;67174;67175 85604;85605;85606;85607;85608;85609;85610;85611;85612;85613;85614;85615;85616;85617 85612 13 DNSLFVPTPVQR Unmodified 1371.7147 0.71466402 3296 Q5SRE7 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 90.109 90.109 2 0.00030253 93679 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.7 99.028 1093300000 0 76770000 89189000 0 128900000 0 162450000 85240000 0 0 228700000 0 322100000 7470 3296 6973 67176;67177;67178;67179;67180;67181;67182 85618;85619;85620;85621;85622;85623;85624;85625 85624 7 DNSNLYMVMEYVPGGEMFSHLR Unmodified 2588.1498 0.14980042 167;2126 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1;P17612;Q15136;K7ERP6 PRKACB;PRKACA;KIN27 cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta;cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 162.55 162.55 2;3 2.8097E-45 169819 QUIQUE_DMIX5_190116_001 173.36 154.52 1028300000 0 93867000 131110000 49664000 52827000 40821000 0 0 192880000 0 346230000 0 120900000 7471 167;2126 6974 67183;67184;67185;67186;67187;67188;67189;67190;67191 85626;85627;85628;85629;85630;85631;85632;85633;85634 85633 9 DNSQVNAVTVLTLLDK Unmodified 1728.9258 0.92577901 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 0 0 0 1 152.74 152.74 2 0.010852 160358 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.649 50.662 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7472 1751 6975 67192 85635 85635 1 DNSTMGYMAAK Oxidation (M) 1203.49 0.49000874 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 24.779 24.779 2 0.00053774 17838 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1 15.605 15.605 2 0.0018557 7609 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.862 77.521 112100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112100000 0 0 0 7475 1931 6976 67217 85668 85668 1159;1160 1 DNSTMGYMMAK Unmodified 1247.4985 0.49846494 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.127 63.127 2 0.0013193 61588 QUIQUE_C1563_190116_001 86.67 68.762 470870000 60888000 87250000 0 90936000 0 73638000 0 51643000 48169000 0 0 0 58349000 7476 1938 6977 67218;67219;67220;67221;67222;67223;67224 85669;85670;85671;85672;85673;85674;85675;85676 85673 5 DNSTMGYMMAK 3 Oxidation (M) 1295.4832 0.4832088 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 3 0 1 1 15.705 15.705 2 0.0021927 8183 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.168 76.272 79308000 0 0 0 0 0 0 0 24799000 0 54509000 0 0 0 7477 1938 6977 67225;67226 85677;85678 85677 1175;1176;1177 2 DNTIEHLLPLFLAQLK Unmodified 1864.0458 0.045834566 2309 P30153;B3KQV6 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 3 1 1 1 2 1 168.17 168.17 2;3 1.2347E-28 162303 QUIQUE_DMIX4_190116_001 172.57 140.08 12213000000 1173400000 1405600000 3524200000 1107500000 846130000 2753900000 0 150640000 243620000 102050000 0 698180000 208160000 7478 2309 6978 67227;67228;67229;67230;67231;67232;67233;67234;67235;67236;67237;67238;67239;67240;67241 85679;85680;85681;85682;85683;85684;85685;85686;85687;85688;85689;85690;85691;85692;85693 85690 10 DNTIEHLLPLFLAQLKDECPEVR Unmodified 2749.4109 0.41090079 2309 P30153;B3KQV6 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 2 3 2 163.64 163.64 3;4 1.627E-179 168285 QUIQUE_DMIX3_190116_001 235.76 228.22 12365000000 410630000 601680000 1040400000 440160000 910500000 430410000 1409300000 805320000 782350000 52398000 990070000 2810500000 1681600000 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77.4 2;3 3.1962E-13 77982 QUIQUE_C1277_190116_001 109.79 79.986 257360000 64124000 0 0 0 0 0 106980000 0 0 0 86251000 0 0 7483 3726 6983 67304;67305;67306;67307;67308;67309;67310;67311;67312 85781;85782;85783;85784;85785;85786;85787;85788;85789 85783 9 DNTTLLTQVQTTMR Oxidation (M) 1636.809 0.80903469 3011 Q13561;H0YI98 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.692 76.692 2 2.416E-10 76302 QUIQUE_C1563_190116_001 134.75 93.354 631860000 83227000 89919000 57234000 54711000 43346000 48436000 0 41038000 54427000 29682000 58956000 38724000 32162000 7484 3011 6984 67313;67314;67315;67316;67317;67318;67319;67320;67321;67322;67323;67324;67325 85790;85791;85792;85793;85794;85795;85796;85797;85798;85799;85800;85801;85802 85795 2458 13 DNTTLLTQVQTTMR Unmodified 1620.8141 0.81412007 3011 Q13561;H0YI98 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.37 106.37 2 1.7039E-17 109465 QUIQUE_C1403_190116_001 151.98 135.72 2293800000 277340000 295640000 0 274080000 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161680000 7491 959 6990 67393;67394;67395;67396;67397;67398;67399;67400;67401;67402;67403;67404;67405 85875;85876;85877;85878;85879;85880;85881;85882;85883;85884;85885;85886;85887;85888;85889;85890;85891;85892;85893;85894;85895;85896 85891 19 DNYLFLK Unmodified 911.47527 0.4752686 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.461 90.461 2 0.02099 93579 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.42 69.828 6052500000 513390000 311520000 360740000 495600000 500640000 543110000 677510000 0 385520000 394570000 678380000 512240000 679310000 7492 4560 6991 67406;67407;67408;67409;67410;67411;67412;67413;67414;67415;67416;67417 85897;85898;85899;85900;85901;85902;85903;85904;85905;85906;85907;85908;85909;85910;85911;85912;85913;85914;85915;85916;85917;85918;85919;85920 85914 24 DNYSPGWK Unmodified 965.4243 0.42429566 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 42.353 42.353 2 0.027098 36837 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.984 60.514 45836000 29368000 0 0 0 0 0 0 0 0 16468000 0 0 0 7493 1929 6992 67418;67419 85921;85922 85922 2 DNYVPEVSALDQEIIEVDPDTK Unmodified 2488.1857 0.18569468 1183 H3BNC9;P08708;H0YN88;A0A075B716 RPS17 40S ribosomal protein S17 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 153.42 153.42 2;3 9.1748E-05 158610 QUIQUE_C1368_190116_001 67.605 56.661 175560000 50993000 0 25023000 0 0 49960000 24430000 0 0 25148000 0 0 0 7494 1183 6993 67420;67421;67422;67423;67424;67425;67426 85923;85924;85925;85926;85927;85928;85929 85925 6 DNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLK Unmodified 2989.4478 0.44779938 1183 H3BNC9;P08708;H0YN88;A0A075B716 RPS17 40S ribosomal protein S17 yes no 0 0 1 1 153.89 153.89 3 0.0070575 156557 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.835 27.74 33769000 0 0 0 0 0 0 0 33769000 0 0 0 0 0 7495 1183 6994 67427 85930 85930 1 DPAAAPATGNR Unmodified 1039.5047 0.50467125 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 13.705 13.705 2 0.048528 5638 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2 yes yes 0 0 0 1 49.33 49.33 2 0.00061849 46763 QUIQUE_C1403_190116_001 78.486 67.538 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7501 3612 7000 67468 85976 85976 1 DPAGIFELVELVGNGTYGQVYK Unmodified 2368.1951 0.19507758 4473 Q9UKE5;C9JVV1 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes no 0 0 0 1 1 173.29 173.29 3 5.2292E-05 176659 QUIQUE_C1277_190116_001 48.229 44.425 11565000 0 8129600 0 0 0 0 0 0 0 3435400 0 0 0 7502 4473 7001 67469;67470 85977;85978 85977 2 DPASDQMQHWK Unmodified 1341.5772 0.57718426 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 42.173 42.173 2 0.003944 39005 QUIQUE_C1277_190116_001 72.638 53.367 106940000 0 34509000 30414000 0 0 42020000 0 0 0 0 0 0 0 7503 1849 7002 67471;67472;67473;67474 85979;85980;85981;85982 85980 3 DPASDQMQHWK Oxidation (M) 1357.5721 0.57209888 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 1 0 1 20.801 20.801 2 0.054434 13502 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.39 35.239 10077000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10077000 0 0 0 7504 1849 7002 67475 85983 85983 1 DPASGTALQEISFWLNLER Unmodified 2146.0695 0.069483134 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 172.54 172.54 2;3 8.7291E-05 176348 QUIQUE_DMIX7_190116_001 109.22 77.581 78554000 0 0 0 0 0 0 0 0 10194000 0 25119000 43241000 0 7505 3053 7003 67476;67477;67478;67479 85984;85985;85986;85987 85987 4 DPCPHQVDCFLSR Unmodified 1629.7028 0.70279548 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 65.592 65.592 2;3 0.010833 64834 QUIQUE_C1368_190116_001 66.289 51.598 86670000 0 27665000 15575000 0 0 32962000 0 0 0 10468000 0 0 0 7506 2123 7004 67480;67481;67482;67483 85988;85989;85990;85991 85989 4 DPCPHQVDCFLSRPTEK Unmodified 2084.9408 0.94079392 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.748 55.748 3 0.00020954 54353 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.449 62.582 444440000 0 57578000 81826000 57001000 42234000 47704000 75817000 82278000 0 0 0 0 0 7507 2123 7005 67484;67485;67486;67487;67488;67489;67490;67491 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Unmodified 2025.0452 0.045242218 3645 Q8NEU8;H0YH86;F8VS86 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 169.99 169.99 2;3 3.5808E-09 171575 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.42 103.91 52306000 11032000 12039000 0 6695600 0 0 0 18150000 0 4390100 0 0 0 7523 3645 7019 67660;67661;67662;67663;67664;67665 86252;86253;86254;86255;86256;86257 86256 5 DPEAPIFQVADYGIVADLFK Unmodified 2207.115 0.11503634 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL83 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 173.95 173.95 2;3 4.0254E-09 175244 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.37 120.81 1572700000 67375000 103510000 121120000 25763000 157290000 0 305720000 140680000 213380000 10328000 176010000 180810000 70758000 7524 2067 7020 67666;67667;67668;67669;67670;67671;67672;67673;67674;67675;67676;67677;67678;67679;67680;67681;67682;67683;67684;67685;67686 86258;86259;86260;86261;86262;86263;86264;86265;86266;86267;86268;86269;86270;86271;86272;86273;86274;86275;86276;86277;86278;86279;86280 86270 23 DPECLLVATDR Unmodified 1287.6129 0.61290107 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.089 79.089 2 0.00012016 78575 QUIQUE_C1563_190116_001 130.66 108.42 811340000 127060000 115110000 103610000 87449000 83384000 141750000 81932000 0 0 38573000 0 32477000 0 7525 3859 7021 67687;67688;67689;67690;67691;67692;67693;67694;67695 86281;86282;86283;86284;86285;86286;86287;86288;86289 86286 8 DPECLLVATDRDPWHPLSDGSR Unmodified 2535.1812 0.1812352 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 1 1 1 111.33 111.33 3 2.7717E-08 115912 QUIQUE_C1218_190116_001 88.872 80.481 121870000 57488000 0 64383000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7526 3859 7022 67696;67697 86290;86291;86292 86291 3 DPEEIEKEEQAAAEK Unmodified 1714.7897 0.78973904 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 1 1 1 1 1 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42.802 2;3 0.00047841 38599 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.97 78.546 3326200000 211940000 235060000 275290000 390400000 424170000 231030000 487580000 121710000 198140000 48889000 221860000 193530000 286610000 7545 50;2631 7041 67826;67827;67828;67829;67830;67831;67832;67833;67834;67835;67836;67837;67838;67839;67840;67841;67842;67843;67844;67845;67846 86465;86466;86467;86468;86469;86470;86471;86472;86473;86474;86475;86476;86477;86478;86479;86480;86481;86482;86483;86484;86485;86486;86487;86488;86489;86490;86491;86492;86493;86494 86492 28 DPILFPSFIHSQK Unmodified 1527.8086 0.80856441 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 110.75 110.75 2;3 0.00011524 114345 QUIQUE_C1403_190116_001 92.856 75.455 1296200000 156490000 126490000 122440000 112410000 259210000 125820000 0 40969000 77303000 63583000 99759000 0 111710000 7546 1849 7042 67847;67848;67849;67850;67851;67852;67853;67854;67855;67856;67857;67858;67859;67860 86495;86496;86497;86498;86499;86500;86501;86502;86503;86504;86505;86506;86507;86508;86509;86510;86511;86512;86513;86514;86515;86516;86517;86518 86505 22 DPIVNVWYSVNGER Unmodified 1646.8053 0.80526994 2988 Q13347;Q5TFK1 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes no 0 0 0 1 20.765 20.765 3 0.052521 13937 QUIQUE_DMIX1_190116_001 20.236 0 58138000 0 0 0 0 0 0 0 58138000 0 0 0 0 0 7547 2988 7043 67861 86519 86519 1 DPLADLNIK Unmodified 997.54441 0.5444108 907 E9PDG8;O60641 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 89.312 89.312 2 0.0078419 92712 QUIQUE_C1218_190116_001 80.455 52.826 190930000 74700000 39237000 0 38475000 20671000 17846000 0 0 0 0 0 0 0 7548 907 7044 67862;67863;67864;67865;67866 86520;86521;86522;86523;86524;86525 86521 6 DPLADLNIKDFL Unmodified 1372.7238 0.72383172 907 E9PDG8;O60641 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 163.82 163.82 2 8.1814E-12 167396 QUIQUE_C1277_190116_001 155.11 136.44 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DPLYIGLR Unmodified 945.52837 0.5283668 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 88.776 88.776 2 0.0055063 89793 QUIQUE_C1563_190116_001 105.2 75.89 91612000 0 15839000 23518000 0 17023000 19764000 15468000 0 0 0 0 0 0 7559 2504 7055 67940;67941;67942;67943;67944;67945 86621;86622;86623;86624;86625;86626;86627 86626 7 DPNAFLFDHLLTLKPVK Unmodified 1967.088 0.088033731 3439 Q7L2H7;J3KNJ2;H0YCQ8 EIF3M Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.34 133.34 3 8.6942E-06 137983 QUIQUE_C1368_190116_001 101.67 97.571 769870000 137090000 90313000 127460000 75067000 97849000 0 99322000 0 45520000 40913000 0 0 56339000 7560 3439 7056 67946;67947;67948;67949;67950;67951;67952;67953;67954 86628;86629;86630;86631;86632;86633;86634;86635;86636 86630 9 DPNIVIAK Unmodified 868.50182 0.5018177 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.682 40.682 2 0.0078552 35434 QUIQUE_DMIX4_190116_001 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86901 5 DPSIHSVNVFQGHTDTVTSAVFTVGDNVVSGSDDR Unmodified 3658.7136 0.71356099 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 134.58 134.58 4 6.753E-05 130817 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.662 31.33 35320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35320000 0 0 0 7584 498 7079 68154 86904 86904 1 DPSLLINACLNK Unmodified 1356.7071 0.7071358 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 no no 0 0 0 1 1 99.293 99.293 2 0.0040362 101080 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.806 74.037 40162000 0 0 0 0 0 14969000 0 25193000 0 0 0 0 0 7585 4137 7080 68155;68156 86905;86906 86906 1 DPSLPLLELQDIMTSVSGR Unmodified 2070.0667 0.066705942 2964 Q13085 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 173.72 173.72 2 1.4536E-37 178009 QUIQUE_C1218_190116_001 194.85 182.49 57581000 19266000 16073000 0 0 10317000 0 0 0 11925000 0 0 0 0 7586 2964 7081 68157;68158;68159;68160 86907;86908;86909;86910 86907 4 DPSQELEFIADILNQDAK Unmodified 2044.9953 0.99531514 2525 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mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 166.39 166.39 2 0.00024716 160320 QUIQUE_DMIX4_190116_001 109.24 93.48 35827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10381000 0 25446000 0 7594 2188 7089 68254;68255;68256;68257;68258 87021;87022;87023;87024;87025 87023 4 DPTFIPAPIQAK Unmodified 1296.7078 0.70778773 1801 P01019 AGT Angiotensinogen;Angiotensin-1;Angiotensin-2;Angiotensin-3;Angiotensin-4;Angiotensin 1-9;Angiotensin 1-7;Angiotensin 1-5;Angiotensin 1-4 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.688 93.688 2 0.00088269 94881 QUIQUE_C1563_190116_001 86.136 68.662 498790000 0 81809000 0 37334000 67791000 54077000 46864000 38869000 0 25703000 65080000 41901000 39362000 7595 1801 7090 68259;68260;68261;68262;68263;68264;68265;68266;68267;68268;68269;68270;68271 87026;87027;87028;87029;87030;87031;87032;87033;87034;87035;87036;87037;87038;87039;87040 87033 14 DPTSLLGVLQAEADSTSEGLEDAVHSR Unmodified 2796.3414 0.34136048 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 166.65 166.65 3 4.7676E-09 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87147;87148;87149;87150;87151;87152;87153;87154;87155;87156;87157;87158;87159;87160;87161;87162;87163 87157 17 DPWHPLSDGSR Unmodified 1265.5789 0.57889882 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 51.333 51.333 2;3 0.014019 48700 QUIQUE_C1277_190116_001 58.955 41.724 347310000 106640000 104250000 0 0 0 0 0 61780000 48618000 26026000 0 0 0 7605 3859 7100 68348;68349;68350;68351;68352 87164;87165;87166;87167;87168 87165 5 DPWPVPQGK Unmodified 1022.5185 0.5185304 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 62.232 62.232 2 0.018094 62253 QUIQUE_C1438_190116_001 64.567 49.898 40176000 0 0 0 0 30493000 0 0 0 0 9683500 0 0 0 7606 1007 7101 68353;68354 87169;87170;87171 87169 3 DPWYSWDQPGLR Unmodified 1518.6892 0.68917755 1710 O95169;E9PQ68;K9J7I2 NDUFB8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.4 126.4 2 0.0029836 131016 QUIQUE_C1368_190116_001 106.2 90.308 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Unmodified 1853.8982 0.89818405 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 124.82 124.82 2;3 7.1622E-257 121759 QUIQUE_DMIX4_190116_001 296.28 279.9 2508800000 381620000 316290000 268130000 87809000 240650000 95765000 238260000 201990000 148350000 189160000 190580000 150180000 0 7613 3117 7105 68440;68441;68442;68443;68444;68445;68446;68447;68448;68449;68450;68451;68452;68453;68454;68455;68456;68457 87281;87282;87283;87284;87285;87286;87287;87288;87289;87290;87291;87292;87293;87294;87295;87296;87297;87298;87299;87300;87301;87302;87303;87304;87305;87306;87307 87301 26 DPYTGQSVSLFQALK Unmodified 1652.841 0.84098675 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.68 128.68 2 4.2214E-29 133337 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.11 153.16 6896000000 579660000 631460000 683940000 254110000 596360000 261500000 602810000 386810000 606730000 448340000 799900000 612150000 432220000 7614 3117 7106 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Unmodified 1361.6398 0.63978452 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.444 97.444 2 4.094E-08 100109 QUIQUE_C1277_190116_001 152.34 126.78 914110000 0 97280000 102420000 92332000 0 79780000 99791000 85694000 0 0 139260000 104790000 112760000 7617 1472 7109 68487;68488;68489;68490;68491;68492;68493;68494;68495 87349;87350;87351;87352;87353;87354;87355;87356;87357;87358 87350 10 DQAGEYECSAENDVSFPDVR Unmodified 2286.9335 0.93351952 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 106.64 106.64 2;3 1.0246E-87 111693 QUIQUE_C1438_190116_001 202.82 190.46 481670000 28509000 93120000 96833000 93107000 50066000 38840000 81195000 0 0 0 0 0 0 7618 3455 7110 68496;68497;68498;68499;68500;68501;68502;68503;68504;68505 87359;87360;87361;87362;87363;87364;87365;87366;87367;87368;87369 87367 11 DQALILMNAR Unmodified 1143.607 0.60702783 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 1 81.913 81.913 2 0.050783 83390 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87380;87381;87382;87383;87384;87385;87386;87387;87388;87389;87390;87391;87392;87393;87394;87395;87396;87397;87398;87399 87384 20 DQASQLLAGTEATLGHAK Unmodified 1809.9221 0.92209062 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.818 99.818 3 0.0012847 97579 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.427 44.088 310150000 0 0 0 0 67809000 0 0 56221000 70372000 26954000 88790000 0 0 7622 1492 7114 68532;68533;68534;68535;68536;68537 87400;87401;87402;87403;87404;87405 87403 5 DQAVENILVSPVVVASSLGLVSLGGK Unmodified 2550.4269 0.42686843 2565 P50454;E9PR70;E9PPV6;E9PJH8;E9PIG2;E9PRS3;E9PNX1;E9PK86;E9PMI5;E9PLA6 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 174.07 174.07 2;3 5.2099E-05 178636 QUIQUE_C1368_190116_001 46.938 44.014 229950000 0 0 20588000 0 96788000 0 85442000 0 0 0 27128000 0 0 7623 2565 7115 68538;68539;68540;68541;68542 87406;87407;87408;87409;87410;87411;87412 87406 7 DQDELKPGPTNR Unmodified 1368.6634 0.66335673 3045 Q14151 SAFB2 Scaffold attachment factor B2 yes yes 0 0 1 1 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68566;68567;68568;68569 87436;87437;87438;87439 87436 4 DQDLEPGAPSMGAK Oxidation (M) 1430.6348 0.63475872 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 31.367 31.367 2 0.00039439 26445 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.032 63.473 90014000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44454000 45560000 0 7630 1929 7122 68570;68571;68572;68573 87440;87441;87442;87443 87442 1155 4 DQDLEPGAPSMGAK Unmodified 1414.6398 0.6398441 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 52.003 52.003 2 0.045416 50922 QUIQUE_C1438_190116_001 48.468 22.084 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7631 1929 7122 68574 87444 87444 1 DQDLNTYSLLAVFAATDGGITR Unmodified 2340.1598 0.1597547 715 C9JE82;C9JVC9;Q9NY47 CACNA2D2 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 170.57 170.57 2 1.4007E-20 176674 QUIQUE_C1438_190116_001 129.05 115.64 43635000 0 0 0 9059900 15002000 0 0 0 0 0 0 0 19573000 7632 715 7123 68575;68576;68577 87445;87446;87447 87446 3 DQDLTQEIAMEHFVK Unmodified 1802.8509 0.85089951 4496 Q9ULX6 AKAP8L A-kinase anchor protein 8-like yes yes 0 0 0 1 102.69 102.69 3 0.0025759 107679 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.823 43.408 33454000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33454000 0 0 7633 4496 7124 68578 87448 87448 1 DQDNMQAELNR Unmodified 1332.5728 0.57282717 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.446 42.446 2 5.1575E-08 38899 QUIQUE_C1403_190116_001 150.66 141.15 248190000 23732000 21365000 30563000 32841000 0 0 30869000 0 33339000 0 36810000 38668000 0 7634 2355 7125 68579;68580;68581;68582;68583;68584;68585;68586;68587;68588 87449;87450;87451;87452;87453;87454;87455;87456;87457;87458;87459 87452 10 DQDTLIQHGIHDGLTVHLVIK Unmodified 2351.2597 0.25974352 4433 Q9UHD9 UBQLN2 Ubiquilin-2 yes yes 0 0 0 1 104.21 104.21 4 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ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 4 2 3 2 2 2 3 3 3 1 2 2 2 176.08 176.08 2;3 0 181073 QUIQUE_C1576_190116_001 336.68 286.57 24364000000 321340000 479830000 900930000 114930000 816480000 548020000 1602500000 961750000 2533600000 62343000 7384000000 7342800000 1296000000 7638 1900;1046 7129 68604;68605;68606;68607;68608;68609;68610;68611;68612;68613;68614;68615;68616;68617;68618;68619;68620;68621;68622;68623;68624;68625;68626;68627;68628;68629;68630;68631;68632;68633;68634 87476;87477;87478;87479;87480;87481;87482;87483;87484;87485;87486;87487;87488;87489;87490;87491;87492;87493;87494;87495;87496;87497;87498;87499;87500;87501;87502;87503;87504;87505;87506;87507;87508;87509;87510;87511;87512;87513 87494 37 DQELYFFHELSPGSCFFLPK Unmodified 2460.146 0.1460189 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 158.21 158.21 2;3 0.0011202 164061 QUIQUE_C1576_190116_001 58.831 54.201 65337000 0 0 0 0 0 0 35889000 29448000 0 0 0 0 0 7639 2253 7130 68635;68636;68637;68638;68639 87514;87515;87516;87517;87518 87517 5 DQEPIPQNIDR Unmodified 1323.6419 0.64189301 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;H0Y314 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 51.447 51.447 2 0.00045939 48785 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.5 75.348 26366000 0 0 0 0 0 0 0 26366000 0 0 0 0 0 7640 1187 7131 68640 87519 87519 1 DQEPTTDMLK Unmodified 1176.5333 0.53325376 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 49.242 49.242 2 0.01605 47051 QUIQUE_C1368_190116_001 88.136 49.33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7641 2009 7132 68641 87520 87520 1 DQEVLLQTFLDDASPGDKR Unmodified 2146.0542 0.054227 1854 P04114;A8MUN2 APOB Apolipoprotein B-100;Apolipoprotein B-48 yes no 0 0 1 1 111.29 111.29 2 0.051784 116662 QUIQUE_C1438_190116_001 36.982 20.844 34808000 0 0 0 0 34808000 0 0 0 0 0 0 0 0 7642 1854 7133 68642 87521 87521 1 DQEVLLQTGR Unmodified 1157.6041 0.60405094 2605;827 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68653;68654;68655;68656;68657;68658;68659;68660;68661;68662;68663;68664;68665;68666;68667;68668;68669;68670 87532;87533;87534;87535;87536;87537;87538;87539;87540;87541;87542;87543;87544;87545;87546;87547;87548;87549;87550;87551;87552;87553 87545 22 DQFGFINYEVGDSK Unmodified 1617.7311 0.73110195 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 122.6 122.6 2 0.0034612 126895 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.021 73.341 123260000 0 0 35916000 0 25264000 0 40006000 0 0 22070000 0 0 0 7646 1645 7137 68671;68672;68673;68674;68675 87554;87555;87556;87557;87558 87558 3 DQFNLIVFSTEATQWRPSLVPASAENVNK Unmodified 3260.6466 0.64659104 669 B7ZKJ8;Q14624;H7C0L5 ITIH4 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 yes no 0 0 1 1 1 1 159.7 159.7 3 1.6504E-25 166222 QUIQUE_C1438_190116_001 102.65 92.501 155360000 0 0 0 0 73701000 0 39250000 0 0 0 42405000 0 0 7647 669 7138 68676;68677;68678 87559;87560;87561;87562 87559 3 DQFNSHIQLVR Unmodified 1355.6946 0.69459728 964 E9PN76;Q8ND24 RNF214 RING finger protein 214 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.824 58.824 3 0.0026371 57575 QUIQUE_C1368_190116_001 63.624 52.305 126050000 0 23819000 22636000 0 0 0 22280000 0 25875000 0 31439000 0 0 7648 964 7139 68679;68680;68681;68682;68683;68684 87563;87564;87565;87566;87567;87568 87564 6 DQFPEVYVPTVFENYIADIEVDGK Unmodified 2786.3327 0.33269327 1937 Q5JR08;P08134;E9PQH6;Q5JR07;Q5JR05 RHOC Rho-related GTP-binding protein RhoC no no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 173.15 173.15 2;3 4.7412E-07 177518 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.981 63.332 562190000 0 0 10099000 0 12962000 0 46289000 38005000 210670000 0 177720000 42070000 24378000 7649 1937 7140 68685;68686;68687;68688;68689;68690;68691;68692;68693;68694 87569;87570;87571;87572;87573;87574;87575;87576;87577;87578;87579 87574 11 DQFPEVYVPTVFENYVADIEVDGK Unmodified 2772.317 0.31704321 2725 P61586;C9JNR4;C9JX21;C9JRM1 RHOA Transforming protein RhoA yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 171.71 171.71 2;3 1.1459E-13 174960 QUIQUE_C1277_190116_001 76.471 69.967 2483500000 56092000 58307000 81480000 18835000 183400000 52126000 166150000 207970000 554750000 7653800 619360000 204850000 272490000 7650 2725 7141 68695;68696;68697;68698;68699;68700;68701;68702;68703;68704;68705;68706;68707;68708;68709;68710;68711;68712;68713;68714 87580;87581;87582;87583;87584;87585;87586;87587;87588;87589;87590;87591;87592;87593;87594;87595;87596;87597;87598;87599;87600;87601;87602;87603;87604 87582 24 DQFSPDDFLGR Unmodified 1295.5782 0.57823012 3161 Q15811 ITSN1 Intersectin-1 no no 0 0 0 1 115.66 115.66 2 0.042645 117913 QUIQUE_C1563_190116_001 52.725 27.588 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 7651 3161 7142 68715 87605 87605 1 DQFTTTEVNMAR Unmodified 1411.6402 0.64017845 2729 P61758;B4DWR3 VBP1 Prefoldin subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.252 66.252 2 0.0002832 64795 QUIQUE_C1563_190116_001 137.98 98.429 687380000 0 119130000 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A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RJE6;A0A2R8Y4X6;A0A2R8Y5E8;P12081;B3KWE1 HARS2;HARS Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial;Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.128 80.128 2 0.00169 81901 QUIQUE_C1576_190116_001 94.692 9.48 508920000 0 83870000 0 0 86170000 0 99932000 0 76731000 42919000 119300000 0 0 7655 413;2035 7146 68734;68735;68736;68737;68738;68739 87624;87625;87626;87627;87628;87629 87626 5 DQGGYTMHQDQEGDTDAGLK Oxidation (M) 2180.8917 0.8916547 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L2Z2 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 31.227 31.227 2;3 1.2482E-24 26283 QUIQUE_C1218_190116_001 138.07 134.84 291090000 61853000 56237000 57028000 0 40726000 38215000 0 0 0 37034000 0 0 0 7656 291 7147 68740;68741;68742;68743;68744;68745;68746;68747 87630;87631;87632;87633;87634;87635;87636;87637;87638;87639 87630 217 10 DQGGYTMHQDQEGDTDAGLK Unmodified 2164.8967 0.89674008 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L2Z2 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 43.867 43.867 2;3 4.3678E-10 40241 QUIQUE_C1403_190116_001 89.484 67.927 346830000 107130000 57854000 0 81435000 54851000 0 0 0 0 45556000 0 0 0 7657 291 7147 68748;68749;68750;68751;68752;68753;68754;68755 87640;87641;87642;87643;87644;87645;87646;87647;87648 87644 7 DQGPAVPEPLK Unmodified 1149.603 0.60298831 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.652 58.652 2 0.0025472 57721 QUIQUE_C1576_190116_001 77.662 40.104 670880000 82279000 69720000 0 82424000 68752000 60583000 65457000 0 74330000 21606000 0 62673000 83062000 7658 3889 7148 68756;68757;68758;68759;68760;68761;68762;68763;68764;68765 87649;87650;87651;87652;87653;87654;87655;87656;87657;87658;87659 87654 11 DQGPIVPAPVK Unmodified 1119.6288 0.62880913 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.683 51.683 2 0.0034836 49161 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regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 172.23 172.23 3 1.5994E-30 178285 QUIQUE_C1438_190116_001 96.123 78.476 39386000 0 0 0 0 39386000 0 0 0 0 0 0 0 0 7662 1615 7152 68783 87677 87677 1 DQGSYTCVASTELDQDLAK Unmodified 2099.9317 0.9317286 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.46 104.46 2 1.1054E-151 109031 QUIQUE_C1438_190116_001 236.55 205.48 668660000 77415000 91401000 0 74485000 74587000 58100000 98017000 0 26989000 16524000 63206000 41759000 46174000 7663 1214;1691 7153 68784;68785;68786;68787;68788;68789;68790;68791;68792;68793;68794 87678;87679;87680;87681;87682;87683;87684;87685;87686;87687;87688;87689;87690;87691;87692 87684 15 DQGTYEDYVEGLR Unmodified 1543.6791 0.67906638 1048 F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;G3V1Y7;F8VPF3;F8VZU9;F8W180;H0YI43 MYL6 Myosin light polypeptide 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.59 103.59 2 7.5087E-08 108217 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.96 130.72 1575800000 211430000 192100000 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88132;88133;88134;88135;88136;88137;88138;88139;88140;88141;88142;88143;88144;88145;88146;88147;88148;88149;88150;88151;88152;88153;88154;88155;88156;88157;88158;88159;88160;88161;88162;88163;88164;88165;88166;88167;88168;88169;88170;88171;88172;88173;88174;88175;88176 88166 1214 43 DQQEAALVDMVNDGVEDLR Unmodified 2115.9743 0.97426212 1957 P09211;A8MX94 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 3 2 3 3 2 3 2 4 2 2 2 2 2 152.19 152.19 2;3 7.4864E-173 161734 QUIQUE_DMIX5_190116_001 249.3 224.44 36347000000 2458300000 2540200000 3958100000 2880000000 2624800000 2194500000 2067000000 1986800000 3142000000 962190000 4580400000 2870800000 4082000000 7710 1957 7199 69168;69169;69170;69171;69172;69173;69174;69175;69176;69177;69178;69179;69180;69181;69182;69183;69184;69185;69186;69187;69188;69189;69190;69191;69192;69193;69194;69195;69196;69197;69198;69199 88177;88178;88179;88180;88181;88182;88183;88184;88185;88186;88187;88188;88189;88190;88191;88192;88193;88194;88195;88196;88197;88198;88199;88200;88201;88202;88203;88204;88205;88206;88207;88208;88209;88210;88211;88212;88213;88214;88215 88207 34 DQQPGTFLLR Unmodified 1173.6142 0.6142217 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.983 83.983 2 2.1789E-05 86208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.81 131.43 984720000 0 0 0 139570000 0 132550000 128140000 159210000 0 0 252710000 0 172540000 7711 2444 7200 69200;69201;69202;69203;69204;69205;69206;69207 88216;88217;88218;88219;88220;88221;88222;88223 88222 8 DQQQKPLYHHFTTAINTENIR Unmodified 2553.2724 0.27243347 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 3 1 2 2 57.419 57.419 3;4;5 1.3011E-43 55771 QUIQUE_C1277_190116_001 152.06 143.21 2031100000 39087000 59977000 88235000 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yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 82.355 82.355 1;2 9.6502E-14 82700 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.91 191.13 22611000000 2797100000 2795500000 0 2129700000 2032500000 525490000 861650000 2838200000 2065200000 968840000 1295000000 2822400000 1479900000 7714 2661 7203 69241;69242;69243;69244;69245;69246;69247;69248;69249;69250;69251;69252;69253;69254;69255;69256;69257;69258;69259;69260 88264;88265;88266;88267;88268;88269;88270;88271;88272;88273;88274;88275;88276;88277;88278;88279;88280;88281;88282;88283;88284;88285;88286;88287;88288;88289;88290 88281 19 DQSGEYECSALNDVAAPDVR Unmodified 2194.9437 0.94369027 3092 Q14982 OPCML Opioid-binding protein/cell adhesion molecule yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.332 99.332 2 9.1787E-24 102896 QUIQUE_C1218_190116_001 171.46 159.1 519430000 63213000 81554000 102070000 71304000 66736000 51452000 83103000 0 0 0 0 0 0 7715 3092 7204 69261;69262;69263;69264;69265;69266;69267 88291;88292;88293;88294;88295;88296;88297 88291 7 DQSGVQELVK Unmodified 1101.5666 0.5666028 3374 Q6NXE6;B4E1N1;H0YH65 ARMC6 Armadillo repeat-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 47.468 47.468 2 0.013549 44507 QUIQUE_C1368_190116_001 64.927 44.346 188580000 40666000 52923000 44021000 0 50968000 0 0 0 0 0 0 0 0 7716 3374 7205 69268;69269;69270;69271 88298;88299;88300;88301 88300 3 DQSTEQSPSDLPQR Unmodified 1586.7172 0.7172428 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 32.572 32.572 2 0.0007116 27765 QUIQUE_C1368_190116_001 82.171 66.631 8048500 0 0 8048500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7717 3891 7206 69272 88302 88302 1 DQTDDQVTIDSALATQK Unmodified 1847.8749 0.87486565 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 86.271 86.271 2;3 7.1613E-182 87479 QUIQUE_DMIX1_190116_001 316.42 289.74 6094200000 599530000 606450000 674060000 564200000 469760000 638500000 437380000 278000000 342260000 314680000 473550000 355400000 340440000 7718 2518 7207 69273;69274;69275;69276;69277;69278;69279;69280;69281;69282;69283;69284;69285;69286;69287;69288;69289 88303;88304;88305;88306;88307;88308;88309;88310;88311;88312;88313;88314;88315;88316;88317;88318;88319;88320;88321;88322;88323;88324;88325;88326;88327;88328;88329;88330;88331;88332;88333;88334;88335;88336;88337;88338;88339 88325 34 DQTTSTTHINHISTVK Unmodified 1781.8908 0.89079049 3386 Q6P995 FAM171B Protein FAM171B yes yes 0 0 0 1 19.628 19.628 3 0.0079688 12376 QUIQUE_C1576_190116_001 43.767 27.102 41373000 0 0 0 0 0 0 41373000 0 0 0 0 0 0 7719 3386 7208 69290 88340 88340 1 DQVANSAFVER Unmodified 1234.5942 0.59421454 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.489 45.489 2 1.3943E-38 43012 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.09 147.81 41951000000 2251300000 3235200000 2920100000 3738800000 3858300000 3889600000 4324300000 2125400000 3460200000 1050800000 4081200000 3679000000 3336900000 7720 1931 7209 69291;69292;69293;69294;69295;69296;69297;69298;69299;69300;69301;69302;69303 88341;88342;88343;88344;88345;88346;88347;88348;88349;88350;88351;88352;88353;88354;88355;88356;88357;88358;88359;88360;88361;88362;88363;88364;88365 88354 25 DQVAYLIQQNVIPPFCNLLTVK Unmodified 2572.3723 0.37233044 1420 O00629 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 168.59 168.59 3 1.4002E-05 170401 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.883 62.311 143310000 0 0 0 0 0 0 35467000 41801000 0 0 0 66038000 0 7721 1420 7210 69304;69305;69306 88366;88367;88368 88367 3 DQVDIAVQELLQLK Unmodified 1610.8879 0.88793694 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 162.2 162.2 2;3 1.4321E-05 169792 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.57 102.31 33984000 0 0 0 0 6218300 0 0 0 0 0 27766000 0 0 7722 1929 7211 69307;69308 88369;88370 88370 2 DQVDSYSLEAK Unmodified 1253.5776 0.57756142 507 F8W717;A0A3B3IU69;O00423;G3V500;G3V3N9 EML1 Echinoderm microtubule-associated protein-like 1 yes no 0 0 0 1 51.439 51.439 2 0.021396 48952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.14 53.711 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7723 507 7212 69309 88371 88371 1 DQVELVENMVTVGK Unmodified 1559.7865 0.78650834 4254 Q9NQE9 HINT3 Histidine triad nucleotide-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 121.2 121.2 2 0.0031702 123823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.189 70.582 363740000 0 73653000 81551000 81566000 0 0 0 86767000 0 40205000 0 0 0 7724 4254 7213 69310;69311;69312;69313;69314 88372;88373;88374;88375;88376 88375 2 DQVGEDNWQQFSEQFPPLLK Unmodified 2404.1335 0.13353995 1446 O14787;K7ESG1 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 1 1 1 1 158.2 158.2 2;3 7.6702E-13 163796 QUIQUE_C1218_190116_001 114.55 110.6 493000000 96379000 73300000 90706000 51854000 76594000 21942000 42565000 0 0 17448000 22208000 0 0 7725 1446 7214 69315;69316;69317;69318;69319;69320;69321;69322;69323;69324;69325;69326;69327;69328;69329 88377;88378;88379;88380;88381;88382;88383;88384;88385;88386;88387;88388;88389;88390;88391;88392;88393;88394 88379 17 DQVGGGGEFGGHDKPK Unmodified 1583.7328 0.73283328 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 1 1 1 1 1 16.157 16.157 2 3.0945E-12 8092 QUIQUE_C1277_190116_001 132.06 119.44 154220000 0 32725000 0 45692000 0 0 0 26511000 49290000 0 0 0 0 7726 4176 7215 69330;69331;69332;69333 88395;88396;88397;88398 88395 3 DQVGILAGWFK Unmodified 1232.6554 0.65535823 87 A0A087WZT0;M0QZ22;Q5PRF9;M0QY61;M0R0X3;M0QXV2 SAMD4B Protein Smaug homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 147.02 147.02 2 0.0061825 152686 QUIQUE_C1368_190116_001 81.972 61.272 9564200 0 0 9564200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7727 87 7216 69334;69335;69336 88399;88400;88401 88399 3 DQVLHEHIQR Unmodified 1273.6527 0.65273247 1057 F8W9S7;Q14C86 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.95 16.95 3 0.0015749 9125 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.01 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1 1 73.64 73.64 2;3 1.6056E-153 73920 QUIQUE_C1277_190116_001 281.07 258.19 2365400000 287890000 216430000 263410000 282900000 237140000 217200000 219970000 84851000 121010000 126360000 104140000 90672000 113390000 7730 2051 7219 69363;69364;69365;69366;69367;69368;69369;69370;69371;69372;69373;69374;69375;69376;69377;69378;69379;69380;69381;69382 88429;88430;88431;88432;88433;88434;88435;88436;88437;88438;88439;88440;88441;88442;88443;88444;88445;88446;88447;88448;88449;88450;88451;88452;88453;88454 88434 25 DQVYPQYVIEYTEDK Unmodified 1888.8731 0.87307474 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 117.41 117.41 2 0.001076 121475 QUIQUE_C1277_190116_001 72.089 59.109 213380000 0 32818000 49657000 0 0 0 0 0 33433000 0 50057000 47415000 0 7731 3453 7220 69383;69384;69385;69386;69387 88455;88456;88457;88458;88459 88455 4 DQWAAAMTLR Unmodified 1161.5601 0.56007764 2711 P61086 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 95.083 95.083 2 0.010101 97854 QUIQUE_C1368_190116_001 69.276 47.748 130740000 0 0 42270000 0 0 0 43949000 0 0 0 0 0 44520000 7732 2711 7221 69388;69389;69390;69391;69392 88460;88461;88462;88463;88464 88460 4 DQWEDRIQVWHAEHR Unmodified 2003.9351 0.93505534 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 2 70.636 70.636 3;4 3.0897E-06 70095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.21 88.519 150270000 0 0 0 0 0 0 0 150270000 0 0 0 0 0 7733 859 7222 69393;69394 88465;88466;88467 88467 3 DQYANYVVQK Unmodified 1226.5932 0.5931519 976 E9PR38;H0YEH2;Q5T1Z4;Q5T1Z8;Q14671;H0YDK8;A0A0C4DG68;A0A0A0MR59;Q8TB72 PUM1;PUM2 Pumilio homolog 1;Pumilio homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.277 50.277 2 0.0075763 47988 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.968 43.886 210710000 33144000 36112000 31326000 42337000 0 0 0 26278000 0 0 0 0 41515000 7734 976 7223 69395;69396;69397;69398;69399;69400;69401 88468;88469;88470;88471;88472;88473;88474 88472 7 DQYELLCLDNTR Unmodified 1538.7035 0.70350699 1838 P02787;C9JVG0 TF Serotransferrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 108.12 108.12 2 5.4345E-13 112697 QUIQUE_C1218_190116_001 161.67 148.47 225380000 0 64057000 0 0 114680000 46646000 0 0 0 0 0 0 0 7735 1838 7224 69402;69403;69404;69405 88475;88476;88477;88478;88479 88475 5 DQYSVIFESGDR Unmodified 1414.6365 0.63647328 2674 P55884;C9JZG1;C9JQN7 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 95.138 95.138 2 0.0015977 97806 QUIQUE_C1368_190116_001 103.87 83.842 95637000 0 0 42078000 30036000 23523000 0 0 0 0 0 0 0 0 7736 2674 7225 69406;69407;69408;69409;69410 88480;88481;88482;88483;88484;88485 88482 4 DRAEWADIDPVPQNDGPNPVVQIIYSDK Unmodified 3150.5258 0.5258072 2525 P49354;E9PQP6 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 147.6 147.6 3 9.8943E-07 152731 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.463 50.797 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7737 2525 7226 69411 88486 88486 1 DRDDFPVVLVGNK Unmodified 1472.7623 0.7623425 1994 P10301 RRAS Ras-related protein R-Ras yes yes 0 0 1 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112130000 7740 921 7229 69425;69426;69427;69428;69429;69430;69431;69432;69433;69434;69435 88502;88503;88504;88505;88506;88507;88508;88509;88510;88511;88512 88511 11 DRDVTFSPATIENELIK Unmodified 1946.9949 0.99492121 559 A8K878;P55145;H7C2D6 MANF Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor yes no 0 0 1 1 1 1 127.42 127.42 3 0.00032219 132623 QUIQUE_C1368_190116_001 57.173 53.72 26218000 0 0 26218000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7741 559 7230 69436;69437;69438 88513;88514;88515 88514 3 DRDYSDHPSGGSYR Unmodified 1610.671 0.67096131 2412;3840 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 1 2 3 3 1 3 1 2 3 3 1 3 2 3 15.422 15.422 2;3;4 3.086E-57 8240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 197.07 163.11 3702000000 166150000 277740000 319270000 313930000 318180000 123010000 301690000 531390000 372900000 15548000 387210000 257820000 317120000 7742 2412;3840 7231 69439;69440;69441;69442;69443;69444;69445;69446;69447;69448;69449;69450;69451;69452;69453;69454;69455;69456;69457;69458;69459;69460;69461;69462;69463;69464;69465;69466;69467;69468 88516;88517;88518;88519;88520;88521;88522;88523;88524;88525;88526;88527;88528;88529;88530;88531;88532;88533;88534;88535;88536;88537;88538;88539;88540;88541;88542;88543;88544;88545 88531 28 DREDFVPFTGEK Unmodified 1438.6729 0.67285879 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 68.636 68.636 2;3 2.5166E-06 68453 QUIQUE_C1368_190116_001 142.83 102.91 4395500000 255890000 937470000 768270000 295900000 468190000 0 716250000 0 0 0 479910000 0 473630000 7743 4356 7232 69469;69470;69471;69472;69473;69474;69475;69476;69477;69478;69479;69480;69481 88546;88547;88548;88549;88550;88551;88552;88553;88554;88555;88556;88557;88558;88559;88560 88551 7 DREGFFTNGLTLGAK Unmodified 1624.8209 0.82092001 1099;2367 G5E9Q6;C9J0J7;C9JQ45;C9J2N0;P35080;C9J712 PFN2 Profilin;Profilin-2 no no 0 0 1 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protein 3 yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 3 3 1 5 3 3 55.396 55.396 2;3 1.6188E-20 53345 QUIQUE_C1277_190116_001 182.02 157.93 903310000 0 37210000 41843000 0 30205000 25719000 116800000 139450000 43523000 0 283070000 99417000 86072000 7746 2714 7235 69510;69511;69512;69513;69514;69515;69516;69517;69518;69519;69520;69521;69522;69523;69524;69525;69526;69527;69528;69529;69530;69531;69532;69533;69534 88595;88596;88597;88598;88599;88600;88601;88602;88603;88604;88605;88606;88607;88608;88609;88610;88611;88612;88613;88614;88615;88616;88617;88618;88619;88620;88621 88597 22 DRFEHELQK Unmodified 1200.5887 0.58873523 947 E9PJP2;Q5TF21 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 1 1 17.028 17.028 3 0.014679 9333 QUIQUE_C1403_190116_001 61.765 36.927 39436000 0 0 0 39436000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7747 947 7236 69535 88622 88622 1 DRFGIDDQDYLVSLTR Unmodified 1911.9327 0.9326553 3668 Q8TBX8;F8VNT5;F8VU68 PIP4K2C Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma yes no 0 0 1 1 1 124.9 124.9 2;3 7.6217E-09 130965 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2 yes no 0 0 1 1 3 3 1 1 2 3 1 1 1 3 4 1 160.37 160.37 2;3 1.5871E-10 161824 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.47 106.6 6690700000 228260000 518580000 548540000 608560000 401310000 513920000 766200000 304880000 434260000 149390000 760720000 865830000 590280000 7751 365 7240 69543;69544;69545;69546;69547;69548;69549;69550;69551;69552;69553;69554;69555;69556;69557;69558;69559;69560;69561;69562;69563;69564;69565;69566;69567 88632;88633;88634;88635;88636;88637;88638;88639;88640;88641;88642;88643;88644;88645;88646;88647;88648;88649;88650;88651;88652;88653;88654;88655;88656;88657;88658;88659;88660;88661;88662;88663;88664;88665;88666 88651 31 DRFSVNLDVK Unmodified 1191.6248 0.62478638 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;A0A024R3B9;E9PNH7 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.214 62.214 3 0.0029925 60761 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.355 46.027 94420000 0 0 0 0 0 0 14125000 40992000 0 0 14173000 0 25130000 7752 977 7241 69568;69569;69570;69571;69572;69573 88667;88668;88669;88670;88671;88672;88673 88673 6 DRGPVVSLWPAPGK Unmodified 1477.8041 0.80414773 3409 Q6UWR7;D6R9P1 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes no 0 0 1 1 1 1 85.843 85.843 3 0.0097038 87459 QUIQUE_DMIX8_190116_001 40.278 33.22 80371000 0 0 0 0 0 0 0 0 18536000 0 36637000 0 25198000 7753 3409 7242 69574;69575;69576 88674;88675;88676 88676 3 DRGYIYWR Unmodified 1127.5512 0.55122751 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 1 1 1 2 1 60.233 60.233 2;3 0.018665 59464 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.679 48.852 179690000 0 0 0 0 0 0 0 0 21903000 0 42619000 86525000 28641000 7754 2777;2938 7243 69577;69578;69579;69580;69581 88677;88678;88679;88680;88681 88679 5 DRHPEEGVVAELQGFAVDK Unmodified 2095.0334 0.033431979 707 C9JAI6;Q96DZ9 CMTM5 CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 102.59 102.59 3 0.0001373 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Synembryn-A yes no 0 0 1 1 59.115 59.115 3 0.043608 57953 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.847 28.96 17716000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17716000 0 7762 4247 7251 69646 88755 88755 1 DRNDFWEGIK Unmodified 1278.5993 0.59929991 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 77.214 77.214 3 0.0011449 78983 QUIQUE_C1218_190116_001 78.513 56.485 104060000 17327000 20358000 0 0 0 0 0 18844000 0 0 0 26138000 21392000 7763 3277 7252 69647;69648;69649;69650;69651;69652;69653 88756;88757;88758;88759;88760;88761;88762 88756 7 DRPFFAGLVK Unmodified 1148.6342 0.63422886 3222;2092 P15531;E7ERL0;E5RHP0;Q32Q12;J3KPD9 NME1;NME1-NME2;NME2 Nucleoside diphosphate kinase A;Nucleoside diphosphate kinase no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 84.805 84.805 2;3 0.00037274 86870 QUIQUE_C1576_190116_001 142.43 70.926 12246000000 977440000 1098700000 1111900000 881220000 1018400000 775720000 1023800000 615200000 969180000 332850000 1433400000 915320000 1093300000 7764 2092;3222 7253 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88842 88842 1 DRPGHSHLCPSVR Unmodified 1516.7317 0.73172784 1489 O15211 RGL2 Ral guanine nucleotide dissociation stimulator-like 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 10.486 10.486 4 0.00012432 2778 QUIQUE_C1438_190116_001 72.681 62.328 39714000 7063000 0 0 9537500 10713000 0 0 0 12400000 0 0 0 0 7768 1489 7257 69708;69709;69710;69711 88843;88844;88845;88846 88845 3 DRPHEVLLCSDLVK Unmodified 1679.8665 0.86648999 1308 J3QTA6;Q9BRQ6;H0Y922 CHCHD6 MICOS complex subunit MIC25 yes no 0 0 1 1 1 2 1 59.624 59.624 2;3 0.001567 59625 QUIQUE_C1218_190116_001 107.65 82.793 186690000 25404000 31034000 130250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7769 1308 7258 69712;69713;69714;69715;69716 88847;88848;88849;88850;88851 88847 5 DRPLEADGQEVPLDTSGSQAR Unmodified 2240.0669 0.066916951 3934 Q96RR4;F5H4I7 CAMKK2 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2 yes no 0 0 1 1 1 62.792 62.792 3 0.026158 62483 QUIQUE_C1218_190116_001 33.342 26.31 65517000 34481000 0 0 0 0 31036000 0 0 0 0 0 0 0 7770 3934 7259 69717;69718 88852;88853 88852 2 DRPMEESLLLFEAMR Unmodified 1835.891 0.89099018 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;A0A0U1RQQ5;A0A1B0GTT3 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 141.4 141.4 3 0.0044096 147199 QUIQUE_C1576_190116_001 53.995 43.798 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7771 2496 7260 69719;69720;69721 88854;88855;88856 88855 3 DRPQEADGIDSVIVVDNVPQVGPDR Unmodified 2689.3307 0.33073621 2674 P55884;C9JZG1 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.6 113.6 3 1.0478E-13 116044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.376 72.188 685640000 0 95098000 108920000 0 129930000 0 0 86285000 0 45492000 75943000 72737000 71234000 7772 2674 7261 69722;69723;69724;69725;69726;69727;69728;69729 88857;88858;88859;88860;88861;88862;88863;88864 88860 8 DRTDIQCLIPCAIDQDPYFR Unmodified 2495.1573 0.15732864 2213 P23381;H0YJP3 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.81 141.81 2;3 8.253E-06 147311 QUIQUE_C1368_190116_001 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1501.7671 0.7671103 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 1 1 67.025 67.025 3 0.028537 66035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.959 17.242 17871000 0 0 0 0 0 0 0 17871000 0 0 0 0 0 7776 959 7265 69745 88881 88881 1 DRVNDVCTNGQDLIK Unmodified 1745.8366 0.83664643 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 2 1 2 53.824 53.824 2;3 3.7603E-08 52315 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.46 87.164 360110000 0 41357000 0 0 0 0 0 61545000 58253000 0 78292000 0 120670000 7777 267;275;3025 7266 69746;69747;69748;69749;69750;69751;69752 88882;88883;88884;88885;88886;88887;88888;88889 88883 7 DRVNDVCTNGQDLIKK Unmodified 1873.9316 0.93160944 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 1 1 41.791 41.791 3 0.0014407 37317 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.851 45.807 71532000 0 0 0 0 0 0 0 71532000 0 0 0 0 0 7778 267;275;3025 7267 69753;69754;69755 88890;88891;88892 88892 2 DRVTDALNATR Unmodified 1230.6317 0.63166267 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 2 48.717 48.717 2;3 0.034173 46272 QUIQUE_C1277_190116_001 83.226 51.291 174370000 0 38015000 0 0 35864000 27308000 0 0 0 0 0 73182000 0 7779 2004 7268 69756;69757;69758;69759;69760 88893;88894;88895;88896;88897 88893 5 DRVTSAVEALLSADSASR Unmodified 1846.9385 0.93846896 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 134.58 134.58 2;3 0.00021406 137941 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.41 46.925 899150000 41429000 36556000 57711000 44050000 58313000 39997000 69144000 110310000 77428000 16595000 191690000 72448000 83487000 7780 2472 7269 69761;69762;69763;69764;69765;69766;69767;69768;69769;69770;69771;69772;69773;69774 88898;88899;88900;88901;88902;88903;88904;88905;88906;88907;88908;88909;88910;88911;88912 88906 15 DRWPEVSPEDTQSLSLSEESPSK Unmodified 2602.2035 0.20347001 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 100.14 100.14 3 8.7269E-12 102596 QUIQUE_C1277_190116_001 99.454 88.911 154140000 0 78256000 0 0 0 0 75884000 0 0 0 0 0 0 7781 921 7270 69775;69776 88913;88914;88915 88913 3 DRWPEVSPEDTQSLSLSEESPSKETSLDVSSK Unmodified 3548.6642 0.66421076 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 2 103.73 103.73 3;4 6.3226E-41 105476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.6 112.49 105980000 0 0 0 0 0 0 0 105980000 0 0 0 0 0 7782 921 7271 69777;69778 88916;88917 88916 2 DRYDSFIELQEK Unmodified 1541.7362 0.73618733 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 82.714 82.714 2;3 0.0003546 83751 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.19 78.886 1363000000 67925000 204290000 68864000 63092000 131460000 83006000 87498000 59775000 63021000 51920000 114740000 186550000 180850000 7783 4284 7272 69779;69780;69781;69782;69783;69784;69785;69786;69787;69788;69789;69790;69791;69792;69793;69794;69795 88918;88919;88920;88921;88922;88923;88924;88925;88926;88927;88928;88929;88930;88931;88932;88933;88934;88935;88936;88937 88929 16 DSAAAVVVYDITNVNSFQQTTK Unmodified 2370.1703 0.17031939 3258 Q53S08;Q9H0N0 RAB6C Ras-related protein Rab-6C yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 3 2 2 145.88 145.88 2;3 1.0797E-44 148748 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.74 173.8 888780000 48678000 74931000 88532000 101480000 35221000 97719000 42954000 133770000 104840000 73842000 0 0 86807000 7784 3258 7273 69796;69797;69798;69799;69800;69801;69802;69803;69804;69805;69806;69807;69808;69809;69810;69811;69812;69813;69814;69815 88938;88939;88940;88941;88942;88943;88944;88945;88946;88947;88948;88949;88950;88951;88952;88953;88954;88955;88956;88957;88958;88959;88960 88951 22 DSAGDSDVVVQELK Unmodified 1460.6995 0.69946747 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 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Unmodified 2169.059 0.058978027 3107 Q15067;K7ELT1;I3L0T4;I3L2U4 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 143.46 143.46 2;3 1.6077E-07 149386 QUIQUE_C1218_190116_001 99.092 92.49 620410000 59797000 72796000 108600000 28006000 96754000 61967000 49919000 0 45421000 24299000 27086000 45759000 0 7791 3107 7280 69846;69847;69848;69849;69850;69851;69852;69853;69854;69855;69856;69857;69858;69859;69860 88997;88998;88999;89000;89001;89002;89003;89004;89005;89006;89007;89008;89009;89010;89011 88997 15 DSATAQAWFSAIHSNVNDLLTR Unmodified 2416.1771 0.1771361 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 155.55 155.55 3 1.7112E-36 161379 QUIQUE_C1218_190116_001 137.09 127.1 1265300000 147570000 118900000 111550000 0 0 58499000 152420000 85720000 146980000 52042000 88535000 135340000 167730000 7792 3029 7281 69861;69862;69863;69864;69865;69866;69867;69868;69869;69870;69871;69872 89012;89013;89014;89015;89016;89017;89018;89019;89020;89021;89022;89023;89024 89012 11 DSAVMDDSVVIPSHQVSTLAK Unmodified 2198.0889 0.088897947 2856;1255;902 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 89.928 89.928 2;3 2.276E-35 91290 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.88 164.7 2150100000 27632000 147770000 239870000 236530000 0 213110000 159550000 301470000 227670000 0 186450000 141890000 268210000 7793 902;1255;2856 7282 69873;69874;69875;69876;69877;69878;69879;69880;69881;69882;69883;69884;69885;69886;69887;69888;69889;69890;69891;69892;69893 89025;89026;89027;89028;89029;89030;89031;89032;89033;89034;89035;89036;89037;89038;89039;89040;89041;89042;89043;89044;89045;89046;89047 89038 22 DSAYQSITHYRPVSASR Unmodified 1936.9391 0.93913766 2561 P50402;Q5HY57 EMD Emerin yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 54.712 54.712 3;4 1.6257E-05 52443 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.41 85.256 592840000 42455000 34381000 86017000 102510000 0 47221000 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89065;89066;89067;89068;89069;89070;89071;89072;89073;89074;89075;89076;89077;89078;89079;89080;89081;89082;89083 89065 19 DSDDEEEVVHVDRDHFMDEFFEQVEEIR Unmodified 3494.4845 0.48447225 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 1 1 154.93 154.93 4 0.068625 159533 QUIQUE_DMIX7_190116_001 17.222 16.475 62053000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62053000 0 7797 2721 7286 69930 89084 89084 1 DSDDVPMVLVGNK Unmodified 1387.6653 0.66533057 1808;1807 P01112;P01111 HRAS;NRAS GTPase HRas;GTPase HRas, N-terminally processed;GTPase NRas no no 0 0 0 1 1 94.028 94.028 2 0.0022189 97161 QUIQUE_C1218_190116_001 78.816 69.272 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7798 1808;1807 7287 69931;69932 89085;89086 89085 2 DSDEADLVLAK Unmodified 1174.5717 0.57174776 2975 Q13185 CBX3 Chromobox protein homolog 3 yes yes 0 0 0 1 67.883 67.883 2 0.03968 67294 QUIQUE_C1403_190116_001 64.191 39.101 25293000 0 0 0 25293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7799 2975 7288 69933 89087 89087 1 DSDELKSWVNEK Unmodified 1448.6783 0.6783381 267;275;3025 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disease 7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.29 103.29 3 6.7726E-10 107427 QUIQUE_C1218_190116_001 89.028 84.027 500310000 51822000 0 0 50168000 54413000 46217000 71226000 32215000 55704000 23383000 58881000 0 56287000 7835 3622 7323 70133;70134;70135;70136;70137;70138;70139;70140;70141;70142 89319;89320;89321;89322;89323;89324;89325;89326;89327;89328;89329 89319 10 DSGDENEPIQER Unmodified 1387.5852 0.58516599 3716 Q8WX93 PALLD Palladin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.021 25.021 2 0.0004639 18022 QUIQUE_C1368_190116_001 114.39 94.607 32115000 0 0 0 0 0 32115000 0 0 0 0 0 0 0 7836 3716 7324 70143;70144;70145;70146;70147 89330;89331;89332;89333;89334 89330 5 DSGDVAALR Unmodified 902.44576 0.44575938 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.361 30.361 2 0.0063617 24471 QUIQUE_C1563_190116_001 84.568 42.915 107800000 0 0 0 43541000 0 43243000 0 0 0 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(M) 1210.5401 0.54007047 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.866 35.866 2 0.0001645 31481 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.31 101.8 461730000 39611000 57029000 54422000 0 0 0 28988000 27977000 75138000 0 103020000 0 75541000 7841 1838 7329 70164;70165;70166;70167;70168;70169;70170;70171 89351;89352;89353;89354;89355;89356;89357;89358 89356 1053 7 DSGFQMNQLR Unmodified 1194.5452 0.54515585 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.34 66.34 2 1.3136E-11 67241 QUIQUE_C1438_190116_001 163.67 90.409 1146700000 0 128710000 0 140230000 353500000 0 70829000 0 84042000 39422000 123410000 128130000 78412000 7842 1838 7329 70172;70173;70174;70175;70176;70177;70178;70179;70180 89359;89360;89361;89362;89363;89364;89365;89366;89367;89368;89369;89370 89362 12 DSGITYLGIK Unmodified 1065.5706 0.57062555 2580 P51452;K7ES89 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.393 86.393 2 0.00026909 88775 QUIQUE_C1576_190116_001 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70197;70198;70199;70200;70201;70202;70203;70204;70205;70206;70207 89389;89390;89391;89392;89393;89394;89395;89396;89397;89398;89399;89400 89394 10 DSGQWHYFDDNSVSPVNENQIESK Unmodified 2794.2107 0.21068066 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.23 105.23 3 3.244E-26 108163 QUIQUE_C1277_190116_001 130.83 124.73 243890000 44430000 48272000 35400000 40760000 0 28671000 46360000 0 0 0 0 0 0 7846 1096 7333 70208;70209;70210;70211;70212;70213 89401;89402;89403;89404;89405;89406 89402 6 DSGSSSVFAESPGGK Unmodified 1410.6263 0.62630252 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.519 46.519 2 4.7606E-06 43455 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.89 124.11 92480000 30439000 30050000 0 0 0 0 0 31990000 0 0 0 0 0 7847 103 7334 70214;70215;70216;70217;70218 89407;89408;89409;89410;89411 89411 5 DSGVASTEDSSSSHITAAAIAAK Unmodified 2175.0291 0.029134462 998 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89439;89440;89441;89442;89443;89444;89445;89446;89447;89448;89449;89450;89451;89452;89453;89454;89455;89456;89457;89458;89459;89460;89461;89462;89463;89464;89465;89466;89467;89468;89469;89470;89471;89472;89473;89474;89475;89476;89477;89478;89479;89480;89481;89482;89483;89484;89485;89486;89487;89488 89469 48 DSHQPIMCSYK Unmodified 1364.5853 0.58530611 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 27.932 27.932 2 0.0052427 22265 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.939 70.245 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7855 4474 7342 70272 89489 89489 1 DSHSLTTNIMEILR Unmodified 1628.8192 0.81920545 1823 P02671;A0A087WUA0 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 2 127.66 127.66 2;3 1.1062E-22 131947 QUIQUE_C1277_190116_001 161.48 140.82 2315400000 119360000 280520000 248440000 292100000 331800000 46083000 292500000 99044000 80272000 63930000 100340000 37538000 323510000 7856 1823 7343 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89538;89539;89540;89541;89542;89543;89544;89545;89546;89547;89548;89549;89550;89551;89552;89553;89554;89555;89556;89557;89558;89559;89560;89561;89562;89563;89564;89565;89566;89567;89568;89569;89570;89571;89572;89573;89574 89567 37 DSIGWMFSK Unmodified 1069.4903 0.49026674 1004 F5H283;Q92563 SPOCK2 Testican-2 yes no 0 0 0 1 113.47 113.47 2 0.044544 117035 QUIQUE_C1277_190116_001 52.255 34.869 9139000 0 9139000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7860 1004 7346 70330 89575 89575 1 DSIHLTPVLTSSILNQLTGR Unmodified 2164.1852 0.18518159 4104 Q9GZT4;I3L4B4;I3L3N0;I3L4W4;Q3ZK31 SRR Serine racemase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 149.82 149.82 2;3 3.5456E-30 155915 QUIQUE_C1576_190116_001 143.46 134.4 2739800000 88749000 120820000 245700000 239350000 196590000 145290000 217790000 260760000 354970000 112620000 233570000 195400000 328220000 7861 4104 7347 70331;70332;70333;70334;70335;70336;70337;70338;70339;70340;70341;70342;70343;70344;70345;70346;70347;70348;70349;70350 89576;89577;89578;89579;89580;89581;89582;89583;89584;89585;89586;89587;89588;89589;89590;89591;89592;89593;89594;89595;89596;89597 89584 22 DSIIYLTADSPNVMTTFR Unmodified 2042.9983 0.99829203 3435 Q7L0Y3;C9JVB6 TRMT10C Mitochondrial ribonuclease P protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 144.56 144.56 2 0.00052954 149828 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.469 57.59 27264000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27264000 0 0 7862 3435 7348 70351;70352;70353 89598;89599;89600 89599 3 DSIKLDDDSERK Unmodified 1419.6842 0.68415175 3499 Q86VP6;F5H6I6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 2 1 17.242 17.242 3 0.034284 9825 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.463 55.586 64125000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64125000 0 0 7863 3499 7349 70354 89601 89601 1 DSILGEPGMGFK Unmodified 1249.6013 0.60127375 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 100.4 100.4 2 0.00018934 102595 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.14 50.336 296510000 29649000 39645000 32781000 22515000 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RNA-binding, signal transduction-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 69.667 69.667 3 0.02738 70116 QUIQUE_C1368_190116_001 28.859 13.32 31677000 0 0 31677000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7876 1642 7360 70426 89693 89693 1 DSLDPSFTHAMQLLTAEIEK Oxidation (M) 2261.0886 0.088563596 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 141.21 141.21 3 0.00053058 145147 QUIQUE_C1277_190116_001 55.575 49.608 85413000 37246000 48167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7877 2908 7361 70427;70428 89694;89695 89695 2385 2 DSLDPSFTHAMQLLTAEIEK Unmodified 2245.0936 0.093648974 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 164.13 164.13 2;3 1.1429E-87 169048 QUIQUE_C1368_190116_001 231.23 195.58 5289500000 520630000 597650000 645010000 524060000 394760000 286410000 438610000 175310000 401360000 132090000 341780000 317200000 514660000 7878 2908 7361 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89871 1 DSLQNQLINIR Unmodified 1312.7099 0.709913 351 Q5VTI5;A0A1B0GUN5;Q9Y2H5 PLEKHA6 Pleckstrin homology domain-containing family A member 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.213 96.213 2 0.0015342 97840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.948 54.204 282210000 27425000 24827000 21825000 22327000 23309000 23920000 20815000 20029000 25746000 7981000 0 30415000 33591000 7892 351 7374 70562;70563;70564;70565;70566;70567;70568;70569;70570;70571;70572;70573 89872;89873;89874;89875;89876;89877;89878;89879;89880;89881;89882;89883;89884 89880 13 DSLSDDVVK Unmodified 976.47131 0.47130543 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 42.114 42.114 2 0.0034294 37173 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.318 38.152 1220900000 0 144170000 180750000 168410000 0 0 0 132810000 175300000 70382000 0 174870000 174180000 7893 3421 7375 70574;70575;70576;70577;70578;70579;70580;70581 89885;89886;89887;89888;89889;89890;89891;89892 89890 7 DSLSPVLHPSDLILTR Unmodified 1761.9625 0.96249887 4230 Q9HCN4 GPN1 GPN-loop GTPase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 114.01 114.01 3 0.0010495 119332 QUIQUE_C1438_190116_001 59.634 48.114 135180000 0 23205000 0 22183000 18549000 24606000 0 19857000 0 0 0 0 26781000 7894 4230 7376 70582;70583;70584;70585;70586;70587 89893;89894;89895;89896;89897;89898;89899 89895 6 DSLSVNEFK Unmodified 1037.5029 0.50293991 3960 Q99584 S100A13 Protein S100-A13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.856 62.856 2 0.013659 61833 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.628 51.481 1092300000 146560000 0 161910000 69953000 0 76131000 0 146830000 219290000 72364000 0 199290000 0 7895 3960 7377 70588;70589;70590;70591;70592;70593;70594;70595 89900;89901;89902;89903;89904;89905;89906;89907 89904 8 DSLSVNEFKELVTQQLPHLLK Unmodified 2437.3217 0.32167508 3960 Q99584 S100A13 Protein S100-A13 yes yes 0 0 1 1 151.92 151.92 3 6.3125E-05 156869 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.122 61.869 70370000 0 0 0 0 0 0 0 0 70370000 0 0 0 0 7896 3960 7378 70596 89908 89908 1 DSLTLVFVETK Unmodified 1250.6758 0.6758189 266 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A2R8YDH3;A0A0J9YVQ7 DDX3X ATP-dependent RNA helicase DDX3X yes no 0 0 0 1 117.88 117.88 2 0.025311 114545 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.124 38.444 12564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12564000 0 0 0 7897 266 7379 70597 89909;89910 89910 2 DSLVDIIGICK Unmodified 1231.6482 0.64822394 2265 P27694;I3L4R8 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 130.52 130.52 2 0.003329 126774 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.165 46.911 176770000 32049000 42431000 34454000 0 0 0 32888000 20761000 0 14191000 0 0 0 7898 2265 7380 70598;70599;70600;70601;70602;70603 89911;89912;89913;89914;89915;89916 89916 6 DSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPR Unmodified 2642.2653 0.26528241 849 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90022 1 DSNTILLPSNPGDVTSMVAQAMGVYGALTK Oxidation (M) 3065.5049 0.50493711 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 169.57 169.57 3 5.8744E-25 173083 QUIQUE_C1277_190116_001 86.304 80.009 38459000 15323000 23136000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7912 4466 7393 70682;70683 90023;90024 90024 2975 2 DSNTILLPSNPGDVTSMVAQAMGVYGALTK Unmodified 3049.51 0.51002248 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 176.4 176.4 2;3 2.8086E-54 177409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.89 131.44 800110000 9301600 16568000 18126000 0 37878000 0 59793000 55127000 141930000 0 244250000 124460000 92678000 7913 4466 7393 70684;70685;70686;70687;70688;70689;70690;70691;70692;70693;70694 90025;90026;90027;90028;90029;90030;90031;90032;90033;90034;90035;90036 90030 12 DSNYHLLMSVQESLER Oxidation (M) 1935.8996 0.89964061 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 1 0 5 3 5 3 4 4 3 4 4 5 4 4 3 112.95 112.95 2;3 2.5853E-24 109418 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.22 139.54 9684500000 626010000 405650000 921310000 477970000 621600000 610970000 399150000 686910000 966460000 646010000 1501900000 1018900000 801730000 7914 1777 7394 70695;70696;70697;70698;70699;70700;70701;70702;70703;70704;70705;70706;70707;70708;70709;70710;70711;70712;70713;70714;70715;70716;70717;70718;70719;70720;70721;70722;70723;70724;70725;70726;70727;70728;70729;70730;70731;70732;70733;70734;70735;70736;70737;70738;70739;70740;70741;70742;70743;70744;70745 90037;90038;90039;90040;90041;90042;90043;90044;90045;90046;90047;90048;90049;90050;90051;90052;90053;90054;90055;90056;90057;90058;90059;90060;90061;90062;90063;90064;90065;90066;90067;90068;90069;90070;90071;90072;90073;90074;90075;90076;90077;90078;90079;90080;90081;90082;90083;90084;90085;90086;90087;90088;90089;90090;90091;90092;90093;90094;90095;90096;90097;90098;90099;90100;90101;90102;90103 90082 972 67 DSNYHLLMSVQESLER Unmodified 1919.9047 0.90472599 1777 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90229;90230 90230 1 DSPDLLLLLR Unmodified 1153.6707 0.67067394 3715 Q8WX92 NELFB Negative elongation factor B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.42 149.42 2 0.0024786 154182 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.698 48.669 115130000 0 19691000 0 13480000 13969000 0 11443000 8958600 14760000 6264500 12521000 14041000 0 7917 3715 7396 70812;70813;70814;70815;70816;70817;70818;70819;70820 90231;90232;90233;90234;90235;90236;90237;90238;90239 90236 8 DSPFGSIHPR Unmodified 1111.5411 0.54105675 4205 Q9HAT2 SIAE Sialate O-acetylesterase yes yes 0 0 0 1 44.785 44.785 3 0.012573 41793 QUIQUE_C1218_190116_001 56.404 42.198 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7918 4205 7397 70821 90240 90240 1 DSPLFDFIESCLR Unmodified 1597.7446 0.74464352 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.25 172.25 2 0.00044576 174995 QUIQUE_C1403_190116_001 100.88 85.613 367680000 17487000 30542000 18503000 20143000 0 16545000 62405000 28437000 31731000 5284800 46540000 54476000 35588000 7919 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P07737;CON__P02584;I3L3D5 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.594 81.594 2 0.00043323 83114 QUIQUE_C1368_190116_001 139.98 122.07 15227000000 1082000000 1198700000 1398500000 1119400000 1339600000 1067100000 1318300000 798470000 1063100000 683480000 1740500000 969100000 1448700000 + 7922 1926 7400 70849;70850;70851;70852;70853;70854;70855;70856;70857;70858;70859;70860;70861 90268;90269;90270;90271;90272;90273;90274;90275;90276;90277;90278;90279;90280;90281;90282;90283;90284;90285;90286;90287;90288;90289 90273 22 DSPTGANSYVIIK Unmodified 1363.6983 0.69834526 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 1 71.379 71.379 2 0.027114 67608 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.32 43.534 64605000 0 34013000 0 0 0 0 0 0 0 30592000 0 0 0 7923 877 7401 70862;70863 90290;90291 90291 2 DSPTILQQVDETLR Unmodified 1613.8261 0.82606496 3705 Q8WVF1;C9JF58 OSCP1 Protein OSCP1 no no 0 0 0 1 1 132.29 132.29 2 0.049588 136472 QUIQUE_C1403_190116_001 51.612 38.258 77663000 0 0 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DSQDAGGFGPEDR Unmodified 1349.5484 0.54838655 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.309 39.309 2 2.3282E-31 36044 QUIQUE_DMIX5_190116_001 212.72 183.64 4826100000 284790000 362490000 448070000 128140000 336350000 136370000 292020000 500710000 581510000 212470000 663540000 539280000 340360000 7927 3117 7405 70884;70885;70886;70887;70888;70889;70890;70891;70892;70893;70894;70895;70896 90314;90315;90316;90317;90318;90319;90320;90321;90322;90323;90324;90325;90326;90327;90328;90329;90330;90331;90332 90330 17 DSQDPYCGWCVVEGR Unmodified 1826.7352 0.73521782 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 105.97 105.97 2 9.2407E-06 108091 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.17 93.01 25883000 0 0 0 0 0 0 0 25883000 0 0 0 0 0 7928 1473 7406 70897 90333 90333 1 DSQEEEKTEALTSAK Unmodified 1664.7741 0.77408897 166;788 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14 GSN Gelsolin no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 27.963 27.963 2;3 2.5469E-230 22364 QUIQUE_DMIX1_190116_001 320.01 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90375;90376;90377;90378;90379;90380;90381;90382;90383;90384;90385;90386;90387 90381 11 DSSAPGGPPER Unmodified 1068.4836 0.48360145 4096 Q9C0E8 LNP Protein lunapark yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 16.071 16.071 2 0.0022528 8667 QUIQUE_C1218_190116_001 79.489 62.258 225170000 31484000 0 29806000 54495000 30028000 22211000 0 0 33947000 0 0 0 23203000 7934 4096 7412 70949;70950;70951;70952;70953;70954;70955 90388;90389;90390;90391;90392;90393;90394 90388 4 DSSDQNFDYMFK Unmodified 1495.5926 0.59255956 3839 Q96E17 RAB3C Ras-related protein Rab-3C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 107.65 107.65 2 0.00051998 110730 QUIQUE_C1277_190116_001 93.556 85.631 515850000 84344000 81776000 81924000 71731000 0 0 88655000 0 41648000 0 65775000 0 0 7935 3839 7413 70956;70957;70958;70959;70960;70961;70962;70963 90395;90396;90397;90398;90399;90400;90401;90402 90396 5 DSSDQNFDYMFK Oxidation (M) 1511.5875 0.58747418 3839 Q96E17 RAB3C Ras-related protein Rab-3C yes yes 0 1 0 1 1 80.794 80.794 2 0.029261 83029 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90408;90409;90410;90411;90412;90413;90414;90415;90416;90417;90418;90419;90420;90421;90422;90423;90424;90425;90426;90427;90428;90429;90430;90431 90421 24 DSSLEADHVISAIPASVLSELLPAEAAPLAR Unmodified 3141.6558 0.65575874 2559 P50336 PPOX Protoporphyrinogen oxidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.6 169.6 3 2.4629E-37 173122 QUIQUE_C1277_190116_001 111.79 105.43 2176300000 250580000 144850000 295190000 100040000 134580000 158040000 63410000 140930000 197070000 36933000 202670000 211530000 240440000 7939 2559 7416 70992;70993;70994;70995;70996;70997;70998;70999;71000;71001;71002;71003;71004 90432;90433;90434;90435;90436;90437;90438;90439;90440;90441;90442;90443;90444 90433 13 DSSLFDIFTLSCNLLK Unmodified 1871.9339 0.93390085 4447 Q9UIA9;E7ESC6 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 175.12 175.12 2;3 4.2016E-66 179464 QUIQUE_C1368_190116_001 199.8 177.6 993120000 24686000 54582000 27046000 14783000 56505000 154470000 84591000 110840000 131260000 11050000 172440000 150870000 0 7940 4447 7417 71005;71006;71007;71008;71009;71010;71011;71012;71013;71014;71015;71016;71017;71018;71019 90445;90446;90447;90448;90449;90450;90451;90452;90453;90454;90455;90456;90457;90458;90459;90460;90461;90462;90463 90448 18 DSSQLGTDATK Unmodified 1121.52 0.52004654 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;E9PQD2;E9PRG1;E9PIG0;E9PQN0;E9PJP4;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 18.517 18.517 2 0.0079026 10836 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.275 48.12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7941 933;1529 7418 71020;71021 90464;90465 90465 2 DSSSLAGTPSDETLATDPLGLAK Unmodified 2245.0962 0.096151394 1612 O75145 PPFIA3 Liprin-alpha-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 128.34 128.34 2 3.0201E-17 132372 QUIQUE_C1403_190116_001 155.57 135.48 84998000 0 0 24818000 35240000 0 0 0 24940000 0 0 0 0 0 7942 1612 7419 71022;71023;71024 90466;90467;90468 90467 3 DSSSLSSCTSGILEER Unmodified 1726.768 0.76795774 4160 Q9H3Q1 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.025 85.025 2 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DSVDSAGTSPTAVLAAGEEVGAGGGPGGGRPGAGTPLR Unmodified 3347.6342 0.63418845 3304 Q5T0D9 TPRG1L Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.14 109.14 3 7.7092E-88 114132 QUIQUE_C1438_190116_001 144.45 133.94 615880000 0 66847000 44568000 52149000 62704000 46364000 55850000 64142000 0 0 64146000 82482000 76627000 7962 3304 7438 71321;71322;71323;71324;71325;71326;71327;71328;71329;71330 90870;90871;90872;90873;90874;90875;90876;90877;90878;90879;90880;90881;90882;90883;90884 90874 15 DSVFLSCSEDNR Unmodified 1427.5987 0.59870757 3991 Q9BQA1;H0Y711 WDR77 Methylosome protein 50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.369 62.369 2 0.0004402 58628 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.06 98.245 521550000 50282000 49799000 58497000 42629000 41337000 53381000 52586000 28122000 28988000 20879000 30399000 34682000 29967000 7963 3991 7439 71331;71332;71333;71334;71335;71336;71337;71338;71339;71340;71341;71342;71343 90885;90886;90887;90888;90889;90890;90891;90892;90893;90894;90895;90896;90897;90898;90899;90900 90897 16 DSVGEPLYMLFR Unmodified 1425.6962 0.69623677 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.04 152.04 2 1.5517E-09 159208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.11 133.33 456480000 62103000 0 52538000 49175000 38746000 0 39947000 37581000 25914000 18894000 44316000 37913000 49354000 7964 1510 7440 71344;71345;71346;71347;71348;71349;71350;71351;71352;71353;71354 90901;90902;90903;90904;90905;90906;90907;90908;90909;90910;90911 90909 11 DSVGEPLYMLFR Oxidation (M) 1441.6912 0.69115139 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 1 0 1 138.88 138.88 2 0.056789 141858 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.98 32.191 21039000 0 0 0 0 0 0 0 21039000 0 0 0 0 0 7965 1510 7440 71355 90912 90912 1 DSVLFSVADR Unmodified 1107.556 0.55603811 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4;E9PLY5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 90.386 90.386 2 0.020428 94163 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A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C0K6;A0A087WWA3;Q4R9M9;O60333 KIF1A;KIF1B;KIF1Bbeta Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.84 156.84 2 4.9983E-13 162061 QUIQUE_C1368_190116_001 183.24 147.36 543400000 57080000 39238000 34052000 72967000 46929000 28721000 65024000 49948000 44596000 15000000 53576000 36272000 0 7969 497 7444 71367;71368;71369;71370;71371;71372;71373;71374;71375;71376;71377;71378;71379 90924;90925;90926;90927;90928;90929;90930;90931;90932;90933;90934;90935;90936 90926 13 DSVMVSWSPPVASFDYYR Unmodified 2104.9564 0.95642721 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 2 3 1 2 1 151.79 151.79 2;3 1.7646E-19 156805 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.54 106.67 227900000 15489000 0 0 0 0 0 0 54198000 31237000 6845300 75360000 44771000 0 7970 3753 7445 71380;71381;71382;71383;71384;71385;71386;71387;71388;71389 90937;90938;90939;90940;90941;90942;90943;90944;90945;90946;90947 90942 11 DSVMVSWSPPVASFDYYR Oxidation (M) 2120.9513 0.95134183 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 1 0 1 143.69 143.69 2 0.039176 151159 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.092 41.304 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7971 3753 7445 71390 90948 90948 1 DSVNPGVMVLLGCGALSSTCGQLASYPLALVR Unmodified 3304.6618 0.66178888 3372 Q6NUK1 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 170.83 170.83 3 7.8244E-14 174779 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.942 63.162 176410000 29913000 0 0 0 0 0 47320000 32797000 0 0 0 0 66375000 7972 3372 7446 71391;71392;71393;71394 90949;90950;90951;90952 90952 4 DSVTHLFDR Unmodified 1088.5251 0.52507234 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 59.816 59.816 2;3 0.0094948 56082 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.749 70.513 818550000 91154000 84839000 84292000 56249000 70060000 82046000 106690000 86195000 60120000 39120000 0 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Unmodified 2064.002 0.001997195 329 A0A140TA86;Q5XKP0 QIL1 Protein QIL1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 169.51 169.51 2;3 2.6513E-87 173637 QUIQUE_DMIX8_190116_001 198.87 182.73 1805100000 67478000 43936000 134280000 14362000 113190000 19665000 118710000 244380000 86664000 11912000 304780000 350200000 295590000 7976 329 7450 71425;71426;71427;71428;71429;71430;71431;71432;71433;71434;71435;71436;71437;71438;71439;71440;71441;71442;71443;71444;71445;71446 90988;90989;90990;90991;90992;90993;90994;90995;90996;90997;90998;90999;91000;91001;91002;91003;91004;91005;91006;91007;91008;91009;91010;91011;91012 91011 25 DSWNAGIMTVMSALSVAPSK Oxidation (M) 2079.9969 0.99691182 329 A0A140TA86;Q5XKP0 QIL1 Protein QIL1 yes no 0 1 0 1 164.57 164.57 2 8.7345E-05 169063 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.022 64.89 16984000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16984000 7977 329 7450 71447 91013 91013 230 1 DSYDSYATHNE Unmodified 1300.4844 0.48438931 3038 Q14011 CIRBP Cold-inducible RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.226 37.226 2 1.2962E-05 33602 QUIQUE_C1576_190116_001 143.21 141 1336900000 116260000 105390000 118080000 108840000 113390000 62040000 90993000 0 175840000 33744000 112440000 100160000 199660000 7978 3038 7451 71448;71449;71450;71451;71452;71453;71454;71455;71456;71457;71458;71459 91014;91015;91016;91017;91018;91019;91020;91021;91022;91023;91024;91025;91026;91027 91022 14 DSYESYGNSR Unmodified 1176.4683 0.46834532 2412;3840 P38159;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.412 26.412 2 0.010719 20729 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.371 52.227 447950000 47197000 53181000 51536000 67480000 54942000 0 0 0 0 0 69303000 42932000 61380000 7979 2412;3840 7452 71460;71461;71462;71463;71464;71465;71466;71467 91028;91029;91030;91031;91032;91033;91034;91035;91036 91035 5 DSYIASQGPLLHTIEDFWR Unmodified 2247.096 0.096032235 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 161.01 161.01 3 4.573E-05 168138 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.511 63.745 120640000 14374000 17773000 17923000 0 0 0 18083000 0 0 0 28075000 24416000 0 7980 2137 7453 71468;71469;71470;71471;71472;71473 91037;91038;91039;91040;91041;91042;91043 91041 6 DSYIEVLLPLGSEPELR Unmodified 1929.0095 0.0095086389 4575 Q9Y305;H7C5Q2;C9J7L8 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 158.76 158.76 2;3 1.778E-12 163192 QUIQUE_DMIX7_190116_001 149.26 134.38 744750000 84861000 78085000 67846000 70079000 59467000 70842000 59043000 44871000 50210000 22297000 53168000 41873000 42109000 7981 4575 7454 71474;71475;71476;71477;71478;71479;71480;71481;71482;71483;71484;71485;71486;71487;71488 91044;91045;91046;91047;91048;91049;91050;91051;91052;91053;91054;91055;91056;91057;91058;91059;91060 91059 16 DSYLILETLPTEYDSR Unmodified 1913.9258 0.92583859 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50;E9PLG2 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 145.28 145.28 2 1.4764E-24 149906 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.02 132.78 1376000000 199450000 160830000 162050000 0 185430000 0 168120000 0 151390000 0 0 173380000 175340000 7982 4672 7455 71489;71490;71491;71492;71493;71494;71495;71496 91061;91062;91063;91064;91065;91066;91067;91068 91067 7 DSYSGGVVNMYHMK Unmodified 1586.6857 0.68574843 2272 X5D2R7;P28062;Q5JNW7;A0A140T998 PSM8;PSMB8 Proteasome subunit beta type;Proteasome subunit beta type-8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.252 67.252 2 0.00024768 67869 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.957 86.433 176440000 0 0 39384000 38043000 0 0 0 0 25140000 0 43739000 0 30132000 7983 2272 7456 71497;71498;71499;71500;71501 91069;91070;91071;91072;91073;91074 91072 5 DSYTLTEELAEYAEIR Unmodified 1901.8895 0.88945308 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 0 1 155.21 155.21 2 0.025076 160925 QUIQUE_C1368_190116_001 50.207 37.007 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7984 2173 7457 71502 91075 91075 1 DSYVAIANACCAPR Unmodified 1566.6919 0.69189644 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.153 68.153 2 1.7414E-17 68064 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.83 141.59 502450000 0 69288000 54382000 39746000 31339000 39711000 55726000 37630000 33129000 10823000 37135000 45360000 48183000 7985 4176 7458 71503;71504;71505;71506;71507;71508;71509;71510;71511;71512;71513;71514 91076;91077;91078;91079;91080;91081;91082;91083;91084;91085;91086;91087 91083 11 DSYVGDEAQSK Unmodified 1197.515 0.51496116 2788;2696;2792;447;2759;548;1333 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;A6NL76;F8WB63;B8ZZJ2;K7EM38;P60709;P62736;P63267;C9JFL5;F6UVQ4;F6QUT6;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L3R2;J3KT65;P68032;P68133 ACTB;ACTA1;ACTG2;ACTG1;ACTA2;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 0 4 4 3 4 3 3 1 4 3 4 2 4 2 23.238 23.238 1;2 0 14892 QUIQUE_C1368_190116_001 335.66 289.24 349100000000 30090000000 30114000000 33257000000 30053000000 28870000000 24235000000 27778000000 22905000000 27625000000 17844000000 21730000000 25642000000 28953000000 7986 447;548;1333;2696;2759;2788;2792 7459 71515;71516;71517;71518;71519;71520;71521;71522;71523;71524;71525;71526;71527;71528;71529;71530;71531;71532;71533;71534;71535;71536;71537;71538;71539;71540;71541;71542;71543;71544;71545;71546;71547;71548;71549;71550;71551;71552;71553;71554;71555 91088;91089;91090;91091;91092;91093;91094;91095;91096;91097;91098;91099;91100;91101;91102;91103;91104;91105;91106;91107;91108;91109;91110;91111;91112;91113;91114;91115;91116;91117;91118;91119;91120;91121;91122;91123;91124;91125;91126;91127;91128;91129;91130;91131;91132;91133;91134;91135;91136;91137;91138;91139;91140;91141;91142;91143;91144;91145;91146;91147;91148;91149;91150;91151;91152;91153;91154;91155;91156;91157;91158;91159;91160;91161;91162;91163;91164 91104 70 DSYVGDEAQSKR Unmodified 1353.6161 0.61607219 2788;2696;2792;447;2759;548;1333 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;C9JUM1;C9JZR7;C9JTX5;A6NL76;F8WB63;B8ZZJ2;K7EM38;P60709;P62736;P63267;C9JFL5;F6UVQ4;F6QUT6;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L3R2;J3KT65;P68032;P68133 ACTB;ACTA1;ACTG2;ACTG1;ACTA2;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 17.072 17.072 2;3 1.2911E-06 9585 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.75 116.88 72993000000 233100000 690670000 237020000 243100000 1690700000 111840000 572410000 15039000000 10180000000 0 19503000000 9952000000 14540000000 7987 447;548;1333;2696;2759;2788;2792 7460 71556;71557;71558;71559;71560;71561;71562;71563;71564;71565;71566;71567;71568;71569;71570;71571;71572;71573;71574;71575 91165;91166;91167;91168;91169;91170;91171;91172;91173;91174;91175;91176;91177;91178;91179;91180;91181;91182;91183;91184;91185;91186;91187;91188;91189;91190;91191;91192;91193;91194;91195;91196;91197;91198 91183 34 DTAAWTVGR Unmodified 975.47739 0.47739386 3090 Q14974;J3KTM9;J3QKQ5 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.419 50.419 2 0.00053812 48349 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.22 102.11 1923700000 0 145710000 199230000 170340000 178530000 149690000 199800000 126830000 163340000 0 200270000 161500000 228480000 7988 3090 7461 71576;71577;71578;71579;71580;71581;71582;71583;71584;71585;71586 91199;91200;91201;91202;91203;91204;91205;91206;91207;91208;91209;91210;91211 91206 11 DTADGVSQELFSAGLVDGHDVVIVAANLQK Unmodified 3067.5462 0.5462083 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 162.33 162.33 3 3.0504E-14 166987 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.516 69.229 150850000 0 0 0 0 0 0 0 0 150850000 0 0 0 0 7989 4417 7462 71587 91212 91212 1 DTAEGVSQELISAGLVDGR Unmodified 1915.9487 0.9486993 1746 O95747 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 133.22 133.22 2 1.9313E-06 129220 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.53 101.93 256640000 57957000 0 0 0 0 0 107910000 62028000 0 28740000 0 0 0 7990 1746 7463 71588;71589;71590;71591 91213;91214;91215;91216 91216 4 DTAGDASESALLK Unmodified 1276.6147 0.61467521 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.69 54.69 2 8.7652E-13 52982 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.24 121.43 865330000 207980000 0 0 0 0 0 0 271950000 230510000 0 0 0 154890000 7991 590 7464 71592;71593;71594;71595 91217;91218;91219;91220;91221 91219 4 DTAIYQKDEALHVK Unmodified 1629.8362 0.83623572 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 2 1 36.013 36.013 2;3 0.00060412 32392 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.17 105.8 379120000 0 0 0 0 0 0 0 198460000 0 0 124120000 56543000 0 7992 921 7465 71596;71597;71598;71599;71600 91222;91223;91224;91225;91226 91223 5 DTAIYQKDEALHVKNEAVK Unmodified 2171.1222 0.12224699 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 39.528 39.528 4 0.047246 35526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.21 22.513 26283000 0 0 0 0 0 0 0 26283000 0 0 0 0 0 7993 921 7466 71601 91227 91227 1 DTALLEDLGK Unmodified 1073.5605 0.56045479 82 A0A087WYU2;Q96S19 C16orf13 UPF0585 protein C16orf13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.276 92.276 2 0.0011275 94331 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0.066447945 3193 Q16762;B1AH48 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 157 157 2;3 2.8949E-28 162366 QUIQUE_C1218_190116_001 139.58 132.04 152860000 49440000 34883000 31696000 18387000 0 18456000 0 0 0 0 0 0 0 8000 3193 7472 71630;71631;71632;71633;71634;71635;71636 91260;91261;91262;91263;91264;91265;91266 91261 7 DTATLNCQSSGSKPAAR Unmodified 1762.8268 0.82681002 3569 Q8N126;A0A0C4DG09 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 15.447 15.447 3 2.1442E-31 7688 QUIQUE_C1368_190116_001 138.39 114.11 211350000 0 33234000 52778000 0 0 17793000 45841000 0 24380000 0 0 0 37325000 8001 3569 7473 71637;71638;71639;71640;71641;71642 91267;91268;91269;91270;91271;91272 91268 6 DTAVQGNIR Unmodified 972.49886 0.49885759 4410 Q9UBV8 PEF1 Peflin yes yes 0 0 0 1 19.386 19.386 2 0.04059 12441 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.351 34.569 44409000 0 0 0 0 0 0 0 0 44409000 0 0 0 0 8002 4410 7474 71643 91273 91273 1 DTCLNGLVQLLSNR Unmodified 1601.8195 0.8195398 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 150.25 150.25 2 0.042073 152941 QUIQUE_C1563_190116_001 43.68 31.103 23256000 0 0 0 0 0 23256000 0 0 0 0 0 0 0 8003 2990 7475 71644 91274 91274 1 DTDAAVGDNIGYITFVLFPR Unmodified 2183.0899 0.089884225 1486 O15144;H7C3F9 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 2 2 1 2 171.34 171.34 2;3 6.3168E-30 179044 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.28 164.49 821750000 16628000 42950000 71524000 28692000 49373000 16009000 69919000 56527000 141460000 0 135600000 71869000 121190000 8004 1486 7476 71645;71646;71647;71648;71649;71650;71651;71652;71653;71654;71655;71656;71657;71658;71659;71660;71661;71662 91275;91276;91277;91278;91279;91280;91281;91282;91283;91284;91285;91286;91287;91288;91289;91290;91291;91292;91293;91294 91291 18 DTDDVPMILVGNK Unmodified 1415.6966 0.6966307 2719 P61224;E7ESV4;F5H7Y6;F5GX62;A6NIZ1;F5H6R7;F5H004;F5H823;B7ZB78;F5GZG1 RAP1B Ras-related protein Rap-1b;Ras-related protein Rap-1b-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 108.19 108.19 2 0.00061002 111299 QUIQUE_C1277_190116_001 113.1 96.07 163580000 35949000 26716000 52108000 48804000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8005 2719 7477 71663;71664;71665;71666;71667;71668;71669 91295;91296;91297;91298;91299;91300;91301 91296 7 DTDIVDEAIYYFK Unmodified 1590.7454 0.74535503 1487 O15145;C9JZD1;F8VR50 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 1 161.55 161.55 2;3 2.9826E-13 165853 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.24 136.94 3254300000 340670000 306890000 296540000 286160000 298140000 16705000 227760000 286190000 294200000 205910000 298960000 197200000 198950000 8006 1487 7478 71670;71671;71672;71673;71674;71675;71676;71677;71678;71679;71680;71681;71682;71683;71684;71685;71686;71687;71688 91302;91303;91304;91305;91306;91307;91308;91309;91310;91311;91312;91313;91314;91315;91316;91317;91318;91319;91320;91321;91322;91323 91322 19 DTDLMTFNISVHR Unmodified 1547.7402 0.74022685 3613 Q8N8D7 NKAIN3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3 yes yes 0 0 0 1 101.93 101.93 3 0.062362 105214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 38.279 21.162 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8007 3613 7479 71689 91324 91324 1 DTDPDSKPFSLQETYEAK Unmodified 2069.9429 0.94294522 820;594 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 75.31 75.31 2;3 5.2109E-76 76370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 228.93 211.56 8196300000 602150000 639170000 1069100000 812820000 772350000 689120000 968060000 219690000 339390000 365910000 734260000 418190000 566100000 8008 820;594 7480 71690;71691;71692;71693;71694;71695;71696;71697;71698;71699;71700;71701;71702;71703;71704;71705;71706;71707;71708;71709;71710;71711;71712;71713;71714;71715;71716 91325;91326;91327;91328;91329;91330;91331;91332;91333;91334;91335;91336;91337;91338;91339;91340;91341;91342;91343;91344;91345;91346;91347;91348;91349;91350;91351;91352;91353;91354;91355;91356;91357;91358;91359;91360;91361;91362;91363;91364;91365;91366;91367;91368;91369;91370;91371;91372;91373;91374;91375;91376;91377 91367 53 DTDSEEEIR Unmodified 1092.4571 0.45711193 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;G3V361;G3V226 CALM2;CALM1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.095 21.095 2 0.00014327 13710 QUIQUE_C1563_190116_001 141.39 110.1 7193600000 1826000000 995680000 882750000 540920000 536530000 630490000 583040000 36413000 141920000 128050000 428400000 184610000 278860000 8009 1128 7481 71717;71718;71719;71720;71721;71722;71723;71724;71725;71726;71727;71728;71729 91378;91379;91380;91381;91382;91383;91384;91385;91386;91387;91388;91389;91390;91391 91384 14 DTDSEEEIREAFR Unmodified 1595.7063 0.70634376 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;G3V361;G3V226 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isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 84.208 84.208 2 0.00065298 86927 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.27 95.068 127720000 0 0 30233000 0 0 0 0 0 0 16269000 81221000 0 0 8012 1187 7484 71756;71757;71758 91420;91421;91422 91422 1 DTDTGALLFIGK Unmodified 1249.6554 0.65541781 2403 P36955;CON__Q95121 SERPINF1 Pigment epithelium-derived factor yes no 0 0 0 1 116.85 116.85 2 0.057369 120591 QUIQUE_C1277_190116_001 49.472 31.437 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8013 2403 7485 71759 91423 91423 1 DTDVEYLEIVR Unmodified 1350.6667 0.66671078 272 A0A0D9SFU4;O95970 LGI1 Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 111.8 111.8 2 0.004713 114754 QUIQUE_C1277_190116_001 79.489 68.855 72022000 51429000 20593000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8014 272 7486 71760;71761;71762 91424;91425;91426 91425 2 DTEAVMAFLEAK Unmodified 1323.6381 0.63805318 3298 Q5SW79;H0Y2V6 CEP170 Centrosomal protein of 170 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.24 136.24 2 0.00053444 140360 QUIQUE_C1403_190116_001 101.38 89.426 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7.0555E-131 71357 QUIQUE_C1277_190116_001 270.21 256.3 2481700000 323830000 352520000 0 188110000 572670000 27327000 89222000 126610000 49862000 179270000 241330000 41741000 289170000 8018 1799 7490 71778;71779;71780;71781;71782;71783;71784;71785;71786;71787;71788;71789;71790;71791;71792;71793;71794;71795;71796;71797;71798;71799;71800;71801 91446;91447;91448;91449;91450;91451;91452;91453;91454;91455;91456;91457;91458;91459;91460;91461;91462;91463;91464;91465;91466;91467;91468;91469;91470;91471;91472;91473;91474;91475 91453 27 DTEGLIQEINDLR Unmodified 1514.7577 0.75765105 3504 Q86W92;A0A0A0MTP2;F5GZP6 PPFIBP1 Liprin-beta-1 yes no 0 0 0 1 140.27 140.27 2 0.045301 144226 QUIQUE_C1403_190116_001 57.149 36.371 29831000 0 0 0 29831000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8019 3504 7491 71802 91476 91476 0 DTEIDDLK Unmodified 947.44476 0.44475633 486 A0A3B3IRY9;O15079 SNPH Syntaphilin yes no 0 0 0 1 43.133 43.133 2 0.035224 39461 QUIQUE_C1563_190116_001 63.565 24.759 30588000 0 0 0 0 0 30588000 0 0 0 0 0 0 0 8020 486 7492 71803 91477 91477 1 DTELAEELLQWFLQEEK Unmodified 2120.0314 0.031366293 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 177.16 177.16 2;3 0 184048 QUIQUE_DMIX5_190116_001 303.51 258.01 499040000 0 7443800 8152400 0 30203000 0 0 0 72561000 0 284850000 58441000 37392000 8021 50;1314 7493 71804;71805;71806;71807;71808;71809;71810;71811;71812;71813;71814;71815 91478;91479;91480;91481;91482;91483;91484;91485;91486;91487;91488;91489;91490;91491;91492;91493;91494;91495 91487 18 DTELAEELLQWFLQEEKR Unmodified 2276.1325 0.13247732 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KRF5;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 171 171 3 1.4367E-45 175359 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.69 156.32 2605600000 0 0 66494000 0 0 0 75645000 0 237550000 0 849900000 1223100000 152940000 8022 50;1314 7494 71816;71817;71818;71819;71820;71821 91496;91497;91498;91499;91500;91501 91498 6 DTELIYGAK Unmodified 1008.5128 0.51277632 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 51.781 51.781 2 0.0018944 50305 QUIQUE_C1218_190116_001 98.997 24.581 123660000 71353000 0 0 52307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8023 699 7495 71822;71823;71824 91502;91503;91504 91502 2 DTEMLATGAQDGK Unmodified 1335.5976 0.59764493 3217 Q2TAY7 SMU1 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 38.105 38.105 2 2.116E-05 34937 QUIQUE_C1218_190116_001 110.84 92.232 37556000 0 0 37556000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8024 3217 7496 71825;71826;71827;71828 91505;91506;91507;91508 91505 4 DTEPGPASGGTLGPSGEEAPRPR Unmodified 2234.0564 0.056352265 67 A0A087WXN9;Q765P7 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.291 47.291 3 7.8717E-14 44408 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.39 94.261 885260000 74285000 0 0 92282000 0 0 0 170100000 139450000 30049000 108370000 71623000 199100000 8025 67 7497 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91558;91559;91560;91561;91562;91563;91564;91565;91566 91561 160 8 DTFEHDPSESIDEFNK Unmodified 1908.8014 0.80136636 4332 Q9NYF8;A0A1W2PQ43;E9PK09;E9PQN2;E9PKI6;E9PK91;E9PJA7 BCLAF1 Bcl-2-associated transcription factor 1 yes no 0 0 0 1 78.96 78.96 3 0.050259 81285 QUIQUE_C1438_190116_001 29.077 26.425 30643000 0 0 0 0 30643000 0 0 0 0 0 0 0 0 8030 4332 7501 71874 91567 91567 1 DTFFQNPQYIFEVK Unmodified 1774.8566 0.85663681 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 146.14 146.14 2 0.00029535 150427 QUIQUE_C1403_190116_001 109.39 95.569 702860000 0 83150000 89350000 91347000 70559000 63288000 0 61941000 107140000 43768000 0 0 92315000 8031 877 7502 71875;71876;71877;71878;71879;71880;71881;71882;71883;71884 91568;91569;91570;91571;91572;91573;91574;91575;91576;91577;91578 91572 9 DTFNHLTTWLEDAR Unmodified 1717.806 0.80599822 2707 P61019;E9PKL7;H7C125 RAB2A Ras-related protein Rab-2A yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 3 1 126.47 126.47 2;3 5.1155E-14 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91607;91608;91609;91610;91611;91612;91613;91614;91615;91616;91617;91618;91619;91620;91621;91622;91623;91624 91620 18 DTFTPSGQEPILTEKETELK Unmodified 2262.1267 0.12672324 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 87.332 87.332 3 0.00067585 88187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.053 38.683 26077000 0 0 0 0 0 0 0 26077000 0 0 0 0 0 8034 2009 7505 71923 91625 91625 1 DTFTPSGQEPILTEKETELKLEEK Unmodified 2761.3909 0.39093643 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 2 1 1 1 93.69 93.69 3 1.2637E-05 95278 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.425 58.627 250730000 0 0 0 0 0 0 0 146070000 47634000 0 0 0 57027000 8035 2009 7506 71924;71925;71926 91626;91627;91628 91626 3 DTGEGYQTPNIILDIQPGGNHVIEDSHKK Unmodified 3174.5582 0.55816997 3239 Q4J6C6;H7C0M0 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes no 0 0 1 1 1 92.67 92.67 4 0.026625 95368 QUIQUE_DMIX3_190116_001 19.22 12.992 138040000 0 0 0 0 0 0 0 0 72130000 0 65905000 0 0 8036 3239 7507 71927;71928 91629;91630 91629 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91716;91717;91718;91719;91720;91721;91722;91723;91724;91725;91726;91727;91728 91721 13 DTGQLYAALHHR Unmodified 1380.6898 0.68984625 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7EIJ4 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 42.294 42.294 3 0.0013661 38826 QUIQUE_C1277_190116_001 68.536 57.926 324140000 55986000 62949000 0 0 31059000 0 36908000 0 34114000 28679000 35207000 39239000 0 8042 665 7512 72008;72009;72010;72011;72012;72013;72014;72015 91729;91730;91731;91732;91733;91734;91735;91736 91730 6 DTHDQLSEPSEVR Unmodified 1511.6852 0.68521439 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 30.265 30.265 2;3 1.5353E-23 24296 QUIQUE_C1563_190116_001 172.8 155.78 11167000000 966420000 936390000 1425500000 563680000 424200000 221100000 1343100000 1146700000 1319500000 593500000 598630000 1240300000 388270000 8043 3117 7513 72016;72017;72018;72019;72020;72021;72022;72023;72024;72025;72026;72027;72028;72029;72030;72031;72032;72033;72034;72035;72036;72037 91737;91738;91739;91740;91741;91742;91743;91744;91745;91746;91747;91748;91749;91750;91751;91752;91753;91754;91755;91756;91757;91758;91759 91746 19 DTHEDHDTSTENTDESNHDPQFEPIVSLPEQEIK Unmodified 3932.7097 0.7096574 2464 P43487;C9JJ34 RANBP1 Ran-specific GTPase-activating protein yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 1 1 3 1 3 3 2 95.557 95.557 3;4;5 6.3491E-40 97255 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.58 100.97 2115500000 251400000 254810000 226080000 223250000 222880000 88749000 93210000 193170000 0 37028000 204810000 192740000 127400000 8044 2464 7514 72038;72039;72040;72041;72042;72043;72044;72045;72046;72047;72048;72049;72050;72051;72052;72053;72054;72055;72056;72057;72058;72059;72060;72061;72062;72063;72064;72065;72066 91760;91761;91762;91763;91764;91765;91766;91767;91768;91769;91770;91771;91772;91773;91774;91775;91776;91777;91778;91779;91780;91781;91782;91783;91784;91785;91786;91787;91788;91789;91790 91778 30 DTHLTITPTVLGER Unmodified 1551.8257 0.82567103 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 2 1 81.037 81.037 2;3 0.00012918 81426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.536 73.175 81640000 0 0 0 28883000 0 0 0 24705000 0 28052000 0 0 0 8045 212 7515 72067;72068;72069;72070 91791;91792;91793;91794;91795 91792 5 DTICNQDER Unmodified 1149.4721 0.47205049 4495 Q9ULV4;B4E3S0;H0YHL7 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 0 1 15.505 15.505 2 0.023183 7540 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.91 46.703 25946000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25946000 0 0 0 8046 4495 7516 72071 91796 91796 1 DTIFDVPVER Unmodified 1189.5979 0.59790293 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.22 104.22 2 0.00025977 108228 QUIQUE_C1576_190116_001 117.04 108.82 2208500000 125720000 16813000 278780000 190870000 126670000 147470000 155640000 199760000 242400000 100370000 206640000 175380000 242000000 8047 1670 7517 72072;72073;72074;72075;72076;72077;72078;72079;72080;72081;72082;72083;72084 91797;91798;91799;91800;91801;91802;91803;91804;91805;91806;91807;91808;91809;91810;91811;91812;91813;91814;91815 91806 19 DTILAELLQIHK Unmodified 1392.7977 0.79766537 2478 P46100 ATRX Transcriptional regulator ATRX yes yes 0 0 0 1 1 141.36 141.36 3 0.00022903 144318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.187 78.653 13314000 0 0 0 0 0 0 0 13314000 0 0 0 0 0 8048 2478 7518 72085;72086 91816;91817 91816 2 DTILHDNLK Unmodified 1067.5611 0.56112349 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 32.888 32.888 2;3 0.00057289 27755 QUIQUE_C1277_190116_001 111.82 71.489 1067100000 89075000 173770000 105310000 181170000 0 114240000 111490000 48802000 146780000 51155000 0 45308000 0 8049 3063 7519 72087;72088;72089;72090;72091;72092;72093;72094;72095;72096;72097;72098;72099 91818;91819;91820;91821;91822;91823;91824;91825;91826;91827;91828;91829;91830 91819 9 DTILQLNLK Unmodified 1056.6179 0.61791009 2294;2556 P50148;P29992;K7EL62 GNAQ;GNA11 Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.858 98.858 1;2 2.3339E-05 101561 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.33 96.309 1678200000 199800000 220950000 118030000 100880000 121340000 199620000 158760000 167280000 153880000 81930000 155710000 0 0 8050 2556;2294 7520 72100;72101;72102;72103;72104;72105;72106;72107;72108;72109;72110;72111 91831;91832;91833;91834;91835;91836;91837;91838;91839;91840;91841;91842;91843;91844;91845;91846;91847 91845 16 DTINTSCDIELLAACR Unmodified 1850.8502 0.85024758 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1;Q5JVM0 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 117.74 117.74 2 0.0016562 121100 QUIQUE_C1403_190116_001 63.091 50.531 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8051 153 7521 72112 91848 91848 1 DTIQHQQGEAVWVSEGK Unmodified 1910.9123 0.91225421 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 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MAVS Mitochondrial antiviral-signaling protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.36 137.36 3 2.6487E-05 143924 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.68 108.91 137060000 19029000 0 0 21029000 17555000 0 0 0 23045000 0 21579000 16964000 17859000 8076 3460 7545 72275;72276;72277;72278;72279;72280;72281;72282 92045;92046;92047;92048;92049;92050;92051;92052 92050 8 DTMDLPEELPGVKPFTR Unmodified 1943.9663 0.96626362 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 118.27 118.27 3 0.00024641 122621 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.783 60.587 77733000 0 0 0 0 0 0 0 0 40480000 0 37253000 0 0 8077 2191 7546 72283;72284 92053;92054 92053 2 DTMSDQALEALSASLGTR Unmodified 1864.8837 0.8836562 240 E7ES10;E9PCH5;E7EVY3;B7Z574;A0A0C4DGB5;P20810;H0Y7F0;H0Y9H6;E9PDE4 CAST Calpastatin no no 0 0 0 1 1 153.3 153.3 3 0.00025164 158349 QUIQUE_C1218_190116_001 49.865 42.733 22524000 22524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8078 240 7547 72285;72286 92055;92056 92055 2 DTNGENIAESLVAEGLATR Unmodified 1958.9545 0.95451296 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 146.63 146.63 2;3 4.0212E-28 151916 QUIQUE_C1368_190116_001 173.36 151.72 885340000 83348000 81805000 115450000 96980000 90142000 27424000 77180000 90610000 0 32894000 96640000 0 92866000 8079 3432 7548 72287;72288;72289;72290;72291;72292;72293;72294;72295;72296;72297;72298;72299;72300;72301;72302;72303;72304;72305;72306;72307;72308 92057;92058;92059;92060;92061;92062;92063;92064;92065;92066;92067;92068;92069;92070;92071;92072;92073;92074;92075;92076;92077;92078;92079;92080;92081;92082 92062 25 DTNGSQFFITTVK Unmodified 1456.7198 0.71980898 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.208 98.208 2 8.6819E-06 102280 QUIQUE_C1218_190116_001 145.91 127.24 2622200000 174050000 208640000 216390000 201640000 191020000 178230000 217780000 240840000 261040000 0 218880000 271110000 242620000 8080 2210 7549 72309;72310;72311;72312;72313;72314;72315;72316;72317;72318;72319;72320 92083;92084;92085;92086;92087;92088;92089;92090;92091;92092;92093;92094;92095;92096 92084 14 DTNVMLVALAAK Unmodified 1244.6799 0.67985842 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 113.64 113.64 2 0.0016479 116792 QUIQUE_C1277_190116_001 79.986 65.983 63214000 0 25059000 0 0 0 0 0 29272000 0 8883000 0 0 0 8081 3037 7550 72321;72322;72323 92097;92098;92099 92097 2 DTNYTLNTDSLDWALYDHLMDFLADR Oxidation (M) 3133.3975 0.39749515 2906 Q07021;I3L3Q7;I3L3B0 C1QBP Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial yes no 0 1 0 1 171.64 171.64 3 1.6844E-14 178968 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.131 75.424 54758000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54758000 0 0 8082 2906 7551 72324 92100 92100 2383 1 DTPALFNFTTQELSSNPPLATILIPPHAR Unmodified 3160.6557 0.65569917 2551 P49841;A0A3B3ITW1 GSK3B Glycogen synthase kinase-3 beta yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 166.08 166.08 3;4 2.0708E-13 171017 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95.492 2;3 1.1812E-46 97241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.39 178.04 3071300000 170260000 285580000 218280000 147890000 234950000 140320000 218030000 271940000 265090000 58527000 399310000 365670000 295440000 8087 856 7556 72370;72371;72372;72373;72374;72375;72376;72377;72378;72379;72380;72381;72382;72383;72384;72385;72386;72387;72388;72389;72390;72391;72392;72393 92154;92155;92156;92157;92158;92159;92160;92161;92162;92163;92164;92165;92166;92167;92168;92169;92170;92171;92172;92173;92174;92175;92176;92177;92178;92179;92180 92169 26 DTPGFIVNR Unmodified 1017.5243 0.52434406 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQV5;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.806 60.806 2 0.00042351 59788 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.57 84.742 3599700000 0 299590000 384370000 310780000 338290000 346420000 288660000 219620000 361200000 0 390520000 287560000 372690000 8088 913 7557 72394;72395;72396;72397;72398;72399;72400;72401;72402;72403;72404 92181;92182;92183;92184;92185;92186;92187;92188;92189;92190;92191;92192;92193;92194;92195;92196;92197;92198;92199 92198 18 DTPGHGSGWAETPR Unmodified 1466.6539 0.65385468 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 29.194 29.194 3 0.044981 23654 QUIQUE_DMIX8_190116_001 32.341 17.139 82863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44997000 0 37866000 8089 1644 7558 72405;72406 92200;92201 92201 1 DTPGLHIGKPENK Unmodified 1404.7361 0.73612775 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 22.808 22.808 2;3 0.00078768 15826 QUIQUE_C1563_190116_001 81.494 59.863 689930000 28149000 63237000 0 97114000 30106000 102240000 116240000 0 107040000 0 63314000 0 82485000 8090 2470 7559 72407;72408;72409;72410;72411;72412;72413;72414;72415;72416;72417;72418 92202;92203;92204;92205;92206;92207;92208;92209;92210;92211;92212;92213;92214 92207 13 DTPQEMEQTR Unmodified 1233.5296 0.52956537 196 A0A0A0MTN0;Q13617 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 25.149 25.149 2 0.027566 18928 QUIQUE_C1218_190116_001 76.827 65.467 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8091 196 7560 72419 92215 92215 1 DTPTQEDWLVSVLPEGSR Unmodified 2027.98 0.97999942 4259 Q9NQW7;Q5T6H7;Q5T6H2;Q5T6H3 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 3 3 1 147.31 147.31 2;3 1.2209E-17 152444 QUIQUE_C1368_190116_001 136.39 114.2 1272800000 135890000 117490000 123130000 100430000 134180000 95002000 126760000 68708000 0 59628000 119280000 89504000 102780000 8092 4259 7561 72420;72421;72422;72423;72424;72425;72426;72427;72428;72429;72430;72431;72432;72433;72434;72435;72436;72437;72438;72439;72440;72441;72442;72443;72444;72445;72446 92216;92217;92218;92219;92220;92221;92222;92223;92224;92225;92226;92227;92228;92229;92230;92231;92232;92233;92234;92235;92236;92237;92238;92239;92240;92241;92242;92243;92244;92245;92246;92247;92248 92223 30 DTPTSAGPNSFNK Unmodified 1334.6103 0.61025853 3710 Q8WW12 PCNP PEST proteolytic signal-containing nuclear protein yes yes 0 0 0 1 1 31.462 31.462 2 0.015854 26740 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.286 37.617 69496000 0 0 0 0 0 0 0 35661000 0 0 0 0 33835000 8093 3710 7562 72447;72448 92249;92250;92251 92250 3 DTQDIVHDLESPGIDPSIIK Unmodified 2191.1008 0.10084284 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 2 135 135 2;3 0.00078513 141973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.163 84.893 110710000 0 0 0 0 0 0 0 0 32593000 0 78118000 0 0 8094 1187 7563 72449;72450;72451 92252;92253;92254 92253 2 DTQEVPLEK Unmodified 1057.5292 0.52915466 4075 Q9BYJ9;A0A024R7W5;A0A087X0Q1;A0A087WY31;Q7Z739 YTHDF1;YTHDF3 YTH domain-containing family protein 1;YTH domain-containing family protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 32.086 32.086 2 0.0091346 27172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.825 44.47 200720000 65064000 51765000 0 0 0 39474000 0 0 44412000 0 0 0 0 8095 4075 7564 72452;72453;72454;72455 92255;92256;92257;92258 92258 4 DTQFSYAVFK Unmodified 1204.5764 0.57643921 3787 Q969P0;C9J8Z4 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.363 98.363 2 0.0015465 100165 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.95 83.773 1043000000 166580000 152380000 0 128930000 0 0 0 99796000 124560000 69379000 113170000 0 188180000 8096 3787 7565 72456;72457;72458;72459;72460;72461;72462;72463 92259;92260;92261;92262;92263;92264;92265;92266 92262 7 DTQSGSLLFIGR Unmodified 1292.6725 0.67246486 2565 P50454;E9PKH2;H0YEP8 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 104.94 104.94 2 3.2589E-05 107641 QUIQUE_C1403_190116_001 150.08 74.337 183690000 31265000 0 0 42351000 0 0 25878000 0 33356000 16046000 34798000 0 0 8097 2565 7566 72464;72465;72466;72467;72468;72469;72470 92267;92268;92269;92270;92271;92272;92273 92268 7 DTSASAVAVGLK Unmodified 1117.5979 0.59790293 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.192 51.192 2 0.0032626 48801 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.4 62.15 3805400000 393520000 339720000 0 408820000 326040000 337100000 0 313290000 428910000 0 467240000 381460000 409350000 8098 1153 7567 72471;72472;72473;72474;72475;72476;72477;72478;72479;72480 92274;92275;92276;92277;92278;92279;92280;92281;92282;92283 92283 1 DTSEDIEELVEPVAAHGPK Unmodified 2034.9746 0.9745797 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.07 117.07 3 1.0908E-08 121116 QUIQUE_C1277_190116_001 84.829 80.988 1511100000 125020000 127430000 135020000 111460000 170490000 81988000 134120000 97721000 88919000 43723000 148830000 108940000 137440000 8099 3954 7568 72481;72482;72483;72484;72485;72486;72487;72488;72489;72490;72491;72492;72493 92284;92285;92286;92287;92288;92289;92290;92291;92292;92293;92294;92295;92296;92297;92298;92299;92300;92301;92302;92303;92304;92305;92306 92287 23 DTSFEQHVLWHTGGK Unmodified 1740.822 0.82198264 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 62.519 62.519 2;3 3.5423E-09 62467 QUIQUE_C1576_190116_001 146.08 132.4 631720000 0 0 0 0 167120000 53759000 186430000 0 0 0 191760000 32661000 0 8100 2524 7569 72494;72495;72496;72497;72498;72499 92307;92308;92309;92310;92311;92312 92310 5 DTSFSGLSLEEYK Unmodified 1474.6828 0.68275477 3323 Q5TAQ0;V5IRT4;Q9BRT2 UQCC2 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2 yes no 0 0 0 1 2 1 108.7 108.7 2 0.0015602 113933 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.687 75.032 122860000 0 38861000 0 0 0 0 0 0 0 0 54824000 29174000 0 8101 3323 7570 72500;72501;72502;72503 92313;92314;92315;92316 92314 3 DTSISCYK Unmodified 972.42225 0.42224675 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 25.727 25.727 2 0.032902 20254 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.038 29.42 103600000 0 0 0 0 0 0 0 40602000 0 0 0 0 63003000 8102 3800 7571 72504;72505 92317;92318 92317 2 DTSITGELEK Unmodified 1091.5346 0.53463397 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 52.597 52.597 2 0.0015194 50666 QUIQUE_C1277_190116_001 96.668 52.221 76721000 0 49366000 0 0 27354000 0 0 0 0 0 0 0 0 8103 2385 7572 72506;72507;72508;72509 92319;92320;92321;92322 92320 4 DTSLYRPALEELR Unmodified 1561.81 0.81002097 2976 Q13200;C9JPC0;H7C2Q3 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 86.027 86.027 3 0.00071718 87380 QUIQUE_C1277_190116_001 82.202 70.51 176020000 57459000 45731000 0 47585000 0 0 0 0 0 25242000 0 0 0 8104 2976 7573 72510;72511;72512;72513 92323;92324;92325;92326 92324 4 DTSLYRPALEELRR Unmodified 1717.9111 0.911132 2976 Q13200;C9JPC0;H7C2Q3 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 2 1 72.18 72.18 4 0.0028642 71668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.078 65.817 35133000 0 0 0 0 0 0 0 35133000 0 0 0 0 0 8105 2976 7574 72514 92327 92327 0 DTSNHFHVFVGDLSPEITTEDIK Unmodified 2600.2395 0.23946159 2852;745 Q01085;E7ETJ9;E7ETC0;A6NKZ9;C9JTN7;H7BY49 TIAL1;TIA1 Nucleolysin TIAR no no 0 0 0 1 1 1 1 114.38 114.38 3;4 9.8874E-05 120011 QUIQUE_C1438_190116_001 39.506 31.973 226500000 0 50461000 53591000 0 66281000 0 0 0 0 0 56171000 0 0 8106 2852;745 7575 72515;72516;72517;72518 92328;92329;92330;92331 92330 3 DTSVLQWR Unmodified 1003.5087 0.50869399 1757 O95834 EML2 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.008 80.008 2 0.016585 81643 QUIQUE_C1218_190116_001 82.913 58.71 95847000 21623000 0 28405000 0 0 0 0 22254000 0 23566000 0 0 0 8107 1757 7576 72519;72520;72521;72522;72523;72524 92332;92333;92334;92335;92336;92337 92332 6 DTSYLFITGPDVVK Unmodified 1553.7977 0.79772495 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3;E7ENC1 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.78 129.78 2 0.00082664 132455 QUIQUE_C1563_190116_001 81.09 75.309 550590000 79001000 0 126060000 68502000 73208000 75376000 0 0 0 39669000 0 88769000 0 8108 739 7577 72525;72526;72527;72528;72529;72530;72531 92338;92339;92340;92341;92342;92343;92344 92342 4 DTTALSFFHMLNGAALR Unmodified 1863.9302 0.93015288 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 148.25 148.25 3 2.3035E-07 153738 QUIQUE_C1368_190116_001 106.42 98.173 167350000 0 39737000 36835000 0 0 43423000 0 47359000 0 0 0 0 0 8109 2452 7578 72532;72533;72534;72535 92345;92346;92347;92348 92346 3 DTTINEIEDTFR Unmodified 1452.6733 0.67325272 3204 Q16864 ATP6V1F V-type proton ATPase subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 127.18 127.18 2 1.7809E-45 132790 QUIQUE_C1218_190116_001 200.71 174.27 1667300000 172620000 194430000 130330000 63047000 113460000 96304000 140150000 109630000 151140000 46451000 158470000 135160000 156140000 8110 3204 7579 72536;72537;72538;72539;72540;72541;72542;72543;72544;72545;72546;72547;72548;72549 92349;92350;92351;92352;92353;92354;92355;92356;92357;92358;92359;92360;92361;92362;92363;92364;92365;92366;92367 92350 18 DTTPDELLSAVMTAVLK Unmodified 1802.9336 0.9335665 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4;F2Z2Q6;F2Z3P7 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 1 177.44 177.44 2;3 8.0049E-05 184168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.813 54.021 765300000 25285000 89399000 0 0 119720000 0 34474000 39149000 182930000 0 140110000 134230000 0 8111 1956 7580 72550;72551;72552;72553;72554;72555;72556;72557;72558;72559;72560;72561;72562 92368;92369;92370;92371;92372;92373;92374;92375;92376;92377;92378;92379;92380;92381;92382;92383 92382 15 DTTPDELLSAVMTAVLK Oxidation (M) 1818.9285 0.92848113 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4;F2Z2Q6;F2Z3P7 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 1 0 1 167.13 167.13 2 0.021493 170104 QUIQUE_C1403_190116_001 66.393 51.493 12271000 0 0 0 12271000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8112 1956 7580 72563 92384 92384 0 DTTPLNVLCSPGIQVVSVGIK Unmodified 2196.1824 0.1824044 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 2 149 149 2;3 1.3856E-07 153063 QUIQUE_C1403_190116_001 108.89 94.636 2389100000 286950000 123550000 110500000 221150000 547830000 284630000 133300000 47195000 72574000 130080000 112940000 103920000 214480000 8113 96 7581 72564;72565;72566;72567;72568;72569;72570;72571;72572;72573;72574;72575;72576;72577;72578;72579;72580;72581 92385;92386;92387;92388;92389;92390;92391;92392;92393;92394;92395;92396;92397;92398;92399;92400;92401;92402;92403;92404 92390 19 DTTSPMELAALEK Unmodified 1404.6806 0.68064628 3415 Q6VY07 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 98.298 98.298 2 0.022186 100898 QUIQUE_C1403_190116_001 51.013 32.332 107360000 0 0 0 42850000 0 0 30963000 0 0 0 0 0 33550000 8114 3415 7582 72582;72583;72584 92405;92406;92407 92405 3 DTTVGTLSQR Unmodified 1076.5462 0.54620171 2589 P51665 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes yes 0 0 0 1 1 30.844 30.844 2 0.001841 25673 QUIQUE_C1218_190116_001 93.267 69.743 286390000 161010000 0 0 125370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8115 2589 7583 72585;72586 92408;92409 92408 2 DTTVIIWQVDPDTHLLK Unmodified 1993.052 0.052042156 4182 Q9H7D7;H0Y9R3 WDR26 WD repeat-containing protein 26 yes no 0 0 0 1 132.03 132.03 3 0.002157 135766 QUIQUE_C1403_190116_001 37.583 28.651 15575000 0 0 0 15575000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8116 4182 7584 72587 92410 92410 1 DTTYWCQMFK Unmodified 1378.5686 0.56859341 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 123.37 123.37 2 0.019072 128403 QUIQUE_C1218_190116_001 60.508 53.613 47833000 19010000 0 0 20654000 0 8169300 0 0 0 0 0 0 0 8117 3405 7585 72588;72589;72590 92411;92412;92413 92411 3 DTVASALMYHR Unmodified 1262.6078 0.60775611 3253 Q53GT1;C9J191 KLHL22 Kelch-like protein 22 yes no 0 0 0 1 1 62.057 62.057 3 0.025955 60819 QUIQUE_C1277_190116_001 29.245 18.148 28696000 11261000 17435000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8118 3253 7586 72591;72592 92414;92415 92415 2 DTVATQLSEAVDATR Unmodified 1575.774 0.77402939 1586 O60664;K7ERZ3;K7EL96 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 0 2 1 2 2 104.74 104.74 2;3 1.0326E-23 101645 QUIQUE_DMIX4_190116_001 150.06 124.67 280090000 0 0 0 12719000 0 12700000 0 181390000 0 73280000 0 0 0 8119 1586 7587 72593;72594;72595;72596;72597;72598;72599 92416;92417;92418;92419;92420;92421;92422 92421 6 DTVCSGVTGAANVAK Unmodified 1448.6929 0.6929423 302 A0A0J9YXN7;Q96Q06 PLIN4 Perilipin-4 yes no 0 0 0 1 46.5 46.5 2 0.0018611 43251 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.813 65.509 24615000 0 0 0 0 0 0 0 24615000 0 0 0 0 0 8120 302 7588 72600 92423 92423 1 DTVFALVNYIFFK Unmodified 1575.8337 0.83371653 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.7 174.7 2;3 5.0769E-07 179603 QUIQUE_C1576_190116_001 160.59 137.27 523080000 0 2022700 140900000 15676000 0 0 205490000 27929000 65883000 0 0 0 65177000 8121 4;1799 7589 72601;72602;72603;72604;72605;72606;72607;72608;72609 92424;92425;92426;92427;92428;92429;92430;92431;92432;92433;92434;92435 92429 12 DTVIKPLLVEPEGLEK Unmodified 1779.003 0.002966698 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 101.15 101.15 2;3 2.2475E-05 105427 QUIQUE_C1438_190116_001 107.53 101.5 1984700000 207240000 214090000 218340000 66238000 370330000 0 66300000 0 128870000 89233000 330190000 0 293910000 8122 1802 7590 72610;72611;72612;72613;72614;72615;72616;72617;72618;72619;72620;72621;72622;72623;72624;72625;72626;72627 92436;92437;92438;92439;92440;92441;92442;92443;92444;92445;92446;92447;92448;92449;92450;92451;92452;92453 92444 17 DTVTISGPQAPVFEFVEQLR Unmodified 2232.1426 0.14264808 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 166.57 166.57 2;3 1.2886E-56 171332 QUIQUE_C1218_190116_001 174.62 159.23 603350000 114180000 142540000 93113000 0 61694000 62600000 79876000 0 0 49341000 0 0 0 8123 2524 7591 72628;72629;72630;72631;72632;72633;72634;72635;72636;72637;72638;72639;72640;72641 92454;92455;92456;92457;92458;92459;92460;92461;92462;92463;92464;92465;92466;92467;92468;92469;92470 92456 14 DTVTISGPQAPVFEFVEQLRK Unmodified 2360.2376 0.23761109 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 151.36 151.36 3 2.6574E-14 154551 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.352 80.076 386130000 0 0 0 0 0 0 0 111780000 83085000 0 107910000 83367000 0 8124 2524 7592 72642;72643;72644;72645 92471;92472;92473;92474;92475;92476 92471 6 DTVYAVIPAEK Unmodified 1204.634 0.63395408 1253 I3L448;A8MRA7;Q5TC12;H0YEW4 ATPAF1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 72.663 72.663 2 0.0038143 74120 QUIQUE_C1218_190116_001 90.263 57.942 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8125 1253 7593 72646;72647;72648;72649;72650;72651;72652 92477;92478;92479;92480;92481;92482;92483 92477 7 DTWVEHWPEEDECQDEENQK Unmodified 2602.019 0.01904006 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain 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Unmodified 1763.9054 0.90537792 1392 O00267 SUPT5H Transcription elongation factor SPT5 yes yes 0 0 0 1 104.8 104.8 2 0.055619 108343 QUIQUE_C1218_190116_001 44.616 19.824 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8129 1392 7597 72659 92490 92490 1 DTYMLSSTVSSK Unmodified 1317.6122 0.61223236 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 61.809 61.809 2 0.020086 57578 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.567 41.326 29525000 0 0 0 19373000 0 0 0 0 0 10152000 0 0 0 8130 3857 7598 72660;72661 92491;92492 92492 1 DTYSWLLK Unmodified 1024.5229 0.52294707 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 112.04 112.04 2 0.0068059 116034 QUIQUE_C1368_190116_001 100.39 84.758 135740000 0 0 88944000 0 22489000 0 24312000 0 0 0 0 0 0 8131 2168 7599 72662;72663;72664;72665 92493;92494;92495;92496;92497 92494 5 DTYYDTPELSLMQADHWLR Unmodified 2353.0685 0.068496856 4028 Q9BU02;G3V5B9;G3V5Q5 THTPA 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92634;92635;92636;92637;92638;92639;92640;92641;92642;92643;92644;92645;92646;92647;92648;92649;92650;92651;92652;92653;92654;92655;92656;92657;92658;92659;92660;92661;92662;92663;92664;92665;92666;92667;92668;92669;92670;92671;92672;92673;92674;92675;92676;92677;92678;92679;92680;92681;92682;92683;92684;92685;92686;92687;92688;92689;92690;92691;92692;92693;92694;92695;92696;92697;92698;92699;92700;92701;92702;92703;92704;92705;92706;92707;92708;92709;92710 92648 77 DVAEVDTVR Unmodified 1002.4982 0.49818889 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.581 34.581 2 0.00049432 29792 QUIQUE_C1368_190116_001 127.56 83.757 1484700000 0 0 451580000 0 0 0 0 280590000 0 330390000 422150000 0 0 8136 3117 7604 72830;72831;72832;72833 92711;92712;92713;92714;92715;92716 92712 6 DVAEVDTVRR Unmodified 1158.5993 0.59929991 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 23.262 23.262 2;3 0.00025508 16508 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.12 84.763 4808500000 0 0 0 65246000 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1 1 43.476 43.476 2 0.017384 40754 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.635 65.588 2241000000 274780000 205500000 215000000 132970000 0 0 188230000 193640000 225340000 0 261480000 249460000 294590000 8153 2890 7621 73019;73020;73021;73022;73023;73024;73025;73026;73027;73028 92926;92927;92928;92929;92930;92931;92932;92933;92934;92935;92936 92932 11 DVCIVLAK Unmodified 916.50519 0.50518852 4591 Q9Y3E7;A0A140T963 CHMP3 Charged multivesicular body protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 62.847 62.847 2 0.0304 58666 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.993 0 72235000 21128000 32074000 0 0 0 0 0 0 0 19033000 0 0 0 8154 4591 7622 73029;73030;73031 92937;92938;92939 92939 3 DVCLYPR Unmodified 921.43784 0.43783723 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 54.531 54.531 2 0.029287 52521 QUIQUE_C1277_190116_001 91.584 55.028 511980000 120200000 131230000 99389000 90074000 0 71088000 0 0 0 0 0 0 0 8155 1553 7623 73032;73033;73034;73035;73036 92940;92941;92942;92943;92944 92941 5 DVCTELLPLIK Unmodified 1299.7108 0.7108242 2102 P16152;E9PQ63;A8MTM1 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.98 134.98 2 0.00046613 141321 QUIQUE_C1438_190116_001 110.87 78.937 571370000 40264000 51714000 64275000 76152000 61724000 90562000 59016000 0 34663000 41204000 0 17364000 34427000 8156 2102 7624 73037;73038;73039;73040;73041;73042;73043;73044;73045;73046;73047;73048 92945;92946;92947;92948;92949;92950;92951;92952;92953;92954;92955;92956;92957;92958;92959;92960 92952 16 DVCTELLPLIKPQGR Unmodified 1737.9447 0.94474031 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 115.84 115.84 2;3 7.6502E-30 119766 QUIQUE_DMIX3_190116_001 189.72 183.06 17714000000 554020000 1118900000 1334400000 1276000000 1661700000 1191100000 1742800000 1395200000 1802000000 483590000 1511700000 1464400000 2178400000 8157 2102 7625 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QUIQUE_C1576_190116_001 206.97 162.65 12418000000 910650000 1200600000 1002700000 947260000 946240000 926940000 1319100000 931470000 958330000 517340000 772760000 1009600000 975310000 8161 267;275;3025 7629 73104;73105;73106;73107;73108;73109;73110;73111;73112;73113;73114;73115;73116;73117;73118;73119;73120;73121;73122;73123;73124;73125;73126 93051;93052;93053;93054;93055;93056;93057;93058;93059;93060;93061;93062;93063;93064;93065;93066;93067;93068;93069;93070;93071;93072;93073;93074;93075;93076;93077;93078;93079;93080;93081;93082;93083;93084;93085;93086;93087;93088;93089;93090;93091;93092;93093;93094;93095;93096 93074 44 DVDETGITVASLER Unmodified 1503.7417 0.74166663 3696 Q8WU90;H7C466 ZC3H15 Zinc finger CCCH domain-containing protein 15 yes no 0 0 0 1 1 97.123 97.123 2 0.0098645 99823 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.087 39.061 54103000 0 0 0 0 0 0 32942000 0 0 0 0 0 21162000 8162 3696 7630 73127;73128 93097;93098 93098 1 DVDETISWIK Unmodified 1204.5976 0.59756858 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 108.37 108.37 1;2 2.6725E-10 113163 QUIQUE_C1576_190116_001 190.02 147.42 17651000000 975210000 1501200000 1436300000 1143100000 1692200000 1176300000 1506500000 1119500000 1575900000 589640000 1694800000 1456200000 1784500000 8163 267;275;3025 7631 73129;73130;73131;73132;73133;73134;73135;73136;73137;73138;73139;73140;73141;73142;73143;73144;73145;73146;73147;73148;73149 93099;93100;93101;93102;93103;93104;93105;93106;93107;93108;93109;93110;93111;93112;93113;93114;93115;93116;93117;93118;93119;93120;93121;93122;93123;93124;93125;93126 93112 20 DVDFELIK Unmodified 977.50696 0.50696266 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.03 102.03 2 0.0068603 106032 QUIQUE_C1218_190116_001 100.19 42.907 1336500000 191890000 242110000 0 172150000 219040000 187150000 212120000 0 0 112040000 0 0 0 8164 2514 7632 73150;73151;73152;73153;73154;73155;73156;73157 93127;93128;93129;93130;93131;93132;93133;93134;93135;93136 93128 10 DVDFELIKVEGK Unmodified 1390.7344 0.73439641 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.878 95.878 3 0.00066757 99689 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.169 74.381 322220000 0 0 0 0 23739000 0 0 64092000 54886000 0 91617000 40202000 47681000 8165 2514 7633 73158;73159;73160;73161;73162;73163 93137;93138;93139;93140;93141;93142 93140 6 DVDGATLAR Unmodified 916.46141 0.46140945 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 29.863 29.863 1;2 0.00016097 24004 QUIQUE_C1277_190116_001 165.11 66.115 4189200000 1219100000 123800000 0 0 0 94646000 970270000 616270000 0 423820000 0 741280000 0 8166 3176 7634 73164;73165;73166;73167;73168;73169;73170;73171;73172;73173 93143;93144;93145;93146;93147;93148;93149;93150;93151;93152 93145 4 DVDGAYMTK Unmodified 998.4379 0.43789681 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 32.663 32.663 1;2 0.010177 27265 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.486 42.131 1897800000 0 96260000 45705000 0 176170000 95846000 0 166590000 168600000 226870000 303260000 272280000 346200000 + 8167 1859 7635 73174;73175;73176;73177;73178;73179;73180;73181;73182;73183;73184 93153;93154;93155;93156;93157;93158;93159;93160;93161;93162;93163 93162 9 DVDGLTSINAGK Unmodified 1188.5986 0.59863121 1005 F5H2F4;V9GY75 MTHFD1 yes no 0 0 0 1 60.187 60.187 2 0.0049359 59618 QUIQUE_C1368_190116_001 83.869 67.329 110110000 0 0 110110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8168 1005 7636 73185 93164 93164 0 DVDGLTSINAGR Unmodified 1216.6048 0.60477922 2027 P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 65.221 65.221 2 0.0022428 66474 QUIQUE_C1438_190116_001 76.143 64.096 259540000 0 0 0 0 117510000 0 0 0 0 0 0 0 142020000 8169 2027 7637 73186;73187 93165;93166 93165 1 DVDHLFQK Unmodified 1000.4978 0.49779495 2350 P32455;Q9H0R5;H3BNS1 GBP1;GBP3 Interferon-induced guanylate-binding protein 1;Guanylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 42.271 42.271 2 0.04789 39476 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.25 82.536 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8170 2350 7638 73188;73189 93167;93168 93167 2 DVDIIDHHDNTYTVK Unmodified 1783.8377 0.83769228 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 53.9 53.9 2;3 6.8887E-66 51761 QUIQUE_C1368_190116_001 202.32 165.74 2083000000 156860000 0 289410000 267960000 271680000 0 228330000 203210000 243420000 0 226860000 27265000 168050000 8171 2178 7639 73190;73191;73192;73193;73194;73195;73196;73197;73198;73199;73200;73201;73202;73203;73204;73205;73206;73207 93169;93170;93171;93172;93173;93174;93175;93176;93177;93178;93179;93180;93181;93182;93183;93184;93185;93186;93187 93171 14 DVDKFGNEITQLAR Unmodified 1604.8158 0.81583463 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 91.081 91.081 3 0.0012499 93446 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.92 56.502 116120000 0 0 0 25508000 0 0 0 0 0 0 50822000 0 39786000 8172 3660 7640 73208;73209;73210;73211;73212 93188;93189;93190;93191;93192 93190 5 DVDLEFLAK Unmodified 1048.5441 0.54407645 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 113.14 113.14 1;2 0.00042731 117030 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.29 93.068 4156600000 250220000 264930000 295360000 290700000 354510000 256460000 341390000 308890000 417660000 155040000 365380000 443500000 412550000 8173 2658 7641 73213;73214;73215;73216;73217;73218;73219;73220;73221;73222;73223;73224;73225;73226;73227;73228 93193;93194;93195;93196;93197;93198;93199;93200;93201;93202;93203;93204;93205;93206;93207;93208;93209;93210;93211;93212;93213;93214;93215;93216;93217;93218;93219;93220 93208 26 DVDNAYMIK Oxidation (M) 1083.4907 0.49066067 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 1 0 1 1 1 1 43.201 43.201 2 0.033651 39762 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.177 43.598 329190000 50905000 0 0 0 0 0 0 40490000 0 170100000 0 0 67699000 + 8174 781;782 7642 73229;73230;73231;73232 93221;93222;93223;93224 93222 4 DVDNAYMIK Unmodified 1067.4957 0.49574604 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 1 58.794 58.794 2 0.012308 54353 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.75 90.589 203830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87534000 0 116300000 0 + 8175 781;782 7642 73233;73234 93225;93226 93225 1 DVDNLFFLQGFLK Unmodified 1554.8082 0.80823006 1608 O75064;E9PAK5 DENND4B DENN domain-containing protein 4B yes no 0 0 0 1 1 1 169.98 169.98 2 0.0011389 171649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.771 67.564 34323000 0 0 0 8313800 13388000 0 0 12621000 0 0 0 0 0 8176 1608 7643 73235;73236;73237 93227;93228;93229 93229 2 DVDPDVIQTHLDK Unmodified 1493.7362 0.73618733 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 64.828 64.828 3 0.064572 64766 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.532 22.055 37516000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37516000 8177 2486 7644 73238 93230 93230 1 DVDQNLMDR Unmodified 1104.487 0.48697227 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 49.235 49.235 2 0.0010839 47536 QUIQUE_C1218_190116_001 107.01 78.833 245630000 67460000 47109000 39384000 0 49751000 0 41928000 0 0 0 0 0 0 8178 2008 7645 73239;73240;73241;73242;73243;73244;73245;73246 93231;93232;93233;93234;93235;93236;93237;93238 93231 8 DVDYVCISDNYWLGK Unmodified 1845.8244 0.82435041 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3QRA8;J3QRH4;J3KRJ8 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 140.68 140.68 2 3.4202E-13 147334 QUIQUE_C1438_190116_001 149.31 135.4 2219400000 150080000 166520000 177070000 146140000 143820000 213360000 194450000 167390000 178700000 116650000 208340000 196250000 160650000 8179 3897 7646 73247;73248;73249;73250;73251;73252;73253;73254;73255;73256;73257;73258;73259;73260 93239;93240;93241;93242;93243;93244;93245;93246;93247;93248;93249;93250;93251;93252;93253;93254;93255;93256;93257;93258;93259;93260;93261;93262;93263;93264;93265 93247 26 DVEDEETWIR Unmodified 1290.5728 0.57281039 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.23 87.23 2 1.8751E-11 88896 QUIQUE_C1403_190116_001 182.69 182.69 16555000000 1227000000 1423900000 1532000000 1286000000 1560700000 1275600000 1613200000 1338600000 1455900000 571350000 1169400000 1043600000 1058300000 8180 267;275;3025 7647 73261;73262;73263;73264;73265;73266;73267;73268;73269;73270;73271;73272;73273 93266;93267;93268;93269;93270;93271;93272;93273;93274;93275;93276;93277;93278;93279;93280;93281;93282;93283;93284;93285;93286;93287;93288;93289;93290;93291;93292;93293;93294;93295;93296;93297;93298;93299;93300;93301;93302 93275 37 DVEDEILWVGER Unmodified 1458.6991 0.69907354 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 135.86 135.86 2;3 2.3864E-08 139995 QUIQUE_C1277_190116_001 168.79 151.36 15965000000 1151100000 1286500000 1209100000 1158100000 1345200000 850280000 1303400000 1352800000 1469200000 537510000 1473900000 1481000000 1346700000 8181 2851 7648 73274;73275;73276;73277;73278;73279;73280;73281;73282;73283;73284;73285;73286;73287;73288;73289;73290;73291;73292;73293;73294;73295;73296;73297 93303;93304;93305;93306;93307;93308;93309;93310;93311;93312;93313;93314;93315;93316;93317;93318;93319;93320;93321;93322;93323;93324;93325;93326;93327;93328;93329;93330;93331;93332;93333;93334;93335;93336;93337;93338;93339;93340;93341;93342 93306 40 DVEDEILWVTER Unmodified 1502.7253 0.72528829 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 149.18 149.18 2;3 3.5974E-10 153630 QUIQUE_C1277_190116_001 157.24 128.52 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Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 123.48 123.48 3 0.001494 128631 QUIQUE_C1368_190116_001 42.172 38.934 38401000 0 0 38401000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8187 3813 7654 73342 93389 93389 1 DVEFEVVGDAPEK Unmodified 1432.6722 0.67219008 4408 Q9UBT2;U3KQ93 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 88.209 88.209 2 0.0013705 91158 QUIQUE_C1438_190116_001 87.363 60.849 60253000 60253000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8188 4408 7655 73343;73344;73345 93390;93391;93392 93391 3 DVEFLAQLK Unmodified 1061.5757 0.57571092 2806;2505 P78356;P48426;H7BXS3;S4R320 PIP4K2B;PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta;Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 108.35 108.35 2 0.0019615 111335 QUIQUE_C1403_190116_001 98.299 70.465 1319000000 117210000 122720000 117690000 78811000 0 96892000 126370000 136760000 111310000 51607000 133250000 130710000 95629000 8189 2806;2505 7656 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93448;93449;93450;93451;93452;93453;93454;93455;93456;93457;93458 93454 1881;1882 9 DVEMGNSVIEENEMK Unmodified 1722.7441 0.74405117 2457 P43003;A0A087X0U3;A0A087WT87 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.876 82.876 2 2.0459E-29 85027 QUIQUE_C1218_190116_001 166.16 152.26 714570000 63712000 50779000 86837000 92825000 37009000 62741000 44788000 50827000 71210000 20369000 47406000 37162000 48907000 8198 2457 7664 73405;73406;73407;73408;73409;73410;73411;73412;73413;73414;73415;73416;73417 93459;93460;93461;93462;93463;93464;93465;93466;93467;93468;93469;93470;93471;93472 93459 14 DVEPEDPMFLMDPFAIHR Unmodified 2157.9863 0.98634713 3156 Q15773;F5H7L5;F5H800;F5H0Y3 MLF2 Myeloid leukemia factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 158.52 158.52 2;3 0.00016394 162872 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.96 67.391 2840900000 84620000 108570000 100620000 87842000 52267000 70491000 130120000 63885000 92109000 13966000 140940000 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2 1 1 1 1 1 164.13 164.13 2;3 5.728E-20 170553 QUIQUE_C1438_190116_001 106.45 99.574 1244500000 129280000 98996000 88795000 151580000 251820000 132610000 113570000 0 37874000 35378000 83192000 59582000 61836000 8208 96 7673 73515;73516;73517;73518;73519;73520;73521;73522;73523;73524;73525;73526;73527;73528;73529;73530 93585;93586;93587;93588;93589;93590;93591;93592;93593;93594;93595;93596;93597;93598;93599;93600;93601 93590 14 DVFDFIPGSDQLNVISCQGLAPSQGRPGLSLVK Unmodified 3513.7926 0.79260335 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 158.46 158.46 3 7.5419E-07 163029 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.482 48.216 245160000 0 0 0 0 99093000 0 0 0 0 0 51551000 55282000 39231000 8209 96 7674 73531;73532;73533;73534 93602;93603;93604;93605 93604 4 DVFEAFYK Unmodified 1017.4807 0.48074791 1310;3018 K4DI93;Q13620;Q13619;A0A0A0MR50 CUL4B;CUL4A Cullin-4B;Cullin-4A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.22 109.22 2 0.018957 112540 QUIQUE_C1277_190116_001 79.116 48.931 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p13;BH3-interacting domain death agonist p11 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 139.35 139.35 2;3 1.663E-13 143873 QUIQUE_C1277_190116_001 102.9 94.659 422440000 0 25452000 22065000 31626000 20884000 19519000 68689000 35126000 39919000 12035000 94723000 29210000 23190000 8214 2675 7678 73582;73583;73584;73585;73586;73587;73588;73589;73590;73591;73592;73593;73594;73595;73596 93661;93662;93663;93664;93665;93666;93667;93668;93669;93670;93671;93672;93673;93674;93675 93661 15 DVFIDSGGVR Unmodified 1063.5298 0.52982336 3318 Q5T6V5 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 66.717 66.717 2 0.013076 66827 QUIQUE_C1218_190116_001 65.305 34.232 302390000 66414000 63005000 0 0 0 0 0 57471000 0 40411000 0 0 75085000 8215 3318 7679 73597;73598;73599;73600;73601 93676;93677;93678;93679;93680;93681 93676 5 DVFIDSGGVRR Unmodified 1219.6309 0.63093439 3318 Q5T6V5 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 0 1 1 45.387 45.387 2 0.0098792 42030 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.056 3.5521 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Aminomethyltransferase;Aminomethyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 178.47 178.47 3;4 1.8063E-06 185272 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.236 47.333 28421000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28421000 0 0 8224 331 7687 73701;73702 93801;93802 93801 2 DVHNIYGLYVHMATADGLR Unmodified 2144.0473 0.047307904 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 3 2 1 120.59 120.59 2;3;4 1.866E-37 126029 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.26 118.17 1252900000 112520000 123760000 131980000 114420000 127570000 38577000 105830000 0 112080000 0 175280000 137900000 73024000 8225 956;3084 7688 73703;73704;73705;73706;73707;73708;73709;73710;73711;73712;73713;73714;73715;73716;73717;73718;73719;73720;73721;73722 93803;93804;93805;93806;93807;93808;93809;93810;93811;93812;93813;93814;93815;93816;93817;93818;93819;93820;93821;93822;93823;93824;93825;93826;93827;93828;93829;93830;93831;93832;93833;93834 93825 32 DVIAQSQSGTGK Unmodified 1189.5939 0.59388018 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.552 19.552 2 2.5819E-05 12523 QUIQUE_C1218_190116_001 140.16 116.74 674030000 95090000 92147000 96098000 89770000 91469000 0 83001000 0 95633000 30821000 0 0 0 8226 2416 7689 73723;73724;73725;73726;73727;73728;73729;73730 93835;93836;93837;93838;93839;93840;93841;93842 93835 3 DVIATDKEDVAFK Unmodified 1449.7351 0.73512469 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 0 1 3 3 4 4 4 3 4 3 2 5 4 2 3 57.355 57.355 2;3 2.0638E-16 56447 QUIQUE_C1218_190116_001 169.52 136.14 38222000000 3777300000 3883300000 3481800000 3310900000 3108000000 3019700000 3194700000 1394000000 2053500000 1782500000 3028200000 2595300000 3593100000 8227 720;2430;740 7690 73731;73732;73733;73734;73735;73736;73737;73738;73739;73740;73741;73742;73743;73744;73745;73746;73747;73748;73749;73750;73751;73752;73753;73754;73755;73756;73757;73758;73759;73760;73761;73762;73763;73764;73765;73766;73767;73768;73769;73770;73771;73772;73773;73774 93843;93844;93845;93846;93847;93848;93849;93850;93851;93852;93853;93854;93855;93856;93857;93858;93859;93860;93861;93862;93863;93864;93865;93866;93867;93868;93869;93870;93871;93872;93873;93874;93875;93876;93877;93878;93879;93880;93881;93882;93883;93884;93885;93886;93887;93888;93889;93890;93891;93892;93893;93894;93895;93896;93897;93898;93899;93900;93901;93902;93903;93904;93905;93906;93907;93908;93909;93910;93911;93912;93913;93914;93915;93916;93917;93918;93919;93920;93921;93922;93923;93924;93925 93846 83 DVIATDKEDVAFKDLDVAILVGSMPR Oxidation (M) 2832.4579 0.45791056 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 1 2 2 1 1 1 139.8 139.8 3;4 9.0565E-12 142855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.701 77.197 902040000 0 0 0 0 0 0 0 575030000 145090000 0 76473000 0 105450000 8228 720;2430;740 7691 73775;73776;73777;73778;73779 93926;93927;93928;93929;93930 93926 432 5 DVIATDKEDVAFKDLDVAILVGSMPR Unmodified 2816.463 0.46299594 2430;720;740 C9JF79;C9JLV6;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 0 2 1 1 1 1 1 150.28 150.28 3 4.7109E-113 153463 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.19 179.64 637950000 0 0 0 0 0 0 0 227650000 125510000 0 66552000 154830000 63414000 8229 720;2430;740 7691 73780;73781;73782;73783;73784 93931;93932;93933;93934;93935;93936 93931 6 DVIDEPIIEEPSR Unmodified 1510.7515 0.75150304 1561 O60216 RAD21 Double-strand-break repair protein rad21 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.747 93.747 2 0.00039329 95500 QUIQUE_C1403_190116_001 92.866 75.393 285420000 33619000 28729000 0 54100000 53588000 55632000 0 31517000 0 0 0 28231000 0 8230 1561 7692 73785;73786;73787;73788;73789;73790;73791 93937;93938;93939;93940;93941;93942;93943;93944 93939 8 DVIEEYFK Unmodified 1041.5019 0.50187728 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.89 103.89 2 0.010611 107442 QUIQUE_C1368_190116_001 91.041 73.006 2477200000 213260000 385400000 243840000 169950000 196710000 187270000 219980000 163120000 206430000 63163000 0 220480000 207560000 8231 2240 7693 73792;73793;73794;73795;73796;73797;73798;73799;73800;73801;73802;73803;73804 93945;93946;93947;93948;93949;93950;93951;93952;93953;93954;93955;93956;93957;93958;93959;93960;93961 93948 17 DVIELTDDSFDK Unmodified 1395.6406 0.64055561 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 1 1 1 105.5 105.5 2 0.0032982 109270 QUIQUE_C1218_190116_001 85.958 59.853 125500000 62484000 63017000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8232 3109 7694 73805;73806;73807 93962;93963;93964 93962 3 DVIEPLFLLAEVEIPNIQK Unmodified 2179.214 0.21402211 862 F5H6L3;E7ERK8;Q17R89;J3KRS3 ARHGAP44 Rho GTPase-activating protein 44 yes no 0 0 0 2 174.15 174.15 2;3 0.00086612 181365 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.11 81.381 21141000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21141000 0 0 8233 862 7695 73808;73809 93965;93966 93965 1 DVIEQLNLVTTWLQLQIPR Unmodified 2278.2685 0.26851729 2901 Q06323;H0YLU2 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 2 178.6 178.6 2;3 0.0001363 185345 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.644 60.532 136890000 0 0 9624300 0 0 0 0 0 0 0 127260000 0 0 8234 2901 7696 73810;73811;73812 93967;93968;93969 93968 2 DVIGIAHHPHQNLIATYSEDGLLK Unmodified 2640.366 0.36599951 3217 Q2TAY7 SMU1 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 91.721 91.721 4 0.028131 92606 QUIQUE_C1563_190116_001 24.303 16.681 72114000 0 0 0 0 0 72114000 0 0 0 0 0 0 0 8235 3217 7697 73813 93970 93970 1 DVIIADCGK Unmodified 989.48518 0.48518136 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.839 37.839 2 0.013805 34049 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94017;94018;94019;94020;94021;94022;94023;94024 94018 5 DVKPHNVMIDHEHR Unmodified 1725.8369 0.8369212 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;V9GYW6 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 2 14.046 14.046 3;4 1.5381E-07 6246 QUIQUE_C1438_190116_001 126.48 121.58 688950000 136530000 87739000 0 62807000 46543000 136840000 88613000 31870000 12077000 7098800 30805000 48021000 0 8244 456 7706 73867;73868;73869;73870;73871;73872;73873;73874;73875;73876;73877;73878;73879;73880;73881;73882 94025;94026;94027;94028;94029;94030;94031;94032;94033;94034;94035;94036;94037;94038;94039;94040;94041 94030 13 DVKPHNVMIDHEHR Oxidation (M) 1741.8318 0.83183582 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;V9GYW6 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 1 1 1 10.556 10.556 4 2.6577E-05 3010 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protein kinase kinase 1;Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 no no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 2 44.709 44.709 2;3 0.0001989 42164 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.83 78.778 2846100000 583770000 373590000 89341000 137210000 144510000 130170000 434030000 191300000 118800000 117860000 145240000 380300000 0 8248 2875;2395 7708 73898;73899;73900;73901;73902;73903;73904;73905;73906;73907;73908;73909;73910;73911;73912;73913 94057;94058;94059;94060;94061;94062;94063;94064;94065;94066;94067;94068;94069;94070;94071;94072;94073;94074 94069 12 DVKPSNVLINALGQVK Unmodified 1693.9727 0.97266962 2606 P52564 MAP2K6 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.13 110.13 3 0.00083865 113453 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.579 53.236 319900000 0 23578000 0 37249000 0 29749000 35873000 30998000 42942000 15689000 26295000 34618000 42909000 8249 2606 7709 73914;73915;73916;73917;73918;73919;73920;73921;73922;73923 94075;94076;94077;94078;94079;94080;94081;94082;94083;94084;94085 94085 11 DVLAEIPDQLVSYMK Unmodified 1719.8753 0.87532334 4225 Q9HCH3 CPNE5 Copine-5 yes yes 0 0 0 1 158.09 158.09 2 0.0476 162307 QUIQUE_C1277_190116_001 40.767 22.709 34734000 0 34734000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8250 4225 7710 73924 94086 94086 1 DVLAEIPEQFLSYMR Unmodified 1809.8971 0.89712142 853 E7ENV7;Q86YQ8 CPNE8 Copine-8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 168.92 168.92 2 7.3101E-06 173464 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.49 96.487 22079000 0 0 0 0 0 0 0 0 22079000 0 0 0 0 8251 853 7711 73925;73926;73927;73928 94087;94088;94089;94090 94090 4 DVLAQITELHQNLDGLKK Unmodified 2034.111 0.11095402 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 115.91 115.91 3;4 0.031194 113598 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.603 21.002 35881000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18878000 17003000 0 0 8252 2225 7712 73929;73930 94091;94092 94091 2 DVLASGFLTVLPHTDPR Unmodified 1836.9734 0.9733979 4025 Q9BTX7;Q5QPC2;A6PVK2 TTPAL Alpha-tocopherol transfer protein-like yes no 0 0 0 1 1 131.21 131.21 3 0.00033248 135611 QUIQUE_C1277_190116_001 65.225 48.541 41650000 0 22435000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19215000 8253 4025 7713 73931;73932 94093;94094 94093 2 DVLCGYLLCTNIGNIPR Unmodified 1976.9812 0.98120217 4367 Q9P0K1;F8WAD8 ADAM22 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22 yes no 0 0 0 1 144.32 144.32 2 4.7919E-07 148742 QUIQUE_C1277_190116_001 108.72 86.661 18442000 0 18442000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8254 4367 7714 73933 94095;94096 94096 2 DVLDNLFEK Unmodified 1091.5499 0.5498901 3466 Q7Z5R6 APBB1IP Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1-interacting protein yes yes 0 0 0 1 124.09 124.09 2 0.044544 127551 QUIQUE_C1403_190116_001 52.255 31.63 25766000 0 0 0 25766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8255 3466 7715 73934 94097 94097 1 DVLEAIAETAFK Unmodified 1305.6816 0.68163256 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 154.15 154.15 2 0.00053744 159444 QUIQUE_C1368_190116_001 102.52 88.945 61283000 0 8079800 16777000 12758000 0 11946000 0 0 0 11721000 0 0 0 8256 2863 7716 73935;73936;73937;73938;73939;73940 94098;94099;94100;94101;94102;94103 94100 6 DVLEGYNGTIFAYGQTSSGK Unmodified 2105.9906 0.99056411 2355;1568 P33176;O60282 KIF5B;KIF5C Kinesin-1 heavy chain;Kinesin heavy chain isoform 5C no no 0 0 0 1 1 1 125.93 125.93 2 0.00043272 128956 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.349 63.801 61142000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61142000 0 0 8257 2355;1568 7717 73941;73942;73943 94104;94105;94106 94105 3 DVLETFTVK Unmodified 1050.5597 0.55972651 415 A6NNI4;A0A2R8Y478;G8JLH6;P21926 CD9 Tetraspanin;CD9 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.023 93.023 2 0.01368 93679 QUIQUE_C1563_190116_001 69.598 42.073 670240000 76761000 107610000 122980000 0 0 100980000 0 85640000 116340000 59935000 0 0 0 8258 415 7718 73944;73945;73946;73947;73948;73949;73950 94107;94108;94109;94110;94111;94112;94113;94114 94111 7 DVLEVGELAK Unmodified 1071.5812 0.58119023 696 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dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 171.49 171.49 2;3 1.8053E-05 174836 QUIQUE_C1277_190116_001 89.846 86.748 740840000 57932000 51453000 80607000 44645000 73499000 66879000 48861000 18475000 138390000 0 101970000 12971000 45155000 8264 2602 7723 73988;73989;73990;73991;73992;73993;73994;73995;73996;73997;73998;73999;74000;74001;74002;74003;74004;74005;74006;74007 94153;94154;94155;94156;94157;94158;94159;94160;94161;94162;94163;94164;94165;94166;94167;94168;94169;94170;94171;94172 94156 16 DVLGTGAFSEVILAEDKR Unmodified 1919 6.5851E-06 3039 Q14012 CAMK1 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 126.93 126.93 2;3 2.0039E-32 132426 QUIQUE_C1218_190116_001 130.56 113.87 1030800000 88147000 101160000 99754000 79020000 61473000 78762000 114030000 0 107990000 39669000 71749000 76001000 113090000 8265 3039 7724 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94194;94195;94196;94197;94198;94199;94200;94201;94202;94203;94204;94205;94206;94207 94194 14 DVLLDVAYAYGK Unmodified 1325.6867 0.68671794 3790 Q969Z0;C9IZN7 TBRG4 Protein TBRG4 yes no 0 0 0 1 129.28 129.28 2 0.018378 132085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.102 42.59 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8268 3790 7727 74039 94208 94208 1 DVLLQVDDERR Unmodified 1356.6997 0.69974224 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 54.205 54.205 3 0.0062793 49218 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.915 23.338 29071000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29071000 0 0 0 8269 2378 7728 74040 94209 94209 1 DVLLTELSNCTVR Unmodified 1518.7712 0.77119262 3162 Q15814 TBCC Tubulin-specific chaperone C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 112.38 112.38 2 1.2147E-06 116152 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.88 100.11 511530000 52988000 62423000 66345000 47953000 43158000 57688000 36907000 0 52204000 0 48071000 43794000 0 8270 3162 7729 74041;74042;74043;74044;74045;74046;74047;74048;74049;74050;74051;74052;74053 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94244;94245;94246;94247;94248;94249;94250;94251;94252;94253;94254;94255;94256 94246 13 DVLSPLRPSR Unmodified 1138.6459 0.64585618 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 1 1 1 48.072 48.072 3 0.032446 46321 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.715 28.138 44608000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19883000 0 24725000 8276 497 7734 74085;74086 94257;94258 94257 2 DVLSVAFSSDNR Unmodified 1308.631 0.63099397 2787 P63244;J3KPE3;H0YAF8;H0Y8W2;D6RHH4;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;D6RFZ9;D6RAU2;E9PD14 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 100.52 100.52 2 3.3316E-20 102882 QUIQUE_C1403_190116_001 212.03 192.76 1160200000 85431000 112730000 94425000 119740000 63597000 107490000 73987000 101890000 60690000 65616000 89835000 85074000 99693000 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94285;94286;94287;94288;94289;94290;94291;94292;94293;94294;94295;94296;94297;94298;94299;94300;94301;94302;94303;94304;94305;94306;94307;94308;94309;94310;94311;94312;94313;94314;94315;94316;94317;94318;94319;94320;94321 94293 34 DVLTGQEFDVR Unmodified 1277.6252 0.62518031 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 89.383 89.383 2 0.022989 91465 QUIQUE_C1368_190116_001 67.207 46.336 111650000 0 0 63847000 0 0 0 47804000 0 0 0 0 0 0 8279 2463 7737 74127;74128 94322;94323 94322 2 DVLTSTYGATAETLSTSTTTHVTK Unmodified 2484.2231 0.22314282 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;H0Y482;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 103.65 103.65 2;3 3.516E-113 106564 QUIQUE_C1277_190116_001 252.47 239.59 3080500000 29588000 403490000 464020000 465060000 312920000 430060000 453380000 37967000 334150000 13034000 50492000 34412000 51970000 8280 1230;4172;346 7738 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74213;74214;74215;74216;74217;74218;74219 94429;94430;94431;94432;94433;94434;94435 94431 5 DVMSDETNNEETESPSQEFVNITK Unmodified 2742.1814 0.18141394 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 117 117 2;3 2.2809E-13 120986 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.6 135.5 219790000 0 0 0 0 0 33624000 0 63796000 0 0 53667000 0 68698000 8290 2483 7746 74220;74221;74222;74223;74224 94436;94437;94438;94439;94440;94441;94442 94440 7 DVMWIGFLTR Unmodified 1236.6325 0.6325143 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 155.82 155.82 2 0.010435 160243 QUIQUE_C1277_190116_001 83.647 56.344 35396000 0 35396000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8291 341 7747 74225 94443;94444 94444 2 DVNAAIAAIK Unmodified 984.5604 0.56039521 2796 P68366 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 73.123 73.123 1;2 1.9862E-09 74621 QUIQUE_C1218_190116_001 179.8 57.289 24262000000 2193500000 2209200000 1995200000 1992400000 1812100000 1721900000 1967900000 1690600000 1304100000 1237600000 2184300000 1824200000 2128800000 8292 2796 7748 74226;74227;74228;74229;74230;74231;74232;74233;74234;74235;74236;74237;74238;74239;74240;74241;74242;74243;74244;74245;74246;74247;74248;74249;74250 94445;94446;94447;94448;94449;94450;94451;94452;94453;94454;94455;94456;94457;94458;94459;94460;94461;94462;94463;94464;94465;94466;94467;94468;94469;94470;94471;94472;94473;94474;94475;94476;94477;94478;94479;94480;94481;94482;94483;94484;94485;94486;94487 94446 31 DVNAAIATIK Unmodified 1014.571 0.5709599 2795;3430;3992;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA3E;TUBA1B;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 2 2 1 3 1 2 63.816 63.816 1;2 1.5981E-11 63340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 219.03 90.649 307580000000 23985000000 24697000000 23687000000 22504000000 23548000000 22391000000 26654000000 21002000000 22475000000 13027000000 32840000000 23754000000 27017000000 8293 1990;2795;3430;3992 7749 74251;74252;74253;74254;74255;74256;74257;74258;74259;74260;74261;74262;74263;74264;74265;74266;74267;74268;74269;74270;74271 94488;94489;94490;94491;94492;94493;94494;94495;94496;94497;94498;94499;94500;94501;94502;94503;94504;94505;94506;94507;94508;94509;94510;94511;94512;94513;94514;94515;94516;94517;94518;94519;94520;94521;94522;94523;94524;94525;94526;94527;94528;94529;94530;94531;94532;94533;94534;94535;94536;94537;94538;94539 94529 52 DVNAAIATIKTK Unmodified 1243.7136 0.71360139 2795;3430;3992;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA3E;TUBA1B;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 1 1 1 1 1 50.719 50.719 2 0.0054959 48721 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.001 74.717 196950000 0 29129000 0 0 0 0 29966000 0 0 0 98586000 39270000 0 8294 1990;2795;3430;3992 7750 74272;74273;74274;74275;74276 94540;94541;94542;94543;94544;94545 94543 5 DVNCPFK Unmodified 878.39564 0.39563807 4535 Q9Y224;G3V4C6;H0YJB9 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 0 1 34.72 34.72 2 0.062217 29989 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.398 39.976 40532000 0 0 0 0 0 0 0 40532000 0 0 0 0 0 8295 4535 7751 74277 94546 94546 1 DVNFEFPEFQL Unmodified 1383.6347 0.63468237 2738 P62081 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.23 173.23 2 0.00047031 180310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.68 80.169 1639900000 114120000 0 64565000 73146000 101840000 73015000 159570000 191750000 247760000 42571000 252690000 170310000 148600000 8296 2738 7752 74278;74279;74280;74281;74282;74283;74284;74285;74286;74287;74288;74289 94547;94548;94549;94550;94551;94552;94553;94554;94555;94556;94557;94558;94559 94556 11 DVNLRPEQLGDICVGNVLQPGAGAIMAR Unmodified 2962.5117 0.51169424 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.38 140.38 3 2.615E-108 146154 QUIQUE_C1218_190116_001 135.75 124.22 1014100000 115550000 169290000 135600000 118600000 104490000 115700000 0 0 0 0 103510000 0 151380000 8297 1956 7753 74290;74291;74292;74293;74294;74295;74296;74297 94560;94561;94562;94563;94564;94565;94566;94567;94568;94569;94570 94561 10 DVNLRPEQLGDICVGNVLQPGAGAIMAR Oxidation (M) 2978.5066 0.50660886 1956 P09110;C9JDE9;B4DVF4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 1 1 1 133.12 133.12 3 3.8937E-08 137400 QUIQUE_C1277_190116_001 62.683 47.073 50760000 0 50760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8298 1956 7753 74298 94571 94571 1212 1 DVNNFDQDFTR Unmodified 1369.5899 0.58985744 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.936 79.936 2 2.3701E-08 81755 QUIQUE_C1218_190116_001 155.06 139.44 289130000 36216000 43463000 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Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 179.42 179.42 3 0.0019812 183055 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.569 41.935 22231000 0 0 0 0 0 0 0 0 10755000 0 11475000 0 0 8302 3071 7756 74316;74317 94590;94591 94590 2 DVNTDFLLILLK Unmodified 1402.8072 0.80716742 1211 H7BXY3;Q7L2E3 DHX30 Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 1 171.07 171.07 2 0.0002808 175443 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.3 94.841 62136000 10945000 0 0 0 0 0 0 11862000 16461000 0 0 22869000 0 8303 1211 7757 74318;74319;74320;74321 94592;94593;94594;94595;94596 94594 5 DVNVAIAAIK Unmodified 1012.5917 0.59169534 688 C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 76.291 76.291 1;2 0.0011141 78046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.54 62.75 5944800000 461560000 472790000 416860000 366050000 533050000 473430000 423700000 277620000 605980000 212210000 895410000 371230000 434900000 8304 688 7758 74322;74323;74324;74325;74326;74327;74328;74329;74330;74331;74332;74333;74334;74335;74336;74337;74338;74339 94597;94598;94599;94600;94601;94602;94603;94604;94605;94606;94607;94608;94609;94610;94611;94612;94613;94614;94615;94616;94617;94618;94619;94620;94621;94622;94623;94624 94621 23 DVNVNFEK Unmodified 963.46616 0.46616048 81 A0A087WYT3;Q15185;B4DDC6 PTGES3 Prostaglandin E synthase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.119 45.119 2 0.0079195 41788 QUIQUE_C1277_190116_001 96.253 61.445 1836800000 0 187770000 0 209770000 312060000 291230000 202350000 59151000 0 187280000 138790000 79616000 168750000 8305 81 7759 74340;74341;74342;74343;74344;74345;74346;74347;74348;74349 94625;94626;94627;94628;94629;94630;94631;94632;94633;94634;94635;94636 94625 10 DVPASGMYFMTYEWLK Unmodified 1936.8739 0.87394313 1552 O43772;C9JPE1 SLC25A20 Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.77 164.77 2 0.00022336 169832 QUIQUE_C1368_190116_001 88.552 77.704 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94647;94648;94649;94650;94651;94652;94653;94654;94655;94656;94657;94658;94659;94660;94661;94662;94663;94664;94665;94666;94667;94668;94669;94670;94671;94672;94673;94674;94675;94676;94677;94678;94679;94680;94681;94682;94683;94684;94685;94686;94687;94688 94671 42 DVPAYSQDTFK Unmodified 1269.5877 0.58773217 1868 P04843;B7Z4L4 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 61.919 61.919 2 0.0284 61045 QUIQUE_C1368_190116_001 51.927 32.14 79751000 0 0 37270000 0 42481000 0 0 0 0 0 0 0 0 8308 1868 7762 74385;74386 94689;94690 94689 2 DVPDLTLIDLPGITR Unmodified 1636.9036 0.903587 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 160.11 160.11 2;3 0.00080147 167827 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.719 74.366 1366800000 0 61476000 319330000 0 0 0 85367000 136150000 74342000 53161000 609990000 27020000 0 8309 2168 7763 74387;74388;74389;74390;74391;74392;74393;74394;74395;74396;74397;74398;74399 94691;94692;94693;94694;94695;94696;94697;94698;94699;94700;94701;94702;94703;94704;94705;94706;94707 94706 17 DVPFSVVYFPLFANLNQLGR Unmodified 2295.2052 0.20518875 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 4 2 176.14 176.14 2;3 1.9633E-117 180883 QUIQUE_C1438_190116_001 222.79 205.68 5814100000 212790000 384820000 392370000 161780000 298560000 0 293810000 378710000 766600000 17118000 1554600000 1353000000 0 8310 4190 7764 74400;74401;74402;74403;74404;74405;74406;74407;74408;74409;74410;74411;74412;74413;74414;74415;74416;74417;74418;74419;74420;74421 94708;94709;94710;94711;94712;94713;94714;94715;94716;94717;94718;94719;94720;94721;94722;94723;94724;94725;94726;94727;94728;94729;94730;94731;94732 94719 24 DVPFSVVYFPLFANLNQLGRPASEEK Unmodified 2936.5072 0.50724401 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 168.41 168.41 3 6.4743E-18 170353 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.58 92.367 582730000 0 0 0 0 0 0 0 136480000 55816000 0 83878000 169910000 136640000 8311 4190 7765 74422;74423;74424;74425;74426 94733;94734;94735;94736;94737 94733 5 DVPGTLLNIALLNLGSSDPSLR Unmodified 2264.2376 0.23761109 1119 H0Y465;P21359;A0A1W2PS74 NF1 Neurofibromin;Neurofibromin truncated yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 172.29 172.29 2;3 0.00095262 175575 QUIQUE_C1277_190116_001 43.799 36.087 216170000 26345000 32709000 16247000 11186000 26596000 0 0 0 31555000 0 28035000 43497000 0 8312 1119 7766 74427;74428;74429;74430;74431;74432;74433;74434;74435;74436;74437 94738;94739;94740;94741;94742;94743;94744;94745;94746;94747;94748 94739 11 DVPIDHSDLVADLLK Unmodified 1648.8672 0.8672015 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 133 133 2;3 4.5419E-13 138614 QUIQUE_C1218_190116_001 110.77 76.09 227060000 48551000 52440000 18728000 20784000 24992000 0 17766000 0 22034000 9907800 0 11861000 0 8313 1060 7767 74438;74439;74440;74441;74442;74443;74444;74445;74446;74447;74448 94749;94750;94751;94752;94753;94754;94755;94756;94757;94758;94759;94760 94750 12 DVPIGAIICITVGKPEDIEAFK Unmodified 2384.2661 0.26613403 1997 P10515;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 2 1 153.79 153.79 2;3 8.7089E-14 158591 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.55 122.23 2408000000 245470000 145670000 148800000 0 118770000 236150000 240040000 101500000 245920000 31792000 395960000 287420000 210510000 8314 1997 7768 74449;74450;74451;74452;74453;74454;74455;74456;74457;74458;74459;74460;74461;74462;74463;74464 94761;94762;94763;94764;94765;94766;94767;94768;94769;94770;94771;94772;94773;94774;94775;94776;94777;94778;94779;94780;94781 94771 21 DVPLGTPLCIIVEK Unmodified 1552.8535 0.85346569 1997 P10515;H0YDD4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.39 135.39 2 0.00025141 138164 QUIQUE_C1563_190116_001 97.163 69.859 4826100000 511000000 442120000 469970000 348440000 407240000 453020000 488280000 231220000 335130000 0 454720000 342220000 342770000 8315 1997 7769 74465;74466;74467;74468;74469;74470;74471;74472;74473;74474;74475;74476 94782;94783;94784;94785;94786;94787;94788;94789;94790;94791;94792;94793 94787 9 DVPLTQYQR Unmodified 1118.572 0.57202253 4197 Q9H9H5;C9JPF8;H7BZQ6 MAP6D1 MAP6 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 50.192 50.192 2 0.0044163 47264 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.046 52.861 83170000 28558000 0 0 0 0 0 0 43774000 0 10837000 0 0 0 8316 4197 7770 74477;74478;74479;74480 94794;94795;94796;94797 94796 4 DVPNETLQVEEDDRPELPWWK Unmodified 2594.2289 0.2288969 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.47 134.47 3 1.2017E-07 137413 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.057 84.077 851980000 107740000 93871000 0 0 0 67483000 127080000 93688000 96689000 37952000 129270000 98208000 0 8317 1727 7771 74481;74482;74483;74484;74485;74486;74487;74488;74489 94798;94799;94800;94801;94802;94803;94804;94805;94806 94802 8 DVPNNQLR Unmodified 954.48829 0.4882929 4075 Q9BYJ9;A0A024R7W5;A0A087X0Q1;A0A087WY31;Q7Z739 YTHDF1;YTHDF3 YTH domain-containing family protein 1;YTH domain-containing family protein 3 yes no 0 0 0 1 20.528 20.528 2 0.042098 13595 QUIQUE_C1368_190116_001 59.205 35.05 23780000 0 0 23780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8318 4075 7772 74490 94807 94807 1 DVPPLSETEATPVPIK Unmodified 1691.8982 0.89816728 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 95.88 95.88 2 0.0041302 98897 QUIQUE_C1218_190116_001 58.098 42.897 178860000 44857000 32112000 0 59932000 0 22360000 0 0 0 19600000 0 0 0 8319 880 7773 74491;74492;74493;74494;74495;74496 94808;94809;94810;94811;94812;94813 94808 6 DVPPLSETEATPVPIKDMEIAQTQK Unmodified 2736.3892 0.38916229 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 113.9 113.9 3 1.3837E-09 116677 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.748 55.026 343140000 0 0 0 0 0 0 0 93786000 118640000 0 0 0 130720000 8320 880 7774 74497;74498;74499 94814;94815;94816;94817 94814 3 DVPPVPTLADIAWIAADEEETYAR Unmodified 2641.2912 0.29116281 4112 Q9H019;C9JF50;E9PLU1;E9PRK5;E9PRW1;E9PSD6 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 173.33 173.33 2;3 4.6788E-11 177411 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.211 87.968 327240000 36765000 35796000 0 3848800 0 0 16364000 55088000 55313000 0 80075000 43989000 0 8321 4112 7775 74500;74501;74502;74503;74504;74505;74506;74507;74508;74509;74510;74511;74512;74513 94818;94819;94820;94821;94822;94823;94824;94825;94826;94827;94828;94829;94830;94831 94827 14 DVPRPILLGASAPLK Unmodified 1545.9243 0.92426287 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 1 1 1 1 92.176 92.176 3 0.0030993 94183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.209 52.801 109990000 34516000 0 0 0 0 0 0 0 46714000 0 0 28756000 0 8322 1416 7776 74514;74515;74516 94832;94833;94834 94833 3 DVPSSEQPELFLK Unmodified 1487.7508 0.75077476 3180 Q16537 PPP2R5E Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform yes yes 0 0 0 1 1 98.922 98.922 2 0.0079364 101480 QUIQUE_C1277_190116_001 76.143 63.527 122270000 0 67337000 0 54933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8323 3180 7777 74517;74518 94835;94836 94835 1 DVPVAEEVSALFAGELNPVAPK Unmodified 2251.1736 0.17361385 1437;437 A0A2R8Y611;O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 170.7 170.7 2;3 2.4274E-36 175443 QUIQUE_C1368_190116_001 185.12 161.71 1067600000 149640000 144170000 44057000 154910000 57572000 55718000 184560000 40600000 0 24784000 50964000 101750000 58859000 8324 437;1437 7778 74519;74520;74521;74522;74523;74524;74525;74526;74527;74528;74529;74530;74531;74532;74533;74534;74535 94837;94838;94839;94840;94841;94842;94843;94844;94845;94846;94847;94848;94849;94850;94851;94852;94853;94854;94855 94843 17 DVPVYLFSR Unmodified 1094.576 0.57604528 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.59 109.59 2 0.00045846 112894 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.04 104.05 2479100000 256000000 247690000 212270000 183710000 177550000 150110000 209630000 161750000 148760000 153620000 199820000 196120000 182040000 8325 3390 7779 74536;74537;74538;74539;74540;74541;74542;74543;74544;74545;74546;74547;74548 94856;94857;94858;94859;94860;94861;94862;94863;94864;94865;94866;94867;94868;94869;94870;94871;94872;94873;94874;94875;94876;94877 94874 22 DVPWGVDSLITLAFQDQR Unmodified 2059.0375 0.037454724 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 172.56 172.56 2;3 3.3018E-38 175860 QUIQUE_C1277_190116_001 201.48 179.73 4528000000 230160000 310700000 279260000 80562000 438580000 0 156830000 387210000 680410000 11518000 956690000 647050000 349060000 8326 3187 7780 74549;74550;74551;74552;74553;74554;74555;74556;74557;74558;74559;74560;74561;74562;74563;74564;74565;74566;74567;74568;74569;74570;74571 94878;94879;94880;94881;94882;94883;94884;94885;94886;94887;94888;94889;94890;94891;94892;94893;94894;94895;94896;94897;94898;94899;94900;94901;94902;94903;94904 94880 27 DVPYPPPLSPAIEAIQK Unmodified 1833.9877 0.98765098 3614 Q8N8N7;G3V3Y1;G3V2R9 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 131.67 131.67 2 0.00028863 135585 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.99 101.41 678260000 0 0 81791000 40876000 0 0 0 75722000 81002000 35261000 155360000 116910000 91342000 8327 3614 7781 74572;74573;74574;74575;74576;74577;74578;74579;74580;74581 94905;94906;94907;94908;94909;94910;94911;94912;94913;94914;94915;94916;94917;94918;94919;94920;94921 94910 16 DVQAGSHDYPGEGIYLLK Unmodified 1960.9531 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Unmodified 1704.8166 0.81662249 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.504 57.504 2 6.8852E-80 56594 QUIQUE_DMIX5_190116_001 263.44 248.57 1701300000 126860000 139190000 153290000 167500000 155120000 159180000 144230000 95690000 91718000 103460000 135980000 120560000 108490000 8331 2617 7785 74596;74597;74598;74599;74600;74601;74602;74603;74604;74605;74606;74607;74608 94939;94940;94941;94942;94943;94944;94945;94946;94947;94948;94949;94950;94951;94952;94953;94954;94955;94956 94952 18 DVQEFIDNPK Unmodified 1203.5772 0.57716749 4544 Q9Y276;C9J1S9 BCS1L Mitochondrial chaperone BCS1 yes no 0 0 0 1 70.815 70.815 2 0.015951 70197 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.231 44.936 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8332 4544 7786 74609 94957 94957 1 DVQEIFR Unmodified 905.46068 0.46068117 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;A0A140T9X9;A0A140T996;F6UJC5;A0A140TA18;A0A140T973;A0A140T9K1;A0A140T9L4 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.99 66.99 2 0.0096417 66605 QUIQUE_C1277_190116_001 150.02 50.1 3018600000 214180000 237870000 294900000 229530000 284990000 210390000 290790000 220410000 201100000 94749000 262590000 191780000 285390000 8333 3027 7787 74610;74611;74612;74613;74614;74615;74616;74617;74618;74619;74620;74621;74622 94958;94959;94960;94961;94962;94963;94964;94965;94966;94967;94968;94969;94970;94971;94972;94973;94974;94975 94961 18 DVQELLTQYTK Unmodified 1336.6874 0.68744622 1085 G3V4F7;P61011 SRP54 Signal recognition particle 54 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 116.8 116.8 2 0.00020633 120818 QUIQUE_DMIX8_190116_001 123.79 78.425 212040000 0 0 35309000 39466000 0 39368000 0 0 39944000 0 0 0 57955000 8334 1085 7788 74623;74624;74625;74626;74627 94976;94977;94978;94979;94980;94981;94982;94983 94983 5 DVQGTDASLDEELDR Unmodified 1661.738 0.73803782 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.142 80.142 2 0.00034943 82485 QUIQUE_C1438_190116_001 99.011 76.965 402060000 0 0 99996000 58348000 69866000 51000000 0 0 36479000 0 0 34981000 51387000 8335 4466 7789 74628;74629;74630;74631;74632;74633;74634;74635 94984;94985;94986;94987;94988;94989;94990;94991 94987 6 DVQGWGENDR Unmodified 1174.5003 0.50031415 2740;2739 P62140;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase no no 0 0 0 1 40.608 40.608 2 0.039491 36814 QUIQUE_C1277_190116_001 60.518 50.931 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8336 2740;2739 7790 74636 94992 94992 1 DVQIGDIVTVGECRPLSK Unmodified 1985.0252 0.025175478 2747 P62280;M0R1H5 RPS11 40S ribosomal protein S11 yes no 0 0 1 1 103.93 103.93 3 0.021905 107443 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.111 32.379 36878000 0 0 0 0 0 0 0 0 36878000 0 0 0 0 8337 2747 7791 74637 94993 94993 1 DVQMLQDAISK Unmodified 1246.6227 0.62273747 3181 Q16543;K7EQA9;K7EL68;K7EIU0 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 85.08 85.08 2 0.00050657 86154 QUIQUE_C1277_190116_001 101.38 69.026 177390000 0 129140000 0 0 0 0 0 0 0 48254000 0 0 0 8338 3181 7792 74638;74639 94994;94995 94994 2 DVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIK Unmodified 2939.4011 0.40112396 2109 P16435;E7EMD0 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 171.96 171.96 3 4.3968E-37 175683 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.32 126.95 387480000 0 21260000 0 0 0 0 47133000 0 66960000 0 128610000 97606000 25909000 8339 2109 7793 74640;74641;74642;74643;74644;74645 94996;94997;94998;94999;95000;95001 95000 6 DVQNTFYDIVAELGAMEHAQAVDYIKK Unmodified 3067.4961 0.49608698 2109 P16435;E7EMD0 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 1 1 167.6 167.6 4 0.0014506 169583 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.324 32.241 17605000 0 0 0 0 0 0 0 17605000 0 0 0 0 0 8340 2109 7794 74646 95002 95002 1 DVQTALALAK Unmodified 1028.5866 0.58660996 3969 Q99714;Q5H928 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 72.783 72.783 1;2 0.00026909 69427 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.41 79.345 8268700000 259080000 183330000 1231800000 829050000 1217900000 1019600000 0 64119000 989460000 109060000 0 1067600000 1297600000 8341 3969 7795 74647;74648;74649;74650;74651;74652;74653;74654;74655;74656;74657;74658 95003;95004;95005;95006;95007;95008;95009;95010;95011;95012;95013;95014;95015 95012 12 DVQVLFMR Unmodified 1006.527 0.52698659 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 102.18 102.18 2 0.033344 106907 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.757 37.795 26961000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26961000 0 0 8342 1450 7796 74659 95016 95016 1 DVRPYIVGAVVR Unmodified 1342.7721 0.77211932 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 76.475 76.475 2;3 0.0013691 77135 QUIQUE_C1277_190116_001 64.65 55.921 424900000 25176000 29055000 0 0 83756000 21955000 29969000 47655000 59209000 17877000 60262000 49985000 0 8343 3576 7797 74660;74661;74662;74663;74664;74665;74666;74667;74668;74669;74670;74671 95017;95018;95019;95020;95021;95022;95023;95024;95025;95026;95027;95028;95029;95030;95031 95019 15 DVSALFPDVVNCMQTDNLELKK Unmodified 2535.2349 0.23491026 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 144.12 144.12 3 1.5887E-05 148912 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.589 54.968 456780000 0 0 0 0 65595000 0 71572000 66428000 0 14964000 70145000 76365000 91708000 8344 2938 7798 74672;74673;74674;74675;74676;74677;74678 95032;95033;95034;95035;95036;95037;95038;95039;95040;95041;95042 95041 10 DVSALFPDVVNCMQTDNLELKK Oxidation (M) 2551.2298 0.22982488 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 1 1 1 126.45 126.45 3 9.7003E-06 129355 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.887 52.432 32429000 0 0 0 0 0 0 0 32429000 0 0 0 0 0 8345 2938 7798 74679 95043 95043 2408 1 DVSDEKLRDYIWNTLNSGR Unmodified 2280.1135 0.11347321 612 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95049;95050;95051;95052;95053;95054;95055;95056;95057;95058;95059;95060;95061;95062;95063;95064;95065;95066;95067;95068;95069;95070;95071;95072;95073;95074;95075;95076;95077;95078;95079;95080;95081;95082;95083;95084;95085;95086;95087;95088;95089;95090;95091;95092;95093;95094;95095;95096;95097;95098;95099;95100;95101;95102;95103;95104;95105;95106;95107;95108;95109;95110;95111;95112;95113;95114;95115;95116;95117;95118;95119;95120;95121;95122;95123;95124;95125;95126;95127;95128;95129;95130;95131;95132;95133;95134;95135 95095 86 DVSELTGFPEMLGGR Unmodified 1606.7661 0.76610724 2339 P31939;F8WEF0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.94 141.94 2 3.284E-44 146082 QUIQUE_C1277_190116_001 184.55 121.27 2226700000 175880000 142190000 203920000 218410000 191840000 189290000 182330000 153450000 141330000 63013000 219520000 147990000 197570000 8348 2339 7801 74740;74741;74742;74743;74744;74745;74746;74747;74748;74749;74750;74751;74752 95136;95137;95138;95139;95140;95141;95142;95143;95144;95145;95146;95147;95148;95149;95150;95151;95152;95153 95138 17 DVSELTGFPEMLGGR Oxidation (M) 1622.761 0.76102187 2339 P31939;F8WEF0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 1 0 1 1 120.07 120.07 2 0.00023344 126549 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.813 71.394 175620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84356000 0 91267000 8349 2339 7801 74753;74754 95154;95155 95154 1738 1 DVSGVLFQYPDTEGKVEDFTELVER Unmodified 2871.3814 0.38143438 2212 P23378;A0A1W2PPK8;A0A1W2PPE1 GLDC Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial yes no 0 0 1 1 154.45 154.45 3 0.026737 159601 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.359 28.71 63719000 0 0 0 0 0 0 0 0 63719000 0 0 0 0 8350 2212 7802 74755 95156 95156 0 DVSLLTQK Unmodified 902.5073 0.50729701 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 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95166;95167;95168;95169;95170;95171;95172 95172 4 DVSSLFPDVVNCMQTDNLELK Unmodified 2423.1349 0.13486186 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7ERB2;K7EN71;K7EJX1 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 161.73 161.73 2;3 1.9385E-07 165316 QUIQUE_C1403_190116_001 88.396 72.875 434240000 74307000 104140000 32393000 106200000 30219000 44992000 29128000 0 0 12857000 0 0 0 8354 2777 7806 74772;74773;74774;74775;74776;74777;74778;74779;74780;74781 95173;95174;95175;95176;95177;95178;95179;95180;95181;95182;95183;95184 95178 10 DVSSLFPDVVNCMQTDNLELKK Unmodified 2551.2298 0.22982488 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7ERB2;K7EN71;K7EJX1 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.26 144.26 2;3 2.5732E-11 149644 QUIQUE_C1368_190116_001 103.95 77.107 2453600000 0 242170000 295020000 189210000 193190000 174960000 243610000 181460000 198360000 49949000 229910000 232300000 223500000 8355 2777 7807 74782;74783;74784;74785;74786;74787;74788;74789;74790;74791;74792;74793;74794;74795 95185;95186;95187;95188;95189;95190;95191;95192;95193;95194;95195;95196;95197;95198;95199;95200;95201;95202;95203;95204 95188 20 DVSSTEEFLELSPQK Unmodified 1707.8203 0.82031089 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 0 2 1 115.62 115.62 2;3 7.2212E-05 121139 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.718 75.285 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8356 4143 7808 74796;74797;74798 95205;95206;95207 95207 3 DVSSVELLMNNHQGIK Oxidation (M) 1798.8883 0.88834765 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 65.934 65.934 2;3 2.7573E-231 66004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 286.95 261.48 4634000000 272440000 378100000 288610000 124130000 403480000 108620000 139340000 456650000 561540000 209950000 583320000 438550000 669330000 8357 2851 7809 74799;74800;74801;74802;74803;74804;74805;74806;74807;74808;74809;74810;74811;74812;74813;74814;74815;74816;74817;74818;74819;74820;74821 95208;95209;95210;95211;95212;95213;95214;95215;95216;95217;95218;95219;95220;95221;95222;95223;95224;95225;95226;95227;95228;95229;95230;95231;95232;95233;95234;95235;95236;95237;95238;95239;95240 95228 2289 32 DVSSVELLMNNHQGIK Unmodified 1782.8934 0.89343302 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 89.805 89.805 2;3 4.8424E-130 92145 QUIQUE_C1277_190116_001 247.79 223.45 17123000000 1489400000 1821600000 1643300000 1291600000 1435200000 1135300000 1463000000 1057800000 1252900000 549810000 1417200000 1200600000 1365100000 8358 2851 7809 74822;74823;74824;74825;74826;74827;74828;74829;74830;74831;74832;74833;74834;74835;74836;74837;74838;74839;74840;74841;74842;74843;74844;74845;74846;74847 95241;95242;95243;95244;95245;95246;95247;95248;95249;95250;95251;95252;95253;95254;95255;95256;95257;95258;95259;95260;95261;95262;95263;95264;95265;95266;95267;95268;95269;95270;95271;95272;95273;95274;95275;95276;95277;95278;95279;95280;95281;95282;95283;95284;95285;95286;95287 95248 47 DVTADFEGQSPK Unmodified 1292.5885 0.58846046 4436 Q9UHL4 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 59.091 59.091 2 9.42E-05 58318 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.5 87.296 507490000 60055000 0 0 0 0 0 98530000 48058000 57101000 36900000 52657000 73206000 80980000 8359 4436 7810 74848;74849;74850;74851;74852;74853;74854;74855 95288;95289;95290;95291;95292;95293;95294;95295;95296 95294 8 DVTATVDSLPLITASILSK Unmodified 1943.0827 0.082673582 2157 P19971;C9JGI3 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 168.01 168.01 2;3 5.477E-12 174251 QUIQUE_C1438_190116_001 146.47 131.91 1186700000 37729000 43674000 433650000 91262000 102020000 75763000 0 83109000 72419000 25305000 169900000 0 51853000 8360 2157 7811 74856;74857;74858;74859;74860;74861;74862;74863;74864;74865;74866;74867;74868;74869;74870;74871;74872;74873;74874;74875;74876 95297;95298;95299;95300;95301;95302;95303;95304;95305;95306;95307;95308;95309;95310;95311;95312;95313;95314;95315;95316;95317;95318;95319;95320;95321;95322 95307 26 DVTCDVHYENYR Unmodified 1569.6518 0.65180577 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;Q99719 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 48.82 48.82 2;3 1.795E-65 47102 QUIQUE_C1218_190116_001 251.56 243.63 3668700000 286200000 541640000 559270000 476310000 490990000 355370000 188150000 33609000 146130000 115350000 118330000 275060000 82336000 8361 1092;3970 7812 74877;74878;74879;74880;74881;74882;74883;74884;74885;74886;74887;74888;74889;74890;74891;74892;74893;74894;74895;74896;74897;74898 95323;95324;95325;95326;95327;95328;95329;95330;95331;95332;95333;95334;95335;95336;95337;95338;95339;95340;95341;95342;95343;95344;95345;95346;95347;95348;95349;95350 95324 28 DVTDTTALITWFK Unmodified 1509.7715 0.7715102 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 155.95 155.95 2 0.00031057 158286 QUIQUE_C1563_190116_001 136.02 119.37 131320000 25457000 0 23263000 0 0 43073000 0 0 39523000 0 0 0 0 8362 2233 7813 74899;74900;74901;74902 95351;95352;95353;95354 95353 4 DVTEALILQLFSQIGPCK Unmodified 2031.0711 0.071063038 745 C9JTN7;F8W8I6;P31483;H7BY49;E5RGV5;E5RG67 TIA1 Nucleolysin TIA-1 isoform p40 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 175.64 175.64 2;3 2.1386E-10 176848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.57 121.85 72688000 3829100 5337800 0 0 5472400 0 4419400 15116000 21684000 0 16829000 0 0 8363 745 7814 74903;74904;74905;74906;74907;74908;74909;74910;74911 95355;95356;95357;95358;95359;95360;95361;95362;95363;95364 95359 10 DVTFSPATIENELIK Unmodified 1675.8669 0.86686715 559 A8K878;P55145;H7C2D6 MANF Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.85 146.85 2 0.00027833 151816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.182 69.755 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3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 17.936 17.936 2;3 5.4265E-22 10483 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.67 146.66 1134500000 0 89154000 100080000 207550000 106280000 0 220100000 0 190140000 15150000 0 206000000 0 8375 3390 7826 75014;75015;75016;75017;75018;75019;75020;75021;75022;75023;75024;75025;75026 95486;95487;95488;95489;95490;95491;95492;95493;95494;95495;95496;95497;95498 95494 12 DVTVFDKDDK Unmodified 1180.5612 0.56118307 720 C9JF79;F8WFC2 MDH1 Malate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 32.009 32.009 2 0.05116 26684 QUIQUE_C1563_190116_001 72.607 37.312 21394000 0 0 0 0 0 21394000 0 0 0 0 0 0 0 8376 720 7827 75027 95499 95499 1 DVTVPELR Unmodified 927.50255 0.50254598 2198 P22570 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 65.613 65.613 2 0.027083 66073 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.998 40.192 52184000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32248000 19935000 0 8377 2198 7828 75028;75029 95500;95501;95502 95500 3 DVTVTAIGIGDMFHEK Unmodified 1731.8502 0.85017123 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 0 0 1 2 3 1 1 2 2 1 121.98 121.98 2;3 0.00040848 124448 QUIQUE_C1563_190116_001 65.943 54.664 717700000 91988000 118460000 176550000 0 87914000 112630000 50860000 0 0 45217000 0 0 34076000 8378 2036 7829 75030;75031;75032;75033;75034;75035;75036;75037;75038;75039;75040;75041;75042 95503;95504;95505;95506;95507;95508;95509;95510;95511;95512;95513;95514;95515;95516;95517;95518;95519 95512 16 DVTVTAIGIGDMFHEK Oxidation (M) 1747.8451 0.84508585 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 1 0 1 2 95.707 95.707 2;3 0.0027112 92210 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.495 39.472 35670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35670000 0 0 0 8379 2036 7829 75043;75044;75045 95520;95521;95522;95523 95522 1342 3 DVTYEEAK Unmodified 953.43419 0.43419164 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 0 0 1 1 20.541 20.541 2 0.02931 13221 QUIQUE_C1277_190116_001 67.981 49.995 116080000 0 71842000 0 0 0 44236000 0 0 0 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DVVHTSEEAR Unmodified 1141.5364 0.53636531 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 14.518 14.518 3 0.042607 6656 QUIQUE_DMIX4_190116_001 28.708 11.468 22133000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22133000 0 0 0 8389 1534 7839 75140 95648 95648 1 DVVICPDASLEDAK Unmodified 1530.7236 0.72357373 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.957 84.957 2 8.4322E-06 86240 QUIQUE_C1368_190116_001 121.02 97.035 4577200000 658590000 493220000 617850000 587560000 447620000 633390000 467040000 68380000 85868000 171580000 174150000 0 171990000 8390 3956 7840 75141;75142;75143;75144;75145;75146;75147;75148;75149;75150;75151;75152 95649;95650;95651;95652;95653;95654;95655;95656;95657;95658;95659;95660;95661;95662;95663;95664;95665 95653 15 DVVICPDASLEDAKK Unmodified 1658.8185 0.81853675 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 62.852 62.852 2 5.5337E-06 63202 QUIQUE_C1576_190116_001 110.08 99.845 2992900000 0 0 0 0 717280000 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Unmodified 1624.7733 0.77330111 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 111.97 111.97 2 0.0010485 109168 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.03 73.221 194800000 0 0 0 0 56930000 0 0 0 65697000 18472000 0 0 53696000 8398 2101 7848 75176;75177;75178;75179 95693;95694;95695;95696 95695 3 DVVTAAGDMLK Unmodified 1118.5642 0.56415996 1924 P07602;C9JIZ6;Q5BJH1 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 95.808 95.808 2 0.014647 97024 QUIQUE_C1563_190116_001 58.37 37.07 26025000 0 0 0 0 0 26025000 0 0 0 0 0 0 0 8399 1924 7849 75180 95697 95697 1 DVVTEAIYPEAVTMFSVNLFR Unmodified 2400.2035 0.20353377 917 E9PFR3;Q14738;H0Y8C4 PPP2R5D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 173.52 173.52 2;3 3.3408E-10 177233 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.79 97.498 102500000 0 0 0 0 6517900 0 0 9691300 14356000 0 34368000 25012000 12558000 8400 917 7850 75181;75182;75183;75184;75185;75186;75187 95698;95699;95700;95701;95702;95703;95704 95702 7 DVVVDLVCYR Unmodified 1236.6173 0.61725816 2869;903;4487 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3;Q9ULD0 OGDH;OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial;2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.48 107.48 2 0.00097688 110583 QUIQUE_C1277_190116_001 121.09 93.268 1805300000 175430000 130550000 171840000 104590000 140600000 144230000 156110000 120330000 176180000 36981000 160730000 139140000 148620000 8401 903;2869;4487 7851 75188;75189;75190;75191;75192;75193;75194;75195;75196;75197;75198;75199;75200 95705;95706;95707;95708;95709;95710;95711;95712;95713;95714;95715;95716;95717;95718;95719;95720 95706 16 DVVVQHVHFDGLGR Unmodified 1576.811 0.81102402 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.597 68.597 3;4 0.00079103 69334 QUIQUE_C1218_190116_001 70.98 64.251 871320000 213010000 102690000 29795000 45945000 0 118500000 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motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 38.72 38.72 2 0.037414 34932 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.359 25.066 583850000 137470000 0 0 160100000 0 122790000 0 0 163490000 0 0 0 0 8412 2412;3840 7861 75315;75316;75317;75318 95855;95856;95857;95858;95859;95860 95860 6 DVYQMSDSQLYEAFTFLK Oxidation (M) 2200.0034 0.003436983 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 0 2 2 3 2 1 2 1 1 1 2 2 1 161.15 161.15 2;3 8.1718E-122 164997 QUIQUE_C1403_190116_001 225.09 211.06 2199000000 214230000 280670000 227870000 165440000 147140000 242320000 113700000 100740000 115340000 165050000 0 284750000 141720000 8413 3050 7862 75319;75320;75321;75322;75323;75324;75325;75326;75327;75328;75329;75330;75331;75332;75333;75334;75335;75336;75337;75338 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75582 96210 96210 1 DWVLNEFK Unmodified 1049.5182 0.51819605 1290 J3KTA4;P17844 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.16 115.16 2 0.0036109 120068 QUIQUE_C1218_190116_001 114.6 92.831 811530000 68226000 83150000 96980000 79507000 49175000 61094000 59746000 53530000 72956000 23801000 47350000 66709000 49310000 8449 1290 7896 75583;75584;75585;75586;75587;75588;75589;75590;75591;75592;75593;75594;75595 96211;96212;96213;96214;96215;96216;96217;96218;96219;96220;96221;96222;96223;96224;96225;96226 96212 16 DWVLNEFR Unmodified 1077.5243 0.52434406 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841;A0A0U1RQJ0 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 118.55 118.55 2 0.040827 122425 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.195 41.408 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8450 381 7897 75596;75597;75598 96227;96228;96229 96229 3 DWVQLDRPFEDFIDR Unmodified 1949.9272 0.92717599 1461 O14939 PLD2 Phospholipase D2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 149 149 3 9.0864E-05 156134 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.961 61.347 74448000 0 0 11949000 11131000 0 0 8162100 0 0 0 16759000 14745000 11702000 8451 1461 7898 75599;75600;75601;75602;75603;75604 96230;96231;96232;96233;96234;96235 96233 5 DWYPHSR Unmodified 959.42496 0.42496436 1866 P04792;F8WE04 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes no 0 0 0 1 31.016 31.016 2 0.056949 25694 QUIQUE_C1277_190116_001 71.141 62.458 139790000 0 139790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8452 1866 7899 75605 96236 96236 1 DYAAYNVLDDPELR Unmodified 1652.7682 0.76821573 3481 Q86SX6 GLRX5 Glutaredoxin-related protein 5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.54 121.54 2 5.3769E-11 125188 QUIQUE_C1277_190116_001 138.75 116.22 492580000 73229000 73603000 70508000 42673000 0 51138000 79072000 43341000 59014000 0 0 0 0 8453 3481 7900 75606;75607;75608;75609;75610;75611;75612;75613 96237;96238;96239;96240;96241;96242;96243;96244;96245 96239 8 DYAEVGR Unmodified 808.37153 0.37153181 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08;H3BS21 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.878 22.878 2 0.01944 16299 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.11 75.263 1981200000 0 439760000 0 0 0 0 479880000 0 242480000 0 819110000 0 0 8454 1793 7901 75614;75615;75616;75617 96246;96247;96248;96249 96248 4 DYAFIHFDER Unmodified 1311.5884 0.58840088 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.975 96.975 2;3 0.0011055 99627 QUIQUE_C1368_190116_001 101.65 84.994 188150000 19074000 0 31783000 28474000 42210000 0 66608000 0 0 0 0 0 0 8455 1581 7902 75618;75619;75620;75621;75622;75623;75624;75625 96250;96251;96252;96253;96254;96255;96256;96257;96258 96251 9 DYAFVHFEDR Unmodified 1297.5728 0.57275081 1525 O43390;B4DT28;A0A286YEZ8 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.31 85.31 2;3 0.0083608 86778 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.314 47.427 434990000 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96279;96280;96281;96282;96283;96284;96285;96286;96287 96283 9 DYAKDDPLEFK Unmodified 1339.6296 0.62959699 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 1 1 66.33 66.33 2 0.015559 66254 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.879 61.071 43036000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43036000 8459 1909 7906 75654 96288 96288 1 DYALHWLVLGTHTSDEQNHLVVAR Unmodified 2773.3936 0.39361124 3183 Q16576;E9PC52;C9J7L0 RBBP7 Histone-binding protein RBBP7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.55 110.55 4 1.5485E-06 114325 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.453 63.5 465880000 0 86149000 95583000 0 64157000 0 73296000 0 55547000 0 0 91143000 0 8460 3183 7907 75655;75656;75657;75658;75659;75660 96289;96290;96291;96292;96293;96294;96295 96294 5 DYAPPPR Unmodified 814.39735 0.39735263 2412;3840 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 20.023 20.023 2 0.043299 12678 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.377 54.268 232080000 39204000 0 0 75518000 0 0 0 0 63148000 0 54214000 0 0 8461 2412;3840 7908 75661;75662;75663;75664 96296;96297;96298;96299 96299 4 DYAVQQYVR Unmodified 1140.5564 0.55637247 4477 Q9UKU7 ACAD8 Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.819 64.819 2 0.00048805 64763 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.4 103.01 510560000 45590000 42658000 63881000 58492000 0 0 0 44954000 43204000 30239000 71381000 40646000 69518000 8462 4477 7909 75665;75666;75667;75668;75669;75670;75671;75672;75673;75674;75675;75676 96300;96301;96302;96303;96304;96305;96306;96307;96308;96309;96310;96311;96312;96313;96314 96311 15 DYAVSTVPVADGLHLK Unmodified 1683.8832 0.88318591 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 6 5 6 5 5 5 4 4 4 5 5 4 4 96.421 96.421 2;3 1.8217E-09 90238 QUIQUE_DMIX4_190116_001 127.37 118.42 56001000000 5779500000 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96315;96316;96317;96318;96319;96320;96321;96322;96323;96324;96325;96326;96327;96328;96329;96330;96331;96332;96333;96334;96335;96336;96337;96338;96339;96340;96341;96342;96343;96344;96345;96346;96347;96348;96349;96350;96351;96352;96353;96354;96355;96356;96357;96358;96359;96360;96361;96362;96363;96364;96365;96366;96367;96368;96369;96370;96371;96372;96373;96374;96375;96376;96377;96378;96379;96380;96381;96382;96383;96384;96385;96386;96387;96388;96389;96390;96391;96392;96393;96394;96395;96396;96397;96398;96399;96400;96401;96402;96403;96404;96405;96406;96407;96408;96409;96410;96411 96383 96 DYCAHHLIR Unmodified 1183.5557 0.55566096 2124 P17568 NDUFB7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.868 18.868 3 0.0034716 11456 QUIQUE_C1277_190116_001 60.91 39.462 1536500000 117290000 159300000 169790000 179500000 135920000 126330000 158750000 0 176600000 0 174780000 0 138220000 8464 2124 7911 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1 DYDALFPVAEDISLLQQASSVLDETR Unmodified 2894.4185 0.41854817 4132 Q9H1I8 ASCC2 Activating signal cointegrator 1 complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 178.55 178.55 3 1.6652E-17 182344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.542 88.178 9456900 0 0 0 0 0 0 0 0 9456900 0 0 0 0 8468 4132 7914 75754 96427 96427 1 DYDAMGSQTK Unmodified 1114.4601 0.46008882 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.961 24.961 2 0.0057685 18336 QUIQUE_C1277_190116_001 76.345 69.152 222190000 38776000 32876000 0 26031000 0 31714000 0 18041000 0 12481000 35590000 26686000 0 8469 4536 7915 75755;75756;75757;75758;75759;75760;75761;75762 96428;96429;96430;96431;96432;96433;96434;96435 96429 7 DYDDMSPR Unmodified 997.38111 0.38111022 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 35.583 35.583 2 0.016543 30995 QUIQUE_C1403_190116_001 120.49 116.64 670990000 0 0 0 120910000 0 105860000 0 85462000 103100000 0 126050000 0 129600000 8470 2735;3319 7916 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Unmodified 1647.7165 0.71651452 855 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.981 77.981 2 3.2352E-09 78938 QUIQUE_C1277_190116_001 140.07 129.84 516150000 29391000 41175000 34347000 58205000 44519000 36826000 34519000 48673000 49313000 0 40371000 41217000 57589000 8489 855 7934 75932;75933;75934;75935;75936;75937;75938;75939;75940;75941;75942;75943 96650;96651;96652;96653;96654;96655;96656;96657;96658;96659;96660;96661;96662 96651 12 DYFDMFAPK Unmodified 1132.4899 0.48993238 344 A0A1B0GTU4;P49023;F5GZ78 PXN Paxillin yes no 0 0 0 1 130.54 130.54 2 0.032733 137369 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.531 32.511 13233000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13233000 0 0 8490 344 7935 75944 96663 96663 1 DYFEEYGK Unmodified 1049.4342 0.43419164 2200 P22626;A0A087WUI2 HNRNPA2B1 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.068 68.068 2 0.0061806 67800 QUIQUE_C1403_190116_001 102.71 98.696 9995800000 1064100000 1014700000 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96726;96727;96728;96729;96730;96731;96732;96733;96734;96735;96736;96737;96738;96739;96740;96741;96742;96743;96744;96745;96746;96747;96748;96749;96750;96751;96752;96753;96754;96755;96756;96757;96758;96759;96760;96761;96762;96763;96764 96728 38 DYFFALAHTVR Unmodified 1338.6721 0.67207093 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 104.27 104.27 2;3 6.2005E-05 107970 QUIQUE_C1368_190116_001 103.08 94.979 11927000000 366340000 418230000 433220000 321590000 473160000 289610000 533330000 1358300000 1834900000 180230000 2168000000 1574900000 1975200000 8494 2016 7939 76018;76019;76020;76021;76022;76023;76024;76025;76026;76027;76028;76029;76030;76031;76032;76033;76034;76035;76036;76037;76038 96765;96766;96767;96768;96769;96770;96771;96772;96773;96774;96775;96776;96777;96778;96779;96780;96781;96782;96783;96784;96785;96786;96787;96788;96789;96790;96791;96792;96793 96767 29 DYFGAHTYELLAK Unmodified 1526.7405 0.74054442 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 101 101 2;3 1.3569E-75 104082 QUIQUE_C1368_190116_001 215.87 189.36 8684700000 788310000 659380000 1028700000 739110000 772990000 623400000 747840000 497240000 661270000 359670000 778840000 645770000 382120000 8495 2602 7940 76039;76040;76041;76042;76043;76044;76045;76046;76047;76048;76049;76050;76051;76052;76053;76054;76055;76056;76057;76058;76059;76060;76061;76062;76063 96794;96795;96796;96797;96798;96799;96800;96801;96802;96803;96804;96805;96806;96807;96808;96809;96810;96811;96812;96813;96814;96815;96816;96817;96818;96819;96820;96821;96822;96823;96824;96825;96826;96827;96828;96829 96803 35 DYFGAHTYELLAKPGQFIHTNWTGHGGTVSSSSYNA Unmodified 3912.8132 0.81321545 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 128.47 128.47 3;4;5 7.5363E-64 131970 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.89 115.13 972340000 0 0 0 0 0 0 0 268700000 43075000 0 273180000 183010000 204360000 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23 DYFLEFEGDPHCLR Unmodified 1796.7828 0.78281994 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 113.15 113.15 2;3 0.00035293 116792 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.527 74.2 1283000000 112390000 155730000 183830000 100320000 119170000 135750000 0 20895000 108880000 41555000 142170000 46396000 115960000 8500 3063 7945 76113;76114;76115;76116;76117;76118;76119;76120;76121;76122;76123;76124;76125;76126;76127;76128;76129;76130;76131;76132 96900;96901;96902;96903;96904;96905;96906;96907;96908;96909;96910;96911;96912;96913;96914;96915;96916;96917;96918;96919;96920;96921 96914 20 DYFLFNPVTDIEEIIR Unmodified 1982.9989 0.99894395 3372 Q6NUK1;A0A3B3IU96 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 174.15 174.15 2 2.3952E-19 177879 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.87 133.61 205090000 0 0 0 0 0 0 109100000 0 0 0 0 50136000 45858000 8501 3372 7946 76133;76134;76135;76136 96922;96923;96924;96925 96925 4 DYFMPCPGR Unmodified 1141.4685 0.46848544 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.586 77.586 2 0.0094802 79297 QUIQUE_C1218_190116_001 75.854 67.082 380190000 60505000 45208000 21149000 36629000 55600000 0 28542000 0 19253000 11753000 31608000 23779000 46159000 8502 1839 7947 76137;76138;76139;76140;76141;76142;76143;76144;76145;76146;76147 96926;96927;96928;96929;96930;96931;96932;96933;96934;96935;96936 96926 11 DYFMPCPGR Oxidation (M) 1157.4634 0.46340006 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 1 0 1 1 1 1 56.059 56.059 2 0.016803 54914 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.915 60.574 157440000 0 0 0 0 34806000 0 0 0 0 22926000 43594000 0 56111000 8503 1839 7947 76148;76149;76150;76151 96937;96938;96939;96940 96939 4 DYFNVPYPLPK Unmodified 1351.6812 0.68123863 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.08 127.08 2 6.5546E-05 133602 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2973 Q13162;H7C3T4 PRDX4 Peroxiredoxin-4 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 79.74 79.74 2;3 0.00047025 80814 QUIQUE_C1277_190116_001 84.605 70.242 932330000 62441000 49953000 62620000 54777000 70712000 91448000 33215000 100650000 85137000 26579000 146170000 84091000 64542000 8511 2973 7955 76208;76209;76210;76211;76212;76213;76214;76215;76216;76217;76218;76219;76220;76221;76222;76223;76224;76225;76226;76227;76228;76229 97021;97022;97023;97024;97025;97026;97027;97028;97029;97030;97031;97032;97033;97034;97035;97036;97037;97038;97039;97040;97041;97042;97043 97023 20 DYHFVSSR Unmodified 1009.4617 0.4617438 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 28.053 28.053 2 0.024959 22591 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.922 24.348 59029000 0 0 0 0 0 0 0 59029000 0 0 0 0 0 8512 487 7956 76230 97044 97044 1 DYHFVTSR Unmodified 1023.4774 0.47739386 2954 Q12959;A0A0C4DFT3 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 1 32.386 32.386 2 0.039916 27694 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.589 26.947 37951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37951000 0 0 8513 2954 7957 76231 97045 97045 1 DYHIGIPLTYSQYK Unmodified 1696.8461 0.84607213 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 103.09 103.09 3 0.042431 105683 QUIQUE_C1277_190116_001 32.925 26.894 29933000 0 29933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8514 4140 7958 76232 97046 97046 1 DYHLLHPVENIPEIILYWK Unmodified 2391.2627 0.26270363 3368 Q6KCM7 SLC25A25 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2 yes yes 0 0 0 1 1 151.87 151.87 3 0.013001 159310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.131 42.18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8515 3368 7959 76233;76234 97047;97048 97047 2 DYHNLFSPR Unmodified 1147.5411 0.54105675 344 A0A1B0GTU4;P49023;F5GZ78 PXN Paxillin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 62.133 62.133 3 0.0067861 59733 QUIQUE_C1563_190116_001 61.78 43.971 84123000 19640000 0 0 0 0 20539000 22938000 0 0 21006000 0 0 0 8516 344 7960 76235;76236;76237;76238;76239;76240 97049;97050;97051;97052;97053;97054 97051 6 DYIDISVAVATPR Unmodified 1418.7405 0.74054442 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 136.26 136.26 2 0.051987 143414 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.741 37.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8517 2404 7961 76241 97055 97055 1 DYIDQWNK Unmodified 1080.4876 0.4876242 397 D6RJF9;A0A286YFI3;A0A286YFC0;A8MWW6;A0A286YFJ6;A0A286YFJ4;A0A286YEN5;A0A286YF85;A0A286YFA6;A0A286YF62;A0A286YEW9;P53779;A0A286YFB6;A0A286YFM6;A0A286YEX7;A0A286YF02;A0A286YEV3;A0A286YES0;A0A286YF35;A0A286YF19;A0A286YF83;A0A286YEY0;A0A286YEV8;P45983 MAPK10;MAPK8 Mitogen-activated protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.216 73.216 2 0.017595 69642 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.297 64.521 327560000 43784000 45483000 0 38723000 36176000 33366000 44563000 0 30724000 11471000 0 43272000 0 8518 397 7962 76242;76243;76244;76245;76246;76247;76248;76249;76250 97056;97057;97058;97059;97060;97061;97062;97063;97064;97065;97066;97067 97066 12 DYIFEVMDCSMPLIGEHQVEDR Oxidation (M) 2698.1713 0.17132372 3755;58 A0A087WW91;Q92777 SYN2 Synapsin-2 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 137.32 137.32 3 3.022E-09 141335 QUIQUE_C1277_190116_001 94.837 88.26 195240000 41769000 30363000 35367000 35717000 0 38253000 0 0 0 13767000 0 0 0 8519 58;3755 7963 76251;76252;76253;76254;76255;76256 97068;97069;97070;97071;97072;97073 97069 47;48 5 DYIFEVMDCSMPLIGEHQVEDR Unmodified 2682.1764 0.1764091 3755;58 A0A087WW91;Q92777 SYN2 Synapsin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.22 153.22 3 4.6324E-45 158621 QUIQUE_C1368_190116_001 150.58 142.87 1486100000 194750000 227080000 202090000 143450000 103030000 143100000 204510000 0 0 48153000 64833000 74398000 80707000 8520 58;3755 7963 76257;76258;76259;76260;76261;76262;76263;76264;76265;76266;76267 97074;97075;97076;97077;97078;97079;97080;97081;97082;97083;97084;97085;97086;97087 97078 13 DYIHVVDLAK Unmodified 1171.6237 0.62372375 3065 Q14376;Q5QPP3;Q5QPP4;Q5QPP9 GALE UDP-glucose 4-epimerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 76.543 76.543 2;3 0.0042673 78331 QUIQUE_C1218_190116_001 64.103 37.43 455460000 45067000 42143000 42188000 42667000 42660000 37399000 33551000 21421000 33720000 22373000 35566000 29812000 26888000 8521 3065 7964 76268;76269;76270;76271;76272;76273;76274;76275;76276;76277;76278;76279;76280;76281 97088;97089;97090;97091;97092;97093;97094;97095;97096;97097;97098;97099;97100;97101;97102;97103 97088 16 DYIIDPR Unmodified 890.44978 0.44978213 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43;C9JF43;C9J8B6;C9JUR7 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.111 62.111 2 0.057389 61338 QUIQUE_C1368_190116_001 70.912 8.1982 1194100000 0 0 150640000 149590000 172720000 127750000 192670000 0 187600000 0 0 213110000 0 8522 756 7965 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deacetylase MACROD2 yes no 0 0 1 1 1 139.35 139.35 3 0.0020435 142599 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.862 42.941 54334000 0 0 0 0 0 0 0 28298000 0 0 0 0 26037000 8525 464 7968 76303;76304 97128;97129 97128 2 DYIPVDQEELR Unmodified 1375.662 0.66195975 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 82.865 82.865 2 0.0043565 85806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.614 53.628 246930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 246930000 0 0 8526 3053 7969 76305 97130 97130 1 DYIPVDQEELRDYVK Unmodified 1880.9156 0.91560825 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 105.05 105.05 3 0.05114 106778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.775 29.544 169770000 0 0 0 0 0 0 0 169770000 0 0 0 0 0 8527 3053 7970 76306 97131 97131 1 DYIPVEGELLFQPGEAWK Unmodified 2090.0361 0.03605774 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.55 156.55 2 2.219E-05 161928 QUIQUE_C1368_190116_001 128.54 105.32 464140000 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synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 112.92 112.92 2 3.1025E-18 116142 QUIQUE_C1403_190116_001 168.8 128.75 3125900000 941400000 562910000 0 556650000 0 599510000 0 293080000 0 172380000 0 0 0 8531 612 7974 76323;76324;76325;76326;76327;76328 97150;97151;97152;97153;97154;97155;97156;97157;97158;97159;97160 97156 11 DYIYAVTPLLEDALMDR Unmodified 1996.9816 0.98157933 1644 O75533;H7C341 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 168.98 168.98 2 0.00089315 174300 QUIQUE_C1576_190116_001 83.087 70.727 42789000 0 20767000 0 0 0 0 22022000 0 0 0 0 0 0 8532 1644 7975 76329;76330 97161;97162;97163 97163 2 DYKAEEDPAK Unmodified 1164.5299 0.52988294 2842 Q00169;F5GWE5;I3L459;I3L4C0;I3NI10 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 15.313 15.313 2;3 0.0022744 7492 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.93 85.752 335040000 16249000 52225000 0 30686000 0 0 0 0 68286000 13778000 0 153810000 0 8533 2842 7976 76331;76332;76333;76334;76335;76336;76337;76338 97164;97165;97166;97167;97168;97169;97170;97171 97170 7 DYKVDQEIINIMQDR Unmodified 1878.9146 0.9145624 1767 O96000;H3BV16 NDUFB10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 129.99 129.99 2;3 3.3563E-10 133172 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.29 76.428 1262900000 0 0 0 0 0 0 144420000 121430000 128130000 0 403270000 312020000 153610000 8534 1767 7977 76339;76340;76341;76342;76343;76344;76345;76346 97172;97173;97174;97175;97176;97177;97178;97179 97173 6 DYLGDFIEHYAQLGPSQPPDLAQAQDEPR Unmodified 3269.5265 0.52653549 2845 Q00577 PURA Transcriptional activator protein Pur-alpha yes yes 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 158.81 158.81 2;3;4 2.0499E-259 162831 QUIQUE_C1277_190116_001 320.22 296.59 10292000000 962830000 1221800000 1200100000 669940000 854770000 731430000 677530000 565460000 709760000 224640000 1056700000 775230000 641980000 8535 2845 7978 76347;76348;76349;76350;76351;76352;76353;76354;76355;76356;76357;76358;76359;76360;76361;76362;76363;76364;76365;76366;76367;76368;76369;76370;76371;76372;76373;76374 97180;97181;97182;97183;97184;97185;97186;97187;97188;97189;97190;97191;97192;97193;97194;97195;97196;97197;97198;97199;97200;97201;97202;97203;97204;97205;97206;97207;97208;97209;97210;97211;97212;97213;97214;97215;97216;97217;97218;97219;97220;97221 97185 40 DYLHLPPEIVPATLR Unmodified 1732.9512 0.9512059 384;2482 A0A1W2PQS6;A0A2R8Y6L3;F6U211;A0A2R8Y7H1;S4R435;A0A2R8YFH6;P46783 RPS10;RPS10-NUDT3 40S ribosomal protein S10 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 3 1 1 1 1 129.04 129.04 3 8.4729E-05 134652 QUIQUE_C1218_190116_001 82.908 72.985 568900000 58181000 43753000 50613000 52254000 57625000 117030000 0 41827000 0 11424000 55124000 0 81069000 8536 384;2482 7979 76375;76376;76377;76378;76379;76380;76381;76382;76383;76384;76385;76386;76387;76388 97222;97223;97224;97225;97226;97227;97228;97229;97230;97231;97232;97233;97234;97235;97236;97237;97238;97239;97240;97241;97242;97243 97223 21 DYLHYHIK Unmodified 1087.5451 0.5450795 1486 O15144;H7C3F9 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 35.811 35.811 2;3 0.0059643 31731 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.981 58.623 2381200000 110560000 132400000 167870000 164360000 119240000 119090000 485050000 237540000 142110000 140170000 210490000 150680000 201610000 8537 1486 7980 76389;76390;76391;76392;76393;76394;76395;76396;76397;76398;76399;76400;76401;76402 97244;97245;97246;97247;97248;97249;97250;97251;97252;97253;97254;97255;97256;97257;97258;97259 97256 14 DYLIDGSR Unmodified 937.45051 0.45051041 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 53.008 53.008 2 0.0073368 48641 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.418 45.255 456630000 0 0 0 0 0 111480000 0 0 0 56675000 107300000 86718000 94458000 8538 2135 7981 76403;76404;76405;76406;76407 97260;97261;97262;97263;97264;97265;97266;97267;97268 97262 9 DYLLCDYNR Unmodified 1230.5339 0.53392246 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 81.815 81.815 2 3.731E-05 81853 QUIQUE_C1563_190116_001 147.52 131.86 4807300000 365360000 492170000 460690000 408930000 363510000 381890000 517720000 189270000 307850000 171640000 407320000 352430000 388520000 8539 585;2493 7982 76408;76409;76410;76411;76412;76413;76414;76415;76416;76417;76418;76419;76420;76421;76422 97269;97270;97271;97272;97273;97274;97275;97276;97277;97278;97279;97280;97281;97282;97283;97284;97285;97286;97287;97288;97289;97290;97291;97292;97293;97294;97295;97296 97280 28 DYLMSTHFWGPVANWGLPIAAINDMK Oxidation (M) 2962.4146 0.41460596 4633 Q9Y5U8 MPC1 Mitochondrial pyruvate carrier 1 yes yes 0 1 0 1 165.76 165.76 3 9.5691E-08 173192 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.332 51.756 57501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57501000 0 0 8540 4633 7983 76423 97297 97297 3054 1 DYLSHQVPISFHK Unmodified 1569.794 0.79397698 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 66.888 66.888 3 0.0029477 67642 QUIQUE_C1218_190116_001 55.105 46.069 142040000 63783000 0 78254000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8541 3419 7984 76424;76425 97298;97299;97300 97299 3 DYMAVLIK Unmodified 951.50994 0.50993955 2807 P78357 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 96.826 96.826 2 0.042451 98587 QUIQUE_C1277_190116_001 58.981 41.42 78845000 34728000 31866000 0 0 0 0 0 0 0 12251000 0 0 0 8542 2807 7985 76426;76427;76428 97301;97302;97303 97302 3 DYMEMYNVIMTVK Unmodified 1635.7347 0.73467246 4135 Q9H1V8 SLC6A17 Sodium-dependent neutral amino acid transporter SLC6A17 yes yes 0 0 0 1 1 154.2 154.2 2 0.00077688 157034 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.198 74.765 16607000 0 0 0 0 0 0 0 16607000 0 0 0 0 0 8543 4135 7986 76429;76430 97304;97305 97304 2 DYMFSGLKDETVGR Unmodified 1616.7505 0.75045718 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 89.684 89.684 2;3 0.0012923 91996 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.191 72.728 321120000 0 0 58780000 54167000 25141000 0 0 27287000 72408000 0 0 27193000 56140000 8544 1654 7987 76431;76432;76433;76434;76435;76436;76437;76438;76439;76440 97306;97307;97308;97309;97310;97311;97312;97313;97314;97315 97312 6 DYNDADMAR Unmodified 1069.4135 0.41347298 3083 Q14696;H0YLI4 MESDC2 LDLR chaperone MESD yes no 0 0 0 1 28.905 28.905 2 0.054774 23059 QUIQUE_C1277_190116_001 49.418 44.844 21143000 0 21143000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8545 3083 7988 76441 97316 97316 1 DYNLNDILLQLGIEEAFTSK Unmodified 2295.1634 0.1634431 1800 P01011;G3V3A0 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 175.33 175.33 3 7.9585E-07 182368 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.968 79.18 43428000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43428000 0 0 8546 1800 7989 76442 97317 97317 1 DYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPR Unmodified 2554.2679 0.26786537 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 158.83 158.83 3 0.0087172 163375 QUIQUE_DMIX7_190116_001 24.552 16.839 79156000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36716000 42440000 0 8547 1096 7990 76443;76444 97318;97319 97319 1 DYNPLLAR Unmodified 960.50288 0.50288033 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.168 66.168 2 0.004682 62841 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.24 84.714 4156900000 535660000 507780000 426970000 409310000 417230000 387280000 448310000 186790000 0 162190000 0 299450000 375890000 8548 4524 7991 76445;76446;76447;76448;76449;76450;76451;76452;76453;76454;76455 97320;97321;97322;97323;97324;97325;97326;97327;97328;97329;97330;97331;97332;97333 97330 13 DYNPYNYSDSISPFNK Unmodified 1922.8323 0.83227255 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.58 116.58 2 3.1662E-24 120687 QUIQUE_C1368_190116_001 150.69 142.83 442260000 21773000 30883000 30453000 39579000 45025000 29200000 56588000 40400000 28628000 0 37554000 36024000 46152000 8549 310;830 7992 76456;76457;76458;76459;76460;76461;76462;76463;76464;76465;76466;76467 97334;97335;97336;97337;97338;97339;97340;97341;97342;97343;97344;97345 97336 11 DYNVTANSK Unmodified 1010.4669 0.46688876 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.037 20.037 2 0.00044066 12576 QUIQUE_C1277_190116_001 118.32 104.17 3477400000 0 533170000 0 361580000 0 348640000 0 987750000 379650000 471820000 0 394830000 0 8550 1775 7993 76468;76469;76470;76471;76472;76473;76474 97346;97347;97348;97349;97350;97351;97352 97346 3 DYPDFSPSVDAEAIQK Unmodified 1780.8156 0.81555986 2045 P12429;D6RFG5;D6RCA8;D6RAZ8 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.55 105.55 2 3.0226E-06 109667 QUIQUE_C1218_190116_001 136.38 121.7 1099000000 66367000 78121000 85666000 78114000 96635000 73070000 98530000 73436000 60105000 38365000 166950000 66906000 116770000 8551 2045 7994 76475;76476;76477;76478;76479;76480;76481;76482;76483;76484;76485;76486;76487 97353;97354;97355;97356;97357;97358;97359;97360;97361;97362;97363;97364;97365 97353 13 DYPFHEEF Unmodified 1082.4345 0.434526 2087 P15121 AKR1B1 Aldose reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.02 100.02 2 0.0096416 103906 QUIQUE_C1218_190116_001 92.319 92.319 3346200000 209240000 334810000 325960000 258270000 309400000 263840000 268970000 145220000 225140000 195360000 266970000 251480000 291530000 8552 2087 7995 76488;76489;76490;76491;76492;76493;76494;76495;76496;76497;76498;76499;76500 97366;97367;97368;97369;97370;97371;97372;97373;97374;97375;97376;97377;97378;97379;97380;97381;97382;97383;97384;97385;97386 97366 21 DYPLELFMAQCYGNISDLGK Unmodified 2333.0708 0.070805042 1012 F5H5P2;P12694;F5GXU9;H0YH31 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 169.13 169.13 2 6.3133E-09 170759 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.46 125.84 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76510;76511;76512;76513;76514;76515;76516;76517;76518;76519;76520;76521;76522;76523;76524;76525;76526;76527;76528;76529;76530;76531;76532;76533;76534;76535;76536 97397;97398;97399;97400;97401;97402;97403;97404;97405;97406;97407;97408;97409;97410;97411;97412;97413;97414;97415;97416;97417;97418;97419;97420;97421;97422;97423;97424;97425;97426;97427 97421 30 DYPVVSIEDPFDQDDWGAWQK Unmodified 2509.1074 0.10738478 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 0 4 2 3 2 2 4 2 2 3 2 4 3 2 166.9 166.9 2;3 2.9454E-233 169177 QUIQUE_C1277_190116_001 267.93 251.71 63153000000 3822200000 3720300000 4778700000 3298800000 4955700000 2884300000 4926900000 6824500000 6675700000 1313600000 6842900000 6928400000 6180800000 8556 1906 7999 76537;76538;76539;76540;76541;76542;76543;76544;76545;76546;76547;76548;76549;76550;76551;76552;76553;76554;76555;76556;76557;76558;76559;76560;76561;76562;76563;76564;76565;76566;76567;76568;76569;76570;76571 97428;97429;97430;97431;97432;97433;97434;97435;97436;97437;97438;97439;97440;97441;97442;97443;97444;97445;97446;97447;97448;97449;97450;97451;97452;97453;97454;97455;97456;97457;97458;97459;97460;97461;97462;97463;97464;97465;97466;97467;97468;97469;97470;97471;97472;97473;97474;97475;97476;97477;97478;97479;97480;97481;97482;97483;97484;97485;97486;97487;97488;97489;97490;97491;97492;97493;97494;97495;97496;97497;97498;97499;97500;97501;97502;97503;97504 97435 75 DYQDLLQVK Unmodified 1120.5764 0.57643921 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.342 94.342 2 0.00048805 96858 QUIQUE_C1368_190116_001 114.89 89.158 1300800000 0 136200000 186030000 136940000 87767000 114390000 121300000 0 144450000 75880000 133450000 0 164390000 8557 16;1475 8000 76572;76573;76574;76575;76576;76577;76578;76579;76580;76581;76582 97505;97506;97507;97508;97509;97510;97511;97512;97513;97514;97515;97516 97507 10 DYQDNKADVILK Unmodified 1420.7198 0.71980898 2494 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DYQELMNTK Unmodified 1140.5121 0.51212439 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.835 60.835 2 0.00011683 56953 QUIQUE_DMIX4_190116_001 160.88 82.957 2557200000 154860000 158760000 0 0 253090000 170710000 0 259520000 0 442660000 327240000 363570000 426790000 + 8560 1859 8002 76604;76605;76606;76607;76608;76609;76610;76611;76612 97543;97544;97545;97546;97547;97548;97549;97550;97551 97548 6 DYQELMNVK Unmodified 1138.5329 0.53285983 781;782;775 CON__P35908;H0YID6;CON__P35908v2;P35908;CON__P12035;P12035 KRT79;KRT2;KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.728 76.728 2 0.0014209 73574 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.83 93.005 977290000 84930000 58875000 42366000 61884000 68274000 0 55182000 39506000 84302000 151430000 115260000 103700000 111570000 + 8561 781;782;775 8003 76613;76614;76615;76616;76617;76618;76619;76620;76621;76622;76623;76624 97552;97553;97554;97555;97556;97557;97558;97559;97560;97561;97562;97563;97564 97561 12 DYQELMNVK Oxidation (M) 1154.5278 0.52777445 781;782;775 CON__P35908;H0YID6;CON__P35908v2;P35908;CON__P12035;P12035 KRT79;KRT2;KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 1 0 2 1 46.484 46.484 2 0.00050483 41826 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.41 69.965 233670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 179800000 0 53868000 0 + 8562 781;782;775 8003 76625;76626;76627 97565;97566;97567 97566 465 3 DYQGLFGVK Unmodified 1025.5182 0.51819605 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.934 92.934 2 0.0053778 90416 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.833 33.123 856110000 94481000 0 86432000 109670000 94191000 0 91933000 51842000 78147000 67795000 0 71996000 109610000 8563 151 8004 76628;76629;76630;76631;76632;76633;76634;76635;76636;76637 97568;97569;97570;97571;97572;97573;97574;97575;97576;97577;97578 97576 11 DYQTSPLLETQAEDHPPR Unmodified 2095.9811 0.98106206 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 70.117 70.117 3 0.0002033 69961 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.062 51.131 419850000 0 0 0 69606000 38119000 0 54842000 77523000 0 0 85458000 0 94307000 8564 4664 8005 76638;76639;76640;76641;76642;76643 97579;97580;97581;97582;97583;97584 97582 3 DYRPYADLVSEIR Unmodified 1595.7944 0.79437091 3251 Q53G44;H7C1K6 IFI44L Interferon-induced protein 44-like yes no 0 0 1 1 106.07 106.07 3 0.0030286 111419 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.482 37.087 13048000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13048000 0 0 8565 3251 8006 76644 97585 97585 1 DYSDHPSGGSYR Unmodified 1339.5429 0.54290725 2412;3840 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BUY5;Q96E39 RBMX;RBMXL1 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA binding motif protein, X-linked-like-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 19.182 19.182 2;3 4.0785E-06 11514 QUIQUE_C1277_190116_001 136.84 86.006 769470000 113990000 102040000 102650000 113510000 0 90894000 34439000 66495000 0 15636000 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Unmodified 1333.6514 0.65139506 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 54.115 54.115 2 0.0011946 52438 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.914 64.541 373650000 77979000 137420000 0 0 0 0 0 0 0 0 158250000 0 0 8582 3432 8022 76803;76804;76805 97760;97761;97762 97762 3 DYVAPTANLDQKDK Unmodified 1576.7733 0.77330111 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 2 1 1 39.189 39.189 2;3 0.0008037 35554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.079 46.159 71285000 0 0 0 0 0 0 0 38518000 32767000 0 0 0 0 8583 3432 8023 76806;76807;76808;76809 97763;97764;97765;97766 97763 4 DYVISLGVVK Unmodified 1091.6227 0.62266112 1420;1413 O00629;O00505 KPNA4;KPNA3 Importin subunit alpha-3;Importin subunit alpha-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 104.67 104.67 2 0.02052 107446 QUIQUE_C1277_190116_001 59.35 47.839 170330000 38143000 34878000 40353000 0 0 43815000 0 0 0 13141000 0 0 0 8584 1420;1413 8024 76810;76811;76812;76813;76814;76815 97767;97768;97769;97770;97771;97772 97768 6 DYVISLGVVKPLLSFISPSIPITFLR Unmodified 2873.667 0.66703912 1420;1413 O00629;O00505 KPNA4;KPNA3 Importin subunit alpha-3;Importin subunit alpha-4 no no 0 0 1 1 174.35 174.35 3 0.0070575 181537 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.835 27.931 47655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47655000 0 0 8585 1420;1413 8025 76816 97773 97773 1 DYVLDCNILPPLLQLFSK Unmodified 2147.1337 0.1336633 2604 P52294;C9JYI4 KPNA1 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 175.96 175.96 2;3 4.7779E-11 176693 QUIQUE_C1563_190116_001 119.96 106 206140000 0 13954000 0 0 0 27163000 0 33594000 37259000 0 61959000 0 32209000 8586 2604 8026 76817;76818;76819;76820;76821;76822;76823 97774;97775;97776;97777;97778;97779;97780;97781 97775 8 DYVLNCSILNPLLTLLTK Unmodified 2089.1493 0.14931336 1587 O60684;Q5TFJ7 KPNA6 Importin subunit alpha-7 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 2 175.11 175.11 2;3 9.4905E-31 180842 QUIQUE_C1438_190116_001 151.44 130.58 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97797;97798;97799;97800;97801;97802;97803;97804;97805;97806;97807;97808;97809;97810;97811;97812;97813;97814;97815;97816;97817;97818;97819;97820;97821;97822;97823 97811 26 DYVSQFEGSALGK Unmodified 1399.662 0.66195975 1821 P02647 APOA1 Apolipoprotein A-I;Proapolipoprotein A-I;Truncated apolipoprotein A-I yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 109.24 109.24 2 6.0003E-16 113728 QUIQUE_C1218_190116_001 158.79 140.48 2127200000 348950000 237420000 87874000 244300000 847110000 253470000 0 0 0 108060000 0 0 0 8589 1821 8029 76864;76865;76866;76867;76868;76869;76870;76871;76872;76873;76874;76875;76876 97824;97825;97826;97827;97828;97829;97830;97831;97832;97833;97834;97835;97836;97837;97838 97825 15 DYWSYLER Unmodified 1130.5033 0.50327426 525 C9J1X0;A4D1P6 WDR91 WD repeat-containing protein 91 yes no 0 0 0 1 1 1 1 115.4 115.4 2 0.020103 120936 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.282 62.132 57492000 19508000 10375000 0 0 11994000 0 0 0 0 0 15615000 0 0 8590 525 8030 76877;76878;76879;76880 97839;97840;97841;97842 97842 4 DYYCILGIEK Unmodified 1272.606 0.60602477 4416 Q9UDY4;C9JUL4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes no 0 0 0 1 114.18 114.18 2 0.063916 116372 QUIQUE_C1563_190116_001 53.751 38.136 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8591 4416 8031 76881 97843 97843 1 DYYFALAHTVR Unmodified 1354.667 0.66698555 2017;948 E9PK47;P06737;P11217 PYGL;PYGM Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 86.308 86.308 3 0.00014921 87742 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.39 101.38 1976400000 51745000 100050000 111420000 140020000 159940000 82514000 123850000 191620000 312910000 59133000 156870000 261690000 224710000 8592 948;2017 8032 76882;76883;76884;76885;76886;76887;76888;76889;76890;76891;76892;76893;76894;76895;76896 97844;97845;97846;97847;97848;97849;97850;97851;97852;97853;97854;97855;97856;97857;97858;97859;97860;97861;97862;97863;97864;97865 97854 21 DYYINIR Unmodified 955.47633 0.47633123 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 76.37 76.37 2 0.029928 77620 QUIQUE_C1218_190116_001 91.093 60.425 73640000 30522000 43118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8593 1506 8033 76897;76898 97866;97867 97866 2 DYYQTLGLAR Unmodified 1198.5982 0.59823728 2241 P25685 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes yes 0 0 0 1 93.237 93.237 2 0.058436 89940 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.465 48.352 24662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24662000 0 0 0 8594 2241 8034 76899 97868 97868 0 EAAAAAAAAVAAAAAAAAAAEPYPVSGAK Unmodified 2453.2551 0.25505207 3385 Q6P6C2 ALKBH5 RNA demethylase ALKBH5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 154.12 154.12 3 2.4301E-08 159617 QUIQUE_C1368_190116_001 57.058 45.809 104400000 0 21804000 28110000 0 0 14099000 0 29518000 0 10868000 0 0 0 8595 3385 8035 76900;76901;76902;76903;76904 97869;97870;97871;97872;97873 97870 4 EAAAALVEEETRR Unmodified 1443.7318 0.73177065 1668 O75934 BCAS2 Pre-mRNA-splicing factor SPF27 yes yes 0 0 1 1 1 48.966 48.966 2;3 0.0038427 45957 QUIQUE_C1277_190116_001 73.781 30.499 51360000 0 34819000 0 0 0 0 0 16542000 0 0 0 0 0 8596 1668 8036 76905;76906 97874;97875 97874 2 EAAAQEAGADTPGK Unmodified 1314.6052 0.60517315 1321 K7EK60;K7EJE6;K7EMY8;K7ERL1 FMNL1 no no 0 0 0 1 1 15.73 15.73 2 0.0038398 7669 QUIQUE_C1403_190116_001 67.214 47.38 28489000 15724000 0 0 12764000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8597 1321 8037 76907;76908 97876;97877 97877 2 EAAASGLPLMVIIHK Unmodified 1548.8698 0.86978446 1763 O95881 TXNDC12 Thioredoxin domain-containing protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.62 105.62 3 0.00083164 108656 QUIQUE_C1277_190116_001 44.132 33.793 455070000 41168000 52131000 0 34932000 52357000 32357000 36196000 33852000 29570000 0 48379000 37304000 56829000 8598 1763 8038 76909;76910;76911;76912;76913;76914;76915;76916;76917;76918;76919 97878;97879;97880;97881;97882;97883;97884;97885;97886;97887;97888;97889;97890;97891;97892 97879 14 EAAAVAPPER Unmodified 1009.5193 0.51925868 800 D3DTX6;Q96SB3 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chain 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.25 82.25 3 2.0944E-06 83542 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.12 100.65 476330000 27203000 45684000 35659000 37957000 41894000 31991000 46011000 34308000 49113000 17199000 30690000 37240000 41386000 8615 4116 8055 77053;77054;77055;77056;77057;77058;77059;77060;77061;77062;77063;77064;77065 98049;98050;98051;98052;98053;98054;98055;98056;98057;98058;98059;98060;98061;98062 98057 14 EAAHLLNDALSIR Unmodified 1421.7627 0.76267685 4286 Q9NSK0;C9J8T5 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 82.843 82.843 2;3 0.001186 84212 QUIQUE_C1368_190116_001 69.716 49.253 294100000 24833000 30054000 45737000 26727000 47031000 55244000 27892000 0 0 0 0 0 36583000 8616 4286 8056 77066;77067;77068;77069;77070;77071;77072;77073;77074;77075;77076;77077;77078;77079 98063;98064;98065;98066;98067;98068;98069;98070;98071;98072;98073;98074;98075;98076;98077 98066 15 EAAIVDPVQPQK Unmodified 1293.6929 0.69286595 3195 Q16775;H3BPQ4;H3BPK3;H3BQW8 HAGH Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 47.354 47.354 2 0.00056642 43901 QUIQUE_C1277_190116_001 110.88 102.66 818740000 337560000 285930000 0 0 0 0 0 195250000 0 0 0 0 0 8617 3195 8057 77080;77081;77082 98078;98079;98080 98079 3 EAAIWELEER Unmodified 1244.6037 0.60371659 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 93.666 93.666 2 0.023917 96022 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.632 38.407 75665000 0 0 0 37400000 0 0 0 0 38265000 0 0 0 0 8618 4145 8058 77083;77084;77085 98081;98082;98083 98083 3 EAALGAGFSDK Unmodified 1064.5138 0.51383895 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38;C9JEY0;C9JE81 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.984 41.984 2 0.00046515 38537 QUIQUE_C1403_190116_001 106.2 83.707 2951200000 235260000 236100000 439050000 331870000 201550000 312970000 285940000 216710000 0 158520000 238710000 0 294530000 8619 2660 8059 77086;77087;77088;77089;77090;77091;77092;77093;77094;77095;77096;77097 98084;98085;98086;98087;98088;98089;98090;98091;98092;98093;98094;98095 98088 11 EAALILGVSPTANK Unmodified 1382.7769 0.77692993 3831 Q96DA6 DNAJC19 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM14 yes yes 0 0 0 1 79.537 79.537 2 0.0087519 80365 QUIQUE_C1277_190116_001 57.39 26.205 40671000 0 40671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8620 3831 8060 77098 98096 98096 1 EAALSTALSEK Unmodified 1118.5819 0.58191851 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.408 45.408 2 0.00043115 42349 QUIQUE_C1277_190116_001 103.01 71.071 4372800000 0 522930000 682540000 0 735700000 537310000 510820000 0 406530000 239140000 0 314990000 422800000 8621 1819;3223 8061 77099;77100;77101;77102;77103;77104;77105;77106;77107 98097;98098;98099;98100;98101;98102;98103;98104;98105;98106;98107;98108;98109;98110;98111;98112 98098 16 EAALSTALSEKR Unmodified 1274.683 0.68302954 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 1 2 2 1 2 31.167 31.167 2;3 0.0029497 26817 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.744 51.85 623000000 0 0 0 0 0 0 0 0 194200000 0 187120000 102880000 138800000 8622 1819;3223 8062 77108;77109;77110;77111;77112;77113;77114 98113;98114;98115;98116;98117;98118;98119 98114 6 EAALTSEEVGADLEQVEVLQK Unmodified 2257.1325 0.1325369 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 4 3 2 132.01 132.01 2;3 1.829E-128 136704 QUIQUE_DMIX3_190116_001 287.48 271.54 14647000000 931770000 1095400000 972250000 1206200000 1269500000 1307800000 999980000 1346800000 1359900000 509420000 1003900000 984370000 1659800000 8623 267;275;3025 8063 77115;77116;77117;77118;77119;77120;77121;77122;77123;77124;77125;77126;77127;77128;77129;77130;77131;77132;77133;77134;77135;77136;77137;77138;77139;77140;77141;77142;77143;77144 98120;98121;98122;98123;98124;98125;98126;98127;98128;98129;98130;98131;98132;98133;98134;98135;98136;98137;98138;98139;98140;98141;98142;98143;98144;98145;98146;98147;98148;98149;98150;98151;98152;98153;98154;98155;98156;98157;98158;98159;98160;98161;98162;98163;98164;98165;98166;98167;98168;98169;98170;98171;98172;98173;98174;98175;98176;98177;98178;98179;98180;98181;98182;98183;98184;98185 98164 66 EAALVQQEEEK Unmodified 1272.6198 0.61976058 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 24.55 24.55 2 0.0026169 17889 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.642 70.083 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8624 3098 8064 77145;77146 98186;98187 98187 2 EAALVQQEEEKAEQR Unmodified 1756.8592 0.85915601 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 1 1 1 1 42.187 42.187 2;3 3.8105E-18 38368 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.18 118.42 41471000 0 0 0 0 0 0 0 24900000 0 16571000 0 0 0 8625 3098 8065 77147;77148;77149 98188;98189;98190 98189 3 EAAMGQGFDR Unmodified 1080.4658 0.4658429 2223 P23786 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 32.27 32.27 2 0.033017 27357 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.493 36.717 19651000 0 0 0 0 0 0 0 19651000 0 0 0 0 0 8626 2223 8066 77150;77151 98191;98192 98191 2 EAAPDAGAEPITADSDPAYSSK Unmodified 2161.9651 0.96513722 3571 Q8N163;E5RHJ4 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.741 63.741 2 7.0946E-100 63895 QUIQUE_C1218_190116_001 201.3 187.62 538160000 49708000 63608000 66866000 48615000 58554000 43854000 0 0 45003000 0 67858000 56314000 37781000 8627 3571 8067 77152;77153;77154;77155;77156;77157;77158;77159;77160;77161;77162 98193;98194;98195;98196;98197;98198;98199;98200;98201;98202;98203;98204;98205 98193 13 EAAQALLLAELR Unmodified 1296.7402 0.74015049 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.6 117.6 2 0.00051629 121589 QUIQUE_C1368_190116_001 94.465 41.983 417680000 43681000 59230000 47346000 34618000 37862000 28047000 47650000 0 29667000 19648000 38773000 0 31154000 8628 4604 8068 77163;77164;77165;77166;77167;77168;77169;77170;77171;77172;77173;77174;77175 98206;98207;98208;98209;98210;98211;98212;98213;98214;98215;98216;98217;98218;98219 98208 14 EAAQALLLAELRR Unmodified 1452.8413 0.84126152 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 1 1 1 1 96.442 96.442 3 0.0026759 99938 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.809 33.164 67645000 0 0 0 0 0 0 0 25410000 0 0 20228000 22008000 0 8629 4604 8069 77176;77177;77178 98220;98221;98222 98221 3 EAAQAMYIDSYNSR Unmodified 1617.7093 0.70932065 4029 Q9BU61 NDUFAF3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.913 65.913 2 0.0002629 66519 QUIQUE_C1218_190116_001 119.39 109.73 193450000 22329000 30679000 0 0 0 19637000 0 29169000 22100000 0 0 29848000 39687000 8630 4029 8070 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EAASQRPLSSSASNR Unmodified 1559.7652 0.76519604 123 A0A087X2H1;Q9ULT8;H0YJP0 HECTD1 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 yes no 0 0 1 1 10.701 10.701 3 0.00020304 3108 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.965 58.989 17011000 0 0 0 0 0 0 0 17011000 0 0 0 0 0 8634 123 8074 77195 98239 98239 1 EAASYQEALAR Unmodified 1207.5833 0.5833155 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 11 13 15 12 10 6 17 12 17 11 12 13 20 77.263 77.263 1;2;3 7.9973E-144 36445 QUIQUE_DMIX8_190116_001 287.77 216.08 864140000000 50464000000 59836000000 80056000000 68715000000 63444000000 68256000000 65372000000 62534000000 76064000000 56677000000 68658000000 65148000000 78921000000 8635 389;395;1336 8075 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98533 296 EAATLEVERPLPMEVEK Unmodified 1939.9925 0.99247837 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 79.894 79.894 2;3 1.6962E-200 80908 QUIQUE_C1277_190116_001 263.83 228.18 1059300000 212460000 223290000 48271000 167790000 0 145250000 75135000 0 0 42248000 0 61385000 83430000 8636 2596 8076 77365;77366;77367;77368;77369;77370;77371;77372;77373;77374;77375;77376;77377;77378;77379;77380 98553;98554;98555;98556;98557;98558;98559;98560;98561;98562;98563;98564;98565;98566;98567;98568;98569 98557 16 EAATLEVERPLPMEVEK Oxidation (M) 1955.9874 0.98739299 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 1 1 1 64.369 64.369 3 0.010019 60032 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.314 31.033 38783000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38783000 0 0 0 8637 2596 8076 77381 98570 98570 2044 1 EAATQAQQTLGSTIDK Unmodified 1660.8268 0.82679325 2496 P47897;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RQU2;F2Z2V6 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.583 54.583 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EACGEAEAVATQCPAPLIHSVEPLTGPVDGGTR Unmodified 3388.6028 0.60275367 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 114.35 114.35 3 1.0812E-51 117635 QUIQUE_C1403_190116_001 119.89 115.27 59789000 0 0 0 25934000 0 0 33854000 0 0 0 0 0 0 8645 1510 8084 77451;77452 98648;98649 98648 2 EACITLGHLSSVLGNK Unmodified 1697.8771 0.87705468 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 93.786 93.786 3 0.0031571 95694 QUIQUE_C1403_190116_001 50.608 46.305 14979000 0 0 0 14979000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8646 1060 8085 77453 98650 98650 1 EACITVAHLSTVLGNK Unmodified 1711.8927 0.89270474 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.73 84.73 3 0.00039873 86156 QUIQUE_C1277_190116_001 66.335 62.432 375970000 49048000 75309000 0 0 53303000 26477000 47947000 0 41388000 22239000 60262000 0 0 8647 310;830 8086 77454;77455;77456;77457;77458;77459;77460;77461;77462;77463 98651;98652;98653;98654;98655;98656;98657;98658;98659;98660;98661 98652 11 EACPELDYFVVFSSVSCGR Unmodified 2220.982 0.98199003 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 156.15 156.15 2 0.00011273 161677 QUIQUE_C1368_190116_001 93.823 88.339 138130000 0 0 26736000 0 0 18689000 34692000 0 0 0 0 35162000 22846000 8648 2524 8087 77464;77465;77466;77467;77468 98662;98663;98664;98665;98666 98662 5 EACWTISNITAGNR Unmodified 1591.7413 0.74128948 1587;2604 P52294;O60684;Q5TFJ7 KPNA1;KPNA6 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed;Importin subunit alpha-7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.712 91.712 2 8.5347E-05 95034 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20.888 2 0.0050407 13899 QUIQUE_C1403_190116_001 69.915 61.732 22115000 0 0 0 22115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8654 3410 8092 77510 98713 98713 1 EADESLNFEEQILEAAK Unmodified 1934.9109 0.91091681 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.18 140.18 2 1.4629E-88 136382 QUIQUE_DMIX4_190116_001 208.08 187.95 953480000 0 116470000 130930000 171510000 0 0 0 112160000 101930000 64282000 0 123780000 132420000 8655 4600 8093 77511;77512;77513;77514;77515;77516;77517;77518;77519 98714;98715;98716;98717;98718;98719;98720;98721;98722;98723;98724 98722 11 EADFLGGMECTLGQIVSQR Unmodified 2109.9823 0.98232439 3793 Q96A23;D6RCT2 CPNE4 Copine-4 yes no 0 0 0 1 1 163.17 163.17 2;3 5.9991E-11 166689 QUIQUE_C1403_190116_001 140.08 120.48 30324000 0 21296000 0 9027600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8656 3793 8094 77520;77521 98725;98726 98726 2 EADGEQDEEEKDDGEAK Unmodified 1892.7396 0.73955396 3545 Q8IX12;A0A0C4DGG8;F5H1H2;F5H2E6 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 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98737 9 EADGSETPEPFAAEAK Unmodified 1647.7264 0.7264105 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.475 57.475 2 5.9554E-46 56213 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.58 177.63 1078000000 61328000 82803000 126980000 97018000 74232000 81800000 84112000 77921000 80854000 30010000 105910000 91029000 84001000 8660 3432 8098 77538;77539;77540;77541;77542;77543;77544;77545;77546;77547;77548;77549;77550 98744;98745;98746;98747;98748;98749;98750;98751;98752;98753;98754;98755;98756;98757;98758;98759 98753 15 EADGSLQPLPQR Unmodified 1309.6626 0.66262845 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 43.278 43.278 2 0.011298 41108 QUIQUE_C1218_190116_001 64.841 45.054 28134000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28134000 0 0 8661 3278 8099 77551;77552 98760;98761 98760 2 EADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK Oxidation (M) 2505.0676 0.067570157 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;M0QZ52 CALM2;CALM1;CALM3 yes no 0 1 0 4 4 4 2 2 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0.77548596 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.652 37.652 2 7.377E-104 33275 QUIQUE_C1403_190116_001 214.81 182.29 715840000 85065000 97906000 65561000 82572000 47741000 82776000 62972000 0 37660000 29969000 50149000 22310000 51156000 8672 4522 8108 77763;77764;77765;77766;77767;77768;77769;77770;77771;77772;77773;77774 99084;99085;99086;99087;99088;99089;99090;99091;99092;99093;99094;99095;99096 99087 12 EAEALIER Unmodified 929.48181 0.48181054 3573 Q8N1B4;A0A0G2JIG2 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes no 0 0 0 1 31.396 31.396 2 0.031416 26049 QUIQUE_C1403_190116_001 66.073 15.946 26345000 0 0 0 26345000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8673 3573 8109 77775 99097 99097 1 EAEALLQSMGLTPESPIVPPPMSPSSK Unmodified 2792.3976 0.39761849 858 E7EQL5;E7EV09;E7EQU2;E7ETL8;E9PGG1 DYNC1I2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 148.96 148.96 3 1.7859E-08 151838 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.069 49.14 322570000 0 0 0 0 56904000 0 0 57060000 69869000 0 79352000 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91695 QUIQUE_C1438_190116_001 62.408 51.243 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8676 2651 8111 77800 99136 99136 1 EAEAMALLAEAERK Unmodified 1530.7712 0.77119262 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0QZM9;M0QZN5;M0R031 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 1 2 1 1 92.653 92.653 2;3 0.00036846 95126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.037 50.159 170840000 0 0 0 0 0 0 0 33901000 71250000 0 30702000 0 34989000 8677 2651 8112 77801;77802;77803;77804;77805 99137;99138;99139;99140;99141;99142 99139 6 EAEAQAAMEANSEGSLTRPK Unmodified 2088.9746 0.97459647 828 D6RI11;O14810;D6RAG3 CPLX1 Complexin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 47.61 47.61 3 1.1869E-75 44805 QUIQUE_C1218_190116_001 159.7 139.33 339600000 148780000 77384000 0 68553000 44891000 0 0 0 0 0 0 0 0 8678 828 8113 77806;77807;77808;77809 99143;99144;99145;99146;99147 99143 5 EAEDGIIAYDDCGVK Unmodified 1653.7192 0.71921663 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 75.987 75.987 2 0.0031847 76334 QUIQUE_C1403_190116_001 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EAEESLQQQQQEQEEALK Unmodified 2143.9869 0.9869353 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 55.341 55.341 2 5.683E-46 54073 QUIQUE_C1576_190116_001 225.33 212.7 43227000 0 0 0 0 0 0 43227000 0 0 0 0 0 0 8682 3241 8117 77828 99167 99167 1 EAEFGQGTGPIWLNEVK Unmodified 1873.921 0.92102798 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7;H0YGZ7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 1 1 121.54 121.54 2 1.3537E-22 125296 QUIQUE_C1403_190116_001 184.31 169.75 240310000 0 0 0 129300000 0 0 0 73896000 0 0 0 0 37113000 8683 725 8118 77829;77830;77831 99168;99169;99170;99171;99172;99173 99169 6 EAEGAPQVEAGK Unmodified 1184.5673 0.56733108 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.31 19.31 2 4.9206E-05 12086 QUIQUE_C1438_190116_001 126.39 93.125 1043700000 134630000 207460000 0 0 218090000 164670000 146420000 0 172440000 0 0 0 0 8684 926;889 8119 77832;77833;77834;77835;77836;77837 99174;99175;99176;99177;99178;99179;99180 99176 5 EAEGAPQVEAGKR Unmodified 1340.6684 0.66844211 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 1 1 14.458 14.458 3 0.045051 6360 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.551 26.894 43558000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43558000 0 0 8685 926;889 8120 77838 99181 99181 1 EAEGEQFVEEALEK Unmodified 1606.7362 0.7362469 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 111.91 111.91 2;3 1.4604E-36 116048 QUIQUE_C1368_190116_001 178.67 162.03 882150000 54536000 47363000 190800000 0 92425000 0 65308000 64179000 59593000 0 258160000 49788000 0 8686 1452 8121 77839;77840;77841;77842;77843;77844;77845;77846;77847;77848;77849 99182;99183;99184;99185;99186;99187;99188;99189;99190;99191;99192;99193;99194;99195 99185 13 EAEHHCLLHSPIPVNCPIR Unmodified 2278.1099 0.10992494 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 1 2 1 3 1 1 2 2 1 57.354 57.354 2;3;4;5 7.1995E-55 54789 QUIQUE_C1563_190116_001 206.69 194.33 2884400000 458300000 339450000 0 357810000 255030000 278460000 315390000 150700000 260180000 83353000 0 0 385680000 8687 4297 8122 77850;77851;77852;77853;77854;77855;77856;77857;77858;77859;77860;77861;77862;77863;77864;77865;77866 99196;99197;99198;99199;99200;99201;99202;99203;99204;99205;99206;99207;99208;99209;99210;99211;99212;99213 99206 12 EAEILSVLSHR Unmodified 1252.6776 0.67755023 802 D4Q8H0;C9J3F7;Q9NYL2 pk;ZAK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase MLT yes no 0 0 0 1 1 82.49 82.49 3 0.040131 83593 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.677 14.282 35313000 0 0 0 0 0 0 23126000 0 0 0 0 12187000 0 8688 802 8123 77867;77868 99214;99215 99215 2 EAEISVPYLTSITALVVWLPANPTEK Unmodified 2840.5212 0.52116274 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 173.98 173.98 2;3 5.7528E-17 175350 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.01 107.22 695000000 0 0 0 0 0 0 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77881;77882;77883;77884;77885;77886;77887;77888;77889;77890;77891;77892;77893;77894;77895;77896;77897;77898;77899;77900;77901;77902;77903;77904;77905;77906;77907;77908;77909;77910;77911;77912;77913;77914;77915;77916;77917;77918;77919 99228;99229;99230;99231;99232;99233;99234;99235;99236;99237;99238;99239;99240;99241;99242;99243;99244;99245;99246;99247;99248;99249;99250;99251;99252;99253;99254;99255;99256;99257;99258;99259;99260;99261;99262;99263;99264;99265;99266;99267;99268;99269;99270;99271;99272;99273;99274;99275;99276;99277;99278;99279;99280;99281;99282;99283;99284;99285;99286;99287;99288;99289;99290;99291;99292;99293;99294 99235 67 EAELDKYLECR Unmodified 1424.6606 0.66057954 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 1 1 2 67.531 67.531 2;3 0.013941 68443 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.24 63.522 73372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30919000 0 42453000 8692 2387 8127 77920;77921;77922 99295;99296;99297 99295 3 EAELDVNEELDKK Unmodified 1530.7413 0.74133228 2460 P43034;I3L495 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 1 3 2 2 47.957 47.957 2;3 1.475E-53 45875 QUIQUE_C1218_190116_001 221.5 168.92 2516800000 81183000 104040000 316140000 252270000 110570000 95796000 118360000 95626000 317120000 113280000 334570000 269270000 308570000 8693 2460 8128 77923;77924;77925;77926;77927;77928;77929;77930;77931;77932;77933;77934;77935;77936;77937;77938;77939;77940;77941;77942;77943 99298;99299;99300;99301;99302;99303;99304;99305;99306;99307;99308;99309;99310;99311;99312;99313;99314;99315;99316;99317;99318;99319;99320;99321;99322;99323;99324;99325;99326;99327 99298 28 EAELGTVISQDDLGEEFYR Unmodified 2170.0066 0.0066081055 4675 yes no 0 0 0 1 2 2 13.518 13.518 4 0.0065189 5720 QUIQUE_DMIX5_190116_001 26.808 17.525 445610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84779000 110740000 250090000 + 8694 4675 8129 77944;77945;77946;77947;77948 99328;99329;99330;99331;99332;99333 99328 4 EAELKEAEKELHEK Unmodified 1681.8523 0.85227972 820;594 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99576 3 EAFEETHLTSLDPVK Unmodified 1714.8414 0.84138068 4309 Q9NVS9;J3QQZ9;A0A286YFL3 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 0 2 2 3 1 2 2 2 2 2 1 2 3 1 82.639 82.639 2;3 3.2171E-65 83724 QUIQUE_DMIX7_190116_001 211.26 191.13 6302800000 453750000 575160000 684070000 202600000 599630000 563090000 549390000 499040000 414450000 133160000 699400000 543600000 385480000 8715 4309 8149 78134;78135;78136;78137;78138;78139;78140;78141;78142;78143;78144;78145;78146;78147;78148;78149;78150;78151;78152;78153;78154;78155;78156;78157;78158 99579;99580;99581;99582;99583;99584;99585;99586;99587;99588;99589;99590;99591;99592;99593;99594;99595;99596;99597;99598;99599;99600;99601;99602;99603;99604;99605;99606;99607;99608 99607 29 EAFEISK Unmodified 822.41233 0.41233399 2891 Q04917;A2IDB2 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 0 1 1 1 33.238 33.238 2 0.02614 28873 QUIQUE_C1576_190116_001 94.539 39.968 1705900000 0 0 499120000 0 0 0 736380000 0 470380000 0 0 0 0 8716 2891 8150 78159;78160;78161 99609;99610;99611 99610 3 EAFLEQFRK Unmodified 1166.6084 0.60840804 2209 P23258 TUBG1 Tubulin gamma-1 chain yes yes 0 0 1 1 60.902 60.902 3 0.026262 59380 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.424 24.136 13634000 0 0 0 0 0 0 0 13634000 0 0 0 0 0 8717 2209 8151 78162 99612 99612 1 EAFLNTEDK Unmodified 1065.4979 0.49785453 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.362 37.362 2 0.00022207 32954 QUIQUE_C1277_190116_001 138.78 122.45 859400000 121630000 105460000 101670000 101230000 70167000 105370000 93628000 0 45713000 67531000 0 47008000 0 8718 267;275;3025 8152 78163;78164;78165;78166;78167;78168;78169;78170;78171;78172 99613;99614;99615;99616;99617;99618;99619;99620;99621;99622 99614 7 EAFLNTEDKGDSLDSVEALIK Unmodified 2293.1325 0.1325369 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 3 2 2 2 3 3 2 1 3 2 2 129.19 129.19 2;3 4.5474E-145 135175 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267;275;3025 8154 78202;78203 99675;99676;99677 99676 3 EAFLQEVWK Unmodified 1148.5866 0.58660996 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.37 109.37 2 0.00041479 112174 QUIQUE_C1403_190116_001 122.74 82.474 490230000 46615000 66369000 0 53323000 46870000 39193000 52537000 63699000 52481000 24003000 0 0 45140000 8721 2254 8155 78204;78205;78206;78207;78208;78209;78210;78211;78212;78213 99678;99679;99680;99681;99682;99683;99684;99685;99686;99687;99688;99689 99680 9 EAFNEFQK Unmodified 1011.4662 0.46616048 3782 Q93100;I3L1N3 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes no 0 0 0 1 1 41.56 41.56 2 0.042156 37319 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.098 44.949 31786000 0 0 0 0 31786000 0 0 0 0 0 0 0 0 8722 3782 8156 78214;78215 99690;99691 99691 2 EAFNMIDQNR Oxidation (M) 1252.5506 0.55063516 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 1 0 1 1 2 2 1 1 1 1 36.119 36.119 2 0.0018017 30905 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.668 75.968 360180000 30460000 47178000 0 0 0 0 61683000 0 74196000 19495000 53817000 39556000 33793000 8723 1303;2234 8157 78216;78217;78218;78219;78220;78221;78222;78223;78224;78225 99692;99693;99694;99695;99696;99697;99698;99699;99700;99701;99702;99703;99704;99705 99701 744 14 EAFNMIDQNR Unmodified 1236.5557 0.55572054 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;J3KTJ1;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.934 59.934 2 1.7941E-05 58595 QUIQUE_C1403_190116_001 147.29 118.87 1396500000 0 0 282530000 223990000 0 187280000 195030000 89554000 0 0 226060000 0 192040000 8724 1303;2234 8157 78226;78227;78228;78229;78230;78231;78232;78233;78234;78235 99706;99707;99708;99709;99710;99711;99712;99713;99714;99715 99709 10 EAFPVGPEPGPPGGR Unmodified 1462.7205 0.72047768 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 68.529 68.529 2 0.0098069 69634 QUIQUE_C1438_190116_001 53.967 36.102 38242000 0 0 0 0 38242000 0 0 0 0 0 0 0 0 8725 730 8158 78236 99716 99716 1 EAFQALEK Unmodified 934.476 0.47599688 2943 Q12792;F8VS81 TWF1 Twinfilin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 38.818 38.818 2 0.01606 34942 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.753 29.874 473460000 0 0 0 0 124900000 0 0 0 145470000 56519000 0 146570000 0 8726 2943 8159 78237;78238;78239;78240 99717;99718;99719;99720 99718 4 EAFQLFDR Unmodified 1024.4978 0.49779495 1048 F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;G3V1Y7 MYL6 Myosin light polypeptide 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 90.462 90.462 1;2 0.0065537 91317 QUIQUE_C1563_190116_001 101.33 64.626 2412300000 303860000 361500000 370520000 0 342650000 240180000 0 155830000 0 73495000 331950000 232310000 0 8727 1048 8160 78241;78242;78243;78244;78245;78246;78247;78248;78249;78250 99721;99722;99723;99724;99725;99726;99727;99728;99729;99730 99725 5 EAFQNAYLELGGLGER Unmodified 1765.8635 0.8635131 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733 ATP1A3;ATP1A4 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 127.14 127.14 2;3 1.7255E-09 131496 QUIQUE_C1368_190116_001 127.56 116.95 1095000000 136080000 116100000 241020000 133540000 0 148510000 135590000 0 60326000 42287000 0 0 81519000 8728 1371 8161 78251;78252;78253;78254;78255;78256;78257;78258;78259;78260;78261 99731;99732;99733;99734;99735;99736;99737;99738;99739;99740;99741 99733 9 EAFQSVVLPAFEK Unmodified 1463.766 0.76603089 3379 Q6P2E9;I3L2F4 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes no 0 0 0 1 117.14 117.14 2 0.057201 120902 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.243 28.55 29132000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29132000 0 8729 3379 8162 78262 99742 99742 1 EAFSLFDK Unmodified 955.4651 0.46509784 1128 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100026;100027;100028;100029;100030;100031;100032;100033;100034;100035;100036;100037;100038;100039;100040;100041;100042;100043;100044;100045;100046;100047;100048;100049;100050;100051;100052;100053;100054;100055;100056;100057;100058;100059;100060 100031 32 EAGGIDLFVGGIGPDGHIAFNEPGSSLVSR Unmodified 2967.4726 0.47264942 3685 Q8TDQ7 GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.93 146.93 3 2.3215E-63 153553 QUIQUE_C1438_190116_001 141.49 129.86 778680000 69568000 72765000 0 68647000 86320000 65728000 78598000 0 0 45134000 118370000 99131000 74415000 8749 3685 8182 78487;78488;78489;78490;78491;78492;78493;78494;78495;78496;78497;78498 100061;100062;100063;100064;100065;100066;100067;100068;100069;100070;100071;100072;100073;100074 100066 13 EAGLAHLCEFIEDCEHTVLATK Unmodified 2542.1832 0.18320904 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 142.08 142.08 4 0.03226 149075 QUIQUE_C1438_190116_001 24.896 13.752 19479000 0 0 0 0 19479000 0 0 0 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100148;100149;100150;100151;100152;100153;100154;100155;100156;100157;100158 100157 11 EAHQLFLEPEVLDPESVELK Unmodified 2321.1791 0.17909316 2420 P39748;I3L3E9 FEN1 Flap endonuclease 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 131.27 131.27 3 1.1645E-06 134200 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.574 82.92 165220000 56604000 0 36713000 0 27328000 0 0 44575000 0 0 0 0 0 8764 2420 8196 78578;78579;78580;78581;78582 100159;100160;100161;100162;100163 100163 5 EAHSDENPSEGDGAVNKEEK Unmodified 2140.9145 0.91449863 4354 Q9NZN5;E9PMR6 ARHGEF12 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 yes no 0 0 1 1 2 1 1 11.127 11.127 3;4 7.2383E-07 3737 QUIQUE_C1438_190116_001 95.205 90.019 30174000 0 0 5200500 0 14275000 0 4569200 0 0 0 0 0 6129800 8765 4354 8197 78583;78584;78585;78586;78587 100164;100165;100166;100167;100168 100166 5 EAIAELER Unmodified 929.48181 0.48181054 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.265 39.265 2 0.0036393 35451 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.18 16.506 4671200000 259230000 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Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.5 114.5 3 3.3846E-05 118192 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.575 74.211 746780000 65418000 0 71223000 66550000 75950000 59681000 64563000 47661000 73179000 19280000 94760000 49701000 58811000 8769 3766 8201 78606;78607;78608;78609;78610;78611;78612;78613;78614;78615;78616;78617 100188;100189;100190;100191;100192;100193;100194;100195;100196;100197;100198;100199;100200;100201 100197 12 EAIDSYIK Unmodified 937.47566 0.47566253 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.867 51.867 2 0.013433 49337 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.323 33.613 7012700000 1197000000 0 762980000 0 0 578040000 0 953400000 608530000 441790000 872420000 873910000 724630000 8770 50 8202 78618;78619;78620;78621;78622;78623;78624;78625;78626 100202;100203;100204;100205;100206;100207;100208;100209;100210 100210 5 EAIENATTNAEVLR Unmodified 1529.7686 0.76855009 980 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alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 3 1 2 1 2 173.05 173.05 2;3;4 1.6787E-143 178148 QUIQUE_C1576_190116_001 259.98 242.27 6544400000 243570000 514740000 1323100000 303920000 109230000 0 643710000 432950000 1386700000 9034400 903800000 20817000 652800000 8773 2778 8205 78642;78643;78644;78645;78646;78647;78648;78649;78650;78651;78652;78653;78654;78655;78656;78657;78658;78659;78660;78661;78662;78663;78664;78665 100226;100227;100228;100229;100230;100231;100232;100233;100234;100235;100236;100237;100238;100239;100240;100241;100242;100243;100244;100245;100246;100247;100248;100249;100250;100251 100238 20 EAIETIVAAMSNLVPPVELANPENQFR Oxidation (M) 2967.5012 0.50117236 2778 P63092;Q5JWF2;S4R3E3;Q5JWE9;H0Y7F4;S4R3V9 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 1 0 1 1 154.3 154.3 3 3.1541E-08 156475 QUIQUE_C1563_190116_001 58.812 46.616 80851000 0 0 43116000 0 0 37735000 0 0 0 0 0 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78671;78672;78673;78674;78675;78676;78677;78678;78679;78680;78681;78682;78683;78684;78685;78686;78687;78688;78689;78690;78691;78692;78693;78694;78695;78696;78697;78698;78699;78700;78701;78702;78703;78704;78705;78706;78707;78708;78709;78710;78711;78712;78713;78714;78715;78716;78717;78718 100257;100258;100259;100260;100261;100262;100263;100264;100265;100266;100267;100268;100269;100270;100271;100272;100273;100274;100275;100276;100277;100278;100279;100280;100281;100282;100283;100284;100285;100286;100287;100288;100289;100290;100291;100292;100293;100294;100295;100296;100297;100298;100299;100300;100301;100302;100303;100304;100305;100306;100307;100308;100309;100310;100311 100306 46 EAIHSQLLEK Unmodified 1166.6295 0.62953741 837 E5RGS4;O60925 PFDN1 Prefoldin subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 26.602 26.602 2 0.003187 21340 QUIQUE_C1218_190116_001 85.733 40.752 268290000 80457000 0 51555000 0 0 38973000 59127000 0 0 0 0 0 38180000 8777 837 8208 78719;78720;78721;78722;78723 100312;100313;100314;100315;100316 100312 5 EAIINLATQPK Unmodified 1196.6765 0.6764876 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 65.664 65.664 2 0.003288 65543 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.267 48.374 105500000 0 0 0 0 46570000 0 0 0 58933000 0 0 0 0 8778 2101 8209 78724;78725;78726 100317;100318;100319 100318 3 EAIIPGSVYDR Unmodified 1218.6245 0.62445203 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 2 70.832 70.832 2 0.010392 66853 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.062 38.892 13830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13830000 0 0 0 8779 3766 8210 78727;78728;78729 100320;100321;100322 100322 2 EAILAIHK Unmodified 893.53345 0.53345218 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 1 1 1 26.873 26.873 2 0.012898 21146 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.029 56.093 1106500000 0 0 0 0 0 354300000 0 0 373220000 0 0 378970000 0 8780 1228;1544 8211 78730;78731;78732 100323;100324;100325 100324 3 EAILDIITSR Unmodified 1129.6343 0.63428844 1936;845 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EALAQCVLAEIPQQVVGYFNTYK Unmodified 2640.3258 0.32577417 1611 O75131 CPNE3 Copine-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 169.84 169.84 2;3 2.6223E-63 174602 QUIQUE_C1368_190116_001 215.23 196.77 3808700000 144090000 137160000 309530000 99985000 223760000 217390000 495550000 431160000 701600000 22161000 287850000 260390000 478020000 8801 1611 8231 78943;78944;78945;78946;78947;78948;78949;78950;78951;78952;78953;78954;78955;78956;78957;78958;78959;78960;78961;78962;78963;78964;78965 100600;100601;100602;100603;100604;100605;100606;100607;100608;100609;100610;100611;100612;100613;100614;100615;100616;100617;100618;100619;100620;100621;100622 100605 22 EALAQTVLAEVPTQLVSYFR Unmodified 2234.1947 0.19468365 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;A6PVH9 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.7 168.7 2;3 3.9815E-101 173692 QUIQUE_C1368_190116_001 268.9 248.43 2298500000 45826000 138890000 215640000 125220000 205120000 193030000 248820000 103420000 254130000 31415000 183090000 301080000 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100666;100667;100668;100669;100670;100671;100672;100673;100674;100675;100676;100677;100678;100679;100680;100681;100682;100683;100684;100685;100686;100687;100688;100689;100690;100691;100692;100693;100694;100695;100696;100697;100698;100699;100700;100701;100702;100703;100704;100705;100706;100707;100708;100709;100710;100711;100712;100713;100714;100715;100716;100717;100718 100670 53 EALDSDGWLHTGDIGK Unmodified 1712.8006 0.8005785 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 90.442 90.442 2;3 4.1345E-06 93423 QUIQUE_C1218_190116_001 79.346 72.307 145200000 45382000 33998000 41674000 0 0 0 0 0 0 24147000 0 0 0 8807 4476 8237 79029;79030;79031;79032;79033;79034;79035;79036 100719;100720;100721;100722;100723;100724;100725;100726 100719 7 EALDVLGAVLK Unmodified 1126.6598 0.6597749 1104 G5EA06;Q92552;D6RH20 MRPS27 28S ribosomal protein S27, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 128.34 128.34 2 0.0020066 134010 QUIQUE_C1218_190116_001 97.635 53.827 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100916;100917;100918;100919;100920;100921;100922;100923;100924;100925;100926;100927;100928 100919 10 EALMAHGLGNR Oxidation (M) 1183.5768 0.57679033 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 1 0 1 1 1 19.072 19.072 2;3 0.021315 11672 QUIQUE_C1563_190116_001 41.704 35.268 146420000 0 42021000 0 0 0 44927000 0 0 59472000 0 0 0 0 8832 2061 8261 79209;79210;79211 100929;100930;100931 100930 3 EALMTELSTVK Unmodified 1220.6322 0.63223953 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 83.489 83.489 2 0.0060393 86011 QUIQUE_C1438_190116_001 76.943 46.256 31617000 0 31617000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8833 3108 8262 79212;79213;79214;79215 100932;100933;100934;100935 100934 3 EALNIIGDISTSTVSTPVPPPVDDTWLQSASSHSPTPQR Unmodified 4100.0338 0.033832494 2569 P50570;K7ENE7 DNM2 Dynamin-2 yes no 0 0 0 2 148.03 148.03 4 0.00032551 155576 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.639 26.235 87731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87731000 0 0 8834 2569 8263 79216;79217 100936;100937 100936 0 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100980;100981;100982;100983;100984;100985;100986;100987;100988;100989;100990;100991;100992;100993;100994;100995;100996;100997 100980 17 EALPGSGQAR Unmodified 984.49886 0.49885759 3881 Q96IU4;F8W9U3;B4DQI4 ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.81 18.81 2 0.00592 11231 QUIQUE_C1368_190116_001 75.825 54.054 1643100000 188960000 166300000 237770000 184190000 0 0 0 184880000 0 0 261720000 163260000 256040000 8842 3881 8270 79269;79270;79271;79272;79273;79274;79275;79276 100998;100999;101000;101001;101002;101003;101004;101005;101006 101000 7 EALPTWDK Unmodified 958.476 0.47599688 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 55.185 55.185 2 0.021461 54794 QUIQUE_C1438_190116_001 75.109 42.639 85580000 0 0 0 0 85580000 0 0 0 0 0 0 0 0 8843 824 8271 79277 101007 101007 1 EALQDVEDENQ Unmodified 1288.5419 0.54190419 2745 P62258;I3L0W5 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.754 56.754 2 0.00048107 54550 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.69 86.955 12483000000 1239900000 1351200000 1190500000 1267600000 882530000 1541900000 1101800000 316120000 695540000 659590000 776950000 655760000 804100000 8844 2745 8272 79278;79279;79280;79281;79282;79283;79284;79285;79286;79287;79288;79289;79290 101008;101009;101010;101011;101012;101013;101014;101015;101016;101017;101018;101019;101020;101021;101022;101023 101018 15 EALQLMATYLPK Unmodified 1376.7374 0.7373733 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 124.12 124.12 2 0.00053075 129628 QUIQUE_C1576_190116_001 99.973 81.637 761780000 56310000 84994000 65817000 92596000 71094000 54126000 68285000 54724000 49490000 0 0 77187000 87152000 8845 3954 8273 79291;79292;79293;79294;79295;79296;79297;79298;79299;79300;79301;79302;79303 101024;101025;101026;101027;101028;101029;101030;101031;101032;101033;101034;101035;101036;101037 101031 14 EALQLWSALQLK Unmodified 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101051;101052;101053;101054;101055;101056;101057;101058;101059;101060;101061;101062;101063;101064;101065 101064 13 EALQSDWLPFELLASGGQK Unmodified 2088.0528 0.052770437 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 163.32 163.32 2;3 1.0973E-99 167832 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.15 164.47 1958800000 138250000 172970000 167240000 170660000 172260000 91677000 183930000 118730000 144160000 49705000 171640000 246550000 131070000 8848 4088 8276 79329;79330;79331;79332;79333;79334;79335;79336;79337;79338;79339;79340;79341;79342;79343;79344;79345;79346;79347;79348;79349;79350 101066;101067;101068;101069;101070;101071;101072;101073;101074;101075;101076;101077;101078;101079;101080;101081;101082;101083;101084;101085;101086;101087;101088;101089;101090;101091;101092;101093;101094;101095;101096;101097 101088 32 EALSAVLPR Unmodified 954.54983 0.54983053 1402 O00408;F5H3Z7;F5H130;F5H5P8 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 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79361;79362;79363;79364;79365;79366;79367;79368;79369;79370;79371;79372;79373;79374;79375;79376;79377 101109;101110;101111;101112;101113;101114;101115;101116;101117;101118;101119;101120;101121;101122;101123;101124;101125;101126;101127;101128;101129;101130 101111 21 EALSTATVQAAER Unmodified 1345.6838 0.68375782 3428 Q709C8;A0A3B3IT88 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 46.733 46.733 2 0.0041067 44260 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.942 50.04 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8852 3428 8280 79378 101131 101131 1 EALTYDGALLGDR Unmodified 1392.6885 0.68850885 3106 Q15056 EIF4H Eukaryotic translation initiation factor 4H yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 91.666 91.666 2 2.8772E-07 93912 QUIQUE_C1277_190116_001 156.48 125.06 3418800000 460420000 412550000 441920000 397130000 353220000 407280000 439270000 0 0 171640000 335410000 0 0 8853 3106 8281 79379;79380;79381;79382;79383;79384;79385;79386;79387;79388 101132;101133;101134;101135;101136;101137;101138;101139;101140;101141;101142;101143 101134 8 EALVSVWLQCTAISR Unmodified 1731.8978 0.89779012 2113 P16870;H0YAM0 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 0 1 139.88 139.88 2 0.0003901 135960 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.324 58.697 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8854 2113 8282 79389 101144 101144 1 EAMDPIAELLSQLSGVR Oxidation (M) 1843.935 0.93496349 4366 Q9P0J7 KCMF1 E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1 yes yes 0 1 0 1 1 1 171.14 171.14 2 2.4995E-22 174575 QUIQUE_C1277_190116_001 142.08 120.38 59010000 0 31793000 0 11685000 0 0 0 15531000 0 0 0 0 0 8855 4366 8283 79390;79391;79392 101145;101146;101147 101145 2922 3 EAMDPIAELLSQLSGVR Unmodified 1827.94 0.94004887 4366 Q9P0J7 KCMF1 E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 173.55 173.55 2;3 5.7466E-63 175024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 189.3 166.58 222570000 0 34561000 0 19661000 24340000 0 0 29600000 24477000 4054200 45946000 39926000 0 8856 4366 8283 79393;79394;79395;79396;79397;79398;79399;79400;79401 101148;101149;101150;101151;101152;101153;101154;101155;101156 101151 9 EAMECSDVIWQR Oxidation (M) 1538.6494 0.64936293 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 1 0 1 64.577 64.577 2 0.019401 63836 QUIQUE_C1277_190116_001 75.294 69.191 19879000 0 19879000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8857 4281 8284 79402 101157 101157 0 EAMECSDVIWQR Unmodified 1522.6544 0.65444831 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 81.067 81.067 2 0.017649 81772 QUIQUE_C1403_190116_001 70.908 43.794 151020000 0 0 0 56866000 0 35022000 59135000 0 0 0 0 0 0 8858 4281 8284 79403;79404;79405 101158;101159;101160 101158 2 EAMEDGEIDGNK Oxidation (M) 1322.5296 0.52962495 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.021 17.021 2 7.4797E-05 9416 QUIQUE_DMIX5_190116_001 124.81 113.32 420330000 38454000 32389000 26622000 31551000 44211000 44615000 28376000 19123000 36953000 0 39876000 32806000 45349000 8859 2145 8285 79406;79407;79408;79409;79410;79411;79412;79413;79414;79415;79416;79417 101161;101162;101163;101164;101165;101166;101167;101168;101169;101170;101171;101172;101173;101174;101175;101176 101174 1488 16 EAMEDGEIDGNK Unmodified 1306.5347 0.53471033 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.453 28.453 2 0.00045647 22310 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.86 103.87 854960000 128500000 83562000 55943000 82446000 82066000 90929000 90608000 33037000 0 35400000 62152000 49180000 61136000 8860 2145 8285 79418;79419;79420;79421;79422;79423;79424;79425;79426;79427;79428;79429 101177;101178;101179;101180;101181;101182;101183;101184;101185;101186;101187;101188;101189 101185 8 EAMEDGEIDGNKVTLDWAKPK Unmodified 2345.1209 0.12092636 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 0 2 1 1 1 84.469 84.469 3;4 0.00064504 85345 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.117 46.314 277040000 0 0 0 0 0 0 0 82766000 85956000 0 0 108320000 0 8861 2145 8286 79430;79431;79432 101190;101191;101192 101190 3 EAMEHPYFYTVVK Unmodified 1612.7596 0.7595653 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A087WY74 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.13 73.13 2 0.00023168 73628 QUIQUE_C1368_190116_001 123.62 101.63 168900000 0 74075000 30739000 0 0 21915000 0 0 0 0 42171000 0 0 8862 456 8287 79433;79434;79435;79436 101193;101194;101195;101196;101197 101195 5 EAMGIYISTLK Unmodified 1224.6424 0.64241028 1730 O95433;G3V438;H0YJU2;H0YJG7 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.549 92.549 2 0.0067314 93814 QUIQUE_C1563_190116_001 97.456 87.17 876840000 95690000 0 0 0 103920000 104840000 124840000 0 112740000 0 130430000 88642000 115740000 8863 1730 8288 79437;79438;79439;79440;79441;79442;79443;79444 101198;101199;101200;101201;101202;101203;101204;101205 101200 0 EAMSAYNSHEEGR Unmodified 1479.6049 0.60485558 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 17.55 17.55 2;3 0.00054638 10453 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.441 78.132 131760000 37730000 21292000 21836000 17390000 0 0 0 15430000 0 18079000 0 0 0 8864 2377 8289 79445;79446;79447;79448;79449;79450 101206;101207;101208;101209;101210;101211 101210 6 EAMTDIITLFGLSSNSK Unmodified 1825.9132 0.91316541 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 162.93 162.93 2 0.010031 164952 QUIQUE_C1563_190116_001 53.448 31.89 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8865 2562 8290 79451 101212 101212 1 EANALAAGHPAQAVAINAR Unmodified 1843.9653 0.96529283 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 46.472 46.472 2;3 3.2311E-101 43978 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.42 197.05 1757100000 0 0 518260000 0 95624000 313620000 721170000 0 0 67018000 41368000 0 0 8866 1472 8291 79452;79453;79454;79455;79456;79457;79458 101213;101214;101215;101216;101217;101218;101219 101219 7 EANEILQR Unmodified 971.50361 0.50360861 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5;C9K0R9;A0A3B3IRL5;C9J381;P20839 IMPDH2;IMPDH1 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2;Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase;Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 1 yes no 0 0 0 1 1 27.092 27.092 2 0.015753 20898 QUIQUE_C1576_190116_001 84.244 44.141 133490000 0 0 0 0 0 0 91493000 0 0 42000000 0 0 0 8867 2040 8292 79459;79460 101220;101221 101220 1 EANELQQWINEK Unmodified 1500.7209 0.72087161 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.241 99.241 2 1.2388E-92 101602 QUIQUE_DMIX1_190116_001 235.01 213.55 24157000000 1604700000 1813700000 1781500000 1697100000 2129800000 1468900000 2087200000 1839000000 2240500000 759610000 2475100000 2075700000 2184200000 8868 267;275;3025 8293 79461;79462;79463;79464;79465;79466;79467;79468;79469;79470;79471;79472;79473 101222;101223;101224;101225;101226;101227;101228;101229;101230;101231;101232;101233;101234;101235;101236;101237;101238;101239;101240;101241;101242;101243;101244;101245;101246;101247;101248;101249;101250;101251;101252;101253 101240 32 EANFDINQLYDCNWVVVNCSTPGNFFHVLR Unmodified 3627.6664 0.66635698 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 162.86 162.86 3 2.6912E-54 170390 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.03 128.04 219900000 0 0 0 0 0 0 0 0 37692000 0 54084000 128130000 0 8869 903;2869 8294 79474;79475;79476 101254;101255;101256;101257 101256 4 EANFTVSSMHGDMPQK Unmodified 1777.7764 0.77635436 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 53.946 53.946 2;3 5.6706E-30 52287 QUIQUE_C1277_190116_001 166.48 148.81 446660000 0 97163000 58067000 63510000 0 0 46277000 35680000 0 0 67771000 28268000 49926000 8870 2416 8295 79477;79478;79479;79480;79481;79482;79483;79484;79485;79486;79487 101258;101259;101260;101261;101262;101263;101264;101265;101266;101267;101268 101260 11 EANGLPIMESNCFDPSK Unmodified 1907.8393 0.83934854 4319 Q9NX14 NDUFB11 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 106.63 106.63 2 0.00036341 110277 QUIQUE_C1218_190116_001 83.474 69.665 25405000 25405000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8871 4319 8296 79488 101269 101269 1 EANHNVSAPYGR Unmodified 1313.6113 0.61126158 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 15.922 15.922 2;3 3.6475E-14 8334 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.48 147.71 1300000000 32445000 45796000 0 45841000 57169000 27869000 180290000 184850000 221520000 16617000 71431000 215000000 201130000 8872 292;882;3442 8297 79489;79490;79491;79492;79493;79494;79495;79496;79497;79498;79499;79500;79501;79502;79503;79504;79505 101270;101271;101272;101273;101274;101275;101276;101277;101278;101279;101280;101281;101282;101283;101284;101285;101286;101287 101280 18 EANIQAVDSEVGLTK Unmodified 1572.7995 0.79951586 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 77.325 77.325 2 0.0093755 78891 QUIQUE_C1218_190116_001 70.089 59.857 96041000 96041000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8873 4145 8298 79506 101288 101288 1 EANKQQNFNTGIK Unmodified 1490.7478 0.74775506 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 17.966 17.966 2 0.041493 10513 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.439 33.875 22192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22192000 0 0 8874 267;275;3025 8299 79507 101289 101289 1 EANLAAIIER Unmodified 1098.6033 0.60332266 838 E5RGX5;Q93045 STMN2 Stathmin;Stathmin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.866 84.866 2 0.008683 86404 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.349 34.158 226550000 0 31616000 23457000 22481000 21563000 0 28838000 19474000 0 0 30538000 21729000 26859000 8875 838 8300 79508;79509;79510;79511;79512;79513;79514;79515;79516 101290;101291;101292;101293;101294;101295;101296;101297;101298 101295 8 EANLAASFGK Unmodified 1006.5084 0.50835964 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.077 47.077 2 0.00017251 44919 QUIQUE_C1438_190116_001 120.12 60.914 6144500000 517860000 381660000 565390000 396130000 449070000 462670000 490270000 409090000 493930000 183280000 659540000 486190000 649390000 8876 1971 8301 79517;79518;79519;79520;79521;79522;79523;79524;79525;79526;79527;79528;79529 101299;101300;101301;101302;101303;101304;101305;101306;101307;101308;101309;101310;101311;101312;101313;101314 101305 15 EANLLNAVIVQR Unmodified 1338.7619 0.76194857 4516 Q9UNZ2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 102.13 102.13 2;3 3.1553E-07 104601 QUIQUE_C1403_190116_001 176.38 157.4 2217700000 202040000 180460000 127780000 135550000 200570000 160620000 174440000 195920000 168200000 49932000 231970000 164910000 225310000 8877 4516 8302 79530;79531;79532;79533;79534;79535;79536;79537;79538;79539;79540;79541;79542;79543;79544 101315;101316;101317;101318;101319;101320;101321;101322;101323;101324;101325;101326;101327;101328;101329;101330;101331 101319 16 EANLQALIATGGDINAAIER Unmodified 2039.0647 0.064732107 4433;4503;4272 Q9UHD9;Q9UMX0;Q9NRR5 UBQLN2;UBQLN1;UBQLN4 Ubiquilin-2;Ubiquilin-1;Ubiquilin-4 no no 0 0 0 1 142.39 142.39 2 0.0054714 138329 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.092 54.767 16020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16020000 0 0 0 8878 4433;4503;4272 8303 79545 101332 101332 1 EANMPLPGYK Oxidation (M) 1134.5379 0.53794521 181 A0A0A0MSQ0;P13797;U3KQI3 PLS3 Plastin-3 yes no 0 1 0 1 31.371 31.371 2 0.060166 26257 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.574 28.792 31942000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31942000 0 8879 181 8304 79546 101333 101333 1 EANQQQQFNR Unmodified 1261.58 0.57996145 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.589 14.589 2 3.2949E-23 6164 QUIQUE_C1563_190116_001 190.93 143.84 907520000 11235000 30164000 0 13031000 0 25418000 0 122240000 36045000 654680000 0 14710000 0 8880 267;275;3025 8305 79547;79548;79549;79550;79551;79552;79553;79554 101334;101335;101336;101337;101338;101339;101340;101341 101337 8 EANSIIITPGYGLCAAK Unmodified 1776.908 0.90802046 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.01 101.01 2 6.2203E-05 105046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.95 108.98 757230000 137120000 0 114830000 94504000 0 81982000 99080000 0 116260000 0 113460000 0 0 8881 2993 8306 79555;79556;79557;79558;79559;79560;79561;79562 101342;101343;101344;101345;101346;101347;101348;101349;101350 101349 9 EAPAEGEAAEPGSPTAAEGEAASAASSTSSPK Unmodified 2914.2952 0.29519815 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 5 4 2 3 2 2 2 3 3 4 2 2 2 70.796 70.796 2;3;4 0 71819 QUIQUE_C1218_190116_001 304.51 299.46 15473000000 1425600000 1841900000 811090000 1497700000 1301400000 1155900000 1212800000 731340000 1443600000 476410000 1084800000 1017300000 1473500000 8882 2293 8307 79563;79564;79565;79566;79567;79568;79569;79570;79571;79572;79573;79574;79575;79576;79577;79578;79579;79580;79581;79582;79583;79584;79585;79586;79587;79588;79589;79590;79591;79592;79593;79594;79595;79596;79597;79598 101351;101352;101353;101354;101355;101356;101357;101358;101359;101360;101361;101362;101363;101364;101365;101366;101367;101368;101369;101370;101371;101372;101373;101374;101375;101376;101377;101378;101379;101380;101381;101382;101383;101384;101385;101386;101387;101388;101389;101390;101391;101392;101393;101394;101395;101396;101397;101398;101399;101400;101401;101402;101403;101404;101405;101406;101407;101408;101409;101410;101411;101412;101413;101414;101415;101416;101417;101418;101419 101355 69 EAPCVLIYIPDGHTK Unmodified 1711.8603 0.86034198 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 93.691 93.691 3 0.014447 95508 QUIQUE_C1277_190116_001 26.89 16.832 1001300000 0 582970000 0 0 0 418300000 0 0 0 0 0 0 0 8883 1929 8308 79599;79600 101420;101421;101422 101421 3 EAPDGCPDHVLR Unmodified 1364.6143 0.61429805 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 26.113 26.113 2;3 9.1689E-06 19850 QUIQUE_C1368_190116_001 131.52 106.66 4121800000 488350000 357830000 283830000 453810000 448200000 412770000 426760000 68403000 225120000 122610000 346400000 259310000 228450000 8884 4393;697 8309 79601;79602;79603;79604;79605;79606;79607;79608;79609;79610;79611;79612;79613;79614;79615;79616;79617;79618;79619;79620;79621;79622;79623;79624 101423;101424;101425;101426;101427;101428;101429;101430;101431;101432;101433;101434;101435;101436;101437;101438;101439;101440;101441;101442;101443;101444;101445;101446;101447;101448;101449;101450;101451;101452;101453;101454;101455;101456;101457;101458;101459;101460;101461 101429 39 EAPDSLPEFTVQMGNLR Unmodified 1902.9146 0.9145624 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 128.58 128.58 2 0.003353 132818 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.57 33.452 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8885 1510 8310 79625 101462 101462 1 EAPEDIQDLMDIFGDR Unmodified 1862.8356 0.83564337 1103 G5E9W9;Q9NUV9 GIMAP4 GTPase IMAP family member 4 yes no 0 0 0 2 1 165.86 165.86 2 0.00023566 170817 QUIQUE_C1368_190116_001 108.59 97.062 54908000 0 0 35674000 19234000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8886 1103 8311 79626;79627;79628 101463;101464;101465 101463 3 EAPEPMELDGPK Unmodified 1311.6017 0.60166768 2444 P42224;J3KPM9;H7BZB5 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 55.886 55.886 2 0.020495 55170 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.595 50.393 246300000 0 0 130560000 0 0 0 0 0 0 0 115730000 0 0 8887 2444 8312 79629;79630 101466;101467 101467 0 EAPEPMELDGPK Oxidation (M) 1327.5966 0.5965823 2444 P42224;J3KPM9;H7BZB5 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 1 0 1 1 36.2 36.2 2 0.036578 32137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.785 31.35 132420000 0 0 0 0 0 0 0 0 47557000 0 84868000 0 0 8888 2444 8312 79631;79632 101468;101469 101468 2 EAPFVPVGIAGFAAIVAYGLYK Unmodified 2252.2245 0.22452721 708 C9JAW5;C9JNU6;Q9Y241 HIGD1A HIG1 domain family member 1A, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 174.76 174.76 2;3 1.5203E-05 178670 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.412 76.448 477440000 24205000 0 0 0 0 3114900 0 0 60597000 0 234730000 127520000 27269000 8889 708 8313 79633;79634;79635;79636;79637;79638;79639 101470;101471;101472;101473;101474;101475;101476;101477;101478 101473 9 EAPGMALAMLMGSLNVTPLGMLSR Oxidation (M) 2475.2358 0.23577866 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 1 0 1 2 1 172.36 172.36 2;3 8.0697E-18 173959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.67 88.109 126960000 0 19430000 0 0 0 0 0 82217000 0 0 0 0 25312000 8890 998 8314 79640;79641;79642;79643 101479;101480;101481;101482 101481 598 4 EAPGMALAMLMGSLNVTPLGMLSR Unmodified 2459.2409 0.24086403 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 175.45 175.45 2;3 7.0184E-13 182505 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.91 126.99 192400000 0 0 0 0 0 0 5648400 32829000 45027000 0 102370000 6534100 0 8891 998 8314 79644;79645;79646;79647;79648;79649;79650;79651 101483;101484;101485;101486;101487;101488;101489;101490;101491 101490 9 EAPLPFILLGGSEK Unmodified 1469.813 0.81298108 439 A0A2R8Y661;A0A2R8YGD3;Q9Y4G8;H0Y8N8 RAPGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 141.43 141.43 2 0.010906 148660 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.452 37.141 25908000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25908000 0 0 8892 439 8315 79652;79653 101492;101493 101492 2 EAPNPIHLTVDTSLQNGR Unmodified 1960.9967 0.99665254 1396 O00303 EIF3F Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 79.11 79.11 3 9.6745E-05 79844 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.658 53.088 252590000 0 33408000 0 0 39782000 0 45953000 42799000 0 0 47823000 42829000 0 8893 1396 8316 79654;79655;79656;79657;79658;79659 101494;101495;101496;101497;101498;101499 101497 5 EAPTAYSLLIMHR Unmodified 1500.7759 0.77588407 2899 Q06203 PPAT Amidophosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 93.518 93.518 3 0.0069026 97538 QUIQUE_C1438_190116_001 39.424 30.826 155770000 0 0 0 0 23396000 0 0 0 32529000 0 48098000 26512000 25237000 8894 2899 8317 79660;79661;79662;79663;79664 101500;101501;101502;101503;101504 101500 5 EAPVPSLHLK Unmodified 1089.6182 0.61824444 4102 Q9GZN8;H7BYU9 C20orf27 UPF0687 protein C20orf27 yes no 0 0 0 1 1 1 44.914 44.914 3 0.015182 41681 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.918 25.711 52186000 28233000 0 0 0 0 0 0 0 23954000 0 0 0 0 8895 4102 8318 79665;79666;79667 101505;101506;101507 101507 3 EAQAALAEAQEDLESER Unmodified 1858.8545 0.85446456 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.472 94.472 2 3.0124E-75 96085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 249.75 224.41 714860000 53964000 53848000 76103000 74494000 65364000 60768000 72438000 48374000 0 23052000 75935000 47352000 63164000 8896 3459 8319 79668;79669;79670;79671;79672;79673;79674;79675;79676;79677;79678;79679;79680 101508;101509;101510;101511;101512;101513;101514;101515;101516;101517;101518;101519;101520 101515 13 EAQAQHNNSEFTEEQKK Unmodified 2016.9137 0.91371077 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 1 1 2 1 1 10.365 10.365 3;4 7.281E-24 2654 QUIQUE_DMIX7_190116_001 148.52 138.42 91028000 9064000 39513000 0 0 0 0 0 0 0 4097100 0 38354000 0 8897 3807 8320 79681;79682;79683;79684;79685 101521;101522;101523;101524;101525 101525 5 EAQAVAQEWK Unmodified 1158.5669 0.56693715 1703 O95057 DIRAS1 GTP-binding protein Di-Ras1 yes yes 0 0 0 1 1 34.583 34.583 2 0.024502 30515 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.148 55.573 47525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47525000 8898 1703 8321 79686;79687 101526;101527 101526 1 EAQAVPATLPELEATK Unmodified 1666.8778 0.87776618 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.689 88.689 2 0.00069941 90644 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.858 78.195 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54604 QUIQUE_C1563_190116_001 96.015 69.631 545600000 75736000 56937000 85456000 57308000 0 49259000 51435000 0 35870000 0 93057000 40542000 0 8902 4285 8325 79704;79705;79706;79707;79708;79709;79710;79711;79712 101544;101545;101546;101547;101548;101549;101550;101551;101552 101548 9 EAQNLSAMEIR Oxidation (M) 1276.6082 0.60815004 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 31.452 31.452 2 0.00014611 26644 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.41 104.47 212670000 0 0 31642000 0 0 0 0 0 61982000 0 0 60874000 58169000 8903 4285 8325 79713;79714;79715;79716;79717;79718 101553;101554;101555;101556;101557;101558;101559 101558 2901 6 EAQNSHVYWWR Unmodified 1474.6742 0.67419619 4565 Q9Y2S7;B4DEM9 POLDIP2 Polymerase delta-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 61.134 61.134 3 0.029854 60036 QUIQUE_C1403_190116_001 39.148 27.615 17087000 0 0 0 17087000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8904 4565 8326 79719 101560 101560 1 EAQNTCAMLTTFNEIDMSNIQEMR Unmodified 2846.2343 0.23433468 2404 P36957;Q86SW4 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 148.32 148.32 3 4.2928E-05 150989 QUIQUE_C1563_190116_001 56.95 50.075 68451000 0 20767000 0 17705000 0 29978000 0 0 0 0 0 0 0 8905 2404 8327 79720;79721;79722 101561;101562;101563 101563 0 EAQQALGSAAADATEAK Unmodified 1630.7798 0.77984305 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 47.89 47.89 2;3 5.0367E-38 45138 QUIQUE_C1218_190116_001 202.13 188.31 2048300000 171410000 214610000 164440000 121390000 251600000 110770000 137400000 137050000 157680000 111210000 151150000 185940000 133680000 8906 2008 8328 79723;79724;79725;79726;79727;79728;79729;79730;79731;79732;79733;79734;79735;79736;79737;79738 101564;101565;101566;101567;101568;101569;101570;101571;101572;101573;101574;101575;101576;101577;101578;101579;101580;101581;101582;101583;101584 101564 21 EAQQYSEALASTR Unmodified 1452.6845 0.68448611 4173 Q9H4G4;Q5VZR0 GLIPR2 Golgi-associated plant pathogenesis-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.478 45.478 2 4.9812E-17 42158 QUIQUE_C1403_190116_001 159.94 132.82 751590000 0 0 189530000 154760000 0 0 0 77308000 113570000 0 0 87418000 129010000 8907 4173 8329 79739;79740;79741;79742;79743;79744 101585;101586;101587;101588;101589;101590 101586 4 EAQTLDSQIQETSI Unmodified 1561.7471 0.74714594 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 98.218 98.218 2 0.020917 101714 QUIQUE_C1218_190116_001 49.35 31.542 78680000 33360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45319000 8908 880 8330 79745;79746 101591;101592 101591 2 EAQTLQQYR Unmodified 1135.5622 0.56218613 2592;1320 K7EK35;P42229;K7EIF9;P51692 STAT5A;STAT5B Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A;Signal transducer and activator of transcription 5B no no 0 0 0 1 1 25.811 25.811 2 0.00062951 19535 QUIQUE_C1403_190116_001 111.29 84.15 113860000 0 56857000 0 57007000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8909 1320;2592 8331 79747;79748 101593;101594 101594 2 EAQTSFLHLGYLPNQLFR Unmodified 2133.1007 0.10072368 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 3 2 1 2 2 2 137.66 137.66 2;3 1.6677E-83 140778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 208.82 178.09 3586700000 261390000 339840000 168780000 298610000 293380000 198540000 169480000 308500000 331520000 78591000 518710000 351390000 267980000 8910 3726 8332 79749;79750;79751;79752;79753;79754;79755;79756;79757;79758;79759;79760;79761;79762;79763;79764;79765;79766;79767;79768;79769;79770;79771;79772;79773 101595;101596;101597;101598;101599;101600;101601;101602;101603;101604;101605;101606;101607;101608;101609;101610;101611;101612;101613;101614;101615;101616;101617;101618;101619;101620;101621;101622;101623;101624;101625;101626;101627 101613 31 EAQVDAEAQR Unmodified 1115.5207 0.52071524 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 1 14.577 14.577 2 0.063897 6649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.756 28.981 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8911 2863 8333 79774 101628 101628 1 EAQVYQAFK Unmodified 1082.5397 0.53965977 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 46.268 46.268 2 0.010394 43238 QUIQUE_C1277_190116_001 74.184 41.574 124130000 0 124130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8912 3878 8334 79775 101629 101629 1 EASAALQVR Unmodified 943.50869 0.50869399 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 23.176 23.176 2 0.050487 16564 QUIQUE_C1576_190116_001 50.607 18.672 62507000 0 0 0 0 0 0 62507000 0 0 0 0 0 0 8913 3718 8335 79776 101630 101630 1 EASADLSPYVR Unmodified 1206.5881 0.58806652 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.737 57.737 2 0.0023111 56086 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.128 53.915 389650000 37865000 42807000 0 47597000 54649000 0 0 52202000 73268000 21142000 0 60122000 0 8914 1386 8336 79777;79778;79779;79780;79781;79782;79783;79784 101631;101632;101633;101634;101635;101636;101637;101638 101636 8 EASDLLEQNR Unmodified 1173.5626 0.56258006 1111;3416 H0Y2S9;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 39.226 39.226 2 0.047017 35698 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.433 36.44 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8915 1111;3416 8337 79785 101639 101639 1 EASDPQPEEADGGLK Unmodified 1541.6845 0.68454569 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 31.796 31.796 2 1.8884E-36 27398 QUIQUE_C1403_190116_001 176.78 160.52 2028700000 309750000 0 27892000 248690000 231190000 197900000 257840000 0 0 147780000 292190000 38335000 277120000 8916 2617 8338 79786;79787;79788;79789;79790;79791;79792;79793;79794;79795;79796;79797;79798;79799 101640;101641;101642;101643;101644;101645;101646;101647;101648;101649;101650;101651;101652;101653;101654 101642 14 EASDTGQPIVFSQPESDEAK Unmodified 2133.9702 0.9702226 3663 Q8TB37;F8W0A2 NUBPL Iron-sulfur protein NUBPL yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.128 72.128 2 6.5163E-38 72387 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.09 122.4 327900000 31764000 0 26589000 20316000 33217000 15480000 54390000 19782000 29513000 0 41820000 0 55029000 8917 3663 8339 79800;79801;79802;79803;79804;79805;79806;79807;79808;79809 101655;101656;101657;101658;101659;101660;101661;101662;101663;101664 101662 10 EASDVLCTITK Unmodified 1235.6068 0.60675306 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 68.022 68.022 2 0.012432 67186 QUIQUE_C1563_190116_001 60.434 38.441 164430000 0 0 39855000 0 0 43708000 46704000 0 0 0 0 0 34166000 8918 982 8340 79810;79811;79812;79813 101665;101666;101667;101668;101669;101670;101671 101668 7 EASEEAFSGSAQPRPPSVVHESR Unmodified 2453.1571 0.15712894 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.634 47.634 3 2.0382E-39 44456 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106.4 81.555 1152200000 189970000 80703000 152940000 155250000 0 72150000 83169000 111070000 155370000 28253000 0 51089000 72220000 8922 1388 8344 79825;79826;79827;79828;79829;79830;79831;79832;79833;79834;79835;79836;79837;79838;79839;79840 101683;101684;101685;101686;101687;101688;101689;101690;101691;101692;101693;101694;101695;101696;101697;101698 101690 13 EASITVSVLHGTHSGPSYTPVPGSTRPIR Unmodified 3002.5574 0.5573821 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 68.413 68.413 4 1.0757E-15 68876 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.991 73.504 267910000 0 0 39503000 0 0 0 0 51777000 50931000 0 60561000 65139000 0 8923 2834 8345 79841;79842;79843;79844;79845 101699;101700;101701;101702;101703 101700 5 EASIYTGITLSEYFR Unmodified 1748.8621 0.86211612 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 4 4 3 4 2 4 4 2 7 2 6 5 2 144.22 144.22 2 3.3019E-18 149344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.08 121.95 2606400000 192500000 375020000 150020000 251160000 105380000 322860000 113470000 159830000 416840000 125800000 101870000 233910000 57785000 8924 2414 8346 79846;79847;79848;79849;79850;79851;79852;79853;79854;79855;79856;79857;79858;79859;79860;79861;79862;79863;79864;79865;79866;79867;79868;79869;79870;79871;79872;79873;79874;79875;79876;79877;79878;79879;79880;79881;79882;79883;79884;79885;79886;79887;79888;79889;79890;79891;79892;79893;79894 101704;101705;101706;101707;101708;101709;101710;101711;101712;101713;101714;101715;101716;101717;101718;101719;101720;101721;101722;101723;101724;101725;101726;101727;101728;101729;101730;101731;101732;101733;101734;101735;101736;101737;101738;101739;101740;101741;101742;101743;101744;101745;101746;101747;101748;101749;101750;101751;101752;101753;101754;101755;101756;101757;101758;101759;101760 101737 56 EASMEGIVTIVGLKPETTYAVR Unmodified 2363.2406 0.24064756 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 3 2 2 2 2 1 3 2 2 127.06 127.06 2;3;4 1.7523E-166 131467 QUIQUE_C1368_190116_001 242.19 230.21 16774000000 1027000000 1208400000 1607400000 1437800000 1615500000 1014800000 1030700000 1210800000 1661100000 319550000 1630800000 1158700000 1851400000 8925 1218;28;112;2057 8347 79895;79896;79897;79898;79899;79900;79901;79902;79903;79904;79905;79906;79907;79908;79909;79910;79911;79912;79913;79914;79915;79916;79917;79918;79919;79920;79921 101761;101762;101763;101764;101765;101766;101767;101768;101769;101770;101771;101772;101773;101774;101775;101776;101777;101778;101779;101780;101781;101782;101783;101784;101785;101786;101787;101788;101789;101790;101791;101792;101793;101794;101795;101796;101797;101798;101799;101800;101801;101802;101803;101804;101805;101806;101807;101808;101809;101810;101811;101812 101771 52 EASMEGIVTIVGLKPETTYAVR Oxidation (M) 2379.2356 0.23556218 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 1 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 106.39 106.39 2;3 8.4674E-54 109784 QUIQUE_DMIX3_190116_001 166.3 154.51 2332500000 0 32339000 0 27678000 524830000 36001000 0 0 596900000 210490000 0 319600000 584670000 8926 1218;28;112;2057 8347 79922;79923;79924;79925;79926;79927;79928;79929;79930;79931;79932;79933;79934;79935 101813;101814;101815;101816;101817;101818;101819;101820;101821;101822;101823;101824;101825;101826;101827 101820 14 14 EASMVITESPAALQLR Oxidation (M) 1730.8873 0.88728501 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 1 0 1 1 1 2 89.869 89.869 2 0.0059032 91059 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.205 37.58 175690000 20808000 0 23835000 0 0 0 0 0 0 26703000 0 0 104340000 8927 2258 8348 79936;79937;79938;79939;79940 101828;101829;101830;101831;101832 101831 1617 4 EASMVITESPAALQLR Unmodified 1714.8924 0.89237039 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.75 105.75 2 3.1832E-20 109070 QUIQUE_C1277_190116_001 170.62 108.31 2429400000 258320000 206250000 242900000 167870000 211830000 115970000 237660000 198210000 0 86701000 196450000 103890000 403330000 8928 2258 8348 79941;79942;79943;79944;79945;79946;79947;79948;79949;79950;79951;79952 101833;101834;101835;101836;101837;101838;101839;101840;101841;101842;101843;101844;101845 101834 9 EASPNPEDGIVR Unmodified 1282.6153 0.61534391 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 40.068 40.068 2 0.0067374 36545 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.847 48.706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8929 1473 8349 79953;79954;79955 101846;101847;101848 101848 3 EASQELPPGFLYK Unmodified 1477.7453 0.74529545 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 2 3 1 2 1 1 2 3 2 93.117 93.117 2 0.00052752 95728 QUIQUE_C1277_190116_001 89.679 73.101 1102700000 75696000 126600000 97408000 130250000 78804000 76955000 0 143550000 0 0 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79979;79980;79981;79982;79983;79984;79985 101875;101876;101877;101878;101879;101880;101881;101882 101875 3065 8 EASSLPQLVEMIVDHQIETGLLKPELK Unmodified 3016.6155 0.61547383 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 166.98 166.98 3;4 6.0703E-37 171147 QUIQUE_DMIX8_190116_001 126.46 123.71 7565200000 664930000 750850000 191760000 142260000 0 169120000 2711300000 675230000 437980000 271760000 975970000 0 574120000 8933 4662 8352 79986;79987;79988;79989;79990;79991;79992;79993;79994;79995;79996;79997;79998;79999;80000;80001 101883;101884;101885;101886;101887;101888;101889;101890;101891;101892;101893;101894;101895;101896;101897;101898 101897 16 EASSSACDLPR Unmodified 1191.519 0.51900068 3944 Q96SZ5 ADO 2-aminoethanethiol dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.667 22.667 2 0.0014591 15638 QUIQUE_C1277_190116_001 99.815 54.135 191420000 40616000 38185000 0 0 0 0 45071000 0 0 0 0 41323000 26224000 8934 3944 8353 80002;80003;80004;80005;80006;80007 101899;101900;101901;101902;101903;101904 101900 6 EASSTQDTGKLPVK Unmodified 1459.7518 0.75183739 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 1 1 19.18 19.18 2 0.046406 11833 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.49 26.284 51971000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51971000 0 0 8935 2439 8354 80008 101905 101905 1 EASSVSEELHK Unmodified 1214.5779 0.57789577 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUC3;A0A1B0GV98;A0A1B0GTC5;A0A1B0GU26;A0A1B0GTY1 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.453 18.453 2 0.0026231 10819 QUIQUE_C1438_190116_001 77.192 45.257 84563000 29132000 23633000 0 0 23849000 0 0 0 0 7949100 0 0 0 8936 334 8355 80009;80010;80011;80012;80013;80014;80015;80016 101906;101907;101908;101909;101910;101911;101912;101913 101908 8 EATADDLIK Unmodified 974.49204 0.49204087 3179 Q16531 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.149 39.149 2 0.01218 34841 QUIQUE_C1277_190116_001 71.692 34.134 663960000 97971000 93346000 92424000 0 96808000 75392000 0 80094000 78446000 49476000 0 0 0 8937 3179 8356 80017;80018;80019;80020;80021;80022;80023;80024 101914;101915;101916;101917;101918;101919;101920;101921 101915 8 EATAGNPGGQTVR Unmodified 1256.6109 0.61092723 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.632 14.632 2 7.3049E-09 6883 QUIQUE_C1438_190116_001 139.86 115.7 524300000 47308000 35638000 59023000 37246000 78524000 0 52633000 38287000 55356000 13020000 57938000 0 49326000 8938 1029 8357 80025;80026;80027;80028;80029;80030;80031;80032;80033;80034;80035 101922;101923;101924;101925;101926;101927;101928;101929;101930;101931;101932;101933;101934 101927 13 EATDAIGHLDR Unmodified 1196.5786 0.57856447 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 31.844 31.844 2;3 2.1195E-12 26773 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.34 117.26 3810500000 516900000 395250000 273510000 279110000 237770000 278710000 311300000 208170000 295990000 118070000 387480000 266210000 242050000 8939 2951 8358 80036;80037;80038;80039;80040;80041;80042;80043;80044;80045;80046;80047;80048;80049;80050;80051;80052;80053;80054;80055;80056;80057;80058;80059;80060 101935;101936;101937;101938;101939;101940;101941;101942;101943;101944;101945;101946;101947;101948;101949;101950;101951;101952;101953;101954;101955;101956;101957;101958;101959;101960;101961;101962 101952 25 EATDPRPCEVENAVESWR Unmodified 2143.9593 0.95928076 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7;A0A0D9SET8 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 2 1 95.878 95.878 2;3 1.4767E-13 98762 QUIQUE_C1368_190116_001 125.45 116.39 2305300000 248040000 212420000 254630000 317540000 180670000 203030000 252540000 84258000 73717000 55854000 154520000 134700000 133350000 8940 2492 8359 80061;80062;80063;80064;80065;80066;80067;80068;80069;80070;80071;80072;80073;80074;80075;80076;80077 101963;101964;101965;101966;101967;101968;101969;101970;101971;101972;101973;101974;101975;101976;101977;101978;101979;101980;101981;101982;101983;101984;101985;101986;101987;101988 101967 25 EATDTPIVIQPASATETTQLTADSHPSYHTDGFN Unmodified 3614.6649 0.66487946 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.44 109.44 3 1.4664E-57 111761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.28 121.7 987880000 106620000 93673000 52354000 106140000 73822000 0 53967000 107470000 127630000 0 88286000 71137000 106770000 8941 4162 8360 80078;80079;80080;80081;80082;80083;80084;80085;80086;80087;80088 101989;101990;101991;101992;101993;101994;101995;101996;101997;101998;101999;102000;102001 101996 13 EATDYLR Unmodified 866.4134 0.41339662 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 32.163 32.163 2 0.061637 27299 QUIQUE_C1368_190116_001 68.7 39.362 20841000 0 0 20841000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8942 2882 8361 80089 102002 102002 1 EATEYEIELYGISK Unmodified 1643.793 0.7930335 2233 P24821;J3QSU6;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.68 109.68 2 0.00023158 106649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.97 91.713 525010000 0 0 0 0 0 59114000 0 127570000 128500000 78745000 0 57942000 73134000 8943 2233 8362 80090;80091;80092;80093;80094;80095 102003;102004;102005;102006;102007;102008;102009;102010;102011 102008 9 EATNPPVIQEEKPK Unmodified 1578.8253 0.82533668 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 24.239 24.239 2;3 1.2196E-17 17548 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.05 144.28 9398800000 1262600000 505030000 1101500000 521590000 799350000 386820000 830300000 411520000 710480000 201790000 837820000 1060900000 769170000 8944 2308 8363 80096;80097;80098;80099;80100;80101;80102;80103;80104;80105;80106;80107;80108;80109;80110;80111;80112;80113;80114;80115;80116;80117;80118;80119;80120;80121;80122 102012;102013;102014;102015;102016;102017;102018;102019;102020;102021;102022;102023;102024;102025;102026;102027;102028;102029;102030;102031;102032;102033;102034;102035;102036;102037;102038;102039;102040;102041;102042;102043;102044 102039 33 EATSILEENQALCTITSFPR Unmodified 2279.1104 0.11036167 2509 P48506;B4E2I4;A0A0C4DGB2 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 140.6 140.6 2;3 1.1838E-06 143570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.25 103.64 108530000 30795000 0 0 40269000 0 0 0 0 0 0 0 0 37470000 8945 2509 8364 80123;80124;80125;80126 102045;102046;102047;102048 102047 3 EATSLHDANDKLENELASK Unmodified 2084.0022 0.0021914296 1612 O75145;R4GN36 PPFIA3 Liprin-alpha-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.555 57.555 3 1.9961E-16 54993 QUIQUE_C1563_190116_001 123.54 107.42 361150000 38042000 45360000 0 37676000 0 55025000 68688000 38520000 0 0 0 0 77842000 8946 1612 8365 80127;80128;80129;80130;80131;80132;80133 102049;102050;102051;102052;102053;102054;102055 102052 7 EATSVPHIYAIGDVVEGRPELTPIAIMAGR Unmodified 3161.6543 0.65431896 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A096LPK7;A0A0U1RQX0 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 138.78 138.78 4 9.2103E-32 144386 QUIQUE_C1218_190116_001 102.6 98.113 270430000 81700000 0 73806000 49584000 0 0 65342000 0 0 0 0 0 0 8947 330 8366 80134;80135;80136;80137 102056;102057;102058;102059;102060 102056 5 EATTDFTVDSRPLTQVGGDHIK Unmodified 2386.1765 0.1764674 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 1 1 75.027 75.027 3 1.5182E-09 74710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.772 75.109 46419000 0 0 0 0 0 0 0 46419000 0 0 0 0 0 8948 1628 8367 80138 102061 102061 1 EATTLANGVLASLNLPAAIEDVSGDTVPQSILTK Unmodified 3407.8035 0.80354519 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 171.18 171.18 3;4 8.385E-31 172528 QUIQUE_C1563_190116_001 87.882 83.389 2793300000 0 65445000 123440000 59649000 310360000 173300000 632350000 144930000 99537000 46347000 108120000 727480000 302360000 8949 3700 8368 80139;80140;80141;80142;80143;80144;80145;80146;80147;80148;80149;80150;80151 102062;102063;102064;102065;102066;102067;102068;102069;102070;102071;102072;102073;102074;102075;102076;102077 102067 15 EATTMHLESLR Oxidation (M) 1302.6238 0.6238001 4737 yes yes 0 1 0 1 161.31 161.31 2 0.012306 166828 QUIQUE_C1368_190116_001 124.08 76.121 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 8950 4737 8369 80152 102078 102078 3098 1 EATTNAPFR Unmodified 1005.488 0.48795855 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.517 23.517 2 2.8264E-06 17080 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.84 95.161 2264800000 233640000 227890000 0 0 282130000 226560000 0 0 297230000 0 408130000 216650000 372590000 8951 2324 8370 80153;80154;80155;80156;80157;80158;80159;80160;80161;80162 102079;102080;102081;102082;102083;102084;102085;102086;102087;102088 102086 10 EATVIQDLK Unmodified 1015.555 0.55497548 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 48.802 48.802 2 0.017275 45350 QUIQUE_C1563_190116_001 65.156 28.455 209050000 45239000 50444000 0 0 0 42815000 0 0 0 15810000 0 0 54743000 8952 3108 8371 80163;80164;80165;80166;80167 102089;102090;102091;102092;102093 102091 5 EATWESVSMMLQLGGTVIGSAR Oxidation (M) 2338.1297 0.1297169 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VW30 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 1 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 166.46 166.46 2;3 1.0947E-10 171274 QUIQUE_C1218_190116_001 104.41 99.431 410640000 19189000 81184000 30816000 42792000 16394000 0 43519000 28482000 89190000 14700000 0 0 44375000 8953 452 8372 80168;80169;80170;80171;80172;80173;80174;80175;80176;80177;80178;80179;80180;80181 102094;102095;102096;102097;102098;102099;102100;102101;102102;102103;102104;102105;102106;102107;102108;102109 102094 326;327 14 EATWESVSMMLQLGGTVIGSAR Unmodified 2322.1348 0.13480228 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VW30 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 169.82 169.82 3 1.12E-05 177229 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.87 59.661 185550000 0 0 11289000 0 0 0 0 22958000 60289000 0 71520000 19498000 0 8954 452 8372 80182;80183;80184;80185;80186;80187;80188 102110;102111;102112;102113;102114;102115;102116 102114 7 EAVAMESYAK Unmodified 1097.5063 0.50631073 2810 P78371;F5GWF6 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.31 36.31 2 0.0015474 32592 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 64.397 3032600000 246780000 266370000 253740000 260560000 197230000 207490000 270980000 229470000 206960000 83682000 288720000 218200000 302470000 8955 2810 8373 80189;80190;80191;80192;80193;80194;80195;80196;80197;80198;80199;80200;80201 102117;102118;102119;102120;102121;102122;102123;102124;102125;102126;102127;102128;102129 102117 7 EAVAMESYAK Oxidation (M) 1113.5012 0.50122535 2810 P78371;F5GWF6 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.889 18.889 2 0.0018369 11380 QUIQUE_C1368_190116_001 96.311 74.783 406330000 0 50871000 59558000 0 41425000 44820000 0 29404000 36643000 30809000 46517000 28290000 37995000 8956 2810 8373 80202;80203;80204;80205;80206;80207;80208;80209;80210;80211 102130;102131;102132;102133;102134;102135;102136;102137;102138;102139 102131 2257 10 EAVAPVQEESDLEK Unmodified 1542.7413 0.74133228 2992;858 E7EQL5;E7EV09;E7EQU2;E7ETL8;E7ESD3;E7EMU4;E9PGG1;E7ET01;E7EUM4;E7ERR6;E7ERH4;E7EU01;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.415 51.415 2 2.0339E-14 49642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.28 122.44 2732200000 218670000 247010000 0 251130000 289020000 220170000 156780000 179050000 288310000 97541000 238800000 242470000 303260000 8957 858;2992 8374 80212;80213;80214;80215;80216;80217;80218;80219;80220;80221;80222;80223;80224 102140;102141;102142;102143;102144;102145;102146;102147;102148;102149;102150;102151;102152;102153;102154 102149 15 EAVAPVQEESDLEKK Unmodified 1670.8363 0.8362953 2992;858 E7EQL5;E7EV09;E7EQU2;E7ETL8;E7ESD3;E7EMU4;E9PGG1;E7ET01;E7EUM4;E7ERR6;E7ERH4;E7EU01;Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 37.256 37.256 2;3 3.1868E-06 32545 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.911 74.366 769840000 0 67798000 0 0 0 71870000 86520000 78858000 106710000 34787000 131760000 83690000 107850000 8958 858;2992 8375 80225;80226;80227;80228;80229;80230;80231;80232;80233;80234;80235;80236;80237 102155;102156;102157;102158;102159;102160;102161;102162;102163;102164;102165;102166;102167;102168 102164 14 EAVATAVQR Unmodified 943.50869 0.50869399 1585 O60645;D6RB59;D6RBR9 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 0 1 1 1 17.895 17.895 2 0.0013972 10558 QUIQUE_C1218_190116_001 104.06 63.028 118210000 38229000 42613000 0 0 0 37364000 0 0 0 0 0 0 0 8959 1585 8376 80238;80239;80240 102169;102170;102171 102169 1 EAVCEVALDYK Unmodified 1295.6068 0.60675306 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 69.257 69.257 2 1.8215E-24 69099 QUIQUE_DMIX3_190116_001 183.67 154.59 5366100000 698630000 608120000 444630000 301750000 446930000 313750000 400750000 324810000 298450000 403040000 458980000 330490000 335820000 8960 2851 8377 80241;80242;80243;80244;80245;80246;80247;80248;80249;80250;80251;80252;80253;80254;80255 102172;102173;102174;102175;102176;102177;102178;102179;102180;102181;102182;102183;102184;102185;102186;102187;102188;102189;102190;102191;102192;102193;102194;102195;102196;102197 102190 26 EAVCEVALDYKK Unmodified 1423.7017 0.70171607 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 2 47.268 47.268 2;3 3.9346E-06 44696 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.93 154.19 6665000000 267510000 156170000 132540000 83146000 795650000 82227000 196330000 977790000 1180000000 208940000 1213400000 262090000 1109200000 8961 2851 8378 80256;80257;80258;80259;80260;80261;80262;80263;80264;80265;80266;80267;80268;80269;80270;80271;80272;80273;80274;80275 102198;102199;102200;102201;102202;102203;102204;102205;102206;102207;102208;102209;102210;102211;102212;102213;102214;102215;102216;102217;102218;102219 102215 14 EAVEAIQNSTSIK Unmodified 1388.7147 0.7147236 1310 K4DI93;Q13620;A6NE76 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 1 1 46.823 46.823 2 2.1373E-10 44429 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.74 68.542 202260000 0 70219000 0 0 0 0 0 0 0 0 60155000 71882000 0 8962 1310 8379 80276;80277;80278 102220;102221;102222 102221 3 EAVEKEFEPLLNWMK Unmodified 1861.9284 0.92842155 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 1 1 2 2 1 139.54 139.54 2;3 3.7728E-78 146510 QUIQUE_DMIX5_190116_001 205.49 186.91 584020000 0 0 0 0 0 0 0 88275000 117810000 0 301940000 0 76003000 8963 2079 8380 80279;80280;80281;80282;80283;80284 102223;102224;102225;102226;102227;102228;102229 102227 7 EAVELPLTHFELYK Unmodified 1687.8821 0.88212328 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 3 2 2 118.26 118.26 2;3 0.00021334 121039 QUIQUE_C1563_190116_001 92.866 78.447 1474900000 154770000 149300000 134120000 146280000 46692000 118380000 54688000 143790000 126490000 29074000 124770000 93906000 152680000 8964 2466 8381 80285;80286;80287;80288;80289;80290;80291;80292;80293;80294;80295;80296;80297;80298;80299;80300;80301;80302;80303;80304;80305;80306;80307;80308;80309 102230;102231;102232;102233;102234;102235;102236;102237;102238;102239;102240;102241;102242;102243;102244;102245;102246;102247;102248;102249;102250;102251;102252;102253;102254;102255;102256;102257;102258;102259;102260;102261;102262;102263;102264 102246 33 EAVEQFESQGVDLSNIVK Unmodified 1990.9848 0.98475045 3374 Q6NXE6;F5H2X2;F5H2K4;F5GWV0;F5H4P3;F5H052;F5H3X1 ARMC6 Armadillo repeat-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.87 122.87 2 6.8499E-76 125584 QUIQUE_DMIX1_190116_001 201.04 177.81 285280000 39834000 29246000 31518000 27358000 40504000 28074000 0 25279000 28429000 0 0 35035000 0 8965 3374 8382 80310;80311;80312;80313;80314;80315;80316;80317;80318;80319 102265;102266;102267;102268;102269;102270;102271;102272;102273;102274 102271 10 EAVFFQSHSAR Unmodified 1277.6153 0.61528433 2402 P36954 POLR2I DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 yes yes 0 0 0 1 1 1 31.007 31.007 2 0.0048497 26047 QUIQUE_C1368_190116_001 70.389 51.609 873190000 0 0 370270000 0 0 229860000 0 0 273050000 0 0 0 0 8966 2402 8383 80320;80321;80322 102275;102276;102277 102275 2 EAVFPFQPGSVAEVCITFDQANLTVK Unmodified 2866.4211 0.42113112 1958 P09382 LGALS1 Galectin-1 yes yes 0 0 0 4 6 6 1 1 162.87 162.87 2;3 1.1036E-56 167629 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.41 134.27 1114900000 0 0 0 0 0 0 0 193170000 400650000 0 295170000 159520000 66355000 8967 1958 8384 80323;80324;80325;80326;80327;80328;80329;80330;80331;80332;80333;80334;80335;80336;80337;80338;80339;80340 102278;102279;102280;102281;102282;102283;102284;102285;102286;102287;102288;102289;102290;102291;102292;102293;102294;102295;102296;102297;102298 102285 20 EAVGDLLDAFK Unmodified 1176.6027 0.60265396 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 133.35 133.35 2 0.00051267 137961 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.4 85.968 279960000 0 0 0 48718000 47329000 0 22334000 0 38073000 18502000 48148000 0 56859000 8968 922 8385 80341;80342;80343;80344;80345;80346;80347 102299;102300;102301;102302;102303;102304;102305;102306 102306 6 EAVIAAAFAK Unmodified 989.55458 0.55458155 3033;1353 K7ES72;Q13938 CAPS Calcyphosin no no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 64.12 64.12 1;2 0.00015879 63312 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.51 132.35 12151000000 652300000 530150000 992820000 561780000 675590000 855730000 1282200000 866640000 1702700000 0 1316500000 743940000 1970600000 8969 1353;3033 8386 80348;80349;80350;80351;80352;80353;80354;80355;80356;80357;80358;80359;80360;80361;80362;80363 102307;102308;102309;102310;102311;102312;102313;102314;102315;102316;102317;102318;102319;102320;102321;102322;102323;102324;102325;102326;102327;102328;102329;102330;102331;102332;102333;102334;102335 102335 25 EAVIAQISSHVK Unmodified 1280.7089 0.70885036 1439 O14672 ADAM10 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 53.916 53.916 2;3 0.00062606 51648 QUIQUE_C1403_190116_001 55.188 42.381 186450000 34614000 29665000 0 30688000 0 30415000 0 0 38125000 22940000 0 0 0 8970 1439 8387 80364;80365;80366;80367;80368;80369;80370;80371 102336;102337;102338;102339;102340;102341;102342;102343;102344 102339 9 EAVILPIK Unmodified 881.5586 0.5586043 4507;1625 Q9UN37;O75351 VPS4A;VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4A;Vacuolar protein sorting-associated protein 4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 66.197 66.197 2 0.014923 66398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.359 50.159 384110000 85190000 0 0 0 90501000 95675000 0 0 0 0 48967000 63777000 0 8971 4507;1625 8388 80372;80373;80374;80375;80376 102345;102346;102347;102348;102349;102350;102351 102350 7 EAVLDVIPTDIHQR Unmodified 1604.8522 0.85222014 1962 P09467;A0A3B3IUC7 FBP1 Fructose-1,6-bisphosphatase 1 yes no 0 0 0 1 86.53 86.53 3 0.019485 87886 QUIQUE_C1403_190116_001 35.118 22.735 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8972 1962 8389 80377 102352 102352 1 EAVLIDPVLETAPR Unmodified 1521.8403 0.84025847 1736 O95571;M0QXB5;M0QY80 ETHE1 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.6 108.6 2 0.00033518 111791 QUIQUE_C1403_190116_001 118.9 83.491 1228800000 0 154750000 147110000 132340000 107980000 112780000 106990000 106810000 0 57298000 142850000 0 159880000 8973 1736 8390 80378;80379;80380;80381;80382;80383;80384;80385;80386;80387 102353;102354;102355;102356;102357;102358;102359;102360;102361;102362;102363;102364;102365;102366;102367;102368;102369;102370 102358 18 EAVLYVDSQEAALK Unmodified 1534.7879 0.78788854 3088 Q14894;I3L325;I3L3Y1 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 81.512 81.512 2 6.3473E-05 82900 QUIQUE_C1277_190116_001 137.17 102.45 7567100000 527770000 688070000 479460000 585530000 658750000 561570000 609010000 435760000 675640000 277740000 888710000 615730000 563320000 8974 3088 8391 80388;80389;80390;80391;80392;80393;80394;80395;80396;80397;80398;80399;80400;80401 102371;102372;102373;102374;102375;102376;102377;102378;102379;102380;102381;102382;102383;102384;102385;102386;102387;102388;102389;102390;102391;102392;102393;102394;102395;102396;102397;102398;102399;102400;102401 102374 31 EAVNLQQDAFVVIGR Unmodified 1657.8788 0.87876924 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;D6RCQ8;D6RF77;D6RIS6 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 2 120.99 120.99 2 0.00052381 117537 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.124 54.206 26920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26920000 0 0 0 8975 1728 8392 80402;80403;80404;80405 102402;102403;102404;102405 102404 4 EAVQCVQELASPSLLFIFVR Unmodified 2305.214 0.21403888 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 169.01 169.01 2;3 1.9774E-07 162805 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.175 89.011 621670000 44423000 51355000 31182000 23874000 49340000 0 101310000 43068000 58566000 14143000 103280000 77199000 23929000 8976 922 8393 80406;80407;80408;80409;80410;80411;80412;80413;80414;80415;80416;80417;80418;80419 102406;102407;102408;102409;102410;102411;102412;102413;102414;102415;102416;102417;102418;102419 102416 14 EAVQLLEDYK Unmodified 1206.6132 0.61321864 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;C9JIV5;H7C1S9 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.804 79.804 2 0.00027754 79702 QUIQUE_C1563_190116_001 145.72 104.7 1160100000 125630000 109380000 147140000 147600000 0 96133000 96139000 72887000 111770000 0 140850000 112570000 0 8977 3679 8394 80420;80421;80422;80423;80424;80425;80426;80427;80428;80429;80430 102420;102421;102422;102423;102424;102425;102426;102427;102428;102429;102430 102424 9 EAVQLLEDYKHGTLRPGVTNEQLWSAQK Unmodified 3209.6469 0.64692539 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;C9JIV5;H7C1S9 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 0 0 2 1 99.287 99.287 4 6.4168E-24 100788 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.441 90.253 101740000 0 0 0 0 0 0 0 101740000 0 0 0 0 0 8978 3679 8395 80431 102431 102431 1 EAVQLMAEAEK Unmodified 1217.5962 0.59618837 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.894 53.894 2 0.0004542 51939 QUIQUE_C1277_190116_001 120.09 95.935 3321900000 587830000 577340000 390590000 503700000 0 450290000 424140000 100690000 0 0 71373000 99933000 115980000 8979 4128 8396 80432;80433;80434;80435;80436;80437;80438;80439;80440;80441;80442 102432;102433;102434;102435;102436;102437;102438;102439;102440;102441;102442;102443;102444;102445 102433 14 EAVQLMAEAEK Oxidation (M) 1233.5911 0.59110299 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 30.932 30.932 2 0.03518 24691 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.436 28.007 15363000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15363000 0 0 0 8980 4128 8396 80443 102446 102446 1 EAVQLMAEAEKR Unmodified 1373.6973 0.6972994 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 43.449 43.449 2;3 1.3131E-05 40205 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.82 105.3 2933800000 93399000 274500000 144630000 118500000 150940000 69472000 192240000 396220000 211520000 32958000 448420000 384530000 416460000 8981 4128 8397 80444;80445;80446;80447;80448;80449;80450;80451;80452;80453;80454;80455;80456;80457;80458;80459;80460;80461 102447;102448;102449;102450;102451;102452;102453;102454;102455;102456;102457;102458;102459;102460;102461;102462;102463;102464;102465;102466;102467;102468 102461 22 EAVSNFLTALSLQR Unmodified 1547.8308 0.83075641 3552 Q8IYB4 PEX5L PEX5-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 140.55 140.55 2 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311280000 301210000 247360000 8984 924 8400 80477;80478;80479;80480;80481;80482;80483;80484;80485;80486;80487;80488;80489;80490;80491;80492;80493;80494;80495;80496;80497;80498 102488;102489;102490;102491;102492;102493;102494;102495;102496;102497;102498;102499;102500;102501;102502;102503;102504;102505;102506;102507;102508;102509;102510;102511;102512;102513;102514 102509 24 EAVTFDQANPTQILGK Unmodified 1730.8839 0.88391419 4541 Q9Y263;E5RIM3;H0YC16 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 102.96 102.96 2 0.00042922 106469 QUIQUE_C1368_190116_001 81.552 73.152 160520000 0 0 37106000 25201000 0 0 0 0 0 0 40965000 23520000 33731000 8985 4541 8401 80499;80500;80501;80502;80503 102515;102516;102517;102518;102519 102515 5 EAVTFLR Unmodified 834.45995 0.45995289 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 52.02 52.02 2 0.019293 50903 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.02 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115.5 110.07 1799400000 178900000 112570000 75245000 100510000 111100000 76095000 114680000 96227000 245400000 65172000 185230000 209710000 228550000 8989 3029 8405 80515;80516;80517;80518;80519;80520;80521;80522;80523;80524;80525;80526;80527;80528;80529;80530;80531;80532 102532;102533;102534;102535;102536;102537;102538;102539;102540;102541;102542;102543;102544;102545;102546;102547;102548;102549;102550;102551;102552;102553;102554;102555;102556 102548 25 EAYALCHCLPVLSTDK Unmodified 1875.8859 0.8859048 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 88.421 88.421 2;3 1.2314E-29 89946 QUIQUE_C1368_190116_001 162.32 145.15 33698000 0 33698000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8990 846 8406 80533;80534;80535 102557;102558;102559 102558 2 EAYEAGLIGK Unmodified 1049.5393 0.53932542 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;E9PMX3;E9PQP1;H0YE81;E9PLC6;E9PJL9 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.416 50.416 2 0.018569 48348 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390570000 76175000 0 0 51311000 41868000 55534000 0 0 0 0 51171000 53587000 60920000 8993 2198 8409 80556;80557;80558;80559;80560;80561;80562 102582;102583;102584;102585;102586;102587;102588 102582 7 EAYMGNVLQGGEGQAPTR Oxidation (M) 1892.8687 0.86867484 2232 P24752;H0YEL7;E9PRQ6 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 3 52.914 52.914 2 6.7568E-45 48646 QUIQUE_DMIX4_190116_001 168.31 161.05 852160000 66920000 56754000 95811000 50601000 64228000 60754000 52222000 71104000 44089000 40665000 125760000 61702000 61550000 8994 2232 8410 80563;80564;80565;80566;80567;80568;80569;80570;80571;80572;80573;80574;80575;80576;80577;80578 102589;102590;102591;102592;102593;102594;102595;102596;102597;102598;102599;102600;102601;102602;102603;102604;102605 102599 1588 16 EAYMGNVLQGGEGQAPTR Unmodified 1876.8738 0.87376021 2232 P24752;H0YEL7;E9PRQ6 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.351 73.351 2 1.7595E-45 73665 QUIQUE_DMIX3_190116_001 224.43 213.82 5231400000 441880000 473360000 528290000 429670000 310470000 339790000 468170000 369040000 437170000 139850000 468330000 353040000 472330000 8995 2232 8410 80579;80580;80581;80582;80583;80584;80585;80586;80587;80588;80589;80590;80591 102606;102607;102608;102609;102610;102611;102612;102613;102614;102615;102616;102617;102618;102619;102620;102621;102622 102618 17 EAYNLFAVNGILFNHESPR Unmodified 2190.0858 0.0858019 1583 O60547 GMDS GDP-mannose 4,6 dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 134.78 134.78 3 0.0099816 138192 QUIQUE_C1403_190116_001 31.917 16.663 59885000 30659000 0 0 29226000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8996 1583 8411 80592;80593 102623;102624 102624 2 EAYPDHTQFEK Unmodified 1363.6044 0.60444487 4361 Q9P016 THYN1 Thymocyte nuclear protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 27.495 27.495 3 0.0066352 21388 QUIQUE_C1368_190116_001 65.241 46.11 31340000 0 31340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8997 4361 8412 80594;80595;80596 102625;102626;102627 102627 3 EAYPEEAYIADLDAK Unmodified 1696.7832 0.7831971 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 1 3 1 2 1 2 111.8 111.8 2 0.00047182 115589 QUIQUE_C1368_190116_001 78.324 64.924 526800000 0 0 0 55666000 42920000 0 153800000 0 0 0 142490000 65178000 66751000 8998 2623 8413 80597;80598;80599;80600;80601;80602;80603;80604;80605;80606;80607;80608;80609;80610;80611;80612;80613;80614 102628;102629;102630;102631;102632;102633;102634;102635;102636;102637;102638;102639;102640;102641;102642;102643;102644;102645;102646 102631 17 EAYPGDVFYLHSR Unmodified 1552.731 0.73104237 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 81.609 81.609 2;3 7.923E-08 83095 QUIQUE_C1277_190116_001 136.02 110.21 43420000000 3789500000 3830800000 3845600000 2762800000 3033100000 3421000000 3879500000 2642200000 3573500000 1266600000 4294400000 3289200000 3792100000 8999 2243 8414 80615;80616;80617;80618;80619;80620;80621;80622;80623;80624;80625;80626;80627;80628;80629;80630;80631;80632;80633;80634;80635;80636;80637;80638;80639;80640 102647;102648;102649;102650;102651;102652;102653;102654;102655;102656;102657;102658;102659;102660;102661;102662;102663;102664;102665;102666;102667;102668;102669;102670;102671;102672;102673;102674;102675;102676;102677;102678;102679;102680;102681;102682;102683;102684;102685;102686;102687;102688;102689 102653 43 ECANGYLELLDHVLLTLQKPSPELK Unmodified 2879.5103 0.51028048 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.68 163.68 4 2.7981E-29 165776 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.81 121.61 1817200000 147150000 44973000 203950000 63017000 138910000 52085000 146410000 213270000 172100000 0 185510000 449810000 0 9000 4600 8415 80641;80642;80643;80644;80645;80646;80647;80648;80649;80650;80651 102690;102691;102692;102693;102694;102695;102696;102697;102698;102699;102700 102697 10 ECCDKPLLEK Unmodified 1290.5948 0.59480816 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 19.593 19.593 2 0.01346 12088 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.051 51.022 25147000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25147000 0 0 0 + 9001 770 8416 80652 102701 102701 1 ECCEKPLLEK Unmodified 1304.6105 0.61045823 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 19.3 19.3 2;3 1.8024E-23 12481 QUIQUE_DMIX1_190116_001 195.58 128.89 23012000000 2660200000 2528700000 1626200000 3979400000 3713000000 3536600000 1720300000 182450000 839330000 399460000 234810000 0 1591500000 + 9002 769 8417 80653;80654;80655;80656;80657;80658;80659;80660;80661;80662;80663;80664;80665;80666;80667;80668;80669;80670;80671;80672;80673 102702;102703;102704;102705;102706;102707;102708;102709;102710;102711;102712;102713;102714;102715;102716;102717;102718;102719;102720;102721;102722 102714 12 ECCHGDLLECADDR Unmodified 1748.6553 0.65525294 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 41.987 41.987 3 9.5544E-05 38782 QUIQUE_C1218_190116_001 89.231 89.159 206930000 37493000 41452000 0 41395000 0 0 35758000 0 0 50831000 0 0 0 + 9003 770 8418 80674;80675;80676;80677;80678 102723;102724;102725;102726;102727 102723 5 ECCHGDLLECADDRADLAK Unmodified 2246.9355 0.93545055 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 58.505 58.505 4 0.0043252 56672 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.382 41.108 19433000 0 0 0 0 0 0 0 19433000 0 0 0 0 0 + 9004 770 8419 80679 102728 102728 1 ECDHSQTDSLEDEEIEAFYK Unmodified 2443.9962 0.99617935 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 106.6 106.6 2;3 6.2722E-267 109956 QUIQUE_C1368_190116_001 282.55 270.57 1310500000 72802000 72674000 198970000 173600000 85602000 153390000 108170000 49404000 85237000 48297000 71754000 89442000 101140000 9005 2578 8420 80680;80681;80682;80683;80684;80685;80686;80687;80688;80689;80690;80691;80692;80693;80694;80695 102729;102730;102731;102732;102733;102734;102735;102736;102737;102738;102739;102740;102741;102742;102743;102744;102745 102732 17 ECEDVMDWINDK Oxidation (M) 1568.6123 0.61230872 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 2 2 1 89.258 89.258 2 0.00081982 91840 QUIQUE_C1438_190116_001 90.05 85.585 563680000 58101000 75140000 91452000 62533000 140920000 0 0 0 98713000 36817000 0 0 0 9006 267;275;3025 8421 80696;80697;80698;80699;80700;80701;80702;80703;80704 102746;102747;102748;102749;102750;102751;102752;102753;102754 102750 161 8 ECEDVMDWINDK Unmodified 1552.6174 0.6173941 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.36 119.36 2 0.0034363 121850 QUIQUE_C1563_190116_001 108.48 104.18 3102600000 424070000 544720000 563200000 373410000 0 409380000 458170000 0 0 133780000 195880000 0 0 9007 267;275;3025 8421 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alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 0 2 1 2 2 3 1 2 1 2 2 3 4 143.72 143.72 3;4 0 146339 QUIQUE_DMIX1_190116_001 292.44 284.48 7840300000 315250000 399530000 329520000 68333000 359050000 62560000 1608400000 312870000 1843500000 0 490300000 1110300000 940670000 9021 1990;2795;3430;3992 8433 80842;80843;80844;80845;80846;80847;80848;80849;80850;80851;80852;80853;80854;80855;80856;80857;80858;80859;80860;80861;80862;80863;80864;80865;80866 102909;102910;102911;102912;102913;102914;102915;102916;102917;102918;102919;102920;102921;102922;102923;102924;102925;102926;102927;102928;102929;102930;102931;102932;102933;102934;102935;102936;102937;102938;102939;102940;102941;102942 102927 32 ECISIHVGQAGVQIGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDK Oxidation (M) 4311.9446 0.94458203 2795;3430;3992;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;F8W0F6;P68363;F8VVB9;F8VS66;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA3E;TUBA1A;TUBA1B;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 1 0 2 3 1 2 2 3 2 140.83 140.83 3;4 6.3784E-64 145383 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.68 108.61 3223000000 0 0 250790000 0 0 0 799380000 145160000 387230000 0 396930000 600380000 643190000 9022 1990;2795;3430;3992 8433 80867;80868;80869;80870;80871;80872;80873;80874;80875;80876;80877;80878;80879;80880;80881 102943;102944;102945;102946;102947;102948;102949;102950;102951;102952;102953;102954;102955;102956;102957;102958 102949 1260 15 ECISVHVGQAGVQMGNACWELYCLEHGIQPDGQMPSDK Unmodified 4299.8904 0.89043797 2796 P68366;C9JJQ8;C9JDL2 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 135.22 135.22 4 1.0367E-10 140136 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.374 57.3 265630000 0 0 0 0 69863000 60048000 64754000 0 0 0 0 0 70969000 9023 2796 8434 80882;80883;80884;80885 102959;102960;102961;102962 102962 4 ECLPENLGGYVK Unmodified 1377.6599 0.65985126 139 A0A0A0MR09;P43378 PTPN9 Protein-tyrosine-phosphatase;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9 yes no 0 0 0 1 1 82.232 82.232 2 0.033394 83649 QUIQUE_C1277_190116_001 53.327 35.059 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9024 139 8435 80886;80887 102963;102964 102963 2 ECLPLIIFLR Unmodified 1272.7264 0.72641468 2757 P62701 RPS4X 40S ribosomal protein S4, X isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.69 153.69 2 0.0019176 157862 QUIQUE_C1403_190116_001 111.82 104.6 361630000 45332000 37957000 22848000 47669000 28022000 51637000 41823000 0 25707000 9032900 16776000 11771000 23051000 9025 2757 8436 80888;80889;80890;80891;80892;80893;80894;80895;80896;80897;80898;80899 102965;102966;102967;102968;102969;102970;102971;102972;102973;102974;102975;102976;102977;102978;102979;102980 102970 16 ECLQALDFLHSNQVIHR Unmodified 2079.032 0.031992191 120 A0A087X294;O75914 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.329 97.329 3 1.5917E-17 101310 QUIQUE_C1218_190116_001 137.52 122 828860000 65164000 80375000 67059000 52044000 71675000 51600000 92244000 48042000 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ECLQALEFLHSNQVIHR Unmodified 2093.0476 0.047642255 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 0 1 3 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 93.485 93.485 2;3;4 5.6732E-45 95301 QUIQUE_C1403_190116_001 171.67 161.48 3323400000 263510000 485890000 250940000 208900000 210880000 201730000 250360000 235790000 173340000 142160000 384740000 236700000 278480000 9028 2970 8439 80936;80937;80938;80939;80940;80941;80942;80943;80944;80945;80946;80947;80948;80949;80950;80951;80952;80953 103024;103025;103026;103027;103028;103029;103030;103031;103032;103033;103034;103035;103036;103037;103038;103039;103040;103041;103042;103043;103044 103031 21 ECMAGTSGSEEVK Unmodified 1383.5646 0.56463025 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;G3V5P0 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.192 20.192 2 9.7454E-06 12754 QUIQUE_C1563_190116_001 121.61 89.673 402130000 37639000 58555000 45834000 47281000 37667000 46549000 33150000 0 0 0 34629000 22299000 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Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.286 50.286 2 0.0025363 48335 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.374 62.762 15567000000 932980000 990670000 1204100000 1249900000 1024100000 1252100000 1182300000 1422200000 1689700000 632340000 1257300000 1284800000 1444100000 9035 4639 8446 80983;80984;80985;80986;80987;80988;80989;80990;80991;80992;80993;80994;80995 103076;103077;103078;103079;103080;103081;103082;103083;103084;103085;103086;103087;103088;103089;103090;103091;103092;103093;103094;103095;103096;103097;103098;103099 103092 24 ECQEESFWK Unmodified 1241.5023 0.50228798 3262 Q56VL3;D6RD77;J3KPI9 OCIAD2 OCIA domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 60.723 60.723 2 0.00078076 60890 QUIQUE_C1218_190116_001 109.86 88.992 140970000 33489000 0 0 0 0 0 0 0 25226000 0 21695000 27001000 33555000 9036 3262 8447 80996;80997;80998;80999;81000;81001;81002;81003 103100;103101;103102;103103;103104;103105;103106;103107 103100 8 ECSIYLIGGSIPEEDAGK Unmodified 1936.9088 0.90880832 4256 Q9NQR4;H7C579 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes no 0 0 0 1 1 111.67 111.67 2 0.00028746 109022 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.592 87.744 141370000 0 81306000 0 0 0 0 0 0 0 60059000 0 0 0 9037 4256 8448 81004;81005 103108;103109 103109 1 ECTEGEHAEHPTVPLKDVVEQHK Unmodified 2668.2551 0.25512843 4091 Q9C040;A0A0J9YX34;C9J084 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 35.787 35.787 5 0.062209 30947 QUIQUE_DMIX1_190116_001 18.56 11.027 66141000 0 0 0 0 0 0 0 66141000 0 0 0 0 0 9038 4091 8449 81006 103110 103110 1 ECVDGVLGGEDYNHNNINQWTASIVEQSLTHLVK Unmodified 3838.8221 0.82206558 538 A6NGJ0;P51808;F2Z328 DYNLT3 Dynein light chain Tctex-type 3 yes no 0 0 0 1 158.26 158.26 4 0.01008 160769 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.062 20.205 169360000 0 0 0 0 0 0 0 169360000 0 0 0 0 0 9039 538 8450 81007 103111 103111 1 ECYCPPDFPSALYCDSR Unmodified 2135.8387 0.83869662 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 0 0 1 116.48 116.48 2 3.4277E-11 121390 QUIQUE_C1576_190116_001 121.28 119.84 64740000 0 0 0 0 0 0 64740000 0 0 0 0 0 0 9040 2598 8451 81008 103112;103113 103113 2 EDAAEETVKPGPEEGTLEK Unmodified 2027.9535 0.9535099 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 1 2 1 41.385 41.385 2;3 2.0913E-64 38235 QUIQUE_C1218_190116_001 188.4 163.55 257740000 58714000 57784000 0 67710000 0 73528000 0 0 0 0 0 0 0 9041 921 8452 81009;81010;81011;81012;81013;81014 103114;103115;103116;103117;103118;103119 103115 6 EDAAEETVKPGPEEGTLEKEEK Unmodified 2414.1337 0.13365911 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 2 1 1 39.477 39.477 3;4 1.5418E-06 35345 QUIQUE_C1403_190116_001 80.303 65.062 190550000 59392000 87814000 0 43343000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9042 921 8453 81015;81016;81017;81018;81019 103120;103121;103122;103123;103124 103123 5 EDAANNYAR Unmodified 1022.4417 0.44173664 2795;3430;3992;2796;1990;688;1031;737;539 C9JQ00;C9K0S6;F8VQQ4;F8VRZ4;F8VWV9;F8VX09;P0DPH8;P0DPH7;P68363;F8VVB9;F8VS66;P68366;C9JJQ8;C9JEV8;C9JDL2;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2;C9J2C0;Q9NY65;A6NHL2 TUBA4A;TUBA8;TUBA1A;TUBA1B;TUBA1C;TUBAL3 Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain;Tubulin alpha-8 chain;Tubulin alpha chain-like 3 no no 0 0 0 1 14.047 14.047 2 0.055932 5842 QUIQUE_C1277_190116_001 49.097 23.697 10710000 0 10710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9043 737;1031;1990;2795;2796;3430;3992;688;539 8454 81020 103125 103125 1 EDAEHNLVLFR Unmodified 1341.6677 0.66771383 2435 P41219;F8W835 PRPH Peripherin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 73.102 73.102 3 0.0023871 73191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.189 36.233 119560000 0 0 38690000 0 0 0 0 29743000 0 31580000 19548000 0 0 9044 2435 8455 81021;81022;81023;81024;81025 103126;103127;103128;103129;103130;103131;103132 103129 7 EDAGTYHCVATNAHGTDSR Unmodified 2060.8606 0.86062935 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.58 18.58 2;3 1.1666E-87 10884 QUIQUE_C1277_190116_001 204.94 196.79 1766100000 101490000 305980000 189830000 159210000 155080000 124730000 193740000 39845000 48566000 45165000 104710000 153090000 144720000 9045 4500 8456 81026;81027;81028;81029;81030;81031;81032;81033;81034;81035;81036;81037;81038;81039 103133;103134;103135;103136;103137;103138;103139;103140;103141;103142;103143;103144;103145;103146 103134 14 EDAIWNLLR Unmodified 1128.5928 0.59275797 857 E7EQB2;E7ER44;P02788 LTF Lactotransferrin;Lactoferricin-H;Kaliocin-1;Lactoferroxin-A;Lactoferroxin-B;Lactoferroxin-C yes no 0 0 0 1 133.85 133.85 2 0.00053564 140414 QUIQUE_C1438_190116_001 112.17 80.237 17520000 0 0 0 0 17520000 0 0 0 0 0 0 0 0 9046 857 8457 81040 103147 103147 1 EDAMAMVDHCLK Unmodified 1418.5992 0.59924161 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 74.234 74.234 2;3 0.0025708 74408 QUIQUE_C1277_190116_001 74.6 64.369 386270000 156980000 69929000 54560000 0 0 0 77087000 27717000 0 0 0 0 0 9047 307 8458 81041;81042;81043;81044;81045;81046;81047;81048 103148;103149;103150;103151;103152;103153;103154;103155 103150 8 EDAMAMVDHCLKK Unmodified 1546.6942 0.69420463 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 58.019 58.019 3 0.00057435 56910 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.622 63.583 238690000 0 0 0 0 0 0 37182000 0 68197000 0 78256000 55052000 0 9048 307 8459 81049;81050;81051;81052 103156;103157;103158;103159;103160;103161 103161 6 EDAMPEALK Unmodified 1002.4692 0.46919694 734 C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 42.058 42.058 2 0.026091 38384 QUIQUE_C1403_190116_001 76.478 57.747 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9049 734 8460 81053;81054 103162;103163 103163 2 EDANVFASAMMHALEVLNSQETGPTLPR Unmodified 3027.443 0.44300555 3615 Q8N8S7;A0A0U1RQP7 ENAH Protein enabled homolog yes no 0 0 0 1 1 169.73 169.73 3 1.4397E-10 173660 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.921 72.557 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9050 3615 8461 81055;81056 103164;103165 103165 2 EDAPIGPHLQSMPSEQIR Unmodified 2003.9735 0.97347426 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.604 74.604 3 4.9842E-11 74703 QUIQUE_C1277_190116_001 95.094 79.856 194830000 62737000 63331000 0 36285000 0 0 0 32482000 0 0 0 0 0 9051 3046 8462 81057;81058;81059;81060 103166;103167;103168;103169;103170 103168 5 EDAPIGPHLQSMPSEQIR Oxidation (M) 2019.9684 0.96838888 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 1 0 1 58.129 58.129 3 0.0059922 53197 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.382 32.594 38662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38662000 0 0 0 9052 3046 8462 81061 103171 103171 2472 1 EDAQEIADTPSGDK Unmodified 1474.6423 0.64234652 845 E5RK69 ANXA6 Annexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.068 32.068 2 1.8238E-22 26306 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.9 142.91 1068900000 0 128800000 141470000 128940000 96941000 101150000 133800000 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103187;103188;103189;103190;103191;103192;103193;103194;103195;103196;103197;103198;103199;103200;103201;103202;103203;103204;103205;103206;103207;103208;103209;103210;103211;103212;103213;103214;103215;103216;103217;103218 103191 32 EDAQVAAEILEIADTPSGDKTSLETR Unmodified 2758.3509 0.35086253 1936 P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 4 1 2 132.52 132.52 2;3 1.0452E-112 135525 QUIQUE_DMIX1_190116_001 229.6 218.49 3515100000 56311000 74615000 107780000 55789000 132280000 0 111580000 509660000 556320000 0 851850000 572570000 486330000 9056 1936 8466 81097;81098;81099;81100;81101;81102;81103;81104;81105;81106;81107;81108;81109;81110;81111;81112 103219;103220;103221;103222;103223;103224;103225;103226;103227;103228;103229;103230;103231;103232;103233;103234;103235;103236;103237;103238 103228 18 EDAVLEYLK Unmodified 1078.5546 0.55464113 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 93.552 93.552 1;2 3.8539E-05 94590 QUIQUE_C1563_190116_001 176.6 128.86 5045500000 392950000 364880000 541180000 494520000 407050000 450180000 453700000 181660000 375420000 320250000 371350000 277430000 414970000 9057 2248 8467 81113;81114;81115;81116;81117;81118;81119;81120;81121;81122;81123;81124;81125;81126 103239;103240;103241;103242;103243;103244;103245;103246;103247;103248;103249;103250;103251;103252;103253;103254;103255;103256;103257;103258;103259;103260;103261;103262;103263;103264;103265;103266 103251 27 EDAVLYLLEIPK Unmodified 1401.7755 0.77553294 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.88 149.88 2 0.00053578 152569 QUIQUE_C1563_190116_001 123.75 110.4 1894300000 97604000 139710000 129690000 163680000 182880000 89105000 224140000 109240000 180150000 89171000 143620000 157000000 188270000 9058 345 8468 81127;81128;81129;81130;81131;81132;81133;81134;81135;81136;81137;81138;81139 103267;103268;103269;103270;103271;103272;103273;103274;103275;103276;103277;103278;103279;103280;103281;103282;103283;103284;103285;103286;103287;103288 103276 22 EDAVSFAEK Unmodified 994.46074 0.46074075 1513 O43181 NDUFS4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 38.589 38.589 2 0.045687 33783 QUIQUE_C1277_190116_001 78.113 55.621 404090000 0 284540000 0 0 0 0 0 119540000 0 0 0 0 0 9059 1513 8469 81140;81141 103289;103290 103289 0 EDCIAYICR Unmodified 1198.5111 0.51107853 3590 Q8N4C8 MINK1 Misshapen-like kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.616 59.616 2 0.0016745 58101 QUIQUE_C1368_190116_001 101.28 84.044 148770000 15273000 26577000 33531000 0 27789000 19917000 25679000 0 0 0 0 0 0 9060 3590 8470 81142;81143;81144;81145;81146;81147 103291;103292;103293;103294;103295;103296 103293 6 EDCPGLNYAALVSGAGPSQAALWAK Unmodified 2545.2271 0.22712276 3124 Q15274;C9JCJ5 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 145.51 145.51 2;3 9.113E-24 149815 QUIQUE_C1403_190116_001 166.48 159.9 984060000 28727000 87388000 140340000 112640000 73597000 72598000 0 26052000 127530000 63253000 153930000 0 98007000 9061 3124 8471 81148;81149;81150;81151;81152;81153;81154;81155;81156;81157;81158;81159;81160;81161;81162;81163;81164;81165;81166;81167 103297;103298;103299;103300;103301;103302;103303;103304;103305;103306;103307;103308;103309;103310;103311;103312;103313;103314;103315;103316;103317;103318;103319;103320 103304 23 EDCSPADKPYIDEAR Unmodified 1764.7625 0.76247843 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.289 38.289 2 4.7202E-05 33864 QUIQUE_C1368_190116_001 100.02 85.864 121320000 31785000 0 51891000 37640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9062 3835 8472 81168;81169;81170;81171;81172;81173 103321;103322;103323;103324;103325;103326 103322 6 EDDGASIVCSVNHESLK Unmodified 1858.8367 0.83670601 3569 Q8N126 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 64.252 64.252 2;3 4.2707E-89 64084 QUIQUE_DMIX5_190116_001 234.92 217.45 3614200000 319780000 308030000 514700000 400370000 88438000 261440000 441030000 182170000 255120000 87828000 279580000 195460000 280300000 9063 3569 8473 81174;81175;81176;81177;81178;81179;81180;81181;81182;81183;81184;81185;81186;81187;81188;81189;81190;81191;81192;81193;81194;81195;81196;81197 103327;103328;103329;103330;103331;103332;103333;103334;103335;103336;103337;103338;103339;103340;103341;103342;103343;103344;103345;103346;103347;103348;103349;103350;103351;103352;103353 103350 22 EDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQR Unmodified 2661.2817 0.28167753 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8;F5H8J9 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 95.095 95.095 3 2.7733E-06 97918 QUIQUE_C1218_190116_001 41.763 34.317 39187000 39187000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9064 113 8474 81198 103354 103354 1 EDDKPETVIK Unmodified 1172.5925 0.5924832 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 18.864 18.864 2;3 0.031734 11594 QUIQUE_C1438_190116_001 79.489 26.138 468950000 0 0 0 0 468950000 0 0 0 0 0 0 0 0 9065 4450 8475 81199;81200 103355;103356 103356 2 EDDKPETVIKR Unmodified 1328.6936 0.69359423 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 15.068 15.068 3 0.024249 7355 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.153 45.924 234030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 234030000 0 9066 4450 8476 81201 103357 103357 1 EDDLNSFNATDLK Unmodified 1480.6682 0.66816734 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.059 85.059 2 7.5087E-08 87490 QUIQUE_C1218_190116_001 162.38 146.16 2530400000 197510000 196140000 240070000 287190000 257730000 167740000 252450000 60183000 140510000 165440000 231430000 163340000 170660000 9067 1977 8477 81202;81203;81204;81205;81206;81207;81208;81209;81210;81211;81212;81213;81214 103358;103359;103360;103361;103362;103363;103364;103365;103366;103367;103368;103369;103370;103371;103372;103373;103374;103375 103359 16 EDDLNSFNATDLKDLSSHQLNEFLAQTLQR Unmodified 3461.6699 0.66990526 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 155.68 155.68 4 7.0146E-25 160575 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.814 75.666 663540000 0 0 0 0 86634000 0 0 0 162160000 0 92927000 146890000 174930000 9068 1977 8478 81215;81216;81217;81218;81219 103376;103377;103378;103379;103380;103381;103382 103378 7 EDDPNFFK Unmodified 1010.4345 0.434526 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.753 59.753 2 0.0036692 59312 QUIQUE_C1218_190116_001 119.89 99.605 720990000 205420000 104540000 154450000 0 0 132550000 0 34744000 0 89282000 0 0 0 9069 1777 8479 81220;81221;81222;81223;81224;81225 103383;103384;103385;103386;103387;103388 103383 6 EDDRETLVSQCR Unmodified 1506.6733 0.67326949 4258 Q9NQW6 ANLN Actin-binding protein anillin yes yes 0 0 1 1 2 2 1 25.787 25.787 2;3 0.010233 19961 QUIQUE_C1576_190116_001 93.058 77.167 209910000 0 19034000 0 0 0 0 70120000 0 0 0 93610000 0 27145000 9070 4258 8480 81226;81227;81228;81229;81230;81231 103389;103390;103391;103392;103393;103394 103391 6 EDDSIRPFK Unmodified 1105.5404 0.54038805 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.378 30.378 2;3 0.01906 24794 QUIQUE_C1403_190116_001 48.091 27.221 412440000 0 87608000 68726000 100870000 0 0 0 47738000 69781000 0 37710000 0 0 9071 1912 8481 81232;81233;81234;81235;81236;81237 103395;103396;103397;103398;103399;103400 103397 5 EDDSIRPFKVETSDEEIHDLHQR Unmodified 2794.3158 0.31581443 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 2 1 1 2 62.671 62.671 3;4;5 2.6443E-05 62299 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.69 72.414 135060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 135060000 0 9072 1912 8482 81238;81239;81240;81241 103401;103402;103403;103404 103401 4 EDDSLTIFGVAER Unmodified 1450.694 0.69398816 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 118.71 118.71 2 0.00018159 123933 QUIQUE_C1218_190116_001 143.5 125.19 1575200000 156940000 181960000 132990000 112490000 170930000 110000000 241320000 102270000 125840000 86397000 154030000 0 0 9073 1214;1691 8483 81242;81243;81244;81245;81246;81247;81248;81249;81250;81251;81252;81253;81254;81255;81256;81257;81258 103405;103406;103407;103408;103409;103410;103411;103412;103413;103414;103415;103416;103417;103418;103419;103420;103421;103422;103423;103424;103425;103426;103427;103428;103429 103407 25 EDDVFLTELMK Unmodified 1338.6377 0.63771883 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 136.43 136.43 2 0.0027402 132698 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.465 58.952 9652700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9652700 0 0 0 9074 4390 8484 81259 103430 103430 1 EDEDDKTVLDLAVVLFETATLR Unmodified 2491.2694 0.26936473 2079 P14625;H0YIV0 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 1 1 1 177.08 177.08 3 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99125 QUIQUE_C1438_190116_001 247.14 242.06 1654600000 134130000 181930000 159150000 186940000 199010000 179830000 199270000 56085000 68470000 39318000 80717000 73711000 96090000 9077 2658 8487 81277;81278;81279;81280;81281;81282;81283;81284;81285;81286;81287;81288;81289;81290;81291;81292 103455;103456;103457;103458;103459;103460;103461;103462;103463;103464;103465;103466;103467;103468;103469;103470;103471;103472 103460 18 EDEEESLNEVGYDDIGGCRK Unmodified 2312.9703 0.97029895 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 75.676 75.676 3 1.3288E-07 76320 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.413 94.223 273600000 0 0 0 0 0 0 0 47691000 46864000 0 65899000 53468000 59678000 9078 2658 8488 81293;81294;81295;81296;81297;81298 103473;103474;103475;103476;103477;103478;103479;103480;103481 103474 8 EDEEGAFGEHGSQGTYSNTK Unmodified 2141.8774 0.87738485 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 32.868 32.868 3 4.6938E-38 26812 QUIQUE_C1368_190116_001 123.43 111.58 293060000 96602000 0 45868000 53381000 31182000 52199000 0 0 0 13825000 0 0 0 9079 2009 8489 81299;81300;81301;81302;81303;81304;81305 103482;103483;103484;103485;103486;103487;103488 103484 7 EDEGEPGDEGQLEDEGSQEK Unmodified 2175.8564 0.85637463 3784 Q969E4 TCEAL3 Transcription elongation factor A protein-like 3 yes yes 0 0 0 1 1 46.272 46.272 2 1.9492E-30 43157 QUIQUE_C1277_190116_001 148.52 128.99 37566000 0 37566000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9080 3784 8490 81306;81307 103489;103490 103489 2 EDEIPETVSLEMLDAAK Unmodified 1888.8976 0.89757493 1052 F8W7Q4;Q96A26;E9PH05 FAM162A Protein FAM162A yes no 0 0 0 1 138.65 138.65 2 0.00039347 144154 QUIQUE_C1218_190116_001 82.069 57.214 206570000 206570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9081 1052 8491 81308 103491 103491 1 EDEISPPPPNPVVK Unmodified 1516.7773 0.77732386 2002 P10644;K7EPB2;K7EIE5;K7EID3;K7EJ40;K7EK41;K7EMU2;K7EMZ6 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 61.926 61.926 2 0.04047 61324 QUIQUE_C1403_190116_001 67.704 50.764 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9082 2002 8492 81309;81310 103492;103493 103493 2 EDELTFIK Unmodified 993.50188 0.50187728 2143 P19174 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1 yes yes 0 0 0 1 77.106 77.106 2 0.039433 78140 QUIQUE_C1218_190116_001 60.895 22.059 27115000 27115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9083 2143 8493 81311 103494 103494 1 EDENAEPVGTTYQK Unmodified 1579.7002 0.70019575 3186 Q16643;D6R9W4 DBN1 Drebrin yes no 0 0 0 1 1 30.008 30.008 2 9.5124E-07 24871 QUIQUE_C1218_190116_001 122.51 101.14 49696000 35093000 14603000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9084 3186 8494 81312;81313 103495;103496 103495 2 EDENSWFNLFVIHQNR Unmodified 2046.9548 0.95478773 1053 F8W7U8;P49959;F5GXT0 MRE11A Double-strand break repair protein MRE11A yes no 0 0 0 1 1 143.24 143.24 3 0.00052761 146530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.09 47.52 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1647.7417 0.74166663 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.185 80.185 2 4.0734E-14 81032 QUIQUE_C1277_190116_001 192.21 174.04 351500000 42708000 75477000 77414000 0 59478000 0 59037000 0 0 37390000 0 0 0 9088 2640 8498 81337;81338;81339;81340;81341;81342;81343 103520;103521;103522;103523;103524;103525;103526 103521 7 EDFATFDYILCMDESNLR Unmodified 2237.9609 0.96092024 2231 P24666 ACP1 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 163.34 163.34 2 2.3579E-30 165289 QUIQUE_DMIX1_190116_001 180.54 149.67 68159000 14436000 0 0 0 0 0 14966000 13327000 0 0 0 0 25431000 9089 2231 8499 81344;81345;81346;81347 103527;103528;103529;103530 103529 3 EDFDSLLQSAK Unmodified 1251.5983 0.59829686 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 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131.56 3 6.8387E-20 135581 QUIQUE_C1403_190116_001 109.23 103.34 340780000 0 66963000 57292000 64021000 56018000 45907000 50578000 0 0 0 0 0 0 9092 3563 8502 81370;81371;81372;81373;81374;81375 103554;103555;103556;103557;103558;103559 103556 5 EDFSSMSAQLLYK Unmodified 1517.7072 0.70719538 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 118.87 118.87 2 0.0022425 122866 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.78 102.19 287580000 0 32496000 0 45389000 0 36634000 81665000 0 0 0 0 41004000 50388000 9093 4390 8503 81376;81377;81378;81379;81380;81381;81382;81383 103560;103561;103562;103563;103564;103565;103566;103567;103568;103569 103569 9 EDFTLLDFINAVK Unmodified 1523.7872 0.78716026 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 169.35 169.35 2;3 0.00011358 172911 QUIQUE_C1277_190116_001 83.137 63.861 385180000 5716700 9095800 0 8993100 0 0 12291000 0 143450000 44032000 154710000 0 6891500 9094 514 8504 81384;81385;81386;81387;81388;81389;81390;81391;81392;81393 103570;103571;103572;103573;103574;103575;103576;103577;103578;103579 103571 9 EDFTSLSLVLYSR Unmodified 1528.7773 0.77732386 822 D6RF35;P02774;D6RBJ7;D6RF20 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 1 142.35 142.35 2 0.0016871 149223 QUIQUE_C1438_190116_001 78.096 67.725 40927000 0 0 0 0 40927000 0 0 0 0 0 0 0 0 9095 822 8505 81394 103580;103581 103580 2 EDGAISTIVLR Unmodified 1172.6401 0.6401021 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.645 80.645 2 0.00049983 81143 QUIQUE_C1403_190116_001 140.88 77.461 733560000 201390000 0 0 149810000 0 168550000 0 122090000 0 91723000 0 0 0 9096 2572 8506 81395;81396;81397;81398;81399;81400 103582;103583;103584;103585;103586;103587;103588 103583 7 EDGFTAEHLAAEAMAADMDPWLVFDAR Unmodified 2978.3215 0.32149343 4156 Q9H3H3 C11orf68 UPF0696 protein C11orf68 yes yes 0 0 0 1 170.01 170.01 3 0.0032825 174021 QUIQUE_DMIX7_190116_001 32.434 29.606 8585900 0 0 0 0 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103602 103602 1 EDGLAQQQTQLNLR Unmodified 1612.8169 0.81689726 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.879 64.879 2 1.7731E-17 63571 QUIQUE_C1403_190116_001 192.12 146.52 954090000 160630000 0 0 292480000 0 0 0 148840000 272740000 79397000 0 0 0 9100 2524 8510 81412;81413;81414;81415;81416 103603;103604;103605;103606;103607 103604 5 EDGNEEDKENQGDETQGQQPPQR Unmodified 2627.0968 0.096773109 1118 H0Y449;P67809 YBX1 Nuclease-sensitive element-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.623 18.623 3 1.4285E-142 11158 QUIQUE_C1403_190116_001 215.98 213.01 537190000 26672000 78004000 63799000 73335000 49909000 52918000 54624000 0 34129000 22874000 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core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 10.888 10.888 3 9.0312E-05 3178 QUIQUE_C1403_190116_001 92.295 66.178 266230000 15574000 0 24765000 18500000 0 0 0 103740000 0 41610000 0 62040000 0 9104 2834 8514 81432;81433;81434;81435;81436;81437;81438 103624;103625;103626;103627;103628;103629;103630;103631 103627 8 EDGSEVGVGGAQVTGSNTR Unmodified 1818.8344 0.83439782 3017 Q13618;A0A087WTG3;H7C399 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 41.046 41.046 2 5.6258E-10 37434 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.77 125.61 244780000 0 42710000 0 0 0 0 52780000 0 0 31313000 64500000 53482000 0 9105 3017 8515 81439;81440;81441;81442;81443;81444 103632;103633;103634;103635;103636;103637 103634 6 EDGSGDRGDGPFR Unmodified 1363.5753 0.57527001 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 20.101 20.101 2;3 0.00026276 13215 QUIQUE_C1218_190116_001 92.856 52.939 1430100000 78438000 101700000 157770000 134550000 101330000 80207000 81543000 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 28.955 28.955 2 0.0028247 23985 QUIQUE_C1218_190116_001 98.73 74.508 523400000 86899000 95902000 0 111200000 0 97531000 0 0 0 0 131870000 0 0 9111 3536 8520 81488;81489;81490;81491;81492 103684;103685;103686;103687;103688;103689 103684 5 EDGVLCCQGECQWLHLDLIK Unmodified 2472.1236 0.12358567 2150 P19623 SRM Spermidine synthase yes yes 0 0 0 1 1 135.75 135.75 3 0.00019213 139962 QUIQUE_C1277_190116_001 62.617 55.256 82080000 0 43460000 0 38620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9112 2150 8521 81493;81494 103690;103691 103690 1 EDGVTPYMIFFK Unmodified 1445.6901 0.69008876 214 Q5W0H4;A0A0B4J2C3;P13693;J3KPG2;H0YCX0 TPT1 Translationally-controlled tumor protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.35 145.35 2 0.0013484 150798 QUIQUE_C1368_190116_001 90.696 73.978 1000100000 0 55705000 51783000 57066000 87239000 0 55741000 142230000 167200000 0 179940000 0 203180000 9113 214 8522 81495;81496;81497;81498;81499;81500;81501;81502;81503 103692;103693;103694;103695;103696;103697;103698;103699;103700;103701;103702;103703;103704;103705 103694 13 EDIANLADEFK Unmodified 1263.5983 0.59829686 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.04 109.04 2 1.8215E-24 113841 QUIQUE_C1218_190116_001 183.67 150.83 2887800000 714940000 361890000 448930000 362980000 0 0 253460000 0 0 294670000 174680000 123130000 153100000 9114 3975 8523 81504;81505;81506;81507;81508;81509;81510;81511;81512;81513;81514 103706;103707;103708;103709;103710;103711;103712;103713;103714;103715;103716;103717;103718;103719;103720;103721;103722;103723;103724 103707 19 EDIDTAMK Unmodified 921.41135 0.41134771 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 27.882 27.882 2 0.031416 22458 QUIQUE_C1218_190116_001 66.073 16.65 257710000 151970000 0 0 0 105750000 0 0 0 0 0 0 0 0 9115 913 8524 81515;81516 103725;103726 103725 2 EDIEFICK Unmodified 1052.4848 0.48484701 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 68.345 68.345 2 0.013433 69152 QUIQUE_C1218_190116_001 87.323 56.819 240220000 79216000 0 0 0 0 66174000 0 0 24072000 33664000 0 0 37090000 9116 2573 8525 81517;81518;81519;81520;81521 103727;103728;103729;103730;103731;103732 103727 6 EDIFYTSK Unmodified 1001.4706 0.47057715 183;2889;2616 P52895;B4DK69;S4R3P0;A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;S4R3D5;Q04828;H0Y804;A6NHU4 AKR1C2;AKR1C3;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C2;Aldo-keto reductase family 1 member C3;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 49.695 49.695 2 0.039276 47843 QUIQUE_C1403_190116_001 89.046 76.839 91163000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91163000 9117 2616;183;2889 8526 81522;81523;81524;81525;81526 103733;103734;103735;103736;103737 103734 5 EDIIQGFR Unmodified 976.49779 0.49779495 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.663 71.663 2 0.004032 71919 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.63 43.64 579990000 76933000 60232000 63447000 57858000 43774000 70495000 57874000 0 27229000 46234000 26496000 23644000 25773000 9118 2051 8527 81527;81528;81529;81530;81531;81532;81533;81534;81535;81536;81537;81538 103738;103739;103740;103741;103742;103743;103744;103745;103746;103747;103748;103749;103750;103751;103752;103753;103754;103755;103756;103757;103758 103753 21 EDILENQFMDSR Oxidation (M) 1511.6562 0.65622244 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 80.645 80.645 2 0.00081982 81660 QUIQUE_C1277_190116_001 90.05 75.36 176290000 32384000 25965000 26648000 28754000 0 28195000 0 0 0 34341000 0 0 0 9119 2277 8528 81539;81540;81541;81542;81543;81544 103759;103760;103761;103762;103763;103764;103765 103761 1645 7 EDILENQFMDSR Unmodified 1495.6613 0.66130782 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.46 101.46 2 1.528E-28 105403 QUIQUE_C1576_190116_001 185.29 169.72 849690000 107460000 114190000 91480000 113750000 66667000 100140000 65234000 0 41994000 0 52252000 46607000 49927000 9120 2277 8528 81545;81546;81547;81548;81549;81550;81551;81552;81553;81554;81555 103766;103767;103768;103769;103770;103771;103772;103773;103774;103775;103776;103777 103773 9 EDILNYLEK Unmodified 1135.5761 0.57610486 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 111.15 111.15 2 0.0025828 113228 QUIQUE_C1563_190116_001 93.267 51.158 34760000 0 0 0 0 0 34760000 0 0 0 0 0 0 0 9121 2014 8529 81556 103778 103778 1 EDIQSVMTEIR Unmodified 1319.6391 0.63911582 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 100.81 100.81 2 0.0048459 103230 QUIQUE_C1403_190116_001 70.399 37.4 18020000 0 0 0 18020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9122 2629 8530 81557 103779 103779 1 EDIQSVMTEIRR Unmodified 1475.7402 0.74022685 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 1 1 84.329 84.329 3 0.00085762 84946 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.531 54.341 26437000 0 0 0 0 0 0 0 26437000 0 0 0 0 0 9123 2629 8531 81558 103780 103780 1 EDISGIASCVFTR Unmodified 1453.6871 0.68712864 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 114.66 114.66 2 2.599E-17 118440 QUIQUE_DMIX7_190116_001 163.84 136.1 316550000 0 0 0 0 0 0 0 53103000 56867000 0 62928000 70556000 73094000 9124 57 8532 81559;81560;81561;81562;81563 103781;103782;103783;103784;103785;103786 103785 4 EDISSIEIVGGATR Unmodified 1445.7362 0.73618733 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 88.687 88.687 2 8.0107E-14 91154 QUIQUE_C1368_190116_001 140.78 117.71 754860000 0 0 106340000 0 146620000 0 133880000 0 0 0 92965000 136250000 138790000 9125 1748 8533 81564;81565;81566;81567;81568;81569;81570;81571 103787;103788;103789;103790;103791;103792;103793;103794;103795;103796 103788 8 EDITHTYK Unmodified 1005.4767 0.47672516 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 16.08 16.08 2 0.0086993 8365 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.561 51.669 25189000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25189000 0 0 0 9126 2190 8534 81572 103797 103797 1 EDITQEFPGK Unmodified 1162.5506 0.55061839 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YE22 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 61.712 61.712 2 0.040284 61810 QUIQUE_C1438_190116_001 51.066 33.826 85804000 0 0 0 0 85804000 0 0 0 0 0 0 0 0 9127 798 8535 81573 103798 103798 1 EDITQSAQHALR Unmodified 1367.6793 0.67934115 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 41.463 41.463 2;3 8.2778E-28 38452 QUIQUE_C1438_190116_001 179.08 139.46 2723500000 126530000 367830000 254490000 102990000 102580000 112360000 327900000 83846000 124730000 116050000 513910000 126850000 363410000 9128 2951 8536 81574;81575;81576;81577;81578;81579;81580;81581;81582;81583;81584;81585;81586;81587;81588;81589;81590;81591 103799;103800;103801;103802;103803;103804;103805;103806;103807;103808;103809;103810;103811;103812;103813;103814;103815;103816;103817;103818;103819;103820 103805 19 EDIVVPVYLR Unmodified 1201.6707 0.67067394 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.13 105.13 2 0.00019132 108439 QUIQUE_C1277_190116_001 123.69 80.443 668150000 60992000 81926000 55526000 50292000 126610000 58316000 51032000 49274000 36796000 0 0 54539000 42846000 9129 1096 8537 81592;81593;81594;81595;81596;81597;81598;81599;81600;81601;81602 103821;103822;103823;103824;103825;103826;103827;103828;103829;103830;103831 103822 11 EDIYAVEIVGGATR Unmodified 1491.7569 0.75692277 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 2 2 3 2 1 3 2 1 1 1 3 103.17 103.17 2;3 7.768E-05 100153 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.271 61.595 280300000 17411000 0 0 15389000 0 19333000 20472000 16786000 0 19221000 59594000 112090000 0 9130 2363 8538 81603;81604;81605;81606;81607;81608;81609;81610;81611;81612;81613;81614;81615;81616;81617;81618;81619;81620;81621;81622;81623 103832;103833;103834;103835;103836;103837;103838;103839;103840;103841;103842;103843;103844;103845;103846;103847;103848;103849;103850;103851;103852;103853;103854;103855 103848 22 EDIYSGGGGGGSR Unmodified 1210.5214 0.52144352 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.052 21.052 2 7.3049E-09 13570 QUIQUE_C1277_190116_001 139.86 125.7 2058200000 286510000 243710000 249830000 205050000 0 171960000 157680000 185600000 155990000 95015000 153150000 0 153680000 9131 2969 8539 81624;81625;81626;81627;81628;81629;81630;81631;81632;81633;81634 103856;103857;103858;103859;103860;103861;103862;103863;103864;103865;103866;103867 103858 10 EDKDAQFYCELNYR Unmodified 1849.7941 0.79411291 2461 P43121 MCAM Cell surface glycoprotein MUC18 yes yes 0 0 1 1 1 76.405 76.405 3 0.015922 77462 QUIQUE_DMIX8_190116_001 36.445 30.904 70156000 0 0 37836000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32320000 9132 2461 8540 81635;81636 103868;103869 103869 2 EDKESNPATINAATELDTPK Unmodified 2143.0281 0.028071829 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 60.213 60.213 2;3 5.7766E-116 59698 QUIQUE_DMIX5_190116_001 256.26 228.4 1742400000 40680000 56859000 80302000 0 83363000 134110000 65837000 128580000 380520000 177790000 183880000 188990000 221460000 9133 2233 8541 81637;81638;81639;81640;81641;81642;81643;81644;81645;81646;81647;81648;81649;81650;81651;81652;81653;81654;81655 103870;103871;103872;103873;103874;103875;103876;103877;103878;103879;103880;103881;103882;103883;103884;103885;103886;103887;103888;103889 103885 19 EDKHECPFGR Unmodified 1273.551 0.55096951 3280;3732 Q92556;H7C0S6;Q5JVZ5;Q96JJ3;H0YCM7;Q5JVZ8 ELMO1;ELMO2 Engulfment and cell motility protein 1;Engulfment and cell motility protein 2 no no 0 0 1 1 13.846 13.846 3 0.028431 5852 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.292 37.337 26114000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26114000 0 0 0 9134 3732;3280 8542 81656 103890 103890 1 EDKLECSEELGDLVK Unmodified 1762.8295 0.82949536 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 81.263 81.263 2;3 1.9541E-129 82191 QUIQUE_C1277_190116_001 241.51 199.97 5110600000 800010000 945310000 215870000 795780000 656170000 177790000 736950000 42872000 65195000 180980000 242560000 113560000 137520000 9135 50;2631 8543 81657;81658;81659;81660;81661;81662;81663;81664;81665;81666;81667;81668;81669;81670;81671;81672;81673;81674;81675;81676 103891;103892;103893;103894;103895;103896;103897;103898;103899;103900;103901;103902;103903;103904;103905;103906;103907;103908;103909;103910 103893 16 EDKSPSEESAPTTSPESVSGSVPSSGSSGR Unmodified 2921.301 0.3010118 2646 P54725 RAD23A UV excision repair protein RAD23 homolog A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.181 47.181 3 1.5119E-35 44508 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.53 94.941 424290000 0 46493000 0 55775000 64257000 52465000 0 0 53439000 0 62061000 43667000 46136000 9136 2646 8544 81677;81678;81679;81680;81681;81682;81683;81684 103911;103912;103913;103914;103915;103916;103917;103918;103919 103915 9 EDKYEEEIK Unmodified 1181.5452 0.54519866 3271;435;2791;1260;1908;557;3325 J3KN67;A0A2R8Y6A3;P06753;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;K7EMU5;U3KQK2;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;K7EPB9;Q5HYB6;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951 TPM3;TPM4;TPM2;DKFZp686J1372;TPM2b Tropomyosin alpha-3 chain;Tropomyosin alpha-4 chain;Tropomyosin beta chain no no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 21.102 21.102 2;3 4.1554E-06 14800 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.99 120.44 2622000000 383710000 519680000 757090000 393170000 0 0 359630000 55136000 153610000 0 0 0 0 + 9137 1260;1908;435;2791;3271;557;3325 8545 81685;81686;81687;81688;81689;81690;81691;81692 103920;103921;103922;103923;103924;103925;103926;103927;103928 103927 8 EDLAAFVEELDKVESQER Unmodified 2106.0117 0.011693483 2879 Q02880 TOP2B DNA topoisomerase 2-beta yes yes 0 0 1 1 1 2 1 148.38 148.38 3 5.5709E-06 154054 QUIQUE_C1218_190116_001 103.5 88.731 89613000 18535000 33692000 0 0 0 37386000 0 0 0 0 0 0 0 9138 2879 8546 81693;81694;81695;81696;81697 103929;103930;103931;103932;103933 103929 3 EDLAALEK Unmodified 887.46001 0.46001246 1990;688 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;C9J2C0;Q9NY65 TUBA3E;TUBA8 Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 42.346 42.346 2 0.025424 36932 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.501 28.587 1702500000 702620000 0 0 637400000 0 0 0 172910000 0 189600000 0 0 0 9139 1990;688 8547 81698;81699;81700;81701 103934;103935;103936;103937 103937 3 EDLDKVEPAVIEAQNAVK Unmodified 1967.0211 0.021135958 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 3 91.289 91.289 2;3 9.1599E-21 93264 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104127;104128;104129;104130;104131;104132;104133;104134;104135;104136;104137;104138;104139;104140;104141;104142;104143;104144;104145;104146;104147;104148;104149;104150;104151;104152;104153;104154;104155;104156;104157;104158;104159;104160;104161;104162 104153 35 EDLRPSAPQQEGEASK Unmodified 1740.8279 0.82785588 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.717 22.717 2 1.153E-13 16610 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.96 122.11 737960000 86418000 103640000 78829000 117190000 75479000 58797000 0 30727000 36686000 0 98967000 0 51220000 9164 1681 8570 81894;81895;81896;81897;81898;81899;81900;81901;81902;81903 104163;104164;104165;104166;104167;104168;104169;104170;104171;104172 104169 10 EDLSPSITQR Unmodified 1144.5724 0.57241646 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 41.65 41.65 2 0.0031639 39424 QUIQUE_C1438_190116_001 85.862 50.506 135390000 0 0 0 0 99783000 0 0 0 0 0 0 0 35604000 9165 2075 8571 81904;81905 104173;104174 104173 1 EDLSWPGLAVGNLFHR Unmodified 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104181;104182;104183;104184;104185;104186;104187;104188;104189;104190;104191;104192;104193 104181 13 EDLVQDQDLEAIR Unmodified 1542.7526 0.75256567 3479 Q7Z7L7;X6RC68;X6RD87 ZER1 Protein zer-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 90.263 90.263 2 0.010751 92609 QUIQUE_C1368_190116_001 69.01 50.265 59487000 0 0 37482000 0 0 0 0 0 0 22004000 0 0 0 9171 3479 8577 81924;81925 104194;104195 104194 2 EDLVVAPAGITLK Unmodified 1324.7602 0.76021723 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 0 1 103.93 103.93 2 0.015697 100762 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.595 58.014 11759000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11759000 0 0 0 9172 2040 8578 81926 104196 104196 0 EDLVYQAK Unmodified 964.48656 0.48656157 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1;I3L0W5 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 31.521 31.521 2 0.0036026 26688 QUIQUE_C1218_190116_001 113.85 76.237 1865700000 773300000 0 595450000 496970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9173 2745 8579 81927;81928;81929 104197;104198;104199 104197 3 EDLYEAADK Unmodified 1052.4662 0.46622005 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 1 1 1 1 35.602 35.602 2 0.016065 31907 QUIQUE_C1218_190116_001 66.27 38.096 232610000 83459000 0 60342000 0 45842000 0 42964000 0 0 0 0 0 0 9174 4184 8580 81930;81931;81932;81933 104200;104201;104202;104203;104204 104200 5 EDLYEAADKWVAAVGK Unmodified 1763.873 0.87301516 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 1 1 1 133.49 133.49 3 0.00065288 139964 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.878 58.439 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9175 4184 8581 81934;81935 104205;104206 104206 2 EDLYLKPIQR Unmodified 1273.703 0.7030367 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 51.683 51.683 2;3 0.0012143 49609 QUIQUE_C1368_190116_001 151.56 134.18 2334400000 163000000 0 227650000 237260000 109250000 261050000 265070000 201330000 236680000 0 159360000 247150000 226600000 9176 2058 8582 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104228;104229;104230;104231;104232;104233;104234;104235;104236;104237;104238;104239;104240;104241;104242;104243;104244;104245;104246;104247;104248;104249;104250;104251;104252;104253;104254;104255;104256;104257;104258;104259 104236 31 EDNGIGILTLNNPSR Unmodified 1611.8216 0.82164829 4294 Q9NTX5;H0Y5L2;J3KP84;E9PPG7;E9PRU6;F2Z2D6;E9PJS8;E9PLY6;E9PIU8 ECHDC1 Ethylmalonyl-CoA decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.42 100.42 2 8.5907E-07 103234 QUIQUE_C1277_190116_001 140 113.49 84612000 0 0 0 0 84612000 0 0 0 0 0 0 0 0 9178 4294 8584 81968;81969;81970;81971;81972;81973;81974;81975;81976 104260;104261;104262;104263;104264;104265;104266;104267;104268 104261 8 EDPANILQELPAPLLDDK Unmodified 1990.0259 0.025886985 372 A0A1W2PNY5;A0A1W2PQZ6;A0A1W2PRF0;A0A1W2PRJ0;A0A1W2PPP6;A0A1X7SBS0;A0A1W2PS93;A0A1W2PR08;A0A1W2PRF5;G5E9D4;Q96EB1;E9PPJ9;A0A1W2PQA7 ELP4 Elongator complex protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 157.5 157.5 2 5.7741E-05 163499 QUIQUE_C1576_190116_001 93.348 77.809 73621000 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EDSLQDAWDYVQAQVK Unmodified 1893.8745 0.87447172 2267 P27701;E9PJC7 CD82 CD82 antigen;Tetraspanin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 153.8 153.8 3 0.0003471 157782 QUIQUE_C1403_190116_001 68.413 64.241 178890000 0 0 37232000 23184000 24931000 24160000 34421000 0 18507000 16450000 0 0 0 9205 2267 8611 82142;82143;82144;82145;82146;82147;82148 104485;104486;104487;104488;104489;104490;104491 104486 7 EDSMMEYLK Unmodified 1144.478 0.47804707 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E9PKN5 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.191 87.191 2 0.0026282 84554 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.162 89.05 530690000 0 0 78855000 70244000 42258000 68211000 78271000 35092000 53038000 28501000 30044000 46179000 0 9206 434 8612 82149;82150;82151;82152;82153;82154;82155;82156;82157;82158 104492;104493;104494;104495;104496;104497;104498;104499;104500;104501;104502 104499 9 EDSPQSHVLVMK Unmodified 1368.6708 0.6707503 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 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Oxidation (M) 1644.8644 0.86442431 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 150.6 150.6 2 0.00012582 157694 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.001 69.634 221000000 22824000 20567000 30449000 19263000 21408000 0 15555000 0 25079000 19847000 0 0 46011000 9228 2976 8634 82325;82326;82327;82328;82329;82330;82331;82332;82333;82334;82335 104698;104699;104700;104701;104702;104703;104704;104705;104706;104707;104708;104709 104707 2434 12 EDVLTLLLPVMGDSK Unmodified 1628.8695 0.86950968 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 167.03 167.03 2;3 3.434E-13 171798 QUIQUE_C1218_190116_001 138.24 103.54 1425800000 203070000 166560000 258140000 138360000 98841000 86562000 113270000 32530000 57727000 40366000 69192000 61202000 100030000 9229 2976 8634 82336;82337;82338;82339;82340;82341;82342;82343;82344;82345;82346;82347;82348;82349;82350;82351;82352;82353 104710;104711;104712;104713;104714;104715;104716;104717;104718;104719;104720;104721;104722;104723;104724;104725;104726;104727;104728 104710 19 EDVPTFGPPLPSPPVFQK Unmodified 1951.0091 0.0091147084 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 136.08 136.08 2 2.2158E-11 141522 QUIQUE_C1218_190116_001 120.84 99.063 368030000 41302000 38769000 28651000 39105000 0 35356000 32013000 56514000 0 17411000 41090000 0 37819000 9230 354 8635 82354;82355;82356;82357;82358;82359;82360;82361;82362;82363;82364;82365 104729;104730;104731;104732;104733;104734;104735;104736;104737;104738;104739;104740;104741 104729 12 EDVSLHGYK Unmodified 1046.5033 0.50327426 2943 Q12792;F8VS81;F8W1Q9 TWF1 Twinfilin-1 yes no 0 0 0 1 23.837 23.837 2 0.038939 17218 QUIQUE_C1403_190116_001 68.383 32.889 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9231 2943 8636 82366 104742 104742 1 EDVSLHGYKK Unmodified 1174.5982 0.59823728 2943 Q12792;F8VS81;F8W1Q9 TWF1 Twinfilin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 15.25 15.25 2;3 0.029915 7539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.652 17.593 158060000 0 0 0 0 0 0 0 23813000 88654000 0 0 0 45594000 9232 2943 8637 82367;82368;82369 104743;104744;104745;104746 104745 4 EDVYVVGTVLR Unmodified 1248.6714 0.67140222 1847 P04003 C4BPA C4b-binding protein alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 93.232 93.232 2 0.0080154 90145 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.162 50.734 132620000 21882000 22705000 0 0 58698000 0 0 0 0 29332000 0 0 0 9233 1847 8638 82370;82371;82372;82373;82374 104747;104748;104749;104750;104751 104751 5 EDWIAYISR Unmodified 1151.5611 0.56112349 263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62 MAP4K4 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 120.43 120.43 2 0.010193 124197 QUIQUE_C1403_190116_001 74.464 52.614 27673000 0 0 0 11895000 0 0 0 0 0 0 15778000 0 0 9234 263 8639 82375;82376;82377;82378;82379;82380;82381 104752;104753;104754;104755;104756;104757;104758 104754 7 EDYAGLKEEFR Unmodified 1355.6357 0.635745 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 1 3 58.705 58.705 2;3 0.015732 57773 QUIQUE_C1368_190116_001 93.096 64.369 79877000 0 0 79877000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9235 2812 8640 82382;82383;82384 104759;104760;104761 104761 3 EDYICYAR Unmodified 1088.4597 0.45969489 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.331 54.331 2 0.013463 49876 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.284 61.547 117390000 0 0 0 0 74068000 0 0 0 0 43323000 0 0 0 9236 756 8641 82385;82386;82387;82388 104762;104763;104764;104765 104765 3 EDYIEFASLDGSNR Unmodified 1614.7162 0.71618016 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 111.37 111.37 2 0.0009464 113646 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protein FAM213A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 45.164 45.164 2 0.006881 42077 QUIQUE_C1403_190116_001 73.985 32.956 1049200000 106530000 131890000 184420000 135440000 0 132590000 164600000 0 0 0 193690000 0 0 9240 4006 8645 82400;82401;82402;82403;82404;82405;82406;82407;82408 104778;104779;104780;104781;104782;104783;104784;104785;104786;104787;104788 104783 11 EEAAGPALALSLIER Unmodified 1538.8304 0.83042206 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 4 3 3 2 1 2 136.84 136.84 2;3 1.5747E-12 141408 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.47 126.16 2499600000 156050000 145910000 252680000 88218000 166650000 184750000 193990000 224280000 302730000 147390000 224510000 175750000 236700000 9241 2578 8646 82409;82410;82411;82412;82413;82414;82415;82416;82417;82418;82419;82420;82421;82422;82423;82424;82425;82426;82427;82428;82429;82430;82431;82432;82433 104789;104790;104791;104792;104793;104794;104795;104796;104797;104798;104799;104800;104801;104802;104803;104804;104805;104806;104807;104808;104809;104810;104811;104812;104813;104814;104815;104816;104817;104818;104819;104820;104821;104822;104823;104824;104825;104826;104827 104812 37 EEAENTLQSFR Unmodified 1322.6103 0.61025853 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 57.105 57.105 1;2 1.1165E-83 56135 QUIQUE_C1277_190116_001 234.05 195.89 128650000000 9069500000 9088300000 14471000000 15487000000 12361000000 11906000000 11209000000 5763800000 10580000000 5788600000 11899000000 0 11023000000 9242 1952 8647 82434;82435;82436;82437;82438;82439;82440;82441;82442;82443;82444;82445;82446;82447;82448;82449;82450;82451;82452;82453;82454 104828;104829;104830;104831;104832;104833;104834;104835;104836;104837;104838;104839;104840;104841;104842;104843;104844;104845;104846;104847;104848;104849;104850;104851;104852;104853;104854;104855;104856;104857;104858;104859;104860;104861;104862;104863;104864;104865;104866 104831 32 EEAENTLQSFRQDVDNASLAR Unmodified 2392.1255 0.12549446 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 1 1 106.5 106.5 3 8.378E-10 108296 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.166 72.378 459550000 0 0 0 0 0 0 0 459550000 0 0 0 0 0 9243 1952 8648 82455 104867;104868 104868 2 EEAERELER Unmodified 1159.5469 0.54692999 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 1 15.391 15.391 2 0.0032543 7642 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.48 66.371 77020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37813000 39207000 0 9244 3117 8649 82456;82457 104869;104870 104869 2 EEAFDAICQLVAGK Unmodified 1549.7446 0.74464352 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 139.86 139.86 2 0.0018271 145100 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104939 13 EEAQMEVEQYR Oxidation (M) 1426.6035 0.60345859 1740 O95670;H0Y474;F2Z307 ATP6V1G2;ATP6V1G2-DDX39B V-type proton ATPase subunit G 2 yes no 0 1 0 1 1 1 37.531 37.531 2 0.01331 32959 QUIQUE_C1563_190116_001 61.56 41.783 93235000 36785000 0 28476000 0 0 27974000 0 0 0 0 0 0 0 9255 1740 8659 82521;82522;82523 104944;104945;104946 104946 947 2 EEAQYDLR Unmodified 1022.4669 0.46688876 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 29.73 29.73 2 0.013835 24072 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 58.62 132180000 0 0 0 0 46351000 85826000 0 0 0 0 0 0 0 9256 1570 8660 82524;82525 104947;104948 104948 2 EEASDYLELDTIK Unmodified 1524.7195 0.71953421 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.32 104.32 2;3 1.5806E-07 107127 QUIQUE_C1403_190116_001 131.82 101.56 4165200000 421060000 459540000 402780000 464130000 421320000 421020000 438940000 172880000 244440000 194890000 0 254870000 269360000 9257 2079 8661 82526;82527;82528;82529;82530;82531;82532;82533;82534;82535;82536;82537;82538 104949;104950;104951;104952;104953;104954;104955;104956;104957;104958;104959;104960;104961;104962;104963;104964;104965 104953 16 EEASGSSVTAEEAK Unmodified 1393.6209 0.6208828 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.476 17.476 2 8.9461E-07 9715 QUIQUE_C1576_190116_001 123.01 113.67 1974500000 0 265000000 323310000 211840000 0 269260000 234990000 0 0 130280000 208370000 120610000 210810000 9258 2051 8662 82539;82540;82541;82542;82543;82544;82545;82546;82547 104966;104967;104968;104969;104970;104971;104972;104973;104974 104970 9 EEASGSSVTAEEAKK Unmodified 1521.7158 0.71584581 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 1 1 2 3 2 2 1 2 1 2 2 2 11.734 11.734 2;3 7.328E-36 4472 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.31 126.9 1107000000 881190 0 76200000 23765000 186080000 0 105630000 72107000 147390000 2621300 281900000 57120000 153300000 9259 2051 8663 82548;82549;82550;82551;82552;82553;82554;82555;82556;82557;82558;82559;82560;82561;82562;82563;82564;82565;82566;82567 104975;104976;104977;104978;104979;104980;104981;104982;104983;104984;104985;104986;104987;104988;104989;104990;104991;104992;104993;104994;104995;104996;104997;104998;104999;105000;105001 104996 26 EEATGGLLGGPQLLPAEGALFLTTYR Unmodified 2673.4014 0.40138196 3507 Q86WG5 SBF2 Myotubularin-related protein 13 yes yes 0 0 0 1 166.8 166.8 3 0.00018936 160859 QUIQUE_DMIX4_190116_001 28.404 26.121 8315000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8315000 0 0 0 9260 3507 8664 82568 105002 105002 1 EEATTFSNAMLFALNIMNSQEGGPSSQR Unmodified 3029.3859 0.3858846 4441 Q9UI08;G3V2K5;G3V5F7 EVL Ena/VASP-like protein yes no 0 0 0 1 170.25 170.25 3 7.2904E-05 172019 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.003 39.842 15706000 0 0 0 0 0 0 0 15706000 0 0 0 0 0 9261 4441 8665 82569 105003 105003 1 EEAVLFLLDLPK Unmodified 1385.7806 0.78061832 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.24 156.24 2 7.1572E-05 162431 QUIQUE_C1576_190116_001 143.89 128.88 860080000 62975000 58975000 71624000 64582000 68020000 55245000 94728000 54995000 85274000 24287000 88309000 68364000 62699000 9262 1074 8666 82570;82571;82572;82573;82574;82575;82576;82577;82578;82579;82580;82581;82582 105004;105005;105006;105007;105008;105009;105010;105011;105012;105013;105014;105015;105016;105017 105011 14 EEAVPEASPVTQAGASVITVETVIQENVGAQK Unmodified 3250.6569 0.65688096 933;1529 E9PHY5;O43491;Q6R5J7;E9PMV8 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.88 160.88 3 1.2786E-25 166229 QUIQUE_C1218_190116_001 85.745 78.648 789910000 51290000 53243000 67616000 114890000 71938000 83981000 60403000 53750000 49759000 45905000 31431000 46807000 58900000 9263 933;1529 8667 82583;82584;82585;82586;82587;82588;82589;82590;82591;82592;82593;82594;82595 105018;105019;105020;105021;105022;105023;105024;105025;105026;105027;105028;105029;105030;105031;105032;105033 105018 15 EECDKYALQSQQR Unmodified 1653.7417 0.74168341 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.842 21.842 2 7.701E-227 15543 QUIQUE_DMIX1_190116_001 292.33 278.53 1645700000 125590000 118750000 155770000 111600000 157100000 98068000 166940000 158620000 0 25025000 150220000 125780000 252190000 9264 2453 8668 82596;82597;82598;82599;82600;82601;82602;82603;82604;82605;82606;82607 105034;105035;105036;105037;105038;105039;105040;105041;105042;105043;105044;105045;105046 105041 13 EECPVFTPPGGETLDQVK Unmodified 2001.9354 0.93535742 4251 Q9NQ88;A0A0U1RQD1 TIGAR Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR yes no 0 0 0 1 98.388 98.388 2 0.0029349 101531 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.414 48.503 24681000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24681000 9265 4251 8669 82608 105047 105047 1 EEDAASTLVTGSEYETMLTEIMSMGYER Unmodified 3142.3668 0.36684823 2646 P54725 RAD23A UV excision repair protein RAD23 homolog A yes yes 0 0 0 1 1 173.16 173.16 3 2.1382E-15 174689 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.711 74.745 19331000 0 0 0 0 0 0 0 7358500 0 0 0 0 11973000 9266 2646 8670 82609;82610 105048;105049 105048 2 EEDACHLIIPLR Unmodified 1464.7395 0.73949856 3347 Q66K14 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes yes 0 0 0 1 1 1 80.976 80.976 3 0.017718 83658 QUIQUE_C1438_190116_001 47.288 41.915 101820000 0 26423000 0 0 38220000 0 0 0 0 0 0 0 37174000 9267 3347 8671 82611;82612;82613 105050;105051;105052 105051 2 EEDATLSSPAVVMPTMGR Unmodified 1889.8863 0.88629874 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 104.88 104.88 2;3 1.6453E-17 108992 QUIQUE_C1218_190116_001 175.21 164.22 1379900000 356690000 313310000 0 297910000 0 291660000 0 0 0 0 0 120300000 0 9268 2870 8672 82614;82615;82616;82617;82618;82619 105053;105054;105055;105056;105057;105058 105053 5 EEDATLSSPAVVMPTMGR Oxidation (M) 1905.8812 0.88121336 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 83.823 83.823 2 3.0898E-13 86283 QUIQUE_C1277_190116_001 124.48 110.82 473960000 0 52289000 130540000 119460000 0 74002000 49045000 0 0 48630000 0 0 0 9269 2870 8672 82620;82621;82622;82623;82624;82625;82626;82627 105059;105060;105061;105062;105063;105064;105065;105066 105059 2347;2348 7 EEDDVVSEDLVQQDVQDLYEAGELK Unmodified 2864.3087 0.30872294 1936 P08133 ANXA6 Annexin A6 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 161.19 161.19 2;3 8.3593E-196 165679 QUIQUE_DMIX3_190116_001 298.71 288.37 8954900000 893130000 701300000 984720000 734440000 792760000 821010000 803390000 301590000 718620000 381920000 817440000 625510000 379120000 9270 1936 8673 82628;82629;82630;82631;82632;82633;82634;82635;82636;82637;82638;82639;82640;82641;82642;82643;82644;82645;82646;82647;82648;82649;82650;82651;82652;82653;82654;82655 105067;105068;105069;105070;105071;105072;105073;105074;105075;105076;105077;105078;105079;105080;105081;105082;105083;105084;105085;105086;105087;105088;105089;105090;105091;105092;105093;105094;105095;105096;105097;105098;105099;105100;105101;105102 105089 35 EEDEEPESPPEK Unmodified 1413.5783 0.57834928 4130 Q9H1E3 NUCKS1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 20.426 20.426 2 0.00048854 13097 QUIQUE_C1563_190116_001 127.76 120.12 72135000 0 0 0 0 0 35852000 21231000 0 0 15051000 0 0 0 9271 4130 8674 82656;82657;82658 105103;105104;105105;105106 105104 4 EEDEEPESPPEKK Unmodified 1541.6733 0.6733123 4130 Q9H1E3 NUCKS1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 12.902 12.902 2;3 0.00020547 3351 QUIQUE_C1277_190116_001 71.268 64.066 204700000 22278000 56420000 0 0 43873000 36307000 13574000 0 15243000 7954100 0 9052200 0 9272 4130 8675 82659;82660;82661;82662;82663;82664;82665;82666;82667;82668;82669;82670 105107;105108;105109;105110;105111;105112;105113;105114;105115;105116;105117;105118;105119;105120;105121;105122;105123;105124 105108 18 EEDFDQLLEALR Unmodified 1476.7096 0.70963822 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 1 1 153.16 153.16 2 0.0042664 159117 QUIQUE_C1218_190116_001 83 58.077 17051000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17051000 9273 4488 8676 82671;82672;82673 105125;105126;105127 105125 3 EEDIAVLAEEK Unmodified 1244.6136 0.61361257 3659 Q8TAF3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes yes 0 0 0 1 1 24.308 24.308 3 0.020933 17243 QUIQUE_C1277_190116_001 33.088 6.4154 150640000 0 84547000 0 0 0 0 0 0 0 66094000 0 0 0 9274 3659 8677 82674;82675 105128;105129 105128 2 EEDKEPLIELFVK Unmodified 1587.8396 0.83958976 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 1 1 123.27 123.27 3 0.005351 119914 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.212 48.334 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9275 4646 8678 82676 105130 105130 1 EEDNKYCADCEAK Unmodified 1630.6239 0.62393604 3553 Q8IYB5 SMAP1 Stromal membrane-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 14.377 14.377 3 0.035028 5938 QUIQUE_C1277_190116_001 36.77 32.222 31571000 12614000 18957000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9276 3553 8679 82677;82678 105131;105132 105132 2 EEDPATGTGDPPR Unmodified 1340.5844 0.58443771 2472 P45974;F5H571 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.038 21.038 2 0.00032845 14392 QUIQUE_C1218_190116_001 136.96 121.3 4506700000 531460000 503230000 531800000 580590000 592710000 544640000 391590000 111070000 142330000 64772000 183170000 145000000 184370000 9277 2472 8680 82679;82680;82681;82682;82683;82684;82685;82686;82687;82688;82689;82690;82691 105133;105134;105135;105136;105137;105138;105139;105140;105141;105142;105143;105144;105145;105146;105147;105148;105149;105150;105151;105152 105133 20 EEDPAVLISEVLR Unmodified 1468.7773 0.77732386 4112 Q9H019;E9PLD2 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 0 1 1 152.93 152.93 2 0.0046404 155406 QUIQUE_C1563_190116_001 68.069 60.182 12839000 0 0 0 0 0 12839000 0 0 0 0 0 0 0 9278 4112 8681 82692;82693 105153;105154 105154 2 EEDPSLLWQVFGSATGLAR Unmodified 2075.0324 0.032369346 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 169.3 169.3 2 7.8564E-05 163103 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.075 54.88 8855700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8855700 0 0 0 9279 2640 8682 82694 105155 105155 1 EEEAIQLDGLNASQIR Unmodified 1784.8905 0.89045614 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.915 99.915 2 5.9554E-46 102517 QUIQUE_C1277_190116_001 186.58 165.33 568740000 133230000 89052000 0 0 92382000 110760000 0 0 0 73557000 69763000 0 0 9280 2079 8683 82695;82696;82697;82698;82699;82700 105156;105157;105158;105159;105160;105161;105162 105158 7 EEEATEWQHK Unmodified 1285.5575 0.55749468 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 2 18.842 18.842 2;3 5.9821E-23 11242 QUIQUE_C1277_190116_001 201.39 170.8 862020000 36124000 67782000 62723000 59952000 46314000 50475000 128990000 41403000 67058000 77110000 34374000 46884000 142830000 9281 434 8684 82701;82702;82703;82704;82705;82706;82707;82708;82709;82710;82711;82712;82713;82714;82715;82716 105163;105164;105165;105166;105167;105168;105169;105170;105171;105172;105173;105174;105175;105176;105177;105178 105164 16 EEEDGQWKEEQK Unmodified 1533.6583 0.65833093 2669 P55735;A8MXL6 SEC13 Protein SEC13 homolog yes no 0 0 1 1 1 18.036 18.036 3 0.0046514 10219 QUIQUE_C1277_190116_001 58.17 49.525 45087000 25618000 19470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9282 2669 8685 82717;82718 105179;105180 105180 1 EEEEEEEDDDEEEKAPVTLLDAQSLAQSFFNR Unmodified 3740.6337 0.63369849 2535 P49593;A8MX49 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 163.84 163.84 3 9.4135E-26 165756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.113 89.301 161290000 0 0 0 16851000 36097000 16095000 38813000 27042000 0 0 0 0 26394000 9283 2535 8686 82719;82720;82721;82722;82723;82724 105181;105182;105183;105184;105185;105186 105185 6 EEEEGGEGEEGEETK Unmodified 1636.6224 0.62239894 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 14.029 14.029 2 1.2396E-53 5864 QUIQUE_C1563_190116_001 216.03 205.72 95111000 0 16415000 0 0 0 26866000 15890000 0 0 0 8123800 0 27816000 9284 1916 8687 82725;82726;82727;82728;82729 105187;105188;105189;105190;105191 105188 5 EEEEVGFDWSDR Unmodified 1496.6056 0.60556708 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 94.397 94.397 2 0.00029958 90837 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.78 110.99 23213000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23213000 0 0 0 9285 3117 8688 82730 105192 105192 1 EEEGEKEEEEGQEEEEEEDEGAK Unmodified 2695.0264 0.026412667 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 36.346 36.346 3 2.6089E-31 31861 QUIQUE_C1438_190116_001 139.2 123.3 124760000 0 59318000 0 0 65440000 0 0 0 0 0 0 0 0 9286 869 8689 82731;82732 105193;105194 105194 2 EEEGMLSPILAHGGVR Unmodified 1693.8458 0.84575455 4065 Q9BXS5;E7ENJ6;K7ENA7;K7EPJ8;K7ER75;K7EQ90 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 85.342 85.342 3 0.0019838 86906 QUIQUE_C1277_190116_001 40.237 33.18 189680000 47137000 42370000 39494000 35350000 25330000 0 0 0 0 0 0 0 0 9287 4065 8690 82733;82734;82735;82736;82737 105195;105196;105197;105198;105199 105196 5 EEEIAALVIDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1892.8496 0.84957888 2788;1333 K7EM38;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;I3L3R2;J3KT65 ACTG1 Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 1 1 0 1 3 2 3 2 1 3 1 1 1 1 1 3 156.99 156.99 2 7.591E-141 157309 QUIQUE_C1403_190116_001 239.48 217.45 19831000000 36874000 3202900000 2019500000 2104900000 1640000000 1768700000 1480900000 892200000 1023700000 1077600000 1476700000 1415300000 1692200000 9288 1333;2788 8691 82738;82739;82740;82741;82742;82743;82744;82745;82746;82747;82748;82749;82750;82751;82752;82753;82754;82755;82756;82757;82758;82759;82760 105200;105201;105202;105203;105204;105205;105206;105207;105208;105209;105210;105211;105212;105213;105214;105215;105216;105217;105218;105219;105220;105221;105222;105223;105224;105225;105226;105227;105228;105229;105230;105231;105232;105233;105234;105235;105236;105237;105238;105239;105240 105210 753 39 EEEIAALVIDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term) 1876.8547 0.85466426 2788;1333 K7EM38;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;I3L3R2;J3KT65 ACTG1 Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.67 161.67 2;3 0 163698 QUIQUE_C1563_190116_001 372.71 351.94 52834000000 5771800000 6831400000 6389900000 4616500000 4872700000 4450100000 4794500000 1956700000 1796400000 762470000 3147400000 3457200000 3986900000 9289 1333;2788 8691 82761;82762;82763;82764;82765;82766;82767;82768;82769;82770;82771;82772;82773;82774 105241;105242;105243;105244;105245;105246;105247;105248;105249;105250;105251;105252;105253;105254;105255;105256;105257;105258;105259;105260;105261;105262;105263;105264;105265;105266;105267;105268;105269;105270;105271;105272;105273;105274;105275;105276;105277;105278;105279;105280;105281;105282 105259 42 EEELSLQDITMR Unmodified 1462.6974 0.69735898 3733 Q92558;Q5SZK5;Q5SZK4 WASF1 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 108.84 108.84 2 0.00029958 112989 QUIQUE_C1218_190116_001 115.78 97.917 64334000 31072000 0 0 33262000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9290 3733 8692 82775;82776;82777 105283;105284;105285 105283 2 EEEPEADQEHA Unmodified 1282.495 0.494954 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 17.281 17.281 2 0.0026819 9271 QUIQUE_C1563_190116_001 76.827 46.66 98883000 21651000 0 0 23609000 0 22904000 19947000 0 0 10772000 0 0 0 9291 2128 8693 82778;82779;82780;82781;82782 105286;105287;105288;105289;105290 105288 4 EEEQTAEEILSK Unmodified 1404.662 0.66201933 2382 P35612 ADD2 Beta-adducin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 63.861 63.861 2 8.7577E-14 64221 QUIQUE_C1218_190116_001 159.4 89.579 801850000 151090000 109020000 96251000 107640000 68142000 114890000 91170000 0 0 0 63644000 0 0 9292 2382 8694 82783;82784;82785;82786;82787;82788;82789;82790 105291;105292;105293;105294;105295;105296;105297;105298;105299;105300 105291 10 EEETEAAIGAPPTATEGPETKPVLMALAEGPGAEGPR Unmodified 3672.7829 0.78288611 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 1 1 1 126.58 126.58 3 1.5457E-69 131387 QUIQUE_C1218_190116_001 122.45 113.31 82170000 44666000 0 0 0 0 37504000 0 0 0 0 0 0 0 9293 2983 8695 82791;82792 105301;105302 105301 2 EEETLDTIK Unmodified 1076.5237 0.52373493 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 0 1 1 1 36.491 36.491 2 0.011794 31996 QUIQUE_C1403_190116_001 72.23 32.584 176050000 0 0 0 93416000 0 82636000 0 0 0 0 0 0 0 9294 1021 8696 82793;82794;82795 105303;105304;105305;105306 105303 4 EEEVQYIQAEK Unmodified 1364.646 0.64597533 1750 O95786 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes yes 0 0 0 1 1 44.7 44.7 2 0.0015573 41836 QUIQUE_C1368_190116_001 113.62 88.063 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9295 1750 8697 82796;82797 105307;105308 105307 2 EEEYEPEKMEAEDYVMAVVDK Unmodified 2532.0924 0.092387924 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 132.55 132.55 3 0.00093263 135402 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.405 70.98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9296 2483 8698 82798 105309 105309 1 EEFAQSAIR Unmodified 1049.5142 0.5141733 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 37.796 37.796 2 0.052014 32182 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.546 39.806 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9297 1655 8699 82799 105310 105310 1 EEFASTCPDDEEIELAYEQVAK Unmodified 2572.1163 0.11629449 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.26 136.26 2 1.2976E-44 140376 QUIQUE_C1277_190116_001 196.95 190.79 375440000 28321000 38922000 49788000 69302000 41058000 28267000 37961000 0 0 0 42066000 0 39759000 9298 1395 8700 82800;82801;82802;82803;82804;82805;82806;82807;82808 105311;105312;105313;105314;105315;105316;105317;105318;105319;105320 105312 10 EEFCGLLSSPTGPLSSCHK Unmodified 2104.9558 0.95577528 4663 Q9Y6R7;A0A087WXI2;A0A087WUZ2 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 97.613 97.613 3 0.029749 94293 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.625 26.82 20664000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20664000 0 0 0 9299 4663 8701 82809 105321 105321 1 EEFEHQQKELEK Unmodified 1572.742 0.74200098 2010;558 A8K7Q2;E9PS65;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 1 1 18.379 18.379 3 0.0033017 11152 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.122 38.911 46224000 0 0 0 0 0 0 0 46224000 0 0 0 0 0 9300 558;2010 8702 82810 105322 105322 1 EEFEYIAFR Unmodified 1202.5608 0.56078914 4096 Q9C0E8 LNP Protein lunapark yes yes 0 0 0 1 1 104.19 104.19 2 0.050487 107133 QUIQUE_C1403_190116_001 50.607 16.354 50523000 0 0 23785000 26738000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9301 4096 8703 82811;82812 105323;105324 105324 2 EEFQQYAAALQAGMEIGWLKPVIGSQYPLEK Unmodified 3493.7592 0.75917796 2917 Q08257 CRYZ Quinone oxidoreductase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 166.77 166.77 3;4 5.8736E-89 171685 QUIQUE_C1218_190116_001 167.87 162.26 1067200000 89621000 44619000 125770000 22109000 40689000 0 57463000 0 296860000 0 0 158890000 231220000 9302 2917 8704 82813;82814;82815;82816;82817;82818;82819;82820;82821;82822 105325;105326;105327;105328;105329;105330;105331;105332;105333;105334 105325 10 EEFQQYAAALQAGMEIGWLKPVIGSQYPLEK Oxidation (M) 3509.7541 0.75409258 2917 Q08257 CRYZ Quinone oxidoreductase yes yes 0 1 1 1 1 158.86 158.86 3 1.5236E-24 165628 QUIQUE_C1438_190116_001 84.515 80.225 68291000 0 0 0 0 37603000 0 0 0 0 0 0 0 30689000 9303 2917 8704 82823;82824 105335;105336 105335 2396 2 EEFRPNAPYR Unmodified 1277.6153 0.61528433 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 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Unmodified 2019.9037 0.90366336 3128 Q15293;E9PP27 RCN1 Reticulocalbin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 111.34 111.34 3;4 0.0016753 116499 QUIQUE_C1218_190116_001 60.209 49.165 120010000 0 0 0 0 24938000 0 51676000 0 0 0 0 43398000 0 9306 3128 8707 82853;82854;82855;82856;82857 105368;105369;105370;105371;105372 105368 5 EEFTAFLHPEEYDYMK Unmodified 2047.8873 0.88734459 1557 O43852;H0Y875 CALU Calumenin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.12 126.12 3 0.0020228 130543 QUIQUE_C1368_190116_001 50.827 39.782 251860000 42752000 0 41170000 0 38737000 35456000 40436000 0 0 0 34607000 0 18700000 9307 1557 8708 82858;82859;82860;82861;82862;82863;82864 105373;105374;105375;105376;105377;105378;105379 105374 5 EEFTSGGPLGQK Unmodified 1248.5986 0.59863121 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.09 48.09 2 4.8127E-14 46208 QUIQUE_C1218_190116_001 163.32 118.24 3970800000 418040000 422170000 413760000 391510000 382060000 427560000 351600000 122340000 212110000 144720000 225640000 211710000 247630000 9308 2460 8709 82865;82866;82867;82868;82869;82870;82871;82872;82873;82874;82875;82876;82877 105380;105381;105382;105383;105384;105385;105386;105387;105388;105389;105390;105391;105392;105393;105394;105395;105396;105397;105398 105382 16 EEFVETCPSEHK Unmodified 1490.6348 0.63475872 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 3 2 2 2 1 2 1 1 1 2 2 2 24.829 24.829 2;3 1.2211E-09 17304 QUIQUE_C1368_190116_001 189.18 175.82 3964600000 361390000 677040000 397940000 408660000 211590000 541600000 182770000 43366000 60475000 0 419420000 183330000 476960000 9309 2009 8710 82878;82879;82880;82881;82882;82883;82884;82885;82886;82887;82888;82889;82890;82891;82892;82893;82894;82895;82896;82897;82898 105399;105400;105401;105402;105403;105404;105405;105406;105407;105408;105409;105410;105411;105412;105413;105414;105415;105416;105417;105418;105419;105420;105421;105422 105407 23 EEFVQWVELLPDTQTPSWLGLPNNAER Unmodified 3167.5564 0.55637905 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 170.18 170.18 3 2.8509E-12 174359 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.925 55.922 31196000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31196000 9310 3053 8711 82899 105423 105423 1 EEFWLGLDNLNK Unmodified 1476.7249 0.72489436 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 136.27 136.27 2 7.2345E-05 140991 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.75 98.873 373380000 0 0 0 0 0 0 0 0 317390000 55995000 0 0 0 9311 2233 8712 82900;82901 105424;105425;105426 105424 3 EEGAGGSAGGPALLPAEGAVFLTTYR Unmodified 2490.2391 0.23906766 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 147.36 147.36 3 0.0004389 142969 QUIQUE_DMIX4_190116_001 34.715 27.094 8716100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8716100 0 0 0 9312 1716 8713 82902 105427 105427 1 EEGASPLDFD Unmodified 1078.4455 0.44548461 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 102.29 102.29 2 0.0001583 107184 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.62 119.62 176560000 0 0 0 0 0 0 61930000 0 0 0 51229000 63404000 0 9313 1245 8714 82903;82904;82905 105428;105429;105430 105429 2 EEGCTHVIVTTACGSLR Unmodified 1888.8771 0.87713103 2966 Q13126;B4DUC8;J3QSB7;F2Z2F3;A0A2R8Y4K0 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.448 55.448 2;3 4.4148E-07 53080 QUIQUE_C1368_190116_001 109 95.797 101710000 23449000 0 24717000 0 0 22164000 0 0 0 31377000 0 0 0 9314 2966 8715 82906;82907;82908;82909 105431;105432;105433;105434;105435 105432 5 EEGFPIRPHYFWPLLVGR Unmodified 2212.1582 0.15817898 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 134.71 134.71 3;4 6.6907E-05 140934 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.874 81.001 602840000 0 0 27289000 0 0 16036000 54012000 37565000 72084000 0 231270000 95796000 68791000 9315 2452 8716 82910;82911;82912;82913;82914;82915;82916;82917;82918 105436;105437;105438;105439;105440;105441;105442;105443;105444;105445;105446 105443 11 EEGGENLDQAR Unmodified 1216.532 0.53200821 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.675 19.675 2 2.9979E-18 12291 QUIQUE_C1576_190116_001 169.09 156 14032000000 1235700000 1446700000 1746800000 1470300000 1136600000 1383100000 1405400000 325650000 630680000 905570000 1089500000 661520000 594960000 9316 845;1936 8717 82919;82920;82921;82922;82923;82924;82925;82926;82927;82928;82929;82930;82931 105447;105448;105449;105450;105451;105452;105453;105454;105455;105456;105457;105458;105459 105453 13 EEGIDELAK Unmodified 1002.487 0.4869555 709 C9JBI3;P78330;C9JEJ7;F8WD74 PSPH Phosphoserine phosphatase yes no 0 0 0 1 43.267 43.267 2 0.05881 40766 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.589 23.601 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9317 709 8718 82932 105460 105460 1 EEGIENFDVYAIKPGHPLQPDFFLDEYPEAVSK Unmodified 3792.8199 0.81992354 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 2 1 2 1 2 1 148.31 148.31 3;4 1.1867E-29 153094 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.817 88.056 1683200000 178740000 200740000 239710000 133750000 112730000 199680000 0 54080000 238980000 63682000 150590000 110500000 0 9318 3421 8719 82933;82934;82935;82936;82937;82938;82939;82940;82941;82942;82943;82944;82945;82946;82947;82948;82949 105461;105462;105463;105464;105465;105466;105467;105468;105469;105470;105471;105472;105473;105474;105475;105476;105477;105478 105473 18 EEGILGFFAGLVPR Unmodified 1503.8086 0.80856441 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 2 170.29 170.29 2;3 0.00015244 175200 QUIQUE_C1368_190116_001 136.63 101.12 2373800000 172270000 163530000 166840000 182420000 140450000 263810000 174590000 88284000 216700000 37882000 326450000 277520000 163020000 9319 4650 8720 82950;82951;82952;82953;82954;82955;82956;82957;82958;82959;82960;82961;82962;82963;82964;82965;82966;82967;82968;82969;82970;82971 105479;105480;105481;105482;105483;105484;105485;105486;105487;105488;105489;105490;105491;105492;105493;105494;105495;105496;105497;105498;105499;105500 105484 22 EEGLAYIWMPTPDMSTEGR Unmodified 2181.9711 0.971091 1718 O95278;H0Y6I8 EPM2A Laforin yes no 0 0 0 1 148.03 148.03 2 0.00058546 153823 QUIQUE_C1576_190116_001 89.46 78.85 24089000 0 0 0 0 0 0 24089000 0 0 0 0 0 0 9320 1718 8721 82972 105501 105501 1 EEGLMQNCNQMHASYLFQQDK Unmodified 2570.0988 0.098827481 2894 Q05329;A0A3B3IU09 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 90.474 90.474 3 1.1778E-10 93571 QUIQUE_C1218_190116_001 91.889 89.16 118200000 48560000 41737000 27904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9321 2894 8722 82973;82974;82975 105502;105503;105504 105502 3 EEGPSAFWK Unmodified 1049.4818 0.48181054 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.126 70.126 2 0.0053947 68862 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 58.282 593300000 95116000 84420000 62698000 62072000 38798000 55916000 61010000 0 42410000 42166000 48697000 0 0 9322 1655 8723 82976;82977;82978;82979;82980;82981;82982;82983;82984;82985;82986 105505;105506;105507;105508;105509;105510;105511;105512;105513;105514;105515;105516;105517;105518;105519;105520;105521 105514 16 EEGPYEVEVTYDGVPVPGSPFPLEAVAPTKPSK Unmodified 3484.729 0.72898327 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.07 142.07 3 1.1905E-38 145005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.2 96.622 851690000 55178000 50871000 70749000 58385000 66936000 39642000 58107000 86150000 75398000 54668000 89084000 91144000 55375000 9323 2178 8724 82987;82988;82989;82990;82991;82992;82993;82994;82995;82996;82997;82998;82999;83000 105522;105523;105524;105525;105526;105527;105528;105529;105530;105531;105532;105533;105534;105535;105536;105537;105538 105530 16 EEGSAHLAVPGVYFTCPLTGATLR Unmodified 2545.2635 0.26350827 4088 Q9BZV1;K7EJ02 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 127.66 127.66 3 2.719E-06 133277 QUIQUE_C1218_190116_001 58.373 51.429 514860000 129940000 0 129700000 0 0 0 0 0 104720000 46532000 0 103960000 0 9324 4088 8725 83001;83002;83003;83004;83005 105539;105540;105541;105542;105543 105539 3 EEGSPLELER Unmodified 1157.5564 0.55643205 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5GZI0 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.686 53.686 2 0.00064277 51779 QUIQUE_C1277_190116_001 127.68 72.309 979710000 146950000 115300000 0 130350000 0 118810000 0 0 74413000 100410000 122420000 52979000 118080000 9325 997 8726 83006;83007;83008;83009;83010;83011;83012;83013;83014 105544;105545;105546;105547;105548;105549;105550;105551;105552;105553 105545 6 EEGVIDSSDKEIVAEAER Unmodified 1974.9382 0.93819419 2653 P55010 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 75.294 75.294 3 0.058701 75404 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EEIAEYRR Unmodified 1064.5251 0.52507234 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 17.727 17.727 2;3 0.0014546 10183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.253 74.789 955270000 0 63154000 27610000 0 135870000 14673000 113250000 239420000 145700000 10726000 108090000 0 96774000 9333 869 8734 83080;83081;83082;83083;83084;83085;83086;83087;83088;83089;83090;83091;83092 105633;105634;105635;105636;105637;105638;105639;105640;105641;105642;105643;105644;105645 105641 12 EEIAPINFK Unmodified 1059.5601 0.56006086 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 0 0 1 70.697 70.697 2 0.040078 71051 QUIQUE_C1368_190116_001 64.567 20.172 40879000 0 0 40879000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9334 2486 8735 83093 105646 105646 1 EEIDHAEYYLYK Unmodified 1571.7144 0.71438925 1104 G5EA06;Q92552;D6RH20;D6RJC7;E5RJ73 MRPS27 28S ribosomal protein S27, mitochondrial yes no 0 0 0 1 69.23 69.23 2 0.0040017 70339 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.173 52.427 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9335 1104 8736 83094 105647 105647 1 EEIDSILNK Unmodified 1059.5448 0.54480473 2613 P52788;H7C2R7 SMS Spermine synthase yes no 0 0 0 1 1 66.408 66.408 2 0.0053947 64585 QUIQUE_C1563_190116_001 86.794 36.162 116250000 66647000 0 0 0 0 49604000 0 0 0 0 0 0 0 9336 2613 8737 83095;83096 105648;105649 105649 1 EEIFGPVLSVYVYPDDK Unmodified 1968.9721 0.9720605 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.12 149.12 2 9.2788E-06 144594 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.46 89.402 557700000 97166000 52355000 96966000 0 57515000 116120000 46149000 0 0 38421000 0 31181000 21832000 9337 2295 8738 83097;83098;83099;83100;83101;83102;83103;83104;83105;83106 105650;105651;105652;105653;105654;105655;105656;105657;105658;105659;105660;105661 105658 11 EEIFGPVLSVYVYPDDKYK Unmodified 2260.1304 0.13035206 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 134.31 134.31 2 0.0012664 139476 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0.74793799 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 2 2 2 1 2 1 122.69 122.69 2 0.00058343 126645 QUIQUE_C1277_190116_001 99.802 36.323 321060000 0 0 71708000 0 0 0 0 0 0 56684000 103850000 0 88823000 9340 1875 8740 83126;83127;83128;83129;83130;83131;83132;83133;83134;83135;83136;83137;83138;83139;83140;83141;83142;83143;83144 105711;105712;105713;105714;105715;105716;105717;105718;105719;105720;105721;105722;105723;105724;105725;105726;105727;105728;105729;105730;105731;105732;105733;105734 105713 1096 24 EEIFGPVMSILSFDTEAEVLER Unmodified 2510.2251 0.22505708 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 3 2 2 172.71 172.71 2;3 2.3399E-15 176596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.44 131.08 510920000 5624800 0 0 0 17542000 0 19613000 61404000 97346000 0 156030000 84582000 68779000 9341 2522 8741 83145;83146;83147;83148;83149;83150;83151;83152;83153;83154;83155;83156;83157;83158 105735;105736;105737;105738;105739;105740;105741;105742;105743;105744;105745;105746;105747;105748;105749;105750 105742 15 EEIFGPVMSILSFDTEAEVLER Oxidation (M) 2526.22 0.2199717 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 1 0 1 2 2 1 2 1 168.34 168.34 2;3 1.5418E-37 172891 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.3 138.81 348940000 0 19025000 0 0 74681000 0 65278000 36978000 118670000 0 0 34306000 0 9342 2522 8741 83159;83160;83161;83162;83163;83164;83165;83166;83167 105751;105752;105753;105754;105755;105756;105757;105758;105759 105758 1946 8 EEIFGPVQPLFK Unmodified 1402.7497 0.74965254 2325 P30837 ALDH1B1 Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.81 126.81 2 0.0010538 139784 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.439 0 164570000 0 0 0 31795000 0 49916000 38895000 0 0 0 0 0 43968000 9343 2325 8742 83168;83169;83170;83171;83172;83173;83174 105760;105761;105762;105763;105764;105765;105766;105767 105766 8 EEIFGPVQQIMK Oxidation (M) 1433.7225 0.72245152 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105782;105783;105784;105785;105786;105787;105788;105789;105790;105791;105792;105793;105794;105795;105796;105797;105798;105799;105800;105801;105802;105803;105804;105805;105806;105807;105808;105809;105810;105811;105812;105813;105814;105815;105816;105817 105789 36 EEIIGNGEQQYVYLK Unmodified 1781.8836 0.88357984 3255 Q53H82 LACTB2 Beta-lactamase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 92.829 92.829 2 0.0011601 95270 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.555 58.355 61167000 0 0 0 0 0 0 0 0 61167000 0 0 0 0 9346 3255 8744 83202 105818 105818 1 EEIIPVAAEYDK Unmodified 1375.6871 0.68711187 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310;E9PJM9;E9PRX4 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 82.896 82.896 2 0.00026424 85303 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.77 91.89 1622100000 157040000 164400000 0 157280000 147450000 142360000 147310000 181080000 0 0 217220000 141970000 165990000 9347 666 8745 83203;83204;83205;83206;83207;83208;83209;83210;83211;83212;83213 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105855;105856;105857 105856 3 EEIQDASQLPPAFDLFEAFAK Unmodified 2365.1478 0.14779303 4181 Q9H7B4;B0QZA0;B0QZ88 SMYD3 Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 170.49 170.49 2;3 9.0135E-07 175212 QUIQUE_C1368_190116_001 117.08 104.93 200870000 9053300 0 41699000 31368000 0 22193000 0 32735000 25751000 0 0 38070000 0 9353 4181 8751 83241;83242;83243;83244;83245;83246;83247;83248 105858;105859;105860;105861;105862;105863;105864;105865 105860 8 EEIQDSLVGQR Unmodified 1272.631 0.63099397 900 E9PC69;Q7KZI7;E7ETY4 MARK2 Serine/threonine-protein kinase MARK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.899 54.899 2 0.0026439 53750 QUIQUE_C1218_190116_001 91.867 38.312 226220000 25765000 31085000 42649000 33763000 0 0 0 0 0 0 52468000 40488000 0 9354 900 8752 83249;83250;83251;83252;83253;83254 105866;105867;105868;105869;105870;105871 105866 5 EEIQPGDIVIIDQFIDR Unmodified 1999.0262 0.026221336 2966 Q13126;B4DUC8;J3QSB7;F2Z2F3;A0A2R8Y4K0 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 1 1 158.95 158.95 2;3 4.4471E-09 161221 QUIQUE_C1563_190116_001 113.35 100.79 1186500000 121600000 105260000 183620000 127910000 160870000 121240000 15808000 54423000 109460000 0 25284000 82882000 78182000 9355 2966 8753 83255;83256;83257;83258;83259;83260;83261;83262;83263;83264;83265;83266;83267;83268;83269;83270 105872;105873;105874;105875;105876;105877;105878;105879;105880;105881;105882;105883;105884;105885;105886;105887;105888 105881 16 EEIQSSISGVTAAYNR Unmodified 1723.8377 0.83769228 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8;A0A087WWP1 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 82.697 82.697 2 0.00010487 84161 QUIQUE_C1368_190116_001 130.99 91.687 328670000 0 0 63514000 44154000 47934000 25350000 31606000 30104000 0 16841000 38270000 0 30897000 9356 2487 8754 83271;83272;83273;83274;83275;83276;83277;83278;83279;83280 105889;105890;105891;105892;105893;105894;105895;105896;105897;105898 105889 5 EEIVQFFSGLEIVPNGITLPVDPEGK Unmodified 2826.4691 0.46912717 2609 P52597 HNRNPF Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 170.98 170.98 3 6.113E-11 174886 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.231 73.89 134400000 0 0 0 0 0 0 0 0 70841000 0 0 50635000 12920000 9357 2609 8755 83281;83282;83283 105899;105900;105901 105900 3 EEIVYLPCIYR Unmodified 1453.7275 0.72753689 2978 Q13228;H0Y532;F2Z2W8;F8WCR4;C9JVL0 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 119.18 119.18 2 5.921E-09 116673 QUIQUE_DMIX4_190116_001 157.86 145.28 5938400000 274580000 372350000 449500000 381180000 475860000 466980000 513270000 475820000 506140000 188200000 603730000 460040000 770720000 9358 2978 8756 83284;83285;83286;83287;83288;83289;83290;83291;83292;83293;83294;83295;83296;83297 105902;105903;105904;105905;105906;105907;105908;105909;105910;105911;105912;105913;105914;105915;105916;105917;105918;105919;105920;105921;105922;105923;105924;105925 105921 24 EEIYQLNSDK Unmodified 1237.5826 0.5826468 810 D6RB81;Q9UHK6 AMACR Alpha-methylacyl-CoA racemase yes no 0 0 0 1 47.263 47.263 2 0.01651 44575 QUIQUE_C1368_190116_001 62.558 38.336 22309000 0 0 22309000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9359 810 8757 83298 105926 105926 1 EEKPAVTAAPK Unmodified 1139.6186 0.61863837 977 E9PR44;P02511;A0A024R3B9;H0YCW8 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 11.085 11.085 2;3 0.0068513 3766 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.6 80.574 426910000 0 0 0 0 0 37106000 0 256630000 31891000 96416000 0 0 4868200 9360 977 8758 83299;83300;83301;83302;83303;83304;83305 105927;105928;105929;105930;105931;105932;105933 105932 5 EELAFLK Unmodified 848.46437 0.46436956 789 CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8 yes no 0 0 0 1 98.071 98.071 2 0.049128 100198 QUIQUE_C1403_190116_001 75.311 0 14538000 0 0 0 14538000 0 0 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.529 70.529 2 0.0045575 67174 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.7 66.805 1795400000 222810000 254520000 0 232860000 0 244010000 0 196230000 0 104260000 299440000 0 241290000 9374 2087 8772 83392;83393;83394;83395;83396;83397;83398;83399 106038;106039;106040;106041;106042;106043;106044;106045;106046;106047 106044 9 EELFVTSK Unmodified 951.49131 0.49131259 2076 P14550;Q5T621;V9GYG2;V9GYP9 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 44.835 44.835 2 0.0081139 41544 QUIQUE_C1403_190116_001 95.531 66.382 842020000 203670000 0 0 227550000 0 0 0 97915000 0 0 152740000 0 160150000 9375 2076 8773 83400;83401;83402;83403;83404;83405 106048;106049;106050;106051;106052;106053;106054;106055 106050 8 EELGDEWLKPELFR Unmodified 1759.8781 0.87810054 969 G3V158;E9PPM8;Q9Y315 DERA Deoxyribose-phosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.74 127.74 3 0.0053274 133304 QUIQUE_C1576_190116_001 58.831 49.511 204050000 0 0 26571000 23845000 30219000 30559000 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106223 139 EELINFK Unmodified 891.47018 0.47018322 4636 Q9Y5X3 SNX5 Sorting nexin-5 yes yes 0 0 0 1 63.472 63.472 2 0.046614 61957 QUIQUE_C1563_190116_001 77.496 16.697 38161000 0 0 0 0 0 38161000 0 0 0 0 0 0 0 9380 4636 8778 83556 106224 106224 1 EELITNWEQIR Unmodified 1429.7201 0.72014333 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.71 106.71 2 1.7778E-18 109509 QUIQUE_DMIX7_190116_001 172.47 137.75 7626400000 395180000 610630000 570590000 412750000 629650000 434840000 603930000 709530000 829810000 288230000 801230000 565580000 774460000 9381 267;275;3025 8779 83557;83558;83559;83560;83561;83562;83563;83564;83565;83566;83567;83568;83569 106225;106226;106227;106228;106229;106230;106231;106232;106233;106234;106235;106236;106237;106238;106239;106240;106241;106242;106243;106244;106245;106246;106247;106248;106249 106245 25 EELLDHLEK Unmodified 1124.5714 0.57135383 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.022 53.022 2;3 0.0019201 50914 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.1 58.538 311800000 0 0 47212000 49408000 21723000 0 34970000 54569000 47955000 34106000 21862000 0 0 9382 2279 8780 83570;83571;83572;83573;83574;83575;83576;83577 106250;106251;106252;106253;106254;106255;106256;106257 106255 8 EELLEYEEK Unmodified 1180.5499 0.54994968 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.444 58.444 2 0.0026282 57458 QUIQUE_C1277_190116_001 93.162 51.975 320090000 63387000 55439000 58269000 55423000 38582000 0 48994000 0 0 0 0 0 0 9383 2472 8781 83578;83579;83580;83581;83582;83583 106258;106259;106260;106261;106262;106263 106259 5 EELLPHLLPLLK Unmodified 1413.8595 0.85953735 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.79 131.79 3 0.0036291 137404 QUIQUE_C1218_190116_001 57.836 47.784 994670000 64532000 162110000 55721000 84241000 93187000 93975000 109990000 23360000 33077000 36815000 93620000 43581000 100460000 9384 1446 8782 83584;83585;83586;83587;83588;83589;83590;83591;83592;83593;83594;83595;83596 106264;106265;106266;106267;106268;106269;106270;106271;106272;106273;106274;106275;106276;106277;106278;106279;106280 106264 16 EELMTSSSFDSLEVLLDSFGPVR Unmodified 2557.2258 0.22578536 1429 O14525;B1AJS1 ASTN1 Astrotactin-1 yes no 0 0 0 1 173.62 173.62 3 0.0046434 177849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 34.914 30.465 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9385 1429 8783 83597 106281 106281 1 EELNAISGPNEFAEFYNR Unmodified 2098.9596 0.95959833 2949 Q12874 SF3A3 Splicing factor 3A subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 129.04 129.04 2 1.6205E-10 133290 QUIQUE_C1277_190116_001 138.42 114.57 209050000 32891000 46389000 0 0 27139000 0 0 0 30515000 0 39284000 32833000 0 9386 2949 8784 83598;83599;83600;83601;83602;83603 106282;106283;106284;106285;106286;106287;106288 106284 7 EELNFLAR Unmodified 990.51345 0.51344502 3705 Q8WVF1;C9JF58;H0YAG0 OSCP1 Protein OSCP1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.998 77.998 2 0.0049014 79074 QUIQUE_C1368_190116_001 107.43 30.583 261860000 0 25555000 29440000 27431000 24909000 0 25420000 33939000 0 0 28014000 29367000 37787000 9387 3705 8785 83604;83605;83606;83607;83608;83609;83610;83611;83612;83613 106289;106290;106291;106292;106293;106294;106295;106296;106297;106298;106299;106300;106301;106302;106303;106304;106305;106306 106292 18 EELPENVPIGNIPK Unmodified 1547.8195 0.81952302 673 Q5VT82;B7ZM79;Q9HC56 PCDH9 Protocadherin-9 yes no 0 0 0 1 92.1 92.1 2 0.037672 94813 QUIQUE_C1576_190116_001 58.699 44.541 49221000 0 0 0 0 0 0 49221000 0 0 0 0 0 0 9388 673 8786 83614 106307 106307 0 EELQANGSAPAADKEEPAAAGSGAASPSAAEK Unmodified 2981.385 0.38501621 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.509 41.509 3 1.2401E-196 38166 QUIQUE_C1277_190116_001 216.7 208.4 1919800000 162120000 189250000 168560000 208630000 220650000 291760000 65742000 44334000 165600000 71025000 88282000 77094000 166740000 9389 2293 8787 83615;83616;83617;83618;83619;83620;83621;83622;83623;83624;83625;83626;83627 106308;106309;106310;106311;106312;106313;106314;106315;106316;106317;106318;106319;106320;106321;106322;106323 106310 16 EELQANGSAPAADKEEPAAAGSGAASPSAAEKGEPAAAAAPEAGASPVEK Unmodified 4585.1692 0.16921636 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 2 1 64.222 64.222 3 1.8867E-12 63004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.328 57.104 30962000 0 0 0 0 0 0 0 30962000 0 0 0 0 0 9390 2293 8788 83628 106324 106324 1 EELQNLIQSLEAANK Unmodified 1698.8788 0.87882882 4318 Q9NX08 COMMD8 COMM domain-containing protein 8 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 146.26 146.26 2;3 3.6851E-06 150660 QUIQUE_C1277_190116_001 142.76 126.39 480990000 57797000 61185000 61496000 69118000 63028000 116810000 15745000 0 0 6163500 29644000 0 0 9391 4318 8789 83629;83630;83631;83632;83633;83634;83635;83636;83637;83638;83639;83640;83641;83642;83643;83644 106325;106326;106327;106328;106329;106330;106331;106332;106333;106334;106335;106336;106337;106338;106339;106340 106328 15 EELQQQDVER Unmodified 1272.5946 0.59460847 1522 O43310 CTIF CBP80/20-dependent translation initiation factor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.11 24.11 2 0.0085768 17501 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.139 68.972 106090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 106090000 9392 1522 8790 83645;83646;83647;83648;83649 106341;106342;106343;106344;106345 106344 5 EELTLEGIR Unmodified 1058.5608 0.56078914 2697 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3KTN0 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.681 76.681 2 0.0080372 77155 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.906 34.825 610510000 48886000 59049000 76293000 88036000 54693000 78814000 0 0 50217000 0 62159000 43618000 48745000 9393 2697 8791 83650;83651;83652;83653;83654;83655;83656;83657;83658;83659 106346;106347;106348;106349;106350;106351;106352;106353;106354;106355 106355 9 EELVAAVEDVRK Unmodified 1356.7249 0.72489436 2250;2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJL0;E5RIE0;P26232;C9IZ88 CTNNA1;CTNNA2 Catenin alpha-1;Catenin alpha-2 no no 0 0 1 1 1 60.446 60.446 3 0.016213 58621 QUIQUE_C1563_190116_001 44.616 32.348 94785000 0 0 0 0 0 59137000 35648000 0 0 0 0 0 0 9394 2369;2250 8792 83660;83661 106356;106357;106358 106356 3 EELVAEQALK Unmodified 1128.6027 0.60265396 873 E7ETZ4;Q9Y6E2;B5MCE7;B5MCH7 BZW2 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 49.324 49.324 2 0.049232 46968 QUIQUE_C1218_190116_001 67.897 0 37440000 37440000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9395 873 8793 83662 106359 106359 0 EELVEESQTK Unmodified 1190.5667 0.56666238 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.84 22.84 2 1.4167E-11 16203 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.32 129.07 1389100000 152250000 83592000 110990000 118810000 136430000 114480000 112930000 73950000 85300000 63553000 105310000 77371000 154110000 9396 2924 8794 83663;83664;83665;83666;83667;83668;83669;83670;83671;83672;83673;83674;83675 106360;106361;106362;106363;106364;106365;106366;106367;106368;106369;106370;106371;106372;106373 106369 13 EELYQNLTR Unmodified 1164.5775 0.57750184 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.686 57.686 2 1.246E-13 55923 QUIQUE_C1403_190116_001 185.84 142.59 22792000000 1708500000 2143900000 2299300000 1931600000 1952000000 2040900000 2058500000 1032100000 1664900000 906200000 2012800000 1439500000 1601500000 9397 267;275;3025 8795 83676;83677;83678;83679;83680;83681;83682;83683;83684;83685;83686;83687;83688 106374;106375;106376;106377;106378;106379;106380;106381;106382;106383;106384;106385;106386;106387;106388;106389;106390;106391 106378 18 EEMGIGGVLGLLWFQK Unmodified 1775.928 0.92802762 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 170.49 170.49 2 0.0021453 174736 QUIQUE_C1218_190116_001 63.694 54.261 17191000 17191000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9398 2623 8796 83689 106392 106392 1 EEMGIGGVLGLLWFQK Oxidation (M) 1791.9229 0.92294224 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 1 0 2 166.69 166.69 2 0.019994 170552 QUIQUE_C1277_190116_001 69.01 54.331 79842000 0 79842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9399 2623 8796 83690;83691 106393;106394 106393 0 EEMIHNLQ Unmodified 1012.4648 0.46478027 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 39.471 39.471 2 0.0093704 35621 QUIQUE_C1218_190116_001 92.677 68.478 122110000 41789000 51614000 0 0 0 0 0 28710000 0 0 0 0 0 9400 1389 8797 83692;83693;83694 106395;106396;106397 106395 3 EEMLEIVQAIYK Unmodified 1464.7534 0.75341729 2826 P84074 HPCA Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 141.91 141.91 2 7.6224E-06 147276 QUIQUE_C1368_190116_001 133.13 112.16 497290000 97435000 89474000 121130000 0 94051000 0 0 0 0 0 0 0 95200000 9401 2826 8798 83695;83696;83697;83698;83699 106398;106399;106400;106401;106402;106403 106401 5 EEMLSWILR Unmodified 1175.6009 0.60087982 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 137.76 137.76 2 0.00068043 142082 QUIQUE_C1277_190116_001 110.81 85.957 62632000 0 14549000 14765000 11796000 0 13524000 7997000 0 0 0 0 0 0 9402 3997 8799 83700;83701;83702;83703;83704;83705 106404;106405;106406;106407;106408;106409;106410 106405 7 EEMQSNVEVVHTYR Unmodified 1719.7886 0.7886336 3737 Q92597 NDRG1 Protein NDRG1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 43.548 43.548 2;3 7.9345E-87 40204 QUIQUE_C1277_190116_001 259.55 227.13 1275200000 167260000 179750000 228300000 282070000 127170000 134140000 51876000 47071000 0 57564000 0 0 0 9403 3737 8800 83706;83707;83708;83709;83710;83711;83712;83713;83714;83715;83716;83717;83718;83719;83720 106411;106412;106413;106414;106415;106416;106417;106418;106419;106420;106421;106422;106423;106424;106425;106426;106427;106428 106414 18 EENEGVYNGSWGGR Unmodified 1552.6542 0.65424861 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;H0YHM6;F8VVF2;F8WDY6;A0A1B0GW65;F8WD33;A0A0J9YWM6;A0A0J9YWK1 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.926 56.926 2 3.0249E-07 55323 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.68 120.57 4260400000 339910000 322320000 508570000 309630000 319710000 372150000 455330000 165150000 290090000 202600000 371770000 287550000 315610000 9404 336 8801 83721;83722;83723;83724;83725;83726;83727;83728;83729;83730;83731;83732;83733 106429;106430;106431;106432;106433;106434;106435;106436;106437;106438;106439;106440;106441;106442;106443 106436 15 EENIEDATEK Unmodified 1176.5146 0.51462681 2822 Q5JSL0;Q5JSK6;Q5JSK9;P82970 HMGN5 High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 22.952 22.952 2 0.00064267 16441 QUIQUE_C1218_190116_001 108.43 64.575 54486000 31136000 0 0 0 0 23350000 0 0 0 0 0 0 0 9405 2822 8802 83734;83735;83736 106444;106445;106446 106444 3 EENQAGPEATTSDPQDLDMK Unmodified 2174.9274 0.92737151 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.691 58.691 2 7.32E-47 57082 QUIQUE_C1368_190116_001 162.46 140.59 279990000 50436000 44998000 57425000 66352000 0 60781000 0 0 0 0 0 0 0 9406 1656 8803 83737;83738;83739;83740;83741 106447;106448;106449;106450;106451 106449 5 EENQAGPEATTSDPQDLDMKK Unmodified 2303.0223 0.022334524 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 41.541 41.541 2;3 1.1107E-14 37908 QUIQUE_C1403_190116_001 96.131 86.374 613520000 0 55268000 0 55308000 44430000 53332000 45563000 70445000 82688000 0 42104000 58978000 105410000 9407 1656 8804 83742;83743;83744;83745;83746;83747;83748;83749;83750;83751;83752 106452;106453;106454;106455;106456;106457;106458;106459;106460;106461;106462;106463;106464 106454 13 EENQAGPEATTSDPQDLDMKK Oxidation (M) 2319.0172 0.017249146 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.867 31.867 3 2.5196E-07 26238 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.326 78.725 441770000 0 38787000 0 48675000 0 0 0 62688000 90650000 32302000 81840000 0 86833000 9408 1656 8804 83753;83754;83755;83756;83757;83758;83759 106465;106466;106467;106468;106469;106470;106471 106469 892 6 EENVEIHQTLDQTLLELNNL Unmodified 2364.1809 0.18088408 3325 Q5TCU3 TPM2 yes yes 0 0 0 1 2 159.55 159.55 2;3 1.4859E-56 163716 QUIQUE_C1277_190116_001 198.29 171.19 149410000 0 35264000 0 0 114140000 0 0 0 0 0 0 0 0 9409 3325 8805 83760;83761;83762 106472;106473;106474 106472 3 EENVGLHQTLDQTLNELNCI Unmodified 2339.1063 0.10633893 2791 P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;K7EPB9 TPM4 Tropomyosin alpha-4 chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.42 148.42 2 7.8023E-47 152546 QUIQUE_C1403_190116_001 203.27 177.15 1135000000 87634000 0 85224000 346470000 133370000 0 103780000 36496000 64000000 0 88340000 109430000 80260000 9410 2791 8806 83763;83764;83765;83766;83767;83768;83769;83770;83771;83772 106475;106476;106477;106478;106479;106480;106481;106482;106483;106484 106477 9 EEPAAAGSGAASPSAAEK Unmodified 1599.7376 0.73764389 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.518 20.518 2 1.7532E-31 13597 QUIQUE_C1438_190116_001 157.43 124.8 237480000 60977000 0 0 42686000 49647000 37020000 0 0 29073000 18080000 0 0 0 9411 2293 8807 83773;83774;83775;83776;83777;83778 106485;106486;106487;106488;106489;106490 106487 6 EEPDIYQIAK Unmodified 1204.5976 0.59756858 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 68.867 68.867 2 0.032181 69584 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.673 33.103 27005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27005000 0 0 9412 1074 8808 83779;83780;83781;83782;83783;83784;83785;83786 106491;106492;106493;106494;106495;106496;106497;106498 106494 8 EEPFFPPPEEFVFIHAVPVEER Unmodified 2640.29 0.2900406 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.13 153.13 3 3.0977E-11 158285 QUIQUE_C1368_190116_001 103.26 95.987 2994200000 229860000 254150000 340530000 249670000 249980000 300540000 282980000 131690000 174930000 116550000 308170000 195030000 160090000 9413 3208 8809 83787;83788;83789;83790;83791;83792;83793;83794;83795;83796;83797;83798;83799 106499;106500;106501;106502;106503;106504;106505;106506;106507;106508;106509;106510;106511;106512;106513;106514;106515;106516;106517;106518;106519;106520;106521;106522;106523;106524;106525;106526;106527 106506 29 EEPIPCTAHWHFGQ Unmodified 1707.7464 0.74637486 2099 P16083;Q5TD07 NQO2 Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase [quinone] yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 82.165 82.165 2;3 0.00070031 84879 QUIQUE_C1438_190116_001 68.809 64.341 403590000 0 0 54738000 0 121610000 39779000 0 0 41954000 0 29946000 42585000 72982000 9414 2099 8810 83800;83801;83802;83803;83804;83805;83806;83807 106528;106529;106530;106531;106532;106533;106534;106535 106529 8 EEPVLFLR Unmodified 1001.5546 0.55458155 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 90.969 90.969 2 0.036566 92122 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.714 30.244 11856000 0 0 0 0 0 0 0 11856000 0 0 0 0 0 9415 4488 8811 83808 106536 106536 1 EEPWVDPNSPVLLEDPVLCALAK Unmodified 2590.2989 0.29889072 2889;2616 P52895;B4DK69;Q04828;H0Y804 AKR1C2;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C2;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 166.34 166.34 2;3 1.5364E-14 171912 QUIQUE_C1576_190116_001 111.64 99.952 1433200000 195120000 144100000 0 180630000 161430000 145620000 173870000 35669000 45339000 105360000 49260000 99290000 97545000 9416 2616;2889 8812 83809;83810;83811;83812;83813;83814;83815;83816;83817;83818;83819;83820;83821;83822;83823;83824;83825;83826;83827;83828;83829 106537;106538;106539;106540;106541;106542;106543;106544;106545;106546;106547;106548;106549;106550;106551;106552;106553;106554;106555;106556;106557;106558;106559 106549 23 EEQCILYLGPR Unmodified 1376.6758 0.67583567 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.435 90.435 2 1.4501E-08 93792 QUIQUE_C1438_190116_001 156.51 117.49 651530000 49466000 62201000 104710000 75687000 65143000 78996000 0 68782000 0 0 96430000 50116000 0 9417 2998 8813 83830;83831;83832;83833;83834;83835;83836;83837;83838 106560;106561;106562;106563;106564;106565;106566;106567;106568;106569 106565 10 EEQELHDIHSTR Unmodified 1492.6906 0.69063412 2590 P51674 GPM6A Neuronal membrane glycoprotein M6-a yes yes 0 0 0 1 2 3 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 15.351 15.351 2;3;4 2.6235E-78 7946 QUIQUE_C1218_190116_001 245.58 219.93 6922100000 70593000 252890000 1184000000 998780000 589920000 439820000 1011300000 347660000 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0.96005184 933;1529 E9PHY5;E9PK52;O43491;Q6R5J7;E9PMV8 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 49.584 49.584 3 2.2992E-13 47655 QUIQUE_C1576_190116_001 95.767 91.498 537320000 0 0 0 116950000 68145000 0 70274000 0 91785000 43521000 89948000 56693000 0 9421 933;1529 8817 83868;83869;83870;83871;83872;83873;83874 106603;106604;106605;106606;106607;106608;106609 106605 5 EEQIPDGMCIDAEGK Unmodified 1690.7178 0.71783642 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 0 0 1 79.315 79.315 2 0.045154 79819 QUIQUE_C1403_190116_001 41.317 32.804 25341000 0 0 0 25341000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9422 3143 8818 83875 106610 106610 1 EEQTDTSDGESVTHHIR Unmodified 1939.8508 0.85077617 2401 P36915;A2AB27 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 20.197 20.197 3 0.005732 13215 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.391 40.786 63773000 0 0 0 0 0 0 36044000 0 27729000 0 0 0 0 9423 2401 8819 83876;83877 106611;106612 106612 2 EEQTILPGDNLITECR Unmodified 1886.9044 0.90439164 3405 Q6UVY6 MOXD1 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P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 1 2 1 31.074 31.074 3;4 1.957E-06 25665 QUIQUE_C1277_190116_001 101.67 93.517 910040000 146750000 132620000 81453000 76229000 86563000 60199000 71733000 0 0 43568000 165670000 45257000 0 9429 2079 8825 83913;83914;83915;83916;83917;83918;83919;83920;83921;83922;83923;83924;83925;83926 106652;106653;106654;106655;106656;106657;106658;106659;106660;106661;106662;106663;106664;106665;106666;106667 106655 16 EESEPEVKEDVIEK Unmodified 1658.7887 0.78867641 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 37.226 37.226 2;3 2.123E-10 33266 QUIQUE_C1403_190116_001 139.32 115.47 315980000 0 40809000 0 32176000 97368000 32362000 31882000 38827000 0 0 42553000 0 0 9430 921 8826 83927;83928;83929;83930;83931;83932;83933;83934;83935;83936;83937 106668;106669;106670;106671;106672;106673;106674;106675;106676;106677;106678 106670 11 EESESTAVGQAHSDISK Unmodified 1773.8017 0.80170071 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 27.592 27.592 2;3 1.9943E-06 21238 QUIQUE_C1277_190116_001 101.62 88.196 240650000 56475000 0 0 0 83319000 100850000 0 0 0 0 0 0 0 9431 2880 8827 83938;83939;83940;83941;83942;83943 106679;106680;106681;106682;106683;106684 106680 4 EESESVLTLK Unmodified 1133.5816 0.58158416 2915;2107 Q08209;E7ETC2;P16298;Q5F2F8;Q5F2G0 PPP3CA;PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.066 55.066 2 0.0010325 53170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.89 93.735 3372200000 594130000 619080000 435180000 482310000 0 394180000 0 301780000 337650000 207860000 0 0 0 9432 2915;2107 8828 83944;83945;83946;83947;83948;83949;83950;83951 106685;106686;106687;106688;106689;106690;106691;106692;106693 106692 9 EESFGPVMIISR Unmodified 1363.6806 0.6805867 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.15 109.15 2 9.1156E-05 111999 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.6 110.11 2146700000 145570000 158330000 387850000 184230000 145560000 129930000 202860000 194710000 0 0 269100000 105600000 222990000 9433 1665 8829 83952;83953;83954;83955;83956;83957;83958;83959;83960;83961;83962 106694;106695;106696;106697;106698;106699;106700;106701;106702;106703;106704;106705 106701 12 EESFGPVMIISR Oxidation (M) 1379.6755 0.67550132 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 93.868 93.868 2 0.011282 96133 QUIQUE_C1368_190116_001 61.213 35.319 196820000 0 0 71839000 0 27555000 0 0 0 0 20331000 77098000 0 0 9434 1665 8829 83963;83964;83965;83966;83967 106706;106707;106708;106709;106710 106706 898 4 EESLATEPAPGTQK Unmodified 1456.7046 0.70455285 705 C9JA33 PALM2 no no 0 0 0 1 1 30.239 30.239 2 4.2877E-05 24514 QUIQUE_C1403_190116_001 118.4 88.149 56922000 31203000 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family homolog 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 10.793 10.793 3 0.00081665 3509 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.089 46.972 78952000 0 0 0 0 0 0 0 0 24391000 8479200 14913000 19710000 11459000 9438 3800 8833 83984;83985;83986;83987;83988 106729;106730;106731;106732;106733 106730 2738 5 EESSYILESNR Unmodified 1325.6099 0.60992418 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 0 0 1 1 47.954 47.954 2 0.030078 42684 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.276 31.279 10307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10307000 0 0 0 9439 3433 8834 83989;83990 106734;106735 106735 2 EESTVFSQAIHYANR Unmodified 1750.8275 0.82746195 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 83.487 83.487 3 0.0010777 84319 QUIQUE_C1368_190116_001 62.287 49.795 188650000 82543000 0 106110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9440 1716 8835 83991;83992;83993 106736;106737;106738 106737 3 EETGFSTYNPQVIIR Unmodified 1752.8683 0.86826413 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 99.95 99.95 2 0.00018531 103091 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106750;106751;106752;106753;106754;106755;106756;106757;106758 106756 9 EETQEDKDCPIKEEK Unmodified 1876.836 0.8360373 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 2 1 2 13.854 13.854 3;4 0.0087082 5995 QUIQUE_C1576_190116_001 65.467 52.949 41791000 0 0 0 0 10961000 0 30830000 0 0 0 0 0 0 9444 2133 8839 84014;84015;84016 106759;106760;106761 106761 3 EETVLATVQALQTASHLSQQADLR Unmodified 2608.3457 0.34565799 1869 P04844 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.5 137.5 3 1.9628E-11 143325 QUIQUE_C1218_190116_001 85.376 70.968 433140000 52330000 0 64020000 57726000 51933000 57572000 53316000 0 51911000 0 0 44336000 0 9445 1869 8840 84017;84018;84019;84020;84021;84022;84023;84024 106762;106763;106764;106765;106766;106767;106768;106769;106770 106762 9 EETVNDFWR Unmodified 1194.5306 0.53055165 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 86.239 86.239 2 0.038361 87589 QUIQUE_C1403_190116_001 83.265 74.051 33179000 0 0 0 33179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9446 2137 8841 84025 106771 106771 0 EEVALSEYK Unmodified 1066.5183 0.51825563 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 43.072 43.072 2 0.00051281 39304 QUIQUE_C1563_190116_001 128.69 96.752 308500000 87929000 51815000 41757000 0 64246000 62754000 0 0 0 0 0 0 0 9447 2009 8842 84026;84027;84028;84029;84030 106772;106773;106774;106775;106776 106776 4 EEVASAVSSSYR Unmodified 1283.5994 0.59935949 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.89 39.89 2 0.00052122 34960 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.342 84.494 1028500000 69630000 0 128740000 0 95173000 97917000 88815000 116730000 0 51569000 107330000 89579000 183040000 9448 3889 8843 84031;84032;84033;84034;84035;84036;84037;84038;84039;84040 106777;106778;106779;106780;106781;106782;106783;106784;106785;106786;106787;106788 106783 9 EEVDQVAR Unmodified 944.45632 0.45632407 1296 J3QL56;O75880 SCO1 Protein SCO1 homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 18.214 18.214 2 0.035632 10434 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.306 25.146 22773000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22773000 0 0 0 9449 1296 8844 84041 106789 106789 1 EEVEGESLDLCLQQLYK Unmodified 2051.9721 0.97213685 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.19 133.19 2 1.9456E-63 137327 QUIQUE_C1403_190116_001 193.73 172.5 521030000 77965000 70645000 67665000 50014000 59636000 71103000 57901000 0 30254000 0 0 0 35849000 9450 3722 8845 84042;84043;84044;84045;84046;84047;84048;84049;84050 106790;106791;106792;106793;106794;106795;106796;106797;106798 106793 6 EEVGQYLK Unmodified 964.48656 0.48656157 3360 Q6GMV3 PTRHD1 Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.284 40.284 2 0.018939 36653 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.146 57.464 426460000 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Dehydrogenase/reductase SDR family member 1 yes yes 0 0 0 1 66.34 66.34 2 0.049356 67147 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.036 19.137 21500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21500000 0 0 9454 3902 8849 84064 106813 106813 1 EEVNIAR Unmodified 829.42938 0.42938104 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 0 0 1 20.408 20.408 2 0.044891 12981 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.994 34.463 170340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 170340000 0 0 0 9455 419;584 8850 84065 106814 106814 1 EEVTELLAR Unmodified 1058.5608 0.56078914 53 A0A087WVZ9;P19388;A0A087WWX0;A0A0A0MQR7 POLR2E DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 yes no 0 0 0 1 73.817 73.817 2 0.048831 74496 QUIQUE_C1218_190116_001 51.066 20.33 23486000 23486000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9456 53 8851 84066 106815 106815 1 EEVVAMIGDGPCVVK Unmodified 1601.7793 0.77931447 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 97.246 97.246 2 0.0062255 100096 QUIQUE_C1368_190116_001 79.23 60.558 157830000 0 28405000 26467000 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106863 106863 0 EEWTEAIQAVADR Unmodified 1516.7158 0.71578623 4538 Q9Y243;F8VS91 AKT3 RAC-gamma serine/threonine-protein kinase yes no 0 0 0 1 120.28 120.28 2 0.0062352 124687 QUIQUE_C1218_190116_001 78.342 67.584 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9463 4538 8858 84106 106864 106864 1 EEWTTAIQTVADGLK Unmodified 1660.8308 0.83081599 2335 P31749 AKT1 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 142.48 142.48 2 0.0012349 145337 QUIQUE_C1563_190116_001 90.614 66.627 25833000 0 0 0 0 0 25833000 0 0 0 0 0 0 0 9464 2335 8859 84107 106865 106865 1 EEYADFKPFER Unmodified 1429.6514 0.65139506 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 72.879 72.879 3 0.035743 73724 QUIQUE_C1218_190116_001 45.257 37.892 162150000 64488000 45353000 39214000 0 0 0 0 0 0 13090000 0 0 0 9465 4252 8860 84108;84109;84110;84111 106866;106867;106868;106869 106866 3 EEYNGVIEEFLATGEK Unmodified 1826.8574 0.85742467 4169 Q9H4A4;C9JMZ3;H7C2T3 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 142.98 142.98 2;3 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106934;106935;106936;106937;106938;106939;106940;106941;106942;106943;106944;106945;106946;106947 106935 13 EFAGEDTSDLFLEER Unmodified 1756.7792 0.77917435 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.59 116.59 2 6.1047E-24 113285 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.63 136.26 244350000 54331000 0 0 47282000 0 30332000 0 46954000 23155000 42300000 0 0 0 9473 1470 8868 84171;84172;84173;84174;84175;84176 106948;106949;106950;106951;106952;106953 106953 4 EFAILHQNLK Unmodified 1211.6663 0.66625727 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 2 58.961 58.961 2;3 0.00084198 56733 QUIQUE_C1563_190116_001 110.55 81.243 796560000 101020000 98841000 114710000 46752000 104390000 102820000 67723000 0 0 45250000 47965000 31756000 35324000 9474 3899 8869 84177;84178;84179;84180;84181;84182;84183;84184;84185;84186;84187;84188;84189;84190;84191;84192;84193;84194 106954;106955;106956;106957;106958;106959;106960;106961;106962;106963;106964;106965;106966;106967;106968;106969;106970;106971;106972;106973 106963 18 EFAIPEEEAEWVGLTLEEAIEK Unmodified 2531.2319 0.23191659 519 A2IDC6;Q13084;Q4TT37 MRPL28 39S ribosomal protein L28, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 173.35 173.35 3 0.0067786 180568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.217 31.809 29810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11612000 18198000 0 9475 519 8870 84195;84196 106974;106975 106974 2 EFANFDFDVWR Unmodified 1444.6412 0.64116473 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;H0Y314;H0Y4F5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 147.12 147.12 2 0.0044631 151882 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.349 52.078 10813000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10813000 0 9476 1187 8871 84197 106976 106976 1 EFANFTFPR Unmodified 1127.54 0.53999412 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.34 102.34 2 0.0017963 103724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.02 67.889 299750000 87717000 88891000 0 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1399.5496 0.54964888 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.221 50.221 2 2.3793E-10 48767 QUIQUE_C1576_190116_001 158.76 129.28 2752300000 346720000 288210000 256600000 293810000 213130000 331720000 261490000 104620000 106080000 97134000 144140000 144860000 163810000 9483 2309 8878 84231;84232;84233;84234;84235;84236;84237;84238;84239;84240;84241;84242;84243 107010;107011;107012;107013;107014;107015;107016;107017;107018;107019;107020;107021;107022;107023;107024;107025;107026;107027;107028;107029 107022 19 EFCPLYYLLNAIPTK Unmodified 1840.9433 0.94334333 1474 O15040 TECPR2 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 169.73 169.73 2 0.0011601 172711 QUIQUE_C1403_190116_001 71.555 65.322 31301000 0 0 0 20817000 0 10484000 0 0 0 0 0 0 0 9484 1474 8879 84244;84245 107030;107031 107030 2 EFCPNEQNWR Unmodified 1378.5724 0.57243324 3711 Q8WW22 DNAJA4 DnaJ homolog subfamily A member 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.581 57.581 2 0.0032227 56898 QUIQUE_C1576_190116_001 91.069 76.554 185550000 0 0 22168000 33627000 25534000 0 37309000 0 0 0 32804000 34110000 0 9485 3711 8880 84246;84247;84248;84249;84250;84251 107032;107033;107034;107035;107036;107037 107035 5 EFCQQEVEPMCK Unmodified 1583.6418 0.64183471 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 53.743 53.743 2 2.2783E-20 51977 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.41 159.08 1613200000 142470000 176770000 197340000 158170000 124750000 152420000 192970000 43797000 46468000 20784000 112170000 88126000 156910000 9486 1282 8881 84252;84253;84254;84255;84256;84257;84258;84259;84260;84261;84262;84263;84264;84265 107038;107039;107040;107041;107042;107043;107044;107045;107046;107047;107048;107049;107050;107051 107045 13 EFCQQEVEPMCK Oxidation (M) 1599.6367 0.63674933 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.797 38.797 2 0.00048104 35704 QUIQUE_C1218_190116_001 101.82 94.26 159810000 0 0 34238000 0 0 0 42939000 0 28530000 0 54101000 0 0 9487 1282 8881 84266;84267;84268;84269;84270;84271;84272;84273;84274 107052;107053;107054;107055;107056;107057;107058;107059;107060 107052 738 9 EFDAILINPK Unmodified 1158.6285 0.62847478 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;H0YDZ7;Q5SZC3 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.619 94.619 2 0.00022828 96925 QUIQUE_C1277_190116_001 124.98 103.46 4492600000 478090000 415110000 433100000 423760000 347930000 422860000 501850000 193420000 189270000 215970000 282920000 234790000 353490000 9488 4567 8882 84275;84276;84277;84278;84279;84280;84281;84282;84283;84284;84285;84286;84287 107061;107062;107063;107064;107065;107066;107067;107068;107069;107070;107071;107072;107073;107074;107075;107076;107077;107078 107063 18 EFDEDLEDKTENDK Unmodified 1725.7217 0.72171905 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 1 1 44.626 44.626 2;3 9.4517E-46 41258 QUIQUE_C1277_190116_001 211.37 186.53 875990000 223780000 166010000 74334000 128090000 62958000 80834000 139990000 0 0 0 0 0 0 9489 419 8883 84288;84289;84290;84291;84292;84293;84294;84295;84296;84297;84298;84299;84300 107079;107080;107081;107082;107083;107084;107085;107086;107087;107088;107089;107090;107091 107081 8 EFDEDLEDKTENDKIR Unmodified 1994.9069 0.90689406 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 50.488 50.488 2;3;4 1.1057E-34 48205 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.86 180.09 1960000000 38050000 43318000 213510000 0 255460000 19680000 31163000 162720000 202340000 64088000 0 34755000 894920000 9490 419 8884 84301;84302;84303;84304;84305;84306;84307;84308;84309;84310;84311;84312;84313;84314;84315;84316 107092;107093;107094;107095;107096;107097;107098;107099;107100;107101;107102;107103;107104;107105;107106;107107;107108;107109 107104 16 EFDEDSEDR Unmodified 1140.4207 0.42072643 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.97 21.97 2 0.025503 14813 QUIQUE_C1403_190116_001 103.56 93.149 657190000 110240000 0 175340000 112430000 92587000 0 119720000 0 0 0 0 46874000 0 9491 4432 8885 84317;84318;84319;84320;84321;84322 107110;107111;107112;107113;107114;107115 107112 5 EFDEDSEDRLVNEK Unmodified 1723.7537 0.75368788 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 52.213 52.213 2;3 1.3646E-67 49782 QUIQUE_DMIX8_190116_001 205.12 171.23 171010000 34002000 0 0 0 0 0 0 61386000 0 0 75622000 0 0 9492 4432 8886 84323;84324;84325;84326 107116;107117;107118;107119 107119 4 EFDELNPSAQR Unmodified 1304.5997 0.59969384 2112 P16615;H7C5W9 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes no 0 0 0 1 1 58.164 58.164 2 0.00045128 56521 QUIQUE_C1403_190116_001 102.55 78.525 92836000 0 0 0 44058000 0 0 0 48777000 0 0 0 0 0 9493 2112 8887 84327;84328 107120;107121;107122 107120 3 EFDFAAAYSYLDTAK Unmodified 1710.7777 0.77771779 2937 Q0VDG4 SCRN3 Secernin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.28 147.28 2 1.4559E-05 152131 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.66 85.225 226820000 0 0 0 0 34526000 29538000 48660000 32822000 0 0 0 40463000 40813000 9494 2937 8888 84329;84330;84331;84332;84333;84334 107123;107124;107125;107126;107127;107128 107128 4 EFDFFNK Unmodified 945.42323 0.42323303 2448 P42356;Q8N8J0;A8MTF1 PI4KA;PI4KAP1 Phosphatidylinositol 4-kinase alpha;Putative inactive phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P1 yes no 0 0 0 1 1 1 95.607 95.607 2 0.046099 99113 QUIQUE_C1218_190116_001 77.944 68.999 45664000 16256000 16516000 12892000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9495 2448 8889 84335;84336;84337 107129;107130;107131 107129 3 EFDGIGAVSGGGATSR Unmodified 1479.6954 0.69538514 2649 P54803;A0A087WX10;G3V5E8;G3V4M2 GALC Galactocerebrosidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.873 65.873 2 3.8865E-05 65629 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.431 57.827 321160000 0 75438000 97180000 0 0 0 0 54081000 43889000 0 50574000 0 0 9496 2649 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0.39774656 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 30.451 30.451 2 0.060724 25376 QUIQUE_C1368_190116_001 69.176 32.082 545040000 0 0 545040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9499 4128 8893 84355 107150 107150 1 EFDSLHWFQSVR Unmodified 1549.7314 0.73137672 118 A0A087X256;Q2M389 KIAA1033 WASH complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.35 113.35 3 0.00042109 116938 QUIQUE_C1403_190116_001 67.456 62.813 191400000 11673000 16874000 13339000 14557000 19252000 12033000 14395000 12402000 18980000 0 22302000 14058000 21537000 9500 118 8894 84356;84357;84358;84359;84360;84361;84362;84363;84364;84365;84366;84367 107151;107152;107153;107154;107155;107156;107157;107158;107159;107160;107161;107162;107163;107164;107165;107166;107167 107157 17 EFDSPETADLK Unmodified 1250.5667 0.56666238 3641 Q8NDN9 RCBTB1 RCC1 and BTB domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 55.971 55.971 2 0.036981 55346 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.602 24.646 15981000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15981000 0 0 9501 3641 8895 84368 107168 107168 1 EFDYVINDLTAVPISTSPEEDSTWEFLR Unmodified 3272.5401 0.54011986 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 169.89 169.89 2;3 1.5639E-126 177253 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.29 182.39 1172200000 0 43032000 0 0 0 89170000 173960000 106000000 193650000 0 262350000 205400000 98581000 9502 2613 8896 84369;84370;84371;84372;84373;84374;84375;84376;84377 107169;107170;107171;107172;107173;107174;107175;107176;107177 107174 9 EFEEDLTGIDDR Unmodified 1437.626 0.62596817 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.25 88.25 2 0.00050608 91250 QUIQUE_C1218_190116_001 125.75 114.6 1093100000 152280000 123410000 189470000 71839000 84517000 101490000 0 27694000 0 92729000 134380000 0 115280000 9503 1961 8897 84378;84379;84380;84381;84382;84383;84384;84385;84386;84387;84388;84389 107178;107179;107180;107181;107182;107183;107184;107185;107186;107187;107188;107189;107190;107191;107192 107178 14 EFEEDLTGIDDRK Unmodified 1565.7209 0.72093119 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 66.47 66.47 2;3 2.6069E-53 66227 QUIQUE_DMIX3_190116_001 204.5 179.72 1488200000 25459000 113050000 171220000 0 42336000 0 27690000 142900000 239960000 36657000 204260000 220670000 263950000 9504 1961 8898 84390;84391;84392;84393;84394;84395;84396;84397;84398;84399;84400;84401;84402;84403;84404;84405;84406;84407 107193;107194;107195;107196;107197;107198;107199;107200;107201;107202;107203;107204;107205;107206;107207;107208;107209;107210;107211;107212;107213 107205 21 EFEETMDALQADIDQLEAEK Unmodified 2324.0366 0.036587605 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 2 2 1 1 2 3 2 1 1 164.33 164.33 2;3 8.9008E-65 169302 QUIQUE_C1218_190116_001 178.67 166.61 279420000 48899000 49947000 23959000 25879000 56330000 29084000 37746000 0 0 7575400 0 0 0 9505 890;3052 8899 84408;84409;84410;84411;84412;84413;84414;84415;84416;84417;84418;84419;84420;84421;84422 107214;107215;107216;107217;107218;107219;107220;107221;107222;107223;107224;107225;107226;107227;107228 107215 14 EFEETMDALQADIDQLEAEKAELK Unmodified 2765.2953 0.29532149 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 156.14 156.14 3 4.6807E-13 163565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.21 98.216 255590000 0 0 0 0 0 0 0 85337000 0 0 170250000 0 0 9506 890;3052 8900 84423;84424 107229;107230;107231 107231 2 EFEGEEEYLEILGITR Unmodified 1925.9258 0.92583859 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 2 3 3 2 2 2 1 2 3 1 3 1 2 159.84 159.84 2;3 7.7934E-112 167077 QUIQUE_DMIX5_190116_001 277.06 252.21 4497500000 316480000 354320000 503000000 338800000 614300000 276910000 422200000 255060000 350410000 94087000 448270000 259880000 263840000 9507 1175 8901 84425;84426;84427;84428;84429;84430;84431;84432;84433;84434;84435;84436;84437;84438;84439;84440;84441;84442;84443;84444;84445;84446;84447;84448;84449;84450;84451 107232;107233;107234;107235;107236;107237;107238;107239;107240;107241;107242;107243;107244;107245;107246;107247;107248;107249;107250;107251;107252;107253;107254;107255;107256;107257;107258;107259;107260;107261;107262 107256 29 EFENLYIENLELR Unmodified 1680.8359 0.83590137 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.6 135.6 2 8.0454E-05 139661 QUIQUE_C1403_190116_001 137.17 102.28 780060000 86803000 83786000 82122000 68883000 76966000 70850000 0 0 40117000 36838000 114340000 51666000 67691000 9508 498 8902 84452;84453;84454;84455;84456;84457;84458;84459;84460;84461;84462 107263;107264;107265;107266;107267;107268;107269;107270;107271;107272;107273;107274;107275 107266 13 EFENLYIENLELRR Unmodified 1836.937 0.9370124 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 111.38 111.38 3 6.0675E-05 114210 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.498 70.833 266650000 0 0 0 0 0 0 0 57134000 47699000 0 48262000 70558000 42992000 9509 498 8903 84463;84464;84465;84466;84467 107276;107277;107278;107279;107280 107276 5 EFEPLLNWMK Oxidation (M) 1321.6377 0.63765925 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 118.34 118.34 2 0.00019478 123843 QUIQUE_C1218_190116_001 122.74 105.35 291680000 32443000 0 29429000 0 30587000 31486000 26540000 16804000 26754000 46273000 0 30511000 20853000 9510 2079 8904 84468;84469;84470;84471;84472;84473;84474;84475;84476;84477;84478 107281;107282;107283;107284;107285;107286;107287;107288;107289;107290;107291 107281 1404 11 EFEPLLNWMK Unmodified 1305.6427 0.64274463 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.11 142.11 2 1.7565E-05 145329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.34 109.78 3012600000 283580000 354420000 279110000 368140000 237480000 255530000 316190000 107430000 169240000 85708000 192430000 160310000 203100000 9511 2079 8904 84479;84480;84481;84482;84483;84484;84485;84486;84487;84488;84489;84490;84491 107292;107293;107294;107295;107296;107297;107298;107299;107300;107301;107302;107303;107304;107305;107306;107307;107308;107309;107310;107311;107312;107313;107314;107315;107316;107317 107309 26 EFESAIVEAAR Unmodified 1220.6037 0.60371659 3098 Q15020;F8VV04;F8W667;F8VVK9;F8VZM2 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 1 74.848 74.848 2 0.0038393 71576 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.15 48.702 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9512 3098 8905 84492;84493;84494 107318;107319;107320 107319 3 EFESVLVDAFSHVAR Unmodified 1704.8471 0.84713476 4255 Q9NQG5 RPRD1B Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 137.83 137.83 2;3 4.1011E-06 143619 QUIQUE_C1218_190116_001 95.981 86.931 873500000 61819000 58212000 76564000 46816000 52646000 126130000 63567000 40940000 68088000 13604000 129360000 70198000 65559000 9513 4255 8906 84495;84496;84497;84498;84499;84500;84501;84502;84503;84504;84505;84506;84507;84508;84509 107321;107322;107323;107324;107325;107326;107327;107328;107329;107330;107331;107332;107333;107334;107335;107336;107337 107321 16 EFEVYGPIK Unmodified 1080.5492 0.54916182 1950 P08621;M0QYR1 SNRNP70 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 78.165 78.165 2 0.0089716 74777 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.282 37.014 95633000 45231000 0 0 27998000 0 0 0 0 0 22404000 0 0 0 9514 1950 8907 84510;84511;84512 107338;107339;107340 107340 3 EFEVYGPIKR Unmodified 1236.6503 0.65027285 1950 P08621;M0QYR1 SNRNP70 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa yes no 0 0 1 1 1 1 55.601 55.601 3 0.017823 54467 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.567 25.611 133370000 0 0 0 0 0 0 0 35462000 0 0 60154000 0 37757000 9515 1950 8908 84513;84514;84515 107341;107342;107343;107344 107343 4 EFEWNLK Unmodified 964.46543 0.46543219 4075 Q9BYJ9 YTHDF1 YTH domain-containing family protein 1 yes yes 0 0 0 1 83.597 83.597 2 0.063196 85382 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.889 18.83 18978000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18978000 9516 4075 8909 84516 107345 107345 1 EFFDSLNEAIMR Unmodified 1470.6813 0.68131498 2457 P43003;A0A087WT87 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.16 135.16 2 1.5134E-09 137944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.28 112.23 1068600000 124560000 91138000 176260000 137720000 0 76167000 67960000 80743000 88550000 42300000 80554000 45672000 57021000 9517 2457 8910 84517;84518;84519;84520;84521;84522;84523;84524;84525;84526;84527;84528 107346;107347;107348;107349;107350;107351;107352;107353;107354;107355;107356;107357;107358 107352 13 EFFDSLNEAIMR Oxidation (M) 1486.6762 0.67622961 2457 P43003;A0A087WT87 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 1 0 1 1 121.6 121.6 2 0.025709 125461 QUIQUE_C1403_190116_001 65.719 44.721 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9518 2457 8910 84529;84530 107359;107360 107359 2 EFFEIMPNYAK Unmodified 1387.6482 0.64822394 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.1 117.1 2 0.0014505 120553 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.615 74.834 305520000 27377000 31852000 0 22220000 26327000 24835000 42529000 30109000 0 0 36295000 33952000 30021000 9519 739 8911 84531;84532;84533;84534;84535;84536;84537;84538;84539;84540;84541 107361;107362;107363;107364;107365;107366;107367;107368;107369;107370;107371 107370 9 EFFLELTMGR Oxidation (M) 1257.6064 0.60635913 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 1 0 1 1 120.73 120.73 2 0.013366 117941 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.563 46.938 37681000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19162000 0 0 18519000 9520 292;882;3442 8912 84542;84543 107372;107373;107374 107373 221 3 EFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVK Oxidation (M) 3894.8397 0.83973228 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 172.33 172.33 3 4.8921E-39 176525 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.492 90.546 252340000 0 13807000 0 0 0 0 27521000 31458000 32934000 0 44288000 102340000 0 9521 2087 8913 84544;84545;84546;84547;84548;84549 107375;107376;107377;107378;107379;107380 107378 1427 6 EFFPNHQWVK Unmodified 1330.6459 0.64585618 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 0 1 65.661 65.661 3 0.024742 64902 QUIQUE_C1403_190116_001 38.754 29.542 17766000 0 0 0 17766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9522 2133 8914 84550 107381 107381 1 EFFSQGDLEK Unmodified 1198.5506 0.55061839 1402 O00408;E9PEF1 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.133 71.133 2 0.00069041 72146 QUIQUE_C1438_190116_001 107.69 64.779 611670000 0 96400000 95252000 78638000 73054000 59334000 89357000 50316000 0 0 0 69321000 0 9523 1402 8915 84551;84552;84553;84554;84555;84556;84557;84558 107382;107383;107384;107385;107386;107387;107388;107389;107390 107386 4 EFFSQYGDVMDVFIPK Unmodified 1920.8968 0.89678707 2968 Q13148;B1AKP7;G3V162;A0A087X260;A0A087WYY0;A0A0A0N0M3;K7EN94;A0A1W2PNU8;A0A087WXQ5;A0A087WV68;A0A087WW61;A0A087WX67;A0A087WXV3;A0A087WYE7;A0A087WZC9;A0A087WZM1 TARDBP;TDP43 TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 164.15 164.15 2 0.001801 169495 QUIQUE_C1368_190116_001 62.088 44.422 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9524 2968 8916 84559 107391 107391 1 EFFSTIVVDAIDVLK Unmodified 1694.9131 0.91308906 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 173.25 173.25 2 0.0001139 180336 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.403 71.136 27452000 0 0 0 0 0 0 6782700 0 0 0 20669000 0 0 9525 2813 8917 84560;84561 107392;107393;107394;107395 107394 4 EFFVGLSK Unmodified 925.49092 0.49091866 1684;1762 O94760;B4DYP1;O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8;H0Y7N1 DDAH1;DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1;N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 no no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 3 2 1 81.918 81.918 1;2 0.0064801 83705 QUIQUE_C1576_190116_001 101.6 38.622 40683000000 2757500000 3059100000 3522100000 2671200000 2592200000 2863400000 2389200000 3642100000 4151100000 1230800000 4634500000 3669900000 3499400000 9526 1684;1762 8918 84562;84563;84564;84565;84566;84567;84568;84569;84570;84571;84572;84573;84574;84575;84576;84577;84578;84579;84580;84581;84582;84583 107396;107397;107398;107399;107400;107401;107402;107403;107404;107405;107406;107407;107408;107409;107410;107411;107412;107413;107414;107415;107416;107417;107418;107419;107420;107421;107422;107423;107424;107425;107426;107427;107428;107429 107410 26 EFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQER Unmodified 2814.4262 0.4262165 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 173.71 173.71 3 1.0515E-08 175128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.217 60.023 64780000 0 0 0 0 16505000 0 0 21981000 26295000 0 0 0 0 9527 1644 8919 84584;84585;84586;84587 107430;107431;107432;107433 107431 4 EFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQER Oxidation (M) 2830.4211 0.42113112 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 1 0 1 170.49 170.49 3 7.1837E-06 172270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.051 41.731 20827000 0 0 0 0 0 0 0 20827000 0 0 0 0 0 9528 1644 8919 84588 107434 107434 886 1 EFGATECINPQDFSK Unmodified 1741.7618 0.76175015 2028 P11766;H0YAG8 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.337 92.337 2 4.7797E-54 95758 QUIQUE_C1218_190116_001 192.6 167.21 1517400000 293330000 216900000 253410000 240880000 158670000 246810000 0 0 0 107400000 0 0 0 9529 2028 8920 84589;84590;84591;84592;84593;84594;84595 107435;107436;107437;107438;107439;107440;107441;107442;107443;107444;107445;107446;107447 107437 11 EFGDKVNLLSVLEAAK Unmodified 1731.9407 0.94070079 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 137.28 137.28 3 6.3496E-05 143774 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.151 64.459 159950000 0 0 0 0 0 0 0 32646000 23723000 0 29183000 33993000 40402000 9530 4006 8921 84596;84597;84598;84599;84600 107448;107449;107450;107451;107452;107453 107451 5 EFGDSLSLEILQIIK Unmodified 1703.9346 0.93455278 4428 Q9UHB9 SRP68 Signal recognition particle subunit SRP68 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.54 169.54 2 1.2101E-05 174312 QUIQUE_C1218_190116_001 99.522 74.136 85754000 18146000 12842000 0 8686400 16870000 0 0 11890000 17319000 0 0 0 0 9531 4428 8922 84601;84602;84603;84604;84605;84606 107454;107455;107456;107457;107458;107459;107460 107454 7 EFGEEALNSLQK Unmodified 1363.662 0.66195975 1232 H7C386;Q9BW91;D6RAW2 NUDT9 ADP-ribose pyrophosphatase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 85.643 85.643 2 0.022154 87281 QUIQUE_C1277_190116_001 80.896 62.584 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9532 1232 8923 84607 107461 107461 1 EFGFSGLNVK Unmodified 1096.5553 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107508;107509;107510;107511;107512;107513;107514;107515;107516;107517;107518;107519;107520;107521;107522;107523 107512 117 15 EFGIDPQNMFEFWDWVGGR Unmodified 2329.0262 0.026238111 199;790 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 0 0 1 1 1 175.03 175.03 2 0.0003893 178641 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.013 55.818 193810000 0 0 0 0 0 0 0 0 37728000 0 100470000 55606000 0 + 9540 199;790 8929 84663;84664;84665 107524;107525;107526;107527 107527 3 EFGNLTR Unmodified 835.41882 0.41881635 1462 O14949 UQCRQ Cytochrome b-c1 complex subunit 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 33.359 33.359 2 0.042242 28670 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.297 57.324 476740000 0 0 0 0 93088000 0 93960000 0 0 0 171320000 118370000 0 9541 1462 8930 84666;84667;84668;84669 107528;107529;107530;107531 107531 4 EFGPVVIDYGK Unmodified 1222.6234 0.6233894 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.08 93.08 2 0.00124 94483 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1 1 1 2 1 1 1 78.101 78.101 3;4 1.6449E-05 79890 QUIQUE_C1438_190116_001 67.928 62.4 756070000 104660000 138360000 44838000 74889000 54446000 52358000 60707000 0 35830000 42227000 59143000 35711000 52899000 9544 1050 8933 84692;84693;84694;84695;84696;84697;84698;84699;84700;84701;84702;84703;84704;84705;84706 107562;107563;107564;107565;107566;107567;107568;107569;107570;107571;107572;107573;107574;107575;107576;107577 107569 15 EFGTNIK Unmodified 807.41267 0.41266834 2079 P14625;Q58FF3 HSP90B1;HSP90B2P Endoplasmin;Putative endoplasmin-like protein yes no 0 0 0 1 26.145 26.145 2 0.050616 20268 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.439 33.753 261680000 0 0 0 0 0 0 0 0 261680000 0 0 0 0 9545 2079 8934 84707 107578 107578 1 EFGVSPDK Unmodified 877.41815 0.41814765 2254 P26640;A0A140T936;H0Y426 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 28.594 28.594 2 0.040092 23594 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.478 36.291 113110000 0 0 0 0 0 0 0 51349000 0 0 61765000 0 0 9546 2254 8935 84708;84709 107579;107580 107579 2 EFHGLGDCIIK Unmodified 1287.6282 0.6281572 2038 P12235;V9GYG0 SLC25A4 ADP/ATP translocase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 66.369 66.369 2;3 5.4916E-24 67374 QUIQUE_C1218_190116_001 206.78 154.07 3165100000 253870000 213920000 277020000 0 149840000 238940000 206130000 532480000 313010000 0 402400000 277660000 299850000 9547 2038 8936 84710;84711;84712;84713;84714;84715;84716;84717;84718;84719;84720;84721;84722 107581;107582;107583;107584;107585;107586;107587;107588;107589;107590;107591;107592;107593 107581 12 EFHGNIIK Unmodified 956.50797 0.50796571 19 A0A075B7D9;Q92804 TAF15 TATA-binding protein-associated factor 2N yes no 0 0 0 1 1 20.634 20.634 2 0.014995 13321 QUIQUE_C1277_190116_001 85.265 58.144 196850000 0 110430000 0 0 0 86418000 0 0 0 0 0 0 0 9548 19 8937 84723;84724 107594;107595 107594 2 EFHLNESGDPSSK Unmodified 1445.6423 0.64228694 221 A0A0C4DFV9;Q01105;A0A087X027;P0DME0 SET;SETSIP Protein SET;Protein SETSIP yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 30.803 30.803 2;3 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107619;107620;107621;107622;107623;107624;107625;107626;107627;107628;107629;107630;107631;107632;107633;107634;107635 107624 14 EFHTTGLAWSK Unmodified 1275.6248 0.62478638 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0S3;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 54.9 54.9 2;3 2.3681E-24 53133 QUIQUE_C1576_190116_001 182.76 151 6612800000 568300000 474870000 735100000 768290000 604870000 332240000 548540000 510850000 311580000 331890000 547750000 542750000 335810000 9551 2857;3307 8940 84759;84760;84761;84762;84763;84764;84765;84766;84767;84768;84769;84770;84771;84772;84773;84774;84775;84776;84777;84778;84779;84780;84781;84782 107636;107637;107638;107639;107640;107641;107642;107643;107644;107645;107646;107647;107648;107649;107650;107651;107652;107653;107654;107655;107656;107657;107658;107659;107660;107661;107662;107663;107664;107665;107666;107667;107668;107669;107670;107671 107656 35 EFIANHPDYK Unmodified 1232.5826 0.58258722 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 30.378 30.378 2 0.00021266 25779 QUIQUE_C1218_190116_001 136.21 114.74 241750000 70162000 0 46922000 74394000 50273000 0 0 0 0 0 0 0 0 9552 438;2509 8941 84783;84784;84785;84786 107672;107673;107674;107675 107672 4 EFIATTPSITTETISTTMENSLK Unmodified 2514.2411 0.24110107 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 2 143.95 143.95 2;3 7.7303E-14 149298 QUIQUE_C1368_190116_001 137.52 119.97 718380000 0 101850000 36924000 87765000 31549000 37846000 76906000 91210000 77859000 22577000 33843000 29256000 90795000 9553 1230;4172;346 8942 84787;84788;84789;84790;84791;84792;84793;84794;84795;84796;84797;84798;84799;84800;84801;84802;84803;84804 107676;107677;107678;107679;107680;107681;107682;107683;107684;107685;107686;107687;107688;107689;107690;107691;107692;107693;107694;107695;107696;107697 107679 22 EFICALSVTSR Unmodified 1281.6387 0.63872189 4498 Q9UM19 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.901 86.901 2 0.0018527 88604 QUIQUE_C1403_190116_001 81.972 61.642 918470000 0 175810000 171810000 115110000 143150000 0 0 55504000 117430000 0 0 0 139660000 9554 4498 8943 84805;84806;84807;84808;84809;84810;84811 107698;107699;107700;107701;107702;107703;107704;107705;107706 107702 5 EFIDQYYSSIK Unmodified 1391.6609 0.66089712 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 98.497 98.497 2 0.043489 101883 QUIQUE_C1368_190116_001 63.184 43.194 113940000 0 0 113940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9555 699 8944 84812 107707 107707 0 EFIEFLK Unmodified 924.49567 0.49566969 915 E9PFK9;Q9UJ41 RABGEF1 Rab5 GDP/GTP exchange factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.62 103.62 2 0.024917 107847 QUIQUE_C1218_190116_001 97.068 76.083 217690000 17864000 23826000 0 17687000 0 0 26486000 23804000 19261000 9607100 22423000 27801000 28936000 9556 915 8945 84813;84814;84815;84816;84817;84818;84819;84820;84821;84822 107708;107709;107710;107711;107712;107713;107714;107715;107716;107717 107708 10 EFIEGVSQFSVK Unmodified 1368.6925 0.6925316 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3 PPP3R1 Calcineurin subunit B type 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.458 98.458 2 0.00027497 102391 QUIQUE_C1218_190116_001 119.22 88.426 1366100000 264990000 190410000 157350000 159130000 154250000 178550000 131820000 0 0 80514000 49125000 0 0 9557 801 8946 84823;84824;84825;84826;84827;84828;84829;84830;84831 107718;107719;107720;107721;107722;107723;107724;107725;107726;107727;107728;107729;107730;107731 107718 13 EFIEKYDK Unmodified 1070.5284 0.52842638 1936;845 E5RK69;H0YC77;P08133;E7EMC6;E5RFF0 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 2 27.115 27.115 2;3 0.023767 21485 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.61 88.339 182480000 0 0 0 0 0 0 0 182480000 0 0 0 0 0 9558 845;1936 8947 84832;84833 107732;107733;107734 107733 3 EFIFSELLANLYSCGDQNTLMEESAEQAQR Oxidation (M) 3508.5763 0.57626415 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171 171 3 8.0429E-88 178311 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.72 157.94 714200000 27438000 56612000 0 0 25705000 22654000 76166000 27082000 43151000 0 161520000 207470000 66396000 9559 269;2893 8948 84834;84835;84836;84837;84838;84839;84840;84841;84842;84843 107735;107736;107737;107738;107739;107740;107741;107742;107743;107744 107742 188 10 EFIFSELLANLYSCGDQNTLMEESAEQAQR Unmodified 3492.5813 0.58134953 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 1 172.39 172.39 3 7.9459E-20 179653 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.534 65.52 156350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 111530000 0 44826000 9560 269;2893 8948 84844;84845 107745;107746 107745 2 EFIGSFLEMFGPEGALK Unmodified 1870.9175 0.91752251 717 C9JEJ2;P49585 PCYT1A Choline-phosphate cytidylyltransferase A yes no 0 0 0 1 1 1 168.94 168.94 2 4.7919E-07 173707 QUIQUE_C1218_190116_001 108.72 86.242 166730000 31367000 0 0 0 0 0 0 0 73409000 0 0 61957000 0 9561 717 8949 84846;84847;84848 107747;107748;107749 107747 2 EFIHILYFR Unmodified 1236.6655 0.66552898 4337 Q9NZ32;V9GYX7;G3V2Q5;G3V5Y4;F6S9Y6 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 1 1 2 110.81 110.81 2;3 0.0035605 115978 QUIQUE_C1218_190116_001 58.596 43.917 433200000 19187000 32147000 37493000 31925000 42671000 25285000 53222000 33104000 32096000 14718000 38546000 38136000 34666000 9562 4337 8950 84849;84850;84851;84852;84853;84854;84855;84856;84857;84858;84859;84860;84861;84862;84863;84864;84865 107750;107751;107752;107753;107754;107755;107756;107757;107758;107759;107760;107761;107762;107763;107764;107765;107766;107767 107751 17 EFILCCLAR Unmodified 1180.5733 0.57328486 4287 Q9NSY0 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.95 106.95 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107819;107820;107821;107822;107823;107824;107825;107826;107827;107828;107829;107830;107831;107832;107833;107834;107835 107831 17 EFLLIFHK Unmodified 1045.5961 0.59605244 4036 Q9BUP0;A0A087X1Z2;C9JTV4;Q8WYH2 EFHD1;PP1187 EF-hand domain-containing protein D1 yes no 0 0 0 1 95.673 95.673 2 0.036561 96875 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.717 18.903 31076000 0 0 0 0 0 0 0 31076000 0 0 0 0 0 9582 4036 8970 84931 107836 107836 1 EFLLIFR Unmodified 936.54329 0.54328858 3815 Q96C19;H0Y4Y4 EFHD2 EF-hand domain-containing protein D2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.4 132.4 2 0.00011419 138469 QUIQUE_C1438_190116_001 172.15 121.84 712390000 69847000 57037000 61063000 53233000 60629000 37759000 55315000 39692000 55988000 0 88023000 72389000 61416000 9583 3815 8971 84932;84933;84934;84935;84936;84937;84938;84939;84940;84941;84942;84943 107837;107838;107839;107840;107841;107842;107843;107844;107845;107846;107847;107848 107841 12 EFLNEENK Unmodified 1021.4716 0.47163978 3921 Q96PY5 FMNL2 Formin-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.297 28.297 2 0.019173 22266 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.77 29.18 197080000 40559000 37603000 0 0 0 0 33073000 0 0 21333000 37818000 26697000 0 9584 3921 8972 84944;84945;84946;84947;84948;84949 107849;107850;107851;107852;107853;107854 107852 6 EFLNVLALTFEDFK Unmodified 1684.8712 0.87122424 728 C9JJN9;Q8N3P4;H7C058 VPS8 Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 170.27 170.27 2 0.00029441 175083 QUIQUE_C1368_190116_001 105.46 88.828 81532000 16165000 9171900 15966000 0 11358000 0 15902000 0 0 0 0 0 12970000 9585 728 8973 84950;84951;84952;84953;84954;84955 107855;107856;107857;107858;107859;107860 107857 6 EFLPEGQDIGAFVAEQK Unmodified 1876.9207 0.92069363 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;H7C0V6 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.84 127.84 2;3 4.3558E-07 131763 QUIQUE_C1277_190116_001 137.84 125.57 827710000 74070000 77167000 76846000 64698000 0 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Serotransferrin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 57.806 57.806 2;3 0.0004366 56337 QUIQUE_C1403_190116_001 71.555 59.689 3171200000 207430000 259980000 293540000 322890000 846860000 254000000 190950000 0 161950000 46313000 235010000 210230000 142040000 9620 1838 9008 85241;85242;85243;85244;85245;85246;85247;85248;85249;85250;85251;85252;85253;85254;85255;85256;85257;85258;85259;85260;85261;85262;85263;85264 108241;108242;108243;108244;108245;108246;108247;108248;108249;108250;108251;108252;108253;108254;108255;108256;108257;108258;108259;108260;108261;108262;108263;108264;108265;108266;108267;108268;108269;108270;108271;108272 108249 26 EFQLGESVK Unmodified 1035.5237 0.52367535 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 54.097 54.097 2 0.042881 50709 QUIQUE_C1563_190116_001 52.716 4.2124 442340000 0 0 0 0 0 319300000 0 0 0 123030000 0 0 0 9621 3063 9009 85265;85266 108273;108274 108273 2 EFQLPTTTFIGGSENTLSLR Unmodified 2210.1219 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Unmodified 912.43413 0.43413207 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.223 88.223 2 0.019775 90174 QUIQUE_C1368_190116_001 120.9 22.483 2011200000 286970000 258910000 240770000 169000000 198070000 179830000 198740000 26922000 56558000 125400000 94237000 71993000 103810000 9630 1245 9017 85315;85316;85317;85318;85319;85320;85321;85322;85323;85324;85325;85326;85327 108328;108329;108330;108331;108332;108333;108334;108335;108336;108337;108338;108339;108340;108341;108342;108343;108344;108345;108346;108347;108348;108349;108350 108333 23 EFSDIFRR Unmodified 1068.5352 0.53524309 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 65.612 65.612 3 0.0033932 65603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.923 45.568 92294000 0 0 0 0 0 0 0 21581000 14674000 0 19344000 15577000 21120000 9631 1245 9018 85328;85329;85330;85331;85332 108351;108352;108353;108354;108355;108356 108351 5 EFSFLDILR Unmodified 1138.6023 0.60226003 3669 Q8TC07 TBC1D15 TBC1 domain family member 15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.38 157.38 2 0.0052265 162072 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.181 68.49 263470000 0 24783000 26181000 20094000 27869000 20334000 26635000 18306000 24314000 15446000 19483000 21587000 18443000 9632 3669 9019 85333;85334;85335;85336;85337;85338;85339;85340;85341;85342;85343;85344 108357;108358;108359;108360;108361;108362;108363;108364;108365;108366;108367;108368;108369;108370 108370 14 EFSGNPIK Unmodified 890.44978 0.44978213 1188 H3BPE7;P35637 FUS RNA-binding protein FUS yes no 0 0 0 1 1 1 1 30.122 30.122 2 0.028279 24079 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.915 46.293 633070000 189810000 197780000 0 0 186330000 0 0 0 0 59157000 0 0 0 9633 1188 9020 85345;85346;85347;85348 108371;108372;108373;108374 108374 4 EFSGYVESGLK Unmodified 1214.5819 0.58191851 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.056 68.056 2 0.0014915 67482 QUIQUE_C1368_190116_001 84.213 65.433 2238300000 215500000 190820000 165230000 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ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.299 89.299 2 0.00029303 90726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.86 96.59 778720000 56952000 0 105590000 111260000 68618000 87886000 85869000 91476000 94200000 0 0 76871000 0 9636 2714 9023 85373;85374;85375;85376;85377;85378;85379;85380;85381 108409;108410;108411;108412;108413;108414;108415;108416;108417;108418;108419 108417 10 EFSITDLVPYSITLR Unmodified 1752.9298 0.92980175 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 163.56 163.56 2 1.3634E-12 167444 QUIQUE_C1277_190116_001 158.4 142.51 1539800000 40698000 105710000 77001000 47066000 131760000 0 133460000 159720000 138680000 16452000 165140000 173860000 350290000 9637 1748 9024 85382;85383;85384;85385;85386;85387;85388;85389;85390;85391;85392;85393;85394 108420;108421;108422;108423;108424;108425;108426;108427;108428;108429;108430;108431;108432 108421 12 EFSITDVVPYPISLR Unmodified 1734.9192 0.91923707 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 155.55 155.55 2;3 4.3474E-28 159663 QUIQUE_C1277_190116_001 164.04 148.84 6892300000 496430000 499180000 489490000 810760000 644780000 353660000 562140000 468330000 536370000 202200000 619390000 494390000 715240000 9638 2363 9025 85395;85396;85397;85398;85399;85400;85401;85402;85403;85404;85405;85406;85407;85408;85409 108433;108434;108435;108436;108437;108438;108439;108440;108441;108442;108443;108444;108445;108446;108447;108448 108434 14 EFSIYMTK Unmodified 1017.4841 0.48411873 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 2 73.894 73.894 1;2 1.2363E-05 75025 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.03 155.75 5374700000 534330000 602930000 445510000 399570000 450340000 332650000 73582000 458770000 413740000 0 710200000 567120000 385950000 9639 1788 9026 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159.54 2 0.00021046 166517 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.011 83.07 553040000 0 86692000 0 49486000 68065000 0 91446000 56719000 90037000 0 110590000 0 0 9644 2474 9030 85446;85447;85448;85449;85450;85451;85452 108496;108497;108498;108499;108500;108501;108502 108502 7 EFSQSFDAAMK Unmodified 1259.5492 0.54923818 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;Q5LJB0;H0Y6Y4 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.17 20.17 2 0.010792 13040 QUIQUE_C1438_190116_001 61.962 46.714 335540000 157760000 0 0 42039000 81032000 0 0 0 0 0 54707000 0 0 9645 4622 9031 85453;85454;85455;85456;85457 108503;108504;108505;108506;108507 108506 5 EFSVTDAVPFPISLIWNHDSEDTEGVHEVFSR Unmodified 3658.7216 0.72160648 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 2 3 165.56 165.56 4 1.4453E-06 172121 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.566 46.805 239100000 0 0 0 0 0 0 64709000 0 0 0 174390000 0 0 9646 180;3738 9032 85458;85459;85460;85461;85462 108508;108509;108510;108511;108512 108510 4 EFTAQNLGK Unmodified 1006.5084 0.50835964 600 B3KS98;O15372;A0A087WZK9 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.615 35.615 2 0.0022266 30715 QUIQUE_C1403_190116_001 95.541 58.382 476440000 66101000 0 84174000 59465000 0 66740000 74762000 0 0 37182000 0 88012000 0 9647 600 9033 85463;85464;85465;85466;85467;85468;85469 108513;108514;108515;108516;108517;108518;108519;108520;108521 108517 9 EFTEAVEAK Unmodified 1022.492 0.49204087 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.449 31.449 2 0.0068412 26195 QUIQUE_C1563_190116_001 83.265 57.528 4918900000 420260000 397770000 438200000 465250000 351060000 409890000 469690000 0 400820000 180970000 465120000 382940000 536940000 9648 2370 9034 85470;85471;85472;85473;85474;85475;85476;85477;85478;85479;85480;85481 108522;108523;108524;108525;108526;108527;108528;108529;108530;108531;108532;108533 108527 7 EFTEREQGEVR Unmodified 1378.6477 0.64770667 1976 P09936;D6RE83 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 19.027 19.027 2 7.9063E-12 12068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.09 124.49 382080000 0 0 0 0 0 0 0 250190000 53669000 0 0 78224000 0 9649 1976 9035 85482;85483;85484 108534;108535;108536 108534 3 EFTESQLQEGK Unmodified 1294.6041 0.60411052 2864 Q01995;H0YCU9 TAGLN Transgelin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 40.387 40.387 2 5.7564E-08 36237 QUIQUE_C1403_190116_001 149.72 114.43 2573800000 0 963660000 0 308060000 952270000 349800000 0 0 0 0 0 0 0 9650 2864 9036 85485;85486;85487;85488;85489;85490;85491 108537;108538;108539;108540;108541;108542;108543;108544;108545 108539 9 EFTGSQNSIFPVFDNLLLLDR Unmodified 2424.2325 0.23252572 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;F5H2X5 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 170.79 170.79 2;3 6.0045E-53 178033 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.34 130.37 580570000 46021000 65505000 0 32776000 70606000 65354000 26173000 49292000 54702000 16058000 46236000 44849000 62996000 9651 462 9037 85492;85493;85494;85495;85496;85497;85498;85499;85500;85501;85502;85503;85504;85505;85506;85507;85508;85509;85510;85511;85512;85513;85514 108546;108547;108548;108549;108550;108551;108552;108553;108554;108555;108556;108557;108558;108559;108560;108561;108562;108563;108564;108565;108566;108567;108568;108569;108570;108571;108572;108573 108569 28 EFTKLEEVLTNK Unmodified 1449.7715 0.7715102 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 1 1 1 83.375 83.375 2 0.012496 85892 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.737 53.622 95870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57025000 38845000 0 9652 2812 9038 85515;85516 108574;108575 108574 1 EFTKLEEVLTNKK Unmodified 1577.8665 0.86647322 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 2 2 1 64.756 64.756 2;3 0.0017685 64005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.275 78.988 411710000 0 0 0 0 0 0 0 252890000 158810000 0 0 0 0 9653 2812 9039 85517;85518;85519 108576;108577;108578 108576 2 EFTMAEIEHFVDPSEK Unmodified 1907.8611 0.86112984 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 139.06 139.06 2;3 4.7275E-06 144470 QUIQUE_C1218_190116_001 81.428 76.218 180440000 43422000 24340000 25087000 19498000 0 33599000 20798000 0 0 13701000 0 0 0 9654 2440 9040 85520;85521;85522;85523;85524;85525;85526;85527 108579;108580;108581;108582;108583;108584;108585;108586 108579 6 EFTMAEIEHFVDPSEKDHPK Unmodified 2385.0947 0.094711606 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 2 1 107.47 107.47 3;4;5 0.00033145 111675 QUIQUE_C1576_190116_001 59.182 51.967 1033900000 86401000 0 175160000 0 91060000 70600000 82099000 52424000 76645000 0 157640000 125850000 116030000 9655 2440 9041 85528;85529;85530;85531;85532;85533;85534;85535;85536;85537;85538;85539;85540;85541 108587;108588;108589;108590;108591;108592;108593;108594;108595;108596;108597;108598;108599;108600;108601;108602;108603;108604 108594 17 EFTNVYIK Unmodified 1012.5229 0.52294707 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;H0YBN4;B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;H0YCC8 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.695 58.695 2 0.015753 58372 QUIQUE_C1438_190116_001 84.244 61.095 256740000 0 0 75937000 47481000 61903000 0 45523000 0 0 0 0 25899000 0 9656 2031;596 9042 85542;85543;85544;85545;85546 108605;108606;108607;108608;108609 108607 5 EFTPEVQASWQK Unmodified 1448.6936 0.69359423 2800 P69892;A0A2R8Y7X9;P69891;E9PBW4 HBG2;HBG1 Hemoglobin subunit gamma-2;Hemoglobin subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 76.73 76.73 2 8.3659E-14 77786 QUIQUE_C1218_190116_001 159.79 141.35 154330000 109870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44461000 0 9657 2800 9043 85547;85548 108610;108611 108610 1 EFTPPVQAAYQK Unmodified 1377.6929 0.69286595 2799 P68871 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes yes 0 0 0 2 3 3 2 3 2 2 2 1 2 4 4 3 61.563 61.563 1;2;3 7.0675E-55 60226 QUIQUE_DMIX8_190116_001 236.92 192.06 182580000000 12914000000 17974000000 15923000000 6650000000 18438000000 11755000000 9423100000 7507500000 11486000000 2969700000 26290000000 20693000000 20555000000 9658 2799 9044 85549;85550;85551;85552;85553;85554;85555;85556;85557;85558;85559;85560;85561;85562;85563;85564;85565;85566;85567;85568;85569;85570;85571;85572;85573;85574;85575;85576;85577;85578;85579;85580;85581 108612;108613;108614;108615;108616;108617;108618;108619;108620;108621;108622;108623;108624;108625;108626;108627;108628;108629;108630;108631;108632;108633;108634;108635;108636;108637;108638;108639;108640;108641;108642;108643;108644;108645;108646;108647;108648;108649;108650;108651;108652;108653;108654;108655;108656;108657;108658;108659;108660;108661;108662;108663;108664;108665;108666;108667;108668;108669;108670;108671;108672;108673;108674;108675;108676;108677;108678;108679;108680;108681;108682;108683;108684;108685;108686;108687;108688;108689;108690;108691;108692;108693;108694;108695 108695 78 EFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH Unmodified 2808.4711 0.47113328 2799 P68871 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes yes 0 0 2 2 1 1 1 3 2 142.03 142.03 4;5 2.2595E-24 148919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.905 76.793 611240000 147500000 0 37597000 0 55792000 35910000 0 0 0 0 241640000 92804000 0 9659 2799 9045 85582;85583;85584;85585;85586;85587;85588;85589;85590;85591 108696;108697;108698;108699;108700;108701;108702;108703;108704;108705;108706;108707;108708 108704 13 EFTPQMQAAYQK Oxidation (M) 1456.6657 0.66566492 1817 P02042 HBD Hemoglobin subunit delta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 35.24 35.24 2 1.1854E-09 30510 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.49 128.38 1242700000 77428000 128790000 98924000 0 86114000 75738000 110620000 0 77252000 28728000 239230000 161250000 158630000 9660 1817 9046 85592;85593;85594;85595;85596;85597;85598;85599;85600;85601;85602;85603 108709;108710;108711;108712;108713;108714;108715;108716;108717;108718;108719;108720;108721;108722;108723 108718 1036 14 EFTPQMQAAYQK Unmodified 1440.6708 0.6707503 1817 P02042 HBD Hemoglobin subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.089 57.089 2 1.8503E-05 55800 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.09 123.57 5601600000 402980000 709920000 565010000 210610000 418440000 374740000 350260000 190820000 339440000 96316000 1170700000 0 772410000 9661 1817 9046 85604;85605;85606;85607;85608;85609;85610;85611;85612;85613;85614;85615 108724;108725;108726;108727;108728;108729;108730;108731;108732;108733;108734;108735;108736;108737;108738;108739;108740 108735 17 EFTRPEEIIFLR Unmodified 1548.83 0.83002813 2206 P23142;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000016046 FBLN1 Fibulin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.26 106.26 3 0.00035242 109363 QUIQUE_C1403_190116_001 83.617 71.257 102080000 0 0 0 13630000 20058000 10931000 23767000 0 0 9345800 24349000 0 0 9662 2206 9047 85616;85617;85618;85619;85620;85621;85622 108741;108742;108743;108744;108745;108746;108747;108748 108743 8 EFTTPEGVPSAPR Unmodified 1386.6779 0.67794416 1691 O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.466 65.466 2 0.0010426 64411 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.417 64.552 872400000 0 135680000 111760000 96950000 0 0 125280000 78879000 0 43557000 129070000 0 151230000 9663 1691 9048 85623;85624;85625;85626;85627;85628;85629;85630 108749;108750;108751;108752;108753;108754;108755;108756;108757;108758;108759 108759 10 EFVADETER Unmodified 1094.488 0.48801813 1647 O75582 RPS6KA5 Ribosomal protein S6 kinase alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 31.032 31.032 2 0.0522 25930 QUIQUE_C1368_190116_001 71.501 42.352 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9664 1647 9049 85631;85632 108760;108761 108760 2 EFVAQNNTVQIK Unmodified 1389.7252 0.72522871 2930 Q08AM6;H3BUU8 VAC14 Protein VAC14 homolog yes no 0 0 0 1 1 51.697 51.697 2 0.00064025 49953 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.095 72.87 150670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77856000 72816000 9665 2930 9050 85633;85634 108762;108763 108762 1 EFVAVTGAEEDR Unmodified 1321.615 0.61500956 4516 Q9UNZ2;F2Z2K0;R4GNE6;G3V4V8;R4GMY2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.51 53.51 2 0.0002924 51157 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.73 83.721 395220000 88489000 94217000 57421000 0 0 42868000 0 68805000 0 43419000 0 0 0 9666 4516 9051 85635;85636;85637;85638;85639;85640;85641;85642 108764;108765;108766;108767;108768;108769;108770;108771;108772 108771 9 EFVDLMNSK Unmodified 1081.5114 0.51139611 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.611 77.611 2 0.00042571 77683 QUIQUE_C1403_190116_001 119.41 83.913 561070000 57201000 52744000 82931000 56594000 0 46661000 0 84856000 107900000 33897000 0 38279000 0 9667 1670 9052 85643;85644;85645;85646;85647;85648;85649;85650;85651;85652 108773;108774;108775;108776;108777;108778;108779;108780;108781;108782;108783;108784 108776 12 EFVEAVLELR Unmodified 1203.6499 0.6499385 1626 O75367;B4DJC3 H2AFY Core histone macro-H2A.1;Histone H2A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 124.68 124.68 2 0.0015737 127559 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.98 81.84 97135000 0 14576000 14546000 0 0 0 0 52702000 0 15311000 0 0 0 9668 1626 9053 85653;85654;85655;85656;85657;85658;85659;85660;85661;85662;85663;85664 108785;108786;108787;108788;108789;108790;108791;108792;108793;108794;108795;108796;108797;108798 108795 13 EFVEEFIWPAIQSSALYEDR Unmodified 2428.1587 0.15869207 1797 P00966;Q5T6L6;Q5T6L5 ASS1 Argininosuccinate synthase yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 167.87 167.87 2;3 5.5282E-24 172509 QUIQUE_C1218_190116_001 176.89 162.86 1760700000 64554000 102570000 0 95943000 110170000 0 185390000 205650000 223850000 14263000 367070000 215990000 175200000 9669 1797 9054 85665;85666;85667;85668;85669;85670;85671;85672;85673;85674;85675;85676;85677;85678;85679;85680;85681;85682;85683;85684;85685;85686 108799;108800;108801;108802;108803;108804;108805;108806;108807;108808;108809;108810;108811;108812;108813;108814;108815;108816;108817;108818;108819;108820;108821;108822;108823;108824;108825;108826;108827 108801 28 EFVGCFIDFPK Unmodified 1357.6377 0.63765925 236 A0A0C4DGA2;O75521 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.5 130.5 2 0.0009083 127192 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.111 72.781 410490000 0 34061000 44894000 38075000 33896000 29973000 43154000 25979000 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108895;108896;108897;108898;108899;108900;108901;108902;108903;108904;108905;108906;108907;108908;108909;108910 108905 16 EFVYQEAAGPHQTLAR Unmodified 1815.8904 0.89039656 3665 Q8TBC5;M0R1U9;M0R364 ZSCAN18 Zinc finger and SCAN domain-containing protein 18 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.414 56.414 3 1.1925E-06 54375 QUIQUE_C1368_190116_001 92.575 74.473 691500000 64211000 55731000 85277000 54237000 60928000 38682000 49695000 42468000 59603000 20562000 54081000 50212000 55816000 9681 3665 9066 85762;85763;85764;85765;85766;85767;85768;85769;85770;85771;85772;85773;85774 108911;108912;108913;108914;108915;108916;108917;108918;108919;108920;108921;108922;108923;108924;108925 108913 13 EFVYSER Unmodified 928.42905 0.42904669 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 0 1 33.896 33.896 2 0.050661 29492 QUIQUE_C1368_190116_001 74.415 41.945 69845000 0 0 69845000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9682 2173 9067 85775 108926 108926 1 EFWVNMPNLMTHLK Unmodified 1758.8586 0.85856784 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108953;108954;108955;108956;108957;108958;108959;108960;108961;108962;108963;108964;108965;108966;108967;108968;108969;108970;108971;108972;108973;108974;108975;108976;108977;108978;108979;108980;108981 108967 29 EGAAHAFAQYNLDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNGK Unmodified 4274.0556 0.055630569 2492 P47755;F8W9N7;C9JUG7;A0A0D9SET8 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 0 0 1 2 1 2 138.62 138.62 4;5 1.8094E-100 141835 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.26 148.26 358710000 0 0 0 0 0 0 0 122020000 46525000 0 0 0 190160000 9688 2492 9073 85821;85822;85823;85824;85825 108982;108983;108984;108985;108986;108987 108982 6 EGAAHAFAQYNMDQFTPVK Unmodified 2123.9735 0.97347426 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 3 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 94.051 94.051 2;3 7.1898E-219 96463 QUIQUE_C1277_190116_001 325.24 303.29 2058200000 149260000 40499000 250650000 259580000 220320000 214330000 253990000 100550000 125220000 98688000 157310000 120510000 67327000 9689 2617 9074 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0.93153309 4541 Q9Y263;H0YBW4 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.08 107.08 3 0.0019144 112121 QUIQUE_C1218_190116_001 54.7 44.642 234970000 29769000 32457000 67440000 36944000 0 0 0 0 0 0 34444000 33921000 0 9702 4541 9084 85917;85918;85919;85920;85921;85922 109093;109094;109095;109096;109097;109098 109093 5 EGAQYLMQAAGLGR Unmodified 1463.7191 0.71909747 2654 P55011;G3XAL9 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes no 0 0 0 1 101.95 101.95 2 0.062535 105320 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.625 22.954 32356000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32356000 9703 2654 9085 85923 109099 109099 1 EGASILLDGR Unmodified 1029.5455 0.54547343 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.292 62.292 2 0.00017757 61395 QUIQUE_C1403_190116_001 123.21 85.397 10989000000 1048000000 1152300000 1248900000 1007200000 883850000 1092600000 932630000 371500000 563590000 424870000 882420000 635570000 745160000 9704 2870 9086 85924;85925;85926;85927;85928;85929;85930;85931;85932;85933;85934;85935;85936 109100;109101;109102;109103;109104;109105;109106;109107;109108;109109;109110;109111;109112;109113;109114;109115;109116 109103 17 EGASILLDGRK Unmodified 1157.6404 0.64043645 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 35.637 35.637 2;3 0.00018557 30975 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.27 85.982 3036500000 0 0 115540000 100350000 174850000 0 144850000 1200000000 507790000 0 394550000 398520000 0 9705 2870 9087 85937;85938;85939;85940;85941;85942;85943;85944;85945 109117;109118;109119;109120;109121;109122;109123;109124;109125;109126 109125 7 EGATLVCGGNQVPR Unmodified 1456.7093 0.70926107 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.4 44.4 2 4.7912E-14 40841 QUIQUE_C1368_190116_001 189.18 161.7 1698200000 178280000 145920000 280840000 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Unmodified 1580.6195 0.61951936 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.057 23.057 2 0.00030523 16393 QUIQUE_C1403_190116_001 129.89 125.59 236370000 0 29066000 0 41667000 43574000 28578000 57434000 0 0 0 0 0 36052000 9708 2207 9090 85975;85976;85977;85978;85979;85980 109161;109162;109163;109164;109165;109166 109162 6 EGCPGPLLATLDQVAAGAGDPGVAAR Unmodified 2462.2224 0.22237174 3563 Q8N0W3 FUK L-fucose kinase yes yes 0 0 0 1 149.86 149.86 3 0.032895 153504 QUIQUE_C1403_190116_001 14.483 6.7706 26489000 0 0 0 26489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9709 3563 9091 85981 109167 109167 1 EGCYGDKDEFPGVR Unmodified 1627.6937 0.69367058 111 Q6PID9;A0A087X1T7;H0YMF1;P16112 ACAN Aggrecan core protein;Aggrecan core protein 2 yes no 0 0 1 1 1 48.21 48.21 2;3 0.0054827 46247 QUIQUE_C1576_190116_001 80.979 71.026 69253000 0 0 42024000 0 0 0 27229000 0 0 0 0 0 0 9710 111 9092 85982;85983 109168;109169 109169 2 EGDALELTCEAIGK Unmodified 1504.7079 0.70792366 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 95.697 95.697 2 0.0015322 98222 QUIQUE_C1368_190116_001 97.163 84.207 111400000 44414000 32417000 34565000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9711 113 9093 85984;85985;85986 109170;109171;109172 109172 3 EGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVR Unmodified 2698.3459 0.34585769 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 136.18 136.18 2;3 4.3775E-115 140438 QUIQUE_C1277_190116_001 256.37 244.68 2813600000 248950000 317550000 321060000 283410000 291200000 232560000 341450000 0 0 45064000 240320000 220050000 271960000 9712 113 9094 85987;85988;85989;85990;85991;85992;85993;85994;85995;85996;85997;85998;85999;86000;86001;86002 109173;109174;109175;109176;109177;109178;109179;109180;109181;109182;109183;109184;109185;109186;109187;109188;109189 109175 17 EGDALELTCEAIGKPQPVMVTWVR Oxidation (M) 2714.3408 0.34077231 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 1 1 1 1 127.29 127.29 3 3.1014E-06 131228 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.454 58.178 73002000 0 0 0 0 0 0 36881000 0 0 0 0 36121000 0 9713 113 9094 86003;86004 109190;109191 109191 73 2 EGDELCGQEEAFR Unmodified 1538.6307 0.63073598 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62 62 2 9.1907E-10 60993 QUIQUE_C1368_190116_001 141.93 125.68 191100000 0 43231000 51276000 0 29170000 0 33966000 0 0 0 0 33455000 0 9714 699 9095 86005;86006;86007;86008;86009;86010;86011;86012 109192;109193;109194;109195;109196;109197;109198;109199;109200 109193 9 EGDETPNSIPADIVFIIK Unmodified 1957.0044 0.004423261 4416 Q9UDY4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 151.14 151.14 2 0.00015602 146619 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.62 88.715 386780000 0 0 0 0 0 0 113460000 74906000 0 36562000 161850000 0 0 9715 4416 9096 86013;86014;86015;86016;86017 109201;109202;109203;109204;109205;109206 109205 6 EGDEVTLICSAR Unmodified 1348.6293 0.62927941 66 A0A087WXM8;P50895 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 65.773 65.773 2 0.033843 65331 QUIQUE_C1277_190116_001 62.303 35.788 51097000 0 51097000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9716 66 9097 86018 109207 109207 0 EGDFGCTVMELR Unmodified 1412.6064 0.60643548 2222 P23634 ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.02 95.02 2 0.0005192 97213 QUIQUE_C1403_190116_001 95.573 83.337 192340000 18428000 0 42967000 23289000 0 19542000 30054000 0 0 0 29179000 0 28878000 9717 2222 9098 86019;86020;86021;86022;86023;86024;86025;86026 109208;109209;109210;109211;109212;109213;109214;109215;109216 109212 8 EGDFTLSLR Unmodified 1036.5189 0.51892433 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.591 83.591 2 0.003694 85497 QUIQUE_C1277_190116_001 90.709 59.419 1180600000 0 118480000 124130000 95839000 95252000 93507000 126080000 0 106350000 0 142960000 134610000 143380000 9718 4091 9099 86027;86028;86029;86030;86031;86032;86033;86034;86035;86036 109217;109218;109219;109220;109221;109222;109223;109224;109225;109226 109217 7 EGDGSCFPDALDR Unmodified 1437.5831 0.5830575 2390 P36222 CHI3L1 Chitinase-3-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 72.401 72.401 2 0.036617 72313 QUIQUE_C1403_190116_001 45.915 35.108 20478000 0 0 0 20478000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9719 2390 9100 86037 109227 109227 1 EGDLIAAQAR Unmodified 1042.5407 0.5407224 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.281 33.281 1;2 0.00019383 28486 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.75 109.89 5643400000 468090000 0 558080000 623580000 0 493630000 503300000 434390000 495220000 263350000 764120000 449400000 590250000 9720 1819;3223 9101 86038;86039;86040;86041;86042;86043;86044;86045;86046;86047;86048;86049 109228;109229;109230;109231;109232;109233;109234;109235;109236;109237;109238;109239;109240;109241 109238 13 EGDLITLLVPEAR Unmodified 1424.7875 0.78749461 4531 Q9UQB8;I3L4C2;B4DWA1;I3L3C6 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.89 144.89 2 0.0004293 152484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.18 91.653 249800000 0 0 0 0 0 0 0 54399000 27005000 18420000 56552000 39904000 53515000 9721 4531 9102 86050;86051;86052;86053;86054;86055;86056;86057;86058 109242;109243;109244;109245;109246;109247;109248;109249;109250;109251;109252;109253;109254 109251 13 EGDLLFTVAK Unmodified 1091.5863 0.58627561 2988 Q13347;Q5TFK1 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.463 90.463 2 0.003379 93915 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.331 63.491 512550000 54108000 66752000 48169000 40557000 69856000 0 41924000 0 0 0 68861000 60678000 61644000 9722 2988 9103 86059;86060;86061;86062;86063;86064;86065;86066;86067;86068 109255;109256;109257;109258;109259;109260;109261;109262;109263;109264;109265;109266;109267 109264 10 EGDLPPLWWYIVTR Unmodified 1743.8984 0.89844205 4658 Q9Y6M9;E9PH64 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 168.07 168.07 2;3 7.4688E-05 175296 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.925 71.819 942500000 106320000 84706000 148420000 71909000 65725000 129080000 157080000 0 24657000 0 73664000 36451000 44494000 9723 4658 9104 86069;86070;86071;86072;86073;86074;86075;86076;86077;86078;86079;86080;86081;86082;86083 109268;109269;109270;109271;109272;109273;109274;109275;109276;109277;109278;109279;109280;109281;109282;109283 109280 14 EGDLPPLWWYIVTRPR Unmodified 1997.0523 0.052316927 4658 Q9Y6M9;E9PH64 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.43 152.43 3 6.8899E-14 159357 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.38 92.629 758850000 0 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EGDQIVGATIYFDNLQSGEVTQLLNTMGHHTVGLK Oxidation (M) 3800.868 0.86795314 2935 Q09666;E9PJZ0;E9PKR9;E9PJC6;E9PLK4;E9PQE3 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 1 0 1 143.72 143.72 4 2.6542E-05 148927 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.921 37.16 119490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119490000 9727 2935 9107 86100 109304 109304 2399 1 EGDQTSNNIPADIVFVLK Unmodified 1958.9949 0.99492121 2241 P25685;M0R080 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.4 142.4 2 1.1664E-05 148988 QUIQUE_C1438_190116_001 129.77 121.04 1193700000 0 126590000 0 91664000 109830000 111850000 119100000 106050000 113950000 42311000 139870000 112620000 119880000 9728 2241 9108 86101;86102;86103;86104;86105;86106;86107;86108;86109;86110;86111 109305;109306;109307;109308;109309;109310;109311;109312;109313;109314;109315;109316;109317;109318 109307 12 EGDTLVLTCAVTGNPR Unmodified 1701.8356 0.83558379 3655 Q8NFZ8 CADM4 Cell adhesion molecule 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 85.638 85.638 2 7.1491E-07 87150 QUIQUE_C1368_190116_001 140.63 121.39 247200000 61160000 60468000 52974000 43491000 0 0 0 0 0 29101000 0 0 0 9729 3655 9109 86112;86113;86114;86115;86116 109319;109320;109321;109322;109323 109321 5 EGDTLVLTCAVTGNPRPNQIR Unmodified 2310.175 0.17502761 3655 Q8NFZ8 CADM4 Cell adhesion molecule 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.168 80.168 3 7.8445E-54 82363 QUIQUE_C1438_190116_001 130.85 116.24 708900000 0 62424000 0 0 100090000 0 92923000 99179000 114140000 33370000 113870000 92905000 0 9730 3655 9110 86117;86118;86119;86120;86121;86122;86123;86124;86125;86126;86127 109324;109325;109326;109327;109328;109329;109330;109331;109332;109333;109334;109335;109336;109337;109338;109339 109329 16 EGDTMMGQQVAK Oxidation (M) 1309.5642 0.56423631 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 1 0 1 1 2 18.258 18.258 2 0.0048294 10566 QUIQUE_C1218_190116_001 70.256 55.958 84914000 15601000 18799000 50514000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9731 3089 9111 86128;86129;86130;86131 109340;109341;109342;109343;109344 109340 2533;2534 5 EGDTMMGQQVAK Unmodified 1293.5693 0.56932169 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 31.217 31.217 2 3.0042E-05 26273 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.57 90.297 448570000 100590000 0 0 103080000 0 0 116890000 0 63955000 0 0 0 64053000 9732 3089 9111 86132;86133;86134;86135;86136 109345;109346;109347;109348;109349 109348 4 EGDTVIFASDDEQDR Unmodified 1695.7224 0.72238775 4494;981;1154 F1T0E5;C9IYE1;A0A087X1P3;Q86UW7;F8W8P5;H7BYR4;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS;CADPS2 Calcium-dependent secretion activator 2;Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.736 69.736 2 1.8011E-06 70838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.93 85.665 179620000 66182000 53783000 0 0 0 0 0 0 0 30029000 0 29622000 0 9733 981;1154;4494 9112 86137;86138;86139;86140;86141;86142;86143;86144;86145 109350;109351;109352;109353;109354;109355;109356;109357;109358 109356 7 EGDTVQLLCR Unmodified 1189.5761 0.57612163 66 A0A087WXM8;P50895;K7ENU8 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.454 59.454 2 0.012155 58842 QUIQUE_C1438_190116_001 66.27 45.75 164450000 40657000 44528000 0 0 48947000 30319000 0 0 0 0 0 0 0 9734 66 9113 86146;86147;86148;86149;86150 109359;109360;109361;109362;109363 109361 5 EGDVLTLLESER Unmodified 1359.6882 0.6881745 2766 P62857 RPS28 40S ribosomal protein S28 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 124.57 124.57 2 0.00012889 130606 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.95 83.98 460920000 108110000 127120000 101740000 0 0 89530000 0 0 0 34425000 0 0 0 9735 2766 9114 86151;86152;86153;86154;86155;86156;86157;86158;86159;86160;86161 109364;109365;109366;109367;109368;109369;109370;109371;109372;109373;109374;109375;109376 109376 13 EGDYVLFHHEGGVDVGDVDAK Unmodified 2257.0287 0.028740531 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 81.304 81.304 4 0.020862 77894 QUIQUE_DMIX4_190116_001 18.597 14.329 138310000 0 56581000 0 0 0 0 0 43274000 0 38457000 0 0 0 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168.97 2;3;4 9.1131E-66 173282 QUIQUE_DMIX3_190116_001 210.36 183.33 12728000000 877550000 960650000 1677700000 871860000 1036900000 1090100000 1928100000 340560000 878380000 162350000 1184700000 662960000 1055900000 9738 1218;28;2057 9117 86184;86185;86186;86187;86188;86189;86190;86191;86192;86193;86194;86195;86196;86197;86198;86199;86200;86201;86202;86203;86204;86205;86206;86207;86208;86209;86210;86211;86212;86213;86214;86215;86216;86217;86218 109408;109409;109410;109411;109412;109413;109414;109415;109416;109417;109418;109419;109420;109421;109422;109423;109424;109425;109426;109427;109428;109429;109430;109431;109432;109433;109434;109435;109436;109437;109438;109439;109440;109441;109442;109443;109444;109445 109433 38 EGEDMIAEEHFGSEK Oxidation (M) 1722.7043 0.70429485 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 3 2 1 2 2 1 1 3 3 2 2 1 2 44.153 44.153 2;3 2.8359E-35 40405 QUIQUE_C1368_190116_001 169.52 144.66 1169800000 237400000 136130000 68924000 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86244;86245;86246;86247;86248;86249;86250;86251;86252;86253;86254;86255;86256;86257;86258;86259;86260;86261;86262;86263;86264;86265;86266;86267;86268;86269;86270 109473;109474;109475;109476;109477;109478;109479;109480;109481;109482;109483;109484;109485;109486;109487;109488;109489;109490;109491;109492;109493;109494;109495;109496;109497;109498;109499;109500;109501;109502;109503;109504;109505;109506 109476 32 EGEEATAEAEEK Unmodified 1291.5416 0.54156984 2961 Q13045 FLII Protein flightless-1 homolog yes yes 0 0 0 1 18.024 18.024 2 0.0077133 10075 QUIQUE_C1277_190116_001 63.32 45.095 8396100 0 8396100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9741 2961 9119 86271 109507 109507 1 EGEEPTVYSDEEEPK Unmodified 1736.7265 0.72647008 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.939 46.939 2 7.2669E-07 44588 QUIQUE_C1576_190116_001 118.9 112.3 177560000 0 26583000 0 27652000 18652000 37846000 41518000 0 0 25312000 0 0 0 9742 1391 9120 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93.152 2 0.00029405 91020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 142.79 124.01 417730000 0 0 63753000 0 0 0 65937000 47756000 72036000 35360000 80040000 0 52847000 9763 3949 9141 86452;86453;86454;86455;86456;86457;86458;86459;86460 109725;109726;109727;109728;109729;109730;109731;109732;109733 109730 8 EGFTQASLGLLANQR Unmodified 1603.8318 0.83181904 3890 Q96JG6;C9JA29 CCDC132 Coiled-coil domain-containing protein 132 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 108.18 108.18 2 1.6786E-06 112903 QUIQUE_C1218_190116_001 115.33 97.015 167950000 29384000 29588000 27535000 0 40952000 0 0 0 0 0 0 40489000 0 9764 3890 9142 86461;86462;86463;86464;86465;86466 109734;109735;109736;109737;109738;109739 109734 6 EGFVEYTEQVVK Unmodified 1426.698 0.6980109 1403;1582 O00410;H0Y8C6;O60518 IPO5;RANBP6 Importin-5;Ran-binding protein 6 no no 0 0 0 1 1 96.913 96.913 2 0.016611 99402 QUIQUE_C1403_190116_001 60.899 44.701 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9765 1403;1582 9143 86467;86468 109740;109741 109740 2 EGFYDLSSEDPFGCK Unmodified 1749.7192 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109745;109746;109747;109748;109749;109750;109751;109752;109753;109754;109755 109746 6 EGGAGGGFGSPMDIFDMFFGGGGR Oxidation (M) 2337.9783 0.97830164 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 173.42 173.42 2 1.2983E-06 177162 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.692 62.871 43229000 0 6479700 0 0 0 0 9788500 6995400 0 0 0 11803000 8163000 9769 2334 9147 86483;86484;86485;86486;86487;86488 109756;109757;109758;109759;109760;109761 109760 1728;1729 6 EGGAGGGFGSPMDIFDMFFGGGGR Unmodified 2321.9834 0.98338702 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 0 1 1 176.9 176.9 3 0.0041091 183890 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.155 30.917 23747000 0 0 0 0 0 0 0 0 7303900 0 16444000 0 0 9770 2334 9147 86489;86490 109762;109763 109763 2 EGGDGEEQDVGDAGR Unmodified 1489.5917 0.59170793 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.758 20.758 2 3.8155E-54 13954 QUIQUE_DMIX1_190116_001 193.28 177.71 1034400000 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hydrolase yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 4 2 2 2 2 2 129.02 129.02 2;3 0.00015696 133546 QUIQUE_C1368_190116_001 86.911 77.423 1834800000 136740000 137030000 133830000 136110000 151230000 170680000 175810000 125690000 141370000 46768000 149450000 179600000 150540000 9773 2524 9150 86505;86506;86507;86508;86509;86510;86511;86512;86513;86514;86515;86516;86517;86518;86519;86520;86521;86522;86523;86524;86525;86526;86527;86528;86529;86530;86531;86532;86533 109778;109779;109780;109781;109782;109783;109784;109785;109786;109787;109788;109789;109790;109791;109792;109793;109794;109795;109796;109797;109798;109799;109800;109801;109802;109803;109804;109805;109806;109807;109808;109809;109810;109811;109812;109813;109814;109815;109816;109817;109818;109819;109820;109821;109822;109823;109824;109825;109826 109789 48 EGGGAIEEEAKEK Unmodified 1345.6361 0.63613893 1039 F8VXC8;Q8TAQ2 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 1 2 1 17.057 17.057 2;3 0.0027041 10065 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.716 49.289 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109841;109842;109843;109844;109845;109846;109847;109848;109849;109850;109851;109852;109853;109854;109855;109856;109857;109858;109859;109860;109861;109862;109863;109864;109865;109866;109867;109868;109869;109870;109871;109872;109873;109874;109875;109876;109877;109878;109879;109880;109881;109882;109883;109884;109885;109886;109887;109888;109889;109890;109891;109892;109893;109894;109895;109896;109897;109898;109899;109900;109901;109902;109903;109904;109905;109906;109907;109908;109909;109910 109854 70 EGGLGPLNIPLLADVTRR Unmodified 1890.0687 0.068695273 2346 P32119;A6NIW5 PRDX2 Peroxiredoxin-2 yes no 0 0 1 1 140.94 140.94 3 8.465E-05 143753 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.441 72.025 41727000 0 0 0 0 0 0 0 41727000 0 0 0 0 0 9779 2346 9155 86581 109911 109911 1 EGGLLTLAGAK Unmodified 1028.5866 0.58660996 1959 P09417;B7Z415;D6RGG7;H0Y8F7 QDPR Dihydropteridine reductase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 72.952 72.952 1;2 7.649E-17 73356 QUIQUE_C1368_190116_001 195.48 131.22 15386000000 1382000000 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110056;110057;110058;110059;110060;110061;110062;110063;110064;110065;110066;110067;110068;110069;110070;110071;110072;110073;110074;110075;110076;110077;110078;110079;110080;110081;110082;110083;110084;110085;110086;110087;110088;110089 110064 32 EGHPVYPQLRPGYIPIPVLHEGAENR Unmodified 2937.525 0.52495976 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 97.574 97.574 4 2.4947E-05 100593 QUIQUE_C1277_190116_001 55.469 48.82 185190000 0 28814000 0 0 31759000 0 0 0 0 0 0 50047000 74571000 9792 1753 9168 86729;86730;86731;86732 110090;110091;110092;110093 110090 2 EGHQVALLSGEMMVEQR Unmodified 1912.9135 0.91351654 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 0 1 1 1 1 83.836 83.836 3 0.003421 85209 QUIQUE_C1403_190116_001 67.449 57.392 141520000 37561000 0 0 31954000 0 0 0 0 28925000 0 0 0 43082000 9793 1021 9169 86733;86734;86735;86736 110094;110095;110096;110097 110095 2 EGHVETVLALLEK Unmodified 1436.7875 0.78749461 2103 P16157 ANK1 Ankyrin-1 yes yes 0 0 0 1 1 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110144;110145;110146;110147;110148;110149;110150;110151;110152;110153;110154;110155;110156;110157;110158;110159;110160;110161;110162;110163;110164;110165;110166;110167;110168;110169;110170;110171;110172;110173 110160 28 EGICAIGGTSEQSSVGTQHSYSEEEK Unmodified 2769.2035 0.20354637 2066 P13796;Q5TBN3 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.803 54.803 3 2.4304E-57 52585 QUIQUE_C1403_190116_001 153.24 148.55 208430000 0 28607000 55064000 104330000 0 0 0 0 0 20430000 0 0 0 9798 2066 9174 86791;86792;86793;86794 110174;110175;110176;110177 110176 4 EGICALGGTSELSSEGTQHSYSEEEK Unmodified 2784.2032 0.20321202 181 A0A0A0MSQ0;P13797 PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 72.55 72.55 3 1.4866E-21 73893 QUIQUE_C1438_190116_001 112.13 105.33 199270000 0 0 0 48132000 60476000 34352000 56308000 0 0 0 0 0 0 9799 181 9175 86795;86796;86797;86798 110178;110179;110180;110181 110179 4 EGIDPTPYYWYTDQR Unmodified 1902.8424 0.84244331 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120 120 2 1.395E-08 125516 QUIQUE_C1438_190116_001 150.06 140.4 2091900000 153060000 200280000 201170000 183750000 148290000 131530000 156500000 124450000 158390000 85500000 225260000 165030000 158670000 9800 1553 9176 86799;86800;86801;86802;86803;86804;86805;86806;86807;86808;86809;86810;86811 110182;110183;110184;110185;110186;110187;110188;110189;110190;110191;110192;110193;110194;110195;110196 110187 14 EGIDPTPYYWYTDQRK Unmodified 2030.9374 0.93740633 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 97.958 97.958 3 0.0022772 99389 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.324 59.606 96411000 0 0 0 0 0 0 0 96411000 0 0 0 0 0 9801 1553 9177 86812 110197 110197 0 EGIILFK Unmodified 818.49019 0.49019038 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 0 1 1 1 81.517 81.517 2 0.049176 84030 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.269 3.248 496050000 0 0 175680000 0 0 0 0 135250000 0 0 185130000 0 0 9802 1890 9178 86813;86814;86815 110198;110199;110200 110200 3 EGIIPANYVQK Unmodified 1230.6608 0.66083754 2439 P41240;H3BUM9 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes no 0 0 0 1 1 1 1 66.786 66.786 2 0.0043186 66575 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.708 52.977 392200000 0 79187000 98439000 101760000 0 0 0 0 112820000 0 0 0 0 9803 2439 9179 86816;86817;86818;86819 110201;110202;110203;110204 110204 4 EGILGQHQFLEGPEGIENTR Unmodified 2223.092 0.09200949 868 E7ESP4;E9PB77;E7EMF1 ITGA2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.086 99.086 3 1.6499E-08 101975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.67 89.957 405090000 0 57109000 0 70989000 75164000 0 62740000 0 90693000 0 48395000 0 0 9804 868 9180 86820;86821;86822;86823;86824;86825 110205;110206;110207;110208;110209;110210;110211;110212 110211 8 EGILNDDIYCPPETAVLLASYAVQSK Unmodified 2865.4106 0.41062602 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 2 2 3 2 1 3 2 2 166.02 166.02 2;3 3.3362E-84 170485 QUIQUE_DMIX8_190116_001 234.04 224.99 8753900000 519590000 454080000 1053100000 717910000 579050000 435430000 611510000 657640000 1037600000 256870000 783430000 642210000 1005400000 9805 2248 9181 86826;86827;86828;86829;86830;86831;86832;86833;86834;86835;86836;86837;86838;86839;86840;86841;86842;86843;86844;86845;86846;86847;86848;86849;86850;86851;86852 110213;110214;110215;110216;110217;110218;110219;110220;110221;110222;110223;110224;110225;110226;110227;110228;110229;110230;110231;110232;110233;110234;110235;110236;110237;110238;110239;110240;110241;110242;110243;110244;110245;110246;110247;110248;110249;110250;110251 110251 37 EGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAK Unmodified 2822.4048 0.40481236 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 159.75 159.75 2;3 2.1788E-100 164733 QUIQUE_DMIX3_190116_001 246.27 235.65 7065300000 445870000 567800000 501250000 463770000 741120000 380390000 564630000 429150000 736920000 180070000 683760000 643780000 726760000 9806 859 9182 86853;86854;86855;86856;86857;86858;86859;86860;86861;86862;86863;86864;86865;86866;86867;86868;86869;86870;86871;86872;86873;86874;86875;86876;86877;86878 110252;110253;110254;110255;110256;110257;110258;110259;110260;110261;110262;110263;110264;110265;110266;110267;110268;110269;110270;110271;110272;110273;110274;110275;110276;110277;110278;110279;110280;110281;110282;110283;110284;110285;110286;110287;110288;110289;110290;110291;110292;110293;110294;110295 110281 43 EGINIFLDGYVPTENLR Unmodified 1948.9894 0.9894419 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 147.61 147.61 2 1.3735E-12 150521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.54 94.813 253740000 54690000 0 0 0 0 0 0 62097000 0 0 71112000 65845000 0 9807 2718 9183 86879;86880;86881;86882 110296;110297;110298;110299 110297 3 EGIPALDNFLDK Unmodified 1330.6769 0.67688153 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.61 130.61 2 0.00065806 134874 QUIQUE_C1368_190116_001 106.29 78.548 351890000 63102000 47067000 44188000 53678000 22012000 53324000 42092000 0 0 26424000 0 0 0 9808 2058 9184 86883;86884;86885;86886;86887;86888;86889;86890 110300;110301;110302;110303;110304;110305;110306;110307;110308;110309 110303 10 EGIPALDNFLDKL Unmodified 1443.7609 0.76094551 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 3 3 1 2 2 1 1 1 2 4 2 162.48 162.48 2 0.00046516 166723 QUIQUE_C1403_190116_001 139.43 101.74 5956200000 257600000 284880000 730060000 546970000 343000000 190040000 628320000 301230000 413630000 98960000 674340000 1048000000 439210000 9809 2058 9185 86891;86892;86893;86894;86895;86896;86897;86898;86899;86900;86901;86902;86903;86904;86905;86906;86907;86908;86909;86910;86911;86912;86913;86914 110310;110311;110312;110313;110314;110315;110316;110317;110318;110319;110320;110321;110322;110323;110324;110325;110326;110327;110328;110329;110330;110331;110332;110333;110334;110335;110336;110337;110338;110339;110340;110341;110342;110343;110344;110345;110346;110347;110348;110349 110324 39 EGIPGLYR Unmodified 903.48142 0.48141661 3372 Q6NUK1 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 62.725 62.725 2 0.017542 62978 QUIQUE_C1576_190116_001 81.381 56.383 39105000 0 0 0 0 0 0 16459000 0 0 0 0 0 22645000 9810 3372 9186 86915;86916;86917;86918 110350;110351;110352;110353 110352 4 EGIPPDQQR Unmodified 1038.5094 0.50942227 623 J3QS39;J3QTR3;F5H6Q2;F5GYU3;F5H2Z3;F5H265;B4DV12;F5H388;F5H747;F5GXK7;J3QKN0;Q5PY61;Q96C32;P62987;P62979;P0CG47;P0CG48;M0R1V7;Q49A90;M0R1M6;M0R2S1;A0A2R8Y422;J3QSA3;F5GZ39 UBB;RPS27A;UBC;UBA52 Ubiquitin-60S ribosomal protein L40;Ubiquitin;60S ribosomal protein L40;Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a;Ubiquitin;40S ribosomal protein S27a;Polyubiquitin-B;Ubiquitin;Polyubiquitin-C;Ubiquitin yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 3 1 2 1 17.109 17.109 2 0.0004731 8305 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.28 97.38 2027100000 93542000 297030000 72731000 131350000 63148000 163740000 85970000 59037000 97705000 571590000 53443000 251270000 86556000 9811 623 9187 86919;86920;86921;86922;86923;86924;86925;86926;86927;86928;86929;86930;86931;86932;86933;86934;86935;86936 110354;110355;110356;110357;110358;110359;110360;110361;110362;110363;110364;110365;110366;110367;110368;110369;110370;110371;110372;110373;110374;110375;110376;110377;110378 110370 24 EGIREETVSLR Unmodified 1287.6783 0.67827852 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 36.578 36.578 2;3 0.0036388 32866 QUIQUE_C1218_190116_001 58.674 43.798 675010000 136740000 0 0 0 236440000 100180000 0 201660000 0 0 0 0 0 9812 2169 9188 86937;86938;86939;86940;86941;86942 110379;110380;110381;110382;110383;110384 110379 6 EGISINCGLLALGNVISALGDK Unmodified 2213.1726 0.172568 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YIM7 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 1 172.15 172.15 2;3 2.4873E-54 176813 QUIQUE_C1368_190116_001 204.13 168.61 720620000 54049000 56073000 18524000 90978000 47429000 33686000 25031000 38597000 64683000 0 100170000 165600000 25805000 9813 356 9189 86943;86944;86945;86946;86947;86948;86949;86950;86951;86952;86953;86954;86955;86956;86957;86958;86959;86960;86961 110385;110386;110387;110388;110389;110390;110391;110392;110393;110394;110395;110396;110397;110398;110399;110400;110401;110402;110403;110404 110388 20 EGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAAR Unmodified 3369.7351 0.73508847 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 2 1 2 1 168.96 168.96 3;4 5.9706E-119 173326 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.6 170.67 3296500000 190760000 190530000 0 0 0 354940000 430110000 308010000 636410000 0 486720000 473240000 225740000 9814 4600 9190 86962;86963;86964;86965;86966;86967;86968;86969;86970;86971;86972;86973;86974;86975 110405;110406;110407;110408;110409;110410;110411;110412;110413;110414;110415;110416;110417;110418 110414 13 EGISQEALHTQMLTAVQEISHLIEPLANAAR Oxidation (M) 3385.73 0.7300031 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 1 0 1 1 156.78 156.78 4 4.7024E-08 161094 QUIQUE_C1277_190116_001 50.492 45.226 169890000 0 79959000 0 0 0 0 0 89935000 0 0 0 0 0 9815 4600 9190 86976;86977 110419;110420 110419 3032 1 EGITVYSMQFGGYAK Unmodified 1649.7759 0.77594365 4274 Q9NRV9;A0A3B3IRV5 HEBP1 Heme-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 111.49 111.49 2 5.8045E-09 113918 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.47 107.5 60813000 0 0 0 0 0 0 0 60813000 0 0 0 0 0 9816 4274 9191 86978 110421 110421 0 EGIVALR Unmodified 756.44939 0.4493882 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 38.783 38.783 2 0.03642 35260 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.121 7.6766 967650000 0 0 0 231720000 219590000 0 273040000 0 0 0 243300000 0 0 9817 2424 9192 86979;86980;86981;86982 110422;110423;110424;110425 110425 4 EGIVALRR Unmodified 912.5505 0.55049923 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 1 1 22.869 22.869 2 0.038194 16299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.134 29.946 41688000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41688000 0 0 9818 2424 9193 86983 110426 110426 1 EGIVTATEQEVKEDIAK Unmodified 1858.9524 0.95238769 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 97.59 97.59 2;3 8.7499E-20 100076 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.84 104.84 675900000 0 52284000 37870000 0 0 24228000 68577000 62347000 120660000 0 87206000 127770000 94952000 9819 2952 9194 86984;86985;86986;86987;86988;86989;86990;86991;86992;86993;86994;86995 110427;110428;110429;110430;110431;110432;110433;110434;110435;110436;110437;110438;110439 110431 12 EGKEPSEIGNLVK Unmodified 1398.7355 0.73545904 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 1 1 41.919 41.919 2 0.020144 39264 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.434 53.654 29774000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29774000 0 0 9820 1187 9195 86996 110440 110440 1 EGKPCIIIK Unmodified 1056.6002 0.60015154 1873 P05026;V9GYR2 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 23.122 23.122 2 0.01723 17062 QUIQUE_C1218_190116_001 104.44 47.39 1870800000 532820000 0 0 0 0 0 0 0 0 138190000 597050000 0 602710000 9821 1873 9196 86997;86998;86999;87000 110441;110442;110443;110444 110441 2 EGKPTIVEEDDPELFK Unmodified 1844.9044 0.90437487 1671 O75937 DNAJC8 DnaJ homolog subfamily C member 8 yes yes 0 0 1 1 1 77.358 77.358 2;3 0.0082561 78904 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.917 28.479 96088000 34792000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61296000 0 0 9822 1671 9197 87001;87002 110445;110446 110446 1 EGKPYLVLGLLWQVIK Unmodified 1855.0971 0.097141855 2066 P13796;Q5TBN3 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 1 1 164.36 164.36 3 0.0045026 171611 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.501 48.841 40237000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40237000 0 0 9823 2066 9198 87003 110447 110447 1 EGLAELYEYK Unmodified 1213.5867 0.58666954 3037 Q14008;H0YDX5 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes no 0 0 0 1 90.201 90.201 2 0.056169 91211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.898 34.391 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9824 3037 9199 87004 110448 110448 1 EGLAQQVQQSLEK Unmodified 1456.7522 0.75217174 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 84.974 84.974 2 0.00046786 87774 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.095 80.638 400630000 0 0 0 0 69317000 0 0 75109000 0 0 104920000 92300000 58984000 9825 3423 9200 87005;87006;87007;87008;87009 110449;110450;110451;110452;110453 110451 5 EGLDDQGLTK Unmodified 1074.5193 0.51931826 4471 Q9UKA9 PTBP2 Polypyrimidine tract-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 36.778 36.778 2 0.00080387 32912 QUIQUE_C1218_190116_001 105.94 75.681 490390000 156390000 115820000 105460000 0 0 0 74346000 0 0 38379000 0 0 0 9826 4471 9201 87010;87011;87012;87013;87014;87015;87016 110454;110455;110456;110457;110458;110459;110460;110461;110462 110454 7 EGLEEGDQILR Unmodified 1257.6201 0.62009493 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 67.637 67.637 2 0.010614 67732 QUIQUE_C1218_190116_001 68.893 47.805 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9827 1074 9202 87017;87018 110463;110464 110463 2 EGLEETLR Unmodified 945.47673 0.47672516 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.676 41.676 2 0.0046215 36851 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.46 64.653 9392400000 1227500000 0 959200000 863610000 1016700000 860980000 2127900000 0 726110000 529080000 0 0 1081200000 9828 1916 9203 87019;87020;87021;87022;87023;87024;87025;87026;87027 110465;110466;110467;110468;110469;110470;110471;110472;110473 110472 4 EGLEIVK Unmodified 786.44872 0.4487195 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 39.579 39.579 2 0.048295 36535 QUIQUE_C1438_190116_001 76.035 16.425 202060000 0 0 0 0 202060000 0 0 0 0 0 0 0 0 9829 2051 9204 87028 110474 110474 1 EGLELLK Unmodified 800.46437 0.46436956 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.215 63.215 2 0.041082 62552 QUIQUE_C1403_190116_001 82.305 1.2052 34501000000 0 2903800000 3479000000 3034400000 2959800000 2822000000 2715000000 2407800000 2634800000 2357100000 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110492;110493;110494;110495;110496;110497;110498;110499;110500;110501;110502;110503;110504;110505;110506;110507;110508;110509;110510;110511;110512;110513;110514;110515;110516;110517;110518;110519 110497 28 EGLELPEDEEEKK Unmodified 1543.7253 0.72534787 1931;1938;3263 P08238;Q58FF7;P07900;Q58FG0;Q58FF6 HSP90AB1;HSP90AB3P;HSP90AA1;HSP90AA5P;HSP90AB4P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3;Heat shock protein HSP 90-alpha;Putative heat shock protein HSP 90-alpha A5;Putative heat shock protein HSP 90-beta 4 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 3 2 2 1 2 3 2 44.418 44.418 2;3 5.4494E-07 40781 QUIQUE_C1368_190116_001 139.86 127.24 3587600000 487590000 539120000 271560000 443480000 291340000 479980000 188380000 260110000 101970000 94661000 207600000 221770000 0 9832 1938;1931;3263 9207 87054;87055;87056;87057;87058;87059;87060;87061;87062;87063;87064;87065;87066;87067;87068;87069;87070;87071;87072;87073;87074;87075;87076;87077;87078;87079;87080;87081 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110642;110643;110644;110645;110646;110647;110648;110649;110650;110651;110652;110653;110654;110655;110656;110657;110658;110659;110660;110661;110662;110663;110664 110646 23 EGLLSMANAGR Unmodified 1117.555 0.55499226 2926 Q08752 PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D yes yes 0 0 0 1 70.168 70.168 2 0.040548 70089 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.493 24.576 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9842 2926 9217 87171 110665 110665 1 EGLMLDSHEELYK Unmodified 1562.7287 0.72865911 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 74.109 74.109 2;3 0.00010867 74486 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.701 74.48 388730000 0 0 49482000 34793000 0 53509000 0 90171000 41841000 27196000 40234000 51507000 0 9843 3053 9218 87172;87173;87174;87175;87176;87177;87178;87179;87180;87181;87182 110666;110667;110668;110669;110670;110671;110672;110673;110674;110675;110676;110677;110678 110674 12 EGLMLDSHEELYK Oxidation (M) 1578.7236 0.72357373 3053 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110682;110683;110684;110685;110686;110687;110688;110689;110690;110691;110692 110690 10 EGLPVALDK Unmodified 940.52295 0.52294707 4535 Q9Y224 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 59.04 59.04 2 0.025354 58717 QUIQUE_C1438_190116_001 59.35 32.22 647590000 0 131350000 0 0 133210000 0 119300000 0 0 0 152200000 0 111530000 9847 4535 9221 87196;87197;87198;87199;87200 110693;110694;110695;110696;110697;110698 110695 5 EGLQDIVIGIIK Unmodified 1296.7653 0.76530261 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 152.42 152.42 2 0.0034387 158981 QUIQUE_C1576_190116_001 94.409 80.291 825370000 0 0 132310000 0 0 0 196910000 81176000 68149000 0 93562000 112790000 140480000 9848 2867 9222 87201;87202;87203;87204;87205;87206;87207 110699;110700;110701;110702;110703;110704;110705 110700 2 EGLQNMEAR Unmodified 1046.4815 0.48149296 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.686 28.686 2 0.0016704 22713 QUIQUE_C1277_190116_001 101.33 60.1 924330000 0 924330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9849 2343 9223 87208;87209;87210;87211;87212;87213;87214;87215 110706;110707;110708;110709;110710;110711;110712;110713;110714 110707 9 EGLTGTGTGPSR Unmodified 1131.552 0.55201537 2242 P25686;C9JRD2;C9JXB9;C9J1G2;E7ETU0;C9JX00 DNAJB2 DnaJ homolog subfamily B member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 20.468 20.468 2 0.012441 13379 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.785 24.522 734200000 0 272530000 0 0 0 0 0 120340000 0 81311000 0 0 260020000 9850 2242 9224 87216;87217;87218;87219 110715;110716;110717;110718 110717 4 EGLTPVLSLLTECSR Unmodified 1673.8658 0.86582129 651 B7WPL0;Q9NVN3;H0YHS3 RIC8B Synembryn-B yes no 0 0 0 1 144.33 144.33 2 0.00070281 149381 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.46 60.797 43250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43250000 9851 651 9225 87220 110719 110719 1 EGLTSIEEVTK Unmodified 1204.6187 0.61869795 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.485 67.485 2 0.00067123 66503 QUIQUE_C1563_190116_001 112.75 73.726 9071600000 542820000 571850000 698780000 339700000 612410000 329850000 776270000 1028900000 1142200000 448530000 1061800000 803410000 715150000 9852 3117 9226 87221;87222;87223;87224;87225;87226;87227;87228;87229;87230;87231;87232;87233 110720;110721;110722;110723;110724;110725;110726;110727;110728;110729;110730;110731;110732;110733;110734 110725 10 EGLVMVEVR Unmodified 1030.5481 0.54811597 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.495 71.495 2 0.009134 71886 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.827 32.38 293960000 0 63961000 63922000 0 0 52126000 0 0 59625000 0 0 54327000 0 9853 3432 9227 87234;87235;87236;87237;87238 110735;110736;110737;110738;110739 110738 5 EGLWAEGQAR Unmodified 1115.536 0.53597137 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 48.883 48.883 2 0.0015231 46719 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.624 75.323 608640000 47216000 78880000 0 0 0 83431000 0 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EGLYFNPYFPGQAIAMAPPIYTDVLEFDDGTPATMSQIAK 2 Oxidation (M) 4410.0752 0.075228303 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 2 0 2 1 169.89 169.89 3;4 7.9148E-16 174341 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.817 63.181 162910000 0 0 0 0 0 0 0 0 142820000 0 0 20098000 0 9857 1947 9229 87256;87257;87258 110761;110762;110763 110761 1188;1189 3 EGMAALQSDPWQQELYR Unmodified 2020.9313 0.93127509 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.62 121.62 2 1.5693E-37 126973 QUIQUE_C1218_190116_001 204.85 186.58 1118200000 134870000 150300000 169970000 0 0 119800000 0 113030000 200730000 48898000 0 0 180640000 9858 2539 9230 87259;87260;87261;87262;87263;87264;87265;87266 110764;110765;110766;110767;110768;110769;110770;110771;110772;110773;110774 110765 10 EGMAALQSDPWQQELYR Oxidation (M) 2036.9262 0.92618971 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 104.26 104.26 2 3.0321E-44 107421 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.95 155.19 163580000 0 0 29054000 15461000 23122000 0 0 14545000 45771000 15769000 0 19856000 0 9859 2539 9230 87267;87268;87269;87270;87271;87272;87273;87274 110775;110776;110777;110778;110779;110780;110781;110782 110779 1988 7 EGMELLAR Unmodified 917.46405 0.46405199 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 59.086 59.086 2 0.056145 57676 QUIQUE_C1277_190116_001 54.157 32.611 24079000 0 24079000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9860 4148 9231 87275 110783 110783 1 EGMNIVEAMER 2 Oxidation (M) 1309.5642 0.56423631 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 2 0 4 1 3 3 2 3 2 1 2 4 2 2 2 27.957 27.957 2 0.00064199 22579 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.06 82.285 3116200000 382590000 97987000 358240000 321530000 167780000 248710000 195910000 79441000 111270000 427150000 278610000 204950000 242080000 9861 2772 9232 87276;87277;87278;87279;87280;87281;87282;87283;87284;87285;87286;87287;87288;87289;87290;87291;87292;87293;87294;87295;87296;87297;87298;87299;87300;87301;87302;87303;87304;87305;87306 110784;110785;110786;110787;110788;110789;110790;110791;110792;110793;110794;110795;110796;110797;110798;110799;110800;110801;110802;110803;110804;110805;110806;110807;110808;110809;110810;110811;110812;110813;110814;110815 110808 2203;2204 27 EGMNIVEAMER Oxidation (M) 1293.5693 0.56932169 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 1 0 3 4 3 4 4 4 3 4 4 4 4 4 4 58.045 58.045 2 0.00024362 48266 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.86 116.21 19782000000 1345000000 2389300000 1421500000 1657100000 1314900000 1694200000 1043700000 1203200000 1353000000 1173700000 1873500000 1524100000 1788700000 9862 2772 9232 87307;87308;87309;87310;87311;87312;87313;87314;87315;87316;87317;87318;87319;87320;87321;87322;87323;87324;87325;87326;87327;87328;87329;87330;87331;87332;87333;87334;87335;87336;87337;87338;87339;87340;87341;87342;87343;87344;87345;87346;87347;87348;87349;87350;87351;87352;87353;87354;87355 110816;110817;110818;110819;110820;110821;110822;110823;110824;110825;110826;110827;110828;110829;110830;110831;110832;110833;110834;110835;110836;110837;110838;110839;110840;110841;110842;110843;110844;110845;110846;110847;110848;110849;110850;110851;110852;110853;110854;110855;110856;110857;110858;110859;110860;110861;110862;110863;110864;110865;110866;110867;110868;110869;110870 110846 2203;2204 52 EGMNIVEAMER Unmodified 1277.5744 0.57440707 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.706 92.706 2 1.9667E-24 96527 QUIQUE_C1218_190116_001 183.43 171.94 27495000000 3163700000 2980200000 2859400000 2615400000 1892800000 2375000000 2624900000 1447300000 1618900000 673190000 1850400000 1478900000 1915300000 9863 2772 9232 87356;87357;87358;87359;87360;87361;87362;87363;87364;87365;87366;87367;87368 110871;110872;110873;110874;110875;110876;110877;110878;110879;110880;110881;110882;110883;110884;110885;110886;110887;110888;110889;110890;110891;110892;110893;110894;110895 110872 25 EGMQLISEKPETEAVVK Oxidation (M) 1902.9608 0.96084389 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 50.338 50.338 2;3 1.5242E-43 47958 QUIQUE_DMIX1_190116_001 173.68 155.87 4355200000 437700000 516240000 76358000 66268000 507520000 341640000 357070000 462520000 630160000 293040000 126190000 446770000 93750000 9864 2851 9233 87369;87370;87371;87372;87373;87374;87375;87376;87377;87378;87379;87380;87381;87382;87383;87384;87385;87386;87387;87388;87389;87390 110896;110897;110898;110899;110900;110901;110902;110903;110904;110905;110906;110907;110908;110909;110910;110911;110912;110913;110914;110915;110916;110917;110918 110909 2291 14 EGMQLISEKPETEAVVK Unmodified 1886.9659 0.96592926 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 67.14 67.14 2;3 5.0515E-160 67266 QUIQUE_C1277_190116_001 246.86 223.74 21032000000 1870200000 2104100000 1937900000 1592300000 1831000000 929330000 1484900000 1551000000 1756500000 635640000 2111700000 1728200000 1499400000 9865 2851 9233 87391;87392;87393;87394;87395;87396;87397;87398;87399;87400;87401;87402;87403;87404;87405;87406;87407;87408;87409;87410;87411;87412;87413;87414;87415;87416 110919;110920;110921;110922;110923;110924;110925;110926;110927;110928;110929;110930;110931;110932;110933;110934;110935;110936;110937;110938;110939;110940;110941;110942;110943;110944;110945;110946;110947;110948;110949;110950;110951 110922 33 EGMSNNSTTSISQAR Oxidation (M) 1597.7002 0.70021252 2557 P50150 GNG4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-4 yes yes 0 1 0 1 18.321 18.321 2 0.00059843 10554 QUIQUE_C1277_190116_001 77.597 62.917 17835000 0 17835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9866 2557 9234 87417 110952 110952 1996 1 EGMTAFVEK Oxidation (M) 1026.4692 0.46919694 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 22.629 22.629 2 0.018753 15877 QUIQUE_C1277_190116_001 66.621 42.419 220050000 0 61752000 0 0 0 0 0 29514000 0 34455000 57581000 36749000 0 9867 2305 9235 87418;87419;87420;87421;87422 110953;110954;110955;110956;110957 110953 5 EGMTAFVEK Unmodified 1010.4743 0.47428232 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.333 49.333 2 0.0051716 45588 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.308 60.705 1249200000 0 0 0 0 180850000 0 234220000 0 180740000 91736000 303090000 0 258530000 9868 2305 9235 87423;87424;87425;87426;87427;87428 110958;110959;110960;110961;110962;110963;110964;110965 110962 8 EGMTAFVEKR Unmodified 1166.5754 0.57539335 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 35.868 35.868 3 0.038147 31421 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.148 20.708 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9869 2305 9236 87429 110966 110966 1 EGMTKEECLQFTANALALAMER Unmodified 2512.176 0.17601517 2275 P28072 PSMB6 Proteasome subunit beta type-6 yes yes 0 0 1 1 141.05 141.05 3 0.041152 144048 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.185 34.381 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9870 2275 9237 87430 110967 110967 1 EGNAIFTFPNTPVK Unmodified 1533.7827 0.78274359 4660 Q9Y6N5;H3BNX3;H3BMS6 SQRDL Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 106.6 106.6 2 0.0030541 110451 QUIQUE_C1368_190116_001 84.605 67.137 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9871 4660 9238 87431;87432 110968;110969 110968 2 EGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDK Unmodified 2593.3599 0.35991107 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 1 1 1 1 157.48 157.48 3 1.4245E-09 159596 QUIQUE_C1563_190116_001 88.79 76.127 663920000 0 0 0 338100000 0 185430000 0 0 0 140390000 0 0 0 9872 469 9239 87433;87434;87435 110970;110971;110972 110971 2 EGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLR Unmodified 2959.5978 0.59784994 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 147.42 147.42 3;4 9.1849E-144 152112 QUIQUE_C1277_190116_001 198.68 192.58 19236000000 1087000000 1754400000 1678300000 968840000 1509800000 2248900000 1205400000 2090500000 1316800000 396350000 1913000000 1687500000 1378900000 9873 469 9240 87436;87437;87438;87439;87440;87441;87442;87443;87444;87445;87446;87447;87448;87449;87450;87451;87452;87453;87454;87455;87456;87457;87458;87459;87460;87461;87462 110973;110974;110975;110976;110977;110978;110979;110980;110981;110982;110983;110984;110985;110986;110987;110988;110989;110990;110991;110992;110993;110994;110995;110996;110997;110998;110999;111000;111001;111002;111003;111004;111005;111006;111007;111008;111009;111010;111011;111012;111013;111014;111015;111016;111017;111018;111019;111020;111021;111022;111023;111024;111025 110980 53 EGNDLYHEMIESGVINLK Oxidation (M) 2075.9834 0.98337024 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W079;H0YI37;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 1 0 2 3 2 4 3 2 2 2 2 3 2 2 1 92.755 92.755 2;3 7.9763E-141 95689 QUIQUE_C1218_190116_001 236.4 198.38 2189700000 99302000 358460000 136290000 350110000 205220000 88746000 89455000 58034000 123600000 347990000 167780000 95507000 69173000 9874 1900;1046 9241 87463;87464;87465;87466;87467;87468;87469;87470;87471;87472;87473;87474;87475;87476;87477;87478;87479;87480;87481;87482;87483;87484;87485;87486;87487;87488;87489;87490;87491;87492 111026;111027;111028;111029;111030;111031;111032;111033;111034;111035;111036;111037;111038;111039;111040;111041;111042;111043;111044;111045;111046;111047;111048;111049;111050;111051;111052;111053;111054;111055;111056;111057 111026 613 32 EGNDLYHEMIESGVINLK Unmodified 2059.9885 0.98845562 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W079;H0YI37;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 131.74 131.74 2;3 0 137551 QUIQUE_C1218_190116_001 351.69 324.01 30118000000 3275900000 2566500000 3350400000 2296500000 1794200000 3175200000 2621700000 1669300000 2210500000 815860000 2463500000 1957300000 1920700000 9875 1900;1046 9241 87493;87494;87495;87496;87497;87498;87499;87500;87501;87502;87503;87504;87505;87506;87507;87508;87509;87510;87511;87512;87513;87514;87515;87516;87517;87518;87519 111058;111059;111060;111061;111062;111063;111064;111065;111066;111067;111068;111069;111070;111071;111072;111073;111074;111075;111076;111077;111078;111079;111080;111081;111082;111083;111084;111085;111086;111087;111088;111089;111090;111091;111092;111093;111094;111095;111096;111097;111098;111099;111100;111101;111102;111103;111104;111105;111106;111107;111108;111109;111110;111111;111112;111113;111114;111115;111116 111059 58 EGNPAPEYTWFK Unmodified 1437.6565 0.65648044 1151 H0YEX9;P57087 JAM2 Junctional adhesion molecule B yes no 0 0 0 1 95.491 95.491 2 0.032964 92020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.844 35.228 31475000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31475000 0 0 0 9876 1151 9242 87520 111117 111117 1 EGNPEEDLTADK Unmodified 1316.5732 0.57320432 2421 P40121;E7ENU9 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.853 37.853 2 8.9169E-05 33720 QUIQUE_C1403_190116_001 121.83 113.07 3994500000 182280000 242610000 340380000 249770000 319030000 313190000 345650000 268120000 403700000 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87535;87536;87537;87538;87539;87540;87541;87542;87543;87544;87545;87546;87547 111147;111148;111149;111150;111151;111152;111153;111154;111155;111156;111157;111158;111159 111149 12 EGPAVVGQFIQDVK Unmodified 1485.7827 0.78274359 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.05 111.05 2 8.931E-11 114004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.9 153.14 5861100000 502390000 482980000 417980000 328750000 551470000 331810000 503300000 499330000 508380000 178860000 480780000 541990000 533080000 9880 3499 9246 87548;87549;87550;87551;87552;87553;87554;87555;87556;87557;87558;87559;87560;87561 111160;111161;111162;111163;111164;111165;111166;111167;111168;111169;111170;111171;111172;111173;111174;111175;111176;111177;111178;111179;111180;111181;111182;111183;111184;111185;111186 111174 27 EGPCLVHTITGDLLR Unmodified 1679.8665 0.86648999 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.37 105.37 3 4.1927E-06 108355 QUIQUE_C1277_190116_001 77.222 59.522 190110000 30113000 31704000 0 22966000 0 0 24892000 24137000 22450000 0 0 33851000 0 9881 264 9247 87562;87563;87564;87565;87566;87567;87568 111187;111188;111189;111190;111191;111192;111193 111188 6 EGPDLDRPGSDR Unmodified 1312.6008 0.60075648 3463 Q7Z4V5;A0A087WZ99 HDGFRP2 Hepatoma-derived growth factor-related protein 2 yes no 0 0 1 1 1 20.771 20.771 3 0.0062691 13975 QUIQUE_C1438_190116_001 51.875 11.873 76543000 0 0 0 37926000 38617000 0 0 0 0 0 0 0 0 9882 3463 9248 87569;87570 111194;111195 111195 2 EGPEGFAR Unmodified 861.39808 0.39808091 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.793 24.793 2 0.0099596 18453 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.9 10.519 447000000 0 0 99786000 0 0 78625000 0 0 0 34956000 147100000 86534000 0 9883 2026 9249 87571;87572;87573;87574;87575 111196;111197;111198;111199;111200 111199 5 EGPEGNDIR Unmodified 985.44649 0.44648767 2854;2853 Q01433;H0Y360;H0YF16;Q01432 AMPD2;AMPD3 AMP deaminase 2;AMP deaminase 3 no no 0 0 0 1 16.202 16.202 2 0.004515 8262 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.819 71.877 43314000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43314000 0 0 0 9884 2854;2853 9250 87576 111201 111201 1 EGPETPPRPR Unmodified 1134.5782 0.57817054 513 A0A5E8;Q99501 GAS2L1 GAS2-like protein 1 yes no 0 0 1 1 14.302 14.302 3 0.026684 6604 QUIQUE_C1403_190116_001 60.398 48.235 16074000 0 0 0 16074000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9885 513 9251 87577 111202 111202 0 EGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEITSIPETEPLQSPTTK Unmodified 4336.1944 0.19435588 985 F2Z357;J3KPC5;P47736;A0A0A0MQY8;X6R8W7;Q5T3T1 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 168.71 168.71 4 0.00013305 170578 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.357 35.116 48943000 0 0 0 0 0 0 0 48943000 0 0 0 0 0 9886 985 9252 87578 111203 111203 0 EGPFYPTLR Unmodified 1078.5447 0.54474515 4486 Q9ULC4 MCTS1 Malignant T-cell-amplified sequence 1 yes yes 0 0 0 1 76.418 76.418 2 0.025868 72163 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.981 40.198 80384000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80384000 0 0 0 9887 4486 9253 87579 111204 111204 1 EGPGLAELLANVASSILSHIK Unmodified 2118.1685 0.1684689 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 176.36 176.36 3 0.032988 180977 QUIQUE_C1576_190116_001 19.722 16.434 45129000 0 0 0 0 0 0 45129000 0 0 0 0 0 0 9888 4449 9254 87580 111205 111205 1 EGPGPEDTVQDNLGAAGAEEEQEEHQK Unmodified 2863.238 0.23801762 847 E7EMG9;P33241;C9JU59;E9PBD8;C9JKF7 LSP1 Lymphocyte-specific protein 1 yes no 0 0 0 1 1 73.023 73.023 3 1.8813E-27 72479 QUIQUE_C1403_190116_001 110.75 100.23 47766000 0 0 0 30074000 0 0 0 0 0 17692000 0 0 0 9889 847 9255 87581;87582 111206;111207 111206 2 EGPIDLGACNQDDWISAVRPVIEK Unmodified 2681.3119 0.31191502 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;Q5LJB0;H0Y6Y4;H0Y4E0 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 135.97 135.97 3 7.2425E-06 140781 QUIQUE_C1218_190116_001 56.562 37.681 119100000 119100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9890 4622 9256 87583 111208 111208 1 EGPIGGESDSEEVR Unmodified 1459.6427 0.64268087 947 E9PJP2;Q5TF21;H3BRB8 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.135 34.135 2 0.0041261 29842 QUIQUE_C1218_190116_001 66.267 45.396 107620000 40581000 0 33335000 0 0 0 0 0 33703000 0 0 0 0 9891 947 9257 87584;87585;87586;87587 111209;111210;111211;111212 111209 4 EGPLSVFGDR Unmodified 1075.5298 0.52982336 2132 P17987;E7ERF2;F5GZ03;F5GZI8;F5GYL4 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 154.39 154.39 2 0.028317 156944 QUIQUE_C1563_190116_001 55.064 36.333 3214500 0 0 0 0 0 3214500 0 0 0 0 0 0 0 9892 2132 9258 87588 111213 111213 1 EGPPSEHSGMSR Unmodified 1269.5408 0.54079876 171 A0A0A0MSA9;A0A0C4DG49 PVR yes no 0 0 0 1 11.239 11.239 3 0.0036377 3567 QUIQUE_C1403_190116_001 57.802 43.135 3587000 0 0 0 3587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9893 171 9259 87589 111214 111214 1 EGPVLILGR Unmodified 952.57057 0.57056597 2140 P19021;H7BYD9 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.613 73.613 2 0.0016745 73906 QUIQUE_C1368_190116_001 101.28 55.268 360260000 36198000 40745000 35774000 30234000 32855000 38667000 39312000 18233000 0 0 24504000 26954000 36782000 9894 2140 9260 87590;87591;87592;87593;87594;87595;87596;87597;87598;87599;87600;87601 111215;111216;111217;111218;111219;111220;111221;111222;111223;111224;111225;111226 111217 12 EGPYDVVVLPGGNLGAQNLSESAAVK Unmodified 2583.318 0.31804626 3956 Q99497;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 130.59 130.59 2;3 4.5661E-99 135527 QUIQUE_C1368_190116_001 180.63 167.04 41682000000 3067100000 3164700000 3356800000 2981500000 3782300000 3230200000 2882400000 3777400000 3617400000 1664700000 3581400000 3455500000 3120100000 9895 3956 9261 87602;87603;87604;87605;87606;87607;87608;87609;87610;87611;87612;87613;87614;87615;87616;87617;87618;87619;87620;87621;87622;87623;87624;87625;87626;87627 111227;111228;111229;111230;111231;111232;111233;111234;111235;111236;111237;111238;111239;111240;111241;111242;111243;111244;111245;111246;111247;111248;111249;111250;111251;111252;111253;111254;111255;111256;111257;111258;111259;111260;111261;111262;111263;111264;111265;111266;111267;111268;111269;111270;111271;111272;111273;111274;111275;111276;111277;111278;111279;111280 111236 54 EGPYSISVLYGDEEVPR Unmodified 1908.9105 0.91052288 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.78 118.78 2 3.567E-11 122277 QUIQUE_C1277_190116_001 148.68 110.28 1251400000 76745000 100210000 105690000 107240000 135500000 77367000 73300000 115460000 104630000 55987000 112780000 118140000 68312000 9896 2178 9262 87628;87629;87630;87631;87632;87633;87634;87635;87636;87637;87638;87639;87640 111281;111282;111283;111284;111285;111286;111287;111288;111289;111290;111291;111292;111293;111294;111295;111296 111282 15 EGQETLVKEEVEAFLR Unmodified 1875.9578 0.95780742 528 A5YM72 CARNS1 Carnosine synthase 1 yes yes 0 0 1 1 1 135.37 135.37 3 0.0065536 140297 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.445 46.633 38312000 0 0 0 0 0 0 0 0 18162000 0 0 20150000 0 9897 528 9263 87641;87642 111297;111298 111297 0 EGQGFVSEDEYLEISDIKR Unmodified 2213.0488 0.048807271 3092 Q14982 OPCML Opioid-binding protein/cell adhesion molecule yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.69 105.69 3 2.9474E-05 108792 QUIQUE_C1277_190116_001 66.874 58.785 1206100000 91140000 114810000 158620000 132850000 131920000 0 130650000 67491000 74749000 0 111000000 91663000 101220000 9898 3092 9264 87643;87644;87645;87646;87647;87648;87649;87650;87651;87652;87653 111299;111300;111301;111302;111303;111304;111305;111306;111307;111308;111309;111310;111311 111300 12 EGQGGPGSVSVDVK Unmodified 1314.6416 0.64155866 16;1475 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87679;87680;87681;87682;87683;87684;87685;87686;87687;87688;87689;87690;87691;87692;87693;87694;87695;87696;87697;87698;87699;87700;87701;87702;87703;87704 111337;111338;111339;111340;111341;111342;111343;111344;111345;111346;111347;111348;111349;111350;111351;111352;111353;111354;111355;111356;111357;111358;111359;111360;111361;111362;111363;111364;111365;111366;111367;111368;111369;111370;111371 111343 33 EGQVDVASVLLEAGAAHSLATKK Unmodified 2293.2278 0.22777469 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 1 1 109.9 109.9 4 0.047168 113329 QUIQUE_DMIX7_190116_001 18.101 14.703 55008000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55008000 0 9904 1255;2856 9270 87705 111372 111372 1 EGREESEAEAPR Unmodified 1358.6062 0.60623578 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 1 1 1 10.393 10.393 3 1.3512E-09 2758 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.56 107.19 21014000 0 0 0 0 0 0 0 12127000 0 8886900 0 0 0 9905 2515 9271 87706;87707 111373;111374;111375 111373 3 EGRPPEPTPAK Unmodified 1177.6091 0.60913632 4529 Q9UQ35 SRRM2 Serine/arginine repetitive matrix protein 2 yes yes 0 0 1 1 10.503 10.503 3 0.059178 2953 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.245 14.101 5447400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5447400 0 0 0 9906 4529 9272 87708 111376 111376 1 EGRPSGEAFVELESEDEVK Unmodified 2105.9753 0.97530798 905 E9PCY7;G8JLB6;P31943;D6RIT2;D6RIU0;D6RBM0;E7EQJ0;D6RAM1;D6R9T0;D6RFM3;D6RDU3;D6RJ04;D6RIH9;E7EN40;D6RDL0 HNRNPH1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 80.001 80.001 3 0.0011585 79758 QUIQUE_C1563_190116_001 58.848 46.575 201250000 44075000 0 0 0 67232000 38187000 0 0 0 0 0 51757000 0 9907 905 9273 87709;87710;87711;87712;87713 111377;111378;111379;111380;111381;111382;111383 111382 7 EGSALTEGAKEEGGEEVAK Unmodified 1889.8854 0.88543034 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;A0A0J9YW31;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 30.603 30.603 2;3 0 25482 QUIQUE_C1438_190116_001 290.71 266.64 6894300000 580880000 605120000 744310000 613510000 522760000 443370000 746530000 479020000 407510000 165920000 544380000 387540000 653420000 9908 143;560;4559 9274 87714;87715;87716;87717;87718;87719;87720;87721;87722;87723;87724;87725;87726;87727;87728;87729;87730;87731;87732;87733;87734;87735;87736;87737;87738;87739 111384;111385;111386;111387;111388;111389;111390;111391;111392;111393;111394;111395;111396;111397;111398;111399;111400;111401;111402;111403;111404;111405;111406;111407;111408;111409;111410;111411;111412;111413;111414 111396 31 EGSGGGGGMDDIFSHIFGGGLFGFMGNQSR Unmodified 2990.3076 0.3075747 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 0 1 1 170.93 170.93 3 1.6197E-19 178313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.588 75.277 148550000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90156000 58397000 0 9909 1600 9275 87740;87741 111415;111416 111415 2 EGSGIGAIDSNLDWSHNFTNMLGYTDHQFTELTR Oxidation (M) 3841.7278 0.72783084 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 143.52 143.52 3;4 1.1858E-21 149142 QUIQUE_C1368_190116_001 82.058 72.43 1749900000 83549000 381810000 251560000 114950000 100850000 82868000 0 0 213800000 193400000 185000000 0 142090000 9910 612 9276 87742;87743;87744;87745;87746;87747;87748;87749;87750;87751;87752;87753;87754;87755 111417;111418;111419;111420;111421;111422;111423;111424;111425;111426;111427;111428;111429;111430 111421 399 13 EGSGIGAIDSNLDWSHNFTNMLGYTDHQFTELTR Unmodified 3825.7329 0.73291622 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 158.81 158.81 3;4 3.2738E-236 162726 QUIQUE_C1277_190116_001 226.5 218.5 11313000000 588910000 1711500000 921740000 0 447950000 312330000 823110000 734660000 1019000000 33417000 2398900000 1483300000 838030000 9911 612 9276 87756;87757;87758;87759;87760;87761;87762;87763;87764;87765;87766;87767;87768;87769;87770;87771 111431;111432;111433;111434;111435;111436;111437;111438;111439;111440;111441;111442;111443;111444;111445;111446;111447;111448;111449;111450;111451;111452 111432 22 EGSIEIDIPVPK Unmodified 1295.6973 0.69728262 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.38 104.38 2 0.0016497 107617 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.974 62.861 407810000 38435000 33365000 46319000 0 0 34666000 0 32583000 53000000 15039000 52850000 45734000 55815000 9912 3933 9277 87772;87773;87774;87775;87776;87777;87778;87779;87780;87781 111453;111454;111455;111456;111457;111458;111459;111460;111461;111462;111463 111463 5 EGSIGGSGGSGGGGGGGLKPSITK Unmodified 1972.9814 0.98139641 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 30.209 30.209 2;3 6.0386E-13 24665 QUIQUE_C1403_190116_001 106.16 91.469 735710000 88188000 58620000 70950000 130130000 65065000 130570000 97247000 0 0 0 0 34962000 59986000 9913 135 9278 87782;87783;87784;87785;87786;87787;87788;87789;87790;87791;87792;87793 111464;111465;111466;111467;111468;111469;111470;111471;111472;111473;111474;111475;111476 111470 13 EGSLGDELLPLGYSEPEQQEGASAGAPSPTLELASR Unmodified 3654.7537 0.75369447 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.21 148.21 3 3.8233E-54 152273 QUIQUE_C1277_190116_001 105.48 96.179 1444200000 99482000 87741000 135150000 149890000 138920000 95898000 62428000 120830000 143140000 70900000 155860000 89032000 94887000 9914 3827 9279 87794;87795;87796;87797;87798;87799;87800;87801;87802;87803;87804;87805;87806 111477;111478;111479;111480;111481;111482;111483;111484;111485;111486;111487;111488;111489 111478 13 EGSLKDQLALAIGK Unmodified 1441.814 0.81404372 2467 P43897;C9JT21 TSFM Elongation factor Ts, mitochondrial;Elongation factor Ts yes no 0 0 1 1 1 86.228 86.228 3 0.036796 89238 QUIQUE_C1438_190116_001 41.092 28.296 69462000 0 0 0 0 20313000 0 0 0 0 0 0 49150000 0 9915 2467 9280 87807;87808 111490;111491 111490 2 EGSLQVGNEAPVTGSSPLGATQLDTDGALWLGGLPELPVGPALPK Unmodified 4408.2802 0.28021078 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 169.61 169.61 4 0.0092566 174055 QUIQUE_DMIX3_190116_001 19.611 18.307 92449000 0 0 0 0 0 0 0 0 34365000 0 58084000 0 0 9916 1408 9281 87809;87810 111492;111493 111492 2 EGSLVINSK Unmodified 945.51311 0.51311067 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 24.099 24.099 2 0.052818 17676 QUIQUE_C1368_190116_001 49.96 0.90219 21201000 0 0 21201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9917 4620 9282 87811 111494 111494 1 EGSQGELTPANSQSR Unmodified 1559.7176 0.71757715 721 C9JFE4;Q13098;A0A096LP07;A0A096LPJ3;A8K070;J3QQX0 GPS1 COP9 signalosome complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.399 20.399 2 1.4399E-129 13713 QUIQUE_DMIX1_190116_001 237.67 198.05 1102800000 106380000 138910000 0 68186000 115200000 0 80211000 90917000 118030000 41400000 143950000 92266000 107360000 9918 721 9283 87812;87813;87814;87815;87816;87817;87818;87819;87820;87821;87822 111495;111496;111497;111498;111499;111500;111501;111502;111503;111504;111505 111500 11 EGSSEKEEGEQEEGETEAEAEGEEAEAK Unmodified 2996.2014 0.20141692 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 54.024 54.024 3 3.4412E-65 52638 QUIQUE_C1576_190116_001 156.7 154.91 126790000 0 59610000 0 0 0 0 67178000 0 0 0 0 0 0 9919 869 9284 87823;87824 111506;111507 111507 2 EGSTHNWQHITDQIGMFCFTGLKPEQVER Oxidation (M) 3460.5929 0.59285769 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 116.8 116.8 4;5 2.2244E-15 120806 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111519;111520;111521;111522;111523;111524;111525;111526;111527;111528;111529;111530;111531;111532;111533;111534;111535;111536;111537;111538;111539;111540;111541;111542;111543;111544;111545;111546;111547;111548;111549;111550;111551;111552;111553;111554;111555;111556;111557;111558;111559;111560;111561;111562;111563;111564;111565;111566;111567;111568;111569;111570;111571;111572;111573;111574;111575;111576;111577;111578;111579;111580;111581;111582;111583;111584;111585;111586;111587;111588 111532 70 EGSVMLQVDVDTVK Unmodified 1518.76 0.75995923 2978 Q13228 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 92.261 92.261 2 0.0013114 87980 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.533 62.627 57413000 0 0 0 0 0 0 0 20459000 0 36955000 0 0 0 9922 2978 9286 87874;87875;87876 111589;111590;111591;111592 111591 4 EGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKK Unmodified 3815.9622 0.9621711 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 2 2 174.18 174.18 3;4 1.3701E-16 181056 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111779;111780;111781;111782;111783;111784;111785;111786;111787;111788 111784 9 EGVKFDESEKTK Unmodified 1395.6882 0.6881745 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 2 2 1 14.508 14.508 2;3 0.020501 6763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.989 51.601 208100000 0 0 0 0 0 0 0 128320000 79779000 0 0 0 0 9944 2079 9307 88048;88049;88050 111789;111790;111791 111789 3 EGVKTENDHINLK Unmodified 1495.7631 0.76307078 563 A8MUA9;A8MU27;P55854 SUMO3 Small ubiquitin-related modifier 3 yes no 0 0 1 1 18.394 18.394 3 0.040495 11117 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.106 42.164 50467000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50467000 0 0 9945 563 9308 88051 111792 111792 0 EGVLYVGSK Unmodified 950.5073 0.50729701 2410;3170 P37840;E7EPV7;D6RA31;Q16143 SNCA;SNCB Alpha-synuclein;Beta-synuclein no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 39.13 39.13 1;2 0.0010925 35115 QUIQUE_C1368_190116_001 106.93 80.703 18278000000 2127500000 2007200000 1148200000 1620500000 1456600000 916390000 1656300000 1222000000 1146500000 577990000 1362500000 1126200000 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88110;88111;88112;88113;88114;88115;88116;88117;88118;88119;88120;88121;88122;88123;88124;88125;88126;88127;88128;88129;88130;88131 111857;111858;111859;111860;111861;111862;111863;111864;111865;111866;111867;111868;111869;111870;111871;111872;111873;111874;111875;111876;111877;111878;111879;111880;111881;111882;111883 111863 21 EGVVQGVASVAEK Unmodified 1271.6721 0.67213051 3170 Q16143 SNCB Beta-synuclein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.428 57.428 2 0.00032416 56844 QUIQUE_C1438_190116_001 136.5 85.523 13616000000 1439600000 1578000000 756940000 1115700000 1347100000 0 981170000 960590000 1015800000 379740000 1474000000 899410000 1668400000 9954 3170 9317 88132;88133;88134;88135;88136;88137;88138;88139;88140;88141;88142;88143 111884;111885;111886;111887;111888;111889;111890;111891;111892;111893;111894;111895;111896;111897;111898;111899 111890 14 EGVYELATFQMK Unmodified 1414.6803 0.68025235 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 110.63 110.63 2 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111915;111916;111917 111916 2947 2 EGVYELATFQMKPGGPALWGDAFKR Unmodified 2767.3792 0.37920673 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 2 1 2 1 1 134.56 134.56 3;4 5.9979E-05 137889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.029 43.231 323030000 0 0 0 0 0 0 0 83120000 108470000 0 0 70547000 60892000 9958 4419 9320 88162;88163;88164;88165;88166 111918;111919;111920;111921;111922 111918 5 EGVYELAVFQMK Unmodified 1412.701 0.70098779 4009 Q9BS92 NIPSNAP3B Protein NipSnap homolog 3B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.8 126.8 2 0.00122 131285 QUIQUE_C1368_190116_001 82.749 58.406 170160000 0 41114000 34774000 41569000 26945000 0 25761000 0 0 0 0 0 0 9959 4009 9321 88167;88168;88169;88170;88171;88172;88173 111923;111924;111925;111926;111927;111928;111929;111930 111925 6 EGVYTVFAPTNEAFR Unmodified 1699.8206 0.82058566 3146 Q15582;H0Y8L3 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 0 1 114.62 114.62 2 0.01764 111411 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.344 37.925 0 0 0 0 0 0 0 0 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EGWPNSPYGVSK Unmodified 1319.6146 0.61461563 1659 O75828 CBR3 Carbonyl reductase [NADPH] 3 yes yes 0 0 0 1 66.104 66.104 2 0.004922 66024 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.441 52.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9963 1659 9325 88193 111959 111959 1 EGWPSSAYGVTK Unmodified 1280.6037 0.60371659 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.675 65.675 2 0.0038048 65129 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.03 49.582 11454000000 0 0 0 0 1473500000 1454900000 1588700000 1348500000 1645100000 559410000 0 1345200000 2038200000 9964 2102 9326 88194;88195;88196;88197;88198;88199;88200;88201 111960;111961;111962;111963;111964;111965;111966;111967;111968;111969;111970;111971;111972;111973;111974;111975 111966 16 EGYAWAEDKEHCEEYGR Unmodified 2127.8592 0.85923236 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 1 3 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 47.195 47.195 2;3;4 0 44666 QUIQUE_C1218_190116_001 338.12 324.09 1956900000 542700000 175380000 140460000 150390000 72628000 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112001;112002;112003;112004;112005;112006;112007;112008;112009;112010;112011;112012;112013;112014;112015;112016;112017;112018;112019;112020;112021;112022;112023;112024;112025;112026;112027;112028;112029;112030 112019 29 EGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPK Unmodified 3751.7941 0.79405992 2933 Q09028 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 152.2 152.2 4 0.00053478 156592 QUIQUE_DMIX7_190116_001 33.727 28.821 424050000 0 0 0 0 0 0 73056000 63913000 70171000 0 0 126870000 90041000 9967 2933 9329 88249;88250;88251;88252;88253 112031;112032;112033;112034;112035 112034 4 EGYLQIGANTQAAQK Unmodified 1590.8002 0.80018457 2205 P23141;H3BQV8;A0A140TA63 CES1 Liver carboxylesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 59.101 59.101 2 0.02875 57116 QUIQUE_C1403_190116_001 45.004 26.332 45538000 0 0 0 32671000 0 0 0 0 0 12866000 0 0 0 9968 2205 9330 88254;88255 112036;112037 112036 2 EGYSGVGLLSR Unmodified 1136.5826 0.58258722 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359 APEX1 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112060;112061;112062;112063;112064;112065;112066;112067;112068;112069;112070;112071 112069 9 EHALAQAELLKR Unmodified 1377.7728 0.7728476 1483 O15126;A0A087WXB0;A0A087WTX8;A0A087WZA6 SCAMP1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 yes no 0 0 1 1 30.938 30.938 3 0.0009562 25722 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.69 72.29 45182000 0 0 0 0 0 0 0 45182000 0 0 0 0 0 9974 1483 9336 88288 112072 112072 0 EHALLAYTLGVK Unmodified 1313.7343 0.73433683 2794;469 A0A2U3TZH3;Q05639;A0A2R8Y488;A0A2R8Y660;P68104;Q5VTE0;A0A087WV01 EEF1A2;EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 2;Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha no no 0 0 0 3 5 3 4 3 3 5 6 4 3 5 3 2 76.66 76.66 2;3 1.7394E-45 76743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 232.84 208.06 36999000000 1801400000 2340800000 4006200000 2979800000 2448000000 2376400000 3462300000 2427600000 3188200000 1076600000 4492900000 3426700000 2972200000 9975 469;2794 9337 88289;88290;88291;88292;88293;88294;88295;88296;88297;88298;88299;88300;88301;88302;88303;88304;88305;88306;88307;88308;88309;88310;88311;88312;88313;88314;88315;88316;88317;88318;88319;88320;88321;88322;88323;88324;88325;88326;88327;88328;88329;88330;88331;88332;88333;88334;88335;88336;88337 112073;112074;112075;112076;112077;112078;112079;112080;112081;112082;112083;112084;112085;112086;112087;112088;112089;112090;112091;112092;112093;112094;112095;112096;112097;112098;112099;112100;112101;112102;112103;112104;112105;112106;112107;112108;112109;112110;112111;112112;112113;112114;112115;112116;112117;112118;112119;112120;112121;112122;112123;112124;112125;112126;112127;112128;112129;112130;112131;112132;112133;112134;112135;112136;112137;112138;112139;112140;112141;112142;112143;112144;112145;112146;112147;112148;112149;112150;112151;112152;112153;112154;112155;112156;112157 112121 83 EHAPSIIFMDEIDSIGSSR Unmodified 2102.9943 0.99426928 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 132.15 132.15 2;3 8.0636E-37 135130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.59 104.58 1764100000 161800000 180550000 149670000 139700000 109480000 129610000 185930000 123010000 118440000 48807000 100570000 134060000 182530000 9976 2743 9338 88338;88339;88340;88341;88342;88343;88344;88345;88346;88347;88348;88349;88350;88351;88352;88353;88354;88355;88356 112158;112159;112160;112161;112162;112163;112164;112165;112166;112167;112168;112169;112170;112171;112172;112173;112174;112175;112176;112177;112178;112179;112180 112173 22 EHASIDAQSGAGVPNPSTSASPK Unmodified 2207.0455 0.045453228 3549 Q8IXJ6 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 40.206 40.206 2;3 2.7915E-248 36947 QUIQUE_C1218_190116_001 268.2 242.21 1207900000 152180000 130400000 132180000 72283000 125760000 0 109960000 63973000 80139000 65600000 105360000 75775000 94268000 9977 3549 9339 88357;88358;88359;88360;88361;88362;88363;88364;88365;88366;88367;88368;88369;88370;88371 112181;112182;112183;112184;112185;112186;112187;112188;112189;112190;112191;112192;112193;112194;112195;112196;112197;112198;112199 112182 19 EHASSLASAGLK Unmodified 1169.6041 0.60405094 1479 O15083;H7C4G9 ERC2 ERC protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 19.864 19.864 2 0.0033196 12639 QUIQUE_C1368_190116_001 72.434 51.487 157630000 0 51152000 38623000 0 0 0 67859000 0 0 0 0 0 0 9978 1479 9340 88372;88373;88374 112200;112201;112202 112201 3 EHASSLASSGLK Unmodified 1185.599 0.59896556 1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2 ERC1 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 16.591 16.591 2 0.0022521 8788 QUIQUE_C1277_190116_001 81.771 63.368 39349000 0 0 19523000 0 0 0 19826000 0 0 0 0 0 0 9979 1107 9341 88375;88376;88377;88378;88379;88380;88381;88382 112203;112204;112205;112206;112207;112208;112209;112210 112203 8 EHAVEGDCDFQLLK Unmodified 1659.7563 0.75627084 748 C9JV77;P02765 AHSG 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P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 26.807 26.807 2 0.057511 21126 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.853 34.876 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9985 2657 9346 88421 112251 112251 1 EHDVQNTFEELEK Unmodified 1616.7318 0.73183023 3594 Q8N4T8;H0Y962 CBR4 Carbonyl reductase family member 4 yes no 0 0 0 1 68.095 68.095 3 0.00049299 68055 QUIQUE_C1218_190116_001 55.98 40.039 33216000 33216000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9986 3594 9347 88422 112252 112252 1 EHDYRDEHFDFIQSHIR Unmodified 2243.0144 0.014427871 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 64.196 64.196 3;5 0.0001053 63581 QUIQUE_C1277_190116_001 80.738 71.048 581380000 39838000 108490000 66872000 58008000 56576000 69216000 0 0 39409000 28268000 69437000 45264000 0 9987 4653 9348 88423;88424;88425;88426;88427;88428;88429;88430;88431;88432;88433 112253;112254;112255;112256;112257;112258;112259;112260;112261;112262;112263;112264;112265;112266;112267 112255 14 EHDYRDEHLDFIQSHLR Unmodified 2209.0301 0.030077935 1515 O43237;B4E2E0 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 1 2 3 3 3 3 2 3 1 3 2 1 2 3 63.853 63.853 3;4;5 1.1711E-37 63165 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.43 152.48 3565400000 255730000 490180000 483140000 381510000 339820000 170670000 389120000 105430000 290840000 145890000 66028000 169330000 277750000 9988 1515 9349 88434;88435;88436;88437;88438;88439;88440;88441;88442;88443;88444;88445;88446;88447;88448;88449;88450;88451;88452;88453;88454;88455;88456;88457;88458;88459;88460;88461;88462;88463;88464 112268;112269;112270;112271;112272;112273;112274;112275;112276;112277;112278;112279;112280;112281;112282;112283;112284;112285;112286;112287;112288;112289;112290;112291;112292;112293;112294;112295;112296;112297;112298;112299;112300;112301;112302;112303;112304;112305;112306;112307 112299 36 EHEEFQITAK Unmodified 1230.5881 0.58806652 1674 O75962;E7EWP2;E7EPJ7;F5H228 TRIO Triple functional domain protein yes no 0 0 0 1 29.952 29.952 3 0.025803 24508 QUIQUE_C1218_190116_001 41.664 33.532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9989 1674 9350 88465 112308 112308 1 EHEHVVECISWAPESSYSSISEATGSETK Unmodified 3235.4252 0.42516646 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 96.782 96.782 3;4 3.5626E-45 99238 QUIQUE_C1277_190116_001 134.4 126.59 1032800000 63063000 201220000 177560000 156880000 148640000 125600000 159880000 0 0 0 0 0 0 9990 2460 9351 88466;88467;88468;88469;88470;88471;88472;88473;88474;88475;88476;88477;88478 112309;112310;112311;112312;112313;112314;112315;112316;112317;112318;112319;112320;112321;112322;112323 112311 13 EHEHVVECISWAPESSYSSISEATGSETKK Unmodified 3363.5201 0.52012948 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.754 84.754 4 2.0196E-35 86515 QUIQUE_C1368_190116_001 115.69 108.68 387230000 0 0 62125000 41309000 63580000 0 52919000 48369000 0 0 0 55157000 63772000 9991 2460 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112341;112342;112343;112344;112345;112346;112347;112348;112349;112350;112351;112352;112353;112354;112355;112356;112357;112358 112342 17 EHFAQFGHVR Unmodified 1226.5945 0.59448931 40 A0A087WUN7;H0YJ40;G3V4X6;G3V2S9;Q9GZT3;H0YJW7;H0YJ07;H0YJU7 SLIRP SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 22.846 22.846 2;3 0.0033397 16390 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.01 96.314 48018000 0 0 0 0 0 0 0 48018000 0 0 0 0 0 9994 40 9355 88507;88508;88509 112359;112360;112361 112360 2 EHFFDLYR Unmodified 1125.5243 0.52434406 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.624 76.624 3 0.0078407 77031 QUIQUE_C1403_190116_001 63.48 46.24 9071600 0 0 0 9071600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9995 1255;2856 9356 88510;88511;88512;88513;88514;88515;88516;88517;88518;88519 112362;112363;112364;112365;112366;112367;112368;112369;112370;112371 112363 10 EHFQDDVFNEK Unmodified 1406.6103 0.61025853 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 48.697 48.697 2;3 0.00038223 44870 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.815 64.331 447670000 33661000 30793000 70919000 77590000 24619000 51054000 21318000 0 29010000 29864000 27239000 16995000 34611000 9996 2465 9357 88520;88521;88522;88523;88524;88525;88526;88527;88528;88529;88530;88531;88532;88533;88534 112372;112373;112374;112375;112376;112377;112378;112379;112380;112381;112382;112383;112384;112385;112386 112381 14 EHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLK Unmodified 3472.4824 0.48236376 3055;1065 Q14240;E7EQG2;E7EMV8;E9PBH4;C9JUF0;F8WE11 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.49 167.49 3 6.7125E-157 171055 QUIQUE_C1277_190116_001 196.08 190.92 1266300000 26684000 115660000 0 0 62610000 65732000 99271000 104730000 172110000 0 297660000 161300000 160550000 9997 3055;1065 9358 88535;88536;88537;88538;88539;88540;88541;88542;88543;88544 112387;112388;112389;112390;112391;112392;112393;112394;112395;112396;112397 112388 11 EHGGPEGMDPDGVIESNWNEIVDNFDDMNLK Oxidation (M) 3488.4773 0.47727839 3055;1065 Q14240;E7EQG2;E7EMV8;E9PBH4;C9JUF0;F8WE11 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 1 0 1 163.47 163.47 3 1.6657E-25 165726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.123 85.408 37607000 0 0 0 0 0 0 0 37607000 0 0 0 0 0 9998 3055;1065 9358 88545 112398 112398 628 1 EHGLIFMETSAK Unmodified 1361.6649 0.66493664 2707;3697 P61019;H7C125;Q8WUD1;A0A3B3ITL1 RAB2A;RAB2B Ras-related protein Rab-2A;Ras-related protein Rab-2B no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 60.534 60.534 2;3 4.8693E-06 60122 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.86 155.77 3761200000 318480000 371910000 392380000 174430000 278360000 286270000 351440000 226640000 313380000 87930000 397720000 162810000 399460000 9999 2707;3697 9359 88546;88547;88548;88549;88550;88551;88552;88553;88554;88555;88556;88557;88558;88559;88560;88561;88562;88563;88564;88565;88566;88567;88568;88569 112399;112400;112401;112402;112403;112404;112405;112406;112407;112408;112409;112410;112411;112412;112413;112414;112415;112416;112417;112418;112419;112420;112421;112422;112423;112424;112425;112426 112416 24 EHGLNPDVVQNIQDICNSK Unmodified 2179.0328 0.032780052 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 91.184 91.184 3 0.0089932 92273 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.919 41.969 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10000 3453 9360 88570 112427 112427 1 EHGPENIVMAIAGNK Unmodified 1578.7824 0.78242601 3021 Q13636 RAB31 Ras-related protein Rab-31 yes yes 0 0 0 1 1 84.722 84.722 3 0.00053172 85056 QUIQUE_C1563_190116_001 51.03 33.819 37580000 0 16843000 0 0 0 20737000 0 0 0 0 0 0 0 10001 3021 9361 88571;88572 112428;112429 112429 1 EHGQIEFYR Unmodified 1177.5516 0.55162144 3498 Q86VN1;A0A3B3ISW7 VPS36 Vacuolar protein-sorting-associated protein 36 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 34.318 34.318 3 0.029699 29100 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.922 20.307 71284000 0 0 0 0 0 15757000 0 0 0 9486500 29456000 0 16584000 10002 3498 9362 88573;88574;88575;88576;88577 112430;112431;112432;112433;112434 112434 5 EHHFEAIALVEK Unmodified 1421.7303 0.73031409 1528 O43488;H3BLU7 AKR7A2 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 50.427 50.427 2;3 1.6327E-146 49486 QUIQUE_C1218_190116_001 265.01 228.32 9337200000 957590000 670260000 747130000 750280000 704870000 683200000 628920000 745530000 773610000 399410000 790310000 633680000 852420000 10003 1528 9363 88578;88579;88580;88581;88582;88583;88584;88585;88586;88587;88588;88589;88590;88591;88592;88593;88594;88595;88596;88597;88598;88599;88600;88601;88602;88603;88604 112435;112436;112437;112438;112439;112440;112441;112442;112443;112444;112445;112446;112447;112448;112449;112450;112451;112452;112453;112454;112455;112456;112457;112458;112459;112460;112461;112462;112463;112464;112465;112466;112467;112468;112469;112470;112471;112472;112473;112474;112475;112476;112477;112478;112479;112480;112481;112482;112483;112484;112485;112486;112487 112436 53 EHHFGSSGMTLHER Unmodified 1623.7212 0.72122274 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 0 0 2 1 1 18.395 18.395 3;4 0.0058762 10923 QUIQUE_C1218_190116_001 47.774 42.059 130300000 55980000 43508000 0 0 0 0 0 30813000 0 0 0 0 0 10004 504 9364 88605;88606;88607;88608 112488;112489;112490;112491 112489 4 EHHFGSSGMTLHER Oxidation (M) 1639.7161 0.71613736 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 10.476 10.476 3;4 0.00012958 2868 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.566 79.675 139740000 0 6432800 0 0 0 0 0 41146000 29734000 11732000 0 50698000 0 10005 504 9364 88609;88610;88611;88612;88613;88614 112492;112493;112494;112495;112496;112497 112494 357 6 EHHTTGLTWSK Unmodified 1295.6258 0.62584901 2422 P40123;E9PDI2;F8WDB9 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 2 2 2 2 17.26 17.26 2;3 0.00062439 9570 QUIQUE_C1277_190116_001 97.565 51.885 2250400000 86920000 295560000 47742000 355140000 242330000 39669000 0 0 150220000 137430000 169030000 286350000 440030000 10006 2422 9365 88615;88616;88617;88618;88619;88620;88621;88622;88623;88624;88625;88626;88627;88628;88629;88630;88631;88632;88633 112498;112499;112500;112501;112502;112503;112504;112505;112506;112507;112508;112509;112510;112511;112512;112513;112514;112515;112516;112517 112500 15 EHIEELLR Unmodified 1037.5506 0.55055881 2717 P61201;B4DIH5;H0YMC2 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.997 44.997 2 0.00062973 42835 QUIQUE_C1218_190116_001 152.41 39.819 856190000 87006000 0 87604000 113670000 88333000 73375000 96270000 47323000 0 0 92262000 72831000 97518000 10007 2717 9366 88634;88635;88636;88637;88638;88639;88640;88641;88642;88643 112518;112519;112520;112521;112522;112523;112524;112525;112526;112527;112528 112518 11 EHIEQQIQTYQR Unmodified 1571.7692 0.76921879 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 36.449 36.449 2 0.00017633 32210 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.83 61.369 86055000 0 29519000 30907000 0 0 25628000 0 0 0 0 0 0 0 10008 173 9367 88644;88645;88646;88647;88648;88649;88650;88651 112529;112530;112531;112532;112533;112534;112535;112536;112537 112535 9 EHIKNPDWR Unmodified 1193.5942 0.59415496 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 16.438 16.438 3 0.017019 8786 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.278 43.064 548680000 22914000 67172000 0 0 0 0 0 0 0 0 306310000 152280000 0 10009 3090 9368 88652;88653;88654;88655 112538;112539;112540;112541 112540 4 EHILPSLAHLLPALDCLEGSTPGL Unmodified 2552.3309 0.33085955 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 164.91 164.91 3 1.1159E-06 169356 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.723 53.423 445540000 0 0 0 68583000 266180000 0 0 0 51414000 0 0 0 59362000 10010 4012 9369 88656;88657;88658;88659 112542;112543;112544;112545 112545 3 EHIMQMLQNPDWK Unmodified 1668.7752 0.77523214 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 1 92.371 92.371 2;3 0.00046282 95612 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.215 80.187 409580000 40832000 40547000 44132000 37689000 69685000 0 40389000 23664000 0 0 70670000 0 41971000 10011 1403 9370 88660;88661;88662;88663;88664;88665;88666;88667;88668;88669;88670;88671 112546;112547;112548;112549;112550;112551;112552;112553;112554;112555;112556;112557;112558;112559 112557 14 EHINLGCDMDFDIAGPSIR Oxidation (M) 2174.9725 0.97248798 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 0 1 0 2 2 2 1 1 1 1 101.95 101.95 2;3 3.1097E-16 104761 QUIQUE_DMIX8_190116_001 124.45 109.89 1157700000 208060000 0 251620000 210860000 0 191350000 0 0 0 99478000 0 153160000 43138000 10012 726;2185 9371 88672;88673;88674;88675;88676;88677;88678;88679;88680;88681 112560;112561;112562;112563;112564;112565;112566;112567;112568;112569;112570 112570 435 7 EHINLGCDMDFDIAGPSIR Unmodified 2158.9776 0.97757336 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 0 0 0 3 4 2 2 3 3 2 5 4 2 5 2 3 121.21 121.21 2;3 2.2741E-74 127700 QUIQUE_C1576_190116_001 150.7 145.61 4901600000 493370000 441820000 373960000 435370000 299640000 526400000 342000000 230350000 421570000 182410000 537770000 341570000 275360000 10013 726;2185 9371 88682;88683;88684;88685;88686;88687;88688;88689;88690;88691;88692;88693;88694;88695;88696;88697;88698;88699;88700;88701;88702;88703;88704;88705;88706;88707;88708;88709;88710;88711;88712;88713;88714;88715;88716;88717;88718;88719;88720;88721 112571;112572;112573;112574;112575;112576;112577;112578;112579;112580;112581;112582;112583;112584;112585;112586;112587;112588;112589;112590;112591;112592;112593;112594;112595;112596;112597;112598;112599;112600;112601;112602;112603;112604;112605;112606;112607;112608;112609;112610;112611;112612;112613;112614;112615;112616;112617;112618;112619;112620;112621;112622;112623;112624;112625;112626;112627;112628;112629;112630;112631;112632;112633;112634;112635;112636;112637;112638;112639;112640;112641;112642;112643;112644;112645;112646;112647;112648;112649;112650;112651;112652;112653;112654;112655 112618 81 EHIPGTLR Unmodified 921.50321 0.50321468 1399 O00330;E9PLU0;E9PRI6 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.873 19.873 2 0.018116 12565 QUIQUE_C1368_190116_001 80.462 52.244 288520000 0 86563000 92042000 0 66653000 0 0 0 0 0 0 43261000 0 10014 1399 9372 88722;88723;88724;88725 112656;112657;112658;112659 112657 4 EHLAQLQEK Unmodified 1094.572 0.57202253 3734 Q92561;E5RHN5 PHYHIP Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein yes no 0 0 0 1 16.212 16.212 3 0.0034629 8643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.358 80.346 18823000 0 0 0 0 0 0 0 18823000 0 0 0 0 0 10015 3734 9373 88726 112660 112660 0 EHLDENSPLGDLLR Unmodified 1606.7951 0.79509919 2143 P19174;A0A0D9SEK2 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1 yes no 0 0 0 1 99.908 99.908 2 0.013657 102685 QUIQUE_C1277_190116_001 71.555 55.665 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10016 2143 9374 88727 112661 112661 1 EHLELFWSR Unmodified 1215.6037 0.60365701 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 3 3 3 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 88.137 88.137 2;3 8.1799E-26 89535 QUIQUE_C1403_190116_001 204.27 191.64 5123100000 655940000 693300000 547320000 484090000 633330000 475490000 0 192640000 253730000 167200000 384900000 376260000 258870000 10017 50 9375 88728;88729;88730;88731;88732;88733;88734;88735;88736;88737;88738;88739;88740;88741;88742;88743;88744;88745;88746;88747;88748;88749;88750;88751;88752;88753;88754;88755;88756;88757;88758 112662;112663;112664;112665;112666;112667;112668;112669;112670;112671;112672;112673;112674;112675;112676;112677;112678;112679;112680;112681;112682;112683;112684;112685;112686;112687;112688;112689;112690;112691;112692;112693;112694;112695;112696;112697;112698;112699;112700;112701;112702;112703;112704;112705;112706 112675 45 EHLIDELDYILLPTEGWNK Unmodified 2297.158 0.15796379 4605 Q9Y4E8;F8W0H4;H0YI31;F8VZG8 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 0 1 161.14 161.14 3 0.056283 166592 QUIQUE_C1368_190116_001 24.793 13.347 77365000 0 0 77365000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10018 4605 9376 88759 112707 112707 1 EHLIDELDYVLVPTEAWNK Unmodified 2283.1423 0.14231373 2965 Q13107;C9JNU9 USP4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 yes no 0 0 0 1 152.23 152.23 3 0.0096436 158025 QUIQUE_C1576_190116_001 37.292 29.67 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10019 2965 9377 88760 112708 112708 1 EHLIENEVSILR Unmodified 1450.778 0.77799256 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 3 3 1 2 3 1 1 1 1 75.313 75.313 2;3 0.00026142 76025 QUIQUE_C1277_190116_001 85.924 78.495 174800000 0 60365000 0 0 38018000 0 0 0 53382000 23036000 0 0 0 10020 3596 9378 88761;88762;88763;88764;88765;88766;88767;88768;88769;88770;88771;88772;88773;88774;88775;88776;88777 112709;112710;112711;112712;112713;112714;112715;112716;112717;112718;112719;112720;112721;112722;112723;112724;112725 112711 16 EHLILVSQLEQLHR Unmodified 1713.9526 0.95260288 4013 Q9BSJ2;F2Z2B9 TUBGCP2 Gamma-tubulin complex component 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.599 87.599 3 3.0445E-05 88264 QUIQUE_C1563_190116_001 113.76 105.78 258780000 16575000 32933000 0 25211000 33828000 27450000 37787000 0 0 0 47768000 37231000 0 10021 4013 9379 88778;88779;88780;88781;88782;88783;88784;88785;88786 112726;112727;112728;112729;112730;112731;112732;112733;112734 112730 7 EHLLDDEEEDEEIMR Unmodified 1900.7997 0.7996518 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 78.528 78.528 3 0.035698 79673 QUIQUE_C1218_190116_001 33.724 29.82 17885000 17885000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10022 4604 9380 88787 112735 112735 1 EHLLLAR Unmodified 850.50249 0.5024864 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.051 24.051 2 0.0083371 17783 QUIQUE_C1277_190116_001 153.67 81.651 3239900000 427030000 320480000 580980000 0 0 0 0 289430000 378910000 0 475050000 444600000 323430000 10023 2529 9381 88788;88789;88790;88791;88792;88793;88794;88795 112736;112737;112738;112739;112740;112741;112742;112743 112737 8 EHLLMALADLDELLIR Oxidation (M) 1880.0077 0.0077344999 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 1 0 1 1 1 2 2 2 1 1 1 1 165.8 165.8 3 2.4449E-19 171867 QUIQUE_C1438_190116_001 143.46 125.54 370510000 26340000 47864000 42376000 42955000 55386000 34012000 53102000 10433000 21046000 0 36995000 0 0 10024 2834 9382 88796;88797;88798;88799;88800;88801;88802;88803;88804;88805;88806;88807;88808 112744;112745;112746;112747;112748;112749;112750;112751;112752;112753;112754;112755;112756;112757 112750 2269 12 EHLLMALADLDELLIR Unmodified 1864.0128 0.012819878 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 2 166.05 166.05 2;3 1.5906E-10 173110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.41 86.926 82539000 0 0 0 0 0 0 0 0 52973000 0 29565000 0 0 10025 2834 9382 88809;88810;88811 112758;112759;112760 112759 3 EHLLMALAGIDTLLIR Unmodified 1778.0124 0.012425947 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 155.08 155.08 3 0.0003699 159799 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.978 58.781 127130000 12467000 14507000 0 0 0 0 0 0 10064000 0 30729000 59366000 0 10026 2834 9383 88812;88813;88814;88815;88816;88817 112761;112762;112763;112764;112765;112766 112766 3 EHLLMALAGIDTLLIR Oxidation (M) 1794.0073 0.0073405694 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 149.56 149.56 3 3.2285E-08 155959 QUIQUE_C1438_190116_001 120.3 101.57 393990000 0 87290000 82336000 0 97746000 35261000 0 58018000 0 33335000 0 0 0 10027 2834 9383 88818;88819;88820;88821;88822;88823 112767;112768;112769;112770;112771;112772 112769 2270 5 EHLLMYLEK Unmodified 1174.6056 0.60563084 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 68.549 68.549 2;3 6.377E-44 66158 QUIQUE_DMIX4_190116_001 215.88 165.08 4648300000 489680000 421520000 535660000 532320000 440910000 481770000 497360000 185020000 59245000 121690000 426670000 52181000 404240000 10028 4356 9384 88824;88825;88826;88827;88828;88829;88830;88831;88832;88833;88834;88835;88836;88837;88838;88839;88840;88841;88842;88843 112773;112774;112775;112776;112777;112778;112779;112780;112781;112782;112783;112784;112785;112786;112787;112788;112789;112790;112791;112792;112793 112789 15 EHLLMYLEK Oxidation (M) 1190.6005 0.60054547 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 61.466 61.466 2;3 4.2451E-07 60656 QUIQUE_C1368_190116_001 159.58 111.72 786020000 0 108260000 144440000 104160000 97879000 87954000 0 0 63473000 0 93565000 86290000 0 10029 4356 9384 88844;88845;88846;88847;88848;88849;88850;88851;88852 112794;112795;112796;112797;112798;112799;112800;112801;112802;112803 112795 2915 10 EHLLSYLEK Unmodified 1130.5972 0.59717465 4333 Q9NYL9 TMOD3 Tropomodulin-3 yes yes 0 0 0 1 1 60.528 60.528 3 0.015384 58755 QUIQUE_C1368_190116_001 50.034 34.826 20078000 0 0 11734000 0 0 0 0 0 0 8344400 0 0 0 10030 4333 9385 88853;88854 112804;112805 112804 2 EHLLTNHLK Unmodified 1103.6087 0.60874239 1992 P10155 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 15.259 15.259 2;3 0.00048677 7601 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.99 28.155 522400000 0 91272000 0 68835000 0 75637000 0 0 109710000 0 0 176950000 0 10031 1992 9386 88855;88856;88857;88858;88859;88860;88861;88862;88863;88864 112806;112807;112808;112809;112810;112811;112812;112813;112814;112815 112815 10 EHLLVSIPLLINHLQAESIVVHTYAAHALER Unmodified 3485.9147 0.91470782 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 153.96 153.96 5 2.7247E-37 161646 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.43 96.137 36084000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36084000 0 0 10032 2657 9387 88865 112816 112816 1 EHLPAPGDDVLVLLCGPPPMVQLACHPNLDK Unmodified 3401.6934 0.69342335 4437 Q9UHQ9 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 148.33 148.33 4 5.3197E-09 152796 QUIQUE_C1403_190116_001 60.527 55.367 506170000 0 61955000 71358000 101640000 0 39905000 88735000 0 81619000 0 0 0 60954000 10033 4437 9388 88866;88867;88868;88869;88870;88871;88872 112817;112818;112819;112820;112821;112822;112823;112824 112819 8 EHMGDILYK Oxidation (M) 1120.5223 0.52229515 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 21.101 21.101 3 0.00097233 14178 QUIQUE_C1368_190116_001 91.069 71.307 721080000 58536000 89265000 75338000 72251000 106340000 0 0 0 66981000 0 124180000 0 128200000 10034 2414 9389 88873;88874;88875;88876;88877;88878;88879;88880 112825;112826;112827;112828;112829;112830;112831;112832;112833 112827 1821 8 EHMGDILYK Unmodified 1104.5274 0.52738052 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 1 40.461 40.461 1;2;3 4.3078E-05 36574 QUIQUE_C1403_190116_001 147.19 123.23 7388500000 716480000 749170000 598790000 676060000 573160000 586220000 803460000 453950000 372090000 98021000 913760000 631600000 215750000 10035 2414 9389 88881;88882;88883;88884;88885;88886;88887;88888;88889;88890;88891;88892;88893;88894;88895;88896;88897;88898;88899;88900;88901;88902;88903;88904;88905 112834;112835;112836;112837;112838;112839;112840;112841;112842;112843;112844;112845;112846;112847;112848;112849;112850;112851;112852;112853;112854;112855;112856;112857;112858;112859;112860;112861;112862;112863;112864;112865;112866 112843 32 EHMIQNEVSILR Unmodified 1467.7504 0.7503976 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 62.531 62.531 2;3 9.9259E-05 63225 QUIQUE_C1218_190116_001 138.22 101.53 274900000 0 0 32392000 57576000 41136000 0 71861000 0 0 0 33988000 37947000 0 10036 1478 9390 88906;88907;88908;88909;88910;88911;88912;88913;88914;88915 112867;112868;112869;112870;112871;112872;112873;112874;112875;112876;112877 112867 11 EHMIQNEVSILR Oxidation (M) 1483.7453 0.74531222 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 1 0 1 52.625 52.625 3 0.0022207 47835 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112913;112914;112915;112916;112917;112918;112919;112920;112921;112922;112923;112924;112925;112926;112927;112928;112929;112930;112931;112932 112928 19 EHNGQVTGIDWAPESNR Unmodified 1908.8715 0.87145203 369;1485 A0A1W2PNV4;O15143;C9JEY1;C9K057;C9JBJ7;C9J4Z7;F8VXW2;C9JQM8;C9JFG9;C9J6C8;C9JTT6 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B no no 0 0 0 1 60.848 60.848 3 0.02399 56542 QUIQUE_DMIX4_190116_001 27.7 17.912 19711000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19711000 0 0 0 10042 369;1485 9394 88966 112933 112933 0 EHNLQVLGLVK Unmodified 1248.719 0.71902112 3760 Q92859;Q59FP8 NEO1 Neogenin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.219 66.219 2;3 0.00015645 66142 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.76 106.08 189060000 25567000 21452000 32744000 0 0 0 24400000 17310000 0 0 39734000 27855000 0 10043 3760 9395 88967;88968;88969;88970;88971;88972;88973;88974;88975 112934;112935;112936;112937;112938;112939;112940;112941;112942;112943 112938 10 EHNPTQYEER Unmodified 1301.5636 0.56364269 4117 Q9H0C8;F8SNU7;H7C2I8 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113048;113049;113050;113051;113052;113053;113054;113055;113056;113057;113058;113059;113060;113061;113062;113063;113064;113065;113066;113067;113068;113069;113070 113055 18 EHSSLAFWK Unmodified 1103.54 0.53999412 1831 P02749;J3KS17;CON__P17690 APOH Beta-2-glycoprotein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.579 57.579 2;3 0.00069495 55825 QUIQUE_C1403_190116_001 77.318 63.019 219670000 64761000 0 30966000 14397000 17960000 0 8138300 6794800 0 11563000 25376000 17317000 22399000 10058 1831 9409 89089;89090;89091;89092;89093;89094;89095;89096;89097;89098;89099 113071;113072;113073;113074;113075;113076;113077;113078;113079;113080;113081;113082 113074 11 EHSSLGHADLDALQQNPQPLIFHMEMLK Unmodified 3198.559 0.55903836 1381 O00170;V9GYQ3 AIP AH receptor-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 121.75 121.75 4;5 0.023182 126666 QUIQUE_C1576_190116_001 23.62 17.459 110350000 0 40794000 0 0 0 0 69552000 0 0 0 0 0 0 10059 1381 9410 89100;89101 113083;113084 113084 2 EHSVFTGVAIVHCSSK Unmodified 1756.8567 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protein kinase 8 yes no 0 0 1 1 1 94.676 94.676 3 0.0129 96252 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.023 41.298 68637000 0 0 0 0 0 0 0 39313000 0 0 0 29323000 0 10064 397 9415 89111;89112 113095;113096 113095 2 EHTLAWK Unmodified 883.4552 0.45520186 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 20.951 20.951 2 0.042242 14217 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.297 38.297 32857000 0 0 0 0 0 0 0 32857000 0 0 0 0 0 10065 2194 9416 89113 113097 113097 1 EHTQLLQQSSSQK Unmodified 1512.7532 0.75323437 3406 Q6UWE0 LRSAM1 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 15.066 15.066 3 0.0001772 6781 QUIQUE_C1563_190116_001 87.831 68.153 46761000 0 0 0 31529000 0 15232000 0 0 0 0 0 0 0 10066 3406 9417 89114;89115;89116 113098;113099;113100 113100 2 EHVAHLLFLR Unmodified 1233.6982 0.6982261 2151 P19652 ORM2 Alpha-1-acid glycoprotein 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 58.268 58.268 2;3 1.3354E-14 55577 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.72 130.13 2176200000 260700000 145820000 170040000 95438000 463880000 61335000 107890000 108490000 81291000 68152000 372950000 82202000 157970000 10067 2151 9418 89117;89118;89119;89120;89121;89122;89123;89124;89125;89126;89127;89128;89129;89130;89131;89132 113101;113102;113103;113104;113105;113106;113107;113108;113109;113110;113111;113112;113113;113114;113115;113116;113117;113118;113119;113120;113121;113122 113120 21 EHVEEISELFYDAK Unmodified 1707.7992 0.79918151 4542 Q9Y265;H7C4G5 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 103.31 103.31 2;3 3.9416E-29 106171 QUIQUE_C1277_190116_001 175.74 149.07 375080000 0 68045000 0 45807000 0 50370000 74511000 20937000 26182000 32941000 27301000 0 28984000 10068 4542 9419 89133;89134;89135;89136;89137;89138;89139;89140;89141;89142;89143;89144 113123;113124;113125;113126;113127;113128;113129;113130;113131;113132;113133;113134;113135;113136;113137 113123 15 EHVESFFQK Unmodified 1149.5455 0.54547343 440 A6NFF4;A0A2R8Y6D7;Q9NS61 KCNIP2 Kv channel-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 41.101 41.101 2 2.9195E-06 37501 QUIQUE_C1218_190116_001 176.75 151.9 35379000 35379000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10069 440 9420 89145 113138 113138 1 EHVIANSGQFHCQR Unmodified 1681.7743 0.77432094 2662 P55160;F8W050 NCKAP1L Nck-associated protein 1-like yes no 0 0 0 1 17.714 17.714 3 0.0023607 10226 QUIQUE_C1368_190116_001 58.595 56.12 12336000 0 0 12336000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10070 2662 9421 89146 113139 113139 1 EHVIEALRR Unmodified 1121.6305 0.63054046 46 F8W7C6;A0A087WV22;X1WI28;P27635;H7C123;H7C2C5 RPL10 60S ribosomal protein L10 yes no 0 0 1 1 18.926 18.926 3 0.03838 11816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.344 0 28595000 0 0 0 0 0 0 0 0 28595000 0 0 0 0 10071 46 9422 89147 113140 113140 1 EHVKPLFNMEDK Unmodified 1485.7286 0.72859953 3028 Q13867;K7ES02;K7ESE8;J3KSD8 BLMH Bleomycin hydrolase yes no 0 0 1 1 36.6 36.6 2 0.010427 32480 QUIQUE_C1576_190116_001 79.148 62.575 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10072 3028 9423 89148 113141 113141 1 EHVMNEVDTNKDR Unmodified 1585.7155 0.71546866 21 E9PKG6;A0A087WSV8;P80303;H0YD18 NUCB2 Nucleobindin-2;Nesfatin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 14.699 14.699 3 2.592E-05 6477 QUIQUE_C1277_190116_001 120.53 109.89 56794000 14246000 16168000 0 0 16963000 0 0 0 0 0 0 0 9418000 10073 21 9424 89149;89150;89151;89152 113142;113143;113144;113145 113143 4 EHVPQLLLLLTAGQSEDSYLQAANALTR Unmodified 3050.6037 0.60366359 2037 P12111 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes yes 0 0 0 1 164.4 164.4 3 5.0627E-15 166268 QUIQUE_C1563_190116_001 75.703 69.476 20877000 0 0 0 0 0 20877000 0 0 0 0 0 0 0 10074 2037 9425 89153 113146;113147 113146 2 EHVYDLFEK Unmodified 1178.5608 0.56078914 3098 Q15020;F8VV04;F8W667;F8VVK9;F8VZM2 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 66.519 66.519 2;3 0.001203 67027 QUIQUE_C1438_190116_001 76.1 53.761 148260000 28628000 19078000 0 15514000 14569000 15729000 11896000 0 0 0 12338000 0 30510000 10075 3098 9426 89154;89155;89156;89157;89158;89159;89160;89161;89162;89163 113148;113149;113150;113151;113152;113153;113154;113155;113156;113157 113153 10 EHWNPAIVALVYNVLK Unmodified 1865.02 0.019954166 3180 Q16537 PPP2R5E Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 157.94 157.94 3 2.5898E-06 162881 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.38 90.858 212850000 0 82343000 43181000 0 0 0 0 0 51330000 0 0 35999000 0 10076 3180 9427 89164;89165;89166;89167 113158;113159;113160;113161 113160 4 EHWNPTIVALVYNVLK Unmodified 1895.0305 0.030518853 3118 Q15172 PPP2R5A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 156.98 156.98 3 4.8157E-06 161529 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.746 68.927 125140000 0 0 0 0 0 0 0 0 65059000 0 0 60081000 0 10077 3118 9428 89168;89169;89170 113162;113163;113164 113164 3 EHWSHDPFEAFK Unmodified 1528.6735 0.67352749 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GV31;F8WC59;C9JYZ0 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 69.88 69.88 2 0.012294 71073 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.103 34.36 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10078 2885 9429 89171 113165 113165 1 EHWSHDPFEAFKDSEGYIYAR Unmodified 2583.1455 0.14550162 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GV31;F8WC59;C9JYZ0 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 1 1 1 109.72 109.72 4 6.2575E-08 112295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.5 89.69 95643000 0 0 0 0 0 0 0 47392000 48252000 0 0 0 0 10079 2885 9430 89172;89173 113166;113167 113166 2 EHYVDLKDRPFFAGLVK Unmodified 2033.0734 0.0734463 3222;2092 P15531;E7ERL0;E5RHP0;Q32Q12;J3KPD9 NME1;NME1-NME2;NME2 Nucleoside diphosphate kinase A;Nucleoside diphosphate kinase no no 0 0 2 1 89.099 89.099 3 0.013408 90011 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.297 35.6 47837000 0 0 0 0 0 0 0 47837000 0 0 0 0 0 10080 2092;3222 9431 89174 113168 113168 1 EIAALHEICNHESVIK Unmodified 1861.9356 0.93563219 3684 Q8TDJ6;H0YLM8 DMXL2 DmX-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 66.415 66.415 3 0.037992 65998 QUIQUE_C1576_190116_001 32.091 20.948 104050000 0 55987000 0 0 0 0 48065000 0 0 0 0 0 0 10081 3684 9432 89175;89176 113169;113170 113170 2 EIADLGEALATAVIPQWQK Unmodified 2052.0892 0.089155943 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 163.42 163.42 2;3 8.685E-74 168599 QUIQUE_C1368_190116_001 250.13 241.41 5995800000 390910000 437800000 452850000 442420000 518050000 340070000 540730000 355890000 427100000 119260000 601860000 511710000 857150000 10082 2533 9433 89177;89178;89179;89180;89181;89182;89183;89184;89185;89186;89187;89188;89189;89190;89191;89192;89193;89194;89195;89196;89197;89198;89199;89200;89201;89202;89203 113171;113172;113173;113174;113175;113176;113177;113178;113179;113180;113181;113182;113183;113184;113185;113186;113187;113188;113189;113190;113191;113192;113193;113194;113195;113196;113197;113198;113199;113200;113201;113202;113203;113204;113205;113206;113207;113208;113209;113210;113211;113212;113213;113214;113215;113216;113217 113180 47 EIADLGEALATAVIPQWQKDELR Unmodified 2565.3439 0.34386708 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 156.97 156.97 3 1.7237E-05 161780 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.011 37.9 157550000 0 0 0 0 0 0 0 76152000 25097000 0 0 27206000 29091000 10083 2533 9434 89204;89205;89206;89207 113218;113219;113220;113221 113219 3 EIAEAYDVLSDPR Unmodified 1476.7096 0.70963822 2241 P25685 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.268 93.268 2 0.0029856 94746 QUIQUE_C1368_190116_001 94.465 70.435 37404000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37404000 0 0 0 10084 2241 9435 89208;89209;89210;89211;89212;89213;89214 113222;113223;113224;113225;113226;113227;113228 113224 7 EIAEAYLGGK Unmodified 1049.5393 0.53932542 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 54.465 54.465 2 0.0061575 49434 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.043 35.79 426030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 426030000 0 0 0 10085 2643 9436 89215;89216 113229;113230 113230 2 EIAEAYLGK Unmodified 992.51786 0.51786169 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 51.362 51.362 1;2 0.0021642 49860 QUIQUE_C1438_190116_001 96.19 27.706 21465000000 2236600000 2160200000 1992600000 2011700000 2159900000 1945000000 2073400000 548400000 1075600000 1143000000 1460500000 1196300000 1461600000 10086 2010 9437 89217;89218;89219;89220;89221;89222;89223;89224;89225;89226;89227;89228;89229;89230 113231;113232;113233;113234;113235;113236;113237;113238;113239;113240;113241;113242;113243;113244;113245;113246;113247;113248;113249 113238 18 EIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQR Unmodified 3000.4869 0.4869025 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 3 2 159.14 159.14 2;3 3.1808E-54 162986 QUIQUE_DMIX7_190116_001 193.9 173.25 9911800000 940870000 1046900000 834840000 744830000 986070000 1085700000 859670000 373160000 615730000 484480000 865340000 583330000 490900000 10087 282 9438 89231;89232;89233;89234;89235;89236;89237;89238;89239;89240;89241;89242;89243;89244;89245;89246;89247;89248;89249;89250;89251;89252;89253;89254;89255;89256;89257;89258;89259 113250;113251;113252;113253;113254;113255;113256;113257;113258;113259;113260;113261;113262;113263;113264;113265;113266;113267;113268;113269;113270;113271;113272;113273;113274;113275;113276;113277;113278;113279;113280;113281;113282;113283;113284;113285;113286;113287;113288;113289;113290;113291;113292;113293;113294;113295;113296;113297;113298;113299;113300 113296 49 EIAEELFTR Unmodified 1106.5608 0.56078914 2854 Q01433;H0Y360;H0YCL9;E9PIJ1;E9PJF6 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.743 84.743 2 0.0083817 87472 QUIQUE_C1438_190116_001 91.069 54.227 338490000 68763000 69611000 61549000 0 49933000 0 0 0 0 0 39646000 0 48989000 10088 2854 9439 89260;89261;89262;89263;89264;89265 113301;113302;113303;113304;113305;113306 113304 5 EIAEGMISEIR Oxidation (M) 1262.6177 0.61765209 1125 H0Y5G8;P0DPD6;P0DPD8 ECE2 yes no 0 1 0 1 1 1 2 51.711 51.711 2 0.0014911 45267 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.639 6.0917 718210000 0 0 428680000 0 0 150260000 0 0 0 0 0 0 139270000 10089 1125 9440 89266;89267;89268;89269;89270 113307;113308;113309;113310;113311 113310 651 4 EIAENALGK Unmodified 943.49746 0.4974606 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.287 27.287 2 0.00164 21278 QUIQUE_C1277_190116_001 101.64 43.832 2066300000 269540000 205500000 129330000 134970000 203410000 150290000 195600000 194400000 139540000 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63343000 0 0 0 45236000 0 0 0 10092 2992 9443 89294;89295;89296;89297;89298 113338;113339;113340;113341;113342 113342 5 EIAVLCHK Unmodified 968.51134 0.51133653 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22 22 2 0.01378 15802 QUIQUE_C1218_190116_001 86.866 52.15 2165500000 320680000 442890000 205770000 332850000 0 378710000 161440000 323190000 0 0 0 0 0 10093 2530 9444 89299;89300;89301;89302;89303;89304;89305 113343;113344;113345;113346;113347;113348;113349 113343 7 EICCYSISCK Unmodified 1318.5356 0.53557872 3808;4308 Q96BM9;Q9NVJ2 ARL8A;ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8A;ADP-ribosylation factor-like protein 8B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.152 46.152 2 0.0001715 43341 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.15 111.29 1248300000 56045000 104870000 90270000 86927000 71665000 79762000 142370000 78768000 116370000 0 116940000 134770000 169560000 10094 3808;4308 9445 89306;89307;89308;89309;89310;89311;89312;89313;89314;89315;89316;89317;89318 113350;113351;113352;113353;113354;113355;113356;113357;113358;113359;113360;113361;113362;113363 113361 14 EICDHQAEQLSR Unmodified 1484.6678 0.66779018 3284 Q5M775;J3KSG2;J3QQM0;J3KRN9 SPECC1 Cytospin-B yes no 0 0 0 1 22.33 22.33 2 0.0071739 15336 QUIQUE_C1277_190116_001 55.718 30.097 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10095 3284 9446 89319 113364 113364 1 EICWNLQNIR Unmodified 1344.6609 0.66085431 4063 Q9BXP5;H7C3A1 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 99.761 99.761 2 0.0021808 101966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.11 60.901 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10096 4063 9447 89320;89321;89322;89323 113365;113366;113367;113368 113366 4 EIDDSVLGQTGPYR Unmodified 1548.742 0.74200098 1535 O43615;M0QXU7 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 0 1 1 84.103 84.103 2 0.00046563 85707 QUIQUE_C1277_190116_001 105.46 68.875 64569000 0 64569000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10097 1535 9448 89324;89325 113369;113370;113371 113370 3 EIDELIKK Unmodified 986.56481 0.56481189 4583 Q9Y3A5;A0A087X020 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 1 1 31.15 31.15 2 0.058745 25907 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.709 26.896 64190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64190000 0 10098 4583 9449 89326 113372 113372 1 EIDGGLETLR Unmodified 1101.5666 0.5666028 2411 P38117;M0QY67 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.304 64.304 2 0.0051889 63813 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.334 41.633 1936400000 232530000 0 0 0 248530000 0 209860000 260650000 210380000 123640000 215750000 225920000 209180000 10099 2411 9450 89327;89328;89329;89330;89331;89332;89333;89334;89335 113373;113374;113375;113376;113377;113378;113379;113380;113381;113382 113378 8 EIDIAATLEHLR Unmodified 1379.7409 0.74087877 3769 Q92932;E7EM83;A0A3B3IU41 PTPRN2 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.42 115.42 3 0.00014618 120472 QUIQUE_C1218_190116_001 85.845 70.643 255760000 21604000 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113414;113415;113416;113417;113418 113417 5 EIDTDSTSQGESK Unmodified 1395.6001 0.60014735 2548 P49792 RANBP2 E3 SUMO-protein ligase RanBP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 14.992 14.992 2 0.0022973 6547 QUIQUE_C1563_190116_001 94.616 48.62 25663000 0 0 14190000 0 0 0 0 11474000 0 0 0 0 0 10106 2548 9457 89367;89368;89369 113419;113420;113421 113420 3 EIDTLNER Unmodified 988.48254 0.48253882 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 27.05 27.05 2 0.0078552 20610 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.492 14.708 176000000 0 0 0 0 0 137550000 0 22362000 0 16090000 0 0 0 10107 498 9458 89370;89371;89372 113422;113423;113424;113425 113425 4 EIDWVLLEQK Unmodified 1271.6762 0.67615325 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.85 120.85 2 0.0014954 124917 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108.3 72.691 63379000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31790000 31590000 0 10108 2868 9459 89373;89374;89375;89376;89377;89378;89379;89380 113426;113427;113428;113429;113430;113431;113432;113433 113432 7 EIDWVLLEQKK Unmodified 1399.7711 0.77111627 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 91.573 91.573 3 0.0014394 93417 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.691 52.178 70218000 0 0 0 0 0 0 0 17536000 12864000 0 0 16731000 23088000 10109 2868 9460 89381;89382;89383;89384;89385 113434;113435;113436;113437;113438 113434 5 EIDYIQYLR Unmodified 1211.6186 0.61863837 3410 Q6UWY5 OLFML1 Olfactomedin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 112.2 112.2 2 0.004459 109555 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.45 75.528 100810000 0 19387000 0 68059000 0 0 0 0 0 13367000 0 0 0 10110 3410 9461 89386;89387;89388;89389 113439;113440;113441;113442 113442 3 EIEAEIQALR Unmodified 1170.6245 0.62445203 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 79.831 79.831 2 6.5339E-05 81311 QUIQUE_C1576_190116_001 141.39 74.357 5115400000 354070000 0 430970000 391310000 523010000 322140000 983350000 0 363260000 258390000 646620000 361080000 481170000 10111 869 9462 89390;89391;89392;89393;89394;89395;89396;89397;89398;89399;89400;89401 113443;113444;113445;113446;113447;113448;113449;113450;113451;113452;113453;113454;113455;113456;113457;113458;113459;113460;113461;113462;113463;113464 113453 21 EIEDAAQFATADPEPPLEELGYHIYSSDPPFEVR Unmodified 3831.7792 0.77918094 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 3 2 1 2 2 2 158.9 158.9 3;4 9.1126E-131 164356 QUIQUE_C1218_190116_001 180.6 171.1 2572000000 231960000 251070000 215360000 182310000 109140000 157000000 203450000 146580000 238690000 23043000 311260000 288720000 213430000 10112 1943 9463 89402;89403;89404;89405;89406;89407;89408;89409;89410;89411;89412;89413;89414;89415;89416;89417;89418;89419;89420;89421;89422;89423;89424;89425 113465;113466;113467;113468;113469;113470;113471;113472;113473;113474;113475;113476;113477;113478;113479;113480;113481;113482;113483;113484;113485;113486;113487;113488;113489;113490;113491;113492;113493;113494;113495;113496 113465 32 EIEDAEKYSFMATVTK Unmodified 1860.8815 0.88153093 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 1 90.132 90.132 3 0.00046799 91114 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.12 55.662 44457000 0 0 0 0 0 0 0 44457000 0 0 0 0 0 10113 1558 9464 89426 113497 113497 1 EIEDFDSLEALR Unmodified 1435.6831 0.68308912 2476 P46060;B0QYT5;B0QYT4 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 117.46 117.46 2 0.00012363 114408 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.68 94.168 229500000 40050000 51948000 0 0 0 54088000 0 25912000 0 25256000 0 32243000 0 10114 2476 9465 89427;89428;89429;89430;89431;89432 113498;113499;113500;113501;113502;113503;113504;113505 113503 5 EIEDPEDR Unmodified 1001.4302 0.4301689 2269 P27824;D6RGY2 CANX Calnexin yes no 0 0 0 1 1 1 21.009 21.009 2 0.027967 14619 QUIQUE_C1218_190116_001 69.198 50.392 667370000 179450000 0 0 286470000 0 201450000 0 0 0 0 0 0 0 10115 2269 9466 89433;89434;89435 113506;113507;113508 113506 3 EIEELKQELIQAEIQNGVK Unmodified 2210.1794 0.17942751 2950 Q12904;D6R937 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes no 0 0 1 1 1 113.65 113.65 3 0.00010189 117405 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.92 70.756 83656000 0 0 0 0 0 0 0 40706000 42950000 0 0 0 0 10116 2950 9467 89436;89437 113509;113510 113510 2 EIEELQSQAQALSQEGK Unmodified 1886.9222 0.92215019 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 2 84.457 84.457 2;3 0 86708 QUIQUE_C1218_190116_001 325.29 271.73 15136000000 1150200000 1486400000 892290000 1537400000 1515600000 962640000 927200000 1045800000 1514000000 472040000 1125800000 1048300000 1458200000 10117 2851 9468 89438;89439;89440;89441;89442;89443;89444;89445;89446;89447;89448;89449;89450;89451;89452;89453;89454;89455;89456;89457;89458;89459;89460 113511;113512;113513;113514;113515;113516;113517;113518;113519;113520;113521;113522;113523;113524;113525;113526;113527;113528;113529;113530;113531;113532;113533;113534;113535;113536;113537;113538;113539;113540;113541;113542;113543;113544 113511 34 EIEGEEIEIVLAKPPDKK Unmodified 2036.1041 0.10413731 1525 O43390;B4DT28;A0A286YEZ8 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 2 1 80.955 80.955 4 0.0044673 83167 QUIQUE_C1368_190116_001 48.59 42.075 78726000 0 0 78726000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10118 1525 9469 89461 113545 113545 1 EIEGLLENIR Unmodified 1184.6401 0.6401021 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.93 100.93 2 0.014578 103719 QUIQUE_C1277_190116_001 74.464 16.875 126350000 26549000 24146000 0 0 0 0 0 0 0 0 46407000 29243000 0 10119 88 9470 89462;89463;89464;89465 113546;113547;113548;113549 113547 3 EIEIAEQDMSALISLR Unmodified 1816.9241 0.92406445 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 3 1 4 4 4 4 4 4 149.28 149.28 2;3 2.1858E-66 154065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 202.44 178.15 1170600000 26950000 19296000 50013000 0 64908000 34910000 22676000 245350000 259680000 224370000 116820000 72827000 32847000 10120 1558 9471 89466;89467;89468;89469;89470;89471;89472;89473;89474;89475;89476;89477;89478;89479;89480;89481;89482;89483;89484;89485;89486;89487;89488;89489;89490;89491;89492;89493;89494;89495;89496;89497;89498;89499;89500;89501;89502 113550;113551;113552;113553;113554;113555;113556;113557;113558;113559;113560;113561;113562;113563;113564;113565;113566;113567;113568;113569;113570;113571;113572;113573;113574;113575;113576;113577;113578;113579;113580;113581;113582;113583;113584;113585;113586;113587;113588;113589;113590;113591 113572 38 EIEIAEQDMSALISLR Oxidation (M) 1832.919 0.91897907 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 1 0 1 1 2 1 117.66 117.66 2 4.2668E-09 114290 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.95 98.475 130710000 0 0 0 0 0 0 0 36051000 34614000 60043000 0 0 0 10121 1558 9471 89503;89504;89505;89506;89507 113592;113593;113594;113595;113596 113596 849 5 EIEIAEQDMSALISLRK Unmodified 1945.019 0.019027468 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 2 1 1 125.55 125.55 3 5.7061E-13 128317 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.39 91.557 171980000 0 0 0 0 0 0 0 98845000 50568000 0 0 0 22565000 10122 1558 9472 89508;89509;89510;89511 113597;113598;113599;113600 113597 4 EIEIAEQEMPALMALR Unmodified 1842.922 0.92195596 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 1 142.5 142.5 2;3 2.9121E-95 146669 QUIQUE_C1403_190116_001 221.55 181.92 1284000000 213900000 22064000 26326000 168250000 34864000 160710000 174320000 13478000 106240000 0 243200000 96922000 23684000 10123 1131;3868 9473 89512;89513;89514;89515;89516;89517;89518;89519;89520;89521;89522;89523;89524;89525;89526;89527;89528 113601;113602;113603;113604;113605;113606;113607;113608;113609;113610;113611;113612;113613;113614;113615;113616;113617;113618;113619;113620;113621 113608 18 EIEIAEQEMPALMALR Oxidation (M) 1858.9169 0.91687058 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.42 129.42 2 4.9272E-13 133619 QUIQUE_DMIX8_190116_001 133.05 110.13 249850000 68721000 0 0 0 0 46744000 0 0 0 43991000 0 0 90391000 10124 1131;3868 9473 89529;89530;89531;89532;89533;89534;89535;89536;89537 113622;113623;113624;113625;113626;113627;113628;113629;113630;113631;113632;113633 113632 657;658 11 EIEIAEQEMPALMALR 2 Oxidation (M) 1874.9118 0.9117852 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 2 0 1 1 1 2 1 101.81 101.81 2 3.9473E-25 104097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.214 17.316 27370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27370000 10128 432 9476 89548 113647 113647 1 EIELIGSGGFGQVFK Unmodified 1579.8246 0.8246084 2149 P19525 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 0 1 134.49 134.49 2 0.0097893 141541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.785 5.5067 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10129 2149 9477 89549 113648 113648 1 EIELLCQEHGQENDDLVQR Unmodified 2324.0703 0.07028777 3145 Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 80.347 80.347 2;3 1.1729E-241 81252 QUIQUE_C1368_190116_001 307.32 253.35 3048300000 329510000 285850000 288190000 274000000 282600000 261390000 302220000 153570000 149900000 134550000 146750000 158790000 280970000 10130 3145 9478 89550;89551;89552;89553;89554;89555;89556;89557;89558;89559;89560;89561;89562;89563;89564;89565;89566;89567;89568;89569;89570;89571;89572;89573;89574 113649;113650;113651;113652;113653;113654;113655;113656;113657;113658;113659;113660;113661;113662;113663;113664;113665;113666;113667;113668;113669;113670;113671;113672;113673;113674;113675;113676;113677;113678;113679;113680;113681;113682;113683;113684;113685;113686;113687 113659 38 EIEMASEERPPAQALEIMMGLK Unmodified 2472.2063 0.20625267 880 E7EVA0;P27816;H7C456 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 141.39 141.39 3 1.7293E-20 147216 QUIQUE_C1218_190116_001 127.5 103.77 810670000 54471000 46511000 0 58255000 75338000 31162000 32507000 141200000 119260000 0 81858000 0 170120000 10131 880 9479 89575;89576;89577;89578;89579;89580;89581;89582;89583;89584;89585;89586;89587 113688;113689;113690;113691;113692;113693;113694;113695;113696;113697;113698;113699;113700;113701;113702;113703;113704;113705;113706 113688 19 EIENLTQQYEEK Unmodified 1522.7151 0.71511753 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 59.649 59.649 2 1.1009E-09 58551 QUIQUE_C1368_190116_001 154.05 131.72 259070000 0 172860000 86210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10132 2385 9480 89588;89589 113707;113708;113709 113709 2 EIENMILNDPDFQHEDLNFLTR Unmodified 2702.2646 0.26463048 3107 Q15067;K7ELT1;I3L0T4 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 146.96 146.96 3 3.2471E-18 154337 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.3 115.35 278950000 0 0 83575000 0 74711000 0 0 0 0 0 120670000 0 0 10133 3107 9481 89590;89591;89592 113710;113711;113712 113712 2 EIENYPTCYK Unmodified 1315.5755 0.57545293 3973 Q99747 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 44.943 44.943 2 0.00028766 41800 QUIQUE_C1368_190116_001 116.05 106.63 841030000 86361000 0 108840000 102470000 122560000 0 168030000 0 0 0 85109000 70648000 97017000 10134 3973 9482 89593;89594;89595;89596;89597;89598;89599;89600 113713;113714;113715;113716;113717;113718;113719;113720 113714 8 EIEPVLSLLTSGSR Unmodified 1499.8195 0.81952302 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.46 135.46 2 0.00086746 141126 QUIQUE_C1218_190116_001 97.911 70.582 386490000 48401000 35867000 0 64330000 44764000 40572000 0 59237000 18980000 14277000 0 22402000 37657000 10135 699 9483 89601;89602;89603;89604;89605;89606;89607;89608;89609;89610 113721;113722;113723;113724;113725;113726;113727;113728;113729;113730;113731 113721 10 EIEQEAAVELSQLR Unmodified 1613.8261 0.82606496 2498 P47985 UQCRFS1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 109.95 109.95 2;3 3.3854E-47 115104 QUIQUE_C1218_190116_001 237.53 186.72 7216600000 991570000 819810000 812860000 738120000 518550000 718060000 864610000 202740000 355490000 290170000 463510000 221400000 219690000 10136 2498 9484 89611;89612;89613;89614;89615;89616;89617;89618;89619;89620;89621;89622;89623;89624;89625;89626;89627;89628;89629;89630;89631;89632;89633;89634 113732;113733;113734;113735;113736;113737;113738;113739;113740;113741;113742;113743;113744;113745;113746;113747;113748;113749;113750;113751;113752;113753;113754;113755;113756;113757;113758;113759;113760;113761;113762;113763;113764;113765;113766;113767;113768;113769;113770;113771;113772;113773;113774;113775;113776 113733 45 EIEQEAAVELSQLRDPQHDLDR Unmodified 2590.2623 0.2623223 2498 P47985 UQCRFS1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 105.68 105.68 3;4 3.8047E-77 108326 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.98 111.6 8976900000 214810000 563440000 597370000 440020000 603850000 357770000 770830000 1078300000 909680000 109450000 1194500000 1090000000 1046900000 10137 2498 9485 89635;89636;89637;89638;89639;89640;89641;89642;89643;89644;89645;89646;89647;89648;89649;89650;89651;89652;89653;89654;89655;89656;89657;89658;89659;89660 113777;113778;113779;113780;113781;113782;113783;113784;113785;113786;113787;113788;113789;113790;113791;113792;113793;113794;113795;113796;113797;113798;113799;113800;113801;113802;113803;113804;113805;113806;113807;113808;113809;113810;113811;113812;113813;113814;113815;113816;113817;113818;113819;113820;113821;113822;113823;113824;113825;113826;113827;113828 113807 52 EIEQELHLAQAEIQSLR Unmodified 2006.0433 0.043268383 3893 Q96JN2;C9JE17;C9JU31;H7C4R2 CCDC136 Coiled-coil domain-containing protein 136 yes no 0 0 0 1 132.46 132.46 3 0.0027603 128907 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.343 39.763 7537400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7537400 0 0 0 10138 3893 9486 89661 113829 113829 1 EIEQKYDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIK Unmodified 3252.6145 0.61454714 2786 P63241;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 0 0 1 1 176.66 176.66 3 0.0053835 177871 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.702 26.755 5160200 0 0 0 0 0 0 0 5160200 0 0 0 0 0 10139 2786 9487 89662 113830 113830 1 EIESSPQYR Unmodified 1107.5197 0.51965261 3714 Q8WWM7;H3BUF6;H3BSK9 ATXN2L Ataxin-2-like protein yes no 0 0 0 1 22.491 22.491 2 0.030211 16009 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.26 45.042 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10140 3714 9488 89663 113831 113831 1 EIESTDTACIGPTLR Unmodified 1661.7931 0.79305028 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4;J3QT38;F8W6R7 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 1 71.23 71.23 2 1.0437E-09 71766 QUIQUE_C1218_190116_001 117.98 90.646 60773000 30654000 30119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10141 318 9489 89664;89665 113832;113833 113832 1 EIETFVSLLR Unmodified 1205.6656 0.66558856 3072 Q14571 ITPR2 Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 yes yes 0 0 0 1 128.65 128.65 2 0.022223 135391 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.934 55.506 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10142 3072 9490 89666 113834 113834 1 EIETYHNLLEGGQEDFESSGAGK Unmodified 2509.1245 0.12449141 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 97.643 97.643 2;3 9.7001E-161 100153 QUIQUE_C1277_190116_001 288.16 256.09 5788500000 218460000 35672000 98559000 297190000 784670000 239870000 0 880950000 77193000 726170000 660230000 794140000 975360000 + 10143 780 9491 89667;89668;89669;89670;89671;89672;89673;89674;89675;89676;89677;89678;89679;89680;89681;89682;89683;89684;89685;89686;89687 113835;113836;113837;113838;113839;113840;113841;113842;113843;113844;113845;113846;113847;113848;113849;113850;113851;113852;113853;113854;113855;113856;113857;113858;113859 113836 22 EIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMR Unmodified 2823.3484 0.34841969 2720;1991;4595 P61225;F6U784;Q9Y3L5;P10114 RAP2B;RAP2A;RAP2C Ras-related protein Rap-2b;Ras-related protein Rap-2c;Ras-related protein Rap-2a no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.09 167.09 2;3 4.6571E-129 172071 QUIQUE_C1368_190116_001 197.46 191 993570000 93348000 100950000 67273000 76088000 72019000 67673000 77478000 69905000 86906000 26442000 68189000 66298000 121000000 10144 2720;4595;1991 9492 89688;89689;89690;89691;89692;89693;89694;89695;89696;89697;89698;89699;89700;89701 113860;113861;113862;113863;113864;113865;113866;113867;113868;113869;113870;113871;113872;113873;113874;113875 113863 15 EIEVLER Unmodified 886.476 0.47599688 1656 O75781 PALM Paralemmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 44.09 44.09 2 0.026204 41519 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.407 8.3208 682980000 0 184980000 100700000 0 174800000 0 0 0 0 0 112500000 0 110010000 10145 1656 9493 89702;89703;89704;89705;89706 113876;113877;113878;113879;113880;113881 113880 6 EIFAPLDER Unmodified 1088.5502 0.55022446 3653 Q8NFX7;F8VZZ2 STXBP6 Syntaxin-binding protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.851 79.851 2 0.0085179 81980 QUIQUE_C1438_190116_001 89.698 50.736 1394600000 141190000 164390000 128730000 166810000 118770000 0 119150000 0 151330000 0 141250000 148120000 114850000 10146 3653 9494 89707;89708;89709;89710;89711;89712;89713;89714;89715;89716 113882;113883;113884;113885;113886;113887;113888;113889;113890;113891;113892;113893;113894;113895 113889 12 EIFAQEALAPFR Unmodified 1390.7245 0.72450043 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.54 121.54 2 7.6843E-06 124171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.92 120.58 809590000 148900000 0 0 96097000 0 0 0 136770000 195710000 66052000 166060000 0 0 10147 3643 9495 89717;89718;89719;89720;89721;89722;89723;89724;89725 113896;113897;113898;113899;113900;113901;113902;113903;113904 113900 9 EIFDIAFPDEQAEALAVER Unmodified 2162.0532 0.053164368 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 151.86 151.86 2;3 7.6852E-08 158991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.46 116.21 953010000 58753000 33268000 119480000 97864000 0 137400000 0 45915000 92953000 19604000 182440000 0 165330000 10148 1324 9496 89726;89727;89728;89729;89730;89731;89732;89733;89734;89735;89736;89737;89738;89739;89740;89741;89742;89743 113905;113906;113907;113908;113909;113910;113911;113912;113913;113914;113915;113916;113917;113918;113919;113920;113921;113922;113923;113924 113922 16 EIFDLIR Unmodified 904.50182 0.5018177 4589 Q9Y3D0;H3BNV7;J3KS95 FAM96B Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18 yes no 0 0 0 1 1 106.84 106.84 2 0.055397 108875 QUIQUE_C1563_190116_001 71.949 35.483 36703000 0 0 0 0 0 15546000 0 0 0 0 21158000 0 0 10149 4589 9497 89744;89745 113925;113926 113925 2 EIFGLYGQTTGK Unmodified 1312.6663 0.66631685 4262 Q9NR31;H0Y5E8 SAR1A GTP-binding protein SAR1a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.028 84.028 2 0.0004691 85413 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.85 107.6 1371200000 142280000 132240000 137430000 137520000 111810000 124040000 130220000 88655000 110890000 44842000 0 99830000 111420000 10150 4262 9498 89746;89747;89748;89749;89750;89751;89752;89753;89754;89755;89756;89757 113927;113928;113929;113930;113931;113932;113933;113934;113935;113936;113937;113938;113939;113940;113941;113942;113943 113938 15 EIFGMSIQEFDR Unmodified 1470.6813 0.68131498 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6;J3QSX6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.02 131.02 2 7.5336E-06 135410 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.23 109.38 387520000 54659000 64576000 0 47832000 52015000 0 0 0 52665000 30060000 38208000 0 47500000 10151 151 9499 89758;89759;89760;89761;89762;89763;89764;89765;89766;89767 113944;113945;113946;113947;113948;113949;113950;113951;113952;113953 113950 10 EIFGMSIQEFDRLPLWR Unmodified 2136.0826 0.082630778 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6;J3QSX6 ABLIM1 no no 0 0 1 1 1 1 1 158.97 158.97 3 1.0383E-18 166168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.39 86.914 149040000 0 0 0 0 0 0 0 19763000 35483000 0 51588000 42206000 0 10152 151 9500 89768;89769;89770;89771 113954;113955;113956;113957 113956 3 EIFGQTIIHHHIPFNWDCEFIR Unmodified 2808.3595 0.35947434 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 125.73 125.73 3;4 1.6903E-09 129961 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.74 83.69 683880000 0 0 86096000 0 0 0 71415000 0 0 0 240350000 286010000 0 10153 1655 9501 89772;89773;89774;89775;89776;89777 113958;113959;113960;113961;113962;113963;113964;113965 113964 7 EIFITFR Unmodified 924.5069 0.50690308 3845 Q96EY1 DNAJA3 DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 95.755 95.755 2 0.021367 97276 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.2 70.484 57870000 21834000 0 17628000 0 0 0 0 18408000 0 0 0 0 0 10154 3845 9502 89778;89779;89780 113966;113967;113968 113968 3 EIFLNILETSTSSFEHR Unmodified 2022.0058 0.0058202445 4651 Q9Y6D5 ARFGEF2 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 yes yes 0 0 0 1 143.77 143.77 3 0.0023276 151248 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.916 37.1 25972000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25972000 0 0 10155 4651 9503 89781 113969 113969 1 EIFLSQPILLELEAPLK Unmodified 1952.1234 0.12341618 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;C9J9S3;C9JP48;F8WE71;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;A0A087WYY5;P62136;E9PMD7;F5H1L6;F5H037 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.08 166.08 2;3 2.6912E-38 171111 QUIQUE_C1368_190116_001 206.69 191.3 16080000000 1466200000 1476300000 2010700000 919760000 1011600000 664610000 1233000000 884540000 1246700000 486040000 1416600000 1414200000 1849400000 10156 2740;1041;2739 9504 89782;89783;89784;89785;89786;89787;89788;89789;89790;89791;89792;89793;89794;89795;89796;89797;89798;89799;89800;89801;89802;89803;89804;89805;89806;89807 113970;113971;113972;113973;113974;113975;113976;113977;113978;113979;113980;113981;113982;113983;113984;113985;113986;113987;113988;113989;113990;113991;113992;113993;113994;113995;113996;113997;113998;113999;114000;114001;114002 113977 32 EIFMQVEDERR Unmodified 1450.6875 0.68746299 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 54.877 54.877 3 0.016732 53093 QUIQUE_C1368_190116_001 34.75 23.844 244180000 0 53597000 46783000 0 0 0 0 31358000 41269000 0 0 42020000 29156000 10157 2379 9505 89808;89809;89810;89811;89812;89813;89814 114003;114004;114005;114006;114007;114008;114009 114004 7 EIFNFVLK Unmodified 1008.5644 0.56441796 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 114.24 114.24 2 0.01603 118590 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.801 65.765 68208000 0 0 11829000 0 0 0 0 0 21616000 0 34764000 0 0 10158 2813 9506 89815;89816;89817 114010;114011;114012 114011 3 EIFSVLDLMK Unmodified 1193.6366 0.63659662 941 E9PJ55;Q9NUJ3 TCP11L1 T-complex protein 11-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 150.68 150.68 2 0.0090473 156403 QUIQUE_C1218_190116_001 70.816 40.741 97081000 24924000 26590000 0 0 22230000 0 0 0 0 6101400 17235000 0 0 10159 941 9507 89818;89819;89820;89821;89822;89823;89824 114013;114014;114015;114016;114017;114018;114019;114020 114013 8 EIFTNLAPFSEVSADGEKR Unmodified 2109.0378 0.037848654 3371 Q8TCE6;Q6NSW5;A0A3B3IRE4 FAM45A;FAM45B Protein FAM45A;Protein FAM45B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.06 110.06 3 5.1672E-08 113909 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.891 81.735 336210000 0 37662000 0 0 44268000 0 37146000 0 57851000 0 71083000 49250000 38946000 10160 3371 9508 89825;89826;89827;89828;89829;89830;89831;89832;89833 114021;114022;114023;114024;114025;114026;114027;114028;114029;114030;114031;114032;114033 114028 13 EIFVDFAPFLSR Unmodified 1439.7449 0.74490152 264;910 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9;E9PEM5;P50851;H0YAC6 NBEA;LRBA Neurobeachin;Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein no no 0 0 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114064;114065;114066;114067;114068;114069;114070;114071;114072;114073;114074;114075;114076;114077;114078 114065 15 EIGELTQLK Unmodified 1029.5706 0.57062555 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 1 60.665 60.665 2 0.035529 59086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.905 35.802 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10166 3136 9514 89875 114079 114079 1 EIGELYLPK Unmodified 1060.5805 0.58046195 1800 P01011;G3V3A0 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.281 83.281 2 0.011732 80649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.04 65.939 940590000 0 0 0 0 273880000 0 0 170500000 0 136600000 0 92580000 267040000 10167 1800 9515 89876;89877;89878;89879;89880 114080;114081;114082;114083;114084 114082 2 EIGHGSFGAVYFAR Unmodified 1509.7365 0.7364621 3446 Q7L7X3;J3QS76 TAOK1 Serine/threonine-protein kinase TAO1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.839 77.839 3 6.0337E-05 78140 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.611 54.323 421840000 31194000 37195000 36018000 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O75145;H0YIJ4;G3V200;O75334;H0YHK3;H0YHJ4;A0A2R8Y7R9;Q13136;A0A1B0GVT3;H0YDW2 PPFIA3;PPFIA2;PPFIA1 Liprin-alpha-3;Liprin-alpha-2;Liprin-alpha-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 50.701 50.701 3 0.012416 49511 QUIQUE_C1218_190116_001 50.353 33.123 137800000 36232000 37200000 35009000 0 0 0 0 0 0 0 29358000 0 0 10170 1612;1078;448 9518 89906;89907;89908;89909 114113;114114;114115;114116 114113 4 EIGLLSEEVELYGETK Unmodified 1807.9091 0.90912589 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 133.52 133.52 2 2.7737E-05 138693 QUIQUE_C1368_190116_001 84.365 69.803 336560000 37173000 0 56706000 32392000 38258000 0 53308000 70418000 48304000 0 0 0 0 10171 1005;2027 9519 89910;89911;89912;89913;89914;89915;89916;89917;89918;89919;89920 114117;114118;114119;114120;114121;114122;114123;114124;114125;114126;114127;114128 114119 10 EIGLQMHEELLK Unmodified 1438.749 0.74900062 1520 O43295;A0A087WZH4 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes no 0 0 0 1 77.782 77.782 3 0.04722 78544 QUIQUE_C1277_190116_001 33.204 18.758 13852000 0 13852000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10172 1520 9520 89921 114129 114129 1 EIGNIISDAMK Unmodified 1189.6013 0.60127375 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 95.575 95.575 2 0.00047489 99261 QUIQUE_C1218_190116_001 131.62 92.81 3265500000 528310000 324490000 377810000 313360000 209020000 384450000 286990000 90434000 268680000 141180000 159240000 0 181560000 10173 2004 9521 89922;89923;89924;89925;89926;89927;89928;89929;89930;89931;89932;89933;89934 114130;114131;114132;114133;114134;114135;114136;114137;114138;114139;114140;114141;114142;114143 114130 12 EIGNIISDAMK Oxidation (M) 1205.5962 0.59618837 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 64.24 64.24 2 0.028812 64351 QUIQUE_C1403_190116_001 53.517 25.78 74754000 0 0 26460000 48294000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10174 2004 9521 89935;89936 114144;114145 114145 1276 2 EIGNLLHPSVPISNDEDVDNKVER Unmodified 2688.3355 0.33548724 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 85.211 85.211 3;4 7.9341E-91 86742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.69 168.4 4383200000 340780000 348180000 487860000 408410000 317740000 364090000 278440000 413900000 451820000 185810000 205430000 0 580780000 10175 2534 9522 89937;89938;89939;89940;89941;89942;89943;89944;89945;89946;89947;89948;89949;89950;89951;89952;89953;89954;89955;89956 114146;114147;114148;114149;114150;114151;114152;114153;114154;114155;114156;114157;114158;114159;114160;114161;114162;114163;114164;114165;114166;114167;114168;114169 114163 23 EIGPNDGFLAQLCQLNDR Unmodified 2058.9793 0.97928792 2580 P51452;K7ELG5 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 2 2 2 139.73 139.73 2;3 1.1735E-53 144545 QUIQUE_DMIX3_190116_001 181.26 150.71 1676400000 112340000 172580000 96572000 139400000 70893000 116830000 114340000 149360000 152290000 43264000 195600000 161720000 151230000 10176 2580 9523 89957;89958;89959;89960;89961;89962;89963;89964;89965;89966;89967;89968;89969;89970;89971;89972;89973;89974;89975;89976 114170;114171;114172;114173;114174;114175;114176;114177;114178;114179;114180;114181;114182;114183;114184;114185;114186;114187;114188;114189;114190;114191;114192;114193;114194;114195;114196;114197;114198;114199;114200;114201;114202;114203 114189 34 EIGQSVDEVEK Unmodified 1231.5932 0.59321148 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.578 34.578 2 0.00025295 30327 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.99 79.113 20582000000 1454900000 1892300000 1261000000 1538500000 1884600000 1155900000 1483000000 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Q01813;H0Y3Y3 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.6 140.6 2 2.1904E-76 144704 QUIQUE_C1277_190116_001 237.1 223.33 4702800000 434890000 531360000 517820000 526830000 418050000 359940000 422680000 358870000 0 177150000 405000000 550260000 0 10180 2861 9527 89999;90000;90001;90002;90003;90004;90005;90006;90007;90008;90009;90010;90011 114229;114230;114231;114232;114233;114234;114235;114236;114237;114238;114239;114240;114241;114242 114230 13 EIGYPVMIK Unmodified 1048.5627 0.5627034 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 78.589 78.589 2 0.041258 75246 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.166 29.012 80936000 0 0 0 0 0 0 0 30448000 0 14344000 0 36144000 0 10181 1881 9528 90012;90013;90014 114243;114244;114245 114244 3 EIHDFVLEQFNTSQGELQK Unmodified 2261.0964 0.096426166 2448 P42356 PI4KA Phosphatidylinositol 4-kinase alpha yes yes 0 0 0 1 110.01 110.01 3 0.0075581 112135 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.756 30.366 64885000 0 0 0 0 0 0 0 64885000 0 0 0 0 0 10182 2448 9529 90015 114246 114246 1 EIHKPGYLANDR Unmodified 1411.7208 0.72081203 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E9PNV3;A0A2R8Y5P0 RDX Radixin yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 18.412 18.412 2;3 0.00078833 10564 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.241 55.701 4572000000 46387000 413110000 407120000 461510000 295770000 349480000 0 271460000 518830000 260670000 587730000 478400000 481570000 10183 434 9530 90016;90017;90018;90019;90020;90021;90022;90023;90024;90025;90026;90027;90028;90029;90030;90031;90032 114247;114248;114249;114250;114251;114252;114253;114254;114255;114256;114257;114258;114259;114260;114261;114262;114263 114263 8 EIHTVPDMGK Unmodified 1125.5488 0.54884425 3123 Q15257;A6PVN5;Q5T949;Q5T948;Q68CR8;A6PVN6 PPP2R4;DKFZp781M17165 Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator yes no 0 0 0 1 25.052 25.052 3 0.037719 19004 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.937 24.322 0 0 0 0 0 0 0 0 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114381 173 EIIDLVLDRIR Unmodified 1353.798 0.79799972 2795;3430;3992;1031 F8VQQ4;F8VRZ4;P68363;F8VVB9;F8VS66;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA1A;TUBA1B;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 1 131.17 131.17 3 0.0076056 133999 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.397 68.195 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10187 1031;2795;3430;3992 9534 90147 114452 114452 1 EIIDPVLDR Unmodified 1068.5815 0.58152458 2796;737 C9JQ00;P68366;C9JJQ8;C9JEV8 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.851 76.851 2 0.00046275 77348 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.73 70.3 37358000000 3299600000 3733200000 2954000000 2783600000 2762400000 2562700000 3698600000 2250700000 2214500000 1495400000 3349500000 2898700000 3354800000 10188 737;2796 9535 90148;90149;90150;90151;90152;90153;90154;90155;90156;90157;90158;90159;90160 114453;114454;114455;114456;114457;114458;114459;114460;114461;114462;114463;114464;114465;114466;114467;114468;114469;114470;114471;114472;114473;114474;114475;114476;114477;114478;114479 114473 27 EIIDTNGAGDAFVGGFLSQLVSDKPLTECIR Unmodified 3321.6551 0.65510682 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.37 166.37 3 2.9291E-255 168148 QUIQUE_DMIX1_190116_001 243.81 227.36 889970000 79051000 101450000 0 90869000 112230000 77756000 68713000 70762000 102000000 20960000 0 54334000 111850000 10189 2663 9536 90161;90162;90163;90164;90165;90166;90167;90168;90169;90170;90171 114480;114481;114482;114483;114484;114485;114486;114487;114488;114489;114490 114486 10 EIIEGCIR Unmodified 988.50117 0.50116577 988 F5GWT4;Q9H4A3;Q96J92 WNK1;WNK4 Serine/threonine-protein kinase WNK1;Serine/threonine-protein kinase WNK4 no no 0 0 0 1 1 41.203 41.203 2 0.039586 38682 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.799 16.078 88628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43293000 0 45334000 10190 988 9537 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Q9Y265;E7ETR0;H7C4G5;H7C4I3 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 153.51 153.51 4 2.4502E-10 157909 QUIQUE_C1277_190116_001 62.302 56.05 389390000 0 84951000 65405000 0 0 0 0 145550000 0 0 0 0 93489000 10195 4542 9542 90217;90218;90219;90220 114545;114546;114547;114548 114545 4 EIISEMGELGVLGPTIK Unmodified 1784.9594 0.95938732 3771 Q92947;K7EKT3;K7ES74 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.42 138.42 2 0.00072462 134636 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.866 73.948 721320000 97779000 56091000 112490000 0 37773000 107580000 62683000 89617000 0 29984000 0 56389000 70943000 10196 3771 9543 90221;90222;90223;90224;90225;90226;90227;90228;90229;90230 114549;114550;114551;114552;114553;114554;114555;114556;114557;114558;114559 114556 10 EIISEVQR Unmodified 972.52401 0.52400971 1509 O43150;A0A286YFG8 ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 52.047 52.047 2 0.039647 49794 QUIQUE_C1403_190116_001 60.76 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38783000 38589000 42442000 28947000 0 46123000 42522000 41519000 10200 3060 9547 90238;90239;90240;90241;90242;90243;90244;90245;90246;90247;90248 114567;114568;114569;114570;114571;114572;114573;114574;114575;114576;114577;114578;114579;114580 114577 12 EIIVDAVK Unmodified 885.51713 0.51713341 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6 RRM2B Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B yes no 0 0 0 1 48.364 48.364 2 0.068045 45977 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.335 12.529 33005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33005000 0 10201 3449 9548 90249 114581 114581 1 EIKDAISGIGTDEK Unmodified 1474.7515 0.75150304 1936 P08133;E5RK63;E5RI05;E5RJF5 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 49.75 49.75 2;3 2.0208E-21 47017 QUIQUE_C1368_190116_001 162.68 131.19 1915600000 30756000 53275000 57186000 38473000 77203000 25561000 75840000 204350000 228200000 0 272420000 408920000 443440000 10202 1936 9549 90250;90251;90252;90253;90254;90255;90256;90257;90258;90259;90260;90261;90262;90263 114582;114583;114584;114585;114586;114587;114588;114589;114590;114591;114592;114593;114594;114595;114596 114584 14 EIKDFFEVAK Unmodified 1224.639 0.63903946 4302 Q9NV70 EXOC1 Exocyst complex component 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 81.568 81.568 3 0.015616 82529 QUIQUE_C1277_190116_001 45.598 32.982 62667000 16425000 31888000 0 0 0 14355000 0 0 0 0 0 0 0 10203 4302 9550 90264;90265;90266 114597;114598;114599 114598 3 EIKDILIQYDR Unmodified 1404.7613 0.76127986 1372 M0R210;P62249 RPS16 40S ribosomal protein S16 yes no 0 0 1 1 1 85.397 85.397 2;3 0.046491 86864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.283 28.059 92664000 0 0 0 0 0 0 0 18622000 0 0 0 0 74042000 10204 1372 9551 90267;90268 114600;114601 114600 2 EIKIEISELNR Unmodified 1342.7456 0.7456298 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 1 1 1 1 1 74.554 74.554 3 0.001733 74296 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.792 30.921 20973000 0 0 0 0 0 0 0 20973000 0 0 0 0 0 + 10205 781;782 9552 90269;90270;90271;90272 114602;114603;114604;114605 114602 4 EILAELTGR Unmodified 1000.5553 0.55530983 1943 P08559;Q5JPU0;Q5JPT9;Q5JPU1 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.401 83.401 2 1.5308E-07 86224 QUIQUE_C1218_190116_001 164.53 66.11 5445800000 558680000 444180000 486820000 325620000 345340000 447060000 485590000 342310000 381950000 192870000 563930000 434180000 437300000 10206 1943 9553 90273;90274;90275;90276;90277;90278;90279;90280;90281;90282;90283;90284;90285 114606;114607;114608;114609;114610;114611;114612;114613;114614;114615;114616;114617;114618;114619;114620;114621;114622;114623;114624;114625 114606 20 EILALIGYVDPVK Unmodified 1428.8228 0.82281749 230 A0A0C4DG51;Q9NP80 PNPLA8 Calcium-independent phospholipase A2-gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.03 146.03 2 0.00092518 148685 QUIQUE_C1563_190116_001 102.52 76.009 287810000 24935000 25093000 23046000 15545000 21002000 24929000 20888000 17090000 31986000 8278000 28780000 23237000 23006000 10207 230 9554 90286;90287;90288;90289;90290;90291;90292;90293;90294;90295;90296;90297;90298 114626;114627;114628;114629;114630;114631;114632;114633;114634;114635;114636;114637;114638 114631 12 EILDAFDK Unmodified 949.47566 0.47566253 1924 P07602;C9JIZ6;A0A0J9YXB8 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 79.51 79.51 2 0.015763 80756 QUIQUE_C1277_190116_001 84.227 51.444 82389000 0 82389000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10208 1924 9555 90299 114639;114640 114640 2 EILDESLR Unmodified 973.50803 0.50802529 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 58.424 58.424 2 0.044601 57311 QUIQUE_C1218_190116_001 78.178 22.087 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10209 3700 9556 90300 114641 114641 1 EILDKFTEEVVK Unmodified 1448.7763 0.77626123 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 89.852 89.852 2;3 3.8654E-06 91766 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.24 107.29 9304900000 133570000 283710000 820990000 257550000 389020000 216320000 358390000 1516300000 1377400000 121780000 1264800000 1220000000 1345100000 10210 2522 9557 90301;90302;90303;90304;90305;90306;90307;90308;90309;90310;90311;90312;90313;90314;90315;90316;90317;90318;90319 114642;114643;114644;114645;114646;114647;114648;114649;114650;114651;114652;114653;114654;114655;114656;114657;114658;114659;114660;114661;114662;114663;114664;114665;114666;114667;114668;114669;114670;114671;114672;114673 114657 31 EILDYIFSGQIR Unmodified 1452.7613 0.76127986 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.33 146.33 2 0.00051588 149265 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.309 44.594 436080000 38498000 51399000 41246000 37493000 51681000 0 0 38688000 62683000 18532000 0 57645000 38216000 10211 4143 9558 90320;90321;90322;90323;90324;90325;90326;90327;90328;90329;90330 114674;114675;114676;114677;114678;114679;114680;114681;114682;114683;114684;114685 114679 11 EILEQGLFSK Unmodified 1162.6234 0.6233894 936 E9PI87;Q9BUP3 HTATIP2 Oxidoreductase HTATIP2 yes no 0 0 0 1 88.209 88.209 2 0.01389 90413 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.654 20.259 61799000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61799000 10212 936 9559 90331 114686 114686 1 EILEQLLEAIVVATNPSGR Unmodified 2051.1263 0.12626973 736 C9JPI5;H0Y5B5;E7EVG2;Q86U86 PBRM1 Protein polybromo-1 yes no 0 0 0 1 1 178.01 178.01 3 0.0001154 185008 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.278 43.908 11111000 0 0 0 0 0 0 0 0 5802200 0 5308900 0 0 10213 736 9560 90332;90333 114687;114688 114688 2 EILETLIK Unmodified 957.57465 0.57464829 2900 Q06210 GFPT1 Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1 yes yes 0 0 0 1 89.931 89.931 2 0.027083 90585 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.998 6.8509 30296000 0 0 0 0 0 0 0 30296000 0 0 0 0 0 10214 2900 9561 90334 114689 114689 1 EILEVLDGR Unmodified 1042.5659 0.56587452 3378 Q6P1N0;K7EMP1 CC2D1A Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A yes no 0 0 0 1 90.249 90.249 2 0.057371 92649 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.91 32.736 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10215 3378 9562 90335 114690 114690 1 EILFLSLVSLGR Unmodified 1345.7969 0.79693709 3340 X6R5W5;Q5VZ89 DENND4C DENN domain-containing protein 4C yes no 0 0 0 1 1 162.52 162.52 2 0.00050211 169873 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.98 92.622 12230000 0 0 2952800 0 0 0 0 0 0 0 9277200 0 0 10216 3340 9563 90336;90337 114691;114692 114692 2 EILGTAQSVGCNVDGR Unmodified 1674.7995 0.79953264 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.224 65.224 2;3 2.1475E-67 65249 QUIQUE_DMIX5_190116_001 205.02 182.11 3193000000 225940000 281700000 386630000 377210000 238950000 271870000 311960000 116730000 148120000 69439000 243650000 220490000 300270000 10217 2304 9564 90338;90339;90340;90341;90342;90343;90344;90345;90346;90347;90348;90349;90350;90351;90352;90353 114693;114694;114695;114696;114697;114698;114699;114700;114701;114702;114703;114704;114705;114706;114707;114708;114709;114710;114711;114712;114713;114714;114715 114713 23 EILHAMGK Unmodified 897.47422 0.47422274 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.953 20.953 2 0.0032247 13956 QUIQUE_C1576_190116_001 160.03 104 3562500000 428570000 0 430540000 0 272980000 0 296270000 370700000 503090000 118190000 394360000 407130000 340680000 10218 2261 9565 90354;90355;90356;90357;90358;90359;90360;90361;90362;90363 114716;114717;114718;114719;114720;114721;114722;114723;114724;114725 114719 4 EILHHVNQAVR Unmodified 1314.7157 0.71566708 1369 M0QZR4;Q92888;M0R2C7;M0QYC1 ARHGEF1 Rho guanine nucleotide exchange factor 1 yes no 0 0 0 1 1 16.989 16.989 3 0.0049646 9147 QUIQUE_C1403_190116_001 56.359 41.483 31972000 0 0 14954000 17019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10219 1369 9566 90364;90365 114726;114727 114727 2 EILHSVYECIEK Unmodified 1518.7388 0.73882986 2348 P32189;Q14409;A6NP46;F8WC39 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 77.424 77.424 2;3 0.00052041 77396 QUIQUE_C1563_190116_001 96.034 5.4208 163100000 0 0 41905000 0 0 83205000 0 0 0 0 0 37989000 0 10220 2348 9567 90366;90367;90368 114728;114729;114730 114729 3 EILIPVFK Unmodified 957.5899 0.58990443 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.4 109.4 2 0.018116 112816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.462 49.794 1300000000 155370000 0 0 0 138060000 121110000 168750000 0 140620000 75603000 171240000 144230000 185060000 10221 2623 9568 90369;90370;90371;90372;90373;90374;90375;90376;90377;90378;90379;90380 114731;114732;114733;114734;114735;114736;114737;114738;114739;114740;114741;114742;114743;114744;114745;114746;114747;114748 114743 18 EILKEQENR Unmodified 1157.6041 0.60405094 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 13.776 13.776 3 0.0014404 6033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.731 61.439 19470000 0 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QUIQUE_C1218_190116_001 110.29 65.984 259540000 90351000 66446000 0 35912000 0 0 43353000 0 0 23475000 0 0 0 10225 330 9572 90396;90397;90398;90399;90400;90401 114764;114765;114766;114767;114768;114769 114765 2 EILLSADHIIIATGGRPR Unmodified 1931.0952 0.095244374 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A096LPK7;A0A096LPD9;E7EWK1;A0A096LNY7 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 85.143 85.143 4 0.03386 87238 QUIQUE_DMIX8_190116_001 30.428 23.857 17654000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17654000 10226 330 9573 90402 114770 114770 1 EILNLTSELLQK Unmodified 1399.7922 0.79224564 3485 Q86TU7;Q6NXR6;C9K0W5 SETD3 Histone-lysine N-methyltransferase setd3 yes no 0 0 0 1 123.42 123.42 2 0.050773 127102 QUIQUE_C1403_190116_001 57.174 24.956 26279000 0 0 0 26279000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10227 3485 9574 90403 114771 114771 1 EILQEAPELITEQLAHR Unmodified 1989.0531 0.053104788 3703 Q8WUY3;A0A088AWP5;X6R9J3 PRUNE2 Protein prune homolog 2 yes no 0 0 0 1 124.68 124.68 3 0.00014575 131259 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.872 51.272 28665000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28665000 0 0 10228 3703 9575 90404 114772 114772 1 EILQEEEDLAEIVQLVGK Unmodified 2054.0783 0.078316486 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 3 3 2 2 3 2 167.45 167.45 2;3 3.5571E-224 171452 QUIQUE_DMIX8_190116_001 273.3 242.02 34365000000 3837100000 4326400000 2948400000 3161700000 2794600000 2192200000 2279100000 1282500000 1840800000 1182800000 2581600000 3766400000 2171100000 10229 2414 9576 90405;90406;90407;90408;90409;90410;90411;90412;90413;90414;90415;90416;90417;90418;90419;90420;90421;90422;90423;90424;90425;90426;90427;90428;90429;90430;90431;90432;90433;90434 114773;114774;114775;114776;114777;114778;114779;114780;114781;114782;114783;114784;114785;114786;114787;114788;114789;114790;114791;114792;114793;114794;114795;114796;114797;114798;114799;114800;114801;114802;114803;114804;114805;114806;114807;114808;114809;114810;114811;114812;114813;114814;114815;114816;114817;114818;114819;114820 114819 46 EILQEIQR Unmodified 1027.5662 0.56620887 4608;1367;1350 K7ERH7;M0QZ28;M0R021;E9PEY4;E7EVB6;O60941;Q9Y4J8 DTNA;DTNB Dystrobrevin;Dystrobrevin beta;Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.648 53.648 2 0.0051766 52313 QUIQUE_C1438_190116_001 106.42 40.612 1721800000 156620000 181940000 187980000 0 174680000 232740000 199890000 0 0 86764000 0 180270000 320890000 10230 1350;1367;4608 9577 90435;90436;90437;90438;90439;90440;90441;90442;90443 114821;114822;114823;114824;114825;114826;114827;114828;114829;114830;114831;114832 114825 8 EILQTYGYEHILTLHNLEK Unmodified 2313.2005 0.20049731 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;A0A2R8Y5U3 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 1 109.63 109.63 4 0.025824 113457 QUIQUE_C1218_190116_001 28.813 20.213 21183000 21183000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10231 462 9578 90444 114833 114833 1 EILSDDKHDWDQR Unmodified 1655.754 0.75396265 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 39.83 39.83 2;3 0.004408 36583 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.342 60.906 281290000 0 82461000 0 0 0 0 0 0 0 0 59531000 69405000 69896000 10232 310;830 9579 90445;90446;90447;90448;90449 114834;114835;114836;114837;114838;114839 114835 4 EILSDDKHDWEQR Unmodified 1669.7696 0.76961272 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1;C9J151;C9JP76 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 39.669 39.669 3 0.0027041 35704 QUIQUE_C1403_190116_001 69.716 48.763 163650000 32442000 36283000 40520000 30258000 0 24153000 0 0 0 0 0 0 0 10233 1060 9580 90450;90451;90452;90453;90454 114840;114841;114842;114843;114844 114843 5 EILSEVER Unmodified 973.50803 0.50802529 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.776 46.776 2 0.0049014 42594 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.43 13.168 1827800000 375870000 287910000 240470000 0 0 0 260480000 0 203060000 183690000 0 0 276320000 10234 2527 9581 90455;90456;90457;90458;90459;90460;90461;90462;90463 114845;114846;114847;114848;114849;114850;114851;114852;114853 114852 9 EILSPVDIIDR Unmodified 1268.6976 0.69761697 1427 O14495;A0A286YES4;A0A286YEZ7;A0A286YF41 PPAP2B Lipid phosphate phosphohydrolase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.96 117.96 2 0.00015012 121702 QUIQUE_C1403_190116_001 128.27 99.352 921260000 81477000 80941000 47338000 96568000 67961000 55625000 43329000 62840000 110360000 42964000 74026000 61574000 96258000 10235 1427 9582 90464;90465;90466;90467;90468;90469;90470;90471;90472;90473;90474;90475;90476 114854;114855;114856;114857;114858;114859;114860;114861;114862;114863;114864;114865;114866;114867;114868;114869;114870;114871;114872;114873;114874 114862 21 EILSVDCSTNNPSQAK Unmodified 1761.8203 0.82032766 2005 P10909;H0YC35 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain;Clusterin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.227 51.227 2 3.0938E-54 49101 QUIQUE_DMIX1_190116_001 234.24 198.53 2866600000 233330000 305120000 302880000 280860000 297200000 262230000 362990000 82460000 114070000 92850000 181600000 154370000 196610000 10236 2005 9583 90477;90478;90479;90480;90481;90482;90483;90484;90485;90486;90487;90488;90489 114875;114876;114877;114878;114879;114880;114881;114882;114883;114884;114885;114886;114887;114888;114889 114884 15 EILTLLQGVHQGAGFQDIPK Unmodified 2163.1688 0.16880325 924 E9PGT1;Q15631;H7C1D4 TSN Translin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 123.23 123.23 2;3 3.7583E-87 128679 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.18 161.91 4800300000 494030000 445790000 480900000 366730000 395140000 217310000 327440000 323230000 447920000 144540000 414260000 394200000 348860000 10237 924 9584 90490;90491;90492;90493;90494;90495;90496;90497;90498;90499;90500;90501;90502;90503;90504;90505;90506;90507;90508;90509;90510;90511;90512 114890;114891;114892;114893;114894;114895;114896;114897;114898;114899;114900;114901;114902;114903;114904;114905;114906;114907;114908;114909;114910;114911;114912;114913;114914;114915 114912 24 EILTTACLAAQCIDR Unmodified 1733.844 0.84403999 3925 Q96QG7 MTMR9 Myotubularin-related protein 9 yes yes 0 0 0 1 101.5 101.5 2 0.0038174 104372 QUIQUE_C1277_190116_001 63.091 36.305 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10238 3925 9585 90513 114916 114916 1 EILVEESNVQR Unmodified 1314.6779 0.67794416 2693 P60510;H3BTA2;H3BV22;I3L4X0 PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 47.762 47.762 2 0.00071707 45082 QUIQUE_C1368_190116_001 123.5 60.623 59572000 0 0 40795000 0 0 0 0 0 0 0 0 18777000 0 10239 2693 9586 90514;90515 114917;114918 114917 2 EILVGDVGQTVDDPYATFVK Unmodified 2165.0892 0.089215523 2220 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;E9PLJ3;E9PS23 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 136.14 136.14 2;3 1.4867E-117 141610 QUIQUE_C1368_190116_001 223.06 182.48 51700000000 6418000000 5136300000 6008900000 5934700000 4265100000 5350000000 4119900000 1419100000 2689200000 2843200000 2794300000 2091700000 2629800000 10240 2220 9587 90516;90517;90518;90519;90520;90521;90522;90523;90524;90525;90526;90527;90528;90529;90530;90531;90532;90533;90534;90535;90536;90537;90538;90539;90540;90541 114919;114920;114921;114922;114923;114924;114925;114926;114927;114928;114929;114930;114931;114932;114933;114934;114935;114936;114937;114938;114939;114940;114941;114942;114943;114944;114945;114946;114947;114948;114949;114950;114951;114952;114953;114954;114955;114956;114957;114958;114959;114960;114961;114962;114963 114927 45 EILVGDVGVTITDPFK Unmodified 1701.9189 0.91890272 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 145.87 145.87 2 3.5248E-11 150339 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.45 87.726 881270000 104570000 81260000 91944000 70116000 0 126000000 106280000 57652000 76444000 100350000 66651000 0 0 10241 2702 9588 90542;90543;90544;90545;90546;90547;90548;90549;90550;90551;90552;90553;90554;90555;90556;90557;90558 114964;114965;114966;114967;114968;114969;114970;114971;114972;114973;114974;114975;114976;114977;114978;114979;114980;114981;114982 114978 15 EIMDAAEDYAK Unmodified 1254.5438 0.54381845 2083 P14868;H7C278 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 66.379 66.379 2 0.032618 67026 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.292 34.751 44907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44907000 0 0 10242 2083 9589 90559 114983 114983 1 EIMENYNIALR Unmodified 1364.6758 0.67583567 1949;587 P08603;B1AKG0;Q03591 CFH;CFHR1 Complement factor H;Complement factor H-related protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.101 89.101 2 0.0020567 92691 QUIQUE_C1438_190116_001 99.139 76.399 169640000 0 0 27229000 0 29229000 0 23814000 0 0 0 38580000 18356000 32429000 10243 1949;587 9590 90560;90561;90562;90563;90564;90565;90566 114984;114985;114986;114987;114988;114989;114990;114991 114986 6 EINGISVANQTVEQLQK Unmodified 1869.9796 0.97960549 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.92 105.92 2 7.6017E-89 109012 QUIQUE_DMIX3_190116_001 211.22 150.01 310580000 34195000 0 0 45482000 0 0 0 53913000 93861000 0 83133000 0 0 10244 472;1460 9591 90567;90568;90569;90570;90571;90572 114992;114993;114994;114995;114996;114997 114996 6 EINLLPDR Unmodified 968.5291 0.52909508 3112 Q15119;D6RDN9;D6RJH7;D6RGV8;D6RHG2 PDK2 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 71 71 2 0.048509 71068 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.109 32.109 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10245 3112 9592 90573;90574 114998;114999 114999 2 EINNAHAILTDATK Unmodified 1509.7787 0.77872084 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 45.368 45.368 2;3 2.2313E-115 42128 QUIQUE_C1438_190116_001 275.44 242.06 8013400000 753510000 880390000 828610000 993250000 837570000 710540000 931810000 75354000 383240000 231950000 520720000 377310000 489180000 10246 4162 9593 90575;90576;90577;90578;90579;90580;90581;90582;90583;90584;90585;90586;90587;90588;90589;90590;90591;90592;90593;90594;90595;90596;90597;90598;90599 115000;115001;115002;115003;115004;115005;115006;115007;115008;115009;115010;115011;115012;115013;115014;115015;115016;115017;115018;115019;115020;115021;115022;115023;115024;115025;115026;115027;115028;115029 115011 29 EINNAHAILTDATKR Unmodified 1665.8798 0.87983187 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 38.23 38.23 2;3 9.0831E-07 35069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.657 72.446 1622100000 0 79076000 68262000 0 72846000 0 91810000 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0.56122321 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 138.35 138.35 4 1.1868E-15 142808 QUIQUE_C1277_190116_001 77.065 74.8 53622000 0 53622000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10261 4140 9606 90713 115161 115161 1 EIQELQSKPDR Unmodified 1341.6888 0.6888432 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02;H0Y9I0;H0Y8L4 MLLT4 Afadin yes no 0 0 1 1 1 19.35 19.35 2 0.0021918 12094 QUIQUE_C1403_190116_001 118.4 82.892 41566000 0 0 0 23970000 0 0 0 0 0 0 17596000 0 0 10262 1258 9607 90714;90715 115162;115163 115162 1 EIQEPLESVEVNQETFR Unmodified 2045.9906 0.99056411 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 1 1 3 106.27 106.27 2;3 6.3463E-89 109712 QUIQUE_DMIX8_190116_001 256.95 237.85 252710000 0 0 0 0 0 25819000 0 0 82607000 0 0 37561000 106720000 10263 2515 9608 90716;90717;90718;90719;90720;90721 115164;115165;115166;115167;115168;115169 115167 4 EIQGFFNIPVDNLR Unmodified 1660.8573 0.85730551 1565 O60256;E7EPA1;C9JJS3;C9K0K7;C9JDU5;I3L0S1 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.01 140.01 2 1.4207E-29 145937 QUIQUE_C1218_190116_001 176.8 126.51 2342900000 186820000 0 189290000 190920000 154920000 143660000 205480000 203390000 216890000 86324000 315820000 248910000 200520000 10264 1565 9609 90722;90723;90724;90725;90726;90727;90728;90729;90730;90731;90732;90733 115170;115171;115172;115173;115174;115175;115176;115177;115178;115179;115180;115181 115170 12 EIQMLAR Unmodified 859.45857 0.45857268 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A2R8YDH3;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 40.306 40.306 2 0.054113 36626 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.618 24.445 35797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35797000 0 10265 266;1504 9610 90734 115182 115182 1 EIQNAVNGVK Unmodified 1070.572 0.57202253 2005 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protease 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 83.721 83.721 3 0.00025374 86356 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.87 50.41 272820000 0 0 77891000 0 0 0 0 54925000 0 0 81249000 58752000 0 10268 825 9613 90752;90753;90754;90755 115205;115206;115207;115208;115209 115208 5 EIQSGMLLR Unmodified 1045.559 0.559015 3916 Q96PE3;B8ZZB2 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 60.444 60.444 2 0.011393 59609 QUIQUE_C1277_190116_001 72.789 26.419 97663000 0 38600000 0 28998000 0 0 0 0 0 0 30065000 0 0 10269 3916 9614 90756;90757;90758 115210;115211;115212 115210 3 EIQTLMQFGDTEIK Unmodified 1651.8127 0.81272309 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 2 1 116.39 116.39 2;3 2.1872E-17 121319 QUIQUE_C1218_190116_001 150.04 115.24 2476900000 280410000 248340000 25627000 257890000 176550000 215600000 303360000 13743000 140950000 90704000 270750000 219170000 233840000 10270 335;1521 9615 90759;90760;90761;90762;90763;90764;90765;90766;90767;90768;90769;90770;90771;90772;90773;90774;90775;90776 115213;115214;115215;115216;115217;115218;115219;115220;115221;115222;115223;115224;115225;115226;115227;115228;115229;115230;115231;115232 115213 19 EIQTTTGNQQVLVR Unmodified 1585.8424 0.84238373 3670 Q8TC12 RDH11 Retinol dehydrogenase 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.074 46.074 2 2.9432E-37 42535 QUIQUE_DMIX8_190116_001 185.08 150.69 800800000 44300000 50986000 75127000 78866000 43401000 65941000 64767000 40873000 0 27648000 115480000 92576000 100830000 10271 3670 9616 90777;90778;90779;90780;90781;90782;90783;90784;90785;90786;90787;90788 115233;115234;115235;115236;115237;115238;115239;115240;115241;115242;115243;115244;115245 115245 13 EIQVIPLQR Unmodified 1094.6448 0.64479354 2286 P29218 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.277 74.277 2 2.6871E-06 71381 QUIQUE_DMIX4_190116_001 151.29 66.027 2579000000 308350000 301930000 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EIRPALELLEPIEQK Unmodified 1776.9986 0.99855002 2560 P50395 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 109.88 109.88 2;3 8.2024E-20 113573 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.85 140.13 11646000000 1051600000 1147000000 1101600000 1059200000 941720000 1108800000 1097500000 694950000 884410000 444960000 706710000 576110000 831300000 10275 2560 9620 90807;90808;90809;90810;90811;90812;90813;90814;90815;90816;90817;90818;90819;90820;90821;90822;90823;90824;90825;90826;90827;90828;90829;90830;90831;90832 115275;115276;115277;115278;115279;115280;115281;115282;115283;115284;115285;115286;115287;115288;115289;115290;115291;115292;115293;115294;115295;115296;115297;115298;115299;115300;115301;115302;115303;115304;115305;115306;115307;115308;115309;115310;115311;115312 115302 35 EIRPNSTVQWEEVCRPWVSGHR Unmodified 2721.3194 0.31940044 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 77.041 77.041 5 8.3972E-05 78523 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.728 47.106 201560000 0 0 0 29615000 38467000 0 0 41999000 0 0 49531000 0 41952000 10276 1785 9621 90833;90834;90835;90836;90837 115313;115314;115315;115316;115317;115318 115317 6 EISEAFTSTGFDR Unmodified 1458.6627 0.66268803 4062 Q9BXK5;A0A087WX97;A0A087WTL4;E9PDD6 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 85.862 85.862 2 0.032093 89024 QUIQUE_C1438_190116_001 67.93 43.809 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10277 4062 9622 90838 115319 115319 1 EISEITGGPINETLK Unmodified 1599.8356 0.83556702 1754 O95822 MLYCD Malonyl-CoA decarboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.079 86.079 2 0.0015102 88844 QUIQUE_C1218_190116_001 88.021 40.017 285580000 30964000 27099000 0 43571000 0 41089000 47548000 0 30294000 0 0 33453000 31561000 10278 1754 9623 90839;90840;90841;90842;90843;90844;90845;90846 115320;115321;115322;115323;115324;115325;115326;115327 115320 8 EISEVFPDQFIHLGGDEVEFK Unmodified 2434.1693 0.16925676 1925 P07686;Q5URX0;H0Y9B6 HEXB Beta-hexosaminidase subunit beta;Beta-hexosaminidase subunit beta chain B;Beta-hexosaminidase subunit beta chain A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.81 143.81 3 0.00045125 150893 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.117 49.568 460990000 48254000 48959000 48636000 46974000 62147000 0 53338000 0 0 0 64947000 49797000 37934000 10279 1925 9624 90847;90848;90849;90850;90851;90852;90853;90854;90855 115328;115329;115330;115331;115332;115333;115334;115335;115336 115334 8 EISFAYEVLSNPEK Unmodified 1624.7985 0.79845323 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 116.06 116.06 2;3 0.00017866 119120 QUIQUE_C1403_190116_001 110.08 94.933 607680000 9845200 0 0 166500000 104320000 0 115340000 0 205490000 6196500 0 0 0 10280 1600 9625 90856;90857;90858;90859;90860;90861;90862 115337;115338;115339;115340;115341;115342;115343;115344 115338 7 EISFAYEVLSNPEKR Unmodified 1780.8996 0.89956426 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 96.387 96.387 2;3 9.0776E-13 99796 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.7 101.16 1804200000 41128000 102120000 88548000 0 119710000 39134000 113760000 219300000 207470000 15221000 367640000 264150000 226000000 10281 1600 9626 90863;90864;90865;90866;90867;90868;90869;90870;90871;90872;90873;90874;90875;90876;90877;90878;90879;90880;90881;90882;90883 115345;115346;115347;115348;115349;115350;115351;115352;115353;115354;115355;115356;115357;115358;115359;115360;115361;115362;115363;115364;115365;115366;115367;115368;115369;115370 115365 25 EISGLWNELDSLK Unmodified 1502.7617 0.76167379 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;H0YJV5 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 140.99 140.99 2 0.00048513 143577 QUIQUE_C1563_190116_001 90.685 72.866 91982000 23831000 0 23356000 0 0 24143000 20652000 0 0 0 0 0 0 10282 3490 9627 90884;90885;90886;90887 115371;115372;115373;115374;115375 115374 3 EISLLPDNLLR Unmodified 1281.7293 0.72925145 3111 Q15118;C9JKT3;F8WEJ6;C9IYB4;F8WC75 PDK1 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 131.07 131.07 2 0.0018206 134988 QUIQUE_C1277_190116_001 96.331 74.245 108280000 23770000 23456000 20832000 0 0 16752000 0 23473000 0 0 0 0 0 10283 3111 9628 90888;90889;90890;90891;90892;90893;90894 115376;115377;115378;115379;115380;115381;115382 115377 7 EISLWFKPEELVDYK Unmodified 1894.9717 0.97166657 3222 Q32Q12;P22392 NME1-NME2;NME2 Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 139.13 139.13 2;3 6.9069E-43 145658 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.81 160.76 9765100000 645980000 584940000 1048700000 410410000 387500000 367850000 852110000 581590000 1153700000 359630000 1329100000 844390000 1199300000 10284 3222 9629 90895;90896;90897;90898;90899;90900;90901;90902;90903;90904;90905;90906;90907;90908;90909;90910;90911;90912;90913;90914 115383;115384;115385;115386;115387;115388;115389;115390;115391;115392;115393;115394;115395;115396;115397;115398;115399;115400;115401;115402;115403;115404;115405;115406;115407;115408;115409;115410 115404 28 EISNFEYLMFLNTIAGR Oxidation (M) 2032.9928 0.99281272 264;910 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9;E9PEM5;P50851;H0YAC6;A0A3B3IU76;A0A3B3IS13 NBEA;LRBA Neurobeachin;Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein no no 0 1 0 1 160.83 160.83 2 0.0010745 163051 QUIQUE_C1563_190116_001 67.456 43.707 17397000 0 0 0 0 0 17397000 0 0 0 0 0 0 0 10285 264;910 9630 90915 115411 115411 151 1 EISPDTTLLDLQNNDISELR Unmodified 2285.1387 0.13868491 2186 P21810;C9JKG1 BGN Biglycan yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 140.43 140.43 2;3 1.3072E-87 144546 QUIQUE_C1277_190116_001 202.13 167.13 989540000 168410000 203470000 80738000 224620000 95075000 65426000 31182000 0 0 79870000 0 40738000 0 10286 2186 9631 90916;90917;90918;90919;90920;90921;90922;90923;90924;90925;90926;90927;90928;90929;90930;90931;90932;90933 115412;115413;115414;115415;115416;115417;115418;115419;115420;115421;115422;115423;115424;115425;115426;115427;115428;115429;115430 115415 19 EISPDTTLLDLQNNDISELRK Unmodified 2413.2336 0.23364793 2186 P21810;C9JKG1 BGN Biglycan yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 120.07 120.07 3 7.1631E-65 123996 QUIQUE_C1277_190116_001 168.27 154.4 2076800000 140340000 287660000 97296000 225170000 148220000 154720000 341330000 0 0 94037000 117750000 286490000 183810000 10287 2186 9632 90934;90935;90936;90937;90938;90939;90940;90941;90942;90943;90944;90945 115431;115432;115433;115434;115435;115436;115437;115438;115439;115440;115441;115442;115443;115444 115433 11 EISPGSGPGEIR Unmodified 1197.599 0.59896556 933;1529 E9PHY5;E9PK52;O43491;Q6R5J7;E9PMV8 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.412 36.412 2 0.00047931 31885 QUIQUE_C1563_190116_001 127.4 89.889 1525800000 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0.18319226 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.12 163.12 3 4.648E-24 167160 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.79 121.17 646910000 52959000 58715000 67439000 0 51374000 0 0 54254000 75948000 0 73478000 74573000 138160000 10291 3555 9636 90966;90967;90968;90969;90970;90971;90972;90973;90974 115468;115469;115470;115471;115472;115473;115474;115475;115476 115475 8 EITALAPSTM Unmodified 1032.5161 0.51614714 447 A0A2R8Y793 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 93.574 93.574 1;2 0.00025579 95546 QUIQUE_C1403_190116_001 117.18 89.003 300080000 42001000 79915000 47976000 40373000 0 39331000 33907000 0 0 16581000 0 0 0 10292 447 9637 90975;90976;90977;90978;90979;90980;90981;90982 115477;115478;115479;115480;115481;115482;115483;115484;115485;115486 115481 7 EITALAPSTMK Unmodified 1160.6111 0.61111015 2788;2696;2792;2759;548 A6NL76;P60709;A0A2R8YFE2;P62736;P63267;P63261;P68032;P68133 ACTA1;ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 1 2 54.994 54.994 2 1.8712E-08 56015 QUIQUE_C1218_190116_001 155.84 125.68 211880000000 18063000000 19775000000 19526000000 18952000000 15416000000 16036000000 17958000000 15803000000 14596000000 8272400000 16679000000 14531000000 16270000000 10293 548;2696;2759;2788;2792 9638 90983;90984;90985;90986;90987;90988;90989;90990;90991;90992;90993;90994;90995;90996;90997;90998;90999;91000;91001;91002;91003;91004;91005;91006 115487;115488;115489;115490;115491;115492;115493;115494;115495;115496;115497;115498;115499;115500;115501;115502;115503;115504;115505;115506;115507;115508;115509;115510;115511;115512;115513;115514;115515;115516;115517;115518;115519;115520;115521;115522;115523;115524;115525;115526;115527;115528;115529;115530;115531;115532;115533;115534;115535;115536;115537;115538;115539;115540;115541;115542;115543;115544;115545;115546;115547;115548;115549;115550 115488 62 EITALAPSTMK Oxidation (M) 1176.606 0.60602477 2788;2696;2792;2759;548 A6NL76;P60709;A0A2R8YFE2;P62736;P63267;P63261;P68032;P68133 ACTA1;ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 1 0 1 2 1 1 1 3 5 4 3 3 1 1 42.355 42.355 2 6.2743E-05 34261 QUIQUE_C1438_190116_001 136.99 82.378 75763000000 0 54171000 8194800000 6294000000 5905800000 5622100000 5492800000 6996000000 7950200000 7363200000 7463300000 7345200000 7081100000 10294 548;2696;2759;2788;2792 9638 91007;91008;91009;91010;91011;91012;91013;91014;91015;91016;91017;91018;91019;91020;91021;91022;91023;91024;91025;91026;91027;91028;91029;91030;91031;91032 115551;115552;115553;115554;115555;115556;115557;115558;115559;115560;115561;115562;115563;115564;115565;115566;115567;115568;115569;115570;115571;115572;115573;115574;115575;115576;115577;115578;115579;115580;115581;115582;115583;115584;115585;115586;115587;115588;115589;115590;115591;115592;115593;115594;115595;115596;115597;115598;115599;115600;115601;115602 115560 366 51 EITENLMATGDLDQDGR Unmodified 1876.8473 0.84727069 2066 P13796;Q5TBN3 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 0 1 95.949 95.949 2 2.3083E-05 92697 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.55 76.26 14279000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14279000 0 0 0 10295 2066 9639 91033 115603 115603 1 EITFENGEELTEEGLPFLILFHMK Unmodified 2835.4041 0.40408408 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 1 169.6 169.6 3 1.9998E-06 176913 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.222 55.061 57420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57420000 0 0 10296 4007 9640 91034 115604 115604 1 EITFLDAK Unmodified 935.4964 0.49639797 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 71.963 71.963 2 0.065856 72639 QUIQUE_C1576_190116_001 51.854 15.974 19598000 0 0 0 0 0 0 19598000 0 0 0 0 0 0 10297 3210 9641 91035 115605 115605 1 EITGIGPSTTTETETIAK Unmodified 1847.9364 0.93640328 1635 O75436;S4R3Q6 VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.215 72.215 2 3.5502E-45 73590 QUIQUE_C1218_190116_001 171.73 139.13 1166500000 118030000 125330000 0 105750000 109530000 87404000 114350000 0 114110000 0 143690000 133990000 114260000 10298 1635 9642 91036;91037;91038;91039;91040;91041;91042;91043;91044;91045 115606;115607;115608;115609;115610;115611;115612;115613;115614;115615;115616 115606 10 EITKPLRPLGK Unmodified 1250.7711 0.77105669 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;H7C0V6 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 20.542 20.542 2;3 0.015658 14215 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.132 49.555 599420000 0 0 131160000 0 0 0 156250000 104020000 176510000 0 31467000 0 0 10299 922 9643 91046;91047;91048;91049;91050;91051 115617;115618;115619;115620;115621;115622 115619 3 EITLENKDNIR Unmodified 1343.7045 0.70449327 4288 Q9NT62;C9JNW8 ATG3 Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3 yes no 0 0 1 1 1 1 31.315 31.315 2 0.0056643 26342 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.55 53.506 87415000 0 0 0 0 0 0 0 36186000 0 0 0 0 51228000 10300 4288 9644 91052;91053;91054 115623;115624;115625;115626 115625 4 EITQDTNDITYADLNLPK Unmodified 2063.0059 0.005879824 2803 P78324 SIRPA Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 111.94 111.94 2;3 4.327E-45 117203 QUIQUE_C1438_190116_001 205.61 179.96 1290700000 104750000 115860000 83820000 143580000 150450000 117130000 117630000 65292000 99649000 94372000 0 94108000 104090000 10301 2803 9645 91055;91056;91057;91058;91059;91060;91061;91062;91063;91064;91065;91066;91067;91068 115627;115628;115629;115630;115631;115632;115633;115634;115635;115636;115637;115638;115639;115640;115641;115642 115633 14 EITTCLPDYYK Unmodified 1401.6486 0.64861787 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 83.646 83.646 2 0.026423 84795 QUIQUE_C1403_190116_001 62.823 43.845 25663000 0 0 0 25663000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10302 3100 9646 91069 115643 115643 1 EIVDPLYGIAEVEIPNIQK Unmodified 2139.1463 0.14633647 3353 Q68EM7;C9IZD3;I3L4P6 ARHGAP17 Rho GTPase-activating protein 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 154.78 154.78 2 2.607E-16 157497 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.48 102.73 143900000 23209000 0 0 0 25900000 0 0 16239000 30332000 0 0 0 48222000 10303 3353 9647 91070;91071;91072;91073;91074 115644;115645;115646;115647;115648 115646 5 EIVDSYLPVILDIIK Unmodified 1728.9913 0.99133938 1924 P07602;C9JIZ6 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 171.04 171.04 2;3 6.8251E-06 172146 QUIQUE_C1563_190116_001 126.1 101.76 3157000000 334570000 67871000 1248200000 28722000 528830000 497080000 328700000 16879000 36618000 0 0 69558000 0 10304 1924 9648 91075;91076;91077;91078;91079;91080;91081;91082;91083;91084;91085;91086;91087 115649;115650;115651;115652;115653;115654;115655;115656;115657;115658;115659;115660;115661;115662;115663;115664 115657 15 EIVDWFNALR Unmodified 1261.6455 0.64552182 1129 H0Y7Q1;O75689;A0A087WTN6;H7C324;H7BZT6;H7C4B3;H7C264;J3KST1;K7ENT1;J3QLP8;Q2V6Q1;Q9NPF8 ADAP1;ADAP2;CENTA2 Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 1;Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 145.55 145.55 2 0.011291 149917 QUIQUE_C1403_190116_001 91.853 66.959 53974000 0 0 0 36085000 0 0 0 0 0 0 17889000 0 0 10305 1129 9649 91088;91089;91090;91091;91092;91093;91094 115665;115666;115667;115668;115669;115670;115671 115667 6 EIVEMNEIEEGK Unmodified 1418.6599 0.65991084 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 73.889 73.889 2 0.046992 74578 QUIQUE_C1218_190116_001 45.126 23.068 23723000 23723000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10306 4145 9650 91095 115672 115672 1 EIVESCDLK Unmodified 1091.5169 0.51687542 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y8V7;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.759 34.759 2 0.0052265 30522 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.181 28.399 426180000 0 58744000 56769000 54418000 74360000 0 0 0 37398000 0 75174000 0 69319000 10307 821 9651 91096;91097;91098;91099;91100;91101;91102 115673;115674;115675;115676;115677;115678;115679;115680 115677 8 EIVHIQAGQCGNQIGTK Unmodified 1851.9261 0.92613014 4033 Q9BUF5;K7ESM5;K7EL29;K7EN98;K7ESQ3;K7EQT3;K7EJ64;K7ERA8;K7EJZ4;K7EPE5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes no 0 0 0 1 1 1 2 4 4 2 2 3 39.777 39.777 2;3 4.7298E-13 38746 QUIQUE_C1218_190116_001 89.232 73.388 1583200000 51602000 0 0 0 58674000 0 0 249660000 293970000 219050000 178890000 203130000 328180000 10308 4033 9652 91103;91104;91105;91106;91107;91108;91109;91110;91111;91112;91113;91114;91115;91116;91117;91118;91119;91120;91121;91122 115681;115682;115683;115684;115685;115686;115687;115688;115689;115690;115691;115692;115693;115694;115695;115696;115697;115698;115699;115700;115701;115702;115703;115704;115705;115706;115707 115681 27 EIVHLQAGQCGNQIGAK Unmodified 1821.9156 0.91556545 2797;1862;1364;1363 P04350;M0R2D3;M0QY85;M0R278;M0R0X0;M0QX14;M0QZL7;M0R2T4;P68371;M0QYM7;M0R042;M0QY37 TUBB4A;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain no no 0 0 0 3 7 5 4 4 5 5 4 5 4 5 4 5 43.334 43.334 2;3 9.0212E-202 40729 QUIQUE_C1277_190116_001 312.31 0 368340000000 28298000000 37476000000 24379000000 33419000000 38884000000 28108000000 39937000000 18004000000 23035000000 12570000000 27617000000 25244000000 31369000000 10309 1862;2797;1364;1363 9653 91123;91124;91125;91126;91127;91128;91129;91130;91131;91132;91133;91134;91135;91136;91137;91138;91139;91140;91141;91142;91143;91144;91145;91146;91147;91148;91149;91150;91151;91152;91153;91154;91155;91156;91157;91158;91159;91160;91161;91162;91163;91164;91165;91166;91167;91168;91169;91170;91171;91172;91173;91174;91175;91176;91177;91178;91179;91180;91181;91182 115708;115709;115710;115711;115712;115713;115714;115715;115716;115717;115718;115719;115720;115721;115722;115723;115724;115725;115726;115727;115728;115729;115730;115731;115732;115733;115734;115735;115736;115737;115738;115739;115740;115741;115742;115743;115744;115745;115746;115747;115748;115749;115750;115751;115752;115753;115754;115755;115756;115757;115758;115759;115760;115761;115762;115763;115764;115765;115766;115767;115768;115769;115770;115771;115772;115773;115774;115775;115776;115777;115778;115779;115780;115781;115782;115783;115784;115785;115786;115787;115788;115789;115790;115791;115792;115793;115794;115795;115796;115797;115798;115799 115717 87 EIVLADVIDNDSWR Unmodified 1643.8155 0.81550028 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 140.16 140.16 2;3 3.9808E-18 146977 QUIQUE_C1438_190116_001 191.53 149.53 6251400000 485160000 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1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.829 54.829 2 7.9618E-06 53734 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.78 91.75 892480000 0 0 222270000 0 0 103190000 0 0 145550000 45702000 177300000 0 198470000 10312 1961 9656 91218;91219;91220;91221;91222;91223 115838;115839;115840;115841;115842;115843 115842 6 EIVTNFLAGFEA Unmodified 1309.6554 0.65541781 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 165.98 165.98 2 0.00053086 167283 QUIQUE_C1563_190116_001 100.02 80.923 10801000000 1460000000 981660000 1832800000 773990000 879650000 1240700000 974950000 465330000 566480000 0 530640000 514520000 580490000 10313 2243 9657 91224;91225;91226;91227;91228;91229;91230;91231;91232;91233;91234;91235;91236 115844;115845;115846;115847;115848;115849;115850;115851;115852;115853;115854;115855;115856;115857;115858;115859;115860;115861;115862;115863;115864;115865;115866;115867;115868;115869 115852 26 EIVVIHQDPEALK Unmodified 1489.814 0.81404372 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 1 1 3 2 2 56.921 56.921 2;3 1.0621E-05 56255 QUIQUE_C1438_190116_001 111.86 91.825 618540000 24042000 63419000 39699000 44534000 42179000 34982000 49578000 24031000 30242000 20664000 89702000 64947000 90525000 10314 2441 9658 91237;91238;91239;91240;91241;91242;91243;91244;91245;91246;91247;91248;91249;91250;91251;91252;91253;91254;91255;91256;91257 115870;115871;115872;115873;115874;115875;115876;115877;115878;115879;115880;115881;115882;115883;115884;115885;115886;115887;115888;115889;115890;115891;115892;115893 115879 22 EIVVLETLEDIDK Unmodified 1514.808 0.80795528 3128 Q15293;E9PP27 RCN1 Reticulocalbin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.27 144.27 2 3.3208E-11 148962 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.23 123.19 1067800000 217790000 183160000 0 88787000 130370000 160320000 129070000 34781000 70829000 0 0 0 52722000 10315 3128 9659 91258;91259;91260;91261;91262;91263;91264;91265;91266;91267 115894;115895;115896;115897;115898;115899;115900;115901;115902;115903;115904;115905;115906;115907 115905 14 EIWDMFGVFFANHPDLR Oxidation (M) 2108.9778 0.97783136 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 2 1 1 1 2 155.54 155.54 3 0.00015299 160067 QUIQUE_C1277_190116_001 74.786 65.037 428580000 61080000 82742000 47165000 0 0 0 70445000 0 37035000 0 130120000 0 0 10316 1639 9660 91268;91269;91270;91271;91272;91273;91274;91275;91276 115908;115909;115910;115911;115912;115913;115914;115915;115916 115911 884 9 EIWDMFGVFFANHPDLR Unmodified 2092.9829 0.98291673 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 167.82 167.82 2;3 7.3914E-75 174941 QUIQUE_DMIX5_190116_001 198.03 180.82 1112100000 0 21381000 20578000 14829000 0 0 98672000 0 128240000 0 494670000 283520000 50179000 10317 1639 9660 91277;91278;91279;91280;91281;91282;91283;91284;91285;91286;91287 115917;115918;115919;115920;115921;115922;115923;115924;115925;115926;115927;115928 115924 11 EIWDMFGVFFANHPDLRR Unmodified 2249.084 0.084027761 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 79.422 79.422 4 0.064136 75627 QUIQUE_DMIX4_190116_001 9.9958 1.5161 16452000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16452000 0 0 0 10318 1639 9661 91288 115929 115929 1 EIWGVEPSDLQIPPPNIPR Unmodified 2156.1266 0.12660408 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 142.19 142.19 2;3 0.00016056 144457 QUIQUE_C1563_190116_001 105.17 97.805 333330000 101990000 0 0 74020000 18459000 65526000 49745000 0 0 23595000 0 0 0 10319 2016 9662 91289;91290;91291;91292;91293;91294;91295;91296;91297;91298;91299;91300;91301;91302 115930;115931;115932;115933;115934;115935;115936;115937;115938;115939;115940;115941;115942;115943 115937 9 EIWGVEPSDLQIPPPNIPRD Unmodified 2271.1535 0.15354711 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 1 2 3 4 6 4 5 5 5 3 5 4 3 142.8 142.8 2;3 2.2295E-66 147232 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.56 166.14 2458700000 0 64497000 235830000 160820000 197930000 131750000 253450000 269910000 292240000 53995000 314670000 263830000 219760000 10320 2016 9663 91303;91304;91305;91306;91307;91308;91309;91310;91311;91312;91313;91314;91315;91316;91317;91318;91319;91320;91321;91322;91323;91324;91325;91326;91327;91328;91329;91330;91331;91332;91333;91334;91335;91336;91337;91338;91339;91340;91341;91342;91343;91344;91345;91346;91347;91348;91349;91350;91351 115944;115945;115946;115947;115948;115949;115950;115951;115952;115953;115954;115955;115956;115957;115958;115959;115960;115961;115962;115963;115964;115965;115966;115967;115968;115969;115970;115971;115972;115973;115974;115975;115976;115977;115978;115979;115980;115981;115982;115983;115984;115985;115986;115987;115988;115989;115990;115991;115992;115993;115994;115995;115996;115997;115998;115999;116000;116001;116002;116003;116004;116005;116006;116007;116008;116009;116010;116011;116012;116013 115981 66 EIWGVEPSR Unmodified 1071.5349 0.53490874 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.2 64.2 2 0.0023637 64380 QUIQUE_C1438_190116_001 94.114 65.94 2908000000 64922000 159310000 196570000 255630000 194220000 192470000 293300000 262890000 374150000 96626000 162290000 347250000 308380000 10321 2017 9664 91352;91353;91354;91355;91356;91357;91358;91359;91360;91361;91362;91363;91364 116014;116015;116016;116017;116018;116019;116020;116021;116022;116023;116024;116025;116026 116018 12 EIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLR Oxidation (M) 3739.7644 0.76441605 1963 P09471;A0A1W2PP38;A0A1W2PQ24 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 1 0 1 173.89 173.89 3 8.3522E-14 181108 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.104 58.559 22927000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22927000 0 0 10322 1963 9665 91365 116027 116027 1227 1 EIYCPAPPQIDNGIIQGER Unmodified 2169.0525 0.052452861 597 H3BLV0;B1AP13;H7BY55;P08174;B1AP15;A0A2R8YDY3;A0A2R8YEC5 CD55 Complement decay-accelerating factor yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 104.89 104.89 2;3 1.3579E-22 109067 QUIQUE_C1218_190116_001 137.8 124.92 282500000 25902000 117180000 0 27840000 31904000 0 32037000 0 0 0 0 0 47638000 10323 597 9666 91366;91367;91368;91369;91370;91371;91372;91373 116028;116029;116030;116031;116032;116033;116034;116035 116028 8 EIYDDSFIR Unmodified 1156.5401 0.5400537 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 55.46 55.46 3 0.03229 53139 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.892 7.9696 13292000 0 0 0 0 0 0 0 13292000 0 0 0 0 0 10324 4334 9667 91374 116036 116036 1 EIYDDSFIRPVTFWIVGDFDSPSGR Unmodified 2917.3923 0.39227384 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 1 1 167.91 167.91 3 0.065365 171970 QUIQUE_DMIX7_190116_001 24.629 19.175 30055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30055000 0 10325 4334 9668 91375 116037 116037 1 EIYDQFGEEGLK Unmodified 1426.6616 0.6616254 4416 Q9UDY4;C9JUL4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes no 0 0 0 1 89.132 89.132 2 0.018678 85631 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.29 67.778 26373000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26373000 0 0 0 10326 4416 9669 91376 116038 116038 0 EIYDQFGEEGLKGGAGGTDGQGGTFR Unmodified 2645.1994 0.19938769 4416 Q9UDY4;C9JUL4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes no 0 0 1 1 90.773 90.773 3 3.898E-09 91738 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.19 69.198 49477000 0 0 0 0 0 0 0 49477000 0 0 0 0 0 10327 4416 9670 91377 116039 116039 1 EIYEESSTWK Unmodified 1270.5717 0.57174776 1768 O96007 MOCS2 Molybdopterin synthase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 54.154 54.154 2 0.014657 53252 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.04 55.127 45288000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45288000 0 0 10328 1768 9671 91378 116040 116040 1 EIYGSTLYDSR Unmodified 1302.6092 0.6091959 3922 Q96Q05 TRAPPC9 Trafficking protein particle complex subunit 9 yes yes 0 0 0 1 1 65.349 65.349 2 0.052925 66206 QUIQUE_C1438_190116_001 60.398 44.959 61874000 0 0 33134000 0 28740000 0 0 0 0 0 0 0 0 10329 3922 9672 91379;91380 116041;116042 116042 1 EIYHFTLEK Unmodified 1178.5972 0.59717465 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 60.902 60.902 2;3 3.5208E-05 57963 QUIQUE_DMIX4_190116_001 156.75 84.525 915190000 0 140790000 0 0 158130000 0 115340000 115540000 0 0 137230000 112890000 135280000 10330 824 9673 91381;91382;91383;91384;91385;91386;91387;91388;91389;91390;91391 116043;116044;116045;116046;116047;116048;116049;116050;116051;116052;116053;116054 116051 12 EIYLPIR Unmodified 902.52255 0.52255314 3227 Q3SXM5 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.714 79.714 2 0.026457 81715 QUIQUE_C1218_190116_001 93.885 40.7 362540000 49377000 53156000 0 0 0 0 0 52867000 61734000 22130000 65289000 0 57988000 10331 3227 9674 91392;91393;91394;91395;91396;91397;91398 116055;116056;116057;116058;116059;116060;116061 116055 7 EIYNQVNVVLK Unmodified 1317.7293 0.72925145 4300 Q9NUQ9;E5RI16;E5RGI7;E5RJE1;E5RIR8;E5RJL8;E5RK61;E5RFS4;E5RHU5;E5RK81;E5RH75 FAM49B Protein FAM49B yes no 0 0 0 1 1 1 82.402 82.402 2 0.0028712 78866 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.629 63.272 173380000 64688000 57554000 0 0 0 0 0 0 0 51141000 0 0 0 10332 4300 9675 91399;91400;91401 116062;116063;116064;116065 116064 2 EIYPYVIQELRPTLNELGISTPEELGLDKV Unmodified 3427.8127 0.81265332 2170 P20674;H3BRM5;H3BV69 COX5A Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 168.17 168.17 2;3;4 1.0276E-64 175526 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.24 133.61 11103000000 108130000 0 0 0 1171500000 0 2808500000 785910000 1500500000 0 1342800000 3385600000 0 10333 2170 9676 91402;91403;91404;91405;91406;91407;91408;91409;91410;91411;91412;91413 116066;116067;116068;116069;116070;116071;116072;116073;116074;116075;116076;116077;116078 116076 11 EIYQEALK Unmodified 992.51786 0.51786169 3357 Q6DKK2 TTC19 Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 41.059 41.059 2 0.020821 38040 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.134 7.8222 36635000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36635000 0 0 10334 3357 9677 91414 116079;116080 116080 2 EIYRPVTTWPFIIK Unmodified 1761.9818 0.98177775 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 127.05 127.05 3 0.0037369 129475 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.292 56.741 95972000 28820000 0 0 38888000 0 0 0 28264000 0 0 0 0 0 10335 3405 9678 91415;91416;91417 116081;116082;116083 116083 3 EIYTHFTCATDTK Unmodified 1585.7083 0.70825802 1870;2779;1953 P63096;P08754;P04899 GNAI1;GNAI3;GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1;Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 45.106 45.106 2;3 4.708E-103 42161 QUIQUE_DMIX3_190116_001 233.54 212.67 9905300000 504760000 662340000 1212300000 1137100000 1343200000 0 784220000 511720000 634870000 167780000 1044600000 798950000 1103500000 10336 2779;1953;1870 9679 91418;91419;91420;91421;91422;91423;91424;91425;91426;91427;91428;91429;91430;91431;91432;91433;91434;91435;91436;91437;91438;91439 116084;116085;116086;116087;116088;116089;116090;116091;116092;116093;116094;116095;116096;116097;116098;116099;116100;116101;116102;116103;116104;116105;116106;116107;116108;116109;116110;116111;116112;116113;116114 116104 30 EIYTNLGPR Unmodified 1061.5506 0.55055881 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 1 1 50.455 50.455 2 0.016207 48445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.073 28.427 119810000 0 0 0 35798000 0 0 0 45737000 38278000 0 0 0 0 10337 1414;3777 9680 91440;91441;91442;91443 116115;116116;116117;116118 116117 4 EIYYHGEPISVNVHVTNNTNK Unmodified 2427.1819 0.18188713 2528;1150 P49407;E9PM35;H0YET9 ARRB1 Beta-arrestin-1 no no 0 0 0 2 1 3 1 1 2 1 64.622 64.622 3;4 3.6607E-09 61772 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.43 60.31 536680000 88917000 58890000 86126000 80979000 57563000 127800000 0 0 0 36400000 0 0 0 10338 2528;1150 9681 91444;91445;91446;91447;91448;91449;91450;91451;91452;91453;91454 116119;116120;116121;116122;116123;116124;116125;116126;116127;116128;116129;116130;116131 116131 12 EKADIQLLVYTIDDLIDK Unmodified 2104.1304 0.13035206 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 1 2 1 1 167.63 167.63 2;3 3.3516E-53 174796 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116149;116150;116151;116152;116153;116154;116155;116156;116157;116158;116159;116160;116161;116162;116163;116164;116165;116166 116166 17 EKAEGDVAALNRR Unmodified 1427.7481 0.74808942 435;2791 A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;P67936 TPM4 Tropomyosin alpha-4 chain no no 0 0 2 1 1 1 1 16.258 16.258 3;4 0.0097055 9169 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.176 48.258 176370000 0 0 0 0 0 0 0 62322000 82983000 0 15509000 0 15557000 10341 435;2791 9684 91489;91490;91491;91492 116167;116168;116169;116170 116167 4 EKAPDFLPLLNK Unmodified 1383.7762 0.77620165 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.343 98.343 3 0.0090071 100432 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.551 50.55 164880000 0 0 23382000 17727000 25869000 0 0 19581000 18740000 0 0 25848000 33737000 10342 1654 9685 91493;91494;91495;91496;91497;91498;91499;91500 116171;116172;116173;116174;116175;116176;116177;116178;116179 116179 9 EKAPSIIFIDELDAIGTK Unmodified 1959.0565 0.056458831 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 138.42 138.42 2;3 0.0031857 141914 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.506 67.957 775190000 0 82373000 0 0 85938000 0 83155000 106680000 87036000 0 130560000 93425000 106030000 10343 4672 9686 91501;91502;91503;91504;91505;91506;91507;91508;91509;91510 116180;116181;116182;116183;116184;116185;116186;116187;116188;116189;116190;116191;116192 116183 10 EKDILTAIAADLCK Unmodified 1559.8229 0.82289384 2587 P51648;J3QRD1;J3QKK9;J3KTG1;C9JGJ2;I3L0X1;K7EN73 ALDH3A2 Fatty aldehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.53 128.53 3 0.00031384 132881 QUIQUE_C1368_190116_001 65.038 52.117 253820000 37565000 16871000 39771000 20725000 28293000 25232000 30635000 23805000 0 14969000 0 15959000 0 10344 2587 9687 91511;91512;91513;91514;91515;91516;91517;91518;91519;91520 116193;116194;116195;116196;116197;116198;116199;116200;116201;116202 116195 10 EKDILVLPLDLTDTGSHEAATK Unmodified 2365.2377 0.23767067 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJE4 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 2 106.16 106.16 3;4 1.1525E-07 109589 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.059 74.443 618720000 0 87390000 57146000 114420000 0 69123000 42986000 52255000 37413000 10904000 44888000 0 102200000 10345 4581 9688 91521;91522;91523;91524;91525;91526;91527;91528;91529;91530;91531;91532;91533;91534;91535 116203;116204;116205;116206;116207;116208;116209;116210;116211;116212;116213;116214;116215;116216;116217;116218;116219;116220 116215 18 EKDIQEESTFSSR Unmodified 1554.7162 0.71618016 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 27.247 27.247 2 3.3202E-06 21793 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.56 107.65 156270000 39265000 0 0 0 0 0 0 31583000 52365000 0 33053000 0 0 10346 2452 9689 91536;91537;91538;91539 116221;116222;116223;116224;116225;116226 116223 6 EKDLEDLFYK Unmodified 1298.6394 0.63943339 2980 Q13242;H0YIB4;S4R3G0 SRSF9 Serine/arginine-rich splicing factor 9 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.424 86.424 2;3 0.0065939 87841 QUIQUE_C1277_190116_001 57.785 39.45 192520000 32860000 39199000 0 45697000 0 0 0 21648000 28345000 0 0 24767000 0 10347 2980 9690 91540;91541;91542;91543;91544;91545 116227;116228;116229;116230;116231;116232 116228 6 EKDNIDITLQWLIQHSK Unmodified 2080.0953 0.095303954 3808;4308 Q96BM9;Q9NVJ2 ARL8A;ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8A;ADP-ribosylation factor-like protein 8B no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 131.34 131.34 2;3;4 1.3744E-30 135527 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.87 104.57 3435500000 180740000 256670000 291230000 200830000 150830000 207510000 377070000 275480000 467790000 69357000 281180000 346830000 329950000 10348 3808;4308 9691 91546;91547;91548;91549;91550;91551;91552;91553;91554;91555;91556;91557;91558;91559;91560;91561;91562;91563;91564;91565;91566;91567;91568;91569;91570;91571;91572 116233;116234;116235;116236;116237;116238;116239;116240;116241;116242;116243;116244;116245;116246;116247;116248;116249;116250;116251;116252;116253;116254;116255;116256;116257;116258;116259;116260;116261;116262;116263;116264;116265;116266;116267;116268;116269;116270;116271;116272;116273;116274;116275 116259 43 EKDPFEVDLSHVYLAYTEESLR Unmodified 2639.2755 0.27551274 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496;H7C2F6 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 1 1 142.76 142.76 3 1.4165E-07 150216 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.56 75.114 29431000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29431000 0 0 10349 88 9692 91573 116276 116276 1 EKDTATLNCQSSGSKPAAR Unmodified 2019.9644 0.96436614 3569 Q8N126;A0A0C4DG09 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes no 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 10.385 10.385 3;4 7.9356E-172 2622 QUIQUE_DMIX8_190116_001 245.03 196.82 881660000 40593000 0 52855000 164690000 142790000 0 71414000 74684000 128150000 12703000 34698000 84645000 74442000 10350 3569 9693 91574;91575;91576;91577;91578;91579;91580;91581;91582;91583;91584;91585;91586;91587;91588;91589;91590;91591;91592;91593 116277;116278;116279;116280;116281;116282;116283;116284;116285;116286;116287;116288;116289;116290;116291;116292;116293;116294;116295;116296;116297 116296 21 EKDVFDDIPK Unmodified 1204.5976 0.59756858 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 62.701 62.701 2;3 0.026885 60972 QUIQUE_C1563_190116_001 41.704 28.613 144000000 0 0 0 0 0 68681000 0 24716000 0 0 0 0 50599000 10351 2009 9694 91594;91595;91596 116298;116299;116300 116298 3 EKDVFDDIPKWEGK Unmodified 1704.8359 0.83590137 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 2 1 86.81 86.81 4 0.0015796 87803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.98 48.921 47064000 0 0 0 0 0 0 0 47064000 0 0 0 0 0 10352 2009 9695 91597 116301;116302 116302 2 EKEDAQEVELQEGK Unmodified 1630.7686 0.76860967 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 1 24.26 24.26 2 0.010669 18069 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4.7327E-11 116875 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.136 59.047 42904000 0 0 0 0 0 0 0 42904000 0 0 0 0 0 10355 2282 9698 91624 116338 116338 1 EKEDPEPSTDGTYVWK Unmodified 1879.8476 0.84758827 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 56.221 56.221 2;3 3.1123E-54 54636 QUIQUE_DMIX3_190116_001 194.98 138.75 1514300000 117960000 146550000 133680000 115200000 148550000 111430000 147830000 105590000 144810000 0 222730000 119910000 0 10356 4435 9699 91625;91626;91627;91628;91629;91630;91631;91632;91633;91634;91635;91636;91637;91638;91639;91640;91641;91642;91643;91644;91645;91646;91647 116339;116340;116341;116342;116343;116344;116345;116346;116347;116348;116349;116350;116351;116352;116353;116354;116355;116356;116357;116358;116359;116360;116361;116362;116363;116364 116358 21 EKEEFAVPENSSVQQFK Unmodified 1994.9585 0.9585357 4433;4503 Q9UHD9;Q9UMX0 UBQLN2;UBQLN1 Ubiquilin-2;Ubiquilin-1 no no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 68.619 68.619 2;3 2.8714E-103 68158 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116382;116383;116384;116385;116386;116387 116383 3 EKEEVAEEAQSGGD Unmodified 1476.6216 0.62161108 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.909 19.909 2 1.218E-45 12996 QUIQUE_C1218_190116_001 218.01 200.15 4229000000 412250000 354880000 308560000 378260000 379440000 219760000 579560000 121650000 254160000 0 321760000 334480000 564190000 10360 1681 9703 91670;91671;91672;91673;91674;91675;91676;91677;91678;91679;91680;91681 116388;116389;116390;116391;116392;116393;116394;116395;116396;116397;116398;116399 116388 10 EKEFEETMDALQADIDQLEAEK Unmodified 2581.1741 0.17414372 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 160.12 160.12 3 6.1055E-07 165529 QUIQUE_C1368_190116_001 75.033 67.041 239440000 0 48973000 53474000 0 0 48447000 0 0 35444000 0 0 53104000 0 10361 890;3052 9704 91682;91683;91684;91685;91686 116400;116401;116402;116403;116404 116401 3 EKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELK Unmodified 3022.4329 0.4328776 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 2 1 1 1 1 2 154.18 154.18 3;4 1.2687E-06 157398 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.924 55.953 441160000 0 0 0 0 28989000 0 0 24182000 33097000 0 70695000 0 284200000 10362 890;3052 9705 91687;91688;91689;91690;91691;91692 116405;116406;116407;116408;116409;116410 116406 6 EKEFGDKVNLLSVLEAAK Unmodified 1989.0783 0.078256906 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 115.37 115.37 3;4 6.2996E-07 120918 QUIQUE_C1438_190116_001 77.221 67.806 953410000 0 25884000 0 0 24628000 0 23582000 62626000 162080000 0 131060000 173240000 350310000 10363 4006 9706 91693;91694;91695;91696;91697;91698;91699;91700;91701;91702;91703;91704 116411;116412;116413;116414;116415;116416;116417;116418;116419;116420;116421;116422;116423 116413 13 EKEISGLWNELDSLK Unmodified 1759.8992 0.89922991 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;H0YJV5 KTN1 Kinectin yes no 0 0 1 1 1 123.33 123.33 3 0.0044397 128301 QUIQUE_C1218_190116_001 73.802 56.733 28772000 14973000 0 0 0 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116436;116437;116438;116439;116440;116441;116442;116443;116444;116445;116446;116447;116448;116449;116450;116451;116452;116453;116454 116449 19 EKENLVQAFK Unmodified 1204.6452 0.64518747 3974 Q99766 ATP5S ATP synthase subunit s, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 36.851 36.851 3 0.019473 32482 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.338 24.902 144720000 0 0 0 0 0 0 0 37929000 41528000 0 29617000 35645000 0 10370 3974 9712 91734;91735;91736;91737 116455;116456;116457;116458 116458 4 EKENSLEAIR Unmodified 1187.6146 0.61461563 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7;A0A3B3ITA2;F5H6A0 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 21.106 21.106 2;3 0.021474 14059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.297 13.824 79246000 0 0 0 0 26778000 0 0 17827000 0 0 34642000 0 0 10371 2322 9713 91738;91739;91740 116459;116460;116461 116461 3 EKEPIAASTNR Unmodified 1214.6255 0.62551466 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 2 10.907 10.907 2;3 0.00030331 3618 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.338 72.798 664590000 0 0 0 0 0 0 0 29520000 0 635080000 0 0 0 10372 267;275;3025 9714 91741;91742;91743;91744;91745 116462;116463;116464;116465;116466 116466 5 EKEPIVGSTDYGK Unmodified 1421.7038 0.70382456 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.687 28.687 2 0.001766 22377 QUIQUE_C1368_190116_001 131.43 38.322 332270000 35040000 59861000 46963000 41858000 33402000 51488000 44368000 0 0 19285000 0 0 0 10373 267;275;3025 9715 91746;91747;91748;91749;91750;91751;91752;91753;91754 116467;116468;116469;116470;116471;116472;116473;116474;116475 116469 9 EKEPIVGSTDYGKDEDSAEALLK Unmodified 2493.2122 0.21224378 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 3 3 4 3 3 3 3 3 3 3 2 2 3 85.418 85.418 2;3;4 3.1096E-246 88055 QUIQUE_C1218_190116_001 275.49 232.11 28657000000 2695200000 2684600000 3183200000 1200500000 3053300000 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53.182 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10375 3467 9717 91793;91794 116538;116539 116538 2 EKEQLMASDDFGR Unmodified 1524.6879 0.68785692 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 46.237 46.237 2;3 3.1303E-88 43599 QUIQUE_DMIX3_190116_001 231.17 213.11 9429200000 298900000 1152900000 1075300000 831650000 862820000 641400000 416370000 644520000 693810000 255960000 777890000 746950000 1030800000 10376 267;275;3025 9718 91795;91796;91797;91798;91799;91800;91801;91802;91803;91804;91805;91806;91807;91808;91809;91810;91811;91812;91813;91814;91815;91816;91817;91818 116540;116541;116542;116543;116544;116545;116546;116547;116548;116549;116550;116551;116552;116553;116554;116555;116556;116557;116558;116559;116560;116561;116562;116563;116564;116565;116566;116567 116556 20 EKEQLMASDDFGR Oxidation (M) 1540.6828 0.68277155 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 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Unmodified 4224.0552 0.055236638 120 A0A087X294 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase yes yes 0 0 2 1 1 155.03 155.03 5 0.00023762 159907 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.276 33.043 106350000 0 0 0 0 0 0 0 0 27420000 0 0 0 78933000 10380 120 9720 91830;91831 116579;116580 116579 2 EKERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWAR Unmodified 4242.0117 0.011657264 2970 Q13153;B3KNX7;E9PKH9 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 2 1 153.39 153.39 5 0.055511 158025 QUIQUE_DMIX7_190116_001 16.179 10.93 104030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 104030000 0 10381 2970 9721 91832 116581 116581 1 EKESVLGNLAK Unmodified 1186.6558 0.65575216 3680 Q8TD30 GPT2 Alanine aminotransferase 2 yes yes 0 0 1 1 1 32.493 32.493 2 0.016862 27823 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.716 43.429 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10382 3680 9722 91833;91834 116582;116583 116583 2 EKETLAVNYEKEEEFLTNELSR Unmodified 2670.3025 0.30245578 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 2 1 1 1 120.97 120.97 4 0.0006374 124954 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.808 40.967 139910000 0 39639000 0 35560000 0 0 0 0 0 0 0 0 64716000 10383 3173 9723 91835;91836;91837 116584;116585;116586 116586 2 EKEVEAIQAQAK Unmodified 1342.7092 0.70924429 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.035 21.035 2;3 0.0026486 14580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.91 99.948 609050000 0 120840000 0 0 56977000 0 59035000 58780000 79344000 0 141410000 92668000 0 10384 1472 9724 91838;91839;91840;91841;91842;91843;91844;91845 116587;116588;116589;116590;116591;116592;116593;116594;116595 116591 9 EKFEEMIQQIK Unmodified 1421.7225 0.72245152 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 81.712 81.712 2;3 2.0683E-30 84225 QUIQUE_C1218_190116_001 195.79 173.55 3753400000 310320000 394900000 318750000 306690000 274530000 271840000 376730000 237610000 219460000 104110000 348070000 260580000 329800000 10385 2514 9725 91846;91847;91848;91849;91850;91851;91852;91853;91854;91855;91856;91857;91858;91859;91860;91861;91862;91863;91864;91865;91866;91867;91868;91869;91870;91871;91872 116596;116597;116598;116599;116600;116601;116602;116603;116604;116605;116606;116607;116608;116609;116610;116611;116612;116613;116614;116615;116616;116617;116618;116619;116620;116621;116622;116623;116624;116625;116626;116627;116628;116629;116630 116597 31 EKFEGVELNTDEPPMVFK Unmodified 2108.0136 0.013607739 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 111.98 111.98 3 0.00023699 115549 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.731 42.116 497200000 57701000 72173000 111390000 73808000 0 0 54612000 0 70311000 0 0 0 57204000 10386 2642 9726 91873;91874;91875;91876;91877;91878;91879;91880;91881;91882 116631;116632;116633;116634;116635;116636;116637;116638;116639;116640;116641;116642 116640 9 EKFENLGIQPPK Unmodified 1398.7507 0.75071518 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 1 55.555 55.555 2 0.016133 54849 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.096 46.157 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10387 4672 9727 91883 116643 116643 1 EKFGAVFLWDSGSSVGEITGHNK Unmodified 2464.2023 0.20228822 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 112.79 112.79 3;4 0.0048545 117578 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.683 37.571 149560000 0 0 0 0 0 0 0 69174000 0 0 80388000 0 0 10388 1609 9728 91884;91885 116644;116645 116645 0 EKFTMVQVWPVR Unmodified 1518.8017 0.80170489 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 1 1 96.695 96.695 3 0.020913 99840 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.568 37.622 22769000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22769000 10389 2414 9729 91886 116646 116646 1 EKGDPLNIAIDK Unmodified 1311.7034 0.70343063 2250 P26232;B9A010 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 55.147 55.147 2;3 0.00066757 52736 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.169 65.834 634720000 0 44079000 30460000 0 0 0 107620000 106010000 56323000 27523000 38703000 118990000 105020000 10390 2250 9730 91887;91888;91889;91890;91891;91892;91893;91894;91895;91896;91897;91898;91899 116647;116648;116649;116650;116651;116652;116653;116654;116655;116656;116657;116658;116659;116660;116661;116662 116662 12 EKGLPILVELLR Unmodified 1378.8548 0.85478632 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 1 1 130.59 130.59 3 0.0012372 137422 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.563 44.262 9992300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9992300 0 0 10391 855;928 9731 91900 116663 116663 1 EKGQEDFSETR Unmodified 1324.5895 0.58952309 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein no no 0 0 1 2 1 1 2 1 15.031 15.031 2;3 0.0028409 7410 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.31 88.161 296210000 0 66244000 0 50379000 0 22546000 0 82512000 74530000 0 0 0 0 10392 1058 9732 91901;91902;91903;91904;91905;91906;91907 116664;116665;116666;116667;116668;116669;116670 116670 7 EKGSSASLVLKR Unmodified 1273.7354 0.73539946 2843 Q00325 SLC25A3 Phosphate carrier protein, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 15.122 15.122 3 0.0058653 7604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.705 53.96 58850000 0 0 0 0 0 0 0 29992000 28858000 0 0 0 0 10393 2843 9733 91908;91909 116671;116672 116671 2 EKGVNSFQMFMTYK Unmodified 1708.7953 0.79529888 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 95.276 95.276 2;3 1.3689E-27 98539 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.61 153.07 160730000 0 0 0 0 0 0 0 54008000 0 0 62220000 44504000 0 10394 3984 9734 91910;91911;91912;91913 116673;116674;116675;116676 116674 4 EKIDLENTLEQEQEALVNR Unmodified 2270.139 0.13901926 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.49 119.49 2 1.7401E-10 125165 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.58 118.92 171740000 0 26493000 34936000 0 30718000 23080000 29521000 0 0 0 26995000 0 0 10395 3173 9735 91914;91915;91916;91917;91918;91919;91920;91921;91922 116677;116678;116679;116680;116681;116682;116683;116684;116685 116683 9 EKIEAELQDICNDVLELLDK Unmodified 2386.1938 0.19375695 2341 P31946 YWHAB 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 171.62 171.62 2;3 2.6001E-243 178809 QUIQUE_DMIX5_190116_001 328.37 292.73 5339100000 0 82186000 9108200 0 98488000 0 448050000 0 248460000 0 3512800000 654480000 285560000 10396 2341 9736 91923;91924;91925;91926;91927;91928;91929;91930;91931 116686;116687;116688;116689;116690;116691;116692;116693;116694 116692 6 EKIETELR Unmodified 1016.5502 0.55022446 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 1 1 1 1 19.26 19.26 2 0.023742 12171 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.37 39.089 7946900000 0 0 2966300000 0 2393500000 0 0 0 0 0 0 2587000000 0 10397 2780 9737 91932;91933;91934 116695;116696;116697 116697 3 EKIETELRDICNDVLSLLEK Unmodified 2416.2519 0.25194053 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 2 2 1 2 2 167.05 167.05 3;4 1.5955E-46 169123 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.98 146.26 2665600000 0 0 0 0 0 0 0 417380000 0 0 364200000 1370700000 513410000 10398 2780 9738 91935;91936;91937;91938;91939;91940;91941 116698;116699;116700;116701;116702;116703;116704 116698 6 EKIFFENHPYFR Unmodified 1625.7991 0.79906235 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 1 2 1 67.621 67.621 3;4 0.00073052 67491 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.727 53.806 177230000 0 0 0 0 0 0 0 58417000 0 0 118810000 0 0 10399 2168 9739 91942;91943;91944 116705;116706;116707 116705 3 EKIIDQVYR Unmodified 1162.6346 0.63462279 1473 O15031;A0A087WU36 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 1 1 1 62.225 62.225 3 0.060091 61351 QUIQUE_C1368_190116_001 46.462 11.017 31575000 0 0 20091000 11483000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10400 1473 9740 91945;91946 116708;116709 116708 2 EKINISEELR Unmodified 1229.6616 0.66156582 4701 yes no 0 0 1 1 2 44.582 44.582 3 0.023189 41840 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.463 24.955 65357000 0 0 0 35041000 0 0 0 0 0 0 30316000 0 0 + 10401 4701 9741 91947;91948;91949 116710;116711;116712 116712 1 EKIQVLGSLVSLEMGK Unmodified 1729.9648 0.96480705 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;F8VVF2;A0A1B0GVU0 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 119.71 119.71 3 6.8734E-19 123958 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.35 85.986 461460000 0 0 0 0 0 0 0 141460000 95509000 0 102500000 62181000 59810000 10402 336 9742 91950;91951;91952;91953;91954 116713;116714;116715;116716;116717;116718 116714 6 EKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEK Unmodified 2806.3041 0.30411203 2788;2696;447;3401;458 A0A2R8Y793;P60709;P63261;I3L4N8;Q6S8J3;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTG1;POTEE Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 3 2 1 4 3 3 147.5 147.5 2;3 2.8724E-128 150445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.2 189.75 6485700000 77998000 173730000 181900000 133010000 335950000 92594000 299900000 855260000 840350000 36080000 1308200000 1258300000 892450000 10403 447;2696;2788;3401;458 9743 91955;91956;91957;91958;91959;91960;91961;91962;91963;91964;91965;91966;91967;91968;91969;91970;91971;91972;91973;91974;91975;91976;91977;91978 116719;116720;116721;116722;116723;116724;116725;116726;116727;116728;116729;116730;116731;116732;116733;116734;116735;116736;116737;116738;116739;116740;116741;116742;116743;116744;116745;116746;116747;116748;116749;116750;116751;116752;116753;116754;116755;116756 116733 38 EKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEK Oxidation (M) 2822.299 0.29902666 2788;2696;447;3401;458 A0A2R8Y793;P60709;P63261;I3L4N8;Q6S8J3;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTG1;POTEE Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;POTE ankyrin domain family member E no no 0 1 1 1 1 1 1 113.28 113.28 3 1.7658E-17 117380 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.86 97.078 424030000 0 0 0 0 0 0 0 123030000 90854000 0 105000000 105150000 0 10404 447;2696;2788;3401;458 9743 91979;91980;91981;91982 116757;116758;116759;116760;116761 116758 321 4 EKLCYVGYNIEQEQK Unmodified 1899.9037 0.90366336 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 1 2 1 1 62.303 62.303 2;3 8.2957E-06 61741 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.21 95.174 149510000 0 0 0 0 0 0 0 58283000 0 0 48976000 42248000 0 10405 2715 9744 91983;91984;91985;91986 116762;116763;116764;116765 116763 4 EKLDSVIEFSIPDSLLIR Unmodified 2073.1358 0.13577179 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;F8VY04 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 150.26 150.26 3 0.0013504 155273 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.893 48.737 143300000 0 0 0 0 0 0 0 0 91173000 0 0 52132000 0 10406 1047 9745 91987;91988 116766;116767 116766 1 EKLDTLVEFPIR Unmodified 1458.8082 0.80823006 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 100.94 100.94 3 0.013675 105043 QUIQUE_C1438_190116_001 53.388 34.288 127990000 22206000 0 24249000 0 26090000 27464000 27980000 0 0 0 0 0 0 10407 1096 9746 91989;91990;91991;91992;91993;91994 116768;116769;116770;116771;116772;116773;116774 116770 6 EKLEAEMEAAR Unmodified 1275.6129 0.61290107 3719 Q8WXF1 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes yes 0 0 1 2 1 1 33.255 33.255 2;3 0.0043429 28583 QUIQUE_C1277_190116_001 48.944 31.508 149800000 0 81129000 42779000 0 25896000 0 0 0 0 0 0 0 0 10408 3719 9747 91995;91996;91997;91998 116775;116776;116777;116778 116776 4 EKLEAEMEAAR Oxidation (M) 1291.6078 0.60781569 3719 Q8WXF1 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes yes 0 1 1 1 14.724 14.724 2 0.024666 6925 QUIQUE_C1368_190116_001 78.655 48.401 11462000 0 0 11462000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10409 3719 9747 91999 116779 116779 1 EKLEATINELV Unmodified 1257.6816 0.68163256 1999 P10599 TXN Thioredoxin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.67 104.67 2 1.952E-17 107286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.12 152.35 5190200000 353490000 469160000 437570000 65865000 0 317470000 433800000 503770000 542450000 157960000 708390000 542160000 658150000 10410 1999 9748 92000;92001;92002;92003;92004;92005;92006;92007;92008;92009;92010;92011 116780;116781;116782;116783;116784;116785;116786;116787;116788;116789;116790;116791;116792;116793;116794;116795;116796;116797;116798;116799;116800 116789 20 EKLEDPDPGVQSAAVNVICELAR Unmodified 2509.2483 0.24825214 1437 O14617;A0A2R8Y4J3;A0A087WYN6 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.02 137.02 3 1.2196E-07 142934 QUIQUE_C1576_190116_001 77.576 65.62 238460000 0 45847000 50441000 37407000 0 25179000 50489000 0 0 0 0 29098000 0 10411 1437 9749 92012;92013;92014;92015;92016;92017 116801;116802;116803;116804;116805;116806 116805 6 EKLEMEMEAAR Unmodified 1335.6163 0.61627189 3122 Q15233;H7C367;C9JYS8 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.91 40.91 2 0.014155 36898 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.037 56.609 324450000 0 75492000 56464000 0 0 0 0 0 48176000 0 0 71901000 72417000 10412 3122 9750 92018;92019;92020;92021;92022;92023;92024;92025 116807;116808;116809;116810;116811;116812;116813;116814;116815 116815 9 EKLEPITLQSGQSLVLPCRPPIGLPPPIIFWMDNSFQR Unmodified 4373.3068 0.30684041 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 2 1 1 1 167.25 167.25 4 2.3426E-100 174586 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.23 155.18 541720000 0 0 0 0 0 0 0 0 142510000 0 234710000 164510000 0 10413 756 9751 92026;92027;92028 116816;116817;116818;116819;116820;116821 116817 6 EKLEQAAIVK Unmodified 1127.655 0.65502388 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 21.728 21.728 2 0.014152 15049 QUIQUE_C1368_190116_001 104.01 43.994 226450000 0 0 57152000 0 44331000 54300000 0 0 0 0 70666000 0 0 10414 2998 9752 92029;92030;92031;92032 116822;116823;116824;116825 116822 1 EKLIAPVAEEEATVPNNK Unmodified 1951.0262 0.026221336 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 58.265 58.265 2;3 8.7759E-53 57170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.48 142.46 3329200000 0 0 0 0 41408000 0 33271000 791970000 601860000 0 529100000 702680000 628920000 10415 1915 9753 92033;92034;92035;92036;92037;92038;92039;92040;92041;92042;92043;92044 116826;116827;116828;116829;116830;116831;116832;116833;116834;116835;116836;116837;116838;116839;116840 116831 15 EKLILPHVDIQLK Unmodified 1544.929 0.92901389 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 86.75 86.75 4 0.00079305 88803 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116849;116850;116851;116852;116853;116854;116855;116856;116857;116858;116859;116860;116861;116862;116863;116864;116865;116866;116867;116868;116869;116870;116871;116872;116873;116874;116875;116876;116877;116878;116879;116880;116881;116882;116883;116884 116868 30 EKLQEEMLQR Oxidation (M) 1318.6551 0.65510023 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 19.667 19.667 2;3 7.0285E-07 12515 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.35 97.671 1660100000 0 126420000 224830000 243220000 157170000 194220000 0 49339000 110990000 258300000 118540000 100180000 76897000 10419 1952 9756 92073;92074;92075;92076;92077;92078;92079;92080;92081;92082;92083;92084;92085 116885;116886;116887;116888;116889;116890;116891;116892;116893;116894;116895;116896;116897 116891 1196 12 EKLQEEMLQREEAENTLQSFR Unmodified 2607.2599 0.25987945 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 0 2 1 2 2 1 2 2 90.951 90.951 3;4 3.9834E-146 92768 QUIQUE_DMIX7_190116_001 206.71 190.42 2546800000 0 0 0 0 0 0 0 915740000 411170000 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yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.64 103.64 2;3 2.9524E-05 106322 QUIQUE_C1277_190116_001 104.55 89.988 507980000 38032000 41447000 31350000 187320000 0 172460000 37378000 0 0 0 0 0 0 10435 4212 9772 92187;92188;92189;92190;92191;92192;92193 117014;117015;117016;117017;117018;117019;117020 117015 7 EKPTDMQNFGLR Unmodified 1434.6925 0.69254837 1039 F8VXC8;Q8TAQ2 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 54.818 54.818 2;3 0.015341 53069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.095 29.263 79466000 0 20190000 0 22814000 0 21599000 0 14863000 0 0 0 0 0 10436 1039 9773 92194;92195;92196;92197;92198 117021;117022;117023;117024;117025 117025 4 EKPYFPIPEEYTFIQNVPLEDR Unmodified 2723.3483 0.34828376 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 143.5 143.5 2;3 3.3499E-37 146279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.75 138.06 15905000000 1092900000 1352300000 1508000000 1111100000 1359800000 1216400000 1271800000 1438900000 1301300000 346980000 1509600000 1270200000 1125600000 10437 2849 9774 92199;92200;92201;92202;92203;92204;92205;92206;92207;92208;92209;92210;92211;92212;92213;92214;92215;92216;92217;92218;92219;92220;92221;92222 117026;117027;117028;117029;117030;117031;117032;117033;117034;117035;117036;117037;117038;117039;117040;117041;117042;117043;117044;117045;117046;117047;117048;117049;117050;117051;117052;117053;117054;117055;117056;117057;117058;117059;117060;117061;117062;117063;117064;117065;117066;117067;117068;117069;117070 117052 44 EKQDTFALASQQK Unmodified 1492.7522 0.75217174 1956 P09110;C9JDE9;H7C131;H0Y4D4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.823 27.823 2 1.6916E-30 22629 QUIQUE_C1218_190116_001 179.35 113.73 699440000 56979000 47091000 61211000 44809000 56578000 61552000 49695000 68427000 54727000 0 63833000 65625000 68913000 10438 1956 9775 92223;92224;92225;92226;92227;92228;92229;92230;92231;92232;92233;92234;92235 117071;117072;117073;117074;117075;117076;117077;117078;117079;117080;117081;117082;117083;117084;117085;117086 117071 16 EKVDKLDASESLR Unmodified 1488.7784 0.77838649 1314 K7EJJ5 CLTC yes yes 0 0 2 1 24.758 24.758 3 0.044118 18613 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.136 44.509 39252000 0 0 0 0 0 0 0 39252000 0 0 0 0 0 10439 1314 9776 92236 117087 117087 1 EKVDLVLLGK Unmodified 1112.6805 0.68051035 2411 P38117 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 65.518 65.518 2;3 0.026075 65999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.743 30.879 471130000 0 0 34985000 23880000 0 109010000 101600000 0 0 0 43036000 29000000 129630000 10440 2411 9777 92237;92238;92239;92240;92241;92242;92243;92244 117088;117089;117090;117091;117092;117093;117094;117095;117096 117094 5 EKVEVQLPELFHK Unmodified 1594.8719 0.87189295 2985 Q13303;Q5TG80;Q5TG81 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 yes no 0 0 1 1 82.626 82.626 4 0.01527 82892 QUIQUE_C1563_190116_001 43.594 37.879 16553000 0 0 0 0 0 16553000 0 0 0 0 0 0 0 10441 2985 9778 92245 117097 117097 1 EKVFDVIIR Unmodified 1117.6495 0.64954457 2035 P12081;B4DDD8;B3KWE1;E7ETE2 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 69.007 69.007 3 0.049612 70097 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.305 17.022 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10442 2035 9779 92246 117098 117098 1 EKVGEQAQVVIIDMNDPSNPIR Unmodified 2451.2428 0.24277283 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KSQ2;J3QL20 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 104.29 104.29 3 5.2816E-21 106313 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.85 123.69 379540000 0 49292000 0 63586000 0 0 0 95507000 0 0 0 94930000 76229000 10443 50 9780 92247;92248;92249;92250;92251 117099;117100;117101;117102;117103;117104 117101 5 EKVNVDIINFGEEEVNTEK Unmodified 2205.0801 0.0801074 2655 Q5VWC4;P55036;A6PVX3 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 no no 0 0 1 1 1 105.55 105.55 3 0.0049998 109241 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Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 89.561 89.561 2;3 0.0091311 86972 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.414 46.635 292400000 58540000 54059000 81864000 53034000 0 0 0 0 0 44901000 0 0 0 10448 2083 9785 92257;92258;92259;92260;92261 117111;117112;117113;117114;117115 117115 5 EKYDTDFYILDKYPLAVR Unmodified 2248.1416 0.14158544 2083 P14868 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 2 1 118.05 118.05 4 0.018392 122879 QUIQUE_C1368_190116_001 37.624 29.234 35323000 0 0 35323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10449 2083 9786 92262 117116 117116 1 EKYEITEQR Unmodified 1194.5881 0.58806652 2878 Q02878 RPL6 60S ribosomal protein L6 yes yes 0 0 1 1 1 19.307 19.307 2;3 0.037329 12063 QUIQUE_C1438_190116_001 40.994 12.789 63713000 0 37350000 0 0 26363000 0 0 0 0 0 0 0 0 10450 2878 9787 92263;92264 117117;117118 117118 2 EKYIDQEELNK Unmodified 1407.6882 0.6881745 1931;1938;3264 P08238;Q58FF8;P07900;Q14568 HSP90AB1;HSP90AB2P;HSP90AA1;HSP90AA2P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta 2;Heat shock protein HSP 90-alpha;Heat shock protein HSP 90-alpha A2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 30.435 30.435 2;3 2.9158E-24 24838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 185.96 134.89 1869700000 101450000 108100000 101380000 106660000 163490000 238380000 380510000 97909000 106150000 18147000 138270000 145980000 163330000 10451 1938;3264;1931 9788 92265;92266;92267;92268;92269;92270;92271;92272;92273;92274;92275;92276;92277;92278;92279 117119;117120;117121;117122;117123;117124;117125;117126;117127;117128;117129;117130;117131;117132;117133;117134 117132 16 EKYPSHSFIGEESVAAGEK Unmodified 2063.98 0.97999942 2286 P29218;H0YBL1;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RIP7;E5RGY4;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 46.152 46.152 4 0.0073832 42851 QUIQUE_C1403_190116_001 27.904 21.13 400030000 0 0 210350000 72507000 0 0 0 117180000 0 0 0 0 0 10452 2286 9789 92280;92281;92282 117135;117136;117137 117136 3 EKYSIGEPTVPSTLAEEFTYNPFMR Unmodified 2905.3844 0.38441127 3195 Q16775;H3BPQ4;H3BPK3;H3BV79 HAGH Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 150.09 150.09 3 2.4996E-06 157328 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.298 49.794 206940000 0 0 0 0 0 0 0 72182000 0 0 34126000 46503000 54131000 10453 3195 9790 92283;92284;92285;92286;92287 117138;117139;117140;117141;117142;117143 117139 5 EKYSLEQDIR Unmodified 1279.6408 0.64083038 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 38.591 38.591 2 0.028353 34742 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.263 28.715 32890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32890000 0 10454 4394 9791 92288 117144 117144 1 ELAACQLLISQHEAK Unmodified 1709.8771 0.87705468 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 69.063 69.063 3 0.00080962 69627 QUIQUE_C1576_190116_001 43.432 34.501 473320000 72505000 0 0 0 65713000 54350000 68796000 0 41022000 26378000 55904000 88655000 0 10455 1568 9792 92289;92290;92291;92292;92293;92294;92295;92296;92297 117145;117146;117147;117148;117149;117150;117151;117152;117153;117154;117155;117156 117150 10 ELAAEDEQVFLMK Unmodified 1521.7385 0.73849551 1515 O43237;J3KRI4;J3KSD2 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 96.164 96.164 2;4 3.3937E-06 105431 QUIQUE_C1563_190116_001 127.76 106.79 902270000 123920000 0 0 121810000 123490000 117130000 94963000 53245000 67788000 59151000 63537000 0 77237000 10456 1515 9793 92298;92299;92300;92301;92302;92303;92304;92305;92306;92307;92308 117157;117158;117159;117160;117161;117162;117163;117164;117165;117166;117167;117168;117169;117170;117171 117162 15 ELAAEMAAAFLNENLPESIFGAPK Unmodified 2532.257 0.25702591 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 172.18 172.18 2;3 3.0356E-24 175524 QUIQUE_C1277_190116_001 125.73 117.88 614330000 63757000 75876000 25855000 0 61238000 73301000 61255000 32067000 52708000 11531000 88618000 40936000 27187000 10457 3135 9794 92309;92310;92311;92312;92313;92314;92315;92316;92317;92318;92319;92320;92321;92322;92323;92324 117172;117173;117174;117175;117176;117177;117178;117179;117180;117181;117182;117183;117184;117185;117186;117187 117174 16 ELAAEVEVQDGPNEDGEMFMRPGK Unmodified 2647.1894 0.18941663 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 101.61 101.61 3 3.4515E-06 105541 QUIQUE_C1218_190116_001 72.033 64.5 102330000 65746000 0 0 36582000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10458 1947 9795 92325;92326 117188;117189 117188 1 ELAAEVEVQDGPNEDGEMFMRPGK Oxidation (M) 2663.1843 0.18433125 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 90.799 90.799 3 1.5212E-06 91951 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.174 62.462 29349000 0 0 0 0 0 0 0 29349000 0 0 0 0 0 10459 1947 9795 92327 117190;117191 117191 1190;1191 2 ELAALFYSVVVSTVSGNELK Unmodified 2125.1307 0.13068641 1259 J3KN16;Q5VYK3;R4GMY1 KIAA0368;ECM29 Proteasome-associated protein ECM29 homolog yes no 0 0 0 2 1 1 172.33 172.33 2;3 3.9544E-07 176672 QUIQUE_C1218_190116_001 124.45 110.78 28466000 18591000 5988800 0 0 0 0 0 0 0 3886400 0 0 0 10460 1259 9796 92328;92329;92330;92331 117192;117193;117194;117195 117192 3 ELAALWGIETR Unmodified 1257.6717 0.67173657 588 F5H7V1;B1AKJ5;O43847 NRD1 Nardilysin yes no 0 0 0 1 1 101.67 101.67 2 0.0040057 103393 QUIQUE_C1563_190116_001 72.485 0 190740000 0 0 0 0 0 78781000 111960000 0 0 0 0 0 0 10461 588 9797 92332;92333 117196;117197 117196 2 ELACLEENLR Unmodified 1245.6023 0.60233638 4742 yes yes 0 0 0 2 1 5 2 2 2 1 1 2 3 2 1 56.92 56.92 2 0.0055609 50500 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.058 23.891 2690300000 121790000 0 780000000 0 389320000 0 0 0 471160000 227320000 700660000 0 0 + 10462 4742 9798 92334;92335;92336;92337;92338;92339;92340;92341;92342;92343;92344;92345;92346;92347;92348;92349;92350;92351;92352;92353;92354;92355;92356;92357 117198;117199;117200;117201;117202;117203;117204;117205;117206;117207;117208;117209;117210;117211;117212;117213;117214;117215;117216;117217;117218;117219;117220;117221;117222 117220 23 ELADESQTLK Unmodified 1132.5612 0.56118307 4516 Q9UNZ2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 30.784 30.784 2 2.5411E-07 25891 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.65 103.23 546140000 0 0 0 0 0 0 139090000 0 0 0 154130000 87368000 165550000 10463 4516 9799 92358;92359;92360;92361 117223;117224;117225;117226 117224 4 ELAEDDSILK Unmodified 1131.5659 0.5659341 2679 P56385 ATP5I ATP synthase subunit e, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 60.746 60.746 1;2 0.00029763 59714 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.7 61.494 3846800000 0 0 322230000 0 289470000 174700000 359840000 362790000 430340000 134120000 655280000 510610000 607440000 10464 2679 9800 92362;92363;92364;92365;92366;92367;92368;92369;92370;92371;92372;92373;92374;92375 117227;117228;117229;117230;117231;117232;117233;117234;117235;117236;117237;117238;117239;117240;117241 117236 14 ELAEDGYSGVEVR Unmodified 1422.6627 0.66268803 2214 P23396;E9PL09;E9PPU1;H0YEU2;F2Z2S8;H0YCJ7;H0YF32;E9PQ96;E9PJH4;E9PK82 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.816 61.816 2 7.7796E-06 60814 QUIQUE_C1368_190116_001 123.51 95.771 1055700000 95558000 112070000 123510000 121530000 0 93733000 86886000 134930000 0 44905000 0 119660000 122970000 10465 2214 9801 92376;92377;92378;92379;92380;92381;92382;92383;92384;92385 117242;117243;117244;117245;117246;117247;117248;117249;117250;117251;117252 117244 9 ELAEEEPHLVEQFQK Unmodified 1824.8894 0.8893935 2429 P40855;Q5QNY5;B7Z8B3;E9PS71 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 0 1 78.561 78.561 3 0.0004787 79582 QUIQUE_C1218_190116_001 59.709 45.877 30052000 30052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10466 2429 9802 92386 117253 117253 1 ELAELSAELDKDLR Unmodified 1600.8308 0.83081599 1580 O60504;E7EQH0 SORBS3 Vinexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 102.43 102.43 3 0.0010414 105372 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.374 37.405 61747000 0 0 0 20174000 0 0 0 12667000 19028000 0 9877300 0 0 10467 1580 9803 92387;92388;92389;92390;92391 117254;117255;117256;117257;117258 117256 5 ELAEQELEK Unmodified 1087.5397 0.53971935 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.031 34.031 2 4.4012E-25 29407 QUIQUE_DMIX3_190116_001 199.7 23.618 4203000000 332570000 347620000 452720000 170940000 401250000 0 379560000 307130000 460090000 0 611490000 406080000 333550000 10468 3117 9804 92392;92393;92394;92395;92396;92397;92398;92399;92400;92401;92402 117259;117260;117261;117262;117263;117264;117265;117266;117267;117268;117269;117270;117271;117272;117273;117274;117275 117269 17 ELAEQLEFIK Unmodified 1218.6496 0.64960415 1093 G3XAI2;P07942 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 100.1 100.1 2 0.0016163 104587 QUIQUE_C1438_190116_001 95.502 62.503 83486000 0 0 0 0 48052000 0 0 0 35433000 0 0 0 0 10469 1093 9805 92403;92404;92405 117276;117277;117278 117276 3 ELAEQLGLSTGEK Unmodified 1373.7038 0.70382456 1657 O75821;K7EL20;K7ER90 EIF3G Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G yes no 0 0 0 1 1 1 72.481 72.481 2 0.0021588 73782 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.48 35.855 356010000 0 0 0 0 0 0 123870000 0 0 0 102430000 0 129710000 10470 1657 9806 92406;92407;92408 117279;117280;117281 117280 3 ELAEQTLNNIK Unmodified 1271.6721 0.67213051 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.892 59.892 2 0.00023011 58355 QUIQUE_C1403_190116_001 144.09 51.649 1915900000 218840000 0 0 214220000 247820000 203660000 0 271580000 0 119570000 271790000 165930000 202520000 10471 3726 9807 92409;92410;92411;92412;92413;92414;92415;92416;92417;92418 117282;117283;117284;117285;117286;117287;117288;117289;117290;117291;117292 117283 10 ELAESDFASTFR Unmodified 1371.6307 0.63065962 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248;F5H4U8 COPS7A COP9 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Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.73 88.73 2 0.0016056 90790 QUIQUE_C1368_190116_001 102 67.07 775410000 68431000 65556000 69984000 75503000 71508000 69306000 0 80712000 82869000 0 90662000 0 100880000 10475 3953 9811 92431;92432;92433;92434;92435;92436;92437;92438;92439;92440 117306;117307;117308;117309;117310;117311;117312;117313;117314;117315;117316 117309 11 ELAFQISK Unmodified 934.51238 0.51238239 3027;260 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;A0A140T996;A0A140T973;A0A140T9K1;A0A140T9L4;F6R6M7;F6QYI9;A0A0G2JJL7;K7EN69;A0A140T9K2;A0A140T9N3;A0A0D9SEM9 DDX39B;DDX39A Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 63.156 63.156 1;2 0.0036416 62590 QUIQUE_C1277_190116_001 129.55 94.449 1632400000 177220000 159310000 123720000 104100000 127170000 113910000 107330000 128830000 107490000 71044000 186230000 111730000 114320000 10476 3027;260 9812 92441;92442;92443;92444;92445;92446;92447;92448;92449;92450;92451;92452;92453;92454;92455;92456 117317;117318;117319;117320;117321;117322;117323;117324;117325;117326;117327;117328;117329;117330;117331;117332;117333;117334;117335;117336;117337;117338 117319 19 ELAGHTGYLSCCR Unmodified 1522.6657 0.66568169 2767;602 P62873;F6UT28;F6X3N5;B3KVK2 GNB1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 32.36 32.36 2;3 1.289E-179 26468 QUIQUE_C1368_190116_001 276 254.26 61409000000 7815900000 6131800000 8975200000 4551700000 4566200000 4280200000 6174100000 2701600000 2886200000 1129400000 3589100000 3674300000 4933300000 10477 2767;602 9813 92457;92458;92459;92460;92461;92462;92463;92464;92465;92466;92467;92468;92469;92470;92471;92472;92473;92474;92475;92476;92477;92478;92479;92480;92481;92482 117339;117340;117341;117342;117343;117344;117345;117346;117347;117348;117349;117350;117351;117352;117353;117354;117355;117356;117357;117358;117359;117360;117361;117362;117363;117364;117365;117366;117367;117368;117369;117370;117371;117372;117373;117374;117375;117376;117377;117378;117379;117380;117381;117382;117383;117384 117345 46 ELAGIVCTLNSENK Unmodified 1546.7661 0.76610725 4327 Q9NXG2 THUMPD1 THUMP domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 84.448 84.448 2 0.0072214 86856 QUIQUE_C1576_190116_001 60.255 25.031 233950000 0 128280000 0 0 0 0 105670000 0 0 0 0 0 0 10478 4327 9814 92483;92484 117385;117386 117386 2 ELAGMFLSEDENFLLLFR Oxidation (M) 2159.0609 0.060892282 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.17 170.17 2 4.7771E-18 175432 QUIQUE_C1576_190116_001 138.94 117.68 243620000 17035000 14245000 21125000 0 15495000 16677000 50806000 0 36876000 0 55431000 0 15934000 10479 1678 9815 92485;92486;92487;92488;92489;92490;92491;92492;92493 117387;117388;117389;117390;117391;117392;117393;117394;117395 117392 912 9 ELAGQGLLR Unmodified 955.54508 0.5450795 3492 Q86UU1;A0A087WZL0 PHLDB1 Pleckstrin homology-like domain family B member 1 yes no 0 0 0 1 53.218 53.218 2 0.007183 50535 QUIQUE_C1563_190116_001 82.305 30.006 18514000 0 0 0 0 0 18514000 0 0 0 0 0 0 0 10480 3492 9816 92494 117396 117396 1 ELAGVLIFESHAK Unmodified 1412.7664 0.76636524 653 B7Z278;Q8WZA2 RAPGEF4 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 no no 0 0 0 1 90.162 90.162 3 0.062362 92059 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.219 11.842 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10481 653 9817 92495 117397 117397 1 ELAILLGMLDPAEK Oxidation (M) 1527.8218 0.82183121 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 134.93 134.93 2 3.4267E-06 138054 QUIQUE_C1563_190116_001 117.09 95.643 1450500000 149670000 161220000 135340000 156480000 106450000 222010000 88938000 39078000 94000000 197730000 31497000 28129000 39920000 10482 2298 9818 92496;92497;92498;92499;92500;92501;92502;92503;92504;92505;92506;92507;92508;92509;92510;92511;92512;92513;92514;92515;92516;92517 117398;117399;117400;117401;117402;117403;117404;117405;117406;117407;117408;117409;117410;117411;117412;117413;117414;117415;117416;117417;117418;117419;117420 117409 1680 16 ELAILLGMLDPAEK Unmodified 1511.8269 0.82691659 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 157.94 157.94 2;3 0.00013696 163906 QUIQUE_C1218_190116_001 130.01 80.638 5893300000 561040000 472060000 508310000 541000000 497430000 549800000 412850000 291790000 487220000 323190000 588240000 272800000 387570000 10483 2298 9818 92518;92519;92520;92521;92522;92523;92524;92525;92526;92527;92528;92529;92530;92531;92532;92533;92534;92535;92536 117421;117422;117423;117424;117425;117426;117427;117428;117429;117430;117431;117432;117433;117434;117435;117436;117437;117438;117439;117440;117441;117442;117443;117444;117445;117446;117447;117448;117449;117450;117451 117421 31 ELAILLGMLDPAEKDEK Oxidation (M) 1899.9863 0.98633036 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 1 1 4 5 4 4 4 4 4 4 4 4 5 4 4 114.96 114.96 2;3 2.0242E-87 119104 QUIQUE_C1403_190116_001 205.87 182.12 16931000000 893450000 1247800000 1473600000 1495600000 1101200000 1268000000 1032300000 1079900000 1888800000 948970000 1637200000 1353800000 1510300000 10484 2298 9819 92537;92538;92539;92540;92541;92542;92543;92544;92545;92546;92547;92548;92549;92550;92551;92552;92553;92554;92555;92556;92557;92558;92559;92560;92561;92562;92563;92564;92565;92566;92567;92568;92569;92570;92571;92572;92573;92574;92575;92576;92577;92578;92579;92580;92581;92582;92583;92584;92585;92586;92587;92588;92589;92590 117452;117453;117454;117455;117456;117457;117458;117459;117460;117461;117462;117463;117464;117465;117466;117467;117468;117469;117470;117471;117472;117473;117474;117475;117476;117477;117478;117479;117480;117481;117482;117483;117484;117485;117486;117487;117488;117489;117490;117491;117492;117493;117494;117495;117496;117497;117498;117499;117500;117501;117502;117503;117504;117505;117506;117507;117508;117509;117510;117511;117512;117513;117514;117515;117516;117517;117518;117519;117520;117521;117522;117523;117524;117525;117526;117527;117528;117529 117474 1680 78 ELAILLGMLDPAEKDEK Unmodified 1883.9914 0.99141573 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 1 2 4 5 4 4 3 3 3 7 2 10 4 3 156.54 156.54 2;3 3.4794E-139 146255 QUIQUE_C1218_190116_001 234.87 229.69 78742000000 3579900000 4760200000 4767500000 7616400000 4188900000 4522500000 5003900000 6369300000 11539000000 3038800000 8788000000 6681000000 7886700000 10485 2298 9819 92591;92592;92593;92594;92595;92596;92597;92598;92599;92600;92601;92602;92603;92604;92605;92606;92607;92608;92609;92610;92611;92612;92613;92614;92615;92616;92617;92618;92619;92620;92621;92622;92623;92624;92625;92626;92627;92628;92629;92630;92631;92632;92633;92634;92635;92636;92637;92638;92639;92640;92641;92642;92643;92644 117530;117531;117532;117533;117534;117535;117536;117537;117538;117539;117540;117541;117542;117543;117544;117545;117546;117547;117548;117549;117550;117551;117552;117553;117554;117555;117556;117557;117558;117559;117560;117561;117562;117563;117564;117565;117566;117567;117568;117569;117570;117571;117572;117573;117574;117575;117576;117577;117578;117579;117580;117581;117582;117583;117584;117585;117586;117587;117588;117589;117590;117591;117592;117593;117594;117595;117596;117597;117598;117599;117600;117601;117602;117603;117604;117605;117606;117607;117608;117609 117533 76 ELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTAR Oxidation (M) 2612.3554 0.35535974 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 1 2 1 124.65 124.65 4 1.1924E-08 127187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.293 73.181 61899000 0 0 0 0 0 0 0 61899000 0 0 0 0 0 10486 2298 9820 92645 117610 117610 1680;1681 1 ELAKVEEEIQTLSQVLAAK Unmodified 2098.1522 0.15215013 2667 P55327;H0YC42;E5RFR7;H0YC44 TPD52 Tumor protein D52 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 151.63 151.63 2;3 1.5987E-63 156551 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.39 135.59 265560000 0 0 0 0 0 0 0 129880000 40566000 0 0 34181000 60932000 10487 2667 9821 92646;92647;92648;92649;92650;92651 117611;117612;117613;117614;117615;117616 117613 6 ELALECDYQR Unmodified 1295.5816 0.58160094 3657 Q8NI60 ADCK3 Atypical kinase ADCK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.604 60.604 2 0.0012588 58230 QUIQUE_C1563_190116_001 99.802 80.531 92975000 40610000 0 0 0 0 24297000 0 16112000 0 11956000 0 0 0 10488 3657 9822 92652;92653;92654;92655;92656;92657;92658;92659;92660 117617;117618;117619;117620;117621;117622;117623;117624;117625 117620 9 ELALGQDR Unmodified 900.46649 0.46649483 2301 P30046;J3KQ18;B5MC82;A6NHG4 DDT;DDTL D-dopachrome decarboxylase;D-dopachrome decarboxylase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 28.423 28.423 2 0.008495 22925 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.114 45.941 1257400000 0 0 0 323740000 0 0 0 0 0 200650000 0 302940000 430100000 10489 2301 9823 92661;92662;92663;92664 117626;117627;117628;117629 117628 4 ELALNTAQFAK Unmodified 1204.6452 0.64518747 3015 Q13596;H0YK42 SNX1 Sorting nexin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.552 73.552 2 1.9688E-05 70614 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.14 103.58 1398600000 104230000 0 150650000 0 169980000 96943000 165680000 102240000 122830000 50775000 157450000 109280000 168590000 10490 3015 9824 92665;92666;92667;92668;92669;92670;92671;92672;92673;92674;92675;92676 117630;117631;117632;117633;117634;117635;117636;117637;117638;117639;117640;117641 117638 8 ELALPGELTQSR Unmodified 1312.6987 0.69867961 1635 O75436;S4R3Q6 VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.794 85.794 2 0.00051557 87268 QUIQUE_C1277_190116_001 109.42 64.258 1019100000 111930000 108640000 95241000 110860000 0 0 106890000 97029000 105390000 53266000 0 114380000 115510000 10491 1635 9825 92677;92678;92679;92680;92681;92682;92683;92684;92685;92686 117642;117643;117644;117645;117646;117647;117648;117649;117650;117651;117652;117653 117643 12 ELALQQEEGK Unmodified 1143.5772 0.57716749 4544 Q9Y276;C9J8G3;C9J1S9 BCS1L Mitochondrial chaperone BCS1 yes no 0 0 0 1 31.193 31.193 2 0.011577 26193 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.502 65.317 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10492 4544 9826 92687 117654 117654 1 ELAMPGEDLK Unmodified 1101.5376 0.53761086 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.298 66.298 2 0.0035536 62397 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.948 62.648 680580000 264020000 0 284570000 0 0 0 0 82992000 0 49001000 0 0 0 10493 2529 9827 92688;92689;92690;92691 117655;117656;117657;117658 117658 3 ELAMPGEDLKFNLILR Unmodified 1858.0023 0.0022551915 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 134.43 134.43 3 0.00038817 137640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.391 63.272 85193000 0 0 0 0 0 0 0 55240000 0 0 0 0 29954000 10494 2529 9828 92692;92693 117659;117660 117659 2 ELANSPDCPQMCAYK Unmodified 1782.7375 0.73752601 2519 P48739;A0A0A0MSW4 PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform yes no 0 0 0 1 1 57.368 57.368 2 1.6718E-24 55871 QUIQUE_C1277_190116_001 157.38 138.25 58142000 0 36708000 0 0 0 0 21434000 0 0 0 0 0 0 10495 2519 9829 92694;92695 117661;117662 117661 2 ELAPAVSVLQLFCSSPK Unmodified 1844.9706 0.97062071 4645;4396 Q9Y678;Q9UBF2 COPG1;COPG2 Coatomer subunit gamma-1;Coatomer subunit gamma-2 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 156 156 2;3 1.1363E-17 161192 QUIQUE_C1368_190116_001 121.56 108.13 1270100000 74042000 178350000 90778000 107740000 111000000 87355000 84171000 73368000 77964000 23142000 80300000 93483000 188390000 10496 4645;4396 9830 92696;92697;92698;92699;92700;92701;92702;92703;92704;92705;92706;92707;92708;92709;92710;92711;92712 117663;117664;117665;117666;117667;117668;117669;117670;117671;117672;117673;117674;117675;117676;117677;117678;117679;117680;117681;117682;117683;117684;117685;117686;117687;117688;117689 117670 27 ELAPAWEDTSPEQDNR Unmodified 1856.8177 0.81768512 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.172 74.172 2 2.2878E-30 74817 QUIQUE_DMIX3_190116_001 167.44 155.91 1036900000 72257000 91087000 125700000 81761000 102160000 157220000 66619000 103810000 79424000 30379000 67706000 58794000 0 10497 921 9831 92713;92714;92715;92716;92717;92718;92719;92720;92721;92722;92723;92724;92725 117690;117691;117692;117693;117694;117695;117696;117697;117698;117699;117700;117701;117702;117703;117704;117705 117701 15 ELAPAWEDTSPEQDNRYWR Unmodified 2362.0614 0.061437643 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 98.224 98.224 3 0.00027416 99817 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.148 60.499 41507000 0 0 0 0 0 0 0 41507000 0 0 0 0 0 10498 921 9832 92726 117706 117706 1 ELAPEAVLFTYVGK Unmodified 1535.8235 0.82354577 1415 O00519 FAAH Fatty-acid amide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 142.06 142.06 2 0.0017238 147422 QUIQUE_C1368_190116_001 87.363 68.583 198970000 15170000 28521000 27393000 16135000 26588000 22657000 0 30851000 0 0 0 0 31654000 10499 1415 9833 92727;92728;92729;92730;92731;92732;92733;92734 117707;117708;117709;117710;117711;117712;117713;117714 117709 3 ELAPLFEELR Unmodified 1215.6499 0.6499385 4426 Q9UHA4 LAMTOR3 Ragulator complex protein LAMTOR3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.31 122.31 2 0.0018783 128031 QUIQUE_C1438_190116_001 104.17 37.91 1106700000 95900000 94913000 82099000 43694000 77969000 81503000 86570000 81647000 101350000 30752000 122240000 89763000 118300000 10500 4426 9834 92735;92736;92737;92738;92739;92740;92741;92742;92743;92744;92745;92746;92747 117715;117716;117717;117718;117719;117720;117721;117722;117723;117724;117725;117726;117727;117728;117729;117730 117719 16 ELAPLQELIEK Unmodified 1281.718 0.71801807 3448 Q7L9L4 MOB1B MOB kinase activator 1B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.46 115.46 2 0.0070958 118901 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.849 34.781 930260000 0 98479000 58778000 75357000 94190000 67496000 0 135010000 0 0 136420000 117740000 146790000 10501 3448 9835 92748;92749;92750;92751;92752;92753;92754;92755;92756 117731;117732;117733;117734;117735;117736;117737;117738;117739;117740 117739 9 ELAPYDENWFYTR Unmodified 1702.7627 0.76273643 2417 P39019;M0R2L9;M0QXK4;M0QYF7;M0R140 RPS19 40S ribosomal protein S19 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 126 126 2 0.00047554 130645 QUIQUE_C1368_190116_001 90.913 65.476 975140000 95525000 90635000 75346000 85696000 96054000 75206000 93166000 29320000 81316000 32960000 76638000 69643000 73631000 10502 2417 9836 92757;92758;92759;92760;92761;92762;92763;92764;92765;92766;92767;92768;92769;92770;92771 117741;117742;117743;117744;117745;117746;117747;117748;117749;117750;117751;117752;117753;117754;117755;117756 117744 15 ELAQQIQK Unmodified 956.5291 0.52909508 2697;3055 P60842;J3KT12;J3KTB5;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25;Q14240;E7EQG2;J3KSN7 EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.68 19.68 2 0.014205 12698 QUIQUE_C1218_190116_001 132.72 18.532 3037400000 391210000 0 245720000 589530000 218550000 0 0 531610000 430790000 0 0 630020000 0 10503 2697;3055 9837 92772;92773;92774;92775;92776;92777;92778 117757;117758;117759;117760;117761;117762;117763 117757 3 ELAQQVQQVAAEYCR Unmodified 1791.8574 0.85738187 1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3KRZ1 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 3 1 3 2 3 2 1 103.51 103.51 2;3 6.6528E-79 106457 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92807;92808;92809;92810;92811;92812;92813;92814;92815;92816;92817;92818;92819 117799;117800;117801;117802;117803;117804;117805;117806;117807;117808;117809;117810;117811;117812;117813;117814 117802 16 ELAQVLLQK Unmodified 1040.623 0.62299547 501 A0A3B3ITP4;Q495G5;Q8IVH4;A0A3B3IRG3;D6RIS5 MMAA Methylmalonic aciduria type A protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 70.448 70.448 2 0.012464 70530 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.296 38.686 37345000 0 0 0 0 0 0 0 0 19397000 0 0 17949000 0 10506 501 9840 92820;92821;92822 117815;117816;117817 117816 3 ELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAK Unmodified 3028.5757 0.57571751 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 1 6 4 3 4 4 4 3 4 3 4 4 4 4 154.07 154.07 2;3;4 6.7254E-283 160176 QUIQUE_C1368_190116_001 264.66 249.02 116540000000 8302000000 8288800000 11287000000 9223500000 9578400000 6705300000 6989800000 7280800000 9660100000 3477900000 15284000000 10161000000 10299000000 10507 2688 9841 92823;92824;92825;92826;92827;92828;92829;92830;92831;92832;92833;92834;92835;92836;92837;92838;92839;92840;92841;92842;92843;92844;92845;92846;92847;92848;92849;92850;92851;92852;92853;92854;92855;92856;92857;92858;92859;92860;92861;92862;92863;92864;92865;92866;92867;92868;92869;92870;92871;92872;92873 117818;117819;117820;117821;117822;117823;117824;117825;117826;117827;117828;117829;117830;117831;117832;117833;117834;117835;117836;117837;117838;117839;117840;117841;117842;117843;117844;117845;117846;117847;117848;117849;117850;117851;117852;117853;117854;117855;117856;117857;117858;117859;117860;117861;117862;117863;117864;117865;117866;117867;117868;117869;117870;117871;117872;117873;117874;117875;117876;117877;117878;117879;117880;117881;117882;117883;117884;117885;117886;117887;117888;117889;117890;117891;117892;117893;117894;117895;117896;117897;117898;117899;117900;117901;117902;117903;117904;117905;117906;117907;117908;117909;117910;117911;117912;117913;117914;117915;117916;117917;117918;117919;117920 117846 101 ELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ Unmodified 3156.6343 0.63429502 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 2 2 153.68 153.68 3;4 1.6605E-29 156562 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.691 92.261 516460000 0 0 0 0 0 0 0 516460000 0 0 0 0 0 10508 2688 9842 92874;92875 117921;117922 117922 2 ELATVLSDQPGLLGPK Unmodified 1636.9036 0.903587 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.68 110.68 2 1.1527E-07 114119 QUIQUE_C1403_190116_001 107.85 84.242 1656900000 147280000 128770000 115160000 126350000 114850000 104070000 151210000 156920000 135930000 69580000 109020000 158840000 138930000 10509 4551 9843 92876;92877;92878;92879;92880;92881;92882;92883;92884;92885;92886;92887;92888 117923;117924;117925;117926;117927;117928;117929;117930;117931;117932;117933;117934;117935;117936;117937;117938;117939 117926 16 ELAVEGMHR Unmodified 1040.5073 0.50731378 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 25.973 25.973 2 0.018516 19854 QUIQUE_C1368_190116_001 64.265 29.44 18536000 0 0 18536000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10510 4389 9844 92889 117940 117940 1 ELAVQIQK Unmodified 927.53893 0.53893149 2416 P38919 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.595 36.595 2 0.0080433 32008 QUIQUE_C1403_190116_001 95.793 40.189 382580000 83715000 0 0 70846000 0 60557000 64703000 0 0 26319000 0 76436000 0 10511 2416 9845 92890;92891;92892;92893;92894;92895 117941;117942;117943;117944;117945;117946;117947 117942 6 ELAVQIYEEAR Unmodified 1319.6721 0.67213051 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;A0A2R8YDH3;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.527 86.527 2 0.0020595 83318 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.688 60.902 2070400000 160720000 150270000 212160000 184460000 184400000 164890000 0 138410000 184050000 88195000 240320000 147730000 214830000 10512 266;1504 9846 92896;92897;92898;92899;92900;92901;92902;92903;92904;92905;92906;92907;92908 117948;117949;117950;117951;117952;117953;117954;117955;117956;117957;117958;117959;117960;117961 117958 13 ELCALFIGSELLPK Unmodified 1588.8535 0.85346569 3522 Q86YJ6;C9JU10;C9J3J1 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes no 0 0 0 1 152.11 152.11 2 0.01186 147476 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.509 60.176 13202000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13202000 0 0 0 10513 3522 9847 92909 117962 117962 1 ELCALFIGSELLPKDELNDLIDR Unmodified 2672.3731 0.3731183 3522 Q86YJ6;C9JU10;C9J3J1 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes no 0 0 1 1 1 162.68 162.68 3 1.3897E-05 165107 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.225 52.387 56924000 0 0 0 0 0 0 0 32869000 24055000 0 0 0 0 10514 3522 9848 92910;92911 117963;117964 117963 2 ELCDYFVDHMGDYEDVLASLETLNHSVLK Unmodified 3411.5639 0.56390855 3468 Q7Z6G3;H3BPH6 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 168.39 168.39 4 0.0012356 172538 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.885 28.51 117240000 0 0 0 0 0 0 45676000 0 0 0 0 0 71565000 10515 3468 9849 92912;92913 117965;117966 117966 2 ELCEENLNPNAHPR Unmodified 1691.7686 0.76856686 1424 O14490;A8MYR7;A8MXQ8;A0A0A0MTP4 DLGAP1 Disks large-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 31.007 31.007 3 0.0018957 29809 QUIQUE_C1277_190116_001 47.189 39.408 318540000 0 45576000 37784000 0 29823000 0 0 0 0 205350000 0 0 0 10516 1424 9850 92914;92915;92916;92917 117967;117968;117969;117970;117971 117967 5 ELCHTQSSHASLR Unmodified 1524.7103 0.7103237 51 F8W7S5;A0A087WVV2;Q9P2E9 RRBP1 Ribosome-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 10.409 10.409 4 0.00080834 2890 QUIQUE_C1218_190116_001 59.898 48.793 12634000 6392600 0 0 0 0 0 0 6240900 0 0 0 0 0 10517 51 9851 92918;92919 117972;117973 117972 2 ELCQGLGQPGSVLR Unmodified 1512.7719 0.77186132 2055 P13489;H0YCR7 RNH1 Ribonuclease inhibitor yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.132 74.132 2 4.491E-11 75348 QUIQUE_C1438_190116_001 138.99 101.8 7508700000 415260000 559600000 821310000 711400000 720210000 628160000 680720000 653640000 642640000 271640000 0 609680000 794450000 10518 2055 9852 92920;92921;92922;92923;92924;92925;92926;92927;92928;92929;92930;92931;92932 117974;117975;117976;117977;117978;117979;117980;117981;117982;117983;117984;117985;117986;117987;117988;117989;117990 117980 16 ELCQLLLEGLEGVLR Unmodified 1740.9444 0.94440596 1072 G3V1A6;P57764;H0YDB0 GSDMD Gasdermin-D yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 1 2 1 170.48 170.48 2;3 9.6128E-45 175253 QUIQUE_C1368_190116_001 151.56 140.04 386920000 15473000 36079000 34189000 14225000 73315000 0 15363000 31919000 33847000 3500600 107260000 0 21740000 10519 1072 9853 92933;92934;92935;92936;92937;92938;92939;92940;92941;92942;92943;92944;92945;92946;92947;92948;92949 117991;117992;117993;117994;117995;117996;117997;117998;117999;118000;118001;118002;118003;118004;118005;118006;118007 117995 17 ELDAFFLHMLMK Oxidation (M) 1509.736 0.73599309 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 3 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 137.18 137.18 2;3 0.00082935 146498 QUIQUE_C1218_190116_001 89.886 43.424 609060000 102700000 78722000 80967000 33787000 56329000 90792000 0 26092000 48284000 15147000 16367000 0 59865000 10520 1678 9854 92950;92951;92952;92953;92954;92955;92956;92957;92958;92959;92960;92961;92962;92963;92964;92965;92966;92967 118008;118009;118010;118011;118012;118013;118014;118015;118016;118017;118018;118019;118020;118021;118022;118023;118024;118025;118026 118010 913;914 16 ELDAFFLHMLMK Unmodified 1493.7411 0.74107847 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 150.44 150.44 2;3 1.0065E-27 156323 QUIQUE_C1218_190116_001 193.38 161.62 2272500000 209880000 238870000 121220000 0 76886000 119960000 243300000 87100000 291160000 21817000 374580000 335050000 152630000 10521 1678 9854 92968;92969;92970;92971;92972;92973;92974;92975;92976;92977;92978;92979;92980;92981;92982;92983;92984;92985;92986;92987 118027;118028;118029;118030;118031;118032;118033;118034;118035;118036;118037;118038;118039;118040;118041;118042;118043;118044;118045;118046;118047;118048;118049;118050 118028 23 ELDALDANDELTPLGR Unmodified 1740.853 0.853008 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.47 115.47 2 6.6122E-95 119453 QUIQUE_C1368_190116_001 218.54 200.28 2625900000 229470000 282060000 217680000 202470000 264300000 184640000 219830000 206920000 243150000 48699000 238050000 288690000 0 10522 2916 9855 92988;92989;92990;92991;92992;92993;92994;92995;92996;92997;92998;92999 118051;118052;118053;118054;118055;118056;118057;118058;118059;118060;118061;118062 118053 12 ELDALGHELPVLAPQWEGYDELQTDGNR Unmodified 3164.5051 0.50507176 2675 P55957;B2ZP78 BID BH3-interacting domain death agonist;BH3-interacting domain death agonist p15;BH3-interacting domain death agonist p13;BH3-interacting domain death agonist p11 yes no 0 0 0 1 146.95 146.95 3 2.4157E-14 149889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.732 80.766 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10523 2675 9856 93000 118063 118063 1 ELDAYNPNTPEWR Unmodified 1603.7267 0.72668527 647 B5MED8;Q96PQ0 SORCS2 VPS10 domain-containing receptor SorCS2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 81.873 81.873 2 6.983E-06 84521 QUIQUE_C1218_190116_001 137.98 120.54 120310000 0 30784000 40522000 0 0 0 0 0 0 0 49001000 0 0 10524 647 9857 93001;93002;93003;93004 118064;118065;118066;118067 118064 4 ELDDATEANEGLSR Unmodified 1518.6798 0.67979466 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.855 47.855 2 0.00019592 44733 QUIQUE_C1368_190116_001 109.39 94.698 1276600000 0 128020000 136410000 105300000 114180000 92110000 134440000 95908000 95893000 38630000 127450000 116930000 91340000 10525 2379 9858 93005;93006;93007;93008;93009;93010;93011;93012;93013;93014;93015;93016 118068;118069;118070;118071;118072;118073;118074;118075;118076;118077;118078;118079;118080 118070 13 ELDDELMK Oxidation (M) 1007.4481 0.44812715 3088 Q14894;I3L325;I3L3Y1 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 36.921 36.921 2 0.014154 32300 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.296 58.684 344100000 69240000 94824000 0 0 0 0 60099000 23849000 70431000 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118120;118121;118122;118123;118124;118125;118126;118127;118128;118129;118130;118131;118132;118133;118134;118135;118136;118137 118120 18 ELDDISLTPDPEPTHEDPNYLMANER Oxidation (M) 3026.3451 0.34512523 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 1 0 1 1 106.67 106.67 3 6.1822E-08 111623 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.109 55.134 106440000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52511000 53926000 0 0 10531 3433 9861 93056;93057 118138;118139 118139 2657 2 ELDDISQEIAQLQR Unmodified 1656.8319 0.83187862 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 129.33 129.33 2 0.0078026 134790 QUIQUE_C1218_190116_001 83.081 66.944 398850000 0 117060000 104500000 0 0 0 0 60464000 0 0 116830000 0 0 10532 4394 9862 93058;93059;93060;93061;93062 118140;118141;118142;118143;118144 118140 4 ELDEATESNEAMGR Unmodified 1550.6519 0.65186535 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 42.001 42.001 2 6.0141E-05 38732 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.09 93.002 259840000 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ELDRDTVFALVNYIFFK Unmodified 2089.0884 0.088427662 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 1 172.13 172.13 2;3 2.8959E-44 179321 QUIQUE_DMIX5_190116_001 200.76 163.34 2649700000 0 10822000 19363000 0 0 0 84544000 137070000 174300000 0 1651700000 339420000 232540000 10556 4;1799 9885 93248;93249;93250;93251;93252;93253;93254;93255;93256;93257;93258;93259;93260 118375;118376;118377;118378;118379;118380;118381;118382;118383;118384;118385;118386;118387;118388 118385 14 ELDRYSLDSEDLYSR Unmodified 1859.8537 0.85373628 182 E7EUA2;A6NHU9;A0A0A0MSQ6;Q9UPX8;H7C1X5 SHANK2 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 yes no 0 0 1 1 1 42.709 42.709 3 0.011754 39532 QUIQUE_DMIX7_190116_001 34.432 6.6655 122970000 0 0 0 0 0 0 0 0 58057000 0 0 64915000 0 10557 182 9886 93261;93262 118389;118390 118390 2 ELDSGLAESVSTLIWAAPR Unmodified 2014.0371 0.037120373 2635 P53990;H3BMU1;H3BUI0;H3BQF7;J3KR23;F5GXM3 IST1 IST1 homolog yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 162.8 162.8 2;3 3.646E-74 166324 QUIQUE_C1403_190116_001 141.55 135.84 778890000 47979000 56140000 188840000 45450000 162290000 117420000 78107000 0 0 0 0 63466000 19198000 10558 2635 9887 93263;93264;93265;93266;93267;93268;93269;93270;93271;93272;93273;93274;93275;93276;93277 118391;118392;118393;118394;118395;118396;118397;118398;118399;118400;118401;118402;118403;118404;118405;118406;118407;118408;118409;118410;118411;118412;118413;118414;118415;118416 118400 26 ELDSITPEVLPGWK Unmodified 1582.8243 0.82427405 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.66 128.66 2 0.00023876 134748 QUIQUE_C1438_190116_001 120.06 93.547 4808300000 493390000 426990000 382150000 398990000 376760000 367360000 448430000 0 413300000 196190000 446580000 379780000 478380000 10559 693;3205 9888 93278;93279;93280;93281;93282;93283;93284;93285;93286;93287;93288;93289 118417;118418;118419;118420;118421;118422;118423;118424;118425;118426;118427;118428 118421 10 ELDSNPFASLVFYWEPLNR Unmodified 2296.1164 0.11643333 4309 Q9NVS9;J3QQV6 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 1 1 172.6 172.6 2;3 4.2637E-06 176863 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.24 111.58 619840000 0 19059000 22365000 7783700 41786000 0 67735000 37419000 91840000 0 193500000 88143000 50212000 10560 4309 9889 93290;93291;93292;93293;93294;93295;93296;93297;93298;93299;93300;93301;93302;93303 118429;118430;118431;118432;118433;118434;118435;118436;118437;118438;118439;118440;118441;118442;118443;118444;118445;118446 118438 18 ELDTVTLEDIKEHVK Unmodified 1767.9254 0.92544466 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 83.999 83.999 3;4 0.0003915 86339 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.574 59.69 595630000 0 36452000 62503000 21064000 33713000 17214000 79449000 72980000 78425000 9622300 83010000 78815000 22378000 10561 1516 9890 93304;93305;93306;93307;93308;93309;93310;93311;93312;93313;93314;93315;93316;93317;93318;93319;93320;93321 118447;118448;118449;118450;118451;118452;118453;118454;118455;118456;118457;118458;118459;118460;118461;118462;118463;118464;118465;118466 118461 16 ELDVEEAHAASTEEK Unmodified 1656.7479 0.74787422 3818 Q96C86 DCPS m7GpppX diphosphatase yes yes 0 0 0 1 32.189 32.189 2 5.049E-09 26873 QUIQUE_C1277_190116_001 162.93 146.29 18469000 0 18469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10562 3818 9891 93322 118467 118467 1 ELDVLQGR Unmodified 928.49779 0.49779495 396 A0A1X7SBT7;O95502 NPTXR Neuronal pentraxin receptor yes no 0 0 0 1 52.751 52.751 2 0.035632 51046 QUIQUE_C1368_190116_001 63.306 23.203 59565000 0 0 59565000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10563 396 9892 93323 118468 118468 1 ELDVVDPDGSVPVGLR Unmodified 1665.8574 0.85736509 2289 P29536;Q9BV00 LMOD1 Leiomodin-1 yes no 0 0 0 1 1 111.05 111.05 2 0.00088408 114349 QUIQUE_C1277_190116_001 68.44 55.24 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10564 2289 9893 93324;93325 118469;118470 118469 2 ELEAELEDERK Unmodified 1359.6518 0.65178899 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 36.243 36.243 2;3 2.8725E-05 32776 QUIQUE_C1218_190116_001 140.16 53.266 619540000 27476000 39139000 36368000 41447000 54217000 30084000 43790000 0 0 0 279470000 33134000 34409000 10565 2379 9894 93326;93327;93328;93329;93330;93331;93332;93333;93334;93335;93336 118471;118472;118473;118474;118475;118476;118477;118478;118479;118480;118481;118482 118472 12 ELEAENYHDIK Unmodified 1359.6307 0.63065962 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.321 32.321 3 0.00021844 27070 QUIQUE_C1277_190116_001 82.171 74.446 6446300000 1195100000 807590000 842870000 644650000 603710000 512830000 534590000 175970000 266210000 322830000 0 233620000 306270000 10566 2851 9895 93337;93338;93339;93340;93341;93342;93343;93344;93345;93346;93347;93348 118483;118484;118485;118486;118487;118488;118489;118490;118491;118492;118493;118494 118484 7 ELEAENYHDIKR Unmodified 1515.7318 0.73177065 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 23.807 23.807 2;3;4 2.5053E-45 17618 QUIQUE_C1218_190116_001 225.01 193.59 19846000000 1031600000 1580400000 1630700000 953850000 1856300000 586620000 1110600000 1829700000 2325300000 433020000 1746000000 2829800000 1932000000 10567 2851 9896 93349;93350;93351;93352;93353;93354;93355;93356;93357;93358;93359;93360;93361;93362;93363;93364;93365;93366;93367;93368;93369;93370;93371;93372;93373;93374;93375 118495;118496;118497;118498;118499;118500;118501;118502;118503;118504;118505;118506;118507;118508;118509;118510;118511;118512;118513;118514;118515;118516;118517;118518;118519;118520;118521;118522;118523;118524;118525;118526 118496 32 ELEAIFGR Unmodified 933.49198 0.4919813 2395 P36507;G5E9C7 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 82.576 82.576 2 0.0048393 79582 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.66 44.816 90993000 30526000 0 0 22220000 0 24316000 0 0 0 13932000 0 0 0 10568 2395 9897 93376;93377;93378;93379 118527;118528;118529;118530 118530 4 ELEAIFGRPVVDGEEGEPHSISPR Unmodified 2619.2929 0.29289414 2395 P36507;G5E9C7 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 92.032 92.032 3;4 6.9681E-101 93540 QUIQUE_DMIX1_190116_001 187.29 159.11 3621100000 236640000 289140000 292600000 253500000 288540000 212640000 298750000 237530000 334480000 92833000 368910000 279120000 436410000 10569 2395 9898 93380;93381;93382;93383;93384;93385;93386;93387;93388;93389;93390;93391;93392;93393;93394;93395;93396;93397;93398;93399;93400;93401;93402;93403;93404;93405 118531;118532;118533;118534;118535;118536;118537;118538;118539;118540;118541;118542;118543;118544;118545;118546;118547;118548;118549;118550;118551;118552;118553;118554;118555;118556;118557;118558;118559;118560;118561;118562;118563;118564;118565;118566;118567;118568;118569 118556 39 ELEALDEVFTK Unmodified 1292.65 0.64999808 4504 Q9UMX5 NENF Neudesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 113.05 113.05 2 0.00043381 117501 QUIQUE_C1218_190116_001 103.26 56.057 131040000 44594000 33394000 0 33059000 0 0 0 19995000 0 0 0 0 0 10570 4504 9899 93406;93407;93408;93409;93410 118570;118571;118572;118573;118574;118575 118570 5 ELEALIQNLDNVVEDSMLVDPK Unmodified 2483.2465 0.2465208 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394;H7C2D1 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 1 1 173.02 173.02 3 7.6182E-09 177255 QUIQUE_C1218_190116_001 66.644 43.943 70587000 22997000 14583000 0 0 0 0 33007000 0 0 0 0 0 0 10571 2 9900 93411;93412;93413 118576;118577;118578 118576 3 ELEAPSEDNSGR Unmodified 1302.5688 0.56878765 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 25.765 25.765 2 4.4905E-78 19048 QUIQUE_C1563_190116_001 225.66 138.87 5291500000 401710000 533370000 405480000 347430000 476540000 326420000 569400000 369960000 421280000 177900000 497550000 325080000 439380000 10572 3862 9901 93414;93415;93416;93417;93418;93419;93420;93421;93422;93423;93424;93425;93426;93427;93428;93429;93430;93431;93432;93433;93434;93435;93436;93437;93438 118579;118580;118581;118582;118583;118584;118585;118586;118587;118588;118589;118590;118591;118592;118593;118594;118595;118596;118597;118598;118599;118600;118601;118602;118603;118604;118605;118606;118607;118608;118609;118610;118611;118612;118613;118614;118615;118616 118594 38 ELEAQLDDAVAEASK Unmodified 1587.7628 0.76279601 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 99.488 99.488 2 4.4245E-09 101772 QUIQUE_C1403_190116_001 144.57 124.81 283450000 0 55549000 0 55952000 67435000 0 0 47598000 0 0 0 0 56921000 10573 4631 9902 93439;93440;93441;93442;93443;93444;93445;93446 118617;118618;118619;118620;118621;118622;118623;118624;118625;118626 118619 10 ELEAVCQDVLSLLDNYLIK Unmodified 2234.1504 0.15043557 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 3 1 3 2 2 1 3 3 2 175.02 175.02 2;3 2.2165E-152 181761 QUIQUE_DMIX5_190116_001 297.5 274.92 32242000000 296770000 540980000 984210000 158950000 1924700000 274130000 2618900000 1234500000 2426000000 39359000 12451000000 7220700000 2071300000 10574 2736 9903 93447;93448;93449;93450;93451;93452;93453;93454;93455;93456;93457;93458;93459;93460;93461;93462;93463;93464;93465;93466;93467;93468;93469;93470 118627;118628;118629;118630;118631;118632;118633;118634;118635;118636;118637;118638;118639;118640;118641;118642;118643;118644;118645;118646;118647;118648;118649;118650;118651;118652;118653;118654;118655 118646 21 ELEDATETADAMNR Unmodified 1564.6675 0.66751541 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.6 55.6 2 1.4757E-36 53807 QUIQUE_DMIX3_190116_001 210.87 202.64 1373600000 98106000 99542000 151300000 156290000 102480000 93453000 96117000 98348000 106560000 40945000 110010000 89529000 130890000 10575 2378 9904 93471;93472;93473;93474;93475;93476;93477;93478;93479;93480;93481;93482;93483 118656;118657;118658;118659;118660;118661;118662;118663;118664;118665;118666;118667;118668 118664 13 ELEDFKLQHGSILGFPK Unmodified 1957.0309 0.030912783 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 3 1 3 3 5 3 3 101.86 101.86 2;3;4 1.8903E-200 104039 QUIQUE_DMIX1_190116_001 286.74 257.2 4638900000 0 26849000 27648000 0 253350000 0 110160000 1137000000 730460000 0 956790000 424330000 972330000 10576 1777 9905 93484;93485;93486;93487;93488;93489;93490;93491;93492;93493;93494;93495;93496;93497;93498;93499;93500;93501;93502;93503;93504;93505;93506 118669;118670;118671;118672;118673;118674;118675;118676;118677;118678;118679;118680;118681;118682;118683;118684;118685;118686;118687;118688;118689;118690;118691;118692;118693;118694;118695;118696;118697;118698;118699;118700;118701;118702;118703;118704;118705;118706;118707;118708;118709;118710;118711;118712;118713;118714;118715;118716;118717;118718;118719;118720;118721;118722;118723;118724;118725;118726;118727;118728;118729;118730;118731;118732;118733;118734;118735;118736;118737;118738 118686 70 ELEDKVIELHK Unmodified 1351.7347 0.73473076 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A1B0GTF8;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 39.066 39.066 2;3 0.0016984 35250 QUIQUE_C1576_190116_001 67.153 41.036 1857800000 0 0 0 0 58982000 0 63380000 501090000 265320000 0 261040000 351130000 356910000 10577 143;560;4559 9906 93507;93508;93509;93510;93511;93512;93513;93514;93515;93516 118739;118740;118741;118742;118743;118744;118745;118746;118747;118748;118749;118750;118751;118752 118740 13 ELEDLIIEAVYTDIIQGK Unmodified 2061.0882 0.08815289 1277 J3KQ41;Q9H9Q2;J3KQ34;J3QT95;A0A087X1P5 COPS7B COP9 signalosome complex subunit 7b yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 175.54 175.54 2;3 8.4207E-39 180465 QUIQUE_C1576_190116_001 126.63 117.53 182280000 4614600 5140500 3743200 0 10897000 0 40029000 14215000 22965000 0 55365000 25311000 0 10578 1277 9907 93517;93518;93519;93520;93521;93522;93523;93524;93525;93526 118753;118754;118755;118756;118757;118758;118759;118760;118761;118762;118763 118757 11 ELEDLLSPLEELVK Unmodified 1625.8764 0.8763692 1362 M0QXN5;P37198 NUP62 Nuclear pore glycoprotein p62 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 168.31 168.31 2 3.1223E-08 171909 QUIQUE_C1277_190116_001 163.83 86.687 468040000 84579000 188810000 145630000 0 0 0 0 0 0 49016000 0 0 0 10579 1362 9908 93527;93528;93529;93530;93531 118764;118765;118766;118767;118768 118765 5 ELEDLQK Unmodified 873.44436 0.4443624 1459 O14933 UBE2L6 Ubiquitin/ISG15-conjugating enzyme E2 L6 yes yes 0 0 0 1 24.911 24.911 2 0.056949 18786 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.141 12.895 45372000 0 0 0 0 0 0 0 45372000 0 0 0 0 0 10580 1459 9909 93532 118769 118769 1 ELEDLVR Unmodified 872.46035 0.46034682 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.933 57.933 2 0.026025 56738 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.777 19.508 1080000000 0 244070000 179670000 0 0 0 241690000 154550000 134750000 125290000 0 0 0 10581 3549 9910 93533;93534;93535;93536;93537;93538 118770;118771;118772;118773;118774;118775 118774 6 ELEDSLER Unmodified 989.46655 0.46655441 1394 O00291 HIP1 Huntingtin-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 37.273 37.273 2 0.032902 33612 QUIQUE_C1438_190116_001 65.038 17.971 28860000 0 0 0 0 28860000 0 0 0 0 0 0 0 0 10582 1394 9911 93539;93540 118776;118777 118776 2 ELEDVTESAESMNR Unmodified 1608.6937 0.69373016 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.849 67.849 2 2.8682E-12 67689 QUIQUE_C1368_190116_001 147.72 121.67 101940000 0 0 0 0 22908000 23411000 0 0 0 0 34475000 21141000 0 10583 3459 9912 93541;93542;93543;93544;93545 118778;118779;118780;118781;118782 118778 4 ELEDYIDNLLVR Unmodified 1490.7617 0.76167379 3417 Q6WKZ4;E7EX40;Q7L804 RAB11FIP1;RAB11FIP2 Rab11 family-interacting protein 1;Rab11 family-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 150.56 150.56 2 0.002184 155791 QUIQUE_C1368_190116_001 91.584 62.857 54969000 19197000 0 15409000 0 0 0 0 0 20364000 0 0 0 0 10584 3417 9913 93546;93547;93548 118783;118784;118785 118784 3 ELEEALR Unmodified 858.4447 0.44469675 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 32.274 32.274 2 0.033128 27064 QUIQUE_C1403_190116_001 88.643 4.5793 103180000 0 0 0 103180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10585 16;1475 9914 93549 118786 118786 1 ELEEAMAGER Oxidation (M) 1149.4972 0.49720261 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.083 19.083 2 0.00098503 11719 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0 0 0 0 0 0 0 0 10588 2379 9916 93574 118811 118811 1 ELEEAVTSALQQETEK Unmodified 1803.8738 0.87380302 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 107 107 2;3 1.0251E-18 110726 QUIQUE_C1368_190116_001 182.71 142.56 201790000 0 0 44027000 0 0 0 0 0 0 0 114910000 42856000 0 10589 1187 9917 93575;93576;93577;93578;93579;93580 118812;118813;118814;118815;118816;118817 118812 6 ELEEDFIK Unmodified 1021.4968 0.4967919 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 3 94.772 94.772 2 0.010611 67793 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.041 56.149 2433300000 0 612100000 0 0 0 705770000 0 0 668520000 441650000 5255400 0 0 10590 3040 9918 93581;93582;93583;93584;93585;93586;93587;93588;93589 118818;118819;118820;118821;118822;118823;118824;118825;118826 118823 9 ELEEDFIKSELK Unmodified 1478.7504 0.75044041 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 1 1 88.862 88.862 3 0.0077822 91045 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pyrophosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.727 26.727 2 0.0025126 20313 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.429 34.511 538350000 59231000 63677000 74589000 90001000 57608000 52013000 0 30150000 41877000 39984000 0 29219000 0 10594 536 9922 93600;93601;93602;93603;93604;93605;93606;93607;93608;93609 118838;118839;118840;118841;118842;118843;118844;118845;118846;118847;118848 118847 11 ELEEETNAFNR Unmodified 1350.6052 0.60517315 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.518 51.518 2 2.4439E-24 49803 QUIQUE_C1277_190116_001 214.12 172.02 6232000000 0 1000200000 951070000 847030000 0 0 929850000 0 739820000 0 602240000 707270000 454510000 10595 535;3739 9923 93610;93611;93612;93613;93614;93615;93616;93617 118849;118850;118851;118852;118853;118854;118855;118856;118857 118849 9 ELEEETNAFNRR Unmodified 1506.7063 0.70628418 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 1 1 1 1 1 38.333 38.333 2;3 0.0041578 33860 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.516 38.894 140790000 0 0 0 0 0 0 0 51726000 44968000 0 44096000 0 0 10596 535;3739 9924 93618;93619;93620;93621 118858;118859;118860;118861 118861 3 ELEEEVNNFQK Unmodified 1377.6412 0.64122431 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.091 58.091 2 1.5536E-30 57823 QUIQUE_C1218_190116_001 240.53 191.97 12713000000 1060300000 1166800000 1173900000 1102000000 931130000 992840000 1006100000 959140000 956670000 482070000 969210000 906690000 1006100000 10597 820 9925 93622;93623;93624;93625;93626;93627;93628;93629;93630;93631;93632;93633;93634 118862;118863;118864;118865;118866;118867;118868;118869;118870;118871;118872;118873;118874;118875;118876;118877;118878;118879;118880;118881 118862 20 ELEEEWVK Unmodified 1060.5077 0.50769094 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 63.477 63.477 2 0.046289 59202 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.547 14.655 24886000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24886000 0 0 0 10598 3037 9926 93635 118882 118882 1 ELEEIAR Unmodified 858.4447 0.44469675 3354 Q6BCY4 CYB5R2 NADH-cytochrome b5 reductase 2 yes yes 0 0 0 1 1 32.031 32.031 2 0.040382 27144 QUIQUE_C1403_190116_001 82.913 0 199580000 0 0 0 103180000 0 0 0 0 0 0 0 0 96399000 10599 3354 9927 93636;93637 118883;118884 118883 2 ELEEIVQPIISK Unmodified 1396.7813 0.7813466 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.28 101.28 2 1.8459E-20 103270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.98 143.03 6665100000 663160000 611270000 626740000 625890000 682190000 673860000 569800000 187000000 326070000 312910000 548120000 400680000 437430000 10600 2007 9928 93638;93639;93640;93641;93642;93643;93644;93645;93646;93647;93648;93649;93650 118885;118886;118887;118888;118889;118890;118891;118892;118893;118894;118895;118896;118897;118898;118899;118900;118901;118902;118903;118904;118905;118906;118907;118908;118909;118910 118900 26 ELEELLESALDDFDK Unmodified 1764.8305 0.83054122 2429 P40855;B7Z8B3 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 169.71 169.71 2;3 1.0649E-13 175771 QUIQUE_C1438_190116_001 170.04 143.25 319960000 0 45022000 89927000 30665000 31675000 38696000 83976000 0 0 0 0 0 0 10601 2429 9929 93651;93652;93653;93654;93655;93656;93657;93658;93659 118911;118912;118913;118914;118915;118916;118917;118918;118919 118917 8 ELEEQLENETLHK Unmodified 1610.7788 0.77878042 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 62.761 62.761 2;3 0.046259 62639 QUIQUE_C1438_190116_001 21.942 18.039 129390000 38506000 0 0 0 47193000 43687000 0 0 0 0 0 0 0 10602 515 9930 93660;93661;93662 118920;118921;118922 118921 3 ELEETLNK Unmodified 974.49204 0.49204087 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 26.291 26.291 2 0.042765 20052 QUIQUE_C1218_190116_001 58.782 21.136 57713000 57713000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10603 310;830 9931 93663 118923 118923 1 ELEEVAIK Unmodified 929.50696 0.50696266 941 E9PJ55;Q9NUJ3;H0YES4 TCP11L1 T-complex protein 11-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 42.543 42.543 2 0.042928 39102 QUIQUE_C1576_190116_001 58.679 3.9053 42802000 20876000 0 0 0 0 0 21926000 0 0 0 0 0 0 10604 941 9932 93664;93665;93666 118924;118925;118926 118925 3 ELEEWYAR Unmodified 1094.5033 0.50327426 1966 P09496;F8WF69;C9J8P9 CLTA Clathrin light chain A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.97 68.97 2 0.0036109 68783 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.6 88.865 2724700000 496380000 546320000 225920000 309060000 263030000 240790000 0 224480000 218540000 0 94673000 0 105450000 10605 1966 9933 93667;93668;93669;93670;93671;93672;93673;93674;93675;93676 118927;118928;118929;118930;118931;118932;118933;118934;118935;118936;118937 118934 11 ELEFLGWYTTGGPPDPSDIHVHK Unmodified 2594.2442 0.24415304 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 127.55 127.55 3;4 2.2817E-40 131794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.41 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Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 89.71 89.71 3 0.00066381 86250 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.127 52.577 76620000 55962000 0 0 0 0 0 0 0 0 20658000 0 0 0 10608 2385 9936 93706;93707 118977;118978 118978 2 ELEGVILELQEQLTGLIPSDHAPLAQGSK Unmodified 3084.6343 0.63429502 3265 Q59EK9 RUNDC3A RUN domain-containing protein 3A yes yes 0 0 0 1 169.11 169.11 3 1.5832E-08 170992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.093 37.694 58683000 0 0 0 0 0 0 0 58683000 0 0 0 0 0 10609 3265 9937 93708 118979 118979 1 ELELKVPLVVR Unmodified 1293.802 0.80202247 3878 Q96I99;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 94.916 94.916 3 0.0018274 96071 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.434 54.4 20802000 0 0 0 0 0 0 0 20802000 0 0 0 0 0 10610 3878 9938 93709 118980 118980 1 ELELLDR Unmodified 886.476 0.47599688 1072 G3V1A6;P57764 GSDMD Gasdermin-D yes no 0 0 0 1 65.937 65.937 2 0.059144 65901 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.998 7.2812 14081000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14081000 10611 1072 9939 93710 118981 118981 1 ELELQILTEAIR Unmodified 1426.8031 0.80314468 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.61 143.61 2 8.0057E-14 148014 QUIQUE_DMIX7_190116_001 188.04 137.43 636750000 58097000 64820000 67191000 38549000 65760000 43181000 61785000 45407000 0 23496000 69180000 52605000 46678000 10612 465 9940 93711;93712;93713;93714;93715;93716;93717;93718;93719;93720;93721;93722 118982;118983;118984;118985;118986;118987;118988;118989;118990;118991;118992;118993;118994;118995;118996;118997;118998 118995 15 ELELVQNAFFTDPNDQSAWFYHR Unmodified 2826.3038 0.30379318 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 151.95 151.95 3 3.4138E-11 158329 QUIQUE_C1576_190116_001 90.968 83.774 540660000 0 0 65934000 0 0 45731000 69494000 66471000 65939000 22527000 0 101580000 102990000 10613 3750 9941 93723;93724;93725;93726;93727;93728;93729;93730 118999;119000;119001;119002;119003;119004;119005;119006;119007;119008;119009 119002 10 ELELVYAR Unmodified 991.53385 0.53384611 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 68.9 68.9 2 0.015425 69095 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.699 32.912 142700000 0 0 45187000 0 57484000 0 0 0 0 0 0 0 40027000 10614 3086 9942 93731;93732;93733 119010;119011;119012 119012 3 ELENAVGSWTDDLTQLSLLK Unmodified 2231.1321 0.13214297 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325;H0Y326 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 165.27 165.27 2 0.00096528 169158 QUIQUE_C1277_190116_001 62.287 50.142 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10615 228 9943 93734 119013 119013 1 ELENFFQELEK Unmodified 1424.6824 0.68236084 2201 P22676;H3BN14;A6NER6 CALB2 Calretinin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.95 134.95 2 1.2385E-29 131548 QUIQUE_DMIX4_190116_001 187.5 135.65 23665000000 1871800000 1732000000 1985300000 1307200000 2269300000 1644500000 1868400000 1646500000 2150900000 635650000 2124100000 1791500000 2638100000 10616 2201 9944 93735;93736;93737;93738;93739;93740;93741;93742;93743;93744;93745;93746;93747 119014;119015;119016;119017;119018;119019;119020;119021;119022;119023;119024;119025;119026;119027;119028;119029;119030;119031;119032;119033;119034;119035;119036;119037;119038;119039;119040;119041;119042 119035 29 ELENLATSLEHYK Unmodified 1545.7675 0.76748745 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 87.41 87.41 3 0.011634 89796 QUIQUE_C1576_190116_001 45.357 35.008 212330000 0 27724000 28951000 29551000 24603000 0 42114000 0 44923000 14466000 0 0 0 10617 348 9945 93748;93749;93750;93751;93752;93753;93754 119043;119044;119045;119046;119047;119048;119049 119047 7 ELEQANDDLER Unmodified 1330.6001 0.60008777 544 A6NIZ0;Q9GZM8;J3KRK9;J3QL85;Q9NXR1;I3L3G9;I3L2S8 NDEL1;NDE1 Nuclear distribution protein nudE-like 1;Nuclear distribution protein nudE homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.397 35.397 2 0.00018187 30649 QUIQUE_C1277_190116_001 135.71 97.625 408380000 41651000 28346000 29415000 48053000 32311000 29182000 42501000 26852000 26328000 0 38105000 24554000 41080000 10618 544 9946 93755;93756;93757;93758;93759;93760;93761;93762;93763;93764;93765;93766;93767 119050;119051;119052;119053;119054;119055;119056;119057;119058;119059;119060;119061;119062;119063 119051 14 ELEQELAEQK Unmodified 1215.5983 0.59829686 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 32.805 32.805 2 0.023806 27908 QUIQUE_C1563_190116_001 56.721 0.45125 178120000 0 0 0 0 0 178120000 0 0 0 0 0 0 0 10619 228 9947 93768 119064 119064 1 ELEQIFCQFDSK Unmodified 1542.7024 0.70244436 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.66 120.66 2 5.488E-05 124417 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.74 109.6 1128900000 133170000 99088000 143200000 0 0 104610000 112450000 76014000 93991000 0 139160000 109510000 117750000 10620 903;2869 9948 93769;93770;93771;93772;93773;93774;93775;93776;93777;93778 119065;119066;119067;119068;119069;119070;119071;119072;119073;119074;119075;119076;119077 119074 13 ELEQLFSQYGR Unmodified 1368.6674 0.66737948 160 A0A0A0MRX1;Q12926;B1AM48;C9JB16 ELAVL2 ELAV-like protein;ELAV-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.52 105.52 2 3.3165E-12 110112 QUIQUE_DMIX5_190116_001 189.38 152.68 503640000 48128000 55627000 45804000 54914000 0 44274000 0 42998000 53231000 20381000 83538000 54746000 0 10621 160 9949 93779;93780;93781;93782;93783;93784;93785;93786;93787;93788 119078;119079;119080;119081;119082;119083;119084;119085;119086;119087;119088 119087 9 ELEQLGR Unmodified 843.44503 0.4450311 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.047 27.047 2 0.020578 20730 QUIQUE_C1368_190116_001 107.74 6.4156 2707800000 0 502950000 537260000 167880000 429110000 0 0 479380000 591250000 0 0 0 0 10622 3117 9950 93789;93790;93791;93792;93793;93794 119089;119090;119091;119092;119093;119094;119095 119090 7 ELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPK Unmodified 3054.4869 0.48691928 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 3 2 2 3 3 3 3 3 140.01 140.01 2;3;4 7.8156E-137 147184 QUIQUE_DMIX5_190116_001 268.42 252.54 19312000000 1380400000 1348100000 1514000000 1874200000 1493700000 1354600000 1587100000 1193800000 1524300000 1098300000 1829400000 1369700000 1744700000 10623 282 9951 93795;93796;93797;93798;93799;93800;93801;93802;93803;93804;93805;93806;93807;93808;93809;93810;93811;93812;93813;93814;93815;93816;93817;93818;93819;93820;93821;93822;93823;93824;93825;93826;93827 119096;119097;119098;119099;119100;119101;119102;119103;119104;119105;119106;119107;119108;119109;119110;119111;119112;119113;119114;119115;119116;119117;119118;119119;119120;119121;119122;119123;119124;119125;119126;119127;119128;119129;119130;119131;119132;119133;119134;119135;119136;119137;119138;119139;119140;119141;119142;119143;119144;119145;119146;119147;119148 119139 51 ELESEKEQLKK Unmodified 1359.7246 0.72456001 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YGU1;A0A087WXD9;A0A2R8YG52;A0A2R8YCU9;A0A2R8Y820 CCDC88A Girdin yes no 0 0 2 1 10.976 10.976 3 0.058571 3376 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.958 29.924 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10624 473 9952 93828 119149 119149 1 ELESFLR Unmodified 892.46543 0.46543219 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 71.435 71.435 2 0.049128 71262 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.311 8.3171 116160000 0 0 46133000 0 0 0 32713000 0 0 0 0 0 37319000 10625 1187 9953 93829;93830;93831 119150;119151;119152 119152 3 ELESMIGIDPGNR Unmodified 1429.6871 0.68712864 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 92.625 92.625 2 0.0055558 96473 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.627 38.954 81310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 81310000 0 0 10626 1140;3457 9954 93832 119153 119153 1 ELESQISELQEDLESER Unmodified 2032.9437 0.9436735 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 134.16 134.16 2;3 5.4754E-181 137954 QUIQUE_C1403_190116_001 254.47 227.5 1865300000 182570000 228740000 189810000 258920000 185690000 130520000 229980000 63245000 86263000 0 90849000 113140000 105570000 10627 2378 9955 93833;93834;93835;93836;93837;93838;93839;93840;93841;93842;93843;93844;93845;93846;93847;93848;93849;93850;93851;93852;93853;93854;93855 119154;119155;119156;119157;119158;119159;119160;119161;119162;119163;119164;119165;119166;119167;119168;119169;119170;119171;119172;119173;119174;119175;119176;119177;119178;119179;119180;119181;119182;119183 119162 28 ELESVCVVEAGPGTCTFDHR Unmodified 2262.0045 0.0045163905 3369 Q6L8Q7;F6T1Q0 PDE12 2',5'-phosphodiesterase 12 yes no 0 0 0 1 84.534 84.534 3 0.0036635 86706 QUIQUE_C1576_190116_001 43.848 34.684 39536000 0 0 0 0 0 0 39536000 0 0 0 0 0 0 10628 3369 9956 93856 119184 119184 1 ELETLQQTVEELQAQVHSMDGAK Unmodified 2583.2486 0.24864607 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45;A0A087WXA6 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 151.29 151.29 3 1.6784E-11 155488 QUIQUE_C1403_190116_001 92.913 82.763 473570000 0 72507000 133780000 48057000 53715000 66255000 50432000 0 0 0 0 0 48823000 10629 3241 9957 93857;93858;93859;93860;93861;93862;93863 119185;119186;119187;119188;119189;119190;119191 119187 7 ELETVCNDVLSLLDK Unmodified 1746.871 0.87096625 2891 Q04917;A2IDB2 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 153.1 153.1 2;3 6.1042E-130 157934 QUIQUE_DMIX3_190116_001 279.86 243.28 24701000000 2598700000 2736700000 1771400000 1410000000 2080100000 2364100000 2185300000 929260000 1619700000 909390000 2005300000 2360500000 1730100000 10630 2891 9958 93864;93865;93866;93867;93868;93869;93870;93871;93872;93873;93874;93875;93876;93877;93878;93879 119192;119193;119194;119195;119196;119197;119198;119199;119200;119201;119202;119203;119204;119205;119206;119207;119208;119209;119210;119211;119212;119213;119214;119215;119216;119217;119218;119219;119220;119221;119222;119223 119211 32 ELETVCNDVLSLLDKFLIK Unmodified 2248.2025 0.20247114 2891 Q04917;A2IDB2 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 1 1 2 1 1 172.59 172.59 2;3 7.9896E-12 176297 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.544 82.672 578320000 0 0 0 0 0 0 0 75792000 0 0 216800000 187940000 97790000 10631 2891 9959 93880;93881;93882;93883;93884 119224;119225;119226;119227;119228 119227 5 ELEVLSEQYSQK Unmodified 1451.7144 0.71438925 1111;3416 H0Y2S9;H0Y7E2;H7C3G6;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 69.628 69.628 2 0.057369 70784 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.472 26.118 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10632 1111;3416 9960 93885 119229 119229 1 ELEVNGIEFYPQK Unmodified 1564.7773 0.77732386 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.03 108.03 2 4.9586E-05 112417 QUIQUE_C1218_190116_001 143.5 98.341 2351400000 225540000 259540000 242580000 224670000 166810000 186950000 216360000 98479000 171900000 111990000 131100000 153350000 162160000 10633 419 9961 93886;93887;93888;93889;93890;93891;93892;93893;93894;93895;93896;93897;93898 119230;119231;119232;119233;119234;119235;119236;119237;119238;119239;119240;119241;119242;119243;119244;119245;119246;119247;119248;119249;119250 119230 21 ELEVQHPAAK Unmodified 1120.5877 0.58767259 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 1 15.227 15.227 2;3 3.9402E-18 7444 QUIQUE_DMIX4_190116_001 184.38 111.59 1854900000 175680000 310950000 19449000 244530000 39546000 220680000 9928900 246690000 190830000 152430000 0 194460000 49754000 10634 2572 9962 93899;93900;93901;93902;93903;93904;93905;93906;93907;93908;93909;93910;93911;93912;93913;93914;93915;93916;93917 119251;119252;119253;119254;119255;119256;119257;119258;119259;119260;119261;119262;119263;119264;119265;119266;119267;119268;119269;119270;119271;119272 119269 19 ELFASLTPWACGSHTPLLAGR Unmodified 2283.147 0.14702195 3347 Q66K14;G3V133 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 0 1 1 1 1 135.81 135.81 3 3.2737E-05 141496 QUIQUE_C1576_190116_001 57.496 52.286 214600000 0 0 0 55683000 55089000 0 39870000 0 0 0 0 63956000 0 10635 3347 9963 93918;93919;93920;93921 119273;119274;119275;119276 119275 2 ELFCHNER Unmodified 1103.4818 0.48182731 4420 Q9UG56 PISD Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme;Phosphatidylserine decarboxylase alpha chain;Phosphatidylserine decarboxylase beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 18.217 18.217 3 0.020698 10216 QUIQUE_C1277_190116_001 44.753 29.091 48756000 21699000 10535000 0 0 0 16522000 0 0 0 0 0 0 0 10636 4420 9964 93922;93923;93924 119277;119278;119279 119278 3 ELFDELVK Unmodified 991.52261 0.52261272 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 100.59 100.59 2 0.0029428 104294 QUIQUE_C1218_190116_001 134.06 91.582 316400000 62685000 0 53132000 63362000 0 0 51548000 26898000 35866000 22908000 0 0 0 10637 2663 9965 93925;93926;93927;93928;93929;93930;93931 119280;119281;119282;119283;119284;119285;119286;119287 119281 8 ELFDELVKK Unmodified 1119.6176 0.61757574 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 73.914 73.914 2;3 0.0016737 74788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.233 60.114 116900000 0 0 0 0 0 0 0 43881000 26891000 0 21359000 24766000 0 10638 2663 9966 93932;93933;93934;93935;93936;93937;93938;93939;93940 119288;119289;119290;119291;119292;119293;119294;119295;119296 119294 9 ELFDLALR Unmodified 975.53893 0.53893149 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.85 114.85 2 0.0036323 119915 QUIQUE_C1218_190116_001 116.54 59.44 245560000 42527000 33523000 35536000 26323000 27659000 30038000 0 0 0 0 34907000 15047000 0 10639 882 9967 93941;93942;93943;93944;93945;93946;93947;93948;93949;93950 119297;119298;119299;119300;119301;119302;119303;119304;119305;119306 119297 10 ELFDYNLR Unmodified 1068.524 0.52400971 3312 Q5T4S7 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes yes 0 0 0 1 91.519 91.519 2 0.040827 95384 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.006 51.61 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10640 3312 9968 93951 119307 119307 1 ELFEDLLR Unmodified 1033.5444 0.5444108 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 125.09 125.09 2 0.048509 130302 QUIQUE_C1218_190116_001 75.109 20.952 4793800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4793800 0 0 0 10641 3565 9969 93952;93953 119308;119309 119308 2 ELFEMAR Unmodified 894.42694 0.4269382 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.508 64.508 2 0.019333 63953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.59 65.375 400810000 0 0 0 59035000 0 36213000 49717000 43200000 46367000 16899000 48994000 41111000 59276000 10642 2389 9970 93954;93955;93956;93957;93958;93959;93960;93961;93962 119310;119311;119312;119313;119314;119315;119316;119317;119318 119313 9 ELFEPYGAVYQINVLR Unmodified 1909.9938 0.993799 299 V9GYD9;Q5VZZ6;A0A0J9YX66;A0A1B0GU44;E9PC62;A0A1B0GUN8;A0A0J9YXJ0;O95319;V9GY47;A0A0J9YXK1 CELF2 CUGBP Elav-like family member 2 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 144.33 144.33 2;3 5.5084E-25 150289 QUIQUE_C1218_190116_001 192.3 161.43 2885200000 247980000 269060000 278460000 175530000 227100000 224880000 197950000 173070000 242990000 64925000 334570000 305910000 142730000 10643 299 9971 93963;93964;93965;93966;93967;93968;93969;93970;93971;93972;93973;93974;93975;93976;93977;93978;93979;93980;93981;93982;93983;93984;93985 119319;119320;119321;119322;119323;119324;119325;119326;119327;119328;119329;119330;119331;119332;119333;119334;119335;119336;119337;119338;119339;119340;119341;119342;119343;119344 119319 25 ELFESSTNNNK Unmodified 1281.5837 0.58370943 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.686 27.686 2 0.0016401 21532 QUIQUE_C1277_190116_001 130.31 105.37 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10644 153 9972 93986;93987;93988;93989;93990 119345;119346;119347;119348;119349 119346 5 ELFGIHVAEVTYKPLR Unmodified 1871.0305 0.030518852 4179 Q9H6Q4 NARFL Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NARFL yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 97.409 97.409 3 0.00092478 100036 QUIQUE_C1403_190116_001 66.059 52.996 152890000 0 0 32196000 21002000 0 19947000 0 0 18200000 0 0 24988000 36557000 10645 4179 9973 93991;93992;93993;93994;93995;93996 119350;119351;119352;119353;119354;119355 119351 6 ELFLLGQHYVFEAK Unmodified 1692.8875 0.88754301 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 117.94 117.94 2;3 9.8625E-05 121055 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.89 83.29 396670000 0 47176000 43858000 52169000 37192000 10027000 0 18866000 41447000 16715000 37407000 34525000 57289000 10646 348 9974 93997;93998;93999;94000;94001;94002;94003;94004;94005;94006;94007;94008 119356;119357;119358;119359;119360;119361;119362;119363;119364;119365;119366;119367 119362 8 ELFNITNGARK Unmodified 1261.6779 0.67788459 2015 P11215 ITGAM Integrin alpha-M yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.063 34.063 3 0.01037 29112 QUIQUE_DMIX8_190116_001 34.087 17.061 203880000 0 0 22699000 30368000 29292000 0 0 0 33955000 0 40211000 0 47359000 10647 2015 9975 94009;94010;94011;94012;94013;94014 119368;119369;119370;119371;119372;119373;119374 119373 6 ELFPDWK Unmodified 933.45962 0.45961853 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.458 96.458 2 0.026204 99149 QUIQUE_C1368_190116_001 94.407 45.647 358930000 0 33160000 44304000 0 42261000 37611000 55495000 0 38580000 0 57411000 50111000 0 10648 3169 9976 94015;94016;94017;94018;94019;94020;94021;94022 119375;119376;119377;119378;119379;119380;119381;119382;119383;119384 119376 10 ELFPIAAQVDKEHLFPAAQVK Unmodified 2350.2685 0.26851729 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 3 1 2 1 2 1 1 1 1 115.2 115.2 3;4 1.1864E-05 120217 QUIQUE_C1218_190116_001 72.883 65.668 973510000 215470000 64493000 191440000 43344000 0 0 168480000 82002000 97927000 28761000 0 0 81588000 10649 2105 9977 94023;94024;94025;94026;94027;94028;94029;94030;94031;94032;94033;94034;94035 119385;119386;119387;119388;119389;119390;119391;119392;119393;119394;119395;119396;119397;119398;119399 119386 10 ELFQELLNLEK Unmodified 1374.7395 0.73948179 3872 Q96HU8 DIRAS2 GTP-binding protein Di-Ras2 yes yes 0 0 0 1 147.54 147.54 2 0.0093516 152627 QUIQUE_C1218_190116_001 82.417 53.69 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10650 3872 9978 94036 119400 119400 1 ELFQELLTLETR Unmodified 1490.7981 0.7980593 1703 O95057 DIRAS1 GTP-binding protein Di-Ras1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 151.99 151.99 2 0.0020514 158814 QUIQUE_C1438_190116_001 77.379 55.293 287250000 0 0 0 0 39099000 0 55314000 0 0 14520000 75272000 64373000 38676000 10651 1703 9979 94037;94038;94039;94040;94041;94042 119401;119402;119403;119404;119405;119406 119401 6 ELFQEMAIDIIPPYMIAAK Unmodified 2192.1261 0.12613508 1686 O94805 ACTL6B Actin-like protein 6B yes yes 0 0 0 1 168.09 168.09 3 0.0089218 170040 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.678 7.5866 14476000 0 0 0 0 0 0 0 14476000 0 0 0 0 0 10652 1686 9980 94043 119407 119407 1 ELFQETLESLR Unmodified 1363.6983 0.69834526 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.12 120.12 2 0.0012865 125800 QUIQUE_C1438_190116_001 103.55 52.94 260650000 0 0 0 49930000 55600000 0 57406000 0 37528000 16165000 44019000 0 0 10653 3459 9981 94044;94045;94046;94047;94048;94049;94050;94051 119408;119409;119410;119411;119412;119413;119414;119415 119410 7 ELFSNLQEFAGPSGK Unmodified 1622.794 0.79403656 1159 H0YI09;Q9H8H3;F8VQX6 METTL7A Methyltransferase-like protein 7A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 116.06 116.06 2 7.6971E-44 118775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 181.66 143.36 2989000000 293380000 0 0 397980000 205680000 0 0 506090000 512580000 0 637820000 435470000 0 10654 1159 9982 94052;94053;94054;94055;94056;94057;94058 119416;119417;119418;119419;119420;119421;119422;119423;119424;119425 119422 9 ELFSPLHALNFGIGGDGTQHVLWR Unmodified 2663.3609 0.36085455 3110 Q15102;M0R389;M0R1K3;M0QZT2;M0QXS6;M0R323 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 1 2 2 2 143.57 143.57 3;4 3.9718E-88 147844 QUIQUE_C1403_190116_001 179.19 168.35 6247300000 295260000 412220000 493450000 289290000 470890000 320790000 603580000 430190000 762200000 66627000 822670000 762890000 517240000 10655 3110 9983 94059;94060;94061;94062;94063;94064;94065;94066;94067;94068;94069;94070;94071;94072;94073;94074;94075;94076;94077;94078;94079;94080;94081;94082;94083;94084 119426;119427;119428;119429;119430;119431;119432;119433;119434;119435;119436;119437;119438;119439;119440;119441;119442;119443;119444;119445;119446;119447;119448;119449;119450;119451;119452;119453;119454;119455;119456;119457;119458;119459;119460;119461;119462;119463;119464;119465;119466;119467;119468;119469;119470;119471;119472;119473;119474 119440 48 ELFSPLHALNFGIGGDTTR Unmodified 2044.0378 0.037789075 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 135.86 135.86 2;3 0 141695 QUIQUE_C1218_190116_001 305.23 285.55 14529000000 1158600000 1320000000 1347200000 1089700000 1132800000 875610000 1112400000 1133700000 1178100000 334500000 1235100000 1215300000 1396100000 10656 2798 9984 94085;94086;94087;94088;94089;94090;94091;94092;94093;94094;94095;94096;94097;94098;94099;94100;94101;94102;94103;94104;94105;94106;94107;94108 119475;119476;119477;119478;119479;119480;119481;119482;119483;119484;119485;119486;119487;119488;119489;119490;119491;119492;119493;119494;119495;119496;119497;119498;119499;119500;119501;119502;119503;119504 119475 30 ELFVMAR Unmodified 864.45276 0.45275902 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1;J3KRP2 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.015 67.015 2 0.042468 67484 QUIQUE_C1576_190116_001 81.1 38.053 241540000 0 0 0 0 57876000 45513000 64363000 0 0 0 73785000 0 0 10657 2743 9985 94109;94110;94111;94112 119505;119506;119507;119508;119509 119508 4 ELFVQSEIFPLETPAFAIK Unmodified 2178.1613 0.16125825 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 162.99 162.99 2 2.1177E-29 168046 QUIQUE_C1368_190116_001 175.28 167.37 527380000 36129000 60243000 64845000 0 59068000 40861000 50328000 32829000 49813000 18700000 72121000 0 42441000 10658 2554 9986 94113;94114;94115;94116;94117;94118;94119;94120;94121;94122;94123;94124 119510;119511;119512;119513;119514;119515;119516;119517;119518;119519;119520;119521 119513 11 ELFWHALR Unmodified 1070.5661 0.56614929 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.276 77.276 3 0.010503 79509 QUIQUE_C1218_190116_001 54.611 36.703 32717000 14636000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18081000 0 0 10659 3891 9987 94125;94126;94127;94128;94129;94130 119522;119523;119524;119525;119526;119527 119522 6 ELGAFGLQVPSELGGVGLCNTQYAR Unmodified 2635.3064 0.30643572 2539 P49748;K7EQP4;J3QKU9 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 3 2 2 1 1 1 2 2 2 2 2 2 149.98 149.98 2;3 4.7246E-69 152637 QUIQUE_DMIX1_190116_001 208.51 183.58 1243100000 83901000 82569000 166290000 78340000 24503000 18927000 35488000 107020000 151240000 51479000 175430000 111040000 156890000 10660 2539 9988 94131;94132;94133;94134;94135;94136;94137;94138;94139;94140;94141;94142;94143;94144;94145;94146;94147;94148;94149;94150;94151;94152;94153;94154 119528;119529;119530;119531;119532;119533;119534;119535;119536;119537;119538;119539;119540;119541;119542;119543;119544;119545;119546;119547;119548;119549;119550;119551;119552;119553;119554 119543 27 ELGATECINPQDYK Unmodified 1636.7403 0.74028643 1774 P00325;D6RHZ6;V9HW50;P07327;P00326 ADH1B;HEL-S-117;ADH1A;ADH1C Alcohol dehydrogenase 1B;Alcohol dehydrogenase 1A;Alcohol dehydrogenase 1C yes no 0 0 0 1 1 2 1 70.224 70.224 2 0.00011102 69128 QUIQUE_C1563_190116_001 113.22 87.839 128600000 0 0 0 0 24748000 39592000 64265000 0 0 0 0 0 0 10661 1774 9989 94155;94156;94157;94158;94159 119555;119556;119557;119558;119559 119557 5 ELGAVIDQVAAALWDQGSTNEALYK Unmodified 2661.3286 0.32861095 3720 Q8WXF7 ATL1 Atlastin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 171.41 171.41 3 6.5661E-20 174819 QUIQUE_C1277_190116_001 109.41 98.855 628730000 0 81018000 61889000 0 0 0 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dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 1 2 2 1 2 2 99.835 99.835 2 7.1552E-14 101187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.71 116.09 8315300000 966200000 1132100000 1592100000 1069100000 0 930730000 38764000 1008100000 1102600000 417620000 0 58117000 0 10675 1875 10001 94332;94333;94334;94335;94336;94337;94338;94339;94340;94341;94342;94343;94344;94345;94346;94347;94348;94349;94350;94351 119779;119780;119781;119782;119783;119784;119785;119786;119787;119788;119789;119790;119791;119792;119793;119794;119795;119796;119797;119798;119799;119800;119801;119802 119792 21 ELGGADNIR Unmodified 943.47231 0.47230849 45 A0A087WUW9;Q9NXU5;A0A0B4J222 ARL15 ADP-ribosylation factor-like protein 15 yes no 0 0 0 1 24.884 24.884 2 0.013805 18313 QUIQUE_C1277_190116_001 69.423 28.394 29315000 0 29315000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10676 45 10002 94352 119803 119803 1 ELGGADNIRK Unmodified 1071.5673 0.5672715 45 A0A087WUW9;Q9NXU5;A0A0B4J222 ARL15 ADP-ribosylation factor-like protein 15 yes no 0 0 1 1 15.683 15.683 3 0.035126 8127 QUIQUE_DMIX1_190116_001 28.088 17.06 14667000 0 0 0 0 0 0 0 14667000 0 0 0 0 0 10677 45 10003 94353 119804 119804 1 ELGGESNFGDALLDAGESMK Unmodified 2038.9154 0.91535026 3981 Q99961;M0R0I3;M0QYE0 SH3GL1 Endophilin-A2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.66 136.66 2 7.4901E-47 142611 QUIQUE_C1576_190116_001 200.44 180.34 709100000 78539000 77501000 88989000 92829000 64286000 65530000 92263000 0 59037000 25647000 0 64474000 0 10678 3981 10004 94354;94355;94356;94357;94358;94359;94360;94361;94362;94363;94364 119805;119806;119807;119808;119809;119810;119811;119812;119813;119814;119815;119816 119812 11 ELGGESNFGDALLDAGESMKR Unmodified 2195.0165 0.016461285 3981 Q99961;M0R0I3;M0QYE0 SH3GL1 Endophilin-A2 yes no 0 0 1 1 119.08 119.08 3 0.044719 121522 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.892 14.608 40481000 0 0 0 0 0 0 0 40481000 0 0 0 0 0 10679 3981 10005 94365 119817 119817 1 ELGGEVFYVGPAR Unmodified 1392.7038 0.70376498 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 1 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0.98765098 3639 Q8NDH3;H0YEP3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 125.47 125.47 3 0.00015677 131269 QUIQUE_C1438_190116_001 82.651 71.606 433010000 40836000 45169000 44937000 0 36082000 0 29917000 49073000 52155000 0 45083000 44163000 45592000 10686 3639 10012 94384;94385;94386;94387;94388;94389;94390;94391;94392;94393;94394 119846;119847;119848;119849;119850;119851;119852;119853;119854;119855;119856;119857 119849 11 ELGIPASVDLVSSDPSHMVASFSK Unmodified 2472.2206 0.2206404 1556 O43815 STRN Striatin yes yes 0 0 0 1 139.64 139.64 3 0.037618 144562 QUIQUE_C1218_190116_001 23.485 16.125 96481000 96481000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10687 1556 10013 94395 119858 119858 1 ELGITALHIK Unmodified 1093.6495 0.64954457 451 A0A2R8Y811;P62263;E5RH77 RPS14 40S ribosomal protein S14 yes no 0 0 0 1 1 1 67.769 67.769 3 0.025343 67936 QUIQUE_C1403_190116_001 38.75 24.116 139250000 0 0 0 50999000 0 0 44871000 0 0 0 43377000 0 0 10688 451 10014 94396;94397;94398 119859;119860;119861 119859 3 ELGIWEPLAVK Unmodified 1253.702 0.70197407 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.07 123.07 2 0.000995 127835 QUIQUE_C1368_190116_001 105.94 90.728 4956600000 404920000 397320000 401510000 417920000 382380000 355410000 449880000 268030000 336660000 177670000 508070000 382770000 474000000 10689 2527 10015 94399;94400;94401;94402;94403;94404;94405;94406;94407;94408;94409;94410;94411 119862;119863;119864;119865;119866;119867;119868;119869;119870;119871;119872;119873;119874;119875;119876;119877 119864 14 ELGLEKDDKDAIEEK Unmodified 1730.8574 0.85742467 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27;K7ER56 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 2 36.179 36.179 2;3 2.1557E-42 32048 QUIQUE_DMIX3_190116_001 203.74 147.19 874870000 16431000 0 122160000 0 0 0 117220000 17679000 146320000 0 178640000 136120000 140310000 10690 1324 10016 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119910;119911 119911 2 ELGLNADLFQPTSLVR Unmodified 1771.9468 0.9468488 3311 Q5T447 HECTD3 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 141.1 141.1 2 0.0018416 145924 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.55 41.633 287270000 0 32085000 39806000 0 0 29380000 0 0 58544000 29039000 0 50504000 47913000 10693 3311 10019 94440;94441;94442;94443;94444;94445;94446 119912;119913;119914;119915;119916;119917;119918 119915 6 ELGLPEELVSR Unmodified 1240.6663 0.66631685 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.13 101.13 2 0.0025583 104216 QUIQUE_C1368_190116_001 90.108 44.947 551640000 76517000 82335000 57305000 50687000 66301000 0 49170000 0 51255000 0 75195000 0 42877000 10694 2554 10020 94447;94448;94449;94450;94451;94452;94453;94454;94455;94456 119919;119920;119921;119922;119923;119924;119925;119926;119927;119928;119929;119930;119931 119921 13 ELGLREENEGVYNGSWGGR Unmodified 2120.9875 0.98754442 336 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119981;119982;119983;119984;119985;119986;119987;119988;119989;119990;119991;119992;119993;119994;119995;119996;119997;119998;119999;120000;120001;120002 119992 19 ELGMEERPYSSR Unmodified 1452.6667 0.66672755 4321 Q9NX46 ADPRHL2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 34.688 34.688 3 0.0064077 30053 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.11 47.08 148200000 33111000 0 0 0 0 30441000 0 0 0 0 37629000 0 47017000 10698 4321 10024 94512;94513;94514;94515 120003;120004;120005;120006;120007 120006 4 ELGPQDLLWMLDHQEDGGEALR Unmodified 2521.1907 0.19073726 3563 Q8N0W3 FUK L-fucose kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 155.49 155.49 3 5.1056E-05 161240 QUIQUE_C1218_190116_001 67.866 60.327 279300000 26297000 0 43987000 54323000 42017000 0 34796000 0 0 0 0 40948000 36931000 10699 3563 10025 94516;94517;94518;94519;94520;94521;94522 120008;120009;120010;120011;120012;120013;120014 120008 6 ELGQTWANLDHMVGQLK Unmodified 1938.9622 0.96218129 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 126.32 126.32 3 0.00013632 129111 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.257 54.098 40159000 0 22668000 0 0 0 0 0 17491000 0 0 0 0 0 10700 228 10026 94523;94524 120015;120016 120016 2 ELGSLPLPLSTSEQR Unmodified 1625.8625 0.86245047 3521 Q86Y82;B1AJQ6 STX12 Syntaxin-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.78 107.78 2 9.853E-06 111119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.44 78.054 1787500000 183810000 177150000 170220000 157770000 169900000 156980000 130270000 123220000 145430000 47383000 157030000 0 168370000 10701 3521 10027 94525;94526;94527;94528;94529;94530;94531;94532;94533;94534;94535;94536 120017;120018;120019;120020;120021;120022;120023;120024;120025;120026;120027;120028 120025 10 ELGSLPQEAFEK Unmodified 1346.6718 0.67179615 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 82.313 82.313 2 0.0064322 84214 QUIQUE_C1218_190116_001 64.82 39.876 53848000 53848000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10702 4532 10028 94537;94538 120029;120030 120029 2 ELGSSTNALR Unmodified 1046.5356 0.53563702 1948 P08579 SNRPB2 U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' yes yes 0 0 0 1 25.965 25.965 2 0.00592 20319 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.825 37.692 370370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 370370000 0 0 10703 1948 10029 94539 120031 120031 1 ELGSSVALYSR Unmodified 1180.6088 0.60880197 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.291 61.291 2 1.8651E-05 60141 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.45 95.754 700000000 0 69412000 92364000 87753000 58933000 72554000 92030000 0 68331000 0 0 71833000 86791000 10704 2952 10030 94540;94541;94542;94543;94544;94545;94546;94547;94548 120032;120033;120034;120035;120036;120037;120038;120039;120040 120040 7 ELGSSVDEVEQLIR Unmodified 1572.7995 0.79951586 754 C9JY79;Q9H254 SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 yes no 0 0 0 1 1 1 126.6 126.6 2 0.0018401 131418 QUIQUE_C1368_190116_001 91.961 67.17 115930000 0 0 43525000 0 0 0 0 37151000 35251000 0 0 0 0 10705 754 10031 94549;94550;94551 120041;120042;120043 120041 3 ELGTAGLYLHSK Unmodified 1287.6823 0.68230126 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 50.002 50.002 2;3 0.0044275 46871 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.789 46.76 647130000 87526000 58493000 0 62037000 0 40084000 0 72932000 130040000 0 46943000 47444000 101630000 10706 1058 10032 94552;94553;94554;94555;94556;94557;94558;94559;94560;94561;94562;94563;94564 120044;120045;120046;120047;120048;120049;120050;120051;120052;120053;120054;120055;120056;120057 120057 14 ELGTVMR Unmodified 804.41637 0.41637351 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;M0QZ52;F8WBR5;G3V479;C9J7T9;P02585 CALM2;CALM1;CALM3;TNNC2 Troponin C, skeletal muscle no no 0 0 0 1 1 1 27.527 27.527 2 0.024915 22430 QUIQUE_C1218_190116_001 97.071 46.105 2239500000 1555900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 391430000 292110000 0 10707 1128 10033 94565;94566;94567 120058;120059;120060 120058 3 ELGVGIALR Unmodified 926.55492 0.5549159 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 76.777 76.777 1;2 3.4291E-05 77539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.69 93.168 14387000000 1182600000 1213500000 919980000 779970000 680610000 1274600000 666200000 1570700000 1960800000 736060000 1118700000 1203100000 1080600000 10708 2855 10034 94568;94569;94570;94571;94572;94573;94574;94575;94576;94577;94578;94579;94580;94581;94582;94583 120061;120062;120063;120064;120065;120066;120067;120068;120069;120070;120071;120072;120073;120074;120075;120076;120077;120078;120079;120080;120081;120082;120083;120084;120085;120086;120087;120088;120089;120090;120091;120092;120093;120094;120095;120096;120097;120098;120099;120100;120101;120102;120103;120104;120105;120106;120107 120087 46 ELGVGIALRK Unmodified 1054.6499 0.64987892 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 0 0 1 2 2 1 48.137 48.137 2;3 0.0032333 46241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.751 32.287 237830000 0 0 0 0 0 0 0 150690000 74307000 0 12836000 0 0 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ELHDMFVDMAMLVESQGEMIDR Unmodified 2595.1478 0.14775151 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 0 1 1 169.11 169.11 3 1.6276E-08 176340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.539 78.788 38891000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22643000 16248000 0 10713 2721 10038 94596;94597 120120;120121 120120 1 ELHEKFDLLK Unmodified 1270.6921 0.69213767 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 1 1 1 49.823 49.823 2 1.4969E-10 47047 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.36 85.149 23528000 0 0 0 0 0 0 0 23528000 0 0 0 0 0 10714 820 10039 94598;94599 120122;120123 120122 2 ELHEKFEHLKR Unmodified 1464.7837 0.78374664 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 2 2 2 1 1 2 13.049 13.049 3;4 0.00022418 5024 QUIQUE_DMIX8_190116_001 103.34 90.715 533220000 0 0 0 0 0 0 0 327480000 68110000 0 4836200 49686000 83107000 10715 535;3739 10040 94600;94601;94602;94603;94604;94605;94606;94607 120124;120125;120126;120127;120128;120129;120130;120131 120130 8 ELHEQLVALDK Unmodified 1293.6929 0.69286595 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75;A0A1B0GTM0 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 50.302 50.302 2;3 0.00099967 47746 QUIQUE_C1368_190116_001 73.951 55.892 463570000 62013000 0 126840000 38694000 0 0 76367000 0 43851000 0 62557000 0 53245000 10716 2223 10041 94608;94609;94610;94611;94612;94613;94614;94615 120132;120133;120134;120135;120136;120137;120138;120139;120140;120141 120133 7 ELHEVCHLLEQER Unmodified 1690.8097 0.80970339 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 54.092 54.092 2;3 0.010294 52313 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.287 48.542 79767000 0 0 0 0 0 43637000 0 36130000 0 0 0 0 0 10717 3125 10042 94616;94617 120142;120143 120143 1 ELHINLIPNK Unmodified 1189.6819 0.68190733 1931 P07900;G3V2J8;Q14568 HSP90AA1;HSP90AA2P Heat shock protein HSP 90-alpha;Heat shock protein HSP 90-alpha A2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 66.345 66.345 2;3 6.4021E-31 66464 QUIQUE_C1277_190116_001 203.93 176.8 17314000000 2058900000 2050400000 1440600000 1875700000 1767800000 2372200000 727660000 578840000 837480000 1034400000 978430000 707340000 883700000 10718 1931 10043 94618;94619;94620;94621;94622;94623;94624;94625;94626;94627;94628;94629;94630;94631;94632;94633;94634;94635;94636;94637;94638;94639;94640;94641;94642 120144;120145;120146;120147;120148;120149;120150;120151;120152;120153;120154;120155;120156;120157;120158;120159;120160;120161;120162;120163;120164;120165;120166;120167;120168;120169;120170;120171;120172;120173;120174;120175;120176;120177;120178;120179;120180;120181;120182;120183;120184;120185;120186 120150 43 ELHINLIPNKQDR Unmodified 1588.8685 0.8685389 1931 P07900;G3V2J8 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes no 0 0 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 50.802 50.802 2;3;4 1.7107E-12 48847 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.85 187.94 20772000000 752300000 1164300000 1038000000 894000000 1818800000 779100000 1698100000 1886700000 1960100000 393330000 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94682;94683;94684;94685;94686;94687;94688;94689;94690 120241;120242;120243;120244;120245;120246;120247;120248;120249;120250;120251 120247 10 ELHLLGVQVQQFQDVATR Unmodified 2080.1065 0.10653734 2021 P11277;H0YJE6 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes no 0 0 0 1 1 116.01 116.01 3 0.0024847 121099 QUIQUE_C1218_190116_001 47.222 38.058 201350000 95851000 0 105500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10721 2021 10046 94691;94692 120252;120253 120252 1 ELHSEFSEVMNEIWASDQIR Oxidation (M) 2435.1063 0.10633893 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 127.72 127.72 3 6.1566E-13 132250 QUIQUE_C1368_190116_001 115.57 111.37 339960000 34702000 37271000 60561000 43131000 31239000 0 0 35506000 52099000 0 0 45454000 0 10722 1153 10047 94693;94694;94695;94696;94697;94698;94699;94700 120254;120255;120256;120257;120258;120259;120260;120261;120262 120256 670 9 ELHSEFSEVMNEIWASDQIR Unmodified 2419.1114 0.1114243 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 153.03 153.03 2;3 6.9526E-154 157196 QUIQUE_DMIX7_190116_001 290.65 257.38 3197000000 240700000 274060000 416450000 246090000 0 199430000 242540000 224640000 466800000 97906000 436340000 56138000 295930000 10723 1153 10047 94701;94702;94703;94704;94705;94706;94707;94708;94709;94710;94711;94712;94713;94714;94715;94716;94717;94718;94719 120263;120264;120265;120266;120267;120268;120269;120270;120271;120272;120273;120274;120275;120276;120277;120278;120279;120280;120281;120282;120283;120284 120282 17 ELHTCDINDK Unmodified 1243.5503 0.55030081 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 16.414 16.414 2;3 0.0068382 9369 QUIQUE_C1218_190116_001 104.2 86.212 47236000 0 0 0 21644000 0 0 0 0 25592000 0 0 0 0 10724 3405 10048 94720;94721;94722;94723 120285;120286;120287;120288 120285 3 ELICVPYMAK Unmodified 1222.609 0.60900166 2953 Q12955;A0A087WTF3;A0A087WZ65 ANK3 Ankyrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 91.904 91.904 2 0.0057299 94286 QUIQUE_C1277_190116_001 76.478 0 688540000 0 78803000 0 0 79839000 0 95881000 67542000 76543000 0 93024000 89970000 106940000 10725 2953 10049 94724;94725;94726;94727;94728;94729;94730;94731 120289;120290;120291;120292;120293;120294;120295;120296;120297 120289 9 ELICWGDSVK Unmodified 1205.5751 0.575059 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.997 84.997 2 0.007395 86554 QUIQUE_C1277_190116_001 73.233 41.012 221540000 0 32746000 0 0 47448000 18035000 0 36546000 0 0 0 38189000 48575000 10726 2377 10050 94732;94733;94734;94735;94736;94737;94738;94739;94740 120298;120299;120300;120301;120302;120303;120304;120305;120306;120307 120298 9 ELIDHSPK Unmodified 937.4869 0.48689592 886 E7EWP0;H0Y886;O43674 NDUFB5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial yes no 0 0 0 1 15.499 15.499 2 0.0065653 7490 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.28 43.117 26141000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26141000 0 0 0 10727 886 10051 94741 120308 120308 1 ELIECAR Unmodified 889.43275 0.43275186 4600;4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;Q9Y490 TLN2;TLN1 Talin-2;Talin-1 no no 0 0 0 1 1 25.719 25.719 2 0.023465 19670 QUIQUE_C1218_190116_001 100.07 10.393 248530000 116710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131820000 0 10728 4606;4600 10052 94742;94743 120309;120310 120309 2 ELIEIISGAAALD Unmodified 1313.7078 0.70784731 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 5 2 1 2 2 2 5 1 6 3 157.7 157.7 2 4.7895E-06 152542 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.41 83.165 290440000 0 166200000 0 0 0 0 0 0 0 124240000 0 0 0 10729 2396 10053 94744;94745;94746;94747;94748;94749;94750;94751;94752;94753;94754;94755;94756;94757;94758;94759;94760;94761;94762;94763;94764;94765;94766;94767;94768;94769;94770;94771;94772;94773;94774;94775 120311;120312;120313;120314;120315;120316;120317;120318;120319;120320;120321;120322;120323;120324;120325;120326;120327;120328;120329;120330;120331;120332;120333;120334;120335;120336;120337;120338;120339;120340;120341;120342;120343;120344 120335 34 ELIEPVLTCFNDADSR Unmodified 1877.8829 0.88292792 2930 Q08AM6;H3BUU8 VAC14 Protein VAC14 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.44 123.44 2 5.3395E-07 127563 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.57 73.574 417560000 45819000 41287000 0 40207000 66102000 26279000 0 34159000 49811000 16577000 0 47261000 50053000 10730 2930 10054 94776;94777;94778;94779;94780;94781;94782;94783;94784;94785;94786 120345;120346;120347;120348;120349;120350;120351;120352;120353;120354;120355;120356 120353 11 ELIFEETAR Unmodified 1106.5608 0.56078914 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.059 71.059 2 3.37E-09 71159 QUIQUE_C1277_190116_001 173.23 70.515 9285500000 1145400000 968850000 889280000 887980000 722710000 853070000 776450000 505000000 571780000 479810000 431700000 536070000 517460000 10731 2281 10055 94787;94788;94789;94790;94791;94792;94793;94794;94795;94796;94797;94798;94799 120357;120358;120359;120360;120361;120362;120363;120364;120365;120366;120367;120368;120369;120370;120371;120372;120373;120374;120375;120376;120377;120378;120379 120361 23 ELIFQETAR Unmodified 1105.5768 0.57677356 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.281 65.281 2 0.00047672 64990 QUIQUE_C1277_190116_001 130.27 105.35 1512900000 194390000 207370000 0 220860000 183400000 179190000 172470000 58214000 113790000 68632000 0 0 114580000 10732 897;2263 10056 94800;94801;94802;94803;94804;94805;94806;94807;94808;94809 120380;120381;120382;120383;120384;120385;120386;120387;120388;120389 120381 8 ELIFSAR Unmodified 834.45995 0.45995289 3026 Q13825 AUH Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 57.112 57.112 2 0.019322 55044 QUIQUE_C1403_190116_001 114.43 15.928 207850000 0 88837000 0 67031000 0 0 0 51981000 0 0 0 0 0 10733 3026 10057 94810;94811;94812;94813 120390;120391;120392;120393;120394 120391 5 ELIHISDWLPTLVK Unmodified 1662.9345 0.9344932 2094 P15848;A0A2U3U034 ARSB Arylsulfatase B yes no 0 0 0 1 1 146.52 146.52 3 8.8124E-05 152152 QUIQUE_C1368_190116_001 80.312 73.893 54575000 0 0 16236000 0 0 0 0 38339000 0 0 0 0 0 10734 2094 10058 94814;94815 120395;120396 120395 2 ELIIEFSK Unmodified 977.54335 0.54334816 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 86.66 86.66 2 0.040092 88152 QUIQUE_C1277_190116_001 60.478 19.25 16656000 0 16656000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10735 1789 10059 94816 120397 120397 1 ELIIGDR Unmodified 814.45487 0.45486751 2243 P25705;K7EK77;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.528 42.528 2 0.0098659 39365 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.94 29.246 23539000000 2484300000 2199200000 2024400000 0 1778500000 1918800000 2166700000 1711800000 1917100000 831490000 2404000000 2149500000 1952900000 10736 2243 10060 94817;94818;94819;94820;94821;94822;94823;94824;94825;94826;94827;94828 120398;120399;120400;120401;120402;120403;120404;120405;120406;120407;120408;120409;120410;120411;120412;120413;120414 120410 17 ELIINEILVMR Unmodified 1341.769 0.76900778 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.18 146.18 2 1.7473E-05 153334 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.02 96.67 437030000 31714000 35225000 29189000 20245000 28178000 44261000 37457000 28297000 57956000 10920000 35693000 42573000 35325000 10737 2970;120 10061 94829;94830;94831;94832;94833;94834;94835;94836;94837;94838;94839;94840;94841 120415;120416;120417;120418;120419;120420;120421;120422;120423;120424;120425;120426;120427;120428;120429;120430 120428 16 ELIINEILVMR Oxidation (M) 1357.7639 0.7639224 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.49 129.49 2 0.00052595 126380 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.17 45.186 92308000 0 18144000 17555000 16245000 16999000 14738000 0 0 0 8627200 0 0 0 10738 2970;120 10061 94842;94843;94844;94845;94846;94847;94848;94849 120431;120432;120433;120434;120435;120436;120437;120438;120439 120438 74 9 ELIKPPTILR Unmodified 1178.7387 0.73869393 2632;4566 Q9Y2T2;P53677;E5RJ52;E7ER80;H0YBA0 AP3M1;AP3M2 AP-3 complex subunit mu-1;AP-3 complex subunit mu-2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 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94865;94866;94867;94868 120456;120457;120458;120459 120459 3 ELILTLCDLIR Unmodified 1357.7639 0.7639224 4041 Q9BV79 MECR Trans-2-enoyl-CoA reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 152.78 152.78 2 0.00048696 157063 QUIQUE_C1277_190116_001 131.44 37.137 277080000 41292000 11619000 0 0 21223000 38189000 38255000 0 27045000 0 34836000 34219000 30401000 10742 4041 10065 94869;94870;94871;94872;94873;94874;94875;94876;94877;94878;94879;94880;94881;94882 120460;120461;120462;120463;120464;120465;120466;120467;120468;120469;120470;120471;120472;120473;120474 120461 15 ELINNELSHFLEEIK Unmodified 1826.9414 0.94142907 1860 P04271 S100B Protein S100-B yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 146.9 146.9 2;3 1.1173E-164 153673 QUIQUE_DMIX5_190116_001 255.15 203.39 4472000000 241790000 267350000 362080000 34228000 167360000 223660000 284190000 240760000 572190000 252360000 715120000 398580000 712330000 10743 1860 10066 94883;94884;94885;94886;94887;94888;94889;94890;94891;94892;94893;94894;94895;94896;94897;94898;94899;94900;94901;94902;94903;94904;94905;94906 120475;120476;120477;120478;120479;120480;120481;120482;120483;120484;120485;120486;120487;120488;120489;120490;120491;120492;120493;120494;120495;120496;120497;120498;120499;120500;120501;120502;120503;120504 120498 30 ELINNELSHFLEEIKEQEVVDK Unmodified 2654.3439 0.34392666 1860 P04271 S100B Protein S100-B yes yes 0 0 1 1 1 3 1 3 1 2 3 3 2 3 3 4 147.74 147.74 2;3;4 6.9657E-234 154404 QUIQUE_DMIX5_190116_001 302.14 283.31 68685000000 1025900000 2380900000 3809400000 253460000 2347400000 1127700000 2699800000 5851600000 18084000000 1227100000 15492000000 6932900000 7452900000 10744 1860 10067 94907;94908;94909;94910;94911;94912;94913;94914;94915;94916;94917;94918;94919;94920;94921;94922;94923;94924;94925;94926;94927;94928;94929;94930;94931;94932;94933;94934;94935;94936 120505;120506;120507;120508;120509;120510;120511;120512;120513;120514;120515;120516;120517;120518;120519;120520;120521;120522;120523;120524;120525;120526;120527;120528;120529;120530;120531;120532;120533;120534;120535;120536;120537;120538;120539;120540;120541;120542;120543;120544;120545;120546;120547;120548;120549;120550;120551;120552;120553;120554;120555;120556;120557 120543 52 ELIPNIPFQMLLR Unmodified 1582.8905 0.8905199 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.48 161.48 2 7.0229E-05 166477 QUIQUE_C1368_190116_001 121.73 96.111 2596500000 176140000 152390000 282550000 156290000 254940000 258000000 224980000 135830000 252690000 39638000 270450000 217630000 174970000 10745 2026 10068 94937;94938;94939;94940;94941;94942;94943;94944;94945;94946;94947;94948;94949 120558;120559;120560;120561;120562;120563;120564;120565;120566;120567;120568;120569;120570;120571 120561 13 ELIPNIPFQMLLR Oxidation (M) 1598.8854 0.88543452 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 2 151.67 151.67 2 0.009786 147061 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.231 61.559 147390000 0 0 0 0 0 0 0 0 83358000 64035000 0 0 0 10746 2026 10068 94950;94951;94952 120572;120573;120574 120573 1337 1 ELIPTEEALR Unmodified 1169.6292 0.62920306 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 72.123 72.123 2;3 0.00037849 73429 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.84 31.545 8659700000 552120000 490500000 766030000 241450000 700550000 326620000 825130000 699660000 934030000 503360000 1149900000 874060000 596330000 10747 3117 10069 94953;94954;94955;94956;94957;94958;94959;94960;94961;94962;94963;94964;94965;94966 120575;120576;120577;120578;120579;120580;120581;120582;120583;120584;120585;120586;120587;120588;120589;120590;120591;120592;120593;120594;120595;120596;120597;120598;120599;120600;120601;120602;120603 120595 29 ELIQTSALNFLTPLR Unmodified 1714.9618 0.96177059 55 A0A087WW40;Q9Y371 SH3GLB1 Endophilin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.1 149.1 2 7.283E-06 155910 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.84 74.774 1533900000 123490000 125460000 140070000 130530000 118140000 111260000 140150000 88717000 150590000 59187000 117530000 114160000 114630000 10748 55 10070 94967;94968;94969;94970;94971;94972;94973;94974;94975;94976;94977;94978;94979 120604;120605;120606;120607;120608;120609;120610;120611;120612;120613;120614;120615;120616;120617 120615 14 ELIRDEGVTSLYK Unmodified 1521.8039 0.80387296 1552 O43772;C9JPE1 SLC25A20 Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 68.569 68.569 2;3 0.0035314 68332 QUIQUE_C1368_190116_001 89.382 40.588 463490000 0 41778000 94674000 0 0 49834000 0 121120000 123850000 0 0 32240000 0 10749 1552 10071 94980;94981;94982;94983;94984;94985;94986;94987;94988;94989 120618;120619;120620;120621;120622;120623;120624;120625;120626;120627;120628 120621 11 ELISFLSEPEILVK Unmodified 1615.9073 0.9072754 532 A6NDU8;A0A0C4DGW6 C5orf51 UPF0600 protein C5orf51 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.11 150.11 2 0.00020809 154945 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.9 77.409 550070000 76274000 47367000 50155000 0 0 54034000 63676000 0 49058000 20544000 70103000 55602000 63257000 10750 532 10072 94990;94991;94992;94993;94994;94995;94996;94997;94998;94999 120629;120630;120631;120632;120633;120634;120635;120636;120637;120638 120634 9 ELISLYPFLLPTSSSFTR Unmodified 2070.1037 0.10374338 3698 Q8WUH2 TGFBRAP1 Transforming growth factor-beta receptor-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 166.01 166.01 2 0.0018501 171086 QUIQUE_C1368_190116_001 84.297 63.87 89280000 0 0 51007000 0 0 24294000 0 0 0 13978000 0 0 0 10751 3698 10073 95000;95001;95002 120639;120640;120641 120639 3 ELISNASDALDK Unmodified 1274.6354 0.63541065 1938;2079 P08238;P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1;F8W026 HSP90AB1;HSP90B1 Heat shock protein HSP 90-beta;Endoplasmin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.948 61.948 2 0.00016149 61999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.61 111.46 21525000000 1739600000 1620100000 1498900000 1939100000 2310300000 1938900000 2308200000 848560000 1061900000 998390000 2154500000 1212900000 1893700000 10752 1938;2079 10074 95003;95004;95005;95006;95007;95008;95009;95010;95011;95012;95013;95014;95015 120642;120643;120644;120645;120646;120647;120648;120649;120650;120651;120652;120653;120654;120655 120653 11 ELISNASDALDKIR Unmodified 1543.8206 0.82058566 1938;2079 P08238;P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1;F8W026 HSP90AB1;HSP90B1 Heat shock protein HSP 90-beta;Endoplasmin no no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 84.561 84.561 2;3 5.1434E-05 85882 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.8 87.599 3668700000 0 50164000 40508000 32326000 195990000 0 117140000 940840000 517820000 0 705600000 599490000 468830000 10753 1938;2079 10075 95016;95017;95018;95019;95020;95021;95022;95023;95024;95025;95026;95027;95028 120656;120657;120658;120659;120660;120661;120662;120663;120664;120665;120666;120667;120668;120669;120670;120671;120672;120673 120673 18 ELISNASDALEK Unmodified 1288.6511 0.65106071 2952 Q12931 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 62.852 62.852 2 5.0904E-05 62244 QUIQUE_C1368_190116_001 126.19 62.629 407130000 0 0 81467000 0 84875000 0 90178000 0 0 0 96258000 54348000 0 10754 2952 10076 95029;95030;95031;95032;95033;95034;95035;95036;95037 120674;120675;120676;120677;120678;120679;120680;120681;120682;120683 120675 8 ELISNSSDALDK Unmodified 1290.6303 0.63032527 1931 P07900;G3V2J8;Q14568 HSP90AA1;HSP90AA2P Heat shock protein HSP 90-alpha;Heat shock protein HSP 90-alpha A2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.423 48.423 2 4.491E-14 46128 QUIQUE_C1218_190116_001 163.64 74.089 36683000000 2587600000 3297200000 2483500000 3241500000 3541000000 3760700000 3875000000 1503700000 2298500000 1556400000 3281400000 2584800000 2671700000 10755 1931 10077 95038;95039;95040;95041;95042;95043;95044;95045;95046;95047;95048;95049;95050;95051 120684;120685;120686;120687;120688;120689;120690;120691;120692;120693;120694;120695;120696;120697;120698;120699;120700;120701;120702;120703;120704;120705;120706 120684 23 ELISNSSDALDKIR Unmodified 1559.8155 0.81550028 1931 P07900;G3V2J8 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 67.647 67.647 2;3 1.8092E-36 67635 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.18 140.87 7834100000 0 0 100540000 60710000 381460000 0 0 1819800000 1422300000 0 1509200000 1354700000 1185300000 10756 1931 10078 95052;95053;95054;95055;95056;95057;95058;95059;95060;95061;95062;95063;95064;95065;95066 120707;120708;120709;120710;120711;120712;120713;120714;120715;120716;120717;120718;120719;120720;120721;120722 120713 16 ELITILEK Unmodified 957.57465 0.57464829 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.35 172.35 2 0.0030423 177562 QUIQUE_C1576_190116_001 133.6 64.217 96525000 0 0 0 0 16292000 6020000 11456000 12279000 12188000 0 14009000 8537800 15744000 10757 3090 10079 95067;95068;95069;95070;95071;95072;95073;95074 120723;120724;120725;120726;120727;120728;120729;120730 120725 8 ELIVDAEDTWIR Unmodified 1458.7355 0.73545904 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.4 122.4 2 4.1874E-14 126386 QUIQUE_C1277_190116_001 163.94 95.205 4792500000 332960000 395750000 334160000 184610000 339720000 228420000 413790000 525630000 435010000 162320000 486950000 589020000 364180000 10758 3753 10080 95075;95076;95077;95078;95079;95080;95081;95082;95083;95084;95085;95086;95087 120731;120732;120733;120734;120735;120736;120737;120738;120739;120740;120741;120742;120743;120744;120745;120746;120747;120748 120732 18 ELIYNQK Unmodified 906.48108 0.48108226 2803 P78324;Q5TFQ8;H3BRP9;H3BV43;H3BML4;H9KV29;O00241;Q9P1W8 SIRPA;SIRPB1;SIRPG Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1;Signal-regulatory protein beta-1 isoform 3;Signal-regulatory protein beta-1;Signal-regulatory protein gamma yes no 0 0 0 1 24.948 24.948 2 0.049334 18457 QUIQUE_C1368_190116_001 75.131 50.775 385860000 0 0 385860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10759 2803 10081 95088 120749 120749 1 ELKELLQTELSGFLDAQK Unmodified 2061.0994 0.099386279 2211 P23297;Q5T7Y6 S100A1 Protein S100-A1;Protein S100 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 153.13 153.13 2;3 2.2661E-30 156258 QUIQUE_DMIX1_190116_001 180.48 133.19 357830000 0 0 0 0 0 0 0 119830000 63734000 0 38176000 81265000 54828000 10760 2211 10082 95089;95090;95091;95092;95093;95094 120750;120751;120752;120753;120754;120755 120751 6 ELKENGELLPILR Unmodified 1522.8719 0.87189295 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 1 1 1 1 90.232 90.232 3 0.00030748 91625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.538 54.155 35564000 0 0 0 0 0 0 0 17158000 18406000 0 0 0 0 10761 1676 10083 95095;95096;95097 120756;120757;120758 120756 3 ELKESAPFAVIGSNTVVEAK Unmodified 2088.1103 0.11028532 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;E7EPG2;Q99719;E7EX32 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 1 1 92.596 92.596 3 0.0084472 93752 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.765 35.057 45062000 0 0 0 0 0 0 0 45062000 0 0 0 0 0 10762 1092;3970 10084 95098 120759 120759 1 ELKIDIIPNPQER Unmodified 1563.8621 0.86205654 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 1 1 1 1 85.212 85.212 3 0.018341 86229 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.277 40.292 215730000 0 0 0 0 0 0 0 94927000 82246000 0 38558000 0 0 10763 1938 10085 95099;95100;95101 120760;120761;120762 120760 3 ELKPEQETTPR Unmodified 1326.6779 0.67794416 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 16.164 16.164 3 0.026022 8276 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.917 19.077 1338300000 250600000 268620000 331680000 0 0 225390000 0 0 0 0 0 0 262000000 10764 4172 10086 95102;95103;95104;95105;95106 120763;120764;120765;120766;120767 120767 1 ELKPTKPMQFLGDEETVR Unmodified 2117.0827 0.082690357 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 70.297 70.297 3 1.118E-05 70265 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.58 88.95 574920000 82060000 89872000 121090000 77795000 0 0 0 63998000 140110000 0 0 0 0 10765 2090 10087 95107;95108;95109;95110;95111;95112 120768;120769;120770;120771;120772;120773 120773 5 ELKPTKPMQFLGDEETVR Oxidation (M) 2133.0776 0.077604979 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 1 2 1 2 1 53.354 53.354 3 0.0012453 50794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.511 70.692 107690000 0 0 0 0 0 0 0 0 68408000 39282000 0 0 0 10766 2090 10087 95113;95114;95115;95116 120774;120775;120776;120777 120775 1429 4 ELLAFQTSEK Unmodified 1164.6027 0.60265396 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.212 67.212 2 0.018419 66639 QUIQUE_C1368_190116_001 75.378 32.132 110580000 0 35282000 0 0 0 0 33760000 0 0 0 0 41541000 0 10767 1414;3777 10088 95117;95118;95119;95120;95121 120778;120779;120780;120781;120782 120779 5 ELLALDSVDPEGR Unmodified 1412.7147 0.7147236 1753 O95817 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.6 103.6 2 5.1128E-05 100944 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.83 65.021 887410000 71724000 61221000 46545000 90689000 93328000 105810000 49536000 47118000 57859000 32352000 61620000 49985000 119620000 10768 1753 10089 95122;95123;95124;95125;95126;95127;95128;95129;95130;95131;95132;95133;95134 120783;120784;120785;120786;120787;120788;120789;120790;120791;120792;120793;120794;120795;120796;120797;120798 120795 15 ELLAVACEQFLGK Unmodified 1476.7647 0.76465068 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.29 119.29 2 0.00014383 123193 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.39 79.496 792510000 64986000 77816000 106990000 72549000 73343000 54274000 81389000 40164000 48346000 32622000 48094000 34131000 57798000 10769 3057 10090 95135;95136;95137;95138;95139;95140;95141;95142;95143;95144;95145;95146;95147 120799;120800;120801;120802;120803;120804;120805;120806;120807;120808;120809;120810;120811;120812;120813;120814 120810 15 ELLAVPDNYK Unmodified 1160.6077 0.60773933 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 75.884 75.884 1;2 6.2157E-14 75933 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.24 136.15 7931400000 0 0 0 1200200000 977080000 0 82681000 1571700000 1795400000 692210000 159650000 0 1452500000 10770 4639 10091 95148;95149;95150;95151;95152;95153;95154;95155 120815;120816;120817;120818;120819;120820;120821;120822;120823;120824;120825;120826;120827;120828;120829;120830;120831;120832;120833;120834;120835;120836;120837;120838;120839 120825 23 ELLCVSEK Unmodified 976.48993 0.48993238 2531 P49441;E7ET59;E7EUX4;E7ENF2;C9J173;B8ZZF6;C9J128;C9J2Z6;C9J2N5 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes no 0 0 0 1 40.416 40.416 2 0.032469 37088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.313 29.433 57906000 0 0 0 0 0 0 0 0 57906000 0 0 0 0 10771 2531 10092 95156 120840 120840 1 ELLDALPMDAYTHGCILHPELTTDSMIPK Unmodified 3280.5818 0.58180722 3907 Q96MZ0;H0Y6A7;H0UIB3;A0A087WWT8 GDAP1L1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1 yes no 0 0 0 1 156.13 156.13 3 0.066584 161080 QUIQUE_DMIX8_190116_001 16.666 6.6076 33098000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33098000 10772 3907 10093 95157 120841 120841 1 ELLDGGANPLQR Unmodified 1281.6677 0.66771383 474;436 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078;F5H392;A0A2R8Y602;A0A2R8YDH5 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog no no 0 0 0 1 1 1 77.261 77.261 2 0.0048686 73933 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.1 40.805 55792000 39409000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16383000 0 0 10773 474;436 10094 95158;95159;95160 120842;120843;120844 120843 2 ELLDLAMQNAWFR Unmodified 1605.7973 0.79734779 175 A0A0A0MSJ0;Q86XP3 DDX42 ATP-dependent RNA helicase DDX42 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 155.07 155.07 2 0.000383 160602 QUIQUE_C1368_190116_001 93.111 72.273 103400000 0 0 31124000 0 0 14470000 0 0 35219000 0 0 22587000 0 10774 175 10095 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120851;120852;120853;120854;120855;120856;120857;120858;120859;120860;120861;120862;120863;120864;120865;120866;120867;120868;120869;120870;120871;120872;120873;120874;120875;120876;120877;120878;120879;120880;120881;120882;120883;120884;120885;120886;120887;120888;120889;120890;120891;120892;120893;120894;120895;120896;120897;120898;120899;120900;120901;120902;120903;120904;120905;120906;120907;120908;120909;120910;120911;120912;120913;120914;120915;120916;120917;120918;120919;120920;120921;120922;120923;120924;120925;120926;120927;120928;120929;120930;120931;120932;120933;120934;120935;120936;120937;120938;120939;120940;120941 120912 69 ELLDLLYK Unmodified 1005.5746 0.57464829 986 F5GWI4;P00813 ADA Adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 123.61 123.61 2 0.054491 120230 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.549 8.8314 7256600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7256600 0 0 0 10776 986 10097 95216 120942 120942 1 ELLDSLPMDAYTHGCILHPELTVDSMIPAYATTR Unmodified 3829.8365 0.83651836 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 3 2 1 1 1 1 1 1 155.16 155.16 3;4 1.4903E-29 160719 QUIQUE_C1218_190116_001 89.129 83.473 1254700000 105060000 118170000 109530000 188660000 0 153960000 147880000 72585000 49208000 0 99558000 90596000 119440000 10777 3662 10098 95217;95218;95219;95220;95221;95222;95223;95224;95225;95226;95227;95228;95229;95230 120943;120944;120945;120946;120947;120948;120949;120950;120951;120952;120953;120954;120955;120956;120957;120958;120959 120944 16 ELLDTVNNVFK Unmodified 1290.682 0.68196691 4035 Q9BUL8;C9J363;C9J5C3;C9J6F3 PDCD10 Programmed cell death protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.14 115.14 2 0.00061313 117010 QUIQUE_C1563_190116_001 99.136 47.14 196750000 31334000 41695000 0 26591000 22770000 26045000 23660000 0 0 24650000 0 0 0 10778 4035 10099 95231;95232;95233;95234;95235;95236;95237;95238 120960;120961;120962;120963;120964;120965;120966;120967;120968 120966 8 ELLDTVTAPQK Unmodified 1213.6554 0.65541781 2403 P36955;I3L4Z0 SERPINF1 Pigment epithelium-derived factor yes no 0 0 0 1 61.307 61.307 2 0.019277 59738 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.461 35.974 24229000 0 0 0 0 0 0 0 24229000 0 0 0 0 0 10779 2403 10100 95239 120969 120969 1 ELLDVGNIGR Unmodified 1084.5877 0.58767259 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.44 86.44 2 0.0015964 88197 QUIQUE_C1277_190116_001 95.741 41.584 443770000 0 107810000 83538000 0 87159000 71161000 0 0 51960000 42150000 0 0 0 10780 4250 10101 95240;95241;95242;95243;95244;95245 120970;120971;120972;120973;120974;120975;120976;120977;120978 120971 9 ELLEAVDAR Unmodified 1014.5346 0.53457439 2290 P29590;H3BT57;H3BT29;H3BUJ5 PML Protein PML yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.965 56.965 2 0.0025126 55816 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.429 6.5957 245340000 0 0 41284000 28165000 44383000 0 0 21473000 22425000 0 0 29575000 58036000 10781 2290 10102 95246;95247;95248;95249;95250;95251;95252 120979;120980;120981;120982;120983;120984;120985;120986;120987 120985 9 ELLEDYR Unmodified 936.45526 0.45526144 554 A6XGL0;A0A087WUA6 YJEFN3 YjeF N-terminal domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 53.531 53.531 2 0.027096 51573 QUIQUE_C1368_190116_001 93.262 65.156 64272000 0 0 34409000 29863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10782 554 10103 95253;95254 120988;120989;120990 120989 3 ELLEEMEILK Unmodified 1245.6526 0.65264062 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.6 122.6 2 0.0027159 128250 QUIQUE_C1438_190116_001 88.37 37.31 237270000 38404000 0 0 37368000 31220000 22517000 38097000 21685000 0 0 23996000 0 23988000 10783 4631 10104 95255;95256;95257;95258;95259;95260;95261;95262;95263 120991;120992;120993;120994;120995;120996;120997;120998;120999;121000 120994 10 ELLEIVK Unmodified 842.51132 0.51131975 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.759 68.759 2 0.019707 65738 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.89 21.601 1143200000 139680000 141240000 0 0 116060000 95332000 108910000 74936000 95963000 70024000 96453000 101300000 103260000 10784 2329 10105 95264;95265;95266;95267;95268;95269;95270;95271;95272;95273;95274 121001;121002;121003;121004;121005;121006;121007;121008;121009;121010;121011;121012;121013;121014 121011 14 ELLEIVKK Unmodified 970.60628 0.60628277 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 1 1 1 41.571 41.571 2 0.041354 38820 QUIQUE_C1218_190116_001 69.198 45.674 58619000 26080000 0 32539000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10785 2329 10106 95275;95276 121015;121016 121015 2 ELLELASR Unmodified 929.5182 0.51819605 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 1 1 65.062 65.062 2 0.039841 63843 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.181 28.577 39525000 0 0 0 0 0 0 0 39525000 0 0 0 0 0 10786 2 10107 95277;95278;95279 121017;121018;121019 121019 3 ELLELEALSMAVESTGTAK Unmodified 1991.0133 0.013273388 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 2 157.61 157.61 2;3 5.584E-39 161728 QUIQUE_C1277_190116_001 149.73 136.31 524900000 36196000 47265000 84918000 42951000 38962000 0 76490000 0 23348000 43140000 48453000 23709000 59471000 10787 3086 10108 95280;95281;95282;95283;95284;95285;95286;95287;95288;95289;95290;95291;95292;95293;95294;95295 121020;121021;121022;121023;121024;121025;121026;121027;121028;121029;121030;121031;121032;121033;121034;121035;121036;121037 121021 13 ELLELEALSMAVESTGTAK Oxidation (M) 2007.0082 0.0081880099 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 1 0 1 1 149.08 149.08 2;3 0.0085625 152625 QUIQUE_C1403_190116_001 73.834 60.065 35807000 0 0 0 35807000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10788 3086 10108 95296;95297 121038;121039 121039 2522 1 ELLELLGFK Unmodified 1060.6168 0.61684746 814 D6RCC4;D6RCC9;Q8NEC7 GSTCD Glutathione S-transferase C-terminal domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 146.64 146.64 2 0.0087437 152263 QUIQUE_C1218_190116_001 77.923 55.431 26160000 11457000 0 0 0 0 0 6524700 0 0 0 0 8178300 0 10789 814 10109 95298;95299;95300;95301;95302;95303 121040;121041;121042;121043;121044;121045 121040 6 ELLENPVQPINDMSYFGCLDSVMENSK Unmodified 3128.4141 0.41407319 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 163.33 163.33 3 0.0029898 168630 QUIQUE_C1218_190116_001 33.024 30.711 59282000 21798000 0 37484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10790 4600 10110 95304;95305 121046;121047 121046 1 ELLEPLFK Unmodified 987.56408 0.56408361 3838 Q96DZ1 ERLEC1 Endoplasmic reticulum lectin 1 yes yes 0 0 0 1 103.55 103.55 2 0.059533 108366 QUIQUE_C1438_190116_001 68.915 28.812 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10791 3838 10111 95306 121048 121048 1 ELLEPMLAVGLSPALTAVLYDLSR Unmodified 2570.403 0.40296186 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 178.11 178.11 3 7.3577E-05 181488 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.182 40.988 39618000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13618000 26000000 0 10792 2447 10112 95307;95308 121049;121050 121050 2 ELLEQNPGK Unmodified 1026.5346 0.53457439 3240 Q4KMP7;H3BSE1 TBC1D10B TBC1 domain family member 10B yes no 0 0 0 1 1 25.899 25.899 2 0.027843 19412 QUIQUE_C1368_190116_001 75.109 40.856 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10793 3240 10113 95309;95310 121051;121052 121052 2 ELLEQVAEFEK Unmodified 1333.6765 0.67654718 4249 Q9NQ48;H7C488 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.52 106.52 2 0.0004883 109910 QUIQUE_C1277_190116_001 125.71 76.295 996290000 0 82069000 98825000 80021000 97829000 83692000 110080000 0 103460000 34367000 98781000 94431000 112730000 10794 4249 10114 95311;95312;95313;95314;95315;95316;95317;95318;95319;95320;95321 121053;121054;121055;121056;121057;121058;121059;121060;121061;121062;121063 121053 10 ELLESYIDGR Unmodified 1193.5928 0.59281755 1792 P00734;E9PIT3 F2 Prothrombin;Activation peptide fragment 1;Activation peptide fragment 2;Thrombin light chain;Thrombin heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 93.382 93.382 2 0.029295 91388 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.378 57.054 22700000 0 0 22700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10795 1792 10115 95322;95323;95324 121064;121065;121066 121065 3 ELLETTCR Unmodified 1020.491 0.49099502 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.081 31.081 2 0.007181 25440 QUIQUE_C1368_190116_001 98.997 57.344 1098400000 113700000 113350000 123850000 102920000 95652000 0 0 0 121280000 45353000 127850000 121680000 132800000 10796 4296 10116 95325;95326;95327;95328;95329;95330;95331;95332;95333;95334 121067;121068;121069;121070;121071;121072;121073;121074;121075;121076 121069 10 ELLEVIGK Unmodified 899.53278 0.53278348 3531 Q8IV38;G3V0G5;F8WB95 ANKMY2 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 75.958 75.958 2 0.028944 77131 QUIQUE_C1218_190116_001 68.312 22.43 59106000 38209000 0 0 0 0 20896000 0 0 0 0 0 0 0 10797 3531 10117 95335;95336 121077;121078 121077 2 ELLEYDLQQR Unmodified 1305.6565 0.65648044 3312 Q5T4S7 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes yes 0 0 0 1 1 81.03 81.03 2 0.027525 81696 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.621 29.928 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10798 3312 10118 95337;95338 121079;121080 121079 2 ELLFHHEWVVK Unmodified 1435.7612 0.76122028 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 71.383 71.383 3 0.0069309 68233 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.247 33.979 122170000 0 0 0 86518000 0 0 0 0 0 35652000 0 0 0 10799 3772 10119 95339;95340 121081;121082;121083;121084 121084 4 ELLFHPALFEVPSLK Unmodified 1738.9658 0.96579333 4439 Q9UHY1;F8W6G1 NRBP1 Nuclear receptor-binding protein yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 137.96 137.96 2;3 0.00042139 142276 QUIQUE_C1277_190116_001 101.35 74.563 544460000 0 71471000 46336000 53455000 0 48717000 43942000 37887000 36758000 25368000 43615000 50920000 85995000 10800 4439 10120 95341;95342;95343;95344;95345;95346;95347;95348;95349;95350;95351;95352;95353 121085;121086;121087;121088;121089;121090;121091;121092;121093;121094;121095;121096;121097 121086 12 ELLFNEVVIMR Unmodified 1361.7377 0.73770765 4381 Q9P286;O96013;Q9NQU5 PAK7;PAK4;PAK6 Serine/threonine-protein kinase PAK 7;Serine/threonine-protein kinase PAK 4;Serine/threonine-protein kinase PAK 6 yes no 0 0 0 1 1 1 133.96 133.96 2 0.0053569 140564 QUIQUE_C1438_190116_001 90.629 54.685 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10801 4381 10121 95354;95355;95356 121098;121099;121100 121098 3 ELLGPDFGYVTR Unmodified 1365.6929 0.69286595 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.74 109.74 2 8.7259E-11 113107 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.36 119.45 16566000000 1117600000 660570000 1334200000 1502000000 1071000000 1163500000 1594500000 1175200000 1577700000 854340000 1693500000 1243800000 1577800000 10802 4560 10122 95357;95358;95359;95360;95361;95362;95363;95364;95365;95366;95367;95368;95369;95370 121101;121102;121103;121104;121105;121106;121107;121108;121109;121110;121111;121112;121113;121114;121115;121116;121117;121118;121119;121120;121121;121122;121123;121124;121125;121126;121127;121128 121117 28 ELLGQGIDYEK Unmodified 1263.6347 0.63468237 4115 Q9H0A8;H3BM91;H3BQF2;H3BRX0 COMMD4 COMM domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.744 71.744 2 0.0010624 72454 QUIQUE_C1576_190116_001 90.696 50.651 208960000 0 53303000 0 0 0 47889000 51073000 56697000 0 0 0 0 0 10803 4115 10123 95371;95372;95373;95374 121129;121130;121131;121132 121131 3 ELLGQGLLLR Unmodified 1110.6761 0.67609367 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 110.79 110.79 2 0.031866 107294 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.878 25.66 33713000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33713000 0 0 0 10804 645 10124 95375 121133 121133 1 ELLGWVSTLAR Unmodified 1243.6925 0.69247202 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 134.36 134.36 2 0.012341 139189 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.518 28.584 133700000 0 0 0 0 0 0 0 23769000 33233000 0 50025000 0 26670000 10805 1187 10125 95376;95377;95378;95379;95380 121134;121135;121136;121137;121138 121136 5 ELLIFLAQYLCNEYQK Unmodified 2044.0339 0.03394925 2113 P16870;D6RF88;C9JE88;D6R930 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 0 2 1 1 168.54 168.54 2;3 4.0955E-07 170598 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.38 99.867 41099000 0 0 0 0 0 0 0 17963000 0 0 23136000 0 0 10806 2113 10126 95381;95382;95383;95384 121139;121140;121141;121142 121140 4 ELLIFNK Unmodified 875.51165 0.5116541 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.591 79.591 2 0.022786 80556 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.47 21.638 446760000 46194000 0 57810000 38492000 38968000 39592000 0 29508000 37405000 21201000 56168000 42622000 38800000 10807 1974 10127 95385;95386;95387;95388;95389;95390;95391;95392;95393;95394;95395 121143;121144;121145;121146;121147;121148;121149;121150;121151;121152;121153;121154 121150 12 ELLIIGGVAAR Unmodified 1110.6761 0.67609367 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 93.709 93.709 2 5.4938E-05 96428 QUIQUE_DMIX3_190116_001 136.8 86.67 1164400000 97198000 135100000 95038000 76831000 81127000 71070000 99145000 89980000 77242000 63534000 99052000 89406000 89687000 10808 3726 10128 95396;95397;95398;95399;95400;95401;95402;95403;95404;95405;95406;95407;95408;95409;95410;95411 121155;121156;121157;121158;121159;121160;121161;121162;121163;121164;121165;121166;121167;121168;121169;121170;121171;121172;121173;121174;121175;121176;121177;121178;121179;121180;121181;121182 121174 28 ELLIQFYK Unmodified 1052.5906 0.59063271 4482 Q9UL18;Q5TA58;Q9UKV8;Q9HCK5 AGO1;AGO2;AGO4 Protein argonaute-1;Protein argonaute;Protein argonaute-2;Protein argonaute-4 no no 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Q09666;E9PJZ0;E9PKR9;E9PJC6;E9PLK4;E9PQE3 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 109.83 109.83 2;3 1.2585E-30 113409 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.65 103.42 917690000 0 0 0 36684000 0 0 73423000 282730000 191240000 0 173590000 160030000 0 10812 2935 10132 95426;95427;95428;95429;95430;95431;95432 121198;121199;121200;121201;121202;121203;121204;121205 121202 8 ELLLQPVTISR Unmodified 1267.75 0.7499869 1063 F8WCF6;P59998;F8WDD7;H7C0A3;A0A0A6YYG9 ARPC4-TTLL3;ARPC4 Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.639 97.639 2 0.00049749 101490 QUIQUE_C1438_190116_001 127.94 102.81 6763700000 516410000 560090000 557380000 498830000 510050000 481590000 564240000 520480000 483080000 232790000 666930000 557530000 614330000 10813 1063 10133 95433;95434;95435;95436;95437;95438;95439;95440;95441;95442;95443;95444;95445 121206;121207;121208;121209;121210;121211;121212;121213;121214;121215;121216;121217;121218;121219;121220;121221;121222;121223 121212 17 ELLLTGPGLEER Unmodified 1325.7191 0.7190807 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.279 92.279 2 0.00045214 93983 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.68 68.335 1849100000 157590000 180490000 206220000 139560000 121840000 146390000 152590000 133070000 171520000 76438000 0 176440000 186970000 10814 3576 10134 95446;95447;95448;95449;95450;95451;95452;95453;95454;95455;95456;95457;95458;95459;95460 121224;121225;121226;121227;121228;121229;121230;121231;121232;121233;121234;121235;121236;121237;121238;121239 121238 13 ELLLYGR Unmodified 862.49125 0.49125301 511 X6RGP5;A0A3F2YNX0;A0A3F2YNZ0;F1T0I1;O15027;A0A0C4DH09 SEC16A Protein transport protein Sec16A yes no 0 0 0 1 1 65.897 65.897 2 0.025482 65041 QUIQUE_C1277_190116_001 95.9 39.734 26734000 0 14478000 0 0 0 0 0 12255000 0 0 0 0 0 10815 511 10135 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ELLQESALIR Unmodified 1170.6608 0.66083754 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.692 82.692 2 0.0001922 83863 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.72 79.371 1272600000 136170000 0 150850000 110560000 134180000 110550000 146820000 77057000 0 43060000 138460000 94767000 130180000 10823 2952 10142 95510;95511;95512;95513;95514;95515;95516;95517;95518;95519;95520 121315;121316;121317;121318;121319;121320;121321;121322;121323;121324;121325 121324 10 ELLQHPFLK Unmodified 1123.639 0.63897988 2974;120 A0A087X294;O75914;Q13177 PAK3;PAK2 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3;Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 55.992 55.992 2;3 0.0045916 55273 QUIQUE_C1438_190116_001 55.112 31.792 1074800000 80355000 84367000 123540000 80285000 78440000 76206000 77085000 101230000 100550000 28396000 70127000 78976000 95247000 10824 120;2974 10143 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95623;95624;95625;95626;95627;95628;95629;95630;95631;95632;95633;95634;95635;95636;95637 121463;121464;121465;121466;121467;121468;121469;121470;121471;121472;121473;121474;121475;121476;121477;121478;121479 121465 16 ELLSNVDEGIYQLEK Unmodified 1748.8832 0.88324549 3773 V9GYM8;Q92974 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 125.07 125.07 2 0.0036087 129645 QUIQUE_C1218_190116_001 81.92 66.582 21855000 21855000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10835 3773 10154 95638 121480 121480 0 ELLSNWYHFLVTR Unmodified 1676.8675 0.86747627 1287 J3QL54;J3KT10;Q9BW27;J3KTC7;J3QLV0;J3QLD4 NUP85 Nuclear pore complex protein Nup85 yes no 0 0 0 1 147.53 147.53 3 0.0045358 152631 QUIQUE_C1218_190116_001 61.212 42.481 7742200 7742200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10836 1287 10155 95639 121481 121481 1 ELLTEFGYK Unmodified 1098.5597 0.55972651 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 92.325 92.325 1;2 3.6231E-05 94359 QUIQUE_C1277_190116_001 175.44 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Unmodified 3689.8862 0.88622897 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 2 1 1 1 157.81 157.81 3;4 2.5501E-86 160418 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.25 146.06 2207300000 0 0 0 0 0 0 163730000 393970000 350680000 0 567690000 303520000 427750000 10839 2529 10158 95669;95670;95671;95672;95673;95674;95675 121520;121521;121522;121523;121524;121525;121526;121527;121528 121523 8 ELLTENHQLK Unmodified 1223.651 0.65100113 3825 Q96CV9;A0A087X2G2;X6RKL2 OPTN Optineurin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27 27 2;3 0.00013245 20867 QUIQUE_C1368_190116_001 121.53 83.116 420630000 0 40964000 52738000 59176000 39889000 39814000 51316000 0 0 0 42468000 40514000 53751000 10840 3825 10159 95676;95677;95678;95679;95680;95681;95682;95683;95684;95685;95686 121529;121530;121531;121532;121533;121534;121535;121536;121537;121538;121539;121540 121530 9 ELLTLIR Unmodified 856.5382 0.53820321 3107 Q15067;K7ESC7;K7ENF1 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 0 1 85.586 85.586 2 0.050661 86177 QUIQUE_C1563_190116_001 74.415 7.3804 53970000 0 0 0 0 0 53970000 0 0 0 0 0 0 0 10841 3107 10160 95687 121541 121541 1 ELLTSFGPLK Unmodified 1103.6227 0.62266112 1338 K7ENG2;P26368 U2AF2 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.79 102.79 2 0.0010709 105578 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.89 81.081 1076200000 121520000 134640000 0 97035000 97511000 112490000 0 48236000 75230000 60283000 122790000 97466000 109020000 10842 1338 10161 95688;95689;95690;95691;95692;95693;95694;95695;95696;95697;95698 121542;121543;121544;121545;121546;121547;121548;121549;121550;121551;121552;121553;121554;121555;121556 121556 14 ELLTTMGDR Unmodified 1034.5066 0.50664508 1303;2234 J3QRS3;P19105;O14950;P24844 MYL12A;MYL12B;MYL9 Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B;Myosin regulatory light polypeptide 9 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.97 50.97 2 0.0012706 48331 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.25 51.673 2154800000 231640000 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10848 2113 10166 95726 121589;121590 121589 2 ELLVLDPEAFTILAK Unmodified 1670.9495 0.94947456 3649 Q8NFJ9;E9PMB7 BBS1 Bardet-Biedl syndrome 1 protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 163.63 163.63 2 0.00025102 168258 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.21 49.462 203930000 0 0 0 0 33263000 20446000 45186000 18964000 23918000 7550200 0 30778000 23820000 10849 3649 10167 95727;95728;95729;95730;95731;95732;95733;95734 121591;121592;121593;121594;121595;121596;121597;121598;121599;121600 121597 10 ELLVPLTSSMYVPGK Unmodified 1632.8797 0.87968044 3955 Q99471 PFDN5 Prefoldin subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.09 126.09 2 0.00053178 129068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.927 52.838 692920000 95271000 94599000 78693000 46726000 57048000 53942000 64237000 55166000 0 0 65234000 0 82009000 10850 3955 10168 95735;95736;95737;95738;95739;95740;95741;95742;95743;95744 121601;121602;121603;121604;121605;121606;121607;121608;121609;121610;121611 121609 11 ELLYFLDSCEPEFK Unmodified 1788.828 0.8280388 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.22 144.22 2 1.8439E-28 148464 QUIQUE_C1277_190116_001 169.65 154.45 1141700000 105650000 114790000 137150000 93753000 79918000 66879000 81433000 69315000 75225000 28631000 98735000 102590000 87636000 10851 1548 10169 95745;95746;95747;95748;95749;95750;95751;95752;95753;95754;95755;95756;95757 121612;121613;121614;121615;121616;121617;121618;121619;121620;121621;121622;121623;121624;121625;121626;121627 121613 16 ELLYGGTSPTAETILK Unmodified 1691.8982 0.89816728 104 A0A087X1A5;Q5JW30;O95793 STAU1 Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 104.52 104.52 2 0.0014326 107212 QUIQUE_C1403_190116_001 64.64 51.048 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10852 104 10170 95758;95759;95760 121628;121629;121630 121628 3 ELMAWNQAENRR Oxidation (M) 1532.7154 0.71540908 4077 Q9BYN8 MRPS26 28S ribosomal protein S26, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 19.509 19.509 2 0.006098 12004 QUIQUE_C1277_190116_001 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121648;121649;121650;121651 121651 2958 4 ELMENGPVQALMEVHEDFFLYK Unmodified 2638.2447 0.24474666 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 0 0 1 1 1 160.22 160.22 3 0.013029 167772 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.333 17.701 137030000 0 36689000 0 0 0 0 0 0 49201000 0 51137000 0 0 10856 4100 10173 95779;95780;95781 121652;121653;121654 121654 2 ELMENGPVQALMEVHEDFFLYK Oxidation (M) 2654.2397 0.23966128 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 1 0 1 154.65 154.65 3 0.00030908 158987 QUIQUE_C1277_190116_001 55.972 49.174 39520000 0 39520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10857 4100 10173 95782 121655 121655 2855 0 ELMGEEILGASLSAPLTSYK Unmodified 2108.0711 0.071122618 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 151.46 151.46 2;3 1.2473E-06 156910 QUIQUE_C1368_190116_001 94.023 88.744 58481000 0 0 47360000 0 0 11121000 0 0 0 0 0 0 0 10858 4389 10174 95783;95784 121656;121657 121656 2 ELMIPGGAK Oxidation (M) 930.48445 0.48445308 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 41.576 41.576 2 0.013511 36834 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.789 45.993 415090000 0 0 0 64882000 0 0 54875000 0 0 69206000 143330000 82802000 0 10859 3984 10175 95785;95786;95787;95788;95789 121658;121659;121660;121661;121662;121663;121664 121660 2821 7 ELMQWYK Unmodified 996.47389 0.47388839 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.89 77.89 2 0.033196 78677 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.591 51.57 347100000 64689000 0 0 0 42080000 0 0 39044000 37445000 0 60752000 45897000 57196000 10860 1148 10176 95790;95791;95792;95793;95794;95795;95796 121665;121666;121667;121668;121669;121670;121671 121668 7 ELMVQLEGLMK Unmodified 1289.6723 0.6723302 4608;1367 M0QZ28;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.92 129.92 2 0.00043691 134256 QUIQUE_C1277_190116_001 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121740;121741;121742;121743;121744;121745 121740 6 ELNHMLSDTGNRK Unmodified 1513.7307 0.73072479 3855 Q96FQ6 S100A16 Protein S100-A16 yes yes 0 0 1 1 18.724 18.724 3 0.048842 11356 QUIQUE_DMIX8_190116_001 30.874 21.878 51868000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51868000 10872 3855 10187 95861 121746 121746 1 ELNHYLEAEK Unmodified 1244.6037 0.60371659 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 32.604 32.604 2 0.010641 27409 QUIQUE_C1563_190116_001 68.485 49.131 16978000 0 0 0 0 0 16978000 0 0 0 0 0 0 0 10873 3125 10188 95862 121747 121747 1 ELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGR Unmodified 2835.4437 0.44365748 2717 P61201;B4DIH5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 173.47 173.47 3 3.1434E-37 177191 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.08 131.71 374890000 0 0 0 0 0 0 0 0 42336000 0 236970000 43375000 52207000 10874 2717 10189 95863;95864;95865;95866 121748;121749;121750;121751;121752 121751 5 ELNIQVDDSYAR Unmodified 1421.6787 0.67867245 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.807 75.807 2 0.00051235 75645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.13 74.337 812730000 0 0 108190000 0 70379000 0 89155000 131370000 0 113280000 119530000 75489000 105320000 10875 2578 10190 95867;95868;95869;95870;95871;95872;95873;95874;95875 121753;121754;121755;121756;121757;121758;121759;121760;121761;121762 121758 8 ELNITAAK Unmodified 858.48108 0.48108226 2738 P62081;B5MCP9;A0A2R8Y623 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.856 27.856 2 0.021461 22465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.109 25.751 1252400000 129820000 114100000 130420000 0 98216000 155050000 0 0 145460000 0 160560000 159690000 159090000 10876 2738 10191 95876;95877;95878;95879;95880;95881;95882;95883;95884 121763;121764;121765;121766;121767;121768;121769;121770;121771;121772 121768 10 ELNKPVQGPLAHR Unmodified 1457.8103 0.81029574 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 19.426 19.426 4 0.0014835 12010 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.7 47.498 76799000 10110000 0 0 0 0 0 0 0 19545000 0 28555000 18589000 0 10877 1416 10192 95885;95886;95887;95888 121773;121774;121775;121776 121775 3 ELNLILTTGGTGFAPR Unmodified 1658.8992 0.89917033 998 F5H039;Q9NQX3;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 123.29 123.29 2 2.4727E-09 126084 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.12 75.835 544420000 77433000 93438000 0 61720000 0 75851000 0 29790000 69743000 30565000 0 49082000 56804000 10878 998 10193 95889;95890;95891;95892;95893;95894;95895;95896;95897;95898 121777;121778;121779;121780;121781;121782;121783;121784;121785;121786 121781 8 ELNLVLSVR Unmodified 1041.6182 0.61824444 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 93.752 93.752 2 0.020343 90601 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.431 57.327 35100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17275000 17825000 0 0 10879 2524 10194 95899;95900;95901;95902;95903;95904;95905;95906 121787;121788;121789;121790;121791;121792;121793;121794 121791 7 ELNMIIMLPDETTDLR Oxidation (M) 1918.938 0.93799995 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 137.71 137.71 2 1.7948E-13 135932 QUIQUE_DMIX4_190116_001 137.59 103.7 228050000 40904000 0 0 26629000 30546000 25059000 0 44157000 0 16506000 0 0 44253000 10880 2371 10195 95907;95908;95909;95910;95911;95912;95913;95914 121795;121796;121797;121798;121799;121800;121801;121802 121800 1769;1770 8 ELNMIIMLPDETTDLR Unmodified 1902.9431 0.94308533 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 1 1 2 147.8 147.8 2;3 1.1094E-36 152681 QUIQUE_DMIX3_190116_001 219.43 173.52 1673600000 0 0 0 0 178290000 117500000 0 261740000 293310000 69004000 276060000 235330000 242320000 10881 2371 10195 95915;95916;95917;95918;95919;95920;95921;95922;95923;95924;95925;95926;95927;95928;95929 121803;121804;121805;121806;121807;121808;121809;121810;121811;121812;121813;121814;121815;121816;121817;121818 121812 15 ELNNEILGPVVQFLGVPYATPPLGAR Unmodified 2763.496 0.49595105 3654 Q8NFZ4 NLGN2 Neuroligin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 170.04 170.04 3 1.7645E-09 171747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.445 74.17 62113000 0 21556000 0 0 22646000 0 0 17910000 0 0 0 0 0 10882 3654 10196 95930;95931;95932 121819;121820;121821 121821 2 ELNNTCEPVVTQPK Unmodified 1627.7876 0.78757097 3738;180 A0A0A0MSM0;Q5TBM3;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 41.08 41.08 2 0.00099911 37377 QUIQUE_C1403_190116_001 80.979 61.626 257390000 82166000 64815000 44951000 0 0 65458000 0 0 0 0 0 0 0 10883 180;3738 10197 95933;95934;95935;95936;95937;95938 121822;121823;121824;121825;121826;121827 121825 6 ELNNTCEPVVTQPKPK Unmodified 1852.9353 0.93529784 3738;180 A0A0A0MSM0;Q5TBM3;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.927 29.927 3 0.00022412 24418 QUIQUE_C1563_190116_001 66.965 49.264 531820000 65937000 0 47442000 63676000 71391000 48260000 85830000 0 0 0 62061000 31042000 56185000 10884 180;3738 10198 95939;95940;95941;95942;95943;95944;95945;95946;95947 121828;121829;121830;121831;121832;121833;121834;121835;121836 121832 9 ELNQLLGPK Unmodified 1010.576 0.57604528 3866 Q96HD9 ACY3 N-acyl-aromatic-L-amino acid amidohydrolase (carboxylate-forming) yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.713 55.713 2 0.0090517 55139 QUIQUE_C1218_190116_001 77.058 45.829 246740000 45127000 33369000 34212000 0 29238000 20206000 27185000 0 0 0 0 0 57401000 10885 3866 10199 95948;95949;95950;95951;95952;95953;95954;95955 121837;121838;121839;121840;121841;121842;121843;121844 121837 8 ELNSEVGSETESNVDSEFAR Unmodified 2197.9611 0.96111448 4608;1367 M0QZ28;M0R0C4;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.944 85.944 2 1.6353E-243 87051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 277.52 255.65 316210000 0 0 40957000 51209000 0 43030000 37189000 44608000 44634000 0 0 0 54586000 10886 1367;4608 10200 95956;95957;95958;95959;95960;95961;95962 121845;121846;121847;121848;121849;121850;121851 121849 7 ELNVMFIETSAK Oxidation (M) 1396.6908 0.69081704 2167 P20340 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.692 89.692 2 0.0011307 91093 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.687 62.348 535880000 51055000 60831000 72911000 46668000 60757000 33497000 24508000 0 37419000 53355000 0 33933000 60943000 10887 2167 10201 95963;95964;95965;95966;95967;95968;95969;95970;95971;95972;95973 121852;121853;121854;121855;121856;121857;121858;121859;121860;121861;121862;121863;121864;121865 121865 1511 13 ELNVMFIETSAK Unmodified 1380.6959 0.69590241 2167 P20340 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes yes 0 0 0 1 1 106.36 106.36 2 6.9971E-07 108966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.08 94.261 432600000 0 0 0 0 0 0 0 170940000 261660000 0 0 0 0 10888 2167 10201 95974;95975 121866;121867 121866 2 ELNVSFINEK Unmodified 1191.6136 0.61355299 717 C9JEJ2;P49585;C9J050;Q9Y5K3 PCYT1A;PCYT1B Choline-phosphate cytidylyltransferase A;Choline-phosphate cytidylyltransferase B yes no 0 0 0 1 1 1 1 80.05 80.05 2 0.018983 81029 QUIQUE_C1403_190116_001 74.269 46.051 79574000 0 0 0 0 38592000 40982000 0 0 0 0 0 0 0 10889 717 10202 95976;95977;95978;95979 121868;121869;121870;121871 121868 4 ELNWDDYK Unmodified 1081.4716 0.47163978 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.549 73.549 2 0.022385 75117 QUIQUE_C1218_190116_001 74.255 53.773 389550000 45877000 42262000 36266000 39720000 22568000 32475000 36945000 0 28199000 0 39468000 29401000 36365000 10890 2463 10203 95980;95981;95982;95983;95984;95985;95986;95987;95988;95989;95990 121872;121873;121874;121875;121876;121877;121878;121879;121880;121881;121882 121872 11 ELNWDDYKK Unmodified 1209.5666 0.5666028 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 47.507 47.507 2;3 0.0030431 43768 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.347 54.422 882780000 42614000 53711000 70990000 55182000 134630000 65660000 0 0 67110000 29847000 222900000 73137000 66997000 10891 2463 10204 95991;95992;95993;95994;95995;95996;95997;95998;95999;96000;96001;96002;96003 121883;121884;121885;121886;121887;121888;121889;121890;121891;121892;121893;121894;121895;121896;121897 121892 15 ELNYFAK Unmodified 883.44397 0.44396847 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.745 47.745 2 0.023536 46048 QUIQUE_C1218_190116_001 99.919 45.394 24826000000 1858900000 2001600000 2249100000 1877600000 1544400000 1429100000 1908000000 1954600000 1980200000 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ELPAWVSFPDVEK Unmodified 1515.7609 0.76094551 4014 Q9BSJ8;F8VZB1 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 136.29 136.29 2 0.011349 139638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.014 60.743 191760000 0 0 0 0 64246000 0 0 0 53896000 0 0 0 73619000 10894 4014 10207 96038;96039;96040;96041 121945;121946;121947;121948;121949 121946 5 ELPDLEDLMK Unmodified 1201.59 0.59004036 4220 Q9HC38;F6TLX2 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.57 133.57 2 0.00097688 138338 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.05 79.396 2070900000 185700000 160550000 178000000 143960000 170950000 141920000 146800000 142120000 178850000 58463000 227350000 154330000 181880000 10895 4220 10208 96042;96043;96044;96045;96046;96047;96048;96049;96050;96051;96052;96053;96054 121950;121951;121952;121953;121954;121955;121956;121957;121958;121959;121960;121961;121962;121963;121964;121965;121966;121967;121968 121963 18 ELPDLEDLMKR Oxidation (M) 1373.6861 0.68606601 4220 Q9HC38;F6TLX2 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 1 1 1 80.454 80.454 3 0.019233 80705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.614 28.749 33134000 0 0 0 0 0 0 0 33134000 0 0 0 0 0 10896 4220 10209 96055 121969 121969 1 ELPDLEDLMKR Unmodified 1357.6912 0.69115139 4220 Q9HC38;F6TLX2 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 112.38 112.38 3 0.00012747 114634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.82 86.489 55721000 0 0 0 0 0 0 0 55721000 0 0 0 0 0 10897 4220 10209 96056;96057;96058;96059;96060 121970;121971;121972;121973;121974 121970 5 ELPELLQR Unmodified 996.5604 0.56039521 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 76.001 76.001 2 0.003959 77897 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.9 61.312 428390000 0 0 137740000 0 0 0 137050000 0 0 0 153600000 0 0 10898 3700 10210 96061;96062;96063 121975;121976;121977 121977 1 ELPEPLFTDEFYPNFAEGIALSDPVAK Unmodified 3008.4695 0.4695211 2020 P11274 BCR Breakpoint cluster region protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.13 169.13 3 3.3592E-08 173153 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.812 52.846 201860000 0 31329000 22488000 0 30149000 0 0 0 36363000 0 47049000 34481000 0 10899 2020 10211 96064;96065;96066;96067;96068;96069 121978;121979;121980;121981;121982;121983 121983 6 ELPEPLLTDR Unmodified 1181.6292 0.62920306 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.768 81.768 2 0.0040375 84081 QUIQUE_C1438_190116_001 82.287 56.55 1263700000 114680000 129830000 116700000 103240000 89876000 0 120770000 91461000 97247000 43935000 137760000 115210000 103000000 10900 366 10212 96070;96071;96072;96073;96074;96075;96076;96077;96078;96079;96080;96081 121984;121985;121986;121987;121988;121989;121990;121991;121992;121993;121994;121995;121996;121997;121998 121990 14 ELPEPLLTFDLYPHVVGFLNIDESQR Unmodified 3040.5546 0.55458814 2912 Q07960;H0YE29 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 168.37 168.37 3 3.6493E-20 172879 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.57 102.34 1227900000 0 0 0 0 0 0 83184000 76231000 154020000 0 361460000 254920000 298040000 10901 2912 10213 96082;96083;96084;96085;96086;96087 121999;122000;122001;122002;122003;122004 122001 6 ELPEVTNSVFHEINMWVSQR Unmodified 2414.1689 0.1688796 217 A0A0C4DFN3;Q99685;E7EWX8;H7C599;H7C5K5;H7C4E0 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 157.99 157.99 3 2.2599E-23 161966 QUIQUE_C1277_190116_001 120.11 96.939 278800000 105070000 0 0 0 0 44601000 0 0 61109000 0 0 0 68016000 10902 217 10214 96088;96089;96090;96091;96092;96093 122005;122006;122007;122008;122009;122010 122006 5 ELPGFVNYR Unmodified 1093.5556 0.55564418 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.703 81.703 2 0.0023496 82872 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.262 58.382 788090000 0 0 290140000 0 0 0 0 87545000 77783000 0 332630000 0 0 10903 2168 10215 96094;96095;96096;96097;96098;96099;96100 122011;122012;122013;122014;122015;122016;122017 122014 7 ELPGHTGYLSCCR Unmodified 1548.6813 0.68133176 2769;4207 P62879;C9JXA5;E7EP32;C9JIS1;C9JZN1;Q9HAV0;H7C5J5 GNB2;GNB4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 no no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 39.071 39.071 2;3 2.5878E-23 36191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.65 154.12 13007000000 912240000 1408500000 1353500000 1181200000 935370000 1118800000 1584000000 738260000 620440000 448160000 626700000 966190000 1113100000 10904 2769;4207 10216 96101;96102;96103;96104;96105;96106;96107;96108;96109;96110;96111;96112;96113;96114;96115;96116;96117;96118;96119;96120;96121;96122;96123;96124;96125;96126;96127 122018;122019;122020;122021;122022;122023;122024;122025;122026;122027;122028;122029;122030;122031;122032;122033;122034;122035;122036;122037;122038;122039;122040;122041;122042;122043;122044;122045;122046;122047;122048;122049;122050;122051;122052;122053;122054;122055;122056;122057;122058;122059;122060;122061;122062;122063;122064;122065;122066;122067;122068;122069;122070;122071;122072;122073;122074;122075;122076;122077 122057 60 ELPLSPAFFGEDGIFR Unmodified 1793.8988 0.89883598 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 158.86 158.86 2;3 9.409E-10 164351 QUIQUE_C1218_190116_001 129.34 118.44 2594800000 11355000 197740000 8625900 211740000 201350000 301910000 257350000 132520000 277730000 96065000 344370000 267310000 286680000 10905 3803 10217 96128;96129;96130;96131;96132;96133;96134;96135;96136;96137;96138;96139;96140;96141;96142;96143;96144;96145;96146;96147;96148 122078;122079;122080;122081;122082;122083;122084;122085;122086;122087;122088;122089;122090;122091;122092;122093;122094;122095;122096;122097;122098;122099;122100;122101;122102;122103;122104;122105 122079 28 ELPLYCSGGLR Unmodified 1263.6282 0.6281572 3068 Q14457 BECN1 Beclin-1 yes yes 0 0 0 1 1 77.073 77.073 2 0.052806 78177 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.368 24.068 74008000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23589000 50419000 10906 3068 10218 96149;96150 122106;122107 122106 2 ELPNIEER Unmodified 998.50327 0.50327426 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.607 45.607 2 0.018262 42019 QUIQUE_C1563_190116_001 80.229 40.126 1836600000 0 0 0 345200000 323950000 381740000 0 187000000 208830000 108290000 0 0 281560000 10907 2037 10219 96151;96152;96153;96154;96155;96156;96157 122108;122109;122110;122111;122112;122113;122114;122115 122111 8 ELPPDQAEYCIAR Unmodified 1560.7242 0.72424243 1544;2047;1242;1228 H7C144;H9KV75;H0YJW3;O43707;F5GXS2;P12814 ACTN4;ACTN1 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S100-A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.357 80.357 2 0.016964 81539 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.305 35.539 653670000 0 0 0 0 0 0 0 125510000 176790000 21504000 105500000 93006000 131360000 10914 2251 10226 96237;96238;96239;96240;96241;96242 122206;122207;122208;122209;122210;122211;122212;122213;122214;122215 122208 10 ELPSTFGQLSALK Unmodified 1389.7504 0.75038083 495 H3BSW0;A0A3B3ISV5;Q8N9N7 LRRC57 Leucine-rich repeat-containing protein 57 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 107.8 107.8 2 0.00089638 112493 QUIQUE_C1438_190116_001 83.397 59.546 652100000 85650000 0 0 0 108730000 0 115390000 0 95686000 0 122680000 123960000 0 10915 495 10227 96243;96244;96245;96246;96247;96248;96249 122216;122217;122218;122219;122220;122221;122222 122217 5 ELPTAFDYVEFTR Unmodified 1586.7617 0.76167379 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 135.15 135.15 2;3 0.0003774 141088 QUIQUE_C1218_190116_001 97.734 88.079 36787000000 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122255;122256;122257;122258;122259;122260;122261;122262;122263;122264;122265;122266;122267;122268;122269 122265 15 ELPVNAQNYVR Unmodified 1301.6728 0.67279921 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 65.31 65.31 2 0.00022235 66298 QUIQUE_C1438_190116_001 122.52 96.132 419590000 0 0 76880000 80483000 62092000 0 95038000 0 0 0 0 0 105100000 10918 2320 10230 96284;96285;96286;96287;96288 122270;122271;122272;122273;122274 122272 3 ELQAGTPLSLFGDTYETQVIAYGQGSSEGLR Unmodified 3286.5994 0.59936608 2488 P46952 HAAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase yes yes 0 0 0 1 159.54 159.54 3 0.00012742 154267 QUIQUE_DMIX4_190116_001 38.012 31.785 10423000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10423000 0 0 0 10919 2488 10231 96289 122275 122275 1 ELQAHGADELLK Unmodified 1322.683 0.68302954 1486 O15144;C9JTV5;G5E9J0 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 44.123 44.123 2;3 3.5433E-45 40763 QUIQUE_C1403_190116_001 196.16 117.39 2322100000 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gamma 1 yes no 0 0 0 1 2 1 178.9 178.9 3 8.1842E-09 185870 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.57 94.014 106720000 0 0 0 0 0 0 0 0 9385200 0 61150000 36186000 0 10922 922 10234 96316;96317;96318;96319 122307;122308;122309;122310 122309 2 ELQAQIAELQEDFESEK Unmodified 2005.948 0.94803059 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 138.48 138.48 2;3 1.4971E-13 145082 QUIQUE_C1438_190116_001 128.9 118.73 514240000 0 0 0 61243000 56340000 48574000 51621000 50596000 56720000 0 60324000 80879000 47943000 10923 2379 10235 96320;96321;96322;96323;96324;96325;96326;96327;96328;96329;96330 122311;122312;122313;122314;122315;122316;122317;122318;122319;122320;122321;122322 122313 11 ELQDALALISR Unmodified 1227.6823 0.68230126 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 12.953 12.953 3 0.052682 5058 QUIQUE_DMIX7_190116_001 23.724 0 22861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22861000 0 10924 1187 10236 96331 122323 122323 1 ELQDQLEAEQYFSTLYK Unmodified 2104.0001 6.61646E-05 1610;2999 Q13464;A0A0U1RQV4;O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK1;ROCK2 Rho-associated protein kinase 1;Rho-associated protein kinase 2 no no 0 0 0 1 141.45 141.45 2 6.2151E-10 137451 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.62 79.395 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10925 2999;1610 10237 96332 122324 122324 1 ELQEALGAR Unmodified 985.51926 0.51925868 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.763 33.763 2 0.00039833 29415 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.74 4.567 1229100000 0 0 170900000 0 158830000 0 168080000 174010000 189340000 0 168520000 0 199360000 10926 16;1475 10238 96333;96334;96335;96336;96337;96338;96339;96340 122325;122326;122327;122328;122329;122330;122331;122332;122333;122334 122332 10 ELQEALPEAPAPLLPHITATSLLGTR Unmodified 2737.5014 0.50143035 4062 Q9BXK5;A0A087WX97;A0A087WTL4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.28 142.28 3 3.4361E-11 146828 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.359 77.53 1339000000 80748000 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Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 1 78.025 78.025 2 0.00044235 80565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.701 59.483 102230000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62027000 0 40206000 10930 2041 10242 96360;96361 122354;122355;122356 122355 3 ELQELVQYPVEHPDK Unmodified 1822.9101 0.91012895 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.216 75.216 3 8.0321E-06 75699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.75 84.874 6380600000 0 664700000 756750000 897990000 0 602890000 0 613030000 690390000 0 704260000 600710000 849920000 10931 2658 10243 96362;96363;96364;96365;96366;96367;96368;96369;96370 122357;122358;122359;122360;122361;122362;122363;122364;122365;122366 122362 7 ELQELVQYPVEHPDKFLK Unmodified 2211.1576 0.15756986 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 100.99 100.99 4 1.2877E-07 103446 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.31 96.982 314200000 0 0 0 0 0 0 0 115560000 48333000 0 99592000 0 50719000 10932 2658 10244 96371;96372;96373;96374 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122388;122389;122390;122391;122392;122393;122394;122395;122396;122397;122398;122399;122400;122401;122402;122403;122404;122405;122406;122407;122408;122409;122410;122411;122412;122413;122414;122415;122416;122417;122418;122419;122420;122421;122422;122423;122424;122425;122426;122427;122428;122429;122430;122431;122432;122433;122434;122435;122436;122437;122438;122439;122440;122441;122442;122443;122444;122445;122446;122447;122448;122449;122450;122451;122452;122453;122454;122455;122456;122457;122458;122459;122460;122461;122462;122463;122464;122465;122466;122467;122468;122469;122470;122471;122472;122473;122474;122475;122476;122477;122478;122479;122480;122481;122482;122483;122484;122485;122486;122487;122488;122489;122490;122491;122492;122493;122494;122495;122496;122497;122498;122499;122500;122501;122502;122503 122424 104 ELQEQMSR Unmodified 1019.4706 0.47059393 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;H0Y503 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 19.727 19.727 2 0.039307 12663 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0.08619583 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.693 68.693 4 0.00012996 68367 QUIQUE_C1368_190116_001 50.938 45.485 838820000 91980000 0 103040000 51949000 71064000 60619000 90438000 62506000 119320000 0 112250000 0 75650000 10952 3643 10263 96557;96558;96559;96560;96561;96562;96563;96564;96565;96566 122610;122611;122612;122613;122614;122615;122616;122617;122618;122619 122611 9 ELQPPAAGDPQAK Unmodified 1320.6674 0.66737948 3347 Q66K14;G3V133 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 0 1 2 31.194 31.194 2 0.041956 26777 QUIQUE_C1576_190116_001 50.353 26.925 46335000 0 0 0 0 0 0 0 0 46335000 0 0 0 0 10953 3347 10264 96567;96568;96569 122620;122621;122622 122620 1 ELQPQQQPR Unmodified 1122.5782 0.57817054 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02 MLLT4 Afadin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 15.513 15.513 2 0.003052 7616 QUIQUE_C1403_190116_001 92.187 56.938 84177000 12528000 15994000 0 23191000 0 14952000 0 0 17512000 0 0 0 0 10954 1258 10265 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122660;122661;122662;122663;122664;122665;122666;122667;122668;122669;122670;122671;122672;122673;122674;122675;122676;122677;122678;122679;122680;122681 122666 20 ELQTLHNLRK Unmodified 1250.7095 0.70951906 2355;1568;2946 P33176;O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840;J3KNA1 KIF5B;KIF5C;KIF5A Kinesin-1 heavy chain;Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein no no 0 0 1 1 1 1 1 17.853 17.853 3 0.016628 10163 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.863 10.611 216320000 0 0 0 0 0 0 0 82735000 42331000 0 49094000 42158000 0 10963 2355;1568;2946 10274 96618;96619;96620;96621 122682;122683;122684;122685 122684 3 ELQTQYDALKK Unmodified 1335.7034 0.70343063 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 1 31.769 31.769 2 0.006117 27881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.013 46.297 38583000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38583000 0 0 10964 271 10275 96622;96623 122686;122687 122686 2 ELQTVLSTYLR Unmodified 1321.7242 0.72416608 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 117.96 117.96 2 0.0018611 122572 QUIQUE_C1218_190116_001 96.342 71.566 64865000 35940000 0 0 0 0 28924000 0 0 0 0 0 0 0 10965 465 10276 96624;96625 122688;122689 122688 2 ELQTVLSTYLRPLQTSEK Unmodified 2105.1368 0.13683442 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 123.08 123.08 2;3 1.5941E-16 127379 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.65 100.75 889150000 0 95439000 59570000 68467000 102090000 0 147050000 0 30036000 0 187300000 35681000 163520000 10966 465 10277 96626;96627;96628;96629;96630;96631;96632;96633;96634;96635;96636;96637;96638;96639 122690;122691;122692;122693;122694;122695;122696;122697;122698;122699;122700;122701;122702;122703 122698 12 ELQVGIPVADEAGQR Unmodified 1580.8158 0.81583463 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.21 84.21 2 8.4046E-20 85140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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98079 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.75 91.803 229180000 0 0 0 0 0 0 0 87427000 53579000 0 26662000 26026000 35488000 10969 3168 10280 96659;96660;96661;96662;96663;96664 122724;122725;122726;122727;122728;122729;122730 122725 6 ELREELGEAAAAFR Unmodified 1560.7896 0.78961988 3834 Q96DE0 NUDT16 U8 snoRNA-decapping enzyme yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.7 96.7 3 8.6906E-11 98536 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.72 125.67 251530000 30744000 34671000 34160000 23459000 0 28385000 0 40694000 46670000 12745000 0 0 0 10970 3834 10281 96665;96666;96667;96668;96669;96670;96671;96672 122731;122732;122733;122734;122735;122736;122737;122738;122739 122737 6 ELRPLLVFIWAK Unmodified 1483.8915 0.89150618 3568 Q8N122 RPTOR Regulatory-associated protein of mTOR yes yes 0 0 1 1 141.5 141.5 3 0.0002685 146172 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.767 90.299 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10971 3568 10282 96673 122740 122740 1 ELRVEQESLLTAFR Unmodified 1689.905 0.90498399 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 1 1 1 104.97 104.97 3 0.0050144 107408 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.709 49.064 41281000 0 0 0 0 0 0 0 17519000 0 0 23763000 0 0 10972 4392 10283 96674;96675 122741;122742 122741 2 ELSAALQDKK Unmodified 1101.603 0.60298831 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 1 1 2 18.275 18.275 2;3 0.0077683 11257 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.113 41.352 80232000 0 0 0 0 0 0 0 32872000 47360000 0 0 0 0 10973 3091 10284 96676;96677;96678 122743;122744;122745 122743 3 ELSANTAAFAK Unmodified 1121.5717 0.57168818 1590 O60749 SNX2 Sorting nexin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 45.022 45.022 2 0.00048107 41814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.69 50.516 170250000 0 90145000 0 0 0 0 0 80109000 0 0 0 0 0 10974 1590 10285 96679;96680;96681;96682;96683 122746;122747;122748;122749;122750 122749 4 ELSAQPEVHR Unmodified 1164.5887 0.58873523 4293 Q9NTJ5;E9PGZ4;F8WDN7 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 18.623 18.623 2;3 0.022257 11052 QUIQUE_C1563_190116_001 57.96 34.531 174370000 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2.7163E-06 89575 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.087 72.429 953560000 0 79025000 90731000 75478000 115660000 50430000 75208000 0 166070000 0 72503000 95314000 133140000 10977 2455 10288 96703;96704;96705;96706;96707;96708;96709;96710;96711;96712;96713;96714;96715 122778;122779;122780;122781;122782;122783;122784;122785;122786;122787;122788;122789;122790 122787 13 ELSDEIEDYTHR Unmodified 1505.6634 0.66341631 3620 Q8N9R8;Q3SXZ0 SCAI;C9orf126 Protein SCAI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.373 77.373 3 0.0034132 77838 QUIQUE_C1277_190116_001 77.124 64.143 167200000 0 38645000 43948000 0 0 0 0 25169000 0 11643000 0 47798000 0 10978 3620 10289 96716;96717;96718;96719;96720;96721 122791;122792;122793;122794;122795;122796;122797 122791 7 ELSDFISYLQR Unmodified 1369.6878 0.68778057 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.88 139.88 2;3 7.7816E-09 136231 QUIQUE_DMIX4_190116_001 185.6 127.64 10737000000 971240000 939370000 1020300000 876450000 913330000 898570000 789770000 607390000 795690000 348590000 1112500000 705520000 758180000 10979 2308 10290 96722;96723;96724;96725;96726;96727;96728;96729;96730;96731;96732;96733;96734;96735 122798;122799;122800;122801;122802;122803;122804;122805;122806;122807;122808;122809;122810;122811;122812;122813;122814;122815;122816;122817;122818;122819;122820;122821 122814 23 ELSDFLR Unmodified 878.44978 0.44978213 873 E7ETZ4;Q9Y6E2;B5MCE7;B5MCH7;Q75MG1;E9PFD4 BZW2 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 84.459 84.459 2 0.040989 86003 QUIQUE_C1277_190116_001 82.386 33.625 8378000 0 8378000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10980 873 10291 96736 122822 122822 1 ELSDIAHR Unmodified 939.47739 0.47739386 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.281 20.281 2 0.0011854 13065 QUIQUE_C1576_190116_001 144.83 77.778 79121000000 7375400000 7896000000 6831400000 6591000000 5800600000 4887400000 6387300000 5745700000 6156800000 1815200000 7829400000 5165700000 6639300000 10981 1851 10292 96737;96738;96739;96740;96741;96742;96743;96744;96745;96746;96747;96748;96749 122823;122824;122825;122826;122827;122828;122829;122830;122831;122832;122833;122834;122835;122836;122837 122830 9 ELSDIALR Unmodified 915.50255 0.50254598 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.23 58.23 2 0.0028106 56508 QUIQUE_C1368_190116_001 134.66 30.552 44091000000 3160300000 3396200000 3907700000 3358200000 3208300000 2869200000 3042700000 4244900000 3654400000 1813300000 3885100000 3692200000 3858600000 10982 1978 10293 96750;96751;96752;96753;96754;96755;96756;96757;96758;96759;96760;96761;96762 122838;122839;122840;122841;122842;122843;122844;122845;122846;122847;122848;122849;122850;122851;122852;122853;122854;122855;122856;122857;122858;122859;122860;122861;122862;122863;122864;122865;122866;122867;122868;122869 122843 32 ELSDLVSICK Unmodified 1162.5904 0.59037471 189 H3BUD4;A0A0A0MT40;Q15111 PLCL1 Phosphoinositide phospholipase C;Inactive phospholipase C-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 109.27 109.27 2 0.012875 111464 QUIQUE_C1563_190116_001 65.465 37.583 104480000 0 23197000 0 0 0 38803000 0 0 42480000 0 0 0 0 10983 189 10294 96763;96764;96765 122870;122871;122872 122871 3 ELSDPAGAIIYTSR Unmodified 1491.7569 0.75692277 1477 O15067;J3KT98 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.063 90.063 2 4.6802E-07 92143 QUIQUE_C1277_190116_001 126.76 54.122 604780000 44217000 60386000 46676000 49005000 51074000 28258000 41045000 59418000 41557000 21714000 63196000 42607000 55623000 10984 1477 10295 96766;96767;96768;96769;96770;96771;96772;96773;96774;96775;96776;96777;96778 122873;122874;122875;122876;122877;122878;122879;122880;122881;122882;122883;122884;122885;122886 122875 12 ELSDQAGSEFENSDVR Unmodified 1781.7704 0.77040058 1521;335 A0A1B0GTF3;K7ELE6;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.635 64.635 2 4.6636E-207 63645 QUIQUE_C1277_190116_001 271.01 258.43 2600700000 329330000 326500000 293520000 271490000 208580000 218930000 282050000 162910000 181840000 129650000 0 195910000 0 10985 335;1521 10296 96779;96780;96781;96782;96783;96784;96785;96786;96787;96788;96789;96790;96791 122887;122888;122889;122890;122891;122892;122893;122894;122895;122896;122897;122898;122899;122900 122888 14 ELSDQATASPIVAR Unmodified 1456.7522 0.75217174 3277 Q5JSH3 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.234 54.234 2 0.00028116 49501 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.685 80.732 1507100000 0 0 370220000 0 0 181930000 215760000 0 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domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 36.921 36.921 2 0.026207 33503 QUIQUE_C1218_190116_001 94.401 53.549 739980000 201220000 0 0 0 0 150320000 184740000 0 203710000 0 0 0 0 10991 3437 10302 96833;96834;96835;96836 122945;122946;122947;122948 122945 4 ELSGLGSALK Unmodified 973.54441 0.5444108 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.495 56.495 2 0.012952 54590 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.404 6.7172 1159000000 165470000 0 0 0 0 134650000 0 109490000 159850000 108010000 193140000 131670000 156760000 10992 2539 10303 96837;96838;96839;96840;96841;96842;96843;96844 122949;122950;122951;122952;122953;122954;122955;122956;122957 122953 8 ELSHLQSENDAAKDEVK Unmodified 1911.9174 0.91739917 2946 Q12840;J3KNA1 KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.442 23.442 3 2.9628E-63 16575 QUIQUE_C1277_190116_001 190.82 169.16 163180000 25029000 20805000 0 36151000 0 0 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3459 10316 96972;96973;96974;96975;96976;96977;96978;96979;96980 123111;123112;123113;123114;123115;123116;123117;123118;123119 123115 7 ELSTLHALLWEVLPQLSK Unmodified 2076.1619 0.16192696 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 162.11 162.11 3 1.0436E-10 169072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.36 97.756 207630000 0 0 0 0 0 0 93575000 48300000 65759000 0 0 0 0 11006 135 10317 96981;96982;96983;96984 123120;123121;123122;123123 123123 2 ELSTTLNADEAVTR Unmodified 1518.7526 0.75256567 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 64.053 64.053 2 3.3062E-10 64034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 131.37 100.8 1749300000 152530000 156690000 121410000 162550000 156800000 138670000 147210000 0 153570000 117920000 141800000 156440000 143760000 11007 2363 10318 96985;96986;96987;96988;96989;96990;96991;96992;96993;96994;96995;96996;96997;96998;96999;97000;97001 123124;123125;123126;123127;123128;123129;123130;123131;123132;123133;123134;123135;123136;123137;123138;123139;123140;123141;123142;123143;123144;123145;123146;123147;123148 123146 25 ELSVMFIETSAK Unmodified 1353.685 0.68500338 4275 Q9NRW1 RAB6B Ras-related protein Rab-6B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.68 107.68 2 2.9925E-06 110008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.98 103.72 1057400000 104370000 104210000 123480000 110890000 92916000 117800000 112020000 91349000 152360000 48035000 0 0 0 11008 4275 10319 97002;97003;97004;97005;97006;97007;97008;97009;97010;97011 123149;123150;123151;123152;123153;123154;123155;123156;123157;123158;123159;123160;123161;123162 123160 13 ELSYMVVSR Unmodified 1082.543 0.54303059 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 2 66.227 66.227 2 0.014665 66304 QUIQUE_C1576_190116_001 68.224 37.999 20726000 0 0 0 0 0 0 20726000 0 0 0 0 0 0 11009 3420 10320 97012;97013 123163;123164 123163 2 ELTADARELK Unmodified 1144.6088 0.60880197 2501 P48059;A0A0M3HER1 LIMS1 LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1 yes no 0 0 1 1 69.905 69.905 3 0.035086 71168 QUIQUE_C1438_190116_001 37.556 1.1745 11275000 0 0 0 0 11275000 0 0 0 0 0 0 0 0 11010 2501 10321 97014 123165 123165 1 ELTAEPTIVAQLCK Unmodified 1571.8229 0.82289384 4028 Q9BU02;G3V5B9 THTPA Thiamine-triphosphatase yes no 0 0 0 1 102.29 102.29 2 0.0033088 99094 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.184 62.33 26744000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26744000 0 0 0 11011 4028 10322 97015 123166 123166 1 ELTAVVQK Unmodified 886.51238 0.51238239 2214 P23396;E9PL09;E9PPU1;F2Z2S8;H0YCJ7;H0YF32;E9PQ96;E9PJH4;E9PK82 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.687 24.687 2 0.036561 18120 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.717 23.499 1523100000 118080000 0 190950000 171290000 147120000 0 167970000 0 164040000 0 215430000 135130000 213080000 11012 2214 10323 97016;97017;97018;97019;97020;97021;97022;97023;97024 123167;123168;123169;123170;123171;123172;123173;123174;123175 123174 7 ELTDEEAER Unmodified 1090.4778 0.47784737 4543 Q9Y266;A0A0A0MSS4;A0A0A0MSU9 NUDC Nuclear migration protein nudC yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.523 20.523 2 0.0019462 13487 QUIQUE_C1576_190116_001 98.458 43.909 1602300000 237410000 0 0 257460000 0 245110000 268430000 121150000 197440000 0 0 0 275270000 11013 4543 10324 97025;97026;97027;97028;97029;97030;97031;97032 123176;123177;123178;123179;123180;123181;123182;123183 123179 7 ELTDEEILASVMIK Unmodified 1589.8222 0.82222514 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 146.25 146.25 2 0.0014426 151331 QUIQUE_C1218_190116_001 78.692 45.463 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11014 3277 10325 97033 123184 123184 1 ELTEEKESAFEFLSSA Unmodified 1815.8414 0.84144026 2430 P40925;B9A041;B8ZZ51 MDH1 Malate dehydrogenase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 2 129.93 129.93 2;3 7.6618E-17 134879 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123193;123194;123195;123196;123197;123198;123199;123200;123201;123202;123203;123204;123205;123206;123207;123208;123209;123210;123211;123212;123213;123214;123215;123216;123217;123218;123219;123220 123215 28 ELTLEKPELK Unmodified 1198.6809 0.68090428 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 48.371 48.371 2;3 0.0021658 47059 QUIQUE_C1218_190116_001 114.51 63.167 833210000 71691000 131330000 115730000 85692000 124470000 37216000 93012000 0 0 23807000 0 70805000 79463000 11018 1472 10329 97056;97057;97058;97059;97060;97061;97062;97063;97064;97065;97066;97067;97068;97069;97070;97071;97072;97073;97074 123221;123222;123223;123224;123225;123226;123227;123228;123229;123230;123231;123232;123233;123234;123235;123236;123237;123238;123239;123240 123223 14 ELTLQDVELLK Unmodified 1299.7286 0.72858275 2962 Q13049 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 123.08 123.08 2 0.0021728 129282 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.986 44.69 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123284;123285;123286;123287;123288;123289;123290;123291;123292;123293;123294;123295;123296;123297 123294 14 ELTSTCSPIISK Unmodified 1334.6752 0.67516697 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 48.537 48.537 2 0.00051585 46398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.297 61.882 231850000 30776000 0 0 0 0 0 0 0 0 71476000 74529000 0 55066000 11024 2363 10335 97122;97123;97124;97125 123298;123299;123300;123301;123302 123301 5 ELTSTCSPIISKPK Unmodified 1559.8229 0.82289384 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 36.3 36.3 2;3 6.2193E-06 32066 QUIQUE_C1576_190116_001 122.51 76.049 1570200000 122290000 191690000 161060000 178730000 317160000 120230000 216600000 18620000 97495000 9761500 54703000 30958000 50915000 11025 2363 10336 97126;97127;97128;97129;97130;97131;97132;97133;97134;97135;97136;97137;97138;97139;97140;97141;97142;97143;97144;97145;97146 123303;123304;123305;123306;123307;123308;123309;123310;123311;123312;123313;123314;123315;123316;123317;123318;123319;123320;123321;123322;123323;123324 123317 22 ELTTEIDNNIEQISSYK Unmodified 1995.9637 0.96368066 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 122.15 122.15 2;3 3.2166E-201 128130 QUIQUE_C1218_190116_001 320.07 293.36 2724100000 197530000 162800000 111080000 177690000 149750000 150140000 160010000 103130000 158050000 525440000 199770000 294310000 334410000 + 11026 776 10337 97147;97148;97149;97150;97151;97152;97153;97154;97155;97156;97157;97158;97159;97160;97161 123325;123326;123327;123328;123329;123330;123331;123332;123333;123334;123335;123336;123337;123338;123339;123340;123341;123342;123343;123344 123325 20 ELTTYEIEEFKK Unmodified 1528.7661 0.76609047 3324 Q5TC84 OGFRL1 Opioid growth factor receptor-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 70.493 70.493 2;3 0.00082938 69445 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.78 84.36 21916000 0 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yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.58 108.58 2 0.00013172 111923 QUIQUE_C1368_190116_001 141.2 95.86 1679100000 110490000 130450000 130370000 128580000 150650000 104300000 136150000 116790000 139990000 81335000 145500000 152950000 151520000 11030 1977 10341 97180;97181;97182;97183;97184;97185;97186;97187;97188;97189;97190;97191;97192;97193 123368;123369;123370;123371;123372;123373;123374;123375;123376;123377;123378;123379;123380;123381;123382 123371 14 ELVASSPEMGQDFDHVTLLR Unmodified 2243.0892 0.089232298 2021 P11277;H0YJE6 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes no 0 0 0 1 1 1 1 113.42 113.42 3 0.015543 117547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.171 17.917 189440000 0 0 53387000 0 55577000 0 0 0 38687000 0 0 41792000 0 11031 2021 10342 97194;97195;97196;97197 123383;123384;123385;123386 123385 4 ELVDDSVNNVR Unmodified 1258.6153 0.61534391 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;A0A3F2YNX8;C9J0F2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.102 47.102 2 3.9678E-08 44800 QUIQUE_C1218_190116_001 182.53 144.97 5151400000 624930000 1138100000 542640000 787540000 980720000 879780000 0 0 0 197670000 0 0 0 11032 150 10343 97198;97199;97200;97201;97202;97203;97204 123387;123388;123389;123390;123391;123392;123393 123387 7 ELVDEEADEAYELLSQAESWQR Unmodified 2609.1769 0.17692091 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 168.81 168.81 2;3 1.003E-05 175102 QUIQUE_C1438_190116_001 94.728 87.526 61707000 0 0 0 0 12350000 0 0 0 0 0 49357000 0 0 11033 130 10344 97205;97206 123394;123395 123394 2 ELVDGAPLWLLK Unmodified 1352.7704 0.77038799 405 A0A286YF37;Q9UK22;R4GNH2 FBXO2 F-box only protein 2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 142.73 142.73 2 0.00050838 149526 QUIQUE_C1218_190116_001 128.36 118.85 19076000000 1228800000 1437500000 1433900000 1335800000 1681000000 2183900000 1747400000 1220100000 1632500000 1013000000 1282300000 1082000000 1798300000 11034 405 10345 97207;97208;97209;97210;97211;97212;97213;97214;97215;97216;97217;97218;97219;97220;97221;97222;97223;97224;97225;97226 123396;123397;123398;123399;123400;123401;123402;123403;123404;123405;123406;123407;123408;123409;123410;123411;123412;123413;123414;123415;123416;123417;123418;123419;123420;123421;123422;123423;123424;123425;123426;123427;123428;123429;123430;123431;123432;123433;123434;123435 123397 38 ELVDYFLNVATAQGR Unmodified 1694.8628 0.86278482 1422 O00754 MAN2B1 Lysosomal alpha-mannosidase;Lysosomal alpha-mannosidase A peptide;Lysosomal alpha-mannosidase B peptide;Lysosomal alpha-mannosidase C peptide;Lysosomal alpha-mannosidase D peptide;Lysosomal alpha-mannosidase E peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 149.17 149.17 2 5.4572E-06 154738 QUIQUE_C1368_190116_001 108.72 88.51 63479000 0 21832000 34888000 0 0 0 0 0 0 6758800 0 0 0 11035 1422 10346 97227;97228;97229 123436;123437;123438 123437 2 ELVEFAQDDDR Unmodified 1335.5943 0.59427411 3078 Q14677 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 66.267 66.267 2 0.00089332 66819 QUIQUE_C1438_190116_001 109.66 79.409 264730000 41437000 38734000 40998000 45610000 39087000 32545000 26318000 0 0 0 0 0 0 11036 3078 10347 97230;97231;97232;97233;97234;97235;97236;97237 123439;123440;123441;123442;123443;123444;123445;123446 123443 7 ELVEFAQDDDRLR Unmodified 1604.7794 0.77944912 3078 Q14677 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes yes 0 0 1 1 71.763 71.763 3 0.052677 71990 QUIQUE_C1277_190116_001 38.366 26.573 23350000 0 23350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11037 3078 10348 97238 123447 123447 1 ELVEIAVPENLVGAILGK Unmodified 1863.0717 0.071714965 4515 Q9UNW9 NOVA2 RNA-binding protein Nova-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.9 167.9 2 4.7838E-11 169803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.35 152.15 750360000 72818000 91951000 86563000 46147000 103550000 30297000 0 146510000 0 26290000 146240000 0 0 11038 4515 10349 97239;97240;97241;97242;97243;97244;97245;97246;97247 123448;123449;123450;123451;123452;123453;123454;123455;123456;123457 123455 10 ELVEPLTPSGEAPNQALLR Unmodified 2033.0793 0.079319539 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.77 106.77 2 6.1607E-08 110173 QUIQUE_C1277_190116_001 129.71 111.57 297800000 19762000 35563000 29628000 0 41104000 0 42594000 0 47036000 0 0 32246000 49867000 11039 1789 10350 97248;97249;97250;97251;97252;97253;97254;97255 123458;123459;123460;123461;123462;123463;123464;123465 123459 8 ELVEPVSR Unmodified 927.50255 0.50254598 2539 P49748;K7EQP4;K7EJW8;J3KS89 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.115 30.115 2 0.007181 24732 QUIQUE_C1368_190116_001 98.997 57.694 1611300000 189320000 0 253320000 145260000 0 177760000 0 0 248920000 0 208590000 169320000 218810000 11040 2539 10351 97256;97257;97258;97259;97260;97261;97262;97263 123466;123467;123468;123469;123470;123471;123472;123473;123474 123467 7 ELVEQDIQPAR Unmodified 1296.6674 0.66737948 4341 Q9NZ94;E7EVK0;A0A087WW27 NLGN3 Neuroligin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.58 48.58 2 0.00044352 46737 QUIQUE_C1438_190116_001 104.17 54.334 296260000 34235000 36322000 39947000 0 35425000 37412000 0 28332000 33061000 18553000 0 32972000 0 11041 4341 10352 97264;97265;97266;97267;97268;97269;97270;97271;97272 123475;123476;123477;123478;123479;123480;123481;123482;123483;123484 123478 6 ELVEVSPLENAIQVVENK Unmodified 2009.0681 0.06808615 3562 Q8IZD9 DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 147.47 147.47 2 1.6642E-17 151499 QUIQUE_C1277_190116_001 135.02 117.85 48345000 25165000 23179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11042 3562 10353 97273;97274 123485;123486 123486 2 ELVFKEDGQEYAQVIK Unmodified 1894.9676 0.96764382 2494 P47813;O14602;A6NJH9 EIF1AX;EIF1AY Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal;Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal yes no 0 0 1 1 1 2 86.209 86.209 2;3 1.1045E-05 88620 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.02 99.999 123520000 0 0 0 0 0 0 0 0 27567000 0 0 0 95955000 11043 2494 10354 97275;97276;97277;97278 123487;123488;123489;123490;123491 123487 5 ELVIAMEELK Unmodified 1173.6315 0.63151124 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4;J3QT38 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 102.05 102.05 2 0.032885 105372 QUIQUE_C1218_190116_001 63.227 40.991 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11044 318 10355 97279 123492 123492 1 ELVLALYDYQEK Unmodified 1482.7606 0.76061116 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.31 116.31 2 6.2627E-05 113744 QUIQUE_DMIX4_190116_001 148.56 111.01 6708300000 669230000 692750000 716440000 673070000 672270000 648970000 636870000 223860000 419490000 459070000 267150000 320680000 308460000 11045 267;275;3025 10356 97280;97281;97282;97283;97284;97285;97286;97287;97288;97289;97290;97291;97292;97293 123493;123494;123495;123496;123497;123498;123499;123500;123501;123502;123503;123504;123505;123506;123507;123508;123509;123510;123511;123512;123513;123514;123515 123509 23 ELVLDNCK Unmodified 989.48518 0.48518136 3749 Q92688 ANP32B Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B yes yes 0 0 0 1 1 1 33.342 33.342 2 0.027083 28240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.998 37.528 92668000 0 0 0 0 0 0 0 59810000 0 32857000 0 0 0 11046 3749 10357 97294;97295;97296 123516;123517;123518 123516 3 ELVLDNSR Unmodified 944.49271 0.49270958 1170 H0YN26;P39687;H7BZ09 ANP32A Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A yes no 0 0 0 1 1 1 32.706 32.706 2 0.024002 27731 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.789 36.202 710010000 0 306450000 0 0 0 0 0 0 306340000 97218000 0 0 0 11047 1170 10358 97297;97298;97299 123519;123520;123521 123520 2 ELVLLLLQWMR Unmodified 1412.8214 0.8213777 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 171.94 171.94 2 4.25E-05 175777 QUIQUE_DMIX7_190116_001 163.99 118.85 80345000 0 0 0 0 0 0 0 0 15209000 0 25672000 39465000 0 11048 3117 10359 97300;97301;97302 123522;123523;123524 123524 3 ELVLNGADTAVNK Unmodified 1342.7092 0.70924429 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 57.216 57.216 2 0.0029168 55275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.05 66.697 32570000 0 0 0 0 0 0 0 32570000 0 0 0 0 0 11049 3270 10360 97303 123525 123525 1 ELVLQGADINLQR Unmodified 1467.8045 0.80454166 3607 Q8N6D5;K7EL63 ANKRD29 Ankyrin repeat domain-containing protein 29 yes no 0 0 0 1 1 1 96.294 96.294 2 0.00068419 99115 QUIQUE_C1277_190116_001 85.958 37.162 68092000 0 36690000 31402000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11050 3607 10361 97304;97305;97306 123526;123527;123528 123526 2 ELVNNLAEIYGR Unmodified 1389.7252 0.72522871 4352 Q9NZN3 EHD3 EH domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 104.47 104.47 2 6.4439E-08 107554 QUIQUE_DMIX8_190116_001 150.08 113.74 511030000 0 0 0 0 308010000 0 203010000 0 0 0 0 0 0 11051 4352 10362 97307;97308;97309;97310;97311 123529;123530;123531;123532;123533;123534 123534 6 ELVNNLGEIYQK Unmodified 1418.7405 0.74054442 4175 Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.066 85.066 2 0.00024465 88053 QUIQUE_C1438_190116_001 117.31 69.028 1021500000 0 0 0 160640000 130950000 0 118170000 105290000 93522000 0 140780000 132560000 139560000 11052 4175 10363 97312;97313;97314;97315;97316;97317;97318;97319 123535;123536;123537;123538;123539;123540;123541;123542 123536 5 ELVPEVPEEQGSK Unmodified 1439.7144 0.71438925 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.864 62.864 2 2.6932E-06 62753 QUIQUE_C1218_190116_001 128.44 86.157 564910000 105610000 99628000 0 101380000 76927000 99651000 0 51073000 0 30642000 0 0 0 11053 921 10364 97320;97321;97322;97323;97324;97325;97326;97327 123543;123544;123545;123546;123547;123548;123549;123550 123543 8 ELVPEVPEEQGSKDR Unmodified 1710.8424 0.84244331 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 2 1 49.035 49.035 2;3 0.0042299 46289 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.46 42.107 227100000 0 0 0 0 0 0 0 127190000 0 0 0 0 99915000 11054 921 10365 97328;97329;97330 123551;123552;123553 123551 3 ELVQVQTLMDNMTLER Unmodified 1918.9492 0.94923334 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 142.22 142.22 2 0.0089094 146934 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.82 84.189 51241000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51241000 0 11055 3108 10366 97331 123554 123554 0 ELVSCSNCTDYQAR Unmodified 1701.7087 0.70866872 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.769 41.769 2 1.5542E-36 37848 QUIQUE_C1563_190116_001 215.56 191.22 1193700000 108310000 145150000 101200000 124510000 126440000 131660000 119970000 39549000 42300000 22437000 84081000 66333000 81800000 11056 2534 10367 97332;97333;97334;97335;97336;97337;97338;97339;97340;97341;97342;97343;97344 123555;123556;123557;123558;123559;123560;123561;123562;123563;123564;123565;123566;123567;123568 123560 14 ELVSDANQHVK Unmodified 1238.6255 0.62551466 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 1 17.66 17.66 2;3 2.6046E-12 9920 QUIQUE_C1277_190116_001 161.02 109.23 8263000000 1203800000 912190000 292610000 418670000 947690000 545790000 504410000 839220000 375020000 362240000 984350000 447430000 429530000 11057 2309 10368 97345;97346;97347;97348;97349;97350;97351;97352;97353;97354;97355;97356;97357;97358;97359;97360;97361;97362;97363 123569;123570;123571;123572;123573;123574;123575;123576;123577;123578;123579;123580;123581;123582;123583;123584;123585;123586;123587;123588 123572 19 ELVSLTDQESEEHYHLTEALK Unmodified 2470.1864 0.18636339 955 E9PKT1;Q8IVF5;E9PMZ8 TIAM2 T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 2 yes no 0 0 0 1 87.427 87.427 3 0.0064796 90869 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.808 34.959 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11058 955 10369 97364 123589 123589 1 ELVTGTLWNLSSYEPLK Unmodified 1949.0146 0.014594017 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.26 150.26 2 1.3773E-12 155604 QUIQUE_C1368_190116_001 125.53 96.721 505650000 0 46471000 52384000 56028000 77632000 26408000 53591000 0 60594000 21948000 0 57289000 53306000 11059 730 10370 97365;97366;97367;97368;97369;97370;97371;97372;97373;97374;97375 123590;123591;123592;123593;123594;123595;123596;123597;123598;123599;123600 123591 10 ELVTGVLWNLSSCDALK Unmodified 1903.9713 0.97134899 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 148.08 148.08 2;3 1.8176E-16 151953 QUIQUE_C1277_190116_001 131.26 99.828 685800000 134980000 141830000 0 221510000 0 82016000 0 0 0 46393000 59066000 0 0 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123718;123719;123720;123721;123722;123723;123724;123725;123726;123727;123728;123729;123730;123731;123732;123733;123734;123735;123736;123737;123738;123739;123740;123741;123742;123743;123744;123745 123743 28 ELWFSDDPNVTK Unmodified 1449.6776 0.67760981 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 101.31 101.31 2 0.016566 105872 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.862 45.776 310520000 0 0 0 0 0 0 0 0 99657000 60669000 150190000 0 0 11068 1756 10379 97478;97479;97480;97481 123746;123747;123748;123749 123749 3 ELWLVIHGR Unmodified 1121.6346 0.63456321 1263 J3KNF8;H3BUX2;O43169;D6RFH4;J3QR91 CYB5B Cytochrome b5 type B yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 79.403 79.403 2;3 0.0055954 80725 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.285 70.391 1199400000 41203000 36073000 103980000 90769000 46444000 89462000 127090000 35078000 144910000 46980000 188460000 136860000 112100000 11069 1263 10380 97482;97483;97484;97485;97486;97487;97488;97489;97490;97491;97492;97493;97494;97495;97496;97497;97498;97499;97500;97501;97502;97503 123750;123751;123752;123753;123754;123755;123756;123757;123758;123759;123760;123761;123762;123763;123764;123765;123766;123767;123768;123769;123770;123771;123772 123767 22 ELWTWLEELQK Unmodified 1473.7504 0.75038083 1674 O75962;E7EWP2;E7EPJ7;F5H228 TRIO Triple functional domain protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 158.94 158.94 2 0.001374 163890 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.65 73.442 30226000 0 0 16979000 0 0 0 0 0 13247000 0 0 0 0 11070 1674 10381 97504;97505;97506;97507 123773;123774;123775;123776 123776 4 ELWVIDEK Unmodified 1030.5335 0.53351176 3169 Q16134;D6RAD5 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.194 89.194 2 0.015148 92194 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.064 52.223 244430000 36677000 0 43769000 0 0 0 0 0 0 22125000 55273000 48391000 38190000 11071 3169 10382 97508;97509;97510;97511;97512;97513 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10400 97666;97667;97668;97669;97670;97671 123964;123965;123966;123967;123968;123969 123964 6 EMAHGSQEAEAPGAVAGAAEVPR Oxidation (M) 2250.0335 0.033508333 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 47.366 47.366 3 9.7332E-09 44054 QUIQUE_C1277_190116_001 83.064 79.425 50891000 0 31273000 0 0 0 0 0 0 0 19618000 0 0 0 11092 3532 10401 97672;97673 123970;123971 123970 2682 2 EMAHGSQEAEAPGAVAGAAEVPR Unmodified 2234.0386 0.038593711 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 52.542 52.542 3 7.0331E-06 49851 QUIQUE_C1563_190116_001 57.152 47.889 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11093 3532 10401 97674 123972 123972 1 EMALLATSLPEGIMVK Unmodified 1701.9045 0.90451498 4094 Q9C0C9;K7ES11 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 0 1 1 1 140.17 140.17 2 0.00057773 145727 QUIQUE_C1218_190116_001 76.522 61.491 63478000 38888000 0 0 0 0 24590000 0 0 0 0 0 0 0 11094 4094 10402 97675;97676;97677 123973;123974;123975 123973 3 EMANLRPEGR Unmodified 1171.5768 0.57679033 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 20.198 20.198 3 0.032446 12889 QUIQUE_C1277_190116_001 50.292 37.201 32959000 0 32959000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11095 3102 10403 97678 123976 123976 1 EMDEAATAEER Unmodified 1250.5085 0.50849557 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 22.916 22.916 2 0.010536 16242 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.201 50.354 78540000 0 0 0 26152000 0 20435000 0 0 0 0 0 0 31953000 11096 922 10404 97679;97680;97681 123977;123978;123979;123980 123980 4 EMDEQIR Unmodified 919.40693 0.40693104 63;3271;1260 J3KN67;Q5HYB6;A0A087WWU8 TPM3;DKFZp686J1372 no no 0 0 0 1 1 1 1 20.987 20.987 2 0.042144 14479 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.381 36.408 560400000 0 0 220340000 0 133300000 0 0 97989000 0 0 0 0 108770000 11097 1260;3271;63 10405 97682;97683;97684;97685 123981;123982;123983;123984 123983 4 EMDPFHYDYQTLR Oxidation (M) 1729.7406 0.74062078 4122 Q9H0Q3;J3QKN1;E9PJ02;E9PHZ3;A0A0A6YYL5;A0A087WZ82 FXYD6;FXYD6-FXYD2 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 84.256 84.256 2;3 0.0010531 86227 QUIQUE_C1576_190116_001 70.332 61.735 488550000 52695000 67101000 56824000 0 47550000 45382000 86396000 0 34826000 20890000 36606000 0 40281000 11098 4122 10406 97686;97687;97688;97689;97690;97691;97692;97693;97694;97695;97696 123985;123986;123987;123988;123989;123990;123991;123992;123993;123994;123995;123996;123997 123990 2865 13 EMDPFHYDYQTLR Unmodified 1713.7457 0.74570615 4122 Q9H0Q3;J3QKN1;E9PJ02;E9PHZ3;A0A0A6YYL5;A0A087WZ82 FXYD6;FXYD6-FXYD2 FXYD domain-containing ion transport regulator 6 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 98.682 98.682 2;3 5.1281E-05 102346 QUIQUE_C1218_190116_001 115.57 109.91 1212500000 155050000 122320000 132520000 104840000 85917000 100910000 205080000 52088000 0 25380000 87064000 60873000 80492000 11099 4122 10406 97697;97698;97699;97700;97701;97702;97703;97704;97705;97706;97707;97708;97709;97710;97711 123998;123999;124000;124001;124002;124003;124004;124005;124006;124007;124008;124009;124010;124011;124012 123998 14 EMDPVTQLYTMTSTLEYK Unmodified 2148.9959 0.99590876 3023 Q13740;F5GXJ9;H7C543 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 159.09 159.09 2 4.5191E-05 166500 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.73 103.57 261870000 0 0 0 69624000 63727000 0 40541000 0 0 0 49929000 38051000 0 11100 3023 10407 97712;97713;97714;97715;97716 124013;124014;124015;124016;124017 124016 3 EMDQTMAANAQK Oxidation (M) 1352.57 0.57004997 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 3 2 1 1 1 1 14 14 2 0.00016908 6086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.15 90.993 240510000 43884000 11670000 13778000 9240400 8188800 40374000 0 50597000 28351000 6508100 9275200 0 18638000 11101 2306 10408 97717;97718;97719;97720;97721;97722;97723;97724;97725;97726;97727;97728;97729;97730;97731 124018;124019;124020;124021;124022;124023;124024;124025;124026;124027;124028;124029;124030;124031;124032 124027 1690;1691 15 EMDQTMAANAQK Unmodified 1336.5751 0.57513535 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.663 23.663 2 4.132E-20 17198 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.99 122.89 1088300000 126070000 115450000 75640000 100930000 59779000 83909000 80873000 122130000 96947000 32717000 105450000 0 88418000 11102 2306 10408 97732;97733;97734;97735;97736;97737;97738;97739;97740;97741;97742;97743;97744 124033;124034;124035;124036;124037;124038;124039;124040;124041;124042;124043;124044;124045;124046 124042 13 EMDRETLIDVAR Unmodified 1446.7137 0.71367774 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.093 64.093 2;3 0.0050238 63285 QUIQUE_C1368_190116_001 77.674 62.337 718760000 0 0 105560000 96088000 0 52013000 0 144230000 0 22345000 0 148690000 149830000 11103 2424 10409 97745;97746;97747;97748;97749;97750;97751;97752 124047;124048;124049;124050;124051;124052;124053;124054;124055 124047 7 EMDRETLIDVAR Oxidation (M) 1462.7086 0.70859237 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 1 1 1 50.213 50.213 3 0.021799 45140 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.555 30.899 25854000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25854000 0 0 0 11104 2424 10409 97753 124056 124056 1 EMDSDIETMQQTIEDLEVASDPLYVPDPDPTKFPVNR Unmodified 4233.961 0.96098641 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 1 2 170.51 170.51 3;4 2.2436E-06 172316 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.693 47.166 33040000 0 0 0 0 0 0 0 33040000 0 0 0 0 0 11105 4475 10410 97754;97755 124057;124058 124058 2 EMEAELEDER Unmodified 1249.5132 0.5132466 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 44.858 44.858 2 0.017866 41544 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.465 56.678 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11106 2378 10411 97756;97757 124059;124060 124060 2 EMEAELEDERK Unmodified 1377.6082 0.60820962 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 27.36 27.36 2;3 0.0090522 21818 QUIQUE_C1576_190116_001 76.943 34.834 30335000 0 0 30335000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11107 2378 10412 97758;97759;97760 124061;124062;124063 124063 3 EMEAELEDERK Oxidation (M) 1393.6031 0.60312424 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 1 1 1 16.198 16.198 3 0.026798 8380 QUIQUE_C1403_190116_001 41.242 34.806 28772000 0 0 0 28772000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11108 2378 10412 97761 124064 124064 1 EMEEATASAQR Unmodified 1221.5296 0.52956537 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 17.458 17.458 2 0.0023613 9638 QUIQUE_C1277_190116_001 78.816 63.174 99217000 0 22946000 0 0 0 19102000 0 0 0 0 18681000 10596000 27892000 11109 4378 10413 97762;97763;97764;97765;97766 124065;124066;124067;124068;124069 124065 4 EMEELIPLVNR Unmodified 1341.6962 0.69623677 4528;840 E5RHK8;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 111 111 2 0.015314 114931 QUIQUE_C1218_190116_001 76.827 57.04 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11110 840;4528 10414 97767 124070 124070 1 EMEENFAVEAANYQDTIGR Oxidation (M) 2201.9535 0.95352668 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 1 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 3 2 2 106.48 106.48 2;3 0 111184 QUIQUE_C1218_190116_001 291.51 286.66 12321000000 730020000 912970000 1449400000 1283700000 983410000 1158700000 792800000 830620000 886010000 766400000 925100000 853760000 748100000 11111 1952 10415 97768;97769;97770;97771;97772;97773;97774;97775;97776;97777;97778;97779;97780;97781;97782;97783;97784;97785;97786;97787;97788;97789;97790;97791;97792;97793;97794;97795 124071;124072;124073;124074;124075;124076;124077;124078;124079;124080;124081;124082;124083;124084;124085;124086;124087;124088;124089;124090;124091;124092;124093;124094;124095;124096;124097;124098;124099;124100;124101;124102;124103;124104;124105;124106;124107;124108;124109;124110;124111;124112;124113;124114;124115;124116;124117;124118;124119;124120;124121 124072 1197 51 EMEENFAVEAANYQDTIGR Unmodified 2185.9586 0.95861206 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 0 5 2 6 6 4 5 4 5 6 4 9 6 5 118.34 118.34 2;3 1.81E-195 121418 QUIQUE_C1368_190116_001 323.66 318.16 27573000000 1959500000 748920000 2581000000 3490000000 1802100000 2602800000 703370000 2610300000 2717200000 1246400000 2660400000 2139900000 2310500000 11112 1952 10415 97796;97797;97798;97799;97800;97801;97802;97803;97804;97805;97806;97807;97808;97809;97810;97811;97812;97813;97814;97815;97816;97817;97818;97819;97820;97821;97822;97823;97824;97825;97826;97827;97828;97829;97830;97831;97832;97833;97834;97835;97836;97837;97838;97839;97840;97841;97842;97843;97844;97845;97846;97847;97848;97849;97850;97851;97852;97853;97854;97855;97856;97857;97858;97859;97860;97861;97862 124122;124123;124124;124125;124126;124127;124128;124129;124130;124131;124132;124133;124134;124135;124136;124137;124138;124139;124140;124141;124142;124143;124144;124145;124146;124147;124148;124149;124150;124151;124152;124153;124154;124155;124156;124157;124158;124159;124160;124161;124162;124163;124164;124165;124166;124167;124168;124169;124170;124171;124172;124173;124174;124175;124176;124177;124178;124179;124180;124181;124182;124183;124184;124185;124186;124187;124188;124189;124190;124191;124192;124193;124194;124195;124196;124197;124198;124199;124200;124201;124202;124203;124204;124205;124206;124207;124208;124209;124210;124211;124212;124213;124214;124215;124216;124217;124218;124219;124220;124221;124222;124223;124224;124225;124226;124227;124228;124229;124230;124231;124232;124233;124234;124235;124236;124237;124238;124239;124240;124241;124242;124243;124244;124245;124246;124247;124248;124249;124250;124251;124252 124138 128 EMELELAQTK Unmodified 1190.5853 0.58528933 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 no no 0 0 0 1 1 63.019 63.019 2 0.015727 63543 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.184 37.625 150300000 0 0 0 0 71237000 0 0 0 0 0 79062000 0 0 11113 4596 10416 97863;97864 124253;124254 124254 2 EMELPAK Unmodified 816.40514 0.40514012 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 28.812 28.812 2 0.044362 22595 QUIQUE_C1368_190116_001 79.454 40.235 239400000 0 91153000 92571000 0 0 0 55675000 0 0 0 0 0 0 11114 3117 10417 97865;97866;97867 124255;124256;124257 124256 3 EMENMYIEELK Unmodified 1427.6313 0.63125325 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 95.445 95.445 2 0.0047842 97717 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.552 62.396 198430000 0 0 41543000 0 0 0 0 42080000 0 0 0 50209000 64594000 11115 981;4494 10418 97868;97869;97870;97871;97872;97873 124258;124259;124260;124261;124262;124263 124263 5 EMEQLFSQYGR Unmodified 1386.6238 0.6238001 3073 Q14576 ELAVL3 ELAV-like protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 92.312 92.312 2 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4636 Q9Y5X3;Q5QPE5;Q5QPE4 SNX5 Sorting nexin-5 yes no 0 0 0 1 1 112.15 112.15 2 0.01927 114873 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.616 55.092 45449000 26624000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18825000 0 11119 4636 10422 97889;97890 124280;124281 124281 2 EMFGSGTACVVCPVSDILYK Unmodified 2232.0265 0.026497386 2644 P54687 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.25 137.25 2 2.5769E-09 141537 QUIQUE_C1277_190116_001 143.93 129.36 324040000 40995000 68439000 44459000 38008000 34999000 42644000 0 0 0 0 54498000 0 0 11120 2644 10423 97891;97892;97893;97894;97895;97896;97897;97898 124282;124283;124284;124285;124286;124287;124288;124289;124290 124283 9 EMFNYAR Unmodified 929.40654 0.40653711 124 A0A087X2I1;P62333;H0YJC0;H0YJS8;H0YJX2 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.547 46.547 2 0.043095 43394 QUIQUE_C1403_190116_001 80.555 49.886 268090000 0 0 0 42748000 0 0 38283000 57954000 0 18667000 58697000 0 51743000 11121 124 10424 97899;97900;97901;97902;97903;97904 124291;124292;124293;124294;124295;124296;124297;124298 124291 8 EMGEAFAADIPR Unmodified 1305.6023 0.60233638 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 92.493 92.493 2 0.027375 95471 QUIQUE_C1218_190116_001 56.043 41.925 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11122 1749 10425 97905;97906 124299;124300 124299 2 EMGGHHIVALCVLK Unmodified 1562.8061 0.80613834 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 53.997 53.997 2;3;4 5.8254E-72 53274 QUIQUE_C1218_190116_001 212.21 170.67 1035600000 79242000 279830000 85750000 64056000 59959000 32489000 79256000 37319000 135570000 0 82835000 63449000 35880000 11123 1787 10426 97907;97908;97909;97910;97911;97912;97913;97914;97915;97916;97917;97918;97919;97920;97921;97922;97923;97924;97925;97926;97927;97928;97929 124301;124302;124303;124304;124305;124306;124307;124308;124309;124310;124311;124312;124313;124314;124315;124316;124317;124318;124319;124320;124321;124322;124323;124324;124325;124326 124303 25 EMGIIPSWGGTTR Unmodified 1403.6867 0.68673471 4294 Q9NTX5;H0Y5L2;H0YCS9 ECHDC1 Ethylmalonyl-CoA decarboxylase yes no 0 0 0 1 104.95 104.95 2 0.066048 106899 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.765 42.67 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11124 4294 10427 97930 124327 124327 1 EMGTPLADTPTRPVTR Oxidation (M) 1756.8778 0.87778296 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.451 36.451 3 2.225E-09 32393 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.48 113.99 3211100000 221280000 221440000 190420000 193230000 349770000 162060000 186310000 179260000 371840000 131610000 440500000 317900000 245440000 11125 3984 10428 97931;97932;97933;97934;97935;97936;97937;97938;97939;97940;97941;97942;97943 124328;124329;124330;124331;124332;124333;124334;124335;124336;124337;124338;124339;124340 124336 2822 12 EMGTPLADTPTRPVTR Unmodified 1740.8829 0.88286834 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 48.667 48.667 2;3 7.6104E-19 46369 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.34 135.07 3180600000 370220000 540070000 406560000 72035000 386520000 43531000 74761000 146090000 308250000 63548000 455390000 272380000 41275000 11126 3984 10428 97944;97945;97946;97947;97948;97949;97950;97951;97952;97953;97954;97955;97956;97957;97958;97959;97960;97961;97962;97963;97964 124341;124342;124343;124344;124345;124346;124347;124348;124349;124350;124351;124352;124353;124354;124355;124356;124357;124358;124359;124360;124361;124362;124363;124364 124361 24 EMIDKWEDR Unmodified 1220.5496 0.54957253 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 44.064 44.064 2;3 0.0005855 41627 QUIQUE_C1218_190116_001 144.5 116.63 450850000 201250000 0 0 0 0 74555000 112690000 0 0 0 62349000 0 0 11127 2851 10429 97965;97966;97967;97968;97969 124365;124366;124367;124368;124369;124370;124371 124366 6 EMIDKWEDR Oxidation (M) 1236.5445 0.54448715 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 1 1 29.038 29.038 2;3 0.01673 23107 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 71.257 232060000 75033000 0 0 0 0 0 43688000 0 0 113340000 0 0 0 11128 2851 10429 97970;97971;97972 124372;124373;124374 124374 2292 1 EMIDKWEDRWEWLR Oxidation (M) 2006.9309 0.93088116 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 106.7 106.7 3;4 2.2249E-07 109958 QUIQUE_C1368_190116_001 126.63 118.27 3532200000 28002000 76413000 107650000 98775000 66706000 43472000 197280000 268980000 462130000 33898000 853750000 913420000 381780000 11129 2851 10430 97973;97974;97975;97976;97977;97978;97979;97980;97981;97982;97983;97984;97985;97986;97987;97988 124375;124376;124377;124378;124379;124380;124381;124382;124383;124384;124385;124386;124387;124388;124389;124390;124391;124392;124393;124394;124395;124396;124397;124398;124399 124378 2292 25 EMIDKWEDRWEWLR Unmodified 1990.936 0.93596654 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 117.85 117.85 3;4 5.4502E-05 123055 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.494 89.225 1132000000 0 0 50278000 22912000 0 0 118060000 98642000 158370000 0 267190000 234950000 181610000 11130 2851 10430 97989;97990;97991;97992;97993;97994;97995;97996;97997;97998;97999;98000;98001;98002;98003 124400;124401;124402;124403;124404;124405;124406;124407;124408;124409;124410;124411;124412;124413;124414;124415 124410 15 EMIFEDTNLK Unmodified 1238.5853 0.58528933 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 0 1 83.551 83.551 2 0.044328 84620 QUIQUE_C1403_190116_001 49.715 28.018 18500000 0 0 0 18500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11131 2133 10431 98004 124416 124416 1 EMIFEVLAPLAENDAIK Oxidation (M) 1917.9758 0.97576567 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 148.18 148.18 2;3 1.8623E-16 144161 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.47 103.17 504940000 66906000 11524000 49762000 49052000 77650000 38858000 56529000 58188000 0 23082000 73389000 0 0 11132 2605 10432 98005;98006;98007;98008;98009;98010;98011;98012;98013;98014;98015;98016;98017;98018;98019 124417;124418;124419;124420;124421;124422;124423;124424;124425;124426;124427;124428;124429;124430;124431;124432 124430 2062 16 EMIFEVLAPLAENDAIK Unmodified 1901.9809 0.98085105 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 160.02 160.02 2;3 7.2791E-54 162274 QUIQUE_C1563_190116_001 186.17 157.88 5539800000 304090000 456980000 455940000 337620000 499880000 391380000 554620000 344220000 473980000 184040000 528780000 469140000 539170000 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98047;98048;98049;98050;98051;98052;98053;98054;98055;98056 124465;124466;124467;124468;124469;124470;124471;124472;124473;124474;124475;124476 124470 10 EMIPFAVVGSDHEYQVNGK Unmodified 2119.0044 0.004440036 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 0 1 100.86 100.86 3 0.00012386 102522 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.784 47.917 73035000 0 0 0 0 0 0 0 73035000 0 0 0 0 0 11136 4432 10435 98057 124477 124477 1 EMIQLPGARPILDPVDFLGLQDK Unmodified 2564.3672 0.36724506 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 158.59 158.59 3 2.603E-05 161146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.802 55.078 153940000 0 0 0 0 0 0 0 51705000 32613000 0 0 38076000 31547000 11137 2198 10436 98058;98059;98060;98061 124478;124479;124480;124481 124478 3 EMITLLVAK Unmodified 1016.594 0.59400353 4494;981 F1T0E5;H7C538;H7C4K9;A0A0C4DGY2;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 93.126 93.126 2 0.046417 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cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 1 0 2 2 2 1 1 1 2 2 2 2 1 1 62.876 62.876 2 0.00041402 59945 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.4 104.75 656210000 35423000 46642000 94791000 54435000 0 41304000 0 44083000 51007000 69299000 115950000 40065000 63208000 11150 2857;3307 10447 98130;98131;98132;98133;98134;98135;98136;98137;98138;98139;98140;98141;98142;98143;98144;98145;98146;98147;98148 124579;124580;124581;124582;124583;124584;124585;124586;124587;124588;124589;124590;124591;124592;124593;124594;124595;124596;124597;124598;124599 124594 2326;2327 20 EMNDAAMFYTNR Unmodified 1461.6017 0.60168445 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 78.289 78.289 2 0.00071589 75255 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.548 72.112 651430000 0 0 0 0 0 0 0 213700000 171460000 74757000 0 191510000 0 11151 2857;3307 10447 98149;98150;98151;98152 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42.051 2;3 0.0010778 38333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.804 78.172 159570000 0 0 0 0 0 0 0 159570000 0 0 0 0 0 11158 2201 10451 98204;98205 124665;124666 124665 1558 2 EMNIQQLTNYRK Unmodified 1536.7719 0.77186132 2201 P22676;H3BN14 CALB2 Calretinin yes no 0 0 1 2 1 1 1 64.759 64.759 2;3 6.155E-07 64186 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.84 119.79 413960000 0 0 0 0 0 0 0 321520000 55513000 0 0 36933000 0 11159 2201 10451 98206;98207;98208;98209;98210 124667;124668;124669;124670;124671;124672 124669 6 EMNPALGIDCLHK Unmodified 1496.7116 0.71156925 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 67.73 67.73 2;3 7.6059E-10 67500 QUIQUE_C1277_190116_001 143.24 117.85 2214500000 265470000 333440000 239470000 0 179000000 152160000 257340000 40573000 175620000 66686000 204390000 134620000 165740000 11160 2514 10452 98211;98212;98213;98214;98215;98216;98217;98218;98219;98220;98221;98222;98223;98224;98225;98226;98227;98228;98229 124673;124674;124675;124676;124677;124678;124679;124680;124681;124682;124683;124684;124685;124686;124687;124688;124689;124690;124691;124692;124693 124677 17 EMNPALGIDCLHK Oxidation (M) 1512.7065 0.70648388 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 1 0 1 1 1 54.672 54.672 2;3 0.015903 53211 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.125 27.136 130190000 0 0 0 0 0 0 0 0 65508000 0 64679000 0 0 11161 2514 10452 98230;98231;98232 124694;124695;124696 124695 2 EMQDAFQNAYMELGGLGER Unmodified 2157.9459 0.94593888 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 146.12 146.12 2 1.8997E-16 150340 QUIQUE_C1403_190116_001 155.98 137.84 154700000 0 33337000 50736000 49261000 0 21363000 0 0 0 0 0 0 0 11162 590 10453 98233;98234;98235;98236 124697;124698;124699;124700 124699 4 EMQDVDLAEVKPLVEK Unmodified 1841.9445 0.94446554 3737 Q92597;E5RIR1;E5RGM5;E5RIV1;E5RIM2;E5RI76;E5RH82;E5RK17;E5RJ98 NDRG1 Protein NDRG1 yes no 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19.099 2 6.0797E-05 12126 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.37 119.37 4207700000 322570000 359310000 451430000 271850000 215480000 346520000 383200000 279790000 323510000 95427000 445510000 341880000 371180000 11166 2337 10456 98244;98245;98246;98247;98248;98249;98250;98251;98252;98253;98254;98255;98256 124708;124709;124710;124711;124712;124713;124714;124715;124716;124717;124718;124719;124720 124715 13 EMQEVETNLQEVVFDYLHATAYQNTALGR Unmodified 3368.5983 0.59832022 1636 O75439;G3V0E4 PMPCB Mitochondrial-processing peptidase subunit beta yes no 0 0 0 1 167.64 167.64 3 1.2822E-19 172772 QUIQUE_C1368_190116_001 90.388 85.176 40275000 0 0 40275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11167 1636 10457 98257 124721 124721 1 EMQNLSFQDCYSSK Oxidation (M) 1751.7131 0.7130854 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.831 60.831 2 5.4425E-58 56939 QUIQUE_DMIX4_190116_001 197.3 180.67 541840000 54252000 46554000 64929000 36038000 28627000 43398000 31894000 20212000 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beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein zeta/delta no no 0 1 0 1 2 1 1 14.413 14.413 2;3 0.0082755 6016 QUIQUE_C1277_190116_001 56.258 48.333 172700000 55594000 69823000 0 0 0 0 0 0 39155000 0 0 8130900 0 11170 2262;2341;2780 10459 98284;98285;98286;98287;98288 124751;124752;124753;124754;124755 124753 1630 5 EMQPTHPIR Unmodified 1107.5495 0.54951295 2780;2341;2262 P27348;P31946;P63104;E7EX29;B0AZS6;B7Z2E6;H0YB80 YWHAQ;YWHAB;YWHAZ 14-3-3 protein theta;14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein zeta/delta no no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 15.053 15.053 2;3 0.0039205 6620 QUIQUE_C1277_190116_001 59.35 43.147 34096000000 3492600000 6077600000 296790000 4168400000 809130000 5037600000 818180000 3322000000 3641200000 300660000 310920000 4339000000 1481600000 11171 2262;2341;2780 10459 98289;98290;98291;98292;98293;98294;98295;98296;98297;98298;98299;98300;98301;98302;98303;98304;98305;98306;98307;98308;98309;98310 124756;124757;124758;124759;124760;124761;124762;124763;124764;124765;124766;124767;124768;124769;124770;124771;124772;124773;124774;124775;124776;124777;124778;124779;124780 124759 25 EMQYFMQQWTGTNK Unmodified 1790.7756 0.77562607 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.87 112.87 2 9.8374E-133 117375 QUIQUE_C1576_190116_001 250.7 236.88 1792900000 102770000 122220000 154400000 73943000 128340000 98826000 195450000 127300000 140270000 58845000 239700000 165440000 185380000 11172 2483 10460 98311;98312;98313;98314;98315;98316;98317;98318;98319;98320;98321;98322;98323 124781;124782;124783;124784;124785;124786;124787;124788;124789;124790;124791;124792;124793;124794;124795;124796;124797;124798;124799 124789 19 EMQYFMQQWTGTNK Oxidation (M) 1806.7705 0.7705407 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 1 0 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 92.078 92.078 2 3.8396E-170 97504 QUIQUE_DMIX3_190116_001 262.54 252.88 2088500000 0 165340000 169770000 39703000 38860000 92547000 151690000 150430000 378970000 35087000 401720000 115130000 349240000 11173 2483 10460 98324;98325;98326;98327;98328;98329;98330;98331;98332;98333;98334;98335;98336;98337;98338;98339;98340;98341;98342;98343 124800;124801;124802;124803;124804;124805;124806;124807;124808;124809;124810;124811;124812;124813;124814;124815;124816;124817;124818;124819;124820;124821 124815 1909;1910 22 EMQYFMQQWTGTNK 2 Oxidation (M) 1822.7655 0.76545532 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 71.768 71.768 2 0.00036601 71838 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.64 89.378 98867000 0 0 0 0 0 0 0 15325000 33965000 0 0 22211000 27366000 11174 2483 10460 98344;98345;98346;98347 124822;124823;124824;124825 124825 1909;1910 3 EMQYFMQQWTGTNKDK Unmodified 2033.8975 0.89753212 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 1 1 92.334 92.334 3 0.0024433 93324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.421 49.891 25791000 0 0 0 0 0 0 0 25791000 0 0 0 0 0 11175 2483 10461 98348 124826 124826 1 EMRDELHVR Unmodified 1183.5768 0.57679033 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 1 1 1 20.033 20.033 3 0.030693 13419 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.161 37.16 75913000 0 0 0 0 0 0 0 28200000 0 0 47714000 0 0 11176 1692 10462 98349;98350 124827;124828 124827 1 EMSCIAEDVIIVTSSLTK Unmodified 1994.9904 0.99042946 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 1 1 168.27 168.27 2;3 3.7672E-11 171914 QUIQUE_C1277_190116_001 86.367 81.157 375090000 20883000 55666000 52559000 39660000 68439000 56983000 27014000 25043000 0 8537400 0 0 20311000 11177 4645 10463 98351;98352;98353;98354;98355;98356;98357;98358;98359;98360;98361;98362;98363;98364 124829;124830;124831;124832;124833;124834;124835;124836;124837;124838;124839;124840;124841;124842 124830 14 EMSGDLEEGMLAVVK Unmodified 1606.7582 0.75824468 2574 P50995;H0Y6E1 ANXA11 Annexin A11 yes no 0 0 0 1 1 125.64 125.64 2 0.0074584 130735 QUIQUE_C1218_190116_001 59.418 46.802 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11178 2574 10464 98365;98366 124843;124844 124843 2 EMSGDLEEGMLAVVK Oxidation (M) 1622.7532 0.7531593 2574 P50995;H0Y6E1 ANXA11 Annexin A11 yes no 0 1 0 1 1 1 110.64 110.64 2 0.00010084 114284 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.653 75.681 62812000 0 0 0 0 0 0 0 0 22089000 17476000 0 23247000 0 11179 2574 10464 98367;98368;98369 124845;124846;124847 124845 2023 3 EMSGSPASGIPVK Unmodified 1258.6227 0.62273747 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 43.794 43.794 2 0.0034819 40493 QUIQUE_C1277_190116_001 73.499 47.94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11180 290;327;328 10465 98370;98371;98372;98373 124848;124849;124850;124851 124848 4 EMSPLWEMVQDGIDLK Unmodified 1889.8903 0.89032148 4647 Q9Y697 NFS1 Cysteine desulfurase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 164.6 164.6 3 0.006446 172089 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.14 41.636 11609000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11609000 0 0 11181 4647 10466 98374 124852 124852 1 EMSSSTLNLVVAGAPK Unmodified 1602.8287 0.8287075 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 95.59 95.59 2 0.0016185 97928 QUIQUE_C1277_190116_001 65.179 51.021 47441000 0 24618000 0 22823000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11182 3675 10467 98375;98376 124853;124854 124853 2 EMSVYEAYR Unmodified 1146.5016 0.5015597 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.404 57.404 2 0.0042623 56611 QUIQUE_C1218_190116_001 89.401 72.625 2125600000 248060000 238590000 353050000 143790000 148120000 156110000 238250000 46699000 103580000 144260000 142030000 93153000 69964000 11183 3117 10468 98377;98378;98379;98380;98381;98382;98383;98384;98385;98386;98387;98388;98389 124855;124856;124857;124858;124859;124860;124861;124862;124863;124864;124865;124866;124867 124855 9 EMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGK Unmodified 3010.3589 0.35894157 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 3 4 5 1 2 2 2 131 131 3;4 4.7521E-24 136407 QUIQUE_C1368_190116_001 98 92.034 1585500000 233740000 267570000 511090000 82485000 159420000 115360000 215820000 0 0 0 0 0 0 11184 1777 10469 98390;98391;98392;98393;98394;98395;98396;98397;98398;98399;98400;98401;98402;98403;98404;98405;98406;98407;98408 124868;124869;124870;124871;124872;124873;124874;124875;124876;124877;124878;124879;124880;124881;124882;124883;124884;124885;124886;124887 124879 13 EMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGK Oxidation (M) 3026.3539 0.35385619 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 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EMSWIADTYASTIGHYDINAHACVTGKPISQGGIHGR Oxidation (M) 4028.8898 0.88976799 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 1 1 1 2 1 2 2 2 2 105.25 105.25 4;5 2.9893E-99 108586 QUIQUE_C1403_190116_001 153.25 149.09 2146200000 0 0 98762000 317850000 0 0 57855000 0 367610000 0 372130000 583230000 348780000 11187 1777 10470 98434;98435;98436;98437;98438;98439;98440;98441;98442;98443;98444;98445 124920;124921;124922;124923;124924;124925;124926;124927;124928;124929;124930;124931;124932;124933 124922 973 14 EMTADVIELK Unmodified 1147.5795 0.57947567 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 78.013 78.013 2 0.065078 79338 QUIQUE_C1576_190116_001 53.756 30.976 69383000 0 0 0 0 0 0 69383000 0 0 0 0 0 0 11188 4285 10471 98446 124934 124934 1 EMTGIWR Unmodified 891.42727 0.42727255 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 57.425 57.425 2 0.049128 56029 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endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.29 80.29 2 0.0036109 82400 QUIQUE_C1218_190116_001 114.6 82.132 3636600000 329300000 316680000 295690000 314510000 249260000 245440000 299930000 285190000 244930000 114380000 358390000 239850000 343040000 11192 2658 10475 98463;98464;98465;98466;98467;98468;98469;98470;98471;98472;98473;98474;98475 124951;124952;124953;124954;124955;124956;124957;124958;124959;124960;124961;124962;124963;124964;124965;124966;124967;124968;124969;124970;124971;124972;124973 124951 23 EMVELPLR Oxidation (M) 1001.5216 0.52156686 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.136 62.136 2 0.012584 61806 QUIQUE_C1403_190116_001 91.041 72.31 655560000 0 0 76060000 68708000 63456000 56058000 61952000 0 0 41630000 106210000 79582000 101900000 11193 2658 10475 98476;98477;98478;98479;98480;98481;98482;98483;98484 124974;124975;124976;124977;124978;124979;124980;124981;124982;124983;124984 124975 2096 11 EMVIFFGHPR Unmodified 1231.6172 0.61719858 3497 Q86V97;Q8WVZ9 KBTBD6;KBTBD7 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 6;Kelch repeat and BTB domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 76.707 76.707 3 0.033004 77763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.225 25.5 22373000 0 0 0 0 0 0 0 11084000 0 0 0 0 11289000 11194 3497 10476 98485;98486;98487 124985;124986;124987 124985 3 EMVLELIR Unmodified 1001.558 0.55795237 909 E9PEB5;Q96AE4 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 3 1 1 1 2 1 1 1 1 1 100.84 100.84 2 0.0036361 107252 QUIQUE_C1277_190116_001 116.88 0 795420000 116680000 151430000 60294000 26169000 65488000 112190000 61732000 32136000 28061000 0 80076000 0 61165000 11195 909 10477 98488;98489;98490;98491;98492;98493;98494;98495;98496;98497;98498;98499;98500;98501;98502 124988;124989;124990;124991;124992;124993;124994;124995;124996;124997;124998;124999;125000;125001;125002;125003;125004;125005 124993 18 EMVQNLMVLR Unmodified 1231.6417 0.64169877 2024 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125011;125012;125013;125014;125015;125016;125017;125018;125019;125020;125021;125022;125023;125024;125025;125026;125027 125015 17 EMYSVEEAEQLMTLISAAR Oxidation (M) 2186.0235 0.023520498 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 1 0 1 1 164.05 164.05 2 0.018623 170594 QUIQUE_C1438_190116_001 43.594 30.614 13585000 0 0 0 0 13585000 0 0 0 0 0 0 0 0 11199 1579 10480 98521;98522 125028;125029 125028 2 EMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAK Unmodified 2852.4459 0.44588931 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 1 3 2 1 168.73 168.73 2;3 1.8957E-19 175818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.57 148.34 1700000000 71652000 88711000 187380000 78046000 114330000 183080000 145320000 119550000 196100000 0 261260000 136550000 118010000 11200 1487 10481 98523;98524;98525;98526;98527;98528;98529;98530;98531;98532;98533;98534;98535;98536;98537;98538;98539;98540;98541;98542 125030;125031;125032;125033;125034;125035;125036;125037;125038;125039;125040;125041;125042;125043;125044;125045;125046;125047;125048;125049;125050;125051;125052;125053;125054 125049 23 EMYTLGITNFPIPGEPGFPLNAIYAK Oxidation (M) 2868.4408 0.44080393 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 1 0 1 1 166.96 166.96 3 0.00041984 168738 QUIQUE_C1563_190116_001 41.763 35.258 88981000 0 0 0 0 0 61114000 0 0 0 27867000 0 0 0 11201 1487 10481 98543;98544 125055;125056 125055 825 2 ENAAAESGSESSSQEATPEK Unmodified 2007.8505 0.85050139 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7ESQ0 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 18.477 18.477 2 5.2185E-30 11011 QUIQUE_C1218_190116_001 180.62 172.71 12028000 12028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11202 665 10482 98545 125057 125057 1 ENAAAPSPVR Unmodified 1010.5145 0.51450765 1656 O75781 PALM Paralemmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.338 17.338 2 1.7826E-07 9709 QUIQUE_C1368_190116_001 152.38 116.94 3399900000 395230000 303860000 246750000 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1080400000 43340000 0 0 128770000 123520000 133340000 123650000 113590000 251580000 0 123990000 0 38656000 11205 2071 10485 98569;98570;98571;98572;98573;98574;98575;98576;98577;98578;98579;98580;98581;98582;98583;98584;98585;98586;98587;98588;98589 125093;125094;125095;125096;125097;125098;125099;125100;125101;125102;125103;125104;125105;125106;125107;125108;125109;125110;125111;125112;125113;125114;125115 125097 20 ENAEVDGDDDAEEMEAK Unmodified 1865.7109 0.71089637 1883 P05198 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 46.927 46.927 2 2.245E-44 44823 QUIQUE_DMIX5_190116_001 171.73 169.98 143100000 0 34952000 29712000 0 24578000 0 0 24628000 0 0 29233000 0 0 11206 1883 10486 98590;98591;98592;98593;98594 125116;125117;125118;125119;125120 125120 4 ENALNNLDPNTELNVSR Unmodified 1911.9286 0.92863256 4608 Q9Y4J8;K7ERZ2;K7ESB2;K7EJ84 DTNA Dystrobrevin alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.21 92.21 2 7.9317E-63 94144 QUIQUE_DMIX3_190116_001 226.59 180.71 1188000000 85034000 77787000 97981000 90021000 80074000 0 114970000 93483000 123500000 59795000 135440000 102980000 126940000 11207 4608 10487 98595;98596;98597;98598;98599;98600;98601;98602;98603;98604;98605;98606 125121;125122;125123;125124;125125;125126;125127;125128;125129;125130;125131;125132 125128 10 ENAPAIIFIDEIDAIATK Unmodified 1943.0252 0.025158703 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 3 2 3 1 2 3 2 3 2 1 2 2 2 170.29 170.29 2;3 1.6344E-32 175170 QUIQUE_C1368_190116_001 196.74 174.41 3335100000 279420000 222510000 322320000 251590000 264130000 164360000 218230000 282450000 256650000 46425000 405550000 336690000 284780000 11208 2466 10488 98607;98608;98609;98610;98611;98612;98613;98614;98615;98616;98617;98618;98619;98620;98621;98622;98623;98624;98625;98626;98627;98628;98629;98630;98631;98632;98633;98634 125133;125134;125135;125136;125137;125138;125139;125140;125141;125142;125143;125144;125145;125146;125147;125148;125149;125150;125151;125152;125153;125154;125155;125156;125157;125158;125159;125160;125161;125162;125163 125141 24 ENAPAIIFIDEIDAIATKR Unmodified 2099.1263 0.12626973 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 162.89 162.89 3 2.4772E-05 169974 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.44 77.276 206340000 0 0 0 0 0 0 0 47784000 45783000 0 52051000 44101000 16619000 11209 2466 10489 98635;98636;98637;98638;98639;98640 125164;125165;125166;125167;125168;125169;125170;125171;125172 125170 8 ENASPAPGTTAEEAMSR Unmodified 1717.7577 0.7577274 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;H0Y710 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 47.389 47.389 2 0.027773 45030 QUIQUE_C1576_190116_001 54.276 46.051 21170000 0 0 0 0 0 0 21170000 0 0 0 0 0 0 11210 7 10490 98641 125173 125173 1 ENAYDLEANLAVLK Unmodified 1561.7988 0.79878758 4404 Q9UBQ5;K7ES31;K7ERF1 EIF3K Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.26 122.26 2 0.0001657 128047 QUIQUE_C1218_190116_001 97.734 79.466 489910000 0 0 141780000 0 0 0 117800000 0 0 0 0 100690000 129650000 11211 4404 10491 98642;98643;98644;98645;98646;98647 125174;125175;125176;125177;125178;125179 125174 6 ENCLILAVSPANSDLANSDALK Unmodified 2314.1475 0.14747546 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 3 2 2 2 3 2 2 1 1 2 3 2 125.36 125.36 2;3 4.1447E-166 129042 QUIQUE_C1277_190116_001 237.4 207.1 4213600000 219060000 304920000 425080000 322180000 471180000 324990000 512540000 227070000 0 72511000 470720000 461430000 401870000 11212 269;2893 10492 98648;98649;98650;98651;98652;98653;98654;98655;98656;98657;98658;98659;98660;98661;98662;98663;98664;98665;98666;98667;98668;98669;98670;98671;98672;98673 125180;125181;125182;125183;125184;125185;125186;125187;125188;125189;125190;125191;125192;125193;125194;125195;125196;125197;125198;125199;125200;125201;125202;125203;125204;125205;125206;125207;125208;125209;125210;125211;125212;125213;125214;125215;125216;125217;125218;125219 125182 40 ENCLILAVTPANTDLANSDALK Unmodified 2342.1788 0.17877559 4528;840 E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.53 129.53 2 3.0909E-36 134090 QUIQUE_DMIX8_190116_001 183.6 165.19 407860000 0 63778000 62579000 67326000 0 40790000 0 0 0 0 70914000 54704000 47768000 11213 840;4528 10493 98674;98675;98676;98677;98678;98679;98680;98681;98682;98683 125220;125221;125222;125223;125224;125225;125226;125227;125228;125229;125230;125231 125231 12 ENCMMHLLR Unmodified 1202.5359 0.53585349 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.683 56.683 2;3 0.012073 54719 QUIQUE_C1368_190116_001 46.891 31.001 134400000 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98696;98697;98698;98699;98700;98701;98702;98703;98704;98705;98706;98707;98708;98709;98710;98711;98712;98713;98714;98715;98716;98717;98718;98719;98720;98721 125244;125245;125246;125247;125248;125249;125250;125251;125252;125253;125254;125255;125256;125257;125258;125259;125260;125261;125262;125263;125264;125265;125266;125267;125268;125269;125270;125271;125272;125273;125274;125275;125276;125277 125245 34 ENDAVWLATQNHSTLVTER Unmodified 2183.0607 0.060709362 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QLH1 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.817 85.817 3 3.5632E-12 87278 QUIQUE_C1403_190116_001 120.11 110.4 841840000 71045000 88966000 75430000 67596000 72007000 59338000 92088000 56982000 66271000 0 69471000 66721000 55927000 11217 245 10497 98722;98723;98724;98725;98726;98727;98728;98729;98730;98731;98732;98733 125278;125279;125280;125281;125282;125283;125284;125285;125286;125287;125288;125289;125290;125291;125292 125281 14 ENDPSGFLQISDALIR Unmodified 1773.8897 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2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.859 52.859 2 0.011743 50943 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.55 38.584 1071300000 197480000 128160000 109540000 130480000 76232000 123690000 71238000 0 53926000 67567000 58022000 54995000 0 11222 3800 10502 98780;98781;98782;98783;98784;98785;98786;98787;98788;98789;98790 125343;125344;125345;125346;125347;125348;125349;125350;125351;125352;125353 125352 11 ENEGFTVTAEGK Unmodified 1280.5885 0.58846046 1803 P01024;M0QYC8 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 41.303 41.303 2 0.050577 35654 QUIQUE_DMIX4_190116_001 44.543 29.282 26919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26919000 0 0 0 11223 1803 10503 98791 125354 125354 1 ENEITGALLPCLDESR Unmodified 1815.8673 0.86727785 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Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 169.61 169.61 2;3 1.3092E-43 174183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.18 118.52 2080000000 0 59061000 277920000 23953000 83184000 51329000 182780000 148720000 164860000 0 502350000 335780000 250070000 11230 3053 10509 98839;98840;98841;98842;98843;98844;98845;98846;98847;98848;98849;98850;98851;98852;98853;98854;98855;98856;98857 125435;125436;125437;125438;125439;125440;125441;125442;125443;125444;125445;125446;125447;125448;125449;125450;125451;125452;125453;125454 125447 18 ENFLFLTPDCK Unmodified 1382.654 0.6540376 1806 P01042 KNG1 Kininogen-1;Kininogen-1 heavy chain;T-kinin;Bradykinin;Lysyl-bradykinin;Kininogen-1 light chain;Low molecular weight growth-promoting factor yes yes 0 0 0 1 1 115.65 115.65 2 0.011446 120154 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.353 40.483 32313000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32313000 11231 1806 10510 98858;98859 125455;125456 125456 2 ENFMTVDQDGSGTVEHHELR Unmodified 2300.0128 0.012772891 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676;C9JIZ3 GCA Grancalcin yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 59.879 59.879 3;4 3.3803E-19 58401 QUIQUE_DMIX8_190116_001 130.11 117.17 1034900000 87430000 120020000 112490000 127390000 92528000 49882000 47824000 94832000 97957000 0 105800000 0 98767000 11232 1210 10511 98860;98861;98862;98863;98864;98865;98866;98867;98868;98869;98870;98871;98872;98873;98874;98875;98876;98877 125457;125458;125459;125460;125461;125462;125463;125464;125465;125466;125467;125468;125469;125470;125471;125472;125473;125474;125475 125474 18 ENFMTVDQDGSGTVEHHELR Oxidation (M) 2316.0077 0.007687513 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676;C9JIZ3 GCA Grancalcin yes no 0 1 0 1 45.554 45.554 4 0.0057485 42658 QUIQUE_C1368_190116_001 40.689 36.037 50039000 0 0 50039000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11233 1210 10511 98878 125476 125476 699 0 ENFQKPGNVK Unmodified 1159.5986 0.59857163 1229 H7C1U8;Q9BUR5;A0A0J9YWW6 APOO Apolipoprotein O yes no 0 0 1 1 1 1 14.456 14.456 2 0.002078 6854 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.99 78.592 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125518;125519;125520;125521;125522;125523;125524;125525;125526;125527;125528;125529 125527 12 ENGINGELTSADRETAEEVSAR Unmodified 2347.0888 0.088774606 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 73.437 73.437 3 4.2071E-07 73010 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.287 68.686 30376000 0 0 0 0 0 0 0 30376000 0 0 0 0 0 11239 2009 10517 98915 125530 125530 1 ENGLPLEYQEK Unmodified 1318.6405 0.64049603 1618 O75223;M0QZK8 GGCT Gamma-glutamylcyclotransferase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 60.711 60.711 2 0.0086663 59812 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.939 52.425 774870000 0 0 113580000 102430000 0 0 0 155650000 138620000 0 131810000 132790000 0 11240 1618 10518 98916;98917;98918;98919;98920;98921;98922 125531;125532;125533;125534;125535;125536;125537 125535 6 ENGTVTAANASTLNDGAAALVLMTADAAK Unmodified 2760.36 0.35998743 2232 P24752 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 151.04 151.04 2;3 1.9047E-54 155889 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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62779 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.58 168.6 1568800000 79224000 170810000 168290000 101210000 247720000 88586000 98051000 131540000 81594000 66490000 192120000 71430000 71708000 11243 3958 10521 98946;98947;98948;98949;98950;98951;98952;98953;98954;98955;98956;98957;98958;98959;98960;98961;98962;98963;98964;98965;98966 125566;125567;125568;125569;125570;125571;125572;125573;125574;125575;125576;125577;125578;125579;125580;125581;125582;125583;125584;125585;125586;125587;125588;125589 125580 22 ENGVYLIDVK Unmodified 1148.6077 0.60773933 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 78.679 78.679 2 0.038902 81290 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.528 29.677 68981000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68981000 0 0 11244 2178 10522 98967 125590 125590 1 ENIASVLENYHTESK Unmodified 1732.8268 0.82679325 3373 Q6NVY1;B9A058;F8W8A6 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 81.809 81.809 2;3 0.0004994 82706 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.46 61.864 1053500000 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125604;125605;125606;125607;125608;125609;125610 125604 5 ENIIAVATTNNLYIFQDK Unmodified 2066.0684 0.068420501 2781 P63151 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes yes 0 0 0 1 143.64 143.64 2 1.0292E-10 139559 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.08 82.557 24791000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24791000 0 0 0 11248 2781 10526 98988 125611 125611 1 ENILEEFSK Unmodified 1107.5448 0.54480473 1525 O43390;B4DT28 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 100 100 2 0.00051641 102747 QUIQUE_C1368_190116_001 112.84 60.987 485130000 53927000 0 56109000 38516000 75177000 41127000 53853000 27237000 42808000 29405000 0 36170000 30797000 11249 1525 10527 98989;98990;98991;98992;98993;98994;98995;98996;98997;98998;98999;99000 125612;125613;125614;125615;125616;125617;125618;125619;125620;125621;125622;125623;125624;125625;125626 125614 14 ENILFGMGNPLLDISAVVDKDFLDK Oxidation (M) 2778.415 0.41498311 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 170.84 170.84 3 4.138E-30 175761 QUIQUE_C1368_190116_001 130.6 123.49 587140000 0 85348000 138300000 0 0 91711000 0 0 0 0 115530000 0 156250000 11250 2663 10528 99001;99002;99003;99004;99005 125627;125628;125629;125630;125631 125628 2110 5 ENILFGMGNPLLDISAVVDKDFLDK Unmodified 2762.4201 0.42006849 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 173.34 173.34 3 2.426E-63 177576 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.71 130.16 341960000 0 0 0 0 14334000 0 16971000 0 44822000 0 121250000 62597000 81994000 11251 2663 10528 99006;99007;99008;99009;99010;99011 125632;125633;125634;125635;125636;125637 125634 4 ENIMVAFK Unmodified 950.48954 0.48953845 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 72.101 72.101 1;2 1.2363E-05 72325 QUIQUE_DMIX3_190116_001 204.03 116 7496100000 142500000 1571800000 118210000 125690000 0 76781000 1086300000 1098100000 1797600000 377370000 0 1101800000 0 11252 2661 10529 99012;99013;99014;99015;99016;99017;99018;99019;99020;99021;99022;99023;99024 125638;125639;125640;125641;125642;125643;125644;125645;125646;125647;125648;125649;125650;125651 125649 7 ENIMVAFK Oxidation (M) 966.48445 0.48445308 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.643 50.643 2 0.020614 48828 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.635 38.916 4011600000 0 352100000 0 0 0 218850000 260970000 510880000 685580000 379310000 594570000 478960000 530330000 11253 2661 10529 99025;99026;99027;99028;99029;99030;99031;99032;99033 125652;125653;125654;125655;125656;125657;125658;125659;125660;125661;125662 125660 11 ENIPTPALEPQTTVIHNPDGNK Unmodified 2384.1972 0.19720284 896 E9PBG7;E9PF82 CAMK2D yes no 0 0 0 1 1 1 1 79.93 79.93 3 0.00023958 81344 QUIQUE_C1218_190116_001 49.076 40.889 960190000 50654000 383640000 0 313690000 0 212210000 0 0 0 0 0 0 0 11254 896 10530 99034;99035;99036;99037 125663;125664;125665;125666 125663 4 ENISEWR Unmodified 932.43519 0.4351947 591 B1ALA9;P60891;A0A2R8Y7H4 PRPS1 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.7 40.7 2 0.0030838 36307 QUIQUE_C1368_190116_001 163.84 76.91 1019700000 214960000 169670000 146510000 166890000 0 148990000 172690000 0 0 0 0 0 0 11255 591 10531 99038;99039;99040;99041;99042;99043 125667;125668;125669;125670;125671;125672;125673;125674 125670 8 ENIVEAIIHSPELIR Unmodified 1731.9519 0.95193418 1727 O95373;E9PLB2 IPO7 Importin-7 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 141.82 141.82 2;3 1.2099E-18 146576 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.31 132.97 2068900000 148230000 134100000 225510000 167030000 180660000 140490000 164490000 132020000 179730000 83373000 189810000 156880000 166530000 11256 1727 10532 99044;99045;99046;99047;99048;99049;99050;99051;99052;99053;99054;99055;99056;99057;99058;99059;99060;99061;99062;99063;99064;99065;99066;99067;99068;99069 125675;125676;125677;125678;125679;125680;125681;125682;125683;125684;125685;125686;125687;125688;125689;125690;125691;125692;125693;125694;125695;125696;125697;125698;125699;125700;125701;125702;125703;125704;125705;125706;125707;125708;125709;125710;125711;125712;125713;125714 125703 39 ENIVIQCEAK Unmodified 1202.5965 0.59652272 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43;C9JF43;C9J8B6 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.51 36.51 2 0.00019619 32514 QUIQUE_C1218_190116_001 123.86 86.302 2327800000 335210000 356260000 311920000 302680000 0 0 385440000 209870000 0 104330000 0 322090000 0 11257 756 10533 99070;99071;99072;99073;99074;99075;99076;99077 125715;125716;125717;125718;125719;125720;125721;125722;125723;125724 125715 9 ENIWDGVTTK Unmodified 1161.5666 0.5666028 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.282 75.282 2 0.0080717 74861 QUIQUE_C1563_190116_001 72.243 33.921 250880000 0 0 0 66467000 0 63012000 121400000 0 0 0 0 0 0 11258 1894 10534 99078;99079;99080;99081 125725;125726;125727;125728;125729 125726 4 ENKEFLEFR Unmodified 1210.5982 0.59823728 1622 O75323;H7C333;C9K068;C9J7B1 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 55.513 55.513 2;3 0.0016769 54004 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.749 53.006 374720000 0 30538000 0 0 43295000 0 35227000 70745000 0 0 78696000 58781000 57438000 11259 1622 10535 99082;99083;99084;99085;99086;99087;99088;99089 125730;125731;125732;125733;125734;125735;125736;125737;125738;125739;125740 125733 11 ENLATVEGNFASIDER Unmodified 1763.8326 0.83260691 3011 Q13561;H0YI98 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.77 104.77 2 2.368E-44 109107 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.02 158.16 4550800000 364590000 409060000 0 319270000 374520000 322790000 379760000 374950000 445540000 147010000 578000000 406280000 429040000 11260 3011 10536 99090;99091;99092;99093;99094;99095;99096;99097;99098;99099;99100;99101 125741;125742;125743;125744;125745;125746;125747;125748;125749;125750;125751;125752;125753;125754;125755;125756;125757;125758;125759;125760;125761 125757 20 ENLEEEAIIMK Oxidation (M) 1333.6435 0.64353249 4364;852 Q9P0J0;B4DEZ3;K7EJE1;E7ENQ6 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 no no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 64.547 64.547 2 0.00054147 64155 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.4 72.584 408610000 58511000 53376000 88683000 0 0 0 34463000 0 53836000 0 70901000 48843000 0 11261 4364;852 10537 99102;99103;99104;99105;99106;99107;99108;99109;99110 125762;125763;125764;125765;125766;125767;125768;125769;125770;125771;125772;125773 125770 499 11 ENLEEEAIIMK Unmodified 1317.6486 0.64861787 4364;852 Q9P0J0;B4DEZ3;K7EJE1;E7ENQ6 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.781 84.781 2 0.00059478 86060 QUIQUE_C1368_190116_001 113.22 66.328 997850000 208370000 0 179110000 0 88847000 0 155180000 129220000 0 60420000 0 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99144;99145;99146;99147;99148;99149;99150;99151;99152;99153;99154;99155;99156 125809;125810;125811;125812;125813;125814;125815;125816;125817;125818;125819;125820;125821;125822;125823 125821 14 ENLLDFIK Unmodified 990.5386 0.53859714 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3;I3L312;I3L398;I3L4M2;I3NI03 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.37 127.37 2 0.0036613 132954 QUIQUE_C1218_190116_001 122.74 70.106 2298400000 239950000 229770000 223480000 206530000 230160000 230340000 206330000 0 124900000 100020000 186810000 139880000 180250000 11271 1917 10545 99157;99158;99159;99160;99161;99162;99163;99164;99165;99166;99167;99168 125824;125825;125826;125827;125828;125829;125830;125831;125832;125833;125834;125835;125836;125837;125838;125839;125840;125841;125842;125843;125844;125845;125846;125847 125825 24 ENLLEEQGSIALR Unmodified 1470.7678 0.7678218 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 5 4 4 4 3 3 4 4 4 3 4 2 3 96.523 96.523 2;3 1.3605E-52 98109 QUIQUE_C1277_190116_001 199.08 161.6 11732000000 848450000 976780000 768270000 777220000 897100000 834800000 786390000 874020000 1385800000 660760000 906270000 980110000 1035700000 11272 267;275;3025 10546 99169;99170;99171;99172;99173;99174;99175;99176;99177;99178;99179;99180;99181;99182;99183;99184;99185;99186;99187;99188;99189;99190;99191;99192;99193;99194;99195;99196;99197;99198;99199;99200;99201;99202;99203;99204;99205;99206;99207;99208;99209;99210;99211;99212;99213;99214;99215 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126270 3 ENQDYVPGER Unmodified 1205.5313 0.53127993 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 29.502 29.502 2 0.029155 24286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.299 36.132 151240000 0 0 0 0 0 0 50994000 42815000 57427000 0 0 0 0 11307 1510 10580 99505;99506;99507 126271;126272;126273 126272 3 ENQEGAANVNVR Unmodified 1299.6167 0.61674089 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.117 20.117 2 4.1202E-05 12700 QUIQUE_C1563_190116_001 127.3 95.928 1071500000 73934000 85531000 97886000 133370000 101900000 142090000 98922000 0 103860000 38054000 86514000 0 109390000 11308 3565 10581 99508;99509;99510;99511;99512;99513;99514;99515;99516;99517;99518 126274;126275;126276;126277;126278;126279;126280;126281;126282;126283;126284;126285 126279 10 ENQELNAHNQELNNR Unmodified 1821.8354 0.83540087 1111;3416 H0Y2S9;H0Y7E2;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 21.255 21.255 3 0.034543 14657 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.592 34.429 40693000 0 0 0 0 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alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.842 78.842 2 0.0022308 79835 QUIQUE_C1277_190116_001 91.085 56.683 315800000 55073000 36570000 47156000 0 0 0 34807000 0 35363000 24053000 0 35146000 47636000 11317 1266;3022 10590 99568;99569;99570;99571;99572;99573;99574;99575;99576;99577;99578 126341;126342;126343;126344;126345;126346;126347;126348;126349;126350;126351;126352;126353 126342 13 ENSETVVTGSLDDLVK Unmodified 1704.8418 0.84177461 1171 H0YN81;Q9GZS3;H0YMF9;H0YM76 WDR61 WD repeat-containing protein 61;WD repeat-containing protein 61, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.62 108.62 2 0.00086559 105806 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.18 74.564 734830000 83584000 85268000 90255000 78028000 89711000 0 0 85185000 76422000 33669000 0 0 112700000 11318 1171 10591 99579;99580;99581;99582;99583;99584;99585;99586;99587 126354;126355;126356;126357;126358;126359;126360;126361;126362;126363;126364 126363 11 ENSIEILSSTIKPYNAEDNENFK Unmodified 2654.2712 0.27115565 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.89 114.89 3 2.3534E-74 118696 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.7 168.14 1535000000 0 0 153480000 0 181370000 0 0 201820000 274610000 66931000 230430000 200890000 225460000 11319 4315 10592 99588;99589;99590;99591;99592;99593;99594;99595 126365;126366;126367;126368;126369;126370;126371;126372;126373;126374;126375 126369 11 ENSLKTDDYGR Unmodified 1296.5946 0.59460847 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 18.711 18.711 2;3 0.032387 11645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.247 23.6 114700000 0 0 0 0 0 0 0 114700000 0 0 0 0 0 11320 267;275;3025 10593 99596;99597 126376;126377 126376 2 ENSQLDEENLELR Unmodified 1587.7376 0.73764389 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YGU1;A0A087WXD9;A0A2R8YG52 CCDC88A Girdin yes no 0 0 0 1 1 1 70.408 70.408 2 5.114E-06 71267 QUIQUE_C1218_190116_001 152.7 117.15 88266000 25331000 0 0 0 32695000 30240000 0 0 0 0 0 0 0 11321 473 10594 99598;99599;99600 126378;126379;126380 126378 2 ENSTLNCASFTAGIVEAVLTHSGFPAK Unmodified 2820.3752 0.37524356 3527 Q8IUR0;M0QZQ8 TRAPPC5 Trafficking protein particle complex subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 167.21 167.21 3 6.7507E-55 169155 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.04 140.02 298200000 20792000 49111000 0 0 0 0 71044000 92070000 65181000 0 0 0 0 11322 3527 10595 99601;99602;99603;99604;99605 126381;126382;126383;126384;126385 126384 4 ENSVDVYQVAK Unmodified 1250.6143 0.61428128 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 46.026 46.026 2 0.03115 43509 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.908 44.803 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11323 2217 10596 99606 126386 126386 1 ENTEFSELELQEWYK Unmodified 1943.8789 0.8788884 2826 P84074 HPCA Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.62 134.62 2 6.4506E-09 138737 QUIQUE_C1403_190116_001 154.28 139.38 394810000 53285000 41279000 52266000 39553000 23220000 24094000 49939000 0 28184000 0 0 41202000 41789000 11324 2826 10597 99607;99608;99609;99610;99611;99612;99613;99614;99615;99616;99617 126387;126388;126389;126390;126391;126392;126393;126394;126395;126396;126397;126398;126399 126391 11 ENTEFTDHELQEWYK Unmodified 1967.8537 0.85373628 2407 P37235;E9PC71 HPCAL1 Hippocalcin-like protein 1 yes no 0 0 0 3 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 93.95 93.95 2;3 1.1862E-283 97554 QUIQUE_C1218_190116_001 306.07 263.26 1439300000 183780000 219180000 207150000 27500000 0 114980000 221890000 0 102190000 8910800 157010000 38148000 158560000 11325 2407 10598 99618;99619;99620;99621;99622;99623;99624;99625;99626;99627;99628;99629;99630;99631;99632;99633;99634;99635;99636;99637;99638 126400;126401;126402;126403;126404;126405;126406;126407;126408;126409;126410;126411;126412;126413;126414;126415;126416;126417;126418;126419;126420;126421 126401 21 ENTEGEYSGIEHVIVDGVVQSIK Unmodified 2501.2286 0.22856255 2558 P50213;H0YL72;H0YLI6;H0YMU3 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 143.17 143.17 2;3 1.9003E-142 147476 QUIQUE_C1277_190116_001 266.29 238.95 13570000000 1426900000 1228800000 1661700000 894860000 930120000 883060000 1288500000 540730000 1147300000 516590000 1013600000 1082200000 955500000 11326 2558 10599 99639;99640;99641;99642;99643;99644;99645;99646;99647;99648;99649;99650;99651;99652;99653;99654;99655;99656;99657;99658;99659;99660;99661;99662;99663;99664;99665 126422;126423;126424;126425;126426;126427;126428;126429;126430;126431;126432;126433;126434;126435;126436;126437;126438;126439;126440;126441;126442;126443;126444;126445;126446;126447;126448;126449;126450;126451;126452;126453;126454;126455;126456;126457;126458;126459;126460;126461;126462;126463;126464;126465;126466;126467;126468 126428 47 ENTEGEYSSLEHESVAGVVESLK Unmodified 2492.1555 0.15545719 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;E9PF84;H7C1W2 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 118.32 118.32 2;3 4.4382E-127 122415 QUIQUE_C1368_190116_001 205.78 194.34 5972000000 687840000 642890000 488130000 368210000 388530000 362850000 553870000 270010000 481030000 166780000 560320000 537190000 464400000 11327 2582 10600 99666;99667;99668;99669;99670;99671;99672;99673;99674;99675;99676;99677;99678;99679;99680;99681;99682;99683;99684;99685;99686;99687;99688;99689 126469;126470;126471;126472;126473;126474;126475;126476;126477;126478;126479;126480;126481;126482;126483;126484;126485;126486;126487;126488;126489;126490;126491;126492;126493;126494;126495;126496;126497;126498;126499;126500;126501;126502;126503;126504;126505;126506 126478 38 ENTLNQLVGAAFGAAGQR Unmodified 1815.9228 0.92275932 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 141.84 141.84 2;3 9.5356E-182 144468 QUIQUE_C1563_190116_001 253.79 235.17 7361400000 1010400000 530380000 816070000 963720000 708710000 1145700000 466720000 191240000 297350000 374070000 333780000 256440000 266820000 11328 2870 10601 99690;99691;99692;99693;99694;99695;99696;99697;99698;99699;99700;99701;99702;99703;99704;99705;99706;99707;99708 126507;126508;126509;126510;126511;126512;126513;126514;126515;126516;126517;126518;126519;126520;126521;126522;126523;126524;126525;126526;126527;126528;126529;126530;126531;126532 126519 26 ENVFPGTTTR Unmodified 1120.5513 0.55128709 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.899 39.899 2 0.0039331 35853 QUIQUE_C1403_190116_001 82.645 30.242 808940000 126900000 119310000 0 85755000 0 74765000 118110000 0 50658000 41443000 92521000 0 99480000 11329 1877 10602 99709;99710;99711;99712;99713;99714;99715;99716;99717 126533;126534;126535;126536;126537;126538;126539;126540;126541;126542 126536 9 ENVFQEHQTLK Unmodified 1371.6783 0.67827852 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.27 34.27 2 0.00078221 29452 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.573 69.635 286020000 0 33763000 0 77386000 40756000 44421000 0 0 0 17187000 26628000 0 45878000 11330 3056 10603 99718;99719;99720;99721;99722;99723;99724 126543;126544;126545;126546;126547;126548;126549 126547 7 ENVIMSQILPCIK Unmodified 1543.8102 0.81022067 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 128.7 128.7 2;3 3.9235E-17 131663 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.67 138.32 4076500000 214200000 355320000 296170000 268320000 314760000 246410000 328260000 350150000 355530000 78750000 338410000 433700000 496560000 11331 2309 10604 99725;99726;99727;99728;99729;99730;99731;99732;99733;99734;99735;99736;99737;99738;99739;99740;99741;99742;99743;99744;99745;99746;99747;99748 126550;126551;126552;126553;126554;126555;126556;126557;126558;126559;126560;126561;126562;126563;126564;126565;126566;126567;126568;126569;126570;126571;126572;126573;126574;126575;126576;126577;126578;126579;126580;126581;126582;126583;126584;126585;126586;126587;126588 126572 39 ENVLIGDGAGFK Unmodified 1218.6245 0.62445203 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.589 75.589 2 5.4825E-05 77251 QUIQUE_C1438_190116_001 125.75 76.95 2105100000 141790000 142550000 198530000 163750000 147290000 143900000 173890000 218440000 195690000 47154000 201970000 148940000 181220000 11332 666 10605 99749;99750;99751;99752;99753;99754;99755;99756;99757;99758;99759;99760;99761 126589;126590;126591;126592;126593;126594;126595;126596;126597;126598;126599;126600;126601;126602;126603;126604;126605 126595 15 ENVLVETLNHEMYEAK Oxidation (M) 1933.9091 0.90914267 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 1 0 3 2 1 2 2 2 1 4 1 3 2 3 3 86.495 86.495 2;3 4.9875E-80 87945 QUIQUE_C1277_190116_001 212.83 195.66 2774000000 204030000 210650000 145930000 177730000 142670000 152280000 0 429420000 239660000 202770000 305400000 281380000 282120000 11333 2261 10606 99762;99763;99764;99765;99766;99767;99768;99769;99770;99771;99772;99773;99774;99775;99776;99777;99778;99779;99780;99781;99782;99783;99784;99785;99786;99787;99788;99789;99790 126606;126607;126608;126609;126610;126611;126612;126613;126614;126615;126616;126617;126618;126619;126620;126621;126622;126623;126624;126625;126626;126627;126628;126629;126630;126631;126632;126633;126634;126635;126636;126637;126638;126639;126640 126612 1624 33 ENVLVETLNHEMYEAK Unmodified 1917.9142 0.91422805 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 1 1 3 111.28 111.28 2;3 6.6235E-130 114423 QUIQUE_C1403_190116_001 279.56 257.33 8332000000 730490000 871030000 963440000 677700000 637560000 547940000 260730000 525230000 810240000 356510000 576040000 653450000 721680000 11334 2261 10606 99791;99792;99793;99794;99795;99796;99797;99798;99799;99800;99801;99802;99803;99804;99805;99806;99807;99808;99809;99810;99811;99812;99813;99814;99815 126641;126642;126643;126644;126645;126646;126647;126648;126649;126650;126651;126652;126653;126654;126655;126656;126657;126658;126659;126660;126661;126662;126663;126664;126665;126666;126667;126668;126669;126670;126671;126672;126673;126674;126675;126676;126677;126678;126679;126680;126681;126682;126683;126684;126685;126686;126687;126688;126689;126690;126691;126692 126655 51 ENVNATENCISAVGK Unmodified 1604.7464 0.74643444 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 49.125 49.125 2 0.0093755 44067 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.089 54.824 18755000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18755000 0 0 0 11335 1403 10607 99816 126693 126693 1 ENVNLAQIR Unmodified 1055.5724 0.57235688 2506 P48444;B0YIW6;Q6P1Q5 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.674 47.674 2 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67.031 27525000 0 0 0 0 0 0 0 27525000 0 0 0 0 0 11340 1627 10612 99855 126749 126749 1 ENVQDVLPALPNPDDYFLLR Unmodified 2327.1798 0.17976186 1680 O76054;Q9UDX4;F8WEE7;C9JTM4 SEC14L2;SEC14L3 SEC14-like protein 2;SEC14-like protein 3 yes no 0 0 0 1 3 1 2 2 3 1 2 1 2 164.61 164.61 2;3 8.0584E-18 168478 QUIQUE_C1277_190116_001 162.37 141.42 1252600000 67356000 175290000 92713000 182240000 125500000 219120000 86057000 0 0 82012000 0 126980000 95295000 11341 1680 10613 99856;99857;99858;99859;99860;99861;99862;99863;99864;99865;99866;99867;99868;99869;99870;99871;99872;99873 126750;126751;126752;126753;126754;126755;126756;126757;126758;126759;126760;126761;126762;126763;126764;126765;126766;126767;126768;126769;126770;126771;126772;126773;126774;126775;126776;126777;126778 126757 25 ENVVQSVTSVAEK Unmodified 1388.7147 0.7147236 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.1 75.1 2 1.4842E-17 76867 QUIQUE_C1218_190116_001 165.66 145.63 2236500000 379120000 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ATP-dependent RNA helicase DHX30 yes no 0 0 0 1 1 1 1 134.7 134.7 2 0.00051982 140086 QUIQUE_C1368_190116_001 95.401 71.652 55824000 0 0 33873000 0 0 0 0 0 0 0 0 21951000 0 11344 1211 10616 99901;99902;99903;99904 126815;126816;126817;126818 126816 4 ENYLFVCSCPK Unmodified 1415.6214 0.62135726 3359 Q6GMV2 SMYD5 SET and MYND domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 78.295 78.295 2 0.0029139 79161 QUIQUE_C1277_190116_001 75.387 57.951 135350000 14608000 22172000 23795000 0 0 23351000 0 29765000 21656000 0 0 0 0 11345 3359 10617 99905;99906;99907;99908;99909;99910;99911 126819;126820;126821;126822;126823;126824;126825 126820 6 ENYPLYIR Unmodified 1066.5447 0.54474515 211 A0A0B4J294;H3BP13;Q9UL33;H3BPN3;A0A0B4J286 TRAPPC2L Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein yes no 0 0 0 1 1 68.148 68.148 2 0.036561 69115 QUIQUE_C1576_190116_001 62.717 0.171 184150000 0 0 0 0 0 0 83236000 0 0 0 0 0 100910000 11346 211 10618 99912;99913 126826;126827 126826 2 ENYTWSQDYTDLEVR Unmodified 1917.8381 0.83808621 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.17 113.17 2 2.4791E-07 115701 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.18 138.99 465950000 0 0 43478000 48889000 43412000 40779000 50309000 56223000 26959000 0 54121000 43254000 58522000 11347 3532 10619 99914;99915;99916;99917;99918;99919;99920;99921;99922;99923 126828;126829;126830;126831;126832;126833;126834;126835;126836;126837 126833 7 ENYVWNVLLHR Unmodified 1441.7466 0.74663285 3730 Q92538 GBF1 Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.27 115.27 3 0.00052869 119375 QUIQUE_C1277_190116_001 82.261 65.144 123240000 0 12792000 16869000 11143000 17749000 0 12275000 0 0 0 19720000 17578000 15115000 11348 3730 10620 99924;99925;99926;99927;99928;99929;99930;99931;99932;99933;99934 126838;126839;126840;126841;126842;126843;126844;126845;126846;126847;126848 126839 10 EPAAAISRPR Unmodified 1066.5883 0.5883413 4460;605 B4DDD6;Q9UJU6;H0Y5J4 DBNL Drebrin-like protein no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 15.108 15.108 2;3 2.8108E-22 6985 QUIQUE_DMIX8_190116_001 189.38 152.98 761530000 18563000 32479000 73860000 40611000 93619000 32285000 48875000 52791000 63355000 0 71494000 59259000 174330000 11349 605;4460 10621 99935;99936;99937;99938;99939;99940;99941;99942;99943;99944;99945;99946;99947;99948;99949;99950 126849;126850;126851;126852;126853;126854;126855;126856;126857;126858;126859;126860;126861;126862;126863;126864;126865;126866 126866 16 EPAAEIEALLGMDLVR Oxidation (M) 1741.892 0.89203604 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 152.71 152.71 2;3 6.5663E-95 157539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 219.42 196.5 7225500000 447810000 478310000 614530000 494510000 515040000 836220000 538560000 319670000 751560000 438180000 590020000 526750000 674300000 11350 2941 10622 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96.778 2;3 4.3426E-36 99768 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.04 155.69 369190000 0 0 0 0 0 0 0 22920000 171870000 0 129920000 0 44479000 11356 166 10626 100069;100070;100071;100072;100073;100074 127034;127035;127036;127037;127038;127039;127040 127037 94;95 7 EPAHLMSLFGGKPMIIYK Unmodified 2031.0686 0.068560618 166 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396 GSN Gelsolin yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 107.39 107.39 2;3;4 9.9992E-21 111990 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.58 121.44 1275100000 0 0 0 0 0 0 0 250500000 204680000 0 212070000 408860000 198950000 11357 166 10626 100075;100076;100077;100078;100079;100080;100081;100082 127041;127042;127043;127044;127045;127046;127047;127048;127049;127050 127047 9 EPANVGVTK Unmodified 913.4869 0.48689592 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 14.775 14.775 2 0.060033 7080 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.96 21.163 11655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11655000 0 0 0 11358 4050 10627 100083 127051 127051 1 EPAPDSGLLGLFQGQNSLLH Unmodified 2092.0589 0.058918448 3799 Q96AB3 ISOC2 Isochorismatase domain-containing protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 158.27 158.27 2;3 1.8566E-23 163915 QUIQUE_C1218_190116_001 173.25 160.33 1119500000 192750000 156270000 216880000 105310000 142690000 91548000 0 0 45653000 0 0 0 168360000 11359 3799 10628 100084;100085;100086;100087;100088;100089;100090;100091;100092;100093;100094;100095 127052;127053;127054;127055;127056;127057;127058;127059;127060;127061;127062;127063;127064;127065;127066 127053 14 EPATINYPFEK Unmodified 1307.6398 0.63976774 1387 O00217;E9PPW7;E9PKH6;E9PN51;F8W9K7 NDUFS8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.866 76.866 2 0.00045729 77703 QUIQUE_C1277_190116_001 111.61 97.837 1521700000 282590000 247310000 0 144770000 169230000 195300000 204270000 174410000 0 103800000 0 0 0 11360 1387 10629 100096;100097;100098;100099;100100;100101;100102;100103;100104;100105;100106;100107;100108 127067;127068;127069;127070;127071;127072;127073;127074;127075;127076;127077;127078;127079;127080;127081;127082;127083;127084 127070 18 EPAVGEPAEVTTTVLVR Unmodified 1766.9414 0.94142907 1885 P05362;K7EKL8 ICAM1 Intercellular adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.96 92.96 2 0.00028849 96558 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.075 78.563 190950000 0 20674000 34227000 27326000 0 30450000 0 23923000 38621000 15724000 0 0 0 11361 1885 10630 100109;100110;100111;100112;100113;100114;100115;100116 127085;127086;127087;127088;127089;127090;127091;127092 127092 6 EPAVLELEGK Unmodified 1083.5812 0.58119023 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.276 67.276 2 0.0020582 68174 QUIQUE_C1218_190116_001 92.051 57.665 2052000000 213450000 224490000 287730000 230580000 219800000 164020000 200470000 0 176490000 145090000 0 0 189850000 11362 2857 10631 100117;100118;100119;100120;100121;100122;100123;100124;100125;100126;100127;100128 127093;127094;127095;127096;127097;127098;127099;127100;127101;127102;127103;127104;127105;127106;127107;127108;127109;127110;127111 127093 19 EPAVLELEGKK Unmodified 1211.6762 0.67615325 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 2 41.38 41.38 2;3 0.0090664 38654 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.207 49.581 229040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105350000 123680000 11363 2857 10632 100129;100130;100131 127112;127113;127114 127112 3 EPCGGQNTVPGVR Unmodified 1369.6408 0.64084715 2006 P10915;D6RBS1 HAPLN1 Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 29.261 29.261 2 0.00017519 23665 QUIQUE_C1368_190116_001 142.83 119.4 814960000 88033000 112480000 90854000 95877000 69492000 80245000 178650000 0 39620000 16976000 42731000 0 0 11364 2006 10633 100132;100133;100134;100135;100136;100137;100138;100139;100140;100141;100142 127115;127116;127117;127118;127119;127120;127121;127122;127123;127124;127125;127126;127127;127128;127129;127130 127120 16 EPCGTPEYLAPEVVGR Unmodified 1772.8403 0.84033482 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 88.362 88.362 2 5.0278E-05 90584 QUIQUE_C1277_190116_001 124.12 106.75 275990000 71423000 85947000 64749000 0 53867000 0 0 0 0 0 0 0 0 11365 872;3632 10634 100143;100144;100145;100146 127131;127132;127133;127134 127132 3 EPDCFKDIVNMLMHHDR Unmodified 2155.9601 0.96014916 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 2 130.73 130.73 3;4 3.5748E-07 135570 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.63 93.843 1686900000 52003000 144330000 126180000 74663000 84613000 54610000 147830000 211780000 144220000 0 238700000 155820000 252190000 11366 2016 10635 100147;100148;100149;100150;100151;100152;100153;100154;100155;100156;100157;100158;100159;100160;100161;100162 127135;127136;127137;127138;127139;127140;127141;127142;127143;127144;127145;127146;127147;127148;127149;127150;127151;127152;127153;127154;127155;127156;127157;127158;127159;127160;127161 127153 27 EPDCFKDIVNMLMHHDR Oxidation (M) 2171.9551 0.95506378 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 1 1 1 2 1 1 115.23 115.23 4 3.8617E-05 120012 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.153 84.222 215610000 0 0 0 0 0 0 0 0 48118000 0 84524000 46633000 36333000 11367 2016 10635 100163;100164;100165;100166;100167 127162;127163;127164;127165;127166 127162 1321;1322 5 EPECIHVMR Unmodified 1169.5321 0.53214833 1521;335 A0A1B0GTF3;K7ENF6;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 26.326 26.326 3 0.064781 20260 QUIQUE_C1576_190116_001 32.32 18.113 73177000 0 0 0 0 0 0 73177000 0 0 0 0 0 0 11368 335;1521 10636 100168 127167 127167 1 EPEEPSQDAPR Unmodified 1253.5524 0.5524093 3612 Q8N7J2 AMER2 APC membrane recruitment protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.169 19.169 2 0.002565 11949 QUIQUE_C1403_190116_001 100.25 87.889 118580000 0 0 0 42200000 23901000 0 25442000 0 0 0 0 27041000 0 11369 3612 10637 100169;100170;100171;100172;100173;100174;100175 127168;127169;127170;127171;127172;127173;127174 127169 3 EPEKEIRPALELLEPIEQK Unmodified 2260.2315 0.23146308 2560 P50395 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 102.63 102.63 4 6.9353E-05 105060 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.007 76.914 288580000 0 0 30396000 0 0 0 0 60567000 49443000 0 76103000 72068000 0 11370 2560 10638 100176;100177;100178;100179;100180 127175;127176;127177;127178;127179 127179 3 EPELAAFVFK Unmodified 1149.607 0.60701105 2958 Q13009;A0A1B0GW57 TIAM1 T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 121.83 121.83 2 0.008683 126589 QUIQUE_C1218_190116_001 83.265 57.528 32556000 13544000 0 0 9442900 0 0 0 0 0 9568400 0 0 0 11371 2958 10639 100181;100182;100183;100184;100185;100186 127180;127181;127182;127183;127184;127185 127180 6 EPELGLEELLR Unmodified 1296.6925 0.6925316 4350 Q9NZL4 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 131.48 131.48 2 0.0035438 136751 QUIQUE_C1218_190116_001 81.338 44.781 158230000 43145000 0 0 41937000 0 30254000 0 0 0 0 0 42896000 0 11372 4350 10640 100187;100188;100189;100190 127186;127187;127188;127189 127186 4 EPESILQVLSQMEK Unmodified 1629.8284 0.82837315 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 153.62 153.62 2;3 1.3162E-36 158340 QUIQUE_C1277_190116_001 226.93 211.62 12362000000 1233900000 1553200000 1245300000 1148600000 899490000 1379300000 947000000 420200000 562530000 406750000 1078400000 613140000 874460000 11373 2120 10641 100191;100192;100193;100194;100195;100196;100197;100198;100199;100200;100201;100202;100203;100204;100205;100206;100207;100208;100209;100210;100211;100212;100213;100214;100215 127190;127191;127192;127193;127194;127195;127196;127197;127198;127199;127200;127201;127202;127203;127204;127205;127206;127207;127208;127209;127210;127211;127212;127213;127214;127215;127216;127217;127218;127219;127220;127221;127222;127223;127224;127225;127226;127227;127228;127229 127196 40 EPESILQVLSQMEK Oxidation (M) 1645.8233 0.82328777 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 2 1 124.74 124.74 2;3 2.4119E-14 122257 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.28 131.69 150790000 0 57513000 0 0 0 0 0 0 0 44952000 48328000 0 0 11374 2120 10641 100216;100217;100218;100219 127230;127231;127232;127233 127232 1447 4 EPETQPVCFFR Unmodified 1408.6445 0.64453555 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 86.414 86.414 2 0.0020474 88037 QUIQUE_C1277_190116_001 93.551 74.457 185470000 65363000 62339000 57773000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11375 4500 10642 100220;100221;100222 127234;127235;127236 127235 3 EPEVLSTMAIIVNK Unmodified 1542.8327 0.83273025 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 126.82 126.82 3 0.0014817 129944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.211 40.577 29035000 0 11022000 0 0 0 0 0 8909200 0 0 0 0 9104500 11376 1470 10643 100223;100224;100225;100226;100227 127237;127238;127239;127240;127241 127239 5 EPFAPSLGSAFHLPDAPPAAAAAALYYSSSTLPAPPR Unmodified 3707.8624 0.86239748 855 E7EPC8;Q9UQB3;D6RF55 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.12 162.12 3 1.8398E-70 165808 QUIQUE_C1277_190116_001 128.6 122.1 436440000 50493000 72366000 50858000 59369000 45040000 55026000 44767000 0 46730000 11790000 0 0 0 11377 855 10644 100228;100229;100230;100231;100232;100233;100234;100235;100236 127242;127243;127244;127245;127246;127247;127248;127249;127250;127251 127243 9 EPFELEAFYTNLHEVPYPDAR Unmodified 2536.1911 0.19105483 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 142.9 142.9 3 0.00012264 148186 QUIQUE_C1368_190116_001 85.737 80.981 771480000 179790000 152860000 186840000 0 0 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3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 104.01 104.01 2;3 1.5402E-12 106708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.91 108.24 3354900000 218680000 271150000 290560000 236400000 232110000 312530000 290490000 227590000 280160000 105130000 330200000 228970000 330970000 11381 3634 10648 100250;100251;100252;100253;100254;100255;100256;100257;100258;100259;100260;100261;100262;100263;100264;100265;100266;100267;100268;100269;100270;100271;100272;100273;100274;100275;100276 127267;127268;127269;127270;127271;127272;127273;127274;127275;127276;127277;127278;127279;127280;127281;127282;127283;127284;127285;127286;127287;127288;127289;127290;127291;127292;127293;127294;127295;127296;127297;127298;127299;127300;127301;127302;127303;127304;127305;127306;127307;127308;127309;127310;127311;127312;127313;127314;127315;127316;127317;127318;127319;127320;127321 127302 55 EPFLQQLK Unmodified 1001.5546 0.55458155 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 2 1 68.021 68.021 2 0.023727 68056 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.039 43.89 24220000 0 0 0 0 0 0 0 0 24220000 0 0 0 0 11382 574 10649 100277;100278;100279 127322;127323;127324 127324 3 EPFLSCCQFAESLR Unmodified 1742.7756 0.77562607 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000007350;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 114.67 114.67 2 2.5245E-05 119920 QUIQUE_C1438_190116_001 119.74 110.74 142090000 0 46944000 0 0 46065000 0 49079000 0 0 0 0 0 0 11383 290;327;328 10650 100280;100281;100282;100283 127325;127326;127327;127328;127329;127330 127328 6 EPFPTIYVDSQK Unmodified 1422.7031 0.70309628 1553 O43776;K7EIU7;K7EPK2;K7EQ35;K7EJ19 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.574 91.574 2 0.010013 92671 QUIQUE_C1403_190116_001 74.533 61.414 377820000 135300000 0 0 115350000 0 71128000 0 0 0 56043000 0 0 0 11384 1553 10651 100284;100285;100286;100287 127331;127332;127333;127334 127332 2 EPFPTIYVDSQKENER Unmodified 1950.9323 0.93232095 1553 O43776;K7EIU7;K7EPK2;K7EQ35;K7EJ19 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 2 1 73.182 73.182 2;3 9.7671E-06 73915 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.14 74.856 1550800000 0 31579000 106190000 84299000 130900000 0 140970000 166890000 229470000 37721000 189310000 215900000 217560000 11385 1553 10652 100288;100289;100290;100291;100292;100293;100294;100295;100296;100297;100298;100299;100300;100301;100302 127335;127336;127337;127338;127339;127340;127341;127342;127343;127344;127345;127346;127347;127348;127349;127350;127351;127352 127345 17 EPFTFPVK Unmodified 963.50657 0.50656873 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PPB5;E9PIP1;E9PR95;E9PSC3;E9PLC5;E9PLB3 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 1 82.752 82.752 2 0.054491 79429 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.549 44.135 24777000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24777000 0 0 0 11386 4127 10653 100303 127353 127353 1 EPFTIAQGK Unmodified 989.5182 0.51819605 2384 P35659;D6RDA2;H0Y8X0;D6R9L5 DEK Protein DEK yes no 0 0 0 1 43.433 43.433 2 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Beta-1,4-glucuronyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 85.688 85.688 2 0.010434 87906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.127 28.409 82559000 0 0 0 0 0 24885000 0 0 30215000 0 27460000 0 0 11393 1531 10660 100326;100327;100328 127377;127378;127379;127380 127379 4 EPGLLASCSDDGEVAFWK Unmodified 1979.8935 0.8934926 1682 O76071 CIAO1 Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1 yes yes 0 0 0 1 130.59 130.59 2 0.0068226 134131 QUIQUE_C1403_190116_001 91.858 77.848 19711000 0 0 0 19711000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11394 1682 10661 100329 127381 127381 0 EPGLQIWR Unmodified 997.53451 0.53451481 166;788;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.701 80.701 2 0.0036608 82082 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.24 68.684 11885000000 1046400000 883450000 1159700000 942790000 1017700000 913520000 1116300000 712240000 876380000 640590000 844430000 635780000 1095900000 + 11395 166;788;3305;311 10662 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Unmodified 2491.2358 0.23583696 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 165.85 165.85 2 1.4666E-27 172999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.46 142.35 414240000 0 17986000 29028000 0 0 0 68247000 0 115820000 0 94732000 88424000 0 11409 2522 10675 100470;100471;100472;100473;100474;100475;100476 127562;127563;127564;127565;127566;127567;127568;127569;127570 127569 8 EPLISGWLFFR Unmodified 1363.7289 0.72885752 2112 P16615;H7C5W9;O14983 ATP2A2;ATP2A1 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 159.49 159.49 2 0.0038272 166945 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.928 53.613 17114000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17114000 0 0 11410 2112 10676 100477;100478 127571;127572 127572 2 EPLMEEYSIATQVWK Unmodified 1822.8811 0.881137 2854 Q01433 AMPD2 AMP deaminase 2 yes yes 0 0 0 1 1 138.41 138.41 2 0.0010443 144307 QUIQUE_C1576_190116_001 72.29 60.971 66791000 0 0 0 0 0 0 32819000 0 0 0 0 33973000 0 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0.36830769 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 1 0 1 119.07 119.07 3 0.00077306 115810 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.746 36.242 41179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41179000 0 0 0 11414 2051 10679 100496 127597 127597 1367 1 EPLPSLEAVYLITPSEK Unmodified 1885.0084 0.0084460064 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A0D9SFQ7;A0A0D9SFW6;A0A0D9SEP9;A0A0D9SEH5;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 141.13 141.13 2;3 2.0737E-37 146943 QUIQUE_C1218_190116_001 190.37 168.49 10126000000 1081500000 993950000 663680000 835380000 860480000 642830000 720890000 541580000 566900000 414180000 925890000 1048300000 830290000 11415 273;342 10680 100497;100498;100499;100500;100501;100502;100503;100504;100505;100506;100507;100508;100509;100510;100511;100512 127598;127599;127600;127601;127602;127603;127604;127605;127606;127607;127608;127609;127610;127611;127612;127613;127614;127615;127616;127617;127618;127619;127620;127621;127622;127623;127624;127625;127626;127627 127598 30 EPLPTLPLGR Unmodified 1091.6339 0.63389451 229 A0A0C4DG44;O43464 HTRA2 Serine protease HTRA2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 90.731 90.731 2 0.049357 94513 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.598 52.213 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11416 229 10681 100513 127628 127628 1 EPLTPEEVQSVR Unmodified 1382.7042 0.70415892 1208 H3BV90;Q6FI81;H3BUG4;H3BT65;H3BPG7 CIAPIN1 Anamorsin yes no 0 0 0 1 1 58.529 58.529 2 0.0035491 58299 QUIQUE_C1576_190116_001 101.38 66.994 128000000 0 0 0 0 0 0 91037000 0 0 0 36961000 0 0 11417 1208 10682 100514;100515 127629;127630 127629 0 EPLVDVVDPK Unmodified 1109.5968 0.5968403 953 E9PKG1;Q99873;E9PQ98;E9PIX6 PRMT1 Protein arginine N-methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 71.636 71.636 2 0.020435 72748 QUIQUE_C1218_190116_001 70.056 50.27 114820000 71973000 0 0 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yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 125.03 125.03 2 0.0010631 129488 QUIQUE_C1368_190116_001 90.685 74.487 271460000 27033000 49710000 83237000 0 0 0 37942000 0 0 0 73542000 0 0 11427 288 10691 100543;100544;100545;100546;100547 127660;127661;127662;127663;127664;127665;127666;127667;127668 127664 9 EPPKPEQVESR Unmodified 1294.6517 0.65172941 1586 O60664;K7ERZ3 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 14.753 14.753 2;3 0.00054757 7321 QUIQUE_C1218_190116_001 94.767 81.367 241450000 39473000 0 0 0 37907000 79931000 45739000 0 38396000 0 0 0 0 11428 1586 10692 100548;100549;100550;100551;100552;100553 127669;127670;127671;127672;127673;127674 127669 6 EPPLELKDTDAAVGDNIGYITFVLFPR Unmodified 2989.5437 0.5436891 1486 O15144;H7C3F9 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 166.45 166.45 3;4 5.6013E-24 173719 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.79 94.558 657930000 0 0 0 0 34393000 0 0 103170000 138610000 0 108770000 150300000 122690000 11429 1486 10693 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no 0 0 0 1 97.513 97.513 2 0.034163 100244 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.2 52.866 23521000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23521000 0 11444 3280 10708 100672 127858 127858 0 EPSTASGGGQLNR Unmodified 1272.6058 0.60584185 426 A0A2R8Y566;Q9P260;A0A075B785 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 0 1 1 1 15.986 15.986 2 0.004591 8329 QUIQUE_C1438_190116_001 70.389 48.941 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11445 426 10709 100673;100674;100675 127859;127860;127861 127860 3 EPTQAVVEEQVLDKEEPLPEEQR Unmodified 2691.3239 0.3239195 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;E9PQD2;E9PRG1;E9PIG0;E9PQN0;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.278 93.278 2;3 7.0274E-53 96514 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.77 138.79 2676200000 211660000 243600000 0 469490000 229120000 323890000 197150000 217040000 287310000 176330000 141050000 179560000 0 11446 933;1529 10710 100676;100677;100678;100679;100680;100681;100682;100683;100684;100685;100686;100687 127862;127863;127864;127865;127866;127867;127868;127869;127870;127871;127872;127873;127874;127875;127876;127877;127878;127879;127880;127881;127882 127881 21 EPTSSEQGGLEGSGSAAGEGKPALSEEER Unmodified 2845.285 0.28496781 942 E9PJ81;E9PRQ7;Q04323 UBXN1 UBX domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 2 1 47.301 47.301 3 1.8939E-27 44430 QUIQUE_C1403_190116_001 108.75 95.503 82210000 0 0 0 34060000 0 48150000 0 0 0 0 0 0 0 11447 942 10711 100688;100689;100690 127883;127884;127885 127883 3 EPTVDISPDTVGTLSLIMLAQAQEVFFLK Unmodified 3161.657 0.6570043 3700 Q8WUM4;A0A3B3IT07;C9IZF9 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 182.3 182.3 3 5.4384E-28 188605 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.97 97.479 10671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10671000 0 0 11448 3700 10712 100691 127886 127886 1 EPVELGQPNTLICHIDK Unmodified 1961.9881 0.98806169 323 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4 EPVQTLYSQSPALELDKFLEDVR Unmodified 2676.3647 0.3646621 4439 Q9UHY1;F8W6G1 NRBP1 Nuclear receptor-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 156.71 156.71 3 3.0316E-23 161457 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.62 118.67 239610000 0 0 0 0 48031000 0 58617000 0 65589000 0 0 67377000 0 11458 4439 10722 100763;100764;100765;100766 127963;127964;127965;127966 127965 4 EPVVTLEGHTK Unmodified 1208.6401 0.6401021 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0;H3BNA2;H3BU76;H3BSL1 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 25.341 25.341 2;3 0.00080513 18576 QUIQUE_C1368_190116_001 95.09 75.819 1246600000 141120000 149930000 309240000 186330000 0 156850000 0 0 65502000 97586000 0 0 140050000 11459 2327 10723 100767;100768;100769;100770;100771;100772;100773;100774;100775;100776 127967;127968;127969;127970;127971;127972;127973;127974;127975;127976;127977;127978 127971 12 EPVVTLEGHTKR Unmodified 1364.7412 0.74121312 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0;H3BNA2;H3BU76;H3BSL1 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 1 1 19.101 19.101 3 0.02912 11912 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.33 18.118 40086000 0 0 0 0 0 0 0 40086000 0 0 0 0 0 11460 2327 10724 100777 127979 127979 1 EPVVTPQDLEGPGR Unmodified 1492.7522 0.75217174 3348 Q66K74 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 72.622 72.622 2 2.3601E-10 74135 QUIQUE_C1218_190116_001 133.89 98.479 284570000 120410000 0 117800000 0 0 0 0 0 0 0 0 46368000 0 11461 3348 10725 100778;100779;100780;100781 127980;127981;127982;127983;127984;127985 127981 6 EPWLLPSQHNDIIR Unmodified 1716.8948 0.89475365 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 1 1 1 94.646 94.646 2 0.0023336 98114 QUIQUE_C1576_190116_001 72.2 60.988 137680000 0 0 0 0 25210000 0 31276000 0 0 0 48390000 32806000 0 11462 956;3084 10726 100782;100783;100784;100785 127986;127987;127988;127989 127987 4 EPYNIDVDHR Unmodified 1256.5786 0.57856447 4429 Q9UHC6;A0A0J9YYA0;A0A0J9YWG3;B7Z1Y6 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 37.814 37.814 2 0.051455 33563 QUIQUE_C1277_190116_001 66.299 44.213 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11463 4429 10727 100786 127990 127990 1 EQADFAVEALAK Unmodified 1290.6456 0.6455814 2379;2385 P35749;P35580 MYH11;MYH10 Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 84.902 84.902 2 0.0020514 81732 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.379 60.148 317880000 90926000 91383000 0 0 0 50495000 0 44883000 0 40191000 0 0 0 11464 2385;2379 10728 100787;100788;100789;100790;100791 127991;127992;127993;127994;127995 127995 5 EQADYCVSHMK Unmodified 1366.5646 0.56457067 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 22.104 22.104 2 0.0046455 14234 QUIQUE_C1277_190116_001 83.456 61.759 33080000 33080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11465 267;275;3025 10729 100792;100793;100794;100795 127996;127997;127998;127999 127997 4 EQADYCVSHMKPYVDGK Oxidation (M) 2041.8874 0.88736137 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 1 2 1 2 1 2 2 3 2 2 2 27.453 27.453 2;3;4 2.0167E-52 21028 QUIQUE_C1368_190116_001 185.27 164.04 3230500000 86406000 303670000 40228000 108080000 0 0 119890000 361570000 322160000 496300000 478510000 419850000 493810000 11466 267;275;3025 10730 100796;100797;100798;100799;100800;100801;100802;100803;100804;100805;100806;100807;100808;100809;100810;100811;100812;100813;100814;100815 128000;128001;128002;128003;128004;128005;128006;128007;128008;128009;128010;128011;128012;128013;128014;128015;128016;128017;128018;128019;128020;128021;128022 128004 163 22 EQADYCVSHMKPYVDGK Unmodified 2025.8924 0.89244675 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 3 3 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 46.16 46.16 2;3;4 1.4284E-35 43181 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.62 153.37 7464500000 390070000 1080400000 647360000 734500000 395100000 559790000 680100000 794050000 459060000 138330000 530810000 531560000 523300000 11467 267;275;3025 10730 100816;100817;100818;100819;100820;100821;100822;100823;100824;100825;100826;100827;100828;100829;100830;100831;100832;100833;100834;100835;100836;100837;100838;100839;100840;100841;100842;100843;100844 128023;128024;128025;128026;128027;128028;128029;128030;128031;128032;128033;128034;128035;128036;128037;128038;128039;128040;128041;128042;128043;128044;128045;128046;128047;128048;128049;128050;128051;128052 128044 22 EQAEAEVASLNR Unmodified 1315.6368 0.63680763 63;3271 Q5HYB6;A0A087WWU8;D6R904 DKFZp686J1372;TPM3 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 43.754 43.754 2;3 0.00017601 40376 QUIQUE_C1277_190116_001 119.22 10.792 9308000000 0 1241200000 1296400000 875220000 1040200000 984050000 839440000 389320000 628140000 471790000 524760000 476410000 541080000 11468 3271;63 10731 100845;100846;100847;100848;100849;100850;100851;100852;100853;100854;100855;100856;100857 128053;128054;128055;128056;128057;128058;128059;128060;128061;128062;128063;128064;128065;128066;128067;128068 128053 13 EQAEAEVASLNRR Unmodified 1471.7379 0.73791866 63;3271 Q5HYB6;A0A087WWU8;D6R904 DKFZp686J1372;TPM3 no no 0 0 1 1 1 1 1 33.057 33.057 3 0.0016603 28170 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.073 3.1815 809910000 0 0 0 0 0 0 0 194120000 208400000 0 243140000 164260000 0 11469 3271;63 10732 100858;100859;100860;100861 128069;128070;128071;128072 128072 2 EQAELEAAR Unmodified 1015.4934 0.49343786 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 19.974 19.974 2 0.019692 12984 QUIQUE_C1218_190116_001 63.419 36.115 993210000 993210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11470 3117 10733 100862 128073 128073 1 EQAELTGLR Unmodified 1015.5298 0.52982336 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 38.334 38.334 2 0.023842 34241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.436 32.262 68315000 0 0 0 0 0 0 0 46874000 0 21441000 0 0 0 11471 3871 10734 100863;100864 128074;128075 128074 2 EQAGGDATENFEDVGHSTDAR Unmodified 2204.9206 0.92064664 1773 P00167 CYB5A Cytochrome b5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.084 50.084 3 2.5483E-10 47800 QUIQUE_C1277_190116_001 107.33 103.72 1145000000 101590000 95943000 101940000 141050000 91933000 107530000 82048000 78580000 73031000 42539000 101110000 50160000 77520000 11472 1773 10735 100865;100866;100867;100868;100869;100870;100871;100872;100873;100874;100875;100876;100877 128076;128077;128078;128079;128080;128081;128082;128083;128084;128085;128086;128087;128088;128089 128077 14 EQAIGEYEDLR Unmodified 1321.615 0.61500956 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 52.653 52.653 2 0.0025929 62291 QUIQUE_C1563_190116_001 77.379 63.081 656790000 0 0 77984000 0 0 54885000 61311000 121190000 0 0 206530000 0 134880000 11473 515 10736 100878;100879;100880;100881;100882;100883;100884;100885;100886;100887 128090;128091;128092;128093;128094;128095;128096;128097;128098;128099;128100 128093 11 EQAIGEYEDLRAENQK Unmodified 1891.8912 0.89118442 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 53.091 53.091 2 0.00059719 51567 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.157 31.565 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11474 515 10737 100888;100889;100890 128101;128102;128103 128101 3 EQALADLNSVER Unmodified 1343.6681 0.66810776 1633 O75410;E7EVI4;E7ET87;B4E3H6;H0YBT8;H0YAY0 TACC1 Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 66.16 66.16 2 0.0058509 65896 QUIQUE_C1218_190116_001 65.5 46.72 23974000 23974000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11475 1633 10738 100891 128104 128104 1 EQALAVSR Unmodified 872.47158 0.4715802 2175 P21281;H0YC04;E5RGH6;H0YAT8 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.02 20.02 2 0.0036755 12829 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.46 48.319 6862400000 589600000 1282300000 0 665980000 0 957820000 0 1154800000 754570000 598300000 0 858980000 0 11476 2175 10739 100892;100893;100894;100895;100896;100897;100898;100899;100900 128105;128106;128107;128108;128109;128110;128111;128112;128113;128114 128114 8 EQALHWVAETLK Unmodified 1423.746 0.74596415 4453 Q9UJ14 GGT7 Gamma-glutamyltransferase 7;Gamma-glutamyltransferase 7 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 7 light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 2 85.689 85.689 2;3 0.00080489 86861 QUIQUE_C1277_190116_001 103.43 75.658 84017000 27221000 24027000 0 0 0 0 0 0 20599000 12170000 0 0 0 11477 4453 10740 100901;100902;100903;100904;100905 128115;128116;128117;128118;128119 128116 5 EQALQDLQQQR Unmodified 1355.6793 0.67934115 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.876 42.876 2 3.018E-08 39509 QUIQUE_C1277_190116_001 154.04 127.52 552020000 0 62233000 0 0 102490000 65917000 59362000 56043000 68246000 29290000 64104000 44342000 0 11478 3108 10741 100906;100907;100908;100909;100910;100911;100912;100913;100914;100915 128120;128121;128122;128123;128124;128125;128126;128127;128128;128129;128130 128120 8 EQALQEAMEQLEQLELER Unmodified 2186.0525 0.052512441 4425 Q9UH65;E7EMB1 SWAP70 Switch-associated protein 70 yes no 0 0 0 2 1 2 163.87 163.87 2;3 8.6686E-24 167886 QUIQUE_C1277_190116_001 178.58 149.78 106100000 0 21404000 17136000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67559000 11479 4425 10742 100916;100917;100918;100919;100920 128131;128132;128133;128134;128135 128132 4 EQANAVSEAVVSSVNTVATK Unmodified 2003.0171 0.017113212 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 3 1 103.16 103.16 2;3 2.3076E-56 105887 QUIQUE_C1277_190116_001 172.42 156.88 1619200000 317530000 320660000 197040000 68023000 81861000 195950000 83849000 30067000 33031000 74626000 55685000 84020000 76870000 11480 1681 10743 100921;100922;100923;100924;100925;100926;100927;100928;100929;100930;100931;100932;100933;100934;100935;100936;100937;100938;100939 128136;128137;128138;128139;128140;128141;128142;128143;128144;128145;128146;128147;128148;128149;128150;128151;128152;128153;128154;128155;128156;128157 128139 20 EQAPDSVEGLLNALR Unmodified 1610.8264 0.82639932 4121 Q9H0Q0 FAM49A Protein FAM49A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.15 143.15 2 6.3799E-06 139214 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.45 99.687 1845500000 143330000 157010000 156170000 103460000 144450000 162120000 168800000 115380000 191080000 64388000 149710000 154350000 135260000 11481 4121 10744 100940;100941;100942;100943;100944;100945;100946;100947;100948;100949;100950;100951;100952 128158;128159;128160;128161;128162;128163;128164;128165;128166;128167;128168;128169;128170 128167 13 EQAPHCICANGR Unmodified 1411.6085 0.60850117 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 14.741 14.741 2;3 0.0038333 7146 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.019 48.065 275030000 0 28743000 14389000 22363000 54576000 14292000 16267000 0 12088000 0 64330000 0 47981000 11482 1802 10745 100953;100954;100955;100956;100957;100958;100959;100960;100961;100962;100963 128171;128172;128173;128174;128175;128176;128177;128178;128179;128180;128181 128178 9 EQASHLGGAVFSGAGNIAAATGLVK Unmodified 2325.2077 0.20770795 3170 Q16143;G4Y816 SNCB Beta-synuclein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 117.4 117.4 2;3 8.5938E-130 121396 QUIQUE_C1368_190116_001 219.99 207.37 10308000000 1555100000 1674900000 669690000 826040000 1010400000 409110000 730730000 430380000 629260000 308380000 859340000 466730000 737610000 11483 3170 10746 100964;100965;100966;100967;100968;100969;100970;100971;100972;100973;100974;100975;100976;100977;100978;100979;100980;100981;100982;100983;100984;100985;100986;100987;100988;100989 128182;128183;128184;128185;128186;128187;128188;128189;128190;128191;128192;128193;128194;128195;128196;128197;128198;128199;128200;128201;128202;128203;128204;128205;128206;128207;128208;128209;128210;128211;128212;128213;128214;128215 128190 32 EQAVEGGEVELSCLVPR Unmodified 1870.9095 0.90947702 3655 Q8NFZ8 CADM4 Cell adhesion molecule 4 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.03 113.03 2 6.0013E-30 116787 QUIQUE_C1277_190116_001 151.44 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81495000 11488 2233 10751 101031;101032;101033;101034;101035;101036;101037;101038 128260;128261;128262;128263;128264;128265;128266;128267 128264 8 EQDDLLVLLADQDQK Unmodified 1741.8734 0.87340909 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 137.41 137.41 2 1.4232E-13 144319 QUIQUE_C1438_190116_001 136.93 116.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11489 1591 10752 101039;101040 128268;128269 128268 2 EQDHFLISPK Unmodified 1212.6139 0.61388734 2382 P35612;C9JTM0;C9J080;A0A1C7CYY0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 41.768 41.768 2;3 0.00020314 38830 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.66 118.88 2980200000 0 349630000 256130000 273020000 241000000 282520000 327310000 155400000 179870000 164310000 241130000 225520000 284380000 11490 2382 10753 101041;101042;101043;101044;101045;101046;101047;101048;101049;101050;101051;101052;101053 128270;128271;128272;128273;128274;128275;128276;128277;128278;128279;128280;128281;128282;128283;128284;128285;128286;128287;128288 128276 12 EQDHIIIIPR Unmodified 1232.6877 0.68772099 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 54.965 54.965 2;3 7.6041E-05 52515 QUIQUE_C1368_190116_001 102.06 79.42 18502000000 1251000000 1532300000 1655900000 1394200000 1480800000 1388500000 1674900000 1027500000 1571000000 646590000 1641100000 1380300000 1857700000 11491 4418 10754 101054;101055;101056;101057;101058;101059;101060;101061;101062;101063;101064;101065;101066;101067;101068;101069;101070;101071;101072;101073;101074;101075;101076;101077;101078;101079 128289;128290;128291;128292;128293;128294;128295;128296;128297;128298;128299;128300;128301;128302;128303;128304;128305;128306;128307;128308;128309;128310;128311;128312;128313;128314;128315;128316;128317;128318;128319;128320;128321;128322;128323;128324;128325;128326;128327;128328;128329;128330;128331;128332 128297 42 EQDLQLEELR Unmodified 1271.6357 0.635745 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 74.196 74.196 2 0.011551 74831 QUIQUE_C1218_190116_001 75.294 33.185 59067000 59067000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11492 1591 10755 101080 128333 128333 1 EQDLSVVIHTLAQEFDIYR Unmodified 2275.1485 0.14846174 650 B7WPJ3;Q8WTX7;H7C1Q1 GATSL3 GATS-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 169.69 169.69 3 0.0051372 174700 QUIQUE_C1368_190116_001 42.711 39.521 96133000 0 0 20356000 0 0 0 0 44690000 0 0 31086000 0 0 11493 650 10756 101081;101082;101083 128334;128335;128336 128334 2 EQDSPPMKPSALDAIR Unmodified 1753.8669 0.86688392 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 1 1 1 64.638 64.638 3 0.016022 63366 QUIQUE_C1403_190116_001 34.498 23.71 111050000 63274000 0 0 47778000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11494 3199 10757 101084;101085 128337;128338 128338 2 EQDYLCHVYVR Unmodified 1480.6769 0.67689831 1502 O15498 YKT6 Synaptobrevin homolog YKT6 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 59.358 59.358 2;3 0.00037546 58688 QUIQUE_C1576_190116_001 114.36 87.265 1371400000 96621000 108700000 118630000 150450000 95009000 110010000 177610000 0 101730000 0 162210000 65133000 185290000 11495 1502 10758 101086;101087;101088;101089;101090;101091;101092;101093;101094;101095;101096;101097;101098;101099;101100;101101;101102 128339;128340;128341;128342;128343;128344;128345;128346;128347;128348;128349;128350;128351;128352;128353;128354;128355;128356;128357;128358 128350 17 EQEAAPGGAGGLAAGK Unmodified 1382.679 0.6790068 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.702 27.702 2 0.0038708 21461 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.437 42.436 1924800000 246600000 0 149070000 0 0 200620000 159010000 325710000 211300000 65199000 0 249020000 318240000 11496 3889 10759 101103;101104;101105;101106;101107;101108;101109;101110;101111;101112 128359;128360;128361;128362;128363;128364;128365;128366;128367;128368;128369 128367 11 EQEAGLLQFLR Unmodified 1302.6932 0.6932003 4350 Q9NZL4;K7EN20 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 127.56 127.56 2 0.00044352 131762 QUIQUE_C1277_190116_001 104.17 75.768 241590000 0 51747000 0 0 0 0 0 72781000 0 30003000 87063000 0 0 11497 4350 10760 101113;101114;101115;101116 128370;128371;128372;128373;128374 128370 4 EQEDIVVLK Unmodified 1071.5812 0.58119023 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000001528 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 56.469 56.469 2 0.045989 54715 QUIQUE_C1403_190116_001 51.854 22.438 20554000 0 0 0 20554000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 11498 3161 10761 101117 128375 128375 1 EQEEADIAAR Unmodified 1130.5204 0.52038089 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.709 21.709 2 0.0026126 15381 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.948 46.839 785910000 90928000 56709000 0 0 91285000 86997000 62340000 65980000 98931000 0 77103000 67025000 88610000 11499 309;4058 10762 101118;101119;101120;101121;101122;101123;101124;101125;101126;101127;101128 128376;128377;128378;128379;128380;128381;128382;128383;128384;128385;128386;128387;128388 128382 13 EQEELLAPADGTVELVR Unmodified 1867.9527 0.95272204 2157 P19971;C9JGI3 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 1 109.23 109.23 2 8.2787E-10 113519 QUIQUE_C1368_190116_001 124.3 101.58 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11500 2157 10763 101129 128389 128389 1 EQEFPVEPVGEK Unmodified 1386.6667 0.66671078 1610 O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 61.91 61.91 2 0.027096 62252 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.452 22.627 35788000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35788000 0 0 11501 1610 10764 101130 128390 128390 1 EQEHMINWVEK Unmodified 1441.666 0.66599927 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 2 54.406 54.406 2;3 6.2453E-57 53241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 231.05 187.97 3303600000 479830000 394990000 410460000 359760000 152500000 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1999.917 0.91702201 987;2987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468;Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRD;PTPRS Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 1 1 59.098 59.098 3 0.013059 58394 QUIQUE_C1576_190116_001 35.834 27.125 91594000 0 29345000 32425000 0 0 0 29824000 0 0 0 0 0 0 11514 987;2987 10777 101228;101229;101230 128511;128512;128513 128513 2 EQFLDGDGWTSR Unmodified 1409.6212 0.62115757 2268 P27797;K7EJB9 CALR Calreticulin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 90.362 90.362 2 9.1839E-05 93983 QUIQUE_C1438_190116_001 134.84 128.54 8675000000 604330000 668440000 709690000 607100000 798940000 615510000 822640000 379570000 687040000 311640000 1058300000 747540000 664340000 11515 2268 10778 101231;101232;101233;101234;101235;101236;101237;101238;101239;101240;101241;101242;101243;101244;101245 128514;128515;128516;128517;128518;128519;128520;128521;128522;128523;128524;128525;128526;128527;128528;128529;128530;128531;128532;128533 128518 17 EQFLQQK Unmodified 919.47633 0.47633123 2919 Q08378 GOLGA3 Golgin subfamily A member 3 yes yes 0 0 0 1 27.111 27.111 2 0.063196 20448 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.889 18.482 82730000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82730000 0 0 0 11516 2919 10779 101246 128534 128534 1 EQFSQGSPSNCLETSLAEIFPLGK Unmodified 2638.2585 0.25848247 4251 Q9NQ88;A0A0U1RQD1 TIGAR Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR yes no 0 0 0 1 162.9 162.9 3 0.0056043 166074 QUIQUE_C1403_190116_001 32.288 29.526 23033000 0 0 0 23033000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11517 4251 10780 101247 128535 128535 1 EQFWEQAK Unmodified 1064.4927 0.49270958 3186 Q16643;D6R9W4 DBN1 Drebrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.911 53.911 2 0.013348 52195 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.435 68.652 2513800000 0 297800000 0 0 271840000 276670000 323190000 230770000 213840000 0 321320000 219920000 358440000 11518 3186 10781 101248;101249;101250;101251;101252;101253;101254;101255;101256 128536;128537;128538;128539;128540;128541;128542;128543;128544;128545;128546 128542 10 EQGFLSFWR Unmodified 1168.5665 0.56654322 2038 P12235;V9GYG0 SLC25A4 ADP/ATP translocase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 131.9 131.9 2 1.9258E-06 135965 QUIQUE_C1403_190116_001 153.78 108.06 7178800000 530380000 490410000 520120000 394790000 326840000 417010000 515270000 673230000 735700000 245110000 920510000 678000000 731410000 11519 2038 10782 101257;101258;101259;101260;101261;101262;101263;101264;101265;101266;101267;101268;101269;101270 128547;128548;128549;128550;128551;128552;128553;128554;128555;128556;128557;128558;128559;128560;128561;128562;128563;128564;128565;128566;128567;128568 128554 21 EQGGSGLGSGSSGGGGSTSGLGSGYIGR Unmodified 2385.0793 0.079272552 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 67.996 67.996 2 1.9335E-53 67762 QUIQUE_C1277_190116_001 176.42 156.04 40000000 0 40000000 0 0 0 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128587;128588;128589;128590;128591;128592 128587 6 EQGNIEEAVR Unmodified 1143.552 0.55201537 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.88 28.88 2 0.0027159 22914 QUIQUE_C1277_190116_001 88.37 41.944 857810000 92247000 84971000 67299000 64269000 74447000 56218000 65080000 0 65569000 33600000 86854000 87163000 80095000 11523 1497 10786 101295;101296;101297;101298;101299;101300;101301;101302;101303;101304;101305;101306 128593;128594;128595;128596;128597;128598;128599;128600;128601;128602;128603;128604;128605 128594 13 EQGQAPITPQQGQALAK Unmodified 1763.9166 0.91661131 2830 P84095 RHOG Rho-related GTP-binding protein RhoG yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.324 46.324 2 1.2288E-06 43599 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.87 107.06 343650000 34458000 38654000 58545000 35574000 29753000 27609000 32677000 0 21738000 15012000 49626000 0 0 11524 2830 10787 101307;101308;101309;101310;101311;101312;101313;101314;101315;101316 128606;128607;128608;128609;128610;128611;128612;128613;128614;128615 128615 9 EQGQVPLNSTALQDIISK Unmodified 1940.0215 0.021470309 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 120.69 120.69 2 0.0057569 125767 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.26 46.005 13405000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13405000 0 0 0 11525 2882 10788 101317;101318 128616;128617 128617 2 EQGSNTAAENTGSNER Unmodified 1663.7034 0.70338365 2803 P78324 SIRPA Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 yes yes 0 0 0 1 2 10.381 10.381 2;3 4.3729E-66 2708 QUIQUE_DMIX4_190116_001 240.59 233.47 162170000 0 70870000 0 0 0 0 0 0 0 91301000 0 0 0 11526 2803 10789 101319;101320;101321 128618;128619;128620 128619 3 EQGVDENETLLLR Unmodified 1514.7577 0.75765105 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 80.326 80.326 2 0.00078152 82640 QUIQUE_C1218_190116_001 115.57 98.548 264590000 0 0 0 0 102610000 0 0 0 0 0 0 161990000 0 11527 4606 10790 101322;101323;101324;101325 128621;128622;128623;128624 128621 3 EQGVEEHETLLLR Unmodified 1551.7893 0.78928553 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 1 55.772 55.772 2;3 8.9821E-10 53711 QUIQUE_C1368_190116_001 120.55 105.29 1216600000 70217000 144050000 192440000 197760000 0 105940000 54432000 133500000 115750000 69397000 0 90252000 42841000 11528 4600 10791 101326;101327;101328;101329;101330;101331;101332;101333;101334;101335;101336;101337;101338;101339;101340;101341;101342;101343;101344;101345;101346 128625;128626;128627;128628;128629;128630;128631;128632;128633;128634;128635;128636;128637;128638;128639;128640;128641;128642;128643;128644;128645;128646;128647;128648;128649;128650;128651 128632 27 EQGVLSFWR Unmodified 1120.5665 0.56654322 2039;1878 P05141;P12236 SLC25A5;SLC25A6 ADP/ATP translocase 2;ADP/ATP translocase 2, N-terminally processed;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.64 110.64 1;2 1.4514E-21 113960 QUIQUE_C1277_190116_001 188.98 144.26 15801000000 1362400000 0 1323900000 963920000 812450000 1177800000 1274100000 1750800000 1703500000 0 2182400000 1501600000 1748100000 11529 1878;2039 10792 101347;101348;101349;101350;101351;101352;101353;101354;101355;101356;101357;101358;101359;101360 128652;128653;128654;128655;128656;128657;128658;128659;128660;128661;128662;128663;128664;128665;128666;128667;128668;128669;128670 128655 18 EQGVTFPAIGSQAAEQAK Unmodified 1830.9112 0.91119158 3756 Q92783;A6NMU3 STAM Signal transducing adapter molecule 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.869 82.869 2 1.9018E-10 85398 QUIQUE_C1218_190116_001 115.1 85.76 392630000 35778000 33544000 43023000 45276000 51873000 33667000 44008000 0 0 19143000 35596000 0 50725000 11530 3756 10793 101361;101362;101363;101364;101365;101366;101367;101368;101369;101370;101371;101372 128671;128672;128673;128674;128675;128676;128677;128678;128679;128680;128681;128682;128683;128684;128685 128671 13 EQGVTFPSGDIQEQLIR Unmodified 1915.964 0.96395543 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.04 115.04 2 1.6492E-12 119758 QUIQUE_C1576_190116_001 124.47 86.448 1218000000 112070000 123100000 117900000 136340000 109640000 82189000 119620000 69668000 75250000 73946000 113530000 84776000 0 11531 2524 10794 101373;101374;101375;101376;101377;101378;101379;101380;101381;101382;101383;101384 128686;128687;128688;128689;128690;128691;128692;128693;128694;128695;128696;128697;128698;128699;128700;128701;128702;128703 128697 18 EQGYDPFKEDLNHLVGYK Unmodified 2151.0273 0.027283968 4301 Q9NV35 NUDT15 Probable 8-oxo-dGTP diphosphatase NUDT15 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 106.42 106.42 4 0.00016421 109438 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.437 46.942 125490000 35687000 43139000 0 0 0 21726000 0 0 24934000 0 0 0 0 11532 4301 10795 101385;101386;101387;101388 128704;128705;128706;128707 128707 4 EQGYDVIAYLANIGQK Unmodified 1780.8996 0.89956426 1797 P00966;Q5T6L6;Q5T6L5 ASS1 Argininosuccinate synthase yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 150.5 150.5 2;3 4.9071E-19 156527 QUIQUE_C1576_190116_001 146.16 109.18 2465600000 175290000 245380000 201070000 273650000 216870000 151100000 156560000 120890000 189480000 97934000 266340000 198560000 172440000 11533 1797 10796 101389;101390;101391;101392;101393;101394;101395;101396;101397;101398;101399;101400;101401;101402;101403;101404;101405;101406;101407;101408;101409;101410;101411;101412;101413 128708;128709;128710;128711;128712;128713;128714;128715;128716;128717;128718;128719;128720;128721;128722;128723;128724;128725;128726;128727;128728;128729;128730;128731;128732;128733;128734;128735;128736;128737;128738;128739;128740;128741;128742;128743 128722 36 EQGYDVIAYLANIGQKEDFEEAR Unmodified 2657.2609 0.26092531 1797 P00966;Q5T6L6;Q5T6L5 ASS1 Argininosuccinate synthase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 150.68 150.68 3 2.0758E-23 153682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.28 120.17 681220000 0 0 0 0 0 0 0 191770000 119220000 0 104260000 97888000 168090000 11534 1797 10797 101414;101415;101416;101417;101418 128744;128745;128746;128747;128748 128744 5 EQHDALEFFNSLVDSLDEALK Unmodified 2419.1543 0.15433498 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 174.6 174.6 3 0.00030245 178689 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.621 51.421 32896000 0 0 0 0 0 0 0 0 32896000 0 0 0 0 11535 1414;3777 10798 101419 128749 128749 1 EQHGLQLQSEINQLHSK Unmodified 1988.0076 0.007551579 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 58.457 58.457 4 0.010163 57362 QUIQUE_C1218_190116_001 37.85 26.73 22766000 22766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11536 3108 10799 101420 128750 128750 1 EQHGVAASCLEDLR Unmodified 1583.7362 0.7362041 1393 O00273;K7ERT1 DFFA DNA fragmentation factor subunit alpha yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 1 1 53.29 53.29 2;3 8.0046E-07 50905 QUIQUE_C1403_190116_001 123.84 97.719 554680000 85860000 85143000 0 93335000 47858000 48411000 0 57130000 60526000 19483000 0 0 56932000 11537 1393 10800 101421;101422;101423;101424;101425;101426;101427;101428;101429;101430;101431;101432;101433 128751;128752;128753;128754;128755;128756;128757;128758;128759;128760;128761;128762;128763 128756 13 EQHPDMSVTK Unmodified 1170.5339 0.53392246 143;4559;560;449 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A3B3ITP0;A0A2R8Y7Y3;Q4VB86;A0A2R8YD30;A0A2U3TZH6;P11171;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3;EPB41 Protein 4.1;Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 15.247 15.247 2;3 0.00065799 7245 QUIQUE_DMIX8_190116_001 129.28 98.544 1431900000 94137000 251340000 92718000 139280000 168180000 282470000 61804000 196370000 0 65830000 0 0 79819000 11538 143;449;560;4559 10801 101434;101435;101436;101437;101438;101439;101440;101441;101442;101443;101444;101445;101446;101447 128764;128765;128766;128767;128768;128769;128770;128771;128772;128773;128774;128775;128776;128777;128778;128779 128779 14 EQHPDMSVTR Unmodified 1198.5401 0.54007047 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;E9PPC9;O43491;Q6R5J7;Q6ZSX4 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 17.758 17.758 2;3 0.00045294 10248 QUIQUE_C1438_190116_001 84.658 72.082 2580800000 145050000 161390000 276540000 304090000 184230000 260420000 167300000 172280000 214010000 71125000 215430000 123490000 285400000 11539 933;1529 10802 101448;101449;101450;101451;101452;101453;101454;101455;101456;101457;101458;101459;101460;101461;101462;101463;101464;101465;101466;101467;101468;101469;101470 128780;128781;128782;128783;128784;128785;128786;128787;128788;128789;128790;128791;128792;128793;128794;128795;128796;128797;128798;128799;128800;128801;128802;128803;128804;128805;128806 128792 17 EQHQHSDLDSNQTHSSGTVTSSSSTANIDDLKK Unmodified 3553.6153 0.61530351 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 1 1 30.316 30.316 5 0.031409 25074 QUIQUE_DMIX1_190116_001 19.396 17.467 65753000 0 0 0 0 0 0 0 65753000 0 0 0 0 0 11540 3037 10803 101471 128807 128807 0 EQIDIFEGIK Unmodified 1190.6183 0.61830402 3878 Q96I99;E9PDQ8;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 107.98 107.98 2 0.014657 111468 QUIQUE_C1368_190116_001 64.04 32.967 424070000 105330000 124250000 148030000 0 0 0 0 0 0 46468000 0 0 0 11541 3878 10804 101472;101473;101474;101475 128808;128809;128810;128811 128810 4 EQIDIFEGIKDSQAQR Unmodified 1875.9327 0.9326553 3878 Q96I99;E9PDQ8;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 92.482 92.482 2 1.4329E-06 93616 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.191 62.964 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11542 3878 10805 101476 128812 128812 1 EQIENLLR Unmodified 1013.5506 0.55055881 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 69.883 69.883 2 0.0055291 70207 QUIQUE_C1218_190116_001 105.12 56.613 202500000 158170000 0 0 0 0 0 0 0 0 44327000 0 0 0 11543 3390 10806 101477;101478 128813;128814 128813 1 EQIEWLIEHK Unmodified 1323.6823 0.68230126 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.295 81.295 3 0.00076476 82210 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.379 66.431 337470000 36981000 46593000 0 37819000 0 0 31547000 24032000 39880000 0 46217000 32285000 42120000 11544 3779 10807 101479;101480;101481;101482;101483;101484;101485;101486;101487;101488 128815;128816;128817;128818;128819;128820;128821;128822;128823;128824;128825;128826;128827;128828;128829 128828 15 EQIKLDEGWVPLEIMIK Unmodified 2040.0965 0.096549507 1890 P05455;E7ERC4;E9PFL9 SSB Lupus La protein yes no 0 0 1 1 147.88 147.88 3 0.0010462 150870 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.955 38.14 45719000 0 0 0 0 0 0 0 45719000 0 0 0 0 0 11545 1890 10808 101489 128830;128831 128831 2 EQILEEFSK Unmodified 1121.5605 0.56045479 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 77.246 77.246 2 0.013527 77372 QUIQUE_C1403_190116_001 69.812 26.042 172990000 0 0 0 71894000 0 58479000 0 42617000 0 0 0 0 0 11546 1581 10809 101490;101491;101492 128832;128833;128834 128832 3 EQIPAGTLLLAVEDPEKR Unmodified 1978.0735 0.073505879 3563 Q8N0W3;I3L3J1;I3L106;I3L171;I3L1X0 FUK L-fucose kinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.57 115.57 3 0.00018008 118599 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.187 57.906 560940000 0 0 59120000 0 64967000 45201000 53217000 42240000 57751000 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61.135 61.135 2 0.00043855 60180 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.7 67.305 2164000000 151360000 160620000 162920000 116380000 194780000 230050000 125500000 118710000 211260000 48779000 180020000 222130000 241520000 11549 2637 10812 101518;101519;101520;101521;101522;101523;101524;101525;101526;101527;101528;101529;101530 128866;128867;128868;128869;128870;128871;128872;128873;128874;128875;128876;128877;128878;128879;128880 128875 15 EQISLAEK Unmodified 916.48656 0.48656157 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 26.469 26.469 2 0.037751 20531 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.962 23 85489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85489000 11550 4414 10813 101531 128881 128881 1 EQISLYPEVK Unmodified 1204.634 0.63395408 4362 Q9P032 NDUFAF4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4 yes yes 0 0 0 1 1 74.277 74.277 2 0.02681 74494 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.567 36.791 77186000 0 0 0 0 0 0 0 44913000 32273000 0 0 0 0 11551 4362 10814 101532;101533 128882;128883;128884 128882 3 EQIVGPLESPVEDSLWPYK Unmodified 2185.0943 0.094300901 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.11 147.11 2 3.546E-08 150037 QUIQUE_C1563_190116_001 123.38 95.522 621230000 29892000 28855000 85833000 41494000 73808000 63602000 0 51469000 0 22676000 112920000 62230000 48450000 11552 4598 10815 101534;101535;101536;101537;101538;101539;101540;101541;101542;101543;101544;101545 128885;128886;128887;128888;128889;128890;128891;128892;128893;128894;128895;128896;128897;128898 128893 13 EQKDWFIEMPTEAK Unmodified 1750.8236 0.82362212 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 2 1 97.708 97.708 2;3 0.029597 99470 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.229 35.821 140950000 0 0 0 0 0 0 0 111800000 0 0 0 0 29145000 11553 2009 10816 101546;101547;101548 128899;128900;128901 128899 3 EQKELTNEMQVQLQK Oxidation (M) 1860.9251 0.92512708 4719 yes yes 0 1 1 1 1 65.669 65.669 2 0.010937 65594 QUIQUE_C1576_190116_001 72.2 7.3804 675780000 0 0 0 0 0 243550000 432230000 0 0 0 0 0 0 + 11554 4719 10817 101549;101550 128902;128903 128903 3091 2 EQKILQETLNELDK Unmodified 1699.8992 0.89922991 2610 P52630;B4DLC8 STAT2 Signal transducer and activator of transcription 2 yes no 0 0 1 1 151.74 151.74 3 0.062167 156226 QUIQUE_C1277_190116_001 32.478 14.972 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11555 2610 10818 101551 128904 128904 1 EQKVPEILQLSDALR Unmodified 1737.9625 0.96249887 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 112.06 112.06 3 0.026087 117824 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.924 40.752 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11556 617 10819 101552 128905 128905 1 EQLAIAEFAR Unmodified 1146.6033 0.60332266 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.468 87.468 2 4.472E-14 89447 QUIQUE_C1277_190116_001 172.25 155.01 4100900000 338280000 335030000 370120000 325580000 400960000 363720000 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101567;101568;101569;101570;101571;101572;101573;101574;101575;101576;101577;101578;101579;101580;101581;101582 128927;128928;128929;128930;128931;128932;128933;128934;128935;128936;128937;128938;128939;128940;128941;128942;128943 128930 15 EQLDAFIDQLYK Unmodified 1481.7402 0.74021007 3359 Q6GMV2 SMYD5 SET and MYND domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 141.27 141.27 2 0.0020514 145206 QUIQUE_C1403_190116_001 77.379 51.993 73085000 0 0 0 53157000 0 0 0 0 0 19928000 0 0 0 11560 3359 10823 101583;101584 128944;128945 128944 2 EQLDMAGAR Unmodified 989.46003 0.46002924 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.771 28.771 2 0.0029288 22784 QUIQUE_C1368_190116_001 92.47 44.727 604230000 104250000 0 114850000 0 0 99497000 0 0 72276000 33216000 108270000 71871000 0 11561 890;3052 10824 101585;101586;101587;101588;101589;101590;101591 128946;128947;128948;128949;128950;128951;128952 128947 6 EQLDSSNSTIAILQTEK Unmodified 1875.9426 0.94255129 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 90.575 90.575 2 1.779E-16 92417 QUIQUE_C1277_190116_001 162.93 125.75 283850000 41436000 42912000 40302000 29974000 31196000 39396000 33806000 0 0 24831000 0 0 0 11562 1591 10825 101592;101593;101594;101595;101596;101597;101598;101599 128953;128954;128955;128956;128957;128958;128959;128960 128954 7 EQLEEEAAAR Unmodified 1144.536 0.53603095 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.563 25.563 2 0.0011605 19126 QUIQUE_C1368_190116_001 100.98 73.497 588640000 65701000 0 48585000 71205000 78148000 73327000 74945000 0 42109000 0 79939000 0 54682000 11563 3459 10826 101600;101601;101602;101603;101604;101605;101606;101607;101608 128961;128962;128963;128964;128965;128966;128967;128968;128969;128970;128971;128972 128962 11 EQLEEEEEAK Unmodified 1232.5408 0.54084156 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.548 20.548 2 0.00020227 13893 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22 EQLFAEASGAR Unmodified 1177.5728 0.57275081 3388 Q6PCB0;J3QLP3 VWA1 von Willebrand factor A domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.651 51.651 2 0.0011688 49880 QUIQUE_C1438_190116_001 89.029 62.356 219160000 26256000 45296000 0 0 110100000 37508000 0 0 0 0 0 0 0 11566 3388 10829 101642;101643;101644;101645;101646;101647 129010;129011;129012;129013;129014;129015 129012 6 EQLGEFYEALDCLCIPR Unmodified 2111.9656 0.96561169 2151 P19652 ORM2 Alpha-1-acid glycoprotein 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 156.16 156.16 2;3 7.3955E-30 161698 QUIQUE_C1218_190116_001 184.21 163.26 1085900000 123100000 79694000 103480000 41643000 279720000 45474000 0 36923000 41729000 42512000 124110000 48247000 119260000 11567 2151 10830 101648;101649;101650;101651;101652;101653;101654;101655;101656;101657;101658;101659;101660;101661;101662 129016;129017;129018;129019;129020;129021;129022;129023;129024;129025;129026;129027;129028;129029;129030;129031;129032;129033 129016 17 EQLGEFYEALDCLR Unmodified 1741.7981 0.79813565 1835 P02763 ORM1 Alpha-1-acid glycoprotein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 141.97 141.97 2;3 2.6184E-29 148973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.62 118.55 8674100000 1088300000 815770000 1048600000 286180000 1598700000 299570000 446270000 426020000 204260000 273630000 895060000 378210000 913570000 11568 1835 10831 101663;101664;101665;101666;101667;101668;101669;101670;101671;101672;101673;101674;101675;101676;101677;101678;101679;101680;101681 129034;129035;129036;129037;129038;129039;129040;129041;129042;129043;129044;129045;129046;129047;129048;129049;129050;129051;129052;129053;129054 129050 21 EQLGPVTQEFWDNLEK Unmodified 1931.9265 0.92650729 1821 P02647;F8W696;CON__P15497 APOA1 Apolipoprotein A-I;Proapolipoprotein A-I;Truncated apolipoprotein A-I yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 140.51 140.51 2;3 5.0835E-36 147626 QUIQUE_C1438_190116_001 172.33 152.2 2527300000 351410000 269430000 126700000 241850000 613740000 318040000 0 0 113940000 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129118 2 EQLLLDELVALVNK Unmodified 1595.9134 0.91342341 3640 Q8NDI1 EHBP1 EH domain-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 169.28 169.28 2 7.0214E-08 172818 QUIQUE_C1277_190116_001 122.7 108.01 28238000 13853000 10968000 0 0 0 0 0 0 0 3416800 0 0 0 11577 3640 10840 101736;101737;101738 129120;129121;129122 129121 2 EQLLLDELVALVNKR Unmodified 1752.0145 0.014534437 3640 Q8NDI1 EHBP1 EH domain-binding protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 159.74 159.74 3 2.9533E-06 164583 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.15 94.566 101350000 0 12468000 8654500 0 11003000 0 0 11531000 17003000 0 22845000 17841000 0 11578 3640 10841 101739;101740;101741;101742;101743;101744;101745 129123;129124;129125;129126;129127;129128;129129 129127 5 EQLMASDDFGR Oxidation (M) 1283.5452 0.54521543 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.658 45.658 2 0.00085348 42803 QUIQUE_C1277_190116_001 96.89 85.725 1808800000 78322000 109000000 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0.51318702 2401 P36915;A2AB27 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.733 22.733 2 0.0021185 16268 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.41 83.051 516370000 0 70379000 48038000 60040000 0 0 61238000 26989000 55143000 0 61980000 68402000 64162000 11581 2401 10843 101771;101772;101773;101774;101775;101776;101777;101778;101779 129163;129164;129165;129166;129167;129168;129169;129170;129171;129172 129169 10 EQLQALIPYVLNPSK Unmodified 1711.9509 0.95087155 3355 Q6DD88;F5H6I7 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 0 1 138.76 138.76 2 0.020392 146219 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.157 49.232 34397000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34397000 0 0 11582 3355 10844 101780 129173 129173 0 EQLQALNDR Unmodified 1085.5465 0.54653606 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 30.901 30.901 2 0.013805 25615 QUIQUE_C1277_190116_001 69.423 42.286 183810000 0 104830000 0 78982000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11583 2033 10845 101781;101782 129174;129175 129174 2 EQLQAPVPPDSVPSLQNMGLLLDK Unmodified 2588.352 0.35198893 3803 Q96AQ6;Q5T173 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 2 1 152.76 152.76 2;3 2.7316E-51 159846 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.49 145.39 608590000 0 44511000 59130000 108530000 0 98849000 73782000 0 60421000 0 47986000 34999000 80374000 11584 3803 10846 101783;101784;101785;101786;101787;101788;101789;101790;101791;101792;101793;101794;101795;101796 129176;129177;129178;129179;129180;129181;129182;129183;129184;129185;129186;129187;129188;129189;129190;129191;129192;129193 129189 18 EQLQDMGLVDLFSPEK Unmodified 1847.8975 0.89751535 1798 P01008 SERPINC1 Antithrombin-III yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 150.02 150.02 2 3.0335E-13 157354 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.98 111.25 339820000 0 46834000 0 0 94915000 31495000 0 0 51068000 16290000 99221000 0 0 11585 1798 10847 101797;101798;101799;101800;101801;101802 129194;129195;129196;129197;129198;129199;129200 129200 6 EQLQGLNDR Unmodified 1071.5309 0.530886 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17.481 2 0.027928 10145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.043 33.614 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11588 1255;2856 10850 101821 129220 129220 1 EQLRQEQALLEEIER Unmodified 1882.9749 0.97485447 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 100.62 100.62 2;3 3.5085E-06 104391 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.68 89.564 1063300000 23143000 36203000 0 0 0 0 141480000 436710000 0 0 384400000 0 41376000 11589 3117 10851 101822;101823;101824;101825;101826;101827;101828;101829;101830 129221;129222;129223;129224;129225;129226;129227;129228;129229 129228 7 EQLSEALQTIQLFLAK Unmodified 1831.0091 0.0091147084 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 2 1 1 168.8 168.8 2;3 0.00052448 175162 QUIQUE_C1438_190116_001 103.44 79.69 100310000 0 0 21798000 0 30181000 0 0 0 0 10875000 37460000 0 0 11590 2882 10852 101831;101832;101833;101834;101835 129230;129231;129232;129233;129234 129232 4 EQLSLLDR Unmodified 972.52401 0.52400971 1800 P01011;G3V595 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.038 63.038 2 0.0024856 62719 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.16 28.497 1108500000 137760000 121710000 238250000 99653000 153730000 0 0 98129000 0 0 259280000 0 0 11591 1800 10853 101836;101837;101838;101839;101840;101841;101842 129235;129236;129237;129238;129239;129240;129241;129242;129243;129244 129244 10 EQLTEEAR Unmodified 974.46689 0.46688876 4407 Q9UBS4;H7C2Y5 DNAJB11 DnaJ homolog subfamily B member 11 yes no 0 0 0 1 17.545 17.545 2 0.031629 9717 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.88 36.73 17315000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17315000 0 0 0 11592 4407 10854 101843 129245 129245 1 EQLTEGEEIAQEIDGR Unmodified 1815.8487 0.8486509 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 0 1 103.09 103.09 2 5.0271E-06 106013 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.348 58.598 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11593 4278 10855 101844 129246 129246 1 EQLTPSQIMSLEK Unmodified 1502.765 0.76504461 2841 Q00059;H7BYN3 TFAM Transcription factor A, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 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101877;101878;101879;101880;101881;101882;101883;101884;101885;101886;101887 129280;129281;129282;129283;129284;129285;129286;129287;129288;129289;129290;129291;129292 129283 12 EQMAISGGFIR Oxidation (M) 1223.5969 0.59685707 2699 P60880 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 56.686 56.686 2 0.0046746 55883 QUIQUE_C1438_190116_001 72.643 23.225 644180000 97719000 89620000 100760000 110030000 85594000 117680000 0 0 0 42782000 0 0 0 11599 2699 10861 101888;101889;101890;101891;101892;101893;101894 129293;129294;129295;129296;129297;129298;129299 129297 2131 5 EQMAISGGFIR Unmodified 1207.6019 0.60194245 2699 P60880 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.229 78.229 2 8.1829E-05 78720 QUIQUE_C1403_190116_001 134.25 84.207 6613600000 790100000 852550000 801920000 841120000 478970000 615810000 675150000 140100000 207760000 166220000 428430000 223090000 392420000 11600 2699 10861 101895;101896;101897;101898;101899;101900;101901;101902;101903;101904;101905;101906;101907 129300;129301;129302;129303;129304;129305;129306;129307;129308;129309;129310;129311;129312;129313;129314;129315;129316 129305 16 EQMALNHGEEQVR Unmodified 1539.71 0.70998935 1927 P07738 BPGM Bisphosphoglycerate mutase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.71 23.71 3 0.00020028 16942 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.622 55.077 294500000 49368000 0 0 0 43611000 35830000 36731000 19649000 0 0 67758000 41550000 0 11601 1927 10862 101908;101909;101910;101911;101912;101913;101914;101915 129317;129318;129319;129320;129321;129322;129323;129324;129325 129323 5 EQMAQQLAEETQGFQR Unmodified 1892.8687 0.86867484 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 96.198 96.198 2;3 2.7727E-24 99333 QUIQUE_C1218_190116_001 151.7 129.17 244120000 52355000 38480000 58657000 0 0 0 0 0 0 39915000 54715000 0 0 11602 3117 10863 101916;101917;101918;101919;101920;101921 129326;129327;129328;129329;129330;129331 129326 5 EQMDNAVYTFETLLHQELGK Unmodified 2365.126 0.12601173 3948 Q96TA1 FAM129B Niban-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 162.75 162.75 3 4.4393E-06 167107 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.391 73.729 145970000 0 0 0 47493000 0 0 32442000 0 66036000 0 0 0 0 11603 3948 10864 101922;101923;101924 129332;129333;129334 129334 3 EQMDQISESNHLIHLSNTNNVK Unmodified 2550.2133 0.21326361 4302 Q9NV70 EXOC1 Exocyst complex component 1 yes yes 0 0 0 1 66.668 66.668 4 0.018337 66191 QUIQUE_C1403_190116_001 27.408 19.786 39557000 0 0 0 39557000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11604 4302 10865 101925 129335 129335 1 EQMEAEIAHLK Unmodified 1297.6336 0.63363651 3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 0 1 1 1 51.349 51.349 3 0.016224 49221 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.761 11.715 90574000 0 37906000 0 35360000 0 0 0 17308000 0 0 0 0 0 11605 3490 10866 101926;101927;101928 129336;129337;129338 129338 3 EQMEKDIQEHK Unmodified 1413.6558 0.65582851 2954;655 Q12959;A0A0C4DFT3;B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;B5MCC5;H7C325 DLG1;DLG2 Disks large homolog 1;Disks large homolog 2 no no 0 0 1 1 13.614 13.614 3 0.028702 5800 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.96 30.132 43533000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43533000 0 0 11606 2954;655 10867 101929 129339 129339 1 EQMQPTHPIR Unmodified 1235.6081 0.60809046 2891 Q04917;A2IDB2 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 16.063 16.063 2;3 0.00012494 8233 QUIQUE_C1438_190116_001 152.86 123.94 3388300000 158640000 214350000 161510000 223210000 171280000 140330000 933180000 107670000 147410000 0 201500000 813170000 116070000 11607 2891 10868 101930;101931;101932;101933;101934;101935;101936;101937;101938;101939;101940;101941;101942 129340;129341;129342;129343;129344;129345;129346;129347;129348;129349;129350;129351;129352 129344 9 EQNFYGSQESIIALCTHLQQLIR Unmodified 2747.3701 0.37009861 4192 Q9H993;F5GZY1 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 154.29 154.29 3 1.4668E-62 159942 QUIQUE_C1218_190116_001 158.89 146.94 417240000 89198000 0 91540000 101190000 0 71332000 0 0 0 63979000 0 0 0 11608 4192 10869 101943;101944;101945;101946;101947 129353;129354;129355;129356;129357;129358;129359 129353 7 EQNGDSLVHAAFVAESAVAGSAEANAFSVLQHVLGAGPHVK Unmodified 4084.0403 0.040255276 2202 P22695;H3BRG4;H3BSJ9 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 1 170.69 170.69 4;5 1.0212E-45 174547 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.94 95.01 2440500000 51057000 0 0 0 0 0 0 0 468940000 0 1777500000 143010000 0 11609 2202 10870 101948;101949;101950;101951;101952;101953;101954 129360;129361;129362;129363;129364;129365;129366;129367;129368 129368 8 EQNILAQVFGILK Unmodified 1471.8399 0.83986454 3072 Q14571 ITPR2 Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 166.06 166.06 2 0.00042177 170969 QUIQUE_C1368_190116_001 116.52 106.23 115970000 12803000 0 73455000 0 0 0 0 0 0 5061200 24653000 0 0 11610 3072 10871 101955;101956;101957;101958;101959 129369;129370;129371;129372;129373;129374 129370 6 EQNIVFNAETYSNLIK Unmodified 1881.9472 0.94724273 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 128.71 128.71 2;3 5.571E-07 131521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.89 116.97 1006900000 84297000 81521000 112870000 104300000 60790000 111390000 81169000 101370000 139030000 42686000 0 87455000 0 11611 2452 10872 101960;101961;101962;101963;101964;101965;101966;101967;101968;101969;101970;101971;101972;101973;101974;101975;101976;101977 129375;129376;129377;129378;129379;129380;129381;129382;129383;129384;129385;129386;129387;129388;129389;129390;129391;129392 129386 17 EQNLQDIK Unmodified 986.50327 0.50327426 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;H0Y9H2;H0YFD8 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.055 23.055 2 0.0079195 16849 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.253 38.694 4759600000 0 708290000 0 0 732050000 756830000 573050000 476690000 583380000 0 488300000 441030000 0 11612 854 10873 101978;101979;101980;101981;101982;101983;101984;101985 129393;129394;129395;129396;129397;129398;129399;129400 129397 8 EQNQDSQTEAEELR Unmodified 1675.7285 0.72853576 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 30.017 30.017 2 2.0145E-28 25078 QUIQUE_C1218_190116_001 168.94 159.25 81247000 27750000 0 0 28875000 0 24623000 0 0 0 0 0 0 0 11613 3597 10874 101986;101987;101988 129401;129402;129403 129401 3 EQNQDSQTEAEELRK Unmodified 1803.8235 0.82349878 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 19.899 19.899 2;3 9.918E-66 12522 QUIQUE_DMIX5_190116_001 229.29 208.83 829790000 196990000 39001000 64150000 152300000 103190000 44578000 70905000 35836000 0 73664000 49169000 0 0 11614 3597 10875 101989;101990;101991;101992;101993;101994;101995;101996;101997;101998;101999;102000 129404;129405;129406;129407;129408;129409;129410;129411;129412;129413;129414;129415 129415 12 EQNSPIYISR Unmodified 1205.6041 0.60405094 1456;4298;4204 O14910;H0YIA8;H0YI92;Q9NUP9;G3V1D4;Q9HAP6 LIN7A;LIN7C;LIN7B Protein lin-7 homolog A;Protein lin-7 homolog C;Protein lin-7 homolog B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.902 43.902 2 0.00018176 41110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.35 89.558 2250800000 269860000 303890000 175920000 130640000 214240000 142140000 234570000 214180000 168540000 0 217100000 0 179690000 11615 1456;4298;4204 10876 102001;102002;102003;102004;102005;102006;102007;102008;102009;102010;102011 129416;129417;129418;129419;129420;129421;129422;129423;129424;129425;129426;129427;129428;129429;129430;129431;129432;129433;129434;129435;129436;129437 129431 21 EQNVPVPK Unmodified 909.49198 0.4919813 3860;3380 Q6P2I3;Q96GK7 FAHD2B;FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B;Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A no no 0 0 0 1 21.495 21.495 2 0.046289 14597 QUIQUE_C1218_190116_001 56.547 30.653 81103000 81103000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11616 3380;3860 10877 102012 129438 129438 1 EQPAAGPAAVPGGGSATAVRPPVPAVDFGNAQEAYR Unmodified 3474.728 0.72802926 62 A0A087WWM6;O43272 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.01 107.01 3 1.7176E-64 109164 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.2 111.04 601730000 63334000 74526000 49330000 0 0 0 64650000 66972000 79969000 44939000 0 61304000 96706000 11617 62 10878 102013;102014;102015;102016;102017;102018;102019;102020;102021 129439;129440;129441;129442;129443;129444;129445;129446;129447;129448;129449 129443 11 EQPEKEPELQQYVPQLQNNTILR Unmodified 2793.4297 0.42972197 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.34 115.34 3 4.0234E-12 120276 QUIQUE_C1218_190116_001 83.245 76.596 749090000 59704000 72293000 87840000 70585000 0 62165000 81849000 61942000 77489000 0 90990000 84234000 0 11618 3046 10879 102022;102023;102024;102025;102026;102027;102028;102029;102030;102031 129450;129451;129452;129453;129454;129455;129456;129457;129458;129459;129460;129461;129462;129463;129464 129450 15 EQPFGEGVPLDGDDPEHIQWIFQK Unmodified 2780.3082 0.30820986 3664 Q8TBC4;F8W8D4 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 144.63 144.63 3 0.0018116 150369 QUIQUE_C1218_190116_001 37.025 33.756 920450000 103280000 123960000 142360000 0 0 105650000 135670000 139140000 0 0 170390000 0 0 11619 3664 10880 102032;102033;102034;102035;102036;102037;102038 129465;129466;129467;129468;129469;129470;129471 129465 7 EQPGNTISAGQEDFPSVLLETAASLPSLSPLSAASFK Unmodified 3758.8891 0.88906574 4252 Q9NQC3;C9J685 RTN4 Reticulon-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.19 173.19 3 5.2735E-43 176907 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.25 96.972 1313400000 68175000 66631000 75771000 48788000 131290000 237950000 101570000 85612000 194980000 0 180680000 0 121970000 11620 4252 10881 102039;102040;102041;102042;102043;102044;102045;102046;102047;102048;102049 129472;129473;129474;129475;129476;129477;129478;129479;129480;129481;129482 129482 11 EQPLDEELKDAFQNAYLELGGLGER Unmodified 2833.377 0.3770177 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 168.64 168.64 2;3 9.7786E-83 173050 QUIQUE_DMIX3_190116_001 204.78 180.22 2337500000 67468000 69932000 69717000 111700000 273810000 88130000 0 290950000 388950000 0 290410000 297950000 388520000 11621 1872 10882 102050;102051;102052;102053;102054;102055;102056;102057;102058;102059;102060;102061 129483;129484;129485;129486;129487;129488;129489;129490;129491;129492;129493;129494 129491 12 EQPLDEEMKEAFQNAYLELGGLGER Unmodified 2865.3491 0.34908839 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 166.89 166.89 2;3 1.524E-82 171337 QUIQUE_DMIX3_190116_001 200.99 176.44 2878600000 128460000 235840000 299950000 179990000 0 0 607120000 299890000 458830000 0 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A0A1B0GWF9;A0A1B0GUK4;A0A1B0GVB2;A0A1B0GTS4;A0A1B0GU53;E7EN11;A0A1B0GTF6;A0A1B0GTA9;A0A1B0GTN8;H0Y476;A0A1C7CYX2;A0A1B0GTX2;O00305;A0A1B0GXG0;A0A1B0GVU5;A0A1B0GUI8;A0A1B0GVF0;A0A1B0GTX8;A0A1B0GTK1;A0A1B0GUU8;E7DBM8;A0A1B0GUW8;A0A1B0GVT6;A0A1B0GTH0;A0A1B0GW63;A0A1B0GV16;A0A1B0GU05;A0A1B0GUM9;A0A1B0GTP6;C9J224;A0A1B0GUJ7;A0A1B0GU32;A0A1B0GVG1;A0A1B0GTX6;A0A1B0GWG5;A0A1B0GUK3;A0A1B0GUI5;A0A1B0GUU5 CACNB4 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.606 36.606 2 0.00083867 32227 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.4 53.542 133730000 25640000 0 31062000 0 0 18308000 0 0 0 0 31578000 27146000 0 11625 332 10886 102077;102078;102079;102080;102081;102082 129512;129513;129514;129515;129516;129517 129516 6 EQQAQQEDPIER Unmodified 1469.6746 0.6746497 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.641 24.641 2 1.0935E-08 18249 QUIQUE_C1218_190116_001 153.97 101.25 55948000 42300000 0 0 0 0 0 0 0 0 13649000 0 0 0 11626 4596 10887 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coiled-coil-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 34.68 34.68 3 0.02447 29916 QUIQUE_C1403_190116_001 24.043 7.2986 155950000 0 0 0 68072000 0 0 0 0 87881000 0 0 0 0 11646 851 10906 102266;102267 129729;129730 129729 2 EQSIFGDHRDEEEETHMK Unmodified 2215.944 0.94402462 3186 Q16643;D6R9W4 DBN1 Drebrin yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 36.403 36.403 3;4 9.9402E-06 31955 QUIQUE_C1438_190116_001 82.007 79.165 1102400000 63216000 75770000 112640000 189560000 219890000 60611000 53432000 76978000 73226000 48701000 88643000 0 39729000 11647 3186 10907 102268;102269;102270;102271;102272;102273;102274;102275;102276;102277;102278;102279;102280;102281;102282;102283;102284;102285 129731;129732;129733;129734;129735;129736;129737;129738;129739;129740;129741;129742;129743;129744;129745;129746;129747;129748;129749 129738 19 EQSILELGSLLAK Unmodified 1399.7922 0.79224564 1388 O00231;J3QRY4 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.33 139.33 2 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dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 35.51 35.51 2;3 1.8747E-54 30587 QUIQUE_DMIX5_190116_001 211.38 195.13 6595100000 572520000 569030000 605310000 415420000 415330000 430580000 655760000 318230000 534470000 137420000 705560000 590970000 644460000 11652 86 10912 102324;102325;102326;102327;102328;102329;102330;102331;102332;102333;102334;102335;102336;102337;102338;102339;102340;102341;102342;102343;102344;102345;102346;102347 129796;129797;129798;129799;129800;129801;129802;129803;129804;129805;129806;129807;129808;129809;129810;129811;129812;129813;129814;129815;129816;129817;129818;129819 129815 19 EQTFSGGTSQDTK Unmodified 1384.6107 0.61065246 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.313 17.313 2 6.7466E-06 9445 QUIQUE_C1563_190116_001 150.46 115.1 244140000 39335000 25604000 13991000 0 32179000 27911000 0 18752000 40451000 0 27744000 18174000 0 11653 504 10913 102348;102349;102350;102351;102352;102353;102354;102355;102356 129820;129821;129822;129823;129824;129825;129826;129827;129828;129829;129830 129824 10 EQTGLEAYALGLDTK Unmodified 1607.8043 0.80426689 2507 P48449;C9J315 LSS Lanosterol synthase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 109.58 109.58 2 0.00038922 113386 QUIQUE_C1368_190116_001 93.766 74.523 57274000 0 0 26726000 30548000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11654 2507 10914 102357;102358;102359;102360;102361;102362 129831;129832;129833;129834;129835;129836 129831 5 EQTLSPTITSGLHNIAR Unmodified 1836.9694 0.96937516 821 D6REX3;O94979;H7BXG7;H0Y8W8 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 1 1 75.815 75.815 2;3 0.0056114 76548 QUIQUE_C1403_190116_001 65.563 51.9 135010000 0 0 76195000 0 0 0 0 0 58812000 0 0 0 0 11655 821 10915 102363;102364;102365;102366 129837;129838;129839;129840 129839 4 EQTVQYILTMVDDMLQENHQR Unmodified 2590.2156 0.2155718 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 169.86 169.86 3 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EQVIAALR Unmodified 898.52362 0.52361577 2647 P54727;H0Y579 RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.545 44.545 2 0.0036718 41390 QUIQUE_DMIX5_190116_001 124.34 54.959 949450000 145670000 111590000 65220000 110570000 146560000 0 68985000 0 0 65372000 77732000 77318000 80433000 11658 2647 10918 102391;102392;102393;102394;102395;102396;102397;102398;102399;102400 129870;129871;129872;129873;129874;129875;129876;129877;129878;129879;129880 129878 11 EQVLQPVSAELLELDIR Unmodified 1951.0626 0.062606842 2401 P36915;A2AB27 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 148.35 148.35 2;3 1.8813E-37 151097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 180.28 150.08 1303400000 126560000 90774000 58293000 138300000 80933000 68731000 102180000 87874000 152950000 49009000 133850000 144020000 69906000 11659 2401 10919 102401;102402;102403;102404;102405;102406;102407;102408;102409;102410;102411;102412;102413;102414;102415;102416;102417;102418;102419;102420;102421;102422;102423;102424 129881;129882;129883;129884;129885;129886;129887;129888;129889;129890;129891;129892;129893;129894;129895;129896;129897;129898;129899;129900;129901;129902;129903;129904;129905 129895 23 EQVNDLFSR Unmodified 1106.5356 0.53563702 2805 P78347;A0A087WW90;A0A0D9SF80;Q86UP8;Q6EKJ0 GTF2I;GTF2IRD2B;GTF2IRD2 General transcription factor II-I;General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2A;General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.428 65.428 2 0.0088115 65165 QUIQUE_C1277_190116_001 77.732 51.627 193190000 0 50976000 0 44382000 0 49431000 0 0 0 0 0 48397000 0 11660 2805 10920 102425;102426;102427;102428 129906;129907;129908;129909 129906 2 EQVPGFTPR Unmodified 1029.5243 0.52434406 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 45.515 45.515 2 0.0017963 41988 QUIQUE_C1563_190116_001 100.02 62.996 442890000 0 0 0 218870000 0 224030000 0 0 0 0 0 0 0 11661 1005;2027 10921 102429;102430 129910;129911;129912 129911 3 EQVPSGAELER Unmodified 1213.5939 0.59388018 193 A0A0A0MTE2;E9PMT2;F8WD26;J3KP06;Q8WWI1;E9PMS6 LMO7 LIM domain only protein 7 yes no 0 0 0 1 39.271 39.271 2 0.0034595 35393 QUIQUE_C1403_190116_001 73.841 47.669 30178000 0 0 0 30178000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11662 193 10922 102431 129913 129913 1 EQVPSLGSNVACGLAYTDYHK Unmodified 2308.0794 0.079395893 516 A1L0T0;M0R026 ILVBL Acetolactate synthase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.012 97.012 3 0.0037359 100548 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.647 26.933 448940000 58119000 0 0 0 58187000 58945000 65191000 53503000 0 0 102490000 0 52507000 11663 516 10923 102432;102433;102434;102435;102436;102437;102438;102439 129914;129915;129916;129917;129918;129919;129920;129921 129920 7 EQVQQDFSGK Unmodified 1164.5411 0.54111633 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;Q01484;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.753 23.753 2 0.00017251 17227 QUIQUE_C1403_190116_001 120.12 90.646 3010200000 196150000 241190000 202820000 370700000 225800000 260290000 220260000 288210000 327080000 137820000 221320000 0 318560000 11664 902;1255;2856;1134 10924 102440;102441;102442;102443;102444;102445;102446;102447;102448;102449;102450;102451 129922;129923;129924;129925;129926;129927;129928;129929;129930;129931;129932;129933;129934 129925 13 EQVSEELVR Unmodified 1087.551 0.55095274 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 39.582 39.582 2 0.023713 34396 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.334 24.983 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11665 3125 10925 102452;102453 129935;129936 129936 2 EQVSPLETTLEK Unmodified 1372.7086 0.70857559 3762 Q92878;A0A1W2PQ90 RAD50 DNA repair protein RAD50 yes no 0 0 0 1 1 66.245 66.245 2 0.0029628 66354 QUIQUE_C1576_190116_001 76.143 49.028 67451000 0 0 0 0 30811000 0 36640000 0 0 0 0 0 0 11666 3762 10926 102454;102455 129937;129938 129938 2 EQVTNVGGAVVTGVTAVAQK Unmodified 1927.0375 0.037454724 2410 P37840;E7EPV7;H6UYS7 SNCA Alpha-synuclein yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 100.12 100.12 2;3 2.3599E-56 103142 QUIQUE_C1277_190116_001 205.28 180.77 12016000000 1734200000 1310400000 928360000 1095000000 1097800000 1019700000 972740000 465220000 589670000 543010000 774330000 608550000 876880000 11667 2410 10927 102456;102457;102458;102459;102460;102461;102462;102463;102464;102465;102466;102467;102468;102469;102470;102471;102472;102473;102474;102475;102476;102477;102478;102479;102480;102481;102482;102483;102484 129939;129940;129941;129942;129943;129944;129945;129946;129947;129948;129949;129950;129951;129952;129953;129954;129955;129956;129957;129958;129959;129960;129961;129962;129963;129964;129965;129966;129967;129968;129969;129970;129971;129972;129973;129974;129975;129976;129977;129978;129979;129980;129981;129982;129983;129984 129947 46 EQWANLEQLSAIR Unmodified 1556.7947 0.79470526 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 119.41 119.41 2;3 4.492E-65 124724 QUIQUE_C1218_190116_001 212.82 174.51 25250000000 1859400000 2056800000 1844200000 1780400000 2245200000 1227800000 2109200000 1797300000 2411300000 748210000 2948500000 2069700000 2151900000 11668 2851 10928 102485;102486;102487;102488;102489;102490;102491;102492;102493;102494;102495;102496;102497;102498;102499;102500;102501;102502;102503;102504;102505;102506;102507;102508;102509;102510;102511 129985;129986;129987;129988;129989;129990;129991;129992;129993;129994;129995;129996;129997;129998;129999;130000;130001;130002;130003;130004;130005;130006;130007;130008;130009;130010;130011;130012;130013;130014 129985 28 EQWANLEQLSAIRK Unmodified 1684.8897 0.88966827 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 91.939 91.939 2;3 1.9758E-05 94159 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.71 90.3 645780000 0 0 0 0 0 0 0 180970000 116600000 0 122520000 114600000 111100000 11669 2851 10929 102512;102513;102514;102515;102516;102517 130015;130016;130017;130018;130019;130020 130017 4 EQWDTIEELIR Unmodified 1430.7042 0.70415892 3190 Q16698 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.71 137.71 2 0.00017618 144537 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.2 116.64 3078900000 331640000 290100000 398900000 0 368800000 371620000 354180000 0 0 128760000 433380000 401490000 0 11670 3190 10930 102518;102519;102520;102521;102522;102523;102524;102525;102526 130021;130022;130023;130024;130025;130026;130027;130028;130029;130030 130029 5 EQWDTIEELIRK Unmodified 1558.7991 0.79912193 3190 Q16698 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 115.18 115.18 3 0.0001366 117920 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.362 64.561 74724000 0 0 0 0 0 0 0 40410000 17197000 0 0 17117000 0 11671 3190 10931 102527;102528;102529 130031;130032;130033 130031 2 EQWLNGLALPERLEDLEVVQQR Unmodified 2634.3766 0.37656419 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 148.5 148.5 3 7.0577E-11 153157 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.27 95.824 178940000 0 0 0 0 0 0 0 29286000 38769000 0 66097000 44784000 0 11672 1472 10932 102530;102531;102532;102533 130034;130035;130036;130037;130038 130038 5 EQWLNNMQIPEK Unmodified 1528.7344 0.73441319 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 95.106 95.106 2 0.00025652 98941 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130051;130052;130053;130054;130055;130056;130057;130058;130059;130060;130061;130062;130063;130064;130065;130066;130067;130068;130069;130070;130071;130072;130073;130074;130075 130060 2293 25 EQWLNNMQIPEKLEDLEVIQHR Unmodified 2761.3857 0.38574867 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 3 2 134.63 134.63 3;4 1.7076E-54 139007 QUIQUE_C1403_190116_001 162.49 155.93 8532400000 656850000 896620000 1066600000 486040000 850130000 386850000 1145200000 191820000 552640000 222770000 1009100000 390150000 677560000 11675 2851 10934 102563;102564;102565;102566;102567;102568;102569;102570;102571;102572;102573;102574;102575;102576;102577;102578;102579;102580;102581;102582;102583;102584;102585;102586;102587;102588 130076;130077;130078;130079;130080;130081;130082;130083;130084;130085;130086;130087;130088;130089;130090;130091;130092;130093;130094;130095;130096;130097;130098;130099;130100;130101;130102;130103;130104;130105;130106;130107;130108;130109;130110;130111;130112;130113;130114;130115;130116 130087 41 EQWTKYEEENFYLEPYLK Unmodified 2408.1212 0.12124393 2085 P14927 UQCRB Cytochrome b-c1 complex subunit 7 yes yes 0 0 1 1 126.66 126.66 2 1.8819E-16 133300 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.71 107.01 55596000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55596000 0 0 11676 2085 10935 102589 130117 130117 1 EQWWLSLR Unmodified 1116.5716 0.5716286 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.07 124.07 2 0.0022624 128667 QUIQUE_C1368_190116_001 137.18 110.22 1481400000 104500000 122660000 156010000 132770000 132750000 82879000 136010000 83609000 138440000 52813000 125700000 122500000 90742000 11677 2129 10936 102590;102591;102592;102593;102594;102595;102596;102597;102598;102599;102600;102601;102602 130118;130119;130120;130121;130122;130123;130124;130125;130126;130127;130128;130129;130130;130131;130132;130133;130134;130135;130136 130122 19 EQYAQEHGLNFQR Unmodified 1618.7488 0.7488177 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 43.744 43.744 2;3 2.593E-06 40664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.88 116.49 1083900000 0 0 236910000 0 0 0 285680000 0 210150000 0 266230000 84951000 0 11678 3116 10937 102603;102604;102605;102606;102607;102608;102609;102610 130137;130138;130139;130140;130141;130142;130143;130144 130142 8 EQYEALQEETR Unmodified 1394.6314 0.6313879 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 41.971 41.971 2 0.00052937 38771 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.3 94.859 249380000 0 0 66880000 0 0 0 0 41019000 38479000 0 63214000 39788000 0 11679 1187 10938 102611;102612;102613;102614;102615;102616;102617;102618 130145;130146;130147;130148;130149;130150;130151;130152 130151 8 EQYEQILAFVQGTVAEGAPIIPISAQLK Unmodified 3012.6172 0.61718839 2432 P41091;Q2VIR3 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171.32 171.32 3 1.8564E-27 174628 QUIQUE_C1277_190116_001 109.71 102.76 1082600000 22672000 90239000 0 22275000 62806000 37202000 285470000 128440000 140950000 8362800 77509000 106700000 100030000 11680 2432 10939 102619;102620;102621;102622;102623;102624;102625;102626;102627;102628;102629;102630 130153;130154;130155;130156;130157;130158;130159;130160;130161;130162;130163;130164 130154 12 EQYPGIEIESR Unmodified 1319.6357 0.635745 4004 Q9BRT3;J3KTI2 MIEN1 Migration and invasion enhancer 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.172 67.172 2 0.0029394 66873 QUIQUE_C1403_190116_001 75.229 45.485 495790000 0 0 0 104240000 135080000 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130188;130189;130190;130191 130188 4 ERDSASFNPELLTHILDGSPEK Unmodified 2454.2027 0.20268215 3107 Q15067;K7ELT1;I3L0T4;I3L2U4 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 122.87 122.87 4 1.6862E-05 126177 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.165 60.285 246790000 0 32776000 24204000 0 0 0 23911000 26036000 45508000 0 41436000 0 52914000 11687 3107 10946 102656;102657;102658;102659;102660;102661;102662 130192;130193;130194;130195;130196;130197;130198 130195 2 ERDVYEELLTQAEIQGNINK Unmodified 2361.1812 0.18121843 2487 P46940;A0A0J9YXZ5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 1 1 125.08 125.08 3 0.0025093 130186 QUIQUE_C1368_190116_001 52.451 38.72 54993000 0 0 54993000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11688 2487 10947 102663 130199 130199 1 EREDEIATMECINNGK Unmodified 1907.8353 0.8353258 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 57.227 57.227 2;3 0 55256 QUIQUE_C1368_190116_001 331.39 298.4 3018400000 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0.89006221 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.964 85.964 2;3 0.00016912 87496 QUIQUE_C1277_190116_001 97.273 73.792 996100000 89663000 104380000 71716000 63308000 86404000 50229000 75490000 109900000 96666000 46569000 0 80130000 121640000 11691 3434 10949 102698;102699;102700;102701;102702;102703;102704;102705;102706;102707;102708;102709;102710;102711 130234;130235;130236;130237;130238;130239;130240;130241;130242;130243;130244;130245;130246;130247 130236 14 EREHLEMELEK Unmodified 1441.6871 0.68712864 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;H0YJP2 KTN1 Kinectin yes no 0 0 1 1 30.045 30.045 3 0.016071 23671 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.6 39.791 8443300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8443300 0 0 0 11692 3490 10950 102712 130248 130248 1 EREMQNLSQHGR Unmodified 1483.695 0.69500799 1483 O15126;A0A087WXB0;A0A087WU14 SCAMP1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 10.865 10.865 3 0.00083797 2917 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.774 62.111 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130272 1 ERFSPLTTNLINLLAENGR Unmodified 2157.1542 0.15421582 2499 P48047;H7C0C1 ATP5O ATP synthase subunit O, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 143.06 143.06 3 0.004618 147618 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.188 40.141 141970000 0 0 0 0 0 0 0 66155000 0 0 39846000 35965000 0 11700 2499 10958 102735;102736;102737 130273;130274;130275 130275 2 ERHNEMEEAVGTIK Oxidation (M) 1657.773 0.77298354 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 1 1 1 15.453 15.453 3 0.0068296 7701 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.657 53.971 13901000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13901000 11701 4631 10959 102738 130276 130276 3052 1 ERHPGSFDVVHVK Unmodified 1505.7739 0.77391024 2757 P62701;C9JEH7;P22090 RPS4X;RPS4Y1 40S ribosomal protein S4, X isoform;40S ribosomal protein S4, Y isoform 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.621 21.621 4 1.0233E-06 14390 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.9 95.448 353420000 69674000 0 48525000 0 44677000 0 69357000 55639000 0 0 65551000 0 0 11702 2757 10960 102739;102740;102741;102742;102743;102744 130277;130278;130279;130280;130281;130282 130282 6 ERLDHWIHSYLHR Unmodified 1760.8859 0.8859203 3580 Q8N3E9;K7EQF2 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes no 0 0 1 1 70.903 70.903 4 0.00011853 71283 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.763 61.694 29319000 0 0 0 0 0 0 0 0 29319000 0 0 0 0 11703 3580 10961 102745 130283 130283 1 ERLDQPMTEIVSR Unmodified 1572.793 0.7929907 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 1 1 64.317 64.317 3 0.029314 63542 QUIQUE_DMIX7_190116_001 33.147 25.739 47007000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47007000 0 11704 2197 10962 102746 130284 130284 1 ERLELCDER Unmodified 1218.5663 0.56628523 1933 P07919 UQCRH Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 1 26.749 26.749 2;3 0.0090281 20522 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.102 49.579 213550000 0 103200000 0 0 0 0 45394000 0 24770000 0 40182000 0 0 11705 1933 10963 102747;102748;102749;102750;102751 130285;130286;130287;130288;130289;130290;130291 130291 7 ERLEQEQLER Unmodified 1328.6684 0.66844211 3615 Q8N8S7;A0A0U1RRM6;A0A075B6E5;A0A0U1RQP7 ENAH Protein enabled homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 21.954 21.954 2 3.9718E-13 14965 QUIQUE_DMIX8_190116_001 181.53 28.286 409970000 0 0 0 78504000 0 0 71857000 0 0 0 80592000 63303000 115720000 11706 3615 10964 102752;102753;102754;102755;102756 130292;130293;130294;130295;130296;130297 130297 6 ERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPK Oxidation (M) 2870.416 0.41604575 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 2 147.93 147.93 3 9.9299E-19 152999 QUIQUE_C1368_190116_001 119.06 116.13 249160000 25368000 0 38761000 44285000 0 38301000 51785000 0 0 50663000 0 0 0 11707 1969 10965 102757;102758;102759;102760;102761;102762;102763 130298;130299;130300;130301;130302;130303;130304;130305;130306 130299 1238 8 ERLEQLFEMADQYQYQVVLVEPK Unmodified 2854.4211 0.42113112 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 0 1 1 1 2 1 6 1 166.44 166.44 3 2.003E-10 160826 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.946 76.193 365340000 0 31320000 0 0 0 0 58651000 63129000 49477000 0 132760000 30005000 0 11708 1969 10965 102764;102765;102766;102767;102768;102769;102770;102771;102772;102773;102774;102775 130307;130308;130309;130310;130311;130312;130313;130314;130315;130316;130317;130318;130319 130312 10 ERNEDFIEIAR Unmodified 1390.6841 0.68409218 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 57.88 57.88 3 0.023391 55885 QUIQUE_C1403_190116_001 41.401 13.737 201240000 0 70090000 0 57755000 0 53363000 0 0 0 20028000 0 0 0 11709 723 10966 102776;102777;102778;102779 130320;130321;130322;130323 130321 3 ERPAAIPIEIK Unmodified 1235.7238 0.72377215 4555 Q9Y2H1 STK38L Serine/threonine-protein kinase 38-like yes yes 0 0 1 1 52.748 52.748 3 0.028364 50941 QUIQUE_C1218_190116_001 49.632 30.886 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11710 4555 10967 102780 130324 130324 1 ERPDLPPIQYEPVLCSR Unmodified 2068.0412 0.041159893 1007 F5H365;Q15436;G3V4V1;G3V1W4;G3V3G5;G3V2R6;G3V5X8;G3V4Q2 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 1 1 1 1 97.281 97.281 3 0.011045 99287 QUIQUE_C1277_190116_001 60.528 51.364 142540000 0 39824000 0 36734000 0 0 65979000 0 0 0 0 0 0 11711 1007 10968 102781;102782;102783 130325;130326;130327 130325 0 ERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGIPEQWAR Unmodified 3966.9177 0.91768052 120 A0A087X294 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase yes yes 0 0 1 2 161.28 161.28 4;5 4.8533E-05 166837 QUIQUE_C1576_190116_001 38.808 34.407 96763000 0 0 0 0 0 0 96763000 0 0 0 0 0 0 11712 120 10969 102784;102785 130328;130329 130328 2 ERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWAR Oxidation (M) 4000.869 0.86901577 2970 Q13153;B3KNX7;E9PKH9 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 1 1 1 1 155.36 155.36 4 5.0848E-07 161259 QUIQUE_C1368_190116_001 51.242 46.841 82545000 0 0 48454000 0 0 0 0 0 0 0 34091000 0 0 11713 2970 10970 102786;102787 130330;130331 130330 2430 2 ERPEISLPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWAR Unmodified 3984.8741 0.87410115 2970 Q13153;B3KNX7;E9PKH9 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 1 1 1 1 159.41 159.41 4 3.3268E-16 163984 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.605 68.038 148140000 0 0 0 0 0 0 38033000 0 0 0 63649000 0 46456000 11714 2970 10970 102788;102789;102790 130332;130333;130334 130334 3 ERPEISPPSDFEHTIHVGFDAVTGEFTGMPEQWAR Unmodified 3968.8428 0.84280102 2974 Q13177 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 150.81 150.81 4;5 0.00044681 155002 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.22 30.945 360320000 0 36835000 0 40809000 0 0 36322000 34194000 0 0 30576000 85599000 95985000 11715 2974 10971 102791;102792;102793;102794;102795;102796;102797;102798;102799;102800 130335;130336;130337;130338;130339;130340;130341;130342;130343;130344 130342 10 ERPETVLIDLIQR Unmodified 1580.8886 0.88860564 3446 Q7L7X3 TAOK1 Serine/threonine-protein kinase TAO1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.52 118.52 3 0.00020872 121170 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.651 70.329 128180000 18318000 15672000 18635000 19880000 0 18455000 13000000 13046000 0 11175000 0 0 0 11716 3446 10972 102801;102802;102803;102804;102805;102806;102807;102808 130345;130346;130347;130348;130349;130350;130351;130352;130353 130351 8 ERPGEQSEVAQLIQQTLEQER Unmodified 2467.2303 0.23029389 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.04 134.04 3 1.6525E-06 138549 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.665 71.266 1166500000 0 0 0 0 172390000 145990000 231780000 137780000 150130000 0 187370000 0 141020000 11717 800 10973 102809;102810;102811;102812;102813;102814;102815 130354;130355;130356;130357;130358;130359;130360 130358 6 ERPGSEEPPAEPVSFYTQPFSHYGQALCVSFPQPCR Unmodified 4150.8942 0.89418467 4169 Q9H4A4;A6NKB8;A0A087WU27;A0A087WUS4 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 1 1 1 1 135.23 135.23 4 1.1958E-63 139484 QUIQUE_C1403_190116_001 115.77 108.62 221310000 0 0 0 74412000 65096000 0 0 0 0 0 0 0 81806000 11718 4169 10974 102816;102817;102818 130361;130362;130363;130364;130365 130362 5 ERPISLGIFPLPAGDGLLTPDAQK Unmodified 2504.3639 0.36387424 1567 O60271;A0A087X2D8;D6RHI8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.24 143.24 3 2.4233E-05 146430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.374 32.031 330580000 0 27286000 20157000 52263000 41197000 0 0 61788000 26827000 0 28582000 26805000 45675000 11719 1567 10975 102819;102820;102821;102822;102823;102824;102825;102826;102827 130366;130367;130368;130369;130370;130371;130372;130373;130374;130375 130371 10 ERPPAPSSFVFQEETK Unmodified 1847.9054 0.90537792 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 69.948 69.948 3 0.0019819 68793 QUIQUE_C1563_190116_001 61.37 43.274 278080000 89055000 0 54333000 0 0 87182000 47507000 0 0 0 0 0 0 11720 2880 10976 102828;102829;102830;102831;102832;102833 130376;130377;130378;130379;130380;130381 130378 6 ERPPAPSSFVFQEETKEQSK Unmodified 2320.1335 0.13353995 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 2 1 2 2 1 2 56.899 56.899 3;4 1.5928E-08 56351 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.65 104.32 421100000 0 0 0 0 0 0 0 49753000 87548000 0 83270000 29514000 171020000 11721 2880 10977 102834;102835;102836;102837;102838;102839;102840;102841 130382;130383;130384;130385;130386;130387;130388;130389 130382 7 ERPPEEVAAR Unmodified 1152.5887 0.58873523 3205;693 C9J406;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 14.334 14.334 2;3 1.6657E-07 6585 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.03 81.877 4878700000 844800000 343260000 576540000 277730000 307980000 0 520600000 304900000 420450000 136660000 351450000 335430000 458910000 11722 693;3205 10978 102842;102843;102844;102845;102846;102847;102848;102849;102850;102851;102852;102853;102854;102855;102856;102857;102858 130390;130391;130392;130393;130394;130395;130396;130397;130398;130399;130400;130401;130402;130403;130404;130405;130406;130407;130408;130409;130410;130411;130412;130413;130414 130405 24 ERPPNPIEFLASYLLK Unmodified 1886.0302 0.030184502 4089 Q9C005 DPY30 Protein dpy-30 homolog yes yes 0 0 1 1 1 167.3 167.3 3 0.023845 172063 QUIQUE_C1218_190116_001 52.172 31.804 16541000 8070700 8470500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11723 4089 10979 102859;102860 130415;130416 130415 1 ERPPTFLTPEGNASNK Unmodified 1756.8744 0.87441214 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 1 1 1 2 1 45.626 45.626 2;3 0.00025828 43130 QUIQUE_C1576_190116_001 101.53 76.059 168120000 0 0 47212000 0 48456000 0 45898000 0 0 26556000 0 0 0 11724 756 10980 102861;102862;102863;102864;102865 130417;130418;130419;130420;130421 130420 5 ERPPTFLTPEGNASNKEELR Unmodified 2284.1448 0.14477334 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 2 1 53.519 53.519 3 0.0029044 51044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.959 36.134 50248000 0 0 0 0 0 0 0 50248000 0 0 0 0 0 11725 756 10981 102866 130422 130422 1 ERPQLAECEEPSIYSPAFPR Unmodified 2375.1216 0.12159506 1418 O00562 PITPNM1 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 92.256 92.256 3 0.013946 93014 QUIQUE_C1563_190116_001 38.942 31.32 84721000 0 44059000 0 0 0 40663000 0 0 0 0 0 0 0 11726 1418 10982 102867;102868 130423;130424 130424 2 ERPQPVQAFSSALHEAAPSQLEGK Unmodified 2576.2983 0.29831387 4163 Q9H425;E5RFY9 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes no 0 0 1 1 1 1 91.591 91.591 3 5.4774E-31 93534 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.27 121.89 106570000 0 0 0 0 0 0 0 43600000 62967000 0 0 0 0 11727 4163 10983 102869;102870;102871 130425;130426;130427 130427 3 ERPSQPEGLR Unmodified 1167.5996 0.59963426 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 1 2 14.804 14.804 2;3 0.013565 6760 QUIQUE_C1403_190116_001 93.096 56.7 80800000 0 0 0 80800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11728 922 10984 102872;102873 130428;130429 130428 1 ERPTSLNVFPLADGTVR Unmodified 1870.9901 0.9901106 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.615 95.615 3 0.0035774 97810 QUIQUE_C1403_190116_001 51.089 42.296 586940000 54386000 0 65321000 59682000 50447000 54144000 53066000 71063000 41341000 0 44303000 43116000 50072000 11729 77 10985 102874;102875;102876;102877;102878;102879;102880;102881;102882;102883;102884 130430;130431;130432;130433;130434;130435;130436;130437;130438;130439;130440;130441;130442;130443;130444 130432 14 ERQEAEEAKEALLQASR Unmodified 1956.9865 0.98648179 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 2 3 1 1 2 1 57.345 57.345 2;3;4 0.00049932 56636 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.152 51.382 1296700000 0 0 0 0 0 0 0 402990000 184190000 0 222700000 202570000 284200000 11730 2248 10986 102885;102886;102887;102888;102889;102890;102891;102892 130445;130446;130447;130448;130449;130450;130451;130452;130453 130447 8 ERQEEQSAAIHISETLEQKPHFESSTVK Unmodified 3237.5902 0.59019838 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 2 1 3 3 2 1 4 3 3 2 3 2 3 67.742 67.742 3;4;5 7.0724E-160 67694 QUIQUE_DMIX5_190116_001 210.11 174.9 9081900000 53152000 1332200000 1179500000 1011000000 53725000 514050000 902490000 900390000 0 218180000 1255000000 737940000 924250000 11731 143;560;4559 10987 102893;102894;102895;102896;102897;102898;102899;102900;102901;102902;102903;102904;102905;102906;102907;102908;102909;102910;102911;102912;102913;102914;102915;102916;102917;102918;102919;102920;102921;102922 130454;130455;130456;130457;130458;130459;130460;130461;130462;130463;130464;130465;130466;130467;130468;130469;130470;130471;130472;130473;130474;130475;130476;130477;130478;130479;130480;130481;130482;130483;130484;130485;130486;130487;130488;130489;130490;130491;130492;130493 130487 40 ERVEAVNMAEGIIHDTETK Unmodified 2141.0423 0.042282105 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 94.153 94.153 3;4 3.4133E-22 96553 QUIQUE_C1368_190116_001 131.18 116.03 4776000000 412090000 320340000 414700000 319100000 336620000 368660000 477210000 228270000 452040000 208600000 440610000 372480000 425260000 11732 2415 10988 102923;102924;102925;102926;102927;102928;102929;102930;102931;102932;102933;102934;102935;102936;102937;102938;102939;102940;102941;102942;102943;102944;102945;102946;102947;102948 130494;130495;130496;130497;130498;130499;130500;130501;130502;130503;130504;130505;130506;130507;130508;130509;130510;130511;130512;130513;130514;130515;130516;130517;130518;130519;130520;130521;130522;130523;130524;130525;130526;130527;130528 130500 34 ERVEFILEQMR Unmodified 1448.7446 0.74458394 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 1 1 1 90.252 90.252 3 0.0090189 93702 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.207 34.82 55384000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30962000 24423000 0 11733 1389 10989 102949;102950 130529;130530;130531 130530 3 ERWENPLMGWASTADPLSNMVLTFSTK Oxidation (M) 3096.4685 0.46849202 1513 O43181 NDUFS4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 1 166.36 166.36 3 3.7543E-15 173713 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.236 78.077 192570000 0 0 0 0 0 0 0 0 54725000 0 79999000 57845000 0 11734 1513 10990 102951;102952;102953 130532;130533;130534 130533 832 3 ESAAHDYTLR Unmodified 1161.5415 0.54145068 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 19.752 19.752 2;3 0.0001557 12907 QUIQUE_C1218_190116_001 122.44 92.969 1864000000 247450000 152270000 136370000 351400000 290890000 0 0 158950000 178050000 84143000 264490000 0 0 11735 2898 10991 102954;102955;102956;102957;102958;102959;102960;102961;102962;102963;102964;102965 130535;130536;130537;130538;130539;130540;130541;130542;130543;130544;130545;130546;130547;130548 130536 14 ESAAPAAAPTAEAPPPSVVTRPEPQALPSPAIR Unmodified 3245.7044 0.70444027 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 1 1 1 90.625 90.625 3 1.6404E-36 92933 QUIQUE_C1277_190116_001 99.446 93.416 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11736 381 10992 102966;102967 130549;130550 130549 2 ESADPLGAWLQDAR Unmodified 1527.7318 0.73177065 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.76 131.76 2 2.2253E-22 128641 QUIQUE_DMIX4_190116_001 198.81 187.28 9071000000 667160000 672000000 690240000 268820000 615340000 353770000 632170000 910550000 1003600000 374050000 1343500000 897020000 642830000 11737 3117 10993 102968;102969;102970;102971;102972;102973;102974;102975;102976;102977;102978;102979;102980 130551;130552;130553;130554;130555;130556;130557;130558;130559;130560;130561;130562;130563;130564;130565;130566;130567;130568;130569;130570;130571;130572 130568 22 ESAFEFLSSA Unmodified 1086.487 0.4869555 2430 P40925;B9A041;B8ZZ51 MDH1 Malate dehydrogenase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 145.05 145.05 1;2 0.0017885 149944 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.561 83.973 7628000000 1818600000 638230000 429930000 549600000 605900000 514890000 454370000 226640000 268160000 436840000 1075700000 286890000 322290000 11738 2430 10994 102981;102982;102983;102984;102985;102986;102987;102988;102989;102990;102991;102992;102993;102994;102995 130573;130574;130575;130576;130577;130578;130579;130580;130581;130582;130583;130584;130585;130586;130587;130588;130589;130590;130591;130592;130593;130594;130595;130596;130597;130598;130599 130598 25 ESAGADTRPTVR Unmodified 1258.6266 0.6265773 1639 O75489;E9PS48;G3V194 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 11.647 11.647 3 0.00050608 3285 QUIQUE_C1563_190116_001 74.46 57.435 279240000 3445100 0 16633000 13578000 17030000 189340000 13985000 0 9270000 1048400 0 6434600 8475400 11739 1639 10995 102996;102997;102998;102999;103000;103001;103002;103003;103004;103005;103006 130600;130601;130602;130603;130604;130605;130606;130607;130608;130609;130610;130611;130612;130613;130614 130607 15 ESAGADTRPTVRPR Unmodified 1511.7805 0.78045218 1639 O75489;E9PS48;G3V194 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes no 0 0 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 11.259 11.259 3;4 0.00014937 2674 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.412 81.683 4215800000 164220000 10604000 435620000 231180000 498030000 10240000 348390000 415310000 179610000 89051000 716640000 594060000 522810000 11740 1639 10996 103007;103008;103009;103010;103011;103012;103013;103014;103015;103016;103017;103018;103019;103020;103021;103022;103023;103024;103025;103026;103027;103028;103029 130615;130616;130617;130618;130619;130620;130621;130622;130623;130624;130625;130626;130627;130628;130629;130630;130631;130632;130633;130634;130635;130636;130637;130638;130639;130640;130641;130642;130643;130644;130645;130646;130647;130648;130649 130648 32 ESAINVAEGK Unmodified 1016.5138 0.51383895 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4;F2Z2I8 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 29.828 29.828 2 0.02797 23669 QUIQUE_C1403_190116_001 76.345 31.626 512080000 289010000 0 0 223070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11741 4466 10997 103030;103031 130650;130651 130651 0 ESALFSTELSVLHNFFSPSPK Unmodified 2336.1689 0.16886283 3715 Q8WX92 NELFB Negative elongation factor B yes yes 0 0 0 1 164.54 164.54 3 8.8704E-07 169177 QUIQUE_C1218_190116_001 79.568 71.946 22411000 22411000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11742 3715 10998 103032 130652;130653 130653 2 ESALLFDAEK Unmodified 1121.5605 0.56045479 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 71.545 71.545 2 0.017645 71538 QUIQUE_C1368_190116_001 61.65 50.43 250830000 0 0 63092000 51825000 48637000 0 0 0 0 20460000 26354000 40466000 0 11743 4336 10999 103033;103034;103035;103036;103037;103038 130654;130655;130656;130657;130658;130659 130654 6 ESAPFAVIGSNTVVEAK Unmodified 1717.8887 0.88866522 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;E7EPG2;Q99719;E7EX32 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 3 98.316 98.316 2;3 4.6746E-10 102127 QUIQUE_C1218_190116_001 148.62 122.57 4007800000 465900000 410810000 387870000 384160000 0 230300000 350230000 258250000 248090000 141170000 301070000 395480000 434450000 11744 1092;3970 11000 103039;103040;103041;103042;103043;103044;103045;103046;103047;103048;103049;103050;103051;103052;103053;103054 130660;130661;130662;130663;130664;130665;130666;130667;130668;130669;130670;130671;130672;130673;130674;130675;130676;130677;130678;130679;130680 130661 21 ESAPGALREETLQR Unmodified 1555.7954 0.79543354 4453 Q9UJ14 GGT7 Gamma-glutamyltransferase 7;Gamma-glutamyltransferase 7 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 7 light chain yes yes 0 0 1 1 37.339 37.339 3 0.014957 33407 QUIQUE_DMIX8_190116_001 37.013 32.383 25771000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25771000 11745 4453 11001 103055 130681 130681 1 ESAREEEEAEQER Unmodified 1590.6758 0.67577191 1493 O15240 VGF Neurosecretory protein VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 14.732 14.732 2;3 0.00031961 7098 QUIQUE_C1218_190116_001 98.902 87.397 142930000 34385000 11683000 0 0 48526000 0 0 0 0 0 48333000 0 0 11746 1493 11002 103056;103057;103058;103059;103060 130682;130683;130684;130685;130686 130682 5 ESARPQPEFVLPR Unmodified 1524.8049 0.80487601 3506 Q86WG3 ATCAY Caytaxin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 60.141 60.141 3 0.0022671 59390 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.548 51.121 163250000 0 0 0 0 0 0 0 21847000 0 0 45783000 34839000 60779000 11747 3506 11003 103061;103062;103063;103064 130687;130688;130689;130690 130688 4 ESASRSEYPITEIR Unmodified 1636.8057 0.80566387 4690 yes yes 0 0 1 1 20.98 20.98 3 0.050686 14100 QUIQUE_DMIX5_190116_001 25.53 13.384 63069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63069000 0 0 + 11748 4690 11004 103065 130691 130691 1 ESATEEKLTPVLLAK Unmodified 1627.9033 0.90325265 3011 Q13561;F8W1I6;H0YI98;F8VW18;F8VX93 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 1 2 67.995 67.995 2;3 0.0034256 66991 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.124 44.518 86538000 0 0 0 0 0 0 0 86538000 0 0 0 0 0 11749 3011 11005 103066;103067 130692;130693 130693 2 ESAYLYAR Unmodified 971.47125 0.47124585 2172 P20774;Q5TBF5 OGN Mimecan yes no 0 0 0 1 36.603 36.603 2 0.042451 32598 QUIQUE_C1576_190116_001 58.981 26.511 279120000 0 0 0 0 0 0 279120000 0 0 0 0 0 0 11750 2172 11006 103068 130694 130694 1 ESCLEAYTGIVQGLK Unmodified 1666.8236 0.82362212 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 122.45 122.45 2;3 6.8063E-19 126928 QUIQUE_C1368_190116_001 175.15 158.52 4373400000 315420000 349050000 421340000 341010000 386310000 336910000 386670000 231760000 359460000 0 434450000 327820000 483230000 11751 3090 11007 103069;103070;103071;103072;103073;103074;103075;103076;103077;103078;103079;103080;103081;103082;103083;103084;103085 130695;130696;130697;130698;130699;130700;130701;130702;130703;130704;130705;130706;130707;130708;130709;130710;130711;130712;130713 130698 16 ESCLEAYTGIVQGLKGDQENVHPDVMLVQPR Unmodified 3481.697 0.69698841 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 131.98 131.98 4 4.1276E-25 135059 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.814 80.327 454150000 0 0 0 0 0 0 0 117810000 70659000 0 85769000 72856000 107060000 11752 3090 11008 103086;103087;103088;103089;103090 130714;130715;130716;130717;130718;130719 130714 6 ESCLQFYHAELK Unmodified 1523.7079 0.70786408 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 66.048 66.048 2;3 0.00094397 64319 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.882 58.837 214060000 0 0 0 0 0 0 0 93514000 0 30956000 0 0 89587000 11753 2564 11009 103091;103092;103093;103094;103095;103096 130720;130721;130722;130723;130724;130725;130726 130726 7 ESDDGTEELEVR Unmodified 1377.5896 0.58958267 998 F5H039;Q9NQX3 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 45.684 45.684 2 9.0156E-09 42572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.06 128.67 827550000 67624000 74733000 102300000 89190000 69029000 87929000 0 103590000 76350000 0 77951000 78862000 0 11754 998 11010 103097;103098;103099;103100;103101;103102;103103;103104;103105;103106;103107;103108 130727;130728;130729;130730;130731;130732;130733;130734;130735;130736;130737;130738 130733 10 ESDFMASVDSSWISWGVGVFLLK Unmodified 2559.2356 0.23556218 3702 Q8WUX9;E5RJI3 CHMP7 Charged multivesicular body protein 7 yes no 0 0 0 1 82.12 82.12 3 0.067583 83221 QUIQUE_DMIX7_190116_001 13.188 0.99184 34874000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34874000 0 11755 3702 11011 103109 130739 130739 1 ESDGAPGDLTSLENER Unmodified 1688.7489 0.74893686 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.687 77.687 2 3.6924E-06 74231 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.87 81.015 671500000 49659000 57051000 0 99744000 61592000 89103000 61195000 86865000 0 35630000 0 54439000 76224000 11756 309;4058 11012 103110;103111;103112;103113;103114;103115;103116;103117;103118;103119 130740;130741;130742;130743;130744;130745;130746;130747;130748;130749;130750 130748 9 ESDGASDEAEESGSQGK Unmodified 1681.6551 0.65509605 1652 O75688 PPM1B Protein phosphatase 1B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.535 13.535 2 3.0531E-223 5982 QUIQUE_DMIX1_190116_001 271.01 242.83 231970000 17642000 0 27127000 9174400 26844000 2128700 34565000 32927000 23640000 0 0 10269000 47655000 11757 1652 11013 103120;103121;103122;103123;103124;103125;103126;103127;103128;103129 130751;130752;130753;130754;130755;130756;130757;130758;130759;130760 130757 10 ESDLNGAQIK Unmodified 1073.5353 0.53530267 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.37 23.37 2 0.0085861 16922 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.491 50.191 266560000 30906000 0 0 39771000 47891000 32463000 0 0 0 0 72813000 0 42718000 11758 2171 11014 103130;103131;103132;103133;103134;103135 130761;130762;130763;130764;130765;130766 130765 4 ESDQGAYTCEAMNAR Unmodified 1701.6723 0.67228321 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 46.101 46.101 2 9.7394E-07 43385 QUIQUE_C1277_190116_001 117.98 104.07 39741000 0 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163560000 34957000 34739000 0 34010000 0 0 0 0 40286000 19569000 0 0 0 11762 661 11018 103144;103145;103146;103147;103148;103149;103150;103151 130776;130777;130778;130779;130780;130781;130782;130783;130784 130783 8 ESDWLQYR Unmodified 1095.4985 0.49852324 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.404 76.404 2 0.00077104 76941 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.4 126.91 2184500000 244240000 198320000 204500000 136620000 188920000 141630000 177860000 223970000 180580000 54551000 221100000 0 212170000 11763 2530 11019 103152;103153;103154;103155;103156;103157;103158;103159;103160;103161;103162;103163 130785;130786;130787;130788;130789;130790;130791;130792;130793;130794;130795;130796;130797;130798 130794 11 ESEAPGGGCSSGGAAPAR Unmodified 1616.6849 0.68489681 2502 P48066 SLC6A11 Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.038 16.038 2 3.7609E-23 8790 QUIQUE_C1218_190116_001 141.13 127.93 363290000 43444000 25029000 48060000 40449000 38707000 23111000 40709000 0 0 0 40648000 26670000 36461000 11764 2502 11020 103164;103165;103166;103167;103168;103169;103170;103171;103172;103173 130799;130800;130801;130802;130803;130804;130805;130806;130807;130808;130809 130799 11 ESEAVEWQQK Unmodified 1232.5673 0.56733108 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.85 34.85 2 0.00027507 30705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.62 107.84 2206100000 148130000 162120000 222540000 0 0 0 0 415910000 402880000 294150000 0 232370000 327940000 11765 2248 11021 103174;103175;103176;103177;103178;103179;103180;103181 130810;130811;130812;130813;130814;130815;130816;130817 130813 7 ESEDAELLWR Unmodified 1246.583 0.58298115 3832 Q96DB5;E5RH53;H0YB83;E5RGC8 RMDN1 Regulator of microtubule dynamics protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.829 88.829 2 0.00055997 92075 QUIQUE_C1218_190116_001 109.71 67.605 597470000 45752000 29335000 54963000 40019000 46231000 44571000 46991000 36419000 58040000 0 88578000 40392000 66179000 11766 3832 11022 103182;103183;103184;103185;103186;103187;103188;103189;103190;103191;103192;103193;103194 130818;130819;130820;130821;130822;130823;130824;130825;130826;130827;130828;130829;130830;130831;130832 130819 13 ESEDKPEIEDVGSDEEEEK Unmodified 2191.9128 0.91282688 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 1 1 44.978 44.978 3 0.00034442 39563 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.261 60.681 41940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41940000 0 0 0 11767 1931 11023 103195 130833 130833 1 ESEDKPEIEDVGSDEEEEKK Unmodified 2320.0078 0.007789897 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 32.498 32.498 2;3;4 3.1481E-46 27459 QUIQUE_C1563_190116_001 161.95 159.02 1673800000 169710000 109320000 260960000 136860000 171470000 260270000 210770000 63594000 42970000 81095000 50782000 72464000 43495000 11768 1931 11024 103196;103197;103198;103199;103200;103201;103202;103203;103204;103205;103206;103207;103208;103209;103210;103211;103212;103213;103214 130834;130835;130836;130837;130838;130839;130840;130841;130842;130843;130844;130845;130846;130847;130848;130849;130850;130851;130852 130840 17 ESEHTGPGWESAR Unmodified 1441.6222 0.6222202 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 20.1 20.1 2 2.4746E-23 13192 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.99 128.2 92168000 31158000 0 0 0 0 0 0 33640000 27369000 0 0 0 0 11769 3565 11025 103215;103216;103217;103218 130853;130854;130855;130856 130855 4 ESEIIDFFLGASLKDEVLK Unmodified 2152.1304 0.13035206 972 E9PQD7;P15880;I3L404;E9PPT0;E9PMM9 RPS2 40S ribosomal protein S2 yes no 0 0 1 1 162.98 162.98 3 0.014437 167818 QUIQUE_DMIX3_190116_001 40.759 31.476 27181000 0 0 0 0 0 0 0 0 27181000 0 0 0 0 11770 972 11026 103219 130857 130857 1 ESELKLEEK Unmodified 1103.571 0.57101948 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 20.197 20.197 2 0.0030269 13012 QUIQUE_DMIX7_190116_001 135.86 60.168 189290000 0 0 0 0 0 0 40226000 41427000 55668000 0 0 51968000 0 11771 1613 11027 103220;103221;103222;103223 130858;130859;130860;130861 130861 4 ESEPQAAAEPAEAK Unmodified 1426.6576 0.65760265 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 21.18 21.18 2 0.00010703 14282 QUIQUE_C1368_190116_001 145.41 137.36 3373100000 296290000 379670000 439670000 417230000 519870000 373170000 463040000 0 97367000 35064000 155100000 77436000 119210000 11772 2817 11028 103224;103225;103226;103227;103228;103229;103230;103231;103232;103233;103234;103235;103236;103237;103238 130862;130863;130864;130865;130866;130867;130868;130869;130870;130871;130872;130873;130874;130875;130876;130877;130878;130879;130880;130881 130867 20 ESESAPGDFSLSVK Unmodified 1451.678 0.67800374 2774 P62993;J3KT38 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.186 75.186 2 0.00029373 76958 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130899;130900;130901;130902;130903;130904;130905;130906;130907;130908;130909;130910;130911;130912;130913;130914;130915;130916;130917;130918 130916 2465 20 ESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISK Unmodified 3326.5217 0.52172616 3030;4044 Q13885;Q9BVA1 TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 3 3 3 1 3 3 2 132.1 132.1 2;3;4 7.4202E-157 137596 QUIQUE_C1218_190116_001 226.08 196.19 56227000000 4233100000 7055300000 4892800000 5386600000 4799600000 3994000000 8659100000 2345300000 2107700000 466230000 2934500000 3736600000 5616600000 11775 3030;4044 11030 103266;103267;103268;103269;103270;103271;103272;103273;103274;103275;103276;103277;103278;103279;103280;103281;103282;103283;103284;103285;103286;103287;103288;103289;103290;103291;103292;103293;103294;103295;103296 130919;130920;130921;130922;130923;130924;130925;130926;130927;130928;130929;130930;130931;130932;130933;130934;130935;130936;130937;130938;130939;130940;130941;130942;130943;130944;130945;130946;130947;130948;130949;130950;130951;130952;130953;130954;130955;130956 130920 36 ESESVDKVMDQK Oxidation (M) 1409.6344 0.63442437 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96;D6RAF8;D6RF44;D6RBQ9 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 2 2 1 3 2 2 13.157 13.157 2;3 3.5853E-13 5638 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.65 132.33 1479500000 31130000 117290000 51137000 3087300 87395000 15309000 40877000 224220000 190330000 27660000 127540000 239700000 323810000 11776 3041 11031 103297;103298;103299;103300;103301;103302;103303;103304;103305;103306;103307;103308;103309;103310;103311;103312;103313;103314;103315;103316;103317;103318;103319 130957;130958;130959;130960;130961;130962;130963;130964;130965;130966;130967;130968;130969;130970;130971;130972;130973;130974;130975;130976;130977;130978;130979;130980 130975 2468 19 ESESVDKVMDQK Unmodified 1393.6395 0.63950975 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96;D6RAF8;D6RF44;D6RBQ9 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 1 1 1 1 1 26.287 26.287 2 2.8679E-45 20308 QUIQUE_DMIX3_190116_001 204.17 166.62 228840000 0 0 0 0 0 0 0 70515000 49295000 0 65864000 43165000 0 11777 3041 11031 103320;103321;103322;103323 130981;130982;130983;130984;130985 130982 5 ESESVDKVMDQKEHK Unmodified 1787.836 0.83597772 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96;D6RAF8;D6RF44;D6RBQ9 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 2 2 16.386 16.386 3;4 0.00021811 8922 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.287 66.691 32450000 0 0 0 0 0 0 0 32450000 0 0 0 0 0 11778 3041 11032 103324;103325 130986;130987 130987 2 ESFAEMNR Unmodified 982.41783 0.41783007 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 31.815 31.815 2 0.0057754 27102 QUIQUE_C1218_190116_001 104.21 82.662 2020100000 434160000 0 0 305680000 0 297440000 230690000 0 0 102520000 380310000 269280000 0 11779 2052 11033 103326;103327;103328;103329;103330;103331;103332 130988;130989;130990;130991;130992;130993;130994 130988 5 ESFNPESYELDK Unmodified 1456.6358 0.63580458 2553 P49903;Q5T5U6 SEPHS1 Selenide, water dikinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.794 82.794 2 0.00051446 83969 QUIQUE_C1368_190116_001 114.89 97.673 257310000 45967000 44396000 34351000 0 49056000 0 0 41255000 42285000 0 0 0 0 11780 2553 11034 103333;103334;103335;103336;103337;103338 130995;130996;130997;130998;130999;131000;131001 130998 7 ESFQQPEVR Unmodified 1118.5356 0.53563702 3994 Q9BQG2;E7EM93 NUDT12 Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12 yes no 0 0 0 1 1 33.773 33.773 2 0.030211 29454 QUIQUE_C1438_190116_001 73.26 49.492 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11781 3994 11035 103339;103340 131002;131003 131002 2 ESFSLVQVQPGVDIIR Unmodified 1785.9625 0.96249887 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.54 129.54 2 4.222E-09 133984 QUIQUE_DMIX8_190116_001 158.01 143.66 747940000 0 74509000 80695000 0 79816000 56888000 64415000 55547000 74436000 35706000 86015000 74897000 65014000 11782 7 11036 103341;103342;103343;103344;103345;103346;103347;103348;103349;103350;103351 131004;131005;131006;131007;131008;131009;131010;131011;131012;131013;131014;131015 131015 12 ESGCSFVLALMQK Unmodified 1468.7054 0.70542124 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 1 130.82 130.82 2;3 5.028E-05 136285 QUIQUE_C1218_190116_001 87.667 80.786 225670000 16264000 0 20694000 14214000 125980000 0 12865000 35648000 0 0 0 0 0 11783 1921 11037 103352;103353;103354;103355;103356;103357;103358;103359;103360;103361;103362;103363 131016;131017;131018;131019;131020;131021;131022;131023;131024;131025;131026;131027 131016 12 ESGDREALQLWSALQLK Unmodified 1943.0112 0.011239973 4200 Q9HA64;I3L378 FN3KRP Ketosamine-3-kinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.19 135.19 3 2.1728E-05 141671 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.54 72.165 294550000 0 0 0 0 17276000 0 0 61485000 45925000 0 65379000 60387000 44099000 11784 4200 11038 103364;103365;103366;103367;103368;103369 131028;131029;131030;131031;131032;131033 131031 6 ESGDVLLSGAEIFAELGEVIK Unmodified 2175.1311 0.13108034 3088 Q14894;I3L325;I3L3Y1 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 2 2 1 3 2 4 1 2 1 1 175.16 175.16 2;3 5.0939E-26 178128 QUIQUE_C1218_190116_001 169.04 141.18 6682600000 172730000 207800000 0 67180000 516540000 0 1017200000 823110000 964050000 0 1130900000 1198900000 584180000 11785 3088 11039 103370;103371;103372;103373;103374;103375;103376;103377;103378;103379;103380;103381;103382;103383;103384;103385;103386;103387;103388 131034;131035;131036;131037;131038;131039;131040;131041;131042;131043;131044;131045;131046;131047;131048;131049;131050;131051;131052;131053;131054;131055;131056;131057;131058;131059 131034 26 ESGHSNWLGDPEEPLTGFSWR Unmodified 2400.0771 0.077087707 3355 Q6DD88;F5H6I7;F5GWF8 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 0 1 132.37 132.37 3 0.02731 137166 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.767 35.499 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11786 3355 11040 103389 131060 131060 1 ESGLHSFEQVK Unmodified 1259.6146 0.61461563 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 32.196 32.196 2 0.00043115 27680 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.01 32.189 116100000 0 0 0 0 0 0 0 42263000 0 15860000 57975000 0 0 11787 4476 11041 103390;103391;103392;103393;103394 131061;131062;131063;131064;131065 131062 5 ESGLQAAHPNSIFLIDHAWTCR Unmodified 2522.2125 0.21247575 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 104.77 104.77 4 0.00901 108118 QUIQUE_DMIX8_190116_001 31.27 24.055 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no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 2 1 123.52 123.52 3;4 2.4307E-10 128936 QUIQUE_C1576_190116_001 106.75 91.494 802470000 0 0 31193000 95815000 134100000 68751000 69029000 42898000 57013000 19330000 99241000 126070000 59022000 11794 2427 11048 103417;103418;103419;103420;103421;103422;103423;103424;103425;103426;103427;103428;103429;103430;103431;103432 131088;131089;131090;131091;131092;131093;131094;131095;131096;131097;131098;131099;131100;131101;131102;131103;131104;131105;131106;131107 131098 18 ESHLLNDEDLTQAK Unmodified 1611.774 0.77402939 3416 Q6WCQ1;J3KSK7 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein yes no 0 0 0 1 48.758 48.758 3 0.0099122 46522 QUIQUE_C1218_190116_001 30.027 10.704 19859000 19859000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11795 3416 11049 103433 131108 131108 1 ESHPATVFILFSDLNPLVTLGGNK Unmodified 2568.3588 0.35878886 3994 Q9BQG2;E7EM93 NUDT12 Peroxisomal NADH pyrophosphatase NUDT12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 167.88 167.88 3 1.2605E-12 172876 QUIQUE_C1368_190116_001 97.974 84.518 257250000 34596000 37125000 41481000 0 0 0 49375000 0 0 0 0 59061000 35608000 11796 3994 11050 103434;103435;103436;103437;103438;103439 131109;131110;131111;131112;131113;131114 131111 5 ESHPGLFPPTFGAVAPFLADLDTTDGLGK Unmodified 2969.4811 0.48108884 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 166.71 166.71 3 2.4953E-06 172860 QUIQUE_C1438_190116_001 55.046 43.523 200210000 0 0 64579000 0 81407000 0 0 54228000 0 0 0 0 0 11797 2075 11051 103440;103441;103442 131115;131116;131117;131118 131116 4 ESHTAVVYTEK Unmodified 1262.6143 0.61428128 533 A6NEM2;P51610 HCFC1 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 15.81 15.81 3 0.00067301 7416 QUIQUE_C1563_190116_001 79.201 60.529 198730000 49946000 0 0 0 0 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reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 38.061 38.061 2 0.021068 34783 QUIQUE_C1218_190116_001 75.738 29.312 915470000 339800000 0 0 287710000 0 287950000 0 0 0 0 0 0 0 11803 2658 11057 103473;103474;103475;103476;103477 131153;131154;131155;131156;131157 131153 5 ESIESEIRR Unmodified 1117.5728 0.57275081 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 29.104 29.104 2;3 0.00074612 23222 QUIQUE_C1277_190116_001 113.7 77.826 3491900000 0 301350000 323850000 353430000 444210000 119660000 255780000 0 329930000 73557000 674270000 305470000 310390000 11804 2658 11058 103478;103479;103480;103481;103482;103483;103484;103485;103486;103487;103488;103489;103490;103491;103492;103493 131158;131159;131160;131161;131162;131163;131164;131165;131166;131167;131168;131169;131170;131171;131172;131173;131174 131159 17 ESILSLLIK Unmodified 1014.6325 0.63249752 3425 Q6ZT12;H7C481;H0Y3K2 UBR3 E3 ubiquitin-protein ligase UBR3 yes no 0 0 0 1 141.3 141.3 2 0.058808 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131203;131204;131205;131206;131207;131208;131209;131210;131211;131212;131213;131214;131215;131216;131217;131218;131219;131220;131221;131222;131223;131224;131225;131226;131227;131228;131229;131230;131231;131232;131233;131234;131235;131236;131237;131238;131239;131240;131241 131207 39 ESIVDVEGVVR Unmodified 1200.635 0.63501672 2083 P14868;C9J7S3;C9JLC1;H7C278;C9JQM9 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.835 84.835 2 1.3559E-05 86316 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.92 63.016 2218900000 191140000 167810000 198720000 192680000 0 186230000 206620000 160240000 205370000 111260000 231710000 178150000 188990000 11809 2083 11063 103553;103554;103555;103556;103557;103558;103559;103560;103561;103562;103563;103564 131242;131243;131244;131245;131246;131247;131248;131249;131250;131251;131252;131253;131254;131255 131250 14 ESIWLPFMETELHCDEK Unmodified 2162.9653 0.96527734 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 139.41 139.41 2;3 5.4997E-05 143586 QUIQUE_C1403_190116_001 89.982 81.966 543400000 41196000 62167000 50386000 35091000 43531000 32831000 43042000 29602000 44652000 11841000 62704000 38969000 47395000 11810 1663 11064 103565;103566;103567;103568;103569;103570;103571;103572;103573;103574;103575;103576;103577;103578 131256;131257;131258;131259;131260;131261;131262;131263;131264;131265;131266;131267;131268;131269;131270;131271;131272;131273;131274 131260 19 ESKDPADETEAD Unmodified 1305.5208 0.5208344 2115 P16949 STMN1 Stathmin yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.484 15.484 2 1.53E-05 7871 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.66 137.75 3626800000 460740000 639280000 366760000 411640000 0 191880000 238120000 0 317830000 83859000 374380000 289660000 252680000 11811 2115 11065 103579;103580;103581;103582;103583;103584;103585;103586;103587;103588;103589;103590 131275;131276;131277;131278;131279;131280;131281;131282;131283;131284;131285;131286;131287;131288 131286 13 ESKDQLSDDVSK Unmodified 1349.6311 0.63105355 2056 P13521 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes yes 0 0 1 1 17.016 17.016 2 0.014275 9519 QUIQUE_C1438_190116_001 85.355 34.009 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11812 2056 11066 103591 131289 131289 1 ESKEEETSIDVAGKPNEVTK Unmodified 2189.0699 0.069936644 2634 P53985 SLC16A1 Monocarboxylate transporter 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 30.736 30.736 3 4.4744E-06 25478 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.837 75.017 149340000 0 41590000 0 0 0 0 0 23830000 44148000 0 39774000 0 0 11813 2634 11067 103592;103593;103594;103595 131290;131291;131292;131293 131292 4 ESKEETPGTEWEK Unmodified 1548.6944 0.69438209 1967 P09497;D6RJD1 CLTB Clathrin light chain B yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 2 25.601 25.601 2;3 1.3942E-63 20212 QUIQUE_DMIX1_190116_001 206.1 139.5 1567700000 154760000 101360000 43712000 77416000 89302000 64193000 95540000 135850000 138730000 31799000 233460000 79769000 321760000 11814 1967 11068 103596;103597;103598;103599;103600;103601;103602;103603;103604;103605;103606;103607;103608;103609;103610;103611;103612;103613 131294;131295;131296;131297;131298;131299;131300;131301;131302;131303;131304;131305;131306;131307;131308;131309;131310;131311;131312;131313 131303 18 ESKKEDLVFIFWAPESAPLK Unmodified 2333.2307 0.2307348 2220;4546 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;Q9Y281 CFL1;CFL2 Cofilin-1;Cofilin-2 no no 0 0 2 3 3 3 3 1 131.78 131.78 2;3;4 1.2527E-74 136524 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.15 173.92 3601500000 0 0 0 0 0 0 0 1083700000 491040000 0 1117500000 697290000 211940000 11815 2220;4546 11069 103614;103615;103616;103617;103618;103619;103620;103621;103622;103623;103624;103625;103626 131314;131315;131316;131317;131318;131319;131320;131321;131322;131323;131324;131325;131326;131327;131328 131317 14 ESKPPKPADEEIGIIQTSTEHTFSEQK Unmodified 3025.488 0.48802471 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 2 3 3 2 3 1 3 1 2 1 77.657 77.657 3;4;5 4.109E-96 78018 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10 ESLAQPVSDSSK Unmodified 1246.6041 0.60411052 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.507 24.507 2 0.00031259 18328 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.42 82.579 1017900000 208950000 0 203300000 215930000 0 0 169450000 0 0 0 0 220250000 0 11818 3889 11072 103656;103657;103658;103659;103660 131368;131369;131370;131371;131372 131372 5 ESLCQAALGLILK Unmodified 1414.7854 0.78538612 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.36 151.36 2 2.9786E-08 157338 QUIQUE_C1218_190116_001 138.66 114.63 1208900000 81154000 95299000 139390000 84312000 108630000 135390000 0 67480000 150640000 36843000 69787000 138410000 101560000 11819 3933 11073 103661;103662;103663;103664;103665;103666;103667;103668;103669;103670;103671;103672 131373;131374;131375;131376;131377;131378;131379;131380;131381;131382;131383;131384;131385;131386;131387;131388 131375 15 ESLDVYELDAK Unmodified 1280.6136 0.61361257 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.419 82.419 2 0.00029455 79701 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.68 66.964 1396000000 0 0 0 0 0 0 0 210940000 245650000 112570000 306980000 243320000 276520000 11820 341 11074 103673;103674;103675;103676;103677;103678;103679 131389;131390;131391;131392;131393;131394;131395;131396 131393 7 ESLEALLQR Unmodified 1057.5768 0.57677356 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.447 94.447 2 0.0086009 95789 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.324 17.642 78922000 15228000 0 0 12875000 0 0 16869000 17426000 0 0 0 16524000 0 11821 1697 11075 103680;103681;103682;103683;103684;103685;103686;103687;103688 131397;131398;131399;131400;131401;131402;131403;131404;131405 131402 9 ESLIDGIK Unmodified 873.48075 0.48074791 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 73.186 73.186 2 0.012053 57752 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.142 0 4480000000 909590000 619280000 673740000 454360000 0 532130000 406580000 0 0 381760000 317500000 185040000 0 11822 2219 11076 103689;103690;103691;103692;103693;103694;103695;103696;103697;103698;103699;103700;103701 131406;131407;131408;131409;131410;131411;131412;131413;131414;131415;131416;131417;131418;131419;131420;131421;131422 131418 15 ESLIDGIKR Unmodified 1029.5819 0.58185894 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 1 48.611 48.611 2 2.7252E-07 55890 QUIQUE_DMIX3_190116_001 163.77 0 3699700000 0 86371000 235570000 61891000 459250000 0 116610000 579940000 754290000 0 625540000 565390000 214800000 11823 2219 11077 103702;103703;103704;103705;103706;103707;103708;103709;103710;103711;103712;103713;103714 131423;131424;131425;131426;131427;131428;131429;131430;131431;131432;131433;131434;131435;131436;131437 131433 14 ESLKPAAKPLPSK Unmodified 1364.8028 0.80275075 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 2 1 14.807 14.807 3 0.022565 6999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.386 51.719 1364200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1364200000 0 0 11824 2483 11078 103715 131438 131438 0 ESLLDGGNK Unmodified 931.46108 0.4610751 1408 O00468 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes yes 0 0 0 1 26.102 26.102 2 0.0058953 20330 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.642 51.999 46926000 0 0 0 0 0 0 0 0 46926000 0 0 0 0 11825 1408 11079 103716 131439 131439 1 ESLLPVAK Unmodified 855.50657 0.50656873 3202;735 C9JNZ1;Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 49.06 49.06 1;2 0.02309 47168 QUIQUE_C1218_190116_001 73.616 50.093 757940000 238570000 0 0 253180000 0 242240000 0 23945000 0 0 0 0 0 11826 735;3202 11080 103717;103718;103719;103720 131440;131441;131442;131443 131440 3 ESLNASIVDAINQAADCWGIR Unmodified 2302.1012 0.10119397 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 169.98 169.98 2;3 7.8645E-45 174369 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.38 110.56 713340000 48835000 80106000 29810000 11511000 33459000 0 57867000 19825000 206180000 0 81562000 61419000 82761000 11827 4466 11081 103721;103722;103723;103724;103725;103726;103727;103728;103729;103730;103731;103732;103733;103734 131444;131445;131446;131447;131448;131449;131450;131451;131452;131453;131454;131455;131456;131457;131458;131459 131456 15 ESLNHALELSVPEK Unmodified 1564.8097 0.80968662 3861 Q96GR2;H0YMZ0;H0YMC3 ACSBG1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 yes no 0 0 0 1 1 69.843 69.843 2 0.0028942 70101 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.345 52.536 20742000 0 0 0 0 0 0 0 0 20742000 0 0 0 0 11828 3861 11082 103735;103736 131460;131461 131461 2 ESLNVDVVK Unmodified 1001.5393 0.53932542 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;H0YJU9;H0YJL0;H0YG16;H0YJT3;H0YGB8 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.119 50.119 2 0.014665 47583 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.224 28.12 316030000 51637000 63284000 0 63545000 0 0 0 49758000 49940000 37866000 0 0 0 11829 1050 11083 103737;103738;103739;103740;103741;103742 131462;131463;131464;131465;131466;131467 131466 6 ESLPELSTAQQNK Unmodified 1443.7205 0.72053726 1277 J3KQ41;Q9H9Q2;J3KQ34 COPS7B COP9 signalosome complex subunit 7b yes no 0 0 0 1 1 1 50.92 50.92 2 0.00044415 49371 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.658 57.406 52219000 0 0 27177000 0 0 0 0 0 25042000 0 0 0 0 11830 1277 11084 103743;103744;103745 131468;131469;131470 131469 3 ESLPIDIDQLSGR Unmodified 1441.7413 0.7412727 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 0 1 115.28 115.28 2 0.023846 112050 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.663 55.512 55884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55884000 0 0 0 11831 3597 11085 103746 131471 131471 1 ESLQQMAEVTR Oxidation (M) 1306.6187 0.61871473 1329 K7ELL7;P14314;K7EPW7;K7EKX1;K7EJ70 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 1 34.944 34.944 2 0.012057 29740 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.974 51.575 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11832 1329 11086 103747;103748;103749;103750 131472;131473;131474;131475 131475 752 4 ESLSEEEAQK Unmodified 1148.5197 0.51971219 4063 Q9BXP5;H7C3A1 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.609 18.609 2 6.3552E-08 11207 QUIQUE_C1438_190116_001 156.51 106.67 495460000 0 0 67220000 0 78542000 62808000 55827000 0 0 21521000 88669000 58931000 61937000 11833 4063 11087 103751;103752;103753;103754;103755;103756;103757;103758 131476;131477;131478;131479;131480;131481;131482;131483 131477 8 ESLSTAAECVK Unmodified 1193.5598 0.55980286 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 37.01 37.01 2 0.062331 32783 QUIQUE_C1576_190116_001 43.958 28.296 39272000 0 0 0 0 0 0 39272000 0 0 0 0 0 0 11834 3555 11088 103759 131484 131484 1 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131561;131562;131563;131564;131565;131566;131567;131568;131569;131570;131571;131572;131573;131574;131575;131576;131577;131578;131579;131580;131581;131582;131583;131584;131585;131586;131587;131588;131589;131590 131577 29 ESPESEGPIYEGLIL Unmodified 1631.793 0.7930335 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 154.66 154.66 2 0.0061647 160199 QUIQUE_C1368_190116_001 100.02 93.914 759640000 0 128070000 89656000 0 145190000 0 0 0 136770000 0 128450000 131500000 0 11847 3926 11101 103845;103846;103847;103848;103849;103850 131591;131592;131593;131594;131595;131596 131592 1 ESPEVLLTLDILK Unmodified 1468.8389 0.83886148 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 151.35 151.35 2 0.020805 154389 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.727 39.861 365710000 0 46976000 0 0 0 0 0 122550000 196190000 0 0 0 0 11848 3053 11102 103851;103852;103853 131597;131598;131599 131598 3 ESPPLLPLGTPC Unmodified 1279.6482 0.64822394 1599 O60883 GPR37L1 Prosaposin receptor GPR37L1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 128.71 128.71 2 0.010177 132774 QUIQUE_C1277_190116_001 60.436 49.726 113750000 0 32918000 0 40204000 0 0 0 0 0 0 0 0 40631000 11849 1599 11103 103854;103855;103856;103857 131600;131601;131602;131603 131601 4 ESPQDSAITR Unmodified 1102.5255 0.52546627 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.867 19.867 2 0.0022304 12420 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.087 62.391 470860000 61892000 50190000 0 48120000 0 43477000 62996000 0 33395000 0 58507000 62072000 50208000 11850 4596 11104 103858;103859;103860;103861;103862;103863;103864;103865;103866;103867;103868 131604;131605;131606;131607;131608;131609;131610;131611;131612;131613;131614;131615 131615 12 ESPQEIAR Unmodified 928.46141 0.46140945 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 18.241 18.241 2 0.013433 10473 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.323 47.365 421980000 0 0 0 0 0 0 0 204120000 139330000 78537000 0 0 0 11851 2848 11105 103869;103870;103871 131616;131617;131618 131617 3 ESQATLEER Unmodified 1061.4989 0.49891717 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 0 1 16.734 16.734 2 0.054518 9442 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.045 35.413 33428000 0 0 0 0 0 0 0 0 33428000 0 0 0 0 11852 1579 11106 103872 131619 131619 1 ESQAVVDPPQAASTGAPQSSAVAAAAATTTATTTTTSSGGHPLEFLR Unmodified 4511.2052 0.20520793 2647 P54727 RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 122.81 122.81 3;4 9.8103E-131 127565 QUIQUE_C1218_190116_001 150.94 139.13 81991000 28718000 0 0 53273000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11853 2647 11107 103873;103874 131620;131621 131620 2 ESQAYYQR Unmodified 1043.4672 0.46722311 517 A2A2V1;P04156 PRNP Major prion protein yes no 0 0 0 1 18.027 18.027 2 0.039823 10512 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.648 42.269 105490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105490000 0 0 0 11854 517 11108 103875 131622 131622 1 ESQDLKEELVAAVEDVRK Unmodified 2057.0641 0.064063405 2250 P26232;C9IZ88 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 112.67 112.67 3;4 0.00017717 117450 QUIQUE_C1438_190116_001 61.102 44.98 694450000 37463000 42744000 50560000 51953000 74092000 0 119660000 188280000 0 26594000 0 0 103100000 11855 2250 11109 103876;103877;103878;103879;103880;103881;103882;103883;103884;103885 131623;131624;131625;131626;131627;131628;131629;131630;131631;131632;131633 131628 10 ESQDTSFTTLVER Unmodified 1511.7104 0.71036651 2900 Q06210 GFPT1 Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.229 81.229 2 0.00029929 83523 QUIQUE_C1218_190116_001 111.27 93.369 353530000 36337000 61236000 67983000 0 56870000 0 0 39257000 0 0 91844000 0 0 11856 2900 11110 103886;103887;103888;103889;103890;103891 131634;131635;131636;131637;131638;131639;131640 131634 7 ESQFLKEELVAAVEDVRK Unmodified 2089.1055 0.10553429 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJL0;E5RIE0 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 2 1 113.6 113.6 3;4 0.0011355 117126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.545 59.606 681820000 0 71449000 86388000 98138000 0 58417000 0 215890000 151540000 0 0 0 0 11857 2369 11111 103892;103893;103894;103895;103896;103897;103898;103899 131641;131642;131643;131644;131645;131646;131647;131648;131649 131649 9 ESQILSLLSDIGSGIR Unmodified 1686.9152 0.91521432 1481 O15111 CHUK Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha yes yes 0 0 0 1 162.78 162.78 2 0.0012995 157241 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.563 41.271 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11858 1481 11112 103900 131650 131650 1 ESQISAEIELLPTNDK Unmodified 1785.8996 0.89962384 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;H7C4C3 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 0 1 1 110.09 110.09 2 0.00026641 113658 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.11 84.919 42846000 0 0 0 0 0 0 0 42846000 0 0 0 0 0 11859 71 11113 103901;103902 131651;131652 131652 2 ESQLFDPSDLQDTSNR Unmodified 1850.8282 0.82824981 4520 Q9UPQ0;D6RD46 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 94.942 94.942 2 0.0004908 98534 QUIQUE_C1368_190116_001 79.466 55.615 305480000 0 0 305480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11860 4520 11114 103903 131653 131653 1 ESQLQEADLQVDKER Unmodified 1786.8697 0.86972069 1602 O60890 OPHN1 Oligophrenin-1 yes yes 0 0 1 1 48.763 48.763 3 0.0044935 45798 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.314 30.841 28834000 0 0 0 0 0 0 0 28834000 0 0 0 0 0 11861 1602 11115 103904 131654 131654 1 ESQLQEADSQVDLVR Unmodified 1715.8326 0.83260691 466 A0A2R8YGB3;Q9UNA1;A0A2R8Y5C0 ARHGAP26 Rho GTPase-activating protein 26 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.932 78.932 2 4.4368E-25 79845 QUIQUE_C1368_190116_001 158.42 126.09 404420000 46237000 0 39142000 38090000 32524000 30815000 32998000 0 27978000 17712000 47212000 45313000 46399000 11862 466 11116 103905;103906;103907;103908;103909;103910;103911;103912;103913;103914;103915;103916 131655;131656;131657;131658;131659;131660;131661;131662;131663;131664;131665;131666 131657 11 ESQPLLGTVIDGMLLLK Unmodified 1826.0223 0.022321932 2205 P23141;H3BSU0 CES1 Liver carboxylesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 168.72 168.72 2 6.2291E-07 171717 QUIQUE_C1403_190116_001 107.65 69.677 37436000 0 0 0 21303000 16133000 0 0 0 0 0 0 0 0 11863 2205 11117 103917;103918 131667;131668 131667 2 ESQPSPPAQEAGYSTLAQSYPSDLPEEPSSPQER Unmodified 3658.6547 0.6547087 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.22 109.22 3 2.8714E-29 111123 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.195 79.277 528000000 86331000 71322000 0 70248000 0 0 45568000 100030000 0 21130000 75304000 58060000 0 11864 2009 11118 103919;103920;103921;103922;103923;103924;103925;103926;103927 131669;131670;131671;131672;131673;131674;131675;131676;131677;131678;131679 131675 11 ESQSHPGDFVLSVR Unmodified 1556.7583 0.75831975 2898 Q06124;A0A1W2PPU4 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 60.962 60.962 2;3 6.8646E-05 60148 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.837 69.897 3677900000 222970000 351420000 360090000 309740000 348820000 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377130000 29606000 28098000 67117000 0 43213000 0 37659000 39581000 0 0 56565000 38929000 36364000 11867 4497 11121 103955;103956;103957;103958;103959;103960;103961;103962;103963;103964 131709;131710;131711;131712;131713;131714;131715;131716;131717;131718 131711 9 ESQTQDNITVR Unmodified 1289.6212 0.62115757 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.665 22.665 2 0.0002088 15596 QUIQUE_C1368_190116_001 123.6 92.066 283580000 83135000 49875000 51368000 75683000 0 0 0 23514000 0 0 0 0 0 11868 3766 11122 103965;103966;103967;103968;103969;103970;103971 131719;131720;131721;131722;131723;131724;131725 131721 7 ESSDQNFDYMFK Unmodified 1509.6082 0.60820962 2163 P20336;M0R257 RAB3A Ras-related protein Rab-3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.17 95.17 2 0.00051774 97884 QUIQUE_DMIX7_190116_001 110.14 102.93 4131600000 413020000 441040000 374190000 384750000 220150000 298510000 339630000 224570000 247700000 99174000 451960000 304980000 331940000 11869 2163 11123 103972;103973;103974;103975;103976;103977;103978;103979;103980;103981;103982;103983;103984 131726;131727;131728;131729;131730;131731;131732;131733;131734;131735;131736;131737;131738 131737 11 ESSDQNFDYMFK Oxidation (M) 1525.6031 0.60312424 2163 P20336;M0R257 RAB3A Ras-related protein Rab-3A yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 70.922 70.922 2 0.0022165 71370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.556 71.428 842410000 0 74878000 136750000 0 44310000 48842000 0 74795000 84126000 52041000 224170000 102490000 0 11870 2163 11123 103985;103986;103987;103988;103989;103990;103991;103992;103993;103994;103995 131739;131740;131741;131742;131743;131744;131745;131746;131747;131748;131749 131747 1506 10 ESSDSANTTIEDEDAK Unmodified 1710.7068 0.70679727 3010 Q13554;H7BZC6 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.063 26.063 2 8.712E-95 19834 QUIQUE_DMIX3_190116_001 216.84 202.6 4145400000 347600000 514130000 373840000 478250000 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4533 11126 104010;104011;104012;104013;104014;104015;104016;104017;104018;104019;104020;104021;104022;104023 131769;131770;131771;131772;131773;131774;131775;131776;131777;131778;131779;131780;131781;131782;131783 131769 15 ESSESTNTTIEDEDTKVR Unmodified 2039.9131 0.91310165 4533 Q9UQM7 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 29.734 29.734 2;3 8.969E-24 24120 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.29 110.12 2234200000 0 66051000 60968000 45889000 159970000 0 102590000 424630000 257240000 0 353130000 419190000 344490000 11874 4533 11127 104024;104025;104026;104027;104028;104029;104030;104031;104032;104033;104034;104035;104036;104037;104038;104039 131784;131785;131786;131787;131788;131789;131790;131791;131792;131793;131794;131795;131796;131797;131798;131799;131800 131797 17 ESSETPDQFMTADETR Unmodified 1842.7578 0.75778698 1143 H0YD13;P16070;H0Y2P0;H0YE40 CD44 CD44 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.728 71.728 2 1.0533E-54 72316 QUIQUE_DMIX3_190116_001 193.73 179.83 3010900000 188800000 223590000 105430000 350410000 146340000 150110000 117360000 283660000 439260000 123950000 301650000 194430000 385880000 11875 1143 11128 104040;104041;104042;104043;104044;104045;104046;104047;104048;104049;104050;104051;104052 131801;131802;131803;131804;131805;131806;131807;131808;131809;131810;131811;131812;131813;131814;131815;131816;131817;131818;131819 131812 19 ESSETPDQFMTADETR Oxidation (M) 1858.7527 0.7527016 1143 H0YD13;P16070;H0Y2P0;H0YE40 CD44 CD44 antigen yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.295 47.295 2 4.6273E-20 44243 QUIQUE_C1368_190116_001 149.23 145.9 683710000 0 54817000 36400000 69365000 37719000 38195000 37196000 54474000 109410000 41666000 65737000 52631000 86103000 11876 1143 11128 104053;104054;104055;104056;104057;104058;104059;104060;104061;104062;104063;104064 131820;131821;131822;131823;131824;131825;131826;131827;131828;131829;131830;131831 131821 664 12 ESSIIGVTLFSSTK Unmodified 1467.7821 0.78207489 2917 Q08257 CRYZ Quinone oxidoreductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 117.57 117.57 2 0.0041274 122980 QUIQUE_C1438_190116_001 66.262 40.324 151420000 0 0 0 0 56468000 53408000 0 0 0 41540000 0 0 0 11877 2917 11129 104065;104066;104067;104068;104069 131832;131833;131834;131835;131836;131837 131833 6 ESSLILAVTPANMDLANSDALK Unmodified 2272.1621 0.16206289 2569 P50570;K7EPK9 DNM2 Dynamin-2 yes no 0 0 0 1 141.15 141.15 2 0.026862 148530 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.03 44.145 96827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 96827000 0 0 11878 2569 11130 104070 131838 131838 1 ESSLTEPVIVGLLK Unmodified 1483.8498 0.84976052 917 E9PFR3;Q14738 PPP2R5D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.11 130.11 2 0.0035325 134660 QUIQUE_C1277_190116_001 80.596 63.16 523190000 0 78209000 71820000 59899000 52095000 49319000 76404000 0 66362000 0 69086000 0 0 11879 917 11131 104071;104072;104073;104074;104075;104076;104077;104078 131839;131840;131841;131842;131843;131844;131845;131846 131839 1 ESSPLYSPTFSDSTSAVK Unmodified 1901.8895 0.88945308 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.427 85.427 2 1.2355E-38 82657 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.68 142.11 3110800000 177910000 164800000 176000000 157540000 211780000 229950000 132860000 386210000 397870000 66426000 338920000 257830000 412730000 11880 2483 11132 104079;104080;104081;104082;104083;104084;104085;104086;104087;104088;104089;104090;104091 131847;131848;131849;131850;131851;131852;131853;131854;131855;131856;131857;131858;131859;131860;131861;131862;131863;131864 131860 18 ESSSEQYVPDVFYK Unmodified 1676.757 0.75698235 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.18 100.18 2 4.0511E-05 103190 QUIQUE_C1368_190116_001 110.93 90.901 831840000 83583000 87713000 79972000 62638000 0 65133000 75512000 44052000 44109000 43676000 96487000 81790000 67177000 11881 3660 11133 104092;104093;104094;104095;104096;104097;104098;104099;104100;104101;104102;104103 131865;131866;131867;131868;131869;131870;131871;131872;131873;131874;131875;131876 131867 10 ESSSESFISR Unmodified 1127.5095 0.50948185 4390 Q9P2R3;I3L3P8 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.27 33.27 2 0.014159 28861 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.985 56.589 559670000 0 94947000 60678000 0 0 0 0 152070000 110660000 0 53638000 0 87672000 11882 4390 11134 104104;104105;104106;104107;104108;104109 131877;131878;131879;131880;131881;131882 131881 3 ESSSHHPGIAEFPSR Unmodified 1636.7594 0.75938238 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 25.6 25.6 2;3;4 0.011707 20041 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.941 22.109 324810000 0 0 0 0 0 0 17129000 0 0 29948000 75830000 0 201900000 11883 1823 11135 104110;104111;104112;104113 131883;131884;131885;131886;131887 131884 5 ESSTVFELK Unmodified 1038.5233 0.523341 3132 Q15370;B8ZZU8;I3L0M9;A0A0B4J296 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.363 58.363 2 0.0079449 58639 QUIQUE_C1218_190116_001 80.165 35.771 811280000 182650000 0 0 153420000 134160000 137050000 0 0 0 0 111800000 0 92195000 11884 3132 11136 104114;104115;104116;104117;104118;104119 131888;131889;131890;131891;131892;131893 131888 5 ESSTVFELKR Unmodified 1194.6245 0.62445203 3132 Q15370;B8ZZU8;I3L0M9;A0A0B4J296 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 37.927 37.927 2;3 0.0070672 34253 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.559 35.966 520800000 0 0 0 0 0 0 0 102370000 119500000 0 98124000 112420000 88378000 11885 3132 11137 104120;104121;104122;104123;104124 131894;131895;131896;131897;131898;131899 131898 5 ESTESSNTTIEDEDVK Unmodified 1782.7643 0.76431215 896;803 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.132 32.132 2 1.0104E-94 26532 QUIQUE_C1368_190116_001 215.71 201.62 1111600000 146420000 113150000 136620000 110230000 87643000 100500000 103770000 34481000 61601000 49721000 70507000 42521000 54486000 11886 803;896 11138 104125;104126;104127;104128;104129;104130;104131;104132;104133;104134;104135;104136;104137 131900;131901;131902;131903;131904;131905;131906;131907;131908;131909;131910;131911;131912 131902 13 ESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVR Unmodified 3173.462 0.46202643 2414 P38606;C9JVW8 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 0 1 2 1 157.82 157.82 3 7.7367E-25 162004 QUIQUE_C1277_190116_001 84.561 78.334 134650000 39545000 82941000 0 0 0 0 0 0 0 12162000 0 0 0 11887 2414 11139 104138;104139;104140;104141 131913;131914;131915;131916;131917 131915 5 ESTFLDEGPDDEQEVPLR Unmodified 2074.9331 0.93310881 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.01 105.01 2 1.2508E-105 107014 QUIQUE_DMIX1_190116_001 222.94 200.22 1743200000 125100000 125670000 189040000 128070000 143250000 203220000 153050000 141160000 106460000 37793000 155130000 95844000 139430000 11888 921 11140 104142;104143;104144;104145;104146;104147;104148;104149;104150;104151;104152;104153;104154 131918;131919;131920;131921;131922;131923;131924;131925;131926;131927;131928;131929;131930;131931;131932;131933 131928 16 ESTFLDEGPDDEQEVPLREHATR Unmodified 2669.2205 0.22051706 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 74.519 74.519 4 1.4385E-31 74207 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139 131.73 113580000 0 0 0 0 0 0 0 113580000 0 0 0 0 0 11889 921 11141 104155 131934;131935 131935 2 ESTGAQVQVAGDMLPNSTER Oxidation (M) 2104.9695 0.96951109 3130;3131;1044;916 Q15365;F8VZX2;H3BRU6;F8W0G4;F8VXH9;Q15366;E9PFP8;P57721;J3QT27 PCBP1;PCBP2;PCBP3 Poly(rC)-binding protein 1;Poly(rC)-binding protein 2;Poly(rC)-binding protein 3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.631 59.631 2 4.4571E-87 58344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 196.18 174.88 1091800000 64569000 97383000 96680000 83678000 69129000 58491000 56314000 105390000 98422000 73286000 112430000 78529000 97538000 11890 3130;1044;3131;916 11142 104156;104157;104158;104159;104160;104161;104162;104163;104164;104165;104166;104167;104168 131936;131937;131938;131939;131940;131941;131942;131943;131944;131945;131946;131947;131948 131944 567 13 ESTGAQVQVAGDMLPNSTER Unmodified 2088.9746 0.97459647 3130;3131;1044;916 Q15365;F8VZX2;H3BRU6;F8W0G4;F8VXH9;Q15366;E9PFP8;P57721;J3QT27 PCBP1;PCBP2;PCBP3 Poly(rC)-binding protein 1;Poly(rC)-binding protein 2;Poly(rC)-binding protein 3 no no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 3 1 79.181 79.181 2;3 2.2702E-220 81426 QUIQUE_C1218_190116_001 262.66 240.08 2256900000 231240000 203950000 199800000 230320000 123760000 151410000 160580000 239850000 162200000 52982000 166740000 168510000 165580000 11891 3130;1044;3131;916 11142 104169;104170;104171;104172;104173;104174;104175;104176;104177;104178;104179;104180;104181;104182;104183;104184;104185;104186 131949;131950;131951;131952;131953;131954;131955;131956;131957;131958;131959;131960;131961;131962;131963;131964;131965;131966;131967;131968;131969;131970;131971;131972;131973;131974;131975;131976;131977;131978;131979;131980 131950 32 ESTITLQQAEYEFLSFVR Unmodified 2160.0739 0.07389981 1155 H0YG54;H0YGR4;Q9Y3B8 REXO2 Oligoribonuclease, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 169.63 169.63 2;3 6.9159E-11 173574 QUIQUE_DMIX7_190116_001 148.68 107.14 464480000 0 48186000 105250000 17964000 17357000 14496000 0 32072000 0 6900100 121570000 68278000 32405000 11892 1155 11143 104187;104188;104189;104190;104191;104192;104193;104194;104195;104196;104197;104198;104199 131981;131982;131983;131984;131985;131986;131987;131988;131989;131990;131991;131992;131993 131992 10 ESTLEAIGYICQDIDPEQLQDK Unmodified 2564.1952 0.19521351 3090 Q14974;J3KTM9;J3QRG4 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 3 2 147.74 147.74 2;3 1.8618E-66 153306 QUIQUE_C1368_190116_001 221.91 209.89 1193300000 140930000 134400000 166920000 149420000 151300000 159600000 60009000 28960000 93860000 0 0 0 107900000 11893 3090 11144 104200;104201;104202;104203;104204;104205;104206;104207;104208;104209;104210;104211;104212;104213;104214;104215;104216;104217;104218 131994;131995;131996;131997;131998;131999;132000;132001;132002;132003;132004;132005;132006;132007;132008;132009;132010;132011;132012;132013;132014;132015;132016;132017;132018 132002 22 ESTLHLVLR Unmodified 1066.6135 0.61349341 623 J3QS39;J3QTR3;F5H6Q2;F5GYU3;F5H2Z3;F5H265;B4DV12;F5H388;F5H747;F5GXK7;J3QKN0;Q5PY61;Q96C32;P62987;P62979;P0CG47;P0CG48;M0R1M6;M0R2S1;A0A2R8Y422 UBB;RPS27A;UBC;UBA52 Ubiquitin-60S ribosomal protein L40;Ubiquitin;60S ribosomal protein L40;Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a;Ubiquitin;40S ribosomal protein S27a;Polyubiquitin-B;Ubiquitin;Polyubiquitin-C;Ubiquitin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 50.353 50.353 2;3 5.0568E-25 49003 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.87 155.06 58011000000 3930600000 4541600000 4413700000 3001900000 4733600000 3709000000 4145200000 5516400000 5182400000 1727300000 5645100000 5139700000 6324200000 11894 623 11145 104219;104220;104221;104222;104223;104224;104225;104226;104227;104228;104229;104230;104231;104232;104233;104234;104235;104236;104237;104238;104239;104240;104241;104242;104243;104244;104245 132019;132020;132021;132022;132023;132024;132025;132026;132027;132028;132029;132030;132031;132032;132033;132034;132035;132036;132037;132038;132039;132040;132041;132042;132043;132044;132045;132046;132047;132048;132049;132050;132051;132052;132053;132054;132055;132056;132057;132058;132059;132060;132061;132062;132063;132064;132065;132066;132067;132068;132069;132070;132071;132072;132073;132074;132075;132076;132077;132078;132079;132080;132081;132082;132083;132084;132085;132086;132087;132088;132089;132090;132091;132092;132093;132094;132095;132096;132097 132065 79 ESTYQGHHTPPVQK Unmodified 1607.7692 0.76921879 1782 P00414 MT-CO3 Cytochrome c oxidase subunit 3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 10.369 10.369 3;4 2.2559E-05 2717 QUIQUE_C1403_190116_001 115.8 86.314 1415200000 244190000 0 0 157390000 55116000 0 0 193990000 301400000 63878000 8226600 390990000 0 11895 1782 11146 104246;104247;104248;104249;104250;104251;104252;104253;104254;104255;104256;104257;104258;104259;104260 132098;132099;132100;132101;132102;132103;132104;132105;132106;132107;132108;132109;132110;132111;132112 132100 14 ESVDGQWVCISDVNK Unmodified 1734.7883 0.78829925 2669 P55735 SEC13 Protein SEC13 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.878 92.878 2 1.0644E-08 96057 QUIQUE_C1218_190116_001 149.38 135.95 939340000 71859000 75620000 101240000 88612000 69232000 68870000 77295000 55109000 69721000 42263000 73685000 68471000 77368000 11896 2669 11147 104261;104262;104263;104264;104265;104266;104267;104268;104269;104270;104271;104272;104273 132113;132114;132115;132116;132117;132118;132119;132120;132121;132122;132123;132124;132125;132126 132113 13 ESVELALK Unmodified 887.4964 0.49639797 1546 O43719;Q5H919;Q5H918 HTATSF1 HIV Tat-specific factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 48.405 48.405 2 0.032564 46069 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.252 26.46 64414000 0 19962000 0 0 20251000 0 0 0 24201000 0 0 0 0 11897 1546 11148 104274;104275;104276 132127;132128;132129 132129 3 ESVEQQADSFK Unmodified 1266.5728 0.57281039 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.779 45.779 2 5.6081E-10 42396 QUIQUE_C1368_190116_001 168.8 135 1964400000 242630000 194290000 214150000 197830000 172110000 148310000 244480000 116660000 173870000 77112000 0 182970000 0 11898 831;1569 11149 104277;104278;104279;104280;104281;104282;104283;104284;104285;104286;104287 132130;132131;132132;132133;132134;132135;132136;132137;132138;132139;132140;132141 132132 11 ESVFTVEGGHR Unmodified 1216.5836 0.58364985 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7;F5H3X6;F5H0C5;F5H2D2 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 31.499 31.499 2;3 0.0002806 26415 QUIQUE_C1277_190116_001 120.12 97.379 3225400000 0 343180000 362010000 402040000 0 0 311330000 215300000 310860000 188220000 452120000 251710000 388670000 11899 1272 11150 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104330;104331;104332;104333;104334;104335;104336;104337;104338;104339;104340;104341 132192;132193;132194;132195;132196;132197;132198;132199;132200;132201;132202;132203;132204 132193 9 ESVLQMMQAGQR Oxidation (M) 1392.649 0.648969 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 0 1 63.147 63.147 2 0.040844 62324 QUIQUE_C1218_190116_001 47.187 35.593 53957000 53957000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11904 1324 11154 104342 132205 132205 1 ESVLQMMQAGQR Unmodified 1376.6541 0.65405438 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 92.647 92.647 2 0.0016118 94087 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.219 64.255 236200000 0 64748000 88168000 0 0 0 0 83282000 0 0 0 0 0 11905 1324 11154 104343;104344;104345 132206;132207;132208 132208 2 ESVLTATSILNNPIVK Unmodified 1697.9564 0.95635086 3266 Q5BKZ1;A0A0A0MRN4 ZNF326 DBIRD complex subunit ZNF326 yes no 0 0 0 1 125.75 125.75 2 0.0073006 131968 QUIQUE_C1438_190116_001 53.967 39.809 36357000 0 0 0 0 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104361;104362;104363;104364;104365;104366;104367;104368;104369;104370;104371;104372;104373 132226;132227;132228;132229;132230;132231;132232;132233;132234;132235;132236;132237;132238;132239 132227 2948 14 ESVNYLVSQQNMLLIPTSFSPLK Unmodified 2607.3618 0.36182533 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 160.18 160.18 2;3 3.4855E-101 165607 QUIQUE_C1218_190116_001 153.83 151.39 4194500000 261490000 336970000 330090000 281960000 463940000 225740000 335460000 204540000 483670000 92915000 343660000 393780000 440290000 11909 4419 11157 104374;104375;104376;104377;104378;104379;104380;104381;104382;104383;104384;104385;104386;104387;104388;104389;104390;104391;104392;104393;104394;104395;104396;104397;104398;104399 132240;132241;132242;132243;132244;132245;132246;132247;132248;132249;132250;132251;132252;132253;132254;132255;132256;132257;132258;132259;132260;132261;132262;132263;132264;132265;132266;132267;132268;132269 132241 30 ESVPEFPLSPPK Unmodified 1325.6867 0.68671794 2115 P16949;A2A2D0 STMN1 Stathmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 93.331 93.331 2 0.00049938 91346 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.2 100.9 2857000000 298160000 299910000 224340000 195280000 247670000 213550000 221300000 119530000 300710000 101920000 222340000 190070000 222250000 11910 2115 11158 104400;104401;104402;104403;104404;104405;104406;104407;104408;104409;104410;104411;104412;104413;104414 132270;132271;132272;132273;132274;132275;132276;132277;132278;132279;132280;132281;132282;132283;132284;132285;132286;132287;132288;132289;132290;132291;132292;132293;132294;132295;132296;132297;132298;132299;132300;132301;132302;132303;132304;132305;132306;132307;132308 132300 39 ESVQVPDDQDFR Unmodified 1433.6423 0.64228694 1002 F5H8G1;F5H1Z6;F5H8H3;Q9Y365;F5GWK5;F5H0V7;F5H5A8;F5H3G8 STARD10 PCTP-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.732 65.732 2 0.00023077 65210 QUIQUE_C1368_190116_001 117.7 93.668 430380000 45938000 46004000 49197000 40793000 40741000 34860000 47082000 39191000 38650000 0 0 0 47928000 11911 1002 11159 104415;104416;104417;104418;104419;104420;104421;104422;104423;104424 132309;132310;132311;132312;132313;132314;132315;132316;132317;132318 132311 10 ESWEPVNNGSGTSEDLFWK Unmodified 2180.9651 0.96507764 981 F1T0E5 CADPS yes yes 0 0 0 1 1 1 126.09 126.09 2 1.1082E-05 129864 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.942 87.328 101290000 29172000 0 0 0 31776000 0 0 0 0 0 0 40342000 0 11912 981 11160 104425;104426;104427 132319;132320;132321 132321 3 ESWHGKPLPK Unmodified 1177.6244 0.62439245 2288 P29401;A0A0B4J1R6;E9PFF2 TKT Transketolase yes no 0 0 1 1 1 15.123 15.123 2;3 0.011472 6896 QUIQUE_C1277_190116_001 103.19 78.417 624920000 569080000 55831000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11913 2288 11161 104428;104429 132322;132323 132323 2 ESWLLPGSNDLLLEVGPR Unmodified 1994.0473 0.047291129 1477 O15067;J3QSG0;J3QSH6;J3KTL4 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 157.29 157.29 2;3 1.5833E-10 161936 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.19 102.95 403950000 31401000 35236000 0 27648000 46577000 13041000 31914000 48217000 42365000 8972500 57762000 33565000 27249000 11914 1477 11162 104430;104431;104432;104433;104434;104435;104436;104437;104438;104439;104440;104441;104442;104443;104444 132324;132325;132326;132327;132328;132329;132330;132331;132332;132333;132334;132335;132336;132337;132338;132339 132335 16 ESYEVSLTQK Unmodified 1182.5768 0.57683314 4320 Q9NX40;D6RDK6;D6RBN5 OCIAD1 OCIA domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.236 47.236 2 0.00023783 44701 QUIQUE_C1277_190116_001 117.81 59.581 790870000 0 109870000 92017000 79803000 88525000 66329000 0 0 72307000 0 102620000 66920000 112490000 11915 4320 11163 104445;104446;104447;104448;104449;104450;104451;104452;104453 132340;132341;132342;132343;132344;132345;132346;132347;132348;132349 132340 7 ESYPVFYLFR Unmodified 1319.655 0.65502388 2297 P30040;F8VY02 ERP29 Endoplasmic reticulum resident protein 29 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 143.43 143.43 2 0.00042432 147570 QUIQUE_C1277_190116_001 111.82 88.745 1005700000 0 85290000 100740000 84335000 86419000 90558000 100190000 58195000 79637000 35167000 102380000 84200000 98544000 11916 2297 11164 104454;104455;104456;104457;104458;104459;104460;104461;104462;104463;104464;104465;104466 132350;132351;132352;132353;132354;132355;132356;132357;132358;132359;132360;132361;132362;132363;132364;132365;132366;132367;132368;132369;132370;132371;132372 132350 23 ESYSALMR Unmodified 955.44332 0.44331654 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 46.752 46.752 2 0.026482 44614 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.32 85.771 1139500000 0 0 152210000 0 0 0 123310000 237770000 0 0 296840000 190960000 138370000 11917 3117 11165 104467;104468;104469;104470;104471;104472;104473 132373;132374;132375;132376;132377;132378;132379;132380;132381 132376 8 ESYSIYVYK Unmodified 1150.5546 0.55464113 1910 Q8N257;Q16778;P33778;P23527;P06899;Q6DRA6;Q6DN03 HIST3H2BB;HIST2H2BE;HIST1H2BB;HIST1H2BO;HIST1H2BJ;HIST2H2BD;HIST2H2BC Histone H2B type 3-B;Histone H2B type 2-E;Histone H2B type 1-B;Histone H2B type 1-O;Histone H2B type 1-J;Putative histone H2B type 2-D;Putative histone H2B type 2-C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.98 70.98 2 0.016345 72458 QUIQUE_C1218_190116_001 65.88 41.658 6341300000 653640000 617450000 390400000 447060000 624740000 469510000 685540000 614870000 735880000 0 0 500140000 602100000 11918 1910 11166 104474;104475;104476;104477;104478;104479;104480;104481;104482;104483;104484 132382;132383;132384;132385;132386;132387;132388;132389;132390;132391;132392;132393 132382 8 ESYSVYVYK Unmodified 1136.539 0.53899107 1593 U3KQK0;Q99880;Q99879;Q99877;Q93079;Q5QNW6;P62807;P58876;P57053;O60814 HIST1H2BN;HIST1H2BL;HIST1H2BM;HIST1H2BH;HIST2H2BF;HIST1H2BC;HIST1H2BD;H2BFS;HIST1H2BK Histone H2B;Histone H2B type 1-L;Histone H2B type 1-M;Histone H2B type 1-N;Histone H2B type 1-H;Histone H2B type 2-F;Histone H2B type 1-C/E/F/G/I;Histone H2B type 1-D;Histone H2B type F-S;Histone H2B type 1-K yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.665 60.665 2 0.0041096 59356 QUIQUE_C1368_190116_001 89.752 54.259 15136000000 1479200000 1219500000 876250000 774270000 1342200000 1267500000 1466700000 1016700000 1625300000 297320000 1386100000 1172700000 1212600000 11919 1593 11167 104485;104486;104487;104488;104489;104490;104491;104492;104493;104494;104495;104496;104497 132394;132395;132396;132397;132398;132399;132400;132401;132402;132403;132404;132405;132406;132407;132408;132409 132396 14 ESYVETELIFALAK Unmodified 1611.8396 0.83958976 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 6 6 6 4 4 6 6 6 7 4 7 8 6 152.52 152.52 2;3 6.129E-14 156732 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.83 131.73 2481700000 317480000 210670000 187540000 215290000 163190000 127180000 210220000 110550000 192830000 0 298060000 269330000 179410000 11920 50 11168 104498;104499;104500;104501;104502;104503;104504;104505;104506;104507;104508;104509;104510;104511;104512;104513;104514;104515;104516;104517;104518;104519;104520;104521;104522;104523;104524;104525;104526;104527;104528;104529;104530;104531;104532;104533;104534;104535;104536;104537;104538;104539;104540;104541;104542;104543;104544;104545;104546;104547;104548;104549;104550;104551;104552;104553;104554;104555;104556;104557;104558;104559;104560;104561;104562;104563;104564;104565;104566;104567;104568;104569;104570;104571;104572;104573 132410;132411;132412;132413;132414;132415;132416;132417;132418;132419;132420;132421;132422;132423;132424;132425;132426;132427;132428;132429;132430;132431;132432;132433;132434;132435;132436;132437;132438;132439;132440;132441;132442;132443;132444;132445;132446;132447;132448;132449;132450;132451;132452;132453;132454;132455;132456;132457;132458;132459;132460;132461;132462;132463;132464;132465;132466;132467;132468;132469;132470;132471;132472;132473;132474;132475;132476;132477;132478;132479;132480;132481;132482;132483;132484;132485;132486;132487;132488;132489;132490;132491;132492;132493;132494;132495;132496;132497;132498;132499;132500;132501;132502;132503;132504;132505;132506 132472 91 ESYVNLCSNPEDK Unmodified 1553.6668 0.66678713 3779 Q93034;H0YCA0 CUL5 Cullin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.129 56.129 2 0.00044618 54864 QUIQUE_C1576_190116_001 97.472 88.771 313340000 46998000 51667000 55312000 50471000 0 38178000 38952000 0 0 31761000 0 0 0 11921 3779 11169 104574;104575;104576;104577;104578;104579;104580 132507;132508;132509;132510;132511;132512;132513 132512 6 ETAAEILFDEVLTFAK Unmodified 1795.9244 0.92438203 3550 Q8IXQ6 PARP9 Poly [ADP-ribose] polymerase 9 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 175.03 175.03 2;3 8.9302E-07 182100 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.52 99.116 56528000 0 6866400 0 0 9198800 0 0 0 12888000 0 17672000 0 9901800 11922 3550 11170 104581;104582;104583;104584;104585;104586;104587 132514;132515;132516;132517;132518;132519;132520 132519 7 ETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPK Unmodified 3890.8109 0.81093458 1610 O75116;E9PF63;D6REE7 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.67 147.67 3 1.2153E-32 150458 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.956 87.439 247790000 30967000 0 30980000 23434000 26738000 0 0 36537000 0 20650000 47706000 30774000 0 11923 1610 11171 104588;104589;104590;104591;104592;104593;104594;104595 132521;132522;132523;132524;132525;132526;132527;132528;132529;132530 132526 10 ETAASLLQAGYK Unmodified 1250.6507 0.65066678 1792 P00734 F2 Prothrombin;Activation peptide fragment 1;Activation peptide fragment 2;Thrombin light chain;Thrombin heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 71.197 71.197 2 0.0014385 72463 QUIQUE_C1218_190116_001 81.338 43.789 68031000 43699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24332000 11924 1792 11172 104596;104597;104598 132531;132532;132533 132531 3 ETAAVIFLHGLGDTGHSWADALSTIR Unmodified 2737.3824 0.38237785 1726 O95372;Q5QPN9;Q5QPQ3;Q5QPQ2;Q5QPN5 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 153.42 153.42 3;4 2.1206E-94 160522 QUIQUE_DMIX5_190116_001 177.41 142.5 3350200000 65689000 279910000 216060000 275630000 208520000 156870000 340540000 275930000 241290000 21048000 449210000 428880000 390590000 11925 1726 11173 104599;104600;104601;104602;104603;104604;104605;104606;104607;104608;104609;104610;104611;104612;104613;104614;104615;104616;104617;104618;104619;104620;104621;104622 132534;132535;132536;132537;132538;132539;132540;132541;132542;132543;132544;132545;132546;132547;132548;132549;132550;132551;132552;132553;132554;132555;132556;132557;132558;132559;132560;132561 132556 21 ETADTDTADQVMASFK Unmodified 1728.7512 0.75124504 2047;1242 H9KV75;H0YJW3;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.98 101.98 2 4.2788E-13 103566 QUIQUE_C1563_190116_001 164.11 147.73 787390000 108030000 87823000 0 87994000 0 60886000 67826000 74554000 44678000 0 93102000 78205000 84289000 11926 1242;2047 11174 104623;104624;104625;104626;104627;104628;104629;104630;104631;104632;104633;104634;104635 132562;132563;132564;132565;132566;132567;132568;132569;132570;132571;132572;132573;132574;132575 132568 14 ETADTDTADQVMASFK Oxidation (M) 1744.7462 0.74615966 2047;1242 H9KV75;H0YJW3;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 1 0 1 1 1 65.25 65.25 2 0.00054504 66003 QUIQUE_C1438_190116_001 80.522 65.646 25214000 0 0 0 0 25214000 0 0 0 0 0 0 0 0 11927 1242;2047 11174 104636;104637;104638 132576;132577;132578 132576 712 3 ETAEADVASLNR Unmodified 1274.6103 0.61025853 1019;1164 F5H7S3;B7Z596;H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.566 45.566 2 1.5181E-20 43550 QUIQUE_C1218_190116_001 175.41 163.18 3209300000 279130000 0 532360000 0 276220000 0 452250000 134600000 390990000 0 362670000 325720000 455340000 11928 1019;1164 11175 104639;104640;104641;104642;104643;104644;104645;104646;104647 132579;132580;132581;132582;132583;132584;132585;132586;132587;132588 132580 10 ETAEADVASLNRR Unmodified 1430.7114 0.71136956 1019;1164 F5H7S3;B7Z596;H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 0 0 1 2 3 2 2 34.197 34.197 2;3 0.00058404 30226 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.227 45.481 632700000 0 0 0 0 0 0 0 123250000 167730000 0 174600000 167120000 0 11929 1019;1164 11176 104648;104649;104650;104651;104652;104653;104654;104655;104656 132589;132590;132591;132592;132593;132594;132595;132596;132597;132598;132599;132600 132590 10 ETAEAYLGK Unmodified 980.48148 0.48147619 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.146 35.146 2 0.0068621 30261 QUIQUE_C1403_190116_001 83.206 64.424 987810000 155370000 132790000 131660000 170690000 134050000 155910000 0 0 0 107350000 0 0 0 11930 2007 11177 104657;104658;104659;104660;104661;104662;104663 132601;132602;132603;132604;132605;132606;132607;132608 132604 5 ETAEAYLGKK Unmodified 1108.5764 0.57643921 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 1 1 20.713 20.713 2 0.021221 14267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.948 69.471 64196000 0 0 0 0 0 0 0 22660000 0 0 0 0 41536000 11931 2007 11178 104664;104665 132609;132610 132609 0 ETAEAYLGQPVKHAVITVPAYFNDSQR Unmodified 3003.509 0.50903493 2117 P17066 HSPA6 Heat shock 70 kDa protein 6 yes yes 0 0 1 1 158.55 158.55 3 0.0023181 162775 QUIQUE_C1277_190116_001 41.475 31.22 182290000 0 182290000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11932 2117 11179 104666 132611 132611 0 ETAENYLGHTAK Unmodified 1332.631 0.63099397 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 24.379 24.379 2;3 3.0312E-46 16930 QUIQUE_C1368_190116_001 204.52 192.48 4596700000 505550000 486020000 558150000 421950000 423640000 416460000 511240000 46699000 132350000 252460000 334660000 220010000 287550000 11933 2415 11180 104667;104668;104669;104670;104671;104672;104673;104674;104675;104676;104677;104678;104679;104680;104681;104682;104683;104684;104685;104686;104687 132612;132613;132614;132615;132616;132617;132618;132619;132620;132621;132622;132623;132624;132625;132626;132627;132628;132629;132630;132631;132632;132633;132634 132615 21 ETAESVLK Unmodified 875.46001 0.46001246 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 23.119 23.119 1 0.03897 16348 QUIQUE_C1403_190116_001 127.02 38.992 20115000 0 0 0 20115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11934 2363 11181 104688 132635 132635 0 ETAHWKPPPWNDVDPPKDTIVK Unmodified 2569.2965 0.29652296 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 76.804 76.804 3;4 7.0933E-11 78050 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.75 108.02 1895900000 0 55997000 230760000 34945000 249870000 0 240780000 48931000 70413000 0 366610000 343980000 253640000 11935 1620 11182 104689;104690;104691;104692;104693;104694;104695;104696;104697;104698;104699;104700;104701;104702 132636;132637;132638;132639;132640;132641;132642;132643;132644;132645;132646;132647;132648;132649;132650;132651 132646 16 ETAIELGYLTAEQFDEWVKPK Unmodified 2466.2319 0.23185701 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 161.7 161.7 2;3 4.5669E-86 167132 QUIQUE_C1218_190116_001 229.32 217.71 8933300000 785230000 763360000 705240000 451930000 637930000 431900000 652150000 757260000 819320000 147360000 962900000 973800000 844930000 11936 1935 11183 104703;104704;104705;104706;104707;104708;104709;104710;104711;104712;104713;104714;104715;104716;104717;104718;104719;104720;104721;104722;104723;104724;104725;104726;104727 132652;132653;132654;132655;132656;132657;132658;132659;132660;132661;132662;132663;132664;132665;132666;132667;132668;132669;132670;132671;132672;132673;132674;132675;132676;132677;132678;132679;132680;132681;132682;132683;132684;132685;132686;132687;132688 132655 36 ETALLIDPK Unmodified 998.56481 0.56481189 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2;E9PJ74;E9PI82 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.903 59.903 2 0.014899 58828 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.897 57.024 4240400000 354070000 369470000 368670000 342350000 353110000 309700000 349570000 349290000 316950000 0 413470000 317100000 396600000 11937 959 11184 104728;104729;104730;104731;104732;104733;104734;104735;104736;104737;104738;104739 132689;132690;132691;132692;132693;132694;132695;132696;132697;132698;132699;132700 132699 12 ETAPTSAYSSPAR Unmodified 1336.6259 0.62590859 1521 O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A yes yes 0 0 0 1 1 1 26.338 26.338 2 0.00013513 20838 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.99 118.22 403130000 0 0 0 0 0 0 216970000 113850000 0 72316000 0 0 0 11938 1521 11185 104740;104741;104742 132701;132702;132703;132704 132703 4 ETAPVSQPENKPESK Unmodified 1639.8053 0.80532952 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 13.231 13.231 2;3 7.7613E-06 5681 QUIQUE_C1403_190116_001 100.4 92.221 553380000 68801000 153900000 21395000 72916000 47577000 50962000 35539000 0 0 30023000 22860000 0 49408000 11939 1753 11186 104743;104744;104745;104746;104747;104748;104749;104750;104751;104752;104753;104754 132705;132706;132707;132708;132709;132710;132711;132712;132713;132714;132715;132716;132717 132708 12 ETASELLMR Oxidation (M) 1064.5172 0.51720977 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 49.605 49.605 2 0.011513 45682 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.213 51.058 2488000000 0 0 0 345410000 0 267340000 0 424920000 650390000 234340000 0 565570000 0 11940 2851 11187 104755;104756;104757;104758;104759;104760 132718;132719;132720;132721;132722;132723;132724;132725 132723 2294 8 ETASELLMR Unmodified 1048.5223 0.52229515 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 62.437 62.437 2 0.00046545 62102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.81 97.64 2536000000 0 0 0 0 0 0 0 480440000 619320000 0 835020000 601210000 0 11941 2851 11187 104761;104762;104763;104764 132726;132727;132728;132729 132726 4 ETAVFINISR Unmodified 1148.619 0.61897272 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.35 80.35 2 0.00092792 81692 QUIQUE_C1277_190116_001 104.01 86.194 427550000 0 79050000 0 0 65839000 77310000 75260000 0 59152000 70939000 0 0 0 11942 4405 11188 104765;104766;104767;104768;104769;104770;104771 132730;132731;132732;132733;132734;132735;132736;132737;132738;132739;132740;132741;132742;132743 132732 14 ETAVPGPLGIEDISPNLSPDDK Unmodified 2263.122 0.12197221 551 A6NNK5;Q12888 TP53BP1 Tumor suppressor p53-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 129.78 129.78 2 1.0924E-05 134254 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.705 78.752 33266000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33266000 0 11943 551 11189 104772;104773;104774 132744;132745;132746 132745 3 ETCAWFTDNYEQAR Unmodified 1789.7366 0.73659803 3020 Q13630 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.934 93.934 2 0.00019577 96087 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.55 113.42 437030000 0 48557000 39228000 0 34859000 35923000 42970000 33679000 45131000 14043000 50084000 41258000 51294000 11944 3020 11190 104775;104776;104777;104778;104779;104780;104781;104782;104783;104784;104785 132747;132748;132749;132750;132751;132752;132753;132754;132755;132756;132757 132757 11 ETCFAEEGK Unmodified 1069.4386 0.4386251 769 CON__P02768-1;P02768;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.349 20.349 2 0.0061041 12814 QUIQUE_C1277_190116_001 85.161 77.471 463260000 76829000 105750000 0 87258000 53648000 99974000 0 0 0 22941000 0 16863000 0 + 11945 769 11191 104786;104787;104788;104789;104790;104791;104792 132758;132759;132760;132761;132762;132763;132764 132759 7 ETCLITFLLAGIECPR Unmodified 1891.9536 0.95359044 3432 Q7KZF4;H7C597 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 169.86 169.86 2;3 8.138E-19 173705 QUIQUE_DMIX7_190116_001 181.66 158.44 1108900000 36656000 84245000 50453000 53689000 122110000 61342000 233340000 84863000 41944000 14870000 117270000 121050000 87097000 11946 3432 11192 104793;104794;104795;104796;104797;104798;104799;104800;104801;104802;104803;104804;104805;104806;104807;104808;104809;104810;104811;104812;104813;104814 132765;132766;132767;132768;132769;132770;132771;132772;132773;132774;132775;132776;132777;132778;132779;132780;132781;132782;132783;132784;132785;132786;132787 132785 21 ETCLNWFFK Unmodified 1243.5696 0.56957969 3458 Q7Z3J2;E7EWW0;C9J7I2;F5H7K1;H3BV68;H3BVG8 C16orf62 UPF0505 protein C16orf62 yes no 0 0 0 1 1 1 1 127.7 127.7 2 0.0073686 130428 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.784 59.547 11300000 0 0 0 0 0 0 0 11300000 0 0 0 0 0 11947 3458 11193 104815;104816;104817;104818 132788;132789;132790;132791 132789 4 ETCSLWPGQALSLQVEQLLHHR Unmodified 2601.3122 0.3121898 2150 P19623;K7EKM4 SRM Spermidine synthase yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 2 1 3 3 2 146.31 146.31 3;4 5.8437E-88 150996 QUIQUE_C1277_190116_001 152.04 144.59 2042300000 141400000 207170000 178540000 191960000 203700000 138460000 110790000 120490000 112080000 29998000 243320000 157490000 206960000 11948 2150 11194 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initiation factor 3 subunit G yes no 0 0 0 1 1 1 1 105.69 105.69 2 0.014665 107327 QUIQUE_C1563_190116_001 68.224 53.448 69905000 19421000 16714000 16454000 0 0 17316000 0 0 0 0 0 0 0 11956 1657 11202 104914;104915;104916;104917 132924;132925;132926;132927 132927 3 ETDLQELFRPFGSISR Unmodified 1893.9585 0.95847612 1657 O75821;K7ENA8;K7EP16 EIF3G Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.98 136.98 2;3 8.9574E-19 143444 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.59 101.3 1296700000 75832000 66712000 143480000 122030000 0 92237000 96365000 127150000 145340000 22718000 135690000 127550000 141640000 11957 1657 11203 104918;104919;104920;104921;104922;104923;104924;104925;104926;104927;104928;104929;104930;104931 132928;132929;132930;132931;132932;132933;132934;132935;132936;132937;132938;132939;132940;132941 132939 14 ETDQMLQVLQESLGELDK Unmodified 2075.0093 0.0092506424 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 166.27 166.27 2;3 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ETDYPAGEDLSESGQVDK Unmodified 1938.8331 0.83306042 1567 O60271;A0A087X2D8;H0YBS5 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 60.268 60.268 2 5.0062E-07 60357 QUIQUE_C1438_190116_001 105.14 87.003 132210000 0 0 28852000 0 41697000 0 28329000 0 0 0 33332000 0 0 11961 1567 11207 104950;104951;104952;104953 132961;132962;132963;132964 132962 4 ETEALLQSIGISPEPPLVPTPMSPSSK Unmodified 2804.4518 0.45176255 690 C9J3E7;E5RJ75;E5RFE1 DYNC1I1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 151.05 151.05 3 1.0133E-19 156676 QUIQUE_C1218_190116_001 93.176 85.73 125660000 28126000 14760000 0 23333000 0 0 0 0 0 0 0 0 59440000 11962 690 11208 104954;104955;104956;104957 132965;132966;132967;132968;132969;132970;132971 132965 7 ETEEILADVLK Unmodified 1258.6656 0.66564814 2681 P56537 EIF6 Eukaryotic translation initiation factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.57 111.57 2 0.00049807 115072 QUIQUE_C1368_190116_001 109.29 61.716 300570000 62462000 58806000 57648000 0 39973000 47901000 0 0 0 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11971 880 11217 104998;104999 133015;133016;133017 133015 3 ETENDDLTNVIQK Unmodified 1517.7209 0.72093119 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 63.991 63.991 2 0.010931 59595 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.532 40.592 56099000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56099000 0 0 0 11972 1727 11218 105000 133018 133018 1 ETEPVEAYVIQK Unmodified 1404.7137 0.71366097 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 69.123 69.123 2 8.8394E-05 68406 QUIQUE_C1563_190116_001 108.57 95.994 741310000 123430000 98067000 0 80745000 64805000 103380000 72441000 71879000 0 55987000 28645000 41939000 0 11973 2483 11219 105001;105002;105003;105004;105005;105006;105007;105008;105009;105010;105011;105012;105013;105014;105015 133019;133020;133021;133022;133023;133024;133025;133026;133027;133028;133029;133030;133031;133032;133033;133034 133025 16 ETETFSDSSPIEIIDEFPTLISSK Unmodified 2684.2956 0.29563906 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 169.42 169.42 2;3 4.1799E-25 170941 QUIQUE_C1563_190116_001 130.17 126.83 1978300000 168140000 215020000 216200000 180810000 233150000 191840000 159500000 182810000 126090000 22741000 77434000 68152000 136380000 11974 4252 11220 105016;105017;105018;105019;105020;105021;105022;105023;105024;105025;105026;105027;105028;105029;105030;105031;105032;105033;105034;105035;105036;105037;105038;105039 133035;133036;133037;133038;133039;133040;133041;133042;133043;133044;133045;133046;133047;133048;133049;133050;133051;133052;133053;133054;133055;133056;133057;133058 133046 23 ETETVFVPVIQAGMEALK Unmodified 1961.018 0.017964835 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 1 156.02 156.02 2 0.00092677 161007 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.295 77.196 188480000 0 0 0 0 0 41399000 0 0 69750000 10387000 66943000 0 0 11975 2636 11221 105040;105041;105042;105043 133059;133060;133061;133062;133063 133061 5 ETEVIDPQDLLEGR Unmodified 1612.7944 0.79443049 2333 P31431 SDC4 Syndecan-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 122.89 122.89 2 0.0001943 127866 QUIQUE_C1218_190116_001 106.67 89.232 134750000 77538000 0 0 0 0 0 0 57211000 0 0 0 0 0 11976 2333 11222 105044;105045;105046;105047;105048 133064;133065;133066;133067;133068 133064 5 ETFASTASQLHSNVVNYVQQIVAPK Unmodified 2730.3977 0.39769356 4169 Q9H4A4;A6NKB8 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.64 145.64 3 1.124E-36 141668 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.65 126.21 1670400000 108990000 83968000 150440000 168630000 92774000 190110000 91812000 138340000 139590000 85736000 149780000 111610000 158570000 11977 4169 11223 105049;105050;105051;105052;105053;105054;105055;105056;105057;105058;105059;105060;105061 133069;133070;133071;133072;133073;133074;133075;133076;133077;133078;133079;133080;133081;133082;133083;133084 133080 15 ETFENYYR Unmodified 1120.4825 0.48253882 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4;J3QT38 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 54.346 54.346 2 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133123;133124;133125;133126;133127;133128;133129;133130;133131;133132;133133;133134;133135;133136 133128 14 ETGANLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVR Unmodified 3378.6415 0.64152244 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 150.29 150.29 3;4 1.9786E-196 157118 QUIQUE_DMIX5_190116_001 218.93 210.65 3407600000 198220000 271430000 298910000 287130000 340590000 160790000 313210000 233440000 242470000 89573000 337410000 329190000 305260000 11986 2514 11232 105107;105108;105109;105110;105111;105112;105113;105114;105115;105116;105117;105118;105119;105120 133137;133138;133139;133140;133141;133142;133143;133144;133145;133146;133147;133148;133149;133150;133151;133152;133153;133154 133149 18 ETGEHLVHVK Unmodified 1147.5986 0.59857163 2178 P21333;Q60FE5 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 12.293 12.293 3 0.0025113 4453 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.518 39.146 5080500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5080500 0 0 0 11987 2178 11233 105121 133155 133155 1 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898.48723 0.48723027 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.081 26.081 2 0.011056 20490 QUIQUE_C1218_190116_001 73.26 38.155 1517700000 111300000 101030000 108900000 134100000 118420000 132800000 119370000 114890000 118490000 53332000 153720000 124970000 126390000 11996 1005;2027 11242 105160;105161;105162;105163;105164;105165;105166;105167;105168;105169;105170;105171;105172 133194;133195;133196;133197;133198;133199;133200;133201;133202;133203;133204;133205;133206 133194 9 ETGWAAPFLR Unmodified 1146.5822 0.58219329 1941 P08247;H7C4W3 SYP Synaptophysin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.16 107.16 2 0.00033118 109654 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.9 117.38 5368400000 360140000 360120000 570350000 366700000 462090000 321030000 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105218;105219;105220;105221;105222;105223;105224;105225;105226;105227;105228;105229;105230;105231;105232;105233;105234;105235;105236 133261;133262;133263;133264;133265;133266;133267;133268;133269;133270;133271;133272;133273;133274;133275;133276;133277;133278;133279 133270 19 ETHYENYR Unmodified 1110.473 0.47303677 1514 O43236;J3QRT6;J3KSZ7 SEPT4 Septin-4 yes no 0 0 0 1 14.322 14.322 3 0.046284 6404 QUIQUE_DMIX4_190116_001 32.892 25.603 9661600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9661600 0 0 0 12005 1514 11250 105237 133280 133280 1 ETIDAVPNAIPGR Unmodified 1351.7096 0.70957864 1304 J3QRS9;X6R4W8;O43670;J3QS27;J3KTL1;J3KRB6;J3KRW6;H0Y3M2 ZNF207 BUB3-interacting and GLEBS motif-containing protein ZNF207 yes no 0 0 0 1 1 1 1 72.597 72.597 2 0.0049031 72808 QUIQUE_C1403_190116_001 67.334 2.5138 658560000 0 0 92203000 262410000 0 0 0 0 0 0 144570000 0 159370000 12006 1304 11251 105238;105239;105240;105241 133281;133282;133283;133284;133285 133282 5 ETIEDVEEMLNNLPGVTSVHSR Unmodified 2468.1853 0.18531753 4512 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Q5M775;J3KSG2;J3QQM0;J3KRN9 SPECC1 Cytospin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 104.5 104.5 3 3.0937E-05 107776 QUIQUE_C1277_190116_001 93.494 86.741 146610000 0 20334000 0 37460000 37347000 22116000 29356000 0 0 0 0 0 0 12009 3284 11254 105260;105261;105262;105263;105264;105265 133307;133308;133309;133310;133311;133312 133307 6 ETIFSISK Unmodified 923.4964 0.49639797 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.963 64.963 2 0.015524 64645 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.568 49.744 829880000 0 106730000 107670000 92519000 79978000 0 96782000 70752000 0 46084000 85427000 63293000 80641000 12010 831;1569 11255 105266;105267;105268;105269;105270;105271;105272;105273;105274;105275 133313;133314;133315;133316;133317;133318;133319;133320;133321;133322;133323;133324;133325 133322 13 ETILAECQGMIK Unmodified 1391.6789 0.67887214 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 76.851 76.851 2 0.034728 78147 QUIQUE_C1576_190116_001 52.725 35.099 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12011 3779 11256 105276 133326 133326 1 ETIPLQETSLYTQDR Unmodified 1792.8843 0.88430813 406 A0A2C9F2P4;A0A286YFF7;P50897;E9PIA8;E9PSE5 PPT1 Palmitoyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 91.252 91.252 2;3 5.3297E-13 93929 QUIQUE_C1576_190116_001 137.16 112.3 5824300000 421890000 509850000 458190000 418310000 603000000 54069000 463070000 385550000 418290000 177000000 632210000 708030000 574900000 12012 406 11257 105277;105278;105279;105280;105281;105282;105283;105284;105285;105286;105287;105288;105289;105290;105291;105292;105293 133327;133328;133329;133330;133331;133332;133333;133334;133335;133336;133337;133338;133339;133340;133341;133342;133343;133344;133345 133336 19 ETISSTATLGFR Unmodified 1281.6565 0.65648044 2271 P27987 ITPKB Inositol-trisphosphate 3-kinase B yes yes 0 0 0 1 73.855 73.855 2 0.031974 73188 QUIQUE_C1563_190116_001 48.284 32.622 19393000 0 0 0 0 0 19393000 0 0 0 0 0 0 0 12013 2271 11258 105294 133346 133346 1 ETKDTDIVDEAIYYFK Unmodified 1948.9306 0.93058962 1487 O15145;C9JZD1;F8VR50 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes no 0 0 1 1 1 1 138.94 138.94 3 0.0024215 145955 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.513 49.725 117190000 0 0 0 0 0 0 0 41971000 0 0 39541000 0 35683000 12014 1487 11259 105295;105296;105297 133347;133348;133349 133348 3 ETKPEPMEEDLPENKK Unmodified 1912.9088 0.90880832 2343 P31948;F5H783 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.49 25.49 3;4 0.001728 20277 QUIQUE_C1218_190116_001 63.918 44.62 1002100000 76567000 123310000 40390000 145110000 109080000 0 0 0 76785000 30798000 111100000 52635000 236300000 12015 2343 11260 105298;105299;105300;105301;105302;105303;105304;105305;105306;105307 133350;133351;133352;133353;133354;133355;133356;133357;133358;133359;133360;133361 133350 12 ETKPEPMEEDLPENKK Oxidation (M) 1928.9037 0.90372294 2343 P31948;F5H783 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 1 2 1 1 1 1 1 18.604 18.604 3 0.0045033 11632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.403 59.48 267060000 0 0 0 47410000 47553000 0 0 44357000 66481000 61261000 0 0 0 12016 2343 11260 105308;105309;105310;105311;105312 133362;133363;133364;133365;133366 133364 1749 5 ETLAPSLLLVLK Unmodified 1295.8064 0.80643914 652 F8W9A8;B7WPL9;Q6PFW1 PPIP5K1 Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.22 138.22 2 0.0045435 143994 QUIQUE_C1218_190116_001 68.893 60.045 69993000 15379000 12478000 0 0 13341000 0 10970000 8659400 9164900 0 0 0 0 12017 652 11261 105313;105314;105315;105316;105317;105318 133367;133368;133369;133370;133371;133372;133373 133367 7 ETLAQLQQEFQR Unmodified 1489.7525 0.75250609 1490 O15212 PFDN6 Prefoldin subunit 6 yes yes 0 0 0 1 1 103.18 103.18 2 0.00081675 106713 QUIQUE_C1277_190116_001 87.485 67.181 137300000 0 52198000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85101000 12018 1490 11262 105319;105320 133374;133375 133374 2 ETLDTMLDGLGR Unmodified 1319.6391 0.63911582 4360 Q9P000 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes yes 0 0 0 1 1 1 119 119 2 0.0031009 121292 QUIQUE_C1563_190116_001 73.067 45.952 46311000 0 0 0 22992000 0 23319000 0 0 0 0 0 0 0 12019 4360 11263 105321;105322;105323 133376;133377;133378;133379 133379 4 ETLEAHGASISGTPEATTSGKPEPVSSVK Unmodified 2866.4196 0.4196108 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 2 1 2 1 1 49.645 49.645 3;4 6.6622E-78 47264 QUIQUE_C1277_190116_001 140.81 137.77 1156300000 73090000 263550000 78808000 219410000 161370000 61026000 186360000 48778000 63868000 0 0 0 0 12020 3452 11264 105324;105325;105326;105327;105328;105329;105330;105331;105332;105333;105334;105335;105336 133380;133381;133382;133383;133384;133385;133386;133387;133388;133389;133390;133391;133392;133393 133381 13 ETLEDGFPVHDGK Unmodified 1442.6678 0.66777341 2319 P30519;A0A087WT44;I3L1Y2 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 55.217 55.217 2 0.0041841 50527 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.346 50.242 17944000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17944000 0 0 0 12021 2319 11265 105337 133394;133395 133395 2 ETLEPLIQAAQLLQVK Unmodified 1793.0299 0.02985015 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 157.93 157.93 2;3 7.1563E-25 160326 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.78 112.12 2399600000 182450000 263410000 237440000 142460000 232960000 150610000 230750000 165290000 146870000 66910000 241550000 171500000 167370000 12022 4607 11266 105338;105339;105340;105341;105342;105343;105344;105345;105346;105347;105348;105349;105350;105351;105352;105353;105354;105355;105356;105357;105358;105359;105360;105361;105362;105363 133396;133397;133398;133399;133400;133401;133402;133403;133404;133405;133406;133407;133408;133409;133410;133411;133412;133413;133414;133415;133416;133417;133418;133419;133420;133421;133422;133423;133424;133425 133414 30 ETLEQLSEFNDSLK Unmodified 1651.7941 0.79409613 3724 Q8WZA0;K7ES95 LZIC Protein LZIC yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.64 109.64 2 7.7314E-14 114347 QUIQUE_C1218_190116_001 141.08 127.96 158230000 41417000 51285000 0 32017000 33513000 0 0 0 0 0 0 0 0 12023 3724 11267 105364;105365;105366;105367;105368;105369 133426;133427;133428;133429;133430;133431;133432;133433 133427 8 ETLEQLSEFNDSLKK Unmodified 1779.8891 0.88905915 3724 Q8WZA0;K7ES95 LZIC Protein LZIC yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.964 86.964 2;3 3.4385E-06 88415 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.42 73.147 221490000 0 0 0 59653000 0 0 0 40280000 0 23509000 45163000 52887000 0 12024 3724 11268 105370;105371;105372;105373;105374;105375;105376 133434;133435;133436;133437;133438;133439;133440 133437 7 ETLFNTLANNR Unmodified 1291.6521 0.65206377 186 A0A0A0MSW3;P35658 NUP214 Nuclear pore complex protein Nup214 yes no 0 0 0 1 83.778 83.778 2 0.03926 85243 QUIQUE_C1277_190116_001 53.965 29.19 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12025 186 11269 105377 133441 133441 1 ETLGLLR Unmodified 800.4756 0.47560295 2545 P49770;H0YJJ8;G3V5E5 EIF2B2 Translation initiation factor eIF-2B subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.413 57.413 2 0.044891 55270 QUIQUE_C1563_190116_001 78.994 22.829 120900000 0 20494000 0 15958000 20731000 16590000 0 0 0 0 27013000 20110000 0 12026 2545 11270 105378;105379;105380;105381;105382;105383 133442;133443;133444;133445;133446;133447 133445 6 ETLGQIWALANR Unmodified 1370.7306 0.73064844 4505 Q9UMZ2 SYNRG Synergin gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 125.58 125.58 2 0.0011021 128694 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.051 70.354 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12027 4505 11271 105384;105385;105386;105387 133448;133449;133450;133451 133450 4 ETLGTGAFSEVVLAEEK Unmodified 1778.8938 0.89381018 3526 Q8IU85 CAMK1D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D yes yes 0 0 0 1 120.1 120.1 2 0.00072566 116429 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.241 55.376 35094000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35094000 0 0 0 12028 3526 11272 105388 133452 133452 1 ETLIDVAR Unmodified 915.50255 0.50254598 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 56.335 56.335 2 0.011936 55213 QUIQUE_C1576_190116_001 89.296 55.78 1093900000 0 277040000 209110000 212630000 181150000 0 213990000 0 0 0 0 0 0 12029 2424 11273 105389;105390;105391;105392;105393 133453;133454;133455;133456;133457 133457 5 ETLISWLQAQMLNPQPEK Unmodified 2125.0878 0.087775735 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 166.34 166.34 3 0.00042263 170767 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.663 41.21 59167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59167000 12030 1534 11274 105394 133458 133458 1 ETLLAMFK Unmodified 951.50994 0.50993955 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 111.78 111.78 2 0.044693 108858 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.559 38.12 37803000 0 0 0 27131000 0 0 0 0 0 10672000 0 0 0 12031 2253 11275 105395;105396 133459;133460 133460 2 ETLLNSATTSLNSK Unmodified 1477.7624 0.76240208 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 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1859.0418 0.041752241 3947 Q96T76;H0Y746 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.62 146.62 3 0.00010775 153513 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.967 64.282 257230000 26725000 33144000 38790000 26683000 0 0 0 0 37540000 0 31976000 27569000 34801000 12038 3947 11282 105455;105456;105457;105458;105459;105460;105461;105462;105463 133541;133542;133543;133544;133545;133546;133547;133548;133549;133550;133551 133549 9 ETLQLVDSTTSYGLTGAVFSQDKDVVQEATK Unmodified 3329.6515 0.65146123 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 137.35 137.35 3;4 6.1231E-215 141474 QUIQUE_C1277_190116_001 232.2 224.02 2905600000 87682000 309680000 264450000 156680000 236930000 313910000 270170000 203220000 194030000 225570000 391560000 0 251720000 12039 2295 11283 105464;105465;105466;105467;105468;105469;105470;105471;105472;105473;105474;105475;105476 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133588;133589;133590;133591;133592;133593;133594;133595;133596;133597;133598;133599;133600;133601;133602;133603;133604;133605;133606;133607;133608;133609;133610;133611;133612;133613;133614;133615;133616;133617;133618;133619;133620;133621;133622;133623;133624;133625;133626;133627;133628;133629;133630;133631;133632;133633;133634;133635;133636;133637;133638;133639;133640;133641;133642;133643;133644;133645;133646;133647;133648;133649;133650;133651;133652;133653;133654;133655;133656;133657;133658;133659;133660;133661;133662;133663 133590 68 ETNLDSLPLVDTHSKR Unmodified 1823.9377 0.93774068 1952 P08670 VIM Vimentin yes yes 0 0 1 1 3 2 2 2 2 57.815 57.815 2;3;4 1.4708E-79 56861 QUIQUE_DMIX5_190116_001 210.41 159.31 3719400000 0 0 0 0 0 0 0 1869900000 711210000 0 330800000 405850000 401700000 12045 1952 11289 105543;105544;105545;105546;105547;105548;105549;105550;105551;105552;105553;105554 133664;133665;133666;133667;133668;133669;133670;133671;133672;133673;133674;133675;133676;133677;133678;133679;133680;133681;133682;133683 133675 20 ETNNAAIIMK Unmodified 1103.5645 0.56449431 2703 P60983;G3V4P8 GMFB Glia maturation factor beta yes no 0 0 0 1 33.311 33.311 2 0.040288 28577 QUIQUE_C1368_190116_001 85.212 58.828 255470000 0 0 255470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12046 2703 11290 105555 133684 133684 0 ETPAATEAPSSTPK Unmodified 1385.6674 0.66743906 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 20.391 20.391 2 7.4566E-08 13487 QUIQUE_C1368_190116_001 130.23 116.64 7666400000 1053300000 1172900000 1047200000 0 1880100000 0 1128200000 114430000 270970000 132980000 457200000 0 409050000 12047 2817 11291 105556;105557;105558;105559;105560;105561;105562;105563;105564;105565;105566;105567;105568 133685;133686;133687;133688;133689;133690;133691;133692;133693;133694;133695;133696;133697 133688 13 ETPALTINR Unmodified 1013.5506 0.55055881 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0;K7EJ68;K7EJB1;K7ER88 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.482 41.482 2 1.9418E-06 38054 QUIQUE_DMIX3_190116_001 153.73 133.17 7064300000 0 486850000 746930000 497920000 601560000 662110000 613060000 518280000 615760000 229710000 843620000 593880000 654570000 12048 2453 11292 105569;105570;105571;105572;105573;105574;105575;105576;105577;105578;105579;105580 133698;133699;133700;133701;133702;133703;133704;133705;133706;133707;133708;133709;133710;133711;133712;133713;133714 133707 17 ETPATSAVTSDQK Unmodified 1333.6361 0.63613893 522 Q69YM1;A2RU67 DKFZp762C0813;KIAA1467 Uncharacterized protein KIAA1467 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.133 19.133 2 0.00023382 12137 QUIQUE_C1218_190116_001 113.44 80.835 338530000 35542000 30799000 29929000 38331000 32125000 30690000 44448000 0 0 0 53156000 0 43511000 12049 522 11293 105581;105582;105583;105584;105585;105586;105587;105588;105589;105590;105591 133715;133716;133717;133718;133719;133720;133721;133722;133723;133724;133725;133726 133715 11 ETPFELIEALLK Unmodified 1401.7755 0.77553294 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 173.92 173.92 2 0.0034704 179043 QUIQUE_C1576_190116_001 121.5 83.953 812370000 0 0 0 0 0 60597000 269320000 155750000 119500000 0 207210000 0 0 12050 2916 11294 105592;105593;105594;105595;105596 133727;133728;133729;133730;133731 133728 3 ETPFLSNPGTNLVFEDEITALQPEVDK Unmodified 3002.4761 0.47606304 2183 P21589;Q96B60 NT5E 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 1 1 162.1 162.1 3 0.00034245 166890 QUIQUE_C1368_190116_001 41.939 37.362 165300000 60692000 0 47970000 56634000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12051 2183 11295 105597;105598;105599 133732;133733;133734 133733 3 ETPFLSNPGTNLVFEDEITALQPEVDKLK Unmodified 3243.6551 0.65509004 2183 P21589;Q96B60 NT5E 5'-nucleotidase yes no 0 0 1 1 1 1 157.93 157.93 3 1.7052E-15 160588 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.439 75.28 295360000 0 0 0 0 0 0 0 78824000 0 0 0 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A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.315 54.315 2 0.0014059 52240 QUIQUE_C1403_190116_001 98.033 71.649 1024300000 0 0 379710000 170760000 206270000 0 267520000 0 0 0 0 0 0 12056 345 11300 105606;105607;105608;105609 133741;133742;133743;133744 133742 4 ETPSSSPASPQETR Unmodified 1472.6743 0.67431535 4058 Q9BX66;S4R406 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.8 17.8 2 0.00019577 10339 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.898 70.202 575630000 52245000 40872000 19636000 74751000 0 0 28815000 75634000 84686000 0 57715000 38007000 103270000 12057 4058 11301 105610;105611;105612;105613;105614;105615;105616;105617;105618;105619 133745;133746;133747;133748;133749;133750;133751;133752;133753;133754;133755;133756 133753 11 ETQALILAPTR Unmodified 1211.6874 0.68738664 2416 P38919 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.62 63.62 2 0.00059439 62418 QUIQUE_C1368_190116_001 99.53 82.754 849050000 91570000 114610000 116120000 89875000 0 106390000 0 0 98576000 38958000 112140000 80806000 0 12058 2416 11302 105620;105621;105622;105623;105624;105625;105626;105627;105628 133757;133758;133759;133760;133761;133762;133763;133764;133765;133766 133759 9 ETQALVLAPTR Unmodified 1197.6717 0.67173657 3055 Q14240;E7EQG2;J3KSN7 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.69 54.69 2 1.5023E-09 53917 QUIQUE_C1218_190116_001 167.67 128.37 3766300000 379150000 367160000 299260000 295810000 333140000 302920000 355540000 126260000 198610000 159120000 420680000 259970000 268670000 12059 3055 11303 105629;105630;105631;105632;105633;105634;105635;105636;105637;105638;105639;105640;105641 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fibrillary acidic protein no no 0 0 1 3 3 2 4 2 4 5 3 6 4 5 23.374 23.374 2;3;4 2.8245E-94 14903 QUIQUE_DMIX3_190116_001 225.79 191.07 5403800000 0 309440000 0 515050000 256490000 477830000 231620000 446500000 892790000 130300000 468620000 708390000 966800000 12079 389;395;1336;1342 11320 105758;105759;105760;105761;105762;105763;105764;105765;105766;105767;105768;105769;105770;105771;105772;105773;105774;105775;105776;105777;105778;105779;105780;105781;105782;105783;105784;105785;105786;105787;105788;105789;105790;105791;105792;105793;105794;105795;105796;105797;105798 133922;133923;133924;133925;133926;133927;133928;133929;133930;133931;133932;133933;133934;133935;133936;133937;133938;133939;133940;133941;133942;133943;133944;133945;133946;133947;133948;133949;133950;133951;133952;133953;133954;133955;133956;133957;133958;133959;133960;133961;133962;133963;133964 133940 35 ETSLDTKSVSEGHLKR Unmodified 1785.9221 0.92209062 395;1336;389;1342 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105815;105816;105817;105818;105819;105820;105821;105822;105823;105824;105825;105826;105827 133981;133982;133983;133984;133985;133986;133987;133988;133989;133990;133991;133992;133993;133994;133995;133996;133997 133981 17 ETSLVDAYEK Unmodified 1153.5503 0.55028404 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 1 52.313 52.313 2 0.039625 50257 QUIQUE_C1218_190116_001 61.56 49.028 147720000 147720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12082 3984 11323 105828 133998 133998 1 ETSPESSLIQDEIAVK Unmodified 1744.8731 0.87307474 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.283 97.283 2 6.0069E-07 100565 QUIQUE_C1218_190116_001 114.82 97.008 3313300000 376170000 307640000 317600000 242440000 396840000 351500000 221280000 212160000 206410000 82965000 356000000 242320000 0 12083 2009 11324 105829;105830;105831;105832;105833;105834;105835;105836;105837;105838;105839;105840 133999;134000;134001;134002;134003;134004;134005;134006;134007;134008;134009;134010;134011;134012;134013;134014;134015;134016;134017;134018;134019 133999 20 ETSSDVALASHILTALR Unmodified 1782.9476 0.94757708 1393 O00273 DFFA DNA fragmentation factor subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.68 127.68 3 7.8314E-08 130705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.714 84.133 513560000 29549000 57340000 54085000 0 0 69639000 0 45933000 70808000 19256000 87100000 0 79851000 12084 1393 11325 105841;105842;105843;105844;105845;105846;105847;105848;105849 134020;134021;134022;134023;134024;134025;134026;134027;134028;134029;134030 134024 11 ETSSLQELEAQK Unmodified 1361.6674 0.66743906 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 53.075 53.075 2 8.5407E-07 51447 QUIQUE_C1218_190116_001 140.45 109.37 252890000 70689000 81279000 0 67517000 0 0 0 0 0 33410000 0 0 0 12085 4394 11326 105850;105851;105852;105853 134031;134032;134033;134034 134031 4 ETSVTPSNLWGGQGLLGVSIR Unmodified 2170.1382 0.1382314 4189 Q9H8Y8 GORASP2 Golgi reassembly-stacking protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 144.58 144.58 2;3 1.0188E-18 151470 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.44 128.49 713680000 41258000 54827000 65366000 35675000 63369000 48795000 66033000 52295000 69482000 11823000 86669000 57886000 60198000 12086 4189 11327 105854;105855;105856;105857;105858;105859;105860;105861;105862;105863;105864;105865;105866;105867 134035;134036;134037;134038;134039;134040;134041;134042;134043;134044;134045;134046;134047;134048;134049 134047 15 ETSYEMMMQCVSR Unmodified 1650.651 0.65101919 4348 Q9NZJ7;H0Y8C3 MTCH1 Mitochondrial carrier homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.082 99.082 2 7.6059E-10 101796 QUIQUE_C1277_190116_001 143.24 129.33 421680000 32724000 33128000 41248000 42353000 0 0 35739000 50593000 34780000 0 67752000 47910000 35452000 12087 4348 11328 105868;105869;105870;105871;105872;105873;105874;105875;105876;105877 134050;134051;134052;134053;134054;134055;134056;134057;134058;134059 134051 10 ETSYGLSFFKPR Unmodified 1430.7194 0.71941505 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 85.758 85.758 2;3 0.0020947 87523 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.958 64.653 1517000000 101220000 119270000 117940000 100140000 80545000 79473000 105560000 0 113380000 49266000 317760000 95189000 237310000 12088 4615 11329 105878;105879;105880;105881;105882;105883;105884;105885;105886;105887;105888;105889;105890;105891 134060;134061;134062;134063;134064;134065;134066;134067;134068;134069;134070;134071;134072;134073 134071 13 ETTDTDTADQVIASFK Unmodified 1740.8054 0.8053891 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 108.94 108.94 2;3 1.2106E-44 113888 QUIQUE_C1218_190116_001 215.45 190.06 4517800000 331110000 392760000 323520000 324440000 563310000 310330000 406100000 314920000 297750000 193930000 371100000 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Unmodified 1445.5664 0.56636158 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.014 23.014 2 3.7649E-41 16342 QUIQUE_C1576_190116_001 190.02 188.21 1534600000 79212000 151740000 114430000 117370000 117880000 91808000 175730000 107810000 126140000 59750000 127420000 104260000 161040000 12091 151 11332 105927;105928;105929;105930;105931;105932;105933;105934;105935;105936;105937;105938;105939 134120;134121;134122;134123;134124;134125;134126;134127;134128;134129;134130;134131;134132;134133 134126 14 ETTGTGPNVYHENDTIAK Unmodified 1945.9017 0.9017491 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 32.361 32.361 2;3 2.4074E-89 27220 QUIQUE_C1277_190116_001 254.18 227.47 3359700000 487690000 266290000 414250000 273970000 230920000 207770000 261790000 185830000 262320000 83798000 239960000 240530000 204560000 12092 3234 11333 105940;105941;105942;105943;105944;105945;105946;105947;105948;105949;105950;105951;105952;105953;105954;105955;105956;105957;105958;105959;105960;105961;105962;105963;105964 134134;134135;134136;134137;134138;134139;134140;134141;134142;134143;134144;134145;134146;134147;134148;134149;134150;134151;134152;134153;134154;134155;134156;134157;134158;134159;134160 134138 24 ETTNIFSNCGCVR Unmodified 1556.6712 0.671161 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2;B1AHE4 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.733 61.733 2 1.7178E-07 61573 QUIQUE_C1576_190116_001 131.09 99.079 718780000 51441000 67695000 56702000 65839000 87997000 65890000 95040000 0 42100000 0 67909000 47077000 71090000 12093 4392 11334 105965;105966;105967;105968;105969;105970;105971;105972;105973;105974;105975 134161;134162;134163;134164;134165;134166;134167;134168;134169;134170;134171;134172;134173;134174;134175 134169 15 ETTVGAVTVTHK Unmodified 1241.6616 0.66156582 4625 Q9Y5L0;C9J7E5;E9PFH4 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.416 19.416 2 0.00052347 12545 QUIQUE_C1218_190116_001 104.22 83.521 376140000 27685000 30019000 0 31330000 33198000 33163000 37162000 0 34538000 10253000 57566000 31916000 49309000 12094 4625 11335 105976;105977;105978;105979;105980;105981;105982;105983;105984;105985;105986;105987 134176;134177;134178;134179;134180;134181;134182;134183;134184;134185;134186;134187;134188 134176 13 ETTVVWDK Unmodified 976.48656 0.48656157 2348 P32189;Q14409;A6NP46 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 0 1 40.394 40.394 2 0.042035 36449 QUIQUE_C1563_190116_001 59.245 19.178 97185000 0 0 0 0 0 97185000 0 0 0 0 0 0 0 12095 2348 11336 105988 134189 134189 1 ETTYYDVLGVKPNATQEELKK Unmodified 2425.2377 0.23767067 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 77.312 77.312 3 0.0010583 77808 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.857 49.397 518470000 76905000 109520000 89544000 0 70710000 0 0 0 0 42678000 0 72447000 56662000 12096 2334 11337 105989;105990;105991;105992;105993;105994;105995 134190;134191;134192;134193;134194;134195;134196 134195 4 ETVAYLQAHALTTEGIFR Unmodified 2019.0425 0.042540102 2912 Q07960;H0YE29 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 109.94 109.94 2;3 8.9123E-76 112763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 200.44 178.88 660170000 0 23960000 75539000 0 83479000 0 0 177890000 41003000 0 50580000 168960000 38758000 12097 2912 11338 105996;105997;105998;105999;106000;106001;106002;106003;106004;106005 134197;134198;134199;134200;134201;134202;134203;134204;134205;134206;134207;134208;134209 134204 11 ETVDQVEELRR Unmodified 1372.6947 0.69465686 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 40.217 40.217 2;3 0.00015485 36751 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.363 66.133 881690000 0 38087000 202830000 67080000 54700000 58187000 0 38231000 79094000 54933000 135860000 76917000 75766000 12098 3053 11339 106006;106007;106008;106009;106010;106011;106012;106013;106014;106015;106016;106017;106018 134210;134211;134212;134213;134214;134215;134216;134217;134218;134219;134220;134221;134222;134223 134218 13 ETVDSFLDLAR Unmodified 1264.6299 0.62993134 2459 P43007 SLC1A4 Neutral amino acid transporter A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 120.03 120.03 2 0.00048344 125449 QUIQUE_C1218_190116_001 113.74 78.302 1152000000 103370000 84031000 120890000 85823000 77716000 65584000 91764000 138970000 136960000 37146000 113340000 0 96424000 12099 2459 11340 106019;106020;106021;106022;106023;106024;106025;106026;106027;106028;106029;106030;106031 134224;134225;134226;134227;134228;134229;134230;134231;134232;134233;134234;134235;134236;134237;134238;134239;134240 134225 16 ETVEEQASTTER Unmodified 1378.6212 0.62121715 1310 K4DI93;Q13620 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.973 21.973 2 3.1471E-37 14973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.04 159.83 479120000 64728000 0 0 35633000 39118000 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134259 6 ETVGFGMLK Unmodified 980.5001 0.50010314 4563 Q9Y2Q5 LAMTOR2 Ragulator complex protein LAMTOR2 yes yes 0 0 0 1 79.579 79.579 2 0.064258 80578 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.994 24.065 19555000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19555000 0 12103 4563 11344 106055 134264 134264 1 ETVINGLENMGAAFQSMMTGGNIGK Unmodified 2569.1975 0.19747889 3614 Q8N8N7;G3V2R9 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 170.39 170.39 2;3 7.1504E-11 175142 QUIQUE_C1368_190116_001 80.786 71.914 139890000 0 26658000 34636000 27196000 23531000 24815000 0 0 0 3058800 0 0 0 12104 3614 11345 106056;106057;106058;106059;106060;106061;106062;106063 134265;134266;134267;134268;134269;134270;134271;134272 134267 8 ETVITMSGDDHPR Unmodified 1456.6616 0.66164217 2911 Q07954;H0YJI8 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes no 0 0 0 1 1 32.863 32.863 2;3 0.020497 28647 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.203 17.898 38489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38489000 0 0 12105 2911 11346 106064;106065 134273;134274 134273 2 ETVKPVEVEEGESVVLPCNPPPSAEPLR Unmodified 3057.5329 0.53286642 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 1 2 99.751 99.751 3 1.2806E-26 104182 QUIQUE_C1438_190116_001 104.51 92.988 38845000 0 0 0 0 38845000 0 0 0 0 0 0 0 0 12106 2345 11347 106066;106067 134275;134276 134275 2 ETVLSALSR Unmodified 974.53966 0.53965977 3700 Q8WUM4;A0A3B3IT07;C9IZF9 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 68.036 68.036 2 0.0025828 67923 QUIQUE_C1277_190116_001 93.267 58.443 917810000 0 138760000 0 121180000 0 90245000 105690000 105000000 0 65564000 153560000 137800000 0 12107 3700 11348 106068;106069;106070;106071;106072;106073;106074;106075 134277;134278;134279;134280;134281;134282;134283;134284 134277 7 ETVNATFPVAIVMLR Unmodified 1659.9018 0.90181287 969 G3V158;E9PPM8;Q9Y315;E9PMH9 DERA Deoxyribose-phosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 143.35 143.35 2 0.0031628 147714 QUIQUE_C1403_190116_001 63.408 44.277 119340000 0 0 0 23705000 17206000 0 20717000 22816000 18270000 0 0 0 16630000 12108 969 11349 106076;106077;106078;106079;106080;106081 134285;134286;134287;134288;134289;134290 134285 5 ETVNVITLYK Unmodified 1178.6547 0.65468953 1009 F5H442;Q99816 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.135 82.135 2 0.0056282 84370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.827 49.573 351670000 0 0 0 0 58771000 0 0 50339000 52631000 0 67624000 58745000 63557000 12109 1009 11350 106082;106083;106084;106085;106086;106087 134291;134292;134293;134294;134295;134296;134297;134298;134299;134300 134297 10 ETVQLYEDEVR Unmodified 1379.6569 0.65687437 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.327 65.327 2 0.0024044 64521 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.523 52.081 734320000 0 70092000 189280000 92065000 0 0 0 0 114630000 44273000 75543000 0 148440000 12110 16;1475 11351 106088;106089;106090;106091;106092;106093;106094 134301;134302;134303;134304;134305;134306;134307 134307 2 ETVQLYEDEVRELEEALR Unmodified 2220.091 0.091006437 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 1 1 149.5 149.5 3 0.0058025 152555 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.547 34.237 63710000 0 0 0 0 0 0 0 63710000 0 0 0 0 0 12111 16;1475 11352 106095 134308 134308 1 ETVQTTEDQILK Unmodified 1403.7144 0.71438925 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.341 58.341 2 5.3135E-06 57228 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.55 101.34 2029300000 222710000 254640000 212960000 245220000 270530000 138850000 213460000 99484000 0 115940000 96555000 90908000 68009000 12112 2135 11353 106096;106097;106098;106099;106100;106101;106102;106103;106104;106105;106106;106107 134309;134310;134311;134312;134313;134314;134315;134316;134317;134318;134319;134320;134321;134322 134320 13 ETVQTTEDQILKR Unmodified 1559.8155 0.81550028 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 49.545 49.545 2;3 8.9283E-07 47629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 94.614 895230000 0 16328000 70473000 37272000 36094000 0 0 177990000 167600000 0 68477000 172110000 148890000 12113 2135 11354 106108;106109;106110;106111;106112;106113;106114;106115;106116;106117;106118;106119;106120;106121 134323;134324;134325;134326;134327;134328;134329;134330;134331;134332;134333;134334;134335;134336;134337 134328 15 ETVSEESNVLCLSK Unmodified 1593.7556 0.75560214 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.34 74.34 2 2.3249E-17 74206 QUIQUE_C1403_190116_001 149.49 130.18 3135900000 273390000 406400000 346660000 323000000 310610000 236070000 328560000 194790000 127220000 113810000 0 223260000 252140000 12114 2058 11355 106122;106123;106124;106125;106126;106127;106128;106129;106130;106131;106132;106133;106134 134338;134339;134340;134341;134342;134343;134344;134345;134346;134347;134348;134349;134350;134351;134352 134343 14 ETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLR Unmodified 2681.3449 0.34492971 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.83 125.83 3 4.5581E-29 131998 QUIQUE_C1438_190116_001 126.32 110.81 4235700000 299300000 331290000 299850000 302380000 356180000 280620000 313730000 294220000 366280000 128500000 427480000 395980000 439910000 12115 890;3052 11356 106135;106136;106137;106138;106139;106140;106141;106142;106143;106144;106145;106146;106147 134353;134354;134355;134356;134357;134358;134359;134360;134361;134362;134363;134364;134365;134366;134367;134368;134369;134370;134371;134372;134373;134374;134375 134362 23 ETVTILPGASFFSSDESFAMIR Oxidation (M) 2420.157 0.15697751 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 2 1 2 2 2 1 2 1 1 1 156.3 156.3 2;3 9.0227E-15 163400 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106167;106168;106169;106170;106171;106172;106173;106174;106175;106176;106177;106178;106179;106180;106181;106182;106183;106184;106185;106186;106187;106188;106189;106190;106191 134398;134399;134400;134401;134402;134403;134404;134405;134406;134407;134408;134409;134410;134411;134412;134413;134414;134415;134416;134417;134418;134419;134420;134421;134422;134423;134424;134425;134426;134427;134428;134429;134430;134431;134432;134433;134434;134435 134401 37 ETVVEVPQVTWEDIGGLEDVK Unmodified 2341.1689 0.16892241 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 151.64 151.64 2;3 5.0939E-26 156782 QUIQUE_C1368_190116_001 169.04 150.31 887270000 145130000 124590000 76614000 128230000 59660000 138730000 79851000 0 30065000 35917000 0 29522000 38953000 12118 2658 11358 106192;106193;106194;106195;106196;106197;106198;106199;106200;106201;106202;106203;106204;106205;106206 134436;134437;134438;134439;134440;134441;134442;134443;134444;134445;134446;134447;134448;134449;134450 134440 14 ETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKR Unmodified 2497.27 0.27003344 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 4 2 136.69 136.69 2;3;4 3.9598E-45 142575 QUIQUE_C1218_190116_001 150.98 137.11 11402000000 714280000 676620000 952880000 809650000 948350000 539710000 1060000000 1186700000 1062900000 335530000 1111000000 1046500000 957540000 12119 2658 11359 106207;106208;106209;106210;106211;106212;106213;106214;106215;106216;106217;106218;106219;106220;106221;106222;106223;106224;106225;106226;106227;106228;106229;106230;106231;106232;106233;106234;106235 134451;134452;134453;134454;134455;134456;134457;134458;134459;134460;134461;134462;134463;134464;134465;134466;134467;134468;134469;134470;134471;134472;134473;134474;134475;134476;134477;134478;134479;134480;134481;134482;134483;134484;134485;134486;134487;134488;134489;134490;134491;134492;134493;134494 134452 43 ETVYCLNDDDETEVLK Unmodified 1941.8514 0.85135302 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 93.952 93.952 2 2.9373E-25 97074 QUIQUE_C1218_190116_001 158.04 146.59 101670000 33103000 26192000 0 0 0 42373000 0 0 0 0 0 0 0 12120 2051 11360 106236;106237;106238;106239 134495;134496;134497;134498 134495 3 ETVYCLNDDDETEVLKEDIIQGFR Unmodified 2900.3386 0.33858329 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.57 145.57 3 3.1153E-161 149713 QUIQUE_C1403_190116_001 230.48 221.98 2889600000 243600000 367180000 338060000 268090000 317520000 214970000 272310000 91060000 132750000 35692000 228530000 213520000 166330000 12121 2051 11361 106240;106241;106242;106243;106244;106245;106246;106247;106248;106249;106250;106251;106252 134499;134500;134501;134502;134503;134504;134505;134506;134507;134508;134509;134510;134511;134512;134513;134514;134515 134503 17 ETWEEAALHLK Unmodified 1325.6616 0.66156582 4301 Q9NV35 NUDT15 Probable 8-oxo-dGTP diphosphatase NUDT15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.845 89.845 3 0.00070534 91467 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.073 48.197 190880000 21907000 17820000 17478000 11610000 0 17520000 20432000 15085000 16390000 7381700 20210000 0 25042000 12122 4301 11362 106253;106254;106255;106256;106257;106258;106259;106260;106261;106262;106263;106264 134516;134517;134518;134519;134520;134521;134522;134523;134524;134525;134526;134527 134523 12 ETWLSENQR Unmodified 1161.5415 0.54145068 2851;1472;2021 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4 SPTBN1;SPTB;SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.613 44.613 2 7.06E-13 42261 QUIQUE_DMIX1_190116_001 181.81 142.14 5175200000 664460000 603980000 0 310900000 529450000 281600000 331420000 664660000 352940000 389750000 357490000 369950000 318550000 12123 2851;2021;1472 11363 106265;106266;106267;106268;106269;106270;106271;106272;106273;106274;106275;106276 134528;134529;134530;134531;134532;134533;134534;134535;134536;134537;134538;134539;134540;134541;134542;134543;134544 134538 17 ETYEVLLSFIQAALGDQPR Unmodified 2149.1055 0.10553429 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 2 2 175.69 175.69 2;3 2.5729E-28 182703 QUIQUE_DMIX5_190116_001 184.21 169.86 156590000 0 0 0 0 0 0 0 0 8689500 0 91598000 56305000 0 12124 1650 11364 106277;106278;106279;106280;106281 134545;134546;134547;134548;134549 134547 5 ETYGDMADCCEK Oxidation (M) 1493.5109 0.51088012 770 CON__P02769 yes yes 0 1 0 1 20.205 20.205 2 0.001057 12743 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.958 81.659 52975000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52975000 0 0 0 + 12125 770 11365 106282 134550 134550 462 1 ETYGEMADCCAK Oxidation (M) 1449.5211 0.52105087 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;A0A087WWT3;H7C013 ALB Serum albumin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.244 20.244 2 0.00061176 12775 QUIQUE_C1368_190116_001 94.309 94.309 3039900000 247970000 462550000 211140000 438330000 454130000 304290000 205810000 39325000 98524000 61722000 124990000 149310000 241820000 + 12126 769 11366 106283;106284;106285;106286;106287;106288;106289;106290;106291;106292;106293;106294;106295 134551;134552;134553;134554;134555;134556;134557;134558;134559;134560;134561;134562;134563 134553 458 13 ETYGEMADCCAK Unmodified 1433.5261 0.52613625 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;A0A087WWT3;H7C013 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.85 36.85 2 0.00017604 32377 QUIQUE_C1277_190116_001 125.48 125.48 6054300000 990560000 1471200000 503320000 1416300000 0 872060000 0 0 224200000 0 175280000 401330000 0 + 12127 769 11366 106296;106297;106298;106299;106300;106301;106302;106303 134564;134565;134566;134567;134568;134569;134570;134571 134565 3 ETYGLVETFNLRPNEFK Unmodified 2056.0266 0.026555687 1253 I3L448;A8MRA7;Q5TC12;H0YEW4;H0YD21 ATPAF1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 yes no 0 0 1 1 1 115.84 115.84 2;3 0.018646 119936 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.86 35.944 102790000 0 0 0 0 0 0 0 0 102790000 0 0 0 0 12128 1253 11367 106304;106305 134572;134573 134572 2 ETYLAILMDR Unmodified 1223.622 0.62200919 3878 Q96I99;E9PDQ8;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 130.25 130.25 2 0.0044076 134583 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.649 74.378 378860000 56805000 0 0 0 42996000 0 0 72120000 0 21624000 66006000 56553000 62755000 12129 3878 11368 106306;106307;106308;106309;106310;106311;106312 134574;134575;134576;134577;134578;134579;134580 134580 6 ETYNALTNWLTDAR Unmodified 1666.7951 0.79509919 2165 P20338 RAB4A Ras-related protein Rab-4A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.68 135.68 2 0.00019123 139917 QUIQUE_C1403_190116_001 93.839 72.467 864150000 85112000 73587000 83268000 84482000 64495000 81515000 102050000 81961000 0 39187000 0 67873000 100620000 12130 2165 11369 106313;106314;106315;106316;106317;106318;106319;106320;106321;106322;106323 134581;134582;134583;134584;134585;134586;134587;134588;134589;134590;134591;134592 134584 11 ETYNSLAAWLTDAR Unmodified 1609.7736 0.77363546 2706 P61018;M0R0X1 RAB4B Ras-related protein Rab-4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.86 138.86 2 0.00071895 143296 QUIQUE_C1277_190116_001 97.214 80.272 216370000 0 54896000 0 47257000 0 0 0 0 0 0 0 44178000 70036000 12131 2706 11370 106324;106325;106326;106327;106328;106329;106330;106331;106332 134593;134594;134595;134596;134597;134598;134599;134600;134601 134593 9 EVAAEAVPETR Unmodified 1170.5881 0.58806652 3375 Q6NY19 KANK3 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 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106340;106341;106342;106343;106344;106345;106346;106347;106348;106349;106350;106351;106352;106353;106354;106355;106356;106357;106358;106359;106360;106361;106362;106363;106364;106365;106366;106367;106368;106369;106370;106371;106372;106373;106374;106375;106376;106377;106378;106379;106380;106381;106382;106383;106384;106385;106386;106387;106388;106389;106390;106391;106392;106393;106394;106395;106396;106397;106398 134609;134610;134611;134612;134613;134614;134615;134616;134617;134618;134619;134620;134621;134622;134623;134624;134625;134626;134627;134628;134629;134630;134631;134632;134633;134634;134635;134636;134637;134638;134639;134640;134641;134642;134643;134644;134645;134646;134647;134648;134649;134650;134651;134652;134653;134654;134655;134656;134657;134658;134659;134660;134661;134662;134663;134664;134665;134666;134667;134668;134669;134670;134671;134672;134673;134674;134675;134676;134677;134678;134679;134680;134681 134621 70 EVAAPDVGR Unmodified 912.46649 0.46649483 3057 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1 EVAETSMHNLLETDIEQVSQLSALVDAQLDYHR Unmodified 3753.8156 0.81558322 3981 Q99961 SH3GL1 Endophilin-A2 yes yes 0 0 0 1 168.83 168.83 3 0.020054 174031 QUIQUE_C1576_190116_001 22.387 16.404 36951000 0 0 0 0 0 0 36951000 0 0 0 0 0 0 12146 3981 11385 106477 134776 134776 1 EVAFFNNFLTDAK Unmodified 1514.7405 0.74054442 4063 Q9BXP5;H7C3A1;A0A0A0MSP6 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.86 137.86 2 1.2044E-12 142514 QUIQUE_DMIX3_190116_001 152.54 123.58 839630000 59564000 76526000 59030000 59727000 68027000 55352000 59561000 69995000 76408000 26227000 80358000 72163000 76691000 12147 4063 11386 106478;106479;106480;106481;106482;106483;106484;106485;106486;106487;106488;106489;106490 134777;134778;134779;134780;134781;134782;134783;134784;134785;134786;134787;134788;134789;134790 134786 14 EVAFFNNFLTDAKR Unmodified 1670.8417 0.84165545 4063 Q9BXP5;H7C3A1;A0A0A0MSP6 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 1 1 38.913 38.913 4 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Unmodified 914.52255 0.52255314 2130 P17900;H0YBY3;E5RJD0 GM2A Ganglioside GM2 activator;Ganglioside GM2 activator isoform short yes no 0 0 0 1 1 1 78.414 78.414 2 0.031713 79484 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.803 34.224 141340000 0 0 0 0 0 0 0 39599000 0 0 65802000 35938000 0 12154 2130 11393 106561;106562;106563 134888;134889;134890 134888 3 EVAIIVDQR Unmodified 1041.5819 0.58185893 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;H0YB62;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 50.109 50.109 2 0.00032624 49233 QUIQUE_C1218_190116_001 136.27 63.02 2424800000 740390000 0 711910000 0 0 268810000 566330000 0 0 0 137400000 0 0 12155 1140;3457 11394 106564;106565;106566;106567;106568 134891;134892;134893;134894;134895 134891 4 EVAKPSPGEGEVLLK Unmodified 1551.8508 0.85082315 3248 Q53FA7;H7BZH6 TP53I3 Quinone oxidoreductase PIG3 yes no 0 0 1 1 1 48.104 48.104 2;3 6.862E-05 44924 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.435 58.291 59424000 0 0 0 0 0 0 0 0 34602000 24821000 0 0 0 12156 3248 11395 106569;106570 134896;134897 134896 2 EVANAVVRPLGQVLGTPSVAGSENLLK Unmodified 2717.5076 0.50757836 3513 Q86X10 RALGAPB Ral GTPase-activating protein subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 123.73 123.73 3 4.0126E-12 128095 QUIQUE_C1277_190116_001 70.051 59.932 71708000 0 32581000 39127000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12157 3513 11396 106571;106572 134898;134899 134898 2 EVANLVQDTLGSLPTILHVDDSLQAIK Unmodified 2888.5495 0.54950276 1124 H0Y599;Q8N1I0;F5GXW1;H0Y7H7 DOCK4 Dedicator of cytokinesis protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 167.49 167.49 3 7.6354E-54 174792 QUIQUE_DMIX5_190116_001 144.4 131.91 359590000 0 60308000 0 0 103200000 0 0 52903000 0 6616900 136560000 0 0 12158 1124 11397 106573;106574;106575;106576;106577 134900;134901;134902;134903;134904 134904 5 EVANSTANLVK Unmodified 1144.6088 0.60880197 4600;4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;Q9Y490 TLN2;TLN1 Talin-2;Talin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.266 28.266 2 0.0009257 22168 QUIQUE_C1368_190116_001 92.838 51.186 2490900000 0 250620000 307460000 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3;4;5 0.00040927 81756 QUIQUE_C1368_190116_001 45.205 37.584 691220000 0 0 276580000 0 0 178400000 0 0 171760000 0 49540000 14936000 0 12162 2191 11401 106594;106595;106596;106597;106598;106599;106600;106601;106602 134922;134923;134924;134925;134926;134927;134928;134929;134930 134923 9 EVASAASDGLLR Unmodified 1187.6146 0.61461563 3681 Q8TD55 PLEKHO2 Pleckstrin homology domain-containing family O member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.373 54.373 2 0.0010478 52436 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.862 47.305 429160000 0 0 0 0 69766000 0 0 69766000 77376000 42862000 0 62241000 107150000 12163 3681 11402 106603;106604;106605;106606;106607;106608 134931;134932;134933;134934;134935;134936;134937 134934 7 EVASEIWK Unmodified 960.49165 0.49164694 1241 H9KV31;O15394 NCAM2 Neural cell adhesion molecule 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.168 54.168 2 0.025651 52209 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.296 36.146 232440000 0 0 0 0 60499000 0 0 0 0 0 69337000 36258000 66347000 12164 1241 11403 106609;106610;106611;106612 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no 0 0 0 1 16.222 16.222 2 0.0086308 8339 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.425 47.271 41579000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41579000 0 0 0 12167 1435 11406 106627 134956 134956 1 EVAWNLTSVDLVR Unmodified 1500.7936 0.79364262 3107 Q15067 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 128.36 128.36 2 2.9804E-06 132391 QUIQUE_DMIX7_190116_001 128.17 91.472 582220000 45559000 66913000 77777000 53661000 66838000 51747000 65328000 31207000 0 17951000 57486000 47755000 0 12168 3107 11407 106628;106629;106630;106631;106632;106633;106634;106635;106636;106637;106638;106639;106640;106641 134957;134958;134959;134960;134961;134962;134963;134964;134965;134966;134967;134968;134969;134970 134970 10 EVAYLGNEVSDEECLKR Unmodified 2009.9364 0.93642005 3652 Q8NFW8 CMAS N-acylneuraminate cytidylyltransferase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.957 69.957 3 5.0752E-07 70087 QUIQUE_C1277_190116_001 86.488 70.974 469950000 45693000 0 62804000 0 0 56828000 85225000 0 0 0 64379000 81011000 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92.101 92.101 2 0.00045776 95138 QUIQUE_C1218_190116_001 107.97 91.024 218700000 33053000 27976000 0 30364000 0 38679000 29448000 21638000 0 18264000 0 19279000 0 12171 1184 11410 106669;106670;106671;106672;106673;106674;106675;106676 135005;135006;135007;135008;135009;135010;135011;135012 135005 7 EVCINPYHYKR Unmodified 1477.7136 0.71361816 3159 Q15797;D6RD62;Q99717;D6RBB4 SMAD1;SMAD5 Mothers against decapentaplegic homolog 1;Mothers against decapentaplegic homolog 5 yes no 0 0 1 1 60.196 60.196 3 0.059835 60111 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.225 18.663 43503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43503000 0 0 12172 3159 11411 106677 135013 135013 1 EVCQLLPFLVR Unmodified 1372.7537 0.75369207 4393 Q9UBB6;H7C2R2 NCDN Neurochondrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 138.84 138.84 2;3 1.3119E-29 143276 QUIQUE_DMIX7_190116_001 187 178.42 7429900000 504550000 731750000 452980000 473440000 723610000 421230000 650050000 550730000 561840000 178630000 783080000 709360000 688650000 12173 4393 11412 106678;106679;106680;106681;106682;106683;106684;106685;106686;106687;106688;106689;106690;106691 135014;135015;135016;135017;135018;135019;135020;135021;135022;135023;135024;135025;135026;135027;135028;135029;135030;135031;135032;135033;135034;135035;135036;135037;135038;135039;135040;135041;135042;135043;135044;135045 135042 32 EVDADGDLIAVSNLNDSDKLQLLSLVTK Unmodified 2984.5554 0.555376 1573 O60443;C9JSR4 DFNA5 Non-syndromic hearing impairment protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 155 155 3 3.4268E-15 161926 QUIQUE_C1438_190116_001 81.799 72.831 137740000 0 0 0 0 38964000 0 0 45650000 53125000 0 0 0 0 12174 1573 11413 106692;106693;106694 135046;135047;135048 135046 3 EVDAEYEAR Unmodified 1080.4724 0.47236807 268 A0A0D9SF70;G5E9L0;Q8N6H7;E9PMU9;H0YDN9 ARFGAP2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 23.464 23.464 2 0.015763 16391 QUIQUE_C1563_190116_001 66.692 40.753 65346000 0 0 0 0 0 28896000 0 22110000 0 14340000 0 0 0 12175 268 11414 106695;106696;106697 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Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 1 1 1 141.69 141.69 3 3.5498E-05 146736 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.359 47.239 86713000 0 0 0 0 0 37989000 0 0 0 0 0 0 48725000 12187 1922;2797;3030;4044 11424 106885;106886 135317;135318 135318 1 EVDEQMLSVQSK Oxidation (M) 1407.6552 0.65515981 1862 P04350 TUBB4A Tubulin beta-4A chain yes yes 0 1 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 35.072 35.072 2 1.2035E-14 29617 QUIQUE_DMIX8_190116_001 167.09 139.32 6253100000 414080000 666060000 445580000 385060000 443510000 410410000 494350000 380880000 413330000 465910000 721620000 464390000 547900000 12188 1862 11425 106887;106888;106889;106890;106891;106892;106893;106894;106895;106896;106897;106898;106899;106900;106901;106902;106903;106904;106905 135319;135320;135321;135322;135323;135324;135325;135326;135327;135328;135329;135330;135331;135332;135333;135334;135335;135336;135337;135338;135339;135340;135341;135342;135343;135344;135345;135346;135347;135348 135347 1076 30 EVDEQMLSVQSK Unmodified 1391.6602 0.66024519 1862 P04350 TUBB4A Tubulin beta-4A chain yes yes 0 0 0 2 3 1 1 1 1 1 2 2 1 3 2 2 56.831 56.831 2 2.7078E-08 56335 QUIQUE_C1218_190116_001 177.78 169.85 55331000000 5176400000 6236400000 5154200000 4434200000 3987900000 4274400000 5960500000 2996800000 2851200000 1613300000 4900200000 3249900000 4495700000 12189 1862 11425 106906;106907;106908;106909;106910;106911;106912;106913;106914;106915;106916;106917;106918;106919;106920;106921;106922;106923;106924;106925;106926;106927 135349;135350;135351;135352;135353;135354;135355;135356;135357;135358;135359;135360;135361;135362;135363;135364;135365;135366;135367;135368;135369;135370;135371;135372;135373;135374;135375;135376;135377;135378 135349 29 EVDEVDAALSDLEITLEGGK Unmodified 2102.0267 0.026674846 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 170.5 170.5 2;3 3.8308E-32 174674 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.27 143.25 131470000 42826000 0 0 0 0 0 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endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.619 78.619 2 5.2656E-06 75652 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.89 103.85 6392800000 601390000 566530000 524310000 544830000 529620000 475640000 535270000 430370000 386540000 311980000 622050000 405110000 459170000 12193 2658 11429 106947;106948;106949;106950;106951;106952;106953;106954;106955;106956;106957;106958;106959 135398;135399;135400;135401;135402;135403;135404;135405;135406;135407;135408;135409;135410;135411;135412;135413;135414;135415;135416;135417;135418;135419;135420 135414 23 EVDIGIPDATGRLEILQIHTK Unmodified 2317.2642 0.2641602 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 2 121.37 121.37 3;4 0.0011366 123931 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.75 39.36 223480000 0 0 0 0 0 0 0 223480000 0 0 0 0 0 12194 2658 11430 106960;106961 135421;135422 135422 2 EVDILISTALIPGK Unmodified 1467.8548 0.8548459 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 136.05 136.05 2 0.023558 141297 QUIQUE_C1218_190116_001 62.271 52.475 34542000 34542000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12195 2993 11431 106962;106963 135423;135424 135424 1 EVDILISTALIPGKK Unmodified 1595.9498 0.94980892 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 109.2 109.2 3 1.9791E-09 112957 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.09 113.94 262610000 0 0 0 19559000 0 0 0 43057000 69251000 0 61851000 43094000 25801000 12196 2993 11432 106964;106965;106966;106967;106968;106969 135425;135426;135427;135428;135429;135430 135427 6 EVDIYTVK Unmodified 965.50696 0.50696266 953 E9PKG1;Q99873;Q9NR22 PRMT1;PRMT8 Protein arginine N-methyltransferase 1;Protein arginine N-methyltransferase 8 yes no 0 0 0 1 50.284 50.284 2 0.018737 47788 QUIQUE_C1277_190116_001 79.469 41.823 82386000 0 82386000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12197 953 11433 106970 135431 135431 1 EVDKNWLEGEHHGR Unmodified 1704.7968 0.79683052 1580 O60504;H0YB51;E5RJP2;E5RIA0 SORBS3 Vinexin yes no 0 0 1 1 1 22.422 22.422 3 0.012144 15532 QUIQUE_C1403_190116_001 51.009 38.626 29961000 0 0 0 29961000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12198 1580 11434 106971;106972 135432;135433 135433 2 EVDLKDYEDQQK Unmodified 1508.6995 0.69946747 1823 P02671;A0A087WUA0 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 43.295 43.295 2;3 2.7916E-77 40310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 250.76 208.89 1855700000 0 0 233460000 395300000 230870000 0 278400000 0 0 0 411590000 0 306110000 12199 1823 11435 106973;106974;106975;106976;106977;106978;106979;106980;106981;106982;106983;106984 135434;135435;135436;135437;135438;135439;135440;135441;135442;135443;135444;135445;135446 135443 12 EVDPLVYNMSHEDPGNVSYSEIGGLSEQIR Unmodified 3333.546 0.5459503 124 A0A087X2I1;P62333;H0YJC0;H0YJS8 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.93 135.93 3 3.6152E-36 142459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.05 102.15 502780000 60594000 72947000 76909000 93305000 0 0 0 55440000 0 0 71154000 72435000 0 12200 124 11436 106985;106986;106987;106988;106989;106990;106991 135447;135448;135449;135450;135451;135452;135453 135452 5 EVDPQGLR Unmodified 912.46649 0.46649483 4528;2569;840 P50570;K7EPK9;E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM2;DNM3 Dynamin-2;Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.004 25.004 2 0.01188 19105 QUIQUE_C1218_190116_001 89.369 53.876 1954700000 189920000 217700000 227990000 188440000 0 170640000 202990000 0 199030000 74787000 303360000 179870000 0 12201 2569;840;4528 11437 106992;106993;106994;106995;106996;106997;106998;106999;107000;107001 135454;135455;135456;135457;135458;135459;135460;135461;135462;135463 135454 10 EVDSGNDIYGNPIKR Unmodified 1675.8166 0.81656291 2098 P16035 TIMP2 Metalloproteinase inhibitor 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 47.079 47.079 3 0.0045436 44383 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.532 21.503 88552000 0 0 0 0 0 0 0 31475000 0 0 57077000 0 0 12202 2098 11438 107002;107003;107004 135464;135465;135466 135466 3 EVDSKPVSQKPPPPSEK Unmodified 1847.9629 0.9628928 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 2 1 3 1 1 1 3 12.431 12.431 3;4 0.0016174 4933 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.542 42.841 116510000 12675000 0 0 0 22345000 0 0 0 2420500 0 5797600 26200000 47070000 12203 1753 11439 107005;107006;107007;107008;107009;107010;107011;107012;107013;107014 135467;135468;135469;135470;135471;135472;135473;135474;135475;135476;135477 135474 11 EVDVGLAADVGTLQR Unmodified 1541.8049 0.80493559 2959 Q13011;M0R248 ECH1 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 3 1 2 1 1 1 2 1 101.48 101.48 2 1.0437E-09 103425 QUIQUE_C1218_190116_001 107.85 81.908 337380000 59390000 43684000 51543000 0 24351000 50935000 0 16117000 0 30259000 61101000 0 0 12204 2959 11440 107015;107016;107017;107018;107019;107020;107021;107022;107023;107024;107025;107026;107027;107028;107029;107030 135478;135479;135480;135481;135482;135483;135484;135485;135486;135487;135488;135489;135490;135491;135492;135493;135494 135479 13 EVDVNLPK Unmodified 912.49165 0.49164694 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 45.38 45.38 2 0.042707 42345 QUIQUE_C1403_190116_001 58.819 32.647 29414000 0 0 0 29414000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12205 2935 11441 107031 135495 135495 1 EVDYEAGDIPTEWEAWIR Unmodified 2177.9906 0.99056411 3572 Q8N183 NDUFAF2 Mimitin, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 159.57 159.57 2 2.4458E-17 163566 QUIQUE_C1277_190116_001 165.7 113.86 270730000 22776000 29821000 27988000 22805000 29179000 32103000 0 32626000 39660000 0 0 33770000 0 12206 3572 11442 107032;107033;107034;107035;107036;107037;107038;107039;107040;107041 135496;135497;135498;135499;135500;135501;135502;135503;135504;135505;135506;135507 135498 8 EVEAIQAQAK Unmodified 1085.5717 0.57168818 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 20.795 20.795 2 0.011339 14052 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.464 31.638 46970000 0 0 0 0 0 0 0 0 46970000 0 0 0 0 12207 1472 11443 107042 135508 135508 1 EVEAKAPILK Unmodified 1096.6492 0.64921022 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 1 1 116.06 116.06 2 0.019557 119682 QUIQUE_C1277_190116_001 86.833 26.073 15434000 0 15434000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12208 2041 11444 107043 135509 135509 1 EVEAVDSEYQLAR Unmodified 1507.7155 0.71545188 588 F5H7V1;B1AKJ5;O43847;G3V1R5 NRD1 Nardilysin yes no 0 0 0 1 1 1 65.158 65.158 2 0.0021831 65869 QUIQUE_C1438_190116_001 74.944 43.073 46252000 0 0 0 0 46252000 0 0 0 0 0 0 0 0 12209 588 11445 107044;107045;107046 135510;135511;135512 135512 3 EVEAVIPDHCIFASNTSALPISEIAAVSK Unmodified 3067.5536 0.55360186 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 1 2 1 2 3 2 141.54 141.54 2;3 4.6507E-177 146813 QUIQUE_C1368_190116_001 253.95 244.42 8196700000 655500000 665390000 1074200000 917480000 703720000 711720000 555910000 373220000 536510000 221840000 597630000 560860000 622720000 12210 1153 11446 107047;107048;107049;107050;107051;107052;107053;107054;107055;107056;107057;107058;107059;107060;107061;107062;107063;107064;107065;107066;107067;107068;107069;107070;107071;107072 135513;135514;135515;135516;135517;135518;135519;135520;135521;135522;135523;135524;135525;135526;135527;135528;135529;135530;135531;135532;135533;135534;135535;135536;135537;135538;135539;135540;135541;135542;135543;135544;135545;135546;135547 135520 34 EVEEDEYK Unmodified 1039.4346 0.43458558 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 18.785 18.785 2 0.025599 11453 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.342 51.706 371440000 0 65625000 0 0 0 0 0 118400000 45333000 142090000 0 0 0 12211 2079 11447 107073;107074;107075;107076 135548;135549;135550;135551 135550 4 EVEEDEYKAFYK Unmodified 1548.6984 0.69840484 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 1 2 62.664 62.664 2;3 1.1643E-08 61259 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.98 150.64 95299000 0 0 0 0 0 0 0 95299000 0 0 0 0 0 12212 2079 11448 107077;107078 135552;135553 135552 2 EVEEEPGIHSLK Unmodified 1365.6776 0.67760981 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.341 32.341 2;3 8.9542E-07 27223 QUIQUE_C1403_190116_001 140.17 91.746 1028400000 91855000 182090000 246570000 58648000 67306000 56039000 62548000 0 44215000 15219000 84389000 48654000 70866000 12213 89 11449 107079;107080;107081;107082;107083;107084;107085;107086;107087;107088;107089;107090;107091;107092;107093 135554;135555;135556;135557;135558;135559;135560;135561;135562;135563;135564;135565;135566;135567;135568;135569;135570;135571 135560 18 EVEELEQLTQQLMQDMEHPQR Unmodified 2610.2054 0.20540104 1114 H0Y2Y8;Q15942;C9JJK5 ZYX Zyxin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.91 162.91 3 3.9044E-44 167335 QUIQUE_DMIX8_190116_001 154.19 140.46 426420000 36497000 35941000 0 55150000 34739000 0 38907000 41709000 53255000 0 77256000 0 52968000 12214 1114 11450 107094;107095;107096;107097;107098;107099;107100;107101;107102 135572;135573;135574;135575;135576;135577;135578;135579;135580;135581 135581 9 EVEELILTESK Unmodified 1288.6762 0.67621283 1073 G3V1C3;Q9BZZ5 API5 Apoptosis inhibitor 5 no no 0 0 0 1 1 81.606 81.606 2 0.0008422 77983 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.309 56.016 70947000 41709000 0 0 0 0 0 0 0 0 29238000 0 0 0 12215 1073 11451 107103;107104 135582;135583;135584;135585;135586 135586 5 EVEERPAPTPWGSK Unmodified 1581.7787 0.77872084 369;1485 A0A1W2PNV4;O15143;C9JEY1;C9K057 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B no no 0 0 1 2 1 1 1 38.66 38.66 2;3 0.0018191 34805 QUIQUE_C1403_190116_001 106.11 79.219 253910000 0 0 163490000 45947000 0 0 0 0 0 0 0 44478000 0 12216 369;1485 11452 107105;107106;107107;107108;107109 135587;135588;135589;135590;135591 135589 5 EVEEYKNFRPDDPAR Unmodified 1863.8751 0.87514042 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 2 1 3 1 1 2 2 41.644 41.644 2;3;4 6.0707E-12 37024 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.02 81.061 963610000 0 0 0 0 76896000 0 0 266660000 102800000 0 160100000 97943000 259200000 12217 269;2893 11453 107110;107111;107112;107113;107114;107115;107116;107117;107118;107119 135592;135593;135594;135595;135596;135597;135598;135599;135600;135601;135602;135603;135604 135603 13 EVEGDDVPESIMLEMK Unmodified 1819.822 0.82196714 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 125.84 125.84 2 0.023234 132399 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.82 36.41 60840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60840000 0 0 12218 3208 11454 107120 135605 135605 1 EVEGLKDLLVGPGVELLLTPR Unmodified 2246.2886 0.28858403 3773 V9GYM8;Q92974;Q5VY93 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.82 159.82 3 2.0836E-07 164754 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.289 89.934 205750000 0 19102000 0 0 0 0 0 28545000 35612000 0 37627000 48910000 35955000 12219 3773 11455 107121;107122;107123;107124;107125;107126 135606;135607;135608;135609;135610;135611;135612 135609 7 EVEIAYSDVAK Unmodified 1222.6081 0.60813326 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 60.453 60.453 2 0.0045096 59631 QUIQUE_C1576_190116_001 90.15 54.27 234600000 0 0 0 0 0 0 120400000 0 0 114200000 0 0 0 12220 4646 11456 107127;107128 135613;135614 135613 0 EVELDPDIQLEDIAEK Unmodified 1854.9099 0.90985417 4051 Q9BW62 KATNAL1 Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 1 yes yes 0 0 0 1 127.62 127.62 2 0.00039995 132184 QUIQUE_C1218_190116_001 82.543 57.69 38884000 38884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12221 4051 11457 107129 135615;135616 135615 2 EVELGWGK Unmodified 916.46543 0.46543219 3910 Q96NN9;C9K029;C9JPU8 AIFM3 Apoptosis-inducing factor 3 yes no 0 0 0 1 60.873 60.873 2 0.065167 60999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.018 8.804 16250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16250000 0 0 12222 3910 11458 107130 135617 135617 1 EVELNELEPEK Unmodified 1327.6507 0.65072636 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5H0E2;H0YFS2;F5H867 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 70.204 70.204 2 0.0025191 66625 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.71 92.328 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12223 997 11459 107131;107132;107133;107134;107135 135618;135619;135620;135621;135622 135622 5 EVEMGPFK Unmodified 935.44225 0.44225391 3499;1614 O75155;Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND2;CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2;Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 56.501 56.501 2 0.0061791 55209 QUIQUE_C1368_190116_001 102.72 59.719 298620000 77928000 0 60285000 0 49704000 0 59079000 0 0 0 51625000 0 0 12224 1614;3499 11460 107136;107137;107138;107139;107140;107141;107142;107143 135623;135624;135625;135626;135627;135628;135629;135630;135631;135632;135633 135627 11 EVEMGPFK Oxidation (M) 951.43717 0.43716853 3499;1614 O75155;Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND2;CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2;Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 no no 0 1 0 1 29.178 29.178 2 0.046619 23605 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.972 37 47895000 0 0 0 0 0 0 0 47895000 0 0 0 0 0 12225 1614;3499 11460 107144 135634 135634 1 EVENLILENTQLLETK Unmodified 1885.0044 0.004423261 1567 O60271;A0A087X2D8;H0YBE9 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 134.99 134.99 2;3 9.5712E-112 137728 QUIQUE_C1563_190116_001 225.15 193.08 480570000 33225000 34197000 28026000 38314000 32584000 45009000 24930000 62388000 38918000 26241000 38080000 38826000 39835000 12226 1567 11461 107145;107146;107147;107148;107149;107150;107151;107152;107153;107154;107155;107156;107157;107158;107159 135635;135636;135637;135638;135639;135640;135641;135642;135643;135644;135645;135646;135647;135648;135649;135650;135651;135652 135640 18 EVENSEDPKFR Unmodified 1348.6259 0.62590859 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 1 1 1 20.104 20.104 2 0.025874 13297 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.607 23.813 54152000 0 0 0 0 0 0 0 0 34249000 0 0 19903000 0 12227 2135 11462 107160;107161 135653;135654 135653 2 EVEPALELLEPIDQK Unmodified 1721.9087 0.90873196 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 133.71 133.71 2;3 2.3436E-129 139338 QUIQUE_C1218_190116_001 234.63 209.84 9125800000 1043300000 909980000 813930000 852510000 927160000 1098300000 904390000 0 507120000 736500000 329380000 401690000 601650000 12228 2328 11463 107162;107163;107164;107165;107166;107167;107168;107169;107170;107171;107172;107173;107174;107175;107176;107177;107178;107179;107180;107181 135655;135656;135657;135658;135659;135660;135661;135662;135663;135664;135665;135666;135667;135668;135669;135670;135671;135672;135673;135674;135675;135676;135677;135678;135679;135680;135681;135682;135683;135684;135685;135686;135687 135656 32 EVEPEPTEDKDLEADEEDTR Unmodified 2345.003 0.0030388701 2160 P20042 EIF2S2 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.952 53.952 3 1.7608E-09 52652 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sorting-associated protein 52 homolog yes yes 0 0 0 1 109.7 109.7 2 0.034586 114044 QUIQUE_C1576_190116_001 52.79 26.117 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12231 3573 11466 107204 135714 135714 1 EVESMGAHLNAYSTR Oxidation (M) 1679.7573 0.75733347 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 28.061 28.061 2;3 1.5903E-94 21737 QUIQUE_C1368_190116_001 220.31 187.79 898180000 132120000 53258000 67181000 35737000 28618000 96429000 0 100520000 53267000 22966000 61096000 171980000 75010000 12232 2337 11467 107205;107206;107207;107208;107209;107210;107211;107212;107213;107214;107215;107216;107217;107218;107219;107220 135715;135716;135717;135718;135719;135720;135721;135722;135723;135724;135725;135726;135727;135728;135729;135730;135731;135732 135719 1730 18 EVESMGAHLNAYSTR Unmodified 1663.7624 0.76241885 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 46.912 46.912 2;3 1.3232E-129 44171 QUIQUE_DMIX3_190116_001 276.47 241.74 4035300000 0 474910000 552860000 98558000 348190000 453790000 168080000 491720000 199090000 28276000 562730000 538520000 118600000 12233 2337 11467 107221;107222;107223;107224;107225;107226;107227;107228;107229;107230;107231;107232;107233;107234;107235;107236;107237;107238;107239;107240;107241 135733;135734;135735;135736;135737;135738;135739;135740;135741;135742;135743;135744;135745;135746;135747;135748;135749;135750;135751;135752;135753;135754;135755 135746 22 EVESQAQQQLER Unmodified 1443.6954 0.69538514 2639 P54284;F8VNV8;F8VWK1;F8VV14;F8W0F8 CACNB3 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 33.372 33.372 2 5.0192E-08 28775 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.73 135.73 103840000 0 32176000 27726000 28866000 0 0 0 0 0 15068000 0 0 0 12234 2639 11468 107242;107243;107244;107245;107246;107247;107248 135756;135757;135758;135759;135760;135761;135762 135762 7 EVESVDLPHCHLIK Unmodified 1674.8399 0.83994089 300 A0A0J9YXF2;A0A0J9YYG4;Q15165;J3QT77;G3XAK4;A0A2Q2SAK4;A0A0J9YXM1 PON2 Serum paraoxonase/arylesterase 2 yes no 0 0 0 3 1 3 3 3 1 2 1 2 2 3 2 53.865 53.865 2;3;4 2.1768E-29 52579 QUIQUE_C1438_190116_001 176.48 140.97 2027800000 304390000 53470000 265690000 263670000 269450000 32852000 258100000 50529000 99535000 0 110340000 160060000 159730000 12235 300 11469 107249;107250;107251;107252;107253;107254;107255;107256;107257;107258;107259;107260;107261;107262;107263;107264;107265;107266;107267;107268;107269;107270;107271;107272;107273;107274 135763;135764;135765;135766;135767;135768;135769;135770;135771;135772;135773;135774;135775;135776;135777;135778;135779;135780;135781;135782;135783;135784;135785;135786;135787;135788;135789 135775 25 EVFASWR Unmodified 893.43955 0.43955179 135;499 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;H0Y3A3;A0A3B3ITG3;Q5VWQ8 SYNGAP1;DAB2IP Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP;Disabled homolog 2-interacting protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.556 63.556 2 0.019773 63173 QUIQUE_DMIX7_190116_001 110.34 63.986 193690000 0 34877000 0 29288000 25036000 0 0 0 0 0 38508000 30685000 35297000 12236 135;499 11470 107275;107276;107277;107278;107279;107280;107281 135790;135791;135792;135793;135794;135795;135796 135795 7 EVFDNDGKPR Unmodified 1175.5571 0.55710075 2915 Q08209 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform yes yes 0 0 1 2 3 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 17.311 17.311 2;3 1.8327E-06 10118 QUIQUE_C1218_190116_001 164.96 125.99 5621700000 611160000 588480000 535520000 492500000 188270000 426950000 494720000 342840000 357600000 200120000 514920000 477040000 391560000 12237 2915 11471 107282;107283;107284;107285;107286;107287;107288;107289;107290;107291;107292;107293;107294;107295;107296;107297;107298;107299;107300;107301;107302;107303;107304;107305;107306 135797;135798;135799;135800;135801;135802;135803;135804;135805;135806;135807;135808;135809;135810;135811;135812;135813;135814;135815;135816;135817;135818;135819;135820;135821;135822 135798 17 EVFDWILDQGYYSER Unmodified 1918.8737 0.87374344 3632 Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 1 2 2 1 154.89 154.89 2;3 6.9415E-19 159143 QUIQUE_C1277_190116_001 108.66 98.521 1230600000 14935000 211090000 237620000 164830000 15359000 9775700 0 14643000 125640000 3562600 171560000 253150000 8414000 12238 3632 11472 107307;107308;107309;107310;107311;107312;107313;107314;107315;107316;107317;107318;107319;107320;107321;107322;107323;107324 135823;135824;135825;135826;135827;135828;135829;135830;135831;135832;135833;135834;135835;135836;135837;135838;135839;135840;135841;135842;135843 135826 21 EVFEDAAEIR Unmodified 1177.5615 0.56151742 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.607 67.607 2 0.0023173 66294 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domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 51.233 51.233 3 0.00022887 49372 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.223 57.298 640410000 0 0 0 0 56802000 0 0 106430000 105250000 0 174940000 119190000 77804000 12244 3827 11477 107356;107357;107358;107359;107360;107361 135876;135877;135878;135879;135880;135881 135879 5 EVFGETLNESR Unmodified 1279.6044 0.60444487 3352 Q68DU8 KCTD16 BTB/POZ domain-containing protein KCTD16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 57.693 57.693 2 0.0040084 57254 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.478 52.716 36701000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36701000 0 0 12245 3352 11478 107362;107363;107364;107365 135882;135883;135884;135885 135884 4 EVFGSGTACQVCPVHR Unmodified 1802.8192 0.81922222 601 M0QZP4;B3KSI3;M0QZ10;M0QXF9;O15382 BCAT2 Branched-chain-amino-acid aminotransferase;Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 49.024 49.024 3 0.026315 46950 QUIQUE_C1576_190116_001 44.294 33.015 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12246 601 11479 107366 135886 135886 1 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SEC7 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 155.86 155.86 2 0.00069031 158513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.813 70.669 13793000 0 0 0 0 0 0 0 13793000 0 0 0 0 0 12249 388 11482 107382 135905 135905 1 EVFLVMPTGGGK Unmodified 1233.6427 0.64274463 2477 P46063;F5H2L2;F8WA66;F8WD97 RECQL ATP-dependent DNA helicase Q1 yes no 0 0 0 1 91.284 91.284 2 0.039655 88147 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.434 22.958 17982000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17982000 0 0 0 12250 2477 11483 107383 135906 135906 0 EVFPFPEVSQDELNEINQFLGPVEK Unmodified 2903.4229 0.42290526 4186 Q9H845;D6RCD8 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171.27 171.27 3 1.2993E-09 175034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.222 69.391 379750000 9260200 26357000 22213000 0 26647000 20879000 0 42157000 103910000 0 60418000 67907000 0 12251 4186 11484 107384;107385;107386;107387;107388;107389;107390;107391;107392 135907;135908;135909;135910;135911;135912;135913;135914;135915 135915 9 EVFPTAALMPGAEK Oxidation (M) 1475.733 0.7330162 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 1 0 1 80.405 80.405 2 0.022077 80416 QUIQUE_C1563_190116_001 61.344 35.28 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12252 2924 11485 107393 135916 135916 1 EVFPVLAAK Unmodified 972.56442 0.56441796 3700 Q8WUM4;F8WDK9 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.695 74.695 2 0.0081931 76174 QUIQUE_C1218_190116_001 79.469 56.159 455550000 49767000 59522000 0 61250000 53375000 51263000 53838000 40087000 34384000 0 0 52063000 0 12253 3700 11486 107394;107395;107396;107397;107398;107399;107400;107401;107402 135917;135918;135919;135920;135921;135922;135923;135924;135925;135926;135927;135928;135929;135930;135931;135932 135918 16 EVFQIASNDHDAAINR Unmodified 1798.8598 0.85982471 4475 Q9UKG1;C9JAB0 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes no 0 0 0 2 1 2 2 3 2 1 1 1 2 1 1 58.623 58.623 2;3 4.9944E-13 57677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.56 133.41 1724700000 174090000 95464000 184020000 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protein 3B;Actin-related protein 3C no no 0 0 0 1 1 2 1 65.461 65.461 2 0.0070623 64183 QUIQUE_C1218_190116_001 64.103 36.8 49226000 0 0 0 32039000 0 0 0 0 0 17187000 0 0 0 12264 2714;4374 11497 107467;107468;107469;107470;107471 136017;136018;136019;136020;136021 136017 5 EVGKDVSDEKLR Unmodified 1373.7151 0.71505795 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 2 1 1 16.248 16.248 2;3 0.00021214 8709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.42 99.675 3460200000 0 0 0 0 0 0 0 512540000 583400000 0 1191200000 653320000 519740000 12265 612 11498 107472;107473;107474;107475;107476;107477 136022;136023;136024;136025;136026;136027 136024 1 EVGLDLFFPK Unmodified 1163.6227 0.62266112 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.91 139.91 2 0.00041584 145360 QUIQUE_C1368_190116_001 111.95 93.171 322390000 30182000 37269000 32825000 27757000 23162000 18160000 21026000 25009000 19787000 12004000 31486000 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136065 4 EVGTPHGIILDSVDAAFICPGSSR Unmodified 2497.2271 0.22712276 1839 P02790 HPX Hemopexin yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 130.5 130.5 2;3 1.0308E-36 136619 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.7 144.49 1737100000 232980000 166320000 121800000 130020000 0 205170000 127450000 47249000 109290000 83931000 155500000 132820000 224550000 12271 1839 11504 107514;107515;107516;107517;107518;107519;107520;107521;107522;107523;107524;107525;107526;107527 136069;136070;136071;136072;136073;136074;136075;136076;136077;136078;136079;136080;136081;136082;136083;136084 136082 16 EVGVYEALK Unmodified 1006.5335 0.53351176 2430 P40925;B9A041;B8ZZ51 MDH1 Malate dehydrogenase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 54.84 54.84 2 0.013659 53590 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.628 30.821 2043700000 0 0 0 0 331670000 470270000 348070000 0 206740000 240410000 246040000 200470000 0 12272 2430 11505 107528;107529;107530;107531;107532;107533;107534 136085;136086;136087;136088;136089;136090;136091 136090 7 EVGVYEALKDDSWLK Unmodified 1750.8778 0.87776618 2430 P40925;B9A041;B8ZZ51 MDH1 Malate dehydrogenase, cytoplasmic yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 2 4 2 2 2 2 117.99 117.99 2;3 5.0187E-53 121808 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.53 165.69 48376000000 3427700000 4352800000 3777600000 3699300000 3558200000 3220000000 3920800000 3072800000 3603000000 1185900000 5488800000 4826100000 4243400000 12273 2430 11506 107535;107536;107537;107538;107539;107540;107541;107542;107543;107544;107545;107546;107547;107548;107549;107550;107551;107552;107553;107554;107555;107556;107557;107558;107559;107560;107561;107562;107563 136092;136093;136094;136095;136096;136097;136098;136099;136100;136101;136102;136103;136104;136105;136106;136107;136108;136109;136110;136111;136112;136113;136114;136115;136116;136117;136118;136119;136120;136121;136122;136123;136124;136125;136126;136127;136128;136129;136130;136131;136132;136133;136134;136135;136136;136137;136138;136139;136140;136141;136142;136143;136144;136145;136146;136147;136148;136149;136150;136151;136152;136153;136154;136155;136156;136157;136158;136159;136160;136161;136162;136163;136164;136165;136166;136167;136168;136169;136170;136171 136137 80 EVGVYEALKDDSWLKGEFVTTVQQR Unmodified 2896.4607 0.46068775 2430 P40925;B9A041;B8ZZ51 MDH1 Malate dehydrogenase, cytoplasmic yes no 0 0 2 2 1 2 135.71 135.71 3;4 6.1656E-14 138584 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.854 77.348 494190000 0 0 0 0 0 0 0 336180000 87790000 0 0 70220000 0 12274 2430 11507 107564;107565;107566;107567;107568 136172;136173;136174;136175;136176;136177 136172 6 EVGYLEFTGPPQKPPR Unmodified 1813.9363 0.93628412 3060 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136184;136185;136186;136187;136188;136189;136190;136191;136192;136193;136194;136195;136196;136197 136188 13 EVIAEEEPPTVTEPLPENR Unmodified 2148.0586 0.058643676 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 88.222 88.222 2 2.6015E-10 89514 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.86 117.66 84361000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 84361000 0 0 12278 2880 11511 107587;107588;107589 136198;136199;136200 136199 2 EVIAGPLLR Unmodified 966.58622 0.58621603 3356 Q6DKJ4;I3L4V6 NXN Nucleoredoxin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 70.031 70.031 2 0.0081931 70756 QUIQUE_C1438_190116_001 79.469 60.738 152900000 19394000 17512000 0 33151000 35201000 0 23178000 0 0 0 0 0 24467000 12279 3356 11512 107590;107591;107592;107593;107594;107595;107596;107597;107598 136201;136202;136203;136204;136205;136206;136207;136208;136209 136206 8 EVIAVQGPPDGTVLVSIK Unmodified 1821.0248 0.024764773 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 2 1 115.5 115.5 2 2.8186E-19 121276 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136223;136224;136225;136226;136227;136228;136229;136230;136231;136232;136233;136234;136235;136236;136237;136238;136239;136240;136241;136242;136243;136244;136245;136246;136247 136224 25 EVICQVLHLGTVTDFK Unmodified 1857.9659 0.96586969 2434 U3KQG5;P41217;F8W7G1 CD200 OX-2 membrane glycoprotein yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 117.44 117.44 2;3 3.1504E-09 121321 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.81 106 2475500000 194950000 250790000 238830000 268280000 259930000 221410000 329530000 108790000 39553000 110340000 249880000 0 203250000 12282 2434 11515 107632;107633;107634;107635;107636;107637;107638;107639;107640;107641;107642;107643;107644;107645;107646;107647;107648;107649;107650;107651;107652 136248;136249;136250;136251;136252;136253;136254;136255;136256;136257;136258;136259;136260;136261;136262;136263;136264;136265;136266;136267;136268;136269;136270;136271;136272 136265 22 EVIDLLK Unmodified 828.49567 0.49566969 3490 Q86UP2;G8JLP4 KTN1;KIAA0430 Kinectin no no 0 0 0 1 65.495 65.495 2 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107659;107660;107661;107662;107663;107664;107665;107666;107667;107668;107669;107670 136279;136280;136281;136282;136283;136284;136285;136286;136287;136288;136289;136290;136291;136292;136293 136287 14 EVIEIDQFSYPVYR Unmodified 1756.8672 0.8672015 3641 Q8NDN9 RCBTB1 RCC1 and BTB domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 41.709 41.709 3 0.031151 37652 QUIQUE_C1277_190116_001 26.124 13.978 67183000 26039000 41144000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12286 3641 11519 107671;107672 136294;136295 136295 2 EVIELPLTNPELFQR Unmodified 1796.9672 0.96724989 124 A0A087X2I1;P62333;H0YJC0;H0YJS8 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.17 141.17 2 2.4982E-13 144423 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.66 127.23 1810100000 168230000 158170000 153500000 178310000 140270000 164940000 0 145340000 136290000 68070000 163650000 139420000 193890000 12287 124 11520 107673;107674;107675;107676;107677;107678;107679;107680;107681;107682;107683;107684 136296;136297;136298;136299;136300;136301;136302;136303;136304;136305;136306;136307;136308;136309 136304 14 EVIELPVKHPELFEALGIAQPK Unmodified 2456.3679 0.36789699 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1;J3KRP2;J3QLH6;J3QRW1;J3QSE0;J3QRR3 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 129.83 129.83 3;4 3.9306E-20 134699 QUIQUE_C1368_190116_001 123.19 111.57 1760500000 27150000 135010000 116200000 97562000 286680000 0 150070000 184650000 177490000 0 208770000 263660000 113250000 12288 2743 11521 107685;107686;107687;107688;107689;107690;107691;107692;107693;107694;107695;107696;107697;107698;107699;107700;107701;107702;107703;107704 136310;136311;136312;136313;136314;136315;136316;136317;136318;136319;136320;136321;136322;136323;136324;136325;136326;136327;136328;136329;136330;136331;136332 136315 23 EVIFSVEDGSVK Unmodified 1307.6609 0.66089712 1757 O95834;K7EIK7;A0A0C4DGQ7;C9JRL6 EML2 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.21 82.21 2 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yes no 0 0 0 1 1 1 1 23.358 23.358 2 0.025111 16907 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.666 12.603 423400000 0 0 0 127270000 0 0 0 0 78453000 0 95212000 0 122470000 12292 2037 11525 107719;107720;107721;107722 136348;136349;136350;136351 136350 4 EVITDNLPGSIR Unmodified 1312.6987 0.69867961 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 1 79.33 79.33 2 0.00051669 80194 QUIQUE_C1403_190116_001 114.4 82.081 242610000 0 0 140560000 102050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12293 4176 11526 107723;107724 136352;136353 136353 2 EVITSDELMAHLGNCLLSIKPQEK Unmodified 2724.3826 0.38263713 3600 Q8N5J2 FAM63A Protein FAM63A yes yes 0 0 1 1 136.28 136.28 4 0.070989 143447 QUIQUE_DMIX5_190116_001 18.497 15.83 38273000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38273000 0 0 12294 3600 11527 107725 136354 136354 1 EVIVGPDTTSYSLADLSPSTHYTAK Unmodified 2651.2966 0.29664212 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 110.97 110.97 2;3 4.1167E-36 114410 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1973.8823 0.88227599 4621 Q9Y5J7 TIMM9 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.747 17.747 3 4.4964E-05 10178 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.461 84.084 300900000 49540000 34976000 35551000 0 42709000 0 0 29210000 0 0 34321000 25926000 48662000 12298 4621 11531 107745;107746;107747;107748;107749;107750;107751;107752 136374;136375;136376;136377;136378;136379;136380;136381 136379 8 EVKPETKPPEPK Unmodified 1377.7504 0.75038083 355 A0A1B0GV38;P14867 GABRA1 Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1 yes no 0 0 2 1 1 1 10.435 10.435 3 0.0065015 3078 QUIQUE_C1403_190116_001 66.498 56.02 40414000 0 0 0 10218000 0 0 0 0 0 0 18373000 0 11824000 12299 355 11532 107753;107754;107755 136382;136383;136384 136382 3 EVLAELEALER Unmodified 1270.6769 0.67688153 3200 Q16822;H0YML5 PCK2 Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 120.91 120.91 2 0.001687 124306 QUIQUE_C1403_190116_001 83 36.999 58009000 0 0 0 32772000 0 0 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1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.313 56.313 2 0.0016704 54675 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.33 70.254 334180000 0 66263000 0 0 76698000 0 61685000 31193000 38756000 0 0 59584000 0 12306 3141 11539 107779;107780;107781;107782;107783;107784;107785 136409;136410;136411;136412;136413;136414;136415;136416 136413 7 EVLDVAAGMIKPGVTTEEIDHAVHLACIAR Unmodified 3214.6479 0.64785337 2624 P53582 METAP1 Methionine aminopeptidase 1 yes yes 0 0 1 2 137.01 137.01 4;5 1.4576E-13 141463 QUIQUE_C1277_190116_001 71.974 63.468 67624000 0 67624000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12307 2624 11540 107786;107787 136417;136418;136419;136420 136419 4 EVLEDFAEDGEK Unmodified 1379.6093 0.60925548 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;H7C141;H7C3G2;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.372 77.372 2 0.000154 79221 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.35 111.68 995610000 91633000 112070000 69956000 71575000 83982000 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1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.544 82.544 2 9.8235E-19 84069 QUIQUE_C1368_190116_001 142.83 117.36 262330000 37545000 42227000 36426000 44830000 0 0 0 0 0 0 0 58332000 42973000 12310 472;1460 11543 107815;107816;107817;107818;107819;107820 136451;136452;136453;136454;136455;136456;136457;136458 136453 8 EVLEGLDYLHR Unmodified 1342.6881 0.68811492 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 86.05 86.05 2;3 0.00033912 88756 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.07 84.619 2098600000 92344000 102560000 223800000 226800000 215220000 209290000 101550000 0 204850000 30480000 251630000 222150000 217910000 12311 4417 11544 107821;107822;107823;107824;107825;107826;107827;107828;107829;107830;107831;107832;107833;107834;107835;107836;107837;107838;107839;107840 136459;136460;136461;136462;136463;136464;136465;136466;136467;136468;136469;136470;136471;136472;136473;136474;136475;136476;136477;136478;136479;136480;136481;136482;136483;136484 136476 25 EVLEGLEYLHK Unmodified 1328.6976 0.69761697 1746 O95747;C9JIG9 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 81.869 81.869 2;3 0.00044673 84109 QUIQUE_C1438_190116_001 114.89 45.267 1464400000 113740000 110710000 128570000 113050000 112300000 115120000 112180000 105450000 107060000 45681000 163860000 104370000 132270000 12312 1746 11545 107841;107842;107843;107844;107845;107846;107847;107848;107849;107850;107851;107852;107853;107854;107855;107856;107857;107858;107859;107860;107861;107862;107863;107864;107865;107866 136485;136486;136487;136488;136489;136490;136491;136492;136493;136494;136495;136496;136497;136498;136499;136500;136501;136502;136503;136504;136505;136506;136507;136508;136509;136510;136511;136512;136513;136514 136495 30 EVLEHVVPELNVQCLR Unmodified 1933.0091 0.0091314834 1511 O43166;F5GYF8;H0YJY2 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 106.43 106.43 3 0.00022348 110522 QUIQUE_C1218_190116_001 73.386 63.329 69286000 23889000 24985000 0 20412000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12313 1511 11546 107867;107868;107869 136515;136516;136517 136515 1 EVLELDSIR Unmodified 1072.5764 0.57643921 2392 P36404 ARL2 ADP-ribosylation factor-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 81.288 81.288 2 0.05253 82522 QUIQUE_C1277_190116_001 50.04 4.705 113400000 0 41397000 0 0 0 0 72001000 0 0 0 0 0 0 12314 2392 11547 107870;107871;107872 136518;136519;136520 136518 3 EVLEQVER Unmodified 1000.5189 0.51892433 1305;1898 J3QRU1;P07947;P06241 YES1;FYN Non-specific protein-tyrosine kinase;Tyrosine-protein kinase Yes;Tyrosine-protein kinase Fyn no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 33.217 33.217 2 0.018262 27936 QUIQUE_C1277_190116_001 80.229 0 1420000000 206780000 235400000 0 214700000 211880000 222880000 0 201180000 0 127170000 0 0 0 12315 1305;1898 11548 107873;107874;107875;107876;107877;107878;107879 136521;136522;136523;136524;136525;136526;136527 136522 7 EVLEYNAIGGK Unmodified 1191.6136 0.61355299 2073 P14324;A0A087WVN4;A0A087X1D8 FDPS Farnesyl pyrophosphate synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.123 60.123 2 1.2933E-08 60016 QUIQUE_C1218_190116_001 156.75 109.76 909950000 124290000 109470000 106600000 0 112680000 91605000 63120000 47556000 68100000 0 62311000 54375000 69844000 12316 2073 11549 107880;107881;107882;107883;107884;107885;107886;107887;107888;107889;107890;107891 136528;136529;136530;136531;136532;136533;136534;136535;136536;136537;136538;136539;136540;136541 136528 13 EVLGSAPSGAR Unmodified 1042.5407 0.5407224 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 23.139 23.139 2 0.013806 16307 QUIQUE_C1403_190116_001 59.153 20.361 59231000 0 0 0 59231000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12317 981;4494 11550 107892 136542 136542 1 EVLGSLPNVFSALCLNAR Unmodified 1959.0248 0.024781548 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 158.67 158.67 2 0.00032507 161203 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.24 81.666 22567000 0 0 0 0 0 0 0 22567000 0 0 0 0 0 12318 3471 11551 107893 136543 136543 1 EVLHELYK Unmodified 1029.5495 0.54949617 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.456 33.456 2 0.0036633 29020 QUIQUE_C1277_190116_001 125.81 66.833 363600000 0 124560000 87588000 0 0 0 87896000 0 0 0 0 0 63558000 12319 2176 11552 107894;107895;107896;107897 136544;136545;136546;136547 136544 3 EVLINNINR Unmodified 1083.6037 0.60365701 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 48.312 48.312 2 0.0041975 45362 QUIQUE_C1218_190116_001 89.55 69.029 87898000 52669000 0 0 0 0 0 0 0 0 35228000 0 0 0 12320 1883 11553 107898;107899 136548;136549 136548 2 EVLLDEDDDLWIALR Unmodified 1813.9098 0.90979459 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 4 5 3 1 3 1 3 3 4 1 15 4 1 161.66 161.66 2 1.2889E-53 164471 QUIQUE_C1576_190116_001 186.81 144.81 1740000000 115300000 203480000 0 48432000 150020000 0 163730000 134140000 254100000 0 384490000 227310000 59027000 12321 273;342 11554 107900;107901;107902;107903;107904;107905;107906;107907;107908;107909;107910;107911;107912;107913;107914;107915;107916;107917;107918;107919;107920;107921;107922;107923;107924;107925;107926;107927;107928;107929;107930;107931;107932;107933;107934;107935;107936;107937;107938;107939;107940;107941;107942;107943;107944;107945;107946;107947 136550;136551;136552;136553;136554;136555;136556;136557;136558;136559;136560;136561;136562;136563;136564;136565;136566;136567;136568;136569;136570;136571;136572;136573;136574;136575;136576;136577;136578;136579;136580;136581;136582;136583;136584;136585;136586;136587;136588;136589;136590;136591;136592;136593;136594;136595;136596;136597;136598;136599;136600;136601;136602;136603;136604;136605;136606;136607 136568 50 EVLLDIK Unmodified 828.49567 0.49566969 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 65.688 65.688 2 0.019757 62198 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.65 6.4594 746310000 0 421440000 0 0 194640000 0 0 0 0 130230000 0 0 0 12322 4069 11555 107948;107949;107950 136608;136609;136610;136611 136610 4 EVLLDIKR Unmodified 984.59678 0.59678072 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.34 42.34 2 0.00058749 39305 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.52 34.726 2292000000 0 0 0 0 218110000 63796000 232850000 283220000 271380000 0 415500000 410430000 396730000 12323 4069 11556 107951;107952;107953;107954;107955;107956;107957;107958 136612;136613;136614;136615;136616;136617;136618;136619;136620;136621 136620 8 EVLLEVQK Unmodified 956.55425 0.5542472 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 47.973 47.973 2 0.0083476 43733 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.662 21.046 481460000 0 0 0 102410000 0 89417000 0 69707000 88525000 41813000 0 89579000 0 12324 4510 11557 107959;107960;107961;107962;107963;107964 136622;136623;136624;136625;136626;136627 136626 6 EVLNCGIAYVALLTK Unmodified 1662.9015 0.90147851 3251 Q53G44 IFI44L Interferon-induced protein 44-like yes yes 0 0 0 1 1 142.39 142.39 2 0.040716 149653 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.205 46.559 80792000 0 0 0 0 47159000 0 0 0 0 0 33633000 0 0 12325 3251 11558 107965;107966 136628;136629 136629 2 EVLPALENNK Unmodified 1125.603 0.60298831 4438 Q9UHV9 PFDN2 Prefoldin subunit 2 yes yes 0 0 0 1 50.096 50.096 2 0.06851 48079 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.98 22.24 18002000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18002000 12326 4438 11559 107967 136630 136630 1 EVLPALENNKEQIQK Unmodified 1751.9418 0.94176342 4438 Q9UHV9 PFDN2 Prefoldin subunit 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 50.791 50.791 2;3 6.1014E-12 48728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.08 129.08 394530000 34212000 34409000 0 25327000 43703000 24309000 0 49803000 0 0 73992000 53589000 55191000 12327 4438 11560 107968;107969;107970;107971;107972;107973;107974;107975;107976;107977;107978 136631;136632;136633;136634;136635;136636;136637;136638;136639;136640;136641;136642 136639 12 EVLPEDCLPR Unmodified 1226.5965 0.59652272 3916 Q96PE3;B8ZZB2 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 68.886 68.886 2 0.0060502 68390 QUIQUE_C1277_190116_001 75.378 11.899 182370000 35665000 39694000 0 35809000 0 0 41754000 0 0 0 0 29453000 0 12328 3916 11561 107979;107980;107981;107982;107983 136643;136644;136645;136646;136647 136644 5 EVLPEHVSVLQGVDLSPDITR Unmodified 2302.2169 0.21687565 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 121.23 121.23 2;3 1.4955E-53 125072 QUIQUE_C1277_190116_001 119.62 111.23 729090000 0 92438000 0 0 117870000 80987000 69288000 77767000 0 34617000 85820000 90111000 80198000 12329 3445 11562 107984;107985;107986;107987;107988;107989;107990;107991;107992;107993;107994 136648;136649;136650;136651;136652;136653;136654;136655;136656;136657;136658;136659;136660;136661;136662 136648 15 EVLPSTR Unmodified 800.43922 0.43921744 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 20.846 20.846 2 0.030069 14002 QUIQUE_C1368_190116_001 90.986 10.608 132590000 0 0 77917000 0 0 0 0 0 0 0 54669000 0 0 12330 3432 11563 107995;107996 136663;136664 136663 2 EVLQALEELAVNYDQK Unmodified 1860.9469 0.94690838 2355;1568;2946 P33176;O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840;J3KNA1 KIF5B;KIF5C;KIF5A Kinesin-1 heavy chain;Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein no no 0 0 0 2 1 2 2 3 2 2 1 1 1 1 2 2 153.35 153.35 2;3 1.9145E-35 159208 QUIQUE_C1218_190116_001 208.27 153.49 1447100000 155920000 105540000 150470000 146540000 155490000 149500000 155310000 53633000 54245000 54370000 48844000 140940000 76302000 12331 2355;1568;2946 11564 107997;107998;107999;108000;108001;108002;108003;108004;108005;108006;108007;108008;108009;108010;108011;108012;108013;108014;108015;108016;108017;108018 136665;136666;136667;136668;136669;136670;136671;136672;136673;136674;136675;136676;136677;136678;136679;136680;136681;136682;136683;136684;136685;136686;136687;136688;136689;136690 136666 22 EVLQEWPLTTVK Unmodified 1441.7817 0.78168095 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 108.7 108.7 2 0.00025503 111896 QUIQUE_C1403_190116_001 117.02 59.063 315580000 0 0 80110000 78350000 0 73262000 0 0 0 26283000 0 0 57573000 12332 4606 11565 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2484;3685 P46926;D6R9P4;D6RFF8;V9GYK3;Q8TDQ7 GNPDA1;GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase;Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 58.098 58.098 2;3 0.00012876 56662 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.116 68.428 1441000000 132360000 136760000 119720000 112400000 116080000 83823000 95614000 110290000 145450000 72825000 115450000 92744000 107460000 12341 2484;3685 11574 108057;108058;108059;108060;108061;108062;108063;108064;108065;108066;108067;108068;108069;108070;108071;108072;108073;108074;108075;108076;108077;108078;108079;108080;108081;108082;108083;108084 136732;136733;136734;136735;136736;136737;136738;136739;136740;136741;136742;136743;136744;136745;136746;136747;136748;136749;136750;136751;136752;136753;136754;136755;136756;136757;136758;136759;136760;136761;136762;136763;136764;136765;136766;136767 136754 33 EVMLALTVLETCVK Unmodified 1604.8518 0.85175113 3427 Q6ZVM7;B7Z2U2;K7ENB0 TOM1L2 TOM1-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 144.62 144.62 2 3.2821E-10 149411 QUIQUE_DMIX7_190116_001 131.43 105.96 90436000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33478000 39973000 16985000 12342 3427 11575 108085;108086;108087 136768;136769;136770;136771;136772 136770 5 EVMLILIR Unmodified 985.59942 0.59942325 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.95 109.95 2 0.016585 113542 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.913 57.295 61909000 0 0 0 0 7617900 0 0 17061000 16245000 0 20986000 0 0 12343 1644 11576 108088;108089;108090;108091;108092;108093 136773;136774;136775;136776;136777;136778 136776 6 EVMLVGIGDK Unmodified 1059.5634 0.56343168 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.915 73.915 2 0.0015607 74651 QUIQUE_C1368_190116_001 113.18 73.073 3780600000 443500000 395810000 385690000 301980000 188500000 396360000 294350000 297280000 252250000 0 238800000 339880000 246190000 12344 2396 11577 108094;108095;108096;108097;108098;108099;108100;108101;108102;108103;108104;108105 136779;136780;136781;136782;136783;136784;136785;136786;136787;136788;136789;136790;136791;136792;136793;136794;136795;136796;136797 136783 19 EVMLVGIGDK Oxidation (M) 1075.5583 0.5583463 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 60.311 60.311 2 0.032167 58179 QUIQUE_C1563_190116_001 55.461 32.97 184630000 0 85657000 0 0 0 98977000 0 0 0 0 0 0 0 12345 2396 11577 108106;108107 136798;136799;136800 136799 3 EVMLVGIGDKIR Unmodified 1328.7486 0.74860669 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 77.654 77.654 3 0.0012715 77548 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.324 61.382 45451000 0 0 0 0 0 0 0 45451000 0 0 0 0 0 12346 2396 11578 108108 136801 136801 1 EVMPLLLAYLK Unmodified 1288.7465 0.74648142 3690 Q8TEX9;H0YN14 IPO4 Importin-4 yes no 0 0 0 1 154.07 154.07 2 0.024037 156814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.598 37.822 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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137081;137082;137083;137084;137085;137086;137087;137088;137089;137090;137091;137092;137093;137094;137095;137096;137097;137098;137099;137100;137101;137102;137103;137104;137105;137106;137107;137108;137109;137110;137111;137112;137113;137114;137115;137116;137117;137118;137119;137120;137121;137122;137123;137124;137125;137126;137127;137128;137129;137130;137131;137132;137133;137134;137135;137136;137137;137138;137139;137140;137141;137142;137143;137144;137145;137146;137147;137148;137149;137150;137151;137152;137153;137154;137155;137156;137157;137158;137159;137160;137161;137162;137163;137164;137165;137166;137167;137168;137169;137170;137171;137172;137173;137174;137175;137176;137177;137178;137179;137180;137181;137182;137183;137184;137185;137186;137187 137082 104 EVQGNESDLFMSYFPR Unmodified 1917.8567 0.85671317 2421 P40121;E7ENU9;B8ZZL6 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 3 2 2 2 2 2 2 140.41 140.41 2;3 0 136792 QUIQUE_DMIX4_190116_001 326.81 317.92 2135800000 97192000 116190000 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137234;137235;137236;137237;137238;137239;137240;137241;137242;137243;137244;137245 137238 1840 10 EVQLEELEAAR Unmodified 1285.6514 0.65139506 2583 P51570;K7EII7 GALK1 Galactokinase yes no 0 0 0 1 1 1 76.955 76.955 2 0.0008422 78404 QUIQUE_C1218_190116_001 94.309 61.954 303600000 101160000 0 0 110240000 0 92208000 0 0 0 0 0 0 0 12381 2583 11612 108436;108437;108438 137246;137247;137248 137246 1 EVQLVESGGGLVQPGGSLR Unmodified 1880.9956 0.99558991 213 S4R460;A0A0B4J2B5 IGHV3OR16-9 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 2 2 1 3 94.348 94.348 2;3 4.7475E-195 96602 QUIQUE_C1277_190116_001 255.91 228.58 3003700000 61035000 1447700000 163880000 112670000 200330000 87982000 94422000 56458000 108980000 70465000 265530000 78071000 256170000 12382 213 11613 108439;108440;108441;108442;108443;108444;108445;108446;108447;108448;108449;108450;108451;108452;108453;108454;108455;108456;108457;108458 137249;137250;137251;137252;137253;137254;137255;137256;137257;137258;137259;137260;137261;137262;137263;137264;137265;137266;137267;137268;137269;137270;137271;137272;137273;137274;137275;137276;137277;137278;137279 137251 30 EVQQGEEFER Unmodified 1249.5575 0.55749468 1791 Q5T9B7;P00568;H0YID2 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.303 27.303 2 1.6182E-07 21068 QUIQUE_DMIX8_190116_001 175.44 171.51 11297000000 1348400000 1146300000 684270000 1216500000 723980000 676920000 701440000 1157600000 764250000 653840000 914700000 590100000 719080000 12383 1791 11614 108459;108460;108461;108462;108463;108464;108465;108466;108467;108468;108469;108470;108471 137280;137281;137282;137283;137284;137285;137286;137287;137288;137289;137290;137291;137292;137293;137294;137295;137296;137297;137298;137299;137300;137301;137302 137302 23 EVQQGEEFERR Unmodified 1405.6586 0.65860571 1791 Q5T9B7;P00568;H0YID2 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 19.723 19.723 2;3 0.00022944 12745 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.95 102.41 8399900000 151810000 0 0 256390000 398310000 0 353730000 740940000 1207500000 0 2241000000 1204900000 1845400000 12384 1791 11615 108472;108473;108474;108475;108476;108477;108478;108479;108480;108481;108482;108483;108484 137303;137304;137305;137306;137307;137308;137309;137310;137311;137312;137313;137314;137315 137309 10 EVQQLLPEPVLGATEPLTSGQLLMK Unmodified 2690.4565 0.456454 321 A0A0U1RRL8;Q8TB22;H0Y9W3 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 1 1 1 155.04 155.04 3 0.00064684 159562 QUIQUE_C1277_190116_001 40.668 33.222 119050000 0 23694000 25447000 0 32250000 0 0 0 37657000 0 0 0 0 12385 321 11616 108485;108486;108487;108488 137316;137317;137318;137319 137316 4 EVQTGWEDLR Unmodified 1231.5833 0.5833155 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 71.991 71.991 2 0.0040375 72269 QUIQUE_C1218_190116_001 82.287 50.983 90122000 90122000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 1005.5495 0.54949617 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 48.808 48.808 2 0.015753 46108 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.244 19.467 259700000 0 114650000 0 0 0 0 0 0 0 35581000 109470000 0 0 12390 89 11621 108501;108502;108503 137332;137333;137334 137334 3 EVQYTLEMIK Unmodified 1252.6373 0.6373249 2525 P49354;E9PQP6;B3KVN2 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.054 89.054 2 0.0014059 91320 QUIQUE_C1368_190116_001 98.033 58.032 417330000 0 0 72002000 57662000 0 0 60073000 0 64827000 0 85853000 0 76916000 12391 2525 11622 108504;108505;108506;108507;108508;108509;108510;108511 137335;137336;137337;137338;137339;137340;137341;137342 137336 8 EVSAQWDQLK Unmodified 1202.5932 0.5931519 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 64.042 64.042 2 0.024519 64594 QUIQUE_C1438_190116_001 76.679 41.241 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12392 2021 11623 108512 137343 137343 1 EVSAYIK Unmodified 808.43307 0.43306943 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 0 1 1 1 27.116 27.116 2 0.039576 21614 QUIQUE_C1576_190116_001 83.614 33.308 819480000 0 0 0 0 0 0 269600000 0 0 0 257650000 292240000 0 12393 469 11624 108513;108514;108515 137344;137345;137346 137344 3 EVSDGIIAPGYEEEALTILSK Unmodified 2233.1366 0.13655965 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 154.71 154.71 2;3 8.5983E-08 159412 QUIQUE_DMIX8_190116_001 130.95 120.7 4003000000 300040000 325690000 492540000 343170000 346490000 224610000 208350000 304690000 398480000 158010000 339000000 275490000 286480000 12394 2339 11625 108516;108517;108518;108519;108520;108521;108522;108523;108524;108525;108526;108527;108528;108529;108530;108531;108532;108533;108534 137347;137348;137349;137350;137351;137352;137353;137354;137355;137356;137357;137358;137359;137360;137361;137362;137363;137364;137365;137366;137367;137368 137368 18 EVSEAVVDTLESEYLK Unmodified 1809.8884 0.88839045 2834 P98160;A0A3B3IT11 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 1 141.34 141.34 2 1.2583E-18 148067 QUIQUE_C1438_190116_001 165.58 137.41 183160000 0 0 0 0 99718000 0 0 83438000 0 0 0 0 0 12395 2834 11626 108535;108536 137369;137370 137369 2 EVSFDGNDLENMVLSLR Unmodified 1936.92 0.9200417 1268 J3KPF0;F8VWT9;Q9Y4D8 HECTD4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4 yes no 0 0 0 1 162.39 162.39 2 0.00061956 166493 QUIQUE_C1277_190116_001 73.466 60.039 9500200 0 9500200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12396 1268 11627 108537 137371;137372 137371 2 EVSFQSTGESEWK Unmodified 1512.6733 0.67325272 2906 Q07021;I3L3Q7;I3L3B0 C1QBP Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 3 1 1 2 2 70.36 70.36 2 1.5353E-23 71063 QUIQUE_C1218_190116_001 172.8 144.01 2065600000 169320000 160610000 195660000 138280000 150930000 183080000 185890000 88964000 219950000 84747000 159190000 112240000 216740000 12397 2906 11628 108538;108539;108540;108541;108542;108543;108544;108545;108546;108547;108548;108549;108550;108551;108552;108553;108554;108555;108556 137373;137374;137375;137376;137377;137378;137379;137380;137381;137382;137383;137384;137385;137386;137387;137388;137389;137390;137391;137392;137393;137394;137395;137396;137397;137398;137399;137400;137401;137402;137403;137404;137405;137406;137407;137408;137409;137410;137411;137412;137413;137414;137415;137416;137417;137418 137374 45 EVSPGAGTEVQDALER Unmodified 1656.7955 0.79549312 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 75.424 75.424 2 9.5688E-07 76109 QUIQUE_C1218_190116_001 111.94 87.082 60253000 60253000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12398 3402 11629 108557 137419 137419 1 EVSQPDWTPPPEVTLVLTK Unmodified 2135.115 0.11503634 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 139.79 139.79 2;3 0.00090359 145458 QUIQUE_C1218_190116_001 75.316 61.6 507850000 58927000 0 54930000 0 59093000 56164000 94461000 0 75043000 30749000 34405000 0 44077000 12399 2059 11630 108558;108559;108560;108561;108562;108563;108564;108565;108566;108567 137420;137421;137422;137423;137424;137425;137426;137427;137428;137429;137430;137431 137421 12 EVSSSFDHVIK Unmodified 1246.6194 0.61936665 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 40.816 40.816 2;3 0.0015261 37420 QUIQUE_C1277_190116_001 83.998 43.895 860940000 90068000 97143000 0 0 0 101230000 121630000 0 256980000 0 193880000 0 0 12400 4650 11631 108568;108569;108570;108571;108572;108573;108574 137432;137433;137434;137435;137436;137437;137438;137439 137434 8 EVSTNTAMIQTSK Unmodified 1408.6868 0.68679429 760;777 K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;CON__P13646-1 KRT13 Keratin, type I cytoskeletal 13 no no 0 0 0 1 1 36.035 36.035 2 0.00046344 31379 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.86 71.504 75471000 0 0 0 0 0 0 0 0 63625000 11846000 0 0 0 + 12401 760;777 11632 108575;108576 137440;137441 137440 1 EVSTNTAMIQTSK Oxidation (M) 1424.6817 0.68170891 760;777 K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;CON__P13646-1 KRT13 Keratin, type I cytoskeletal 13 no no 0 1 0 1 23.935 23.935 2 0.00053837 16952 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.813 69.087 16907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16907000 0 0 0 + 12402 760;777 11632 108577 137442 137442 448 1 EVSTYIK Unmodified 838.44363 0.44363412 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 25.408 25.408 2 0.045326 19266 QUIQUE_C1438_190116_001 78.616 15.901 15243000000 0 2092900000 3184900000 2474700000 2229400000 0 0 0 2244100000 0 3016500000 0 0 12403 2794 11633 108578;108579;108580;108581;108582;108583 137443;137444;137445;137446;137447;137448;137449 137446 7 EVTDEIVK Unmodified 931.48623 0.48622722 2213 P23381 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 33.259 33.259 2 0.0036031 27933 QUIQUE_C1368_190116_001 113.89 34.743 1775000000 176380000 224000000 559910000 294890000 230930000 0 0 131570000 157350000 0 0 0 0 12404 2213 11634 108584;108585;108586;108587;108588;108589;108590 137450;137451;137452;137453;137454;137455;137456;137457 137452 8 EVTDKEQEFAAR Unmodified 1421.6787 0.67867245 143;4559 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;J3QS55;J3KS70;J3QKY2;J3KRD1;J3QKK4;J3QR33;J3QRQ6;J3QLU5;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 24.61 24.61 2;3 3.5127E-09 18217 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.48 117.7 5034700000 236080000 367740000 368110000 214160000 370030000 424750000 340690000 524610000 436050000 114510000 463750000 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Unmodified 1130.5204 0.52038089 677 B8ZZQ6;P06454;B8ZZA1;B8ZZW7;H7C2N1 PTMA Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 20.354 20.354 2 2.7059E-11 13576 QUIQUE_C1218_190116_001 166.16 130.28 50774000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50774000 0 12426 677 11655 108869;108870;108871;108872 137824;137825;137826;137827 137824 3 EVVETPLLHPER Unmodified 1417.7565 0.75652884 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 55.155 55.155 2;3 9.4979E-06 53493 QUIQUE_C1403_190116_001 145.25 113.38 455910000 89278000 33816000 25583000 156680000 0 26670000 0 0 0 0 59497000 0 64391000 12427 2389 11656 108873;108874;108875;108876;108877;108878;108879;108880;108881;108882;108883;108884 137828;137829;137830;137831;137832;137833;137834;137835;137836;137837;137838;137839 137831 8 EVVFLDFNHFYGMQK Unmodified 1872.8869 0.88689108 3345 Q63HM9 PLCXD3 PI-PLC X domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 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108939;108940;108941;108942;108943;108944;108945 137899;137900;137901;137902;137903;137904;137905;137906 137901 5 EVVLEVK Unmodified 814.48002 0.48001963 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.146 37.146 2 0.019557 33839 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.04 15.242 1297500000 143890000 134610000 150540000 0 111860000 0 0 140400000 152960000 0 156600000 125240000 181450000 12435 2994 11664 108946;108947;108948;108949;108950;108951;108952;108953;108954 137907;137908;137909;137910;137911;137912;137913;137914;137915;137916 137912 10 EVVNAIIESGK Unmodified 1157.6292 0.62920306 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 57.958 57.958 2 0.00044625 57094 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.42 65.119 931860000 0 0 0 0 0 0 0 176550000 168200000 0 233690000 190530000 162890000 12436 4281 11665 108955;108956;108957;108958;108959 137917;137918;137919;137920;137921 137917 4 EVVQNFAK Unmodified 933.49198 0.4919813 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 27.235 27.235 1;2 3.4171E-05 21651 QUIQUE_DMIX3_190116_001 199.37 107.05 9898200000 1013500000 0 1223800000 0 0 924330000 1045300000 959570000 1225400000 561260000 1536700000 1071800000 336520000 12437 3040 11666 108960;108961;108962;108963;108964;108965;108966;108967;108968;108969;108970 137922;137923;137924;137925;137926;137927;137928;137929;137930;137931;137932;137933;137934;137935 137929 12 EVVSPQEFK Unmodified 1061.5393 0.53932542 1241 H9KV31;O15394 NCAM2 Neural cell adhesion molecule 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 43.693 43.693 2 0.0058507 40770 QUIQUE_C1277_190116_001 102 60.37 216270000 0 54592000 0 0 0 0 55289000 0 0 0 40407000 0 65981000 12438 1241 11667 108971;108972;108973;108974;108975;108976 137936;137937;137938;137939;137940;137941 137937 5 EVVTEHLINK Unmodified 1180.6452 0.64518747 3017 Q13618;H7C1L6;A0A087X1R9 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.451 32.451 2 1.7349E-05 27401 QUIQUE_C1277_190116_001 147.36 112.43 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137993 2 EVWFFGLQYQDTK Unmodified 1659.7933 0.79330827 2248 P26038;V9GZ54 MSN Moesin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 144.74 144.74 2;3 3.9495E-41 149868 QUIQUE_C1368_190116_001 189.72 174.52 1935100000 95774000 109870000 174600000 117060000 113350000 105500000 188570000 201660000 293440000 106680000 239740000 0 188800000 12446 2248 11675 109025;109026;109027;109028;109029;109030;109031;109032;109033;109034;109035;109036;109037;109038;109039;109040 137995;137996;137997;137998;137999;138000;138001;138002;138003;138004;138005;138006;138007;138008;138009;138010;138011;138012;138013;138014;138015;138016;138017;138018 137998 24 EVWFFGLQYVDSK Unmodified 1616.7875 0.78749461 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E9PNV3;E9PQ82 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 154.48 154.48 2 0.0019983 158245 QUIQUE_C1403_190116_001 95.477 72.791 235870000 0 0 0 68639000 0 0 0 0 0 0 0 167230000 0 12447 434 11676 109041;109042 138019;138020;138021 138019 3 EVWFGFHQSVR Unmodified 1390.6782 0.67821894 4482 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3-beta;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-alpha;Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.613 24.613 2 0.0043079 18407 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.296 52.595 1098900000 92300000 78703000 154890000 99265000 100710000 109520000 0 100590000 95269000 30705000 119900000 0 117070000 12455 6;3650;4349 11684 109095;109096;109097;109098;109099;109100;109101;109102;109103;109104;109105 138082;138083;138084;138085;138086;138087;138088;138089;138090;138091;138092;138093 138092 12 EVYELLDSPGK Unmodified 1248.6238 0.62378333 2195 P22234;E9PBS1 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.97 77.97 2 0.00011076 78684 QUIQUE_C1368_190116_001 131.5 111.72 2350000000 251300000 190020000 206840000 210260000 183190000 229600000 171400000 135900000 163950000 131420000 166480000 137240000 172440000 12456 2195 11685 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subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 1 47.818 47.818 2;3 0.0001484 44505 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.19 98.759 7269000000 761980000 950420000 249550000 262800000 985490000 262920000 323480000 183620000 738170000 215720000 1115200000 911550000 308140000 12463 2309 11692 109159;109160;109161;109162;109163;109164;109165;109166;109167;109168;109169;109170;109171;109172;109173;109174;109175;109176;109177 138162;138163;138164;138165;138166;138167;138168;138169;138170;138171;138172;138173;138174;138175;138176;138177;138178;138179;138180 138180 18 EWAMNVGDK Unmodified 1048.4648 0.46478027 2189 P21964;E7EMS6;E7EUU8;F8WBW9 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 55.589 55.589 2 0.048374 53992 QUIQUE_C1218_190116_001 51.193 39.782 37737000 37737000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12464 2189 11693 109178 138181 138181 1 EWAMNVGDKK Unmodified 1176.5597 0.55974328 2189 P21964;E7EMS6;E7EUU8;F8WBW9 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 1 1 1 1 32.342 32.342 3 0.017664 26661 QUIQUE_C1368_190116_001 38.402 30.845 107550000 0 0 44504000 0 0 0 0 0 49005000 14038000 0 0 0 12465 2189 11694 109179;109180;109181 138182;138183;138184 138182 3 EWAVVLADTAVTSGR Unmodified 1573.81 0.81002097 3712 Q8WW59 SPRYD4 SPRY domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 118.96 118.96 2 0.0037892 122686 QUIQUE_C1277_190116_001 79.492 34.124 32611000 0 12456000 0 0 0 20155000 0 0 0 0 0 0 0 12466 3712 11695 109182;109183 138185;138186 138185 2 EWCFKPCEIR Unmodified 1423.6377 0.63767603 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.522 72.522 2 0.0014457 72526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 133.57 102.5 1040200000 142110000 226050000 160010000 129360000 0 100480000 0 97755000 0 25076000 0 0 159350000 12467 4567 11696 109184;109185;109186;109187;109188;109189;109190;109191 138187;138188;138189;138190;138191;138192;138193;138194 138192 8 EWDENLKDDSLPSNPIDFSYR Unmodified 2539.1503 0.15031223 375 A0A1W2PPJ5;Q96SW2;J3QT87 CRBN Protein cereblon yes no 0 0 1 1 1 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109202;109203;109204;109205;109206;109207;109208;109209;109210;109211;109212;109213 138206;138207;138208;138209;138210;138211;138212;138213;138214;138215;138216;138217;138218 138213 10 EWEVVSVAEYHR Unmodified 1502.7154 0.7153923 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.399 83.399 2 4.2144E-06 84841 QUIQUE_C1277_190116_001 148.32 123.53 295660000 30887000 34685000 0 0 39398000 22399000 0 28677000 39286000 0 59442000 40890000 0 12471 3597 11700 109214;109215;109216;109217;109218;109219;109220;109221;109222 138219;138220;138221;138222;138223;138224;138225;138226;138227;138228 138220 10 EWFFLLSK Unmodified 1068.5644 0.56441796 361 K7ERN1;A0A1B0GVY1;Q96PU5 NEDD4L E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like yes no 0 0 0 1 1 1 144.66 144.66 2 0.031416 148943 QUIQUE_C1277_190116_001 66.073 0 33074000 9516400 12127000 11431000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12472 361 11701 109223;109224;109225 138229;138230;138231 138230 3 EWFLQAAK Unmodified 991.51272 0.51271674 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;A0A0J9YXP8;A0A0J9YYH3;A0A2R8Y6C7;A0A0J9YX90;K7ERC6 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.885 83.885 2 0.0036046 86992 QUIQUE_C1218_190116_001 114.02 25.289 11944000000 1444500000 1292000000 802570000 865230000 954060000 597640000 972340000 648030000 741490000 380970000 1195200000 1163100000 886520000 12473 199 11702 109226;109227;109228;109229;109230;109231;109232;109233;109234;109235;109236;109237;109238 138232;138233;138234;138235;138236;138237;138238;138239;138240;138241;138242;138243;138244;138245;138246;138247;138248;138249;138250;138251;138252;138253;138254;138255;138256;138257;138258;138259;138260;138261;138262;138263 138233 32 EWFWDLATGTMK Unmodified 1483.6806 0.6805867 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.77 153.77 2 7.8699E-06 159394 QUIQUE_C1218_190116_001 132.88 123.69 413480000 63889000 54053000 15120000 23712000 64749000 42279000 35055000 0 20629000 15213000 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1438.718 0.71797526 2307 P30086 PEBP1 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide yes yes 0 0 0 3 2 2 3 2 1 3 2 1 3 3 2 3 67.05 67.05 2;3;4 3.0897E-62 67482 QUIQUE_DMIX1_190116_001 231.2 206.43 15381000000 62692000 3351600000 1042500000 58080000 570450000 53431000 2642300000 26851000 47503000 1352500000 2827800000 1617600000 1728000000 12479 2307 11706 109281;109282;109283;109284;109285;109286;109287;109288;109289;109290;109291;109292;109293;109294;109295;109296;109297;109298;109299;109300;109301;109302;109303;109304;109305;109306;109307;109308;109309;109310 138319;138320;138321;138322;138323;138324;138325;138326;138327;138328;138329;138330;138331;138332;138333;138334;138335;138336;138337;138338;138339;138340;138341;138342;138343;138344;138345;138346;138347;138348;138349;138350;138351;138352;138353;138354;138355;138356 138340 37 EWIECAHGIGYTR Unmodified 1590.7249 0.72491113 1559 O43920 NDUFS5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 2 2 1 66.472 66.472 2;3 9.1135E-18 66206 QUIQUE_C1277_190116_001 183.33 148.96 1482800000 146420000 175940000 161900000 102540000 55865000 81860000 89773000 87160000 142510000 42289000 168640000 147040000 80877000 12480 1559 11707 109311;109312;109313;109314;109315;109316;109317;109318;109319;109320;109321;109322;109323;109324;109325;109326;109327;109328;109329;109330;109331 138357;138358;138359;138360;138361;138362;138363;138364;138365;138366;138367;138368;138369;138370;138371;138372;138373;138374;138375;138376;138377;138378;138379;138380;138381 138360 24 EWIEGVTGR Unmodified 1045.5193 0.51925868 2599 P51911;K7ERM8 CNN1 Calponin-1 yes no 0 0 0 1 1 66.377 66.377 2 0.047822 66598 QUIQUE_C1576_190116_001 51.346 34.57 44236000 0 0 0 0 0 0 44236000 0 0 0 0 0 0 12481 2599 11708 109332;109333 138382;138383 138383 2 EWIPRPPEK Unmodified 1150.6135 0.61349341 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 44.07 44.07 3 0.0056341 41140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.568 52.798 1518100000 135040000 113880000 155010000 91579000 128860000 0 0 217450000 105010000 63935000 156130000 144230000 206930000 12482 2460 11709 109334;109335;109336;109337;109338;109339;109340;109341;109342;109343;109344;109345;109346 138384;138385;138386;138387;138388;138389;138390;138391;138392;138393;138394;138395;138396;138397;138398;138399;138400;138401;138402;138403;138404;138405;138406;138407;138408 138396 25 EWLDKIEK Unmodified 1059.5601 0.56006086 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 2 2 52.648 52.648 2;3 0.010224 51349 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.02 38.892 4299700000 172030000 432120000 376940000 381350000 523930000 0 115640000 368560000 684130000 0 162260000 677480000 405220000 12483 2851 11710 109347;109348;109349;109350;109351;109352;109353;109354;109355;109356;109357;109358;109359;109360;109361;109362 138409;138410;138411;138412;138413;138414;138415;138416;138417;138418;138419;138420;138421;138422;138423;138424;138425;138426 138418 11 EWLEGEDLSEELKK Unmodified 1703.8254 0.82539626 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 93.294 93.294 2;3 0.00039449 95538 QUIQUE_C1277_190116_001 57.414 41.869 270670000 40892000 70728000 55420000 0 35819000 36430000 0 0 0 0 0 31378000 0 12484 3037 11711 109363;109364;109365;109366;109367;109368;109369;109370;109371 138427;138428;138429;138430;138431;138432;138433;138434;138435;138436;138437 138430 11 EWLEVLEDTKR Unmodified 1416.7249 0.72489436 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.264 96.264 3 0.00015485 100106 QUIQUE_C1218_190116_001 87.363 64.643 348170000 28738000 24724000 29331000 24536000 27299000 21770000 28374000 20064000 20306000 12370000 43344000 34477000 32832000 12485 3555 11712 109372;109373;109374;109375;109376;109377;109378;109379;109380;109381;109382;109383;109384 138438;138439;138440;138441;138442;138443;138444;138445;138446;138447;138448;138449;138450;138451;138452;138453;138454;138455 138440 18 EWLQAGHPFQQR Unmodified 1495.732 0.73204542 3925 Q96QG7 MTMR9 Myotubularin-related protein 9 yes yes 0 0 0 1 1 59.48 59.48 2;3 0.003993 57773 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.564 31.583 24946000 0 0 0 0 0 0 0 24946000 0 0 0 0 0 12486 3925 11713 109385;109386 138456;138457 138457 2 EWNDSTSVQNPTR Unmodified 1532.6855 0.68554874 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YDI8 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.406 43.406 2 8.8549E-06 40156 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.47 107.21 386490000 0 0 48473000 49132000 47736000 0 0 58007000 36721000 40129000 67589000 0 38700000 12487 4598 11714 109387;109388;109389;109390;109391;109392;109393;109394;109395 138458;138459;138460;138461;138462;138463;138464;138465;138466;138467;138468 138468 10 EWNVICITDVVYNHTAANSK Unmodified 2333.111 0.11103037 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 132.16 132.16 3 0.010387 138666 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.797 29.606 85763000 0 0 0 0 0 0 0 34687000 0 0 51076000 0 0 12488 2377 11715 109396;109397 138469;138470 138470 2 EWPQTHQASISYTGPTERPPNEPEETPVQRPSLYR Unmodified 4076.9617 0.9616706 3254 Q53H12;A0A3B3ISZ0;E9PC15;A0A3B3ITD0;A0A3B3ISY9;A0A0G2JLG5 AGK Acylglycerol kinase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 82.397 82.397 5 0.024653 82596 QUIQUE_DMIX1_190116_001 20.745 15.018 52158000 0 0 0 0 0 0 0 52158000 0 0 0 0 0 12489 3254 11716 109398 138471 138471 1 EWQELDDAEK Unmodified 1261.5463 0.54626129 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.984 57.984 2 0.0053847 56909 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.662 56.156 692500000 67860000 0 73554000 45276000 85879000 0 93992000 68534000 63602000 24694000 103320000 65792000 0 12490 2976 11717 109399;109400;109401;109402;109403;109404;109405;109406;109407;109408 138472;138473;138474;138475;138476;138477;138478;138479;138480;138481 138480 7 EWQHEEFYR Unmodified 1322.568 0.56799978 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 47.646 47.646 2 0.038939 45400 QUIQUE_C1218_190116_001 68.383 43.564 25327000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25327000 0 12491 2952 11718 109409;109410;109411 138482;138483;138484 138482 3 EWSGLLEELAR Unmodified 1301.6616 0.66156582 2861 Q01813;Q5VSR5;V9GYV7 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.5 137.5 2 2.7642E-12 141593 QUIQUE_C1403_190116_001 160.59 105.86 2605400000 229950000 255750000 251130000 273960000 0 254540000 246820000 203170000 206800000 118370000 0 296350000 268600000 12492 2861 11719 109412;109413;109414;109415;109416;109417;109418;109419;109420;109421;109422;109423;109424 138485;138486;138487;138488;138489;138490;138491;138492;138493;138494;138495;138496;138497;138498;138499;138500;138501 138490 17 EWSLESSPAQNWTPPQPR Unmodified 2108.9916 0.99156716 3610 Q8N6T3;F8VWH9;F8W1U7;E5RHT6;E5RHC5 ARFGAP1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.05 115.05 2 2.1625E-25 118431 QUIQUE_C1277_190116_001 180.09 159.14 127140000 32315000 0 0 0 42391000 0 0 52440000 0 0 0 0 0 12493 3610 11720 109425;109426;109427;109428;109429;109430;109431;109432;109433;109434 138502;138503;138504;138505;138506;138507;138508;138509;138510;138511 138503 10 EWSQHINGASHSR Unmodified 1507.6916 0.69163717 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991;H0Y8T4 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 2 1 2 3 3 2 14.892 14.892 2;3;4 2.5888E-23 7180 QUIQUE_DMIX5_190116_001 169.65 154.64 1927000000 139570000 202920000 158830000 167320000 173100000 156470000 93501000 78463000 239970000 0 373240000 143610000 0 12494 307 11721 109435;109436;109437;109438;109439;109440;109441;109442;109443;109444;109445;109446;109447;109448;109449;109450;109451;109452;109453;109454;109455;109456;109457;109458;109459;109460;109461 138512;138513;138514;138515;138516;138517;138518;138519;138520;138521;138522;138523;138524;138525;138526;138527;138528;138529;138530;138531;138532;138533;138534;138535;138536;138537;138538;138539;138540 138537 25 EWTDGLFTHVLR Unmodified 1472.7412 0.74121312 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 3 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 117.4 117.4 2;3 2.2187E-05 121553 QUIQUE_C1368_190116_001 120.77 115.06 2006800000 24547000 165450000 147880000 140100000 77957000 152320000 108400000 162300000 178440000 66894000 357700000 172070000 252750000 12495 3053 11722 109462;109463;109464;109465;109466;109467;109468;109469;109470;109471;109472;109473;109474;109475;109476;109477;109478;109479;109480 138541;138542;138543;138544;138545;138546;138547;138548;138549;138550;138551;138552;138553;138554;138555;138556;138557;138558;138559;138560;138561;138562;138563;138564;138565;138566;138567;138568 138547 21 EWTNEVFSLATNLLAQNMSR Unmodified 2323.1267 0.12668044 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7;A0A0D9SFJ4 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 1 2 172.48 172.48 2;3 3.7025E-18 175861 QUIQUE_C1277_190116_001 123.63 116.64 612600000 0 70637000 58591000 15079000 24170000 0 82550000 55447000 36153000 0 101790000 91799000 76388000 12496 4250 11723 109481;109482;109483;109484;109485;109486;109487;109488;109489;109490;109491;109492;109493;109494 138569;138570;138571;138572;138573;138574;138575;138576;138577;138578;138579;138580;138581;138582;138583 138569 15 EWTNEVFSLATNLLAQNMSR Oxidation (M) 2339.1216 0.12159506 4250 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138636 3 EYADSFGK Unmodified 915.39741 0.39741221 3953 Q99447;I3L1R7;I3L1L9;I3L3V9 PCYT2 Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 30.672 30.672 2 0.045132 25266 QUIQUE_C1277_190116_001 57.281 36.016 113870000 0 54979000 0 0 0 0 58893000 0 0 0 0 0 0 12504 3953 11730 109544;109545 138638;138639 138638 2 EYAEDDNIYQQK Unmodified 1514.6525 0.65251728 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.718 44.718 2 0.00046239 41282 QUIQUE_DMIX8_190116_001 133.13 114.87 2620700000 318230000 240680000 254660000 189780000 0 213620000 304260000 269240000 167540000 104930000 271730000 0 286040000 12505 1282 11731 109546;109547;109548;109549;109550;109551;109552;109553;109554;109555;109556 138640;138641;138642;138643;138644;138645;138646;138647;138648;138649;138650;138651 138651 11 EYAENIGDGR Unmodified 1122.4942 0.49416614 35 A0A087WUB9;Q8WYA6 CTNNBL1 Beta-catenin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 29.53 29.53 2 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138702;138703;138704;138705;138706;138707;138708;138709;138710;138711;138712;138713;138714;138715;138716 138703 15 EYCISSDDLFSLPYCPGK Unmodified 2149.9336 0.93364286 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 142.09 142.09 2 4.9151E-05 144540 QUIQUE_C1563_190116_001 94.122 84.464 57253000 30288000 0 0 0 0 26966000 0 0 0 0 0 0 0 12513 22 11739 109597;109598;109599;109600 138717;138718;138719;138720 138719 4 EYCPMVFR Oxidation (M) 1116.4732 0.47323646 2806;2505 P78356;A0A087WT35;P48426 PIP4K2B;PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta;Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha no no 0 1 0 1 52.306 52.306 2 0.069594 51052 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.554 46.324 44203000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44203000 0 0 12514 2806;2505 11740 109601 138721 138721 1 EYCPQVFR Unmodified 1097.4964 0.49641475 3668 Q8TBX8;F8VNT5;F8VU68 PIP4K2C Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma 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Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 0 1 118.84 118.84 2 2.1241E-06 122264 QUIQUE_C1403_190116_001 111.64 74.05 16117000 0 0 0 16117000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12517 1635 11743 109626 138747 138747 1 EYDNLPEAFPITLEWGGR Unmodified 2106.0058 0.0058202445 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 158.05 158.05 2 0.0012458 162971 QUIQUE_C1218_190116_001 66.004 60.502 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12518 3891 11744 109627 138748 138748 1 EYDPVEAR Unmodified 977.44543 0.44542503 3145;1349 K7ERD8;K7EL66;Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.036 29.036 2 0.018737 23605 QUIQUE_C1438_190116_001 79.469 49.283 2023200000 315000000 284860000 313390000 261220000 224680000 290050000 0 67141000 135330000 131510000 0 0 0 12519 1349;3145 11745 109628;109629;109630;109631;109632;109633;109634;109635;109636 138749;138750;138751;138752;138753;138754;138755;138756;138757;138758 138754 10 EYDQALADLKK Unmodified 1292.6612 0.66123147 2926 Q08752;H0Y8J0 PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D yes no 0 0 1 1 48.428 48.428 3 0.02846 45796 QUIQUE_C1403_190116_001 29.303 20.558 40320000 0 0 0 40320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12520 2926 11746 109637 138759 138759 1 EYEAEGIAK Unmodified 1008.4764 0.47639081 4223 Q9HCC0;D6RD67 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 25.886 25.886 2 0.017149 19740 QUIQUE_C1218_190116_001 65.246 38.45 86738000 86738000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12521 4223 11747 109638 138760 138760 1 EYEATLEECCAK Unmodified 1501.6065 0.60649506 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 45.211 45.211 2 5.7164E-05 39734 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.48 118.2 60786000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60786000 0 0 0 + 12522 770 11748 109639;109640 138761;138762;138763 138762 3 EYEEEFFQNSK Unmodified 1448.6096 0.60958983 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.957 74.957 2 2.8161E-08 75146 QUIQUE_C1368_190116_001 154.35 142.72 583170000 86678000 74293000 75553000 47785000 60142000 74996000 94370000 0 34203000 35154000 0 0 0 12523 831;1569 11749 109641;109642;109643;109644;109645;109646;109647;109648;109649 138764;138765;138766;138767;138768;138769;138770;138771;138772 138766 9 EYEIPSNLTPADVFFR Unmodified 1896.9258 0.92577901 3699 Q8WUM0 NUP133 Nuclear pore complex protein Nup133 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 150.02 150.02 2 0.0009369 155674 QUIQUE_C1218_190116_001 80.979 66.821 115750000 41521000 33259000 0 0 0 0 0 40974000 0 0 0 0 0 12524 3699 11750 109650;109651;109652;109653 138773;138774;138775;138776 138773 3 EYELESLFEHYCYSR Unmodified 2023.8622 0.86219247 2049 P12955;K7ES25;V9GY89 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 134.2 134.2 2 7.3252E-66 138116 QUIQUE_C1403_190116_001 210.91 197.25 550450000 41584000 52214000 66258000 56502000 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138833;138834;138835;138836;138837;138838;138839;138840;138841 138834 8 EYFGEFGEIEAIELPMDPK Oxidation (M) 2229.0188 0.018752696 805 D6R9P3;D6RD18;D6RBZ0;Q99729 HNRNPAB Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B yes no 0 1 0 1 150.06 150.06 2 0.00016054 154962 QUIQUE_C1218_190116_001 81.904 76.75 42208000 42208000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12532 805 11757 109711 138842 138842 484 1 EYFGEFGEIEAIELPMDPK Unmodified 2213.0238 0.023838074 805 D6R9P3;D6RD18;D6RBZ0;Q99729 HNRNPAB Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B yes no 0 0 0 2 1 1 1 158.91 158.91 2;3 0.0001182 163339 QUIQUE_C1277_190116_001 83.877 74.827 107490000 0 67016000 0 0 0 0 0 40478000 0 0 0 0 0 12533 805 11757 109712;109713;109714;109715;109716 138843;138844;138845;138846;138847;138848 138845 5 EYFGGFGEVESIELPMDNK Oxidation (M) 2175.9671 0.96705148 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96;D6RAF8 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 137.66 137.66 2 1.6704E-11 142294 QUIQUE_DMIX8_190116_001 119.88 114.9 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109925 139133 139133 1 EYIPTVFDNYSAQSAVDGR Unmodified 2130.9858 0.98581308 2830 P84095 RHOG Rho-related GTP-binding protein RhoG yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 119.87 119.87 2;3 2.0801E-63 123974 QUIQUE_DMIX3_190116_001 179.65 163.71 1000700000 62278000 83246000 147950000 107360000 73627000 107660000 83879000 67234000 88312000 30814000 0 62054000 86239000 12554 2830 11776 109926;109927;109928;109929;109930;109931;109932;109933;109934;109935;109936;109937;109938;109939;109940 139134;139135;139136;139137;139138;139139;139140;139141;139142;139143;139144;139145;139146;139147;139148;139149 139145 15 EYKPLIIYNAIDSLTR Unmodified 1908.0357 0.03566381 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 136.13 136.13 2;3 1.7515E-09 142119 QUIQUE_C1218_190116_001 132.97 113.87 1852200000 139710000 170970000 225100000 263930000 152670000 114790000 226970000 38581000 179320000 0 241070000 99058000 0 12555 2142 11777 109941;109942;109943;109944;109945;109946;109947;109948;109949;109950;109951;109952;109953;109954;109955;109956;109957;109958;109959;109960 139150;139151;139152;139153;139154;139155;139156;139157;139158;139159;139160;139161;139162;139163;139164;139165;139166;139167;139168;139169;139170 139151 20 EYKVEILNPPREGK Unmodified 1670.8992 0.89917033 3709 Q8WVY7 UBLCP1 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 13.21 13.21 4 0.0032893 5287 QUIQUE_C1438_190116_001 42.388 21.655 693480000 0 0 0 0 245170000 0 37375000 0 39926000 0 90752000 118850000 161410000 12556 3709 11778 109961;109962;109963;109964;109965;109966 139171;139172;139173;139174;139175;139176 139171 6 EYLDNVQLGHILER Unmodified 1697.8737 0.87368386 2278 P28288 ABCD3 ATP-binding cassette sub-family D member 3 yes yes 0 0 0 1 104.36 104.36 3 0.013957 109654 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.568 38.196 35240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35240000 0 0 12557 2278 11779 109967 139177 139177 1 EYLLGSTAEEK Unmodified 1238.603 0.60304789 1523 O43324;D6RBD7;C9J1V9;H0YAL7;D6RCQ0 EEF1E1;EEF1E1-BLOC1S5 Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 50.915 50.915 2 0.00017468 48117 QUIQUE_C1368_190116_001 126.31 108.8 484340000 76416000 80224000 78149000 0 69067000 0 0 0 0 27398000 82455000 70631000 0 12558 1523 11780 109968;109969;109970;109971;109972;109973;109974;109975 139178;139179;139180;139181;139182;139183;139184;139185 139180 7 EYLLQYNDPNR Unmodified 1423.6732 0.67319314 1709 O95168;F2Z3P9;C9JXQ9 NDUFB4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.573 73.573 2 0.00028242 70456 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.48 112.39 292420000 52309000 47793000 0 24750000 32757000 44293000 0 0 0 22287000 68234000 0 0 12559 1709 11781 109976;109977;109978;109979;109980;109981;109982;109983;109984;109985;109986 139186;139187;139188;139189;139190;139191;139192;139193;139194;139195;139196;139197;139198 139196 12 EYLLQYNDPNRR Unmodified 1579.7743 0.77430417 1709 O95168;F2Z3P9;C9JXQ9 NDUFB4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 2 2 54.641 54.641 2;3 1.4847E-05 52952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.37 95.99 1755100000 144200000 175620000 196090000 68429000 109580000 63761000 177850000 139410000 156000000 29057000 145680000 185360000 164090000 12560 1709 11782 109987;109988;109989;109990;109991;109992;109993;109994;109995;109996;109997;109998;109999;110000;110001;110002;110003;110004;110005;110006;110007;110008 139199;139200;139201;139202;139203;139204;139205;139206;139207;139208;139209;139210;139211;139212;139213;139214;139215;139216;139217;139218;139219;139220;139221 139212 22 EYLLSGDISEAEHCLK Unmodified 1862.872 0.87202888 3247 Q53EL6 PDCD4 Programmed cell death protein 4 yes yes 0 0 0 1 103.59 103.59 3 0.050871 107474 QUIQUE_C1576_190116_001 23.53 20.274 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12561 3247 11783 110009 139222 139222 1 EYLPFLNTLK Unmodified 1236.6754 0.67542497 1707 O95163;F5H2T0 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 126.88 126.88 2 0.018671 130760 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.828 42.046 98920000 0 19651000 0 17746000 0 0 0 0 0 0 0 32350000 29172000 12562 1707 11784 110010;110011;110012;110013 139223;139224;139225;139226 139225 4 EYLPIGGLAEFCK Unmodified 1495.7381 0.73810158 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.86 126.86 2 0.00037505 132864 QUIQUE_C1218_190116_001 94.363 80.244 4271500000 597440000 472130000 478840000 392370000 331830000 433530000 343560000 111100000 158060000 212160000 247130000 213760000 279610000 12563 1788 11785 110014;110015;110016;110017;110018;110019;110020;110021;110022;110023;110024;110025;110026 139227;139228;139229;139230;139231;139232;139233;139234;139235;139236;139237;139238;139239;139240;139241;139242;139243;139244;139245;139246;139247;139248;139249;139250;139251 139228 24 EYLQTHWEEEECQQDVSLLR Unmodified 2591.1598 0.15983106 4440 Q9UHY7 ENOPH1 Enolase-phosphatase E1 yes yes 0 0 0 3 2 2 2 2 2 3 1 1 1 106.72 106.72 2;3 2.3451E-87 109644 QUIQUE_C1277_190116_001 246.18 234.71 2661500000 370110000 331410000 296100000 248250000 251660000 375260000 399220000 0 123400000 92540000 0 0 173580000 12564 4440 11786 110027;110028;110029;110030;110031;110032;110033;110034;110035;110036;110037;110038;110039;110040;110041;110042;110043;110044;110045 139252;139253;139254;139255;139256;139257;139258;139259;139260;139261;139262;139263;139264;139265;139266;139267;139268;139269;139270;139271;139272;139273;139274;139275;139276 139256 25 EYLSADAFK Unmodified 1042.4971 0.49712625 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 68.518 68.518 2 0.033312 68140 QUIQUE_C1403_190116_001 55.37 34.916 49074000 0 0 0 49074000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12565 4336 11787 110046 139277 139277 1 EYLTSHLEIR Unmodified 1259.651 0.65100113 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 59.628 59.628 2;3 0.0073141 58695 QUIQUE_C1403_190116_001 70.977 55.087 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12566 4551 11788 110047;110048;110049;110050;110051;110052;110053 139278;139279;139280;139281;139282;139283;139284 139280 7 EYLVSLINAHSLDPATLYEVEELETATER Unmodified 3304.6351 0.63508288 210 A0A0B4J293;H0YKX0;Q96EP0;H0YKI4 RNF31 E3 ubiquitin-protein ligase RNF31 yes no 0 0 0 1 163.58 163.58 3 7.9464E-05 165832 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.125 42.71 18422000 0 0 0 0 0 0 0 18422000 0 0 0 0 0 12567 210 11789 110054 139285 139285 1 EYNALVAQGVR Unmodified 1218.6357 0.63568542 966 E9PNP3;Q9H7C9;E9PIQ4;E9PR47 AAMDC Mth938 domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 53.636 53.636 2 0.00045233 51404 QUIQUE_C1277_190116_001 122.52 101.61 157870000 0 37156000 0 39177000 0 0 61984000 0 0 19551000 0 0 0 12568 966 11790 110055;110056;110057;110058;110059 139286;139287;139288;139289;139290 139286 5 EYNEFAEVFLK Unmodified 1387.666 0.66598249 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.75 128.75 2 0.00036306 134296 QUIQUE_C1218_190116_001 117.53 97.529 756930000 58618000 66359000 72122000 61911000 78614000 56000000 74788000 0 71930000 41367000 89176000 86044000 0 12569 1727 11791 110060;110061;110062;110063;110064;110065;110066;110067;110068;110069;110070;110071 139291;139292;139293;139294;139295;139296;139297;139298;139299;139300;139301;139302;139303;139304;139305;139306;139307;139308;139309 139292 19 EYNIGVLR Unmodified 962.51853 0.5185304 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 65.106 65.106 2 0.041878 65745 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.462 41.644 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12570 1414;3777 11792 110072 139310 139310 1 EYNLEQQR Unmodified 1078.5043 0.5043369 3471 Q7Z6Z7;H0Y659;A0A087X146 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes no 0 0 0 1 1 1 27.029 27.029 2 0.012204 20875 QUIQUE_C1563_190116_001 88.942 70.564 54366000 0 0 0 26116000 0 28249000 0 0 0 0 0 0 0 12571 3471 11793 110073;110074;110075 139311;139312;139313 139312 3 EYNNLLALGTER Unmodified 1391.7045 0.70449327 1078 G3V200;O75334;H0YHK3 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 93.72 93.72 2 0.002818 95953 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.885 59.587 194400000 0 0 0 0 0 0 0 34790000 32046000 0 51080000 39176000 37309000 12572 1078 11794 110076;110077;110078;110079;110080;110081 139314;139315;139316;139317;139318;139319 139318 6 EYPDFNFVGR Unmodified 1242.5669 0.56693715 3920 Q96PU8;F5GXS8;F5GYM3;F5H5U6;F5H8C8 QKI Protein quaking yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.75 103.75 2 0.00036236 106502 QUIQUE_C1277_190116_001 113.41 105.84 1487800000 120350000 131930000 156070000 145100000 105990000 148280000 119680000 84986000 126140000 50156000 101000000 99341000 98810000 12573 3920 11795 110082;110083;110084;110085;110086;110087;110088;110089;110090;110091;110092;110093;110094 139320;139321;139322;139323;139324;139325;139326;139327;139328;139329;139330;139331;139332;139333;139334;139335;139336;139337;139338;139339;139340;139341 139322 22 EYPFILDAFQR Unmodified 1397.698 0.69795133 2446 P42285 SKIV2L2 Superkiller viralicidic activity 2-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.05 143.05 2 0.014356 148199 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.347 45.56 12781000 0 0 0 0 12781000 0 0 0 0 0 0 0 0 12574 2446 11796 110095;110096;110097;110098;110099;110100;110101;110102;110103 139342;139343;139344;139345;139346;139347;139348;139349;139350 139347 9 EYQAGDFEAAER Unmodified 1384.5895 0.58952309 1497 O15294;C9JZL3 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.412 53.412 2 8.195E-05 51004 QUIQUE_C1403_190116_001 108.47 86.384 353480000 46765000 38062000 47940000 0 0 34009000 36568000 26988000 0 13884000 30634000 33821000 44810000 12575 1497 11797 110104;110105;110106;110107;110108;110109;110110;110111;110112;110113;110114;110115 139351;139352;139353;139354;139355;139356;139357;139358;139359;139360;139361;139362;139363;139364;139365 139354 15 EYQDAFLFNELK Unmodified 1515.7246 0.72456001 4536 Q9Y230 RUVBL2 RuvB-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 128.14 128.14 2 0.00051615 132148 QUIQUE_C1403_190116_001 94.409 63.335 344290000 0 66295000 53778000 53234000 54176000 52086000 64715000 0 0 0 0 0 0 12576 4536 11798 110116;110117;110118;110119;110120;110121 139366;139367;139368;139369;139370;139371;139372 139369 7 EYQDAFLFNELKGETMDTS Unmodified 2236.9834 0.98342982 4536 Q9Y230 RUVBL2 RuvB-like 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 143.25 143.25 2 1.0326E-06 146331 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.37 87.767 181490000 0 0 0 0 23042000 0 0 46045000 33428000 0 0 32087000 46893000 12577 4536 11799 110122;110123;110124;110125;110126 139373;139374;139375;139376;139377 139374 5 EYQDLLNVK Unmodified 1120.5764 0.57643921 1952;869;1916;3176;2033 P08670;B0YJC4;B0YJC5;P07196;P12036;E7ESP9;P07197;E7EMV2;Q16352 VIM;NEFL;NEFH;NEFM;INA Vimentin;Neurofilament light polypeptide;Neurofilament heavy polypeptide;Neurofilament medium polypeptide;Alpha-internexin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 74.975 74.975 1;2 1.3526E-05 76775 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.76 138.2 87023000000 5786600000 5948200000 6672300000 7380200000 6925100000 6431100000 8688400000 5476000000 6233100000 4666300000 9375400000 5639100000 7800900000 12578 1952;1916;2033;869;3176 11800 110127;110128;110129;110130;110131;110132;110133;110134;110135;110136;110137;110138;110139;110140 139378;139379;139380;139381;139382;139383;139384;139385;139386;139387;139388;139389;139390;139391;139392;139393;139394;139395;139396;139397;139398;139399;139400;139401;139402;139403;139404;139405;139406;139407;139408;139409;139410;139411;139412;139413;139414;139415;139416;139417;139418;139419;139420;139421;139422;139423;139424;139425 139417 47 EYQELLNVK Unmodified 1134.5921 0.59208927 2435 P41219;H7C5W5 PRPH Peripherin yes no 0 0 0 1 1 1 1 68.041 68.041 2 0.0058804 68440 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.997 64.189 298420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 109490000 115000000 0 73932000 12579 2435 11801 110141;110142;110143;110144 139426;139427;139428;139429 139428 3 EYQELMNTK Unmodified 1154.5278 0.52777445 778;792 CON__P13647;P13647;H0YI76;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 no no 0 0 0 1 42.009 42.009 2 0.0061041 36404 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.161 56.738 38005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38005000 0 0 0 + 12580 778;792 11802 110145 139430 139430 1 EYQISAGDFPEVK Unmodified 1481.7038 0.70382456 4138 Q9H223 EHD4 EH domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 94.838 94.838 2 0.016168 92008 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.542 48.052 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12581 4138 11803 110146;110147 139431;139432 139432 2 EYQLNDSAAYYLNDLDR Unmodified 2061.928 0.92796385 2779 P63096;A0A3B3ITM0 GNAI1 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 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EYQLNDSASYYLNDLDR Unmodified 2077.9229 0.92287848 1953 P08754 GNAI3 Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.75 125.75 2 2.4133E-22 130922 QUIQUE_C1218_190116_001 167.14 144.95 1166800000 89868000 83351000 127770000 76917000 93834000 70775000 102730000 71179000 122110000 45538000 89909000 91157000 101700000 12585 1953 11807 110207;110208;110209;110210;110211;110212;110213;110214;110215;110216;110217;110218;110219 139501;139502;139503;139504;139505;139506;139507;139508;139509;139510;139511;139512;139513;139514;139515;139516;139517;139518;139519;139520;139521 139501 21 EYQLSDSAK Unmodified 1039.4822 0.48220447 2294;1758 P29992;O95837 GNA11;GNA14 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-14 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.194 25.194 2 0.0084418 19026 QUIQUE_C1218_190116_001 78.77 39.228 971140000 119460000 117210000 0 119050000 0 101930000 139330000 0 148390000 51237000 0 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12 EYQVETIVDTLCTNMLSDK Unmodified 2258.0446 0.044649871 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 157.74 157.74 2;3 0.00042086 161630 QUIQUE_C1277_190116_001 60.564 51.633 36388000 17105000 19283000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12592 3499 11814 110292;110293;110294 139624;139625;139626 139625 3 EYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLR Unmodified 2784.331 0.33099549 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 1 1 148.99 148.99 3 0.015247 155694 QUIQUE_C1438_190116_001 32.896 15.394 156230000 0 0 0 0 156230000 0 0 0 0 0 0 0 0 12593 3499 11815 110295 139627 139627 1 EYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLR Oxidation (M) 2800.3259 0.32591011 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 1 1 1 1 127.01 127.01 3 3.4219E-05 133449 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.964 51.299 86113000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49520000 36593000 0 12594 3499 11815 110296;110297 139628;139629 139628 2676 1 EYQWIGLNDR Unmodified 1292.6149 0.61494998 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.338 92.338 2 7.6808E-19 94184 QUIQUE_C1403_190116_001 186.25 165.92 12646000000 1116200000 996680000 1109000000 856290000 878390000 742480000 1389300000 856360000 1069800000 470470000 1033000000 1069600000 1058200000 12595 3862 11816 110298;110299;110300;110301;110302;110303;110304;110305;110306;110307;110308;110309;110310 139630;139631;139632;139633;139634;139635;139636;139637;139638;139639;139640;139641;139642;139643;139644;139645;139646;139647;139648;139649;139650;139651;139652;139653;139654;139655;139656 139636 27 EYRPCDPQLVSER Unmodified 1647.7675 0.76750423 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 43.246 43.246 3 0.0021882 40142 QUIQUE_C1438_190116_001 71.879 59.519 265760000 54114000 0 0 50765000 93250000 0 67627000 0 0 0 0 0 0 12596 1472 11817 110311;110312;110313;110314 139657;139658;139659;139660 139659 4 EYSDLLNTQDMYNDDLIHFSK Unmodified 2560.1428 0.14278401 2873 Q02410;A0A0G2JMD7 APBA1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family A member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 135.84 135.84 3 0.00035138 141363 QUIQUE_C1218_190116_001 55.127 47.594 107470000 28103000 39101000 0 0 0 0 0 0 0 0 40262000 0 0 12597 2873 11818 110315;110316;110317 139661;139662;139663 139661 2 EYSLQVLK Unmodified 978.5386 0.53859714 2360 P34897;G3V2Y4;H0YIZ0 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial;Serine hydroxymethyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.887 67.887 2 0.018657 67726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.597 22.133 463580000 35739000 45915000 58928000 36968000 39187000 27235000 30742000 47432000 45842000 0 0 38632000 56956000 12598 2360 11819 110318;110319;110320;110321;110322;110323;110324;110325;110326;110327;110328;110329 139664;139665;139666;139667;139668;139669;139670;139671;139672;139673;139674;139675;139676;139677 139673 14 EYSSELNAPSQESDSHPR Unmodified 2031.877 0.87699092 2543 P49756;E9PQU5 RBM25 RNA-binding protein 25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.931 32.931 3 9.5153E-05 28161 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.234 73.476 572180000 0 48821000 91998000 50637000 50835000 39449000 33128000 43002000 40255000 16768000 54658000 48506000 54122000 12599 2543 11820 110330;110331;110332;110333;110334;110335;110336;110337;110338;110339;110340;110341 139678;139679;139680;139681;139682;139683;139684;139685;139686;139687;139688;139689;139690;139691;139692;139693 139691 16 EYSVLNAVDQAR Unmodified 1363.6732 0.67319314 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 0 0 1 1 1 85.14 85.14 2 0.0067803 86400 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.693 66.114 186960000 0 0 0 0 0 0 0 0 84188000 0 0 102770000 0 12600 2486 11821 110342;110343;110344 139694;139695;139696 139696 2 EYTAAVEAK Unmodified 980.48148 0.48147619 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7;F5H3X6;U3KPZ5 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.458 20.458 2 0.027289 13134 QUIQUE_C1563_190116_001 57.96 39.974 2725200000 0 0 0 0 497790000 519940000 0 507630000 502810000 0 697000000 0 0 12601 1272 11822 110345;110346;110347;110348;110349 139697;139698;139699;139700;139701 139698 5 EYTACELMNIYK Unmodified 1533.6844 0.68435145 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 111.52 111.52 2 0.0043906 115177 QUIQUE_C1277_190116_001 70.908 60.385 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12602 4284 11823 110350;110351;110352 139702;139703;139704 139702 3 EYTDASFTNR Unmodified 1202.5204 0.52038089 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 41.759 41.759 2 0.053392 39100 QUIQUE_C1438_190116_001 66.621 44.535 174870000 0 0 0 0 174870000 0 0 0 0 0 0 0 0 12603 1784 11824 110353 139705 139705 0 EYTDLEVSHK Unmodified 1219.5721 0.57208211 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 27.755 27.755 2;3 0.0050459 22591 QUIQUE_C1218_190116_001 115.71 103.48 405540000 0 76952000 72892000 90224000 0 0 0 70854000 94618000 0 0 0 0 12604 4252 11825 110354;110355;110356;110357;110358;110359;110360;110361 139706;139707;139708;139709;139710;139711;139712;139713 139706 8 EYTHSHVCVSASESK Unmodified 1719.7522 0.75224809 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 1 2 14.204 14.204 3;4 4.0905E-19 5840 QUIQUE_DMIX8_190116_001 119.45 113.36 243840000 24458000 18972000 30718000 20870000 23373000 0 38410000 10009000 0 0 27754000 13060000 36221000 12605 497 11826 110362;110363;110364;110365;110366;110367;110368;110369;110370;110371;110372;110373;110374;110375 139714;139715;139716;139717;139718;139719;139720;139721;139722;139723;139724;139725;139726;139727;139728 139727 15 EYTLDVYR Unmodified 1057.508 0.50802529 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 69.512 69.512 2 0.035224 68634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.565 37.828 101330000 0 0 0 0 0 0 0 101330000 0 0 0 0 0 12606 2641 11827 110376 139729 139729 1 EYTVTEPER Unmodified 1122.5193 0.51931826 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.218 31.218 2 0.0071305 25919 QUIQUE_C1277_190116_001 82.452 56.558 714460000 0 84530000 113760000 0 127320000 53306000 127480000 0 92326000 49004000 0 66730000 0 12607 2075 11828 110377;110378;110379;110380;110381;110382;110383;110384 139730;139731;139732;139733;139734;139735;139736;139737 139730 7 EYTVTEPERDGASPSR Unmodified 1792.8228 0.8227705 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 30.713 30.713 3 0.00032155 25706 QUIQUE_C1277_190116_001 79.771 67.625 115750000 0 34107000 44477000 0 0 0 0 0 0 0 0 37170000 0 12608 2075 11829 110385;110386;110387 139738;139739;139740 139738 3 EYVESQLQR Unmodified 1150.5619 0.56185177 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 36.502 36.502 2 0.0022073 32588 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.741 70.923 273710000 0 0 0 0 0 0 0 0 71684000 0 73724000 70044000 58262000 12609 3627 11830 110388;110389;110390;110391;110392;110393;110394 139741;139742;139743;139744;139745;139746;139747;139748;139749 139748 9 EYVLPSFEVIVEPTEK Unmodified 1877.9662 0.96624684 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 140.49 140.49 2 4.9458E-13 136728 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.69 117.46 369460000 64266000 0 0 0 0 0 0 0 68170000 57414000 115930000 0 63672000 12610 1803 11831 110395;110396;110397;110398;110399;110400 139750;139751;139752;139753;139754;139755;139756;139757 139754 8 EYVNSTSEESHDEDEIRPVQQQDLHR Unmodified 3139.4079 0.40787691 3628 Q8NBU5 ATAD1 ATPase family AAA domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 49.185 49.185 4 7.8515E-11 46009 QUIQUE_C1563_190116_001 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3.2724E-05 146746 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.644 59.552 92094000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92094000 0 12613 269;2893 11834 110414 139772 139772 1 EYWMDPEGEMKPGR Unmodified 1723.7334 0.73342691 2637 P53999 SUB1 Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 80.488 80.488 3 0.0053274 81690 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.831 54.863 146300000 30875000 0 0 0 0 35163000 0 0 32568000 0 0 0 47692000 12614 2637 11835 110415;110416;110417;110418 139773;139774;139775;139776 139775 3 EYYDHLPELK Unmodified 1305.6241 0.62411768 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.281 71.281 2;3 1.794E-07 72140 QUIQUE_C1218_190116_001 152.34 128.39 7670800000 539410000 563400000 748080000 473380000 517300000 439220000 692380000 549680000 647510000 227030000 746980000 638840000 887630000 12615 2016 11836 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EYYSEADASHCIHQILESVNHIHQHDIVHR Unmodified 3636.6917 0.69166053 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 3 2 3 1 2 1 1 1 1 2 1 110.32 110.32 4;5;6;7 2.4814E-36 114969 QUIQUE_C1576_190116_001 108.88 100.7 2832900000 0 647080000 301000000 572030000 0 97187000 489120000 132740000 65296000 48029000 112630000 197060000 170720000 12617 412;3299 11838 110448;110449;110450;110451;110452;110453;110454;110455;110456;110457;110458;110459;110460;110461;110462;110463;110464;110465 139848;139849;139850;139851;139852;139853;139854;139855;139856;139857;139858;139859;139860;139861;139862;139863;139864;139865;139866;139867;139868 139858 13 EYYSEADASHCIQQILEAVLHCHQMGVVHR Oxidation (M) 3595.6395 0.6394903 4533;3010;896 E9PBG7;E9PF82;E7EQE4;Q9UQM7;Q13554;H7BXS4;E7ETC9 CAMK2D;CAMK2B;CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 1 0 2 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A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.208 74.208 2 6.4671E-24 74528 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.32 196.13 3594800000 549650000 517030000 218660000 343080000 227420000 0 160340000 569520000 259350000 123580000 182820000 359890000 83442000 + 12634 199;790 11853 110628;110629;110630;110631;110632;110633;110634;110635;110636;110637;110638;110639 140052;140053;140054;140055;140056;140057;140058;140059;140060;140061;140062;140063;140064;140065 140058 14 FAAYLER Unmodified 868.4443 0.44430282 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 45.859 45.859 2 0.020578 42649 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.74 32.434 1012600000 0 0 0 0 0 186730000 0 0 464940000 0 0 0 360890000 12635 2017 11854 110640;110641;110642 140066;140067;140068;140069 140068 4 FACHSASLTVR Unmodified 1247.6081 0.60809046 3122 Q15233;C9JYS8;C9IZL7 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 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140092;140093;140094;140095;140096;140097 140092 6 FADAASLLLSLMTSR Unmodified 1594.8389 0.83887826 1287 J3QL54;J3KT10;Q9BW27;J3QS63;J3QL91;F5H0W7;J3QLH0 NUP85 Nuclear pore complex protein Nup85 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1 2 171.31 171.31 2;3 1.3894E-35 175653 QUIQUE_DMIX3_190116_001 210.79 175.14 291950000 22353000 27908000 12330000 17684000 0 0 13223000 24898000 41220000 4583200 86574000 11368000 29812000 12638 1287 11857 110668;110669;110670;110671;110672;110673;110674;110675;110676;110677;110678;110679;110680;110681;110682;110683;110684;110685 140098;140099;140100;140101;140102;140103;140104;140105;140106;140107;140108;140109;140110;140111;140112;140113;140114;140115 140108 18 FADDQLIIDFDNFVR Unmodified 1826.8839 0.88391419 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.9 166.9 2;3 1.1816E-65 171957 QUIQUE_C1368_190116_001 244.95 234 5050400000 290690000 299640000 286500000 238630000 342390000 311470000 494960000 341280000 651880000 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140784;140785;140786;140787;140788;140789;140790;140791;140792;140793;140794;140795;140796;140797 140797 13 FADYLVR Unmodified 882.45995 0.45995289 679 B8ZZW5;Q8NBF6;H7C0I1 AVL9 Late secretory pathway protein AVL9 homolog yes no 0 0 0 1 1 64.378 64.378 2 0.023846 64156 QUIQUE_C1576_190116_001 99.279 46.181 68379000 0 0 0 0 0 0 36117000 0 0 0 0 32262000 0 12654 679 11873 111172;111173 140798;140799 140798 2 FAEAFEAIPR Unmodified 1149.5819 0.58185893 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.777 87.777 2 2.1789E-05 89691 QUIQUE_C1403_190116_001 146.81 117.65 3941000000 0 352800000 377320000 380600000 402950000 387400000 346750000 287890000 309180000 0 378590000 377380000 340160000 12655 2572 11874 111174;111175;111176;111177;111178;111179;111180;111181;111182;111183;111184 140800;140801;140802;140803;140804;140805;140806;140807;140808;140809;140810;140811;140812;140813;140814;140815;140816;140817;140818;140819;140820;140821;140822 140805 23 FAEALGSTEAK Unmodified 1122.5557 0.55570376 2805 P78347 GTF2I General transcription factor II-I yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.988 35.988 2 0.00043115 30997 QUIQUE_C1563_190116_001 103.01 75.751 429210000 46614000 56249000 49114000 0 0 79118000 67750000 49078000 59679000 21605000 0 0 0 12656 2805 11875 111185;111186;111187;111188;111189;111190;111191;111192;111193;111194;111195;111196 140823;140824;140825;140826;140827;140828;140829;140830;140831;140832;140833;140834;140835 140828 12 FAEALITFVSDNSVLHR Unmodified 1917.9949 0.99486163 3713 Q8WWI5 SLC44A1 Choline transporter-like protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 143.03 143.03 2;3 1.8685E-10 139522 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.56 106.63 1912800000 175920000 199450000 233130000 123100000 191850000 138800000 274800000 143740000 56029000 49558000 206900000 0 119540000 12657 3713 11876 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76.254 3 0.0074208 77081 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.32 34.644 104840000 0 0 0 0 40978000 0 0 27825000 0 0 0 0 36036000 12670 1327 11889 111328;111329;111330;111331 140976;140977;140978;140979 140978 4 FAEVEHVVNAILFLLSDR Unmodified 2071.1102 0.11022574 3464 Q7Z4W1 DCXR L-xylulose reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 173.68 173.68 3 9.231E-14 180858 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.14 111.5 455840000 0 0 0 0 0 0 0 0 24270000 0 250170000 181400000 0 12671 3464 11890 111332;111333;111334 140980;140981;140982;140983 140981 4 FAEVYFAQSQQK Unmodified 1444.6987 0.69867961 3048 Q14165;F5H1S8;H0YG07;F5GX14 MLEC Malectin yes no 0 0 0 1 70.512 70.512 2 0.012441 66468 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.785 46.634 24144000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24144000 0 0 0 12672 3048 11891 111335 140984 140984 1 FAEWCLDYGAHGCR Unmodified 1740.7137 0.71369452 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 80.478 80.478 2;3 1.1116E-17 82474 QUIQUE_C1218_190116_001 154.35 122.34 172080000 25839000 43756000 0 40801000 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Unmodified 3528.7274 0.72736056 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 3 1 1 123.78 123.78 3;5 9.6203E-75 127566 QUIQUE_DMIX7_190116_001 154.63 146.11 1517900000 0 78012000 89632000 77881000 129480000 57164000 112980000 141540000 274800000 0 355770000 48653000 151950000 12697 2308 11914 111543;111544;111545;111546;111547;111548;111549;111550;111551;111552;111553;111554;111555;111556 141222;141223;141224;141225;141226;141227;141228;141229;141230;141231;141232;141233;141234;141235;141236;141237 141236 16 FAIDIGGSLTK Unmodified 1120.6128 0.61282471 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 99.127 99.127 2 0.0025929 101322 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.379 57.892 51853000 0 0 0 16829000 0 0 0 18679000 0 0 0 0 16345000 12698 4304 11915 111557;111558;111559 141238;141239;141240 141239 3 FAIELNELDPVLK Unmodified 1499.8235 0.82354577 4084 Q9BZF3 OSBPL6 Oxysterol-binding protein-related protein 6 yes yes 0 0 0 1 142.14 142.14 2 0.0040685 146048 QUIQUE_C1403_190116_001 71.03 33.919 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12699 4084 11916 111560 141241 141241 1 FAIHGDPK Unmodified 883.4552 0.45520186 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 16.652 16.652 2 0.027991 8723 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.176 39.838 134440000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 134440000 0 0 0 12700 4050 11917 111561 141242 141242 1 FAIQDISVEETSAK Unmodified 1536.7672 0.7671531 1544;2047;1242;2381 H9KV75;G3V2W4;G3V2X9;G3V2E8;O43707;P12814;G3V2N5;G3V5M4;P35609 ACTN1;ACTN4;ACTN2 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1;Alpha-actinin-2 no no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 92.794 92.794 2 1.7642E-17 94893 QUIQUE_C1277_190116_001 183.33 167.2 8167200000 777830000 729420000 591940000 701130000 793470000 590680000 695630000 514150000 533340000 325680000 712330000 663800000 537760000 12701 1242;1544;2047;2381 11918 111562;111563;111564;111565;111566;111567;111568;111569;111570;111571;111572;111573;111574;111575;111576;111577;111578 141243;141244;141245;141246;141247;141248;141249;141250;141251;141252;141253;141254;141255;141256;141257;141258;141259;141260;141261;141262;141263;141264;141265 141246 23 FAIQTDPNSNDGLVTVVKPIDFETNR Unmodified 2889.4509 0.45085135 2141 P19022 CDH2 Cadherin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.71 128.71 3 3.2952E-51 131500 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.17 138.46 3244200000 233280000 283980000 232880000 280280000 228160000 196700000 312520000 231020000 330950000 120130000 243970000 189410000 360950000 12702 2141 11919 111579;111580;111581;111582;111583;111584;111585;111586;111587;111588;111589;111590;111591 141266;141267;141268;141269;141270;141271;141272;141273;141274;141275;141276;141277;141278;141279;141280 141274 13 FAISENPLITLR Unmodified 1372.7715 0.77145062 4367 Q9P0K1;F8WAD8;E7EPF1 ADAM22 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 122.74 122.74 2 0.011942 126614 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.37 45.017 270290000 0 0 45940000 0 45517000 36579000 47327000 0 0 17699000 48166000 29064000 0 12703 4367 11920 111592;111593;111594;111595;111596;111597;111598 141281;141282;141283;141284;141285;141286;141287 141287 4 FAIVMMGR Unmodified 923.47211 0.47211425 3778 Q93009 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.178 86.178 2 0.0048159 88741 QUIQUE_C1218_190116_001 107.74 83.789 80876000 19041000 24061000 0 0 0 0 0 20197000 17577000 0 0 0 0 12704 3778 11921 111599;111600;111601;111602;111603;111604;111605 141288;141289;141290;141291;141292;141293;141294 141288 7 FAKPVYPGQTLQTEMWK Unmodified 2023.0237 0.023718915 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 92.31 92.31 2;3 1.5105E-12 94638 QUIQUE_C1277_190116_001 122.08 109.61 1195500000 56419000 83039000 92084000 68912000 64315000 54040000 78604000 69524000 130660000 0 216890000 111630000 169360000 12705 455 11922 111606;111607;111608;111609;111610;111611;111612;111613;111614;111615;111616;111617;111618;111619;111620 141295;141296;141297;141298;141299;141300;141301;141302;141303;141304;141305;141306;141307;141308;141309;141310 141297 14 FALCQPLLLFSSLQHGYSLAR Unmodified 2420.2675 0.26747144 1184 H3BNU1;Q9ULP9;H3BV07;A0A2R8Y518;H3BTP5 TBC1D24 TBC1 domain family member 24 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 157.34 157.34 3 5.6254E-14 160036 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.76 108.12 1017400000 38946000 0 53776000 0 104320000 0 0 119060000 149310000 0 181120000 223260000 147560000 12706 1184 11923 111621;111622;111623;111624;111625;111626;111627;111628 141311;141312;141313;141314;141315;141316;141317;141318;141319 141314 9 FALDFGLVPAPPAGTR Unmodified 1627.8722 0.8722273 3842 Q96EM0 L3HYPDH Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.99 138.99 2 8.6818E-06 144193 QUIQUE_C1368_190116_001 102.4 75.694 352930000 0 34760000 50176000 38163000 49934000 31657000 39679000 0 47257000 0 0 33829000 27478000 12707 3842 11924 111629;111630;111631;111632;111633;111634;111635;111636;111637 141320;141321;141322;141323;141324;141325;141326;141327;141328;141329;141330 141321 11 FALDMAR Unmodified 822.40581 0.40580882 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 1 63.079 63.079 2 0.047361 58728 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.847 28.673 19475000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19475000 0 0 0 12708 194 11925 111638 141331;141332 141332 2 FALEVAAK Unmodified 847.48035 0.48035398 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.313 53.313 2 0.01729 52072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.784 33.61 3775900000 0 367100000 315550000 287000000 332980000 301140000 251590000 385390000 324330000 197780000 413090000 298830000 301160000 12709 959 11926 111639;111640;111641;111642;111643;111644;111645;111646;111647;111648;111649;111650 141333;141334;141335;141336;141337;141338;141339;141340;141341;141342;141343;141344;141345;141346;141347;141348;141349;141350;141351;141352;141353;141354 141349 22 FALFDQDK Unmodified 982.476 0.47599688 3853 Q96FN4 CPNE2 Copine-2 yes yes 0 0 0 1 79.823 79.823 2 0.03977 79858 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.682 34.855 13504000 0 0 0 0 0 0 0 13504000 0 0 0 0 0 12710 3853 11927 111651 141355 141355 1 FALGIFAINEAVESGDVGK Unmodified 1935.9942 0.99419293 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 153.15 153.15 2 0.0011531 156888 QUIQUE_C1403_190116_001 80.522 65.135 11777000 0 0 0 11777000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12711 2487 11928 111652;111653 141356;141357 141356 2 FALGLSGGSLVSMLAR Unmodified 1577.8599 0.85994805 1723 O95336;M0R261;M0R0U3 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 2 150.66 150.66 2 0.00043277 154134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.431 54.102 668400000 0 72612000 0 84120000 0 74955000 40716000 150490000 134550000 0 0 0 110960000 12712 1723 11929 111654;111655;111656;111657;111658;111659;111660;111661;111662;111663;111664;111665 141358;141359;141360;141361;141362;141363;141364;141365;141366;141367;141368;141369;141370;141371;141372;141373;141374 141367 16 FALITWIGENVSGLQR Unmodified 1802.9679 0.9679186 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 0 2 2 2 4 2 2 2 2 3 1 3 2 2 159.8 159.8 2;3 2.2555E-36 165007 QUIQUE_C1368_190116_001 218.18 187.31 11710000000 470180000 496940000 663000000 825000000 890490000 433180000 668650000 940490000 1220200000 540080000 1264000000 1091100000 2207100000 12713 3040 11930 111666;111667;111668;111669;111670;111671;111672;111673;111674;111675;111676;111677;111678;111679;111680;111681;111682;111683;111684;111685;111686;111687;111688;111689;111690;111691;111692;111693;111694 141375;141376;141377;141378;141379;141380;141381;141382;141383;141384;141385;141386;141387;141388;141389;141390;141391;141392;141393;141394;141395;141396;141397;141398;141399;141400;141401;141402;141403;141404;141405;141406;141407;141408;141409;141410;141411;141412;141413;141414;141415;141416;141417;141418 141383 43 FALLQEGAHVPLQFR Unmodified 1724.9362 0.93622454 3606 Q8N6C5 IGSF1 Immunoglobulin superfamily member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 2 1 110.79 110.79 2;3 5.4284E-10 114036 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.14 101.77 640240000 57438000 0 0 0 0 0 0 58974000 220290000 26783000 92890000 101740000 82126000 12714 3606 11931 111695;111696;111697;111698;111699;111700;111701;111702;111703;111704;111705;111706;111707;111708;111709;111710 141419;141420;141421;141422;141423;141424;141425;141426;141427;141428;141429;141430;141431;141432;141433;141434;141435;141436;141437 141437 18 FALNHPELVEGLVLINVDPCAK Unmodified 2447.2883 0.28826646 4423 Q9UGV2;Q5TH30;F8WBF9;Q5TH29 NDRG3 Protein NDRG3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 145.8 145.8 3 8.7772E-05 151507 QUIQUE_C1218_190116_001 54.559 45.72 195100000 79331000 0 0 0 29329000 86441000 0 0 0 0 0 0 0 12715 4423 11932 111711;111712;111713;111714 141438;141439;141440;141441 141438 4 FALNQNLPDLGGPR Unmodified 1510.7892 0.78922595 3375 Q6NY19 KANK3 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 105.68 105.68 2 0.016134 110637 QUIQUE_C1438_190116_001 66.595 44.85 35344000 0 0 0 0 35344000 0 0 0 0 0 0 0 0 12716 3375 11933 111715 141442 141442 1 FALPSPQHILGLPVGQHIYLSAR Unmodified 2513.3907 0.39069811 1778 P00387;B1AHF3 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes no 0 0 0 2 3 2 3 2 2 1 2 3 2 4 5 3 128.87 128.87 3;4 1.9479E-31 133793 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.22 131.18 6155300000 281350000 277160000 437020000 365560000 367360000 305700000 320300000 475550000 820290000 149250000 667440000 765490000 922860000 12717 1778 11934 111716;111717;111718;111719;111720;111721;111722;111723;111724;111725;111726;111727;111728;111729;111730;111731;111732;111733;111734;111735;111736;111737;111738;111739;111740;111741;111742;111743;111744;111745;111746;111747;111748;111749 141443;141444;141445;141446;141447;141448;141449;141450;141451;141452;141453;141454;141455;141456;141457;141458;141459;141460;141461;141462;141463;141464;141465;141466;141467;141468;141469;141470;141471;141472;141473;141474;141475;141476;141477;141478;141479;141480;141481;141482;141483;141484;141485;141486;141487;141488;141489 141469 42 FALPTAHHTLGLPVGK Unmodified 1657.9304 0.93041088 4437 Q9UHQ9 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes yes 0 0 0 3 3 2 2 1 2 1 2 2 2 3 2 3 72.303 72.303 2;3;4 1.2129E-13 72927 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.74 102.85 3246700000 383540000 278550000 306140000 262100000 75454000 174730000 139550000 217940000 332060000 56812000 392370000 276460000 351020000 12718 4437 11935 111750;111751;111752;111753;111754;111755;111756;111757;111758;111759;111760;111761;111762;111763;111764;111765;111766;111767;111768;111769;111770;111771;111772;111773;111774;111775;111776;111777 141490;141491;141492;141493;141494;141495;141496;141497;141498;141499;141500;141501;141502;141503;141504;141505;141506;141507;141508;141509;141510;141511;141512;141513;141514;141515;141516;141517;141518;141519;141520;141521;141522;141523;141524;141525;141526;141527;141528;141529 141517 39 FALSAMDMEQR Unmodified 1297.5795 0.57949245 1700 O94925;B7Z509 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.11 89.11 2 0.00050707 89725 QUIQUE_C1563_190116_001 110.14 77.915 1456900000 200060000 141520000 112850000 107570000 93373000 118320000 170630000 76642000 0 42899000 129040000 129180000 134800000 12719 1700 11936 111778;111779;111780;111781;111782;111783;111784;111785;111786;111787;111788;111789 141530;141531;141532;141533;141534;141535;141536;141537;141538;141539;141540;141541 141535 12 FALSAMDMEQR Oxidation (M) 1313.5744 0.57440707 1700 O94925;B7Z509 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial no no 0 1 0 1 1 67.621 67.621 2 0.023434 64481 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.056 60.276 37095000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37095000 0 12720 1700 11936 111790;111791 141542;141543 141542 2 FALVEVIAMIK Unmodified 1232.7203 0.72026667 3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;A0A0G2JQH3;A0A087WVZ5;Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 157.56 157.56 2 0.0008802 161738 QUIQUE_C1277_190116_001 93.551 74.572 174910000 12061000 10056000 0 0 0 0 19194000 29574000 28206000 4806900 23891000 47118000 0 12721 292;3442 11937 111792;111793;111794;111795;111796;111797;111798;111799;111800;111801;111802;111803;111804 141544;141545;141546;141547;141548;141549;141550;141551;141552;141553;141554;141555;141556;141557;141558;141559 141546 16 FALVEVIAMIK Oxidation (M) 1248.7152 0.71518129 3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;A0A0G2JQH3;A0A087WVZ5;Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 1 0 1 140.87 140.87 2 0.065911 143861 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.676 47.083 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12722 292;3442 11937 111805 141560 141560 1 FALVFPLMYHTWNGIR Unmodified 1964.0131 0.013094649 3965 Q99643 SDHC Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 148.97 148.97 3 1.2828E-06 155684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.358 72.256 164040000 0 0 0 0 0 0 0 26526000 50809000 0 47121000 39586000 0 12723 3965 11938 111806;111807;111808;111809 141561;141562;141563;141564;141565;141566 141564 5 FALWVGR Unmodified 847.47046 0.47045799 1674 O75962;E7EWP2;E7EPJ7 TRIO Triple functional domain protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 91.689 91.689 2 0.023734 94312 QUIQUE_C1277_190116_001 99.511 89.761 71816000 0 13642000 7840100 0 0 0 11557000 0 0 0 13485000 13374000 11918000 12724 1674 11939 111810;111811;111812;111813;111814;111815 141567;141568;141569;141570;141571;141572 141567 6 FAMEPEEFDSDTLR Unmodified 1685.7243 0.72430201 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.38 108.38 2 2.2081E-17 112852 QUIQUE_C1218_190116_001 149.96 135.8 706380000 63509000 69123000 81447000 96329000 71083000 82176000 79279000 23620000 51049000 28164000 0 0 60596000 12725 2059 11940 111816;111817;111818;111819;111820;111821;111822;111823;111824;111825;111826 141573;141574;141575;141576;141577;141578;141579;141580;141581;141582;141583 141573 10 FAMEPEEFDSDTLR Oxidation (M) 1701.7192 0.71921663 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 1 0 1 1 85.203 85.203 2 0.0057668 81834 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.397 70.441 41439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14258000 0 27181000 0 12726 2059 11940 111827;111828 141584;141585 141584 1383 1 FAMVAPDVQIEDGK Unmodified 1518.7388 0.73882986 4408 Q9UBT2;K7ESK7 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.861 97.861 2 0.0014995 100146 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2111600000 0 0 0 0 0 0 0 1928700000 0 0 0 0 182920000 12738 1952 11952 111905;111906;111907 141710;141711;141712 141710 3 FAPPLVIKEDELR Unmodified 1525.8504 0.85042922 1856 P04181 OAT Ornithine aminotransferase, mitochondrial;Ornithine aminotransferase, hepatic form;Ornithine aminotransferase, renal form yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.141 87.141 3 0.00039681 88570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.087 68.077 670760000 26428000 48114000 35099000 0 62365000 26941000 46779000 54658000 63326000 0 115350000 120360000 71341000 12739 1856 11953 111908;111909;111910;111911;111912;111913;111914;111915;111916;111917;111918 141713;141714;141715;141716;141717;141718;141719;141720;141721;141722;141723;141724 141719 12 FAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNR Unmodified 3478.6793 0.67934773 2965 Q13107;H7C189 USP4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 170.12 170.12 3 2.8014E-06 177472 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.324 44.176 31812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31812000 0 0 12740 2965 11954 111919 141725 141725 1 FAPSPTGFLHLGGLR Unmodified 1568.8463 0.8463469 1202 H3BTB7;Q5JPH6 EARS2 Probable glutamate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 110.75 110.75 3 3.7928E-07 113229 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.85 100.25 182060000 33322000 27316000 40231000 27431000 0 0 0 21642000 21935000 10183000 0 0 0 12741 1202 11955 111920;111921;111922;111923;111924;111925;111926;111927 141726;141727;141728;141729;141730;141731;141732;141733 141731 7 FAQALGLTEAVK Unmodified 1246.6921 0.69213767 2805 P78347 GTF2I General transcription factor II-I yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 77.741 77.741 2 0.014838 75017 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.096 42.946 165840000 0 37959000 31471000 32280000 33247000 0 0 0 0 30884000 0 0 0 12742 2805 11956 111928;111929;111930;111931;111932 141734;141735;141736;141737;141738 141738 5 FAQEAEAAR Unmodified 991.47231 0.47230849 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.545 17.545 2 2.2774E-06 9936 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.63 108.82 3173800000 371540000 245690000 211570000 120690000 256810000 161670000 390050000 196610000 163980000 131550000 356910000 192520000 374250000 12743 2033 11957 111933;111934;111935;111936;111937;111938;111939;111940;111941;111942;111943;111944;111945 141739;141740;141741;141742;141743;141744;141745;141746;141747;141748;141749;141750;141751 141749 12 FAQENELMFLETSALTGENVEEAFLK Unmodified 2959.4161 0.41610532 2706 P61018;M0R0X1 RAB4B Ras-related protein Rab-4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 170.13 170.13 3 1.5131E-19 172064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.95 91.003 371550000 0 31024000 39536000 0 0 0 0 57401000 0 0 120290000 71263000 52036000 12744 2706 11958 111946;111947;111948;111949;111950;111951 141752;141753;141754;141755;141756;141757 141754 6 FAQENELMFLETSALTGENVEEAFVQCAR Unmodified 3332.5329 0.53294277 2165 P20338;A0A087WYT5 RAB4A Ras-related protein Rab-4A yes no 0 0 0 1 169.47 169.47 3 1.9826E-27 176830 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.86 95.784 59354000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59354000 0 0 12745 2165 11959 111952 141758 141758 1 FAQEQIAPLVSTMDENSK Unmodified 2006.9619 0.96190652 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.27 106.27 2 3.5277E-23 109622 QUIQUE_C1368_190116_001 141.65 122.55 121240000 0 0 38103000 0 41208000 0 27858000 0 0 14070000 0 0 0 12746 2470 11960 111953;111954;111955;111956;111957;111958;111959 141759;141760;141761;141762;141763;141764;141765 141759 6 FAQHGTFEYEYSQR Unmodified 1761.7747 0.7746981 2208 P23246;H0Y9K7 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 50.605 50.605 2;3 5.6383E-59 48450 QUIQUE_C1277_190116_001 204.32 179.47 2168900000 56881000 245820000 239080000 209350000 166460000 178180000 194460000 152970000 138980000 80898000 128200000 198690000 178900000 12747 2208 11961 111960;111961;111962;111963;111964;111965;111966;111967;111968;111969;111970;111971;111972;111973;111974;111975;111976;111977;111978;111979;111980;111981;111982 141766;141767;141768;141769;141770;141771;141772;141773;141774;141775;141776;141777;141778;141779;141780;141781;141782;141783;141784;141785;141786;141787;141788;141789;141790;141791;141792;141793;141794;141795;141796 141769 30 FAQMLEK Unmodified 865.43677 0.4367746 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.349 35.349 2 0.021308 30129 QUIQUE_C1368_190116_001 105.39 57.149 4592800000 646260000 0 558790000 436830000 397470000 364900000 351770000 0 349970000 0 677850000 442630000 366400000 12748 2518 11962 111983;111984;111985;111986;111987;111988;111989;111990;111991;111992 141797;141798;141799;141800;141801;141802;141803;141804;141805;141806;141807;141808;141809 141798 13 FAQPGSFEYEYAMR Unmodified 1694.7399 0.73989249 3122 Q15233;H7C367;C9JYS8 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.49 99.49 2 1.0205E-06 101816 QUIQUE_DMIX7_190116_001 121.9 115.87 3081800000 290990000 262260000 256210000 295780000 202130000 203580000 238060000 213750000 219820000 72289000 353220000 261890000 211830000 12749 3122 11963 111993;111994;111995;111996;111997;111998;111999;112000;112001;112002;112003;112004;112005 141810;141811;141812;141813;141814;141815;141816;141817;141818;141819;141820;141821;141822;141823;141824;141825;141826;141827;141828;141829;141830 141829 21 FAQPGSFEYEYAMR Oxidation (M) 1710.7348 0.73480712 3122 Q15233;H7C367;C9JYS8 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 1 0 1 1 1 84.892 84.892 2 0.017242 86339 QUIQUE_C1403_190116_001 53.237 45.133 140960000 0 0 0 68581000 0 0 0 0 0 0 72375000 0 0 12750 3122 11963 112006;112007;112008 141831;141832;141833 141832 3 FAQPGTFEFEYASR Unmodified 1648.7522 0.75217174 3719 Q8WXF1 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.23 102.23 2 0.00026163 105127 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.313 80.388 1747700000 159390000 190110000 140300000 0 129620000 127100000 130890000 120590000 163130000 54865000 209460000 174480000 147790000 12751 3719 11964 112009;112010;112011;112012;112013;112014;112015;112016;112017;112018;112019;112020 141834;141835;141836;141837;141838;141839;141840;141841;141842;141843;141844;141845 141841 12 FAQQITGMR Unmodified 1050.528 0.52804923 502 A0A3B3ITT1;Q6IQ22 RAB12 Ras-related protein Rab-12 yes no 0 0 0 1 43.845 43.845 2 0.017396 40974 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.36 63.233 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12752 502 11965 112021 141846 141846 1 FAQVSDPTVGVDFFSR Unmodified 1770.8577 0.85769944 3830 Q96DA2 RAB39B Ras-related protein Rab-39B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 129.02 129.02 2 4.4683E-06 133046 QUIQUE_C1277_190116_001 102.97 89.064 203170000 44147000 45430000 57660000 0 0 0 0 0 55931000 0 0 0 0 12753 3830 11966 112022;112023;112024;112025;112026 141847;141848;141849;141850;141851 141848 5 FAQVSSSNVVLK Unmodified 1277.698 0.69795133 4163 Q9H425;E5RFY9 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes no 0 0 0 1 1 56.932 56.932 2 0.027867 55233 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.201 69.248 163000000 0 0 0 0 0 0 0 69512000 93491000 0 0 0 0 12754 4163 11967 112027;112028 141852;141853 141852 0 FASCFYGPFR Unmodified 1250.5543 0.55426398 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 98.026 98.026 2 1.794E-07 95856 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.96 151.3 2018300000 106970000 91314000 157730000 160930000 127420000 132310000 167970000 182070000 193480000 85102000 181480000 178220000 253330000 12755 2061 11968 112029;112030;112031;112032;112033;112034;112035;112036;112037;112038;112039;112040;112041;112042 141854;141855;141856;141857;141858;141859;141860;141861;141862;141863;141864;141865;141866;141867;141868;141869;141870;141871;141872;141873;141874;141875;141876;141877;141878;141879;141880 141873 27 FASDDEHDEHDENGATGPVKR Unmodified 2324.9894 0.98939491 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 1 1 1 1 17.622 17.622 4 0.0020626 10575 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.81 35.832 136270000 0 0 0 0 0 0 0 50703000 0 0 49452000 36111000 0 12756 1890 11969 112043;112044;112045 141881;141882;141883 141881 3 FASEIAGVDDLGTTGR Unmodified 1607.7791 0.77911477 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 89.628 89.628 2 1.9825E-07 86577 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.39 89.459 860240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 252420000 607820000 0 0 12757 2280 11970 112046;112047 141884;141885 141884 2 FASENDLPEWK Unmodified 1334.6143 0.61428128 2464 P43487;F6WQW2;C9JXG8;C9JJ34;C9JGV6;C9JDM3;C9JIC6 RANBP1 Ran-specific GTPase-activating protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 84.346 84.346 2 4.3452E-06 85744 QUIQUE_C1277_190116_001 147.4 128.31 2991500000 275210000 235100000 219950000 224500000 238200000 237400000 205100000 203710000 231390000 80029000 323750000 223070000 294100000 12758 2464 11971 112048;112049;112050;112051;112052;112053;112054;112055;112056;112057;112058;112059;112060;112061 141886;141887;141888;141889;141890;141891;141892;141893;141894;141895;141896;141897;141898;141899;141900;141901;141902;141903 141888 18 FASENDLPEWKER Unmodified 1619.758 0.7579854 2464 P43487;F6WQW2;C9JXG8;C9JJ34;C9JGV6;C9JDM3;C9JIC6 RANBP1 Ran-specific GTPase-activating protein yes no 0 0 1 1 66.731 66.731 3 0.027573 65731 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.891 31.042 30665000 0 0 0 0 0 0 0 30665000 0 0 0 0 0 12759 2464 11972 112062 141904 141904 1 FASFEAQGALANIAVDK Unmodified 1750.889 0.88899957 288 A0A0G2JMH6;P01903;Q30118;A0A0G2JH46 HLA-DRA HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 114.95 114.95 2 1.5488E-18 117782 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.38 142.91 742320000 0 71688000 86463000 60226000 0 25013000 92262000 77896000 63029000 41655000 93918000 62344000 67830000 12760 288 11973 112063;112064;112065;112066;112067;112068;112069;112070;112071;112072;112073;112074;112075;112076 141905;141906;141907;141908;141909;141910;141911;141912;141913;141914;141915;141916;141917;141918;141919;141920 141915 14 FASFIDK Unmodified 826.4225 0.42250475 781;782;778;764;792;772;779;775;793;787 CON__P35908;H0YHD9;F8VS61;CON__P35908v2;P35908;CON__P05787;P05787;F8VUG2;F8W1U3;CON__Q9H552;CON__Q9DCV7;CON__Q3KNV1;CON__P08729;P08729;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__Q8VED5;CON__P13647;P13647;F8W0C6;CON__Q32MB2;Q86Y46;CON__Q6IME9;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2;CON__P12035;P12035;CON__P19013;P19013;CON__Q6IFZ6;CON__Q7Z794;Q7Z794 KRT72;KRT77;KRT2;KRT8;KRT7;KRT6C;KRT6A;KRT5;KRT73;KRT3;KRT4 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 8;Keratin, type II cytoskeletal 7;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 5;Keratin, type II cytoskeletal 73;Keratin, type II cytoskeletal 3;Keratin, type II cytoskeletal 4;Keratin, type II cytoskeletal 1b no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.564 54.564 2 0.022679 51384 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.69 9.2243 2788700000 216980000 162840000 123000000 201120000 181380000 156490000 132890000 174630000 0 369910000 296330000 368800000 404330000 + 12761 781;782;772;764;778;787;792;775;779;793 11974 112077;112078;112079;112080;112081;112082;112083;112084;112085;112086;112087;112088 141921;141922;141923;141924;141925;141926;141927;141928;141929;141930;141931;141932;141933 141930 13 FASFIER Unmodified 868.4443 0.44430282 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.522 58.522 2 0.019293 57027 QUIQUE_C1403_190116_001 114.02 22.439 9628800000 1070900000 997020000 658160000 598350000 784430000 577690000 1467900000 504840000 0 434790000 1012200000 661530000 861030000 12762 1916 11975 112089;112090;112091;112092;112093;112094;112095;112096;112097;112098;112099;112100 141934;141935;141936;141937;141938;141939;141940;141941;141942;141943;141944;141945;141946;141947;141948;141949;141950 141938 17 FASFPDYLVIQIK Unmodified 1539.8337 0.83371653 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 2 145.98 145.98 2;3 0.0018526 152549 QUIQUE_C1438_190116_001 71.153 33.826 1507200000 147430000 126850000 139260000 0 151250000 0 180120000 186940000 160230000 48568000 13258000 206510000 146790000 12763 2472 11976 112101;112102;112103;112104;112105;112106;112107;112108;112109;112110;112111;112112;112113;112114;112115;112116;112117;112118 141951;141952;141953;141954;141955;141956;141957;141958;141959;141960;141961;141962;141963;141964;141965;141966;141967;141968;141969 141957 14 FASGGCDNLIK Unmodified 1180.5547 0.55465791 2669 P55735;A8MXL6 SEC13 Protein SEC13 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.209 44.209 2 0.0011655 40761 QUIQUE_C1403_190116_001 89.08 59.93 684550000 85871000 87508000 0 74982000 79182000 48326000 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112137;112138 141993;141994 141994 2 FASQQGMTAYGTR Unmodified 1416.6456 0.64559818 2599 P51911;B7Z7E1;K7EQ72;K7ER02 CNN1 Calponin-1;Calponin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.035 42.035 2 4.8312E-17 38299 QUIQUE_C1277_190116_001 160.18 146.19 87169000 0 87169000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12767 2599 11980 112139;112140;112141;112142;112143 141995;141996;141997;141998;141999 141995 5 FASQQGMTAYGTR Oxidation (M) 1432.6405 0.6405128 2599 P51911;B7Z7E1;K7EQ72;K7ER02 CNN1 Calponin-1;Calponin yes no 0 1 0 1 24.832 24.832 2 0.0093806 18286 QUIQUE_C1277_190116_001 72.34 46.781 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12768 2599 11980 112144 142000 142000 2048 1 FASTMVHALNTILLTSTELFQLR Unmodified 2605.3938 0.39379416 2930 Q08AM6;H3BQD9 VAC14 Protein VAC14 homolog yes no 0 0 0 1 1 172.68 172.68 3 1.3514E-08 177041 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.16 53.714 87153000 0 0 0 0 0 0 0 0 61909000 0 0 25244000 0 12769 2930 11981 112145;112146 142001;142002 142001 2 FASWALESDNNTALLLSK Unmodified 1979 6.5851004E-06 2983 Q13263 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 133.11 133.11 2 0.00012374 135745 QUIQUE_C1563_190116_001 113.76 92.2 256040000 45569000 44837000 0 0 0 33685000 0 34455000 0 23302000 40963000 33233000 0 12770 2983 11982 112147;112148;112149;112150;112151;112152;112153 142003;142004;142005;142006;142007;142008;142009 142005 5 FASYCLTEPGSGSDAASLLTSAK Unmodified 2332.0893 0.089291877 4477 Q9UKU7 ACAD8 Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.92 119.92 2 4.121E-18 123735 QUIQUE_C1277_190116_001 149 137.08 702780000 62163000 61555000 66376000 61528000 48830000 60052000 58846000 45091000 51718000 0 73174000 58156000 55295000 12771 4477 11983 112154;112155;112156;112157;112158;112159;112160;112161;112162;112163;112164;112165 142010;142011;142012;142013;142014;142015;142016;142017;142018;142019;142020;142021;142022 142011 12 FASYIEK Unmodified 856.43307 0.43306943 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 1 3 1 2 1 2 2 2 3 2 1 2 2 41.254 41.254 2 0.021308 29066 QUIQUE_C1277_190116_001 105.39 73.812 613540000000 34056000000 46167000000 49074000000 46348000000 45459000000 47247000000 51161000000 42706000000 54228000000 38736000000 51119000000 49597000000 57644000000 12772 389;395;1336 11984 112166;112167;112168;112169;112170;112171;112172;112173;112174;112175;112176;112177;112178;112179;112180;112181;112182;112183;112184;112185;112186;112187;112188;112189 142023;142024;142025;142026;142027;142028;142029;142030;142031;142032;142033;142034;142035;142036;142037;142038;142039;142040;142041;142042;142043;142044;142045;142046;142047;142048;142049;142050;142051;142052;142053;142054;142055;142056;142057;142058;142059;142060;142061;142062;142063;142064;142065;142066;142067;142068;142069;142070;142071;142072;142073;142074;142075;142076;142077;142078;142079;142080;142081;142082;142083;142084;142085;142086;142087;142088;142089;142090;142091;142092;142093;142094;142095;142096;142097;142098;142099;142100;142101;142102;142103;142104;142105;142106;142107;142108;142109;142110 142031 88 FASYIEKVR Unmodified 1111.6026 0.60259438 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 37.252 37.252 2;3 3.2048E-24 33030 QUIQUE_DMIX5_190116_001 199.07 148.94 2560400000 242980000 139290000 320580000 206080000 249230000 191320000 167070000 0 301850000 0 255600000 421420000 64946000 12773 389;395;1336 11985 112190;112191;112192;112193;112194;112195;112196;112197;112198;112199;112200;112201;112202;112203 142111;142112;142113;142114;142115;142116;142117;142118;142119;142120;142121;142122;142123;142124;142125 142122 8 FATASADGQIYIYDGK Unmodified 1718.8152 0.81516593 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 3 1 5 1 92.951 92.951 2 6.3495E-06 86976 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.24 103.47 291190000 0 0 0 0 0 24764000 34401000 70564000 26482000 100300000 0 34687000 0 12774 1609 11986 112204;112205;112206;112207;112208;112209;112210;112211;112212;112213;112214;112215;112216;112217;112218;112219;112220 142126;142127;142128;142129;142130;142131;142132;142133;142134;142135;142136;142137;142138;142139;142140;142141;142142;142143 142141 15 FATDGEGYKPCDPQVIR Unmodified 1951.9098 0.90981137 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 3 5 4 4 6 2 4 5 4 4 4 5 3 62.379 62.379 2;3 1.4554E-43 61146 QUIQUE_C1438_190116_001 194.98 171.75 20809000000 1646500000 2151400000 1453000000 1808300000 2149000000 1062900000 1417000000 1672700000 1899300000 738740000 1438400000 1859300000 1512800000 12775 2851 11987 112221;112222;112223;112224;112225;112226;112227;112228;112229;112230;112231;112232;112233;112234;112235;112236;112237;112238;112239;112240;112241;112242;112243;112244;112245;112246;112247;112248;112249;112250;112251;112252;112253;112254;112255;112256;112257;112258;112259;112260;112261;112262;112263;112264;112265;112266;112267;112268;112269;112270;112271;112272;112273 142144;142145;142146;142147;142148;142149;142150;142151;142152;142153;142154;142155;142156;142157;142158;142159;142160;142161;142162;142163;142164;142165;142166;142167;142168;142169;142170;142171;142172;142173;142174;142175;142176;142177;142178;142179;142180;142181;142182;142183;142184;142185;142186;142187;142188;142189;142190;142191;142192;142193;142194;142195;142196;142197;142198;142199;142200;142201;142202;142203;142204;142205 142166 60 FATEAAITILR Unmodified 1204.6816 0.68157298 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 97.201 97.201 2 0.00058088 99513 QUIQUE_C1403_190116_001 99.815 81.035 1188100000 272600000 293750000 0 233320000 0 218670000 0 0 41745000 128020000 0 0 0 12776 2132 11988 112274;112275;112276;112277;112278;112279;112280;112281;112282 142206;142207;142208;142209;142210;142211;142212;142213;142214;142215;142216;142217;142218 142211 13 FATEYCNTIEGTAK Unmodified 1603.7188 0.7188227 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 61.799 61.799 2 1.9902E-28 60286 QUIQUE_C1368_190116_001 208.56 187.69 1601000000 201890000 148910000 109230000 158450000 101780000 134710000 128930000 111800000 109300000 52259000 106010000 107770000 129920000 12777 1108;1404 11989 112283;112284;112285;112286;112287;112288;112289;112290;112291;112292;112293;112294;112295;112296;112297;112298 142219;142220;142221;142222;142223;142224;142225;142226;142227;142228;142229;142230;142231;142232;142233;142234;142235;142236;142237;142238;142239;142240 142224 21 FATFVFNVFDENK Unmodified 1576.7562 0.75619449 2741 P62166 NCS1 Neuronal calcium sensor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 146.01 146.01 2 0.0040675 148424 QUIQUE_C1563_190116_001 69.672 59.421 81111000 25362000 27445000 0 0 0 28305000 0 0 0 0 0 0 0 12778 2741 11990 112299;112300;112301 142241;142242;142243 142243 3 FATFVFNVFDENKDGR Unmodified 1904.9057 0.90571227 2741 P62166 NCS1 Neuronal calcium sensor 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.93 128.93 3 2.2203E-07 134407 QUIQUE_C1576_190116_001 113.65 104.25 615410000 44034000 62421000 59381000 42294000 60726000 43621000 77586000 0 39649000 9262900 66453000 48744000 61239000 12779 2741 11991 112302;112303;112304;112305;112306;112307;112308;112309;112310;112311;112312;112313 142244;142245;142246;142247;142248;142249;142250;142251;142252;142253;142254;142255;142256 142251 12 FATGDIIQIINK Unmodified 1331.7449 0.74490152 2840 Q00013;A8MTH1;C9JB34;C9J9J4 MPP1 55 kDa erythrocyte membrane protein yes no 0 0 0 1 118.17 118.17 2 0.0054402 114830 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.299 48.074 13804000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13804000 0 0 0 12780 2840 11992 112314 142257 142257 1 FATGDIIQIINKDDSNWWQGR Unmodified 2476.2135 0.21352161 2840 Q00013;A8MTH1;C9JB34;C9J9J4 MPP1 55 kDa erythrocyte membrane protein yes no 0 0 1 1 150.79 150.79 3 0.014133 153566 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.687 32.336 22937000 0 0 0 0 0 0 0 22937000 0 0 0 0 0 12781 2840 11993 112315 142258 142258 1 FATHGAALTVK Unmodified 1114.6135 0.61349341 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 24.207 24.207 2;3 0.00081872 18072 QUIQUE_C1218_190116_001 94.804 51.935 726850000 69067000 44844000 94536000 37089000 0 0 0 144760000 0 0 251050000 85510000 0 12782 3719 11994 112316;112317;112318;112319;112320;112321;112322;112323;112324 142259;142260;142261;142262;142263;142264;142265;142266;142267;142268;142269 142260 11 FATLAELVQYYMEHHGQLK Unmodified 2277.1252 0.12522387 2898 Q06124;A0A1W2PPU4 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 149.19 149.19 3;4 1.2305E-36 153174 QUIQUE_DMIX7_190116_001 153.95 150.67 1139000000 30121000 89023000 138030000 49513000 42293000 0 76852000 65194000 118630000 0 230860000 240680000 57790000 12783 2898 11995 112325;112326;112327;112328;112329;112330;112331;112332;112333;112334;112335;112336 142270;142271;142272;142273;142274;142275;142276;142277;142278;142279;142280;142281;142282;142283;142284;142285;142286;142287;142288 142285 18 FATLAELVQYYMEHHGQLK Oxidation (M) 2293.1201 0.1201385 2898 Q06124;A0A1W2PPU4 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 134.05 134.05 4 3.3046E-17 139735 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.83 119.84 323880000 0 92162000 0 0 0 0 0 40849000 0 31687000 99618000 0 59566000 12784 2898 11995 112337;112338;112339;112340;112341 142289;142290;142291;142292;142293;142294 142293 2376 6 FATLTELVEYYTQQQGVLQDR Unmodified 2501.2438 0.24381868 2287 P29350;F5H5H9;F5H1Z8;F5H0N8;F5GY79 PTPN6 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6 yes no 0 0 0 1 1 168.11 168.11 3 0.0012086 172970 QUIQUE_C1368_190116_001 56.748 40.52 82422000 0 0 57538000 24884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12785 2287 11996 112342;112343 142295;142296 142295 0 FATLTLQER Unmodified 1077.5819 0.58185894 2932 Q09019;G5E9A7;M0R0L4 DMWD Dystrophia myotonica WD repeat-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 63.424 63.424 2 0.009134 63436 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.827 51.933 100920000 0 0 0 35099000 0 0 0 0 29452000 0 36367000 0 0 12786 2932 11997 112344;112345;112346;112347;112348 142297;142298;142299;142300;142301;142302 142301 6 FATLYSTR Unmodified 957.49198 0.4919813 1699 O94919 ENDOD1 Endonuclease domain-containing 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.275 47.275 2 0.013714 44262 QUIQUE_C1403_190116_001 86.953 68.171 583950000 0 56996000 76959000 64975000 50348000 51075000 0 64397000 64688000 0 97835000 56675000 0 12787 1699 11998 112349;112350;112351;112352;112353;112354;112355;112356;112357 142303;142304;142305;142306;142307;142308;142309;142310;142311 142305 8 FATTFYQHLADSK Unmodified 1527.7358 0.73579339 1798 P01008;Q8TCE1 SERPINC1 Antithrombin-III yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 71.146 71.146 2;3 0.00037394 72768 QUIQUE_C1218_190116_001 131.82 120.5 545990000 63078000 56485000 53807000 0 186590000 0 41438000 0 0 0 0 0 144590000 12788 1798 11999 112358;112359;112360;112361;112362;112363;112364;112365 142312;142313;142314;142315;142316;142317;142318;142319;142320 142312 9 FATVEVTDKPVDEALR Unmodified 1788.9258 0.92577901 4274 Q9NRV9;A0A3B3IRV5;F5GWX2 HEBP1 Heme-binding protein 1 yes no 0 0 1 2 2 3 2 2 1 2 2 2 2 3 2 2 75.993 75.993 2;3 1.0311E-145 76225 QUIQUE_DMIX1_190116_001 243.11 209.15 3066300000 350890000 301060000 245620000 239910000 201400000 58038000 168970000 278310000 332930000 131020000 254740000 257040000 246420000 12789 4274 12000 112366;112367;112368;112369;112370;112371;112372;112373;112374;112375;112376;112377;112378;112379;112380;112381;112382;112383;112384;112385;112386;112387;112388;112389;112390;112391;112392 142321;142322;142323;142324;142325;142326;142327;142328;142329;142330;142331;142332;142333;142334;142335;142336;142337;142338;142339;142340;142341;142342;142343;142344;142345;142346;142347;142348;142349 142336 29 FAVEEIIQK Unmodified 1075.5914 0.59136099 4008 Q9BS40 LXN Latexin yes yes 0 0 0 1 1 1 82.215 82.215 2 0.0063617 83706 QUIQUE_C1368_190116_001 84.568 52.213 114060000 0 0 40885000 40037000 0 33139000 0 0 0 0 0 0 0 12790 4008 12001 112393;112394;112395 142350;142351;142352 142350 3 FAVFGLGNK Unmodified 951.5178 0.51780212 2109 P16435 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.246 90.246 2 0.00041907 93029 QUIQUE_C1576_190116_001 119.89 92.362 689380000 0 59725000 61707000 56933000 56269000 48053000 65551000 41006000 75161000 27825000 75164000 58363000 63621000 12791 2109 12002 112396;112397;112398;112399;112400;112401;112402;112403;112404;112405;112406;112407 142353;142354;142355;142356;142357;142358;142359;142360;142361;142362;142363;142364;142365;142366;142367;142368;142369;142370;142371 142362 19 FAVFIEK Unmodified 852.47454 0.47454032 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.501 70.501 2 0.026204 70611 QUIQUE_C1403_190116_001 94.407 43.371 8701000000 970700000 845130000 615310000 442630000 696100000 547850000 812580000 610870000 559540000 394820000 933960000 631680000 639820000 12792 3176 12003 112408;112409;112410;112411;112412;112413;112414;112415;112416;112417;112418;112419;112420 142372;142373;142374;142375;142376;142377;142378;142379;142380;142381;142382;142383;142384;142385;142386;142387;142388;142389;142390;142391;142392;142393 142378 22 FAVGIVIGR Unmodified 930.56509 0.56508666 909;3875 E9PEB5;Q96AE4;Q96I24 FUBP1;FUBP3 Far upstream element-binding protein 1;Far upstream element-binding protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.807 89.807 2 0.0013183 92603 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.8 60.392 322540000 41625000 54183000 31078000 25445000 0 0 35701000 34004000 34280000 0 43938000 0 22288000 12793 909;3875 12004 112421;112422;112423;112424;112425;112426;112427;112428;112429 142394;142395;142396;142397;142398;142399;142400;142401;142402;142403;142404;142405 142402 12 FAVGSGAR Unmodified 763.39769 0.39768698 369;3752 A0A1W2PNV4;E9PF58;Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 0 0 0 1 1 19.552 19.552 2 0.017397 12566 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.613 49.143 201620000 0 0 0 0 0 0 0 38153000 0 163470000 0 0 0 12794 369;3752 12005 112430;112431 142406;142407 142406 2 FAVHVESVLNR Unmodified 1269.683 0.68296996 2475 P46019 PHKA2 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 66.617 66.617 3 0.0048548 67136 QUIQUE_C1576_190116_001 48.004 35.377 61684000 0 0 0 0 20579000 0 9895900 0 20543000 0 0 0 10665000 12795 2475 12006 112432;112433;112434;112435;112436;112437;112438 142408;142409;142410;142411;142412;142413;142414 142409 7 FAVLDFCYHLLK Unmodified 1524.7799 0.77990682 3442 Q7L576;H0YL50 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 126.84 126.84 3 0.00026504 132574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.08 57.53 329370000 11440000 25457000 37589000 0 24281000 0 35668000 24839000 45861000 0 45681000 42891000 35662000 12796 3442 12007 112439;112440;112441;112442;112443;112444;112445;112446;112447;112448;112449;112450;112451 142415;142416;142417;142418;142419;142420;142421;142422;142423;142424;142425;142426;142427;142428;142429 142427 14 FAVLHGEAPR Unmodified 1095.5825 0.58252764 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 3 2 2 29.969 29.969 2;3 0.0092014 24266 QUIQUE_C1368_190116_001 64.103 39.328 825700000 0 84349000 117390000 0 0 0 112150000 26956000 0 48212000 124550000 142100000 169990000 12797 2674 12008 112452;112453;112454;112455;112456;112457;112458;112459;112460;112461;112462;112463;112464;112465;112466 142430;142431;142432;142433;142434;142435;142436;142437;142438;142439;142440;142441;142442;142443;142444 142431 9 FAVLYQQLDGEDQTK Unmodified 1753.8523 0.85227972 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 96.1 96.1 2 2.1229E-79 99177 QUIQUE_DMIX5_190116_001 211.64 193.83 6457000000 787830000 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142503;142504;142505;142506;142507;142508;142509;142510;142511;142512;142513;142514;142515;142516;142517;142518;142519;142520;142521;142522;142523;142524;142525;142526;142527;142528;142529;142530;142531;142532;142533;142534;142535;142536;142537;142538;142539;142540;142541;142542;142543;142544;142545;142546;142547;142548;142549;142550;142551;142552;142553;142554;142555;142556;142557;142558;142559;142560;142561;142562;142563 142514 60 FAWVEADGVNCIMGVLSNK Unmodified 2109.0023 0.002331546 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 158.06 158.06 2;3 2.1005E-16 163749 QUIQUE_C1218_190116_001 161.21 143.99 793250000 89567000 91764000 86732000 80241000 75438000 53505000 95965000 0 29906000 27610000 55207000 68314000 39005000 12804 4443 12015 112561;112562;112563;112564;112565;112566;112567;112568;112569;112570;112571;112572;112573;112574;112575;112576;112577;112578;112579;112580;112581 142564;142565;142566;142567;142568;142569;142570;142571;142572;142573;142574;142575;142576;142577;142578;142579;142580;142581;142582;142583;142584;142585;142586;142587;142588 142566 22 FAYDGLK Unmodified 812.40685 0.40685468 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 48.699 48.699 2 0.053305 47069 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.039 16.529 225920000 0 0 0 0 0 0 0 0 111210000 0 0 0 114710000 12805 2280 12016 112582;112583 142589;142590 142589 2 FAYDGLKR Unmodified 968.50797 0.50796571 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 31.336 31.336 2 0.033557 26582 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.975 36.881 96004000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 96004000 0 0 12806 2280 12017 112584;112585 142591;142592 142592 2 FAYGYIEDLK Unmodified 1217.5968 0.5968403 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.887 98.887 2 0.0031874 101068 QUIQUE_C1403_190116_001 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142605;142606;142607;142608;142609;142610;142611;142612;142613;142614;142615;142616;142617;142618;142619;142620;142621;142622;142623;142624;142625;142626;142627;142628;142629;142630;142631;142632;142633;142634 142629 29 FCADHPFLFFIR Unmodified 1568.7598 0.75984008 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.01 133.01 3 0.00013851 136768 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108.35 101.31 735140000 36294000 55069000 67024000 64340000 58025000 27915000 50829000 57297000 55306000 0 126720000 58438000 77884000 12809 2564 12020 112620;112621;112622;112623;112624;112625;112626;112627;112628;112629;112630;112631 142635;142636;142637;142638;142639;142640;142641;142642;142643;142644;142645;142646;142647 142646 12 FCADLVEHLK Unmodified 1230.6067 0.60669348 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.897 65.897 3 0.0010176 65574 QUIQUE_C1576_190116_001 73.781 65.023 459820000 28578000 42216000 40726000 34207000 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dehydrogenase 1-like protein;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)] yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 26.561 26.561 2 0.028546 20566 QUIQUE_C1563_190116_001 90.709 77.712 1130600000 0 0 208360000 0 0 207210000 0 0 136930000 0 190780000 185480000 201870000 12820 3579 12031 112697;112698;112699;112700;112701;112702 142719;142720;142721;142722;142723;142724 142720 1 FCEVIPGLNDTAENLLR Unmodified 1959.9724 0.97241163 4245 Q9NPH2;J3KRH4 ISYNA1 Inositol-3-phosphate synthase 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 141.28 141.28 2;3 3.567E-11 147069 QUIQUE_C1218_190116_001 148.68 136.32 541600000 84507000 0 96243000 123620000 23065000 86749000 0 70553000 0 56863000 0 0 0 12821 4245 12032 112703;112704;112705;112706;112707;112708;112709;112710;112711 142725;142726;142727;142728;142729;142730;142731;142732;142733;142734;142735 142726 10 FCFLVEK Unmodified 941.46807 0.46807473 4531 Q9UQB8;I3L4C2;I3L2M4;B4DWA1;I3L1C8;I3L4A3 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 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reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.745 65.745 3 5.275E-07 66531 QUIQUE_C1218_190116_001 90.707 85.047 428160000 38908000 45192000 66316000 49912000 51946000 45733000 83794000 0 0 0 0 46357000 0 12824 2524 12035 112725;112726;112727;112728;112729;112730;112731;112732 142751;142752;142753;142754;142755;142756;142757;142758 142751 8 FCGDLDCPDWVLAEISTLAK Unmodified 2309.0708 0.070805042 4115 Q9H0A8;A0A0B4J287;H3BM91;H3BRX0;H3BTV9 COMMD4 COMM domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 2 170.39 170.39 2;3 6.8071E-16 175690 QUIQUE_C1576_190116_001 113.35 108.05 220020000 18629000 29079000 0 10057000 31797000 0 0 56296000 26900000 0 0 17355000 29903000 12825 4115 12036 112733;112734;112735;112736;112737;112738;112739;112740;112741;112742;112743;112744;112745;112746 142759;142760;142761;142762;142763;142764;142765;142766;142767;142768;142769;142770;142771;142772;142773 142766 14 FCGGLIK Unmodified 793.41565 0.41564523 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 0 1 37.851 37.851 2 0.043926 33906 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.833 53.354 62272000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62272000 12826 4662 12037 112747 142774;142775 142774 2 FCGLCVCPCNK Unmodified 1413.5662 0.56616735 2699 P60880 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 60.595 60.595 2 0.0023872 60104 QUIQUE_C1576_190116_001 94.302 87.023 239690000 0 34508000 0 0 44495000 0 65870000 0 20376000 0 0 25038000 49403000 12827 2699 12038 112748;112749;112750;112751;112752;112753 142776;142777;142778;142779;142780;142781 142778 2 FCGMFCPVEGSSENK Oxidation (M) 1763.6953 0.69532684 365 A0A1C7CYX9 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.831 58.831 2 4.7627E-18 57337 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.48 126.89 463530000 32844000 44330000 0 41537000 0 0 39122000 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FCLGLLSNVNR Unmodified 1291.6707 0.67069072 663;3159 B7Z5N5;Q15796;H3BVD1;P84022;O15198;H0YNV1;H0YKE2;H0YAK7;Q15797;Q99717 SMAD2;SMAD3;SMAD9;SMAD5;SMAD1 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 2;Mothers against decapentaplegic homolog 3;Mothers against decapentaplegic homolog 9;Mothers against decapentaplegic homolog 1;Mothers against decapentaplegic homolog 5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 108.3 108.3 2 0.00076036 112012 QUIQUE_C1368_190116_001 96.034 81.364 238630000 0 55979000 55258000 39466000 0 0 45679000 0 0 0 0 0 42245000 12835 663;3159 12045 112820;112821;112822;112823;112824 142859;142860;142861;142862;142863;142864;142865 142861 7 FCLGQLSNVHR Unmodified 1329.6612 0.66118866 1312 K7EIU8;Q13485;A0A087WUF3 SMAD4 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 64.283 64.283 3 0.00052133 64644 QUIQUE_C1218_190116_001 82.417 70.203 252000000 29444000 47623000 39050000 0 44176000 35341000 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113077;113078;113079;113080;113081;113082;113083;113084;113085;113086;113087;113088;113089 143193;143194;143195;143196;143197;143198;143199;143200;143201;143202;143203;143204;143205;143206;143207;143208;143209;143210;143211;143212;143213;143214 143207 22 FDCHYCR Unmodified 1056.3906 0.39056947 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0;A0A0D9SG53;A0A0D9SGD1;A0A0D9SEY7;A0A0D9SGC5 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 18.357 18.357 2;3 0.014875 10642 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.268 65.911 6786700000 590300000 1160300000 389510000 428890000 460380000 345230000 457080000 538970000 678940000 157870000 587420000 473340000 518480000 12869 3283 12078 113090;113091;113092;113093;113094;113095;113096;113097;113098;113099;113100;113101;113102;113103;113104;113105;113106 143215;143216;143217;143218;143219;143220;143221;143222;143223;143224;143225;143226;143227;143228;143229;143230;143231 143228 16 FDCHYCRDPLQGK Unmodified 1694.7293 0.72934458 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0;A0A0D9SG53;A0A0D9SGD1;A0A0D9SEY7;A0A0D9SGC5 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 1 1 38.525 38.525 4 0.00024031 34305 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.412 64.632 63517000 0 0 0 0 0 0 0 63517000 0 0 0 0 0 12870 3283 12079 113107 143232 143232 1 FDDAVVQSDMK Oxidation (M) 1269.5547 0.55471749 2010 P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 36.929 36.929 2 0.0017047 32788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.817 57.563 687270000 173920000 148690000 0 133560000 0 0 0 39684000 73126000 0 118290000 0 0 12871 2010 12080 113108;113109;113110;113111;113112;113113 143233;143234;143235;143236;143237;143238;143239;143240 143240 1308 7 FDDAVVQSDMK Unmodified 1253.5598 0.55980286 2010 P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 57.253 57.253 2 1.9426E-05 55453 QUIQUE_C1368_190116_001 140.16 113.78 5011500000 566230000 525090000 515700000 583010000 333940000 488650000 410820000 132950000 226230000 0 520980000 329420000 378510000 12872 2010 12080 113114;113115;113116;113117;113118;113119;113120;113121;113122;113123;113124;113125;113126;113127 143241;143242;143243;143244;143245;143246;143247;143248;143249;143250;143251;143252;143253;143254;143255;143256 143245 13 FDDDKVSIVTPEDILR Unmodified 1860.9469 0.94690838 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 117.2 117.2 2;3 2.4402E-06 120626 QUIQUE_C1403_190116_001 142.91 129 1950900000 140160000 194340000 193550000 189180000 0 99820000 219720000 96230000 215900000 63360000 196530000 140970000 201180000 12873 2642 12081 113128;113129;113130;113131;113132;113133;113134;113135;113136;113137;113138;113139;113140;113141;113142;113143;113144;113145;113146;113147;113148 143257;143258;143259;143260;143261;143262;143263;143264;143265;143266;143267;143268;143269;143270;143271;143272;143273;143274;143275;143276;143277;143278;143279;143280;143281;143282;143283 143265 25 FDDGAGGDNEVQR Unmodified 1378.5749 0.57493566 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.074 28.074 2 4.8594E-41 22519 QUIQUE_DMIX1_190116_001 188.28 177.45 1889700000 129420000 113240000 194990000 138840000 122550000 133830000 155490000 109050000 138510000 57245000 206520000 165390000 224610000 12874 2389 12082 113149;113150;113151;113152;113153;113154;113155;113156;113157;113158;113159;113160;113161 143284;143285;143286;143287;143288;143289;143290;143291;143292;143293;143294;143295;143296;143297;143298 143292 15 FDDGLVHLCWVR Unmodified 1515.7293 0.72926823 1376 M0R344;Q9NRA0;E9PCV4 SPHK2 Sphingosine kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 114.75 114.75 3 0.003419 119357 QUIQUE_C1576_190116_001 69.979 58.187 20160000 0 0 0 0 0 0 20160000 0 0 0 0 0 0 12875 1376 12083 113162;113163 143299;143300 143300 2 FDDHKGPTISLTQIV Unmodified 1669.8675 0.86753585 3167 Q15904;A0A0C4DGX8 ATP6AP1 V-type proton ATPase subunit S1 yes no 0 0 1 2 1 103.41 103.41 2;3 0.0112 106755 QUIQUE_C1218_190116_001 78.342 57.19 283200000 246640000 0 0 0 0 0 0 0 0 36561000 0 0 0 12876 3167 12084 113164;113165;113166 143301;143302;143303 143301 2 FDDPGLMLMGFK Unmodified 1369.641 0.64103007 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 144.15 144.15 2 0.0016479 149573 QUIQUE_C1218_190116_001 79.986 64.778 265340000 81302000 45612000 54185000 36008000 0 0 37068000 0 0 11163000 0 0 0 12877 2050 12085 113167;113168;113169;113170;113171;113172 143304;143305;143306;143307;143308;143309 143304 3 FDDPGLMLMGFKPLVLLK Oxidation (M) 2049.1043 0.10427742 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.24 153.24 3 5.8054E-08 160086 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.43 96.738 1216400000 71848000 129490000 98476000 86454000 51253000 72608000 58761000 91431000 110270000 27134000 160620000 192030000 65997000 12878 2050 12086 113173;113174;113175;113176;113177;113178;113179;113180;113181;113182;113183;113184;113185 143310;143311;143312;143313;143314;143315;143316;143317;143318;143319;143320;143321;143322;143323;143324 143322 1362;1363 15 FDDPGLMLMGFKPLVLLK Unmodified 2033.1094 0.1093628 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 162.16 162.16 2;3 1.5154E-13 169143 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.45 113.93 2469600000 128170000 228010000 221160000 118260000 0 98468000 227030000 322320000 210820000 16158000 334230000 266900000 298110000 12879 2050 12086 113186;113187;113188;113189;113190;113191;113192;113193;113194;113195;113196;113197;113198;113199;113200;113201;113202;113203 143325;143326;143327;143328;143329;143330;143331;143332;143333;143334;143335;143336;143337;143338;143339;143340;143341;143342;143343 143341 18 FDDPGLMLMGFKPLVLLK 2 Oxidation (M) 2065.0992 0.099192044 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 2 1 1 1 1 1 141.33 141.33 3 0.0033898 138029 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.513 50.467 246920000 0 0 50621000 0 0 0 0 0 59316000 51003000 85976000 0 0 12880 2050 12086 113204;113205;113206;113207 143344;143345;143346;143347 143346 1362;1363 4 FDDPLLGPR Unmodified 1028.5291 0.52909508 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 85.188 85.188 2 0.0068412 87275 QUIQUE_C1368_190116_001 83.265 53.927 114010000 0 0 45376000 32607000 0 0 0 0 0 0 0 36024000 0 12881 4389 12087 113208;113209;113210 143348;143349;143350;143351 143348 3 FDDTNPEK Unmodified 964.41379 0.41379055 1929;2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;A0A0U1RQT0;A0A0U1RR66;P07814;V9GYZ6 QARS;EPRS Glutamine--tRNA ligase;Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase no no 0 0 0 1 18.649 18.649 2 0.037522 10795 QUIQUE_C1277_190116_001 62.107 47.443 33872000 0 33872000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12882 2496;1929 12088 113211 143352 143352 1 FDDTNPEKEEAK Unmodified 1421.6311 0.63105355 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;A0A0U1RQT0;A0A0U1RR66 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 19.139 19.139 2 4.9507E-09 11825 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.53 137.27 116830000 27284000 0 0 31240000 0 0 0 19190000 39113000 0 0 0 0 12883 2496 12089 113212;113213;113214;113215;113216 143353;143354;143355;143356;143357 143357 5 FDDTNPEKEKEDFEK Unmodified 1869.8269 0.82685283 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 2 1 1 1 1 36.748 36.748 3 9.5299E-09 32144 QUIQUE_C1438_190116_001 102.64 92.298 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PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.97 34.97 2 0.0036361 30929 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.88 57.679 2077200000 151450000 151530000 173630000 191950000 150600000 151370000 173550000 146750000 152500000 101730000 197430000 157940000 176820000 12887 2129 12093 113233;113234;113235;113236;113237;113238;113239;113240;113241;113242;113243;113244;113245 143376;143377;143378;143379;143380;143381;143382;143383;143384;143385;143386;143387;143388;143389;143390 143385 14 FDEAYIYMQR Unmodified 1334.5965 0.59652272 3357 Q6DKK2;K7ERR1;K7EKH7 TTC19 Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 88.163 88.163 2 0.017959 91667 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.162 74.068 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12888 3357 12094 113246;113247 143391;143392 143392 2 FDECVLDK Unmodified 1024.4535 0.45354688 2600 P51970 NDUFA8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 52.267 52.267 2 0.018463 51042 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FDEILEASDGIMVAR Oxidation (M) 1680.8029 0.80288668 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 1 0 1 1 1 108.51 108.51 2 0.0023628 105069 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.267 50.895 95587000 32853000 20796000 0 0 0 0 0 0 0 41937000 0 0 0 12893 1203;2077 12099 113294;113295;113296 143456;143457;143458;143459 143459 693 4 FDEILEASDGIMVAR Unmodified 1664.808 0.80797206 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 2 3 3 125.08 125.08 2;3 1.4104E-12 128857 QUIQUE_C1218_190116_001 132.17 112.93 1325600000 314150000 293230000 0 260430000 0 261400000 28580000 0 0 0 57431000 110360000 0 12894 1203;2077 12099 113297;113298;113299;113300;113301;113302;113303;113304;113305;113306;113307;113308;113309;113310;113311;113312;113313 143460;143461;143462;143463;143464;143465;143466;143467;143468;143469;143470;143471;143472;143473;143474;143475;143476;143477;143478;143479;143480 143460 19 FDEISFVNFAR Unmodified 1343.651 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FDFLCQYHKPASK Unmodified 1639.7817 0.78169773 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JTK6 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 1 3 2 2 1 2 1 2 3 1 2 1 1 2 53.241 53.241 2;3;4 4.0262E-06 51644 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.282 60.6 1769700000 224410000 245590000 207490000 205590000 149530000 136740000 160080000 50313000 42805000 74622000 76750000 83492000 112260000 12901 1276 12106 113335;113336;113337;113338;113339;113340;113341;113342;113343;113344;113345;113346;113347;113348;113349;113350;113351;113352;113353;113354;113355;113356;113357 143503;143504;143505;143506;143507;143508;143509;143510;143511;143512;143513;143514;143515;143516;143517;143518;143519;143520;143521;143522;143523;143524;143525;143526 143517 23 FDFPDELRPAVVHGVWYFNSPYPK Unmodified 2879.4071 0.40713604 2173 P20916;M0QZU4;M0R3B9 MAG Myelin-associated glycoprotein yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 1 142.37 142.37 3;4 1.8168E-08 148127 QUIQUE_C1368_190116_001 80.082 73.13 987040000 0 0 67398000 33259000 70724000 0 212330000 57741000 0 0 296120000 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143572 288 FDGALNVDLTEFQTNLVPYPRIHFPLATYAPVISAEK Unmodified 4146.1466 0.14661783 2795;3430;3992;2796;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;F8VVB9;C9JDS9;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA3E;TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 1 1 168.23 168.23 3 4.0411E-10 172216 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.184 53.149 122930000 0 0 0 0 0 0 41880000 0 0 0 0 81055000 0 12905 1990;2795;2796;3430;3992 12110 113586;113587 143880;143881 143881 2 FDGGEEVLISGEFNDLRK Unmodified 2023.9851 0.9850848 3190 Q16698 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 113.96 113.96 2;3 0.00046955 119143 QUIQUE_C1438_190116_001 78.705 38.128 937840000 73133000 112760000 73766000 118060000 112630000 0 76029000 0 124620000 37029000 81808000 0 128000000 12906 3190 12111 113588;113589;113590;113591;113592;113593;113594;113595;113596;113597;113598;113599 143882;143883;143884;143885;143886;143887;143888;143889;143890;143891;143892;143893;143894;143895;143896;143897;143898;143899;143900 143889 17 FDGIFESLLPINGLLSGDK Unmodified 2034.0674 0.067357869 4394 Q9UBC2;M0R165 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 170.92 170.92 2 3.7169E-16 173667 QUIQUE_C1403_190116_001 121.76 108.56 225500000 0 0 0 37949000 92502000 72712000 0 0 0 22337000 0 0 0 12907 4394 12112 113600;113601;113602;113603 143901;143902;143903;143904 143901 4 FDGILGMAYPR Unmodified 1238.6118 0.61177885 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19;F8WD96;F8W787 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.43 116.43 2 5.6193E-08 120621 QUIQUE_C1368_190116_001 149.94 119.37 9965500000 791510000 969260000 924760000 741840000 871290000 677710000 793960000 491340000 691940000 265690000 1053500000 787360000 905320000 12908 358 12113 113604;113605;113606;113607;113608;113609;113610;113611;113612;113613;113614;113615;113616 143905;143906;143907;143908;143909;143910;143911;143912;143913;143914;143915;143916;143917;143918;143919;143920;143921;143922;143923;143924;143925;143926;143927;143928;143929;143930 143909 26 FDGILGMAYPR Oxidation (M) 1254.6067 0.60669348 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19;F8WD96;F8W787 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 1 0 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 90.982 90.982 2 0.00068956 93743 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.802 74.243 1059600000 99747000 128800000 0 84956000 87417000 0 86605000 0 114240000 143020000 149770000 0 165010000 12909 358 12113 113617;113618;113619;113620;113621;113622;113623;113624;113625;113626;113627;113628;113629;113630 143931;143932;143933;143934;143935;143936;143937;143938;143939;143940;143941;143942;143943;143944;143945;143946;143947;143948 143943 251 14 FDGILTEGEGPR Unmodified 1289.6252 0.62518031 3867 Q96HE7 ERO1L ERO1-like protein alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 74.055 74.055 2 0.010798 74578 QUIQUE_C1576_190116_001 73.885 54.099 56112000 0 0 0 0 0 0 24735000 0 0 31377000 0 0 0 12910 3867 12114 113631;113632;113633 143949;143950;143951 143950 1 FDGLLGFPGGFVDR Unmodified 1495.746 0.74596415 4003 Q9BRJ7;K7EIN2;K7ENA3;W4VSQ8 NUDT16L1 Protein syndesmos yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.24 147.24 2 0.008531 151403 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.977 53.746 234980000 36433000 0 40362000 0 0 25636000 42511000 24799000 26398000 11946000 0 26893000 0 12911 4003 12115 113634;113635;113636;113637;113638;113639;113640;113641;113642 143952;143953;143954;143955;143956;143957;143958;143959;143960;143961;143962;143963;143964 143963 12 FDGLLGFPGGFVDRR Unmodified 1651.8471 0.84707518 4003 Q9BRJ7;K7EIN2;K7ENA3;W4VSQ8 NUDT16L1 Protein syndesmos yes no 0 0 1 1 126.08 126.08 3 0.053081 130255 QUIQUE_DMIX7_190116_001 28.956 17.695 11430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11430000 0 12912 4003 12116 113643 143965 143965 0 FDGVQDPR Unmodified 932.43519 0.4351947 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.617 32.617 2 0.030357 27051 QUIQUE_C1218_190116_001 67.032 39.865 1521600000 164370000 0 0 0 215570000 214740000 0 183140000 199390000 57324000 302590000 184460000 0 12913 1391 12117 113644;113645;113646;113647;113648;113649;113650;113651 143966;143967;143968;143969;143970;143971;143972;143973;143974 143966 9 FDHGAEAIMPTIFNLIPNSAK Unmodified 2285.1514 0.15143862 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 150.61 150.61 3 0.0047701 155108 QUIQUE_C1277_190116_001 24.548 20.671 74039000 0 24408000 16473000 0 0 16579000 0 0 0 0 0 16579000 0 12914 1060 12118 113652;113653;113654;113655 143975;143976;143977;143978 143975 4 FDHGAEAIVPTLFNLVPNSAK Unmodified 2239.1637 0.16371787 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 143.14 143.14 3 0.0037817 148024 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.515 34.862 485210000 0 0 0 0 0 0 0 63503000 86266000 0 136260000 98891000 100290000 12915 310;830 12119 113656;113657;113658;113659;113660 143979;143980;143981;143982;143983;143984 143984 5 FDHIFYTGNTAVGK Unmodified 1568.7623 0.7623425 2587 P51648;J3QRD1;I3L1M4 ALDH3A2 Fatty aldehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 65.759 65.759 3 0.00044892 65670 QUIQUE_C1368_190116_001 50.641 44.927 65943000 0 0 65943000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12916 2587 12120 113661;113662 143985;143986;143987 143986 3 FDHLVAIER Unmodified 1098.5822 0.58219329 3457;1140 H0YB09;H0YB62;H0YB11;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.426 47.426 3 0.0021815 44767 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.643 59.29 2522200000 279200000 193690000 259510000 0 223880000 192200000 195660000 166860000 211710000 107910000 296870000 241890000 152810000 12917 1140;3457 12121 113663;113664;113665;113666;113667;113668;113669;113670;113671;113672;113673;113674 143988;143989;143990;143991;143992;143993;143994;143995;143996;143997;143998;143999;144000;144001;144002;144003;144004;144005;144006;144007;144008;144009;144010;144011 144002 24 FDHVITNMNNNYEPR Unmodified 1862.837 0.83698078 184 A0A0A0MSV6;D6R934;P02746 C1QB Complement C1q subcomponent subunit B yes no 0 0 0 2 1 2 59.493 59.493 2;3 7.1695E-11 59102 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.498 76.122 96923000 0 0 32759000 31759000 0 0 0 0 0 0 32405000 0 0 12918 184 12122 113675;113676;113677;113678;113679 144012;144013;144014;144015;144016;144017 144017 6 FDIELGR Unmodified 848.43922 0.43921744 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;A6PVV2;B1AQN8 WNK2;WNK3 Serine/threonine-protein kinase WNK2 no no 0 0 0 1 1 2 1 2 75.463 75.463 2 0.02472 75501 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.473 0 149710000 0 0 0 0 0 0 27839000 0 19522000 0 33596000 19712000 49044000 12919 1056 12123 113680;113681;113682;113683;113684;113685;113686 144018;144019;144020;144021;144022;144023;144024 144023 7 FDITIGPK Unmodified 889.49092 0.49091866 4566 Q9Y2T2 AP3M1 AP-3 complex subunit mu-1 yes yes 0 0 0 1 1 74.894 74.894 2 0.011743 76197 QUIQUE_C1368_190116_001 89.55 58.26 60273000 0 0 35863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24410000 12920 4566 12124 113687;113688 144025;144026 144025 2 FDKDHDVMLFLK Unmodified 1506.7541 0.754086 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 2 1 1 1 84.211 84.211 3;4 0.0014363 86662 QUIQUE_C1218_190116_001 76.728 65.782 169650000 60882000 0 0 0 0 0 0 37864000 37497000 0 0 33405000 0 12921 3778 12125 113689;113690;113691;113692;113693 144027;144028;144029;144030;144031 144028 5 FDKEFQALEK Unmodified 1253.6292 0.62920306 3912 Q96NT1 NAP1L5 Nucleosome assembly protein 1-like 5 yes yes 0 0 1 1 1 48.695 48.695 2 0.017521 46904 QUIQUE_C1438_190116_001 88.576 63.438 83968000 0 0 0 39248000 44720000 0 0 0 0 0 0 0 0 12922 3912 12126 113694;113695 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chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain;Tubulin alpha-8 chain;Tubulin alpha chain-like 3 no no 0 1 0 1 3 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 59.989 59.989 2 0.031214 54540 QUIQUE_C1368_190116_001 94.163 46.42 35895000000 2960900000 3586000000 3399900000 2656200000 0 2618700000 3203800000 1201200000 2020100000 3440400000 4349800000 2910800000 3546700000 12929 1990;2795;2796;3430;3992;688;539 12133 113744;113745;113746;113747;113748;113749;113750;113751;113752;113753;113754;113755;113756;113757;113758;113759;113760 144087;144088;144089;144090;144091;144092;144093;144094;144095;144096;144097;144098;144099;144100;144101;144102;144103;144104;144105;144106;144107 144092 363 21 FDLMYAK Unmodified 886.42588 0.42587556 2795;3430;3992;2796;1990;688;539 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17;A6NHL2 TUBA3E;TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C;TUBA8;TUBAL3 Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain;Tubulin alpha-8 chain;Tubulin alpha chain-like 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.81 72.81 2 0.021705 73135 QUIQUE_C1368_190116_001 104.11 57.74 133790000000 14026000000 14114000000 12473000000 13573000000 9908400000 10629000000 13952000000 4376000000 6061400000 4816900000 11954000000 7798200000 10109000000 12930 1990;2795;2796;3430;3992;688;539 12133 113761;113762;113763;113764;113765;113766;113767;113768;113769;113770;113771;113772;113773 144108;144109;144110;144111;144112;144113;144114;144115;144116;144117;144118;144119;144120;144121;144122;144123;144124;144125;144126;144127;144128;144129;144130;144131;144132;144133;144134;144135;144136;144137;144138;144139;144140;144141;144142;144143;144144;144145;144146;144147;144148 144119 41 FDLNEPLHLSFLQNAAK Unmodified 1956.0105 0.010511692 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.62 133.62 3 3.1848E-11 137746 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Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 34.807 34.807 3 0.044073 30315 QUIQUE_C1368_190116_001 25.914 14.965 17126000 0 0 17126000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12933 1615 12136 113798 144175 144175 1 FDLQIQSSNLFDK Unmodified 1553.7726 0.77257283 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 122.84 122.84 2 0.0046404 128974 QUIQUE_C1438_190116_001 68.069 48.715 276130000 0 0 0 0 69109000 0 64255000 0 80995000 0 0 61770000 0 12934 1909 12137 113799;113800;113801;113802 144176;144177;144178;144179 144176 2 FDLSGSR Unmodified 780.37662 0.37661719 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.202 34.202 2 0.010031 30050 QUIQUE_C1218_190116_001 140.12 47.425 3314600000 256740000 332720000 413790000 297250000 316230000 300530000 297330000 256770000 382180000 131220000 0 0 329780000 12935 1688 12138 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144196;144197;144198;144199;144200;144201;144202;144203;144204;144205;144206;144207;144208 144202 13 FDLTGIPPAPR Unmodified 1182.6397 0.63970816 2643;2362 Q53FA3;P34931;P54652 HSPA1L;HSPA2 Heat shock 70 kDa protein 1-like;Heat shock-related 70 kDa protein 2 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 2 2 1 2 2 95.03 95.03 2 0.0013831 96780 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.67 41.321 813510000 0 18282000 0 88006000 0 112200000 109980000 17152000 0 10612000 222340000 208170000 26758000 12937 2362;2643 12140 113827;113828;113829;113830;113831;113832;113833;113834;113835;113836;113837;113838;113839;113840;113841;113842;113843;113844 144209;144210;144211;144212;144213;144214;144215;144216;144217;144218;144219;144220;144221;144222;144223;144224;144225;144226 144225 16 FDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILK Unmodified 2703.3836 0.38360663 166;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 172.09 172.09 2;3 1.6563E-31 176397 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.39 128.29 1552500000 12992000 0 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FDNSYSLWR Unmodified 1186.5407 0.5407224 4159 Q9H3P7 ACBD3 Golgi resident protein GCP60 yes yes 0 0 0 1 1 93.99 93.99 2 0.02664 91166 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.426 41.313 39161000 0 0 0 0 24863000 0 0 0 0 14298000 0 0 0 12947 4159 12149 113928;113929 144316;144317 144317 2 FDNTYSFIHAK Unmodified 1341.6354 0.63535107 1680 O76054;B3KRD8 SEC14L2 SEC14-like protein 2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 60.191 60.191 2;3 5.3108E-09 59511 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.96 102.59 6454600000 283860000 338970000 764900000 344820000 271210000 645200000 332790000 591150000 396030000 271730000 979810000 399490000 834590000 12948 1680 12150 113930;113931;113932;113933;113934;113935;113936;113937;113938;113939;113940;113941;113942;113943;113944;113945;113946;113947;113948;113949;113950 144318;144319;144320;144321;144322;144323;144324;144325;144326;144327;144328;144329;144330;144331;144332;144333;144334;144335;144336;144337;144338 144329 19 FDNVLPVSLAFDK Unmodified 1463.766 0.76603089 1725 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44190000 0 0 0 0 12951 1913 12153 113963;113964;113965;113966;113967 144352;144353;144354;144355;144356 144352 5 FDPETNSDDACTYHPGVPVFHDALK Unmodified 2831.2497 0.2497087 4430 Q9UHD1;E9PPQ5;E9PIZ4;E9PSD5;E9PL00 CHORDC1 Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 89.891 89.891 3;4 3.7763E-14 91660 QUIQUE_C1403_190116_001 86.856 84.383 811790000 38218000 0 119540000 44429000 43031000 135730000 109180000 39304000 62160000 0 90367000 79657000 50173000 12952 4430 12154 113968;113969;113970;113971;113972;113973;113974;113975;113976;113977;113978;113979;113980;113981;113982 144357;144358;144359;144360;144361;144362;144363;144364;144365;144366;144367;144368;144369;144370;144371;144372 144362 16 FDPTQFQDCIIQGLTETGTDLEAVAK Unmodified 2896.3801 0.38005417 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;C9JFN4;C9J188;C9JWF5;C9JV57 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 173.04 173.04 2;3 8.3762E-23 180352 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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Unmodified 1942.8836 0.88363942 3631 Q8NC51 SERBP1 Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.22 154.22 2 7.1902E-07 156774 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.13 132.02 802390000 91938000 87079000 71658000 113630000 0 58529000 0 108070000 87198000 0 103750000 80541000 0 12958 3631 12160 114026;114027;114028;114029;114030;114031;114032;114033;114034 144418;144419;144420;144421;144422;144423;144424;144425;144426 144423 8 FDQPLEASTWLK Unmodified 1433.7191 0.7190807 2579 P51398;V9GZ03;V9GYJ9;V9GYL9;V9GYJ3;V9GY11 DAP3 28S ribosomal protein S29, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 115.06 115.06 2 0.047404 118744 QUIQUE_C1403_190116_001 50.791 33.797 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12959 2579 12161 114035;114036 144427;144428 144427 2 FDSDAASPR Unmodified 964.42502 0.42502394 2316;2318;377;325 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995.43084 0.4308376 2312;1995;2063;324;393;2313;1891;2104 A0A140T955;A0A140T933;A0A1W2PRT9;A0A140T9I0;A0A140T9X5;A0A140T913;P01892;A0A1W2PPQ2;Q5SRN7;A0A1W2PS24;Q5SRN5;P04439;P05534;P10316;P13746;P16188;P30453;P30457;A0A140T8W8;A0A1W2PR61;A0A1W2PPF8;A0A140T8Y4;A0A0G2JPD3;P30450;P18462;P16190;P30456 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 16.047 16.047 2 0.00047977 8211 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.49 95.212 260430000 0 39709000 18307000 0 0 0 0 83006000 41486000 53344000 0 24574000 0 12961 324;393;1891;1995;2063;2104;2312;2313 12163 114041;114042;114043;114044;114045;114046;114047;114048;114049;114050;114051 144433;144434;144435;144436;144437;144438;144439;144440;144441;144442;144443;144444;144445 144444 13 FDSDVGEFR Unmodified 1070.4669 0.46688876 1816;2159 P20039;A0A182DWF4;A0A140T9T6;A0A140T8Z3;A0A0G2JJV3;A0A0G2JII1;H0Y7G7;A0A182DWG2;A0A140T9P1;A0A140T9A5;A0A140T976;A0A140T966;A0A140T915;A0A140T8Z7;H0Y5P2;A0A182DWF5;A0A140T9Y2;A0A140T9Y0;A0A140T9Q1;A0A140T9P7;A0A140T9I3;A0A140T928;Q5EP54;A0A182DWE9;P04440;Q5Y7A7;P01912 HLA-DRB1;HLA-DPB1 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-11 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DP beta 1 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-13 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-3 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 61.103 61.103 2 0.016001 60748 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.25 80.306 648430000 0 81601000 128250000 57209000 0 38474000 0 0 100120000 0 135580000 107210000 0 12962 2159;1816 12164 114052;114053;114054;114055;114056;114057;114058 144446;144447;144448;144449;144450;144451;144452 144451 4 FDSDVGEYR Unmodified 1086.4618 0.46180338 2815;3211;2065 P13760;P79483;A0A140T958;Q9TQE0;P13761;A0A182DWH4;Q29974;P04229;Q30154 HLA-DRB1;HLA-DRB3;HLA-DRB5 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-4 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-9 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-7 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-16 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-1 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.756 45.756 2 0.0071923 42815 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.279 70.558 463860000 34064000 0 99558000 56682000 28074000 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FDSLTDLVEHYK Unmodified 1465.7089 0.70890994 2898 Q06124;A0A1W2PPU4;H0YF12 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 113.25 113.25 2;3 1.0457E-08 116849 QUIQUE_DMIX8_190116_001 154.24 125.51 2510200000 306630000 228680000 259230000 258040000 202050000 208780000 228340000 51534000 121050000 152800000 206330000 118920000 167790000 12966 2898 12168 114080;114081;114082;114083;114084;114085;114086;114087;114088;114089;114090;114091;114092;114093;114094;114095;114096;114097;114098;114099;114100;114101;114102;114103;114104;114105;114106 144475;144476;144477;144478;144479;144480;144481;144482;144483;144484;144485;144486;144487;144488;144489;144490;144491;144492;144493;144494;144495;144496;144497;144498;144499;144500;144501;144502;144503;144504;144505;144506;144507;144508;144509;144510;144511;144512;144513 144513 36 FDSLTDLVEHYKK Unmodified 1593.8039 0.80387296 2898 Q06124;A0A1W2PPU4;H0YF12 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 3 3 91.448 91.448 2;3;4 7.077E-05 93085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.925 80.779 973060000 0 55445000 47712000 60601000 63158000 0 52456000 132320000 182310000 28833000 96405000 109490000 144340000 12967 2898 12169 114107;114108;114109;114110;114111;114112;114113;114114;114115;114116;114117;114118;114119;114120;114121;114122;114123;114124;114125;114126 144514;144515;144516;144517;144518;144519;144520;144521;144522;144523;144524;144525;144526;144527;144528;144529;144530;144531;144532;144533;144534;144535 144522 20 FDSNHNPEEPNIIR Unmodified 1680.7856 0.78559713 3936 Q96RT1 ERBB2IP Protein LAP2 yes yes 0 0 0 1 1 46.157 46.157 3 0.00078342 44102 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.556 48.178 82999000 0 0 0 0 0 0 0 0 44979000 0 0 0 38020000 12968 3936 12170 114127;114128 144536;144537 144536 2 FDSPESAEK Unmodified 1008.44 0.4400053 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0;A0A0C4DGV1;H0YKS1 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.587 20.587 2 0.0037409 13641 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.601 39.265 566420000 86889000 89177000 0 0 0 78082000 69245000 62373000 65008000 37296000 0 78350000 0 12969 140 12171 114129;114130;114131;114132;114133;114134;114135;114136 144538;144539;144540;144541;144542;144543;144544;144545;144546 144543 9 FDSPESHVGVAWR Unmodified 1485.7001 0.70007659 1988 P0DN79;P35520 CBS Cystathionine beta-synthase yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 2 67.105 67.105 2;3 0.00032927 66826 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.809 45.433 578070000 0 67712000 63338000 44435000 0 27358000 40462000 82263000 55218000 35653000 55408000 37457000 68766000 12970 1988 12172 114137;114138;114139;114140;114141;114142;114143;114144;114145;114146;114147;114148;114149;114150;114151;114152;114153;114154 144547;144548;144549;144550;144551;144552;144553;144554;144555;144556;144557;144558;144559;144560;144561;144562;144563;144564;144565;144566 144556 19 FDSSHDRNEPFVFSLGK Unmodified 1980.933 0.93298965 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 83.677 83.677 3 0.015076 86556 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.557 28.677 37407000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37407000 0 0 12971 2998 12173 114155 144567 144567 1 FDTDELNFPTEK Unmodified 1454.6565 0.65654002 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.815 97.815 2 0.0037598 100714 QUIQUE_C1368_190116_001 110.84 90.061 1304900000 182850000 0 280800000 0 0 110930000 0 142580000 176310000 53483000 173520000 0 184450000 12972 590 12174 114156;114157;114158;114159;114160;114161;114162;114163 144568;144569;144570;144571;144572;144573;144574;144575;144576;144577 144569 7 FDTEEEAIAIANAADVGLAGYFYSQDPAQIWR Unmodified 3530.663 0.66302897 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 175.24 175.24 3 4.3844E-20 182496 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.276 67.648 143820000 0 0 0 0 0 0 0 0 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144664 5 FDVSGLTTEQMLR Unmodified 1495.7341 0.73407884 3484 Q86TP1;A0A3B3ITN0;Q5SZG1;Q5SZF2 PRUNE Protein prune homolog yes no 0 0 0 1 1 1 115.21 115.21 2 0.0043683 119420 QUIQUE_C1368_190116_001 83.397 62.526 199090000 0 60649000 76621000 0 0 61817000 0 0 0 0 0 0 0 12990 3484 12192 114248;114249;114250 144669;144670;144671 144670 3 FDVSGYPTLK Unmodified 1125.5706 0.57062555 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 81.231 81.231 2 0.003115 85823 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.136 0 1343100000 133930000 66658000 77062000 91672000 131540000 132650000 98427000 45859000 100910000 69309000 178050000 94440000 122560000 12991 2059 12193 114251;114252;114253;114254;114255;114256;114257;114258;114259;114260;114261;114262;114263;114264;114265;114266;114267;114268;114269;114270;114271 144672;144673;144674;144675;144676;144677;144678;144679;144680;144681;144682;144683;144684;144685;144686;144687;144688;144689;144690;144691;144692;144693;144694;144695;144696;144697 144691 24 FDVSIDMPDLLDINHLRAR Unmodified 2239.1419 0.14193657 1239 H7C5J3;Q92995 USP13 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13 yes no 0 0 1 1 1 160.86 160.86 3 0.0013706 165501 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.412 32.47 647430000 0 0 0 0 0 0 0 354660000 292770000 0 0 0 0 12992 1239 12194 114272;114273 144698;144699 144699 2 FDVSSTSVFK Unmodified 1115.5499 0.5498901 3948 Q96TA1 FAM129B Niban-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 82.416 82.416 2 0.019828 82816 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.607 28.16 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12993 3948 12195 114274 144700 144700 1 FDWGPAPPTTFKPNSPDLAK Unmodified 2185.0844 0.084404916 673 Q5VT82;B7ZM79;Q9HC56 PCDH9 Protocadherin-9 yes no 0 0 1 1 104.11 104.11 3 0.052257 105903 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.923 33.329 31465000 0 0 0 0 0 0 0 31465000 0 0 0 0 0 12994 673 12196 114275 144701 144701 0 FDYAFDDSAPNEMVYR Unmodified 1938.8094 0.80942862 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.75 117.75 2 8.0014E-10 122717 QUIQUE_C1218_190116_001 129.34 123.31 616700000 41473000 60429000 60580000 63550000 25913000 52301000 54878000 42480000 44763000 12408000 62142000 55546000 40239000 12995 1377 12197 114276;114277;114278;114279;114280;114281;114282;114283;114284;114285;114286;114287;114288 144702;144703;144704;144705;144706;144707;144708;144709;144710;144711;144712;144713;144714;144715;144716;144717 144702 16 FDYAFDDSAPNEMVYR Oxidation (M) 1954.8043 0.80434324 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 1 0 1 102.57 102.57 2 0.00064748 104365 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.597 70.03 25510000 0 0 0 0 0 0 0 25510000 0 0 0 0 0 12996 1377 12197 114289 144718 144718 769 1 FDYSGVGSSDGNSEESTLGK Unmodified 2034.8654 0.86542318 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 74.587 74.587 2 9.5282E-30 74927 QUIQUE_C1368_190116_001 174.47 158.72 1689300000 200520000 102610000 146760000 0 126530000 141510000 124330000 186560000 139640000 69047000 159390000 125480000 166920000 12997 4297 12198 114290;114291;114292;114293;114294;114295;114296;114297;114298;114299;114300;114301;114302 144719;144720;144721;144722;144723;144724;144725;144726;144727;144728;144729;144730;144731;144732;144733;144734;144735;144736 144723 18 FDYVMQFLNK Unmodified 1303.6271 0.62709457 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.68 129.68 2 0.00033775 134208 QUIQUE_C1277_190116_001 114.28 104.33 2017800000 301760000 195400000 203280000 150040000 0 193220000 221920000 54803000 116150000 78397000 181700000 172830000 148320000 12998 1700 12199 114303;114304;114305;114306;114307;114308;114309;114310;114311;114312;114313;114314;114315 144737;144738;144739;144740;144741;144742;144743;144744;144745;144746;144747;144748;144749;144750;144751;144752;144753 144740 16 FDYVMQFLNK Oxidation (M) 1319.622 0.62200919 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 111.37 111.37 2 0.0053417 113657 QUIQUE_C1277_190116_001 80.684 63.907 47052000 0 25214000 0 0 0 0 0 0 0 21838000 0 0 0 12999 1700 12199 114316;114317;114318 144754;144755;144756 144754 933 3 FEAAETLEEAAMR Unmodified 1466.6711 0.67114423 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;H0YJU9;H0YJL0;H0YG16;H0YJT3 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.43 98.43 2 1.4723E-12 101368 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.15 91.902 594030000 0 120660000 64154000 90459000 58961000 0 73706000 0 58546000 0 0 53532000 74013000 13000 1050 12200 114319;114320;114321;114322;114323;114324;114325;114326 144757;144758;144759;144760;144761;144762;144763;144764;144765 144763 9 FEAAETLEEAAMR Oxidation (M) 1482.6661 0.66605885 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;H0YJU9;H0YJL0;H0YG16;H0YJT3 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 85.983 85.983 2 0.0091234 88738 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.408 39.668 76928000 0 0 0 28435000 0 0 0 22141000 0 0 26353000 0 0 13001 1050 12200 114327;114328;114329;114330;114331 144766;144767;144768;144769;144770 144770 622 5 FEACNYPLELYER Unmodified 1702.7661 0.76610724 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.88 109.88 2 0.00018312 114826 QUIQUE_C1438_190116_001 115.29 106.28 724790000 152170000 0 0 97390000 57292000 59758000 82496000 26609000 40109000 0 48352000 91487000 69124000 13002 1877 12201 114332;114333;114334;114335;114336;114337;114338;114339;114340;114341;114342;114343 144771;144772;144773;144774;144775;144776;144777;144778;144779;144780;144781;144782;144783 144775 12 FEAFEHENK Unmodified 1149.5091 0.50908792 4403 Q9UBQ0;F8VXU5;Q05DG7 VPS29 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 21.686 21.686 2;3 1.3861E-09 14475 QUIQUE_DMIX5_190116_001 187.78 159.6 1920200000 181400000 274680000 134160000 154840000 188460000 112210000 140000000 139180000 80326000 153650000 78114000 117410000 165810000 13003 4403 12202 114344;114345;114346;114347;114348;114349;114350;114351;114352;114353;114354;114355;114356;114357;114358;114359;114360;114361;114362;114363;114364;114365;114366;114367 144784;144785;144786;144787;144788;144789;144790;144791;144792;144793;144794;144795;144796;144797;144798;144799;144800;144801;144802;144803;144804;144805;144806;144807;144808;144809;144810;144811 144807 28 FEAHPNDLYVEGLPENIPFR Unmodified 2356.1488 0.14879609 2805 P78347 GTF2I General transcription factor II-I yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 126.02 126.02 3 0.0002637 130174 QUIQUE_C1277_190116_001 60.621 52.434 1026000000 0 108340000 84444000 98592000 82112000 91118000 63611000 107230000 110220000 0 99610000 94275000 86395000 13004 2805 12203 114368;114369;114370;114371;114372;114373;114374;114375;114376;114377;114378;114379 144812;144813;144814;144815;144816;144817;144818;144819;144820;144821;144822;144823;144824;144825;144826 144812 13 FEALAAHDALVELSGAMNTTACSLMK Unmodified 2750.3078 0.30775762 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.36 158.36 2;3 1.2847E-36 164046 QUIQUE_C1218_190116_001 168.89 151.81 1389400000 252120000 102310000 221950000 110140000 77537000 132400000 155860000 35134000 51374000 32872000 0 96065000 121680000 13005 1935 12204 114380;114381;114382;114383;114384;114385;114386;114387;114388;114389;114390;114391;114392;114393 144827;144828;144829;144830;144831;144832;144833;144834;144835;144836;144837;144838;144839;144840;144841;144842;144843 144828 17 FEALAAHDALVELSGAMNTTACSLMK Oxidation (M) 2766.3027 0.30267225 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 147.68 147.68 3 3.5889E-09 151929 QUIQUE_C1277_190116_001 68.445 64.913 52443000 0 31211000 0 0 0 0 0 0 0 21232000 0 0 0 13006 1935 12204 114394;114395 144844;144845 144844 1167 1 FEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTR Unmodified 3937.0262 0.026168341 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 0 2 2 174.99 174.99 3;4 2.0879E-16 179024 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.525 66.124 80777000 0 0 0 0 0 0 0 0 37105000 0 43672000 0 0 13007 2715 12205 114396;114397;114398;114399 144846;144847;144848;144849 144847 4 FEAPLFNAR Unmodified 1063.5451 0.5450795 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.325 82.325 2 0.00048694 79972 QUIQUE_DMIX4_190116_001 127.12 113.54 4831500000 464520000 378900000 457990000 295770000 254110000 323240000 402520000 276820000 427120000 186210000 531980000 419680000 412690000 13008 2280 12206 114400;114401;114402;114403;114404;114405;114406;114407;114408;114409;114410;114411;114412 144850;144851;144852;144853;144854;144855;144856;144857;144858;144859;144860;144861;144862;144863;144864;144865 144861 15 FEAWLAEVEGR Unmodified 1305.6354 0.63535107 671 B7ZL14;Q96RU3;H0Y7W6 FNBP1 Formin-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 114.69 114.69 2 0.0063248 120532 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.228 49.844 22069000 0 0 22069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13009 671 12207 114413;114414;114415;114416;114417 144866;144867;144868;144869;144870 144869 5 FEDATVQSDMK Oxidation (M) 1285.5496 0.54963211 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 23.089 23.089 2 0.016481 16349 QUIQUE_DMIX8_190116_001 59.067 49.885 126980000 0 0 0 20786000 0 22704000 0 0 0 0 30420000 27627000 25444000 13010 2643 12208 114418;114419;114420;114421;114422 144871;144872;144873;144874;144875 144875 2082 5 FEDCFEIVSPK Unmodified 1369.6224 0.62240312 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 94.799 94.799 2 0.0040262 97704 QUIQUE_C1218_190116_001 72.434 56.772 15966000 15966000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13011 2357 12209 114423 144876 144876 1 FEDENFILK Unmodified 1153.5655 0.56554017 2772 P62937;F8WE65;C9J5S7 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 3 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.394 89.394 2 5.5789E-10 90792 QUIQUE_C1277_190116_001 176.4 94.766 69126000000 7893700000 7516600000 7183400000 6101900000 5827600000 6708500000 5878700000 1978200000 3283700000 3656300000 5105600000 3649200000 4342100000 13012 2772 12210 114424;114425;114426;114427;114428;114429;114430;114431;114432;114433;114434;114435;114436;114437;114438;114439;114440;114441 144877;144878;144879;144880;144881;144882;144883;144884;144885;144886;144887;144888;144889;144890;144891;144892;144893;144894;144895;144896;144897;144898;144899;144900;144901;144902;144903;144904;144905;144906;144907;144908;144909;144910;144911;144912;144913 144881 37 FEDFEPSDSR Unmodified 1227.5044 0.50439647 3311 Q5T447 HECTD3 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3 yes yes 0 0 0 1 52.986 52.986 2 0.029682 50920 QUIQUE_C1277_190116_001 54.608 15.061 21900000 0 21900000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13013 3311 12211 114442 144914 144914 1 FEDFLAR Unmodified 896.43922 0.43921744 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.876 75.876 2 0.019293 76420 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.02 58.582 788680000 91781000 69511000 0 104640000 65872000 0 93534000 49114000 72409000 0 82667000 72415000 86736000 13014 4487 12212 114443;114444;114445;114446;114447;114448;114449;114450;114451;114452 144915;144916;144917;144918;144919;144920;144921;144922;144923;144924 144921 10 FEDFVTALSILLR Unmodified 1522.8395 0.83953018 31 A0A087WTU8;A0A0C4DFQ7;A0A0A0MS16;A0A1B0GTZ7;Q9NZI2 KCNIP1 Kv channel-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.52 173.52 2 0.00038085 177663 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.616 77.18 105420000 7416900 4964500 5520100 0 6658200 0 16564000 9779700 10659000 0 14476000 19361000 10015000 13015 31 12213 114453;114454;114455;114456;114457;114458;114459;114460;114461;114462;114463 144925;144926;144927;144928;144929;144930;144931;144932;144933;144934;144935;144936 144932 12 FEDGGYVVCNTR Unmodified 1415.614 0.6139637 1383 O00182;J3KSY2;Q6DKI2;Q3B8N2;J3QSH0;J3KS82;J3KT17;J3QR96 LGALS9;LGALS9C;LGALS9B Galectin-9;Galectin;Galectin-9C;Galectin-9B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.966 53.966 2 0.00015929 51745 QUIQUE_C1368_190116_001 138.25 93.168 473830000 28487000 30879000 72714000 44239000 39162000 27907000 45140000 37333000 22075000 15964000 47798000 23731000 38401000 13016 1383 12214 114464;114465;114466;114467;114468;114469;114470;114471;114472;114473;114474;114475;114476 144937;144938;144939;144940;144941;144942;144943;144944;144945;144946;144947;144948;144949;144950 144939 14 FEDGVLDPDYPR Unmodified 1421.6463 0.64630969 1848 P04004 VTN Vitronectin;Vitronectin V65 subunit;Vitronectin V10 subunit;Somatomedin-B yes yes 0 0 0 1 89.702 89.702 2 0.0080138 92373 QUIQUE_C1576_190116_001 67.726 51.393 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13017 1848 12215 114477 144951 144951 1 FEDHEGLPTVVK Unmodified 1369.6878 0.68778057 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 51.427 51.427 2 8.5339E-05 50003 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.66 72.937 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13018 617 12216 114478;114479;114480 144952;144953;144954 144954 3 FEDKTVAYTEQK Unmodified 1457.7038 0.70382456 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 1 1 26.831 26.831 2 0.010874 20866 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.889 58.426 39567000 0 0 0 0 0 0 0 39567000 0 0 0 0 0 13019 2308 12217 114481 144955 144955 1 FEDLEVSTFER Unmodified 1370.6354 0.63541065 1348 K7ERC8;Q06136 KDSR 3-ketodihydrosphingosine reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.039 96.039 2 0.00018514 98442 QUIQUE_C1277_190116_001 125.48 116.5 536560000 62618000 59125000 0 58137000 0 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144975;144976;144977;144978;144979;144980 144979 3 FEDYLNAESR Unmodified 1242.5517 0.55168102 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4 SEPT7 Septin-7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.275 65.275 2 4.815E-14 64944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 180.44 154.5 23287000000 1809000000 1991400000 2640100000 1863400000 1762800000 1786300000 2141000000 969030000 1482300000 897150000 2429200000 1565400000 1949900000 13023 3171 12221 114505;114506;114507;114508;114509;114510;114511;114512;114513;114514;114515;114516;114517 144981;144982;144983;144984;144985;144986;144987;144988;144989;144990;144991;144992;144993;144994;144995;144996;144997;144998;144999;145000;145001;145002;145003;145004;145005 144991 25 FEEAENSLLHLK Unmodified 1428.7249 0.72489436 300 A0A0J9YXF2;A0A0J9YYG4;Q15165;J3QT77;G3XAK4;A0A0J9YXU7 PON2 Serum paraoxonase/arylesterase 2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 71.026 71.026 2;3 6.2536E-06 72540 QUIQUE_C1218_190116_001 134.57 112.23 2108600000 358320000 403520000 190390000 184550000 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114537;114538;114539;114540;114541;114542;114543;114544;114545;114546 145026;145027;145028;145029;145030;145031;145032;145033;145034;145035 145027 10 FEEDIINSMSNSPATSKPPVTLR Oxidation (M) 2548.2479 0.24791778 916 E9PFP8;P57721;J3QT27 PCBP3 Poly(rC)-binding protein 3 yes no 0 1 1 1 1 1 1 83.884 83.884 3 2.6703E-10 85132 QUIQUE_C1277_190116_001 85.805 83.723 150110000 43629000 39867000 29293000 0 0 37320000 0 0 0 0 0 0 0 13027 916 12225 114547;114548;114549;114550 145036;145037;145038;145039 145037 568 4 FEEDIINSMSNSPATSKPPVTLR Unmodified 2532.253 0.25300316 916 E9PFP8;P57721;J3QT27 PCBP3 Poly(rC)-binding protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.01 104.01 3 1.3059E-30 108723 QUIQUE_C1218_190116_001 113.42 110.41 1214400000 132710000 129620000 132310000 123060000 0 116850000 97940000 0 94877000 42353000 156690000 81550000 106440000 13028 916 12225 114551;114552;114553;114554;114555;114556;114557;114558;114559;114560;114561 145040;145041;145042;145043;145044;145045;145046;145047;145048;145049;145050;145051 145040 12 FEEEDDDDDFPAPSDGYYR Unmodified 2280.8607 0.86073173 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.44 101.44 2 3.9534E-75 103164 QUIQUE_DMIX1_190116_001 195.71 192.93 238020000 0 0 0 0 47305000 0 0 55794000 0 0 49865000 43640000 41411000 13029 3434 12226 114562;114563;114564;114565;114566;114567 145052;145053;145054;145055;145056;145057 145054 6 FEEEIKAEQEER Unmodified 1535.7104 0.71036651 3815 Q96C19 EFHD2 EF-hand domain-containing protein D2 yes yes 0 0 1 2 1 1 31.035 31.035 2;3 0.0019053 25203 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.86 69.92 123300000 0 0 0 74683000 0 0 0 15064000 0 0 0 0 33551000 13030 3815 12227 114568;114569;114570;114571 145058;145059;145060;145061 145061 4 FEEELAAR Unmodified 963.46616 0.46616048 2877 Q02818 NUCB1 Nucleobindin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 36.822 36.822 2 0.020244 32606 QUIQUE_C1438_190116_001 77.058 56.359 96307000 41204000 0 24900000 0 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FEEKVEQGGER Unmodified 1306.6153 0.61534391 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 1 2 16.581 16.581 2;3 0.012784 9103 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.338 58.598 66697000 0 0 0 0 0 0 0 66697000 0 0 0 0 0 13034 4662 12231 114588;114589 145085;145086 145086 2 FEELCSDLFR Unmodified 1314.5914 0.59143734 282;2117 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;P17066;P48741 HSPA1B;HSPA1A;HSPA6;HSPA7 Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 6;Putative heat shock 70 kDa protein 7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.87 107.87 2 2.5915E-14 111246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.65 155.62 13307000000 1160100000 1253900000 1410300000 1340100000 1052800000 1465200000 1398700000 401970000 672160000 761940000 938370000 657960000 793340000 13035 282;2117 12232 114590;114591;114592;114593;114594;114595;114596;114597;114598;114599;114600;114601;114602 145087;145088;145089;145090;145091;145092;145093;145094;145095;145096;145097;145098;145099;145100;145101;145102;145103;145104;145105;145106;145107;145108;145109;145110;145111 145103 23 FEELFPDWIFPSESER Unmodified 2026.9313 0.93125832 2473 P45984 MAPK9 Mitogen-activated protein kinase 9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 165.08 165.08 2 2.2292E-05 168998 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.56 79.33 311300000 25099000 32714000 22813000 24774000 27678000 22446000 39118000 0 23273000 4166000 33184000 31876000 24160000 13036 2473 12233 114603;114604;114605;114606;114607;114608;114609;114610;114611;114612;114613;114614;114615;114616;114617 145112;145113;145114;145115;145116;145117;145118;145119;145120;145121;145122;145123;145124;145125;145126 145125 15 FEELGVK Unmodified 820.43307 0.43306943 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 0 1 1 38.734 38.734 2 0.055848 35552 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.715 16.928 441510000 0 0 0 0 0 0 0 163760000 0 0 277740000 0 0 13037 2888 12234 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subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.921 99.921 2 0.00042753 104013 QUIQUE_C1438_190116_001 119.27 67.42 525730000 56048000 62528000 0 36709000 61388000 0 41558000 53217000 46452000 26300000 42184000 50580000 48767000 13041 645 12237 114659;114660;114661;114662;114663;114664;114665;114666;114667;114668;114669;114670 145177;145178;145179;145180;145181;145182;145183;145184;145185;145186;145187;145188;145189;145190 145182 13 FEEMIQQIK Unmodified 1164.5849 0.5848954 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 68.045 68.045 2 0.003868 67721 QUIQUE_C1403_190116_001 90.308 72.489 68571000 0 0 0 68571000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13042 2514 12238 114671 145191 145191 1 FEEQGASDLAK Unmodified 1193.5564 0.55643205 3454 Q7Z2Z2 EFTUD1 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 33.32 33.32 2 0.010536 28408 QUIQUE_C1403_190116_001 62.201 35.818 25889000 0 0 0 25889000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13043 3454 12239 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17.701 2 0.00048805 10332 QUIQUE_C1218_190116_001 114.89 73.948 14857000000 2084700000 1286300000 1549900000 1733300000 911460000 1904100000 795570000 387410000 1189500000 1084500000 489920000 808060000 632200000 13046 2855 12242 114686;114687;114688;114689;114690;114691;114692;114693;114694;114695;114696;114697;114698 145209;145210;145211;145212;145213;145214;145215;145216;145217;145218;145219;145220;145221;145222;145223;145224 145209 16 FEEVAWSK Unmodified 994.476 0.47599688 4341 Q9NZ94 NLGN3 Neuroligin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.578 57.578 2 0.016365 56423 QUIQUE_C1576_190116_001 83.265 36.198 105150000 0 30627000 0 20745000 0 0 29179000 0 0 0 0 24597000 0 13047 4341 12243 114699;114700;114701;114702;114703 145225;145226;145227;145228;145229;145230 145227 6 FEFPEQLPLDEFLQK Unmodified 1878.9404 0.94036644 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.23 101.23 2 1.5234E-06 166148 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145317;145318;145319;145320;145321;145322;145323;145324;145325;145326;145327;145328;145329;145330;145331;145332;145333;145334;145335;145336;145337;145338;145339;145340;145341;145342;145343;145344 145327 17 FEHCNFNDVTTRLR Unmodified 1807.8424 0.84240051 471 E9PNW4;A0A2U3TZL5;E9PR17;P13987 CD59 CD59 glycoprotein yes no 0 0 1 1 130.36 130.36 4 0.040287 134922 QUIQUE_DMIX3_190116_001 25.718 12.885 20832000 0 0 0 0 0 0 0 0 20832000 0 0 0 0 13059 471 12255 114807 145345 145345 1 FEHGGQDSVYWK Unmodified 1451.647 0.64697839 405 A0A286YF37;Q9UK22 FBXO2 F-box only protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 42.465 42.465 2;3 3.8208E-07 38092 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.46 127.59 18789000000 1091400000 1336500000 949300000 1491600000 1371000000 1739700000 1565700000 1596200000 1677700000 496240000 1916900000 1256800000 2300200000 13060 405 12256 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806.41742 0.41741937 3850 Q96FC7 PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 31.989 31.989 2 0.041681 26990 QUIQUE_C1277_190116_001 81.784 33.61 1349700000 0 276030000 0 328510000 0 336060000 0 0 213660000 0 195480000 0 0 13062 3850 12258 114839;114840;114841;114842;114843 145399;145400;145401;145402;145403 145399 5 FEIAETVR Unmodified 963.50255 0.50254598 4701 yes no 0 0 0 1 1 1 20.345 20.345 2 0.036566 13191 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.714 0 103660000 0 0 0 0 0 0 0 36076000 21504000 0 46081000 0 0 + 13063 4701 12259 114844;114845;114846 145404;145405;145406 145406 3 FEIGEGENLDLPYGLER Unmodified 1949.9371 0.93707198 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 136.81 136.81 2;3 4.8801E-10 140908 QUIQUE_C1277_190116_001 116.98 102.72 1112600000 132210000 135750000 105570000 0 162420000 173750000 133910000 0 0 0 172010000 0 97015000 13064 2876 12260 114847;114848;114849;114850;114851;114852;114853;114854;114855 145407;145408;145409;145410;145411;145412;145413;145414;145415;145416 145408 8 FEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELK Unmodified 3712.6502 0.65020018 1010;1033 F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;H0YH88;F8W118;F8VV59;F8VRJ2 NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 148.31 148.31 3 3.8984E-25 153818 QUIQUE_C1218_190116_001 91.66 89.935 214550000 47188000 35338000 0 38717000 0 28593000 64715000 0 0 0 0 0 0 13065 1010;1033 12261 114856;114857;114858;114859;114860 145417;145418;145419;145420;145421 145417 5 FEIINAIYEPTEEECEWKPDEEDEISEELKEK Unmodified 3969.7878 0.78775629 1010;1033 F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;H0YH88;F8W118;F8VV59;F8VRJ2 NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 2 1 1 1 2 2 1 139.04 139.04 3;4 1.0634E-36 145874 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.56 103.56 996430000 0 0 94397000 94713000 0 0 123050000 0 0 0 294220000 253320000 136730000 13066 1010;1033 12262 114861;114862;114863;114864;114865;114866;114867;114868 145422;145423;145424;145425;145426;145427;145428;145429;145430 145425 9 FEIPYFTTSGIQVR Unmodified 1656.8512 0.8511575 4065 Q9BXS5;E7ENJ6;K7EJL1 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 140.94 140.94 2 0.00086135 148001 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.763 69.838 135270000 0 0 0 0 71948000 0 0 0 0 0 63319000 0 0 13067 4065 12263 114869;114870;114871;114872;114873;114874 145431;145432;145433;145434;145435;145436 145435 6 FEISAIR Unmodified 834.45995 0.45995289 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.478 62.478 2 0.0099023 62314 QUIQUE_C1438_190116_001 144.29 72.274 1429500000 102770000 97223000 109900000 124250000 131850000 91068000 93524000 90672000 104640000 66875000 152550000 133640000 130520000 13068 3857 12264 114875;114876;114877;114878;114879;114880;114881;114882;114883;114884;114885;114886;114887 145437;145438;145439;145440;145441;145442;145443;145444;145445;145446;145447;145448;145449;145450;145451 145443 15 FEITVGPK Unmodified 889.49092 0.49091866 2632 P53677;E5RJ52 AP3M2 AP-3 complex subunit mu-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.442 59.442 2 0.020244 58365 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.058 43.319 387690000 0 83875000 0 70234000 72275000 0 0 49850000 0 0 0 54058000 57400000 13069 2632 12265 114888;114889;114890;114891;114892;114893 145452;145453;145454;145455;145456;145457 145456 6 FEIVYNLLSLR Unmodified 1365.7656 0.76563696 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.72 149.72 2 0.00025017 156727 QUIQUE_DMIX5_190116_001 140.45 113.33 3764500000 252220000 337760000 307100000 204060000 271140000 267010000 287350000 244090000 312380000 121560000 489170000 393310000 277350000 13070 1639 12266 114894;114895;114896;114897;114898;114899;114900;114901;114902;114903;114904;114905;114906 145458;145459;145460;145461;145462;145463;145464;145465;145466;145467;145468;145469;145470;145471;145472;145473;145474;145475;145476;145477;145478;145479;145480;145481;145482;145483;145484;145485;145486;145487;145488 145482 31 FEIWDTAGQER Unmodified 1350.6204 0.62042929 2575;2166;2708 P51148;K7ERI8;K7ERQ8;F8VVK3;K7ENY4;F8VWU4;F8VVZ0;P20339;P61020;F8VUA5 RAB5C;RAB5B;RAB5A Ras-related protein Rab-5C;Ras-related protein Rab-5A;Ras-related protein Rab-5B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.194 91.194 2 3.5298E-05 92476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.66 117.79 4074800000 421940000 450800000 466350000 488240000 320580000 398210000 414160000 133070000 227210000 176470000 310450000 0 267300000 13071 2575;2166;2708 12267 114907;114908;114909;114910;114911;114912;114913;114914;114915;114916;114917;114918;114919 145489;145490;145491;145492;145493;145494;145495;145496;145497;145498;145499;145500;145501;145502;145503;145504;145505;145506;145507;145508;145509;145510;145511;145512;145513 145504 25 FEKEAAEMGK Unmodified 1138.5329 0.53285983 2794;469 A0A2U3TZH3;Q05639;A0A2R8Y488;A0A2R8Y660;A0A2R8YDN5;P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01;Q5JR01;A6PW80 EEF1A2;EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 2;Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha no no 0 0 1 1 1 1 1 15.436 15.436 3 0.013859 7399 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.971 37.685 105650000 0 0 0 0 0 0 0 42298000 20866000 0 25761000 0 16729000 13072 469;2794 12268 114920;114921;114922;114923 145514;145515;145516;145517 145517 3 FELALQLGELK Unmodified 1259.7125 0.71253876 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.63 129.63 2 0.00046242 133848 QUIQUE_C1277_190116_001 114.4 89.002 191990000 23365000 28112000 25996000 0 28814000 0 35087000 0 18127000 0 32489000 0 0 13073 2380 12269 114924;114925;114926;114927;114928;114929;114930;114931;114932 145518;145519;145520;145521;145522;145523;145524;145525;145526 145519 9 FELAVDAVHR Unmodified 1155.6037 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25 FELDTSER Unmodified 995.45599 0.45598972 1869 P04844 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 46.042 46.042 2 0.022525 43884 QUIQUE_C1438_190116_001 74.127 44.554 71781000 0 0 24595000 0 17499000 0 29687000 0 0 0 0 0 0 13076 1869 12272 114959;114960;114961 145556;145557;145558 145557 3 FELFVMK Unmodified 912.47791 0.47791114 3103 Q15046 KARS Lysine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.37 107.37 2 0.021961 111821 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.29 75.179 536500000 39708000 46586000 63374000 45309000 35000000 43922000 42915000 35582000 0 0 79837000 54329000 49939000 13077 3103 12273 114962;114963;114964;114965;114966;114967;114968;114969;114970;114971;114972 145559;145560;145561;145562;145563;145564;145565;145566;145567;145568;145569;145570;145571;145572 145569 14 FELLCSPLFNK Unmodified 1366.6955 0.69550848 2936 Q0VDF9 HSPA14 Heat shock 70 kDa protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 130.89 130.89 2 0.0013793 135867 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145582;145583;145584;145585;145586;145587;145588;145589;145590;145591;145592;145593;145594;145595;145596 145588 10 FELSENCSERPGLR Unmodified 1692.789 0.78896795 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 53.125 53.125 2;3 0.00015392 51968 QUIQUE_C1218_190116_001 87.498 63.617 1070900000 258950000 52626000 79953000 59636000 57721000 0 60661000 0 101200000 59693000 140480000 0 199960000 13081 890;3052 12277 114995;114996;114997;114998;114999;115000;115001;115002;115003;115004;115005;115006;115007;115008;115009 145597;145598;145599;145600;145601;145602;145603;145604;145605;145606;145607;145608;145609;145610;145611 145597 15 FELTGIPPAPR Unmodified 1196.6554 0.65535823 2010;558 A8K7Q2;E9PS65;E9PM13;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 0 1 1 1 91.614 91.614 2 0.037801 93901 QUIQUE_C1277_190116_001 60.436 26.184 349520000 0 112900000 0 0 127580000 109040000 0 0 0 0 0 0 0 13082 558;2010 12278 115010;115011;115012 145612;145613;145614 145612 2 FEMEQNLR Oxidation (M) 1081.4862 0.48624399 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 1 0 1 1 24.137 24.137 2 0.042726 17749 QUIQUE_C1438_190116_001 63.054 45.068 68362000 37509000 0 0 0 30853000 0 0 0 0 0 0 0 0 + 13083 780 12279 115013;115014 145615;145616 145616 2 FEMEQNLR Unmodified 1065.4913 0.49132937 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 50.855 50.855 2 0.044601 45918 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.178 58.475 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 13084 780 12279 115015 145617 145617 1 FENAAAGNKPEAVEVTFADFDGVLYHISNPNGDK Unmodified 3635.7169 0.71685545 1486 O15144;C9JTV5;G5E9J0 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 145.92 145.92 3;4 3.4698E-31 150791 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.636 89.174 1867200000 97591000 195810000 145740000 169330000 130670000 147150000 157340000 34845000 0 60871000 319710000 242830000 165350000 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115032;115033;115034;115035;115036;115037;115038;115039;115040;115041;115042;115043;115044;115045;115046;115047;115048;115049;115050;115051;115052;115053;115054;115055;115056;115057;115058;115059;115060;115061;115062;115063;115064;115065;115066;115067;115068;115069;115070;115071 145635;145636;145637;145638;145639;145640;145641;145642;145643;145644;145645;145646;145647;145648;145649;145650;145651;145652;145653;145654;145655;145656;145657;145658;145659;145660;145661;145662;145663;145664;145665;145666;145667;145668;145669;145670;145671;145672;145673;145674;145675;145676;145677;145678;145679;145680;145681;145682;145683;145684;145685;145686;145687;145688;145689;145690;145691;145692;145693;145694;145695;145696;145697;145698;145699;145700;145701;145702;145703;145704;145705;145706;145707;145708;145709;145710;145711;145712;145713;145714;145715;145716;145717;145718 145686 83 FENSIESLR Unmodified 1093.5404 0.54038805 2824 P83111 LACTB Serine beta-lactamase-like protein LACTB, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 57.669 57.669 2 0.053957 55761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.679 22.903 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13088 2824 12283 115072 145719 145719 1 FENTYIEACLDFIKDHLVNTETK Unmodified 2799.3425 0.34254645 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 153.9 153.9 3;4 3.5054E-14 158055 QUIQUE_C1277_190116_001 107.56 101.67 1229900000 63696000 157080000 91915000 116930000 48654000 147720000 64153000 153620000 104450000 22318000 119130000 140230000 0 13089 4304 12284 115073;115074;115075;115076;115077;115078;115079;115080;115081;115082;115083;115084;115085;115086;115087 145720;145721;145722;145723;145724;145725;145726;145727;145728;145729;145730;145731;145732;145733;145734;145735 145721 15 FEPGILQLSQWFK Unmodified 1591.8399 0.83986454 3614 Q8N8N7;G3V3Y1;G3V2R9 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.79 159.79 2 0.00012162 163951 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.52 90.191 671840000 44813000 52751000 48798000 42528000 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96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 75.506 75.506 3;4 9.2961E-18 75966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.79 93.754 1048900000 0 89100000 115900000 88796000 222080000 120720000 0 105960000 164470000 0 141910000 0 0 13092 96 12286 115115;115116;115117;115118;115119;115120;115121;115122;115123 145776;145777;145778;145779;145780;145781;145782;145783;145784 145781 68 8 FEPPLFHPNVYPSGTVCLSILEEDKDWRPAITIK Unmodified 3968.0182 0.018246192 577 H3BQQ9;B0QYN7;P63279 UBE2I SUMO-conjugating enzyme UBC9 yes no 0 0 2 1 1 143.46 143.46 5 3.5351E-05 146314 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.477 31.478 200670000 0 0 0 0 0 0 130590000 70076000 0 0 0 0 0 13093 577 12287 115124;115125 145785;145786 145786 2 FEPQINAEESEIR Unmodified 1560.742 0.74200098 2348 P32189;Q14409 GK;GK3P Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 72.744 72.744 2 0.0040675 73387 QUIQUE_C1576_190116_001 69.672 39.649 287110000 41273000 0 0 63413000 0 0 68604000 44641000 0 0 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145868;145869;145870;145871;145872;145873;145874;145875;145876 145870 9 FESKPQSQEVK Unmodified 1305.6565 0.65648044 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 1 1 11.004 11.004 3 0.028262 3408 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.786 29.155 9926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9926000 0 0 0 13104 3154 12298 115195 145877 145877 0 FESLEPEMNNQASR Oxidation (M) 1666.7257 0.72569899 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.189 43.189 2 7.1937E-14 40842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.89 137.58 4457400000 33206000 468430000 279000000 0 402410000 203300000 33664000 518030000 593570000 234040000 589700000 526440000 575560000 13105 2851 12299 115196;115197;115198;115199;115200;115201;115202;115203;115204;115205;115206;115207;115208 145878;145879;145880;145881;145882;145883;145884;145885;145886;145887;145888;145889;145890;145891;145892;145893;145894 145885 2296 17 FESLEPEMNNQASR Unmodified 1650.7308 0.73078437 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.235 62.235 2 2.2063E-71 61798 QUIQUE_DMIX3_190116_001 205.52 162.78 7596900000 655780000 820070000 644310000 579890000 684440000 463090000 730590000 0 637710000 199230000 837600000 622010000 722240000 13106 2851 12299 115209;115210;115211;115212;115213;115214;115215;115216;115217;115218;115219;115220;115221 145895;145896;145897;145898;145899;145900;145901;145902;145903;145904;145905;145906;145907;145908;145909;145910;145911;145912;145913;145914;145915;145916;145917;145918;145919;145920;145921;145922 145913 28 FESPEVAER Unmodified 1062.4982 0.49818889 2603 P52272;A0A087X0X3 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.294 35.294 2 0.00048677 31695 QUIQUE_C1218_190116_001 114.99 92.207 1692400000 132660000 142520000 139940000 130900000 139870000 134190000 131020000 116140000 128150000 65320000 160320000 134280000 137130000 13107 2603 12300 115222;115223;115224;115225;115226;115227;115228;115229;115230;115231;115232;115233;115234 145923;145924;145925;145926;145927;145928;145929;145930;145931;145932;145933;145934;145935;145936;145937;145938;145939;145940;145941;145942;145943;145944;145945 145924 23 FESVHPNIYAIYDLIER Unmodified 2078.0473 0.047291129 3913 Q96P47;C9J975 AGAP3 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 142.76 142.76 2;3 3.3495E-07 147000 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.468 83.625 1100800000 84458000 142030000 102460000 0 146620000 80258000 102550000 69596000 36138000 0 138270000 137010000 61365000 13108 3913 12301 115235;115236;115237;115238;115239;115240;115241;115242;115243;115244;115245;115246;115247;115248;115249 145946;145947;145948;145949;145950;145951;145952;145953;145954;145955;145956;145957;145958;145959;145960;145961 145959 14 FESVHPNIYSIYELLER Unmodified 2108.0579 0.057855815 4521 Q9UPQ3;A0A0U1RRF1 AGAP1 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 145.85 145.85 3 9.1265E-05 152842 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.46 57.337 91501000 0 0 0 0 0 0 23143000 0 0 0 30830000 37529000 0 13109 4521 12302 115250;115251;115252 145962;145963;145964 145963 2 FETEQALR Unmodified 992.49271 0.49270958 773 CON__P08727;P08727;C9JM50 KRT19 Keratin, type I cytoskeletal 19 no no 0 0 0 1 63.679 63.679 2 0.062361 62211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.683 21.679 45706000 0 0 0 0 0 0 0 45706000 0 0 0 0 0 + 13110 773 12303 115253 145965;145966 145965 2 FETFCLDPSLVTK Unmodified 1555.7592 0.75923095 4428 Q9UHB9 SRP68 Signal recognition particle subunit SRP68 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 124.23 124.23 2 0.0083393 127053 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.435 42.763 352630000 48805000 0 54492000 51488000 55043000 0 49455000 47168000 25119000 21062000 0 0 0 13111 4428 12304 115254;115255;115256;115257;115258;115259;115260;115261 145967;145968;145969;145970;145971;145972;145973;145974;145975 145973 8 FETLEPEMNTLAAQITAVNDIAEQLLK Unmodified 3001.5318 0.53180378 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 178.23 178.23 3 0.014387 183626 QUIQUE_C1438_190116_001 39.506 37.056 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13112 1472 12305 115262 145976 145976 1 FETLEPEMNTLAAQITAVNDIAEQLLK Oxidation (M) 3017.5267 0.52671841 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 1 0 1 174.32 174.32 3 1.6626E-08 179122 QUIQUE_C1576_190116_001 62.1 55.805 149640000 0 0 0 0 0 0 149640000 0 0 0 0 0 0 13113 1472 12305 115263 145977 145977 816 1 FEVAQVESLR Unmodified 1176.6139 0.61388734 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 80.79 80.79 2 0.016178 77477 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.823 8.1005 135410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 135410000 0 0 0 13114 2041 12306 115264 145978 145978 1 FEVGDIMLIR Unmodified 1191.6322 0.63217995 1786 P00491;G3V5M2;G3V393 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.83 133.83 2 0.00014497 140147 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.09 100.53 2337000000 142260000 137220000 158640000 173710000 184550000 130620000 173010000 210720000 266650000 53131000 234130000 227150000 245260000 13115 1786 12307 115265;115266;115267;115268;115269;115270;115271;115272;115273;115274;115275;115276;115277 145979;145980;145981;145982;145983;145984;145985;145986;145987;145988;145989;145990;145991;145992;145993;145994;145995 145992 16 FEVGDIMLIR Oxidation (M) 1207.6271 0.62709457 1786 P00491;G3V5M2;G3V393 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 1 0 1 116.07 116.07 2 0.033579 119226 QUIQUE_C1403_190116_001 55.064 42.027 23332000 0 0 0 23332000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13116 1786 12307 115278 145996 145996 1 FEVIEFDDGAGSVLR Unmodified 1652.8046 0.80460124 1998 P10586;A2A437 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130 130 2 7.3101E-06 136406 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.49 90.602 373210000 0 31524000 35153000 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.64 160.64 3 2.5575E-11 166292 QUIQUE_C1218_190116_001 83.09 76.441 826360000 117410000 82364000 95048000 33168000 55258000 0 154810000 0 57734000 25459000 116900000 88209000 0 13119 64 12310 115299;115300;115301;115302;115303;115304;115305;115306;115307;115308 146019;146020;146021;146022;146023;146024;146025;146026;146027;146028 146019 9 FEVNNTILHPEIVECR Unmodified 1968.9727 0.97274598 2049 P12955 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 94.993 94.993 2;3 8.7913E-36 98660 QUIQUE_C1218_190116_001 193.06 172.68 3241500000 276920000 320590000 334780000 300880000 300160000 247430000 246440000 203890000 234640000 69270000 358470000 35896000 312130000 13120 2049 12311 115309;115310;115311;115312;115313;115314;115315;115316;115317;115318;115319;115320;115321;115322;115323;115324;115325;115326;115327;115328;115329;115330;115331;115332 146029;146030;146031;146032;146033;146034;146035;146036;146037;146038;146039;146040;146041;146042;146043;146044;146045;146046;146047;146048;146049;146050;146051;146052;146053;146054;146055 146030 26 FEVQGLQPNGEEMTLK Oxidation (M) 1834.8771 0.87711426 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.901 82.901 2 5.173E-06 85108 QUIQUE_C1218_190116_001 103.14 77.793 697210000 72579000 92188000 84338000 87939000 0 69334000 52468000 0 0 69912000 91614000 76834000 0 13121 2197 12312 115333;115334;115335;115336;115337;115338;115339;115340;115341 146056;146057;146058;146059;146060;146061;146062;146063;146064 146056 1544 7 FEVQGLQPNGEEMTLK Unmodified 1818.8822 0.88219964 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.1 101.1 2 3.0475E-29 103694 QUIQUE_C1277_190116_001 199.8 167.28 1842900000 284040000 217890000 245160000 0 191600000 208060000 229260000 63830000 90346000 89514000 0 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phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.68 102.68 2 0.00046562 106663 QUIQUE_C1576_190116_001 131.06 101.91 635370000 53225000 0 65016000 53913000 55951000 52545000 56491000 47529000 48844000 0 67270000 55203000 79386000 13125 4474 12315 115362;115363;115364;115365;115366;115367;115368;115369;115370;115371;115372 146086;146087;146088;146089;146090;146091;146092;146093;146094;146095;146096;146097;146098 146093 12 FFADDTQAALTK Unmodified 1326.6456 0.6455814 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.099 73.099 2 0.00054662 73080 QUIQUE_C1403_190116_001 109.42 85.99 771190000 0 67155000 120240000 65873000 53311000 65232000 85200000 55350000 57773000 33552000 99552000 67948000 0 13126 1692 12316 115373;115374;115375;115376;115377;115378;115379;115380;115381;115382;115383 146099;146100;146101;146102;146103;146104;146105;146106;146107;146108;146109;146110;146111;146112;146113;146114 146102 16 FFADLLDYIK Unmodified 1243.6489 0.64887587 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.79 156.79 2 0.0044813 161221 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.629 77.175 6095800000 399200000 618960000 524320000 490640000 506760000 365280000 517210000 400580000 490220000 141200000 597870000 519780000 523800000 13127 1787 12317 115384;115385;115386;115387;115388;115389;115390;115391;115392;115393;115394;115395;115396 146115;146116;146117;146118;146119;146120;146121;146122;146123;146124;146125;146126;146127;146128;146129;146130;146131;146132;146133;146134 146134 20 FFAGIVWQHVYEK Unmodified 1622.8245 0.82454882 2335 P31749;A0A087WY56;G3V3X1;G3V2I6 AKT1 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase yes no 0 0 0 1 109.66 109.66 3 0.04927 113998 QUIQUE_C1576_190116_001 45.507 38.674 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13128 2335 12318 115397 146135 146135 1 FFALVNALDEHLFPVR Unmodified 1887.0043 0.004304102 3908 Q96N67;A0A0U1RRC1;A0A0U1RQJ5 DOCK7 Dedicator of cytokinesis protein 7 yes no 0 0 0 1 153.25 153.25 3 0.00015339 157561 QUIQUE_C1277_190116_001 66.246 52.342 19020000 0 19020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13129 3908 12319 115398 146136 146136 1 FFAPAILSPNLFQLTPHHTDPQTSR Unmodified 2834.4504 0.45039784 3075 Q14644 RASA3 Ras GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 132.57 132.57 4 1.4855E-10 136927 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.646 72.236 157040000 0 0 0 0 0 0 0 0 58845000 0 0 45482000 52715000 13130 3075 12320 115399;115400;115401 146137;146138;146139 146138 3 FFAPECGR Unmodified 982.43309 0.43308621 3865 Q96HC4;H0Y8Y3;A0A0A0MSP3 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.078 41.078 2 0.0061791 36626 QUIQUE_C1368_190116_001 102.72 91.351 974200000 92830000 115800000 121220000 106020000 101780000 0 85559000 84439000 62012000 0 73020000 78871000 52647000 13131 3865 12321 115402;115403;115404;115405;115406;115407;115408;115409;115410;115411;115412 146140;146141;146142;146143;146144;146145;146146;146147;146148;146149;146150;146151 146142 12 FFCFQVLEHQVK Unmodified 1580.781 0.78096945 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 100.05 100.05 3 0.001058 104145 QUIQUE_C1576_190116_001 60.509 49.251 133860000 0 0 0 0 69320000 0 0 0 0 0 64544000 0 0 13132 1534 12322 115413;115414;115415;115416;115417;115418;115419;115420 146152;146153;146154;146155;146156;146157;146158;146159 146155 7 FFDANYDGK Unmodified 1075.4611 0.4610751 3150;4524 Q15691;Q9UPY8;C9JB30 MAPRE1;MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1;Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.331 56.331 2 0.0015563 55514 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.51 88.738 5194900000 586260000 494740000 550920000 466680000 460550000 393020000 484000000 128280000 305860000 237110000 382880000 309420000 395150000 13133 3150;4524 12323 115421;115422;115423;115424;115425;115426;115427;115428;115429;115430;115431;115432;115433 146160;146161;146162;146163;146164;146165;146166;146167;146168;146169;146170;146171;146172;146173;146174 146172 13 FFDANYDGKDYDPVAAR Unmodified 1962.8748 0.87480607 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 86.093 86.093 2;3 1.9225E-43 87277 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.87 172.67 3988000000 0 131460000 235960000 161840000 264910000 77181000 212650000 476400000 583850000 0 554310000 539250000 750140000 13134 3150 12324 115434;115435;115436;115437;115438;115439;115440;115441;115442;115443;115444;115445;115446;115447;115448;115449;115450;115451;115452;115453;115454 146175;146176;146177;146178;146179;146180;146181;146182;146183;146184;146185;146186;146187;146188;146189;146190;146191;146192;146193;146194;146195;146196 146187 19 FFDANYDGKDYNPLLAR Unmodified 2017.9534 0.95339074 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 107.35 107.35 2;3 1.0311E-35 112149 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.6 145.37 2760700000 23337000 70402000 40917000 38862000 125010000 29564000 94634000 602100000 344150000 0 337330000 508360000 546030000 13135 4524 12325 115455;115456;115457;115458;115459;115460;115461;115462;115463;115464;115465;115466;115467;115468;115469;115470 146197;146198;146199;146200;146201;146202;146203;146204;146205;146206;146207;146208;146209;146210;146211;146212;146213;146214;146215;146216;146217;146218;146219 146213 22 FFDDDLLVSTSR Unmodified 1413.6776 0.67760981 1560 O43924 PDE6D Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.83 115.83 2 0.00081439 119886 QUIQUE_C1277_190116_001 94.363 74.576 248870000 0 0 85965000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 162900000 13136 1560 12326 115471;115472;115473;115474;115475;115476;115477;115478 146220;146221;146222;146223;146224;146225;146226;146227 146220 8 FFDDPMLLELAK Unmodified 1437.7214 0.72138888 3099 Q15029;K7EP67 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.89 146.89 2 0.00065806 151041 QUIQUE_C1277_190116_001 94.616 81.025 376240000 47395000 53817000 0 65456000 45970000 43786000 37291000 39092000 0 0 0 0 43434000 13137 3099 12327 115479;115480;115481;115482;115483;115484;115485;115486;115487 146228;146229;146230;146231;146232;146233;146234;146235;146236;146237 146229 7 FFDDPMLLELAK Oxidation (M) 1453.7163 0.71630351 3099 Q15029;K7EP67 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes no 0 1 0 1 132.69 132.69 2 0.02374 139588 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.597 25.314 24363000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24363000 0 0 13138 3099 12327 115488 146238 146238 1 FFDEESYSLLR Unmodified 1404.6561 0.65614609 2584 P51571;A6NLM8 SSR4 Translocon-associated protein subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 117.11 117.11 2 0.00040189 119803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.3 82.052 458050000 0 0 0 0 0 0 0 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FFDIQLGIK Unmodified 1079.6015 0.60153174 4499 Q9UM22;D6RIH7 EPDR1 Mammalian ependymin-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.22 122.22 2 0.0096498 126010 QUIQUE_C1277_190116_001 85.212 65.735 309590000 32981000 28180000 27686000 17360000 34601000 36691000 37545000 10396000 16960000 9567600 26644000 30978000 0 13142 4499 12331 115502;115503;115504;115505;115506;115507;115508;115509;115510;115511;115512;115513 146254;146255;146256;146257;146258;146259;146260;146261;146262;146263;146264;146265 146255 12 FFDSFGNLSSASAIMGNPK Oxidation (M) 2004.9251 0.92512708 2800 P69892;A0A2R8Y7X9;P69891 HBG2;HBG1 Hemoglobin subunit gamma-2;Hemoglobin subunit gamma-1 yes no 0 1 0 1 1 118.21 118.21 2 1.7112E-05 123511 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.69 89.965 97397000 64338000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33060000 0 0 13143 2800 12332 115514;115515 146266;146267;146268 146267 2250 3 FFDSFGNLSSASAIMGNPK Unmodified 1988.9302 0.93021246 2800 P69892;A0A2R8Y7X9;P69891 HBG2;HBG1 Hemoglobin subunit gamma-2;Hemoglobin subunit gamma-1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 137.99 137.99 2;3 6.1552E-36 142304 QUIQUE_DMIX7_190116_001 152.74 129.62 444690000 212500000 0 0 0 0 0 0 0 46928000 0 77149000 49816000 58295000 13144 2800 12332 115516;115517;115518;115519;115520;115521 146269;146270;146271;146272;146273;146274;146275 146274 6 FFDTNTSVLMK Unmodified 1301.6326 0.63257388 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 94.624 94.624 2 0.0019247 97854 QUIQUE_C1218_190116_001 81.525 42.563 92375000 25642000 0 0 0 0 0 66733000 0 0 0 0 0 0 13145 3037 12333 115522;115523 146276;146277 146276 2 FFEDHENVVEVLSDWTR Unmodified 2120.9803 0.98033378 3466 Q7Z5R6 APBB1IP Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1-interacting protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 148.66 148.66 2;3 0.00026775 155417 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.779 44.218 161070000 17849000 0 41142000 26357000 0 0 0 23079000 0 11153000 20440000 21054000 0 13146 3466 12334 115524;115525;115526;115527;115528;115529;115530;115531 146278;146279;146280;146281;146282;146283;146284;146285;146286 146285 8 FFEDYGLFMR Oxidation (M) 1339.5907 0.59070906 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.84 122.84 2 0.014129 126860 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.621 56.659 230210000 33389000 20007000 33498000 24505000 18302000 26881000 21524000 15614000 21530000 14958000 0 0 0 13147 2952 12335 115532;115533;115534;115535;115536;115537;115538;115539;115540;115541 146287;146288;146289;146290;146291;146292;146293;146294;146295;146296;146297 146296 11 FFEDYGLFMR Unmodified 1323.5958 0.59579444 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.36 137.36 2 0.0001418 141545 QUIQUE_C1403_190116_001 121.96 100.21 435560000 31210000 0 46627000 33457000 33103000 27430000 42142000 29122000 38752000 0 65963000 44710000 43045000 13148 2952 12335 115542;115543;115544;115545;115546;115547;115548;115549;115550;115551;115552;115553 146298;146299;146300;146301;146302;146303;146304;146305;146306;146307;146308;146309;146310;146311;146312 146302 15 FFEECDPNKDK Unmodified 1427.6027 0.60273031 3070 Q14515 SPARCL1 SPARC-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 29.693 29.693 2 0.0067101 24204 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.265 84.961 55412000 0 0 0 0 0 0 30134000 0 0 0 25278000 0 0 13149 3070 12336 115554;115555 146313;146314 146314 2 FFEEPEDPSNR Unmodified 1365.5837 0.58370943 2839 Q00005 PPP2R2B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.158 57.158 2 0.00047427 56628 QUIQUE_C1218_190116_001 113.62 105.7 226380000 31257000 38324000 0 29470000 0 0 0 35542000 0 0 38001000 0 53787000 13150 2839 12337 115556;115557;115558;115559;115560;115561 146315;146316;146317;146318;146319;146320 146315 6 FFEEVLLFEDELHDHGVSSLSVK Unmodified 2675.3119 0.31189825 1651 O75663 TIPRL TIP41-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.2 151.2 4 2.0779E-12 158449 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.76 90.609 193110000 0 0 0 0 0 0 0 0 41614000 0 68837000 60143000 22518000 13151 1651 12338 115562;115563;115564;115565 146321;146322;146323;146324 146322 3 FFEEVNDPAK Unmodified 1194.5557 0.55570376 2539 P49748;K7EQP4;J3KS89 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 60.002 60.002 2 0.0066136 59469 QUIQUE_C1438_190116_001 74.376 53.751 785500000 141640000 95772000 121410000 0 101360000 121010000 0 0 0 66010000 84182000 54113000 0 13152 2539 12339 115566;115567;115568;115569;115570;115571;115572;115573 146325;146326;146327;146328;146329;146330;146331;146332 146328 4 FFEEVNDPAKNDALEMVEETTWQGLK Unmodified 3039.4172 0.41716796 2539 P49748;K7EQP4;J3KS89 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.35 152.35 3 4.2288E-30 157307 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.9 124.84 1050400000 0 78127000 0 56565000 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Unmodified 1237.588 0.58800695 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 77.95 77.95 2;3 8.4205E-05 79751 QUIQUE_C1438_190116_001 99.568 73.76 6298000000 584900000 585730000 560700000 428850000 601440000 287700000 585250000 411460000 426670000 177640000 388340000 564160000 695170000 13156 1282 12343 115591;115592;115593;115594;115595;115596;115597;115598;115599;115600;115601;115602;115603;115604;115605;115606;115607;115608;115609;115610;115611;115612;115613;115614;115615;115616 146362;146363;146364;146365;146366;146367;146368;146369;146370;146371;146372;146373;146374;146375;146376;146377;146378;146379;146380;146381;146382;146383;146384;146385;146386;146387;146388;146389;146390;146391;146392;146393;146394;146395;146396;146397;146398;146399;146400;146401;146402;146403;146404;146405;146406;146407 146376 46 FFEILSPVYR Unmodified 1269.6758 0.67575932 865 H0YBP1;E7ESA6;Q05397;H0YB99 PTK2 Focal adhesion kinase 1 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alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes yes 0 1 0 1 1 100.28 100.28 2 0.0084917 102480 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.347 48.715 83397000 0 0 44709000 0 0 0 0 38688000 0 0 0 0 0 13168 2640 12352 115810;115811 146719;146720 146720 2078 2 FFGGDRGAPK Unmodified 1050.5247 0.52467841 571;1217 J3QL64;A8MZH3;P02686;E9PJ72;E9PMR5;H0YF02;H0YEA2;J3QKL5;J3QQK6;E9PNZ1;E9PKX9;J3KT34;F5H7N4;F8WEU6;H7BYR8 MBP Myelin basic protein no no 0 0 1 1 20.622 20.622 3 0.021088 13620 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.598 31.828 128910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 128910000 0 0 13169 571;1217 12353 115812 146721 146721 1 FFGGYVPEMVLTPDDQR Unmodified 1969.9244 0.9243988 2677 P56192;H0YIP0 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.14 140.14 2 0.00023445 146125 QUIQUE_C1576_190116_001 111.52 82.197 575420000 51547000 56968000 68857000 58051000 39388000 47686000 64241000 33953000 35870000 0 67169000 51687000 0 13170 2677 12354 115813;115814;115815;115816;115817;115818;115819;115820;115821;115822;115823;115824 146722;146723;146724;146725;146726;146727;146728;146729;146730;146731;146732;146733;146734 146729 13 FFGHGAEDSLADQAANEWGR Unmodified 2176.9562 0.95624429 1985 P0DJI8;E9PQD6 SAA1 Serum amyloid A-1 protein;Amyloid protein A;Serum amyloid protein A(2-104);Serum amyloid protein A(3-104);Serum amyloid protein A(2-103);Serum amyloid protein A(2-102);Serum amyloid protein A(4-101);Serum amyloid A protein yes no 0 0 0 2 1 1 2 103.19 103.19 2;3 2.6104E-47 106437 QUIQUE_DMIX8_190116_001 166.09 152.97 517230000 0 187990000 0 0 0 0 97162000 0 0 0 71955000 0 160120000 13171 1985 12355 115825;115826;115827;115828;115829;115830 146735;146736;146737;146738;146739;146740;146741 146741 5 FFGNLMDASK Unmodified 1128.5274 0.52738052 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 90.455 90.455 2 0.0027576 93855 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.136 72.985 5018600000 375150000 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FFGPGEFDPSVDVYAMK Oxidation (M) 1920.8604 0.86040156 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 1 0 1 1 1 129.08 129.08 2 0.013771 133849 QUIQUE_C1368_190116_001 47.039 34.462 88126000 0 0 39803000 21759000 0 0 0 26563000 0 0 0 0 0 13177 2806 12359 115868;115869;115870 146791;146792;146793 146791 2252 3 FFGPNAEISQPPALSQLVNLYLGR Unmodified 2630.3857 0.38567232 1190 H3BQ53;Q9BQ70;Q9H384 TCF25 Transcription factor 25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.49 169.49 3 9.6412E-06 174390 QUIQUE_C1368_190116_001 55.705 48.752 137870000 12624000 0 20669000 0 0 0 18246000 0 0 0 26485000 43749000 16096000 13178 1190 12360 115871;115872;115873;115874;115875;115876 146794;146795;146796;146797;146798;146799 146795 6 FFGTEDHAWIK Unmodified 1349.6404 0.64043645 1335 K7EMM8;Q49A26;K7EQB2 GLYR1 Putative oxidoreductase GLYR1 yes no 0 0 0 1 79.368 79.368 3 0.029479 79507 QUIQUE_DMIX1_190116_001 28.232 14.831 13471000 0 0 0 0 0 0 0 13471000 0 0 0 0 0 13179 1335 12361 115877 146800 146800 1 FFHETEAPR Unmodified 1132.5302 0.53015772 251 A0A0C4DGS0;A0A2Y9D025;P56556;R4GN43 NDUFA6 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.179 23.179 3 0.00014447 16426 QUIQUE_C1438_190116_001 99.688 83.49 818730000 98950000 106910000 126460000 78413000 62537000 53847000 96605000 20101000 39386000 23459000 68390000 43669000 0 13180 251 12362 115878;115879;115880;115881;115882;115883;115884;115885;115886;115887;115888;115889 146801;146802;146803;146804;146805;146806;146807;146808;146809;146810;146811;146812;146813 146805 11 FFHETEAPRPK Unmodified 1357.6779 0.67788459 251 A0A0C4DGS0;A0A2Y9D025;P56556;R4GN43 NDUFA6 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 2 19.691 19.691 2;3 0.00026025 13068 QUIQUE_C1218_190116_001 150.17 121.23 2196700000 238080000 417840000 0 75962000 0 192330000 50511000 56026000 169010000 0 632410000 65293000 299200000 13181 251 12363 115890;115891;115892;115893;115894;115895;115896;115897;115898;115899;115900;115901;115902;115903;115904 146814;146815;146816;146817;146818;146819;146820;146821;146822;146823;146824;146825;146826;146827;146828 146814 10 FFHLAFEEEFGR Unmodified 1527.7147 0.71466402 2988 Q13347 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 118.31 118.31 3 0.0016641 122308 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.695 45.232 232970000 0 12799000 20280000 15446000 0 18476000 21035000 14162000 30622000 0 53101000 47046000 0 13182 2988 12364 115905;115906;115907;115908;115909;115910;115911;115912;115913;115914;115915 146829;146830;146831;146832;146833;146834;146835;146836;146837;146838;146839;146840 146836 9 FFHSLLGTNAK Unmodified 1233.6506 0.6506072 2555 P50135 HNMT Histamine N-methyltransferase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 1 2 2 3 52.664 52.664 2;3 1.7339E-05 50462 QUIQUE_C1368_190116_001 166.07 140.44 3838800000 325010000 508420000 308380000 336000000 254180000 318190000 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45687000 54798000 13187 4165 12369 115959;115960;115961;115962;115963;115964;115965;115966;115967;115968;115969;115970;115971 146891;146892;146893;146894;146895;146896;146897;146898;146899;146900;146901;146902;146903;146904;146905;146906;146907 146891 17 FFLCQVAGDAK Unmodified 1254.6067 0.60669348 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 2 3 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 87.653 87.653 2 0.00011076 87984 QUIQUE_C1403_190116_001 131.5 100.82 16787000000 1032700000 1279500000 1723300000 1384800000 1810000000 1096100000 1703600000 785790000 1232600000 402490000 1469300000 978000000 1888800000 13188 1218;28;2057 12370 115972;115973;115974;115975;115976;115977;115978;115979;115980;115981;115982;115983;115984;115985;115986;115987;115988;115989;115990;115991;115992;115993;115994;115995;115996;115997;115998;115999;116000;116001;116002 146908;146909;146910;146911;146912;146913;146914;146915;146916;146917;146918;146919;146920;146921;146922;146923;146924;146925;146926;146927;146928;146929;146930;146931;146932;146933;146934;146935;146936;146937;146938;146939;146940;146941;146942;146943;146944;146945;146946;146947;146948;146949;146950;146951;146952;146953;146954;146955;146956 146922 47 FFLEETLVR Unmodified 1152.6179 0.61791009 4357 Q9NZT2;A0A0A0MRN5;A0A087X028 OGFR Opioid growth factor receptor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.5 113.5 2 0.0023457 117360 QUIQUE_C1368_190116_001 94.302 66.566 275710000 22506000 23630000 22996000 26899000 22380000 22288000 19618000 17660000 22688000 0 28051000 23375000 23623000 13189 4357 12371 116003;116004;116005;116006;116007;116008;116009;116010;116011;116012;116013;116014 146957;146958;146959;146960;146961;146962;146963;146964;146965;146966;146967;146968;146969;146970;146971;146972;146973;146974 146960 18 FFLENGK Unmodified 853.4334 0.43340378 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 1 1 1 52.93 52.93 2 0.041589 49064 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.864 59.128 82119000 0 0 30560000 0 27763000 0 0 0 0 23797000 0 0 0 13190 3434 12372 116015;116016;116017 146975;146976;146977 146977 3 FFLENGKHDEAWMVLK Unmodified 1962.9662 0.96620404 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 1 1 1 103.18 103.18 4 0.0078115 107355 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.252 34.055 57217000 0 0 0 0 0 0 0 26339000 0 0 30878000 0 0 13191 3434 12373 116018;116019 146978;146979 146979 2 FFLGDLCSR Unmodified 1113.5277 0.52771487 3153 Q15738;C9JDR0 NSDHL Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 102.28 102.28 2 0.0074526 105229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.548 63.562 20444000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20444000 0 13192 3153 12374 116020 146980 146980 1 FFLGNQFGDSQQLR Unmodified 1655.8056 0.80560429 1187;2882 H3BPE1;H3BQK9;H0Y314;H0Y4F5;Q03001;F8W9J4 MACF1;DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 107.33 107.33 2 1.7001E-07 112704 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FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 86.35 86.35 3 8.185E-05 89983 QUIQUE_C1403_190116_001 63.128 59.508 23286000 0 0 23286000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13209 357;734 12390 116190;116191;116192;116193;116194 147204;147205;147206;147207;147208 147205 4 FFPYYVYNIIGGLDEEGK Unmodified 2123.0252 0.025158703 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 166.36 166.36 2;3 5.6807E-14 170836 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.453 70.085 1231700000 84721000 78865000 123320000 54890000 48021000 85716000 48159000 79876000 169950000 7441900 140590000 182830000 127310000 13210 2169 12391 116195;116196;116197;116198;116199;116200;116201;116202;116203;116204;116205;116206;116207;116208;116209;116210;116211;116212;116213;116214;116215;116216 147209;147210;147211;147212;147213;147214;147215;147216;147217;147218;147219;147220;147221;147222;147223;147224;147225;147226;147227;147228;147229;147230;147231;147232 147225 24 FFQEENTEK Unmodified 1170.5193 0.51931826 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.195 28.195 2 0.0016157 22555 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.4 102.15 661320000 0 0 119190000 0 92255000 83164000 0 82116000 0 40329000 133330000 110940000 0 13211 1389 12392 116217;116218;116219;116220;116221;116222;116223 147233;147234;147235;147236;147237;147238;147239;147240;147241 147240 8 FFQLAAQWPTHVK Unmodified 1571.8249 0.82488317 3415 Q6VY07;B4DF77;E9PSG7;H0YCU5 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 98.553 98.553 2;3 0.00019551 101103 QUIQUE_C1277_190116_001 67.019 16.911 281510000 0 71813000 0 0 51320000 45154000 0 113230000 0 0 0 0 0 13212 3415 12393 116224;116225;116226;116227;116228 147242;147243;147244;147245;147246;147247 147242 6 FFQPTEMAAQDFFQR Oxidation (M) 1877.8407 0.84066917 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.35 124.35 2 1.5567E-08 121559 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.51 17.716 826970000 75289000 83461000 84266000 78396000 82490000 49393000 0 0 80356000 60271000 106180000 126860000 0 13213 1749 12394 116229;116230;116231;116232;116233;116234;116235;116236;116237;116238 147248;147249;147250;147251;147252;147253;147254;147255;147256;147257;147258 147256 954 10 FFQPTEMAAQDFFQR Unmodified 1861.8458 0.84575455 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 1 136.73 136.73 2;3 5.1599E-06 139743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.99 127.46 2626600000 282630000 278510000 298400000 27536000 234230000 186990000 306640000 217830000 199710000 68078000 297610000 0 228450000 13214 1749 12394 116239;116240;116241;116242;116243;116244;116245;116246;116247;116248;116249;116250;116251;116252;116253;116254;116255;116256 147259;147260;147261;147262;147263;147264;147265;147266;147267;147268;147269;147270;147271;147272;147273;147274;147275;147276;147277;147278 147272 20 FFQPTEMASQDFFQR Unmodified 1877.8407 0.84066917 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 1 3 2 2 2 129.8 129.8 2;3 9.101E-36 133617 QUIQUE_C1403_190116_001 174.4 14.571 2391900000 249840000 254190000 284090000 233710000 0 174650000 267300000 124720000 113310000 49430000 262470000 187930000 190270000 13215 1701 12395 116257;116258;116259;116260;116261;116262;116263;116264;116265;116266;116267;116268;116269;116270;116271;116272;116273;116274;116275;116276;116277;116278;116279;116280;116281 147279;147280;147281;147282;147283;147284;147285;147286;147287;147288;147289;147290;147291;147292;147293;147294;147295;147296;147297;147298;147299;147300;147301;147302;147303;147304 147285 24 FFQSFSDALIDEDPQAALEELTK Unmodified 2613.2486 0.24862929 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 167.79 167.79 2;3 7.6206E-51 174904 QUIQUE_DMIX5_190116_001 202.33 192.53 1811100000 64387000 96199000 72572000 61908000 207330000 80404000 165360000 230520000 216750000 22504000 273570000 216730000 102880000 13216 4572 12396 116282;116283;116284;116285;116286;116287;116288;116289;116290;116291;116292;116293;116294;116295;116296;116297;116298;116299;116300;116301;116302;116303;116304 147305;147306;147307;147308;147309;147310;147311;147312;147313;147314;147315;147316;147317;147318;147319;147320;147321;147322;147323;147324;147325;147326;147327 147323 22 FFQTACDVPELQDK Unmodified 1696.7767 0.77667193 2487 P46940;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 91.388 91.388 2 0.057533 92973 QUIQUE_C1403_190116_001 40.616 22.557 33234000 0 0 0 33234000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13217 2487 12397 116305 147328 147328 1 FFRPHFLQAPGDLTVQEGK Unmodified 2186.1273 0.12727278 3716 Q8WX93 PALLD Palladin yes yes 0 0 1 1 1 90.241 90.241 3;4 0.005005 92070 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.326 38.525 51641000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51641000 0 13218 3716 12398 116306;116307 147329;147330 147330 2 FFSCMQSDFLK Unmodified 1408.6155 0.6155436 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 110.23 110.23 2 0.0048057 115022 QUIQUE_C1218_190116_001 108.43 99.969 616130000 88082000 122990000 97847000 64546000 0 0 139690000 46409000 0 0 0 56571000 0 13219 3549 12399 116308;116309;116310;116311;116312;116313;116314 147331;147332;147333;147334;147335;147336;147337 147331 3 FFSEAVIEGLASDGGLFVPAK Unmodified 2153.1045 0.10447166 3557 Q8IYQ7 THNSL1 Threonine synthase-like 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 163.9 163.9 2;3 1.0731E-09 168319 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.17 79.037 368610000 21663000 16900000 41755000 32437000 58247000 24887000 64781000 21695000 37879000 9716200 0 0 38651000 13220 3557 12400 116315;116316;116317;116318;116319;116320;116321;116322;116323;116324;116325;116326;116327 147338;147339;147340;147341;147342;147343;147344;147345;147346;147347;147348;147349;147350;147351 147349 13 FFSELEFGKPSSAISPTPEISSETPGYIYSSNFHAVK Unmodified 4049.9575 0.95747965 309 A0A0U1RQI5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.23 133.23 4 2.2616E-54 137650 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.88 98.183 1898900000 68348000 98833000 0 139440000 121070000 108360000 181410000 193360000 275040000 45154000 0 255320000 412560000 13221 309 12401 116328;116329;116330;116331;116332;116333;116334;116335;116336;116337;116338 147352;147353;147354;147355;147356;147357;147358;147359;147360;147361;147362;147363;147364;147365;147366 147362 14 FFSFIEGCLVK Unmodified 1345.674 0.67404476 263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819 MAP4K4 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 131.49 131.49 2 0.0025448 138327 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.677 63.471 20172000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20172000 0 0 13222 263 12402 116339;116340;116341 147367;147368;147369 147368 3 FFSLSSVDK Unmodified 1028.5179 0.51786169 4611 Q9Y4P8 WIPI2 WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.555 81.555 2 0.00164 78863 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protein homolog yes no 0 0 1 1 1 1 126.16 126.16 4 0.0034299 129443 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.548 27.044 139730000 0 0 0 0 0 0 0 52740000 0 0 0 35728000 51262000 13225 3947 12405 116362;116363;116364 147399;147400;147401 147399 3 FFTGDVFGYHGYTFANLGEHEFVEEK Unmodified 3039.3715 0.37153839 4395 Q9UBE0;M0QX65;B3KNJ4;M0R054;M0QYM8 SAE1 SUMO-activating enzyme subunit 1;SUMO-activating enzyme subunit 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 136.65 136.65 3 0.00069525 141383 QUIQUE_C1277_190116_001 38.513 26.316 89876000 0 38947000 0 0 0 0 0 0 0 0 50930000 0 0 13226 4395 12406 116365;116366 147402;147403 147402 2 FFTINPEDGFIK Unmodified 1426.7133 0.71326704 1206 H3BUU9;P55287 CDH11 Cadherin-11 yes no 0 0 0 1 1 1 128.22 128.22 2 0.0036456 132506 QUIQUE_C1368_190116_001 74.267 54.952 80037000 0 0 0 0 0 0 80037000 0 0 0 0 0 0 13227 1206 12407 116367;116368;116369 147404;147405;147406 147404 3 FFTNFESR Unmodified 1046.4821 0.48214489 4309 Q9NVS9;J3QQZ9;J3QQV6;A0A286YFL3 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.624 69.624 2 6.4098E-06 69301 QUIQUE_C1403_190116_001 168.45 134.45 2960700000 226960000 236830000 226070000 209840000 284710000 226510000 203990000 269180000 244000000 68266000 300300000 241260000 222830000 13228 4309 12408 116370;116371;116372;116373;116374;116375;116376;116377;116378;116379;116380;116381;116382 147407;147408;147409;147410;147411;147412;147413;147414;147415;147416;147417;147418;147419;147420;147421;147422;147423;147424 147411 17 FFTQGWAGWR Unmodified 1254.5934 0.59342667 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.7 115.7 2 3.3584E-05 119144 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.34 132.71 538920000 43470000 52412000 0 43566000 58353000 53796000 63418000 60257000 80804000 18356000 0 64492000 0 13229 2880 12409 116383;116384;116385;116386;116387;116388;116389;116390;116391;116392 147425;147426;147427;147428;147429;147430;147431;147432;147433;147434;147435;147436 147434 11 FFTYGNFPLEQHLK Unmodified 1739.8671 0.86714192 3276 Q5JRX3 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 106.62 106.62 3 0.001815 109852 QUIQUE_C1403_190116_001 43.305 37.932 264430000 0 0 64688000 32439000 0 0 50031000 28290000 34841000 0 0 0 54136000 13230 3276 12410 116393;116394;116395;116396;116397;116398 147437;147438;147439;147440;147441;147442 147438 6 FFVADTANEALEAAK Unmodified 1595.7831 0.78313752 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.62 110.62 2 2.5422E-18 112984 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.79 119.76 925000000 150660000 171520000 0 224130000 0 0 0 141220000 168650000 68829000 0 0 0 13231 3878 12411 116399;116400;116401;116402;116403;116404 147443;147444;147445;147446;147447;147448;147449 147447 6 FFVADTANEALEAAKR Unmodified 1751.8842 0.88424855 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 98.53 98.53 3 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147492;147493;147494;147495;147496;147497 147493 5 FFVTLLEAQADYHR Unmodified 1708.8573 0.85730551 3353 Q68EM7 ARHGAP17 Rho GTPase-activating protein 17 yes yes 0 0 0 1 1 113.87 113.87 3 0.014486 117334 QUIQUE_C1368_190116_001 28.986 18.501 27951000 11481000 0 16470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13241 3353 12420 116440;116441 147498;147499 147499 2 FFVTTLPAFFHAK Unmodified 1524.8129 0.8129215 4131 Q9H1E5 TMX4 Thioredoxin-related transmembrane protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 126.35 126.35 3 0.00084684 130787 QUIQUE_C1277_190116_001 72.958 66.102 323520000 0 27677000 44090000 39688000 17959000 23401000 26890000 22871000 31524000 0 24111000 28588000 36721000 13242 4131 12421 116442;116443;116444;116445;116446;116447;116448;116449;116450;116451;116452;116453 147500;147501;147502;147503;147504;147505;147506;147507;147508;147509;147510;147511;147512 147500 12 FFWEMAEEEGWIR Oxidation (M) 1744.7555 0.75554256 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 2 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 145.71 145.71 2 3.227E-17 150128 QUIQUE_C1277_190116_001 163.64 156.26 1093200000 112240000 97710000 72408000 125630000 63482000 128300000 109220000 86815000 76033000 48812000 69357000 62404000 40818000 13243 2851 12422 116454;116455;116456;116457;116458;116459;116460;116461;116462;116463;116464;116465;116466;116467;116468;116469;116470;116471;116472;116473;116474 147513;147514;147515;147516;147517;147518;147519;147520;147521;147522;147523;147524;147525;147526;147527;147528;147529;147530;147531;147532;147533;147534;147535;147536;147537;147538;147539;147540;147541;147542;147543;147544 147516 2297 32 FFWEMAEEEGWIR Unmodified 1728.7606 0.76062794 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 158.85 158.85 2;3 1.0448E-07 162816 QUIQUE_DMIX7_190116_001 134.68 120.52 673500000 0 23376000 12953000 16193000 0 0 28357000 67002000 124110000 6956900 157010000 169660000 67876000 13244 2851 12422 116475;116476;116477;116478;116479;116480;116481;116482;116483;116484;116485 147545;147546;147547;147548;147549;147550;147551;147552;147553;147554;147555;147556;147557;147558 147556 14 FFWNQSLHLHLK Unmodified 1568.8252 0.82521752 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66;C9J1Z6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 95.765 95.765 3;4 0.0010832 96838 QUIQUE_C1563_190116_001 65.179 57.396 276870000 80080000 23383000 0 0 0 17178000 0 22587000 14010000 0 65233000 54401000 0 13245 723 12423 116486;116487;116488;116489;116490;116491;116492;116493;116494;116495 147559;147560;147561;147562;147563;147564;147565;147566;147567;147568 147564 10 FFYAGTPPAGLAADSHVK Unmodified 1847.9206 0.92063405 1699 O94919 ENDOD1 Endonuclease domain-containing 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 80.981 80.981 3 0.017976 82265 QUIQUE_C1218_190116_001 35.133 29.923 42693000 42693000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13246 1699 12424 116496;116497 147569;147570 147569 2 FFYQFLLGNER Unmodified 1432.7139 0.71393574 3573 Q8N1B4 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes yes 0 0 0 1 139.12 139.12 2 0.030758 144240 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.518 40.684 44092000 0 0 0 0 0 0 0 0 44092000 0 0 0 0 13247 3573 12425 116498 147571 147571 1 FFYSDQNVDSR Unmodified 1376.5997 0.59969384 4600;4606 Q9Y4G6;Q9Y490 TLN2;TLN1 Talin-2;Talin-1 no no 0 0 0 1 61.276 61.276 2 0.010657 59882 QUIQUE_C1403_190116_001 73.499 63.844 114430000 0 0 0 114430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13248 4606;4600 12426 116499 147572 147572 1 FFYSDQNVDSRDPVQLNLLYVQAR Unmodified 2886.4301 0.43005633 4600;4606 Q9Y4G6;Q9Y490 TLN2;TLN1 Talin-2;Talin-1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.56 135.56 3 3.1698E-63 139893 QUIQUE_DMIX7_190116_001 164.35 157.63 780430000 0 0 39373000 0 46920000 0 41434000 110130000 132910000 0 144910000 152170000 112580000 13249 4606;4600 12427 116500;116501;116502;116503;116504;116505;116506;116507 147573;147574;147575;147576;147577;147578;147579;147580 147579 7 FGAFHSPALEDADFDGKPMVLVAGQYSTGK Unmodified 3154.507 0.50698602 4353 Q9NZN4 EHD2 EH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 123.13 123.13 4 2.1512E-19 126944 QUIQUE_C1403_190116_001 77.065 71.223 167660000 0 59341000 0 49125000 59195000 0 0 0 0 0 0 0 0 13250 4353 12428 116508;116509;116510 147581;147582;147583;147584;147585 147583 5 FGAHLGQPHSTTIIIRDPDELDR Unmodified 2587.3143 0.31429829 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 1 1 1 70.524 70.524 4 8.3463E-06 70478 QUIQUE_C1403_190116_001 61.345 48.667 117290000 0 0 0 28793000 0 0 0 0 88493000 0 0 0 0 13251 2101 12429 116511;116512 147586;147587 147586 2 FGALCEAETGR Unmodified 1209.5448 0.5448215 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.227 47.227 2 0.011121 45199 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.974 61.938 451140000 55570000 0 0 0 75390000 0 0 69278000 0 0 104980000 84083000 61838000 13252 1408 12430 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148081 616 FGAPHASESCSK Unmodified 1276.5506 0.55063516 1615 O75170;T1ECW5;A0A0A0MSJ8 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 1 13.375 13.375 3 0.05246 5507 QUIQUE_DMIX8_190116_001 26.124 18.861 12751000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12751000 13257 1615 12435 117045 148291 148291 1 FGAPPHAGGGIGLER Unmodified 1434.7368 0.73679645 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 47.658 47.658 2;3 0.0079905 45289 QUIQUE_C1438_190116_001 45.33 39.074 2771100000 187330000 264740000 251480000 0 271120000 251490000 254190000 188810000 178340000 83993000 334560000 220620000 284430000 13258 2083 12436 117046;117047;117048;117049;117050;117051;117052;117053;117054;117055;117056;117057;117058;117059;117060;117061 148292;148293;148294;148295;148296;148297;148298;148299;148300;148301;148302;148303;148304;148305;148306;148307;148308;148309;148310;148311;148312 148297 18 FGAQLQCVTGPQATR Unmodified 1632.8042 0.80422409 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Unmodified 861.4457 0.4456998 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.894 19.894 2 0.0069326 12915 QUIQUE_C1438_190116_001 99.919 66.181 411470000 0 71029000 60771000 0 69997000 61607000 0 0 0 0 89901000 0 58167000 13261 4331 12439 117090;117091;117092;117093;117094;117095 148342;148343;148344;148345;148346;148347 148344 6 FGATLEIVTDK Unmodified 1192.634 0.63395408 2755 P62495;B7Z7P8 ETF1 Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 yes no 0 0 0 1 85.029 85.029 2 0.019826 81483 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.249 39.607 9717200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9717200 0 0 0 13262 2755 12440 117096 148348 148348 1 FGATLEIVTDKSQEGSQFVK Unmodified 2183.111 0.1110136 2755 P62495;B7Z7P8 ETF1 Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 93.519 93.519 3 0.0025952 96372 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.19 54.198 207020000 0 0 0 0 0 0 0 58116000 49183000 0 55708000 0 44010000 13263 2755 12441 117097;117098;117099;117100 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117111;117112;117113;117114;117115;117116;117117;117118;117119;117120;117121;117122;117123;117124;117125;117126;117127;117128;117129;117130;117131;117132;117133;117134;117135;117136;117137;117138 148364;148365;148366;148367;148368;148369;148370;148371;148372;148373;148374;148375;148376;148377;148378;148379;148380;148381;148382;148383;148384;148385;148386;148387;148388;148389;148390;148391;148392;148393;148394;148395;148396;148397;148398;148399;148400;148401;148402;148403;148404;148405;148406;148407;148408;148409;148410;148411;148412;148413;148414;148415;148416;148417;148418;148419 148375 55 FGAVVIAK Unmodified 803.49052 0.49052473 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 43.848 43.848 2 0.033714 39853 QUIQUE_C1277_190116_001 64.523 41.788 126540000 0 39385000 0 0 0 0 0 57060000 0 30096000 0 0 0 13266 1510 12444 117139;117140;117141 148420;148421;148422 148420 3 FGAVWTGDNTAEWDHLK Unmodified 1945.8959 0.89587586 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 105.32 105.32 2;3 3.3899E-44 108677 QUIQUE_C1368_190116_001 168.85 152.59 4347900000 346500000 390140000 430660000 319310000 380480000 272400000 325590000 212060000 337000000 115520000 465060000 359420000 393810000 13267 956;3084 12445 117142;117143;117144;117145;117146;117147;117148;117149;117150;117151;117152;117153;117154;117155;117156;117157;117158;117159;117160;117161;117162;117163;117164;117165;117166;117167;117168 148423;148424;148425;148426;148427;148428;148429;148430;148431;148432;148433;148434;148435;148436;148437;148438;148439;148440;148441;148442;148443;148444;148445;148446;148447;148448;148449;148450;148451;148452;148453;148454;148455;148456 148432 33 FGAYIVDGLR Unmodified 1109.5869 0.58694431 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.725 94.725 2 0.013076 97250 QUIQUE_C1277_190116_001 65.305 44.785 31863000 0 14234000 0 0 17628000 0 0 0 0 0 0 0 0 13268 2964 12446 117169;117170;117171;117172;117173;117174;117175 148457;148458;148459;148460;148461;148462;148463 148458 6 FGCALMEMR Unmodified 1113.4769 0.47694163 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 80.641 80.641 2 0.014665 81351 QUIQUE_C1403_190116_001 68.224 43.301 21013000 0 0 0 21013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13269 699 12447 117176;117177;117178 148464;148465;148466 148464 3 FGDEDLTWQDEHSAPFSWETK Unmodified 2524.0819 0.081898314 4163 Q9H425;E5RI90 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes no 0 0 0 1 123.17 123.17 3 0.02931 125722 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.993 19.547 87086000 0 0 0 0 0 0 0 87086000 0 0 0 0 0 13270 4163 12448 117179 148467 148467 1 FGDEFLGELR Unmodified 1181.5717 0.57168818 3075 Q14644 RASA3 Ras GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 112.74 112.74 2 0.0016837 115327 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.692 78.489 123430000 0 0 41324000 0 0 0 33108000 26325000 0 0 0 22674000 0 13271 3075 12449 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1627.8644 0.86436473 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.33 137.33 2 2.2059E-10 143913 QUIQUE_C1438_190116_001 134.3 116.44 1199300000 118260000 0 192120000 107330000 126550000 151400000 146380000 133580000 92688000 0 130940000 0 0 13277 2194 12455 117208;117209;117210;117211;117212;117213;117214;117215;117216 148497;148498;148499;148500;148501;148502;148503;148504;148505;148506 148501 10 FGDPVVQSDMK Oxidation (M) 1237.5649 0.56488824 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.373 37.373 2 0.0004994 33115 QUIQUE_C1277_190116_001 115.7 105.79 2530800000 136220000 163890000 184480000 173610000 120400000 149370000 192670000 148980000 239430000 203830000 352790000 209720000 255400000 13278 282 12456 117217;117218;117219;117220;117221;117222;117223;117224;117225;117226;117227;117228;117229 148507;148508;148509;148510;148511;148512;148513;148514;148515;148516;148517;148518;148519;148520;148521;148522;148523;148524;148525 148509 210 16 FGDPVVQSDMK Unmodified 1221.57 0.56997362 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 53.786 53.786 2 0.00023661 52637 QUIQUE_C1218_190116_001 121.5 110.87 4874900000 404700000 438010000 445830000 471850000 336610000 451220000 418980000 262460000 274980000 261080000 453100000 279960000 376140000 13279 282 12456 117230;117231;117232;117233;117234;117235;117236;117237;117238;117239;117240;117241;117242;117243 148526;148527;148528;148529;148530;148531;148532;148533;148534;148535;148536;148537;148538;148539;148540;148541;148542;148543;148544;148545;148546;148547;148548;148549;148550;148551;148552 148527 27 FGDRFPAMSDAYDR Unmodified 1646.7147 0.71474038 1786 P00491;G3V5M2 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 76.436 76.436 2;3 0.00011809 77296 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.508 75.457 630970000 0 0 0 0 62343000 0 0 126570000 116360000 0 81482000 85003000 159200000 13280 1786 12457 117244;117245;117246;117247;117248;117249;117250;117251 148553;148554;148555;148556;148557;148558;148559;148560 148555 5 FGDRFPAMSDAYDR Oxidation (M) 1662.7097 0.709655 1786 P00491;G3V5M2 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 1 1 1 1 54.542 54.542 3 0.0032408 52132 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.919 56.293 117360000 0 0 0 0 0 0 0 102210000 0 15149000 0 0 0 13281 1786 12457 117252;117253 148561;148562 148561 993 2 FGDTSLQEVINVESLVR Unmodified 1904.9844 0.98435652 3916 Q96PE3;B8ZZB2 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 149.39 149.39 2;3 3.0832E-44 145050 QUIQUE_DMIX4_190116_001 169.62 148.32 313130000 87851000 119190000 0 0 0 0 0 0 0 20189000 14871000 71027000 0 13282 3916 12458 117254;117255;117256;117257;117258 148563;148564;148565;148566;148567;148568 148566 6 FGDVLHVIDASDEEWWQAR Unmodified 2272.0549 0.054895702 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 2 1 145.91 145.91 2;3 2.2473E-28 152804 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.29 127.15 1869400000 157090000 211020000 170500000 98030000 95872000 97230000 157500000 82369000 157830000 30094000 228720000 258780000 124380000 13283 487 12459 117259;117260;117261;117262;117263;117264;117265;117266;117267;117268;117269;117270;117271;117272;117273;117274;117275;117276;117277 148569;148570;148571;148572;148573;148574;148575;148576;148577;148578;148579;148580;148581;148582;148583;148584;148585;148586;148587;148588 148585 20 FGDYNKEVHK Unmodified 1235.5935 0.59348625 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 1 1 1 15.24 15.24 2;3 0.005566 7470 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.53 36.11 170680000 0 0 0 0 0 0 0 135080000 22515000 0 13081000 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262000000 213250000 237110000 13289 1153 12465 117297;117298;117299;117300;117301;117302;117303;117304;117305;117306;117307;117308 148608;148609;148610;148611;148612;148613;148614;148615;148616;148617;148618;148619;148620 148616 12 FGELVMTK Oxidation (M) 939.47355 0.47355404 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 40.732 40.732 2 0.021967 35665 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.809 55.623 103480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37974000 0 65504000 0 13290 1153 12465 117309;117310 148621;148622 148621 2 FGEPVLAGFAR Unmodified 1162.6135 0.61349341 1477 O15067 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes yes 0 0 0 1 101.48 101.48 2 0.031715 98273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.729 43.918 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13291 1477 12466 117311 148623 148623 1 FGEVISYQQLAALAGNPK Unmodified 1904.9996 0.99961265 2110 P16455 MGMT Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 139.31 139.31 2 0.00027399 143430 QUIQUE_C1403_190116_001 106.49 89.959 84638000 0 0 0 42611000 0 0 0 20469000 21559000 0 0 0 0 13292 2110 12467 117312;117313;117314 148624;148625;148626 148624 3 FGEVVDCTLK Unmodified 1166.5642 0.56415996 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96;D6RAF8;D6RF44;D6RBQ9;D6RD83 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 62.776 62.776 2 0.00017251 60215 QUIQUE_C1277_190116_001 120.12 0 13762000000 1316100000 1368300000 1317900000 1102800000 1055200000 895490000 969830000 985110000 1017500000 333770000 1165100000 1189800000 1044700000 13293 3041 12468 117315;117316;117317;117318;117319;117320;117321;117322;117323;117324;117325;117326;117327;117328;117329;117330;117331;117332;117333;117334;117335;117336;117337;117338;117339;117340 148627;148628;148629;148630;148631;148632;148633;148634;148635;148636;148637;148638;148639;148640;148641;148642;148643;148644;148645;148646;148647;148648;148649;148650;148651;148652;148653;148654;148655;148656;148657;148658;148659 148630 33 FGEVVDCTLKLDPITGR Unmodified 1918.9822 0.98224803 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96;D6RAF8;D6RF44;D6RBQ9;D6RD83 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 1 1 112.64 112.64 3 5.1971E-10 114701 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.23 98.461 112780000 0 0 0 0 0 0 0 112780000 0 0 0 0 0 13294 3041 12469 117341 148660 148660 1 FGEYCSSENGK Unmodified 1276.503 0.50301627 1566 O60268 KIAA0513 Uncharacterized protein KIAA0513 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.581 23.581 2 1.7473E-05 16758 QUIQUE_C1403_190116_001 141.02 123.39 547020000 41274000 41246000 0 57698000 47105000 50510000 59550000 50310000 30998000 15217000 96889000 0 56227000 13295 1566 12470 117342;117343;117344;117345;117346;117347;117348;117349;117350;117351;117352 148661;148662;148663;148664;148665;148666;148667;148668;148669;148670;148671;148672;148673 148663 13 FGFAIGSQTTK Unmodified 1155.5924 0.59242362 3710 Q8WW12 PCNP PEST proteolytic signal-containing nuclear protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 70.176 70.176 2 0.00047841 70204 QUIQUE_C1277_190116_001 101.97 70.04 170870000 39941000 33174000 0 40408000 57350000 0 0 0 0 0 0 0 0 13296 3710 12471 117353;117354;117355;117356;117357 148674;148675;148676;148677;148678 148675 5 FGFGFGGTGK Unmodified 973.46577 0.46576654 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 81.183 81.183 2 0.00076103 81687 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.6 41.353 1086600000 173350000 0 172990000 0 0 138530000 165540000 79180000 0 59657000 157540000 0 139850000 13297 3726 12472 117358;117359;117360;117361;117362;117363;117364;117365 148679;148680;148681;148682;148683;148684;148685;148686;148687;148688;148689 148689 9 FGFGLLNAK Unmodified 965.53345 0.53345218 2284 P29120 PCSK1 Neuroendocrine convertase 1 yes yes 0 0 0 1 102.98 102.98 2 0.045002 104787 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.676 41.477 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13298 2284 12473 117366 148690 148690 1 FGFIFNCDIK Unmodified 1259.6009 0.60087982 1405 O00442 RTCA RNA 3'-terminal phosphate cyclase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 121.13 121.13 2 0.013076 126510 QUIQUE_C1218_190116_001 65.305 43.219 109270000 22119000 0 28210000 0 0 28474000 0 0 30467000 0 0 0 0 13299 1405 12474 117367;117368;117369;117370 148691;148692;148693;148694 148691 4 FGFLQEFSK Unmodified 1101.5495 0.54949617 380 A0A1W2PQ86;A0A1W2PQ11;Q02246 CNTN2 Contactin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 113.06 113.06 2 0.001828 117057 QUIQUE_C1218_190116_001 114.5 74.395 13802000 13802000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13300 380 12475 117371;117372;117373 148695;148696;148697 148695 3 FGFPAFSGISR Unmodified 1184.5978 0.59784335 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 117.5 117.5 2 0.00047427 114818 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.62 95.397 730830000 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117.28 117.28 2 0.0036146 123063 QUIQUE_C1218_190116_001 112.17 95.395 5049500000 420460000 258820000 368100000 273320000 186730000 423860000 361580000 393540000 614980000 175560000 551420000 565520000 455560000 13303 2843;1035 12478 117395;117396;117397;117398;117399;117400;117401;117402;117403;117404;117405;117406;117407 148725;148726;148727;148728;148729;148730;148731;148732;148733;148734;148735;148736;148737;148738;148739;148740;148741;148742;148743;148744;148745;148746;148747;148748;148749;148750;148751;148752;148753;148754;148755;148756 148725 32 FGGAAVFPNQEQAR Unmodified 1490.7266 0.72662569 2157 P19971;C9JGI3 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 62.919 62.919 2 9.3057E-07 61844 QUIQUE_C1368_190116_001 122.69 87.149 341770000 0 64769000 228980000 0 0 0 0 0 0 48023000 0 0 0 13304 2157 12479 117408;117409;117410 148757;148758;148759;148760 148759 4 FGGAFAPAR Unmodified 892.45554 0.45553621 3580 Q8N3E9;K7EQF2;F5GXC1 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes no 0 0 0 1 1 42.092 42.092 2 0.0075421 38940 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.297 56.298 113680000 0 0 0 0 0 0 0 39621000 0 0 0 74058000 0 13305 3580 12480 117411;117412 148761;148762 148761 2 FGGALDAAAK Unmodified 919.47633 0.47633123 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 34.554 34.554 2 0.012155 29538 QUIQUE_C1403_190116_001 66.27 43.251 1287600000 123240000 124140000 96246000 111350000 114210000 100870000 125110000 103700000 87421000 51841000 134040000 0 115440000 13306 2623 12481 117413;117414;117415;117416;117417;117418;117419;117420;117421;117422;117423;117424;117425 148763;148764;148765;148766;148767;148768;148769;148770;148771;148772;148773;148774;148775;148776 148767 11 FGGFDPQGALR Unmodified 1163.5724 0.57235688 963 E9PMV2 HLA-DQA1 yes yes 0 0 0 1 1 84.695 84.695 2 0.00044387 86975 QUIQUE_C1368_190116_001 104.2 76.946 99400000 0 0 49101000 0 0 0 0 0 0 0 50300000 0 0 13307 963 12482 117426;117427 148777;148778;148779 148777 3 FGGFGGPGGVGGLGGPGGFGPGGYPGGIHEVSVNQSLLQPLNVK Unmodified 4091.0653 0.065347814 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 150.23 150.23 3;4 1.1322E-33 157122 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.403 85.251 2533100000 109770000 29263000 0 65120000 227430000 74783000 35733000 37925000 230550000 309020000 564740000 469700000 379050000 + 13308 781;782 12483 117428;117429;117430;117431;117432;117433;117434;117435;117436;117437;117438;117439;117440;117441;117442;117443;117444;117445;117446;117447 148780;148781;148782;148783;148784;148785;148786;148787;148788;148789;148790;148791;148792;148793;148794;148795;148796;148797;148798;148799;148800;148801;148802;148803;148804;148805;148806 148801 27 FGGGNPELLTQMVSK Oxidation (M) 1592.7868 0.78684269 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 74.224 74.224 2 8.0761E-06 75149 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.09 91.52 959900000 68664000 0 0 0 0 0 78254000 155970000 186590000 74512000 135890000 137680000 122340000 13309 1153 12484 117448;117449;117450;117451;117452;117453;117454;117455;117456;117457;117458;117459;117460 148807;148808;148809;148810;148811;148812;148813;148814;148815;148816;148817;148818;148819;148820;148821;148822;148823 148813 671 17 FGGGNPELLTQMVSK Unmodified 1576.7919 0.79192806 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.26 103.26 2 1.1146E-06 106177 QUIQUE_C1368_190116_001 117.45 103.78 4100800000 549650000 0 884810000 603150000 347330000 0 491080000 0 0 211320000 0 429080000 584390000 13310 1153 12484 117461;117462;117463;117464;117465;117466;117467;117468 148824;148825;148826;148827;148828;148829;148830;148831;148832 148825 9 FGGLAAGEDNGQR Unmodified 1290.5953 0.59527717 362 A0A1B0GWA2;A0A2R8YEL0;O00116 AGPS Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 1 35.314 35.314 2 0.023598 30801 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.284 26.761 53922000 0 0 0 26118000 0 0 0 0 0 0 0 0 27804000 13311 362 12485 117469;117470 148833;148834 148834 2 FGGNPGGFGNQGGFGNSR Unmodified 1725.7608 0.76077937 2968 Q13148;A0A087WX29 TARDBP TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.831 67.831 2 9.8071E-54 67592 QUIQUE_DMIX1_190116_001 227.57 218.57 1554100000 134050000 165140000 0 0 172150000 135360000 171360000 163250000 187360000 48408000 180520000 0 196500000 13312 2968 12486 117471;117472;117473;117474;117475;117476;117477;117478;117479;117480 148835;148836;148837;148838;148839;148840;148841;148842;148843;148844 148840 10 FGGSGSQVDSAR Unmodified 1166.5316 0.53161428 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 19.357 19.357 2 0.00046016 12115 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Unmodified 895.40106 0.4010578 2845 Q00577 PURA Transcriptional activator protein Pur-alpha yes yes 0 0 0 1 15.348 15.348 2 0.065318 7457 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.473 76.991 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13316 2845 12490 117498 148862 148862 1 FGIDDQDFQNSLTR Unmodified 1654.7587 0.75871368 2505 P48426 PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.28 108.28 2 6.7261E-37 111694 QUIQUE_C1368_190116_001 183 164.86 2189600000 202660000 190140000 122420000 139150000 179750000 131360000 223580000 186200000 142500000 76276000 246340000 197510000 151670000 13317 2505 12491 117499;117500;117501;117502;117503;117504;117505;117506;117507;117508;117509;117510;117511 148863;148864;148865;148866;148867;148868;148869;148870;148871;148872;148873;148874;148875;148876 148865 13 FGIDDQDYLVSLTR Unmodified 1640.8046 0.80460124 3668 Q8TBX8;F8VNT5;F8VU68 PIP4K2C Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 27.279 27.279 2 0.057162 20667 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.756 22.154 15800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15800000 0 0 0 13323 2993 12497 117541 148908 148908 1 FGILTEK Unmodified 806.4538 0.45380487 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 53.392 53.392 2 0.021367 49480 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.2 71.013 219020000 0 50776000 59737000 0 0 0 0 29150000 0 33041000 0 46318000 0 13324 3169 12498 117542;117543;117544;117545;117546 148909;148910;148911;148912;148913;148914 148913 6 FGINCLIQFEDFANANAFR Unmodified 2246.0579 0.05787259 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 2 2 1 166.01 166.01 2;3 4.9636E-22 169689 QUIQUE_C1277_190116_001 170.18 140.85 1579400000 47877000 123790000 154530000 27538000 142700000 41493000 165350000 91755000 109500000 8435300 265050000 291350000 110000000 13325 3198 12499 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FHDLRPDEVADLFQTTQR Unmodified 2187.0709 0.070880117 2547 P49789;E9PBZ0;A0A0A0MRB0 FHIT Bis(5'-adenosyl)-triphosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 109.84 109.84 4 0.011056 111982 QUIQUE_C1563_190116_001 46.121 37.302 266380000 30215000 0 57374000 32539000 0 25695000 60622000 0 0 0 0 0 59938000 13429 2547 12599 118645;118646;118647;118648;118649;118650 150250;150251;150252;150253;150254;150255 150253 2 FHDNFGFDDLVR Unmodified 1480.6735 0.67352749 1380 O00165 HAX1 HCLS1-associated protein X-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 101.89 101.89 3 0.0011786 106320 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.314 39.774 40892000 0 0 0 12268000 0 0 0 0 12432000 0 16192000 0 0 13430 1380 12600 118651;118652;118653;118654 150256;150257;150258;150259 150258 4 FHDPDSAVVAQHLTNTVFVDR Unmodified 2367.1608 0.16075776 2895 Q5T760;Q05519;B4DWT1 SRSF11 Serine/arginine-rich splicing factor 11 yes no 0 0 0 1 1 93.9 93.9 3;4 0.0067215 96885 QUIQUE_C1403_190116_001 42.172 34.083 30076000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30076000 0 0 13431 2895 12601 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150428;150429;150430;150431;150432;150433;150434;150435;150436;150437;150438;150439;150440;150441;150442;150443;150444;150445;150446;150447;150448;150449 150434 20 FHMYEGYPLWK Unmodified 1469.6802 0.68019277 1786 P00491;G3V5M2;G3V393 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 98.633 98.633 2;3 0.00024923 101318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.387 66.977 672390000 24857000 26799000 32388000 25529000 28571000 22394000 0 90998000 107110000 12887000 115270000 117250000 68336000 13452 1786 12621 118824;118825;118826;118827;118828;118829;118830;118831;118832;118833;118834;118835;118836;118837;118838;118839;118840 150450;150451;150452;150453;150454;150455;150456;150457;150458;150459;150460;150461;150462;150463;150464;150465;150466;150467;150468;150469;150470;150471;150472;150473;150474;150475;150476;150477;150478 150462 28 FHMYEGYPLWK Oxidation (M) 1485.6751 0.67510739 1786 P00491;G3V5M2;G3V393 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 1 0 1 1 78.936 78.936 2;3 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Unmodified 2364.1611 0.16109211 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 84.655 84.655 3 0.000431 85754 QUIQUE_C1403_190116_001 44.312 26.016 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13457 498 12625 118849;118850 150488;150489 150489 2 FHQLDIDDLQSIR Unmodified 1598.8053 0.80526994 2102;1659 O75828;P16152;E9PQ63;A8MTM1 CBR3;CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 3;Carbonyl reductase [NADPH] 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 3 3 2 2 2 98.126 98.126 2;3 5.1606E-54 100221 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.09 156.15 38601000000 2033200000 2711900000 3016600000 2621600000 3384600000 3153000000 3224400000 2755700000 3488700000 1626000000 3343600000 3199100000 4042600000 13458 1659;2102 12626 118851;118852;118853;118854;118855;118856;118857;118858;118859;118860;118861;118862;118863;118864;118865;118866;118867;118868;118869;118870;118871;118872;118873;118874;118875;118876;118877;118878;118879 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FHTSTYDLPGPEGAGPFEASQPADSAVPATSGK Unmodified 3288.5211 0.52111576 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.97 101.97 3 4.6081E-86 104312 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.67 142.82 1399200000 113420000 0 116090000 126160000 107410000 122530000 52742000 219980000 98004000 40088000 167430000 110670000 124670000 13468 921 12636 118977;118978;118979;118980;118981;118982;118983;118984;118985;118986;118987;118988;118989 150667;150668;150669;150670;150671;150672;150673;150674;150675;150676;150677;150678;150679;150680;150681;150682;150683;150684;150685;150686;150687;150688 150680 22 FHVATSTLPK Unmodified 1099.6026 0.60259438 1599 O60883 GPR37L1 Prosaposin receptor GPR37L1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 2 2 31.479 31.479 2;3 0.0029722 25596 QUIQUE_DMIX8_190116_001 55.461 40.788 3719700000 398180000 342390000 478670000 372290000 104790000 109930000 0 96692000 394440000 185770000 555990000 347450000 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histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain no no 0 0 0 1 1 116.87 116.87 2 0.0004449 119857 QUIQUE_C1403_190116_001 101.95 76.016 398940000 0 0 0 266600000 0 0 0 132350000 0 0 0 0 0 13479 280;324;393;1891;1995;2063;2104;2312;2313;2318 12647 119050;119051 150757;150758 150757 2 FICDASSLHQVR Unmodified 1431.6929 0.69288272 4011 Q9BSH4 TACO1 Translational activator of cytochrome c oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 43.693 43.693 2;3 0.0015135 40417 QUIQUE_C1368_190116_001 67.08 60.191 382580000 70236000 49676000 54807000 56738000 42397000 22098000 0 0 0 0 40327000 46300000 0 13480 4011 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119185;119186;119187;119188;119189;119190;119191;119192;119193;119194;119195;119196;119197 150924;150925;150926;150927;150928;150929;150930;150931;150932;150933;150934;150935;150936;150937;150938 150927 14 FIEAGQYNNHLYGTSVQSVR Unmodified 2282.108 0.10799391 2954 Q12959;A0A0C4DFT3 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.468 75.468 3 4.5195E-31 73445 QUIQUE_C1576_190116_001 118.52 87.413 1170800000 180000000 96096000 89725000 59324000 78092000 66906000 98775000 80316000 68790000 40038000 94601000 121800000 96372000 13500 2954 12667 119198;119199;119200;119201;119202;119203;119204;119205;119206;119207;119208;119209;119210;119211 150939;150940;150941;150942;150943;150944;150945;150946;150947;150948;150949;150950;150951;150952;150953;150954;150955;150956;150957 150948 19 FIEAGQYNSHLYGTSVQSVR Unmodified 2255.0971 0.097094868 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 2 1 1 75.328 75.328 2;3 1.4953E-56 76113 QUIQUE_C1218_190116_001 174.17 160.49 376730000 219050000 0 0 0 0 0 0 95621000 0 62052000 0 0 0 13501 487 12668 119212;119213;119214;119215 150958;150959;150960;150961 150959 4 FIECYIAEQNMVSIAVGCATR Unmodified 2431.1334 0.13342207 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 3 3 2 2 169.63 169.63 3 0.0010044 162555 QUIQUE_C1368_190116_001 31.488 28.298 212410000 59371000 3266400 25455000 0 0 0 3909900 5314900 26101000 0 51532000 15225000 22235000 13502 2288 12669 119216;119217;119218;119219;119220;119221;119222;119223;119224;119225;119226;119227;119228;119229;119230;119231;119232 150962;150963;150964;150965;150966;150967;150968;150969;150970;150971;150972;150973;150974;150975;150976;150977;150978 150965 17 FIEDELQIPVK Unmodified 1329.718 0.71801807 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 104.47 104.47 2 0.0024825 109607 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.65 72.497 60475000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60475000 0 0 13503 2320 12670 119233 150979 150979 0 FIEFEDALEQEK Unmodified 1496.7035 0.70349021 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 109.71 109.71 2 8.398E-06 114094 QUIQUE_C1218_190116_001 157.96 119.65 96845000 34633000 0 0 0 0 27256000 34956000 0 0 0 0 0 0 13504 77 12671 119234;119235;119236 150980;150981;150982;150983 150980 4 FIEFEDALEQEKK Unmodified 1624.7985 0.79845323 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 1 2 1 1 87.612 87.612 2;3 0.001403 89811 QUIQUE_C1218_190116_001 83.045 63.802 217770000 132980000 0 0 0 0 0 0 65659000 0 19134000 0 0 0 13505 77 12672 119237;119238;119239;119240 150984;150985;150986;150987 150985 3 FIEFEDSQEQEKK Unmodified 1655.7679 0.76788138 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 1 1 1 42.694 42.694 3 0.045302 39500 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.227 21.856 35249000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35249000 0 0 13506 1567 12673 119241;119242 150988;150989 150989 2 FIEIAAR Unmodified 818.46504 0.46503826 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7;A0A1W2PQD4;A0A1W2PPE9 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 47.43 47.43 2 0.021961 45392 QUIQUE_C1218_190116_001 103.29 53.166 3711400000 439200000 0 409240000 441570000 0 449540000 465580000 447600000 0 0 580580000 0 478120000 13507 2849 12674 119243;119244;119245;119246;119247;119248;119249;119250 150990;150991;150992;150993;150994;150995;150996;150997;150998 150990 9 FIFDCVSQEYGINPER Unmodified 1972.8989 0.89891233 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.05 131.05 2 8.2019E-36 133861 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.23 153.47 633330000 56880000 58030000 59611000 49722000 0 68110000 65663000 53613000 40117000 0 64429000 57584000 59570000 13508 531 12675 119251;119252;119253;119254;119255;119256;119257;119258;119259;119260;119261 150999;151000;151001;151002;151003;151004;151005;151006;151007;151008;151009;151010 151005 12 FIFLTTAVTNSAR Unmodified 1439.7773 0.77726428 4139 Q9H267;F5H008 VPS33B Vacuolar protein sorting-associated protein 33B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 108.18 108.18 2 0.0012892 113148 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.763 26.566 130250000 0 30713000 0 0 0 0 39769000 0 0 0 59773000 0 0 13509 4139 12676 119262;119263;119264;119265;119266;119267 151011;151012;151013;151014;151015;151016 151016 6 FIFTLVGGHISPLLVACEK Unmodified 2100.1442 0.1441684 516 A1L0T0;E9PJS0;E9PL44 ILVBL Acetolactate synthase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 139.85 139.85 2;3 1.406E-11 144488 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.77 91.52 288450000 27729000 62867000 42101000 0 0 26628000 0 40524000 88603000 0 0 0 0 13510 516 12677 119268;119269;119270;119271;119272;119273;119274;119275 151017;151018;151019;151020;151021;151022;151023;151024;151025 151023 9 FIFVGTLK Unmodified 923.54804 0.54803961 3361 Q6GQQ9 OTUD7B OTU domain-containing protein 7B yes yes 0 0 0 1 91.836 91.836 2 0.067645 94224 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.43 18.459 13932000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13932000 13511 3361 12678 119276 151026 151026 1 FIFYELLTR Unmodified 1200.6543 0.6542956 168 A0A0A0MS69;Q14123 PDE1C Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.44 143.44 2 0.0054684 149529 QUIQUE_C1576_190116_001 95.099 52.072 150920000 16070000 21785000 11410000 0 11250000 0 14056000 12115000 12454000 0 19331000 16117000 16334000 13512 168 12679 119277;119278;119279;119280;119281;119282;119283;119284;119285;119286 151027;151028;151029;151030;151031;151032;151033;151034;151035;151036;151037 151032 11 FIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYAR Unmodified 2809.5127 0.51266374 804 D6R9H7;E7EQ97;E7EPU7;P05496;Q06055;P48201 ATP5G1;ATP5G2;ATP5G3 ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial;ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial;ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial yes no 0 0 0 5 185.19 185.19 3 0.00033439 187783 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.767 24.571 26072000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26072000 0 0 13513 804 12680 119287;119288;119289;119290;119291 151038;151039;151040;151041;151042 151038 4 FIGELFK Unmodified 852.47454 0.47454032 922;170 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;A0A0A0MSA7;A0A0U1RQK7;O43432 EIF4G1;EIF4G3 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1;Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 no no 0 0 0 1 88.788 88.788 2 0.042242 92458 QUIQUE_C1438_190116_001 81.297 8.2579 52302000 0 0 0 0 52302000 0 0 0 0 0 0 0 0 13514 922;170 12681 119292 151043 151043 1 FIHDQTSPNPK Unmodified 1282.6306 0.63060004 2621 P53007;B4DP62 SLC25A1 Tricarboxylate transport protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 15.059 15.059 2;3 8.6193E-05 6357 QUIQUE_C1563_190116_001 133.83 116.59 638510000 0 71447000 0 90845000 0 43750000 191560000 54361000 63478000 0 0 52698000 70371000 13515 2621 12682 119293;119294;119295;119296;119297;119298;119299;119300;119301 151044;151045;151046;151047;151048;151049;151050;151051;151052 151046 8 FIHQQPQSSSPVYGSSAK Unmodified 1946.9486 0.94863972 344 A0A1B0GTU4;P49023;F5GZ78;A0A1B0GU60;F5H836 PXN Paxillin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.995 28.995 3 9.5587E-08 23197 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.62 75.471 227570000 0 0 0 57220000 0 32929000 0 44543000 72622000 20260000 0 0 0 13516 344 12683 119302;119303;119304;119305;119306;119307;119308 151053;151054;151055;151056;151057;151058;151059;151060;151061 151057 9 FIHTLESQR Unmodified 1129.588 0.58800695 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.12 23.12 3 0.0033351 16599 QUIQUE_C1576_190116_001 60.828 24.382 322870000 0 22102000 33531000 33779000 29122000 0 50521000 0 45388000 0 52657000 0 55770000 13517 1510 12684 119309;119310;119311;119312;119313;119314;119315;119316 151062;151063;151064;151065;151066;151067;151068;151069 151066 4 FIHVSHLNANIK Unmodified 1391.7674 0.76736829 3197 Q16795;A0A3B3ISG8 NDUFA9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 34.456 34.456 2;3 0.00024388 30042 QUIQUE_C1277_190116_001 86.114 66.473 877660000 64209000 115990000 59578000 75906000 0 71889000 32576000 0 142570000 0 128360000 78976000 107610000 13518 3197 12685 119317;119318;119319;119320;119321;119322;119323;119324;119325;119326;119327;119328;119329 151070;151071;151072;151073;151074;151075;151076;151077;151078;151079;151080;151081;151082;151083 151072 12 FIIENTDLAVANSIR Unmodified 1674.8941 0.89408495 2147 P19387;H3BRR2 POLR2C DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 117.43 117.43 2 2.938E-06 120908 QUIQUE_C1277_190116_001 132.76 103.29 78629000 19817000 17877000 0 0 0 14906000 0 0 26029000 0 0 0 0 13519 2147 12686 119330;119331;119332;119333;119334 151084;151085;151086;151087;151088;151089 151085 6 FIIEYEDAMHKPGLWHHQTEVSGTQTTAQLK Oxidation (M) 3610.7515 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151104;151105;151106;151107;151108;151109;151110;151111;151112;151113;151114;151115;151116;151117;151118;151119;151120;151121;151122;151123;151124;151125;151126;151127;151128;151129;151130;151131;151132;151133;151134;151135;151136;151137;151138;151139;151140;151141;151142;151143;151144;151145;151146;151147;151148;151149;151150;151151;151152;151153;151154;151155;151156 151120 53 FIINSYPK Unmodified 980.53312 0.53311783 3846 Q96EY7;B8ZZQ4 PTCD3 Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 62.416 62.416 2 0.025599 61808 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.342 21.318 39664000 0 0 0 0 0 0 0 0 19246000 0 0 20418000 0 13524 3846 12690 119377;119378 151157;151158 151157 2 FIIPNVVK Unmodified 928.57459 0.57458871 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 3 1 1 2 2 1 88.389 88.389 1;2 0.0048159 91297 QUIQUE_C1218_190116_001 107.74 40.751 13916000000 1252400000 1225100000 1014800000 1329700000 1184600000 788970000 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119399;119400;119401;119402;119403;119404;119405;119406;119407;119408;119409;119410;119411;119412;119413;119414;119415;119416;119417;119418 151198;151199;151200;151201;151202;151203;151204;151205;151206;151207;151208;151209;151210;151211;151212;151213;151214;151215;151216;151217;151218;151219;151220;151221;151222;151223;151224;151225;151226;151227;151228;151229;151230;151231;151232;151233;151234;151235;151236;151237;151238;151239;151240;151241;151242;151243;151244;151245;151246;151247;151248 151198 47 FIITALPTIYHCK Unmodified 1575.8483 0.84832073 4158 Q9H3N1 TMX1 Thioredoxin-related transmembrane protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 102.73 102.73 3 0.00014912 105787 QUIQUE_C1277_190116_001 73.466 67.199 357580000 32623000 24098000 26796000 37975000 24004000 36516000 29940000 31419000 33253000 13233000 29787000 0 37939000 13527 4158 12693 119419;119420;119421;119422;119423;119424;119425;119426;119427;119428;119429;119430;119431 151249;151250;151251;151252;151253;151254;151255;151256;151257;151258;151259;151260;151261;151262;151263 151250 15 FIKDNWEELYNR Unmodified 1625.7838 0.78380622 959 E9PLK3;P55786;H0YDG0 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 85.276 85.276 2;3 9.6465E-07 87175 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.95 117.38 1153000000 0 0 0 0 0 0 0 293830000 217030000 0 395620000 81908000 164570000 13528 959 12694 119432;119433;119434;119435;119436;119437;119438;119439 151264;151265;151266;151267;151268;151269;151270;151271;151272;151273 151268 10 FIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELR Unmodified 2890.4614 0.46135645 4514 Q9UNS2 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 118.24 118.24 3;4 5.0016E-24 122102 QUIQUE_C1277_190116_001 120.63 109.52 1732000000 142190000 151620000 69208000 95998000 140980000 97804000 161690000 197850000 164030000 0 195880000 212990000 101800000 13529 4514 12695 119440;119441;119442;119443;119444;119445;119446;119447;119448;119449;119450;119451;119452;119453;119454;119455;119456;119457;119458;119459;119460;119461 151274;151275;151276;151277;151278;151279;151280;151281;151282;151283;151284;151285;151286;151287;151288;151289;151290;151291;151292;151293;151294;151295;151296;151297;151298;151299;151300;151301;151302;151303;151304;151305;151306 151276 33 FIKPWESPDEMELDELLK Unmodified 2218.0868 0.086772682 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468;A0A1B0GU15 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 1 1 1 1 1 142.77 142.77 3 0.0011178 146946 QUIQUE_C1277_190116_001 61.87 39.649 197550000 43962000 67928000 0 0 0 40380000 45284000 0 0 0 0 0 0 13530 987 12696 119462;119463;119464;119465 151307;151308;151309;151310 151308 4 FILHEALVENTIPNIK Unmodified 1850.0302 0.030184502 3324 Q5TC84;A0A3B3IRI0 OGFRL1 Opioid growth factor receptor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 107.88 107.88 2;3 0.00015103 110837 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.615 68.276 267590000 27900000 21274000 0 31455000 32080000 0 0 31690000 110720000 12474000 0 0 0 13531 3324 12697 119466;119467;119468;119469;119470;119471;119472;119473 151311;151312;151313;151314;151315;151316;151317;151318;151319;151320 151318 9 FILIQNR Unmodified 902.53379 0.53378653 1366 M0R0N4;M0QYZ2;P53680;X6R390 AP2S1 AP-2 complex subunit sigma yes no 0 0 0 1 1 1 60.218 60.218 2 0.021299 56680 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.42 76.89 815570000 0 296270000 0 0 0 0 0 0 0 133790000 385500000 0 0 13532 1366 12698 119474;119475;119476 151321;151322;151323 151322 3 FILLVSGFCPR Unmodified 1307.706 0.70601359 3723 Q8WZ82 OVCA2 Ovarian cancer-associated gene 2 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.12 130.12 2 0.00346 133779 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.78 66.636 143910000 0 0 25404000 0 20058000 28680000 0 0 0 0 29294000 23766000 16707000 13533 3723 12699 119477;119478;119479;119480;119481;119482;119483;119484;119485;119486 151324;151325;151326;151327;151328;151329;151330;151331;151332;151333;151334;151335 151331 12 FILNGDFER Unmodified 1109.5506 0.55055881 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.209 89.209 2 0.021719 90953 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.962 32.586 500840000 50976000 0 74052000 0 0 43130000 0 69733000 73817000 30370000 0 71747000 87013000 13534 2807 12700 119487;119488;119489;119490;119491;119492;119493;119494 151336;151337;151338;151339;151340;151341;151342;151343 151340 8 FILNLPTFSVR Unmodified 1305.7445 0.74450759 2538 P49721;A0A087WVV1 PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.03 143.03 2 2.8044E-05 147991 QUIQUE_DMIX8_190116_001 149.72 108.73 5894100000 574260000 460380000 552400000 321960000 518210000 542060000 420820000 365390000 499560000 168690000 576620000 456030000 437720000 13535 2538 12701 119495;119496;119497;119498;119499;119500;119501;119502;119503;119504;119505;119506;119507 151344;151345;151346;151347;151348;151349;151350;151351;151352;151353;151354;151355;151356;151357;151358;151359;151360;151361;151362;151363;151364;151365;151366;151367 151367 23 FILNVQSK Unmodified 947.54402 0.54401687 200 A0A0A0MTS7;A0A0A0MRA3;Q8WZ42 TTN Titin yes no 0 0 0 1 53.421 53.421 2 0.043693 51316 QUIQUE_C1403_190116_001 58.194 5.0308 45155000 0 0 0 45155000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13536 200 12702 119508 151368 151368 1 FILPEGASQGMTPFR Unmodified 1649.8236 0.82356254 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;H0Y314;H0Y4F5;H0Y6T5;H0Y7I1 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 118.69 118.69 2 0.013708 121247 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.04 25.273 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13537 1187 12703 119509 151369 151369 1 FILPVNEGK Unmodified 1015.5702 0.57023162 4583 Q9Y3A5;A0A087X020 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 71.6 71.6 2 0.00053812 70253 QUIQUE_C1563_190116_001 130.22 73.173 658510000 102360000 106580000 0 125680000 0 94483000 0 73484000 105270000 50654000 0 0 0 13538 4583 12704 119510;119511;119512;119513;119514;119515;119516 151370;151371;151372;151373;151374;151375;151376 151373 5 FILSCADDK Unmodified 1067.4957 0.49574604 2460 P43034;I3L3N5 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.98 51.98 2 0.0037167 50585 QUIQUE_C1438_190116_001 90.657 58.722 1728800000 0 240040000 0 0 261820000 0 0 131690000 141540000 172450000 278880000 233670000 268740000 13539 2460 12705 119517;119518;119519;119520;119521;119522;119523;119524;119525;119526 151377;151378;151379;151380;151381;151382;151383;151384;151385;151386;151387;151388;151389 151379 13 FILSIAYSPDGK Unmodified 1309.6918 0.69180331 1171 H0YN81;Q9GZS3;H0YMF9;H0YL19;H3BQA8 WDR61 WD repeat-containing protein 61;WD repeat-containing protein 61, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 111.59 111.59 2 0.018809 116801 QUIQUE_C1438_190116_001 59.908 25.655 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13540 1171 12706 119527;119528;119529;119530 151390;151391;151392;151393 151392 4 FILTESDTVKR Unmodified 1307.7085 0.70851601 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 1 1 46.688 46.688 3 0.023701 43521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.563 21.764 18549000 0 0 0 0 0 0 0 18549000 0 0 0 0 0 13541 3718 12707 119531 151394 151394 1 FIMESGAK Unmodified 881.43169 0.43168922 2214 P23396;E9PL09;H0YEU2 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.286 29.286 2 0.023413 23368 QUIQUE_C1403_190116_001 73.324 34.487 589840000 0 0 0 115580000 63716000 0 89455000 0 97542000 30583000 0 96971000 95993000 13542 2214 12708 119532;119533;119534;119535;119536;119537;119538 151395;151396;151397;151398;151399;151400;151401 151395 7 FINDCTELFR Unmodified 1313.6074 0.60742176 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 92.512 92.512 2 0.0020562 94438 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.062 78.06 156210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25385000 0 52469000 78360000 13543 1692 12709 119539;119540;119541;119542;119543 151402;151403;151404;151405;151406;151407 151407 6 FINDQYEK Unmodified 1055.4924 0.49237523 4432 Q9UHD8;K7EL40;K7EK18;K7ER52;K7EIE4;K7EQD7;K7ELJ9 SEPT9 Septin-9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.68 31.68 2 0.003669 26192 QUIQUE_DMIX4_190116_001 124.83 91.096 7300700000 536620000 502240000 754320000 495580000 465940000 503830000 564900000 602350000 575120000 347070000 738150000 539870000 674740000 13544 4432 12710 119544;119545;119546;119547;119548;119549;119550;119551;119552;119553;119554;119555;119556 151408;151409;151410;151411;151412;151413;151414;151415;151416;151417;151418;151419;151420 151417 12 FINLFPETK Unmodified 1107.5964 0.59644637 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 102.95 102.95 2 0.00043092 107252 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.72 98.798 1500700000 111280000 122770000 135470000 112890000 111960000 98107000 118180000 119670000 100710000 53383000 148390000 139500000 128420000 13545 1749 12711 119557;119558;119559;119560;119561;119562;119563;119564;119565;119566;119567;119568;119569;119570;119571 151421;151422;151423;151424;151425;151426;151427;151428;151429;151430;151431;151432;151433;151434;151435;151436;151437;151438;151439;151440;151441;151442;151443;151444;151445;151446 151442 26 FINLQPSTLTDK Unmodified 1375.7347 0.73473076 3628 Q8NBU5 ATAD1 ATPase family AAA domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 86.26 86.26 2 0.00050211 89000 QUIQUE_C1218_190116_001 105.98 57.552 244790000 63326000 65609000 0 72105000 0 0 0 0 0 0 43750000 0 0 13546 3628 12712 119572;119573;119574;119575;119576 151447;151448;151449;151450;151451;151452 151447 5 FINLQPSTLTDKWYGESQK Unmodified 2254.127 0.12699801 3628 Q8NBU5 ATAD1 ATPase family AAA domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 110.1 110.1 3 0.00031551 113547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.449 63.343 110250000 0 0 0 0 0 0 0 46258000 63989000 0 0 0 0 13547 3628 12713 119577;119578 151453;151454;151455 151455 2 FINMFAVLDELK Unmodified 1438.753 0.75302336 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;A0A087WWZ1;A0A087WTQ3;A0A087WVE1;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 166.41 166.41 2;3 0.00060022 173406 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.86 75.293 2563100000 157780000 235410000 268830000 139110000 216400000 0 206580000 221690000 328280000 0 241830000 340290000 206880000 13548 292;882;3442 12714 119579;119580;119581;119582;119583;119584;119585;119586;119587;119588;119589;119590;119591 151456;151457;151458;151459;151460;151461;151462;151463;151464;151465;151466;151467;151468;151469 151467 14 FINMFAVLDELK Oxidation (M) 1454.7479 0.74793799 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;A0A087WWZ1;A0A087WTQ3;A0A087WVE1;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 3 1 1 134.66 134.66 2 0.00062075 137580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.22 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151483;151484;151485;151486;151487;151488;151489;151490;151491;151492;151493;151494;151495;151496;151497;151498;151499;151500;151501;151502;151503;151504;151505;151506;151507;151508;151509;151510;151511;151512;151513;151514;151515;151516;151517;151518;151519;151520;151521;151522;151523;151524 151488 38 FIPCSPFSDYVYKR Unmodified 1777.8498 0.84977729 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 99.036 99.036 3 0.00011674 101469 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.457 73.689 488670000 0 0 0 0 0 0 0 196850000 107840000 0 0 96637000 87340000 13551 3051 12716 119622;119623;119624;119625 151525;151526;151527;151528;151529;151530 151525 6 FIPEFIR Unmodified 920.51199 0.51198846 1115 Q5QPK2;H0Y368;O60762 DPM1 Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 89.033 89.033 2 0.065273 92664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.596 59.394 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13552 1115 12717 119626 151531 151531 1 FIPEITISDILR Unmodified 1415.8024 0.8024164 750 C9JVN9;Q9H9P8 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151639;151640;151641;151642;151643;151644;151645;151646;151647;151648;151649;151650;151651;151652;151653;151654;151655;151656;151657;151658;151659;151660;151661;151662;151663;151664;151665;151666;151667;151668;151669 151642 30 FIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGK Oxidation (M) 2862.368 0.3680497 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 2 98.091 98.091 3;4 6.6753E-06 100700 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.247 50.76 428630000 0 0 0 0 0 51815000 0 59505000 48653000 0 57364000 0 211300000 13564 2308 12728 119727;119728;119729;119730;119731;119732 151670;151671;151672;151673;151674;151675;151676 151676 1694 7 FIQFEPEEDIKR Unmodified 1549.7777 0.77765821 825 D6RGX2;Q9NUQ7;D6RB53;D6RA67 UFSP2 Ufm1-specific protease 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 72.54 72.54 3 0.018382 72812 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.401 27.722 90347000 0 0 22403000 0 0 0 0 0 36927000 0 0 0 31016000 13565 825 12729 119733;119734;119735;119736 151677;151678;151679;151680 151680 3 FIQLLSDQSDQSVLIQK Unmodified 1961.047 0.046956778 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.46 120.46 2 3.4175E-10 123149 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.37 101.83 318530000 0 37461000 36058000 35815000 39811000 25437000 27158000 38669000 47652000 30465000 0 0 0 13566 1727 12730 119737;119738;119739;119740;119741;119742;119743;119744;119745;119746;119747 151681;151682;151683;151684;151685;151686;151687;151688;151689;151690;151691 151688 11 FIQPNIGELPTALK Unmodified 1539.8661 0.86607929 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 116.42 116.42 2 0.018468 122080 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.439 36.426 149480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68988000 80495000 0 13567 3037 12731 119748;119749 151692;151693 151692 2 FIQQTYPSGGEEQAQYCR Unmodified 2160.9535 0.9534671 3700 Q8WUM4;A0A3B3IT07;C9IZF9;F8WEQ7;F8WBR8 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.535 61.535 2 2.7375E-45 60298 QUIQUE_C1368_190116_001 196.57 184.6 708180000 62601000 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protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.589 60.589 2 0.00056989 60513 QUIQUE_C1218_190116_001 153.73 107.3 5766600000 559470000 0 436670000 495150000 510130000 382840000 477820000 472760000 418670000 228600000 698170000 524530000 561820000 13574 907;3002 12738 119774;119775;119776;119777;119778;119779;119780;119781;119782;119783;119784;119785 151721;151722;151723;151724;151725;151726;151727;151728;151729;151730;151731;151732;151733;151734;151735;151736;151737;151738;151739;151740 151721 20 FISADQSVALGELVK Unmodified 1575.8508 0.85082315 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.56 113.56 2 9.1676E-13 116982 QUIQUE_C1403_190116_001 134.98 113.98 1346400000 206380000 177930000 150590000 161700000 143190000 170110000 211070000 0 0 0 125470000 0 0 13575 335;1521 12739 119786;119787;119788;119789;119790;119791;119792;119793 151741;151742;151743;151744;151745;151746;151747;151748;151749;151750;151751;151752;151753;151754;151755;151756;151757 151749 17 FISADVHGIWSR Unmodified 1386.7044 0.70443369 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.62 83.62 3 0.00020154 85028 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.479 60.471 768080000 54197000 52493000 61472000 56071000 54749000 68166000 58123000 70082000 60254000 21487000 67610000 72324000 71054000 13576 514 12740 119794;119795;119796;119797;119798;119799;119800;119801;119802;119803;119804;119805;119806 151758;151759;151760;151761;151762;151763;151764;151765;151766;151767;151768;151769;151770;151771;151772;151773;151774 151769 17 FISANLPCNK Unmodified 1162.5805 0.58047873 987;1998;2987 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9;H0Y380;Q3KPI9;F5GWR7;P23468;Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRF;PTPRD;PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F;Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.849 50.849 2 0.0020935 48140 QUIQUE_C1563_190116_001 91.853 60.564 464680000 119600000 0 90423000 77602000 63420000 55428000 0 0 0 0 58209000 0 0 13577 1998;987;2987 12741 119807;119808;119809;119810;119811;119812;119813 151775;151776;151777;151778;151779;151780;151781;151782 151780 8 FISATDTIR Unmodified 1022.5397 0.53965977 4449 Q9UID3;E9PJ36;E9PKX7;E9PMB6;E9PQN6 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 49.047 49.047 2 0.022221 46039 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.602 17.744 91571000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13745000 34416000 0 43410000 13578 4449 12742 119814;119815;119816 151783;151784;151785 151785 3 FISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLK Unmodified 2937.3709 0.37086969 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 2 153.16 153.16 3;4 3.7124E-17 157273 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.73 85.556 6844600000 111740000 147350000 256360000 148740000 200410000 31137000 224510000 735590000 842140000 0 1664500000 1477500000 1004600000 13579 2308 12743 119817;119818;119819;119820;119821;119822;119823;119824;119825;119826;119827;119828;119829;119830;119831;119832;119833;119834;119835;119836 151786;151787;151788;151789;151790;151791;151792;151793;151794;151795;151796;151797;151798;151799;151800;151801;151802;151803;151804;151805;151806;151807;151808 151805 22 FISELAR Unmodified 834.45995 0.45995289 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 44.979 44.979 2 0.020578 41796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.74 43.221 563490000 182090000 120490000 0 0 0 0 0 163890000 0 0 0 97026000 0 13580 292;882;3442 12744 119837;119838;119839;119840 151809;151810;151811;151812 151811 4 FISETLR Unmodified 864.47052 0.47051757 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 41.765 41.765 2 0.017616 38213 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.72 10.563 4587900000 517990000 0 799770000 0 551140000 0 0 686560000 0 379770000 959820000 692880000 0 13581 3117 12745 119841;119842;119843;119844;119845;119846;119847 151813;151814;151815;151816;151817;151818;151819;151820 151818 8 FISETLRR Unmodified 1020.5716 0.5716286 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 26.915 26.915 2 0.041816 21413 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.915 27.413 74883000 0 0 0 0 0 0 0 0 74883000 0 0 0 0 13582 3117 12746 119848 151821 151821 1 FISFLQELSCFVTR Unmodified 1745.8811 0.88107742 118 A0A087X256;Q2M389;F8VYH7;F8VQX3;R4GMM5 KIAA1033 WASH complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 170.41 170.41 2 0.00093178 173838 QUIQUE_C1277_190116_001 100.55 72.812 11408000 0 0 0 0 0 0 11408000 0 0 0 0 0 0 13583 118 12747 119849;119850 151822;151823 151822 2 FISGIFTK Unmodified 911.51165 0.5116541 1036 J3KNM6;F8VVT9;Q99490 AGAP2 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 77.758 77.758 2 0.01606 79463 QUIQUE_C1218_190116_001 83.753 70.245 25493000 14029000 0 0 0 0 0 0 0 11465000 0 0 0 0 13584 1036 12748 119851;119852;119853 151824;151825;151826 151824 3 FISNPNSIILAVTAANTDMATSEALK Unmodified 2691.3789 0.37893196 1108;1404 G8JLD5;O00429;F8VZ52;B4DDQ3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 158.42 158.42 2;3 1.3319E-70 163662 QUIQUE_C1368_190116_001 166.65 153.97 1740400000 200350000 0 150060000 123730000 152130000 138760000 158320000 185750000 149470000 51186000 46765000 218970000 164910000 13585 1108;1404 12749 119854;119855;119856;119857;119858;119859;119860;119861;119862;119863;119864;119865;119866;119867;119868;119869;119870;119871 151827;151828;151829;151830;151831;151832;151833;151834;151835;151836;151837;151838;151839;151840;151841;151842;151843;151844;151845;151846;151847 151830 21 FISNPNSIILAVTAANTDMATSEALK Oxidation (M) 2707.3738 0.37384658 1108;1404 G8JLD5;O00429;F8VZ52;B4DDQ3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 1 0 1 148.01 148.01 3 6.5026E-06 143452 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.656 47.857 25895000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25895000 0 0 0 13586 1108;1404 12749 119872 151848 151848 639 1 FISVGYVDDTQFVR Unmodified 1644.8148 0.814772 2316;377;325;2064 A0A1W2PPR8;P01889;F6U0H7;P30480;P30462;O19617;A0A140T921;A0A140T9H5;A0A140T9U8;A2AEA2;P10321;A0A140TA05;A0A140T9L3;A0A140T9E1;A0A140T942;F8W9Z8;A0A140TA12;A0A140T9Z7;P13747 HLA-B;HLA-C;HLA-E HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, Cw-7 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.6 115.6 2 0.00041234 120554 QUIQUE_C1576_190116_001 106.29 79.618 654650000 0 60567000 0 39398000 92327000 55535000 31250000 100080000 159790000 37391000 0 78310000 0 13587 377;2316;325;2064 12750 119873;119874;119875;119876;119877;119878;119879;119880;119881 151849;151850;151851;151852;151853;151854;151855;151856;151857;151858 151853 7 FITHAPPGEFNEVFNDVR Unmodified 2088.0065 0.0064889465 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 3 2 103.62 103.62 2;3 1.3169E-05 106742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.882 89.903 4240200000 307390000 327420000 437100000 426960000 291050000 315970000 312640000 325540000 344280000 0 458630000 285020000 408220000 13588 2617 12751 119882;119883;119884;119885;119886;119887;119888;119889;119890;119891;119892;119893;119894;119895;119896;119897;119898;119899;119900;119901;119902;119903;119904;119905 151859;151860;151861;151862;151863;151864;151865;151866;151867;151868;151869;151870;151871;151872;151873;151874;151875;151876;151877;151878;151879;151880;151881;151882;151883;151884;151885;151886;151887;151888;151889;151890;151891 151880 31 FITIFGTR Unmodified 953.53345 0.53345218 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 97.653 97.653 1;2 7.5511E-05 100162 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.17 82.94 22037000000 1373000000 2146000000 1845700000 2182700000 1974400000 2079600000 2144800000 1130600000 1358700000 1168400000 1571400000 830490000 2230600000 13589 1954 12752 119906;119907;119908;119909;119910;119911;119912;119913;119914;119915;119916;119917;119918;119919;119920;119921;119922;119923 151892;151893;151894;151895;151896;151897;151898;151899;151900;151901;151902;151903;151904;151905;151906;151907;151908;151909;151910;151911;151912;151913;151914;151915;151916;151917;151918;151919;151920;151921;151922;151923;151924;151925 151914 31 FITPEDLSK Unmodified 1048.5441 0.54407645 1748 O95757;E9PDE8 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.279 70.279 2 0.0020914 71086 QUIQUE_C1576_190116_001 96.948 66.444 1034300000 0 143210000 99907000 0 0 111830000 103010000 126260000 94418000 0 133130000 116950000 105550000 13590 1748 12753 119924;119925;119926;119927;119928;119929;119930;119931;119932 151926;151927;151928;151929;151930;151931;151932;151933;151934;151935;151936;151937;151938 151931 13 FITTVGIDFR Unmodified 1167.6288 0.62880913 1385 O00194;K7ES41;H3BUD9;H3BS49;H3BVH7;H3BN55;P51159;H3BU81 RAB27B;RAB27A Ras-related protein Rab-27B;Ras-related protein Rab-27A yes no 0 0 0 1 108.64 108.64 2 0.045203 110579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.423 11.29 42776000 0 0 0 0 0 0 0 42776000 0 0 0 0 0 13591 1385 12754 119933 151939 151939 1 FITVGWGR Unmodified 934.50249 0.5024864 1707 O95163 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 83.525 83.525 2 0.031742 85106 QUIQUE_C1277_190116_001 65.777 38.072 31878000 0 13909000 0 0 17969000 0 0 0 0 0 0 0 0 13592 1707 12755 119934;119935;119936;119937 151940;151941;151942;151943 151941 4 FITVGYVDDTLFVR Unmodified 1643.8559 0.85590853 2315;2317 P30479;P30481;A0A140T9Y5;A0A140T997;A0A140TA14;A0A140TA11 HLA-B HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain no no 0 0 0 1 1 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151946;151947;151948;151949;151950;151951;151952;151953;151954;151955;151956;151957;151958;151959;151960;151961;151962;151963;151964;151965;151966;151967;151968;151969;151970;151971;151972;151973;151974;151975;151976;151977 151957 31 FIVDGWHEMDAENPLHQPSPSLNK Oxidation (M) 2776.2915 0.29151393 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 94.105 94.105 3;4 9.2151E-12 97214 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.084 87.769 806790000 51986000 44025000 0 121470000 0 0 0 61363000 84236000 143860000 65413000 0 234430000 13595 913 12757 119964;119965;119966;119967;119968;119969;119970;119971;119972 151978;151979;151980;151981;151982;151983;151984;151985;151986 151984 564 8 FIVDQTQTPNLK Unmodified 1402.7456 0.7456298 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 71.508 71.508 2 0.0033572 71337 QUIQUE_C1277_190116_001 72.325 49.585 165390000 30854000 41865000 0 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151998;151999;152000;152001;152002;152003;152004;152005;152006;152007;152008;152009;152010;152011;152012;152013;152014 152008 17 FIVLSNNYLQIR Unmodified 1478.8245 0.82454882 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 122.3 122.3 2 6.8062E-28 126890 QUIQUE_C1368_190116_001 180.44 153.32 15456000000 983550000 1134000000 1360100000 1222300000 1394100000 899150000 1420800000 1150000000 1491500000 480650000 1384900000 1047700000 1487500000 13599 1218;28;2057 12761 119996;119997;119998;119999;120000;120001;120002;120003;120004;120005;120006;120007;120008;120009;120010 152015;152016;152017;152018;152019;152020;152021;152022;152023;152024;152025;152026;152027;152028;152029;152030;152031;152032;152033;152034;152035;152036;152037;152038;152039;152040;152041;152042;152043;152044;152045;152046;152047;152048;152049;152050;152051;152052;152053;152054;152055;152056;152057 152022 43 FIVYSYK Unmodified 918.48511 0.485105 2703 P60983 GMFB Glia maturation factor beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 61.325 61.325 2 0.023465 59403 QUIQUE_C1563_190116_001 100.07 66.375 2946400000 357530000 0 0 0 0 362230000 376260000 382770000 412100000 133190000 423440000 0 498860000 13600 2703 12762 120011;120012;120013;120014;120015;120016;120017;120018 152058;152059;152060;152061;152062;152063;152064;152065;152066;152067;152068 152060 11 FIWNSEK Unmodified 922.45487 0.45486751 1873 P05026 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.883 58.883 2 0.017367 59231 QUIQUE_C1218_190116_001 132.96 76.45 10284000000 983890000 913200000 909750000 862300000 807570000 624530000 962820000 614120000 779250000 345800000 882580000 746860000 851780000 13601 1873 12763 120019;120020;120021;120022;120023;120024;120025;120026;120027;120028;120029;120030;120031 152069;152070;152071;152072;152073;152074;152075;152076;152077;152078;152079;152080;152081;152082;152083;152084;152085;152086;152087;152088;152089;152090;152091;152092;152093 152069 25 FIWNSEKK Unmodified 1050.5498 0.54983053 1873 P05026 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes yes 0 0 1 1 33.232 33.232 3 0.063306 28656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.557 15.093 160100000 0 0 0 0 0 0 0 160100000 0 0 0 0 0 13602 1873 12764 120032 152094 152094 1 FIYEGSSDFSCLPTFGVIIGQK Unmodified 2464.1984 0.1984484 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 157.92 157.92 2;3 2.3421E-45 162663 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.68 126.58 492640000 23095000 0 29159000 0 27811000 74468000 56620000 69597000 44259000 9117300 60839000 97674000 0 13603 455 12765 120033;120034;120035;120036;120037;120038;120039;120040;120041;120042;120043;120044;120045;120046;120047;120048 152095;152096;152097;152098;152099;152100;152101;152102;152103;152104;152105;152106;152107;152108;152109;152110;152111 152106 15 FIYGNQDLFATSQSK Unmodified 1717.8312 0.83115034 3884 Q96J02 ITCH E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog yes yes 0 0 0 1 1 99.246 99.246 2 0.015241 96590 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.967 37.713 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13604 3884 12766 120049;120050 152112;152113 152113 2 FIYITPEELAAVANFIR Unmodified 1966.0564 0.056399252 3873 Q96HY6 DDRGK1 DDRGK domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 171.03 171.03 2;3 7.1877E-14 178283 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.93 120.51 812330000 44436000 89238000 124910000 28106000 40202000 10867000 71354000 38711000 61022000 6733300 130050000 139820000 26876000 13605 3873 12767 120051;120052;120053;120054;120055;120056;120057;120058;120059;120060;120061;120062;120063;120064;120065;120066;120067;120068;120069;120070;120071;120072;120073;120074;120075 152114;152115;152116;152117;152118;152119;152120;152121;152122;152123;152124;152125;152126;152127;152128;152129;152130;152131;152132;152133;152134;152135;152136;152137;152138;152139;152140;152141 152137 28 FIYMAVQHYIETLQR Unmodified 1910.9713 0.97128941 2898 Q06124 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 134.03 134.03 2;3 1.306E-12 138109 QUIQUE_C1403_190116_001 132.76 109.39 1122200000 120270000 100480000 69381000 124790000 59208000 0 78768000 96636000 74231000 0 222180000 69811000 106480000 13606 2898 12768 120076;120077;120078;120079;120080;120081;120082;120083;120084;120085;120086;120087;120088;120089;120090;120091;120092;120093;120094;120095 152142;152143;152144;152145;152146;152147;152148;152149;152150;152151;152152;152153;152154;152155;152156;152157;152158;152159;152160;152161;152162;152163 152149 21 FIYMAVQHYIETLQR Oxidation (M) 1926.9662 0.96620404 2898 Q06124 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes yes 0 1 0 1 1 1 128.69 128.69 3 5.4976E-07 133785 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.2 90.387 75623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75623000 0 0 13607 2898 12768 120096;120097;120098 152164;152165;152166 152165 2377 3 FKDFLLSLK Unmodified 1109.6485 0.64848194 3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 1 1 93.622 93.622 3 0.054987 94814 QUIQUE_C1563_190116_001 37.696 9 33084000 0 0 0 0 0 33084000 0 0 0 0 0 0 0 13608 3490 12769 120099 152167 152167 1 FKDFYQFTFNFAK Unmodified 1701.8191 0.81912909 749 C9JVE2;Q96GG9 DCUN1D1 DCN1-like protein;DCN1-like protein 1 yes no 0 0 1 1 127.86 127.86 3 0.0034097 130565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.001 45.711 24619000 0 0 0 0 0 0 0 24619000 0 0 0 0 0 13609 749 12770 120100 152168 152168 1 FKDIFQEIFDK Unmodified 1428.7289 0.7289171 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 1 3 2 2 2 2 2 3 2 2 1 2 2 2 132.88 132.88 2;3 0.00011281 138625 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.91 116.49 18073000000 1236700000 1492600000 1740000000 1223500000 1363500000 1451100000 1251500000 938510000 1653500000 188790000 1896900000 2093400000 1542600000 13610 2518 12771 120101;120102;120103;120104;120105;120106;120107;120108;120109;120110;120111;120112;120113;120114;120115;120116;120117;120118;120119;120120;120121;120122;120123;120124;120125;120126;120127 152169;152170;152171;152172;152173;152174;152175;152176;152177;152178;152179;152180;152181;152182;152183;152184;152185;152186;152187;152188;152189;152190;152191;152192;152193;152194;152195;152196;152197;152198;152199;152200;152201;152202;152203;152204;152205;152206;152207;152208;152209;152210;152211;152212;152213;152214 152207 44 FKDIFQEIFDKHYK Unmodified 1856.9461 0.94612052 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 2 2 2 2 2 1 100.09 100.09 3;4 2.0071E-21 104072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.18 146.8 1493300000 0 0 0 0 0 0 0 304570000 480590000 0 184740000 411850000 111590000 13611 2518 12772 120128;120129;120130;120131;120132;120133;120134;120135;120136 152215;152216;152217;152218;152219;152220;152221;152222;152223;152224;152225;152226;152227 152223 13 FKDIFQEIYDK Unmodified 1444.7238 0.72383172 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 103.52 103.52 2;3 0.00011658 106082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.24 90.611 2065800000 103350000 138770000 143010000 147810000 142340000 109140000 135800000 217380000 180190000 58623000 208450000 261460000 219520000 13612 1662 12773 120137;120138;120139;120140;120141;120142;120143;120144;120145;120146;120147;120148;120149;120150 152228;152229;152230;152231;152232;152233;152234;152235;152236;152237;152238;152239;152240;152241;152242;152243;152244;152245;152246;152247;152248;152249;152250;152251;152252;152253 152241 25 FKDLGEENFK Unmodified 1225.5979 0.59790293 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;A0A087WWT3;C9JKR2;H7C013 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 41.403 41.403 2;3 1.0451E-06 38136 QUIQUE_C1277_190116_001 153.05 122.48 55124000000 4338600000 4917500000 2054300000 4575100000 8834900000 2236000000 3723000000 1776000000 4578100000 1059700000 5668800000 5471900000 5889700000 + 13613 769 12774 120151;120152;120153;120154;120155;120156;120157;120158;120159;120160;120161;120162;120163;120164;120165;120166;120167;120168;120169;120170;120171;120172;120173;120174;120175 152254;152255;152256;152257;152258;152259;152260;152261;152262;152263;152264;152265;152266;152267;152268;152269;152270;152271;152272;152273;152274;152275;152276;152277;152278;152279;152280;152281;152282;152283 152258 25 FKDPGLVDQLVK Unmodified 1357.7606 0.76055158 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 78.771 78.771 2;3 0.0016058 80818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.088 65.98 1481100000 0 140430000 0 119300000 108530000 107810000 123680000 114750000 135090000 71628000 183280000 154370000 222200000 13614 2534 12775 120176;120177;120178;120179;120180;120181;120182;120183;120184;120185;120186;120187 152284;152285;152286;152287;152288;152289;152290;152291;152292;152293;152294;152295;152296;152297 152294 9 FKDPLKDGEAK Unmodified 1246.6558 0.65575216 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 2 1 2 20.333 20.333 2;3 0.0070661 12987 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.845 53.811 5503300000 427350000 0 472510000 614620000 454210000 0 644860000 516960000 195150000 0 1099400000 181730000 896490000 13615 2414 12776 120188;120189;120190;120191;120192;120193;120194;120195;120196;120197;120198;120199;120200;120201;120202 152298;152299;152300;152301;152302;152303;152304;152305;152306;152307;152308;152309;152310;152311;152312 152312 9 FKEIAEAYDVLSDPR Unmodified 1751.873 0.87301516 2241 P25685 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 97.351 97.351 2;3 1.1609E-05 101565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.21 107.66 460080000 0 0 40377000 0 0 0 47783000 0 0 0 130530000 96998000 144400000 13616 2241 12777 120203;120204;120205;120206;120207;120208;120209;120210 152313;152314;152315;152316;152317;152318;152319;152320 152316 6 FKEIQNLIK Unmodified 1131.6652 0.66519463 3821 Q96CN7 ISOC1 Isochorismatase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 2 53.226 53.226 2;3 0.00026572 50764 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.73 69.154 120400000 0 0 0 0 0 0 0 120400000 0 0 0 0 0 13617 3821 12778 120211;120212 152321;152322 152321 1 FKELSTLR Unmodified 992.56548 0.56548059 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFF6;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 29.817 29.817 2 0.049337 24474 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phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.81 148.81 3 1.93E-07 153974 QUIQUE_C1368_190116_001 59.661 57.122 561850000 82225000 91927000 57770000 56626000 64878000 39068000 75223000 0 0 0 0 48297000 45837000 13621 2107 12781 120227;120228;120229;120230;120231;120232;120233;120234;120235 152338;152339;152340;152341;152342;152343;152344;152345;152346;152347 152340 10 FKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEK Oxidation (M) 3070.3729 0.3728603 2915 Q08209;E7ETC2 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 142.2 142.2 3 3.8349E-10 146484 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.571 82.344 216460000 35584000 38972000 0 39120000 0 37211000 0 0 0 0 0 35576000 29997000 13622 2915 12782 120236;120237;120238;120239;120240;120241 152348;152349;152350;152351;152352;152353 152352 2391 5 FKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEK Unmodified 3054.3779 0.37794568 2915 Q08209;E7ETC2 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.94 154.94 3 3.7316E-15 159318 QUIQUE_C1403_190116_001 71.085 64.721 1436800000 127800000 181700000 221380000 132070000 107890000 120690000 157980000 44067000 45527000 9580900 96787000 106410000 84925000 13623 2915 12782 120242;120243;120244;120245;120246;120247;120248;120249;120250;120251;120252;120253;120254 152354;152355;152356;152357;152358;152359;152360;152361;152362;152363;152364;152365;152366;152367;152368;152369 152360 16 FKESFAEMNR Unmodified 1257.5812 0.58120701 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 37.996 37.996 2 0.026625 34583 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.111 35.512 228030000 0 0 0 0 0 0 0 75471000 0 0 0 80071000 72487000 13624 2052 12783 120255;120256;120257 152370;152371;152372 152370 2 FKESFAEMNR Oxidation (M) 1273.5761 0.57612163 2052 P13073;H3BPG0;H3BN72;H3BNV9 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 1 1 1 22.434 22.434 2 0.033299 15929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.533 72.496 65511000 0 0 0 0 0 0 0 0 65511000 0 0 0 0 13625 2052 12783 120258 152373 152373 1 FKEYCPMVFR Unmodified 1375.6417 0.64169877 2806;2505 P78356;A0A087WT35;P48426 PIP4K2B;PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta;Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha no no 0 0 1 1 68.025 68.025 2 0.049105 69002 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.005 34.722 34132000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34132000 0 0 13626 2806;2505 12784 120259 152374 152374 1 FKGDETVVIGQGKPYVFDR Unmodified 2154.111 0.11095402 1568 O60282 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 75.366 75.366 3;4 0.00075825 76929 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.358 59.592 383860000 0 0 0 42817000 0 0 55757000 0 61748000 0 63709000 70590000 89236000 13627 1568 12785 120260;120261;120262;120263;120264;120265;120266;120267 152375;152376;152377;152378;152379;152380;152381;152382;152383 152379 9 FKGPFTDVVTTNLK Unmodified 1565.8453 0.84534384 4369 Q9P0L0 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 86.695 86.695 2;3 0.003597 84811 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.32 38.214 479620000 91625000 0 0 80141000 55060000 0 0 0 0 27222000 225570000 0 0 13628 4369 12786 120268;120269;120270;120271;120272;120273 152384;152385;152386;152387;152388;152389 152387 2 FKIPEMHLK Unmodified 1141.6318 0.63178602 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 59.534 59.534 3 0.0069423 57755 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.173 48.365 19072000 0 0 0 0 0 0 0 19072000 0 0 0 0 0 13629 2935 12787 120274 152390 152390 1 FKIPGSPPESMGR Unmodified 1401.7075 0.70747015 2560;3300 P50395;Q5SX87;V9GYF8;Q5SX90;V9GYJ7;Q5SX86 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 2 1 2 60.009 60.009 2;3 0.0019912 58398 QUIQUE_C1368_190116_001 72.705 56.482 2305200000 138620000 166040000 273510000 158200000 0 0 211260000 272670000 266360000 0 326270000 175190000 317090000 13630 2560;3300 12788 120275;120276;120277;120278;120279;120280;120281;120282;120283;120284;120285;120286;120287;120288;120289;120290 152391;152392;152393;152394;152395;152396;152397;152398;152399;152400;152401;152402;152403;152404;152405;152406;152407;152408;152409;152410;152411;152412 152393 20 FKLDLDFPNLPYLLDGK Unmodified 2007.0717 0.071714965 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 3 2 2 1 160.06 160.06 2;3 3.8692E-62 167045 QUIQUE_DMIX5_190116_001 189.1 152.81 5953900000 113330000 158820000 93589000 73806000 179460000 0 639070000 639060000 1057300000 0 1456400000 1253200000 289800000 13631 2174 12789 120291;120292;120293;120294;120295;120296;120297;120298;120299;120300;120301;120302;120303;120304;120305;120306;120307;120308;120309 152413;152414;152415;152416;152417;152418;152419;152420;152421;152422;152423;152424;152425;152426;152427;152428;152429;152430;152431;152432 152429 20 FKLEESYDMESVLR Unmodified 1744.8342 0.83418681 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 106.11 106.11 3 0.0047148 109492 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.549 53.968 204050000 32633000 0 0 32059000 0 0 0 58329000 54635000 26398000 0 0 0 13632 2371 12790 120310;120311;120312;120313;120314 152433;152434;152435;152436;152437;152438;152439 152437 7 FKLEESYTLNSDLAR Unmodified 1784.8945 0.89447888 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 0 0 1 1 1 1 88.209 88.209 2;3 0.0003455 91335 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.39 70.84 77930000 0 0 0 51329000 0 0 0 0 0 26601000 0 0 0 13633 2324 12791 120315;120316;120317 152440;152441;152442 152442 1 FKLGLDFPNLPYLIDGAHK Unmodified 2157.1623 0.16226131 1965;141;2883;481 A0A0A0MR85;A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1;P09488;B9ZVX7;H3BRM6;Q03013 GSTM4;GSTM5;GSTM1 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AH receptor-interacting protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 137.6 137.6 3 0.00016117 142667 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.834 56.765 98527000 0 18028000 0 0 0 0 0 0 32766000 0 26478000 21255000 0 13637 1381 12795 120325;120326;120327;120328 152451;152452;152453;152454 152452 2 FKLWYTLDR Unmodified 1240.6604 0.66044361 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 0 1 1 96.895 96.895 3 0.0011011 98298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.15 64.139 16860000 0 0 0 0 0 0 0 16860000 0 0 0 0 0 13638 1778 12796 120329 152455 152455 1 FKMPDLHLK Unmodified 1127.6161 0.61613595 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 67.023 67.023 3 0.051667 65430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.368 37.722 19214000 0 0 0 0 0 0 0 19214000 0 0 0 0 0 13639 2935 12797 120330 152456 152456 1 FKMPEMHFK Unmodified 1193.5726 0.57255658 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 60.359 60.359 3 0.047559 58571 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.75 24.084 35801000 0 0 0 0 0 0 0 35801000 0 0 0 0 0 13640 2935 12798 120331 152457 152457 1 FKMPEMNIK Unmodified 1136.5722 0.57222223 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 66.492 66.492 3 0.0065259 65307 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.426 50.615 64656000 0 0 0 0 0 0 0 64656000 0 0 0 0 0 13641 2935 12799 120332 152458;152459 152459 2 FKNEEEVFAWNNEVK Unmodified 1881.8897 0.88972785 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 84.207 84.207 2;3 6.6961E-206 85208 QUIQUE_DMIX1_190116_001 331.3 287.67 14228000000 1218800000 915180000 1852700000 936090000 1574400000 1179300000 0 1437000000 1947000000 750050000 0 557120000 1860000000 13642 336 12800 120333;120334;120335;120336;120337;120338;120339;120340;120341;120342;120343;120344;120345;120346;120347;120348;120349;120350;120351;120352;120353 152460;152461;152462;152463;152464;152465;152466;152467;152468;152469;152470;152471;152472;152473;152474;152475;152476;152477;152478;152479;152480;152481;152482;152483 152473 20 FKNHEHSYQLEQR Unmodified 1714.8176 0.81756596 4387 Q9P2G1 ANKIB1 Ankyrin repeat and IBR domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 13.174 13.174 3 0.00024902 5016 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.264 84.32 20546000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10261000 0 10285000 13643 4387 12801 120354;120355 152484;152485 152485 2 FKPAYNPYTEPSMEVFSYHQGLK Unmodified 2732.2945 0.29447405 4547 Q9Y285;K7ER00;K7EPH2 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 100.15 100.15 3;4 6.468E-06 102364 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.165 60.403 1336200000 105110000 143330000 113300000 76635000 89034000 109920000 120350000 98258000 194720000 0 0 136620000 148890000 13644 4547 12802 120356;120357;120358;120359;120360;120361;120362;120363;120364;120365;120366;120367 152486;152487;152488;152489;152490;152491;152492;152493;152494;152495;152496;152497 152493 11 FKPEELVDYK Unmodified 1266.6496 0.64960415 1572 O60361 NME2P1 Putative nucleoside diphosphate kinase yes yes 0 0 1 1 67.455 67.455 3 0.03283 63289 QUIQUE_DMIX4_190116_001 39.179 31.814 17777000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17777000 0 0 0 13645 1572 12803 120368 152498 152498 1 FKPFTVEIVDSVEAYATMLR Unmodified 2315.1872 0.18715543 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 3 168.26 168.26 2;3 9.3068E-23 170409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.98 123.12 2660300000 0 57074000 0 0 0 0 192160000 267470000 1049400000 0 588560000 0 505630000 13646 2400 12804 120369;120370;120371;120372;120373;120374;120375;120376;120377 152499;152500;152501;152502;152503;152504;152505;152506;152507;152508 152501 8 FKPFTVEIVDSVEAYATMLR Oxidation (M) 2331.1821 0.18207005 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 1 1 1 2 1 2 163.8 163.8 3 0.00095524 167041 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.975 51.496 484320000 0 0 0 0 43786000 0 0 204480000 87595000 0 0 0 148460000 13647 2400 12804 120378;120379;120380;120381;120382;120383 152509;152510;152511;152512;152513;152514 152511 1806 3 FKPGYLEATLNWFR Unmodified 1740.8988 0.8987764 4150 Q9H2U2;D6R967;H0Y9D8 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.98 135.98 3 3.6295E-07 139864 QUIQUE_DMIX7_190116_001 126.1 111.31 874460000 42477000 49313000 80109000 47075000 42118000 51352000 79053000 76244000 85726000 0 123330000 116360000 81302000 13648 4150 12805 120384;120385;120386;120387;120388;120389;120390;120391;120392;120393;120394;120395 152515;152516;152517;152518;152519;152520;152521;152522;152523;152524;152525;152526;152527 152525 13 FKPPPPNSDIGWR Unmodified 1509.7728 0.7728476 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 57.6 57.6 3 1.0708E-07 56451 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.69 116.15 681690000 0 72152000 63165000 63153000 72169000 81937000 82513000 0 76224000 0 88739000 81636000 0 13649 438;2509 12806 120396;120397;120398;120399;120400;120401;120402;120403;120404;120405 152528;152529;152530;152531;152532;152533;152534;152535;152536;152537;152538;152539;152540;152541 152537 14 FKPTLSQQQK Unmodified 1203.6612 0.66117189 669 B7ZKJ8;Q14624 ITIH4 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 17.516 17.516 3 0.0043116 10379 QUIQUE_C1218_190116_001 74.6 57.763 146220000 40391000 0 17464000 0 0 0 0 18968000 14471000 0 0 0 54931000 + 13650 669 12807 120406;120407;120408;120409;120410 152542;152543;152544;152545;152546;152547 152543 6 FKQEGVLNSK Unmodified 1148.619 0.61897272 2615 P52888;K7EP46;K7EL02;K7EIK4;K7EL32 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 1 1 17.921 17.921 2 0.002169 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0 0 1 1 81.202 81.202 3 0.027738 82476 QUIQUE_C1277_190116_001 28.203 17.718 27473000 0 27473000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13654 2041 12811 120426 152563 152563 1 FKVEYHAGGSTQNSIK Unmodified 1764.8795 0.87949752 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 28.144 28.144 3 4.269E-05 23219 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.922 75.847 149270000 0 0 0 0 0 0 0 53519000 57989000 0 37763000 0 0 13655 2663 12812 120427;120428;120429 152564;152565;152566 152564 3 FKWWGLQNK Unmodified 1205.6346 0.63456321 2842 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 80.493 80.493 3 0.004145 81267 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.816 60.508 163740000 0 0 0 0 0 0 0 36615000 32578000 0 38730000 36769000 19050000 13656 2842 12813 120430;120431;120432;120433;120434 152567;152568;152569;152570;152571 152571 5 FKWWGLQSK Unmodified 1178.6237 0.62366417 2519 P48739;A0A0A0MSW4 PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform yes no 0 0 1 1 1 83.478 83.478 3 0.0098982 85306 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.518 53.715 37197000 0 0 0 0 0 0 0 21537000 0 0 15660000 0 0 13657 2519 12814 120435;120436 152572;152573 152573 2 FLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYK Unmodified 2616.2683 0.2682593 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 130.81 130.81 3 3.4107E-51 133761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.53 116.65 2599300000 147100000 195550000 202010000 170760000 192900000 132960000 194700000 253720000 260140000 54391000 312160000 298310000 184590000 13658 225 12815 120437;120438;120439;120440;120441;120442;120443;120444;120445;120446;120447;120448;120449;120450 152574;152575;152576;152577;152578;152579;152580;152581;152582;152583;152584;152585;152586;152587;152588;152589;152590;152591;152592;152593;152594;152595;152596;152597;152598;152599 152589 26 FLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKR Unmodified 2772.3694 0.36937032 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 1 1 118.25 118.25 3 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152645;152646;152647;152648;152649;152650;152651;152652;152653;152654;152655;152656;152657;152658;152659;152660;152661;152662;152663;152664;152665;152666;152667;152668;152669;152670;152671;152672;152673;152674;152675;152676;152677;152678;152679;152680;152681;152682;152683;152684;152685;152686;152687;152688;152689;152690;152691;152692;152693;152694;152695;152696;152697;152698;152699;152700;152701;152702;152703;152704;152705;152706;152707;152708;152709;152710;152711;152712;152713;152714;152715;152716;152717;152718;152719;152720;152721;152722;152723;152724;152725;152726;152727;152728;152729;152730;152731;152732;152733;152734;152735;152736;152737;152738;152739;152740;152741;152742;152743;152744;152745;152746;152747;152748;152749;152750;152751;152752;152753;152754;152755;152756;152757;152758;152759;152760;152761;152762;152763;152764;152765;152766;152767;152768;152769;152770;152771;152772;152773;152774;152775;152776;152777;152778;152779;152780;152781;152782;152783;152784;152785;152786;152787;152788;152789;152790;152791;152792;152793;152794;152795;152796;152797;152798;152799;152800;152801;152802;152803;152804;152805;152806;152807;152808;152809;152810;152811;152812;152813;152814;152815;152816;152817;152818;152819;152820;152821;152822;152823;152824;152825;152826;152827;152828;152829;152830;152831;152832;152833;152834;152835;152836;152837;152838;152839;152840;152841;152842;152843;152844;152845;152846;152847;152848;152849;152850;152851;152852;152853;152854;152855;152856;152857;152858;152859;152860;152861;152862;152863;152864;152865;152866;152867;152868;152869;152870;152871;152872;152873;152874;152875;152876;152877;152878;152879;152880;152881;152882;152883;152884;152885;152886;152887;152888;152889;152890;152891 152722 235 FLAVGLVDNTVR Unmodified 1302.7296 0.7295858 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 99.907 99.907 2 0.0028309 101368 QUIQUE_C1563_190116_001 86.624 49.433 28467000 0 0 0 0 0 28467000 0 0 0 0 0 0 0 13669 3135 12826 120604;120605;120606 152892;152893;152894;152895 152894 4 FLAWNYFAHLR Unmodified 1436.7353 0.73533988 326 H7C5D3;H7C4U4;Q0P5T2;A0A140T9G8;Q5SQH8 C6orf136 Uncharacterized protein C6orf136 yes no 0 0 0 1 121.62 121.62 3 0.013872 126096 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.267 47.424 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13670 326 12827 120607 152896 152896 1 FLCFGSEGGTYYIK Unmodified 1640.7545 0.75447993 1992 P10155 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 115.95 115.95 2 8.0622E-05 120847 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.71 112.02 567510000 96591000 115290000 0 122750000 0 105650000 0 0 127230000 0 0 0 0 13671 1992 12828 120608;120609;120610;120611;120612;120613;120614 152897;152898;152899;152900;152901;152902;152903 152903 7 FLCGVVEGFYGR Unmodified 1402.6704 0.67035637 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 116.92 116.92 2 0.0041184 120492 QUIQUE_C1277_190116_001 86.898 69.386 174840000 41091000 35803000 0 32162000 28304000 37476000 0 0 0 0 0 0 0 13672 1579 12829 120615;120616;120617;120618;120619 152904;152905;152906;152907;152908;152909 152905 4 FLCIFLEK Unmodified 1068.5678 0.56778878 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 113.55 113.55 2 0.010167 117700 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.626 51.98 30232000 0 0 0 0 0 0 0 0 14462000 0 0 15770000 0 13673 2813 12830 120620;120621;120622;120623 152910;152911;152912;152913;152914 152912 5 FLCPAIMSPSLFGLMQEYPDEQTSR Unmodified 2916.3496 0.34962244 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 165.79 165.79 3 0.00053237 167682 QUIQUE_C1563_190116_001 41.911 35.548 58274000 0 0 31979000 0 0 26294000 0 0 0 0 0 0 0 13674 135 12831 120624;120625 152915;152916 152916 2 FLCTPLAAACPSGAQQGDAAGAAPGEREELLLLQSTAEQLR Unmodified 4267.1002 0.1001547 396 A0A1X7SBT7;O95502 NPTXR Neuronal pentraxin receptor yes no 0 0 1 1 150.44 150.44 4 1.6741E-06 155647 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.429 43.47 78641000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 78641000 13675 396 12832 120626 152917 152917 1 FLDASGAK Unmodified 807.41267 0.41266834 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;C9JFN4;C9J188;C9JWF5;C9JV57 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 23.271 23.271 2 0.015844 17170 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.097 19.34 190770000 0 0 0 0 0 0 0 96931000 93841000 0 0 0 0 13676 3437 12833 120627;120628 152918;152919 152918 2 FLDAYAEHK Unmodified 1092.524 0.52400971 285 A0A0G2JNZ5;A0A0G2JLB3;P04062;A0A0G2JNZ0 GBA Glucosylceramidase yes no 0 0 0 1 1 1 34.85 34.85 3 0.025074 30328 QUIQUE_C1368_190116_001 37.556 28.811 76887000 0 0 26839000 0 0 0 0 0 23773000 0 26275000 0 0 13677 285 12834 120629;120630;120631 152920;152921;152922 152920 3 FLDDFESCPALYQR Unmodified 1759.7876 0.78757097 4048 Q9BVM4 GGACT Gamma-glutamylaminecyclotransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 118.3 118.3 2 0.0024365 122131 QUIQUE_C1403_190116_001 74.944 61.989 109660000 0 31588000 40669000 0 0 37404000 0 0 0 0 0 0 0 13678 4048 12835 120632;120633;120634;120635 152923;152924;152925;152926 152925 4 FLDFIGHILT Unmodified 1174.6386 0.63864553 2505 P48426;H7BXS3 PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 154.91 154.91 2 0.00071614 160355 QUIQUE_C1368_190116_001 107.29 82.372 1217000000 127740000 212380000 102120000 68744000 0 0 0 0 109700000 0 245030000 227340000 123950000 13679 2505 12836 120636;120637;120638;120639;120640;120641;120642;120643 152927;152928;152929;152930;152931;152932;152933;152934 152929 8 FLDFITNIFA Unmodified 1199.6227 0.62266112 3668 Q8TBX8 PIP4K2C Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 177.42 177.42 2 0.029857 182088 QUIQUE_C1576_190116_001 54.549 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120656;120657;120658;120659;120660;120661;120662;120663;120664;120665 152947;152948;152949;152950;152951;152952;152953;152954;152955;152956;152957;152958;152959 152953 12 FLDGNELTLADCNLLPK Unmodified 1931.9663 0.96626362 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.71 139.71 2 0.00023941 145986 QUIQUE_C1576_190116_001 111.12 97.314 1072300000 0 0 128400000 123050000 92690000 81501000 94106000 94738000 89117000 41135000 121190000 96348000 110040000 13683 1395 12840 120666;120667;120668;120669;120670;120671;120672;120673;120674;120675;120676 152960;152961;152962;152963;152964;152965;152966;152967;152968;152969;152970;152971;152972;152973;152974;152975 152966 16 FLDGNEMTLADCNLLPK Unmodified 1949.9227 0.92268424 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 133.93 133.93 2 0.00044268 139108 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.622 54.866 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13684 4646 12841 120677;120678;120679 152976;152977;152978 152978 3 FLDGNEMTLADCNLLPK Oxidation (M) 1965.9176 0.91759886 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 1 0 1 1 118.75 118.75 2 0.00012556 121125 QUIQUE_C1563_190116_001 92.925 70.451 81683000 0 0 0 0 0 36766000 0 0 0 0 0 44917000 0 13685 4646 12841 120680;120681 152979;152980 152979 3060 2 FLDINLYK Unmodified 1024.5593 0.55933258 4267 Q9NRF8 CTPS2 CTP synthase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.37 102.37 2 0.0083476 105034 QUIQUE_C1403_190116_001 94.662 16.047 204600000 26998000 0 29382000 24562000 0 25716000 0 0 27765000 17504000 0 24773000 27898000 13686 4267 12842 120682;120683;120684;120685;120686;120687;120688;120689;120690 152981;152982;152983;152984;152985;152986;152987;152988;152989;152990 152983 10 FLDKPEDVLLK Unmodified 1315.7388 0.73875351 1230 H7C2K6 EPB41L1 yes yes 0 0 1 1 1 81.861 81.861 3 0.02567 84325 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.426 32.305 60424000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27869000 32555000 0 13687 1230 12843 120691;120692 152991;152992 152991 2 FLDLLEPLGR Unmodified 1171.6601 0.66010926 2021 P11277;H0YJE6 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.92 142.92 2 0.0001578 148192 QUIQUE_C1368_190116_001 122.52 62.119 417910000 45265000 46245000 36617000 29809000 45731000 34016000 21785000 24846000 18930000 11710000 47305000 30458000 25190000 13688 2021 12844 120693;120694;120695;120696;120697;120698;120699;120700;120701;120702;120703;120704;120705 152993;152994;152995;152996;152997;152998;152999;153000;153001;153002;153003;153004;153005 152995 13 FLDLPWEDVLLPHVLNR Unmodified 2075.1204 0.12039649 219 X6RCZ8;X6RJB2;X6RGT4;X6RHD7;A0A0C4DFV0;Q9H469 FBXL15 F-box/LRR-repeat protein 15 yes no 0 0 0 1 164.33 164.33 3 0.00021609 166581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.995 44.936 6239600 0 0 0 0 0 0 0 6239600 0 0 0 0 0 13689 219 12845 120706 153006 153006 1 FLDLWNK Unmodified 934.49125 0.49125301 749 C9JVE2;Q96GG9 DCUN1D1 DCN1-like protein;DCN1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.73 102.73 2 0.020194 104941 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.98 62.319 698970000 57015000 48003000 62123000 54461000 47021000 53364000 66239000 55402000 54507000 22556000 57957000 52840000 67480000 13690 749 12846 120707;120708;120709;120710;120711;120712;120713;120714;120715;120716;120717;120718;120719 153007;153008;153009;153010;153011;153012;153013;153014;153015;153016;153017;153018;153019 153014 13 FLDNFDSSEK Unmodified 1200.5299 0.52988294 3033 Q13938 CAPS Calcyphosin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.989 65.989 2 0.0002521 66050 QUIQUE_C1576_190116_001 125.82 109.67 8295400000 640840000 457540000 856620000 459030000 412860000 582220000 1031900000 437510000 1012000000 374030000 638690000 441380000 950810000 13691 3033 12847 120720;120721;120722;120723;120724;120725;120726;120727;120728;120729;120730;120731;120732 153020;153021;153022;153023;153024;153025;153026;153027;153028;153029;153030;153031;153032;153033;153034 153027 14 FLDNFSSGR Unmodified 1041.488 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3310 Q5T440 IBA57 Putative transferase CAF17, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 137.47 137.47 2 2.8773E-14 142858 QUIQUE_C1218_190116_001 126.07 106.23 41396000 19945000 21450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13695 3310 12851 120745;120746 153047;153048 153047 2 FLDTAFNLQAFEGK Unmodified 1599.7933 0.79330827 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 140.12 140.12 2 4.7479E-07 144901 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.48 117.18 581590000 0 0 0 0 98950000 105980000 125650000 100220000 150790000 0 0 0 0 13696 4487 12852 120747;120748;120749;120750;120751 153049;153050;153051;153052;153053;153054;153055 153054 7 FLDTDTICYR Unmodified 1302.5914 0.59143734 689 C9J2Q2;Q8N5M1 ATPAF2 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 82.213 82.213 2 0.0079414 83384 QUIQUE_C1368_190116_001 85.67 63.178 160750000 32821000 37893000 34350000 25351000 0 0 30335000 0 0 0 0 0 0 13697 689 12853 120752;120753;120754;120755;120756 153056;153057;153058;153059;153060;153061 153058 5 FLDVLELAEK Unmodified 1175.6438 0.64379049 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.83 130.83 2 0.0031874 135578 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.731 60.808 374580000 0 19341000 32806000 0 15933000 23227000 24149000 36854000 34641000 22819000 64170000 69277000 31361000 13698 1187 12854 120757;120758;120759;120760;120761;120762;120763;120764;120765;120766;120767;120768 153062;153063;153064;153065;153066;153067;153068;153069;153070;153071;153072;153073;153074;153075;153076 153072 15 FLDVPLCK Unmodified 990.52084 0.52083858 874 F5GXV3;F5H4Z6;F5GZ45;F5H3Z4;E7EU04;J3KR13;J3KQP4;P14207 FOLR2 Folate receptor beta yes no 0 0 0 1 80.893 80.893 2 0.019858 81774 QUIQUE_C1403_190116_001 77.674 40.973 32396000 0 0 0 32396000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13699 874 12855 120769 153077 153077 1 FLDVVQLVHR Unmodified 1224.6979 0.69789175 3213 Q2M3C7 SPHKAP A-kinase anchor protein SPHKAP yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.151 96.151 3 0.0016278 97690 QUIQUE_C1563_190116_001 63.816 43.039 101760000 0 12005000 0 0 13201000 9817400 11174000 0 0 0 18615000 16622000 20329000 13700 3213 12856 120770;120771;120772;120773;120774;120775;120776;120777;120778;120779 153078;153079;153080;153081;153082;153083;153084;153085;153086;153087 153082 10 FLEAGIYEVPIIITDSGNPPK Unmodified 2272.1991 0.19910032 2141 P19022 CDH2 Cadherin-2 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 150.46 150.46 2;3 6.796E-14 155170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.55 107.62 1617800000 162300000 150770000 166430000 130290000 109850000 105060000 109440000 132750000 199980000 53018000 106900000 57658000 133340000 13701 2141 12857 120780;120781;120782;120783;120784;120785;120786;120787;120788;120789;120790;120791;120792;120793;120794;120795;120796;120797;120798;120799;120800;120801;120802;120803;120804;120805 153088;153089;153090;153091;153092;153093;153094;153095;153096;153097;153098;153099;153100;153101;153102;153103;153104;153105;153106;153107;153108;153109;153110;153111;153112;153113;153114;153115;153116;153117;153118;153119;153120;153121 153111 33 FLEDTTDDGELSK Unmodified 1468.6569 0.65693395 1514 O43236;J3QLA8;J3QRS4;J3KS85;J3KS26 SEPT4 Septin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.991 63.991 2 0.0025987 60077 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.781 49.751 420130000 61830000 78266000 0 48234000 0 0 0 0 58346000 32027000 0 0 141420000 13702 1514 12858 120806;120807;120808;120809;120810;120811;120812;120813;120814;120815 153122;153123;153124;153125;153126;153127;153128;153129;153130;153131 153130 7 FLEDVKK Unmodified 877.49092 0.49091866 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;G3V2B9;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.653 20.653 2 0.028807 13344 QUIQUE_C1277_190116_001 111.28 30.901 5895400000 0 1291300000 1269800000 599320000 0 414500000 0 442200000 0 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120832;120833;120834;120835;120836;120837;120838;120839;120840;120841;120842;120843;120844;120845;120846;120847;120848;120849;120850;120851;120852;120853;120854 153148;153149;153150;153151;153152;153153;153154;153155;153156;153157;153158;153159;153160;153161;153162;153163;153164;153165;153166;153167;153168;153169;153170;153171;153172;153173 153162 23 FLEEQEITDLK Unmodified 1363.6871 0.68711187 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 90.986 90.986 2 1.3438E-05 94249 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.98 92.375 1628700000 134590000 0 148170000 118920000 103880000 90092000 90684000 407290000 159350000 0 150070000 83756000 141880000 13706 1594 12862 120855;120856;120857;120858;120859;120860;120861;120862;120863;120864;120865;120866;120867 153174;153175;153176;153177;153178;153179;153180;153181;153182;153183;153184;153185;153186;153187;153188;153189;153190 153187 16 FLEESVSMSPEER Unmodified 1538.6923 0.6922736 2091 P15374;A0A087WTB8;Q5TBK7 UCHL3 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 75.337 75.337 2 0.00017175 76136 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.7 70.677 513690000 47816000 31337000 49605000 52615000 48017000 40885000 51884000 0 46887000 0 74904000 40542000 29199000 13707 2091 12863 120868;120869;120870;120871;120872;120873;120874;120875;120876;120877;120878;120879 153191;153192;153193;153194;153195;153196;153197;153198;153199;153200;153201;153202;153203;153204;153205;153206;153207 153202 14 FLEESVSMSPEER Oxidation (M) 1554.6872 0.68718822 2091 P15374;A0A087WTB8;Q5TBK7 UCHL3 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 1 0 1 1 55.443 55.443 2 0.00066891 50614 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.22 77.282 10151000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10151000 0 0 0 13708 2091 12863 120880;120881 153208;153209 153209 1434 2 FLEFQYLTGGLVDPEVHGR Unmodified 2176.0953 0.095303954 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 1 138.55 138.55 3 0.0013296 142685 QUIQUE_C1403_190116_001 52.814 48.375 103380000 0 0 0 64968000 0 0 0 0 0 0 0 0 38413000 13709 2096 12864 120882;120883 153210;153211 153210 2 FLEFTTLSAAELPGSSAVR Unmodified 1995.0313 0.031306714 3085 Q14699;C9JHG2;C9JWQ9;F8WAR1;C9JRN3 RFTN1 Raftlin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.07 139.07 2 0.00043196 145774 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.262 61.386 172440000 0 0 0 23954000 0 25890000 31245000 19446000 23805000 10548000 37558000 0 0 13710 3085 12865 120884;120885;120886;120887;120888;120889;120890 153212;153213;153214;153215;153216;153217;153218;153219 153218 8 FLEGTSCIAGVFVDATK Unmodified 1813.892 0.89203604 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 3 2 2 3 2 4 135.88 135.88 2;3 2.4133E-22 142432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 167.14 136.59 5449200000 502840000 505750000 641870000 54349000 475770000 294840000 584720000 101370000 506610000 390480000 669000000 582610000 138940000 13711 3117 12866 120891;120892;120893;120894;120895;120896;120897;120898;120899;120900;120901;120902;120903;120904;120905;120906;120907;120908;120909;120910;120911;120912;120913;120914;120915;120916;120917;120918;120919 153220;153221;153222;153223;153224;153225;153226;153227;153228;153229;153230;153231;153232;153233;153234;153235;153236;153237;153238;153239;153240;153241;153242;153243;153244;153245;153246;153247;153248;153249;153250;153251;153252;153253;153254;153255;153256;153257;153258;153259;153260;153261;153262;153263;153264;153265;153266 153256 47 FLEHLSGAGK Unmodified 1057.5556 0.55564418 2861 Q01813 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.348 30.348 2 0.0049678 24995 QUIQUE_C1277_190116_001 103.55 63.479 1477900000 0 281670000 229040000 253050000 182230000 0 0 131500000 179100000 0 0 221290000 0 13712 2861 12867 120920;120921;120922;120923;120924;120925;120926;120927 153267;153268;153269;153270;153271;153272;153273;153274 153267 1 FLELACDSQEDVDSWK Unmodified 1940.8462 0.84620806 4528;840 E5RHK8;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.94 116.94 2 2.0311E-13 119344 QUIQUE_C1563_190116_001 136.7 123.72 513630000 54281000 61274000 56307000 42956000 57805000 42326000 57278000 0 0 0 46398000 48874000 46137000 13713 840;4528 12868 120928;120929;120930;120931;120932;120933;120934;120935;120936;120937 153275;153276;153277;153278;153279;153280;153281;153282;153283;153284 153280 9 FLELFLGEFR Unmodified 1269.6758 0.67575932 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.37 158.37 2 5.5605E-14 160909 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.14 142.32 468550000 34705000 34513000 20363000 23073000 30504000 32784000 25239000 49224000 49208000 9561100 69898000 50969000 38506000 13714 3722 12869 120938;120939;120940;120941;120942;120943;120944;120945;120946;120947;120948;120949;120950 153285;153286;153287;153288;153289;153290;153291;153292;153293;153294;153295;153296;153297;153298;153299;153300;153301 153296 17 FLELGKEEDFHPELESLDGDLDPGLPSTEDVILK Unmodified 3795.8618 0.86184793 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QL89 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 1 1 1 151.83 151.83 4 4.156E-05 154417 QUIQUE_C1563_190116_001 38.452 30.835 243840000 0 0 0 0 0 90019000 0 153820000 0 0 0 0 0 13715 245 12870 120951;120952 153302;153303;153304;153305 153303 4 FLELLPK Unmodified 858.52149 0.52149051 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.885 93.885 2 0.023465 96141 QUIQUE_C1277_190116_001 100.07 38.069 3178700000 290730000 304640000 219600000 210300000 258140000 189440000 288140000 219560000 194020000 120940000 319730000 261720000 301740000 13716 2777 12871 120953;120954;120955;120956;120957;120958;120959;120960;120961;120962;120963;120964;120965 153306;153307;153308;153309;153310;153311;153312;153313;153314;153315;153316;153317;153318;153319;153320;153321;153322;153323;153324;153325;153326;153327;153328;153329;153330;153331;153332;153333;153334;153335;153336;153337;153338;153339 153308 34 FLELVQLK Unmodified 988.59572 0.59571809 3959 Q99570 PIK3R4 Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 102.93 102.93 2 0.031742 105968 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.777 19.406 23393000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12042000 11351000 0 13717 3959 12872 120966;120967 153340;153341 153341 2 FLEMCNDLLAR Oxidation (M) 1396.6479 0.64790636 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 1 0 1 84.466 84.466 2 0.0010364 86374 QUIQUE_C1218_190116_001 93.649 57.224 63015000 63015000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13718 2363 12873 120968 153342 153342 1757 1 FLEMCNDLLAR Unmodified 1380.653 0.65299174 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.36 108.36 2 0.00053951 113049 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.76 83.453 2122400000 211440000 0 0 245540000 242900000 200760000 0 0 257350000 75655000 355680000 293460000 239570000 13719 2363 12873 120969;120970;120971;120972;120973;120974;120975;120976;120977;120978 153343;153344;153345;153346;153347;153348;153349;153350;153351;153352;153353 153350 11 FLEMHQL Oxidation (M) 932.44259 0.44258826 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 1 0 1 1 1 45.81 45.81 2 0.024939 43466 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.29 93.297 1050600000 0 0 313980000 0 0 0 254750000 0 0 0 481820000 0 0 13720 4639 12874 120979;120980;120981 153354;153355;153356 153356 3 FLEMHQL Unmodified 916.44767 0.44767364 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 1 76.192 76.192 2 0.031743 72339 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.703 57.233 255330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 255330000 0 0 0 13721 4639 12874 120982 153357 153357 1 FLENEDR Unmodified 921.41921 0.41921028 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 1 23.686 23.686 2 0.019688 16802 QUIQUE_C1277_190116_001 110.61 33.765 395580000 0 240080000 0 0 0 0 0 0 0 155500000 0 0 0 13722 4;1799 12875 120983;120984 153358;153359;153360 153358 3 FLENEDRR Unmodified 1077.5203 0.52032131 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 17.089 17.089 2;3 0.0022245 9296 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.568 72.521 14163000000 789370000 1375500000 1097500000 731090000 2225700000 0 1048300000 792030000 553380000 594330000 3040400000 414060000 1501300000 13723 4;1799 12876 120985;120986;120987;120988;120989;120990;120991;120992;120993;120994;120995;120996;120997;120998;120999;121000;121001;121002 153361;153362;153363;153364;153365;153366;153367;153368;153369;153370;153371;153372;153373;153374;153375;153376;153377;153378;153379;153380;153381;153382;153383 153379 22 FLEPTLR Unmodified 874.49125 0.49125301 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.285 59.285 2 0.020194 58323 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.98 33.067 3419500000 255480000 235020000 325260000 275220000 269050000 188770000 287650000 260100000 271030000 131350000 347420000 257550000 315580000 13724 2083 12877 121003;121004;121005;121006;121007;121008;121009;121010;121011;121012;121013;121014;121015 153384;153385;153386;153387;153388;153389;153390;153391;153392;153393;153394;153395;153396;153397;153398;153399;153400;153401;153402;153403;153404;153405 153395 22 FLEPYNDSIQAQK Unmodified 1551.7569 0.75692277 2074 P14415;I3L1V9 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.227 71.227 2 9.5161E-06 71427 QUIQUE_C1368_190116_001 121.83 86.319 538090000 0 0 60516000 0 42871000 0 47852000 85801000 84239000 0 89990000 56285000 70540000 13725 2074 12878 121016;121017;121018;121019;121020;121021;121022;121023 153406;153407;153408;153409;153410;153411;153412;153413;153414 153406 9 FLEQELETITIPDLR Unmodified 1815.9618 0.96183016 2656 P55058 PLTP Phospholipid transfer protein yes yes 0 0 0 2 151.99 151.99 2;3 0.02883 155546 QUIQUE_C1403_190116_001 35.303 27.895 58259000 0 0 0 58259000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13726 2656 12879 121024;121025 153415;153416 153416 2 FLEQLQELDAK Unmodified 1332.6925 0.6925316 3573 Q8N1B4 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes yes 0 0 0 1 1 103.47 103.47 2 0.0025453 106950 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.775 73.689 99197000 0 0 46930000 0 0 0 0 0 52267000 0 0 0 0 13727 3573 12880 121026;121027 153417;153418 153418 2 FLEQQNAALR Unmodified 1188.6251 0.62512073 2435 P41219 PRPH Peripherin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.594 46.594 2 9.158E-06 43906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.38 93.833 1303500000 68462000 0 224970000 44688000 0 0 66176000 206520000 85642000 250210000 227990000 0 128820000 13728 2435 12881 121028;121029;121030;121031;121032;121033;121034;121035;121036;121037 153419;153420;153421;153422;153423;153424;153425;153426;153427;153428 153425 8 FLEQQNK Unmodified 905.46068 0.46068117 395;1336;389;1952;778;764;792;772;775;100 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;CON__Q61726;Q8IWY7;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136;P08670;B0YJC4;A0A1B0GTT5;CON__P05787;P05787;CON__H-INV:HIT000292931;F8VUG2;F8W1U3;CON__Q9DCV7;CON__Q3KNV1;CON__P08729;P08729;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__Q8VED5;CON__P13647;P13647;F8W0C6;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2;CON__P12035;P12035;A0A087X106;CON__O43790;CON__Q14533;O43790;Q14533;CON__Q6NT21;CON__P78385;P78385;CON__P78386;P78386;U3KPR1 GFAP;VIM;KRT8;KRT7;KRT6C;KRT6A;KRT5;KRT3;KRT81;KRT86;KRT83;KRT85 Glial fibrillary acidic protein;Vimentin;Keratin, type II cytoskeletal 8;Keratin, type II cytoskeletal 7;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 5;Keratin, type II cytoskeletal 3;Keratin, type II cuticular Hb6;Keratin, type II cuticular Hb1;Keratin, type II cuticular Hb3;Keratin, type II cuticular Hb5 no no 0 0 0 1 16.658 16.658 2 0.040382 8722 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.913 21.352 595420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 595420000 0 0 0 + 13729 389;395;1336;1952;772;764;778;792;775;100 12882 121038 153429 153429 1 FLEQQNKALAAELNQLR Unmodified 1985.0694 0.069423554 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 108.78 108.78 2;3 2.0433E-222 112313 QUIQUE_DMIX3_190116_001 270.8 229.75 1942200000 100850000 56683000 289990000 144400000 173650000 94477000 87206000 42306000 208230000 44705000 401760000 192090000 105860000 13730 389;395;1336 12883 121039;121040;121041;121042;121043;121044;121045;121046;121047;121048;121049;121050;121051;121052;121053;121054;121055;121056;121057;121058 153430;153431;153432;153433;153434;153435;153436;153437;153438;153439;153440;153441;153442;153443;153444;153445;153446;153447;153448;153449;153450;153451;153452;153453 153444 24 FLEQQNQVLETK Unmodified 1475.762 0.76200815 787 CON__Q32MB2;Q86Y46;CON__Q6IME9;H0YIG3 KRT73;KRT72 Keratin, type II cytoskeletal 73 no no 0 0 0 1 1 2 61.534 61.534 2 0.00044231 56700 QUIQUE_DMIX4_190116_001 110.88 80.32 149250000 41153000 0 0 40128000 0 0 0 0 0 67969000 0 0 0 + 13731 787 12884 121059;121060;121061;121062 153454;153455;153456;153457;153458 153457 5 FLEQQNQVLQTK Unmodified 1474.778 0.77799256 781;782;1859;793 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908;P04264;CON__P04264;CON__Q6IFZ6;CON__Q7Z794;Q7Z794 KRT2;KRT1;KRT77 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 1;Keratin, type II cytoskeletal 1b no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.54 57.54 2 6.5104E-14 55581 QUIQUE_DMIX8_190116_001 161.63 133.62 25734000000 1367400000 1199000000 0 1424400000 2388100000 1595500000 1004200000 1972700000 2043200000 3134200000 3092000000 3353400000 3159600000 + 13732 781;782;1859;793 12885 121063;121064;121065;121066;121067;121068;121069;121070;121071;121072;121073;121074 153459;153460;153461;153462;153463;153464;153465;153466;153467;153468;153469;153470;153471;153472;153473;153474 153474 16 FLEQVHQLYDDSFPMEIR Unmodified 2266.0729 0.072853952 2444 P42224;J3KPM9;E7EPD2;D2KFR9;E7ENM1;E9PH66 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 1 1 2 1 2 137.88 137.88 2;3 1.4623E-15 144236 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.28 133.72 1637800000 134950000 52531000 289340000 145770000 77046000 85277000 107310000 95310000 93274000 18993000 369460000 61833000 106700000 13733 2444 12886 121075;121076;121077;121078;121079;121080;121081;121082;121083;121084;121085;121086;121087;121088;121089;121090;121091;121092;121093;121094 153475;153476;153477;153478;153479;153480;153481;153482;153483;153484;153485;153486;153487;153488;153489;153490;153491;153492;153493;153494;153495;153496 153493 19 FLESEFSSENLR Unmodified 1456.6834 0.68342347 2549;32 A0A0A0MRA9;B7Z2N1;A0A087WTW9;P49758;B7Z7N5;P49802;Q5T3H5 RGS6;RGS7 Regulator of G-protein signaling 6;Regulator of G-protein signaling 7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.039 89.039 2 4.0176E-07 90936 QUIQUE_C1277_190116_001 145.25 92.766 1315600000 161970000 163320000 0 139210000 122390000 139030000 0 143710000 0 62683000 191810000 191490000 0 13734 32;2549 12887 121095;121096;121097;121098;121099;121100;121101;121102;121103 153497;153498;153499;153500;153501;153502;153503;153504;153505;153506;153507 153498 7 FLESPDFQPNIAK Unmodified 1504.7562 0.75619449 917;1163 E9PFR3;Q14738;H0Y8C4;H0YJ35;H0YJ75;Q13362;Q96B13 PPP2R5D;PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 93.943 93.943 2 5.0692E-17 96177 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.79 103.06 615920000 74866000 0 0 0 0 64504000 0 0 130340000 0 115450000 104500000 126260000 13735 917;1163 12888 121104;121105;121106;121107;121108;121109 153508;153509;153510;153511;153512;153513;153514;153515 153510 8 FLESPDFQPSIAK Unmodified 1477.7453 0.74529545 3118 Q15172 PPP2R5A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.63 94.63 2 0.0016037 98377 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.655 30.372 306350000 0 67935000 0 0 0 60483000 0 0 0 0 96446000 81486000 0 13736 3118 12889 121110;121111;121112;121113;121114;121115;121116 153516;153517;153518;153519;153520;153521;153522;153523 153520 7 FLESPDFQPSVAK Unmodified 1463.7296 0.72964538 3119 Q15173;E9PNY3;E9PQN5 PPP2R5B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.765 85.765 2 0.0013879 88849 QUIQUE_C1438_190116_001 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2657 12892 121131;121132;121133;121134;121135;121136;121137;121138;121139;121140;121141;121142;121143;121144;121145;121146;121147;121148;121149;121150;121151;121152;121153;121154 153539;153540;153541;153542;153543;153544;153545;153546;153547;153548;153549;153550;153551;153552;153553;153554;153555;153556;153557;153558;153559;153560;153561;153562;153563;153564;153565 153558 27 FLEVDEYPEHIK Unmodified 1517.7402 0.74021007 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 72.512 72.512 2 0.0093934 73501 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.353 27.393 122370000 27418000 0 0 20161000 0 0 0 0 0 0 44793000 0 29995000 13740 3895 12893 121155;121156;121157;121158;121159;121160;121161 153566;153567;153568;153569;153570;153571;153572 153571 7 FLEVQYLTGGLIEPDTPGR Unmodified 2104.0841 0.084070566 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 3 2 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 4 146.45 146.45 2;3 3.9851E-74 153776 QUIQUE_DMIX5_190116_001 238.43 213.57 8058400000 707030000 693010000 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153626;153627;153628;153629 153628 3 FLFACETESDQR Unmodified 1501.6507 0.65074314 1129 H0Y7Q1;O75689;A0A087WTN6;H7C324;A0A3B3ISA7 ADAP1 Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 77.17 77.17 2 0.0079089 78168 QUIQUE_C1218_190116_001 77.662 58.568 40176000 40176000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13743 1129 12896 121194 153630 153630 1 FLFASVMADK Unmodified 1127.5685 0.56851706 3957 Q99523 SORT1 Sortilin yes yes 0 0 0 1 109.29 109.29 2 0.039681 113209 QUIQUE_C1218_190116_001 51.268 26.345 16216000 16216000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13744 3957 12897 121195 153631 153631 1 FLFDSVSSQNVGLR Unmodified 1567.7995 0.79945628 1403;1117 O00410;H0Y8C6;E7ETV3;C9JMV5;H0Y3V4 IPO5 Importin-5 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 116.23 116.23 2;3 0.0002053 118995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.616 75.871 2763500000 237800000 188670000 208180000 235350000 228240000 174430000 240900000 208970000 230870000 120890000 232710000 202730000 253790000 13745 1403;1117 12898 121196;121197;121198;121199;121200;121201;121202;121203;121204;121205;121206;121207;121208;121209;121210;121211 153632;153633;153634;153635;153636;153637;153638;153639;153640;153641;153642;153643;153644;153645;153646;153647;153648;153649;153650;153651;153652 153644 20 FLFGGLAGMGATVFVQPLDLVK Oxidation (M) 2295.2337 0.23371169 2881 Q02978 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes yes 0 1 0 2 1 2 1 1 1 1 2 2 1 2 1 166.91 166.91 2;3 7.6785E-45 171800 QUIQUE_C1218_190116_001 155.43 143.07 1214400000 149810000 65946000 149170000 52203000 24882000 80083000 126560000 150360000 159390000 42780000 138170000 75072000 0 13746 2881 12899 121212;121213;121214;121215;121216;121217;121218;121219;121220;121221;121222;121223;121224;121225;121226;121227;121228 153653;153654;153655;153656;153657;153658;153659;153660;153661;153662;153663;153664;153665;153666;153667;153668;153669;153670;153671;153672 153654 2362 20 FLFGGLAGMGATVFVQPLDLVK Unmodified 2279.2388 0.23879707 2881 Q02978 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 170.96 170.96 2;3 1.8384E-36 175543 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.77 138.17 271950000 0 0 32462000 0 0 0 0 21662000 39479000 0 57206000 105210000 15923000 13747 2881 12899 121229;121230;121231;121232;121233;121234;121235 153673;153674;153675;153676;153677;153678;153679;153680 153676 7 FLFGIYQQAEK Unmodified 1342.6921 0.69213767 932 E9PHY0;P11117;B7Z7D2;E9PQY3;E9PP23 ACP2 Lysosomal acid phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 108.43 108.43 2 0.00049293 111472 QUIQUE_C1403_190116_001 108.81 78.641 196460000 46775000 44143000 0 41177000 0 0 0 0 0 0 32172000 0 32190000 13748 932 12900 121236;121237;121238;121239;121240;121241;121242;121243;121244;121245;121246 153681;153682;153683;153684;153685;153686;153687;153688;153689;153690;153691;153692;153693;153694 153684 14 FLFILLGPK Unmodified 1046.6528 0.65283903 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 142.31 142.31 2 0.0012847 147134 QUIQUE_C1277_190116_001 105.12 88.152 1090700000 66492000 58422000 106010000 58456000 65665000 57275000 97630000 101220000 135690000 31350000 138190000 114990000 59373000 13749 4662 12901 121247;121248;121249;121250;121251;121252;121253;121254;121255;121256;121257;121258;121259;121260;121261 153695;153696;153697;153698;153699;153700;153701;153702;153703;153704;153705;153706;153707;153708;153709;153710;153711;153712;153713;153714;153715;153716;153717;153718;153719;153720;153721;153722;153723 153698 29 FLFILLGPLGK Unmodified 1216.7584 0.75836674 687 E7EW28;C9J240;Q6U841;F8WDX9 SLC4A10 Anion exchange protein;Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger yes no 0 0 0 1 160.49 160.49 2 0.0046089 168059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.548 60.646 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13750 687 12902 121262 153724 153724 1 FLFNLPLNIER Unmodified 1374.766 0.76597131 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.55 148.55 2 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153737;153738;153739;153740;153741;153742;153743;153744;153745;153746;153747;153748;153749;153750;153751;153752;153753;153754;153755;153756;153757;153758;153759;153760;153761;153762;153763;153764 153743 28 FLFPFFDSAYQGFASGNLER Unmodified 2312.0902 0.090218576 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 168.69 168.69 2;3 9.911E-47 173002 QUIQUE_DMIX3_190116_001 201.06 179.43 14301000000 756510000 967610000 787920000 572480000 1081500000 489860000 1859300000 549170000 1407700000 95322000 2335000000 2303900000 1094900000 13753 2120 12905 121288;121289;121290;121291;121292;121293;121294;121295;121296;121297;121298;121299;121300;121301;121302;121303;121304;121305;121306;121307;121308;121309;121310;121311;121312 153765;153766;153767;153768;153769;153770;153771;153772;153773;153774;153775;153776;153777;153778;153779;153780;153781;153782;153783;153784;153785;153786;153787;153788;153789;153790;153791;153792;153793;153794;153795;153796 153785 31 FLFSLFGQK Unmodified 1085.591 0.59096706 2971 Q13155;A8MU58 AIMP2 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 136.61 136.61 2 3.3002E-05 133489 QUIQUE_DMIX4_190116_001 157.21 98.227 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13754 2971 12906 121313;121314;121315;121316;121317;121318;121319 153797;153798;153799;153800;153801;153802;153803 153801 7 FLFTTGFHTK Unmodified 1197.6182 0.61824444 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.83 72.83 3 0.0059787 70543 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.426 49.421 193260000 0 19681000 18880000 28976000 29338000 0 20834000 18387000 20706000 10084000 0 0 26374000 13755 1414;3777 12907 121320;121321;121322;121323;121324;121325;121326;121327;121328 153804;153805;153806;153807;153808;153809;153810;153811;153812 153811 8 FLFVDADQIVR Unmodified 1321.703 0.7030367 4334 Q9NYU2 UGGT1 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954.50355 0.50354903 3346 Q63ZY3 KANK2 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 16.164 16.164 2 0.012324 8290 QUIQUE_C1403_190116_001 71.491 43.966 17118000 0 0 0 17118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13760 3346 12912 121375 153863 153863 1 FLGLTER Unmodified 834.45995 0.45995289 1912 P07099 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 64.244 64.244 2 0.02472 63497 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.473 40.963 622530000 0 145700000 0 177000000 0 0 0 110940000 0 54783000 0 134100000 0 13761 1912 12913 121376;121377;121378;121379;121380 153864;153865;153866;153867;153868;153869;153870;153871 153869 8 FLGPVIVEIPHFAALR Unmodified 1778.0243 0.024311263 2856 Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 2 3 2 139.61 139.61 2;3 9.1952E-07 144611 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.35 105.57 6128500000 555010000 658950000 568850000 549750000 401460000 303440000 584750000 270520000 382520000 204230000 671790000 534090000 443110000 13762 2856 12914 121381;121382;121383;121384;121385;121386;121387;121388;121389;121390;121391;121392;121393;121394;121395;121396;121397;121398;121399;121400;121401;121402;121403;121404;121405;121406;121407 153872;153873;153874;153875;153876;153877;153878;153879;153880;153881;153882;153883;153884;153885;153886;153887;153888;153889;153890;153891;153892;153893;153894;153895;153896;153897;153898;153899;153900;153901;153902;153903;153904;153905;153906;153907;153908;153909;153910;153911;153912;153913 153912 40 FLGQNVHAR Unmodified 1040.5516 0.55156186 3916 Q96PE3;B8ZZB2 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 0 1 20.305 20.305 2 0.065724 13232 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.813 16.393 46256000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46256000 13763 3916 12915 121408 153914 153914 1 FLGSDEEDKDSLQELSTEQK Unmodified 2297.0547 0.05468051 1256 J3KMX1;Q99567 NUP88 Nuclear pore complex protein Nup88 yes no 0 0 1 1 83.057 83.057 3 3.2931E-06 84447 QUIQUE_C1277_190116_001 78.917 59.881 27823000 0 27823000 0 0 0 0 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154050;154051;154052;154053;154054;154055;154056;154057;154058;154059;154060;154061;154062;154063;154064;154065;154066;154067;154068;154069;154070;154071;154072;154073;154074;154075;154076;154077;154078;154079;154080;154081;154082;154083;154084;154085;154086;154087;154088;154089;154090;154091;154092;154093;154094 154055 45 FLIGPEGEPFRR Unmodified 1416.7514 0.75138388 30 A0A087WTS0;P18283;H0YJK8 GPX2 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 2 yes no 0 0 1 1 1 80.496 80.496 3 0.006771 82371 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.693 30.115 65094000 0 0 0 0 0 0 0 0 17713000 0 0 0 47382000 13777 30 12929 121522;121523 154095;154096 154095 1 FLIIPLGSHPVAK Unmodified 1390.8337 0.83365695 3415 Q6VY07;B4DF77;E9PNZ9 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 84.533 84.533 2;3 0.0035511 85756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.464 34.598 1019900000 93549000 118870000 84496000 93680000 76897000 72520000 76878000 93400000 58718000 29398000 93846000 68119000 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154114;154115;154116;154117;154118;154119;154120;154121;154122;154123;154124;154125;154126;154127;154128 154120 14 FLINLEGGDIR Unmodified 1245.6717 0.67173657 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.22 112.22 2 0.00058088 115857 QUIQUE_C1368_190116_001 99.815 43.557 884790000 102040000 78187000 110320000 79464000 82442000 109830000 66338000 0 0 37259000 91843000 77616000 49455000 13781 4285 12933 121553;121554;121555;121556;121557;121558;121559;121560;121561;121562;121563;121564 154129;154130;154131;154132;154133;154134;154135;154136;154137;154138;154139;154140;154141;154142;154143 154131 15 FLINLEGGDIREESSYK Unmodified 1968.9793 0.97927114 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 100.7 100.7 3 0.00174 103092 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.864 38.645 184410000 0 0 0 0 0 0 0 65245000 49243000 0 0 69925000 0 13782 4285 12934 121565;121566;121567 154144;154145;154146 154146 3 FLIPDYNDEIR Unmodified 1393.6878 0.68778057 1642 O75525;E5RG12;H0YAQ1;H0YAQ3;E5RJZ9 KHDRBS3 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 111.06 111.06 2 0.0029289 113542 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.294 57.026 334150000 0 0 0 0 0 0 0 79536000 64416000 109160000 81042000 0 0 13783 1642 12935 121568;121569;121570;121571 154147;154148;154149;154150 154147 3 FLIPNASQAESK Unmodified 1303.6772 0.67721588 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.063 65.063 2 0.00012754 64572 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.25 115.44 90117000000 8130000000 7989200000 7489800000 7196000000 6205900000 6357200000 7605700000 7880700000 7059200000 3435900000 6624800000 6986600000 7155900000 13784 2780 12936 121572;121573;121574;121575;121576;121577;121578;121579;121580;121581;121582;121583;121584 154151;154152;154153;154154;154155;154156;154157;154158;154159;154160;154161;154162;154163;154164;154165;154166;154167;154168;154169;154170;154171;154172;154173;154174;154175;154176;154177;154178;154179;154180;154181;154182;154183;154184;154185;154186;154187 154179 37 FLIQLYK Unmodified 923.54804 0.54803961 1077 G3V1S3;Q6ZUT9;H0YGE5 DENND5B DENN domain-containing protein 5B yes no 0 0 0 1 1 1 97.127 97.127 2 0.026077 99334 QUIQUE_C1277_190116_001 94.669 48.645 36410000 12498000 11370000 0 0 0 0 12543000 0 0 0 0 0 0 13785 1077 12937 121585;121586;121587 154188;154189;154190 154189 3 FLIQNVLR Unmodified 1001.6022 0.60220045 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.137 96.137 2 0.011649 98061 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.673 30.033 504070000 0 52969000 46839000 39354000 47056000 35025000 32342000 0 45343000 17183000 62000000 65746000 60217000 13786 2441 12938 121588;121589;121590;121591;121592;121593;121594;121595;121596;121597;121598 154191;154192;154193;154194;154195;154196;154197;154198;154199;154200;154201 154201 10 FLISDQPHPIDPLLK Unmodified 1731.956 0.95595693 1614 O75155 CAND2 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 104.08 104.08 3 0.016872 106305 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.511 14.68 71844000 21244000 0 0 0 0 0 0 14340000 0 0 21127000 15133000 0 13787 1614 12939 121599;121600;121601;121602 154202;154203;154204;154205 154203 4 FLISLTNPHDR Unmodified 1311.6935 0.69353465 3730 Q92538 GBF1 Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 0 1 68.292 68.292 3 0.019478 69395 QUIQUE_C1438_190116_001 45.257 20.402 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13788 3730 12940 121603 154206 154206 1 FLISYDR Unmodified 912.47052 0.47051757 3668 Q8TBX8;F8VNT5;F8VU68 PIP4K2C Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.23 69.23 2 0.020425 70024 QUIQUE_C1218_190116_001 108.24 59.996 297580000 72621000 58318000 0 44216000 53600000 47817000 0 0 0 21006000 0 0 0 13789 3668 12941 121604;121605;121606;121607;121608;121609 154207;154208;154209;154210;154211;154212;154213;154214 154207 8 FLITGADQNR Unmodified 1133.5829 0.58292157 3379 Q6P2E9 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.513 50.513 2 0.015709 47981 QUIQUE_C1403_190116_001 90.709 34.162 72023000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23563000 48460000 0 0 13790 3379 12942 121610;121611;121612;121613;121614;121615 154215;154216;154217;154218;154219;154220 154216 6 FLITHNPTNATLNK Unmodified 1582.8467 0.84674083 2957 Q12974;Q93096;A0A3B3ISR8;E9PMY3;E9PML8;E9PJC0;E9PRR9;A0A0D9SGK2 PTP4A2;PTP4A1 Protein tyrosine phosphatase type IVA 2;Protein tyrosine phosphatase type IVA 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.348 48.348 3 7.3791E-05 45824 QUIQUE_C1277_190116_001 75.018 56.189 534440000 24315000 49240000 65721000 53437000 40104000 44807000 44613000 39390000 60336000 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Q14894;I3L325;I3L2W5 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 1 1 168.36 168.36 4 5.5398E-16 172486 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.846 65.624 142810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 142810000 0 13795 3088 12947 121667 154284 154284 1 FLLADNLYCK Unmodified 1255.6271 0.62709457 2729 P61758;B4DWR3 VBP1 Prefoldin subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.155 99.155 2 0.0024053 101901 QUIQUE_C1277_190116_001 103.56 82.1 1144400000 120270000 153080000 140620000 129620000 0 103250000 142450000 92783000 94121000 42326000 0 0 125920000 13796 2729 12948 121668;121669;121670;121671;121672;121673;121674;121675;121676;121677 154285;154286;154287;154288;154289;154290;154291;154292;154293;154294 154286 9 FLLDAVFAK Unmodified 1022.5801 0.58006802 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.35 129.35 2 0.0097087 134887 QUIQUE_C1218_190116_001 75.213 40.405 167470000 18754000 29750000 28393000 18507000 0 20243000 0 0 18444000 9580200 0 0 23802000 13797 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2021.0007 0.0006752871 4724 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 120.48 120.48 2;3 0.00070188 134798 QUIQUE_C1368_190116_001 43.297 29.256 969390000 100450000 160110000 183690000 0 68100000 0 148220000 0 42815000 0 266000000 0 0 + 13824 4724 12976 121875;121876;121877;121878;121879;121880;121881;121882 154517;154518;154519;154520;154521;154522;154523;154524 154519 8 FLMANGQLVK Oxidation (M) 1135.606 0.6059652 2560;2328;3300 P31150;G5E9U5;P50395;V9GYF8;Q5SX90;V9GYJ7;Q5SX86 GDI1;GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor alpha;Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 1 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 1 1 2 1 51.564 51.564 2 0.00030389 50154 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.16 74.037 4646900000 150030000 337230000 331480000 293030000 161990000 286270000 127020000 631920000 662170000 195570000 446320000 729770000 294070000 13825 2328;2560;3300 12977 121883;121884;121885;121886;121887;121888;121889;121890;121891;121892;121893;121894;121895;121896;121897;121898;121899;121900;121901;121902 154525;154526;154527;154528;154529;154530;154531;154532;154533;154534;154535;154536;154537;154538;154539;154540;154541;154542;154543;154544 154537 1712 13 FLMANGQLVK Unmodified 1119.6111 0.61105057 2560;2328;3300 P31150;G5E9U5;P50395;V9GYF8;Q5SX90;V9GYJ7;Q5SX86 GDI1;GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor alpha;Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.8 69.8 2 0.0086876 69784 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.342 42.193 6897500000 1177100000 1172600000 0 0 0 832310000 0 0 0 0 1439600000 1182300000 1093600000 13826 2328;2560;3300 12977 121903;121904;121905;121906;121907;121908 154545;154546;154547;154548;154549;154550;154551 154550 5 FLMPEAYPSSPR Unmodified 1393.67 0.67002202 1511 O43166 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 85.949 85.949 2 0.036153 87653 QUIQUE_C1277_190116_001 61.56 41.231 14874000 0 14874000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13827 1511 12978 121909 154552 154552 0 FLMSLVNQVPK Unmodified 1274.7057 0.70567924 1396 O00303;H0YDT6 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Unmodified 846.42357 0.42356738 1722 O95298;E9PM14;A0A087WUM3;E9PQ53;E9PRQ4;E9PRJ5;A0A087WY27 NDUFC2;KCTD14;NDUFC2-KCTD14 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2;NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 subunit C2, isoform 2 yes no 0 0 0 1 32.013 32.013 2 0.055848 27005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.715 25.763 125030000 0 0 0 0 0 0 0 125030000 0 0 0 0 0 13845 1722 12994 122061 154734 154734 1 FLPDVSASSPEEPHSDSEGAGSGAR Unmodified 2485.0993 0.099339292 3630 Q8NC44 FAM134A Protein FAM134A yes yes 0 0 0 1 1 61.038 61.038 3 0.0005774 59682 QUIQUE_C1277_190116_001 39.067 35.263 70511000 36185000 34326000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13846 3630 12995 122062;122063 154735;154736 154736 1 FLPEEEKLTEQER Unmodified 1646.8152 0.81516593 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GTE6;A0A0D9SFK7;A0A1B0GUH6;A0A1B0GV79;A0A1B0GW21 KIAA1279;KIF1BP KIF1-binding protein yes no 0 0 1 1 1 55.013 55.013 3 0.0010545 53885 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.814 63.427 173270000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77680000 95593000 13847 348 12996 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N-terminal kinase-like protein yes no 0 0 0 1 1 44.823 44.823 2 0.041096 41709 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.074 39.553 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13882 949 13027 122306;122307 155055;155056 155056 2 FLSAIVSSVDK Unmodified 1164.639 0.63903946 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 86.996 86.996 2 0.00073327 88322 QUIQUE_C1403_190116_001 114.4 68.683 45257000 0 0 0 45257000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13883 2487 13028 122308 155057 155057 1 FLSAVLAAQK Unmodified 1046.6124 0.61243078 2862 Q01968 OCRL Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 68.319 68.319 2 0.0274 67789 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.37 27.536 98703000 27064000 24368000 0 0 0 0 0 22068000 0 0 0 25203000 0 13884 2862 13029 122309;122310;122311;122312;122313 155058;155059;155060;155061;155062 155060 5 FLSDFRDLMSWINGIR Oxidation (M) 1984.9829 0.98291673 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 2 1 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yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.92 139.92 3 5.6614E-05 144996 QUIQUE_C1368_190116_001 93.959 91.957 615780000 42942000 88500000 51291000 57698000 38510000 19058000 74639000 33870000 41364000 0 70059000 56016000 41835000 13914 3778 13057 122573;122574;122575;122576;122577;122578;122579;122580;122581;122582;122583;122584;122585 155403;155404;155405;155406;155407;155408;155409;155410;155411;155412;155413;155414;155415;155416 155406 13 FLTNGPSSSPGQER Unmodified 1475.7005 0.70047052 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.603 35.603 2 1.5753E-10 31808 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.99 107.07 320690000 0 25987000 0 24985000 30052000 24840000 0 35831000 35587000 8980100 51284000 40515000 42629000 13915 3459 13058 122586;122587;122588;122589;122590;122591;122592;122593;122594;122595;122596 155417;155418;155419;155420;155421;155422;155423;155424;155425;155426;155427 155422 11 FLTTYDRR Unmodified 1070.5509 0.55089316 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 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155479;155480;155481;155482;155483;155484;155485;155486;155487;155488;155489;155490;155491 155486 13 FLVEDYDASSK Unmodified 1272.5874 0.58739782 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.44 68.44 2 0.0014075 69176 QUIQUE_C1576_190116_001 96.89 85.4 2538500000 0 199690000 343160000 227680000 197720000 241600000 216560000 165200000 282900000 171310000 0 181820000 310870000 13920 2578 13063 122636;122637;122638;122639;122640;122641;122642;122643;122644;122645;122646 155492;155493;155494;155495;155496;155497;155498;155499;155500;155501;155502;155503;155504 155498 10 FLVEDYDASSKNDFIGQSTIPLNSLK Unmodified 2900.4444 0.44436899 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 1 1 1 133.16 133.16 3 1.0871E-08 137859 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.772 55.03 267740000 0 0 0 0 0 0 0 155490000 112250000 0 0 0 0 13921 2578 13064 122647;122648 155505;155506;155507 155507 3 FLVEPQEDTR Unmodified 1232.6037 0.60371659 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 53.183 53.183 2 0.0020911 51378 QUIQUE_C1218_190116_001 91.867 73.087 184450000 76191000 73563000 0 0 0 0 0 34698000 0 0 0 0 0 13922 1096 13065 122649;122650;122651;122652;122653;122654;122655 155508;155509;155510;155511;155512;155513;155514 155508 6 FLVFFYPEDVR Unmodified 1430.7234 0.72343779 3233 Q460N5;H7C4Y3;A0A3B3ITD5 PARP14 Poly [ADP-ribose] polymerase 14 yes no 0 0 0 1 1 145.64 145.64 2 0.0034836 149892 QUIQUE_C1403_190116_001 87.308 47.306 64311000 0 0 37449000 26862000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13923 3233 13066 122656;122657 155515;155516;155517 155517 3 FLVFNSK Unmodified 853.46979 0.46978929 2348;3066 P32189;A6NP46;F8WC39;F8WDA9;F8WBI8;Q14410 GK;GK2 Glycerol kinase;Glycerol kinase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 67.343 67.343 2 0.037414 67162 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.359 46.568 132930000 0 0 0 0 31323000 0 0 0 0 0 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155522;155523;155524;155525;155526;155527;155528;155529;155530;155531;155532;155533;155534;155535;155536;155537;155538;155539;155540;155541;155542;155543;155544;155545;155546;155547;155548;155549;155550;155551;155552;155553;155554;155555;155556;155557;155558;155559;155560;155561;155562;155563;155564;155565;155566;155567;155568;155569;155570;155571;155572;155573;155574;155575;155576;155577;155578;155579 155566 57 FLVGFTNK Unmodified 924.5069 0.50690308 484 C9J3L8;C9J5W0;A0A3B3IRT8;E9PAL7;C9IZQ1;P43307 SSR1 Translocon-associated protein subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 70.293 70.293 2 0.0086993 71208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.561 39.851 96835000 0 0 0 50442000 0 0 0 0 0 0 46393000 0 0 13926 484 13069 122690;122691 155580;155581 155581 2 FLVGPDGVPLR Unmodified 1168.6604 0.66044361 41 A0A087WUQ6;P07203;A0A2R8Y6B6 GPX1 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.012 93.012 2 0.00047031 95497 QUIQUE_C1368_190116_001 106.68 78.509 863420000 121590000 0 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155632;155633;155634;155635;155636;155637;155638;155639;155640;155641;155642;155643;155644;155645 155632 13 FLVHDSFWALPEQFLGNK Unmodified 2147.084 0.084010986 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.56 151.56 3 0.00033155 156180 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.788 39.149 112330000 0 0 0 0 0 0 0 0 57273000 0 0 55055000 0 13931 2834 13074 122738;122739;122740;122741 155646;155647;155648;155649;155650 155650 5 FLVIALK Unmodified 802.53166 0.53166127 4473;3590;263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62;H7C0P6;Q8N4C8;Q9UKE5 MAP4K4;MINK1;TNIK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4;Misshapen-like kinase 1;TRAF2 and NCK-interacting protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.235 89.235 2 0.05526 91762 QUIQUE_C1576_190116_001 72.021 33.65 201040000 0 0 0 0 0 0 36579000 22908000 30160000 0 42766000 40342000 28285000 13932 263;3590;4473 13075 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155715;155716;155717;155718;155719;155720;155721;155722;155723;155724;155725;155726;155727;155728;155729;155730;155731;155732;155733;155734;155735 155733 21 FLVNSFLK Unmodified 966.55385 0.55385327 247;1323 A0A0C4DGQ5;P04632;K7ELJ7;K7EM73;K7ES78;K7EMQ1;K7EKD8 CAPNS1 Calpain small subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 175.01 175.01 2 0.0036031 178498 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.89 66.146 133480000 7648500 0 4275800 0 0 0 5103000 26002000 38159000 2578800 20023000 11655000 18030000 13939 247;1323 13082 122809;122810;122811;122812;122813;122814;122815;122816;122817 155736;155737;155738;155739;155740;155741;155742;155743;155744 155743 9 FLVPDHVNMSELIK Unmodified 1640.8596 0.8596137 529 H3BTL1;Q9GZQ8;A6NCE7 MAP1LC3B;MAP1LC3B2 Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B;Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.47 113.47 3 5.6737E-05 117364 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.494 57.848 7962700000 697120000 653100000 774520000 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156002;156003;156004;156005;156006;156007;156008;156009;156010;156011;156012;156013;156014;156015;156016;156017;156018;156019 156002 17 FMADCPHTIGVEFGTR Oxidation (M) 1852.8236 0.8236389 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 1 0 1 1 72.857 72.857 3 0.00021399 73385 QUIQUE_C1277_190116_001 73.208 69.547 129200000 0 72158000 57044000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13963 2713 13103 123042;123043 156020;156021 156020 2140 1 FMATNDLMTELQK Unmodified 1540.7266 0.72655062 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.81 109.81 2 0.00032838 113334 QUIQUE_C1277_190116_001 110.38 96.446 2010300000 0 190490000 127020000 171900000 141520000 142660000 212770000 204400000 169520000 44808000 194900000 207020000 203240000 13964 3499 13104 123044;123045;123046;123047;123048;123049;123050;123051;123052;123053;123054;123055 156022;156023;156024;156025;156026;156027;156028;156029;156030;156031;156032;156033;156034 156022 10 FMATNDLMTELQK Oxidation (M) 1556.7215 0.72146524 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 97.05 97.05 2 0.0046683 94036 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.616 81.66 124830000 0 0 0 0 0 0 0 84639000 0 40188000 0 0 0 13965 3499 13104 123056;123057 156035;156036 156036 2677 0 FMATYLR Unmodified 900.45276 0.45275902 2868 Q02156;P24723;G3V5F8;G3V3E7;G3V304;G3V4Q9;G3V5U5;G3V4X4;G3V5Y6;G3V4Q6 PRKCE;PRKCH Protein kinase C epsilon type;Protein kinase C eta type yes no 0 0 0 1 1 59.02 59.02 2 0.042144 58217 QUIQUE_C1218_190116_001 81.381 46.304 42611000 20437000 22174000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13966 2868 13105 123058;123059 156037;156038 156037 2 FMAYEQIK Unmodified 1028.5001 0.50010314 3368;1368 Q6KCM7;M0QZJ5;Q9BV35;M0QZT4 SLC25A25;SLC25A23 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2;Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3 no no 0 0 0 1 56.195 56.195 2 0.035784 54776 QUIQUE_C1218_190116_001 63.21 32.791 76732000 76732000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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1 1 1 168.72 168.72 3 6.5283E-19 172396 QUIQUE_C1277_190116_001 90.468 85.26 205350000 0 81096000 0 0 0 0 0 0 48787000 16159000 0 59308000 0 13970 4353 13108 123073;123074;123075;123076 156052;156053;156054;156055 156052 4 FMDDIAALVSTIASDIVSR Oxidation (M) 2039.0245 0.024506776 3908 Q96N67;A0A1B0GWE0 DOCK7 Dedicator of cytokinesis protein 7 yes no 0 1 0 1 176.53 176.53 3 0.0028424 181149 QUIQUE_C1576_190116_001 46.159 36.995 5110400 0 0 0 0 0 0 5110400 0 0 0 0 0 0 13971 3908 13109 123077 156056 156056 2774 1 FMDDIAALVSTIASDIVSR Unmodified 2023.0296 0.029592154 3908 Q96N67;A0A1B0GWE0 DOCK7 Dedicator of cytokinesis protein 7 yes no 0 0 0 1 181.46 181.46 3 0.0099319 184398 QUIQUE_DMIX7_190116_001 37.112 33.451 3239400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3239400 0 13972 3908 13109 123078 156057 156057 1 FMDEFFEQVEEIR Unmodified 1717.7658 0.76577289 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 156.28 156.28 2;3 1.8204E-64 160293 QUIQUE_C1277_190116_001 207.34 197.68 3214100000 266690000 321160000 370890000 319330000 229510000 193040000 482260000 99908000 159410000 44818000 280550000 232130000 214390000 13973 3185 13110 123079;123080;123081;123082;123083;123084;123085;123086;123087;123088;123089;123090;123091;123092;123093;123094;123095;123096;123097;123098;123099 156058;156059;156060;156061;156062;156063;156064;156065;156066;156067;156068;156069;156070;156071;156072;156073;156074;156075;156076;156077;156078;156079;156080 156060 23 FMDEFFEQVEEIR Oxidation (M) 1733.7607 0.76068752 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.29 134.29 2 2.6574E-17 138075 QUIQUE_C1403_190116_001 164.43 147.79 484770000 0 79168000 98025000 67692000 47788000 64376000 63164000 0 0 21372000 0 43181000 0 13974 3185 13110 123100;123101;123102;123103;123104;123105;123106;123107;123108;123109 156081;156082;156083;156084;156085;156086;156087;156088;156089;156090 156084 2611 9 FMDQHPEMDFSK Unmodified 1510.6221 0.62208554 4543 Q9Y266 NUDC Nuclear migration protein nudC yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 64.357 64.357 2;3 0.0015511 64125 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.708 61.817 617420000 94010000 66826000 0 82642000 0 0 61627000 75049000 52719000 0 60342000 51586000 72617000 13975 4543 13111 123110;123111;123112;123113;123114;123115;123116;123117;123118;123119 156091;156092;156093;156094;156095;156096;156097;156098;156099;156100;156101 156099 10 FMEDTAAEK Unmodified 1040.4485 0.4484615 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86;A0A1B0GV31;C9JYZ0 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 23.946 23.946 2 0.027429 17642 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.859 24.216 48437000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48437000 0 0 13976 2885 13112 123120 156102 156102 1 FMEFVSVSVTHPELK Unmodified 1748.8807 0.88074307 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 104.26 104.26 3 0.0097344 107897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 34.909 30.606 93452000 0 0 33937000 0 23314000 0 0 0 36201000 0 0 0 0 13977 4336 13113 123121;123122;123123 156103;156104;156105;156106 156106 4 FMELLEPLNER Unmodified 1389.6962 0.69623677 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.18 122.18 2 4.7677E-06 126051 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.2 128.11 9276400000 788570000 865620000 593140000 863340000 836720000 596510000 616110000 966340000 879870000 224130000 0 877200000 1168800000 13978 2851 13114 123124;123125;123126;123127;123128;123129;123130;123131;123132;123133;123134;123135;123136;123137 156107;156108;156109;156110;156111;156112;156113;156114;156115;156116;156117;156118;156119;156120;156121;156122;156123;156124;156125;156126;156127;156128;156129;156130;156131;156132 156131 26 FMELLEPLNERK Unmodified 1517.7912 0.79119978 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 1 95.138 95.138 3 3.8119E-05 96747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.84 99.567 113460000 0 0 0 0 0 0 0 68520000 44942000 0 0 0 0 13979 2851 13115 123138;123139 156133;156134 156133 2 FMELNLAQK Unmodified 1092.5638 0.56376603 2729 P61758;B4DWR3 VBP1 Prefoldin subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 78.593 78.593 2 0.0036713 79500 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.36 73.313 338660000 0 0 0 37117000 0 0 0 55672000 0 0 94367000 77789000 73718000 13980 2729 13116 123140;123141;123142;123143;123144;123145;123146 156135;156136;156137;156138;156139;156140;156141;156142 156136 7 FMEPYIFGSR Unmodified 1245.5852 0.58522975 4582 Q9Y399;Q5T8A0 MRPS2 28S ribosomal protein S2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 108.84 108.84 2 0.038373 112202 QUIQUE_C1277_190116_001 60.828 47.053 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13981 4582 13117 123147 156143 156143 1 FMEQVIFK Unmodified 1040.5365 0.53648865 2714 P61158;B4DXW1;F8WDR7 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.439 89.439 2 0.0079195 90674 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.253 53.007 4574600000 288270000 356240000 430520000 367950000 299120000 288450000 386810000 361320000 326190000 145890000 488910000 368690000 466230000 13982 2714 13118 123148;123149;123150;123151;123152;123153;123154;123155;123156;123157;123158;123159;123160 156144;156145;156146;156147;156148;156149;156150;156151;156152;156153;156154;156155;156156;156157;156158;156159;156160 156152 17 FMETVAEK Oxidation (M) 969.44773 0.44773322 2005 P10909;H0YAS8 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 20.143 20.143 2 0.029657 12670 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.877 46.427 266690000 40895000 0 0 0 43051000 0 42776000 0 39550000 50244000 0 50174000 0 13983 2005 13119 123161;123162;123163;123164;123165;123166 156161;156162;156163;156164;156165;156166 156165 6 FMETVAEK Unmodified 953.45282 0.4528186 2005 P10909;H0YAS8 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 31.27 31.27 1;2 0.019173 25936 QUIQUE_C1277_190116_001 78.77 49.872 972000000 0 217030000 250360000 271510000 0 213220000 19880000 0 0 0 0 0 0 13984 2005 13119 123167;123168;123169;123170;123171;123172 156167;156168;156169;156170;156171;156172;156173 156167 6 FMGTELNGK Oxidation (M) 1011.4695 0.46953129 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YF78;A0A286YFE1 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.643 23.643 2 0.0013944 16809 QUIQUE_C1403_190116_001 106.14 66.598 920470000 55878000 53469000 89620000 54714000 0 54783000 0 127920000 140380000 108920000 125990000 108800000 0 13985 404 13120 123173;123174;123175;123176;123177;123178;123179;123180;123181;123182 156174;156175;156176;156177;156178;156179;156180;156181;156182;156183 156177 286 9 FMGTELNGK Unmodified 995.47462 0.47461667 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YF78;A0A286YFE1 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 41.451 41.451 2 0.0022907 37635 QUIQUE_C1368_190116_001 94.874 66.362 1766400000 0 0 254410000 166110000 0 204390000 227220000 0 0 66198000 325070000 253190000 269860000 13986 404 13120 123183;123184;123185;123186;123187;123188;123189;123190 156184;156185;156186;156187;156188;156189;156190;156191 156184 4 FMLLFSR Unmodified 912.48914 0.48914452 468 A0A2R8YGH5;H7C1E4;P61966 AP1S1 AP-1 complex subunit sigma-1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 112.95 112.95 2 0.043201 118183 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.462 68.269 52184000 0 0 0 0 0 0 0 11670000 0 0 12531000 15497000 12486000 13987 468 13121 123191;123192;123193;123194 156192;156193;156194;156195 156193 4 FMLQDVLDLR Unmodified 1248.6536 0.65364367 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;H7C044 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 140.06 140.06 2 0.010962 145810 QUIQUE_C1218_190116_001 68.016 0 58422000 15942000 0 0 0 18570000 0 0 0 23910000 0 0 0 0 13988 922 13122 123195;123196;123197;123198;123199 156196;156197;156198;156199;156200 156196 4 FMNAVFFLLPK Unmodified 1325.7206 0.72060102 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 155.41 155.41 2 0.035425 162841 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162437 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.864 54.964 58441000 0 0 0 0 0 0 0 11110000 26257000 0 21073000 0 0 13992 4370 13126 123211;123212;123213;123214 156214;156215;156216;156217 156214 4 FMPAGLIAGASLLMVAK Oxidation (M) 1704.9307 0.93067015 4370 Q9P0S9 TMEM14C Transmembrane protein 14C yes yes 0 1 0 1 150.72 150.72 3 0.003553 155832 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.372 41.266 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13993 4370 13126 123215 156218 156218 2923 1 FMPIMQWLYFDALECLPEDKEVLTEDK 2 Oxidation (M) 3391.5702 0.57023948 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 2 1 1 1 1 1 1 161.76 161.76 3 3.4451E-12 164115 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.212 67.371 303640000 0 0 0 0 0 0 70327000 52769000 42398000 0 83004000 55140000 0 13994 2197 13127 123216;123217;123218;123219;123220 156219;156220;156221;156222;156223;156224;156225;156226 156221 1545;1546 7 FMPIMQWLYFDALECLPEDKEVLTEDK Oxidation (M) 3375.5753 0.57532486 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 1 1 1 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A0A2R8Y5H9;Q8IVT5;A0A0A0MQW1;A8MY87 KSR1 Kinase suppressor of Ras 1 yes no 0 0 0 1 85.507 85.507 3 0.030184 88688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.613 32.812 17333000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17333000 0 0 14044 430 13173 123570 156664 156664 0 FNGAHIPGSPFK Unmodified 1270.6459 0.64585618 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 61.362 61.362 3 0.0079177 56994 QUIQUE_DMIX4_190116_001 36.679 25.927 21319000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21319000 0 0 0 14045 3061 13174 123571 156665 156665 1 FNGEDIDTISPTLGFNIK Unmodified 1979.984 0.98402217 2392 P36404;V9GYD0 ARL2;ARL2-SNX15 ADP-ribosylation factor-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 136.89 136.89 2 0.00024126 140023 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.474 69.795 142460000 0 0 0 0 0 0 0 65735000 76728000 0 0 0 0 14046 2392 13175 123572;123573 156666;156667;156668 156666 3 FNGGGHINHSIFWTNLSPNGGGEPK Unmodified 2636.252 0.25203238 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 3 1 82.812 82.812 3;4 1.6019E-20 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Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 3 86.216 86.216 3;4 2.1419E-05 87541 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.72 66.879 990860000 46981000 252070000 0 0 0 0 0 78743000 146580000 31871000 114770000 319830000 0 14049 199 13178 123592;123593;123594;123595;123596;123597;123598;123599;123600;123601 156700;156701;156702;156703;156704;156705;156706;156707;156708;156709 156704 7 FNHPEIVQLVSELEAER Unmodified 2009.0218 0.02180466 3461 Q7Z4H3 HDDC2 HD domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.74 138.74 3 3.0548E-06 135362 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.96 87.261 629840000 95591000 50405000 71945000 47668000 38502000 51445000 45780000 52820000 44236000 31514000 0 0 99931000 14050 3461 13179 123602;123603;123604;123605;123606;123607;123608;123609;123610;123611;123612;123613 156710;156711;156712;156713;156714;156715;156716;156717;156718;156719;156720;156721;156722 156721 12 FNIDLVSK Unmodified 934.51238 0.51238239 2228 P24386;P26374 CHM;CHML Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1;Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2 yes no 0 0 0 1 78.483 78.483 2 0.036831 79601 QUIQUE_C1277_190116_001 62.546 34.124 12377000 0 12377000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14051 2228 13180 123614 156723 156723 1 FNILGTHTK Unmodified 1029.5607 0.56072956 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 37.869 37.869 2 0.054756 33680 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.423 24.5 73574000 0 0 0 0 0 0 0 73574000 0 0 0 0 0 14052 2444 13181 123615 156724 156724 1 FNIPDLK Unmodified 845.4647 0.46470391 2176 P21283 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.107 82.107 2 0.028135 84720 QUIQUE_C1218_190116_001 92.467 66.848 1871300000 209170000 211890000 189910000 159240000 153400000 158020000 168750000 166200000 0 68581000 200510000 0 185620000 14053 2176 13182 123616;123617;123618;123619;123620;123621;123622;123623;123624;123625;123626 156725;156726;156727;156728;156729;156730;156731;156732;156733;156734;156735;156736;156737;156738;156739 156726 15 FNISNGGPAPEAITDK Unmodified 1629.7999 0.79985021 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.226 74.226 2 0.0013622 74540 QUIQUE_C1277_190116_001 83.617 63.487 4591800000 415440000 489300000 0 583860000 0 0 404350000 496880000 668110000 370030000 0 699160000 464690000 14054 2400 13183 123627;123628;123629;123630;123631;123632;123633;123634;123635 156740;156741;156742;156743;156744;156745;156746;156747;156748 156741 7 FNISNGGPAPEAITDKIFQISK Unmodified 2346.222 0.22196103 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 1 2 1 129.76 129.76 2;3 1.7961E-19 132744 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.3 113.88 412920000 0 0 0 0 0 0 0 298440000 114480000 0 0 0 0 14055 2400 13184 123636;123637;123638 156749;156750;156751;156752 156751 4 FNITPEIK Unmodified 960.52803 0.52803245 2462 P43155 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes yes 0 0 0 1 67.318 67.318 2 0.012195 68365 QUIQUE_C1438_190116_001 88.954 59.147 141260000 0 0 0 0 141260000 0 0 0 0 0 0 0 0 14056 2462 13185 123639 156753 156753 1 FNKPFVFLMIEQNTK Unmodified 1854.9702 0.97022678 1799;4 A0A024R6I7;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 125.63 125.63 2;3 1.0373E-11 130521 QUIQUE_C1576_190116_001 131.17 115.08 2865500000 251880000 191240000 563790000 0 465970000 0 411130000 224500000 0 84171000 365930000 306890000 0 14057 4;1799 13186 123640;123641;123642;123643;123644;123645;123646;123647;123648;123649;123650;123651;123652;123653 156754;156755;156756;156757;156758;156759;156760;156761;156762;156763;156764;156765;156766;156767;156768;156769;156770;156771;156772;156773;156774 156767 20 FNKPFVFLMIEQNTK Oxidation (M) 1870.9651 0.9651414 1799;4 A0A024R6I7;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 1 1 1 2 103.16 103.16 2;3 3.9552E-17 107930 QUIQUE_C1438_190116_001 140.91 107.71 286460000 0 56159000 0 0 230300000 0 0 0 0 0 0 0 0 14058 4;1799 13186 123654;123655;123656 156775;156776;156777 156777 3 3 FNLDLSTVTQAFLK Unmodified 1595.8559 0.85590853 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 161.25 161.25 2 0.0021229 166432 QUIQUE_C1368_190116_001 92.112 58.887 213270000 0 54468000 80497000 0 0 61226000 0 0 0 17080000 0 0 0 14059 4331 13187 123657;123658;123659;123660 156778;156779;156780;156781 156779 4 FNLETEWK Unmodified 1065.5131 0.51311067 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 85.792 85.792 2 0.0059506 87356 QUIQUE_C1368_190116_001 113.89 95.084 311980000 0 0 111770000 0 0 92514000 107690000 0 0 0 0 0 0 14060 831;1569 13188 123661;123662;123663;123664 156782;156783;156784;156785 156782 3 FNLMAIVSDR Unmodified 1164.5961 0.59612879 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;Q5LJB0;H0Y6Y4;H0Y4E0;H0Y636 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.02 127.02 2 0.0034764 131505 QUIQUE_C1368_190116_001 84.213 67.436 352990000 35765000 31066000 45484000 23475000 30368000 22341000 34920000 17529000 21525000 0 29821000 29118000 31573000 14061 4622 13189 123665;123666;123667;123668;123669;123670;123671;123672;123673;123674;123675;123676;123677 156786;156787;156788;156789;156790;156791;156792;156793;156794;156795;156796;156797;156798;156799;156800 156788 15 FNLMAIVSDRK Unmodified 1292.6911 0.69109181 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;Q5LJB0;H0Y6Y4;H0Y4E0;H0Y636 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 97.622 97.622 3 0.016339 99976 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.991 35.584 57571000 0 0 0 0 0 0 0 29366000 28205000 0 0 0 0 14062 4622 13190 123678;123679 156801;156802 156802 2 FNLTGLNEQVPHYR Unmodified 1686.8478 0.84780346 2790 P67870;Q5SRQ6;Q5SRQ3;N0E472;A0A0G2JM12;N0E644;A0A0G2JM58 CSNK2B;CSNK2B-LY6G5B-1181;CSNK2B-LY6G5B--991;CSNK2B-LY6G5B-562 Casein kinase II subunit beta yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 86.929 86.929 2;3 2.8008E-07 88776 QUIQUE_C1277_190116_001 122.46 107.07 2863500000 381390000 327970000 316580000 314430000 215090000 413190000 294170000 64919000 149990000 71014000 162040000 152750000 0 14063 2790 13191 123680;123681;123682;123683;123684;123685;123686;123687;123688;123689;123690;123691;123692;123693;123694;123695 156803;156804;156805;156806;156807;156808;156809;156810;156811;156812;156813;156814;156815;156816;156817;156818 156805 11 FNLTYVSHDGDDKK Unmodified 1637.7686 0.76855009 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 36.183 36.183 3 0.047131 31964 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.587 29.937 52864000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52864000 14064 2253 13192 123696 156819 156819 0 FNLWQDLPEIR Unmodified 1429.7354 0.73539946 3602 Q8N5V2 NGEF Ephexin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 145.74 145.74 2 0.0018333 151876 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.22 93.948 60122000 33310000 0 0 26812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14065 3602 13193 123697;123698;123699;123700;123701;123702 156820;156821;156822;156823;156824;156825 156824 6 FNNVAPLK Unmodified 901.50215 0.50215205 2807 P78357 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.96 32.96 2 0.014923 29063 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.359 44.132 429760000 0 0 97054000 115620000 0 71203000 0 62011000 83869000 0 0 0 0 14066 2807 13194 123703;123704;123705;123706;123707;123708 156826;156827;156828;156829;156830;156831 156830 6 FNNWGGSLSLGHPFGATGCR Unmodified 2133.9803 0.98029097 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 2 2 101.63 101.63 2;3 1.5902E-48 104499 QUIQUE_C1368_190116_001 157.35 141.13 4495800000 306390000 308650000 585080000 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81096 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.67 136.45 4624900000 705420000 467570000 527850000 395210000 342640000 383630000 359120000 226120000 284600000 349280000 0 255370000 328070000 14069 3975 13197 123736;123737;123738;123739;123740;123741;123742;123743;123744;123745;123746;123747 156869;156870;156871;156872;156873;156874;156875;156876;156877;156878;156879;156880;156881 156877 12 FNPETDYLTGTDGKK Unmodified 1684.7944 0.79443049 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 58.641 58.641 2;3 1.054E-12 57071 QUIQUE_DMIX8_190116_001 175.74 159.49 14484000000 1030500000 1191500000 1257400000 805990000 891290000 717580000 990650000 1300700000 1583800000 392650000 1645600000 1310500000 1366300000 14070 3975 13198 123748;123749;123750;123751;123752;123753;123754;123755;123756;123757;123758;123759;123760;123761;123762;123763;123764;123765;123766;123767;123768;123769;123770;123771;123772;123773 156882;156883;156884;156885;156886;156887;156888;156889;156890;156891;156892;156893;156894;156895;156896;156897;156898;156899;156900;156901;156902;156903;156904;156905;156906;156907;156908;156909;156910;156911;156912;156913;156914;156915;156916;156917;156918 156918 37 FNPILDMLAALK Unmodified 1344.7475 0.74754405 3782 Q93100 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.77 169.77 2 0.00080102 175929 QUIQUE_C1438_190116_001 87.806 57.64 775240000 84086000 80040000 106830000 57587000 76408000 23314000 0 43112000 108190000 23084000 76145000 54360000 42083000 14071 3782 13199 123774;123775;123776;123777;123778;123779;123780;123781;123782;123783;123784;123785 156919;156920;156921;156922;156923;156924;156925;156926;156927;156928;156929;156930;156931 156923 13 FNPILDMLAALKK Unmodified 1472.8425 0.84250707 3782 Q93100 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 153.88 153.88 3 9.7221E-05 158917 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protein 12 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 32.871 32.871 2;3 3.2838E-55 27756 QUIQUE_C1218_190116_001 195.77 161.9 1116900000 93028000 98960000 195990000 98428000 0 92725000 113170000 75273000 71274000 0 92831000 77628000 107580000 14079 3049 13207 123835;123836;123837;123838;123839;123840;123841;123842;123843;123844;123845;123846;123847;123848;123849;123850;123851 156998;156999;157000;157001;157002;157003;157004;157005;157006;157007;157008;157009;157010;157011;157012;157013;157014;157015 156999 16 FNQVLDQFGEK Unmodified 1323.6459 0.64591575 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 79.035 79.035 2 0.0010064 80080 QUIQUE_C1277_190116_001 108.43 95.396 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14080 1516 13208 123852;123853;123854;123855;123856;123857;123858;123859;123860;123861 157016;157017;157018;157019;157020;157021;157022;157023;157024;157025 157017 10 FNRDVDETISWIK Unmodified 1621.81 0.81002097 267;275;3025 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157556;157557;157558;157559;157560;157561;157562;157563;157564;157565;157566;157567;157568;157569;157570;157571;157572;157573 157569 18 FPDYLTVSPPIGDLQVFYK Unmodified 2198.13 0.12995813 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 162.71 162.71 2 0.0040329 167814 QUIQUE_C1218_190116_001 104.41 89.978 47081000 27697000 19384000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14113 2638 13239 124194;124195;124196 157574;157575;157576 157574 1 FPEAFSSIHYK Unmodified 1324.6452 0.64518747 1089 G3V5N8;Q9HBF4 ZFYVE1 Zinc finger FYVE domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 71.405 71.405 3 0.021448 71171 QUIQUE_DMIX8_190116_001 42.809 34.402 49910000 0 18012000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17940000 13957000 14114 1089 13240 124197;124198;124199 157577;157578;157579 157579 3 FPEAVLAAGLTPETPAEIVALEHK Unmodified 2502.337 0.33699079 3522 Q86YJ6 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 139.82 139.82 3 6.2827E-08 142861 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.561 59.055 239850000 0 0 0 48767000 0 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124218;124219;124220;124221;124222;124223;124224;124225;124226;124227;124228;124229;124230 157598;157599;157600;157601;157602;157603;157604;157605;157606;157607;157608;157609;157610;157611;157612;157613;157614 157609 16 FPEELTQTFMSCNLITGMFQR Unmodified 2549.1753 0.17528689 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 168.06 168.06 3 0.0080107 169622 QUIQUE_C1563_190116_001 35.538 15.546 86721000 0 0 0 0 0 86721000 0 0 0 0 0 0 0 14118 2255 13244 124231 157615 157615 1 FPEHELTFDPQR Unmodified 1514.7154 0.7153923 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2;J3KTF1;J3QL06;J3QQH7;J3QLE9 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 no no 0 0 0 1 67.3 67.3 3 0.044943 67299 QUIQUE_C1218_190116_001 22.395 7.3635 17503000 17503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14119 89 13245 124232 157616 157616 1 FPEILQK Unmodified 873.496 0.49600404 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 63.521 63.521 2 0.019738 60143 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.99 81.216 68649000 0 0 0 0 0 0 0 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157670;157671;157672;157673;157674;157675;157676;157677;157678;157679;157680;157681;157682;157683;157684;157685;157686;157687;157688;157689;157690;157691;157692;157693;157694;157695;157696;157697;157698;157699;157700;157701;157702;157703;157704;157705 157672 36 FPFFNPIQTQVFNTVYNSDDNVFVGAPTGSGK Unmodified 3506.6783 0.6782851 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 1 168.37 168.37 3 3.9212E-20 172071 QUIQUE_C1277_190116_001 78.025 72.918 56304000 0 45001000 0 0 0 11303000 0 0 0 0 0 0 0 14127 1650 13253 124303;124304 157706;157707 157706 2 FPFIPMPLDYILPELLK Oxidation (M) 2061.1261 0.12605872 1451 O14874 BCKDK [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 2 175.34 175.34 2 5.8673E-07 180376 QUIQUE_C1576_190116_001 97.911 85.285 56989000 0 0 0 0 0 5577400 0 8421700 23656000 0 0 19335000 0 14128 1451 13254 124305;124306;124307;124308;124309;124310 157708;157709;157710;157711;157712;157713 157709 807 5 FPFIPMPLDYILPELLK Unmodified 2045.1311 0.1311441 1451 O14874 BCKDK [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 178.22 178.22 2 0.010913 185066 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.5 60.017 5794000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5794000 0 0 14129 1451 13254 124311 157714 157714 1 FPFISLASK Unmodified 1008.5644 0.56441796 1511 O43166;F5GYF8 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 107.83 107.83 2 0.03011 111832 QUIQUE_C1368_190116_001 56.258 35.703 22286000 0 0 22286000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14130 1511 13255 124312 157715 157715 1 FPFLGVHFTPR Unmodified 1316.703 0.70297712 750 C9JVN9;Q9H9P8 L2HGDH L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 3 1 1 1 2 102.2 102.2 3 0.00041033 104828 QUIQUE_C1368_190116_001 74.76 59.221 282200000 29565000 32593000 51739000 20579000 18580000 18347000 33990000 28701000 0 0 0 30033000 18068000 14131 750 13256 124313;124314;124315;124316;124317;124318;124319;124320;124321;124322;124323;124324;124325;124326;124327;124328;124329;124330;124331;124332;124333 157716;157717;157718;157719;157720;157721;157722;157723;157724;157725;157726;157727;157728;157729;157730;157731;157732;157733;157734;157735;157736;157737 157720 20 FPFTFDEK Unmodified 1029.4807 0.48074791 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.972 97.972 2 0.0047749 100781 QUIQUE_C1277_190116_001 107.9 82.897 33534000 0 33534000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14132 4607 13257 124334;124335;124336;124337;124338;124339 157738;157739;157740;157741;157742;157743 157738 6 FPFTFDEKR Unmodified 1185.5819 0.58185893 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 3 1 1 1 72.503 72.503 3 0.005071 72842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.692 63.27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14133 4607 13258 124340;124341;124342;124343;124344;124345 157744;157745;157746;157747;157748;157749 157745 6 FPGDSVVTGR Unmodified 1033.5193 0.51925868 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;F8WBI9;E7ENC1;H7C5C9;C9JVW9;C9JVY9;C9JAW3 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 55.081 55.081 2 0.019809 53560 QUIQUE_C1218_190116_001 72.643 42.976 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14134 739 13259 124346 157750 157750 1 FPGFEPLTPWILDLLGHYAVMNNPTR Oxidation (M) 3013.516 0.51603456 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 1 0 1 172.31 172.31 3 0.00016596 179450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.305 38.801 102130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 102130000 0 0 14135 626 13260 124347 157751 157751 405 1 FPGINYPVLTPNLK Unmodified 1571.8712 0.87116466 2388 P35914 HMGCL Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.21 126.21 2 2.1872E-17 130573 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.04 125.58 794490000 0 53683000 56062000 46912000 57655000 0 78702000 72091000 97801000 26115000 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157831 162 FPGQLNADLRK Unmodified 1257.683 0.68296996 3030;4044;2797;1862;1922;3006;4033;3230;4171 P04350;M0R2D3;Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;G3V2A3;Q13885;Q3ZCM7;A0A075B736;Q5SQY0;A6NNZ2;Q9BUF5;K7ESM5;Q9BVA1;Q9H4B7;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000025008 TUBB4A;TUBB;TUBB4B;TUBB3;TUBB2A;TUBB8;TUBB6;TUBB2B;TUBB1 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-8 chain;Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334;Tubulin beta-6 chain;Tubulin beta-2B chain;Tubulin beta-1 chain no no 0 0 1 3 3 2 3 2 3 3 2 3 1 3 2 3 45.474 45.474 2;3 2.6499E-24 44374 QUIQUE_DMIX5_190116_001 183.72 161.08 35516000000 595800000 1520500000 718900000 1171100000 2923400000 510810000 2135900000 5571400000 4587200000 360270000 4549500000 4526400000 6344500000 + 14139 1862;1922;2797;3006;3030;3230;4033;4044;4171 13264 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158103 203 FPHIDLVVQR Unmodified 1222.6822 0.68224168 4087 Q9BZQ8 FAM129A Protein Niban yes yes 0 0 0 1 1 81.409 81.409 3 0.002927 82440 QUIQUE_C1403_190116_001 59.426 35.083 15682000 0 0 0 15682000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14140 4087 13265 124434;124435 158143;158144 158143 2 FPHWDEVLELR Unmodified 1439.7197 0.7197494 1720 O95294 RASAL1 RasGAP-activating-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 122.65 122.65 3 0.00060873 127134 QUIQUE_C1218_190116_001 100.69 67.827 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14141 1720 13266 124436 158145 158145 1 FPILSANIK Unmodified 1001.591 0.59096706 2183 P21589;Q96B60 NT5E 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 82.255 82.255 2 0.054227 84349 QUIQUE_C1368_190116_001 49.57 16.019 31433000 0 0 31433000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14142 2183 13267 124437 158146 158146 1 FPITTPR Unmodified 830.46504 0.46503826 4108 Q9GZV7 HAPLN2 Hyaluronan and proteoglycan link protein 2 yes yes 0 0 0 1 44.641 44.641 2 0.047361 38988 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.847 16.553 50913000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50913000 0 0 0 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dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.62 123.62 2 0.0010391 129155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.43 79.323 356320000 24046000 25915000 41385000 49869000 21646000 32823000 58663000 0 28382000 18020000 13529000 21104000 20939000 14148 2184 13273 124473;124474;124475;124476;124477;124478;124479;124480;124481;124482;124483;124484 158196;158197;158198;158199;158200;158201;158202;158203;158204;158205;158206;158207;158208 158206 12 FPLIEQTYYPNHK Unmodified 1648.8249 0.82494275 3755 Q92777 SYN2 Synapsin-2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 79.181 79.181 2;3 9.8934E-203 80016 QUIQUE_C1403_190116_001 283.58 225.72 10605000000 1198800000 1087300000 1037300000 879850000 757720000 663540000 946230000 450110000 504150000 457110000 806550000 797240000 1019300000 14149 3755 13274 124485;124486;124487;124488;124489;124490;124491;124492;124493;124494;124495;124496;124497;124498;124499;124500;124501;124502;124503;124504;124505;124506;124507;124508;124509;124510 158209;158210;158211;158212;158213;158214;158215;158216;158217;158218;158219;158220;158221;158222;158223;158224;158225;158226;158227;158228;158229;158230;158231;158232;158233;158234;158235;158236;158237;158238;158239;158240;158241;158242;158243;158244;158245;158246;158247;158248;158249;158250;158251 158220 42 FPLIYGEGK Unmodified 1022.5437 0.54368251 4493 Q9ULR3 PPM1H Protein phosphatase 1H yes yes 0 0 0 1 1 1 79.421 79.421 2 0.022248 80465 QUIQUE_C1277_190116_001 61.582 46.212 120030000 55136000 38772000 0 0 0 0 26125000 0 0 0 0 0 0 14150 4493 13275 124511;124512;124513 158252;158253;158254 158253 3 FPLMEAEVLQR Unmodified 1331.6908 0.69075746 3253 Q53GT1;C9J191;C9JHG1 KLHL22 Kelch-like protein 22 yes no 0 0 0 1 1 107.59 107.59 2 0.025311 112247 QUIQUE_C1218_190116_001 53.124 36.181 81021000 36956000 0 44065000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14151 3253 13276 124514;124515 158255;158256 158255 2 FPLMLDMYELCTPELQEK Unmodified 2256.0516 0.051649504 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 158.7 158.7 2;3 4.4749E-07 164088 QUIQUE_C1218_190116_001 141.37 115.25 173670000 35266000 41622000 0 19686000 0 29636000 0 14005000 0 4169600 0 0 29283000 14152 2642 13277 124516;124517;124518;124519;124520;124521;124522;124523 158257;158258;158259;158260;158261;158262;158263;158264 158257 7 FPLSFASAEYQEALSR Unmodified 1814.8839 0.88391419 2358 P34059 GALNS N-acetylgalactosamine-6-sulfatase yes yes 0 0 0 1 1 131.05 131.05 2 4.844E-05 134861 QUIQUE_C1403_190116_001 80.17 56.934 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14153 2358 13278 124524;124525 158265;158266 158265 2 FPLVEQTFFPNHK Unmodified 1602.8195 0.81946344 1471 O14994 SYN3 Synapsin-3 yes yes 0 0 0 1 1 101.89 101.89 3 0.038836 105793 QUIQUE_C1218_190116_001 46.985 33.849 70889000 36501000 34388000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14154 1471 13279 124526;124527 158267;158268 158267 0 FPLVEQTFFPNHKPMVTAPHFPVVVK Unmodified 3005.599 0.59897633 1471 O14994 SYN3 Synapsin-3 yes yes 0 0 1 1 118.6 118.6 5 0.00060793 122292 QUIQUE_C1277_190116_001 38.279 35.915 57137000 0 57137000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14155 1471 13280 124528 158269 158269 1 FPNGVQLSPAEDFVLVAETTMAR Unmodified 2491.2417 0.24171019 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 168.68 168.68 2;3 2.6092E-30 173033 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.62 139.3 505260000 45179000 40421000 53179000 36967000 35397000 28041000 51194000 72958000 20592000 0 57999000 63332000 0 14156 4234 13281 124529;124530;124531;124532;124533;124534;124535;124536;124537;124538;124539;124540;124541;124542 158270;158271;158272;158273;158274;158275;158276;158277;158278;158279;158280;158281;158282;158283 158281 13 FPPFFTLQPNVDTR Unmodified 1677.8515 0.85149185 4002 Q9BRG1;K7EKV4;K7EP45 VPS25 Vacuolar protein-sorting-associated protein 25 yes no 0 0 0 1 137.77 137.77 2 0.0057157 143002 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.073 34.869 36633000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36633000 14157 4002 13282 124543 158284 158284 1 FPQCNKAQMTNILQQIK Unmodified 2061.05 0.049950441 964 E9PN76;Q8ND24 RNF214 RING finger protein 214 yes no 0 0 1 1 20.956 20.956 3 0.027693 14007 QUIQUE_DMIX8_190116_001 35.757 15.666 89863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89863000 14158 964 13283 124544 158285 158285 0 FPQDDLCQYITSDDLTQMLDNLGLK Oxidation (M) 2958.3627 0.36268955 2555 P50135 HNMT Histamine N-methyltransferase yes yes 0 1 0 1 164.83 164.83 3 0.0015205 170121 QUIQUE_C1368_190116_001 45.972 39.608 33124000 0 0 33124000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14159 2555 13284 124545 158286 158286 1994 0 FPQDDLCQYITSDDLTQMLDNLGLK Unmodified 2942.3678 0.36777492 2555 P50135 HNMT Histamine N-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.61 172.61 3 7.5724E-46 176832 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.36 133.15 471170000 0 0 0 0 26457000 5638700 31248000 16744000 133610000 0 111030000 70088000 76349000 14160 2555 13284 124546;124547;124548;124549;124550;124551;124552;124553 158287;158288;158289;158290;158291;158292;158293;158294 158291 7 FPQFILLLQDMLK Unmodified 1604.9 0.90002195 3339 Q5VXI4;Q9HCE6;E9PB39;A0A384DVK7;H0YAN8;O15013 ARHGEF10L;ARHGEF10 Rho guanine nucleotide exchange factor 10-like protein;Rho guanine nucleotide exchange factor 10 yes no 0 0 0 1 1 173.52 173.52 2 0.03482 180772 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.08 60.476 14699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6841300 7857500 0 14161 3339 13285 124554;124555 158295;158296 158295 0 FPQHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIK Unmodified 3111.5984 0.59844356 61 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YLB8;H0YNH0 GMPR2 GMP reductase;GMP reductase 2 yes no 0 0 0 1 168.75 168.75 3 1.1371E-27 173247 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.45 96.032 184400000 0 0 0 0 0 0 0 0 184400000 0 0 0 0 14162 61 13286 124556 158297 158297 1 FPQHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIK Oxidation (M) 3127.5934 0.59335818 61 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YLB8;H0YNH0 GMPR2 GMP reductase;GMP reductase 2 yes no 0 1 0 1 166.85 166.85 3 8.0354E-06 171210 QUIQUE_DMIX8_190116_001 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no 0 0 0 1 86.123 86.123 2 0.036271 87639 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.549 22.614 18159000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18159000 0 14165 107 13288 124569 158310 158310 1 FPSGNYPPCIGDNR Unmodified 1592.7042 0.70417569 1555 O43813 LANCL1 LanC-like protein 1 yes yes 0 0 0 5 3 2 5 3 3 2 2 2 1 5 3 71.565 71.565 2 0.0002018 72109 QUIQUE_C1277_190116_001 117.86 91.187 1415600000 183680000 186710000 0 129720000 284130000 121320000 272150000 42393000 100590000 18834000 0 0 76086000 14166 1555 13289 124570;124571;124572;124573;124574;124575;124576;124577;124578;124579;124580;124581;124582;124583;124584;124585;124586;124587;124588;124589;124590;124591;124592;124593;124594;124595;124596;124597;124598;124599;124600;124601;124602;124603;124604;124605 158311;158312;158313;158314;158315;158316;158317;158318;158319;158320;158321;158322;158323;158324;158325;158326;158327;158328;158329;158330;158331;158332;158333;158334;158335;158336;158337;158338;158339;158340;158341;158342;158343;158344;158345;158346;158347;158348;158349;158350;158351;158352;158353;158354 158320 44 FPSHFSSDLK Unmodified 1163.5611 0.56112349 167;2126 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;P17612 PRKACB;PRKACA cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta;cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha no no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 1 43.137 43.137 2;3 0.0041355 39482 QUIQUE_C1403_190116_001 81.95 47.947 1319400000 138480000 340140000 132150000 236890000 124040000 69460000 107720000 0 0 76538000 94013000 0 0 14167 167;2126 13290 124606;124607;124608;124609;124610;124611;124612;124613;124614;124615;124616;124617 158355;158356;158357;158358;158359;158360;158361;158362;158363;158364;158365;158366;158367;158368;158369 158360 15 FPSHFSSDLKDLLR Unmodified 1660.8573 0.85730551 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FPTLWSGAR Unmodified 1033.5345 0.53451481 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 1 4 1 4 2 2 91.627 91.627 2 1.3211E-06 94061 QUIQUE_C1576_190116_001 155.75 116.21 586250000 77278000 71971000 54256000 50686000 59783000 0 43480000 68552000 20499000 35158000 0 63041000 41543000 14175 3208 13298 124668;124669;124670;124671;124672;124673;124674;124675;124676;124677;124678;124679;124680;124681;124682;124683;124684;124685;124686;124687;124688;124689;124690;124691;124692 158433;158434;158435;158436;158437;158438;158439;158440;158441;158442;158443;158444;158445;158446;158447;158448;158449;158450;158451;158452;158453;158454;158455;158456;158457;158458;158459;158460;158461;158462;158463;158464;158465;158466;158467;158468 158448 36 FPVAPLIPYPLITK Unmodified 1567.9378 0.93778767 2543 P49756;H0YE46 RBM25 RNA-binding protein 25 yes no 0 0 0 1 147.78 147.78 2 0.032892 150370 QUIQUE_C1563_190116_001 58.676 46.1 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158616 78 FQDLGAAYEVLSDSEK Unmodified 1770.8312 0.83120992 4407 Q9UBS4 DNAJB11 DnaJ homolog subfamily B member 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.49 122.49 2;3 4.6499E-05 126620 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.74 91.367 683210000 71152000 18756000 84328000 72190000 0 55010000 74961000 35364000 56069000 25903000 79847000 39818000 69813000 14189 4407 13312 124816;124817;124818;124819;124820;124821;124822;124823;124824;124825;124826;124827 158637;158638;158639;158640;158641;158642;158643;158644;158645;158646;158647;158648;158649;158650;158651 158651 13 FQDLISTIK Unmodified 1063.5914 0.59136099 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.337 84.337 2 0.0012418 85261 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.52 65.417 326510000 33221000 65061000 36106000 27966000 28430000 25291000 41797000 26628000 0 7894100 0 34117000 0 14190 1520 13313 124828;124829;124830;124831;124832;124833;124834;124835;124836;124837;124838;124839;124840 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inner membrane translocase subunit Tim9 yes yes 0 0 0 2 53.333 53.333 2;3 3.7964E-12 51623 QUIQUE_C1218_190116_001 132.59 100.06 62447000 62447000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14216 4621 13337 125013;125014 158862;158863 158863 2 FQEYIDAHPETIVLDPLPAIR Unmodified 2436.2689 0.26891122 3013 Q13572;G3V5A3;G3V588 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 136.45 136.45 3 3.5062E-05 139237 QUIQUE_C1563_190116_001 67.43 63.479 857590000 61641000 87441000 71082000 91249000 85515000 83866000 81806000 0 121390000 57839000 115770000 0 0 14217 3013 13338 125015;125016;125017;125018;125019;125020;125021;125022;125023;125024;125025 158864;158865;158866;158867;158868;158869;158870;158871;158872;158873;158874 158869 10 FQEYILALADVPSSPYGVK Unmodified 2096.083 0.083007933 1241 H9KV31;O15394 NCAM2 Neural cell adhesion molecule 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 1 145.56 145.56 2;3 2.86E-11 150436 QUIQUE_DMIX8_190116_001 118.13 106.21 1110400000 59539000 137950000 109030000 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39.164 2 1.6649E-07 35135 QUIQUE_C1277_190116_001 168.25 103.83 4363900000 267760000 279000000 390140000 347670000 319760000 322720000 407010000 315760000 324950000 167040000 446870000 365510000 409690000 14298 2083 13415 125804;125805;125806;125807;125808;125809;125810;125811;125812;125813;125814;125815;125816 159931;159932;159933;159934;159935;159936;159937;159938;159939;159940;159941;159942;159943;159944;159945;159946 159933 14 FQTIDIEPDIEALLSQGPSCA Unmodified 2303.0991 0.099128282 41 A0A087WUQ6;P07203;A0A2R8Y6B6 GPX1 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 172.66 172.66 2;3 1.3167E-07 175895 QUIQUE_C1277_190116_001 62.002 58.621 172280000 24435000 37140000 0 13304000 64932000 0 9134500 0 0 0 0 23330000 0 14299 41 13416 125817;125818;125819;125820;125821;125822;125823;125824;125825 159947;159948;159949;159950;159951;159952;159953;159954;159955;159956 159949 10 FQTIDLSPFLFTR Unmodified 1583.8348 0.83477916 3824 Q96CU9 FOXRED1 FAD-dependent 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nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha no no 0 0 1 2 1 2 102.5 102.5 3;4 1.2703E-05 105016 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.638 72.159 159250000 0 0 0 0 0 0 0 85204000 16150000 0 0 0 57896000 14306 2778;2413 13423 125842;125843;125844;125845;125846 159973;159974;159975;159976;159977 159974 5 FQVDPSGEIVELAK Unmodified 1530.793 0.79297392 4210 Q9HB07;F8VR84;F8VQQ3 C12orf10 UPF0160 protein MYG1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.75 113.75 2 0.00026184 117638 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.03 85.562 1330600000 0 119920000 141270000 95651000 130710000 73236000 87902000 116750000 130150000 0 171900000 134760000 128380000 14307 4210 13424 125847;125848;125849;125850;125851;125852;125853;125854;125855;125856;125857 159978;159979;159980;159981;159982;159983;159984;159985;159986;159987;159988 159985 10 FQVIVYNPLGR Unmodified 1304.7241 0.7241065 1422 O00754;M0R174 MAN2B1 Lysosomal alpha-mannosidase;Lysosomal alpha-mannosidase A peptide;Lysosomal alpha-mannosidase B peptide;Lysosomal alpha-mannosidase C peptide;Lysosomal alpha-mannosidase D peptide;Lysosomal alpha-mannosidase E peptide yes no 0 0 0 1 117.69 117.69 2 0.039559 121933 QUIQUE_C1218_190116_001 47.603 30.577 16695000 16695000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14308 1422 13425 125858 159989 159989 1 FQVLLAELK Unmodified 1059.6328 0.63283187 4115 Q9H0A8;A0A0B4J287 COMMD4 COMM domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 106.83 106.83 2 0.025354 111895 QUIQUE_C1438_190116_001 59.35 32.046 17455000 0 0 0 0 17455000 0 0 0 0 0 0 0 0 14309 4115 13426 125859 159990 159990 1 FQVVAIEGLDATGK Unmodified 1446.7718 0.77184455 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 108.32 108.32 2 0.0055023 105061 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.473 33.219 6554200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6554200 0 0 0 14310 3269 13427 125860 159991 159991 1 FQVWDLGGQTSIRPYWR Unmodified 2108.0592 0.059193219 2426 P40616;B4DZG7;F8VYN9 ARL1 ADP-ribosylation factor-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 130.33 130.33 3 0.00050824 136662 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1-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.2 131.2 2 0.0046339 135300 QUIQUE_C1277_190116_001 96.668 72.513 955950000 0 89649000 86808000 65293000 85688000 58179000 84984000 85921000 80439000 27369000 111570000 97036000 83017000 14313 2983 13430 125885;125886;125887;125888;125889;125890;125891;125892;125893;125894;125895;125896 160023;160024;160025;160026;160027;160028;160029;160030;160031;160032;160033;160034;160035;160036 160023 14 FQWDMAK Unmodified 924.41637 0.41637351 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 0 1 1 70.327 70.327 2 0.024915 70186 QUIQUE_C1403_190116_001 97.071 70.962 202300000 0 0 0 104230000 0 0 98074000 0 0 0 0 0 0 14314 2176 13431 125897;125898 160037;160038 160037 1 FRAPELLFQPDLVGDESEGLHEVVAFAIHK Unmodified 3362.7299 0.72992674 2442 P42025 ACTR1B Beta-centractin yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 153.79 153.79 4;5 2.1168E-40 156851 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.35 106.38 1378200000 0 0 0 0 0 0 0 189780000 229200000 0 427560000 291640000 239980000 14315 2442 13432 125899;125900;125901;125902;125903;125904;125905;125906;125907;125908 160039;160040;160041;160042;160043;160044;160045;160046;160047;160048 160039 10 FRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQK Unmodified 3451.8504 0.85037623 2716 P61163;R4GMT0 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 2 1 2 1 161.5 161.5 4;5 3.8289E-19 165845 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.611 74.458 360040000 0 0 0 0 0 0 0 0 21374000 0 236380000 102290000 0 14316 2716 13433 125909;125910;125911;125912 160049;160050;160051;160052 160052 4 FRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK Oxidation (M) 3549.6189 0.61893778 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 1 1 1 133.81 133.81 4 0.00010823 136754 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.728 38.967 119590000 0 0 0 0 0 0 0 119590000 0 0 0 0 0 14317 447;2696;2788 13434 125913 160053 160053 316;317 1 FRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMK Unmodified 3533.624 0.62402316 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 1 2 1 1 1 140.28 140.28 3;4 2.0784E-136 143673 QUIQUE_DMIX1_190116_001 187.04 176.65 625300000 0 0 0 0 0 0 0 480950000 47074000 0 53789000 0 43488000 14318 447;2696;2788 13434 125914;125915;125916;125917;125918 160054;160055;160056;160057;160058;160059 160055 5 FRDEFVIPHLHK Unmodified 1536.8201 0.82013215 426 A0A2R8Y566;Q9P260 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 56.779 56.779 4 0.0096797 56126 QUIQUE_C1277_190116_001 48.513 41.311 191960000 24177000 28976000 55601000 0 0 0 0 0 0 0 36883000 0 46319000 14319 426 13435 125919;125920;125921;125922;125923;125924 160060;160061;160062;160063;160064;160065;160066 160062 7 FREDHPDLIQNAK Unmodified 1581.79 0.78995423 954 E9PKP7;P17480 UBTF Nucleolar transcription factor 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 30.101 30.101 3 0.001161 24742 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.167 53.412 118120000 0 0 0 0 0 0 0 26418000 0 12369000 0 39175000 40157000 14320 954 13436 125925;125926;125927;125928 160067;160068;160069;160070 160068 4 FREFLESQEDYDPCWSLQEK Unmodified 2605.1431 0.14311836 3610 Q8N6T3;F8VWH9;F8W1U7;E5RHT6;E5RHC5;F8VWB3;E5RGL6 ARFGAP1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 1 1 115.85 115.85 3 0.00083296 118156 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.825 35.024 29813000 0 0 0 0 0 0 0 29813000 0 0 0 0 0 14321 3610 13437 125929 160071 160071 1 FRELAEEAAR Unmodified 1190.6044 0.60438529 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 25.589 25.589 2;3 0.0014457 20541 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.4 51.836 1297100000 0 0 0 0 63756000 0 0 450660000 183870000 0 232770000 220980000 145090000 14322 3117 13438 125930;125931;125932;125933;125934;125935;125936;125937 160072;160073;160074;160075;160076;160077;160078;160079;160080;160081;160082 160075 11 FRENVQDVLPALPNPDDYFLLR Unmodified 2630.3493 0.34928681 1680 O76054;Q9UDX4;F8WEE7;C9JTM4 SEC14L2;SEC14L3 SEC14-like protein 2;SEC14-like protein 3 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 152.8 152.8 2;3 2.3466E-27 155937 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.04 121.63 2226500000 0 198150000 205570000 104280000 108880000 154830000 145480000 252070000 398790000 63159000 400190000 0 195120000 14323 1680 13439 125938;125939;125940;125941;125942;125943;125944;125945;125946;125947;125948;125949;125950 160083;160084;160085;160086;160087;160088;160089;160090;160091;160092;160093;160094;160095;160096;160097;160098;160099;160100;160101;160102;160103;160104 160096 21 FREWAVVLADTAVTSGR Unmodified 1876.9795 0.97954591 3712 Q8WW59 SPRYD4 SPRY domain-containing protein 4 yes yes 0 0 1 1 115.03 115.03 3 0.023063 121059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.476 23.196 36868000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36868000 0 0 14324 3712 13440 125951 160105 160105 0 FRGHSVEHALR Unmodified 1307.6847 0.6847013 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 1 1 1 12.149 12.149 3 0.046871 4012 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.788 33.101 8511200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2359600 6151700 0 14325 335;1521 13441 125952;125953 160106;160107 160106 1 FRGTEPEPR Unmodified 1087.5411 0.54105675 2238 P25325;B1AH49 MPST 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase;Sulfurtransferase yes no 0 0 1 1 12.612 12.612 3 0.040993 4840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.848 26.495 4506300 0 0 0 0 0 0 0 4506300 0 0 0 0 0 14326 2238 13442 125954 160108 160108 1 FRHENIIGINDIIR Unmodified 1708.9373 0.93728717 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 1 3 3 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 80.318 80.318 2;3;4 2.5238E-57 81869 QUIQUE_C1438_190116_001 198.57 159.94 12427000000 667160000 742250000 306840000 619520000 822930000 515530000 745170000 1409100000 1408100000 257230000 2214300000 1419900000 1298900000 14327 2281 13443 125955;125956;125957;125958;125959;125960;125961;125962;125963;125964;125965;125966;125967;125968;125969;125970;125971;125972;125973;125974;125975;125976;125977;125978;125979;125980;125981;125982;125983;125984;125985;125986;125987;125988;125989;125990;125991 160109;160110;160111;160112;160113;160114;160115;160116;160117;160118;160119;160120;160121;160122;160123;160124;160125;160126;160127;160128;160129;160130;160131;160132;160133;160134;160135;160136;160137;160138;160139;160140;160141;160142;160143;160144;160145;160146;160147;160148;160149;160150;160151;160152;160153;160154;160155;160156;160157;160158;160159;160160;160161;160162;160163;160164;160165 160125 55 FRHENVIGIR Unmodified 1239.6836 0.68363867 2263;897 E9PBK7;P27361;E9PQW4;E9PJF0 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 23.715 23.715 2;3 0.0012287 16643 QUIQUE_C1368_190116_001 75.197 58.565 3479100000 172250000 181970000 220920000 93694000 295490000 84219000 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SERPINC1 Antithrombin-III yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.646 84.646 3 0.0015102 86145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.568 70.095 81016000 0 0 0 0 20100000 0 0 17059000 0 0 25019000 18839000 0 14330 1798 13446 126022;126023;126024;126025;126026;126027 160206;160207;160208;160209;160210;160211 160208 6 FRLDCPLAMER Unmodified 1406.6799 0.6798752 4467 Q9UK41;E9PQR7;E9PM90 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 83.776 83.776 3 0.0074264 84823 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.841 43.737 35627000 0 0 0 0 0 0 0 9887500 0 0 0 11880000 13860000 14331 4467 13447 126028;126029;126030 160212;160213;160214;160215 160215 4 FRLDNLLNMAYGVK Unmodified 1652.8708 0.87084709 160;3073 A0A0A0MRX1;Q12926;Q14576 ELAVL2;ELAVL3 ELAV-like protein;ELAV-like protein 2;ELAV-like protein 3 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 136.4 136.4 2;3 0.00014749 140603 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.68 56.934 343090000 0 20475000 0 0 18676000 0 0 25750000 101590000 0 40628000 110090000 25888000 14332 160;3073 13448 126031;126032;126033;126034;126035;126036;126037;126038;126039 160216;160217;160218;160219;160220;160221;160222;160223;160224 160222 9 FRLEAPDADELPK Unmodified 1499.762 0.76200815 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 80.227 80.227 2;3 0.0075161 81319 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.034 45.53 6565800000 242820000 0 1995300000 0 906350000 0 0 190400000 325440000 1148200000 1757300000 0 0 14333 3975 13449 126040;126041;126042;126043;126044;126045;126046;126047;126048 160225;160226;160227;160228;160229;160230;160231;160232;160233 160228 6 FRLEAPDADELPKGEFDPGQDTYQHPPK Unmodified 3196.5102 0.51015714 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 2 1 3 3 3 3 2 93.294 93.294 3;4;5 4.2711E-36 96389 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.75 120.37 5069300000 85960000 83570000 0 0 205140000 0 97803000 832760000 813850000 0 1311000000 826330000 812920000 14334 3975 13450 126049;126050;126051;126052;126053;126054;126055;126056;126057;126058;126059;126060;126061;126062;126063;126064;126065;126066;126067 160234;160235;160236;160237;160238;160239;160240;160241;160242;160243;160244;160245;160246;160247;160248;160249;160250;160251;160252;160253;160254;160255;160256;160257;160258 160250 24 FRLENDLEELALYQIQLLK Unmodified 2347.2787 0.27874763 2963 Q13057;K7EQ60 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 1 1 1 166.92 166.92 3 0.00012485 171547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.97 71.094 48950000 0 0 0 0 0 0 0 0 22403000 0 0 0 26547000 14335 2963 13451 126068;126069 160259;160260 160259 2 FRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLR Unmodified 2991.5494 0.54944318 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 2 1 1 1 128.62 128.62 4 1.0072E-10 133062 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.693 69.924 188800000 0 0 0 0 0 0 0 0 72355000 0 45461000 0 70983000 14336 1921 13452 126070;126071;126072 160261;160262;160263;160264 160261 3 FRPDMEEEEAK Unmodified 1379.6027 0.60273031 3952 Q99436 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 28.392 28.392 2;3 0.00022713 22579 QUIQUE_C1403_190116_001 138.71 104.51 716160000 140040000 137880000 71738000 125970000 45854000 0 69240000 0 47800000 0 0 0 77637000 14337 3952 13453 126073;126074;126075;126076;126077;126078;126079;126080;126081;126082;126083;126084;126085 160265;160266;160267;160268;160269;160270;160271;160272;160273;160274;160275;160276;160277 160270 10 FRPDMEEEEAK Oxidation (M) 1395.5976 0.59764493 3952 Q99436 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7 yes yes 0 1 1 1 1 19.217 19.217 2 0.024621 12157 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.683 52.24 59445000 0 0 0 0 0 0 0 0 33515000 0 0 25929000 0 14338 3952 13453 126086;126087 160278;160279 160278 2 FRPLNEAEILR Unmodified 1356.7514 0.75138388 1568 O60282 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 69.276 69.276 3 0.0018084 69025 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.655 66.329 174280000 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160319;160320;160321;160322;160323;160324;160325;160326;160327;160328;160329;160330;160331;160332;160333;160334;160335;160336;160337;160338;160339;160340;160341;160342;160343;160344;160345;160346;160347;160348;160349;160350;160351;160352;160353;160354;160355;160356;160357;160358;160359;160360;160361;160362;160363 160354 44 FRPTLVFR Unmodified 1034.6025 0.6025348 1198 H3BRN4;P80404 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 59.87 59.87 2 0.04259 59794 QUIQUE_C1218_190116_001 133.86 92.36 1218700000 336370000 0 350820000 0 0 0 0 218260000 313260000 0 0 0 0 14347 1198 13462 126152;126153;126154;126155 160364;160365;160366;160367 160364 0 FRQDLMNIAGTTLSSK Unmodified 1780.9142 0.91416847 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 91.291 91.291 2;3 1.4981E-43 94569 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.17 153.36 1023400000 0 0 65635000 33373000 127030000 58468000 46262000 139220000 0 0 215160000 109120000 229150000 14348 2810 13463 126156;126157;126158;126159;126160;126161;126162;126163;126164;126165;126166;126167;126168;126169 160368;160369;160370;160371;160372;160373;160374;160375;160376;160377;160378;160379;160380;160381;160382 160378 12 FRSETITEEELVGLMNK Unmodified 1994.9983 0.99829203 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 114.81 114.81 2;3 1.1372E-74 118665 QUIQUE_DMIX8_190116_001 245.03 215.1 3147400000 0 53113000 52735000 0 164550000 39533000 117810000 592990000 536560000 0 607050000 477420000 505670000 14349 2102 13464 126170;126171;126172;126173;126174;126175;126176;126177;126178;126179;126180;126181;126182;126183;126184;126185;126186;126187;126188 160383;160384;160385;160386;160387;160388;160389;160390;160391;160392;160393;160394;160395;160396;160397;160398;160399;160400;160401;160402;160403 160402 19 FRWENNFLIPGLASGPPDLR Unmodified 2298.1909 0.19093567 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 143.85 143.85 3 0.011495 151242 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.444 21.619 35833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35833000 0 0 14350 3102 13465 126189;126190 160404;160405 160405 2 FSAASSDNTENLIK Unmodified 1495.7155 0.71545188 2270 P27986;E5RHI0;E5RGI8 PIK3R1 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.576 58.576 2 4.4288E-05 57900 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.66 88.669 370840000 0 47210000 42130000 37903000 0 42606000 35982000 44476000 0 0 45530000 33837000 41167000 14351 2270 13466 126191;126192;126193;126194;126195;126196;126197;126198;126199;126200;126201 160406;160407;160408;160409;160410;160411;160412;160413;160414;160415;160416 160414 8 FSAELIQHIPLSLR Unmodified 1622.9144 0.91442646 3554 Q8IYB8 SUPV3L1 ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 116.23 116.23 3 0.0036296 122314 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.774 26.933 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14352 3554 13467 126202 160417 160417 1 FSAFLEK Unmodified 840.43815 0.43815481 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.521 56.521 2 0.022155 53384 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.77 54.858 9358300000 738740000 746170000 763160000 624670000 678580000 581110000 750420000 648880000 788490000 367390000 952190000 824260000 894290000 14353 2016 13468 126203;126204;126205;126206;126207;126208;126209;126210;126211;126212;126213;126214;126215 160418;160419;160420;160421;160422;160423;160424;160425;160426;160427;160428;160429;160430;160431;160432 160429 15 FSAICQGDGTWSPR Unmodified 1580.7042 0.70417569 1847 P04003 C4BPA C4b-binding protein alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 77.189 77.189 2 1.3035E-28 79310 QUIQUE_C1438_190116_001 171.92 155.79 147680000 0 0 37441000 0 57492000 17059000 0 0 0 0 0 0 35693000 14354 1847 13469 126216;126217;126218;126219;126220;126221;126222;126223 160433;160434;160435;160436;160437;160438;160439;160440 160437 8 FSALQQAVPTESTDNRR Unmodified 1918.9497 0.94970235 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;H7C044 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.114 51.114 3 5.3789E-13 49172 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.93 103.16 775270000 0 78403000 28525000 91627000 72356000 49527000 0 65071000 90471000 0 94240000 84480000 120570000 14355 922 13470 126224;126225;126226;126227;126228;126229;126230;126231;126232;126233;126234 160441;160442;160443;160444;160445;160446;160447;160448;160449;160450;160451 160447 11 FSANLSWLFPELSGLPAR Unmodified 2004.0469 0.046897198 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;A0A0A0MTR5 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 1 168.47 168.47 3 0.00047237 175729 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.568 37.646 38367000 0 0 0 0 0 0 0 11248000 0 0 27119000 0 0 14356 1025 13471 126235;126236 160452;160453 160453 2 FSAPLPLELYTSSNFIGLFVK Unmodified 2342.2562 0.25622127 3691 Q8TF42 UBASH3B Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B yes yes 0 0 0 2 171.94 171.94 2;3 5.5013E-06 179249 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.62 88.857 41594000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41594000 0 0 14357 3691 13472 126237;126238 160454;160455 160454 2 FSAPVVPSSFNFGGPAPGMN Unmodified 1978.9247 0.92473315 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 150.69 150.69 2 0.002792 155523 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.324 61.382 233820000 0 31449000 0 0 0 0 0 35698000 34782000 0 43680000 43010000 45203000 14358 1727 13473 126239;126240;126241;126242;126243;126244 160456;160457;160458;160459;160460;160461;160462 160461 6 FSATEVTNK Unmodified 995.49238 0.49237523 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 26.564 26.564 2 0.0088115 20788 QUIQUE_C1438_190116_001 77.732 62.956 180110000 0 0 0 0 100440000 79667000 0 0 0 0 0 0 0 14359 3571 13474 126245;126246 160463;160464 160463 2 FSAVALCK Unmodified 894.46332 0.4633237 1976 P09936;D6RE83 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 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90.208 2 1.6162E-05 93067 QUIQUE_C1368_190116_001 101.32 92.521 164830000 0 0 124590000 0 0 40241000 0 0 0 0 0 0 0 14363 856 13478 126294;126295;126296 160540;160541;160542 160541 2 FSCEPAGGLTSLTEPPKGPGFGVQAGL Unmodified 2673.3109 0.31085239 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 135.61 135.61 2;3 6.0987E-09 138855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.649 26.926 159050000 0 49259000 31020000 0 0 0 0 78769000 0 0 0 0 0 14364 856 13479 126297;126298;126299;126300;126301 160543;160544;160545;160546;160547 160547 5 FSCMAWTHDGK Unmodified 1338.5485 0.54852667 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 46.763 46.763 2;3 0.0013047 43760 QUIQUE_C1438_190116_001 86.898 79.252 118790000 0 42329000 0 0 12904000 0 50128000 0 0 13432000 0 0 0 14365 2503 13480 126302;126303;126304;126305;126306;126307;126308;126309;126310;126311 160548;160549;160550;160551;160552;160553;160554;160555;160556;160557;160558 160552 11 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FSDFLGLHSK Unmodified 1149.5819 0.58185893 1590 O60749;D6RC15 SNX2 Sorting nexin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 67.91 67.91 2;3 0.00049284 68250 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.397 71.183 848190000 76242000 60710000 81571000 0 80666000 0 74279000 61416000 79759000 38998000 73760000 69888000 150900000 14368 1590 13483 126326;126327;126328;126329;126330;126331;126332;126333;126334;126335;126336;126337;126338;126339 160580;160581;160582;160583;160584;160585;160586;160587;160588;160589;160590;160591;160592;160593;160594;160595 160586 16 FSDFLGLYEK Unmodified 1217.5968 0.5968403 3015 Q13596 SNX1 Sorting nexin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.5 116.5 2 0.0077151 120469 QUIQUE_C1403_190116_001 101.65 80.118 164720000 0 0 0 0 51821000 0 0 0 0 0 52946000 59952000 0 14369 3015 13484 126340;126341;126342;126343;126344;126345;126346;126347 160596;160597;160598;160599;160600;160601;160602;160603 160597 8 FSDHVALLSVFQAWDDAR Unmodified 2076.0065 0.0064889465 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA 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19.766 2 2.0332E-19 12897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 196.39 85.851 37023000000 1624900000 1737800000 1713300000 0 2458200000 0 2373500000 6012800000 3007300000 628450000 6238900000 5269000000 5959200000 14389 2044 13503 126426;126427;126428;126429;126430;126431;126432;126433;126434;126435;126436 160692;160693;160694;160695;160696;160697;160698;160699;160700;160701;160702;160703 160698 11 FSFDLGK Unmodified 812.40685 0.40685468 2876 Q02790;F5H1U3 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.501 81.501 2 0.039576 78828 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.614 3.3205 470100000 0 76252000 79344000 71552000 110880000 74359000 0 29053000 0 28657000 0 0 0 14390 2876 13504 126437;126438;126439;126440;126441;126442;126443 160704;160705;160706;160707;160708;160709;160710;160711;160712 160712 9 FSFDLGKGEVIK Unmodified 1338.7184 0.71835242 2876 Q02790;F5H1U3 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 1 1 88.317 88.317 3 0.011968 91801 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.524 32.05 35403000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35403000 0 0 14391 2876 13505 126444 160713 160713 1 FSFEQPDGR Unmodified 1081.4829 0.48287317 1070 G3V169;P29466 CASP1 Caspase;Caspase-1;Caspase-1 subunit p20;Caspase-1 subunit p10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 59.265 59.265 2 0.00045175 57905 QUIQUE_C1368_190116_001 124.98 91.245 153600000 0 0 32332000 37595000 0 0 0 21432000 19584000 0 27639000 15015000 0 14392 1070 13506 126445;126446;126447;126448;126449;126450;126451;126452 160714;160715;160716;160717;160718;160719;160720;160721 160714 8 FSFGLLDLPFR Unmodified 1310.7023 0.70230842 540 J3KTL8;A6NHR9 SMCHD1 Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.42 163.42 2 0.00052849 169666 QUIQUE_C1438_190116_001 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aldolase yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 2 2 2 3 80.81 80.81 2;3;4 7.1399E-55 82217 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.39 161.59 7525500000 0 140950000 28065000 0 44133000 0 39287000 2467500000 422530000 0 1759800000 1422200000 1201000000 14417 1851 13528 126782;126783;126784;126785;126786;126787;126788;126789;126790;126791;126792;126793;126794;126795;126796;126797 161201;161202;161203;161204;161205;161206;161207;161208;161209;161210;161211;161212;161213;161214;161215;161216;161217;161218;161219;161220;161221 161207 19 FSHEEIAMATVTALRR Oxidation (M) 1846.936 0.93596654 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BU78;H3BR68 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 1 1 2 1 67.818 67.818 3;4 0.0011421 68016 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.885 52.157 271650000 0 0 0 0 0 0 0 222550000 0 0 49104000 0 0 14418 1851 13528 126798;126799;126800 161222;161223;161224 161224 1064 3 FSHLAADTIINGGATSHLAPTDPADR Unmodified 2647.299 0.29904215 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 84.499 84.499 3 0.024235 86561 QUIQUE_C1576_190116_001 25.157 17.165 33274000 0 0 0 0 0 0 33274000 0 0 0 0 0 0 14419 1613 13529 126801 161225 161225 1 FSHQGVQLIDFSPCER Unmodified 1918.8996 0.89958103 2674 P55884;C9JQN7 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 88.874 88.874 2;3 1.5978E-30 91613 QUIQUE_DMIX5_190116_001 172.57 156.44 674670000 64927000 79709000 72845000 67015000 80748000 62360000 79975000 0 55325000 0 60153000 51608000 0 14420 2674 13530 126802;126803;126804;126805;126806;126807;126808;126809;126810;126811;126812;126813 161226;161227;161228;161229;161230;161231;161232;161233;161234;161235;161236;161237;161238;161239;161240;161241 161240 16 FSHSGSYSSHISSK Unmodified 1509.6848 0.68482046 360 A0A1B0GWI0;A0A1B0GVV8;A0A1B0GW50;A0JP08;O60315;A0A1X7SC99;E7EUW9;A0A1B0GV02;H0YMD3;H0YMN2;H0YND9;U3KQ51;E7ESP8;P37275 ZEB2;ZEB1 Zinc finger E-box-binding homeobox 2;Zinc finger E-box-binding homeobox 1 yes no 0 0 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161248;161249;161250;161251;161252;161253;161254;161255;161256;161257;161258;161259 161252 12 FSIQTMCPIEGEGNIAR Oxidation (M) 1937.8975 0.89753212 2971 Q13155;A8MU58 AIMP2 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 yes no 0 1 0 1 86.526 86.526 2 0.041739 87073 QUIQUE_C1563_190116_001 51.211 37.532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14424 2971 13533 126831 161260 161260 1 FSIVGTR Unmodified 778.43374 0.43373813 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 43.607 43.607 2 0.045326 40790 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.616 18.257 81019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42969000 38050000 0 14425 2279 13534 126832;126833 161261;161262 161262 2 FSLAATR Unmodified 764.41809 0.41808807 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.305 36.305 2 0.019342 32715 QUIQUE_C1218_190116_001 114.72 55.08 2262700000 254840000 0 0 229280000 275870000 216920000 0 254570000 231860000 123970000 355950000 0 319480000 14426 4356 13535 126834;126835;126836;126837;126838;126839;126840;126841;126842 161263;161264;161265;161266;161267;161268;161269;161270;161271;161272 161263 7 FSLAATRSNDPVAIAFADMLK Unmodified 2237.1514 0.15143862 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 1 1 149.52 149.52 3 0.022335 155304 QUIQUE_C1368_190116_001 34.405 31.259 13806000 0 0 13806000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14427 4356 13536 126843 161273 161273 1 FSLDALITHVLPFEK Unmodified 1728.9451 0.94505789 1774 P00325;D6RHZ6;V9HW50;P07327 ADH1B;HEL-S-117;ADH1A Alcohol dehydrogenase 1B;Alcohol dehydrogenase 1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 157.62 157.62 3 5.3723E-05 162874 QUIQUE_C1368_190116_001 86.39 75.11 110190000 0 0 35594000 0 0 54305000 20294000 0 0 0 0 0 0 14428 1774 13537 126844;126845;126846;126847;126848;126849 161274;161275;161276;161277;161278;161279 161275 6 FSLDAVSLK Unmodified 978.5386 0.53859714 4653 Q9Y6G9;C9JGM7;C9JLW1 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.637 91.637 2 0.01368 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126897;126898;126899;126900;126901;126902;126903;126904;126905;126906;126907;126908;126909;126910;126911;126912;126913;126914;126915;126916;126917;126918 161331;161332;161333;161334;161335;161336;161337;161338;161339;161340;161341;161342;161343;161344;161345;161346;161347;161348;161349;161350;161351;161352;161353;161354;161355 161348 23 FSLHEMLNEMSEFK Unmodified 1740.7851 0.78512813 2853 Q01432;E9PKC5 AMPD3 AMP deaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 145.68 145.68 3 0.012023 150009 QUIQUE_C1277_190116_001 43.878 36.676 29867000 0 13623000 0 16244000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14436 2853 13545 126919;126920 161356;161357 161356 2 FSLIDLAGNER Unmodified 1233.6354 0.63535107 1377 O00139 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.67 115.67 2 2.6888E-08 120937 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.56 120.76 1434400000 108940000 122230000 140350000 108380000 0 102520000 155230000 128010000 105280000 46055000 121480000 159540000 136370000 14437 1377 13546 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126944;126945 161393;161394 161393 2 FSLPLYFVSAADGTNVVK Unmodified 1927.0091 0.0091147084 4400 Q9UNT1;Q9UBK7;B7ZBD5;A8MXF6 RABL2B;RABL2A Rab-like protein 2B;Rab-like protein 2A yes no 0 0 0 1 150.85 150.85 2 0.0074763 158460 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.167 48.807 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14440 4400 13549 126946 161395 161395 1 FSLSCSETLMGELGNIAK Unmodified 1955.9332 0.93324893 4567 Q9Y2T3;Q5SZC5 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 147.77 147.77 2;3 9.4343E-31 153563 QUIQUE_C1218_190116_001 187.44 164.86 3330400000 223630000 334870000 389510000 523480000 200760000 210400000 256330000 204110000 206060000 70878000 239780000 212160000 258430000 14441 4567 13550 126947;126948;126949;126950;126951;126952;126953;126954;126955;126956;126957;126958;126959;126960;126961;126962;126963 161396;161397;161398;161399;161400;161401;161402;161403;161404;161405;161406;161407;161408;161409;161410;161411;161412;161413;161414;161415;161416;161417;161418;161419;161420;161421 161396 25 FSLVGIGGQDLNEGNR Unmodified 1674.8325 0.83254733 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.53 104.53 2 2.6309E-19 101902 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.71 131.45 2032200000 132800000 107560000 270730000 312000000 156010000 119850000 148420000 134400000 0 97928000 246180000 125830000 180530000 14442 2066 13551 126964;126965;126966;126967;126968;126969;126970;126971;126972;126973;126974;126975 161422;161423;161424;161425;161426;161427;161428;161429;161430;161431;161432;161433;161434;161435 161430 12 FSLVPHNYGLVLYENK Unmodified 1891.9832 0.98323431 3948 Q96TA1 FAM129B Niban-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 113.05 113.05 3 9.1117E-05 116037 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.022 56.616 255960000 0 0 0 40092000 54037000 0 0 32027000 37180000 0 40178000 0 52447000 14443 3948 13552 126976;126977;126978;126979;126980;126981 161436;161437;161438;161439;161440;161441;161442;161443;161444 161438 8 FSLYFLAYEDK Unmodified 1394.6758 0.6758189 2888 Q04760 GLO1 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161534;161535;161536;161537;161538;161539;161540;161541;161542;161543;161544;161545;161546;161547;161548;161549;161550;161551;161552;161553;161554;161555;161556;161557;161558;161559;161560;161561 161551 26 FSMVVQDGIVK Oxidation (M) 1237.6377 0.63765925 2300 P30044 PRDX5 Peroxiredoxin-5, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 57.501 57.501 2 0.00027534 55965 QUIQUE_C1576_190116_001 121.73 96.957 3059800000 320020000 326600000 356410000 107590000 339450000 150830000 283300000 0 129910000 165160000 433640000 312410000 134500000 14455 2300 13562 127074;127075;127076;127077;127078;127079;127080;127081;127082;127083;127084;127085;127086;127087;127088;127089;127090;127091;127092;127093 161562;161563;161564;161565;161566;161567;161568;161569;161570;161571;161572;161573;161574;161575;161576;161577;161578;161579;161580;161581 161572 1685 17 FSMVVQDGIVK Unmodified 1221.6427 0.64274463 2300 P30044 PRDX5 Peroxiredoxin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 3 1 2 2 1 3 2 1 2 1 85.434 85.434 2 0.00043855 81752 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.7 73.446 12543000000 1272200000 1249100000 1198700000 926160000 1108800000 999400000 1324300000 1001800000 21899000 374070000 1575200000 0 1491100000 14456 2300 13562 127094;127095;127096;127097;127098;127099;127100;127101;127102;127103;127104;127105;127106;127107;127108;127109;127110;127111;127112;127113;127114;127115;127116;127117 161582;161583;161584;161585;161586;161587;161588;161589;161590;161591;161592;161593;161594;161595;161596;161597;161598;161599;161600;161601;161602;161603;161604;161605;161606;161607;161608;161609;161610;161611;161612;161613;161614;161615;161616 161609 35 FSNAEPEPR Unmodified 1045.4829 0.48287317 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.447 19.447 2 1.2424E-05 12701 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.94 172.94 9925300000 0 911910000 965960000 737840000 812940000 778190000 980820000 762030000 770890000 396620000 974860000 860400000 972880000 14457 535;3739 13563 127118;127119;127120;127121;127122;127123;127124;127125;127126;127127;127128;127129 161617;161618;161619;161620;161621;161622;161623;161624;161625;161626;161627;161628 161623 1 FSNISAAK Unmodified 836.43922 0.43921744 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 18.83 18.83 2 0.017005 11329 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.241 48.883 105590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105590000 0 0 0 14458 2573 13564 127130 161629 161629 1 FSNISPENHISLTNVVGHSLGCTWHSLR Unmodified 3161.5465 0.54649984 1646 O75569 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes yes 0 0 0 1 109.89 109.89 4 0.037644 112071 QUIQUE_DMIX1_190116_001 19.997 10.201 37421000 0 0 0 0 0 0 0 37421000 0 0 0 0 0 14459 1646 13565 127131 161630;161631 161630 2 FSNLVLQALLVLLK Unmodified 1569.9858 0.98580049 1245 I3L0N3;P46459;I3L2G1;K7EQD6 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 2 2 3 2 176.51 176.51 2;3 4.873E-35 179872 QUIQUE_DMIX7_190116_001 181.66 179.15 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Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.5 105.5 2 0.00042753 109814 QUIQUE_C1576_190116_001 119.27 90.762 846970000 82155000 57543000 74325000 65657000 48367000 57001000 63317000 57404000 73861000 31814000 76701000 75475000 83353000 14474 2452 13580 127260;127261;127262;127263;127264;127265;127266;127267;127268;127269;127270;127271;127272 161780;161781;161782;161783;161784;161785;161786;161787;161788;161789;161790;161791;161792;161793;161794;161795;161796 161789 17 FSPTLGILK Unmodified 974.58007 0.58006802 3607 Q8N6D5;K7EQM1 ANKRD29 Ankyrin repeat domain-containing protein 29 yes no 0 0 0 1 1 92.603 92.603 2 0.021719 93578 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.962 33.064 16430000 0 0 0 0 0 0 0 16430000 0 0 0 0 0 14475 3607 13581 127273;127274 161797;161798 161797 2 FSPVTPK Unmodified 774.42759 0.42759012 1114 H0Y2Y8;Q15942;H7C3D3 ZYX Zyxin yes no 0 0 0 1 23.166 23.166 2 0.069773 16361 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.757 46.991 53002000 0 0 0 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1982.9949 0.99492121 3845 Q96EY1 DNAJA3 DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 132.34 132.34 3 8.8023E-05 136999 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.983 66.753 235210000 35644000 0 0 0 0 24952000 36569000 0 26146000 0 36600000 42813000 32482000 14482 3845 13588 127302;127303;127304;127305;127306;127307;127308 161829;161830;161831;161832;161833;161834;161835;161836 161836 8 FSQMLHPIFEEASDVIKEEFPNENQVVFAR Unmodified 3549.7239 0.72385508 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 157.76 157.76 3;4 3.5153E-13 162771 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.016 59.22 478210000 0 0 0 0 0 0 0 0 46832000 0 324410000 52707000 54259000 14483 4007 13589 127309;127310;127311;127312;127313 161837;161838;161839;161840;161841 161841 5 FSQQYSTIVK Unmodified 1199.6186 0.61863837 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4;E9PLY5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.503 48.503 2 0.0044743 45961 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161853;161854;161855;161856;161857;161858;161859;161860;161861;161862 161854 9 FSSAVGLVTIVECCPVLLGPPLLGR Unmodified 2653.4336 0.43355049 2634 P53985;Q5T8R5 SLC16A1 Monocarboxylate transporter 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.89 168.89 3 4.2877E-14 173303 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.932 79.086 299190000 24053000 16806000 0 25147000 17994000 0 35697000 31871000 64289000 12710000 22840000 19052000 28734000 14487 2634 13593 127335;127336;127337;127338;127339;127340;127341;127342;127343;127344;127345 161863;161864;161865;161866;161867;161868;161869;161870;161871;161872;161873 161869 11 FSSCGGGGGSFGAGGGFGSR Unmodified 1764.7274 0.72743033 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 3 1 2 2 3 63.617 63.617 2 2.2564E-37 59787 QUIQUE_DMIX4_190116_001 152.89 142.28 721170000 0 0 0 0 60283000 0 0 147350000 34722000 166920000 109310000 154750000 47839000 + 14488 1859 13594 127346;127347;127348;127349;127350;127351;127352;127353;127354;127355;127356;127357;127358;127359;127360;127361;127362 161874;161875;161876;161877;161878;161879;161880;161881;161882;161883;161884;161885;161886;161887;161888;161889;161890;161891;161892;161893;161894 161884 18 FSSETWQNLGTLHR Unmodified 1674.8114 0.81141795 3881 Q96IU4;F8W9U3;B4DQI4 ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.836 81.836 3 1.8857E-05 83068 QUIQUE_C1368_190116_001 95.631 83.005 2646700000 0 0 289980000 276400000 280290000 233330000 232060000 0 303110000 162450000 339130000 227740000 302190000 14489 3881 13595 127363;127364;127365;127366;127367;127368;127369;127370;127371;127372 161895;161896;161897;161898;161899;161900;161901;161902;161903;161904;161905;161906;161907 161895 13 FSSFEEAVK Unmodified 1042.4971 0.49712625 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.666 53.666 2 0.0019297 50232 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162165;162166;162167;162168;162169;162170;162171;162172;162173;162174;162175;162176;162177;162178;162179;162180;162181;162182;162183;162184;162185;162186;162187;162188;162189;162190;162191;162192;162193 162177 29 FSVLMQMR Unmodified 1010.5041 0.50414266 4003 Q9BRJ7;K7ENA3;W4VSQ8 NUDT16L1 Protein syndesmos yes no 0 0 0 1 85.232 85.232 2 0.039798 85673 QUIQUE_C1563_190116_001 87.323 59.068 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14514 4003 13619 127585 162194 162194 1 FSVNLDVK Unmodified 920.49673 0.49673232 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;A0A024R3B9;E9PNH7 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 3 1 2 2 3 3 2 71.007 71.007 1;2 0.007181 70749 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.997 43.556 10462000000 678800000 1063800000 776270000 596250000 794750000 567110000 1513600000 690290000 596400000 968350000 710610000 671810000 834420000 14515 977 13620 127586;127587;127588;127589;127590;127591;127592;127593;127594;127595;127596;127597;127598;127599;127600;127601;127602;127603;127604;127605;127606;127607;127608;127609 162195;162196;162197;162198;162199;162200;162201;162202;162203;162204;162205;162206;162207;162208;162209;162210;162211;162212;162213;162214;162215;162216;162217;162218;162219;162220;162221;162222;162223;162224;162225;162226;162227;162228;162229;162230;162231;162232;162233;162234;162235;162236;162237;162238;162239;162240;162241;162242;162243;162244;162245;162246;162247;162248;162249;162250;162251;162252 162227 55 FSVPGFK Unmodified 780.41703 0.41702544 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 76.084 76.084 2 0.044362 76400 QUIQUE_C1403_190116_001 79.454 61.687 264480000 34832000 0 0 43998000 38282000 0 0 69305000 0 0 0 35002000 43063000 14516 2935 13621 127610;127611;127612;127613;127614;127615 162253;162254;162255;162256;162257;162258 162254 6 FSVSGLK Unmodified 736.41194 0.41194006 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 44.259 44.259 2 0.047361 40739 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.847 22.082 65824000 0 0 0 0 0 0 0 65824000 0 0 0 0 0 14517 2935 13622 127616 162259 162259 1 FSVSPVVR Unmodified 889.50215 0.50215205 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.159 51.159 2 0.0013514 49451 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143 123.37 6026800000 444590000 429520000 497550000 529340000 541680000 402550000 497550000 411260000 456770000 180500000 628040000 466570000 540850000 14518 2058 13623 127617;127618;127619;127620;127621;127622;127623;127624;127625;127626;127627;127628;127629 162260;162261;162262;162263;162264;162265;162266;162267;162268;162269;162270;162271;162272;162273 162267 11 FSWFAGEK Unmodified 970.45487 0.45486751 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 84.582 84.582 2 0.0036626 86574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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nexin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 57.872 57.872 3 0.0023777 56832 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.529 51.997 280620000 37696000 35961000 37205000 0 0 0 0 44768000 78096000 0 0 0 46893000 14535 1911 13640 128097;128098;128099;128100;128101;128102 163030;163031;163032;163033;163034;163035 163034 6 FTAVEDQYYCVDCYK Unmodified 1959.8019 0.8019004 3283 Q5JXI8;Q13642 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.869 93.869 2 1.0511E-129 97194 QUIQUE_C1218_190116_001 238.98 233.03 3114200000 267950000 339910000 204490000 206900000 147310000 167580000 248480000 297990000 299470000 153560000 203450000 299440000 277680000 14536 3283 13641 128103;128104;128105;128106;128107;128108;128109;128110;128111;128112;128113;128114;128115 163036;163037;163038;163039;163040;163041;163042;163043;163044;163045;163046;163047;163048;163049;163050;163051 163037 15 FTCEQALQHPWIAGDTALDK Unmodified 2300.0896 0.089566649 3039 Q14012;H7C071 CAMK1 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.601 98.601 3 3.704E-05 102534 QUIQUE_C1576_190116_001 71.073 67.882 638890000 0 129490000 108930000 0 0 137230000 162290000 0 0 0 100960000 0 0 14537 3039 13642 128116;128117;128118;128119;128120 163052;163053;163054;163055;163056 163055 3 FTCTVTHTDLPSPLK Unmodified 1715.8553 0.8552566 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 0 1 1 68.972 68.972 2 1.6922E-44 69208 QUIQUE_C1368_190116_001 185.59 156.89 105830000 0 0 33304000 0 72523000 0 0 0 0 0 0 0 0 14538 352 13643 128121;128122 163057;163058 163057 2 FTDCGHFQNTEFHELITVVK Unmodified 2421.1423 0.1423305 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 100.89 100.89 3;4 5.2534E-05 103603 QUIQUE_C1277_190116_001 69.122 60.732 1362800000 75930000 187780000 87478000 160930000 0 149850000 103410000 185750000 193360000 0 68584000 63630000 86065000 14539 1663 13644 128123;128124;128125;128126;128127;128128;128129;128130;128131;128132;128133;128134;128135;128136;128137;128138 163059;163060;163061;163062;163063;163064;163065;163066;163067;163068;163069;163070;163071;163072;163073;163074;163075 163060 17 FTDDYQLFEELGK Unmodified 1603.7406 0.740604 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.32 132.32 2 7.6059E-10 137659 QUIQUE_C1218_190116_001 143.24 127.27 4931100000 707360000 684690000 435300000 462450000 566080000 343580000 0 443040000 546410000 251300000 0 0 490950000 14540 412;3299 13645 128139;128140;128141;128142;128143;128144;128145;128146;128147;128148 163076;163077;163078;163079;163080;163081;163082;163083;163084;163085 163076 9 FTDEEVDELYR Unmodified 1414.6252 0.62523989 1303 J3QRS3;P19105;O14950 MYL12A;MYL12B Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.676 86.676 2 5.3108E-09 83640 QUIQUE_DMIX4_190116_001 157.96 136.49 4084800000 343790000 278150000 403650000 346910000 335770000 285230000 381280000 177070000 284790000 124010000 420040000 351980000 352150000 14541 1303 13646 128149;128150;128151;128152;128153;128154;128155;128156;128157;128158;128159;128160;128161 163086;163087;163088;163089;163090;163091;163092;163093;163094;163095;163096;163097;163098;163099;163100 163096 15 FTDEEVDEMYR Unmodified 1432.5817 0.58166052 2234 P24844 MYL9 Myosin regulatory light polypeptide 9 yes yes 0 0 0 1 1 1 75.991 75.991 2 0.00014594 77555 QUIQUE_C1438_190116_001 128.6 120.14 121060000 32051000 42940000 0 0 46065000 0 0 0 0 0 0 0 0 14542 2234 13647 128162;128163;128164 163101;163102;163103 163103 3 FTDEYQLFEELGK Unmodified 1617.7563 0.75625407 896;803 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.48 134.48 2 0.00012676 131119 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.07 123.88 5275500000 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163120;163121;163122;163123;163124;163125;163126;163127;163128;163129;163130;163131;163132;163133;163134;163135;163136 163121 13 FTDFDEVR Unmodified 1027.4611 0.4610751 4528;2569;840 P50570;E5RHK8;Q9UQ16 DNM2;DNM3 Dynamin-2;Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 58.551 58.551 2 0.0036806 57190 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.92 105.29 587110000 0 132930000 120050000 112100000 0 101770000 0 0 0 51253000 0 0 69008000 14545 2569;840;4528 13650 128193;128194;128195;128196;128197;128198;128199 163137;163138;163139;163140;163141;163142;163143 163143 5 FTDFDEVRQEIEAETDR Unmodified 2098.9443 0.9443422 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 128.51 128.51 3 1.0481E-16 132918 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.22 106.24 192900000 0 0 0 0 0 0 24601000 33768000 33463000 0 36295000 38943000 25827000 14546 2569 13651 128200;128201;128202;128203;128204;128205 163144;163145;163146;163147;163148;163149;163150;163151 163148 7 FTDFEEVR Unmodified 1041.4767 0.47672516 2893;269 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domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 2 119.88 119.88 3;4 9.1209E-07 125436 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.36 81.421 255580000 0 30869000 0 0 0 0 28311000 46152000 0 0 70399000 23994000 55860000 14552 3387 13657 128234;128235;128236;128237;128238;128239;128240;128241;128242;128243;128244;128245;128246 163181;163182;163183;163184;163185;163186;163187;163188;163189;163190;163191;163192;163193 163189 11 FTEEEELQMTR Unmodified 1411.6289 0.62894506 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 64.438 64.438 2 2.5927E-24 64801 QUIQUE_C1218_190116_001 182.39 164.96 627940000 47464000 77888000 62951000 52699000 0 0 60441000 53295000 43342000 26817000 47075000 50387000 105580000 14553 62 13658 128247;128248;128249;128250;128251;128252;128253;128254;128255;128256;128257;128258 163194;163195;163196;163197;163198;163199;163200;163201;163202;163203;163204;163205;163206;163207;163208;163209;163210 163194 16 FTEEEELQMTR Oxidation (M) 1427.6239 0.62385968 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 48.124 48.124 2 0.053355 45382 QUIQUE_C1277_190116_001 60.518 34.004 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14554 62 13658 128259 163211 163211 1 FTEEVVK Unmodified 850.44363 0.44363412 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 26.984 26.984 2 0.039849 20894 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.377 34.616 2751100000 0 0 0 0 625850000 0 774060000 0 0 0 521230000 376380000 453550000 14555 2522 13659 128260;128261;128262;128263;128264 163212;163213;163214;163215;163216 163216 5 FTEEYQLFEELGK Unmodified 1631.7719 0.77190413 4533 Q9UQM7;D6RFJ0 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 131.37 131.37 2 7.0241E-05 128433 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.96 137.36 13267000000 1512100000 1621400000 715170000 880720000 1218100000 573290000 1335000000 843540000 659030000 417950000 1179800000 1303200000 1007500000 14556 4533 13660 128265;128266;128267;128268;128269;128270;128271;128272;128273;128274;128275;128276;128277;128278;128279 163217;163218;163219;163220;163221;163222;163223;163224;163225;163226;163227;163228;163229;163230;163231 163227 10 FTELVCSLSDVYQMEK Unmodified 1947.8958 0.89580079 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 135.3 135.3 2 9.7065E-19 139327 QUIQUE_C1277_190116_001 142.91 112.36 211530000 55854000 51345000 0 34816000 0 23575000 45943000 0 0 0 0 0 0 14557 3060 13661 128280;128281;128282;128283;128284 163232;163233;163234;163235;163236;163237 163234 6 FTENDSEKVDR Unmodified 1338.6052 0.60517315 35 A0A087WUB9;Q8WYA6 CTNNBL1 Beta-catenin-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 16.221 16.221 3 0.002119 8695 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.289 76.834 132160000 0 21417000 0 0 0 0 0 0 0 0 52043000 28819000 29878000 14558 35 13662 128285;128286;128287;128288 163238;163239;163240;163241 163239 2 FTEWLHEVLK Unmodified 1300.6816 0.68157298 3216 Q2TAL8 QRICH1 Glutamine-rich protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 98.825 98.825 3 0.011018 101463 QUIQUE_C1277_190116_001 49.189 37.27 8651200 0 8651200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14559 3216 13663 128289;128290 163242;163243 163243 2 FTEYETQVK Unmodified 1143.5448 0.54480473 2968 Q13148;B1AKP7;G3V162;A0A087X260;A0A087WYY0;A0A087WX29;A0A0A0N0M3;K7EN94;K7EJM5;A0A087WXQ5;A0A087WV68;A0A087WW61;A0A087WX67;A0A087WXV3 TARDBP;TDP43 TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.632 34.632 2 0.0077604 29304 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.684 49.38 1214200000 0 0 177830000 0 203490000 0 187010000 174430000 0 95520000 0 202110000 173830000 14560 2968 13664 128291;128292;128293;128294;128295;128296;128297 163244;163245;163246;163247;163248;163249;163250 163250 6 FTFEEAAK Unmodified 941.44945 0.44944778 912;826 E9PF17;P13611;Q86W61;D6RGZ6 VCAN Versican core protein no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 48.147 48.147 1;2 0.0064687 46536 QUIQUE_C1438_190116_001 101.64 69.173 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163268;163269;163270;163271;163272;163273;163274;163275;163276;163277;163278;163279;163280;163281;163282;163283;163284;163285;163286;163287;163288;163289;163290;163291;163292;163293;163294;163295 163277 28 FTFGLDWVPK Unmodified 1208.623 0.62299547 2472;1239 P45974;H7C5J3;Q92995 USP5;USP13 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.3 140.3 2 0.0072129 144447 QUIQUE_C1403_190116_001 85.676 57.502 1752700000 128460000 142620000 144310000 107230000 163740000 110170000 163990000 132120000 142740000 53146000 168420000 146530000 149250000 14563 2472;1239 13667 128331;128332;128333;128334;128335;128336;128337;128338;128339;128340;128341;128342;128343 163296;163297;163298;163299;163300;163301;163302;163303;163304;163305;163306;163307;163308;163309 163299 10 FTFHLEPQAQATQVSDVPATSR Unmodified 2429.1975 0.19753719 1595 O60826 CCDC22 Coiled-coil domain-containing protein 22 yes yes 0 0 0 1 1 1 90.395 90.395 3 2.1546E-05 87978 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.426 42.238 165160000 0 0 0 0 53303000 0 0 0 0 34121000 77739000 0 0 14564 1595 13668 128344;128345;128346 163310;163311;163312 163311 3 FTFIPDQSFDQLFQLQEITLYNNR Unmodified 2976.4658 0.46577313 2218 P23515 OMG Oligodendrocyte-myelin glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.86 170.86 3 1.7098E-31 174727 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.84 126.69 1119300000 0 40683000 0 0 90435000 38074000 191020000 34955000 119270000 0 320680000 223470000 60709000 14565 2218 13669 128347;128348;128349;128350;128351;128352;128353;128354;128355 163313;163314;163315;163316;163317;163318;163319;163320;163321;163322 163321 10 FTFQEAANECR Unmodified 1371.5877 0.58774895 111 Q6PID9;A0A087X1T7;H0YMF1;P16112 ACAN Aggrecan core protein;Aggrecan core protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61.735 61.735 2 0.011358 60699 QUIQUE_C1576_190116_001 72.643 66.722 253390000 58791000 49854000 0 0 0 44932000 84340000 0 0 15472000 0 0 0 14566 111 13670 128356;128357;128358;128359;128360 163323;163324;163325;163326;163327 163326 4 FTFTVPAMPALTPAPSPAS Unmodified 1901.9597 0.95972167 3866 Q96HD9;E9PRA7 ACY3 N-acyl-aromatic-L-amino acid amidohydrolase (carboxylate-forming) yes no 0 0 0 1 160.41 160.41 2 0.0016751 165119 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.198 46.218 23426000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23426000 0 14567 3866 13671 128361 163328 163328 1 FTGEGATAHLETGGFIR Unmodified 1762.8638 0.86384745 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 75.533 75.533 2;3 6.127E-18 77038 QUIQUE_C1218_190116_001 124.47 101.23 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14568 3643 13672 128362;128363;128364;128365;128366 163329;163330;163331;163332;163333 163329 5 FTGESYTVLGDTAIESGQHYWEVK Unmodified 2716.2657 0.26567634 156 A0A0C4DG97;A0A0A0MRS5;F8W946;Q9BXM9;Q8N450 FSD1L FSD1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 129.59 129.59 3 3.0486E-06 134824 QUIQUE_C1218_190116_001 57.068 50.711 334130000 95649000 48700000 57195000 52049000 53977000 0 0 0 0 26563000 0 0 0 14569 156 13673 128367;128368;128369;128370;128371;128372 163334;163335;163336;163337;163338;163339;163340 163334 7 FTGHCSCRPGVSGVR Unmodified 1675.7671 0.76712707 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 15.195 15.195 3;4 0.0013302 7063 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.675 50.417 611910000 0 66551000 0 0 31100000 0 0 190790000 96720000 0 54926000 91889000 79929000 14570 2665 13674 128373;128374;128375;128376;128377;128378;128379;128380;128381;128382;128383 163341;163342;163343;163344;163345;163346;163347;163348;163349;163350;163351 163351 11 FTGLESIFR Unmodified 1068.5604 0.56039521 3592 Q8N4Q0 ZADH2 Zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.23 115.23 2 3.1682E-06 119093 QUIQUE_C1368_190116_001 167.24 114.08 468480000 42005000 35034000 43880000 29123000 39960000 42704000 48678000 37556000 32985000 0 38091000 38469000 39998000 14571 3592 13675 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163367;163368;163369;163370;163371;163372;163373;163374;163375 163367 9 FTHVLTAGGIGPTHDDVTFEAVAQAFGDELKPHPK Unmodified 3701.8478 0.84781005 3647 Q8NFF5;Q5T196 FLAD1 FAD synthase;Molybdenum cofactor biosynthesis protein-like region;FAD synthase region yes no 0 0 1 1 130.75 130.75 5 6.8121E-11 137609 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.776 57.226 39843000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39843000 0 0 14574 3647 13678 128407 163376 163376 1 FTIGDHSR Unmodified 931.45118 0.45117911 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 19.422 19.422 2 0.0039847 12116 QUIQUE_C1403_190116_001 110.81 52.147 2138600000 0 431680000 0 841300000 0 0 362910000 0 396920000 105840000 0 0 0 14575 1609 13679 128408;128409;128410;128411;128412 163377;163378;163379;163380;163381 163378 1 FTISDHPQPIDPLLK Unmodified 1719.9196 0.91957142 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 96.516 96.516 2;3 3.434E-13 98358 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1569.913 0.91302948 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.06 120.06 2 1.3314E-05 125799 QUIQUE_C1218_190116_001 126.71 108.65 3200700000 186690000 231170000 286670000 251920000 275430000 233470000 262740000 236820000 243310000 127150000 344340000 263370000 257650000 14578 2617 13682 128441;128442;128443;128444;128445;128446;128447;128448;128449;128450;128451;128452;128453 163419;163420;163421;163422;163423;163424;163425;163426;163427;163428;163429;163430;163431;163432;163433;163434;163435;163436;163437;163438 163419 20 FTITPSTTQVVGILK Unmodified 1603.9185 0.91850879 2492 P47755 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 119 119 2;3 3.9254E-06 122624 QUIQUE_C1403_190116_001 103.91 94.222 9104400000 724080000 889010000 411580000 722380000 732130000 728530000 665660000 612320000 667620000 396290000 1009100000 772550000 773110000 14579 2492 13683 128454;128455;128456;128457;128458;128459;128460;128461;128462;128463;128464;128465;128466;128467 163439;163440;163441;163442;163443;163444;163445;163446;163447;163448;163449;163450;163451;163452;163453;163454 163443 14 FTKPELDACDVPEK Unmodified 1647.7814 0.78142296 1607 O75061;S4R305 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes no 0 0 1 1 1 53.577 53.577 3 0.020634 51576 QUIQUE_C1403_190116_001 32.917 25.681 56198000 0 0 0 56198000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14580 1607 13684 128468;128469 163455;163456 163456 2 FTLFGIANK Unmodified 1009.5597 0.55966693 496 A0A3B3ISX9;A0A140T8Z8;A0A140T9C0;A0A140T902;A0A140T8Y3;A0A140TA52;A0A140TA41;A0A140TA33;P22105;A0A140T923;A0A140T956;A0A087WWA5 TNXB Tenascin-X yes no 0 0 0 1 104.5 104.5 2 0.021287 109677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.229 56.706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14581 496 13685 128470 163457 163457 1 FTLGSVAGAVGATAVYPIDLVK Unmodified 2148.1831 0.18305633 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 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2474 P45985 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.236 69.236 3 2.0037E-10 69229 QUIQUE_C1277_190116_001 92.307 72.488 523280000 0 58733000 0 60823000 25339000 61947000 0 61738000 40557000 77767000 47470000 32318000 56592000 14584 2474 13688 128499;128500;128501;128502;128503;128504;128505;128506;128507;128508 163490;163491;163492;163493;163494;163495;163496;163497;163498;163499;163500;163501;163502 163490 12 FTLPPLVFAAYQLAFR Unmodified 1853.024 0.023976912 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 174.12 174.12 2;3 1.9167E-05 177996 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.717 64.907 873460000 0 0 26119000 0 75278000 0 137590000 26370000 238440000 0 206140000 112060000 51459000 14585 3926 13689 128509;128510;128511;128512;128513;128514;128515;128516;128517;128518;128519 163503;163504;163505;163506;163507;163508;163509;163510;163511;163512;163513;163514 163513 12 FTLRDEGK Unmodified 964.49779 0.49779495 2089 P15170;H3BR35 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A no no 0 0 1 1 1 1 1 1 19.47 19.47 2 3.8919E-05 11957 QUIQUE_DMIX8_190116_001 169.09 38.813 283830000 0 0 0 36342000 0 0 0 52543000 74219000 0 0 81307000 39418000 14586 2089 13690 128520;128521;128522;128523;128524 163515;163516;163517;163518;163519 163519 5 FTLSANVGDLK Unmodified 1163.6186 0.61863837 4140 Q9H269;Q5JUA9;Q5JUB0 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 85.832 85.832 2 0.030025 88730 QUIQUE_C1576_190116_001 57.348 9.0653 35118000 0 0 35118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14587 4140 13691 128525;128526;128527 163520;163521;163522 163522 3 FTLTQSEADADILFNFSHFK Unmodified 2330.1219 0.12191263 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 149.98 149.98 3 0.00055487 155277 QUIQUE_C1368_190116_001 67.312 64.097 385360000 0 0 96442000 43651000 0 0 113900000 0 0 15439000 115930000 0 0 14588 3049 13692 128528;128529;128530;128531;128532 163523;163524;163525;163526;163527 163523 3 FTMELAK Oxidation (M) 854.42079 0.42079019 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 22.014 22.014 2 0.029547 15375 QUIQUE_C1218_190116_001 97.068 59.115 1144500000 277550000 0 0 0 0 0 0 0 0 302790000 564160000 0 0 14589 1777 13693 128533;128534;128535 163528;163529;163530 163528 3 FTMVQVWPVR Unmodified 1261.6641 0.66414878 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.83 118.83 2 8.6762E-15 122946 QUIQUE_C1277_190116_001 176.4 136.4 10425000000 1310700000 1313300000 0 1222400000 0 0 1324500000 0 568760000 581500000 1471500000 1168100000 1464000000 14590 2414 13694 128536;128537;128538;128539;128540;128541;128542;128543;128544 163531;163532;163533;163534;163535;163536;163537;163538;163539;163540;163541;163542;163543;163544;163545;163546;163547 163533 16 FTMVQVWPVR Oxidation (M) 1277.6591 0.6590634 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 1 0 1 1 1 1 92.094 92.094 2 0.00098142 93912 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.57 90.417 496590000 90854000 102170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 128880000 174690000 14591 2414 13694 128545;128546;128547;128548 163548;163549;163550;163551;163552 163552 1822 4 FTPGTFTNQIQAAFR Unmodified 1697.8526 0.85255449 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 127.4 127.4 2;3 3.1094E-94 131314 QUIQUE_C1277_190116_001 215.56 191.31 7822800000 544050000 647520000 715210000 648210000 735400000 501170000 617620000 474410000 582250000 218570000 819230000 537780000 781330000 14592 225 13695 128549;128550;128551;128552;128553;128554;128555;128556;128557;128558;128559;128560;128561;128562;128563;128564;128565;128566;128567;128568;128569;128570;128571;128572;128573 163553;163554;163555;163556;163557;163558;163559;163560;163561;163562;163563;163564;163565;163566;163567;163568;163569;163570;163571;163572;163573;163574;163575;163576;163577;163578;163579;163580;163581;163582;163583;163584;163585 163555 33 FTPGTFTNQIQAAFREPR Unmodified 2080.049 0.049022463 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 1 1 114.88 114.88 3 0.00053682 119243 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.716 57.428 45061000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45061000 14593 225 13696 128574 163586 163586 1 FTPPAFIRPTR Unmodified 1301.7244 0.72444085 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.262 66.262 3 0.0013665 66277 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.763 69.551 658520000 44131000 77083000 53632000 52920000 70812000 0 63804000 42314000 55214000 15756000 59812000 45139000 77906000 14594 4522 13697 128575;128576;128577;128578;128579;128580;128581;128582;128583;128584;128585;128586 163587;163588;163589;163590;163591;163592;163593;163594;163595;163596;163597;163598;163599;163600;163601;163602;163603;163604;163605 163601 19 FTPPLEDSCFHYGFNSNYLK Unmodified 2435.0892 0.089232298 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.71 120.71 3 0.00011274 124208 QUIQUE_C1403_190116_001 64.83 42.004 893730000 156000000 105530000 0 119510000 0 104120000 144330000 123920000 107960000 32361000 0 0 0 14595 1912 13698 128587;128588;128589;128590;128591;128592;128593;128594 163606;163607;163608;163609;163610;163611;163612;163613 163608 6 FTPSPVDFTITPETLQNVK Unmodified 2133.0994 0.099386279 562 A8MTY9;O14972;A8MY26 DSCR3 Down syndrome critical region protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 135.84 135.84 2 6.6583E-11 141719 QUIQUE_C1576_190116_001 113.54 100.4 196100000 30658000 0 0 0 0 0 35205000 29429000 0 0 38724000 26089000 35990000 14596 562 13699 128595;128596;128597;128598;128599;128600 163614;163615;163616;163617;163618;163619 163615 6 FTPTTIYPTDRR Unmodified 1466.7518 0.75177781 683 C9J069 C9orf172 Uncharacterized protein C9orf172 yes yes 0 0 1 1 47.282 47.282 3 0.012244 45364 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.568 37.923 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14597 683 13700 128601 163620 163620 1 FTPVDESVTFIGR Unmodified 1466.7405 0.74054442 2942 Q12768;E7EQI7 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes no 0 0 0 1 1 1 1 106.94 106.94 2 0.0040517 109261 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.658 74.971 124370000 0 0 0 0 0 0 22980000 28865000 0 0 36432000 36095000 0 14598 2942 13701 128602;128603;128604;128605 163621;163622;163623;163624 163622 2 FTQAGSEVSALLGR Unmodified 1434.7467 0.74669243 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 3 1 1 1 1 3 2 1 1 2 2 1 1 99.801 99.801 2;3 7.0371E-18 102607 QUIQUE_C1368_190116_001 185.18 164.31 47923000000 5003200000 3654500000 4338100000 3065300000 3105800000 4081300000 3959900000 3439200000 3774600000 1824300000 4387700000 3953200000 3336200000 14599 1900;1046 13702 128606;128607;128608;128609;128610;128611;128612;128613;128614;128615;128616;128617;128618;128619;128620;128621;128622;128623;128624;128625 163625;163626;163627;163628;163629;163630;163631;163632;163633;163634;163635;163636;163637;163638;163639;163640;163641;163642;163643;163644;163645;163646;163647;163648;163649;163650;163651;163652;163653;163654;163655;163656;163657;163658;163659;163660;163661;163662;163663;163664;163665;163666;163667;163668 163636 39 FTQDTQPHYIYSPR Unmodified 1751.8267 0.82673367 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 50.152 50.152 2;3 3.0617E-58 47277 QUIQUE_C1368_190116_001 199.96 168.32 2426000000 0 114330000 285100000 164320000 0 136670000 208820000 287280000 283630000 101170000 326150000 254940000 263560000 14600 3053 13703 128626;128627;128628;128629;128630;128631;128632;128633;128634;128635;128636;128637;128638;128639;128640;128641;128642;128643;128644;128645;128646 163669;163670;163671;163672;163673;163674;163675;163676;163677;163678;163679;163680;163681;163682;163683;163684;163685;163686;163687;163688;163689;163690;163691 163673 22 FTQISPVWLQLK Unmodified 1458.8235 0.82348619 4057 Q9BWS9;E9PI70;E9PIP0;E9PRL3;E9PPH0;E9PPA0 CHID1 Chitinase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 130.61 130.61 2 0.0036395 134661 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.36 96.943 155740000 52120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 65196000 38419000 0 14601 4057 13704 128647;128648;128649 163692;163693;163694 163694 1 FTQQDIDEAK Unmodified 1193.5564 0.55643205 3276 Q5JRX3;A0A0A0MRX9;B1APQ0 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 34.925 34.925 2 0.001766 30756 QUIQUE_C1218_190116_001 93.701 74.635 70122000 31176000 38946000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14602 3276 13705 128650;128651 163695;163696 163695 2 FTQSYDYLTDEEER Unmodified 1794.7584 0.75843891 3265 Q59EK9 RUNDC3A RUN domain-containing protein 3A yes yes 0 0 0 1 83.568 83.568 2 0.00023222 84692 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.103 87.798 19227000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19227000 0 14603 3265 13706 128652 163697 163697 1 FTSIPCSQPQHK Unmodified 1428.682 0.68198369 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 0 1 22.447 22.447 3 0.047128 15926 QUIQUE_C1368_190116_001 26.969 19.104 28996000 0 0 28996000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14604 4278 13707 128653 163698 163698 1 FTSSPGLSTEDLK Unmodified 1380.6773 0.67727546 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;A0A2R8YGH2;A0A2R8Y4K4;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 62.761 62.761 2 0.018525 61933 QUIQUE_C1277_190116_001 75.416 56.809 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14605 472;1460 13708 128654 163699 163699 1 FTSSPGLSTEDLKR Unmodified 1536.7784 0.77838649 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;A0A2R8YGH2;A0A2R8Y4K4;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 47.846 47.846 2;3 0.00023528 45284 QUIQUE_C1277_190116_001 110.86 85.471 351050000 0 20710000 0 0 0 0 19220000 82912000 162210000 0 37529000 28469000 0 14606 472;1460 13709 128655;128656;128657;128658;128659;128660;128661 163700;163701;163702;163703;163704;163705;163706 163700 7 FTTDAIALAMSR Unmodified 1295.6544 0.65437195 283 A2ACR1;A0A0G2JJA7;P28065 PSMB9 Proteasome subunit beta type;Proteasome subunit beta type-9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.09 106.09 2 0.00035282 111066 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.57 88.27 787000000 0 0 98469000 82172000 85753000 49076000 51336000 74048000 82488000 0 88241000 75742000 99676000 14607 283 13710 128662;128663;128664;128665;128666;128667;128668;128669;128670;128671 163707;163708;163709;163710;163711;163712;163713;163714;163715;163716 163714 7 FTTDDSICVLGISK Unmodified 1554.76 0.75995923 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.36 105.36 2 0.0013723 102685 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.814 71.548 1789300000 197520000 215110000 205580000 227820000 157640000 151920000 0 97538000 0 95009000 126100000 152320000 162710000 14608 2861 13711 128672;128673;128674;128675;128676;128677;128678;128679;128680;128681;128682 163717;163718;163719;163720;163721;163722;163723;163724;163725;163726;163727;163728;163729;163730 163727 12 FTTDLDSPR Unmodified 1050.4982 0.49818889 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 43.673 43.673 2 0.00043335 40222 QUIQUE_C1403_190116_001 133.68 86.845 2139500000 68121000 50835000 123200000 56040000 103120000 151080000 91567000 200790000 372480000 101080000 297920000 235990000 287260000 14609 2233 13712 128683;128684;128685;128686;128687;128688;128689;128690;128691;128692;128693;128694;128695;128696;128697;128698 163731;163732;163733;163734;163735;163736;163737;163738;163739;163740;163741;163742;163743;163744;163745;163746;163747;163748;163749;163750;163751;163752 163738 22 FTTGDAMSK Unmodified 956.42733 0.42733213 3040 Q14019 COTL1 Coactosin-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 23.306 23.306 1;2 0.0079259 16906 QUIQUE_C1438_190116_001 80.219 58.291 2887800000 264570000 0 325950000 198760000 206310000 228190000 0 317100000 350970000 107140000 397890000 0 490940000 14610 3040 13713 128699;128700;128701;128702;128703;128704;128705;128706;128707;128708;128709 163753;163754;163755;163756;163757;163758;163759;163760;163761;163762;163763;163764 163757 10 FTTGDAMSKR Unmodified 1112.5284 0.52844316 3040 Q14019 COTL1 Coactosin-like protein yes yes 0 0 1 2 1 1 19.107 19.107 2;3 0.0013821 12211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.848 54.623 255110000 0 0 0 0 0 0 0 177900000 0 0 43387000 0 33827000 14611 3040 13714 128710;128711;128712;128713 163765;163766;163767;163768;163769 163767 5 FTTLEGLLK Unmodified 1020.5855 0.58554733 1226 H7C0E5;O75312;H7BZM7 ZPR1 Zinc finger protein ZPR1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 104.21 104.21 2 0.0255 107847 QUIQUE_C1576_190116_001 59.245 36.226 54494000 13500000 13221000 0 15066000 0 0 12708000 0 0 0 0 0 0 14612 1226 13715 128714;128715;128716;128717 163770;163771;163772;163773 163773 4 FTTYEIR Unmodified 928.46543 0.46543219 1578 O60493 SNX3 Sorting nexin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 47.487 47.487 2 0.01962 44040 QUIQUE_C1403_190116_001 118.69 96.064 375780000 0 0 0 155740000 0 153510000 0 0 0 66527000 0 0 0 14613 1578 13716 128718;128719;128720;128721 163774;163775;163776;163777;163778 163774 5 FTVAELK Unmodified 806.4538 0.45380487 2996 Q13435;E9PPJ0 SF3B2 Splicing factor 3B subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 53.223 53.223 2 0.037414 51469 QUIQUE_C1218_190116_001 85.359 50.159 132620000 49457000 41105000 0 0 0 0 0 42055000 0 0 0 0 0 14614 2996 13717 128722;128723;128724 163779;163780;163781 163779 3 FTVAMSPELIQQFLQATVSGLHETQPPSVR Unmodified 3310.702 0.70199743 3915 Q96P70 IPO9 Importin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 169.54 169.54 3;4 3.5403E-88 176791 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.29 158.11 367780000 34351000 21166000 0 0 35765000 0 33586000 0 19003000 0 128660000 95253000 0 14615 3915 13718 128725;128726;128727;128728;128729;128730;128731 163782;163783;163784;163785;163786;163787;163788 163787 7 FTVDGIPYFVDHNR Unmodified 1678.8104 0.81035532 3884 Q96J02 ITCH E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog yes yes 0 0 0 1 107.81 107.81 3 0.061781 110687 QUIQUE_C1403_190116_001 39.509 36.253 20498000 0 0 0 20498000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14616 3884 13719 128732 163789 163789 0 FTVDQTQTPSLK Unmodified 1363.6983 0.69834526 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4I5;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.414 61.414 2 0.00080913 61157 QUIQUE_C1438_190116_001 112.3 84.087 579590000 0 79518000 74856000 0 50771000 49336000 0 62477000 0 20556000 105330000 74004000 62736000 14617 310;830 13720 128733;128734;128735;128736;128737;128738;128739;128740;128741 163790;163791;163792;163793;163794;163795;163796;163797;163798;163799 163792 10 FTVIYNEQMASK Oxidation (M) 1445.6861 0.68606601 1159 H0YI09;Q9H8H3;F8VQX6 METTL7A Methyltransferase-like protein 7A yes no 0 1 0 1 1 57.559 57.559 2 0.0055553 55752 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.485 26.172 472560000 0 0 0 0 0 0 0 228980000 243580000 0 0 0 0 14618 1159 13721 128742;128743 163800;163801 163800 676 2 FTVLLMPNGPMR Unmodified 1374.7152 0.71519807 4530 Q9UQ80 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.33 117.33 2 0.00044811 121090 QUIQUE_C1277_190116_001 110.41 79.795 479830000 46182000 52362000 57060000 38655000 40480000 47756000 42690000 0 0 0 62657000 29237000 62753000 14619 4530 13722 128744;128745;128746;128747;128748;128749;128750;128751;128752;128753 163802;163803;163804;163805;163806;163807;163808;163809;163810;163811;163812;163813 163803 10 FTVLTESAAK Unmodified 1065.5706 0.57062555 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.688 47.688 2 0.00023561 44782 QUIQUE_C1563_190116_001 117.89 87.705 13285000000 1234000000 1366300000 968120000 898460000 1113700000 836200000 2017200000 0 674780000 820040000 1257600000 836960000 1261500000 14620 1916 13723 128754;128755;128756;128757;128758;128759;128760;128761;128762;128763;128764;128765 163814;163815;163816;163817;163818;163819;163820;163821;163822;163823;163824;163825;163826;163827;163828;163829;163830;163831;163832 163821 19 FTVNLSGCPR Unmodified 1149.5601 0.56007764 4020 Q9BTE3 MCMBP Mini-chromosome maintenance complex-binding protein yes yes 0 0 0 1 62.598 62.598 2 0.043709 61631 QUIQUE_C1403_190116_001 59.35 25.799 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14621 4020 13724 128766 163833 163833 1 FTVPMLK Unmodified 834.46735 0.46734645 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.473 82.473 2 0.031782 84442 QUIQUE_C1368_190116_001 89.673 65.487 227570000 0 0 54901000 0 0 9315500 0 0 31615000 0 52040000 46433000 33262000 14622 2050 13725 128767;128768;128769;128770;128771;128772 163834;163835;163836;163837;163838;163839 163834 6 FTVTTGHYTIK Unmodified 1266.6608 0.66083754 2511 P48553 TRAPPC10 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 46.742 46.742 3 0.0032442 44334 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.343 32.35 151660000 0 26059000 24447000 0 0 0 0 22047000 22754000 8329400 48026000 0 0 14623 2511 13726 128773;128774;128775;128776;128777;128778;128779 163840;163841;163842;163843;163844;163845;163846 163843 7 FTVVVATQLPESTSLR Unmodified 1746.9516 0.95159983 3012 Q13564;J3QRA5;J3KRK3 NAE1 NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 108.6 108.6 2 3.1099E-29 113659 QUIQUE_DMIX5_190116_001 197.3 185.43 604840000 0 0 102420000 0 0 82992000 0 78598000 64175000 54303000 72621000 79915000 69816000 14624 3012 13727 128780;128781;128782;128783;128784;128785;128786;128787 163847;163848;163849;163850;163851;163852;163853;163854 163852 7 FTYGFQNIVDAYGIGTYR Unmodified 2084.0003 0.0003409361 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;F5H1T6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 150.64 150.64 2;3 9.8248E-11 155996 QUIQUE_C1368_190116_001 118.24 108.71 885980000 0 0 124150000 163860000 88031000 92111000 146450000 22101000 0 0 18870000 0 230410000 14625 3780 13728 128788;128789;128790;128791;128792;128793;128794;128795;128796;128797;128798 163855;163856;163857;163858;163859;163860;163861;163862;163863;163864;163865;163866;163867;163868 163856 14 FTYYTILDIFR Unmodified 1450.7497 0.74965254 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 166.01 166.01 2 1.8712E-08 173209 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.84 127.12 151430000 0 0 0 0 0 5554800 18085000 0 31416000 0 42574000 30322000 23477000 14626 3822 13729 128799;128800;128801;128802;128803;128804 163869;163870;163871;163872;163873;163874;163875 163873 7 FVADEELVHLLLDEVVASAALR Unmodified 2408.2951 0.29512597 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 172.54 172.54 3 2.482E-09 177736 QUIQUE_C1576_190116_001 96.718 84.93 316930000 0 0 0 0 0 0 123110000 0 27917000 0 64049000 101850000 0 14627 4449 13730 128805;128806;128807;128808 163876;163877;163878;163879 163876 4 FVADGIFK Unmodified 895.48035 0.48035398 2214 P23396;E9PL09;E9PPU1;F2Z2S8;H0YCJ7;E9PQ96;E9PJH4;E9PK82;E9PQX2 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 79.139 79.139 2 0.020244 79863 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.058 56.198 216160000 0 0 0 113590000 0 0 0 102580000 0 0 0 0 0 14628 2214 13731 128809;128810 163880;163881;163882 163882 3 FVADLWK Unmodified 877.46979 0.46978929 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 86.176 86.176 2 0.057389 88389 QUIQUE_C1368_190116_001 70.912 53.218 25979000 0 0 25979000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14629 2385 13732 128811 163883 163883 1 FVAFSGEGQSLR Unmodified 1296.6463 0.64625011 3764 Q92890 UFD1L Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 69.068 69.068 2 0.002367 69856 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.706 59.258 52195000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52195000 14630 3764 13733 128812;128813;128814;128815;128816 163884;163885;163886;163887;163888 163886 5 FVAISDLYEPIDDGCESQVFCSCSYDATTHFETTCNDIK Unmodified 4593.9233 0.92329705 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 0 1 147.6 147.6 4 1.2925E-10 150348 QUIQUE_C1563_190116_001 61.372 60.138 26099000 0 0 0 0 0 26099000 0 0 0 0 0 0 0 14631 2328 13734 128817 163889 163889 1 FVALASNEK Unmodified 977.5182 0.51819605 1393 O00273;K7ERT1 DFFA DNA fragmentation factor subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 28.995 28.995 2 0.00040551 23436 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.18 74.143 274680000 0 0 0 0 0 0 0 0 76252000 0 102390000 0 96039000 14632 1393 13735 128818;128819;128820 163890;163891;163892;163893 163893 3 FVALENISCK Unmodified 1179.5958 0.59579444 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 67.036 67.036 2 0.0016837 66956 QUIQUE_C1403_190116_001 94.692 74.171 110610000 0 0 0 33373000 0 27924000 0 0 0 0 0 0 49308000 14633 3660 13736 128821;128822;128823;128824;128825 163894;163895;163896;163897;163898 163894 5 FVALICEASGGGAFLVLPLGK Unmodified 2118.1547 0.15473309 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0;H3BNA2;H3BU76;H3BSL1 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 167.59 167.59 2 0.0014086 171712 QUIQUE_C1218_190116_001 84.892 65.76 22617000 13469000 0 0 9147200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14634 2327 13737 128826;128827 163899;163900 163899 2 FVAPEEVLPFTEGDILEK Unmodified 2032.0405 0.040474416 2545 P49770 EIF2B2 Translation initiation factor eIF-2B subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 147.73 147.73 2;3 4.2892E-05 152997 QUIQUE_C1368_190116_001 95.264 83.496 583190000 23241000 58721000 57124000 74305000 0 55238000 68511000 60260000 0 0 77047000 52048000 56691000 14635 2545 13738 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lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 1 1 39.873 39.873 3 0.046805 36528 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.137 9.193 33926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33926000 0 0 14642 2911 13745 128889 163970 163970 1 FVCSPDEVMDTIDEGK Unmodified 1840.7859 0.78591599 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 113.35 113.35 2 0.00043289 116862 QUIQUE_C1277_190116_001 101.39 83.122 190940000 0 36398000 45111000 0 36730000 33565000 39141000 0 0 0 0 0 0 14643 2355 13746 128890;128891;128892;128893;128894 163971;163972;163973;163974;163975 163971 5 FVDDLFETIFSTAHR Unmodified 1796.8733 0.87334951 4227;4452 Q9HCM2;Q9UIW2 PLXNA4;PLXNA1 Plexin-A4;Plexin-A1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 151.7 151.7 3 6.7446E-08 158611 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.5 96.795 1060900000 70932000 83069000 87556000 69531000 64253000 41604000 95396000 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124596 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.754 85.47 21641000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21641000 0 0 0 14654 1868 13756 128959 164052 164052 1 FVDILGLR Unmodified 931.5491 0.54910224 35 A0A087WUB9;Q8WYA6 CTNNBL1 Beta-catenin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.67 111.67 2 0.0036687 115048 QUIQUE_C1277_190116_001 124.89 67.424 26713000 0 26713000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14655 35 13757 128960;128961;128962;128963;128964;128965;128966;128967;128968;128969;128970 164053;164054;164055;164056;164057;164058;164059;164060;164061;164062;164063 164054 11 FVDILTNWYVR Unmodified 1424.7452 0.74523587 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.11 144.11 2 0.00044387 151058 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.62 79.369 351880000 22247000 24596000 20786000 19296000 26844000 18036000 28462000 0 47779000 20427000 46030000 42166000 35209000 14656 2441 13758 128971;128972;128973;128974;128975;128976;128977;128978;128979;128980;128981;128982 164064;164065;164066;164067;164068;164069;164070;164071;164072;164073;164074;164075;164076;164077;164078;164079 164077 16 FVDLYGAQK Unmodified 1039.5338 0.53384611 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.654 56.654 2 1.7508E-06 55180 QUIQUE_C1368_190116_001 154.35 109.74 4645900000 367580000 319050000 577020000 370210000 316190000 0 395100000 311020000 411750000 281670000 462260000 414770000 419310000 14657 1153 13759 128983;128984;128985;128986;128987;128988;128989;128990;128991;128992;128993;128994 164080;164081;164082;164083;164084;164085;164086;164087;164088;164089;164090;164091;164092;164093;164094;164095 164082 15 FVDPSQDHALAK Unmodified 1326.6568 0.65681479 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02;H0Y7R8 MLLT4 Afadin yes no 0 0 0 1 32.494 32.494 3 0.049705 27192 QUIQUE_C1277_190116_001 20.825 11.291 35790000 0 35790000 0 0 0 0 0 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Unmodified 1260.6543 0.6542956 3174 Q16222 UAP1 UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylgalactosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.43 159.43 2 0.00013875 163651 QUIQUE_C1277_190116_001 121.85 92.763 158650000 13640000 16173000 19576000 0 20414000 0 19778000 15590000 0 0 21194000 19208000 13079000 14680 3174 13781 129180;129181;129182;129183;129184;129185;129186;129187;129188;129189 164325;164326;164327;164328;164329;164330;164331;164332;164333;164334;164335 164327 11 FVFDRPLPVSR Unmodified 1331.735 0.73500553 2244 P25786;F5GX11;B4DEV8 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1;Proteasome subunit alpha type yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 75.082 75.082 2;3 0.00010009 77319 QUIQUE_C1218_190116_001 105.13 87.325 4602800000 519340000 299350000 301190000 346550000 346450000 307080000 274780000 460310000 341050000 181270000 569300000 320250000 335850000 14681 2244 13782 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164392;164393;164394;164395;164396;164397;164398;164399;164400;164401;164402;164403;164404;164405;164406;164407;164408;164409;164410;164411;164412;164413;164414;164415;164416;164417;164418;164419;164420;164421 164402 30 FVFSLVDAMNGK Oxidation (M) 1342.6591 0.65912298 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 105.13 105.13 2 0.00052454 108706 QUIQUE_C1368_190116_001 110.88 95.001 2215700000 184940000 191560000 176800000 0 138150000 129580000 0 310340000 217280000 126760000 266800000 253380000 220130000 14686 2431 13786 129233;129234;129235;129236;129237;129238;129239;129240;129241;129242;129243;129244 164422;164423;164424;164425;164426;164427;164428;164429;164430;164431;164432;164433;164434;164435 164424 1855 11 FVGAVDPIMEK Unmodified 1204.6162 0.61619553 1864 P04424 ASL Argininosuccinate lyase yes yes 0 0 0 1 75.367 75.367 2 0.054368 76179 QUIQUE_C1368_190116_001 45.137 30.374 55421000 0 0 55421000 0 0 0 0 0 0 0 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yes yes 0 0 0 1 1 1 61.202 61.202 2;3 0.0050264 59273 QUIQUE_C1563_190116_001 63.624 45.76 69092000 0 46247000 0 0 0 22845000 0 0 0 0 0 0 0 14690 3245 13790 129261;129262;129263 164455;164456;164457 164457 3 FVGFPDK Unmodified 808.41194 0.41194006 2006 P10915 HAPLN1 Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 55.149 55.149 2 0.048295 54059 QUIQUE_C1218_190116_001 76.035 60.814 106540000 40139000 37888000 28515000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14691 2006 13791 129264;129265;129266 164458;164459;164460 164458 3 FVGFPDKK Unmodified 936.5069 0.50690308 2006 P10915 HAPLN1 Hyaluronan and proteoglycan link protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 56.172 56.172 2 0.038555 53176 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.912 45.914 1261500000 0 0 0 0 0 0 0 0 377690000 133500000 414650000 335630000 0 14692 2006 13792 129267;129268;129269;129270 164461;164462;164463;164464 164462 4 FVGGIAQIIAAQEEMLK Unmodified 1816.9757 0.97570609 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 156.72 156.72 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mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 2 2 2 1 2 103.57 103.57 3;4 6.2572E-06 107046 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.236 83.506 696550000 0 0 70481000 0 19985000 0 43739000 79623000 129270000 0 181050000 59488000 112910000 14697 1360 13797 129314;129315;129316;129317;129318;129319;129320;129321;129322;129323;129324;129325 164512;164513;164514;164515;164516;164517;164518;164519;164520;164521;164522;164523;164524 164517 11 FVGPGGYNLK Unmodified 1050.5498 0.54983053 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 59.681 59.681 2 0.057516 59109 QUIQUE_C1576_190116_001 65.676 51.162 18389000 0 0 0 0 0 0 18389000 0 0 0 0 0 0 14698 3675 13798 129326 164525 164525 0 FVGQDVEGER Unmodified 1134.5306 0.53055165 476 A0A3B3IRI2;P17812;B4E1E0 CTPS1 CTP synthase 1;CTP synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.439 34.439 2 0.0095369 29975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.1 43.928 413460000 0 83457000 37951000 0 60170000 0 61869000 0 40434000 30970000 0 46304000 52307000 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A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A087WY74 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 0 1 2 2 2 3 2 1 1 2 2 2 2 98.86 98.86 2;3;4 4.061E-18 102712 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.718 81.477 2791700000 98772000 282830000 276910000 257510000 282910000 209630000 152650000 88509000 251820000 0 312560000 274800000 302750000 14702 456 13802 129348;129349;129350;129351;129352;129353;129354;129355;129356;129357;129358;129359;129360;129361;129362;129363;129364;129365;129366;129367;129368;129369 164547;164548;164549;164550;164551;164552;164553;164554;164555;164556;164557;164558;164559;164560;164561;164562;164563;164564;164565;164566;164567;164568;164569;164570;164571;164572 164566 23 FVHTSFHGVGHDYVQLAFK Unmodified 2188.0854 0.08540797 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 76.943 76.943 3;4 5.9999E-05 77875 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.793 55.757 1506200000 0 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FVIFPIQYPDIWK Unmodified 1664.8967 0.89665113 3449 Q7LG56;H0YAV1 RRM2B Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.23 163.23 2 0.00047983 167615 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.943 82.689 564380000 41192000 48745000 56147000 56676000 53047000 34432000 58891000 42204000 56819000 13409000 55490000 0 47326000 14706 3449 13806 129391;129392;129393;129394;129395;129396;129397;129398;129399;129400;129401;129402 164597;164598;164599;164600;164601;164602;164603;164604;164605;164606;164607;164608 164605 12 FVIFPTDLEIYK Unmodified 1483.7963 0.79626839 3550 Q8IXQ6 PARP9 Poly [ADP-ribose] polymerase 9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 146.36 146.36 2 0.0006638 152294 QUIQUE_C1218_190116_001 98.048 82.477 190100000 19178000 25085000 0 28617000 20695000 0 0 32503000 0 0 45251000 0 18770000 14707 3550 13807 129403;129404;129405;129406;129407;129408;129409 164609;164610;164611;164612;164613;164614;164615;164616 164609 7 FVIGGPQGDAGLTGR Unmodified 1443.747 0.74702678 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.337 80.337 2 1.3397E-08 81303 QUIQUE_C1277_190116_001 132.32 94.847 4213000000 336040000 385390000 415260000 380270000 324130000 304350000 314360000 367260000 376170000 194160000 409930000 405710000 0 14708 2329 13808 129410;129411;129412;129413;129414;129415;129416;129417;129418;129419;129420;129421;129422;129423 164617;164618;164619;164620;164621;164622;164623;164624;164625;164626;164627;164628;164629;164630;164631;164632;164633;164634;164635;164636;164637;164638 164619 22 FVIGGPQGDAGLTGRK Unmodified 1571.842 0.8419898 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 1 1 57.719 57.719 3 6.9595E-05 55693 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.148 70.209 59890000 0 0 0 0 0 0 0 59890000 0 0 0 0 0 14709 2329 13809 129424 164639 164639 1 FVIHCNSPVWGADKCEELLEK Unmodified 2530.1985 0.19846517 1626 O75367;B4DJC3 H2AFY Core histone macro-H2A.1;Histone H2A yes no 0 0 1 1 1 90.041 90.041 3 3.9852E-23 92929 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.32 113.36 57821000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57821000 0 0 14710 1626 13810 129425;129426 164640;164641 164640 2 FVIKPIDK Unmodified 958.58515 0.5851534 859;2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.328 35.328 2 0.024073 30974 QUIQUE_C1368_190116_001 122.74 48.303 4948800000 0 0 977590000 0 0 862810000 936500000 0 853130000 0 652890000 0 665860000 14711 2248;434;859 13811 129427;129428;129429;129430;129431;129432 164642;164643;164644;164645;164646;164647 164642 4 FVIKPIDKK Unmodified 1086.6801 0.68011642 859;2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 0 2 1 20.233 20.233 2 0.051084 13193 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.23 45.912 582040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 582040000 0 0 14712 2248;434;859 13812 129433 164648 164648 0 FVINYDYPNSSEDYIHR Unmodified 2130.9647 0.96468371 1290 J3KTA4;P17844 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 98.204 98.204 2;3 1.4954E-29 101025 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.1 138.23 1063300000 0 76701000 137490000 109450000 84977000 72227000 74689000 72718000 76358000 44017000 96494000 138330000 79821000 14713 1290 13813 129434;129435;129436;129437;129438;129439;129440;129441;129442;129443;129444;129445;129446;129447 164649;164650;164651;164652;164653;164654;164655;164656;164657;164658;164659;164660;164661;164662;164663;164664;164665 164659 17 FVINYDYPNSSEDYVHR Unmodified 2116.949 0.94903365 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 92.335 92.335 2;3 5.2641E-23 95417 QUIQUE_C1218_190116_001 184.1 166.43 1762100000 178500000 210480000 170300000 147730000 135310000 126400000 127060000 136430000 151330000 66777000 0 162400000 149410000 14714 381 13814 129448;129449;129450;129451;129452;129453;129454;129455;129456;129457;129458;129459;129460;129461;129462;129463 164666;164667;164668;164669;164670;164671;164672;164673;164674;164675;164676;164677;164678;164679;164680;164681 164667 15 FVIPDFMSFTSHIDELYESAK Oxidation (M) 2491.1617 0.16172854 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 2 2 1 1 2 1 1 163.13 163.13 3 5.4461E-09 165043 QUIQUE_C1563_190116_001 102.07 94.852 533730000 41177000 100230000 0 89949000 39570000 52098000 134600000 14678000 0 0 0 61425000 0 14715 1700 13815 129464;129465;129466;129467;129468;129469;129470;129471;129472;129473;129474 164682;164683;164684;164685;164686;164687;164688;164689;164690;164691;164692 164688 934 11 FVIPDFMSFTSHIDELYESAK Unmodified 2475.1668 0.16681392 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.47 167.47 3 8.4759E-36 171054 QUIQUE_C1277_190116_001 146.64 138.92 2203300000 94520000 135470000 115790000 37451000 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114611 QUIQUE_C1218_190116_001 63.578 54.934 63809000 37708000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26101000 0 0 14721 3443 13820 129505;129506 164725;164726 164725 2 FVLCPECENPETDLHVNPK Unmodified 2297.0457 0.045652924 2653 P55010;H0YLZ1;H0YN40 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes no 0 0 0 3 1 1 1 2 1 1 1 87.977 87.977 3 3.9967E-07 90016 QUIQUE_C1277_190116_001 102.58 95.183 349150000 0 129070000 0 75196000 68805000 76080000 0 0 0 0 0 0 0 14722 2653 13821 129507;129508;129509;129510;129511;129512;129513;129514;129515;129516;129517 164727;164728;164729;164730;164731;164732;164733;164734;164735;164736;164737 164728 10 FVLDHEDGLNLNEDLENFLQK Unmodified 2501.2074 0.20743318 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 153.33 153.33 3 1.7776E-08 160542 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.02 85.248 331640000 0 0 70640000 45446000 50738000 0 43901000 0 0 0 74009000 46902000 0 14723 3091 13822 129518;129519;129520;129521;129522;129523 164738;164739;164740;164741;164742;164743 164742 6 FVLDYHFEEVQK Unmodified 1552.7562 0.75619449 3853 Q96FN4 CPNE2 Copine-2 yes yes 0 0 0 1 1 92.53 92.53 3 0.035211 95262 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.806 11.671 31848000 0 0 12378000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19470000 14724 3853 13823 129524;129525 164744;164745 164745 2 FVLELPDCTLAHFALGADAPGDADAPDPR Unmodified 3050.4444 0.44438576 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 154.53 154.53 3 1.1302E-15 159504 QUIQUE_C1218_190116_001 78.429 68.97 29236000 29236000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14725 3269 13824 129526 164746;164747 164746 2 FVLHAVQLVK Unmodified 1152.7019 0.70191449 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 66.762 66.762 2;3 0.00091183 67144 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.136 62.342 574670000 46268000 50647000 45651000 41291000 44584000 32845000 29116000 48200000 42916000 23855000 52220000 50523000 66554000 14726 2285 13825 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10 FVPFAAVAAANCINIPLMR Unmodified 2074.0856 0.085607665 163;4195 Q9H9B4;A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5 SFXN1;SFXN3 Sideroflexin-1;Sideroflexin;Sideroflexin-3 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 157.45 157.45 2;3 1.2243E-16 163508 QUIQUE_C1576_190116_001 161.62 133.27 3172700000 109170000 221730000 231580000 112510000 207900000 147850000 254960000 364710000 198840000 20620000 541470000 452840000 308540000 14753 4195;163 13849 129723;129724;129725;129726;129727;129728;129729;129730;129731;129732;129733;129734;129735;129736;129737;129738;129739;129740;129741;129742;129743;129744;129745;129746;129747 164971;164972;164973;164974;164975;164976;164977;164978;164979;164980;164981;164982;164983;164984;164985;164986;164987;164988;164989;164990;164991;164992;164993;164994;164995;164996;164997;164998;164999 164985 25 FVPFPAVASANICNVVLMR Unmodified 2104.0962 0.096172352 3679 Q8TD22 SFXN5 Sideroflexin-5 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 1 3 1 2 2 2 153.92 153.92 2;3 6.421E-06 158859 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Unmodified 835.44397 0.44396847 3202 Q16851;C9J6Q0 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 24.924 24.924 2 0.061225 18711 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.915 24.304 162390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 162390000 0 0 14761 3202 13857 129809 165075 165075 1 FVQDTLK Unmodified 849.45962 0.45961853 1536 O43617;A0A087WWM0;A0A087WYS5 TRAPPC3 Trafficking protein particle complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 27.908 27.908 2 0.055848 22156 QUIQUE_C1576_190116_001 71.715 20.678 80457000 0 0 0 0 0 0 80457000 0 0 0 0 0 0 14762 1536 13858 129810 165076 165076 1 FVQDTLKGDGVTEIR Unmodified 1676.8733 0.87334951 1536 O43617;A0A087WWM0;A0A087WYS5 TRAPPC3 Trafficking protein particle complex subunit 3 yes no 0 0 1 2 1 63.05 63.05 2;3 7.2872E-09 62232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.24 90.598 103740000 0 0 0 0 0 0 0 53252000 0 0 0 50492000 0 14763 1536 13859 129811;129812;129813 165077;165078;165079 165078 2 FVQLINTVLNGDQHFMSALDK Unmodified 2389.21 0.21001614 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 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129908;129909;129910;129911;129912;129913;129914;129915;129916;129917;129918 165191;165192;165193;165194;165195;165196;165197;165198;165199;165200;165201;165202;165203;165204 165203 12 FVSSPEEVMDVIDEGK Unmodified 1779.8237 0.8236817 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 134.27 134.27 2 0.00013633 138371 QUIQUE_C1403_190116_001 95.417 77.944 162910000 0 0 37822000 33157000 0 0 0 0 22322000 0 42886000 26724000 0 14778 1568 13873 129919;129920;129921;129922;129923 165205;165206;165207;165208;165209 165206 1 FVSSPQTIVELFFQEVAR Unmodified 2096.0942 0.094241321 1071 G3V198;Q12769;E9PR16 NUP160 Nuclear pore complex protein Nup160 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 173.72 173.72 2;3 0.0028553 177954 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.624 60.423 76896000 0 11292000 4425600 0 0 0 7128000 17787000 0 0 0 21430000 14835000 14779 1071 13874 129924;129925;129926;129927;129928;129929;129930;129931 165210;165211;165212;165213;165214;165215;165216;165217;165218 165216 9 FVTAIWNLLVTTGQEVK Unmodified 1918.0564 0.056399252 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 165.34 165.34 2;3 2.4865E-23 168979 QUIQUE_C1277_190116_001 107.73 100.42 157030000 16370000 32571000 0 14726000 0 0 16835000 20293000 27243000 0 0 28989000 0 14780 2657 13875 129932;129933;129934;129935;129936;129937;129938;129939;129940 165219;165220;165221;165222;165223;165224;165225;165226;165227 165220 9 FVTDSNAVVQLK Unmodified 1319.7085 0.70851601 3037 Q14008;E9PQH5 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 71.613 71.613 2 0.0054325 72084 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.321 49.225 160540000 0 0 0 0 0 0 0 31815000 51708000 0 77015000 0 0 14781 3037 13876 129941;129942;129943 165228;165229;165230 165229 3 FVTHVSDWGALATISTLEAVR Unmodified 2272.1852 0.18518159 479 A0A3B3IRL2;O75629 CREG1 Protein CREG1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 144.29 144.29 3 2.4389E-05 148842 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.209 45.925 425750000 0 0 111310000 0 0 0 70624000 0 59537000 0 93974000 90305000 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165249;165250;165251;165252;165253;165254;165255 165250 7 FVTLSATNAK Unmodified 1050.571 0.5709599 3938 Q96S55 WRNIP1 ATPase WRNIP1 yes yes 0 0 0 1 1 1 39.796 39.796 2 0.0039024 35814 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.75 62.23 56504000 23590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32914000 0 0 14785 3938 13880 129964;129965;129966 165256;165257;165258 165258 3 FVTQAEGAK Unmodified 949.4869 0.48689592 1854 P04114 APOB Apolipoprotein B-100;Apolipoprotein B-48 yes yes 0 0 0 1 16.365 16.365 2 0.0062107 8531 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.916 16.935 17411000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17411000 0 0 0 14786 1854 13881 129967 165259 165259 1 FVTSNTQELGK Unmodified 1222.6194 0.61936665 4063 Q9BXP5;H7C3A1 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.758 33.758 2 0.0004904 28054 QUIQUE_C1368_190116_001 108.57 89.794 126450000 0 0 39971000 59048000 0 0 0 0 0 27436000 0 0 0 14787 4063 13882 129968;129969;129970;129971 165260;165261;165262;165263 165260 4 FVTTEFEPCFDAADFIR Unmodified 2063.9299 0.92987811 2563 P50440 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 150.27 150.27 2;3 3.567E-11 154410 QUIQUE_C1403_190116_001 148.68 130.87 2448300000 158530000 188960000 207340000 264800000 255750000 213650000 0 117310000 240270000 8032700 294210000 295520000 203980000 14788 2563 13883 129972;129973;129974;129975;129976;129977;129978;129979;129980;129981;129982;129983;129984 165264;165265;165266;165267;165268;165269;165270;165271;165272;165273;165274;165275;165276;165277;165278;165279 165269 16 FVTVEELLETAR Unmodified 1405.7453 0.74529545 941 E9PJ55;Q9NUJ3;R4GNF5;E9PP52;E9PMB0 TCP11L1 T-complex protein 11-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.89 141.89 2 0.00054662 144989 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.42 87.426 386300000 40829000 33400000 0 36178000 56637000 34937000 0 36469000 36184000 0 69127000 0 42538000 14789 941 13884 129985;129986;129987;129988;129989;129990;129991;129992;129993;129994;129995 165280;165281;165282;165283;165284;165285;165286;165287;165288;165289;165290 165287 10 FVTVQTISGTGALR Unmodified 1448.7987 0.798728 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 1 3 2 3 3 2 2 3 2 4 3 4 85.058 85.058 2;3 3.2981E-22 87290 QUIQUE_C1438_190116_001 194.54 180.33 24017000000 2587400000 72006000 2197400000 1754400000 1911600000 1837800000 1829500000 1690000000 1762400000 861520000 2705100000 2546900000 2260800000 14790 1788 13885 129996;129997;129998;129999;130000;130001;130002;130003;130004;130005;130006;130007;130008;130009;130010;130011;130012;130013;130014;130015;130016;130017;130018;130019;130020;130021;130022;130023;130024;130025;130026;130027;130028;130029;130030 165291;165292;165293;165294;165295;165296;165297;165298;165299;165300;165301;165302;165303;165304;165305;165306;165307;165308;165309;165310;165311;165312;165313;165314;165315;165316;165317;165318;165319;165320;165321;165322;165323;165324;165325;165326;165327;165328;165329;165330;165331;165332;165333;165334;165335;165336;165337;165338;165339;165340;165341;165342;165343;165344;165345;165346;165347;165348;165349;165350;165351;165352;165353;165354;165355;165356;165357;165358;165359;165360 165311 63 FVVDLSDQVAPTDIEEGMR Unmodified 2120.0096 0.0095849934 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.67 132.67 2 1.1109E-45 137554 QUIQUE_C1368_190116_001 164.88 124.31 705940000 73644000 71475000 73376000 55947000 0 63055000 45992000 67345000 55225000 22967000 61163000 60682000 55067000 14791 2389 13886 130031;130032;130033;130034;130035;130036;130037;130038;130039;130040;130041;130042;130043 165361;165362;165363;165364;165365;165366;165367;165368;165369;165370;165371;165372;165373 165363 13 FVVDVDKNIDINDVTPNCR Unmodified 2232.0845 0.084481271 2743 P62195;J3QSA9;J3KRP2;J3QLH6;J3QRW1 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 1 1 101.8 101.8 2 0.0024492 103527 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.73 89.96 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14792 2743 13887 130044 165374 165374 1 FVVEDYDATSPNDFVGQFTLPLSSLK Unmodified 2888.412 0.41200622 3580 Q8N3E9 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 3 165.93 165.93 2;3 7.0301E-23 170112 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.35 110.71 1009000000 77601000 0 146710000 122080000 0 0 0 122520000 171260000 0 163650000 205150000 0 14793 3580 13888 130045;130046;130047;130048;130049;130050;130051;130052;130053;130054 165375;165376;165377;165378;165379;165380;165381;165382;165383;165384 165384 10 FVVGYALDYNEYFR Unmodified 1754.8304 0.83042206 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 142.15 142.15 2 0.0068877 147410 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.439 47.003 150180000 0 0 0 0 0 0 78809000 0 0 0 71367000 0 0 14794 1787 13889 130055;130056;130057;130058;130059 165385;165386;165387;165388;165389 165387 4 FVVLADPR Unmodified 915.5178 0.51780212 4550 Q9Y296;E9PQE8;E9PKS9;E9PN70 TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 63.39 63.39 2 0.036566 59381 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.714 38.742 52807000 0 34103000 0 0 0 0 0 0 0 18705000 0 0 0 14795 4550 13890 130060;130061;130062 165390;165391;165392 165392 3 FVVLETGGEAGITR Unmodified 1447.7671 0.76709352 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 84.199 84.199 2 0.036809 80974 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.348 41.719 6182600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6182600 0 0 0 14796 3453 13891 130063 165393 165393 0 FVVMVTPEDLK Unmodified 1276.6737 0.67371041 2964 Q13085 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase no no 0 0 0 1 1 104.64 104.64 2 0.016585 107631 QUIQUE_C1277_190116_001 56.563 44.036 16506000 0 16506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14797 2964 13892 130064;130065 165394;165395 165394 2 FVVQNVSAQK Unmodified 1118.6084 0.60840804 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.443 34.443 2 0.00083066 29582 QUIQUE_C1368_190116_001 105.52 66.729 2952900000 335360000 338070000 270120000 403800000 0 330570000 0 0 0 0 475190000 333220000 466540000 14798 180;3738 13893 130066;130067;130068;130069;130070;130071;130072;130073 165396;165397;165398;165399;165400;165401;165402;165403;165404 165398 8 FVVSSLQGEDCR Unmodified 1395.6453 0.64526383 944 E9PJE4;Q9GZQ3 COMMD5 COMM domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 60.818 60.818 2 0.00051875 59893 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.75 91.66 189950000 0 0 0 0 0 0 0 34998000 36552000 0 0 56139000 62265000 14799 944 13894 130074;130075;130076;130077 165405;165406;165407;165408 165406 4 FVVTDGGITR Unmodified 1063.5662 0.56620887 2640 P54289;H0Y715 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.898 59.898 2 0.013708 59850 QUIQUE_C1218_190116_001 88.37 53.121 1353300000 151390000 187900000 208600000 0 183450000 123830000 0 118240000 111200000 0 175580000 93139000 0 14800 2640 13895 130078;130079;130080;130081;130082;130083;130084;130085;130086 165409;165410;165411;165412;165413;165414;165415;165416;165417;165418 165409 6 FVVYNVYMAGR Unmodified 1317.654 0.65397802 3899 Q96L92 SNX27 Sorting nexin-27 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.495 97.495 2 0.00048451 100232 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.71 86.403 226860000 0 0 0 0 41883000 0 0 0 60707000 0 0 66320000 57950000 14801 3899 13896 130087;130088;130089;130090;130091;130092;130093;130094 165419;165420;165421;165422;165423;165424;165425;165426;165427;165428;165429 165428 11 FVWEPTTPPPTLANPGR Unmodified 1878.9628 0.96283322 4692 yes no 0 0 0 1 1 71.496 71.496 3 0.0099708 72911 QUIQUE_C1576_190116_001 28.956 12.077 136180000 0 0 0 0 0 0 41483000 0 0 0 0 0 94695000 + 14802 4692 13897 130095;130096 165430;165431;165432 165430 3 FVWNGHLLR Unmodified 1140.6192 0.61924749 4293 Q9NTJ5;E9PGZ4;F8WDN7 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 76.294 76.294 3 0.0069791 76615 QUIQUE_C1403_190116_001 60.436 46.23 13903000 0 0 0 13903000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14803 4293 13898 130097;130098;130099;130100;130101 165433;165434;165435;165436;165437 165434 5 FVYAGSNSGVVQAPLAFCGK Unmodified 2071.0197 0.01969617 3759 Q92854 SEMA4D Semaphorin-4D yes yes 0 0 0 1 110.11 110.11 2 0.034608 113537 QUIQUE_C1277_190116_001 65.295 51.616 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14804 3759 13899 130102 165438 165438 1 FVYHLSDLCK Unmodified 1280.6223 0.62234354 817 D6RHJ6;D6RD17;P01591 JCHAIN;IGJ Immunoglobulin J chain yes no 0 0 0 1 2 66.506 66.506 2;3 0.026126 67404 QUIQUE_C1438_190116_001 67.507 46.56 71496000 0 0 23414000 0 48082000 0 0 0 0 0 0 0 0 14805 817 13900 130103;130104;130105 165439;165440;165441 165441 3 FVYKEEHPFEK Unmodified 1451.7085 0.70851601 1209 H6UMI1;O95166;I3L3J4 GABARAP Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.281 31.281 3;4 0.015451 25918 QUIQUE_C1277_190116_001 61.932 48.164 225500000 32984000 0 0 0 35334000 0 39590000 43531000 0 19511000 54548000 0 0 14806 1209 13901 130106;130107;130108;130109;130110;130111;130112 165442;165443;165444;165445;165446;165447;165448 165443 7 FVYVWDTTSR Unmodified 1272.6139 0.61388734 3836 Q96DI7;Q9NSS8 SNRNP40;DKFZp434D199 U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.546 95.546 2 0.0082342 99132 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.594 40.607 283540000 0 42378000 0 50541000 0 36480000 39562000 32253000 0 0 43208000 0 39122000 14807 3836 13902 130113;130114;130115;130116;130117;130118;130119;130120 165449;165450;165451;165452;165453;165454;165455;165456;165457 165455 9 FWAGLTPVLHAK Unmodified 1338.7448 0.74484194 3587 Q8N461 FBXL16 F-box/LRR-repeat protein 16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 89.488 89.488 3 0.0035306 86476 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.109 34.732 44692000 0 0 0 0 0 0 0 33432000 0 11260000 0 0 0 14808 3587 13903 130121;130122;130123;130124 165458;165459;165460;165461 165461 4 FWAHEHWGLDDPADVMTFSK Unmodified 2388.0634 0.063351898 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 3 1 4 2 3 122.52 122.52 2;3;4 7.977E-30 127953 QUIQUE_DMIX5_190116_001 170.11 162.74 2606900000 157610000 207950000 239430000 69219000 0 45390000 222320000 251050000 339390000 15264000 446870000 283090000 329310000 14809 1198 13904 130125;130126;130127;130128;130129;130130;130131;130132;130133;130134;130135;130136;130137;130138;130139;130140;130141;130142;130143;130144;130145;130146;130147;130148;130149 165462;165463;165464;165465;165466;165467;165468;165469;165470;165471;165472;165473;165474;165475;165476;165477;165478;165479;165480;165481;165482;165483;165484;165485;165486;165487;165488;165489;165490;165491;165492;165493;165494;165495;165496;165497 165487 32 FWAHEHWGLDDPADVMTFSK Oxidation (M) 2404.0583 0.05826652 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 103.79 103.79 3;4 0.0015079 106185 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.188 42.076 147970000 0 0 0 56794000 0 0 0 47942000 0 0 43234000 0 0 14810 1198 13904 130150;130151;130152;130153 165498;165499;165500;165501 165500 684 4 FWAWDPEEER Unmodified 1363.5833 0.5833155 4520 Q9UPQ0;E7EPK0;E9PDJ9;H0Y8P3;G5EA03 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 113.46 113.46 2 0.021334 116644 QUIQUE_C1403_190116_001 69.825 52.594 32353000 0 0 0 14304000 0 18049000 0 0 0 0 0 0 0 14811 4520 13905 130154;130155 165502;165503 165502 2 FWAYEQYKK Unmodified 1261.6132 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166339 240 FWHDTCFR Unmodified 1167.492 0.49199807 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2;A0A0D9SFI6;A0A0D9SFB0;Q5JXH9;A0A0D9SGB2;Q5JXI0;A0A0D9SG53;A0A0D9SGD1 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 2 2 49.672 49.672 2;3 0.00035916 48732 QUIQUE_C1218_190116_001 144.38 141.7 7563700000 490020000 603270000 635380000 551180000 445740000 277150000 681580000 360110000 640110000 217780000 681030000 1082800000 897500000 14821 3283 13915 130597;130598;130599;130600;130601;130602;130603;130604;130605;130606;130607;130608;130609;130610;130611;130612;130613;130614;130615;130616;130617 166354;166355;166356;166357;166358;166359;166360;166361;166362;166363;166364;166365;166366;166367;166368;166369;166370;166371;166372;166373;166374;166375;166376;166377;166378;166379;166380;166381 166355 24 FWINIIK Unmodified 932.54837 0.54837396 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 116.44 116.44 2 0.021961 120824 QUIQUE_C1368_190116_001 103.28 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166651;166652;166653;166654;166655;166656;166657;166658;166659;166660;166661;166662;166663;166664;166665;166666;166667;166668;166669;166670;166671;166672;166673;166674;166675;166676;166677;166678;166679;166680;166681;166682;166683;166684;166685;166686;166687;166688;166689;166690;166691;166692;166693;166694;166695;166696;166697;166698;166699;166700;166701;166702;166703;166704;166705;166706;166707;166708;166709;166710;166711;166712;166713 166698 62 FYEEVHDLERK Unmodified 1463.7045 0.70449327 3972;1010;1033 Q99733;C9JZI7;C9J6D1;A8MXH2;E9PS34;E9PNJ7;E9PKT8;E9PNW0;E9PJJ2;F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;F8W020;F8W0J6;H0YH88;H0YHC3;F8VXI6;F8VUX1;F8VVB5;F8W118;F8VV59;F8VRJ2;B7Z9C2 NAP1L4;NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 4;Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 37.564 37.564 3 0.0009922 34058 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.727 47.971 211290000 0 0 0 0 0 0 0 63715000 45702000 0 50024000 51851000 0 14857 3972;1010;1033 13951 130872;130873;130874;130875 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Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H yes no 0 0 0 1 1 1 94.202 94.202 2 0.0016354 97367 QUIQUE_C1576_190116_001 68.536 54.378 279630000 0 0 0 0 0 102950000 79077000 0 0 0 97598000 0 0 14883 758 13976 131086;131087;131088 166994;166995;166996 166995 3 FYHDAKEIFGR Unmodified 1381.6779 0.67788459 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 50.788 50.788 3 0.0069591 48369 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.967 39.405 24540000 0 0 0 0 0 0 0 24540000 0 0 0 0 0 14884 2851 13977 131089 166997 166997 1 FYHDWNDKEIEVLNK Unmodified 1948.9319 0.93192702 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JCJ9 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 1 2 1 3 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 77.772 77.772 2;3 2.3133E-78 78605 QUIQUE_C1277_190116_001 204.13 174.2 2713800000 220210000 46242000 305660000 219380000 213900000 189570000 43356000 289810000 45867000 82464000 382060000 292630000 382640000 14885 1276 13978 131090;131091;131092;131093;131094;131095;131096;131097;131098;131099;131100;131101;131102;131103;131104;131105;131106;131107;131108;131109;131110;131111;131112 166998;166999;167000;167001;167002;167003;167004;167005;167006;167007;167008;167009;167010;167011;167012;167013;167014;167015;167016;167017;167018;167019;167020 167000 21 FYHPEKEDGKLNK Unmodified 1603.7995 0.79945628 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 2 1 15.555 15.555 4 0.064452 7757 QUIQUE_DMIX5_190116_001 21.668 18.748 38892000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38892000 0 0 14886 1803 13979 131113 167021 167021 1 FYIGEMVLAIDSIHQLHYVHR Unmodified 2540.2998 0.2998342 4631 Q9Y5S2;A0A0U1RRC3 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 135.77 135.77 5 3.4344E-14 140156 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.98 71.162 39172000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39172000 0 14887 4631 13980 131114 167022 167022 1 FYIHEVQELIDIR Unmodified 1673.8777 0.8777066 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 125.8 125.8 3 0.0014346 131459 QUIQUE_C1438_190116_001 66.004 55.579 77911000 0 23751000 0 0 25467000 0 0 28694000 0 0 0 0 0 14888 3270 13981 131115;131116;131117;131118 167023;167024;167025;167026 167024 1 FYLAFQSVHK Unmodified 1238.6448 0.64479354 2942 Q12768 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes yes 0 0 0 1 1 71.345 71.345 3 0.0075673 71635 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.258 70.589 15388000 0 0 0 15388000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14889 2942 13982 131119;131120 167027;167028 167028 2 FYLDLYPR Unmodified 1085.5546 0.55458155 2615 P52888;K7EP46;K7EMU4 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 111.85 111.85 2 0.018957 117155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.116 52.514 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1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 168.07 168.07 3 0.042777 173299 QUIQUE_C1576_190116_001 19.715 15.329 25972000 0 0 0 0 0 0 25972000 0 0 0 0 0 0 14893 2483 13986 131136 167044 167044 1 FYLVGLDAR Unmodified 1052.5655 0.56548059 4480 Q9UL12;A0A0A0MT55;Q5SYV1;Q5SYV2 SARDH Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 101.59 101.59 2 0.024578 105503 QUIQUE_C1438_190116_001 68.224 39.711 30636000 14224000 0 0 0 16413000 0 0 0 0 0 0 0 0 14894 4480 13987 131137;131138;131139;131140;131141 167045;167046;167047;167048;167049 167048 5 FYLYPDLSR Unmodified 1172.5866 0.58660996 2502 P48066 SLC6A11 Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 105.7 105.7 2 0.0066743 110119 QUIQUE_C1218_190116_001 119.29 100.03 367230000 106420000 58770000 0 0 0 74327000 0 0 0 0 127720000 0 0 14895 2502 13988 131142;131143;131144;131145 167050;167051;167052;167053 167050 2 FYMQTEVSELR Unmodified 1401.6599 0.65985126 3910 Q96NN9 AIFM3 Apoptosis-inducing factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 90.33 90.33 2 0.010614 93174 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.893 55.937 30753000 0 30753000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14896 3910 13989 131146;131147 167054;167055 167055 2 FYNAGLAYCHSK Unmodified 1429.6449 0.6448699 3670 Q8TC12;G3V2G6;G3V234;H0YJ46;H0YJ10;H0YIZ8 RDH11 Retinol dehydrogenase 11 yes no 0 0 0 1 41.478 41.478 2 0.067069 37811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.188 40.542 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14897 3670 13990 131148 167056 167056 1 FYNELTEILVR Unmodified 1395.7398 0.73981614 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 131.75 131.75 2 0.00044077 137535 QUIQUE_C1218_190116_001 121.73 109.21 1584800000 155950000 174550000 139360000 0 202960000 0 168720000 178200000 0 0 208770000 184090000 172210000 14898 3700 13991 131149;131150;131151;131152;131153;131154;131155;131156;131157;131158;131159;131160;131161;131162;131163 167057;167058;167059;167060;167061;167062;167063;167064;167065;167066;167067;167068;167069;167070;167071;167072;167073 167057 16 FYNQVSTPLLR Unmodified 1336.7139 0.71393574 2153 Q5T985;P19823;CON__Q9TRI1 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.545 83.545 2 0.002534 84482 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.136 75.612 144660000 12653000 16910000 0 0 36995000 22895000 15536000 0 19976000 0 0 0 19694000 14899 2153 13992 131164;131165;131166;131167;131168;131169;131170;131171 167074;167075;167076;167077;167078;167079;167080;167081 167081 7 FYPCEECAEDLR Unmodified 1587.6334 0.63337851 2671 P55789;H3BQQ4;H3BRD2 GFER FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR;Sulfhydryl oxidase yes no 0 0 0 1 72.096 72.096 2 0.012658 72164 QUIQUE_C1403_190116_001 57.532 54.799 23248000 0 0 0 23248000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14900 2671 13993 131172 167082 167082 1 FYPDRPHQK Unmodified 1186.5883 0.5883413 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1;H3BUV0;H3BTM1;H3BRA2;H3BQD1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 11.011 11.011 3 0.052407 3418 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.016 43.986 13733000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13733000 0 0 0 14901 3778 13994 131173 167083 167083 0 FYPEDVAEELIQDITQK Unmodified 2036.9943 0.99425251 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 171.98 171.98 2;3 1.8191E-117 175885 QUIQUE_DMIX8_190116_001 312.05 292.85 25030000000 688470000 796060000 1228800000 896550000 1130000000 0 3194300000 1991300000 4797000000 253780000 3461100000 4169000000 2424000000 14902 859 13995 131174;131175;131176;131177;131178;131179;131180;131181;131182;131183;131184;131185;131186;131187;131188;131189;131190;131191;131192;131193;131194;131195;131196;131197;131198 167084;167085;167086;167087;167088;167089;167090;167091;167092;167093;167094;167095;167096;167097;167098;167099;167100;167101;167102;167103;167104;167105;167106;167107;167108;167109 167109 23 FYPEDVSEELIQDITQR Unmodified 2080.9953 0.99531514 2248 P26038;V9GZ54 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137.8 3 0.003854 144641 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.866 44.552 71735000 0 0 71735000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14904 4544 13997 131229;131230;131231 167161;167162;167163 167162 3 FYPPDPAQLSEDITR Unmodified 1747.8417 0.84171503 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A1B0GTF8;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 2 2 120.49 120.49 2 6.1816E-06 123489 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.85 83.555 3693100000 285430000 282610000 319050000 319230000 176230000 263210000 296490000 312220000 422200000 79158000 282920000 292120000 362190000 14905 143;560;4559 13998 131232;131233;131234;131235;131236;131237;131238;131239;131240;131241;131242;131243;131244;131245;131246;131247;131248;131249;131250;131251;131252;131253;131254;131255;131256;131257 167164;167165;167166;167167;167168;167169;167170;167171;167172;167173;167174;167175;167176;167177;167178;167179;167180;167181;167182;167183;167184;167185;167186;167187;167188;167189;167190;167191;167192;167193;167194;167195;167196;167197;167198;167199;167200;167201;167202;167203;167204;167205;167206;167207;167208;167209;167210;167211;167212;167213;167214;167215;167216;167217 167198 53 FYPPDPAQLTEDITR Unmodified 1761.8574 0.85736509 4172;3243;449 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A3B3ITP0;A0A2R8Y7Y3;Q4VB86;A0A2R8YD30;A0A2U3TZH6;P11171;A0A2R8Y6D0;A0A2R8Y420;A0A2R8Y7N0;A0A2R8YFR9;A0A2R8Y6G5;A0A2R8Y570;A0A2R8Y5G2;A0A2R8Y5Z6;A0A3B3IU06;A0A1B0GWG0;A0A3B3IUD6;A0A2R8YCW8;A0A2R8Y6T6;A0A3B3ITC5;Q4VXN0;Q4VXN1 EPB41L1;EPB41 Band 4.1-like protein 1;Protein 4.1 no no 0 0 0 1 1 1 2 2 3 129.92 129.92 2 6.1816E-06 133209 QUIQUE_C1403_190116_001 107.85 81.804 657380000 261910000 0 0 287650000 0 0 0 0 0 107820000 0 0 0 14906 4172;449;3243 13999 131258;131259;131260;131261;131262;131263;131264;131265;131266;131267 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O60216;Q9H4I0;E5RG18;E5RI01;E5RFZ5 RAD21;RAD21L1 Double-strand-break repair protein rad21 homolog;Double-strand-break repair protein rad21-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 120.05 120.05 2 0.0049014 122432 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.43 90.19 47445000 15613000 18583000 0 0 0 0 0 13248000 0 0 0 0 0 14916 1561 14008 131329;131330;131331;131332 167312;167313;167314;167315 167315 4 FYSLPQSPQQFK Unmodified 1468.7351 0.73506511 3393 Q6PI48;A0A3B3IT01;A0A3B3ISK7;A0A3B3IS01;A0A3B3ITS3;A0A3B3IS54 DARS2 Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 88.335 88.335 2 0.03879 89196 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.462 34.596 28006000 0 0 0 0 0 0 0 28006000 0 0 0 0 0 14917 3393 14009 131333 167316 167316 1 FYSQAIELNPSNAIYYGNR Unmodified 2219.0647 0.064732107 1148 H0YDU8;P53041 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.34 118.34 2;3 9.8894E-74 120960 QUIQUE_DMIX1_190116_001 234.52 221.12 982170000 0 0 131130000 79115000 0 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167350 10 FYTAEVVLALDAIHSMGLIHR Unmodified 2355.2409 0.24092233 1610 O75116;D6REE7 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 159.48 159.48 4 1.465E-06 166729 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.358 63.29 69064000 0 0 0 0 0 0 0 0 13486000 0 30982000 24596000 0 14923 1610 14015 131372;131373;131374 167360;167361;167362 167361 2 FYTDPSYFFDLWK Unmodified 1727.7872 0.78716026 4523;4667 Q9UPY6;Q9Y6W5 WASF3;WASF2 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3;Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.23 168.23 2 8.5638E-13 173010 QUIQUE_C1218_190116_001 154.35 139.01 1831100000 79808000 105100000 135450000 127110000 155560000 128700000 162100000 171240000 200550000 39317000 188940000 188710000 148480000 14924 4523;4667 14016 131375;131376;131377;131378;131379;131380;131381;131382;131383;131384;131385;131386;131387 167363;167364;167365;167366;167367;167368;167369;167370;167371;167372;167373;167374;167375 167363 13 FYTDPVEAVK Unmodified 1167.5812 0.58119023 2673 P55809 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 67.177 67.177 1;2 0.0017894 66809 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.02 83.053 8391000000 754090000 656070000 841400000 720400000 556010000 335160000 792230000 533470000 786490000 288690000 653490000 711880000 761610000 14925 2673 14017 131388;131389;131390;131391;131392;131393;131394;131395;131396;131397;131398;131399;131400;131401;131402;131403 167376;167377;167378;167379;167380;167381;167382;167383;167384;167385;167386;167387;167388;167389;167390;167391;167392 167392 12 FYTEDGNWDLVGNNTPIFFIR Unmodified 2517.1965 0.19647456 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 163.93 163.93 2;3 6.2923E-08 170857 QUIQUE_C1438_190116_001 93.371 84.981 473930000 15307000 0 41412000 0 85036000 0 107230000 0 0 26277000 146120000 52543000 0 14926 1849 14018 131404;131405;131406;131407;131408;131409;131410;131411;131412;131413;131414;131415 167393;167394;167395;167396;167397;167398;167399;167400;167401;167402;167403;167404;167405 167397 13 FYTEDSPGLK Unmodified 1155.5448 0.54480473 2691 P60468;S4R3B5 SEC61B Protein transport protein Sec61 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 49.041 49.041 2 0.013076 45948 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.305 31.302 48091000 0 0 0 0 0 0 0 31284000 0 16808000 0 0 0 14927 2691 14019 131416;131417 167406;167407 167406 2 FYTENGVLLLAQLLNEDPVLQLK Unmodified 2629.4367 0.43670483 4148 Q9H2M9;H7C4Y9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 174.67 174.67 3 5.9039E-11 176102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.176 83.976 278940000 0 7328600 0 0 16596000 0 0 21890000 26870000 0 131620000 74637000 0 14928 4148 14020 131418;131419;131420;131421;131422;131423 167408;167409;167410;167411;167412;167413 167410 5 FYTIDTGQK Unmodified 1071.5237 0.52367535 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.798 49.798 2 0.0040203 46823 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60.685 60.685 2;3 0.002454 59932 QUIQUE_C1277_190116_001 78.934 69.502 767570000 66214000 76753000 48617000 63810000 51676000 56153000 52527000 45345000 49554000 0 82622000 90140000 84157000 14936 4508 14028 131480;131481;131482;131483;131484;131485;131486;131487;131488;131489;131490;131491;131492;131493;131494 167478;167479;167480;167481;167482;167483;167484;167485;167486;167487;167488;167489;167490;167491;167492;167493 167479 11 FYVLSMFPYPSGK Unmodified 1534.753 0.75302336 3100 Q15031;C9JYR8 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 143.44 143.44 2 0.0021831 148182 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.944 52.858 65167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30730000 34437000 0 14937 3100 14029 131495;131496 167494;167495 167495 2 FYYIYNEK Unmodified 1138.5335 0.53351176 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement 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Unmodified 906.45593 0.45593014 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.044 35.044 2 0.00043042 30111 QUIQUE_C1277_190116_001 123.69 88.866 1403000000 152210000 155500000 138180000 136280000 146070000 118640000 0 125330000 0 121340000 170450000 138960000 0 14967 1255;2856 14057 131795;131796;131797;131798;131799;131800;131801;131802;131803;131804;131805 167896;167897;167898;167899;167900;167901;167902;167903;167904;167905;167906;167907;167908;167909;167910 167898 15 GAAVNLTLVTPEK Unmodified 1311.7398 0.73981614 4190;4134 Q9H1K4;Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;K4DIB6;K4DIB3;A0A0D9SFA8;K4DIB0;K4DIA2;A0A0D9SG84;E9PI74;E9PQ36 SLC25A18;SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 2;Mitochondrial glutamate carrier 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.479 76.479 2 0.0021576 77752 QUIQUE_C1576_190116_001 123.79 103.49 4085700000 305280000 472210000 450260000 296270000 317280000 286460000 418330000 241570000 0 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14060 131823;131824;131825;131826;131827;131828;131829;131830;131831;131832;131833;131834;131835 167929;167930;167931;167932;167933;167934;167935;167936;167937;167938;167939;167940;167941;167942;167943 167941 13 GACASHVSTMASFLK Unmodified 1565.733 0.73303298 4460 Q9UJU6;H0Y5J4;F8WBG8 DBNL Drebrin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 62.102 62.102 2;3 1.0094E-65 61013 QUIQUE_C1277_190116_001 200.93 164.24 223790000 48790000 37848000 0 49356000 0 0 0 60441000 27357000 0 0 0 0 14971 4460 14061 131836;131837;131838;131839;131840 167944;167945;167946;167947;167948 167945 5 GACHGQTGMFPR Oxidation (M) 1333.5656 0.56557372 2774 P62993 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 14.538 14.538 3 0.0015516 6338 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.961 86.498 346540000 69877000 0 0 0 0 0 78247000 0 0 0 96879000 0 101540000 14972 2774 14062 131841;131842;131843;131844 167949;167950;167951;167952 167952 2209 2 GACHGQTGMFPR Unmodified 1317.5707 0.5706591 2774 P62993 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 2 20.591 20.591 2;3 9.0518E-14 13332 QUIQUE_C1403_190116_001 159.11 117.24 1516900000 32721000 208360000 268240000 273150000 46202000 190310000 221790000 68097000 21878000 0 0 0 186150000 14973 2774 14062 131845;131846;131847;131848;131849;131850;131851;131852;131853;131854;131855;131856;131857;131858;131859;131860;131861;131862 167953;167954;167955;167956;167957;167958;167959;167960;167961;167962;167963;167964;167965;167966;167967;167968;167969;167970;167971 167959 19 GACILNMLK Oxidation (M) 1034.5253 0.52527203 3377 Q6P179;D6RGW0 ERAP2 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 yes no 0 1 0 1 45.067 45.067 2 0.062296 42313 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.039 11.248 251460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 251460000 0 14974 3377 14063 131863 167972 167972 1 GACSTPDMPQFEPVK Unmodified 1662.7382 0.73817793 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 80.628 80.628 2 0.0099965 81755 QUIQUE_C1277_190116_001 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167975;167976;167977;167978;167979;167980;167981;167982;167983;167984;167985;167986;167987;167988;167989;167990;167991;167992;167993;167994;167995 167978 19 GADDAADADTAIINAEGGQNNSEEKK Unmodified 2603.1583 0.15831073 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.512 60.512 3 8.0889E-25 60291 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.67 113.22 335010000 41328000 0 41304000 59636000 54744000 0 46365000 0 0 0 41365000 0 50271000 14978 113 14067 131883;131884;131885;131886;131887;131888;131889;131890 167996;167997;167998;167999;168000;168001;168002;168003;168004 168002 9 GADDAMESSKPGPVQVVLVQK Unmodified 2154.0991 0.099068703 3355 Q6DD88;F5GWF8 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 1 1 74.861 74.861 3 0.00087351 74611 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.877 38.169 38246000 0 0 0 0 0 0 0 38246000 0 0 0 0 0 14979 3355 14068 131891 168005 168005 1 GADEAALAR Unmodified 872.43519 0.4351947 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 19.03 19.03 2 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168032;168033;168034;168035;168036;168037;168038;168039;168040;168041;168042;168043;168044;168045;168046;168047;168048;168049;168050;168051;168052;168053;168054;168055;168056;168057;168058;168059;168060;168061;168062;168063;168064;168065;168066;168067;168068;168069;168070;168071;168072;168073;168074;168075;168076;168077;168078;168079;168080;168081;168082;168083;168084;168085;168086;168087;168088;168089;168090;168091;168092;168093 168048 59 GADFLVTEVENGGSLGSKK Unmodified 1906.9636 0.96362108 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 2 2 2 2 1 94.711 94.711 2;3 7.5217E-64 96882 QUIQUE_DMIX7_190116_001 184.98 170.95 1760300000 0 0 0 0 0 0 0 729240000 287460000 0 344740000 346250000 52628000 14984 1203;2077 14073 131949;131950;131951;131952;131953;131954;131955;131956;131957 168094;168095;168096;168097;168098;168099;168100;168101;168102;168103 168102 10 GADFQCFQQAR Unmodified 1326.5775 0.57751861 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.886 54.886 2 0.0004904 51066 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.72 82.627 897320000 76440000 101700000 79301000 82423000 137090000 41429000 94792000 47717000 93414000 35754000 0 0 107260000 14985 2419 14074 131958;131959;131960;131961;131962;131963;131964;131965;131966;131967;131968 168104;168105;168106;168107;168108;168109;168110;168111;168112;168113;168114;168115;168116;168117;168118;168119 168118 14 GADIMYTGTVDCWR Oxidation (M) 1659.7021 0.70212678 2038;2039 P12235;P12236 SLC25A4;SLC25A6 ADP/ATP translocase 1;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 86.065 86.065 2 0.0098187 83138 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.274 43.976 411690000 70788000 0 73745000 0 0 57222000 0 61906000 43669000 46056000 0 58300000 0 14986 2038;2039 14075 131969;131970;131971;131972;131973;131974;131975 168120;168121;168122;168123;168124;168125;168126 168125 1348 6 GADIMYTGTVDCWR Unmodified 1643.7072 0.70721216 2038;2039 P12235;P12236 SLC25A4;SLC25A6 ADP/ATP translocase 1;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.6 101.6 2 4.7456E-07 104406 QUIQUE_C1368_190116_001 126.71 85.984 2350500000 213370000 211110000 268860000 192260000 113620000 217930000 202800000 142560000 149380000 62641000 217070000 177480000 181420000 14987 2038;2039 14075 131976;131977;131978;131979;131980;131981;131982;131983;131984;131985;131986;131987;131988 168127;168128;168129;168130;168131;168132;168133;168134;168135;168136;168137;168138;168139;168140;168141;168142;168143;168144;168145 168131 19 GADINAPDKHHITPLLSAVYEGHVSCVK Unmodified 3027.5236 0.52363913 2687 P58546 MTPN Myotrophin yes yes 0 0 1 2 2 1 2 3 1 2 2 1 77.651 77.651 3;4;5 7.3259E-16 78706 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.179 71.972 2180900000 0 260850000 384930000 0 0 0 132130000 242490000 294630000 21073000 353050000 261370000 230420000 14988 2687 14076 131989;131990;131991;131992;131993;131994;131995;131996;131997;131998;131999;132000;132001;132002;132003;132004 168146;168147;168148;168149;168150;168151;168152;168153;168154;168155;168156;168157;168158;168159;168160;168161;168162;168163 168153 18 GADKVNTFSALLLEPYKPPSAQ Unmodified 2345.2267 0.22671206 1543 O43681;A0A087WXS7 ASNA1 ATPase ASNA1 yes no 0 0 2 1 1 2 1 123.92 123.92 2;3 0.00022216 128161 QUIQUE_DMIX7_190116_001 87.148 60.607 362590000 0 0 0 0 0 0 0 101940000 92044000 0 0 85032000 83578000 14989 1543 14077 132005;132006;132007;132008;132009 168164;168165;168166;168167;168168 168166 2 GADMSVPDEK Oxidation (M) 1063.4492 0.44918978 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 1 0 1 15.785 15.785 2 0.045347 8166 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.749 35.546 16671000 0 0 0 0 0 0 0 16671000 0 0 0 0 0 14990 4390 14078 132010 168169 168169 1 GADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGGDPFK Unmodified 3457.5375 0.5374941 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R3I1 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.12 148.12 3 5.5059E-16 155116 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.264 68.315 397400000 38101000 39653000 37497000 40916000 42525000 28333000 0 35212000 39233000 0 44834000 0 51099000 14991 4394 14079 132011;132012;132013;132014;132015;132016;132017;132018;132019;132020 168170;168171;168172;168173;168174;168175;168176;168177;168178;168179;168180;168181;168182;168183 168180 13 GADPFKGDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGGDPFKESDPFR Unmodified 4188.8613 0.86134744 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R3I1 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 2 1 149.75 149.75 4 2.0621E-16 152615 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.765 69.844 95631000 0 0 0 0 0 0 0 95631000 0 0 0 0 0 14992 4394 14080 132021 168184 168184 1 GADQAELEEIAFDSSLVFIPAEFR Unmodified 2653.2912 0.29116281 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 2 172.92 172.92 2;3 1.1383E-14 180137 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149 137.21 127490000 0 0 0 0 0 0 0 15307000 14417000 0 97768000 0 0 14993 2037 14081 132022;132023;132024;132025 168185;168186;168187;168188;168189 168189 5 GADQKPTSADCAVR Unmodified 1474.6834 0.68344025 1375 M0R3F6;M0R2Z9;Q8IX01 SUGP2 SURP and G-patch domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 12.085 12.085 3 0.0048406 4390 QUIQUE_C1438_190116_001 60.196 50.684 12824000 0 0 0 0 4383700 0 3685000 0 0 0 0 0 4755700 14994 1375 14082 132026;132027;132028;132029 168190;168191;168192;168193 168191 3 GADSGEEKEEGINR Unmodified 1489.6645 0.66447894 4045 Q9BVG4 PBDC1 Protein PBDC1 yes yes 0 0 1 1 12.592 12.592 3 0.042893 4406 QUIQUE_C1277_190116_001 51.546 43.231 1680400 0 1680400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14995 4045 14083 132030 168194 168194 0 GADSGEEKEEGINREDK Unmodified 1861.829 0.82897809 4045 Q9BVG4 PBDC1 Protein PBDC1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 10.527 10.527 3 0.00027568 2849 QUIQUE_C1368_190116_001 95.347 84.086 61004000 0 0 9577900 8598600 11462000 0 15092000 0 0 0 16274000 0 0 14996 4045 14084 132031;132032;132033;132034;132035 168195;168196;168197;168198;168199 168195 4 GADVFLEALAR Unmodified 1160.619 0.61897272 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.36 122.36 2 0.00079465 127913 QUIQUE_C1438_190116_001 95.311 76.217 769870000 62731000 55604000 56491000 40638000 72845000 42945000 88502000 44548000 61403000 29688000 89344000 51413000 73723000 14997 2068 14085 132036;132037;132038;132039;132040;132041;132042;132043;132044;132045;132046;132047;132048 168200;168201;168202;168203;168204;168205;168206;168207;168208;168209;168210;168211;168212;168213;168214;168215;168216;168217 168204 18 GADYMDCLYR Unmodified 1262.506 0.50599315 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 82.735 82.735 2 0.032175 85065 QUIQUE_C1218_190116_001 53.775 41.927 76779000 18559000 0 24347000 22330000 0 11544000 0 0 0 0 0 0 0 14998 196 14086 132049;132050;132051;132052;132053 168218;168219;168220;168221;168222 168218 5 GAEAANVTGPDGVPVEGSR Unmodified 1781.8544 0.85440498 258 A0A0D9SEI8;P16989 YBX3 Y-box-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 53.843 53.843 2 2.6397E-45 51784 QUIQUE_C1403_190116_001 160.46 137.23 36993000 0 0 0 36993000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14999 258 14087 132054 168223 168223 1 GAEAANVTGPGGVPVQGSK Unmodified 1694.8588 0.85876208 1118 H0Y449;P67809 YBX1 Nuclease-sensitive element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.976 41.976 2 9.3055E-23 38733 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.55 123.86 635890000 56691000 67130000 63066000 76434000 44883000 87164000 60741000 0 51942000 24497000 66691000 36648000 0 15000 1118 14088 132055;132056;132057;132058;132059;132060;132061;132062;132063;132064;132065;132066 168224;168225;168226;168227;168228;168229;168230;168231;168232;168233;168234;168235 168232 12 GAEADQIIEYLK Unmodified 1348.6874 0.68744622 2950 Q12904;D6R937 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 112.21 112.21 2 0.00056803 117811 QUIQUE_C1438_190116_001 96.342 81.093 79556000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79556000 0 15001 2950 14089 132067;132068;132069;132070 168236;168237;168238;168239 168236 4 GAEDAPDADTAIINAEGSQVNAEEK Unmodified 2514.1358 0.13578438 3582 Q8N3J6 CADM2 Cell adhesion molecule 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 89.661 89.661 2;3 1.0223E-217 92477 QUIQUE_C1218_190116_001 251.02 236.55 838970000 149140000 141150000 39744000 164020000 44770000 48517000 103110000 0 32598000 86341000 0 0 29590000 15002 3582 14090 132071;132072;132073;132074;132075;132076;132077;132078;132079;132080;132081;132082;132083;132084;132085;132086 168240;168241;168242;168243;168244;168245;168246;168247;168248;168249;168250;168251;168252;168253;168254;168255;168256 168240 17 GAEDAPDADTAIINAEGSQVNAEEKK Unmodified 2642.2307 0.2307474 3582 Q8N3J6 CADM2 Cell adhesion molecule 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.729 75.729 3 1.3599E-19 76065 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.95 99.975 1092800000 0 76338000 69213000 0 121280000 45442000 0 152500000 211540000 0 154860000 105160000 156440000 15003 3582 14091 132087;132088;132089;132090;132091;132092;132093;132094;132095 168257;168258;168259;168260;168261;168262;168263;168264;168265;168266;168267 168267 11 GAEDAPDADTAIINAEGSQVNAEEKKEYFI Unmodified 3194.4891 0.48914693 3582 Q8N3J6 CADM2 Cell adhesion molecule 2 yes yes 0 0 2 1 122.18 122.18 3 3.2366E-12 124934 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.718 64.354 37187000 0 0 0 0 0 0 0 37187000 0 0 0 0 0 15004 3582 14092 132096 168268 168268 1 GAEEMETVIPVDVMR 2 Oxidation (M) 1706.7855 0.78552206 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.443 75.443 2 1.9093E-12 77155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.17 104.16 2430500000 135570000 211680000 273620000 227700000 192190000 191480000 0 0 303220000 167030000 241120000 251150000 235750000 15005 3956 14093 132097;132098;132099;132100;132101;132102;132103;132104;132105;132106;132107 168269;168270;168271;168272;168273;168274;168275;168276;168277;168278;168279;168280;168281;168282 168280 2791;2792 14 GAEEMETVIPVDVMR Oxidation (M) 1690.7906 0.79060744 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 97.704 97.704 2 1.57E-35 99465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 173.04 154.41 13069000000 921150000 1090100000 1187000000 1059100000 844020000 929580000 805750000 884330000 1092700000 562550000 1263400000 1110100000 1319200000 15006 3956 14093 132108;132109;132110;132111;132112;132113;132114;132115;132116;132117;132118;132119;132120;132121;132122;132123;132124;132125;132126;132127;132128;132129;132130;132131;132132;132133 168283;168284;168285;168286;168287;168288;168289;168290;168291;168292;168293;168294;168295;168296;168297;168298;168299;168300;168301;168302;168303;168304;168305;168306;168307;168308;168309;168310;168311;168312;168313;168314 168301 2791;2792 32 GAEEMETVIPVDVMR Unmodified 1674.7957 0.79569281 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 119.22 119.22 2;3 9.8757E-54 124725 QUIQUE_C1218_190116_001 188.96 169.72 23340000000 1817600000 1878900000 2079000000 2070700000 1558400000 1817700000 1826900000 1825600000 1712400000 592800000 2241600000 1648100000 2270600000 15007 3956 14093 132134;132135;132136;132137;132138;132139;132140;132141;132142;132143;132144;132145;132146;132147;132148;132149;132150;132151;132152;132153;132154;132155;132156;132157;132158;132159 168315;168316;168317;168318;168319;168320;168321;168322;168323;168324;168325;168326;168327;168328;168329;168330;168331;168332;168333;168334;168335;168336;168337;168338;168339;168340;168341;168342;168343;168344;168345;168346;168347;168348;168349;168350 168316 34 GAEEMETVIPVDVMRR Oxidation (M) 1846.8917 0.89171846 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 1 1 79.236 79.236 3 0.011573 80525 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.727 32.652 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15008 3956 14094 132160 168351 168351 2791;2792 1 GAEGQRPGFGYGGR Unmodified 1407.6644 0.66435979 1217 H7BYR8 MBP yes yes 0 0 1 2 2 3 1 2 30.32 30.32 2;3 4.8764E-07 17857 QUIQUE_DMIX8_190116_001 130.23 99.976 2768900000 0 0 0 0 0 0 0 324380000 263960000 0 749230000 181030000 1250300000 15009 1217 14095 132161;132162;132163;132164;132165;132166;132167;132168;132169;132170 168352;168353;168354;168355;168356;168357;168358;168359;168360;168361 168360 9 GAEHITTYTFNTHK Unmodified 1618.774 0.77396981 3478 Q7Z7K6 CENPV Centromere protein V yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.442 29.442 3 8.7317E-05 24597 QUIQUE_C1218_190116_001 78.505 66.715 584990000 56322000 74050000 43284000 0 0 64691000 59002000 42163000 0 17005000 95428000 78411000 54631000 15010 3478 14096 132171;132172;132173;132174;132175;132176;132177;132178;132179;132180 168362;168363;168364;168365;168366;168367;168368;168369;168370;168371 168362 9 GAEIATTGQLYAAWDGGLDHCSPGWLADGSVR Unmodified 3330.5364 0.53638867 3862 Q96GW7;Q5T3I6 BCAN Brevican core protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 146.59 146.59 3 1.5641E-31 150725 QUIQUE_C1218_190116_001 99.446 93.96 200970000 26449000 45743000 0 37287000 44373000 0 0 0 0 0 0 47115000 0 15011 3862 14097 132181;132182;132183;132184;132185 168372;168373;168374;168375;168376;168377 168372 4 GAEILADTFK Unmodified 1063.555 0.55497548 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.587 76.587 2 0.00014729 77434 QUIQUE_C1368_190116_001 138.1 104.01 29199000000 3027400000 2778600000 3218700000 2995000000 2261900000 2808200000 2375200000 788410000 1788200000 1359900000 2408300000 1536200000 1853200000 15012 1684 14098 132186;132187;132188;132189;132190;132191;132192;132193;132194;132195;132196;132197;132198 168378;168379;168380;168381;168382;168383;168384;168385;168386;168387;168388;168389;168390;168391;168392;168393;168394;168395;168396;168397;168398;168399 168382 22 GAEILADTFKDYAVSTVPVADGLHLK Unmodified 2729.4276 0.42759671 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 1 4 4 4 3 3 3 4 7 6 2 6 7 7 137.89 137.89 2;3;4 1.0814E-175 141640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 281.5 264.42 65566000000 501260000 2704200000 2071600000 1006100000 2870200000 1147300000 2607000000 10508000000 11282000000 172190000 9372300000 8668200000 12656000000 15013 1684 14099 132199;132200;132201;132202;132203;132204;132205;132206;132207;132208;132209;132210;132211;132212;132213;132214;132215;132216;132217;132218;132219;132220;132221;132222;132223;132224;132225;132226;132227;132228;132229;132230;132231;132232;132233;132234;132235;132236;132237;132238;132239;132240;132241;132242;132243;132244;132245;132246;132247;132248;132249;132250;132251;132252;132253;132254;132255;132256;132257;132258 168400;168401;168402;168403;168404;168405;168406;168407;168408;168409;168410;168411;168412;168413;168414;168415;168416;168417;168418;168419;168420;168421;168422;168423;168424;168425;168426;168427;168428;168429;168430;168431;168432;168433;168434;168435;168436;168437;168438;168439;168440;168441;168442;168443;168444;168445;168446;168447;168448;168449;168450;168451;168452;168453;168454;168455;168456;168457;168458;168459;168460;168461;168462;168463;168464;168465;168466;168467;168468;168469;168470;168471;168472;168473;168474;168475;168476;168477;168478;168479;168480;168481;168482;168483;168484;168485;168486;168487;168488;168489 168445 87 GAEILEVLHSLPAVR Unmodified 1602.9093 0.90934108 3095 Q15008;H7C531 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 128.32 128.32 2;3 1.8915E-13 133880 QUIQUE_C1576_190116_001 136.51 116.68 1301400000 122250000 0 40691000 0 153620000 0 178970000 85033000 0 0 131300000 110340000 479230000 15014 3095 14100 132259;132260;132261;132262;132263;132264;132265;132266;132267;132268 168490;168491;168492;168493;168494;168495;168496;168497;168498;168499 168494 9 GAEILPR Unmodified 754.43374 0.43373813 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 29.221 29.221 2 0.043095 23284 QUIQUE_C1218_190116_001 80.555 21.574 122310000 89874000 0 0 0 0 0 0 0 0 32433000 0 0 0 15015 153 14101 132269;132270 168500;168501 168500 2 GAEIVADTFR Unmodified 1077.5455 0.54547343 1762 O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8;H0Y7N1 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.82 62.82 2 4.3384E-05 61562 QUIQUE_DMIX8_190116_001 144.12 72.779 2566700000 299380000 249780000 164240000 169120000 259490000 138710000 208960000 128330000 174930000 138320000 240650000 171840000 222940000 15016 1762 14102 132271;132272;132273;132274;132275;132276;132277;132278;132279;132280;132281;132282;132283 168502;168503;168504;168505;168506;168507;168508;168509;168510;168511;168512;168513;168514;168515;168516;168517;168518;168519 168519 16 GAEIVADTFRDFAVSTVPVSGPSHLR Unmodified 2727.398 0.39802792 1762 O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8;H0Y7N1 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 127.87 127.87 3 1.478E-10 132115 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.799 56.543 475610000 0 0 0 0 0 0 0 238070000 100020000 0 0 137520000 0 15017 1762 14103 132284;132285;132286 168520;168521;168522;168523;168524 168523 5 GAELEYESLK Unmodified 1137.5554 0.55536941 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 55.872 55.872 2 0.021665 54027 QUIQUE_C1277_190116_001 58.433 41.878 50430000 0 50430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15018 4607 14104 132287;132288;132289 168525;168526;168527 168525 3 GAELEYESLKR Unmodified 1293.6565 0.65648044 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 39.131 39.131 2;3 0.00036286 35019 QUIQUE_C1277_190116_001 72.652 47.798 1245700000 140390000 199960000 84478000 123500000 91883000 98350000 99070000 44843000 67643000 0 106620000 90457000 98496000 15019 4607 14105 132290;132291;132292;132293;132294;132295;132296;132297;132298;132299;132300;132301;132302;132303;132304;132305;132306;132307;132308 168528;168529;168530;168531;168532;168533;168534;168535;168536;168537;168538;168539;168540;168541;168542;168543;168544;168545;168546;168547;168548;168549;168550 168530 22 GAELVEGCDGILGDNFRPTQPLSDR Unmodified 2715.2922 0.29224222 2368 P35219 CA8 Carbonic anhydrase-related protein yes yes 0 0 1 1 1 112.97 112.97 3 1.2154E-07 116891 QUIQUE_C1368_190116_001 64.028 51.948 70759000 0 0 41416000 29343000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15020 2368 14106 132309;132310 168551;168552 168551 2 GAENFDKFFTR Unmodified 1330.6306 0.63060004 2121 P17252 PRKCA Protein kinase C alpha type yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 3 2 2 2 2 78.203 78.203 2;3 1.8863E-18 79553 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.6 127.8 2483200000 22142000 63536000 44389000 36232000 101220000 19865000 164830000 535470000 418530000 0 322000000 483200000 271760000 15021 2121 14107 132311;132312;132313;132314;132315;132316;132317;132318;132319;132320;132321;132322;132323;132324;132325;132326;132327;132328;132329 168553;168554;168555;168556;168557;168558;168559;168560;168561;168562;168563;168564;168565;168566;168567;168568;168569;168570;168571;168572;168573;168574;168575;168576;168577 168562 24 GAESPFEEK Unmodified 992.44509 0.44509068 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 27.488 27.488 2 0.0022002 21210 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.815 54.367 511030000 48135000 34680000 0 0 0 22966000 0 212020000 97633000 0 76309000 19290000 0 15022 2483 14108 132330;132331;132332;132333;132334;132335;132336;132337;132338 168578;168579;168580;168581;168582;168583;168584;168585;168586;168587 168586 10 GAEVAHFMNALR Unmodified 1314.6503 0.65028963 2183 P21589;Q96B60 NT5E 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 2 1 1 72.35 72.35 2;3 0.0066625 72680 QUIQUE_C1403_190116_001 64.841 44.537 130880000 0 0 0 63810000 0 0 27945000 0 0 0 39129000 0 0 15023 2183 14109 132339;132340;132341;132342 168588;168589;168590;168591 168589 3 GAEYVASVLK Unmodified 1035.5601 0.56006086 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 1 60.824 60.824 2 0.041067 56106 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.805 7.9354 70342000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70342000 0 0 0 15024 4664 14110 132343 168592 168592 1 GAFAVAHEATTCHGEIYVSGGSLFYR Unmodified 2799.3075 0.30749835 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 3 1 1 2 1 1 98.562 98.562 3;4 4.2267E-58 101253 QUIQUE_C1277_190116_001 157.83 145.34 1280500000 57547000 137310000 109960000 92653000 101840000 0 267650000 0 117000000 46317000 96442000 109980000 143840000 15025 1688 14111 132344;132345;132346;132347;132348;132349;132350;132351;132352;132353;132354;132355;132356;132357;132358 168593;168594;168595;168596;168597;168598;168599;168600;168601;168602;168603;168604;168605;168606;168607;168608;168609;168610;168611;168612;168613;168614;168615 168595 20 GAFCDLVWSDPEDVDTWAISPR Unmodified 2535.1376 0.13763905 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 3 1 2 1 1 2 1 1 1 160.5 160.5 2;3 5.9267E-08 164515 QUIQUE_C1277_190116_001 115.1 107.32 308430000 0 62047000 17954000 45749000 40747000 30542000 33336000 24521000 35481000 0 0 0 18050000 15026 1421 14112 132359;132360;132361;132362;132363;132364;132365;132366;132367;132368;132369;132370;132371;132372 168616;168617;168618;168619;168620;168621;168622;168623;168624;168625;168626;168627;168628;168629;168630 168618 15 GAFGEVAVVK Unmodified 975.53893 0.53893149 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta no no 0 0 0 1 1 54.933 54.933 2 0.047085 53601 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.794 19.456 121560000 0 0 0 0 0 0 0 59907000 0 0 0 0 61656000 15027 4631 14113 132373;132374 168631;168632 168631 2 GAFGEVQLVR Unmodified 1074.5822 0.58219329 1610;2999 Q13464;A0A0U1RQV4;O75116;D6REE7;C9JFJ0 ROCK1;ROCK2 Rho-associated protein kinase 1;Rho-associated protein kinase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.048 74.048 2 0.00013573 74636 QUIQUE_DMIX7_190116_001 121.74 91.668 590550000 0 0 50423000 55121000 58984000 47749000 43429000 89995000 43308000 0 54885000 76578000 70074000 15028 2999;1610 14114 132375;132376;132377;132378;132379;132380;132381;132382;132383;132384 168633;168634;168635;168636;168637;168638;168639;168640;168641;168642;168643;168644;168645 168644 13 GAFHRPVLGGFR Unmodified 1312.7153 0.71527314 241 A0A0C4DGG1;Q9UKS6;E9PIY1;E9PJ75;E9PNM9 PACSIN3 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 yes no 0 0 1 1 38.568 38.568 3 0.055225 35103 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.18 21.29 34623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34623000 0 0 15029 241 14115 132385 168646 168646 1 GAFIYNTLTDFIR Unmodified 1529.7878 0.78782897 521 A2RTX5;B7ZLP8;H0YKB9 TARSL2 Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 150.02 150.02 2 7.664E-06 155937 QUIQUE_C1218_190116_001 123.63 95.421 247680000 29822000 0 0 0 44650000 30197000 40053000 27465000 0 0 75490000 0 0 15030 521 14116 132386;132387;132388;132389;132390;132391 168647;168648;168649;168650;168651;168652;168653 168647 7 GAFNFDQETVINPETGEQIQSWYR Unmodified 2828.3042 0.30418711 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 145.89 145.89 2 7.9288E-07 153412 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117 106.36 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15031 4330 14117 132392 168654 168654 1 GAFPPVWNPIAYLDYNNLWR Unmodified 2405.1957 0.1956867 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 3 2 171.52 171.52 2;3 1.6611E-29 175776 QUIQUE_DMIX3_190116_001 166.38 151.82 733930000 0 25276000 27601000 0 32201000 0 53043000 26511000 130660000 0 232600000 134950000 71093000 15032 2179 14118 132393;132394;132395;132396;132397;132398;132399;132400;132401;132402;132403;132404;132405;132406 168655;168656;168657;168658;168659;168660;168661;168662;168663;168664;168665;168666;168667;168668;168669;168670;168671;168672 168663 18 GAFSEEYK Unmodified 929.41306 0.41306227 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0;K7EN66 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.385 28.385 2 0.01655 23205 QUIQUE_C1218_190116_001 119.57 58.778 5456300000 620740000 775670000 0 558130000 0 528210000 918150000 501780000 506620000 281530000 765490000 0 0 15033 1969 14119 132407;132408;132409;132410;132411;132412;132413;132414;132415 168673;168674;168675;168676;168677;168678;168679;168680;168681 168673 4 GAFSEEYKR Unmodified 1085.5142 0.5141733 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0;K7EN66 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 19.69 19.69 2;3 0.00023669 12070 QUIQUE_DMIX8_190116_001 108.74 95.706 17193000000 654070000 2485600000 2728900000 1882900000 970730000 0 1273300000 1204700000 442340000 700670000 2736500000 483880000 1629800000 15034 1969 14120 132416;132417;132418;132419;132420;132421;132422;132423;132424;132425;132426;132427;132428;132429;132430;132431;132432;132433;132434 168682;168683;168684;168685;168686;168687;168688;168689;168690;168691;168692;168693;168694;168695;168696;168697;168698;168699;168700;168701;168702;168703 168701 20 GAFSVVR Unmodified 734.40752 0.40752338 4533;412;3010;3299;896;803 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;E7EQE4;Q9UQM7;D6RFJ0;A0A2Q3DQE3;Q13555;Q5SWX3;Q13554;H7BXS4;E9PBE8;E7ETC9;E7ERS6 CAMK2D;CAMK2B;CAMK2A;CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.614 32.614 2 0.016314 27694 QUIQUE_C1277_190116_001 133.99 95.786 15188000000 1834900000 1922500000 1003000000 1185600000 1513000000 0 1443400000 0 1132600000 597140000 1557400000 1638400000 1359700000 15035 803;896;4533;412;3299;3010 14121 132435;132436;132437;132438;132439;132440;132441;132442;132443;132444;132445 168704;168705;168706;168707;168708;168709;168710;168711;168712;168713;168714;168715 168705 12 GAGAFGYFEVTHDITK Unmodified 1711.8206 0.82058566 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 97.463 97.463 2;3 3.5401E-09 101520 QUIQUE_C1218_190116_001 124.06 90.972 1979800000 165040000 247960000 254910000 110280000 227990000 107250000 124480000 84255000 130170000 0 273670000 117680000 136090000 15036 1849 14122 132446;132447;132448;132449;132450;132451;132452;132453;132454;132455;132456;132457;132458;132459;132460;132461;132462;132463;132464;132465;132466;132467 168716;168717;168718;168719;168720;168721;168722;168723;168724;168725;168726;168727;168728;168729;168730;168731;168732;168733;168734;168735;168736;168737;168738;168739 168717 22 GAGAGHPGAGGAQPPDSPAGVR Unmodified 1882.9034 0.90342086 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 22.882 22.882 2 1.092E-34 16757 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.96 109.08 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15037 3029 14123 132468;132469 168740;168741 168740 2 GAGALLQHGLVNFTFNK Unmodified 1785.9526 0.95260288 1358 M0QWZ7;Q9NP81;M0R2C6;M0R259 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.14 110.14 3 0.00029218 113243 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.724 55.239 208940000 43057000 31053000 0 0 0 0 0 29723000 32159000 0 72949000 0 0 15038 1358 14124 132470;132471;132472;132473;132474;132475 168742;168743;168744;168745;168746;168747;168748 168746 7 GAGATLEHQQEISK Unmodified 1467.7318 0.73177065 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 19.268 19.268 2;3 8.311E-14 11782 QUIQUE_C1368_190116_001 140.45 101.7 139560000 45523000 0 30453000 34693000 0 0 28892000 0 0 0 0 0 0 15039 4631 14125 132476;132477;132478;132479 168749;168750;168751;168752 168750 4 GAGAYICGEETALIESIEGK Unmodified 2066.983 0.98303589 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;H0YE81;E9PLC6 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 151.17 151.17 2;3 1.5368E-06 156403 QUIQUE_C1368_190116_001 123.1 106.43 1130000000 176250000 181500000 123090000 138490000 0 0 150880000 0 0 46351000 0 120440000 192960000 15040 1069 14126 132480;132481;132482;132483;132484;132485;132486;132487;132488;132489 168753;168754;168755;168756;168757;168758;168759;168760;168761;168762;168763;168764;168765 168758 13 GAGGEDLIMLDIYAIEELR Unmodified 2077.0402 0.04015684 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 170.32 170.32 3 0.051535 177693 QUIQUE_DMIX5_190116_001 25.496 16.895 20951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20951000 0 0 15041 2533 14127 132490 168766 168766 1 GAGHPCYLDKPEEWHTGLLDFLQGLQ Unmodified 2980.4178 0.41777708 3881 Q96IU4;F8W9U3 ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 152.16 152.16 3 2.2017E-11 159078 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.245 72.916 317690000 0 0 74494000 0 0 0 61262000 0 61745000 0 120190000 0 0 15042 3881 14128 132491;132492;132493;132494;132495;132496 168767;168768;168769;168770;168771;168772 168771 6 GAGIGGLGITVEGPSESK Unmodified 1627.8417 0.84171503 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 91.854 91.854 2 0.00061231 93773 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.795 57.93 178620000 0 0 0 0 0 0 0 32871000 43863000 20418000 0 39650000 41817000 15043 1628 14129 132497;132498;132499;132500;132501;132502;132503;132504 168773;168774;168775;168776;168777;168778;168779;168780 168777 8 GAGPGCYLAGSLTLSK Unmodified 1550.7763 0.776278 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 95.152 95.152 2 0.0024185 97562 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.924 48.766 163070000 0 0 0 0 0 0 51341000 28853000 0 0 0 38075000 44804000 15044 2285 14130 132505;132506;132507;132508 168781;168782;168783;168784 168783 3 GAGQQQSQEMMEVDR Unmodified 1692.7196 0.71956776 3140 Q15435;B5MBZ8;C9JRC4 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.679 41.679 2 1.7476E-79 38875 QUIQUE_C1218_190116_001 257.42 250.53 1080100000 90885000 110640000 55791000 101690000 87512000 86216000 75754000 96322000 72174000 30259000 79036000 69972000 123900000 15045 3140 14131 132509;132510;132511;132512;132513;132514;132515;132516;132517;132518;132519;132520;132521 168785;168786;168787;168788;168789;168790;168791;168792;168793;168794;168795;168796;168797 168785 12 GAGQQQSQEMMEVDRR Unmodified 1848.8207 0.82067879 3140 Q15435;B5MBZ8;C9JRC4 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 1 1 30.503 30.503 3 0.0040125 25562 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.926 36.311 34658000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34658000 0 0 15046 3140 14132 132522 168798 168798 1 GAGQTVTIIAQYQPEDYAR Unmodified 2080.0225 0.022532941 655 B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2 DLG2 Disks large homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 103.05 103.05 2 1.1824E-37 105923 QUIQUE_C1277_190116_001 180.48 145.79 96783000 0 24644000 0 0 0 0 0 37684000 0 0 0 34455000 0 15047 655 14133 132523;132524;132525 168799;168800;168801 168799 2 GAGSYTIMVLFADQATPTSPIR Unmodified 2295.1569 0.15691793 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 151.24 151.24 2;3 8.6033E-28 154302 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.563 78.975 235050000 0 0 29293000 0 0 0 0 76523000 43786000 16067000 0 69385000 0 15048 2178 14134 132526;132527;132528;132529;132530;132531;132532 168802;168803;168804;168805;168806;168807;168808;168809;168810 168806 9 GAGTDDHTLIR Unmodified 1154.568 0.56799978 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 19.485 19.485 2;3 2.0918E-69 11798 QUIQUE_DMIX8_190116_001 224.86 197.34 63888000000 3052200000 5577000000 5607400000 6600100000 5077000000 6230000000 6370700000 4184900000 4664300000 2211400000 4521500000 3066400000 6725700000 15049 1954 14135 132533;132534;132535;132536;132537;132538;132539;132540;132541;132542;132543;132544;132545;132546;132547;132548;132549;132550;132551;132552;132553;132554;132555;132556;132557;132558 168811;168812;168813;168814;168815;168816;168817;168818;168819;168820;168821;168822;168823;168824;168825;168826;168827;168828;168829;168830;168831;168832;168833;168834;168835;168836;168837;168838 168837 28 GAGTDDSTLVR Unmodified 1090.5255 0.52546627 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.275 23.275 2 0.0060479 16940 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.414 31.795 2196900000 368900000 336750000 0 0 0 0 0 321530000 427300000 183480000 0 0 558940000 15050 2161 14136 132559;132560;132561;132562;132563;132564 168839;168840;168841;168842;168843;168844 168841 5 GAGTDEGCLIEILASR Unmodified 1660.809 0.80903469 1968 P09525 ANXA4 Annexin A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 132.28 132.28 2;3 8.5749E-08 136577 QUIQUE_C1403_190116_001 147.71 132.44 1859000000 149860000 148840000 179290000 213630000 187310000 0 155020000 0 198700000 79650000 180680000 153940000 212090000 15051 1968 14137 132565;132566;132567;132568;132569;132570;132571;132572;132573;132574;132575;132576;132577 168845;168846;168847;168848;168849;168850;168851;168852;168853;168854;168855;168856;168857;168858 168849 12 GAGTGGLGLAIEGPSEAK Unmodified 1583.8155 0.81550028 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.822 77.822 2 2.3178E-17 79731 QUIQUE_C1218_190116_001 132.99 115.25 663480000 36874000 0 47477000 59550000 56632000 34350000 102390000 28231000 67080000 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Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.809 85.809 2 0.00073035 87888 QUIQUE_C1277_190116_001 110.34 85.833 750690000 62029000 56968000 69819000 63823000 53105000 47697000 69874000 45961000 61055000 23328000 69257000 63869000 63903000 15057 1421 14143 132620;132621;132622;132623;132624;132625;132626;132627;132628;132629;132630;132631;132632 168902;168903;168904;168905;168906;168907;168908;168909;168910;168911;168912;168913;168914;168915;168916;168917 168905 15 GAGWTGHVAGTR Unmodified 1168.5738 0.57375386 3124 Q15274;C9JCJ5 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 20.279 20.279 2;3 0.0013486 13267 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.317 73.47 2304100000 222100000 87995000 244800000 0 0 117920000 0 371680000 454660000 77600000 306530000 176050000 244760000 15058 3124 14144 132633;132634;132635;132636;132637;132638;132639;132640;132641;132642;132643;132644;132645 168918;168919;168920;168921;168922;168923;168924;168925;168926;168927;168928;168929;168930 168926 8 GAGYTFGQDISETFNHANGLTLVSR Unmodified 2654.2725 0.27249305 2758;2789 P62714;H0YC23;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 1 3 1 2 1 1 1 1 1 2 132.94 132.94 2;3 5.5582E-98 137444 QUIQUE_DMIX3_190116_001 211.13 192.3 3557500000 30660000 0 35595000 416870000 355010000 614260000 0 486640000 51969000 162620000 727620000 676260000 0 15059 2758;2789 14145 132646;132647;132648;132649;132650;132651;132652;132653;132654;132655;132656;132657;132658;132659;132660 168931;168932;168933;168934;168935;168936;168937;168938;168939;168940;168941;168942;168943;168944;168945;168946;168947;168948;168949;168950 168943 20 GAHGIIVVYDVTDQESFNNVK Unmodified 2304.1386 0.13862533 2763 P62820;E7END7 RAB1A Ras-related protein Rab-1A yes no 0 0 0 3 1 1 1 1 2 1 2 1 1 100.8 100.8 3 1.8374E-14 103072 QUIQUE_C1403_190116_001 119.68 109.93 649520000 128100000 0 0 49840000 51648000 51629000 0 62176000 162410000 69064000 0 74651000 0 15060 2763 14146 132661;132662;132663;132664;132665;132666;132667;132668;132669;132670;132671;132672;132673;132674 168951;168952;168953;168954;168955;168956;168957;168958;168959;168960;168961;168962;168963;168964;168965;168966;168967 168958 15 GAHGIIVVYDVTDQESYANVK Unmodified 2277.1277 0.12772629 4124 Q9H0U4 RAB1B Ras-related protein Rab-1B yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 96.098 96.098 3 3.1068E-14 93308 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.264 75.227 820610000 113630000 69984000 60579000 57477000 45129000 66385000 96990000 66304000 53860000 52581000 42314000 40799000 54580000 15061 4124 14147 132675;132676;132677;132678;132679;132680;132681;132682;132683;132684;132685;132686;132687;132688;132689;132690 168968;168969;168970;168971;168972;168973;168974;168975;168976;168977;168978;168979;168980;168981;168982;168983 168980 9 GAHLTALEMLTAFASHIR Unmodified 1938.0146 0.014551212 3841 Q96EL3 MRPL53 39S ribosomal protein L53, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 145.23 145.23 3 2.7343E-06 149855 QUIQUE_DMIX7_190116_001 87.388 66.651 37447000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24713000 12734000 15062 3841 14148 132691;132692 168984;168985;168986 168984 3 GAHNGQGLGNAFLSHISACDGIFHLTR Unmodified 2849.378 0.37797795 1276 J3KQ32;Q9NTK5 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 115.06 115.06 5 7.4787E-13 117681 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.451 63.728 206830000 0 0 0 0 0 0 50485000 44635000 0 30373000 81340000 0 0 15063 1276 14149 132693;132694;132695;132696 168987;168988;168989;168990;168991;168992 168988 5 GAHSVGLMWWMLAR Oxidation (M) 1629.7908 0.79082263 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 1 0 1 1 113.16 113.16 3 0.011451 117149 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.761 34.225 47992000 0 0 0 0 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QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.326 60.848 34241000 0 0 0 15046000 0 0 0 19195000 0 0 0 0 0 15067 2944 14152 132711;132712;132713 169008;169009;169010 169010 3 GAIEVLIR Unmodified 869.53345 0.53345218 2543 P49756;E9PQU5 RBM25 RNA-binding protein 25 yes no 0 0 0 1 69.464 69.464 2 0.050383 69702 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.637 9.0743 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15068 2543 14153 132714 169011 169011 1 GAILNISSGSGMLPVPLLTIYSATK Unmodified 2502.3767 0.37674711 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6;A0A1B0GV93 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 166.79 166.79 2;3 5.1161E-19 171239 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.67 139.12 434730000 26970000 0 0 27556000 0 25235000 43956000 42494000 129260000 9858600 129410000 0 0 15069 3252 14154 132715;132716;132717;132718;132719;132720;132721;132722;132723;132724 169012;169013;169014;169015;169016;169017;169018;169019;169020;169021 169018 10 GAILNISSGSGMLPVPLLTIYSATK Oxidation (M) 2518.3717 0.37166174 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6;A0A1B0GV93 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 1 0 1 2 1 159.42 159.42 2;3 2.4935E-08 164327 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.816 70.5 183100000 0 0 0 0 0 0 0 59290000 93258000 0 0 30553000 0 15070 3252 14154 132725;132726;132727;132728 169022;169023;169024;169025 169024 2640 3 GAILTTMLATR Unmodified 1146.6431 0.64307898 4533;3010;896;803;1135 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;Q9UQM7;Q13554;H7BZC6 CAMK2D;CAMK2A;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 92.678 92.678 1;2 1.3813E-08 95783 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.62 119.6 19155000000 1890500000 2217700000 1440200000 1604800000 1575400000 1149800000 1816600000 1256500000 1107300000 528270000 1640100000 1748800000 1179000000 15071 803;896;1135;4533;3010 14155 132729;132730;132731;132732;132733;132734;132735;132736;132737;132738;132739;132740;132741;132742 169026;169027;169028;169029;169030;169031;169032;169033;169034;169035;169036;169037;169038;169039;169040;169041;169042;169043;169044;169045;169046;169047;169048;169049 169044 23 GAILTTMLATR Oxidation (M) 1162.638 0.63799361 4533;3010;896;803;1135 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;Q9UQM7;Q13554;H7BZC6 CAMK2D;CAMK2A;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 1 0 1 1 57.79 57.79 2 0.0070333 56492 QUIQUE_C1368_190116_001 67.704 32.348 761160000 0 461090000 300070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15072 803;896;1135;4533;3010 14155 132743;132744 169050;169051 169051 480 2 GAILTTMLVSR Unmodified 1160.6587 0.65872905 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.119 94.119 2 0.0010651 95779 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.4 64.367 2754200000 296560000 307870000 244490000 255250000 262300000 200520000 301330000 288520000 0 0 332560000 0 264770000 15073 412;3299 14156 132745;132746;132747;132748;132749;132750;132751;132752;132753;132754 169052;169053;169054;169055;169056;169057;169058;169059;169060;169061 169061 6 GAIPGQAPGSVPGPGLVK Unmodified 1600.8937 0.89369102 3052 Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.095 75.095 2 0.015141 75992 QUIQUE_C1277_190116_001 56.295 32.459 750590000 0 94837000 0 114850000 109590000 0 118430000 0 91119000 0 0 107670000 114090000 15074 3052 14157 132755;132756;132757;132758;132759;132760;132761 169062;169063;169064;169065;169066;169067;169068 169062 0 GAIQFVTQYQHSSGQR Unmodified 1805.8809 0.8808945 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 60.434 60.434 2 2.0584E-12 59140 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.64 100.76 112810000 0 0 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Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.468 67.468 3 7.941E-30 67428 QUIQUE_C1277_190116_001 143.57 115.72 497710000 39283000 57941000 61293000 40533000 30896000 28163000 24688000 28571000 42270000 13806000 63365000 42017000 24881000 15077 553 14160 132791;132792;132793;132794;132795;132796;132797;132798;132799;132800;132801;132802;132803 169102;169103;169104;169105;169106;169107;169108;169109;169110;169111;169112;169113;169114;169115 169103 13 GAITPVLLLCICR Unmodified 1484.8207 0.82072577 1599 O60883 GPR37L1 Prosaposin receptor GPR37L1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 136.17 136.17 2 0.0018321 141047 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.087 63.784 89807000 0 0 19954000 0 0 0 17763000 0 27431000 0 24660000 0 0 15078 1599 14161 132804;132805;132806;132807 169116;169117;169118;169119 169118 4 GAIYSIPIMEDGGGGSSTPEDPAEAPR Unmodified 2673.2228 0.22282525 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 119.7 119.7 2;3 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11186 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.265 31.41 159840000 0 0 0 0 0 0 0 62551000 37766000 0 0 41864000 17656000 15083 2378 14166 132846;132847;132848;132849 169165;169166;169167;169168 169167 4 GALDMLTK Unmodified 847.44734 0.44733929 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3KRZ4;J3KSZ5;J3QS45 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 69.295 69.295 2 0.008111 68945 QUIQUE_C1368_190116_001 95.541 42.378 402700000 72225000 52114000 60584000 0 44297000 39978000 0 71217000 0 0 62280000 0 0 15084 3464 14167 132850;132851;132852;132853;132854;132855;132856;132857 169169;169170;169171;169172;169173;169174;169175;169176 169171 8 GALEGSSCPFR Unmodified 1179.5343 0.53425682 2319 P30519;A0A087WT44 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 1 45.255 45.255 2 0.0012786 41408 QUIQUE_C1277_190116_001 87.308 53.511 164700000 78410000 52796000 0 0 0 0 0 0 0 33492000 0 0 0 15085 2319 14168 132858;132859;132860;132861;132862;132863;132864;132865;132866;132867;132868;132869 169177;169178;169179;169180;169181;169182;169183;169184;169185;169186;169187;169188;169189 169179 13 GALEMVQMAVEAK Unmodified 1375.684 0.68395752 1536 O43617;A0A087WWM0;A0A087WYS5 TRAPPC3 Trafficking protein particle complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.22 119.22 2 2.9319E-05 122154 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.11 127.79 346430000 0 0 0 0 0 0 0 58402000 73377000 22458000 69076000 61485000 61628000 15086 1536 14169 132870;132871;132872;132873;132874;132875 169190;169191;169192;169193;169194;169195;169196 169191 5 GALFGANANR Unmodified 989.50428 0.50427732 2397 P36543 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.021 33.021 2 0.00093482 28657 QUIQUE_C1218_190116_001 103.91 79.952 10370000000 1218000000 1291500000 1142200000 991250000 889940000 903110000 1130400000 700550000 803130000 402190000 0 898050000 0 15087 2397 14170 132876;132877;132878;132879;132880;132881;132882;132883;132884;132885;132886 169197;169198;169199;169200;169201;169202;169203;169204;169205;169206;169207;169208 169197 12 GALFGANANRK Unmodified 1117.5992 0.59924033 2397 P36543 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes yes 0 0 1 1 1 17.993 17.993 2 0.0059188 10411 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.492 60.981 786640000 0 0 0 0 0 0 0 491700000 0 0 0 294940000 0 15088 2397 14171 132887;132888 169209;169210 169210 2 GALFQAHAR Unmodified 969.51445 0.51444807 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 18.838 18.838 2 0.054554 11842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.975 60.199 184160000 0 0 0 0 0 0 0 184160000 0 0 0 0 0 15089 98;3487 14172 132889 169211 169211 0 GALGSIALLGLVGTTVCSAFQHLGWVK Unmodified 2754.4891 0.48909153 1453 Q5VV89;O14880 MGST3 Microsomal glutathione S-transferase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 174.71 174.71 3 5.9245E-162 181684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.31 196.07 603940000 0 0 0 0 0 0 0 0 37289000 0 203810000 362840000 0 15090 1453 14173 132890;132891;132892 169212;169213;169214;169215 169213 4 GALILSNVQPSDTMVTQCEAR Unmodified 2289.1093 0.10931581 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 102.71 102.71 2 3.2068E-06 106416 QUIQUE_C1576_190116_001 105.46 85.079 23992000 0 0 0 0 0 0 23992000 0 0 0 0 0 0 15091 2345 14174 132893 169216 169216 1 GALINVPPPFLGLPR Unmodified 1559.9188 0.91878356 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 141.07 141.07 2 0.010099 147407 QUIQUE_C1438_190116_001 60.518 49.767 117230000 0 33460000 0 25561000 20477000 0 0 19152000 18578000 0 0 0 0 15092 2254 14175 132894;132895;132896;132897;132898 169217;169218;169219;169220;169221 169219 5 GALIVLEGVDR Unmodified 1140.6503 0.65027285 2224 P23919;G5E9E9 DTYMK Thymidylate kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 92.41 92.41 2 0.031296 90012 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.805 29.277 52487000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14286000 0 19427000 18774000 15093 2224 14176 132899;132900;132901;132902 169222;169223;169224;169225 169223 4 GALLPLSIR Unmodified 938.5913 0.59130141 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.903 91.903 2 0.013461 93626 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.905 35.802 121510000 0 24460000 15473000 17765000 20397000 16150000 0 0 0 0 0 0 27265000 15094 3896 14177 132903;132904;132905;132906;132907;132908;132909 169226;169227;169228;169229;169230;169231;169232 169232 7 GALLSMDALDLTDK Unmodified 1461.7385 0.73849551 4497 Q9ULZ3;H3BP42 PYCARD Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD yes no 0 0 0 1 1 129.49 129.49 2 0.009531 134850 QUIQUE_C1368_190116_001 75.416 59.786 36686000 0 0 36686000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15095 4497 14178 132910;132911 169233;169234 169234 2 GALLVFAEHR Unmodified 1111.6138 0.61382777 4436 Q9UHL4;R4GNE8;R4GN05 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 60.49 60.49 2;3 0.0016056 58962 QUIQUE_C1368_190116_001 70.399 57.82 1118000000 118140000 161520000 111060000 80930000 116620000 64982000 69593000 37757000 79443000 27090000 102430000 98109000 50320000 15096 4436 14179 132912;132913;132914;132915;132916;132917;132918;132919;132920;132921;132922;132923;132924;132925;132926;132927;132928;132929;132930;132931;132932;132933 169235;169236;169237;169238;169239;169240;169241;169242;169243;169244;169245;169246;169247;169248;169249;169250;169251;169252;169253;169254;169255;169256;169257;169258 169241 24 GALMANFLTQGQVCCNGTR Unmodified 2096.9554 0.95539813 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 106.97 106.97 2 2.3001E-08 110406 QUIQUE_C1368_190116_001 134.21 112.01 98408000 0 0 32676000 41794000 0 0 23938000 0 0 0 0 0 0 15097 2522 14180 132934;132935;132936 169259;169260;169261 169259 2 GALPDDTEALQSLIDTHK Unmodified 1922.9585 0.9585357 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.59 117.59 3 7.1888E-05 121805 QUIQUE_C1368_190116_001 61.648 50.534 266220000 0 32832000 44398000 0 0 0 37207000 0 30358000 24760000 47672000 48998000 0 15098 1187 14181 132937;132938;132939;132940;132941;132942;132943 169262;169263;169264;169265;169266;169267;169268;169269 169264 7 GALPEGITSELECVTNSTLAAIIR Unmodified 2514.3 0.29995335 4523 Q9UPY6 WASF3 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 172.21 172.21 2;3 4.1975E-88 179363 QUIQUE_DMIX5_190116_001 245.19 233.4 1687400000 95185000 94614000 73853000 227360000 131580000 0 0 44685000 216120000 0 322650000 223570000 257750000 15099 4523 14182 132944;132945;132946;132947;132948;132949;132950;132951;132952;132953;132954;132955;132956;132957;132958 169270;169271;169272;169273;169274;169275;169276;169277;169278;169279;169280;169281;169282;169283;169284;169285 169281 15 GALPLDTVTFYK Unmodified 1323.7075 0.70745338 2297 P30040 ERP29 Endoplasmic reticulum resident protein 29 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.51 110.51 2 0.00053514 115376 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P11309 PIM1 Serine/threonine-protein kinase pim-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 34.1 34.1 2 0.00053564 29230 QUIQUE_C1218_190116_001 112.17 9.4521 822630000 191550000 0 0 149110000 0 174780000 0 174010000 0 0 0 133180000 0 15103 2023 14186 132973;132974;132975;132976;132977 169301;169302;169303;169304;169305 169301 5 GALQNIIPASTGAAK Unmodified 1410.7831 0.78307794 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 3 2 3 2 3 2 2 74.026 74.026 2;3 1.1793E-06 73803 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.91 132.96 217820000000 19363000000 19358000000 1460200000 19540000000 15176000000 16338000000 16830000000 19489000000 18482000000 8944300000 22995000000 18937000000 20907000000 15104 1863 14187 132978;132979;132980;132981;132982;132983;132984;132985;132986;132987;132988;132989;132990;132991;132992;132993;132994;132995;132996;132997;132998;132999;133000;133001;133002;133003;133004;133005;133006;133007 169306;169307;169308;169309;169310;169311;169312;169313;169314;169315;169316;169317;169318;169319;169320;169321;169322;169323;169324;169325;169326;169327;169328;169329;169330;169331;169332;169333;169334;169335;169336;169337;169338;169339;169340;169341;169342;169343;169344;169345;169346;169347;169348;169349;169350;169351;169352;169353;169354;169355;169356;169357;169358;169359;169360;169361;169362;169363;169364;169365;169366;169367;169368;169369;169370;169371;169372;169373;169374 169350 69 GALQQGEAFQR Unmodified 1203.5996 0.59963426 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.341 37.341 2 2.4138E-24 33386 QUIQUE_DMIX7_190116_001 182.69 106.83 2371500000 153260000 135250000 169780000 200440000 140710000 230130000 275680000 131700000 221960000 0 255410000 187700000 269510000 15105 3803 14188 133008;133009;133010;133011;133012;133013;133014;133015;133016;133017;133018;133019 169375;169376;169377;169378;169379;169380;169381;169382;169383;169384;169385;169386;169387;169388;169389 169388 15 GALQYLVPILTQTLTK Unmodified 1758.0291 0.029121869 3090 Q14974 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 164.07 164.07 2;3 3.2131E-24 168003 QUIQUE_C1403_190116_001 177.93 162.72 10670000000 613480000 635530000 837770000 556260000 1630500000 471880000 1137900000 526240000 609820000 244720000 898190000 1301400000 1206600000 15106 3090 14189 133020;133021;133022;133023;133024;133025;133026;133027;133028;133029;133030;133031;133032;133033;133034;133035;133036;133037;133038;133039;133040;133041;133042;133043;133044;133045;133046 169390;169391;169392;169393;169394;169395;169396;169397;169398;169399;169400;169401;169402;169403;169404;169405;169406;169407;169408;169409;169410;169411;169412;169413;169414;169415;169416;169417;169418;169419;169420;169421;169422;169423;169424;169425;169426;169427;169428;169429;169430;169431;169432;169433;169434;169435;169436;169437;169438;169439;169440;169441;169442;169443;169444 169406 54 GALSALREEHR Unmodified 1237.6527 0.65273247 1464 O14964;I3L1E3 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 1 1 1 1 19.385 19.385 3 0.0091484 11898 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.37 28.897 220480000 0 0 0 0 0 0 0 0 50918000 0 0 77584000 91979000 15107 1464 14190 133047;133048;133049 169445;169446;169447 169447 2 GALSPGGFDDSTLPLVDK Unmodified 1787.8941 0.89414453 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 118.12 118.12 2 0.0075452 124089 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.116 35.24 175350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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169474;169475;169476;169477;169478;169479;169480;169481;169482;169483;169484;169485;169486;169487 169478 10 GALYCELCYEK Unmodified 1404.6054 0.60537285 3865 Q96HC4;H0Y8Y3;A0A0A0MSP3 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.84 74.84 2 0.0039565 72171 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.607 52.83 484280000 40039000 55219000 53109000 0 46765000 49310000 55319000 64487000 69342000 50689000 0 0 0 15114 3865 14197 133088;133089;133090;133091;133092;133093;133094;133095;133096;133097;133098 169488;169489;169490;169491;169492;169493;169494;169495;169496;169497;169498;169499 169498 11 GAMGIMLVYDITNGK Unmodified 1581.7895 0.78948522 2709 P61026 RAB10 Ras-related protein Rab-10 yes yes 0 0 0 1 142.84 142.84 2 0.017427 150375 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.695 62.033 41098000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41098000 0 0 15115 2709 14198 133099 169500 169500 0 GAMLTHGNVVADFSGFLK Unmodified 1862.9349 0.93490391 4476;703 Q9UKU0;E7ERD7;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 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126750000 134150000 85234000 130560000 102180000 73119000 64597000 21630000 71933000 106070000 47969000 15118 2132 14201 133114;133115;133116;133117;133118;133119;133120;133121;133122;133123;133124;133125;133126 169518;169519;169520;169521;169522;169523;169524;169525;169526;169527;169528;169529;169530;169531;169532;169533;169534 169521 17 GANDFMCDEMER Oxidation (M) 1489.5272 0.52719888 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 1 0 1 1 47.054 47.054 2 0.038172 44432 QUIQUE_C1277_190116_001 48.188 41.804 56055000 0 31037000 25018000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15119 2132 14201 133127;133128 169535;169536 169535 2 GANFLTQILLRPGASDLTGSFR Unmodified 2333.2492 0.24917883 1115 Q5QPK2;H0Y368;O60762;Q5QPJ9 DPM1 Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 1 1 1 145.89 145.89 3 0.0023072 150737 QUIQUE_C1277_190116_001 43.497 29.625 91844000 0 29890000 0 0 0 0 0 0 0 0 61954000 0 0 15120 1115 14202 133129;133130 169537;169538 169537 2 GANIQLLDLPGIIEGAAQGK Unmodified 1977.0895 0.089490294 570 A8MZF9;P55039;J3QRI9;J3QKW7;J3QR71 DRG2 Developmentally-regulated GTP-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 160.29 160.29 2 0.00019662 165951 QUIQUE_C1576_190116_001 91.812 79.045 103830000 17225000 0 0 22813000 24895000 14911000 23984000 0 0 0 0 0 0 15121 570 14203 133131;133132;133133;133134;133135 169539;169540;169541;169542;169543 169543 5 GANPVEIR Unmodified 854.46102 0.46101552 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.644 23.644 2 1.18E-06 17291 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.75 124.72 11730000000 0 1285500000 1457400000 1202400000 1163300000 1261000000 1537100000 610370000 1017200000 680320000 1515600000 0 0 15122 2004 14204 133136;133137;133138;133139;133140;133141;133142;133143;133144;133145 169544;169545;169546;169547;169548;169549;169550;169551;169552;169553;169554;169555 169555 12 GANPVEIRR Unmodified 1010.5621 0.56212655 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 16.372 16.372 2 0.02126 8456 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.625 29.663 355950000 0 0 0 0 0 0 0 202120000 153830000 0 0 0 0 15123 2004 14205 133146;133147 169556;169557 169557 2 GANQWIK Unmodified 815.42899 0.42898711 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 28.746 28.746 2 0.019813 23470 QUIQUE_C1218_190116_001 121.87 44.124 1175900000 342730000 370530000 0 0 0 0 0 0 339130000 123540000 0 0 0 15124 1943 14206 133148;133149;133150;133151 169558;169559;169560;169561 169558 4 GANVIAGVWLEEAGQK Unmodified 1640.8522 0.85222014 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 3 3 1 1 2 2 1 3 2 117.67 117.67 2;3 6.8421E-06 121555 QUIQUE_C1368_190116_001 130.56 97.616 2115400000 20073000 255650000 326070000 84817000 0 59948000 276000000 199670000 0 149300000 446040000 297790000 0 15125 3117 14207 133152;133153;133154;133155;133156;133157;133158;133159;133160;133161;133162;133163;133164;133165;133166;133167;133168;133169;133170;133171 169562;169563;169564;169565;169566;169567;169568;169569;169570;169571;169572;169573;169574;169575;169576;169577;169578;169579;169580;169581;169582;169583;169584;169585;169586 169568 23 GAPAPHCEMSR Unmodified 1211.5176 0.51756089 185 A0A0G2JKZ1;A0A0A0MSV9;O15533;A2AB90;A0A0G2JH37;C9JA35;Q6P1N7 TAPBP Tapasin yes no 0 0 0 1 11.192 11.192 3 0.039863 3573 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.737 28.718 8662700 0 0 0 0 0 0 0 8662700 0 0 0 0 0 15126 185 14208 133172 169587;169588 169587 2 GAPAVVISQGR Unmodified 1053.5931 0.59309232 1430 O14531 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.037 33.037 2 2.731E-08 28172 QUIQUE_C1576_190116_001 154.49 115.47 4380900000 359430000 468280000 376510000 407310000 0 330290000 408110000 298680000 341590000 179050000 523640000 322670000 365370000 15127 1430 14209 133173;133174;133175;133176;133177;133178;133179;133180;133181;133182;133183;133184 169589;169590;169591;169592;169593;169594;169595;169596;169597;169598;169599;169600;169601;169602 169595 14 GAPEPGTQDASIPVEK Unmodified 1594.7839 0.7838658 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.286 49.286 2 4.7552E-07 44949 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.24 90.764 799580000 58143000 63111000 67657000 58786000 49449000 54024000 62598000 43937000 66919000 34430000 95087000 67355000 78084000 15128 4323 14210 133185;133186;133187;133188;133189;133190;133191;133192;133193;133194;133195;133196;133197 169603;169604;169605;169606;169607;169608;169609;169610;169611;169612;169613;169614;169615;169616 169613 14 GAPGVSVDMNITYMSPAK Unmodified 1836.875 0.87500577 4246 Q9NPJ3 ACOT13 Acyl-coenzyme A thioesterase 13;Acyl-coenzyme A thioesterase 13, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 104.92 104.92 2 0.036257 108439 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.043 44.31 68920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68920000 15129 4246 14211 133198 169617 169617 0 GAPLNTPVTEDR Unmodified 1268.6361 0.63607935 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 39.155 39.155 2 0.0093664 35569 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.282 50.474 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15130 3169 14212 133199;133200 169618;169619 169619 2 GAPLVKPLPVNPTDPAVTGPDIFAK Unmodified 2513.3894 0.38936071 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.67 117.67 3 7.5978E-18 121666 QUIQUE_C1403_190116_001 73.11 66.158 1286900000 101620000 115010000 104070000 80938000 130870000 77008000 92480000 79546000 119700000 40308000 121640000 105220000 118440000 15131 4161 14213 133201;133202;133203;133204;133205;133206;133207;133208;133209;133210;133211;133212;133213 169620;169621;169622;169623;169624;169625;169626;169627;169628;169629;169630;169631;169632;169633 169624 14 GAPLVVICQGK Unmodified 1140.6325 0.6325143 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.481 54.481 2 5.6798E-30 53551 QUIQUE_C1218_190116_001 192.11 181.24 21862000000 1275600000 1253500000 1851800000 1773500000 1547600000 1109300000 1989800000 1240700000 2169600000 596220000 1975400000 1883100000 3196000000 15132 3051 14214 133214;133215;133216;133217;133218;133219;133220;133221;133222;133223;133224;133225;133226 169634;169635;169636;169637;169638;169639;169640;169641;169642;169643;169644;169645;169646;169647;169648;169649;169650;169651;169652;169653;169654 169634 21 GAPNPWLFEEPEETR Unmodified 1770.8213 0.82131394 4511 Q9UNK0;K7EQB1 STX8 Syntaxin-8 yes no 0 0 0 1 1 1 111.34 111.34 2 0.00085887 115496 QUIQUE_C1277_190116_001 95.498 83.93 55874000 0 0 0 0 0 0 0 0 28342000 0 27532000 0 0 15133 4511 14215 133227;133228;133229 169655;169656;169657 169655 3 GAPPGYRPSAWVHLLHQLPR Unmodified 2251.2127 0.21267417 4154 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2053.0116 0.011633904 2166 P20339 RAB5A Ras-related protein Rab-5A yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 129.06 129.06 2;3 3.3839E-55 133445 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.65 144.6 448030000 0 42163000 63319000 54349000 0 0 0 50125000 51020000 17562000 75921000 46096000 47472000 15140 2166 14221 133276;133277;133278;133279;133280;133281;133282;133283;133284;133285;133286;133287;133288;133289 169723;169724;169725;169726;169727;169728;169729;169730;169731;169732;169733;169734;169735;169736 169731 13 GAQAAIVVYDITNQETFAR Unmodified 2066.0433 0.043268383 2708 P61020;F8VUA5 RAB5B Ras-related protein Rab-5B yes no 0 0 0 3 2 1 2 1 2 2 2 1 2 1 1 1 126.45 126.45 2;3 9.5694E-86 131842 QUIQUE_C1218_190116_001 196.58 175.35 1297100000 141210000 128050000 62666000 157190000 43567000 168230000 136430000 153150000 66960000 64736000 65934000 48645000 60333000 15141 2708 14222 133290;133291;133292;133293;133294;133295;133296;133297;133298;133299;133300;133301;133302;133303;133304;133305;133306;133307;133308;133309;133310 169737;169738;169739;169740;169741;169742;169743;169744;169745;169746;169747;169748;169749;169750;169751;169752;169753;169754;169755;169756;169757;169758;169759;169760;169761 169738 23 GAQAAIVVYDITNTDTFAR Unmodified 2025.0167 0.016719282 2575 P51148;K7ERI8;K7ERQ8;F8VVK3;K7ENY4 RAB5C Ras-related protein Rab-5C yes no 0 0 0 2 2 1 2 4 1 2 2 3 2 2 1 3 129.59 129.59 2;3 1.6762E-55 126005 QUIQUE_DMIX4_190116_001 129.88 112.81 469380000 87107000 22042000 46675000 0 57279000 0 38942000 0 60568000 78326000 48607000 29831000 0 15142 2575 14223 133311;133312;133313;133314;133315;133316;133317;133318;133319;133320;133321;133322;133323;133324;133325;133326;133327;133328;133329;133330;133331;133332;133333;133334;133335;133336;133337 169762;169763;169764;169765;169766;169767;169768;169769;169770;169771;169772;169773;169774;169775;169776;169777;169778;169779;169780;169781;169782;169783;169784;169785;169786;169787;169788;169789;169790 169782 25 GAQEEEPTDPQLMR Unmodified 1599.7199 0.71988533 93 H0YKH1;A0A087X0P4;H0YLF5;A0A0A0MTI0;P40424;F8WA05 PBX1 Pre-B-cell leukemia transcription factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.361 51.361 2 7.8234E-18 49892 QUIQUE_C1218_190116_001 192.38 182.38 149230000 24380000 40844000 20151000 0 0 37185000 0 26667000 0 0 0 0 0 15143 93 14224 133338;133339;133340;133341;133342 169791;169792;169793;169794;169795 169791 5 GAQELIR Unmodified 785.43955 0.43955179 4500 Q9UMF0;K7EIL3 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes no 0 0 0 1 22.67 22.67 2 0.046324 15846 QUIQUE_C1576_190116_001 77.748 23.223 50359000 0 0 0 0 0 0 50359000 0 0 0 0 0 0 15144 4500 14225 133343 169796 169796 1 GAQGVILVYDVTR Unmodified 1389.7616 0.76161421 4237 Q9NP72;A0A087X163;H0Y6T8 RAB18 Ras-related protein Rab-18 yes no 0 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169830;169831;169832;169833;169834;169835;169836;169837;169838;169839;169840;169841 169831 11 GASAINWTLIHGDKK Unmodified 1609.8576 0.85763986 1665 O75891;C9IZ36;C9JYZ6;C9JY00 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 51.428 51.428 2;3;4 2.2486E-06 49474 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.92 98.553 2061000000 138290000 202450000 263500000 180550000 110460000 241900000 167740000 373090000 248740000 0 0 41610000 92716000 15150 1665 14231 133379;133380;133381;133382;133383;133384;133385;133386;133387;133388;133389;133390;133391;133392;133393;133394;133395;133396;133397;133398 169842;169843;169844;169845;169846;169847;169848;169849;169850;169851;169852;169853;169854;169855;169856;169857;169858;169859;169860;169861;169862;169863;169864 169861 20 GASAYFLFLR Unmodified 1143.6077 0.60767975 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 128.38 128.38 2 0.0023978 131836 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.36 79.972 308150000 0 0 0 0 53867000 0 0 45643000 56541000 0 68279000 83821000 0 15151 1510 14232 133399;133400;133401;133402;133403 169865;169866;169867;169868;169869;169870;169871;169872 169867 8 GASELVAELSTLYQCIR Unmodified 1908.9615 0.96151259 1110 X6RLT1;H0UI80;Q8IXH7 NELFCD;TH1L Negative elongation factor C/D yes no 0 0 0 1 1 1 1 165.96 165.96 3 6.841E-05 170567 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.681 57.264 47303000 0 0 0 0 16702000 0 0 0 18695000 0 0 0 11906000 15152 1110 14233 133404;133405;133406;133407 169873;169874;169875;169876 169875 4 GASFEELCHNYTQDR Unmodified 1825.769 0.76896079 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.827 63.827 3 3.5353E-06 63302 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.566 88.304 273780000 0 39635000 0 98013000 0 0 0 0 43246000 0 51243000 41645000 0 15153 271 14234 133408;133409;133410;133411;133412;133413;133414;133415;133416 169877;169878;169879;169880;169881;169882;169883;169884;169885 169884 7 GASGIQGLAR Unmodified 928.50903 0.50902834 3033;1353 K7ES72;Q13938 CAPS Calcyphosin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.152 29.152 2 0.00014162 23413 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.26 96.37 9119200000 0 0 0 0 0 0 1745900000 1110900000 2455000000 0 1659500000 0 2147900000 15154 1353;3033 14235 133417;133418;133419;133420;133421 169886;169887;169888;169889;169890 169889 5 GASGSFVVVQK Unmodified 1077.5819 0.58185894 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;Q5SWC8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 37.044 37.044 2 0.0055121 32644 QUIQUE_C1277_190116_001 78.264 40.452 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15155 3297 14236 133422 169891 169891 1 GASGTFQLK Unmodified 907.47633 0.47633123 3297 Q5SSJ5;B0QZK4 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 29.964 29.964 2 0.011056 24855 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.26 44.111 51239000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51239000 15156 3297 14237 133423 169892 169892 1 GASIAHCPNSNLSLSSGFLNVLEVLK Unmodified 2726.4061 0.40614976 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;H0YDZ7;Q5SZC3;Q5SZC5 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 152.8 152.8 2;3 4.5853E-39 159374 QUIQUE_C1438_190116_001 139.67 126.88 4568500000 0 0 0 793300000 0 798300000 1012900000 0 718560000 0 0 74053000 1171400000 15157 4567 14238 133424;133425;133426;133427;133428;133429;133430;133431;133432 169893;169894;169895;169896;169897;169898;169899;169900;169901;169902 169894 9 GASIVEDKLVEDLR Unmodified 1542.8253 0.82533668 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 87.356 87.356 2;3 4.9897E-07 87897 QUIQUE_DMIX8_190116_001 124.3 97.333 10691000000 0 0 0 0 458490000 0 0 3540200000 0 0 2078100000 2344700000 2269100000 15158 1777 14239 133433;133434;133435;133436;133437;133438;133439;133440 169903;169904;169905;169906;169907;169908;169909;169910;169911 169911 9 GASLLLYQR Unmodified 1019.5764 0.57637963 17 A0A075B7B5;B7ZM87;O75044;Q5VZB4;A0A075B7E6;A0A075B7E9 SRGAP2 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 66.62 66.62 2 0.018564 65718 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.997 57.968 20650000 0 0 0 0 0 0 0 20650000 0 0 0 0 0 15159 17 14240 133441 169912 169912 0 GASQAGMLAPGTR Unmodified 1215.603 0.60300508 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.941 30.941 2 0.0006708 26171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.276 68.89 1382000000 0 43403000 71583000 161090000 101330000 145910000 33850000 210450000 182800000 40768000 137840000 85566000 167440000 15160 3137;908 14241 133442;133443;133444;133445;133446;133447;133448;133449;133450;133451;133452;133453 169913;169914;169915;169916;169917;169918;169919;169920;169921;169922;169923;169924 169919 11 GASQAGMLAPGTR Oxidation (M) 1231.5979 0.5979197 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 1 0 1 1 1 20.142 20.142 2 0.0045824 13489 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.483 73.955 354370000 0 0 0 0 0 88377000 0 0 139550000 0 0 0 126450000 15161 3137;908 14241 133454;133455;133456 169925;169926;169927 169926 559 0 GASQAGMTGYGMPR 2 Oxidation (M) 1414.5969 0.59693343 4444;2408 P37802;Q9UI15;C9J5W6 TAGLN2;TAGLN3 Transgelin-2;Transgelin-3 no no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.885 17.885 2 7.302E-08 10725 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.41 122.37 698850000 33069000 42087000 28593000 48609000 38164000 31797000 26223000 104160000 69588000 37346000 82311000 49960000 106940000 15162 2408;4444 14242 133457;133458;133459;133460;133461;133462;133463;133464;133465;133466;133467;133468;133469 169928;169929;169930;169931;169932;169933;169934;169935;169936;169937;169938;169939;169940;169941 169936 1812;1813 12 GASQAGMTGYGMPR Oxidation (M) 1398.602 0.6020188 4444;2408 P37802;Q9UI15;C9J5W6 TAGLN2;TAGLN3 Transgelin-2;Transgelin-3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.42 31.42 2 5.2792E-05 26638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.28 106.79 617240000 71598000 46663000 0 58950000 36445000 0 33187000 71345000 67651000 24017000 70087000 48918000 88374000 15163 2408;4444 14242 133470;133471;133472;133473;133474;133475;133476;133477;133478;133479;133480;133481;133482 169942;169943;169944;169945;169946;169947;169948;169949;169950;169951;169952;169953;169954;169955;169956;169957 169950 1812;1813 16 GASQAGMTGYGMPR Unmodified 1382.6071 0.60710418 4444;2408 P37802;Q9UI15;C9J5W6 TAGLN2;TAGLN3 Transgelin-2;Transgelin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 48.368 48.368 2 0.00031522 46872 QUIQUE_C1218_190116_001 100.69 85.072 587310000 92285000 123360000 0 191360000 0 0 0 0 107050000 0 73252000 0 0 15164 2408;4444 14242 133483;133484;133485;133486;133487 169958;169959;169960;169961;169962 169958 4 GASQAGMTGYGR Unmodified 1154.5139 0.51385572 2864 Q01995;H0YCU9 TAGLN Transgelin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.018 22.018 2 4.2507E-14 15567 QUIQUE_C1218_190116_001 163.88 103.4 1055500000 136790000 245980000 84236000 124350000 152070000 79522000 99833000 0 0 79622000 53084000 0 0 15165 2864 14243 133488;133489;133490;133491;133492;133493;133494;133495;133496 169963;169964;169965;169966;169967;169968;169969;169970;169971 169963 9 GASQAGMTGYGR Oxidation (M) 1170.5088 0.50877035 2864 Q01995;H0YCU9 TAGLN Transgelin yes no 0 1 0 1 13.385 13.385 2 3.2667E-05 5376 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.86 92.016 5802600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5802600 0 0 0 15166 2864 14243 133497 169972 169972 2338 1 GASQAGMTGYGRPR Oxidation (M) 1423.6626 0.66264523 2864 Q01995;H0YCU9 TAGLN Transgelin yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 10.632 10.632 3 0.01659 2999 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.726 42.898 227580000 0 0 0 0 22787000 0 0 57885000 113280000 0 11255000 0 22371000 15167 2864 14244 133498;133499;133500;133501;133502 169973;169974;169975;169976;169977 169975 2338 5 GASQAGMTGYGRPR Unmodified 1407.6677 0.6677306 2864 Q01995;H0YCU9 TAGLN Transgelin yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 18.681 18.681 2;3 2.0779E-14 11492 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.93 94.256 505240000 0 0 0 0 0 0 0 55227000 176180000 0 91496000 116280000 66057000 15168 2864 14244 133503;133504;133505;133506;133507;133508;133509 169978;169979;169980;169981;169982;169983;169984 169980 7 GASQEEEKGAEYVASVLK Unmodified 1893.932 0.9319866 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 95.052 95.052 2;3 3.8196E-23 97059 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.59 150.25 329950000 0 0 0 46553000 0 0 0 132240000 68866000 0 0 0 82296000 15169 4664 14245 133510;133511;133512;133513;133514;133515;133516 169985;169986;169987;169988;169989;169990;169991;169992 169987 8 GASSAGEASEKEPLK Unmodified 1459.7155 0.71545188 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 1 1 14.092 14.092 3 0.021242 5752 QUIQUE_C1277_190116_001 44.312 29.436 17289000 0 17289000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15170 730 14246 133517 169993 169993 1 GASSPGILVLTTGLSK Unmodified 1499.8559 0.85590853 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 1 110.04 110.04 2 0.033128 107505 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.209 30.846 128950000 0 48866000 59517000 0 0 0 0 0 0 20563000 0 0 0 15171 465 14247 133518;133519;133520 169994;169995;169996 169996 3 GASSPGILVLTTGLSKPFMR Unmodified 2031.1187 0.11868193 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 1 1 1 129.53 129.53 3 0.00046497 132811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.719 51.265 37862000 0 0 0 0 0 0 0 20510000 0 0 0 0 17352000 15172 465 14248 133521;133522 169997;169998;169999 169997 3 GASVIIR Unmodified 714.43882 0.43882351 4123 Q9H0R4;K7ER15;K7EQD2;A0A1B0GXB1 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 22.124 22.124 2 0.023365 14954 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.27 42.82 64238000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64238000 0 0 0 15173 4123 14249 133523 170000 170000 1 GASYSDDIYKEDFNELLHK Unmodified 2243.0382 0.038242585 866 E7ESC9;Q8IZU2;H0YAG1 WDR17 WD repeat-containing protein 17 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 104.17 104.17 3;4 0.011593 107743 QUIQUE_C1277_190116_001 34.586 25.767 206120000 24219000 23344000 0 0 0 0 0 0 62183000 0 29868000 0 66510000 15174 866 14250 133524;133525;133526;133527;133528;133529;133530 170001;170002;170003;170004;170005;170006;170007;170008 170003 8 GATATLPCVLGTTPPSYK Unmodified 1832.9342 0.93423521 4108 Q9GZV7;Q5T3J1 HAPLN2 Hyaluronan and proteoglycan link protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.256 97.256 2 3.6767E-23 100144 QUIQUE_C1277_190116_001 141.32 125.06 2002000000 209150000 277640000 134520000 91116000 139810000 0 328480000 92831000 70375000 76443000 250740000 147470000 183450000 15175 4108 14251 133531;133532;133533;133534;133535;133536;133537;133538;133539;133540;133541;133542 170009;170010;170011;170012;170013;170014;170015;170016;170017;170018;170019;170020;170021;170022;170023;170024;170025;170026 170011 18 GATDIDKNGYPDLIVGAFGVDR Unmodified 2292.1386 0.13862533 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 1 1 130.71 130.71 3 0.025186 133252 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.882 23.606 76035000 0 0 0 0 0 0 0 76035000 0 0 0 0 0 15176 1909 14252 133543 170027 170027 1 GATGHLLGAAGAVEAAFTTLACYYQK Unmodified 2640.3006 0.30062206 4313 Q9NWU1 OXSM 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 161.6 161.6 3 0.0022275 166012 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.32 27.423 31234000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31234000 0 15177 4313 14253 133544 170028 170028 1 GATLAFLNDEVWNLSNVQQGK Unmodified 2303.1546 0.15460975 1755 O95825;A6NND8;A6NHJ8;A6NMA8;H7C0X3 CRYZL1 Quinone oxidoreductase-like protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 151.55 151.55 2;3 6.512E-26 155851 QUIQUE_C1277_190116_001 169.62 126.24 359880000 27026000 76373000 0 70163000 28813000 0 0 26213000 71455000 0 0 26271000 33568000 15178 1755 14254 133545;133546;133547;133548;133549;133550;133551;133552;133553;133554;133555;133556;133557 170029;170030;170031;170032;170033;170034;170035;170036;170037;170038;170039;170040;170041 170032 13 GATLALTQVTPQDER Unmodified 1598.8264 0.82639932 2461 P43121 MCAM Cell surface glycoprotein MUC18 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 69.9 69.9 2 1.4862E-29 69936 QUIQUE_C1368_190116_001 166.69 126.78 554620000 0 75158000 85689000 67339000 83742000 54952000 0 0 54486000 0 54489000 35816000 42952000 15179 2461 14255 133558;133559;133560;133561;133562;133563;133564;133565;133566;133567;133568 170042;170043;170044;170045;170046;170047;170048;170049;170050;170051;170052 170043 9 GATLSHYNIVNNSNILGER Unmodified 2071.0447 0.044665367 3819 Q96CM8;E9PF16 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 81.801 81.801 3 4.5404E-05 79342 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.938 50.151 455760000 0 0 0 0 0 69892000 49368000 51012000 69381000 29118000 76829000 44748000 65415000 15180 3819 14256 133569;133570;133571;133572;133573;133574;133575;133576 170053;170054;170055;170056;170057;170058;170059;170060;170061 170057 9 GATPAPQAGEPSPGLGAR Unmodified 1632.822 0.82198264 3199 Q16799 RTN1 Reticulon-1 yes yes 0 0 0 1 40.958 40.958 2 0.00031824 38210 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.551 63.666 159110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 159110000 15181 3199 14257 133577 170062;170063 170063 2 GATQQILDEAER Unmodified 1329.6525 0.6524577 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.329 59.329 2;3 1.0287E-20 60269 QUIQUE_DMIX8_190116_001 204.5 168.17 6230500000 577520000 496130000 581770000 507790000 475210000 487780000 583080000 528080000 365770000 193680000 524220000 434950000 474490000 15182 2810 14258 133578;133579;133580;133581;133582;133583;133584;133585;133586;133587;133588;133589;133590;133591 170064;170065;170066;170067;170068;170069;170070;170071;170072;170073;170074;170075;170076;170077;170078;170079;170080;170081;170082;170083 170082 20 GATVLPANTPGNVGSGK Unmodified 1538.8053 0.80526994 2192 P22059 OSBP Oxysterol-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 47.263 47.263 2 0.00057369 43932 QUIQUE_C1368_190116_001 91.245 74.593 227700000 0 0 30201000 61767000 0 53686000 27301000 0 29387000 25360000 0 0 0 15183 2192 14259 133592;133593;133594;133595;133596;133597 170084;170085;170086;170087;170088;170089;170090 170084 7 GATVTEDSETSTESFQK Unmodified 1815.801 0.80103201 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 41.503 41.503 2 1.1357E-10 38457 QUIQUE_C1438_190116_001 120.53 101.78 282410000 46650000 47749000 30373000 0 42485000 0 44423000 38769000 0 0 0 31959000 0 15184 1255;2856 14260 133598;133599;133600;133601;133602;133603;133604;133605 170091;170092;170093;170094;170095;170096;170097;170098 170094 8 GATYGKPVHHGVNQLK Unmodified 1704.906 0.90598704 460 A0A2R8YEM3;E7EQV9;P61313;E7EX53;A0A2R8Y738;E7ENU7 RPL15 Ribosomal protein L15;60S ribosomal protein L15 yes no 0 0 1 1 1 1 10.296 10.296 3;4 0.016486 2821 QUIQUE_C1403_190116_001 57.328 47.131 41918000 0 0 0 15383000 18114000 0 0 0 8420900 0 0 0 0 15185 460 14261 133606;133607;133608 170099;170100;170101 170099 1 GAVAEDGDELR Unmodified 1130.5204 0.52038089 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;G3V5D9;G3V2D9 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 27.344 27.344 2 0.017019 21242 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.823 43.729 55066000 0 55066000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15186 2266 14262 133609;133610;133611 170102;170103;170104 170104 3 GAVAEDGDELRTEPEAK Unmodified 1785.8381 0.83808621 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;G3V5D9 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 32.809 32.809 2;3 1.6539E-38 27686 QUIQUE_C1277_190116_001 167.98 124.44 1079700000 0 95086000 107310000 96761000 92071000 0 0 124340000 160940000 19865000 200030000 145810000 37493000 15187 2266 14263 133612;133613;133614;133615;133616;133617;133618;133619;133620;133621;133622;133623;133624;133625;133626;133627;133628 170105;170106;170107;170108;170109;170110;170111;170112;170113;170114;170115;170116;170117;170118;170119;170120;170121;170122;170123 170106 18 GAVAGGLIQDLDNCSVMAVDCEDRR Unmodified 2720.2316 0.23163257 3645 Q8NEU8 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 122.86 122.86 3 1.0836E-10 126538 QUIQUE_C1403_190116_001 78.324 74.796 145480000 0 32391000 0 29529000 0 42621000 40936000 0 0 0 0 0 0 15188 3645 14264 133629;133630;133631;133632 170124;170125;170126;170127;170128 170125 5 GAVAMAETLK Unmodified 989.52157 0.52156686 2476 P46060;H0Y4Q3 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 44.973 44.973 2 0.012155 41911 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.27 32.72 209790000 30300000 33341000 0 50211000 0 0 0 0 44225000 0 51714000 0 0 15189 2476 14265 133633;133634;133635;133636;133637 170129;170130;170131;170132;170133;170134;170135 170135 7 GAVASVTFDDFHK Unmodified 1392.6674 0.66737948 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 65.628 65.628 2;3 2.2434E-06 65402 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.62 92.549 1429200000 82966000 188480000 212780000 116570000 0 80664000 98640000 153120000 52603000 56048000 203710000 59717000 123950000 15190 3086 14266 133638;133639;133640;133641;133642;133643;133644;133645;133646;133647;133648;133649;133650;133651;133652;133653 170136;170137;170138;170139;170140;170141;170142;170143;170144;170145;170146;170147;170148;170149;170150;170151;170152;170153 170146 17 GAVDAAVPTNIIAAK Unmodified 1409.7878 0.78782897 4443 Q9UI12;E5RG49;E5RHH0;E5RK31;E5RJG1 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.721 81.721 2 3.2129E-05 83984 QUIQUE_C1218_190116_001 92.943 79.987 6345900000 529540000 598800000 521960000 484240000 542870000 443970000 430880000 337820000 546240000 190980000 583880000 581910000 552770000 15191 4443 14267 133654;133655;133656;133657;133658;133659;133660;133661;133662;133663;133664;133665;133666 170154;170155;170156;170157;170158;170159;170160;170161;170162;170163;170164;170165;170166;170167 170154 13 GAVDDDVAEADIISTVEFNHSGELLATGDK Unmodified 3087.452 0.45203314 2781 P63151;E5RIY1 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 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Unmodified 1221.4689 0.46889614 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.373 14.373 2 0.00016294 6747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.46 109.59 302130000 21624000 47882000 14872000 20442000 15234000 38832000 17999000 42600000 32802000 0 0 28149000 21695000 15195 2334 14271 133680;133681;133682;133683;133684;133685;133686;133687;133688;133689;133690;133691 170182;170183;170184;170185;170186;170187;170188;170189;170190;170191;170192;170193 170189 12 GAVGALLVYDIAK Unmodified 1288.7391 0.73908786 3168 Q15907;H3BMH2;H3BSC1;P62491 RAB11B;RAB11A Ras-related protein Rab-11B;Ras-related protein Rab-11A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.42 116.42 2 0.00073893 120646 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.658 62.665 4105500000 338900000 357320000 373860000 300230000 283000000 255240000 305740000 286290000 451820000 211750000 412380000 259360000 269630000 15196 3168 14272 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170214;170215;170216;170217;170218;170219;170220;170221;170222;170223;170224;170225;170226;170227;170228;170229;170230;170231;170232;170233;170234;170235;170236;170237;170238;170239;170240;170241;170242;170243;170244;170245;170246;170247;170248;170249;170250;170251;170252 170214 37 GAVLAAVSSHK Unmodified 1038.5822 0.58219329 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 20.295 20.295 2 0.0020435 13539 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.787 35.827 397280000 0 0 0 0 0 0 0 149570000 0 45979000 0 0 201720000 15198 472;1460 14274 133731;133732;133733 170253;170254;170255 170254 2 GAVLFGLDPAVIK Unmodified 1298.7598 0.7598233 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.29 129.29 2 0.0043094 126195 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.263 68.308 4036900000 432870000 387090000 325300000 279520000 280300000 281720000 361700000 222600000 194240000 166370000 391120000 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Unmodified 1845.9665 0.96652161 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUG1;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GW48;A0A1B0GVJ1;A0A1B0GVE7;A0A1B0GU62;A0A1B0GU06;A0A1B0GV95;A0A1B0GVC9;A0A1B0GV88 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 148.69 148.69 2 1.9821E-07 153538 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.39 94.533 415230000 36638000 29727000 41213000 0 89515000 0 41512000 0 35246000 0 48412000 43548000 49422000 15210 341 14283 133848;133849;133850;133851;133852;133853;133854;133855;133856;133857 170386;170387;170388;170389;170390;170391;170392;170393;170394;170395 170392 8 GAVQGGLDTTK Unmodified 1045.5404 0.54038805 302 A0A0J9YXN7;Q96Q06 PLIN4 Perilipin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 18.642 18.642 2 0.00052274 11613 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.61 13.809 148590000 0 0 0 36761000 0 0 0 111830000 0 0 0 0 0 15211 302 14284 133858;133859;133860;133861 170396;170397;170398;170399 170398 4 GAVSAEQVIAGFNR Unmodified 1417.7314 0.73137672 4438 Q9UHV9 PFDN2 Prefoldin subunit 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 1 98.195 98.195 2;3 2.4962E-37 100991 QUIQUE_C1277_190116_001 185.33 156.24 1563300000 187710000 199470000 218260000 0 164440000 17980000 169650000 118520000 142640000 44256000 0 134380000 165970000 15212 4438 14285 133862;133863;133864;133865;133866;133867;133868;133869;133870;133871;133872;133873;133874;133875;133876;133877;133878;133879;133880 170400;170401;170402;170403;170404;170405;170406;170407;170408;170409;170410;170411;170412;170413;170414;170415;170416;170417;170418;170419;170420 170405 19 GAVVATYR Unmodified 835.4552 0.45520186 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 0 1 20.588 20.588 2 0.018957 13875 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.116 58.561 58603000 0 0 0 0 0 0 0 58603000 0 0 0 0 0 15213 3515 14286 133881 170421 170421 1 GAVVILR Unmodified 726.47521 0.47520902 1266;3022 J3KNV4;G3V2I4;G3V2C6;Q13683 ITGA7 Integrin alpha-7;Integrin alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form no no 0 0 0 1 37.229 37.229 2 0.047935 33071 QUIQUE_C1218_190116_001 76.347 22.826 29322000 29322000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15214 1266;3022 14287 133882 170422 170422 1 GAVWGATLNK Unmodified 1015.5451 0.5450795 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.02 52.02 2 0.00024032 49401 QUIQUE_C1563_190116_001 117.72 78.905 1293700000 90895000 78927000 117280000 145520000 115990000 103060000 133930000 70312000 108840000 0 99161000 116950000 112810000 15215 4592 14288 133883;133884;133885;133886;133887;133888;133889;133890;133891;133892;133893;133894 170423;170424;170425;170426;170427;170428;170429;170430;170431;170432;170433;170434;170435;170436;170437;170438 170429 16 GAVYLFHGTSGSGISPSHSQR Unmodified 2144.0399 0.03991434 2015 P11215 ITGAM Integrin alpha-M yes yes 0 0 0 1 1 43.85 43.85 3 0.00028873 41112 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.309 57.147 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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cis-trans isomerase FKBP8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 100.18 100.18 2 0.028823 104363 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.422 48.14 38546000 0 0 0 0 0 0 22668000 0 0 0 15878000 0 0 15219 3062 14292 133912;133913;133914;133915;133916;133917 170458;170459;170460;170461;170462;170463 170462 6 GAWSNVLR Unmodified 901.477 0.47699993 2038;2039;1878 P05141;P12235;P12236 SLC25A5;SLC25A4;SLC25A6 ADP/ATP translocase 2;ADP/ATP translocase 2, N-terminally processed;ADP/ATP translocase 1;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 60.091 60.091 2 0.0036046 58780 QUIQUE_C1368_190116_001 114.02 87.061 4249900000 1021700000 973090000 1221500000 0 0 0 1033600000 0 0 0 0 0 0 15220 1878;2038;2039 14293 133918;133919;133920;133921 170464;170465;170466;170467;170468;170469 170467 6 GAYDIFLNAK Unmodified 1110.571 0.5709599 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.12 98.12 2 0.00052153 100004 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134171;134172;134173 170776;170777;170778;170779 170778 3 GCQLLVYPGAFNLTTGPAHWELLQR Unmodified 2840.4432 0.44320397 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.87 149.87 3 8.3317E-57 155036 QUIQUE_C1368_190116_001 150.62 130.18 2272900000 75570000 97103000 221240000 112930000 133790000 90967000 228470000 190620000 223270000 43990000 272590000 245620000 336730000 15256 4256 14329 134174;134175;134176;134177;134178;134179;134180;134181;134182;134183;134184;134185;134186 170780;170781;170782;170783;170784;170785;170786;170787;170788;170789;170790;170791;170792;170793;170794;170795;170796;170797 170783 18 GCSFLPDPYQK Unmodified 1310.5965 0.59652272 1924 P07602;C9JIZ6;Q5BJH1 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.932 81.932 2 1.6525E-05 83511 QUIQUE_C1277_190116_001 141.48 133.68 4006400000 301930000 385490000 314340000 190800000 288790000 253430000 349480000 233690000 287920000 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DLGAP1 Disks large-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 31.417 31.417 2 0.0022428 26132 QUIQUE_C1277_190116_001 76.143 57.397 38842000 0 24401000 0 0 0 14440000 0 0 0 0 0 0 0 15260 1424 14333 134203;134204 170831;170832 170831 2 GCTALHYAVLADDYR Unmodified 1723.7988 0.79880436 474;436 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078;F5H392;A0A2R8Y6R5;A0A2R8Y602;A0A2R8YDH5 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog no no 0 0 0 1 1 1 1 78.397 78.397 3 0.014195 79075 QUIQUE_C1368_190116_001 43.024 24.886 90515000 19895000 0 28660000 16962000 0 0 24998000 0 0 0 0 0 0 15261 474;436 14334 134205;134206;134207;134208 170833;170834;170835;170836 170834 0 GCTATLGNFAK Unmodified 1138.5441 0.54409322 972 E9PQD7;P15880;H0YEN5 RPS2 40S ribosomal protein S2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.894 45.894 2 0.0016179 40637 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.429 68.914 26471000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26471000 0 0 0 15262 972 14335 134209;134210;134211;134212 170837;170838;170839;170840 170840 4 GCTGSLNMTLQR Unmodified 1336.6228 0.62275425 3865 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31.099 1092800000 193170000 165310000 181390000 115180000 0 131580000 0 101930000 84804000 0 119470000 0 0 15268 1379 14341 134226;134227;134228;134229;134230;134231;134232;134233;134234 170854;170855;170856;170857;170858;170859;170860;170861;170862;170863;170864 170854 11 GCWDSIHVVEVQEK Unmodified 1684.7879 0.78790532 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 3 2 2 2 2 2 2 77.085 77.085 2;3 1.9501E-71 74276 QUIQUE_DMIX4_190116_001 206.58 171.04 6943500000 371820000 472290000 579130000 417800000 631330000 458300000 719340000 538680000 565110000 292330000 451610000 697750000 747980000 15269 585;2493 14342 134235;134236;134237;134238;134239;134240;134241;134242;134243;134244;134245;134246;134247;134248;134249;134250;134251;134252;134253;134254;134255;134256 170865;170866;170867;170868;170869;170870;170871;170872;170873;170874;170875;170876;170877;170878;170879;170880;170881;170882;170883;170884;170885;170886;170887;170888;170889;170890;170891;170892;170893;170894;170895;170896;170897 170890 33 GCYIGQELTAR Unmodified 1266.6027 0.60267073 3310 Q5T440 IBA57 Putative transferase CAF17, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 58.951 58.951 2 0.034797 57838 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.398 43.302 60718000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60718000 0 15270 3310 14343 134257 170898 170898 1 GDAAVRDELMAAVR Unmodified 1472.7406 0.7405612 3095 Q15008;C9J7B7 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 78.479 78.479 2;3 0.00064183 79051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.675 43.445 442340000 18972000 41303000 32094000 41054000 44204000 0 60663000 78691000 0 9222700 53934000 62200000 0 15271 3095 14344 134258;134259;134260;134261;134262;134263;134264;134265;134266;134267;134268;134269;134270 170899;170900;170901;170902;170903;170904;170905;170906;170907;170908;170909;170910;170911;170912;170913;170914;170915 170908 17 GDAAVYCFHAAAGEWR Unmodified 1779.7787 0.77873762 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 80.303 80.303 2;3 2.3778E-24 81227 QUIQUE_C1368_190116_001 157.52 142.82 2695300000 206050000 182510000 271260000 195830000 195660000 208410000 251300000 175050000 152950000 105780000 226400000 222920000 301200000 15272 1688 14345 134271;134272;134273;134274;134275;134276;134277;134278;134279;134280;134281;134282;134283;134284;134285;134286;134287;134288;134289;134290;134291;134292;134293;134294;134295 170916;170917;170918;170919;170920;170921;170922;170923;170924;170925;170926;170927;170928;170929;170930;170931;170932;170933;170934;170935;170936;170937;170938;170939;170940;170941;170942;170943;170944;170945;170946;170947 170923 31 GDADQASNILASFGLSAR Unmodified 1791.8751 0.87514042 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 147.44 147.44 2;3 2.0099E-17 152994 QUIQUE_C1218_190116_001 157.67 147.99 3593800000 303260000 329040000 330860000 288800000 492940000 343440000 276750000 323030000 311840000 81049000 0 259600000 253180000 15273 307 14346 134296;134297;134298;134299;134300;134301;134302;134303;134304;134305;134306;134307;134308;134309;134310;134311;134312;134313;134314;134315;134316;134317;134318;134319 170948;170949;170950;170951;170952;170953;170954;170955;170956;170957;170958;170959;170960;170961;170962;170963;170964;170965;170966;170967;170968;170969;170970;170971;170972;170973;170974;170975 170948 25 GDAEKPEEELEEDDDEELDETLSER Unmodified 2920.2105 0.21052504 4280 Q9NS69 TOMM22 Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 104.44 104.44 3 1.6642E-10 108422 QUIQUE_C1218_190116_001 80.711 77.184 88893000 33293000 0 0 27547000 0 28054000 0 0 0 0 0 0 0 15274 4280 14347 134320;134321;134322 170976;170977;170978 170976 2 GDAFDFNVALQDHFK Unmodified 1722.8002 0.80018457 4311 Q9NVZ3;F6SKB8 NECAP2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 116.38 116.38 3 0.00099606 121180 QUIQUE_C1218_190116_001 53.328 47.03 104260000 18487000 15582000 0 0 32858000 22229000 0 0 0 15101000 0 0 0 15275 4311 14348 134323;134324;134325;134326;134327 170979;170980;170981;170982;170983;170984 170979 6 GDAFDFNVSLQDHFK Unmodified 1738.7951 0.79509919 387 F5GYH1;A0A1W2PRM0;A0A1W2PRL5;A0A1W2PR09;Q8NC96 NECAP1 Adaptin ear-binding coat-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 112.21 112.21 3 3.5907E-06 115501 QUIQUE_C1277_190116_001 90.229 84.066 404090000 53572000 42624000 39047000 35754000 40875000 43955000 47328000 0 30971000 0 0 38797000 31164000 15276 387 14349 134328;134329;134330;134331;134332;134333;134334;134335;134336;134337;134338;134339 170985;170986;170987;170988;170989;170990;170991;170992;170993;170994;170995;170996;170997 170986 12 GDAMIMEETGK Oxidation (M) 1196.5053 0.50532445 4530 Q9UQ80;F8VR77;F8W0A3;H0YIN7 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 1 0 1 1 1 1 29.232 29.232 2 0.011382 23236 QUIQUE_C1277_190116_001 63.076 53.165 112500000 23293000 36949000 32413000 0 0 19849000 0 0 0 0 0 0 0 15277 4530 14350 134340;134341;134342;134343 170998;170999;171000;171001 170999 2993 4 GDAPSPEEK Acetyl (Protein N-term) 970.42436 0.42435524 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 1 0 0 1 22.2 22.2 2 0.0406 15027 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.04 31.31 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15278 2641 14351 134344 171002 171002 1 GDARPAEIDSLWEISK Unmodified 1785.8897 0.88972785 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 101.65 101.65 2;3 3.4542E-12 104067 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.6 116.19 1815000000 0 86875000 85237000 0 96706000 43185000 81974000 349540000 177100000 0 426700000 307080000 160650000 15279 1069 14352 134345;134346;134347;134348;134349;134350;134351;134352;134353;134354;134355;134356;134357 171003;171004;171005;171006;171007;171008;171009;171010;171011;171012;171013;171014;171015 171008 10 GDASKEDIDTAMK Unmodified 1379.6239 0.62385968 913 E9PF18;Q16836;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 23.164 23.164 2 0.0027292 16714 QUIQUE_C1218_190116_001 92.295 60.453 102350000 37532000 37527000 0 0 0 27290000 0 0 0 0 0 0 0 15280 913 14353 134358;134359;134360 171016;171017;171018 171016 3 GDATVSYEDPPTAK Unmodified 1449.6624 0.66235368 576 B0QYK0;Q01844;A0A0D9SFL3;C9JGE3;H7BY36 EWSR1 RNA-binding protein EWS yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.267 39.267 2 0.00057025 35872 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.93 66.387 1270000000 89119000 131990000 132820000 131980000 105700000 79501000 91890000 92340000 93931000 32415000 113740000 89269000 85350000 15281 576 14354 134361;134362;134363;134364;134365;134366;134367;134368;134369;134370;134371;134372;134373 171019;171020;171021;171022;171023;171024;171025;171026;171027;171028;171029;171030;171031 171026 11 GDCVECMACSDNTVR Unmodified 1772.6586 0.65862376 2365 P34949;H3BPB8;F5GX71;H3BP57 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 48.571 48.571 2 0.05907 46029 QUIQUE_C1218_190116_001 47.189 43.764 38525000 38525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15282 2365 14355 134374 171032 171032 0 GDCYQVLIEDCIPVLK Unmodified 1920.9325 0.93252065 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 141.74 141.74 2 0.00099822 144269 QUIQUE_C1563_190116_001 70.622 57.194 329470000 56954000 63729000 0 0 0 69013000 66262000 0 0 23177000 0 0 50334000 15283 2613 14356 134375;134376;134377;134378;134379;134380 171033;171034;171035;171036;171037;171038 171035 6 GDDFETVSFWLSNTCR Unmodified 1932.8312 0.8312267 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 151.52 151.52 2 0.00037413 155852 QUIQUE_C1277_190116_001 100.55 94.551 57468000 15779000 18803000 22886000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15284 4607 14357 134381;134382;134383 171039;171040;171041 171040 3 GDDGIFDDNFIEER Unmodified 1640.6954 0.69544472 1578 O60493 SNX3 Sorting nexin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.47 124.47 2 2.2081E-17 130310 QUIQUE_C1576_190116_001 149.96 127.87 776930000 0 123630000 78415000 108770000 0 106780000 82716000 0 88415000 39514000 67937000 0 80757000 15285 1578 14358 134384;134385;134386;134387;134388;134389;134390;134391;134392;134393;134394 171042;171043;171044;171045;171046;171047;171048;171049;171050;171051;171052;171053;171054;171055 171049 14 GDDLEEGVTSEEFDK Unmodified 1668.7003 0.70025533 3427;1008 Q6ZVM7;B7Z2U2;F5H3S6 TOM1L2 TOM1-like protein 2 no no 0 0 0 1 80.319 80.319 2 0.0003916 80251 QUIQUE_C1563_190116_001 103.44 82.662 33197000 0 0 0 0 0 33197000 0 0 0 0 0 0 0 15286 3427;1008 14359 134395 171056 171056 1 GDDLLPAGTEDYIHIR Unmodified 1783.8741 0.87407779 1332;1589 K7EM18;P41567;O60739 EIF1;EIF1B Eukaryotic translation initiation factor 1;Eukaryotic translation initiation factor 1b no no 0 0 0 1 1 106.71 106.71 3 0.0027002 110707 QUIQUE_C1368_190116_001 52.112 33.974 301250000 0 183980000 117280000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15287 1332;1589 14360 134396;134397 171057;171058 171058 2 GDDLQAIKK Unmodified 986.53966 0.53965977 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V2D6;G3V5V7 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 0 1 1 1 1 18.153 18.153 2 0.02367 10492 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.351 36.276 70979000 0 0 0 0 0 0 0 0 20165000 0 32301000 0 18514000 15288 598 14361 134398;134399;134400 171059;171060;171061 171061 3 GDDLSTAILK Unmodified 1031.5499 0.5498901 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.023 70.023 1;2 0.0052535 66312 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.113 46.178 2062600000 309100000 334950000 364010000 93305000 0 250360000 409730000 108720000 0 192410000 0 0 0 15289 2658 14362 134401;134402;134403;134404;134405;134406;134407;134408 171062;171063;171064;171065;171066;171067;171068;171069;171070;171071;171072;171073;171074;171075 171075 12 GDDSEWLKLPVDQK Acetyl (Protein N-term) 1670.8152 0.81516593 3037 Q14008;E9PQH5 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes no 1 0 1 1 121.27 121.27 2 2.4953E-07 125874 QUIQUE_DMIX8_190116_001 129.84 104.98 37652000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37652000 15290 3037 14363 134409 171076 171076 1 GDDTPLHLAASHGHR Unmodified 1582.7601 0.76005109 194 A0A0A0MTH3;Q13418;A0A087WWY6 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 20.121 20.121 3;4 0.0011303 13357 QUIQUE_C1218_190116_001 60.474 50.941 667480000 147470000 0 69291000 133890000 61391000 0 0 73225000 87305000 31627000 0 63277000 0 15291 194 14364 134410;134411;134412;134413;134414;134415;134416;134417;134418;134419 171077;171078;171079;171080;171081;171082;171083;171084;171085;171086 171077 10 GDECELLGHSK Unmodified 1243.5503 0.55030081 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 25.116 25.116 2 0.0030566 18584 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.667 77.701 195070000 57819000 0 0 77411000 0 59840000 0 0 0 0 0 0 0 15292 2529 14365 134420;134421;134422;134423 171087;171088;171089;171090 171090 2 GDECQLVGPAQPSHWK Unmodified 1807.8312 0.83116712 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 55.662 55.662 2;3 2.6621E-06 54310 QUIQUE_C1576_190116_001 107.53 84.517 1474800000 193860000 196660000 280840000 84213000 208360000 39814000 60241000 42953000 59909000 59528000 157120000 91325000 0 15293 3117 14366 134424;134425;134426;134427;134428;134429;134430;134431;134432;134433;134434;134435;134436;134437;134438;134439;134440 171091;171092;171093;171094;171095;171096;171097;171098;171099;171100;171101;171102;171103;171104;171105;171106;171107 171101 16 GDEDTKDDSEETVPNPFSQLTDQELEEYKK Unmodified 3485.5482 0.54817795 2382 P35612;C9JTM0;A0A1C7CYY0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 119.64 119.64 3;4 2.2301E-29 122336 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.878 93.964 1350900000 123810000 174110000 99891000 113710000 135660000 0 98720000 200430000 98971000 0 75734000 84887000 144930000 15294 2382 14367 134441;134442;134443;134444;134445;134446;134447;134448;134449;134450;134451;134452;134453;134454;134455 171108;171109;171110;171111;171112;171113;171114;171115;171116;171117;171118;171119;171120;171121;171122;171123;171124;171125;171126;171127;171128;171129;171130 171124 22 GDEEGVPAVVIDMSGLR Unmodified 1742.8509 0.85089951 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.84 137.84 2 0.0013488 140795 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.554 71.891 720930000 0 0 0 182800000 0 0 0 69559000 71086000 69325000 164810000 78270000 85085000 15295 2066 14368 134456;134457;134458;134459;134460;134461;134462 171131;171132;171133;171134;171135;171136;171137 171132 6 GDEELDSLIK Unmodified 1117.5503 0.55028404 1979 Q71UI9;P0C0S5;C9J0D1;C9J386 H2AFV;H2AFZ Histone H2A.V;Histone H2A.Z;Histone H2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.279 82.279 2 0.00048526 83703 QUIQUE_C1277_190116_001 110.87 84.7 950840000 0 148950000 0 79598000 145980000 95561000 115720000 0 113550000 0 86626000 69602000 95257000 15296 1979 14369 134463;134464;134465;134466;134467;134468;134469;134470;134471 171138;171139;171140;171141;171142;171143;171144;171145;171146;171147 171138 9 GDEEVISTLHYFSK Unmodified 1623.7781 0.77805214 3645 Q8NEU8;F8VXB0;F8VWV2;F8W124 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 100.24 100.24 2;3 0.0056865 102874 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.245 69.08 256900000 0 0 0 0 63054000 0 0 37650000 50136000 16571000 39300000 0 50187000 15297 3645 14370 134472;134473;134474;134475;134476;134477 171148;171149;171150;171151;171152;171153 171153 6 GDEGIFEESFIEER Unmodified 1655.7315 0.73149588 95 A0A087X0R6;Q9UMY4 SNX12 Sorting nexin-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.89 121.89 2 0.00035887 126965 QUIQUE_C1218_190116_001 88.187 75.61 778070000 87582000 0 106480000 113990000 0 119490000 88689000 68524000 66500000 0 48811000 78002000 0 15298 95 14371 134478;134479;134480;134481;134482;134483;134484;134485;134486 171154;171155;171156;171157;171158;171159;171160;171161;171162 171154 7 GDEGPPGSEGAR Unmodified 1127.4843 0.48432973 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 14.035 14.035 2 0.00044658 6045 QUIQUE_DMIX4_190116_001 110.53 84.797 42400000 0 0 0 0 0 0 0 27346000 0 15054000 0 0 0 15299 96 14372 134487;134488 171163;171164 171164 2 GDELADSALEIFK Unmodified 1406.6929 0.69292553 3146 Q15582;D6RBX4;H0YAH8 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 0 1 1 135.07 135.07 2 0.0045379 138865 QUIQUE_C1403_190116_001 68.355 54.848 68885000 0 0 0 42517000 0 0 0 26368000 0 0 0 0 0 15300 3146 14373 134489;134490 171165;171166 171165 2 GDERPHYYGK Acetyl (Protein N-term) 1262.568 0.56799978 3535 Q8IWA5;K7EPV6;K7ER17;K7EMR2 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 1 0 1 1 1 1 1 20.343 20.343 3 0.033726 13521 QUIQUE_C1218_190116_001 45.915 36.911 295280000 51039000 0 107720000 0 0 0 0 91861000 0 0 0 44664000 0 15301 3535 14374 134491;134492;134493;134494 171167;171168;171169;171170 171167 2 GDFCIQVGR Unmodified 1050.4917 0.49166372 3222;2092;1572 P15531;E7ERL0;O60361;Q32Q12;J3KPD9;P22392 NME1;NME2P1;NME1-NME2;NME2 Nucleoside diphosphate kinase A;Putative nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.682 62.682 2 0.00024078 62494 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.33 115.44 9168100000 760870000 871750000 715130000 703300000 675860000 586340000 765660000 838670000 526450000 377140000 954070000 788770000 604100000 15302 2092;1572;3222 14375 134495;134496;134497;134498;134499;134500;134501;134502;134503;134504;134505;134506;134507 171171;171172;171173;171174;171175;171176;171177;171178;171179;171180;171181;171182;171183;171184;171185;171186;171187;171188;171189;171190;171191;171192;171193;171194 171190 23 GDFDENLNYPEQK Unmodified 1567.6791 0.67906638 4403 Q9UBQ0;F8VXU5 VPS29 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 69.976 69.976 2 5.1525E-17 70300 QUIQUE_DMIX3_190116_001 196.44 191.1 1926600000 123370000 153580000 168750000 140950000 163830000 135810000 136460000 107980000 133200000 59513000 211930000 200730000 190550000 15303 4403 14376 134508;134509;134510;134511;134512;134513;134514;134515;134516;134517;134518;134519;134520;134521 171195;171196;171197;171198;171199;171200;171201;171202;171203;171204;171205;171206;171207;171208;171209;171210;171211;171212;171213;171214;171215 171208 21 GDFFMTLR Unmodified 985.46914 0.46913736 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 101.93 101.93 2 0.032469 106019 QUIQUE_C1576_190116_001 65.313 49.11 53522000 0 0 18269000 0 16428000 0 18826000 0 0 0 0 0 0 15304 4140 14377 134522;134523;134524 171216;171217;171218 171218 3 GDFFPPERPQQLPHGLGGIGMGLGPGGQPIDANHLNK Unmodified 3817.9111 0.91109578 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R019;M0QZM1;M0R0N3 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 113.76 113.76 4;5 0.00017586 117436 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.468 23.928 309550000 42280000 0 96381000 0 40094000 0 37249000 49793000 43748000 0 0 0 0 15305 2603 14378 134525;134526;134527;134528;134529;134530;134531 171219;171220;171221;171222;171223;171224;171225 171225 7 GDFIALDLGGSSFR Unmodified 1453.7201 0.72014333 2146 P19367;B1AR63;B1AR62 HK1 Hexokinase-1;Hexokinase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.47 131.47 2 0.00011021 134195 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.94 76.985 8980200000 837450000 794390000 806420000 527390000 740970000 662810000 885030000 497950000 665550000 296670000 865730000 799980000 599900000 15306 2146 14379 134532;134533;134534;134535;134536;134537;134538;134539;134540;134541;134542;134543;134544;134545;134546 171226;171227;171228;171229;171230;171231;171232;171233;171234;171235;171236;171237;171238;171239;171240;171241;171242;171243;171244;171245;171246 171239 20 GDFIHVMDNSDPNWWK Unmodified 1959.8574 0.85738187 2774 P62993 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 127.11 127.11 2;3 2.0709E-13 131097 QUIQUE_C1277_190116_001 173.19 151.62 394520000 68262000 112070000 32083000 101480000 0 29263000 0 0 0 17922000 33436000 0 0 15307 2774 14380 134547;134548;134549;134550;134551;134552;134553;134554;134555;134556 171247;171248;171249;171250;171251;171252;171253;171254;171255;171256 171249 10 GDFILVGDLMR Unmodified 1234.638 0.63799361 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 135.93 135.93 2 0.010427 139794 QUIQUE_C1403_190116_001 62.303 43.991 83815000 0 0 0 40438000 0 0 43377000 0 0 0 0 0 0 15308 3179 14381 134557;134558;134559;134560 171257;171258;171259;171260;171261;171262 171259 6 GDFIPGLR Unmodified 873.47085 0.47085192 1943 P08559 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 79.142 79.142 2 0.011649 79530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.673 60.335 673580000 228720000 0 0 0 0 0 0 118310000 156620000 0 0 169940000 0 15309 1943 14382 134561;134562;134563;134564 171263;171264;171265;171266 171264 4 GDFLASLENDIK Unmodified 1320.6561 0.65614609 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 137.03 137.03 2 0.017932 133255 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.5 36.804 15775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15775000 0 0 0 15310 1245 14383 134565 171267 171267 1 GDFLASLENDIKPAFGTNQEDYASYIMNGIIK Oxidation (M) 3549.6974 0.69736556 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 1 1 1 1 164.81 164.81 3 7.5995E-26 166983 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.258 86.276 177810000 0 0 0 0 0 0 0 56361000 35734000 0 85717000 0 0 15311 1245 14384 134566;134567;134568 171268;171269;171270 171268 721 3 GDFLASLENDIKPAFGTNQEDYASYIMNGIIK Unmodified 3533.7025 0.70245094 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 169.07 169.07 4 0.028985 176559 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.452 18.472 188890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 188890000 0 0 15312 1245 14384 134569 171271 171271 1 GDFVTSFYWPWQTK Unmodified 1760.8199 0.81985737 3614 Q8N8N7;G3V3Y1 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.27 158.27 2 0.00017867 163288 QUIQUE_C1368_190116_001 110.08 98.544 2146900000 122530000 129560000 157160000 141620000 149100000 109650000 137890000 211870000 163620000 47788000 364860000 223400000 187830000 15313 3614 14385 134570;134571;134572;134573;134574;134575;134576;134577;134578;134579;134580;134581;134582;134583 171272;171273;171274;171275;171276;171277;171278;171279;171280;171281;171282;171283;171284;171285;171286;171287;171288 171275 16 GDGAELIWDKDDPSAMDFVTSAANLR Unmodified 2793.2916 0.29157351 4408 Q9UBT2;K7ESK7 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.42 148.42 3 6.025E-09 152521 QUIQUE_C1403_190116_001 70.533 63.421 499170000 69456000 0 88751000 77230000 61306000 46502000 68447000 40111000 0 0 0 47367000 0 15314 4408 14386 134584;134585;134586;134587;134588;134589;134590;134591 171289;171290;171291;171292;171293;171294;171295;171296;171297;171298 171291 10 GDGPICLVLAPTR Unmodified 1367.7231 0.72312022 381;1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3KRZ1;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.35 103.35 2 0.00038551 106771 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.82 81.05 3081000000 323320000 315140000 315460000 278070000 266860000 231650000 254760000 144270000 196740000 87574000 235970000 214580000 216630000 15315 1290;381 14387 134592;134593;134594;134595;134596;134597;134598;134599;134600;134601;134602;134603;134604 171299;171300;171301;171302;171303;171304;171305;171306;171307;171308;171309;171310;171311;171312;171313;171314;171315;171316;171317;171318;171319;171320;171321;171322 171315 24 GDGPVQGIINFEQK Unmodified 1500.7573 0.75725712 1783 P00441 SOD1 Superoxide dismutase [Cu-Zn] yes yes 0 0 0 2 2 2 3 3 2 2 3 2 3 2 2 2 99.216 99.216 2;3 2.1683E-17 102141 QUIQUE_C1218_190116_001 176.8 156.5 54895000000 5153200000 4806800000 5857000000 4709700000 5656500000 4802800000 4429400000 3244200000 87679000 1892900000 5027600000 4108500000 5118900000 15316 1783 14388 134605;134606;134607;134608;134609;134610;134611;134612;134613;134614;134615;134616;134617;134618;134619;134620;134621;134622;134623;134624;134625;134626;134627;134628;134629;134630;134631;134632;134633;134634 171323;171324;171325;171326;171327;171328;171329;171330;171331;171332;171333;171334;171335;171336;171337;171338;171339;171340;171341;171342;171343;171344;171345;171346;171347;171348;171349;171350;171351;171352;171353;171354;171355;171356;171357;171358;171359;171360;171361;171362;171363;171364;171365;171366;171367;171368;171369;171370;171371;171372;171373;171374;171375;171376;171377 171324 52 GDGPWYYYETIDK Unmodified 1605.6987 0.69873919 886 E7EWP0;H0Y886;O43674 NDUFB5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 116.03 116.03 2 0.0065039 120370 QUIQUE_C1218_190116_001 64.199 54.311 64346000 36918000 0 0 27428000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15317 886 14389 134635;134636 171378;171379 171378 1 GDGPWYYYETIDKELIDHSPK Unmodified 2525.1751 0.17507042 886 E7EWP0;H0Y886;O43674 NDUFB5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 137.66 137.66 3 0.00057086 142919 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.49 60.956 201430000 0 0 0 0 0 0 0 0 62667000 0 89404000 49361000 0 15318 886 14390 134637;134638;134639;134640 171380;171381;171382;171383 171381 2 GDGPYSLVAVINSAQDAPSEAPTEVGVK Unmodified 2770.3661 0.36611866 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 139.22 139.22 2;3 1.2223E-64 144174 QUIQUE_C1368_190116_001 201.12 193.71 4923100000 478970000 371420000 534900000 440960000 324960000 302600000 489800000 297590000 383180000 125220000 445840000 320810000 406840000 15319 2948 14391 134641;134642;134643;134644;134645;134646;134647;134648;134649;134650;134651;134652;134653;134654;134655;134656;134657;134658;134659;134660;134661;134662;134663;134664 171384;171385;171386;171387;171388;171389;171390;171391;171392;171393;171394;171395;171396;171397;171398;171399;171400;171401;171402;171403;171404;171405;171406;171407;171408;171409;171410 171389 26 GDGSPSPEYTLFR Unmodified 1424.6572 0.65720872 66 A0A087WXM8;P50895;K7ENU8 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.709 86.709 2 0.0011249 87526 QUIQUE_C1403_190116_001 81.865 62.078 205690000 51527000 50030000 0 40114000 42450000 0 0 0 0 21569000 0 0 0 15320 66 14392 134665;134666;134667;134668;134669;134670;134671;134672 171411;171412;171413;171414;171415;171416;171417;171418 171414 8 GDGTFVDAAASAGVDDPHQHGR Unmodified 2178.9679 0.96787161 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79;Q5T4F6 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 0 1 51.482 51.482 3 0.00043894 50355 QUIQUE_C1438_190116_001 46.415 36.885 26354000 0 0 0 0 26354000 0 0 0 0 0 0 0 0 15321 218 14393 134673 171419 171419 1 GDGVVLVAPPLR Unmodified 1191.6976 0.69755739 2750 P62310 LSM3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3 yes yes 0 0 0 1 1 86.554 86.554 2 0.0056851 88473 QUIQUE_C1277_190116_001 88.177 76.222 202340000 0 103230000 99107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15322 2750 14394 134674;134675 171420;171421 171420 1 GDHAWSFLK Acetyl (Protein N-term) 1101.5243 0.52434406 2038 P12235;V9GYG0 SLC25A4 ADP/ATP translocase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 3 1 2 2 2 1 2 1 1 98.88 98.88 2 1.5152E-06 102735 QUIQUE_C1218_190116_001 164.57 117.5 9928800000 757590000 703620000 754360000 503680000 537530000 581150000 695730000 743010000 946190000 284920000 1347200000 998290000 1075600000 15323 2038 14395 134676;134677;134678;134679;134680;134681;134682;134683;134684;134685;134686;134687;134688;134689;134690;134691;134692;134693;134694 171422;171423;171424;171425;171426;171427;171428;171429;171430;171431;171432;171433;171434;171435;171436;171437;171438;171439;171440;171441;171442;171443;171444;171445;171446;171447;171448;171449;171450;171451;171452;171453;171454;171455 171424 34 GDHAWSFLKDFLAGGVAAAVSK Acetyl (Protein N-term) 2288.159 0.15896684 2038 P12235;V9GYG0 SLC25A4 ADP/ATP translocase 1 yes no 1 0 1 1 168.11 168.11 3 0.00025155 172184 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.844 41.828 134870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 134870000 0 15324 2038 14396 134695 171456 171456 1 GDHLGCWALR Unmodified 1183.5557 0.55566096 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 14.416 14.416 2 0.010986 5999 QUIQUE_C1563_190116_001 67.981 31.475 484280000 95147000 83554000 33393000 88844000 0 152020000 31316000 0 0 0 0 0 0 15325 1713 14397 134696;134697;134698;134699;134700;134701 171457;171458;171459;171460;171461;171462 171461 6 GDIFLVR Unmodified 818.46504 0.46503826 2658 P55072;C9IZA5;C9JUP7 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes no 0 0 0 1 73.185 73.185 2 0.046614 69621 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.496 19.25 71938000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71938000 0 0 0 15326 2658 14398 134702 171463 171463 1 GDIIQLQR Unmodified 941.52943 0.52942943 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 50.654 50.654 2 0.020996 49211 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.854 30.136 20783000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20783000 0 0 15327 1929 14399 134703 171464 171464 1 GDILHVISQEDPNWWQAYR Unmodified 2326.1131 0.11307928 3583 Q8N3R9 MPP5 MAGUK p55 subfamily member 5 yes yes 0 0 0 1 143.37 143.37 3 0.00051699 139242 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.348 37.277 8635500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8635500 0 0 0 15328 3583 14400 134704 171465 171465 1 GDILTLLNSTNK Unmodified 1287.7034 0.70343063 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.43 112.43 2 1.9225E-14 109720 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.19 127.18 2241400000 0 277700000 348170000 246120000 0 337860000 264510000 0 144590000 118880000 0 259060000 244480000 15329 267;275;3025 14401 134705;134706;134707;134708;134709;134710;134711;134712;134713;134714 171466;171467;171468;171469;171470;171471;171472;171473;171474;171475;171476;171477 171475 12 GDILTLLNSTNKDWWK Unmodified 1902.984 0.98396259 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 145.16 145.16 2;3 1.7024E-94 149905 QUIQUE_DMIX3_190116_001 221.8 202.14 2539100000 31557000 145970000 157270000 114430000 242620000 0 198090000 262300000 385080000 7548000 346140000 327240000 320840000 15330 267;275;3025 14402 134715;134716;134717;134718;134719;134720;134721;134722;134723;134724;134725;134726;134727;134728;134729;134730;134731;134732;134733;134734;134735;134736 171478;171479;171480;171481;171482;171483;171484;171485;171486;171487;171488;171489;171490;171491;171492;171493;171494;171495;171496;171497;171498;171499;171500;171501;171502;171503;171504;171505;171506;171507;171508 171498 30 GDIPDLSQAPSSLLDALEQHLASLEGK Unmodified 2803.424 0.42396789 3002 Q13492 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 170.25 170.25 3 1.8214E-92 175116 QUIQUE_C1368_190116_001 173.86 156.36 850670000 0 64596000 73704000 0 127220000 0 119880000 0 0 0 0 261510000 203750000 15331 3002 14403 134737;134738;134739;134740;134741;134742 171509;171510;171511;171512;171513;171514 171510 6 GDIPDLSQAPSSLLDALEQHLASLEGKK Unmodified 2931.5189 0.51893091 3002 Q13492 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 165.78 165.78 3;4 1.0255E-15 169918 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.534 75.307 681650000 0 0 0 0 0 0 0 0 58069000 0 146750000 293860000 182970000 15332 3002 14404 134743;134744;134745;134746 171515;171516;171517;171518 171517 4 GDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGK Oxidation (M) 2952.4386 0.43863168 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 1 0 1 1 2 154.82 154.82 3 6.7017E-31 158864 QUIQUE_C1403_190116_001 113.93 107.28 228760000 48092000 0 72075000 108590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15333 907 14405 134747;134748;134749;134750 171519;171520;171521;171522 171522 552 4 GDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGK Unmodified 2936.4437 0.44371706 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.52 167.52 3 1.8689E-108 171997 QUIQUE_DMIX3_190116_001 179.2 170.09 4883300000 0 782020000 935190000 331500000 0 190730000 530050000 205250000 515670000 73585000 452990000 256710000 609590000 15334 907 14405 134751;134752;134753;134754;134755;134756;134757;134758;134759;134760;134761 171523;171524;171525;171526;171527;171528;171529;171530;171531;171532;171533 171529 11 GDIPGLGDDGYGTK Unmodified 1363.6256 0.62557424 655 B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;B5MCC5;A8MVA8 DLG2 yes no 0 0 0 1 1 74.774 74.774 2 0.062758 76634 QUIQUE_C1438_190116_001 39.581 24.32 62870000 0 0 0 0 62870000 0 0 0 0 0 0 0 0 15335 655 14406 134762;134763 171534;171535 171534 2 GDITLLEVDAIVNAANASLLGGGGVDGCIHR Unmodified 3076.5611 0.56114685 464 A0A2R8YFN3;A1Z1Q3 MACROD2 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD2 yes no 0 0 0 1 168.81 168.81 3 2.3449E-05 173031 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.125 35.666 113820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 113820000 15336 464 14407 134764 171536 171536 0 GDIVFFLQK Unmodified 1065.5859 0.58588168 3484 Q86TP1 PRUNE Protein prune homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 112.92 112.92 2 0.0091527 117437 QUIQUE_C1368_190116_001 76.774 63.103 129570000 0 29566000 30368000 0 0 0 0 0 0 0 34506000 35134000 0 15337 3484 14408 134765;134766;134767;134768 171537;171538;171539;171540 171538 4 GDIYFCTGYDPPMKPYGR Unmodified 2135.9445 0.94448232 4274 Q9NRV9;A0A3B3IRV5 HEBP1 Heme-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 97.132 97.132 3 0.019893 99156 QUIQUE_C1403_190116_001 30.956 26.287 128970000 0 0 0 84921000 0 0 0 0 44051000 0 0 0 0 15338 4274 14409 134769;134770 171541;171542;171543 171542 3 GDKDGSLEVTGQLGEVMK Unmodified 1861.9091 0.90914267 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 83.204 83.204 3 0.0045994 83249 QUIQUE_C1563_190116_001 39.364 31.05 112920000 26743000 0 26319000 0 0 24268000 0 35590000 0 0 0 0 0 15339 1324 14410 134771;134772;134773;134774 171544;171545;171546;171547 171546 4 GDKEEVAYEER Unmodified 1323.5943 0.59427411 4274 Q9NRV9;F5GWX2 HEBP1 Heme-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 17.678 17.678 2;3 2.7902E-07 9987 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.07 127.29 2141700000 171910000 98008000 94780000 0 330090000 84018000 293130000 119350000 274650000 39715000 380930000 68696000 186460000 15340 4274 14411 134775;134776;134777;134778;134779;134780;134781;134782;134783;134784;134785;134786;134787;134788;134789;134790 171548;171549;171550;171551;171552;171553;171554;171555;171556;171557;171558;171559;171560;171561;171562;171563;171564 171561 12 GDKPIWEQIGSSFIQHYYQLFDNDR Acetyl (Protein N-term) 3097.457 0.45699936 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 1 0 1 1 172.67 172.67 3 7.9E-69 176467 QUIQUE_DMIX7_190116_001 160.47 155.15 126670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 126670000 0 15341 2734 14412 134791 171565 171565 1 GDKVDILYNNIK Unmodified 1390.7456 0.7456298 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 1 1 2 60.127 60.127 2;3 0.0030631 59411 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.468 32.091 78356000 22364000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55992000 0 0 15342 4620 14413 134792;134793;134794 171566;171567;171568 171567 3 GDLAALLSGVR Unmodified 1070.6084 0.60840804 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 114.25 114.25 2 0.032602 118862 QUIQUE_C1368_190116_001 56.404 29.54 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15343 1913 14414 134795 171569 171569 1 GDLDFTYVTSR Unmodified 1272.5986 0.59863121 1607 O75061;S4R305 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.995 91.995 2 0.0023411 95381 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.05 89.381 425100000 68865000 0 0 65480000 59107000 54918000 0 0 0 26510000 80169000 0 70049000 15344 1607 14415 134796;134797;134798;134799;134800;134801;134802 171570;171571;171572;171573;171574;171575;171576 171575 5 GDLDLELVLLCK Unmodified 1386.7429 0.74285261 2951 Q12906;K7EKJ9;K7ER69;K7EJ09;K7EKY0 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 144.24 144.24 2 0.0020259 151666 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.869 49.306 308490000 42341000 0 59019000 0 0 0 0 0 65018000 0 40055000 67755000 34299000 15345 2951 14416 134803;134804;134805;134806;134807;134808;134809 171577;171578;171579;171580;171581;171582;171583 171580 3 GDLEEYGQDLLHTVFK Unmodified 1862.905 0.90504357 2465 P43490 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 154.66 154.66 3 0.0079425 149694 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.791 40.652 143010000 49350000 0 36891000 38905000 0 0 0 0 0 17868000 0 0 0 15346 2465 14417 134810;134811;134812;134813;134814 171584;171585;171586;171587;171588 171588 4 GDLENAFLNLVQCIQNK Unmodified 1974.9833 0.98331066 1920 P07355;H0YM50 ANXA2 Annexin A2;Annexin yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 1 168.55 168.55 2;3 9.4988E-89 169981 QUIQUE_C1563_190116_001 265.72 247.53 717800000 80212000 81361000 154090000 132590000 63565000 61247000 79381000 0 0 35977000 0 29369000 0 15347 1920 14418 134815;134816;134817;134818;134819;134820;134821;134822;134823;134824;134825;134826;134827;134828;134829 171589;171590;171591;171592;171593;171594;171595;171596;171597;171598;171599;171600;171601;171602;171603;171604 171599 16 GDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADR Unmodified 2837.417 0.4170488 1920 P07355;H0YM50 ANXA2 Annexin A2;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 3 1 2 2 2 169.12 169.12 2;3 6.4112E-113 173243 QUIQUE_DMIX7_190116_001 246.69 231.18 20893000000 123590000 357900000 1001300000 277480000 1690100000 750780000 1658100000 338980000 1833200000 33514000 3678400000 8461100000 688810000 15348 1920 14419 134830;134831;134832;134833;134834;134835;134836;134837;134838;134839;134840;134841;134842;134843;134844;134845;134846;134847;134848 171605;171606;171607;171608;171609;171610;171611;171612;171613;171614;171615;171616;171617;171618;171619;171620;171621;171622;171623;171624 171622 19 GDLETLQPGDDVEFTIK Unmodified 1875.9102 0.91018852 1645 O75534;E9PLT0;E9PNG3 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.44 118.44 2 1.5704E-16 122477 QUIQUE_C1368_190116_001 132.47 107.87 702280000 76255000 0 100660000 76995000 75557000 71786000 78681000 0 67914000 32816000 35894000 40045000 45676000 15349 1645 14420 134849;134850;134851;134852;134853;134854;134855;134856;134857;134858;134859 171625;171626;171627;171628;171629;171630;171631;171632;171633;171634;171635;171636;171637;171638;171639 171627 14 GDLETQTQLEHAR Unmodified 1496.7219 0.72193424 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 1 1 1 29.752 29.752 2;3 3.2352E-09 25043 QUIQUE_C1218_190116_001 140.07 103.38 728720000 79471000 36812000 102530000 100090000 0 99864000 138840000 0 75679000 0 27825000 29080000 38532000 15350 4414 14421 134860;134861;134862;134863;134864;134865;134866;134867;134868;134869;134870;134871;134872;134873;134874;134875;134876 171640;171641;171642;171643;171644;171645;171646;171647;171648;171649;171650;171651;171652;171653;171654;171655;171656 171641 17 GDLFAATFLIK Unmodified 1194.6649 0.66486028 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 137.64 137.64 2 0.0048097 142698 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.749 65.51 258560000 0 44177000 0 0 60635000 0 0 0 77431000 0 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171664;171665;171666;171667;171668;171669;171670;171671;171672;171673;171674;171675;171676;171677;171678;171679;171680;171681;171682;171683;171684;171685;171686;171687;171688;171689;171690 171664 27 GDLIGVVEALTR Unmodified 1241.698 0.69795133 475 A0A384DVU0;Q8IY17 PNPLA6 Neuropathy target esterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 149.09 149.09 2 0.018529 153974 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.259 33.389 117700000 0 15575000 41638000 0 0 38427000 0 0 8037900 0 0 14025000 0 15354 475 14425 134896;134897;134898;134899;134900 171691;171692;171693;171694;171695;171696 171694 5 GDLNDCFIPCTPK Unmodified 1535.6748 0.6748494 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 86.374 86.374 2 0.0054364 88788 QUIQUE_C1218_190116_001 65.842 54.352 326790000 55843000 0 0 0 101790000 99776000 0 69376000 0 0 0 0 0 15355 1005;2027 14426 134901;134902;134903;134904 171697;171698;171699;171700 171697 1 GDLPGLVR Acetyl (Protein N-term) 867.48142 0.48141661 3849 Q96F85;B8ZZB8 CNRIP1 CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.069 98.069 2 0.0039835 100736 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.793 52.727 2081200000 192110000 187450000 145820000 159010000 171760000 155740000 157600000 143870000 149930000 85840000 162130000 179740000 190190000 15356 3849 14427 134905;134906;134907;134908;134909;134910;134911;134912;134913;134914;134915;134916;134917 171701;171702;171703;171704;171705;171706;171707;171708;171709;171710;171711;171712;171713;171714;171715;171716;171717;171718 171711 18 GDLQPQLDSALQDVNDMYLLLEETEK Unmodified 2976.4274 0.42739829 67 A0A087WXN9;Q765P7;I3L2G4 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 173.92 173.92 2;3 4.6209E-20 177495 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.58 96.652 286960000 0 0 0 0 0 0 25515000 28592000 77943000 0 24422000 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171732;171733;171734;171735;171736;171737;171738;171739;171740;171741;171742 171734 8 GDLYFANVEEK Unmodified 1283.6034 0.60338224 92 A0A087X0M8;O00533 CHL1 Neural cell adhesion molecule L1-like protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.619 76.619 2 0.0027921 77035 QUIQUE_C1368_190116_001 76.143 45.579 487510000 52589000 0 61135000 62300000 70355000 0 68283000 27364000 40548000 33075000 71862000 0 0 15360 92 14431 134941;134942;134943;134944;134945;134946;134947;134948;134949 171743;171744;171745;171746;171747;171748;171749;171750;171751 171744 9 GDLYMAGLAQGMYSNLPK Unmodified 1927.9172 0.91720493 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN3 Neurexin-3 yes no 0 0 0 1 138.39 138.39 2 0.017373 142662 QUIQUE_C1277_190116_001 44.132 23.292 39608000 0 39608000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15361 319 14432 134950 171752 171752 1 GDNFETVTWLSDSEVVR Unmodified 1952.9116 0.91158551 3351 Q68D91 MBLAC2 Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 132.08 132.08 2 0.0095282 134716 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.306 42.189 66563000 0 0 0 0 0 0 0 51393000 0 15170000 0 0 0 15362 3351 14433 134951;134952 171753;171754 171753 1 GDNLETLVLLNPSDK Unmodified 1626.8465 0.84646606 3348 Q66K74;M0QY41;M0QXQ9;M0R1J2 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 122.8 122.8 2 1.4657E-05 126785 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.781 77.308 263320000 51133000 0 76616000 0 0 0 0 50330000 66187000 19059000 0 0 0 15363 3348 14434 134953;134954;134955;134956;134957;134958 171755;171756;171757;171758;171759;171760 171759 4 GDNPNKPMNPLITGVFGAIAGAASVFGNTPLDVIK Oxidation (M) 3510.8181 0.81808982 2621 P53007;B4DP62 SLC25A1 Tricarboxylate transport protein, mitochondrial yes no 0 1 1 1 172.96 172.96 3 6.1482E-05 177156 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.896 34.099 86822000 0 0 0 0 0 0 0 0 86822000 0 0 0 0 15364 2621 14435 134959 171761 171761 2074 1 GDNPNKPMNPLITGVFGAIAGAASVFGNTPLDVIK Unmodified 3494.8232 0.8231752 2621 P53007;B4DP62 SLC25A1 Tricarboxylate transport protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 174.34 174.34 3 0.00010758 181504 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.622 29.241 49897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49897000 0 0 15365 2621 14435 134960 171762;171763 171763 2 GDNQILQHHVLTR Unmodified 1529.8063 0.806273 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.157 29.157 3 0.012093 23414 QUIQUE_DMIX4_190116_001 36.022 25.167 233470000 0 0 85508000 0 66914000 0 0 53756000 0 27295000 0 0 0 15366 506 14436 134961;134962;134963;134964;134965 171764;171765;171766;171767;171768 171767 5 GDNVYEFHLEFLDLVKPEPVYK Unmodified 2650.3319 0.33190541 4363 Q9P035;H3BS72;H3BPZ1 HACD3 Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 yes no 0 0 1 1 1 1 143.1 143.1 4 2.4343E-06 146300 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.771 69.039 301480000 0 63441000 0 0 0 0 0 92980000 0 0 145050000 0 0 15367 4363 14437 134966;134967;134968 171769;171770;171771 171770 3 GDPAHAGLAELGHR Unmodified 1399.6957 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171785;171786;171787;171788;171789;171790;171791;171792;171793;171794;171795;171796;171797 171795 13 GDPESPRPPALDDAFSILDLFLGR Unmodified 2597.3126 0.31256695 1380 O00165;E9PIQ7 HAX1 HCLS1-associated protein X-1 yes no 0 0 1 1 1 1 174.57 174.57 3 5.0472E-05 181637 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.235 47.246 58305000 0 0 0 0 0 0 16423000 0 0 0 22115000 19766000 0 15370 1380 14440 134992;134993;134994 171798;171799;171800 171799 3 GDPFKDIILYVK Unmodified 1406.781 0.78095267 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;H0Y503 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 120.36 120.36 2;3 0.00073352 123308 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.53 73.479 281330000 0 25449000 18464000 0 28092000 0 26866000 71539000 37068000 0 0 73852000 0 15371 3437 14441 134995;134996;134997;134998;134999;135000;135001;135002;135003;135004 171801;171802;171803;171804;171805;171806;171807;171808;171809;171810 171806 10 GDPFQNDPFAEQQTTSTDPFGGDPFK Unmodified 2842.2358 0.23583277 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R3I1 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 149.52 149.52 3 3.9473E-08 153340 QUIQUE_C1403_190116_001 63.138 59.611 17755000 0 0 0 17755000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15372 4394 14442 135005 171811 171811 1 GDPGEAGPQGDQGR Unmodified 1339.5753 0.57527001 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 13.89 13.89 2 8.93E-08 5792 QUIQUE_C1563_190116_001 144.35 124.59 121470000 0 11115000 0 0 0 43393000 0 39963000 0 0 13476000 0 13527000 15373 96 14443 135006;135007;135008;135009;135010;135011;135012 171812;171813;171814;171815;171816;171817;171818 171814 7 GDPGNPGQDSQER Unmodified 1355.5702 0.57018463 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 12.041 12.041 2 7.2077E-06 3339 QUIQUE_C1563_190116_001 147.91 141.01 147590000 0 0 0 0 6396900 101020000 0 13628000 3920900 0 0 22624000 0 15374 2037 14444 135013;135014;135015;135016;135017;135018 171819;171820;171821;171822;171823;171824 171821 6 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135051;135052;135053;135054;135055;135056;135057;135058;135059;135060;135061;135062;135063;135064;135065;135066;135067;135068;135069;135070;135071;135072 171861;171862;171863;171864;171865;171866;171867;171868;171869;171870;171871;171872;171873;171874;171875;171876;171877;171878;171879;171880;171881;171882;171883;171884;171885;171886;171887;171888;171889 171888 25 GDQILSVNGIDLR Unmodified 1398.7467 0.74669243 655 B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;Q6ZSU2 DLG2 Disks large homolog 2 yes no 0 0 0 1 106.68 106.68 2 0.0083393 109872 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.435 44.493 28549000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28549000 0 15383 655 14452 135073 171890 171890 1 GDQLLSVNGVSVEGEHHEK Unmodified 2032.9814 0.98139641 1456;4298 O14910;Q9NUP9;G3V1D4 LIN7A;LIN7C Protein lin-7 homolog A;Protein lin-7 homolog C no no 0 0 0 1 52.675 52.675 3 0.00036736 50874 QUIQUE_C1218_190116_001 61.616 50.572 24210000 24210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15384 1456;4298 14453 135074 171891 171891 1 GDQPAASGDSDDDEPPPLPR Unmodified 2034.8767 0.87665657 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 58.002 58.002 2 1.9469E-75 56712 QUIQUE_C1277_190116_001 230.86 225.25 1094300000 95009000 98109000 78347000 105320000 94196000 68589000 92294000 61025000 92762000 36724000 88986000 90781000 92166000 15385 1391 14454 135075;135076;135077;135078;135079;135080;135081;135082;135083;135084;135085;135086;135087;135088 171892;171893;171894;171895;171896;171897;171898;171899;171900;171901;171902;171903;171904;171905;171906;171907;171908;171909;171910;171911;171912;171913;171914;171915;171916;171917;171918;171919;171920;171921;171922;171923;171924;171925;171926;171927;171928 171896 37 GDQTCAMSYLTVLPR Unmodified 1710.8069 0.8069262 4080 Q9BZ71 PITPNM3 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3 yes yes 0 0 0 1 122.17 122.17 2 0.0046639 126629 QUIQUE_C1218_190116_001 61.375 55.272 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15386 4080 14455 135089 171929 171929 1 GDREAFEETHLTSLDPVK Unmodified 2042.9909 0.99089846 4309 Q9NVS9;J3QQZ9;A0A286YFL3 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 1 1 1 74.437 74.437 3;4 0.00042306 74582 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.726 41.883 135470000 0 0 0 0 0 0 0 52037000 83434000 0 0 0 0 15387 4309 14456 135090;135091 171930;171931;171932 171932 3 GDREQLLQR Acetyl (Protein N-term) 1155.5996 0.59963426 2891 Q04917;F8WEB6;A2IDB1 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 38.333 38.333 2 9.301E-09 33765 QUIQUE_DMIX4_190116_001 169.44 135.48 9331000000 811570000 1099600000 1016500000 848750000 978380000 726710000 906810000 0 768460000 259680000 0 489940000 1424600000 15388 2891 14457 135092;135093;135094;135095;135096;135097;135098;135099;135100;135101;135102;135103;135104;135105 171933;171934;171935;171936;171937;171938;171939;171940;171941;171942;171943;171944;171945;171946;171947;171948;171949 171946 14 GDRGPIGSIGPK Unmodified 1152.6251 0.62512073 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 26.11 26.11 3 0.057496 20468 QUIQUE_C1438_190116_001 28.361 11.983 49094000 0 0 0 0 49094000 0 0 0 0 0 0 0 0 15389 2037 14458 135106 171950 171950 1 GDRSEDFGVNEDLADSDAR Unmodified 2066.8777 0.8777192 1853 P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 67.608 67.608 2;3 4.0692E-35 68169 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.68 136.33 617880000 0 0 0 0 0 0 0 117910000 137780000 0 183990000 60295000 117910000 15390 1853 14459 135107;135108;135109;135110;135111;135112;135113;135114;135115 171951;171952;171953;171954;171955;171956;171957;171958;171959;171960 171956 9 GDRWIQDEIEFGYIEAPHK Unmodified 2302.1018 0.10184589 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 112.83 112.83 4 0.00065438 115230 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.711 33.111 25520000 0 0 0 0 0 0 0 25520000 0 0 0 0 0 15391 4560 14460 135116 171961 171961 1 GDSALFAVNGFNILVDGGSDR Unmodified 2123.0283 0.028346601 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.21 156.21 2 5.5618E-35 158638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 182.57 152.76 265350000 19289000 26747000 17871000 18924000 0 0 41322000 27528000 26281000 17111000 33951000 36327000 0 15392 921 14461 135117;135118;135119;135120;135121;135122;135123;135124;135125;135126 171962;171963;171964;171965;171966;171967;171968;171969;171970;171971;171972 171967 11 GDSALFAVNGFNILVDGGSDRK Unmodified 2251.1233 0.12330962 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 137.56 137.56 2;3 1.9521E-11 140902 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.96 93.83 577160000 0 0 0 0 0 0 0 113720000 120360000 0 131670000 141270000 70136000 15393 921 14462 135127;135128;135129;135130;135131;135132;135133;135134 171973;171974;171975;171976;171977;171978;171979;171980 171973 8 GDSALFAVNGFNMLINGGSER Unmodified 2168.0321 0.03205177 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 155.21 155.21 2;3 1.9559E-43 159981 QUIQUE_DMIX3_190116_001 196.33 175.49 1433300000 0 70481000 117530000 71808000 82515000 58485000 0 196250000 259070000 21035000 246830000 183460000 125870000 15394 2483 14463 135135;135136;135137;135138;135139;135140;135141;135142;135143;135144;135145;135146;135147 171981;171982;171983;171984;171985;171986;171987;171988;171989;171990;171991;171992;171993;171994;171995;171996;171997;171998;171999;172000 171993 20 GDSALFAVNGFNMLINGGSER Oxidation (M) 2184.027 0.026966392 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 1 0 1 145.45 145.45 2 0.0041179 148389 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.405 37.196 77105000 0 0 0 0 0 0 0 77105000 0 0 0 0 0 15395 2483 14463 135148 172001 172001 1911 1 GDSFTHTPPLDPQELDILK Unmodified 2122.0582 0.058249746 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8;A0A1W2PRR9 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 121.5 121.5 3 0.0011972 124309 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.504 43.508 123020000 0 0 0 0 0 0 38192000 31603000 53228000 0 0 0 0 15396 1789 14464 135149;135150;135151 172002;172003;172004 172003 3 GDSIDQCALIQSIK Unmodified 1546.7661 0.76610725 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 97.649 97.649 2 6.4378E-07 99315 QUIQUE_C1277_190116_001 125.22 96.49 1528700000 138080000 87864000 88094000 192310000 212980000 261940000 97634000 56613000 0 96447000 122710000 76462000 97539000 15397 2037 14465 135152;135153;135154;135155;135156;135157;135158;135159;135160;135161;135162;135163;135164;135165;135166;135167 172005;172006;172007;172008;172009;172010;172011;172012;172013;172014;172015;172016;172017;172018;172019;172020;172021;172022;172023 172006 16 GDSKKDDEENYLDLFSHK Unmodified 2138.9756 0.97564233 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 2 1 2 1 72.521 72.521 3;4 0.0025081 72231 QUIQUE_DMIX8_190116_001 53.779 47.798 254470000 0 0 0 0 0 0 0 47291000 132590000 0 0 0 74589000 15398 2908 14466 135168;135169;135170;135171 172024;172025;172026;172027 172027 4 GDSLDSVEALIK Unmodified 1245.6452 0.64524705 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 115.88 115.88 2 0.0010478 112306 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.862 61.625 193540000 127470000 0 0 0 0 0 0 0 0 66073000 0 0 0 15399 267;275;3025 14467 135172;135173;135174;135175;135176 172028;172029;172030;172031;172032 172032 5 GDSPASSKPISINYR Unmodified 1590.8002 0.80018457 1833 P02751;H0Y7Z1 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes no 0 0 1 1 39.577 39.577 3 0.025605 36463 QUIQUE_C1438_190116_001 31.089 12.266 34978000 0 0 0 0 34978000 0 0 0 0 0 0 0 0 15400 1833 14468 135177 172033 172033 1 GDSVIVVLR Unmodified 956.56548 0.56548059 2751 P62316;K7EJB5 SNRPD2 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.866 67.866 2 0.027067 64094 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.119 36.191 275020000 0 0 0 0 0 0 0 50708000 72547000 22703000 129060000 0 0 15401 2751 14469 135178;135179;135180;135181 172034;172035;172036;172037 172036 4 GDSVSDSGSDALR Unmodified 1264.5531 0.55313758 3247 Q53EL6;Q5VZS7 PDCD4 Programmed cell death protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 27.325 27.325 2 0.010931 20693 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.532 44.905 9870900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9870900 0 0 0 15402 3247 14470 135182;135183;135184;135185 172038;172039;172040;172041 172041 4 GDTFFIISK Unmodified 1026.5386 0.53859714 3035 Q13976;A0A0A0MSB3 PRKG1 cGMP-dependent protein kinase 1 no no 0 0 0 1 93.863 93.863 2 0.062819 97922 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.187 28.496 36956000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36956000 0 0 15403 3035 14471 135186 172042 172042 1 GDTNFYGK Unmodified 900.39775 0.39774656 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 23.132 23.132 2 0.03564 16160 QUIQUE_C1403_190116_001 63.301 38.482 980960000 0 0 0 236040000 0 0 0 744930000 0 0 0 0 0 15404 2870 14472 135187;135188 172043;172044 172043 2 GDTNIKPILQVINIRPITTGNSPPR Unmodified 2713.5239 0.52389713 2265 P27694;I3L524;I3L2M5 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 109.01 109.01 4 4.3304E-09 112600 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.341 66.765 338870000 0 0 0 0 0 0 32815000 43680000 93184000 0 58204000 54822000 56162000 15405 2265 14473 135189;135190;135191;135192;135193;135194 172045;172046;172047;172048;172049;172050 172047 4 GDTVAPGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLR Unmodified 3948.0098 0.0097899955 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 1 2 1 169.83 169.83 3;4 5.07E-42 174298 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.681 87.346 183540000 0 0 0 0 0 0 0 0 123200000 0 60335000 0 0 15406 1492 14474 135195;135196;135197 172051;172052;172053 172052 3 GDTVEGLSWLR Unmodified 1231.6197 0.619701 1025 F6UJY1;Q5T013;J9JIE9;H0YB70 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.02 109.02 2 0.0004904 114186 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.57 73.638 522700000 0 0 59379000 56008000 53686000 41798000 52030000 0 55452000 26814000 71714000 41944000 63875000 15407 1025 14475 135198;135199;135200;135201;135202;135203;135204;135205;135206;135207;135208;135209;135210 172054;172055;172056;172057;172058;172059;172060;172061;172062;172063;172064;172065;172066;172067;172068;172069;172070;172071 172068 18 GDTVIDGWQWLINDTLR Unmodified 2000.9956 0.99558991 1283 J3KR97;Q9BTW9;I3L439;I3L163;I3L500;I3L143;I3L1S3 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.8 169.8 2 2.6922E-63 174597 QUIQUE_C1368_190116_001 192.86 170.66 651920000 31047000 51414000 64722000 20222000 42006000 0 63236000 64649000 165260000 6010200 0 80554000 62798000 15408 1283 14476 135211;135212;135213;135214;135215;135216;135217;135218;135219;135220;135221 172072;172073;172074;172075;172076;172077;172078;172079;172080;172081;172082 172074 11 GDVAEGDLIEHFSQFGTVEK Unmodified 2177.0277 0.027677899 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.58 122.58 3 3.8299E-18 120085 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.508 85.347 3167800000 312730000 328480000 362970000 208030000 222490000 201280000 194590000 246920000 240950000 106810000 267700000 215520000 259300000 15409 2969 14477 135222;135223;135224;135225;135226;135227;135228;135229;135230;135231;135232;135233;135234 172083;172084;172085;172086;172087;172088;172089;172090;172091;172092;172093;172094;172095;172096;172097;172098;172099;172100;172101;172102;172103 172097 21 GDVDILMEFLLNVTTAPEFR Oxidation (M) 2295.1457 0.14568454 2202 P22695;H3BRG4;H3BSJ9;H3BP04 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 2 1 2 176.01 176.01 2;3 8.308E-30 179898 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146 113.38 385600000 4461300 17348000 0 0 0 13986000 51130000 34637000 105030000 0 79884000 79121000 0 15410 2202 14478 135235;135236;135237;135238;135239;135240;135241;135242;135243;135244;135245 172104;172105;172106;172107;172108;172109;172110;172111;172112;172113;172114;172115 172111 1564 12 GDVDMSEVEHFMPILMEK Unmodified 2105.9472 0.94718443 4065 Q9BXS5;E7ENJ6;K7ENA7 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 149.05 149.05 3 9.3976E-05 154298 QUIQUE_C1368_190116_001 68.129 59.841 138840000 42987000 0 19349000 24673000 0 19179000 17257000 15397000 0 0 0 0 0 15411 4065 14479 135246;135247;135248;135249;135250;135251 172116;172117;172118;172119;172120;172121 172117 6 GDVDVSLPK Unmodified 928.48656 0.48656157 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 49.258 49.258 2 0.024347 46603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.074 40.227 63009000 0 0 0 0 0 0 0 63009000 0 0 0 0 0 15412 2935 14480 135252 172122 172122 1 GDVEEDEAVPDSEQDIKPR Unmodified 2126.9604 0.96038619 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 53.278 53.278 2;3 1.9895E-41 51121 QUIQUE_C1277_190116_001 154.47 133.52 1244400000 114030000 158830000 78356000 103360000 86077000 76046000 93556000 94286000 88863000 61970000 130010000 64819000 94221000 15413 1446 14481 135253;135254;135255;135256;135257;135258;135259;135260;135261;135262;135263;135264;135265;135266;135267;135268 172123;172124;172125;172126;172127;172128;172129;172130;172131;172132;172133;172134;172135;172136;172137;172138;172139;172140 172126 17 GDVEEDETIPDSEQDIRPR Unmodified 2198.9927 0.99274896 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 64.616 64.616 3 0.00068979 63437 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.167 58.684 208890000 0 67530000 0 0 0 0 0 77961000 0 0 0 63395000 0 15414 3772 14482 135269;135270;135271;135272;135273 172141;172142;172143;172144;172145 172144 3 GDVENIEVVQK Unmodified 1228.6299 0.62993134 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.273 46.273 2 0.00047241 44018 QUIQUE_C1218_190116_001 106.88 48.284 508270000 119150000 68493000 0 0 73857000 73335000 0 0 84711000 0 88719000 0 0 15415 2452 14483 135274;135275;135276;135277;135278;135279 172146;172147;172148;172149;172150;172151;172152;172153 172147 8 GDVENTILDILGGLR Unmodified 1583.8519 0.85188578 2405 P36959 GMPR GMP reductase 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 171.39 171.39 2;3 1.1667E-67 175711 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.48 126.51 2074700000 52178000 125760000 359880000 37001000 108410000 134980000 96282000 106000000 414550000 38479000 184700000 302390000 114100000 15416 2405 14484 135280;135281;135282;135283;135284;135285;135286;135287;135288;135289;135290;135291;135292;135293;135294;135295;135296;135297;135298;135299;135300;135301;135302;135303 172154;172155;172156;172157;172158;172159;172160;172161;172162;172163;172164;172165;172166;172167;172168;172169;172170;172171;172172;172173;172174;172175;172176;172177;172178;172179;172180 172172 27 GDVGLGLVK Unmodified 856.50182 0.5018177 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 56.675 56.675 2 0.055108 55417 QUIQUE_C1277_190116_001 49.325 20.427 222170000 0 76268000 90740000 0 55162000 0 0 0 0 0 0 0 0 15417 3432 14485 135304;135305;135306 172181;172182;172183 172181 3 GDVGMAGVAIDTVEDTK Unmodified 1676.7927 0.79271593 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 104.84 104.84 2 9.9393E-07 107690 QUIQUE_C1403_190116_001 131.66 119.8 512720000 66925000 54113000 69600000 52697000 0 78999000 88343000 0 48310000 0 53728000 0 0 15418 2191 14486 135307;135308;135309;135310;135311;135312;135313;135314;135315 172184;172185;172186;172187;172188;172189;172190;172191;172192;172193 172187 8 GDVLAAWSGIR Unmodified 1143.6037 0.60365701 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 105.54 105.54 2 0.013514 109528 QUIQUE_C1218_190116_001 59.426 37.962 83343000 52347000 0 0 0 30995000 0 0 0 0 0 0 0 0 15419 2463 14487 135316;135317 172194;172195 172194 2 GDVLAAWSGIRPLVTDPK Unmodified 1894.0312 0.031247134 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 121.69 121.69 2;3 0.042779 124715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.964 51.826 118570000 0 0 0 0 0 0 62766000 16309000 0 0 39494000 0 0 15420 2463 14488 135318;135319;135320 172196;172197;172198 172197 3 GDVPILTTEDDMVSQPAK Unmodified 1914.9245 0.92445838 3272 Q5HYI7 MTX3 Metaxin-3 yes yes 0 0 0 1 97.701 97.701 2 0.0027008 101102 QUIQUE_C1576_190116_001 69.108 53.352 29675000 0 0 0 0 0 0 29675000 0 0 0 0 0 0 15421 3272 14489 135321 172199 172199 1 GDVPSVGLEGPDVDLQGPEAK Unmodified 2078.0168 0.016778861 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 107.03 107.03 2 0.00024011 108805 QUIQUE_C1563_190116_001 88.768 80.039 23853000 0 0 0 0 0 23853000 0 0 0 0 0 0 0 15422 2935 14490 135322 172200 172200 1 GDVREPFHSILSVLK Unmodified 1695.9308 0.93080481 3634 Q8NCW5;Q5T3I4 APOA1BP NAD(P)H-hydrate epimerase yes no 0 0 1 1 106.21 106.21 3 0.01313 108290 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.641 42.566 21716000 0 0 0 0 0 0 0 21716000 0 0 0 0 0 15423 3634 14491 135323 172201 172201 0 GDVSNLDPNFSFEGTK Unmodified 1725.7846 0.78459408 2859 Q01650 SLC7A5 Large neutral amino acids transporter small subunit 1 yes yes 0 0 0 1 101.25 101.25 2 0.00090762 104476 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.277 51.245 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15424 2859 14492 135324 172202 172202 1 GDVTAEEAAGASPAK Unmodified 1372.647 0.64703797 2520 P49006 MARCKSL1 MARCKS-related protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 27.513 27.513 2 3.1954E-09 22692 QUIQUE_C1218_190116_001 128.85 99.103 823790000 140350000 103220000 80052000 0 159350000 93055000 91962000 0 0 0 79821000 0 75983000 15425 2520 14493 135325;135326;135327;135328;135329;135330;135331;135332;135333;135334 172203;172204;172205;172206;172207;172208;172209;172210;172211;172212;172213 172204 9 GDVTAQIALQPALK Unmodified 1423.8035 0.80347903 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 3 1 2 1 2 5 3 2 84.565 84.565 2;3 8.212E-23 87566 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.66 152.54 25499000000 1779100000 1951700000 2733300000 1725200000 1723400000 2069900000 2057800000 1780600000 2139500000 826850000 2609600000 1994600000 2107400000 15426 1855 14494 135335;135336;135337;135338;135339;135340;135341;135342;135343;135344;135345;135346;135347;135348;135349;135350;135351;135352;135353;135354;135355;135356;135357;135358;135359;135360 172214;172215;172216;172217;172218;172219;172220;172221;172222;172223;172224;172225;172226;172227;172228;172229;172230;172231;172232;172233;172234;172235;172236;172237;172238;172239;172240;172241;172242;172243;172244;172245;172246;172247;172248;172249;172250;172251;172252;172253;172254;172255 172244 40 GDVTIGPR Unmodified 813.43447 0.43446642 1400 O00399;E5RK00;E5RFU3 DCTN6 Dynactin subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.309 23.309 2 0.02842 16186 QUIQUE_C1277_190116_001 68.787 24.38 467010000 98319000 106430000 90482000 0 86301000 0 0 44077000 0 41396000 0 0 0 15427 1400 14495 135361;135362;135363;135364;135365;135366 172256;172257;172258;172259;172260;172261 172257 5 GDVTITNDGATILK Unmodified 1416.746 0.74602373 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.643 73.643 2 9.0134E-10 74004 QUIQUE_C1277_190116_001 147.37 107.31 1777200000 0 263410000 227780000 265720000 195340000 247090000 0 90092000 94045000 156370000 0 102140000 135180000 15428 2573 14496 135367;135368;135369;135370;135371;135372;135373;135374;135375;135376 172262;172263;172264;172265;172266;172267;172268;172269;172270;172271;172272;172273;172274 172262 12 GDVTLTFLPLSFWGK Unmodified 1679.8923 0.89229404 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.51 167.51 2 1.3637E-05 171163 QUIQUE_C1277_190116_001 121.68 106.99 359230000 11032000 23989000 37405000 14148000 24488000 15476000 22434000 36887000 72066000 5372100 0 52827000 43106000 15429 3420 14497 135377;135378;135379;135380;135381;135382;135383;135384;135385;135386;135387;135388 172275;172276;172277;172278;172279;172280;172281;172282;172283;172284;172285;172286 172276 11 GDVVIVLTGWR Unmodified 1213.6819 0.68190733 2077 P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase PKM;Pyruvate kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 121.34 121.34 2 1.8469E-06 125859 QUIQUE_C1368_190116_001 148.62 118.06 2009400000 254550000 233640000 189460000 199710000 101570000 397440000 197620000 44623000 93106000 104360000 66457000 62401000 64425000 15430 2077 14498 135389;135390;135391;135392;135393;135394;135395;135396;135397;135398;135399;135400;135401;135402;135403 172287;172288;172289;172290;172291;172292;172293;172294;172295;172296;172297;172298;172299;172300;172301;172302;172303;172304;172305;172306;172307;172308;172309;172310;172311;172312;172313;172314;172315;172316;172317;172318 172295 31 GDVVIVLTGWRPGSGFTNTMR Oxidation (M) 2278.1528 0.15283561 2077 P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase PKM;Pyruvate kinase no no 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 120.5 120.5 2;3 4.1055E-05 124798 QUIQUE_C1403_190116_001 72.644 64.423 4159300000 230690000 310900000 356650000 322630000 0 0 461230000 288570000 508870000 195290000 545510000 499780000 439200000 15431 2077 14499 135404;135405;135406;135407;135408;135409;135410;135411;135412;135413;135414;135415;135416;135417;135418 172319;172320;172321;172322;172323;172324;172325;172326;172327;172328;172329;172330;172331;172332;172333;172334;172335;172336;172337;172338 172323 1401 20 GDVVIVLTGWRPGSGFTNTMR Unmodified 2262.1579 0.15792099 2077 P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase PKM;Pyruvate kinase no no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 128.9 128.9 2;3 4.1022E-19 134515 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.508 79.069 8162600000 220870000 365150000 401370000 184070000 180110000 163620000 751990000 1017600000 1219500000 91803000 1466300000 1292800000 807510000 15432 2077 14499 135419;135420;135421;135422;135423;135424;135425;135426;135427;135428;135429;135430;135431;135432;135433;135434;135435;135436;135437;135438;135439;135440 172339;172340;172341;172342;172343;172344;172345;172346;172347;172348;172349;172350;172351;172352;172353;172354;172355;172356;172357;172358;172359;172360;172361;172362;172363;172364;172365;172366;172367;172368;172369;172370;172371;172372 172366 34 GDVVLVVPSDSEADQDAGWLVGVK Unmodified 2454.2278 0.22783427 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 2 1 2 2 3 1 3 146.61 146.61 2;3 4.0284E-12 151805 QUIQUE_C1368_190116_001 135.47 116.07 1850400000 259730000 80095000 67894000 235100000 187840000 64367000 147070000 74644000 168970000 73478000 191110000 60407000 239680000 15433 2530 14500 135441;135442;135443;135444;135445;135446;135447;135448;135449;135450;135451;135452;135453;135454;135455;135456;135457;135458;135459;135460;135461;135462;135463 172373;172374;172375;172376;172377;172378;172379;172380;172381;172382;172383;172384;172385;172386;172387;172388;172389;172390;172391;172392;172393;172394;172395;172396;172397;172398 172376 24 GDVVNQDDLYQALASGK Unmodified 1791.8639 0.86390703 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.37 111.37 2 1.7719E-16 114851 QUIQUE_C1368_190116_001 160.69 143.32 4277000000 474110000 468190000 277960000 214550000 269500000 198680000 255650000 483060000 433120000 244000000 374610000 308770000 274760000 15434 4405 14501 135464;135465;135466;135467;135468;135469;135470;135471;135472;135473;135474;135475;135476 172399;172400;172401;172402;172403;172404;172405;172406;172407;172408;172409;172410;172411;172412;172413;172414;172415;172416;172417;172418;172419;172420;172421;172422;172423 172403 25 GDVVPKDVNAAIATIK Unmodified 1609.9039 0.90392136 2795;3430;3992;1990 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;P68363;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA3E;TUBA1B;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 1 1 1 1 2 87.246 87.246 2;3 2.458E-05 90846 QUIQUE_C1438_190116_001 76.586 65.856 160070000 0 0 0 0 45079000 0 0 0 0 0 115000000 0 0 15435 1990;2795;3430;3992 14502 135477;135478;135479;135480;135481 172424;172425;172426;172427;172428 172425 5 GDWSALGK Unmodified 832.40792 0.40791731 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 45.909 45.909 1 0.039735 42962 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.81 72.26 382950000 0 0 0 0 0 76992000 78304000 76756000 0 0 101970000 48923000 0 15436 2123 14503 135482;135483;135484;135485;135486 172429;172430;172431;172432;172433 172433 0 GDWSVGAPGGVQEITYTVPADK Unmodified 2246.0855 0.085527129 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 117.38 117.38 2 0.013717 122174 QUIQUE_C1576_190116_001 56.527 51.637 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15437 3875 14504 135487 172434 172434 1 GDYAPILQK Unmodified 1003.5338 0.53384611 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180;E9PQ14 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 1 49.036 49.036 2 0.026145 46544 QUIQUE_C1218_190116_001 58.782 41.417 49766000 49766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15438 4330 14505 135488;135489 172435;172436 172435 2 GDYDAFFEAR Unmodified 1189.504 0.50400254 1627 O75368 SH3BGRL SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.846 97.846 2 2.1922E-11 100098 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.69 152.16 5285400000 0 469270000 613380000 323730000 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14508 135503;135504;135505;135506;135507;135508;135509;135510;135511;135512;135513;135514;135515 172454;172455;172456;172457;172458;172459;172460;172461;172462;172463;172464;172465;172466;172467;172468;172469;172470;172471;172472;172473;172474;172475;172476 172455 23 GDYPQAMK Unmodified 908.4062 0.40620276 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 21.893 21.893 2 0.035882 14833 QUIQUE_C1218_190116_001 63.148 44.483 66394000 66394000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15442 2343 14509 135516 172477 172477 1 GDYYEAHQMYR Unmodified 1431.5877 0.58774895 3444 Q7L5D6 GET4 Golgi to ER traffic protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 36.124 36.124 3 0.015867 31706 QUIQUE_C1218_190116_001 36.982 31.996 21005000 21005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15443 3444 14510 135517 172478 172478 1 GEAAAERPGEAAVASSPSK Unmodified 1783.8701 0.87005504 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 19.994 19.994 2;3 1.1574E-131 12376 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172507;172508;172509;172510;172511;172512 172512 6 GEAAFAFIVVK Unmodified 1150.6386 0.63864553 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 112.88 112.88 2 0.0012574 109668 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.639 67.853 23812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23812000 0 0 0 15446 4296 14513 135549 172513 172513 1 GEAAGAVQELAR Unmodified 1170.5993 0.59929991 4434 Q9UHG2 PCSK1N ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.91 42.91 2 0.00064034 39665 QUIQUE_C1277_190116_001 115.42 80.267 652270000 0 225480000 0 0 0 0 0 69438000 110040000 0 159410000 0 87910000 15447 4434 14514 135550;135551;135552;135553;135554;135555;135556;135557;135558;135559;135560 172514;172515;172516;172517;172518;172519;172520;172521;172522;172523;172524;172525 172516 12 GEADFVESLLQLFR Unmodified 1622.8304 0.83042206 126 A0A096LNH6;Q14185 DOCK1 Dedicator of cytokinesis protein 1 yes no 0 0 0 1 176.43 176.43 2 0.03859 180434 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0 2 1 52.928 52.928 4 2.0954E-12 50857 QUIQUE_C1277_190116_001 69.981 63.277 78480000 0 78480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15451 2483 14518 135570 172536 172536 1 GEAGAAGPAGPAGPR Unmodified 1234.6054 0.60544792 27 A0A087WTA8;P08123 COL1A2 Collagen alpha-2(I) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.349 19.349 2 1.6376E-29 12360 QUIQUE_C1218_190116_001 166.55 145.1 1576200000 250150000 205700000 329170000 220530000 103070000 130900000 215010000 0 27060000 58469000 0 0 36151000 15452 27 14519 135571;135572;135573;135574;135575;135576;135577;135578;135579;135580 172537;172538;172539;172540;172541;172542;172543;172544;172545;172546 172537 9 GEAGAPGEEDIQGPTK Unmodified 1554.7162 0.71618016 1874 P05060;A0A0A0MT66 CHGB Secretogranin-1;PE-11;GAWK peptide;CCB peptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.467 36.467 2 1.6665E-05 32791 QUIQUE_C1218_190116_001 101.32 88.364 493110000 72086000 49925000 58573000 36932000 73495000 45290000 0 0 24045000 17008000 45945000 36255000 33560000 15453 1874 14520 135581;135582;135583;135584;135585;135586;135587;135588;135589;135590;135591 172547;172548;172549;172550;172551;172552;172553;172554;172555;172556;172557;172558;172559 172547 13 GEAGSDVSLVDLGFQTDFR Unmodified 2011.9487 0.9486993 3535 Q8IWA5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 141.79 141.79 2 1.1079E-17 146497 QUIQUE_DMIX3_190116_001 130.61 116.93 176960000 0 0 0 0 0 35057000 48290000 37332000 56284000 0 0 0 0 15454 3535 14521 135592;135593;135594;135595;135596;135597;135598 172560;172561;172562;172563;172564;172565;172566 172564 6 GEAGTPVAAGTTAAAIPR Unmodified 1609.8424 0.84238373 243 A0A0C4DGH3;Q9Y6R0;M0QXQ4 NUMBL Numb-like protein yes no 0 0 0 1 1 58.156 58.156 2 0.0019786 57561 QUIQUE_C1218_190116_001 69.716 51.448 59946000 27307000 0 0 0 0 32639000 0 0 0 0 0 0 0 15455 243 14522 135599;135600 172567;172568 172567 2 GEAHLAVNDFELAR Unmodified 1540.7634 0.76340513 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 74.194 74.194 2;3 5.9295E-05 74734 QUIQUE_C1277_190116_001 73.386 57.999 812730000 84336000 86582000 65704000 80911000 73696000 99062000 51895000 25476000 34661000 44276000 79418000 37347000 49368000 15456 2876 14523 135601;135602;135603;135604;135605;135606;135607;135608;135609;135610;135611;135612;135613;135614;135615;135616;135617;135618;135619;135620 172569;172570;172571;172572;172573;172574;172575;172576;172577;172578;172579;172580;172581;172582;172583;172584;172585;172586;172587;172588;172589;172590 172572 22 GEAIDTANHGEVKR Unmodified 1495.7379 0.73791866 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;F5GXQ8 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 1 1 2 1 11.191 11.191 3;4 0.0010859 3732 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.656 37.517 13863000 0 0 0 0 0 0 0 0 3144700 0 7706300 0 3012200 15457 228 14524 135621;135622;135623;135624 172591;172592;172593;172594;172595;172596 172591 6 GEAIEAILAALEVVSEPFR Unmodified 2013.0783 0.078256906 2976 Q13200;H7C1H2 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 179.44 179.44 2;3 1.9092E-22 186108 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.83 123.42 92936000 0 0 0 0 0 0 0 0 8156300 0 67856000 16924000 0 15458 2976 14525 135625;135626;135627;135628;135629 172597;172598;172599;172600;172601 172600 5 GEALSALDSK Unmodified 989.50294 0.50293991 1632 O75396 SEC22B Vesicle-trafficking protein SEC22b yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 35.686 35.686 2 0.015863 31561 QUIQUE_C1576_190116_001 63.076 30.721 370840000 0 0 0 89297000 0 68657000 69339000 0 70699000 0 72851000 0 0 15459 1632 14526 135630;135631;135632;135633;135634 172602;172603;172604;172605;172606 172604 2 GEAQAAGPSGVSVSR Unmodified 1371.6743 0.67425577 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.556 26.556 2 1.1226E-43 20296 QUIQUE_C1368_190116_001 179.35 164.21 6811300000 437310000 617720000 598710000 506500000 537710000 463430000 541680000 523290000 585830000 238860000 784580000 532160000 443490000 15460 1688 14527 135635;135636;135637;135638;135639;135640;135641;135642;135643;135644;135645;135646;135647 172607;172608;172609;172610;172611;172612;172613;172614;172615;172616;172617;172618;172619;172620;172621;172622;172623;172624;172625 172609 19 GEAQDLLSQIAQLQEENK Unmodified 2013.0015 0.0014631481 3267 Q5EBL4;A0A1B0GVV3 RILPL1 RILP-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 144.71 144.71 2 8.882E-39 149379 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.64 139.52 178830000 25463000 0 42605000 0 0 0 0 21881000 36841000 10230000 0 41808000 0 15461 3267 14528 135648;135649;135650;135651;135652;135653 172626;172627;172628;172629;172630;172631 172629 5 GEASEDLCEMALDPELLLLR Unmodified 2273.0919 0.091934414 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119;A0A087X2B6 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 167.13 167.13 3 0.0040298 170614 QUIQUE_C1277_190116_001 43.116 38.847 54063000 22500000 16682000 0 14881000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15462 3571 14529 135654;135655;135656 172632;172633;172634 172633 3 GEATVSFDDPPSAK Unmodified 1419.6518 0.65178899 19;1188 A0A075B7D9;Q92804;H3BPE7;P35637 TAF15;FUS TATA-binding protein-associated factor 2N;RNA-binding protein FUS no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.792 51.792 2 3.0874E-05 50457 QUIQUE_C1438_190116_001 142.07 121.76 2044800000 272200000 282540000 263850000 257860000 218960000 230130000 0 136780000 164390000 85514000 0 0 132600000 15463 19;1188 14530 135657;135658;135659;135660;135661;135662;135663;135664;135665;135666 172635;172636;172637;172638;172639;172640;172641;172642;172643;172644 172639 10 GEAVDEGEIAENLPEQEILIQSVCETMVPK Unmodified 3326.5898 0.58978895 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 163.21 163.21 3 5.9378E-09 166991 QUIQUE_C1403_190116_001 62.683 56.717 121700000 0 0 47626000 22970000 0 0 0 0 0 8988600 0 42117000 0 15464 3053 14531 135667;135668;135669;135670 172645;172646;172647;172648 172646 3 GEAVGSITQPLPSSYLIIR Unmodified 2000.0942 0.094241321 4083 Q9BZF1;F8VUA7;F8VQX7 OSBPL8 Oxysterol-binding protein-related protein 8;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 0 1 129.1 129.1 2 0.00042314 132800 QUIQUE_C1403_190116_001 68.809 37.982 20477000 0 0 0 20477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15465 4083 14532 135671 172649 172649 1 GEAYNLFEHNCNTFSNEVAQFLTGR Unmodified 2917.309 0.30895491 3366 Q6ICB0 DESI1 Desumoylating isopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.03 160.03 3 7.4611E-08 165861 QUIQUE_C1576_190116_001 63.122 60.715 264880000 15888000 34145000 28082000 20363000 0 10763000 54036000 36481000 0 0 30262000 0 34857000 15466 3366 14533 135672;135673;135674;135675;135676;135677;135678;135679;135680 172650;172651;172652;172653;172654;172655;172656;172657;172658;172659 172656 10 GECQAEGVLFFQGDR Unmodified 1711.7624 0.76241885 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 102.48 102.48 2 0.0003901 104728 QUIQUE_C1403_190116_001 78.324 65.748 204160000 0 156100000 0 0 0 0 30433000 0 0 17628000 0 0 0 15467 1839 14534 135681;135682;135683;135684;135685;135686 172660;172661;172662;172663;172664;172665 172662 5 GEDAAQAEK Acetyl (Protein N-term) 959.4196 0.41960421 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 1 0 0 1 18.127 18.127 2 0.018604 10784 QUIQUE_C1438_190116_001 54.191 40.195 13147000 0 0 0 0 13147000 0 0 0 0 0 0 0 0 15468 1751 14535 135687 172666 172666 1 GEDEAELALSLLAQLGITPLPLSR Unmodified 2505.369 0.3690192 3348 Q66K74 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 178.49 178.49 2;3 3.4189E-15 185282 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.01 131.58 249390000 0 0 0 0 0 0 0 10350000 30083000 0 146830000 48561000 13572000 15469 3348 14536 135688;135689;135690;135691;135692;135693;135694 172667;172668;172669;172670;172671;172672;172673 172671 7 GEDEEENNLEVR Unmodified 1431.6114 0.61138074 1868 P04843;F8WF32 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 34.647 34.647 2 4.0176E-07 30185 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.25 95.14 99669000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54947000 0 44722000 15470 1868 14537 135695;135696;135697 172674;172675;172676 172676 3 GEDFYCVTCHETK Unmodified 1644.6548 0.65484224 3283 Q5JXI8;Q13642;Q5JXH8;Q5JXH7;Q5JXI3;A0A0D9SFZ9;Q5JXI2 FHL1 Four and a half LIM domains protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 43.503 43.503 2;3 4.5406E-05 40644 QUIQUE_C1576_190116_001 132.55 125.43 4759300000 421570000 463250000 270080000 311490000 306430000 232790000 350330000 493890000 459830000 325520000 377410000 372100000 374610000 15471 3283 14538 135698;135699;135700;135701;135702;135703;135704;135705;135706;135707;135708;135709;135710;135711;135712;135713;135714;135715;135716;135717;135718;135719;135720;135721;135722;135723 172677;172678;172679;172680;172681;172682;172683;172684;172685;172686;172687;172688;172689;172690;172691;172692;172693;172694;172695;172696;172697;172698;172699;172700;172701;172702;172703;172704;172705;172706;172707;172708;172709;172710 172693 29 GEDIGEDLFSEALGR Unmodified 1606.7475 0.74748029 1354 K7ESN3;Q8N2G8 GHDC GH3 domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 142.72 142.72 2 0.016699 139032 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.948 33.377 46057000 0 0 36003000 0 0 0 0 0 0 10054000 0 0 0 15472 1354 14539 135724;135725 172711;172712 172712 1 GEDLDSQVGVIDFSMYLK Unmodified 2014.9558 0.95575851 3433;1145 Q7L099;D6RCQ1;H0YD93;Q8WXA3 RUFY3;RUFY2 Protein RUFY3;RUN and FYVE domain-containing protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 155.54 155.54 2 2.3455E-13 158253 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.16 133.22 75887000 0 0 0 0 0 0 0 29044000 24402000 0 0 22441000 0 15473 3433;1145 14540 135726;135727;135728;135729 172713;172714;172715;172716;172717 172714 4 GEDLTEEEDGGIIR Unmodified 1531.7002 0.70019575 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 85.778 85.778 2;3 1.693E-37 72362 QUIQUE_C1218_190116_001 185.77 144.49 882930000 130380000 109910000 89847000 106310000 81897000 113500000 28779000 0 0 71538000 66115000 29973000 54678000 15474 2876 14541 135730;135731;135732;135733;135734;135735;135736;135737;135738;135739;135740;135741;135742 172718;172719;172720;172721;172722;172723;172724;172725;172726;172727;172728;172729;172730;172731 172719 13 GEDPLVDDQNER Unmodified 1385.6059 0.60590143 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 38.919 38.919 2 0.0025395 34896 QUIQUE_C1403_190116_001 79.659 53.72 20731000 0 0 0 0 20731000 0 0 0 0 0 0 0 0 15475 1520 14542 135743;135744;135745;135746 172732;172733;172734;172735 172732 4 GEDPLVDDQNERDINSVAGVLK Unmodified 2382.1663 0.16629665 1520 O43295 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 1 1 106.16 106.16 3 0.00065716 108253 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.32 39.608 17263000 0 0 0 0 0 0 0 17263000 0 0 0 0 0 15476 1520 14543 135747 172736 172736 1 GEDSVPDTVHHVVVPVNPK Unmodified 2024.0327 0.032703697 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 54.248 54.248 3;4 0.0010408 51950 QUIQUE_C1368_190116_001 54.319 40.692 898010000 0 94653000 195330000 201240000 75865000 72614000 98264000 28081000 40423000 0 43705000 0 47835000 15477 3726 14544 135748;135749;135750;135751;135752;135753;135754;135755;135756;135757;135758;135759 172737;172738;172739;172740;172741;172742;172743;172744;172745;172746;172747;172748 172738 12 GEDVPLTEQTVSQVLQSAK Unmodified 2028.0375 0.037514303 1034 F8VVA7;P61923;F8W651;F8VYK5 COPZ1 Coatomer subunit zeta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.72 127.72 2 4.5039E-28 131673 QUIQUE_C1277_190116_001 141.07 120.23 561840000 44473000 53617000 49472000 68163000 60910000 65823000 57217000 37049000 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1195.5146 0.51456723 4309 Q9NVS9;J3QQZ9 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.348 82.348 2 0.00047712 79350 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.52 80.096 2176300000 200680000 197850000 0 173020000 197910000 185240000 196150000 146500000 170490000 69041000 254280000 149910000 235260000 15483 4309 14549 135798;135799;135800;135801;135802;135803;135804;135805;135806;135807;135808;135809 172789;172790;172791;172792;172793;172794;172795;172796;172797;172798;172799;172800;172801;172802 172799 13 GEEGHDPKEPEQLR Unmodified 1619.754 0.75396265 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 1 3 3 2 3 3 3 1 1 1 2 3 2 2 15.875 15.875 2;3;4 3.3863E-14 7481 QUIQUE_C1563_190116_001 118.52 99.278 2737400000 370360000 398770000 241270000 342300000 322850000 242680000 40060000 79583000 27744000 98846000 302730000 192830000 77380000 15484 2601 14550 135810;135811;135812;135813;135814;135815;135816;135817;135818;135819;135820;135821;135822;135823;135824;135825;135826;135827;135828;135829;135830;135831;135832;135833;135834;135835;135836;135837;135838 172803;172804;172805;172806;172807;172808;172809;172810;172811;172812;172813;172814;172815;172816;172817;172818;172819;172820;172821;172822;172823;172824;172825;172826;172827;172828;172829;172830;172831;172832;172833 172818 25 GEEGHDPKEPEQLRK Unmodified 1747.8489 0.84892567 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 10.454 10.454 4 1.0098E-18 2659 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.1 135.35 540730000 0 0 0 0 53542000 0 0 128270000 93732000 0 39344000 131390000 94449000 15485 2601 14551 135839;135840;135841;135842;135843;135844 172834;172835;172836;172837;172838;172839 172837 6 GEELGGGQDPVQLLSGFPR Unmodified 1954.9749 0.97485447 942 E9PJ81;E9PRQ7;Q04323;A0A087WTZ5 UBXN1 UBX domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.52 136.52 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172888;172889;172890;172891;172892;172893;172894;172895;172896;172897;172898;172899;172900;172901;172902;172903;172904;172905;172906;172907;172908;172909;172910;172911;172912;172913;172914;172915;172916;172917;172918;172919;172920;172921;172922 172901 35 GEETGIDVTLPTGEVTVPGVSGDVSLPEIATGGLEGK Unmodified 3579.8043 0.80433305 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 163.38 163.38 3 1.1021E-06 165463 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.761 39.143 89831000 0 0 0 0 0 0 0 58399000 0 0 31432000 0 0 15492 2935 14557 135915;135916 172923;172924 172923 2 GEETPVIVGSALCALEGR Unmodified 1856.9302 0.93021246 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 140.19 140.19 2;3 1.2641E-53 145036 QUIQUE_C1368_190116_001 180.84 143.6 2421700000 473640000 349670000 402070000 389610000 39498000 379550000 42489000 0 0 170180000 133770000 0 41226000 15493 2529 14558 135917;135918;135919;135920;135921;135922;135923;135924;135925;135926;135927;135928;135929;135930;135931;135932;135933;135934;135935;135936 172925;172926;172927;172928;172929;172930;172931;172932;172933;172934;172935;172936;172937;172938;172939;172940;172941;172942;172943;172944;172945;172946;172947;172948;172949;172950;172951;172952;172953;172954;172955 172935 29 GEETPVIVGSALCALEGRDPELGLK Unmodified 2609.3371 0.33706714 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.98 144.98 3 5.4526E-17 147783 QUIQUE_C1563_190116_001 112.86 105.24 1459700000 57257000 122570000 152890000 167280000 251950000 84753000 121640000 113750000 0 21805000 132890000 112190000 120720000 15494 2529 14559 135937;135938;135939;135940;135941;135942;135943;135944;135945;135946;135947;135948 172956;172957;172958;172959;172960;172961;172962;172963;172964;172965;172966;172967;172968;172969;172970;172971 172962 13 GEEVDVAR Unmodified 873.41921 0.41921028 1684 O94760 DDAH1 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Unmodified 1086.5921 0.59208927 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 46.995 46.995 2 0.0011141 44372 QUIQUE_C1403_190116_001 101.54 47.574 404450000 0 0 59451000 64769000 47857000 0 63951000 0 0 0 63139000 38814000 66465000 15497 1074 14562 135971;135972;135973;135974;135975;135976;135977 172996;172997;172998;172999;173000;173001;173002 172997 7 GEFDPGQDTYQHPPK Unmodified 1714.7587 0.75871368 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 42.314 42.314 2;3 6.1452E-29 38829 QUIQUE_DMIX3_190116_001 182.1 170.17 8589900000 968990000 1025900000 782120000 727900000 704740000 1036400000 574560000 325670000 660420000 464300000 498850000 366260000 453770000 15498 3975 14563 135978;135979;135980;135981;135982;135983;135984;135985;135986;135987;135988;135989;135990;135991;135992;135993;135994;135995;135996;135997;135998;135999;136000;136001;136002;136003 173003;173004;173005;173006;173007;173008;173009;173010;173011;173012;173013;173014;173015;173016;173017;173018;173019;173020;173021;173022;173023;173024;173025;173026;173027;173028;173029;173030;173031;173032;173033;173034;173035;173036;173037;173038;173039;173040;173041;173042;173043;173044;173045;173046;173047;173048;173049 173035 47 GEFDPGQDTYQHPPKDSSGQHVDVSPTSQR Unmodified 3295.4766 0.47662518 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 49.722 49.722 5 0.02149 46738 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.671 17.459 45080000 0 0 0 0 0 0 0 45080000 0 0 0 0 0 15499 3975 14564 136004 173050;173051 173050 2 GEFGDVMLGDYR Unmodified 1357.5973 0.597251 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 0 1 107.1 107.1 2 0.01168 109298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.676 49.932 30344000 0 0 0 0 0 0 0 30344000 0 0 0 0 0 15500 2439 14565 136005 173052;173053 173053 2 GEFGGFGSVSGK Unmodified 1127.5247 0.52473799 2933 Q09028;C9JPP3 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.475 61.475 2 0.0015038 60891 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.916 59.616 1005300000 106010000 115680000 112070000 113690000 83457000 106080000 107110000 0 75139000 40453000 77764000 0 67798000 15501 2933 14566 136006;136007;136008;136009;136010;136011;136012;136013;136014;136015;136016 173054;173055;173056;173057;173058;173059;173060;173061;173062;173063;173064;173065;173066 173064 12 GEFGVYLVSDGSSR Unmodified 1471.6943 0.69432251 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 94.85 94.85 2 0.01214 91602 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.7 42.412 377620000 132730000 94440000 0 0 63990000 0 0 0 0 86464000 0 0 0 15502 1620 14567 136017;136018;136019;136020 173067;173068;173069;173070 173070 4 GEFGVYLVSDGSSRPYR Unmodified 1887.9115 0.91152593 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 84.855 84.855 3 1.6257E-05 86281 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.41 90.036 746810000 0 43461000 0 0 0 0 0 224380000 200180000 0 278780000 0 0 15503 1620 14568 136021;136022;136023;136024 173071;173072;173073;173074 173072 4 GEFKDEEETVTTK Unmodified 1511.6991 0.69913312 3078 Q14677 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.119 28.119 2 9.4986E-07 22245 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.5 96.078 333550000 37007000 0 46957000 55062000 0 46778000 0 0 47974000 0 57653000 42117000 0 15504 3078 14569 136025;136026;136027;136028;136029;136030;136031;136032 173075;173076;173077;173078;173079;173080;173081;173082 173081 8 GEFSAAPDPGWPDCFNSGVFVFQPSLHTHK Unmodified 3330.5193 0.51928204 382 A0A1W2PQ75;O15488 GYG2 Glycogenin-2 yes no 0 0 0 1 1 137.41 137.41 3;4 0.0015484 142904 QUIQUE_C1576_190116_001 18.122 15.758 51327000 0 0 0 0 0 0 40685000 0 0 10642000 0 0 0 15505 382 14570 136033;136034 173083;173084;173085 173083 3 GEFTIETEGK Unmodified 1109.5241 0.52406928 2440 P41250;H7C443 GARS Glycine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.772 45.772 2 0.00014691 42812 QUIQUE_C1438_190116_001 122.13 73.852 1610500000 172300000 179240000 211500000 188750000 168670000 167270000 201700000 0 0 105490000 215600000 0 0 15506 2440 14571 136035;136036;136037;136038;136039;136040;136041;136042;136043;136044;136045 173086;173087;173088;173089;173090;173091;173092;173093;173094;173095;173096;173097 173091 8 GEFTNLQGVAASTNGK Unmodified 1592.7794 0.77944912 4091 Q9C040 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 66.438 66.438 2 0.060877 65303 QUIQUE_C1563_190116_001 45.891 34.159 28537000 0 0 0 0 0 28537000 0 0 0 0 0 0 0 15507 4091 14572 136046 173098 173098 0 GEFTNLQGVSAASSGR Unmodified 1579.759 0.75904803 1631 O75382;A0A1W2PPI7 TRIM3 Tripartite motif-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.703 65.703 2 9.8235E-19 66117 QUIQUE_C1218_190116_001 142.83 129.02 139760000 32791000 35242000 0 0 0 27393000 0 0 0 0 0 44332000 0 15508 1631 14573 136047;136048;136049;136050 173099;173100;173101;173102 173099 4 GEFTYYEIQDNTGK Unmodified 1663.7366 0.73658126 3188 Q16666 IFI16 Gamma-interferon-inducible protein 16 yes yes 0 0 0 1 81.763 81.763 2 0.00028858 83535 QUIQUE_C1368_190116_001 99.215 64.829 35943000 0 0 35943000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15509 3188 14574 136051 173103 173103 1 GEFVTTVQQR Unmodified 1163.5935 0.59348625 2430 P40925;B9A041;B8ZZ51 MDH1 Malate dehydrogenase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.823 36.823 2 3.7247E-23 33053 QUIQUE_DMIX5_190116_001 190.26 154.91 59690000000 5366400000 5673700000 5682500000 4669000000 4214100000 4436900000 5215600000 3624800000 4327800000 1499200000 4945900000 5007200000 5027100000 15510 2430 14575 136052;136053;136054;136055;136056;136057;136058;136059;136060;136061;136062;136063;136064 173104;173105;173106;173107;173108;173109;173110;173111;173112;173113;173114;173115;173116;173117;173118;173119;173120;173121;173122;173123;173124;173125;173126;173127;173128;173129;173130 173126 27 GEFYNEASNLQVAIR Unmodified 1709.8373 0.83729835 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;E9PMX3;E9PQP1;E9PPR0;E9PLC6;E9PJL9 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 102.19 102.19 2 1.0958E-22 106321 QUIQUE_C1218_190116_001 194.5 176.69 624880000 0 0 105630000 0 103990000 0 113480000 44333000 51211000 83885000 0 0 122350000 15511 1069 14576 136065;136066;136067;136068;136069;136070;136071;136072;136073;136074 173131;173132;173133;173134;173135;173136;173137;173138;173139;173140 173131 10 GEGAEPQYVDK Unmodified 1191.5408 0.54078198 4166 Q9H479 FN3K Fructosamine-3-kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 22.036 22.036 2 0.0053953 14490 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.556 38.489 69935000 69935000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15512 4166 14577 136075;136076;136077;136078;136079 173141;173142;173143;173144;173145 173145 5 GEGDAATEQAAPQAPASSEEK Unmodified 2042.9029 0.90287132 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 30.493 30.493 2 7.5638E-165 24491 QUIQUE_C1368_190116_001 236.3 226.77 326390000 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173157;173158;173159;173160;173161;173162;173163;173164;173165;173166;173167 173161 11 GEGEICVR Unmodified 918.42292 0.42291545 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 0 0 1 21.992 21.992 2 0.038705 15092 QUIQUE_C1218_190116_001 61.357 16.665 27283000 27283000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15516 4476 14581 136099 173168 173168 1 GEGENEAVTPK Unmodified 1129.5251 0.52513192 3199 Q16799 RTN1 Reticulon-1 yes yes 0 0 0 1 14.574 14.574 2 0.035958 6617 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.998 24.075 4623400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4623400 0 0 0 15517 3199 14582 136100 173169 173169 1 GEGGILINSQGER Unmodified 1328.6684 0.66844211 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.882 43.882 2 7.52E-10 40577 QUIQUE_DMIX7_190116_001 176.48 153.06 3982900000 364690000 371540000 412040000 191310000 297100000 235530000 346950000 155580000 251570000 172680000 473130000 314930000 395800000 15518 2326 14583 136101;136102;136103;136104;136105;136106;136107;136108;136109;136110;136111;136112;136113 173170;173171;173172;173173;173174;173175;173176;173177;173178;173179;173180;173181;173182;173183;173184;173185;173186;173187;173188;173189;173190;173191;173192;173193;173194;173195 173193 26 GEGGTTNPHIFPEGSEPK Unmodified 1852.8592 0.85915601 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5H3F0 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 1 2 2 43.514 43.514 2;3 1.7296E-53 39988 QUIQUE_C1277_190116_001 178.68 152.27 4334900000 315530000 446280000 367960000 315730000 476100000 298110000 448510000 220350000 251780000 248380000 319460000 365220000 261450000 15519 1282 14584 136114;136115;136116;136117;136118;136119;136120;136121;136122;136123;136124;136125;136126;136127;136128;136129;136130;136131;136132;136133;136134;136135 173196;173197;173198;173199;173200;173201;173202;173203;173204;173205;173206;173207;173208;173209;173210;173211;173212;173213;173214;173215;173216;173217;173218;173219;173220;173221;173222;173223;173224;173225;173226;173227;173228;173229;173230;173231;173232;173233 173201 38 GEGLYADPYGLLHEGR Unmodified 1745.8373 0.83729835 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7;A0A087WU33 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.45 101.45 3 0.0024725 105953 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.862 43.074 362050000 0 75638000 52144000 0 64528000 0 48148000 0 0 0 68013000 0 53582000 15520 103 14585 136136;136137;136138;136139;136140;136141 173234;173235;173236;173237;173238;173239 173238 5 GEGMPQYR Unmodified 936.41235 0.41235077 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 25.473 25.473 2 0.033272 19523 QUIQUE_C1576_190116_001 64.803 44.248 123010000 0 0 0 38577000 0 0 40862000 0 0 0 43573000 0 0 15521 1600 14586 136142;136143;136144 173240;173241;173242 173241 3 GEGMSQAATICK Oxidation (M) 1267.5537 0.55367163 2114 P16930;H3BNP8 FAH Fumarylacetoacetase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.168 16.168 2 2.7743E-06 8370 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.66 115.92 143920000 15407000 27773000 0 0 0 14496000 0 0 35198000 20986000 0 30061000 0 15522 2114 14587 136145;136146;136147;136148;136149;136150;136151;136152;136153;136154;136155;136156;136157 173243;173244;173245;173246;173247;173248;173249;173250;173251;173252;173253;173254;173255 173252 1445 13 GEGMSQAATICK Unmodified 1251.5588 0.55875701 2114 P16930;H3BNP8 FAH Fumarylacetoacetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.282 28.282 2 0.00017846 22407 QUIQUE_C1403_190116_001 119.16 101.92 605500000 42127000 52641000 99309000 76275000 42770000 56937000 49173000 49140000 49483000 23028000 64616000 0 0 15523 2114 14587 136158;136159;136160;136161;136162;136163;136164;136165;136166;136167;136168 173256;173257;173258;173259;173260;173261;173262;173263;173264;173265;173266;173267 173260 11 GEGPDVDVNLPK Unmodified 1238.6143 0.61428128 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.012 65.012 2 0.0023456 65562 QUIQUE_C1218_190116_001 78.655 57.785 2034100000 148480000 0 166010000 147690000 161410000 239700000 260480000 303210000 0 105970000 192730000 139540000 168870000 15524 2935 14588 136169;136170;136171;136172;136173;136174;136175;136176;136177;136178;136179 173268;173269;173270;173271;173272;173273;173274;173275;173276;173277;173278;173279;173280 173269 12 GEGPDVDVTLPK Unmodified 1225.619 0.6190323 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 69.886 69.886 2 0.0040185 69154 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.865 60.493 60641000 0 0 0 0 0 0 0 60641000 0 0 0 0 0 15525 2935 14589 136180 173281 173281 1 GEGPEFDVNLSK Unmodified 1290.6092 0.6091959 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 72.647 72.647 2 0.00060313 69393 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.855 69.115 777360000 0 0 0 98969000 83274000 110500000 113310000 139100000 74909000 42248000 0 0 115050000 15526 2935 14590 136181;136182;136183;136184;136185;136186;136187;136188 173282;173283;173284;173285;173286;173287;173288;173289;173290 173289 9 GEGPEVDVNLPK Unmodified 1252.6299 0.62993134 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.845 65.845 2 0.0023456 64923 QUIQUE_C1368_190116_001 78.655 59.384 2471200000 0 218380000 251950000 256280000 285840000 379190000 0 410590000 0 119190000 0 228860000 320900000 15527 2935 14591 136189;136190;136191;136192;136193;136194;136195;136196;136197 173291;173292;173293;173294;173295;173296;173297;173298;173299 173292 7 GEGQLGPAER Unmodified 1012.4938 0.49377221 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.874 18.874 2 0.00013542 11768 QUIQUE_C1218_190116_001 121.73 67.576 5646800000 431560000 445440000 586650000 547070000 439770000 461180000 477990000 501580000 499590000 239880000 515830000 0 500280000 15528 2058 14592 136198;136199;136200;136201;136202;136203;136204;136205;136206;136207;136208;136209 173300;173301;173302;173303;173304;173305;173306;173307;173308;173309;173310;173311 173300 3 GEGTGVLGSLSLPLSELLVADQLCLDR Unmodified 2811.4688 0.4688096 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 171.97 171.97 3 0.00058696 176342 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.934 35.001 20213000 0 0 0 0 0 0 0 0 20213000 0 0 0 0 15529 4014 14593 136210 173312 173312 1 GEGTTTAEAAPATGSKPDEPGK Unmodified 2070.9706 0.97055695 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 20.053 20.053 2;3 2.0079E-35 12582 QUIQUE_C1368_190116_001 193.32 178.76 1637800000 314070000 97926000 178570000 216770000 213520000 102530000 223160000 0 0 53736000 84866000 63370000 89251000 15530 2128 14594 136211;136212;136213;136214;136215;136216;136217;136218;136219;136220;136221;136222;136223;136224;136225;136226;136227 173313;173314;173315;173316;173317;173318;173319;173320;173321;173322;173323;173324;173325;173326;173327;173328;173329;173330;173331 173318 19 GEGYAKPNEGAIVEVALEGYYK Unmodified 2356.1587 0.15869207 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 119.03 119.03 3 0.00027051 123783 QUIQUE_C1576_190116_001 53.444 45.452 382420000 86787000 0 0 76158000 0 76436000 89587000 53456000 0 0 0 0 0 15531 2876 14595 136228;136229;136230;136231;136232 173332;173333;173334;173335;173336;173337 173336 5 GEGYAKPNEGAIVEVALEGYYKDK Unmodified 2599.2806 0.28059812 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 2 1 108.53 108.53 3 0.034098 112310 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.091 31.469 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15532 2876 14596 136233 173338 173338 1 GEHGFIGCR Unmodified 1031.4607 0.46069794 3187 Q16658;C9JFC0;A0A0A0MSB2;C9JPH9 FSCN1 Fascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 17.938 17.938 2 0.0017605 10801 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.39 85.182 328920000 0 0 0 0 0 31880000 0 197600000 0 64344000 0 35097000 0 15533 3187 14597 136234;136235;136236;136237 173339;173340;173341;173342 173340 4 GEHPGLSIGDVAK Unmodified 1278.6568 0.65681479 1960 P09429;Q5T7C4;B2RPK0 HMGB1;HMGB1P1 High mobility group protein B1;Putative high mobility group protein B1-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 40.8 40.8 2;3 0.00017967 38496 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.41 87.785 683310000 75391000 31618000 130320000 35205000 0 114710000 0 0 77615000 91216000 69557000 57678000 0 15534 1960 14598 136238;136239;136240;136241;136242;136243;136244;136245;136246;136247 173343;173344;173345;173346;173347;173348;173349;173350;173351;173352;173353 173352 10 GEHSIVYLKPSYAFGSVGK Unmodified 2038.0524 0.052376507 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 1 2 3 3 3 3 3 3 3 3 1 2 2 1 76.604 76.604 2;3;4 5.4451E-73 77641 QUIQUE_C1576_190116_001 189.86 168.61 3292100000 187280000 335300000 258590000 244840000 393830000 272010000 366930000 261530000 330870000 58086000 175830000 278610000 128410000 15535 2876 14599 136248;136249;136250;136251;136252;136253;136254;136255;136256;136257;136258;136259;136260;136261;136262;136263;136264;136265;136266;136267;136268;136269;136270;136271;136272;136273;136274;136275;136276;136277;136278;136279 173354;173355;173356;173357;173358;173359;173360;173361;173362;173363;173364;173365;173366;173367;173368;173369;173370;173371;173372;173373;173374;173375;173376;173377;173378;173379;173380;173381;173382;173383;173384;173385;173386;173387;173388;173389;173390;173391;173392;173393;173394;173395;173396;173397;173398;173399;173400;173401;173402;173403 173386 47 GEIAEAYADLVK Unmodified 1277.6503 0.65033243 1096 G5E9A6;P51784;Q5JXD3 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 101.54 101.54 2 0.015048 102575 QUIQUE_C1563_190116_001 55.806 34.718 180560000 0 0 0 0 0 180560000 0 0 0 0 0 0 0 15536 1096 14600 136280 173404 173404 1 GEIAGPPDTPYEGGR Unmodified 1514.7001 0.70013617 2711 P61086;D6RDM7 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes no 0 0 0 1 1 1 1 56.137 56.137 2 0.00095556 53591 QUIQUE_C1368_190116_001 74.326 59.354 53858000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53858000 0 0 0 15537 2711 14601 136281;136282;136283;136284 173405;173406;173407;173408 173406 4 GEIDAHEDSFK Unmodified 1246.5466 0.54659564 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 27.631 27.631 2;3 0.00012168 21382 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.53 101.39 11688000000 1787900000 632030000 451160000 1164600000 547010000 1215200000 1442500000 280860000 746240000 1039000000 841050000 734460000 806390000 15538 267;275;3025 14602 136285;136286;136287;136288;136289;136290;136291;136292;136293;136294;136295;136296;136297;136298;136299;136300;136301;136302;136303;136304;136305;136306 173409;173410;173411;173412;173413;173414;173415;173416;173417;173418;173419;173420;173421;173422;173423;173424;173425;173426;173427;173428;173429;173430;173431;173432;173433;173434;173435;173436;173437;173438;173439 173431 27 GEIEQRPTPGSR Acetyl (Protein N-term) 1367.6793 0.67934115 734;357 A0A1B0GV68;M0QYB0;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.412 29.412 2 0.00085531 23471 QUIQUE_C1368_190116_001 112.75 87.311 1236600000 0 128590000 143390000 195140000 0 0 177920000 173700000 149440000 0 0 108960000 159510000 15539 357;734 14603 136307;136308;136309;136310;136311;136312;136313;136314 173440;173441;173442;173443;173444;173445;173446;173447;173448 173441 7 GEIGAVGNAGPAGPAGPR Unmodified 1546.7852 0.7852032 27 A0A087WTA8;P08123 COL1A2 Collagen alpha-2(I) chain yes no 0 0 0 1 1 46.785 46.785 2 0.00056005 43648 QUIQUE_C1277_190116_001 93.011 43.563 138830000 0 74407000 0 64421000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15540 27 14604 136315;136316 173449;173450 173449 2 GEILQIVNR Unmodified 1040.5978 0.59784335 4358 Q9NZW5;B8ZZG1;C9J4Q3 MPP6 MAGUK p55 subfamily member 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.456 67.456 2 0.0032955 67501 QUIQUE_C1277_190116_001 91.626 71.071 573360000 0 62050000 62513000 57682000 56077000 57386000 70160000 0 63889000 0 79804000 63801000 0 15541 4358 14605 136317;136318;136319;136320;136321;136322;136323;136324;136325 173451;173452;173453;173454;173455;173456;173457;173458;173459 173451 5 GEIQSLKEENNR Unmodified 1415.7005 0.70047052 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5;O95317;Q9UES5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 18.779 18.779 2;3 0.0095683 11439 QUIQUE_C1438_190116_001 56.122 33.205 199880000 0 0 70626000 33730000 54489000 0 0 0 0 0 0 0 41034000 15542 4607 14606 136326;136327;136328;136329;136330 173460;173461;173462;173463;173464 173462 4 GEITLSQWIPLMEENCR Unmodified 2074.9816 0.9815961 2361 P34913;E5RFU2;H0YAW7;E5RI53 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 153.41 153.41 2 4.2245E-18 157629 QUIQUE_C1277_190116_001 125.53 96.228 203450000 0 0 0 0 0 0 61875000 0 0 0 0 69212000 72358000 15543 2361 14607 136331;136332;136333;136334 173465;173466;173467;173468 173465 3 GEITPELLGVMR Unmodified 1313.7013 0.70132214 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 111.19 111.19 2 0.00045214 116261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.68 78.232 665290000 0 94657000 85512000 0 65266000 77193000 84542000 26936000 52864000 0 88127000 44811000 45384000 15544 2142 14608 136335;136336;136337;136338;136339;136340;136341;136342;136343;136344;136345 173469;173470;173471;173472;173473;173474;173475;173476;173477;173478;173479;173480;173481;173482 173480 14 GELASYDMR Unmodified 1040.4597 0.45969489 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 44.762 44.762 2 0.027804 40958 QUIQUE_C1368_190116_001 57.59 44.011 234830000 72015000 0 75307000 59396000 0 0 0 0 0 28110000 0 0 0 15545 86 14609 136346;136347;136348;136349 173483;173484;173485;173486;173487 173484 4 GELASYDMR Oxidation (M) 1056.4546 0.45460951 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 28.844 28.844 2 0.059024 22328 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.805 33.511 23080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23080000 0 0 0 15546 86 14609 136350 173488 173488 1 GELEDTLDSTNAQQELR Unmodified 1917.8916 0.89157835 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 88.389 88.389 2 7.2369E-31 89576 QUIQUE_C1403_190116_001 196.38 172.71 62810000 23704000 0 0 39106000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15547 3459 14610 136351;136352 173489;173490 173490 2 GELGELGDAWTSTPMR Oxidation (M) 1734.7883 0.78829925 4720 yes yes 0 1 0 1 1 59.967 59.967 2 0.0099349 59096 QUIQUE_C1368_190116_001 52.928 8.7403 36198000 0 0 19274000 0 0 0 0 0 0 0 16924000 0 0 + 15548 4720 14611 136353;136354 173491;173492;173493 173491 3092 3 GELLALVK Unmodified 841.5273 0.52730417 3887 Q96JB5;J3QQY1;J3QL86 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 76.176 76.176 2 0.026074 75728 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.912 30.71 78256000 28727000 0 0 0 0 0 0 27365000 0 22164000 0 0 0 15549 3887 14612 136355;136356;136357 173494;173495;173496 173495 3 GELLEAIK Unmodified 871.50148 0.50148335 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5;G8JLJ2 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.986 58.986 2 0.02931 58559 QUIQUE_C1218_190116_001 67.981 0 3632500000 877420000 0 1025300000 0 0 932000000 0 166880000 0 418280000 0 212650000 0 15550 1855 14613 136358;136359;136360;136361;136362;136363 173497;173498;173499;173500;173501;173502 173497 6 GELLEAIKR Unmodified 1027.6026 0.60259438 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5;G8JLJ2 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 41.199 41.199 2 0.0043508 37822 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.439 41.833 4788700000 0 0 1100200000 0 0 0 0 0 0 109450000 2049000000 0 1530100000 15551 1855 14614 136364;136365;136366;136367 173503;173504;173505;173506 173505 4 GELPDFQDGTK Unmodified 1205.5564 0.55643205 1381 O00170;E9PMH2 AIP AH receptor-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 61.735 61.735 2 0.015744 61072 QUIQUE_C1576_190116_001 57.347 46.196 205640000 73394000 0 0 0 0 74454000 57786000 0 0 0 0 0 0 15552 1381 14615 136368;136369;136370 173507;173508;173509 173509 3 GELPLDINIQEPR Acetyl (Protein N-term) 1534.7991 0.79912193 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;S4R3N9 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 1 0 0 1 1 1 1 143.85 143.85 2 0.00079443 139846 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.653 67.488 117420000 0 0 0 0 23828000 0 0 0 0 8161700 0 40597000 44829000 15553 163 14616 136371;136372;136373;136374 173510;173511;173512;173513;173514 173511 5 GELQGQNVLTVR Unmodified 1312.7099 0.709913 321 A0A0U1RRL8;Q8TB22 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.024 59.024 2 0.0012956 58460 QUIQUE_C1438_190116_001 82.261 47.874 338730000 57457000 0 38904000 0 43518000 0 44454000 0 48163000 21295000 55397000 29537000 0 15554 321 14617 136375;136376;136377;136378;136379;136380;136381;136382;136383 173515;173516;173517;173518;173519;173520;173521;173522;173523 173517 9 GELQNWPDLLPK Unmodified 1408.7351 0.73506511 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 126.37 126.37 2 0.00076734 132101 QUIQUE_C1576_190116_001 88.496 62.453 394020000 94891000 99063000 0 0 100760000 62077000 37230000 0 0 0 0 0 0 15555 3772 14618 136384;136385;136386;136387;136388;136389;136390;136391 173524;173525;173526;173527;173528;173529;173530;173531;173532 173530 9 GELSGDFEK Unmodified 980.44509 0.44509068 1936 P08133 ANXA6 Annexin A6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.509 35.509 2 0.0014496 30829 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.56 79.591 8875100000 632180000 626000000 856050000 733300000 0 686610000 790620000 468870000 856410000 401750000 1120200000 805480000 897550000 15556 1936 14619 136392;136393;136394;136395;136396;136397;136398;136399;136400;136401;136402;136403 173533;173534;173535;173536;173537;173538;173539;173540;173541;173542;173543;173544;173545;173546 173543 13 GELSGHFEDLLLAIVNCVR Unmodified 2141.0939 0.093923745 2045 P12429;D6RA82 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 2 168.52 168.52 2;3 9.8615E-37 175681 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.72 87.117 407700000 0 0 0 0 0 0 86549000 0 0 0 321150000 0 0 15557 2045 14620 136404;136405;136406 173547;173548;173549;173550 173548 4 GELSTLLYNTHPYR Unmodified 1662.8366 0.83657007 368 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90.382 90.382 3 0.0081896 92270 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.172 47.704 28842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28842000 0 15560 3490 14623 136422 173568 173568 1 GELVGGLDIVK Unmodified 1098.6285 0.62847478 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 0 1 87.645 87.645 2 0.053707 91042 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.167 40.653 85809000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85809000 0 0 15561 1676 14624 136423 173569 173569 0 GELVTHFLTTDVDSLSYLK Unmodified 2137.0943 0.094300901 701 C9J695;Q6ICL3;C9JDT9;A0A0A0MSI5 TANGO2 Transport and Golgi organization protein 2 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 136.45 136.45 3 0.0040623 139114 QUIQUE_C1563_190116_001 44.468 35.536 186970000 29253000 34662000 44449000 39195000 0 39406000 0 0 0 0 0 0 0 15562 701 14625 136424;136425;136426;136427;136428 173570;173571;173572;173573;173574 173574 1 GELWDTCNIGVPWYDR Unmodified 1979.8836 0.88359662 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 141.52 141.52 2 1.5098E-05 146424 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.53 87.87 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136436;136437;136438;136439;136440;136441;136442;136443;136444;136445;136446;136447;136448;136449;136450;136451;136452;136453;136454;136455;136456;136457;136458;136459 173583;173584;173585;173586;173587;173588;173589;173590;173591;173592;173593;173594;173595;173596;173597;173598;173599;173600;173601;173602;173603;173604;173605;173606;173607 173587 1133;1134 24 GEMMDLQHGSLFLQTPK Oxidation (M) 1946.923 0.92301859 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 1 0 4 4 4 4 4 3 4 4 5 3 3 3 4 90.216 90.216 2;3 3.812E-104 93183 QUIQUE_C1277_190116_001 219.95 177.91 10514000000 984260000 1041600000 1040900000 903140000 863590000 626210000 634190000 557610000 825590000 639010000 868100000 747330000 782540000 15566 1915 14628 136460;136461;136462;136463;136464;136465;136466;136467;136468;136469;136470;136471;136472;136473;136474;136475;136476;136477;136478;136479;136480;136481;136482;136483;136484;136485;136486;136487;136488;136489;136490;136491;136492;136493;136494;136495;136496;136497;136498;136499;136500;136501;136502;136503;136504;136505;136506;136507;136508 173608;173609;173610;173611;173612;173613;173614;173615;173616;173617;173618;173619;173620;173621;173622;173623;173624;173625;173626;173627;173628;173629;173630;173631;173632;173633;173634;173635;173636;173637;173638;173639;173640;173641;173642;173643;173644;173645;173646;173647;173648;173649;173650;173651;173652;173653;173654;173655;173656;173657;173658;173659;173660;173661;173662;173663;173664;173665;173666;173667;173668;173669;173670;173671;173672;173673;173674;173675;173676;173677;173678;173679;173680;173681;173682;173683;173684;173685 173621 1133;1134 78 GEMMDLQHGSLFLQTPK Unmodified 1930.9281 0.92810397 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 105.38 105.38 2;3 0 109846 QUIQUE_C1576_190116_001 314.17 284.26 36726000000 3343600000 3195300000 4088800000 3539900000 2748300000 3144100000 3105800000 1670600000 2453500000 799010000 3029100000 2451500000 3156400000 15567 1915 14628 136509;136510;136511;136512;136513;136514;136515;136516;136517;136518;136519;136520;136521;136522;136523;136524;136525;136526;136527;136528;136529;136530;136531;136532;136533;136534;136535;136536 173686;173687;173688;173689;173690;173691;173692;173693;173694;173695;173696;173697;173698;173699;173700;173701;173702;173703;173704;173705;173706;173707;173708;173709;173710;173711;173712;173713;173714;173715;173716;173717;173718;173719;173720;173721;173722;173723;173724;173725;173726;173727;173728;173729;173730;173731;173732;173733;173734;173735;173736;173737;173738;173739 173715 54 GEMMDLQHGSLFLR Oxidation (M) 1648.7701 0.77014677 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 1 0 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 85.265 85.265 2;3 0.00038292 86741 QUIQUE_C1277_190116_001 75.764 57.626 1914800000 78736000 393390000 378730000 304420000 61294000 0 53833000 79661000 88269000 213770000 110130000 69617000 82922000 15568 1775 14629 136537;136538;136539;136540;136541;136542;136543;136544;136545;136546;136547;136548;136549;136550;136551;136552 173740;173741;173742;173743;173744;173745;173746;173747;173748;173749;173750;173751;173752;173753;173754;173755;173756 173741 964;965 12 GEMMDLQHGSLFLR Unmodified 1632.7752 0.77523214 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 101.91 101.91 2;3 4.1064E-101 104830 QUIQUE_C1368_190116_001 230.59 199.98 9406500000 1028900000 970680000 1032500000 991610000 498120000 465720000 765160000 592680000 530390000 199210000 893920000 585310000 852220000 15569 1775 14629 136553;136554;136555;136556;136557;136558;136559;136560;136561;136562;136563;136564;136565;136566;136567;136568;136569;136570;136571;136572;136573;136574;136575;136576;136577 173757;173758;173759;173760;173761;173762;173763;173764;173765;173766;173767;173768;173769;173770;173771;173772;173773;173774;173775;173776;173777;173778;173779;173780;173781;173782;173783;173784;173785;173786;173787;173788;173789;173790;173791;173792 173767 36 GEMMDLQHGSLFLR 2 Oxidation (M) 1664.7651 0.76506139 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 2 0 1 1 1 66.568 66.568 3 0.00091968 65881 QUIQUE_C1277_190116_001 73.887 67.45 197480000 0 76336000 0 0 0 43016000 0 0 0 78126000 0 0 0 15570 1775 14629 136578;136579;136580 173793;173794;173795 173793 964;965 2 GEMTALREELKK Unmodified 1403.7442 0.74424959 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 2 1 34.565 34.565 3 0.023716 30344 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.693 35.325 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GENIPAVEAPVVADGVGLYAVAASVIMR Unmodified 2767.4579 0.45785098 1409 O00478;C9JUV8;C9JQT8 BTN3A3 Butyrophilin subfamily 3 member A3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.14 172.14 3 8.6238E-19 178057 QUIQUE_C1438_190116_001 86.48 79.903 418270000 54081000 65251000 37497000 76115000 44366000 0 24955000 0 25530000 21093000 0 38804000 30578000 15574 1409 14633 136596;136597;136598;136599;136600;136601;136602;136603;136604;136605 173811;173812;173813;173814;173815;173816;173817;173818;173819;173820 173815 10 GENLEAVVCEEPQVK Unmodified 1699.8087 0.80870034 313 A0A0U1RQT8;Q8TCZ2 CD99L2 CD99 antigen-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.341 79.341 2 2.7971E-44 79923 QUIQUE_C1403_190116_001 184.87 163.2 862210000 113200000 120910000 71060000 116960000 105510000 73426000 74719000 0 45850000 16868000 60866000 62833000 0 15575 313 14634 136606;136607;136608;136609;136610;136611;136612;136613;136614;136615;136616 173821;173822;173823;173824;173825;173826;173827;173828;173829;173830;173831 173824 11 GENLFAITDEGMDVPLAMEEWHHER Unmodified 2925.3062 0.30617772 3412 Q6UXB8 PI16 Peptidase inhibitor 16 yes yes 0 0 0 1 140.57 140.57 4 0.059602 147844 QUIQUE_DMIX5_190116_001 14.483 12.009 35470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35470000 0 0 15576 3412 14635 136617 173832 173832 1 GENLVSMTVEGPPPK Unmodified 1553.7759 0.77594365 1298 J3QLE5;P63162;P14678 SNRPN;SNRPB Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' yes no 0 0 0 1 1 1 1 77.618 77.618 2 0.008254 79428 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.392 55.15 109610000 0 38358000 41810000 0 0 0 0 0 0 0 29441000 0 0 15577 1298 14636 136618;136619;136620;136621 173833;173834;173835;173836 173836 3 GENQGQTFTCGSALSPITDFK Unmodified 2257.0321 0.03211135 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 110.85 110.85 2 3.4381E-35 115741 QUIQUE_C1218_190116_001 146.1 133.27 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173865;173866;173867;173868;173869;173870;173871;173872;173873;173874;173875;173876;173877;173878;173879;173880;173881;173882;173883;173884;173885;173886;173887;173888;173889;173890;173891;173892;173893;173894;173895;173896;173897;173898;173899;173900;173901;173902;173903;173904;173905;173906;173907;173908;173909;173910;173911 173871 47 GEPDPIVLTPGTYGLSNALLETPWR Unmodified 2695.3857 0.38573189 701 C9J695;Q6ICL3;C9JDT9 TANGO2 Transport and Golgi organization protein 2 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 163.02 163.02 3 1.172E-08 165396 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.3 60.595 183440000 0 27111000 26318000 0 21516000 0 0 21720000 35450000 11791000 0 0 39530000 15583 701 14642 136666;136667;136668;136669;136670;136671;136672 173912;173913;173914;173915;173916;173917;173918 173915 7 GEPGAAPLSAPAFSLVFPFLK Unmodified 2115.1405 0.14046323 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.55 169.55 2 0.00020272 171318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.448 69.834 166260000 0 18838000 27217000 17734000 0 0 0 28298000 0 0 34774000 39399000 0 15584 3740 14643 136673;136674;136675;136676;136677;136678 173919;173920;173921;173922;173923;173924 173922 6 GEPGRPALYFCGSIR Unmodified 1678.825 0.82495953 1133 H0Y8X4;O43598 DNPH1 2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1 yes no 0 0 1 1 69.83 69.83 3 0.061434 70220 QUIQUE_DMIX3_190116_001 29.618 22.728 135900000 0 0 0 0 0 0 0 0 135900000 0 0 0 0 15585 1133 14644 136679 173925 173925 1 GEPSIPSNR Unmodified 955.47231 0.47230849 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 22.214 22.214 2 0.0207 15713 QUIQUE_C1368_190116_001 82.452 50.098 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15586 2948 14645 136680;136681;136682;136683 173926;173927;173928;173929 173926 4 GEPSSPGELNFPYLFQLLEDEGYK Unmodified 2728.2908 0.29082846 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;J9JIE9;A0A0A0MTR5;H0YB70;F6UJY9;H0YB18 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 170.03 170.03 3 0.0085264 177451 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.638 24.567 57288000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57288000 0 0 15587 1025 14646 136684 173930 173930 1 GEPSWFHR Unmodified 1014.4672 0.46716353 4444 Q9UI15;C9J5W6 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 38.819 38.819 2 0.0109 34876 QUIQUE_C1403_190116_001 90.661 63.797 542530000 0 0 113140000 121420000 0 0 0 0 0 23087000 102590000 83471000 98823000 15588 4444 14647 136685;136686;136687;136688;136689;136690 173931;173932;173933;173934;173935;173936;173937;173938;173939;173940 173933 10 GEQGFMGNTGPTGAVGDR Oxidation (M) 1765.769 0.76896079 1946 P08572 COL4A2 Collagen alpha-2(IV) chain;Canstatin yes yes 0 1 0 2 2 2 2 1 2 2 1 42.559 42.559 2 1.0561E-53 39254 QUIQUE_C1438_190116_001 182.57 168.41 446590000 104850000 52934000 32234000 0 101300000 0 0 0 70521000 19560000 65191000 0 0 15589 1946 14648 136691;136692;136693;136694;136695;136696;136697;136698;136699;136700;136701;136702;136703;136704 173941;173942;173943;173944;173945;173946;173947;173948;173949;173950;173951;173952;173953;173954 173947 1187 14 GEQGFMGNTGPTGAVGDR Unmodified 1749.774 0.77404617 1946 P08572 COL4A2 Collagen alpha-2(IV) chain;Canstatin yes yes 0 0 0 1 61.69 61.69 2 0.04286 60750 QUIQUE_C1277_190116_001 36.928 23.972 24675000 0 24675000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15590 1946 14648 136705 173955 173955 1 GEQGQYLQQDANECWIQMMR Unmodified 2484.062 0.062048044 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 130 130 2 1.3328E-87 135476 QUIQUE_C1218_190116_001 240.59 227.17 259920000 35980000 41304000 0 0 0 0 36622000 29233000 0 0 41001000 40110000 35674000 15591 2642 14649 136706;136707;136708;136709;136710;136711;136712;136713 173956;173957;173958;173959;173960;173961;173962;173963 173956 8 GEQGYGFHLHGEK Unmodified 1457.6688 0.66877646 3147 Q15599 SLC9A3R2 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 yes yes 0 0 0 2 1 2 23.516 23.516 2;3 0.00068626 16779 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.03 88.883 222590000 0 59937000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 162650000 15592 3147 14650 136714;136715;136716;136717;136718 173964;173965;173966;173967;173968;173969 173969 6 GEQILLSDNAASLAVQAFLQMCNLPIK Unmodified 2943.5198 0.51979931 1634 O75431;C9JAZ1 MTX2 Metaxin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 173.83 173.83 3 2.0739E-12 176974 QUIQUE_C1277_190116_001 69.152 62.989 403430000 8036200 12152000 4121200 0 22070000 0 28930000 43487000 70045000 0 103950000 110640000 0 15593 1634 14651 136719;136720;136721;136722;136723;136724;136725;136726;136727 173970;173971;173972;173973;173974;173975;173976;173977;173978;173979;173980;173981 173971 12 GEQILLSDNAASLAVQAFLQMCNLPIK Oxidation (M) 2959.5147 0.51471393 1634 O75431;C9JAZ1 MTX2 Metaxin-2 yes no 0 1 0 1 169.52 169.52 3 0.00040664 174419 QUIQUE_C1368_190116_001 40.454 28.713 45399000 0 0 45399000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15594 1634 14651 136728 173982 173982 882 1 GEQPIFSTR Acetyl (Protein N-term) 1075.5298 0.52982336 3523 Q86YM7 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes yes 1 0 0 1 78.616 78.616 2 0.030231 80971 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.937 33.842 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15595 3523 14652 136729 173983 173983 1 GEQQPISSPWDVVFGTSGSEVQR Unmodified 2489.1823 0.18228106 3623 Q8NBF2 NHLRC2 NHL repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 142.18 142.18 2;3 1.1385E-13 147614 QUIQUE_C1368_190116_001 149.99 130.93 183960000 0 0 34978000 0 0 29759000 25786000 0 0 0 37285000 0 56153000 15596 3623 14653 136730;136731;136732;136733;136734;136735 173984;173985;173986;173987;173988;173989 173984 5 GEQSAGENSLEDLTK Unmodified 1576.7217 0.72165947 144 A0A0A0MRE5;Q9ULH1;H0YBF7 ASAP1 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 62.695 62.695 2 0.0079566 61707 QUIQUE_C1403_190116_001 55.314 44.408 51257000 0 25181000 0 26076000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15597 144 14654 136736;136737 173990;173991 173991 2 GEQVSQNGLPAEQGSPR Unmodified 1752.8391 0.83908927 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.184 36.184 2 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173999;174000;174001;174002;174003;174004;174005;174006;174007;174008;174009 174005 10 GESEDDFWWCIDR Unmodified 1713.6729 0.67293514 1558;3868;1131 H0Y8B3;O43865;Q96HN2 AHCYL2;AHCYL1 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 2;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.51 136.51 2 4.2363E-06 141530 QUIQUE_C1368_190116_001 149.23 134.36 5218500000 319040000 435550000 286050000 365900000 379530000 399710000 458240000 529010000 486350000 137600000 460490000 434780000 526200000 15601 1131;1558;3868 14658 136756;136757;136758;136759;136760;136761;136762;136763;136764;136765;136766;136767;136768 174010;174011;174012;174013;174014;174015;174016;174017;174018;174019;174020;174021;174022;174023;174024;174025 174013 16 GESGPSGPAGPTGAR Unmodified 1296.6058 0.60584185 1818 P02452 COL1A1 Collagen alpha-1(I) chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.007 18.007 2 6.4675E-29 10624 QUIQUE_C1368_190116_001 161.99 129.15 621030000 152410000 73672000 121930000 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174038 11 GETALHMAAR Unmodified 1055.5182 0.51821282 2856;1255;2953 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651;Q12955 ANK2;ANK3 Ankyrin-2;Ankyrin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 17.918 17.918 2;3 0.0003996 10273 QUIQUE_C1277_190116_001 80.755 66.598 1636900000 207390000 166480000 88093000 135810000 70972000 114790000 84114000 153680000 154020000 50605000 28209000 284770000 97941000 15605 1255;2856;2953 14662 136786;136787;136788;136789;136790;136791;136792;136793;136794;136795;136796;136797;136798;136799;136800 174047;174048;174049;174050;174051;174052;174053;174054;174055;174056;174057;174058;174059;174060;174061;174062;174063;174064;174065 174048 18 GETAVPGAPEALR Unmodified 1266.6568 0.65681479 531 A6NDG6 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.393 54.393 2 0.00047916 52617 QUIQUE_C1277_190116_001 90.827 63.524 626160000 56620000 52460000 50501000 46599000 46297000 38528000 51258000 42536000 46316000 0 76160000 57017000 61863000 15606 531 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174354;174355;174356;174357;174358;174359;174360;174361;174362;174363;174364;174365;174366;174367;174368;174369;174370 174364 16 GFAFVEFSHLQDATR Unmodified 1723.8318 0.83181904 2837 P98175 RBM10 RNA-binding protein 10 yes yes 0 0 0 1 1 110.81 110.81 3 4.1571E-05 116417 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.529 66.614 39800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26559000 0 13241000 15633 2837 14689 137045;137046 174371;174372 174371 2 GFAFVQYVNER Unmodified 1328.6513 0.65133548 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V555;G3V575;G3V5X6;G3V3K6;G3V251;B4DSU6;G3V4M8 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 101.71 101.71 2 4.2253E-24 105683 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.68 156.25 12487000000 944610000 1029100000 919140000 794250000 1000400000 981330000 897430000 1058400000 1015600000 457750000 1343300000 1067100000 979080000 15634 598 14690 137047;137048;137049;137050;137051;137052;137053;137054;137055;137056;137057;137058;137059;137060;137061 174373;174374;174375;174376;174377;174378;174379;174380;174381;174382;174383;174384;174385;174386;174387;174388;174389;174390;174391;174392;174393;174394 174390 21 GFAFVTFDDHDSVDK Unmodified 1698.7526 0.75256567 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8VTQ5;A0A2R8Y4L2;H0YH80 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 4 2 2 2 2 2 99.2 99.2 2;3 2.6892E-18 102315 QUIQUE_C1368_190116_001 155.48 140.79 10347000000 935690000 1278900000 1101000000 971180000 806400000 931760000 908210000 398860000 583280000 400470000 823200000 633670000 574440000 15635 1049 14691 137062;137063;137064;137065;137066;137067;137068;137069;137070;137071;137072;137073;137074;137075;137076;137077;137078;137079;137080;137081;137082;137083;137084;137085;137086;137087;137088;137089;137090 174395;174396;174397;174398;174399;174400;174401;174402;174403;174404;174405;174406;174407;174408;174409;174410;174411;174412;174413;174414;174415;174416;174417;174418;174419;174420;174421;174422;174423;174424;174425;174426;174427;174428;174429;174430;174431;174432;174433;174434;174435;174436;174437;174438;174439;174440 174404 43 GFAFVTFDDHDSVDKIVIQK Unmodified 2280.1426 0.14264808 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8VTQ5;A0A2R8Y4L2;H0YH80 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 1 3 2 2 2 115.83 115.83 2;3;4 8.6134E-32 119007 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.31 64.138 1728000000 0 0 0 0 0 0 0 696810000 333730000 0 302900000 394580000 0 15636 1049 14692 137091;137092;137093;137094;137095;137096;137097;137098;137099 174441;174442;174443;174444;174445;174446;174447;174448;174449;174450;174451 174444 7 GFAFVTFDDHDTVDK Unmodified 1712.7682 0.76821573 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 0 3 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 100.3 100.3 2;3 3.2537E-18 104242 QUIQUE_C1218_190116_001 142.19 119.31 8903600000 1242900000 1461300000 1218100000 542380000 547480000 600820000 517680000 321100000 393010000 231770000 1003300000 427530000 396210000 15637 2601 14693 137100;137101;137102;137103;137104;137105;137106;137107;137108;137109;137110;137111;137112;137113;137114;137115;137116;137117 174452;174453;174454;174455;174456;174457;174458;174459;174460;174461;174462;174463;174464;174465;174466;174467;174468;174469;174470;174471;174472;174473;174474;174475;174476;174477 174452 23 GFAFVTFDDHDTVDKIVVQK Unmodified 2280.1426 0.14264808 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 1 3 3 2 3 1 114.02 114.02 2;3;4 2.5312E-74 116900 QUIQUE_DMIX1_190116_001 188.4 79.403 2466600000 0 0 0 0 0 0 0 792020000 514990000 0 408540000 534900000 216150000 15638 2601 14694 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174492;174493;174494;174495;174496;174497;174498;174499;174500;174501;174502;174503;174504;174505;174506;174507;174508;174509;174510;174511;174512;174513;174514;174515;174516;174517 174497 26 GFAFVYFENVDDAK Unmodified 1620.746 0.74602373 2775 P62995;H7BXF3 TRA2B Transformer-2 protein homolog beta yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.6 133.6 2 1.7167E-07 138465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.47 102.38 1133100000 92810000 106700000 91467000 99176000 124170000 118160000 110070000 127120000 0 70000000 106770000 0 86635000 15640 2775 14696 137143;137144;137145;137146;137147;137148;137149;137150;137151;137152;137153;137154;137155;137156 174518;174519;174520;174521;174522;174523;174524;174525;174526;174527;174528;174529;174530;174531;174532;174533;174534;174535;174536;174537;174538 174532 19 GFAFVYFER Unmodified 1134.5498 0.54983053 3014 Q13595 TRA2A Transformer-2 protein homolog alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 119.48 119.48 2 0.0051716 123430 QUIQUE_C1277_190116_001 98.299 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GFAYVQFEDVRDAEDALHNLDR Unmodified 2579.2041 0.20407913 1640 Q5JRI1;O75494 SRSF10 Serine/arginine-rich splicing factor 10 yes no 0 0 1 1 136.63 136.63 4 0.00026784 139571 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.729 23.359 23535000 0 0 0 0 0 0 0 23535000 0 0 0 0 0 15646 1640 14702 137190 174576 174576 1 GFCFITFK Unmodified 1018.4946 0.49462383 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 0 1 1 1 112.37 112.37 2 0.0064558 115153 QUIQUE_C1403_190116_001 101.69 80.163 678100000 330770000 0 0 261230000 0 0 0 0 0 0 0 0 86094000 15647 3041 14703 137191;137192;137193 174577;174578;174579 174578 3 GFCFITFKEEEPVK Unmodified 1729.8385 0.83854391 3041 Q14103;H0Y8G5;H0YA96 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 98.637 98.637 2;3 0.00019332 101475 QUIQUE_C1277_190116_001 90.412 80.612 788160000 55551000 106920000 117770000 54929000 107080000 52748000 116970000 38170000 38893000 0 49272000 0 49852000 15648 3041 14704 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Unmodified 1704.7705 0.77052392 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 113.5 113.5 2 0.00094102 116838 QUIQUE_C1277_190116_001 80.014 71.501 220460000 35135000 40831000 44402000 0 0 40113000 43564000 0 0 16411000 0 0 0 15650 39 14706 137233;137234;137235;137236;137237;137238 174622;174623;174624;174625;174626;174627 174623 6 GFCFITYTDEEPVKK Unmodified 1832.8655 0.86548694 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 88.403 88.403 2;3 0.0036949 89415 QUIQUE_C1563_190116_001 80.834 63.892 878970000 0 0 284150000 0 148060000 174630000 179840000 0 0 0 92288000 0 0 15651 39 14707 137239;137240;137241;137242;137243;137244;137245;137246 174628;174629;174630;174631;174632;174633;174634;174635;174636 174632 5 GFCFLEYEDHK Unmodified 1443.6129 0.61290107 1525;1581 O43390;B4DT28;O60506;B7Z645 HNRNPR;SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 84.634 84.634 2;3 3.8076E-05 85181 QUIQUE_C1563_190116_001 138.4 129.81 3472700000 170820000 245730000 516170000 343770000 294290000 310990000 287930000 115680000 225650000 67408000 338160000 285320000 270780000 15652 1525;1581 14708 137247;137248;137249;137250;137251;137252;137253;137254;137255;137256;137257;137258;137259;137260;137261;137262;137263;137264;137265;137266;137267;137268;137269;137270 174637;174638;174639;174640;174641;174642;174643;174644;174645;174646;174647;174648;174649;174650;174651;174652;174653;174654;174655;174656;174657;174658;174659;174660;174661;174662;174663;174664 174650 27 GFCHLCDGQEACCVGLEAGINPTDHLITAYR Unmodified 3533.5585 0.55846279 1943 P08559;Q5JPU0;Q5JPU1 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 114.46 114.46 3;4 4.3555E-54 117119 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.5 123.32 2880400000 263230000 506630000 361710000 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174823 323 GFCYVEFDEVDSLK Unmodified 1706.7498 0.74978848 3106 Q15056 EIF4H Eukaryotic translation initiation factor 4H yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.13 127.13 2 0.00020803 130770 QUIQUE_C1403_190116_001 91.937 84.371 1718400000 157170000 183770000 173060000 200260000 150480000 188550000 150710000 56644000 93822000 86775000 88521000 84568000 104050000 15655 3106 14711 137404;137405;137406;137407;137408;137409;137410;137411;137412;137413;137414;137415;137416 175021;175022;175023;175024;175025;175026;175027;175028;175029;175030;175031;175032;175033;175034;175035;175036;175037;175038;175039;175040 175026 20 GFDEYMK Oxidation (M) 904.36367 0.36366924 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 0 1 0 1 27.421 27.421 2 0.052607 21474 QUIQUE_C1218_190116_001 79.454 69.983 108140000 108140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15656 2855 14712 137417 175041 175041 1 GFDEYMK Unmodified 888.36875 0.36875462 2855 Q01469 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes yes 0 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49783000 0 15664 362 14719 137463;137464 175094;175095;175096 175094 3 GFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYK Oxidation (M) 3440.6486 0.64862446 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 162.41 162.41 3 4.8402E-75 167082 QUIQUE_DMIX8_190116_001 155.8 146.81 4552600000 283440000 593670000 261570000 254560000 222100000 195590000 404170000 157630000 308850000 113230000 407780000 796370000 553610000 15665 273;342 14720 137465;137466;137467;137468;137469;137470;137471;137472;137473;137474;137475;137476;137477;137478 175097;175098;175099;175100;175101;175102;175103;175104;175105;175106;175107;175108;175109;175110;175111;175112;175113;175114 175114 201 17 GFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYK Unmodified 3424.6537 0.65370983 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 167.65 167.65 3;4 3.8872E-64 173835 QUIQUE_C1438_190116_001 148.15 145.87 17391000000 723250000 438130000 1882600000 492220000 846360000 552760000 2909100000 0 1060300000 80863000 3494300000 3786000000 1124900000 15666 273;342 14720 137479;137480;137481;137482;137483;137484;137485;137486;137487;137488;137489;137490;137491;137492;137493;137494;137495;137496 175115;175116;175117;175118;175119;175120;175121;175122;175123;175124;175125;175126;175127;175128;175129;175130;175131;175132 175122 18 GFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEAR Oxidation (M) 4504.1421 0.14206231 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 1 1 2 1 2 164.27 164.27 3;4 2.7356E-84 166913 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.01 119.53 939800000 0 0 0 0 0 0 0 217800000 0 0 154730000 567260000 0 15667 273;342 14721 137497;137498;137499;137500;137501 175133;175134;175135;175136;175137;175138;175139 175135 201 7 GFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEAR Unmodified 4488.1471 0.14714769 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 168.23 168.23 4 7.9183E-128 172704 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.11 157.3 1336500000 0 0 0 0 0 0 0 140880000 273820000 0 376450000 400980000 144370000 15668 273;342 14721 137502;137503;137504;137505;137506 175140;175141;175142;175143;175144 175141 5 GFDPVSTVLHELTFQAMAYDLLPIENDTYK Unmodified 3426.6694 0.6693599 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 176.06 176.06 3 9.0977E-06 183132 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.486 47.108 34256000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34256000 0 0 15669 1384 14722 137507 175145 175145 1 GFDQDMANK Unmodified 1024.4284 0.42839476 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 27.171 27.171 2 0.0051163 20864 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.435 75.794 303460000 53854000 46949000 0 58551000 0 38393000 0 48205000 43549000 13963000 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175154;175155;175156;175157;175158;175159;175160;175161;175162;175163;175164;175165;175166;175167;175168 175158 15 GFDSFLGR Unmodified 897.43447 0.43446642 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 85.215 85.215 2 0.036561 87039 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.717 30.604 33692000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33692000 15673 2486 14726 137529;137530;137531;137532;137533 175169;175170;175171;175172;175173 175173 5 GFDVFNALDLMENK Unmodified 1611.7603 0.76029359 2311;1584 P30419;Q5VUC6;O60551 NMT1;NMT2 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1;Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase;Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.07 160.07 2 3.076E-05 165674 QUIQUE_C1218_190116_001 111.63 93.362 680730000 83982000 80575000 0 81185000 53148000 0 0 68249000 75985000 0 77057000 76182000 84367000 15674 2311;1584 14727 137534;137535;137536;137537;137538;137539;137540;137541;137542;137543;137544;137545 175174;175175;175176;175177;175178;175179;175180;175181;175182;175183;175184;175185;175186;175187 175174 12 GFDVFNALDLMENK Oxidation (M) 1627.7552 0.75520821 2311;1584 P30419;Q5VUC6;O60551 NMT1;NMT2 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1;Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase;Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 2 no no 0 1 0 1 141.33 141.33 2 0.021038 137357 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.286 39.42 14655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14655000 0 0 0 15675 2311;1584 14727 137546 175188 175188 1 GFEALIER Unmodified 933.49198 0.4919813 3925 Q96QG7 MTMR9 Myotubularin-related protein 9 yes yes 0 0 0 1 81.306 81.306 2 0.061928 81229 QUIQUE_C1563_190116_001 52.786 17.49 15633000 0 0 0 0 0 15633000 0 0 0 0 0 0 0 15676 3925 14728 137547 175189 175189 1 GFEANAPAFDR Unmodified 1193.5465 0.54653606 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 61.725 61.725 2 0.00043381 61097 QUIQUE_C1277_190116_001 103.26 79.827 997470000 0 169870000 0 116890000 119170000 75449000 128630000 0 0 60749000 101690000 135790000 89239000 15677 723 14729 137548;137549;137550;137551;137552;137553;137554;137555;137556;137557;137558 175190;175191;175192;175193;175194;175195;175196;175197;175198;175199;175200;175201;175202 175190 12 GFEDGIVQLK Unmodified 1104.5815 0.58152458 4501 Q9UMS0;C9J8Q1;F8W9P7;H7C537 NFU1 NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 88.016 88.016 2 0.0037697 90550 QUIQUE_C1218_190116_001 83.206 51.917 50869000 29856000 21013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15678 4501 14730 137559;137560 175203;175204;175205 175203 3 GFEDLMTVNLAR Unmodified 1364.6758 0.67583567 376 A0A1W2PPJ9;Q7RTN6;J3QS66;A0A1W2PQE8;A0A1W2PS04;A0A1W2PR00;A0A1W2PP78;A0A1W2PNV7;A0A1W2PPG2;A0A1W2PPM8;A0A1W2PQF1;J3QKR7;A0A1W2PQ20;A0A1W2PPI1;J3KSK5;J3KSA2;A0A1W2PR44;A0A1W2PRW9;A0A1W2PR65;Q86YC8;J3QQS3;A0A1W2PRQ6;A0A1W2PQ00;J3QKU4;J3QRC1 STRADA STE20-related kinase adapter protein alpha yes no 0 0 0 1 127 127 2 0.005323 131131 QUIQUE_C1277_190116_001 85.355 75.401 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15679 376 14731 137561 175206 175206 1 GFEEVIK Unmodified 820.43307 0.43306943 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.303 49.303 2 0.031782 47194 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.673 39.554 1135100000 101870000 0 146690000 0 65596000 120140000 118270000 78507000 103300000 57270000 140660000 85509000 117280000 15680 1689 14732 137562;137563;137564;137565;137566;137567;137568;137569;137570;137571;137572 175207;175208;175209;175210;175211;175212;175213;175214;175215;175216;175217 175215 11 GFEFTLMVVGESGLGK Unmodified 1669.8385 0.83854391 3171;3097 Q16181;E7ES33;E7EPK1;A0A0U1RRD1;Q15019;C9JB25;C9J938;C9IZU3;C9JQJ4;C9JZI2;A0A1B0GXJ2;C9JFT1;F8WB65;C9JT15;C9JSE7 SEPT7;SEPT2 Septin-7;Septin-2 no no 0 0 0 1 4 5 3 157.34 157.34 2 0.0033814 163429 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.593 63.336 201430000 0 0 0 0 0 0 0 27402000 55737000 0 72597000 45691000 0 15681 3171;3097 14733 137573;137574;137575;137576;137577;137578;137579;137580;137581;137582;137583;137584;137585 175218;175219;175220;175221;175222;175223;175224;175225;175226;175227;175228;175229;175230;175231;175232 175219 14 GFEGSFEELCR Unmodified 1329.566 0.56595087 2354 P33121;E7EPM6;B7Z3Z9;H0Y9U7 ACSL1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.607 89.607 2 0.00043473 92504 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.12 95.196 368450000 22786000 36711000 41472000 46271000 27392000 26505000 38632000 21896000 0 14415000 29830000 32883000 29661000 15682 2354 14734 137586;137587;137588;137589;137590;137591;137592;137593;137594;137595;137596;137597;137598 175233;175234;175235;175236;175237;175238;175239;175240;175241;175242;175243;175244;175245;175246 175244 14 GFEKPTENSSAVLLQWHEK Unmodified 2199.096 0.096032235 3986 Q9BPX5 ARPC5L Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 2 75.954 75.954 3;4 0.00016227 76348 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.951 49.828 1913200000 196160000 189730000 0 334620000 0 161410000 0 374210000 0 75818000 219560000 361690000 0 15683 3986 14735 137599;137600;137601;137602;137603;137604;137605;137606;137607;137608;137609 175247;175248;175249;175250;175251;175252;175253;175254;175255;175256;175257;175258 175253 7 GFELLYQPEVVR Unmodified 1448.7664 0.76636524 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.7 117.7 2 0.0005257 121901 QUIQUE_C1368_190116_001 98.048 66.627 578790000 36078000 36336000 53985000 35162000 39679000 38453000 47950000 38862000 56801000 17439000 59958000 52293000 65794000 15684 730 14736 137610;137611;137612;137613;137614;137615;137616;137617;137618;137619;137620;137621;137622 175259;175260;175261;175262;175263;175264;175265;175266;175267;175268;175269;175270;175271;175272;175273 175262 14 GFELTFK Unmodified 840.43815 0.43815481 252 A0A0C4DGS1;P39656;U3KQ84 DDOST Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 82.336 82.336 2 0.031782 83208 QUIQUE_C1403_190116_001 89.673 64.116 226760000 0 0 26042000 28489000 31868000 22807000 33399000 22568000 36756000 0 0 0 24827000 15685 252 14737 137623;137624;137625;137626;137627;137628;137629;137630 175274;175275;175276;175277;175278;175279;175280;175281 175275 8 GFENVELGVIGK Unmodified 1260.6714 0.67140222 1087 G3V583;Q8N128;G3V3Z5 FAM177A1 Protein FAM177A1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.643 98.643 2 0.0021332 101282 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.85 55.948 347990000 46008000 39151000 32069000 25997000 0 23754000 0 28924000 33628000 0 35848000 36566000 46043000 15686 1087 14738 137631;137632;137633;137634;137635;137636;137637;137638;137639;137640 175282;175283;175284;175285;175286;175287;175288;175289;175290;175291;175292 175291 11 GFESPSDNSSAMLLQWHEK Unmodified 2161.9739 0.97386819 1503 O15511;B1ALC0 ARPC5 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 2 99.764 99.764 2;3 1.0391E-28 102373 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.47 112.69 1100800000 0 0 157090000 143150000 77144000 0 103990000 127940000 122160000 0 130490000 131130000 107700000 15687 1503 14739 137641;137642;137643;137644;137645;137646;137647;137648;137649;137650;137651;137652 175293;175294;175295;175296;175297;175298;175299;175300;175301;175302;175303;175304;175305;175306;175307 175305 15 GFETAPLTK Unmodified 962.5073 0.50729701 3105 Q15052 ARHGEF6 Rho guanine nucleotide exchange factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 40.216 40.216 2 0.021719 36496 QUIQUE_C1403_190116_001 61.962 22.316 133400000 0 0 0 24446000 31182000 42578000 0 0 0 0 35189000 0 0 15688 3105 14740 137653;137654;137655;137656 175308;175309;175310;175311 175308 4 GFETVSYLLEGGSMAHEDFCGHTGK Unmodified 2728.1898 0.18975098 1419 O00625 PIR Pirin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 120.9 120.9 4 1.3916E-10 124981 QUIQUE_C1368_190116_001 76.198 73.369 222330000 33625000 0 45345000 33661000 0 0 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protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.09 130.09 2 1.6233E-10 135439 QUIQUE_C1218_190116_001 135.86 125.49 2952500000 393520000 318430000 401780000 290540000 219900000 215290000 193800000 111850000 214400000 101520000 145200000 163580000 182720000 15724 3038 14773 138029;138030;138031;138032;138033;138034;138035;138036;138037;138038;138039;138040;138041;138042 175849;175850;175851;175852;175853;175854;175855;175856;175857;175858;175859;175860;175861;175862;175863;175864 175850 16 GFGFVTFENIDDAKDAMMAMNGK Unmodified 2508.1124 0.11235228 3038 Q14011;K7ENX8;K7ELV6;K7EJV5;K7ELT6;K7EJV1;K7EMY9;K7EPM4;K7ER40;K7EQR7;D6W5Y5 CIRBP Cold-inducible RNA-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 149.34 149.34 3 1.6775E-10 154524 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.546 82.743 282460000 0 0 44115000 0 0 0 0 97628000 69628000 0 71092000 0 0 15725 3038 14774 138043;138044;138045;138046 175865;175866;175867;175868 175867 3 GFGFVTFENSADADR Unmodified 1631.7216 0.72159989 122 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175907;175908;175909;175910;175911;175912;175913;175914;175915;175916;175917;175918;175919;175920;175921;175922;175923;175924;175925;175926;175927;175928;175929;175930;175931;175932;175933;175934;175935;175936;175937;175938;175939;175940;175941;175942;175943;175944;175945;175946;175947;175948;175949;175950;175951;175952;175953;175954;175955;175956;175957;175958;175959;175960;175961;175962;175963 175927 56 GFGFVTYATVEEVDAAMNAR Oxidation (M) 2162.9943 0.99426928 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;F8W646;A0A2R8Y4L2;F8VYN5 HNRNPA1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed yes no 0 1 0 2 3 1 1 2 2 1 137.57 137.57 2;3 1.5113E-12 141710 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108.17 87.743 399780000 96746000 0 111260000 0 35024000 41608000 0 0 0 55301000 59840000 0 0 15732 1049 14779 138108;138109;138110;138111;138112;138113;138114;138115;138116;138117;138118;138119 175964;175965;175966;175967;175968;175969;175970;175971;175972;175973;175974;175975 175975 619 7 GFGFVTYATVEEVDAAMNARPHK Unmodified 2509.206 0.20599339 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;F8W646;A0A2R8Y4L2;F8VYN5 HNRNPA1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 132.19 132.19 3;4 1.9324E-50 135745 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.11 142.42 2781500000 0 49759000 48751000 0 91528000 0 84250000 639190000 485000000 0 519670000 447260000 416090000 15733 1049 14780 138120;138121;138122;138123;138124;138125;138126;138127;138128;138129;138130;138131;138132;138133 175976;175977;175978;175979;175980;175981;175982;175983;175984;175985;175986;175987;175988;175989;175990;175991;175992;175993;175994;175995;175996;175997 175985 21 GFGFVTYATVEEVDAAMNARPHK Oxidation (M) 2525.2009 0.20090801 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;F8W646;A0A2R8Y4L2;F8VYN5 HNRNPA1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed yes no 0 1 1 1 1 1 108.11 108.11 3;4 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138141;138142;138143;138144;138145;138146;138147;138148;138149;138150;138151;138152;138153;138154;138155;138156;138157;138158;138159;138160 176005;176006;176007;176008;176009;176010;176011;176012;176013;176014;176015;176016;176017;176018;176019;176020;176021;176022;176023;176024;176025;176026 176006 18 GFGGAMTDAAALNILALSPPAQNLLLK Unmodified 2666.4466 0.44655801 285 A0A0G2JNZ5;A0A0G2JLB3;P04062 GBA Glucosylceramidase yes no 0 0 0 1 1 168.14 168.14 3 0.00048653 171926 QUIQUE_C1277_190116_001 39.579 33.019 76510000 0 43999000 0 0 32511000 0 0 0 0 0 0 0 0 15737 285 14783 138161;138162 176027;176028 176027 2 GFGGIGGILR Unmodified 945.5396 0.53960019 2755 P62495;B7Z7P8 ETF1 Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 90.518 90.518 2 0.0049612 93570 QUIQUE_C1576_190116_001 79.116 50.693 132230000 0 0 0 0 0 0 67046000 0 0 0 0 0 65186000 15738 2755 14784 138163;138164;138165;138166;138167;138168;138169;138170;138171;138172;138173;138174 176029;176030;176031;176032;176033;176034;176035;176036;176037;176038;176039;176040 176034 12 GFGGITHGPPEK Unmodified 1195.5986 0.59857163 2539 P49748 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 25.118 25.118 2;3 0.00053075 17907 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.973 77.068 675930000 23443000 0 0 154550000 0 149420000 50537000 0 46390000 36183000 51103000 18125000 146180000 15739 2539 14785 138175;138176;138177;138178;138179;138180;138181;138182;138183;138184;138185 176041;176042;176043;176044;176045;176046;176047;176048;176049;176050;176051 176050 10 GFGGITHGPPEKK Unmodified 1323.6935 0.69353465 2539 P49748 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 16.424 16.424 2;3 0.014824 8848 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.05 19.233 432820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 432820000 0 0 15740 2539 14786 138186;138187 176052;176053 176052 2 GFGGIYGVGK Unmodified 953.49707 0.49706667 3639 Q8NDH3;H0YEP3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.429 64.429 2 0.0061286 64562 QUIQUE_C1438_190116_001 75.109 49.659 330960000 0 32076000 0 34634000 36798000 0 38114000 34893000 32245000 17524000 42894000 31205000 30572000 15741 3639 14787 138188;138189;138190;138191;138192;138193;138194;138195;138196;138197 176054;176055;176056;176057;176058;176059;176060;176061;176062;176063;176064;176065 176057 11 GFGGQYGIQK Unmodified 1053.5243 0.52434406 2072 P14317;E7EVW7 HCLS1 Hematopoietic lineage cell-specific protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.987 42.987 2 0.00028064 40666 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.3 85.879 561120000 0 0 74801000 97451000 71308000 0 0 70290000 42150000 0 89453000 55655000 60012000 15742 2072 14788 138198;138199;138200;138201;138202;138203;138204;138205;138206;138207;138208 176066;176067;176068;176069;176070;176071;176072;176073;176074;176075;176076 176071 10 GFGHIGIAVPDVYSACK Unmodified 1789.8821 0.88214006 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 98.728 98.728 2;3 5.7081E-30 103245 QUIQUE_C1218_190116_001 178.1 165.6 17200000000 1033500000 1314200000 1222500000 1224500000 1411100000 1159600000 1465000000 1273400000 1349200000 457790000 1805500000 1603200000 1880400000 15743 2888 14789 138209;138210;138211;138212;138213;138214;138215;138216;138217;138218;138219;138220;138221;138222;138223;138224;138225;138226;138227;138228;138229;138230;138231;138232;138233;138234 176077;176078;176079;176080;176081;176082;176083;176084;176085;176086;176087;176088;176089;176090;176091;176092;176093;176094;176095;176096;176097;176098;176099;176100;176101;176102;176103;176104;176105;176106;176107;176108;176109;176110;176111;176112;176113;176114;176115;176116;176117;176118;176119;176120;176121;176122;176123;176124;176125;176126;176127;176128;176129;176130;176131;176132;176133;176134;176135;176136;176137;176138;176139 176080 63 GFGHIGIAVPDVYSACKR Unmodified 1945.9833 0.98325108 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 1 2 1 2 1 83.292 83.292 3;4 0.0020784 84785 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.81 19.753 347270000 0 0 0 0 0 0 0 108850000 64910000 0 144400000 29110000 0 15744 2888 14790 138235;138236;138237;138238;138239;138240 176140;176141;176142;176143;176144;176145 176140 4 GFGIAVSGGR Unmodified 919.48756 0.48756462 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;U3KQJ2;A0A3B3IU26;B1AN86 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 49.99 49.99 2 0.0048569 47407 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.474 54.476 304880000 0 0 0 0 52171000 0 69198000 37296000 0 34504000 0 55470000 56237000 15745 345 14791 138241;138242;138243;138244;138245;138246;138247;138248 176146;176147;176148;176149;176150;176151;176152;176153 176152 5 GFGIFVDSVDSGSK Unmodified 1413.6776 0.67760981 439 A0A2R8Y661;A0A2R8YGD3;Q9Y4G8;H0Y8N8 RAPGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 108.04 108.04 2 0.013353 111490 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176183;176184;176185;176186;176187;176188;176189;176190;176191;176192;176193;176194;176195;176196;176197;176198;176199;176200;176201;176202;176203;176204;176205;176206;176207;176208;176209;176210;176211;176212;176213;176214;176215;176216;176217;176218;176219;176220;176221;176222;176223;176224;176225;176226;176227;176228;176229;176230;176231;176232;176233;176234;176235;176236 176201 54 GFGTDEQAIIDCLGSR Unmodified 1737.7992 0.79919829 2574 P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 125.99 125.99 2;3 4.5109E-13 129779 QUIQUE_DMIX7_190116_001 149.38 140.19 376430000 17780000 0 0 0 0 23028000 0 34769000 0 0 105080000 80267000 115510000 15750 2574 14796 138300;138301;138302;138303;138304;138305;138306 176237;176238;176239;176240;176241;176242;176243 176242 6 GFGTDEQAIVDVVANR Unmodified 1689.8322 0.83221298 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 123.22 123.22 2;3 8.5042E-14 126081 QUIQUE_C1563_190116_001 176.78 171.28 2034900000 0 32846000 217010000 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TRAF6 TNF receptor-associated factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 127.4 127.4 3 0.00103 130979 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.277 59.678 54242000 0 0 0 0 0 0 0 12901000 16626000 0 24715000 0 0 15753 4609 14799 138337;138338;138339 176289;176290;176291 176289 3 GFHCESSAHWPIFK Unmodified 1701.7722 0.77219568 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 0 1 1 1 64.448 64.448 3;4 0.0062624 63597 QUIQUE_C1368_190116_001 45.357 32.975 126590000 0 46579000 42818000 37189000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15754 2674 14800 138340;138341;138342 176292;176293;176294 176293 3 GFHGEIEDLQQWLTDTER Unmodified 2173.0076 0.0076111585 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 1 141.55 141.55 3 1.8762E-05 148517 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.819 64.325 87432000 0 0 0 0 0 0 27924000 0 0 0 35040000 24469000 0 15755 2882 14801 138343;138344;138345 176295;176296;176297 176296 1 GFHQVPFAPIVFIER Unmodified 1755.9461 0.94606094 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;H7C0R3;A0A0U1RQX5;A0A0U1RRC8 QARS 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176310;176311;176312;176313;176314;176315;176316;176317;176318;176319;176320;176321;176322;176323;176324;176325;176326;176327;176328;176329;176330;176331;176332;176333;176334 176311 19 GFIGPGIDVPAPDMSTGER Oxidation (M) 1930.9095 0.90947702 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.71 103.71 2 2.826E-45 106394 QUIQUE_DMIX7_190116_001 161.21 128.88 5782700000 332450000 354810000 587950000 382780000 333770000 355670000 287550000 469780000 584450000 315960000 727060000 510540000 539940000 15758 1777 14804 138379;138380;138381;138382;138383;138384;138385;138386;138387;138388;138389;138390;138391 176335;176336;176337;176338;176339;176340;176341;176342;176343;176344;176345;176346;176347;176348;176349;176350;176351;176352;176353;176354;176355;176356;176357;176358;176359;176360;176361;176362;176363;176364;176365 176362 974 31 GFIGPGIDVPAPDMSTGER Unmodified 1914.9146 0.9145624 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 119.74 119.74 2;3 3.989E-22 124904 QUIQUE_C1218_190116_001 166.38 165.13 17507000000 1569900000 1233200000 1952600000 1481500000 1177600000 1438700000 1205000000 1211800000 1184600000 505680000 1848300000 1225400000 1472400000 15759 1777 14804 138392;138393;138394;138395;138396;138397;138398;138399;138400;138401;138402;138403;138404;138405;138406;138407 176366;176367;176368;176369;176370;176371;176372;176373;176374;176375;176376;176377;176378;176379;176380;176381;176382;176383;176384;176385;176386;176387;176388;176389;176390;176391 176366 25 GFIMAEVMK Unmodified 1024.5086 0.50855934 1276 J3KQ32;Q9NTK5 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.286 91.286 2 0.0061462 95102 QUIQUE_C1218_190116_001 85.064 63.362 460340000 50141000 52773000 63651000 46690000 0 0 68348000 0 35180000 32216000 111340000 0 0 15760 1276 14805 138408;138409;138410;138411;138412;138413;138414;138415;138416;138417 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176434;176435;176436;176437;176438;176439;176440;176441;176442;176443;176444;176445;176446;176447;176448;176449;176450;176451;176452;176453;176454;176455;176456;176457;176458;176459;176460;176461;176462;176463;176464;176465;176466;176467;176468;176469;176470;176471;176472;176473;176474;176475;176476;176477;176478 176434 42 GFKEQIYDVYR Unmodified 1416.7038 0.70376498 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 70.622 70.622 2 0.016457 69991 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.42 56.821 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15767 2416 14812 138472 176479 176479 1 GFKFDTDELNFPTEK Unmodified 1786.8414 0.84138068 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 106.57 106.57 2;3 8.8713E-60 109387 QUIQUE_DMIX1_190116_001 199.96 175.27 713480000 0 0 0 0 0 0 0 282120000 153170000 0 108840000 57704000 111640000 15768 590 14813 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176664;176665;176666;176667;176668;176669;176670;176671;176672;176673;176674 176670 11 GFLVFAGCLMK Oxidation (M) 1257.625 0.62498608 2872 Q02338;C9JM78;C9JQ90;A0A0G2JRX6;C9JEB9 BDH1 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 114 114 2 0.0016144 117030 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.011 66.224 138100000 0 0 24883000 15539000 0 21363000 19611000 0 0 14833000 0 41872000 0 15787 2872 14831 138619;138620;138621;138622;138623;138624 176675;176676;176677;176678;176679;176680 176680 2355 4 GFLVMGSK Unmodified 837.44186 0.44185998 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.726 57.726 2 0.0061645 56148 QUIQUE_C1403_190116_001 102.77 71.194 1347900000 131410000 167640000 129340000 174900000 0 126390000 146050000 112090000 0 47927000 159420000 152750000 0 15788 4172 14832 138625;138626;138627;138628;138629;138630;138631;138632;138633;138634 176681;176682;176683;176684;176685;176686;176687;176688;176689;176690 176684 10 GFLWDEGFHQLVVQR Unmodified 1829.9213 0.92130275 478 A0A3B3IRW2;A0A3B3IRK6;Q13724;A0A3B3IS52;C9J8D4 MOGS Mannosyl-oligosaccharide glucosidase yes no 0 0 0 1 128.12 128.12 3 0.049156 133377 QUIQUE_C1368_190116_001 39.629 20.807 31437000 0 0 31437000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15789 478 14833 138635 176691 176691 0 GFMVLIEK Unmodified 935.51502 0.51502492 4534 Q9Y217;Q9Y216 MTMR6;MTMR7 Myotubularin-related protein 6;Myotubularin-related protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 91.545 91.545 2 0.020244 93501 QUIQUE_C1368_190116_001 77.058 45.103 88941000 18406000 14687000 15816000 0 20554000 0 19477000 0 0 0 0 0 0 15790 4534 14834 138636;138637;138638;138639;138640;138641 176692;176693;176694;176695;176696;176697 176694 6 GFMVQTGDPTGTGR Unmodified 1422.6562 0.65616287 4146 Q9H2H8;H7BZ14;C9K058 PPIL3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.095 59.095 2 0.00041616 57838 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.344 59.455 254920000 0 0 0 0 49418000 0 0 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176744 439 27 GFPGYMYTDLATIYER Unmodified 1895.8764 0.87638598 2175;731 P21281;C9JL73;P15313 ATP6V1B2;ATP6V1B1 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform;V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform no no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 144.97 144.97 2 4.2808E-66 147941 QUIQUE_DMIX1_190116_001 199.7 180.56 3371500000 269660000 302810000 299030000 244700000 233950000 231840000 306490000 258890000 214670000 57606000 368110000 313220000 270540000 15799 2175;731 14841 138685;138686;138687;138688;138689;138690;138691;138692;138693;138694;138695;138696;138697;138698;138699;138700;138701;138702 176755;176756;176757;176758;176759;176760;176761;176762;176763;176764;176765;176766;176767;176768;176769;176770;176771;176772;176773;176774;176775;176776;176777;176778;176779;176780;176781;176782;176783;176784;176785;176786;176787;176788;176789;176790;176791;176792 176777 38 GFPSVLR Unmodified 774.43882 0.43882351 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.41 59.41 2 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Unmodified 1818.8788 0.87882882 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 0 1 2 3 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 117.64 117.64 2;3 3.527E-44 122906 QUIQUE_C1438_190116_001 179.72 167.23 2366300000 221740000 254410000 229290000 199570000 238580000 160080000 191760000 116710000 0 99512000 225800000 233470000 195340000 15815 2596 14856 138837;138838;138839;138840;138841;138842;138843;138844;138845;138846;138847;138848;138849;138850;138851;138852;138853;138854;138855;138856;138857 176977;176978;176979;176980;176981;176982;176983;176984;176985;176986;176987;176988;176989;176990;176991;176992;176993;176994;176995;176996;176997;176998;176999 176986 22 GFSFLFSHFK Unmodified 1215.6077 0.60767975 350 A0A1B0GUI1;Q6GYQ0 RALGAPA1 Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 110.42 110.42 2;3 0.014852 114443 QUIQUE_C1368_190116_001 45.598 35.911 54514000 0 0 10351000 10276000 0 0 10475000 0 11489000 0 0 11923000 0 15816 350 14857 138858;138859;138860;138861;138862 177000;177001;177002;177003;177004 177000 5 GFSFVASSLIQEPSQQDLHK Unmodified 2217.1066 0.10659692 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 110.51 110.51 3 2.295E-06 114249 QUIQUE_C1277_190116_001 67.719 60.446 302820000 0 72211000 0 0 0 0 47690000 0 0 0 60699000 63760000 58455000 15817 982 14858 138863;138864;138865;138866;138867;138868;138869 177005;177006;177007;177008;177009;177010;177011 177005 7 GFSGLDGAK Unmodified 850.41848 0.418482 1818 P02452 COL1A1 Collagen alpha-1(I) chain yes yes 0 0 0 1 31.223 31.223 2 0.036508 26236 QUIQUE_C1368_190116_001 84.568 35.209 271570000 0 0 271570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15818 1818 14859 138870 177012 177012 0 GFSGYNTR Unmodified 900.40898 0.40897995 3215 Q2TAA2;H7C5G1;C9JE02 IAH1 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog yes no 0 0 0 1 1 22.219 22.219 2 0.054229 15268 QUIQUE_C1277_190116_001 54.611 40.454 188880000 0 105700000 0 83182000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15819 3215 14860 138871;138872 177013;177014 177013 2 GFSIPECQK Unmodified 1064.4961 0.4960804 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8W4S1;F8VRP1;F8VX68;F8VZK9;F8VX07;F8VWQ5;F8VTT8;F8W642 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.392 48.392 2 0.00078076 46219 QUIQUE_C1277_190116_001 109.86 101.95 7755600000 779250000 736310000 771510000 513390000 617450000 627140000 714860000 482320000 523720000 0 713670000 653410000 622570000 15820 612 14861 138873;138874;138875;138876;138877;138878;138879;138880;138881;138882;138883;138884 177015;177016;177017;177018;177019;177020;177021;177022;177023;177024;177025;177026 177016 12 GFSLADIPYQEIAGEHLR Unmodified 2015.0112 0.011239973 4640 Q9Y625 GPC6 Glypican-6;Secreted glypican-6 yes yes 0 0 0 1 132.4 132.4 3 0.00016111 136106 QUIQUE_C1403_190116_001 54.004 45.185 17954000 0 0 0 17954000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15821 4640 14862 138885 177027;177028 177027 2 GFSLEELR Unmodified 949.4869 0.48689592 1306 J3QSB4;P26373 RPL13 60S ribosomal protein L13 yes no 0 0 0 1 85.099 85.099 2 0.033644 86361 QUIQUE_C1403_190116_001 64.567 36.46 14951000 0 0 0 14951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15822 1306 14863 138886 177029 177029 1 GFSLESCR Unmodified 954.42292 0.42291545 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.401 42.401 2 0.0034797 39181 QUIQUE_C1277_190116_001 162.07 134.75 1712200000 140490000 144080000 161130000 139620000 158820000 131460000 159530000 0 151150000 64517000 182450000 150000000 128980000 15823 1921 14864 138887;138888;138889;138890;138891;138892;138893;138894;138895;138896;138897;138898 177030;177031;177032;177033;177034;177035;177036;177037;177038;177039;177040;177041;177042;177043;177044 177031 9 GFSLGSTVQSHTK Unmodified 1347.6783 0.67827852 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 37.429 37.429 2 0.022034 33114 QUIQUE_C1403_190116_001 59.84 5.3534 46590000 0 0 0 46590000 0 0 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mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.2 160.2 3 1.5641E-31 165399 QUIQUE_C1368_190116_001 99.446 92.439 545670000 39773000 28872000 49318000 34154000 31507000 32296000 43447000 35874000 59587000 25531000 71858000 51031000 42419000 15827 2591 14868 138916;138917;138918;138919;138920;138921;138922;138923;138924;138925;138926;138927;138928 177063;177064;177065;177066;177067;177068;177069;177070;177071;177072;177073;177074;177075 177065 13 GFSQEELETCMINQAPGCPDYSILSFMGAFHGR Unmodified 3748.6419 0.64185807 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 162.44 162.44 3 0.001207 167898 QUIQUE_C1368_190116_001 29.532 27.719 65956000 0 0 24197000 0 0 0 0 0 0 0 0 41760000 0 15828 1198 14869 138929;138930 177076;177077 177076 2 GFSSGSAVVSGGSR Unmodified 1253.6 0.60002819 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.599 30.599 2 4.7456E-07 25514 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177199;177200;177201;177202;177203;177204;177205;177206;177207;177208;177209;177210;177211;177212;177213 177208 14 GFVAGATNILFR Unmodified 1264.6928 0.69280637 679 B8ZZW5;Q8NBF6;H7C0I1 AVL9 Late secretory pathway protein AVL9 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.79 112.79 2 0.00024564 116262 QUIQUE_DMIX8_190116_001 118.18 74.931 147690000 0 15492000 19262000 0 18140000 19691000 22263000 0 0 0 27422000 25421000 0 15842 679 14883 139039;139040;139041;139042;139043;139044;139045;139046;139047 177214;177215;177216;177217;177218;177219;177220;177221;177222 177222 7 GFVDDIIQPSSTR Unmodified 1433.7151 0.71505795 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;E9PEC3 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 97.752 97.752 2 0.00013532 100275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.02 100.77 234340000 0 0 0 0 0 0 0 62223000 50271000 43833000 78011000 0 0 15843 739 14884 139048;139049;139050;139051;139052;139053;139054 177223;177224;177225;177226;177227;177228;177229 177225 7 GFVDLVIK Unmodified 889.5273 0.52730417 1778 P00387;B1AHF3 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 99.952 99.952 2 0.028279 104000 QUIQUE_C1218_190116_001 68.915 36.444 194150000 43562000 0 57931000 0 24276000 35921000 32456000 0 0 0 0 0 0 15844 1778 14885 139055;139056;139057;139058;139059 177230;177231;177232;177233;177234 177230 5 GFVEFAAKPPAR Unmodified 1288.6928 0.69280637 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 54.053 54.053 2;3 0.002835 52588 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.61 88.867 354740000 0 33542000 37160000 28895000 0 24647000 33289000 77201000 27117000 28753000 31409000 0 32724000 15845 3719 14886 139060;139061;139062;139063;139064;139065;139066;139067;139068;139069;139070 177235;177236;177237;177238;177239;177240;177241;177242;177243;177244;177245 177241 8 GFVEIQTPK Unmodified 1017.5495 0.54949617 2083 P14868 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 58.341 58.341 2 0.0004112 57123 QUIQUE_C1403_190116_001 120.46 100.82 248590000 0 0 0 133660000 0 114930000 0 0 0 0 0 0 0 15846 2083 14887 139071;139072;139073;139074;139075;139076;139077;139078;139079;139080;139081 177246;177247;177248;177249;177250;177251;177252;177253;177254;177255;177256;177257 177249 12 GFVFITFK Unmodified 957.53239 0.53238955 805 D6R9P3;D6RD18;D6RBZ0;Q99729 HNRNPAB Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.82 118.82 2 0.027083 124214 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.998 51.216 259380000 0 38784000 36171000 31271000 27109000 45531000 28907000 0 13137000 0 20476000 17994000 0 15847 805 14888 139082;139083;139084;139085;139086;139087;139088;139089;139090 177258;177259;177260;177261;177262;177263;177264;177265;177266;177267 177266 10 GFVFITFKEEEPVK Unmodified 1668.8763 0.87630962 805 D6R9P3;D6RD18;D6RBZ0;Q99729 HNRNPAB Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B yes no 0 0 1 1 102.56 102.56 3 0.043824 107488 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.005 19.561 13377000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13377000 0 0 15848 805 14889 139091 177268 177268 1 GFVFITFKEEEPVKK Unmodified 1796.9713 0.97127264 805 D6R9P3;D6RD18;D6RBZ0;Q99729 HNRNPAB Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A/B yes no 0 0 2 1 1 2 1 1 1 2 2 1 2 82.282 82.282 3;4 1.3497E-06 83568 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.444 72.816 1248700000 39261000 83466000 104250000 85847000 77555000 0 78175000 192600000 198090000 0 196140000 193300000 0 15849 805 14890 139092;139093;139094;139095;139096;139097;139098;139099;139100;139101;139102;139103;139104;139105 177269;177270;177271;177272;177273;177274;177275;177276;177277;177278;177279;177280;177281;177282;177283;177284 177278 15 GFVFSLIK Unmodified 909.53239 0.53238955 3908 Q96N67;A0A1B0GWE0 DOCK7 Dedicator of cytokinesis protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 113.69 113.69 2 0.035632 117234 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.306 13.282 22583000 7396200 0 6907000 0 0 0 0 0 8279900 0 0 0 0 15850 3908 14891 139106;139107;139108 177285;177286;177287 177287 3 GFVGCEYQPR Unmodified 1211.5393 0.53934219 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;J9JIE9;H0YB70 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 48.549 48.549 2 0.0032505 46843 QUIQUE_C1438_190116_001 83.005 62.104 247500000 0 0 0 0 54858000 50448000 43691000 0 0 0 35853000 0 62653000 15851 1025 14892 139109;139110;139111;139112;139113 177288;177289;177290;177291;177292 177288 5 GFVLQDTVEQLR Unmodified 1403.7409 0.74087877 2677 P56192;H0YHV5;H0YIC2 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 108.81 108.81 2 0.057703 114554 QUIQUE_C1438_190116_001 51.927 18.06 1198800000 0 0 0 0 1198800000 0 0 0 0 0 0 0 0 15852 2677 14893 139114 177293 177293 1 GFVPDTPVGVAHFLLQR Unmodified 1851.9996 0.99955308 60 A0A2R8Y7T6;A0A087WWK8;A0A3B3IRZ4;Q6DN90;A0A3B3IU98;A0A0C4DGT3;A0A2R8Y695 IQSEC1 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 142.31 142.31 3 1.1545E-17 149031 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.61 95.585 208140000 33238000 24374000 0 0 0 0 24355000 13270000 25916000 0 29809000 22692000 34488000 15853 60 14894 139115;139116;139117;139118;139119;139120;139121;139122 177294;177295;177296;177297;177298;177299;177300;177301 177299 8 GFVPFLVSATAGTTVYGAFDPLLAVADICKK Unmodified 3227.6941 0.69405851 2894 Q05329;A0A3B3IU09 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 169.89 169.89 3 2.1085E-13 177207 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.101 60.534 192960000 0 0 0 0 0 0 0 7853000 0 0 76046000 109060000 0 15854 2894 14895 139123;139124;139125 177302;177303;177304 177303 3 GFVPSPTSQPGGHESLVDR Unmodified 1965.9545 0.95445338 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 62.117 62.117 2;3 3.8928E-06 61273 QUIQUE_C1368_190116_001 78.505 56.46 329670000 0 0 0 0 0 85878000 133870000 0 0 0 0 0 109920000 15855 2254 14896 139126;139127;139128;139129;139130 177305;177306;177307;177308;177309 177305 5 GFVQVDDGRK Unmodified 1119.5673 0.5672715 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 21.651 21.651 2;3 0.009792 14418 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.725 30.98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15856 2638 14897 139131;139132;139133;139134;139135;139136 177310;177311;177312;177313;177314;177315 177315 6 GFVTADMIR Unmodified 1008.5063 0.50625115 4437 Q9UHQ9 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 73.885 73.885 2 0.0053778 74716 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.833 64.341 1044300000 162380000 0 198800000 0 0 0 125820000 106260000 148310000 0 158090000 0 144670000 15857 4437 14898 139137;139138;139139;139140;139141;139142;139143 177316;177317;177318;177319;177320;177321;177322 177320 6 GFVVGYDTR Unmodified 1012.4978 0.49779495 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.144 59.144 2 0.0063921 58753 QUIQUE_C1218_190116_001 84.498 48.454 1224800000 206850000 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4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 130.24 130.24 2 0.00026463 135595 QUIQUE_C1368_190116_001 73.156 59.956 25009000 0 0 25009000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15860 3518 14901 139168 177353 177353 1 GFWDYIR Unmodified 955.4552 0.45520186 3265 Q59EK9 RUNDC3A RUN domain-containing protein 3A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 120.21 120.21 2 0.029287 125357 QUIQUE_C1576_190116_001 91.584 54.997 75170000 0 0 0 16107000 18748000 0 22329000 0 17986000 0 0 0 0 15861 3265 14902 139169;139170;139171;139172;139173 177354;177355;177356;177357;177358 177356 5 GFWLSQWK Unmodified 1050.5287 0.52870115 4041 Q9BV79 MECR Trans-2-enoyl-CoA reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 113.93 113.93 2 0.019453 119727 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.706 74.195 22382000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22382000 0 0 15862 4041 14903 139174 177359 177359 1 GFYCNDESIK Unmodified 1231.5179 0.51793805 1427 O14495 PPAP2B Lipid phosphate phosphohydrolase 3 yes yes 0 0 0 1 1 44.613 44.613 2 0.02771 40689 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139371;139372;139373;139374;139375;139376;139377;139378;139379;139380;139381;139382;139383 177600;177601;177602;177603;177604;177605;177606;177607;177608;177609;177610;177611;177612 177601 13 GGDLMAYDR Unmodified 996.43348 0.43348014 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 44.627 44.627 2 0.0015563 41261 QUIQUE_C1403_190116_001 102.51 83.731 335970000 0 0 59010000 83910000 42180000 67829000 46572000 0 0 36464000 0 0 0 15890 2735;3319 14929 139384;139385;139386;139387;139388;139389 177613;177614;177615;177616;177617;177618;177619;177620;177621 177615 9 GGDLMAYDRR Oxidation (M) 1168.5295 0.52950579 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 1 1 1 1 19.849 19.849 3 0.016536 12393 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.894 34.201 160920000 0 0 0 0 0 0 0 109150000 0 0 0 0 51764000 15891 2735;3319 14930 139390;139391 177622;177623 177623 1 GGDLMAYDRR Unmodified 1152.5346 0.53459117 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 1 1 30.169 30.169 3 0.041133 25310 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.108 32.74 76896000 0 0 0 0 0 0 0 0 76896000 0 0 0 0 15892 2735;3319 14930 139392 177624 177624 0 GGDPALIR Unmodified 797.43955 0.43955179 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 25.079 25.079 2 0.050464 18756 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.504 25.663 112100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112100000 0 15893 2534 14931 139393 177625 177625 1 GGDRVPADLR Unmodified 1054.552 0.55195579 590;1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2;Q13733;E9PRA5;B1AKY9;P50993 ATP1A3;ATP1A4;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 19.658 19.658 3 0.010469 12570 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.567 0 866360000 0 0 0 0 0 0 0 193380000 118540000 0 258670000 120870000 174900000 15894 1371;590 14932 139394;139395;139396;139397;139398 177626;177627;177628;177629;177630 177628 3 GGDSIGETPTPGASK Unmodified 1372.647 0.64703797 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 27.593 27.593 2 0.00074433 21430 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.819 42.616 34318000 0 0 0 0 0 0 0 34318000 0 0 0 0 0 15895 1644 14933 139399;139400;139401 177631;177632;177633 177633 3 GGDVAVELPFTLMHPK Unmodified 1709.8811 0.88107742 1150 H0YET9 ARRB1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 3 1 1 1 1 117.56 117.56 2;3 0.00011155 121505 QUIQUE_C1368_190116_001 62.861 52.227 291110000 36665000 31907000 52135000 31920000 0 37355000 27560000 0 18639000 17198000 37735000 0 0 15896 1150 14934 139402;139403;139404;139405;139406;139407;139408;139409;139410;139411;139412;139413;139414 177634;177635;177636;177637;177638;177639;177640;177641;177642;177643;177644;177645;177646 177638 13 GGEAEDLVGKPYSQDASR Unmodified 1877.8755 0.87553435 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 1 1 1 46.812 46.812 3 0.018259 44321 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.186 37.16 165350000 0 0 0 0 0 0 0 132180000 0 0 33172000 0 0 15897 4517 14935 139415;139416 177647;177648 177647 2 GGEEPLPEGLFWLLVTGHIPTEEQVSWLSK Unmodified 3347.7078 0.70779432 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;H0YH82;F8VPF9;F8W1S4;F8W4S1;F8VRP1;F8VX68;F8VZK9;F8VX07;F8VWQ5 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 172.38 172.38 3 1.3253E-05 179607 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.104 31.825 240400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 148820000 91576000 0 15898 612 14936 139417;139418 177649;177650 177649 2 GGEIQPVSVK Unmodified 1012.5553 0.55530983 2727 P61604;B8ZZL8;B8ZZ54 HSPE1 10 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.121 28.121 2 0.00069809 21936 QUIQUE_C1277_190116_001 107.57 92.799 10476000000 932490000 1314500000 1121500000 298680000 1007800000 622860000 1054800000 364530000 746720000 137110000 988920000 813580000 1072600000 15899 2727 14937 139419;139420;139421;139422;139423;139424;139425;139426;139427;139428;139429;139430;139431 177651;177652;177653;177654;177655;177656;177657;177658;177659;177660;177661;177662;177663;177664;177665;177666 177653 15 GGELCLSMASFLK Oxidation (M) 1427.6789 0.67887214 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 1 0 1 100.61 100.61 2 0.030933 97241 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.998 21.669 21210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21210000 0 0 0 15900 98;3487 14938 139432 177667 177667 1 GGELGISLRPDGR Unmodified 1325.7052 0.70516197 2296 P30039;A0A0C4DFS0 PBLD Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein yes no 0 0 1 1 1 58.096 58.096 3 0.044707 56208 QUIQUE_C1277_190116_001 30.998 10.791 40023000 0 27467000 0 0 0 0 0 0 0 12556000 0 0 0 15901 2296 14939 139433;139434 177668;177669 177668 2 GGELVYTDSEAR Unmodified 1295.5994 0.59935949 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 40.59 40.59 2 0.00027315 37008 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.52 94.821 5743300000 619440000 0 0 0 0 0 709110000 939130000 800400000 531190000 891050000 813930000 439010000 15902 3117 14940 139435;139436;139437;139438;139439;139440;139441;139442 177670;177671;177672;177673;177674;177675;177676;177677;177678;177679 177674 9 GGENIYPAELEDFFHTHPK Unmodified 2200.0225 0.022532941 3819 Q96CM8;E9PF16 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 115.67 115.67 3;4 1.4864E-11 118669 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.4 106.45 913230000 52376000 46491000 140100000 102960000 54582000 44136000 68007000 54670000 89919000 35471000 74348000 66198000 83970000 15903 3819 14941 139443;139444;139445;139446;139447;139448;139449;139450;139451;139452;139453;139454;139455;139456;139457;139458;139459 177680;177681;177682;177683;177684;177685;177686;177687;177688;177689;177690;177691;177692;177693;177694;177695;177696;177697 177689 16 GGEPNQRPELK Unmodified 1223.6258 0.62584901 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 1 1 4 1 1 1 2 1 2 2 1 2 1 12.8 12.8 2;3 0.00047851 5993 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.201 66.406 510490000 40247000 123520000 14670000 14228000 22115000 19944000 0 151700000 0 19459000 0 58900000 45709000 15904 3043 14942 139460;139461;139462;139463;139464;139465;139466;139467;139468;139469;139470;139471;139472;139473;139474;139475;139476;139477;139478 177698;177699;177700;177701;177702;177703;177704;177705;177706;177707;177708;177709;177710;177711;177712;177713;177714;177715;177716;177717;177718;177719;177720 177713 23 GGETSEMYLIQPDSSVKPYR Unmodified 2256.0732 0.073247883 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 1 1 1 1 85.618 85.618 2;3 7.5239E-05 86777 QUIQUE_C1403_190116_001 106.17 94.198 138460000 0 95085000 0 43378000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15905 1824 14943 139479;139480;139481 177721;177722;177723 177722 3 GGETVMVNAAAGAVGSVVGQIAK Unmodified 2085.0888 0.088838367 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.11 148.11 2;3 1.0515E-100 154910 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.96 168.78 1607400000 126810000 133130000 161890000 201590000 73618000 105920000 125620000 96956000 132260000 51067000 148890000 119730000 129920000 15906 3089 14944 139482;139483;139484;139485;139486;139487;139488;139489;139490;139491;139492;139493;139494;139495;139496 177724;177725;177726;177727;177728;177729;177730;177731;177732;177733;177734;177735;177736;177737;177738;177739;177740;177741;177742 177739 17 GGFCNFMHLKPISR Unmodified 1662.8123 0.81228635 1987 P0DN76;Q01081 U2AF1 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit yes no 0 0 1 1 1 73.846 73.846 3 0.0010578 74451 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.678 53.047 65209000 0 0 0 28418000 0 0 0 0 36791000 0 0 0 0 15907 1987 14945 139497;139498 177743;177744 177744 2 GGFEEPVLLK Unmodified 1087.5914 0.59136099 4598 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178161;178162;178163;178164;178165;178166;178167;178168;178169;178170;178171;178172 178165 11 GGHSGQLGPSSVAPSFRPEDELEHLTK Unmodified 2831.3838 0.38383441 3781 Q93052;A0A087WZF1;C9JUT4;C9JXK9 LPP Lipoma-preferred partner yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 87.959 87.959 3;4;5 1.8464E-44 89518 QUIQUE_C1277_190116_001 133.15 123.81 390020000 70147000 90503000 0 0 102650000 0 0 0 52768000 73945000 0 0 0 15956 3781 14993 139855;139856;139857;139858;139859;139860;139861;139862 178173;178174;178175;178176;178177;178178;178179;178180 178175 8 GGHSGQLGPSSVAPSFRPEDELEHLTKK Unmodified 2959.4788 0.47879743 3781 Q93052;A0A087WZF1;C9JUT4;C9JXK9 LPP Lipoma-preferred partner yes no 0 0 2 1 1 78.805 78.805 5 0.011934 79487 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.9 20.395 125070000 0 0 0 0 0 0 0 64736000 0 0 0 60337000 0 15957 3781 14994 139863;139864 178181;178182 178181 2 GGHVDLTMLGAMQVSK Unmodified 1642.8171 0.81709696 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 3 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shock protein, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 41.139 41.139 2 0.016736 38602 QUIQUE_C1218_190116_001 82.671 54.143 800540000 180370000 0 187360000 0 111170000 91916000 0 104730000 0 0 124980000 0 0 15961 2727;4746 14997 139922;139923;139924;139925;139926;139927 178254;178255;178256;178257;178258;178259;178260 178254 6 GGISNVWFDR Unmodified 1149.5567 0.55670682 3338 Q5VWZ2 LYPLAL1 Lysophospholipase-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 92.037 92.037 2 0.0044743 94330 QUIQUE_C1403_190116_001 80.787 43.946 522260000 0 0 0 108110000 0 0 0 0 118010000 0 160510000 0 135640000 15962 3338 14998 139928;139929;139930;139931 178261;178262;178263;178264 178261 4 GGIVDEGALLR Unmodified 1098.6033 0.60332266 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YF78 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.498 79.498 2 5.5403E-05 80650 QUIQUE_C1368_190116_001 136.75 69.759 19656000000 1388900000 1542400000 1904100000 1291400000 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type-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 73.111 73.111 2 0.0092523 73235 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.216 33.049 436590000 0 56273000 78399000 0 0 0 0 0 72869000 0 97769000 57429000 73848000 15965 3969 15000 139958;139959;139960;139961;139962;139963 178295;178296;178297;178298;178299;178300 178300 2798 6 GGIYSHTPVSLGRPER Unmodified 1724.8958 0.89581629 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 0 1 3 3 3 3 3 3 3 3 2 2 2 3 2 37.903 37.903 2;3;4 2.5446E-08 33456 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.31 126.77 7212900000 626600000 851500000 905140000 427080000 695420000 579380000 576650000 391830000 352480000 188260000 415330000 708040000 495240000 15966 4100 15001 139964;139965;139966;139967;139968;139969;139970;139971;139972;139973;139974;139975;139976;139977;139978;139979;139980;139981;139982;139983;139984;139985;139986;139987;139988;139989;139990;139991;139992;139993;139994;139995;139996;139997;139998 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140020;140021;140022;140023;140024;140025;140026;140027;140028;140029;140030;140031 178363;178364;178365;178366;178367;178368;178369;178370;178371;178372;178373;178374;178375;178376;178377;178378;178379 178367 17 GGLEMLPQALETHLTSR Unmodified 1851.9513 0.95128225 2559 P50336;H0YFP3 PPOX Protoporphyrinogen oxidase yes no 0 0 0 1 1 2 116.17 116.17 3 0.00028525 120188 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.022 58.108 137110000 0 0 0 0 0 0 0 54630000 41513000 0 0 0 40968000 15971 2559 15006 140032;140033;140034;140035 178380;178381;178382;178383 178381 2 GGLIAYR Unmodified 748.42317 0.42317345 2531 P49441 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 35.865 35.865 2 0.050312 31568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.597 17.494 125930000 0 0 0 0 0 41432000 0 0 0 0 84493000 0 0 15972 2531 15007 140036;140037 178384;178385 178385 2 GGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPK Unmodified 2466.2828 0.28284673 2528 P49407 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 160.99 160.99 3 4.4145E-05 165424 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GGLLGDLASSDVAVELPFTLMHPKPK Unmodified 2691.4306 0.4305736 2528 P49407 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 147.6 147.6 4 5.32E-24 152700 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.45 109.58 734640000 0 0 0 0 0 0 0 116710000 161830000 0 149130000 239070000 67906000 15976 2528 15009 140056;140057;140058;140059;140060 178404;178405;178406;178407;178408 178405 5 GGLMQCEELIAYLR Unmodified 1651.8062 0.80619792 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 136.69 136.69 2 0.00082527 143867 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.958 68.933 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15977 1909 15010 140061 178409 178409 1 GGLSAVDAFEIHVHR Unmodified 1606.8216 0.82158871 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 1 1 77.948 77.948 2;3;4 0.0006147 79422 QUIQUE_C1438_190116_001 80.245 56.495 1048400000 23840000 147360000 117740000 132550000 166700000 0 0 131330000 23418000 60045000 135210000 0 110210000 15978 3043 15011 140062;140063;140064;140065;140066;140067;140068;140069;140070;140071;140072;140073;140074;140075;140076 178410;178411;178412;178413;178414;178415;178416;178417;178418;178419;178420;178421;178422;178423;178424 178416 13 GGLSDGEGPPGGR Unmodified 1154.5316 0.53161428 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 22.609 22.609 2 1.1189E-24 16306 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.06 142.81 2588500000 140140000 161690000 215100000 139560000 185590000 140780000 224010000 163850000 233380000 100980000 335080000 229290000 319050000 15979 3434 15012 140077;140078;140079;140080;140081;140082;140083;140084;140085;140086;140087;140088;140089;140090 178425;178426;178427;178428;178429;178430;178431;178432;178433;178434;178435;178436;178437;178438;178439;178440;178441;178442 178433 18 GGLSDGEGPPGGRGEAQR Unmodified 1695.7925 0.79247343 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 1 1 19.584 19.584 3 0.00041685 12618 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 103.1 103.1 5 1.8477E-10 104701 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.925 53.348 1363200000 0 0 0 0 0 0 0 228040000 170180000 31082000 227880000 706070000 0 15990 2524 15023 140146;140147;140148;140149;140150 178508;178509;178510;178511;178512;178513 178513 6 GGNVPQLDAPISQFSGLK Unmodified 1826.9527 0.95266246 1154 H0YFP0 CADPS yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.46 117.46 2 0.00036589 120206 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.73 84.396 767190000 63247000 73498000 68729000 67411000 0 51093000 71947000 66048000 59874000 0 93657000 74525000 77164000 15991 1154 15024 140151;140152;140153;140154;140155;140156;140157;140158;140159;140160;140161 178514;178515;178516;178517;178518;178519;178520;178521;178522;178523;178524;178525;178526 178521 11 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synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.72 137.72 3 1.2317E-53 141129 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.89 136.04 463530000 0 0 40553000 30329000 0 0 47461000 61023000 46550000 0 79282000 80247000 78081000 15998 2524 15031 140201;140202;140203;140204;140205;140206;140207;140208 178568;178569;178570;178571;178572;178573;178574;178575 178571 8 GGPFSDSYR Unmodified 984.43011 0.43010932 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RIF9;E5RG43;E5RFE7;E5RFL2;E5RGU8;H0YBE2 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.969 39.969 2 0.00033265 37369 QUIQUE_C1218_190116_001 136.11 99.093 3063200000 212530000 229530000 231980000 152480000 442260000 295360000 139800000 78102000 117610000 83207000 436520000 334750000 309030000 15999 1795 15032 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functional domain protein;Kalirin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.97 75.97 2 0.018569 76786 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.91 35.173 76581000 0 0 0 0 0 0 0 0 20513000 0 0 29138000 26930000 16003 1674;1212 15036 140256;140257;140258;140259;140260;140261;140262 178649;178650;178651;178652;178653;178654;178655 178654 6 GGPLDGTYR Unmodified 934.45084 0.45084476 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.053 36.053 2 0.000347 31267 QUIQUE_DMIX4_190116_001 135.77 116.29 9436700000 515840000 783420000 753040000 764150000 862290000 705910000 762780000 615840000 0 388810000 1380500000 920740000 983370000 16004 1796 15037 140263;140264;140265;140266;140267;140268;140269;140270;140271;140272;140273;140274 178656;178657;178658;178659;178660;178661;178662;178663;178664;178665;178666;178667;178668;178669 178665 13 GGPNIITLADIVK Unmodified 1309.7606 0.76055158 456 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178701;178702;178703;178704;178705;178706;178707;178708;178709;178710;178711;178712;178713;178714 178701 14 GGPPFAFVEFEDPRDAEDAVYGR Unmodified 2540.1608 0.16081734 1294 J3KTL2;Q07955 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 140.59 140.59 3 5.2595E-08 147594 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.272 52.912 1072400000 0 69614000 0 0 0 0 64367000 183390000 150160000 0 279480000 175120000 150290000 16009 1294 15042 140314;140315;140316;140317;140318;140319;140320;140321;140322 178715;178716;178717;178718;178719;178720;178721;178722;178723;178724;178725;178726 178723 11 GGPQSVIHVLADEVQHCQSILNSLLPR Unmodified 2966.5396 0.53962355 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 162.23 162.23 4 1.7397E-14 169113 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.881 77.653 225180000 0 0 49025000 0 40623000 0 65240000 0 0 0 70296000 0 0 16010 550 15043 140323;140324;140325;140326 178727;178728;178729;178730 178730 2 GGPTPQEAIQR Unmodified 1152.5887 0.58873523 4164 Q9H444 CHMP4B Charged multivesicular body protein 4b yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 27.14 27.14 2 5.4713E-05 21469 QUIQUE_C1438_190116_001 144.09 119.17 348710000 0 72018000 58838000 0 0 0 55881000 27155000 0 0 75303000 59511000 0 16011 4164 15044 140327;140328;140329;140330;140331;140332;140333;140334;140335;140336 178731;178732;178733;178734;178735;178736;178737;178738;178739;178740 178733 8 GGPTVDPEELFR Unmodified 1315.6408 0.64083038 3845 Q96EY1 DNAJA3 DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.56 106.56 2 0.0012074 110047 QUIQUE_C1368_190116_001 82.831 62.84 293420000 0 0 35922000 0 40199000 47155000 39565000 0 32387000 16428000 0 41211000 40550000 16012 3845 15045 140337;140338;140339;140340;140341;140342;140343;140344 178741;178742;178743;178744;178745;178746;178747;178748 178741 8 GGPVQVLEDEELK Unmodified 1411.7195 0.71947463 2978 Q13228 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 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94.071 2 0.010355 90674 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.567 37.938 42094000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42094000 0 0 0 16015 1450 15048 140364 178781 178781 1 GGQDNIPVLK Unmodified 1039.5662 0.56620887 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.088 47.088 2 0.0018596 43975 QUIQUE_C1368_190116_001 93.162 73.459 1507000000 149270000 0 237390000 160380000 189840000 136400000 198160000 116730000 138820000 0 0 0 179980000 16016 1371 15049 140365;140366;140367;140368;140369;140370;140371;140372;140373 178782;178783;178784;178785;178786;178787;178788;178789;178790 178783 9 GGQFLTPLGSPEDMDLEELIQDISR Unmodified 2759.3324 0.3323757 2987 Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 172.47 172.47 3 1.8223E-10 179758 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.23 68.935 55331000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32137000 0 23194000 16017 2987 15050 140374;140375 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membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 10.997 10.997 4 0.016696 3431 QUIQUE_DMIX4_190116_001 35.037 24.611 2556400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2556400 0 0 0 16043 2834 15075 140555 178999 178999 1 GGSPIIQEPEEPSEHR Unmodified 1760.8329 0.83294126 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;Q01484;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 40.143 40.143 2;3 6.6089E-10 36207 QUIQUE_C1277_190116_001 126.76 113.76 308050000 92614000 0 0 22237000 65737000 89795000 37667000 0 0 0 0 0 0 16044 902;1255;2856;1134 15076 140556;140557;140558;140559;140560;140561;140562;140563 179000;179001;179002;179003;179004;179005;179006;179007 179001 8 GGSPIIQEPEEPSEHREESSPR Unmodified 2446.1361 0.13605915 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;Q01484;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 35.377 35.377 3;4 3.8802E-11 30549 QUIQUE_C1563_190116_001 107.33 94.097 3142500000 220840000 305160000 121630000 269940000 342860000 217240000 214770000 341790000 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Unmodified 1417.6838 0.68375782 2642 P54578 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 47.224 47.224 2;3 7.5593E-137 45244 QUIQUE_DMIX1_190116_001 254.07 215.77 1930100000 181080000 211620000 192440000 186840000 228870000 172400000 122620000 96708000 105520000 0 302090000 0 129910000 16055 2642 15087 140640;140641;140642;140643;140644;140645;140646;140647;140648;140649;140650;140651;140652;140653;140654;140655;140656;140657 179090;179091;179092;179093;179094;179095;179096;179097;179098;179099;179100;179101;179102;179103;179104;179105;179106;179107;179108 179104 7 GGTLLSVTGEVEPR Unmodified 1413.7464 0.74635808 887 E9PID8;E7EWR4;P33240 CSTF2 Cleavage stimulation factor subunit 2 no no 0 0 0 1 83.901 83.901 2 0.0075675 80448 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.944 37.753 12970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12970000 0 0 0 16056 887 15088 140658 179109 179109 1 GGTLTQYEGK Unmodified 1052.5138 0.51383895 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.797 24.797 2 0.0013142 18081 QUIQUE_C1368_190116_001 99.136 65.697 2541900000 278120000 215910000 337240000 311870000 301780000 247190000 0 0 0 150230000 377710000 321810000 0 16057 3202 15089 140659;140660;140661;140662;140663;140664;140665;140666;140667 179110;179111;179112;179113;179114;179115;179116;179117;179118 179112 7 GGTPSAFDR Unmodified 906.41954 0.41954463 2861;452;2129 A0A2R8Y891;P08237;Q01813;B1APP6;V9GY25;P17858 PFKM;PFKP;PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type;ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type;ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.267 22.267 2 0.0084418 16085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.77 38.502 5861100000 1195300000 1111800000 0 0 0 0 882730000 909330000 920780000 0 0 841050000 0 16058 452;2861;2129 15090 140668;140669;140670;140671;140672;140673 179119;179120;179121;179122;179123;179124 179122 6 GGTWEFLQAPAFTGYGEK Unmodified 1957.921 0.92102798 3747 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179157;179158;179159;179160;179161;179162;179163;179164;179165;179166;179167;179168;179169;179170;179171;179172;179173;179174;179175;179176;179177 179157 15 GGVDTAAAPAGGAPPAHAPGPGR Unmodified 1950.966 0.96602112 3077 Q14657 LAGE3 EKC/KEOPS complex subunit LAGE3 yes yes 0 0 0 1 32.915 32.915 3 0.045071 27827 QUIQUE_C1403_190116_001 13.271 3.1067 53696000 0 0 0 53696000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16063 3077 15095 140720 179178 179178 1 GGVDVTLPR Unmodified 912.50288 0.50288033 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 50.891 50.891 2 0.032733 49094 QUIQUE_DMIX8_190116_001 55.531 20.425 59296000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59296000 16064 2935 15096 140721 179179 179179 1 GGVGAPGSPSTPPTR Unmodified 1336.6735 0.67352749 4493 Q9ULR3 PPM1H Protein phosphatase 1H yes yes 0 0 0 1 1 1 26.1 26.1 2 0.0039735 19760 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.56 55.73 205610000 0 84154000 0 0 71755000 0 0 0 0 0 0 0 49697000 16065 4493 15097 140722;140723;140724 179180;179181;179182 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179295;179296;179297;179298;179299;179300;179301;179302;179303;179304;179305;179306;179307;179308;179309;179310;179311;179312;179313;179314;179315;179316;179317;179318;179319 179313 25 GHAAFTSDPKPTIEVSGK Unmodified 1840.9319 0.93192702 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 34.386 34.386 2;3 3.6736E-121 29420 QUIQUE_C1277_190116_001 226.59 210.06 3892600000 273460000 351000000 0 381320000 344190000 271500000 340540000 317630000 310160000 147940000 474070000 386330000 294440000 16078 1779 15110 140853;140854;140855;140856;140857;140858;140859;140860;140861;140862;140863;140864;140865;140866;140867;140868;140869;140870;140871;140872;140873;140874;140875;140876 179320;179321;179322;179323;179324;179325;179326;179327;179328;179329;179330;179331;179332;179333;179334;179335;179336;179337;179338;179339;179340;179341;179342;179343;179344;179345;179346;179347;179348 179322 24 GHAAFTSDPKPTIEVSGKK Unmodified 1969.0269 0.026890038 1779 P00390 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179394;179395;179396;179397;179398;179399;179400;179401;179402;179403;179404;179405;179406;179407;179408;179409;179410;179411;179412;179413;179414;179415;179416;179417;179418;179419 179403 16 GHAYAVTDVR Unmodified 1087.5411 0.54105675 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 19.948 19.948 2 0.029697 12553 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.246 50.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16086 877 15118 140943 179420 179420 1 GHAYSVTGAEEVESNGSLQK Unmodified 2061.9603 0.96032661 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 47.333 47.333 2;3 4.3636E-65 44733 QUIQUE_DMIX8_190116_001 230.36 200.42 114820000 0 0 0 0 0 0 0 0 86511000 0 0 0 28306000 16087 2127 15119 140944;140945;140946 179421;179422;179423 179423 3 GHDDLGDHYLDCGDLSNALK Unmodified 2213.9648 0.96476007 721 C9JFE4;Q13098;A0A096LP07;A0A096LPJ3;A8K070;J3KSA5;J3QLT0;J3KRJ4 GPS1 COP9 signalosome complex subunit 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 89.318 89.318 3;4 0.0050341 90305 QUIQUE_C1563_190116_001 39.387 36.546 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factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 89.907 89.907 3 0.01208 93651 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.689 25.924 44153000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44153000 0 0 16111 1187 15140 141162 179694 179694 0 GHGFITPADGGPDIFLHISDVEGEYVPVEGDEVTYK Unmodified 3858.8265 0.82646548 4569 Q9Y2V2;H3BSW7;H3BUY4;H3BPY5;H3BNU9 CARHSP1 Calcium-regulated heat stable protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 145.72 145.72 4 3.5684E-11 141470 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.666 57.809 229550000 0 0 0 85728000 0 0 0 102310000 0 41514000 0 0 0 16112 4569 15141 141163;141164;141165 179695;179696;179697 179697 3 GHGWDYGIGGGWDHISVR Unmodified 1967.9027 0.90269258 3470 Q7Z6L1 TECPR1 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 97.34 97.34 3 0.020792 99498 QUIQUE_C1403_190116_001 34.202 28.993 36746000 0 0 0 36746000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16113 3470 15142 141166 179698 179698 1 GHHVAQLDPLGILDADLDSFVPSDLITTIDK Unmodified 3314.7034 0.70343722 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 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GHLDPTWALQQLQQLR Unmodified 1903.0064 0.006429367 901 H0YA68;E9PCD7;Q9Y2E5 MAN2B2 Alpha-mannosidase;Epididymis-specific alpha-mannosidase yes no 0 0 0 1 137.26 137.26 3 2.382E-05 142272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.373 55.609 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16127 901 15156 141376 179942 179942 1 GHLENNPALEK Unmodified 1220.6149 0.61494998 1888 P05388;F8VWS0;F8VW21;F8VU65;F8VPE8;G3V210;F8VQY6;F8VRK7;Q8NHW5;F8VZS0;F8VWV4;F8VS58 RPLP0;RPLP0P6 60S acidic ribosomal protein P0;60S acidic ribosomal protein P0-like yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 3 15.96 15.96 2;3 1.8632E-08 7799 QUIQUE_C1277_190116_001 168.22 124.78 5963700000 404730000 503660000 563320000 582180000 567740000 408450000 560000000 341070000 345180000 139190000 705310000 416330000 426530000 16128 1888 15157 141377;141378;141379;141380;141381;141382;141383;141384;141385;141386;141387;141388;141389;141390;141391;141392;141393;141394;141395;141396;141397;141398;141399;141400;141401 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8.4058E-101 143542 QUIQUE_DMIX5_190116_001 242.48 229.65 2162200000 121190000 176360000 173970000 165420000 163540000 103620000 181860000 164350000 179110000 61352000 283830000 208880000 178700000 16133 2787 15162 141418;141419;141420;141421;141422;141423;141424;141425;141426;141427;141428;141429;141430;141431 179994;179995;179996;179997;179998;179999;180000;180001;180002;180003;180004;180005;180006;180007;180008;180009;180010;180011 180006 18 GHNQLAYDGKDYIALNEDLSSWTAADTAAQITQLK Unmodified 3820.8544 0.85441157 2314 P30461 HLA-B HLA class I histocompatibility antigen, B-13 alpha chain yes yes 0 0 1 1 142.44 142.44 4 3.7504E-07 145423 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.607 49.645 42955000 0 0 0 0 0 0 0 42955000 0 0 0 0 0 16134 2314 15163 141432 180012 180012 1 GHNQYAYDGKDYIALNEDLR Unmodified 2354.0927 0.092737771 2316;2315 P30479;P30480 HLA-B HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain no no 0 0 1 1 76.84 76.84 3 1.7305E-06 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180035;180036;180037;180038;180039;180040;180041;180042;180043;180044;180045;180046;180047;180048 180048 14 GHQAALGLMER Unmodified 1181.5975 0.59752577 1297 J3QL71;Q96FV2 SCRN2 Secernin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 32.103 32.103 2 0.012372 27207 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.349 47.921 143460000 0 0 55190000 0 0 0 28257000 0 0 0 60011000 0 0 16141 1297 15170 141467;141468;141469 180049;180050;180051 180051 3 GHQFSCVCLHGDR Unmodified 1571.6722 0.67216406 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.088 22.088 3 0.0017831 14983 QUIQUE_C1403_190116_001 50.897 42.007 926560000 87403000 130860000 114690000 95781000 106800000 77202000 126170000 0 60262000 0 64198000 63191000 0 16142 3726 15171 141470;141471;141472;141473;141474;141475;141476;141477;141478;141479 180052;180053;180054;180055;180056;180057;180058;180059;180060;180061 180055 10 GHQLLSADVDIK Unmodified 1294.6881 0.68811492 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 51.408 51.408 2;3 0.0005314 49403 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.28 109.43 4998000000 782110000 601640000 333470000 341020000 454700000 325480000 397120000 159980000 168090000 294290000 495910000 316830000 327400000 16143 1245 15172 141480;141481;141482;141483;141484;141485;141486;141487;141488;141489;141490;141491;141492;141493;141494;141495;141496;141497;141498;141499;141500;141501;141502;141503;141504;141505 180062;180063;180064;180065;180066;180067;180068;180069;180070;180071;180072;180073;180074;180075;180076;180077;180078;180079;180080;180081;180082;180083;180084;180085;180086;180087;180088;180089;180090;180091;180092;180093;180094;180095;180096;180097;180098 180091 35 GHQLLSADVDIKELAVETK Unmodified 2065.1055 0.10553429 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 2 1 1 89.588 89.588 3;4 4.1258E-05 91079 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.831 70.774 269500000 0 0 0 0 0 0 0 154420000 52389000 0 0 0 62694000 16144 1245 15173 141506;141507;141508;141509 180099;180100;180101;180102;180103 180099 5 GHSAQIAKPIRPGQHPAASPTHPSAIR Unmodified 2781.4899 0.48991166 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 2 1 1 18.31 18.31 5 0.039581 10913 QUIQUE_DMIX7_190116_001 21.882 15.233 70811000 0 0 0 0 0 0 0 0 32818000 0 0 37993000 0 16145 2355 15174 141510;141511 180104;180105 180105 2 GHSLSDGLEEVQK Unmodified 1397.6787 0.67867245 1634 O75431;C9JNK6;C9JAZ1 MTX2 Metaxin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 1 40.767 40.767 2;3 8.9982E-105 37890 QUIQUE_C1218_190116_001 242.35 218.55 764540000 122770000 109840000 107520000 83951000 77688000 72522000 104260000 0 0 0 85993000 0 0 16146 1634 15175 141512;141513;141514;141515;141516;141517;141518;141519;141520;141521;141522;141523 180106;180107;180108;180109;180110;180111;180112;180113;180114;180115;180116;180117;180118 180106 12 GHSTRPLAVEVVTEDLPQLGDLAVSEVGWDGLR Unmodified 3514.8056 0.80561088 2233 P24821;E9PC84 TNC Tenascin yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 160.1 160.1 3;4 6.6211E-75 165166 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.16 139.89 2058200000 0 0 0 0 0 0 0 262370000 713330000 35805000 266110000 403070000 377530000 16147 2233 15176 141524;141525;141526;141527;141528;141529;141530 180119;180120;180121;180122;180123;180124;180125;180126;180127;180128 180121 10 GHTACADAYLTPAIQR Unmodified 1743.8363 0.8362525 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 53.749 53.749 3 0.01949 51729 QUIQUE_C1368_190116_001 36.638 25.979 71177000 0 0 39301000 0 0 0 31875000 0 0 0 0 0 0 16148 1450 15177 141531;141532 180129;180130 180129 1 GHTAEILDFALSK Unmodified 1400.73 0.72997974 716 C9JG97;C9JEH3;Q13685;H7C0R2 AAMP Angio-associated migratory cell protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.016 92.016 3 0.0001123 94597 QUIQUE_C1576_190116_001 74.987 56.256 231020000 0 26752000 0 22900000 21162000 29083000 27625000 16736000 15295000 9290000 25111000 18646000 18425000 16149 716 15178 141533;141534;141535;141536;141537;141538;141539;141540;141541;141542;141543;141544 180131;180132;180133;180134;180135;180136;180137;180138;180139;180140;180141;180142;180143;180144;180145 180138 14 GHTDSVQDISFDHSGK Unmodified 1728.7703 0.770341 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 31.494 31.494 2;3 2.2418E-283 26235 QUIQUE_C1277_190116_001 335.74 325.51 11613000000 1415900000 1124600000 955360000 957820000 843170000 834260000 894570000 722950000 843450000 352910000 1005500000 728650000 934290000 16150 2460 15179 141545;141546;141547;141548;141549;141550;141551;141552;141553;141554;141555;141556;141557;141558;141559;141560;141561;141562;141563;141564;141565;141566;141567;141568;141569;141570 180146;180147;180148;180149;180150;180151;180152;180153;180154;180155;180156;180157;180158;180159;180160;180161;180162;180163;180164;180165;180166;180167;180168;180169;180170;180171;180172;180173;180174 180149 26 GHTDYIHCLALR Unmodified 1454.7089 0.70886714 3503 Q86W42 THOC6 THO complex subunit 6 homolog yes yes 0 0 0 1 1 51.151 51.151 3 0.014018 49777 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.714 32.61 50183000 0 0 23022000 0 0 0 0 0 0 0 27161000 0 0 16151 3503 15180 141571;141572 180175;180176 180176 2 GHTECVEALINQGASIFVK Unmodified 2072.0361 0.036074515 450 H7C209;A0A2R8Y7Y4;Q8N8A2;H7C4A0 ANKRD44 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit B yes no 0 0 0 1 133.94 133.94 3 0.018317 138858 QUIQUE_C1218_190116_001 24.011 20.059 16324000 16324000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16152 450 15181 141573 180177 180177 1 GHTELLTVEQALADFAELLR Unmodified 2225.1692 0.16919718 4436 Q9UHL4;R4GNE8;R4GN05 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 172.52 172.52 3 3.3612E-47 179685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.26 121.03 297580000 0 0 0 0 0 0 0 0 60541000 0 111800000 125240000 0 16153 4436 15182 141574;141575;141576 180178;180179;180180 180179 3 GHTEVIVPHLTESYNSHR Unmodified 2075.0185 0.018450616 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 39.917 39.917 4 0.00014178 35513 QUIQUE_C1368_190116_001 70.802 62.323 385810000 45636000 43848000 89946000 52341000 40667000 48440000 64929000 0 0 0 0 0 0 16154 514 15183 141577;141578;141579;141580;141581;141582;141583 180181;180182;180183;180184;180185;180186;180187 180183 6 GHTFAEELQK Unmodified 1158.5669 0.56693715 3847 Q96EY8;S4R3P5;F5H4Z7 MMAB Cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 27.143 27.143 2 0.01636 21507 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.653 73.559 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16155 3847 15184 141584 180188 180188 1 GHTGIGELAAALNEFDNK Unmodified 1855.9064 0.90644055 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 122.01 122.01 2;3 3.3104E-274 127357 QUIQUE_DMIX5_190116_001 297.03 276.07 6282600000 340150000 462070000 543740000 568020000 391480000 471350000 684170000 473500000 606970000 87372000 588130000 603120000 462520000 16156 2250 15185 141585;141586;141587;141588;141589;141590;141591;141592;141593;141594;141595;141596;141597;141598;141599;141600;141601;141602;141603;141604;141605;141606;141607;141608;141609 180189;180190;180191;180192;180193;180194;180195;180196;180197;180198;180199;180200;180201;180202;180203;180204;180205;180206;180207;180208;180209;180210;180211;180212;180213;180214;180215;180216;180217;180218;180219;180220;180221 180216 33 GHTPTQPGALNQR Unmodified 1375.6957 0.69565991 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 15.068 15.068 2;3 8.5064E-08 7264 QUIQUE_C1403_190116_001 135.71 118.69 772280000 81905000 45256000 165910000 22007000 33650000 57765000 0 116190000 51127000 0 43973000 47803000 106690000 16157 2834 15186 141610;141611;141612;141613;141614;141615;141616;141617;141618;141619;141620;141621;141622;141623;141624;141625;141626 180222;180223;180224;180225;180226;180227;180228;180229;180230;180231;180232;180233;180234;180235;180236;180237;180238;180239 180228 16 GHVDILAPTVQELAALEK Unmodified 1903.0415 0.041477469 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 126.48 126.48 2;3 1.423E-45 130682 QUIQUE_C1277_190116_001 169.64 155.78 3045400000 264630000 259330000 236980000 220820000 264580000 223170000 165490000 244740000 272720000 108630000 362230000 189660000 232410000 16158 3726 15187 141627;141628;141629;141630;141631;141632;141633;141634;141635;141636;141637;141638;141639;141640;141641;141642;141643;141644;141645;141646;141647;141648;141649 180240;180241;180242;180243;180244;180245;180246;180247;180248;180249;180250;180251;180252;180253;180254;180255;180256;180257;180258;180259;180260;180261;180262;180263;180264;180265;180266;180267;180268;180269;180270;180271;180272;180273;180274 180244 33 GHVEPGEDDLETALR Unmodified 1636.7693 0.76927837 2571 P50583 NUDT2 Bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase [asymmetrical] yes yes 0 0 0 1 1 1 62.974 62.974 2;3 0.0085201 61987 QUIQUE_C1403_190116_001 58.674 32.662 25157000 0 0 0 0 0 25157000 0 0 0 0 0 0 0 16159 2571 15188 141650;141651;141652 180275;180276;180277 180276 3 GHVFEESQVAGTPMFVVK Unmodified 1960.9717 0.97168334 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 92.306 92.306 2;3 5.7903E-142 95822 QUIQUE_C1218_190116_001 297.54 282.67 4027000000 324230000 360530000 440990000 422080000 347780000 268940000 393030000 324350000 101200000 131780000 481950000 315420000 114680000 16160 2058 15189 141653;141654;141655;141656;141657;141658;141659;141660;141661;141662;141663;141664;141665;141666;141667;141668;141669;141670;141671;141672;141673;141674;141675;141676 180278;180279;180280;180281;180282;180283;180284;180285;180286;180287;180288;180289;180290;180291;180292;180293;180294;180295;180296;180297;180298;180299;180300;180301;180302;180303 180279 23 GHVFEESQVAGTPMFVVK Oxidation (M) 1976.9666 0.96659797 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 1 0 1 1 78.326 78.326 2;3 2.8774E-09 79270 QUIQUE_C1368_190116_001 98.943 85.516 47943000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47943000 0 0 16161 2058 15189 141677;141678 180304;180305 180304 1376 1 GHVITAISITHFK Unmodified 1422.7983 0.79833407 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 51.323 51.323 2;3 0.0021018 49949 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.181 48.828 669290000 0 108650000 70160000 79560000 44391000 82979000 65178000 35869000 61496000 0 66102000 54905000 0 16162 3899 15190 141679;141680;141681;141682;141683;141684;141685;141686;141687;141688;141689;141690 180306;180307;180308;180309;180310;180311;180312;180313;180314;180315;180316;180317;180318 180315 11 GHVPLALCVLR Unmodified 1233.7016 0.70159692 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 71.718 71.718 3 0.00064197 68437 QUIQUE_C1563_190116_001 87.913 64.537 9439700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9439700 0 0 0 16163 205 15191 141691;141692;141693;141694;141695 180319;180320;180321;180322;180323 180322 5 GHVSELEADLAEQQHLR Unmodified 1930.9497 0.94970235 1394 O00291 HIP1 Huntingtin-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.651 65.651 3 8.7574E-05 64519 QUIQUE_C1563_190116_001 85.988 70.353 620850000 0 0 0 52578000 68086000 97444000 155080000 0 0 0 72160000 51993000 123510000 16164 1394 15192 141696;141697;141698;141699;141700;141701;141702 180324;180325;180326;180327;180328;180329;180330 180326 5 GHWFLSPR Unmodified 998.50863 0.50863441 3850;3734 Q92561;E5RHN5;Q96FC7 PHYHIP;PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein;Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.391 53.391 2 0.0016223 51897 QUIQUE_C1277_190116_001 140.12 114.5 4380200000 233730000 306420000 329400000 318910000 423970000 341290000 496410000 278690000 267300000 65032000 511940000 450490000 356660000 16165 3734;3850 15193 141703;141704;141705;141706;141707;141708;141709;141710;141711;141712;141713;141714;141715 180331;180332;180333;180334;180335;180336;180337;180338;180339;180340;180341;180342;180343;180344;180345;180346;180347;180348 180332 17 GHYEVTGSDDETGK Unmodified 1493.627 0.62703081 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 2 1 16.054 16.054 2;3 1.699E-15 8287 QUIQUE_C1403_190116_001 149.31 139.08 68582000 0 0 0 48624000 0 19957000 0 0 0 0 0 0 0 16166 2935 15194 141716;141717;141718 180349;180350;180351 180350 3 GHYITIVK Unmodified 929.53345 0.53345218 1223 H7BZK6;P62068 USP46 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46 yes no 0 0 0 1 25.333 25.333 2 0.030013 18492 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.344 35.389 8058100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8058100 0 0 0 16167 1223 15195 141719 180352 180352 1 GHYNNVSCAVFHPR Unmodified 1656.7579 0.7579426 2630 P53621;A0A3B3IS84;A0A3B3IT15;A0A3B3ISC6;A0A3B3IU89;A0A3B3ITV3;A0A3B3ISK1 COPA Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 0 1 1 1 31.126 31.126 3 0.00017013 26231 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.115 56.648 116600000 41285000 48367000 0 0 0 0 0 26947000 0 0 0 0 0 16168 2630 15196 141720;141721;141722 180353;180354;180355;180356 180356 3 GHYTEGAELIENVLEVVR Unmodified 2027.0324 0.032369346 4171 Q9H4B7 TUBB1 Tubulin beta-1 chain yes yes 0 0 0 1 148.25 148.25 3 0.00017538 152147 QUIQUE_C1403_190116_001 57.525 44.685 53050000 0 0 0 53050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 16169 4171 15197 141723 180357 180357 1 GHYTEGAELVDAVLDVVR Unmodified 1941.9796 0.97960549 1862;4033;1352 P04350;M0R278;M0R1I1;Q9BUF5;K7ESM5;K7EL29;K7ES63 TUBB4A;TUBB6 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-6 chain no no 0 0 0 4 4 4 3 6 5 6 3 5 6 6 3 6 158.21 158.21 2;3;4 0 154709 QUIQUE_C1218_190116_001 373.19 355.82 176430000000 19902000000 9447500000 14895000000 10733000000 18342000000 14741000000 23718000000 8549200000 12110000000 6228400000 14065000000 10724000000 12973000000 16170 1862;4033;1352 15198 141724;141725;141726;141727;141728;141729;141730;141731;141732;141733;141734;141735;141736;141737;141738;141739;141740;141741;141742;141743;141744;141745;141746;141747;141748;141749;141750;141751;141752;141753;141754;141755;141756;141757;141758;141759;141760;141761;141762;141763;141764;141765;141766;141767;141768;141769;141770;141771;141772;141773;141774;141775;141776;141777;141778;141779;141780;141781;141782;141783;141784 180358;180359;180360;180361;180362;180363;180364;180365;180366;180367;180368;180369;180370;180371;180372;180373;180374;180375;180376;180377;180378;180379;180380;180381;180382;180383;180384;180385;180386;180387;180388;180389;180390;180391;180392;180393;180394;180395;180396;180397;180398;180399;180400;180401;180402;180403;180404;180405;180406;180407;180408;180409;180410;180411;180412;180413;180414;180415;180416;180417;180418;180419;180420;180421;180422;180423;180424;180425;180426;180427;180428;180429;180430;180431;180432;180433;180434;180435;180436;180437;180438;180439;180440;180441;180442;180443;180444;180445;180446;180447;180448;180449;180450;180451;180452;180453;180454;180455;180456;180457;180458;180459;180460;180461;180462;180463;180464;180465 180363 107 GHYTEGAELVDAVLDVVRK Unmodified 2070.0746 0.074568512 1862;4033;1352 P04350;M0R278;M0R1I1;Q9BUF5;K7ESM5;K7EL29;K7ES63 TUBB4A;TUBB6 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-6 chain no no 0 0 1 1 3 3 3 2 2 134.77 134.77 2;3;4 5.8687E-64 138151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.14 174.61 6460800000 0 0 0 0 28520000 0 0 3124400000 478430000 0 1241200000 1102000000 486320000 16171 1862;4033;1352 15199 141785;141786;141787;141788;141789;141790;141791;141792;141793;141794;141795;141796;141797;141798 180466;180467;180468;180469;180470;180471;180472;180473;180474;180475;180476;180477;180478;180479;180480;180481;180482;180483;180484;180485;180486;180487 180469 22 GHYTEGAELVDSVLDVVR Unmodified 1957.9745 0.97452012 3030;4044;2797;1922;3006 Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;G3V2A3;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB4B;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 13 12 12 14 13 12 14 10 13 6 12 16 11 158.66 158.66 2;3;4 0 143077 QUIQUE_C1218_190116_001 426.05 412.62 560800000000 44484000000 43980000000 48924000000 40249000000 69952000000 31884000000 46200000000 25246000000 40883000000 23992000000 47213000000 56952000000 40841000000 16172 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180488;180489;180490;180491;180492;180493;180494;180495;180496;180497;180498;180499;180500;180501;180502;180503;180504;180505;180506;180507;180508;180509;180510;180511;180512;180513;180514;180515;180516;180517;180518;180519;180520;180521;180522;180523;180524;180525;180526;180527;180528;180529;180530;180531;180532;180533;180534;180535;180536;180537;180538;180539;180540;180541;180542;180543;180544;180545;180546;180547;180548;180549;180550;180551;180552;180553;180554;180555;180556;180557;180558;180559;180560;180561;180562;180563;180564;180565;180566;180567;180568;180569;180570;180571;180572;180573;180574;180575;180576;180577;180578;180579;180580;180581;180582;180583;180584;180585;180586;180587;180588;180589;180590;180591;180592;180593;180594;180595;180596;180597;180598;180599;180600;180601;180602;180603;180604;180605;180606;180607;180608;180609;180610;180611;180612;180613;180614;180615;180616;180617;180618;180619;180620;180621;180622;180623;180624;180625;180626;180627;180628;180629;180630;180631;180632;180633;180634;180635;180636;180637;180638;180639;180640;180641;180642;180643;180644;180645;180646;180647;180648;180649;180650;180651;180652;180653;180654;180655;180656;180657;180658;180659;180660;180661;180662;180663;180664;180665;180666;180667;180668;180669;180670;180671;180672;180673;180674;180675;180676;180677;180678;180679;180680;180681;180682;180683;180684;180685;180686;180687;180688;180689;180690;180691;180692;180693;180694;180695;180696;180697;180698;180699;180700;180701;180702;180703;180704;180705;180706;180707;180708;180709;180710;180711;180712;180713;180714;180715;180716;180717;180718;180719;180720;180721;180722;180723;180724;180725;180726;180727;180728;180729;180730;180731;180732;180733;180734;180735;180736;180737;180738;180739;180740;180741;180742;180743;180744;180745;180746;180747;180748;180749;180750;180751;180752;180753;180754;180755;180756;180757;180758;180759;180760;180761;180762 180494 262 GHYTEGAELVDSVLDVVRK Unmodified 2086.0695 0.069483134 3030;4044;2797;1922;3006 Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;G3V2A3;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB4B;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 1 1 5 3 3 3 3 130.1 130.1 2;3;4 3.0143E-152 126745 QUIQUE_DMIX1_190116_001 241.42 229.06 17482000000 0 0 0 0 144460000 0 0 5519400000 2507100000 0 4014400000 3053200000 2243900000 16173 1922;2797;3006;3030;4044 15201 141957;141958;141959;141960;141961;141962;141963;141964;141965;141966;141967;141968;141969;141970;141971;141972;141973;141974 180763;180764;180765;180766;180767;180768;180769;180770;180771;180772;180773;180774;180775;180776;180777;180778;180779;180780;180781;180782;180783;180784;180785;180786;180787;180788;180789;180790;180791;180792;180793;180794;180795 180772 33 GHYTIGK Unmodified 774.40244 0.40243801 2795;3430;3992;2796;1990;1031;737 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3729 Q92526 CCT6B T-complex protein 1 subunit zeta-2 yes yes 0 0 0 1 1 125.84 125.84 2 0.00043296 128413 QUIQUE_C1563_190116_001 111.65 2.2329 988470000 0 0 0 526710000 0 461760000 0 0 0 0 0 0 0 16201 3729 15229 142126;142127 180966;180967 180967 2 GIDQCIPLFVEAALER Unmodified 1829.9346 0.93456956 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 162.43 162.43 2;3 2.2184E-13 168003 QUIQUE_C1218_190116_001 136.38 99.791 970690000 72968000 84869000 75277000 75688000 85676000 59843000 99121000 17375000 103010000 7763300 89115000 100810000 99179000 16202 1727 15230 142128;142129;142130;142131;142132;142133;142134;142135;142136;142137;142138;142139;142140;142141;142142;142143;142144;142145;142146;142147;142148;142149;142150;142151 180968;180969;180970;180971;180972;180973;180974;180975;180976;180977;180978;180979;180980;180981;180982;180983;180984;180985;180986;180987;180988;180989;180990;180991;180992;180993;180994;180995;180996 180969 29 GIDVQQVSLVINYDLPTNR Unmodified 2143.1273 0.12733236 2697;3055 P60842;Q14240;E7EQG2 EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 2 3 1 140.89 140.89 2;3 2.1893E-115 147897 QUIQUE_C1438_190116_001 280.23 253.13 1437500000 135190000 184320000 104290000 0 97251000 96937000 59991000 215100000 50767000 113520000 288250000 91926000 0 16203 2697;3055 15231 142152;142153;142154;142155;142156;142157;142158;142159;142160;142161;142162;142163;142164;142165;142166;142167;142168 180997;180998;180999;181000;181001;181002;181003;181004;181005;181006;181007;181008;181009;181010;181011;181012;181013;181014;181015 181003 15 GIDYDKLIVR Unmodified 1190.6659 0.66592292 2213 P23381;G3V277;G3V3H8;G3V3Y5;G3V423;G3V5U1;G3V456;G3V3P2;G3V227;G3V3X0;G3V5W1;G3V3S7;G3V2Y7 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 73.061 73.061 2;3 0.00023716 74260 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.29 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2461.2741 0.27405618 300 A0A0J9YXF2;A0A0J9YYG4;Q15165;J3QT77;G3XAK4 PON2 Serum paraoxonase/arylesterase 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 168.69 168.69 2;3 1.3932E-24 173088 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.57 164.4 665970000 0 0 0 0 54662000 0 73268000 106090000 159070000 0 174410000 46853000 51621000 16207 300 15235 142186;142187;142188;142189;142190;142191;142192;142193;142194;142195;142196;142197;142198 181036;181037;181038;181039;181040;181041;181042;181043;181044;181045;181046;181047;181048 181043 13 GIEDDLMDLIK Unmodified 1260.6272 0.62715415 4001 Q9BRF8 CPPED1 Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.98 155.98 2 0.0023616 159794 QUIQUE_C1403_190116_001 103.7 72.627 409320000 42665000 40470000 48993000 49808000 59024000 0 0 33000000 67658000 30705000 0 0 36996000 16208 4001 15236 142199;142200;142201;142202;142203;142204;142205;142206;142207 181049;181050;181051;181052;181053;181054;181055;181056;181057;181058 181053 6 GIEDEQDLVPLEVTGVVFHYR Unmodified 2414.2118 0.21179027 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 148.92 148.92 2;3 5.98E-44 153637 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.18 167.25 6956000000 576570000 559640000 549700000 353850000 474280000 438480000 838960000 399500000 556510000 246410000 780330000 711730000 470050000 16209 1436 15237 142208;142209;142210;142211;142212;142213;142214;142215;142216;142217;142218;142219;142220;142221;142222;142223;142224;142225;142226;142227;142228;142229;142230 181059;181060;181061;181062;181063;181064;181065;181066;181067;181068;181069;181070;181071;181072;181073;181074;181075;181076;181077;181078;181079;181080;181081;181082;181083;181084;181085;181086;181087;181088 181079 28 GIEEEEILPGFILCDPNNLCHSGR Unmodified 2768.2898 0.28979937 2089 P15170;H3BR35 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.76 139.76 3 1.39E-18 143987 QUIQUE_C1277_190116_001 115.36 107.74 741610000 78603000 118690000 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142250;142251;142252;142253;142254;142255 181110;181111;181112;181113;181114;181115 181113 6 GIEESLRK Unmodified 930.51345 0.51344502 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PQV5;A0A1W2PQC2;A0A1W2PRT2;A0A1W2PP40;A0A1W2PQ55 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 18.677 18.677 2 0.058745 11233 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.709 0 217780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 217780000 16213 913 15241 142256 181116 181116 1 GIEEVGIYR Unmodified 1034.5397 0.53965977 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.939 60.939 2 0.00057338 60211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.82 63.967 829700000 0 103180000 111530000 83832000 0 0 0 78408000 93689000 0 139270000 115630000 104170000 16214 366 15242 142257;142258;142259;142260;142261;142262;142263;142264;142265 181117;181118;181119;181120;181121;181122;181123;181124;181125 181121 8 GIEFEDESSDR Unmodified 1282.5313 0.53133951 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 51.686 51.686 2;3 0.0002806 44433 QUIQUE_C1277_190116_001 120.12 91.032 190560000 26411000 71784000 27124000 32985000 0 32261000 0 0 0 0 0 0 0 16215 4668 15243 142266;142267;142268;142269;142270;142271;142272;142273 181126;181127;181128;181129;181130;181131;181132;181133 181127 8 GIEFEDESSDRDARPALETQPQQEK Unmodified 2874.3268 0.32677305 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 2 2 1 60.167 60.167 3;4 6.2048E-09 58861 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.532 50.916 166990000 0 0 0 0 0 0 0 109850000 57145000 0 0 0 0 16216 4668 15244 142274;142275;142276 181134;181135;181136;181137;181138 181135 5 GIEGTYADLCTNK Unmodified 1440.6555 0.65549416 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.254 63.254 2 2.593E-06 62710 QUIQUE_C1277_190116_001 154.24 123.01 452110000 0 59029000 44626000 42374000 0 0 45725000 0 64119000 0 65775000 56826000 73640000 16217 4476 15245 142277;142278;142279;142280;142281;142282;142283;142284;142285;142286;142287;142288 181139;181140;181141;181142;181143;181144;181145;181146;181147;181148;181149;181150;181151 181140 13 GIEGVQVIPLIPGAGEIIIADNIIK Unmodified 2541.4782 0.47817572 2278 P28288 ABCD3 ATP-binding cassette sub-family D member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 169.12 169.12 3 0.011976 174224 QUIQUE_C1368_190116_001 27.672 24.748 66056000 0 0 29383000 0 0 0 0 28240000 0 8432200 0 0 0 16218 2278 15246 142289;142290;142291 181152;181153;181154 181152 3 GIEILTDMSR Unmodified 1133.5751 0.575059 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 94.287 94.287 2 0.00014691 96388 QUIQUE_C1277_190116_001 122.13 80.706 180140000 38523000 30088000 30205000 24642000 16310000 30829000 0 0 0 9541400 0 0 0 16219 2573 15247 142292;142293;142294;142295;142296;142297;142298;142299 181155;181156;181157;181158;181159;181160;181161;181162 181156 8 GIEILTDMSRPVELSDR Unmodified 1929.983 0.98297631 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 113.51 113.51 2;3 8.8194E-25 116721 QUIQUE_C1403_190116_001 149.44 139.28 2645700000 329210000 290410000 227640000 314610000 251010000 239550000 314070000 66431000 138450000 70905000 161110000 106050000 136310000 16220 2573 15248 142300;142301;142302;142303;142304;142305;142306;142307;142308;142309;142310;142311;142312;142313;142314;142315;142316;142317;142318;142319 181163;181164;181165;181166;181167;181168;181169;181170;181171;181172;181173;181174;181175;181176;181177;181178;181179;181180;181181;181182;181183 181169 20 GIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSK Unmodified 3389.7348 0.7348137 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 2 1 1 133.75 133.75 3;4 6.2641E-47 136755 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.64 121.67 202450000 0 0 0 0 0 0 0 134680000 0 0 0 67771000 0 16221 2573 15249 142320;142321 181184;181185;181186 181184 3 GIEKPPFELPDFIK Unmodified 1628.8814 0.881395 2996 Q13435;E9PPJ0 SF3B2 Splicing factor 3B subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 123.68 123.68 3 0.0096879 126277 QUIQUE_C1563_190116_001 43.791 24.959 88853000 0 29725000 0 0 0 24739000 34389000 0 0 0 0 0 0 16222 2996 15250 142322;142323;142324 181187;181188;181189 181188 3 GIEMSEVR Unmodified 919.44332 0.44331654 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.438 33.438 2 0.0036456 28502 QUIQUE_C1403_190116_001 128.86 61.826 3853800000 0 511040000 405230000 373810000 321340000 349700000 396690000 382170000 327120000 140780000 334950000 0 310980000 16223 1971 15251 142325;142326;142327;142328;142329;142330;142331;142332;142333;142334;142335 181190;181191;181192;181193;181194;181195;181196;181197;181198;181199;181200;181201;181202;181203 181193 14 GIEMSEVR Oxidation (M) 935.43823 0.43823117 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 1 0 1 18.064 18.064 2 0.05046 10698 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.917 26.852 78708000 0 0 0 0 0 0 0 78708000 0 0 0 0 0 16224 1971 15251 142336 181204 181204 1 GIEQAVQSHAVAEEEAR Unmodified 1822.881 0.88095408 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 1 2 2 2 56.84 56.84 2;3 3.7389E-121 55288 QUIQUE_DMIX5_190116_001 226.24 177.5 8741600000 652780000 809000000 917310000 686950000 625320000 725480000 879980000 393980000 588160000 181640000 746700000 465860000 1068500000 16225 693;3205 15252 142337;142338;142339;142340;142341;142342;142343;142344;142345;142346;142347;142348;142349;142350;142351;142352;142353;142354;142355;142356;142357;142358;142359;142360;142361;142362 181205;181206;181207;181208;181209;181210;181211;181212;181213;181214;181215;181216;181217;181218;181219;181220;181221;181222;181223;181224;181225;181226;181227;181228;181229;181230;181231;181232;181233;181234;181235;181236 181230 32 GIEQAVQSHAVAEEEARK Unmodified 1950.9759 0.9759171 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 1 1 46.326 46.326 3 7.4054E-05 43784 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.645 39.1 39808000 0 0 0 0 0 0 0 0 39808000 0 0 0 0 16226 693;3205 15253 142363 181237 181237 1 GIFAIIKPFLK Unmodified 1245.7849 0.78491584 4025 Q9BTX7;Q5QPC2 TTPAL Alpha-tocopherol transfer protein-like yes no 0 0 1 1 1 1 132.93 132.93 3 0.012934 138733 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.067 65.156 6672500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6672500 0 16227 4025 15254 142364;142365;142366 181238;181239;181240 181239 3 GIFASGSPFK Unmodified 1009.5233 0.52328142 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.235 78.235 2 0.00074092 78452 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.91 69.752 1986000000 195200000 174160000 159210000 117780000 143640000 125130000 162550000 118130000 176250000 66713000 177730000 175760000 193710000 16228 3198 15255 142367;142368;142369;142370;142371;142372;142373;142374;142375;142376;142377;142378;142379 181241;181242;181243;181244;181245;181246;181247;181248;181249;181250;181251;181252;181253 181253 11 GIFDEYSQITSLVTEEIVNVHK Unmodified 2520.2748 0.27478446 2111 P16591 FER Tyrosine-protein kinase Fer yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 169.8 169.8 3 8.4537E-09 174421 QUIQUE_C1218_190116_001 90.968 84.709 416610000 27679000 38752000 95769000 26485000 36488000 54006000 0 55007000 82426000 0 0 0 0 16229 2111 15256 142380;142381;142382;142383;142384;142385;142386;142387 181254;181255;181256;181257;181258;181259;181260;181261 181254 8 GIFEALRPLETLPVEGLIR Unmodified 2122.215 0.21502516 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.68 159.68 3 1.0364E-07 161973 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.45 103.18 3906700000 43726000 121120000 351030000 227130000 58440000 244200000 239020000 234140000 696350000 327990000 462920000 584620000 315990000 16230 3053 15257 142388;142389;142390;142391;142392;142393;142394;142395;142396;142397;142398;142399;142400;142401 181262;181263;181264;181265;181266;181267;181268;181269;181270;181271;181272;181273;181274;181275;181276;181277;181278;181279;181280;181281;181282;181283 181272 22 GIFEPFGR Unmodified 921.47085 0.47085192 3069 Q14498;G3XAC6;A0A0U1RQH7;H0Y4X3;A0A0U1RQW2 RBM39 RNA-binding protein 39 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.817 92.817 2 0.012432 94381 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.643 70.017 157090000 16177000 0 0 16955000 0 0 21610000 18516000 16588000 11350000 29764000 0 26130000 16231 3069 15258 142402;142403;142404;142405;142406;142407;142408;142409 181284;181285;181286;181287;181288;181289;181290;181291 181287 8 GIFFSHR Unmodified 862.44497 0.44497152 2213 P23381;G3V277;G3V3H8;G3V3Y5;G3V423;G3V5U1;G3V456;G3V3P2;G3V227;G3V2Y7 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 0 1 1 1 1 31.946 31.946 2 0.0093563 26960 QUIQUE_C1277_190116_001 150.82 102.58 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181410;181411;181412 181410 2 GIFVQSLIPFYVATSMTAPSNFLHR Unmodified 2795.4469 0.44689236 3227 Q3SXM5 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 167.35 167.35 3 3.9232E-09 174760 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.227 66.252 178170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 154030000 0 24143000 16240 3227 15267 142490;142491 181413;181414 181413 2 GIGFGDIFK Unmodified 952.50182 0.5018177 4623 Q9Y5K6 CD2AP CD2-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.03 116.03 2 0.021719 119187 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.962 31.777 52471000 8057700 0 0 9491600 0 10379000 9316900 0 0 6166600 0 0 9058900 16241 4623 15268 142492;142493;142494;142495;142496;142497;142498;142499;142500;142501 181415;181416;181417;181418;181419;181420;181421;181422;181423;181424 181424 10 GIGGIFFDDLDSPSKEEVFR Unmodified 2227.0797 0.079713469 2398 P36551 CPOX Oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 136.45 136.45 3 4.944E-06 142001 QUIQUE_C1368_190116_001 83.423 74.953 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181427;181428;181429;181430;181431;181432;181433;181434;181435;181436;181437;181438;181439;181440;181441;181442;181443;181444;181445;181446;181447;181448;181449 181428 22 GIGIENIHYLNDGLWHMK Unmodified 2109.0466 0.046579622 4486;485 A0A3B3IRV3;Q9ULC4 MCTS1 Malignant T-cell-amplified sequence 1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 115.42 115.42 3;4 4.185E-14 118555 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.6 84.367 868360000 34797000 51791000 40459000 0 36001000 25905000 0 116270000 128820000 10828000 178730000 180170000 64579000 16245 485;4486 15272 142525;142526;142527;142528;142529;142530;142531;142532;142533;142534;142535;142536;142537;142538;142539;142540 181450;181451;181452;181453;181454;181455;181456;181457;181458;181459;181460;181461;181462;181463;181464;181465;181466;181467;181468;181469;181470;181471 181462 21 GIGLAIAR Unmodified 769.48102 0.48102268 1659 O75828 CBR3 Carbonyl reductase [NADPH] 3 yes yes 0 0 0 1 1 51.512 51.512 2 0.0050828 49444 QUIQUE_C1368_190116_001 106.76 44.422 83354000 0 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181564;181565;181566;181567;181568;181569;181570;181571;181572;181573;181574;181575;181576;181577;181578;181579;181580;181581;181582;181583;181584;181585;181586 181570 19 GIHNSIGDYR Unmodified 1130.5469 0.54687041 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 22.554 22.554 2 0.026919 16112 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.531 29.425 15828000 0 0 0 0 0 0 0 0 15828000 0 0 0 0 16257 2096 15282 142637 181587 181587 1 GIHPTIISESFQK Unmodified 1455.7722 0.7721789 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 58.168 58.168 2;3 5.8409E-65 57172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.28 184.95 7296800000 582070000 711650000 627550000 626740000 639550000 492660000 685110000 232950000 553750000 121480000 801890000 657080000 564280000 16258 2573 15283 142638;142639;142640;142641;142642;142643;142644;142645;142646;142647;142648;142649;142650;142651;142652;142653;142654;142655;142656;142657;142658;142659;142660;142661 181588;181589;181590;181591;181592;181593;181594;181595;181596;181597;181598;181599;181600;181601;181602;181603;181604;181605;181606;181607;181608;181609;181610;181611;181612;181613;181614;181615;181616;181617;181618;181619;181620;181621 181612 34 GIHQSTIDLK Unmodified 1110.6033 0.60332266 3059 Q14258;A0A3B3IUA7 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.463 22.463 3 0.0068489 16184 QUIQUE_C1218_190116_001 45.598 26.853 190370000 46301000 44818000 30710000 30624000 0 0 0 0 0 0 0 0 37914000 16259 3059 15284 142662;142663;142664;142665;142666;142667 181622;181623;181624;181625;181626;181627;181628 181622 7 GIHSAIDASQTPDVVFASILAAFSK Unmodified 2544.3224 0.32240336 1047 F8W1A4;P54819;F8VY04 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 169.17 169.17 2;3 1.4395E-98 173492 QUIQUE_DMIX3_190116_001 227.4 214.57 2644200000 78533000 16945000 287200000 208520000 14386000 140380000 358050000 202710000 361460000 32785000 396060000 281570000 265620000 16260 1047 15285 142668;142669;142670;142671;142672;142673;142674;142675;142676;142677;142678;142679;142680;142681;142682 181629;181630;181631;181632;181633;181634;181635;181636;181637;181638;181639;181640;181641;181642;181643;181644 181638 13 GIHTLLQNLAK Unmodified 1206.7085 0.70845643 3184 Q16620 NTRK2 BDNF/NT-3 growth factors receptor yes yes 0 0 0 1 1 1 66.1 66.1 2;3 0.0020369 66568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.535 51.726 57375000 0 0 0 0 0 0 0 0 23887000 0 33487000 0 0 16261 3184 15286 142683;142684;142685 181645;181646;181647;181648 181646 3 GIHVEVPPAEAER Unmodified 1402.7205 0.72047768 2411 P38117 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 41.042 41.042 2;3 0.0014352 35932 QUIQUE_C1368_190116_001 52.576 41.966 272540000 33378000 0 33837000 30624000 38014000 0 0 27160000 0 13685000 28623000 24437000 42784000 16262 2411 15287 142686;142687;142688;142689;142690;142691;142692;142693;142694;142695;142696;142697;142698 181649;181650;181651;181652;181653;181654;181655;181656;181657;181658;181659;181660;181661 181650 13 GIHYWEVELQK Unmodified 1400.7089 0.70885036 3059 Q14258 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 76.28 76.28 3 0.0070324 77333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.189 44.786 32084000 0 0 0 0 0 0 0 0 12809000 0 0 19275000 0 16263 3059 15288 142699;142700;142701;142702;142703 181662;181663;181664;181665;181666 181664 4 GIIASSIGTILK Unmodified 1171.7176 0.71762413 4267 Q9NRF8 CTPS2 CTP synthase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 114.49 114.49 2 0.00068644 113198 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.15 77.114 178260000 23483000 0 31883000 22073000 33485000 0 0 0 29258000 10963000 0 0 27118000 16264 4267 15289 142704;142705;142706;142707;142708;142709;142710;142711 181667;181668;181669;181670;181671;181672;181673;181674;181675 181674 8 GIIASSVGTILK Unmodified 1157.702 0.70197407 476 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;A0A3B3ITB8;A0A3B3ITH9 CTPS1 CTP synthase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.908 97.908 2 0.0013861 100683 QUIQUE_C1368_190116_001 93.667 55.364 345770000 37156000 30059000 56547000 0 39899000 0 47598000 0 0 0 57783000 35133000 41597000 16265 476 15290 142712;142713;142714;142715;142716;142717;142718;142719 181676;181677;181678;181679;181680;181681;181682;181683 181678 4 GIIDSFYQEQK Unmodified 1326.6456 0.6455814 3861 Q96GR2;F5H4U6 ACSBG1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.263 95.263 2 0.00059478 97097 QUIQUE_C1403_190116_001 113.62 88.846 381770000 65154000 55621000 84992000 64792000 0 87234000 0 0 0 23973000 0 0 0 16266 3861 15291 142720;142721;142722;142723;142724;142725;142726 181684;181685;181686;181687;181688;181689;181690;181691 181688 8 GIIDSTHTEQR Unmodified 1255.6157 0.61567826 470 H0Y7S3;A0A2U3U055;A0A2U3TZI3;Q01814;A0A2R8Y4R4 ATP2B2 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2 yes no 0 0 0 1 19.621 19.621 2 0.047701 12536 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.927 26.368 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16267 470 15292 142727 181692 181692 1 GIIDSTVGEHR Unmodified 1182.5993 0.59929991 2222 P23634 ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 36.663 36.663 2 0.00043473 32355 QUIQUE_C1368_190116_001 120.12 86.322 338380000 0 0 56377000 0 41621000 0 44053000 31920000 60997000 0 49910000 0 53502000 16268 2222 15293 142728;142729;142730;142731;142732;142733;142734 181693;181694;181695;181696;181697;181698;181699 181693 7 GIIDSTVSDQR Unmodified 1189.5939 0.59388018 2158 P20020;E7ERY9 ATP2B1 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1;Calcium-transporting ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.485 48.485 2 0.0052982 46279 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.276 21.832 306530000 0 0 58236000 0 36409000 33810000 39795000 0 34646000 0 56284000 0 47349000 16269 2158 15294 142735;142736;142737;142738;142739;142740;142741 181700;181701;181702;181703;181704;181705;181706 181704 6 GIIHDPYSEFMVEEHELR Unmodified 2200.0259 0.02590376 4013 Q9BSJ2;F2Z2B9 TUBGCP2 Gamma-tubulin complex component 2 yes no 0 0 0 1 105.35 105.35 3 0.022351 108926 QUIQUE_C1218_190116_001 41.348 29.497 18367000 18367000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16270 4013 15295 142742 181707 181707 0 GIIIMGEDDDSHPSEMR Unmodified 1900.8295 0.82951214 4103 Q9GZP4 PITHD1 PITH domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 69.8 69.8 2;3 1.8218E-29 70452 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.07 139.49 1039900000 80728000 33700000 73905000 96937000 82478000 61124000 110040000 69669000 66414000 0 90333000 123820000 150760000 16271 4103 15296 142743;142744;142745;142746;142747;142748;142749;142750;142751;142752;142753;142754;142755;142756;142757;142758;142759 181708;181709;181710;181711;181712;181713;181714;181715;181716;181717;181718;181719;181720;181721;181722;181723;181724;181725;181726;181727;181728 181722 20 GIIIMGEDDDSHPSEMR Oxidation (M) 1916.8244 0.82442676 4103 Q9GZP4 PITHD1 PITH domain-containing protein 1 yes yes 0 1 0 1 55.98 55.98 2 0.0010937 55218 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.191 88.346 39552000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39552000 0 0 16272 4103 15296 142760 181729 181729 2859 0 GIILAGTEEQK Unmodified 1157.6292 0.62920306 4186 Q9H845 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.782 41.782 2 0.00044188 38622 QUIQUE_C1576_190116_001 104.01 63.946 447020000 0 42394000 48640000 37476000 56280000 34538000 38729000 0 45520000 18083000 47702000 37487000 40174000 16273 4186 15297 142761;142762;142763;142764;142765;142766;142767;142768;142769;142770;142771 181730;181731;181732;181733;181734;181735;181736;181737;181738;181739;181740 181735 9 GIILFISR Unmodified 917.56984 0.56983769 4582 Q9Y399;Q5T8A0 MRPS2 28S ribosomal protein S2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 103.77 103.77 2 0.054229 106809 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.611 26.189 10506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10506000 0 16274 4582 15298 142772 181741 181741 1 GIIPLENLSIR Unmodified 1223.7238 0.72377215 270 A0A0D9SFG6;Q99418;Q15438;O43739 CYTH2;CYTH1;CYTH3 Cytohesin-2;Cytohesin-1;Cytohesin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.68 116.68 2 0.0042567 121862 QUIQUE_C1438_190116_001 90.906 63.081 378220000 56747000 59649000 0 0 65556000 0 47360000 42674000 42821000 0 63417000 0 0 16275 270 15299 142773;142774;142775;142776;142777;142778;142779;142780 181742;181743;181744;181745;181746;181747;181748;181749 181744 7 GIIPNSFAHIFGHIAK Unmodified 1720.9413 0.94130991 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496;C9J9X2 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 1 108.11 108.11 4 0.041339 111364 QUIQUE_DMIX7_190116_001 22.327 12.539 25091000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25091000 0 16276 88 15300 142781 181750 181750 1 GIIRPGTAFELLEAQAATGYVIDPIK Unmodified 2742.4956 0.4956167 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 3 2 3 2 3 1 2 3 3 1 3 3 3 154.09 154.09 2;3;4 4.5501E-56 160743 QUIQUE_C1438_190116_001 158.15 139.79 12125000000 731690000 568330000 1055300000 349650000 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0.96592926 722 C9JFR7;P99999 CYCS Cytochrome c yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 164.31 164.31 2;3 3.4748E-121 169556 QUIQUE_C1218_190116_001 226.73 210.6 6804500000 597220000 724400000 752690000 364410000 373720000 336550000 604210000 338740000 726560000 65868000 904800000 598610000 416720000 16280 722 15303 142857;142858;142859;142860;142861;142862;142863;142864;142865;142866;142867;142868;142869;142870;142871;142872;142873;142874;142875;142876;142877;142878;142879;142880;142881;142882 181848;181849;181850;181851;181852;181853;181854;181855;181856;181857;181858;181859;181860;181861;181862;181863;181864;181865;181866;181867;181868;181869;181870;181871;181872;181873;181874;181875;181876;181877;181878;181879;181880;181881;181882 181849 35 GIIWGEDTLMEYLENPKK Oxidation (M) 2151.0558 0.055806905 722 C9JFR7;P99999 CYCS Cytochrome c yes no 0 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 2 136.3 136.3 2;3 1.6178E-05 143061 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.203 70.404 1336500000 145160000 101250000 139640000 61245000 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181899;181900;181901;181902;181903;181904;181905;181906;181907;181908;181909;181910;181911;181912;181913;181914;181915;181916;181917;181918;181919;181920;181921;181922;181923;181924;181925;181926;181927;181928;181929 181916 30 GIKPVTLELGGK Unmodified 1210.7285 0.72852317 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 3 2 1 2 1 2 2 2 2 2 1 50.181 50.181 2;3 0.00023652 48607 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.86 116.07 17049000000 681580000 725210000 1934200000 1419600000 891500000 1220900000 950740000 1772400000 1773600000 642170000 2218400000 1513700000 1304900000 16283 2522 15305 142920;142921;142922;142923;142924;142925;142926;142927;142928;142929;142930;142931;142932;142933;142934;142935;142936;142937;142938;142939;142940;142941 181930;181931;181932;181933;181934;181935;181936;181937;181938;181939;181940;181941;181942;181943;181944;181945;181946;181947;181948;181949;181950;181951;181952;181953;181954;181955;181956;181957;181958;181959;181960;181961;181962;181963 181950 30 GILAADESTGSIAK Unmodified 1331.6933 0.69325988 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 4 3 3 3 3 1 1 3 4 3 1 4 2 56.619 56.619 2 9.2999E-08 53778 QUIQUE_DMIX3_190116_001 152.62 132.29 125710000000 11533000000 11422000000 11109000000 9535600000 9759000000 8234600000 11448000000 7697300000 8737600000 3683200000 12260000000 9641500000 10650000000 16284 1851 15306 142942;142943;142944;142945;142946;142947;142948;142949;142950;142951;142952;142953;142954;142955;142956;142957;142958;142959;142960;142961;142962;142963;142964;142965;142966;142967;142968;142969;142970;142971;142972;142973;142974;142975;142976 181964;181965;181966;181967;181968;181969;181970;181971;181972;181973;181974;181975;181976;181977;181978;181979;181980;181981;181982;181983;181984;181985;181986;181987;181988;181989;181990;181991;181992;181993;181994;181995;181996;181997;181998;181999;182000;182001;182002;182003;182004;182005;182006;182007;182008;182009;182010;182011;182012;182013;182014;182015;182016;182017;182018;182019;182020;182021;182022;182023;182024;182025 182004 61 GILAADESTGSIAKR Unmodified 1487.7944 0.79437091 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 1 41.075 41.075 2 1.8259E-09 37927 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.1 103.42 133540000 0 0 0 0 0 0 0 74302000 0 0 59235000 0 0 16285 1851 15307 142977;142978;142979 182026;182027;182028;182029 182027 4 GILAADESVGSMAK Oxidation (M) 1363.6653 0.66533057 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 48.154 48.154 2 1.9068E-14 46012 QUIQUE_C1277_190116_001 147.74 129.88 15953000000 791380000 1126700000 1089500000 903500000 770540000 924670000 654360000 1870800000 1536600000 1402200000 1708700000 1602600000 1571500000 16286 1978 15308 142980;142981;142982;142983;142984;142985;142986;142987;142988;142989;142990;142991;142992;142993;142994;142995 182030;182031;182032;182033;182034;182035;182036;182037;182038;182039;182040;182041;182042;182043;182044;182045;182046;182047;182048;182049;182050;182051;182052;182053;182054;182055;182056;182057;182058;182059;182060;182061;182062;182063;182064;182065 182034 1254 36 GILAADESVGSMAK Unmodified 1347.6704 0.67041595 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.728 69.728 2 1.2199E-28 69380 QUIQUE_C1368_190116_001 172.27 123.48 21345000000 1639200000 1800400000 1933000000 1668800000 1546900000 1598700000 1492800000 1326400000 1513500000 808450000 2347900000 1719300000 1949700000 16287 1978 15308 142996;142997;142998;142999;143000;143001;143002;143003;143004;143005;143006;143007;143008 182066;182067;182068;182069;182070;182071;182072;182073;182074;182075;182076;182077;182078;182079;182080;182081;182082;182083;182084;182085;182086;182087;182088;182089;182090;182091;182092;182093;182094;182095;182096;182097;182098 182073 33 GILADEDSSRPVWLK Unmodified 1684.8784 0.87843489 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 2 1 90.105 90.105 2;3 9.0098E-05 90974 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.49 79.706 488750000 0 112630000 0 104520000 0 0 0 211460000 0 60139000 0 0 0 16288 2524 15309 143009;143010;143011;143012;143013 182099;182100;182101;182102;182103 182101 3 GILAIAWSMADPELLLSCGK Unmodified 2144.101 0.10098296 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 171.83 171.83 2 1.9267E-06 175693 QUIQUE_DMIX7_190116_001 126.1 112.42 48715000 0 0 0 0 0 0 0 0 18808000 0 0 29907000 0 16289 821 15310 143014;143015 182104;182105 182105 2 GILCGLTQFTNK Unmodified 1350.6966 0.69657112 3066 Q14410 GK2 Glycerol kinase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.953 95.953 2 0.0018378 99728 QUIQUE_C1218_190116_001 78.759 0 229280000 39405000 0 23416000 31021000 23529000 39870000 43311000 0 0 0 0 28731000 0 16290 3066 15311 143016;143017;143018;143019;143020;143021;143022 182106;182107;182108;182109;182110;182111;182112;182113 182106 7 GILDKEEAEAIKR Unmodified 1470.8042 0.80420731 3717 Q8WXD2 SCG3 Secretogranin-3 yes yes 0 0 2 1 1 45.638 45.638 3 0.029246 42461 QUIQUE_C1438_190116_001 70.622 34.976 74482000 34972000 0 0 0 39510000 0 0 0 0 0 0 0 0 16291 3717 15312 143023;143024 182114;182115 182115 1 GILEQGWQADSTTR Unmodified 1560.7532 0.75323437 925 E9PGT6;Q99627;H7C3S9 COPS8 COP9 signalosome complex subunit 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.608 78.608 2 1.1147E-14 78755 QUIQUE_C1403_190116_001 148.28 129.5 6840000000 757520000 0 0 1038100000 861610000 0 992580000 541250000 589470000 0 712490000 656790000 690230000 16292 925 15313 143025;143026;143027;143028;143029;143030;143031;143032;143033 182116;182117;182118;182119;182120;182121;182122;182123;182124;182125 182117 10 GILFVGSGVSGGEEGAR Unmodified 1590.8002 0.80018457 2602 P52209;K7EM49;K7EPF6;K7EMN2 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 87.434 87.434 2 7.7774E-07 88827 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.49 80.373 7162200000 0 522280000 640560000 662640000 547140000 476880000 516960000 681030000 1036800000 309290000 546660000 525470000 696470000 16293 2602 15314 143034;143035;143036;143037;143038;143039;143040;143041;143042;143043;143044;143045;143046;143047;143048 182126;182127;182128;182129;182130;182131;182132;182133;182134;182135;182136;182137;182138;182139;182140;182141 182141 16 GILGNAIK Unmodified 784.48069 0.48068833 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969;K7EJ20;A0A0A0MTT1 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 42.82 42.82 2 0.021335 40134 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.311 6.9123 248890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 248890000 0 0 16294 23 15315 143049 182142 182142 1 GILGYTEHQVVSSDFNSDTHSSTFDAGAGIALNDHFVK Unmodified 4035.8875 0.88750261 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 83 90 117 91 89 89 93 96 102 44 110 106 105 151.98 151.98 3;4;5 0 128071 QUIQUE_C1218_190116_001 253.11 240.61 279940000000 17729000000 22831000000 26897000000 18987000000 14428000000 14423000000 21058000000 23642000000 23345000000 5866800000 38155000000 26454000000 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182153 1759 GILLFGPPGTGK Unmodified 1155.6652 0.66519463 4507;1625 Q9UN37;O75351 VPS4A;VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4A;Vacuolar protein sorting-associated protein 4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 102.97 102.97 2 0.00046173 107508 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.29 96.934 1586500000 108340000 121460000 109900000 105420000 123600000 109460000 129610000 112000000 108350000 50840000 154790000 195180000 157600000 16296 4507;1625 15317 144265;144266;144267;144268;144269;144270;144271;144272;144273;144274;144275;144276;144277;144278 184005;184006;184007;184008;184009;184010;184011;184012;184013;184014;184015;184016;184017;184018;184019;184020;184021;184022;184023;184024;184025;184026;184027;184028 184024 24 GILLFGTK Unmodified 847.51674 0.51673948 2539 P49748;K7EQP4;J3QKU9 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.918 86.918 2 0.0036323 84530 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.54 78.589 1469800000 136220000 87861000 143120000 83156000 101400000 107420000 93688000 103160000 154350000 67450000 156510000 105230000 130200000 16297 2539 15318 144279;144280;144281;144282;144283;144284;144285;144286;144287;144288;144289;144290;144291 184029;184030;184031;184032;184033;184034;184035;184036;184037;184038;184039;184040;184041;184042;184043;184044;184045;184046 184041 18 GILLITGR Unmodified 841.53854 0.53853756 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 73.405 73.405 2 0.048788 74067 QUIQUE_C1218_190116_001 55.902 18.927 104910000 37916000 30545000 0 0 0 0 0 36452000 0 0 0 0 0 16298 2377 15319 144292;144293;144294 184047;184048;184049 184047 3 GILLYGPPGCGK Unmodified 1230.6431 0.64307898 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.93 76.93 2 0.0013988 78184 QUIQUE_C1277_190116_001 81.594 58.854 8731800000 811830000 929670000 719790000 691800000 703340000 626480000 901020000 421920000 473090000 260000000 698670000 738030000 756200000 16299 1245 15320 144295;144296;144297;144298;144299;144300;144301;144302;144303;144304;144305;144306;144307 184050;184051;184052;184053;184054;184055;184056;184057;184058;184059;184060;184061;184062;184063;184064;184065;184066;184067;184068;184069;184070;184071;184072;184073;184074 184052 25 GILPGVSPLALHIK Unmodified 1413.8708 0.87077073 189 H3BUD4;A0A0A0MT40;Q15111 PLCL1 Phosphoinositide phospholipase C;Inactive phospholipase C-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 104.42 104.42 3 0.0065184 108589 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.527 40.746 56766000 4983000 0 0 0 0 0 0 10141000 0 0 13796000 10726000 17120000 16300 189 15321 144308;144309;144310;144311;144312 184075;184076;184077;184078;184079 184077 5 GILQYVAR Unmodified 918.5287 0.52870115 321 A0A0U1RRL8;Q8TB22;H0Y9W3 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 1 1 1 72.291 72.291 2 0.018746 72796 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.454 45.715 83776000 0 0 0 0 0 0 0 0 26378000 0 36441000 20957000 0 16301 321 15322 144313;144314;144315;144316 184080;184081;184082;184083;184084 184082 5 GILSCEASAVPMAEFQWFK Unmodified 2170.0227 0.022732637 3092 Q14982 OPCML Opioid-binding protein/cell adhesion molecule yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 157.02 157.02 2;3 3.7949E-06 164037 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.13 117.8 1033400000 0 177400000 166300000 139200000 111390000 96227000 32772000 0 0 0 121210000 81307000 107600000 16302 3092 15323 144317;144318;144319;144320;144321;144322;144323;144324;144325;144326 184085;184086;184087;184088;184089;184090;184091;184092;184093;184094 184092 10 GILSCEASAVPMAEFQWFKEETR Unmodified 2685.2567 0.25670833 3092 Q14982 OPCML Opioid-binding protein/cell adhesion molecule yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 146.3 146.3 3 1.6612E-07 151422 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.112 67.308 231740000 0 0 0 0 0 0 0 47252000 30031000 0 49034000 58536000 46888000 16303 3092 15324 144327;144328;144329;144330;144331 184095;184096;184097;184098;184099;184100 184100 6 GILSGTSDLLLTFDEAEVR Unmodified 2035.0474 0.047350708 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 2 1 2 2 3 3 2 1 2 1 2 1 2 159 159 2;3 6.0231E-100 164898 QUIQUE_C1576_190116_001 211.06 180.86 1039200000 109330000 21997000 131300000 81527000 172490000 125040000 123630000 13960000 69010000 27031000 28352000 59419000 76090000 16304 2135 15325 144332;144333;144334;144335;144336;144337;144338;144339;144340;144341;144342;144343;144344;144345;144346;144347;144348;144349;144350;144351;144352;144353;144354;144355 184101;184102;184103;184104;184105;184106;184107;184108;184109;184110;184111;184112;184113;184114;184115;184116;184117;184118;184119;184120;184121;184122;184123;184124;184125;184126;184127;184128;184129 184118 26 GILSGTSDLLLTFDEAEVRK Unmodified 2163.1423 0.14231373 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.6 141.6 3 3.052E-31 147038 QUIQUE_C1368_190116_001 120.92 101.88 933400000 0 41247000 34117000 37275000 81378000 0 71681000 134120000 157680000 13113000 118700000 124260000 119830000 16305 2135 15326 144356;144357;144358;144359;144360;144361;144362;144363;144364;144365;144366 184130;184131;184132;184133;184134;184135;184136;184137;184138;184139;184140;184141 184131 12 GILSLIQSSTR Unmodified 1173.6717 0.67173657 4109;162 A0A0A0MS29;H7C433;E9PQX8;Q9GZY8 MFF Mitochondrial fission factor no no 0 0 0 1 1 107.03 107.03 2 0.002588 110271 QUIQUE_C1403_190116_001 99.855 61.769 114290000 0 0 0 54116000 0 0 0 0 60173000 0 0 0 0 16306 162;4109 15327 144367;144368 184142;184143 184142 0 GILTVDELLAIR Unmodified 1311.7762 0.77620165 2054 P13473 LAMP2 Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.14 146.14 2 8.9968E-11 152253 QUIQUE_C1218_190116_001 186.25 136.83 1465200000 154220000 184690000 151660000 0 0 0 180490000 115570000 226940000 54903000 165420000 110510000 120790000 16307 2054 15328 144369;144370;144371;144372;144373;144374;144375;144376;144377;144378 184144;184145;184146;184147;184148;184149;184150;184151;184152;184153;184154;184155;184156;184157 184145 10 GILVASNPR Unmodified 925.53451 0.53451481 2850 Q00978;H0YMB0 IRF9 Interferon regulatory factor 9 yes no 0 0 0 1 1 30.255 30.255 2 0.019489 24680 QUIQUE_C1368_190116_001 63.565 31.095 62796000 0 0 42219000 20577000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16308 2850 15329 144379;144380 184158;184159 184158 2 GILVFQLK Unmodified 916.57459 0.57458871 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02;H0Y7R8 MLLT4 Afadin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.83 102.83 2 0.021335 105768 QUIQUE_C1403_190116_001 75.311 36.94 57420000 0 10403000 9007600 12947000 0 0 0 9944800 0 0 0 0 15118000 16309 1258 15330 144381;144382;144383;144384;144385;144386;144387;144388 184160;184161;184162;184163;184164;184165;184166;184167;184168 184163 9 GIMESPIVR Unmodified 1000.5376 0.53755128 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;Q14168;A0A087WVY2;E5RK50;E5RJK0;E5RK44;E5RI32;E5RIU3;A0A087X0C7;E5RFN8 MPP2 MAGUK p55 subfamily member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 58.487 58.487 2 0.019221 56644 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.418 56.766 249980000 0 77605000 65981000 0 0 0 0 57573000 0 0 0 0 48826000 16310 159 15331 144389;144390;144391;144392 184169;184170;184171;184172 184172 2 GIMGEDTYPYQGK Oxidation (M) 1473.6446 0.64459513 91 A0A087X0D5;P09668;E9PKT6 CTSH Pro-cathepsin H;Cathepsin H mini chain;Cathepsin H;Cathepsin H heavy chain;Cathepsin H light chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.652 45.652 2 0.0001384 42386 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.7 109.38 184910000 0 0 0 0 0 16924000 28512000 0 56339000 33639000 49498000 0 0 16311 91 15332 144393;144394;144395;144396;144397;144398;144399;144400;144401;144402 184173;184174;184175;184176;184177;184178;184179;184180;184181;184182;184183 184179 64 11 GIMGEDTYPYQGK Unmodified 1457.6497 0.6496805 91 A0A087X0D5;P09668;E9PKT6 CTSH Pro-cathepsin H;Cathepsin H mini chain;Cathepsin H;Cathepsin H heavy chain;Cathepsin H light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.344 68.344 2 5.3237E-05 67124 QUIQUE_C1563_190116_001 114.5 96.228 801400000 47219000 49083000 73679000 60495000 0 37831000 71508000 54250000 115060000 39180000 129010000 74201000 49885000 16312 91 15332 144403;144404;144405;144406;144407;144408;144409;144410;144411;144412;144413;144414 184184;184185;184186;184187;184188;184189;184190;184191;184192;184193;184194;184195;184196 184188 9 GINTLVTYDMVPEPK Oxidation (M) 1691.844 0.84402321 2170 P20674;H3BNX8 COX5A Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.797 92.797 2 6.5284E-09 95919 QUIQUE_C1218_190116_001 127.37 106.71 1395300000 186160000 166510000 198740000 0 116550000 0 144400000 79188000 118500000 0 136610000 116400000 132270000 16313 2170 15333 144415;144416;144417;144418;144419;144420;144421;144422;144423;144424 184197;184198;184199;184200;184201;184202;184203;184204;184205;184206;184207;184208;184209;184210;184211;184212;184213;184214 184197 1519 18 GINTLVTYDMVPEPK Unmodified 1675.8491 0.84910859 2170 P20674;H3BNX8 COX5A Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 110.67 110.67 2 3.194E-06 113544 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.08 112.33 5280500000 630340000 577640000 478640000 245930000 348430000 382570000 445850000 307160000 342290000 97771000 546580000 402050000 475230000 16314 2170 15333 144425;144426;144427;144428;144429;144430;144431;144432;144433;144434;144435;144436;144437;144438 184215;184216;184217;184218;184219;184220;184221;184222;184223;184224;184225;184226;184227;184228;184229;184230;184231;184232;184233;184234 184227 20 GIPAPEEER Unmodified 996.48762 0.4876242 1730 O95433;G3V438;H0YJU2 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 24.514 24.514 2 0.021719 18557 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.962 37.068 139650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 139650000 16315 1730 15334 144439 184235 184235 1 GIPATPR Unmodified 710.40752 0.40752338 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 19.11 19.11 2 0.02784 12205 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.692 40.461 121450000 28960000 0 0 22187000 0 0 0 37839000 0 0 0 0 32464000 16316 2377 15335 144440;144441;144442;144443 184236;184237;184238;184239 184238 4 GIPEFWFTIFR Unmodified 1411.7289 0.72885752 3972 Q99733;C9JZI7;C9J6D1;A8MXH2;H0YCI4 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 168.17 168.17 2 0.00044829 174299 QUIQUE_C1438_190116_001 102.61 84.744 561960000 50522000 87479000 0 58835000 124980000 0 217740000 0 0 22398000 0 0 0 16317 3972 15336 144444;144445;144446;144447;144448;144449 184240;184241;184242;184243;184244;184245 184243 5 GIPEFWLTVFK Unmodified 1335.7227 0.72270951 1010;1033 F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;F8W020;F8W0J6;H0YH88;H0YHC3;F8VXI6;F8VUX1;F8W118;F8VV59;B7Z9C2 NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.57 161.57 2 0.00044829 166553 QUIQUE_C1368_190116_001 102.61 79.18 3921000000 268300000 263830000 200300000 172490000 307360000 220250000 349650000 248180000 434590000 114550000 520420000 446710000 374350000 16318 1010;1033 15337 144450;144451;144452;144453;144454;144455;144456;144457;144458;144459;144460;144461;144462 184246;184247;184248;184249;184250;184251;184252;184253;184254;184255;184256;184257;184258;184259;184260;184261;184262;184263 184248 18 GIPHLVTHDAR Unmodified 1214.652 0.65200419 2757 P62701;C9JEH7;P22090;Q8TD47 RPS4X;RPS4Y1;RPS4Y2 40S ribosomal protein S4, X isoform;40S ribosomal protein S4, Y isoform 1;40S ribosomal protein S4, Y isoform 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 19.977 19.977 3 0.0080065 12660 QUIQUE_C1277_190116_001 62.408 46.03 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16319 2757 15338 144463;144464;144465;144466;144467 184264;184265;184266;184267;184268 184264 5 GIPLESTDGER Unmodified 1172.5673 0.56733108 347 A0A1B0GW37;A0A1B0GU97;S4R308;K7ESG9;K7EKH0;U3KPY9;K7EJB0;S4R3K4;A0A087WXP2;Q5W0Y9;B1AKN6;C9JWJ8;U3KQE8;A0A1B0GWJ4;A0A0A0MRX8;K7EN08;B1AKN7;A0A1B0GWI9;Q5VW27;B1AKN5;A0A286YEX4;B1AKN8;Q5VW30;A0A2R8Y7V8;Q5VW26;O00712;Q14938;P08651;Q12857 NFIA;NFIX;NFIB;NFIC Nuclear factor 1;Nuclear factor 1 B-type;Nuclear factor 1 X-type;Nuclear factor 1 C-type;Nuclear factor 1 A-type yes no 0 0 0 2 39.183 39.183 2 0.033669 34949 QUIQUE_C1563_190116_001 56.013 37.283 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16320 347 15339 144468;144469 184269;184270 184269 2 GIPNVLR Unmodified 767.46537 0.46537261 1462 O14949 UQCRQ Cytochrome b-c1 complex subunit 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 49.329 49.329 2 0.049861 46384 QUIQUE_C1563_190116_001 74.832 20.295 311070000 0 0 0 0 0 46488000 0 0 132960000 0 0 131630000 0 16321 1462 15340 144470;144471;144472 184271;184272;184273 184271 3 GIPVLVGLLDHPK Unmodified 1356.8129 0.8129215 759 C9JZR2;O60716;E9PKY0 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 111.36 111.36 3 0.00012286 115109 QUIQUE_C1218_190116_001 69.229 57.363 63901000 48305000 0 0 0 0 0 0 0 0 15596000 0 0 0 16322 759 15341 144473;144474;144475;144476;144477 184274;184275;184276;184277;184278;184279 184274 6 GIQAEEILQTYLK Unmodified 1504.8137 0.81370936 2350 P32455;Q9H0R5;H3BNS1 GBP1;GBP3 Interferon-induced guanylate-binding protein 1;Guanylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 135.62 135.62 2 0.034209 140455 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.781 58.809 33245000 0 0 0 0 0 0 0 0 33245000 0 0 0 0 16323 2350 15342 144478 184280 184280 0 GIQEEMEALVK Oxidation (M) 1261.6224 0.62240312 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.767 55.767 2 0.00048616 53961 QUIQUE_C1277_190116_001 116.05 77.088 5144200000 585310000 839700000 0 0 739600000 663130000 650330000 400550000 0 578590000 686960000 0 0 16324 365 15343 144479;144480;144481;144482;144483;144484;144485;144486 184281;184282;184283;184284;184285;184286;184287;184288 184282 260 7 GIQEEMEALVK Unmodified 1245.6275 0.6274885 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 4 1 1 117.49 117.49 1;2;3 2.3215E-12 123261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 161.79 121.52 66768000000 5630600000 5880100000 6514200000 5189300000 5220900000 4846500000 5795400000 3353100000 4365000000 2868800000 6224400000 4932600000 5947400000 16325 365 15343 144487;144488;144489;144490;144491;144492;144493;144494;144495;144496;144497;144498;144499;144500;144501;144502;144503;144504 184289;184290;184291;184292;184293;184294;184295;184296;184297;184298;184299;184300;184301;184302;184303;184304;184305;184306;184307;184308;184309;184310;184311;184312;184313;184314;184315;184316;184317;184318;184319;184320;184321;184322;184323;184324;184325;184326;184327;184328;184329;184330;184331;184332;184333;184334 184325 45 GIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFK Oxidation (M) 2870.3983 0.39828719 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 1 1 4 1 147.05 147.05 3;4 2.4524E-17 157634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.41 84.054 456410000 0 0 0 0 0 0 0 298290000 0 0 158120000 0 0 16326 365 15344 144505;144506;144507;144508;144509 184335;184336;184337;184338;184339 184337 256;260 4 GIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFK Unmodified 2854.4034 0.40337257 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 1 2 163.37 163.37 3;4 4.9079E-07 170821 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.145 48.965 143180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 143180000 0 0 16327 365 15344 144510;144511 184340;184341 184341 2 GIQEIADSVK Unmodified 1058.5608 0.56078914 1399 O00330;H0YD97 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 62.055 62.055 2 0.011682 58969 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.962 31.344 645840000 0 0 0 0 240270000 0 0 0 0 75355000 330210000 0 0 16328 1399 15345 144512;144513;144514 184342;184343;184344 184343 3 GIQMLWHPSIVK Unmodified 1407.7697 0.76967648 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 92.36 92.36 3 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1.185E-24 132195 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.887 84.541 1211700000 151670000 123390000 129000000 147590000 0 0 0 141540000 181650000 98689000 64302000 173840000 0 16332 4123 15349 144521;144522;144523;144524;144525;144526;144527;144528;144529 184351;184352;184353;184354;184355;184356;184357;184358;184359;184360;184361 184358 2866 11 GIQTSDPNAVVMGLAPEHFHYQILNQAFR Unmodified 3252.6139 0.61385113 4123 Q9H0R4;K7ER15;K7EQD2;K7EMY7 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134 134 3 3.0781E-78 138288 QUIQUE_C1277_190116_001 158.94 152.97 1181500000 80362000 115000000 121650000 131480000 85005000 0 104360000 95414000 97716000 0 114910000 99899000 135710000 16333 4123 15349 144530;144531;144532;144533;144534;144535;144536;144537;144538;144539;144540 184362;184363;184364;184365;184366;184367;184368;184369;184370;184371;184372;184373;184374;184375;184376;184377;184378;184379;184380 184365 19 GIRPAINVGLSVSR Unmodified 1437.8416 0.84159587 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 3 2 2 2 2 2 65.078 65.078 2;3 1.3383E-70 64689 QUIQUE_DMIX3_190116_001 191.52 157.65 19919000000 1800500000 1670500000 1365200000 1050200000 929590000 634790000 1335700000 2840900000 2487000000 709660000 1826700000 1539800000 1728200000 16334 2243 15350 144541;144542;144543;144544;144545;144546;144547;144548;144549;144550;144551;144552;144553;144554;144555;144556;144557;144558;144559;144560;144561;144562;144563;144564;144565;144566 184381;184382;184383;184384;184385;184386;184387;184388;184389;184390;184391;184392;184393;184394;184395;184396;184397;184398;184399;184400;184401;184402;184403;184404;184405;184406;184407;184408;184409;184410;184411;184412;184413;184414;184415;184416;184417;184418;184419;184420;184421;184422;184423;184424;184425;184426;184427;184428 184414 40 GIRPGLTTVLAR Unmodified 1252.7616 0.76155464 4306 Q9NVH1;B1AK20;Q5TH61 DNAJC11 DnaJ homolog subfamily C member 11 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.558 54.558 3 0.00089457 50766 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.64 38.523 332090000 36146000 37054000 31829000 49513000 0 29938000 25915000 38766000 38054000 17058000 0 27816000 0 16335 4306 15351 144567;144568;144569;144570;144571;144572;144573;144574;144575;144576 184429;184430;184431;184432;184433;184434;184435;184436;184437;184438 184437 7 GISAFLVPMPTPGLTLGK Unmodified 1798.0063 0.0062779369 2105 P16219 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.67 151.67 2 0.0021832 157870 QUIQUE_C1576_190116_001 95.138 70.285 595770000 0 0 0 0 0 0 140840000 146610000 205630000 0 102680000 0 0 16336 2105 15352 144577;144578;144579;144580 184439;184440;184441;184442;184443 184439 4 GISAFLVPMPTPGLTLGK Oxidation (M) 1814.0012 0.001192559 2105 P16219 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 136.62 136.62 2 0.00042811 139624 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.986 65.081 28874000 0 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 1803.9003 0.90029254 362 A0A1B0GWA2;A0A2R8YEL0;O00116;B8ZZ81 AGPS Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 139.93 139.93 2 0.017419 144933 QUIQUE_C1218_190116_001 51.064 38.796 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16343 362 15356 144650 184528 184528 1 GISEDSHLESLQDVGQSAAPTFMISPETVTGTGK Unmodified 3488.6617 0.66170834 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 134.33 134.33 3 3.4643E-65 138765 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.81 129.9 598310000 0 0 0 54255000 83181000 74101000 0 0 219690000 30197000 57388000 79493000 0 16344 880 15357 144651;144652;144653;144654;144655;144656;144657 184529;184530;184531;184532;184533;184534;184535;184536 184533 8 GISEDSHLESLQDVGQSAAPTFMISPETVTGTGK Oxidation (M) 3504.6566 0.65662296 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 1 0 1 126.21 126.21 3 1.1446E-38 130764 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.405 91.961 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184571;184572;184573;184574;184575;184576;184577;184578;184579;184580;184581;184582;184583;184584;184585;184586;184587 184571 15 GISLNPEQWSQLK Unmodified 1498.778 0.77799256 2637 P53999 SUB1 Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.16 116.16 2 0.00038486 118908 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.791 68.853 1381700000 120760000 0 0 134860000 158350000 195690000 0 127640000 177000000 0 153540000 149650000 164180000 16350 2637 15362 144707;144708;144709;144710;144711;144712;144713;144714;144715;144716;144717;144718;144719 184588;184589;184590;184591;184592;184593;184594;184595;184596;184597;184598;184599;184600;184601;184602;184603;184604;184605;184606;184607;184608;184609;184610 184596 23 GISLNPEQWSQLKEQISDIDDAVR Unmodified 2740.3668 0.36678737 2637 P53999 SUB1 Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15 yes yes 0 0 1 1 147.66 147.66 3 0.016608 152843 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.956 37.523 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16351 2637 15363 144720 184611 184611 1 GISNMLDVNGLFTLSHITQLVLSHNK Unmodified 2850.5062 0.50619816 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 165.52 165.52 4 7.1075E-30 167286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.46 115.35 195370000 69519000 0 0 0 0 0 0 50679000 75174000 0 0 0 0 16352 3136 15364 144721;144722;144723;144724 184612;184613;184614;184615 184614 4 GISPVPINLR Unmodified 1064.6342 0.63422886 2893;269;2569 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;P50570 DNM1;DNM2 Dynamin-1;Dynamin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.593 78.593 2 5.1427E-05 79406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.12 67.908 12926000000 1318400000 1309800000 1168300000 0 1147800000 1033600000 1159600000 859440000 774250000 434550000 1390500000 1097800000 1232500000 16353 269;2893;2569 15365 144725;144726;144727;144728;144729;144730;144731;144732;144733;144734;144735;144736 184616;184617;184618;184619;184620;184621;184622;184623;184624;184625;184626;184627;184628 184622 12 GISPVVSEHR Unmodified 1079.5724 0.57235688 427 H0YH87;A0A2R8Y7P6;A0A2R8YDM9;F8VQP2;F8WB06;V9GY86;A0A2R8Y5A6;Q99700;F8W0B5 ATXN2 Ataxin-2 yes no 0 0 0 1 29.047 29.047 2 0.033996 23556 QUIQUE_C1368_190116_001 53.166 26.564 29390000 0 0 29390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16354 427 15366 144737 184629 184629 1 GISQEQMNEFR Oxidation (M) 1353.5983 0.59831364 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;H0YJW3;H0YJ11;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 1 0 1 1 1 31.996 31.996 2 0.0057528 26966 QUIQUE_C1277_190116_001 97.857 74.429 158170000 0 85851000 0 0 72320000 0 0 0 0 0 0 0 0 16355 1242;2047 15367 144738;144739;144740 184630;184631;184632 184630 713 2 GISQEQMQEFR Oxidation (M) 1367.614 0.6139637 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.929 31.929 2 1.1856E-05 27041 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.66 106.57 1271800000 103400000 100500000 0 93994000 137500000 0 113290000 94029000 125620000 61392000 202190000 116230000 123640000 16356 1228;1544 15368 144741;144742;144743;144744;144745;144746;144747;144748;144749;144750;144751 184633;184634;184635;184636;184637;184638;184639;184640;184641;184642;184643 184639 703 11 GISQEQMQEFR Unmodified 1351.619 0.61904908 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.274 56.274 2 5.1885E-24 55535 QUIQUE_C1218_190116_001 204.7 130.57 3120700000 276170000 266560000 270970000 290160000 309120000 219850000 244400000 178180000 177340000 77606000 328410000 241710000 240200000 16357 1228;1544 15368 144752;144753;144754;144755;144756;144757;144758;144759;144760;144761;144762;144763;144764 184644;184645;184646;184647;184648;184649;184650;184651;184652;184653;184654;184655;184656;184657;184658;184659;184660;184661;184662;184663 184644 20 GISQTNLITTVTPEK Unmodified 1600.8672 0.8672015 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3KT37;A0A0J9YW26;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.028 79.028 2 1.5467E-12 80152 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.48 124.89 4521900000 389030000 354830000 375700000 412800000 309120000 411620000 399040000 374170000 311220000 161660000 301720000 272530000 448430000 16358 143;560;4559 15369 144765;144766;144767;144768;144769;144770;144771;144772;144773;144774;144775;144776;144777 184664;184665;184666;184667;184668;184669;184670;184671;184672;184673;184674;184675;184676;184677;184678;184679;184680;184681;184682;184683;184684;184685;184686 184677 23 GISQTNLITTVTPEKK Unmodified 1728.9622 0.96216452 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;A0A0J9YW26;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 59.225 59.225 2 0.0018785 58165 QUIQUE_C1576_190116_001 85.845 56.078 212430000 25496000 0 30039000 25265000 0 0 35466000 38538000 30405000 0 0 27224000 0 16359 143;560;4559 15370 144778;144779;144780;144781;144782;144783;144784 184687;184688;184689;184690;184691;184692;184693 184690 7 GISSIPINLR Unmodified 1068.6291 0.62914348 4528;840 E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.376 81.376 2 0.0013563 82318 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.629 72.735 579030000 0 0 0 93074000 0 0 117380000 103260000 0 0 0 156630000 108690000 16360 840;4528 15371 144785;144786;144787;144788;144789;144790 184694;184695;184696;184697;184698;184699 184698 3 GISSSNEGVEEPSK Unmodified 1418.6525 0.65251728 4329 Q9NXV6 CDKN2AIP CDKN2A-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 22.959 22.959 2 0.00012731 16258 QUIQUE_C1403_190116_001 112.13 75.432 36955000 0 0 0 21955000 0 0 0 0 0 0 0 15000000 0 16361 4329 15372 144791;144792;144793 184700;184701;184702 184700 3 GISVHISNAEPK Unmodified 1250.6619 0.66190017 2968 Q13148;B1AKP7;G3V162;A0A087X260;A0A087WYY0;A0A087WX29;A0A1W2PNU8;A0A087WXQ5;A0A087WV68;A0A087WW61;A0A087WX67;A0A087WXV3;A0A087WYE7;A0A087WZC9;A0A087WTZ4;K7EL26 TARDBP TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 30.49 30.49 2;3 0.00052755 26109 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.34 77.534 826720000 0 85197000 0 0 0 120150000 0 63561000 68224000 0 321320000 95890000 72387000 16362 2968 15373 144794;144795;144796;144797;144798;144799;144800;144801 184703;184704;184705;184706;184707;184708;184709;184710;184711;184712 184705 10 GITAFIVEK Unmodified 976.55933 0.55933258 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YLC3;H0YKV0 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.885 76.885 2 0.0037167 77945 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.657 64.055 1259100000 0 80949000 90208000 0 101290000 51685000 85012000 129470000 182530000 16174000 201920000 166610000 153280000 16363 192 15374 144802;144803;144804;144805;144806;144807;144808;144809;144810;144811;144812 184713;184714;184715;184716;184717;184718;184719;184720;184721;184722;184723;184724;184725;184726;184727;184728 184723 15 GITALQADIK Unmodified 1028.5866 0.58660996 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 58.758 58.758 2 0.0058045 58478 QUIQUE_C1438_190116_001 76.221 40.866 98750000 0 0 0 0 32614000 0 0 0 0 0 33175000 32962000 0 16364 3675 15375 144813;144814;144815 184729;184730;184731 184729 3 GITENVLDK Unmodified 987.52368 0.52367535 3812 Q96BW5;A0A0A0MSI3 PTER Phosphotriesterase-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.267 45.267 2 0.039144 42013 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.753 16.222 70925000 0 29812000 0 0 0 0 0 23862000 0 17251000 0 0 0 16365 3812 15376 144816;144817;144818;144819 184732;184733;184734;184735;184736 184735 5 GITFDSGGISIK Unmodified 1193.6292 0.62920306 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.567 99.567 2 6.6745E-07 102146 QUIQUE_DMIX7_190116_001 142.43 90.573 3053100000 0 213750000 315570000 373570000 197830000 255270000 183040000 372140000 303110000 153710000 272380000 201210000 211530000 16366 2282 15377 144820;144821;144822;144823;144824;144825;144826;144827;144828;144829;144830;144831;144832 184737;184738;184739;184740;184741;184742;184743;184744;184745;184746;184747;184748;184749;184750;184751;184752;184753;184754;184755;184756 184753 20 GITGVDLFGTTDAVVK Unmodified 1591.8457 0.84573777 2630 P53621;A0A3B3IS84;A0A3B3IT15;A0A3B3ISC6;A0A3B3ITV3;A0A3B3ISK1;A0A3B3IU78 COPA Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 0 1 121.96 121.96 2 0.0074474 125592 QUIQUE_C1403_190116_001 78.903 50.698 59194000 0 0 0 59194000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16367 2630 15378 144833 184757 184757 0 GITGVEDKESWHGKPLPK Unmodified 1977.032 0.031975415 2288 P29401;A0A0B4J1R6;E9PFF2 TKT Transketolase yes no 0 0 2 1 3 4 3 3 3 2 3 4 2 4 2 4 34.565 34.565 2;3;4;5 5.223E-67 30109 QUIQUE_DMIX3_190116_001 193.06 164.74 10838000000 76211000 743570000 633690000 643730000 834610000 566540000 720530000 1203600000 1212000000 326120000 1483500000 986360000 1407500000 16368 2288 15379 144834;144835;144836;144837;144838;144839;144840;144841;144842;144843;144844;144845;144846;144847;144848;144849;144850;144851;144852;144853;144854;144855;144856;144857;144858;144859;144860;144861;144862;144863;144864;144865;144866;144867;144868;144869;144870;144871 184758;184759;184760;184761;184762;184763;184764;184765;184766;184767;184768;184769;184770;184771;184772;184773;184774;184775;184776;184777;184778;184779;184780;184781;184782;184783;184784;184785;184786;184787;184788;184789;184790;184791;184792;184793;184794;184795;184796;184797;184798;184799;184800;184801;184802;184803;184804;184805;184806;184807;184808;184809;184810;184811;184812;184813;184814;184815;184816;184817;184818 184797 59 GITHIGYTDLPSR Unmodified 1428.7361 0.73612775 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.104 57.104 3 1.4225E-06 55908 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.34 91.958 2559600000 214280000 135330000 224490000 181980000 82052000 229430000 184180000 193910000 270630000 102790000 258550000 189850000 292160000 16369 2993 15380 144872;144873;144874;144875;144876;144877;144878;144879;144880;144881;144882;144883;144884 184819;184820;184821;184822;184823;184824;184825;184826;184827;184828;184829;184830;184831;184832;184833;184834 184830 14 GITINAAHVEYSTAAR Unmodified 1672.8533 0.85328277 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 56.787 56.787 2;3 1.6896E-44 55481 QUIQUE_C1576_190116_001 199.31 177.12 10553000000 607880000 802430000 1013600000 668960000 720510000 703310000 864100000 730210000 869770000 244880000 1044100000 904780000 1379000000 16370 2529 15381 144885;144886;144887;144888;144889;144890;144891;144892;144893;144894;144895;144896;144897;144898;144899;144900;144901;144902;144903;144904;144905;144906;144907;144908;144909;144910 184835;184836;184837;184838;184839;184840;184841;184842;184843;184844;184845;184846;184847;184848;184849;184850;184851;184852;184853;184854;184855;184856;184857;184858;184859;184860;184861;184862;184863 184850 28 GITLHPELFSIDNGLLTPTMK Unmodified 2296.2137 0.21370453 2354 P33121;E7EPM6;B7Z3Z9;H0Y9U7 ACSL1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 140.93 140.93 3 3.9108E-08 145586 QUIQUE_C1403_190116_001 96.379 88.29 91970000 0 0 0 35150000 0 0 0 0 0 0 42486000 0 14334000 16371 2354 15382 144911;144912;144913 184864;184865;184866 184864 3 GITNLCVIGGDGSLTGADTFR Unmodified 2123.0317 0.031717419 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 2 1 1 125.23 125.23 2;3 0 129822 QUIQUE_C1563_190116_001 311 284.37 5180200000 449770000 476440000 448540000 482720000 410880000 475130000 408340000 335850000 379630000 187050000 450110000 343590000 332110000 16372 452 15383 144914;144915;144916;144917;144918;144919;144920;144921;144922;144923;144924;144925;144926;144927;144928;144929;144930;144931;144932;144933 184867;184868;184869;184870;184871;184872;184873;184874;184875;184876;184877;184878;184879;184880;184881;184882;184883;184884;184885;184886;184887;184888;184889;184890;184891;184892;184893;184894;184895;184896;184897;184898;184899;184900;184901;184902;184903;184904;184905;184906 184884 39 GITNLCVIGGDGSLTGANLFR Unmodified 2134.0841 0.08408734 2861 Q01813;Q5VSR5;V9GYV7 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 3 2 2 1 2 1 3 2 2 1 2 3 1 142.42 142.42 2;3 8.8601E-233 148211 QUIQUE_C1576_190116_001 262.92 231.32 7093200000 680820000 671340000 830530000 451500000 701170000 418530000 698060000 429940000 523730000 148910000 174580000 872300000 491810000 16373 2861 15384 144934;144935;144936;144937;144938;144939;144940;144941;144942;144943;144944;144945;144946;144947;144948;144949;144950;144951;144952;144953;144954;144955;144956;144957;144958 184907;184908;184909;184910;184911;184912;184913;184914;184915;184916;184917;184918;184919;184920;184921;184922;184923;184924;184925;184926;184927;184928;184929;184930;184931;184932;184933;184934;184935;184936 184921 28 GITQEQMNEFR Unmodified 1351.619 0.61904908 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.561 58.561 2 0.00045729 57085 QUIQUE_C1277_190116_001 123.86 89.473 438420000 67513000 64005000 49829000 59801000 0 31107000 45829000 28058000 41925000 0 0 50351000 0 16374 2381 15385 144959;144960;144961;144962;144963;144964;144965;144966;144967;144968;144969 184937;184938;184939;184940;184941;184942;184943;184944;184945;184946;184947 184938 11 GITSFLVDR Unmodified 1006.5447 0.54474515 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.257 91.257 2 0.00040788 92769 QUIQUE_DMIX8_190116_001 134.3 40.922 448960000 48096000 57651000 66025000 0 0 46147000 63527000 28452000 47996000 19080000 0 0 71985000 16375 2470 15386 144970;144971;144972;144973;144974;144975;144976;144977;144978 184948;184949;184950;184951;184952;184953;184954;184955;184956;184957 184957 8 GITSFLVDRDTPGLHIGKPENK Unmodified 2393.2703 0.27030821 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 83.437 83.437 5 1.6003E-07 84562 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.413 63.953 48616000 0 0 0 0 0 0 0 20741000 27875000 0 0 0 0 16376 2470 15387 144979;144980 184958;184959 184958 2 GITSVVPSHQATVLLFEPSNGTLLAVMDGNVITAK Unmodified 3578.9018 0.90181945 3088 Q14894;I3L325;I3L2W5;I3NI53 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 2 3 2 2 2 157.77 157.77 3;4 1.0997E-51 162064 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.3 109.6 4121900000 116410000 146510000 196150000 313140000 163040000 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G3V158;E9PPM8;Q9Y315;E9PMH9;E9PPK3;E9PML7 DERA Deoxyribose-phosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.834 66.834 2 1.6494E-05 63996 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.21 86.335 230550000 0 0 34709000 30490000 31035000 18299000 33358000 0 34044000 0 48612000 0 0 16379 969 15389 145010;145011;145012;145013;145014;145015;145016;145017;145018;145019 184999;185000;185001;185002;185003;185004;185005;185006;185007;185008 185006 8 GITTEQLDALGCR Unmodified 1432.698 0.69802768 4064 Q9BXR0;K7ESP6;K7EJ21 QTRT1 Queuine tRNA-ribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 78.402 78.402 2 0.00044576 79300 QUIQUE_C1277_190116_001 112.13 85.456 101060000 0 32961000 0 33560000 0 0 0 0 0 0 0 34541000 0 16380 4064 15390 145020;145021;145022;145023 185009;185010;185011;185012 185009 4 GITWGEETLMEYLENPK Oxidation (M) 2024.9401 0.94010844 783 CON__P62894 yes yes 0 1 0 1 1 152.6 152.6 2 0.013186 157925 QUIQUE_C1218_190116_001 57.802 42.926 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 16381 783 15391 145024;145025 185013;185014 185013 478 2 GIVDQSQQAYQEAFEISK Unmodified 2039.98 0.97999942 2780 P63104;B0AZS6;B7Z2E6;H0YB80 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 0 4 4 4 3 3 5 3 2 2 3 4 3 3 124.43 124.43 2;3 8.581E-182 126300 QUIQUE_C1563_190116_001 318.49 299.3 72635000000 7230500000 7005100000 6543300000 6283700000 6647000000 6538100000 7537300000 3154200000 4143700000 3269400000 4784300000 4324400000 5173500000 16382 2780 15392 145026;145027;145028;145029;145030;145031;145032;145033;145034;145035;145036;145037;145038;145039;145040;145041;145042;145043;145044;145045;145046;145047;145048;145049;145050;145051;145052;145053;145054;145055;145056;145057;145058;145059;145060;145061;145062;145063;145064;145065;145066;145067;145068 185015;185016;185017;185018;185019;185020;185021;185022;185023;185024;185025;185026;185027;185028;185029;185030;185031;185032;185033;185034;185035;185036;185037;185038;185039;185040;185041;185042;185043;185044;185045;185046;185047;185048;185049;185050;185051;185052;185053;185054;185055;185056;185057;185058;185059;185060;185061;185062;185063;185064;185065;185066;185067;185068;185069;185070;185071;185072;185073;185074;185075;185076;185077;185078;185079;185080;185081;185082;185083;185084;185085;185086;185087;185088;185089;185090;185091 185048 77 GIVDQSQQAYQEAFEISKK Unmodified 2168.075 0.074962442 2780 P63104;B0AZS6;B7Z2E6;H0YB80 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 106.87 106.87 2;3 5.4073E-46 109414 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.15 144.33 17728000000 75691000 0 116000000 132390000 602690000 86440000 381320000 4347100000 3016500000 0 2169300000 3436000000 3364800000 16383 2780 15393 145069;145070;145071;145072;145073;145074;145075;145076;145077;145078;145079;145080;145081;145082;145083;145084 185092;185093;185094;185095;185096;185097;185098;185099;185100;185101;185102;185103;185104;185105;185106;185107;185108;185109;185110;185111;185112;185113;185114 185100 21 GIVEESVTGVHR Unmodified 1281.6677 0.66771383 1558;3868;1131 H0Y8B3;O43865;Q96HN2 AHCYL2;AHCYL1 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 2;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 39.799 39.799 2;3 1.1489E-22 35466 QUIQUE_C1368_190116_001 180.8 136.35 27864000000 2160000000 2051000000 2263400000 2677500000 2130500000 2279800000 2195800000 2342600000 2585700000 1367800000 2767100000 2099700000 943470000 16384 1131;1558;3868 15394 145085;145086;145087;145088;145089;145090;145091;145092;145093;145094;145095;145096;145097;145098;145099;145100;145101;145102;145103;145104;145105;145106;145107;145108;145109 185115;185116;185117;185118;185119;185120;185121;185122;185123;185124;185125;185126;185127;185128;185129;185130;185131;185132;185133;185134;185135;185136;185137;185138;185139;185140;185141;185142;185143;185144 185123 28 GIVEFASK Unmodified 849.45962 0.45961853 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 1 1 44.747 44.747 2 0.025599 42324 QUIQUE_C1438_190116_001 71.342 41.144 380260000 0 0 0 0 158940000 146540000 0 0 74784000 0 0 0 0 16385 2208 15395 145110;145111;145112;145113 185145;185146;185147;185148 185145 4 GIVEFASKPAAR Unmodified 1244.6877 0.68772099 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 1 1 1 2 1 37.914 37.914 2;3 0.003418 35026 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.89 49.999 478220000 0 0 0 0 0 0 0 114420000 70220000 0 240330000 0 53257000 16386 2208 15396 145114;145115;145116;145117;145118 185149;185150;185151;185152;185153 185149 4 GIVEFSGK Unmodified 835.44397 0.44396847 3122 Q15233;H7C367;C9IZL7 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 0 1 1 40.435 40.435 2 0.0075564 35552 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.602 59.956 170600000 0 0 84666000 0 0 0 0 0 0 85937000 0 0 0 16387 3122 15397 145119;145120 185154;185155;185156;185157 185156 4 GIVEFSGKPAAR Unmodified 1230.6721 0.67207093 3122 Q15233;H7C367;C9IZL7 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 1 2 1 32.299 32.299 2;3 0.010289 27454 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.309 68.371 368750000 0 0 0 0 0 0 0 0 234730000 0 134020000 0 0 16388 3122 15398 145121;145122;145123 185158;185159;185160 185160 1 GIVFEDVKVPK Unmodified 1229.702 0.70197407 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 69.041 69.041 3 0.0021413 69353 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.344 52.614 85655000 0 0 0 0 0 0 0 0 41104000 0 44551000 0 0 16389 666 15399 145124;145125 185161;185162 185161 2 GIVFQHPEIVAHMDLMR Unmodified 1992.0074 0.0073573444 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 102.13 102.13 4 0.0012526 104414 QUIQUE_C1403_190116_001 41.912 37.944 31505000 0 0 0 11358000 0 0 0 20147000 0 0 0 0 0 16390 2225 15400 145126;145127 185163;185164;185165 185163 3 GIVFVIQSQSNSFHAK Unmodified 1760.921 0.9209684 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 80.723 80.723 2;3 6.7372E-05 82923 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.98 92.59 103530000 0 0 0 0 0 0 0 0 66927000 0 36605000 0 0 16391 3419 15401 145128;145129 185166;185167 185167 2 GIVGVENVAELK Unmodified 1226.6871 0.68705229 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 0 0 0 1 1 1 83.274 83.274 2 0.012441 80219 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.785 41.153 31260000 0 0 0 22134000 0 0 0 0 0 9126000 0 0 0 16392 948 15402 145130;145131;145132 185168;185169;185170 185170 3 GIVGVENVAELKK Unmodified 1354.782 0.78201531 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 0 0 1 1 1 1 1 59.011 59.011 3 0.0078491 57678 QUIQUE_C1277_190116_001 43.184 25.972 81012000 40306000 0 40706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16393 948 15403 145133;145134;145135;145136 185171;185172;185173;185174 185172 3 GIVHTQAGYLLYAALTHK Unmodified 1955.0629 0.062881613 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 104.76 104.76 3;4 7.2942E-05 107705 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.316 74.153 947910000 20307000 80332000 55905000 86014000 81027000 65953000 118660000 36987000 152170000 24073000 122990000 46789000 56710000 16394 4296 15404 145137;145138;145139;145140;145141;145142;145143;145144;145145;145146;145147;145148;145149;145150;145151;145152;145153;145154;145155;145156 185175;185176;185177;185178;185179;185180;185181;185182;185183;185184;185185;185186;185187;185188;185189;185190;185191;185192;185193;185194;185195;185196;185197;185198 185193 21 GIVIATGDR Unmodified 900.50288 0.50288033 590 B1AKY9;P50993 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 31.782 31.782 2 0.0082763 26744 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.89 61.206 371990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 204800000 0 167190000 16395 590 15405 145157;145158 185199;185200 185200 1 GIVLLEELLPK Unmodified 1222.7537 0.75367529 4590 Q9Y3D6 FIS1 Mitochondrial fission 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 151.55 151.55 2 0.00014897 156583 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.36 78.321 3005300000 219970000 250510000 213340000 150980000 208360000 248220000 172310000 239560000 236230000 198980000 243360000 405080000 218450000 16396 4590 15406 145159;145160;145161;145162;145163;145164;145165;145166;145167;145168;145169;145170;145171;145172;145173 185201;185202;185203;185204;185205;185206;185207;185208;185209;185210;185211;185212;185213;185214;185215;185216;185217;185218;185219;185220;185221;185222;185223;185224;185225;185226;185227;185228;185229;185230;185231;185232;185233;185234;185235 185221 34 GIVNEQFLLQR Unmodified 1315.7248 0.72483478 2539 P49748;J3QRJ8 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.1 97.1 2 3.6504E-05 99885 QUIQUE_C1277_190116_001 138.54 120.73 2889400000 253300000 195350000 284650000 168610000 200250000 204840000 186920000 240560000 232540000 117070000 325080000 251720000 228510000 16397 2539 15407 145174;145175;145176;145177;145178;145179;145180;145181;145182;145183;145184;145185;145186 185236;185237;185238;185239;185240;185241;185242;185243;185244;185245;185246;185247;185248;185249 185237 14 GIVNGAAPELPVPTGGPAVGAR Unmodified 1999.0851 0.085073618 2175 P21281;E5RGH6;H0YAT8 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.77 102.77 2 1.6238E-20 104648 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.76 114.51 582330000 32136000 31153000 0 59698000 31244000 31686000 0 97748000 76350000 0 69210000 69784000 83317000 16398 2175 15408 145187;145188;145189;145190;145191;145192;145193;145194;145195;145196 185250;185251;185252;185253;185254;185255;185256;185257;185258;185259 185255 10 GIVSKDEITFVSGAPR Unmodified 1674.8941 0.89408495 2207 P23229;C9JXX7 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes no 0 0 1 1 1 1 76.617 76.617 3 0.004685 77967 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.237 44.041 403320000 0 0 0 0 0 0 0 114500000 155850000 0 0 0 132970000 16399 2207 15409 145197;145198;145199 185260;185261;185262 185260 3 GIVSLSDILQALVLTGGEK Unmodified 1912.0881 0.088093311 1042 F8VYY9;P54619;H0YIC9 PRKAG1 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 173.21 173.21 2;3 3.9558E-55 178329 QUIQUE_C1576_190116_001 226.23 204.59 1096200000 39673000 80512000 90688000 15872000 60154000 0 46399000 85727000 111770000 7563000 286500000 228510000 42856000 16400 1042 15410 145200;145201;145202;145203;145204;145205;145206;145207;145208;145209;145210;145211;145212;145213;145214;145215;145216;145217;145218;145219;145220 185263;185264;185265;185266;185267;185268;185269;185270;185271;185272;185273;185274;185275;185276;185277;185278;185279;185280;185281;185282;185283 185271 21 GIVSYTEK Unmodified 895.4651 0.46509784 3239 Q4J6C6;H7C0M0;H7BZP6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 26.836 26.836 2 0.023908 20656 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.875 39.946 464160000 0 0 83027000 0 0 0 123310000 0 0 0 149210000 0 108610000 16401 3239 15411 145221;145222;145223;145224 185284;185285;185286;185287;185288 185287 5 GIVTDSVR Unmodified 845.46068 0.46068117 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 26.614 26.614 2 0.023067 19762 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.637 14.95 56319000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56319000 0 0 0 16402 2075 15412 145225 185289 185289 1 GIVVLGINR Unmodified 939.58655 0.58655038 3026 Q13825 AUH Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.102 73.102 2 0.00043566 73829 QUIQUE_C1576_190116_001 118.69 84.683 950360000 82876000 89016000 68549000 69910000 66511000 62817000 82705000 62973000 81371000 46820000 77543000 85924000 73350000 16403 3026 15413 145226;145227;145228;145229;145230;145231;145232;145233;145234;145235;145236;145237;145238 185290;185291;185292;185293;185294;185295;185296;185297;185298;185299;185300;185301;185302;185303;185304;185305;185306 185299 16 GIVVTAYSPLGSPDRPWAK Unmodified 2013.0684 0.068360922 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 0 1 1 1 1 99.869 99.869 2;3 0.0032572 102472 QUIQUE_C1277_190116_001 52.298 37.208 186380000 0 70052000 38916000 0 0 0 0 0 0 77412000 0 0 0 16404 2087 15414 145239;145240;145241 185307;185308;185309;185310 185308 4 GIVVTAYSPLGSPDRPWAKPEDPSLLEDPR Unmodified 3261.667 0.66699213 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 4 2 2 119.88 119.88 3;4 1.8031E-86 125513 QUIQUE_C1218_190116_001 161.25 140.22 26277000000 1419500000 1977700000 2294800000 1551000000 1779400000 1862300000 1418800000 1846900000 2215600000 507130000 5111400000 2140600000 2151600000 16405 2087 15415 145242;145243;145244;145245;145246;145247;145248;145249;145250;145251;145252;145253;145254;145255;145256;145257;145258;145259;145260;145261;145262;145263;145264;145265;145266;145267;145268;145269;145270 185311;185312;185313;185314;185315;185316;185317;185318;185319;185320;185321;185322;185323;185324;185325;185326;185327;185328;185329;185330;185331;185332;185333;185334;185335;185336;185337;185338;185339;185340;185341;185342;185343;185344;185345;185346;185347;185348;185349;185350;185351;185352;185353;185354;185355;185356;185357;185358 185313 47 GIVVYTGDR Unmodified 978.51345 0.51344502 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.012 41.012 2 0.00013646 36670 QUIQUE_C1368_190116_001 141.78 104.76 709110000 51323000 57510000 112760000 52382000 0 45841000 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1 1 41.085 41.085 2 0.010453 37316 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.401 57.465 62190000 33923000 0 0 0 0 0 0 0 28267000 0 0 0 0 16408 363 15418 145295;145296;145297;145298;145299 185387;185388;185389;185390;185391 185391 5 GIVYDTGGLSIK Unmodified 1221.6605 0.66050319 3639 Q8NDH3;H0YEP3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 83.602 83.602 2 0.0036395 84220 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.36 92.571 179280000 30278000 0 0 0 24451000 0 0 42186000 35601000 19078000 0 27683000 0 16409 3639 15419 145300;145301;145302;145303;145304;145305 185392;185393;185394;185395;185396;185397 185394 5 GIVYIFNGR Unmodified 1037.5658 0.56581494 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 83.204 83.204 2 0.05864 84927 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.346 18.539 31588000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31588000 16410 1909 15420 145306 185398 185398 1 GIWMWCVPHPK Unmodified 1409.6737 0.67366761 2350 P32455;Q9H0R5;F6X827;F6SPX6 GBP1;GBP3 Interferon-induced guanylate-binding protein 1;Guanylate-binding protein 3 no no 0 0 0 1 1 99.449 99.449 2;3 0.020131 102079 QUIQUE_C1368_190116_001 60.973 46.855 25423000 0 0 0 25423000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16411 2350 15421 145307;145308 185399;185400 185399 2 GIYAVGDVCGK Unmodified 1137.5488 0.54884425 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 52.698 52.698 2 0.012624 51037 QUIQUE_C1576_190116_001 72.928 53.95 125410000 0 0 0 0 0 0 125410000 0 0 0 0 0 0 16412 1779 15422 145309 185401 185401 1 GIYAYGFEK Unmodified 1046.5073 0.50729701 2697;3055;2416;1065 P38919;I3L3H2;J3QQP0;P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25;J3KT04;J3KS93;Q14240;E7EQG2;J3KSN7;E7EMV8;E9PBH4;C9JUF0;F8WE11 EIF4A3;EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed;Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 68.444 68.444 2 0.016007 64862 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.351 45.051 230960000 111060000 0 0 0 0 79675000 0 0 0 40231000 0 0 0 16413 2416;2697;3055;1065 15423 145310;145311;145312 185402;185403;185404 185404 3 GIYAYGFEKPSAIQQR Unmodified 1826.9315 0.93153309 2697;3055;2416;1065 P38919;I3L3H2;J3QQP0;P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25;J3KT04;J3KS93;Q14240;E7EQG2;J3KSN7;E7EMV8;E9PBH4;F8WE11 EIF4A3;EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed;Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.157 71.157 2;3 1.3175E-78 71159 QUIQUE_DMIX3_190116_001 206.1 194.16 14273000000 863910000 1254900000 1152600000 847780000 1035500000 792350000 1111500000 1418200000 1235000000 455850000 1431200000 1335500000 1338900000 16414 2416;2697;3055;1065 15424 145313;145314;145315;145316;145317;145318;145319;145320;145321;145322;145323;145324;145325;145326;145327;145328;145329;145330;145331;145332;145333;145334;145335;145336;145337;145338 185405;185406;185407;185408;185409;185410;185411;185412;185413;185414;185415;185416;185417;185418;185419;185420;185421;185422;185423;185424;185425;185426;185427;185428;185429;185430;185431;185432;185433;185434;185435;185436;185437;185438;185439 185426 35 GIYLWDVEGR Unmodified 1206.6033 0.60332266 1856 P04181 OAT Ornithine aminotransferase, mitochondrial;Ornithine aminotransferase, hepatic form;Ornithine aminotransferase, renal form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.39 113.39 2 0.0046342 116915 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.239 61.799 363650000 74803000 0 0 0 58316000 84939000 82118000 0 63475000 0 0 0 0 16415 1856 15425 145339;145340;145341;145342;145343;145344;145345;145346;145347 185440;185441;185442;185443;185444;185445;185446;185447;185448 185448 9 GIYLWDVEGRK Unmodified 1334.6983 0.69828568 1856 P04181 OAT Ornithine aminotransferase, mitochondrial;Ornithine aminotransferase, hepatic form;Ornithine aminotransferase, renal form yes yes 0 0 1 1 82.146 82.146 3 0.012402 82526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.796 37.842 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16416 1856 15426 145348 185449 185449 1 GIYQSLEGAVQAGQLK Unmodified 1660.8784 0.87843489 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 3 3 115.16 115.16 2;3 2.0843E-79 119206 QUIQUE_C1277_190116_001 205.8 187.13 9266800000 808460000 824600000 647050000 307120000 686580000 409080000 644810000 919730000 1113700000 403020000 944810000 1054200000 503590000 16417 3117 15427 145349;145350;145351;145352;145353;145354;145355;145356;145357;145358;145359;145360;145361;145362;145363;145364;145365;145366;145367;145368;145369;145370;145371;145372;145373;145374;145375 185450;185451;185452;185453;185454;185455;185456;185457;185458;185459;185460;185461;185462;185463;185464;185465;185466;185467;185468;185469;185470;185471;185472;185473;185474;185475;185476;185477;185478;185479;185480;185481;185482;185483;185484;185485;185486;185487;185488;185489;185490;185491;185492;185493;185494;185495 185456 44 GIYTGLSAGLLR Unmodified 1219.6925 0.69247202 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.48 104.48 2 0.00053436 107415 QUIQUE_C1403_190116_001 128.28 85.682 3798300000 317580000 238880000 385800000 261550000 171050000 275670000 0 404120000 366040000 130040000 558510000 357020000 332050000 16418 2881 15428 145376;145377;145378;145379;145380;145381;145382;145383;145384;145385;145386;145387 185496;185497;185498;185499;185500;185501;185502;185503;185504;185505;185506;185507;185508;185509;185510;185511 185500 14 GKDCAVIVTQK Unmodified 1217.6438 0.64380726 1091 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12928000 28454000 35145000 59267000 16421 1408 15431 145392;145393;145394;145395;145396;145397;145398;145399;145400;145401;145402;145403;145404;145405;145406;145407 185516;185517;185518;185519;185520;185521;185522;185523;185524;185525;185526;185527;185528;185529;185530;185531 185524 16 GKDILYIGDHIFGDILK Unmodified 1916.0407 0.040749188 2552 P49902;Q5JUV6 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.59 135.59 3;4 0.0022846 140284 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.943 54.124 319310000 0 0 0 0 34730000 0 0 57963000 66411000 0 26493000 29218000 104500000 16422 2552 15432 145408;145409;145410;145411;145412;145413 185532;185533;185534;185535;185536;185537;185538 185538 6 GKDLIGVQNLLK Unmodified 1296.7765 0.776536 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 78.927 78.927 2;3 1.8136E-36 78953 QUIQUE_DMIX8_190116_001 188.99 147.99 13281000000 573110000 807090000 656370000 542290000 1076000000 399390000 772700000 1563000000 1580100000 319840000 1877500000 1453700000 1660000000 16423 267;275;3025 15433 145414;145415;145416;145417;145418;145419;145420;145421;145422;145423;145424;145425;145426;145427;145428;145429;145430;145431;145432;145433;145434;145435;145436;145437;145438;145439 185539;185540;185541;185542;185543;185544;185545;185546;185547;185548;185549;185550;185551;185552;185553;185554;185555;185556;185557;185558;185559;185560;185561;185562;185563;185564;185565;185566;185567;185568;185569;185570;185571;185572;185573;185574;185575;185576;185577;185578;185579;185580;185581;185582;185583;185584;185585;185586;185587;185588 185585 48 GKDLIGVQNLLKK Unmodified 1424.8715 0.87149901 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 1 1 58.707 58.707 3 0.001891 57293 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.942 84.043 134240000 0 0 0 0 0 0 0 106620000 27617000 0 0 0 0 16424 267;275;3025 15434 145440;145441 185589;185590;185591 185589 3 GKDQSGEVLSSV Unmodified 1204.5935 0.59354583 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 0 1 1 1 42.939 42.939 2 1.8513E-05 38350 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.75 133.08 1528400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 464450000 0 0 1064000000 16425 2661 15435 145442;145443 185592;185593 185592 0 GKDVFIIQTVSK Unmodified 1333.7606 0.76055158 1565 O60256;E7EPA1;C9JJS3;C9K0K7;C9JDU5;C9JDH0;E7EW35;I3L331;I3L164 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 58.094 58.094 2 0.055271 56396 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.385 55.895 29494000 0 0 0 0 0 0 0 29494000 0 0 0 0 0 16426 1565 15436 145444 185594 185594 0 GKDYYCILGIEK Unmodified 1457.7225 0.72245152 4416 Q9UDY4;C9JUL4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes no 0 0 1 1 79.849 79.849 3 0.052591 80899 QUIQUE_C1277_190116_001 39.947 20.27 23876000 0 23876000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16427 4416 15437 145445 185595 185595 1 GKEDEGEEAASPMLQIQR Unmodified 1986.9317 0.93166902 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 61.309 61.309 2;3 1.6366E-121 59654 QUIQUE_C1368_190116_001 230.26 212.45 100360000 0 0 33643000 0 0 0 0 66716000 0 0 0 0 0 16428 3053 15438 145446;145447;145448;145449;145450 185596;185597;185598;185599;185600 185596 5 GKEEELQDVRDQLEQAQEER Unmodified 2428.1466 0.14662384 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 2 1 1 82.312 82.312 3 0.012762 84460 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.342 45.538 133470000 0 0 0 0 0 0 0 58770000 0 0 74699000 0 0 16429 3241 15439 145451;145452 185601;185602 185602 2 GKEEVASALVHILQSTGK Unmodified 1866.0211 0.021076378 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A1B0GW70 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 106.08 106.08 3;4 6.0245E-31 109378 QUIQUE_C1277_190116_001 150.69 140.94 912960000 64079000 133010000 95050000 84099000 0 113010000 83803000 52582000 65246000 0 0 144280000 77800000 16430 135 15440 145453;145454;145455;145456;145457;145458;145459;145460;145461;145462;145463;145464;145465;145466;145467 185603;185604;185605;185606;185607;185608;185609;185610;185611;185612;185613;185614;185615;185616;185617;185618 185605 13 GKEGSALTEGAKEEGGEEVAK Unmodified 2075.0019 0.0018570786 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;A0A0J9YW31;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 2 2 1 2 2 2 22.668 22.668 2;3 2.3689E-25 16861 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.04 118.09 991520000 0 0 0 0 0 0 0 153560000 141990000 0 282980000 186110000 226890000 16431 143;560;4559 15441 145468;145469;145470;145471;145472;145473;145474;145475;145476 185619;185620;185621;185622;185623;185624;185625;185626;185627 185620 9 GKEHDDIFDK Unmodified 1202.5568 0.5567664 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 16.063 16.063 3 0.0021721 8151 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.479 73.315 40348000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40348000 0 0 0 16432 831;1569 15442 145477 185628;185629;185630 185629 3 GKEHMIQNEVSILR Unmodified 1652.8668 0.86682434 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 2 48.617 48.617 2;3 0.00050429 46452 QUIQUE_C1277_190116_001 137.84 113.49 538460000 47699000 130480000 0 72584000 0 0 102070000 0 59611000 0 0 0 126010000 16433 1478 15443 145478;145479;145480;145481;145482;145483;145484;145485;145486;145487 185631;185632;185633;185634;185635;185636;185637;185638;185639;185640 185632 5 GKEHMIQNEVSILR Oxidation (M) 1668.8617 0.86173896 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 1 1 1 1 1 38.931 38.931 3 0.013708 33667 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.827 39.353 39468000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11971000 0 27498000 0 16434 1478 15443 145488;145489;145490 185641;185642;185643 185641 823 1 GKELDSNPFASLVFYWEPLNR Unmodified 2481.2329 0.23286007 4309 Q9NVS9;J3QQV6 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 1 1 1 1 163.66 163.66 3 0.0039748 166038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.413 37.791 113960000 0 0 0 0 0 0 0 32925000 25220000 0 55812000 0 0 16435 4309 15444 145491;145492;145493 185644;185645;185646 185644 2 GKELQPGSHIQSDKEIDAFVR Unmodified 2353.2026 0.20262257 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 1 54.573 54.573 4 0.0015896 52937 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.559 41.371 298090000 0 0 0 0 0 0 0 90000000 84404000 0 123680000 0 0 16436 3643 15445 145494;145495;145496 185647;185648;185649 185649 3 GKEQELVQAVK Unmodified 1227.6823 0.68230126 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.565 28.565 2 0.0064354 22665 QUIQUE_C1277_190116_001 125.97 74.903 246040000 28520000 31903000 0 0 0 0 0 39074000 43721000 0 36975000 31715000 34131000 16437 3718 15446 145497;145498;145499;145500;145501;145502;145503 185650;185651;185652;185653;185654;185655;185656 185651 3 GKESSIENEIAVLR Unmodified 1543.8206 0.82058566 3526 Q8IU85 CAMK1D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D yes yes 0 0 1 1 77.67 77.67 2 0.062952 77661 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.392 51.706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16438 3526 15447 145504 185657 185657 1 GKEVDNFVDKLK Unmodified 1390.7456 0.7456298 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 2 1 46.393 46.393 3 0.025446 43128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.976 41.786 21800000 0 0 0 0 0 0 0 21800000 0 0 0 0 0 16439 2506 15448 145505 185658 185658 1 GKFNTSDVSAIEK Unmodified 1394.7042 0.70415892 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 2 36.525 36.525 2;3 4.9989E-119 31996 QUIQUE_C1438_190116_001 248.32 187.5 2671000000 94378000 121380000 114100000 167200000 218140000 54945000 281160000 599950000 309750000 21916000 0 0 688060000 16440 2146 15449 145506;145507;145508;145509;145510;145511;145512;145513;145514;145515;145516;145517;145518;145519;145520 185659;185660;185661;185662;185663;185664;185665;185666;185667;185668;185669;185670;185671;185672;185673;185674;185675;185676 185665 17 GKFPVQLENVDSFVELGQVALR Unmodified 2444.3064 0.30635936 3731 Q92542;H0Y3Z4;Q5T205;Q5T209 NCSTN Nicastrin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 149.59 149.59 3 0.0043264 152495 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.987 31.365 173910000 42897000 41914000 40972000 0 0 0 0 37911000 0 10217000 0 0 0 16441 3731 15450 145521;145522;145523;145524;145525 185677;185678;185679;185680;185681 185680 5 GKFQDNFEFVQWFK Unmodified 1818.873 0.87295558 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 135.54 135.54 2;3 0.0055074 140500 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.326 48.48 257590000 0 0 0 0 0 0 0 0 36240000 0 67747000 114600000 39010000 16442 3150 15451 145526;145527;145528;145529;145530 185682;185683;185684;185685;185686;185687 185682 4 GKGASGSFVVVQK Unmodified 1262.6983 0.69828568 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;Q5SWC8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 yes no 0 0 1 1 20.929 20.929 2 0.0046392 14122 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.9 45.523 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16443 3297 15452 145531 185688 185688 1 GKGGEIQPVSVK Unmodified 1197.6717 0.67173657 2727 P61604;B8ZZL8 HSPE1 10 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 17.482 17.482 2;3 8.6102E-17 10028 QUIQUE_DMIX5_190116_001 177.04 144.72 1211500000 39714000 51551000 41106000 12477000 94544000 15942000 57295000 89376000 120800000 0 341240000 137330000 210070000 16444 2727 15453 145532;145533;145534;145535;145536;145537;145538;145539;145540;145541;145542;145543;145544;145545 185689;185690;185691;185692;185693;185694;185695;185696;185697;185698;185699;185700;185701;185702 185700 8 GKGGVTGSPEASISGSK Unmodified 1517.7686 0.76855009 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 18.797 18.797 2 0.058269 11640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.128 43.366 14627000 0 0 0 0 0 0 0 14627000 0 0 0 0 0 16445 2935 15454 145546 185703 185703 1 GKIEEDSEVLMMIK Unmodified 1620.8103 0.81028025 1601 O60888;C9IZG4 CUTA Protein CutA yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 1 94.459 94.459 2;3 3.0312E-07 96870 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.07 113.94 374180000 44797000 38209000 0 0 0 59951000 0 51362000 40844000 0 0 81529000 57486000 16446 1601 15455 145547;145548;145549;145550;145551;145552;145553;145554;145555;145556;145557 185704;185705;185706;185707;185708;185709;185710;185711;185712;185713;185714 185711 10 GKKPDIDITGPK Unmodified 1267.7136 0.71360139 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 2 1 19.194 19.194 3 0.018977 11889 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.401 40.742 47672000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47672000 0 0 16447 2935 15456 145558 185715 185715 1 GKLDDYQER Unmodified 1122.5306 0.53055165 3067 Q14444;E9PLA9 CAPRIN1 Caprin-1 yes no 0 0 1 1 16.55 16.55 2 0.012856 8995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.74 89.947 29716000 0 0 0 0 0 0 0 29716000 0 0 0 0 0 16448 3067 15457 145559 185716;185717 185716 2 GKLDGNQDLIR Unmodified 1227.6571 0.65714914 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 1 2 1 2 2 1 2 29.653 29.653 2;3 0.00012144 23906 QUIQUE_C1563_190116_001 140.49 100.22 12763000000 1171700000 696290000 881140000 0 1123500000 649640000 754500000 1607300000 1079400000 325250000 2168600000 723550000 1582000000 16449 2518 15458 145560;145561;145562;145563;145564;145565;145566;145567;145568;145569;145570;145571;145572;145573;145574;145575;145576;145577 185718;185719;185720;185721;185722;185723;185724;185725;185726;185727;185728;185729;185730;185731;185732;185733;185734;185735;185736 185724 12 GKLPIVNEDDELVAIIAR Unmodified 1964.0942 0.094241321 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 1 1 1 127.68 127.68 3 0.0046865 133958 QUIQUE_C1438_190116_001 50.831 46.161 42859000 0 0 20578000 0 22282000 0 0 0 0 0 0 0 0 16450 2040 15459 145578;145579 185737;185738 185738 1 GKNNTVGLIQLNRPK Unmodified 1650.9529 0.95293723 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 1 34.036 34.036 3 0.00018766 28915 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.135 67.15 305900000 0 0 0 0 0 0 0 83750000 60212000 0 161940000 0 0 16451 2305 15460 145580;145581;145582 185739;185740;185741 185741 1 GKNPEDLIWHTPEGISIKPLYSK Unmodified 2621.3853 0.38533796 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 104.14 104.14 3;4;5 1.2584E-05 107276 QUIQUE_C1368_190116_001 40.098 33.735 335810000 21495000 12377000 31099000 22284000 25597000 23493000 0 24334000 36951000 0 86507000 51671000 0 16452 2191 15461 145583;145584;145585;145586;145587;145588;145589;145590;145591;145592;145593 185742;185743;185744;185745;185746;185747;185748;185749;185750;185751;185752;185753 185744 11 GKNQAFLELATEEAAITMVNYYSAVTPHLR Unmodified 3336.6813 0.68126199 4471 Q9UKA9 PTBP2 Polypyrimidine tract-binding protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 166.46 166.46 4 0.00010358 173616 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.894 36.234 86408000 0 0 0 0 0 0 0 28260000 0 0 58148000 0 0 16453 4471 15462 145594;145595 185754;185755 185755 2 GKPAVAALGDLTDLPTYEHIQTALSSK Unmodified 2795.4705 0.47052416 2940 Q10713 PMPCA Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 127.76 127.76 4 0.0096466 133313 QUIQUE_C1218_190116_001 27.775 21.547 193130000 58737000 0 0 0 0 0 0 0 75655000 0 0 58734000 0 16454 2940 15463 145596;145597;145598 185756;185757;185758 185756 3 GKPLALVEEIR Unmodified 1223.7238 0.72377215 3326 Q5TDF0;Q9BSD7 NTPCR Cancer-related nucleoside-triphosphatase yes no 0 0 1 1 60.743 60.743 3 0.053744 60193 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.433 35.9 41839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41839000 16455 3326 15464 145599 185759 185759 0 GKPLPEPVLWTK Unmodified 1363.7864 0.7863724 3582 Q8N3J6 CADM2 Cell adhesion molecule 2 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 66.216 66.216 2;3 0.0012265 67166 QUIQUE_C1218_190116_001 71.632 68.002 4274700000 442040000 550080000 477880000 534970000 249460000 245360000 380440000 234070000 493170000 196900000 254770000 215590000 0 16456 3582 15465 145600;145601;145602;145603;145604;145605;145606;145607;145608;145609;145610;145611;145612;145613;145614;145615;145616;145617 185760;185761;185762;185763;185764;185765;185766;185767;185768;185769;185770;185771;185772;185773;185774;185775;185776;185777 185760 14 GKPLPEYHVR Unmodified 1194.6509 0.65094155 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 17.509 17.509 3 0.040703 10291 QUIQUE_C1368_190116_001 35.178 23.312 31646000 0 0 31646000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16457 2813 15466 145618 185778 185778 1 GKPNWEHLNEDLHVLITVEDAQNR Unmodified 2826.4049 0.40490421 3920 Q96PU8;F5GXS8;F5GYM3;H0YG47 QKI Protein quaking yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.14 117.14 4 0.00012505 122570 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.839 40.335 398670000 0 50135000 72040000 0 0 0 64270000 0 75384000 0 74089000 62752000 0 16458 3920 15467 145619;145620;145621;145622;145623;145624 185779;185780;185781;185782;185783;185784 185783 5 GKPPPSFSWTR Unmodified 1258.6459 0.64585618 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43;C9JF43;C9J8B6 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 1 1 1 1 41.511 41.511 3 0.0037022 38624 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.175 47.17 80994000 0 0 0 0 36921000 0 0 0 44073000 0 0 0 0 16459 756 15468 145625;145626;145627 185785;185786;185787 185787 3 GKPVSVPLKPLIAVPTTSGTGSETTGVAIFDYEHLK Unmodified 3708.9978 0.99782833 3542 Q8IWW8 ADHFE1 Hydroxyacid-oxoacid transhydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 121.05 121.05 5 0.015042 125435 QUIQUE_DMIX3_190116_001 23.79 22.3 55255000 0 0 0 0 0 0 0 0 55255000 0 0 0 0 16460 3542 15469 145628 185788 185788 1 GKSDPYHATSGALSPAK Unmodified 1685.8373 0.83729835 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 20.507 20.507 2;3 6.2119E-88 13880 QUIQUE_DMIX1_190116_001 210.37 182.89 1192000000 0 0 0 0 0 0 0 277780000 283640000 0 275480000 143620000 211490000 16461 2123 15470 145629;145630;145631;145632;145633;145634;145635 185789;185790;185791;185792;185793;185794;185795;185796 185791 7 GKSEVEEWSDMYTVTSQLMLK Unmodified 2460.1553 0.15526295 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8;F5H125;F5H8J9;F5H0H5 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 148.68 148.68 3 0.0010596 155638 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.195 27.919 156090000 0 29968000 0 0 0 0 21915000 0 24677000 0 41521000 0 38004000 16462 113 15471 145636;145637;145638;145639;145640;145641 185797;185798;185799;185800;185801;185802 185801 6 GKTEQQTADQLLAR Unmodified 1557.8111 0.8110836 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 38.352 38.352 2;3 5.4466E-58 34604 QUIQUE_DMIX7_190116_001 222.49 176.61 780390000 0 48636000 90894000 0 57986000 0 51358000 39434000 159830000 0 76690000 137300000 118250000 16463 2008 15472 145642;145643;145644;145645;145646;145647;145648;145649;145650;145651;145652;145653;145654;145655;145656;145657;145658;145659 185803;185804;185805;185806;185807;185808;185809;185810;185811;185812;185813;185814;185815;185816;185817;185818;185819;185820;185821;185822;185823;185824 185821 21 GKVEEVELPVEK Unmodified 1354.7344 0.73439641 953 E9PKG1;Q99873;E9PQ98;E9PIX6;H0YDE4;E9PNR9;Q9NR22 PRMT1;PRMT8 Protein arginine N-methyltransferase 1;Protein arginine N-methyltransferase 8 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 43.688 43.688 2 0.00092558 40272 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.752 80.648 260170000 0 54395000 0 39171000 39017000 31152000 45654000 0 0 14102000 0 36683000 0 16464 953 15473 145660;145661;145662;145663;145664;145665;145666;145667;145668;145669;145670 185825;185826;185827;185828;185829;185830;185831;185832;185833;185834;185835;185836 185833 10 GKVPVTYLELLS Unmodified 1317.7544 0.75440357 667;668 B7ZC38;Q9NR46;B7ZC39 SH3GLB2 Endophilin-B2 no no 0 0 1 1 122.72 122.72 2 0.059132 127800 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.765 48.046 133170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 133170000 16465 667;668 15474 145671 185837 185837 1 GKWERPFEVK Unmodified 1274.6772 0.6771563 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 2 1 1 1 31.283 31.283 2 0.0039916 26509 QUIQUE_DMIX4_190116_001 148.91 101.31 382500000 0 0 115580000 0 236750000 0 0 0 0 30174000 0 0 0 16466 4;1799 15475 145672;145673;145674 185838;185839;185840 185840 1 GKWNEPFDETYTR Unmodified 1641.7423 0.74233534 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 1 1 67.559 67.559 2 0.0066881 66767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.911 80.103 30799000 0 0 0 0 0 0 0 30799000 0 0 0 0 0 16467 2564 15476 145675 185841 185841 1 GKYSEVFEAINITNNEK Unmodified 1954.9636 0.96362108 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;V9GYA2;A0A2R8YDY7;A0A2R8YEW1;A0A2R8YCK2;A0A2R8Y3W6;A0A2R8Y797;A0A2R8YEL7;V9GY80;A0A2R8YF47;A0A2R8Y7T1 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 1 1 1 93.427 93.427 3 0.0089689 96660 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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185852;185853;185854;185855;185856;185857;185858;185859;185860;185861;185862 185857 10 GLAAGDAIAEIR Unmodified 1155.6248 0.62478638 4046 Q9BVJ7 DUSP23 Dual specificity protein phosphatase 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.781 75.781 2 0.00079055 76679 QUIQUE_C1277_190116_001 105.98 82.904 242880000 0 44723000 0 37168000 44943000 0 33051000 0 41382000 0 41613000 0 0 16471 4046 15480 145695;145696;145697;145698;145699;145700;145701;145702;145703 185863;185864;185865;185866;185867;185868;185869;185870;185871;185872;185873 185863 10 GLAAGSAETLPANFR Unmodified 1473.7576 0.75759147 448 A0A2R8Y7R9;Q13136 PPFIA1 Liprin-alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 77.774 77.774 2 1.0041E-05 78347 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.01 101.34 110700000 0 0 0 42378000 0 0 0 30243000 38077000 0 0 0 0 16472 448 15481 145704;145705;145706 185874;185875;185876 185875 3 GLAAHYFFPR Unmodified 1177.6033 0.60326308 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 67.847 67.847 3 0.0082888 67964 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cytoplasmic no no 0 0 0 1 1 1 31.128 31.128 2 0.010766 25936 QUIQUE_C1368_190116_001 73.665 34.873 221230000 0 0 72144000 82829000 0 0 0 0 66260000 0 0 0 0 16495 413;2035 15504 145876;145877;145878 186095;186096;186097 186095 3 GLAPNFMK Unmodified 876.45276 0.45275902 3368 Q6KCM7 SLC25A25 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2 yes yes 0 0 0 1 58.876 58.876 2 0.050731 57488 QUIQUE_C1277_190116_001 55.441 0 23666000 0 23666000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16496 3368 15505 145879 186098 186098 1 GLAPVQAYLHIPDIIK Unmodified 1747.0032 0.0032414695 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 133.16 133.16 2;3 1.1354E-07 137584 QUIQUE_C1277_190116_001 96.993 87.072 1965400000 104300000 118990000 403760000 104950000 158120000 135140000 147890000 104780000 205800000 74136000 128630000 126110000 152780000 16497 2026 15506 145880;145881;145882;145883;145884;145885;145886;145887;145888;145889;145890;145891;145892;145893;145894;145895 186099;186100;186101;186102;186103;186104;186105;186106;186107;186108;186109;186110;186111;186112;186113;186114;186115;186116;186117;186118;186119;186120;186121;186122;186123;186124;186125;186126;186127;186128 186102 29 GLATFCLDK Unmodified 1023.5059 0.5059168 1391;1488 O00264;O15173;U3KQM0 PGRMC1;PGRMC2 Membrane-associated progesterone receptor component 1;Membrane-associated progesterone receptor component 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 70.496 70.496 2 0.0025126 71322 QUIQUE_C1576_190116_001 93.429 44.07 2036500000 0 595450000 0 0 513990000 0 457530000 0 0 0 469560000 0 0 16498 1391;1488 15507 145896;145897;145898;145899;145900;145901;145902 186129;186130;186131;186132;186133;186134;186135 186133 6 GLATSLQNDLQEVPK Unmodified 1611.8468 0.84680041 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 105.53 105.53 2 0.0048923 109255 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.64 83.287 283770000 0 0 0 0 0 87589000 0 0 89220000 0 0 0 106960000 16499 3565 15508 145903;145904;145905 186136;186137;186138 186137 0 GLATVIR Unmodified 728.45447 0.45447358 3432 Q7KZF4;H7C597 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 33.374 33.374 2 0.046324 28782 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.748 0.028797 65332000 0 0 0 0 0 0 0 65332000 0 0 0 0 0 16500 3432 15509 145906 186139 186139 1 GLAVFISDIR Unmodified 1089.6182 0.61824444 1749;1701 O94973;E9PR62;M0R2D9;O95782 AP2A2;AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-2;AP-2 complex subunit alpha-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.87 110.87 2 0.0012888 115885 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.442 72.188 1541900000 0 0 0 0 236420000 0 222890000 0 293670000 0 328590000 283240000 177060000 16501 1701;1749 15510 145907;145908;145909;145910;145911;145912 186140;186141;186142;186143;186144;186145;186146;186147;186148 186145 9 GLAVNMVDSK Unmodified 1032.5274 0.52738052 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 0 1 47.78 47.78 2 0.016916 44820 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.334 49.164 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16502 1021 15511 145913 186149 186149 1 GLAYGLYLR Unmodified 1024.5706 0.57056597 4103 Q9GZP4 PITHD1 PITH domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 90.485 90.485 2 0.0021334 88960 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.51 64.575 2519300000 106490000 181520000 223020000 151740000 260670000 145970000 247930000 156670000 265350000 61775000 377900000 0 340200000 16503 4103 15512 145914;145915;145916;145917;145918;145919;145920;145921;145922;145923;145924;145925;145926 186150;186151;186152;186153;186154;186155;186156;186157;186158;186159;186160;186161;186162;186163;186164;186165 186163 11 GLAYVCHQR Unmodified 1102.5342 0.53419724 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;A0A0U1RQT0;A0A0U1RQQ5 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 17.082 17.082 2;3 0.0025848 9487 QUIQUE_C1403_190116_001 93.262 60.422 52125000 0 0 0 25010000 0 0 0 0 27115000 0 0 0 0 16504 2496 15513 145927;145928 186166;186167 186166 2 GLCAIAQAESLR Unmodified 1287.6605 0.66051996 2214 P23396;F2Z2S8;H0YCJ7;H0YF32 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.024 78.024 2 0.00048867 79906 QUIQUE_C1218_190116_001 107.08 85.63 2554800000 163700000 197470000 290250000 203790000 165610000 183110000 226340000 179760000 186100000 68469000 225630000 244560000 219980000 16505 2214 15514 145929;145930;145931;145932;145933;145934;145935;145936;145937;145938;145939;145940;145941 186168;186169;186170;186171;186172;186173;186174;186175;186176;186177;186178;186179;186180 186168 12 GLCEKPLASAAAK Unmodified 1314.6966 0.69657112 4625 Q9Y5L0;C9J7E5;E9PFH4 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 1 1 21.535 21.535 3 0.037606 14854 QUIQUE_C1438_190116_001 45.115 32.847 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16506 4625 15515 145942 186181 186181 1 GLCEQNLNPDANPR Unmodified 1596.7315 0.73145307 4554 Q9Y2H0;F8WF49;A0A0B4J2C2 DLGAP4 Disks large-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.298 46.298 2 1.8041E-28 44119 QUIQUE_C1218_190116_001 169.82 154.25 139330000 27777000 30311000 29783000 28408000 0 23056000 0 0 0 0 0 0 0 16507 4554 15516 145943;145944;145945;145946;145947;145948 186182;186183;186184;186185;186186;186187 186182 6 GLCESVVEADLVEALEK Unmodified 1859.9186 0.91864472 649 B7WPG3;C9IYN3;D6W592;Q8WVV9;H7BXH8;C9JJZ7 HNRNPLL;HNRPLL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like yes no 0 0 0 1 1 1 151.02 151.02 3 0.00053401 155763 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.044 36.579 83730000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12252000 71478000 0 16508 649 15517 145949;145950;145951 186188;186189;186190 186190 3 GLCGAIHSSIAK Unmodified 1212.6285 0.62849155 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 1 1 30.353 30.353 2;3 1.6094E-05 25211 QUIQUE_C1277_190116_001 142.55 113.13 10834000000 1131600000 956730000 1392900000 1075900000 324100000 1165600000 630750000 709840000 850680000 318650000 1240600000 506270000 530650000 16509 2396 15518 145952;145953;145954;145955;145956;145957;145958;145959;145960;145961;145962;145963;145964;145965;145966;145967;145968;145969;145970;145971;145972;145973 186191;186192;186193;186194;186195;186196;186197;186198;186199;186200;186201;186202;186203;186204;186205;186206;186207;186208;186209;186210;186211;186212;186213 186193 18 GLCGMGGPR Unmodified 903.40549 0.40549125 1762 O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8;H0Y7N1 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes no 0 0 0 1 1 25.124 25.124 2 0.028606 18649 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.661 76.126 275680000 0 0 0 0 0 0 0 0 104490000 0 0 0 171190000 16510 1762 15519 145974;145975 186214;186215 186215 1 GLCGTVLIHK Unmodified 1096.6063 0.60629955 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.954 36.954 2 0.0093328 32850 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.696 52.078 339180000 35919000 0 32663000 39918000 0 39969000 55055000 24898000 35012000 0 0 35806000 39940000 16511 3226 15520 145976;145977;145978;145979;145980;145981;145982;145983;145984;145985 186216;186217;186218;186219;186220;186221;186222;186223;186224;186225;186226;186227;186228;186229;186230 186226 14 GLCVDGECVCEEPYTGEDCR Unmodified 2403.9076 0.90758082 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 87.502 87.502 2 1.8577E-23 88337 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.53 128.9 15040000 0 0 0 0 0 0 0 15040000 0 0 0 0 0 16512 3753 15521 145986 186231 186231 1 GLDAHLEQIFQEAHGMVAR Unmodified 2121.0426 0.042556877 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 126.9 126.9 3 8.2534E-05 131935 QUIQUE_C1368_190116_001 55.267 46.221 122620000 0 24991000 29285000 0 0 0 0 0 0 0 36987000 31356000 0 16513 2021 15522 145987;145988;145989;145990 186232;186233;186234;186235 186233 4 GLDDCLQQYIK Unmodified 1351.6442 0.6442012 433 A0A2R8Y5R2;A0A2R8YDB6;A0A2R8Y7K8;A0A2R8YFM1;A0A2R8Y5S6;A0A2R8Y622;A0A2R8YGJ7;A0A2U3TZH5;A0A2R8Y700;A0A2R8Y7A1;A0A2R8YED7;Q8WXI2 CNKSR2 Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2 yes no 0 0 0 1 1 108.82 108.82 2 0.018151 112200 QUIQUE_C1277_190116_001 55.898 8.1918 32016000 0 32016000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16514 433 15523 145991;145992 186236;186237 186237 2 GLDFSDR Unmodified 808.37153 0.37153181 3011 Q13561;F8W1I6;F8VW18;F8VX93;F8VRV7;H0YHL1 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 39.943 39.943 2 0.032104 36529 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.427 29.632 576400000 0 0 0 0 0 0 0 176830000 186530000 0 0 0 213030000 16515 3011 15524 145993;145994;145995 186238;186239;186240 186238 2 GLDGIPFTVDATSQIHCIEDFHR Unmodified 2627.2438 0.24383546 3149 Q15654;H7BZE2 TRIP6 Thyroid receptor-interacting protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.64 131.64 4 0.00011746 137442 QUIQUE_C1576_190116_001 48.5 43.974 383260000 0 38407000 46262000 0 45107000 37647000 59471000 33147000 38954000 0 36049000 0 48219000 16516 3149 15525 145996;145997;145998;145999;146000;146001;146002;146003;146004 186241;186242;186243;186244;186245;186246;186247;186248;186249 186245 8 GLDHDFGPSR Unmodified 1099.5047 0.50467125 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 1 1 2 28.356 28.356 2;3 0.0050875 22079 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.267 66.307 898990000 0 46890000 0 127910000 48459000 44704000 46710000 0 149980000 45736000 67556000 67930000 253120000 16517 345 15526 146005;146006;146007;146008;146009;146010;146011;146012;146013;146014;146015;146016;146017;146018 186250;186251;186252;186253;186254;186255;186256;186257;186258;186259;186260;186261;186262;186263 186263 12 GLDISHISQR Unmodified 1124.5938 0.5938206 3574 Q8N1F7;H3BVG0;H3BM93;H3BNN5;H3BV11;H3BRI8 NUP93 Nuclear pore complex protein Nup93 yes no 0 0 0 1 1 1 40.903 40.903 2;3 0.014827 37137 QUIQUE_C1277_190116_001 39.625 24.958 13775000 0 13775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16518 3574 15527 146019;146020;146021 186264;186265;186266 186264 3 GLDISNVK Unmodified 844.46543 0.46543219 266 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A0J9YVQ7;A0A087WVZ1 DDX3X ATP-dependent RNA helicase DDX3X yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.917 37.917 2 0.018957 34032 QUIQUE_C1576_190116_001 79.116 42.141 349840000 0 76834000 0 85948000 94961000 0 92100000 0 0 0 0 0 0 16519 266 15528 146022;146023;146024;146025 186267;186268;186269;186270 186270 4 GLDKLEENLPILQQPTEK Unmodified 2064.1103 0.11028532 1586 O60664;K7EL96;K7ER39 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 1 1 2 3 2 1 2 1 1 108.55 108.55 2;3 2.304E-181 112006 QUIQUE_DMIX3_190116_001 258.41 242.49 695260000 0 0 0 56178000 90659000 0 0 112440000 128940000 24159000 0 74062000 208830000 16520 1586 15529 146026;146027;146028;146029;146030;146031;146032;146033;146034;146035;146036;146037;146038 186271;186272;186273;186274;186275;186276;186277;186278;186279;186280;186281;186282;186283;186284;186285;186286 186280 15 GLDLSSGLVVTSLCK Unmodified 1547.8229 0.82289384 4571 Q9Y2Y0;H3BU49 ARL2BP ADP-ribosylation factor-like protein 2-binding protein yes no 0 0 0 1 121.98 121.98 2 0.01179 126463 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.864 51.192 23665000 0 0 0 0 0 0 0 0 23665000 0 0 0 0 16521 4571 15530 146039 186287 186287 1 GLDNTEFQGK Unmodified 1107.5197 0.51965261 4055 Q9BWF3;E9PB51 RBM4 RNA-binding protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 34.067 34.067 2 0.00053407 29232 QUIQUE_C1277_190116_001 110.12 49.22 382660000 50337000 41805000 50693000 0 62348000 37802000 54028000 0 0 0 85646000 0 0 16522 4055 15531 146040;146041;146042;146043;146044;146045;146046;146047;146048 186288;186289;186290;186291;186292;186293;186294;186295;186296;186297 186290 7 GLDPTGTVILLCK Unmodified 1385.7588 0.75883702 3142 Q15477 SKIV2L Helicase SKI2W yes yes 0 0 0 1 109.21 109.21 2 0.050388 112173 QUIQUE_C1403_190116_001 48.998 33.416 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16523 3142 15532 146049 186298 186298 1 GLDPYNVLAPK Unmodified 1185.6394 0.63937381 2000 P10606 COX5B Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.688 90.688 2 0.00043709 93529 QUIQUE_C1576_190116_001 103.56 71.243 2450400000 437110000 319460000 301780000 150360000 0 191740000 245900000 0 0 95583000 0 327280000 381210000 16524 2000 15533 146050;146051;146052;146053;146054;146055;146056;146057;146058;146059 186299;186300;186301;186302;186303;186304;186305;186306;186307;186308;186309;186310;186311;186312 186307 14 GLDSGAETEEEKDTWEEK Unmodified 2051.8807 0.88073889 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 52.996 52.996 2 6.734E-225 50552 QUIQUE_C1277_190116_001 327.82 303.97 78986000 0 47304000 0 0 0 0 0 31681000 0 0 0 0 0 16525 921 15534 146060;146061;146062;146063;146064;146065 186313;186314;186315;186316;186317;186318 186313 6 GLDSGAETEEEKDTWEEKK Unmodified 2179.9757 0.97570191 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 39.401 39.401 3 7.8189E-05 36201 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.666 77.37 34000000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34000000 0 0 16526 921 15535 146066 186319 186319 1 GLDSLTNVDLR Unmodified 1201.6303 0.63026569 272 A0A0D9SFU4;O95970;A0A1B0GUD3;A0A1B0GV33 LGI1 Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 yes no 0 0 0 1 89.44 89.44 2 0.029524 86104 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.532 33.41 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16527 272 15536 146067 186320 186320 1 GLDTVVALLADVVLQPR Unmodified 1778.0302 0.030184501 2940 Q10713 PMPCA Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 177.9 177.9 2;3 1.4319E-37 182053 QUIQUE_C1368_190116_001 199.43 188.53 752270000 38950000 32193000 100700000 18070000 44674000 0 0 81397000 79469000 21220000 209290000 104550000 21753000 16528 2940 15537 146068;146069;146070;146071;146072;146073;146074;146075;146076;146077;146078;146079;146080;146081;146082;146083;146084 186321;186322;186323;186324;186325;186326;186327;186328;186329;186330;186331;186332;186333;186334;186335;186336;186337 186325 17 GLDVEDVK Unmodified 873.44436 0.4443624 381;1290 J3KTA4;P17844;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.212 38.212 2 0.0061806 33898 QUIQUE_C1563_190116_001 102.71 50.03 2027900000 220580000 220780000 247040000 198090000 190470000 176650000 0 90323000 165130000 101640000 226940000 190270000 0 16529 1290;381 15538 146085;146086;146087;146088;146089;146090;146091;146092;146093;146094;146095 186338;186339;186340;186341;186342;186343;186344;186345;186346;186347;186348;186349;186350 186344 13 GLDVPQVSLIINYDLPNNR Unmodified 2139.1324 0.13241774 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 148.29 148.29 2 1.8343E-07 151289 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.58 93.441 101900000 0 0 0 0 0 0 0 39773000 0 0 40651000 21479000 0 16530 2416 15539 146096;146097;146098 186351;186352;186353 186351 3 GLDWVKEEAPDILCLQETK Unmodified 2243.1144 0.11438442 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359;G3V5D9 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 131.44 131.44 2;3 3.2685E-73 135565 QUIQUE_C1277_190116_001 192.32 150.91 1806300000 98392000 168100000 168670000 96146000 139670000 64005000 142680000 163930000 154930000 20701000 198520000 295890000 94650000 16531 2266 15540 146099;146100;146101;146102;146103;146104;146105;146106;146107;146108;146109;146110;146111;146112;146113;146114;146115;146116;146117;146118;146119;146120;146121 186354;186355;186356;186357;186358;186359;186360;186361;186362;186363;186364;186365;186366;186367;186368;186369;186370;186371;186372;186373;186374;186375;186376;186377;186378;186379;186380;186381 186358 27 GLDYLHSEK Unmodified 1060.5189 0.51892433 622;629 B4DR80;Q9Y6E0;H0Y630;Q8NBY1;B4E0Y9;Q9P289 STK24;STK26 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 26 no no 0 0 0 1 1 19.019 19.019 2 0.020669 11346 QUIQUE_C1277_190116_001 62.717 5.5398 1878600000 0 998970000 0 879590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16532 622;629 15541 146122;146123 186382;186383 186382 2 GLDYYTGVIYEAVLLQTPAQAGEEPLGVGSVAAGGR Unmodified 3620.8362 0.83624231 2035 P12081;B4DDD8;B3KWE1;E7ETE2;B4E1C5 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.15 169.15 3 1.8165E-24 170899 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.917 75.582 224670000 0 0 0 0 0 0 42188000 46444000 0 6243600 35381000 60748000 33664000 16533 2035 15542 146124;146125;146126;146127;146128;146129 186384;186385;186386;186387;186388;186389 186385 6 GLEAALVYVENAHVAGK Unmodified 1739.9206 0.92063405 3037 Q14008;E9PQH5 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 2 1 113.92 113.92 2;3 1.9419E-07 117116 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.018 68.289 489260000 0 0 48868000 38857000 50415000 42285000 0 37511000 95069000 0 85234000 47157000 43866000 16534 3037 15543 146130;146131;146132;146133;146134;146135;146136;146137;146138;146139;146140;146141;146142;146143 186390;186391;186392;186393;186394;186395;186396;186397;186398;186399;186400;186401;186402;186403;186404;186405 186396 15 GLEAEVLR Unmodified 885.49198 0.4919813 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.659 54.659 2 0.0075564 53344 QUIQUE_C1576_190116_001 97.602 30.608 214480000 0 0 0 37395000 0 0 51344000 43815000 0 0 0 33536000 48390000 16535 3459 15544 146144;146145;146146;146147;146148 186406;186407;186408;186409;186410 186407 5 GLECLVSILK Unmodified 1130.6369 0.63693097 4651;4652 Q9Y6D5;Q9Y6D6;E5RIF2 ARFGEF2;ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2;Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.71 128.71 2 0.0029057 134755 QUIQUE_C1438_190116_001 87.308 55.373 195240000 15361000 18042000 17593000 12293000 22366000 11641000 18351000 0 16542000 0 16263000 21092000 25700000 16536 4651;4652 15545 146149;146150;146151;146152;146153;146154;146155;146156;146157;146158;146159;146160 186411;186412;186413;186414;186415;186416;186417;186418;186419;186420;186421;186422;186423;186424 186416 14 GLEEENAQLR Unmodified 1157.5677 0.56766543 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 33.796 33.796 2 0.0010752 29316 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.65 93.778 555050000 0 0 0 109580000 0 0 140410000 0 115360000 0 189700000 0 0 16537 3803 15546 146161;146162;146163;146164 186425;186426;186427;186428 186427 4 GLEELIDYTGGLK Unmodified 1406.7293 0.72931103 4187 Q9H871 RMND5A Protein RMD5 homolog A yes yes 0 0 0 1 136.02 136.02 2 0.0059023 143160 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.893 50.113 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16538 4187 15547 146165 186429 186429 1 GLEESLGMVAQALNR Unmodified 1586.8086 0.80864076 3723 Q8WZ82 OVCA2 Ovarian cancer-associated gene 2 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 144.43 144.43 2 0.0048756 149984 QUIQUE_C1218_190116_001 78.342 62.452 84651000 23043000 32211000 0 29397000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16539 3723 15548 146166;146167;146168 186430;186431;186432 186430 3 GLEETVAK Unmodified 845.44945 0.44944778 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.695 21.695 2 0.024721 14428 QUIQUE_C1277_190116_001 72.138 30.636 420240000 0 78785000 0 0 0 50969000 0 76245000 72794000 0 89092000 52358000 0 16540 2355 15549 146169;146170;146171;146172;146173;146174 186433;186434;186435;186436;186437;186438 186433 6 GLEETVAR Unmodified 873.4556 0.45559579 2946 Q12840;J3KNA1 KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 25.869 25.869 2 0.045132 19580 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.281 15.779 53261000 0 0 0 0 0 0 0 25508000 0 0 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1079.5611 0.56112349 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 70.086 70.086 2 0.0054673 65957 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.948 51.927 88772000 56282000 0 0 0 0 0 0 0 0 32490000 0 0 0 16546 2938 15555 146218;146219;146220 186494;186495;186496 186496 3 GLELEPGAGLFVAQAGGADPDKFQGVIAELK Unmodified 3096.6132 0.61316565 2419 P39060 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.44 154.44 3 7.25E-31 159087 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.66 94.296 1848400000 112580000 183730000 99028000 0 314320000 66615000 97780000 98428000 197550000 95524000 250190000 175460000 157230000 16547 2419 15556 146221;146222;146223;146224;146225;146226;146227;146228;146229;146230;146231;146232 186497;186498;186499;186500;186501;186502;186503;186504;186505;186506;186507;186508 186504 12 GLELFLDLVSQPSR Unmodified 1572.8512 0.8511575 1983 Q6ICJ4;P0CG30;A0A087WY67;P0CG29 Em:AP000351.3;GSTT2B;GSTT2 Glutathione S-transferase theta-2B;Glutathione S-transferase theta-2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 1 159.52 159.52 2;3 2.255E-07 163605 QUIQUE_C1277_190116_001 150.94 137.74 1027500000 124630000 88686000 46237000 0 0 18132000 142190000 125470000 173130000 0 288570000 20445000 0 16548 1983 15557 146233;146234;146235;146236;146237;146238;146239;146240;146241;146242;146243;146244 186509;186510;186511;186512;186513;186514;186515;186516;186517;186518;186519;186520;186521;186522 186512 13 GLELFLDLVSQPSR Acetyl (Protein N-term) 1614.8617 0.86172219 1983 Q6ICJ4;P0CG30;A0A087WY67;P0CG29 Em:AP000351.3;GSTT2B;GSTT2 Glutathione S-transferase theta-2B;Glutathione S-transferase theta-2 yes no 1 0 0 1 181.15 181.15 2 0.00077279 187706 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.76 58.506 6113800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6113800 0 0 16549 1983 15557 146245 186523 186523 1 GLELISK Unmodified 758.4538 0.45380487 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 45.043 45.043 2 0.050661 41167 QUIQUE_C1563_190116_001 74.415 18.974 169380000 0 78255000 0 0 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186606;186607;186608;186609;186610;186611;186612;186613;186614;186615 186609 7 GLESTTLADK Unmodified 1033.5292 0.52915466 2177 P21291;E9PND2;E9PP21 CSRP1 Cysteine and glycine-rich protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.728 31.728 2 0.0043648 26479 QUIQUE_C1277_190116_001 81.163 40.139 4617100000 0 766970000 919460000 886530000 728910000 778140000 0 0 0 537050000 0 0 0 16560 2177 15568 146317;146318;146319;146320;146321;146322;146323;146324 186616;186617;186618;186619;186620;186621;186622;186623;186624;186625;186626 186616 11 GLESTTLADKDGEIYCK Unmodified 1898.8932 0.89315825 2177 P21291;E9PND2;E9PP21 CSRP1 Cysteine and glycine-rich protein 1 yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 3 3 2 2 2 2 59.55 59.55 2;3 2.4472E-180 59269 QUIQUE_C1438_190116_001 256.57 224.36 30702000000 1652000000 692760000 2009000000 1860300000 550100000 676930000 1858600000 4131900000 4591600000 1357500000 3913200000 3280400000 4127900000 16561 2177 15569 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186720;186721;186722;186723;186724;186725;186726;186727;186728;186729;186730;186731;186732;186733;186734;186735;186736;186737;186738;186739;186740;186741;186742;186743;186744;186745;186746 186729 27 GLEYLYLSVHDEDR Unmodified 1707.8104 0.8104149 1515 O43237;H3BUM4 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 98.493 98.493 3 0.0082854 95271 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.408 34.7 17352000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17352000 0 0 0 16570 1515 15578 146415 186747 186747 1 GLEYLYLSVHDEDRDDHTR Unmodified 2332.072 0.072002329 1515 O43237 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.813 74.813 4 2.6298E-06 75400 QUIQUE_C1576_190116_001 99.891 84.801 1251600000 62588000 135950000 134130000 0 112640000 81495000 124700000 90287000 80253000 65818000 134740000 106010000 122960000 16571 1515 15579 146416;146417;146418;146419;146420;146421;146422;146423;146424;146425;146426;146427 186748;186749;186750;186751;186752;186753;186754;186755;186756;186757;186758;186759;186760;186761;186762;186763;186764;186765;186766 186758 18 GLFATQLIR Unmodified 1017.5971 0.59711507 3359 Q6GMV2;C9IYN9;E2QRN5;F8WEJ9 SMYD5 SET and MYND domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.559 93.559 2 0.0001503 95434 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.98 101.68 468230000 43983000 51385000 32649000 29892000 45924000 25203000 34660000 40214000 35711000 0 45596000 43045000 39968000 16572 3359 15580 146428;146429;146430;146431;146432;146433;146434;146435;146436;146437;146438;146439 186767;186768;186769;186770;186771;186772;186773;186774;186775;186776;186777;186778;186779;186780 186774 14 GLFDEEMNEILTDPSDDTK Unmodified 2167.9467 0.94670997 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 152.86 152.86 2;3 6.6067E-267 148079 QUIQUE_DMIX4_190116_001 288.77 270.64 5031000000 245140000 399360000 473520000 172140000 337640000 216790000 426600000 407580000 506570000 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146519;146520;146521;146522;146523;146524;146525;146526;146527;146528;146529;146530;146531;146532;146533;146534;146535 186903;186904;186905;186906;186907;186908;186909;186910;186911;186912;186913;186914;186915;186916;186917;186918;186919;186920;186921;186922;186923 186911 20 GLFIIDGK Unmodified 861.496 0.49600404 2346 P32119 PRDX2 Peroxiredoxin-2 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 3 1 2 2 2 1 3 2 2 88.826 88.826 1;2 0.0018988 91716 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.85 69.673 39850000000 2752100000 2522200000 3918300000 2295100000 4164700000 2425700000 2329300000 3291800000 3485600000 1256800000 5417400000 3035000000 2955900000 16581 2346 15588 146536;146537;146538;146539;146540;146541;146542;146543;146544;146545;146546;146547;146548;146549;146550;146551;146552;146553;146554;146555;146556;146557;146558;146559;146560 186924;186925;186926;186927;186928;186929;186930;186931;186932;186933;186934;186935;186936;186937;186938;186939;186940;186941;186942;186943;186944;186945;186946;186947;186948;186949;186950;186951;186952;186953;186954;186955;186956;186957;186958;186959;186960;186961;186962;186963;186964;186965;186966;186967;186968;186969;186970;186971;186972;186973;186974;186975;186976 186961 48 GLFIIDGKGVLR Unmodified 1286.7711 0.77105669 2346 P32119 PRDX2 Peroxiredoxin-2 yes yes 0 0 1 1 96.202 96.202 3 0.059597 100591 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.238 13.362 17122000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17122000 0 0 16582 2346 15589 146561 186977 186977 1 GLFIIDPNGVIK Unmodified 1284.7442 0.74417324 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.6 129.6 2 0.00052413 134081 QUIQUE_C1277_190116_001 115.71 100.05 13740000000 1236100000 1056500000 1103800000 786670000 967350000 1000300000 970060000 981630000 1222100000 532100000 1401500000 1313100000 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15594 146600;146601;146602 187035;187036;187037 187036 3 GLFLPEDENLR Unmodified 1301.6616 0.66156582 2944 Q12797 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 97.708 97.708 2 0.015527 99666 QUIQUE_C1403_190116_001 57.55 34.121 107340000 0 25590000 0 30731000 0 34192000 0 0 0 16823000 0 0 0 16588 2944 15595 146603;146604;146605;146606 187038;187039;187040;187041;187042 187040 5 GLFPASYVQVIR Unmodified 1348.7503 0.75032125 3930 Q96RF0 SNX18 Sorting nexin-18 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 118.41 118.41 2 0.0053604 121460 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.056 45.281 124510000 0 0 28779000 49170000 0 46562000 0 0 0 0 0 0 0 16589 3930 15596 146607;146608;146609;146610;146611;146612 187043;187044;187045;187046;187047;187048 187046 5 GLFPDNFVR Unmodified 1063.5451 0.5450795 3806 Q96B97;Q5VSN0 SH3KBP1 SH3 domain-containing kinase-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 102.45 102.45 2 0.038033 105877 QUIQUE_C1368_190116_001 68.787 45.358 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16590 3806 15597 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Unmodified 1324.587 0.58702067 1714 O95218 ZRANB2 Zinc finger Ran-binding domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 86.204 86.204 2 0.023691 88366 QUIQUE_DMIX8_190116_001 53.751 34.436 35639000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35639000 16594 1714 15601 146627 187063 187063 1 GLFSSDSGIEMTPAESTEVNK Unmodified 2198.0049 0.004893546 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.72 105.72 2 1.847E-112 109131 QUIQUE_C1368_190116_001 262.37 241.52 580480000 55968000 0 45234000 79728000 50143000 46227000 28733000 51398000 55750000 0 54086000 46254000 66956000 16595 3199 15602 146628;146629;146630;146631;146632;146633;146634;146635;146636;146637;146638 187064;187065;187066;187067;187068;187069;187070;187071;187072;187073;187074 187065 11 GLFTGLTPR Unmodified 960.53927 0.53926584 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.049 82.049 2 0.00028853 84944 QUIQUE_C1218_190116_001 137.18 67.747 2200100000 184350000 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146653;146654;146655;146656;146657;146658;146659 187096;187097;187098;187099;187100;187101;187102;187103 187096 8 GLGACTSRPIHPSK Unmodified 1479.7616 0.76163099 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734;B8ZZI0;C9JN42 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 0 1 1 13.86 13.86 4 0.016754 6093 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.227 35.543 61359000 0 0 0 0 0 0 0 61359000 0 0 0 0 0 16599 4106 15606 146660 187104 187104 1 GLGAFVIDSDHLGHR Unmodified 1592.8059 0.80593865 2963 Q13057;K7EQ60 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 72.531 72.531 2;3;4 3.6374E-09 72980 QUIQUE_C1277_190116_001 92.039 83.211 1639800000 126170000 164110000 141110000 131280000 121760000 88706000 154720000 115730000 118160000 64908000 127720000 131100000 154370000 16600 2963 15607 146661;146662;146663;146664;146665;146666;146667;146668;146669;146670;146671;146672;146673;146674;146675;146676;146677;146678;146679;146680;146681;146682;146683;146684;146685;146686;146687 187105;187106;187107;187108;187109;187110;187111;187112;187113;187114;187115;187116;187117;187118;187119;187120;187121;187122;187123;187124;187125;187126;187127;187128;187129;187130;187131;187132;187133;187134;187135;187136;187137;187138;187139 187110 35 GLGAGAGAGEESPATSLPR Unmodified 1696.838 0.83802663 1488 O15173 PGRMC2 Membrane-associated progesterone receptor component 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.566 60.566 2 8.935E-05 56753 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.944 28.904 512380000 0 0 0 0 0 0 0 101240000 103680000 80644000 116880000 0 109950000 16601 1488 15608 146688;146689;146690;146691;146692 187140;187141;187142;187143;187144;187145 187143 6 GLGATFILR Unmodified 946.56 0.56000128 146 A0A0A0MRF4;P49406;S4R3W9 MRPL19 39S ribosomal protein L19, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 88.145 88.145 2 0.024241 89693 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.923 44.565 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16602 146 15609 146693;146694 187146;187147 187147 2 GLGATLLR Unmodified 799.49159 0.49158736 4190;4134 Q9H1K4;Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;E9PS95 SLC25A18;SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 2;Mitochondrial glutamate carrier 1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 54.145 54.145 2 0.039163 51293 QUIQUE_C1563_190116_001 89.673 37.442 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16603 4134;4190 15610 146695;146696;146697;146698;146699;146700;146701;146702;146703;146704 187148;187149;187150;187151;187152;187153;187154;187155;187156;187157 187153 10 GLGAVILVHAENGDLIAQEQK Unmodified 2174.1695 0.16953153 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 107.75 107.75 2;3 8.476E-165 111527 QUIQUE_C1277_190116_001 278.84 252.21 10950000000 1120300000 1111700000 972730000 874460000 795380000 939390000 1172600000 463320000 664130000 614120000 729050000 826890000 665860000 16604 3050 15611 146705;146706;146707;146708;146709;146710;146711;146712;146713;146714;146715;146716;146717;146718;146719;146720;146721;146722;146723;146724;146725;146726;146727;146728;146729;146730 187158;187159;187160;187161;187162;187163;187164;187165;187166;187167;187168;187169;187170;187171;187172;187173;187174;187175;187176;187177;187178;187179;187180;187181;187182;187183;187184;187185;187186;187187;187188;187189;187190;187191;187192;187193;187194;187195;187196;187197;187198;187199;187200;187201;187202;187203 187163 45 GLGAVILVHAENGDLIAQEQKR Unmodified 2330.2706 0.27064256 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 3 2 2 2 2 2 94.302 94.302 2;3;4 2.8207E-66 96834 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172 154.85 5720300000 36608000 189160000 181410000 88841000 392100000 56626000 350640000 980000000 615720000 46152000 819130000 1155400000 808520000 16605 3050 15612 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0.019862 136661 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.694 42.246 15896000 0 0 0 0 0 0 0 15896000 0 0 0 0 0 16617 1250 15624 146844 187351 187351 0 GLGLSPDLVVCR Unmodified 1284.686 0.68600643 476 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;B4E1E0;A0A3B3ITB8 CTPS1 CTP synthase 1;CTP synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.022 99.022 2 3.4383E-14 103182 QUIQUE_C1218_190116_001 164.68 108.43 441130000 47544000 46762000 44223000 46154000 39107000 38715000 0 32355000 30332000 14989000 35639000 26877000 38434000 16618 476 15625 146845;146846;146847;146848;146849;146850;146851;146852;146853;146854;146855;146856 187352;187353;187354;187355;187356;187357;187358;187359;187360;187361;187362;187363;187364;187365;187366;187367;187368 187353 17 GLGMTLSYLFR Oxidation (M) 1272.6536 0.65364367 1387 O00217;E9PPW7;E9PKH6;E9PN51;F8W9K7 NDUFS8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 1 1 1 2 2 1 2 2 1 1 130.78 130.78 2 0.00017181 133646 QUIQUE_C1563_190116_001 128.69 105.26 1298100000 151680000 139240000 75376000 48511000 69504000 184040000 116040000 56237000 180830000 82228000 128530000 0 65868000 16619 1387 15626 146857;146858;146859;146860;146861;146862;146863;146864;146865;146866;146867;146868;146869;146870;146871;146872;146873;146874 187369;187370;187371;187372;187373;187374;187375;187376;187377;187378;187379;187380;187381;187382;187383;187384;187385;187386;187387;187388;187389;187390 187379 778 21 GLGMTLSYLFR Unmodified 1256.6587 0.65872905 1387 O00217;E9PPW7;E9PKH6;E9PN51;F8W9K7 NDUFS8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial yes no 0 0 0 1 141.32 141.32 2 1.1162E-05 144189 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.09 96.24 169110000 0 0 0 0 0 0 0 169110000 0 0 0 0 0 16620 1387 15626 146875 187391;187392 187392 2 GLGNQVEVLK Unmodified 1055.5975 0.597509 4380 Q9P265 DIP2B Disco-interacting protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 50.967 50.967 2 0.061443 49678 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.436 27.553 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16621 4380 15627 146876 187393 187393 1 GLGPLAEAAAAGDGAAAAGAAR Unmodified 1807.9177 0.91767394 1556 O43815 STRN Striatin yes yes 0 0 0 1 1 93.679 93.679 2 0.010216 97999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.177 24.616 63288000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38891000 0 24398000 16622 1556 15628 146877;146878 187394;187395 187394 2 GLGPSPAGDGPSGSGK Unmodified 1339.6368 0.63680763 567 F5GYS3;A8MXU7;Q92934 BAD Bcl2-associated agonist of cell death yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.75 24.75 2 6.5854E-06 19202 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.417 60.193 145360000 21832000 24219000 12206000 32775000 0 20316000 34011000 0 0 0 0 0 0 16623 567 15629 146879;146880;146881;146882;146883;146884;146885;146886 187396;187397;187398;187399;187400;187401;187402;187403 187402 8 GLGSFEYQDTTDR Unmodified 1487.6529 0.65285163 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 69.854 69.854 2 3.2792E-06 70506 QUIQUE_C1218_190116_001 108.47 89.199 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16624 4517 15630 146887;146888 187404;187405 187404 2 GLGSTVQEIDLTGVK Unmodified 1515.8144 0.81443765 3821 Q96CN7;D6RGE2 ISOC1 Isochorismatase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.691 96.691 2 2.2378E-06 98931 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.22 93.871 2308600000 203100000 227070000 177770000 159360000 209850000 145500000 148160000 171220000 143130000 69935000 254710000 220870000 177920000 16625 3821 15631 146889;146890;146891;146892;146893;146894;146895;146896;146897;146898;146899;146900;146901 187406;187407;187408;187409;187410;187411;187412;187413;187414;187415;187416;187417;187418;187419;187420;187421 187415 16 GLGTDDNTLIR Unmodified 1173.599 0.59896556 1968 P09525;Q6P452 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.217 56.217 2 1.4675E-08 54756 QUIQUE_DMIX3_190116_001 183.65 129.49 1734100000 0 0 201190000 170260000 247290000 138480000 187140000 140340000 161920000 0 279420000 0 208080000 16626 1968 15632 146902;146903;146904;146905;146906;146907;146908;146909;146910 187422;187423;187424;187425;187426;187427;187428;187429;187430;187431 187429 9 GLGTDEDAIISVLAYR Unmodified 1691.873 0.87301516 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 148.48 148.48 2;3 1.143E-07 152917 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.2 96.741 1072000000 40385000 186440000 32708000 68915000 35828000 35993000 179240000 39823000 327220000 18142000 38928000 33101000 35288000 16627 1968 15633 146911;146912;146913;146914;146915;146916;146917;146918;146919;146920;146921;146922;146923;146924;146925;146926 187432;187433;187434;187435;187436;187437;187438;187439;187440;187441;187442;187443;187444;187445;187446;187447;187448;187449;187450;187451 187450 20 GLGTDEDSLIEIICSR Unmodified 1776.8564 0.85637882 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;A6NMY6;H0YKS4;H0YNP5;H0YN28;H0YL33;H0YMM1;H0YNA0;H0YN52;H0YLE2 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 145.22 145.22 2;3 3.0722E-44 148135 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146953;146954;146955;146956;146957;146958;146959;146960;146961;146962;146963;146964;146965;146966;146967;146968;146969;146970;146971;146972;146973;146974;146975;146976;146977;146978;146979;146980;146981;146982 187482;187483;187484;187485;187486;187487;187488;187489;187490;187491;187492;187493;187494;187495;187496;187497;187498;187499;187500;187501;187502;187503;187504;187505;187506;187507;187508;187509;187510;187511;187512;187513;187514;187515;187516;187517;187518;187519;187520;187521;187522;187523;187524;187525;187526;187527;187528;187529;187530;187531;187532;187533;187534;187535;187536;187537 187537 56 GLGTDEDTLIEILASR Unmodified 1701.8785 0.87849447 1853 P04083;Q5T3N1 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 154.97 154.97 2;3 1.325E-130 162325 QUIQUE_DMIX5_190116_001 241.17 188.89 11250000000 432510000 686660000 1062000000 786330000 948050000 759090000 1180200000 625080000 1338100000 357050000 1351100000 617050000 1106800000 16630 1853 15636 146983;146984;146985;146986;146987;146988;146989;146990;146991;146992;146993;146994;146995;146996;146997;146998;146999;147000;147001;147002;147003;147004;147005;147006;147007;147008 187538;187539;187540;187541;187542;187543;187544;187545;187546;187547;187548;187549;187550;187551;187552;187553;187554;187555;187556;187557;187558;187559;187560;187561;187562;187563;187564;187565;187566;187567;187568;187569 187564 31 GLGTDEESILTLLTSR Unmodified 1703.8941 0.89414453 1954 P08758;E9PHT9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 157.9 157.9 2;3 1.3159E-54 162536 QUIQUE_DMIX3_190116_001 232.42 210.08 70438000000 3933500000 5157400000 5838900000 5702200000 7430200000 4852400000 6426400000 5853900000 6083100000 2307500000 6937800000 3296900000 6617300000 16631 1954 15637 147009;147010;147011;147012;147013;147014;147015;147016;147017;147018;147019;147020;147021;147022;147023;147024;147025;147026;147027;147028;147029;147030;147031;147032;147033;147034;147035;147036;147037;147038 187570;187571;187572;187573;187574;187575;187576;187577;187578;187579;187580;187581;187582;187583;187584;187585;187586;187587;187588;187589;187590;187591;187592;187593;187594;187595;187596;187597;187598;187599;187600;187601;187602;187603;187604;187605;187606;187607;187608;187609;187610;187611;187612;187613;187614;187615;187616;187617;187618 187600 47 GLGTETAEFAELK Unmodified 1364.6824 0.68236084 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7;F5H6A0 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.679 87.679 2 0.0003282 88963 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.39 61.593 540970000 40370000 53268000 48950000 49630000 48331000 47506000 52929000 38872000 39814000 20859000 0 61966000 38472000 16632 2322 15638 147039;147040;147041;147042;147043;147044;147045;147046;147047;147048;147049;147050 187619;187620;187621;187622;187623;187624;187625;187626;187627;187628;187629;187630;187631;187632;187633;187634;187635;187636 187631 18 GLGTGTLYIAESR Unmodified 1336.6987 0.69867961 945 E9PMI6;E9PJF4;J3KN38;P54105 CLNS1A Methylosome subunit pICln yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.786 77.786 2 2.9319E-05 78188 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.11 96.806 1014100000 83127000 86848000 45106000 72985000 105550000 81883000 71550000 69616000 90172000 45147000 90329000 79109000 92678000 16633 945 15639 147051;147052;147053;147054;147055;147056;147057;147058;147059;147060;147061;147062;147063 187637;187638;187639;187640;187641;187642;187643;187644;187645;187646;187647;187648;187649;187650;187651;187652;187653 187646 15 GLGVDSKPELQR Unmodified 1297.699 0.69901396 1766 O95990;C9JAU5 FAM107A Protein FAM107A yes no 0 0 1 1 32.937 32.937 3 0.037411 28340 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.954 16.097 51527000 0 0 0 0 0 0 0 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187671;187672;187673;187674;187675;187676;187677 187673 7 GLGVHLSFVR Unmodified 1083.6189 0.61891314 3610 Q8N6T3;E5RHC5;F8VWB3;E5RGL6;E5RIU2 ARFGAP1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 70.031 70.031 3 0.00030367 70812 QUIQUE_C1277_190116_001 81.099 68.122 336910000 44207000 37887000 0 28901000 0 27134000 26449000 48853000 25179000 0 45314000 24170000 28814000 16637 3610 15643 147084;147085;147086;147087;147088;147089;147090;147091;147092;147093;147094 187678;187679;187680;187681;187682;187683;187684;187685;187686;187687;187688 187679 10 GLHEAHQLYGR Unmodified 1279.6422 0.64216778 4453 Q9UJ14 GGT7 Gamma-glutamyltransferase 7;Gamma-glutamyltransferase 7 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 7 light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 16.308 16.308 3 0.0035441 8195 QUIQUE_C1277_190116_001 62.166 47.349 155420000 0 55254000 0 65118000 0 0 0 35052000 0 0 0 0 0 16638 4453 15644 147095;147096;147097;147098;147099 187689;187690;187691;187692;187693 187690 3 GLHLSDIPIHDATR Unmodified 1543.8107 0.81068967 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.479 59.479 3 0.00067525 58812 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.565 56.497 335220000 36671000 38128000 34005000 0 25762000 0 36165000 28173000 30920000 0 43609000 33173000 28611000 16639 2357 15645 147100;147101;147102;147103;147104;147105;147106;147107;147108;147109;147110;147111 187694;187695;187696;187697;187698;187699;187700;187701;187702;187703;187704;187705 187701 12 GLHQSIEEFR Unmodified 1214.6044 0.60438529 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 38.507 38.507 2;3 0.0001578 34017 QUIQUE_C1563_190116_001 122.52 98.362 10113000000 659920000 778100000 907650000 194660000 699150000 245370000 752220000 1068100000 1073200000 462880000 1599900000 1092500000 579800000 16640 3117 15646 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147191;147192;147193;147194;147195;147196;147197;147198;147199;147200;147201;147202;147203;147204;147205 187833;187834;187835;187836;187837;187838;187839;187840;187841;187842;187843;187844;187845;187846;187847;187848;187849;187850;187851 187843 17 GLIDYNFHCFR Unmodified 1440.6609 0.66085431 4213 Q9HB90 RRAGC Ras-related GTP-binding protein C no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.582 93.582 2;3 0.00012879 95673 QUIQUE_C1368_190116_001 105.2 92.01 394150000 62933000 35410000 39434000 33904000 28119000 34023000 39623000 0 13190000 15355000 34920000 18365000 38874000 16645 4213 15651 147206;147207;147208;147209;147210;147211;147212;147213;147214;147215;147216;147217;147218;147219 187852;187853;187854;187855;187856;187857;187858;187859;187860;187861;187862;187863;187864;187865 187855 12 GLIEIISNAAEYENIPIR Unmodified 2014.0735 0.073505879 1650 O75643;B4E0P5 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 159.91 159.91 2;3 2.9094E-23 164141 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187932;187933;187934;187935;187936;187937;187938;187939;187940;187941;187942;187943;187944;187945 187940 14 GLILHYYSER Unmodified 1249.6455 0.64552182 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 2 55.283 55.283 2;3 0.0087692 53169 QUIQUE_C1563_190116_001 71.223 31.156 416800000 33492000 40851000 32530000 29827000 38691000 66110000 34525000 0 28775000 0 73737000 0 38267000 16653 2867 15658 147281;147282;147283;147284;147285;147286;147287;147288;147289;147290;147291;147292;147293;147294;147295;147296 187946;187947;187948;187949;187950;187951;187952;187953;187954;187955;187956;187957;187958;187959;187960;187961 187954 16 GLILTLK Unmodified 756.51093 0.51092582 2296 P30039;A0A0C4DFS0;V9GY00 PBLD Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.951 72.951 2 0.033008 73045 QUIQUE_C1368_190116_001 88.734 8.3571 267020000 0 0 34002000 30540000 0 0 26475000 22854000 32342000 10919000 42490000 29752000 37642000 16654 2296 15659 147297;147298;147299;147300;147301;147302;147303;147304;147305 187962;187963;187964;187965;187966;187967;187968;187969;187970 187962 9 GLITGIGYEVMVSGFTQGHQTK Unmodified 2322.1678 0.16781697 2233 P24821 TNC Tenascin yes yes 0 0 0 1 1 134.02 134.02 3 1.3973E-05 138065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.76 53.53 76990000 0 0 0 0 0 0 0 0 45163000 31828000 0 0 0 16655 2233 15660 147306;147307 187971;187972;187973 187972 3 GLITGIGYEVMVSGFTQGHQTKPLR Unmodified 2688.4058 0.40575583 2233 P24821 TNC Tenascin yes yes 0 0 1 2 2 1 1 122.6 122.6 3;4 1.7134E-19 127338 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.16 101.89 789570000 0 0 0 0 0 0 0 0 369260000 0 149110000 128820000 142380000 16656 2233 15661 147308;147309;147310;147311;147312;147313 187974;187975;187976;187977;187978;187979;187980 187974 7 GLITIAAQELSDNR Unmodified 1499.7944 0.79437091 3853 Q96FN4;H3BPR8 CPNE2 Copine-2 yes no 0 0 0 1 116.42 116.42 3 0.062784 121236 QUIQUE_C1576_190116_001 30.961 17.825 19409000 0 0 0 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4.6009E-10 96474 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.876 71.889 322650000 0 0 0 82578000 121710000 44734000 0 0 47125000 26503000 0 0 0 16660 1833 15665 147326;147327;147328;147329;147330;147331 187996;187997;187998;187999;188000;188001;188002 188001 6 GLKPNAIYLFLVR Unmodified 1502.8973 0.89731983 29 A0A087WZ85;A0A0A0MSX4;A0A087WTM1;Q9Y6N7;H7C4Y7 ROBO1 Roundabout homolog 1 yes no 0 0 1 1 122.42 122.42 3 0.0099531 128838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.772 47.402 14927000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14927000 0 0 16661 29 15666 147332 188003 188003 1 GLLAGNVFDWGAK Unmodified 1346.6983 0.69828568 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26;H0Y9E4 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.38 133.38 2 2.1249E-10 139225 QUIQUE_C1218_190116_001 147.75 111.81 1090900000 102950000 95502000 81428000 0 117570000 80670000 96488000 87782000 93969000 0 136090000 101900000 96546000 16662 4304 15667 147333;147334;147335;147336;147337;147338;147339;147340;147341;147342;147343;147344 188004;188005;188006;188007;188008;188009;188010;188011;188012;188013;188014;188015;188016;188017 188005 14 GLLALEGELTPILVQMVK Unmodified 1923.1115 0.11147129 652 F8W9A8;B7WPL9;Q6PFW1;A0A087WZV0;O43314 PPIP5K1;PPIP5K2 Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 1;Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 169.88 169.88 2;3 0.00082795 173499 QUIQUE_C1277_190116_001 56.774 51.564 63088000 14927000 7172200 0 0 17634000 0 0 6844300 0 0 0 0 16511000 16663 652 15668 147345;147346;147347;147348;147349 188018;188019;188020;188021;188022 188019 5 GLLALLFPLR Unmodified 1111.7118 0.7117509 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.67 164.67 2 0.00023436 170044 QUIQUE_C1218_190116_001 117.93 103.16 151370000 16530000 18990000 12365000 21236000 0 7896100 21385000 0 11979000 0 21848000 19140000 0 16664 1716 15669 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2689 P60201;B1B1G3;B1B1G4;B1B1G6;B1B1G2;B1B1G1 PLP1 Myelin proteolipid protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.307 32.307 2 0.0036608 27093 QUIQUE_C1403_190116_001 126.24 105.69 2457500000 213320000 139270000 543920000 102780000 0 70969000 465550000 0 229140000 89775000 602780000 0 0 16667 2689 15672 147374;147375;147376;147377;147378;147379;147380;147381;147382;147383;147384 188049;188050;188051;188052;188053;188054;188055;188056;188057;188058;188059 188052 11 GLLEFEHQR Unmodified 1127.5724 0.57235688 3084;956 E9PKU7;E9PNH1;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 47.08 47.08 2;3 0.00015679 44718 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.802 81.534 2430700000 236830000 222460000 225830000 124210000 237760000 64457000 114230000 140140000 199330000 16267000 300750000 191580000 356850000 16668 956;3084 15673 147385;147386;147387;147388;147389;147390;147391;147392;147393;147394;147395;147396;147397;147398;147399;147400;147401;147402;147403;147404;147405;147406;147407;147408;147409 188060;188061;188062;188063;188064;188065;188066;188067;188068;188069;188070;188071;188072;188073;188074;188075;188076;188077;188078;188079;188080;188081;188082;188083;188084;188085;188086;188087;188088;188089;188090;188091;188092;188093 188086 31 GLLEPLGLECTFIDDISAYHK Unmodified 2390.1828 0.18279833 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 160.33 160.33 2;3 1.0199E-75 162754 QUIQUE_DMIX1_190116_001 211.51 192.78 29088000000 1589900000 1193600000 2181100000 2117900000 1771400000 1367400000 3372800000 2361400000 3037400000 763920000 2801500000 3217500000 3311500000 16669 4560 15674 147410;147411;147412;147413;147414;147415;147416;147417;147418;147419;147420;147421;147422;147423;147424;147425;147426;147427;147428;147429;147430;147431;147432;147433;147434;147435;147436 188094;188095;188096;188097;188098;188099;188100;188101;188102;188103;188104;188105;188106;188107;188108;188109;188110;188111;188112;188113;188114;188115;188116;188117;188118;188119;188120;188121;188122;188123;188124;188125;188126;188127;188128;188129;188130;188131;188132;188133;188134;188135 188117 42 GLLFHPEWVVK Unmodified 1323.7339 0.7339429 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 102.17 102.17 2;3 0.0021092 104625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.439 54.387 999260000 72306000 120990000 92403000 55860000 95427000 53417000 111910000 47629000 49353000 23250000 99385000 55056000 122280000 16670 1446 15675 147437;147438;147439;147440;147441;147442;147443;147444;147445;147446;147447;147448;147449;147450;147451;147452;147453;147454;147455 188136;188137;188138;188139;188140;188141;188142;188143;188144;188145;188146;188147;188148;188149;188150;188151;188152;188153;188154;188155;188156;188157;188158 188151 20 GLLFPVCTPLPVEGELCHDPASR Unmodified 2563.2563 0.2563144 1024 F6SYF8;Q9UBP4 DKK3 Dickkopf-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.2 135.2 3 1.4218E-12 139560 QUIQUE_C1403_190116_001 101.71 93.714 744930000 62131000 105500000 108740000 76503000 103270000 74762000 91915000 0 0 0 31733000 45219000 45153000 16671 1024 15676 147456;147457;147458;147459;147460;147461;147462;147463;147464;147465 188159;188160;188161;188162;188163;188164;188165;188166;188167;188168;188169;188170 188163 12 GLLFSASK Unmodified 821.4647 0.46470391 1680 O76054;B3KRD8;C9JZI9;C9JYY7 SEC14L2 SEC14-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.61 53.61 2 0.0061806 51862 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.71 49.192 2091200000 161560000 161090000 202520000 164500000 127340000 190810000 0 202590000 197740000 95603000 235050000 160130000 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188186;188187;188188;188189;188190;188191;188192;188193;188194;188195;188196;188197;188198;188199;188200;188201;188202;188203;188204;188205;188206;188207;188208 188206 22 GLLGCNIIPLQR Unmodified 1352.7598 0.75984008 1390 O00233;J3KN29 PSMD9 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.68 110.68 2 6.8156E-05 114014 QUIQUE_DMIX8_190116_001 136.75 124.71 1033900000 0 136080000 0 161600000 120730000 117930000 96865000 75673000 72432000 20426000 63625000 62545000 105990000 16675 1390 15680 147500;147501;147502;147503;147504;147505;147506;147507;147508;147509;147510 188209;188210;188211;188212;188213;188214;188215;188216;188217;188218;188219 188219 7 GLLGIDGFTNYTR Unmodified 1425.7252 0.72522871 1604 O75038;B9DI82 PLCH2 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase eta-2;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.93 121.93 2 0.0012514 126268 QUIQUE_DMIX8_190116_001 81.017 68.803 125600000 0 36768000 0 0 0 0 0 0 24920000 0 0 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188228;188229;188230;188231;188232;188233;188234;188235;188236;188237;188238;188239 188228 12 GLLIDLLIK Unmodified 996.65832 0.65831834 2228 P24386 CHM Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1 yes yes 0 0 0 1 1 146.8 146.8 2 0.049731 153929 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.565 40.546 11171000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11171000 0 16679 2228 15684 147531;147532 188240;188241 188240 2 GLLLDTSR Unmodified 873.49198 0.4919813 1185 H3BS10;H3BP20;P06865;H3BU85;H3BTD4 HEXA Beta-hexosaminidase;Beta-hexosaminidase subunit alpha yes no 0 0 0 1 46.17 46.17 2 0.043693 43206 QUIQUE_C1218_190116_001 58.194 0 32104000 32104000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16680 1185 15685 147533 188242 188242 1 GLLLFVDEADAFLR Unmodified 1577.8453 0.84534384 1112 H0Y2W2;Q5SV16;Q5T2N8 ATAD3A;ATAD3C ATPase family AAA domain-containing protein 3C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.51 168.51 2 0.00020278 174669 QUIQUE_C1438_190116_001 107.4 61.428 864070000 55789000 70008000 84250000 26218000 30457000 24203000 56171000 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147574;147575;147576;147577;147578;147579;147580;147581;147582;147583;147584;147585;147586 188283;188284;188285;188286;188287;188288;188289;188290;188291;188292;188293;188294;188295;188296;188297;188298;188299;188300;188301;188302;188303;188304;188305;188306;188307;188308;188309 188284 27 GLLNAIVIK Unmodified 939.6117 0.6117025 1856 P04181 OAT Ornithine aminotransferase, mitochondrial;Ornithine aminotransferase, hepatic form;Ornithine aminotransferase, renal form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.391 96.391 2 0.00034292 98540 QUIQUE_DMIX7_190116_001 135.87 95.597 995920000 83483000 77856000 68096000 58532000 68022000 83951000 83185000 56751000 88418000 33080000 121520000 103750000 69269000 16686 1856 15691 147587;147588;147589;147590;147591;147592;147593;147594;147595;147596;147597;147598;147599 188310;188311;188312;188313;188314;188315;188316;188317;188318;188319;188320;188321;188322;188323;188324;188325;188326 188324 17 GLLNDAFQK Unmodified 1004.5291 0.52909508 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6;H0YAW7;E5RI53 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.012 72.012 2 0.00078076 72254 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.86 55.313 955460000 65412000 67473000 75300000 69196000 74448000 79706000 60064000 79178000 86221000 41474000 90017000 73164000 93809000 16687 2361 15692 147600;147601;147602;147603;147604;147605;147606;147607;147608;147609;147610;147611;147612 188327;188328;188329;188330;188331;188332;188333;188334;188335;188336;188337;188338;188339;188340 188334 14 GLLPEELTPLILATQK Unmodified 1735.0131 0.013137454 2067 P13804;H0YLU7;H0YL12;H0YKF0 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 2 2 1 153.28 153.28 2;3 1.5045E-07 157428 QUIQUE_C1277_190116_001 115.8 104.33 3887300000 104030000 151980000 588020000 674650000 105930000 127070000 100490000 108250000 614670000 44972000 601900000 514720000 150580000 16688 2067 15693 147613;147614;147615;147616;147617;147618;147619;147620;147621;147622;147623;147624;147625;147626;147627;147628;147629;147630 188341;188342;188343;188344;188345;188346;188347;188348;188349;188350;188351;188352;188353;188354;188355;188356;188357;188358 188342 15 GLLPEHFLFLAQK Unmodified 1511.85 0.85003529 370 A0A1W2PNW1;P42226;G3V2X7;H0YJH6 STAT6 Signal transducer and activator of transcription 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 122.71 122.71 3 0.00019591 127233 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.313 72.9 44705000 0 0 0 0 0 0 0 0 21573000 0 0 0 23133000 16689 370 15694 147631;147632;147633;147634;147635 188359;188360;188361;188362;188363 188363 4 GLLPGCVYHVQLK Unmodified 1482.8017 0.80170489 101 A0A0G2JN29;A0A087X117;Q15155;A0A0G2JP90;A0A087WW46;J3KN36;P69849;Q5JPE7;A0A087WTD5 NOMO1;NOMO3;NOMO2 Nodal modulator 1;Nodal modulator 3;Nodal modulator 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.52 83.52 3 0.00067391 84823 QUIQUE_C1368_190116_001 74.611 61.819 320240000 34668000 29794000 23023000 25703000 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188419;188420;188421;188422;188423;188424;188425;188426;188427;188428;188429;188430;188431;188432;188433;188434;188435;188436 188431 18 GLLQSGQIPGR Unmodified 1124.6302 0.63020611 1972 P09661;H0YMA0;H0YLR3 SNRPA1 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' yes no 0 0 0 1 57.783 57.783 2 0.051467 57460 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.828 41.85 46116000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46116000 0 0 16694 1972 15699 147691 188437 188437 0 GLLQTEPQNNQAK Unmodified 1439.7369 0.73685603 4590 Q9Y3D6 FIS1 Mitochondrial fission 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 31.736 31.736 2 0.0011167 26053 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.3 91.072 713980000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 109090000 604890000 0 0 16695 4590 15700 147692;147693 188438;188439 188439 2 GLLSDSMTDVPVDTGVAAR Unmodified 1902.9357 0.93569177 80 A0A087WYR3;O43399;A0A087WZ51 TPD52L2 Tumor protein D54 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 113.61 113.61 2;3 4.3793E-11 110548 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.18 124.95 343220000 101110000 125830000 0 0 0 0 0 0 0 21712000 94573000 0 0 16696 80 15701 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188452;188453;188454;188455;188456;188457;188458;188459;188460;188461;188462;188463;188464;188465;188466;188467;188468;188469 188461 18 GLLSQGSPLSWEETKR Unmodified 1786.9214 0.92136233 2509 P48506;E1CEI4;A0A0C4DGB2;D6RGF8 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 86.573 86.573 2;3 5.5802E-20 88303 QUIQUE_DMIX3_190116_001 173.76 142.57 642090000 27508000 116570000 0 69263000 0 41793000 78932000 35496000 178330000 0 0 43401000 50790000 16699 2509 15704 147719;147720;147721;147722;147723;147724;147725;147726;147727;147728;147729 188470;188471;188472;188473;188474;188475;188476;188477;188478;188479;188480;188481 188479 8 GLLSSLDHTSIR Unmodified 1297.699 0.69901396 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 71.625 71.625 2;3 4.1874E-14 71696 QUIQUE_C1368_190116_001 163.94 131.1 8593700000 1037600000 678620000 1092800000 434190000 328060000 681690000 722660000 440260000 792020000 231570000 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188539;188540;188541;188542;188543;188544;188545;188546;188547;188548;188549;188550;188551;188552;188553 188539 15 GLLVAHLHEHK Unmodified 1252.704 0.70403976 3959 Q99570 PIK3R4 Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.064 16.064 3 0.00074491 8850 QUIQUE_C1218_190116_001 78.653 55.735 35056000 20538000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14518000 16704 3959 15709 147788;147789;147790;147791;147792;147793 188554;188555;188556;188557;188558;188559 188554 6 GLMAALCPHK Unmodified 1096.5522 0.55215549 1945 P08571 CD14 Monocyte differentiation antigen CD14;Monocyte differentiation antigen CD14, urinary form;Monocyte differentiation antigen CD14, membrane-bound form yes yes 0 0 0 1 46.308 46.308 3 0.028837 43346 QUIQUE_C1403_190116_001 32.637 16.097 14905000 0 0 0 14905000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16705 1945 15710 147794 188560 188560 1 GLMLVHNK Unmodified 910.50586 0.50585722 2484 P46926;D6RAY7;D6RFF8 GNPDA1 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 20.364 20.364 2 0.018746 13535 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.454 57.907 71755000 0 0 0 0 0 0 0 71755000 0 0 0 0 0 16706 2484 15711 147795 188561 188561 1 GLMPDGTSR Unmodified 932.43857 0.43856552 2028 P11766;H0YAG8 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes no 0 0 0 1 31.856 31.856 2 0.0013644 27199 QUIQUE_C1368_190116_001 104.37 80.393 276620000 0 0 276620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16707 2028 15712 147796 188562 188562 1 GLMPGLTFSNELISR Unmodified 1633.8498 0.84977729 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6;C9JXC1;A0A286YFD6;P31350 RRM2B;RRM2 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B;Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 yes no 0 0 0 1 134.83 134.83 2 0.020349 140468 QUIQUE_C1368_190116_001 61.11 46.42 47180000 0 0 47180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16708 3449 15713 147797 188563 188563 1 GLMPGLTFSNELISR Oxidation (M) 1649.8447 0.84469192 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6;C9JXC1;A0A286YFD6;P31350 RRM2B;RRM2 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B;Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 yes no 0 1 0 1 115.85 115.85 2 0.026615 118292 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.175 44.194 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16709 3449 15713 147798 188564 188564 1 GLMTLQALYGTIPQIFGK Unmodified 1950.0649 0.064855448 462 A0A2R8YF87;Q96AX1 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 1 167.66 167.66 2 0.0012471 171745 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.76 52.441 70348000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70348000 0 16710 462 15714 147799 188565;188566 188566 2 GLMVLELPK Unmodified 998.58344 0.58343884 1256 J3KMX1;Q99567 NUP88 Nuclear pore complex protein Nup88 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.64 105.64 2 0.018516 108835 QUIQUE_C1277_190116_001 64.265 34.926 55221000 0 11779000 0 0 11549000 10487000 0 0 16928000 4478300 0 0 0 16711 1256 15715 147800;147801;147802;147803;147804;147805;147806 188567;188568;188569;188570;188571;188572;188573 188568 7 GLMVTCGTDR Unmodified 1108.5005 0.50051385 3536 Q8IWB7 WDFY1 WD repeat and FYVE domain-containing 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188684;188685;188686;188687;188688;188689;188690;188691;188692;188693;188694;188695;188696;188697 188687 14 GLPFSSFLILPFQR Unmodified 1620.9028 0.90279914 3602 Q8N5V2;C9JTV7 NGEF Ephexin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 168.16 168.16 2 0.00095587 172249 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.52 87.659 162120000 0 0 0 0 0 0 0 0 38487000 0 44417000 50531000 28684000 16729 3602 15733 147921;147922;147923;147924;147925 188698;188699;188700;188701;188702 188701 5 GLPILVELLR Unmodified 1121.7172 0.7172302 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 151.6 151.6 2 0.00028201 157424 QUIQUE_C1218_190116_001 116.25 77.459 1841400000 180680000 176840000 136730000 100900000 72862000 173590000 172440000 81317000 224580000 128120000 109980000 174310000 109060000 16730 855;928 15734 147926;147927;147928;147929;147930;147931;147932;147933;147934;147935;147936;147937;147938;147939;147940;147941 188703;188704;188705;188706;188707;188708;188709;188710;188711;188712;188713;188714;188715;188716;188717;188718;188719;188720;188721;188722;188723;188724 188703 22 GLPLLVALLDHPR Unmodified 1412.8504 0.85036964 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 139.37 139.37 3 0.00012759 145687 QUIQUE_C1438_190116_001 77.912 75.35 242580000 27447000 0 10329000 8125800 12907000 26605000 13603000 13811000 44327000 10896000 21743000 15749000 37036000 16731 730 15735 147942;147943;147944;147945;147946;147947;147948;147949;147950;147951;147952;147953;147954;147955;147956;147957;147958;147959;147960 188725;188726;188727;188728;188729;188730;188731;188732;188733;188734;188735;188736;188737;188738;188739;188740;188741;188742;188743;188744;188745;188746;188747 188732 23 GLPNVQR Unmodified 782.43989 0.43988615 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 23.352 23.352 2 0.024451 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protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 155.69 155.69 2;3 0.040161 160207 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.815 60.128 42483000 10888000 0 0 0 0 0 0 0 27094000 4500500 0 0 0 16736 730 15739 148007;148008;148009 188807;188808;188809 188808 1 GLPWSCSADEVMR Unmodified 1506.6595 0.65953368 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.903 97.903 2 4.3915E-10 100706 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.89 136.7 2511600000 215490000 262960000 261080000 184750000 161750000 183400000 196440000 182430000 156910000 0 232010000 223440000 250940000 16737 2672 15740 148010;148011;148012;148013;148014;148015;148016;148017;148018;148019;148020;148021 188810;188811;188812;188813;188814;188815;188816;188817;188818;188819;188820;188821;188822;188823 188820 13 GLPWSCSADEVMR Oxidation (M) 1522.6544 0.65444831 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 1 0 1 1 1 78.027 78.027 2 0.0048325 78571 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3750.7195 0.71951476 2609 P52597;A0A1B0GW42 HNRNPF Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 157.93 157.93 4 0.00067384 162594 QUIQUE_DMIX7_190116_001 32.496 30.829 215690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 117350000 98342000 0 16740 2609 15742 148038;148039 188846;188847 188847 2 GLPWTLAK Unmodified 884.51199 0.51198846 3383 Q6P587 FAHD1 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 84.828 84.828 2 0.0075912 86408 QUIQUE_C1277_190116_001 97.473 50.706 407730000 34154000 40988000 47117000 29619000 30853000 36305000 33698000 29145000 30985000 20996000 36370000 37500000 0 16741 3383 15743 148040;148041;148042;148043;148044;148045;148046;148047;148048;148049;148050;148051;148052;148053 188848;188849;188850;188851;188852;188853;188854;188855;188856;188857;188858;188859;188860;188861;188862;188863;188864;188865;188866;188867;188868;188869;188870;188871 188849 24 GLQDEDGYR Unmodified 1051.4571 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Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.721 72.721 2 0.0061041 73008 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.161 57.674 448550000 32708000 57771000 50203000 69221000 16959000 0 0 33471000 26751000 14385000 50479000 42128000 54478000 16746 699 15748 148091;148092;148093;148094;148095;148096;148097;148098;148099;148100;148101;148102;148103 188913;188914;188915;188916;188917;188918;188919;188920;188921;188922;188923;188924;188925;188926;188927 188922 15 GLQHLYALVLVNNK Unmodified 1580.9039 0.90386178 2186 P21810 BGN Biglycan yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 98.347 98.347 2;3 5.1302E-22 101702 QUIQUE_C1576_190116_001 159.11 136.78 1375400000 61402000 150850000 62393000 154270000 110000000 39787000 275240000 0 43241000 57605000 129040000 185860000 105670000 16747 2186 15749 148104;148105;148106;148107;148108;148109;148110;148111;148112;148113;148114;148115;148116;148117;148118;148119;148120;148121;148122 188928;188929;188930;188931;188932;188933;188934;188935;188936;188937;188938;188939;188940;188941;188942;188943;188944;188945;188946;188947;188948 188939 21 GLQKEEVVLLTHGDSVDK Unmodified 1966.0371 0.037120373 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 1 1 1 1 61.043 61.043 3 0.0023133 59920 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.688 52.027 91002000 0 0 0 0 0 0 0 28244000 0 0 39218000 23539000 0 16748 2554 15750 148123;148124;148125 188949;188950;188951 188951 3 GLQNSASDLR Unmodified 1059.5309 0.530886 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 26.058 26.058 2 0.0027503 19995 QUIQUE_C1403_190116_001 88.177 51.018 366840000 0 0 0 54981000 87894000 51119000 65921000 0 0 0 106920000 0 0 16749 103 15751 148126;148127;148128;148129;148130 188952;188953;188954;188955;188956;188957;188958 188953 5 GLQQITGHGGLR Unmodified 1235.6735 0.67346791 4442 Q9UI09;F8VRD8;H0YID5;F8VXI1 NDUFA12 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha 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Diphosphomevalonate decarboxylase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 136.39 136.39 3 9.846E-15 139708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.02 67.94 326480000 0 0 0 0 0 0 0 66707000 64640000 0 51166000 86390000 57576000 16757 2626 15758 148183;148184;148185;148186;148187 189013;189014;189015;189016;189017 189013 5 GLQVVEHACSVTSLMMGETMPSITK Unmodified 2705.2897 0.28966472 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.37 134.37 3 1.8029E-38 138455 QUIQUE_C1277_190116_001 140.07 122.64 955830000 159670000 184140000 0 101400000 0 138500000 0 106850000 104620000 36595000 0 0 124070000 16758 2870 15759 148188;148189;148190;148191;148192;148193;148194;148195 189018;189019;189020;189021;189022;189023;189024;189025;189026 189020 7 GLQVVEHACSVTSLMMGETMPSITK Oxidation (M) 2721.2846 0.28457934 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 1 0 2 119.99 119.99 3 0.0012316 123365 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3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.07 120.07 2 6.7294E-10 123571 QUIQUE_C1403_190116_001 143.96 120.61 719760000 81558000 79990000 0 95144000 0 83730000 108530000 70342000 0 49027000 0 69310000 82131000 16773 2427 15773 148339;148340;148341;148342;148343;148344;148345;148346;148347;148348;148349;148350;148351 189193;189194;189195;189196;189197;189198;189199;189200;189201;189202;189203;189204;189205;189206;189207;189208 189197 16 GLSISGNGPCLGFR Unmodified 1433.7085 0.70853279 4476;703 Q9UKU0;E7ERD7;C9J3Z0;C9J4I1;C9JK59;C9JT10;C9JPA5;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 0 1 1 95.749 95.749 2 0.0036853 99055 QUIQUE_C1576_190116_001 67.726 52.518 50901000 0 0 0 0 0 0 50901000 0 0 0 0 0 0 16774 4476;703 15774 148352;148353 189209;189210 189209 2 GLSLLKPLGTYILYGSSNMVTGETK Unmodified 2641.4037 0.40369014 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 146.18 146.18 3 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189373;189374;189375;189376;189377;189378;189379;189380;189381;189382;189383 189383 6 GLSTFLFR Unmodified 939.5178 0.51780212 2853 Q01432;E9PKC5;H0YDY8 AMPD3 AMP deaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 106.61 106.61 2 0.028823 103417 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.422 40.897 4896700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4896700 0 0 0 16790 2853 15789 148493;148494;148495;148496 189384;189385;189386;189387 189386 4 GLSTLQAVLDSAAEK Unmodified 1501.7988 0.79878758 2445 P42262;F8W7L6;D6REK8;D6R9Z0 GRIA2 Glutamate receptor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.81 121.81 2 2.0935E-06 124064 QUIQUE_C1563_190116_001 99.752 73.813 143620000 43879000 46226000 0 0 0 0 0 22217000 31299000 0 0 0 0 16791 2445 15790 148497;148498;148499;148500;148501;148502;148503;148504;148505;148506 189388;189389;189390;189391;189392;189393;189394;189395;189396;189397 189393 9 GLSVNDFYSGLESSGWLR Unmodified 1985.9483 0.94830537 4534 Q9Y217 MTMR6 Myotubularin-related protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 158.8 158.8 2 2.4326E-10 160965 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189415;189416;189417;189418;189419;189420;189421;189422;189423;189424;189425;189426;189427;189428;189429;189430;189431;189432;189433;189434;189435;189436;189437;189438;189439;189440;189441;189442;189443;189444;189445;189446;189447;189448;189449;189450;189451;189452;189453;189454;189455;189456;189457;189458;189459;189460 189420 45 GLTEGLHGFHVHEFGDNTAGCTSAGPHFNPLSR Unmodified 3518.6174 0.61743295 1783 P00441;H7BYH4 SOD1 Superoxide dismutase [Cu-Zn] yes no 0 0 0 4 3 4 4 4 6 4 4 3 4 4 3 4 91.904 91.904 3;4;5;6 0 95757 QUIQUE_C1218_190116_001 291.93 284.56 105050000000 8427500000 11665000000 14232000000 9802400000 8664600000 9618100000 11675000000 3382500000 5980200000 1436700000 5720300000 4594500000 9854600000 16797 1783 15796 148552;148553;148554;148555;148556;148557;148558;148559;148560;148561;148562;148563;148564;148565;148566;148567;148568;148569;148570;148571;148572;148573;148574;148575;148576;148577;148578;148579;148580;148581;148582;148583;148584;148585;148586;148587;148588;148589;148590;148591;148592;148593;148594;148595;148596;148597;148598;148599;148600;148601;148602 189461;189462;189463;189464;189465;189466;189467;189468;189469;189470;189471;189472;189473;189474;189475;189476;189477;189478;189479;189480;189481;189482;189483;189484;189485;189486;189487;189488;189489;189490;189491;189492;189493;189494;189495;189496;189497;189498;189499;189500;189501;189502;189503;189504;189505;189506;189507;189508;189509;189510;189511;189512;189513;189514;189515;189516;189517;189518;189519;189520;189521;189522;189523;189524;189525;189526;189527;189528;189529;189530;189531;189532;189533;189534;189535;189536;189537;189538;189539;189540;189541;189542;189543;189544;189545;189546;189547;189548;189549;189550;189551;189552;189553;189554;189555;189556;189557;189558;189559 189464 93 GLTEQEVETILDK Unmodified 1473.7563 0.75625407 3017 Q13618 CUL3 Cullin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.87 113.87 2 2.901E-17 117722 QUIQUE_C1368_190116_001 163.34 139.25 1076600000 0 120880000 130460000 0 120000000 0 127160000 100770000 138780000 46184000 165570000 126820000 0 16798 3017 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SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 135.56 135.56 3 5.8236E-15 140609 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.55 92.996 227370000 0 0 0 0 0 0 0 0 81729000 0 83882000 61761000 0 16801 4152 15800 148616;148617;148618 189575;189576;189577 189575 3 GLTLIELWEGLTVDDVQK Unmodified 2028.0779 0.077922555 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 4 2 3 2 2 171.14 171.14 2;3 1.3645E-90 174846 QUIQUE_DMIX7_190116_001 259.85 214.78 3579000000 220590000 0 194840000 37898000 188930000 34483000 408540000 366920000 416540000 22489000 683720000 800400000 203620000 16802 2673 15801 148619;148620;148621;148622;148623;148624;148625;148626;148627;148628;148629;148630;148631;148632;148633;148634;148635;148636;148637;148638;148639;148640;148641;148642;148643 189578;189579;189580;189581;189582;189583;189584;189585;189586;189587;189588;189589;189590;189591;189592;189593;189594;189595;189596;189597;189598;189599;189600;189601;189602;189603;189604 189601 26 GLTLTITTPK Unmodified 1043.6227 0.62266112 4740 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 95.158 95.158 2 0.0051889 96298 QUIQUE_C1563_190116_001 78.334 25.618 70114000 0 0 14913000 24768000 0 30433000 0 0 0 0 0 0 0 + 16803 4740 15802 148644;148645;148646;148647 189605;189606;189607;189608 189608 4 GLTMLDHEQVTPEDPGAQFLIR Unmodified 2466.2213 0.2213091 4395 Q9UBE0;M0QZS6;M0QX65;B3KNJ4 SAE1 SUMO-activating enzyme subunit 1;SUMO-activating enzyme subunit 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 122.38 122.38 3 0.0027004 128974 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.499 41.49 123060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 123060000 0 0 16804 4395 15803 148648 189609 189609 0 GLTPLAR Unmodified 726.43882 0.43882351 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.047 30.047 2 0.02103 24166 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Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 90.255 90.255 2 0.00029757 87582 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.719 65.381 238890000 0 32990000 36341000 29137000 50871000 27948000 38580000 0 0 23024000 0 0 0 16807 2107 15805 148669;148670;148671;148672;148673;148674;148675 189632;189633;189634;189635;189636;189637;189638 189638 1442 7 GLTPTGMLPSGVLSGGK Oxidation (M) 1586.8338 0.83379288 2915 Q08209;E7ETC2 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.209 88.209 2 1.2204E-12 89620 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.87 93.391 524940000 52082000 63108000 0 65315000 44623000 0 0 73604000 0 56702000 0 87068000 82441000 16808 2915 15806 148676;148677;148678;148679;148680;148681;148682;148683;148684;148685;148686 189639;189640;189641;189642;189643;189644;189645;189646;189647;189648;189649 189648 2392 10 GLTPTGMLPSGVLSGGK Unmodified 1570.8389 0.83887826 2915 Q08209;E7ETC2 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 109.52 109.52 2 0.00033146 112292 QUIQUE_C1403_190116_001 106.17 77.216 2754200000 346670000 407640000 297270000 356720000 272640000 253920000 293480000 261080000 183940000 80863000 0 0 0 16809 2915 15806 148687;148688;148689;148690;148691;148692;148693;148694;148695;148696;148697 189650;189651;189652;189653;189654;189655;189656;189657;189658;189659;189660;189661;189662;189663 189654 14 GLTPTGTLPLGVLSGGK Unmodified 1566.8981 0.8981077 2508 P48454 PPP3CC Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform yes yes 0 0 0 1 1 118.01 118.01 2 0.01555 123225 QUIQUE_C1576_190116_001 45.79 30.646 59321000 0 0 0 0 0 0 22326000 0 0 0 0 0 36996000 16810 2508 15807 148698;148699 189664;189665 189664 2 GLTSVINQK Unmodified 958.54475 0.54474515 1915 P07195 LDHB 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16817 4556 15814 148756 189733 189733 1 GLVAVITGGASGLGLATAER Unmodified 1812.0105 0.010511692 3969 Q99714;Q5H928 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes no 0 0 0 3 2 2 1 3 2 2 2 2 2 2 2 2 135.12 135.12 2;3 3.4272E-47 139790 QUIQUE_C1368_190116_001 124.18 116.77 5423200000 600700000 464610000 451870000 250560000 406730000 445030000 370790000 418630000 498160000 176010000 518900000 423740000 397500000 16818 3969 15815 148757;148758;148759;148760;148761;148762;148763;148764;148765;148766;148767;148768;148769;148770;148771;148772;148773;148774;148775;148776;148777;148778;148779;148780;148781;148782;148783 189734;189735;189736;189737;189738;189739;189740;189741;189742;189743;189744;189745;189746;189747;189748;189749;189750;189751;189752;189753;189754;189755;189756;189757;189758;189759;189760;189761;189762;189763;189764;189765;189766;189767;189768;189769;189770;189771;189772;189773;189774;189775 189740 42 GLVCAPESLHTVHAALISVEK Unmodified 2230.178 0.17798773 2685 P57772;C9J8T0 EEFSEC Selenocysteine-specific elongation factor yes no 0 0 0 1 91.615 91.615 3 0.02369 93698 QUIQUE_C1277_190116_001 27.846 18.682 61697000 0 61697000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16819 2685 15816 148784 189776 189776 1 GLVDKFPLFMAVYK Unmodified 1626.8844 0.88437189 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.43 139.43 3 0.00013788 144589 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.688 83.167 235120000 0 13606000 11899000 0 0 0 0 44215000 59393000 0 42143000 0 63862000 16820 2184 15817 148785;148786;148787;148788;148789;148790 189777;189778;189779;189780;189781;189782 189780 5 GLVEDTLR Unmodified 901.4869 0.48689592 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.064 52.064 2 0.00059621 50496 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.15 87.476 2446600000 205860000 183640000 186250000 66027000 213190000 89513000 160200000 258060000 284750000 0 409490000 243860000 145740000 16821 3117 15818 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72.819 2 0.046324 74331 QUIQUE_C1218_190116_001 77.748 42.643 84044000 41990000 0 42054000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16823 3720 15820 148825;148826 189823;189824 189823 2 GLVFAISSDR Unmodified 1063.5662 0.56620887 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.725 81.725 2 0.0012588 83954 QUIQUE_C1218_190116_001 99.802 35.235 504910000 57422000 69270000 0 0 36541000 0 63118000 44454000 61496000 31675000 64395000 76541000 0 16824 3596 15821 148827;148828;148829;148830;148831;148832;148833;148834;148835 189825;189826;189827;189828;189829;189830;189831;189832;189833;189834 189825 10 GLVFDTLYGNLLK Unmodified 1451.8024 0.8024164 2552 P49902;Q5JUV4;Q5JUV3;H0YHR8 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 149.39 149.39 2 0.00012146 155143 QUIQUE_C1368_190116_001 117.53 54.31 1249700000 0 0 174920000 0 207230000 0 133330000 198780000 0 66396000 135440000 145220000 188390000 16825 2552 15822 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diphosphate kinase A;Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.135 47.135 2 0.00032589 44692 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.83 78.038 1374800000 0 0 0 0 65916000 0 0 287690000 231810000 0 364290000 222860000 202230000 16827 2092;3222 15824 148858;148859;148860;148861;148862;148863 189861;189862;189863;189864;189865;189866 189863 4 GLVGIEFK Unmodified 861.496 0.49600404 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 79.016 79.016 2 0.027083 75148 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.998 21.825 7175200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7175200 0 0 0 16828 2096 15825 148864 189867 189867 1 GLVGPELHDR Unmodified 1091.5724 0.57235688 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 29.281 29.281 2;3 0.001439 23859 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.635 59.502 5530000000 515450000 469530000 613170000 229970000 259160000 0 350020000 362580000 814740000 209750000 1008200000 423650000 273800000 16829 3117 15826 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189890;189891;189892;189893;189894;189895;189896;189897;189898;189899;189900;189901;189902;189903;189904;189905;189906;189907;189908;189909;189910;189911;189912;189913;189914;189915;189916 189906 23 GLVLDHGAR Unmodified 936.51411 0.51411372 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.059 19.059 2 0.00088036 11696 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.92 74.032 1729600000 237520000 0 172210000 311540000 0 304720000 123870000 294420000 0 139090000 0 0 146210000 16831 2424 15828 148908;148909;148910;148911;148912;148913;148914;148915 189917;189918;189919;189920;189921;189922;189923;189924 189923 2 GLVLGIYSK Unmodified 948.56442 0.56441796 2282 P28838;H0Y983 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 77.748 77.748 2 0.034981 77692 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.642 44.956 310350000 0 0 0 0 0 0 0 310350000 0 0 0 0 0 16832 2282 15829 148916 189925 189925 0 GLVLGPIHK Unmodified 932.58074 0.58073672 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5H0E2;H0YFS2 SLC3A2 4F2 cell-surface 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A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 2 1 1 146.09 146.09 2;3 5.0623E-07 151253 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.326 77.764 809910000 0 0 0 0 0 0 0 72816000 112640000 0 373420000 162680000 88353000 16843 267;275;3025 15839 149009;149010;149011;149012;149013;149014;149015 190025;190026;190027;190028;190029;190030;190031;190032 190031 7 GLVSTLQSATEQMAATVAGSVR Unmodified 2176.1158 0.1157814 3379 Q6P2E9;I3L2F4 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 165.01 165.01 3 5.8383E-06 167068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.88 51.286 327100000 50894000 0 0 0 0 31402000 38996000 53429000 0 9584900 93224000 49567000 0 16844 3379 15840 149016;149017;149018;149019;149020;149021;149022 190033;190034;190035;190036;190037;190038;190039;190040;190041 190037 9 GLVVDMDGFEEER Unmodified 1494.6661 0.66605885 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.71 107.71 2 0.00043589 110888 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149062;149063;149064;149065;149066;149067;149068;149069;149070;149071;149072;149073;149074;149075;149076;149077;149078;149079;149080;149081;149082;149083;149084;149085 190089;190090;190091;190092;190093;190094;190095;190096;190097;190098;190099;190100;190101;190102;190103;190104;190105;190106;190107;190108;190109;190110;190111;190112;190113;190114;190115 190112 25 GLVVLGFPCNQFGHQENAKNEEILNSLK Unmodified 3154.587 0.58696767 41 A0A087WUQ6;P07203 GPX1 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 120.29 120.29 3;4 0.00034498 126372 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.428 34.768 404610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 146720000 53519000 204370000 16849 41 15844 149086;149087;149088 190116;190117;190118 190116 3 GLVVPVIR Unmodified 851.55927 0.559273 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 74.764 74.764 2 0.0021914 80643 QUIQUE_C1218_190116_001 137.5 57.128 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Guanidinoacetate N-methyltransferase yes no 0 0 0 2 158.86 158.86 5 7.2552E-07 166613 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.544 50.251 181040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 181040000 0 0 16854 3064 15849 149127;149128 190178;190179 190179 2 GLWIPEGEK Unmodified 1027.5338 0.53384611 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 71.028 71.028 2 0.047822 71549 QUIQUE_C1576_190116_001 51.346 27.143 25477000 0 0 0 0 0 0 25477000 0 0 0 0 0 0 16855 1789 15850 149129 190180 190180 1 GLWWLVPR Unmodified 1025.5811 0.58107107 165 A0A0A0MS47;Q96PE5;A0A0A0MTN4 OPALIN Opalin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.9 133.9 2 0.0042842 138240 QUIQUE_C1277_190116_001 109.7 89.222 379160000 65368000 54829000 63514000 0 36991000 0 0 43745000 21074000 15035000 0 46259000 32348000 16856 165 15851 149130;149131;149132;149133;149134;149135;149136;149137;149138;149139;149140 190181;190182;190183;190184;190185;190186;190187;190188;190189;190190;190191;190192 190183 12 GLYDFEPENQGELGFK Unmodified 1841.8472 0.84719434 3983 Q99963 SH3GL3 Endophilin-A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 124.5 124.5 2 3.3306E-05 128822 QUIQUE_C1368_190116_001 121.68 112.19 335210000 61851000 63690000 73518000 48269000 0 51068000 0 0 0 36815000 0 0 0 16857 3983 15852 149141;149142;149143;149144;149145;149146;149147;149148 190193;190194;190195;190196;190197;190198;190199;190200;190201;190202;190203;190204;190205;190206 190197 14 GLYDGPVCEVSVTPK Unmodified 1619.7865 0.78650834 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 2 4 3 2 3 87.577 87.577 2 5.8267E-19 97203 QUIQUE_C1218_190116_001 148.18 99.9 90124000000 8424400000 10477000000 9563100000 8083900000 8781300000 6993600000 9843500000 3097300000 4787200000 3096000000 7545900000 404940000 9025300000 16858 365 15853 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110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 34.815 34.815 2 0.0014535 30235 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.568 61.855 55473000 0 0 0 0 0 0 0 55473000 0 0 0 0 0 16864 1408 15859 149223 190303 190303 1 GLYVTDQEK Unmodified 1051.5186 0.51858998 2928 Q08AD1 CAMSAP2 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 29.874 29.874 2 0.051333 24533 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.338 43.647 22881000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22881000 0 16865 2928 15860 149224 190304 190304 1 GMAAAGNYAWVNR Unmodified 1379.6405 0.64045322 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.366 70.366 2 1.7054E-12 69405 QUIQUE_C1563_190116_001 149.94 122.19 1307700000 93156000 120940000 128410000 103390000 87297000 92023000 104510000 121220000 98584000 0 153820000 109870000 94492000 16866 4593 15861 149225;149226;149227;149228;149229;149230;149231;149232;149233;149234;149235;149236 190305;190306;190307;190308;190309;190310;190311;190312;190313;190314;190315;190316;190317;190318 190310 14 GMAAAGNYAWVNR Oxidation (M) 1395.6354 0.63536784 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 1 0 1 1 51.589 51.589 2 0.00091862 50409 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.213 70.006 19507000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19507000 0 0 16867 4593 15861 149237;149238 190319;190320 190320 3028 2 GMAFLHTLEPLIPR Unmodified 1593.8701 0.87011881 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 128.03 128.03 3 1.2692E-05 134066 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.37 112.68 708790000 69812000 45068000 63089000 69557000 45385000 61099000 56049000 53809000 65665000 0 74125000 49572000 55556000 16868 194 15862 149239;149240;149241;149242;149243;149244;149245;149246;149247;149248;149249;149250;149251 190321;190322;190323;190324;190325;190326;190327;190328;190329;190330;190331;190332;190333;190334;190335;190336 190333 15 GMAFTLEER Unmodified 1052.4961 0.4960804 3198 Q16798;E9PMB9;E9PNN2 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 69.027 69.027 2 0.0016745 69476 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.28 65.099 159840000 0 0 49292000 0 0 0 0 0 57981000 0 0 0 52564000 16869 3198 15863 149252;149253;149254;149255;149256;149257;149258;149259;149260;149261;149262;149263 190337;190338;190339;190340;190341;190342;190343;190344;190345;190346;190347;190348 190345 12 GMALYEEEQVER Unmodified 1452.6555 0.65549416 4558 Q9Y2J0;F8VP47 RPH3A Rabphilin-3A yes no 0 0 0 1 1 64.418 64.418 2 0.001344 64422 QUIQUE_C1218_190116_001 90.108 70.322 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16870 4558 15864 149264;149265 190349;190350 190349 2 GMATCFAYGQTGSGK Unmodified 1534.6544 0.65444831 1377 O00139;Q8N4N8 KIF2A;KIF2B Kinesin-like protein KIF2A;Kinesin-like protein KIF2B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.92 55.92 2 5.272E-29 54405 QUIQUE_C1277_190116_001 163.12 156.45 422240000 36826000 39876000 65597000 53294000 39049000 41169000 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190382;190383;190384;190385;190386;190387;190388;190389;190390;190391;190392;190393;190394;190395;190396;190397;190398;190399;190400;190401;190402;190403;190404 190383 23 GMDLQPGNALK Unmodified 1142.5754 0.57539335 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 57.095 57.095 2 0.0024619 55634 QUIQUE_C1277_190116_001 78.192 60.806 273920000 52225000 55643000 56058000 61889000 0 0 0 0 0 0 48110000 0 0 16876 3576 15868 149318;149319;149320;149321;149322 190405;190406;190407;190408;190409 190406 5 GMDVSFSGILSFIEDVAHR Oxidation (M) 2095.0044 0.004440036 4243 Q9NPF4 OSGEP Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase yes yes 0 1 0 1 1 169.9 169.9 3 1.8888E-05 177292 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.107 82.625 105760000 0 0 0 0 0 0 0 0 47674000 0 58088000 0 0 16877 4243 15869 149323;149324 190410;190411 190411 2888 2 GMDYLFSQHDLSFLDDVIPEK Unmodified 2468.157 0.15697751 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 0 1 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QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.616 85.184 3683600000 390650000 341820000 366040000 286390000 201690000 320410000 299460000 215160000 250490000 55995000 350880000 274620000 330000000 16887 2673 15878 149397;149398;149399;149400;149401;149402;149403;149404;149405;149406;149407;149408;149409 190514;190515;190516;190517;190518;190519;190520;190521;190522;190523;190524;190525;190526;190527;190528;190529;190530 190525 17 GMGGAMDLVSSAK Oxidation (M) 1238.5635 0.56350803 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 51.347 51.347 2 0.019348 49346 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.652 61.942 760920000 0 0 103730000 0 0 126110000 0 111080000 274180000 0 0 145820000 0 16888 2673 15878 149410;149411;149412;149413;149414 190531;190532;190533;190534;190535 190534 4 GMGGAMDLVSSAK 2 Oxidation (M) 1254.5584 0.55842266 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 2 0 1 1 28.669 28.669 2 0.025634 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0.97814893 3634 Q8NCW5 APOA1BP NAD(P)H-hydrate epimerase yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 2 132.2 132.2 2;3 1.7134E-07 136722 QUIQUE_C1277_190116_001 109.84 94.636 5428900000 415820000 403630000 389080000 344790000 438380000 347680000 416220000 441980000 470170000 221410000 593790000 407930000 538040000 16952 3634 15924 149916;149917;149918;149919;149920;149921;149922;149923;149924;149925;149926;149927;149928;149929;149930;149931;149932;149933 191184;191185;191186;191187;191188;191189;191190;191191;191192;191193;191194;191195;191196;191197;191198;191199;191200;191201;191202;191203;191204;191205;191206;191207;191208 191188 25 GNAGQSNYGFANSAMER Unmodified 1772.7536 0.75364508 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.919 57.919 2 5.8193E-30 56862 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.66 137.1 483970000 29467000 42482000 36829000 50995000 37737000 36207000 40167000 57589000 42656000 0 0 60186000 49656000 16953 2524 15925 149934;149935;149936;149937;149938;149939;149940;149941;149942;149943;149944 191209;191210;191211;191212;191213;191214;191215;191216;191217;191218;191219;191220 191216 12 GNAGQSNYGFANSAMER Oxidation (M) 1788.7486 0.7485597 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 40.178 40.178 2 7.4719E-17 36601 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.09 121.2 205070000 0 0 0 0 0 0 0 27456000 43472000 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191227;191228;191229;191230;191231;191232;191233;191234;191235;191236;191237;191238;191239;191240;191241;191242;191243;191244;191245;191246;191247;191248;191249;191250;191251;191252;191253;191254;191255;191256;191257;191258;191259;191260;191261;191262;191263;191264;191265;191266;191267;191268;191269;191270;191271 191267 164 40 GNAMVEEGHFAAEDVK Unmodified 1702.7621 0.7620845 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 3 3 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 2 52.403 52.403 2;3 3.1446E-44 50024 QUIQUE_C1403_190116_001 180.48 161.85 10026000000 800430000 1154000000 524920000 756230000 831990000 663830000 911240000 883020000 843260000 200220000 997210000 823480000 636020000 16956 267;275;3025 15926 149996;149997;149998;149999;150000;150001;150002;150003;150004;150005;150006;150007;150008;150009;150010;150011;150012;150013;150014;150015;150016;150017;150018;150019;150020;150021;150022;150023;150024;150025 191272;191273;191274;191275;191276;191277;191278;191279;191280;191281;191282;191283;191284;191285;191286;191287;191288;191289;191290;191291;191292;191293;191294;191295;191296;191297;191298;191299;191300;191301;191302;191303;191304;191305;191306;191307;191308;191309;191310;191311;191312;191313;191314 191284 42 GNDIIAAAK Unmodified 871.47633 0.47633123 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 24.807 24.807 2 0.034139 18740 QUIQUE_C1438_190116_001 70.525 35.031 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16957 2135 15927 150026;150027 191315;191316 191315 2 GNDISSGTVLSDYVGSGPPK Unmodified 1948.9378 0.93780026 2307 P30086 PEBP1 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide yes yes 0 0 0 4 5 4 5 5 4 4 6 6 4 5 4 5 99.606 99.606 2;3 2.694E-243 104502 QUIQUE_DMIX5_190116_001 276.1 267.99 99229000000 6787000000 8526700000 8110600000 7420000000 6999200000 7025400000 6815300000 7554200000 9279400000 3941600000 9659000000 8200800000 8909500000 16958 2307 15928 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191317;191318;191319;191320;191321;191322;191323;191324;191325;191326;191327;191328;191329;191330;191331;191332;191333;191334;191335;191336;191337;191338;191339;191340;191341;191342;191343;191344;191345;191346;191347;191348;191349;191350;191351;191352;191353;191354;191355;191356;191357;191358;191359;191360;191361;191362;191363;191364;191365;191366;191367;191368;191369;191370;191371;191372;191373;191374;191375;191376;191377;191378;191379;191380;191381;191382;191383;191384;191385;191386;191387;191388;191389;191390;191391;191392;191393;191394;191395;191396;191397;191398;191399;191400;191401;191402;191403;191404;191405;191406;191407;191408;191409;191410;191411;191412;191413;191414;191415;191416;191417;191418;191419;191420;191421;191422;191423;191424;191425;191426;191427;191428 191406 110 GNDKVPGAWTEACEQK Unmodified 1788.8101 0.81009732 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 42.307 42.307 2;3 2.875E-05 36323 QUIQUE_C1368_190116_001 118.76 85.533 107530000 0 0 0 0 0 0 0 107530000 0 0 0 0 0 16959 1665 15929 150089;150090 191429;191430;191431 191429 3 GNDMQVGTYIEK Oxidation (M) 1369.6184 0.61838038 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 39.89 39.89 2 6.9686E-05 35798 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.3 104.4 809400000 81846000 87394000 49833000 0 0 76321000 79787000 93087000 75356000 43302000 66699000 103440000 52337000 16960 2280 15930 150091;150092;150093;150094;150095;150096;150097;150098;150099;150100;150101;150102;150103;150104;150105;150106;150107;150108 191432;191433;191434;191435;191436;191437;191438;191439;191440;191441;191442;191443;191444;191445;191446;191447;191448;191449;191450 191444 1650 19 GNDMQVGTYIEK Unmodified 1353.6235 0.62346575 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 60.305 60.305 2 0.00056616 59125 QUIQUE_C1403_190116_001 92.611 74.747 1040900000 258780000 0 239550000 169570000 0 0 184380000 0 0 0 0 188630000 0 16961 2280 15930 150109;150110;150111;150112;150113 191451;191452;191453;191454;191455 191453 4 GNDVAFHFNPR Unmodified 1272.6 0.59996862 2131 P17931;G3V3R6 LGALS3 Galectin-3;Galectin yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 49.657 49.657 2;3 0.00048589 46916 QUIQUE_C1403_190116_001 108.15 91.944 5194500000 421700000 280650000 663710000 476280000 385900000 454370000 438480000 504140000 351930000 125280000 364800000 312750000 414520000 16962 2131 15931 150114;150115;150116;150117;150118;150119;150120;150121;150122;150123;150124;150125;150126;150127;150128;150129;150130;150131;150132;150133 191456;191457;191458;191459;191460;191461;191462;191463;191464;191465;191466;191467;191468;191469;191470;191471;191472;191473;191474;191475;191476;191477;191478 191462 22 GNEEAQIFRPLK Unmodified 1400.7412 0.74121312 3099 Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes yes 0 0 1 1 1 1 56.363 56.363 2 0.0027019 54657 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.48 82.418 62929000 30590000 32339000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16963 3099 15932 150134;150135;150136 191479;191480;191481 191481 3 GNEFEDYCLK Unmodified 1273.5285 0.52850274 2249 P26196;Q8IV96 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 70.802 70.802 2 0.018883 70372 QUIQUE_C1403_190116_001 74.464 70.166 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16964 2249 15933 150137;150138;150139;150140 191482;191483;191484;191485 191484 4 GNEFEDYCLKR Unmodified 1429.6296 0.62961376 2249 P26196;Q8IV96 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 50.666 50.666 2;3 0.0018957 49120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.471 49.49 295560000 0 0 0 0 22712000 0 31253000 28765000 35183000 0 82722000 40735000 54192000 16965 2249 15934 150141;150142;150143;150144;150145;150146;150147;150148 191486;191487;191488;191489;191490;191491;191492;191493;191494;191495 191488 10 GNEFFCEVDEDYIQDK Unmodified 2006.8204 0.82038724 2790 P67870;Q5SRQ6;Q5SRQ3;N0E472;A0A0G2JM12;N0E644;A0A0G2JM58 CSNK2B;CSNK2B-LY6G5B-1181;CSNK2B-LY6G5B--991;CSNK2B-LY6G5B-562 Casein kinase II subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.74 121.74 2 4.3724E-06 125873 QUIQUE_C1368_190116_001 103.11 94.596 583750000 69498000 87854000 59873000 71979000 49187000 92661000 73860000 0 0 22950000 0 25290000 30601000 16966 2790 15935 150149;150150;150151;150152;150153;150154;150155;150156;150157;150158;150159 191496;191497;191498;191499;191500;191501;191502;191503;191504;191505;191506 191498 11 GNEFFCEVDEDYIQDKFNLTGLNEQVPHYR Unmodified 3675.6576 0.65762601 2790 P67870;Q5SRQ6;Q5SRQ3;N0E472;A0A0G2JM12;N0E644;A0A0G2JM58 CSNK2B;CSNK2B-LY6G5B-1181;CSNK2B-LY6G5B--991;CSNK2B-LY6G5B-562 Casein kinase II subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 143.88 143.88 3;4 7.6743E-37 146995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.43 108.68 847920000 0 52363000 0 0 59724000 0 32570000 212520000 0 0 0 187730000 303010000 16967 2790 15936 150160;150161;150162;150163;150164;150165;150166;150167 191507;191508;191509;191510;191511;191512;191513;191514;191515 191510 8 GNEFLFSHLWPLIEK Unmodified 1828.9512 0.9512059 3215 Q2TAA2;H7C5G1 IAH1 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog yes no 0 0 0 2 1 1 3 2 1 1 1 1 1 2 2 2 150.01 150.01 2;3 9.2582E-10 154342 QUIQUE_C1403_190116_001 124.47 102.8 1954700000 97770000 106110000 138270000 196690000 168180000 72848000 139110000 96168000 157500000 44922000 291980000 199180000 245980000 16968 3215 15937 150168;150169;150170;150171;150172;150173;150174;150175;150176;150177;150178;150179;150180;150181;150182;150183;150184;150185;150186;150187 191516;191517;191518;191519;191520;191521;191522;191523;191524;191525;191526;191527;191528;191529;191530;191531;191532;191533;191534;191535;191536;191537;191538;191539;191540;191541;191542;191543;191544;191545;191546;191547 191524 32 GNEIEPNFSATR Unmodified 1333.6262 0.62624295 203 A0A0A6YYH1;Q7Z6K5 C15orf38-AP3S2;ARPIN Arpin yes no 0 0 0 1 1 1 1 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437720000 16971 2414 15940 150200;150201;150202;150203;150204;150205;150206;150207;150208;150209;150210;150211;150212 191560;191561;191562;191563;191564;191565;191566;191567;191568;191569;191570;191571;191572 191568 9 GNEMSEVLR Oxidation (M) 1049.4812 0.48115861 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 1 20.067 20.067 2 0.0014666 12799 QUIQUE_C1576_190116_001 105.57 82.548 443240000 0 0 259410000 0 0 0 183840000 0 0 0 0 0 0 16972 2414 15940 150213;150214 191573;191574 191574 1823 2 GNFGGSFAGSFGGAGGHAPGVAR Unmodified 2033.9456 0.94562002 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R2I7;M0QY96 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 3 1 76.156 76.156 2;3 6.8452E-40 76825 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.82 177.84 3388800000 68824000 80152000 429820000 301440000 379190000 326300000 37836000 381700000 393400000 225450000 321600000 362370000 80719000 16973 2603 15941 150215;150216;150217;150218;150219;150220;150221;150222;150223;150224;150225;150226;150227;150228;150229;150230;150231;150232;150233;150234;150235;150236 191575;191576;191577;191578;191579;191580;191581;191582;191583;191584;191585;191586;191587;191588;191589;191590;191591;191592;191593;191594;191595;191596;191597;191598;191599 191590 20 GNFLELSAAASAPAEK Unmodified 1574.794 0.79403656 3388 Q6PCB0;J3QLP3 VWA1 von Willebrand factor A domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 92.29 92.29 2 0.0011066 95742 QUIQUE_C1438_190116_001 69.345 51.448 149300000 0 47398000 0 0 101900000 0 0 0 0 0 0 0 0 16974 3388 15942 150237;150238 191600;191601 191601 1 GNFNYIEFTR Unmodified 1259.5935 0.59348625 1303 J3QRS3;P19105;O14950 MYL12A;MYL12B Myosin regulatory light chain 12A;Myosin regulatory light chain 12B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.576 93.576 2 0.0010325 95478 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.89 104.85 3671800000 293980000 284870000 386510000 266930000 301240000 239970000 297540000 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191652;191653;191654 191654 3 GNHETDNMNQIYGFEGEVK Unmodified 2180.9433 0.94329634 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.445 80.445 2;3 1.9935E-172 81637 QUIQUE_C1277_190116_001 292.27 257.31 263260000 39777000 43506000 41901000 0 0 0 79551000 20511000 0 0 0 0 38015000 16983 1148 15951 150287;150288;150289;150290;150291;150292;150293 191655;191656;191657;191658;191659;191660;191661 191656 7 GNHETDNMNQIYGFEGEVK Oxidation (M) 2196.9382 0.93821096 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 1 0 1 63.474 63.474 3 0.00051414 59041 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.073 49.785 17311000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17311000 0 0 0 16984 1148 15951 150294 191662 191662 666 1 GNHHEFVSLVK Unmodified 1265.6517 0.65166983 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 23.555 23.555 2;3 0.00029427 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191751 8 GNILIPGINEAVAAVTEEEHK Unmodified 2203.1485 0.14846174 3897 Q96KP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes yes 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 139.82 139.82 2;3 6.4507E-54 142770 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.37 111.28 37252000000 2567600000 2984000000 3616300000 3060200000 2357100000 3075900000 2611400000 2591000000 3579300000 1471600000 3190300000 2990900000 3156500000 16991 3897 15958 150372;150373;150374;150375;150376;150377;150378;150379;150380;150381;150382;150383;150384;150385;150386;150387;150388;150389;150390;150391;150392;150393;150394;150395;150396;150397;150398 191758;191759;191760;191761;191762;191763;191764;191765;191766;191767;191768;191769;191770;191771;191772;191773;191774;191775;191776;191777;191778;191779;191780;191781;191782;191783;191784;191785;191786;191787;191788;191789;191790;191791;191792;191793;191794;191795;191796;191797;191798;191799;191800;191801;191802;191803;191804 191785 47 GNILSYWIR Unmodified 1120.6029 0.60292873 4113 Q9H061 TMEM126A Transmembrane protein 126A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.32 131.32 2 0.001153 134656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.36 77.018 449010000 31038000 0 49683000 40553000 33591000 35736000 41645000 50192000 49779000 12835000 51999000 0 51956000 16992 4113 15959 150399;150400;150401;150402;150403;150404;150405;150406;150407;150408;150409 191805;191806;191807;191808;191809;191810;191811;191812;191813;191814;191815;191816;191817 191813 13 GNKPDFHLAMPTEQAEGFYNSFLEQLR Unmodified 3138.4869 0.48691928 3688 Q8TEA8;A0A2R8YCT7;A0A2R8Y6X2;A0A087WZV9 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1;D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 1 152.96 152.96 3;4 1.8345E-18 157727 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.723 78.918 887310000 144290000 156150000 170300000 0 36293000 0 0 0 69977000 0 91005000 193050000 26247000 16993 3688 15960 150410;150411;150412;150413;150414;150415;150416;150417;150418;150419;150420;150421 191818;191819;191820;191821;191822;191823;191824;191825;191826;191827;191828;191829;191830 191826 11 GNKPDFHLAMPTEQAEGFYNSFLEQLR Oxidation (M) 3154.4818 0.4818339 3688 Q8TEA8;A0A2R8YCT7;A0A2R8Y6X2;A0A087WZV9 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1;D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase yes no 0 1 1 1 145.01 145.01 4 0.00042096 140676 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.347 40.236 45580000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45580000 0 0 0 16994 3688 15960 150422 191831 191831 2711 1 GNKPDFHLAMPTEQAEGFYNSFLEQLRK Unmodified 3266.5819 0.5818823 3688 Q8TEA8;A0A2R8YCT7;A0A2R8Y6X2;A0A087WZV9 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1;D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase yes no 0 0 2 2 1 2 1 145.24 145.24 4;5 3.5144E-24 150212 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.691 86.175 255230000 0 0 0 0 0 0 0 64458000 46740000 0 101030000 43001000 0 16995 3688 15961 150423;150424;150425;150426;150427;150428 191832;191833;191834;191835;191836;191837 191834 6 GNKPWISLPR Unmodified 1166.656 0.65602693 2757 P62701 RPS4X 40S ribosomal protein S4, X isoform yes yes 0 0 1 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192074 39 GNPVLQLNPALPGVFGGPYPFGIDPIWNIATNK Unmodified 3475.8292 0.82924685 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;F5H1T6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.32 172.32 3 4.1549E-52 179599 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.93 119.03 1680000000 0 46824000 33764000 0 88274000 35136000 90338000 152310000 164360000 0 273590000 455600000 339820000 17013 3780 15979 150591;150592;150593;150594;150595;150596;150597;150598;150599;150600 192091;192092;192093;192094;192095;192096;192097;192098;192099;192100;192101;192102;192103 192100 13 GNPVPQQYLWEK Unmodified 1457.7303 0.73031409 3569 Q8N126;A0A0C4DG09 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.184 82.184 2 0.00051588 83286 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.309 83.951 2686700000 238010000 275630000 0 236220000 0 193980000 388400000 152860000 257890000 103080000 274850000 195320000 370500000 17014 3569 15980 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D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.89 136.89 3 4.7075E-05 140410 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.417 65.359 417800000 40484000 46877000 49727000 40862000 44007000 0 50262000 47819000 49451000 0 0 0 48315000 17017 824 15983 150626;150627;150628;150629;150630;150631;150632;150633;150634;150635;150636 192131;192132;192133;192134;192135;192136;192137;192138;192139;192140;192141;192142;192143 192139 13 GNRPAILTYHDVGLNHK Unmodified 1904.0017 0.0016783401 1191;4492;1181 H3BPH8;H3BRT9;H3BMR6;H3BR92;H3BNQ1;H3BN97;H3BQ86;H3BQJ4;H3BNE7;Q9ULP0 NDRG4 Protein NDRG4 no no 0 0 1 3 3 2 3 2 3 3 1 3 2 2 1 2 40.042 40.042 2;3;4 2.5977E-75 36218 QUIQUE_C1277_190116_001 168.42 153.85 8373600000 953830000 887820000 917240000 799410000 355080000 584220000 934700000 371670000 691590000 240280000 528540000 495760000 613440000 17018 1181;1191;4492 15984 150637;150638;150639;150640;150641;150642;150643;150644;150645;150646;150647;150648;150649;150650;150651;150652;150653;150654;150655;150656;150657;150658;150659;150660;150661;150662;150663;150664;150665;150666 192144;192145;192146;192147;192148;192149;192150;192151;192152;192153;192154;192155;192156;192157;192158;192159;192160;192161;192162;192163;192164;192165;192166;192167;192168;192169;192170;192171;192172;192173;192174;192175;192176;192177;192178;192179;192180 192150 32 GNRPVILTYHDIGLNHK Unmodified 1946.0486 0.048628533 4423 Q9UGV2;Q5TH30;Q5TH29 NDRG3 Protein NDRG3 yes no 0 0 1 1 1 1 51.229 51.229 4 0.00022163 48979 QUIQUE_C1403_190116_001 71.354 66.036 496350000 0 204870000 0 148680000 0 0 142810000 0 0 0 0 0 0 17019 4423 15985 150667;150668;150669 192181;192182;192183 192182 2 GNRPVILTYHDIGMNHK Unmodified 1964.005 0.0050491585 3737 Q92597;E5RIR1;E5RGM5;E5RIV1;E5RIM2;E5RI76;E5RH82;E5RK17 NDRG1 Protein NDRG1 yes no 0 0 1 3 2 2 1 2 1 2 2 44.188 44.188 3;4 1.2775E-23 40779 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15987 150686;150687;150688;150689;150690;150691;150692;150693;150694;150695;150696 192202;192203;192204;192205;192206;192207;192208;192209;192210;192211;192212 192205 11 GNSGLGFSIAGGTDNPHIGDDPSIFITK Unmodified 2786.3511 0.3511373 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19;K7EKP9;C9JYG3;A0A3B3ITI9;O14909;K7EKU8;C9JWP9;A0A3B3ISL1;A0A3B3IRP2 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 129.61 129.61 3 0.020655 134505 QUIQUE_DMIX3_190116_001 23.571 18.411 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17023 487 15988 150697;150698 192213;192214 192214 2 GNSIFGLAPMLSDTDK Unmodified 1664.808 0.80797206 1882 P05186;B1ANL0 ALPL Alkaline phosphatase, tissue-nonspecific isozyme yes no 0 0 0 1 135.21 135.21 2 0.0080422 138957 QUIQUE_C1403_190116_001 53.252 41.089 19489000 0 0 0 19489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17024 1882 15989 150699 192215 192215 1 GNSIIMLEALER Unmodified 1344.7071 0.7071358 565 Q49AN9;F5H013;P62308;A8MWD9 SNRPG;SNRPGP15 Small nuclear ribonucleoprotein G;Putative small nuclear ribonucleoprotein G-like protein 15 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.05 117.05 2 0.0005223 121076 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.756 53.891 424210000 29084000 54564000 42673000 0 32320000 28002000 41748000 24868000 40730000 0 50809000 34110000 45301000 17025 565 15990 150700;150701;150702;150703;150704;150705;150706;150707;150708;150709;150710;150711;150712 192216;192217;192218;192219;192220;192221;192222;192223;192224;192225;192226;192227;192228;192229;192230 192226 14 GNSIIMLEALERV Unmodified 1443.7755 0.77554972 565 Q49AN9;F5H013;P62308;A8MWD9 SNRPG;SNRPGP15 Small nuclear ribonucleoprotein G;Putative small nuclear ribonucleoprotein G-like protein 15 yes no 0 0 1 1 1 1 1 140.4 140.4 2 0.0059132 144065 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.864 53.61 195360000 0 0 0 0 0 0 0 70612000 69208000 0 55542000 0 0 17026 565 15991 150713;150714;150715;150716 192231;192232;192233;192234;192235 192232 5 GNSLDIPVAVTIFFGANDSALKDENPK Unmodified 2831.4341 0.43413865 3215 Q2TAA2;H7C5G1;C9JE02 IAH1 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 157.41 157.41 3 4.1126E-08 162218 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.032 55.805 128260000 31928000 0 0 0 0 0 0 0 37455000 0 58872000 0 0 17027 3215 15992 150717;150718;150719 192236;192237;192238;192239 192238 4 GNSLFFR Unmodified 839.42899 0.42898711 4650 Q9Y6C9 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.619 63.619 2 0.019803 62033 QUIQUE_C1563_190116_001 122.15 93.626 1308200000 148770000 156090000 0 115920000 0 138420000 141800000 0 143350000 0 163660000 153890000 146310000 17028 4650 15993 150720;150721;150722;150723;150724;150725;150726;150727;150728 192240;192241;192242;192243;192244;192245;192246;192247;192248 192243 9 GNSSESIEAIR Unmodified 1161.5626 0.56258006 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.563 32.563 2 1.1955E-05 27839 QUIQUE_C1218_190116_001 143.7 125.88 748490000 130610000 127830000 132110000 108640000 0 0 0 0 54038000 58808000 77713000 0 58751000 17029 831;1569 15994 150729;150730;150731;150732;150733;150734;150735;150736 192249;192250;192251;192252;192253;192254;192255;192256;192257 192249 8 GNSSESIEAIREYEEEFFQNSK Unmodified 2592.1616 0.1616052 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 1 137.66 137.66 3 2.1443E-20 141976 QUIQUE_DMIX7_190116_001 126.69 119.15 153760000 0 0 0 0 0 0 0 72847000 0 0 0 80911000 0 17030 831;1569 15995 150737;150738 192258;192259;192260 192260 3 GNTAAQMAQILSFNK Unmodified 1592.7981 0.79807608 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YDD0;A0A2R8Y517 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 112.17 112.17 2;3 4.1808E-29 110018 QUIQUE_DMIX4_190116_001 203.61 175.6 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16025 150979;150980;150981;150982;150983;150984;150985;150986;150987;150988;150989;150990;150991 192565;192566;192567;192568;192569;192570;192571;192572;192573;192574;192575;192576;192577 192570 12 GPAAIEECCNWFHK Unmodified 1717.7341 0.73409561 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.389 75.389 3 0.0032588 75297 QUIQUE_C1403_190116_001 55.314 44.269 185580000 47865000 38122000 0 29031000 70559000 0 0 0 0 0 0 0 0 17062 2377 16026 150992;150993;150994;150995 192578;192579;192580;192581;192582;192583 192580 6 GPAEGEEAEPADR Unmodified 1326.5688 0.56878765 1327 K7EL81;Q9BZL4 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.356 17.356 2 0.00038363 9846 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.096 84.233 113750000 0 0 0 13243000 0 13580000 10231000 13446000 9306800 0 16440000 16412000 21093000 17063 1327 16027 150996;150997;150998;150999;151000;151001;151002;151003 192584;192585;192586;192587;192588;192589;192590;192591 192589 8 GPAESPDEGITTTEGEGECEQTPEELEPVEK Unmodified 3343.4409 0.44093568 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.867 91.867 3 5.5096E-88 94921 QUIQUE_C1218_190116_001 163.31 154.46 573130000 58483000 57237000 0 47488000 53750000 76823000 48642000 0 0 0 77715000 68860000 84135000 17064 2483 16028 151004;151005;151006;151007;151008;151009;151010;151011;151012 192592;192593;192594;192595;192596;192597;192598;192599;192600 192592 9 GPAFNMASPESDFGINLK Unmodified 1893.8931 0.89309867 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 130.41 130.41 2 0.00034127 133130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.87 85.661 141470000 0 0 0 0 0 57050000 0 84418000 0 0 0 0 0 17065 2935 16029 151013;151014 192601;192602;192603 192602 3 GPAFVNPLIPESPEEEELFR Unmodified 2269.1267 0.12666366 4575 Q9Y305;H7C5Q2 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 150.89 150.89 2;3 1.9212E-56 156307 QUIQUE_C1368_190116_001 173.25 142.81 1213800000 218450000 134440000 195810000 168640000 82958000 124190000 75060000 38929000 62702000 52952000 59678000 0 0 17066 4575 16030 151015;151016;151017;151018;151019;151020;151021;151022;151023;151024;151025;151026;151027;151028;151029;151030;151031 192604;192605;192606;192607;192608;192609;192610;192611;192612;192613;192614;192615;192616;192617;192618;192619;192620;192621;192622;192623;192624;192625;192626 192610 22 GPAGEAGASPPVR Unmodified 1164.5887 0.58873523 2995 Q13425;A0A140TA73 SNTB2 Beta-2-syntrophin yes no 0 0 0 1 20.801 20.801 2 0.026931 13986 QUIQUE_C1438_190116_001 48.561 25.132 27591000 0 0 0 0 27591000 0 0 0 0 0 0 0 0 17067 2995 16031 151032 192627 192627 1 GPAHCLLLGER Unmodified 1221.6288 0.6288259 3124 Q15274;C9JCJ5 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 39.518 39.518 2;3 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1374.664 0.66402543 1347 K7EQQ1;O96005 CLPTM1 Cleft lip and palate transmembrane protein 1 yes no 0 0 0 1 1 19.519 19.519 2 8.3788E-05 12318 QUIQUE_C1368_190116_001 117.25 91.814 60664000 0 0 21430000 0 0 39233000 0 0 0 0 0 0 0 17071 1347 16035 151084;151085 192701;192702 192701 2 GPAPSAMPQSR Unmodified 1097.5288 0.52877751 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 21.464 21.464 2 0.052516 14574 QUIQUE_C1218_190116_001 60.518 36.364 21819000 21819000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17072 1472 16036 151086 192703 192703 0 GPAPVLEYDYYGAYGSR Unmodified 1876.8632 0.86317875 4480 Q9UL12;A0A0A0MT55;Q5SYV1 SARDH Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 106.58 106.58 2 0.00031101 111854 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.38 103.65 46029000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46029000 0 0 17073 4480 16037 151087;151088 192704;192705 192705 2 GPATVEDLPSAFEEK Unmodified 1588.7621 0.76206772 1455 O14908;K7EM11 GIPC1 PDZ domain-containing protein GIPC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.629 60.629 3 4.7322E-36 60523 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.9 139.51 476230000 0 53843000 29515000 46134000 51447000 52366000 28885000 36185000 46531000 0 36391000 34870000 60060000 17076 3149 16040 151139;151140;151141;151142;151143;151144;151145;151146;151147;151148;151149 192794;192795;192796;192797;192798;192799;192800;192801;192802;192803;192804;192805 192800 12 GPAYGLSR Unmodified 819.4239 0.42390173 2408 P37802;X6RJP6 TAGLN2 Transgelin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.752 24.752 2 0.0017974 18326 QUIQUE_DMIX4_190116_001 139.31 89.194 2013400000 347820000 385530000 0 448200000 412240000 266920000 0 0 0 152730000 0 0 0 17077 2408 16041 151150;151151;151152;151153;151154;151155 192806;192807;192808;192809;192810;192811;192812 192812 6 GPCSTYGCGSDSVFEVK Unmodified 1848.7658 0.76584925 931 E9PHR9;Q9NRQ2 PLSCR4 Phospholipid scramblase 4 yes no 0 0 0 1 1 76.63 76.63 2 0.0001231 77309 QUIQUE_C1277_190116_001 115.12 108.46 51845000 0 33020000 0 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192816;192817;192818;192819;192820;192821;192822;192823;192824;192825;192826;192827;192828;192829;192830;192831;192832;192833;192834;192835;192836;192837 192825 21 GPDALTLLEYTETR Unmodified 1577.7937 0.7937022 3887 Q96JB5;J3QRM1 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 133.58 133.58 2;3 0.00018981 139818 QUIQUE_C1438_190116_001 93.623 75.814 387060000 54068000 0 55820000 0 59249000 0 70684000 45574000 0 0 59088000 0 42581000 17081 3887 16045 151177;151178;151179;151180;151181;151182;151183;151184;151185;151186 192838;192839;192840;192841;192842;192843;192844;192845;192846;192847;192848;192849;192850 192842 12 GPDEALLTCK Unmodified 1102.5329 0.53285983 3486 Q86TV6;Q6PIF1;A0A0C4DGK5;H0YK02 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.759 45.759 2 0.00022091 43731 QUIQUE_C1218_190116_001 118.41 94.379 206340000 32403000 0 0 42937000 28548000 27971000 0 0 29041000 0 45439000 0 0 17082 3486 16046 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151220;151221;151222;151223;151224;151225;151226;151227;151228;151229;151230 192891;192892;192893;192894;192895;192896;192897;192898;192899;192900;192901;192902;192903 192903 13 GPDTLWQCPSSPWEK Unmodified 1786.7985 0.79847001 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 109.55 109.55 2 1.8426E-06 113034 QUIQUE_C1403_190116_001 114.71 79 108190000 0 0 0 108190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17088 725 16052 151231 192904 192904 1 GPDVLTATVSGK Unmodified 1143.6136 0.61355299 669 B7ZKJ8;Q14624;H7C0L5 ITIH4 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 yes no 0 0 0 1 1 1 53.399 53.399 2 0.0008444 49978 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.13 94.572 82681000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43532000 0 39150000 17089 669 16053 151232;151233;151234 192905;192906;192907 192905 3 GPDWILGEIK Unmodified 1126.6023 0.60226003 1069 G3V0I5;P49821;E9PMX3;E9PQP1;E9PPR0;E9PPS5 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.2 117.2 2 0.00018922 120756 QUIQUE_C1277_190116_001 128.36 96.427 4954800000 440790000 427080000 399400000 369830000 323970000 343310000 381540000 357270000 358670000 147330000 537640000 470050000 397920000 17090 1069 16054 151235;151236;151237;151238;151239;151240;151241;151242;151243;151244;151245;151246;151247 192908;192909;192910;192911;192912;192913;192914;192915;192916;192917;192918;192919;192920;192921;192922;192923;192924;192925;192926;192927;192928;192929;192930;192931;192932;192933 192910 26 GPDWSIPILDFVEQK Unmodified 1742.8879 0.88793694 632 B5MC35;B5MD16;B5MCA1;Q96G28 CFAP36 Cilia- and flagella-associated protein 36 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 167.53 167.53 2 0.0011638 171152 QUIQUE_C1277_190116_001 95.477 82.901 131160000 19424000 32047000 0 25051000 26900000 0 0 0 0 0 0 0 27737000 17091 632 16055 151248;151249;151250;151251;151252 192934;192935;192936;192937;192938 192935 5 GPEAGYVATPIAMVQAAMTLLSDASHLPK Oxidation (M) 2954.4882 0.48816483 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 171.06 171.06 3 1.1645E-54 172760 QUIQUE_C1563_190116_001 145.18 134.41 579000000 42242000 57094000 52487000 31573000 42486000 119610000 63213000 80972000 35625000 15795000 0 0 37907000 17092 3629 16056 151253;151254;151255;151256;151257;151258;151259;151260;151261;151262;151263;151264;151265 192939;192940;192941;192942;192943;192944;192945;192946;192947;192948;192949;192950;192951;192952 192946 2700;2701 14 GPEAGYVATPIAMVQAAMTLLSDASHLPK Unmodified 2938.4933 0.49325021 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 2 2 3 2 176.47 176.47 3;4 3.8202E-93 177867 QUIQUE_DMIX1_190116_001 173.53 164.44 3669700000 24117000 52440000 43669000 24235000 59062000 0 161620000 227220000 544350000 0 510230000 1799300000 223440000 17093 3629 16056 151266;151267;151268;151269;151270;151271;151272;151273;151274;151275;151276;151277;151278;151279;151280;151281;151282;151283;151284 192953;192954;192955;192956;192957;192958;192959;192960;192961;192962;192963;192964;192965;192966;192967;192968;192969;192970;192971;192972;192973;192974 192963 20 GPEATWR Unmodified 815.3926 0.3926016 4458 Q9UJQ1 LAMP5 Lysosome-associated membrane glycoprotein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.326 23.326 2 0.024658 16228 QUIQUE_C1563_190116_001 97.602 52.991 542670000 97341000 0 100560000 0 80325000 90348000 0 0 89468000 31546000 53086000 0 0 17094 4458 16057 151285;151286;151287;151288;151289;151290;151291 192975;192976;192977;192978;192979;192980;192981 192978 7 GPEEEHLGILGPVIWAEVGDTIR Unmodified 2486.2805 0.28053854 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 155.93 155.93 3 7.6733E-06 162586 QUIQUE_C1438_190116_001 61.616 47.886 86920000 0 0 0 0 69233000 0 0 0 0 17687000 0 0 0 17095 1784 16058 151292;151293;151294 192982;192983;192984 192982 3 GPEEEHPSVTLFR Unmodified 1496.726 0.72595699 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86;A0A1B0GV31;F8WC59;C9JYZ0;A0A1B0GTG3;A0A1B0GVZ3;A0A1B0GVG0;A0A1B0GU36 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 59.777 59.777 3 0.034067 57884 QUIQUE_C1563_190116_001 37.793 27.672 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17096 2885 16059 151295 192985 192985 1 GPEEKPAQESNYR Unmodified 1503.6954 0.69538514 2918 Q08357 SLC20A2 Sodium-dependent phosphate transporter 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 14.082 14.082 3 0.0012167 6395 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.185 69.008 44068000 0 0 0 0 11409000 0 0 0 12186000 0 8748800 0 11724000 17097 2918 16060 151296;151297;151298;151299;151300 192986;192987;192988;192989;192990 192989 4 GPEEPERPVR Unmodified 1164.5887 0.58873523 4468 Q9UK61 FAM208A Protein FAM208A yes yes 0 0 1 1 1 14.035 14.035 3 0.011515 5970 QUIQUE_C1368_190116_001 51.445 24.659 11776000 4935300 0 6841100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17098 4468 16061 151301;151302 192991;192992 192992 2 GPEFQEFLLTK Unmodified 1307.6762 0.67615325 985 F2Z357;J3KPC5;P47736;A0A0A0MQY8;X6R8W7 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 113.59 113.59 2 0.014293 117082 QUIQUE_C1403_190116_001 58.699 46.852 54745000 12537000 0 18135000 10665000 0 0 0 0 0 0 0 0 13408000 17099 985 16062 151303;151304;151305;151306 192993;192994;192995;192996 192995 3 GPEGFTTHLETTFTGDGTPK Unmodified 2091.9749 0.97491405 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 89.489 89.489 3 7.0387E-05 90656 QUIQUE_C1277_190116_001 66.874 57.344 101830000 41210000 42031000 0 0 0 0 0 0 0 18591000 0 0 0 17100 699 16063 151307;151308;151309 192997;192998;192999 192998 3 GPELLTMWFGESEANVR Oxidation (M) 1950.9146 0.9145624 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 0 2 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 2 2 150.21 150.21 2;3 5.1809E-28 145687 QUIQUE_DMIX4_190116_001 146.36 124.72 3421400000 273680000 257460000 215770000 204800000 286040000 181190000 309730000 267580000 291500000 104380000 302240000 300280000 426770000 17101 2658 16064 151310;151311;151312;151313;151314;151315;151316;151317;151318;151319;151320;151321;151322;151323;151324;151325;151326;151327;151328;151329 193000;193001;193002;193003;193004;193005;193006;193007;193008;193009;193010;193011;193012;193013;193014;193015;193016;193017;193018;193019;193020;193021;193022;193023;193024;193025;193026;193027;193028;193029;193030 193022 2097 30 GPELLTMWFGESEANVR Unmodified 1934.9196 0.91964777 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 154.05 154.05 2 6.5891E-13 158421 QUIQUE_DMIX7_190116_001 109 93.835 337670000 25364000 33190000 21066000 20310000 32386000 23430000 0 42072000 43860000 14227000 35734000 0 46031000 17102 2658 16064 151330;151331;151332;151333;151334;151335;151336;151337;151338;151339;151340;151341;151342 193031;193032;193033;193034;193035;193036;193037;193038;193039;193040;193041;193042;193043 193042 11 GPEPESVIGYSGEDLPSAPR Unmodified 2055.9749 0.97491405 1214 H7BY57;H7C0L6 NFASC yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 99.88 99.88 2;3 2.1118E-56 102415 QUIQUE_C1368_190116_001 212.87 198.19 1278400000 141670000 116980000 157980000 137470000 126880000 150310000 149420000 0 85463000 30235000 0 92896000 89117000 17103 1214 16065 151343;151344;151345;151346;151347;151348;151349;151350;151351;151352;151353;151354;151355;151356;151357;151358 193044;193045;193046;193047;193048;193049;193050;193051;193052;193053;193054;193055;193056;193057;193058;193059;193060;193061;193062;193063 193047 20 GPEPESVIGYSGEDYPR Unmodified 1850.8323 0.83227255 1691 O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin yes no 0 0 0 1 1 86.971 86.971 2 8.0042E-07 88934 QUIQUE_C1218_190116_001 106.32 99.887 51803000 51803000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17104 1691 16066 151359;151360 193064;193065 193064 2 GPEPGPQPTMEGDVLDTLEALGYK Unmodified 2513.1996 0.19957061 3246 Q52LJ0 FAM98B Protein FAM98B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 165.93 165.93 3 1.3121E-12 170719 QUIQUE_C1368_190116_001 63.158 56.693 170850000 27009000 35876000 43124000 29125000 0 28343000 0 0 0 7375500 0 0 0 17105 3246 16067 151361;151362;151363;151364;151365;151366 193066;193067;193068;193069;193070;193071;193072 193069 7 GPEPSAQEQMEGMLCR Unmodified 1818.7699 0.76988877 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 90.008 90.008 2 1.7255E-09 93129 QUIQUE_C1218_190116_001 127.56 114.6 98333000 26220000 21151000 0 26350000 0 24612000 0 0 0 0 0 0 0 17106 1472 16068 151367;151368;151369;151370 193073;193074;193075;193076 193073 4 GPETLYAGQK Unmodified 1062.5346 0.53457439 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN3 Neurexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.942 29.942 2 0.0010333 23803 QUIQUE_C1368_190116_001 102.51 62.245 241210000 45568000 53523000 64075000 0 0 0 58274000 0 0 19772000 0 0 0 17107 319 16069 151371;151372;151373;151374;151375;151376 193077;193078;193079;193080;193081;193082;193083 193079 6 GPEVDVSGPK Unmodified 983.49238 0.49237523 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 26.17 26.17 2 0.052073 19440 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.032 18.899 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17108 2935 16070 151377 193084 193084 1 GPEVQLVAHSPWLK Unmodified 1559.846 0.84601255 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 2 1 1 86.709 86.709 2;3 1.5739E-11 88901 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.96 92.89 394140000 0 0 0 0 21248000 0 0 0 58557000 0 190360000 65273000 58703000 17109 290;327;328 16071 151378;151379;151380;151381;151382;151383 193085;193086;193087;193088;193089;193090;193091 193086 6 GPEYLTQMWHFMCDALIK Unmodified 2239.0264 0.026437806 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.32 166.32 3 5.6538E-06 170682 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.569 90.522 314100000 0 12710000 17591000 0 10049000 0 34782000 20117000 63582000 0 40354000 64653000 50267000 17110 1403 16072 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104.44 79.514 24232000 0 0 0 0 0 24232000 0 0 0 0 0 0 0 17118 533 16080 151457;151458;151459 193191;193192;193193 193192 3 GPFSVVR Unmodified 760.42317 0.42317345 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;A0A2R8Y4K4;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 41.734 41.734 2 0.019658 38280 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.22 72.455 378800000 0 0 0 55296000 46751000 42161000 0 51616000 68575000 0 52728000 61670000 0 17119 472;1460 16081 151460;151461;151462;151463;151464;151465;151466 193194;193195;193196;193197;193198;193199;193200;193201;193202;193203;193204 193203 11 GPFTDVVTTNLK Unmodified 1290.682 0.68196691 4369;1719 Q9P0L0;O95292;E5RK64 VAPA;VAPB Vesicle-associated membrane protein-associated protein A;Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.41 89.41 2 2.4761E-07 91352 QUIQUE_C1277_190116_001 146.88 118.79 2006300000 366220000 371620000 304080000 292310000 0 270620000 316570000 0 0 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89043000 40464000 17122 4001 16084 151483;151484;151485;151486;151487;151488;151489;151490;151491;151492;151493;151494 193228;193229;193230;193231;193232;193233;193234;193235;193236;193237;193238;193239;193240;193241;193242 193241 15 GPGAGEGPGGAFAR Unmodified 1199.5683 0.56833414 681 Q9NQA3;C4AMC7;Q6VEQ5 WASH6P;WASH3P;WASH2P WAS protein family homolog 6;Putative WAS protein family homolog 3;WAS protein family homolog 2 yes no 0 0 0 1 35.068 35.068 2 0.0043512 30504 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.483 74.536 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17123 681 16085 151495 193243 193243 1 GPGAGSALDDGR Unmodified 1071.4945 0.49450049 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 20.846 20.846 2 0.00046016 13518 QUIQUE_C1403_190116_001 109.42 84.9 491200000 105920000 131570000 137180000 116530000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17124 1749 16086 151496;151497;151498;151499;151500 193244;193245;193246;193247;193248 193247 5 GPGASGEQPEPGEAAAGGAAEEAR Unmodified 2164.9621 0.96211753 4159 Q9H3P7 ACBD3 Golgi resident protein GCP60 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 41.653 41.653 2 4.5136E-101 38470 QUIQUE_DMIX5_190116_001 192.23 179.25 183890000 0 38681000 0 31263000 30005000 0 0 0 0 0 48799000 35138000 0 17125 4159 16087 151501;151502;151503;151504;151505 193249;193250;193251;193252;193253 193252 5 GPGDGAEEDEAASGGPGGR Unmodified 1684.6925 0.69248461 3567 Q8N111 CEND1 Cell cycle exit and neuronal differentiation protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 26.669 26.669 2 0 19433 QUIQUE_C1218_190116_001 350.8 348.06 3131200000 189610000 222150000 279970000 354670000 135580000 318790000 309360000 185460000 218150000 63284000 368070000 205360000 280740000 17126 3567 16088 151506;151507;151508;151509;151510;151511;151512;151513;151514;151515;151516;151517;151518;151519;151520;151521;151522;151523;151524;151525;151526;151527;151528;151529;151530;151531 193254;193255;193256;193257;193258;193259;193260;193261;193262;193263;193264;193265;193266;193267;193268;193269;193270;193271;193272;193273;193274;193275;193276;193277;193278;193279;193280;193281;193282;193283;193284;193285;193286;193287;193288;193289;193290 193255 37 GPGDINLQDER Unmodified 1212.5735 0.57347909 4377 Q9P227;A0A087WZ73 ARHGAP23 Rho GTPase-activating protein 23 yes no 0 0 0 1 1 46.008 46.008 2 0.0040097 43532 QUIQUE_C1576_190116_001 89.047 61.305 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17127 4377 16089 151532;151533 193291;193292 193292 2 GPGDLEAPSNLVISER Unmodified 1652.837 0.836964 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715;H0Y4P7 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 1 95.436 95.436 2 1.3879E-29 98122 QUIQUE_C1218_190116_001 164.13 128.19 44893000 44893000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17128 90 16090 151534;151535 193293;193294 193293 2 GPGFGVQAGL Unmodified 901.46577 0.46576654 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 94.556 94.556 1 0.020408 97213 QUIQUE_C1368_190116_001 97.033 70.071 88022000 0 43985000 44037000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17129 856 16091 151536;151537 193295;193296 193296 0 GPGGRPHFLTQLHSTFQTPDR Unmodified 2348.1774 0.17741087 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 1 1 61.991 61.991 4 0.00013366 61415 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.304 50.466 52926000 0 0 0 0 0 0 0 0 52926000 0 0 0 0 17130 1877 16092 151538 193297 193297 1 GPGGSPGGLQK Unmodified 953.49304 0.49304393 3792 Q96A00;K7EJB8;K7EMN0 PPP1R14A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 14A yes no 0 0 0 1 14.296 14.296 2 0.0041938 6364 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.744 48.61 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17131 3792 16093 151539 193298 193298 1 GPGGSSLLIEALSNSSHK Unmodified 1752.9006 0.90062689 4011 Q9BSH4 TACO1 Translational activator of cytochrome c oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.151 93.151 3 8.3941E-06 95109 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.97 65.183 661710000 58861000 54423000 64297000 44739000 0 50495000 65699000 52159000 48353000 26250000 84610000 53048000 58781000 17132 4011 16094 151540;151541;151542;151543;151544;151545;151546;151547;151548;151549;151550;151551 193299;193300;193301;193302;193303;193304;193305;193306;193307;193308;193309;193310;193311 193305 11 GPGGVWAAEAISDAR Unmodified 1455.7106 0.71064128 1985 P0DJI8 SAA1 Serum amyloid A-1 protein;Amyloid protein A;Serum amyloid protein A(2-104);Serum amyloid protein A(3-104);Serum amyloid protein A(2-103);Serum amyloid protein A(2-102);Serum amyloid protein A(4-101) yes yes 0 0 0 1 1 92.797 92.797 2 0.00045056 95582 QUIQUE_C1277_190116_001 97.911 81.24 122530000 0 71910000 50623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17133 1985 16095 151552;151553 193312;193313 193312 2 GPGIFEDLQNYILEK Unmodified 1734.8829 0.88285156 4131 Q9H1E5 TMX4 Thioredoxin-related transmembrane protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 156.64 156.64 2 1.3373E-05 160742 QUIQUE_C1403_190116_001 97.163 76.124 149590000 0 0 46144000 53527000 19828000 0 0 0 0 0 30094000 0 0 17134 4131 16096 151554;151555;151556;151557;151558 193314;193315;193316;193317;193318 193316 3 GPGLFFILPCTDSFIK Unmodified 1810.9328 0.93277864 2258 P27105;F8VSL7 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.95 162.95 2 2.3485E-05 166835 QUIQUE_C1403_190116_001 134.3 118.34 4285400000 325390000 289390000 361160000 177760000 324440000 160810000 400400000 331430000 361150000 123540000 345940000 315940000 768040000 17135 2258 16097 151559;151560;151561;151562;151563;151564;151565;151566;151567;151568;151569;151570;151571 193319;193320;193321;193322;193323;193324;193325;193326;193327;193328;193329;193330;193331;193332;193333;193334 193323 16 GPGLGSTQGQTIALPAQGLIEFR Unmodified 2310.2332 0.23319442 2845 Q00577 PURA Transcriptional activator protein Pur-alpha yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 2 2 2 2 2 1 1 2 137.3 137.3 2;3 1.9983E-201 141700 QUIQUE_DMIX3_190116_001 321.02 301.7 10504000000 952450000 1224900000 973700000 906050000 423300000 963040000 841600000 952600000 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193387;193388;193389;193390;193391;193392;193393;193394;193395;193396;193397;193398;193399;193400;193401;193402;193403;193404;193405;193406;193407;193408;193409;193410;193411;193412;193413 193391 26 GPGTSFEFALAIVEALNGK Unmodified 1919.9993 0.9992783 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 2 2 3 2 3 2 2 4 3 2 4 3 2 172.72 172.72 2;3 3.1132E-242 176590 QUIQUE_DMIX3_190116_001 328.08 265.67 15192000000 301660000 549260000 1559000000 245770000 678090000 120910000 847710000 1829000000 1743700000 44033000 3005900000 3162000000 1105000000 17140 3956 16102 151634;151635;151636;151637;151638;151639;151640;151641;151642;151643;151644;151645;151646;151647;151648;151649;151650;151651;151652;151653;151654;151655;151656;151657;151658;151659;151660;151661;151662;151663;151664;151665;151666;151667 193414;193415;193416;193417;193418;193419;193420;193421;193422;193423;193424;193425;193426;193427;193428;193429;193430;193431;193432;193433;193434;193435;193436;193437;193438;193439;193440;193441;193442;193443;193444;193445;193446;193447;193448;193449;193450;193451;193452;193453;193454 193436 39 GPGTSFEFALAIVEALNGKEVAAQVK Unmodified 2645.4065 0.40646734 3956 Q99497;K7ELW0;K7EN27 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 166.94 166.94 3 2.582E-196 169120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 237.95 231.92 626950000 0 0 0 0 0 0 0 472470000 47069000 0 63792000 0 43615000 17141 3956 16103 151668;151669;151670;151671 193455;193456;193457;193458 193455 4 GPGVDLPSVNLSMPK Unmodified 1509.7861 0.78611441 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 112.58 112.58 2 0.0062631 114231 QUIQUE_C1563_190116_001 60.255 40.992 35053000 0 0 0 35053000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17142 2935 16104 151672;151673 193459;193460 193460 1 GPGVGLLGISK Unmodified 996.59678 0.59678072 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.21 75.21 2 0.00036306 75706 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.53 83.569 1807100000 235340000 124270000 203560000 188410000 226520000 221200000 0 343060000 0 128050000 0 0 136640000 17143 98;3487 16105 151674;151675;151676;151677;151678;151679;151680;151681;151682 193461;193462;193463;193464;193465;193466;193467;193468;193469 193467 9 GPGYGIMSIR Unmodified 1049.5328 0.53280025 1012 F5H5P2;P12694;F5GXU9 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.435 73.435 2 0.008101 73015 QUIQUE_C1563_190116_001 83.948 61.817 729080000 59204000 59242000 86351000 64088000 0 56824000 82297000 84564000 86027000 0 0 76290000 74197000 17144 1012 16106 151683;151684;151685;151686;151687;151688;151689;151690;151691;151692 193470;193471;193472;193473;193474;193475;193476;193477;193478;193479 193474 8 GPGYPQAEALLAEAMLK Unmodified 1757.9022 0.9022068 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 2 2 2 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 146.22 146.22 2;3 9.4808E-45 150372 QUIQUE_DMIX7_190116_001 142.91 132.27 4287100000 341870000 388090000 343680000 371230000 304270000 278120000 370340000 253630000 258800000 114610000 405380000 384250000 472860000 17145 3982 16107 151693;151694;151695;151696;151697;151698;151699;151700;151701;151702;151703;151704;151705;151706;151707;151708;151709;151710;151711;151712;151713;151714;151715;151716;151717;151718;151719;151720 193480;193481;193482;193483;193484;193485;193486;193487;193488;193489;193490;193491;193492;193493;193494;193495;193496;193497;193498;193499;193500;193501;193502;193503;193504;193505;193506;193507;193508;193509;193510;193511;193512;193513;193514;193515;193516;193517;193518;193519;193520;193521;193522;193523;193524;193525;193526;193527;193528;193529;193530;193531;193532;193533;193534;193535;193536;193537;193538;193539;193540;193541;193542;193543;193544;193545;193546;193547 193541 68 GPGYPQAEALLAEAMLK Oxidation (M) 1773.8971 0.89712142 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 1 0 1 1 1 129.41 129.41 2 0.0026538 126662 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.235 54.537 66721000 0 0 51225000 0 0 0 0 0 0 15496000 0 0 0 17146 3982 16107 151721;151722;151723 193548;193549;193550 193550 2818 3 GPHGGPSQPTGPR Unmodified 1243.6058 0.60578227 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 10.549 10.549 3 0.00013427 2883 QUIQUE_C1563_190116_001 91.313 74.781 3986600 0 0 0 0 0 3986600 0 0 0 0 0 0 0 17147 4517 16108 151724 193551 193551 1 GPHHLDNSSPGPGSEAR Unmodified 1713.7819 0.78190874 3714 Q8WWM7;H3BUF6 ATXN2L Ataxin-2-like protein yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 10.391 10.391 3;4 3.4113E-07 2684 QUIQUE_C1438_190116_001 103.6 92.66 168580000 24387000 0 0 41215000 28224000 0 0 7992000 27989000 0 0 38774000 0 17148 3714 16109 151725;151726;151727;151728;151729;151730;151731;151732 193552;193553;193554;193555;193556;193557;193558;193559 193555 8 GPHLVQSDGTVPFWAHAGNAIPSSDQIR Unmodified 2956.458 0.45800241 2523 P49257 LMAN1 Protein ERGIC-53 yes yes 0 0 0 2 102.12 102.12 3;4 2.7407E-27 104938 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.954 89.247 150610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 150610000 0 17149 2523 16110 151733;151734 193560;193561 193560 2 GPIDAITGEAR Unmodified 1098.5669 0.56693715 4227;4452;1605;2593 Q9HCM2;Q9UIW2;O75051;P51805 PLXNA4;PLXNA1;PLXNA2;PLXNA3 Plexin-A4;Plexin-A1;Plexin-A2;Plexin-A3 no no 0 0 0 1 66.618 66.618 2 0.024662 66461 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.056 38.827 64877000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64877000 17150 4227;4452;1605;2593 16111 151735 193562 193562 0 GPIFALK Unmodified 744.45341 0.45341094 4086 Q9BZK7;A0A0D9SF63;A0A1B0GVH3;Q9BQ87 TBL1XR1;TBL1Y F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1;F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1Y no no 0 0 0 1 62.128 62.128 2 0.05526 61180 QUIQUE_C1277_190116_001 72.021 27.075 24515000 0 24515000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17151 4086 16112 151736 193563 193563 1 GPIGSIGPK Unmodified 824.4756 0.47560295 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 30.676 30.676 2 0.0090467 25678 QUIQUE_C1218_190116_001 77.072 32.305 340390000 100280000 0 0 0 0 191430000 0 0 0 48678000 0 0 0 17152 2037 16113 151737;151738;151739 193564;193565;193566 193564 3 GPILMELQTYR Oxidation (M) 1335.6857 0.68567208 1943 P08559;P29803 PDHA1;PDHA2 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial;Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, testis-specific form, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 3 2 2 1 2 2 2 3 1 89.898 89.898 2 0.00051811 92232 QUIQUE_C1277_190116_001 103.55 88.88 644080000 47138000 34755000 42758000 25009000 58250000 68574000 32222000 47257000 40040000 0 122040000 86567000 39476000 17153 1943 16114 151740;151741;151742;151743;151744;151745;151746;151747;151748;151749;151750;151751;151752;151753;151754;151755;151756;151757;151758;151759;151760;151761 193567;193568;193569;193570;193571;193572;193573;193574;193575;193576;193577;193578;193579;193580;193581;193582;193583;193584;193585;193586;193587;193588;193589;193590;193591 193568 1183 21 GPILMELQTYR Unmodified 1319.6908 0.69075746 1943 P08559;P29803 PDHA1;PDHA2 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial;Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, testis-specific form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.59 104.59 2 1.6571E-18 108988 QUIQUE_DMIX5_190116_001 171.56 151.8 6672600000 568790000 519110000 620440000 414550000 484630000 474270000 587430000 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151784;151785;151786;151787 193636;193637;193638;193639 193639 1 GPKPQLTEVR Unmodified 1123.635 0.63495714 3486 Q86TV6 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes yes 0 0 1 1 18.262 18.262 3 0.0079199 10939 QUIQUE_C1438_190116_001 57.348 30.675 49722000 0 0 0 0 49722000 0 0 0 0 0 0 0 0 17160 3486 16120 151788 193640 193640 1 GPLASQISGLYLPYK Unmodified 1605.8766 0.87664397 2183 P21589;Q96B60 NT5E 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.73 121.73 2 1.4263E-12 125982 QUIQUE_C1368_190116_001 164.9 130.37 771600000 73084000 55143000 75738000 85798000 78352000 0 69123000 34814000 69819000 19691000 91756000 48103000 70178000 17161 2183 16121 151789;151790;151791;151792;151793;151794;151795;151796;151797;151798;151799;151800;151801 193641;193642;193643;193644;193645;193646;193647;193648;193649;193650;193651;193652;193653;193654;193655;193656;193657;193658 193646 17 GPLEYVPSAK Unmodified 1059.5601 0.56006086 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.565 60.565 2 0.011933 59027 QUIQUE_C1403_190116_001 76.827 49.002 726890000 97450000 0 0 170440000 195540000 0 0 81652000 0 0 181810000 0 0 17162 3086 16122 151802;151803;151804;151805;151806 193659;193660;193661;193662;193663 193660 5 GPLGDQYQTVK Unmodified 1204.6088 0.60880197 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.936 39.936 2 0.00019439 36903 QUIQUE_C1218_190116_001 124.74 103.24 1764100000 187300000 174530000 201570000 132590000 260790000 116350000 172370000 0 188210000 98787000 231630000 0 0 17163 2665 16123 151807;151808;151809;151810;151811;151812;151813;151814;151815;151816 193664;193665;193666;193667;193668;193669;193670;193671;193672;193673;193674;193675 193665 10 GPLGPNWK Unmodified 867.46029 0.46028724 2842;2519 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459;I3L4C0;P48739;A0A0A0MSW4;B3KYB6 PITPNA;PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform;Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.324 45.324 1;2 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GPLTSGSDEENVALPLGDNVLTHNLGIPVLVVCTK Unmodified 3627.8818 0.88181229 1515 O43237;B4E2E0 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 157.74 157.74 3;4 6.4124E-87 165013 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.17 142.31 2513600000 166180000 177190000 157440000 118980000 228710000 110580000 285690000 161270000 213970000 106480000 456390000 132140000 198540000 17181 1515 16141 151935;151936;151937;151938;151939;151940;151941;151942;151943;151944;151945;151946;151947;151948;151949 193811;193812;193813;193814;193815;193816;193817;193818;193819;193820;193821;193822;193823;193824;193825;193826;193827;193828 193825 17 GPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSK Unmodified 2402.1907 0.1906609 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 3 2 3 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 133.3 133.3 2;3 2.8951E-100 139296 QUIQUE_C1438_190116_001 232.28 219.45 42305000000 3672100000 4128600000 3594800000 3313900000 3168400000 3281400000 3612500000 2252500000 3167500000 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N-terminally processed yes no 0 0 0 1 41.038 41.038 2 0.051266 37523 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.88 39.571 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17184 1440 16144 151980 193872 193872 1 GPMDSDDSHGSVLR Unmodified 1471.6362 0.6361557 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 31.001 31.001 2;3 7.7314E-14 25738 QUIQUE_C1277_190116_001 141.08 130.93 1117600000 141760000 140840000 159290000 169580000 104690000 37668000 56494000 36402000 42610000 0 144530000 39543000 44234000 17185 3533 16145 151981;151982;151983;151984;151985;151986;151987;151988;151989;151990;151991;151992;151993;151994;151995;151996;151997;151998;151999 193873;193874;193875;193876;193877;193878;193879;193880;193881;193882;193883;193884;193885;193886;193887;193888;193889;193890;193891 193876 17 GPMDSDDSHGSVLR Oxidation (M) 1487.6311 0.63107033 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 3 1 18.572 18.572 2;3 6.0169E-14 11122 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194017;194018;194019;194020;194021;194022;194023;194024;194025;194026 194022 10 GPPPSGIATLVSGIAGEEQQR Unmodified 2063.0647 0.064732107 3052 Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 3 1 127.66 127.66 2;3 2.7964E-16 133348 QUIQUE_C1438_190116_001 146 127.17 515220000 127300000 0 70470000 0 0 0 103630000 36775000 22707000 0 0 115310000 39030000 17199 3052 16158 152114;152115;152116;152117;152118;152119;152120;152121;152122;152123;152124;152125;152126;152127 194027;194028;194029;194030;194031;194032;194033;194034;194035;194036;194037;194038;194039;194040;194041;194042 194031 15 GPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQAPGSVPGPGLVK Unmodified 2975.6444 0.6444062 890 E7EX90 DCTN1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 154.75 154.75 3 3.7373E-51 159715 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.33 105.83 667010000 68616000 43313000 0 0 0 90064000 51813000 0 181880000 0 0 120090000 111240000 17200 890 16159 152128;152129;152130;152131;152132;152133;152134;152135;152136 194043;194044;194045;194046;194047;194048;194049;194050;194051;194052;194053 194053 11 GPPPSWGR Unmodified 852.42424 0.42423608 2831 P84103 SRSF3 Serine/arginine-rich splicing factor 3 yes yes 0 0 0 1 24.791 24.791 2 0.043045 18658 QUIQUE_C1218_190116_001 58.604 46.344 54322000 54322000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17201 2831 16160 152137 194054 194054 1 GPPQEEEEEEDEEEEATKEDAEAPGIR Unmodified 3041.2745 0.27452228 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.604 72.604 3 3.0396E-144 73070 QUIQUE_C1403_190116_001 204.31 199.55 652720000 69803000 73240000 63517000 98221000 72526000 55703000 53534000 28613000 43330000 14616000 0 36301000 43321000 17202 2596 16161 152138;152139;152140;152141;152142;152143;152144;152145;152146;152147;152148;152149 194055;194056;194057;194058;194059;194060;194061;194062;194063;194064;194065;194066;194067;194068;194069 194061 14 GPPQEEEEEEDEEEEATKEDAEAPGIRDHESL Unmodified 3622.5191 0.51906266 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 2 1 79.488 79.488 4 0.023775 79445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 24.829 23.913 60406000 0 0 0 0 0 0 0 60406000 0 0 0 0 0 17203 2596 16162 152150 194070 194070 1 GPPSEPVLTQTSEQAPSSAPR Unmodified 2135.0495 0.049475973 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 1 59.069 59.069 2 5.7993E-119 57956 QUIQUE_C1277_190116_001 217.48 177 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17204 987 16163 152151;152152 194071;194072 194071 2 GPPVFTQEER Unmodified 1158.5669 0.56693715 3953 Q99447;I3L1R7;I3L2Q1 PCYT2 Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.855 37.855 2 0.042123 34353 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.582 31.293 293190000 0 0 0 0 119540000 0 0 43445000 0 30893000 99312000 0 0 17205 3953 16164 152153;152154;152155;152156 194073;194074;194075;194076 194074 4 GPPVPPLPK Unmodified 900.54329 0.54328858 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 1 51.279 51.279 2 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194107;194108;194109;194110;194111;194112;194113;194114;194115;194116;194117;194118;194119;194120 194109 13 GPQLAAQNLGISLANLLLSK Unmodified 2020.1681 0.16807497 483 F5H345;A0A3B3IRR1;A0A3F2YNY7;P08397 HMBS Porphobilinogen deaminase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 167 167 2;3 4.2876E-18 172013 QUIQUE_C1368_190116_001 122.49 110.11 445580000 44195000 27910000 59393000 28244000 21630000 20324000 21988000 49012000 34761000 11544000 72243000 19090000 35242000 17211 483 16170 152198;152199;152200;152201;152202;152203;152204;152205;152206;152207;152208;152209;152210;152211;152212;152213 194121;194122;194123;194124;194125;194126;194127;194128;194129;194130;194131;194132;194133;194134;194135;194136 194124 16 GPQLFHMDPSGTFVQCDAR Unmodified 2161.9673 0.96734302 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 98.323 98.323 2;3 1.4196E-45 100927 QUIQUE_C1368_190116_001 163.99 149.43 2810100000 276340000 287340000 316110000 267610000 210030000 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194209;194210;194211;194212;194213;194214;194215;194216;194217 194209 9 GPSAGGGPGSGTSPQVEWTAR Unmodified 1954.9133 0.91331684 3459 Q7Z406;M0QY43;A0A2R8Y4C3;A0A2R8Y454 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 62.28 62.28 2 0.00036563 58102 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.669 68.696 5969300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5969300 0 0 0 17219 3459 16178 152278 194218 194218 1 GPSASAPSPAPASAPK Unmodified 1391.7045 0.70449327 265 A0A0D9SF30 NCAM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.476 23.476 2 1.0574E-09 17002 QUIQUE_C1438_190116_001 128.85 110.54 5854200000 439900000 0 0 755890000 773460000 281170000 511650000 425010000 859450000 109950000 554030000 0 1143700000 17220 265 16179 152279;152280;152281;152282;152283;152284;152285;152286;152287;152288 194219;194220;194221;194222;194223;194224;194225;194226;194227;194228;194229 194221 6 GPSFDVQVGLHELLGHGSGK Unmodified 2033.033 0.033038048 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 110.73 110.73 3;4 9.3814E-10 115588 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56843 QUIQUE_C1563_190116_001 147.36 130.59 5253200000 413890000 329720000 557610000 465650000 297000000 341570000 421100000 393040000 481560000 218710000 531170000 382020000 420190000 17225 1778 16184 152321;152322;152323;152324;152325;152326;152327;152328;152329;152330;152331;152332;152333 194269;194270;194271;194272;194273;194274;194275;194276;194277;194278;194279;194280;194281;194282;194283;194284;194285 194276 15 GPSGSASSRPGVSATPPK Unmodified 1638.8325 0.83254733 3348 Q66K74 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes yes 0 0 1 1 1 1 16.88 16.88 3 0.0010296 9329 QUIQUE_C1368_190116_001 48.59 30.889 114770000 0 0 28306000 0 0 0 36361000 0 0 0 0 50100000 0 17226 3348 16185 152334;152335;152336 194286;194287;194288 194286 3 GPSGYGFNLHSDK Unmodified 1377.6313 0.63132832 1441 O14745 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 40.541 40.541 2;3 1.0893E-09 35746 QUIQUE_C1368_190116_001 158.08 146.48 582940000 0 0 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 1 65.542 65.542 2;3 6.8104E-06 65228 QUIQUE_C1576_190116_001 107.09 82.71 2533800000 340900000 322390000 279040000 269540000 210240000 256290000 264050000 85185000 109830000 122960000 131700000 76649000 65033000 17230 307 16189 152352;152353;152354;152355;152356;152357;152358;152359;152360;152361;152362;152363;152364;152365;152366;152367 194305;194306;194307;194308;194309;194310;194311;194312;194313;194314;194315;194316;194317;194318;194319;194320 194312 16 GPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFK Unmodified 2896.4317 0.43169581 3996 Q9BQI5;Q6ZV33 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171.22 171.22 3 5.4471E-54 174552 QUIQUE_C1277_190116_001 143.32 130.38 484230000 25399000 80617000 61250000 26719000 30737000 0 74043000 33668000 60264000 3630600 0 47077000 40829000 17231 3996 16190 152368;152369;152370;152371;152372;152373;152374;152375;152376;152377;152378 194321;194322;194323;194324;194325;194326;194327;194328;194329;194330;194331;194332 194322 11 GPSPLTMGAQDTLPVAAAFTETVNAYFK Oxidation (M) 2912.4266 0.42661043 3996 Q9BQI5;Q6ZV33 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 169.21 169.21 3 1.2701E-24 174162 QUIQUE_C1368_190116_001 100.93 83.95 273220000 0 46899000 38365000 36433000 48292000 47954000 0 46971000 0 8305400 0 0 0 17232 3996 16190 152379;152380;152381;152382;152383;152384;152385 194333;194334;194335;194336;194337;194338;194339 194334 2833 7 GPSPVSSEGIK Unmodified 1056.5451 0.54513908 4152 Q9H2X9 SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 0 1 23.935 23.935 2 0.038317 17958 QUIQUE_C1438_190116_001 64.711 28.01 69992000 0 0 0 0 69992000 0 0 0 0 0 0 0 0 17233 4152 16191 152386 194340 194340 0 GPSPWGFR Unmodified 902.43989 0.43988615 2566 P50479 PDLIM4 PDZ and LIM domain protein 4 yes yes 0 0 0 1 63.739 63.739 2 0.044044 63553 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.616 57.088 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 930.46583 0.46582612 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.52 21.52 2 0.00053812 14562 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.22 100.84 3303300000 0 407840000 275520000 378320000 0 0 0 407110000 332820000 187350000 523750000 385030000 405530000 17237 1907 16195 152405;152406;152407;152408;152409;152410;152411;152412;152413 194361;194362;194363;194364;194365;194366;194367;194368;194369;194370;194371;194372;194373;194374 194369 14 GPSTVTDLEDTKR Unmodified 1417.7049 0.7048872 1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 29.895 29.895 2;3 0.00066245 24204 QUIQUE_C1563_190116_001 113.47 76.779 924500000 0 114110000 147250000 183530000 88612000 159190000 0 65255000 70452000 0 65630000 0 30478000 17238 1701 16196 152414;152415;152416;152417;152418;152419;152420;152421;152422;152423;152424;152425;152426;152427;152428;152429;152430;152431;152432 194375;194376;194377;194378;194379;194380;194381;194382;194383;194384;194385;194386;194387;194388;194389;194390;194391;194392;194393;194394 194385 16 GPSVDWGK Unmodified 844.40792 0.40791731 3202;735 C9JNZ1;C9JVG3;C9JWG0;C9JQU9;C9JUW1;C9JTZ5;F2Z3H1;Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 33.56 33.56 2 0.009742 28986 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.187 62.811 969960000 121960000 149300000 0 0 64020000 0 0 162650000 136250000 0 185660000 150120000 0 17239 735;3202 16197 152433;152434;152435;152436;152437;152438;152439 194395;194396;194397;194398;194399;194400;194401;194402;194403;194404 194404 10 GPSVFPLAPCSR Unmodified 1286.6441 0.64414162 398;402;408 A0A286YES1;P01860;A0A286YEY4;P01859;A0A286YFJ8;P01861 IGHG3;IGHG2;IGHG4 Ig gamma-3 chain C region;Ig gamma-2 chain C region;Ig gamma-4 chain C region no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 81.143 81.143 2 1.9436E-10 81849 QUIQUE_DMIX8_190116_001 157.96 107.35 5388300000 0 462590000 578590000 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194580 12 GPTGVEMEALTSAAVAALTLYDMCK Oxidation (M) 2614.2329 0.23286135 4343 Q9NZB8 MOCS1 Molybdenum cofactor biosynthesis protein 1;Cyclic pyranopterin monophosphate synthase;Cyclic pyranopterin monophosphate synthase accessory protein yes yes 0 1 0 1 171.79 171.79 3 1.0536E-07 176561 QUIQUE_C1368_190116_001 61.524 54.164 8276700 0 0 8276700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17252 4343 16209 152566 194591 194591 2911 1 GPTGVIATTMTDSFLTGQMLLQDLK Unmodified 2637.3394 0.33937533 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 173 173 3 8.5957E-11 180147 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.061 72.7 173740000 7534200 0 22141000 0 11540000 10490000 0 21613000 0 0 37873000 32187000 30360000 17253 2198 16210 152567;152568;152569;152570;152571;152572;152573;152574 194592;194593;194594;194595;194596;194597;194598;194599;194600 194598 9 GPTISLTQIV Unmodified 1027.5914 0.59136099 3167 Q15904;A0A0C4DGX8 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superfamily member 1 yes yes 0 0 0 1 30.187 30.187 3 0.010015 25105 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.288 24.814 101250000 0 0 0 0 0 0 0 0 101250000 0 0 0 0 17262 3606 16219 152628 194663 194663 1 GPVKPTGGPGGGGTQTQQQMNQLK Unmodified 2365.1808 0.18084127 2249 P26196;Q8IV96 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 32.002 32.002 3 1.713E-75 26607 QUIQUE_C1277_190116_001 127.5 113.87 788190000 0 97380000 73035000 92010000 59563000 58639000 0 115680000 81533000 11797000 99365000 0 99182000 17263 2249 16220 152629;152630;152631;152632;152633;152634;152635;152636;152637;152638;152639 194664;194665;194666;194667;194668;194669;194670;194671;194672;194673;194674;194675 194664 12 GPVLEALVAR Unmodified 1023.6077 0.60767976 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 1 83.604 83.604 2 0.029498 85382 QUIQUE_C1218_190116_001 75.738 60.357 18336000 18336000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17264 1650 16221 152640;152641 194676;194677 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152689;152690;152691;152692;152693;152694;152695;152696;152697;152698;152699;152700 194729;194730;194731;194732;194733;194734;194735;194736;194737;194738;194739;194740;194741 194741 13 GPVVLAEDFLDIMGQPINPQCR Oxidation (M) 2484.2141 0.21411524 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 1 0 2 3 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 148.99 148.99 2;3 1.072E-99 153438 QUIQUE_C1277_190116_001 200.21 186.12 1513900000 195500000 236830000 183310000 147980000 176180000 166380000 151470000 58779000 55734000 52904000 0 0 88784000 17272 2175 16229 152701;152702;152703;152704;152705;152706;152707;152708;152709;152710;152711;152712;152713;152714;152715;152716;152717;152718;152719;152720;152721 194742;194743;194744;194745;194746;194747;194748;194749;194750;194751;194752;194753;194754;194755;194756;194757;194758;194759;194760;194761;194762;194763;194764;194765;194766;194767;194768;194769 194747 1525 28 GPVVLAEDFLDIMGQPINPQCR Unmodified 2468.2192 0.21920061 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 3 2 168.35 168.35 2;3 2.8355E-88 169903 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.85 184.88 12187000000 1015200000 1341600000 1527200000 783050000 1061600000 1347500000 1393300000 536910000 441530000 135560000 972360000 923410000 707600000 17273 2175 16229 152722;152723;152724;152725;152726;152727;152728;152729;152730;152731;152732;152733;152734;152735;152736;152737;152738;152739;152740;152741;152742;152743;152744;152745;152746;152747;152748 194770;194771;194772;194773;194774;194775;194776;194777;194778;194779;194780;194781;194782;194783;194784;194785;194786;194787;194788;194789;194790;194791;194792;194793;194794;194795;194796;194797;194798;194799;194800;194801;194802;194803;194804;194805;194806;194807;194808;194809;194810 194794 40 GPVVPAFALWDGELLTHSGLEVPEGL Unmodified 2702.3956 0.3955683 3712 Q8WW59 SPRYD4 SPRY domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 171.4 171.4 2;3 8.3514E-08 175754 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Unmodified 1081.508 0.50802529 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.26 72.26 2 0.0016056 72575 QUIQUE_C1277_190116_001 102 77.058 554150000 55843000 61802000 35758000 43777000 41627000 35713000 0 42646000 42716000 23803000 63316000 43384000 63768000 17277 3277 16233 152766;152767;152768;152769;152770;152771;152772;152773;152774;152775;152776;152777 194829;194830;194831;194832;194833;194834;194835;194836;194837;194838;194839;194840;194841;194842;194843;194844;194845 194831 17 GPYESGSGHSSGLGHQESR Unmodified 1927.8409 0.84088018 795 CON__Q86YZ3;Q86YZ3 HRNR Hornerin yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 12.957 12.957 3;4 2.8019E-100 4989 QUIQUE_DMIX8_190116_001 180.14 154.58 198270000 0 0 0 0 31436000 0 0 28434000 21247000 0 5907200 44352000 66891000 + 17278 795 16234 152778;152779;152780;152781;152782;152783;152784;152785;152786;152787;152788 194846;194847;194848;194849;194850;194851;194852;194853;194854;194855;194856 194856 11 GPYESGSGHSSGLGHR Unmodified 1583.7077 0.70768116 795 CON__Q86YZ3;Q86YZ3 HRNR Hornerin yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 10.471 10.471 3;4 6.7579E-25 2749 QUIQUE_DMIX7_190116_001 152.89 128.33 729830000 32552000 3341200 0 21304000 185150000 0 0 49147000 101260000 149380000 0 187700000 0 + 17279 795 16235 152789;152790;152791;152792;152793;152794;152795;152796;152797;152798;152799;152800 194857;194858;194859;194860;194861;194862;194863;194864;194865;194866;194867;194868;194869;194870 194869 11 GPYPTMYTFRPWTIR Unmodified 1884.9345 0.93450998 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 117.96 117.96 3 0.037389 121736 QUIQUE_DMIX7_190116_001 34.82 25.02 48379000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48379000 0 17280 2191 16236 152801 194871 194871 1 GQAAVQQLQAEGLSPR Unmodified 1651.8642 0.86418181 2102;1659 O75828;P16152;E9PQ63;A8MTM1 CBR3;CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 3;Carbonyl reductase [NADPH] 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 67.074 67.074 2;3 1.1706E-165 66360 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1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.108 43.108 2 0.0029057 39519 QUIQUE_C1368_190116_001 87.308 71.646 2395900000 137370000 156460000 301490000 198930000 187600000 276140000 196160000 161980000 156100000 78182000 200970000 142800000 201730000 17285 1665 16241 152839;152840;152841;152842;152843;152844;152845;152846;152847;152848;152849;152850;152851 194935;194936;194937;194938;194939;194940;194941;194942;194943;194944;194945;194946;194947;194948;194949;194950;194951 194937 16 GQAQAIEFLK Unmodified 1103.5975 0.597509 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 68.724 68.724 2 0.0036481 68899 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.623 61.663 392930000 0 0 41312000 0 75029000 0 0 62733000 0 0 83699000 71787000 58368000 17286 4414 16242 152852;152853;152854;152855;152856;152857 194952;194953;194954;194955;194956;194957;194958;194959 194957 8 GQATDIAIQAEEIMK Unmodified 1616.808 0.80797206 3192 Q16740;M0R208 CLPP ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial;ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 114.84 114.84 2 4.1032E-06 118667 QUIQUE_C1277_190116_001 98.167 75.25 126220000 0 0 55696000 0 0 0 70519000 0 0 0 0 0 0 17287 3192 16243 152858;152859;152860 194960;194961;194962;194963 194960 3 GQAVDYEGSR Unmodified 1080.4836 0.48360145 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 19.122 19.122 2 0.0089843 11504 QUIQUE_C1277_190116_001 70.908 51.93 178370000 29466000 35220000 0 0 0 0 0 0 0 28988000 40768000 0 43924000 17288 2059 16244 152861;152862;152863;152864;152865 194964;194965;194966;194967;194968 194965 4 GQAVELMKPHKPDR Unmodified 1604.8457 0.84569497 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 2 1 18.326 18.326 4 0.02135 10801 QUIQUE_C1218_190116_001 43.813 24.235 20061000 20061000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17289 3722 16245 152866 194969 194969 1 GQAVTLLPFFTSLTGGSLEELRR Unmodified 2491.3435 0.34347315 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.58 159.58 3 0.00063836 166700 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.497 39.545 279030000 0 0 0 0 24777000 0 0 36205000 49539000 0 46879000 51008000 70625000 17290 2813 16246 152867;152868;152869;152870;152871;152872 194970;194971;194972;194973;194974;194975;194976 194973 7 GQCDLELINVCNENSLFK Unmodified 2151.9929 0.99288907 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 1 1 2 2 2 132.35 132.35 2;3 9.0375E-123 136594 QUIQUE_C1277_190116_001 287.04 267.2 7418100000 728480000 874480000 490750000 591090000 884380000 583030000 758700000 269710000 247290000 119420000 642980000 640050000 587710000 17291 50 16247 152873;152874;152875;152876;152877;152878;152879;152880;152881;152882;152883;152884;152885;152886;152887;152888;152889;152890;152891;152892;152893 194977;194978;194979;194980;194981;194982;194983;194984;194985;194986;194987;194988;194989;194990;194991;194992;194993;194994;194995;194996;194997;194998;194999;195000 194980 18 GQCGENLAWASYDQTGK Unmodified 1883.8108 0.81082561 4173 Q9H4G4 GLIPR2 Golgi-associated plant pathogenesis-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.677 78.677 2 1.8651E-38 79189 QUIQUE_C1403_190116_001 204.13 190.47 357800000 25577000 34564000 61760000 52814000 45567000 30851000 42241000 0 0 0 39293000 0 25134000 17292 4173 16248 152894;152895;152896;152897;152898;152899;152900;152901;152902 195001;195002;195003;195004;195005;195006;195007;195008;195009 195004 9 GQDHCGIESEVVAGIPR Unmodified 1822.8632 0.86319553 1930 P07858;R4GMQ5 CTSB Cathepsin B;Cathepsin B light chain;Cathepsin B heavy chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 78.871 78.871 2;3 1.0369E-52 79899 QUIQUE_C1368_190116_001 218.68 169.18 2612500000 187650000 268030000 324440000 249490000 287110000 225880000 206710000 160150000 42214000 61530000 233820000 159660000 205760000 17293 1930 16249 152903;152904;152905;152906;152907;152908;152909;152910;152911;152912;152913;152914;152915;152916;152917;152918;152919;152920;152921;152922;152923;152924;152925;152926;152927;152928;152929 195010;195011;195012;195013;195014;195015;195016;195017;195018;195019;195020;195021;195022;195023;195024;195025;195026;195027;195028;195029;195030;195031;195032;195033;195034;195035;195036;195037;195038;195039;195040;195041;195042;195043 195015 33 GQDIFIIQTIPR Unmodified 1399.7823 0.78234966 3071 Q14558;C9JNQ3 PRPSAP1 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.3 116.3 2 0.00052646 119835 QUIQUE_DMIX8_190116_001 119.27 97.529 784200000 60702000 72898000 55213000 74144000 58818000 56236000 68225000 68736000 103300000 28614000 0 61340000 75977000 17294 3071 16250 152930;152931;152932;152933;152934;152935;152936;152937;152938;152939;152940;152941 195044;195045;195046;195047;195048;195049;195050;195051;195052;195053;195054;195055 195055 12 GQDLGQAVLDAGHSVSTLEK Unmodified 2024.0174 0.017447563 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.34 103.34 3 7.7118E-07 106799 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.128 81.722 978960000 80432000 91998000 90346000 53984000 115250000 52295000 62157000 107510000 127580000 0 118610000 0 78804000 17295 1492 16251 152942;152943;152944;152945;152946;152947;152948;152949;152950;152951;152952;152953 195056;195057;195058;195059;195060;195061;195062;195063;195064;195065;195066;195067;195068;195069 195066 13 GQDMETEAHQNKLEEMINELAVAMTAVK Unmodified 3129.4781 0.47807043 989 F5GX39;Q15363 TMED2 Transmembrane emp24 domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 163.42 163.42 4 0.023625 167381 QUIQUE_C1277_190116_001 24.618 18.523 102760000 0 63248000 0 0 0 0 0 39513000 0 0 0 0 0 17296 989 16252 152954;152955 195070;195071 195070 2 GQDPLADRGEKDTAK Unmodified 1599.7853 0.78526278 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 2 1 1 1 14.038 14.038 3 0.0021226 6537 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.759 62.328 48891000 0 0 0 0 0 0 0 14958000 0 0 19419000 0 14514000 17297 3086 16253 152956;152957;152958 195072;195073;195074 195073 2 GQDVVQEWQETSPTR Unmodified 1758.8173 0.81729119 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.914 75.914 2 2.0397E-24 77432 QUIQUE_C1218_190116_001 196.7 176.41 647480000 64737000 51109000 58069000 55452000 58199000 80628000 44009000 61455000 0 19974000 53068000 35213000 65563000 17298 921 16254 152959;152960;152961;152962;152963;152964;152965;152966;152967;152968;152969;152970 195075;195076;195077;195078;195079;195080;195081;195082;195083;195084;195085;195086;195087;195088;195089 195075 14 GQDVVQEWQETSPTREEPAGEQK Unmodified 2627.21 0.20995237 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 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195219;195220;195221;195222;195223;195224;195225;195226;195227;195228;195229;195230;195231;195232;195233;195234;195235 195222 17 GQFHEYQESTIGAAFLTQTVCLDDTTVK Unmodified 3158.4866 0.48664451 2575 P51148;K7ERI8;K7ERQ8;F8VVK3;F8VWU4;F8VSF8 RAB5C Ras-related protein Rab-5C yes no 0 0 0 1 134.19 134.19 3 8.3563E-15 139867 QUIQUE_C1368_190116_001 84.515 78.42 56484000 0 0 56484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17312 2575 16267 153091 195236 195236 0 GQFSEVYR Unmodified 984.46649 0.46649483 3686 Q8TDX7;F8WAG2;F5H3U7 NEK7 Serine/threonine-protein kinase Nek7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 38.456 38.456 2 0.014995 34799 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.265 67.417 31371000 0 0 0 0 0 0 0 0 31371000 0 0 0 0 17313 3686 16268 153092;153093;153094;153095 195237;195238;195239;195240 195239 4 GQFSTDELVAEVEK Unmodified 1550.7464 0.74641766 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.34 107.34 2 1.3883E-22 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MACROD2 yes no 0 0 1 1 1 1 10.281 10.281 3 2.2559E-08 2707 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.66 104.17 75024000 0 0 0 0 0 0 0 18627000 3054600 0 0 53342000 0 17359 464 16311 153582;153583;153584 195861;195862;195863 195863 3 GQNDLMGTAEDFADQFLR Unmodified 2026.9055 0.90545427 1495 Q5T8U5;O15260 SURF4 Surfeit locus protein 4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 168.17 168.17 2;3 1.2738E-13 170011 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.76 116.91 52249000 0 0 0 0 0 0 14915000 26815000 10519000 0 0 0 0 17360 1495 16312 153585;153586;153587;153588;153589 195864;195865;195866;195867;195868 195866 5 GQNEAALECLR Unmodified 1259.5928 0.59283433 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 47.553 47.553 2 0.0071493 44118 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.162 52.698 246920000 0 0 103980000 0 0 0 41744000 0 0 0 101200000 0 0 17361 119 16313 153590;153591;153592;153593 195869;195870;195871;195872 195871 4 GQNLDVVQTPR Unmodified 1225.6415 0.64149908 1510 O43157 PLXNB1 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nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.886 78.886 2 2.1947E-46 79573 QUIQUE_DMIX1_190116_001 186.87 162.78 1023900000 78142000 87578000 123540000 97186000 71825000 77622000 86186000 55909000 68650000 32847000 102710000 60055000 81660000 17364 2142 16316 153621;153622;153623;153624;153625;153626;153627;153628;153629;153630;153631;153632;153633 195900;195901;195902;195903;195904;195905;195906;195907;195908;195909;195910;195911;195912 195907 13 GQNVLLTENAEVK Unmodified 1413.7464 0.74635808 4473;3590;263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62;Q8N4C8;I3L2I2;Q9UKE5;C9J338 MAP4K4;MINK1;TNIK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4;Misshapen-like kinase 1;TRAF2 and NCK-interacting protein kinase no no 0 0 0 1 56.339 56.339 2 0.0020047 54997 QUIQUE_C1218_190116_001 133.91 115.47 75839000 75839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17365 263;3590;4473 16317 153634 195913 195913 0 GQNVTEEECLEK Unmodified 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yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 3 1 1 1 2 3 2 85.771 85.771 2 0.0020592 87282 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.692 74.906 1377700000 83570000 108700000 97192000 94310000 82352000 151660000 139930000 64738000 125570000 80557000 99438000 89751000 159880000 17387 2268 16339 153800;153801;153802;153803;153804;153805;153806;153807;153808;153809;153810;153811;153812;153813;153814;153815;153816;153817;153818;153819;153820 196138;196139;196140;196141;196142;196143;196144;196145;196146;196147;196148;196149;196150;196151;196152;196153;196154;196155;196156;196157;196158;196159;196160;196161;196162;196163;196164 196154 24 GQTPGGAQFVGLELYK Unmodified 1663.857 0.85697116 3016 Q13616 CUL1 Cullin-1 yes yes 0 0 0 1 106.34 106.34 2 0.0082506 110028 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.051 30.172 29238000 0 0 0 0 0 0 0 0 29238000 0 0 0 0 17388 3016 16340 153821 196165 196165 1 GQVCLPVISAENWK Unmodified 1599.8079 0.80791248 2793 P68036;A0A1B0GUS4 UBE2L3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 yes no 0 0 0 2 113.78 113.78 2 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196483;196484;196485;196486;196487;196488;196489;196490;196491;196492;196493;196494;196495;196496;196497;196498;196499;196500;196501 196491 19 GQYISPFHDIPIYADKDVFHMVVEVPR Oxidation (M) 3187.5801 0.58009138 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 1 1 1 1 127.72 127.72 4;5 1.3818E-05 130370 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.707 46.927 247260000 0 189490000 0 0 0 0 0 57763000 0 0 0 0 0 17411 3120 16362 154085;154086 196502;196503 196503 2580 2 GQYQDHAIDRR Unmodified 1357.6487 0.64870972 3045 Q14151 SAFB2 Scaffold attachment factor B2 yes yes 0 0 1 1 10.724 10.724 3 0.010135 3086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.004 31.75 22878000 0 0 0 0 0 0 0 22878000 0 0 0 0 0 17412 3045 16363 154087 196504 196504 1 GRDIVVLGVEK Unmodified 1183.6925 0.69247202 1448 O14818 PSMA7 Proteasome subunit alpha type-7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 44.786 44.786 2;3 3.8594E-07 41325 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.49 80.216 331810000 49313000 40887000 0 0 0 0 0 69474000 0 0 93610000 78521000 0 17413 1448 16364 154088;154089;154090;154091;154092;154093;154094;154095 196505;196506;196507;196508;196509;196510;196511;196512;196513 196511 7 GRDPSSDTYEEDSELLLQIR Unmodified 2322.0975 0.097548378 4395 Q9UBE0;M0QZS6 SAE1 SUMO-activating enzyme subunit 1;SUMO-activating enzyme subunit 1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 117.36 117.36 3 0.0014323 119622 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.206 43.56 50136000 0 0 0 0 0 0 0 50136000 0 0 0 0 0 17414 4395 16365 154096 196514 196514 1 GRDVIAQSQSGTGK Unmodified 1402.7165 0.71645494 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 11.45 11.45 3 0.003572 3713 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.754 46.387 16505000 0 0 0 0 0 0 0 16505000 0 0 0 0 0 17415 2416 16366 154097 196515 196515 1 GRDWNVDLIPK Unmodified 1311.6935 0.69353465 2560;2328;3300 P31150;G5E9U5;P50395;Q5SX87;V9GYF8;Q5SX90;V9GYJ7;Q5SX86 GDI1;GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor alpha;Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 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154124;154125 196556;196557 196556 2 GREDVALEQDTYWR Unmodified 1736.8118 0.81181188 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.248 73.248 2;3 1.0724E-09 74082 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.81 112.06 560020000 49733000 60617000 82076000 0 67791000 66749000 0 88832000 0 33045000 49225000 61950000 0 17418 921 16369 154126;154127;154128;154129;154130;154131;154132;154133;154134;154135 196558;196559;196560;196561;196562;196563;196564;196565;196566;196567;196568;196569 196566 10 GREFGNLTR Unmodified 1048.5414 0.5413911 1462 O14949 UQCRQ Cytochrome b-c1 complex subunit 8 yes yes 0 0 1 1 1 1 20.88 20.88 3 0.008205 13849 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.309 79.158 282110000 0 0 0 0 0 0 0 69994000 0 0 116800000 0 95317000 17419 1462 16370 154136;154137;154138 196570;196571;196572 196571 1 GRELPTAFDYVEFTR Unmodified 1799.8842 0.88424855 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 2 1 2 108.86 108.86 2;3 2.2558E-79 111895 QUIQUE_DMIX1_190116_001 230.36 198.35 1524600000 0 0 0 0 0 0 0 424330000 175720000 0 434490000 201700000 288330000 17420 267;275;3025 16371 154139;154140;154141;154142;154143;154144;154145;154146 196573;196574;196575;196576;196577;196578;196579;196580 196574 6 GRESVLIISTDPAHNISDAFDQK Unmodified 2512.2558 0.25578035 1543 O43681;A0A087WXS7;K7ERW9 ASNA1 ATPase ASNA1 yes no 0 0 1 2 1 103.32 103.32 3;4 3.4923E-06 108264 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.501 59.249 134940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87466000 0 47469000 17421 1543 16372 154147;154148;154149 196581;196582;196583 196581 3 GRFEELSAWTEK Unmodified 1451.7045 0.70449327 3825 Q96CV9 OPTN Optineurin yes yes 0 0 1 1 75.726 75.726 2 0.024604 76510 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.153 40.589 38466000 0 0 0 0 0 0 0 0 38466000 0 0 0 0 17422 3825 16373 154150 196584 196584 1 GRFQDNLDFIQWFK Unmodified 1812.8948 0.89475365 3145;1349 K7ERD8;K7EL66;M0QX52;Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 no no 0 0 1 1 142.3 142.3 3 0.00013519 149740 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.386 63.637 31480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31480000 0 0 17423 1349;3145 16374 154151 196585 196585 1 GRLDAELGAQQR Unmodified 1312.6848 0.68476088 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 1 1 2 1 28.01 28.01 2;3 0.0033929 22519 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.29 61.604 410140000 0 0 0 0 0 0 82784000 0 0 0 207340000 0 120010000 17424 16;1475 16375 154152;154153;154154;154155 196586;196587;196588;196589;196590 196588 5 GRLDSGQLGLYPANYVEAI Unmodified 2035.0375 0.037454724 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.27 138.27 2 0.00091135 141175 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.448 68.247 2015400000 76471000 111140000 76930000 56443000 188680000 23791000 83897000 583780000 345500000 0 0 397840000 70949000 17425 4069 16376 154156;154157;154158;154159;154160;154161;154162;154163;154164;154165;154166 196591;196592;196593;196594;196595;196596;196597;196598;196599;196600;196601 196598 11 GRLDYLSSLK Unmodified 1150.6346 0.63462279 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5H0E2;H0YFS2 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 60.85 60.85 2;3 0.0011335 60110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.09 49.171 1443800000 0 61077000 49429000 51107000 51363000 30821000 66282000 212030000 287770000 0 276270000 146060000 211610000 17426 997 16377 154167;154168;154169;154170;154171;154172;154173;154174;154175;154176;154177;154178;154179 196602;196603;196604;196605;196606;196607;196608;196609;196610;196611;196612;196613;196614 196611 13 GRLESAQATFQAHR Unmodified 1570.7964 0.79643659 106 A0A087X1E4;P53365 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 1 1 1 27.15 27.15 3 0.021203 21128 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.722 32.043 78069000 0 0 0 0 0 0 0 31446000 46624000 0 0 0 0 17427 106 16378 154180;154181 196615;196616 196616 2 GRLPLLAVCDYK Unmodified 1403.7595 0.75950572 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 3 2 1 77.515 77.515 2;3 0.00080863 78173 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.28 72.282 887570000 29574000 40790000 44638000 0 59696000 0 0 101050000 115680000 27126000 285610000 109590000 73811000 17428 3117 16379 154182;154183;154184;154185;154186;154187;154188;154189;154190;154191;154192;154193;154194;154195;154196;154197;154198 196617;196618;196619;196620;196621;196622;196623;196624;196625;196626;196627;196628;196629;196630;196631;196632;196633;196634;196635;196636;196637;196638;196639;196640;196641 196639 25 GRLPQLSAAIALVGGISQQLQER Unmodified 2404.355 0.35504089 1631 O75382;A0A1W2PPI7;E9PMK8 TRIM3 Tripartite motif-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 158.09 158.09 3 1.1017E-05 160653 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.786 73.247 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17429 1631 16380 154199 196642 196642 1 GRNDLMEYAK Unmodified 1195.5656 0.56555694 1797 P00966;Q5T6L6;Q5T6L5 ASS1 Argininosuccinate synthase 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Unmodified 2037.0392 0.039186058 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 106.82 106.82 3;4 3.4593E-06 109532 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.882 96.063 710690000 42095000 96574000 106360000 82275000 34051000 30090000 44931000 24371000 41083000 0 55761000 109040000 44054000 17433 4378 16384 154215;154216;154217;154218;154219;154220;154221;154222;154223;154224;154225;154226;154227;154228;154229;154230 196658;196659;196660;196661;196662;196663;196664;196665;196666;196667;196668;196669;196670;196671;196672;196673;196674;196675;196676 196669 18 GRPGPIGVLLMK Unmodified 1236.7376 0.73764807 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 1 2 1 2 68.958 68.958 2;3 0.020995 69961 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.513 35.079 223340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86145000 26875000 110320000 17434 345 16385 154231;154232;154233;154234;154235 196677;196678;196679;196680;196681;196682;196683 196677 7 GRPLPEPYEASR Unmodified 1370.6943 0.69426293 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 28.314 28.314 2;3 0.0042453 23222 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.913 57.723 1161300000 0 0 154010000 0 0 0 0 213040000 308760000 79540000 115220000 171610000 119110000 17435 57 16386 154236;154237;154238;154239;154240;154241;154242;154243;154244 196684;196685;196686;196687;196688;196689;196690;196691;196692;196693 196686 9 GRPTSTNPIASIFAWTR Unmodified 1873.9799 0.97988027 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 127.59 127.59 2;3 3.2056E-74 133092 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.28 175.48 7296300000 121980000 118610000 147130000 103820000 201440000 63836000 301920000 1017200000 1115500000 144080000 1471500000 1265600000 1223700000 17436 2518 16387 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196733 196733 1 GSAAALCNNLSVLQLPAR Unmodified 1853.9782 0.97816571 4191 Q9H977;C9J016 WDR54 WD repeat-containing protein 54 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 113.57 113.57 2;3 2.8134E-17 118745 QUIQUE_C1218_190116_001 166.48 142.22 695530000 43742000 36400000 60565000 55364000 83357000 29962000 58534000 49765000 85406000 0 43467000 69108000 79854000 17439 4191 16390 154271;154272;154273;154274;154275;154276;154277;154278;154279;154280;154281;154282;154283;154284;154285 196734;196735;196736;196737;196738;196739;196740;196741;196742;196743;196744;196745;196746;196747;196748;196749;196750;196751;196752;196753 196734 18 GSAAAVIVYDITK Unmodified 1306.7133 0.71326704 3021 Q13636 RAB31 Ras-related protein Rab-31 yes yes 0 0 0 1 1 101.75 101.75 2 0.012369 99056 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.087 38.613 64092000 0 0 0 0 0 47379000 0 0 0 16713000 0 0 0 17440 3021 16391 154286;154287 196754;196755 196755 2 GSAADSEESPAIEAIHLLR Unmodified 1964.9803 0.98033378 2061 P13716;B7ZBK6 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes no 0 0 0 2 1 1 2 3 2 2 2 2 2 1 1 1 110.02 110.02 2;3 4.91E-28 113116 QUIQUE_C1403_190116_001 140.31 119.64 6041500000 398300000 309890000 342240000 585200000 424360000 385930000 585900000 669790000 622390000 228110000 483790000 389530000 616060000 17441 2061 16392 154288;154289;154290;154291;154292;154293;154294;154295;154296;154297;154298;154299;154300;154301;154302;154303;154304;154305;154306;154307;154308;154309 196756;196757;196758;196759;196760;196761;196762;196763;196764;196765;196766;196767;196768;196769;196770;196771;196772;196773;196774;196775;196776;196777;196778;196779;196780;196781;196782;196783 196761 27 GSAGHWTSESSVSGSTGQWHSESGSFRPDSPGSGNAR Unmodified 3732.6174 0.61736919 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 2 3 2 57.809 57.809 4;5 3.1676E-99 55747 QUIQUE_C1368_190116_001 151.38 149.74 1041800000 36870000 93355000 128790000 131980000 0 58843000 131540000 0 0 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2812 P78417 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 41.42 41.42 2 0.00027359 38308 QUIQUE_C1576_190116_001 106.29 92.084 3985200000 308730000 351280000 295100000 336670000 348960000 173750000 263580000 288680000 305180000 152210000 421140000 315660000 424230000 17445 2812 16396 154335;154336;154337;154338;154339;154340;154341;154342;154343;154344;154345;154346;154347;154348 196809;196810;196811;196812;196813;196814;196815;196816;196817;196818;196819;196820;196821;196822;196823;196824;196825;196826;196827;196828;196829;196830;196831 196820 21 GSASDWYDALCILLR Unmodified 1738.8349 0.83485551 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 170 170 2 0.050076 177334 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.265 46.688 85662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85662000 0 0 17446 3777 16397 154349 196832 196832 1 GSCHIGGNVATNAGGLR Unmodified 1639.7849 0.78488563 3588 Q8N465;B5MCV2;G5E9E8;H7C021 D2HGDH D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 30.308 30.308 3 0.04989 24753 QUIQUE_C1277_190116_001 27.714 17.288 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17447 3588 16398 154350 196833 196833 1 GSCPTCPEDR Unmodified 1177.4492 0.44920656 4663 Q9Y6R7;A0A087WXI2;A0A087WUZ2 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 13.556 13.556 2 0.01116 5511 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.621 60.416 5429700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5429700 0 0 0 17448 4663 16399 154351 196834 196834 1 GSCSTEVEKETQEK Unmodified 1610.7094 0.70938023 1624 O75348 ATP6V1G1 V-type proton ATPase subunit G 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.197 14.197 2;3 8.5941E-17 5852 QUIQUE_C1563_190116_001 153.54 131.21 396190000 12656000 60575000 0 0 0 27954000 0 0 20416000 0 101330000 86029000 87226000 17449 1624 16400 154352;154353;154354;154355;154356;154357;154358 196835;196836;196837;196838;196839;196840;196841 196837 5 GSCYPATGDLLVGR Unmodified 1464.7031 0.70311306 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.916 80.916 2 0.0038583 81855 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Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 125.21 125.21 2;3 1.0632E-158 128976 QUIQUE_C1277_190116_001 216.17 204.2 7054200000 436860000 492940000 800130000 423020000 659450000 575080000 783130000 407070000 355520000 198330000 606960000 690160000 625560000 17453 336 16404 154368;154369;154370;154371;154372;154373;154374;154375;154376;154377;154378;154379;154380;154381;154382;154383;154384;154385;154386;154387;154388;154389;154390;154391;154392;154393;154394 196851;196852;196853;196854;196855;196856;196857;196858;196859;196860;196861;196862;196863;196864;196865;196866;196867;196868;196869;196870;196871;196872;196873;196874;196875;196876;196877;196878;196879;196880;196881;196882;196883;196884;196885;196886;196887;196888;196889;196890;196891;196892;196893;196894;196895;196896;196897;196898 196853 47 GSDCVDQFR Unmodified 1082.4451 0.44510746 3593 Q8N4Q1 CHCHD4 Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40 yes yes 0 0 0 1 32.583 32.583 2 0.05253 27284 QUIQUE_C1277_190116_001 50.04 38.971 36570000 0 36570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17454 3593 16405 154395 196899 196899 1 GSDDAPDADTAIINAEGGQSGGDDKK Unmodified 2503.0946 0.094647844 3569 Q8N126 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 59.358 59.358 2;3 3.9E-37 55453 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.41 130.01 1185000000 116050000 134530000 185500000 136020000 0 48920000 141740000 57158000 0 73433000 83996000 75581000 132080000 17455 3569 16406 154396;154397;154398;154399;154400;154401;154402;154403;154404;154405;154406;154407;154408 196900;196901;196902;196903;196904;196905;196906;196907;196908;196909;196910;196911;196912;196913 196910 14 GSDDAPDADTAIINAEGGQSGGDDKKEYFI Unmodified 3055.353 0.35304738 3569 Q8N126 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 113 113 3 1.0564E-29 118682 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.614 88.509 168840000 0 0 0 0 0 0 0 0 36780000 0 46298000 29553000 56210000 17456 3569 16407 154409;154410;154411;154412 196914;196915;196916;196917 196915 4 GSDEGQFNEQNFVSK Unmodified 1684.7329 0.73289286 4313 Q9NWU1;C9J2G3;C9JQQ2 OXSM 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 62.774 62.774 2 0.0021738 62018 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.515 51.348 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17457 4313 16408 154413 196918 196918 1 GSDFDCELR Unmodified 1097.4448 0.44477311 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.73 45.73 2 1.4234E-19 42808 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.81 191.88 9638200000 879330000 1015000000 902720000 887580000 648070000 830940000 899690000 562550000 604570000 287420000 731030000 741730000 647560000 17458 2735;3319 16409 154414;154415;154416;154417;154418;154419;154420;154421;154422;154423;154424;154425;154426 196919;196920;196921;196922;196923;196924;196925;196926;196927;196928;196929;196930;196931;196932 196928 13 GSDGAPDTGYLWHVPLTFITSK Unmodified 2361.1641 0.1641118 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 147.79 147.79 3 0.041622 151537 QUIQUE_C1403_190116_001 24.303 21.501 71478000 0 0 0 71478000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17459 4336 16410 154427 196933 196933 1 GSDHSASLEPGELAELVR Unmodified 1865.9119 0.91191986 4263 Q9NR45;Q5TBR1;Q5TBR0 NANS Sialic acid synthase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 98.995 98.995 2;3 2.0378E-17 101755 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.18 157.2 1074000000 56027000 196370000 0 0 43139000 164660000 73371000 50223000 59992000 84908000 77280000 209570000 58417000 17460 4263 16411 154428;154429;154430;154431;154432;154433;154434;154435;154436;154437;154438;154439;154440;154441;154442;154443;154444;154445;154446;154447 196934;196935;196936;196937;196938;196939;196940;196941;196942;196943;196944;196945;196946;196947;196948;196949;196950;196951;196952;196953;196954;196955;196956;196957 196950 24 GSDLFSPK Unmodified 849.42323 0.42323303 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;A0A2R8YF01;A0A1B0GXI6 VPS45 Vacuolar protein 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RAB6B;RAB6A Ras-related protein Rab-6B;Ras-related protein Rab-6A no no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 109.55 109.55 2;3 2.9657E-14 113357 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.15 149 4729900000 318590000 316500000 417990000 368590000 294590000 353780000 353320000 412070000 473290000 182950000 490780000 334730000 412690000 17464 4275;2167 16415 154459;154460;154461;154462;154463;154464;154465;154466;154467;154468;154469;154470;154471;154472;154473;154474;154475;154476 196969;196970;196971;196972;196973;196974;196975;196976;196977;196978;196979;196980;196981;196982;196983;196984;196985;196986;196987;196988;196989;196990;196991;196992;196993;196994;196995;196996;196997;196998;196999;197000;197001;197002 196991 34 GSDVIIMLVGNK Oxidation (M) 1260.6748 0.67477304 2167;4275 Q9NRW1;J3KR73;C9JU14;P20340 RAB6B;RAB6A Ras-related protein Rab-6B;Ras-related protein Rab-6A no no 0 1 0 1 92.357 92.357 2 0.010217 88937 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 60.784 23421000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23421000 0 0 0 17465 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197035;197036;197037;197038;197039;197040;197041;197042;197043;197044;197045;197046;197047;197048;197049;197050;197051;197052;197053;197054;197055;197056;197057;197058;197059;197060;197061;197062;197063;197064;197065;197066;197067;197068;197069 197056 1571 35 GSELETAMETLINVFHAHSGK Unmodified 2270.1001 0.10013134 2211 P23297;Q5T7Y5;Q5T7Y4 S100A1 Protein S100-A1 yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 2 3 1 1 1 2 160.54 160.54 3;4 8.5064E-09 164630 QUIQUE_C1277_190116_001 89.028 81.204 892780000 23622000 29860000 90705000 0 34486000 0 35670000 127060000 227010000 13872000 88533000 88551000 133420000 17472 2211 16420 154533;154534;154535;154536;154537;154538;154539;154540;154541;154542;154543;154544;154545;154546;154547;154548;154549 197070;197071;197072;197073;197074;197075;197076;197077;197078;197079;197080;197081;197082;197083;197084;197085;197086;197087 197071 15 GSELETAMETLINVFHAHSGK Acetyl (Protein N-term) 2312.1107 0.11069602 2211 P23297;Q5T7Y5;Q5T7Y4 S100A1 Protein S100-A1 yes no 1 0 0 2 1 1 1 2 3 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GSFFISQVVLTPK Unmodified 1421.7919 0.79185171 3345 Q63HM9 PLCXD3 PI-PLC X domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.1 121.1 2 3.4346E-05 118567 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.52 100.28 1298000000 114430000 110660000 102550000 84961000 99670000 100050000 124290000 76327000 107380000 35220000 152110000 109490000 80898000 17483 3345 16429 154623;154624;154625;154626;154627;154628;154629;154630;154631;154632;154633;154634;154635 197165;197166;197167;197168;197169;197170;197171;197172;197173;197174;197175;197176;197177;197178 197175 4 GSFGAMDDPFK Unmodified 1170.5016 0.5015597 4394 Q9UBC2;M0R3I1 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 92.714 92.714 2 0.059175 93548 QUIQUE_C1563_190116_001 44.425 37.205 19176000 0 0 0 0 0 19176000 0 0 0 0 0 0 0 17484 4394 16430 154636 197179 197179 1 GSFGELALMYNTPR Unmodified 1554.7501 0.75006325 2069;2331 P13861;H7C1L0;P31323 PRKAR2A;PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory 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154694;154695;154696;154697;154698;154699;154700;154701;154702;154703;154704;154705;154706;154707;154708;154709;154710 197240;197241;197242;197243;197244;197245;197246;197247;197248;197249;197250;197251;197252;197253;197254;197255;197256;197257;197258;197259 197250 19 GSGDTSNFDDYEEEDIR Unmodified 1947.7606 0.76062375 167 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4 PRKACB cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 77.441 77.441 2 4.3368E-121 78220 QUIQUE_C1368_190116_001 225.13 208.99 109890000 27530000 0 50102000 0 0 0 32253000 0 0 0 0 0 0 17494 167 16439 154711;154712;154713 197260;197261;197262 197261 3 GSGEGQGQILQR Unmodified 1228.616 0.61601261 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.513 23.513 2 0.00047863 16825 QUIQUE_C1403_190116_001 107.9 87.001 308760000 38237000 38662000 0 38465000 39475000 28948000 46514000 0 0 14022000 40409000 0 24032000 17495 1716 16440 154714;154715;154716;154717;154718;154719;154720;154721;154722 197263;197264;197265;197266;197267;197268;197269;197270;197271 197265 6 GSGGLGGACGGAGFGSR Unmodified 1423.6263 0.62625972 764 CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259 KRT6C;KRT6A Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A no no 0 0 0 1 1 1 40.173 40.173 2 0.00051766 37093 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.262 59.63 118310000 0 0 0 0 0 0 0 42106000 0 0 0 35372000 40836000 + 17496 764 16441 154723;154724;154725 197272;197273;197274 197272 3 GSGIQWDLR Unmodified 1030.5196 0.51959303 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.135 74.135 2 0.00014103 75761 QUIQUE_C1218_190116_001 141.52 120.89 1857300000 277890000 214570000 141960000 165680000 146040000 132750000 160290000 58771000 95965000 96226000 147780000 121060000 98348000 17497 1620 16442 154726;154727;154728;154729;154730;154731;154732;154733;154734;154735;154736;154737;154738 197275;197276;197277;197278;197279;197280;197281;197282;197283;197284;197285;197286;197287;197288;197289;197290;197291;197292;197293;197294;197295;197296;197297;197298;197299;197300;197301;197302;197303 197276 29 GSGIQWDLRK Unmodified 1158.6146 0.61455605 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 2 45.037 45.037 2;3 0.0029158 42208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.359 36.597 603570000 0 0 0 0 22584000 0 0 102680000 136130000 0 78354000 154330000 109490000 17498 1620 16443 154739;154740;154741;154742;154743;154744;154745;154746;154747 197304;197305;197306;197307;197308;197309;197310;197311;197312;197313 197308 9 GSGNLEAIHIIK Unmodified 1250.6983 0.69828568 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 2 3 2 3 1 1 2 1 1 2 52.228 52.228 2;3 9.1118E-05 49353 QUIQUE_C1563_190116_001 121.61 75.635 2875600000 188780000 169990000 482800000 219960000 525620000 211610000 237740000 104580000 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41903000 0 17501 4532 16446 154772;154773;154774;154775;154776;154777;154778;154779;154780;154781;154782 197339;197340;197341;197342;197343;197344;197345;197346;197347;197348;197349 197345 11 GSGSTVSEAECR Unmodified 1238.5197 0.51972896 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 14.522 14.522 2 0.013095 6216 QUIQUE_C1277_190116_001 57.019 47.626 19911000 0 19911000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17502 4522 16447 154783 197350 197350 1 GSGSVVGELMYK Oxidation (M) 1241.5962 0.59618837 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.401 57.401 2 0.0026439 55703 QUIQUE_C1403_190116_001 76.228 60.613 376990000 33546000 34607000 0 35961000 0 25558000 0 28567000 41665000 38856000 55418000 37462000 45352000 17503 1655 16448 154784;154785;154786;154787;154788;154789;154790;154791;154792;154793 197351;197352;197353;197354;197355;197356;197357;197358;197359;197360;197361 197354 889 10 GSGSVVGELMYK Unmodified 1225.6013 0.60127375 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 1 75.549 75.549 2 0.0053377 74863 QUIQUE_C1563_190116_001 66.595 49.819 335940000 0 0 0 0 0 115270000 0 76468000 0 0 144200000 0 0 17504 1655 16448 154794;154795;154796 197362;197363;197364 197362 3 GSGTAEVELK Unmodified 989.50294 0.50293991 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;H3BT25;P14618 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.993 21.993 2 0.00023561 15178 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.89 87.47 23893000000 3890800000 2188800000 3010300000 2768400000 1600700000 2738600000 1995000000 591310000 0 1442700000 1271500000 1291500000 1103400000 17505 1203;2077 16449 154797;154798;154799;154800;154801;154802;154803;154804;154805;154806;154807;154808 197365;197366;197367;197368;197369;197370;197371;197372;197373;197374;197375;197376;197377 197373 8 GSGTAEVELKK Unmodified 1117.5979 0.59790293 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;H3BT25;P14618 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 1 3 2 2 1 1 1 2 2 1 2 2 13.633 13.633 2;3 0.00011437 5867 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.34 84.099 676150000 21750000 15113000 59758000 28607000 0 3020800 29864000 64619000 55710000 203740000 62468000 56636000 74864000 17506 1203;2077 16450 154809;154810;154811;154812;154813;154814;154815;154816;154817;154818;154819;154820;154821;154822;154823;154824;154825;154826;154827;154828 197378;197379;197380;197381;197382;197383;197384;197385;197386;197387;197388;197389;197390;197391;197392;197393;197394;197395;197396;197397;197398;197399 197393 20 GSGTASDDEFENLR Unmodified 1496.6379 0.63792984 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 58.454 58.454 2 0.015434 57281 QUIQUE_C1576_190116_001 52.693 42.739 122240000 26728000 48090000 0 0 0 0 47420000 0 0 0 0 0 0 17507 3471 16451 154829;154830;154831;154832 197400;197401;197402;197403;197404 197403 5 GSHGQTPSPGALPLGR Unmodified 1530.7903 0.79028858 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 38.502 38.502 2;3 8.712E-95 34748 QUIQUE_C1403_190116_001 216.84 196.54 18939000000 1911800000 1825500000 1957200000 1697600000 1389400000 1139400000 1739400000 994780000 929440000 606150000 1740000000 1565400000 1442900000 17508 2125 16452 154833;154834;154835;154836;154837;154838;154839;154840;154841;154842;154843;154844;154845;154846;154847;154848;154849;154850;154851;154852;154853;154854;154855;154856;154857;154858;154859 197405;197406;197407;197408;197409;197410;197411;197412;197413;197414;197415;197416;197417;197418;197419;197420;197421;197422;197423;197424;197425;197426;197427;197428;197429;197430;197431;197432;197433;197434;197435;197436;197437;197438;197439;197440;197441;197442;197443;197444;197445;197446;197447;197448;197449;197450;197451;197452;197453;197454;197455;197456;197457;197458;197459;197460;197461;197462;197463;197464;197465 197420 61 GSHTDAPDTATGNCLLQR Unmodified 1912.8697 0.86973747 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 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0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 142.98 142.98 2 0.00080312 148016 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.911 80.047 1892000000 173000000 0 296390000 189760000 166820000 224800000 180050000 172240000 185330000 89721000 0 213880000 0 17511 1890 16455 154885;154886;154887;154888;154889;154890;154891;154892;154893;154894;154895;154896;154897 197492;197493;197494;197495;197496;197497;197498;197499;197500;197501;197502;197503;197504;197505;197506;197507;197508;197509 197507 17 GSIFVVFDSIESAKK Unmodified 1625.8665 0.86647322 1890 P05455;E7ERC4;E9PGX9 SSB Lupus La protein yes no 0 0 1 2 1 118.34 118.34 2;3 0.0011818 124306 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.848 48.993 63487000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28324000 35162000 0 17512 1890 16456 154898;154899;154900 197510;197511;197512 197510 3 GSIGPTVLEVFNTLLK Unmodified 1686.9556 0.95562257 353 A0A1B0GUZ7;Q14156 EFR3A Protein EFR3 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.27 169.27 2 0.0036323 175523 QUIQUE_C1438_190116_001 79.089 56.447 118490000 0 18528000 0 17245000 25134000 0 0 10421000 15713000 0 31454000 0 0 17513 353 16457 154901;154902;154903;154904;154905;154906 197513;197514;197515;197516;197517;197518;197519 197515 7 GSIGQYIQDR Unmodified 1135.5622 0.56218613 4253 Q9NQC7;J3KRR7;H3BS09;H3BSW9;H3BTB8 CYLD Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD yes no 0 0 0 1 54.058 54.058 2 0.024222 53092 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.432 35.806 32459000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32459000 0 0 17514 4253 16458 154907 197520 197520 1 GSIGVWHYICPR Unmodified 1443.7081 0.70813886 4135 Q9H1V8 SLC6A17 Sodium-dependent neutral amino acid transporter SLC6A17 yes yes 0 0 0 1 82.639 82.639 3 0.0039474 84579 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.592 37.638 31400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31400000 17515 4135 16459 154908 197521 197521 1 GSIHDFPGFDPNQDAEALYTAMK Unmodified 2523.1376 0.13763905 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6;E5RFF0;E5RI05;E5RJR0;E5RIU8 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 141.09 141.09 2;3 3.502E-62 146236 QUIQUE_C1368_190116_001 191.37 179.23 12838000000 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383930000 232430000 374630000 0 242180000 17517 845;1936 16460 154936;154937;154938;154939;154940;154941;154942;154943;154944;154945;154946;154947 197569;197570;197571;197572;197573;197574;197575;197576;197577;197578;197579;197580;197581;197582;197583 197571 495 15 GSIINISSIVGK Unmodified 1186.6921 0.69213767 3728 Q92506 HSD17B8 Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.92 105.92 2 0.0046595 108552 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.557 41.254 367920000 0 58876000 0 0 0 62818000 48213000 0 0 22725000 99927000 75362000 0 17518 3728 16461 154948;154949;154950;154951;154952;154953 197584;197585;197586;197587;197588;197589 197589 5 GSILDPSPEAAVVGGNVLTSQR Unmodified 2166.1281 0.12806065 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 120.5 120.5 2;3 3.6913E-27 124788 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.47 118.79 116360000 0 0 0 0 0 0 0 40556000 46535000 0 29264000 0 0 17519 1450 16462 154954;154955;154956;154957;154958 197590;197591;197592;197593;197594 197592 5 GSILSLSLLR Unmodified 1057.6495 0.64954457 4292 Q9NTJ4;A0A0C4DGU9 MAN2C1 Alpha-mannosidase 2C1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 120.47 120.47 2 0.0066136 123565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.376 34.309 181700000 0 23485000 0 0 29462000 0 23937000 31287000 35695000 0 0 37831000 0 17520 4292 16463 154959;154960;154961;154962;154963;154964 197595;197596;197597;197598;197599;197600;197601 197599 7 GSIPEFFHIMK Unmodified 1304.6587 0.65872905 4271 Q9NRN7;E9PLW6;E9PNF3 AASDHPPT L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.63 103.63 3 0.0018554 108497 QUIQUE_C1218_190116_001 55.401 32.175 262100000 24290000 25746000 34453000 25729000 0 22728000 32226000 19863000 17490000 6836800 25749000 0 26991000 17521 4271 16464 154965;154966;154967;154968;154969;154970;154971;154972;154973;154974;154975 197602;197603;197604;197605;197606;197607;197608;197609;197610;197611;197612;197613;197614 197602 13 GSISEDELITAIK Unmodified 1374.7242 0.72422566 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.702 99.702 2 0.000373 102376 QUIQUE_C1277_190116_001 115.57 79.192 1171000000 141590000 100890000 95142000 147580000 100220000 121450000 75250000 98898000 110410000 0 65018000 0 114520000 17522 3199 16465 154976;154977;154978;154979;154980;154981;154982;154983;154984;154985;154986 197615;197616;197617;197618;197619;197620;197621;197622;197623;197624;197625;197626;197627 197616 13 GSITISAEEIK Unmodified 1146.6132 0.61321864 1611 O75131;A0A087WYQ3;E5RHZ0;A0A087WXR6;H0YB26 CPNE3 Copine-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.464 59.464 2 0.0012557 55611 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.15 48.902 251710000 61052000 0 50303000 41346000 0 36113000 0 0 18775000 44123000 0 0 0 17523 1611 16466 154987;154988;154989;154990;154991;154992 197628;197629;197630;197631;197632;197633 197633 5 GSITISAEEIKDNR Unmodified 1531.7842 0.78420015 1611 O75131;A0A087WYQ3;E5RHZ0;A0A087WXR6;H0YB26 CPNE3 Copine-3 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 50.567 50.567 2;3 1.9282E-09 48114 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.32 108.29 2498800000 111380000 141410000 174190000 113810000 195680000 122190000 223280000 292060000 342650000 50356000 177150000 254760000 299830000 17524 1611 16467 154993;154994;154995;154996;154997;154998;154999;155000;155001;155002;155003;155004;155005;155006;155007;155008;155009;155010;155011;155012;155013;155014;155015;155016;155017 197634;197635;197636;197637;197638;197639;197640;197641;197642;197643;197644;197645;197646;197647;197648;197649;197650;197651;197652;197653;197654;197655;197656;197657;197658;197659;197660;197661;197662;197663;197664;197665 197655 31 GSITSVQAIYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSR Unmodified 3713.8788 0.8788354 1900 P06576;H0YH81;H0YI37 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 0 3 3 5 1 3 3 3 4 3 3 1 4 4 152.57 152.57 3;4 5.6093E-183 157119 QUIQUE_C1218_190116_001 200.86 187.2 5312700000 336490000 332120000 543990000 267730000 349100000 433520000 292310000 516520000 500300000 444680000 282130000 672600000 341230000 17525 1900 16468 155018;155019;155020;155021;155022;155023;155024;155025;155026;155027;155028;155029;155030;155031;155032;155033;155034;155035;155036;155037;155038;155039;155040;155041;155042;155043;155044;155045;155046;155047;155048;155049;155050;155051;155052;155053;155054;155055;155056;155057 197666;197667;197668;197669;197670;197671;197672;197673;197674;197675;197676;197677;197678;197679;197680;197681;197682;197683;197684;197685;197686;197687;197688;197689;197690;197691;197692;197693;197694;197695;197696;197697;197698;197699;197700;197701;197702;197703;197704;197705;197706;197707;197708;197709;197710;197711;197712;197713;197714;197715;197716;197717;197718;197719;197720;197721;197722;197723;197724;197725;197726 197667 57 GSLAADKVVEEIR Unmodified 1385.7514 0.75144346 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8YF45 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 2 62.264 62.264 2;3 0.020749 60814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.845 65.541 29622000 0 0 0 0 0 0 0 29622000 0 0 0 0 0 17526 455 16469 155058;155059 197727;197728 197727 2 GSLAAVAHAQSLVEAQPNVDKLVEDHLAVQSLIR Unmodified 3577.9216 0.92164369 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;Q02218;A0A0D9SFS3;C9J4G7 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 1 2 1 2 1 133.96 133.96 4;5 8.8702E-47 138612 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.91 105.64 1156100000 0 0 0 0 0 0 0 383260000 291990000 0 0 240720000 240170000 17527 903;2869 16470 155060;155061;155062;155063;155064;155065 197729;197730;197731;197732;197733;197734 197734 6 GSLACPSPTCFSPQESPSK Unmodified 2035.8979 0.89792605 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 69.541 69.541 2 1.6479E-16 70003 QUIQUE_C1218_190116_001 151.74 143.22 85942000 33744000 52198000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17528 3452 16471 155066;155067;155068;155069;155070 197735;197736;197737;197738;197739 197735 4 GSLAEAVGSPPPAATPTPTPPTR Unmodified 2171.1222 0.12224699 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 0 1 2 1 78.502 78.502 2;3 2.1636E-13 78766 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.72 108.52 122130000 0 0 0 29886000 0 0 0 66843000 25403000 0 0 0 0 17529 4654 16472 155071;155072;155073;155074 197740;197741;197742;197743 197741 4 GSLALQPFLVGGR Unmodified 1313.7456 0.74557022 3570 Q8N145 LGI3 Leucine-rich repeat LGI family member 3 yes yes 0 0 0 1 73.587 73.587 3 0.021043 74039 QUIQUE_C1277_190116_001 27.967 16.503 31109000 0 31109000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17530 3570 16473 155075 197744 197744 1 GSLASLDSLR Unmodified 1017.5455 0.54547343 759 C9JZR2;O60716;E9PKY0 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 70.372 70.372 2 0.016628 70690 QUIQUE_C1218_190116_001 62.463 21.739 28966000 28966000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17531 759 16474 155076;155077 197745;197746 197745 2 GSLASLDSLRK Unmodified 1145.6404 0.64043645 759 C9JZR2;O60716;E9PKY0 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 1 1 45.788 45.788 3 0.002277 42579 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2149.0427 0.042659261 4583 Q9Y3A5;A0A087X020 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 2 1 2 114.9 114.9 2;3 1.3398E-20 118628 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.81 147.13 97315000 0 0 0 0 0 0 0 62997000 34318000 0 0 0 0 17538 4583 16481 155106;155107;155108 197778;197779;197780 197779 3 GSLGDSDGKHETVNQEEK Unmodified 1928.8712 0.87117726 2836 P98172 EFNB1 Ephrin-B1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 11.854 11.854 3;4 0.00010486 4136 QUIQUE_C1438_190116_001 92.307 83.965 23823000 0 0 0 0 7623100 0 5498900 3766200 0 0 6934600 0 0 17539 2836 16482 155109;155110;155111;155112;155113 197781;197782;197783;197784;197785 197781 5 GSLGGGFSSGGFSGGSFSR Unmodified 1706.7649 0.76486169 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.912 90.912 2 1.6293E-05 92414 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.993 87.305 1686700000 122400000 85644000 0 118310000 117430000 95227000 0 159680000 182080000 314740000 0 240390000 250790000 + 17540 776 16483 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197871;197872;197873;197874;197875;197876;197877;197878;197879;197880;197881 197873 11 GSLLVAR Unmodified 714.43882 0.43882351 3167 Q15904;A0A0C4DGX8 ATP6AP1 V-type proton ATPase subunit S1 yes no 0 0 0 1 27.277 27.277 2 0.04113 21238 QUIQUE_C1563_190116_001 82.263 10.242 48168000 0 0 0 0 0 48168000 0 0 0 0 0 0 0 17549 3167 16492 155194 197882 197882 1 GSLLWNQQDGTLSLSQR Unmodified 1901.9595 0.95953875 1374 M0R2A0;Q5UCC4 EMC10 ER membrane protein complex subunit 10 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 110.98 110.98 2 4.8166E-31 115895 QUIQUE_C1218_190116_001 158.2 136 60252000 18588000 0 25837000 0 0 0 0 0 0 0 0 15826000 0 17550 1374 16493 155195;155196;155197;155198;155199;155200 197883;197884;197885;197886;197887;197888;197889 197883 6 GSLQILDQLLLPK Unmodified 1436.8603 0.86026563 4039 Q9BV20 MRI1 Methylthioribose-1-phosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.12 151.12 2 5.9969E-06 156449 QUIQUE_C1368_190116_001 125.24 106.93 469900000 16988000 48311000 66710000 53596000 57670000 0 0 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protein 36 yes yes 0 0 0 1 37.952 37.952 2 0.034659 33814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.104 47.59 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17554 3498 16497 155218 197907 197907 1 GSLVDNIQQHFLLSDR Unmodified 1840.9432 0.94316041 1527 O43427;E9PSD3 FIBP Acidic fibroblast growth factor intracellular-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 120.87 120.87 2;3 3.9616E-19 126400 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.9 107.06 389000000 0 56903000 32277000 0 0 37709000 34102000 40778000 28201000 11513000 51067000 36148000 60308000 17555 1527 16498 155219;155220;155221;155222;155223;155224;155225;155226;155227;155228;155229;155230;155231;155232 197908;197909;197910;197911;197912;197913;197914;197915;197916;197917;197918;197919;197920;197921;197922;197923 197920 16 GSLVDYLR Unmodified 921.49198 0.4919813 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.572 88.572 2 0.010748 90440 QUIQUE_C1368_190116_001 90.862 53.216 367410000 33460000 0 45923000 29091000 37129000 34795000 33977000 0 44288000 0 52415000 0 56327000 17556 2439 16499 155233;155234;155235;155236;155237;155238;155239;155240;155241 197924;197925;197926;197927;197928;197929;197930;197931;197932;197933 197925 10 GSLVQASEANLQAAQDFVR Unmodified 2003.0072 0.007217228 2154 P19827 ITIH1 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H1 yes yes 0 0 0 1 127.45 127.45 2 2.2969E-07 130086 QUIQUE_C1563_190116_001 105.14 90.882 22899000 0 0 0 0 0 22899000 0 0 0 0 0 0 0 17557 2154 16500 155242 197934 197934 1 GSMAGSTGVHDTVVNQLLSK Oxidation (M) 2015.9946 0.99460363 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 0 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 70.703 70.703 2;3 4.5035E-18 69996 QUIQUE_DMIX8_190116_001 128.71 105.47 4454700000 340500000 393710000 399500000 61834000 60731000 212820000 310490000 415450000 374910000 351270000 533290000 465320000 534900000 17558 1245 16501 155243;155244;155245;155246;155247;155248;155249;155250;155251;155252;155253;155254;155255;155256;155257;155258;155259;155260;155261;155262;155263;155264;155265;155266 197935;197936;197937;197938;197939;197940;197941;197942;197943;197944;197945;197946;197947;197948;197949;197950;197951;197952;197953;197954;197955;197956;197957;197958;197959;197960;197961 197960 722 26 GSMAGSTGVHDTVVNQLLSK Unmodified 1999.9997 0.99968901 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 81.168 81.168 2;3 2.8906E-101 82287 QUIQUE_C1277_190116_001 210.08 178.85 7871900000 858850000 1052100000 719040000 751500000 569780000 581670000 810450000 314290000 347010000 132660000 594670000 541870000 597990000 17559 1245 16501 155267;155268;155269;155270;155271;155272;155273;155274;155275;155276;155277;155278;155279;155280;155281;155282;155283;155284;155285;155286;155287;155288;155289;155290;155291;155292 197962;197963;197964;197965;197966;197967;197968;197969;197970;197971;197972;197973;197974;197975;197976;197977;197978;197979;197980;197981;197982;197983;197984;197985;197986;197987;197988;197989;197990;197991 197965 29 GSMSDSANILDEVPFPAR Unmodified 1904.8938 0.89382695 3104 Q15049;A6PVC3 MLC1 Membrane protein MLC1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 133.15 133.15 2 5.9298E-18 136207 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.35 128.02 581920000 0 77709000 88993000 0 0 0 0 98398000 122990000 0 107900000 85928000 0 17560 3104 16502 155293;155294;155295;155296;155297;155298;155299;155300;155301 197992;197993;197994;197995;197996;197997;197998;197999;198000;198001 197997 9 GSMSDSANILDEVPFPAR Oxidation (M) 1920.8887 0.88874158 3104 Q15049;A6PVC3 MLC1 Membrane protein MLC1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 124.43 124.43 2 4.0635E-23 127195 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.87 126.73 531930000 0 0 0 68590000 0 51708000 0 103390000 144510000 76456000 0 0 87275000 17561 3104 16502 155302;155303;155304;155305;155306;155307;155308;155309;155310;155311;155312 198002;198003;198004;198005;198006;198007;198008;198009;198010;198011;198012;198013 198007 2549 12 GSMYMQQQQPLLSTQDFNMAADIDPQNADVYHHR Unmodified 3948.7618 0.76179028 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 127.66 127.66 4 2.1689E-51 132299 QUIQUE_C1368_190116_001 115.3 110.39 127600000 0 0 67349000 60255000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17562 1689 16503 155313;155314 198014;198015 198014 2 GSNDTIFDNEAK Unmodified 1309.5786 0.57862405 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 43.256 43.256 2 0.0059005 39220 QUIQUE_C1563_190116_001 81.335 59.485 223690000 38344000 34692000 35617000 34585000 0 37299000 43150000 0 0 0 0 0 0 17563 4474 16504 155315;155316;155317;155318;155319;155320;155321;155322 198016;198017;198018;198019;198020;198021;198022;198023 198021 6 GSNMDFREPTEEER Oxidation (M) 1711.7108 0.71077721 3106 Q15056 EIF4H Eukaryotic translation initiation factor 4H yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 25.205 25.205 3 0.0012907 20081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.908 75.706 354190000 0 33508000 0 0 0 0 0 66209000 57344000 0 67294000 0 129830000 17564 3106 16505 155323;155324;155325;155326;155327 198024;198025;198026;198027;198028 198025 2550 4 GSNMDFREPTEEER Unmodified 1695.7159 0.71586259 3106 Q15056 EIF4H Eukaryotic translation initiation factor 4H yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 38.923 38.923 2;3 0.00017684 35229 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.651 70.291 791710000 0 0 0 0 0 0 56876000 190400000 155430000 0 139060000 88474000 161470000 17565 3106 16505 155328;155329;155330;155331;155332;155333;155334;155335;155336;155337;155338;155339;155340 198029;198030;198031;198032;198033;198034;198035;198036;198037;198038;198039;198040;198041;198042 198038 14 GSNMFNHLSAVSESIPALGWIAVSPK Oxidation (M) 2727.369 0.36903597 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;F8WDB9 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 1 0 1 143.36 143.36 3 0.00040719 148348 QUIQUE_C1218_190116_001 41.939 38.412 35989000 35989000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17566 2422 16506 155341 198043 198043 1846 1 GSNMFNHLSAVSESIPALGWIAVSPK Unmodified 2711.3741 0.37412135 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;F8WDB9 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 153.78 153.78 3 7.218E-08 158436 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.621 50.973 1129100000 100270000 175240000 0 257320000 0 0 118840000 100330000 0 0 114650000 81682000 180730000 17567 2422 16506 155342;155343;155344;155345;155346;155347;155348;155349;155350 198044;198045;198046;198047;198048;198049;198050;198051;198052;198053 198053 8 GSNNVALGYDEGSIIVK Unmodified 1734.8788 0.87882882 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 1 1 90.092 90.092 2 5.4315E-05 91146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.084 81.544 167650000 0 0 0 0 0 0 0 80663000 0 0 0 86990000 0 17568 2380 16507 155351;155352 198054;198055 198054 2 GSNPHLQTFTFTR Unmodified 1504.7423 0.74227576 4014 Q9BSJ8;F8VZB1 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes no 0 0 0 1 1 57.507 57.507 3 0.055753 56566 QUIQUE_DMIX3_190116_001 23.419 9.4558 139810000 0 0 0 0 0 0 0 0 66018000 0 73794000 0 0 17569 4014 16508 155353;155354 198056;198057 198056 2 GSNTCELIFEDCK Unmodified 1571.6596 0.65959326 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YLC3;H0YKV0 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.182 76.182 2 0.00050786 76315 QUIQUE_C1403_190116_001 90.146 72.71 716160000 120400000 90834000 130860000 75541000 82832000 94383000 96133000 0 0 0 0 0 25181000 17570 192 16509 155355;155356;155357;155358;155359;155360;155361;155362;155363 198058;198059;198060;198061;198062;198063;198064;198065;198066;198067 198061 10 GSNTCELIFEDCKIPAANILGHENK Unmodified 2829.3426 0.34256323 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YLC3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 106.47 106.47 4 0.02405 111503 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198136;198137;198138;198139;198140;198141;198142;198143;198144;198145;198146;198147;198148;198149;198150;198151;198152;198153;198154;198155;198156;198157;198158;198159;198160;198161;198162;198163;198164;198165;198166;198167;198168;198169;198170;198171 198160 36 GSPMEISLPIALSK Oxidation (M) 1457.78 0.7799664 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 105.11 105.11 2 0.0068728 108698 QUIQUE_C1576_190116_001 62.924 48.463 318810000 43348000 35165000 0 0 50386000 0 45046000 87130000 0 57737000 0 0 0 17581 1977 16520 155432;155433;155434;155435;155436;155437 198172;198173;198174;198175;198176;198177 198175 1250 6 GSPMEISLPIALSK Unmodified 1441.7851 0.78505177 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.92 125.92 2 0.00023261 130665 QUIQUE_C1368_190116_001 92.247 73.575 1752400000 158950000 173590000 162550000 0 145980000 152370000 148590000 138560000 164080000 59978000 141890000 152780000 153050000 17582 1977 16520 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198370;198371;198372;198373;198374;198375;198376;198377;198378;198379;198380;198381;198382;198383;198384;198385;198386 198372 16 GSSGGGVSCIIR Unmodified 1148.5608 0.56080592 1409 O00478;C9JUV8;C9JQT8 BTN3A3 Butyrophilin subfamily 3 member A3 yes no 0 0 0 1 36.825 36.825 2 0.032964 32191 QUIQUE_C1563_190116_001 47.844 22.107 48442000 0 0 0 0 0 48442000 0 0 0 0 0 0 0 17603 1409 16541 155602 198387 198387 1 GSSGGSGAKPSDAASEAAR Unmodified 1661.7605 0.7605046 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;H7C044 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 10.755 10.755 3 1.533E-07 3183 QUIQUE_C1403_190116_001 94.384 83.329 154620000 0 0 0 18059000 33979000 0 0 13919000 25795000 0 12824000 12466000 37577000 17604 922 16542 155603;155604;155605;155606;155607;155608;155609 198388;198389;198390;198391;198392;198393;198394;198395;198396 198388 9 GSSGPTQINQVVSHPNQPLTITAHDDR Unmodified 2868.4114 0.41144615 993 F5GYK2;Q9NRL3;M0R317 STRN4 Striatin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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198408;198409;198410;198411;198412;198413;198414;198415;198416;198417;198418 198414 11 GSSHQVEYEILFPGCVLR Unmodified 2090.0255 0.025509829 1680;1234 H7C417;B5MC44;O76054;B3KRD8;Q9UDX4 SEC14L3;SEC14L2 SEC14-like protein 2;SEC14-like protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 3 1 115.62 115.62 2;3 1.8317E-10 119689 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.85 129.17 1570600000 0 0 81280000 74925000 0 248470000 0 219140000 74618000 0 474190000 305760000 92218000 17608 1234;1680 16546 155628;155629;155630;155631;155632;155633;155634;155635;155636;155637;155638 198419;198420;198421;198422;198423;198424;198425;198426;198427;198428;198429;198430;198431;198432;198433 198425 12 GSSLHLHVSKPPR Unmodified 1413.7841 0.78408099 3789 Q969V3;K7ELZ9;A0A0C4DGP7;K7EMW4;K7EQ66;K7ENM2 NCLN Nicalin yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 14.263 14.263 3;4 0.00059894 6273 QUIQUE_C1403_190116_001 76.357 66.578 281730000 25346000 15716000 28249000 19497000 16273000 43266000 22824000 11996000 30775000 0 31244000 20335000 16205000 17609 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198464 2 GSSNHNLLAAPR Unmodified 1235.6371 0.6370824 2825 P83436 COG7 Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7 yes yes 0 0 0 1 19.916 19.916 3 0.063232 12825 QUIQUE_DMIX8_190116_001 21.246 2.1141 31176000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31176000 17612 2825 16550 155668 198465 198465 1 GSSPSHSATSVHTSV Unmodified 1439.6641 0.66408501 1061 F8WA39;Q13613 MTMR1 Myotubularin-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 13.747 13.747 2;3 1.0545E-10 5854 QUIQUE_C1438_190116_001 107.17 92.908 189750000 26409000 0 0 12114000 17491000 0 16960000 0 30798000 0 32905000 0 53074000 17613 1061 16551 155669;155670;155671;155672;155673;155674;155675;155676;155677 198466;198467;198468;198469;198470;198471;198472;198473;198474 198468 9 GSSSGGGYSSGSSSYGSGGR Unmodified 1739.6983 0.69829827 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.951 18.951 2 7.7793E-76 11305 QUIQUE_C1277_190116_001 194.48 176.21 694020000 42233000 49529000 0 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 52.798 52.798 2 0.0041127 50981 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.136 68.818 1087100000 0 0 0 133920000 0 154510000 0 161560000 204270000 0 156310000 168950000 107560000 17619 3235 16557 155718;155719;155720;155721;155722;155723;155724;155725 198530;198531;198532;198533;198534;198535;198536;198537;198538;198539 198538 10 GSSYSSIPK Unmodified 924.45526 0.45526144 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 22.072 22.072 2 0.035683 15569 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.712 36.048 25430000 0 0 0 0 0 0 0 25430000 0 0 0 0 0 17620 3061 16558 155726 198540 198540 1 GSTAENAEYLR Unmodified 1209.5626 0.56258006 1789 P00533;E9PFD7 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 30.087 30.087 2 0.0055472 24754 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.657 47.787 28818000 0 0 0 0 0 0 0 28818000 0 0 0 0 0 17621 1789 16559 155727 198541 198541 1 GSTAPVGGGAFPTIVER Unmodified 1614.8366 0.83657007 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.612 86.612 2 0.00087199 88260 QUIQUE_C1277_190116_001 68.171 54.013 2747300000 358280000 346540000 380720000 0 0 339570000 340180000 187200000 0 0 313460000 227560000 253820000 17622 3109 16560 155728;155729;155730;155731;155732;155733;155734;155735;155736 198542;198543;198544;198545;198546;198547;198548;198549;198550 198543 2 GSTDDKGPVAGWINALEAYQK Unmodified 2219.0859 0.08586148 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3KSV5;A0A087WYZ1;A0A087WVS2;J3QRH4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 1 3 2 2 3 2 2 3 2 3 3 2 2 5 140.88 140.88 2;3 3.3744E-164 145947 QUIQUE_C1368_190116_001 276.18 274.54 10134000000 707180000 629630000 931880000 653960000 666910000 569130000 1016900000 832640000 991550000 294600000 809830000 845840000 1184100000 17623 3897 16561 155737;155738;155739;155740;155741;155742;155743;155744;155745;155746;155747;155748;155749;155750;155751;155752;155753;155754;155755;155756;155757;155758;155759;155760;155761;155762;155763;155764;155765;155766;155767;155768;155769;155770 198551;198552;198553;198554;198555;198556;198557;198558;198559;198560;198561;198562;198563;198564;198565;198566;198567;198568;198569;198570;198571;198572;198573;198574;198575;198576;198577;198578;198579;198580;198581;198582;198583;198584;198585;198586;198587;198588;198589;198590;198591;198592;198593;198594;198595;198596;198597;198598;198599;198600;198601;198602;198603;198604;198605;198606;198607;198608 198560 56 GSTDNLMDDIER Unmodified 1364.5878 0.58780853 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.857 82.857 2 7.0311E-06 83657 QUIQUE_DMIX1_190116_001 133.75 119.98 2389800000 214390000 226700000 211110000 196770000 156680000 182340000 198400000 171950000 170300000 65584000 226090000 164200000 205300000 17624 2572 16562 155771;155772;155773;155774;155775;155776;155777;155778;155779;155780;155781;155782;155783 198609;198610;198611;198612;198613;198614;198615;198616;198617;198618;198619;198620;198621 198616 11 GSTDNLMDDIER Oxidation (M) 1380.5827 0.58272315 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 1 0 1 1 50.407 50.407 2 0.012974 48728 QUIQUE_C1277_190116_001 59.542 46.965 46296000 0 24451000 0 0 0 0 0 0 0 21845000 0 0 0 17625 2572 16562 155784;155785 198622;198623 198622 2018 2 GSTESCNTTTEDEDLK Unmodified 1785.7211 0.72106713 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.932 22.932 2 2.7767E-165 16007 QUIQUE_C1368_190116_001 256.63 248.41 1222900000 125080000 147280000 126110000 147990000 121700000 125340000 175160000 0 35159000 23921000 57956000 64256000 72965000 17626 412;3299 16563 155786;155787;155788;155789;155790;155791;155792;155793;155794;155795;155796;155797 198624;198625;198626;198627;198628;198629;198630;198631;198632;198633;198634;198635 198626 12 GSTESCNTTTEDEDLKAAPLR Unmodified 2294.0332 0.033233562 412 A0A2Q3DQE3;H0Y6G2 CAMK2G yes no 0 0 1 1 45.521 45.521 3 0.020844 42528 QUIQUE_DMIX7_190116_001 33.656 20.231 34700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34700000 0 17627 412 16564 155798 198636 198636 1 GSTESCNTTTEDEDLKVR Unmodified 2040.8906 0.89059207 3299 Q5SWX3 CAMK2G no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.461 28.461 3 1.3374E-14 22825 QUIQUE_C1403_190116_001 130.39 121.11 356770000 0 0 42612000 55422000 53885000 0 56402000 0 0 0 55422000 35712000 57317000 17628 3299 16565 155799;155800;155801;155802;155803;155804;155805;155806 198637;198638;198639;198640;198641;198642;198643;198644;198645 198639 9 GSTGFGQDSILSLPGNVGHQDVK Unmodified 2312.1397 0.13968796 727 C9JIF9;P13798 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 99.302 99.302 2;3 1.4957E-17 103709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.03 140.7 1526200000 0 37656000 210740000 0 237890000 0 0 0 212410000 0 294590000 178340000 354580000 17629 727 16566 155807;155808;155809;155810;155811;155812;155813;155814;155815;155816;155817 198646;198647;198648;198649;198650;198651;198652;198653;198654;198655;198656 198653 10 GSTHPQPGVSPPAAPAAPGPK Unmodified 1919.9854 0.98535957 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 36.247 36.247 2;3 6.774E-07 31788 QUIQUE_C1277_190116_001 81.967 75.55 2050300000 260440000 166780000 145070000 127180000 301710000 166230000 157910000 97771000 130680000 68185000 122930000 122460000 182940000 17630 1700 16567 155818;155819;155820;155821;155822;155823;155824;155825;155826;155827;155828;155829;155830;155831;155832;155833 198657;198658;198659;198660;198661;198662;198663;198664;198665;198666;198667;198668;198669;198670;198671;198672;198673;198674;198675;198676;198677;198678;198679;198680;198681;198682;198683;198684 198659 26 GSTIETEQKEDKGEDSEPVTSK Unmodified 2393.1082 0.10817264 3615 Q8N8S7;A0A0U1RRM6 ENAH Protein enabled homolog yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 18.883 18.883 3;4 7.7822E-88 11935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 195.36 185.67 1801400000 73504000 136970000 79828000 153320000 144610000 95375000 82943000 215260000 216020000 87533000 183790000 110990000 221270000 17631 3615 16568 155834;155835;155836;155837;155838;155839;155840;155841;155842;155843;155844;155845;155846;155847 198685;198686;198687;198688;198689;198690;198691;198692;198693;198694;198695;198696;198697;198698;198699 198692 15 GSTNLGVNQAGFTLHSAIYAAR Unmodified 2247.1396 0.13962838 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2;D6RF25 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 1 1 1 95.478 95.478 2;3 2.2915E-37 98976 QUIQUE_C1218_190116_001 119.79 105.75 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GSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNK Oxidation (M) 4306.1157 0.1157284 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 1 0 1 1 1 167.45 167.45 3;4 3.1862E-23 169505 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.321 69.388 379260000 0 0 238680000 0 0 0 0 48733000 0 0 0 91847000 0 17634 2255 16571 155880;155881;155882 198741;198742;198743 198742 1615 3 GSTPEAAAQVVQWVSFADSDIVPPASTWVFPTLGIMHHNK Unmodified 4290.1208 0.12081378 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 3 2 1 168.65 168.65 3;4;5 4.2265E-24 170512 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.343 79.346 2891300000 0 0 0 0 0 0 145510000 222380000 204230000 0 704000000 1541400000 73837000 17635 2255 16571 155883;155884;155885;155886;155887;155888;155889;155890;155891 198744;198745;198746;198747;198748;198749;198750;198751;198752 198745 8 GSTPYGGVKLEDLIVK Unmodified 1674.9192 0.91923707 2232 P24752;H0YEL7 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 99.344 99.344 2;3 0.016022 100742 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.498 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198784 4 GSVEEPKPEEPKR Unmodified 1480.7522 0.75217174 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 13.953 13.953 3;4 0.0069837 5625 QUIQUE_C1277_190116_001 77.527 57.517 109230000 20478000 19958000 0 0 0 21248000 0 0 0 0 33119000 14424000 0 17642 2880 16578 155924;155925;155926;155927;155928 198788;198789;198790;198791;198792 198789 4 GSVHSLDAGLLLPSGDPFSK Unmodified 1996.0266 0.026555687 3125 Q15276;I3L456 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 119.29 119.29 3 0.0036635 123136 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.848 34.433 158880000 0 0 0 0 0 53720000 32436000 34723000 0 0 0 0 38005000 17643 3125 16579 155929;155930;155931;155932 198793;198794;198795;198796 198796 4 GSVILDSGHLSTASSSDDLKGEEGSFR Unmodified 2750.2995 0.29949566 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 79.353 79.353 4 0.047316 80120 QUIQUE_C1403_190116_001 20.734 8.2412 34466000 0 0 0 34466000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17644 271 16580 155933 198797 198797 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198801;198802;198803;198804;198805;198806;198807;198808;198809;198810;198811;198812;198813;198814;198815;198816;198817;198818;198819;198820;198821;198822;198823;198824 198804 23 GSVPLGLATVLQDLLR Unmodified 1650.9669 0.96685596 3702 Q8WUX9;E5RJI3;E5RIU9 CHMP7 Charged multivesicular body protein 7 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 171.11 171.11 2;3 3.2912E-54 172369 QUIQUE_C1563_190116_001 188.91 172.65 471460000 28911000 180100000 0 19431000 67024000 15922000 0 0 36864000 10220000 36176000 61047000 15766000 17647 3702 16583 155956;155957;155958;155959;155960;155961;155962;155963;155964;155965;155966;155967 198825;198826;198827;198828;198829;198830;198831;198832;198833;198834;198835;198836 198831 11 GSVPYDAELSFALR Unmodified 1523.762 0.76200815 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.11 120.11 2 0.001585 124122 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.548 69.244 3331400000 207390000 236290000 300210000 202770000 267990000 238680000 271880000 280290000 337920000 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kinase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 31.697 31.697 2 0.0077449 26648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.283 42.284 178610000 0 0 0 0 62868000 0 0 0 0 0 77354000 38384000 0 17651 263;3590 16587 155984;155985;155986;155987 198856;198857;198858;198859;198860 198858 5 GSWQPVGDLLIDSLQDHLEK Unmodified 2249.1328 0.13281167 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304;F5GZY3 DMD Dystrophin yes no 0 0 0 1 149.93 149.93 3 0.028364 154585 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.947 18.901 21075000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21075000 0 17652 8 16588 155988 198861 198861 1 GSYGDLGGPIITTQVTIPK Unmodified 1916.0255 0.025493054 2735;3319 P61978;S4R359;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.84 117.84 2 1.0127E-45 120789 QUIQUE_DMIX1_190116_001 209.39 177.14 14028000000 1136800000 1435100000 1222500000 1356800000 0 1060000000 975820000 1190600000 1236200000 574610000 1505200000 1142700000 1191600000 17653 2735;3319 16589 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1198.4925 0.49245158 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 0 0 2 3 3 2 2 2 2 2 3 3 3 1 2 35.463 35.463 2 4.9188E-14 31687 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.73 156.47 33018000000 3558700000 3188800000 1650500000 2590600000 2005800000 1974200000 1577100000 1383600000 4749700000 973060000 3442300000 2804000000 3119600000 17657 2661 16592 156048;156049;156050;156051;156052;156053;156054;156055;156056;156057;156058;156059;156060;156061;156062;156063;156064;156065;156066;156067;156068;156069;156070;156071;156072;156073;156074;156075;156076;156077 198928;198929;198930;198931;198932;198933;198934;198935;198936;198937;198938;198939;198940;198941;198942;198943;198944;198945;198946;198947;198948;198949;198950;198951;198952;198953;198954;198955;198956;198957;198958;198959;198960;198961;198962;198963;198964 198952 35 GSYMEVEDNRSQVETDDLILKPGVVHVIDVDR Oxidation (M) 3642.7836 0.78355481 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 1 2 1 105.85 105.85 5 9.5211E-05 108050 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.139 39.372 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199019;199020;199021;199022;199023;199024;199025;199026;199027;199028;199029;199030;199031 199019 13 GTANIQLHGPPR Unmodified 1259.6735 0.67346791 4671 R4GMX5;R4GN83 BSG yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 24.659 24.659 3 0.00015228 18134 QUIQUE_C1218_190116_001 78.653 62.399 143740000 53130000 34438000 0 31149000 0 25023000 0 0 0 0 0 0 0 17665 4671 16599 156135;156136;156137;156138;156139 199032;199033;199034;199035;199036 199032 5 GTAVVNGEFK Unmodified 1020.524 0.52400971 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 29.676 29.676 1;2 2.1266E-09 24148 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.1 126.38 6719500000 588470000 473150000 550400000 424660000 457480000 0 523850000 480930000 670810000 252340000 865390000 733910000 698130000 17666 2302 16600 156140;156141;156142;156143;156144;156145;156146;156147;156148;156149;156150;156151;156152;156153;156154;156155;156156;156157 199037;199038;199039;199040;199041;199042;199043;199044;199045;199046;199047;199048;199049;199050;199051;199052;199053;199054;199055;199056;199057 199052 15 GTAVVNGEFKDLSLDDFK Unmodified 1953.9684 0.96837211 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 1 109.82 109.82 2;3 9.4011E-18 112404 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.55 145.5 349290000 0 0 0 0 0 0 0 139000000 116480000 0 0 50445000 43364000 17667 2302 16601 156158;156159;156160;156161;156162;156163;156164 199058;199059;199060;199061;199062;199063;199064;199065 199060 8 GTAVVNGEFKDLSLDDFKGK Unmodified 2139.0848 0.084798847 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 2 2 1 93.941 93.941 3 7.2952E-29 93253 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.21 97.43 1759900000 0 0 0 0 0 0 0 1712000000 47920000 0 0 0 0 17668 2302 16602 156165;156166;156167 199066;199067;199068 199066 3 GTAYTFFTPGNLK Unmodified 1415.7085 0.70851601 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.51 102.51 2 2.5757E-17 105318 QUIQUE_C1277_190116_001 163.88 151.71 1923100000 155970000 181180000 171710000 153190000 161630000 152770000 162110000 131050000 151700000 65093000 257140000 179540000 0 17669 381 16603 156168;156169;156170;156171;156172;156173;156174;156175;156176;156177;156178;156179 199069;199070;199071;199072;199073;199074;199075;199076;199077;199078;199079;199080 199070 12 GTAYVVYEDIFDAK Unmodified 1589.7613 0.76133944 4585 Q9Y3B4 SF3B6 Splicing factor 3B subunit 6 yes yes 0 0 0 1 1 130.79 130.79 2 0.01006 133884 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.44 54.234 62911000 0 0 31867000 0 0 0 0 31044000 0 0 0 0 0 17670 4585 16604 156180;156181 199081;199082 199082 1 GTCNYYANAYSFWLATIER Unmodified 2299.0368 0.036802797 494 A0A3B3ISV3;P02462 COL4A1 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten yes no 0 0 0 1 1 1 164.46 164.46 2 4.3753E-05 168510 QUIQUE_C1277_190116_001 116.79 106.14 47805000 0 24033000 23771000 0 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199099;199100;199101;199102;199103;199104;199105;199106;199107;199108;199109;199110;199111 199102 13 GTDLWLGVDALGLNIYEK Unmodified 1976.0255 0.025493054 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 1 1 1 162.52 162.52 2 9.3739E-39 167248 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.51 151.15 99768000 0 0 0 0 0 0 0 0 52633000 0 47135000 0 0 17677 859 16610 156208;156209;156210 199112;199113;199114 199113 3 GTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPK Unmodified 2773.4538 0.45381146 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 2 1 1 1 1 142.83 142.83 3 5.5428E-16 147760 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.019 88.667 855500000 0 0 0 0 0 0 0 210260000 274640000 0 210620000 159980000 0 17678 859 16611 156211;156212;156213;156214 199115;199116;199117;199118;199119 199117 5 GTDSQAMEEEKPEGHV Unmodified 1742.7417 0.74174299 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 26.066 26.066 3 0.00079463 19613 QUIQUE_C1563_190116_001 48.405 37.135 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156226;156227;156228;156229;156230;156231;156232;156233;156234;156235;156236;156237;156238 199131;199132;199133;199134;199135;199136;199137;199138;199139;199140;199141;199142;199143;199144;199145;199146;199147 199139 17 GTEAAGAMFLEAIPMSIPPEVK Unmodified 2258.1327 0.13267702 1799;4 A0A024R6I7;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 1 1 4 3 1 1 1 2 157.67 157.67 2;3 2.7748E-149 164133 QUIQUE_C1438_190116_001 226.24 195.67 719450000 76867000 0 35881000 24940000 185540000 0 0 128690000 0 0 78762000 0 188780000 17682 4;1799 16615 156239;156240;156241;156242;156243;156244;156245;156246;156247;156248;156249;156250;156251;156252;156253 199148;199149;199150;199151;199152;199153;199154;199155;199156;199157;199158;199159;199160;199161;199162;199163;199164;199165;199166;199167;199168;199169 199154 21 GTEAPAVVTEEEDDDEETAPPVIAPR Unmodified 2736.2614 0.26137882 2974 Q13177 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes yes 0 0 0 1 98.163 98.163 3 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proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 3 2 2 2 1 1 39.808 39.808 2;3 2.1366E-18 36097 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.7 125.92 1127900000 37180000 74726000 107370000 0 127680000 0 98028000 128190000 129970000 51642000 179950000 85173000 107970000 17690 3780 16623 156304;156305;156306;156307;156308;156309;156310;156311;156312;156313;156314;156315;156316;156317;156318;156319;156320 199236;199237;199238;199239;199240;199241;199242;199243;199244;199245;199246;199247;199248;199249;199250;199251;199252;199253 199247 14 GTEICNYSYSNTILAVK Unmodified 1931.9299 0.92987811 4611 Q9Y4P8 WIPI2 WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 101.67 101.67 2 1.1537E-06 103025 QUIQUE_C1563_190116_001 94.122 79.56 39155000 0 0 0 0 0 0 39155000 0 0 0 0 0 0 17691 4611 16624 156321;156322;156323;156324 199254;199255;199256;199257 199255 4 GTEIGVLAK Unmodified 886.51238 0.51238239 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.595 37.595 2 0.00164 33135 QUIQUE_C1368_190116_001 101.64 24.797 1950300000 147940000 159630000 197680000 149330000 132140000 152250000 157400000 106970000 168170000 56236000 183500000 166860000 172180000 17692 4450 16625 156325;156326;156327;156328;156329;156330;156331;156332;156333;156334;156335;156336;156337 199258;199259;199260;199261;199262;199263;199264;199265;199266;199267;199268;199269;199270;199271;199272;199273;199274;199275 199261 18 GTEITHAVVIK Unmodified 1166.6659 0.66592292 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.789 29.789 2 5.3564E-08 24414 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.35 97.869 829730000 89733000 73674000 62865000 77883000 101320000 58676000 89602000 63487000 87468000 28172000 0 0 96856000 17693 645 16626 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4304 16632 156361 199301 199301 1 GTEVQVDDIK Unmodified 1102.5506 0.55061839 4536 Q9Y230 RUVBL2 RuvB-like 2 yes yes 0 0 0 1 36.722 36.722 2 0.033546 32396 QUIQUE_C1218_190116_001 53.317 25.988 33694000 33694000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17700 4536 16633 156362 199302 199302 1 GTEVQVDDIKR Unmodified 1258.6517 0.65172941 4536 Q9Y230 RUVBL2 RuvB-like 2 yes yes 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 24.614 24.614 2;3 9.5565E-05 17211 QUIQUE_C1368_190116_001 117.52 82.765 1611100000 115340000 39191000 145250000 130580000 133940000 122490000 170650000 35266000 149640000 12658000 210840000 137000000 208290000 17701 4536 16634 156363;156364;156365;156366;156367;156368;156369;156370;156371;156372;156373;156374;156375;156376;156377;156378;156379;156380;156381;156382;156383;156384;156385 199303;199304;199305;199306;199307;199308;199309;199310;199311;199312;199313;199314;199315;199316;199317;199318;199319;199320;199321;199322;199323;199324;199325;199326;199327;199328 199307 26 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no 0 0 1 1 40.478 40.478 3 0.060218 34656 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.341 7.2546 76683000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76683000 0 0 0 17711 445 16644 156529 199567 199567 1 GTFGIPLWVQVLGPLIGVQVPEEK Unmodified 2575.4414 0.44139628 1983 Q6ICJ4;P0CG30 Em:AP000351.3;GSTT2B Glutathione S-transferase theta-2B yes no 0 0 0 1 1 1 2 177.24 177.24 2;3 5.7403E-07 184000 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.41 100.32 340380000 0 6746800 0 0 0 0 60004000 39277000 0 0 234360000 0 0 17712 1983 16645 156530;156531;156532;156533;156534 199568;199569;199570;199571;199572 199571 5 GTFHWSGNEQMTK Unmodified 1521.6671 0.6670619 4351 Q9NZL9;H7C0X7 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 2 40.823 40.823 2;3 0.0089016 39811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.692 55.548 38184000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38184000 17713 4351 16646 156535;156536;156537;156538 199573;199574;199575;199576 199574 4 GTFPDAR Unmodified 762.36605 0.3660525 3122 Q15233 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes yes 0 0 0 1 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199710 295 GTGHVSSGYVER Unmodified 1247.5895 0.58946351 1090 G3V5Z3;Q6IN85;G3V5A2;H0YIY8;G3V4R3;G3V231 SMEK1 Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A yes no 0 0 0 1 13.624 13.624 3 0.0096493 5923 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.189 26.323 20740000 0 0 0 0 0 0 0 20740000 0 0 0 0 0 17726 1090 16658 156775 199993 199993 1 GTGLDEAMEWLVETLK Unmodified 1790.8761 0.87605162 2426 P40616;B4DZG7;F8W1Z8 ARL1 ADP-ribosylation factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 170.88 170.88 2;3 1.3669E-66 178730 QUIQUE_C1576_190116_001 203.51 191.35 328190000 8882300 17853000 0 0 18766000 0 21073000 58600000 7199600 0 88172000 107640000 0 17727 2426 16659 156776;156777;156778;156779;156780;156781;156782;156783;156784;156785 199994;199995;199996;199997;199998;199999;200000;200001;200002;200003;200004 199997 10 GTGLQPGEEELPDIAPPLVTPDEPK Unmodified 2598.3065 0.30647852 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 131.69 131.69 2;3 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157062;157063;157064;157065;157066;157067;157068;157069;157070;157071;157072;157073;157074;157075;157076;157077;157078;157079;157080 200360;200361;200362;200363;200364;200365;200366;200367;200368;200369;200370;200371;200372;200373;200374;200375;200376;200377;200378;200379;200380;200381 200365 21 GTLQHAEIFLK Unmodified 1255.6925 0.69247202 2352 P32929 CTH Cystathionine gamma-lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 57.317 57.317 3 0.03188 54952 QUIQUE_C1563_190116_001 28.283 17.628 86531000 0 13172000 0 43958000 0 29401000 0 0 0 0 0 0 0 17760 2352 16691 157081;157082;157083 200382;200383;200384 200384 3 GTLQQFVDNFFQSVLAPGHAVPPAVK Unmodified 2766.4493 0.4493352 1473 O15031;A6QRG9 PLXNB2 Plexin-B2 yes no 0 0 0 1 1 169.89 169.89 3 6.0908E-10 175213 QUIQUE_C1576_190116_001 84.674 73.151 165170000 0 0 0 0 0 0 108070000 0 0 0 57095000 0 0 17761 1473 16692 157084;157085 200385;200386 200385 1 GTLSDEHAGVISVLAQQAAK Unmodified 1994.0433 0.043268383 253 R4GMU8;E9PLX3;A0A0C4DGV4;O43504 LAMTOR5 Ragulator complex 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ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.57 101.57 2 0.00085312 104511 QUIQUE_C1403_190116_001 83.729 33.445 552320000 0 0 150010000 37576000 51545000 0 51527000 0 42951000 0 89472000 72943000 56302000 17767 626 16697 157117;157118;157119;157120;157121;157122;157123;157124 200418;200419;200420;200421;200422;200423;200424;200425 200419 7 GTNESLER Unmodified 904.42502 0.42502394 395;1336;389;1952 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136;P08670;B0YJC4;B0YJC5 GFAP;VIM Glial fibrillary acidic protein;Vimentin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 11.583 11.583 2 0.01159 4327 QUIQUE_C1218_190116_001 89.752 38.786 63862000 7028600 0 0 0 0 0 15271000 0 0 0 15948000 9147200 16468000 17768 389;395;1336;1952 16698 157125;157126;157127;157128;157129;157130 200426;200427;200428;200429;200430;200431 200426 5 GTNNSFQVASK Unmodified 1151.5571 0.55710075 1402 O00408;E9PEF1;H7C009;F5GXX2;C9JPD5 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 20.855 20.855 2 0.03823 13471 QUIQUE_C1563_190116_001 64.82 43.292 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17769 1402 16699 157131;157132;157133 200432;200433;200434 200434 3 GTNVNQLNYR Unmodified 1177.584 0.5839842 2862 Q01968;A0A2R8YG38;A0A2R8YCN4 OCRL Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1 yes no 0 0 0 1 1 1 30.792 30.792 2 0.0030195 25277 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.67 59.977 110750000 0 0 0 0 41138000 0 0 0 26916000 0 0 0 42691000 17770 2862 16700 157134;157135;157136 200435;200436;200437 200437 2 GTPEGACSVGHEGSVDAPAPSK Unmodified 2108.9433 0.94329634 1604 O75038;B9DI82 PLCH2 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase eta-2;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 97.013 97.013 2 0.034923 100052 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.526 11.063 54746000 0 0 0 0 0 0 0 0 54746000 0 0 0 0 17771 1604 16701 157137 200438 200438 1 GTPEQPQCGFSNAVVQILR Unmodified 2100.0422 0.042222526 3481 Q86SX6 GLRX5 Glutaredoxin-related protein 5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 126 126 2 0.043091 131001 QUIQUE_C1218_190116_001 58.071 52.792 108700000 55679000 53016000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17772 3481 16702 157138;157139 200439;200440 200439 0 GTPGEGLGR Acetyl (Protein N-term) 884.43519 0.4351947 1762 O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes no 1 0 0 1 1 1 40.351 40.351 1;2 0.016646 36486 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.88 26.753 314100000 0 0 0 170220000 0 0 0 143880000 0 0 0 0 0 17773 1762 16703 157140;157141;157142 200441;200442;200443 200443 2 GTPGPDSSGSLGSGEFTGVK Unmodified 1835.8537 0.85373628 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.637 70.637 2 3.5399E-37 70591 QUIQUE_C1277_190116_001 189.1 165.42 1198800000 98856000 125150000 116930000 108850000 0 96251000 119290000 85657000 84718000 34651000 104420000 100620000 123370000 17774 4394 16704 157143;157144;157145;157146;157147;157148;157149;157150;157151;157152;157153;157154 200444;200445;200446;200447;200448;200449;200450;200451;200452;200453;200454;200455 200445 12 GTPLDTEVPMER Unmodified 1343.6391 0.63911582 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 69.378 69.378 2 0.00051689 69308 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.692 60.306 845610000 123350000 99090000 82451000 72006000 68656000 83941000 55137000 54978000 38510000 35183000 79357000 0 52952000 17775 2026 16705 157155;157156;157157;157158;157159;157160;157161;157162;157163;157164;157165;157166;157167;157168 200456;200457;200458;200459;200460;200461;200462;200463;200464;200465;200466;200467;200468;200469;200470;200471;200472 200465 17 GTPLISPLIK Unmodified 1037.6485 0.64848194 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 82.57 82.57 2 0.028173 85339 QUIQUE_C1438_190116_001 55.112 37.076 512100000 0 126240000 116700000 0 131010000 0 0 0 0 0 0 138150000 0 17776 2524 16706 157169;157170;157171;157172 200473;200474;200475;200476 200475 4 GTPQQIDYAR Unmodified 1147.5622 0.56218613 909 E9PEB5;Q96AE4 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.555 29.555 2 0.00032039 24149 QUIQUE_C1576_190116_001 114.89 72.296 1410400000 152550000 136310000 121420000 117020000 132350000 122450000 111280000 0 93516000 46484000 138950000 111120000 126960000 17777 909 16707 157173;157174;157175;157176;157177;157178;157179;157180;157181;157182;157183;157184 200477;200478;200479;200480;200481;200482;200483;200484;200485;200486;200487;200488;200489 200483 13 GTPSQSPVVGR Unmodified 1083.5673 0.5672715 2608 P52594;C9J2I0;B8ZZY2 AGFG1 Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 18.893 18.893 2 0.019862 11574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.235 22.449 152050000 0 0 0 0 45769000 0 0 0 0 0 48058000 0 58220000 17778 2608 16708 157185;157186;157187 200490;200491;200492 200491 3 GTQGAEEVLR Unmodified 1058.5356 0.53563702 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.489 26.489 2 6.4605E-05 20639 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.48 95.464 11586000000 0 0 1607300000 0 1484700000 0 1386400000 0 1601200000 566990000 2248300000 1593500000 1097100000 17779 3117 16709 157188;157189;157190;157191;157192;157193;157194;157195 200493;200494;200495;200496;200497;200498;200499;200500;200501 200498 8 GTQGVVTNFEIFR Unmodified 1466.7518 0.75177781 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.92 110.92 2 0.0002399 113991 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.22 99.79 2297100000 153330000 157240000 184470000 208820000 208070000 193630000 138250000 187920000 150850000 84192000 232730000 205560000 192080000 17780 2674 16710 157196;157197;157198;157199;157200;157201;157202;157203;157204;157205;157206;157207;157208 200502;200503;200504;200505;200506;200507;200508;200509;200510;200511;200512;200513;200514;200515 200511 14 GTRDDEYDYLFK Acetyl (Protein N-term) 1562.6889 0.68890278 3168 Q15907;H3BMH2;H3BSC1;P62491;B4DQU5 RAB11B;RAB11A Ras-related protein Rab-11B;Ras-related protein Rab-11A yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.98 106.98 2 0.0012003 109771 QUIQUE_C1403_190116_001 110.08 85.239 5776800000 344200000 449540000 421540000 341810000 411560000 332730000 444090000 497150000 572960000 153770000 658200000 496650000 652600000 17781 3168 16711 157209;157210;157211;157212;157213;157214;157215;157216;157217;157218;157219;157220;157221 200516;200517;200518;200519;200520;200521;200522;200523;200524;200525;200526;200527;200528 200519 8 GTRPAPGGCIQPR Unmodified 1365.6936 0.69355142 3934 Q96RR4 CAMKK2 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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Unmodified 1803.0295 0.02945622 825 D6RGX2;Q9NUQ7;H0YA18 UFSP2 Ufm1-specific protease 2 yes no 0 0 0 1 137.07 137.07 3 0.045366 139738 QUIQUE_C1563_190116_001 28.627 17.154 32406000 0 0 0 0 0 32406000 0 0 0 0 0 0 0 17784 825 16714 157245 200557 200557 1 GTSLENLIMEITAPDSQGK Unmodified 2002.9881 0.98812127 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 162.58 162.58 2;3 5.573E-05 166974 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.866 46.264 63226000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35296000 27930000 0 17785 1187 16715 157246;157247;157248 200558;200559;200560 200560 3 GTSLNVVVLNNSK Unmodified 1343.7409 0.74087877 1443 O14772 FPGT Fucose-1-phosphate guanylyltransferase yes yes 0 0 0 1 65.075 65.075 2 0.019325 63958 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.836 21.892 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17786 1443 16716 157249 200561 200561 1 GTSVGWLK Unmodified 846.45995 0.45995289 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 47.831 47.831 2 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171.27 3 0.043917 174783 QUIQUE_C1277_190116_001 21.453 14.421 30390000 0 30390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17802 1830 16732 157338 200667 200667 1 GTVIIIANHGDR Unmodified 1264.6888 0.68878362 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 29.305 29.305 2;3 5.2898E-20 23445 QUIQUE_C1563_190116_001 170.47 129.48 4438500000 466720000 356960000 440620000 474020000 329070000 417320000 448700000 104400000 255810000 220400000 378650000 245010000 300820000 17803 3202 16733 157339;157340;157341;157342;157343;157344;157345;157346;157347;157348;157349;157350;157351;157352;157353;157354;157355;157356;157357;157358;157359;157360;157361;157362;157363 200668;200669;200670;200671;200672;200673;200674;200675;200676;200677;200678;200679;200680;200681;200682;200683;200684;200685;200686;200687;200688;200689;200690;200691;200692;200693 200679 16 GTVIIIANHGDRIDIPPGAVLENK Unmodified 2511.3809 0.38092129 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 1 1 96.494 96.494 3 0.00063892 97757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.215 43.183 21445000 0 0 0 0 0 0 0 21445000 0 0 0 0 0 17804 3202 16734 157364 200694 200694 0 GTVLALTENNFDDTIAEGITFIK Unmodified 2481.2639 0.26388542 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 2 1 1 167.12 167.12 2;3 1.2349E-07 171856 QUIQUE_C1218_190116_001 105.46 85.882 95913000 55860000 27585000 0 0 0 0 0 0 0 12467000 0 0 0 17805 3627 16735 157365;157366;157367;157368 200695;200696;200697;200698 200696 4 GTVLCGPPPAVENASLIGAR Unmodified 1978.0306 0.030595207 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.34 101.34 2 2.5482E-12 104381 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.74 85.443 597340000 54793000 0 51834000 52435000 67688000 39770000 77925000 0 59802000 0 59441000 58982000 74672000 17806 1436 16736 157369;157370;157371;157372;157373;157374;157375;157376;157377;157378;157379 200699;200700;200701;200702;200703;200704;200705;200706;200707;200708;200709;200710;200711 200709 13 GTVLDQVPVNPSLYLIK Unmodified 1855.0455 0.045500215 4644 Q9Y657;Q5JUX0 SPIN1;SPIN3 Spindlin-1;Spindlin-3 yes no 0 0 0 1 140.55 140.55 2 0.0024055 147879 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.628 24.891 26360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26360000 0 0 17807 4644 16737 157380 200712 200712 1 GTVLLADNVICPGAPDFLAHVR Unmodified 2334.2154 0.21543586 2189 P21964 COMT Catechol O-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 133.52 133.52 3 9.5437E-06 139838 QUIQUE_C1438_190116_001 65.454 59.487 1730400000 243280000 0 0 0 208830000 301070000 371690000 0 286730000 0 318790000 0 0 17808 2189 16738 157381;157382;157383;157384;157385;157386 200713;200714;200715;200716;200717;200718 200714 3 GTVLPQGPLLLSPSSLFSALHR Unmodified 2289.2845 0.28450171 3081 Q14693 LPIN1 Phosphatidate phosphatase LPIN1 yes yes 0 0 0 1 154.21 154.21 3 0.0055618 159269 QUIQUE_DMIX8_190116_001 39.086 34.83 22920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22920000 17809 3081 16739 157387 200719 200719 0 GTVLTLMR Unmodified 889.50552 0.50552287 1552 O43772;C9JPE1 SLC25A20 Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein yes no 0 0 0 1 1 67.348 67.348 2 0.042765 67277 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.782 18.209 90648000 0 0 50018000 0 0 0 0 40630000 0 0 0 0 0 17810 1552 16740 157388;157389 200720;200721 200721 2 GTVLYLQK Unmodified 920.53312 0.53311783 616 B4DKF8;E5RJ29;Q9NYI0;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 PH and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 43.318 43.318 2 0.0036477 40758 QUIQUE_C1218_190116_001 117.93 36.15 284260000 99334000 0 73599000 0 0 0 0 0 0 32592000 78737000 0 0 17811 616 16741 157390;157391;157392;157393 200722;200723;200724;200725 200722 3 GTVMYVGLTDFKPGYWIGVR Unmodified 2258.1558 0.15579572 3951 Q99426;K7EP07 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 2 143.43 143.43 2;3 3.4604E-100 146443 QUIQUE_DMIX1_190116_001 206.32 186.48 1431200000 28007000 45595000 56491000 31755000 28717000 27306000 79667000 183190000 255840000 28204000 294800000 216170000 155410000 17812 3951 16742 157394;157395;157396;157397;157398;157399;157400;157401;157402;157403;157404;157405;157406;157407;157408;157409;157410;157411 200726;200727;200728;200729;200730;200731;200732;200733;200734;200735;200736;200737;200738;200739;200740;200741;200742;200743;200744;200745;200746;200747;200748;200749;200750;200751;200752 200739 24 GTVMYVGLTDFKPGYWIGVR Oxidation (M) 2274.1507 0.15071034 3951 Q99426;K7EP07 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 135.81 135.81 2;3 7.7327E-07 140129 QUIQUE_C1403_190116_001 97.32 89.608 550950000 0 59937000 63860000 77903000 68477000 61789000 0 64122000 77410000 0 77451000 0 0 17813 3951 16742 157412;157413;157414;157415;157416;157417;157418;157419;157420 200753;200754;200755;200756;200757;200758;200759;200760;200761 200755 2784 8 GTVPDDAVEALADSLGK Unmodified 1656.8206 0.82064524 240 E7ES10;E9PCH5;E7EVY3;B7Z574;A0A0C4DGB5;P20810;H0Y7F0;H0Y9H6;E9PDE4;E7EQ12;A0A0A0MR45;E7EQA0;H0YD33 CAST Calpastatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 137.95 137.95 2 0.00018788 142451 QUIQUE_C1403_190116_001 97.551 82.861 224840000 0 0 0 74486000 45977000 0 0 0 0 0 51366000 0 53013000 17814 240 16743 157421;157422;157423;157424;157425 200762;200763;200764;200765;200766 200763 5 GTVPLPTISGHR Unmodified 1233.683 0.68296996 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 45.537 45.537 3 0.0010712 43034 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.175 48.474 824480000 71684000 69655000 0 78528000 70710000 81620000 0 152820000 56107000 23629000 99533000 0 120200000 17815 921 16744 157426;157427;157428;157429;157430;157431;157432;157433;157434;157435;157436 200767;200768;200769;200770;200771;200772;200773;200774;200775;200776;200777;200778;200779;200780;200781;200782;200783;200784;200785 200776 19 GTVQALHATGAR Unmodified 1180.6313 0.63126874 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 15.164 15.164 2;3 7.1717E-14 7722 QUIQUE_C1218_190116_001 160.98 118.9 4639100000 467550000 555540000 205450000 472890000 87875000 483210000 251450000 407490000 591060000 164600000 0 624440000 327570000 17816 3464 16745 157437;157438;157439;157440;157441;157442;157443;157444;157445;157446;157447;157448;157449;157450;157451;157452;157453;157454;157455;157456;157457;157458 200786;200787;200788;200789;200790;200791;200792;200793;200794;200795;200796;200797;200798;200799;200800;200801;200802;200803;200804;200805;200806;200807 200786 12 GTVQEAGTLLSSK Unmodified 1289.6827 0.68269519 3531 Q8IV38;G3V0G5 ANKMY2 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.644 58.644 2 0.00041285 57625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.015 54.986 841850000 0 72691000 76790000 77450000 69924000 64268000 62455000 67127000 76744000 23496000 84126000 71654000 95122000 17817 3531 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A5;Annexin yes no 0 0 2 1 79.579 79.579 4 7.5658E-06 79619 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.617 54.395 194900000 0 0 0 0 0 0 0 194900000 0 0 0 0 0 17823 1954 16752 157524 200911 200911 1 GTVTGQVQGPEDK Unmodified 1314.6416 0.64155866 2078 P14621;U3KQL2;U3KPX1;U3KPX8;E9PF46;F8WA34 ACYP2 Acylphosphatase-2;Acylphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.133 21.133 2 7.4349E-65 14416 QUIQUE_C1218_190116_001 211.64 189.89 6203700000 532420000 565170000 782360000 321670000 544910000 712350000 588290000 288410000 0 322130000 0 676260000 869710000 17824 2078 16753 157525;157526;157527;157528;157529;157530;157531;157532;157533;157534;157535 200912;200913;200914;200915;200916;200917;200918;200919;200920;200921;200922;200923;200924;200925;200926;200927;200928 200913 16 GTVTGQVQGPEDKVNSMK Unmodified 1873.9204 0.92037606 2078 P14621;U3KQL2;U3KPX8 ACYP2 Acylphosphatase-2 yes no 0 0 1 2 2 2 38.639 38.639 2;3 1.3486E-16 34917 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.84 140.38 240430000 0 0 0 0 0 0 0 117450000 0 0 0 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201064;201065;201066;201067;201068;201069;201070;201071;201072;201073;201074;201075;201076;201077;201078;201079;201080;201081;201082;201083;201084;201085;201086;201087;201088 201080 25 GTWESHPETTELVVLQGR Unmodified 2038.012 0.011968255 2401 P36915;A0A140T8Y2 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 88.153 88.153 2;3 1.3744E-37 90827 QUIQUE_DMIX5_190116_001 176.25 154.95 830370000 121250000 88102000 53429000 70794000 93596000 0 105650000 51201000 51306000 54410000 0 84607000 56019000 17834 2401 16762 157623;157624;157625;157626;157627;157628;157629;157630;157631;157632;157633;157634;157635;157636;157637 201089;201090;201091;201092;201093;201094;201095;201096;201097;201098;201099;201100;201101;201102;201103;201104;201105;201106;201107 201104 19 GTWIHPEIDNPEYSPDPSIYAYDNFGVLGLDLWQVK Unmodified 4147.9844 0.98436311 2268 P27797;K7EL50 CALR Calreticulin yes no 0 0 0 1 168.92 168.92 3 0.0082914 173448 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.22 31.872 0 0 0 0 0 0 0 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2468.301 0.30099921 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 166.13 166.13 2;3 4.1351E-98 170575 QUIQUE_DMIX3_190116_001 221.47 202.4 3471100000 345080000 316850000 0 480480000 442290000 133670000 174150000 229040000 357430000 157500000 351970000 240490000 242130000 17846 4600 16773 157695;157696;157697;157698;157699;157700;157701;157702;157703;157704;157705;157706;157707;157708;157709;157710;157711;157712;157713;157714;157715;157716 201168;201169;201170;201171;201172;201173;201174;201175;201176;201177;201178;201179;201180;201181;201182;201183;201184;201185;201186;201187;201188;201189;201190;201191;201192;201193 201185 26 GVAALTSDPAVQAIVLDTASDVLDKASSLIEEAKK Unmodified 3524.8825 0.8825238 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 2 1 1 1 171.56 171.56 4 2.1928E-10 173232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.666 57.179 143840000 0 0 0 0 0 0 0 69254000 0 0 45462000 29119000 0 17847 4600 16774 157717;157718;157719 201194;201195;201196 201194 2 GVAASTTDPAAAHAMLDSAR Unmodified 1911.9109 0.910874 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 59.827 59.827 2;3 0.00163 58854 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.42 59.284 73746000 0 73746000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17848 4606 16775 157720;157721 201197;201198 201198 2 GVAEVLQDGDCPAVLIPSKPLAR Unmodified 2404.2784 0.27843005 3535 Q8IWA5;K7EPV6;K7ESF5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 1 1 2 1 113.08 113.08 2;3 5.4911E-17 117010 QUIQUE_C1368_190116_001 141.97 123.14 753880000 128860000 0 478110000 0 0 0 0 0 0 0 146920000 0 0 17849 3535 16776 157722;157723;157724;157725 201199;201200;201201;201202 201200 3 GVAFVGGFSYADVLGSAK Unmodified 1743.8832 0.88318591 1477 O15067;H0YGH1 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 138.69 138.69 2 0.0011693 134939 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.104 45.967 133200000 0 0 0 34041000 36117000 0 0 40307000 0 22735000 0 0 0 17850 1477 16777 157726;157727;157728;157729 201203;201204;201205;201206 201206 3 GVAGAHGLLCLLSDHVDK Unmodified 1860.9516 0.9516166 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 95.14 95.14 2;3 4.1258E-24 97931 QUIQUE_C1576_190116_001 121.82 105.51 1370700000 130000000 137490000 197520000 140400000 181290000 171850000 164120000 0 59749000 38218000 55617000 30058000 64349000 17851 4405 16778 157730;157731;157732;157733;157734;157735;157736;157737;157738;157739;157740;157741;157742;157743;157744;157745 201207;201208;201209;201210;201211;201212;201213;201214;201215;201216;201217;201218;201219;201220;201221;201222;201223;201224;201225;201226 201220 20 GVAGAHGLLCLLSDHVDKR Unmodified 2017.0527 0.052727633 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 1 1 3 3 2 3 1 2 3 3 1 1 3 1 82.946 82.946 3;4;5 1.9018E-17 84354 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.11 100.9 5917900000 241780000 570980000 647280000 413940000 503100000 215680000 508930000 477970000 569780000 115030000 525560000 579090000 548720000 17852 4405 16779 157746;157747;157748;157749;157750;157751;157752;157753;157754;157755;157756;157757;157758;157759;157760;157761;157762;157763;157764;157765;157766;157767;157768;157769;157770;157771;157772 201227;201228;201229;201230;201231;201232;201233;201234;201235;201236;201237;201238;201239;201240;201241;201242;201243;201244;201245;201246;201247;201248;201249;201250;201251;201252;201253;201254;201255;201256;201257;201258;201259;201260;201261;201262;201263 201255 30 GVAGALRPLVQATVPATPEQPVLDLK Unmodified 2639.501 0.50103642 2498 P47985;P0C7P4 UQCRFS1;UQCRFS1P1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11;Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 126.05 126.05 3 2.7869E-07 129646 QUIQUE_C1277_190116_001 56.769 49.97 238330000 58613000 74452000 0 0 43202000 21065000 40994000 0 0 0 0 0 0 17853 2498 16780 157773;157774;157775;157776;157777 201264;201265;201266;201267;201268 201265 5 GVAGVPAEFSIWTR Unmodified 1488.7725 0.77251325 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 128.42 128.42 2 0.0012421 133878 QUIQUE_C1576_190116_001 88.496 69.18 240680000 0 0 0 0 0 0 121760000 0 60183000 58737000 0 0 0 17854 3061 16781 157778;157779;157780;157781 201269;201270;201271;201272 201269 4 GVAINFVK Unmodified 846.49634 0.49633839 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.024 56.024 2 0.02493 53711 QUIQUE_C1563_190116_001 71.949 46.331 247010000 0 34944000 42488000 35583000 38238000 35521000 37783000 0 22455000 0 0 0 0 17855 2416 16782 157782;157783;157784;157785;157786;157787;157788 201273;201274;201275;201276;201277;201278;201279;201280;201281 201278 9 GVAINFVTEEDKR Unmodified 1476.7573 0.75725712 3055 Q14240 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 59.535 59.535 2;3 0.00010135 58600 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.763 64.505 1829700000 151240000 177630000 113540000 158980000 42159000 127820000 133290000 210660000 183860000 59177000 183530000 136900000 150870000 17856 3055 16783 157789;157790;157791;157792;157793;157794;157795;157796;157797;157798;157799;157800;157801;157802;157803;157804;157805;157806;157807;157808;157809;157810;157811;157812 201282;201283;201284;201285;201286;201287;201288;201289;201290;201291;201292;201293;201294;201295;201296;201297;201298;201299;201300;201301;201302;201303;201304;201305;201306 201295 20 GVAINMVTEEDKR Unmodified 1460.7293 0.72932781 2697 P60842 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes yes 0 0 1 1 43.872 43.872 3 0.064297 41472 QUIQUE_C1438_190116_001 20.009 2.4229 23551000 0 0 0 0 23551000 0 0 0 0 0 0 0 0 17857 2697 16784 157813 201307 201307 1 GVALADFNR Unmodified 961.49813 0.49812931 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79;Q5T4F6 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 58.874 58.874 2 0.0016745 58411 QUIQUE_C1438_190116_001 101.28 84.508 265220000 0 52446000 36494000 0 44711000 0 45307000 0 0 12391000 0 36094000 37782000 17858 218 16785 157814;157815;157816;157817;157818;157819;157820 201308;201309;201310;201311;201312;201313;201314 201310 7 GVALHRPDVYLLPPAR Unmodified 1773.005 0.004972804 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 1 70.946 70.946 3;4 2.7203E-06 70828 QUIQUE_C1368_190116_001 103.88 100.25 729440000 0 0 179440000 0 238430000 0 0 0 85295000 20037000 112480000 42267000 51492000 17859 352 16786 157821;157822;157823;157824;157825;157826;157827;157828;157829;157830;157831;157832;157833 201315;201316;201317;201318;201319;201320;201321;201322;201323;201324;201325;201326;201327;201328;201329;201330 201315 13 GVAPLWMR Unmodified 928.49529 0.49529253 2843;1035 Q00325;F8VVM2 SLC25A3 Phosphate carrier protein, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.242 77.242 2 0.0036873 77991 QUIQUE_C1277_190116_001 121.68 80.182 2985000000 326170000 194750000 0 192090000 0 230960000 212210000 292460000 407840000 67838000 412800000 338720000 309180000 17860 2843;1035 16787 157834;157835;157836;157837;157838;157839;157840;157841;157842;157843;157844 201331;201332;201333;201334;201335;201336;201337;201338;201339;201340;201341 201332 10 GVASDSGGGVSPALAAK Unmodified 1442.7365 0.73652168 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 39.363 39.363 2 1.5535E-05 35214 QUIQUE_C1563_190116_001 101.39 83.57 195880000 0 0 0 52486000 22989000 33263000 0 25580000 35710000 0 0 0 25849000 17861 4340 16788 157845;157846;157847;157848;157849;157850;157851;157852;157853 201342;201343;201344;201345;201346;201347;201348;201349;201350;201351 201345 10 GVASLFAGR Unmodified 876.48175 0.48175096 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79;Q5T4F6 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 0 1 1 67.12 67.12 2 0.0090557 66640 QUIQUE_C1218_190116_001 77.046 41.553 58417000 46199000 0 0 0 0 0 0 0 0 12218000 0 0 0 17862 218 16789 157854;157855 201352;201353 201352 2 GVATNWLR Unmodified 915.49265 0.49265 2109 P16435;H0Y4R2;E7EMD0 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 61.658 61.658 2 0.016146 60579 QUIQUE_C1277_190116_001 83.614 47.027 101480000 0 50421000 0 0 0 35194000 0 0 0 15861000 0 0 0 17863 2109 16790 157856;157857;157858;157859 201354;201355;201356;201357 201354 4 GVAVLCTE Unmodified 847.41095 0.41095378 3053 Q14204;A0A2R8Y706 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 58.287 58.287 1 0.038567 57030 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.66 110.69 195750000 0 0 0 0 0 47198000 0 0 0 0 84839000 0 63715000 17864 3053 16791 157860;157861;157862 201358;201359;201360 201360 0 GVAVNLIPGLPAYILFMCVR Oxidation (M) 2218.2006 0.20063742 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 1 0 1 168.78 168.78 2 0.010653 175961 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.915 33.289 269560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 269560000 0 0 17865 4607 16792 157863 201361 201361 3044 1 GVAYTLLTPK Unmodified 1061.6121 0.61209643 175 A0A0A0MSJ0;Q86XP3 DDX42 ATP-dependent RNA helicase DDX42 yes no 0 0 0 1 1 1 70.661 70.661 2 0.0094304 71061 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.256 50.619 77168000 0 0 0 0 0 0 0 17729000 22769000 0 36670000 0 0 17866 175 16793 157864;157865;157866 201362;201363;201364 201362 3 GVCEETSGAYEK Unmodified 1328.5554 0.55544577 1834 P02760;S4R3Y4 AMBP Protein AMBP;Alpha-1-microglobulin;Inter-alpha-trypsin inhibitor light chain;Trypstatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.854 22.854 2 0.00051689 16053 QUIQUE_C1368_190116_001 94.692 73.791 159010000 26389000 58260000 29999000 0 27286000 0 0 0 0 0 0 0 17077000 17867 1834 16794 157867;157868;157869;157870;157871;157872 201365;201366;201367;201368;201369;201370 201367 5 GVCTEAGMYALR Unmodified 1326.606 0.60604155 2743 P62195 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 66.341 66.341 2 0.0099372 65117 QUIQUE_C1563_190116_001 60.717 48.491 30907000 0 0 0 0 0 30907000 0 0 0 0 0 0 0 17868 2743 16795 157873;157874;157875;157876;157877 201371;201372;201373;201374;201375 201373 5 GVDAQGTLSK Unmodified 974.50327 0.50327426 571;1217 J3QL64;A8MZH3;P02686;E9PJ72;C9J6H1;H7BYR8 MBP Myelin basic protein no no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 2 1 1 2 2 1 2 19.412 19.412 2 1.2998E-07 11123 QUIQUE_C1277_190116_001 154.12 110 70672000000 8779400000 6861400000 7712700000 3372300000 5540400000 2951000000 10251000000 2141600000 2722100000 2388500000 9147600000 3214900000 5588200000 17869 571;1217 16796 157878;157879;157880;157881;157882;157883;157884;157885;157886;157887;157888;157889;157890;157891;157892;157893;157894;157895;157896;157897 201376;201377;201378;201379;201380;201381;201382;201383;201384;201385;201386;201387;201388;201389;201390;201391;201392;201393;201394;201395;201396;201397;201398;201399 201380 21 GVDASGETTYK Unmodified 1126.5142 0.51423288 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 20.032 20.032 2 0.00023219 12761 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.73 101.96 114160000 0 0 0 0 0 78648000 0 0 0 35514000 0 0 0 17870 1570 16797 157898;157899;157900 201400;201401;201402 201402 3 GVDASGETTYKK Unmodified 1254.6092 0.6091959 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 1 1 12.517 12.517 3 0.00053969 4828 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.65 46.842 4558200 0 0 0 0 0 0 0 4558200 0 0 0 0 0 17871 1570 16798 157901 201403 201403 1 GVDCDIDVPK Unmodified 1116.5121 0.51212439 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.77 47.77 2 0.013177 45484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.224 45.521 638270000 135050000 0 0 0 0 144110000 0 0 0 68789000 141320000 0 148990000 17872 2898 16799 157902;157903;157904;157905;157906 201404;201405;201406;201407;201408;201409;201410 201408 6 GVDDLDFFIGDEAIDKPTYATK Unmodified 2429.1638 0.16383703 4374 Q9P1U1 ACTR3B Actin-related protein 3B yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 134.95 134.95 2;3 2.2949E-128 140598 QUIQUE_C1218_190116_001 215 195.32 844990000 169920000 33412000 0 0 0 118840000 146540000 0 0 0 179520000 93235000 103530000 17873 4374 16800 157907;157908;157909;157910;157911;157912;157913;157914;157915 201411;201412;201413;201414;201415;201416;201417;201418;201419;201420 201413 10 GVDDLDFFIGDEAIEKPTYATK Unmodified 2443.1795 0.17948709 2714 P61158;B4DXW1;F8WDR7 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 134.91 134.91 2;3 4.1478E-65 137975 QUIQUE_DMIX1_190116_001 218.4 193.08 10116000000 681860000 858620000 798470000 675700000 720920000 700690000 836650000 923820000 797800000 407700000 1039000000 818290000 856230000 17874 2714 16801 157916;157917;157918;157919;157920;157921;157922;157923;157924;157925;157926;157927;157928;157929;157930;157931;157932;157933;157934;157935;157936;157937;157938;157939;157940;157941 201421;201422;201423;201424;201425;201426;201427;201428;201429;201430;201431;201432;201433;201434;201435;201436;201437;201438;201439;201440;201441;201442;201443;201444;201445;201446;201447;201448;201449;201450;201451;201452;201453;201454;201455;201456;201457;201458;201459 201444 39 GVDDSTGFR Unmodified 952.42502 0.42502394 1402 O00408;E9PEF1;H0YFL1 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 27.086 27.086 2 0.033312 20862 QUIQUE_C1277_190116_001 55.37 31.846 111610000 0 111610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17875 1402 16802 157942 201460 201460 1 GVDEATIIDILTK Unmodified 1386.7606 0.76061116 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 148.67 148.67 2;3 4.1645E-06 154812 QUIQUE_C1218_190116_001 152.07 122.6 7847300000 320160000 483750000 752710000 804710000 571830000 712830000 825160000 362770000 868930000 361260000 595380000 328220000 859580000 17876 1853 16803 157943;157944;157945;157946;157947;157948;157949;157950;157951;157952;157953;157954;157955;157956;157957;157958;157959;157960;157961;157962;157963;157964;157965;157966;157967;157968 201461;201462;201463;201464;201465;201466;201467;201468;201469;201470;201471;201472;201473;201474;201475;201476;201477;201478;201479;201480;201481;201482;201483;201484;201485;201486;201487;201488;201489;201490;201491;201492;201493;201494;201495 201462 32 GVDEATIIDILTKR Unmodified 1542.8617 0.86172219 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 133.66 133.66 2;3 1.6065E-14 136865 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.85 129.13 382540000 0 0 0 0 0 0 0 111150000 108010000 0 52767000 47388000 63222000 17877 1853 16804 157969;157970;157971;157972;157973;157974 201496;201497;201498;201499;201500;201501;201502 201496 7 GVDEVTIVNILTNR Unmodified 1541.8413 0.8413211 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YKS4;H0YMM1;H0YKZ7;H0YLV6;H0YMT9;H0YKX9;H0YKL9;H0YMW4;H0YKV8;H0YMD9 ANXA2 Annexin A2;Annexin yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 3 2 2 140.55 140.55 2;3 2.3332E-14 144739 QUIQUE_C1277_190116_001 140.82 123.61 20723000000 1270700000 1660800000 166240000 2666200000 1844300000 1644900000 2005800000 1268600000 2197700000 1337800000 1145000000 1426700000 2087900000 17878 1920 16805 157975;157976;157977;157978;157979;157980;157981;157982;157983;157984;157985;157986;157987;157988;157989;157990;157991;157992;157993;157994;157995;157996;157997;157998;157999;158000;158001 201503;201504;201505;201506;201507;201508;201509;201510;201511;201512;201513;201514;201515;201516;201517;201518;201519;201520;201521;201522;201523;201524;201525;201526;201527;201528;201529;201530;201531;201532;201533;201534;201535;201536;201537;201538;201539;201540 201505 37 GVDGSFLAR Unmodified 920.47158 0.4715802 2898 Q06124;A0A1W2PPU4 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 53.58 53.58 2 0.001153 48511 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.36 56.23 85695000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85695000 0 0 0 17879 2898 16806 158002 201541 201541 1 GVDIVMDPLGGSDTAK Oxidation (M) 1589.7607 0.76068752 3958 Q99536;K7ESA3;K7ENX2;K7EM19 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.633 82.633 2 1.5016E-18 79702 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.91 119.44 958020000 64569000 101550000 85944000 81445000 90045000 76092000 0 0 99701000 80794000 108570000 78391000 90915000 17880 3958 16807 158003;158004;158005;158006;158007;158008;158009;158010;158011;158012;158013 201542;201543;201544;201545;201546;201547;201548;201549;201550;201551;201552;201553 201550 2794 10 GVDIVMDPLGGSDTAK Unmodified 1573.7658 0.76577289 3958 Q99536;K7ESA3;K7ENX2;K7EM19 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.44 103.44 2 1.8969E-05 107719 QUIQUE_C1218_190116_001 122.34 108.44 4099500000 381330000 439470000 365140000 418410000 0 347590000 418080000 392390000 0 119340000 438520000 367090000 412120000 17881 3958 16807 158014;158015;158016;158017;158018;158019;158020;158021;158022;158023;158024;158025 201554;201555;201556;201557;201558;201559;201560;201561;201562;201563;201564;201565;201566;201567;201568;201569;201570;201571;201572 201555 19 GVDIYTR Unmodified 822.42357 0.42356738 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 1 1 31.544 31.544 2 0.038851 26423 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.244 31.561 180570000 0 0 0 0 0 0 0 0 55638000 24585000 100350000 0 0 17882 2885 16808 158026;158027;158028 201573;201574;201575 201573 3 GVDLHEQSQQNK Unmodified 1381.6586 0.65860571 2708 P61020 RAB5B Ras-related protein Rab-5B yes yes 0 0 0 1 12.206 12.206 3 3.772E-10 4417 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.67 116.63 6506500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6506500 0 0 0 17883 2708 16809 158029 201576 201576 1 GVDLLQNLIK Unmodified 1111.6601 0.66010926 144;1509 A0A0A0MRE5;Q9ULH1;H0YBF7;O43150;A0A286YFG8 ASAP1;ASAP2 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1;Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 121.25 121.25 2 0.0059387 125095 QUIQUE_C1403_190116_001 75.761 33.921 179490000 0 29484000 0 24473000 0 27616000 21756000 0 23246000 0 0 28921000 23989000 17884 144;1509 16810 158030;158031;158032;158033;158034;158035;158036;158037;158038;158039;158040 201577;201578;201579;201580;201581;201582;201583;201584;201585;201586;201587;201588 201580 9 GVDLQENNPASR Unmodified 1298.6215 0.62149192 2575 P51148;K7EIP6 RAB5C Ras-related protein Rab-5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.484 32.484 2 2.5569E-21 27380 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.06 131.9 3357300000 279860000 258550000 377310000 330040000 221490000 302160000 296440000 211020000 236930000 99379000 318920000 185980000 239210000 17885 2575 16811 158041;158042;158043;158044;158045;158046;158047;158048;158049;158050;158051;158052;158053 201589;201590;201591;201592;201593;201594;201595;201596;201597;201598;201599;201600;201601;201602;201603;201604;201605;201606;201607;201608;201609;201610;201611;201612;201613 201604 25 GVDLTEPTQPTR Unmodified 1312.6623 0.6622941 2166 P20339 RAB5A Ras-related protein Rab-5A yes yes 0 0 0 1 1 45.288 45.288 2 7.1368E-05 42252 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.86 90.598 210570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86624000 123940000 0 0 17886 2166 16812 158054;158055 201614;201615;201616 201616 3 GVDLVLNSLAEEK Unmodified 1385.7402 0.74021007 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.83 106.83 2 1.2044E-12 109825 QUIQUE_C1403_190116_001 152.54 107.79 1156700000 0 112750000 104760000 138510000 117270000 0 123930000 125620000 112370000 65562000 136480000 0 119490000 17887 2524 16813 158056;158057;158058;158059;158060;158061;158062;158063;158064;158065 201617;201618;201619;201620;201621;201622;201623;201624;201625;201626;201627;201628 201619 10 GVDLYLR Unmodified 834.45995 0.45995289 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 1 62.225 62.225 2 0.025454 61037 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.957 45.418 80983000 0 0 0 0 0 0 0 43448000 0 0 0 37535000 0 17888 1534 16814 158066;158067 201629;201630 201629 2 GVDPAPLAK Unmodified 866.48617 0.48616764 123 A0A087X2H1;Q9ULT8;A0A087WVU6;G3V4V5 HECTD1 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1 yes no 0 0 0 1 23.978 23.978 2 0.023951 17480 QUIQUE_C1218_190116_001 60.358 4.2364 61317000 61317000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17889 123 16815 158068 201631 201631 1 GVDPDLAPLENFNVK Unmodified 1626.8253 0.82533668 305 A0A0J9YYF7;Q86T65 DAAM2 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 119.04 119.04 2 0.00032949 122559 QUIQUE_C1277_190116_001 81.92 70.707 297540000 54475000 56820000 67667000 0 0 0 36673000 0 0 0 0 81904000 0 17890 305 16816 158069;158070;158071;158072;158073 201632;201633;201634;201635;201636;201637;201638 201633 7 GVDPVVSFPVALSCR Unmodified 1601.8236 0.82356254 1811 P01229 LHB Lutropin subunit beta yes yes 0 0 0 1 120.68 120.68 2 7.4178E-05 125184 QUIQUE_C1218_190116_001 91.123 76.151 29174000 29174000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17891 1811 16817 158074 201639 201639 1 GVEAEEWGK Unmodified 1003.4611 0.4610751 1108 G8JLD5;F8VUJ9;F8VYL3 DNM1L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.454 35.454 2 0.0068412 31007 QUIQUE_C1438_190116_001 83.265 63.788 545270000 62121000 74357000 46089000 0 55327000 41587000 0 31370000 44198000 23758000 82349000 0 84114000 17892 1108 16818 158075;158076;158077;158078;158079;158080;158081;158082;158083;158084 201640;201641;201642;201643;201644;201645;201646;201647;201648;201649 201643 10 GVEEEEEDGEMRE Unmodified 1536.5886 0.58859639 2749 P62306 SNRPF Small nuclear ribonucleoprotein F yes yes 0 0 1 1 1 1 1 36.75 36.75 2 1.441E-05 32807 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.61 96.222 56581000 0 0 0 0 0 0 0 23999000 32582000 0 0 0 0 17893 2749 16819 158085;158086;158087;158088 201650;201651;201652;201653 201650 4 GVEFPMADLDALSPIHTPQR Unmodified 2193.0888 0.088838367 3427 Q6ZVM7 TOM1L2 TOM1-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.01 137.01 3 7.2302E-07 142788 QUIQUE_C1576_190116_001 77.391 72.633 792620000 144850000 159280000 0 118800000 0 113800000 111070000 0 60384000 0 0 0 84427000 17894 3427 16820 158089;158090;158091;158092;158093;158094;158095;158096;158097 201654;201655;201656;201657;201658;201659;201660;201661;201662 201659 8 GVEFPMADLDALSPIHTPQR Oxidation (M) 2209.0838 0.08375299 3427 Q6ZVM7 TOM1L2 TOM1-like protein 2 yes yes 0 1 0 1 121.34 121.34 3 0.001056 125860 QUIQUE_C1218_190116_001 64.705 55.762 39387000 39387000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17895 3427 16820 158098 201663 201663 2656 0 GVEGLIDIENPNR Unmodified 1424.726 0.72595699 2997 Q13442 PDAP1 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein yes yes 0 0 0 1 95.061 95.061 2 0.0069257 97056 QUIQUE_C1403_190116_001 67.726 47.939 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17896 2997 16821 158099 201664 201664 1 GVEGSDYINASFLDGYR Unmodified 1861.8483 0.84825697 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9;H0Y380 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 127.7 127.7 2 0.011005 124170 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.555 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17897 1998 16822 158100 201665 201665 1 GVEICIATPGR Unmodified 1171.6019 0.60194245 381;1290 J3KTA4;P17844;J3KRZ1;J3QSF1;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 0 1 1 66.784 66.784 2 0.0040903 66408 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.275 55.802 394550000 0 0 210590000 0 0 0 0 0 0 0 0 183960000 0 17898 1290;381 16823 158101;158102 201666;201667 201667 2 GVEIEGPLSTETNWDIAHMISGFE Unmodified 2631.2163 0.21628331 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 168.8 168.8 2;3 2.1074E-74 173183 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.49 159.54 1183800000 54495000 71343000 66429000 46266000 85416000 0 93816000 102680000 160940000 0 237230000 102690000 162490000 17899 2274 16824 158103;158104;158105;158106;158107;158108;158109;158110;158111;158112;158113;158114;158115;158116;158117;158118;158119;158120;158121;158122 201668;201669;201670;201671;201672;201673;201674;201675;201676;201677;201678;201679;201680;201681;201682;201683;201684;201685;201686;201687;201688;201689;201690;201691;201692;201693 201684 26 GVEIEGPLSTETNWDIAHMISGFE Oxidation (M) 2647.2112 0.21119793 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 1 0 1 153.95 153.95 2 0.0012826 159009 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.527 48.059 29740000 0 0 0 0 0 0 0 0 29740000 0 0 0 0 17900 2274 16824 158123 201694 201694 1641 0 GVEITGFPEAQALGLEVFHAGTALK Unmodified 2554.3431 0.3431388 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 155.05 155.05 3 3.3322E-14 161250 QUIQUE_C1438_190116_001 87.659 74.292 1469900000 111200000 0 181570000 0 245100000 151030000 243340000 175630000 0 0 0 207130000 154910000 17901 2194 16825 158124;158125;158126;158127;158128;158129;158130;158131;158132;158133 201695;201696;201697;201698;201699;201700;201701;201702;201703;201704;201705;201706;201707 201699 11 GVEKPPHLAALILAR Unmodified 1583.9511 0.95114632 3652 Q8NFW8;F5H296 CMAS N-acylneuraminate cytidylyltransferase yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 72.943 72.943 3;4 7.651E-06 74834 QUIQUE_C1218_190116_001 73.887 65.71 1380000000 124770000 162000000 85922000 99003000 92024000 97391000 115910000 107520000 134380000 0 135480000 106480000 119110000 17902 3652 16826 158134;158135;158136;158137;158138;158139;158140;158141;158142;158143;158144;158145;158146;158147;158148;158149;158150 201708;201709;201710;201711;201712;201713;201714;201715;201716;201717;201718;201719;201720;201721;201722;201723;201724;201725;201726;201727;201728 201709 21 GVENVYTQHQPFLHETLDHLIK Unmodified 2617.3289 0.32888572 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;A0A2R8YF01;A0A1B0GXI6 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 99.665 99.665 4 0.057034 104313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.426 12.396 67227000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67227000 0 0 17903 4276 16827 158151 201729 201729 1 GVEPEEFDR Unmodified 1076.4775 0.47745344 4522 Q9UPV7 KIAA1045 Protein KIAA1045 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.71 42.71 2 0.01368 39163 QUIQUE_C1277_190116_001 69.598 53.454 204840000 0 53682000 0 0 44010000 0 0 54132000 0 0 0 53011000 0 17904 4522 16828 158152;158153;158154;158155;158156;158157;158158 201730;201731;201732;201733;201734;201735;201736 201731 7 GVEPSPSPIKPGDIKR Unmodified 1675.9257 0.92571943 3764 Q92890 UFD1L Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog yes yes 0 0 2 1 34.207 34.207 3 0.066472 29557 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.073 38.24 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17905 3764 16829 158159 201737 201737 1 GVESQGMLLCASIEGINR Unmodified 1932.9397 0.93973129 2641 P54577 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 119.61 119.61 2;3 5.0837E-07 124669 QUIQUE_C1218_190116_001 105.03 93.446 250120000 48383000 31020000 36058000 32465000 52201000 24929000 0 25066000 0 0 0 0 0 17906 2641 16830 158160;158161;158162;158163;158164;158165;158166;158167;158168;158169 201738;201739;201740;201741;201742;201743;201744;201745;201746;201747;201748;201749;201750;201751;201752 201738 14 GVETCGILCGK Unmodified 1192.558 0.55802872 1739 O95630;C9JK83 STAMBP STAM-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 49.58 49.58 2 0.011381 48103 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.334 51.951 98005000 0 0 0 0 27016000 0 0 0 0 0 37160000 0 33830000 17907 1739 16831 158170;158171;158172;158173 201753;201754;201755;201756 201755 3 GVETIANDVVSLATK Unmodified 1515.8144 0.81443765 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 134.32 134.32 2;3 6.6519E-44 131226 QUIQUE_DMIX4_190116_001 182.35 156.41 7247400000 756740000 527170000 765970000 472400000 471250000 564710000 819280000 339910000 599090000 204150000 592480000 517810000 616460000 17908 1997 16832 158174;158175;158176;158177;158178;158179;158180;158181;158182;158183;158184;158185;158186;158187;158188;158189;158190;158191;158192;158193;158194;158195;158196 201757;201758;201759;201760;201761;201762;201763;201764;201765;201766;201767;201768;201769;201770;201771;201772;201773;201774;201775;201776;201777;201778;201779;201780;201781;201782;201783;201784;201785;201786;201787;201788 201780 32 GVEVDPSLIK Unmodified 1055.5863 0.58627561 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;H7C141;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 67.83 67.83 2 0.022384 63520 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.859 26.855 43828000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43828000 0 0 0 17909 831;1569 16833 158197 201789 201789 1 GVEVDPSLIKDTWHQVYR Unmodified 2141.0906 0.090552927 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;H7C141;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 1 108.69 108.69 4 0.0013847 111359 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.326 40.087 76590000 0 0 0 0 0 0 0 34470000 0 0 42119000 0 0 17910 831;1569 16834 158198;158199 201790;201791 201790 2 GVEVTVGHEQEEGGK Unmodified 1553.7322 0.73216458 215 P0DPI2;A0A0B4J2D5;A0A096LPI6;A0A096LNH5;H7C1F6;H7C2G3;A0A0B4J2H4 C21orf33 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 2 1 1 20.872 20.872 2;3 5.6978E-130 14025 QUIQUE_DMIX3_190116_001 240.6 213.27 4195800000 298080000 746240000 287380000 639590000 217430000 700750000 307180000 195210000 113510000 74952000 326050000 122200000 167200000 17911 215 16835 158200;158201;158202;158203;158204;158205;158206;158207;158208;158209;158210;158211;158212;158213;158214;158215;158216;158217 201792;201793;201794;201795;201796;201797;201798;201799;201800;201801;201802;201803;201804;201805;201806;201807;201808;201809;201810;201811 201806 20 GVEVTVGHEQEEGGKWPYAGTAEAIK Unmodified 2741.3297 0.32967358 215 P0DPI2;A0A0B4J2D5;A0A096LPI6;A0A096LNH5;H7C1F6;H7C2G3;A0A0B4J2H4 C21orf33 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 3 75.353 75.353 3;4 8.9907E-37 76977 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.03 124.18 1861200000 0 143100000 92071000 0 83802000 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201838;201839;201840;201841;201842;201843;201844;201845;201846;201847;201848;201849;201850;201851;201852;201853;201854;201855;201856;201857;201858;201859;201860;201861;201862;201863;201864 201840 975;976 26 GVFHGIENFINEASYMSILGMTPGFGDK Oxidation (M) 3046.4205 0.4204792 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 2 3 2 2 2 2 2 3 1 4 3 2 165.76 165.76 2;3 3.7246E-283 170480 QUIQUE_DMIX3_190116_001 264.69 248.01 12933000000 236810000 1118600000 822440000 130230000 525460000 479410000 1121300000 460590000 1779500000 17965000 1943600000 2897500000 1399200000 17914 1777 16837 158252;158253;158254;158255;158256;158257;158258;158259;158260;158261;158262;158263;158264;158265;158266;158267;158268;158269;158270;158271;158272;158273;158274;158275;158276;158277;158278;158279;158280;158281 201865;201866;201867;201868;201869;201870;201871;201872;201873;201874;201875;201876;201877;201878;201879;201880;201881;201882;201883;201884;201885;201886;201887;201888;201889;201890;201891;201892;201893;201894;201895;201896;201897 201885 975;976 31 GVFHGIENFINEASYMSILGMTPGFGDK Unmodified 3030.4256 0.42556457 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 4 1 1 169.05 169.05 2;3;4 1.1916E-241 176430 QUIQUE_DMIX5_190116_001 323.69 298.64 2923800000 0 0 0 0 35960000 0 246430000 92102000 434440000 0 977380000 983570000 153900000 17915 1777 16837 158282;158283;158284;158285;158286;158287;158288;158289;158290;158291 201898;201899;201900;201901;201902;201903;201904;201905;201906;201907;201908 201906 10 GVFHQTVSR Unmodified 1029.5356 0.53557744 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 16.025 16.025 2 0.0021472 8267 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.367 42.162 283960000 66726000 0 0 0 0 151550000 0 0 0 65683000 0 0 0 17916 96 16838 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box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.748 80.748 2 0.003379 81921 QUIQUE_C1403_190116_001 96.331 57.309 2152800000 255150000 292500000 236930000 198070000 219450000 155750000 247330000 0 0 0 223820000 153500000 170300000 17920 1412 16842 158300;158301;158302;158303;158304;158305;158306;158307;158308;158309 201918;201919;201920;201921;201922;201923;201924;201925;201926;201927;201928;201929 201921 12 GVFSGLR Unmodified 734.40752 0.40752338 2186 P21810;C9JKG1 BGN Biglycan yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.328 47.328 2 0.019333 43852 QUIQUE_C1368_190116_001 114.6 60.059 927310000 88157000 127370000 56466000 119150000 88884000 42759000 0 47928000 39127000 58483000 70314000 109370000 79289000 17921 2186 16843 158310;158311;158312;158313;158314;158315;158316;158317;158318;158319;158320;158321 201930;201931;201932;201933;201934;201935;201936;201937;201938;201939;201940;201941;201942 201933 13 GVFVLNK Unmodified 775.45922 0.4592246 1803 P01024;CON__Q2UVX4 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.769 46.769 2 0.019896 44059 QUIQUE_C1277_190116_001 109.94 81.077 298360000 0 67673000 0 52842000 0 0 0 18236000 0 42616000 55086000 0 61906000 17922 1803 16844 158322;158323;158324;158325;158326;158327 201943;201944;201945;201946;201947;201948;201949;201950 201943 8 GVFVQSVLPYFVATK Unmodified 1653.913 0.91302948 3252 Q53GQ0;A0A1B0GV93 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 144.65 144.65 2 4.0681E-06 147679 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.27 116.51 1189000000 99791000 0 0 135160000 115060000 0 154350000 205410000 0 73096000 233950000 0 172160000 17923 3252 16845 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Unmodified 1828.9167 0.91667089 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 104.45 104.45 2;3 3.1225E-89 101575 QUIQUE_DMIX4_190116_001 205.8 187.99 10302000000 660310000 520180000 1194800000 841750000 832270000 552610000 985720000 804830000 956600000 215900000 1216600000 576510000 944090000 17930 1872;1371;590 16852 158387;158388;158389;158390;158391;158392;158393;158394;158395;158396;158397;158398;158399;158400;158401;158402;158403;158404;158405;158406;158407;158408;158409;158410;158411;158412;158413;158414 202018;202019;202020;202021;202022;202023;202024;202025;202026;202027;202028;202029;202030;202031;202032;202033;202034;202035;202036;202037;202038;202039;202040;202041;202042;202043;202044;202045;202046;202047;202048;202049;202050;202051;202052;202053;202054;202055;202056;202057;202058 202047 37 GVGISVLEMSHR Unmodified 1283.6656 0.66560534 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 67.151 67.151 2;3 1.3517E-09 64508 QUIQUE_DMIX4_190116_001 152.97 132.27 23879000000 1739000000 1762200000 2087900000 2231500000 1795700000 1750100000 1835700000 2475000000 2838800000 847150000 1567000000 1286200000 1663200000 17931 4639 16853 158415;158416;158417;158418;158419;158420;158421;158422;158423;158424;158425;158426;158427;158428;158429;158430;158431;158432;158433;158434;158435;158436;158437 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P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 146.23 146.23 2;3 9.0356E-14 152458 QUIQUE_C1576_190116_001 134.88 118.36 3327500000 246860000 306430000 18954000 22570000 312690000 383060000 356220000 256530000 382870000 121140000 287630000 293590000 338940000 17936 2574 16856 158458;158459;158460;158461;158462;158463;158464;158465;158466;158467;158468;158469;158470;158471;158472;158473;158474;158475;158476;158477;158478;158479;158480;158481 202124;202125;202126;202127;202128;202129;202130;202131;202132;202133;202134;202135;202136;202137;202138;202139;202140;202141;202142;202143;202144;202145;202146;202147;202148;202149 202136 25 GVGVFGDMAQDTGIPADIWR Oxidation (M) 2119.9997 0.99968901 2677 P56192 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 139.62 139.62 2 0.0027362 144247 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.004 56.722 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17937 2677 16857 158482 202150 202150 2120 1 GVGVFGDMAQDTGIPADIWR Unmodified 2104.0048 0.004774387 2677 P56192 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 153.83 153.83 2 0.015503 158922 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.823 34.136 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17938 2677 16857 158483 202151 202151 1 GVGWSHPLPQCEIVK Unmodified 1705.861 0.86101068 1847 P04003 C4BPA C4b-binding protein alpha chain yes yes 0 0 0 1 69.833 69.833 2 0.011997 71051 QUIQUE_C1438_190116_001 61.235 43.426 38773000 0 0 0 0 38773000 0 0 0 0 0 0 0 0 17939 1847 16858 158484 202152 202152 1 GVHLRPVNQTAR Unmodified 1346.7531 0.75311521 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 12.519 12.519 3 0.00029853 3303 QUIQUE_C1563_190116_001 94.538 78.401 300190000 0 0 10049000 0 5748200 170660000 0 14089000 14699000 0 0 84944000 0 17940 515 16859 158485;158486;158487;158488;158489;158490;158491 202153;202154;202155;202156;202157;202158;202159 202156 6 GVHLRPVNQTARPK Unmodified 1571.9008 0.90084208 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 2 1 10.434 10.434 4 0.0011248 2920 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.705 54.502 24147000 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202170;202171;202172;202173;202174;202175;202176;202177;202178;202179;202180;202181;202182;202183;202184;202185;202186;202187;202188;202189;202190;202191 202190 17 GVIALCIEDGSIHR Unmodified 1538.7875 0.78751139 2326 P31040;D6RFM5 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 79.811 79.811 2;3 5.1879E-11 81220 QUIQUE_C1277_190116_001 131.82 116.85 3998900000 331740000 328360000 415790000 241180000 279930000 87872000 321780000 199130000 503040000 154560000 475670000 323550000 336330000 17944 2326 16862 158522;158523;158524;158525;158526;158527;158528;158529;158530;158531;158532;158533;158534;158535;158536;158537;158538;158539;158540;158541;158542;158543;158544;158545 202192;202193;202194;202195;202196;202197;202198;202199;202200;202201;202202;202203;202204;202205;202206;202207;202208;202209;202210;202211;202212;202213;202214;202215;202216;202217;202218;202219;202220;202221 202195 28 GVIDLDVFLK Unmodified 1117.6383 0.63831118 1009 F5H442;Q99816;J3QRU6;J3QKS4 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 141.75 141.75 2 0.023795 146584 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.729 34.598 114440000 0 0 0 0 0 0 0 27087000 29693000 0 31252000 26404000 0 17945 1009 16863 158546;158547;158548;158549 202222;202223;202224;202225 202223 4 GVIDLIFEK Unmodified 1032.5855 0.58554733 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.76 129.76 2 0.0035378 133970 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.069 54.368 341430000 0 54671000 37787000 49523000 43623000 42753000 27700000 45962000 0 0 0 0 39411000 17946 922 16864 158550;158551;158552;158553;158554;158555;158556;158557 202226;202227;202228;202229;202230;202231;202232;202233;202234 202234 6 GVIDLVFEK Unmodified 1018.5699 0.56989727 170 A0A0A0MSA7;A0A0U1RQK7;O43432 EIF4G3 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 yes no 0 0 0 1 1 1 113.36 113.36 2 0.026913 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0 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 71.725 71.725 2 2.7743E-06 71147 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.66 116.57 6672000000 0 684670000 285340000 294020000 254470000 258020000 568280000 759080000 417230000 426440000 1155500000 869430000 699490000 17949 267;275;3025 16866 158574;158575;158576;158577;158578;158579;158580;158581;158582;158583;158584;158585;158586;158587;158588;158589;158590;158591;158592 202261;202262;202263;202264;202265;202266;202267;202268;202269;202270;202271;202272;202273;202274;202275;202276;202277;202278;202279;202280;202281;202282;202283 202273 165 20 GVIECLK Unmodified 817.43677 0.4367746 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 37.25 37.25 2 0.046324 32880 QUIQUE_C1277_190116_001 77.748 44.01 312740000 0 177080000 0 0 0 135660000 0 0 0 0 0 0 0 17950 86 16867 158593;158594 202284;202285 202284 2 GVIESVVTIEDDFITVVQTTTDEGESGSHSVR Unmodified 3405.6424 0.6423531 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 2 2 3 1 3 1 2 2 1 3 2 2 172.76 172.76 3;4 2.3151E-64 175322 QUIQUE_C1403_190116_001 145.29 133.55 3738500000 101860000 390560000 552780000 66501000 370730000 88971000 402720000 127810000 384870000 0 437960000 231700000 582010000 17951 2009 16868 158595;158596;158597;158598;158599;158600;158601;158602;158603;158604;158605;158606;158607;158608;158609;158610;158611;158612;158613;158614;158615;158616;158617;158618 202286;202287;202288;202289;202290;202291;202292;202293;202294;202295;202296;202297;202298;202299;202300;202301;202302;202303;202304;202305;202306;202307;202308;202309;202310 202293 19 GVIFYLR Unmodified 866.50142 0.50142377 1756 O95831;E9PMA0 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.105 86.105 2 0.041759 84082 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.716 59.094 342230000 0 0 48190000 0 44711000 0 0 0 0 32385000 102270000 57962000 56718000 17952 1756 16869 158619;158620;158621;158622;158623;158624 202311;202312;202313;202314;202315;202316;202317 202313 7 GVIINTASVAAFEGQVGQAAYSASK Unmodified 2438.2442 0.24415304 3969 Q99714 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 139.71 139.71 2;3 2.0004E-98 143927 QUIQUE_C1277_190116_001 183.36 171.38 4022100000 248020000 303390000 292470000 282320000 300620000 213670000 247040000 364740000 362630000 123970000 400660000 494580000 388000000 17953 3969 16870 158625;158626;158627;158628;158629;158630;158631;158632;158633;158634;158635;158636;158637;158638;158639;158640;158641;158642;158643;158644;158645;158646;158647;158648;158649;158650 202318;202319;202320;202321;202322;202323;202324;202325;202326;202327;202328;202329;202330;202331;202332;202333;202334;202335;202336;202337;202338;202339;202340;202341;202342;202343;202344;202345;202346;202347;202348;202349;202350;202351;202352;202353 202322 36 GVILLIVDK Unmodified 968.62702 0.62701821 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YCH5;H0YD77;H0YEC5;H0YCF8;H0YE44 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 98.547 98.547 2 0.025868 102631 QUIQUE_C1218_190116_001 58.981 28.312 115790000 17492000 0 0 14664000 16009000 0 18076000 18574000 14482000 0 0 0 16489000 17954 798 16871 158651;158652;158653;158654;158655;158656;158657 202354;202355;202356;202357;202358;202359;202360 202354 7 GVILTSDRPGVFSAGLDLTEMCGR Unmodified 2550.257 0.25704268 2443 P42126;Q96DC0;H3BS70 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 130.71 130.71 3 3.9315E-20 133980 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.5 115.62 522960000 0 0 107980000 0 95447000 0 0 80401000 101460000 0 137670000 0 0 17955 2443 16872 158658;158659;158660;158661;158662;158663 202361;202362;202363;202364;202365;202366 202363 6 GVILTSDRPGVFSAGLDLTEMCGR Oxidation (M) 2566.252 0.2519573 2443 P42126;Q96DC0;H3BS70 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 1 1 1 119.03 119.03 3 0.0015192 115756 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.888 36.857 15823000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15823000 0 0 0 17956 2443 16872 158664 202367 202367 1866 1 GVIPMNAK Unmodified 828.45276 0.45275902 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 0 1 30.115 30.115 2 0.045047 24968 QUIQUE_C1438_190116_001 57.335 40.064 39317000 0 0 0 0 39317000 0 0 0 0 0 0 0 0 17957 4593 16873 158665 202368 202368 1 GVIPNSFDHIFTHISR Unmodified 1838.9428 0.94276648 1476 O15066 KIF3B Kinesin-like protein KIF3B;Kinesin-like protein KIF3B, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 100.15 100.15 4 9.4295E-05 102415 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.497 81.787 45045000 0 0 0 0 26311000 0 0 18734000 0 0 0 0 0 17958 1476 16874 158666;158667 202369;202370 202370 2 GVIQAIQK Unmodified 855.5178 0.51780212 4252;1055 Q9NQC3;H7C106;A0A0U1RQR6;F8W914 RTN4 Reticulon-4;Reticulon no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.384 30.384 2 0.013801 24717 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.838 45.336 2812400000 303630000 260420000 322280000 326280000 254820000 0 288410000 130880000 182690000 118150000 223060000 211220000 190520000 17959 4252;1055 16875 158668;158669;158670;158671;158672;158673;158674;158675;158676;158677;158678;158679 202371;202372;202373;202374;202375;202376;202377;202378;202379;202380;202381;202382 202380 7 GVISDILDWK Unmodified 1144.6128 0.61282471 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes no 0 0 0 1 141.4 141.4 2 0.013076 144509 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.305 31.052 16614000 0 0 0 0 0 0 0 16614000 0 0 0 0 0 17960 2964 16876 158680 202383 202383 1 GVIVDKDFSHPQMPK Unmodified 1696.8607 0.86067633 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 53.794 53.794 3;4 0.0002794 52547 QUIQUE_C1576_190116_001 73.156 62.212 1023600000 162910000 119670000 0 0 109850000 89793000 188660000 118800000 63341000 0 81591000 0 88946000 17961 2514 16877 158681;158682;158683;158684;158685;158686;158687;158688;158689;158690;158691;158692 202384;202385;202386;202387;202388;202389;202390;202391;202392;202393;202394;202395;202396;202397;202398 202392 13 GVIVDKDFSHPQMPK Oxidation (M) 1712.8556 0.85559095 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 1 1 1 33.433 33.433 3 0.037525 28490 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.813 30.667 189620000 0 0 0 0 0 0 0 0 189620000 0 0 0 0 17962 2514 16877 158693 202399 202399 1 GVIVESAYSDIVK Unmodified 1378.7344 0.73439641 3118 Q15172 PPP2R5A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform yes yes 0 0 0 1 91.392 91.392 2 0.054036 95059 QUIQUE_C1438_190116_001 55.401 41.708 37957000 0 0 0 0 37957000 0 0 0 0 0 0 0 0 17963 3118 16878 158694 202400 202400 0 GVLDVPACQIAIRPEGK Unmodified 1821.9771 0.97710307 2143 P19174;A0A0D9SEK2 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.674 85.674 3 8.0475E-08 87373 QUIQUE_C1403_190116_001 91.457 82.173 432250000 0 50429000 52422000 40098000 47493000 47883000 57437000 0 0 0 50469000 46544000 39480000 17964 2143 16879 158695;158696;158697;158698;158699;158700;158701;158702;158703 202401;202402;202403;202404;202405;202406;202407;202408;202409;202410;202411;202412 202404 12 GVLETFSGTETNK Unmodified 1381.6725 0.67252444 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.912 65.912 2 3.1415E-31 65824 QUIQUE_C1277_190116_001 177.78 143.53 3519900000 239200000 286910000 358360000 296690000 306550000 327320000 274530000 204180000 323900000 0 293660000 309490000 299080000 17965 4450 16880 158704;158705;158706;158707;158708;158709;158710;158711;158712;158713;158714;158715 202413;202414;202415;202416;202417;202418;202419;202420;202421;202422;202423;202424;202425 202414 13 GVLFASGQNLAR Unmodified 1231.6673 0.6673199 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.271 68.271 2 5.1646E-14 67960 QUIQUE_C1368_190116_001 162.97 142.34 6526100000 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Uncharacterized protein C9orf172 yes yes 0 0 0 1 1 1 157.59 157.59 2 0.0037401 161741 QUIQUE_C1403_190116_001 55.314 41.305 132870000 0 0 0 34364000 0 0 0 0 49552000 0 48953000 0 0 17968 683 16883 158739;158740;158741 202462;202463;202464 202462 1 GVLFQPCER Unmodified 1104.5386 0.53861391 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 54.426 54.426 2 0.001153 52988 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.36 81.433 207070000 0 0 0 0 0 0 0 44495000 35473000 0 49001000 34585000 43516000 17969 2911 16884 158742;158743;158744;158745;158746 202465;202466;202467;202468;202469;202470 202467 6 GVLFYGPPGCGK Unmodified 1250.6118 0.61177885 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.759 74.759 2 0.00052022 75480 QUIQUE_C1277_190116_001 93.551 74.771 3619800000 368220000 320310000 327040000 334250000 339600000 287530000 434850000 0 0 0 380200000 412500000 415280000 17970 2658 16885 158747;158748;158749;158750;158751;158752;158753;158754;158755;158756 202471;202472;202473;202474;202475;202476;202477;202478;202479;202480;202481;202482;202483;202484;202485;202486;202487;202488;202489;202490;202491;202492;202493;202494;202495;202496 202474 26 GVLHQFSGTETNK Unmodified 1416.6997 0.69974224 2259 P27144;D3DQ64 AK4 Adenylate kinase 4, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 25.482 25.482 2;3 1.4859E-64 19272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 244.95 207.22 3487100000 154870000 290270000 186820000 225150000 313350000 257260000 289110000 254420000 267700000 112430000 383900000 160390000 591450000 17971 2259 16886 158757;158758;158759;158760;158761;158762;158763;158764;158765;158766;158767;158768;158769;158770;158771;158772;158773;158774;158775;158776;158777;158778;158779;158780;158781;158782 202497;202498;202499;202500;202501;202502;202503;202504;202505;202506;202507;202508;202509;202510;202511;202512;202513;202514;202515;202516;202517;202518;202519;202520;202521;202522;202523;202524;202525;202526;202527;202528;202529;202530;202531 202518 33 GVLHQVMVLDSEALR Unmodified 1665.8872 0.88722543 4306 Q9NVH1 DNAJC11 DnaJ homolog subfamily C member 11 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 102.39 102.39 2;3 5.7458E-05 105387 QUIQUE_C1368_190116_001 85.837 77.661 474280000 28086000 85854000 72125000 54883000 0 35229000 0 57665000 31893000 0 37478000 31943000 39127000 17972 4306 16887 158783;158784;158785;158786;158787;158788;158789;158790;158791;158792;158793;158794;158795;158796 202532;202533;202534;202535;202536;202537;202538;202539;202540;202541;202542;202543;202544;202545;202546 202536 13 GVLIEPVYPDIIR Unmodified 1482.8446 0.84461556 3119 Q15173;E9PNY3;E9PQN5 PPP2R5B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126 126 2 0.0014578 131133 QUIQUE_C1576_190116_001 59.426 28.862 219770000 27926000 29694000 0 19636000 15124000 12298000 26899000 22855000 0 0 0 30833000 34500000 17973 3119 16888 158797;158798;158799;158800;158801;158802;158803;158804;158805 202547;202548;202549;202550;202551;202552;202553;202554;202555;202556 202553 10 GVLIPFALSLPEKPPR Unmodified 1733.024 0.023976912 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 4 126.09 126.09 2;3 9.6776E-07 131708 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.417 93.585 1274300000 0 38506000 45513000 0 102930000 22371000 81225000 186060000 266880000 12663000 114960000 170870000 232340000 17974 1688 16889 158806;158807;158808;158809;158810;158811;158812;158813;158814;158815;158816;158817;158818;158819;158820;158821 202557;202558;202559;202560;202561;202562;202563;202564;202565;202566;202567;202568;202569;202570;202571;202572;202573;202574;202575;202576;202577;202578;202579;202580;202581;202582 202575 26 GVLIPFALSLPEKPPRGEQGAP Unmodified 2272.258 0.25795261 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 2 2 1 1 125.08 125.08 3 2.0951E-07 128896 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.718 86.462 263850000 0 0 0 0 0 0 0 135250000 0 0 63168000 0 65435000 17975 1688 16890 158822;158823;158824;158825 202583;202584;202585;202586;202587 202584 5 GVLLDISGVLYDSGAGGGTAIAGSVEAVAR Unmodified 2774.445 0.44503769 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 0 4 183.9 183.9 3 0.0013588 187350 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.612 25.5 40796000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40796000 0 0 17976 4111 16891 158826;158827;158828;158829 202588;202589;202590;202591;202592 202590 5 GVLLEIEDLQVNQFK Unmodified 1743.9407 0.94070079 2487 P46940;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 142.1 142.1 2 0.00057891 147221 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.734 92.01 14493000 0 0 0 0 0 0 0 0 14493000 0 0 0 0 17977 2487 16892 158830 202593 202593 1 GVLLFGPPGTGK Unmodified 1141.6495 0.64954457 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.353 91.353 2 0.00076734 93032 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.496 71.956 1208000000 111270000 99603000 123480000 104650000 88282000 84869000 83862000 109950000 99787000 42897000 68354000 82716000 108230000 17978 2389 16893 158831;158832;158833;158834;158835;158836;158837;158838;158839;158840;158841;158842;158843 202594;202595;202596;202597;202598;202599;202600;202601;202602;202603;202604;202605;202606;202607;202608;202609;202610;202611;202612 202610 19 GVLLYGPPGCGK Unmodified 1216.6274 0.62742892 3628 Q8NBU5 ATAD1 ATPase family AAA domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 66.353 66.353 2 0.0050033 65498 QUIQUE_C1403_190116_001 67.563 50.787 335170000 66590000 51918000 0 55016000 0 0 0 40559000 53525000 0 0 67565000 0 17979 3628 16894 158844;158845;158846;158847;158848;158849 202613;202614;202615;202616;202617;202618 202615 6 GVLLYGPPGTGK Unmodified 1157.6445 0.64445919 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1;J3KRP2;J3QLH6;J3QRW1;J3QRR3;Q8NB90 PSMC5;SPATA5 26S protease regulatory subunit 8;Spermatogenesis-associated protein 5 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 66.512 66.512 2 0.0034573 67274 QUIQUE_C1403_190116_001 116.3 0 953490000 126390000 177120000 0 185510000 0 91957000 135620000 0 117450000 0 0 119440000 0 17980 2743 16895 158850;158851;158852;158853;158854;158855;158856;158857;158858 202619;202620;202621;202622;202623;202624;202625;202626;202627;202628;202629;202630 202623 9 GVLMYGPPGCGK Unmodified 1234.5838 0.58384954 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 1 61.8 61.8 2 0.016587 60151 QUIQUE_C1563_190116_001 60.91 46.914 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17981 2466 16896 158859 202631 202631 1 GVLMYGPPGTGK Oxidation (M) 1191.5958 0.59579444 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 1 0 1 53.618 53.618 2 0.038572 51571 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.704 47.004 102520000 0 0 0 0 0 0 0 102520000 0 0 0 0 0 17982 4672 16897 158860 202632 202632 0 GVLNMSLTPSQGTHTFDPVTK Unmodified 2229.11 0.10996774 2632 P53677;E5RJ52;H0YAY4 AP3M2 AP-3 complex subunit mu-2 yes no 0 0 0 1 97.953 97.953 3 0.0097962 100602 QUIQUE_DMIX7_190116_001 34.405 25.911 105580000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105580000 0 17983 2632 16898 158861 202633 202633 1 GVLSEPLPDLQLLTGDIR Unmodified 1935.0677 0.06769222 1116 H0Y3A8;O75129 ASTN2 Astrotactin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.42 157.42 2 7.7357E-05 163062 QUIQUE_C1218_190116_001 117.07 111.99 236490000 22700000 0 47434000 20843000 38086000 24262000 23610000 0 32295000 8628400 0 18629000 0 17984 1116 16899 158862;158863;158864;158865;158866;158867;158868;158869;158870 202634;202635;202636;202637;202638;202639;202640;202641;202642 202634 8 GVLSNAWHR Unmodified 1038.5359 0.5359118 2591 P51687 SUOX Sulfite oxidase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 35.937 35.937 2 0.011332 32282 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.875 37.674 59119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35106000 0 24013000 17985 2591 16900 158871;158872 202643;202644;202645 202643 3 GVLSQAMVMCASSPEK Unmodified 1693.7837 0.78374792 2950 Q12904 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 86.654 86.654 2 7.2846E-14 88620 QUIQUE_C1277_190116_001 138.94 126.36 136980000 0 30658000 41322000 32732000 0 32269000 0 0 0 0 0 0 0 17986 2950 16901 158873;158874;158875;158876 202646;202647;202648;202649 202646 4 GVLSTHQNIR Unmodified 1123.6098 0.60980502 3238 Q4G176;A0A3B3ISK9;F5H2G6;F5GX20 ACSF3 Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 18.724 18.724 2;3 0.00464 11488 QUIQUE_C1438_190116_001 80.219 56.45 113570000 0 0 0 0 69602000 0 0 0 0 0 43966000 0 0 17987 3238 16902 158877;158878;158879;158880;158881;158882;158883 202650;202651;202652;202653;202654;202655;202656 202652 7 GVLTNPNCEFEANYVAIHTLATWYK Unmodified 2910.4011 0.40106438 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 0 0 1 1 2 1 150.41 150.41 3 5.4549E-06 153211 QUIQUE_C1563_190116_001 55.469 50.638 198420000 0 61670000 0 0 44232000 33575000 0 58939000 0 0 0 0 0 17988 1579 16903 158884;158885;158886;158887;158888 202657;202658;202659;202660;202661;202662 202660 6 GVLVCDECCSVHR Unmodified 1589.6749 0.67486617 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;K7EN79 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 33.036 33.036 2;3 5.0841E-05 28022 QUIQUE_C1277_190116_001 120.09 106.66 369340000 58869000 107270000 0 0 51241000 0 60597000 26597000 0 0 0 29959000 34807000 17989 245 16904 158889;158890;158891;158892;158893;158894;158895;158896;158897 202663;202664;202665;202666;202667;202668;202669;202670;202671 202665 8 GVLVFLEQALIQYALR Unmodified 1832.056 0.056005322 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 176 176 2 2.7944E-05 179536 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.31 65.976 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17990 2534 16905 158898 202672 202672 1 GVMGGQSAGPQHTEAETIQK Unmodified 2024.9586 0.95855248 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.472 29.472 3 1.3313E-06 24747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.49 72.098 250990000 0 41215000 0 38514000 39308000 58386000 0 39625000 0 0 0 33941000 0 17991 1591 16906 158899;158900;158901;158902;158903;158904 202673;202674;202675;202676;202677;202678 202677 5 GVMLAVDAVIAELK Oxidation (M) 1443.8007 0.80070184 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 1 0 3 3 1 2 3 3 145.87 145.87 2;3 8.0884E-05 151075 QUIQUE_C1218_190116_001 99.531 79.521 259930000 46454000 51080000 0 0 0 91133000 0 0 0 71264000 0 0 0 17992 2004 16907 158905;158906;158907;158908;158909;158910;158911;158912;158913;158914;158915;158916;158917;158918;158919 202679;202680;202681;202682;202683;202684;202685;202686;202687;202688;202689;202690;202691;202692;202693 202679 1277 14 GVMLAVDAVIAELK Unmodified 1427.8058 0.80578722 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 1 161.04 161.04 2;3 6.989E-05 166958 QUIQUE_C1218_190116_001 96.464 85.251 2918900000 340190000 368750000 536690000 253680000 271060000 109660000 648740000 73306000 156260000 29384000 131220000 0 0 17993 2004 16907 158920;158921;158922;158923;158924;158925;158926;158927;158928;158929;158930;158931;158932;158933;158934;158935;158936;158937;158938;158939;158940 202694;202695;202696;202697;202698;202699;202700;202701;202702;202703;202704;202705;202706;202707;202708;202709;202710;202711;202712;202713;202714;202715;202716;202717;202718 202695 22 GVMLAVDAVIAELKK Unmodified 1555.9008 0.90075023 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 145.01 145.01 2;3 3.1328E-13 150019 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.11 95.313 23165000000 980190000 1582600000 2005400000 1689900000 2712800000 1215900000 1406200000 1811400000 2830800000 627860000 2422100000 2513700000 1365700000 17994 2004 16908 158941;158942;158943;158944;158945;158946;158947;158948;158949;158950;158951;158952;158953;158954;158955;158956;158957;158958;158959;158960;158961;158962;158963;158964;158965;158966;158967 202719;202720;202721;202722;202723;202724;202725;202726;202727;202728;202729;202730;202731;202732;202733;202734;202735;202736;202737;202738;202739;202740;202741;202742;202743;202744;202745;202746;202747;202748;202749;202750;202751;202752;202753;202754;202755;202756;202757;202758;202759;202760;202761;202762;202763;202764;202765;202766 202765 43 GVMLAVDAVIAELKK Oxidation (M) 1571.8957 0.89566485 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 3 2 3 3 2 128.33 128.33 2;3 1.8234E-08 130562 QUIQUE_C1563_190116_001 109.83 103.92 4292900000 132100000 238110000 165460000 123770000 166140000 139580000 270690000 537140000 665360000 325120000 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19272000 25223000 0 0 0 41732000 17997 4390 16910 158997;158998;158999 202804;202805;202806 202805 2926 3 GVNAIVYMIDAADR Unmodified 1506.7501 0.75006325 4308 Q9NVJ2 ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8B yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 138.63 138.63 2;3 0.00087292 135302 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.937 67.146 354340000 120690000 0 0 15741000 0 15148000 0 0 13109000 50062000 139590000 0 0 17998 4308 16911 159000;159001;159002;159003;159004;159005;159006;159007;159008 202807;202808;202809;202810;202811;202812;202813;202814;202815 202813 8 GVNAIVYMIDAADREK Unmodified 1763.8876 0.88761936 4308 Q9NVJ2 ARL8B ADP-ribosylation factor-like protein 8B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.63 121.63 3 4.7189E-07 125690 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.96 91.613 867200000 0 0 0 0 24158000 0 33951000 151860000 192090000 0 156280000 140600000 168260000 17999 4308 16912 159009;159010;159011;159012;159013;159014;159015 202816;202817;202818;202819;202820;202821;202822 202822 7 GVNCIDYYSGGDKPYLISGADDR Unmodified 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159028;159029;159030;159031;159032;159033;159034;159035;159036;159037;159038;159039;159040;159041;159042;159043;159044;159045;159046;159047;159048;159049;159050 202836;202837;202838;202839;202840;202841;202842;202843;202844;202845;202846;202847;202848;202849;202850;202851;202852;202853;202854;202855;202856;202857;202858;202859;202860;202861;202862;202863 202848 28 GVNEDTYSGILDCAR Unmodified 1668.7413 0.74134906 4190 Q9H936;E9PJH7 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 0 1 88.52 88.52 2 0.00032949 91024 QUIQUE_C1576_190116_001 81.92 75.679 219960000 0 0 0 0 0 0 219960000 0 0 0 0 0 0 18002 4190 16915 159051 202864 202864 1 GVNETLVAQR Unmodified 1085.5829 0.58292157 426 A0A2R8Y566 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.951 31.951 2 0.00074092 27536 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.91 72.908 395410000 68676000 46045000 0 44260000 0 33757000 45983000 35398000 0 19993000 0 37374000 63927000 18003 426 16916 159052;159053;159054;159055;159056;159057;159058;159059;159060;159061;159062 202865;202866;202867;202868;202869;202870;202871;202872;202873;202874;202875;202876;202877;202878 202873 14 GVNIGGAGSYIYEKPLAEGPQVTGPIEVPAAR Unmodified 3209.6721 0.67207751 2618 P52943;H0YFA4 CRIP2 Cysteine-rich protein 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 121.33 121.33 3;4 1.8788E-157 125429 QUIQUE_C1368_190116_001 201.8 192.81 9594000000 709090000 820780000 494950000 743990000 856050000 478750000 516770000 992750000 1276200000 42474000 779120000 851960000 1031200000 18004 2618 16917 159063;159064;159065;159066;159067;159068;159069;159070;159071;159072;159073;159074;159075;159076;159077;159078;159079;159080;159081;159082;159083;159084;159085;159086;159087 202879;202880;202881;202882;202883;202884;202885;202886;202887;202888;202889;202890;202891;202892;202893;202894;202895;202896;202897;202898;202899;202900;202901;202902;202903;202904;202905;202906;202907;202908;202909;202910;202911;202912;202913;202914;202915;202916;202917;202918;202919;202920;202921 202888 43 GVNLPGAAVDLPAVSEK Unmodified 1635.8832 0.88318591 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 103.21 103.21 2;3 2.2527E-05 106036 QUIQUE_C1368_190116_001 94.569 83.299 43789000000 4169500000 4763100000 4234600000 3954900000 3199500000 3427300000 3558200000 2094000000 2957500000 2212900000 3360300000 2335600000 3521100000 18005 1203;2077 16918 159088;159089;159090;159091;159092;159093;159094;159095;159096;159097;159098;159099;159100;159101;159102;159103;159104;159105;159106;159107;159108;159109;159110;159111;159112 202922;202923;202924;202925;202926;202927;202928;202929;202930;202931;202932;202933;202934;202935;202936;202937;202938;202939;202940;202941;202942;202943;202944;202945;202946;202947;202948;202949;202950;202951;202952;202953;202954;202955;202956;202957;202958;202959;202960;202961;202962 202930 40 GVNLPGAAVDLPAVSEKDIQDLK Unmodified 2348.2587 0.25874047 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 1 2 3 2 3 2 2 2 3 124.19 124.19 2;3 2.0709E-159 127683 QUIQUE_DMIX1_190116_001 228.9 210.07 8052000000 0 166340000 193050000 0 405300000 0 296260000 1926500000 1127700000 0 1571000000 1391700000 974120000 18006 1203;2077 16919 159113;159114;159115;159116;159117;159118;159119;159120;159121;159122;159123;159124;159125;159126;159127;159128;159129;159130;159131;159132 202963;202964;202965;202966;202967;202968;202969;202970;202971;202972;202973;202974;202975;202976;202977;202978;202979;202980;202981;202982;202983;202984;202985;202986;202987;202988;202989;202990;202991;202992;202993;202994;202995;202996;202997 202973 34 GVNLQEFLNVTSVHLFK Unmodified 1944.0469 0.046897198 1785 P00488;Q9NQP5;A6PVK5;H0Y796 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 149.52 149.52 2;3 8.4204E-05 154188 QUIQUE_DMIX7_190116_001 110.07 96.64 1429800000 0 0 0 475620000 238470000 0 0 0 0 0 501010000 36082000 178600000 18007 1785 16920 159133;159134;159135;159136;159137;159138 202998;202999;203000;203001;203002;203003;203004 203002 7 GVNQATAGVVASTISGK Unmodified 1558.8315 0.83148469 1394 O00291 HIP1 Huntingtin-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 71.472 71.472 2 0.0040233 71679 QUIQUE_C1277_190116_001 55.896 43.32 90253000 0 48006000 0 0 0 0 42247000 0 0 0 0 0 0 18008 1394 16921 159139;159140;159141;159142 203005;203006;203007;203008 203005 4 GVNSFLVFMAYK Unmodified 1374.7006 0.70059386 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 141.19 141.19 2 0.001153 146506 QUIQUE_C1368_190116_001 101.65 77.616 740100000 0 119990000 79667000 0 0 0 89483000 121390000 0 26379000 161900000 141280000 0 18009 1430 16922 159143;159144;159145;159146;159147;159148;159149 203009;203010;203011;203012;203013;203014;203015;203016 203010 7 GVNSFMVYMAYK Oxidation (M) 1424.6468 0.64684373 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 95.283 95.283 2 0.0076067 97243 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.841 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159160;159161;159162;159163;159164;159165;159166;159167;159168;159169;159170;159171;159172;159173 203034;203035;203036;203037;203038;203039;203040;203041;203042;203043;203044;203045;203046;203047;203048;203049;203050;203051;203052;203053 203048 19 GVNSFQMFMTYK Oxidation (M) 1467.6527 0.65265739 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 1 0 1 1 1 1 99.717 99.717 2 0.0010765 105750 QUIQUE_C1438_190116_001 85.622 75.099 154200000 0 0 27411000 0 31171000 0 0 0 0 0 54169000 0 41453000 18013 3984 16924 159174;159175;159176;159177 203054;203055;203056;203057 203055 2823 4 GVNSFQMFMTYK 2 Oxidation (M) 1483.6476 0.64757201 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 2 0 1 73.924 73.924 2 0.039664 74617 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.472 34.5 48678000 0 0 0 0 0 0 0 0 48678000 0 0 0 0 18014 3984 16924 159178 203058 203058 2823 1 GVNSFQVYMAYK Oxidation (M) 1421.6649 0.66493664 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 74.138 74.138 2 0.00044719 74397 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.62 94.268 1232700000 102170000 173720000 89659000 0 98116000 53162000 71279000 71409000 104150000 92411000 118700000 136890000 121010000 18015 3050 16925 159179;159180;159181;159182;159183;159184;159185;159186;159187;159188;159189;159190;159191;159192 203059;203060;203061;203062;203063;203064;203065;203066;203067;203068;203069;203070;203071;203072 203067 2476 11 GVNSFQVYMAYK Unmodified 1405.67 0.67002202 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 95.197 95.197 2 0.000522 97668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.5 100.29 4397400000 161860000 346710000 272860000 206490000 330160000 189000000 356980000 518640000 408660000 90222000 387620000 608960000 519220000 18016 3050 16925 159193;159194;159195;159196;159197;159198;159199;159200;159201;159202;159203;159204;159205;159206;159207;159208;159209 203073;203074;203075;203076;203077;203078;203079;203080;203081;203082;203083;203084;203085;203086;203087;203088;203089;203090;203091;203092;203093;203094 203084 22 GVNTDSGSVCR Unmodified 1150.5037 0.50368497 2049 P12955;V9GYE4 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.88 14.88 2 1.6903E-05 7386 QUIQUE_C1218_190116_001 150.27 117.37 972160000 96320000 206660000 43540000 91602000 48270000 141480000 30087000 76985000 76462000 0 23818000 105870000 31070000 18017 2049 16926 159210;159211;159212;159213;159214;159215;159216;159217;159218;159219;159220;159221 203095;203096;203097;203098;203099;203100;203101;203102;203103;203104;203105;203106;203107 203095 12 GVNTFSPEGR Unmodified 1062.5094 0.50942227 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.386 31.386 2 0.00018176 25941 QUIQUE_C1403_190116_001 123.35 73.315 3503200000 279820000 320550000 0 301690000 273030000 222260000 290060000 288560000 285290000 130000000 417660000 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159237;159238;159239;159240;159241;159242;159243;159244;159245;159246;159247;159248;159249;159250;159251;159252;159253;159254;159255;159256;159257;159258 203127;203128;203129;203130;203131;203132;203133;203134;203135;203136;203137;203138;203139;203140;203141;203142;203143;203144;203145;203146;203147;203148 203129 19 GVNVSALSR Unmodified 901.49813 0.49812931 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.179 34.179 2 0.00016809 28567 QUIQUE_C1368_190116_001 140.09 98.66 5564600000 491820000 497610000 382190000 394980000 549350000 406390000 447300000 325360000 303880000 335990000 523550000 483940000 422290000 18021 2414 16930 159259;159260;159261;159262;159263;159264;159265;159266;159267;159268;159269;159270;159271 203149;203150;203151;203152;203153;203154;203155;203156;203157;203158;203159;203160;203161;203162;203163;203164;203165;203166;203167;203168;203169;203170;203171;203172;203173;203174;203175 203153 27 GVNVVPFLELIGLPDSVVSILK Unmodified 2307.3454 0.34537063 1316 K7EK00;Q96ND0 FAM210A Protein FAM210A yes no 0 0 0 1 1 177.51 177.51 2 0.0004963 184306 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.729 69.469 50093000 0 0 0 0 0 0 0 0 26808000 0 23285000 0 0 18022 1316 16931 159272;159273 203176;203177;203178 203177 3 GVPAGNSDTEGGQPGR Unmodified 1497.6808 0.68079771 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3;G3V3B0;G3V3T3 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 17.879 17.879 2 0.0019815 10677 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.614 80.66 127290000 0 0 12103000 0 24617000 0 0 33616000 15488000 0 19549000 0 21913000 18023 4745 16932 159274;159275;159276;159277;159278;159279 203179;203180;203181;203182;203183;203184 203182 1 GVPALVALVASSQSVR Unmodified 1552.8937 0.89369102 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 135.2 135.2 3 0.024027 131435 QUIQUE_DMIX4_190116_001 23.527 21.675 6519800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6519800 0 0 0 18024 730 16933 159280;159281 203185;203186 203185 2 GVPELVLK Unmodified 853.5273 0.52730417 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 66.227 66.227 2 0.0304 65896 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.993 48.188 145390000 0 34197000 0 0 55392000 0 0 0 55804000 0 0 0 0 18025 2207 16934 159282;159283;159284 203187;203188;203189 203189 3 GVPESLASGEGAGAGLPALDLAK Unmodified 2079.0848 0.084798847 1762 O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.43 123.43 2 8.1277E-40 126811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 203.52 188.13 2110300000 174900000 149850000 147560000 177670000 172490000 143360000 215050000 168210000 185150000 68496000 179570000 122470000 205570000 18026 1762 16935 159285;159286;159287;159288;159289;159290;159291;159292;159293;159294;159295;159296;159297 203190;203191;203192;203193;203194;203195;203196;203197;203198;203199;203200;203201;203202;203203;203204;203205;203206;203207;203208;203209;203210;203211;203212;203213;203214;203215;203216;203217;203218;203219;203220;203221;203222;203223;203224;203225;203226 203214 37 GVPGAIVNVSSQCSQR Unmodified 1657.8206 0.82060243 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3KRZ4;J3KSZ5;J3QS45 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 1 57.006 57.006 2 0.021671 55448 QUIQUE_C1277_190116_001 58.32 42.456 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18027 3464 16936 159298 203227 203227 1 GVPIIFADELDDSKPPPSSSMPLILQEEK Unmodified 3151.5999 0.59988335 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 144.91 144.91 3 3.7235E-38 149457 QUIQUE_C1277_190116_001 130.23 124.39 250340000 0 72900000 0 0 42909000 0 0 73403000 0 0 0 61129000 0 18028 3043 16937 159299;159300;159301;159302;159303;159304 203228;203229;203230;203231;203232;203233 203228 6 GVPLVYEAFNWR Unmodified 1449.7405 0.74048484 3200 Q16822;H0YM31 PCK2 Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 139.2 139.2 2 0.00052337 144364 QUIQUE_C1368_190116_001 110.76 98.709 81789000 0 0 42848000 0 0 0 0 38940000 0 0 0 0 0 18029 3200 16938 159305;159306;159307;159308 203234;203235;203236;203237 203236 4 GVPQIEVTFDIDANGILNVSAVDK Unmodified 2513.3013 0.30133356 2010;558 A8K7Q2;E9PS65;E9PM13;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 0 2 178.08 178.08 3 0.067533 185595 QUIQUE_DMIX5_190116_001 18.497 15.283 18768000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18768000 0 0 18030 558;2010 16939 159309;159310 203238;203239 203239 2 GVPQQIEVAR Unmodified 1095.6037 0.60365701 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 41.256 41.256 2 0.009734 37300 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.812 52.426 49544000 0 0 0 0 0 0 0 49544000 0 0 0 0 0 18031 3875 16940 159311;159312 203240;203241 203240 2 GVPTGFILPIR Unmodified 1168.6968 0.69682911 2027;1005 F5H2F4;V9GYY3;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.06 115.06 2 0.0005986 120454 QUIQUE_C1438_190116_001 99.442 89.413 1946800000 82609000 140050000 143800000 136530000 158660000 122560000 143850000 179630000 200350000 49319000 183790000 178250000 227450000 18032 1005;2027 16941 159313;159314;159315;159316;159317;159318;159319;159320;159321;159322;159323;159324;159325;159326 203242;203243;203244;203245;203246;203247;203248;203249;203250;203251;203252;203253;203254;203255;203256;203257;203258;203259;203260;203261;203262;203263;203264;203265;203266;203267;203268;203269;203270;203271 203252 30 GVPVAEFNTETTPATNR Unmodified 1802.8799 0.87989145 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 69.567 69.567 2 4.5903E-19 70586 QUIQUE_C1218_190116_001 134.01 118.43 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18033 4323 16942 159327;159328 203272;203273 203272 2 GVPVSEAECTAMGLR Unmodified 1575.7385 0.73851229 3791;3332 Q969Z3;F6V6Z1;Q5VT66 MARC2;MARC1 Mitochondrial amidoxime reducing component 2;Mitochondrial amidoxime-reducing component 1 no no 0 0 0 1 82.908 82.908 2 0.00066822 85817 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.345 78.201 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18034 3791;3332 16943 159329 203274 203274 1 GVPYRPTDLFDELVAHEVAR Unmodified 2283.1648 0.1647805 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 134.08 134.08 4 2.7497E-07 139827 QUIQUE_C1218_190116_001 85.146 76.652 67751000 13183000 0 14912000 0 0 0 0 0 0 9085900 30570000 0 0 18035 1716 16944 159330;159331;159332;159333 203275;203276;203277;203278 203275 4 GVQCEEEEEEK Unmodified 1364.5402 0.54018963 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 15.069 15.069 2 0.00042066 7486 QUIQUE_C1218_190116_001 115.71 96.736 26064000 12310000 0 13754000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18036 998 16945 159334;159335;159336 203279;203280;203281 203279 2 GVQCEEEEEEKKDSGVASTEDSSSSHITAAAIAAK Unmodified 3649.6537 0.65372243 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 2 1 1 1 56.063 56.063 4 2.1085E-15 54308 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.317 66.824 143130000 0 53169000 0 36696000 0 0 0 0 0 0 0 0 53263000 18037 998 16946 159337;159338;159339 203282;203283;203284 203284 3 GVQDIVVGEGTHFLIPWVQK Unmodified 2221.1895 0.18953869 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0;D6RBK0 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.98 148.98 2;3 3.2683E-07 153217 QUIQUE_C1277_190116_001 94.973 89.159 1662200000 238030000 185440000 249900000 156950000 93724000 185950000 161840000 28688000 73659000 72820000 86523000 57888000 70803000 18038 2370 16947 159340;159341;159342;159343;159344;159345;159346;159347;159348;159349;159350;159351;159352;159353 203285;203286;203287;203288;203289;203290;203291;203292;203293;203294;203295;203296;203297;203298 203286 14 GVQDIVVGEGTHFLIPWVQKPIIFDCR Unmodified 3122.6375 0.63754668 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0;D6RBK0 PHB Prohibitin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 157.3 157.3 3;4 4.2635E-92 162247 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.26 133.86 10090000000 488850000 511980000 1058300000 455440000 412520000 420800000 1116600000 583610000 1042700000 132140000 1489200000 965410000 1412200000 18039 2370 16948 159354;159355;159356;159357;159358;159359;159360;159361;159362;159363;159364;159365;159366;159367;159368;159369;159370;159371;159372;159373;159374;159375;159376;159377;159378;159379;159380 203299;203300;203301;203302;203303;203304;203305;203306;203307;203308;203309;203310;203311;203312;203313;203314;203315;203316;203317;203318;203319;203320;203321;203322;203323;203324;203325;203326;203327;203328;203329;203330;203331;203332;203333 203321 34 GVQGIIVVNTEGIPIK Unmodified 1635.956 0.95595693 4240 Q9NP97;B1AKR6 DYNLRB1 Dynein light chain roadblock-type 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.37 111.37 2 2.4815E-09 116293 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.1 116.67 847580000 86577000 144860000 68833000 0 66338000 34874000 66219000 81153000 77476000 43267000 92890000 85091000 0 18040 4240 16949 159381;159382;159383;159384;159385;159386;159387;159388;159389;159390;159391 203334;203335;203336;203337;203338;203339;203340;203341;203342;203343;203344;203345;203346 203345 12 GVQLGLVAFR Unmodified 1058.6237 0.62366417 4544 Q9Y276;C9J8G3;C9JAS4;A0A2R8Y7T3;C9J4Q9 BCS1L Mitochondrial chaperone BCS1 yes no 0 0 0 1 1 102.86 102.86 2 0.0034722 106792 QUIQUE_C1218_190116_001 84.227 66.987 39259000 22694000 0 0 0 0 16565000 0 0 0 0 0 0 0 18041 4544 16950 159392;159393 203347;203348;203349;203350 203348 4 GVQLQTHPNVDK Unmodified 1334.6943 0.69426293 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 20.894 20.894 2;3 0.00038346 13508 QUIQUE_C1403_190116_001 113.44 82.371 114670000 34005000 17144000 22821000 22904000 0 0 0 0 0 17792000 0 0 0 18042 2506 16951 159394;159395;159396;159397;159398;159399 203351;203352;203353;203354;203355;203356 203355 6 GVQLQTHPNVDKK Unmodified 1462.7892 0.78922595 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 1 2 1 2 1 1 14.576 14.576 2;3 8.0545E-05 6835 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.858 63.891 1891900000 115010000 90696000 167580000 112880000 206200000 135800000 168380000 116130000 178910000 38905000 272370000 117790000 171220000 18043 2506 16952 159400;159401;159402;159403;159404;159405;159406;159407;159408;159409;159410;159411;159412;159413;159414;159415;159416;159417 203357;203358;203359;203360;203361;203362;203363;203364;203365;203366;203367;203368;203369;203370;203371;203372;203373;203374 203368 18 GVQPLLDAVLEYLPNPSEVQNYAILNK Unmodified 2996.5859 0.58588827 3932 Q96RP9;C9IZ01;F8WAU4 GFM1 Elongation factor G, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 173.53 173.53 3 1.8691E-05 177271 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.141 46.564 84330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22792000 30040000 31498000 18044 3932 16953 159418;159419;159420 203375;203376;203377 203376 3 GVQVETISPGDGR Unmodified 1313.6575 0.65754307 2773 P62942;A0A087WZM5;Q1JUQ3;A0A087WTS4;A0A087WV48 FKBP1A;FKBP12-Exin Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 44.341 44.341 2 0.00013049 39880 QUIQUE_DMIX4_190116_001 129.82 98.59 573850000 0 0 0 0 0 196460000 188660000 0 0 0 0 188730000 0 18045 2773 16954 159421;159422;159423;159424;159425;159426;159427;159428;159429;159430;159431;159432 203378;203379;203380;203381;203382;203383;203384;203385;203386;203387;203388;203389 203387 11 GVQVLPR Unmodified 767.46537 0.46537261 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;H0YJ30 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 29.003 29.003 2 0.026664 23488 QUIQUE_C1277_190116_001 93.593 45.419 169450000 0 58450000 0 0 0 0 0 0 54315000 0 0 56688000 0 18046 998 16955 159433;159434;159435 203390;203391;203392 203390 3 GVQWMELVK Oxidation (M) 1104.5638 0.56376603 2918 Q08357 SLC20A2 Sodium-dependent phosphate transporter 2 yes yes 0 1 0 1 19.801 19.801 2 0.036288 12594 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.122 11.715 51318000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51318000 0 0 0 18047 2918 16956 159436 203393 203393 1 GVQYLNEIK Unmodified 1062.571 0.5709599 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.586 57.586 2 0.00073327 56669 QUIQUE_C1576_190116_001 110.31 87.381 3197400000 313490000 305120000 389670000 425620000 294590000 380790000 278220000 0 117520000 155570000 244430000 136310000 156080000 18048 2058 16957 159437;159438;159439;159440;159441;159442;159443;159444;159445;159446;159447;159448 203394;203395;203396;203397;203398;203399;203400;203401;203402;203403;203404;203405;203406;203407;203408;203409 203402 13 GVQYLNEIKDSVVAGFQWATK Unmodified 2352.2114 0.21139634 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 3 2 1 2 2 1 155.84 155.84 2;3 2.9013E-98 160483 QUIQUE_DMIX3_190116_001 233.52 213.14 1725400000 18803000 77836000 79754000 92008000 122260000 38225000 0 338510000 293540000 15124000 311000000 208570000 129780000 18049 2058 16958 159449;159450;159451;159452;159453;159454;159455;159456;159457;159458;159459;159460;159461;159462;159463;159464;159465;159466 203410;203411;203412;203413;203414;203415;203416;203417;203418;203419;203420;203421;203422;203423;203424;203425;203426;203427;203428;203429;203430;203431;203432;203433 203423 22 GVRPVSFSDWEK Unmodified 1405.699 0.69901396 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 65.695 65.695 3 0.062427 65843 QUIQUE_C1576_190116_001 25.908 12.474 25382000 0 0 0 0 0 0 25382000 0 0 0 0 0 0 18050 2198 16959 159467 203434 203434 1 GVRPVSFSDWEKLDAEEVAR Unmodified 2289.139 0.13895968 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 1 100.51 100.51 4 8.8017E-06 103059 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.912 65.645 189570000 0 0 0 0 0 0 0 34097000 0 0 52696000 49168000 53608000 18051 2198 16960 159468;159469;159470;159471 203435;203436;203437;203438;203439 203435 5 GVSAIVYMVDAADQEK Unmodified 1694.8185 0.81853675 3808 Q96BM9;A0A087X2J2 ARL8A ADP-ribosylation factor-like protein 8A yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 126.56 126.56 3 8.7684E-07 129453 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.387 73.554 243820000 31668000 43938000 0 33547000 34562000 0 34462000 17388000 0 0 0 19544000 28710000 18052 3808 16961 159472;159473;159474;159475;159476;159477;159478;159479;159480 203440;203441;203442;203443;203444;203445;203446;203447;203448;203449;203450;203451 203448 11 GVSAVVVGADR Unmodified 1028.5615 0.56145784 4039 Q9BV20 MRI1 Methylthioribose-1-phosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 1 36.104 36.104 2 0.012972 31674 QUIQUE_C1368_190116_001 59.931 39.649 88436000 0 0 38298000 0 0 0 0 0 50138000 0 0 0 0 18053 4039 16962 159481;159482 203452;203453 203452 1 GVSCQFGPDVTK Unmodified 1293.6023 0.60233638 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 1 1 1 48.423 48.423 2 0.00082587 46211 QUIQUE_C1218_190116_001 87.298 64.558 379590000 133720000 159130000 0 0 0 0 0 86735000 0 0 0 0 0 18054 1148 16963 159483;159484;159485 203454;203455;203456 203454 2 GVSCSEVTASSLIK Unmodified 1436.7181 0.71809442 2382 P35612;C9JTM0;C9J080;A0A1C7CYY0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.568 65.568 2 0.00019577 65509 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.55 99.875 3913100000 374660000 437990000 387900000 317600000 389380000 335240000 550750000 0 124360000 90179000 275320000 229110000 400610000 18055 2382 16964 159486;159487;159488;159489;159490;159491;159492;159493;159494;159495;159496;159497 203457;203458;203459;203460;203461;203462;203463;203464;203465;203466;203467;203468;203469;203470 203464 13 GVSEHDFAYQDPK Unmodified 1491.663 0.66302238 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 37.227 37.227 2;3 1.5994E-23 32988 QUIQUE_C1277_190116_001 172.61 142.36 1117200000 79653000 76385000 57207000 97751000 101410000 65091000 122510000 88312000 80517000 61610000 96928000 81569000 108290000 18056 1510 16965 159498;159499;159500;159501;159502;159503;159504;159505;159506;159507;159508;159509;159510;159511;159512;159513;159514;159515;159516;159517;159518;159519;159520;159521;159522;159523 203471;203472;203473;203474;203475;203476;203477;203478;203479;203480;203481;203482;203483;203484;203485;203486;203487;203488;203489;203490;203491;203492;203493;203494;203495;203496;203497;203498 203475 27 GVSGDRDENSFSLNSSISSSAR Unmodified 2271.0363 0.036345105 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.373 62.373 3 2.0081E-17 61393 QUIQUE_C1277_190116_001 108.96 87.605 538650000 47245000 0 37765000 105540000 0 41104000 0 86340000 51265000 33071000 51017000 34613000 50690000 18057 2009 16966 159524;159525;159526;159527;159528;159529;159530;159531;159532;159533;159534 203499;203500;203501;203502;203503;203504;203505;203506;203507;203508;203509;203510 203500 12 GVSPEPIHLK Unmodified 1075.6026 0.60259438 1108;1404 G8JLD5;F8VUJ9;O00429;B4DPZ9;F8W1W3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 30.979 30.979 2;3 0.0060448 25211 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.292 38.656 2144900000 127520000 339520000 149970000 122890000 149310000 0 177830000 180420000 267590000 86554000 175750000 175220000 192340000 18058 1108;1404 16967 159535;159536;159537;159538;159539;159540;159541;159542;159543;159544;159545;159546;159547;159548;159549 203511;203512;203513;203514;203515;203516;203517;203518;203519;203520;203521;203522;203523;203524;203525;203526 203524 13 GVSPNYPR Unmodified 888.44537 0.44536545 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 20.537 20.537 2 0.039586 13680 QUIQUE_C1438_190116_001 60.799 37.908 51854000 0 0 0 0 51854000 0 0 0 0 0 0 0 0 18059 2225 16968 159550 203527 203527 1 GVSQMPLR Unmodified 886.46947 0.46947171 2339 P31939;C9JLK0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 29.663 29.663 2 0.022208 23970 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.415 18.974 135160000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28768000 106390000 0 0 18060 2339 16969 159551;159552;159553 203528;203529;203530 203529 3 GVSSQETAGIGASAHLVNFK Unmodified 1972.0014 0.0014035686 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 76.007 76.007 2;3 2.1427E-06 75883 QUIQUE_C1403_190116_001 92.063 79.083 107290000 0 0 0 26839000 0 0 0 0 0 57398000 23052000 0 0 18061 2465 16970 159554;159555;159556 203531;203532;203533 203531 2 GVSTFMAEMLETASILR Unmodified 1854.922 0.92195596 443 A0A2R8YFH0;E9PHA6;A0A2R8Y6P0;A0A2R8YG02;P43246;A0A2R8Y713 MSH2 DNA mismatch repair protein Msh2 yes no 0 0 0 1 169.91 169.91 2 0.056231 172612 QUIQUE_C1403_190116_001 50.207 40.42 6052700 0 0 0 6052700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18062 443 16971 159557 203534 203534 1 GVSVGPILSSSASDIFCDNENGPNFLFHNR Unmodified 3249.5149 0.51492494 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79;Q5T4F6 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 0 1 149.15 149.15 3 0.0095265 154925 QUIQUE_C1368_190116_001 29.341 23.854 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18063 218 16972 159558 203535 203535 1 GVTDTLAQIR Unmodified 1072.5877 0.58767259 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 69.456 69.456 2 0.017969 70625 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.709 58.838 22307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22307000 0 0 18064 103 16973 159559 203536 203536 0 GVTEAIQNFSFR Unmodified 1367.6834 0.68336389 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 106.04 106.04 2 1.6181E-09 109258 QUIQUE_C1403_190116_001 151.83 123.1 128750000 0 0 0 35894000 0 0 0 0 46454000 0 0 0 46406000 18065 310;830 16974 159560;159561;159562 203537;203538;203539 203537 2 GVTECYECHPKPTQR Unmodified 1860.8247 0.82470153 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 17.714 17.714 3;4 9.2452E-05 10236 QUIQUE_C1277_190116_001 83.633 78.424 439950000 47665000 39532000 48843000 47716000 73000000 19149000 0 0 29234000 0 64952000 18981000 50880000 18066 4408 16975 159563;159564;159565;159566;159567;159568;159569;159570;159571;159572;159573 203540;203541;203542;203543;203544;203545;203546;203547;203548;203549;203550;203551 203542 12 GVTFNVTTVDTK Unmodified 1280.6612 0.66123147 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.866 67.866 2 0.00020546 68039 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.4 96.955 1461300000 97829000 101580000 164970000 152690000 113820000 97677000 149310000 108770000 120430000 115730000 131110000 0 107360000 18067 1395 16976 159574;159575;159576;159577;159578;159579;159580;159581;159582;159583;159584;159585 203552;203553;203554;203555;203556;203557;203558;203559;203560;203561;203562;203563;203564 203563 13 GVTHNIALLR Unmodified 1092.6404 0.64037687 1881 P05165;A0A1B0GU58;H0Y5U0;Q5JTW6 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.136 38.136 3 0.00087196 33885 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.898 66.378 510390000 39192000 54808000 65514000 41460000 56406000 0 0 46918000 59564000 22260000 67197000 0 57066000 18068 1881 16977 159586;159587;159588;159589;159590;159591;159592;159593;159594;159595 203565;203566;203567;203568;203569;203570;203571;203572;203573;203574;203575 203572 9 GVTIASGGVLPNIHPELLAK Unmodified 1985.131 0.13096118 1626 O75367;D6RCF2 H2AFY Core histone macro-H2A.1;Histone H2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.72 111.72 3 4.4398E-06 116348 QUIQUE_C1576_190116_001 77.39 74.053 695620000 81223000 58777000 0 72557000 0 0 87472000 67572000 104640000 33940000 74406000 70050000 44979000 18069 1626 16978 159596;159597;159598;159599;159600;159601;159602;159603;159604;159605 203576;203577;203578;203579;203580;203581;203582;203583;203584;203585;203586 203579 11 GVTIIGPATVGGIKPGCFK Unmodified 1871.0339 0.033889671 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 93.593 93.593 2;3 0.012611 96891 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.068 32.904 406750000 34873000 0 0 0 105330000 0 0 0 0 0 145830000 0 120720000 18070 2623 16979 159606;159607;159608;159609 203587;203588;203589;203590 203589 4 GVTIPYRPKPSSSPVIFAGGQDR Unmodified 2428.2863 0.28629262 3131 Q15366;H3BSS4 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 73.086 73.086 3 5.7217E-07 73968 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.975 71.529 412750000 0 0 0 0 0 0 0 112380000 60686000 0 92746000 71200000 75732000 18071 3131 16980 159610;159611;159612;159613;159614 203591;203592;203593;203594;203595 203593 5 GVTLGFR Unmodified 748.42317 0.42317345 2353 P32969;D6RAN4;A0A2R8Y5Y7;H0Y9V9;E7ESE0 RPL9 60S ribosomal protein L9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 50.391 50.391 2 0.021446 48430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.94 62.226 267430000 0 52429000 0 0 0 0 0 52753000 0 24295000 70494000 0 67461000 18072 2353 16981 159615;159616;159617;159618;159619 203596;203597;203598;203599;203600;203601 203597 6 GVTQYYAYVTER Unmodified 1448.6936 0.69359423 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.773 87.773 2 5.2304E-07 89592 QUIQUE_C1368_190116_001 143.96 119.93 1144600000 110380000 124110000 127230000 0 126760000 103580000 0 130750000 122300000 48541000 133770000 117210000 0 18073 2249 16982 159620;159621;159622;159623;159624;159625;159626;159627;159628;159629 203602;203603;203604;203605;203606;203607;203608;203609;203610;203611;203612 203605 11 GVTSEEFDK Unmodified 1010.4557 0.45565537 1592 O60784 TOM1 Target of Myb protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 26.106 26.106 2 0.013154 19968 QUIQUE_C1403_190116_001 70.332 49.707 96180000 0 0 31302000 24149000 0 40728000 0 0 0 0 0 0 0 18074 1592 16983 159630;159631;159632 203613;203614;203615 203614 3 GVTSEEFDKFLEER Unmodified 1684.7944 0.79443049 1592 O60784 TOM1 Target of Myb protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 99.324 99.324 2;3 0.00018528 102250 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.13 89.78 307140000 0 0 27912000 36318000 33175000 0 0 43684000 70692000 0 49148000 46216000 0 18075 1592 16984 159633;159634;159635;159636;159637;159638;159639;159640;159641;159642 203616;203617;203618;203619;203620;203621;203622;203623;203624;203625;203626;203627;203628;203629 203624 14 GVTSILPVLR Unmodified 1053.6546 0.65462995 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 115.04 115.04 2 0.017254 120442 QUIQUE_C1218_190116_001 61.962 49.435 132270000 27858000 0 0 40394000 30301000 33717000 0 0 0 0 0 0 0 18076 3740 16985 159643;159644;159645;159646 203630;203631;203632;203633 203630 4 GVTSVSQIFHSPDLAIR Unmodified 1825.9686 0.96864688 1879 P05155;H9KV48;E9PGN7 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.9 104.9 2;3;4 4.167E-05 108514 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.616 80.241 1545100000 241790000 93362000 186750000 82069000 219420000 57255000 87129000 90261000 71094000 62959000 167280000 52423000 133350000 18077 1879 16986 159647;159648;159649;159650;159651;159652;159653;159654;159655;159656;159657;159658;159659;159660;159661 203634;203635;203636;203637;203638;203639;203640;203641;203642;203643;203644;203645;203646;203647;203648;203649 203644 9 GVTVGEGVR Unmodified 872.47158 0.4715802 3880 Q96IJ6;A0A087WUI8;A0A0U1RRC2 GMPPA Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 21.056 21.056 2 0.011056 14577 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.26 26.834 676800000 0 0 0 0 161960000 0 209970000 47342000 0 0 173990000 0 83535000 18078 3880 16987 159662;159663;159664;159665;159666 203650;203651;203652;203653;203654 203652 5 GVVDSDDLPLNVSR Unmodified 1484.7471 0.74708636 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.601 89.601 2 7.3818E-14 92767 QUIQUE_C1218_190116_001 167.6 144.17 8937600000 724370000 788330000 729560000 861950000 801610000 768100000 735230000 452210000 604150000 330490000 844820000 646740000 650030000 18079 2079 16988 159667;159668;159669;159670;159671;159672;159673;159674;159675;159676;159677;159678;159679 203655;203656;203657;203658;203659;203660;203661;203662;203663;203664;203665;203666;203667;203668;203669;203670;203671;203672;203673 203656 19 GVVDSEDLPLNISR Unmodified 1512.7784 0.77838649 1931;1938 P08238;P07900 HSP90AB1;HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-beta;Heat shock protein HSP 90-alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.653 99.653 2 1.8341E-22 102223 QUIQUE_C1277_190116_001 190.53 0 55181000000 4771200000 4511700000 3338000000 4485000000 4359800000 5039100000 4511100000 4771700000 3975900000 2724300000 4730100000 3944900000 4018000000 18080 1938;1931 16989 159680;159681;159682;159683;159684;159685;159686;159687;159688;159689;159690;159691;159692 203674;203675;203676;203677;203678;203679;203680;203681;203682;203683;203684;203685;203686;203687;203688;203689;203690;203691;203692;203693 203675 20 GVVEVTHDLQK Unmodified 1223.651 0.65100113 2565 P50454;E9PKH2 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.572 32.572 2 0.00018402 27756 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.57 103.61 477610000 40591000 38384000 63123000 65188000 69698000 40851000 0 32769000 33894000 17020000 55651000 0 20436000 18081 2565 16990 159693;159694;159695;159696;159697;159698;159699;159700;159701;159702;159703;159704 203694;203695;203696;203697;203698;203699;203700;203701;203702;203703;203704;203705;203706;203707 203704 14 GVVFLYR Unmodified 852.48577 0.48577371 3862 Q96GW7;Q5T3I6;Q5T3I7 BCAN Brevican core protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.754 71.754 2 0.014053 69391 QUIQUE_DMIX4_190116_001 136.19 100.58 5972400000 422140000 369990000 638370000 436660000 389060000 362290000 521550000 341150000 537080000 213460000 641970000 566100000 532600000 18082 3862 16991 159705;159706;159707;159708;159709;159710;159711;159712;159713;159714;159715;159716;159717 203708;203709;203710;203711;203712;203713;203714;203715;203716;203717;203718;203719;203720;203721;203722;203723;203724;203725;203726;203727;203728;203729;203730;203731;203732;203733;203734;203735 203728 28 GVVFSVTTVDLK Unmodified 1263.7075 0.70745338 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.16 103.16 2 0.00055081 106379 QUIQUE_C1368_190116_001 107.24 82.107 1216500000 99659000 135280000 143550000 115020000 108350000 126960000 125260000 39004000 76959000 94856000 92974000 58609000 0 18083 4646 16992 159718;159719;159720;159721;159722;159723;159724;159725;159726;159727;159728;159729 203736;203737;203738;203739;203740;203741;203742;203743;203744;203745;203746;203747;203748;203749;203750 203739 14 GVVHVYTR Unmodified 929.5083 0.50830006 2854 Q01433;H0Y360 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 16.712 16.712 2 0.045132 8692 QUIQUE_C1277_190116_001 57.281 41.127 29503000 0 29503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18084 2854 16993 159730 203751 203751 1 GVVLFPWQAR Unmodified 1171.6502 0.65021327 4565 Q9Y2S7 POLDIP2 Polymerase delta-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 121.66 121.66 2 0.0071331 124994 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.616 51.845 36439000 0 0 0 0 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782.46504 0.46503826 1658 O75822;H0YLP3 EIF3J Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J yes no 0 0 0 1 1 27.015 27.015 2 0.053939 21161 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.65 23.541 118400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60668000 57735000 0 18088 1658 16997 159750;159751 203771;203772 203771 2 GVVPLAGTDGETTTQGLDGLSER Unmodified 2272.1183 0.11828382 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 7 7 9 7 6 7 6 7 6 8 7 8 6 107.82 107.82 2;3 3.7438E-87 112198 QUIQUE_DMIX1_190116_001 206.43 201.63 151500000000 13535000000 14496000000 14544000000 12113000000 10395000000 10412000000 10890000000 12122000000 11348000000 5265800000 12878000000 11296000000 12210000000 18089 1978 16998 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Unmodified 1121.5658 0.56581494 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 109.81 109.81 1;2 2.3017E-08 113886 QUIQUE_DMIX3_190116_001 201.39 164.69 36266000000 2190700000 2416600000 2395700000 2894400000 1747800000 2142100000 2725800000 3408800000 6175400000 1735800000 2502400000 2679800000 3250800000 18095 2661 17004 159944;159945;159946;159947;159948;159949;159950;159951;159952;159953;159954;159955;159956;159957;159958 204037;204038;204039;204040;204041;204042;204043;204044;204045;204046;204047;204048;204049;204050;204051;204052;204053;204054;204055;204056;204057;204058;204059;204060;204061;204062;204063;204064;204065;204066;204067;204068;204069;204070;204071;204072;204073;204074;204075;204076 204062 38 GVYIIGSSGFDSIPADLGVIYTR Unmodified 2399.2373 0.23727674 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 160.9 160.9 2;3 8.2521E-18 166856 QUIQUE_C1576_190116_001 149.44 134.76 902340000 55728000 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C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.768 35.768 2 0.00033265 31479 QUIQUE_DMIX3_190116_001 136.11 75.325 4133600000 0 0 488020000 368910000 0 370540000 511730000 331100000 420070000 199810000 539330000 423900000 480190000 18098 693;3205 17007 159992;159993;159994;159995;159996;159997;159998;159999;160000;160001 204114;204115;204116;204117;204118;204119;204120;204121;204122;204123;204124;204125;204126;204127 204121 13 GVYSSDVFDIFPGTYQTLEMFPR Unmodified 2668.2519 0.25194053 1784 P00450;H7C5R1;H7C5N5 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 169.49 169.49 2;3 4.1996E-23 176858 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.5 149.44 227740000 0 25207000 0 0 21145000 0 0 0 31648000 3919600 95748000 23446000 26630000 18099 1784 17008 160002;160003;160004;160005;160006;160007;160008;160009 204128;204129;204130;204131;204132;204133;204134;204135 204133 8 GVYSSDVFDIFPGTYQTLEMFPR Oxidation (M) 2684.2469 0.24685515 1784 P00450;H7C5R1;H7C5N5 CP Ceruloplasmin yes no 0 1 0 1 166.6 166.6 3 8.1247E-05 172877 QUIQUE_C1438_190116_001 57.142 53.247 55833000 0 0 0 0 55833000 0 0 0 0 0 0 0 0 18100 1784 17008 160010 204136 204136 991 0 GVYSTQVGFAGGYTSNPTYK Unmodified 2095.9851 0.9850848 4454 Q9UJ68;E5RIA9;E9PJ70;E5RJK1 MSRA Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase yes no 0 0 0 1 1 86.097 86.097 2 0.00019662 88248 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.812 77.803 65004000 0 0 29231000 0 0 0 0 0 35773000 0 0 0 0 18101 4454 17009 160011;160012 204137;204138 204138 2 GVYVLMSGLDLER Unmodified 1450.749 0.74900062 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YLC3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 129.87 129.87 2 0.0003774 126516 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.015 77.575 1209600000 95789000 125040000 105290000 70615000 91258000 81624000 83263000 72393000 124760000 32914000 159190000 97925000 69493000 18102 192 17010 160013;160014;160015;160016;160017;160018;160019;160020;160021;160022;160023;160024;160025;160026;160027;160028 204139;204140;204141;204142;204143;204144;204145;204146;204147;204148;204149;204150;204151;204152;204153;204154;204155;204156;204157;204158;204159;204160;204161;204162;204163;204164;204165;204166 204159 27 GWAAAVTFHPR Unmodified 1211.62 0.61997578 1477 O15067;H0YGH1 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.209 61.209 3 0.0037753 61540 QUIQUE_C1218_190116_001 68.536 58.164 301420000 0 33832000 0 102400000 0 0 29531000 0 31505000 11043000 31351000 30262000 31494000 18103 1477 17011 160029;160030;160031;160032;160033;160034;160035;160036;160037 204167;204168;204169;204170;204171;204172;204173;204174;204175 204167 7 GWAEDVAGMAYALR Unmodified 1508.7082 0.70819844 928 E9PHB5 CTNND2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 148.34 148.34 2;3 0.0011036 153252 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.456 80.431 144290000 0 6591000 0 7774500 14336000 0 0 14982000 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cluster assembly factor NUBP2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.5 107.5 2 0.0023637 111015 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.114 71.401 248560000 0 0 33240000 35494000 37203000 24138000 32086000 0 33234000 0 31549000 21619000 0 18106 4637 17014 160066;160067;160068;160069;160070;160071;160072;160073;160074 204206;204207;204208;204209;204210;204211;204212;204213;204214 204212 9 GWDDLFNK Unmodified 993.4556 0.45559579 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 106.52 106.52 2 0.0076983 110886 QUIQUE_C1576_190116_001 97.075 71.248 491590000 0 0 81894000 0 0 0 55810000 102200000 105580000 47665000 0 98443000 0 18107 3053 17015 160075;160076;160077;160078;160079;160080 204215;204216;204217;204218;204219;204220;204221 204217 7 GWDEALLTMSK Unmodified 1249.6013 0.60127375 2846 Q00688 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.19 114.19 2 0.00044625 117542 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.42 82.338 484370000 72755000 0 0 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204236;204237;204238;204239;204240;204241;204242;204243;204244;204245;204246;204247;204248;204249;204250;204251;204252;204253;204254;204255;204256;204257;204258;204259;204260;204261;204262;204263;204264;204265;204266;204267;204268;204269;204270;204271;204272;204273;204274;204275 204268 40 GWDLTVK Unmodified 817.4334 0.43340378 1880 P05161 ISG15 Ubiquitin-like protein ISG15 yes yes 0 0 0 1 65.108 65.108 2 0.028495 63711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.191 75.264 82078000 0 0 0 0 0 0 0 82078000 0 0 0 0 0 18110 1880 17018 160114 204276 204276 1 GWDLVDAVTPGPQPTLEQLEEGGPRPLER Unmodified 3155.5887 0.58874181 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 1 1 1 145.77 145.77 3 3.9651E-15 148894 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.226 64.615 52660000 0 0 0 0 0 0 0 52660000 0 0 0 0 0 18111 3210 17019 160115;160116 204277;204278;204279 204279 3 GWDQGLLGMCEGEK Unmodified 1578.6807 0.68066306 2256 P26885;F5H0N4 FKBP2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP2;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 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0.70007659 1546 O43719 HTATSF1 HIV Tat-specific factor 1 yes yes 0 0 0 1 114.78 114.78 2 0.01324 120438 QUIQUE_C1438_190116_001 68.069 58.636 45640000 0 0 0 0 45640000 0 0 0 0 0 0 0 0 18114 1546 17022 160140 204311 204311 0 GWEEGVAQMSVGQR Unmodified 1532.7042 0.70417569 2773 P62942;Q5W0X3;Q1JUQ5 FKBP1A;FKBP12-Exip2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.739 86.739 2 4.3493E-22 89502 QUIQUE_C1218_190116_001 199.03 172.99 2888600000 283150000 307210000 249610000 193200000 235350000 186040000 227260000 160860000 207110000 61083000 278530000 222670000 276570000 18115 2773 17023 160141;160142;160143;160144;160145;160146;160147;160148;160149;160150;160151;160152;160153 204312;204313;204314;204315;204316;204317;204318;204319;204320;204321;204322;204323;204324;204325;204326;204327;204328;204329;204330;204331 204313 20 GWEEGVAQMSVGQR Oxidation (M) 1548.6991 0.69909031 2773 P62942;Q5W0X3;Q1JUQ5 FKBP1A;FKBP12-Exip2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 60.361 60.361 2 3.4965E-10 59395 QUIQUE_C1368_190116_001 132.32 117.06 711210000 58885000 120400000 131480000 38119000 77678000 54090000 109590000 38827000 36134000 0 0 46006000 0 18116 2773 17023 160154;160155;160156;160157;160158;160159;160160;160161;160162;160163;160164;160165 204332;204333;204334;204335;204336;204337;204338;204339;204340;204341;204342;204343;204344;204345;204346 204336 2207 14 GWEFMWNER Unmodified 1253.5288 0.52877751 2046 P12532 CKMT1A Creatine kinase U-type, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 122.42 122.42 2 0.00045846 125152 QUIQUE_C1563_190116_001 117.04 107.45 2510900000 220520000 223070000 202530000 212650000 137020000 155320000 233080000 212210000 0 41680000 331760000 300330000 240720000 18117 2046 17024 160166;160167;160168;160169;160170;160171;160172;160173;160174;160175;160176;160177;160178;160179;160180 204347;204348;204349;204350;204351;204352;204353;204354;204355;204356;204357;204358;204359;204360;204361;204362;204363;204364;204365;204366;204367;204368;204369;204370;204371;204372;204373;204374 204357 27 GWENHVEGQK Unmodified 1182.5418 0.54178503 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 19.247 19.247 2;3 2.2889E-11 11981 QUIQUE_DMIX7_190116_001 160.36 110.24 2085400000 30146000 88360000 164970000 93627000 69476000 79197000 141670000 352970000 207930000 0 241930000 302630000 312480000 18118 3053 17025 160181;160182;160183;160184;160185;160186;160187;160188;160189;160190;160191;160192;160193;160194;160195 204375;204376;204377;204378;204379;204380;204381;204382;204383;204384;204385;204386;204387;204388;204389 204387 14 GWEVVESDLYAMNFNPIISR Unmodified 2339.1256 0.1256178 620 B4DLR8;P15559;H3BRK3;H3BNV2 NQO1 NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 165.27 165.27 2;3 1.9868E-07 169318 QUIQUE_DMIX7_190116_001 126.63 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GWGVSVVVGVAASGEEIATRPFQLVTGR Unmodified 2841.5137 0.51372638 2028 P11766 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes yes 0 0 1 1 2 4 1 165.59 165.59 3 4.1335E-37 169794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.52 122.3 518800000 0 0 0 0 0 0 0 29022000 98092000 0 296880000 94804000 0 18122 2028 17028 160213;160214;160215;160216;160217;160218;160219;160220 204410;204411;204412;204413;204414;204415;204416;204417;204418 204411 8 GWHGYDNELMDMR Unmodified 1622.6606 0.66059632 3409 Q6UWR7 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes yes 0 0 0 1 1 85.443 85.443 2;3 0.022626 87690 QUIQUE_C1576_190116_001 50.786 44.683 61419000 0 0 0 40289000 0 0 21130000 0 0 0 0 0 0 18123 3409 17029 160221;160222 204419;204420 204420 2 GWHTILIVEK Unmodified 1194.6761 0.67609367 3678 Q8TD19 NEK9 Serine/threonine-protein kinase Nek9 yes yes 0 0 0 1 68.993 68.993 3 0.054046 65016 QUIQUE_DMIX4_190116_001 33.875 16.363 10442000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10442000 0 0 0 18124 3678 17030 160223 204421 204421 1 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1525 O43390;B4DT28 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.593 97.593 2 0.010978 100052 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.993 58.779 442090000 0 0 0 0 74927000 0 0 87738000 0 0 98627000 83643000 97158000 18156 1525 17060 160513;160514;160515;160516;160517;160518 204806;204807;204808;204809;204810;204811;204812;204813;204814;204815 204808 10 GYAFNHSADFETVR Unmodified 1612.727 0.72701962 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 62.388 62.388 2;3 1.8088E-17 61764 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.89 144.23 8779500000 608160000 673900000 656900000 854340000 533320000 563370000 786760000 733250000 650000000 297200000 866880000 744100000 811330000 18157 2715 17061 160519;160520;160521;160522;160523;160524;160525;160526;160527;160528;160529;160530;160531;160532;160533;160534;160535;160536;160537;160538;160539;160540;160541;160542;160543;160544 204816;204817;204818;204819;204820;204821;204822;204823;204824;204825;204826;204827;204828;204829;204830;204831;204832;204833;204834;204835;204836;204837;204838;204839;204840;204841;204842;204843;204844;204845;204846;204847;204848;204849;204850;204851 204837 36 GYAFVQYSNER Unmodified 1332.6099 0.6098646 3287 Q5QPL9;Q9UKM9;Q5QPM2;Q5QPM1 RALY RNA-binding protein Raly yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.162 64.162 2 6.5546E-05 63935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.79 124.96 455530000 0 0 0 0 59197000 0 60020000 52444000 68442000 0 82204000 72508000 60715000 18158 3287 17062 160545;160546;160547;160548;160549;160550;160551;160552;160553;160554;160555;160556 204852;204853;204854;204855;204856;204857;204858;204859;204860;204861;204862;204863 204858 12 GYAFVTFCTK Unmodified 1192.5587 0.55868065 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 89.479 89.479 2 0.0030195 91448 QUIQUE_C1368_190116_001 86.67 70.467 147410000 0 23894000 49101000 0 30714000 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160565;160566;160567;160568;160569 204873;204874;204875;204876;204877 204876 3 GYAVNVFDIQQGFDNPQVR Unmodified 2166.0494 0.049416394 3153 Q15738;C9JDR0 NSDHL Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 1 134.25 134.25 2 4.4714E-28 138536 QUIQUE_DMIX7_190116_001 182.07 169.3 27999000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27999000 0 18162 3153 17066 160570;160571 204878;204879 204879 2 GYAWSGGGR Unmodified 909.40931 0.4093143 2591 P51687 SUOX Sulfite oxidase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 32.148 32.148 2 0.02075 26920 QUIQUE_C1403_190116_001 62.659 32.046 73144000 0 0 0 21784000 0 26972000 0 0 0 0 0 24388000 0 18163 2591 17067 160572;160573;160574 204880;204881;204882 204880 3 GYAYTFITEDQAR Unmodified 1533.71 0.70997257 234 A0A0C4DG89;Q7L014 DDX46 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 yes no 0 0 0 1 1 90.099 90.099 2 0.027884 92933 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.211 42.688 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18164 234 17068 160575;160576 204883;204884 204884 2 GYAYVEFENPDEAEK Unmodified 1759.7577 0.75771063 1180 H3BV80;H3BMS0;H3BMM9;H3BTC0;Q15287;H3BPG5 RNPS1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.121 87.121 2 7.0515E-19 88095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.91 142.42 408170000 30278000 0 0 0 63058000 34546000 24109000 45108000 54202000 16370000 42237000 43159000 55100000 18165 1180 17069 160577;160578;160579;160580;160581;160582;160583;160584;160585;160586 204885;204886;204887;204888;204889;204890;204891;204892;204893;204894 204889 10 GYDAPLCNLLLFK Unmodified 1522.7854 0.78538612 1577 O60488;H0Y9A0 ACSL4 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.28 147.28 2 0.0033735 152525 QUIQUE_C1368_190116_001 71.614 56.923 149050000 27586000 0 30546000 0 0 0 35038000 0 22060000 12899000 0 0 20918000 18166 1577 17070 160587;160588;160589;160590;160591;160592 204895;204896;204897;204898;204899;204900 204896 5 GYDCSDMSCPNDCHQHGR Oxidation (M) 2210.7623 0.76225398 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 1 0 1 12.581 12.581 4 0.00011123 4690 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.12 74.099 7538800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7538800 0 18167 2233 17071 160593 204901 204901 1592 1 GYDDRDYYSR Unmodified 1308.5371 0.53709359 2775 P62995;H7BXF3;H7C2L4 TRA2B Transformer-2 protein homolog beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 28.326 28.326 3 0.0097819 22966 QUIQUE_C1438_190116_001 55.401 52.083 457060000 0 0 0 0 49373000 0 0 102190000 67797000 0 135000000 0 102700000 18168 2775 17072 160594;160595;160596;160597;160598 204902;204903;204904;204905;204906 204902 3 GYDELVPHQISVVSEER Unmodified 1955.9589 0.95887005 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 95.858 95.858 2;3 0.00025782 96554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.912 63.036 15561000 15561000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18169 2377 17073 160599;160600;160601 204907;204908;204909 204909 3 GYDFAAVLEWFAER Unmodified 1672.7886 0.78855725 4352;4175 Q9NZN3;Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4;C9JDQ8 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Unmodified 1448.7664 0.76636524 759 C9JZR2;O60716 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.54 121.54 2 3.7127E-05 127072 QUIQUE_C1438_190116_001 127.76 81.303 1245400000 103270000 76877000 98864000 107230000 101280000 68388000 110200000 95555000 106990000 48910000 116590000 101900000 109380000 18180 759 17084 160678;160679;160680;160681;160682;160683;160684;160685;160686;160687;160688;160689;160690 205013;205014;205015;205016;205017;205018;205019;205020;205021;205022;205023;205024;205025;205026;205027 205017 14 GYENGNFVGPTIISNVKPNMTCYK Unmodified 2702.2833 0.28325743 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.09 105.09 3 1.2785E-12 108264 QUIQUE_C1277_190116_001 100.79 93.509 559300000 0 80127000 55979000 51872000 64001000 58322000 61810000 42239000 0 0 0 59195000 85758000 18181 2870 17085 160691;160692;160693;160694;160695;160696;160697;160698;160699 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no 0 0 0 1 1 1 65.146 65.146 2 0.0066443 65219 QUIQUE_C1576_190116_001 139.31 134.9 516850000 146890000 0 0 0 0 0 222000000 0 0 0 147950000 0 0 18187 3117;13 17090 160724;160725;160726 205064;205065;205066 205065 1 GYFDEEMNR Oxidation (M) 1175.4553 0.45533779 3117;13 Q15149;H0YDN1;A0A075B730;P58107 PLEC;EPPK1 Plectin;Epiplakin no no 0 1 0 1 44.949 44.949 2 0.0051085 39665 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.296 68.007 68781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68781000 0 0 0 18188 3117;13 17090 160727 205067 205067 9 1 GYFEDRRPSANCDPFSVTEALIR Unmodified 2699.2762 0.27619822 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 2 1 119.58 119.58 4 0.00086486 122044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.953 37.507 67323000 0 0 0 0 0 0 0 67323000 0 0 0 0 0 18189 2086 17091 160728 205068 205068 1 GYFEYIEENK Unmodified 1290.5768 0.57683314 2849 Q00839;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PRI6 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.358 89.358 2 0.0026357 92877 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205117;205118;205119;205120;205121;205122;205123;205124;205125;205126;205127;205128;205129;205130;205131;205132;205133;205134;205135;205136;205137;205138;205139;205140;205141;205142;205143;205144;205145;205146;205147;205148;205149;205150;205151;205152;205153 205126 34 GYFIQPTVFGDVQDGMTIAKEEIFGPVMQILK Oxidation (M) 3586.8092 0.80916462 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 169.77 169.77 3 7.5621E-06 174246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.888 44.832 37811000 0 0 0 0 0 0 0 0 37811000 0 0 0 0 18196 1875 17097 160795 205154 205154 1096;1097 1 GYFSEEMNR Unmodified 1131.4655 0.46550855 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.686 54.686 2 9.6027E-05 53302 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.73 153.73 3149700000 241620000 249790000 401610000 120200000 206790000 84991000 314200000 284210000 336740000 124130000 482110000 303320000 0 18197 3117 17098 160796;160797;160798;160799;160800;160801;160802;160803;160804;160805;160806;160807 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205203;205204;205205;205206;205207;205208;205209;205210;205211;205212;205213;205214;205215;205216;205217;205218;205219;205220;205221;205222;205223;205224;205225;205226;205227;205228 205203 23 GYGFGMVK Unmodified 857.41056 0.41055985 4545;832 E5RFP6;E5RFL1;Q9Y277;E5RJN6;E5RHZ6;E5RHE1 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 no no 0 0 0 1 58.914 58.914 2 0.040382 56699 QUIQUE_C1563_190116_001 60.294 50.109 230290000 0 0 0 0 0 230290000 0 0 0 0 0 0 0 18205 832;4545 17104 160860 205229;205230 205229 2 GYGFIEYEK Unmodified 1104.5128 0.51277632 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;H0YCP8 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.041 73.041 2 0.0063921 73981 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.498 68.025 817310000 74765000 74902000 85600000 0 60881000 65074000 69859000 0 89135000 37531000 90478000 79270000 89812000 18206 295 17105 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3603 17109 160911 205282;205283 205282 2 GYGHYFDLCLVNSNLER Unmodified 2055.9473 0.94725951 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;Q14168 MPP2 MAGUK p55 subfamily member 2 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 114.1 114.1 2;3 6.2093E-17 117801 QUIQUE_C1277_190116_001 161.63 147.95 750600000 102090000 134820000 123710000 29203000 55114000 0 97150000 74892000 32156000 30273000 42697000 0 28490000 18211 159 17110 160912;160913;160914;160915;160916;160917;160918;160919;160920;160921;160922;160923;160924 205284;205285;205286;205287;205288;205289;205290;205291;205292;205293;205294;205295;205296 205286 9 GYGLCHGSAGNAYAFLTLYNLTQDMK Unmodified 2864.3262 0.32618488 1555 O43813;H7C2E3 LANCL1 LanC-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.82 150.82 3 5.0637E-18 156481 QUIQUE_C1368_190116_001 100.44 94.99 1620000000 0 171930000 125890000 90193000 79517000 69148000 151700000 151830000 153160000 0 184680000 218510000 223420000 18212 1555 17111 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Unmodified 2576.1972 0.19720284 4150 Q9H2U2;H0Y9D8;D6RGV9;D6RGI1 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 108.66 108.66 3 0.00018647 112195 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.69 56.92 218880000 0 0 0 0 0 0 0 52103000 49646000 0 60001000 57130000 0 18231 4150 17130 161086;161087;161088;161089 205500;205501;205502;205503;205504;205505 205503 6 GYKPPDEGPSEYQTIPLNK Unmodified 2132.0426 0.042599681 3767 Q92905;E5RHF2 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 no no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 68.643 68.643 2;3 1.4648E-21 69527 QUIQUE_C1218_190116_001 136.24 114.01 2276200000 203240000 177800000 179040000 184430000 151210000 140580000 170920000 156320000 172110000 89560000 261250000 168120000 221610000 18232 3767 17131 161090;161091;161092;161093;161094;161095;161096;161097;161098;161099;161100;161101;161102;161103;161104;161105 205506;205507;205508;205509;205510;205511;205512;205513;205514;205515;205516;205517;205518;205519;205520;205521;205522;205523;205524 205507 18 GYLAAIK Unmodified 734.43268 0.4326755 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 0 1 39.386 39.386 2 0.062919 36363 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.033 18.722 337030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 337030000 0 0 18233 2530 17132 161106 205525 205525 1 GYLDDPTVPR Unmodified 1131.556 0.55603812 2024 P11413;E7EUI8 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 63.948 63.948 2 0.00032039 64209 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.89 96.859 382130000 0 0 0 0 0 0 160070000 0 0 0 222060000 0 0 18234 2024 17133 161107;161108 205526;205527 205527 2 GYLDKLEPSK Unmodified 1148.6077 0.60773933 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 50.365 50.365 2;3 8.5579E-62 48426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 230.06 166.64 12740000000 736990000 793710000 927780000 539660000 848500000 502250000 888600000 1119800000 1459400000 218950000 1805200000 1481100000 1417700000 18235 2243 17134 161109;161110;161111;161112;161113;161114;161115;161116;161117;161118;161119;161120;161121;161122;161123;161124;161125;161126;161127;161128;161129;161130;161131;161132;161133;161134;161135 205528;205529;205530;205531;205532;205533;205534;205535;205536;205537;205538;205539;205540;205541;205542;205543;205544;205545;205546;205547;205548;205549;205550;205551;205552;205553;205554;205555;205556;205557;205558;205559;205560;205561;205562;205563;205564;205565;205566;205567;205568;205569;205570;205571;205572 205555 45 GYLDPAVTR Unmodified 990.51345 0.51344502 3921 Q96PY5 FMNL2 Formin-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 50.063 50.063 2 0.061422 48037 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.574 28.792 35754000 0 0 0 0 0 0 0 0 35754000 0 0 0 0 18236 3921 17135 161136 205573 205573 1 GYLEELVR Unmodified 977.5182 0.51819605 3265 Q59EK9 RUNDC3A RUN domain-containing protein 3A yes yes 0 0 0 1 1 1 87.715 87.715 2 0.039651 88645 QUIQUE_C1563_190116_001 90.706 42.591 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18237 3265 17136 161137;161138;161139 205574;205575;205576 205575 3 GYLGPEQLPDCLK Unmodified 1488.7283 0.72826518 2431 P40926 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.369 97.369 2 1.5761E-12 99776 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.61 112.31 28447000000 2696300000 2680400000 2879400000 1938900000 2225600000 2065500000 2356000000 1710700000 1690500000 754370000 2297500000 2390200000 2761300000 18238 2431 17137 161140;161141;161142;161143;161144;161145;161146;161147;161148;161149;161150;161151;161152 205577;205578;205579;205580;205581;205582;205583;205584;205585;205586;205587;205588;205589;205590;205591;205592;205593;205594;205595;205596;205597;205598;205599;205600;205601;205602;205603 205593 27 GYLGVMPAYSAAEDALTTK Oxidation (M) 1972.9452 0.94519382 3088 Q14894;I3L325;I3L2W5;I3NI53 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 114.15 114.15 2 6.4456E-55 118432 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.99 160.49 3120700000 157330000 213290000 210020000 214520000 202840000 161330000 160060000 228290000 403610000 135080000 432320000 323020000 279020000 18239 3088 17138 161153;161154;161155;161156;161157;161158;161159;161160;161161;161162;161163;161164;161165;161166;161167;161168;161169;161170;161171;161172;161173;161174;161175;161176;161177;161178;161179 205604;205605;205606;205607;205608;205609;205610;205611;205612;205613;205614;205615;205616;205617;205618;205619;205620;205621;205622;205623;205624;205625;205626;205627;205628;205629;205630;205631;205632;205633;205634;205635;205636;205637;205638 205626 2530 34 GYLGVMPAYSAAEDALTTK Unmodified 1956.9503 0.9502792 3088 Q14894;I3L325;I3L2W5;I3NI53 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 1 2 1 1 3 2 1 1 1 1 1 1 1 131.2 131.2 2;3 2.0689E-28 135359 QUIQUE_C1403_190116_001 169.62 156.66 6182400000 412900000 531830000 425770000 612590000 481510000 416580000 439490000 401570000 534520000 107920000 844650000 516310000 456770000 18240 3088 17138 161180;161181;161182;161183;161184;161185;161186;161187;161188;161189;161190;161191;161192;161193;161194;161195;161196 205639;205640;205641;205642;205643;205644;205645;205646;205647;205648;205649;205650;205651;205652;205653;205654;205655;205656;205657;205658;205659;205660;205661;205662;205663;205664;205665 205645 27 GYLHFLEPHTSGWAR Unmodified 1769.8638 0.86378788 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 82.843 82.843 4 0.0014357 85003 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.864 39.294 107720000 0 0 20119000 0 0 0 0 16267000 0 0 26244000 15874000 29220000 18241 497 17139 161197;161198;161199;161200;161201 205666;205667;205668;205669;205670;205671 205668 6 GYLISGSSYAR Unmodified 1172.5826 0.58258722 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.805 56.805 2 0.00045793 55628 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.52 77.302 2614900000 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0 44441000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18245 4631 17143 161215;161216;161217;161218;161219;161220 205686;205687;205688;205689;205690;205691 205686 6 GYLVTQDELDQTLEEFK Unmodified 2026.9735 0.97351706 53 A0A087WVZ9;P19388;A0A0A0MQR7 POLR2E DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 150.84 150.84 2 6.8423E-75 154928 QUIQUE_C1277_190116_001 198.57 178.93 192040000 36312000 39725000 0 44209000 0 31224000 0 30399000 0 10171000 0 0 0 18246 53 17144 161221;161222;161223;161224;161225;161226 205692;205693;205694;205695;205696;205697;205698 205693 5 GYMDLMPFINK Unmodified 1327.6305 0.63046539 1526 O43396;K7ER96;K7EML9 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.79 138.79 2 0.0004729 141943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.93 87.139 465260000 0 0 0 0 60417000 0 0 62230000 61334000 14957000 97783000 67728000 100810000 18247 1526 17145 161227;161228;161229;161230;161231;161232;161233 205699;205700;205701;205702;205703;205704;205705 205700 5 GYMDLMPFINK Oxidation (M) 1343.6254 0.62538001 1526 O43396;K7ER96;K7EML9 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 1 0 1 117.65 117.65 2 0.043767 122147 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.338 53.425 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18248 1526 17145 161234 205706 205706 1 GYMVSCLVDHR Unmodified 1335.6064 0.6063759 3765 Q92896;H3BM42;H3BQU9 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes no 0 0 0 1 1 59.816 59.816 2 0.012341 58490 QUIQUE_C1403_190116_001 60.518 43.681 26925000 0 0 0 26925000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18249 3765 17146 161235;161236 205707;205708;205709 205708 3 GYNAQEYYDR Unmodified 1277.5313 0.53127993 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.417 41.417 2 4.5026E-14 38614 QUIQUE_C1576_190116_001 172.21 163.87 1600500000 82437000 131990000 105460000 178770000 114200000 147410000 246920000 0 172290000 101430000 81012000 114660000 123930000 18250 2017 17147 161237;161238;161239;161240;161241;161242;161243;161244;161245;161246;161247;161248;161249 205710;205711;205712;205713;205714;205715;205716;205717;205718;205719;205720;205721;205722;205723;205724;205725;205726 205719 17 GYNAQEYYDRIPELR Unmodified 1885.8959 0.89587586 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 92.362 92.362 2;3 1.6226E-17 95023 QUIQUE_DMIX3_190116_001 176.42 146.42 1765100000 0 53809000 56975000 64068000 80223000 37603000 108480000 220890000 430610000 0 208160000 285980000 218350000 18251 2017 17148 161250;161251;161252;161253;161254;161255;161256;161257;161258;161259;161260;161261;161262;161263;161264 205727;205728;205729;205730;205731;205732;205733;205734;205735;205736;205737;205738;205739;205740;205741;205742;205743;205744;205745;205746;205747;205748;205749;205750;205751 205742 25 GYNDDYYEESYFTTR Unmodified 1921.7643 0.76425257 2561 P50402;Q5HY57 EMD Emerin yes no 0 0 0 1 101.01 101.01 2 9.5933E-06 102573 QUIQUE_C1563_190116_001 103.75 97.31 28069000 0 0 0 0 0 28069000 0 0 0 0 0 0 0 18252 2561 17149 161265 205752 205752 1 GYNFEDLTDR Unmodified 1228.536 0.53603095 4182 Q9H7D7;H0Y9R3 WDR26 WD repeat-containing protein 26 yes no 0 0 0 1 1 1 1 85.627 85.627 2 0.02742 86335 QUIQUE_C1563_190116_001 76.679 53.966 64776000 0 0 0 0 0 18771000 18851000 0 0 0 0 0 27154000 18253 4182 17150 161266;161267;161268;161269 205753;205754;205755;205756 205754 2 GYNLLKPMGK Unmodified 1119.6111 0.61105057 3958 Q99536;K7ESA3;K7ENX2;K7EM19 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 49.297 49.297 2;3 0.0010371 47645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.749 77.423 2556300000 117580000 136700000 263740000 295850000 247960000 93083000 0 310780000 258110000 0 302480000 212410000 317670000 18254 3958 17151 161270;161271;161272;161273;161274;161275;161276;161277;161278;161279;161280;161281;161282;161283;161284;161285;161286;161287;161288 205757;205758;205759;205760;205761;205762;205763;205764;205765;205766;205767;205768;205769;205770;205771;205772;205773;205774;205775;205776;205777;205778 205770 20 GYNLLKPMGK Oxidation (M) 1135.606 0.6059652 3958 Q99536;K7ESA3;K7ENX2;K7EM19 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 1 1 1 31.137 31.137 3 0.038653 24818 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.276 40.99 29079000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29079000 0 0 0 18255 3958 17151 161289 205779 205779 1 GYNPGLLVHPDLAYLQAEGGGDR Unmodified 2411.187 0.18697251 2155 P19838;D6RH30 NFKB1 Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit;Nuclear factor NF-kappa-B p50 subunit yes no 0 0 0 1 1 118.66 118.66 3 0.0010123 121243 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.491 37.614 67484000 0 0 0 0 0 0 27287000 40197000 0 0 0 0 0 18256 2155 17152 161290;161291 205780;205781 205781 1 GYPGDEGGPGER Unmodified 1189.5 0.4999798 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 22.61 22.61 2 0.0083203 15445 QUIQUE_C1563_190116_001 81.338 71.75 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205791;205792;205793;205794;205795;205796;205797;205798;205799;205800;205801;205802;205803;205804;205805;205806;205807 205794 17 GYPHWPAR Unmodified 982.47733 0.47733428 2596;1637;0;3463 O75475;P51858;A0A024R216;Q9Y3E1;H3BPQ6;Q7Z4V5;M0R0J3 PSIP1;HDGF;HDGFRP3;HDGFRP2 PC4 and SFRS1-interacting protein;Hepatoma-derived growth factor;Hepatoma-derived growth factor-related protein 3;Hepatoma-derived growth factor-related protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.128 34.128 2 0.0050828 30035 QUIQUE_C1218_190116_001 106.76 75.472 1552000000 123970000 169350000 98852000 157690000 161830000 123470000 128240000 51760000 114320000 0 154920000 129160000 138420000 18260 1637;2596;0;3463 17156 161314;161315;161316;161317;161318;161319;161320;161321;161322;161323;161324;161325 205808;205809;205810;205811;205812;205813;205814;205815;205816;205817;205818;205819;205820;205821;205822;205823;205824;205825;205826;205827;205828;205829 205808 22 GYPPEDIFNLVGK Unmodified 1447.7347 0.73473076 4263 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205838;205839;205840;205841;205842;205843;205844;205845;205846;205847;205848;205849 205842 10 GYPTLLWFR Unmodified 1151.6128 0.61276513 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.92 135.92 2 0.0035378 140932 QUIQUE_C1368_190116_001 107.32 94.051 245690000 0 0 24643000 38523000 19097000 28995000 32198000 0 0 0 42704000 31423000 28111000 18264 3627 17160 161346;161347;161348;161349;161350;161351;161352;161353;161354;161355 205850;205851;205852;205853;205854;205855;205856;205857;205858;205859;205860 205853 11 GYQGDPSSALLELLDPEQNANFLDHYLDVPVDLSK Unmodified 3871.8792 0.87922933 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 172.93 172.93 3 8.1204E-22 180081 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.077 72.742 420150000 0 0 0 0 0 0 0 0 105120000 0 192290000 122750000 0 18265 1324 17161 161356;161357;161358 205861;205862;205863 205862 3 GYQINWWK Unmodified 1093.5345 0.53451481 92 A0A087X0M8;O00533;H7C0J0 CHL1 Neural cell adhesion molecule L1-like protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.689 98.689 2 0.0048159 102092 QUIQUE_C1368_190116_001 107.74 51.623 203590000 0 0 41350000 0 35356000 0 0 0 0 0 58830000 38591000 29459000 18266 92 17162 161359;161360;161361;161362;161363 205864;205865;205866;205867;205868;205869 205864 6 GYQPCDPQVIQDR Unmodified 1574.7147 0.71474038 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 1 53.865 53.865 2 0.012454 52529 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.043 42.137 63096000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40411000 22684000 0 18267 2021 17163 161364;161365 205870;205871 205870 2 GYQQDAYDGKDYIALNEDLR Unmodified 2346.0764 0.076419005 2312;2313 P30453;P30457;A0A140T8W8;A0A1W2PR61;A0A1W2PPF8;A0A140T8Y4;A0A0G2JPD3;P30450;P18462;P16190;P30456 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain no no 0 0 1 1 2 95.886 95.886 2;3 1.3059E-22 99759 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.78 133.9 218710000 46508000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 172200000 0 0 18268 2312;2313 17164 161366;161367;161368 205872;205873;205874 205874 3 GYQVTYVR Unmodified 984.50288 0.50288033 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 37.979 37.979 2 0.0036478 34076 QUIQUE_DMIX7_190116_001 128.48 102.66 167830000 0 0 0 0 0 0 0 37535000 0 0 47858000 31231000 51202000 18269 1998 17165 161369;161370;161371;161372;161373;161374;161375;161376 205875;205876;205877;205878;205879;205880;205881;205882;205883;205884 205883 10 GYSDRDGYGR Unmodified 1144.4897 0.48974946 2412 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BUY5 RBMX RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 15.211 15.211 3 0.011823 7125 QUIQUE_C1277_190116_001 61.593 51.797 15798000 0 15798000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18270 2412 17166 161377;161378 205885;205886 205886 2 GYSECIVTVGGEER Unmodified 1554.6984 0.69842161 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.352 65.352 2 2.2081E-17 64973 QUIQUE_C1277_190116_001 149.96 122.84 267580000 30343000 39148000 35602000 29289000 40371000 31392000 42205000 0 0 0 0 19225000 0 18271 4143 17167 161379;161380;161381;161382;161383;161384;161385;161386;161387 205887;205888;205889;205890;205891;205892;205893;205894;205895 205888 9 GYSFSLTTFSPSGK Unmodified 1477.7089 0.70890994 5 A0A024RA52;P25787;H3BT36 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.72 111.72 2 7.3463E-07 109673 QUIQUE_DMIX4_190116_001 156.58 130.46 1728500000 153180000 144570000 114920000 106280000 146420000 106100000 113870000 164180000 163470000 69028000 181700000 141990000 122810000 18272 5 17168 161388;161389;161390;161391;161392;161393;161394;161395;161396;161397;161398;161399;161400;161401 205896;205897;205898;205899;205900;205901;205902;205903;205904;205905;205906;205907;205908;205909;205910;205911;205912;205913;205914;205915;205916;205917;205918;205919;205920;205921;205922 205913 27 GYSFTTTAER Unmodified 1131.5197 0.51965261 2788;2696;447;458 A0A2R8Y793;P60709;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 0 4 4 4 6 4 5 3 5 4 3 6 5 4 40.671 40.671 1;2 6.799E-14 37826 QUIQUE_C1563_190116_001 169.57 143.63 326900000000 28097000000 26674000000 27427000000 22606000000 26082000000 23780000000 27156000000 27335000000 25715000000 13175000000 27122000000 27343000000 24391000000 18273 447;2696;2788;458 17169 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205923;205924;205925;205926;205927;205928;205929;205930;205931;205932;205933;205934;205935;205936;205937;205938;205939;205940;205941;205942;205943;205944;205945;205946;205947;205948;205949;205950;205951;205952;205953;205954;205955;205956;205957;205958;205959;205960;205961;205962;205963;205964;205965;205966;205967;205968;205969;205970;205971;205972;205973;205974;205975;205976;205977;205978;205979;205980;205981;205982;205983;205984;205985;205986;205987;205988;205989;205990;205991;205992;205993;205994;205995;205996;205997;205998;205999;206000;206001;206002;206003;206004;206005;206006;206007;206008;206009;206010;206011;206012;206013;206014;206015;206016;206017;206018;206019;206020;206021;206022;206023;206024;206025;206026;206027;206028;206029;206030;206031;206032;206033;206034;206035;206036;206037;206038;206039;206040;206041;206042;206043;206044;206045;206046;206047;206048;206049;206050;206051;206052;206053;206054;206055;206056;206057;206058;206059;206060;206061;206062;206063;206064;206065;206066;206067;206068 205976 142 GYSFVTTAER Unmodified 1129.5404 0.54038805 2792;2759 P62736;P63267;P68032;P68133 ACTA2;ACTG2;ACTC1;ACTA1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.171 53.171 2 0.00014729 50040 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.1 112.36 10221000000 1180700000 2294000000 668580000 992490000 1842100000 293450000 670260000 317320000 519020000 348370000 300440000 615670000 178610000 18274 2759;2792 17170 161459;161460;161461;161462;161463;161464;161465;161466;161467;161468;161469;161470;161471 206069;206070;206071;206072;206073;206074;206075;206076;206077;206078;206079;206080;206081;206082;206083;206084;206085;206086 206082 17 GYSIFSYATK Unmodified 1135.555 0.55497548 1826 P02741 CRP C-reactive protein;C-reactive protein(1-205) yes yes 0 0 0 1 1 88.294 88.294 2 0.0016163 91873 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.502 78.962 95015000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95015000 0 0 18275 1826 17171 161472;161473 206087;206088 206088 2 GYSIPFMGSDVSVVR Unmodified 1612.7919 0.79192806 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 127.66 127.66 2 0.00046187 131819 QUIQUE_C1403_190116_001 78.653 66.49 319790000 0 0 83807000 63156000 61740000 45421000 65668000 0 0 0 0 0 0 18276 3629 17172 161474;161475;161476;161477;161478;161479;161480;161481 206089;206090;206091;206092;206093;206094;206095;206096 206092 8 GYSIPFMGSDVSVVR Oxidation (M) 1628.7868 0.78684269 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 1 0 1 103.65 103.65 2 0.012277 100496 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.569 45.923 19011000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19011000 0 0 0 18277 3629 17172 161482 206097 206097 2702 1 GYSLVSGGTDNHLVLVDLRPK Unmodified 2239.1961 0.19608063 2360 P34897;G3V2Y4;H0YIZ0 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial;Serine hydroxymethyltransferase yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 98.625 98.625 3;4 6.0985E-07 100599 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68.888 395880000 0 0 137060000 110430000 0 0 0 0 0 0 148400000 0 0 18280 434 17175 161506;161507;161508 206125;206126;206127 206126 3 GYSYDLEVEQAYDLAR Unmodified 1890.8636 0.86357268 2276 P28074 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 125.62 125.62 2 0.0063202 130954 QUIQUE_C1218_190116_001 58.04 49.086 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18281 2276 17176 161509;161510;161511 206128;206129;206130 206128 3 GYTLLSEGIDEMVGIIYKPK Unmodified 2225.1654 0.16535735 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.94 162.94 3 9.7366E-13 165236 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.67 109.07 331300000 19187000 33227000 52292000 0 0 15588000 38080000 23359000 50642000 0 0 69664000 29257000 18282 1650 17177 161512;161513;161514;161515;161516;161517;161518;161519;161520 206131;206132;206133;206134;206135;206136;206137;206138;206139;206140 206136 10 GYTLVEYETYK Unmodified 1364.65 0.64999808 4632 Q9Y5S9;A0A0J9YW13 RBM8A RNA-binding protein 8A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.697 81.697 2 0.00040189 82761 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.3 99.634 929920000 0 107180000 100170000 0 89213000 92961000 101900000 80542000 0 0 138940000 94008000 125010000 18283 4632 17178 161521;161522;161523;161524;161525;161526;161527;161528;161529 206141;206142;206143;206144;206145;206146;206147;206148;206149;206150 206150 8 GYTNWAIGLSVADLIESMLK Oxidation (M) 2196.1137 0.11365613 1915 P07195;A0A3B3IS95 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain yes no 0 1 0 1 3 3 2 2 1 2 2 4 1 4 3 3 171.32 171.32 2;3 1.8805E-65 175679 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.27 174.92 3590600000 61392000 249480000 237650000 38963000 116670000 19498000 675660000 238290000 772900000 7103100 421620000 556080000 195270000 18284 1915 17179 161530;161531;161532;161533;161534;161535;161536;161537;161538;161539;161540;161541;161542;161543;161544;161545;161546;161547;161548;161549;161550;161551;161552;161553;161554;161555;161556;161557;161558;161559;161560 206151;206152;206153;206154;206155;206156;206157;206158;206159;206160;206161;206162;206163;206164;206165;206166;206167;206168;206169;206170;206171;206172;206173;206174;206175;206176;206177;206178;206179;206180;206181;206182;206183;206184 206171 1136 30 GYTNWAIGLSVADLIESMLK Unmodified 2180.1187 0.11874151 1915 P07195;A0A3B3IS95 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain yes no 0 0 0 2 1 1 178.74 178.74 2;3 8.3786E-88 185328 QUIQUE_DMIX5_190116_001 203.27 182.81 304450000 0 0 0 0 0 0 0 0 67478000 0 127610000 109360000 0 18285 1915 17179 161561;161562;161563;161564 206185;206186;206187;206188;206189 206187 5 GYTPLHAAASNGQINVVK Unmodified 1838.9639 0.96389585 450 H7C209;A0A2R8Y7Y4;Q8N8A2 ANKRD44 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit B yes no 0 0 0 1 1 32.313 32.313 3 0.0055212 26594 QUIQUE_DMIX4_190116_001 30.107 8.2757 276940000 0 194850000 0 0 0 0 0 0 0 82087000 0 0 0 18286 450 17180 161565;161566 206190;206191 206191 2 GYTQQLAFR Unmodified 1082.5509 0.55089316 1803 P01024;CON__Q2UVX4 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.642 56.642 2 0.0013557 54942 QUIQUE_C1368_190116_001 104.45 77.486 416290000 0 0 95282000 0 0 0 0 0 50048000 54683000 93382000 41513000 81385000 18287 1803 17181 161567;161568;161569;161570;161571;161572;161573;161574;161575;161576 206192;206193;206194;206195;206196;206197;206198;206199;206200;206201 206193 8 GYTSIFNMETQQR Unmodified 1573.7195 0.7194914 1556 O43815 STRN Striatin yes yes 0 0 0 1 93.632 93.632 2 0.012712 94859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.819 57.074 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18288 1556 17182 161577 206202 206202 1 GYTSWAIGLSVADLAESIMK Unmodified 2111.0609 0.060892282 1775 P00338 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 172.35 172.35 2 3.314E-37 173889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.12 132.05 446750000 0 0 0 0 0 0 0 105760000 100960000 0 0 132530000 107510000 18289 1775 17183 161578;161579;161580;161581;161582 206203;206204;206205;206206;206207 206203 4 GYVIIKPLVWV Unmodified 1285.7798 0.77983046 1827 P02743 APCS Serum amyloid P-component;Serum amyloid P-component(1-203) yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 141.66 141.66 2 0.008085 148471 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.798 81.917 200590000 0 28042000 0 0 31745000 0 0 0 46516000 24603000 69679000 0 0 18290 1827 17184 161583;161584;161585;161586;161587 206208;206209;206210;206211;206212 206212 2 GYVSCALGCPYEGK Unmodified 1559.6748 0.6748494 2388 P35914 HMGCL Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 67.846 67.846 2 0.0033422 68333 QUIQUE_C1277_190116_001 87.777 77.254 47275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47275000 18291 2388 17185 161588;161589 206213;206214 206213 2 GYVSDIDCR Unmodified 1083.4655 0.46550855 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.611 39.611 2 0.020183 35594 QUIQUE_C1403_190116_001 84.568 70.896 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18292 438;2509 17186 161590;161591;161592;161593;161594;161595;161596;161597 206215;206216;206217;206218;206219;206220;206221;206222 206216 8 GYVVWQEVFDNK Unmodified 1482.7143 0.71432967 1185 H3BS10;H3BP20;P06865 HEXA Beta-hexosaminidase;Beta-hexosaminidase subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 125.65 125.65 2 0.00052765 129585 QUIQUE_C1403_190116_001 103.88 90.109 153390000 0 0 0 28251000 34283000 21173000 32653000 0 0 0 37034000 0 0 18293 1185 17187 161598;161599;161600;161601;161602;161603 206223;206224;206225;206226;206227;206228;206229 206223 6 GYWAGLDASAQTTSHELTIPNDLIGCIIGR Unmodified 3228.5874 0.5873616 1044 F8VZX2 PCBP2 no no 0 0 0 1 1 160.19 160.19 3 2.3135E-14 164878 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.65 68.489 134420000 0 0 0 0 0 0 0 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0 0 1 29.903 29.903 2 0.0084418 24804 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.77 51.887 34224000 0 0 0 0 0 0 0 0 34224000 0 0 0 0 18297 3142 17191 161619 206250 206250 1 GYYEVTPPTLVQTQVEGGATLFK Unmodified 2497.2741 0.27405618 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 140.09 140.09 2;3 5.8583E-14 145167 QUIQUE_C1368_190116_001 133.66 128.86 1546100000 138300000 123650000 137690000 111920000 122500000 113570000 57285000 63647000 169140000 77968000 137560000 142210000 150650000 18298 1553 17192 161620;161621;161622;161623;161624;161625;161626;161627;161628;161629;161630;161631;161632;161633;161634;161635;161636;161637;161638;161639;161640;161641;161642;161643;161644;161645;161646 206251;206252;206253;206254;206255;206256;206257;206258;206259;206260;206261;206262;206263;206264;206265;206266;206267;206268;206269;206270;206271;206272;206273;206274;206275;206276;206277;206278;206279;206280;206281;206282;206283 206259 32 GYYFEIPSIGAIR Unmodified 1484.7664 0.76636524 715 C9JE82;C9JVC9;Q9NY47 CACNA2D2 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 139.82 139.82 2 0.0025616 143991 QUIQUE_C1277_190116_001 73.885 57.747 159190000 23987000 23156000 28276000 25416000 33683000 0 24668000 0 0 0 0 0 0 18299 715 17193 161647;161648;161649;161650;161651;161652 206284;206285;206286;206287;206288;206289 206285 6 GYYIIIVPLK Unmodified 1177.7111 0.71108219 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468;A0A1B0GU15 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 124.94 124.94 2 0.04137 121551 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.703 44.922 7072400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7072400 0 0 0 18300 987 17194 161653 206290 206290 1 GYYIIIVPLKK Unmodified 1305.806 0.80604521 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468;A0A1B0GU15 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.982 91.982 3 0.00035816 93112 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.067 71.379 62148000 0 0 0 0 0 0 0 27168000 27127000 7853100 0 0 0 18301 987 17195 161654;161655;161656;161657;161658;161659;161660;161661 206291;206292;206293;206294;206295;206296;206297;206298 206294 8 GYYSLETFTYLLALK Unmodified 1780.9287 0.92873912 1421 O00743;Q5T1S7 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 165.55 165.55 2 1.6722E-09 167596 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.82 114.94 177240000 0 16608000 0 0 0 0 38164000 29954000 0 0 0 61337000 31174000 18302 1421 17196 161662;161663;161664;161665;161666 206299;206300;206301;206302;206303 206301 3 GYYSPYSVSGSGSTAGSR Unmodified 1781.7857 0.78565671 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.725 55.725 2 8.249E-18 53984 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.62 121.49 816330000 53882000 0 0 44938000 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Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.285 64.285 2 2.068E-05 63313 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.09 90.617 207170000 0 0 0 0 0 0 0 0 37056000 23323000 71050000 40653000 35090000 18305 1725 17199 161688;161689;161690;161691;161692;161693 206326;206327;206328;206329;206330;206331 206331 6 HAACPVLVGNK Unmodified 1164.6074 0.60736218 2060 P13674 P4HA1 Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 17.193 17.193 2 0.01785 9111 QUIQUE_C1368_190116_001 56.014 39.238 21466000 11660000 0 9805700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18306 2060 17200 161694;161695 206332;206333 206333 1 HAAGVLAQEDLVGLLEPINTR Unmodified 2215.1961 0.19608063 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;J9JIE9;A0A0A0MTR5;H0YB70;F6UJY9;H0YB18 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.29 132.29 3 1.0863E-08 138204 QUIQUE_C1218_190116_001 71.309 57.15 939480000 77913000 57458000 67604000 72468000 64611000 81661000 76266000 89805000 80757000 38056000 81576000 59723000 91580000 18307 1025 17201 161696;161697;161698;161699;161700;161701;161702;161703;161704;161705;161706;161707;161708 206334;206335;206336;206337;206338;206339;206340;206341;206342;206343;206344;206345;206346;206347;206348;206349;206350;206351 206336 17 HAALVSQPETTK Unmodified 1280.6725 0.67246486 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 2 15.141 15.141 2;3 2.2335E-37 6788 QUIQUE_C1277_190116_001 234.99 199.63 8523800000 574650000 864600000 876890000 584930000 1105300000 460520000 554260000 671130000 373090000 101800000 1017600000 543850000 795130000 18308 2009 17202 161709;161710;161711;161712;161713;161714;161715;161716;161717;161718;161719;161720;161721;161722;161723;161724;161725;161726;161727;161728;161729;161730 206352;206353;206354;206355;206356;206357;206358;206359;206360;206361;206362;206363;206364;206365;206366;206367;206368;206369;206370;206371;206372;206373 206353 16 HAAVLVETIK Unmodified 1079.6339 0.63389451 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 29.149 29.149 2 0.00035538 23429 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.66 71.06 297660000 77495000 68703000 0 48643000 27111000 35553000 0 0 22558000 17593000 0 0 0 18309 310;830 17203 161731;161732;161733;161734;161735;161736;161737;161738 206374;206375;206376;206377;206378;206379;206380;206381;206382 206381 9 HAAVLVETIKK Unmodified 1207.7289 0.72885752 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.449 18.449 3 0.0011378 10844 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.359 34.964 410490000 15962000 0 24885000 26610000 28566000 0 30503000 53188000 49725000 0 61734000 65866000 53453000 18310 310;830 17204 161739;161740;161741;161742;161743;161744;161745;161746;161747;161748 206383;206384;206385;206386;206387;206388;206389;206390;206391;206392 206390 6 HAAYSVGWEMAPAGAPGPGR Unmodified 1980.9265 0.92646449 3787 Q969P0 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 77.035 77.035 2;3 2.2785E-196 77710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 254.47 240.8 2504700000 135810000 198620000 277870000 210650000 166340000 123920000 369370000 132760000 146810000 50045000 241860000 176430000 274210000 18311 3787 17205 161749;161750;161751;161752;161753;161754;161755;161756;161757;161758;161759;161760;161761;161762;161763;161764;161765;161766;161767;161768;161769;161770;161771;161772 206393;206394;206395;206396;206397;206398;206399;206400;206401;206402;206403;206404;206405;206406;206407;206408;206409;206410;206411;206412;206413;206414;206415;206416;206417;206418;206419 206409 24 HAAYSVGWEMAPAGAPGPGR Oxidation (M) 1996.9214 0.92137911 3787 Q969P0 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.395 62.395 3 1.7003E-06 61492 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.375 78.833 369110000 0 0 0 0 0 0 64577000 38701000 48275000 30145000 48256000 59124000 80032000 18312 3787 17205 161773;161774;161775;161776;161777;161778;161779;161780 206420;206421;206422;206423;206424;206425;206426;206427 206426 2733 8 HACVPVDFEEVHVSSNADEEDIR Unmodified 2653.1715 0.17145838 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;E9PF84 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 80.88 80.88 3;4 3.6782E-127 82057 QUIQUE_C1277_190116_001 207.37 196.66 3357300000 375990000 464800000 337500000 271820000 237640000 211730000 345110000 109700000 187490000 82799000 258750000 253660000 220350000 18313 2582 17206 161781;161782;161783;161784;161785;161786;161787;161788;161789;161790;161791;161792;161793;161794;161795;161796;161797;161798;161799;161800;161801;161802;161803;161804;161805;161806 206428;206429;206430;206431;206432;206433;206434;206435;206436;206437;206438;206439;206440;206441;206442;206443;206444;206445;206446;206447;206448;206449;206450;206451;206452;206453;206454;206455;206456;206457;206458;206459;206460;206461 206432 34 HADHSSLTLGSGSSTTR Unmodified 1712.8078 0.80778914 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 16.579 16.579 3 4.9166E-05 8882 QUIQUE_C1218_190116_001 74.141 67.388 23875000 23875000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18314 3471 17207 161807;161808 206462;206463 206462 2 HADYIASYGSK Unmodified 1210.5619 0.56185177 2628 Q5T4U8;P53611 RABGGTB Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.338 24.338 2 1.5014E-18 17969 QUIQUE_C1218_190116_001 173.24 147.17 306620000 84086000 48912000 0 76673000 0 39302000 0 57649000 0 0 0 0 0 18315 2628 17208 161809;161810;161811;161812;161813;161814;161815;161816 206464;206465;206466;206467;206468;206469;206470;206471;206472;206473 206464 9 HADYLNDDQK Unmodified 1217.5313 0.53127993 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 15.865 15.865 2 3.2713E-23 7941 QUIQUE_DMIX4_190116_001 190.96 146.57 59353000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59353000 0 0 0 18316 4607 17209 161817 206474 206474 1 HAEATLGSGNLR Unmodified 1224.6211 0.62109799 3448 Q7L9L4;D6RCK3 MOB1B MOB kinase activator 1B no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 19.19 19.19 2;3 3.5175E-37 12401 QUIQUE_DMIX1_190116_001 187.1 167.79 1531500000 0 123480000 124520000 118540000 92087000 161770000 124900000 166710000 134110000 35281000 162950000 93973000 193190000 18317 3448 17210 161818;161819;161820;161821;161822;161823;161824;161825;161826;161827;161828;161829;161830;161831;161832 206475;206476;206477;206478;206479;206480;206481;206482;206483;206484;206485;206486;206487;206488;206489 206482 14 HAEDIFGELFNEANNFYIR Unmodified 2298.0705 0.070545766 4523 Q9UPY6 WASF3 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 162.31 162.31 2;3 1.1415E-22 164483 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.58 84.52 896430000 0 49189000 39749000 46058000 39012000 56767000 83412000 38073000 115270000 9301500 103770000 133930000 181900000 18318 4523 17211 161833;161834;161835;161836;161837;161838;161839;161840;161841;161842;161843;161844;161845;161846 206490;206491;206492;206493;206494;206495;206496;206497;206498;206499;206500;206501;206502;206503;206504;206505;206506 206498 17 HAELIASTFVDQCK Unmodified 1617.7821 0.78209166 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2;B1AHE4 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 64.585 64.585 2;3 3.4153E-08 64851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.4 141 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18319 4392 17212 161847;161848;161849;161850 206507;206508;206509;206510 206509 4 HAEMVHTGLKLER Oxidation (M) 1535.7878 0.78784574 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 1 1 1 16.168 16.168 4 0.021017 8640 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206519 206519 1 HAFFEGLNWENIR Unmodified 1631.7845 0.78447492 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 116.34 116.34 2;3 3.493E-06 121917 QUIQUE_C1218_190116_001 93.336 75.934 455160000 22592000 39066000 33444000 36171000 41721000 31383000 34898000 40065000 39787000 0 51270000 47379000 37380000 18324 4631 17217 161860;161861;161862;161863;161864;161865;161866;161867;161868;161869;161870;161871;161872 206520;206521;206522;206523;206524;206525;206526;206527;206528;206529;206530;206531;206532 206520 13 HAGGVTGGWDNLLAVIPGGSSTPLIPK Unmodified 2613.3915 0.39148597 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;H0YD04 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 2 149.96 149.96 2;3 6.9432E-44 155827 QUIQUE_C1218_190116_001 133.86 114.53 5963000000 428400000 348170000 637060000 256790000 370980000 334600000 523240000 354420000 487650000 133880000 808680000 587040000 692110000 18325 1069 17218 161873;161874;161875;161876;161877;161878;161879;161880;161881;161882;161883;161884;161885;161886;161887;161888;161889;161890;161891;161892;161893;161894 206533;206534;206535;206536;206537;206538;206539;206540;206541;206542;206543;206544;206545;206546;206547;206548;206549;206550;206551;206552;206553;206554;206555;206556;206557;206558;206559 206535 27 HAGTPLYLGATAGMR Unmodified 1514.7664 0.76638202 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 3 2 2 1 2 2 1 56.901 56.901 2;3 0.00010218 54975 QUIQUE_C1368_190116_001 115.33 98.993 1763100000 46929000 180000000 137140000 64978000 105150000 53620000 192250000 187950000 299510000 37585000 178190000 169140000 110660000 18326 4626 17219 161895;161896;161897;161898;161899;161900;161901;161902;161903;161904;161905;161906;161907;161908;161909;161910;161911;161912;161913;161914;161915;161916 206560;206561;206562;206563;206564;206565;206566;206567;206568;206569;206570;206571;206572;206573;206574;206575;206576;206577;206578;206579;206580;206581;206582;206583 206564 19 HAGTPLYLGATAGMR Oxidation (M) 1530.7613 0.76129664 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 1 0 1 39.986 39.986 2 0.0023081 36644 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.56 49.889 61086000 0 0 0 0 0 0 0 0 61086000 0 0 0 0 18327 4626 17219 161917 206584;206585 206585 3048 2 HAHSILQFQFAEVK Unmodified 1653.8627 0.86272524 3221 Q32MZ4 LRRFIP1 Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 73.228 73.228 3 0.00074383 73820 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.513 60.243 169660000 0 0 0 0 61171000 0 0 0 0 0 63817000 44677000 0 18328 3221 17220 161918;161919;161920;161921 206586;206587;206588;206589;206590 206590 5 HAIPIIK Unmodified 790.50651 0.50650915 266;1504 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microtubule-associated protein-like 1 yes no 0 0 1 1 72.233 72.233 4 0.012335 72659 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.111 21.189 23972000 0 0 0 0 0 0 0 0 23972000 0 0 0 0 18363 507 17253 162220 206970 206970 1 HAVGNNEFGTVDHER Unmodified 1680.7604 0.76044502 4365 Q9P0J1 PDP1 [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.821 19.821 3 2.3133E-05 12371 QUIQUE_C1368_190116_001 72.175 64.583 378060000 86354000 0 92912000 0 0 0 50207000 0 0 34369000 63983000 0 50230000 18364 4365 17254 162221;162222;162223;162224;162225;162226;162227 206971;206972;206973;206974;206975;206976;206977 206972 7 HAVGPVVVHCSAGVGR Unmodified 1600.8256 0.82562823 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 22.198 22.198 3 0.005242 15915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.134 50.257 87876000 0 0 0 0 0 0 0 25106000 0 16204000 0 0 46566000 18365 2217 17255 162228;162229;162230 206978;206979;206980 206978 1 HAVLMGLQPATEYIVNLVAVHGTVTSEPIVGSITTGIDPPK Unmodified 4224.2504 0.25043097 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 163.32 163.32 4 4.8571E-85 165757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.78 113.72 462480000 0 0 0 0 52651000 0 135760000 86132000 0 0 86230000 101710000 0 18366 3753 17256 162231;162232;162233;162234;162235 206981;206982;206983;206984;206985;206986;206987;206988;206989 206986 9 HAVSDPSILDSLDLNEDER Unmodified 2123.9971 0.99710605 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 107.63 107.63 2;3 5.0914E-55 111046 QUIQUE_C1368_190116_001 205.88 184.32 320900000 111220000 0 80408000 65080000 42807000 0 0 0 0 21387000 0 0 0 18367 1883 17257 162236;162237;162238;162239;162240;162241;162242 206990;206991;206992;206993;206994;206995;206996 206992 5 HAVSDPSILDSLDLNEDEREVLINNINR Unmodified 3189.5902 0.59019838 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 137.02 137.02 3;4 2.122E-126 143684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 191.42 166.58 608760000 0 78672000 69077000 0 0 0 64712000 131660000 80899000 0 71077000 63832000 48837000 18368 1883 17258 162243;162244;162245;162246;162247;162248;162249;162250;162251;162252 206997;206998;206999;207000;207001;207002;207003;207004;207005;207006;207007;207008;207009 207005 12 HAVSDPSILDSLDLNEDEREVLINNINRR Unmodified 3345.6913 0.6913094 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 2 1 128.03 128.03 4 1.3888E-05 130788 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.956 46.114 57314000 0 0 0 0 0 0 0 57314000 0 0 0 0 0 18369 1883 17259 162253 207010 207010 1 HAVTEAEIQK Unmodified 1124.5826 0.58258722 4489 Q9ULJ8 PPP1R9A Neurabin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 13.953 13.953 2 0.00018076 6245 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.13 85.785 127380000 11174000 13912000 0 9239600 0 0 0 47712000 13283000 20919000 0 11139000 0 18370 4489 17260 162254;162255;162256;162257;162258;162259;162260 207011;207012;207013;207014;207015;207016;207017 207014 7 HAVTEAEIQQLK Unmodified 1365.7252 0.72522871 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 37.548 37.548 2;3 1.5681E-09 34132 QUIQUE_C1218_190116_001 152.04 134.57 547110000 104680000 102210000 101240000 39613000 56696000 40580000 102080000 0 0 0 0 0 0 18371 800 17261 162261;162262;162263;162264;162265;162266;162267;162268;162269;162270;162271;162272;162273;162274;162275 207018;207019;207020;207021;207022;207023;207024;207025;207026;207027;207028;207029;207030;207031;207032 207018 15 HAVTEAEIQQLKR Unmodified 1521.8263 0.82633974 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 1 1 29.831 29.831 3 0.014749 24446 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.446 6.7093 50037000 0 0 0 0 0 0 0 50037000 0 0 0 0 0 18372 800 17262 162276 207033 207033 1 HAVTGEAVELR Unmodified 1180.62 0.62003536 188 A0A2P0CTB1;A0A0A0MT35;Q8TBF2;J3QKK8;A0A0G2JSF1;A0A2P0CTH9;J3KRV9;A0A2P0CU24;A0A0A0MRV4;A0A0G2JRR6;J3KPF6;J3KPF5 FAM213B Prostamide/prostaglandin F synthase yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 22.752 22.752 2;3 3.578E-06 15778 QUIQUE_C1368_190116_001 147.78 98.681 873890000 0 0 106680000 103220000 85397000 0 146540000 142700000 0 38493000 136090000 114770000 0 18373 188 17263 162277;162278;162279;162280;162281;162282;162283;162284;162285;162286;162287;162288;162289;162290;162291;162292;162293;162294;162295;162296;162297;162298 207034;207035;207036;207037;207038;207039;207040;207041;207042;207043;207044;207045;207046;207047;207048;207049;207050;207051;207052;207053;207054;207055 207037 22 HAVVNLINYQDDAELATR Unmodified 2041.0229 0.022867292 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 2 2 1 4 2 1 2 2 2 2 2 2 1 90.802 90.802 2;3 4.5129E-76 92239 QUIQUE_DMIX1_190116_001 242.43 208.54 2084900000 121170000 0 107120000 123160000 274200000 0 104310000 340620000 164600000 88723000 372750000 265090000 123200000 18374 425 17264 162299;162300;162301;162302;162303;162304;162305;162306;162307;162308;162309;162310;162311;162312;162313;162314;162315;162316;162317;162318;162319;162320;162321;162322;162323 207056;207057;207058;207059;207060;207061;207062;207063;207064;207065;207066;207067;207068;207069;207070;207071;207072;207073;207074;207075;207076;207077;207078;207079;207080;207081;207082;207083;207084;207085;207086;207087;207088;207089;207090;207091 207073 36 HAYDLIQK Unmodified 986.51853 0.5185304 2930 Q08AM6;H3BQD9 VAC14 Protein VAC14 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 26.382 26.382 2 0.0084554 20215 QUIQUE_C1277_190116_001 94.262 47.891 342630000 79480000 70634000 0 0 0 53024000 0 50934000 0 0 0 0 88561000 18375 2930 17265 162324;162325;162326;162327;162328 207092;207093;207094;207095;207096 207093 5 HAYYVTVEAAPYWLHKPQSHLYGPGETAR Unmodified 3340.6418 0.64178044 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 1 2 84.215 84.215 4;5 1.3711E-24 84876 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.887 91.4 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HCDEVGFNAEEAHNIVK Unmodified 1967.8796 0.87957387 538 A6NGJ0;P51808 DYNLT3 Dynein light chain Tctex-type 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 50.314 50.314 2;3 5.9101E-23 48409 QUIQUE_C1438_190116_001 142.39 132.39 1605700000 120110000 160720000 123840000 103070000 126900000 124080000 207120000 76588000 88308000 53843000 149670000 127600000 143800000 18379 538 17269 162345;162346;162347;162348;162349;162350;162351;162352;162353;162354;162355;162356;162357;162358 207117;207118;207119;207120;207121;207122;207123;207124;207125;207126;207127;207128;207129;207130;207131 207122 15 HCELCRPFFYR Unmodified 1583.7126 0.71257231 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 1 1 53.805 53.805 3 0.036552 52262 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.077 40.079 33414000 0 0 0 0 0 0 0 0 33414000 0 0 0 0 18380 2665 17270 162359 207132 207132 1 HCESLRPGAAPR Unmodified 1349.6623 0.6622513 3189 Q16678 CYP1B1 Cytochrome P450 1B1 yes yes 0 0 1 1 1 10.429 10.429 3 0.00066304 2843 QUIQUE_C1403_190116_001 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207149;207150;207151;207152;207153;207154;207155;207156;207157;207158;207159;207160;207161;207162;207163;207164;207165;207166;207167;207168;207169;207170;207171;207172;207173;207174;207175 207153 25 HCILDVSGNAIKR Unmodified 1481.7773 0.77728105 2954;655;3279 Q12959;A0A0C4DFT3;B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;B5MCC5;H7C325;Q5JUW8;Q92796 DLG1;DLG2;DLG3 Disks large homolog 1;Disks large homolog 2;Disks large homolog 3 no no 0 0 1 1 40.417 40.417 3 0.059588 36768 QUIQUE_DMIX7_190116_001 20.271 10.735 48524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48524000 0 18386 2954;655;3279 17276 162399 207176 207176 1 HCIMQANAEYHQSILAK Oxidation (M) 2028.951 0.95096468 3700 Q8WUM4;F8WDK9 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 1 0 1 30.284 30.284 3 0.001673 25030 QUIQUE_DMIX8_190116_001 53.395 48.1 67244000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67244000 18387 3700 17277 162400 207177 207177 2712 1 HCIMQANAEYHQSILAK Unmodified 2012.9561 0.95605006 3700 Q8WUM4;F8WDK9 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 43.109 43.109 3 0.0062986 40123 QUIQUE_DMIX8_190116_001 34.485 28.775 47013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47013000 18388 3700 17277 162401 207178 207178 1 HCLLTCEECK Unmodified 1348.5574 0.5573768 3262 Q56VL3 OCIAD2 OCIA domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 21.009 21.009 2 0.0025981 14620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.029 63.407 77882000 0 0 0 0 0 0 0 50242000 0 0 0 0 27639000 18389 3262 17278 162402;162403;162404 207179;207180;207181 207179 3 HCLPEGAPHR Unmodified 1172.5509 0.55090993 3042 Q14112 NID2 Nidogen-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.864 10.864 3 4.3291E-05 3005 QUIQUE_C1368_190116_001 120.99 96.113 367180000 13089000 0 43745000 38508000 81019000 0 40710000 18438000 40537000 7506100 15438000 44490000 23698000 18390 3042 17279 162405;162406;162407;162408;162409;162410;162411;162412;162413;162414;162415 207182;207183;207184;207185;207186;207187;207188;207189;207190;207191;207192;207193;207194;207195;207196;207197;207198;207199;207200;207201;207202;207203;207204 207185 22 HCLQTVWNKPTVK Unmodified 1609.8399 0.83988131 1924 P07602;C9JIZ6;Q5BJH1 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 1 1 1 1 1 30.455 30.455 3 0.0021752 24672 QUIQUE_C1277_190116_001 71.933 67.993 139250000 34226000 32610000 0 0 35368000 0 0 37044000 0 0 0 0 0 18391 1924 17280 162416;162417;162418;162419 207205;207206;207207;207208 207206 4 HCLRAHFSPQLCIR Unmodified 1793.893 0.89299629 3965 Q99643;A0A087WZU7;D6RBX6 SDHC Succinate dehydrogenase cytochrome b560 subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 37.17 37.17 3 0.012862 33314 QUIQUE_C1218_190116_001 36.944 3.2593 1894500000 454850000 0 0 0 828760000 340120000 0 0 270770000 0 0 0 0 18392 3965 17281 162420;162421;162422;162423 207209;207210;207211;207212 207209 4 HCNMVLENVK Oxidation (M) 1258.5798 0.5798268 2751 P62316 SNRPD2 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 17.01 17.01 2 0.0069012 9548 QUIQUE_C1218_190116_001 76.17 56.393 111190000 31255000 43527000 0 0 0 0 0 0 28628000 7781200 0 0 0 18393 2751 17282 162424;162425;162426;162427 207213;207214;207215;207216 207213 2181 4 HCNMVLENVK Unmodified 1242.5849 0.58491218 2751 P62316 SNRPD2 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 yes yes 0 0 0 1 24.652 24.652 2 0.00025821 18432 QUIQUE_DMIX8_190116_001 133.23 109.01 83745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83745000 18394 2751 17282 162428 207217 207217 1 HCPTVQHVLVAHR Unmodified 1552.8045 0.80449886 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 15.264 15.264 3;4 1.4883E-06 7334 QUIQUE_C1368_190116_001 125.28 114.23 3003000000 217500000 206650000 338690000 303230000 211000000 202450000 321220000 168180000 80861000 84828000 291550000 323210000 253600000 18395 4296 17283 162429;162430;162431;162432;162433;162434;162435;162436;162437;162438;162439;162440;162441;162442;162443;162444;162445;162446;162447;162448;162449;162450;162451;162452;162453 207218;207219;207220;207221;207222;207223;207224;207225;207226;207227;207228;207229;207230;207231;207232;207233;207234;207235;207236;207237;207238;207239;207240;207241;207242;207243;207244;207245;207246;207247;207248;207249;207250;207251;207252 207224 34 HCVMIATAGDR Unmodified 1229.5645 0.56451109 4247 Q9NPQ8;H0YEN0 RIC8A Synembryn-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.604 20.604 2 0.00088553 13490 QUIQUE_C1403_190116_001 93.467 72.02 141190000 0 33929000 24119000 28072000 0 35142000 0 0 0 0 19928000 0 0 18396 4247 17284 162454;162455;162456;162457;162458;162459 207253;207254;207255;207256;207257;207258 207255 6 HDAATCFVDAGNAFK Unmodified 1622.7147 0.71474038 2651 P54920;M0R2M1;M0R058;M0R0I4 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 72.653 72.653 2;3 1.6676E-94 73257 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1648.8897 0.88966827 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 136.69 136.69 2;3 1.2314E-13 143302 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.8 123.54 632590000 29296000 0 101340000 0 0 20136000 77987000 0 84741000 29262000 111850000 96492000 81494000 18399 1516 17287 162490;162491;162492;162493;162494;162495;162496;162497;162498;162499;162500;162501;162502;162503;162504;162505 207294;207295;207296;207297;207298;207299;207300;207301;207302;207303;207304;207305;207306;207307;207308;207309;207310;207311;207312 207305 18 HDATASSSSAAATVR Unmodified 1430.675 0.67498405 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 2 1 1 1 11.903 11.903 2;3 0.0008561 4262 QUIQUE_C1403_190116_001 63.923 55.324 19927000 0 0 0 6389500 6893900 0 4371900 2271300 0 0 0 0 0 18400 4517 17288 162506;162507;162508;162509;162510 207313;207314;207315;207316;207317 207314 5 HDCVGYVMK Unmodified 1107.4841 0.4841355 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 22.187 22.187 2 0.010766 15252 QUIQUE_C1403_190116_001 73.665 53.183 56182000 0 31525000 0 24657000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18401 1096 17289 162511;162512;162513 207318;207319;207320 207320 3 HDDSSDNFCEADDIQSPEAEYVDLLLNPER Unmodified 3492.49 0.48995156 3867 Q96HE7;G3V3E6;G3V5B3 ERO1L ERO1-like protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 157.94 157.94 3 7.4023E-54 162010 QUIQUE_C1277_190116_001 131.5 126.64 102220000 28570000 35794000 37857000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18402 3867 17290 162514;162515;162516 207321;207322;207323 207322 3 HDDYLVMLK Unmodified 1132.5587 0.55868065 4535 Q9Y224;G3V4C6;H0YJB9 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 70.089 70.089 2 0.0061041 69962 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.161 42.765 499270000 0 117230000 95275000 0 0 0 86785000 96398000 0 0 0 103580000 0 18403 4535 17291 162517;162518;162519;162520;162521 207324;207325;207326;207327;207328 207328 5 HDEAFSTEPLK Unmodified 1272.5986 0.59863121 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C3Y8;A0A087WWA3;Q4R9M9;O60333 KIF1A;KIF1B;KIF1Bbeta Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.958 34.958 2 0.00045447 30706 QUIQUE_C1438_190116_001 105.2 89.051 275880000 0 0 0 45320000 53387000 0 0 0 0 0 108700000 68472000 0 18404 497 17292 162522;162523;162524;162525 207329;207330;207331;207332;207333 207330 5 HDEAWMILK Unmodified 1141.559 0.559015 3436 Q7L1I2;B3KT41;Q496J9 SV2B;SV2C Synaptic vesicle glycoprotein 2B;Synaptic vesicle glycoprotein 2C yes no 0 0 0 1 76.568 76.568 2 0.022248 77544 QUIQUE_C1218_190116_001 61.582 44.196 39930000 39930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18405 3436 17293 162526 207334 207334 1 HDEAWMVLK Unmodified 1127.5434 0.54336494 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 64.815 64.815 2 0.018244 65277 QUIQUE_C1438_190116_001 91.069 58.176 112720000 0 42279000 45007000 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0.65017415 1745 O95741;H0YK44 CPNE6 Copine-6 yes no 0 1 0 1 1 1 1 154.82 154.82 3 3.9011E-52 160405 QUIQUE_C1218_190116_001 120.93 116.82 179780000 36069000 0 48842000 0 0 35911000 0 0 0 0 0 58956000 0 18410 1745 17298 162537;162538;162539;162540 207347;207348;207349;207350 207347 950 4 HDFIGEFTSTFQEMQEGTANPGQEMQWDCINPK Unmodified 3871.6553 0.65525953 1745 O95741;H0YK44 CPNE6 Copine-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 160.15 160.15 3;4 1.7356E-86 165364 QUIQUE_C1368_190116_001 156.11 152 1054200000 87342000 144440000 132830000 65006000 52824000 115540000 112850000 30683000 56334000 0 93384000 69933000 93000000 18411 1745 17298 162541;162542;162543;162544;162545;162546;162547;162548;162549;162550;162551;162552;162553;162554 207351;207352;207353;207354;207355;207356;207357;207358;207359;207360;207361;207362;207363;207364;207365;207366;207367 207353 17 HDFLGQAFCTLGEIVGSPGSR Unmodified 2247.0743 0.074250936 4225 Q9HCH3;A0A0J9YWA1;A0A0J9YWU8 CPNE5 Copine-5 yes no 0 0 0 1 158.24 158.24 3 8.386E-08 163913 QUIQUE_C1576_190116_001 73.383 70.486 33798000 0 0 0 0 0 0 33798000 0 0 0 0 0 0 18412 4225 17299 162555 207368 207368 1 HDFSTVLTVFPILR Unmodified 1643.9035 0.90352742 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.43 144.43 3 9.9387E-11 149106 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.13 121.77 198700000 20269000 0 36744000 0 23118000 0 30590000 16860000 31039000 10798000 0 29281000 0 18413 173 17300 162556;162557;162558;162559;162560;162561;162562;162563;162564 207369;207370;207371;207372;207373;207374;207375;207376;207377 207375 6 HDGAFLIR Unmodified 927.49265 0.49265 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.86 33.86 2 6.2635E-40 29084 QUIQUE_C1277_190116_001 217.5 84.029 3415300000 312490000 380770000 389600000 328540000 265540000 326520000 309920000 151580000 187310000 121400000 241880000 189020000 210750000 18414 2774 17301 162565;162566;162567;162568;162569;162570;162571;162572;162573;162574;162575;162576;162577 207378;207379;207380;207381;207382;207383;207384;207385;207386;207387;207388;207389;207390;207391 207380 12 HDGYGSHGPLLPLPSR Unmodified 1701.8587 0.8587025 649 B7WPG3;C9IYN3;D6W592;Q8WVV9 HNRNPLL;HNRPLL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like yes no 0 0 0 1 1 1 56.176 56.176 3 0.0033178 52557 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.079 32.573 109160000 0 0 0 0 40081000 44815000 0 0 0 24266000 0 0 0 18415 649 17302 162578;162579;162580 207392;207393;207394 207394 1 HDHAVSLLTAASPTIALLLER Unmodified 2227.2325 0.23246614 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 141.58 141.58 3 0.00026396 147339 QUIQUE_C1576_190116_001 65.085 62.751 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18416 289 17303 162581 207395 207395 1 HDHTLSLTVLWLK Unmodified 1561.8617 0.86166261 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.31 104.31 3 0.00075025 102343 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.881 64.035 507420000 25023000 49881000 70835000 28347000 0 46313000 94401000 18609000 74271000 15794000 83942000 0 0 18417 756 17304 162582;162583;162584;162585;162586;162587;162588;162589;162590;162591 207396;207397;207398;207399;207400;207401;207402;207403;207404;207405 207404 7 HDIDSPPASER Unmodified 1222.5578 0.55782903 4368 Q9P0K9 FRRS1L DOMON domain-containing protein FRRS1L yes yes 0 0 0 1 1 1 14.947 14.947 2 0.010255 7476 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.463 52.51 55320000 0 0 0 0 0 29096000 0 0 0 0 0 26224000 0 18418 4368 17305 162592;162593;162594 207406;207407;207408 207408 2 HDIIAWVNDIVSLNYTK Unmodified 2000.0367 0.036726442 3145;1349 K7ERD8;M0QX52;K7ENB3;Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 no no 0 0 0 1 2 1 1 3 1 3 3 2 156.99 156.99 2;3 2.7595E-19 163694 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.56 98.5 1011000000 34360000 136530000 25261000 0 24014000 0 337320000 51659000 0 0 176140000 168080000 57660000 18419 1349;3145 17306 162595;162596;162597;162598;162599;162600;162601;162602;162603;162604;162605;162606;162607;162608;162609;162610;162611 207409;207410;207411;207412;207413;207414;207415;207416;207417;207418;207419;207420;207421;207422;207423;207424;207425;207426 207420 12 HDIIGEFK Unmodified 957.49198 0.4919813 2182 P21579;J3KQA0 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 41.649 41.649 1;2 0.0036662 39146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.31 93.379 13815000000 1194400000 1343500000 1438800000 1315200000 926530000 1286800000 1332900000 474510000 671440000 396320000 1261300000 977670000 1195800000 18420 2182 17307 162612;162613;162614;162615;162616;162617;162618;162619;162620;162621;162622;162623;162624;162625;162626 207427;207428;207429;207430;207431;207432;207433;207434;207435;207436;207437;207438;207439;207440;207441;207442;207443 207435 10 HDIIGEFKVPMNTVDFGHVTEEWR Unmodified 2855.3701 0.37009861 2182 P21579;J3KQA0 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 1 1 129.99 129.99 4 2.0515E-12 132620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.222 67.269 45247000 0 0 0 0 0 0 0 45247000 0 0 0 0 0 18421 2182 17308 162627 207444 207444 1 HDIIGEVK Unmodified 909.49198 0.4919813 3618 Q8N9I0 SYT2 Synaptotagmin-2 yes yes 0 0 0 1 21.685 21.685 2 0.046766 14579 QUIQUE_C1277_190116_001 76.478 15.796 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18422 3618 17309 162628 207445 207445 1 HDLDLICR Unmodified 1040.5073 0.50731378 2740;2739;1041 P62140;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.514 42.514 2 2.9313E-15 39037 QUIQUE_C1368_190116_001 194.27 147.85 4361300000 351760000 492960000 399110000 435000000 398210000 370110000 477260000 0 250680000 146620000 348960000 314950000 375650000 18423 2740;1041;2739 17310 162629;162630;162631;162632;162633;162634;162635;162636;162637;162638;162639;162640 207446;207447;207448;207449;207450;207451;207452;207453;207454;207455;207456;207457;207458;207459;207460;207461;207462;207463;207464 207449 16 HDLETAMHVK Unmodified 1179.5706 0.57064232 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.915 19.915 3 0.00079896 12613 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.363 62.437 488750000 69962000 65784000 63589000 0 63194000 78668000 51893000 0 54578000 0 41081000 0 0 18424 4414 17311 162641;162642;162643;162644;162645;162646;162647;162648 207465;207466;207467;207468;207469;207470;207471;207472 207472 7 HDLGHFMLR Unmodified 1124.5549 0.55493268 2299 P30043;M0R192;A0A2R8YEP4 BLVRB Flavin reductase (NADPH) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 41.479 41.479 2;3 0.00040425 37683 QUIQUE_C1368_190116_001 100.02 85.343 2927400000 282640000 300480000 213610000 210560000 242360000 274150000 219300000 0 165680000 0 418360000 170710000 429590000 18425 2299 17312 162649;162650;162651;162652;162653;162654;162655;162656;162657;162658;162659;162660;162661 207473;207474;207475;207476;207477;207478;207479;207480;207481;207482;207483;207484;207485;207486;207487 207476 15 HDLGHFMLR Oxidation (M) 1140.5498 0.5498473 2299 P30043;M0R192;A0A2R8YEP4 BLVRB Flavin reductase (NADPH) yes no 0 1 0 1 1 2 1 2 1 2 1 31.38 31.38 3 0.0012288 27519 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.921 70.518 1459100000 0 0 90917000 0 0 73172000 0 240950000 208130000 147350000 195660000 290840000 212070000 18426 2299 17312 162662;162663;162664;162665;162666;162667;162668;162669;162670;162671;162672 207488;207489;207490;207491;207492;207493;207494;207495;207496;207497;207498;207499 207492 1682 8 HDLHFHFTAR Unmodified 1279.621 0.62103841 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 27.111 27.111 3 0.057779 21018 QUIQUE_C1277_190116_001 33.057 22.686 42114000 0 42114000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18427 2807 17313 162673 207500 207500 1 HDMLAWVNDSLHLNYTK Oxidation (M) 2071.9786 0.97855964 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 96.095 96.095 3 1.0572E-07 99616 QUIQUE_C1218_190116_001 109.42 104.42 934890000 157740000 0 0 119160000 135830000 0 0 153420000 121770000 67729000 179240000 0 0 18428 4524 17314 162674;162675;162676;162677;162678;162679;162680 207501;207502;207503;207504;207505;207506;207507;207508;207509 207501 2988 8 HDMLAWVNDSLHLNYTK Unmodified 2055.9836 0.98364501 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 122.8 122.8 2;3 2.4015E-07 127337 QUIQUE_C1218_190116_001 84.829 82.882 749740000 422870000 0 0 0 0 0 0 0 0 57487000 0 269370000 0 18429 4524 17314 162681;162682;162683;162684;162685 207510;207511;207512;207513;207514;207515;207516;207517;207518 207510 9 HDSATSFVDAGNAYK Unmodified 1581.7059 0.70594983 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 48.877 48.877 2;3 6.8946E-130 46611 QUIQUE_C1218_190116_001 274 255.73 8184700000 650230000 989300000 342910000 674700000 376910000 328690000 839950000 511690000 521400000 377280000 969250000 715000000 887380000 18430 4128 17315 162686;162687;162688;162689;162690;162691;162692;162693;162694;162695;162696;162697;162698;162699;162700;162701;162702;162703;162704;162705;162706;162707;162708 207519;207520;207521;207522;207523;207524;207525;207526;207527;207528;207529;207530;207531;207532;207533;207534;207535;207536;207537;207538;207539;207540;207541;207542;207543;207544;207545;207546;207547;207548 207520 27 HDSATSFVDAGNAYKK Unmodified 1709.8009 0.80091285 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 33.243 33.243 3 7.9337E-05 28614 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.923 57.717 485500000 0 0 0 0 0 0 0 99115000 77229000 0 92800000 130340000 86012000 18431 4128 17316 162709;162710;162711;162712;162713 207549;207550;207551;207552;207553 207550 5 HDSFVPCSEK Unmodified 1204.5183 0.5182724 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QL89 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.086 20.086 2 0.0015235 12738 QUIQUE_C1368_190116_001 96.618 75.88 911720000 113010000 120380000 131920000 104730000 104070000 0 118890000 0 0 19665000 79631000 54426000 65006000 18432 245 17317 162714;162715;162716;162717;162718;162719;162720;162721;162722;162723 207554;207555;207556;207557;207558;207559;207560;207561;207562;207563 207556 10 HDSIPAADTFEDLSDVEGGGSEPTQR Unmodified 2729.2053 0.20526093 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.76 105.76 3 1.4453E-29 107852 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.2 115.67 458280000 0 46050000 0 91590000 60850000 0 0 67145000 68445000 52501000 0 71699000 0 18433 1741 17318 162724;162725;162726;162727;162728;162729;162730 207564;207565;207566;207567;207568;207569;207570 207567 7 HDSLHDPAAPSR Unmodified 1301.6113 0.61126158 491 A0A3B3ISP1;Q92625 ANKS1A Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 11.942 11.942 3 0.0020135 4843 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.967 42.754 12352000 0 0 655060 0 0 0 4286800 3137700 0 0 0 0 4272400 18434 491 17319 162731;162732;162733;162734;162735;162736;162737 207571;207572;207573;207574;207575;207576;207577;207578;207579 207577 8 HDSVFVAAHTSAGK Unmodified 1425.7001 0.70007659 3142 Q15477 SKIV2L Helicase SKI2W yes yes 0 0 0 1 16.861 16.861 3 8.2792E-05 8997 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.173 75.922 13415000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13415000 0 0 0 18435 3142 17320 162738 207580 207580 1 HDTSLKPISVSYNPATAK Unmodified 1928.0003 0.0003409361 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RIF9;E5RG43;E5RFL2;E5RGU8;E5RII2 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 0 1 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 48.327 48.327 2;3;4 5.8207E-161 45036 QUIQUE_C1368_190116_001 248.2 207.48 11471000000 773940000 791560000 1174700000 584520000 1630400000 973950000 613840000 327040000 483550000 305520000 1526500000 1135800000 1149900000 18436 1795 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207621;207622;207623;207624;207625;207626;207627;207628;207629;207630;207631;207632;207633;207634;207635;207636;207637;207638 207623 18 HDWDYCEHR Unmodified 1316.4993 0.49926829 2124 P17568 NDUFB7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.406 20.406 2;3 0.0086813 12910 QUIQUE_C1277_190116_001 90.709 85.744 331450000 77783000 29402000 0 22391000 0 0 48068000 40965000 56853000 0 55986000 0 0 18438 2124 17323 162779;162780;162781;162782;162783;162784;162785 207639;207640;207641;207642;207643;207644;207645 207640 6 HDYVLNVQAK Unmodified 1185.6142 0.6142217 4553 Q9Y2D0 CA5B Carbonic anhydrase 5B, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 32.254 32.254 2 4.4858E-14 27341 QUIQUE_C1563_190116_001 172.23 140.3 112940000 33999000 0 0 0 0 58481000 0 0 0 0 0 0 20463000 18439 4553 17324 162786;162787;162788;162789;162790;162791;162792 207646;207647;207648;207649;207650;207651;207652 207650 7 HEAFESDLAAHQDR Unmodified 1624.723 0.72299688 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162800;162801;162802;162803;162804;162805;162806;162807;162808;162809;162810;162811;162812;162813;162814;162815;162816;162817;162818;162819;162820;162821;162822;162823;162824;162825 207660;207661;207662;207663;207664;207665;207666;207667;207668;207669;207670;207671;207672;207673;207674;207675;207676;207677;207678;207679;207680;207681;207682;207683;207684;207685;207686;207687;207688;207689;207690;207691;207692;207693;207694;207695;207696 207669 35 HEAIETDIAAYEER Unmodified 1645.7584 0.75837933 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 69.151 69.151 2;3 2.3542E-32 68558 QUIQUE_C1368_190116_001 174.23 138.68 434200000 70716000 69084000 0 57948000 54382000 0 0 42822000 39156000 36440000 0 63648000 0 18442 2851 17327 162826;162827;162828;162829;162830;162831;162832;162833;162834;162835;162836;162837;162838;162839;162840;162841;162842;162843;162844;162845 207697;207698;207699;207700;207701;207702;207703;207704;207705;207706;207707;207708;207709;207710;207711;207712;207713;207714;207715;207716 207700 20 HEAIKDSVTHLFDR Unmodified 1666.8427 0.84271808 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 1 1 2 1 2 2 2 56.992 56.992 3;4 5.6756E-14 54731 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.91 98.508 499520000 0 0 16719000 0 0 0 0 89382000 24575000 0 149320000 72115000 147410000 18443 4226 17328 162846;162847;162848;162849;162850;162851;162852;162853;162854;162855 207717;207718;207719;207720;207721;207722;207723;207724;207725;207726;207727 207727 11 HEALENDFAVHETR Unmodified 1666.7699 0.76994707 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 36.07 36.07 3 0.016807 31430 QUIQUE_C1277_190116_001 40.639 30.443 39551000 0 39551000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18444 1820 17329 162856 207728 207728 1 HEALKENGVTHPIDYHTTDYVDEIKK Unmodified 3051.4938 0.49377879 3958 Q99536;K7ENX2;K7EM19 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 2 1 1 1 53.751 53.751 4 3.5158E-09 52309 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.678 66.076 206860000 0 0 0 0 0 0 0 0 69699000 0 63182000 0 73978000 18445 3958 17330 162857;162858;162859 207729;207730;207731;207732 207729 4 HEALLYTWLAEHKPLVLCGPPGSGK Unmodified 2772.4421 0.44214134 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 119.7 119.7 3;4 1.5097E-19 124368 QUIQUE_C1368_190116_001 109.39 102.66 706010000 0 0 166580000 0 0 0 86405000 65660000 0 0 47628000 200810000 138930000 18446 3053 17331 162860;162861;162862;162863;162864;162865;162866;162867 207733;207734;207735;207736;207737;207738;207739;207740;207741;207742;207743 207734 11 HEALMSDLSAYGSSIQALR Oxidation (M) 2063.9946 0.99460363 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 2 2 2 2 2 3 1 98.099 98.099 2;3 1.3138E-17 100947 QUIQUE_C1218_190116_001 130.61 106.94 651150000 92952000 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207758;207759;207760;207761;207762;207763;207764;207765;207766;207767;207768;207769;207770;207771;207772;207773;207774;207775;207776;207777;207778;207779;207780;207781;207782;207783;207784;207785;207786;207787;207788;207789;207790 207769 31 HEAMITDLEER Unmodified 1342.6187 0.61871473 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 47.447 47.447 2 0.00045939 45115 QUIQUE_C1438_190116_001 114.5 102.45 154230000 41939000 0 0 0 50816000 0 61476000 0 0 0 0 0 0 18449 2378 17333 162905;162906;162907;162908;162909 207791;207792;207793;207794;207795;207796 207793 6 HEAPMQMASAQDAR Unmodified 1541.6715 0.67149535 3839 Q96E17 RAB3C Ras-related protein Rab-3C yes yes 0 0 0 2 1 24.19 24.19 2;3 6.1622E-05 17656 QUIQUE_C1403_190116_001 101.89 82.126 69017000 0 0 0 29185000 0 0 39831000 0 0 0 0 0 0 18450 3839 17334 162910;162911;162912 207797;207798;207799;207800 207798 4 HEARPLAELR Unmodified 1190.652 0.65200419 2290 P29590;H3BT57 PML Protein PML yes no 0 0 1 1 16.991 16.991 3 0.064148 9370 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207852;207853;207854;207855;207856;207857;207858;207859;207860;207861;207862;207863;207864;207865;207866 207865 15 HEEAIHAVACHPSK Unmodified 1584.7467 0.74670921 993 F5GYK2;Q9NRL3;M0R317 STRN4 Striatin-4 yes no 0 0 0 1 10.421 10.421 4 0.00031706 2876 QUIQUE_C1277_190116_001 76.939 72.239 3380900 0 3380900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18459 993 17342 162971 207867 207867 1 HEEAPGHRPTTNPNASK Unmodified 1841.8769 0.87687176 2177 P21291;E9PS42;E9PND2;E9PP21 CSRP1 Cysteine and glycine-rich protein 1 yes no 0 0 1 2 10.114 10.114 3;4 9.5356E-45 2564 QUIQUE_DMIX4_190116_001 127.49 113.63 155720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 155720000 0 0 0 18460 2177 17343 162972;162973 207868;207869 207868 2 HEELMLGDPCLK Unmodified 1440.6741 0.67412112 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 64.926 64.926 2 0.0052254 64059 QUIQUE_C1368_190116_001 66.92 50.722 96405000 44121000 0 52284000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18461 1929 17344 162974;162975 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HELQHPIIAR Unmodified 1212.6727 0.67273963 4429 Q9UHC6 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.797 16.797 3 0.0013395 9173 QUIQUE_C1438_190116_001 67.334 48.588 1105800000 130130000 129800000 112570000 91710000 83185000 65198000 116730000 47079000 66993000 0 102250000 62846000 97293000 18491 4429 17374 163340;163341;163342;163343;163344;163345;163346;163347;163348;163349;163350;163351 208315;208316;208317;208318;208319;208320;208321;208322;208323;208324;208325;208326 208319 10 HELTEISNVDVETQSGK Unmodified 1884.9065 0.90650013 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 56.115 56.115 3 7.2956E-07 53635 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.319 68.863 23369000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23369000 0 0 0 18492 2935 17375 163352;163353 208327;208328;208329 208327 3 HELWQEELSK Unmodified 1297.6303 0.63026569 3758 Q92845 KIFAP3 Kinesin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.695 56.695 2 0.0015742 55494 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6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 1 0 1 55.719 55.719 3 0.046731 51013 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.373 27.047 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18495 2602 17377 163376 208365 208365 1 HEMLPEFYK Unmodified 1192.5587 0.55868065 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.177 61.177 2 0.00041537 60910 QUIQUE_C1576_190116_001 120.15 107.57 2098200000 242190000 203360000 170360000 192830000 160350000 157590000 171130000 149170000 147190000 0 179730000 147500000 176800000 18496 3499 17378 163377;163378;163379;163380;163381;163382;163383;163384;163385;163386;163387;163388 208366;208367;208368;208369;208370;208371;208372;208373;208374;208375;208376;208377 208372 11 HEMLPEFYK Oxidation (M) 1208.5536 0.55359527 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 47.69 47.69 2 0.0022884 45073 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.629 82.997 576010000 0 0 0 0 0 0 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E9PBK7;P27361;E9PQW4;E9PJF0 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.961 19.961 2 0.00048867 12831 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.51 120.31 3055000000 348010000 428810000 337520000 400210000 243150000 390780000 231240000 0 156680000 146500000 88861000 163190000 120040000 18499 897;2263 17380 163419;163420;163421;163422;163423;163424;163425;163426;163427;163428;163429;163430 208418;208419;208420;208421;208422;208423;208424;208425;208426;208427;208428;208429 208428 11 HENVIGLLDVFTPAR Unmodified 1679.8995 0.89950468 627 B4E0K5;Q16539;E7EX54;B5TY33;H7C4E2 MAPK14 Mitogen-activated protein kinase 14 yes no 0 0 0 1 1 131.92 131.92 3 2.6238E-05 135902 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.797 60.512 25889000 0 0 0 0 0 0 0 25889000 0 0 0 0 0 18500 627 17381 163431;163432 208430;208431 208431 2 HEPENPPPYEEAMSVSLK Unmodified 2052.9463 0.94625646 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 1 2 80.48 80.48 3 0.0018436 80520 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208443;208444;208445;208446;208447;208448;208449;208450;208451;208452 208443 7 HEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWK Unmodified 2719.3767 0.37670431 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 164.74 164.74 2;3 7.5304E-12 168743 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.988 92.718 2427500000 67796000 125110000 138660000 116040000 0 0 364580000 163350000 244260000 9661400 414600000 494120000 289300000 18504 1875 17385 163454;163455;163456;163457;163458;163459;163460;163461;163462;163463;163464;163465 208453;208454;208455;208456;208457;208458;208459;208460;208461;208462;208463;208464;208465;208466;208467;208468;208469;208470;208471 208470 19 HEPVGVCGQIIPWNFPLLMQAWK Oxidation (M) 2735.3716 0.37161893 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.52 157.52 3 5.0668E-06 162223 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.936 57.945 596180000 0 0 0 108750000 124150000 97513000 0 0 66657000 0 0 99344000 99766000 18505 1875 17385 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163483;163484;163485;163486;163487;163488;163489;163490;163491;163492;163493;163494;163495;163496;163497;163498;163499 208490;208491;208492;208493;208494;208495;208496;208497;208498;208499;208500;208501;208502;208503;208504;208505;208506;208507;208508;208509;208510;208511;208512 208502 23 HEQISDLER Unmodified 1125.5415 0.54145068 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.367 22.367 2 0.00044053 15644 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.33 31.501 590310000 0 40989000 56798000 0 72195000 56770000 62929000 34163000 48709000 0 83886000 62081000 71789000 18508 2285 17388 163500;163501;163502;163503;163504;163505;163506;163507;163508;163509 208513;208514;208515;208516;208517;208518;208519;208520;208521;208522;208523 208521 10 HEQLLYVSR Unmodified 1143.6037 0.60365701 62 A0A087WWM6;O43272 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.374 34.374 2 7.8568E-08 29642 QUIQUE_DMIX7_190116_001 166.33 129.3 1537500000 119190000 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1283.6721 0.67213051 1052 F8W7Q4;Q96A26 FAM162A Protein FAM162A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 42.12 42.12 2 4.5233E-16 39959 QUIQUE_C1218_190116_001 202.96 129.71 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18517 1052 17397 163596;163597;163598;163599;163600;163601;163602;163603;163604 208632;208633;208634;208635;208636;208637;208638;208639;208640 208632 9 HETWSGHVISS Unmodified 1238.568 0.56799978 4569 Q9Y2V2 CARHSP1 Calcium-regulated heat stable protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.27 30.27 2 0.0073656 25168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.156 43.856 611290000 0 0 0 132130000 102790000 67452000 0 0 0 0 90594000 85968000 132360000 18518 4569 17398 163605;163606;163607;163608;163609;163610 208641;208642;208643;208644;208645;208646 208644 5 HEVEKSEISENTDASGK Unmodified 1858.8545 0.85446456 4427 Q9UHB6;F8VQE1;F8VRN8 LIMA1 LIM domain and actin-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 13.466 13.466 3 0.0067873 5575 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.141 65.91 15646000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15646000 0 0 18519 4427 17399 163611 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208663;208664;208665;208666;208667;208668;208669;208670;208671 208667 9 HEVSASTQSTPASSR Unmodified 1543.7227 0.72266253 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 1 10.306 10.306 2;3 2.5012E-111 2711 QUIQUE_C1403_190116_001 267.43 227.43 758630000 309870000 95601000 0 67327000 31089000 0 0 15462000 8531300 88519000 0 140030000 2202500 18522 2851 17402 163634;163635;163636;163637;163638;163639;163640;163641;163642;163643;163644;163645;163646;163647;163648;163649;163650;163651 208672;208673;208674;208675;208676;208677;208678;208679;208680;208681;208682;208683;208684;208685;208686;208687;208688;208689;208690 208678 18 HEVTICNYEASANPADHR Unmodified 2082.9178 0.91775029 4103 Q9GZP4;X6R8S9 PITHD1 PITH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.223 40.223 3 1.617E-31 36493 QUIQUE_C1403_190116_001 154.51 146.01 714110000 66656000 67270000 0 104980000 0 85647000 86503000 56707000 76683000 0 63132000 0 106540000 18523 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0.8277963 4546 Q9Y281 CFL2 Cofilin-2 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 59.11 59.11 2;3 9.8801E-28 57685 QUIQUE_C1368_190116_001 171.05 136.36 3178100000 151670000 198410000 239880000 191400000 241040000 122170000 264080000 279080000 349640000 132560000 384190000 291660000 332340000 18526 4546 17406 163677;163678;163679;163680;163681;163682;163683;163684;163685;163686;163687;163688;163689;163690;163691;163692;163693;163694;163695;163696;163697;163698 208717;208718;208719;208720;208721;208722;208723;208724;208725;208726;208727;208728;208729;208730;208731;208732;208733;208734;208735;208736;208737;208738;208739;208740;208741;208742;208743 208720 26 HEYFMHATDK Unmodified 1277.5499 0.54990688 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 18.182 18.182 2;3 5.7076E-12 10615 QUIQUE_C1277_190116_001 166.19 142.23 1492100000 155110000 162930000 130420000 138720000 165720000 82339000 112460000 60570000 124120000 33701000 122610000 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208767;208768;208769;208770;208771;208772;208773;208774;208775;208776;208777;208778;208779;208780;208781;208782;208783;208784;208785;208786;208787;208788;208789;208790;208791 208774 25 HEYPLSWMK Oxidation (M) 1205.5539 0.55392962 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 1 0 1 1 45.32 45.32 2 0.0074537 41365 QUIQUE_C1277_190116_001 84.743 65.472 90823000 0 46038000 0 0 0 0 0 0 0 44784000 0 0 0 18529 3549 17409 163743;163744 208792;208793 208792 2686 2 HEYPLSWMK Unmodified 1189.559 0.559015 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 65.669 65.669 2 0.046798 65752 QUIQUE_C1368_190116_001 51.63 36.249 139160000 0 0 139160000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18530 3549 17409 163745 208794 208794 1 HEYWFAVPQER Unmodified 1460.6837 0.68369824 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 79.3 79.3 2;3 0.00047628 80355 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.24 84.504 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208805;208806;208807;208808;208809;208810;208811;208812;208813;208814;208815;208816;208817;208818;208819;208820;208821;208822;208823;208824 208806 18 HFATSCHQDEYSQQIVCHCR Unmodified 2562.0587 0.058694001 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 31.698 31.698 4 0.00024731 26432 QUIQUE_C1277_190116_001 59.9 52.367 101610000 0 49263000 0 0 52344000 0 0 0 0 0 0 0 0 18534 2665 17413 163773;163774 208825;208826 208825 2 HFCPNVPIILVANK Unmodified 1620.881 0.88101784 2760 P62745 RHOB Rho-related GTP-binding protein RhoB yes yes 0 0 0 1 3 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 90.375 90.375 2;3 1.7693E-06 93331 QUIQUE_C1576_190116_001 116.52 93.831 1714000000 94179000 135400000 222840000 69782000 218240000 64359000 283180000 30965000 94433000 50009000 172600000 65559000 212480000 18535 2760 17414 163775;163776;163777;163778;163779;163780;163781;163782;163783;163784;163785;163786;163787;163788;163789;163790;163791;163792;163793;163794;163795 208827;208828;208829;208830;208831;208832;208833;208834;208835;208836;208837;208838;208839;208840;208841;208842;208843;208844;208845;208846;208847;208848;208849;208850;208851 208840 20 HFCPNVPIILVANKK Unmodified 1748.976 0.97598086 2760 P62745 RHOB Rho-related GTP-binding protein RhoB yes yes 0 0 1 1 1 2 2 69.743 69.743 3 0.00014499 68687 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.527 70.469 250930000 0 0 0 0 0 0 0 111110000 0 0 83496000 56328000 0 18536 2760 17415 163796;163797;163798;163799;163800;163801 208852;208853;208854;208855;208856;208857 208857 5 HFCPNVPIILVGNK Unmodified 1606.8654 0.86536778 2725;1937 Q5JR08;P08134;E9PQH6;Q5JR07;Q5JR05;P61586;C9JNR4;C9JX21 RHOC;RHOA Rho-related GTP-binding protein RhoC;Transforming protein RhoA no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 89.721 89.721 2;3 3.3268E-37 92278 QUIQUE_C1277_190116_001 194.06 176 9726700000 846140000 1027700000 1391300000 994880000 833720000 1004400000 1094200000 346450000 556470000 258420000 473820000 282310000 616970000 18537 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209035;209036;209037;209038;209039;209040;209041;209042;209043;209044;209045;209046 209035 10 HFHPLFEYFDYESR Unmodified 1885.8424 0.84238373 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 2 1 1 2 2 105.4 105.4 2;3 2.0909E-05 108398 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.551 93.45 1212000000 0 70685000 0 84240000 47176000 58555000 187310000 68308000 171840000 38037000 190140000 264500000 31197000 18549 3926 17427 163933;163934;163935;163936;163937;163938;163939;163940;163941;163942;163943;163944;163945;163946;163947;163948;163949;163950 209047;209048;209049;209050;209051;209052;209053;209054;209055;209056;209057;209058;209059;209060;209061;209062;209063;209064;209065;209066;209067 209065 20 HFHVPDQGINIYR Unmodified 1594.8005 0.80045934 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.775 60.775 3 1.6564E-06 60228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.25 92.697 438760000 0 36229000 0 61457000 34375000 48246000 0 70323000 71937000 11444000 0 37416000 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209300 4 HFNSMSGPATLR Unmodified 1316.6296 0.62955418 4575 Q9Y305 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 32.32 32.32 2 0.00053235 27347 QUIQUE_C1218_190116_001 100.58 71.858 267370000 60514000 59588000 0 23973000 0 22013000 25066000 29279000 24651000 0 0 22284000 0 18564 4575 17442 164137;164138;164139;164140;164141;164142;164143;164144;164145;164146 209304;209305;209306;209307;209308;209309;209310;209311;209312;209313;209314;209315 209304 12 HFNTGPKPNSTAAGVSVIATTALDK Unmodified 2496.2973 0.29725124 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 0 1 1 75.327 75.327 3 4.5108E-19 76237 QUIQUE_C1218_190116_001 103.63 97.405 37477000 37477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18565 1478 17443 164147 209316 209316 1 HFNTGPKPNSTAAGVSVIATTALDKER Unmodified 2781.441 0.44095536 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 0 2 1 71.455 71.455 4 1.8416E-18 70720 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.541 81.892 169660000 0 0 0 0 0 0 0 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209585 225 HFTEDIQTR Unmodified 1145.5465 0.54653606 2808 P78362;H7C5L6;H7C521 SRPK2 SRSF protein kinase 2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.259 21.259 2 0.0053778 13979 QUIQUE_C1277_190116_001 86.833 37.474 195970000 41585000 46904000 0 0 0 0 0 0 0 0 66980000 40498000 0 18575 2808 17453 164378;164379;164380;164381;164382;164383 209696;209697;209698;209699;209700;209701 209697 6 HFTEFVPLR Unmodified 1144.6029 0.60292873 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 3 2 2 1 1 2 2 2 1 1 63.512 63.512 2;3 1.3211E-06 62194 QUIQUE_C1403_190116_001 155.75 130.83 4003400000 501890000 342160000 417540000 291850000 344410000 301550000 428770000 94351000 159100000 350550000 317010000 184020000 270160000 18576 2414 17454 164384;164385;164386;164387;164388;164389;164390;164391;164392;164393;164394;164395;164396;164397;164398;164399;164400;164401;164402;164403;164404;164405;164406 209702;209703;209704;209705;209706;209707;209708;209709;209710;209711;209712;209713;209714;209715;209716;209717;209718;209719;209720;209721;209722;209723;209724;209725;209726;209727;209728;209729;209730;209731;209732;209733;209734;209735;209736;209737;209738;209739 209712 36 HFTILDAPGHK Unmodified 1234.6459 0.64585618 2089 P15170;H3BR35;H3BSV8 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.091 32.091 3 0.0016575 27174 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.211 49.855 708370000 0 0 0 0 115310000 0 119220000 84822000 0 43829000 121840000 87001000 136350000 18577 2089 17455 164407;164408;164409;164410;164411;164412;164413;164414;164415;164416 209740;209741;209742;209743;209744;209745;209746;209747;209748;209749 209746 8 HFTQPHAQDFLR Unmodified 1495.732 0.73204542 3238 Q4G176;A0A3B3ISK9;F5H5A1;F5H362;F5H755;H0YGC7;F5H2G6;F5H3B2;H0YH37 ACSF3 Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 43.58 43.58 3 0.0081011 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2;3 1.2597E-05 80014 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.57 119.1 4138900000 329000000 299690000 404100000 311680000 245840000 119270000 352570000 352310000 405780000 55964000 492250000 310100000 460350000 18585 3089 17461 164469;164470;164471;164472;164473;164474;164475;164476;164477;164478;164479;164480;164481;164482;164483;164484;164485;164486;164487;164488;164489;164490;164491;164492 209817;209818;209819;209820;209821;209822;209823;209824;209825;209826;209827;209828;209829;209830;209831;209832;209833;209834;209835;209836;209837;209838;209839;209840;209841 209833 23 HFVLDECDK Unmodified 1161.5125 0.51245874 260 A0A0D9SEM9 DDX39A no no 0 0 0 1 31.749 31.749 2 0.051988 27066 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.558 39.129 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18586 260 17462 164493 209842 209842 1 HFVTISSPLATQIPQAVGAAYAAK Unmodified 2440.3114 0.31144474 1012 F5H5P2;P12694;F5GXU9;H0YH31 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 120.96 120.96 2;3 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Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 2 1 2 3 1 63.976 63.976 2;3 0.00035616 63555 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.044 59.022 1394100000 84561000 92414000 83876000 88257000 69691000 76262000 54508000 340770000 256300000 42456000 0 164570000 40407000 18601 959 17476 164600;164601;164602;164603;164604;164605;164606;164607;164608;164609;164610;164611;164612;164613;164614;164615;164616;164617;164618;164619 209961;209962;209963;209964;209965;209966;209967;209968;209969;209970;209971;209972;209973;209974;209975;209976;209977;209978;209979;209980;209981;209982 209976 19 HGDLLFLFPSSLAGPSSEMETSVPPGFK Unmodified 2946.4473 0.44734587 3660 Q8TAT6;I3L4U9;A0A0D9SFI9 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes no 0 0 0 1 1 155.35 155.35 3 1.9181E-05 158081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.507 34.824 43838000 0 0 0 0 0 0 0 43838000 0 0 0 0 0 18602 3660 17477 164620;164621 209983;209984 209983 2 HGDLPDIQIK Unmodified 1134.6033 0.60332266 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 51.609 51.609 2 0.018983 49944 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.269 49.325 38955000 0 0 38955000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18603 2813 17478 164622;164623 209985;209986 209986 2 HGDTWGSICDSDFSLEAASVLCR Unmodified 2582.1166 0.11658604 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 139.22 139.22 3 0.00048215 143171 QUIQUE_C1403_190116_001 45.011 41.797 15043000 0 0 0 15043000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18604 725 17479 164624 209987 209987 1 HGEAQVKIWR Unmodified 1222.6571 0.65708956 2139 P18669;Q8N0Y7 PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 yes no 0 0 1 1 20.569 20.569 3 0.013091 13678 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.565 31.358 22356000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22356000 0 0 18605 2139 17480 164625 209988 209988 1 HGEEVSPAASDLAMVLTR Unmodified 1881.9255 0.92546143 67 A0A087WXN9;Q765P7 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 0 1 1 105 105 3 0.003584 106802 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0 1 0 1 138.54 138.54 3 0.00043337 143542 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.841 40.314 47316000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47316000 18608 2026 17482 164651 210020 210020 1338 1 HGEGGHYHYDTTPDIVEYLGYFLPAEFLYR Unmodified 3558.6521 0.65207035 4127 Q9H0W9;A0A087WT99 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 1 165.77 165.77 5 8.6045E-09 173212 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.722 54.054 28640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28640000 0 0 18609 4127 17483 164652 210021 210021 1 HGEIDYEAIVK Unmodified 1272.635 0.63501672 124 A0A087X2I1;P62333 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.654 57.654 2;3 0.0017685 56732 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.598 71.747 686150000 0 144370000 184370000 0 0 161320000 0 0 0 83535000 112550000 0 0 18610 124 17484 164653;164654;164655;164656;164657;164658 210022;210023;210024;210025;210026;210027;210028 210028 7 HGEQDPSLWEQALSYFAR Unmodified 2132.9916 0.99156716 65;4141 A0A087WXL6;B7Z879;A0A0G2JS92;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 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210305;210306;210307;210308;210309;210310;210311;210312;210313;210314;210315;210316;210317;210318;210319;210320;210321;210322;210323;210324;210325;210326;210327;210328;210329;210330;210331;210332;210333;210334;210335;210336;210337;210338;210339;210340;210341;210342;210343;210344;210345;210346;210347;210348;210349;210350;210351;210352;210353;210354;210355;210356;210357;210358;210359;210360 210335 56 HGGYKPSDEHKTDLNPDNLQGGDDLDPNYVLSSR Unmodified 3752.7303 0.73027368 2044 P12277;G3V4N7;G3V461 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 2 3 3 3 3 3 3 3 4 3 2 3 3 3 78.791 78.791 3;4;5 0 80024 QUIQUE_C1277_190116_001 301.93 293.46 69704000000 1207400000 2241800000 2538700000 1813300000 3213200000 1687300000 3569900000 13809000000 9533700000 347770000 10100000000 10183000000 9458400000 18627 2044 17501 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delta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 80.546 80.546 3 1.0687E-09 82155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.944 73.844 25357000 0 0 0 0 0 0 25357000 0 0 0 0 0 0 18628 437;1437 17502 164909;164910;164911;164912 210447;210448;210449;210450 210450 4 HGIHPSLVADVHQYFYR Unmodified 2038.0173 0.017328404 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 1 1 77.384 77.384 4 0.0073298 78276 QUIQUE_DMIX8_190116_001 55.815 52.669 84635000 0 0 25675000 0 0 0 0 0 0 0 0 28800000 30161000 18629 3891 17503 164913;164914;164915 210451;210452;210453;210454 210454 3 HGIIEDWDLMER Unmodified 1512.7031 0.70311306 4374 Q9P1U1 ACTR3B Actin-related protein 3B yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 106.54 106.54 2;3 0.0003375 109171 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.182 72.829 732580000 68197000 83545000 68214000 81255000 39240000 37578000 62686000 62513000 17791000 0 74292000 65792000 71474000 18630 4374 17504 164916;164917;164918;164919;164920;164921;164922;164923;164924;164925;164926;164927;164928;164929;164930;164931;164932;164933;164934;164935;164936;164937 210455;210456;210457;210458;210459;210460;210461;210462;210463;210464;210465;210466;210467;210468;210469;210470;210471;210472;210473;210474;210475;210476;210477;210478;210479 210470 25 HGILQFLHIYHAVK Unmodified 1674.9358 0.93583061 2509 P48506;A0A2R8YEL6;E1CEI4;A0A0C4DGB2;D6RGF8 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 80.147 80.147 3;4 6.1301E-05 79616 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.82 93.19 249120000 26616000 45223000 0 0 0 25721000 0 49788000 0 23247000 78521000 0 0 18631 2509 17505 164938;164939;164940;164941;164942;164943;164944 210480;210481;210482;210483;210484;210485;210486 210485 7 HGINCFINR Unmodified 1129.5451 0.54509627 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 1 32.574 32.574 2;3 5.2418E-07 27745 QUIQUE_C1438_190116_001 158.36 141.58 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GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 27.145 27.145 2 0.0021472 21757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.367 75.846 343010000 0 0 0 0 0 0 0 141330000 0 24587000 177090000 0 0 18634 2194 17508 164973;164974;164975 210519;210520;210521;210522 210519 4 HGITQANELVNLTEFFVNHILPDLK Unmodified 2861.5076 0.50757837 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 2 2 1 171.07 171.07 3;4 1.086E-19 178271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.72 100.26 304410000 0 0 0 0 0 0 0 0 150940000 0 147680000 0 5790900 18635 2657 17509 164976;164977;164978;164979;164980 210523;210524;210525;210526;210527 210526 5 HGIVEDWDLMER Unmodified 1498.6875 0.68746299 2714 P61158;B4DXW1;F8WDR7 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 2 2 96.999 96.999 2;3 7.1913E-07 99186 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.88 124.06 3885400000 290090000 342390000 381410000 400200000 318920000 241070000 342450000 258530000 281440000 98065000 265750000 307310000 357780000 18636 2714 17510 164981;164982;164983;164984;164985;164986;164987;164988;164989;164990;164991;164992;164993;164994;164995;164996;164997;164998;164999;165000;165001;165002;165003;165004;165005;165006 210528;210529;210530;210531;210532;210533;210534;210535;210536;210537;210538;210539;210540;210541;210542;210543;210544;210545;210546;210547;210548;210549;210550;210551;210552;210553;210554;210555;210556;210557;210558;210559 210546 20 HGLANLTAELLQQGANPNLQTEEALPLPK Unmodified 3079.6302 0.6302127 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.32 142.32 3 4.1356E-93 147076 QUIQUE_DMIX8_190116_001 173.21 170.87 1622900000 84441000 128690000 119550000 88050000 219230000 112270000 186970000 164690000 0 110950000 0 218090000 189950000 18637 4390 17511 165007;165008;165009;165010;165011;165012;165013;165014;165015;165016;165017 210560;210561;210562;210563;210564;210565;210566;210567;210568;210569;210570;210571;210572;210573;210574;210575;210576 210576 17 HGLDVSACEVFR Unmodified 1388.6507 0.65068356 4526 Q9UQ03 CORO2B Coronin-2B yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 67.322 67.322 2;3 0.00019274 67202 QUIQUE_C1277_190116_001 143.5 127.62 705870000 26833000 102910000 47695000 34216000 34070000 72548000 43434000 43090000 90320000 21823000 32671000 108200000 48071000 18638 4526 17512 165018;165019;165020;165021;165022;165023;165024;165025;165026;165027;165028;165029;165030;165031;165032;165033;165034;165035 210577;210578;210579;210580;210581;210582;210583;210584;210585;210586;210587;210588;210589;210590;210591;210592;210593;210594;210595;210596;210597;210598;210599;210600;210601;210602 210582 26 HGLEAISIMDSR Unmodified 1327.6554 0.65543458 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.375 67.375 2;3 0.00025119 67439 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.943 86.736 137220000 0 37504000 0 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HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 142.58 142.58 2;3 6.5213E-65 148385 QUIQUE_C1218_190116_001 224.42 212.22 11700000000 640110000 1012900000 808970000 803720000 0 864120000 1583800000 676540000 896860000 499300000 1661000000 1345000000 908140000 18641 1931 17514 165068;165069;165070;165071;165072;165073;165074;165075;165076;165077;165078;165079;165080;165081;165082;165083;165084;165085;165086;165087;165088;165089;165090;165091;165092 210637;210638;210639;210640;210641;210642;210643;210644;210645;210646;210647;210648;210649;210650;210651;210652;210653;210654;210655;210656;210657;210658;210659;210660;210661;210662;210663;210664;210665;210666;210667;210668;210669;210670;210671;210672;210673 210640 35 HGLEVIYMIEPIDEYCVQQLKEFEGK Unmodified 3166.5355 0.53550895 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 1 1 150.72 150.72 3 1.3163E-17 153477 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.08 94.179 36855000 0 0 0 0 0 0 0 36855000 0 0 0 0 0 18642 1931 17515 165093 210674 210674 1 HGLINAGYR Unmodified 999.52501 0.52501276 4480 Q9UL12;A0A0A0MT55;Q5SYV2 SARDH Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 21.363 21.363 2 0.032934 14488 QUIQUE_C1368_190116_001 71.134 50.509 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18643 4480 17516 165094 210675 210675 1 HGLIPNLLGEGIYAR Unmodified 1621.894 0.89402537 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 113.07 113.07 3 0.00016355 116534 QUIQUE_C1403_190116_001 76.262 68.286 233850000 19149000 0 12310000 25610000 0 0 25004000 35357000 36585000 9211900 42302000 28324000 0 18644 2377 17517 165095;165096;165097;165098;165099;165100;165101;165102;165103;165104 210676;210677;210678;210679;210680;210681;210682;210683;210684;210685 210678 8 HGLLLANAYIYVVQLPAK Unmodified 1982.1353 0.13531827 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 1 1 134.75 134.75 3 5.1102E-05 141038 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.148 82.178 57440000 0 0 0 0 0 0 0 22131000 0 0 35309000 0 0 18645 2345 17518 165105;165106;165107 210686;210687;210688 210687 3 HGLLVPNNTTDQELQHIR Unmodified 2084.0763 0.076299846 2681 P56537;B7ZBH1 EIF6 Eukaryotic translation initiation factor 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 61.246 61.246 3 4.3597E-06 60007 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.361 72.369 1156800000 115070000 104210000 119850000 0 95018000 99694000 78409000 103300000 102400000 18902000 122590000 88668000 108710000 18646 2681 17519 165108;165109;165110;165111;165112;165113;165114;165115;165116;165117;165118;165119;165120 210689;210690;210691;210692;210693;210694;210695;210696;210697;210698;210699;210700;210701;210702 210696 14 HGLPPSETIAIVEHINAK Unmodified 1925.0371 0.037060793 1695 O94903;E5RFX7;H0YBG2 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 78.124 78.124 3 7.7492E-05 79095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.007 72.591 909320000 53909000 84230000 89978000 79627000 66121000 112940000 112350000 64971000 60925000 31266000 0 63272000 89729000 18647 1695 17520 165121;165122;165123;165124;165125;165126;165127;165128;165129;165130;165131;165132;165133 210703;210704;210705;210706;210707;210708;210709;210710;210711;210712;210713;210714;210715;210716;210717 210712 12 HGLQHEGIFR Unmodified 1192.6101 0.61013937 17 A0A075B7B5;B7ZM87;O75044;Q5VZB4 SRGAP2 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.058 20.058 3 9.0988E-05 12555 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.23 96.128 554930000 83009000 88346000 75695000 72146000 48078000 0 0 49242000 38895000 20885000 36700000 41931000 0 18648 17 17521 165134;165135;165136;165137;165138;165139;165140;165141;165142;165143;165144 210718;210719;210720;210721;210722;210723;210724;210725;210726;210727;210728 210727 8 HGLVPFAFVR Unmodified 1141.6396 0.63964859 2980 Q13242;H0YIB4;S4R3G0 SRSF9 Serine/arginine-rich splicing factor 9 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 87.549 87.549 2 0.0016861 89006 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210739;210740;210741;210742;210743;210744;210745;210746;210747;210748;210749 210739 10 HGMDEFISSNPCNFDHASLFEMVQR Unmodified 2967.2738 0.27383173 4494;981;1154 F1T0E5;H7C4P2;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 131.47 131.47 3;4 8.5405E-99 135528 QUIQUE_C1277_190116_001 181.82 172.95 382010000 80751000 112130000 0 27632000 0 0 44337000 0 0 0 40401000 33226000 43534000 18651 981;1154;4494 17524 165164;165165;165166;165167;165168;165169;165170;165171;165172;165173 210750;210751;210752;210753;210754;210755;210756;210757;210758;210759;210760;210761 210752 12 HGNALWLNER Unmodified 1208.6051 0.60505399 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.131 39.131 2 0.0055595 35549 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.029 65.986 353600000 0 0 0 0 52512000 40493000 96946000 0 0 0 99779000 0 63869000 18652 1881 17525 165174;165175;165176;165177;165178;165179 210762;210763;210764;210765;210766;210767 210766 6 HGNIQVSCVECSNQQGR Unmodified 1971.8639 0.86394058 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 23.474 23.474 3 0.0017554 16926 QUIQUE_C1576_190116_001 53.504 44.408 25544000 0 0 0 0 0 0 25544000 0 0 0 0 0 0 18653 3684 17526 165180 210768 210768 1 HGNPEEEEWLTAER Unmodified 1695.7489 0.74887728 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 1 57.665 57.665 2 1.6693E-05 57477 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.49 90.238 29745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29745000 18654 3777 17527 165181;165182 210769;210770 210769 2 HGNQYIQVNEPWKR Unmodified 1767.8805 0.88050057 2677 P56192 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 47.96 47.96 3 0.0048747 45509 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.806 41.248 113140000 0 0 0 0 0 0 0 0 59427000 0 0 53715000 0 18655 2677 17528 165183;165184 210771;210772;210773 210771 3 HGPGVSTPDVAVR Unmodified 1290.668 0.66804818 3760 Q92859;Q59FP8 NEO1 Neogenin yes no 0 0 0 1 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165196;165197;165198;165199;165200;165201;165202;165203;165204;165205;165206;165207;165208;165209;165210;165211;165212;165213;165214;165215;165216;165217 210785;210786;210787;210788;210789;210790;210791;210792;210793;210794;210795;210796;210797;210798;210799;210800;210801;210802;210803;210804;210805;210806;210807 210804 23 HGQEEAAQSPYR Unmodified 1371.6167 0.61674089 4265 Q9NRD1;J3KQ72 FBXO6 F-box only protein 6 yes no 0 0 0 1 1 13.332 13.332 2;3 0.0017016 5284 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.163 89.12 25781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11199000 0 14582000 18659 4265 17532 165218;165219 210808;210809 210809 2 HGQEHVEVYHAHYKPLEFTVAGR Unmodified 2703.3306 0.33061705 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A096LPK7;A0A0U1RQX0;A0A096LPH4;A0A096LPB7;A0A096LP96 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 49.297 49.297 5 0.0075774 46477 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.767 18.213 46829000 0 0 0 0 0 0 0 46829000 0 0 0 0 0 18660 330 17533 165220 210810 210810 1 HGQGFYLISPSEFER Unmodified 1765.8424 0.84238373 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 103.24 103.24 2;3 2.3753E-35 107751 QUIQUE_DMIX5_190116_001 169.57 152.2 1987300000 123060000 135520000 185280000 130390000 122260000 137010000 179620000 151840000 201350000 40502000 176460000 204560000 199480000 18661 57 17534 165221;165222;165223;165224;165225;165226;165227;165228;165229;165230;165231;165232;165233;165234;165235;165236;165237;165238;165239;165240;165241;165242;165243;165244;165245;165246;165247 210811;210812;210813;210814;210815;210816;210817;210818;210819;210820;210821;210822;210823;210824;210825;210826;210827;210828;210829;210830;210831;210832;210833;210834;210835;210836;210837;210838;210839;210840;210841;210842;210843;210844;210845;210846;210847;210848;210849;210850;210851;210852;210853;210854;210855;210856 210846 46 HGSALDVLLSMGFPR Unmodified 1598.8239 0.8238969 3691 Q8TF42 UBASH3B Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B yes yes 0 0 0 1 148.62 148.62 3 0.014131 153200 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.208 14.581 10011000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10011000 0 18662 3691 17535 165248 210857 210857 1 HGSFLVR Unmodified 814.44497 0.44497152 2898 Q06124;A0A1W2PPU4 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 19.586 19.586 2 0.024913 12580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.075 39.611 43875000 0 0 0 0 0 0 0 43875000 0 0 0 0 0 18663 2898 17536 165249 210858 210858 1 HGSGADSDYENTQSGDPLLGLEGK Unmodified 2446.0884 0.088440254 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QL89 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.774 83.774 3 1.251E-11 84706 QUIQUE_C1403_190116_001 88.79 81.812 341920000 40848000 49431000 58405000 46261000 32477000 47728000 37855000 0 28912000 0 0 0 0 18664 245 17537 165250;165251;165252;165253;165254;165255;165256;165257 210859;210860;210861;210862;210863;210864;210865;210866 210862 8 HGSGSGHSSSYGQHGSGSGWSSSSGR Unmodified 2476.0137 0.013652602 795 CON__Q86YZ3;Q86YZ3 HRNR Hornerin yes no 0 0 0 1 1 10.149 10.149 4 5.5832E-10 2566 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.948 76.588 6372100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4009200 2362900 + 18665 795 17538 165258;165259 210867;210868 210868 0 HGSIIYHPSLLPR Unmodified 1488.8201 0.82013215 1665 O75891;C9IZ36;C9JYZ6;C9JY00 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 1 3 50.628 50.628 2;3 0.00013077 49482 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.79 0 2062700000 0 0 351890000 0 170330000 0 251530000 187070000 127770000 62021000 420270000 161240000 330590000 18666 1665 17539 165260;165261;165262;165263;165264;165265;165266;165267;165268;165269;165270;165271;165272;165273;165274;165275 210869;210870;210871;210872;210873;210874;210875;210876;210877;210878;210879;210880;210881;210882;210883;210884;210885;210886;210887;210888 210881 18 HGSILACAEVAYALYK Unmodified 1764.8869 0.88689108 1283 J3KR97;Q9BTW9;I3L439;I3L163;I3L0V3;I3L500;I3L143;I3L4D2;I3L3H4;I3L131;I3L1S3 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 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Unmodified 1129.588 0.58800695 4604 Q9Y4E6;A2RRE0;K7EMF3 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 40.354 40.354 2 0.015709 37269 QUIQUE_C1576_190116_001 90.709 61.371 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18670 4604 17543 165293;165294;165295 210907;210908;210909 210908 3 HGSYEDAVHSGALND Unmodified 1570.6648 0.6648133 2132 P17987;E7EQR6;F5H282 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 38.746 38.746 2;3 1.9707E-94 34119 QUIQUE_C1368_190116_001 218.62 204.41 1942800000 241440000 190720000 128430000 216430000 211570000 180430000 205760000 100100000 42867000 115850000 75246000 79071000 154870000 18671 2132 17544 165296;165297;165298;165299;165300;165301;165302;165303;165304;165305;165306;165307;165308;165309;165310;165311;165312;165313;165314;165315;165316;165317 210910;210911;210912;210913;210914;210915;210916;210917;210918;210919;210920;210921;210922;210923;210924;210925;210926;210927;210928;210929;210930;210931;210932;210933 210914 23 HGTCAAQVDALNSQK Unmodified 1598.7471 0.74710314 85 D6REQ6;D6RHI9;A0A087WZM2;O00584;H0YAE9 RNASET2 Ribonuclease T2 yes no 0 0 0 1 20.392 20.392 2 0.0072835 13205 QUIQUE_C1576_190116_001 67.118 54.027 19568000 0 0 0 0 0 0 19568000 0 0 0 0 0 0 18672 85 17545 165318 210934 210934 0 HGTDDGVVWMNWK Unmodified 1543.6878 0.68779734 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 91.719 91.719 2;3 2.9605E-90 93871 QUIQUE_C1277_190116_001 233.09 223.75 1968000000 191560000 254740000 83083000 369160000 216640000 38167000 212850000 116370000 48083000 92827000 0 92391000 252100000 18673 1824 17546 165319;165320;165321;165322;165323;165324;165325;165326;165327;165328;165329;165330;165331;165332;165333;165334;165335;165336;165337;165338;165339;165340;165341 210935;210936;210937;210938;210939;210940;210941;210942;210943;210944;210945;210946;210947;210948;210949;210950;210951;210952;210953;210954;210955;210956;210957;210958;210959;210960 210941 26 HGTDDGVVWMNWK Oxidation (M) 1559.6827 0.68271197 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 1 0 1 72.062 72.062 3 0.0080037 68042 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.429 42.628 14548000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14548000 0 0 0 18674 1824 17546 165342 210961 210961 1046 1 HGTLRPGVTNEQLWSAQK Unmodified 2021.0443 0.044271436 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;C9JIV5;H7C1S9 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 0 0 1 2 2 1 45.341 45.341 3;4 2.1588E-13 41104 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.94 105.94 192250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60394000 57932000 0 73926000 18675 3679 17547 165343;165344;165345;165346;165347 210962;210963;210964;210965;210966 210964 5 HGVDHQVISVTFEK Unmodified 1594.8104 0.81035532 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 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210979;210980;210981;210982;210983;210984;210985;210986;210987;210988;210989;210990;210991;210992;210993;210994;210995;210996;210997;210998;210999;211000;211001;211002;211003;211004;211005;211006;211007;211008;211009;211010;211011;211012;211013;211014;211015;211016;211017;211018;211019;211020;211021;211022;211023;211024;211025;211026;211027;211028;211029;211030;211031;211032;211033 210985 55 HGVESTLER Unmodified 1026.5094 0.50942227 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 14.65 14.65 2 0.029676 6604 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.378 28.892 37463000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37463000 0 0 0 18678 922 17550 165390 211034 211034 1 HGVFLVR Unmodified 826.48136 0.48135703 2479 P46108;I3L297 CRK Adapter molecule crk yes no 0 0 0 1 1 28.538 28.538 2 0.01786 24057 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.48 106.33 374010000 0 0 0 0 0 0 0 157830000 0 0 0 0 216180000 18679 2479 17551 165391;165392 211035;211036 211035 2 HGVIVAADSR Unmodified 1023.5461 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165454;165455;165456;165457;165458;165459;165460;165461;165462;165463;165464 211121;211122;211123;211124;211125;211126;211127;211128;211129;211130;211131 211130 11 HGYIGEFEIIDDHR Unmodified 1699.7954 0.79543354 1182;1252 H3BN98;I3L246;I3L3P7;P62244 RPS15A 40S ribosomal protein S15a no no 0 0 0 1 1 1 75.816 75.816 3 6.0361E-05 78062 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.891 66.058 402360000 0 0 0 0 0 0 0 0 157470000 0 120540000 0 124360000 18686 1182;1252 17558 165465;165466;165467 211132;211133;211134 211133 2 HGYPLIIYDVFPDACK Unmodified 1906.9288 0.9287559 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.35 133.35 3 4.0606E-08 137951 QUIQUE_C1403_190116_001 91.812 81.891 285230000 0 0 48350000 42779000 41477000 46097000 0 0 37240000 20110000 0 0 49182000 18687 2338 17559 165468;165469;165470;165471;165472;165473;165474;165475;165476 211135;211136;211137;211138;211139;211140;211141;211142;211143;211144;211145 211138 9 HGYPLIIYDVFPDACKEFQDAGEQVVSSPADVAEK Unmodified 3893.8458 0.84582071 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 151.5 151.5 4 1.6148E-07 154707 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.375 49.661 97857000 0 0 0 0 0 0 0 50381000 0 0 0 47476000 0 18688 2338 17560 165477;165478 211146;211147;211148;211149 211147 4 HHAAYVNNLNVTEEK Unmodified 1737.8434 0.84344636 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5;G8JLJ2;G5E9P6;F5GXZ9 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 4 3 3 3 3 2 4 24.199 24.199 2;3;4 2.5422E-129 17760 QUIQUE_DMIX3_190116_001 286.93 252.4 23861000000 3114400000 1218000000 4983400000 2401500000 1678400000 2034300000 1992200000 515240000 1282400000 685840000 1549600000 1114500000 1291500000 18689 1855 17561 165479;165480;165481;165482;165483;165484;165485;165486;165487;165488;165489;165490;165491;165492;165493;165494;165495;165496;165497;165498;165499;165500;165501;165502;165503;165504;165505;165506;165507;165508;165509;165510;165511;165512;165513;165514;165515;165516;165517;165518 211150;211151;211152;211153;211154;211155;211156;211157;211158;211159;211160;211161;211162;211163;211164;211165;211166;211167;211168;211169;211170;211171;211172;211173;211174;211175;211176;211177;211178;211179;211180;211181;211182;211183;211184;211185;211186;211187;211188;211189;211190;211191;211192;211193;211194;211195;211196;211197;211198;211199;211200;211201;211202;211203;211204 211188 52 HHAAYVNNLNVTEEKYQEALAK Unmodified 2541.2612 0.26120008 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5;G8JLJ2;G5E9P6;F5GXZ9 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 3 2 1 2 2 2 59.71 59.71 2;3;4 3.3666E-114 59278 QUIQUE_DMIX1_190116_001 261.78 242.57 6870500000 0 75859000 76004000 35898000 399290000 0 329400000 1846600000 507190000 68231000 1188000000 1028000000 1316100000 18690 1855 17562 165519;165520;165521;165522;165523;165524;165525;165526;165527;165528;165529;165530;165531;165532;165533;165534;165535;165536;165537 211205;211206;211207;211208;211209;211210;211211;211212;211213;211214;211215;211216;211217;211218;211219;211220;211221;211222;211223;211224;211225;211226;211227;211228;211229;211230 211217 25 HHCPNTPIILVGTK Unmodified 1585.8399 0.83988131 2776 P63000 RAC1 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 32.951 32.951 2;3 9.6096E-07 28718 QUIQUE_C1218_190116_001 122.42 90.58 8224000000 336550000 781450000 1139700000 858170000 571450000 768880000 868430000 328570000 601490000 143700000 672670000 422280000 730670000 18691 2776 17563 165538;165539;165540;165541;165542;165543;165544;165545;165546;165547;165548;165549;165550;165551;165552;165553;165554;165555;165556;165557;165558;165559;165560;165561;165562;165563;165564;165565 211231;211232;211233;211234;211235;211236;211237;211238;211239;211240;211241;211242;211243;211244;211245;211246;211247;211248;211249;211250;211251;211252;211253;211254;211255;211256;211257;211258;211259;211260;211261;211262;211263;211264;211265;211266;211267;211268;211269 211232 37 HHGEQIQTLEDR Unmodified 1461.6961 0.69605384 1111 H0Y2S9;H0Y7E2 MPRIP yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 17.498 17.498 3 0.0058601 9815 QUIQUE_C1277_190116_001 39.394 26.656 105110000 22269000 21696000 0 0 0 18052000 23557000 0 0 0 19541000 0 0 18692 1111 17564 165566;165567;165568;165569;165570 211270;211271;211272;211273;211274;211275;211276 211272 7 HHGIPFYVAAPSSSCDLR Unmodified 2012.9527 0.95267924 4039 Q9BV20 MRI1 Methylthioribose-1-phosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 66.559 66.559 3 0.00090383 66661 QUIQUE_C1368_190116_001 45.618 37.138 29703000 0 0 29703000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18693 4039 17565 165571 211277 211277 1 HHGPQTLYLPVTLSSIPVFQR Unmodified 2389.2906 0.29064972 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 2 2 2 4 2 2 2 2 2 2 1 2 126.28 126.28 2;3;4 3.1234E-11 130784 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.57 103.95 3020500000 121280000 219690000 261120000 256410000 358880000 210950000 285860000 207680000 252090000 96323000 386340000 156960000 206940000 18694 956;3084 17566 165572;165573;165574;165575;165576;165577;165578;165579;165580;165581;165582;165583;165584;165585;165586;165587;165588;165589;165590;165591;165592;165593;165594;165595;165596;165597 211278;211279;211280;211281;211282;211283;211284;211285;211286;211287;211288;211289;211290;211291;211292;211293;211294;211295;211296;211297;211298;211299;211300;211301;211302;211303;211304;211305;211306;211307;211308;211309;211310;211311;211312;211313;211314;211315;211316;211317;211318;211319 211303 42 HHGTPMLLDGVK Unmodified 1303.6707 0.67069072 4102 Q9GZN8;H7BYU9 C20orf27 UPF0687 protein C20orf27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.656 29.656 3 0.0024721 23511 QUIQUE_DMIX8_190116_001 49.448 34.304 151020000 0 0 29539000 0 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211326;211327;211328;211329;211330;211331;211332;211333;211334;211335;211336;211337;211338;211339;211340;211341;211342;211343;211344;211345;211346;211347;211348;211349;211350;211351;211352;211353;211354;211355;211356;211357;211358;211359;211360;211361;211362;211363;211364 211358 39 HHITIAEIYETELVDIEK Unmodified 2152.1052 0.10519994 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 2 3 1 3 3 2 3 2 3 3 1 124.27 124.27 2;3;4 1.9392E-135 128369 QUIQUE_DMIX3_190116_001 228.25 193.95 2037400000 0 86801000 190030000 157580000 95831000 130010000 323530000 62596000 157760000 123690000 309690000 276930000 122950000 18697 4128 17569 165631;165632;165633;165634;165635;165636;165637;165638;165639;165640;165641;165642;165643;165644;165645;165646;165647;165648;165649;165650;165651;165652;165653;165654;165655;165656;165657;165658 211365;211366;211367;211368;211369;211370;211371;211372;211373;211374;211375;211376;211377;211378;211379;211380;211381;211382;211383;211384;211385;211386;211387;211388;211389;211390;211391;211392;211393;211394;211395;211396;211397;211398;211399 211385 32 HHITPLLSAVYEGHVSCVK Unmodified 2146.0993 0.099343474 2687 P58546 MTPN Myotrophin yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 61.96 61.96 3;4 3.2229E-13 62802 QUIQUE_C1218_190116_001 114.99 110.08 1213000000 203050000 280150000 0 0 62673000 49515000 224850000 0 124220000 63083000 149030000 0 56398000 18698 2687 17570 165659;165660;165661;165662;165663;165664;165665;165666;165667;165668;165669;165670;165671;165672;165673 211400;211401;211402;211403;211404;211405;211406;211407;211408;211409;211410;211411;211412;211413;211414;211415;211416 211400 16 HHLGDDVVLFTTDGAHK Unmodified 1860.9119 0.91186028 2106 P16278;C9J4G9;C9J539 GLB1 Beta-galactosidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.878 57.878 4 0.003526 56366 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.249 35.91 155080000 0 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Unmodified 2070.0395 0.039520409 351 Q5VTI5;A0A1B0GUN5;Q9Y2H5 PLEKHA6 Pleckstrin homology domain-containing family A member 6 yes no 0 0 1 2 1 1 10.326 10.326 4;5 7.1992E-05 2774 QUIQUE_C1403_190116_001 63.337 58.21 41416000 0 0 0 18435000 6254300 0 0 0 0 0 0 16727000 0 18708 351 17580 165754;165755;165756;165757 211520;211521;211522;211523 211520 4 HHSDGSVSLSGHLQPPPVTTEQHGAR Unmodified 2730.3222 0.32223721 185 A0A0G2JKZ1;A0A0A0MSV9;O15533;A2AB90;A0A0G2JH37;A0A0A0MT98 TAPBP Tapasin yes no 0 0 0 1 1 36.06 36.06 5 0.0061601 31664 QUIQUE_C1218_190116_001 27.89 25.277 140980000 46299000 0 0 0 0 0 0 94685000 0 0 0 0 0 18709 185 17581 165758;165759 211524;211525 211524 2 HHSLGGQYGVQGFPTIK Unmodified 1824.9271 0.92711641 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 60.357 60.357 3;4 0.00016378 58350 QUIQUE_C1563_190116_001 74.726 65.442 577320000 67132000 63421000 95034000 83519000 27796000 108190000 78237000 0 0 53987000 0 0 0 18710 3109 17582 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211564;211565;211566;211567;211568;211569;211570;211571;211572;211573;211574;211575;211576;211577;211578;211579;211580;211581;211582;211583;211584;211585;211586;211587;211588;211589;211590;211591;211592;211593;211594;211595;211596;211597;211598;211599;211600;211601;211602;211603;211604;211605;211606;211607;211608;211609;211610;211611;211612;211613;211614;211615;211616;211617;211618;211619;211620;211621;211622;211623;211624;211625;211626;211627;211628;211629;211630;211631;211632;211633;211634;211635 211606 68 HIADLSPGDK Unmodified 1051.5298 0.52982336 4355 Q9NZQ3;H7C0T9 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 1 19.187 19.187 2 0.016339 11653 QUIQUE_C1368_190116_001 85.29 61.136 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18716 4355 17588 165833;165834 211636;211637 211637 2 HIAEEADRKYEEVAR Unmodified 1814.8911 0.89112484 63;3271;435;2791;1260;1908 J3KN67;K7EP68;P06753;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;A0A2R8YEU4;K7EMU5;A0A2R8YHD2;K7EPV9;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;Q5HYB6;A0A087WWU8 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211924;211925;211926;211927;211928;211929;211930;211931;211932;211933;211934;211935;211936;211937;211938;211939;211940;211941;211942;211943;211944;211945;211946;211947;211948;211949;211950;211951;211952;211953;211954;211955;211956;211957;211958 211925 32 HIDPVVLK Unmodified 919.5491 0.54910224 4398 Q9UBI1;R4GMW6;H0Y4W0;H0Y6Z9;R4GMX3;R4GN54 COMMD3;COMMD3-BMI1 COMM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 27.508 27.508 2 0.027762 21883 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.383 28.081 120930000 0 50786000 30351000 0 0 0 0 0 39794000 0 0 0 0 18731 4398 17603 166036;166037;166038;166039 211959;211960;211961;211962 211961 4 HIDSAHLYNNEEQVGLAIR Unmodified 2178.0818 0.081779155 183;2889 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;S4R3D5;Q04828;A6NHU4 AKR1C3;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C3;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 70.091 70.091 2;3 2.3861E-55 71158 QUIQUE_C1218_190116_001 133.93 113.28 1708100000 86112000 128690000 117800000 142310000 138570000 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P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.472 49.472 2 0.00013172 47544 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.6 81.335 788240000 102060000 0 93988000 0 0 0 0 132410000 121150000 0 122660000 91966000 124010000 18735 1881 17607 166061;166062;166063;166064;166065;166066;166067 211991;211992;211993;211994;211995;211996;211997 211993 3 HIEPELAGR Unmodified 1020.5352 0.53524309 2833 P86791;P86790 CCZ1;CCZ1B Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog;Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B yes no 0 0 0 1 1 21.271 21.271 2 0.026403 14683 QUIQUE_C1218_190116_001 58.596 42.085 116110000 42736000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 73374000 0 18736 2833 17608 166068;166069 211998;211999 211998 1 HIEVQILGDQYGNILHLYER Unmodified 2409.2441 0.24409346 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 128.9 128.9 3;4 4.8029E-57 131776 QUIQUE_C1563_190116_001 153.14 148.53 419700000 0 0 0 0 32624000 21839000 40545000 25705000 57668000 0 201370000 39951000 0 18737 2026 17609 166070;166071;166072;166073;166074;166075;166076 212000;212001;212002;212003;212004;212005;212006 212001 7 HIEVQVAQETR Unmodified 1308.6786 0.67861287 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.329 23.329 2 0.0004502 17552 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.79 69.987 233330000 25873000 21872000 0 32575000 26854000 18120000 0 20685000 0 0 22785000 27908000 36653000 18738 1567 17610 166077;166078;166079;166080;166081;166082;166083;166084;166085;166086 212007;212008;212009;212010;212011;212012;212013;212014;212015;212016 212012 10 HIEWESVLTNTAGCLR Unmodified 1884.9152 0.9152311 759 C9JZR2;O60716 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 115.28 115.28 2;3 6.2554E-67 120525 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.49 143.97 997420000 59319000 57994000 106880000 91530000 103500000 51977000 64158000 57266000 54414000 0 120120000 106050000 124210000 18739 759 17611 166087;166088;166089;166090;166091;166092;166093;166094;166095;166096;166097;166098;166099;166100;166101;166102;166103;166104 212017;212018;212019;212020;212021;212022;212023;212024;212025;212026;212027;212028;212029;212030;212031;212032;212033;212034;212035;212036;212037;212038;212039;212040 212035 23 HIFALFNTEQR Unmodified 1374.7044 0.70443369 2893;269;4528;840 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;E5RHK8;Q9UQ16 DNM1;DNM3 Dynamin-1;Dynamin-3 no no 0 0 0 1 3 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 77.692 77.692 2;3 9.7588E-13 78551 QUIQUE_C1576_190116_001 132.01 102.67 5545700000 352100000 435300000 292360000 258050000 362000000 279670000 637860000 430240000 378320000 239000000 716720000 564580000 599480000 18740 269;2893;840;4528 17612 166105;166106;166107;166108;166109;166110;166111;166112;166113;166114;166115;166116;166117;166118;166119;166120;166121;166122;166123;166124;166125;166126 212041;212042;212043;212044;212045;212046;212047;212048;212049;212050;212051;212052;212053;212054;212055;212056;212057;212058;212059;212060;212061;212062;212063;212064;212065;212066;212067;212068;212069;212070;212071;212072;212073;212074;212075;212076;212077;212078;212079;212080;212081;212082;212083;212084;212085;212086;212087;212088;212089;212090;212091;212092 212060 51 HIGFVYHPTK Unmodified 1197.6295 0.62947783 179 A0A0A0MSK6;Q13017 ARHGAP5 Rho GTPase-activating protein 5 yes no 0 0 0 1 21.97 21.97 3 0.05474 15269 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.723 17.859 24087000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24087000 0 0 18741 179 17613 166127 212093;212094 212093 2 HIGISFTPK Unmodified 998.55492 0.5549159 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 40.018 40.018 2 0.00045761 36284 QUIQUE_C1563_190116_001 117.1 83.582 673500000 0 0 98521000 96019000 49677000 64596000 137140000 0 74282000 0 0 39828000 113430000 18742 3061 17614 166128;166129;166130;166131;166132;166133;166134;166135 212095;212096;212097;212098;212099;212100;212101;212102;212103 212099 8 HIGLVYSGMGPDYR Oxidation (M) 1579.7453 0.74531222 5 A0A024RA52;P25787 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 1 0 2 2 1 2 1 1 1 2 2 2 2 1 57.213 57.213 2;3 9.7769E-07 55968 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.63 105.31 870470000 66464000 87203000 54345000 30914000 40592000 0 0 42383000 109590000 58363000 148050000 124400000 108160000 18743 5 17615 166136;166137;166138;166139;166140;166141;166142;166143;166144;166145;166146;166147;166148;166149;166150;166151;166152;166153;166154 212104;212105;212106;212107;212108;212109;212110;212111;212112;212113;212114;212115;212116;212117;212118;212119;212120;212121;212122;212123;212124 212113 6 20 HIGLVYSGMGPDYR Unmodified 1563.7504 0.7503976 5 A0A024RA52;P25787 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 72.026 72.026 2;3 6.5432E-05 72161 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.438 61.15 1757600000 208170000 211640000 119730000 111090000 103610000 86611000 140650000 190070000 105520000 21272000 153690000 0 305580000 18744 5 17615 166155;166156;166157;166158;166159;166160;166161;166162;166163;166164;166165;166166;166167;166168;166169;166170;166171 212125;212126;212127;212128;212129;212130;212131;212132;212133;212134;212135;212136;212137;212138;212139;212140;212141;212142;212143;212144;212145;212146;212147;212148;212149;212150;212151 212141 25 HIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPK Unmodified 2393.2379 0.23794545 1511 O43166;F5GYF8;H0YJY2 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 132.97 132.97 3 0.0027662 139967 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.138 24.862 41088000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41088000 0 0 18745 1511 17616 166172 212152 212152 1 HIGSIDPNCNVSEVVK Unmodified 1766.8621 0.8621329 3112 Q15119;D6RDN9;D6RJH7;D6R983 PDK2 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.169 58.169 2 4.5672E-09 56725 QUIQUE_C1277_190116_001 143.42 127.89 102630000 19974000 32277000 0 23498000 0 26886000 0 0 0 0 0 0 0 18746 3112 17617 166173;166174;166175;166176;166177 212153;212154;212155;212156;212157 212154 5 HIGSIDPTCNVADVVK Unmodified 1723.8563 0.85631924 3113 Q15120 PDK3 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 70.876 70.876 2 0.016602 70742 QUIQUE_C1403_190116_001 61.48 37.629 20025000 0 0 0 20025000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18747 3113 17618 166178 212158 212158 0 HIGTSALMDLLLR Unmodified 1438.7966 0.79661951 1615 O75170 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 2 1 3 1 1 1 1 129.34 129.34 2;3 5.6384E-06 134831 QUIQUE_C1368_190116_001 88.021 0 71085000 12444000 34170000 10235000 0 14236000 0 0 0 0 0 0 0 0 18748 1615 17619 166179;166180;166181;166182;166183;166184;166185;166186;166187;166188 212159;212160;212161;212162;212163;212164;212165;212166;212167;212168 212164 10 HIHITQATETTTTR Unmodified 1608.822 0.82198264 3078 Q14677 CLINT1 Clathrin interactor 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.505 16.505 2;3 1.4068E-14 8738 QUIQUE_DMIX5_190116_001 144.27 123.84 568960000 37381000 0 36673000 81948000 65057000 30886000 42949000 34952000 48626000 21988000 68203000 35501000 64792000 18749 3078 17620 166189;166190;166191;166192;166193;166194;166195;166196;166197;166198;166199;166200;166201 212169;212170;212171;212172;212173;212174;212175;212176;212177;212178;212179;212180;212181;212182 212180 13 HIHSCFTNISCFLLPHPGLK Unmodified 2377.1824 0.1823616 3720 Q8WXF7;H0YJ65 ATL1 Atlastin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 98.171 98.171 4 0.00019043 101350 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.757 58.421 183760000 0 0 63179000 0 0 0 0 0 47208000 0 0 73373000 0 18750 3720 17621 166202;166203;166204 212183;212184;212185;212186 212184 3 HIIEDPCTLR Unmodified 1252.6234 0.62340617 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 37.613 37.613 2 0.005136 33565 QUIQUE_C1576_190116_001 78.516 37.487 62443000 0 31015000 0 0 0 0 31427000 0 0 0 0 0 0 18751 3471 17622 166205;166206;166207 212187;212188;212189 212189 3 HIISPNPHVR Unmodified 1168.6465 0.64652488 1259 J3KN16;Q5VYK3 KIAA0368;ECM29 Proteasome-associated protein ECM29 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 14.89 14.89 3 0.0046433 6858 QUIQUE_C1438_190116_001 63.076 32.389 156760000 19130000 0 22712000 0 25189000 0 27132000 14592000 0 0 48004000 0 0 18752 1259 17623 166208;166209;166210;166211;166212;166213 212190;212191;212192;212193;212194;212195 212192 5 HILAILQDCPSLRPPIDHLCELLPR Unmodified 2975.5837 0.58373697 2109 P16435;H0Y4R2;E7EMD0 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 1 1 140.45 140.45 4 0.034241 144361 QUIQUE_C1403_190116_001 23.917 17.553 24269000 0 0 0 24269000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18753 2109 17624 166214 212196 212196 1 HILANFK Unmodified 841.48102 0.48102268 214 Q5W0H4;A0A0B4J2C3;P13693;J3KPG2;H0YCX0;E9PJF7;Q56UQ5 TPT1 Translationally-controlled tumor protein;TPT1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.345 23.345 2 1.1796E-19 16666 QUIQUE_C1438_190116_001 197.65 76.898 7214300000 634970000 595960000 731080000 648130000 632110000 447820000 0 572040000 645230000 0 720130000 695910000 890890000 18754 214 17625 166215;166216;166217;166218;166219;166220;166221;166222;166223;166224;166225 212197;212198;212199;212200;212201;212202;212203;212204;212205;212206;212207;212208;212209;212210 212202 12 HILELASILDVR Unmodified 1377.798 0.79799972 3620 Q8N9R8 SCAI Protein SCAI yes yes 0 0 0 1 1 1 1 123.42 123.42 3 0.00089893 127340 QUIQUE_C1277_190116_001 84.479 69.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18755 3620 17626 166226;166227;166228;166229 212211;212212;212213;212214 212211 4 HILGFDTGDAVLNEAAQILR Unmodified 2152.1277 0.12766671 4535 Q9Y224 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 2 2 1 157.29 157.29 2;3 3.576E-44 163226 QUIQUE_C1576_190116_001 157.91 142.28 3979700000 346720000 257560000 525180000 234290000 0 371160000 458300000 415530000 393680000 73573000 215900000 506900000 180930000 18756 4535 17627 166230;166231;166232;166233;166234;166235;166236;166237;166238;166239;166240;166241;166242;166243;166244;166245;166246;166247 212215;212216;212217;212218;212219;212220;212221;212222;212223;212224;212225;212226;212227;212228;212229;212230;212231;212232;212233 212224 15 HILILQNK Unmodified 977.6022 0.60220045 2432 P41091;Q2VIR3 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.877 27.877 2 0.0035896 22758 QUIQUE_C1218_190116_001 112.66 45.608 593220000 69374000 89000000 58205000 64945000 35216000 53535000 0 59357000 44000000 16915000 55406000 47268000 0 18757 2432 17628 166248;166249;166250;166251;166252;166253;166254;166255;166256;166257;166258;166259 212234;212235;212236;212237;212238;212239;212240;212241;212242;212243;212244;212245;212246;212247;212248;212249 212235 16 HILLAVANDEELNQLLK Unmodified 1932.068 0.068026571 1626 O75367;D6RCF2 H2AFY Core histone macro-H2A.1;Histone H2A no no 0 0 0 1 1 1 1 124.35 124.35 3 0.00024795 128113 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.598 33.94 82847000 0 0 0 0 82847000 0 0 0 0 0 0 0 0 18758 1626 17629 166260;166261;166262;166263 212250;212251;212252;212253;212254 212252 5 HILQFVAIK Unmodified 1067.6492 0.64915064 1232 H7C386;Q9BW91;D6RAW2 NUDT9 ADP-ribose pyrophosphatase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 68.167 68.167 2 0.039409 68566 QUIQUE_C1218_190116_001 53.679 41.248 45923000 22299000 23624000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18759 1232 17630 166264;166265 212255;212256 212255 2 HILYGCSELFNATQFIK Unmodified 2040.0139 0.01388251 3708 Q8WVM8 SCFD1 Sec1 family domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 122.34 122.34 3 0.0010367 127122 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.514 40.922 40825000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40825000 18760 3708 17631 166266 212257 212257 1 HILYNEQR Unmodified 1071.5461 0.54614213 2592;1320 K7EK35;P42229;C9JVV6;P51692;C9J4I3 STAT5A;STAT5B Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A;Signal transducer and activator of transcription 5B no no 0 0 0 1 16.026 16.026 2 0.048329 8415 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.011 22.214 48181000 0 0 0 0 0 0 0 48181000 0 0 0 0 0 18761 1320;2592 17632 166267 212258 212258 1 HIMGQNVADYMR Unmodified 1433.6544 0.65438873 442 A0A2R8Y6J3;P46777 RPL5 60S ribosomal protein L5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.629 59.629 2 0.0020052 58912 QUIQUE_C1277_190116_001 77.677 66.526 128840000 0 25080000 50196000 0 0 0 30831000 0 22729000 0 0 0 0 18762 442 17633 166268;166269;166270;166271;166272 212259;212260;212261;212262;212263 212260 5 HINDSAPEVR Unmodified 1136.5574 0.5574351 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.55 15.55 2 9.3779E-08 7848 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.42 115.15 796430000 57778000 69703000 84820000 78135000 0 41016000 92641000 71933000 92985000 45468000 102520000 0 59437000 18763 3037 17634 166273;166274;166275;166276;166277;166278;166279;166280;166281;166282;166283 212264;212265;212266;212267;212268;212269;212270;212271;212272;212273;212274 212273 11 HINEVYYAK Unmodified 1135.5662 0.56620887 441 A0A2R8YDF3;A0A2R8Y6L5;A0A2R8Y6I6;Q13627;A0A2R8Y443;A0A2R8YEY4;M0R2X3;M0R131;E7EMI5;Q9Y463 DYRK1A;DYRK1B Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A;Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 19.981 19.981 2 0.0093679 12619 QUIQUE_C1277_190116_001 76.17 38.009 38024000 0 38024000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18764 441 17635 166284;166285;166286 212275;212276;212277 212275 3 HINMDGTINVDDFK Unmodified 1617.7457 0.74570615 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 84.895 84.895 3 0.02647 86465 QUIQUE_C1277_190116_001 46.318 41.039 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18765 1650 17636 166287 212278 212278 1 HINTWVAEK Unmodified 1096.5665 0.56654322 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12;A0A2R8Y6A7 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.773 22.773 2 8.9327E-08 15857 QUIQUE_C1368_190116_001 166.07 114.28 3155200000 236610000 196930000 233050000 272220000 276940000 183600000 235100000 276170000 276780000 137820000 285640000 241200000 303120000 18766 2371 17637 166288;166289;166290;166291;166292;166293;166294;166295;166296;166297;166298;166299;166300 212279;212280;212281;212282;212283;212284;212285;212286;212287;212288;212289;212290;212291 212281 12 HINTWVSK Unmodified 983.51886 0.51886475 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 0 1 1 19.81 19.81 2 0.0043454 12763 QUIQUE_C1218_190116_001 109.48 54.037 136950000 56209000 80745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18767 2564 17638 166301;166302 212292;212293;212294 212292 3 HIPDEIFLLTAEQIAQEVSEQHLSQGR Unmodified 3087.5625 0.56252706 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 162.32 162.32 3;4 2.7962E-65 165812 QUIQUE_C1277_190116_001 156.51 150.29 1445100000 824310000 189120000 240770000 190920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18768 3198 17639 166303;166304;166305;166306;166307;166308;166309 212295;212296;212297;212298;212299;212300;212301;212302 212298 6 HIPGAAFFDIDQCSDR Unmodified 1847.8261 0.82608174 2238 P25325;B1AH49 MPST 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase;Sulfurtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 99.304 99.304 2;3 0.024824 102347 QUIQUE_C1368_190116_001 44.925 39.497 115110000 0 0 39792000 38219000 37098000 0 0 0 0 0 0 0 0 18769 2238 17640 166310;166311;166312 212303;212304;212305 212303 1 HIPGSPFTAK Unmodified 1053.5607 0.56072956 3061;1628 Q14315;O75369;E7EN95 FLNC;FLNB Filamin-C;Filamin-B no no 0 0 0 1 30.916 30.916 2 0.057388 25369 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.447 9.2876 17578000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17578000 0 0 0 18770 3061;1628 17641 166313 212306 212306 1 HIQDAPEEFISELAEYLIKPLNK Unmodified 2696.4061 0.40613299 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 169.36 169.36 3;4 1.3416E-13 173238 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.95 100.9 778990000 0 13740000 0 11409000 113240000 0 75509000 0 0 0 284180000 280900000 0 18771 1692 17642 166314;166315;166316;166317;166318;166319;166320 212307;212308;212309;212310;212311;212312;212313 212313 6 HIQEHYGGTATFYLSQAADGAK Unmodified 2364.1135 0.11347321 2583 P51570;K7EII7 GALK1 Galactokinase yes no 0 0 0 2 1 1 2 70.808 70.808 3;4 2.614E-05 70915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.035 54.637 200300000 0 33638000 0 0 0 0 0 40880000 0 24789000 0 0 100990000 18772 2583 17643 166321;166322;166323;166324;166325;166326 212314;212315;212316;212317;212318;212319;212320 212317 7 HIQETEWQSQEGK Unmodified 1598.7325 0.73249893 3070 Q14515 SPARCL1 SPARC-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 23.235 23.235 2 4.808E-17 16918 QUIQUE_C1438_190116_001 160.22 122.66 27234000 0 0 0 0 27234000 0 0 0 0 0 0 0 0 18773 3070 17644 166327 212321 212321 1 HIQHTLVDSQSQEDISLLLQLVQNK Unmodified 2885.5247 0.52468499 3583 Q8N3R9;G3V2H1 MPP5 MAGUK p55 subfamily member 5 yes no 0 0 0 1 1 1 147.51 147.51 4 7.7725E-09 153078 QUIQUE_C1368_190116_001 68.291 65.851 124410000 0 26812000 36016000 0 0 0 0 0 61584000 0 0 0 0 18774 3583 17645 166328;166329;166330 212322;212323;212324 212323 3 HISDGVADSGLTLK Unmodified 1411.7307 0.73070802 3548 Q8IXI2;H7BXZ6 RHOT1 Mitochondrial Rho GTPase 1;Mitochondrial Rho GTPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.824 51.824 2 0.00082463 50647 QUIQUE_C1218_190116_001 103.43 79.4 26257000 0 0 0 0 0 0 26257000 0 0 0 0 0 0 18775 3548 17646 166331;166332;166333;166334;166335 212325;212326;212327;212328;212329 212325 5 HISDLYEDLR Unmodified 1259.6146 0.61461563 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1;E9PKG0 PLEC Plectin no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.171 68.171 2;3 0.00017251 68199 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.12 104.46 2956400000 474510000 374910000 244450000 156350000 217150000 190290000 191150000 150060000 244170000 218680000 215290000 173960000 105430000 18776 3117 17647 166336;166337;166338;166339;166340;166341;166342;166343;166344;166345;166346;166347;166348;166349 212330;212331;212332;212333;212334;212335;212336;212337;212338;212339;212340;212341;212342;212343;212344;212345;212346;212347;212348;212349;212350;212351;212352;212353 212350 24 HISDLYEDLRDGHNLISLLEVLSGDSLPR Unmodified 3275.6786 0.67861945 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1;E9PKG0 PLEC Plectin no no 0 0 1 2 1 168.67 168.67 4;5 4.1531E-28 176067 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.82 109.18 816140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 616790000 199350000 0 18777 3117 17648 166350;166351;166352 212354;212355;212356 212354 1 HISDSVFLEAAK Unmodified 1315.6772 0.67721588 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PQT3;A0A1W2PQY8;A0A1W2PR68 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 1 60.569 60.569 2;3 8.4126E-07 57116 QUIQUE_DMIX4_190116_001 149.96 102.14 1093800000 0 137010000 26433000 29082000 17212000 174570000 152880000 101760000 0 63450000 106860000 134530000 150030000 18778 374 17649 166353;166354;166355;166356;166357;166358;166359;166360;166361;166362;166363;166364;166365;166366;166367;166368 212357;212358;212359;212360;212361;212362;212363;212364;212365;212366;212367;212368;212369;212370;212371;212372 212368 9 HISEGCVFIYCQVGEKPYWK Unmodified 2499.1715 0.17152214 4000 Q9BRA2;I3L2R6 TXNDC17 Thioredoxin domain-containing protein 17 yes no 0 0 1 1 1 1 1 92.703 92.703 3;4 0.0024603 93780 QUIQUE_C1563_190116_001 47.68 44.534 124690000 0 0 0 0 0 43551000 0 0 44484000 0 0 36655000 0 18779 4000 17650 166369;166370;166371;166372 212373;212374;212375;212376;212377 212374 5 HISLTLPATFR Unmodified 1254.7085 0.70845643 4183 Q9H7P6 MVB12B Multivesicular body subunit 12B yes yes 0 0 0 1 83.763 83.763 3 0.011265 85065 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.844 33.491 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18780 4183 17651 166373 212378 212378 1 HISPDQVPVEYGGTMTDPDGNPK Unmodified 2453.1169 0.11690361 1680;1234 H7C417;O76054;B3KRD8;C9JZI9 SEC14L2 SEC14-like protein 2 no no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 74.748 74.748 2;3 1.3099E-45 75140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.71 147.29 995210000 111820000 81004000 130570000 114070000 144530000 95577000 0 0 90070000 0 137920000 0 89658000 18781 1234;1680 17652 166374;166375;166376;166377;166378;166379;166380;166381;166382;166383;166384;166385;166386;166387;166388 212379;212380;212381;212382;212383;212384;212385;212386;212387;212388;212389;212390;212391;212392;212393;212394;212395 212390 15 HISPSAKPFENGQYLDIYGITR Unmodified 2505.2652 0.26522283 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 1 2 1 1 97.5 97.5 3;4 5.3577E-07 101804 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.112 61.381 222310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 116760000 51560000 53986000 18782 3455 17653 166389;166390;166391;166392 212396;212397;212398;212399 212396 4 HISPVQALSEFK Unmodified 1354.7245 0.72450043 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 78.385 78.385 2;3 0.00061064 79877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.701 59.941 1191700000 26060000 86160000 85720000 138000000 0 109780000 98739000 138350000 109530000 39277000 91468000 133780000 134890000 18783 2250 17654 166393;166394;166395;166396;166397;166398;166399;166400;166401;166402;166403;166404;166405;166406;166407;166408 212400;212401;212402;212403;212404;212405;212406;212407;212408;212409;212410;212411;212412;212413;212414;212415;212416;212417;212418 212411 16 HISQISVAEDDDESLLGHLMIVGK Unmodified 2605.3058 0.30576701 2546 P49773 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 127.54 127.54 3;4 1.6299E-51 131517 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.1 147.15 2186600000 261840000 252990000 217300000 172630000 153130000 193870000 200070000 70712000 134860000 149840000 142300000 99977000 137080000 18784 2546 17655 166409;166410;166411;166412;166413;166414;166415;166416;166417;166418;166419;166420;166421;166422;166423 212419;212420;212421;212422;212423;212424;212425;212426;212427;212428;212429;212430;212431;212432;212433;212434;212435;212436 212430 16 HISTLNIQLSDSK Unmodified 1454.7729 0.77290718 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 53.164 53.164 2;3 3.4247E-17 51632 QUIQUE_C1438_190116_001 162.49 121.49 245880000 26466000 117170000 0 0 37509000 0 0 0 0 0 0 64739000 0 18785 2385 17656 166424;166425;166426;166427;166428;166429 212437;212438;212439;212440;212441;212442 212440 6 HITDKDDFANNR Unmodified 1444.6695 0.66950474 4666 Q9Y6W3 CAPN7 Calpain-7 yes yes 0 0 1 1 16.421 16.421 3 0.0005949 8700 QUIQUE_C1218_190116_001 72.496 54.687 16153000 16153000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18786 4666 17657 166430 212443 212443 1 HITESVNSIR Unmodified 1154.6044 0.60438529 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 1 20.374 20.374 2 0.048615 13367 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.283 7.254 15144000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15144000 0 18787 2863 17658 166431 212444 212444 1 HITFVDNAK Unmodified 1043.54 0.53999412 1725 O95352 ATG7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes yes 0 0 0 1 1 1 21.44 21.44 2 0.00016116 14747 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.35 81.667 127320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54569000 72755000 18788 1725 17659 166432;166433;166434 212445;212446;212447;212448 212447 4 HITIFSPEGR Unmodified 1155.6037 0.60365701 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1;G3V3U4;G3V4S5;G3V2S7 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 45.242 45.242 2;3 4.5026E-14 41716 QUIQUE_C1403_190116_001 172.21 125.79 2901300000 259910000 303410000 262310000 252020000 279760000 197600000 263260000 289000000 229460000 147820000 0 217110000 199610000 18789 1091 17660 166435;166436;166437;166438;166439;166440;166441;166442;166443;166444;166445;166446;166447;166448 212449;212450;212451;212452;212453;212454;212455;212456;212457;212458;212459;212460;212461;212462;212463;212464;212465 212453 17 HITNQWTSALEFR Unmodified 1601.795 0.79503961 474 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078;F5H392;A0A2R8Y6R5 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog yes no 0 0 0 1 1 1 26.446 26.446 3 0.044199 20131 QUIQUE_C1576_190116_001 33.204 1.8143 178280000 63517000 0 0 0 0 0 68084000 0 46680000 0 0 0 0 18790 474 17661 166449;166450;166451 212466;212467;212468 212467 3 HITTLQASFLTK Unmodified 1358.7558 0.75580056 4483 Q9UL25 RAB21 Ras-related protein Rab-21 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.465 62.465 2;3 0.00014693 61661 QUIQUE_C1277_190116_001 120.03 84.881 436990000 87686000 92806000 30884000 31393000 37579000 32360000 26031000 32935000 0 0 0 28405000 36905000 18791 4483 17662 166452;166453;166454;166455;166456;166457;166458;166459;166460;166461;166462;166463;166464 212469;212470;212471;212472;212473;212474;212475;212476;212477;212478;212479;212480;212481;212482;212483;212484 212474 16 HIVAVLPEIDPVLFQGK Unmodified 1874.0666 0.066570008 4455 Q9UJ70;C9JEV6;H7C286 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 132.33 132.33 2;3 3.5299E-13 136850 QUIQUE_C1403_190116_001 98.694 77.16 2877100000 218680000 221710000 250840000 203170000 176140000 172340000 298600000 157700000 252760000 72690000 236490000 244760000 371200000 18792 4455 17663 166465;166466;166467;166468;166469;166470;166471;166472;166473;166474;166475;166476;166477;166478;166479;166480;166481;166482;166483;166484;166485;166486;166487;166488;166489 212485;212486;212487;212488;212489;212490;212491;212492;212493;212494;212495;212496;212497;212498;212499;212500;212501;212502;212503;212504;212505;212506;212507;212508;212509;212510;212511;212512;212513;212514;212515;212516;212517;212518 212494 32 HIVLSGGSTMYPGLPSR Unmodified 1770.9087 0.90868916 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 3 2 2 77.029 77.029 2;3 4.7454E-161 77738 QUIQUE_DMIX3_190116_001 248.77 169.84 2487100000 253370000 262180000 169690000 219390000 182810000 137270000 233260000 66708000 160870000 49748000 290030000 253110000 208650000 18793 2715 17664 166490;166491;166492;166493;166494;166495;166496;166497;166498;166499;166500;166501;166502;166503;166504;166505;166506;166507;166508;166509;166510;166511;166512;166513;166514;166515 212519;212520;212521;212522;212523;212524;212525;212526;212527;212528;212529;212530;212531;212532;212533;212534;212535;212536;212537;212538;212539;212540;212541;212542;212543;212544;212545;212546;212547;212548;212549;212550;212551;212552;212553;212554;212555;212556;212557;212558;212559;212560 212545 42 HIVLSGGSTMYPGLPSR Oxidation (M) 1786.9036 0.90360378 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 1 0 1 1 2 2 66.327 66.327 2;3 0.00053195 64603 QUIQUE_C1563_190116_001 79.492 48.061 217940000 0 0 0 0 0 45788000 0 0 0 14402000 51309000 106440000 0 18794 2715 17664 166516;166517;166518;166519;166520;166521 212561;212562;212563;212564;212565;212566;212567 212561 2145 6 HIVNHAVVNEDPNAR Unmodified 1683.8441 0.84411507 4257 Q9NQT8;E7ERX9 KIF13B Kinesin-like protein KIF13B;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 17.928 17.928 3 0.0022132 10378 QUIQUE_C1438_190116_001 50.024 39.67 51434000 0 0 0 13871000 25842000 0 0 0 0 0 0 11721000 0 18795 4257 17665 166522;166523;166524 212568;212569;212570 212569 1 HIVPACFLAPLK Unmodified 1364.7639 0.76386282 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 89.721 89.721 2;3 0.0019322 93148 QUIQUE_C1438_190116_001 56.359 48.227 388470000 28220000 0 44567000 0 52870000 32420000 49747000 0 36356000 0 43637000 41568000 59080000 18796 1534 17666 166525;166526;166527;166528;166529;166530;166531;166532;166533;166534;166535;166536;166537;166538 212571;212572;212573;212574;212575;212576;212577;212578;212579;212580;212581;212582;212583;212584;212585 212577 15 HIWYIGGK Unmodified 972.51814 0.51813647 3538 Q8IWQ3 BRSK2 Serine/threonine-protein kinase BRSK2 yes yes 0 0 0 1 44.061 44.061 2 0.042358 41304 QUIQUE_C1576_190116_001 79.939 51.427 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18797 3538 17667 166539 212586 212586 1 HIYLLPSGR Unmodified 1054.5924 0.59236404 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 3 1 44.558 44.558 2;3 0.00040467 41323 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.13 70.44 6258300000 812960000 699870000 453120000 336600000 658550000 331220000 421460000 531830000 263410000 285310000 670830000 426700000 366430000 18798 2120 17668 166540;166541;166542;166543;166544;166545;166546;166547;166548;166549;166550;166551;166552;166553;166554;166555;166556;166557;166558;166559;166560;166561;166562;166563;166564 212587;212588;212589;212590;212591;212592;212593;212594;212595;212596;212597;212598;212599;212600;212601;212602;212603;212604;212605;212606;212607;212608;212609;212610;212611;212612;212613;212614;212615;212616;212617;212618;212619;212620;212621;212622;212623 212618 36 HIYYITGETK Unmodified 1223.6186 0.61863837 1931 P07900;Q58FG0 HSP90AA1;HSP90AA5P Heat shock protein HSP 90-alpha;Putative heat shock protein HSP 90-alpha A5 yes no 0 0 0 3 1 1 3 2 2 1 2 3 2 1 2 1 31.301 31.301 1;2;3 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yes 0 0 1 1 79.049 79.049 3 0.032939 75215 QUIQUE_DMIX4_190116_001 28.627 22.047 15958000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15958000 0 0 0 18801 2657 17671 166591 212658 212658 1 HKDFLEELEESR Unmodified 1530.7314 0.7314363 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 1 1 1 79.399 79.399 3 0.030218 81492 QUIQUE_C1438_190116_001 60.161 37.963 65098000 0 0 0 29733000 35365000 0 0 0 0 0 0 0 0 18802 2021 17672 166592;166593 212659;212660 212660 1 HKDIDILIVR Unmodified 1220.7241 0.7241065 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;E9PF84;H7C1W2 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.287 48.287 3 0.0002463 45554 QUIQUE_C1368_190116_001 96.171 85.8 2367400000 0 0 262980000 0 221890000 0 303690000 0 320210000 118670000 438430000 372220000 329270000 18803 2582 17673 166594;166595;166596;166597;166598;166599;166600;166601 212661;212662;212663;212664;212665;212666;212667;212668;212669;212670 212662 10 HKDVAEEIANYRPTLDTLHEQASALPQEHAESPDVR Unmodified 4065.978 0.97804895 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 2 4 2 2 4 2 1 4 3 3 5 3 3 3 94.833 94.833 3;4;5;6 0 97120 QUIQUE_DMIX3_190116_001 258.97 246.01 21779000000 2273300000 1005900000 537640000 1652900000 1075000000 656690000 1652400000 2808400000 1643500000 615620000 2015900000 3015400000 2825900000 18804 2851 17674 166602;166603;166604;166605;166606;166607;166608;166609;166610;166611;166612;166613;166614;166615;166616;166617;166618;166619;166620;166621;166622;166623;166624;166625;166626;166627;166628;166629;166630;166631;166632;166633;166634;166635;166636;166637;166638;166639;166640 212671;212672;212673;212674;212675;212676;212677;212678;212679;212680;212681;212682;212683;212684;212685;212686;212687;212688;212689;212690;212691;212692;212693;212694;212695;212696;212697;212698;212699;212700;212701;212702;212703;212704;212705;212706;212707;212708;212709;212710;212711;212712;212713;212714;212715;212716;212717;212718;212719;212720;212721;212722;212723;212724;212725;212726;212727;212728;212729;212730 212710 56 HKEAIGPGGEVVNR Unmodified 1461.7688 0.76882486 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 16.277 16.277 3 0.004853 8609 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.156 38.052 89279000 0 0 0 0 0 0 0 0 16929000 0 31537000 17073000 23739000 18805 3718 17675 166641;166642;166643;166644 212731;212732;212733;212734 212733 4 HKEDAGVICSEFMSLR Unmodified 1877.8764 0.87640275 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 1 1 1 83.045 83.045 3 0.0074655 84326 QUIQUE_C1403_190116_001 35.872 26.214 104740000 0 0 47486000 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17679 166654 212744 212744 1 HKEQLLAAEPVR Unmodified 1389.7728 0.7728476 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 21.449 21.449 2;3 0.0036092 15249 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.393 53.972 921030000 88623000 130390000 86977000 67280000 0 91106000 96556000 111060000 71069000 0 41625000 86524000 49818000 18810 4088 17680 166655;166656;166657;166658;166659;166660;166661;166662;166663;166664;166665;166666;166667 212745;212746;212747;212748;212749;212750;212751;212752;212753;212754;212755;212756;212757;212758;212759;212760 212756 16 HKFPDEDSYQK Unmodified 1392.631 0.63099397 3415 Q6VY07;B4DF77 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 1 2 18.447 18.447 2;3 0.01766 10897 QUIQUE_C1403_190116_001 98.048 72.489 68935000 0 0 0 68935000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18811 3415 17681 166668;166669 212761;212762 212762 2 HKGPPVFTQEER Unmodified 1423.7208 0.72081203 3953 Q99447;I3L1R7;I3L2Q1 PCYT2 Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.752 16.752 3 0.0030323 8440 QUIQUE_C1576_190116_001 56.951 41.196 775580000 54886000 52933000 60571000 59483000 59279000 0 77544000 51126000 57954000 0 133610000 71197000 96997000 18812 3953 17682 166670;166671;166672;166673;166674;166675;166676;166677;166678;166679;166680 212763;212764;212765;212766;212767;212768;212769;212770;212771;212772;212773 212768 9 HKHIAEVSQEVTR Unmodified 1532.8059 0.80593865 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 3 3 2 2 13.514 13.514 2;3;4 5.9228E-10 5686 QUIQUE_C1576_190116_001 113.53 99.498 1030300000 19845000 33510000 0 19382000 14988000 0 51134000 199700000 168230000 0 278060000 86994000 158440000 18813 273;342 17683 166681;166682;166683;166684;166685;166686;166687;166688;166689;166690;166691;166692;166693;166694;166695;166696;166697;166698;166699;166700 212774;212775;212776;212777;212778;212779;212780;212781;212782;212783;212784;212785;212786;212787;212788;212789;212790;212791;212792;212793 212780 16 HKLDVTSVEDYK Unmodified 1432.7198 0.71980898 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 38.056 38.056 2;3 1.187E-09 33826 QUIQUE_C1277_190116_001 158.01 101.1 3131200000 221810000 285510000 282060000 272160000 153020000 222250000 353760000 270670000 229470000 0 374570000 338520000 127420000 18814 2514 17684 166701;166702;166703;166704;166705;166706;166707;166708;166709;166710;166711;166712;166713;166714;166715;166716;166717;166718;166719;166720;166721;166722 212794;212795;212796;212797;212798;212799;212800;212801;212802;212803;212804;212805;212806;212807;212808;212809;212810;212811;212812;212813;212814;212815;212816;212817;212818;212819;212820;212821 212797 25 HKPLLIDMNK Unmodified 1207.6747 0.67471346 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1;E9PKG0 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 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2942.4913 0.49131918 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 3 3 2 132.89 132.89 2;3;4 2.8865E-108 137519 QUIQUE_DMIX8_190116_001 181.62 175.19 6463900000 94282000 514400000 233670000 140520000 294800000 142530000 243000000 882580000 955180000 0 969590000 1128000000 865420000 18817 4418 17687 166749;166750;166751;166752;166753;166754;166755;166756;166757;166758;166759;166760;166761;166762;166763;166764;166765;166766;166767;166768 212854;212855;212856;212857;212858;212859;212860;212861;212862;212863;212864;212865;212866;212867;212868;212869;212870;212871;212872;212873;212874;212875 212874 18 HKSEVEIPATVTAFVFEEDGAPVPALR Unmodified 2908.4971 0.49707326 2382 P35612 ADD2 Beta-adducin yes yes 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 136.47 136.47 3;4 1.2341E-26 139436 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.87 96.457 2127400000 78658000 190030000 87570000 126540000 105940000 92297000 192450000 320720000 185210000 0 248250000 229520000 270180000 18818 2382 17688 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yes no 0 0 0 1 25.053 25.053 2 0.0020173 18639 QUIQUE_C1403_190116_001 83.948 52.526 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18821 2932 17691 166794 212905 212905 1 HLAEEYGER Unmodified 1102.5043 0.5043369 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 15.743 15.743 2 0.061422 8155 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.574 29.726 43618000 0 0 0 0 0 0 0 43618000 0 0 0 0 0 18822 3277 17692 166795 212906 212906 1 HLAEHSPYYEAMK Unmodified 1574.7188 0.71876312 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 26.95 26.95 2;3 5.3574E-07 21733 QUIQUE_C1218_190116_001 97.463 87.342 621230000 100210000 79149000 65695000 93622000 0 63632000 87775000 44819000 41684000 0 0 44644000 0 18823 2952 17693 166796;166797;166798;166799;166800;166801;166802;166803;166804;166805 212907;212908;212909;212910;212911;212912;212913;212914;212915;212916;212917 212908 7 HLAEHSPYYEAMK Oxidation (M) 1590.7137 0.71367774 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 1 0 1 19.036 19.036 3 0.010257 11490 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.79 40.13 41107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41107000 0 0 0 18824 2952 17693 166806 212918 212918 2425 1 HLAEHSPYYEAMKK Oxidation (M) 1718.8086 0.80864076 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 1 1 1 13.449 13.449 4 0.00024925 5612 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.96 72.783 20507000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20507000 0 0 18825 2952 17694 166807 212919 212919 2425 1 HLAEYTHVEAECPFLTFDDLLNR Unmodified 2789.3119 0.31191502 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.11 137.11 4 1.6495E-51 142835 QUIQUE_C1218_190116_001 114.02 100.96 414120000 59745000 75135000 68170000 48029000 0 64854000 79640000 0 0 18545000 0 0 0 18826 1553 17695 166808;166809;166810;166811;166812;166813;166814 212920;212921;212922;212923;212924;212925;212926;212927;212928 212921 8 HLAGLAVGR Unmodified 892.52428 0.52428448 4649 Q9Y6C2 EMILIN1 EMILIN-1 yes yes 0 0 0 1 23.282 23.282 2 0.045399 16295 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.018 9.2447 14378000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14378000 0 0 0 18827 4649 17696 166815 212929 212929 1 HLAGLGLTEAIDK Unmodified 1336.7351 0.73506511 2565 P50454;E9PKH2 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 1 1 66.577 66.577 2 0.0014009 66109 QUIQUE_C1403_190116_001 80.014 57.928 67486000 0 22849000 20843000 23794000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18828 2565 17697 166816;166817;166818 212930;212931;212932 212932 1 HLAGVPLIGWVLR Unmodified 1429.8558 0.85578937 3652 Q8NFW8;F5H296 CMAS N-acylneuraminate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 133.39 133.39 2;3 1.5207E-09 138119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.53 75.562 268060000 0 20146000 18915000 0 25357000 0 30993000 22352000 28520000 0 34597000 64424000 22760000 18829 3652 17698 166819;166820;166821;166822;166823;166824;166825;166826;166827;166828;166829;166830;166831;166832;166833;166834 212933;212934;212935;212936;212937;212938;212939;212940;212941;212942;212943;212944;212945;212946;212947;212948;212949;212950 212942 18 HLAILGAGLMGAGIAQVSVDK Unmodified 2020.1139 0.11393091 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 124.82 124.82 3 2.9262E-05 129421 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.49 82.731 139240000 48991000 0 0 0 0 0 44656000 0 0 0 0 45595000 0 18830 1153 17699 166835;166836;166837;166838;166839;166840 212951;212952;212953;212954;212955;212956 212955 4 HLALNLQEK Unmodified 1064.5978 0.59784335 3079 Q14683;G8JLG1 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 0 1 30.643 30.643 2 0.012857 25433 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.747 38.605 52542000 0 0 0 0 0 0 0 52542000 0 0 0 0 0 18831 3079 17700 166841 212957 212957 1 HLAPEVFR Unmodified 967.52395 0.52395013 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6;J3QSX6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.255 32.255 2 0.016597 28430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.7 61.013 1480200000 0 199520000 0 0 174160000 144470000 112390000 138910000 231910000 0 192480000 0 286310000 18832 151 17701 166842;166843;166844;166845;166846;166847;166848;166849;166850 212958;212959;212960;212961;212962;212963;212964;212965;212966 212963 8 HLAQVGDSMDR Unmodified 1227.5666 0.56661958 2675 P55957 BID BH3-interacting domain death agonist;BH3-interacting domain death agonist p15;BH3-interacting domain death agonist p13;BH3-interacting domain death agonist p11 yes yes 0 0 0 1 1 1 20.779 20.779 2 0.0026953 13733 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.033 70.508 58062000 20830000 0 0 0 0 0 0 0 37232000 0 0 0 0 18833 2675 17702 166851;166852;166853 212967;212968;212969 212969 1 HLAVMPHPER Unmodified 1185.6077 0.60769653 1477 O15067 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 18.728 18.728 3 5.7359E-05 11158 QUIQUE_C1368_190116_001 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212978;212979;212980;212981;212982;212983;212984;212985;212986;212987;212988;212989;212990;212991 212987 13 HLCELLAQQF Unmodified 1257.6176 0.61759251 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.96 102.96 2 0.0048585 106023 QUIQUE_C1403_190116_001 79.469 59.139 1198000000 93204000 128220000 110370000 89648000 87322000 73230000 100370000 74086000 66980000 36072000 102820000 141710000 93971000 18837 1749 17705 166872;166873;166874;166875;166876;166877;166878;166879;166880;166881;166882;166883;166884 212992;212993;212994;212995;212996;212997;212998;212999;213000;213001;213002;213003;213004;213005;213006;213007;213008;213009;213010;213011;213012;213013;213014 212998 23 HLCEPGADGAETFADGVPR Unmodified 1997.8901 0.89013856 242 A0A2R8Y7I0;A0A2R8YDW2;A0A2R8Y4X2;A0A2R8YD40;A0A2R8YDJ9;A0A2R8Y425;A0A2R8Y5J0;A0A2R8YFK9;A0A2U3TZM0;A0A2R8YFD8;F5GWX5;A0A2R8Y212;A0A2R8Y521;A0A0C4DGG9;Q14839;A0A2R8YE38;A0A2R8Y5M9;A0A2R8Y7M9;A0A2R8Y8C1;Q8TDI0;K7EMY3;A0A2R8YER1;A0A2R8Y445 CHD4;CHD5 Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4;Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5 yes no 0 0 0 1 71.609 71.609 3 0.066411 72260 QUIQUE_C1576_190116_001 23.293 19.632 42475000 0 0 0 0 0 0 42475000 0 0 0 0 0 0 18838 242 17706 166885 213015 213015 1 HLCHTALPR Unmodified 1103.5658 0.56583172 3733 Q92558;Q5SZK5;Q5SZK4;Q5SZK3 WASF1 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 1 yes no 0 0 0 1 11.142 11.142 3 0.00093578 3426 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.853 69.767 15598000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15598000 0 0 0 18839 3733 17707 166886 213016 213016 1 HLCTILGDMLVTQALDSPNPEELPSPEQLK Unmodified 3344.6632 0.66322866 3580 Q8N3E9 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes yes 0 0 0 1 1 155.16 155.16 3 9.458E-10 158688 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46.214 46.214 2;3 0.0001322 44236 QUIQUE_C1218_190116_001 117.14 93.991 536110000 35523000 0 70945000 0 0 65081000 91566000 71323000 0 29339000 90876000 81461000 0 18844 1607 17712 166935;166936;166937;166938;166939;166940;166941;166942 213084;213085;213086;213087;213088;213089;213090;213091 213084 7 HLDLASLK Unmodified 895.51272 0.51271674 3626 Q8NBN7;G8JLA1;K7EMY5 RDH13 Retinol dehydrogenase 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.3 40.3 2 0.0036304 37682 QUIQUE_C1218_190116_001 116.37 41.956 208130000 21747000 36543000 0 32162000 0 0 0 0 0 0 40510000 33138000 44032000 18845 3626 17713 166943;166944;166945;166946;166947;166948;166949;166950;166951 213092;213093;213094;213095;213096;213097;213098;213099;213100;213101 213093 10 HLDLSNVAGYK Unmodified 1215.6248 0.62478638 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 55.433 55.433 2;3 0.00053964 54322 QUIQUE_C1576_190116_001 82.029 68.675 593690000 0 0 0 0 23289000 0 24647000 0 327010000 192290000 0 0 26453000 18846 4510 17714 166952;166953;166954;166955;166956;166957 213102;213103;213104;213105;213106;213107;213108 213103 6 HLDMADLEAK Unmodified 1141.5438 0.54375887 1648 O75600;H7BZ75 GCAT 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 48.266 48.266 2 0.016499 45773 QUIQUE_C1218_190116_001 87.258 50.863 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18847 1648 17715 166958 213109 213109 1 HLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQR Oxidation (M) 3057.5666 0.56656658 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 1 1 3 3 2 2 1 117.88 117.88 3;4;5 2.8378E-37 121411 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.23 121.38 1207400000 0 0 0 0 0 0 0 404720000 232630000 0 262260000 169700000 138120000 18848 2483 17716 166959;166960;166961;166962;166963;166964;166965;166966;166967;166968;166969 213110;213111;213112;213113;213114;213115;213116;213117;213118;213119;213120;213121;213122;213123;213124;213125 213113 1912 16 HLDRVDSILLTHIGDDNLPGINSMLQR Unmodified 3041.5717 0.57165196 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 132.91 132.91 3;4;5 1.9656E-30 137215 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.34 103.42 400590000 0 0 0 0 0 0 0 33164000 161890000 0 166570000 38967000 0 18849 2483 17716 166970;166971;166972;166973;166974;166975 213126;213127;213128;213129;213130;213131 213131 5 HLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYK Unmodified 3744.8022 0.80216499 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.96 159.96 3 4.0956E-51 165470 QUIQUE_C1218_190116_001 115.18 106.78 896160000 50442000 93033000 66203000 29531000 40436000 29154000 72328000 96485000 98368000 0 137180000 90215000 92781000 18850 2176 17717 166976;166977;166978;166979;166980;166981;166982;166983;166984;166985;166986;166987 213132;213133;213134;213135;213136;213137;213138;213139;213140;213141;213142;213143 213132 12 HLDSSAAAIIDAPMDIPGLNLSQQEYYPYVYYK Oxidation (M) 3760.7971 0.79707961 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 153.11 153.11 3 1.9697E-14 158571 QUIQUE_C1368_190116_001 61.499 56.287 68382000 0 0 28351000 0 0 0 0 40031000 0 0 0 0 0 18851 2176 17717 166988;166989;166990;166991 213144;213145;213146;213147 213145 1529 3 HLDSSSNERPDISSIQR Unmodified 1939.9348 0.93478057 2552 P49902;Q5JUV6 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 34.353 34.353 3 0.0016309 28671 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.522 41.478 445720000 55617000 0 0 0 0 0 0 97930000 94914000 0 0 85899000 111360000 18852 2552 17718 166992;166993;166994;166995;166996 213148;213149;213150;213151;213152;213153 213153 5 HLDSVLSDHTR Unmodified 1278.6317 0.63166267 118 A0A087X256;Q2M389;F8W1W1 KIAA1033 WASH complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 21.009 21.009 3 0.026659 14273 QUIQUE_C1438_190116_001 39.702 30.635 105010000 0 0 0 0 26699000 0 0 0 0 0 40160000 38148000 0 18853 118 17719 166997;166998;166999;167000 213154;213155;213156;213157 213154 2 HLDTFLK Unmodified 872.4756 0.47560295 2586 P51580 TPMT Thiopurine S-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 33.188 33.188 2 0.047935 27025 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.347 42.854 10670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10670000 0 0 0 18854 2586 17720 167001 213158 213158 1 HLDVMDLSK Unmodified 1056.5274 0.52738052 495 H3BSW0;A0A3B3ISV5;Q8N9N7 LRRC57 Leucine-rich repeat-containing protein 57 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.364 51.364 2 0.0024957 49355 QUIQUE_C1576_190116_001 93.467 70.114 337020000 42404000 43499000 47559000 46551000 37122000 0 38604000 36862000 0 0 0 0 44424000 18855 495 17721 167002;167003;167004;167005;167006;167007;167008;167009 213159;213160;213161;213162;213163;213164;213165;213166 213164 7 HLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFER Unmodified 3045.4866 0.48658493 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9;E5RJY3 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 153.53 153.53 3 2.3285E-84 157877 QUIQUE_C1277_190116_001 170.55 158.81 1084700000 97885000 118310000 0 54028000 64465000 88704000 91733000 127240000 75254000 0 111580000 98568000 156940000 18856 907 17722 167010;167011;167012;167013;167014;167015;167016;167017;167018;167019;167020;167021;167022;167023 213167;213168;213169;213170;213171;213172;213173;213174;213175;213176;213177;213178;213179;213180;213181;213182;213183;213184 213171 18 HLDYLIQATNETNVNIPQMADTLFER Oxidation (M) 3061.4815 0.48149955 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9;E5RJY3 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 1 0 2 136.48 136.48 3 1.1271E-15 138770 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.176 74.773 84169000 0 0 0 0 0 0 0 84169000 0 0 0 0 0 18857 907 17722 167024;167025 213185;213186 213185 553 2 HLEEDYADAYQDLYQPHR Unmodified 2261.9978 0.99777475 2639 P54284;F8VNV8 CACNB3 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 yes no 0 0 0 1 85.613 85.613 3 9.3954E-06 86321 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.235 84.198 29461000 0 0 0 0 0 0 0 29461000 0 0 0 0 0 18858 2639 17723 167026 213187 213187 1 HLEEIVEK Unmodified 995.52876 0.52876073 51 F8W7S5;A0A087WVV2;Q9P2E9;A0A087WU26 RRBP1 Ribosome-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 20.469 20.469 2 0.034212 13112 QUIQUE_C1368_190116_001 64.207 25.401 81482000 24846000 0 32496000 0 0 0 24140000 0 0 0 0 0 0 18859 51 17724 167027;167028;167029 213188;213189;213190 213189 3 HLEEIVHVEQGR Unmodified 1444.7423 0.74227576 2854 Q01433;H0Y360 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 31.285 31.285 2;3 0.0013047 26598 QUIQUE_C1218_190116_001 90.913 69.914 864600000 170230000 138660000 117280000 83460000 0 66355000 100980000 88188000 0 0 0 99447000 0 18860 2854 17725 167030;167031;167032;167033;167034;167035;167036;167037;167038;167039 213191;213192;213193;213194;213195;213196;213197;213198;213199;213200 213192 9 HLEEPLSLQELDTSSGVLLPFFDPDTNIVYLCGK Unmodified 3845.9074 0.90735834 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 2 1 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213238 19 HLEGAYADWDVVMSR Unmodified 1747.7988 0.79880436 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 2 1 1 100.65 100.65 2;3 0.0054144 103816 QUIQUE_C1368_190116_001 47.639 43.248 181650000 0 0 119390000 0 0 0 0 37359000 0 0 0 0 24895000 18866 1670 17730 167080;167081;167082;167083 213243;213244;213245;213246;213247 213243 5 HLEGLSEEAIMELNLPTGIPIVYELDK Oxidation (M) 3038.5522 0.55220488 2139 P18669 PGAM1 Phosphoglycerate mutase 1 yes yes 0 1 0 3 2 2 3 2 2 1 1 2 2 2 3 1 162.38 162.38 2;3 8.0323E-283 166951 QUIQUE_DMIX3_190116_001 263.15 253.96 18046000000 898540000 1492100000 1201600000 1197000000 2219300000 1534900000 1379700000 1501000000 985670000 481300000 1409700000 1489400000 2256200000 18867 2139 17731 167084;167085;167086;167087;167088;167089;167090;167091;167092;167093;167094;167095;167096;167097;167098;167099;167100;167101;167102;167103;167104;167105;167106;167107;167108;167109 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213287;213288;213289;213290;213291;213292;213293;213294;213295;213296;213297;213298;213299;213300;213301;213302;213303;213304;213305;213306;213307;213308;213309;213310;213311;213312;213313;213314;213315;213316;213317;213318;213319;213320;213321;213322;213323;213324 213300 29 HLEGMSDQAIMELNLPTGIPIVYELNK Oxidation (M) 3040.5249 0.52494427 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 152.96 152.96 3 2.2064E-12 148482 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.361 65.776 199490000 0 0 0 56389000 0 0 0 0 59810000 40160000 0 0 43130000 18869 2090 17732 167141;167142;167143;167144 213325;213326;213327;213328 213327 1430;1431 4 HLEGMSDQAIMELNLPTGIPIVYELNK Unmodified 3024.53 0.53002965 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.24 158.24 3 3.4026E-08 162579 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.722 52.359 1001400000 0 0 0 0 61611000 0 88441000 183220000 214880000 0 129110000 191110000 133060000 18870 2090 17732 167145;167146;167147;167148;167149;167150;167151 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213390;213391;213392;213393;213394;213395;213396;213397;213398;213399;213400;213401;213402;213403;213404;213405;213406;213407;213408;213409;213410;213411;213412;213413;213414;213415;213416;213417;213418;213419;213420;213421;213422;213423;213424;213425;213426;213427;213428;213429;213430;213431;213432;213433;213434;213435;213436;213437;213438;213439;213440;213441 213391 52 HLEINPDHSIIETLR Unmodified 1785.9373 0.93734675 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 4 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 77.703 77.703 2;3;4 9.7186E-95 79965 QUIQUE_C1218_190116_001 215 207.77 39964000000 3114500000 3881600000 2946400000 3488200000 3549300000 3399400000 3356500000 2368000000 2243400000 1941500000 3885100000 2703600000 3086900000 18876 1931 17738 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dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 1 1 30.845 30.845 2;3 0.00044897 26250 QUIQUE_C1218_190116_001 117.72 103.82 1917500000 166770000 202800000 193700000 149300000 183030000 122980000 240780000 28167000 0 47683000 241110000 163590000 177570000 18880 4658 17741 167290;167291;167292;167293;167294;167295;167296;167297;167298;167299;167300;167301;167302;167303;167304 213525;213526;213527;213528;213529;213530;213531;213532;213533;213534;213535;213536;213537;213538;213539;213540 213526 14 HLEVLHSLLK Unmodified 1187.7026 0.70264277 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 1 1 53.403 53.403 3 0.018694 51792 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.167 44.16 21286000 0 0 21286000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18881 2882 17742 167305;167306;167307;167308 213541;213542;213543;213544 213542 4 HLFLTSKPMVYLVNLSEK Unmodified 2118.1547 0.15473309 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JCJ9 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 1 1 1 113.95 113.95 3 0.010842 116768 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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213568;213569;213570;213571;213572;213573;213574 213572 6 HLGGIPWTYAEDAVPTLTPCR Unmodified 2353.1525 0.15250126 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 130.06 130.06 2;3 6.6995E-76 135079 QUIQUE_C1368_190116_001 235.22 222.09 4480700000 495850000 328070000 551980000 330610000 304500000 435930000 433610000 297930000 319910000 95375000 261780000 241660000 383500000 18888 2337 17749 167337;167338;167339;167340;167341;167342;167343;167344;167345;167346;167347;167348;167349;167350;167351;167352;167353;167354;167355;167356;167357;167358;167359;167360 213575;213576;213577;213578;213579;213580;213581;213582;213583;213584;213585;213586;213587;213588;213589;213590;213591;213592;213593;213594;213595;213596;213597;213598;213599;213600;213601;213602;213603;213604;213605;213606;213607;213608;213609;213610;213611;213612;213613;213614;213615;213616;213617;213618;213619;213620 213585 46 HLGIVDAFQQGK Unmodified 1311.6935 0.69353465 2564 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1183.6462 0.64619053 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;F5H1T6;K7ERA0;K7ERA6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 2 62.23 62.23 2;3 2.611E-05 61646 QUIQUE_C1277_190116_001 112.75 98.929 1101000000 35853000 133010000 139600000 129180000 50308000 32242000 59976000 26477000 52814000 0 180820000 62134000 198630000 18891 3780 17752 167386;167387;167388;167389;167390;167391;167392;167393;167394;167395;167396;167397;167398;167399;167400;167401;167402;167403;167404 213654;213655;213656;213657;213658;213659;213660;213661;213662;213663;213664;213665;213666;213667;213668;213669;213670;213671;213672;213673;213674 213656 19 HLGVCISVANNR Unmodified 1338.6827 0.68265239 1525 O43390;B4DT28 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 39.029 39.029 2;3 0.0017461 35476 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.46 0 796610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 796610000 18892 1525 17753 167405;167406 213675;213676 213675 2 HLGWLAEK Unmodified 952.51305 0.51305109 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 37.025 37.025 2 0.01657 32675 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.16 84.69 347260000 84462000 0 0 0 0 0 0 0 88133000 0 0 83550000 91116000 18893 3029 17754 167407;167408;167409;167410;167411;167412;167413 213677;213678;213679;213680;213681;213682;213683;213684 213683 5 HLGYKPEEYK Unmodified 1262.6295 0.62953741 1014 F5H6E2;O00159 MYO1C Unconventional myosin-Ic yes no 0 0 1 1 1 1 17.667 17.667 3 0.0087758 10002 QUIQUE_C1403_190116_001 52.725 40.149 103480000 0 0 0 36264000 0 0 36866000 0 0 0 30351000 0 0 18894 1014 17755 167414;167415;167416 213685;213686;213687 213685 3 HLHAILGPMLLNRPLDGVTNSLPSPEQLK Unmodified 3159.7227 0.72267329 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 122.6 122.6 4 0.00024751 126728 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.104 37.88 374550000 0 0 48038000 0 0 0 0 0 84343000 0 83712000 72386000 86070000 18895 2578 17756 167417;167418;167419;167420;167421 213688;213689;213690;213691;213692;213693;213694 213693 6 HLHDSQHVAVFHR Unmodified 1581.7913 0.79129163 3674 Q8TCG5 CPT1C Carnitine O-palmitoyltransferase 1, brain isoform yes yes 0 0 0 1 1 13.35 13.35 4 0.00084337 5403 QUIQUE_C1368_190116_001 62.338 56.623 11629000 0 0 3750800 0 0 0 0 0 0 0 7877900 0 0 18896 3674 17757 167422;167423 213695;213696 213695 1 HLHFTLVK Unmodified 993.57599 0.5759857 2016;2017;948 P11216;E9PK47;P06737;P11217 PYGB;PYGL;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 28.089 28.089 2 0.0036109 22756 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.6 73.1 1120900000 115790000 108590000 64358000 75535000 78543000 61395000 109100000 95222000 68045000 41517000 96745000 69090000 136960000 18897 2016;948;2017 17758 167424;167425;167426;167427;167428;167429;167430;167431;167432;167433;167434;167435;167436;167437 213697;213698;213699;213700;213701;213702;213703;213704;213705;213706;213707;213708;213709;213710;213711;213712;213713 213708 16 HLHFVDVDDLHIIVQELR Unmodified 2197.1644 0.16438657 3388 Q6PCB0 VWA1 von Willebrand factor A domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 131 131 4 0.022503 133911 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.366 22.675 16326000 0 0 0 0 0 0 0 16326000 0 0 0 0 0 18898 3388 17759 167438 213714 213714 1 HLHSIMVLK Unmodified 1076.6165 0.6164703 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.527 25.527 3 0.00013036 19551 QUIQUE_C1277_190116_001 104.06 88.175 1022800000 99073000 90017000 61747000 81787000 85132000 88100000 84355000 66362000 78210000 0 90081000 73832000 124070000 18899 1403 17760 167439;167440;167441;167442;167443;167444;167445;167446;167447;167448;167449;167450 213715;213716;213717;213718;213719;213720;213721;213722;213723;213724;213725;213726;213727;213728;213729;213730 213716 16 HLIEDLIIESSK Unmodified 1395.7609 0.76094551 2923 Q08495;E5RFK4;E5RJC0;E5RGQ0;E5RGQ7 DMTN Dematin yes no 0 0 0 2 2 4 2 2 2 2 1 2 1 2 2 99.228 99.228 2;3 0.00046529 100641 QUIQUE_C1563_190116_001 128.01 99.616 969040000 111680000 84687000 87073000 135590000 70285000 113100000 77111000 49768000 0 0 59966000 56919000 122860000 18900 2923 17761 167451;167452;167453;167454;167455;167456;167457;167458;167459;167460;167461;167462;167463;167464;167465;167466;167467;167468;167469;167470;167471;167472;167473;167474 213731;213732;213733;213734;213735;213736;213737;213738;213739;213740;213741;213742;213743;213744;213745;213746;213747;213748;213749;213750;213751;213752;213753;213754;213755;213756;213757 213744 23 HLIEMGYLQGGK Unmodified 1344.686 0.68600643 3652 Q8NFW8;F5GYM0 CMAS N-acylneuraminate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.864 63.864 2 7.6382E-05 62846 QUIQUE_C1277_190116_001 123.29 96.158 88391000 0 54374000 0 0 0 0 0 34018000 0 0 0 0 0 18901 3652 17762 167475;167476;167477;167478;167479;167480 213758;213759;213760;213761;213762;213763 213759 6 HLIEQDFPGMR Unmodified 1341.65 0.64995528 4175 Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9JIJ3;C9IZH1 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.188 65.188 2 0.00098767 64057 QUIQUE_C1403_190116_001 91.867 70.997 76233000 0 0 0 52372000 0 0 0 23862000 0 0 0 0 0 18902 4175 17763 167481;167482;167483;167484 213764;213765;213766;213767;213768;213769 213766 6 HLIGGLDDVSNK Unmodified 1266.6568 0.65681479 3035 Q13976;A0A0A0MSB3 PRKG1 cGMP-dependent protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 45.324 45.324 3 0.0043376 42596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.341 24.441 18234000 0 0 0 0 0 0 0 0 18234000 0 0 0 0 18903 3035 17764 167485 213770 213770 1 HLILLIK Unmodified 848.58476 0.58475947 3312 Q5T4S7 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes yes 0 0 0 1 56.802 56.802 2 0.046142 52127 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.906 0 6787600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6787600 0 0 0 18904 3312 17765 167486 213771 213771 1 HLILPEK Unmodified 848.51199 0.51198846 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 1 21.881 21.881 2 0.050616 15000 QUIQUE_C1576_190116_001 74.439 2.7238 57284000 0 0 0 0 0 0 25390000 0 31894000 0 0 0 0 18905 1650 17766 167487;167488 213772;213773 213772 2 HLIPAANTGESK Unmodified 1236.6463 0.64625011 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 18.62 18.62 2;3 1.2423E-08 11328 QUIQUE_DMIX4_190116_001 159.4 116.16 84729000000 6884900000 9058800000 7801400000 7257300000 6878100000 7516400000 8431200000 3565500000 5360600000 2805600000 7438200000 5356400000 6374000000 18906 2745 17767 167489;167490;167491;167492;167493;167494;167495;167496;167497;167498;167499;167500;167501;167502;167503;167504;167505;167506;167507;167508;167509;167510;167511;167512;167513;167514 213774;213775;213776;213777;213778;213779;213780;213781;213782;213783;213784;213785;213786;213787;213788;213789;213790;213791;213792;213793;213794;213795;213796;213797;213798;213799;213800;213801;213802;213803;213804;213805;213806;213807;213808;213809;213810;213811;213812;213813;213814;213815;213816 213806 43 HLISSLQNHNHQLK Unmodified 1667.8856 0.88558595 3333;1186 Q5VTR2;H3BP71;O75150 RNF20;RNF40 E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A;E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 18.168 18.168 4 0.0019526 10714 QUIQUE_C1277_190116_001 54.005 42.746 111170000 0 28488000 0 16455000 30404000 18962000 16866000 0 0 0 0 0 0 18907 3333;1186 17768 167515;167516;167517;167518;167519 213817;213818;213819;213820;213821 213817 5 HLISTHFAPGDFQGFALVNPQR Unmodified 2451.2448 0.24476216 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 112.88 112.88 3;4 1.2675E-20 116507 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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213849;213850;213851;213852;213853;213854;213855;213856;213857;213858;213859;213860;213861;213862;213863;213864;213865;213866 213856 17 HLLFEVQPGSDSSAFWK Unmodified 1946.9527 0.95266246 961 E9PLX2;E9PQV2;Q8WVD5 RNF141 RING finger protein 141 yes no 0 0 0 1 1 119.92 119.92 3 0.0041529 125663 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.085 37.902 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18910 961 17771 167553;167554 213867;213868 213868 2 HLLFQSHMATK Unmodified 1311.6758 0.6757761 646 E7EW69;B5ME97;Q9P0V9;C9JEQ7;F5H1W3;F8WC85 SEPT10 Septin-10 yes no 0 0 0 1 1 25.097 25.097 3 0.011211 18413 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.391 38.306 112080000 0 0 0 0 0 0 0 55668000 56407000 0 0 0 0 18911 646 17772 167555;167556 213869;213870;213871 213870 3 HLLGVEDLLQK Unmodified 1263.7187 0.71868677 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 3 2 2 3 2 2 4 2 2 3 2 2 96.361 96.361 1;2;3 4.088E-37 95204 QUIQUE_DMIX8_190116_001 230.24 163.55 24713000000 1895100000 2297700000 1735500000 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Unmodified 1095.6037 0.60365701 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.46 35.46 2 0.000957 30266 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.56 55.06 1611000000 846970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 764050000 0 18914 2396 17775 167589;167590;167591;167592;167593;167594;167595 213923;213924;213925;213926;213927;213928;213929 213928 7 HLLNVINENFGTLAFCR Unmodified 2017.0204 0.020364872 2570 P50579;F8VRR3;F8VQZ7 METAP2 Methionine aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.85 129.85 3 5.5527E-06 134051 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.01 93.475 220270000 0 0 0 29600000 35227000 21191000 41775000 0 34501000 18424000 0 0 39554000 18915 2570 17776 167596;167597;167598;167599;167600;167601;167602 213930;213931;213932;213933;213934;213935;213936;213937 213935 8 HLLPCVIHAAVLK Unmodified 1469.8541 0.85407481 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 66.003 66.003 3 4.1486E-05 64551 QUIQUE_C1563_190116_001 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213974;213975;213976;213977;213978;213979;213980;213981;213982;213983 213975 7 HLLVHAPEDKK Unmodified 1285.7143 0.71427009 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 1 1 10.516 10.516 3 0.0017537 2839 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.649 44.429 34029000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34029000 0 0 0 18921 2623 17782 167647 213984 213984 1 HLLVSNVGGDGEEIER Unmodified 1722.8537 0.8536767 1653 O75694;E9PF10 NUP155 Nuclear pore complex protein Nup155 yes no 0 0 0 1 54.705 54.705 3 0.00031447 53858 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.975 49.222 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18922 1653 17783 167648 213985 213985 1 HLMLPDFDLLEDIESK Unmodified 1913.9445 0.94446554 2051 P13010;C9JZ81 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 2 1 154.26 154.26 2;3 8.3011E-10 159580 QUIQUE_C1368_190116_001 139.78 108.91 2235200000 286330000 361480000 154240000 102090000 158710000 237540000 245900000 80829000 195340000 17242000 137300000 181140000 77054000 18923 2051 17784 167649;167650;167651;167652;167653;167654;167655;167656;167657;167658;167659;167660;167661;167662;167663;167664;167665;167666;167667;167668;167669;167670 213986;213987;213988;213989;213990;213991;213992;213993;213994;213995;213996;213997;213998;213999;214000;214001;214002;214003;214004;214005;214006;214007;214008;214009 213993 24 HLMLPDFDLLEDIESK Oxidation (M) 1929.9394 0.93938016 2051 P13010;C9JZ81 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 149.24 149.24 2;3 1.6433E-13 153808 QUIQUE_DMIX7_190116_001 137.81 91.927 1990000000 0 193820000 121070000 102980000 90136000 218940000 68232000 185450000 262180000 89427000 333720000 201590000 122450000 18924 2051 17784 167671;167672;167673;167674;167675;167676;167677;167678;167679;167680;167681;167682;167683;167684;167685;167686;167687;167688;167689 214010;214011;214012;214013;214014;214015;214016;214017;214018;214019;214020;214021;214022;214023;214024;214025;214026;214027;214028;214029;214030;214031 214028 1368 20 HLNATVNNLQAK Unmodified 1321.7102 0.71024735 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 20.627 20.627 2;3 1.3087E-54 13147 QUIQUE_C1403_190116_001 208.15 169.6 4623900000 447130000 276270000 292440000 272030000 436230000 337980000 485270000 295060000 264680000 94904000 502280000 468420000 451260000 18925 3433 17785 167690;167691;167692;167693;167694;167695;167696;167697;167698;167699;167700;167701;167702;167703;167704;167705;167706;167707;167708;167709;167710;167711 214032;214033;214034;214035;214036;214037;214038;214039;214040;214041;214042;214043;214044;214045;214046;214047;214048;214049;214050;214051;214052;214053 214036 16 HLNEIDLFHCIDPNDSK Unmodified 2065.9527 0.95273882 81 A0A087WYT3;Q15185 PTGES3 Prostaglandin E synthase 3 yes no 0 0 0 3 2 3 3 3 3 3 3 4 3 3 2 4 94.983 94.983 2;3;4 7.7385E-63 92679 QUIQUE_DMIX4_190116_001 212.24 200.26 11379000000 823320000 944410000 562450000 947700000 1047900000 1072200000 1171100000 760000000 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167757;167758;167759;167760;167761;167762;167763;167764;167765;167766;167767;167768;167769;167770;167771;167772;167773;167774;167775;167776;167777;167778;167779;167780;167781;167782;167783;167784;167785;167786;167787;167788;167789;167790;167791;167792;167793;167794;167795;167796;167797;167798;167799;167800;167801;167802;167803;167804;167805 214110;214111;214112;214113;214114;214115;214116;214117;214118;214119;214120;214121;214122;214123;214124;214125;214126;214127;214128;214129;214130;214131;214132;214133;214134;214135;214136;214137;214138;214139;214140;214141;214142;214143;214144;214145;214146;214147;214148;214149;214150;214151;214152;214153;214154;214155;214156;214157;214158;214159;214160;214161;214162;214163;214164;214165;214166;214167;214168;214169;214170;214171;214172;214173;214174;214175;214176;214177;214178;214179;214180;214181 214127 70 HLNLEYHSSMIADAVK Unmodified 1826.8985 0.8985184 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 3 2 2 1 1 1 2 1 1 2 68.043 68.043 2;3;4 4.1675E-55 67644 QUIQUE_C1277_190116_001 195.1 169.09 771380000 82551000 214110000 67369000 0 0 62917000 0 74155000 125040000 40747000 0 0 104500000 18930 86 17790 167806;167807;167808;167809;167810;167811;167812;167813;167814;167815;167816;167817;167818;167819;167820;167821 214182;214183;214184;214185;214186;214187;214188;214189;214190;214191;214192;214193;214194;214195;214196;214197;214198;214199 214185 16 HLNLEYHSSMIADAVK Oxidation (M) 1842.8934 0.89343302 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 54.111 54.111 3 0.011097 52023 QUIQUE_C1576_190116_001 48.391 37.757 79223000 0 79223000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18931 86 17790 167822;167823 214200;214201 214201 59 1 HLNLEYHSSMIADAVKK Unmodified 1954.9935 0.99348142 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 55.25 55.25 4 0.022798 53395 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.974 20.506 99189000 0 0 0 0 0 0 0 41051000 0 0 0 58138000 0 18932 86 17791 167824;167825 214202;214203 214202 2 HLNLGMNR Unmodified 953.48652 0.48651876 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 1 22.131 22.131 2 0.052831 15284 QUIQUE_C1218_190116_001 71.715 9.0005 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18933 3136 17792 167826 214204 214204 1 HLNPDTELKR Unmodified 1221.6466 0.64658446 1190 H3BQ53;Q9BQ70;Q9H7D3;H3BSP8;H3BSS3 TCF25 Transcription factor 25 yes no 0 0 1 1 14.831 14.831 3 0.0087977 7059 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.73 41.357 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18934 1190 17793 167827 214205 214205 1 HLNRPTLDDSSEEEHAIEITTQEITQLFHR Unmodified 3558.7339 0.7339025 1205 H3BU86;O14662;Q96NX8;F8W9Z6;B7ZBM8;B7ZBM4;B7ZBM5 STX16-NPEPL1;STX16 Syntaxin-16 yes no 0 0 1 1 1 144.42 144.42 5 8.1838E-06 151158 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.101 47.066 118000000 0 0 0 0 0 0 0 41380000 0 0 76620000 0 0 18935 1205 17794 167828;167829 214206;214207 214207 2 HLNYTEFTQFLQELQLEHAR Unmodified 2516.2448 0.24482174 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 140.55 140.55 3;4 3.6956E-38 145268 QUIQUE_DMIX8_190116_001 155.49 147.87 2509800000 28094000 54980000 319970000 73601000 80462000 0 238630000 49403000 263860000 0 725210000 481040000 194560000 18936 1655 17795 167830;167831;167832;167833;167834;167835;167836;167837;167838;167839;167840;167841;167842;167843;167844;167845;167846;167847 214208;214209;214210;214211;214212;214213;214214;214215;214216;214217;214218;214219;214220;214221;214222;214223;214224;214225;214226;214227 214227 19 HLPDGNICR Unmodified 1080.5135 0.51346179 3505 Q86WA6 BPHL Valacyclovir hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 20.044 20.044 2 0.037685 12593 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.157 25.645 361650000 0 0 139390000 0 0 0 0 0 0 39687000 68589000 0 113990000 18937 3505 17796 167848;167849;167850;167851 214228;214229;214230;214231 214231 4 HLPDNECIEK Unmodified 1253.571 0.57103625 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 20.084 20.084 2 0.032175 13213 QUIQUE_C1368_190116_001 53.775 32.247 28491000 0 0 28491000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18938 2638 17797 167852;167853 214232;214233 214232 2 HLPGADPELVLLGR Unmodified 1485.8304 0.83036248 59 A0A087WWF1;Q8WWX9 SELM Selenoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.227 97.227 3 0.00026626 100049 QUIQUE_C1368_190116_001 80.31 72.854 58979000 24581000 0 18756000 0 0 0 0 0 0 0 15643000 0 0 18939 59 17798 167854;167855;167856;167857 214234;214235;214236;214237 214235 4 HLPNDPMFK Unmodified 1097.5328 0.53280025 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;H0YIC4 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 38.634 38.634 2 0.00043323 34666 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.89 65.536 2293600000 243360000 206220000 207300000 171000000 135030000 136850000 170080000 196130000 170750000 57849000 225190000 187020000 186810000 18940 612 17799 167858;167859;167860;167861;167862;167863;167864;167865;167866;167867;167868;167869;167870;167871 214238;214239;214240;214241;214242;214243;214244;214245;214246;214247;214248;214249;214250;214251;214252;214253;214254;214255;214256;214257;214258;214259;214260;214261;214262;214263;214264;214265;214266;214267;214268;214269;214270;214271;214272;214273;214274;214275;214276;214277 214262 40 HLPSTEPDPHVVR Unmodified 1482.7579 0.75792582 142 A0A0A0MRA5;B7Z4B8;Q9BUJ2;M0R3F1;M0QYZ0;M0QYI8;M0QYM5 HNRNPUL1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 23.687 23.687 3 0.00075025 17715 QUIQUE_C1218_190116_001 73.881 51.835 722630000 61619000 89328000 151830000 109360000 0 0 64926000 0 84202000 0 0 105770000 55595000 18941 142 17800 167872;167873;167874;167875;167876;167877;167878;167879;167880;167881 214278;214279;214280;214281;214282;214283;214284;214285;214286;214287 214278 8 HLPSVPGLLR Unmodified 1087.6502 0.65021327 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 3 2 2 3 2 1 68.241 68.241 2;3 0.00073328 67876 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.464 59.321 7821000000 602830000 687690000 676870000 617690000 548570000 561550000 488810000 540440000 732410000 265270000 857570000 633320000 607980000 18942 2261 17801 167882;167883;167884;167885;167886;167887;167888;167889;167890;167891;167892;167893;167894;167895;167896;167897;167898;167899;167900;167901;167902;167903;167904;167905;167906;167907;167908;167909 214288;214289;214290;214291;214292;214293;214294;214295;214296;214297;214298;214299;214300;214301;214302;214303;214304;214305;214306;214307;214308;214309;214310;214311;214312;214313;214314;214315;214316;214317;214318;214319;214320;214321;214322;214323;214324;214325;214326;214327;214328;214329;214330;214331;214332;214333;214334;214335;214336;214337;214338;214339;214340 214325 53 HLPYFCR Unmodified 991.46981 0.46980607 3785 Q969G6 RFK Riboflavin kinase yes yes 0 0 0 1 40.146 40.146 2 0.05526 34391 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.021 38.329 9467000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9467000 0 0 0 18943 3785 17802 167910 214341 214341 1 HLQAAFEDGFDNCDAGWLSDR Unmodified 2423.0237 0.023671928 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 118.01 118.01 3 9.387E-07 122013 QUIQUE_C1368_190116_001 80.303 75.686 275200000 60166000 60564000 47422000 38313000 0 0 68732000 0 0 0 0 0 0 18944 1436 17803 167911;167912;167913;167914;167915 214342;214343;214344;214345;214346;214347 214345 6 HLQAVDYASR Unmodified 1158.5782 0.57817054 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.842 22.842 2 0.00035396 16981 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.38 53.528 2985100000 221630000 256770000 332260000 266420000 268910000 163300000 282500000 255150000 0 113620000 493140000 331420000 0 18945 3434 17804 167916;167917;167918;167919;167920;167921;167922;167923;167924;167925;167926 214348;214349;214350;214351;214352;214353;214354;214355;214356;214357;214358;214359 214356 12 HLQDFHLNGFDHNFCLK Unmodified 2140.9901 0.99012738 3816 Q96C23;H7C1B5;B8ZZ75 GALM Aldose 1-epimerase yes no 0 0 0 1 89.766 89.766 4 0.03737 90782 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.979 20.546 40686000 0 0 0 0 0 0 0 40686000 0 0 0 0 0 18946 3816 17805 167927 214360 214360 1 HLQDLFAPLVVR Unmodified 1406.8034 0.80341945 4494;981;1236 F1T0E5;Q9ULU8;H7C4T6 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 112.77 112.77 2;3 2.1811E-10 117520 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.01 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215851 1458 HLQFIPVVPPR Unmodified 1301.7608 0.76082635 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 77.027 77.027 3 0.0019791 77456 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.719 57.415 20594000 0 11592000 0 0 0 0 0 0 9001500 0 0 0 0 18950 3043 17809 169209;169210;169211;169212;169213;169214;169215 215986;215987;215988;215989;215990;215991;215992 215991 6 HLQIIYEINQR Unmodified 1425.7728 0.7728476 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 65.615 65.615 2;3 3.2476E-06 65667 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.53 97.297 2539700000 0 102500000 276450000 134240000 210430000 0 407140000 311860000 432720000 0 45430000 354520000 264370000 18951 2017 17810 169216;169217;169218;169219;169220;169221;169222;169223;169224;169225;169226;169227;169228;169229;169230;169231;169232;169233 215993;215994;215995;215996;215997;215998;215999;216000;216001;216002;216003;216004;216005;216006;216007;216008;216009;216010;216011 216004 19 HLQINQTFEELR Unmodified 1526.7841 0.78414057 2592;1320 K7EK35;P42229;K7EIF9;P51692;C9J4I3 STAT5A;STAT5B Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A;Signal transducer and activator of transcription 5B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.529 71.529 2 5.2656E-06 71986 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.24 110.05 322040000 0 35693000 0 42124000 29213000 28486000 45916000 0 29309000 0 44181000 29404000 37718000 18952 1320;2592 17811 169234;169235;169236;169237;169238;169239;169240;169241;169242;169243 216012;216013;216014;216015;216016;216017;216018;216019;216020;216021 216018 10 HLQLAIR Unmodified 849.51847 0.51847082 3196;1871;1979;2100 Q93077;Q7L7L0;P04908;Q71UI9;P0C0S5;C9J0D1;C9J386;A0A3B3IS11;Q96QV6;P16104;Q16777;Q6FI13;A0A0U1RR32;A0A0U1RRH7;Q99878;Q96KK5;Q9BTM1;P20671;P0C0S8;H0YFX9 HIST1H2AC;HIST3H2A;HIST1H2AB;H2AFV;H2AFZ;HIST1H2AA;H2AFX;HIST2H2AC;HIST2H2AA3;HIST1H2AJ;HIST1H2AH;H2AFJ;HIST1H2AD;HIST1H2AG Histone H2A type 1-C;Histone H2A type 3;Histone H2A type 1-B/E;Histone H2A.V;Histone H2A.Z;Histone H2A;Histone H2A type 1-A;Histone H2AX;Histone H2A type 2-C;Histone H2A type 2-A;Histone H2A type 1-J;Histone H2A type 1-H;Histone H2A.J;Histone H2A type 1-D;Histone H2A type 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 27.085 27.085 2 0.019198 22078 QUIQUE_C1218_190116_001 112.66 32.83 14122000000 2727000000 0 0 0 2169400000 1487400000 0 2465200000 2413700000 615780000 0 0 2243900000 18953 1871;1979;2100;3196 17812 169244;169245;169246;169247;169248;169249;169250 216022;216023;216024;216025;216026;216027;216028 216022 4 HLQLQTQLEQLQEETFR Unmodified 2140.0913 0.091281208 3500 Q86VS8 HOOK3 Protein Hook homolog 3 yes yes 0 0 0 1 118.93 118.93 3 0.052617 122781 QUIQUE_C1277_190116_001 40.186 34.533 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18954 3500 17813 169251 216029 216029 1 HLQNLFVPR Unmodified 1122.6298 0.62981218 3513 Q86X10 RALGAPB Ral GTPase-activating protein subunit beta yes yes 0 0 0 1 49.025 49.025 2 0.028277 47410 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes no 0 0 0 2 1 1 157.38 157.38 3;4 0.0035592 162967 QUIQUE_C1218_190116_001 40.158 30.644 219190000 73456000 125950000 0 0 0 0 0 0 19781000 0 0 0 0 18963 1650 17822 169298;169299;169300;169301 216078;216079;216080;216081 216078 4 HLSGNQFILELFHGPTGSFK Unmodified 2228.1378 0.13783747 3557 Q8IYQ7 THNSL1 Threonine synthase-like 1 yes yes 0 0 0 1 127.95 127.95 3 0.0017578 132588 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.616 38.694 31290000 0 0 0 0 0 0 0 0 31290000 0 0 0 0 18964 3557 17823 169302 216082 216082 1 HLSLCHGLSDLAR Unmodified 1477.746 0.74598093 4388 Q9P2I0 CPSF2 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 yes yes 0 0 0 1 53.98 53.98 3 0.0045271 52359 QUIQUE_C1218_190116_001 39.815 27.008 15024000 15024000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18965 4388 17824 169303 216083 216083 1 HLSLGSVQLCGVGK Unmodified 1453.7711 0.77113304 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 69.137 69.137 3 0.036203 70315 QUIQUE_C1438_190116_001 42.941 28.977 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18966 2377 17825 169304 216084 216084 1 HLSLLTTLSNR Unmodified 1253.7092 0.70918471 822 D6RF35;P02774;D6RBJ7 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 65.819 65.819 2;3 0.0012061 63704 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.2 62.545 305010000 0 16873000 13310000 0 140180000 0 0 0 0 16374000 97205000 0 21068000 18967 822 17826 169305;169306;169307;169308;169309;169310;169311;169312;169313 216085;216086;216087;216088;216089;216090;216091;216092;216093;216094 216089 9 HLSNVSSTGSIDMVDSPQLATLADEVSASLAK Oxidation (M) 3258.5926 0.59256614 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.24 146.24 3 1.4438E-48 148582 QUIQUE_C1563_190116_001 130.72 119.07 457720000 59651000 0 0 165870000 0 78857000 0 0 56704000 27155000 0 0 69484000 18968 291;1247 17827 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39.69 3 4.3775E-05 36358 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.07 78.924 85915000 0 0 0 0 0 0 0 44990000 40925000 0 0 0 0 18970 4014 17828 169334;169335;169336 216131;216132;216133 216131 3 HLSSCAAPAPLTSAER Unmodified 1666.8097 0.80970339 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 32.801 32.801 2;3 5.8476E-36 26761 QUIQUE_C1368_190116_001 171.57 126.44 666100000 41094000 75686000 131960000 79507000 62085000 61600000 93525000 28594000 0 12022000 0 0 80022000 18971 3365 17829 169337;169338;169339;169340;169341;169342;169343;169344;169345;169346;169347;169348;169349;169350;169351;169352;169353 216134;216135;216136;216137;216138;216139;216140;216141;216142;216143;216144;216145;216146;216147;216148;216149;216150;216151 216137 17 HLSSGDLLR Unmodified 996.53524 0.53524309 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.592 28.592 2 0.001153 21960 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.36 52.802 3282100000 314380000 336150000 450010000 0 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216162;216163;216164;216165;216166;216167;216168;216169;216170;216171;216172;216173;216174;216175;216176;216177;216178;216179;216180;216181;216182;216183;216184;216185;216186;216187;216188;216189;216190;216191;216192;216193;216194;216195;216196;216197;216198;216199;216200;216201;216202;216203;216204;216205;216206;216207 216192 46 HLSVVTLAAK Unmodified 1037.6233 0.62332982 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248;F5H4U8 COPS7A COP9 signalosome complex subunit 7a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.953 33.953 2 3.6014E-39 28869 QUIQUE_C1403_190116_001 207.29 150.01 1106900000 104870000 131760000 123040000 97857000 87907000 99832000 136490000 74620000 101090000 31617000 117840000 0 0 18974 4411 17832 169390;169391;169392;169393;169394;169395;169396;169397;169398;169399;169400 216208;216209;216210;216211;216212;216213;216214;216215;216216;216217;216218;216219;216220;216221;216222 216213 13 HLTDAYFK Unmodified 993.49198 0.4919813 2878 Q02878 RPL6 60S ribosomal protein L6 yes yes 0 0 0 1 1 34.338 34.338 2 0.043548 29267 QUIQUE_C1277_190116_001 58.286 36.739 33703000 0 33703000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18975 2878 17833 169401;169402 216223;216224 216223 2 HLTEYFTFK Unmodified 1184.5866 0.58660996 2915;2107 Q08209;E7ETC2;E9PPC8;E9PK68;P16298;Q5F2F8 PPP3CA;PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.659 70.659 2 1.3328E-56 70543 QUIQUE_C1368_190116_001 228.39 197.16 5347300000 401280000 519130000 482910000 459680000 428980000 371080000 517620000 325390000 302770000 148230000 459560000 459650000 471020000 18976 2915;2107 17834 169403;169404;169405;169406;169407;169408;169409;169410;169411;169412;169413;169414;169415 216225;216226;216227;216228;216229;216230;216231;216232;216233;216234;216235;216236;216237;216238;216239;216240;216241;216242;216243;216244 216229 20 HLTGEFEK Unmodified 959.47125 0.47124585 643 B5MDF5;P62826;J3KQE5;F5H018;H0YFC6 RAN GTP-binding nuclear protein Ran yes no 0 0 0 1 16.142 16.142 2 0.00015674 8347 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.9 105.73 400540000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 400540000 0 0 0 18977 643 17835 169416 216245 216245 1 HLTIVSLASR Unmodified 1095.64 0.64004252 1277 J3KQ41;Q9H9Q2;J3KQ34 COPS7B COP9 signalosome complex subunit 7b yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.914 48.914 2 0.0031874 45409 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.731 71.612 389960000 36818000 43524000 41466000 35879000 40623000 31983000 38038000 0 19697000 0 33778000 34177000 33974000 18978 1277 17836 169417;169418;169419;169420;169421;169422;169423;169424;169425;169426;169427 216246;216247;216248;216249;216250;216251;216252;216253;216254;216255;216256 216256 11 HLTNLPSSHPVVHQQPSR Unmodified 2033.0555 0.055504825 3612 Q8N7J2 AMER2 APC membrane recruitment protein 2 yes yes 0 0 0 2 1 19.199 19.199 3;4 0.025559 11742 QUIQUE_C1403_190116_001 32.627 17.668 315430000 0 0 0 205400000 0 110040000 0 0 0 0 0 0 0 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216297 21 HLVAGGGAGAVSR Unmodified 1150.6207 0.62070406 3368 Q6KCM7;H7C4Z4 SLC25A25 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 2 2 2 2 1 14.799 14.799 2;3 6.9837E-09 7320 QUIQUE_C1218_190116_001 111.63 91.423 859930000 114900000 59868000 116170000 45781000 61940000 0 56989000 96654000 0 21452000 109900000 111520000 64767000 18984 3368 17842 169474;169475;169476;169477;169478;169479;169480;169481;169482;169483;169484;169485;169486;169487;169488;169489;169490 216304;216305;216306;216307;216308;216309;216310;216311;216312;216313;216314;216315;216316;216317;216318;216319;216320;216321 216304 16 HLVDEPQNLIK Unmodified 1304.7089 0.70885036 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 52.955 52.955 2;3 1.4578E-05 49272 QUIQUE_DMIX4_190116_001 142.43 111.35 1237800000 125350000 97058000 56971000 79314000 123440000 90850000 71663000 84798000 94384000 413960000 0 0 0 + 18985 770 17843 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216340;216341;216342;216343;216344;216345;216346;216347;216348;216349;216350;216351;216352;216353;216354;216355;216356;216357;216358;216359;216360;216361;216362;216363;216364;216365;216366;216367;216368 216367 29 HLVFPLLEFLSVK Unmodified 1540.9017 0.90173651 2690 P60228;H0YBR5;E5RHS5;E5RII3;E5RIP5;E5RJ25;H0YBP5 EIF3E Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 160.65 160.65 2;3 0.00026599 166146 QUIQUE_C1368_190116_001 83.314 70.954 96295000 10451000 0 20462000 0 20067000 0 0 0 0 0 12626000 32688000 0 18987 2690 17845 169531;169532;169533;169534;169535;169536;169537;169538;169539;169540;169541;169542 216369;216370;216371;216372;216373;216374;216375;216376;216377;216378;216379;216380;216381 216371 13 HLVGVCYTEDEAK Unmodified 1519.6977 0.69769333 1947 P08574 CYC1 Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 1 1 36.623 36.623 2;3 5.5021E-17 32146 QUIQUE_C1277_190116_001 185.18 159.24 2967900000 420620000 276920000 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protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 166.03 166.03 3 4.239E-12 171018 QUIQUE_C1218_190116_001 66.467 58.475 146400000 36732000 42371000 25513000 33769000 0 0 0 0 0 8016800 0 0 0 18993 935 17851 169575;169576;169577;169578;169579 216418;216419;216420;216421;216422;216423 216418 6 HLVPGAPFLLQALVR Unmodified 1629.9719 0.97188176 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 135.55 135.55 2;3 8.277E-08 141580 QUIQUE_C1438_190116_001 120.57 113.2 568810000 0 32251000 23648000 50207000 91828000 17794000 44371000 28363000 48688000 25390000 105130000 57769000 43375000 18994 290;327;328 17852 169580;169581;169582;169583;169584;169585;169586;169587;169588;169589;169590;169591;169592;169593 216424;216425;216426;216427;216428;216429;216430;216431;216432;216433;216434;216435;216436;216437;216438;216439;216440;216441 216428 17 HLVSPEALDLLDK Unmodified 1448.7875 0.78749461 2152 P19784;H3BSA1;H3BV19 CSNK2A2 Casein kinase II subunit alpha' yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 1 1 3 1 1 94.099 94.099 2;3 0.00039709 96515 QUIQUE_C1277_190116_001 80.312 63.1 534810000 55427000 21362000 45278000 63653000 30394000 32100000 56439000 30566000 52128000 0 49532000 44785000 53142000 18995 2152 17853 169594;169595;169596;169597;169598;169599;169600;169601;169602;169603;169604;169605;169606;169607;169608;169609;169610;169611 216442;216443;216444;216445;216446;216447;216448;216449;216450;216451;216452;216453;216454;216455;216456;216457;216458;216459;216460 216444 17 HLVSVCADNNHVR Unmodified 1519.7314 0.73139349 4619 Q9Y597;H0Y5P8 KCTD3 BTB/POZ domain-containing protein KCTD3 yes no 0 0 0 1 17.249 17.249 3 0.0078057 9753 QUIQUE_C1368_190116_001 36.658 13.144 15162000 0 0 15162000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18996 4619 17854 169612 216461 216461 1 HLVTMATSEHVIMQNEALVALALIAALELGTAEK 2 Oxidation (M) 3618.9001 0.90010489 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 2 0 1 170.11 170.11 4 1.6768E-57 175214 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169616;169617;169618;169619;169620;169621;169622;169623;169624;169625;169626;169627;169628;169629;169630;169631;169632;169633;169634;169635;169636;169637;169638;169639;169640 216465;216466;216467;216468;216469;216470;216471;216472;216473;216474;216475;216476;216477;216478;216479;216480;216481;216482;216483;216484;216485;216486;216487;216488;216489;216490;216491;216492;216493;216494;216495;216496;216497 216471 33 HLWDYTFGPEK Unmodified 1391.651 0.65100113 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 91.258 91.258 2;3 2.8827E-18 93017 QUIQUE_C1368_190116_001 169.41 131.93 3858600000 420970000 382350000 301660000 360900000 268900000 290590000 316400000 305400000 229600000 131050000 304770000 261490000 284500000 19000 2715 17857 169641;169642;169643;169644;169645;169646;169647;169648;169649;169650;169651;169652;169653;169654;169655;169656;169657;169658;169659;169660;169661;169662;169663 216498;216499;216500;216501;216502;216503;216504;216505;216506;216507;216508;216509;216510;216511;216512;216513;216514;216515;216516;216517;216518;216519;216520;216521;216522;216523;216524;216525;216526;216527;216528;216529;216530;216531 216503 33 HLWKPAVEAYGEFLCMFEENYPETLKR Unmodified 3356.5998 0.59984055 1680 O76054;B3KRD8;C9JZI9 SEC14L2 SEC14-like protein 2 yes no 0 0 2 1 156 156 4 0.010254 160609 QUIQUE_DMIX7_190116_001 28.434 23.429 49439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49439000 0 19001 1680 17858 169664 216532;216533 216533 2 HLYDTLQYPIGLIASSWGGTPIEAWSSGR Unmodified 3174.5774 0.57744884 4205 Q9HAT2 SIAE Sialate O-acetylesterase yes yes 0 0 0 1 168.07 168.07 3 2.6528E-54 172138 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.26 135.65 120870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 120870000 0 19002 4205 17859 169665 216534 216534 1 HLYHQAFPTPK Unmodified 1337.6881 0.68805534 3720 Q8WXF7 ATL1 Atlastin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 23.479 23.479 3 0.0010135 18099 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.566 65.807 175890000 0 0 0 0 0 0 0 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216540;216541;216542;216543;216544;216545;216546;216547;216548;216549;216550;216551;216552;216553;216554;216555;216556;216557;216558;216559;216560;216561;216562;216563;216564;216565;216566;216567;216568;216569;216570;216571 216564 31 HMAGAAAAGAVVGGLGGYMLGSAMSR Unmodified 2362.1344 0.13442513 517 A2A2V1;P04156;X6RKS3 PRNP Major prion protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 131.51 131.51 3 1.5268E-11 136985 QUIQUE_C1218_190116_001 67.827 64.408 78688000 28294000 0 12515000 0 0 0 0 0 37879000 0 0 0 0 19005 517 17862 169695;169696;169697;169698 216572;216573;216574;216575 216572 4 HMALDMGNEIDTQNR Unmodified 1743.7669 0.7668523 2699 P60880 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 60.074 60.074 2;3 1.0363E-65 58640 QUIQUE_C1368_190116_001 200.82 186.91 2263000000 258050000 282420000 289420000 287540000 176770000 246340000 191620000 87200000 53698000 0 137100000 63593000 189250000 19006 2699 17863 169699;169700;169701;169702;169703;169704;169705;169706;169707;169708;169709;169710;169711;169712;169713;169714;169715;169716;169717;169718;169719;169720 216576;216577;216578;216579;216580;216581;216582;216583;216584;216585;216586;216587;216588;216589;216590;216591;216592;216593;216594;216595;216596;216597 216581 22 HMALDMGNEIDTQNR Oxidation (M) 1759.7618 0.76176692 2699 P60880 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes yes 0 1 0 1 37.341 37.341 2 3.96E-12 33002 QUIQUE_C1277_190116_001 134.18 124.18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19007 2699 17863 169721 216598 216598 2132 1 HMDPPPAPVQDR Oxidation (M) 1374.635 0.63503349 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 2 1 2 1 1 16.544 16.544 2;3 0.0055944 9169 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.448 39.484 218080000 16997000 32317000 0 29139000 0 0 0 0 68397000 0 45151000 26084000 0 19008 2483 17864 169722;169723;169724;169725;169726;169727;169728;169729 216599;216600;216601;216602;216603;216604;216605;216606 216604 1913 6 HMDPPPAPVQDR Unmodified 1358.6401 0.64011887 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 2 1 3 1 1 1 1 1 1 24.411 24.411 2 0.00027315 17928 QUIQUE_C1218_190116_001 116.52 106.73 575620000 98817000 68277000 0 64312000 106240000 0 0 62038000 68907000 0 0 75071000 31959000 19009 2483 17864 169730;169731;169732;169733;169734;169735;169736;169737;169738;169739;169740;169741;169742 216607;216608;216609;216610;216611;216612;216613;216614;216615;216616;216617;216618;216619;216620;216621 216607 15 HMEDTHPDHQDILK Unmodified 1714.7733 0.77331789 3105 Q15052 ARHGEF6 Rho guanine nucleotide exchange factor 6 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 18.8 18.8 3;4 0.00013513 11513 QUIQUE_C1368_190116_001 60.178 53.45 257280000 0 0 144690000 45494000 35218000 0 0 0 0 0 0 0 31880000 19010 3105 17865 169743;169744;169745;169746;169747 216622;216623;216624;216625;216626 216623 5 HMEDYHTDRQDIQK Oxidation (M) 1830.7955 0.79550989 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 1 1 1 10.325 10.325 4 0.0081274 2730 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.333 45.829 9628700 0 0 0 0 0 0 0 0 9628700 0 0 0 0 19011 465 17866 169748 216627 216627 339 1 HMEDYHTDRQDIQK Unmodified 1814.8006 0.80059527 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 1 1 14.626 14.626 3 0.02925 6836 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.122 47.946 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19012 465 17866 169749 216628 216628 1 HMEIDIIK Unmodified 997.52665 0.52665224 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 0 1 1 49.868 49.868 2 0.043548 48074 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.286 22.1 70158000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32329000 37829000 19013 3234 17867 169750;169751 216629;216630 216629 2 HMEIDIIKR Unmodified 1153.6278 0.62776327 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 35.309 35.309 3 0.0055002 31083 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.751 40.351 103230000 0 13844000 0 0 0 0 0 0 0 0 37029000 29573000 22786000 19014 3234 17868 169752;169753;169754;169755;169756 216631;216632;216633;216634;216635 216634 5 HMGGILAVANIR Unmodified 1250.6918 0.69176051 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 70.775 70.775 3 0.001125 71144 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.359 42.59 65614000 0 29071000 0 0 21275000 0 0 15267000 0 0 0 0 0 19015 2503 17869 169757;169758;169759;169760 216636;216637;216638;216639 216638 3 HMGLFDHAAR Oxidation (M) 1169.54 0.5400109 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.919 16.919 3 0.00066108 9816 QUIQUE_C1218_190116_001 90.108 77.53 1173800000 160510000 160570000 173030000 0 89121000 99703000 134820000 0 171590000 68506000 0 115970000 0 19016 2558 17870 169761;169762;169763;169764;169765;169766;169767;169768;169769 216640;216641;216642;216643;216644;216645;216646;216647;216648 216640 2000 5 HMGLFDHAAR Unmodified 1153.5451 0.54509627 2558 P50213;H0YL72;H0YNF5 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 2 24.683 24.683 2;3 0.00016083 20059 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.88 101.95 6103600000 72771000 583550000 587660000 507920000 539700000 507860000 799040000 239350000 456810000 102980000 637060000 567090000 501860000 19017 2558 17870 169770;169771;169772;169773;169774;169775;169776;169777;169778;169779;169780;169781;169782;169783;169784;169785;169786;169787;169788;169789;169790 216649;216650;216651;216652;216653;216654;216655;216656;216657;216658;216659;216660;216661;216662;216663;216664;216665;216666;216667;216668;216669;216670;216671 216661 17 HMGLMLATCSADGIVR Unmodified 1730.8266 0.82661579 1331 K7ELV2;Q96EE3;K7EP88;K7ENI5 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 0 1 83.512 83.512 3 0.046153 85596 QUIQUE_C1368_190116_001 27.208 15.937 19855000 0 0 19855000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19018 1331 17871 169791 216672 216672 0 HMLADVFSVK Unmodified 1145.5903 0.59031513 3961 Q99598 TSNAX Translin-associated protein X yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.365 75.365 2 0.020504 75755 QUIQUE_C1403_190116_001 81.95 63.548 115620000 0 0 0 51038000 0 0 0 0 64579000 0 0 0 0 19019 3961 17872 169792;169793;169794;169795 216673;216674;216675;216676 216673 2 HMLAEEDFTR Unmodified 1247.5605 0.56047157 3279 Q5JUW8;Q92796 DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 46.534 46.534 2 0.028317 43459 QUIQUE_C1277_190116_001 55.064 34.734 17468000 0 17468000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19020 3279 17873 169796;169797 216677;216678 216678 2 HMLEEEGTLDLLGLKR Unmodified 1852.9717 0.97168334 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 1 1 97.027 97.027 3 0.014581 99446 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.54 35.753 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19021 1187 17874 169798 216679 216679 1 HMLPTVLR Unmodified 965.54806 0.54805639 2309 P30153;B3KQV6;E9PH38 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41 41 2 0.0093704 36720 QUIQUE_C1563_190116_001 92.677 69.153 2949700000 419810000 355980000 256920000 247960000 332150000 226610000 340240000 290310000 174720000 67782000 0 237250000 0 19022 2309 17875 169799;169800;169801;169802;169803;169804;169805;169806;169807;169808;169809 216680;216681;216682;216683;216684;216685;216686;216687;216688;216689;216690;216691;216692;216693;216694;216695 216687 16 HMLPTVLR Oxidation (M) 981.54297 0.54297101 2309 P30153;B3KQV6;E9PH38 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 1 0 1 29.132 29.132 2 0.031211 24137 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.69 53.397 79764000 0 0 0 0 0 0 0 79764000 0 0 0 0 0 19023 2309 17875 169810 216696 216696 1 HMMAFIEQEANEK Oxidation (M) 1592.6963 0.69631312 2397 P36543;Q96A05 ATP6V1E1;ATP6V1E2 V-type proton ATPase subunit E 1;V-type proton ATPase subunit E 2 yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 41.333 41.333 2;3 0.00019887 37272 QUIQUE_C1403_190116_001 103.21 90.094 85953000 53596000 0 0 0 32357000 0 0 0 0 0 0 0 0 19024 2397 17876 169811;169812;169813;169814;169815;169816 216697;216698;216699;216700;216701;216702 216699 1798;1799 6 HMMAFIEQEANEK Unmodified 1576.7014 0.7013985 2397 P36543;Q96A05 ATP6V1E1;ATP6V1E2 V-type proton ATPase subunit E 1;V-type proton ATPase subunit E 2 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 66.047 66.047 2;3 7.0244E-32 64259 QUIQUE_DMIX8_190116_001 206.27 196.31 2483500000 200850000 344960000 218480000 212600000 160940000 235090000 287650000 111440000 113790000 76090000 164780000 125650000 231180000 19025 2397 17876 169817;169818;169819;169820;169821;169822;169823;169824;169825;169826;169827;169828;169829;169830;169831;169832;169833;169834;169835;169836;169837;169838;169839;169840;169841;169842;169843 216703;216704;216705;216706;216707;216708;216709;216710;216711;216712;216713;216714;216715;216716;216717;216718;216719;216720;216721;216722;216723;216724;216725;216726;216727;216728;216729;216730;216731;216732;216733;216734;216735;216736;216737;216738;216739;216740;216741;216742;216743;216744;216745;216746 216743 44 HMMAFIEQEANEKAEEIDAK Unmodified 2333.0668 0.066782296 2397 P36543;Q96A05 ATP6V1E1;ATP6V1E2 V-type proton ATPase subunit E 1;V-type proton ATPase subunit E 2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 3 94.621 94.621 3;4 2.4437E-56 96824 QUIQUE_DMIX8_190116_001 169.49 165.97 2221700000 138530000 146520000 130220000 130950000 124250000 51916000 142940000 188840000 148820000 0 404800000 257190000 356690000 19026 2397 17877 169844;169845;169846;169847;169848;169849;169850;169851;169852;169853;169854;169855;169856;169857;169858;169859;169860;169861 216747;216748;216749;216750;216751;216752;216753;216754;216755;216756;216757;216758;216759;216760;216761;216762;216763;216764;216765;216766;216767;216768;216769 216767 20 HMMAFIEQEANEKAEEIDAK Oxidation (M) 2349.0617 0.061696918 2397 P36543;Q96A05 ATP6V1E1;ATP6V1E2 V-type proton ATPase subunit E 1;V-type proton ATPase subunit E 2 yes no 0 1 1 1 1 1 72.722 72.722 3 0.00095432 73716 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.983 52.285 206460000 0 61512000 71219000 0 0 0 0 0 0 0 73728000 0 0 19027 2397 17877 169862;169863;169864 216770;216771;216772 216772 1798;1799 3 HMNLILCDCDEFRK Unmodified 1849.8273 0.82734407 1298 J3QLE5;P63162;P14678;J3KRY3;S4R3P3 SNRPN;SNRPB Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' yes no 0 0 1 1 66.193 66.193 3 0.06123 66164 QUIQUE_C1576_190116_001 27.458 17.119 61269000 0 0 0 0 0 0 61269000 0 0 0 0 0 0 19028 1298 17878 169865 216773 216773 1 HMNSAGVLATLR Unmodified 1268.6659 0.66593969 1761 O95861 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.778 47.778 3 0.00074263 45461 QUIQUE_C1576_190116_001 74.698 59.159 242450000 0 0 27584000 32769000 23468000 25672000 25437000 14730000 0 0 29630000 37921000 25236000 19029 1761 17879 169866;169867;169868;169869;169870;169871;169872;169873;169874;169875;169876 216774;216775;216776;216777;216778;216779;216780;216781;216782;216783;216784;216785;216786 216779 12 HMQEWLETR Unmodified 1228.5659 0.56589129 1919 P07311;G3V2U7 ACYP1 Acylphosphatase-1;Acylphosphatase yes no 0 0 0 1 44.035 44.035 2 0.060416 40796 QUIQUE_C1277_190116_001 47.853 22.91 37678000 0 37678000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19030 1919 17880 169877 216787 216787 1 HMSEFMECNLNELVK Unmodified 1879.8267 0.82667537 2244 P25786;F5GX11 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 100.64 100.64 2;3 0.0011044 103288 QUIQUE_C1277_190116_001 81.803 77.63 284790000 40752000 50375000 0 68452000 0 0 0 42497000 0 0 0 0 82712000 19031 2244 17881 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Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 2 70.541 70.541 2;3 0.00039041 72224 QUIQUE_C1218_190116_001 107.18 79.433 347940000 33671000 26545000 0 18722000 0 0 43813000 25235000 24449000 0 59084000 55313000 61107000 19036 196 17885 169918;169919;169920;169921;169922;169923;169924;169925;169926;169927;169928;169929;169930;169931 216832;216833;216834;216835;216836;216837;216838;216839;216840;216841;216842;216843;216844;216845;216846 216832 15 HNAVFDQLDLVTYEEVVK Unmodified 2118.0633 0.063335123 1460 O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 131.48 131.48 2;3 2.6642E-23 135736 QUIQUE_DMIX7_190116_001 165.34 110.53 211270000 0 0 38775000 0 0 0 0 0 50413000 28731000 55265000 38086000 0 19037 1460 17886 169932;169933;169934;169935;169936;169937;169938 216847;216848;216849;216850;216851;216852;216853;216854;216855 216853 9 HNCDHAEDAGVICSK Unmodified 1711.7043 0.70425204 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 1 1 14.871 14.871 3 5.882E-05 6937 QUIQUE_C1368_190116_001 85.636 78.125 122760000 0 0 42730000 61143000 0 0 0 0 0 0 18883000 0 0 19038 725 17887 169939;169940;169941 216856;216857;216858 216856 2 HNDDEQYAWESSAGGSFTVR Unmodified 2254.9516 0.95155284 1931;1938 P08238;P07900;Q14568 HSP90AB1;HSP90AA1;HSP90AA2P Heat shock protein HSP 90-beta;Heat shock protein HSP 90-alpha;Heat shock protein HSP 90-alpha A2 no no 0 0 0 8 15 7 12 9 9 10 12 8 8 10 13 9 93.275 93.275 2;3 1.4468E-38 85505 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.9 145.95 5214300000 260020000 569180000 273300000 514820000 334540000 469960000 565860000 413650000 327700000 215560000 378940000 458920000 431830000 19039 1938;1931 17888 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217323 3 HNIQFSSFDIFSDEEVR Unmodified 2068.949 0.94903365 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.63 125.63 3 0.00011012 130429 QUIQUE_C1368_190116_001 82.877 73.472 318780000 0 29804000 45849000 37475000 40773000 0 0 0 29553000 12410000 48889000 35905000 38126000 19055 1676 17901 170286;170287;170288;170289;170290;170291;170292;170293;170294 217325;217326;217327;217328;217329;217330;217331;217332;217333;217334 217327 8 HNISHMSMDIAR Unmodified 1410.6496 0.6496377 3536 Q8IWB7 WDFY1 WD repeat and FYVE domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.226 28.226 3 0.00026697 22817 QUIQUE_C1218_190116_001 85.536 72.909 143040000 33864000 0 0 0 0 39631000 0 0 55328000 14218000 0 0 0 19056 3536 17902 170295;170296;170297;170298;170299;170300 217335;217336;217337;217338;217339;217340;217341 217335 7 HNITLLWDR Unmodified 1166.6196 0.61964142 474 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog yes no 0 0 0 1 71.787 71.787 2 0.025785 73160 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.439 48.742 44945000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44945000 0 0 19057 474 17903 170301 217342 217342 1 HNKPDEGYYQCVATVESLGTIISR Unmodified 2736.3177 0.31772868 3760 Q92859 NEO1 Neogenin yes yes 0 0 1 1 118.85 118.85 3 0.020668 125157 QUIQUE_DMIX5_190116_001 22.716 20.845 52257000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52257000 0 0 19058 3760 17904 170302 217343 217343 1 HNLASYYPEPK Unmodified 1317.6354 0.63535107 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.123 37.123 2 7.3996E-05 32694 QUIQUE_C1403_190116_001 154.24 127.86 1158900000 138250000 118990000 117010000 74307000 78861000 82623000 120950000 0 104660000 0 123300000 87069000 112880000 19059 3198 17905 170303;170304;170305;170306;170307;170308;170309;170310;170311;170312;170313 217344;217345;217346;217347;217348;217349;217350;217351;217352;217353;217354;217355;217356;217357 217347 13 HNLCGESEKEQIR Unmodified 1598.7471 0.74710314 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 13.951 13.951 3 2.7067E-10 5978 QUIQUE_C1403_190116_001 142.85 129.13 222820000 0 70782000 0 37157000 0 0 74143000 0 0 0 12690000 0 28052000 19060 2277 17906 170314;170315;170316;170317;170318;170319 217358;217359;217360;217361;217362;217363 217359 5 HNLCGESEKEQIREDILENQFMDSR Unmodified 3076.3978 0.39784627 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 89.781 89.781 3;4 7.9514E-20 91737 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.31 108.14 621620000 55573000 73395000 61218000 0 0 0 0 44689000 53507000 0 74520000 85957000 172770000 19061 2277 17907 170320;170321;170322;170323;170324;170325;170326;170327;170328 217364;217365;217366;217367;217368;217369;217370;217371;217372;217373;217374;217375;217376 217375 13 HNLCGETEEEK Unmodified 1344.5616 0.56159378 1965;141;2883;481 A0A0A0MR85;A6NNT0;A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1;P09488;E7EWW9;B9ZVX7;H3BRM6;Q03013 GSTM4;GSTM5;GSTM1 Glutathione S-transferase Mu 5;Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 0 1 10.611 10.611 2 1.1515E-06 2998 QUIQUE_DMIX4_190116_001 155.97 126.5 21897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21897000 0 0 0 19062 141;481;1965;2883 17908 170329 217377 217377 1 HNLCGETEEEKIR Unmodified 1613.7468 0.74676879 1965;141;2883;481 A0A0A0MR85;A6NNT0;A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1;P09488;E7EWW9;B9ZVX7;H3BRM6;Q03013 GSTM4;GSTM5;GSTM1 Glutathione S-transferase Mu 5;Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 1 1 19.178 19.178 3 0.0016996 11869 QUIQUE_C1218_190116_001 73.927 68.244 82662000 82662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19063 141;481;1965;2883 17909 170330 217378 217378 1 HNLEELEQVVYKPQK Unmodified 1852.9683 0.96831253 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 1 1 1 1 73.303 73.303 3 0.00010279 74135 QUIQUE_C1368_190116_001 65.038 55.784 113720000 0 0 45865000 0 0 28488000 0 0 0 0 39369000 0 0 19064 1750 17910 170331;170332;170333 217379;217380;217381 217379 3 HNLITEMVALNPDFKPPADYKPPATR Unmodified 2934.5062 0.50619816 3148 Q15637 SF1 Splicing factor 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 112.63 112.63 4 1.0174E-07 116090 QUIQUE_C1277_190116_001 61.732 55.368 399930000 82547000 94788000 0 91706000 0 0 0 65554000 0 0 0 65338000 0 19065 3148 17911 170334;170335;170336;170337;170338 217382;217383;217384;217385;217386 217383 2 HNLQDFINIK Unmodified 1240.6564 0.65642086 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 80.752 80.752 2;3 4.627E-23 83170 QUIQUE_C1218_190116_001 188.87 148.85 11037000000 758810000 850220000 911910000 474360000 792810000 634770000 1095400000 824460000 912350000 347600000 1306600000 999930000 1128000000 19066 2483 17912 170339;170340;170341;170342;170343;170344;170345;170346;170347;170348;170349;170350;170351;170352;170353;170354;170355;170356;170357;170358;170359;170360;170361;170362;170363;170364 217387;217388;217389;217390;217391;217392;217393;217394;217395;217396;217397;217398;217399;217400;217401;217402;217403;217404;217405;217406;217407;217408;217409;217410;217411;217412;217413;217414;217415;217416;217417;217418 217388 30 HNMCGETEEEKIR Oxidation (M) 1647.6981 0.69810403 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 1 1 1 1 1 1 10.428 10.428 3 3.7167E-08 2677 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.21 133.04 84758000 8373100 11442000 0 0 0 0 0 46558000 18385000 0 0 0 0 19067 2174 17913 170365;170366;170367;170368 217419;217420;217421;217422 217422 1521 3 HNNCMASHLTPAVYAR Oxidation (M) 1856.841 0.8410203 2046 P12532;F8WCN3;C9JSQ1;C9J995;C9J8F6;C9JT96;C9JJX8;C9J6W7 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.908 21.908 3 1.6968E-07 14579 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.63 109.57 1648800000 153620000 84677000 124690000 91761000 88017000 80992000 131270000 153630000 123420000 119740000 116060000 179390000 201560000 19068 2046 17914 170369;170370;170371;170372;170373;170374;170375;170376;170377;170378;170379;170380;170381 217423;217424;217425;217426;217427;217428;217429;217430;217431;217432;217433;217434;217435;217436;217437;217438 217438 1357 16 HNNCMASHLTPAVYAR Unmodified 1840.8461 0.84610568 2046 P12532;F8WCN3;C9JSQ1;C9J995;C9J8F6;C9JT96;C9JJX8;C9J6W7 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 0 0 1 3 2 2 1 2 2 1 2 1 34.539 34.539 2;3;4 3.2418E-06 29719 QUIQUE_C1563_190116_001 95.631 87.118 1979000000 203240000 393970000 240190000 296390000 39258000 197050000 332200000 181930000 0 0 68519000 0 26305000 19069 2046 17914 170382;170383;170384;170385;170386;170387;170388;170389;170390;170391;170392;170393;170394;170395;170396;170397;170398 217439;217440;217441;217442;217443;217444;217445;217446;217447;217448;217449;217450;217451;217452;217453;217454;217455;217456 217450 13 HNNLDLVIIR Unmodified 1205.6881 0.68805534 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 68.07 68.07 2;3 1.2911E-14 67043 QUIQUE_C1563_190116_001 175.91 137.78 3899600000 481820000 44962000 465170000 294450000 282210000 287940000 49776000 274560000 346630000 133050000 405760000 442810000 390420000 19070 86 17915 170399;170400;170401;170402;170403;170404;170405;170406;170407;170408;170409;170410;170411;170412;170413;170414;170415;170416;170417;170418;170419;170420;170421;170422 217457;217458;217459;217460;217461;217462;217463;217464;217465;217466;217467;217468;217469;217470;217471;217472;217473;217474;217475;217476;217477;217478;217479;217480;217481 217467 18 HNNLYLVATSK Unmodified 1258.667 0.66698555 4065 Q9BXS5;E7ENJ6;K7ENA7;K7EPJ8;K7ER75;K7EQ90 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 33.257 33.257 2 2.8925E-09 28527 QUIQUE_C1277_190116_001 163.84 124.29 601560000 63894000 104180000 56619000 71416000 0 0 78835000 0 0 0 130390000 96225000 0 19071 4065 17916 170423;170424;170425;170426;170427;170428;170429 217482;217483;217484;217485;217486;217487;217488 217483 6 HNPVFGVMS Unmodified 986.46439 0.46438634 2714;4374 P61158;B4DXW1;Q9P1U1 ACTR3;ACTR3B Actin-related protein 3;Actin-related protein 3B no no 0 0 0 1 1 1 64.198 64.198 2 0.010801 63664 QUIQUE_C1576_190116_001 73.616 63.705 264750000 0 91703000 0 95710000 0 0 77335000 0 0 0 0 0 0 19072 2714;4374 17917 170430;170431;170432 217489;217490;217491 217491 2 HNQLPLVIEFTEQTAPK Unmodified 1964.0367 0.036726442 1917 P07237;H7BZ94;I3L312;I3L398;I3L4M2;I3NI03 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 1 3 1 2 2 2 108.96 108.96 2;3 0.00011557 112694 QUIQUE_C1277_190116_001 82.007 76.578 1409500000 112840000 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E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 1 1 1 14.425 14.425 3 0.0022113 6478 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.943 47.413 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19075 855 17920 170466;170467 217529;217530 217530 2 HNSEKPPEPVKPEVK Unmodified 1713.905 0.90498399 4430 Q9UHD1;E9PPQ5;E9PIZ4;E9PSD5 CHORDC1 Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1 yes no 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 3 1 1 3 12.349 12.349 3;4 3.2553E-29 5402 QUIQUE_C1218_190116_001 133.16 114.77 1106600000 68384000 184990000 51530000 0 56227000 335670000 34402000 83236000 62160000 0 44586000 127740000 57698000 19076 4430 17921 170468;170469;170470;170471;170472;170473;170474;170475;170476;170477;170478;170479;170480;170481;170482;170483;170484;170485;170486;170487 217531;217532;217533;217534;217535;217536;217537;217538;217539;217540;217541;217542;217543;217544;217545;217546;217547;217548;217549;217550;217551;217552;217553;217554;217555 217532 23 HNSPSAAHFITR Unmodified 1336.6636 0.6636315 3639 Q8NDH3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 17.935 17.935 2;3 0.00015723 10681 QUIQUE_C1218_190116_001 86.944 71.742 592380000 141640000 0 0 68490000 83833000 0 0 102330000 94905000 0 101180000 0 0 19077 3639 17922 170488;170489;170490;170491;170492;170493;170494 217556;217557;217558;217559;217560;217561;217562 217556 6 HNSSGSILFLGR Unmodified 1286.6731 0.67313356 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 2 2 1 1 1 1 2 60.837 60.837 2;3 6.4278E-05 60198 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.67 105.35 1311200000 61214000 222620000 51392000 193460000 62413000 94439000 0 169370000 82645000 29213000 72315000 49542000 222540000 19078 2324 17923 170495;170496;170497;170498;170499;170500;170501;170502;170503;170504;170505;170506;170507;170508;170509;170510;170511 217563;217564;217565;217566;217567;217568;217569;217570;217571;217572;217573;217574;217575;217576;217577;217578;217579;217580;217581;217582;217583 217577 18 HNTALLAATDLLK Unmodified 1379.7773 0.77726428 4574 Q9Y2Z9;A0A0D9SFJ1 COQ6 Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 86.267 86.267 2;3 0.00057424 89107 QUIQUE_C1218_190116_001 56.65 47.921 123510000 48650000 19538000 19702000 0 17987000 17639000 0 0 0 0 0 0 0 19079 4574 17924 170512;170513;170514;170515;170516;170517;170518;170519 217584;217585;217586;217587;217588;217589;217590;217591 217584 8 HNTYGVDCEK Unmodified 1221.5084 0.508436 2008 P11047;R4GNC7 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 13.533 13.533 2 0.0029145 5569 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.258 74.221 5348900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5348900 0 0 0 19080 2008 17925 170520 217592 217592 1 HNVADSQITTIGNLVPQK Unmodified 1934.0221 0.022139011 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 83.557 83.557 3 0.051485 83996 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.548 22.147 22478000 0 0 0 0 0 0 0 22478000 0 0 0 0 0 19081 987 17926 170521 217593 217593 1 HNVDDSLLTTVGSLLEDETYTVR Unmodified 2576.2606 0.26059096 2987 Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 162.34 162.34 2;3 5.8846E-51 169637 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.84 140.08 229400000 0 0 0 0 0 0 0 72043000 0 0 65106000 92248000 0 19082 2987 17927 170522;170523;170524;170525 217594;217595;217596;217597;217598;217599 217598 6 HNVEVLGILSDDVETDTVAPGENLK Unmodified 2663.329 0.32900488 2089 P15170;H3BR35 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A yes no 0 0 0 1 2 1 1 127.26 127.26 3 4.0136E-09 123878 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.158 66.052 221850000 61941000 0 51723000 0 0 71814000 0 0 0 36373000 0 0 0 19083 2089 17928 170526;170527;170528;170529;170530 217600;217601;217602;217603;217604 217604 3 HNVHVMNISTGK Unmodified 1335.6718 0.67175335 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 no no 0 0 0 2 1 1 17.855 17.855 2;3 0.00075931 10349 QUIQUE_C1368_190116_001 67.519 56.97 237750000 0 111170000 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324520000 281910000 417110000 441690000 91828000 195020000 287360000 420690000 19086 2978 17930 170549;170550;170551;170552;170553;170554;170555;170556;170557;170558;170559;170560;170561;170562;170563;170564;170565;170566;170567;170568;170569;170570;170571;170572;170573 217626;217627;217628;217629;217630;217631;217632;217633;217634;217635;217636;217637;217638;217639;217640;217641;217642;217643;217644;217645;217646;217647;217648;217649;217650;217651;217652;217653;217654;217655;217656;217657 217635 30 HNYECLVYVQLPFMEDLR Oxidation (M) 2341.0871 0.087123808 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 1 0 1 1 1 134.1 134.1 3 0.00060248 137026 QUIQUE_C1563_190116_001 59.585 54.005 125490000 0 0 0 0 0 46369000 0 0 39916000 0 39205000 0 0 19087 2051 17931 170574;170575;170576 217658;217659;217660 217658 1369 3 HNYGVGESFTVQR Unmodified 1492.7059 0.70589025 2815;3211;2065;2159 P13760;Q30167;P79483;A0A140T958;Q9TQE0;P13761;A0A182DWH4;Q29974;P04229;Q30154;P20039 HLA-DRB1;HLA-DRB3;HLA-DRB5 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-4 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-10 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-9 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-7 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-16 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-1 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-11 beta chain no no 0 0 0 1 1 1 46.909 46.909 3 0.0023671 43465 QUIQUE_C1403_190116_001 47.621 39.211 89630000 0 0 0 34412000 0 0 0 23289000 31929000 0 0 0 0 19088 2065;2815;3211;2159 17932 170577;170578;170579 217661;217662;217663 217661 3 HNYGVVESFTVQR Unmodified 1534.7528 0.75284044 1816 Q5Y7A7;P01912 HLA-DRB1 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-13 beta chain;HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-3 chain no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 61.06 61.06 2;3 0.00032377 59591 QUIQUE_C1368_190116_001 110.52 95.51 132000000 0 32376000 86778000 0 0 0 0 0 0 12842000 0 0 0 19089 1816 17933 170580;170581;170582;170583;170584;170585;170586 217664;217665;217666;217667;217668;217669;217670;217671 217666 8 HNYLPFIMELLK Unmodified 1516.8112 0.81120694 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;H0Y6Y4;H0Y4E0;H0Y636;H0Y4K0 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 149.69 149.69 3 0.04073 154867 QUIQUE_DMIX8_190116_001 34.685 27.973 7822200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7822200 19090 4622 17934 170587 217672 217672 1 HNYPDLVER Unmodified 1141.5516 0.55162144 4357 Q9NZT2;A0A087X028;Q4VXW3 OGFR Opioid growth factor receptor yes no 0 0 0 1 1 31.823 31.823 2 0.048831 27096 QUIQUE_C1218_190116_001 51.066 18.711 81778000 51539000 0 0 30239000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19091 4357 17935 170588;170589 217673;217674 217673 2 HPAELAMEPTPELPAEVLMVEVENVVHEDFQVTEEVK Unmodified 4184.0334 0.033363488 1324 K7EKE6;P36776 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 172.32 172.32 4 3.0462E-23 179537 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.415 73.071 107700000 0 0 0 0 0 0 0 0 34330000 0 73366000 0 0 19092 1324 17936 170590;170591 217675;217676;217677 217677 3 HPAGQQLDEFLQLAVDK Unmodified 1907.9741 0.97412619 3947 Q96T76;H0Y746 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 122.43 122.43 3 0.061279 126901 QUIQUE_C1218_190116_001 23.37 7.2318 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19093 3947 17937 170592 217678 217678 1 HPAGVYQVSGLHNK Unmodified 1505.7739 0.77391024 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7;H0Y4U1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 19.735 19.735 3 0.036776 12355 QUIQUE_C1218_190116_001 25.731 12.594 63795000 63795000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19094 422 17938 170593 217679 217679 1 HPALPAMVNDPPVPALLWAQEVGQVLAGR Unmodified 3045.6222 0.62223097 1274 J3KQ12;E9PIU3;H7BXM1;E9PJK0;E9PSB5 BSCL2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 169.67 169.67 3 3.3355E-20 174379 QUIQUE_C1368_190116_001 92.819 87.218 151600000 32648000 25499000 43289000 26515000 0 0 0 23654000 0 0 0 0 0 19095 1274 17939 170594;170595;170596;170597;170598;170599 217680;217681;217682;217683;217684;217685;217686 217682 7 HPDADSLYVEK Unmodified 1272.5986 0.59863121 2641 P54577 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 31.227 31.227 2 1.4524E-18 25839 QUIQUE_DMIX7_190116_001 173.37 126.29 897680000 85277000 92415000 103290000 87315000 73914000 86708000 53587000 55896000 0 44038000 71553000 47337000 96348000 19096 2641 17940 170600;170601;170602;170603;170604;170605;170606;170607;170608;170609;170610;170611;170612 217687;217688;217689;217690;217691;217692;217693;217694;217695;217696;217697;217698;217699;217700;217701;217702;217703;217704;217705;217706;217707;217708 217704 21 HPDASVNFSEFSK Unmodified 1463.6681 0.66810776 1960 P09429;Q5T7C4 HMGB1 High mobility group protein B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 59.394 59.394 2 0.018408 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217731;217732;217733;217734;217735;217736;217737;217738;217739;217740;217741;217742;217743;217744;217745;217746;217747;217748;217749;217750;217751;217752;217753;217754;217755;217756;217757;217758;217759;217760;217761;217762;217763;217764;217765;217766;217767;217768;217769;217770;217771;217772;217773;217774;217775;217776;217777;217778;217779;217780;217781;217782;217783;217784;217785;217786;217787;217788;217789;217790;217791;217792;217793;217794;217795;217796;217797;217798;217799;217800;217801;217802;217803;217804;217805;217806;217807 217739 77 HPEAEMAQNSVR Unmodified 1367.6252 0.62519709 2084 P14923 JUP Junction plakoglobin yes yes 0 0 0 1 16.326 16.326 2 0.0037316 8523 QUIQUE_C1403_190116_001 74.162 36.686 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19104 2084 17948 170664 217808 217808 1 HPEAEMAQNSVR Oxidation (M) 1383.6201 0.62011171 2084 P14923 JUP Junction plakoglobin yes yes 0 1 0 1 10.326 10.326 3 0.00063016 2763 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.819 64.237 4790500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4790500 0 0 0 19105 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217825;217826;217827;217828;217829;217830;217831;217832;217833 217826 8 HPEPFFALAK Unmodified 1155.6077 0.60767975 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0;F8WCF4 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 65.309 65.309 2 6.0468E-05 64606 QUIQUE_C1218_190116_001 143.45 88.84 193390000 68502000 0 0 0 0 0 0 85980000 0 38906000 0 0 0 19108 3549 17951 170685;170686;170687;170688;170689 217834;217835;217836;217837;217838 217834 5 HPESEWPFLIITDLFLK Unmodified 2084.0983 0.098264067 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 171.92 171.92 3 2.0876E-30 176184 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.56 110.32 197430000 0 0 0 0 0 0 35125000 4564800 36508000 0 51186000 70050000 0 19109 4392 17952 170690;170691;170692;170693;170694 217839;217840;217841;217842;217843 217841 5 HPESNTAGMDIFAK Unmodified 1516.698 0.69802768 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 2 2 3 1 3 3 1 2 1 2 2 2 2 52.348 52.348 2;3 3.0617E-58 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QUIQUE_DMIX4_190116_001 35.496 29.054 113670000 0 0 0 0 40109000 0 0 0 0 73564000 0 0 0 + 19112 770 17954 170722;170723;170724 217875;217876;217877 217876 3 HPFFLDDRR Unmodified 1201.5992 0.59924033 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUG1;A0A1B0GV06 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 35.508 35.508 3 0.016906 31686 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.276 18.514 230040000 0 0 0 0 0 0 0 54077000 58727000 0 65286000 51950000 0 19113 341 17955 170725;170726;170727;170728 217878;217879;217880;217881 217878 4 HPFFVTIDWNTLYR Unmodified 1807.9046 0.90459006 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 137.96 137.96 3 0.00010803 142540 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.705 64.58 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19114 982 17956 170729 217882 217882 1 HPFILMYEER Unmodified 1333.6489 0.64889264 2474 P45985 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 74.838 74.838 2 0.014937 75279 QUIQUE_C1277_190116_001 63.816 33.252 41307000 0 41307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19115 2474 17957 170730;170731;170732 217883;217884;217885 217884 3 HPGSFDVVHVK Unmodified 1220.6302 0.63020611 2757 P62701;C9JEH7;P22090 RPS4X;RPS4Y1 40S ribosomal protein S4, X isoform;40S ribosomal protein S4, Y isoform 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.226 26.226 3 0.004138 20066 QUIQUE_C1277_190116_001 58.743 43.429 426470000 51047000 72735000 41960000 79604000 0 0 0 43626000 38919000 26001000 72580000 0 0 19116 2757 17958 170733;170734;170735;170736;170737;170738;170739;170740;170741;170742 217886;217887;217888;217889;217890;217891;217892;217893;217894;217895 217887 8 HPHDIIDDINSGAVECPAS Unmodified 2045.9113 0.91126793 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 86.313 86.313 2;3 5.6908E-93 87809 QUIQUE_DMIX8_190116_001 210.35 204.87 1253900000 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Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 101.37 101.37 3 0.013548 105536 QUIQUE_C1218_190116_001 38.237 26.778 85105000 46263000 0 38841000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19128 4645 17970 170845;170846 218020;218021 218020 1 HPSFPTTQQLNVDR Unmodified 1638.8114 0.81141795 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 1 1 55.12 55.12 2 0.011326 53788 QUIQUE_C1438_190116_001 49.189 29.427 109730000 0 0 0 51923000 57808000 0 0 0 0 0 0 0 0 19129 3042 17971 170847;170848 218022;218023 218023 2 HPSHSTTPSGPGDEVAR Unmodified 1730.7972 0.79722445 106 A0A087X1E4;P53365;E9PRV8;E9PPY7 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 0 1 3 2 2 2 2 2 3 2 11.242 11.242 3;4 6.8023E-05 4395 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.385 69.654 177630000 0 0 16457000 14382000 24240000 0 23822000 10742000 19154000 0 21488000 20482000 26858000 19130 106 17972 170849;170850;170851;170852;170853;170854;170855;170856;170857;170858;170859;170860;170861;170862;170863;170864;170865;170866;170867 218024;218025;218026;218027;218028;218029;218030;218031;218032;218033;218034;218035;218036;218037;218038;218039;218040;218041;218042;218043;218044;218045;218046;218047;218048 218036 24 HPSKPDPSGECNPDLR Unmodified 1804.8162 0.81624534 2933 Q09028 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes yes 0 0 1 1 1 1 3 1 1 17.795 17.795 2;3;4 0.00032991 10147 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.347 59.761 873250000 155130000 114180000 130500000 215760000 0 0 153930000 0 0 0 103760000 0 0 19131 2933 17973 170868;170869;170870;170871;170872;170873;170874;170875 218049;218050;218051;218052;218053;218054;218055;218056 218056 6 HPSLAFK Unmodified 798.43882 0.43882351 1162 H0YIE9;Q4G104;O94952 FBXO21 F-box only protein 21 yes no 0 0 0 1 20.143 20.143 2 0.028135 12797 QUIQUE_C1277_190116_001 92.467 20.112 29571000 0 29571000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19132 1162 17974 170876 218057 218057 1 HPSLIPLFVFIGTGATGATLYLLR Unmodified 2556.4468 0.44681601 1410 O00483 NDUFA4 Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4 yes yes 0 0 0 1 172.35 172.35 3 9.4826E-07 179626 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.039 79.764 68018000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68018000 0 0 19133 1410 17975 170877 218058 218058 0 HPSPAIVAR Unmodified 946.53485 0.53484916 1119 H0Y465;P21359;J3QSG6;J3KSX8 NF1 Neurofibromin;Neurofibromin truncated yes no 0 0 0 1 1 1 1 14.901 14.901 2 0.032733 6507 QUIQUE_C1277_190116_001 55.531 28.006 40643000 7395200 12148000 0 0 0 0 0 9546800 0 0 0 11553000 0 19134 1119 17976 170878;170879;170880;170881 218059;218060;218061;218062 218060 4 HPSSQLAGPGVEGGEGTQKPR Unmodified 2088.0348 0.034828962 3469 Q7Z6L0;A0A0G2JLL6 PRRT2 Proline-rich transmembrane protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 19.278 19.278 3 3.3388E-53 11624 QUIQUE_C1368_190116_001 164.94 155.18 153450000 29281000 0 65919000 43996000 0 0 0 0 0 14259000 0 0 0 19135 3469 17977 170882;170883;170884;170885 218063;218064;218065;218066 218064 4 HPSTNSLLR Unmodified 1023.5461 0.54614213 4362 Q9P032 NDUFAF4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4 yes yes 0 0 0 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CAMK1D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D yes no 0 0 0 1 43.119 43.119 3 0.010636 40591 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.791 22.901 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19148 3526 17990 170974 218168 218168 1 HPWICQR Unmodified 995.47595 0.47595408 896;803;1135 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 19.261 19.261 2 0.019712 12447 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.54 75.711 2550900000 60218000 0 389230000 404330000 310100000 400080000 451380000 0 0 0 0 287380000 248140000 19149 803;896;1135 17991 170975;170976;170977;170978;170979;170980;170981;170982;170983 218169;218170;218171;218172;218173;218174;218175;218176;218177 218177 9 HPYFYAPELLFFAK Unmodified 1741.8868 0.88681473 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;H7C013 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 143.02 143.02 2;3 8.5154E-37 147822 QUIQUE_C1277_190116_001 215.89 197.22 50827000000 2452600000 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171011;171012;171013;171014;171015;171016;171017 218235;218236;218237;218238;218239;218240;218241 218240 6 HPYYNSISK Unmodified 1107.5349 0.53490874 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 16.512 16.512 2 0.0025123 9173 QUIQUE_DMIX4_190116_001 149.57 92.395 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19152 2090 17994 171018;171019;171020;171021;171022;171023;171024;171025;171026;171027 218242;218243;218244;218245;218246;218247;218248;218249;218250;218251 218250 10 HQADIASYQEAIQQLDAELR Unmodified 2298.124 0.1240379 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 136.87 136.87 2;3 3.8913E-135 142487 QUIQUE_C1218_190116_001 232.74 212.08 1780700000 217550000 175710000 215130000 0 146550000 137080000 217400000 133010000 111660000 0 176490000 113930000 136230000 19153 2033 17995 171028;171029;171030;171031;171032;171033;171034;171035;171036;171037;171038;171039;171040;171041;171042;171043 218252;218253;218254;218255;218256;218257;218258;218259;218260;218261;218262;218263;218264;218265;218266;218267;218268;218269;218270;218271 218252 18 HQAEMALNER Unmodified 1197.5561 0.55605489 2108 P16333;C9JAB9 NCK1 Cytoplasmic protein NCK1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 16.568 16.568 2;3 0.00092572 9526 QUIQUE_C1218_190116_001 104.05 82.748 124170000 12479000 18648000 15574000 22943000 12820000 0 0 0 18074000 0 0 23634000 0 19154 2108 17996 171044;171045;171046;171047;171048;171049;171050;171051 218272;218273;218274;218275;218276;218277;218278;218279;218280;218281 218272 10 HQAFEAELHANADR Unmodified 1607.7441 0.74406667 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 4 4 5 3 3 5 2 2 3 3 3 5 4 29.291 29.291 2;3 2.6008E-37 22063 QUIQUE_C1277_190116_001 196.15 181 13286000000 981880000 1308000000 1301900000 905410000 1090300000 892780000 988940000 1085000000 1084700000 660910000 878510000 1028800000 1078600000 19155 267;275;3025 17997 171052;171053;171054;171055;171056;171057;171058;171059;171060;171061;171062;171063;171064;171065;171066;171067;171068;171069;171070;171071;171072;171073;171074;171075;171076;171077;171078;171079;171080;171081;171082;171083;171084;171085;171086;171087;171088;171089;171090;171091;171092;171093;171094;171095;171096;171097 218282;218283;218284;218285;218286;218287;218288;218289;218290;218291;218292;218293;218294;218295;218296;218297;218298;218299;218300;218301;218302;218303;218304;218305;218306;218307;218308;218309;218310;218311;218312;218313;218314;218315;218316;218317;218318;218319;218320;218321;218322;218323;218324;218325;218326;218327;218328;218329;218330;218331;218332;218333;218334;218335;218336;218337;218338;218339;218340;218341;218342;218343;218344;218345;218346;218347;218348;218349;218350;218351;218352;218353;218354;218355;218356 218291 71 HQAFEAELSANQSR Unmodified 1586.7437 0.74373232 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 1 1 36.204 36.204 2;3 5.2472E-58 31871 QUIQUE_DMIX4_190116_001 196.15 180.95 12215000000 495670000 789250000 590460000 1571800000 0 556810000 1611400000 1486700000 1879600000 667260000 864570000 595500000 1105500000 19156 267;275;3025 17998 171098;171099;171100;171101;171102;171103;171104;171105;171106;171107;171108;171109;171110;171111;171112;171113;171114;171115 218357;218358;218359;218360;218361;218362;218363;218364;218365;218366;218367;218368;218369;218370;218371;218372;218373;218374;218375;218376;218377;218378;218379;218380;218381;218382;218383;218384;218385;218386;218387;218388;218389;218390;218391;218392 218386 36 HQAFEAEVQANSGAIVK Unmodified 1797.901 0.90096124 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFF6;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 4 3 2 2 2 3 1 4 2 3 2 4 57.707 57.707 2;3 3.5806E-201 57651 QUIQUE_C1218_190116_001 284.38 267.47 13517000000 782260000 1174100000 1089000000 984620000 1260400000 1337200000 971930000 297620000 1235700000 559640000 964140000 933550000 1927200000 19157 267;275;3025 17999 171116;171117;171118;171119;171120;171121;171122;171123;171124;171125;171126;171127;171128;171129;171130;171131;171132;171133;171134;171135;171136;171137;171138;171139;171140;171141;171142;171143;171144;171145;171146;171147;171148;171149 218393;218394;218395;218396;218397;218398;218399;218400;218401;218402;218403;218404;218405;218406;218407;218408;218409;218410;218411;218412;218413;218414;218415;218416;218417;218418;218419;218420;218421;218422;218423;218424;218425;218426;218427;218428;218429;218430;218431;218432;218433;218434;218435;218436;218437;218438;218439;218440;218441;218442;218443;218444 218396 47 HQAFMAELAANKDWLDK Unmodified 1986.9622 0.96218129 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 93.625 93.625 3 0.025503 97741 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.6 35.065 38735000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38735000 0 0 19158 1472 18000 171150 218445 218445 1 HQAFMAELASNK Oxidation (M) 1361.6398 0.63978452 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 2 1 1 2 1 2 1 2 22.974 22.974 2;3 8.7153E-07 15785 QUIQUE_DMIX8_190116_001 141.71 114.82 5560700000 227310000 578510000 496440000 286360000 534090000 318850000 309900000 182030000 677960000 232020000 716100000 314100000 686990000 19159 2851 18001 171151;171152;171153;171154;171155;171156;171157;171158;171159;171160;171161;171162;171163;171164;171165;171166;171167;171168;171169;171170 218446;218447;218448;218449;218450;218451;218452;218453;218454;218455;218456;218457;218458;218459;218460;218461;218462;218463;218464;218465;218466;218467 218466 2298 16 HQAFMAELASNK Unmodified 1345.6449 0.6448699 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 3 1 2 1 1 2 2 2 3 42.076 42.076 2;3 1.2869E-78 39850 QUIQUE_C1218_190116_001 231.05 104.98 4298800000 375510000 568840000 420120000 223470000 513420000 209960000 459380000 134700000 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(M) 2032.9677 0.9676606 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 64.79 64.79 3 0.0019004 63703 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.278 42.889 556840000 0 0 0 0 56202000 0 0 0 214190000 0 0 142900000 143550000 19162 2851 18002 171205;171206;171207;171208 218510;218511;218512;218513 218513 2298 4 HQAFMAELASNKEWLDKIEK Oxidation (M) 2403.1893 0.18928069 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 2 1 2 2 2 1 82.289 82.289 3;4 1.7263E-06 83541 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.011 78.687 2070500000 0 0 0 0 92513000 0 0 654940000 502710000 0 509250000 311060000 0 19163 2851 18003 171209;171210;171211;171212;171213;171214;171215;171216 218514;218515;218516;218517;218518;218519;218520;218521 218521 2298 7 HQAFMAELASNKEWLDKIEK Unmodified 2387.1944 0.19436607 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 3 1 1 100.18 100.18 3;4 2.3489E-47 103000 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.59 157.4 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yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 26.428 26.428 2;3 0.00012344 19995 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.83 98.882 1789700000 0 301450000 230000000 0 240970000 0 223290000 289390000 0 51613000 285860000 0 167140000 19195 2912 18031 171621;171622;171623;171624;171625;171626;171627;171628;171629;171630;171631;171632;171633;171634 219118;219119;219120;219121;219122;219123;219124;219125;219126;219127;219128;219129;219130;219131;219132 219130 12 HQIVEVAGDDKYGRK Unmodified 1713.8798 0.87983187 2912 Q07960;H0YE29;E9PNR6 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 18.605 18.605 3;4 0.0098765 11385 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.237 42.092 491060000 0 0 0 0 0 0 0 93369000 97958000 0 98546000 108860000 92335000 19196 2912 18032 171635;171636;171637;171638;171639 219133;219134;219135;219136;219137 219134 4 HQLLEADISAHEDR Unmodified 1632.7856 0.78559713 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 1 3 1 1 1 2 2 3 4 2 1 37.305 37.305 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19198 267;275;3025 18034 171665;171666;171667;171668;171669;171670;171671;171672;171673 219178;219179;219180;219181;219182;219183;219184;219185;219186;219187 219179 9 HQLYIDETVNSNIPTNLR Unmodified 2126.0756 0.075631144 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 89.098 89.098 2;3 7.1728E-64 92248 QUIQUE_C1218_190116_001 226.24 204.48 3046900000 227790000 304760000 235850000 419090000 389240000 72935000 335790000 70113000 79096000 154310000 374560000 116440000 266960000 19199 1824 18035 171674;171675;171676;171677;171678;171679;171680;171681;171682;171683;171684;171685;171686;171687;171688;171689;171690;171691;171692;171693;171694;171695 219188;219189;219190;219191;219192;219193;219194;219195;219196;219197;219198;219199;219200;219201;219202;219203;219204;219205;219206;219207;219208;219209;219210;219211;219212;219213;219214;219215;219216;219217;219218;219219;219220;219221 219189 32 HQNVQLPR Unmodified 990.53591 0.5359118 322 A0A0U1RRM4;P26599;A6NLN1;K7EK45;A0A0D9SF20;A0A087WUW5 PTBP1 Polypyrimidine tract-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.149 16.149 2 0.0006708 8247 QUIQUE_DMIX4_190116_001 151.51 95.5 440040000 31418000 56992000 0 59566000 0 40135000 23358000 65738000 60796000 26999000 0 75040000 0 19200 322 18036 171696;171697;171698;171699;171700;171701;171702;171703;171704;171705 219222;219223;219224;219225;219226;219227;219228;219229;219230;219231;219232;219233;219234;219235 219234 14 HQPADLLEFALQHFTR Unmodified 1921.9799 0.97988027 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 9 9 4 5 6 8 5 7 9 6 4 4 10 147.11 147.11 3 1.7511E-08 153984 QUIQUE_C1218_190116_001 111.22 89.067 2186300000 162160000 207310000 35665000 246970000 183440000 229140000 112040000 235680000 210410000 61499000 70884000 104010000 327070000 19201 2331 18037 171706;171707;171708;171709;171710;171711;171712;171713;171714;171715;171716;171717;171718;171719;171720;171721;171722;171723;171724;171725;171726;171727;171728;171729;171730;171731;171732;171733;171734;171735;171736;171737;171738;171739;171740;171741;171742;171743;171744;171745;171746;171747;171748;171749;171750;171751;171752;171753;171754;171755;171756;171757;171758;171759;171760;171761;171762;171763;171764;171765;171766;171767;171768;171769;171770;171771;171772;171773;171774;171775;171776;171777;171778;171779;171780;171781;171782;171783;171784;171785;171786;171787;171788;171789;171790;171791 219236;219237;219238;219239;219240;219241;219242;219243;219244;219245;219246;219247;219248;219249;219250;219251;219252;219253;219254;219255;219256;219257;219258;219259;219260;219261;219262;219263;219264;219265;219266;219267;219268;219269;219270;219271;219272;219273;219274;219275;219276;219277;219278;219279;219280;219281;219282;219283;219284;219285;219286;219287;219288;219289;219290;219291;219292;219293;219294;219295;219296;219297;219298;219299;219300;219301;219302;219303;219304;219305;219306;219307;219308;219309;219310;219311;219312;219313;219314;219315;219316;219317;219318;219319;219320;219321;219322 219243 59 HQPDFIYLR Unmodified 1187.6087 0.60874239 4662;687 Q9Y6R1;Q2Y0W8;E7EW28;C9J240;Q6U841 SLC4A4;SLC4A8;SLC4A10 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1;Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1;Anion exchange protein;Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger no no 0 0 0 1 1 61.659 61.659 2 0.0052265 60819 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.181 64.4 110030000 46374000 0 0 0 0 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Secernin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 21.574 21.574 2 1.3352E-36 14677 QUIQUE_C1576_190116_001 179.35 139.42 37098000 0 0 0 0 0 0 37098000 0 0 0 0 0 0 19206 2937 18042 171799;171800;171801 219330;219331;219332 219331 3 HQQEPTKDPVILNALLHVCK Unmodified 2339.242 0.24198497 3458 Q7Z3J2;E7EWW0;C9J7I2;F5H7K1;H3BV68 C16orf62 UPF0505 protein C16orf62 yes no 0 0 1 1 82.166 82.166 4 0.008006 83720 QUIQUE_DMIX3_190116_001 20.423 16.76 34190000 0 0 0 0 0 0 0 0 34190000 0 0 0 0 19207 3458 18043 171802 219333 219333 1 HQQLLGEVLTQLSSR Unmodified 1707.9268 0.92678206 3016 Q13616;A0A0C4DGX4 CUL1 Cullin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 113.48 113.48 3 6.4187E-05 118467 QUIQUE_C1218_190116_001 84.842 77.784 129510000 24933000 24315000 18346000 18792000 0 0 0 22897000 20223000 0 0 0 0 19208 3016 18044 171803;171804;171805;171806;171807;171808 219334;219335;219336;219337;219338;219339;219340 219334 6 HQSEIKPGEPEPQILDFQTQQYK Unmodified 2739.3504 0.35040902 3107 Q15067 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 79.066 79.066 3;4 5.0339E-18 80032 QUIQUE_C1368_190116_001 119.28 105.55 350650000 0 0 148310000 29957000 0 82142000 0 0 63432000 26809000 0 0 0 19209 3107 18045 171809;171810;171811;171812;171813;171814 219341;219342;219343;219344;219345;219346 219342 6 HQSFVLVGETGSGK Unmodified 1444.731 0.73104237 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 39.722 39.722 2;3 1.6178E-17 35695 QUIQUE_C1368_190116_001 152.32 111.6 432040000 0 0 67227000 30840000 33538000 30271000 83052000 0 0 0 104470000 33887000 48762000 19210 1506 18046 171815;171816;171817;171818;171819;171820;171821;171822;171823;171824;171825 219347;219348;219349;219350;219351;219352;219353;219354;219355;219356;219357 219347 9 HQSLEAEVQTK Unmodified 1268.6361 0.63607935 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 18.943 18.943 2 0.016015 11598 QUIQUE_C1438_190116_001 71.896 48.103 165360000 0 0 0 0 165360000 0 0 0 0 0 0 0 0 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O75569;G5E9Q4 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes no 0 0 1 1 10.43 10.43 3 0.058813 2824 QUIQUE_DMIX4_190116_001 36.303 18.495 6160100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6160100 0 0 0 19225 1646 18061 171931 219478 219478 1 HRDGGEALVSPDGTVTEAPR Unmodified 2063.0032 0.0031944826 3868 Q96HN2 AHCYL2 Putative adenosylhomocysteinase 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 39.654 39.654 3;4 9.3734E-09 36076 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.176 78.254 910020000 0 24488000 0 48452000 51037000 32366000 0 153510000 149650000 0 137760000 99516000 213240000 19226 3868 18062 171932;171933;171934;171935;171936;171937;171938;171939;171940;171941;171942;171943;171944;171945 219479;219480;219481;219482;219483;219484;219485;219486;219487;219488;219489;219490;219491;219492;219493;219494;219495;219496 219490 17 HRDTGILDSIGR Unmodified 1338.7004 0.70041094 571;1217 J3QL64;A8MZH3;P02686;E9PJ72;E9PMR5;H0YF02;H0YEA2;J3QKL5;J3QQK6;E9PNZ1;E9PKX9;J3KT34;F5H7N4;F8WEU6;H7BYR8 MBP Myelin basic protein no no 0 0 1 2 3 2 3 1 2 4 2 1 1 4 1 3 39.478 39.478 2;3 0.00030344 33295 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.71 95.213 22936000000 980720000 1514600000 1288700000 619980000 1166000000 343070000 3731100000 1390000000 1310800000 125220000 5929500000 1576100000 2959900000 19227 571;1217 18063 171946;171947;171948;171949;171950;171951;171952;171953;171954;171955;171956;171957;171958;171959;171960;171961;171962;171963;171964;171965;171966;171967;171968;171969;171970;171971;171972;171973;171974 219497;219498;219499;219500;219501;219502;219503;219504;219505;219506;219507;219508;219509;219510;219511;219512;219513;219514;219515;219516;219517;219518;219519;219520;219521;219522;219523;219524;219525;219526;219527;219528;219529;219530 219523 31 HRDYETATLSDIK Unmodified 1547.758 0.7579854 1544 O43707 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 34.583 34.583 2;3 0.00042732 30240 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.022 45.613 1906900000 0 356390000 0 0 662020000 246520000 0 340250000 0 74943000 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171989;171990;171991;171992;171993;171994;171995;171996;171997;171998;171999;172000;172001;172002;172003 219548;219549;219550;219551;219552;219553;219554;219555;219556;219557;219558;219559;219560;219561;219562;219563 219551 16 HRLPDLQAILR Unmodified 1330.7834 0.78335271 4355 Q9NZQ3 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes yes 0 0 1 1 71.871 71.871 3 0.040668 73141 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.691 48.82 44907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44907000 0 0 19231 4355 18067 172004 219564 219564 0 HRPDLIDFDK Unmodified 1254.6357 0.63568542 2851;2021 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277 SPTBN1;SPTB Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 40.427 40.427 2;3 0.00018719 36861 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.18 96.908 20547000000 1765400000 2117200000 2045600000 1901800000 1610400000 1320000000 1377400000 1029500000 2198500000 512110000 1582800000 1422200000 1663900000 19232 2851;2021 18068 172005;172006;172007;172008;172009;172010;172011;172012;172013;172014;172015;172016;172017;172018;172019;172020;172021;172022;172023;172024;172025;172026;172027;172028;172029;172030 219565;219566;219567;219568;219569;219570;219571;219572;219573;219574;219575;219576;219577;219578;219579;219580;219581;219582;219583;219584;219585;219586;219587;219588;219589;219590;219591;219592;219593;219594;219595;219596;219597;219598;219599;219600;219601;219602;219603;219604;219605;219606;219607;219608;219609;219610;219611;219612;219613;219614;219615;219616 219603 52 HRPDLIDFDKLK Unmodified 1495.8147 0.81471242 2851;2021 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277 SPTBN1;SPTB Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic no no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 54.609 54.609 3;4 0.00026603 52344 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.326 64.407 1418200000 26692000 73645000 69244000 50288000 105140000 0 84360000 208750000 157560000 16257000 200560000 249780000 175890000 19233 2851;2021 18069 172031;172032;172033;172034;172035;172036;172037;172038;172039;172040;172041;172042;172043;172044 219617;219618;219619;219620;219621;219622;219623;219624;219625;219626;219627;219628;219629;219630;219631;219632;219633;219634;219635;219636;219637;219638 219631 19 HRPDLIDYSK Unmodified 1242.6357 0.63568542 2381 P35609 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.296 23.296 2;3 0.010496 16714 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.84 44.882 373370000 0 30350000 0 81982000 55374000 0 74007000 0 0 0 72870000 0 58792000 19234 2381 18070 172045;172046;172047;172048;172049;172050 219639;219640;219641;219642;219643;219644;219645;219646 219645 8 HRPDLLDFESLKK Unmodified 1596.8624 0.86239089 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 2 1 1 59.673 59.673 4 0.021305 57801 QUIQUE_C1277_190116_001 35.891 23.915 160150000 0 72891000 0 0 0 0 0 87260000 0 0 0 0 0 19235 1472 18071 172051;172052 219647;219648 219647 2 HRPELIDYGK Unmodified 1226.6408 0.6407708 2047;1242 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O43707;K7EJH8 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.379 35.379 4 0.00027029 31365 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.543 68.19 953800000 0 43855000 22831000 28182000 82694000 0 73358000 169600000 144730000 0 150770000 113380000 124400000 19238 1544;1313 18074 172076;172077;172078;172079;172080;172081;172082;172083;172084;172085 219673;219674;219675;219676;219677;219678;219679;219680;219681;219682;219683 219680 10 HRPHEVGSVQWAGSTFGPMQK Oxidation (M) 2351.1229 0.12293246 2382 P35612 ADD2 Beta-adducin yes yes 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 1 1 45.96 45.96 3;4 1.3528E-09 42765 QUIQUE_C1277_190116_001 104.38 87.235 979650000 97222000 162190000 66590000 51686000 0 121840000 0 185070000 202730000 17487000 0 74832000 0 19239 2382 18075 172086;172087;172088;172089;172090;172091;172092;172093;172094;172095;172096;172097;172098;172099 219684;219685;219686;219687;219688;219689;219690;219691;219692;219693;219694;219695;219696;219697;219698;219699 219688 1788 16 HRPHEVGSVQWAGSTFGPMQK Unmodified 2335.128 0.12801784 2382 P35612 ADD2 Beta-adducin yes yes 0 0 1 1 2 3 2 1 2 1 1 1 2 55.857 55.857 3;4 3.473E-14 54454 QUIQUE_C1403_190116_001 95.957 88.153 1531500000 0 195350000 212660000 232000000 142900000 87009000 227980000 0 94631000 0 126380000 55781000 156830000 19240 2382 18075 172100;172101;172102;172103;172104;172105;172106;172107;172108;172109;172110;172111;172112;172113;172114;172115 219700;219701;219702;219703;219704;219705;219706;219707;219708;219709;219710;219711;219712;219713;219714;219715;219716;219717;219718;219719 219705 19 HRPQLLVER Unmodified 1146.6622 0.66217494 2496 P47897;A0A1B0GVU9;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RRI9;A0A0U1RQE9;A0A0U1RQU2;A0A0U1RQL2 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 17.308 17.308 3 0.00031722 9698 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.25 94.942 533870000 122930000 77622000 0 94108000 0 0 0 81452000 79544000 0 0 78221000 0 19241 2496 18076 172116;172117;172118;172119;172120;172121 219720;219721;219722;219723;219724;219725 219724 3 HRPQVAIICGSGLGGLTDK Unmodified 1978.0418 0.041828595 1786 P00491;G3V5M2;G3V2H3 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 1 2 1 2 3 2 1 1 1 2 1 3 2 2 64.601 64.601 2;3;4 5.2317E-54 63900 QUIQUE_C1403_190116_001 192.24 146.33 4377400000 306490000 225480000 355170000 365460000 427370000 218300000 319840000 228510000 417260000 116960000 423260000 380770000 592560000 19242 1786 18077 172122;172123;172124;172125;172126;172127;172128;172129;172130;172131;172132;172133;172134;172135;172136;172137;172138;172139;172140;172141;172142;172143;172144 219726;219727;219728;219729;219730;219731;219732;219733;219734;219735;219736;219737;219738;219739;219740;219741;219742;219743;219744;219745;219746;219747;219748;219749;219750;219751;219752;219753;219754;219755;219756 219732 29 HRPQVAIICGSGLGGLTDKLTQAQIFDYGEIPNFPR Unmodified 3968.0367 0.036690223 1786 P00491;G3V5M2;G3V2H3 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 2 2 1 2 1 141.96 141.96 4;5 1.8265E-16 145242 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.709 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219776;219777;219778;219779;219780;219781;219782;219783;219784;219785;219786;219787;219788;219789;219790;219791;219792;219793;219794;219795;219796;219797;219798;219799;219800;219801;219802;219803;219804;219805;219806;219807;219808;219809;219810;219811;219812;219813;219814;219815;219816;219817;219818;219819;219820;219821;219822;219823;219824 219786 49 HSAILASPNPDEK Unmodified 1377.6888 0.6888432 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 22.379 22.379 2;3 2.8563E-103 15078 QUIQUE_C1277_190116_001 289.22 248.5 1722200000 267300000 226140000 129670000 272460000 106580000 90930000 131550000 42690000 74319000 0 203240000 66536000 110740000 19249 3185 18083 172191;172192;172193;172194;172195;172196;172197;172198;172199;172200;172201;172202;172203;172204;172205;172206 219825;219826;219827;219828;219829;219830;219831;219832;219833;219834;219835;219836;219837;219838;219839;219840;219841;219842 219828 18 HSANMNFSNHNNVR Unmodified 1640.7226 0.72261972 3936 Q96RT1 ERBB2IP Protein LAP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 13.951 13.951 3 6.9201E-05 6024 QUIQUE_C1368_190116_001 96.089 85.143 46363000 0 0 21492000 0 0 0 0 0 18268000 0 0 6602400 0 19250 3936 18084 172207;172208;172209 219843;219844;219845 219843 3 HSASLIFLHGSGDSGQGLR Unmodified 1937.9708 0.97077214 3338 Q5VWZ2 LYPLAL1 Lysophospholipase-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 56.589 56.589 2;4 1.7132E-22 55764 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.71 122.48 461100000 0 18150000 0 0 84146000 0 0 0 70373000 31273000 80305000 78071000 98780000 19251 3338 18085 172210;172211;172212;172213;172214;172215;172216;172217;172218;172219 219846;219847;219848;219849;219850;219851;219852;219853;219854;219855;219856 219849 9 HSATFSSIVK Unmodified 1075.5662 0.56620887 3348 Q66K74;M0QY41;M0QXQ9;M0QZ50 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.627 24.627 2 0.0015194 18586 QUIQUE_C1563_190116_001 96.668 43.175 689440000 0 0 78476000 66423000 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QUIQUE_C1218_190116_001 133.42 108.54 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19255 734 18089 172231;172232;172233;172234;172235;172236;172237;172238;172239 219870;219871;219872;219873;219874;219875;219876;219877;219878 219870 9 HSEHVWVEVVR Unmodified 1375.6997 0.69968266 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 2 1 1 3 1 1 2 2 1 3 2 1 1 35.742 35.742 2;3 1.0561E-99 30731 QUIQUE_C1403_190116_001 242.83 218.8 8411700000 537210000 351470000 723040000 905400000 443100000 620800000 958830000 707530000 792310000 384450000 775130000 470870000 741490000 19256 4560 18090 172240;172241;172242;172243;172244;172245;172246;172247;172248;172249;172250;172251;172252;172253;172254;172255;172256;172257;172258;172259;172260 219879;219880;219881;219882;219883;219884;219885;219886;219887;219888;219889;219890;219891;219892;219893;219894;219895;219896;219897;219898;219899;219900;219901;219902;219903;219904;219905;219906;219907;219908;219909;219910;219911;219912;219913;219914;219915 219888 37 HSEIQQLER Unmodified 1138.5731 0.57308516 2947 Q12846 STX4 Syntaxin-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 20.16 20.16 2 0.014799 12833 QUIQUE_C1368_190116_001 115.13 82.293 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19257 2947 18091 172261;172262;172263;172264;172265 219916;219917;219918;219919;219920 219918 5 HSELSELNVK Unmodified 1154.5932 0.5931519 3756;1664 O75886;Q92783 STAM2;STAM Signal transducing adapter molecule 2;Signal transducing adapter molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.969 29.969 2 6.9902E-50 24534 QUIQUE_C1403_190116_001 218.58 172.9 833920000 0 130000000 0 140360000 0 140030000 130180000 0 0 0 141700000 0 151650000 19258 1664;3756 18092 172266;172267;172268;172269;172270;172271 219921;219922;219923;219924;219925;219926 219922 6 HSEQVPDILQLNAIFNMLNTK Unmodified 2424.2471 0.24712992 1070 G3V169;P29466;H0YEC7;B4DVD8 CASP1 Caspase;Caspase-1;Caspase-1 subunit p20;Caspase-1 subunit p10 yes no 0 0 0 1 164.59 164.59 3 0.0022703 167704 QUIQUE_C1403_190116_001 43.888 40.614 8832400 0 0 0 8832400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19259 1070 18093 172272 219927 219927 1 HSFALYTPER Unmodified 1219.5986 0.59857163 3470 Q7Z6L1 TECPR1 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 44.372 44.372 2 0.051225 41615 QUIQUE_C1576_190116_001 57.267 36.321 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19260 3470 18094 172273 219928 219928 1 HSFCEGCITR Unmodified 1265.5281 0.52812558 3619 Q8N9I9;A0A0C4DGI8;F8VUZ4 DTX3 Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3 yes no 0 0 0 1 1 1 23.049 23.049 2 0.0091438 17039 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.267 66.307 148180000 0 0 0 45846000 0 0 0 42400000 59931000 0 0 0 0 19261 3619 18095 172274;172275;172276 219929;219930;219931;219932 219931 4 HSFDTFSHQR Unmodified 1260.5636 0.56358311 2587 P51648 ALDH3A2 Fatty aldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 17.71 17.71 3 0.0042673 9896 QUIQUE_C1368_190116_001 64.103 56.493 87510000 27653000 16054000 22511000 0 0 21292000 0 0 0 0 0 0 0 19262 2587 18096 172277;172278;172279;172280 219933;219934;219935;219936 219935 4 HSFDTFSHQRPCLLK Unmodified 1871.9101 0.91008614 2587 P51648 ALDH3A2 Fatty aldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 46.247 46.247 4 0.0079574 43747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.956 19.482 93753000 0 0 0 0 0 0 0 44032000 49721000 0 0 0 0 19263 2587 18097 172281;172282 219937;219938 219937 2 HSGNITFDEIVNIAR Unmodified 1684.8533 0.85328277 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 2 2 108.25 108.25 2;3 2.4102E-44 110784 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.05 130.18 1838000000 125130000 163670000 190540000 173570000 119730000 100200000 127460000 150570000 169100000 48173000 189930000 157740000 122150000 19264 2304 18098 172283;172284;172285;172286;172287;172288;172289;172290;172291;172292;172293;172294;172295;172296;172297;172298;172299;172300;172301;172302;172303;172304;172305;172306;172307;172308 219939;219940;219941;219942;219943;219944;219945;219946;219947;219948;219949;219950;219951;219952;219953;219954;219955;219956;219957;219958;219959;219960;219961;219962;219963;219964;219965;219966;219967;219968;219969 219958 28 HSGPNSADSANDGFVR Unmodified 1629.7132 0.71316047 2609 P52597 HNRNPF Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 1 1 2 2 1 21.23 21.23 2;3 1.8347E-283 13859 QUIQUE_C1277_190116_001 300.33 279.55 1555400000 53299000 201070000 125250000 190450000 164080000 133710000 73763000 103790000 73925000 27715000 272510000 83898000 51914000 19265 2609 18099 172309;172310;172311;172312;172313;172314;172315;172316;172317;172318;172319;172320;172321;172322;172323;172324;172325;172326;172327;172328;172329;172330;172331 219970;219971;219972;219973;219974;219975;219976;219977;219978;219979;219980;219981;219982;219983;219984;219985;219986;219987;219988;219989;219990;219991;219992;219993 219971 21 HSGQFTDEYLPEQR Unmodified 1705.7696 0.76961272 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 3 1 1 2 55.351 55.351 2;3 7.6844E-07 54130 QUIQUE_C1576_190116_001 124.12 107.59 518380000 47285000 38236000 24505000 24707000 134300000 35682000 39018000 50740000 27295000 24096000 72517000 0 0 19266 3042 18100 172332;172333;172334;172335;172336;172337;172338;172339;172340;172341;172342;172343;172344;172345;172346;172347 219994;219995;219996;219997;219998;219999;220000;220001;220002;220003;220004;220005;220006;220007;220008;220009 220002 13 HSGSSHLPQQLK Unmodified 1317.6789 0.67894722 2913 Q08117;K7ELQ8 AES Amino-terminal enhancer of split yes no 0 0 0 1 10.825 10.825 3 0.001407 3200 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.132 48.525 8872200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8872200 0 0 0 19267 2913 18101 172348 220010;220011 220011 2 HSGYLWAIGK Unmodified 1130.5873 0.58727866 4494;981;1154 F1T0E5;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 66.475 66.475 2 5.0109E-05 63744 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.28 103.22 190430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39883000 150540000 0 0 19268 981;1154;4494 18102 172349;172350 220012;220013 220012 2 HSIEVPIPR Unmodified 1046.5873 0.58727866 2948 Q12860;H0YIJ1 CNTN1 Contactin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.345 42.345 2 4.4449E-18 39012 QUIQUE_C1576_190116_001 190.08 154.79 2844900000 172990000 262780000 298740000 224130000 268780000 206680000 344490000 106170000 205030000 66036000 296790000 181950000 210270000 19269 2948 18103 172351;172352;172353;172354;172355;172356;172357;172358;172359;172360;172361;172362;172363 220014;220015;220016;220017;220018;220019;220020;220021;220022;220023;220024;220025;220026;220027;220028;220029;220030;220031;220032;220033;220034;220035;220036;220037;220038;220039;220040;220041;220042;220043 220029 30 HSIHWPCR Unmodified 1091.5083 0.50831684 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 18.761 18.761 3 0.002102 10912 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220111;220112;220113;220114;220115;220116 220114 6 HSLNSSSASTTEPDFQK Unmodified 1834.8333 0.83333519 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 28.484 28.484 2;3 4.7578E-121 22557 QUIQUE_C1403_190116_001 224.34 193.06 530790000 100320000 92319000 45346000 86211000 38906000 67111000 78714000 0 21870000 0 0 0 0 19277 2452 18111 172426;172427;172428;172429;172430;172431;172432;172433;172434;172435;172436;172437;172438 220117;220118;220119;220120;220121;220122;220123;220124;220125;220126;220127;220128;220129 220123 11 HSLPDLPYDYGALEPHINAQIMQLHHSK Oxidation (M) 3239.5822 0.58221665 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;G5E9P6;F5GXZ9 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 103.26 103.26 4;5 8.4703E-13 106361 QUIQUE_C1277_190116_001 70.112 67.705 586260000 102070000 105860000 0 0 0 102210000 0 0 0 60210000 103520000 0 112370000 19278 1855 18112 172439;172440;172441;172442;172443;172444 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172612;172613;172614;172615;172616;172617;172618;172619;172620;172621;172622;172623;172624;172625 220350;220351;220352;220353;220354;220355;220356;220357;220358;220359;220360;220361;220362;220363;220364;220365;220366;220367;220368;220369;220370;220371;220372;220373 220369 24 HSQDLAFLSMLNDIAAVPATAMPFR Oxidation (M) 2731.3462 0.34619204 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 163.48 163.48 3 1.3338E-14 168729 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.114 84.391 764720000 40666000 90141000 0 72255000 0 0 0 99486000 110410000 35827000 0 143640000 172280000 19293 2524 18126 172626;172627;172628;172629;172630;172631;172632;172633;172634 220374;220375;220376;220377;220378;220379;220380;220381;220382;220383;220384 220380 1953;1954 10 HSQDLAFLSMLNDIAAVPATAMPFR Unmodified 2715.3513 0.35127742 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 168.61 168.61 3 1.334E-19 172977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.45 103.78 697030000 0 71174000 40490000 0 95397000 0 121020000 112300000 112460000 11800000 0 132390000 0 19294 2524 18126 172635;172636;172637;172638;172639;172640;172641;172642 220385;220386;220387;220388;220389;220390;220391;220392;220393 220390 9 HSQEELLQR Unmodified 1138.5731 0.57308516 3379 Q6P2E9 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 19.799 19.799 2 0.020581 12379 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3 3 3 5 125.39 125.39 2;3 3.2057E-146 132383 QUIQUE_C1218_190116_001 276.97 260.6 14996000000 1169000000 1426600000 951710000 1120500000 1324200000 1129200000 1376600000 823370000 1124800000 452850000 1438100000 1174400000 1484600000 19298 1931 18130 172654;172655;172656;172657;172658;172659;172660;172661;172662;172663;172664;172665;172666;172667;172668;172669;172670;172671;172672;172673;172674;172675;172676;172677;172678;172679;172680;172681;172682;172683;172684;172685;172686;172687;172688;172689;172690;172691;172692;172693;172694;172695;172696;172697;172698;172699 220405;220406;220407;220408;220409;220410;220411;220412;220413;220414;220415;220416;220417;220418;220419;220420;220421;220422;220423;220424;220425;220426;220427;220428;220429;220430;220431;220432;220433;220434;220435;220436;220437;220438;220439;220440;220441;220442;220443;220444;220445;220446;220447;220448;220449;220450;220451;220452;220453;220454;220455;220456;220457;220458;220459;220460;220461;220462;220463;220464;220465;220466;220467;220468;220469;220470;220471;220472;220473;220474;220475;220476;220477;220478;220479;220480;220481;220482;220483;220484;220485;220486;220487;220488;220489;220490;220491;220492;220493;220494;220495;220496;220497;220498;220499;220500;220501;220502;220503;220504;220505;220506;220507;220508;220509;220510;220511;220512;220513;220514;220515;220516;220517;220518;220519;220520;220521;220522;220523;220524;220525;220526;220527;220528;220529;220530;220531;220532;220533;220534;220535;220536;220537;220538 220409 129 HSQFLGYPITLYLEK Unmodified 1807.9509 0.95087155 3264 Q58FF8 HSP90AB2P Putative heat shock protein HSP 90-beta 2 yes yes 0 0 0 1 1 5 1 2 119.18 119.18 2;3 8.3422E-185 125309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 264.29 0 2512000000 0 0 0 0 0 0 522070000 0 0 0 1484700000 0 505170000 19299 3264 18131 172700;172701;172702;172703;172704;172705;172706;172707;172708;172709 220539;220540;220541;220542;220543;220544;220545;220546;220547;220548;220549;220550;220551 220544 11 HSQGINWYHWK Unmodified 1454.6844 0.68436695 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 3 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 50.345 50.345 2;3;4 1.5706E-05 48469 QUIQUE_C1277_190116_001 141.88 115.19 6434100000 442240000 709500000 264370000 311980000 141640000 239600000 268820000 1211100000 657610000 81839000 988860000 425930000 690610000 19300 3753 18132 172710;172711;172712;172713;172714;172715;172716;172717;172718;172719;172720;172721;172722;172723;172724;172725;172726;172727;172728;172729;172730;172731;172732;172733;172734 220552;220553;220554;220555;220556;220557;220558;220559;220560;220561;220562;220563;220564;220565;220566;220567;220568;220569;220570;220571;220572;220573;220574;220575;220576;220577;220578;220579;220580;220581;220582;220583;220584;220585 220557 34 HSQTIDDPQCPSGTK Unmodified 1669.7366 0.73659803 494 A0A3B3ISV3;P02462 COL4A1 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 16.296 16.296 2;3 3.3556E-112 9124 QUIQUE_DMIX1_190116_001 272.92 234.35 2929900000 257400000 509410000 271760000 178950000 422890000 90773000 265280000 194310000 249520000 62893000 159810000 54255000 212640000 19301 494 18133 172735;172736;172737;172738;172739;172740;172741;172742;172743;172744;172745;172746;172747;172748;172749;172750;172751;172752;172753;172754;172755;172756;172757 220586;220587;220588;220589;220590;220591;220592;220593;220594;220595;220596;220597;220598;220599;220600;220601;220602;220603;220604;220605;220606;220607;220608;220609;220610;220611;220612;220613 220606 28 HSQYHVDGSLEK Unmodified 1398.6528 0.65279205 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 15.775 15.775 2;3 0.00013851 7838 QUIQUE_C1576_190116_001 90.759 83.557 689820000 103440000 72326000 29788000 0 89660000 66500000 86549000 0 0 32958000 79035000 54315000 75251000 19302 3871 18134 172758;172759;172760;172761;172762;172763;172764;172765;172766;172767;172768;172769 220614;220615;220616;220617;220618;220619;220620;220621;220622;220623;220624;220625 220621 11 HSQYHVDGSLEKDR Unmodified 1669.7808 0.78084611 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 15.207 15.207 3;4 0.0011088 8077 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.281 46.689 146570000 0 0 0 0 0 0 0 36431000 0 0 23974000 71678000 14485000 19303 3871 18135 172770;172771;172772;172773 220626;220627;220628;220629 220626 4 HSSALGGASLGAR Unmodified 1182.6105 0.6105333 4455 Q9UJ70;H7C3G9;C9JEV6;H7C286;H0YF44 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.712 19.712 2;3 1.7322E-23 12529 QUIQUE_DMIX4_190116_001 172.21 153.12 858430000 119080000 146880000 0 137070000 0 97546000 142300000 73224000 81996000 60333000 0 0 0 19304 4455 18136 172774;172775;172776;172777;172778;172779;172780;172781;172782 220630;220631;220632;220633;220634;220635;220636;220637;220638;220639 220638 8 HSSDTNLVTEGLIAEQFLETTAAQLTYHGLCELTAAAK Unmodified 4103.0157 0.015739589 3600 Q8N5J2 FAM63A Protein FAM63A yes yes 0 0 0 1 175.39 175.39 4 4.1411E-89 182480 QUIQUE_DMIX5_190116_001 148.77 142.44 153020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 153020000 0 0 19305 3600 18137 172783 220640 220640 1 HSSGIVADLSEQSLK Unmodified 1569.7999 0.79985021 3140 Q15435;H7C003;C9JD73;B5MBZ8;C9JRC4;H7C118 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 63.631 63.631 2;3 2.1655E-256 62490 QUIQUE_C1368_190116_001 296.28 272.6 1510400000 154940000 176680000 131690000 144600000 0 108690000 173380000 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NAV1 Neuron navigator 1 yes no 0 0 0 1 166.01 166.01 3 2.1229E-06 169870 QUIQUE_C1277_190116_001 60.735 57.088 16017000 0 16017000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19319 149 18151 172897 220771 220771 1 HSVDGESLSSELQQLGLPK Unmodified 2023.0222 0.02219859 4115 Q9H0A8;A0A0B4J287;H3BM91;H3BQF2;H3BPG2 COMMD4 COMM domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 117.88 117.88 3 0.041585 121208 QUIQUE_C1403_190116_001 26.968 9.4796 31645000 0 0 0 31645000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19320 4115 18152 172898 220772 220772 1 HSVGVVIGR Unmodified 922.53485 0.53484916 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R0I5 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.907 19.907 2 0.00052713 12585 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.55 94.061 1825200000 209310000 286160000 222060000 246030000 240420000 147090000 138840000 0 0 0 184210000 151060000 0 19321 3770 18153 172899;172900;172901;172902;172903;172904;172905;172906;172907 220773;220774;220775;220776;220777;220778;220779;220780;220781 220780 4 HSVHTLVFR Unmodified 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21.941 2 0.00040974 14945 QUIQUE_C1403_190116_001 122.44 82.368 476360000 49494000 43936000 80126000 82170000 36365000 55779000 57386000 0 0 0 71107000 0 0 19340 1330 18171 173009;173010;173011;173012;173013;173014;173015;173016;173017;173018 220892;220893;220894;220895;220896;220897;220898;220899;220900;220901 220895 5 HTFLNIAEHFEK Unmodified 1484.7412 0.74121312 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.579 70.579 3 0.00058846 70629 QUIQUE_C1277_190116_001 77.644 69.045 323860000 46759000 44647000 39170000 36842000 35886000 31486000 0 0 41423000 18112000 0 29532000 0 19341 3896 18172 173019;173020;173021;173022;173023;173024;173025;173026;173027 220902;220903;220904;220905;220906;220907;220908;220909;220910;220911;220912;220913;220914 220904 12 HTFMGVVSLGSPSGEVSHPR Unmodified 2080.016 0.016007775 748 C9JV77;P02765 AHSG Alpha-2-HS-glycoprotein;Alpha-2-HS-glycoprotein chain A;Alpha-2-HS-glycoprotein chain B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.594 66.594 3 1.4899E-10 66884 QUIQUE_C1277_190116_001 94.838 84.781 356360000 0 63139000 50081000 69501000 118320000 30991000 24333000 0 0 0 0 0 0 19342 748 18173 173028;173029;173030;173031;173032;173033;173034 220915;220916;220917;220918;220919;220920;220921 220915 5 HTGCCGDNDPIDVCEIGSK Unmodified 2132.8561 0.85613759 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 1 2 56.168 56.168 2;3 1.2437E-86 55338 QUIQUE_C1218_190116_001 204.17 194.12 1558900000 305010000 184640000 95010000 205870000 220920000 140790000 234550000 0 0 0 0 43921000 128230000 19343 3120 18174 173035;173036;173037;173038;173039;173040;173041;173042;173043;173044;173045;173046;173047;173048;173049;173050 220922;220923;220924;220925;220926;220927;220928;220929;220930;220931;220932;220933;220934;220935;220936;220937;220938;220939;220940 220923 19 HTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTAK Oxidation (M) 2806.3167 0.31668283 2772 P62937;F8WE65;C9J5S7 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 1 0 2 4 2 2 2 1 3 2 2 1 2 2 2 96.188 96.188 2;3 3.9283E-126 99185 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.19 182.56 9983200000 339800000 603740000 581690000 474320000 645840000 25375000 491370000 1001200000 1102600000 510010000 1418300000 1440900000 1348100000 19344 2772 18175 173051;173052;173053;173054;173055;173056;173057;173058;173059;173060;173061;173062;173063;173064;173065;173066;173067;173068;173069;173070;173071;173072;173073;173074;173075;173076;173077 220941;220942;220943;220944;220945;220946;220947;220948;220949;220950;220951;220952;220953;220954;220955;220956;220957;220958;220959;220960;220961;220962;220963;220964;220965;220966;220967;220968;220969;220970;220971;220972;220973;220974;220975;220976;220977;220978 220971 2205 38 HTGPGILSMANAGPNTNGSQFFICTAK Unmodified 2790.3218 0.3217682 2772 P62937;F8WE65;C9J5S7 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 2 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 113.01 113.01 2;3 1.0105E-213 115707 QUIQUE_DMIX1_190116_001 280.81 268.07 13953000000 635220000 1006900000 949330000 811590000 850470000 628490000 922160000 1481700000 1400100000 431540000 1576100000 1529500000 1730100000 19345 2772 18175 173078;173079;173080;173081;173082;173083;173084;173085;173086;173087;173088;173089;173090;173091;173092;173093;173094;173095;173096;173097;173098;173099;173100;173101;173102;173103;173104;173105 220979;220980;220981;220982;220983;220984;220985;220986;220987;220988;220989;220990;220991;220992;220993;220994;220995;220996;220997;220998;220999;221000;221001;221002;221003;221004;221005;221006;221007;221008;221009;221010;221011;221012;221013;221014;221015;221016;221017;221018;221019;221020;221021;221022;221023;221024;221025;221026;221027;221028 221008 50 HTGPITCLQFNPK Unmodified 1511.7555 0.75548298 3413 Q6UXN9 WDR82 WD repeat-containing protein 82 yes yes 0 0 0 1 1 54.811 54.811 2 0.0036747 53152 QUIQUE_C1277_190116_001 83.499 49.293 103210000 0 65775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37431000 0 19346 3413 18176 173106;173107 221029;221030 221029 1 HTGPNSPDTANDGFVR Unmodified 1683.7601 0.76011066 905;2672 E9PCY7;G8JLB6;P31943;D6RIT2;D6RIU0;D6RBM0;E7EQJ0;D6RAM1;D6R9T0;D6RFM3;D6RDU3;D6RJ04;D6RIH9;E5RGV0;E5RGH4;H0YAQ2;P55795 HNRNPH1;HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 1 2 2 2 2 27.985 27.985 2;3 8.2818E-36 21490 QUIQUE_C1368_190116_001 195.72 184.5 10056000000 974480000 871310000 1014700000 861440000 746420000 793650000 730370000 631220000 534810000 276350000 930690000 862200000 827820000 19347 905;2672 18177 173108;173109;173110;173111;173112;173113;173114;173115;173116;173117;173118;173119;173120;173121;173122;173123;173124;173125;173126;173127;173128;173129;173130;173131;173132;173133 221031;221032;221033;221034;221035;221036;221037;221038;221039;221040;221041;221042;221043;221044;221045;221046;221047;221048;221049;221050;221051;221052;221053;221054;221055;221056;221057;221058;221059;221060;221061;221062;221063 221038 32 HTGVIPTHHQFITNER Unmodified 1885.9547 0.95472815 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.873 22.873 4 0.00053047 16354 QUIQUE_C1403_190116_001 49.463 43.619 950560000 0 0 126270000 146300000 0 109420000 169260000 0 118610000 0 114520000 0 166190000 19348 309;4058 18178 173134;173135;173136;173137;173138;173139;173140 221064;221065;221066;221067;221068;221069;221070 221065 6 HTGYVIELQHVVK Unmodified 1521.8304 0.83036248 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;H7C0R3;A0A0U1RQX5;A0A0U1RRC8;A0A0U1RQX9 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 50.65 50.65 3 0.0021548 48469 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.908 41.657 261360000 0 0 0 59501000 50906000 43273000 58736000 0 0 0 48945000 0 0 19349 2496 18179 173141;173142;173143;173144;173145 221071;221072;221073;221074;221075;221076 221076 6 HTHLAVSFGR Unmodified 1123.5887 0.58867565 3787 Q969P0;C9J8Z4 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 2 1 1 1 1 2 1 21.558 21.558 3 4.2796E-05 14673 QUIQUE_C1438_190116_001 103.26 86.715 1766500000 274150000 166140000 201680000 116410000 112610000 106480000 126240000 132770000 122600000 0 100400000 132340000 174640000 19350 3787 18180 173146;173147;173148;173149;173150;173151;173152;173153;173154;173155;173156;173157;173158;173159;173160;173161 221077;221078;221079;221080;221081;221082;221083;221084;221085;221086;221087;221088;221089;221090;221091;221092 221083 12 HTLADNFNPVSEER Unmodified 1627.759 0.75904803 1156 H0YGT2;P20645 M6PR Cation-dependent mannose-6-phosphate receptor yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 63.464 63.464 2;3 1.6654E-28 62926 QUIQUE_C1277_190116_001 170.4 126.2 984420000 31077000 87587000 102280000 92101000 96374000 72117000 34811000 82480000 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173337;173338;173339;173340;173341;173342;173343;173344;173345;173346;173347;173348;173349;173350;173351;173352;173353;173354;173355;173356;173357;173358;173359;173360 221294;221295;221296;221297;221298;221299;221300;221301;221302;221303;221304;221305;221306;221307;221308;221309;221310;221311;221312;221313;221314;221315;221316;221317;221318;221319;221320;221321;221322;221323;221324;221325 221295 30 HTNYTMEHIR Oxidation (M) 1316.5932 0.59316868 1544;2047;1242;2381;1228 H7C144;H9KV75;H7C5W8;H0YJW3;H0YJ11;O43707;F5GXS2;P12814;P35609;F6THM6 ACTN4;ACTN1;ACTN2 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1;Alpha-actinin-2 no no 0 1 0 1 10.294 10.294 3 0.00026695 2686 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.34 78.489 56378000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56378000 0 0 0 19362 1228;1242;1544;2047;2381 18191 173361 221326 221326 704 1 HTPLVEFEEEESDKR Unmodified 1843.8588 0.85882166 3933 Q96RQ3;E9PHF7;F5GYT8 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 50.022 50.022 3 3.1954E-06 46991 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36286000 0 19365 2527 18194 173377;173378;173379;173380;173381;173382;173383 221343;221344;221345;221346;221347;221348;221349 221344 6 HTQGAQPGLADQAAK Unmodified 1491.743 0.74300404 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WU33 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 13.547 13.547 2;3 9.0957E-13 6224 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.02 116.04 256140000 85775000 14037000 9647700 0 0 0 7385000 13960000 8624800 15874000 85306000 0 15533000 19366 103 18195 173384;173385;173386;173387;173388;173389;173390;173391;173392;173393;173394;173395;173396 221350;221351;221352;221353;221354;221355;221356;221357;221358;221359;221360;221361;221362;221363;221364;221365 221357 15 HTQLEQMFR Unmodified 1188.571 0.57097667 4583 Q9Y3A5;A0A087X020 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 0 1 1 1 46.591 46.591 2 0.0037409 42957 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.601 74.398 118420000 0 0 48321000 0 0 0 45816000 0 0 24284000 0 0 0 19367 4583 18196 173397;173398;173399 221366;221367;221368 221368 3 HTQWGIDILEK Unmodified 1338.6932 0.6932003 671 B7ZL14;Q96RU3 FNBP1 Formin-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 88.502 88.502 2 0.020901 85161 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.691 30.078 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19368 671 18197 173400 221369 221369 1 HTTDFYFNIAGHQAMHYSR Unmodified 2295.028 0.027969445 1718 O95278;H0Y6I8;A0A1W2PPT8;A0A1W2PRS5;H0Y7S8;A0A1W2PRC9;A0A1W2PPJ6 EPM2A Laforin yes no 0 0 0 1 71.388 71.388 4 0.0038759 71504 QUIQUE_DMIX7_190116_001 28.831 25.592 28708000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28708000 0 19369 1718 18198 173401 221370 221370 1 HTTSIFDDFAHYEK Unmodified 1709.7686 0.76855009 4075 Q9BYJ9;A0A024R7W5;A0A087X0Q1;A0A087WY31;Q7Z739 YTHDF1;YTHDF3 YTH domain-containing family protein 1;YTH domain-containing family protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.523 84.523 3 0.0026968 86618 QUIQUE_C1277_190116_001 56.527 42.954 404520000 0 56620000 55138000 53677000 0 46222000 39503000 0 59055000 0 54962000 0 39345000 19370 4075 18199 173402;173403;173404;173405;173406;173407;173408;173409 221371;221372;221373;221374;221375;221376;221377;221378;221379 221371 7 HTVDDGLDIR Unmodified 1139.5571 0.55710075 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 34.09 34.09 2 0.0010325 29502 QUIQUE_C1368_190116_001 117.89 83.082 1957800000 0 0 353320000 0 430410000 0 409050000 0 0 0 402250000 0 362740000 19371 3499 18200 173410;173411;173412;173413;173414;173415 221380;221381;221382;221383;221384;221385;221386;221387;221388;221389 221381 9 HTVTMIPGDGIGPELMLHVK Unmodified 2144.1122 0.11221635 2582 P51553;E7EQB8;E9PF84 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 105.13 105.13 3;4 1.5854E-09 108649 QUIQUE_C1277_190116_001 108.75 104.45 2059400000 308140000 245850000 186780000 108070000 158970000 28507000 196920000 71352000 125520000 46547000 203120000 191330000 188340000 19372 2582 18201 173416;173417;173418;173419;173420;173421;173422;173423;173424;173425;173426;173427;173428;173429;173430;173431;173432;173433;173434;173435;173436;173437;173438;173439;173440 221390;221391;221392;221393;221394;221395;221396;221397;221398;221399;221400;221401;221402;221403;221404;221405;221406;221407;221408;221409;221410;221411;221412;221413;221414;221415;221416;221417;221418;221419;221420;221421;221422;221423;221424 221396 34 HTVTMIPGDGIGPELMLHVK Oxidation (M) 2160.1071 0.10713097 2582 P51553;E7EQB8;E9PF84 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 92.334 92.334 3 0.0011824 94377 QUIQUE_C1277_190116_001 51.524 44.862 54037000 0 54037000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19373 2582 18201 173441 221425 221425 2031 1 HTWKPSPLIVMQR Unmodified 1591.8657 0.86570213 4112 Q9H019;C9JF50;E9PLU1;E9PRK5;E9PRW1;E9PSD6 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 1 1 1 1 1 58.28 58.28 3 0.010695 56669 QUIQUE_C1403_190116_001 41.227 29.25 135910000 0 0 0 25574000 0 0 28973000 28147000 0 0 53212000 0 0 19374 4112 18202 173442;173443;173444;173445 221426;221427;221428;221429 221426 4 HTYLPLEVCNIVAGQR Unmodified 1868.9567 0.95670198 4482 Q9UL18;Q5TA58;Q9UKV8;Q9HCK5 AGO1;AGO2;AGO4 Protein argonaute-1;Protein argonaute;Protein argonaute-2;Protein argonaute-4 no no 0 0 0 1 101.91 101.91 3 0.013688 105549 QUIQUE_C1368_190116_001 38.613 29.083 25041000 0 0 25041000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19375 4482 18203 173446 221430 221430 1 HVAAASLIR Unmodified 936.5505 0.55049923 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 1 20.736 20.736 2 0.050487 13480 QUIQUE_C1277_190116_001 50.607 30.052 54952000 0 23275000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31677000 0 19376 2456 18204 173447;173448 221431;221432 221431 2 HVAEVLEYTKDEQLESLFQR Unmodified 2433.2176 0.21760393 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 114.16 114.16 3 1.5452E-24 117272 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ADP-ribose hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 87.648 87.648 3 0.0027179 88877 QUIQUE_C1403_190116_001 61.48 53.756 138600000 0 0 0 54839000 0 35914000 47852000 0 0 0 0 0 0 19380 2283 18208 173462;173463;173464 221447;221448;221449 221447 3 HVDLLEVAQETDGFSGSDLK Unmodified 2159.0382 0.038242585 3628 Q8NBU5 ATAD1 ATPase family AAA domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 118.81 118.81 2;3 7.8293E-48 124178 QUIQUE_C1218_190116_001 193.47 179.21 66510000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18254000 48256000 0 0 19381 3628 18209 173465;173466;173467 221450;221451;221452 221450 3 HVDLLINK Unmodified 950.55492 0.5549159 2196 P22307;E9PLD1;H0YCB0 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.464 33.464 2 0.0036755 28073 QUIQUE_C1368_190116_001 120.46 66.903 679960000 73644000 72410000 110210000 48164000 53200000 0 101240000 0 0 26617000 82146000 0 112330000 19382 2196 18210 173468;173469;173470;173471;173472;173473;173474;173475;173476 221453;221454;221455;221456;221457;221458;221459;221460;221461;221462;221463;221464 221456 12 HVDNIMFENHTVADR Unmodified 1796.8264 0.82641609 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 44.885 44.885 3 2.1215E-10 41779 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.43 98.018 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19383 3660 18211 173477;173478;173479 221465;221466;221467 221466 3 HVEAVAYYK Unmodified 1078.5447 0.54474515 1551 O43765 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.994 20.994 2 1.9258E-06 13762 QUIQUE_C1277_190116_001 153.78 134.14 2000700000 146590000 223910000 202910000 208290000 234430000 0 248230000 89363000 189650000 0 0 200390000 256920000 19384 1551 18212 173480;173481;173482;173483;173484;173485;173486;173487;173488;173489;173490 221468;221469;221470;221471;221472;221473;221474;221475;221476;221477;221478 221469 10 HVEAVYIDIADR Unmodified 1399.7096 0.70957864 2842 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459;I3L4C0;I3L2X8;I3NI10 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 0 2 3 2 1 3 2 2 2 2 2 2 3 2 66.973 66.973 2;3 6.2086E-10 67610 QUIQUE_C1438_190116_001 156.12 121.59 1761900000 142280000 209400000 142860000 86635000 118570000 126490000 105070000 155910000 145610000 91334000 155930000 179250000 102530000 19385 2842 18213 173491;173492;173493;173494;173495;173496;173497;173498;173499;173500;173501;173502;173503;173504;173505;173506;173507;173508;173509;173510;173511;173512;173513;173514;173515;173516;173517;173518 221479;221480;221481;221482;221483;221484;221485;221486;221487;221488;221489;221490;221491;221492;221493;221494;221495;221496;221497;221498;221499;221500;221501;221502;221503;221504;221505;221506;221507;221508;221509;221510;221511;221512;221513;221514;221515;221516;221517;221518;221519;221520;221521;221522;221523 221492 39 HVEDGNVTVQHAALSALR Unmodified 1915.9864 0.98642221 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 3 3 2 2 3 3 2 2 3 2 2 2 2 54.961 54.961 2;3;4 3.9371E-141 52844 QUIQUE_C1403_190116_001 285.65 267.52 9246500000 732590000 966480000 793110000 631150000 801620000 790360000 776590000 416910000 751600000 224640000 773240000 758080000 830150000 19386 2605 18214 173519;173520;173521;173522;173523;173524;173525;173526;173527;173528;173529;173530;173531;173532;173533;173534;173535;173536;173537;173538;173539;173540;173541;173542;173543;173544;173545;173546;173547;173548;173549 221524;221525;221526;221527;221528;221529;221530;221531;221532;221533;221534;221535;221536;221537;221538;221539;221540;221541;221542;221543;221544;221545;221546;221547;221548;221549;221550;221551;221552;221553;221554;221555;221556;221557;221558 221532 30 HVEDVPAFQALGSLNDLQFFR Unmodified 2402.2019 0.20189429 2237 P25311;C9JEV0;H7BZJ8 AZGP1 Zinc-alpha-2-glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.71 156.71 3 2.1367E-08 160948 QUIQUE_C1277_190116_001 99.409 88.541 615130000 72092000 60151000 65341000 44271000 109960000 46802000 81124000 23733000 0 21967000 89688000 0 0 19387 2237 18215 173550;173551;173552;173553;173554;173555;173556;173557;173558;173559 221559;221560;221561;221562;221563;221564;221565;221566;221567;221568 221560 7 HVEMTSLCAHWQVHR Unmodified 1889.8777 0.87774015 2897 Q05707;J3QT83 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 47.128 47.128 4 0.048085 44715 QUIQUE_C1576_190116_001 28.986 19.455 27926000 0 0 0 0 0 0 27926000 0 0 0 0 0 0 19388 2897 18216 173560 221569 221569 1 HVEPGNAAIR Unmodified 1062.557 0.55704117 3195 Q16775;H3BPQ4;H3BPK3 HAGH Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 12.809 12.809 2;3 0.00087741 5625 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.614 46.838 429810000 0 4112400 0 0 0 2207600 0 250480000 11387000 150640000 0 10979000 0 19389 3195 18217 173561;173562;173563;173564;173565;173566;173567;173568;173569 221570;221571;221572;221573;221574;221575;221576;221577;221578 221577 9 HVFAIFNTEQR Unmodified 1360.6888 0.68878362 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 65.768 65.768 2;3 0.00053784 65111 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.89 85.977 744890000 90298000 115450000 48966000 146680000 32265000 40352000 0 73674000 0 21788000 135760000 39654000 0 19390 2569 18218 173570;173571;173572;173573;173574;173575;173576;173577;173578;173579;173580;173581;173582;173583;173584 221579;221580;221581;221582;221583;221584;221585;221586;221587;221588;221589;221590;221591;221592;221593;221594 221592 15 HVFFVDDFDAFK Unmodified 1485.6929 0.69286595 2897 Q05707;A0A0A0MQT7 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 126.32 126.32 2;3 0.00043733 129414 QUIQUE_C1403_190116_001 80.979 76.075 126070000 48195000 0 0 69153000 0 0 0 0 0 8720400 0 0 0 19391 2897 18219 173585;173586;173587;173588;173589;173590;173591;173592;173593 221595;221596;221597;221598;221599;221600;221601;221602;221603 221598 9 HVFFVDDFDAFKK Unmodified 1613.7878 0.78782897 2897 Q05707;A0A0A0MQT7 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 1 1 101.31 101.31 3 0.0064675 103707 QUIQUE_C1403_190116_001 49.774 36.095 47580000 0 0 0 47580000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19392 2897 18220 173594 221604 221604 1 HVFGESDELIGQK Unmodified 1457.7151 0.71505795 2688 P60174;U3KPZ0;U3KQF3;U3KPS5 TPI1 Triosephosphate isomerase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 54.93 54.93 2;3 3.7526E-42 54051 QUIQUE_C1218_190116_001 193.96 187.59 63495000000 5814300000 5794900000 6186300000 4880100000 4339400000 4322600000 5304700000 3904900000 3892000000 2120400000 6506600000 4923700000 5505200000 19393 2688 18221 173595;173596;173597;173598;173599;173600;173601;173602;173603;173604;173605;173606;173607;173608;173609;173610;173611;173612;173613;173614;173615;173616;173617;173618;173619;173620 221605;221606;221607;221608;221609;221610;221611;221612;221613;221614;221615;221616;221617;221618;221619;221620;221621;221622;221623;221624;221625;221626;221627;221628;221629;221630;221631;221632;221633;221634;221635;221636;221637;221638;221639;221640;221641;221642;221643;221644;221645 221606 41 HVFGQPVK Unmodified 910.50249 0.5024864 3999 Q9BR76;A0A087WW53;F5H390;F5H0D2 CORO1B Coronin-1B;Coronin yes no 0 0 0 1 14.869 14.869 2 0.062361 6741 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.683 25.887 95143000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95143000 0 0 0 19394 3999 18222 173621 221646 221646 1 HVFLFTDVLLCAK Unmodified 1561.8327 0.83267067 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3L1U8 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 2 1 1 131.8 131.8 3 0.00039085 137458 QUIQUE_C1576_190116_001 59.57 31.708 33337000 0 0 0 0 0 0 14861000 0 0 0 0 18475000 0 19395 366 18223 173622;173623;173624;173625 221647;221648;221649;221650 221647 3 HVFLTGPPGVGK Unmodified 1207.6713 0.67134264 3326 Q5TDF0;Q9BSD7 NTPCR Cancer-related nucleoside-triphosphatase yes no 0 0 0 1 46.876 46.876 2 0.011346 43737 QUIQUE_C1403_190116_001 59.067 39.973 34068000 0 0 0 34068000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19396 3326 18224 173626 221651 221651 1 HVFTTFYAK Unmodified 1112.5655 0.56548059 4031 Q9BUB7 TMEM70 Transmembrane protein 70, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 42.014 42.014 2 0.0095368 37613 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.696 53.564 53611000 0 0 0 0 0 0 0 35155000 0 0 0 18456000 0 19397 4031 18225 173627;173628;173629 221652;221653;221654 221654 3 HVGDLGNVTADK Unmodified 1224.6099 0.6098646 1783 P00441;H7BYH4 SOD1 Superoxide dismutase [Cu-Zn] yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 23.986 23.986 2;3 8.6808E-28 17867 QUIQUE_C1277_190116_001 178.71 141.65 29837000000 5060300000 2989700000 3630600000 2768200000 3204700000 3423800000 1992100000 866870000 1244400000 1053200000 1387800000 1075600000 1139200000 19398 1783 18226 173630;173631;173632;173633;173634;173635;173636;173637;173638;173639;173640;173641;173642;173643;173644;173645;173646;173647;173648;173649;173650;173651;173652;173653;173654;173655;173656 221655;221656;221657;221658;221659;221660;221661;221662;221663;221664;221665;221666;221667;221668;221669;221670;221671;221672;221673;221674;221675;221676;221677;221678;221679;221680;221681;221682;221683;221684;221685;221686;221687;221688;221689;221690;221691;221692 221658 37 HVGDLGNVTADKDGVADVSIEDSVISLSGDHCIIGR Unmodified 3719.8061 0.80608116 1783 P00441;H7BYH4 SOD1 Superoxide dismutase [Cu-Zn] yes no 0 0 1 3 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 127.82 127.82 3;4;5 0 133791 QUIQUE_C1218_190116_001 279.68 274.72 96014000000 7575400000 9316400000 9287200000 9790500000 7306500000 5907400000 9608800000 4593300000 6253900000 1547300000 9914600000 8966200000 5946800000 19399 1783 18227 173657;173658;173659;173660;173661;173662;173663;173664;173665;173666;173667;173668;173669;173670;173671;173672;173673;173674;173675;173676;173677;173678;173679;173680;173681;173682;173683;173684;173685;173686;173687;173688;173689;173690;173691;173692;173693;173694;173695;173696 221693;221694;221695;221696;221697;221698;221699;221700;221701;221702;221703;221704;221705;221706;221707;221708;221709;221710;221711;221712;221713;221714;221715;221716;221717;221718;221719;221720;221721;221722;221723;221724;221725;221726;221727;221728;221729;221730;221731;221732;221733;221734;221735;221736;221737;221738;221739;221740;221741;221742;221743;221744;221745;221746;221747;221748;221749;221750;221751;221752;221753;221754;221755;221756;221757;221758;221759;221760;221761;221762;221763;221764;221765;221766;221767;221768;221769;221770 221694 77 HVGMAVAGLLADAR Unmodified 1379.7344 0.73435361 2245 P25788 PSMA3 Proteasome subunit alpha type-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 82.978 82.978 2;3 1.077E-05 84700 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.87 91.004 1502200000 129380000 157920000 115720000 88684000 137600000 113190000 134150000 96800000 104610000 21861000 171420000 81728000 149150000 19400 2245 18228 173697;173698;173699;173700;173701;173702;173703;173704;173705;173706;173707;173708;173709;173710;173711;173712;173713;173714;173715;173716;173717;173718;173719 221771;221772;221773;221774;221775;221776;221777;221778;221779;221780;221781;221782;221783;221784;221785;221786;221787;221788;221789;221790;221791;221792;221793;221794;221795;221796;221797;221798;221799;221800;221801;221802;221803;221804;221805;221806;221807 221792 35 HVGMAVAGLLADAR Oxidation (M) 1395.7293 0.72926823 2245 P25788 PSMA3 Proteasome subunit alpha type-3 yes yes 0 1 0 1 66.882 66.882 2 0.02688 67521 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.284 36.648 31728000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31728000 0 0 19401 2245 18228 173720 221808 221808 1 HVGNQQYNVTYVVK Unmodified 1647.8369 0.83690442 1628 O75369;E7EN95;A0A0A0MT44 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 42.938 42.938 2 0.0030764 39441 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.531 50.333 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19402 1628 18229 173721 221809 221809 1 HVGPGVLSMANAGPNTNGSQFFICTIK Unmodified 2816.3738 0.37380378 2310 P30405;H0Y548 PPIF Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 121.16 121.16 3 1.7434E-44 124420 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.76 124.77 554780000 0 0 0 0 0 0 53266000 86724000 101110000 0 112510000 86334000 114830000 19403 2310 18230 173722;173723;173724;173725;173726;173727;173728 221810;221811;221812;221813;221814;221815;221816;221817;221818;221819;221820;221821 221811 12 HVGPGVLSMANAGPNTNGSQFFICTIK Oxidation (M) 2832.3687 0.3687184 2310 P30405;H0Y548 PPIF Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 1 0 1 105.78 105.78 3 1.7662E-05 111054 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.094 38.551 57619000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57619000 0 0 19404 2310 18230 173729 221822 221822 1704 1 HVGTQLPEAAR Unmodified 1177.6204 0.62036971 3556 Q8IYK2 CCDC105 Coiled-coil domain-containing protein 105 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 37.317 37.317 3 0.0066281 33554 QUIQUE_C1438_190116_001 42.336 19.016 96589000 0 0 0 0 35024000 0 37612000 0 0 0 0 0 23953000 19405 3556 18231 173730;173731;173732;173733;173734 221823;221824;221825;221826;221827;221828 221825 6 HVHPTTAPDVTSSLPEEK Unmodified 1943.9589 0.95887005 3416 Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 37.045 37.045 3 0.00066552 32603 QUIQUE_DMIX3_190116_001 40.432 32.09 137280000 0 57537000 0 0 0 0 0 37521000 42217000 0 0 0 0 19406 3416 18232 173735;173736;173737 221829;221830;221831 221831 3 HVHVHVLPR Unmodified 1092.6305 0.63048088 2547 P49789 FHIT Bis(5'-adenosyl)-triphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 14.042 14.042 3 0.0035316 6301 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.246 51.812 24919000 0 0 0 0 0 0 0 13645000 0 11275000 0 0 0 19407 2547 18233 173738;173739 221832;221833 221833 1 HVIDFFK Unmodified 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initiation factor 3 subunit D yes yes 0 0 1 1 152.61 152.61 4 7.741E-25 157685 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85 80.094 50787000 0 0 0 0 0 0 0 0 50787000 0 0 0 0 19411 1500 18236 173752 221846 221846 1 HVINFDLPSDIEEYVHR Unmodified 2082.0171 0.017053633 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A0J9YVQ7;A0A087WVZ1;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 3 2 1 2 123.87 123.87 3;4 2.8218E-17 129664 QUIQUE_C1218_190116_001 135.45 129.02 2002000000 128090000 139170000 199570000 178450000 141990000 150320000 212760000 97335000 159940000 96069000 184260000 136660000 177380000 19412 266;1504 18237 173753;173754;173755;173756;173757;173758;173759;173760;173761;173762;173763;173764;173765;173766;173767;173768;173769;173770 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222028;222029;222030;222031;222032;222033;222034;222035;222036;222037;222038;222039;222040;222041;222042;222043;222044;222045;222046;222047;222048;222049;222050;222051;222052;222053;222054;222055;222056;222057;222058;222059;222060;222061;222062;222063;222064;222065;222066;222067;222068;222069;222070;222071;222072;222073;222074 222058 47 HVLSDLSTK Unmodified 998.53966 0.53965977 825 D6RGX2;Q9NUQ7;D6RB53;D6RA67;D6R9J7 UFSP2 Ufm1-specific protease 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 21.942 21.942 2 0.035737 14256 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.812 44.918 31463000 31463000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19426 825 18251 173927;173928;173929;173930 222075;222076;222077;222078 222078 3 HVLSVLSK Unmodified 881.53345 0.53345218 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7;A0A2R8Y7I7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 25.434 25.434 2 0.0056294 18600 QUIQUE_C1277_190116_001 104.75 49.242 796770000 0 195360000 0 183880000 0 184790000 0 159360000 0 73372000 0 0 0 19427 2513 18252 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0.47316669 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 170.89 170.89 3 3.5415E-99 178137 QUIQUE_DMIX5_190116_001 184.68 172.48 1013700000 0 0 99780000 0 0 0 95844000 22862000 145380000 0 273120000 272520000 104180000 19430 2620 18254 173954;173955;173956;173957;173958;173959;173960 222104;222105;222106;222107;222108;222109;222110 222108 5 HVLVILTDMSSYAEALR Oxidation (M) 1932.9979 0.9978981 2175;731 P21281;C9JL73;P15313;C9JNS9 ATP6V1B2;ATP6V1B1 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform;V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform no no 0 1 0 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 104.16 104.16 2;3 1.9025E-05 106222 QUIQUE_C1563_190116_001 95.428 88.858 512350000 45373000 72488000 52074000 72343000 51940000 51159000 46275000 0 32354000 9451400 41413000 37475000 0 19431 2175;731 18255 173961;173962;173963;173964;173965;173966;173967;173968;173969;173970;173971;173972;173973;173974;173975 222111;222112;222113;222114;222115;222116;222117;222118;222119;222120;222121;222122;222123;222124;222125;222126;222127;222128 222121 440 16 HVLVILTDMSSYAEALR Unmodified 1917.003 0.002983473 2175;731 P21281;C9JL73;P15313;C9JNS9 ATP6V1B2;ATP6V1B1 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform;V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform no no 0 0 0 3 3 1 3 5 6 3 4 3 3 4 4 4 141.5 141.5 2;3 2.1931E-104 145899 QUIQUE_C1277_190116_001 168.67 162.14 2663700000 174280000 291400000 0 158380000 183050000 282500000 203070000 208370000 128160000 101290000 336380000 422860000 174000000 19432 2175;731 18255 173976;173977;173978;173979;173980;173981;173982;173983;173984;173985;173986;173987;173988;173989;173990;173991;173992;173993;173994;173995;173996;173997;173998;173999;174000;174001;174002;174003;174004;174005;174006;174007;174008;174009;174010;174011;174012;174013;174014;174015;174016;174017;174018;174019;174020;174021 222129;222130;222131;222132;222133;222134;222135;222136;222137;222138;222139;222140;222141;222142;222143;222144;222145;222146;222147;222148;222149;222150;222151;222152;222153;222154;222155;222156;222157;222158;222159;222160;222161;222162;222163;222164;222165;222166;222167;222168;222169;222170;222171;222172;222173;222174;222175;222176;222177;222178;222179;222180;222181;222182;222183;222184;222185;222186;222187;222188;222189;222190;222191;222192;222193;222194;222195;222196 222139 59 HVLVTLGEK Unmodified 994.58113 0.58113065 1048 F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;G3V1Y7;F8VPF3;F8VZU9;F8W180;H0YI43;F8VXL3 MYL6 Myosin light polypeptide 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.462 26.462 2 1.0147E-06 20261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.75 125.53 4364200000 476390000 493920000 382120000 298980000 486760000 305600000 370590000 246740000 302390000 92759000 363440000 279770000 264730000 19433 1048 18256 174022;174023;174024;174025;174026;174027;174028;174029;174030;174031;174032;174033;174034 222197;222198;222199;222200;222201;222202;222203;222204;222205;222206;222207;222208;222209;222210;222211 222208 12 HVMDVVDEELSK Unmodified 1399.6653 0.66533057 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27;K7ER56 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.293 71.293 2 0.00089492 71392 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.885 76.528 602750000 74057000 54011000 88004000 54821000 0 69532000 59234000 53190000 33145000 0 62331000 54428000 0 19434 1324 18257 174035;174036;174037;174038;174039;174040;174041;174042;174043;174044 222212;222213;222214;222215;222216;222217;222218;222219;222220;222221;222222;222223 222220 12 HVNGQDQIVPGLYACGEAACASVHGANR Unmodified 2950.3563 0.35625623 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 83.769 83.769 3;4 3.0555E-27 86609 QUIQUE_C1218_190116_001 108.05 104.69 239850000 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174063;174064;174065;174066;174067;174068;174069;174070;174071;174072 222243;222244;222245;222246;222247;222248;222249;222250;222251;222252 222252 7 HVPGGGNVQIQNK Unmodified 1346.7055 0.70549632 880;1058 E7EVA0;P27816;F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 15.837 15.837 2;3 0.00010483 7941 QUIQUE_C1277_190116_001 84.479 56.798 1368000000 102620000 144260000 0 0 120850000 73121000 76504000 209740000 142120000 53676000 139990000 126770000 178390000 19438 880;1058 18261 174073;174074;174075;174076;174077;174078;174079;174080;174081;174082;174083;174084;174085 222253;222254;222255;222256;222257;222258;222259;222260;222261;222262;222263;222264;222265;222266;222267;222268;222269 222255 17 HVPGGGSVQIVYKPVDLSK Unmodified 1979.084 0.084010986 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 0 1 3 3 3 3 2 3 3 3 2 2 3 2 3 62.294 62.294 2;3;4 1.0177E-05 61772 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.384 87.853 10205000000 622790000 865700000 466580000 1073700000 572160000 494230000 565800000 1154900000 817330000 252760000 770180000 1122300000 1426800000 19439 291 18262 174086;174087;174088;174089;174090;174091;174092;174093;174094;174095;174096;174097;174098;174099;174100;174101;174102;174103;174104;174105;174106;174107;174108;174109;174110;174111;174112;174113;174114;174115;174116;174117;174118;174119;174120 222270;222271;222272;222273;222274;222275;222276;222277;222278;222279;222280;222281;222282;222283;222284;222285;222286;222287;222288;222289;222290;222291;222292;222293;222294;222295;222296;222297;222298;222299;222300;222301;222302;222303;222304;222305;222306;222307;222308;222309;222310;222311;222312;222313;222314;222315 222310 44 HVPGPGKPALSK Unmodified 1186.6822 0.68224168 3612 Q8N7J2 AMER2 APC membrane recruitment protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 10.951 10.951 3 0.00035242 2945 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.617 63.856 173220000 4449600 0 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0 40998000 0 45260000 0 42292000 19442 3687 18265 174136;174137;174138;174139;174140;174141;174142;174143;174144 222343;222344;222345;222346;222347;222348;222349;222350;222351;222352 222345 9 HVQETTDSILSHFQSLSYSLAER Unmodified 2647.2878 0.28780876 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 2 129.12 129.12 3;4 0.0066568 134169 QUIQUE_DMIX3_190116_001 38.583 31.551 191620000 0 0 0 0 0 0 0 0 53613000 0 138000000 0 0 19443 1187 18266 174145;174146;174147 222353;222354;222355 222353 2 HVQLLGR Unmodified 821.48717 0.48717069 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 19.82 19.82 2 0.056726 12836 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.258 11.648 55796000 0 0 0 0 0 0 0 55796000 0 0 0 0 0 19444 292;882;3442 18267 174148 222356 222356 1 HVQLVLGQLIDENYLDR Unmodified 2024.0691 0.069089203 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 129.23 129.23 2;3 0.00022544 135245 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.32 87.641 94004000 0 29563000 17327000 0 0 0 0 0 0 17468000 0 29646000 0 19445 1692 18268 174149;174150;174151;174152;174153;174154;174155;174156;174157 222357;222358;222359;222360;222361;222362;222363;222364;222365 222364 8 HVQSLEPDPGTPGSER Unmodified 1704.8067 0.80672651 4321 Q9NX46 ADPRHL2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.32 29.32 2;3 3.0951E-10 23525 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.53 89.145 697920000 59163000 58623000 63894000 48088000 53542000 46015000 52620000 57254000 53435000 21657000 63376000 61996000 58261000 19446 4321 18269 174158;174159;174160;174161;174162;174163;174164;174165;174166;174167;174168;174169;174170;174171 222366;222367;222368;222369;222370;222371;222372;222373;222374;222375;222376;222377;222378;222379;222380;222381 222379 16 HVSILDLPGNILIIPQATLGGR Unmodified 2296.3267 0.32670087 3854 Q96FN9 DTD2 Probable D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 153.83 153.83 3 4.6356E-05 149489 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.055 47.346 61597000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15550000 0 17920000 28126000 19447 3854 18270 174172;174173;174174;174175;174176 222382;222383;222384;222385;222386;222387 222384 6 HVSIQEAESYAESVGAK Unmodified 1803.8639 0.86390703 4483 Q9UL25 RAB21 Ras-related protein Rab-21 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 2 1 2 1 2 2 1 1 89.159 89.159 2;3 9.8748E-53 90679 QUIQUE_C1368_190116_001 216.15 198.34 1534600000 166640000 181970000 156050000 147120000 88442000 134470000 83793000 120230000 90437000 16250000 201350000 58722000 89168000 19448 4483 18271 174177;174178;174179;174180;174181;174182;174183;174184;174185;174186;174187;174188;174189;174190;174191;174192;174193;174194;174195;174196;174197;174198 222388;222389;222390;222391;222392;222393;222394;222395;222396;222397;222398;222399;222400;222401;222402;222403;222404;222405;222406;222407;222408;222409;222410;222411 222392 22 HVSLPSFNQLFGLSDPVNR Unmodified 2126.0909 0.090887278 2535 P49593;A8MX49;B5MCT7;C9J2F3 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.68 141.68 2;3 4.3032E-10 147684 QUIQUE_C1218_190116_001 103.75 88.875 393260000 37886000 34712000 32787000 36238000 45902000 38562000 33620000 38798000 22205000 0 0 35705000 36842000 19449 2535 18272 174199;174200;174201;174202;174203;174204;174205;174206;174207;174208;174209;174210;174211 222412;222413;222414;222415;222416;222417;222418;222419;222420;222421;222422;222423;222424 222412 7 HVSPAGAAVGIPLSEDEAK Unmodified 1846.9425 0.94249171 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 61.968 61.968 2;3 2.7052E-45 60861 QUIQUE_C1403_190116_001 198.74 180.47 1961900000 90723000 96958000 250050000 210040000 309480000 230010000 266870000 171270000 198930000 61222000 76326000 0 0 19450 2339 18273 174212;174213;174214;174215;174216;174217;174218;174219;174220;174221;174222;174223;174224;174225;174226;174227;174228;174229;174230;174231;174232 222425;222426;222427;222428;222429;222430;222431;222432;222433;222434;222435;222436;222437;222438;222439;222440;222441;222442;222443;222444;222445;222446;222447 222430 18 HVSPLIGR Unmodified 877.51339 0.51338544 4195 Q9H9B4;D6RFI0 SFXN1 Sideroflexin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.331 19.331 2 0.0056247 12332 QUIQUE_C1218_190116_001 104.76 65.546 5557600000 500810000 876290000 361940000 617520000 203290000 672020000 283220000 654270000 551300000 0 119700000 717220000 0 19451 4195 18274 174233;174234;174235;174236;174237;174238;174239;174240;174241;174242;174243 222448;222449;222450;222451;222452;222453;222454;222455;222456;222457;222458 222448 11 HVTQEFVSR Unmodified 1101.5567 0.55670682 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 17.938 17.938 2 0.0016157 10988 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.9 72.747 456090000 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330540000 0 383250000 19454 913 18277 174260;174261;174262;174263;174264;174265;174266;174267;174268;174269;174270;174271;174272;174273;174274;174275;174276;174277;174278;174279 222476;222477;222478;222479;222480;222481;222482;222483;222484;222485;222486;222487;222488;222489;222490;222491;222492;222493;222494;222495;222496 222489 19 HVTVIGGGLMGAGIAQVAAATGHTVVLVDQTEDILAK Oxidation (M) 3627.9294 0.92943118 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A1W2PQV5;A0A1W2PP40 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 149.25 149.25 4 2.3702E-33 152409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.29 91.501 241280000 0 0 81881000 0 44111000 0 0 115280000 0 0 0 0 0 19455 913 18277 174280;174281;174282 222497;222498;222499;222500 222499 565 4 HVTVVGELSR Unmodified 1095.6037 0.60365701 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;A0A2R8YF01;A0A1B0GXI6;A0A2R8YEX8 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 1 1 28.956 28.956 2 0.0051889 23046 QUIQUE_C1368_190116_001 78.334 56.098 270690000 90303000 77637000 102750000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19456 4276 18278 174283;174284;174285 222501;222502;222503 222503 1 HVVFIAQR Unmodified 968.55558 0.55558461 2738 P62081;B5MCP9;A0A2R8Y623 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.358 23.358 2 0.001375 17314 QUIQUE_C1218_190116_001 142.74 128.82 1790300000 190430000 187430000 0 206340000 0 183060000 0 175840000 200430000 0 232980000 214200000 199610000 19457 2738 18279 174286;174287;174288;174289;174290;174291;174292;174293;174294 222504;222505;222506;222507;222508;222509;222510;222511;222512;222513 222505 10 HVVFYPTLK Unmodified 1102.6175 0.61751616 4057 Q9BWS9;H0YDL6;H0YCC4;H0YC89 CHID1 Chitinase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 53.243 53.243 2 0.044546 51238 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.88 42.304 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19458 4057 18280 174295;174296 222514;222515 222515 2 HVVLGAIENK Unmodified 1078.6135 0.61349341 2438 P41227 NAA10 N-alpha-acetyltransferase 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 25.246 25.246 2 0.00073994 19240 QUIQUE_C1277_190116_001 106.93 84.795 249760000 31346000 50490000 32861000 0 0 36661000 0 0 0 0 43369000 18211000 36824000 19459 2438 18281 174297;174298;174299;174300;174301;174302;174303;174304 222516;222517;222518;222519;222520;222521;222522;222523 222517 6 HVVLYPLVAK Unmodified 1137.691 0.69101545 1381 O00170 AIP AH receptor-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.343 56.343 2 0.0027159 55421 QUIQUE_C1576_190116_001 111.04 98.842 439090000 42708000 42468000 48458000 41971000 48086000 38179000 40829000 0 0 0 52784000 45275000 38333000 19460 1381 18282 174305;174306;174307;174308;174309;174310;174311;174312;174313;174314 222524;222525;222526;222527;222528;222529;222530;222531;222532;222533 222530 4 HVVPNEVVVQR Unmodified 1274.7095 0.70951906 166;788;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 28.264 28.264 2;3 4.7677E-06 22876 QUIQUE_C1438_190116_001 147.2 131 27182000000 2026400000 1922300000 2373100000 2334600000 2063600000 1971600000 2322200000 2218800000 768700000 1100500000 3131700000 2075900000 2872700000 + 19461 166;788;3305;311 18283 174315;174316;174317;174318;174319;174320;174321;174322;174323;174324;174325;174326;174327;174328;174329;174330;174331;174332;174333;174334;174335;174336;174337;174338;174339 222534;222535;222536;222537;222538;222539;222540;222541;222542;222543;222544;222545;222546;222547;222548;222549;222550;222551;222552;222553;222554;222555;222556;222557;222558;222559;222560;222561;222562;222563;222564;222565;222566;222567;222568;222569;222570;222571;222572;222573;222574;222575;222576;222577 222546 43 HVVQLLQGR Unmodified 1048.6142 0.61416212 2804 P78333 GPC5 Glypican-5;Secreted glypican-5 yes yes 0 0 0 1 29.268 29.268 2 0.037513 23571 QUIQUE_C1277_190116_001 54.205 41.652 19265000 0 19265000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19462 2804 18284 174340 222578 222578 1 HVVQPGYPAHR Unmodified 1259.6523 0.65233854 1355 K7ESP4;Q8WVC6 DCAKD Dephospho-CoA kinase domain-containing protein yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 1 1 2 12.438 12.438 3 6.1011E-05 5172 QUIQUE_C1368_190116_001 123.63 111.76 244590000 26680000 0 29427000 0 10267000 0 13706000 29485000 34769000 0 12966000 71532000 15760000 19463 1355 18285 174341;174342;174343;174344;174345;174346;174347;174348;174349;174350;174351;174352;174353;174354 222579;222580;222581;222582;222583;222584;222585;222586;222587;222588;222589;222590;222591;222592;222593 222581 14 HVVQSISTQQEK Unmodified 1382.7154 0.7153923 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 5 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 13.898 13.898 2;3 1.6327E-146 5600 QUIQUE_C1277_190116_001 265.01 239.39 12953000000 1828200000 768880000 1662600000 648420000 820380000 585300000 1449500000 760410000 1155500000 325910000 1036700000 648820000 1262100000 19464 2230 18286 174355;174356;174357;174358;174359;174360;174361;174362;174363;174364;174365;174366;174367;174368;174369;174370;174371;174372;174373;174374;174375;174376;174377;174378;174379;174380;174381;174382;174383;174384 222594;222595;222596;222597;222598;222599;222600;222601;222602;222603;222604;222605;222606;222607;222608;222609;222610;222611;222612;222613;222614;222615;222616;222617;222618;222619;222620;222621;222622;222623;222624;222625;222626;222627;222628;222629 222599 35 HVVQSISTQQEKETIAK Unmodified 1925.0218 0.02180466 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 21.93 21.93 2;3 1.6999E-247 14701 QUIQUE_DMIX8_190116_001 288.53 251.54 3540400000 0 47266000 0 0 88610000 0 92670000 900670000 547970000 0 552530000 667940000 642760000 19465 2230 18287 174385;174386;174387;174388;174389;174390;174391;174392;174393;174394;174395;174396;174397 222630;222631;222632;222633;222634;222635;222636;222637;222638;222639;222640;222641;222642;222643;222644 222644 14 HVVWHPSQELLASASYDDTVK Unmodified 2381.1652 0.16517443 1682 O76071 CIAO1 Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.559 83.559 3 6.4716E-14 84406 QUIQUE_C1403_190116_001 114.88 106.09 371560000 46504000 51427000 47831000 47231000 0 37613000 45066000 39560000 0 14023000 0 42307000 0 19466 1682 18288 174398;174399;174400;174401;174402;174403;174404;174405;174406 222645;222646;222647;222648;222649;222650;222651;222652;222653;222654 222648 9 HVVYILK Unmodified 870.53272 0.5327239 3295 Q5SQI0 ATAT1 Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 27.773 27.773 2 0.063443 21093 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.76 48.198 17203000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17203000 0 0 0 19467 3295 18289 174407 222655 222655 1 HVYGELDVQIQR Unmodified 1455.747 0.74702678 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 0 2 61.372 61.372 2;3 0.0059821 57110 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.347 29.403 38494000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38494000 0 0 0 19468 1785 18290 174408;174409 222656;222657 222656 1 HWDHLTQVK Unmodified 1162.5883 0.5883413 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 19.732 19.732 2;3 8.5356E-08 12826 QUIQUE_DMIX3_190116_001 166.16 123.56 9689300000 877640000 987930000 1168700000 900680000 889450000 0 989120000 549760000 599880000 272250000 1387500000 206430000 860040000 19469 2305 18291 174410;174411;174412;174413;174414;174415;174416;174417;174418;174419;174420;174421;174422;174423;174424;174425;174426;174427;174428;174429;174430;174431;174432 222658;222659;222660;222661;222662;222663;222664;222665;222666;222667;222668;222669;222670;222671;222672;222673;222674;222675;222676;222677;222678;222679;222680;222681;222682 222675 15 HWEEILQQSLWER Unmodified 1752.8584 0.85836815 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 122.85 122.85 2;3 0.00016478 128141 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.565 69.507 438870000 37879000 0 42923000 0 63936000 0 129890000 40236000 0 15937000 54507000 53562000 0 19470 831;1569 18292 174433;174434;174435;174436;174437;174438;174439;174440;174441;174442;174443;174444 222683;222684;222685;222686;222687;222688;222689;222690;222691;222692;222693;222694;222695;222696;222697 222693 14 HWELTAEGEEIAR Unmodified 1539.7318 0.73177065 4547 Q9Y285;K7ER00;K7ER16;K7EK06 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 68.794 68.794 2;3 0.0003774 67602 QUIQUE_C1563_190116_001 94.465 80.874 936670000 95266000 95244000 72680000 100350000 69369000 75872000 77300000 97213000 35877000 22744000 78711000 68693000 47348000 19471 4547 18293 174445;174446;174447;174448;174449;174450;174451;174452;174453;174454;174455;174456;174457;174458;174459;174460;174461;174462;174463;174464;174465;174466;174467 222698;222699;222700;222701;222702;222703;222704;222705;222706;222707;222708;222709;222710;222711;222712;222713;222714;222715;222716;222717;222718;222719;222720;222721;222722;222723 222710 24 HWGGNVLGPK Unmodified 1063.5563 0.55631289 2754 Q5T8U2;P62424 RPL7A 60S ribosomal protein L7a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.298 30.298 2 0.00874 24723 QUIQUE_C1277_190116_001 95.741 75.116 350930000 40772000 72299000 0 0 0 0 0 63338000 55939000 0 118580000 0 0 19472 2754 18294 174468;174469;174470;174471;174472;174473 222724;222725;222726;222727;222728;222729 222725 3 HWGPIFVK Unmodified 982.53887 0.53887191 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.747 56.747 2 0.018058 54990 QUIQUE_C1403_190116_001 80.555 48.427 204350000 0 43335000 0 29261000 0 41609000 28266000 0 31471000 0 0 30409000 0 19473 506 18295 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HWLDSPWPGFFNVDGEPK Unmodified 2126.985 0.98502522 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 146.26 146.26 2;3 3.1583E-10 152128 QUIQUE_C1218_190116_001 82.007 72.219 113800000 36510000 0 0 0 0 0 0 0 23963000 0 0 53323000 0 19476 4487 18298 174497;174498;174499;174500;174501;174502;174503;174504;174505 222759;222760;222761;222762;222763;222764;222765;222766;222767 222759 7 HWLDSPWPGFFTLDGQPR Unmodified 2155.0276 0.02755874 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 152.61 152.61 2;3 7.0349E-15 155405 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.29 121.25 1083200000 47105000 58082000 98698000 65203000 55014000 54747000 101260000 51002000 106770000 22545000 220960000 122660000 79126000 19477 903;2869 18299 174506;174507;174508;174509;174510;174511;174512;174513;174514;174515;174516;174517;174518;174519;174520 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HWSDMLANPR Unmodified 1225.5662 0.56622565 2182;3618 P21579;J3KQA0;Q8N9I0 SYT1;SYT2 Synaptotagmin-1;Synaptotagmin-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 55.045 55.045 2;3 0.0003244 53972 QUIQUE_C1218_190116_001 154.12 31.942 5490200000 500120000 584220000 640140000 526840000 330370000 350100000 594280000 217550000 261370000 83553000 525860000 422430000 453340000 19486 2182;3618 18306 174658;174659;174660;174661;174662;174663;174664;174665;174666;174667;174668;174669;174670;174671;174672;174673;174674;174675;174676;174677;174678;174679;174680;174681;174682;174683 223021;223022;223023;223024;223025;223026;223027;223028;223029;223030;223031;223032;223033;223034;223035;223036;223037;223038;223039;223040;223041;223042;223043;223044;223045;223046;223047;223048 223021 25 HWSDMLANPR Oxidation (M) 1241.5611 0.56114027 2182;3618 P21579;J3KQA0;Q8N9I0 SYT1;SYT2 Synaptotagmin-1;Synaptotagmin-2 no no 0 1 0 2 1 1 2 1 1 1 2 33.663 33.663 2 0.0016695 27813 QUIQUE_C1368_190116_001 98.009 82.347 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223061;223062;223063;223064;223065;223066;223067;223068;223069;223070;223071;223072;223073;223074;223075;223076;223077;223078;223079;223080;223081;223082;223083;223084;223085;223086;223087;223088;223089;223090;223091;223092;223093;223094;223095;223096;223097;223098;223099;223100;223101;223102;223103;223104;223105;223106;223107;223108;223109;223110 223080 48 HYCEPYTTWCQETYSQTKPK Unmodified 2606.1206 0.12060878 1229 H7C1U8;Q9BUR5 APOO Apolipoprotein O yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 60.348 60.348 3;4 3.0915E-47 60195 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.53 161.69 1842300000 0 171050000 159110000 115220000 170390000 84937000 178210000 93926000 183200000 119700000 182960000 188540000 195030000 19489 1229 18308 174733;174734;174735;174736;174737;174738;174739;174740;174741;174742;174743;174744;174745;174746;174747;174748;174749;174750;174751;174752;174753 223111;223112;223113;223114;223115;223116;223117;223118;223119;223120;223121;223122;223123;223124;223125;223126;223127;223128;223129;223130;223131;223132;223133;223134;223135 223123 23 HYCLCWATK Unmodified 1237.5372 0.5372337 4448 Q9UIC8 LCMT1 Leucine carboxyl methyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.33 47.33 2 0.00040551 44189 QUIQUE_C1403_190116_001 122.18 92.37 526420000 34924000 58089000 42799000 45548000 44945000 36186000 45548000 41035000 35382000 13648000 40551000 40461000 47308000 19490 4448 18309 174754;174755;174756;174757;174758;174759;174760;174761;174762;174763;174764;174765;174766 223136;223137;223138;223139;223140;223141;223142;223143;223144;223145;223146;223147;223148;223149 223139 14 HYCTVANPVSR Unmodified 1302.6139 0.61390412 3086 Q14764;H3BQK6;H3BRL2;H3BUK7;H3BNF6;H3BP76 MVP Major vault protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.437 21.437 2 1.4936E-12 14436 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.04 136.69 547870000 0 69221000 80418000 66783000 91381000 55206000 90475000 0 0 0 94381000 0 0 19491 3086 18310 174767;174768;174769;174770;174771;174772;174773;174774;174775 223150;223151;223152;223153;223154;223155;223156;223157;223158;223159 223157 10 HYCYPHFTCAVDTENIR Unmodified 2181.936 0.93604289 2778;2413 P63092;Q5JWF2;A0A0A0MR13;P38405 GNAS;GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas;Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha no no 0 0 0 1 2 2 2 2 3 7 2 1 2 3 66.804 66.804 3;4 1.6709E-30 66825 QUIQUE_C1403_190116_001 151.8 148.51 1817800000 34002000 196610000 211900000 174430000 149280000 259370000 385510000 0 0 49109000 81283000 124340000 151970000 19492 2778;2413 18311 174776;174777;174778;174779;174780;174781;174782;174783;174784;174785;174786;174787;174788;174789;174790;174791;174792;174793;174794;174795;174796;174797;174798;174799;174800;174801;174802 223160;223161;223162;223163;223164;223165;223166;223167;223168;223169;223170;223171;223172;223173;223174;223175;223176;223177;223178;223179;223180;223181;223182;223183;223184;223185;223186;223187;223188;223189;223190;223191;223192;223193;223194;223195;223196;223197;223198;223199 223170 33 HYCYPHFTCAVDTENIRR Unmodified 2338.0372 0.037153923 2778;2413 P63092;Q5JWF2;A0A0A0MR13;P38405 GNAS;GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas;Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha no no 0 0 1 1 1 56.153 56.153 4 2.4565E-08 54910 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.35 106.45 111390000 0 0 0 0 0 0 0 65881000 45504000 0 0 0 0 19493 2778;2413 18312 174803;174804 223200;223201;223202;223203 223202 4 HYDGSYSTFGER Unmodified 1417.5899 0.58985744 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.604 34.604 2 7.5229E-05 30070 QUIQUE_C1277_190116_001 123.42 112.06 578160000 0 73989000 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223221;223222;223223;223224;223225;223226 223222 3 HYEAVHDAGNDSGHGGESNLALK Unmodified 2377.0683 0.068313935 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 23.827 23.827 4 3.0189E-05 17484 QUIQUE_C1277_190116_001 55.02 46.63 336490000 118190000 47195000 119980000 0 0 51123000 0 0 0 0 0 0 0 19497 3108 18316 174826;174827;174828;174829 223227;223228;223229;223230 223228 4 HYEGSTVPEK Unmodified 1145.5353 0.53530267 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08;H3BS21 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 0 0 1 10.497 10.497 2 0.00019822 2895 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.21 86.856 12973000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12973000 0 0 0 19498 1793 18317 174830 223231 223231 1 HYEVEILDAK Unmodified 1215.6136 0.61355299 4335 Q9NZ01;M0R3C3 TECR Very-long-chain enoyl-CoA reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 53.287 53.287 2 0.00085166 51331 QUIQUE_C1403_190116_001 105.2 81.24 179500000 0 0 59011000 49705000 0 0 70788000 0 0 0 0 0 0 19499 4335 18318 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223249;223250;223251;223252;223253;223254;223255;223256;223257;223258;223259;223260;223261;223262;223263;223264;223265;223266;223267;223268;223269;223270;223271;223272;223273;223274;223275;223276;223277;223278;223279;223280;223281;223282;223283;223284;223285;223286;223287;223288;223289;223290;223291;223292;223293;223294;223295;223296;223297;223298;223299;223300;223301;223302;223303;223304;223305;223306;223307;223308;223309;223310;223311;223312;223313;223314;223315;223316;223317;223318;223319;223320;223321;223322;223323;223324;223325;223326;223327;223328;223329;223330;223331;223332;223333;223334;223335;223336;223337;223338;223339;223340;223341;223342;223343 223252 89 HYFQNTQGLIFVVDSNDRER Unmodified 2437.1775 0.17747045 2827;2134;2828 P84085;C9J1Z8;P84077;P61204;F5H423;F5H0C7;P18085;C9JAK5;C9JPM4 ARF5;ARF1;ARF3;ARF4 ADP-ribosylation factor 5;ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3;ADP-ribosylation factor 4 no no 0 0 1 1 4 2 1 1 1 3 1 4 4 1 91.535 91.535 3;4 7.8868E-135 92850 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57.72 2 0.0070247 54483 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.439 52.171 129920000 0 0 0 30683000 0 41383000 39191000 0 0 18662000 0 0 0 19504 3669 18323 174932;174933;174934;174935 223382;223383;223384;223385 223385 4 HYGFQLYQSDPSGNYGGWK Unmodified 2202.9759 0.9759171 2246 P25789;H0YMZ1;H0YL69;H0YN18;H0YMA1;H0YLC2;H0YKT8;H0YMI6;H0YKS0;H0YMV3 PSMA4 Proteasome subunit alpha type-4;Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 97.985 97.985 2;3 3.5939E-86 101708 QUIQUE_DMIX5_190116_001 252.04 238.84 1929800000 115460000 141030000 216770000 163190000 133050000 128810000 187000000 58648000 98116000 72876000 253710000 165840000 195300000 19505 2246 18324 174936;174937;174938;174939;174940;174941;174942;174943;174944;174945;174946;174947;174948;174949;174950;174951;174952;174953;174954;174955;174956;174957;174958 223386;223387;223388;223389;223390;223391;223392;223393;223394;223395;223396;223397;223398;223399;223400;223401;223402;223403;223404;223405;223406;223407;223408;223409;223410;223411;223412 223407 27 HYGGLTGLNK Unmodified 1058.5509 0.55089316 2139;2090 P15259;P18669;Q8N0Y7 PGAM2;PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 2;Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 no no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 22.185 22.185 1;2;3 9.9774E-40 15000 QUIQUE_DMIX5_190116_001 212.58 170.93 63242000000 6342800000 5278600000 5245800000 4811700000 4945200000 4151700000 4602900000 5287800000 4383400000 2256800000 5802200000 4966900000 5166000000 19506 2090;2139 18325 174959;174960;174961;174962;174963;174964;174965;174966;174967;174968;174969;174970;174971;174972;174973;174974;174975;174976;174977;174978;174979;174980;174981;174982;174983;174984 223413;223414;223415;223416;223417;223418;223419;223420;223421;223422;223423;223424;223425;223426;223427;223428;223429;223430;223431;223432;223433;223434;223435;223436;223437;223438;223439;223440;223441;223442;223443;223444;223445;223446;223447;223448;223449;223450;223451;223452 223446 36 HYGNKPIGMGGTFIIQK Unmodified 1859.9716 0.97162377 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PJU8;E9PPB5;A0A1W2PRB8 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.604 55.604 3 0.00045419 54396 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.187 66.828 763990000 0 0 93754000 72872000 61529000 0 100790000 59422000 91546000 0 124430000 78527000 81128000 19507 4127 18326 174985;174986;174987;174988;174989;174990;174991;174992;174993 223453;223454;223455;223456;223457;223458;223459;223460;223461;223462;223463;223464 223462 11 HYGPGWVSMANAGK Unmodified 1473.6823 0.68231804 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 55.973 55.973 2;3 1.3162E-36 54699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 223.87 196.76 840790000 0 0 109110000 101780000 77007000 75722000 85588000 158930000 0 15681000 88325000 64550000 64098000 19508 2210 18327 174994;174995;174996;174997;174998;174999;175000;175001;175002;175003;175004;175005;175006;175007;175008;175009;175010 223465;223466;223467;223468;223469;223470;223471;223472;223473;223474;223475;223476;223477;223478;223479;223480;223481;223482;223483 223473 13 HYGPGWVSMANAGK Oxidation (M) 1489.6772 0.67723266 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 35.813 35.813 2;3 0.0061194 30786 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.831 68.624 179560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46087000 38870000 41495000 53103000 19509 2210 18327 175011;175012;175013;175014 223484;223485;223486;223487 223487 1570 1 HYGVNCDDWLLR Unmodified 1546.6987 0.69869638 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 85.796 85.796 2;3 2.731E-06 88710 QUIQUE_C1218_190116_001 138.25 124.9 780670000 125750000 64314000 25264000 80152000 74965000 52904000 94500000 37481000 29210000 14591000 50330000 97045000 34165000 19510 723 18328 175015;175016;175017;175018;175019;175020;175021;175022;175023;175024;175025;175026;175027;175028;175029;175030;175031;175032;175033;175034;175035;175036;175037 223488;223489;223490;223491;223492;223493;223494;223495;223496;223497;223498;223499;223500;223501;223502;223503;223504;223505;223506;223507;223508;223509;223510;223511;223512 223489 25 HYGYNSYSVSNSEK Unmodified 1633.7009 0.70086445 1930 P07858 CTSB Cathepsin B;Cathepsin B light chain;Cathepsin B heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.067 28.067 2;3 2.5002E-115 22323 QUIQUE_C1438_190116_001 273.24 231.36 931600000 119620000 127460000 153250000 0 134620000 125450000 0 0 78064000 76423000 116710000 0 0 19511 1930 18329 175038;175039;175040;175041;175042;175043;175044;175045 223513;223514;223515;223516;223517;223518;223519;223520 223516 6 HYGYNSYSVSNSEKDIMAEIYK Unmodified 2597.1744 0.17441849 1930 P07858 CTSB Cathepsin B;Cathepsin B light chain;Cathepsin B heavy chain yes yes 0 0 1 1 2 1 1 102.83 102.83 3;4 6.509E-06 105012 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.49 65.275 574950000 0 0 0 0 0 0 0 0 75722000 0 324720000 84222000 90292000 19512 1930 18330 175046;175047;175048;175049;175050 223521;223522;223523;223524;223525;223526 223524 6 HYHPSCALCVR Unmodified 1398.6285 0.62850833 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 19.696 19.696 2;3 0.00039948 12264 QUIQUE_C1403_190116_001 85.958 77.548 353430000 60471000 0 106050000 122920000 0 0 0 0 0 0 0 63997000 0 19513 3362 18331 175051;175052;175053;175054;175055 223527;223528;223529;223530;223531 223529 4 HYLDFINHYANLFHEK Unmodified 2059.9904 0.99044495 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 2 116.97 116.97 3;4 4.2373E-25 120964 QUIQUE_C1277_190116_001 154.46 142.79 1281500000 0 39309000 107300000 42820000 30385000 45274000 86726000 122260000 225310000 27114000 269830000 154160000 131050000 19514 3053 18332 175056;175057;175058;175059;175060;175061;175062;175063;175064;175065;175066;175067;175068;175069;175070;175071 223532;223533;223534;223535;223536;223537;223538;223539;223540;223541;223542;223543;223544;223545;223546;223547;223548;223549;223550;223551;223552;223553;223554;223555;223556;223557 223532 26 HYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLK Unmodified 3216.6601 0.66013262 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 3 2 2 2 3 2 165.49 165.49 3;4 1.9823E-211 170891 QUIQUE_C1576_190116_001 243.97 236 11721000000 126320000 528630000 622380000 0 470360000 1044900000 1646100000 630520000 765330000 0 2733100000 2122500000 1030700000 19515 2281 18333 175072;175073;175074;175075;175076;175077;175078;175079;175080;175081;175082;175083;175084;175085;175086;175087;175088;175089;175090;175091 223558;223559;223560;223561;223562;223563;223564;223565;223566;223567;223568;223569;223570;223571;223572;223573;223574;223575;223576;223577;223578;223579;223580 223565 20 HYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMK Oxidation (M) 3250.6115 0.61146786 2263;897 E9PBK7;E9PRH7;P27361;E9PQW4;E9PJF0;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 159.25 159.25 3;4 3.3263E-31 164031 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.91 109.31 445010000 0 25039000 0 0 91193000 0 0 103620000 124920000 0 100250000 0 0 19516 897;2263 18334 175092;175093;175094;175095;175096;175097;175098 223581;223582;223583;223584;223585;223586;223587 223586 535 6 HYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMK Unmodified 3234.6166 0.61655324 2263;897 E9PBK7;E9PRH7;P27361;E9PQW4;E9PJF0;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 2 2 164.51 164.51 3;4 3.7514E-78 171480 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.46 146.93 565990000 0 0 59291000 0 0 0 147630000 38846000 0 0 140310000 179920000 0 19517 897;2263 18334 175099;175100;175101;175102;175103;175104;175105 223588;223589;223590;223591;223592;223593;223594 223591 6 HYLFDVQR Unmodified 1076.5403 0.54032847 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 52.647 52.647 2;3 5.2577E-06 49224 QUIQUE_DMIX4_190116_001 170.06 147.04 8482800000 1366800000 1384900000 536200000 579800000 457530000 587410000 280180000 1140500000 520730000 408210000 504610000 441190000 274750000 19518 2230 18335 175106;175107;175108;175109;175110;175111;175112;175113;175114;175115;175116;175117;175118;175119;175120 223595;223596;223597;223598;223599;223600;223601;223602;223603;223604;223605;223606;223607;223608;223609;223610;223611;223612;223613;223614;223615;223616;223617;223618;223619;223620;223621;223622;223623;223624 223614 30 HYLFYDGESVSGK Unmodified 1500.6885 0.68850885 1635 O75436;S4R3Q6;S4R2Y3 VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 1 64.239 64.239 2;3 1.4114E-06 64367 QUIQUE_C1218_190116_001 129.69 104.81 810920000 88761000 66214000 64855000 51875000 52538000 51090000 0 100460000 84392000 46435000 74727000 63818000 65752000 19519 1635 18336 175121;175122;175123;175124;175125;175126;175127;175128;175129;175130;175131;175132;175133;175134;175135;175136 223625;223626;223627;223628;223629;223630;223631;223632;223633;223634;223635;223636;223637;223638;223639;223640;223641 223625 16 HYLLSQGWWDEEQEK Unmodified 1946.8799 0.87989145 1012 F5H5P2;P12694 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 100.63 100.63 2;3 1.1017E-146 105370 QUIQUE_C1218_190116_001 242.48 228.45 464240000 0 39972000 110950000 0 0 0 103750000 0 49490000 0 61693000 41665000 56716000 19520 1012 18337 175137;175138;175139;175140;175141;175142;175143;175144;175145;175146;175147;175148;175149;175150;175151;175152 223642;223643;223644;223645;223646;223647;223648;223649;223650;223651;223652;223653;223654;223655;223656;223657;223658 223642 15 HYLPLSSILDTLDVMAYNK Unmodified 2192.1187 0.11874151 1185 H3BS10;H3BP20;P06865;H3BU85;H3BTD4 HEXA Beta-hexosaminidase;Beta-hexosaminidase subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 162.67 162.67 3 6.421E-06 166904 QUIQUE_C1277_190116_001 94.882 87.308 199360000 41321000 39773000 57743000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60524000 19521 1185 18338 175153;175154;175155;175156 223659;223660;223661;223662 223660 1 HYNGEAYEDDEHHPR Unmodified 1867.751 0.75100254 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 3 2 11.579 11.579 3;4 3.3813E-06 3349 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.54 98.963 343250000 0 0 10065000 1348800 37338000 0 27423000 29811000 29181000 0 74325000 96648000 37111000 19522 2334 18339 175157;175158;175159;175160;175161;175162;175163;175164;175165;175166;175167;175168;175169;175170;175171;175172;175173;175174 223663;223664;223665;223666;223667;223668;223669;223670;223671;223672;223673;223674;223675;223676;223677;223678;223679;223680;223681;223682;223683 223683 19 HYPCTLVGTWNTWYGEQDQAVHLWR Unmodified 3116.4352 0.43515848 1622 O75323;H7C333 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 2 135.95 135.95 3;4 1.4855E-10 142560 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.646 69.419 184810000 0 0 0 0 0 0 37259000 0 0 0 93679000 53867000 0 19523 1622 18340 175175;175176;175177;175178 223684;223685;223686;223687 223685 4 HYPYISTR Unmodified 1035.5138 0.51377937 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9;A0A096LP52 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 3 24.346 24.346 2 0.0036146 18901 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.17 60.483 4802500000 582450000 557050000 0 0 777300000 0 0 300320000 0 229880000 541150000 602050000 1212300000 19524 273;342 18341 175179;175180;175181;175182;175183;175184;175185;175186;175187;175188;175189;175190 223688;223689;223690;223691;223692;223693;223694;223695;223696;223697;223698;223699;223700;223701;223702;223703;223704;223705;223706;223707;223708;223709;223710;223711;223712 223704 24 HYQEEGQGTEVVQGVLLGLVVEDR Unmodified 2653.3348 0.33475896 600 B3KS98;O15372;A0A087WZK9;E5RFW7;E5RFH0;E5RGU4 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 143.07 143.07 3 6.5039E-05 147410 QUIQUE_C1277_190116_001 49.186 41.74 60300000 0 30117000 0 0 0 0 0 0 0 30183000 0 0 0 19525 600 18342 175191;175192;175193 223713;223714;223715 223713 3 HYQFASGAFLHIK Unmodified 1517.7779 0.77793298 3700 Q8WUM4;A0A3B3IT07;C9IZF9 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.611 68.611 3 0.0001219 66525 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.102 55.259 1201300000 87075000 119380000 0 0 108430000 86430000 99999000 104060000 138090000 56769000 121060000 152460000 127560000 19526 3700 18343 175194;175195;175196;175197;175198;175199;175200;175201;175202;175203;175204 223716;223717;223718;223719;223720;223721;223722;223723;223724;223725;223726 223723 10 HYQHVAAVDPEK Unmodified 1392.6786 0.67861287 658 F5GZ08;B7Z4G8;P51693;S4R3U6;K7EMN4 APLP1 Amyloid-like protein 1;C30 yes no 0 0 0 1 1 1 14.017 14.017 3 8.7694E-05 6134 QUIQUE_C1368_190116_001 96.745 71.892 217660000 81025000 61280000 75352000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19527 658 18344 175205;175206;175207 223727;223728;223729 223729 2 HYQINQQWER Unmodified 1400.6585 0.65854613 1833 P02751 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes yes 0 0 0 1 1 36.89 36.89 2 0.012136 32560 QUIQUE_C1403_190116_001 66.299 50.669 36879000 0 0 0 23534000 0 0 0 0 13345000 0 0 0 0 19528 1833 18345 175208;175209 223730;223731 223730 2 HYRPPEGTYGK Unmodified 1303.6309 0.63093439 3916 Q96PE3;B8ZZB2 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 12.898 12.898 3 0.00033768 5878 QUIQUE_C1218_190116_001 101.39 79.366 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223744;223745;223746;223747;223748;223749;223750;223751;223752;223753;223754;223755 223748 11 HYSDFFQGQR Unmodified 1283.5683 0.56833414 1725 O95352;H7C059 ATG7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes no 0 0 0 1 1 1 44.612 44.612 2 0.018966 40565 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.301 62.708 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19532 1725 18349 175231;175232;175233 223756;223757;223758 223757 3 HYSLDDWK Unmodified 1062.4771 0.47705951 2405 P36959 GMPR GMP reductase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.911 49.911 2 0.0036115 45927 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.65 91.578 439650000 42241000 55518000 81226000 0 0 56558000 0 89254000 0 29557000 0 85298000 0 19533 2405 18350 175234;175235;175236;175237;175238;175239;175240 223759;223760;223761;223762;223763;223764;223765;223766 223765 8 HYSVVLPTVSHSGFLYK Unmodified 1933.0098 0.0097834104 3914 Q96P48;E7EU13;F5GWN4;F8WBT0 ARAP1 Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 85.341 85.341 3 0.043019 86913 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223774;223775;223776 223775 3 HYVGELYNYGVDHLGEEAILQVHDKEVLASQLLVLTGQR Unmodified 4405.2706 0.27064914 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 155.89 155.89 5 0.00038004 160483 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.896 35.648 123720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 123720000 0 19538 4148 18355 175251 223777 223777 1 HYVYGPLPQSFDK Unmodified 1549.7565 0.75652884 2052 P13073;H3BPG0 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 68.949 68.949 2;3 1.3605E-52 68715 QUIQUE_C1368_190116_001 199.08 172.96 1908200000 329100000 180280000 249460000 210670000 0 237890000 156330000 0 84415000 116750000 187090000 156240000 0 19539 2052 18356 175252;175253;175254;175255;175256;175257;175258;175259;175260;175261;175262;175263;175264;175265;175266;175267;175268;175269;175270 223778;223779;223780;223781;223782;223783;223784;223785;223786;223787;223788;223789;223790;223791;223792;223793;223794;223795;223796;223797;223798;223799;223800;223801;223802 223785 25 HYVYGPLPQSFDKEWVAK Unmodified 2163.0789 0.078925608 2052 P13073;H3BPG0 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 90.014 90.014 3 0.00016461 92817 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.614 59.508 843020000 0 0 0 0 0 0 0 101220000 135680000 0 307340000 146200000 152570000 19540 2052 18357 175271;175272;175273;175274;175275;175276 223803;223804;223805;223806;223807;223808;223809;223810;223811 223808 9 HYWEVEVGDR Unmodified 1288.5836 0.58364985 1409 O00478;C9JZT5;R4GNB9;R4GMV1;Q4VAN1;Q96F44;Q6AZZ1;Q13410 BTN3A3;TRIM11;BTN1A1;TRIM68 Butyrophilin subfamily 3 member A3;E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11;E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68;Butyrophilin subfamily 1 member A1 no no 0 0 0 1 55.318 55.318 2 0.04442 52942 QUIQUE_C1563_190116_001 59.153 35.303 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19541 1409 18358 175277 223812 223812 1 HYWEVEVGDRK Unmodified 1416.6786 0.67861287 1409 O00478;C9JZT5 BTN3A3 Butyrophilin subfamily 3 member A3 no no 0 0 1 1 1 1 36.089 36.089 3 0.0033724 31054 QUIQUE_DMIX8_190116_001 42.689 30.421 159930000 0 0 0 0 0 0 0 35411000 50107000 0 0 0 74413000 19542 1409 18359 175278;175279;175280 223813;223814;223815;223816 223816 4 HYYEVSCHDQGLCR Unmodified 1822.7515 0.75153659 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 28.569 28.569 2;3 2.0942E-29 22739 QUIQUE_C1403_190116_001 174.39 170.15 1569200000 136560000 194490000 231690000 201370000 116300000 117210000 230680000 58822000 81586000 0 0 92711000 107760000 19543 3726 18360 175281;175282;175283;175284;175285;175286;175287;175288;175289;175290;175291;175292;175293;175294;175295;175296 223817;223818;223819;223820;223821;223822;223823;223824;223825;223826;223827;223828;223829;223830;223831;223832;223833 223823 16 HYYSITINYR Unmodified 1328.6513 0.65133548 1411 O00487 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes yes 0 0 0 1 60.473 60.473 3 0.029309 59348 QUIQUE_C1277_190116_001 40.331 31.931 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19544 1411 18361 175297 223834 223834 1 HYYWGGSGPGIQK Unmodified 1448.6837 0.68369824 4429 Q9UHC6 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes yes 0 0 0 1 45.561 45.561 2 0.056683 43487 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.321 54.885 45369000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45369000 0 0 19545 4429 18362 175298 223835 223835 0 IAAADYIPTVEDILR Unmodified 1658.8879 0.88793694 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 3 2 2 1 2 150.71 150.71 2;3 8.9065E-24 156497 QUIQUE_C1218_190116_001 151.26 131.5 2438300000 211170000 203630000 338040000 198410000 207520000 216050000 216400000 0 187120000 48405000 170560000 100070000 340950000 19546 2142 18363 175299;175300;175301;175302;175303;175304;175305;175306;175307;175308;175309;175310;175311;175312;175313;175314;175315;175316;175317;175318;175319;175320 223836;223837;223838;223839;223840;223841;223842;223843;223844;223845;223846;223847;223848;223849;223850;223851;223852;223853;223854;223855;223856;223857;223858;223859;223860;223861 223836 23 IAAAGLDVTSPEPLPTNHPLLTLK Unmodified 2467.3686 0.36862527 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 116.35 116.35 2;3 4.1404E-114 120101 QUIQUE_C1277_190116_001 264.92 216.39 11120000000 993330000 57525000 1140100000 1091500000 896030000 813260000 967650000 915140000 1193800000 431050000 1387100000 65386000 1168600000 19547 4405 18364 175321;175322;175323;175324;175325;175326;175327;175328;175329;175330;175331;175332;175333;175334;175335;175336;175337;175338;175339;175340;175341;175342;175343 223862;223863;223864;223865;223866;223867;223868;223869;223870;223871;223872;223873;223874;223875;223876;223877;223878;223879;223880;223881;223882;223883;223884;223885;223886;223887;223888;223889 223869 24 IAAAILNTPDLR Unmodified 1266.7296 0.7295858 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 88.622 88.622 2 5.9368E-38 89514 QUIQUE_C1368_190116_001 230.24 130.44 21783000000 2694300000 2243300000 2414700000 1799600000 1903700000 2081000000 2118300000 575610000 928940000 842560000 1799900000 1336200000 1044800000 19548 1788 18365 175344;175345;175346;175347;175348;175349;175350;175351;175352;175353;175354;175355;175356;175357;175358 223890;223891;223892;223893;223894;223895;223896;223897;223898;223899;223900;223901;223902;223903;223904;223905;223906;223907;223908;223909;223910;223911;223912;223913;223914;223915;223916;223917;223918;223919;223920 223897 31 IAAAILNTPDLRK Unmodified 1394.8245 0.82454882 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 3 3 2 3 1 2 3 2 63.075 63.075 2;3 3.9567E-31 63161 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.1 154.33 3411800000 0 97624000 0 32371000 161360000 0 144480000 955150000 549620000 21860000 474370000 515390000 459570000 19549 1788 18366 175359;175360;175361;175362;175363;175364;175365;175366;175367;175368;175369;175370;175371;175372;175373;175374;175375;175376;175377;175378;175379;175380;175381 223921;223922;223923;223924;223925;223926;223927;223928;223929;223930;223931;223932;223933;223934;223935;223936;223937;223938;223939;223940;223941;223942;223943;223944;223945;223946;223947;223948;223949;223950;223951;223952;223953;223954 223945 31 IAAANGIGR Unmodified 841.477 0.47699993 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.583 19.583 2 0.00039966 12224 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.29 61.651 2089700000 217130000 284190000 0 0 0 303870000 159490000 282170000 375550000 202640000 144820000 0 119810000 19550 2400 18367 175382;175383;175384;175385;175386;175387;175388;175389;175390 223955;223956;223957;223958;223959;223960;223961;223962;223963 223961 2 IAAAQYSVTGSAVAR Unmodified 1463.7732 0.77324153 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9;E5RJY3;E5RK53;E5RGP8 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 4 3 1 3 2 2 2 1 2 3 2 2 2 52.355 52.355 2 9.5781E-36 49892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 174.24 148.12 4306900000 636750000 578960000 245180000 382760000 481700000 227510000 300640000 361260000 140560000 181180000 288450000 216430000 265550000 19551 907 18368 175391;175392;175393;175394;175395;175396;175397;175398;175399;175400;175401;175402;175403;175404;175405;175406;175407;175408;175409;175410;175411;175412;175413;175414;175415;175416;175417;175418;175419 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175423;175424 224003;224004 224004 2 IAAGLPMAGIPFLTTDLTYR Unmodified 2120.134 0.13399765 4113 Q9H061;E9PI90 TMEM126A Transmembrane protein 126A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 1 2 163.56 163.56 2;3 0.00039829 169483 QUIQUE_C1576_190116_001 84.753 77.714 468280000 20500000 30959000 18242000 12467000 19075000 41986000 69357000 26067000 35311000 0 63335000 42901000 88079000 19554 4113 18371 175425;175426;175427;175428;175429;175430;175431;175432;175433;175434;175435;175436;175437;175438;175439;175440 224005;224006;224007;224008;224009;224010;224011;224012;224013;224014;224015;224016;224017;224018;224019;224020;224021;224022;224023;224024;224025 224013 20 IAAGLPMAGIPFLTTDLTYR Oxidation (M) 2136.1289 0.12891227 4113 Q9H061;E9PI90 TMEM126A Transmembrane protein 126A yes no 0 1 0 1 1 151.97 151.97 2 0.05365 159470 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.408 34.794 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19555 4113 18371 175441;175442 224026;224027 224027 2 IAAIDSLNQYTR Unmodified 1363.7096 0.70957864 3422 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IAAQDLLLAVATDFQNESAAALAAAATR Unmodified 2785.461 0.4610221 3915 Q96P70 IPO9 Importin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 176.86 176.86 3;4 7.794E-39 177917 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.78 120.66 1019900000 28276000 34782000 23893000 9781500 13947000 27980000 100120000 68325000 160580000 0 113210000 345890000 93109000 19559 3915 18375 175488;175489;175490;175491;175492;175493;175494;175495;175496;175497;175498;175499;175500;175501;175502;175503;175504 224106;224107;224108;224109;224110;224111;224112;224113;224114;224115;224116;224117;224118;224119;224120;224121;224122;224123;224124;224125 224116 20 IAAQGFTVAAILLGLAVTAMK Unmodified 2058.1911 0.19111859 4052 Q9BW72 HIGD2A HIG1 domain family member 2A, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 179.18 179.18 3 6.5594E-08 185949 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.269 84.879 14566000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14566000 0 0 19560 4052 18376 175505 224126 224126 1 IAAQTLLGTAK Unmodified 1085.6445 0.64445919 3256 Q53H96;A0A0A0MQS1;B5MD87 PYCRL Pyrroline-5-carboxylate 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Unmodified 1514.7042 0.70415892 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 66.725 66.725 2;3 3.1076E-20 66727 QUIQUE_DMIX3_190116_001 176.78 136.28 3990900000 240410000 415470000 310940000 370980000 375400000 202550000 388860000 251380000 360380000 114150000 435920000 205250000 319210000 19573 2079 18389 175587;175588;175589;175590;175591;175592;175593;175594;175595;175596;175597;175598;175599;175600;175601;175602;175603;175604;175605;175606;175607;175608 224238;224239;224240;224241;224242;224243;224244;224245;224246;224247;224248;224249;224250;224251;224252;224253;224254;224255;224256;224257;224258;224259;224260;224261;224262;224263;224264 224254 26 IADDKYNDTFWKEFGTNIK Unmodified 2304.1063 0.10626257 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 2 1 106.13 106.13 4 0.020034 108040 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.523 23.466 35200000 0 0 0 0 0 0 0 35200000 0 0 0 0 0 19574 2079 18390 175609 224265 224265 1 IADFELPTIIVPEQTIEIPSIK Unmodified 2465.3669 0.36689393 1854 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175651;175652;175653;175654;175655;175656;175657;175658;175659;175660;175661;175662;175663;175664;175665;175666;175667;175668;175669;175670;175671;175672;175673;175674;175675;175676;175677;175678 224308;224309;224310;224311;224312;224313;224314;224315;224316;224317;224318;224319;224320;224321;224322;224323;224324;224325;224326;224327;224328;224329;224330;224331;224332;224333;224334;224335;224336;224337;224338;224339;224340;224341;224342;224343 224317 33 IADSIGCSTNNILFLTDVTR Unmodified 2209.1049 0.10488236 4440 Q9UHY7;D6RA00;A0A0C4DGY8 ENOPH1 Enolase-phosphatase E1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 140.89 140.89 2;3 1.0081E-23 146230 QUIQUE_C1368_190116_001 176.4 154.48 2557800000 63934000 187770000 253600000 112070000 325230000 313150000 293950000 124600000 255320000 40453000 86190000 189070000 312420000 19586 4440 18402 175679;175680;175681;175682;175683;175684;175685;175686;175687;175688;175689;175690;175691;175692;175693;175694;175695;175696;175697;175698;175699;175700 224344;224345;224346;224347;224348;224349;224350;224351;224352;224353;224354;224355;224356;224357;224358;224359;224360;224361;224362;224363;224364;224365;224366;224367;224368;224369;224370;224371 224350 22 IADSSVQTDDEDGESR Unmodified 1722.718 0.71803066 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.212 25.212 2 3.3988E-20 19200 QUIQUE_C1438_190116_001 149.26 135.91 241920000 20483000 0 23098000 23876000 30256000 0 31590000 0 0 10719000 39914000 23170000 38808000 19587 4517 18403 175701;175702;175703;175704;175705;175706;175707;175708;175709;175710;175711 224372;224373;224374;224375;224376;224377;224378;224379;224380;224381;224382 224375 11 IAEAYQMLK Unmodified 1065.5529 0.55286699 4465 Q9UJY5;B0QYR6;B0QYS3;B0QYS5 GGA1 ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 yes no 0 0 0 1 1 60.518 60.518 2 0.0061462 58889 QUIQUE_C1403_190116_001 85.064 58.102 54469000 23359000 0 0 31109000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19588 4465 18404 175712;175713 224383;224384 224384 2 IAECSSQLAEEEEK Unmodified 1621.7141 0.71413125 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.704 37.704 2 2.2067E-58 33260 QUIQUE_C1277_190116_001 201.46 171.69 399420000 68994000 62819000 57501000 51905000 35582000 57666000 48342000 0 0 16611000 0 0 0 19589 2379 18405 175714;175715;175716;175717;175718;175719;175720;175721;175722 224385;224386;224387;224388;224389;224390;224391;224392;224393 224386 9 IAECSSQLAEEEEKAK Unmodified 1820.8462 0.84620806 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 2 2 34.723 34.723 2;3 1.1978E-13 30568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.46 104.71 82800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82800000 0 0 19590 2379 18406 175723;175724;175725;175726 224394;224395;224396;224397 224395 4 IAEESNFPFIK Unmodified 1293.6605 0.66050319 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 98.248 98.248 2 2.3637E-08 102077 QUIQUE_C1218_190116_001 155.07 133.54 5907900000 528100000 524420000 523830000 446480000 461200000 427400000 540220000 335950000 348270000 266820000 476380000 486610000 542260000 19591 1245 18407 175727;175728;175729;175730;175731;175732;175733;175734;175735;175736;175737;175738;175739;175740 224398;224399;224400;224401;224402;224403;224404;224405;224406;224407;224408;224409;224410;224411;224412;224413;224414;224415;224416;224417;224418;224419;224420;224421;224422;224423;224424;224425;224426;224427;224428;224429;224430;224431;224432;224433;224434;224435;224436;224437;224438;224439;224440;224441 224399 43 IAEFAFEYAR Unmodified 1215.5924 0.59242362 2558 P50213;H0YL72;H0YMU3 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.217 97.217 2 0.00069809 99427 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.57 68.426 8983500000 848850000 849980000 956340000 0 708980000 748340000 925490000 459730000 644380000 281090000 945580000 832270000 782440000 19592 2558 18408 175741;175742;175743;175744;175745;175746;175747;175748;175749;175750;175751;175752 224442;224443;224444;224445;224446;224447;224448;224449;224450;224451;224452;224453;224454;224455;224456;224457;224458;224459;224460;224461;224462 224455 21 IAEFTTNLTEEEEK Unmodified 1652.7781 0.77811172 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 79.58 79.58 2;3 1.2667E-115 77987 QUIQUE_DMIX3_190116_001 237.84 219.57 2032700000 163160000 45960000 167010000 222340000 340690000 138750000 171450000 126500000 126720000 87787000 156330000 151630000 134360000 19593 2378 18409 175753;175754;175755;175756;175757;175758;175759;175760;175761;175762;175763;175764;175765;175766 224463;224464;224465;224466;224467;224468;224469;224470;224471;224472;224473;224474;224475;224476 224472 14 IAEFTTNLTEEEEKSK Unmodified 1867.9051 0.90510315 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 60.76 60.76 2;3 5.8146E-07 60032 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.42 123.55 266500000 0 0 0 0 0 0 0 19305000 68375000 0 91915000 86902000 0 19594 2378 18410 175767;175768;175769;175770 224477;224478;224479;224480 224477 4 IAEGAQQGDPLSR Unmodified 1340.6684 0.66844211 4455 Q9UJ70;H7C3G9;C9JEV6;H7C286;E9PPU6 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.803 36.803 2 9.5567E-32 32163 QUIQUE_C1277_190116_001 183.99 155.59 1651300000 149400000 146800000 158030000 157020000 94616000 120570000 147970000 74243000 154240000 71981000 117040000 127270000 132070000 19595 4455 18411 175771;175772;175773;175774;175775;175776;175777;175778;175779;175780;175781;175782;175783 224481;224482;224483;224484;224485;224486;224487;224488;224489;224490;224491;224492;224493;224494;224495;224496 224483 16 IAEITHLQQQLQESQQMLGR Unmodified 2350.2063 0.20632774 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000001528 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 114.8 114.8 3 0.0017998 118222 QUIQUE_C1277_190116_001 48.371 35.523 146330000 37661000 60071000 0 0 0 48601000 0 0 0 0 0 0 0 + 19596 3161 18412 175784;175785;175786 224497;224498;224499 224498 2 IAELEEEQSQGSTTNSDWMK Unmodified 2282.0009 0.0008708006 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 84.177 84.177 2;3 0 85626 QUIQUE_C1277_190116_001 297.16 285.1 1132200000 105050000 109260000 119350000 63319000 89675000 99152000 119130000 44050000 85756000 26692000 103080000 61861000 105810000 19597 2483 18413 175787;175788;175789;175790;175791;175792;175793;175794;175795;175796;175797;175798;175799;175800;175801;175802;175803;175804;175805;175806;175807;175808;175809 224500;224501;224502;224503;224504;224505;224506;224507;224508;224509;224510;224511;224512;224513;224514;224515;224516;224517;224518;224519;224520;224521;224522 224502 23 IAELEEEQSQGSTTNSDWMK Oxidation (M) 2297.9958 0.99578542 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 1 0 1 67.257 67.257 2 7.4297E-07 63078 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.531 93.377 9169300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9169300 0 0 0 19598 2483 18413 175810 224523 224523 1914 1 IAELESLTLR Unmodified 1143.6499 0.6499385 1479 O15083 ERC2 ERC protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 90.447 90.447 2 0.033862 92064 QUIQUE_C1403_190116_001 64.841 41.769 158990000 0 0 0 31145000 0 0 36408000 28129000 0 0 36788000 26519000 0 19599 1479 18414 175811;175812;175813;175814;175815 224524;224525;224526;224527;224528 224524 3 IAELLENVTLIHKPVSLQPR Unmodified 2269.3158 0.31580184 3082 Q14694;J3KT19 USP10 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.83 103.83 4 1.0208E-07 107019 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.67 87.441 438210000 31616000 35493000 38310000 32732000 37151000 41558000 44850000 36841000 32863000 0 35407000 27171000 44213000 19600 3082 18415 175816;175817;175818;175819;175820;175821;175822;175823;175824;175825;175826;175827 224529;224530;224531;224532;224533;224534;224535;224536;224537;224538;224539;224540;224541 224537 12 IAELLSPGSVDPLTR Unmodified 1566.8617 0.86172219 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12;A0A2R8Y6A7 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.14 114.14 2 8.5909E-06 118343 QUIQUE_DMIX3_190116_001 130.56 116.4 6238500000 442360000 359430000 391790000 462960000 515700000 348670000 392400000 531750000 622690000 264200000 722680000 531740000 652130000 19601 2371 18416 175828;175829;175830;175831;175832;175833;175834;175835;175836;175837;175838;175839;175840 224542;224543;224544;224545;224546;224547;224548;224549;224550;224551;224552;224553;224554;224555;224556 224550 15 IAELMPGASGAEVK Oxidation (M) 1387.7017 0.70171607 2743 P62195 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes yes 0 1 0 1 19.804 19.804 2 0.021075 12345 QUIQUE_C1563_190116_001 51.268 14.934 92850000 0 0 0 0 0 92850000 0 0 0 0 0 0 0 19602 2743 18417 175841 224557 224557 1 IAEMTDIKPILR Unmodified 1398.7905 0.7904715 3276 Q5JRX3;A0A0A0MRX9;H0Y7L7 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes no 0 0 1 1 73.612 73.612 3 0.040944 73768 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.789 29.911 28469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28469000 0 19603 3276 18418 175842 224558 224558 1 IAENLGDVQISDK Unmodified 1400.7147 0.7147236 474;436 A0A2U3TZY2;H0YGM0;Q9H078;A0A2R8Y602 CLPB Caseinolytic peptidase B protein homolog no no 0 0 0 1 1 1 69.207 69.207 2 0.0058268 68788 QUIQUE_C1277_190116_001 72.34 50.876 119830000 0 50627000 0 0 0 35336000 0 33866000 0 0 0 0 0 19604 474;436 18419 175843;175844;175845 224559;224560;224561 224559 3 IAENNDLLWMDYHQK Unmodified 1888.8778 0.87778296 1412 O00499 BIN1 Myc box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 89.196 89.196 2;3 5.6495E-36 90969 QUIQUE_C1368_190116_001 175.54 139.83 4117800000 400820000 438360000 118650000 352510000 267290000 290330000 468100000 250790000 308250000 110200000 382190000 359540000 370800000 19605 1412 18420 175846;175847;175848;175849;175850;175851;175852;175853;175854;175855;175856;175857;175858;175859;175860;175861;175862;175863;175864;175865;175866;175867;175868 224562;224563;224564;224565;224566;224567;224568;224569;224570;224571;224572;224573;224574;224575;224576;224577;224578;224579;224580;224581;224582;224583;224584;224585 224566 23 IAENPANPPVGGK Unmodified 1262.6619 0.66190017 74 A0A087WYF6;E7ESD2;A0A0A0MR88;A0A096LPC5;Q9Y4E1;Q641Q2;F8W7U3;J3KP36;Q5SRD0 FAM21A;FAM21C;FAM21D WASH complex subunit FAM21C;WASH complex subunit FAM21A;Putative WASH complex subunit FAM21 yes no 0 0 0 1 27.603 27.603 2 0.022255 21607 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.978 32.81 33366000 0 0 0 0 0 0 0 33366000 0 0 0 0 0 19606 74 18421 175869 224586 224586 1 IAENVEEVK Unmodified 1029.5342 0.53424004 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.832 25.832 2 0.00045846 19336 QUIQUE_C1368_190116_001 117.04 72.589 3326500000 404190000 407870000 362600000 0 340290000 364420000 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0.75144346 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 51.885 51.885 2;3 1.9892E-28 49746 QUIQUE_C1403_190116_001 201.84 156.48 2103900000 122900000 136600000 336850000 171370000 121630000 103670000 134790000 107260000 355630000 45304000 152480000 141340000 174020000 19612 2250 18427 175914;175915;175916;175917;175918;175919;175920;175921;175922;175923;175924;175925;175926;175927;175928 224633;224634;224635;224636;224637;224638;224639;224640;224641;224642;224643;224644;224645;224646;224647;224648;224649;224650;224651;224652;224653 224640 21 IAESHLQSISNLNENQASEEEDELGELR Unmodified 3153.4698 0.46980847 4412 Q9UD71;J3KSJ8;J3KT77 PPP1R1B Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.07 105.07 3 7.9681E-236 107921 QUIQUE_DMIX3_190116_001 246.17 234.75 2059100000 110750000 196690000 69203000 265610000 137920000 247290000 68546000 145640000 204150000 87754000 123240000 132400000 269970000 19613 4412 18428 175929;175930;175931;175932;175933;175934;175935;175936;175937;175938;175939;175940;175941 224654;224655;224656;224657;224658;224659;224660;224661;224662;224663;224664;224665;224666;224667;224668 224664 15 IAESLGGSGYSVER Unmodified 1423.6943 0.69432251 353 A0A1B0GUZ7;Q14156 EFR3A Protein EFR3 homolog A yes no 0 0 0 1 56.866 56.866 2 0.042826 55332 QUIQUE_C1277_190116_001 72.34 49.6 15583000 0 15583000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19614 353 18429 175942 224669 224669 0 IAEVDASVVR Unmodified 1057.5768 0.57677356 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 45.148 45.148 1;2 0.0014059 42706 QUIQUE_C1218_190116_001 98.033 53.586 10164000000 894980000 540240000 909800000 735290000 764910000 779110000 761540000 556940000 884910000 431190000 1164700000 815720000 924400000 19615 2337 18430 175943;175944;175945;175946;175947;175948;175949;175950;175951;175952;175953;175954;175955;175956;175957 224670;224671;224672;224673;224674;224675;224676;224677;224678;224679;224680;224681;224682;224683;224684;224685;224686;224687;224688;224689;224690 224671 19 IAEVDCTAER Unmodified 1162.5288 0.52883709 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.368 23.368 2 0.00045168 16805 QUIQUE_C1576_190116_001 111.39 78.129 517970000 74445000 0 0 99000000 94875000 0 84074000 0 0 0 65990000 47460000 52126000 19616 3627 18431 175958;175959;175960;175961;175962;175963;175964;175965;175966;175967 224691;224692;224693;224694;224695;224696;224697;224698;224699;224700 224696 10 IAEVGGVPYLLPLVNQK Unmodified 1809.04 0.040020906 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PPB5;A0A1W2PRB8;E9PIP1;E9PR95;E9PSC3;E9PLC5;E9PLB3 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 1 1 2 2 139.08 139.08 2;3 3.9271E-05 143600 QUIQUE_C1403_190116_001 98.754 79.014 2937100000 122420000 180900000 256310000 235950000 277140000 136220000 178070000 311830000 352440000 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heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 156.8 156.8 2 2.6859E-10 159504 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.42 97.036 37103000 0 0 0 0 0 0 0 37103000 0 0 0 0 0 19622 3053 18436 176004 224740 224740 1 IAFLQGER Unmodified 932.50797 0.50796571 2960 Q13033;G3V340 STRN3 Striatin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 55.681 55.681 2 0.023483 55259 QUIQUE_C1218_190116_001 73.26 49.057 247610000 47956000 41178000 38295000 37413000 0 0 0 0 38509000 0 0 0 44260000 19623 2960 18437 176005;176006;176007;176008;176009;176010 224741;224742;224743;224744;224745;224746;224747 224741 7 IAFSCPQK Unmodified 949.46914 0.46913736 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 31.239 31.239 2 0.054491 25744 QUIQUE_C1277_190116_001 54.549 43.48 215500000 0 215500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19624 4220 18438 176011 224748 224748 1 IAFSSTSLLK Unmodified 1065.607 0.60701105 4575 Q9Y305;H7C5Q2 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 81.78 81.78 2 0.0076585 82889 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kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 171.11 171.11 3 1.842E-54 174551 QUIQUE_C1277_190116_001 138.02 131.8 310760000 0 63475000 43596000 11958000 34583000 0 59108000 37701000 30523000 0 0 0 29822000 19628 865 18442 176025;176026;176027;176028;176029;176030;176031;176032 224763;224764;224765;224766;224767;224768;224769;224770 224763 8 IAGDAPLQGVLGGALTIPCHVHYLRPPPSR Unmodified 3161.692 0.69204187 3862 Q96GW7;Q5T3I7;V9GY88;Q5T3I8 BCAN Brevican core protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 118.48 118.48 4;5 2.2875E-13 123340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.213 64.782 3046400000 124680000 208330000 321420000 67714000 248320000 173000000 491200000 203690000 425930000 0 373780000 408350000 0 19629 3862 18443 176033;176034;176035;176036;176037;176038;176039;176040;176041;176042;176043;176044;176045;176046 224771;224772;224773;224774;224775;224776;224777;224778;224779;224780;224781;224782;224783;224784;224785;224786;224787;224788 224785 18 IAGDYVSEEVWYR Unmodified 1585.7413 0.7412727 1749;1701 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0.37056889 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 87.542 87.542 4 8.3938E-54 89258 QUIQUE_C1277_190116_001 142.94 142.22 578710000 76604000 143870000 98636000 75944000 85324000 69696000 0 0 0 28633000 0 0 0 19632 3549 18446 176065;176066;176067;176068;176069;176070;176071 224815;224816;224817;224818;224819;224820;224821 224816 7 IAGTNAEVMPAQWEFQIGPCEGISMGDHLWVAR Oxidation (M) 3685.7116 0.71159261 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.01 146.01 3 2.2706E-51 150246 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.8 107.41 852020000 37817000 61250000 111410000 0 0 51272000 54061000 64444000 71613000 0 211550000 108690000 79912000 19633 2086 18447 176072;176073;176074;176075;176076;176077;176078;176079;176080;176081 224822;224823;224824;224825;224826;224827;224828;224829;224830;224831;224832;224833 224832 1422;1423 11 IAGTNAEVMPAQWEFQIGPCEGISMGDHLWVAR Unmodified 3669.7167 0.71667799 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 4 2 2 155.2 155.2 3;4 3.4744E-46 161141 QUIQUE_C1218_190116_001 108.72 95.279 776380000 32330000 0 82020000 0 0 0 31696000 54258000 0 0 361770000 119650000 94655000 19634 2086 18447 176082;176083;176084;176085;176086;176087;176088;176089;176090;176091;176092;176093 224834;224835;224836;224837;224838;224839;224840;224841;224842;224843;224844;224845;224846;224847;224848 224834 15 IAGTNAEVMPAQWEFQIGPCEGISMGDHLWVAR 2 Oxidation (M) 3701.7065 0.70650724 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 2 0 1 1 1 1 139.94 139.94 3 3.5915E-38 146675 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.878 89.467 210620000 0 0 0 0 0 0 0 35601000 44538000 19612000 110870000 0 0 19635 2086 18447 176094;176095;176096;176097 224849;224850;224851;224852 224852 1422;1423 4 IAGYVTHLMK Unmodified 1131.6111 0.61105057 1183 H3BNC9;P08708;H0YN88;A0A075B716 RPS17 40S ribosomal protein S17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 46.633 46.633 3 0.0016208 43721 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.14 61.175 350490000 73970000 56464000 0 0 29968000 45994000 0 46117000 46616000 0 0 51364000 0 19636 1183 18448 176098;176099;176100;176101;176102;176103;176104 224853;224854;224855;224856;224857;224858;224859 224858 7 IAHDIFDHIYSMDENLEFHIK Unmodified 2586.2213 0.2213091 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 127.31 127.31 4 0.0031382 131857 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.825 31.928 21022000 0 0 0 0 0 0 0 0 21022000 0 0 0 0 19637 1568 18449 176105 224860 224860 1 IAHIMGPPDR Unmodified 1105.5702 0.57024839 3770 Q92945;A0A087WTP3 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 27.191 27.191 2;3 0.0065151 21089 QUIQUE_C1403_190116_001 49.35 29.589 234870000 29696000 30925000 28025000 29808000 0 20485000 35659000 0 0 0 0 32430000 27847000 19638 3770 18450 176106;176107;176108;176109;176110;176111;176112;176113;176114;176115 224861;224862;224863;224864;224865;224866;224867;224868;224869;224870 224865 10 IAHIMGPPDR Oxidation (M) 1121.5652 0.56516301 3770 Q92945;A0A087WTP3 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.569 19.569 3 0.0042454 12863 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.408 37.849 774920000 0 73507000 69026000 65915000 38374000 57365000 36220000 94930000 82963000 0 97225000 75930000 83462000 19639 3770 18450 176116;176117;176118;176119;176120;176121;176122;176123;176124;176125;176126 224871;224872;224873;224874;224875;224876;224877;224878;224879;224880;224881 224877 2726 9 IAHVELADAGQYR Unmodified 1441.7314 0.73137672 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 49.18 49.18 2;3 0.00081804 47147 QUIQUE_C1438_190116_001 56.205 19.511 419420000 0 34920000 97301000 31775000 71745000 28870000 0 43689000 30823000 13897000 35126000 31276000 0 19640 2834 18451 176127;176128;176129;176130;176131;176132;176133;176134;176135;176136;176137 224882;224883;224884;224885;224886;224887;224888;224889;224890;224891;224892;224893;224894 224888 12 IAIANIIDEIIEK Unmodified 1453.8392 0.83919583 1854 P04114 APOB Apolipoprotein B-100;Apolipoprotein B-48 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 164.26 164.26 2 0.00062348 171197 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.6 82.484 76685000 0 0 19028000 0 28498000 17568000 0 0 0 11591000 0 0 0 19641 1854 18452 176138;176139;176140;176141;176142;176143;176144;176145 224895;224896;224897;224898;224899;224900;224901;224902 224900 8 IAICGAISTYNR Unmodified 1337.6762 0.67617003 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.582 70.582 2 5.2876E-05 67271 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.97 85.245 2175500000 146080000 159950000 180090000 158810000 124340000 162210000 194220000 208970000 215970000 88746000 170290000 146600000 219190000 19642 3089 18453 176146;176147;176148;176149;176150;176151;176152;176153;176154;176155;176156;176157;176158 224903;224904;224905;224906;224907;224908;224909;224910;224911;224912;224913;224914;224915;224916;224917;224918;224919;224920 224915 18 IAIDLFK Unmodified 818.49019 0.49019038 1892 P05546 SERPIND1 Heparin cofactor 2 yes yes 0 0 0 1 94.601 94.601 2 0.057389 98420 QUIQUE_C1438_190116_001 70.912 26.381 18410000 0 0 0 0 18410000 0 0 0 0 0 0 0 0 19643 1892 18454 176159 224921 224921 1 IAIFGATGQTGLTTLAQAVQAGYEVTVLVR Unmodified 3047.6655 0.66553557 2299 P30043;M0R192;A0A2R8YEP4;A0A2R8Y7Y9;M0QZL1 BLVRB Flavin reductase (NADPH) yes no 0 0 0 3 178.61 178.61 3 0.00014746 183604 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.479 33.903 21049000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21049000 0 0 19644 2299 18455 176160;176161;176162 224922;224923;224924 224922 3 IAIIGAGIGGTSAAYYLR Unmodified 1765.9727 0.97266962 4435 Q9UHG3;F8W8W4 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 126.72 126.72 2;3 1.3048E-14 123718 QUIQUE_DMIX4_190116_001 130.56 111.82 1260500000 89644000 86755000 60903000 66598000 97717000 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176251;176252;176253;176254;176255;176256;176257;176258;176259;176260;176261;176262;176263;176264;176265;176266;176267 225022;225023;225024;225025;225026;225027;225028;225029;225030;225031;225032;225033;225034;225035;225036;225037;225038;225039;225040;225041;225042;225043;225044;225045;225046;225047;225048;225049;225050;225051;225052;225053;225054;225055;225056;225057;225058;225059;225060;225061;225062;225063;225064 225057 43 IAIPDASK Unmodified 813.45962 0.45961853 1669 O75935;X6RCK5;X6RLR1;X6RA56;A0A0A0MRV8 DCTN3 Dynactin subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 34.533 34.533 2 0.030205 29249 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.169 41.343 140190000 0 0 0 0 0 0 0 0 90695000 49500000 0 0 0 19653 1669 18464 176268;176269 225065;225066 225066 2 IAIPGLAGAGNSVLLVSNLNPER Unmodified 2274.2696 0.26957993 322 A0A0U1RRM4;P26599;A6NLN1;K7EK45 PTBP1 Polypyrimidine tract-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 3 2 2 2 2 149.17 149.17 2;3 2.1624E-23 154621 QUIQUE_C1368_190116_001 88.09 79.802 1673800000 109640000 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225102;225103;225104;225105;225106;225107;225108;225109;225110;225111;225112;225113;225114;225115 225103 14 IAIYELLFK Unmodified 1108.6532 0.65323296 384;2482 A0A1W2PQS6;A0A2R8Y6L3;F6U211;A0A2R8Y7H1;A0A2R8YFH6;P46783 RPS10 40S ribosomal protein S10 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.84 145.84 2 0.00011333 150395 QUIQUE_C1277_190116_001 143.12 134.7 2279100000 159690000 186510000 171690000 200190000 180090000 151770000 147240000 186540000 208120000 73428000 227730000 223580000 162490000 19656 384;2482 18467 176307;176308;176309;176310;176311;176312;176313;176314;176315;176316;176317;176318;176319;176320 225116;225117;225118;225119;225120;225121;225122;225123;225124;225125;225126;225127;225128;225129;225130;225131;225132;225133;225134;225135;225136;225137;225138 225119 23 IAKEEIFGPVQQIMK Unmodified 1729.9437 0.94367768 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 1 1 2 3 2 3 2 98.392 98.392 2;3 3.8227E-18 100822 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.66 149.93 831500000 0 0 0 0 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176342;176343;176344 225164;225165;225166 225166 1 IALALASR Unmodified 813.50724 0.50723743 4453 Q9UJ14 GGT7 Gamma-glutamyltransferase 7;Gamma-glutamyltransferase 7 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 7 light chain yes yes 0 0 0 1 50.966 50.966 2 0.032564 48880 QUIQUE_C1218_190116_001 65.252 18.901 34742000 34742000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19660 4453 18471 176345 225167 225167 1 IALDFQR Unmodified 861.47085 0.47085192 2131 P17931;G3V3R6 LGALS3 Galectin-3;Galectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.48 62.48 2 0.017387 62671 QUIQUE_C1218_190116_001 132.94 74.774 4273100000 372130000 331060000 469250000 378680000 423680000 333560000 288440000 313980000 349380000 156750000 445910000 0 410330000 19661 2131 18472 176346;176347;176348;176349;176350;176351;176352;176353;176354;176355;176356;176357 225168;225169;225170;225171;225172;225173;225174;225175;225176;225177;225178;225179;225180 225168 13 IALEDVPEK Unmodified 1012.5441 0.54407645 1507 O43148 RNMT mRNA cap guanine-N7 methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 49.436 49.436 2 0.036679 46829 QUIQUE_C1563_190116_001 54.436 31.365 48991000 0 0 0 0 0 14442000 0 0 0 0 18254000 0 16294000 19662 1507 18473 176358;176359;176360 225181;225182;225183 225181 3 IALGIPLPEIK Unmodified 1162.7325 0.73254592 2332 P31327 CPS1 Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 126.45 126.45 2 0.047469 131083 QUIQUE_C1368_190116_001 46.158 42.214 33010000 0 0 17329000 0 0 0 15681000 0 0 0 0 0 0 19663 2332 18474 176361;176362 225184;225185 225184 2 IALLEEAK Unmodified 885.51713 0.51713341 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 53.238 53.238 2 0.0064687 50529 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.64 50.745 1623000000 200480000 147260000 117830000 175800000 0 138460000 144830000 80512000 134820000 116260000 134270000 123080000 109430000 19664 434 18475 176363;176364;176365;176366;176367;176368;176369;176370;176371;176372;176373;176374;176375;176376 225186;225187;225188;225189;225190;225191;225192;225193;225194;225195;225196;225197;225198;225199;225200;225201 225201 16 IALLEEAKK Unmodified 1013.6121 0.61209643 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.62 31.62 2 0.01369 26192 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.478 41.67 388880000 0 0 0 48300000 42593000 30172000 40202000 0 94080000 0 57645000 0 75883000 19665 434 18476 176377;176378;176379;176380;176381;176382;176383;176384 225202;225203;225204;225205;225206;225207;225208;225209 225209 7 IALLEEARR Unmodified 1069.6244 0.62439245 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 40.214 40.214 2;3 0.0004984 37369 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.308 49.577 1477500000 0 0 0 0 0 0 0 468570000 420790000 0 252270000 170240000 165670000 19666 859 18477 176385;176386;176387;176388;176389;176390;176391;176392 225210;225211;225212;225213;225214;225215;225216;225217;225218;225219 225211 8 IALLPLLQAETDR Unmodified 1451.8348 0.83477916 4364;852 Q9P0J0;B4DEZ3;K7EJE1;U3KQP3;E7ENQ6 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 no no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 138.78 138.78 2;3 7.2724E-06 143861 QUIQUE_C1368_190116_001 92.925 80.299 1375400000 240750000 141170000 136850000 93084000 87331000 215210000 110900000 34189000 54373000 48504000 72576000 64027000 76436000 19667 4364;852 18478 176393;176394;176395;176396;176397;176398;176399;176400;176401;176402;176403;176404;176405;176406;176407;176408;176409;176410;176411;176412;176413;176414 225220;225221;225222;225223;225224;225225;225226;225227;225228;225229;225230;225231;225232;225233;225234;225235;225236;225237;225238;225239;225240;225241;225242;225243;225244;225245;225246 225229 22 IALLPLLQAETDRR Unmodified 1607.9359 0.93589019 4364;852 Q9P0J0;B4DEZ3;K7EJE1;U3KQP3;E7ENQ6 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 115.72 115.72 2;3 9.2478E-48 120954 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.32 147.29 4100900000 276990000 245770000 315280000 170750000 197900000 187440000 283920000 285690000 410220000 129060000 585160000 469920000 542780000 19668 4364;852 18479 176415;176416;176417;176418;176419;176420;176421;176422;176423;176424;176425;176426;176427;176428 225247;225248;225249;225250;225251;225252;225253;225254;225255;225256;225257;225258;225259;225260;225261;225262;225263;225264;225265;225266;225267;225268;225269;225270;225271;225272 225266 26 IALLQSLLDDANLR Unmodified 1553.8777 0.8777066 3500 Q86VS8;H0YE69 HOOK3 Protein Hook homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.7 156.7 2 4.8122E-05 161378 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.39 84.268 860610000 92009000 57813000 45621000 80998000 63593000 64080000 104950000 69313000 31589000 12527000 57055000 149360000 31706000 19669 3500 18480 176429;176430;176431;176432;176433;176434;176435;176436;176437;176438;176439;176440;176441 225273;225274;225275;225276;225277;225278;225279;225280;225281;225282;225283;225284;225285 225281 11 IALQLDDGSR Unmodified 1086.5669 0.56693715 4082 Q9BZE9;J3QR12;J3QL04;J3QR50;J3QRW3;J3KRG1 ASPSCR1 Tether containing UBX domain for GLUT4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 58.355 58.355 2 0.029295 57272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.378 24.771 35986000 0 0 0 35986000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19670 4082 18481 176442;176443;176444;176445 225286;225287;225288;225289 225288 3 IALVITDGR Unmodified 956.56548 0.56548059 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.398 65.398 2 9.1646E-05 65082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.38 60.131 3199300000 252710000 189990000 168160000 275080000 424730000 380970000 200390000 217010000 219220000 128070000 248030000 240610000 254330000 19671 96 18482 176446;176447;176448;176449;176450;176451;176452;176453;176454;176455;176456;176457;176458 225290;225291;225292;225293;225294;225295;225296;225297;225298;225299;225300;225301;225302;225303;225304;225305 225300 15 IALYCHQLNICSK Unmodified 1618.796 0.79596759 2250;2369 P35221;G3XAM7;P26232;A0A0A0MRI5 CTNNA1;CTNNA2 Catenin alpha-1;Catenin alpha-2 no no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 64.704 64.704 2;3 9.8071E-08 64732 QUIQUE_C1576_190116_001 132.25 117.28 2688600000 182410000 242440000 286580000 381330000 0 281770000 336260000 0 195320000 0 192930000 299680000 289900000 19672 2369;2250 18483 176459;176460;176461;176462;176463;176464;176465;176466;176467;176468;176469;176470;176471;176472;176473;176474;176475 225306;225307;225308;225309;225310;225311;225312;225313;225314;225315;225316;225317;225318;225319;225320;225321;225322;225323 225314 9 IALYELMK Unmodified 979.54124 0.54123967 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.162 99.162 2 0.021461 102690 QUIQUE_C1576_190116_001 75.109 50.111 173120000 0 29798000 28905000 29277000 0 20814000 28373000 0 12859000 0 0 23089000 0 19673 310;830 18484 176476;176477;176478;176479;176480;176481;176482 225324;225325;225326;225327;225328;225329;225330 225328 7 IALYETPTGWK Unmodified 1277.6656 0.66558856 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.329 89.329 2 3.2127E-12 87059 QUIQUE_DMIX4_190116_001 159.37 134.23 8604400000 744090000 0 0 937370000 750760000 692080000 750550000 913830000 0 428330000 1210500000 919100000 1257800000 19674 2400 18485 176483;176484;176485;176486;176487;176488;176489;176490;176491;176492;176493;176494 225331;225332;225333;225334;225335;225336;225337;225338;225339;225340;225341;225342;225343;225344;225345;225346;225347;225348;225349;225350 225343 20 IALYGLGSIPDER Unmodified 1402.7456 0.7456298 1053 F8W7U8;P49959;F5GXT0 MRE11A Double-strand break repair protein MRE11A yes no 0 0 0 1 1 111.38 111.38 2 0.02023 115433 QUIQUE_C1368_190116_001 57.347 32.509 37760000 0 0 0 0 37760000 0 0 0 0 0 0 0 0 19675 1053 18486 176495;176496 225351;225352 225351 1 IAMENDDGRTEEEK Unmodified 1635.7046 0.7046292 3714 Q8WWM7;H3BUF6;H3BSK9 ATXN2L Ataxin-2-like protein yes no 0 0 1 1 19.104 19.104 3 0.050939 11648 QUIQUE_C1403_190116_001 48.527 42.05 37850000 0 0 0 37850000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19676 3714 18487 176497 225353 225353 0 IAMLEPLTVDLNPQYYLLVNR Unmodified 2474.3243 0.32431761 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 166.47 166.47 2;3 2.1227E-13 168344 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.28 109.26 185390000 26085000 27093000 0 12808000 19672000 19784000 17123000 39523000 0 0 0 0 23298000 19677 348 18488 176498;176499;176500;176501;176502;176503;176504;176505;176506;176507;176508 225354;225355;225356;225357;225358;225359;225360;225361;225362;225363;225364 225363 9 IAMQTLDMGR Unmodified 1134.5525 0.55254942 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 66.575 66.575 2 0.011309 67134 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.507 44.794 229340000 0 0 0 0 0 0 60158000 0 0 0 104380000 0 64797000 19678 2105 18489 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H7BXH2;E9PKF6;Q5H9R7;E9PQP7;H0YEN2;H0YDW1 PPP6R3 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 17.353 17.353 2 0.011004 9692 QUIQUE_C1576_190116_001 61.765 43.502 15820000 0 0 0 0 0 0 15820000 0 0 0 0 0 0 19682 952 18493 176516;176517 225373;225374 225374 2 IANDNSLNHEYLPILGLAEFR Unmodified 2398.2281 0.22810904 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 3 3 3 144.54 144.54 2;3 1.7737E-208 149263 QUIQUE_C1277_190116_001 300.18 279.23 23036000000 1891100000 2013700000 1858300000 1397600000 1744800000 1764100000 1674700000 1729500000 1662300000 821980000 2500000000 2053700000 1924300000 19683 2120 18494 176518;176519;176520;176521;176522;176523;176524;176525;176526;176527;176528;176529;176530;176531;176532;176533;176534;176535;176536;176537;176538;176539;176540;176541;176542;176543;176544;176545;176546;176547;176548 225375;225376;225377;225378;225379;225380;225381;225382;225383;225384;225385;225386;225387;225388;225389;225390;225391;225392;225393;225394;225395;225396;225397;225398;225399;225400;225401;225402;225403;225404;225405;225406;225407;225408;225409;225410;225411;225412;225413;225414;225415;225416;225417;225418;225419;225420;225421;225422;225423;225424;225425;225426;225427;225428 225383 53 IANELLLTER Unmodified 1170.6608 0.66083754 656 F8W1R0;B7Z493;E9PJX4;F8VWL3;Q96M96;H0YDQ0;E9PNX0 FGD4 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 72.583 72.583 2 0.013656 72974 QUIQUE_C1403_190116_001 64.841 28.08 90429000 0 0 0 26966000 0 0 0 0 31625000 0 31837000 0 0 19684 656 18495 176549;176550;176551;176552 225429;225430;225431;225432 225429 4 IANEVIGEMNLKPEEVFLAQGTLRPDLIESASLVASGK Unmodified 4038.1347 0.13473251 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 157.34 157.34 4 3.7732E-23 163107 QUIQUE_C1218_190116_001 80.048 72.368 570010000 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670320000 0 0 0 0 0 0 0 154640000 114020000 0 161680000 121200000 118790000 19687 1961 18498 176573;176574;176575;176576;176577;176578;176579;176580;176581;176582 225453;225454;225455;225456;225457;225458;225459;225460;225461;225462;225463 225453 11 IANLQTDLSDGLR Unmodified 1414.7416 0.74160705 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.755 89.755 2 0.00042745 90953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.42 96.737 998050000 0 0 136210000 0 0 100090000 0 160880000 152320000 96605000 164420000 187530000 0 19688 2178 18499 176583;176584;176585;176586;176587;176588;176589 225464;225465;225466;225467;225468;225469;225470 225466 6 IANPVEGSSGR Unmodified 1085.5465 0.54653606 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.35 23.35 2 0.00075517 16908 QUIQUE_C1438_190116_001 96.143 71.988 2819500000 243180000 266600000 0 334280000 326720000 261280000 285140000 292080000 383190000 0 0 0 427060000 19689 3130 18500 176590;176591;176592;176593;176594;176595;176596;176597;176598;176599 225471;225472;225473;225474;225475;225476;225477;225478;225479;225480;225481 225474 10 IANPVEGSTDR Unmodified 1157.5677 0.56766543 3131;1044 F8VZX2;H3BRU6;Q15366;H3BSS4 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.245 28.245 2 0.00043473 22677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.15 80.77 3525200000 216520000 304370000 263630000 359710000 282830000 321550000 278780000 274160000 278950000 83682000 286040000 240220000 334710000 19690 1044;3131 18501 176600;176601;176602;176603;176604;176605;176606;176607;176608;176609;176610;176611;176612 225482;225483;225484;225485;225486;225487;225488;225489;225490;225491;225492;225493;225494;225495;225496;225497;225498;225499;225500 225498 19 IAPAFSSMSNK Oxidation (M) 1167.5594 0.55940893 1526 O43396;K7ER96;K7EML9;K7EPB7 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 1 0 1 24.588 24.588 2 0.010544 18226 QUIQUE_C1368_190116_001 63.734 33.659 51906000 0 0 51906000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19691 1526 18502 176613 225501 225501 834 1 IAPAFSSMSNK Unmodified 1151.5645 0.56449431 1526 O43396;K7ER96;K7EML9;K7EPB7 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 43.277 43.277 2 0.028817 41012 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.765 34.139 288950000 0 0 0 0 0 0 0 0 71138000 0 105810000 0 112000000 19692 1526 18502 176614;176615;176616 225502;225503;225504 225503 3 IAPELYHK Unmodified 969.52837 0.5283668 3103 Q15046 KARS Lysine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 22.049 22.049 2 0.016964 15407 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.305 18.999 104040000 0 0 0 29430000 0 0 0 0 0 0 45946000 28667000 0 19693 3103 18503 176617;176618;176619 225505;225506;225507 225507 3 IAPESAIK Unmodified 827.47527 0.4752686 3368;1368 Q6KCM7;M0QZP9;M0QZJ5;Q9BV35;M0QZT4;M0R1W8 SLC25A25;SLC25A23 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2;Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 21.729 21.729 2 0.031416 14713 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.073 15.946 496480000 0 0 120820000 0 0 0 0 0 0 0 158200000 118170000 99283000 19694 3368;1368 18504 176620;176621;176622;176623 225508;225509;225510;225511 225511 3 IAPLAEGALPYNLAELQR Unmodified 1938.0575 0.057461885 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 134.12 134.12 2;3 8.798E-32 136990 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.11 136.24 5203600000 437920000 417490000 371050000 379290000 213310000 288470000 379550000 430560000 473230000 256390000 635300000 569610000 351420000 19695 1655 18505 176624;176625;176626;176627;176628;176629;176630;176631;176632;176633;176634;176635;176636;176637;176638;176639;176640;176641 225512;225513;225514;225515;225516;225517;225518;225519;225520;225521;225522;225523;225524;225525;225526;225527;225528;225529;225530;225531;225532;225533;225534;225535 225522 24 IAPLEEGTLPFNLAEAQR Unmodified 1968.0316 0.031641065 4459 Q9UJS0 SLC25A13 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 2 132.81 132.81 2;3 1.1396E-104 137625 QUIQUE_C1368_190116_001 215.02 194.64 1357100000 125250000 81647000 111700000 118110000 103540000 96483000 124210000 83216000 144880000 44955000 114360000 112890000 95856000 19696 4459 18506 176642;176643;176644;176645;176646;176647;176648;176649;176650;176651;176652;176653;176654;176655;176656;176657;176658;176659;176660;176661;176662;176663;176664;176665;176666;176667 225536;225537;225538;225539;225540;225541;225542;225543;225544;225545;225546;225547;225548;225549;225550;225551;225552;225553;225554;225555;225556;225557;225558;225559;225560;225561;225562;225563;225564;225565;225566;225567;225568;225569 225542 31 IAPPEAPVTGYMFGK Unmodified 1576.796 0.79595081 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 105.26 105.26 2 0.01384 110165 QUIQUE_C1438_190116_001 51.013 17.262 66371000 0 0 0 0 66371000 0 0 0 0 0 0 0 0 19697 1974 18507 176668 225570 225570 1 IAPRPPNSAQMYNFTSFAMVLNEVDKDMESVIPK Unmodified 3838.8732 0.87323821 4066 Q9BXW6;J3QSB8 OSBPL1A Oxysterol-binding protein-related protein 1 yes no 0 0 2 1 1 1 168.66 168.66 4 4.7077E-10 176070 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.302 54.103 283680000 0 0 0 0 0 0 0 68644000 0 0 96155000 118880000 0 19698 4066 18508 176669;176670;176671 225571;225572;225573 225572 3 IAPSFAVESIEDALK Unmodified 1588.8348 0.83483874 2332 P31327 CPS1 Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 144.52 144.52 2 0.0053177 149775 QUIQUE_C1368_190116_001 58.754 43.377 106060000 0 0 54641000 25073000 0 0 0 26350000 0 0 0 0 0 19699 2332 18509 176672;176673;176674 225574;225575;225576 225574 3 IAPVFFR Unmodified 848.49086 0.49085908 3373 Q6NVY1;B8ZZZ0;H7BYI7 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.409 76.409 2 0.019175 76987 QUIQUE_C1368_190116_001 112.27 56.012 1510300000 137500000 172530000 166880000 0 147740000 101350000 147560000 116890000 187070000 72214000 0 148410000 112200000 19700 3373 18510 176675;176676;176677;176678;176679;176680;176681;176682;176683;176684;176685 225577;225578;225579;225580;225581;225582;225583;225584;225585;225586;225587;225588;225589;225590 225579 14 IAPVHIDTESISALIK Unmodified 1705.9614 0.96143623 4291 Q9NTI5 PDS5B Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.5 115.5 3 0.0014164 119515 QUIQUE_C1368_190116_001 56.339 37.51 148510000 16106000 20707000 22020000 0 22897000 0 19003000 13091000 16067000 0 18619000 0 0 19701 4291 18511 176686;176687;176688;176689;176690;176691;176692;176693 225591;225592;225593;225594;225595;225596;225597;225598 225593 8 IAPWIMTPNILPPVSVFVCCMK Oxidation (M) 2588.3027 0.30273601 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 1 0 1 1 167.63 167.63 3 6.8672E-06 169827 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.251 63.836 183300000 0 0 0 0 0 0 0 95034000 88263000 0 0 0 0 19702 4560 18512 176694;176695 225599;225600 225599 3012;3013 2 IAPWIMTPNILPPVSVFVCCMK Unmodified 2572.3078 0.30782139 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 2 1 2 170.17 170.17 2;3 0.00012931 174543 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.059 46.555 280410000 0 0 0 0 0 0 0 0 134130000 0 32414000 0 113860000 19703 4560 18512 176696;176697;176698;176699;176700 225601;225602;225603;225604;225605;225606 225601 6 IAPYSVEIK Unmodified 1018.5699 0.56989727 2813 P78527;F5GX40 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes no 0 0 0 1 56.451 56.451 2 0.062233 55940 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.349 13.536 22190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22190000 0 0 19704 2813 18513 176701 225607 225607 1 IAPYVAHNFSK Unmodified 1245.6506 0.6506072 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 33.259 33.259 2;3 0.0023872 27889 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.655 55.227 314340000 0 60733000 0 0 196070000 0 0 42033000 0 15505000 0 0 0 19705 2026 18514 176702;176703;176704;176705 225608;225609;225610;225611 225611 4 IAQDAFDDVVK Unmodified 1219.6085 0.60846762 3921 Q96PY5;C9IZY8 FMNL2 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element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.483 34.483 2 0.0015727 28982 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.027 54.135 401090000 69017000 0 0 0 0 0 0 49788000 61264000 36237000 103640000 81142000 0 19714 909 18521 176790;176791;176792;176793;176794;176795;176796 225735;225736;225737;225738;225739;225740;225741 225739 3 IAQLEEELEEEQGNTELINDR Unmodified 2471.1664 0.16635622 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 118.95 118.95 2;3 8.4528E-113 124059 QUIQUE_C1218_190116_001 268.92 250.19 1893700000 139350000 140350000 146150000 259180000 197500000 118000000 144300000 146090000 138940000 75307000 164270000 175510000 48758000 19715 2378 18522 176797;176798;176799;176800;176801;176802;176803;176804;176805;176806;176807;176808;176809;176810;176811;176812;176813;176814;176815;176816;176817;176818;176819;176820;176821;176822 225742;225743;225744;225745;225746;225747;225748;225749;225750;225751;225752;225753;225754;225755;225756;225757;225758;225759;225760;225761;225762;225763;225764;225765;225766;225767;225768;225769;225770;225771;225772;225773;225774;225775 225742 33 IAQLEEELEEEQSNMELLNDR Unmodified 2531.1697 0.16972704 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 140.82 140.82 2;3 8.5684E-43 145059 QUIQUE_C1277_190116_001 150.57 131.74 181150000 49622000 0 50404000 0 0 25027000 0 0 0 0 56100000 0 0 19716 2379 18523 176823;176824;176825;176826;176827 225776;225777;225778;225779;225780 225777 5 IAQLEEQLDNETK Unmodified 1529.7573 0.7573167 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.979 64.979 2 4.9182E-08 63865 QUIQUE_C1403_190116_001 168.22 148.08 1789200000 147020000 122750000 182780000 263460000 195640000 140500000 182430000 152990000 154970000 118150000 0 128470000 0 19717 2378 18524 176828;176829;176830;176831;176832;176833;176834;176835;176836;176837;176838 225781;225782;225783;225784;225785;225786;225787;225788;225789;225790;225791;225792 225784 12 IAQLEEQVEQEAR Unmodified 1541.7686 0.76855009 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 68.61 68.61 2 5.438E-13 69409 QUIQUE_C1218_190116_001 155.97 101.9 361140000 65049000 122630000 78805000 0 0 0 0 0 0 26722000 0 67941000 0 19718 2385 18525 176839;176840;176841;176842;176843;176844 225793;225794;225795;225796;225797;225798;225799 225793 6 IAQLICER Unmodified 1001.5328 0.53280025 2356 P33316;H0YNW5;H0YKC5;A0A0C4DGL3;H0YMP1 DUT Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 41.827 41.827 2 0.052624 36323 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.877 31.609 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19719 2356 18526 176845 225800 225800 1 IAQLQEALLHCGK Unmodified 1479.7868 0.78678311 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;A0A0A6YYJ5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 65.279 65.279 3 0.00010709 64507 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.959 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225812;225813;225814;225815;225816;225817;225818;225819;225820;225821 225819 7 IAQSAELADR Unmodified 1072.5513 0.55128709 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;A0A0A6YYJ5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 23.349 23.349 2 0.020467 16577 QUIQUE_C1563_190116_001 71.349 38.509 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19723 1187 18530 176867 225822 225822 1 IAQSAELADREK Unmodified 1329.6888 0.6888432 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;A0A0A6YYJ5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 1 1 1 18.564 18.564 2 0.0061688 11016 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.896 55.978 55127000 0 0 0 0 0 0 0 17941000 0 0 37186000 0 0 19724 1187 18531 176868;176869 225823;225824 225824 2 IAQSDYIPTQQDVLR Unmodified 1745.8948 0.89481323 1870 P04899 GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.969 87.969 2 5.7268E-13 89292 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.93 122.7 9221900000 750460000 692920000 846560000 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Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 111.86 111.86 2 0.006297 117002 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.574 42.338 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19728 1802 18535 176887;176888 225844;225845 225845 2 IASATHNIYAYR Unmodified 1378.6993 0.69934831 500 A0A3B3ITH3;Q9P2X3 IMPACT Protein IMPACT yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 32.215 32.215 3 0.00020154 27187 QUIQUE_C1277_190116_001 75.479 55.272 449230000 128510000 58112000 0 0 62648000 46139000 68876000 0 0 0 0 0 84940000 19729 500 18536 176889;176890;176891;176892;176893;176894;176895 225846;225847;225848;225849;225850;225851;225852;225853 225847 8 IASDEEIQGTK Unmodified 1189.5826 0.5826468 3716 Q8WX93;A0A3B3ISX8 PALLD Palladin yes no 0 0 0 1 1 21.661 21.661 2 0.00085274 14723 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.087 19.239 100480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100480000 0 0 0 19730 3716 18537 176896;176897 225854;225855 225854 2 IASFPTAK Unmodified 833.4647 0.46470391 1011 H0Y8R1;F5H5I6;H0YAK1;Q12849 GRSF1 G-rich sequence factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 30.821 30.821 2 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176903;176904;176905;176906;176907;176908;176909;176910;176911;176912;176913;176914;176915;176916;176917;176918;176919;176920;176921;176922;176923;176924 225861;225862;225863;225864;225865;225866;225867;225868;225869;225870;225871;225872;225873;225874;225875;225876;225877;225878;225879;225880;225881;225882;225883;225884;225885;225886;225887;225888;225889;225890;225891;225892;225893;225894;225895;225896;225897;225898;225899;225900;225901;225902 225890 40 IASHPILCR Unmodified 1065.5753 0.57533377 1715 O95219;F8W9T3 SNX4 Sorting nexin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.669 19.669 3 0.012883 12299 QUIQUE_C1563_190116_001 43.442 10.064 119930000 0 0 0 0 0 39403000 0 0 0 0 41968000 38557000 0 19734 1715 18541 176925;176926;176927;176928 225903;225904;225905;225906 225903 4 IASHYYITNDTVQTYNQLLKPTLSEIELFR Unmodified 3569.8406 0.8405994 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 1 1 1 1 152 152 4 6.4204E-25 159245 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.48 84.598 169720000 0 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domain-containing protein 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.82 121.82 2 4.2359E-06 124610 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.46 79.712 376820000 39485000 49168000 33707000 42385000 42195000 0 33725000 29986000 37896000 0 0 35865000 32404000 19738 4255 18545 176940;176941;176942;176943;176944;176945;176946;176947;176948;176949;176950 225919;225920;225921;225922;225923;225924;225925;225926;225927;225928;225929 225925 9 IASLPVEVQEVSLLDK Unmodified 1738.9717 0.97166657 248 A0A0C4DGQ6;Q96P16;K7EP82 RPRD1A Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 131.14 131.14 2 6.6752E-05 135745 QUIQUE_C1368_190116_001 113.65 82.218 199510000 34453000 37550000 44835000 19861000 27601000 0 35211000 0 0 0 0 0 0 19739 248 18546 176951;176952;176953;176954;176955;176956;176957 225930;225931;225932;225933;225934;225935;225936 225932 6 IASMAPGALLLEAQK Unmodified 1511.8381 0.83814998 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 108.52 108.52 2 0.043316 111507 QUIQUE_C1403_190116_001 49.448 34.304 25188000 0 0 0 25188000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19740 4140 18547 176958 225937 225937 0 IASMAPGALLLEAQKEYEK Unmodified 2061.0816 0.081627725 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 1 1 119.77 119.77 3 0.050488 122309 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.121 24.384 23363000 0 0 0 0 0 0 0 23363000 0 0 0 0 0 19741 4140 18548 176959 225938 225938 1 IASPEGQDYLK Unmodified 1219.6085 0.60846762 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.258 50.258 2 0.0002806 48039 QUIQUE_C1368_190116_001 120.12 55.081 1369600000 0 0 225650000 0 205830000 0 213030000 0 0 0 292260000 236990000 195810000 19742 4593 18549 176960;176961;176962;176963;176964;176965 225939;225940;225941;225942;225943;225944 225939 6 IASQMITEGR Unmodified 1104.5597 0.55974328 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7;D6RD63 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.307 35.307 2 0.00048744 31318 QUIQUE_C1218_190116_001 128.86 64.1 887480000 144530000 153540000 158000000 142030000 0 0 121430000 121840000 0 46122000 0 0 0 19743 824 18550 176966;176967;176968;176969;176970;176971;176972 225945;225946;225947;225948;225949;225950;225951;225952 225945 5 IASQVAALDLGYKPGVEAIR Unmodified 2070.1473 0.14733952 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 96.871 96.871 2;3 7.1593E-37 100580 QUIQUE_C1218_190116_001 161.66 120.26 8850700000 971810000 815060000 981480000 609320000 576370000 733260000 767420000 309150000 655350000 400310000 779110000 651290000 600790000 19744 2280 18551 176973;176974;176975;176976;176977;176978;176979;176980;176981;176982;176983;176984;176985;176986;176987;176988;176989;176990;176991;176992;176993;176994;176995;176996;176997;176998 225953;225954;225955;225956;225957;225958;225959;225960;225961;225962;225963;225964;225965;225966;225967;225968;225969;225970;225971;225972;225973;225974;225975;225976;225977;225978;225979;225980;225981;225982;225983;225984;225985 225955 33 IASSEFADDPCSSVK Unmodified 1611.7087 0.70865195 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.119 55.119 2 2.4873E-24 54033 QUIQUE_C1218_190116_001 156.69 143.33 2112700000 193630000 234390000 224330000 225800000 179900000 214100000 255160000 54482000 89846000 59353000 104190000 134490000 143060000 19745 2250 18552 176999;177000;177001;177002;177003;177004;177005;177006;177007;177008;177009;177010;177011 225986;225987;225988;225989;225990;225991;225992;225993;225994;225995;225996;225997;225998;225999;226000;226001;226002 225987 17 IASSEFADDPCSSVKR Unmodified 1767.8098 0.80976297 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 1 1 41.964 41.964 3 0.044975 38558 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.488 16.048 50019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50019000 0 19746 2250 18553 177012 226003;226004 226003 2 IASTLLLYQELMR Unmodified 1549.8538 0.85380004 4431 Q9UHD2 TBK1 Serine/threonine-protein kinase TBK1 yes yes 0 0 0 1 142.59 142.59 2 0.0017551 147571 QUIQUE_C1218_190116_001 77.64 63.221 16800000 16800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19747 4431 18554 177013 226005 226005 1 IASWADLVNAHVVPGSGVVK Unmodified 2018.0949 0.094910023 2012 P11172 UMPS Uridine 5'-monophosphate synthase;Orotate phosphoribosyltransferase;Orotidine 5'-phosphate decarboxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.09 123.09 3 2.4836E-06 128594 QUIQUE_C1576_190116_001 82.586 73.539 903890000 65715000 73020000 87662000 0 69699000 66969000 62699000 75832000 84866000 33626000 90203000 80968000 112630000 19748 2012 18555 177014;177015;177016;177017;177018;177019;177020;177021;177022;177023;177024;177025 226006;226007;226008;226009;226010;226011;226012;226013;226014;226015;226016;226017;226018;226019;226020 226013 12 IATCLELR Unmodified 974.5219 0.52190122 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 52.628 52.628 2 0.0057754 50316 QUIQUE_C1368_190116_001 104.21 28.174 297860000 0 50633000 57421000 0 0 73928000 47863000 0 68015000 0 0 0 0 19749 3807 18556 177026;177027;177028;177029;177030;177031 226021;226022;226023;226024;226025;226026 226022 6 IATEKDFLEAVNK Unmodified 1476.7824 0.78240924 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 1 73.709 73.709 2;3 8.3344E-31 74192 QUIQUE_DMIX1_190116_001 183.08 144.81 684530000 34696000 102760000 0 29111000 53206000 0 0 169970000 39876000 0 67740000 133960000 53203000 19750 2389 18557 177032;177033;177034;177035;177036;177037;177038;177039;177040;177041;177042;177043 226027;226028;226029;226030;226031;226032;226033;226034;226035;226036;226037;226038 226033 11 IATFPGMWER Unmodified 1206.5856 0.5855641 3422 Q6YP21 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 99.395 99.395 2 0.0035536 102223 QUIQUE_C1403_190116_001 83.948 55.549 170880000 0 0 46796000 40474000 0 0 23747000 0 0 0 0 0 59865000 19751 3422 18558 177044;177045;177046;177047;177048 226039;226040;226041;226042;226043 226040 4 IATGHGQQGVTQVVLK Unmodified 1634.9104 0.91040372 533 A6NEM2;P51610 HCFC1 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.409 35.409 3 2.6902E-06 31939 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.563 57.9 413110000 0 54407000 0 48142000 41360000 28148000 26974000 50146000 51348000 0 53214000 31294000 28079000 19752 533 18559 177049;177050;177051;177052;177053;177054;177055;177056;177057;177058 226044;226045;226046;226047;226048;226049;226050;226051;226052;226053 226049 10 IATGSFLK Unmodified 835.48035 0.48035398 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 46.401 46.401 1;2 0.014579 43665 QUIQUE_C1218_190116_001 85.813 50.18 764690000 267290000 0 0 0 0 0 51431000 0 327430000 118540000 0 0 0 19753 2195 18560 177059;177060;177061;177062 226054;226055;226056;226057 226054 3 IATIPAFGTIMETVIQR Unmodified 1860.0179 0.017905256 426 A0A2R8Y566;Q9P260 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 3 159.78 159.78 2;3 2.6225E-05 166239 QUIQUE_C1438_190116_001 93.51 76.571 183620000 20545000 28465000 12298000 14231000 29848000 9091100 15191000 10010000 0 0 0 16204000 27738000 19754 426 18561 177063;177064;177065;177066;177067;177068;177069;177070;177071;177072;177073;177074;177075;177076 226058;226059;226060;226061;226062;226063;226064;226065;226066;226067;226068;226069;226070;226071;226072 226064 14 IATITTTHTPSQQGTQETR Unmodified 2070.0342 0.03416026 1237 H7C4U7;H7C535;Q96QZ7;A0A087WXD2;H7C5T8;A0A087WT53 MAGI1 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 24.171 24.171 3 8.1287E-17 17846 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.89 87.17 72568000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72568000 19755 1237 18562 177077;177078 226073;226074 226074 2 IATLASGLEVGK Unmodified 1157.6656 0.66558856 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.841 69.841 2 2.764E-05 69854 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.97 100.04 3126800000 170500000 177000000 370590000 276300000 285130000 239030000 365980000 133600000 268950000 60614000 312640000 162270000 304200000 19756 1371 18563 177079;177080;177081;177082;177083;177084;177085;177086;177087;177088;177089;177090;177091 226075;226076;226077;226078;226079;226080;226081;226082;226083;226084;226085;226086;226087;226088;226089;226090;226091;226092;226093;226094 226086 20 IATLASGLEVGR Unmodified 1185.6717 0.67173657 590 B1AKY9;P50993 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.155 74.155 2 0.0038048 75050 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.03 41.363 2220700000 196630000 126600000 215410000 179840000 163130000 115290000 117530000 303760000 212950000 64794000 210760000 163410000 150580000 19757 590 18564 177092;177093;177094;177095;177096;177097;177098;177099;177100;177101;177102;177103;177104 226095;226096;226097;226098;226099;226100;226101;226102;226103;226104;226105;226106;226107;226108;226109 226105 15 IATLDMSSDQIAANLQAVINEVCR Unmodified 2631.2996 0.29963578 4073 Q9BYD6 MRPL1 39S ribosomal protein L1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 169.92 169.92 3 9.3457E-12 173535 QUIQUE_C1277_190116_001 90.308 79.765 23888000 0 23888000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19758 4073 18565 177105 226110 226110 1 IATLGYLPTQQDVLR Unmodified 1686.9305 0.93047046 2294 P29992;K7EL62;A0A087WVZ3 GNA11 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 yes no 0 0 0 1 1 1 111.96 111.96 2 1.1342E-05 116590 QUIQUE_C1218_190116_001 100.93 83.989 792290000 263950000 271200000 0 0 0 0 0 0 257140000 0 0 0 0 19759 2294 18566 177106;177107;177108 226111;226112;226113 226111 3 IATLISSFLK Unmodified 1091.659 0.65904662 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.04 124.04 2 0.0018716 128270 QUIQUE_C1403_190116_001 107.57 46.893 1486100000 105860000 113050000 163270000 135970000 153180000 141350000 107940000 42825000 93322000 85358000 124960000 91732000 127270000 19760 1728 18567 177109;177110;177111;177112;177113;177114;177115;177116;177117;177118;177119;177120;177121 226114;226115;226116;226117;226118;226119;226120;226121;226122;226123;226124;226125;226126;226127;226128 226118 15 IATSLDGFDVASVQQQR Unmodified 1833.9221 0.92209062 1586 O60664;K7ERZ3 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.85 101.85 2 4.4179E-30 104654 QUIQUE_DMIX7_190116_001 153.38 136.85 1512300000 0 0 0 193700000 0 154940000 0 322340000 272100000 0 0 202010000 367190000 19761 1586 18568 177122;177123;177124;177125;177126;177127 226129;226130;226131;226132;226133;226134;226135 226134 7 IATTAEPADKVK Unmodified 1242.682 0.68196691 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 1 1 15.031 15.031 3 0.022926 7309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.183 24.387 26191000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26191000 0 0 19762 2882 18569 177128 226136 226136 1 IAVAAQNCYK Unmodified 1136.5648 0.56482866 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.119 26.119 2 4.1437E-23 19923 QUIQUE_C1277_190116_001 189.62 143.19 69386000000 5655600000 6963100000 5049900000 5848900000 5407600000 5719500000 5520100000 5074200000 4484300000 2045700000 7325000000 4670700000 5621200000 19763 2688 18570 177129;177130;177131;177132;177133;177134;177135;177136;177137;177138;177139;177140;177141 226137;226138;226139;226140;226141;226142;226143;226144;226145;226146;226147;226148;226149;226150;226151;226152;226153;226154;226155;226156;226157;226158;226159;226160;226161;226162;226163;226164;226165 226139 29 IAVAGAQHYLSAILR Unmodified 1581.8991 0.89911075 1038 F8VW41;Q86VP3 PACS2 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 107.01 107.01 3 4.2619E-05 112819 QUIQUE_C1218_190116_001 82.55 49.355 89655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89655000 19764 1038 18571 177142;177143 226166;226167 226166 1 IAVAHNGELVNAAR Unmodified 1433.7739 0.77391024 2899 Q06203;D6RCC8 PPAT Amidophosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 31.842 31.842 2;3 0.00035624 26655 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.42 62.106 528420000 77090000 33316000 29947000 47786000 40400000 38715000 35432000 59573000 51462000 24856000 52693000 37147000 0 19765 2899 18572 177144;177145;177146;177147;177148;177149;177150;177151;177152;177153;177154;177155;177156;177157;177158 226168;226169;226170;226171;226172;226173;226174;226175;226176;226177;226178;226179;226180;226181;226182 226178 13 IAVAQYSDDVK Unmodified 1207.6085 0.60846762 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 48.738 48.738 2 0.00043855 44400 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.7 68.255 518980000 0 89096000 0 195310000 0 0 0 0 0 91434000 143150000 0 0 19766 2037 18573 177159;177160;177161;177162;177163 226183;226184;226185;226186;226187 226186 3 IAVAQYSDDVKVESR Unmodified 1678.8526 0.85261407 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 54.505 54.505 3 0.0031141 53033 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.591 46.296 244330000 0 0 0 0 0 0 0 59893000 43290000 0 51106000 39436000 50606000 19767 2037 18574 177164;177165;177166;177167;177168 226188;226189;226190;226191;226192 226191 5 IAVDELFTSLR Unmodified 1262.6871 0.68705229 3695 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226228;226229;226230;226231;226232;226233;226234;226235;226236;226237;226238;226239;226240;226241;226242;226243;226244;226245;226246;226247;226248;226249;226250;226251;226252;226253;226254;226255;226256;226257;226258;226259;226260;226261;226262;226263;226264;226265;226266;226267;226268;226269;226270;226271;226272;226273;226274;226275;226276;226277;226278;226279;226280;226281;226282;226283;226284;226285;226286;226287;226288;226289;226290;226291;226292;226293;226294;226295;226296;226297;226298;226299;226300;226301;226302;226303;226304;226305;226306;226307;226308;226309;226310;226311;226312;226313;226314;226315;226316;226317;226318;226319;226320;226321;226322;226323;226324;226325;226326;226327;226328;226329;226330;226331;226332;226333;226334;226335;226336;226337;226338;226339;226340;226341;226342;226343;226344;226345;226346;226347;226348;226349;226350;226351;226352;226353;226354;226355;226356;226357;226358;226359;226360;226361;226362;226363;226364;226365;226366;226367;226368;226369;226370;226371;226372;226373;226374;226375;226376;226377;226378;226379;226380;226381;226382;226383;226384;226385;226386;226387;226388;226389;226390;226391;226392;226393;226394;226395;226396;226397;226398;226399;226400;226401;226402;226403;226404;226405;226406;226407;226408;226409;226410;226411;226412;226413 226343 182 IAVGSDADVVIWDPDK Unmodified 1698.8465 0.84646606 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 118.09 118.09 2 4.3767E-09 114752 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.45 103.32 621480000 0 0 308650000 0 0 237320000 0 0 0 75498000 0 0 0 19773 3050 18580 177284;177285;177286;177287 226414;226415;226416;226417;226418;226419;226420 226419 6 IAVGSDADVVIWDPDKLK Unmodified 1940.0255 0.025493054 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 113.3 113.3 2;3 2.6738E-32 116956 QUIQUE_DMIX3_190116_001 203.87 178.17 21650000000 1607800000 1809700000 1740700000 1583500000 1623300000 1232500000 1891800000 1469100000 1891800000 612650000 2209900000 2043900000 1933100000 19774 3050 18581 177288;177289;177290;177291;177292;177293;177294;177295;177296;177297;177298;177299;177300;177301;177302;177303;177304;177305;177306;177307;177308;177309;177310;177311;177312;177313 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226462;226463;226464;226465;226466;226467;226468;226469;226470;226471;226472;226473;226474;226475;226476;226477;226478;226479;226480;226481;226482;226483;226484;226485;226486 226465 24 IAVMELFR Unmodified 977.53682 0.536823 3179 Q16531;F5GY55;F5H2L3;F5GWI0;F5GZY8;F5GYG8;F5H198 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.21 114.21 2 0.0033704 117760 QUIQUE_C1277_190116_001 132.09 74.63 343200000 65792000 33036000 35163000 48391000 28221000 37165000 35490000 0 0 23820000 23461000 12666000 0 19776 3179 18583 177333;177334;177335;177336;177337;177338;177339;177340;177341;177342;177343 226487;226488;226489;226490;226491;226492;226493;226494;226495;226496;226497 226488 11 IAVMELFRPK Unmodified 1202.6845 0.68454987 3179 Q16531;F5GY55;F5H2L3;F5GWI0;F5GZY8;F5GYG8;F5H198 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 90.344 90.344 3 0.00022541 92670 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.048 64.173 857810000 41749000 83231000 66062000 45622000 68396000 0 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177358;177359;177360;177361;177362;177363;177364;177365;177366;177367;177368;177369;177370 226519;226520;226521;226522;226523;226524;226525;226526;226527;226528;226529;226530;226531;226532;226533 226519 15 IAVVGAGIGGSAVAHFLQQHFGPR Unmodified 2388.2815 0.28148202 3625 Q8NBM8;D6R9J0 PCYOX1L Prenylcysteine oxidase-like yes no 0 0 0 1 132.51 132.51 4 1.0535E-07 139439 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.766 49.406 48343000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48343000 0 0 19780 3625 18587 177371 226534;226535 226535 2 IAVVGEGR Unmodified 799.4552 0.45520186 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.318 22.318 2 0.00061966 15314 QUIQUE_C1277_190116_001 152.63 42.098 11981000000 855500000 835200000 1164700000 922840000 995860000 1047200000 1077900000 881350000 0 780820000 1295500000 921920000 1201900000 19781 1609 18588 177372;177373;177374;177375;177376;177377;177378;177379;177380;177381;177382;177383 226536;226537;226538;226539;226540;226541;226542;226543;226544;226545;226546;226547;226548 226537 9 IAVYEEGGK Unmodified 964.48656 0.48656157 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2;Q8IV92 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 24.506 24.506 2 0.048831 18400 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.066 10.798 101590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 101590000 19782 4250 18589 177384 226549 226549 1 IAVYSCPFDGMITETK Unmodified 1830.8532 0.85320769 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 114.49 114.49 2 0.00042458 118273 QUIQUE_DMIX8_190116_001 81.709 65.572 1167600000 0 0 0 0 0 0 362200000 0 0 0 271700000 235930000 297730000 19783 2572 18590 177385;177386;177387;177388 226550;226551;226552;226553 226553 4 IAVYSCPFDGMITETK Oxidation (M) 1846.8481 0.84812231 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 1 0 1 94.868 94.868 2 0.011083 91549 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62.132 555840000 56200000 54577000 57540000 52358000 47052000 54587000 60411000 0 44400000 34718000 44538000 0 49456000 19786 1881 18592 177403;177404;177405;177406;177407;177408;177409;177410;177411;177412;177413 226580;226581;226582;226583;226584;226585;226586;226587;226588;226589;226590 226580 11 IAWDDEETRDGFR Unmodified 1608.7168 0.71684887 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 69.164 69.164 3 0.0011974 68817 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.891 43.287 103280000 0 0 0 0 0 0 0 56761000 0 0 0 46518000 0 19787 1881 18593 177414;177415 226591;226592 226591 2 IAWTHITIPESLR Unmodified 1535.846 0.84601255 4119 Q9H0E2;F2Z2Y8;E7EN89;E9PP67;E9PQ25 TOLLIP Toll-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 103.79 103.79 2;3 1.24E-06 106793 QUIQUE_C1277_190116_001 126.95 122.73 4342700000 320100000 302000000 445270000 288840000 339100000 312980000 397750000 269850000 322090000 80842000 452840000 391840000 419140000 19788 4119 18594 177416;177417;177418;177419;177420;177421;177422;177423;177424;177425;177426;177427;177428;177429;177430;177431;177432;177433;177434;177435;177436;177437 226593;226594;226595;226596;226597;226598;226599;226600;226601;226602;226603;226604;226605;226606;226607;226608;226609;226610;226611;226612;226613;226614;226615;226616;226617;226618;226619;226620;226621;226622;226623;226624;226625;226626;226627;226628;226629 226596 32 IAYTFAR Unmodified 840.44939 0.4493882 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 47.355 47.355 2 0.035909 44722 QUIQUE_C1218_190116_001 86.512 35.476 125360000 125360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19789 1324 18595 177438 226630 226630 1 IAYVYPDER Unmodified 1124.5502 0.55022446 3693 Q8WTS6;D6RJA0 SETD7 Histone-lysine N-methyltransferase SETD7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.552 52.552 2 0.0074526 51140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.548 61.844 681870000 0 0 77704000 79920000 106210000 0 70452000 88028000 61807000 0 64162000 65038000 68546000 19790 3693 18596 177439;177440;177441;177442;177443;177444;177445;177446;177447 226631;226632;226633;226634;226635;226636;226637;226638;226639;226640;226641 226636 11 ICALDDNVCMAFAGLTADAR Unmodified 2182.9809 0.98094418 1448 O14818 PSMA7 Proteasome subunit alpha type-7 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 144.63 144.63 2;3 1.4953E-56 148807 QUIQUE_C1277_190116_001 174.17 155.1 874040000 64864000 85055000 114030000 69970000 61540000 80417000 103640000 54398000 73274000 27150000 0 68307000 71392000 19791 1448 18597 177448;177449;177450;177451;177452;177453;177454;177455;177456;177457;177458;177459;177460;177461;177462;177463;177464;177465;177466;177467;177468;177469;177470;177471;177472 226642;226643;226644;226645;226646;226647;226648;226649;226650;226651;226652;226653;226654;226655;226656;226657;226658;226659;226660;226661;226662;226663;226664;226665;226666;226667;226668;226669;226670 226645 28 ICDDELILIK Unmodified 1230.653 0.65297497 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.981 98.981 2 0.00019854 101693 QUIQUE_DMIX7_190116_001 138.06 102.62 2469000000 312650000 335600000 280440000 295200000 260560000 263670000 338110000 0 0 0 188860000 0 193940000 19792 2132 18598 177473;177474;177475;177476;177477;177478;177479;177480;177481;177482;177483 226671;226672;226673;226674;226675;226676;226677;226678;226679;226680;226681;226682 226681 12 ICDECNYGSYQGR Unmodified 1620.6297 0.62969012 3450 Q7RTV0 PHF5A PHD finger-like domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.526 39.526 2 9.8599E-10 36085 QUIQUE_DMIX5_190116_001 169.37 159.14 206970000 0 21808000 33439000 18314000 0 21154000 0 17656000 27888000 0 35014000 31698000 0 19793 3450 18599 177484;177485;177486;177487;177488;177489;177490;177491;177492 226683;226684;226685;226686;226687;226688;226689;226690;226691 226690 8 ICDFENASKPQSIQESTGSIIEVLSK Unmodified 2879.4223 0.42225334 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.71 130.71 3 5.0772E-37 134689 QUIQUE_C1403_190116_001 136.71 126.56 2354100000 180040000 211160000 232890000 182290000 169820000 175900000 161700000 209680000 161550000 83171000 203800000 210190000 171860000 19794 455 18600 177493;177494;177495;177496;177497;177498;177499;177500;177501;177502;177503;177504;177505 226692;226693;226694;226695;226696;226697;226698;226699;226700;226701;226702;226703;226704;226705;226706;226707 226696 16 ICDGIFYTPQYLNPSVISLLK Unmodified 2440.2712 0.27121941 2967 Q13131 PRKAA1 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 164.53 164.53 2;3 0.00023369 169357 QUIQUE_C1368_190116_001 64.394 59.679 104790000 0 0 40278000 35139000 14208000 0 15162000 0 0 0 0 0 0 19795 2967 18601 177506;177507;177508;177509;177510;177511;177512 226708;226709;226710;226711;226712;226713;226714 226709 7 ICDGVQFGAGIR Unmodified 1291.6343 0.63430521 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 0 1 1 71.721 71.721 2 0.004044 71236 QUIQUE_C1403_190116_001 72.325 49.585 46556000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46556000 0 19796 4615 18602 177513;177514 226715;226716 226715 2 ICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHR Oxidation (M) 2803.2946 0.2945504 896;803;1135 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 148.13 148.13 3 3.9874E-14 152137 QUIQUE_C1277_190116_001 86.006 53.054 724040000 112960000 118840000 0 96839000 111110000 89505000 0 63800000 0 43029000 0 0 87958000 19797 803;896;1135 18603 177515;177516;177517;177518;177519;177520;177521;177522 226717;226718;226719;226720;226721;226722;226723;226724;226725;226726 226719 481 10 ICDPGLTAFEPEALGNLVEGMDFHR Unmodified 2787.2996 0.29963578 896;803;1135 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.52 160.52 3 2.3176E-51 165713 QUIQUE_C1368_190116_001 149.18 142.72 5746400000 638810000 568050000 459770000 410980000 392320000 293790000 386290000 336050000 402670000 94364000 432830000 723170000 607310000 19798 803;896;1135 18603 177523;177524;177525;177526;177527;177528;177529;177530;177531;177532;177533;177534;177535 226727;226728;226729;226730;226731;226732;226733;226734;226735;226736;226737;226738;226739;226740;226741;226742 226730 14 ICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHK Oxidation (M) 2791.2833 0.28331701 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.41 143.41 3 1.5632E-10 148746 QUIQUE_C1368_190116_001 76.02 68.988 807890000 92526000 128250000 78188000 0 0 91601000 0 84291000 65842000 50294000 75128000 70246000 71524000 19799 412;3299 18604 177536;177537;177538;177539;177540;177541;177542;177543;177544;177545;177546 226743;226744;226745;226746;226747;226748;226749;226750;226751;226752;226753;226754 226745 294 12 ICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHK Unmodified 2775.2884 0.28840239 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157 157 2;3 7.7627E-85 162883 QUIQUE_C1218_190116_001 141.53 138.43 7302800000 643780000 813340000 747510000 590010000 436060000 479050000 433330000 425840000 562500000 206570000 631390000 778040000 555410000 19800 412;3299 18604 177547;177548;177549;177550;177551;177552;177553;177554;177555;177556;177557;177558;177559;177560 226755;226756;226757;226758;226759;226760;226761;226762;226763;226764;226765;226766;226767;226768;226769;226770;226771;226772 226755 18 ICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHR Oxidation (M) 2819.2895 0.28946502 3010 Q13554;H7C394 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.95 144.95 3 3.2057E-14 149884 QUIQUE_C1368_190116_001 87.511 76.2 1718400000 210260000 249700000 178700000 188810000 0 187770000 155800000 0 150070000 95777000 156020000 145490000 0 19801 3010 18605 177561;177562;177563;177564;177565;177566;177567;177568;177569;177570 226773;226774;226775;226776;226777;226778;226779;226780;226781;226782;226783;226784;226785 226776 2456 13 ICDPGLTSFEPEALGNLVEGMDFHR Unmodified 2803.2946 0.2945504 3010 Q13554;H7C394 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 0 0 0 2 2 2 3 4 2 2 1 2 1 3 1 1 158.13 158.13 2;3;4 8.2488E-50 165209 QUIQUE_DMIX5_190116_001 169.61 123.99 13221000000 1289300000 1207000000 1003700000 1245000000 826200000 808620000 1366200000 769300000 753380000 167000000 1394200000 1212500000 1179100000 19802 3010 18605 177571;177572;177573;177574;177575;177576;177577;177578;177579;177580;177581;177582;177583;177584;177585;177586;177587;177588;177589;177590;177591;177592;177593;177594;177595;177596 226786;226787;226788;226789;226790;226791;226792;226793;226794;226795;226796;226797;226798;226799;226800;226801;226802;226803;226804;226805;226806;226807;226808;226809;226810;226811;226812;226813;226814;226815;226816;226817;226818;226819 226816 34 ICDQISDAVLDAHLQQDPDAK Unmodified 2351.1063 0.10633893 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 95.291 95.291 2 0.046882 96339 QUIQUE_C1563_190116_001 31.914 18.51 25623000 0 0 0 0 0 25623000 0 0 0 0 0 0 0 19803 2329 18606 177597 226820 226820 1 ICDQWDALGSLTHSR Unmodified 1757.8155 0.81551705 1544 O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 96.529 96.529 2;3 1.2009E-53 98976 QUIQUE_C1277_190116_001 187.44 162.59 7422300000 578970000 744550000 640970000 558050000 826590000 420820000 683730000 532280000 460600000 181150000 696280000 539570000 558770000 19804 1544 18607 177598;177599;177600;177601;177602;177603;177604;177605;177606;177607;177608;177609;177610;177611;177612;177613;177614;177615;177616;177617;177618;177619;177620;177621;177622;177623 226821;226822;226823;226824;226825;226826;226827;226828;226829;226830;226831;226832;226833;226834;226835;226836;226837;226838;226839;226840;226841;226842;226843;226844;226845;226846;226847;226848;226849;226850 226824 27 ICDQWDNLGALTQK Unmodified 1660.7879 0.78790532 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 105.7 105.7 2;3 2.3621E-05 108870 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.91 128.44 2286300000 208850000 213270000 187550000 249510000 235070000 128740000 205430000 121170000 118110000 79803000 181290000 184140000 173410000 19805 1242;2047 18608 177624;177625;177626;177627;177628;177629;177630;177631;177632;177633;177634;177635;177636;177637;177638 226851;226852;226853;226854;226855;226856;226857;226858;226859;226860;226861;226862;226863;226864;226865;226866 226862 16 ICDVYNAVMDVVK Unmodified 1524.7316 0.73163599 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 133.02 133.02 2 0.025553 137840 QUIQUE_C1218_190116_001 54.471 39.205 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19806 4620 18609 177639 226867 226867 1 ICEDSAEILDSDVLDRPLNIMIPK Unmodified 2755.3772 0.3772174 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 1 1 1 148.1 148.1 3 7.1246E-06 150559 QUIQUE_C1563_190116_001 56.766 49.123 143720000 0 0 0 72740000 0 70976000 0 0 0 0 0 0 0 19807 3772 18610 177640;177641 226868;226869 226869 2 ICEDSSELLDSDALNRPLNIMIPK Unmodified 2742.3568 0.35681631 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 137.33 137.33 3 2.0415E-12 142893 QUIQUE_C1218_190116_001 99.441 89.954 334760000 77878000 96144000 57695000 51563000 0 51480000 0 0 0 0 0 0 0 19808 1446 18611 177642;177643;177644;177645;177646 226870;226871;226872;226873;226874;226875 226870 6 ICEEAFAR Unmodified 994.45422 0.45421558 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 35.641 35.641 2 0.013775 31282 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.872 45.751 569730000 0 0 265110000 0 0 172170000 0 0 0 0 132450000 0 0 19809 903;2869 18612 177647;177648;177649 226876;226877;226878;226879 226878 4 ICEEAYGR Unmodified 996.43348 0.43348014 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 21.488 21.488 2 0.040422 15000 QUIQUE_C1218_190116_001 85.265 42.199 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19810 4487 18613 177650;177651;177652;177653 226880;226881;226882;226883 226880 4 ICEPGYSPTYK Unmodified 1313.5962 0.59618837 1930 P07858 CTSB Cathepsin B;Cathepsin B light chain;Cathepsin B heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 44.819 44.819 2 0.0024521 41834 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.4 72.556 1155200000 341280000 0 194400000 221570000 0 0 0 254670000 0 143250000 0 0 0 19811 1930 18614 177654;177655;177656;177657;177658 226884;226885;226886;226887;226888 226887 3 ICEQFEAETPTDSETTQK Unmodified 2112.9157 0.91574419 2429 P40855;Q5QNY5;H0YJ60;H0YDY4;G3V3G9 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 0 1 1 1 58.958 58.958 2 5.2556E-11 57352 QUIQUE_C1277_190116_001 154.1 140.42 47772000 20549000 27223000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19812 2429 18615 177659;177660;177661 226889;226890;226891 226890 3 ICEVINEAVWK Unmodified 1359.6857 0.68567208 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 91.161 91.161 2 0.024354 92250 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.426 43.545 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19813 2285 18616 177662 226892 226892 1 ICFELLELLK Unmodified 1276.7101 0.71009592 1644 O75533;H7C341 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 157.48 157.48 2 0.0076035 161923 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.928 46.039 39628000 15849000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23779000 19814 1644 18617 177663;177664 226893;226894 226894 2 ICFNTPLAPQALEDVK Unmodified 1814.9237 0.92367052 3548 Q8IXI2;H7BXZ6 RHOT1 Mitochondrial Rho GTPase 1;Mitochondrial Rho GTPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 121.15 121.15 2 3.0358E-09 125111 QUIQUE_C1277_190116_001 125.03 113.17 218940000 0 43595000 0 45343000 0 46567000 0 0 33871000 0 49561000 0 0 19815 3548 18618 177665;177666;177667;177668;177669;177670;177671 226895;226896;226897;226898;226899;226900;226901 226895 5 ICGDIHGQYTDLLR Unmodified 1659.8039 0.80388973 2740 P62140;E7ETD8;C9J9S3;C9JP48 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 78.009 78.009 2;3 2.0044E-29 79664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 193.49 156.15 4261400000 438170000 489070000 545050000 471100000 472570000 453480000 541060000 0 0 143010000 128010000 83088000 496770000 19816 2740 18619 177672;177673;177674;177675;177676;177677;177678;177679;177680;177681;177682;177683;177684;177685;177686;177687;177688;177689;177690 226902;226903;226904;226905;226906;226907;226908;226909;226910;226911;226912;226913;226914;226915;226916;226917;226918;226919;226920;226921 226918 17 ICGDIHGQYYDLLR Unmodified 1721.8195 0.8195398 2739;1041 F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;A0A087WYY5;P62136;E9PMD7;F5H1L6;F5H037 PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 87.243 87.243 2;3 2.1939E-23 89107 QUIQUE_C1277_190116_001 167.71 144.83 4894500000 350290000 519300000 537210000 390420000 357960000 79424000 530190000 313490000 416950000 101870000 480370000 393360000 423610000 19817 1041;2739 18620 177691;177692;177693;177694;177695;177696;177697;177698;177699;177700;177701;177702;177703;177704;177705;177706;177707;177708;177709;177710;177711;177712;177713;177714;177715 226922;226923;226924;226925;226926;226927;226928;226929;226930;226931;226932;226933;226934;226935;226936;226937;226938;226939;226940;226941;226942;226943;226944;226945;226946;226947;226948 226925 26 ICGLEEDLK Unmodified 1075.522 0.52196079 1610 O75116;E9PF63 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 58.35 58.35 2 0.057718 57421 QUIQUE_C1576_190116_001 49.536 21.429 31999000 0 0 0 0 0 0 31999000 0 0 0 0 0 0 19818 1610 18621 177716;177717 226949;226950 226950 2 ICGVEDAVSEMTR Unmodified 1465.6541 0.65411395 709 C9JBI3;P78330 PSPH Phosphoserine phosphatase yes no 0 0 0 1 92.13 92.13 2 0.015905 94549 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.259 43.43 14564000 0 0 0 0 0 0 0 0 14564000 0 0 0 0 19819 709 18622 177718 226951 226951 1 ICHQIEYYFGDFNLPR Unmodified 2070.9622 0.96218129 1890 P05455;E7ERC4;E9PFL9 SSB Lupus La protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 3 125.39 125.39 2;3 2.4607E-36 130979 QUIQUE_C1218_190116_001 194.7 180.01 2994200000 235450000 260410000 300600000 201520000 133550000 158080000 260080000 297100000 259180000 78507000 315760000 259900000 234090000 19820 1890 18623 177719;177720;177721;177722;177723;177724;177725;177726;177727;177728;177729;177730;177731;177732;177733;177734;177735;177736;177737;177738;177739;177740;177741;177742;177743;177744 226952;226953;226954;226955;226956;226957;226958;226959;226960;226961;226962;226963;226964;226965;226966;226967;226968;226969;226970;226971;226972;226973;226974;226975;226976;226977;226978;226979;226980;226981;226982;226983;226984;226985;226986;226987;226988 226953 37 ICHSSVYIWPSSDINTIPGELTDASACK Unmodified 3120.4532 0.45323589 825 D6RGX2;Q9NUQ7;D6RB53;D6RA67 UFSP2 Ufm1-specific protease 2 yes no 0 0 0 1 128.1 128.1 3 0.0019344 133257 QUIQUE_C1368_190116_001 34.04 22.623 52625000 0 0 52625000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19821 825 18624 177745 226989 226989 1 ICKPLHELIMQLLEETPEEK Unmodified 2449.2597 0.25966844 2798 P68402;J3KNE3 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes no 0 0 1 2 4 3 1 2 4 1 3 3 2 3 4 143.42 143.42 2;3;4 2.1065E-36 148321 QUIQUE_C1277_190116_001 164.53 146.43 5552000000 307190000 451080000 543100000 0 236810000 571970000 873770000 31616000 514370000 0 1027400000 330990000 663730000 19822 2798 18625 177746;177747;177748;177749;177750;177751;177752;177753;177754;177755;177756;177757;177758;177759;177760;177761;177762;177763;177764;177765;177766;177767;177768;177769;177770;177771;177772;177773;177774;177775;177776;177777 226990;226991;226992;226993;226994;226995;226996;226997;226998;226999;227000;227001;227002;227003;227004;227005;227006;227007;227008;227009;227010;227011;227012;227013;227014;227015;227016;227017;227018;227019;227020;227021;227022;227023 226994 29 ICKPLHELIMQLLEETPEEK Oxidation (M) 2465.2546 0.25458307 2798 P68402;J3KNE3 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes no 0 1 1 1 136.98 136.98 3 0.0038494 141473 QUIQUE_C1277_190116_001 54.637 51.174 170170000 0 170170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19823 2798 18625 177778 227024 227024 2246 0 ICLDILK Unmodified 873.49937 0.49937486 2712 P61088;F8VQQ8;F8VSD4;F8VV71 UBE2N Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.647 87.647 2 0.019305 88691 QUIQUE_C1563_190116_001 114.19 34.732 4824800000 538640000 532180000 397510000 433920000 501700000 436480000 0 280350000 243640000 208790000 396590000 434340000 420650000 19824 2712 18626 177779;177780;177781;177782;177783;177784;177785;177786;177787;177788;177789;177790 227025;227026;227027;227028;227029;227030;227031;227032;227033;227034;227035;227036;227037;227038;227039;227040 227032 16 ICLDILKDK Unmodified 1116.6213 0.62128091 2712 P61088;F8VQQ8 UBE2N Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 68.79 68.79 3 0.0019637 69135 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 61.778 160030000 0 0 0 0 0 0 0 37249000 0 0 59351000 27021000 36413000 19825 2712 18627 177791;177792;177793;177794;177795 227041;227042;227043;227044;227045 227043 5 ICLEYWNHLAAELYR Unmodified 1949.9458 0.94580295 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 140.96 140.96 2;3 8.1543E-45 145053 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.75 143.5 260040000 25193000 31188000 24422000 25027000 0 0 0 32213000 31537000 0 37719000 52742000 0 19826 1470 18628 177796;177797;177798;177799;177800;177801;177802;177803;177804;177805;177806;177807 227046;227047;227048;227049;227050;227051;227052;227053;227054;227055;227056;227057;227058;227059;227060 227059 14 ICLTDHFKPLWAR Unmodified 1655.8606 0.86061675 4588 Q9Y3C8 UFC1 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 3 2 3 1 3 1 3 3 3 92.347 92.347 2;3;4 3.8611E-13 96210 QUIQUE_C1218_190116_001 128.67 90.653 2533800000 62738000 82973000 120150000 88169000 128640000 85452000 285680000 104260000 269410000 31480000 394600000 322080000 558200000 19827 4588 18629 177808;177809;177810;177811;177812;177813;177814;177815;177816;177817;177818;177819;177820;177821;177822;177823;177824;177825;177826;177827;177828;177829;177830;177831;177832;177833 227061;227062;227063;227064;227065;227066;227067;227068;227069;227070;227071;227072;227073;227074;227075;227076;227077;227078;227079;227080;227081;227082;227083;227084;227085;227086;227087;227088;227089;227090;227091;227092;227093 227062 33 ICMAIPAMAIPPLIMDTLEK Unmodified 2227.1489 0.14886113 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 171.13 171.13 2;3 0.00066969 174607 QUIQUE_C1277_190116_001 54.964 46.141 252390000 0 64629000 0 0 0 9187600 0 20032000 0 0 72449000 86097000 0 19828 163 18630 177834;177835;177836;177837;177838;177839;177840 227094;227095;227096;227097;227098;227099;227100 227095 6 ICMNEDPAK Unmodified 1076.4631 0.46306571 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 25.432 25.432 2 0.024285 18294 QUIQUE_C1368_190116_001 60.118 33.516 100240000 0 32006000 27336000 0 0 0 0 40903000 0 0 0 0 0 19829 194 18631 177841;177842;177843 227101;227102;227103 227102 3 ICMPLTVDEYK Unmodified 1367.6465 0.64650938 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 92.767 92.767 2 0.0014073 94546 QUIQUE_C1277_190116_001 85.29 75.337 121680000 0 55241000 0 56441000 0 0 0 0 0 9997400 0 0 0 19830 4474 18632 177844;177845;177846 227104;227105;227106 227104 3 ICNNMLLAISMIGTAEAMNLGIR Unmodified 2505.2576 0.25757673 2338 P31937;H7BZL2 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 172.98 172.98 3 1.6886E-23 177184 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.2 108.96 228360000 0 0 0 0 0 0 0 40789000 75550000 0 87451000 0 24569000 19831 2338 18633 177847;177848;177849;177850;177851 227107;227108;227109;227110;227111 227108 5 ICNQVLVCER Unmodified 1289.622 0.62202597 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;A0A2R8Y5P6;A0A2R8Y6E6;A0A0U1RQF8 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 41.103 41.103 2 2.044E-07 37171 QUIQUE_C1368_190116_001 151.44 98.271 3415400000 324680000 302090000 337610000 250870000 326270000 292260000 382080000 161600000 168350000 74462000 260790000 254090000 280250000 19832 445 18634 177852;177853;177854;177855;177856;177857;177858;177859;177860;177861;177862;177863;177864;177865 227112;227113;227114;227115;227116;227117;227118;227119;227120;227121;227122;227123;227124;227125;227126;227127;227128;227129;227130;227131;227132;227133;227134;227135;227136;227137;227138;227139;227140;227141;227142;227143;227144 227117 33 ICPVETLVEEAIQCAEK Unmodified 1987.9595 0.95946368 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 5 3 2 3 3 3 2 3 4 3 2 165.84 165.84 2;3 4.9868E-140 169650 QUIQUE_C1277_190116_001 296.17 255.58 12416000000 980360000 1035900000 1707100000 291450000 777230000 904480000 1405300000 591960000 871700000 227400000 969070000 1281500000 1372900000 19833 2305 18635 177866;177867;177868;177869;177870;177871;177872;177873;177874;177875;177876;177877;177878;177879;177880;177881;177882;177883;177884;177885;177886;177887;177888;177889;177890;177891;177892;177893;177894;177895;177896;177897;177898;177899;177900;177901;177902;177903 227145;227146;227147;227148;227149;227150;227151;227152;227153;227154;227155;227156;227157;227158;227159;227160;227161;227162;227163;227164;227165;227166;227167;227168;227169;227170;227171;227172;227173;227174;227175;227176;227177;227178;227179;227180;227181;227182;227183;227184;227185;227186;227187;227188;227189;227190;227191;227192 227149 44 ICQEVLPK Unmodified 985.52665 0.52665224 1622 O75323 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes yes 0 0 0 1 33.28 33.28 2 0.03982 28454 QUIQUE_C1218_190116_001 87.251 42.831 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19834 1622 18636 177904 227193 227193 1 ICQRYDQLMEAWEK Unmodified 1868.8549 0.85493903 125 A0A088AWL3;O75376;E7EVU5;E7EW50;J3KS51 NCOR1 Nuclear receptor corepressor 1 yes no 0 0 1 1 162.15 162.15 2 0.043389 164502 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.353 29.345 14080000 0 0 0 0 0 0 0 14080000 0 0 0 0 0 19835 125 18637 177905 227194 227194 1 ICQSNLQLVR Unmodified 1229.655 0.65504065 1266;3022 J3KNV4;H0YJ26;Q13683 ITGA7 Integrin alpha-7;Integrin alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form no no 0 0 0 1 1 50.829 50.829 2 0.017497 47894 QUIQUE_C1563_190116_001 82.279 37.197 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19836 1266;3022 18638 177906;177907 227195;227196 227196 2 ICRPLLIVEK Unmodified 1239.7373 0.73731372 378 C9J4M6;A0A1W2PPT5;C9J2Y9;P30876 POLR2B DNA-directed RNA polymerase;DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 yes no 0 0 1 1 49.567 49.567 3 0.0020152 47165 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.321 60.262 14148000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14148000 0 19837 378 18639 177908 227197 227197 1 ICSIALVGK Unmodified 959.54739 0.54738768 4267 Q9NRF8 CTPS2 CTP synthase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 53.172 53.172 2 0.009538 51516 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.692 31.272 103180000 0 0 0 34810000 0 0 0 0 0 0 33865000 34500000 0 19838 4267 18640 177909;177910;177911;177912;177913 227198;227199;227200;227201;227202 227200 5 ICSLQEEQQQLR Unmodified 1530.746 0.7460405 3946 Q96T51;H0YAC8 RUFY1 RUN and FYVE domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 52.529 52.529 2 0.0031829 50966 QUIQUE_C1576_190116_001 91.584 64.486 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19839 3946 18641 177914;177915 227203;227204 227203 2 ICSVHTPSSNPK Unmodified 1325.6398 0.63978452 1439 O14672 ADAM10 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 14.051 14.051 3 0.0021019 5985 QUIQUE_C1368_190116_001 63.944 51.447 55418000 0 0 16441000 0 9297700 0 17909000 0 11770000 0 0 0 0 19840 1439 18642 177916;177917;177918;177919 227205;227206;227207;227208;227209 227205 5 ICSWNVDGLR Unmodified 1218.5815 0.58154136 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359;G3V5D9 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 80.328 80.328 2 0.031601 76674 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.04 48.425 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19841 2266 18643 177920 227210 227210 1 ICSWSLDMLSHPQDSMELVHK Unmodified 2512.1549 0.1548858 2992 Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.82 122.82 3;4 0.00010904 128152 QUIQUE_C1576_190116_001 61.276 58.735 931340000 58771000 85471000 140710000 0 0 107000000 159390000 75260000 122750000 24187000 0 0 157800000 19842 2992 18644 177921;177922;177923;177924;177925;177926;177927;177928;177929 227211;227212;227213;227214;227215;227216;227217;227218;227219 227215 5 ICTLVHTAMDNPVDLIATNITPTEALLQWK Unmodified 3377.7363 0.73633403 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 164.69 164.69 3 0.00012815 168751 QUIQUE_C1277_190116_001 41.432 36.575 31130000 0 31130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19843 3753 18645 177930 227220 227220 1 ICTVSENFLR Unmodified 1237.6125 0.61250714 2590 P51674;D6R9D2 GPM6A Neuronal membrane glycoprotein M6-a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.176 73.176 2 0.00015656 70832 QUIQUE_DMIX4_190116_001 134.91 70.074 23969000000 1921300000 2260100000 3012100000 2141200000 1683600000 1782300000 3020900000 900290000 1435600000 927250000 1662600000 1606100000 1616000000 19844 2590 18646 177931;177932;177933;177934;177935;177936;177937;177938;177939;177940;177941;177942;177943 227221;227222;227223;227224;227225;227226;227227;227228;227229;227230;227231;227232;227233;227234 227231 12 ICVEHHAFFR Unmodified 1314.6292 0.62916025 734;357 A0A1B0GV68;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.82 34.82 3 0.0015762 30209 QUIQUE_C1277_190116_001 77.662 58.99 932770000 77988000 105660000 113510000 138390000 0 0 159800000 0 0 25871000 0 159760000 151800000 19845 357;734 18647 177944;177945;177946;177947;177948;177949;177950;177951 227235;227236;227237;227238;227239;227240;227241;227242;227243;227244 227236 10 ICVLDVDLQGVR Unmodified 1385.7337 0.7336849 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2;B1ANG9;B1ANH3 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.8 114.8 2 1.1779E-05 120264 QUIQUE_C1438_190116_001 130.66 110.67 929250000 0 0 146560000 110500000 108320000 133620000 135450000 0 0 0 166660000 0 128150000 19846 3194 18648 177952;177953;177954;177955;177956;177957;177958;177959;177960;177961 227245;227246;227247;227248;227249;227250;227251;227252;227253;227254;227255;227256;227257 227251 12 ICVNGDDAHPLWK Unmodified 1523.7191 0.71909747 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969;K7EJ20;K7EKX7;K7ENB4;A0A0A0MTT1 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 62.638 62.638 2;3 0.00077649 61978 QUIQUE_C1277_190116_001 80.522 68.939 2365000000 195480000 310890000 263590000 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177979;177980;177981;177982;177983;177984;177985;177986;177987;177988;177989 227275;227276;227277;227278;227279;227280;227281;227282;227283;227284;227285;227286;227287;227288 227286 14 ICYIFHETFGR Unmodified 1441.6813 0.6812554 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 3 2 2 2 81.432 81.432 2;3 6.0544E-30 82242 QUIQUE_C1403_190116_001 191.85 169.86 3799900000 273570000 368040000 277990000 266820000 312950000 298130000 374940000 189630000 268750000 89551000 355940000 371780000 351780000 19850 1108;1404 18652 177990;177991;177992;177993;177994;177995;177996;177997;177998;177999;178000;178001;178002;178003;178004;178005;178006;178007;178008;178009;178010;178011;178012;178013;178014;178015;178016;178017 227289;227290;227291;227292;227293;227294;227295;227296;227297;227298;227299;227300;227301;227302;227303;227304;227305;227306;227307;227308;227309;227310;227311;227312;227313;227314;227315;227316;227317;227318;227319;227320;227321;227322;227323;227324;227325;227326;227327;227328;227329 227301 41 ICYQEVSQCFGVLSSR Unmodified 1931.887 0.88696744 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.58 116.58 2 4.7152E-07 121786 QUIQUE_C1438_190116_001 122.46 108.5 90159000 0 54332000 0 35827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19851 3179 18653 178018;178019;178020;178021;178022;178023 227330;227331;227332;227333;227334;227335 227333 6 IDALEFLPFEGK Unmodified 1377.718 0.71801807 1340 K7ENP1;Q7Z4G4;Q5JY02;Q5JY01 TRMT11 tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase homolog yes no 0 0 0 1 1 1 146.7 146.7 2 0.014838 154045 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.221 32.928 36516000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15766000 20750000 0 19852 1340 18654 178024;178025;178026 227336;227337;227338 227337 3 IDALNTEELR Unmodified 1172.6037 0.60371659 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.189 63.189 2 0.0011693 63234 QUIQUE_C1218_190116_001 115.71 69.699 146420000 68439000 44771000 0 0 0 33215000 0 0 0 0 0 0 0 19853 3597 18655 178027;178028;178029;178030;178031;178032 227339;227340;227341;227342;227343;227344;227345;227346 227339 7 IDALSCLYVILCNHSPQVFHPHVQALVPPVVACVGDPFYK Unmodified 4559.2956 0.2956238 3499 Q86VP6;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 165.55 165.55 5 0.00055244 173034 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.737 27.302 179350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 179350000 0 0 19854 3499 18656 178033 227347 227347 1 IDAMHGVVGPYVK Oxidation (M) 1400.7122 0.71222118 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 2 2 2 42.14 42.14 2;3 0.00051512 39129 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.957 65.463 260970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80674000 105820000 74468000 19855 2400 18657 178034;178035;178036;178037;178038;178039;178040;178041;178042;178043;178044;178045 227348;227349;227350;227351;227352;227353;227354;227355;227356;227357;227358;227359 227354 1807 12 IDAMHGVVGPYVK Unmodified 1384.7173 0.71730656 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.109 64.109 3 1.9394E-05 62909 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.793 61.987 2840200000 0 0 293710000 238840000 291130000 196860000 198930000 165250000 195780000 123770000 452530000 327820000 355550000 19856 2400 18657 178046;178047;178048;178049;178050;178051;178052;178053;178054;178055;178056 227360;227361;227362;227363;227364;227365;227366;227367;227368;227369;227370 227370 2 IDANNVAYTTGK Unmodified 1265.6252 0.62518031 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.577 36.577 2 0.00010165 31977 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.29 55.413 1219300000 157360000 129390000 241280000 168530000 0 167410000 0 121830000 0 78599000 0 154930000 0 19857 1670 18658 178057;178058;178059;178060;178061;178062;178063;178064;178065 227371;227372;227373;227374;227375;227376;227377;227378;227379;227380;227381 227380 11 IDAPSVK Unmodified 728.40685 0.40685468 4259 Q9NQW7;Q5T6H7;Q5T6H2;Q5T6H3 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 22.027 22.027 2 0.042214 15322 QUIQUE_C1218_190116_001 81.32 45.687 122520000 59839000 62683000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19858 4259 18659 178066;178067 227382;227383 227382 2 IDAQAIEEFYGLTSDISK Unmodified 1998.9786 0.97860244 1223 H7BZK6;P62068;O75317 USP46;USP12 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 156.81 156.81 2;3 4.1061E-07 159384 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.42 91.052 402960000 33298000 58858000 22270000 43508000 0 20020000 44328000 26487000 0 11253000 74347000 28555000 40031000 19859 1223 18660 178068;178069;178070;178071;178072;178073;178074;178075;178076;178077;178078;178079;178080;178081 227384;227385;227386;227387;227388;227389;227390;227391;227392;227393;227394;227395;227396;227397;227398;227399;227400;227401 227396 18 IDAQEIMQSLR Unmodified 1302.6602 0.66018561 3368 Q6KCM7 SLC25A25 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 121.12 121.12 2 0.00048892 127305 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.43 74.51 97073000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97073000 0 0 19860 3368 18661 178082;178083;178084 227402;227403;227404 227404 3 IDASKNEEDEGHSNSSPR Unmodified 1970.8566 0.85658982 3041 Q14103;D6RAF8;D6RD83 HNRNPD Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 1 2 2 2 1 3 10.216 10.216 2;3;4 2.3445E-224 2617 QUIQUE_DMIX1_190116_001 224.86 202.65 76215000 0 18931000 0 0 0 0 0 6762700 14365000 0 6233600 29922000 0 19861 3041 18662 178085;178086;178087;178088;178089;178090;178091;178092;178093;178094 227405;227406;227407;227408;227409;227410;227411;227412;227413;227414 227407 10 IDASQTEFEK Unmodified 1166.5455 0.54553301 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y8V7;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.158 37.158 2 0.02771 32850 QUIQUE_C1403_190116_001 66.504 37.088 89623000 0 39325000 50297000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19862 821 18663 178095;178096;178097;178098 227415;227416;227417;227418 227417 4 IDATQVEVNPFGETPEGQVVCFDAK Unmodified 2749.2905 0.29051088 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 138.26 138.26 2 6.0572E-25 143558 QUIQUE_C1368_190116_001 164.01 153.81 78423000 0 0 39878000 0 0 0 38545000 0 0 0 0 0 0 19863 3878 18664 178099;178100 227419;227420 227419 2 IDATSASVLASR Unmodified 1189.6303 0.63026569 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 58.491 58.491 2 0.054544 53647 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.897 11.577 74493000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74493000 0 0 0 19864 2059 18665 178101 227421 227421 1 IDAVNAETIR Unmodified 1100.5826 0.58258722 1636 O75439;G3V0E4 PMPCB Mitochondrial-processing 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227529;227530;227531;227532;227533;227534;227535;227536;227537;227538;227539;227540;227541;227542;227543;227544;227545;227546;227547;227548;227549;227550;227551;227552;227553;227554;227555;227556;227557;227558;227559;227560;227561;227562;227563;227564;227565;227566;227567;227568;227569;227570;227571;227572;227573;227574;227575;227576;227577;227578;227579;227580;227581;227582;227583;227584;227585;227586;227587 227535 58 IDDVAALDKK Unmodified 1086.5921 0.59208927 948 E9PK47;P06737 PYGL Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.888 25.888 3 0.0074497 19764 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.829 32.136 270390000 16192000 20483000 22476000 0 0 15321000 0 39410000 33575000 0 45467000 23481000 53983000 19878 948 18678 178219;178220;178221;178222;178223;178224;178225;178226;178227 227588;227589;227590;227591;227592;227593;227594;227595;227596 227593 8 IDDVLHTLTGAMSLLR Unmodified 1753.9397 0.93965493 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02 MLLT4 Afadin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 156.05 156.05 2;3 7.421E-25 160191 QUIQUE_C1277_190116_001 123.03 97.205 230280000 36314000 34785000 0 22853000 22151000 0 43782000 0 0 0 24849000 45544000 0 19879 1258 18679 178228;178229;178230;178231;178232;178233;178234;178235;178236 227597;227598;227599;227600;227601;227602;227603;227604;227605 227598 9 IDDVVNTR Unmodified 930.47706 0.47705951 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.347 25.347 2 0.00033036 19688 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.04 86 2798800000 251760000 258580000 0 307370000 312540000 226810000 0 280640000 296900000 124930000 0 336340000 402960000 19880 2573 18680 178237;178238;178239;178240;178241;178242;178243;178244;178245;178246 227606;227607;227608;227609;227610;227611;227612;227613;227614;227615 227611 8 IDEAILITWTK Unmodified 1301.7231 0.72310344 2146 P19367;B1AR63 HK1 Hexokinase-1;Hexokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.03 124.03 2 2.136E-37 129543 QUIQUE_C1218_190116_001 202.05 153.26 2859900000 289670000 310990000 253290000 260010000 230020000 240950000 321530000 293010000 0 112340000 0 325760000 222300000 19881 2146 18681 178247;178248;178249;178250;178251;178252;178253;178254;178255;178256;178257 227616;227617;227618;227619;227620;227621;227622;227623;227624;227625;227626;227627;227628;227629;227630;227631;227632;227633;227634 227616 19 IDEFESMMHL Unmodified 1250.5311 0.53114527 611 B4DIZ1;Q8TAM6 ERMN Ermin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 129.47 129.47 2 0.00025601 134832 QUIQUE_C1218_190116_001 117.17 98.075 67648000 22126000 19718000 0 0 0 0 18743000 0 0 0 0 7060500 0 19882 611 18682 178258;178259;178260;178261;178262 227635;227636;227637;227638;227639 227635 5 IDEHHFVAVALR Unmodified 1405.7466 0.74663285 4271 Q9NRN7;E9PLW6 AASDHPPT L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 1 55.648 55.648 2;3;4 0.00073638 53407 QUIQUE_C1368_190116_001 74.76 63.974 731010000 96766000 108310000 116010000 122930000 81755000 0 0 42493000 0 58962000 0 0 103790000 19883 4271 18683 178263;178264;178265;178266;178267;178268;178269;178270;178271;178272;178273;178274;178275 227640;227641;227642;227643;227644;227645;227646;227647;227648;227649;227650;227651;227652;227653;227654 227643 14 IDEKNFVVVMVTK Unmodified 1520.8273 0.82725094 2647;2646 P54725;K7ENJ0;K7ELW1;P54727;Q5W0S5;Q5W0S4 RAD23A;RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog A;UV excision repair protein RAD23 homolog B no no 0 0 1 1 166.12 166.12 3 0.024135 169935 QUIQUE_C1277_190116_001 36.284 17.462 13985000 0 13985000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19884 2646;2647 18684 178276 227655 227655 1 IDELEEQCSEINR Unmodified 1633.7254 0.72536464 4282 Q9NSB8;H0YNR9 HOMER2 Homer protein homolog 2 yes no 0 0 0 1 57.978 57.978 2 0.00010845 56825 QUIQUE_C1218_190116_001 101.39 80.616 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19885 4282 18685 178277 227656 227656 1 IDELEPR Unmodified 870.4447 0.44469675 3084 Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.183 29.183 2 0.019682 23106 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.57 65.041 543870000 170800000 134870000 0 0 0 0 0 30105000 59081000 49765000 99247000 0 0 19886 3084 18686 178278;178279;178280;178281;178282;178283 227657;227658;227659;227660;227661;227662 227661 6 IDELIEETVK Unmodified 1187.6285 0.62853436 4494;981 F1T0E5;H7C538;H7C4K9;A0A0C4DGY2;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 73.639 73.639 2 0.019579 73950 QUIQUE_C1277_190116_001 60.102 29.785 169610000 0 169610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19887 981;4494 18687 178284 227663 227663 1 IDELIEETVKEMITLLVAK Unmodified 2186.212 0.2119732 4494;981 F1T0E5;H7C538;H7C4K9;A0A0C4DGY2;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 1 1 1 176.67 176.67 3 0.0039469 177861 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.722 40.346 55185000 0 0 0 0 0 0 0 5637500 22068000 0 27480000 0 0 19888 981;4494 18688 178285;178286;178287 227664;227665;227666 227664 3 IDELPEGAVKPPANK Unmodified 1576.8461 0.84607213 0 A0A024R216;Q9Y3E1 HDGFRP3 Hepatoma-derived growth factor-related protein 3 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 45.558 45.558 2;3 6.2782E-06 42104 QUIQUE_C1368_190116_001 103.97 80.461 3459900000 342010000 337960000 400710000 303700000 410630000 288160000 220060000 72453000 256850000 82691000 241530000 196260000 306920000 19889 0 18689 178288;178289;178290;178291;178292;178293;178294;178295;178296;178297;178298;178299;178300;178301;178302;178303;178304;178305;178306;178307 227667;227668;227669;227670;227671;227672;227673;227674;227675;227676;227677;227678;227679;227680;227681;227682;227683;227684;227685;227686;227687;227688;227689;227690;227691;227692;227693;227694;227695;227696;227697;227698;227699;227700 227674 34 IDELPEGAVKPPANKYPIFFFGTHETAFLGPK Unmodified 3529.8286 0.82857815 0 A0A024R216;Q9Y3E1 HDGFRP3 Hepatoma-derived growth factor-related protein 3 yes no 0 0 2 1 2 1 1 129.17 129.17 4;5 9.3688E-14 133028 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.809 64.05 544000000 0 0 0 0 0 0 0 87973000 169700000 0 137030000 149290000 0 19890 0 18690 178308;178309;178310;178311;178312 227701;227702;227703;227704;227705;227706;227707 227707 7 IDEMPEAAVK Oxidation (M) 1117.5325 0.53252548 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 1 0 1 1 1 1 26.205 26.205 2 0.0068833 20557 QUIQUE_C1218_190116_001 76.221 31.774 90005000 27589000 22491000 0 0 0 0 0 0 0 0 39925000 0 0 19891 2596 18691 178313;178314;178315;178316 227708;227709;227710;227711 227708 2045 4 IDEMPEAAVK Unmodified 1101.5376 0.53761086 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 44.628 44.628 2 0.0036016 40602 QUIQUE_C1563_190116_001 83.783 39.336 292140000 99707000 77175000 0 0 0 62644000 0 52612000 0 0 0 0 0 19892 2596 18691 178317;178318;178319;178320;178321;178322;178323 227712;227713;227714;227715;227716;227717;227718 227716 7 IDEPLEGSEDR Unmodified 1258.5677 0.56772501 2735 P61978;S4R359 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 39.528 39.528 2 3.3099E-06 36172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.56 103.58 9777400000 835290000 926990000 867340000 879240000 851710000 748540000 701720000 593500000 715110000 333370000 772900000 719560000 832120000 19893 2735 18692 178324;178325;178326;178327;178328;178329;178330;178331;178332;178333;178334;178335;178336;178337 227719;227720;227721;227722;227723;227724;227725;227726;227727;227728;227729;227730;227731;227732;227733;227734;227735;227736;227737;227738;227739;227740;227741;227742;227743;227744;227745;227746 227737 28 IDEPLEGSEDRIITITGTQDQIQNAQYLLQNSVK Unmodified 3828.9381 0.93814119 2735 P61978 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K yes yes 0 0 1 1 151.85 151.85 3 2.5643E-48 154279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.26 107.64 102670000 0 0 0 0 0 0 0 102670000 0 0 0 0 0 19894 2735 18693 178338 227747 227747 1 IDESIHLQLR Unmodified 1222.667 0.66698555 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 63.894 63.894 3 0.0034878 62712 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.348 39.081 24357000 0 0 0 0 0 0 0 24357000 0 0 0 0 0 19895 574 18694 178339;178340;178341;178342;178343;178344 227748;227749;227750;227751;227752;227753 227752 6 IDESSLTGESDHVK Unmodified 1515.7053 0.70528113 2158;2222 P20020;P23634 ATP2B1;ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 no no 0 0 0 2 1 1 1 39.477 39.477 2;3 9.7936E-08 35833 QUIQUE_C1368_190116_001 132.17 97.369 157820000 0 0 157820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19896 2158;2222 18695 178345;178346;178347;178348;178349 227754;227755;227756;227757;227758 227755 5 IDESSLTGESDHVKK Unmodified 1643.8002 0.80024414 2158;2222 P20020;P23634 ATP2B1;ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 no no 0 0 1 1 1 1 28.594 28.594 3 0.0031001 22463 QUIQUE_C1368_190116_001 52.527 39.649 195250000 0 57087000 89945000 0 0 0 0 48214000 0 0 0 0 0 19897 2158;2222 18696 178350;178351;178352 227759;227760;227761 227760 3 IDESSLTGESDQVR Unmodified 1534.7111 0.71109479 470 H0Y7S3;A0A2U3U055;A0A2U3TZI3;Q01814 ATP2B2 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2 yes no 0 0 0 1 1 2 59.423 59.423 2 4.996E-05 59239 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.08 83.321 370750000 0 0 0 0 0 0 34618000 0 314900000 0 21234000 0 0 19898 470 18697 178353;178354;178355;178356 227762;227763;227764;227765 227765 3 IDEYDYSKPIQGQQK Unmodified 1810.8737 0.87374344 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 2 1 2 1 44.148 44.148 2;3 2.2135E-93 40483 QUIQUE_C1403_190116_001 214.82 174.1 2296200000 398050000 349100000 138260000 84762000 115740000 86943000 0 211030000 248930000 248770000 93144000 207170000 114300000 19899 2326 18698 178357;178358;178359;178360;178361;178362;178363;178364;178365;178366;178367;178368;178369;178370;178371;178372;178373;178374 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subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 43.521 43.521 2 0.012053 38917 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.142 26.428 338760000 0 0 149650000 108950000 0 0 0 0 0 80164000 0 0 0 19903 1953 18702 178416;178417;178418 227836;227837;227838;227839 227839 4 IDFGTHISGR Unmodified 1101.5567 0.55670682 2570 P50579;F8VRR3;F8VQZ7;G3V1U3 METAP2 Methionine aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.147 43.147 3 0.00045294 39781 QUIQUE_C1277_190116_001 84.658 58.616 620040000 49988000 47557000 43109000 49549000 64363000 36738000 54625000 47231000 0 52772000 51867000 58014000 64225000 19904 2570 18703 178419;178420;178421;178422;178423;178424;178425;178426;178427;178428;178429;178430 227840;227841;227842;227843;227844;227845;227846;227847;227848;227849;227850;227851;227852 227841 11 IDFTPSER Unmodified 963.46616 0.46616048 4378 Q9P253;H0YMC9;H0YLM6 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes no 0 0 0 1 45.165 45.165 2 0.04974 42363 QUIQUE_C1277_190116_001 55.676 23.721 187770000 0 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20 IDGQQTIIACIESHQFQAK Unmodified 2186.079 0.079001963 2492 P47755;F8W9N7;A0A0D9SET8 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 0 0 0 3 1 4 2 2 2 3 1 1 2 2 1 2 111.97 111.97 2;3 9.9318E-29 116333 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.6 118.86 2593000000 268870000 200320000 374720000 258410000 187790000 167910000 238320000 86980000 142730000 131170000 238940000 114310000 182550000 19917 2492 18716 178542;178543;178544;178545;178546;178547;178548;178549;178550;178551;178552;178553;178554;178555;178556;178557;178558;178559;178560;178561;178562;178563;178564;178565;178566;178567 227986;227987;227988;227989;227990;227991;227992;227993;227994;227995;227996;227997;227998;227999;228000;228001;228002;228003;228004;228005;228006;228007;228008;228009;228010;228011;228012;228013;228014;228015;228016;228017;228018;228019 228015 32 IDGSLVIR Unmodified 871.51272 0.51271674 4437 Q9UHQ9;H7C0R7 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 53.164 53.164 2 0.015035 51072 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228102;228103;228104;228105;228106;228107;228108;228109;228110;228111;228112;228113;228114;228115;228116;228117;228118;228119;228120;228121;228122;228123;228124;228125;228126;228127;228128;228129;228130;228131;228132 228120 29 IDHYVLEYR Unmodified 1206.6033 0.60332266 4024 Q9BTV5;M0R366 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 51.287 51.287 3 0.0018399 47411 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.325 50.756 189630000 40601000 23821000 26125000 28332000 0 26185000 26939000 0 0 17628000 0 0 0 19927 4024 18725 178654;178655;178656;178657;178658;178659;178660 228133;228134;228135;228136;228137;228138;228139;228140;228141 228141 8 IDIASDGLLHK Unmodified 1180.6452 0.64518747 4726 yes yes 0 0 0 1 1 19.509 19.509 3 0.0040955 12235 QUIQUE_C1368_190116_001 57.348 4.7697 459690000 0 257440000 202250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 19928 4726 18726 178661;178662 228142;228143 228143 2 IDIIPNPQER Unmodified 1193.6404 0.64043645 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P 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0 0 1 1 1 1 120.83 120.83 3 0.00041357 123854 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.094 36.956 136960000 0 27755000 0 0 60020000 0 0 49186000 0 0 0 0 0 19946 4009 18742 178807;178808;178809 228345;228346;228347 228347 3 IDKTDYMVGSYGPR Oxidation (M) 1616.7505 0.75045718 1293 J3KTF8;J3QQX2;P52565 ARHGDIA Rho GDP-dissociation inhibitor 1 yes no 0 1 1 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 46.963 46.963 2;3 3.4651E-21 43665 QUIQUE_C1368_190116_001 162.22 142.46 1897800000 91198000 191080000 164640000 130100000 159000000 0 157820000 219620000 56446000 61142000 250430000 192160000 224180000 19947 1293 18743 178810;178811;178812;178813;178814;178815;178816;178817;178818;178819;178820;178821;178822;178823;178824;178825;178826;178827;178828;178829;178830 228348;228349;228350;228351;228352;228353;228354;228355;228356;228357;228358;228359;228360;228361;228362;228363;228364;228365;228366;228367;228368;228369;228370 228351 741 20 IDKTDYMVGSYGPR Unmodified 1600.7555 0.75554256 1293 J3KTF8;J3QQX2;P52565 ARHGDIA Rho GDP-dissociation inhibitor 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 58.683 58.683 2;3 4.2613E-14 58011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 148.78 129.02 7894900000 529680000 665240000 734030000 658140000 584250000 294930000 593300000 712550000 773980000 169610000 887670000 641520000 650000000 19948 1293 18743 178831;178832;178833;178834;178835;178836;178837;178838;178839;178840;178841;178842;178843;178844;178845;178846;178847;178848;178849;178850;178851;178852;178853;178854;178855 228371;228372;228373;228374;228375;228376;228377;228378;228379;228380;228381;228382;228383;228384;228385;228386;228387;228388;228389;228390;228391;228392;228393;228394;228395;228396;228397;228398;228399;228400 228393 29 IDKVNEIVETNRPDSK Unmodified 1855.964 0.96395543 3095 Q15008 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.017 35.017 3 0.0017189 31194 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.317 71.218 476260000 44486000 44845000 35587000 0 46912000 0 0 52363000 52178000 0 76733000 39653000 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179060;179061;179062;179063;179064;179065;179066;179067;179068;179069;179070;179071;179072;179073;179074;179075;179076;179077;179078;179079;179080;179081;179082;179083;179084;179085 228632;228633;228634;228635;228636;228637;228638;228639;228640;228641;228642;228643;228644;228645;228646;228647;228648;228649;228650;228651;228652;228653;228654;228655;228656;228657;228658;228659;228660;228661;228662;228663;228664;228665;228666;228667;228668;228669;228670;228671;228672;228673;228674;228675;228676;228677;228678;228679;228680;228681;228682;228683;228684;228685;228686;228687;228688;228689;228690;228691;228692;228693;228694;228695;228696;228697;228698;228699;228700;228701 228636 67 IDNSVLVLIVGLSTVGAGAYAYK Unmodified 2322.2835 0.28349865 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 174.29 174.29 3 6.767E-11 178416 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.208 81.951 53410000 0 0 0 0 0 0 0 5629100 11935000 0 18980000 16866000 0 19981 1756 18775 179086;179087;179088;179089 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IDSDISGTLK Unmodified 1047.5448 0.54480473 1045 F8W031;F8VXJ7;F8W1K5 CNPY2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.184 46.184 2 0.0037048 44019 QUIQUE_C1218_190116_001 83.429 22.669 140370000 86327000 0 54041000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20008 1045 18801 179301;179302;179303;179304;179305 228966;228967;228968;228969;228970 228966 5 IDSDLGDAWAFFYK Unmodified 1646.7617 0.76167379 1697 O94906 PRPF6 Pre-mRNA-processing factor 6 yes yes 0 0 0 1 157.41 157.41 2 0.00025429 161635 QUIQUE_C1277_190116_001 91.549 71.246 22632000 0 22632000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20009 1697 18802 179306 228971 228971 1 IDSEGGVSANHTSR Unmodified 1428.6593 0.65933399 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 3 2 2 1 2 1 1 2 1 1 11.802 11.802 2;3 1.8333E-29 3288 QUIQUE_C1563_190116_001 150.26 134.32 660240000 0 0 3489200 0 69110000 225680000 38706000 33576000 41502000 2161300 121430000 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Unmodified 1518.7348 0.73480712 1744 O95721;C9JAF7 SNAP29 Synaptosomal-associated protein 29;Synaptosomal-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 112.09 112.09 2 0.005355 115780 QUIQUE_C1368_190116_001 67.385 41.726 277610000 0 0 0 48846000 0 67314000 0 73375000 88074000 0 0 0 0 20023 1744 18815 179391;179392;179393;179394;179395 229064;229065;229066;229067;229068 229064 4 IDSSDEDRISEVR Unmodified 1519.7114 0.71142914 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66;C9J1Z6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 1 1 38.526 38.526 3 0.046317 34521 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.066 12.657 41207000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41207000 0 20024 723 18816 179396 229069 229069 1 IDSVLLTHIGADNLPGINGLLQR Unmodified 2428.3438 0.3438075 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 145.82 145.82 2;3 2.125E-18 151714 QUIQUE_C1218_190116_001 119.37 99.468 4507500000 210920000 272240000 375820000 266850000 296860000 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IDTTINDLVSK Unmodified 1217.6503 0.65033243 4715 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 151.9 151.9 2 0.0024096 156238 QUIQUE_C1277_190116_001 78.516 17.926 687900000 0 65933000 106960000 63474000 67275000 100680000 62550000 56712000 87511000 0 76804000 0 0 + 20032 4715 18824 179485;179486;179487;179488;179489;179490;179491;179492;179493;179494 229185;229186;229187;229188;229189;229190;229191;229192;229193;229194;229195 229185 10 IDTYLDIPLVIR Unmodified 1429.8181 0.81806646 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 144.38 144.38 2 0.00040847 150018 QUIQUE_C1218_190116_001 112.75 75.404 126610000 21643000 22617000 0 17985000 29935000 23115000 0 0 0 11316000 0 0 0 20033 3895 18825 179495;179496;179497;179498;179499;179500;179501 229196;229197;229198;229199;229200;229201;229202;229203;229204 229196 9 IDVDAPDIDIHGPDAK Unmodified 1689.821 0.82097959 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 2 1 1 2 81.126 81.126 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IDYIAGLDSR Unmodified 1121.5717 0.57168818 1928 P07741;H3BQB1;H3BQF1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 70.325 70.325 2;3 0.0023978 82330 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.15 49.121 849180000 0 0 202990000 0 186660000 0 200160000 0 0 0 42082000 0 217280000 20051 1928 18843 179649;179650;179651;179652;179653 229383;229384;229385;229386;229387;229388;229389 229389 5 IDYNVEQSCIK Unmodified 1367.6391 0.63911582 1205 H3BU86;O14662;B7ZBM8 STX16-NPEPL1;STX16 Syntaxin-16 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.672 56.672 2 0.0030568 54896 QUIQUE_C1368_190116_001 74.841 50.811 197380000 39707000 0 32956000 0 30467000 37841000 38391000 0 18021000 0 0 0 0 20052 1205 18844 179654;179655;179656;179657;179658;179659;179660;179661 229390;229391;229392;229393;229394;229395;229396;229397 229392 7 IEAASMSGAGR Unmodified 1048.4971 0.49714303 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 1 1 21.935 21.935 2 0.00066494 15599 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.044 44.49 113340000 0 0 0 0 0 0 0 38005000 41732000 0 33608000 0 0 20053 2911 18845 179662;179663;179664 229398;229399;229400 229398 2 IEADLEHLK Unmodified 1066.5659 0.56587452 4354 Q9NZN5;E9PMR6 ARHGEF12 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 yes no 0 0 0 1 1 40.156 40.156 3 0.015909 36692 QUIQUE_C1218_190116_001 41.08 25.418 29784000 13970000 15813000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20054 4354 18846 179665;179666 229401;229402 229401 2 IEADSESQEDIIR Unmodified 1503.7053 0.70528113 2675 P55957 BID BH3-interacting domain death agonist;BH3-interacting domain death agonist p15;BH3-interacting domain death agonist p13;BH3-interacting domain death agonist p11 yes yes 0 0 0 1 1 52.797 52.797 2 6.7256E-06 51716 QUIQUE_C1438_190116_001 138.25 84.567 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20055 2675 18847 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2 1 1 1 1 1 2 15.123 15.123 2;3 9.6128E-10 7402 QUIQUE_C1576_190116_001 136.27 91.958 982140000 40303000 41923000 149790000 107660000 0 46185000 183410000 18609000 45728000 33446000 79115000 78991000 156980000 20068 3061;2178 18860 179747;179748;179749;179750;179751;179752;179753;179754;179755;179756;179757;179758;179759;179760;179761 229490;229491;229492;229493;229494;229495;229496;229497;229498;229499;229500;229501;229502;229503;229504 229497 14 IECSDNGDGTCSVSYLPTKPGEYFVNILFEEVHIPGSPFK Unmodified 4502.1087 0.1086537 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 1 1 167.46 167.46 4 1.512E-05 171577 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.773 45.449 40612000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40612000 0 20069 1628 18861 179762 229505 229505 1 IECVLPENCR Unmodified 1288.5904 0.59039149 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 46.937 46.937 2 0.00055997 43917 QUIQUE_C1368_190116_001 109.71 64.633 370260000 0 0 65728000 0 0 0 82210000 0 0 34221000 56788000 0 131310000 20070 3143 18862 179763;179764;179765;179766;179767 229506;229507;229508;229509;229510;229511 229506 5 IECVSAETTEDCIAK Unmodified 1724.7597 0.75970124 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 55.709 55.709 2 4.6234E-05 55531 QUIQUE_C1438_190116_001 113.22 94.957 539730000 0 0 0 0 539730000 0 0 0 0 0 0 0 0 20071 1838 18863 179768 229512 229512 0 IEDELITFVCETASATCPVVHK Unmodified 2518.2084 0.20836116 2897 Q05707;A0A0A0MQT7 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 145.07 145.07 3 1.4841E-08 148965 QUIQUE_C1403_190116_001 87.352 76.052 160400000 26925000 0 0 39797000 50927000 0 33956000 0 0 8798700 0 0 0 20072 2897 18864 179769;179770;179771;179772;179773 229513;229514;229515;229516;229517;229518;229519 229515 6 IEDFGLHFVR Unmodified 1231.635 0.63495714 757 C9JZB0;Q9BT40 INPP5K Inositol polyphosphate 5-phosphatase K yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 90.12 90.12 3 0.0016086 93768 QUIQUE_C1438_190116_001 74.376 61.42 117360000 0 0 0 0 25332000 0 0 0 17384000 0 30067000 25882000 18692000 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229568;229569;229570;229571;229572;229573;229574;229575;229576;229577;229578;229579;229580;229581;229582;229583;229584;229585;229586;229587;229588;229589;229590;229591 229574 20 IEDLEEGQQVIR Unmodified 1427.7256 0.72562264 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.077 65.077 2 0.00051875 65203 QUIQUE_C1218_190116_001 112.75 52.158 201900000 31437000 0 44346000 49054000 0 0 40197000 0 0 36864000 0 0 0 20081 3037 18873 179835;179836;179837;179838;179839;179840;179841;179842;179843 229592;229593;229594;229595;229596;229597;229598;229599;229600;229601 229592 10 IEDLGAAMEEALILDNK Unmodified 1843.9237 0.9237301 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 3 2 149.99 149.99 2;3 9.4282E-13 155517 QUIQUE_C1218_190116_001 154.47 133.52 2108100000 242310000 49063000 101030000 344960000 258430000 241270000 38006000 42574000 57967000 134450000 90366000 218020000 289610000 20082 267;275;3025 18874 179844;179845;179846;179847;179848;179849;179850;179851;179852;179853;179854;179855;179856;179857;179858;179859;179860;179861;179862;179863;179864;179865;179866;179867;179868;179869;179870;179871;179872 229602;229603;229604;229605;229606;229607;229608;229609;229610;229611;229612;229613;229614;229615;229616;229617;229618;229619;229620;229621;229622;229623;229624;229625;229626;229627;229628;229629;229630;229631;229632;229633;229634;229635;229636;229637;229638;229639;229640;229641;229642;229643;229644;229645;229646;229647;229648;229649;229650;229651;229652;229653;229654 229604 52 IEDLGAAMEEALILDNK Oxidation (M) 1859.9186 0.91864472 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 119.55 119.55 2 0.00096997 116278 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.265 58.602 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20083 267;275;3025 18874 179873 229655 229655 167 1 IEDLSQQAQLAAAEK Unmodified 1613.8261 0.82606496 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3;F8W0W4;F8W1N5;F8VNW4 NACA Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.159 69.159 2 4.8479E-24 68205 QUIQUE_C1563_190116_001 189.24 125.96 1678700000 172760000 180460000 105220000 155060000 0 96666000 104520000 220660000 116690000 86769000 145090000 130630000 164150000 20084 892 18875 179874;179875;179876;179877;179878;179879;179880;179881;179882;179883;179884;179885 229656;229657;229658;229659;229660;229661;229662;229663;229664;229665;229666;229667;229668;229669 229661 13 IEDPNQFVPLNTNPNEVLEK Unmodified 2309.1539 0.15394104 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 118.9 118.9 2;3 4.0414E-09 122995 QUIQUE_C1277_190116_001 142.45 128.77 6919400000 452670000 559110000 634480000 743420000 632180000 689720000 616120000 102790000 168360000 395870000 348300000 345360000 1231000000 20085 4418 18876 179886;179887;179888;179889;179890;179891;179892;179893;179894;179895;179896;179897;179898;179899;179900;179901;179902;179903;179904;179905;179906;179907;179908;179909 229670;229671;229672;229673;229674;229675;229676;229677;229678;229679;229680;229681;229682;229683;229684;229685;229686;229687;229688;229689;229690;229691;229692;229693;229694;229695;229696;229697;229698;229699;229700;229701;229702;229703 229673 32 IEDPNQFVPLNTNPNEVLEKR Unmodified 2465.2551 0.25505207 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 104.69 104.69 3 1.1135E-08 107272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.94 87.07 955230000 0 0 0 0 0 0 0 242790000 207810000 0 152390000 160350000 191880000 20086 4418 18877 179910;179911;179912;179913;179914 229704;229705;229706;229707;229708;229709 229705 6 IEDVGSDEEDDSGK Unmodified 1493.6005 0.60054128 1938;3264 P08238;Q58FF8 HSP90AB1;HSP90AB2P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.232 24.232 2 1.1917E-07 17452 QUIQUE_DMIX4_190116_001 129.84 119.88 356000000 41246000 41633000 77465000 52195000 35478000 49898000 32420000 0 0 25660000 0 0 0 20087 1938;3264 18878 179915;179916;179917;179918;179919;179920;179921;179922 229710;229711;229712;229713;229714;229715;229716;229717 229717 8 IEDVGSDEEDDSGKDK Unmodified 1736.7224 0.72244733 1938;3264 P08238;Q58FF8 HSP90AB1;HSP90AB2P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta 2 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 18.732 18.732 2;3 6.1149E-111 11069 QUIQUE_C1277_190116_001 225.33 211.74 1989500000 129050000 189770000 224980000 182800000 187630000 224350000 286310000 49241000 67572000 86147000 138030000 128940000 94642000 20088 1938;3264 18879 179923;179924;179925;179926;179927;179928;179929;179930;179931;179932;179933;179934;179935;179936;179937;179938;179939;179940;179941;179942;179943;179944;179945;179946 229718;229719;229720;229721;229722;229723;229724;229725;229726;229727;229728;229729;229730;229731;229732;229733;229734;229735;229736;229737;229738;229739;229740;229741 229721 22 IEDVGSDEEDDSGKDKK Unmodified 1864.8174 0.81741035 1938;3264 P08238;Q58FF8 HSP90AB1;HSP90AB2P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta 2 no no 0 0 2 2 1 3 3 2 3 2 2 1 3 3 3 12.903 12.903 2;3;4 2.2222E-139 3322 QUIQUE_C1563_190116_001 206.95 200.37 2820300000 89501000 214760000 258470000 0 280300000 411080000 24565000 198480000 252200000 1936100 113630000 505510000 469820000 20089 1938;3264 18880 179947;179948;179949;179950;179951;179952;179953;179954;179955;179956;179957;179958;179959;179960;179961;179962;179963;179964;179965;179966;179967;179968;179969;179970;179971;179972;179973;179974 229742;229743;229744;229745;229746;229747;229748;229749;229750;229751;229752;229753;229754;229755;229756;229757;229758;229759;229760;229761;229762;229763;229764;229765;229766;229767;229768;229769;229770;229771 229752 25 IEDVLPFFPDFVTIDHFK Unmodified 2178.1037 0.10374338 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.67 163.67 3 7.9818E-05 165714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.51 79.327 703300000 72916000 50037000 58740000 53671000 82362000 0 95176000 54573000 63009000 0 94204000 78606000 0 20090 4378 18881 179975;179976;179977;179978;179979;179980;179981;179982;179983;179984 229772;229773;229774;229775;229776;229777;229778;229779;229780;229781 229778 10 IEDVTPIPSDSTR Unmodified 1428.7096 0.70963822 451 A0A2R8Y811;P62263 RPS14 40S ribosomal protein S14 yes no 0 0 0 1 1 1 59.664 59.664 2 0.0018703 58656 QUIQUE_C1218_190116_001 100.82 64.876 166970000 123880000 0 0 0 0 0 0 0 0 43093000 0 0 0 20091 451 18882 179985;179986;179987 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no 0 1 0 1 1 27.549 27.549 2 0.012479 20858 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.657 60.437 60795000 0 0 0 0 0 0 0 34413000 0 26382000 0 0 0 20095 4128 18885 180030;180031 229839;229840 229840 2870 2 IEEEEQEPEPPEPFEYIDD Unmodified 2332.9747 0.97469885 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 142.78 142.78 2 0.0018289 147057 QUIQUE_C1277_190116_001 58.313 53.747 110010000 0 34988000 0 26916000 48104000 0 0 0 0 0 0 0 0 20096 3954 18886 180032;180033;180034 229841;229842;229843 229841 3 IEEELGDEAR Unmodified 1159.5357 0.5356966 1955 P09104;F5H0C8 ENO2 Gamma-enolase;Enolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 33.819 33.819 1;2 2.8264E-31 29631 QUIQUE_C1218_190116_001 204.7 34.379 49007000000 3488600000 4290800000 3647000000 3261500000 4207800000 3284100000 4194700000 3734900000 3232100000 2021600000 5027200000 3966600000 4650000000 20097 1955 18887 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intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.99 143.99 3 0.0010048 139805 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.55 44.088 10837000 0 0 0 10837000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20102 1395 18892 180080;180081;180082;180083 229915;229916;229917;229918 229918 4 IEEFLEEVLCPPK Unmodified 1601.8011 0.80109577 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 2 1 141.34 141.34 2;3 0.00029525 137713 QUIQUE_DMIX4_190116_001 129.7 84.566 479140000 75755000 0 0 76649000 18605000 0 67841000 27792000 42527000 40731000 49577000 35887000 43776000 20103 4646 18893 180084;180085;180086;180087;180088;180089;180090;180091;180092;180093;180094;180095;180096;180097 229919;229920;229921;229922;229923;229924;229925;229926;229927;229928;229929;229930;229931;229932 229928 14 IEEFVYEK Unmodified 1055.5175 0.51752734 55 A0A087WW40;Q9Y371 SH3GLB1 Endophilin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.958 54.958 2 0.0036418 53198 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.4 37.93 681660000 64827000 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18.35 18.35 3 0.006697 10671 QUIQUE_C1368_190116_001 67.08 36.516 33767000 0 18305000 15463000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20123 714 18912 180280;180281 230135;230136 230136 2 IEFGVDVTTK Unmodified 1107.5812 0.58119023 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 77.947 77.947 2 0.035415 79372 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.518 35.7 110910000 0 0 0 0 0 0 0 0 55043000 0 0 0 55872000 20124 2195 18913 180282;180283 230137;230138 230138 2 IEFISTMEGYK Unmodified 1316.6322 0.63223953 3757 Q92820 GGH Gamma-glutamyl hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 100.59 100.59 2 0.0029139 103803 QUIQUE_C1368_190116_001 75.387 45.644 52085000 0 25867000 26218000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20125 3757 18914 180284;180285;180286 230139;230140;230141;230142 230140 4 IEFLQSHENQEIYQK Unmodified 1904.9268 0.92684164 1587;2604 P52294;O60684;O15131 KPNA1;KPNA6;KPNA5 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed;Importin subunit alpha-7;Importin subunit alpha-6 no no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 65.935 65.935 2;3 5.0486E-54 65526 QUIQUE_C1277_190116_001 172.99 148.7 770760000 127920000 115270000 116370000 93304000 51684000 111770000 96163000 0 0 58272000 0 0 0 20126 2604;1587 18915 180287;180288;180289;180290;180291;180292;180293;180294;180295;180296;180297;180298;180299 230143;230144;230145;230146;230147;230148;230149;230150;230151;230152;230153;230154;230155 230145 13 IEFPLPDRR Unmodified 1141.6244 0.62439245 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 63.31 63.31 3 0.032337 62827 QUIQUE_C1218_190116_001 42.348 17.473 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20127 2466 18916 180300 230156 230156 1 IEFSEFIQALSVTSR Unmodified 1725.8938 0.8937506 2741 P62166 NCS1 Neuronal calcium sensor 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 159.87 159.87 2;3 5.3318E-24 164840 QUIQUE_C1368_190116_001 154.28 135.54 104370000 20909000 18036000 50470000 11359000 0 0 0 0 0 3596200 0 0 0 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230175;230176;230177;230178;230179;230180;230181;230182;230183;230184;230185;230186;230187;230188;230189;230190;230191;230192;230193 230176 19 IEFVVVGPEAPLAAGIVGNLR Unmodified 2120.1994 0.19937509 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 2 1 2 157.79 157.79 2;3 7.1569E-07 163114 QUIQUE_C1218_190116_001 81.723 73.333 57603000 34930000 0 0 0 0 11240000 0 0 0 11433000 0 0 0 20131 2194 18920 180326;180327;180328;180329;180330 230194;230195;230196;230197;230198 230194 5 IEGATLLYIHK Unmodified 1256.7129 0.71287311 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.575 66.575 3 0.0029721 66080 QUIQUE_C1368_190116_001 54.286 36.018 294550000 36724000 0 27120000 36180000 27996000 25174000 21649000 0 20771000 16717000 30554000 23112000 28556000 20132 3555 18921 180331;180332;180333;180334;180335;180336;180337;180338;180339;180340;180341 230199;230200;230201;230202;230203;230204;230205;230206;230207;230208;230209;230210 230200 12 IEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSK Unmodified 2909.3463 0.3463112 2748 P62304;A6NHK2 SNRPE Small nuclear ribonucleoprotein E yes no 0 0 0 1 1 1 166.48 166.48 3 1.0797E-19 170534 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.56 101.4 224740000 0 0 0 0 0 0 0 0 74005000 0 77829000 72903000 0 20133 2748 18922 180342;180343;180344 230211;230212;230213 230213 3 IEGDETSTEAATR Unmodified 1378.6212 0.62121715 733 C9JLU1;P52434 POLR2H DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 yes no 0 0 0 1 20.199 20.199 2 6.8514E-05 13203 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.45 93.641 62994000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62994000 0 0 20134 733 18923 180345 230214 230214 1 IEGDMIVCAAYAHELPK Unmodified 1915.9172 0.91720493 442 A0A2R8Y6J3;P46777;Q5T7N0;A0A2R8Y4A2 RPL5 60S ribosomal protein L5 yes no 0 0 0 1 1 97.253 97.253 3 0.0014409 100323 QUIQUE_C1277_190116_001 37.175 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AHNAK yes yes 0 1 0 1 1 1 1 62.015 62.015 2 0.0088892 70661 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.705 45.538 334360000 0 60024000 0 0 0 0 0 60044000 0 0 214300000 0 0 20138 2935 18926 180360;180361;180362;180363 230230;230231;230232;230233 230231 2401 4 IEGFEVLK Unmodified 933.51713 0.51713341 3140 Q15435;C9JD73;C9J177;C9JRC4;H7C118 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.25 77.25 2 0.010594 77784 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.064 30.416 1441900000 178850000 151280000 146000000 160950000 119680000 117600000 140560000 115180000 129130000 73732000 0 108940000 0 20139 3140 18927 180364;180365;180366;180367;180368;180369;180370;180371;180372;180373;180374 230234;230235;230236;230237;230238;230239;230240;230241;230242;230243;230244;230245;230246 230243 13 IEGFEVLKK Unmodified 1061.6121 0.61209643 3140 Q15435;C9JD73;C9J177;C9JRC4;H7C118 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.413 49.413 3 0.005714 47473 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18990 180830;180831;180832;180833;180834;180835;180836;180837;180838;180839;180840;180841;180842 230824;230825;230826;230827;230828;230829;230830;230831;230832;230833;230834;230835;230836;230837 230832 14 IEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLQQR Unmodified 3812.9109 0.91086381 4461 Q9UJW0 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 137.57 137.57 3;4 5.8944E-86 143348 QUIQUE_C1218_190116_001 154.8 144.97 2177600000 164050000 174500000 191960000 155750000 176040000 151790000 133810000 107580000 164070000 54969000 259610000 239660000 203820000 20205 4461 18991 180843;180844;180845;180846;180847;180848;180849;180850;180851;180852;180853;180854;180855;180856;180857;180858;180859;180860;180861;180862;180863;180864;180865;180866;180867;180868 230838;230839;230840;230841;230842;230843;230844;230845;230846;230847;230848;230849;230850;230851;230852;230853;230854;230855;230856;230857;230858;230859;230860;230861;230862;230863;230864;230865;230866;230867 230840 30 IEPEAVLQTR Unmodified 1154.6295 0.62953741 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.465 61.465 2 0.0049519 61450 QUIQUE_C1438_190116_001 79.148 43.853 1466300000 194350000 0 239370000 225520000 155310000 252160000 0 80401000 0 0 83905000 85154000 150160000 20206 1230;4172;346 18992 180869;180870;180871;180872;180873;180874;180875;180876;180877;180878 230868;230869;230870;230871;230872;230873;230874;230875;230876;230877;230878 230871 10 IEPELDGSAQVTSHDASTNGLINFIK Unmodified 2755.3665 0.36645302 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 120.68 120.68 3 2.8677E-46 125981 QUIQUE_C1218_190116_001 142.32 123.28 1387700000 206020000 129760000 99154000 81647000 119220000 66513000 91361000 82372000 69353000 87474000 128230000 157320000 69294000 20207 199 18993 180879;180880;180881;180882;180883;180884;180885;180886;180887;180888;180889;180890;180891;180892;180893 230879;230880;230881;230882;230883;230884;230885;230886;230887;230888;230889;230890;230891;230892;230893;230894;230895;230896;230897;230898;230899;230900;230901;230902 230880 24 IEPELDGSSPVTSHDSSTNGLINFIK Unmodified 2756.3505 0.3504686 790 CON__Q3ZBD7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 125.8 125.8 3 5.2598E-09 130093 QUIQUE_C1218_190116_001 65.901 59.538 287530000 141720000 53928000 0 48162000 0 0 0 0 0 43723000 0 0 0 + 20208 790 18994 180894;180895;180896;180897 230903;230904;230905;230906;230907 230904 5 IEPEPFENCLLR Unmodified 1515.7392 0.73916421 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 104.6 104.6 2 0.016275 108691 QUIQUE_C1218_190116_001 68.657 48.37 229660000 96174000 0 0 74064000 59425000 0 0 0 0 0 0 0 0 20209 2513 18995 180898;180899;180900 230908;230909;230910 230908 1 IEPEPFENCLLRPGSPAR Unmodified 2081.0364 0.036408866 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 90.044 90.044 2;3 3.8949E-07 93474 QUIQUE_C1218_190116_001 119.45 91.243 3242600000 281180000 235520000 264200000 219560000 292700000 186120000 292290000 258860000 192740000 70827000 341220000 239060000 368370000 20210 2513 18996 180901;180902;180903;180904;180905;180906;180907;180908;180909;180910;180911;180912;180913;180914;180915;180916;180917;180918;180919;180920;180921 230911;230912;230913;230914;230915;230916;230917;230918;230919;230920;230921;230922;230923;230924;230925;230926;230927;230928;230929;230930;230931;230932;230933;230934;230935 230913 24 IEPFTTYFLNLQGGK Unmodified 1726.893 0.89302232 910 E9PEM5;P50851;H0YAC6;A0A3B3IU76;A0A3B3IS13;A0A3B3ISK3 LRBA Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 145.49 145.49 2 1.4665E-05 150962 QUIQUE_C1368_190116_001 94.767 69.641 170680000 0 24484000 33778000 17967000 0 0 24885000 0 0 0 38710000 30854000 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Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 86.311 86.311 3 0.016963 87404 QUIQUE_C1403_190116_001 25.185 12.049 24540000 0 0 0 24540000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20214 2096 19000 180944 230958 230958 1 IEPSTVVPAQTPWDKPR Unmodified 1920.0105 0.010511692 3276 Q5JRX3 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 75.181 75.181 3 0.00065266 75781 QUIQUE_C1368_190116_001 65.949 48.668 145150000 0 0 55207000 0 0 0 52347000 0 37593000 0 0 0 0 20215 3276 19001 180945;180946;180947;180948 230959;230960;230961;230962 230960 4 IEPVITDMLR Unmodified 1185.6427 0.64274463 4739 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 168.76 168.76 2 0.001132 170288 QUIQUE_C1563_190116_001 101.33 43.768 85218000 10063000 0 0 8439600 10853000 8131100 0 15787000 0 3993900 0 9309800 18641000 + 20216 4739 19002 180949;180950;180951;180952;180953;180954;180955;180956 230963;230964;230965;230966;230967;230968;230969;230970 230966 8 IEQASLTR Unmodified 916.49779 0.49779495 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.601 20.601 2 0.001227 13412 QUIQUE_C1368_190116_001 144.38 63.998 1102300000 55069000 0 196580000 0 0 0 0 122210000 115610000 0 474040000 60967000 77849000 20217 1975 19003 180957;180958;180959;180960;180961;180962;180963 230971;230972;230973;230974;230975;230976;230977;230978 230973 5 IEQDGIKPEDK Unmodified 1270.6405 0.64049603 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 15.938 15.938 2;3 0.0042358 7733 QUIQUE_C1403_190116_001 117.02 68.739 258730000 57626000 45337000 0 19495000 39003000 13876000 66064000 0 0 17327000 0 0 0 20218 2128 19004 180964;180965;180966;180967;180968;180969;180970;180971;180972 230979;230980;230981;230982;230983;230984;230985;230986;230987;230988 230984 9 IEQEFLTEALPVGLIGMNCILMK Unmodified 2618.3522 0.35218862 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6 RRM2B Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 169.83 169.83 3 4.5977E-07 171573 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.049 56.619 278450000 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1.4888E-10 160119 QUIQUE_C1438_190116_001 76.417 70.311 306890000 26526000 77652000 40655000 0 54776000 0 0 0 0 0 0 0 107290000 20226 4524 19011 181026;181027;181028;181029;181030;181031 231052;231053;231054;231055;231056;231057 231055 2989;2990 5 IEQLCSGAAYCQFMDMLFPGSIALK Unmodified 2849.3261 0.32605023 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.77 170.77 2;3 2.3239E-17 176908 QUIQUE_C1438_190116_001 97.94 91.846 776190000 45152000 67424000 52400000 40360000 60938000 0 71705000 90918000 114650000 0 90610000 120470000 21568000 20227 3150 19012 181032;181033;181034;181035;181036;181037;181038;181039;181040;181041;181042 231058;231059;231060;231061;231062;231063;231064;231065;231066;231067;231068 231062 11 IEQLHQEQANNDFFLLAELLSDYIR Unmodified 3018.5087 0.50870058 3015 Q13596;H0YK42 SNX1 Sorting nexin-1 yes no 0 0 0 1 1 172.39 172.39 3 5.7519E-99 179674 QUIQUE_DMIX5_190116_001 183.42 172.81 85492000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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170385 QUIQUE_C1403_190116_001 122.7 78.4 2493700000 221510000 118730000 289820000 144470000 152620000 146830000 285580000 123670000 194770000 75427000 228870000 200610000 310790000 20230 903;2869 19015 181069;181070;181071;181072;181073;181074;181075;181076;181077;181078;181079;181080;181081;181082 231096;231097;231098;231099;231100;231101;231102;231103;231104;231105;231106;231107;231108;231109;231110;231111;231112;231113;231114;231115;231116 231104 20 IEQSQHLFQAHK Unmodified 1464.7474 0.74736113 2622 P53367 ARFIP1 Arfaptin-1 yes yes 0 0 0 1 1 19.35 19.35 3;4 0.037107 12154 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.645 19.889 154050000 35570000 0 0 0 0 0 0 118480000 0 0 0 0 0 20231 2622 19016 181083;181084 231117;231118 231118 2 IEQVDKEDEITEK Unmodified 1574.7675 0.76754703 4570 Q9Y2X3 NOP58 Nucleolar protein 58 yes yes 0 0 1 1 20.626 20.626 3 0.069703 13557 QUIQUE_DMIX5_190116_001 27.409 7.3999 186630000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 186630000 0 0 20232 4570 19017 181085 231119 231119 1 IESALLDGSER Unmodified 1188.5986 0.59863121 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 1 53.133 53.133 2 0.0065099 52108 QUIQUE_C1438_190116_001 79.148 50.974 37892000 0 0 0 0 37892000 0 0 0 0 0 0 0 0 20233 3042 19018 181086 231120 231120 1 IESEGLLSLTTQLVK Unmodified 1629.9189 0.91890272 1104 G5EA06;Q92552 MRPS27 28S ribosomal protein S27, mitochondrial yes no 0 0 0 1 139.29 139.29 2 0.010902 144301 QUIQUE_C1218_190116_001 67.456 47.153 40881000 40881000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20234 1104 19019 181087 231121 231121 1 IESFVETLK Unmodified 1064.5754 0.57537657 2545 P49770;H0YJJ8;G3V5E5 EIF2B2 Translation initiation factor eIF-2B subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 74.889 74.889 2 0.018244 75175 QUIQUE_C1277_190116_001 91.069 46.674 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20235 2545 19020 181088;181089;181090 231122;231123;231124 231123 3 IESGELDPER Unmodified 1143.5408 0.54078198 2165 P20338;A0A087WYT5 RAB4A Ras-related protein Rab-4A yes no 0 0 0 1 1 1 1 35.506 35.506 2 0.018419 31436 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.378 14.788 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20236 2165 19021 181091;181092;181093;181094 231125;231126;231127;231128 231126 4 IESILMSLPLTAR Unmodified 1442.8167 0.81668625 2398 P36551;H0YA22 CPOX Oxygen-dependent coproporphyrinogen-III oxidase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 135.27 135.27 2 0.00048139 139716 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.4 73.242 82832000 13890000 0 27957000 0 0 0 0 21142000 19843000 0 0 0 0 20237 2398 19022 181095;181096;181097;181098;181099;181100 231129;231130;231131;231132;231133;231134;231135;231136 231136 8 IESLEEEIR Unmodified 1116.5663 0.56626845 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 2 3 3 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 61.273 61.273 2 2.3242E-09 59272 QUIQUE_DMIX4_190116_001 173.23 115.68 94697000000 5911600000 6146300000 10273000000 7940900000 4804000000 9172000000 8179000000 4708700000 8444600000 4695400000 7663400000 6497700000 10261000000 20238 389;395;1336 19023 181101;181102;181103;181104;181105;181106;181107;181108;181109;181110;181111;181112;181113;181114;181115;181116;181117;181118;181119;181120;181121;181122;181123;181124 231137;231138;231139;231140;231141;231142;231143;231144;231145;231146;231147;231148;231149;231150;231151;231152;231153;231154;231155;231156;231157;231158;231159;231160;231161;231162;231163;231164;231165;231166;231167;231168;231169;231170;231171 231162 35 IESLEFLDEMELLEQLMR Oxidation (M) 2253.0909 0.090871782 4448 Q9UIC8 LCMT1 Leucine carboxyl methyltransferase 1 yes yes 0 1 0 1 1 168.61 168.61 2 1.582E-07 176255 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.38 88.148 111090000 0 0 0 0 0 0 86680000 0 0 0 24408000 0 0 20239 4448 19024 181125;181126 231172;231173 231173 2968;2969 2 IESLPPLLIGK Unmodified 1178.7275 0.72746054 495 H3BSW0;A0A3B3ISV5;Q8N9N7 LRRC57 Leucine-rich repeat-containing protein 57 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.71 110.71 2 0.0056749 114183 QUIQUE_C1277_190116_001 86.67 77.807 782520000 70915000 70407000 86185000 76609000 73815000 68077000 90502000 27023000 0 27553000 68770000 52085000 70580000 20240 495 19025 181127;181128;181129;181130;181131;181132;181133;181134;181135;181136;181137;181138 231174;231175;231176;231177;231178;231179;231180;231181;231182;231183;231184;231185 231175 4 IESLSSQLSNLQK Unmodified 1445.7726 0.77257283 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 82.098 82.098 2 2.0489E-21 83452 QUIQUE_C1277_190116_001 169.93 135.4 1507400000 181010000 182880000 226890000 146000000 173350000 189280000 169490000 0 0 88382000 150120000 0 0 20241 2171 19026 181139;181140;181141;181142;181143;181144;181145;181146;181147;181148 231186;231187;231188;231189;231190;231191;231192;231193;231194;231195;231196 231188 10 IESPELDCEEGWTR Unmodified 1719.741 0.74101471 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 85.992 85.992 2 0.00031417 88035 QUIQUE_C1368_190116_001 99.5 86.147 97731000 0 0 47299000 0 0 0 0 0 0 0 50432000 0 0 20242 119 19027 181149;181150 231197;231198 231197 1 IESQHGIERPR Unmodified 1320.6898 0.68984626 4665 Q9Y6V0;E9PE96 PCLO Protein piccolo yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 10.515 10.515 3 9.0495E-06 2892 QUIQUE_C1403_190116_001 124.1 65.733 85374000 6329700 0 12840000 16409000 5722200 0 0 13309000 7975000 0 0 22789000 0 20243 4665 19028 181151;181152;181153;181154;181155;181156;181157 231199;231200;231201;231202;231203;231204;231205;231206;231207;231208 231202 10 IESVLSSSGK Unmodified 1005.5342 0.53424004 2130 P17900 GM2A Ganglioside GM2 activator;Ganglioside GM2 activator isoform short yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.969 27.969 2 0.0011055 22843 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.65 42.729 1036200000 0 111660000 74646000 81934000 92596000 82020000 90599000 55951000 75690000 46079000 134900000 87577000 102510000 20244 2130 19029 181158;181159;181160;181161;181162;181163;181164;181165;181166;181167;181168;181169 231209;231210;231211;231212;231213;231214;231215;231216;231217;231218;231219;231220;231221 231216 11 IESWLETHALLEK Unmodified 1567.8246 0.8246084 4094 Q9C0C9;K7ES11 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.508 92.508 3 0.00045132 95840 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.892 69.95 467620000 38893000 60028000 49729000 0 49620000 0 54366000 0 46074000 0 58283000 40181000 70444000 20245 4094 19030 181170;181171;181172;181173;181174;181175;181176;181177;181178;181179 231222;231223;231224;231225;231226;231227;231228;231229;231230;231231;231232 231229 8 IETALTSLHQR Unmodified 1267.6884 0.68844927 3163 Q15818 NPTX1 Neuronal pentraxin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 35.513 35.513 2;3 0.0010755 31897 QUIQUE_C1218_190116_001 107.21 78.287 541660000 73488000 75533000 55148000 58568000 63264000 42742000 59803000 0 0 21651000 0 37940000 53529000 20246 3163 19031 181180;181181;181182;181183;181184;181185;181186;181187;181188;181189;181190;181191;181192;181193;181194;181195 231233;231234;231235;231236;231237;231238;231239;231240;231241;231242;231243;231244;231245;231246;231247;231248 231234 16 IETATTLK Unmodified 875.4964 0.49639797 4445 Q9UI26;F8WDV0 IPO11 Importin-11 yes no 0 0 0 1 20.551 20.551 2 0.055944 13168 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.205 13.632 9685800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9685800 0 0 0 20247 4445 19032 181196 231249 231249 1 IETDYWPCPPSLAVVETEWR Unmodified 2447.1467 0.14674718 2923 Q08495;E5RFK4 DMTN Dematin yes no 0 0 0 1 1 1 157.89 157.89 3 0.0016598 161641 QUIQUE_C1403_190116_001 49.188 34.418 41009000 0 19907000 0 21102000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20248 2923 19033 181197;181198;181199 231250;231251;231252 231251 3 IETELRDICNDVLSLLEK Unmodified 2159.1144 0.11438442 2780 P63104;E7EX29;B0AZS6;E7ESK7 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 1 1 1 2 3 2 1 2 165.21 165.21 2;3 1.5722E-121 169518 QUIQUE_DMIX8_190116_001 230.38 186.39 7037500000 0 0 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18483000 0 20251 3913 19036 181214;181215;181216;181217;181218;181219;181220;181221;181222;181223;181224 231268;231269;231270;231271;231272;231273;231274;231275;231276;231277;231278 231270 10 IETIAASSTPTPIRK Unmodified 1583.8883 0.88827129 3913 Q96P47;E7ESL9;H7C5G0;H7C4U6 AGAP3 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 40.056 40.056 3 0.052057 36309 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.555 24.928 43934000 0 0 0 0 0 0 0 43934000 0 0 0 0 0 20252 3913 19037 181225 231279 231279 0 IETIEVMEDR Unmodified 1233.5911 0.59110299 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 70.065 70.065 2 2.5819E-11 70284 QUIQUE_C1277_190116_001 159.37 91.611 4937900000 433370000 476070000 478850000 357420000 326590000 306830000 353460000 361800000 278700000 204480000 619830000 375380000 365150000 20253 2601 19038 181226;181227;181228;181229;181230;181231;181232;181233;181234;181235;181236;181237;181238;181239 231280;231281;231282;231283;231284;231285;231286;231287;231288;231289;231290;231291;231292;231293;231294;231295;231296;231297;231298;231299;231300;231301;231302;231303;231304;231305;231306;231307;231308;231309;231310;231311;231312;231313;231314;231315 231284 36 IETIEVMEDR Oxidation (M) 1249.586 0.58601761 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 1 0 1 1 45.214 45.214 2 0.020732 41917 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.78 33.605 153180000 0 83016000 0 0 0 0 0 70166000 0 0 0 0 0 20254 2601 19038 181240;181241 231316;231317 231317 2 IETIPNGYFK Unmodified 1180.6128 0.61282471 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 79.016 79.016 2 0.001331 80514 QUIQUE_C1218_190116_001 98.933 53.552 87632000 21608000 0 0 45351000 0 0 0 0 0 20673000 0 0 0 20255 2598 19039 181242;181243;181244;181245;181246 231318;231319;231320;231321;231322;231323;231324 231318 7 IETLDPALIRPGR Unmodified 1449.8304 0.83036248 2742 P62191 PSMC1 26S protease regulatory subunit 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 73.183 73.183 3 0.0049058 74411 QUIQUE_C1576_190116_001 62.924 54.411 303800000 0 0 116800000 0 61026000 0 61313000 0 0 0 64654000 0 0 20256 2742 19040 181247;181248;181249;181250 231325;231326;231327;231328 231327 4 IETLLTEWNK Unmodified 1245.6605 0.66050319 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 103.18 103.18 2 0.011822 106653 QUIQUE_C1218_190116_001 91.087 49.658 13933000 13933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20257 3684 19041 181251 231329 231329 0 IETMLGDVAVAVHPK Unmodified 1578.844 0.84396364 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.635 91.635 3 9.9017E-05 94000 QUIQUE_C1277_190116_001 81.703 73.169 562310000 0 49000000 53019000 58890000 47098000 46875000 70327000 38434000 48841000 0 59344000 41487000 48994000 20258 2254 19042 181252;181253;181254;181255;181256;181257;181258;181259;181260;181261;181262 231330;231331;231332;231333;231334;231335;231336;231337;231338;231339;231340 231330 11 IETQDIQALR Unmodified 1185.6354 0.63535107 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PQT3;A0A1W2PQY8;A0A1W2PQ37;A0A1W2PQF8;A0A1W2PR68;A0A1W2PRS2;A0A1W2PRY9;A0A1W2PQH4;A0A1W2PRH1 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.488 57.488 2 0.00027507 56645 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.62 73.455 1228800000 139510000 144940000 0 166740000 0 178810000 0 0 0 71628000 197050000 155570000 174510000 20259 374 19043 181263;181264;181265;181266;181267;181268;181269;181270;181271 231341;231342;231343;231344;231345;231346;231347;231348;231349;231350 231348 8 IETSINLAWTAGSNNTR Unmodified 1846.9173 0.91733959 4545 Q9Y277 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 yes yes 0 0 0 1 98.394 98.394 2 0.00018853 99620 QUIQUE_C1563_190116_001 89.959 73.017 32054000 0 0 0 0 0 32054000 0 0 0 0 0 0 0 20260 4545 19044 181272 231351 231351 1 IETSSLDGENRR Unmodified 1375.6692 0.66917039 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 19.3 19.3 2;3 0.00063655 11924 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.71 63.1 749840000 37137000 0 0 0 364410000 0 46452000 54275000 63625000 52107000 71941000 59892000 0 20261 3042 19045 181273;181274;181275;181276;181277;181278;181279;181280;181281 231352;231353;231354;231355;231356;231357;231358;231359;231360 231359 9 IETSYMDGTNR Unmodified 1285.5609 0.5608655 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.955 37.955 2 0.00098767 33573 QUIQUE_C1368_190116_001 91.867 61.297 262970000 0 0 77523000 39852000 61655000 47999000 35942000 0 0 0 0 0 0 20262 2075 19046 181282;181283;181284;181285;181286;181287;181288;181289;181290 231361;231362;231363;231364;231365;231366;231367;231368;231369 231363 9 IETSYMDGTNR Oxidation (M) 1301.5558 0.55578012 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 55.745 55.745 3 0.022096 55037 QUIQUE_C1438_190116_001 41.283 6.7511 225960000 0 0 0 0 46719000 0 86310000 0 0 0 0 0 92930000 20263 2075 19046 181291;181292;181293 231370;231371;231372 231370 3 IETSYMDGTNRR Unmodified 1441.662 0.66197652 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 24.68 24.68 3 0.0057828 18869 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.382 26.763 149600000 0 0 0 0 0 0 0 0 40164000 0 47716000 0 61719000 20264 2075 19047 181294;181295;181296;181297;181298 231373;231374;231375;231376;231377 231374 5 IETVNESWNALATPSDK Unmodified 1873.9058 0.90577185 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.235 96.235 2 4.9159E-181 98865 QUIQUE_DMIX3_190116_001 255.15 234.19 1823800000 147230000 149930000 165090000 158220000 162040000 148400000 131180000 124530000 140240000 70320000 224720000 0 201910000 20265 2180 19048 181299;181300;181301;181302;181303;181304;181305;181306;181307;181308;181309;181310 231378;231379;231380;231381;231382;231383;231384;231385;231386;231387;231388;231389;231390;231391;231392 231387 15 IETVNESWNALATPSDKLFFWNSK Unmodified 2796.3759 0.37589549 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 1 1 148.29 148.29 3 0.027056 151084 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.421 19.353 90918000 0 0 0 0 0 0 0 90918000 0 0 0 0 0 20266 2180 19049 181311 231393 231393 1 IETWHKPDLGTLENVHGLDPNTWK Unmodified 2799.398 0.39802792 2519 P48739;A0A0A0MSW4;B3KYB6;B3KYB7 PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 109.39 109.39 4;5 2.9868E-13 112888 QUIQUE_C1277_190116_001 83.826 71.86 738830000 104950000 187870000 44402000 0 34116000 54755000 0 90772000 0 25052000 78144000 118770000 0 20267 2519 19050 181312;181313;181314;181315;181316;181317;181318;181319;181320;181321 231394;231395;231396;231397;231398;231399;231400;231401;231402;231403;231404;231405;231406;231407 231397 14 IETWHKPDLGTQENVHK Unmodified 2031.0174 0.017387984 2842 Q00169;F5GWE5;I3L4H1;I3L459;I3L4C0;I3L2X8;I3NI10 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 34.031 34.031 3;4 1.0466E-22 29112 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.96 97.879 2240700000 57813000 72706000 138750000 110110000 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231489;231490;231491;231492;231493;231494;231495;231496;231497;231498;231499 231497 1661 11 IEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPK Unmodified 4565.1512 0.15123002 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 3 2 1 160.3 160.3 3;4;5 6.5762E-100 167687 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.75 159.25 3487500000 0 0 0 0 76340000 0 146830000 196360000 360200000 0 1256400000 1278800000 172580000 20274 2281 19056 181395;181396;181397;181398;181399;181400;181401;181402;181403;181404;181405 231500;231501;231502;231503;231504;231505;231506;231507;231508;231509;231510;231511;231512;231513;231514;231515 231509 15 IEVFCER Unmodified 951.4484 0.44840192 4146 Q9H2H8;B8ZZ77;H7BZ14;C9K058;F8WC82;C9J4N2 PPIL3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 45.569 45.569 2 0.062173 42895 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.422 12.396 22846000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22846000 20275 4146 19057 181406 231516 231516 1 IEVGAFNGLPSLNTLELFDNR Unmodified 2318.1907 0.1906609 4289 Q9NT99;M0R2G0 LRRC4B Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes no 0 0 0 1 164.78 164.78 3 0.0025373 168843 QUIQUE_C1277_190116_001 43.116 28.346 15992000 0 15992000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20276 4289 19058 181407 231517 231517 1 IEVGLVVGNSQVAFEK Unmodified 1687.9145 0.91448604 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 2 2 109.77 109.77 2 5.3251E-36 113204 QUIQUE_C1368_190116_001 172.09 148.55 1158000000 0 0 259750000 0 189170000 102550000 145300000 34065000 124400000 0 87671000 165610000 49497000 20277 1245 19059 181408;181409;181410;181411;181412;181413;181414;181415;181416;181417;181418;181419;181420;181421;181422;181423;181424 231518;231519;231520;231521;231522;231523;231524;231525;231526;231527;231528;231529;231530;231531;231532;231533;231534;231535;231536;231537 231521 20 IEVIEIMTDR Oxidation (M) 1233.6275 0.6274885 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8VTQ5;A0A2R8Y4L2;F8VYN5;H0YH80 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 72.141 72.141 2 0.0014915 73128 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.815 54.734 1721200000 125620000 163740000 150690000 109140000 131410000 131210000 107200000 132900000 136170000 0 191630000 210060000 131440000 20278 1049 19060 181425;181426;181427;181428;181429;181430;181431;181432;181433;181434;181435;181436;181437 231538;231539;231540;231541;231542;231543;231544;231545;231546;231547;231548;231549;231550;231551 231548 620 12 IEVIEIMTDR Unmodified 1217.6326 0.63257388 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8VTQ5;A0A2R8Y4L2;F8VYN5;H0YH80 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.64 105.64 2 0.0002246 108311 QUIQUE_C1403_190116_001 134.25 82.251 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IEYDTFGELKVPNDKYYGAQTVR Unmodified 2705.3337 0.33369632 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 97.288 97.288 3 5.6478E-11 98935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.11 85.003 98203000 0 0 0 0 0 0 0 58690000 0 0 0 39513000 0 20296 1935 19077 181632;181633 231817;231818;231819 231817 3 IEYNVEHAVDYVER Unmodified 1734.8213 0.82131394 3185 Q16623 STX1A Syntaxin-1A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 83.089 83.089 2;3 1.1877E-46 84259 QUIQUE_C1403_190116_001 191.06 171.93 3585800000 347270000 441310000 536730000 467200000 342950000 241250000 446330000 49138000 185360000 20394000 83966000 176380000 247530000 20297 3185 19078 181634;181635;181636;181637;181638;181639;181640;181641;181642;181643;181644;181645;181646;181647;181648;181649;181650;181651;181652;181653;181654;181655;181656 231820;231821;231822;231823;231824;231825;231826;231827;231828;231829;231830;231831;231832;231833;231834;231835;231836;231837;231838;231839;231840;231841;231842;231843;231844 231827 22 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231928 29 IFASQASGFSDALTGMVK Unmodified 1828.9029 0.90293508 2897 Q05707;J3QT83 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 1 1 128.08 128.08 2 0.00013101 132041 QUIQUE_C1403_190116_001 89.46 64.605 164720000 0 0 0 76672000 55358000 0 0 0 0 0 0 0 32690000 20306 2897 19086 181741;181742;181743 231954;231955;231956 231954 2 IFAYYDVSK Unmodified 1104.5492 0.54916182 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.056 74.056 2 0.0037167 75715 QUIQUE_C1218_190116_001 90.657 61.319 4692700000 445730000 411480000 387790000 261500000 326870000 409770000 424380000 312570000 437210000 128480000 417770000 446840000 282350000 20307 1678 19087 181744;181745;181746;181747;181748;181749;181750;181751;181752;181753;181754;181755;181756 231957;231958;231959;231960;231961;231962;231963;231964;231965;231966;231967;231968;231969;231970;231971;231972;231973;231974;231975;231976;231977;231978;231979;231980;231981;231982;231983;231984;231985 231958 29 IFCCHGGLSPDLQSMEQIR Oxidation (M) 2263.0184 0.018392316 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;F8W1A0;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;P62136 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.854 73.854 3 4.293E-05 75411 QUIQUE_C1218_190116_001 79.514 70.657 918330000 68576000 107270000 114020000 71662000 63417000 71744000 73180000 46210000 38370000 44141000 66875000 80538000 72333000 20308 2740;1041;2739 19088 181757;181758;181759;181760;181761;181762;181763;181764;181765;181766;181767;181768;181769 231986;231987;231988;231989;231990;231991;231992;231993;231994;231995;231996;231997;231998;231999;232000;232001 231988 610 15 IFCCHGGLSPDLQSMEQIR Unmodified 2247.0235 0.023477694 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;F8W1A0;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;P62136 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.875 98.875 2;3 1.232E-86 101679 QUIQUE_C1277_190116_001 204.18 188.29 2533400000 330100000 378340000 235080000 50650000 267200000 243200000 357050000 0 153300000 0 149710000 172240000 196490000 20309 2740;1041;2739 19088 181770;181771;181772;181773;181774;181775;181776;181777;181778;181779;181780;181781;181782 232002;232003;232004;232005;232006;232007;232008;232009;232010;232011;232012;232013;232014;232015;232016 232006 15 IFCCHGGLSPDLQSMEQIRR Unmodified 2403.1246 0.12458872 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;F8W1A0;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;P62136 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 1 1 1 1 1 1 82.78 82.78 4 1.0208E-06 85090 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.146 71.274 334170000 0 0 0 0 0 0 0 80351000 60936000 0 58317000 62184000 72382000 20310 2740;1041;2739 19089 181783;181784;181785;181786;181787 232017;232018;232019;232020;232021;232022;232023;232024 232020 8 IFCVHGGLSPSIQTLDQIR Unmodified 2140.1099 0.10990816 2693 P60510;H3BTA2;H3BV22 PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 108.67 108.67 3 0.047372 112909 QUIQUE_C1368_190116_001 15.035 6.2121 53336000 0 0 53336000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20311 2693 19090 181788 232025 232025 1 IFDAVGFTFPNR Unmodified 1382.6983 0.69828568 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 125.89 125.89 2;3 8.2297E-47 131774 QUIQUE_DMIX5_190116_001 205.09 132.55 8901300000 858180000 908330000 570540000 638420000 869770000 578060000 780940000 627930000 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232074;232075;232076;232077;232078;232079;232080;232081;232082;232083;232084;232085;232086;232087 232084 13 IFDLENLGKK Unmodified 1175.655 0.65502388 2468 P45381 ASPA Aspartoacylase yes yes 0 0 1 1 1 76.055 76.055 3 0.0055619 77240 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.276 58.989 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20317 2468 19096 181830;181831 232088;232089 232089 2 IFDLQDWTQEDER Unmodified 1693.7584 0.75837933 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;Q5T9Q8 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.38 127.38 2 6.4996E-13 132706 QUIQUE_C1218_190116_001 177.76 94.364 966310000 151880000 72391000 112650000 101250000 69192000 156480000 93300000 0 41051000 67285000 55943000 44887000 0 20318 445 19097 181832;181833;181834;181835;181836;181837;181838;181839;181840;181841;181842 232090;232091;232092;232093;232094;232095;232096;232097;232098;232099;232100;232101 232090 11 IFDLQDWTQEDERDK Unmodified 1936.8803 0.88028538 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;Q5T9Q8 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.94 106.94 3 2.3106E-18 110277 QUIQUE_C1368_190116_001 125.28 108.06 357180000 68036000 52109000 66973000 44312000 0 59236000 44502000 0 22011000 0 0 0 0 20319 445 19098 181843;181844;181845;181846;181847;181848;181849 232102;232103;232104;232105;232106;232107;232108 232104 7 IFDLQDWTQEDERDKDAAK Unmodified 2322.0764 0.076419005 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 1 2 3 1 2 1 1 1 1 1 91.094 91.094 3;4 2.0157E-54 93028 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.15 143.62 1991900000 121220000 102230000 127550000 100270000 246020000 167360000 139320000 325860000 145890000 57377000 133740000 151080000 173990000 20320 445 19099 181850;181851;181852;181853;181854;181855;181856;181857;181858;181859;181860;181861;181862;181863;181864;181865;181866 232109;232110;232111;232112;232113;232114;232115;232116;232117;232118;232119;232120;232121;232122;232123;232124;232125;232126;232127;232128;232129;232130 232124 22 IFDSEEILAGYK Unmodified 1383.6922 0.69219725 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 112.22 112.22 2 5.2864E-05 109669 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.05 110.45 2009900000 272090000 221600000 161560000 162950000 145200000 147070000 136940000 127040000 144580000 111950000 142600000 101490000 134780000 20321 1553 19100 181867;181868;181869;181870;181871;181872;181873;181874;181875;181876;181877;181878;181879;181880 232131;232132;232133;232134;232135;232136;232137;232138;232139;232140;232141;232142;232143;232144;232145;232146;232147;232148;232149 232145 18 IFDSEEILAGYKR Unmodified 1539.7933 0.79330827 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 91.411 91.411 2;3 0.00029384 94728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.918 74.194 719280000 0 0 0 0 25396000 0 0 153210000 126420000 0 143900000 147820000 122520000 20322 1553 19101 181881;181882;181883;181884;181885;181886;181887 232150;232151;232152;232153;232154;232155;232156;232157 232153 7 IFDTSSGHLIQELR Unmodified 1614.8366 0.83657007 3285 Q5MNZ6 WDR45B WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.889 88.889 3 3.5545E-19 92262 QUIQUE_C1218_190116_001 136.51 113.06 463170000 66316000 72324000 76166000 61276000 0 61194000 46329000 0 0 37541000 42019000 0 0 20323 3285 19102 181888;181889;181890;181891;181892;181893;181894;181895;181896 232158;232159;232160;232161;232162;232163;232164;232165;232166 232158 7 IFDTSSGHLIQELRR Unmodified 1770.9377 0.9376811 3285 Q5MNZ6 WDR45B WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 3 yes yes 0 0 1 1 77.284 77.284 4 0.0030551 77269 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.823 38.23 25673000 0 0 0 0 0 0 0 25673000 0 0 0 0 0 20324 3285 19103 181897 232167 232167 1 IFEEQCQTQER Unmodified 1466.646 0.64599211 2270 P27986;H0YBC2 PIK3R1 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.672 29.672 2 0.00010542 24909 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.01 83.542 325240000 0 0 0 0 59614000 0 38383000 28111000 126660000 0 0 0 72474000 20325 2270 19104 181898;181899;181900;181901;181902;181903;181904;181905;181906;181907;181908 232168;232169;232170;232171;232172;232173;232174;232175;232176;232177;232178;232179 232176 12 IFEGTNDILR Unmodified 1176.6139 0.61388734 2539 P49748;G3V1M7;J3QRJ8;J3KSR4 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.156 80.156 2 0.00069041 81341 QUIQUE_C1277_190116_001 107.69 24.944 2254000000 233080000 173540000 237520000 149870000 199850000 209030000 183550000 0 264030000 135410000 0 252200000 215900000 20326 2539 19105 181909;181910;181911;181912;181913;181914;181915;181916;181917;181918;181919 232180;232181;232182;232183;232184;232185;232186;232187;232188;232189;232190;232191;232192;232193 232181 14 IFELTELR Unmodified 1019.5651 0.56514624 3523 Q86YM7;Q86YM6 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.605 98.605 2 0.0039304 100956 QUIQUE_C1403_190116_001 111.01 29.711 416860000 0 53739000 40510000 43026000 0 41553000 45986000 16139000 19759000 9500600 66120000 40497000 40027000 20327 3523 19106 181920;181921;181922;181923;181924;181925;181926;181927;181928;181929;181930 232194;232195;232196;232197;232198;232199;232200;232201;232202;232203;232204 232196 9 IFELTELRDNLAK Unmodified 1560.8512 0.8511575 3523 Q86YM7;Q86YM6 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes no 0 0 1 1 104.28 104.28 3 0.031761 106143 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.938 21.551 28717000 0 0 0 0 0 0 0 28717000 0 0 0 0 0 20328 3523 19107 181931 232205 232205 1 IFEMGPVFTL Oxidation (M) 1168.5838 0.58383277 1781 P00403 MT-CO2 Cytochrome c oxidase subunit 2 yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 1 1 2 149.5 149.5 1;2 0.00080179 153648 QUIQUE_C1403_190116_001 116.9 86.737 796740000 180820000 103610000 27197000 30462000 0 129610000 0 26454000 0 0 95209000 89857000 113520000 20329 1781 19108 181932;181933;181934;181935;181936;181937;181938;181939;181940;181941;181942;181943;181944 232206;232207;232208;232209;232210;232211;232212;232213;232214;232215;232216;232217;232218 232211 987 7 IFEMGPVFTL Unmodified 1152.5889 0.58891815 1781 P00403 MT-CO2 Cytochrome c oxidase subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 167.73 167.73 1;2 0.001484 172042 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.093 82.311 4255100000 621260000 221220000 301610000 326290000 0 216890000 168470000 459440000 590870000 0 673560000 285490000 390010000 20330 1781 19108 181945;181946;181947;181948;181949;181950;181951;181952;181953;181954;181955;181956;181957;181958;181959 232219;232220;232221;232222;232223;232224;232225;232226;232227;232228;232229;232230;232231;232232;232233;232234 232228 12 IFEPNCLDAFPNLK Unmodified 1676.8232 0.82322819 141;2883 A0A0A0MR85;A6NNT0;Q03013 GSTM4 Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 0 2 2 1 126.07 126.07 2;3 6.9514E-14 131279 QUIQUE_C1218_190116_001 141.93 116.55 2151700000 924750000 0 0 1227000000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20331 141;2883 19109 181960;181961;181962;181963;181964 232235;232236;232237;232238;232239;232240;232241;232242 232235 8 IFEPNCLDAFPNLKDFISR Unmodified 2295.1358 0.13578856 141;2883 A0A0A0MR85;A6NNT0;Q03013 GSTM4 Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 149.4 149.4 3 4.5248E-06 153796 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.311 71.413 206490000 21816000 0 0 47163000 0 0 0 53993000 50088000 0 33427000 0 0 20332 141;2883 19110 181965;181966;181967;181968;181969 232243;232244;232245;232246;232247;232248 232247 5 IFEPPPPKK Unmodified 1051.6066 0.60661712 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 1 1 1 20.038 20.038 3 0.0096497 12829 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.436 40.138 45954000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23417000 22538000 0 20333 1506 19111 181970;181971 232249;232250 232249 2 IFEQVLSELEPLCLAEQDFISK Unmodified 2607.3142 0.31420644 4302 Q9NV70 EXOC1 Exocyst complex component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.38 172.38 2;3 1.4162E-09 177566 QUIQUE_C1576_190116_001 99.441 82.01 331320000 11584000 14769000 0 0 36592000 0 34438000 0 0 0 70780000 76332000 86823000 20334 4302 19112 181972;181973;181974;181975;181976;181977;181978;181979 232251;232252;232253;232254;232255;232256;232257;232258;232259;232260;232261;232262 232256 11 IFFDDYVACCVK Unmodified 1535.6789 0.67887214 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676 GCA Grancalcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 117.1 117.1 2 0.00076734 120702 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.496 73.484 836810000 48073000 69992000 76084000 62839000 81348000 47247000 71833000 66457000 45817000 23362000 78140000 71908000 93707000 20335 1210 19113 181980;181981;181982;181983;181984;181985;181986;181987;181988;181989;181990;181991;181992;181993 232263;232264;232265;232266;232267;232268;232269;232270;232271;232272;232273;232274;232275;232276;232277;232278 232278 15 IFFENHPYFR Unmodified 1368.6615 0.66150624 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 81.647 81.647 2;3 7.8417E-12 83172 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.57 136.57 2039600000 46118000 102750000 524940000 37552000 70242000 21219000 131910000 137900000 108510000 30296000 660090000 39844000 128280000 20336 2168 19114 181994;181995;181996;181997;181998;181999;182000;182001;182002;182003;182004;182005;182006;182007;182008;182009;182010 232279;232280;232281;232282;232283;232284;232285;232286;232287;232288;232289;232290;232291;232292;232293;232294;232295;232296;232297;232298;232299;232300;232301 232296 23 IFFHLNAVALGDGGHYTCR Unmodified 2147.0371 0.037077568 1858 P04217;M0R009 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 94.387 94.387 4 2.3475E-05 98343 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polyphosphate 1-phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.354 42.354 2 0.007746 39128 QUIQUE_C1576_190116_001 97.798 75.306 998480000 103090000 90388000 89316000 87816000 86612000 0 82787000 105890000 107970000 41571000 0 96594000 106450000 20340 2531 19118 182015;182016;182017;182018;182019;182020;182021;182022;182023;182024;182025 232308;232309;232310;232311;232312;232313;232314;232315;232316;232317;232318;232319 232313 9 IFGEDFIATFK Unmodified 1286.6547 0.65468953 3282 Q5JX83;Q96MM6 HSPA12B Heat shock 70 kDa protein 12B yes no 0 0 0 1 142.26 142.26 2 0.0023872 149683 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.655 55.915 24290000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24290000 0 0 20341 3282 19119 182026 232320 232320 1 IFGEDFIEQFK Unmodified 1371.6711 0.67106787 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.38 145.38 2 4.4089E-24 149142 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.37 139.02 4322400000 309120000 396370000 329230000 277340000 384140000 227340000 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channel subunit alpha-2/delta-2;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 59.055 59.055 2 0.0088084 57521 QUIQUE_C1368_190116_001 77.741 39.322 119870000 37381000 0 45712000 0 36781000 0 0 0 0 0 0 0 0 20344 715 19122 182051;182052;182053 232359;232360;232361 232360 3 IFGLDIK Unmodified 804.47454 0.47454032 3791 Q969Z3;X1WI34 MARC2 Mitochondrial amidoxime reducing component 2 yes no 0 0 0 1 1 1 99.669 99.669 2 0.050661 102497 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.415 29.804 166190000 0 0 56593000 0 0 0 0 0 0 0 67881000 41718000 0 20345 3791 19123 182054;182055;182056 232362;232363;232364 232364 3 IFGLLMGTLQK Unmodified 1219.6999 0.69986558 4153 Q9H307 PNN Pinin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.56 128.56 2 0.0033259 134150 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.173 54.536 247900000 28593000 28659000 0 24832000 23364000 21966000 27086000 22557000 0 0 19739000 29558000 21551000 20346 4153 19124 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232452;232453;232454;232455;232456;232457;232458;232459;232460;232461;232462;232463;232464;232465;232466;232467;232468 232453 17 IFHDLDMLTTVQEENEPVIYNR Unmodified 2675.2901 0.29011695 2824 P83111 LACTB Serine beta-lactamase-like protein LACTB, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 128.71 128.71 3 2.6141E-10 134273 QUIQUE_C1218_190116_001 102.39 90.084 325210000 44451000 43974000 66758000 62987000 0 0 48062000 0 58974000 0 0 0 0 20352 2824 19130 182125;182126;182127;182128;182129;182130 232469;232470;232471;232472;232473;232474 232469 6 IFHELTQTDK Unmodified 1230.6245 0.62445203 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 27.884 27.884 2;3 0.00022142 22658 QUIQUE_C1218_190116_001 124.74 52.866 2189700000 73856000 121520000 127040000 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232498;232499;232500;232501;232502;232503;232504;232505;232506;232507;232508;232509;232510;232511;232512;232513;232514;232515;232516;232517;232518;232519;232520 232498 23 IFHLEVCSR Unmodified 1159.5808 0.58081308 3756;1664 O75886;Q92783 STAM2;STAM Signal transducing adapter molecule 2;Signal transducing adapter molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.947 50.947 3 0.00093578 48010 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.231 74.078 849550000 63657000 81704000 76551000 67631000 70904000 67737000 68728000 39997000 62660000 25421000 75251000 75903000 73403000 20355 1664;3756 19133 182170;182171;182172;182173;182174;182175;182176;182177;182178;182179;182180;182181;182182 232521;232522;232523;232524;232525;232526;232527;232528;232529;232530;232531;232532;232533;232534;232535 232535 14 IFHSLGPEK Unmodified 1026.5498 0.54983053 1471 O14994 SYN3 Synapsin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 23.929 23.929 2 0.012779 17230 QUIQUE_C1438_190116_001 70.856 44.962 110310000 0 0 0 0 21724000 0 62759000 25825000 0 0 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1 1 1 1 1 86.598 86.598 3 0.0010568 88293 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.72 89.366 431720000 29523000 32800000 53444000 27990000 27919000 38452000 35340000 20967000 42870000 0 43749000 37264000 41405000 20358 3200 19136 182206;182207;182208;182209;182210;182211;182212;182213;182214;182215;182216;182217;182218 232565;232566;232567;232568;232569;232570;232571;232572;232573;232574;232575;232576;232577;232578 232574 14 IFIGTFK Unmodified 824.47963 0.47962569 1298 J3QLE5;P63162;P14678;J3KRY3;S4R3P3 SNRPN;SNRPB Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.873 70.873 2 0.019482 72794 QUIQUE_C1218_190116_001 111.28 41.889 1315600000 164040000 179940000 178590000 0 115140000 0 118190000 0 149640000 0 170860000 129930000 109230000 20359 1298 19137 182219;182220;182221;182222;182223;182224;182225;182226;182227 232579;232580;232581;232582;232583;232584;232585;232586;232587;232588;232589 232579 11 IFILGPSHHVPLSR Unmodified 1571.8936 0.89363144 4576 Q9Y316 MEMO1 Protein MEMO1 yes yes 0 0 0 1 1 61.581 61.581 3 0.033219 61428 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.037 14.574 89816000 0 0 0 0 0 0 0 35165000 0 0 0 0 54651000 20360 4576 19138 182228;182229 232590;232591 232590 1 IFINLPR Unmodified 871.52797 0.52797287 1526 O43396;K7ER96 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.341 83.341 2 0.0098498 84519 QUIQUE_DMIX3_190116_001 148.12 55.838 2577500000 145590000 218710000 218550000 198390000 218630000 169130000 201440000 186900000 200790000 91471000 255700000 218830000 253340000 20361 1526 19139 182230;182231;182232;182233;182234;182235;182236;182237;182238;182239;182240;182241;182242 232592;232593;232594;232595;232596;232597;232598;232599;232600;232601;232602;232603;232604;232605 232600 14 IFINNEWHDSVSGK Unmodified 1644.7896 0.78961988 1776 P00352;Q5SYQ9;Q5SYQ8;Q5SYQ7 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 4 2 2 2 2 66.631 66.631 2;3 1.4009E-22 65834 QUIQUE_DMIX8_190116_001 184.55 133.11 7114300000 405170000 475730000 673360000 690370000 639600000 643190000 519010000 649350000 603080000 239020000 592130000 534780000 449550000 20362 1776 19140 182243;182244;182245;182246;182247;182248;182249;182250;182251;182252;182253;182254;182255;182256;182257;182258;182259;182260;182261;182262;182263;182264;182265;182266;182267;182268;182269;182270 232606;232607;232608;232609;232610;232611;232612;232613;232614;232615;232616;232617;232618;232619;232620;232621;232622;232623;232624;232625;232626;232627;232628;232629;232630;232631;232632;232633;232634;232635;232636;232637;232638;232639;232640;232641;232642;232643;232644;232645;232646;232647;232648;232649;232650;232651;232652;232653;232654;232655;232656;232657;232658 232657 53 IFINNEWHESK Unmodified 1415.6834 0.68336389 1113 H0Y2X5;P47895;H0YNQ3 ALDH1A3 Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3 yes no 0 0 0 1 1 1 51.862 51.862 3 0.006697 49123 QUIQUE_C1277_190116_001 50.149 42.425 51319000 0 22912000 0 0 0 0 0 15203000 0 13203000 0 0 0 20363 1113 19141 182271;182272;182273 232659;232660;232661 232659 3 IFLITLDNSDPSLK Unmodified 1574.8556 0.85557418 3044 Q14139 UBE4A Ubiquitin conjugation factor E4 A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 129.58 129.58 2 0.0012551 134411 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.062 59.254 98501000 0 0 0 0 0 0 0 0 41612000 0 56889000 0 0 20364 3044 19142 182274;182275;182276;182277 232662;232663;232664;232665 232663 4 IFLLGLADNEAAIVQAESEETK Unmodified 2360.2111 0.21112157 4428 Q9UHB9 SRP68 Signal recognition particle subunit SRP68 yes yes 0 0 0 1 156.15 156.15 3 0.0065377 151089 QUIQUE_DMIX4_190116_001 34.405 30.15 11619000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11619000 0 0 0 20365 4428 19143 182278 232666 232666 1 IFLLGLADNEAAIVQAESEETKER Unmodified 2645.3548 0.3548257 4428 Q9UHB9 SRP68 Signal recognition particle subunit SRP68 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 142.43 142.43 3 8.0312E-15 147492 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.14 97.082 312100000 0 60020000 0 0 0 0 0 0 79876000 0 0 98344000 73864000 20366 4428 19144 182279;182280;182281;182282 232667;232668;232669;232670 232668 4 IFLQDIK Unmodified 875.51165 0.5116541 1841 P02794;G3V192;G3V1D1;E9PRK8;E9PKY7;E9PPQ4 FTH1 Ferritin heavy chain;Ferritin heavy chain, N-terminally processed;Ferritin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.361 70.361 2 0.030069 71818 QUIQUE_C1218_190116_001 90.986 22.952 13025000000 1359400000 1165700000 1286300000 1082000000 1121800000 1201300000 0 1107400000 2008800000 627940000 1158900000 905510000 0 20367 1841 19145 182283;182284;182285;182286;182287;182288;182289;182290;182291;182292;182293 232671;232672;232673;232674;232675;232676;232677;232678;232679;232680;232681;232682;232683;232684;232685 232671 15 IFLQDIKKPDCDDWESGLNAMECALHLEK Unmodified 3474.6258 0.6257973 1841 P02794;G3V192;G3V1D1;E9PPQ4 FTH1 Ferritin heavy chain;Ferritin heavy chain, N-terminally processed;Ferritin yes no 0 0 2 1 149.49 149.49 5 0.0028395 152274 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.14 19.513 43881000 0 0 0 0 0 0 0 43881000 0 0 0 0 0 20368 1841 19146 182294 232686 232686 1 IFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMGK Unmodified 2684.4135 0.41352655 2500 P48050 KCNJ4 Inward rectifier potassium channel 4 yes yes 0 0 0 1 168.21 168.21 3 0.00033367 172642 QUIQUE_C1218_190116_001 49.577 37.955 15221000 15221000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20369 2500 19147 182295 232687 232687 0 IFNAEVLFR Unmodified 1107.6077 0.60767976 570 A8MZF9;P55039 DRG2 Developmentally-regulated GTP-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 113.57 113.57 2 0.0070247 117216 QUIQUE_C1368_190116_001 92.439 34.88 70123000 17477000 0 19590000 12601000 0 0 20455000 0 0 0 0 0 0 20370 570 19148 182296;182297;182298;182299;182300 232688;232689;232690;232691;232692 232690 5 IFNFYPR Unmodified 955.49159 0.49158736 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.715 85.715 2 0.0099266 87239 QUIQUE_C1277_190116_001 142.53 80.529 3297100000 312300000 322530000 312100000 263800000 211520000 207380000 264080000 226490000 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921.50724 0.50723743 3050;3051 Q14194;E9PD68;Q14195;H0YBT4 CRMP1;DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 1;Dihydropyrimidinase-related protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.711 77.711 2 0.0075475 78434 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.88 94.877 30655000000 2509500000 2400300000 2413900000 2302700000 2219500000 1850400000 2496700000 2137900000 2666200000 1347200000 2634300000 2583000000 3093300000 20373 3050;3051 19151 182334;182335;182336;182337;182338;182339;182340;182341;182342;182343;182344;182345;182346;182347 232741;232742;232743;232744;232745;232746;232747;232748;232749;232750;232751;232752;232753;232754;232755;232756;232757;232758;232759;232760;232761;232762;232763;232764;232765;232766;232767;232768;232769;232770;232771;232772;232773;232774;232775;232776;232777;232778;232779;232780;232781;232782;232783;232784;232785;232786;232787 232772 47 IFNSFLHTALK Unmodified 1289.7132 0.71320746 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.594 82.594 3 0.00016723 83756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.045 51.202 119530000 0 29036000 17868000 0 24538000 0 0 17244000 0 7885200 22960000 0 0 20374 3270 19152 182348;182349;182350;182351;182352;182353;182354 232788;232789;232790;232791;232792;232793;232794;232795 232792 8 IFNTNNLWISLAAVK Unmodified 1702.9406 0.94064121 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 148.03 148.03 2;3 1.297E-05 152289 QUIQUE_C1403_190116_001 97.911 69.898 3495700000 241940000 237940000 277080000 207230000 240980000 179470000 275380000 362670000 261740000 96375000 464120000 407030000 243730000 20375 3202 19153 182355;182356;182357;182358;182359;182360;182361;182362;182363;182364;182365;182366;182367;182368;182369;182370;182371;182372;182373;182374;182375;182376;182377 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Unmodified 947.4964 0.49639797 4605 Q9Y4E8;H0YI31;F8VZG8;F8VVY7;H0YHM4 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 0 1 1 1 65.401 65.401 2 0.039247 62550 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.142 52.957 36018000 0 0 16677000 19341000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20406 4605 19183 182547;182548;182549 233014;233015;233016 233016 3 IFSNALPDDLR Unmodified 1259.651 0.65100113 4287 Q9NSY0;E9PR11 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.814 89.814 2 0.0012094 92606 QUIQUE_C1576_190116_001 88.392 61.088 219540000 47862000 0 0 0 47535000 0 59213000 0 0 0 0 0 64930000 20407 4287 19184 182550;182551;182552;182553;182554;182555 233017;233018;233019;233020;233021;233022;233023 233022 7 IFSPNVVNLTLVDLPGMTK Oxidation (M) 2073.118 0.11801323 1108;1404 G8JLD5;F8VUJ9;O00429;B4DPZ9;F8W1W3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 145.57 145.57 2;3 1.4948E-73 148640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 186.7 175.8 790180000 51731000 66392000 53666000 46981000 57155000 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233040;233041;233042;233043;233044;233045;233046;233047;233048;233049;233050;233051;233052;233053;233054;233055;233056;233057;233058;233059;233060;233061;233062 233047 23 IFSQETLTK Unmodified 1065.5706 0.57062555 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 44.946 44.946 2 0.0013568 41617 QUIQUE_DMIX7_190116_001 104.44 39.87 302410000 0 0 0 0 0 0 0 160730000 0 0 0 141680000 0 20410 4435 19186 182592;182593 233063;233064 233064 2 IFSQHLQNR Unmodified 1141.5992 0.59924033 3276 Q5JRX3 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 19.631 19.631 2;3 0.00019917 12808 QUIQUE_C1218_190116_001 95.502 65.835 222530000 78290000 0 116210000 0 0 0 28036000 0 0 0 0 0 0 20411 3276 19187 182594;182595;182596;182597;182598;182599;182600;182601;182602 233065;233066;233067;233068;233069;233070;233071;233072;233073 233066 9 IFSSVQWLSGVKPVLSTK Unmodified 1975.1142 0.11424848 4094 Q9C0C9;K7EQ12 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.77 121.77 3 0.00017161 125628 QUIQUE_C1277_190116_001 82.482 44.899 630870000 44553000 40660000 0 30132000 75139000 0 64163000 54625000 90326000 26756000 0 99617000 104890000 20412 4094 19188 182603;182604;182605;182606;182607;182608;182609;182610;182611;182612 233074;233075;233076;233077;233078;233079;233080;233081;233082;233083;233084 233075 6 IFSVTNGGQER Unmodified 1206.5993 0.59929991 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.398 38.398 2 8.3353E-13 35071 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.83 128.86 1076000000 87360000 95761000 80916000 81669000 82910000 99122000 0 104000000 89371000 36948000 112690000 138230000 66979000 20413 2179 19189 182613;182614;182615;182616;182617;182618;182619;182620;182621;182622;182623;182624 233085;233086;233087;233088;233089;233090;233091;233092;233093;233094;233095;233096;233097 233092 13 IFTAEELEAEIGR Unmodified 1476.746 0.74602373 2516 P48723 HSPA13 Heat shock 70 kDa protein 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 125.37 125.37 2 0.0020186 130008 QUIQUE_C1368_190116_001 79.659 64.969 61950000 0 0 0 0 34138000 0 27812000 0 0 0 0 0 0 20414 2516 19190 182625;182626;182627 233098;233099;233100 233098 2 IFTAEELEAEIGRYPFK Unmodified 2012.0255 0.025493054 2516 P48723 HSPA13 Heat shock 70 kDa protein 13 yes yes 0 0 1 1 1 1 139.83 139.83 3 3.6981E-05 144539 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.962 76.311 74252000 0 0 0 0 0 0 0 21575000 0 0 27924000 24752000 0 20415 2516 19191 182628;182629;182630 233101;233102;233103 233103 2 IFTALPLGNPIYQMLELK Unmodified 2060.138 0.13802039 1443 O14772;H0YDF0 FPGT Fucose-1-phosphate guanylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.48 168.48 2 1.622E-11 170434 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.04 110.09 294050000 17197000 0 58069000 18852000 19149000 0 0 24524000 30168000 6941000 0 51704000 67450000 20416 1443 19192 182631;182632;182633;182634;182635;182636;182637;182638;182639 233104;233105;233106;233107;233108;233109;233110;233111;233112;233113 233108 10 IFTASNVSSVPLPAENVTITAGQR Unmodified 2471.302 0.30200227 3047 Q14157;F8W726;Q5VU77 UBAP2L Ubiquitin-associated protein 2-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 118.43 118.43 3 6.4184E-05 123643 QUIQUE_C1576_190116_001 49.287 42.094 284190000 0 0 60140000 45156000 0 47985000 45324000 34861000 0 0 50727000 0 0 20417 3047 19193 182640;182641;182642;182643;182644;182645;182646 233114;233115;233116;233117;233118;233119;233120;233121 233117 8 IFTEDLPEVESLPR Unmodified 1643.8407 0.8406524 3888 Q96JC1 VPS39 Vam6/Vps39-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 119.93 119.93 2 0.010031 122356 QUIQUE_C1563_190116_001 60.598 46.44 53568000 0 27864000 0 0 0 0 25704000 0 0 0 0 0 0 20418 3888 19194 182647;182648;182649;182650 233122;233123;233124;233125 233123 4 IFTIESTR Unmodified 965.5182 0.51819605 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.542 51.542 2 0.015844 49527 QUIQUE_C1368_190116_001 84.097 52.143 1204700000 0 0 195240000 0 0 0 0 145480000 178300000 0 267090000 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20424 3915 19200 182687 233165 233165 1 IFTNLYGR Unmodified 982.52362 0.52361577 1069 G3V0I5;P49821;E9PQP1;E9PPS5 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.461 64.461 2 0.01188 63402 QUIQUE_C1403_190116_001 89.369 52.275 3467500000 328130000 321090000 286960000 220300000 243990000 253930000 282520000 163520000 239470000 128480000 393990000 310310000 294820000 20425 1069 19201 182688;182689;182690;182691;182692;182693;182694;182695;182696;182697;182698;182699;182700 233166;233167;233168;233169;233170;233171;233172;233173;233174;233175;233176;233177;233178;233179;233180;233181;233182 233170 13 IFTPLLHQIELEK Unmodified 1579.8974 0.89737941 2024 P11413 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.41 103.41 3 0.0028759 106891 QUIQUE_C1576_190116_001 47.037 26.656 328360000 34463000 33725000 0 42820000 50469000 65259000 47670000 0 0 10761000 0 0 43194000 20426 2024 19202 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233232;233233;233234;233235;233236;233237;233238;233239;233240;233241;233242;233243;233244;233245;233246;233247;233248;233249;233250;233251;233252;233253;233254;233255;233256;233257;233258;233259;233260;233261;233262;233263;233264;233265;233266;233267;233268;233269;233270;233271;233272;233273;233274;233275;233276 233232 44 IFVEFTSVFDCQK Unmodified 1618.7701 0.77012999 1338 K7ENG2;P26368 U2AF2 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit yes no 0 0 0 1 135.81 135.81 2 0.025716 140347 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.189 35.031 38218000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38218000 0 20434 1338 19210 182764 233277 233277 1 IFVFEPPPGVK Unmodified 1228.6856 0.68559572 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 102.56 102.56 2 0.002132 104519 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.239 59.337 753840000 0 0 0 0 0 0 0 156360000 155730000 70816000 185870000 185070000 0 20435 3053 19211 182765;182766;182767;182768;182769 233278;233279;233280;233281;233282;233283 233278 5 IFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGK Unmodified 2909.3984 0.39842185 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8VTQ5;A0A2R8Y4L2;F8VYN5 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 2 2 1 96.955 96.955 3;4 0.0089359 98852 QUIQUE_DMIX3_190116_001 32.952 26.303 312710000 0 0 0 0 0 0 0 201420000 111290000 0 0 0 0 20436 1049 19212 182770;182771;182772 233284;233285;233286 233286 3 IFVGGIKEDTEEYNLR Unmodified 1881.9472 0.94724273 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 82.916 82.916 2;3 3.081E-18 84016 QUIQUE_C1403_190116_001 178.15 140.15 13553000000 694860000 1268700000 1370600000 942770000 850670000 731150000 980630000 916610000 1190200000 212510000 1718600000 1571800000 1104200000 20437 2601 19213 182773;182774;182775;182776;182777;182778;182779;182780;182781;182782;182783;182784;182785;182786;182787;182788;182789;182790;182791;182792;182793;182794;182795;182796 233287;233288;233289;233290;233291;233292;233293;233294;233295;233296;233297;233298;233299;233300;233301;233302;233303;233304;233305;233306;233307;233308;233309;233310;233311;233312;233313;233314;233315;233316;233317;233318;233319;233320;233321 233299 34 IFVGGIKEDTEEYNLRDYFEK Unmodified 2564.2435 0.24348433 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 2 2 1 1 112.94 112.94 3;4 2.0178E-06 116037 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.987 69.339 521740000 0 0 0 0 0 0 0 394020000 69270000 0 0 58452000 0 20438 2601 19214 182797;182798;182799;182800 233322;233323;233324;233325;233326;233327 233327 6 IFVGGIPHNCGETELR Unmodified 1797.8832 0.88320269 1319 K7EQ55;K7EK33;Q96EP5;K7EQ02 DAZAP1 DAZ-associated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 67.069 67.069 2;3 0.0017205 67211 QUIQUE_C1277_190116_001 61.235 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233360;233361;233362;233363;233364;233365;233366;233367;233368;233369;233370;233371;233372;233373;233374;233375;233376;233377;233378;233379;233380;233381;233382;233383;233384;233385 233382 26 IFVGNVDGADTTPEELAALFAPYGTVMSCAVMK Unmodified 3473.6557 0.65570044 3919 Q96PK6;A0A0A6YYI9;F8WDX3;A0A0A0MSL8;B8ZZ74 RBM14;RBM14-RBM4 RNA-binding protein 14 yes no 0 0 0 1 171.9 171.9 3 6.0458E-46 179231 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.09 100.71 54676000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54676000 0 0 20444 3919 19220 182842 233386 233386 1 IFVGNVSAACTSQELR Unmodified 1750.8672 0.86721827 3919 Q96PK6;A0A0A6YYI9;F8WDX3;A0A0A0MSL8;B8ZZ74 RBM14;RBM14-RBM4 RNA-binding protein 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 79.015 79.015 2 2.9774E-37 80030 QUIQUE_DMIX7_190116_001 177.1 142.57 553980000 0 106240000 102190000 0 0 99959000 65337000 0 0 0 105010000 75250000 0 20445 3919 19221 182843;182844;182845;182846;182847;182848 233387;233388;233389;233390;233391;233392 233392 6 IFVGSSQVPIVFENTDLHSYVVMNHGR Unmodified 3044.5178 0.51782548 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 127.48 127.48 3 8.2421E-21 130214 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.633 87.27 37451000 0 0 0 0 0 0 0 37451000 0 0 0 0 0 20446 2075 19222 182849 233393 233393 1 IFVMATHGLLSSDAPR Unmodified 1713.8872 0.88722543 1565 O60256;I3L0S1;I3L4G9 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 2 86.313 86.313 2;3 1.0073E-09 88297 QUIQUE_C1277_190116_001 124.25 110.17 1778600000 97447000 105160000 81133000 178370000 106170000 120440000 116480000 130860000 156580000 41575000 222720000 201820000 219870000 20447 1565 19223 182850;182851;182852;182853;182854;182855;182856;182857;182858;182859;182860;182861;182862;182863;182864;182865;182866;182867;182868;182869 233394;233395;233396;233397;233398;233399;233400;233401;233402;233403;233404;233405;233406;233407;233408;233409;233410;233411;233412;233413;233414;233415;233416 233395 22 IFVNDDR Unmodified 877.42938 0.42938104 2951 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182925;182926;182927;182928;182929;182930;182931;182932;182933;182934;182935;182936;182937;182938;182939;182940;182941;182942;182943;182944;182945;182946;182947 233483;233484;233485;233486;233487;233488;233489;233490;233491;233492;233493;233494;233495;233496;233497;233498;233499;233500;233501;233502;233503;233504;233505;233506;233507;233508;233509;233510;233511;233512;233513;233514;233515;233516;233517;233518;233519;233520 233483 37 IFYVSHDSQDLK Unmodified 1450.7092 0.70924429 1606 O75052;E9PSG0 NOS1AP Carboxyl-terminal PDZ ligand of neuronal nitric oxide synthase protein yes no 0 0 0 1 1 46.191 46.191 3 0.020963 42884 QUIQUE_C1277_190116_001 42.475 29.712 36437000 20071000 16366000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20457 1606 19233 182948;182949 233521;233522 233522 2 IFYVTEK Unmodified 898.48002 0.48001963 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0;J3QS95;J3QRS7 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 47.466 47.466 2 0.060724 42338 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.176 28.49 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cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 1 1 67.094 67.094 1;2 0.0018988 66006 QUIQUE_C1563_190116_001 138.85 70.815 13870000000 1371400000 1379600000 1255300000 1053600000 1265900000 789610000 1175400000 999050000 934990000 0 1554300000 1102700000 988520000 20460 2120 19236 182972;182973;182974;182975;182976;182977;182978;182979;182980;182981;182982;182983;182984;182985;182986;182987;182988;182989;182990 233560;233561;233562;233563;233564;233565;233566;233567;233568;233569;233570;233571;233572;233573;233574;233575;233576;233577;233578;233579;233580;233581;233582 233570 15 IGAEVYHNLK Unmodified 1142.6084 0.60840804 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 29.446 29.446 2;3 1.398E-11 23838 QUIQUE_C1368_190116_001 162.97 95.8 208850000000 16107000000 12844000000 16267000000 17234000000 15363000000 14352000000 15970000000 17090000000 19258000000 7737700000 20108000000 17002000000 19520000000 20461 1906 19237 182991;182992;182993;182994;182995;182996;182997;182998;182999;183000;183001;183002;183003;183004;183005;183006;183007;183008;183009;183010;183011;183012;183013;183014;183015;183016 233583;233584;233585;233586;233587;233588;233589;233590;233591;233592;233593;233594;233595;233596;233597;233598;233599;233600;233601;233602;233603;233604;233605;233606;233607;233608;233609;233610;233611;233612;233613;233614;233615;233616;233617;233618;233619;233620;233621;233622;233623;233624;233625;233626;233627;233628;233629;233630;233631;233632 233593 50 IGAFGYMECSAK Unmodified 1332.5842 0.58424348 2725 P61586 RHOA Transforming protein RhoA yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.341 74.341 2 0.00050347 75493 QUIQUE_C1438_190116_001 105.86 95.632 4507800000 244260000 361380000 666700000 422860000 377470000 302370000 422850000 240880000 284040000 84717000 415080000 227020000 458210000 20462 2725 19238 183017;183018;183019;183020;183021;183022;183023;183024;183025;183026;183027;183028;183029 233633;233634;233635;233636;233637;233638;233639;233640;233641;233642;233643;233644;233645;233646;233647;233648;233649;233650;233651;233652;233653 233641 19 IGAFGYMECSAK Oxidation (M) 1348.5792 0.5791581 2725 P61586 RHOA Transforming protein RhoA yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 55.507 55.507 2 0.0076276 54554 QUIQUE_C1576_190116_001 64.82 48.939 283900000 0 0 81812000 0 0 0 56847000 0 32560000 0 64538000 48144000 0 20463 2725 19238 183030;183031;183032;183033;183034 233654;233655;233656;233657;233658 233655 2158 5 IGAHGKPVIFLHPK Unmodified 1512.8929 0.89290316 3917 Q96PE7;H7BZS7 MCEE Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 23.103 23.103 4 0.045404 16435 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.496 15.508 31666000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31666000 0 20464 3917 19239 183035 233659 233659 1 IGAHIATPEQLYAAYLGGYEQCDAGWLSDQTVR Unmodified 3652.7256 0.725646 3862 Q96GW7;Q5T3I6 BCAN Brevican core protein yes no 0 0 0 2 1 1 3 1 2 2 2 1 1 1 2 1 156.06 156.06 3;4 1.667E-130 163299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.66 173.86 4330500000 180690000 313230000 685510000 476630000 218530000 274710000 357110000 278440000 308980000 38255000 308310000 402480000 487660000 20465 3862 19240 183036;183037;183038;183039;183040;183041;183042;183043;183044;183045;183046;183047;183048;183049;183050;183051;183052;183053;183054;183055 233660;233661;233662;233663;233664;233665;233666;233667;233668;233669;233670;233671;233672;233673;233674;233675;233676;233677;233678;233679;233680;233681;233682;233683;233684;233685;233686;233687;233688;233689;233690;233691;233692;233693;233694 233689 34 IGAIHSLIFGGFASK Unmodified 1516.8402 0.84019889 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 105.3 105.3 2;3 9.7798E-07 109886 QUIQUE_C1218_190116_001 85.493 75.693 433160000 33160000 51966000 66619000 39264000 0 0 0 67645000 57316000 43440000 73749000 0 0 20466 205 19241 183056;183057;183058;183059;183060;183061;183062;183063;183064 233695;233696;233697;233698;233699;233700;233701;233702;233703;233704;233705;233706 233696 10 IGALEGYR Unmodified 877.46577 0.46576654 1553 O43776;K7EIU7;K7EPK2;K7EQ35;K7EMQ6 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 40.35 40.35 2 0.0020036 36221 QUIQUE_C1368_190116_001 138.37 63.65 894250000 0 0 162530000 0 0 0 202710000 143240000 170400000 0 0 0 215370000 20467 1553 19242 183065;183066;183067;183068;183069 233707;233708;233709;233710;233711 233707 5 IGALQLQLSQLHEQCSSLEK Unmodified 2281.1736 0.17363063 3946 Q96T51;H0YA47 RUFY1 RUN and FYVE domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 97.346 97.346 3 5.8912E-07 100645 QUIQUE_C1576_190116_001 92.31 79.273 182310000 0 65149000 0 69909000 0 0 47253000 0 0 0 0 0 0 20468 3946 19243 183070;183071;183072 233712;233713;233714 233714 3 IGALYIR Unmodified 804.48577 0.48577371 132 A0A0A0MQU4;Q96I15;H7C3V9;H7C277;H7C1N7 SCLY Selenocysteine lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 53.349 53.349 2 0.019338 50858 QUIQUE_C1277_190116_001 114.67 59.21 80476000 0 24986000 0 0 0 25594000 0 20699000 0 9196900 0 0 0 20469 132 19244 183073;183074;183075;183076 233715;233716;233717;233718 233715 4 IGASFLQR Unmodified 890.4974 0.49740102 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 54.849 54.849 1;2 2.4962E-52 53543 QUIQUE_C1277_190116_001 226.98 149.23 23378000000 2343800000 2111200000 1856900000 1551900000 1669300000 1575700000 1671800000 1650500000 1758300000 693130000 2545700000 2018400000 1931100000 20470 1788 19245 183077;183078;183079;183080;183081;183082;183083;183084;183085;183086;183087;183088;183089;183090;183091 233719;233720;233721;233722;233723;233724;233725;233726;233727;233728;233729;233730;233731;233732;233733;233734 233720 6 IGASTLLSDIER Unmodified 1273.6878 0.68778057 969 G3V158;E9PPM8;Q9Y315 DERA Deoxyribose-phosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.89 106.89 2 0.00035662 110247 QUIQUE_C1277_190116_001 98.04 74.896 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20471 969 19246 183092;183093;183094;183095;183096;183097;183098 233735;233736;233737;233738;233739;233740;233741 233735 7 IGAVHTVIFAGFSAESLAGR Unmodified 2002.0636 0.063609895 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 118.26 118.26 3 0.0088929 116892 QUIQUE_DMIX4_190116_001 36.679 27.737 231420000 0 41412000 44760000 0 0 0 0 0 0 100070000 0 45174000 0 20472 4296 19247 183099;183100;183101;183102 233742;233743;233744;233745 233744 4 IGAVNCGDDR Unmodified 1075.4717 0.47165656 3546 Q8IXB1;E7EP04 DNAJC10 DnaJ homolog subfamily C member 10 yes no 0 0 0 1 1 17.973 17.973 2 0.016479 10561 QUIQUE_C1218_190116_001 62.582 36.643 41977000 23244000 18733000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20473 3546 19248 183103;183104 233746;233747 233746 2 IGCFALSEPGNGSDAGAASTTAR Unmodified 2209.007 0.0069592315 2105 P16219 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 78.736 78.736 2 1.5024E-17 80160 QUIQUE_C1576_190116_001 117 79.382 38967000 0 0 0 0 0 0 38967000 0 0 0 0 0 0 20474 2105 19249 183105 233748 233748 1 IGCGSHFCEK Unmodified 1193.4958 0.49576282 3412 Q6UXB8 PI16 Peptidase inhibitor 16 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 14.835 14.835 2;3 0.00044759 6300 QUIQUE_C1563_190116_001 111.46 78.456 400020000 9643800 0 9555400 21279000 0 87215000 6566600 40355000 110240000 0 0 64908000 50258000 20475 3412 19250 183106;183107;183108;183109;183110;183111;183112;183113;183114;183115;183116;183117;183118;183119;183120;183121 233749;233750;233751;233752;233753;233754;233755;233756;233757;233758;233759;233760;233761;233762;233763;233764 233756 14 IGCIITAR Unmodified 902.50077 0.50077184 2950 Q12904 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes yes 0 0 0 1 38.621 38.621 2 0.009742 34735 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.187 35.646 46710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46710000 0 20476 2950 19251 183122 233765 233765 1 IGCPLTPLPPVSIAIR Unmodified 1702.9804 0.98039754 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 127.75 127.75 2 0.0014784 132894 QUIQUE_C1576_190116_001 65.574 59.471 137390000 22142000 31482000 0 27328000 24229000 0 32206000 0 0 0 0 0 0 20477 3102 19252 183123;183124;183125;183126;183127 233766;233767;233768;233769;233770;233771 233771 5 IGCTVSLLNFYK Unmodified 1413.7326 0.73262227 1124 H0Y599;Q8N1I0;H0Y7H7;C9J7D9;C9JDB3;C9J637 DOCK4 Dedicator of cytokinesis protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 119.41 119.41 2 0.020796 122953 QUIQUE_C1277_190116_001 63.283 49.165 63709000 19820000 24001000 0 0 19888000 0 0 0 0 0 0 0 0 20478 1124 19253 183128;183129;183130 233772;233773;233774 233773 1 IGDEDVGR Unmodified 859.40356 0.40356022 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.777 18.777 2 0.0037565 11448 QUIQUE_C1218_190116_001 111.65 60.682 3867500000 544520000 642750000 483120000 527900000 0 486490000 0 473960000 489250000 219520000 0 0 0 20479 2210 19254 183131;183132;183133;183134;183135;183136;183137;183138 233775;233776;233777;233778;233779;233780;233781;233782 233775 8 IGDEYFTFITDCK Unmodified 1607.7178 0.71776007 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 130.74 130.74 2 0.00011908 134937 QUIQUE_C1403_190116_001 100.72 85.75 34557000 0 0 0 0 34557000 0 0 0 0 0 0 0 0 20480 2527 19255 183139;183140;183141;183142 233783;233784;233785;233786 233783 4 IGDEYFTFITDCKDPK Unmodified 1947.8924 0.89242997 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 109.56 109.56 2;3 0.00081121 112892 QUIQUE_C1277_190116_001 91.939 68.713 445870000 27868000 41016000 50339000 49697000 55405000 0 69560000 0 0 0 0 0 151980000 20481 2527 19256 183143;183144;183145;183146;183147;183148;183149 233787;233788;233789;233790;233791;233792;233793;233794;233795 233789 9 IGDFGLATVK Unmodified 1019.5651 0.56514624 453 H7C560;A0A2U3TZI2;A0A2R8Y8E0;P15056;H7C155;P04049;H7C4S5;A0A2R8Y492;Q96II5;P10398 BRAF;RAF1;ARAF Serine/threonine-protein kinase B-raf;RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase;Serine/threonine-protein kinase A-Raf yes no 0 0 0 1 1 1 76.632 76.632 2 0.040288 77217 QUIQUE_C1403_190116_001 71.451 43.746 135380000 0 0 0 43611000 0 0 38682000 0 0 0 53086000 0 0 20482 453 19257 183150;183151;183152 233796;233797;233798 233796 0 IGDFGLVTSLK Unmodified 1148.6441 0.64412484 2149 P19525 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.69 105.69 2 0.00043381 109999 QUIQUE_C1576_190116_001 105.98 74.04 837960000 0 72667000 99842000 57908000 66996000 54341000 78027000 60583000 0 33531000 148800000 82994000 82267000 20483 2149 19258 183153;183154;183155;183156;183157;183158;183159;183160;183161;183162;183163;183164 233799;233800;233801;233802;233803;233804;233805;233806;233807;233808;233809;233810;233811 233805 12 IGDFIDVSEGPLIPR Unmodified 1626.8617 0.86172219 724 C9JG87;Q9NYK5 MRPL39 39S ribosomal protein L39, mitochondrial yes no 0 0 0 1 136.34 136.34 2 0.014836 141254 QUIQUE_C1218_190116_001 66.267 41.923 24138000 24138000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20484 724 19259 183165 233812 233812 1 IGDGEDDETEEGAGDMSQVKPVLSK Unmodified 2605.1701 0.17012097 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 1 1 74.719 74.719 3 2.4324E-10 75346 QUIQUE_C1218_190116_001 79.021 74.95 47707000 47707000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20485 77 19260 183166 233813;233814 233813 2 IGDKEGALTAFR Unmodified 1276.6776 0.67755023 3095 Q15008;C9J0E9 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 0 1 1 1 1 47.979 47.979 3 0.002856 45255 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.479 55.82 210070000 0 0 0 0 0 0 0 70785000 62935000 0 0 76351000 0 20486 3095 19261 183167;183168;183169 233815;233816;233817 233816 0 IGDKLDIICPR Unmodified 1298.7017 0.70165649 2836 P98172 EFNB1 Ephrin-B1 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233905;233906;233907;233908;233909;233910;233911;233912;233913;233914;233915;233916;233917;233918;233919;233920;233921;233922;233923;233924;233925;233926;233927;233928;233929 233906 25 IGDQEFDSLPALLEFYK Unmodified 1983.983 0.98295954 2479 P46108;I3L297 CRK Adapter molecule crk yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 164.92 164.92 2;3 1.8653E-53 169304 QUIQUE_DMIX3_190116_001 224.42 210.76 2370800000 244970000 27652000 154820000 0 211820000 144480000 295700000 210220000 207590000 10518000 326640000 346920000 189430000 20495 2479 19269 183252;183253;183254;183255;183256;183257;183258;183259;183260;183261;183262;183263;183264;183265;183266;183267 233930;233931;233932;233933;233934;233935;233936;233937;233938;233939;233940;233941;233942;233943;233944;233945;233946;233947;233948 233941 17 IGDSSQGDNNLQK Unmodified 1374.6375 0.63753591 274 A0A0D9SG77;A0A1B0GVL3;Q05086 UBE3A Ubiquitin-protein ligase E3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.733 17.733 2 3.5346E-17 10796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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P12081;B4DDD8;B3KWE1;E7ETE2;B4E1C5 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.29 133.29 3 1.4614E-24 137488 QUIQUE_C1403_190116_001 130.09 112.72 1304400000 110420000 112560000 146680000 122530000 107890000 116790000 132870000 134760000 0 66055000 120960000 0 132860000 20501 2035 19275 183306;183307;183308;183309;183310;183311;183312;183313;183314;183315;183316 233988;233989;233990;233991;233992;233993;233994;233995;233996;233997;233998 233991 9 IGEAEAAVIEAMGK Unmodified 1387.7017 0.70171607 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 111.58 111.58 2 0.0067716 116062 QUIQUE_C1576_190116_001 76.255 38.234 25855000 0 0 0 0 0 0 25855000 0 0 0 0 0 0 20502 3057 19276 183317 233999 233999 1 IGEDFISDLDQLR Unmodified 1519.7518 0.75183739 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.99 143.99 2 0.00027099 149729 QUIQUE_C1218_190116_001 112.13 77.562 3136000000 176450000 240160000 354390000 348800000 233110000 288430000 321560000 125100000 295750000 160800000 130150000 265630000 195620000 20503 2017 19277 183318;183319;183320;183321;183322;183323;183324;183325;183326;183327;183328;183329;183330 234000;234001;234002;234003;234004;234005;234006;234007;234008;234009;234010;234011;234012;234013;234014 234001 13 IGEDFISDLDQLRK Unmodified 1647.8468 0.84680041 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 1 122.67 122.67 2;3 3.188E-11 125419 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.96 102.82 3604600000 72556000 213560000 248920000 323290000 199860000 173060000 375550000 532550000 510490000 99767000 152450000 421280000 281290000 20504 2017 19278 183331;183332;183333;183334;183335;183336;183337;183338;183339;183340;183341;183342;183343;183344;183345;183346;183347;183348 234015;234016;234017;234018;234019;234020;234021;234022;234023;234024;234025;234026;234027;234028;234029;234030;234031;234032;234033;234034;234035;234036;234037;234038;234039;234040;234041 234031 25 IGEEEIQKPEEK Unmodified 1427.7144 0.71438925 3141 Q15459 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 24.246 24.246 2;3 3.7669E-27 17849 QUIQUE_C1218_190116_001 181.4 146.68 716230000 136050000 81476000 44938000 108020000 0 71796000 42507000 87940000 83070000 20796000 0 0 39628000 20505 3141 19279 183349;183350;183351;183352;183353;183354;183355;183356;183357;183358;183359;183360;183361;183362;183363;183364;183365 234042;234043;234044;234045;234046;234047;234048;234049;234050;234051;234052;234053;234054;234055;234056;234057;234058 234042 16 IGEEFLTDLSQLK Unmodified 1491.7821 0.78207489 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.55 142.55 2 6.1134E-08 147202 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.67 147.67 11105000000 1198700000 1032300000 1269000000 824340000 960920000 976790000 1070300000 372870000 776210000 523000000 768780000 609230000 722160000 20506 2016 19280 183366;183367;183368;183369;183370;183371;183372;183373;183374;183375;183376;183377;183378 234059;234060;234061;234062;234063;234064;234065;234066;234067;234068;234069;234070;234071;234072;234073;234074;234075;234076;234077;234078;234079;234080;234081;234082;234083;234084;234085 234077 27 IGEEFLTDLSQLKK Unmodified 1619.877 0.8770379 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 117.91 117.91 2;3 6.3955E-23 121453 QUIQUE_C1277_190116_001 135.04 122.9 13795000000 517750000 800360000 962740000 662840000 875550000 529240000 718520000 1428100000 1616300000 226800000 1787100000 1776500000 1892800000 20507 2016 19281 183379;183380;183381;183382;183383;183384;183385;183386;183387;183388;183389;183390;183391;183392;183393;183394;183395;183396;183397;183398;183399;183400;183401;183402;183403 234086;234087;234088;234089;234090;234091;234092;234093;234094;234095;234096;234097;234098;234099;234100;234101;234102;234103;234104;234105;234106;234107;234108;234109;234110;234111;234112;234113;234114;234115;234116;234117;234118;234119;234120;234121;234122;234123;234124;234125;234126;234127;234128;234129;234130;234131;234132;234133;234134;234135;234136;234137 234090 52 IGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAK Unmodified 2872.3515 0.35153123 2933 Q09028;H0YCT5;H0YF10;H0YDK2;H0YEU5 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 1 91.624 91.624 3;4 1.6942E-44 94662 QUIQUE_C1438_190116_001 134.91 122.36 1345200000 0 252860000 57382000 51481000 74538000 62379000 270740000 164430000 73356000 85601000 197620000 54797000 0 20508 2933 19282 183404;183405;183406;183407;183408;183409;183410;183411;183412;183413;183414;183415;183416;183417;183418;183419;183420 234138;234139;234140;234141;234142;234143;234144;234145;234146;234147;234148;234149;234150;234151;234152;234153;234154;234155;234156;234157;234158;234159 234143 22 IGEGTYGTVFK Unmodified 1170.5921 0.59208927 2844 Q00535 CDK5 Cyclin-dependent-like kinase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.777 66.777 2 0.0092213 66622 QUIQUE_C1277_190116_001 63.426 32.834 1093300000 0 320200000 0 0 258090000 180290000 0 0 0 0 334710000 0 0 20509 2844 19283 183421;183422;183423;183424 234160;234161;234162;234163 234160 2 IGEHMEEHGIK Unmodified 1278.6027 0.60267073 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 16.304 16.304 2;3 0.0019934 9092 QUIQUE_C1218_190116_001 81.099 10.547 802230000 37360000 214910000 151210000 0 43451000 0 0 122760000 152180000 0 41039000 0 39320000 20510 22 19284 183425;183426;183427;183428;183429;183430;183431;183432;183433;183434 234164;234165;234166;234167;234168;234169;234170;234171;234172;234173;234174 234164 11 IGEHTPSALAIMENANVLAR Oxidation (M) 2122.0841 0.084087341 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BR04;H3BU78 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 1 0 3 4 2 3 4 3 4 3 3 4 4 4 2 84.143 84.143 2;3 1.7893E-23 82040 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.16 111.6 17620000000 1500200000 1897400000 984270000 1287500000 1491700000 1204600000 1396800000 964620000 1361900000 1157200000 2031600000 1566900000 775720000 20511 1851 19285 183435;183436;183437;183438;183439;183440;183441;183442;183443;183444;183445;183446;183447;183448;183449;183450;183451;183452;183453;183454;183455;183456;183457;183458;183459;183460;183461;183462;183463;183464;183465;183466;183467;183468;183469;183470;183471;183472;183473;183474;183475;183476;183477 234175;234176;234177;234178;234179;234180;234181;234182;234183;234184;234185;234186;234187;234188;234189;234190;234191;234192;234193;234194;234195;234196;234197;234198;234199;234200;234201;234202;234203;234204;234205;234206;234207;234208;234209;234210;234211;234212;234213;234214;234215;234216;234217;234218;234219;234220;234221;234222;234223;234224;234225;234226 234212 1065 48 IGEHTPSALAIMENANVLAR Unmodified 2106.0892 0.089172718 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BR04;H3BU78 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 2 2 3 2 3 2 4 4 2 2 4 2 2 118.85 118.85 2;3;4 0 122609 QUIQUE_C1403_190116_001 292.81 276.87 112730000000 10388000000 9298300000 10002000000 9184500000 8110800000 6934400000 8747900000 8639800000 8907100000 2938400000 11836000000 8363100000 9381500000 20512 1851 19285 183478;183479;183480;183481;183482;183483;183484;183485;183486;183487;183488;183489;183490;183491;183492;183493;183494;183495;183496;183497;183498;183499;183500;183501;183502;183503;183504;183505;183506;183507;183508;183509;183510;183511 234227;234228;234229;234230;234231;234232;234233;234234;234235;234236;234237;234238;234239;234240;234241;234242;234243;234244;234245;234246;234247;234248;234249;234250;234251;234252;234253;234254;234255;234256;234257;234258;234259;234260;234261;234262;234263;234264;234265;234266;234267;234268;234269;234270;234271;234272;234273;234274;234275;234276;234277;234278;234279;234280;234281;234282;234283;234284;234285;234286;234287;234288;234289;234290;234291;234292;234293;234294;234295;234296;234297;234298;234299;234300;234301;234302;234303;234304;234305;234306;234307;234308;234309;234310;234311;234312;234313;234314;234315;234316;234317;234318;234319;234320;234321;234322;234323;234324;234325;234326;234327;234328;234329;234330;234331;234332 234256 104 IGEIVAEMDVPLHCR Unmodified 1737.8542 0.85421075 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0;X6RFQ9;X6RCI6;H7C3M4 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 2 2 93.896 93.896 2;3 1.4692E-05 97746 QUIQUE_C1218_190116_001 112.13 88.89 879290000 54986000 110300000 33376000 25038000 27411000 84114000 45605000 0 88073000 26290000 183640000 0 200460000 20513 3296 19286 183512;183513;183514;183515;183516;183517;183518;183519;183520;183521;183522;183523;183524;183525;183526;183527 234333;234334;234335;234336;234337;234338;234339;234340;234341;234342;234343;234344;234345;234346;234347;234348 234333 14 IGELEQSLLLEK Unmodified 1370.7657 0.76569654 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.7 104.7 2 0.00048824 107700 QUIQUE_C1403_190116_001 107.11 57.399 653720000 0 0 0 52053000 0 87202000 87070000 54779000 77221000 26661000 92999000 77573000 98159000 20514 4414 19287 183528;183529;183530;183531;183532;183533;183534;183535;183536 234349;234350;234351;234352;234353;234354;234355;234356;234357;234358 234350 10 IGELLDQASVTR Unmodified 1300.6987 0.69867961 4321 Q9NX46 ADPRHL2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.01 74.01 2 0.00071589 75268 QUIQUE_C1438_190116_001 89.548 21.985 748010000 81952000 57739000 91704000 68634000 74606000 51932000 68360000 62771000 0 45787000 70892000 73629000 0 20515 4321 19288 183537;183538;183539;183540;183541;183542;183543;183544;183545;183546;183547 234359;234360;234361;234362;234363;234364;234365;234366;234367;234368;234369;234370;234371;234372 234364 14 IGELNPEDK Unmodified 1013.5029 0.50293991 2591 P51687 SUOX Sulfite oxidase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 29.666 29.666 2 0.014814 24083 QUIQUE_C1368_190116_001 68.016 58.622 165260000 0 43853000 76537000 0 0 0 0 0 0 0 0 44866000 0 20516 2591 19289 183548;183549;183550;183551;183552 234373;234374;234375;234376;234377 234374 5 IGELVGVLVNHFK Unmodified 1423.8187 0.81873516 1302 K7EIG7;J3QRN6;O94832 MYO1D Unconventional myosin-Id yes no 0 0 0 1 1 1 119.32 119.32 3 4.7906E-05 124537 QUIQUE_C1277_190116_001 92.112 71.052 27247000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27247000 0 0 20517 1302 19290 183553;183554;183555 234378;234379;234380 234378 3 IGEMPLTDSILCDGLTDAFHNCHMGITAENVAK Unmodified 3629.6623 0.66225916 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.66 145.66 4 8.3433E-66 149842 QUIQUE_C1277_190116_001 138.7 123.77 1087900000 70053000 127060000 106470000 106650000 52556000 58718000 113880000 76495000 74976000 0 76543000 109940000 114540000 20518 4054 19291 183556;183557;183558;183559;183560;183561;183562;183563;183564;183565;183566;183567 234381;234382;234383;234384;234385;234386;234387;234388;234389;234390;234391;234392 234382 12 IGEMPLTDSILCDGLTDAFHNCHMGITAENVAK Oxidation (M) 3645.6572 0.65717378 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 1 0 1 138.62 138.62 4 1.4871E-29 143060 QUIQUE_C1277_190116_001 90.98 76.163 67106000 0 67106000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20519 4054 19291 183568 234393 234393 2843 1 IGETIFFR Unmodified 981.52837 0.5283668 3354 Q6BCY4;E9PMI2;E9PIV9;E9PQW2 CYB5R2 NADH-cytochrome b5 reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.792 92.792 2 0.00029504 94600 QUIQUE_C1368_190116_001 160.03 119.92 276100000 39434000 33180000 36035000 36347000 48710000 27353000 0 37767000 0 17269000 0 0 0 20520 3354 19292 183569;183570;183571;183572;183573;183574;183575;183576 234394;234395;234396;234397;234398;234399;234400;234401;234402;234403;234404;234405;234406 234398 13 IGEWELIQESGVPLKPLFGPGYTGIR Unmodified 2855.5222 0.5221658 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 3 2 2 154.29 154.29 2;3;4 6.0028E-142 159108 QUIQUE_DMIX3_190116_001 206.98 190.99 5250800000 0 610610000 32429000 26042000 33618000 301020000 1020400000 529400000 34820000 199920000 897800000 718240000 846510000 20521 2472 19293 183577;183578;183579;183580;183581;183582;183583;183584;183585;183586;183587;183588;183589;183590;183591;183592;183593 234407;234408;234409;234410;234411;234412;234413;234414;234415;234416;234417;234418;234419;234420;234421;234422;234423 234415 16 IGEYLEK Unmodified 850.44363 0.44363412 3499 Q86VP6;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 32.752 32.752 2 0.029232 28223 QUIQUE_C1277_190116_001 91.626 4.7602 1176700000 0 419660000 349140000 0 0 0 0 0 0 0 0 407900000 0 20522 3499 19294 183594;183595;183596 234424;234425;234426;234427 234424 4 IGFDVVTLSGTR Unmodified 1263.6823 0.68230126 3326 Q5TDF0;Q9BSD7 NTPCR Cancer-related nucleoside-triphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.75 106.75 2 0.0018542 109970 QUIQUE_C1277_190116_001 78.653 58.866 504630000 52468000 37726000 0 59540000 0 69638000 62190000 26801000 63125000 21385000 63170000 48588000 0 20523 3326 19295 183597;183598;183599;183600;183601;183602;183603;183604;183605;183606 234428;234429;234430;234431;234432;234433;234434;234435;234436;234437;234438;234439;234440;234441 234429 14 IGFEAVMR Unmodified 921.47422 0.47422274 1734;1733 O95487;O95486 SEC24B;SEC24A Protein transport protein Sec24B;Protein transport protein Sec24A no no 0 0 0 1 92.625 92.625 2 0.05326 94814 QUIQUE_C1277_190116_001 71.378 4.0341 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20524 1734;1733 19296 183607 234442 234442 1 IGFEEKDIAANEENRK Unmodified 1861.917 0.91700524 1627 O75368 SH3BGRL SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein yes yes 0 0 2 1 2 1 40.04 40.04 2;3;4 1.7113E-13 36272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.45 103.53 666680000 0 0 0 0 0 0 0 136500000 276020000 0 0 254150000 0 20525 1627 19297 183608;183609;183610;183611 234443;234444;234445;234446 234445 3 IGFFNQQYAEQLR Unmodified 1612.7998 0.79979063 1157 H0YGW7;Q8NE71 ABCF1 ATP-binding cassette sub-family F member 1 yes no 0 0 0 1 1 107.47 107.47 2 0.0021831 111093 QUIQUE_C1368_190116_001 74.944 60.525 104430000 0 0 50312000 0 0 0 54118000 0 0 0 0 0 0 20526 1157 19298 183612;183613 234447;234448 234447 2 IGFFQGDIR Unmodified 1051.5451 0.5450795 2354 P33121;E7EPM6;B7Z3Z9;D6RER0;H0Y9Z9 ACSL1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 yes no 0 0 0 1 1 88.18 88.18 2 0.012734 89683 QUIQUE_C1403_190116_001 70.919 44.317 16077000 0 0 0 16077000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20527 2354 19299 183614;183615 234449;234450 234449 2 IGFGPIPFSLPEGLPK Unmodified 1667.9287 0.92867954 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 155.35 155.35 2 0.011201 158129 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.207 38.342 105670000 0 0 0 0 0 0 0 105670000 0 0 0 0 0 20528 2033 19300 183616 234451 234451 1 IGFGQCAGK Unmodified 936.44874 0.44873627 2114 P16930 FAH Fumarylacetoacetase yes yes 0 0 0 1 1 27.103 27.103 2 0.019849 20570 QUIQUE_C1368_190116_001 63.306 27.813 291830000 0 0 217340000 0 0 0 0 0 0 74497000 0 0 0 20529 2114 19301 183617;183618 234452;234453 234452 2 IGFPETTEEELEEIASENSDCIFPSAPDVK Unmodified 3352.5181 0.51806379 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 164.91 164.91 3 7.4083E-25 168535 QUIQUE_C1277_190116_001 84.948 82.532 107100000 0 22943000 30227000 35398000 0 18529000 0 0 0 0 0 0 0 20530 4592 19302 183619;183620;183621;183622 234454;234455;234456;234457;234458;234459 234454 6 IGFPSTSPAK Unmodified 1003.5338 0.53384611 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 44.124 44.124 2 0.029351 41158 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.465 1.045 21482000 0 0 0 21482000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20531 4414 19303 183623;183624;183625 234460;234461;234462 234462 3 IGFPWSEIR Unmodified 1103.5764 0.57637963 859;2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.25 118.25 2 0.00041587 123853 QUIQUE_C1218_190116_001 133.55 97.668 28327000000 1573800000 1880300000 2390400000 2094700000 2059200000 1706100000 2210800000 1996700000 3036500000 941220000 2799400000 2660500000 2977700000 20532 2248;434;859 19304 183626;183627;183628;183629;183630;183631;183632;183633;183634;183635;183636;183637;183638 234463;234464;234465;234466;234467;234468;234469;234470;234471;234472;234473;234474;234475;234476;234477;234478;234479;234480;234481;234482;234483;234484;234485;234486;234487;234488;234489;234490;234491;234492;234493;234494;234495 234464 33 IGFVGFPSVGK Unmodified 1106.6124 0.61243078 4549 Q9Y295 DRG1 Developmentally-regulated GTP-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 104.66 104.66 2 0.029666 108140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.436 18.173 22589000 0 0 0 0 0 0 0 0 22589000 0 0 0 0 20533 4549 19305 183639 234496 234496 1 IGGDAATTVNNSTPDFGFGGQK Unmodified 2153.0025 0.0025257806 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R0I5 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.186 93.186 2 4.8835E-21 95280 QUIQUE_DMIX8_190116_001 167.55 151.02 964370000 84125000 75785000 53599000 100730000 86971000 53663000 78112000 65320000 71313000 29021000 103580000 77215000 84933000 20534 3770 19306 183640;183641;183642;183643;183644;183645;183646;183647;183648;183649;183650;183651;183652 234497;234498;234499;234500;234501;234502;234503;234504;234505;234506;234507;234508;234509 234509 13 IGGDAGTSLNSNDYGYGGQK Unmodified 1972.8763 0.87626263 909 E9PEB5;Q96AE4;C9JSZ1 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.028 62.028 2 3.5848E-75 61148 QUIQUE_C1277_190116_001 244.58 235.85 661730000 53704000 56727000 45661000 55823000 57165000 47151000 44425000 52530000 51960000 0 74784000 55382000 66418000 20535 909 19307 183653;183654;183655;183656;183657;183658;183659;183660;183661;183662;183663;183664;183665 234510;234511;234512;234513;234514;234515;234516;234517;234518;234519;234520;234521;234522 234511 13 IGGDSGLSVR Unmodified 959.50361 0.50360861 1594 O60825;I1Z9G3;P16118 PFKFB2;PFKFB1 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase;6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 1;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.439 32.439 2 0.0016705 27457 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.85 35.933 2158900000 258730000 203440000 0 0 239110000 176040000 0 279930000 281720000 102280000 284490000 0 333160000 20536 1594 19308 183666;183667;183668;183669;183670;183671;183672;183673;183674 234523;234524;234525;234526;234527;234528;234529;234530;234531 234528 4 IGGGIDVPVPR Unmodified 1078.6135 0.61349341 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R0I5 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.831 71.831 2 2.3904E-05 73499 QUIQUE_C1218_190116_001 139.74 109.05 1681300000 145520000 184110000 132590000 151800000 139560000 114310000 121810000 106990000 123150000 46600000 146550000 126670000 141630000 20537 3770 19309 183675;183676;183677;183678;183679;183680;183681;183682;183683;183684;183685;183686;183687 234532;234533;234534;234535;234536;234537;234538;234539;234540;234541;234542;234543;234544;234545;234546;234547;234548;234549;234550;234551;234552;234553;234554;234555;234556;234557;234558;234559 234534 28 IGGGIGFGGLEAMNSMGGFGGVGR Unmodified 2197.0408 0.040842317 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0;A0A0C4DGV1 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 146.42 146.42 2 8.3788E-06 150962 QUIQUE_C1277_190116_001 83.54 72.327 24018000 0 24018000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20538 140 19310 183688 234560 234560 1 IGGIFAFK Unmodified 851.49052 0.49052473 2196 P22307;H0YF61 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 91.026 91.026 2 0.017542 92567 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.381 46.489 748130000 0 109930000 0 80773000 0 0 86795000 97146000 86764000 53859000 152840000 80020000 0 20539 2196 19311 183689;183690;183691;183692;183693;183694;183695;183696 234561;234562;234563;234564;234565;234566;234567;234568 234564 8 IGGIGTVPVGR Unmodified 1024.6029 0.60292873 2794;469 A0A2U3TZH3;Q05639;P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9 EEF1A2;EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 2;Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.664 54.664 2 1.1162E-05 53382 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.09 97.663 61855000000 4496000000 4995500000 5973100000 5724000000 4649100000 4764300000 4562000000 4950900000 4484500000 2164000000 5435100000 4565100000 5092000000 20540 469;2794 19312 183697;183698;183699;183700;183701;183702;183703;183704;183705;183706;183707;183708;183709 234569;234570;234571;234572;234573;234574;234575;234576;234577;234578;234579;234580;234581;234582;234583;234584;234585;234586 234578 18 IGGILANELSVDEAALHAAVIAINEAIDR Unmodified 2957.5822 0.58219987 2487 P46940;A0A0J9YXZ5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 175.38 175.38 4 0.0019162 182492 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.111 24.462 13686000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13686000 0 0 20541 2487 19313 183710 234587 234587 1 IGGNEGIDVPIPR Unmodified 1335.7147 0.71466402 909 E9PEB5;Q96AE4 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.228 85.228 2 0.0011361 88269 QUIQUE_C1438_190116_001 106.16 82.838 1134700000 118270000 112440000 102840000 107180000 121890000 111500000 0 78340000 99628000 34588000 154430000 93648000 0 20542 909 19314 183711;183712;183713;183714;183715;183716;183717;183718;183719;183720;183721 234588;234589;234590;234591;234592;234593;234594;234595;234596;234597;234598;234599;234600 234593 12 IGGQPLGFDECGIVAQISEPLAAADIPAYYISTFK Unmodified 3710.8542 0.85420056 541 A6NHX0 GATSL2 GATS-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 172.32 172.32 3 4.6928E-30 173845 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.858 85.952 196680000 0 0 0 0 15656000 0 12582000 26060000 21028000 0 62699000 58656000 0 20543 541 19315 183722;183723;183724;183725;183726;183727 234601;234602;234603;234604;234605;234606 234603 6 IGGVQQDTILAEGLHFR Unmodified 1852.9795 0.97954591 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5H3X6;F5H0C5;F5H2D2 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 106.5 106.5 2;3 1.7808E-13 110906 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.21 108.12 11317000000 880740000 1008700000 1440900000 850390000 649640000 899200000 879150000 666460000 815970000 321400000 1239400000 839160000 826200000 20544 1272 19316 183728;183729;183730;183731;183732;183733;183734;183735;183736;183737;183738;183739;183740;183741;183742;183743;183744;183745 234607;234608;234609;234610;234611;234612;234613;234614;234615;234616;234617;234618;234619;234620;234621;234622;234623;234624;234625;234626;234627;234628;234629;234630;234631;234632;234633;234634 234631 27 IGHALHAHDPVFK Unmodified 1440.7626 0.76261727 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0;H7C2Q0 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 19.314 19.314 2;3;4 0.00041232 12412 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.83 80.089 1213300000 55552000 298290000 0 104350000 173520000 0 0 0 18275000 0 251450000 88347000 223480000 20545 3296 19317 183746;183747;183748;183749;183750;183751;183752;183753;183754;183755 234635;234636;234637;234638;234639;234640;234641;234642;234643;234644 234640 10 IGHFQLMQGK Unmodified 1157.6015 0.60154852 192 A0A0A0MT83;P26440;H0YLC3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 40.649 40.649 2;3 5.1456E-08 36969 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.75 124.96 1057300000 80965000 85363000 129180000 87230000 99252000 84976000 146540000 49246000 61296000 0 133360000 99890000 0 20546 192 19318 183756;183757;183758;183759;183760;183761;183762;183763;183764;183765;183766;183767 234645;234646;234647;234648;234649;234650;234651;234652;234653;234654;234655;234656;234657;234658 234658 13 IGHFQLMQGK Oxidation (M) 1173.5965 0.59646314 192 A0A0A0MT83;P26440;H0YLC3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 25.936 25.936 3 0.0049079 19487 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.48 46.336 78947000 0 0 0 0 0 0 0 27752000 51194000 0 0 0 0 20547 192 19318 183768;183769 234659;234660 234660 113 2 IGHKVESESYR Unmodified 1303.6521 0.65206377 4440 Q9UHY7;D6RA00;A0A0C4DGY8 ENOPH1 Enolase-phosphatase E1 yes no 0 0 1 1 10.408 10.408 3 1.2447E-05 2752 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.9 98.698 37085000 0 0 0 0 0 0 0 37085000 0 0 0 0 0 20548 4440 19319 183770 234661 234661 1 IGHPAPNFK Unmodified 979.52395 0.52395013 2904 Q06830;A0A0A0MSI0;A0A0A0MRQ5 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.108 18.108 2 0.00046865 10309 QUIQUE_C1403_190116_001 116.3 89.161 35951000000 2910700000 2663000000 2443000000 3014200000 2682800000 2056300000 2333400000 3945800000 3342000000 824300000 4000100000 1965700000 3769900000 20549 2904 19320 183771;183772;183773;183774;183775;183776;183777;183778;183779;183780;183781;183782;183783 234662;234663;234664;234665;234666;234667;234668;234669;234670;234671;234672;234673;234674;234675 234665 10 IGHPHGLQVTYLK Unmodified 1461.8092 0.80923311 1129 H0Y7Q1;O75689;A0A087WTN6;H7C324;A0A3B3ISA7;H7BZT6;H7C4B3;H7C264 ADAP1 Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.369 35.369 3 7.7212E-05 30541 QUIQUE_C1403_190116_001 118.87 106.87 529210000 86527000 69731000 0 54864000 0 36157000 62425000 30847000 43287000 0 0 73617000 71757000 20550 1129 19321 183784;183785;183786;183787;183788;183789;183790;183791;183792 234676;234677;234678;234679;234680;234681;234682;234683;234684 234678 8 IGHYILGDTLGVGTFGK Unmodified 1746.9305 0.93047046 2967 Q13131;Q96E92 PRKAA1 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 106.36 106.36 3 0.00010884 109449 QUIQUE_C1277_190116_001 56.872 47.084 139500000 28765000 36612000 0 25778000 0 15166000 0 0 33177000 0 0 0 0 20551 2967 19322 183793;183794;183795;183796;183797;183798 234685;234686;234687;234688;234689;234690 234686 5 IGIASQALGIAQTALDCAVNYAENR Unmodified 2618.3122 0.31224938 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 172.89 172.89 3 6.1003E-08 180021 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.701 57.243 105790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105790000 0 0 20552 2105 19323 183799 234691 234691 1 IGIEIIK Unmodified 784.50584 0.50584045 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.37 68.37 2 0.019305 65294 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.19 14.802 15110000000 1795100000 1340500000 1557600000 1179300000 1149400000 1361900000 1333200000 652450000 1042200000 746860000 904730000 956850000 1090500000 20553 2004 19324 183800;183801;183802;183803;183804;183805;183806;183807;183808;183809;183810;183811;183812 234692;234693;234694;234695;234696;234697;234698;234699;234700;234701;234702;234703;234704;234705;234706;234707;234708;234709;234710;234711;234712 234707 21 IGIEIIKR Unmodified 940.60695 0.60695147 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 46.235 46.235 2 0.014405 44230 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.187 26.41 681690000 0 0 0 0 0 0 0 0 252880000 0 428820000 0 0 20554 2004 19325 183813;183814 234713;234714 234713 1 IGIFGQDEDVTSK Unmodified 1407.6882 0.6881745 2112 P16615;H7C5W9 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 83.477 83.477 2 0.00036316 85315 QUIQUE_C1218_190116_001 93.843 68.222 176560000 53890000 48897000 0 0 0 0 0 50198000 0 23578000 0 0 0 20555 2112 19326 183815;183816;183817;183818;183819;183820 234715;234716;234717;234718;234719;234720 234715 6 IGIFPPAISISSIPLLPSSVR Unmodified 2163.2667 0.26672638 4474 Q9UKF7 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 167.15 167.15 2;3 4.3285E-08 169145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.666 90.861 377280000 0 14872000 0 63059000 43037000 24932000 34686000 28103000 22671000 0 0 0 145920000 20556 4474 19327 183821;183822;183823;183824;183825;183826;183827;183828;183829;183830;183831 234721;234722;234723;234724;234725;234726;234727;234728;234729;234730;234731 234728 11 IGIGELITR Unmodified 970.58113 0.58113065 1251 I3L2B0;K7EIG1;O75153 CLUH Clustered mitochondria protein homolog yes no 0 0 0 1 1 90.059 90.059 2 0.020857 91372 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.582 27.333 29444000 11115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18329000 0 20557 1251 19328 183832;183833 234732;234733;234734 234734 3 IGIHSGSVLAGVVGVR Unmodified 1519.8835 0.88346068 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.552 82.552 3 0.001305 84239 QUIQUE_C1277_190116_001 37.657 32.79 137120000 0 22046000 25410000 0 0 20257000 18272000 0 0 0 30333000 20805000 0 20558 2357 19329 183834;183835;183836;183837;183838;183839;183840 234735;234736;234737;234738;234739;234740;234741;234742 234735 5 IGIIDDDIFEEDEHFFVR Unmodified 2208.0375 0.037514303 1015 F5H6L7;Q9UPR5 SLC8A2 Sodium/calcium exchanger 2 yes no 0 0 0 1 152.54 152.54 3 0.00013347 158295 QUIQUE_C1368_190116_001 73.279 54.52 21346000 0 0 21346000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20559 1015 19330 183841 234743 234743 1 IGIIDGEYVVNPTR Unmodified 1544.8199 0.81985738 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.27 101.27 2 0.00096169 104263 QUIQUE_C1368_190116_001 79.82 54.383 146170000 0 0 43034000 46034000 42815000 0 0 0 0 14289000 0 0 0 20560 3675 19331 183842;183843;183844;183845;183846;183847;183848;183849 234744;234745;234746;234747;234748;234749;234750;234751;234752 234745 8 IGIIGGTGLDDPEILEGR Unmodified 1823.9629 0.9628928 2966 Q13126;B4DUC8;J3QSB7;F2Z2F3;F8WES2 MTAP S-methyl-5'-thioadenosine phosphorylase;Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 134.47 134.47 2;3 6.3956E-54 139005 QUIQUE_DMIX3_190116_001 218.11 187.24 2415000000 160290000 170480000 194600000 186750000 211970000 190430000 174810000 168760000 212760000 104300000 266380000 167100000 206420000 20561 2966 19332 183850;183851;183852;183853;183854;183855;183856;183857;183858;183859;183860;183861;183862;183863;183864;183865 234753;234754;234755;234756;234757;234758;234759;234760;234761;234762;234763;234764;234765;234766;234767;234768;234769;234770 234764 18 IGILHENFQTLK Unmodified 1411.7823 0.78234966 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.137 72.137 3 0.0023788 72095 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.492 63.142 1837700000 263500000 261130000 0 172310000 204770000 180870000 0 0 0 97218000 194680000 249080000 214160000 20562 4653 19333 183866;183867;183868;183869;183870;183871;183872;183873;183874 234771;234772;234773;234774;234775;234776;234777;234778;234779 234778 5 IGILITDGK Unmodified 928.55933 0.55933258 2897 Q05707;J3QT83;Q4G0W3 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 66.817 66.817 2 0.00053895 67417 QUIQUE_C1438_190116_001 130.27 21.259 246130000 0 0 0 76379000 61662000 0 39608000 0 0 37458000 31019000 0 0 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234805;234806;234807;234808;234809;234810;234811;234812;234813;234814;234815;234816 234808 2 IGKPAPDFK Unmodified 971.54402 0.54401687 2346 P32119;A6NIW5 PRDX2 Peroxiredoxin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 19.566 19.566 2 0.026959 12545 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.11 85.243 3636600000 955590000 0 0 0 0 0 0 1269000000 0 0 0 1412000000 0 20569 2346 19339 183912;183913;183914 234817;234818;234819 234818 0 IGLAQYSGDPR Unmodified 1175.5935 0.59348625 2897 Q05707;J3QT83;Q4G0W3 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 53.718 53.718 2 0.041349 49001 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.816 33.252 60233000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60233000 0 0 0 20570 2897 19340 183915 234820 234820 0 IGLDDEEKLDLFR Unmodified 1561.7988 0.79878758 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 1 1 1 1 111.88 111.88 3 0.00011238 116088 QUIQUE_C1218_190116_001 98.531 85.904 14303000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14303000 0 0 0 20571 153 19341 183916;183917;183918 234821;234822;234823 234821 3 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234854;234855;234856;234857;234858;234859;234860;234861;234862;234863;234864;234865;234866;234867;234868;234869;234870;234871;234872;234873;234874;234875;234876;234877;234878;234879;234880;234881;234882;234883;234884;234885;234886;234887;234888;234889;234890;234891;234892;234893;234894;234895;234896;234897;234898;234899;234900 234854 45 IGLFNSSADR Unmodified 1078.5407 0.5407224 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 1 1 57.053 57.053 2 0.0058045 56324 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.221 36.575 413680000 0 0 0 0 0 0 81438000 0 90159000 0 112250000 0 129830000 20579 2068 19349 183960;183961;183962;183963 234901;234902;234903;234904 234902 4 IGLFYMDNDLITR Unmodified 1569.7861 0.78611441 3095 Q15008;C9J0E9 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.84 138.84 2 0.0044815 144402 QUIQUE_C1218_190116_001 78.096 18.898 719070000 163720000 0 0 121430000 0 126000000 135210000 136320000 0 36399000 0 0 0 20580 3095 19350 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1.8948E-05 120154 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.759 61.214 19167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19167000 0 0 0 20582 4567 19351 183998 234942 234942 3019 1 IGLGVILNLAK Unmodified 1109.7172 0.7172302 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 131.66 131.66 2 0.00043996 137373 QUIQUE_C1218_190116_001 103.83 79.678 214380000 39889000 19051000 0 12536000 31575000 23915000 23976000 0 29938000 0 0 18957000 14538000 20583 3402 19352 183999;184000;184001;184002;184003;184004;184005;184006;184007;184008;184009 234943;234944;234945;234946;234947;234948;234949;234950;234951;234952;234953;234954;234955;234956 234943 12 IGLHSGSVFAGVVGVK Unmodified 1525.8617 0.86166261 2865 Q02108;J3KPQ8 GUCY1A3 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 84.896 84.896 3 0.001289 82241 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.328 48.277 50094000 16022000 0 0 0 0 0 0 0 24391000 9681400 0 0 0 20584 2865 19353 184010;184011;184012 234957;234958;234959 234959 2 IGLIHGHQVIPWGDMASLALLQR Unmodified 2524.3737 0.37366784 4403 Q9UBQ0;F8VXU5 VPS29 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 137.88 137.88 3;4 6.0575E-08 144081 QUIQUE_C1218_190116_001 75.358 71.548 2416900000 71195000 134200000 189480000 119150000 85850000 44828000 135960000 172200000 375210000 0 381800000 379320000 327730000 20585 4403 19354 184013;184014;184015;184016;184017;184018;184019;184020;184021;184022;184023;184024;184025;184026;184027;184028;184029;184030;184031;184032;184033;184034;184035;184036 234960;234961;234962;234963;234964;234965;234966;234967;234968;234969;234970;234971;234972;234973;234974;234975;234976;234977;234978;234979;234980;234981;234982;234983;234984;234985;234986;234987 234960 27 IGLIHGHQVIPWGDMASLALLQR Oxidation (M) 2540.3686 0.36858246 4403 Q9UBQ0;F8VXU5 VPS29 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 yes no 0 1 0 1 1 1 121.52 121.52 3;4 1.1507E-05 123912 QUIQUE_C1563_190116_001 56.529 52.725 237720000 0 0 0 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235000;235001;235002;235003;235004;235005;235006;235007;235008;235009;235010;235011;235012;235013;235014 235010 15 IGLIQGNR Unmodified 869.5083 0.50830006 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VP00 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.588 32.588 2 0.0060258 27523 QUIQUE_C1438_190116_001 103.29 75.581 7781400000 802920000 757080000 891180000 753280000 721350000 606270000 0 589420000 726170000 351300000 0 728810000 853660000 20589 452 19357 184060;184061;184062;184063;184064;184065;184066;184067;184068;184069;184070 235015;235016;235017;235018;235019;235020;235021;235022;235023;235024;235025 235019 8 IGLMSLSK Unmodified 847.48372 0.48372479 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 0 0 1 1 65.43 65.43 2 0.040092 65423 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.478 32.055 39060000 0 0 0 0 0 0 0 0 16803000 0 22256000 0 0 20590 2486 19358 184071;184072 235026;235027 235026 2 IGLNLFNINPDK Unmodified 1356.7402 0.74015049 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 126.65 126.65 2 0.0064264 130776 QUIQUE_C1403_190116_001 81.771 60.901 69316000 0 25290000 0 18102000 0 0 0 0 0 0 25924000 0 0 20591 4519 19359 184073;184074;184075;184076 235028;235029;235030;235031 235029 4 IGLNLFNK Unmodified 917.53345 0.53345218 60;388 A0A2R8Y7T6;A0A087WWK8;A0A3B3IRZ4;Q6DN90;A0A3B3IU98;A0A0C4DGT3;A0A2R8Y695;A0A1W2PRJ5;A0A1W2PR28;Q5JU85 IQSEC1;IQSEC2 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 1;IQ motif and SEC7 domain-containing protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.116 89.116 2 0.0064474 90905 QUIQUE_C1403_190116_001 101.72 53.548 589400000 74804000 55074000 0 74384000 54419000 0 63036000 64090000 76066000 0 0 72138000 55389000 20592 60;388 19360 184077;184078;184079;184080;184081;184082;184083;184084;184085 235032;235033;235034;235035;235036;235037;235038;235039;235040 235034 8 IGLPILCVGSVWK Unmodified 1440.8163 0.81629232 4455 Q9UJ70;H7C3G9;C9JEV6;H7C286;H0YF44 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 146.74 146.74 2 0.00041285 152389 QUIQUE_C1368_190116_001 96.015 74.643 1494400000 97743000 134980000 136830000 136260000 109380000 100720000 121030000 73205000 119450000 37894000 133180000 130620000 163070000 20593 4455 19361 184086;184087;184088;184089;184090;184091;184092;184093;184094;184095;184096;184097;184098;184099 235041;235042;235043;235044;235045;235046;235047;235048;235049;235050;235051;235052;235053;235054;235055;235056;235057;235058;235059;235060 235045 19 IGLSVSEVIEGYEIACR Unmodified 1893.9506 0.95061355 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 1 1 3 2 2 1 2 1 3 2 1 147.02 147.02 2 9.2788E-06 151602 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.79 109.55 560550000 0 42324000 0 30125000 84334000 83256000 49900000 56741000 65832000 7733500 36492000 66012000 37802000 20594 2572 19362 184100;184101;184102;184103;184104;184105;184106;184107;184108;184109;184110;184111;184112;184113;184114;184115;184116;184117;184118 235061;235062;235063;235064;235065;235066;235067;235068;235069;235070;235071;235072;235073;235074;235075;235076;235077;235078;235079;235080;235081 235073 19 IGLVEALCGFQFTFK Unmodified 1728.8909 0.89091383 1600 O60884 DNAJA2 DnaJ homolog subfamily A member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 3 1 162.74 162.74 2;3 1.6786E-06 168451 QUIQUE_C1576_190116_001 115.33 89.209 1154600000 50565000 62644000 69835000 32518000 66274000 52690000 118670000 80157000 116950000 14179000 140820000 268710000 80533000 20595 1600 19363 184119;184120;184121;184122;184123;184124;184125;184126;184127;184128;184129;184130;184131;184132;184133;184134 235082;235083;235084;235085;235086;235087;235088;235089;235090;235091;235092;235093;235094;235095;235096;235097;235098;235099;235100;235101;235102 235090 20 IGLVRPGTALELLEAQAATGFIVDPVSNLR Unmodified 3119.7343 0.73428384 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 1 1 1 1 166.28 166.28 3 3.8701E-19 172446 QUIQUE_C1438_190116_001 78.311 72.345 82811000 0 15071000 0 38621000 29119000 0 0 0 0 0 0 0 0 20596 2096 19364 184135;184136;184137 235103;235104;235105 235105 3 IGNCPFSQR Unmodified 1077.5026 0.50256276 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 30.799 30.799 2 0.014899 25010 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.897 37.712 425440000 0 0 0 0 0 0 0 0 104060000 140710000 0 0 180660000 20597 1395 19365 184138;184139;184140;184141 235106;235107;235108;235109 235109 4 IGNFIVK Unmodified 789.47487 0.47487467 2848 Q00796;H0YLA4;H0YKB3 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.321 48.321 2 0.01997 46554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.7 44.373 2212000000 161100000 0 189490000 198330000 0 168020000 268780000 239380000 311830000 0 288030000 0 387090000 20598 2848 19366 184142;184143;184144;184145;184146;184147;184148;184149;184150 235110;235111;235112;235113;235114;235115;235116;235117;235118 235115 9 IGNFLNYGSHTGDADGFK Unmodified 1911.8751 0.87514042 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 85.058 85.058 3 7.882E-05 82290 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.723 71.13 170060000 52164000 0 0 34136000 55670000 0 0 0 0 28094000 0 0 0 20599 3210 19367 184151;184152;184153;184154 235119;235120;235121;235122;235123 235123 5 IGNFSTDIK Unmodified 993.51311 0.51311067 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 50.973 50.973 2 0.00043488 48194 QUIQUE_C1403_190116_001 118.74 69.302 429010000 0 100180000 0 219580000 0 0 0 0 0 109250000 0 0 0 20600 2066 19368 184155;184156;184157 235124;235125;235126;235127 235126 4 IGNFSTDIKDSK Unmodified 1323.667 0.66704513 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 1 1 37.886 37.886 3 0.049959 33699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.685 16.66 87341000 0 0 0 0 0 0 0 87341000 0 0 0 0 0 20601 2066 19369 184158 235128 235128 1 IGNILDLCTALSALSGIPADK Unmodified 2141.1402 0.14020524 4605 Q9Y4E8 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 168.97 168.97 2;3 7.9394E-19 170469 QUIQUE_C1563_190116_001 123.97 112.6 583320000 40430000 38634000 0 40914000 29084000 79557000 87146000 45750000 83296000 13271000 33556000 19115000 72564000 20602 4605 19370 184159;184160;184161;184162;184163;184164;184165;184166;184167;184168;184169;184170;184171;184172;184173;184174;184175;184176 235129;235130;235131;235132;235133;235134;235135;235136;235137;235138;235139;235140;235141;235142;235143;235144;235145;235146 235136 17 IGNITPADAGTYYCVK Unmodified 1741.8345 0.83452116 2803 P78324 SIRPA Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.421 84.421 2 0.00028713 86867 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.87 89.894 541120000 0 37465000 64107000 36499000 53567000 20303000 78665000 0 32036000 25875000 62833000 54874000 74898000 20603 2803 19371 184177;184178;184179;184180;184181;184182;184183;184184;184185;184186;184187 235147;235148;235149;235150;235151;235152;235153;235154;235155;235156;235157;235158;235159 235157 13 IGNSGVEEIK Unmodified 1044.5451 0.54513908 4555 Q9Y2H1 STK38L Serine/threonine-protein kinase 38-like yes yes 0 0 0 1 1 1 26.318 26.318 2 0.0021986 19849 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.265 27.731 126730000 0 88494000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38232000 20604 4555 19372 184188;184189;184190 235160;235161;235162;235163 235163 4 IGNSGVEEIKGHPFFEGVDWEHIR Unmodified 2751.3405 0.34051304 4555 Q9Y2H1 STK38L Serine/threonine-protein kinase 38-like yes yes 0 0 1 1 104.86 104.86 5 0.05428 106781 QUIQUE_DMIX1_190116_001 19.011 11.735 22603000 0 0 0 0 0 0 0 22603000 0 0 0 0 0 20605 4555 19373 184191 235164 235164 1 IGNSYFKEEK Unmodified 1213.5979 0.59790293 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 24.441 24.441 2;3 0.001283 17826 QUIQUE_C1403_190116_001 123.86 76.286 2665800000 44759000 98212000 0 76460000 151760000 44573000 127510000 370710000 176150000 18452000 242490000 1052900000 261820000 20606 2343 19374 184192;184193;184194;184195;184196;184197;184198;184199;184200;184201;184202;184203;184204;184205 235165;235166;235167;235168;235169;235170;235171;235172;235173;235174;235175;235176;235177;235178 235167 14 IGNTEDGAPHKEDEPSVGQVAR Unmodified 2305.0935 0.093466053 4094 Q9C0C9 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 29.592 29.592 3;4 1.9601E-54 24838 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.87 122.37 1292900000 131180000 91774000 103210000 92440000 148230000 91438000 39804000 98129000 101100000 0 152110000 119030000 124480000 20607 4094 19375 184206;184207;184208;184209;184210;184211;184212;184213;184214;184215;184216;184217;184218;184219;184220;184221;184222;184223;184224;184225;184226;184227;184228 235179;235180;235181;235182;235183;235184;235185;235186;235187;235188;235189;235190;235191;235192;235193;235194;235195;235196;235197;235198;235199;235200;235201 235193 23 IGNTGGMLDNILASK Oxidation (M) 1518.7712 0.77119262 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 81.307 81.307 2 5.5849E-05 82351 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.295 74.564 310620000 0 50627000 0 0 0 0 0 87863000 64270000 42847000 0 65016000 0 20608 2623 19376 184229;184230;184231;184232;184233 235202;235203;235204;235205;235206;235207 235207 2076 6 IGNTGGMLDNILASK Unmodified 1502.7763 0.776278 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 108.41 108.41 2 1.3968E-05 112836 QUIQUE_C1576_190116_001 96.059 71.767 661120000 0 0 0 161560000 160930000 140220000 176920000 0 0 0 0 0 21480000 20609 2623 19376 184234;184235;184236;184237;184238;184239 235208;235209;235210;235211;235212;235213 235211 4 IGNVEISQVTIVGIIR Unmodified 1710.004 0.003969751 2097 P15927;Q5TEJ7 RPA2 Replication protein A 32 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 133.41 133.41 2 0.019081 129999 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.915 32.715 30739000 0 0 0 0 0 13698000 0 0 0 17041000 0 0 0 20610 2097 19377 184240;184241 235214;235215 235215 1 IGPALSCGNTVVVK Unmodified 1413.765 0.76498503 1776 P00352;Q5SYQ9;Q5SYQ8;Q5SYQ7 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 63.524 63.524 2 0.0022958 64078 QUIQUE_C1218_190116_001 75.474 46.748 93380000 0 41341000 52038000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20611 1776 19378 184242;184243;184244 235216;235217;235218 235216 3 IGPALSCGNTVVVKPAEQTPLTALHVASLIK Unmodified 3183.769 0.76895478 1776 P00352;Q5SYQ9;Q5SYQ8 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 122.06 122.06 3;4 2.556E-36 126302 QUIQUE_C1403_190116_001 107.45 106.83 13113000000 612680000 853330000 1028300000 1369600000 1111700000 1128300000 1066500000 1138400000 1067100000 300900000 977000000 1322000000 1137000000 20612 1776 19379 184245;184246;184247;184248;184249;184250;184251;184252;184253;184254;184255;184256;184257;184258;184259;184260;184261;184262;184263;184264;184265;184266;184267;184268;184269 235219;235220;235221;235222;235223;235224;235225;235226;235227;235228;235229;235230;235231;235232;235233;235234;235235;235236;235237;235238;235239;235240;235241;235242;235243;235244;235245;235246;235247;235248;235249;235250;235251;235252;235253;235254;235255;235256;235257;235258;235259;235260;235261 235230 43 IGPECHDVQPPEGR Unmodified 1589.7256 0.72563941 995 F5GZH3;F5H866;F5GZ38;F5H1B8;Q9UF11;F5H3M1;F5H114;F5H0R6;F5GY87;F5H190 PLEKHB1 Pleckstrin homology domain-containing family B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 31.052 31.052 3 0.00010456 25525 QUIQUE_C1576_190116_001 69.201 56.841 167400000 42531000 0 0 48103000 0 0 76768000 0 0 0 0 0 0 20613 995 19380 184270;184271;184272;184273;184274 235262;235263;235264;235265;235266 235265 5 IGPEPTTDSFIAVMHGPTEGVVPGNALVVDPR Unmodified 3271.6547 0.65471289 4175 Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9JIJ3;C9IZH1 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 140.42 140.42 3;4 4.1297E-09 147251 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.076 49.002 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117.09 2;3 6.2816E-64 122269 QUIQUE_C1218_190116_001 224.59 219.74 32496000000 2579200000 2652500000 2746600000 2340400000 2955000000 2204400000 2733100000 2628400000 2434000000 1059000000 3062900000 2303400000 2797000000 20616 2309 19383 184295;184296;184297;184298;184299;184300;184301;184302;184303;184304;184305;184306;184307;184308;184309;184310;184311;184312;184313;184314;184315;184316;184317;184318;184319;184320 235293;235294;235295;235296;235297;235298;235299;235300;235301;235302;235303;235304;235305;235306;235307;235308;235309;235310;235311;235312;235313;235314;235315;235316;235317;235318;235319;235320;235321;235322;235323;235324;235325;235326;235327;235328;235329 235295 37 IGPITPLEFYR Unmodified 1304.7129 0.71287311 3028 Q13867;K7ES02;K7ESE8;J3KSD8 BLMH Bleomycin hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.4 119.4 2 9.3564E-05 125093 QUIQUE_C1218_190116_001 133.13 102.88 1858500000 173820000 189550000 176230000 0 0 0 180890000 184580000 174580000 74648000 256420000 188550000 259200000 20617 3028 19384 184321;184322;184323;184324;184325;184326;184327;184328;184329;184330 235330;235331;235332;235333;235334;235335;235336;235337;235338;235339;235340;235341 235331 10 IGPLGLSPK Unmodified 880.5382 0.53820321 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.277 57.277 2 0.00076343 55690 QUIQUE_C1368_190116_001 110.03 61.239 2979800000 195790000 254200000 304540000 247720000 217680000 244960000 215010000 217580000 223960000 87851000 286410000 238250000 245870000 20618 2304 19385 184331;184332;184333;184334;184335;184336;184337;184338;184339;184340;184341;184342;184343 235342;235343;235344;235345;235346;235347;235348;235349;235350;235351;235352;235353;235354;235355;235356;235357;235358;235359;235360;235361;235362 235346 21 IGPQQSISTSVGPSASQR Unmodified 1798.9173 0.91733959 3697 Q8WUD1 RAB2B Ras-related protein Rab-2B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.013 53.013 2 2.931E-17 51208 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.08 108.2 233990000 26424000 31087000 28195000 31232000 27027000 32857000 26276000 30891000 0 0 0 0 0 20619 3697 19386 184344;184345;184346;184347;184348;184349;184350;184351 235363;235364;235365;235366;235367;235368;235369;235370 235370 8 IGPSILNSDLANLGAECLR Unmodified 2012.0361 0.036074515 3804 Q96AT9;C9J9T0;C9IZU8;F8WBT4 RPE Ribulose-phosphate 3-epimerase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 138.88 138.88 2;3 0.00011141 143987 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.975 60.017 186820000 0 0 0 0 31808000 40709000 0 0 34879000 0 0 38632000 40790000 20620 3804 19387 184352;184353;184354;184355;184356;184357;184358 235371;235372;235373;235374;235375;235376;235377 235377 7 IGPVTYSIDGCVR Unmodified 1435.7129 0.71294946 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 80.61 80.61 2 0.063652 80894 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.284 37.996 21568000 0 0 0 0 0 0 0 21568000 0 0 0 0 0 20621 2225 19388 184359 235378 235378 1 IGPYQPNVPVGIDYVIPK Unmodified 1968.072 0.072049316 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;B3KM87;Q68E03 MATR3;DKFZp686L22104 Matrin-3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 131.54 131.54 2;3 6.1757E-14 136679 QUIQUE_C1368_190116_001 129.37 110.24 6914200000 573070000 652610000 521570000 470060000 573780000 443300000 460420000 549780000 564950000 168520000 740780000 618130000 577280000 20622 307 19389 184360;184361;184362;184363;184364;184365;184366;184367;184368;184369;184370;184371;184372;184373;184374;184375;184376;184377;184378;184379;184380;184381;184382;184383;184384;184385 235379;235380;235381;235382;235383;235384;235385;235386;235387;235388;235389;235390;235391;235392;235393;235394;235395;235396;235397;235398;235399;235400;235401;235402;235403;235404;235405;235406;235407;235408;235409;235410;235411;235412;235413;235414;235415;235416;235417;235418;235419;235420;235421;235422;235423 235387 44 IGPYTNFVNIGER Unmodified 1478.7518 0.75177781 3968 Q99707 MTR Methionine synthase yes yes 0 0 0 1 1 101.07 101.07 2 0.0083393 104721 QUIQUE_C1576_190116_001 61.435 43.962 34356000 0 0 0 0 0 0 34356000 0 0 0 0 0 0 20623 3968 19390 184386;184387 235424;235425 235424 2 IGQFVFAR Unmodified 936.51814 0.51813647 4271 Q9NRN7 AASDHPPT L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.65 73.65 2 0.0060987 75309 QUIQUE_C1218_190116_001 103.02 59.894 710290000 54980000 81214000 50577000 0 58457000 0 65427000 70299000 68162000 25971000 85818000 76383000 72998000 20624 4271 19391 184388;184389;184390;184391;184392;184393;184394;184395;184396;184397;184398 235426;235427;235428;235429;235430;235431;235432;235433;235434;235435;235436;235437;235438;235439 235426 14 IGQLEEQLEQEAK Unmodified 1513.7624 0.76240208 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.742 78.742 2 3.3208E-11 79516 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.23 131.06 1812800000 161200000 189750000 174880000 162140000 139610000 140380000 152460000 107410000 156100000 0 137550000 156040000 135270000 20625 2379 19392 184399;184400;184401;184402;184403;184404;184405;184406;184407;184408;184409;184410 235440;235441;235442;235443;235444;235445;235446;235447;235448;235449;235450;235451 235448 10 IGQLFQGPGR Unmodified 1071.5825 0.58252764 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 57.504 57.504 2 0.0089771 55665 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.919 43.394 177280000 0 0 0 0 0 0 59317000 0 0 0 69693000 0 48271000 20626 4517 19393 184411;184412;184413 235452;235453;235454 235454 2 IGQLQGEIIPTSFYHQGR Unmodified 2043.0538 0.05377349 885 E7EWD3;O75077 ADAM23 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 23 yes no 0 0 0 1 1 98.201 98.201 3 0.0052232 102100 QUIQUE_C1576_190116_001 43.946 35.301 153890000 0 0 62255000 0 0 0 91633000 0 0 0 0 0 0 20627 885 19394 184414;184415 235455;235456;235457 235457 3 IGQLYMISK Unmodified 1051.5736 0.57360243 4474 Q9UKF7;E7EU35;A0A0C4DGP0 PITPNC1 Cytoplasmic phosphatidylinositol transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 69.528 69.528 2 0.020122 69094 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.09 66.088 160030000 29200000 0 0 36897000 0 0 0 37429000 0 0 0 0 56508000 20628 4474 19395 184416;184417;184418;184419;184420 235458;235459;235460;235461;235462 235461 5 IGQLYYHYYLR Unmodified 1487.7561 0.75613491 3620 Q8N9R8;Q3SXZ0 SCAI;C9orf126 Protein SCAI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.03 78.03 3 0.0016393 78048 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.525 56.033 198630000 0 33004000 0 28760000 0 0 0 0 38117000 12536000 0 39230000 46987000 20629 3620 19396 184421;184422;184423;184424;184425;184426;184427;184428;184429 235463;235464;235465;235466;235467;235468;235469;235470;235471 235471 9 IGQPTLLLYVDAGPETMTQR Oxidation (M) 2218.1304 0.13036883 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.15 125.15 2;3 9.6622E-47 130804 QUIQUE_C1218_190116_001 161.82 150.88 1456900000 142670000 0 75270000 62200000 115310000 0 106110000 188160000 216410000 0 216610000 158900000 175280000 20630 1791 19397 184430;184431;184432;184433;184434;184435;184436;184437;184438;184439;184440 235472;235473;235474;235475;235476;235477;235478;235479;235480;235481;235482;235483;235484;235485 235473 1016 14 IGQPTLLLYVDAGPETMTQR Unmodified 2202.1355 0.13545421 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 2 2 2 137.05 137.05 2;3 3.7547E-75 144096 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.63 176.24 8183000000 541000000 589210000 583890000 463030000 470960000 567040000 343410000 860960000 1192600000 153760000 877630000 701340000 838210000 20631 1791 19397 184441;184442;184443;184444;184445;184446;184447;184448;184449;184450;184451;184452;184453;184454;184455;184456;184457;184458;184459;184460;184461;184462;184463;184464;184465;184466 235486;235487;235488;235489;235490;235491;235492;235493;235494;235495;235496;235497;235498;235499;235500;235501;235502;235503;235504;235505;235506;235507;235508;235509;235510;235511;235512;235513;235514;235515;235516;235517;235518;235519;235520;235521;235522;235523;235524;235525;235526;235527;235528 235520 43 IGQQPQQPGAPPQQDYTK Unmodified 1979.9701 0.97010344 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R0C6;M0QYG1 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.392 40.392 2 2.4333E-13 36658 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.53 151.7 598800000 71135000 59807000 94557000 68807000 0 52709000 0 57317000 64779000 19133000 0 57848000 52703000 20632 3770 19398 184467;184468;184469;184470;184471;184472;184473;184474;184475;184476;184477;184478 235529;235530;235531;235532;235533;235534;235535;235536;235537;235538;235539;235540;235541 235537 13 IGQTSSSVSFK Unmodified 1139.5823 0.58225287 2122 P17301 ITGA2 Integrin alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 31.781 31.781 2 0.0064192 26982 QUIQUE_C1438_190116_001 84.054 53.318 175310000 0 49098000 35106000 0 39510000 0 0 51601000 0 0 0 0 0 20633 2122 19399 184479;184480;184481;184482 235542;235543;235544;235545 235544 3 IGRPSETGIIGIIDPECR Unmodified 1982.0255 0.025509829 3179 Q16531;F5GY55;F5H2L3;F5GWI0;F5GZY8 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 105.15 105.15 3 0.0062546 107945 QUIQUE_C1277_190116_001 35.624 26.46 119620000 0 119620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20634 3179 19400 184483 235546 235546 1 IGSCTQQDVELHVQK Unmodified 1740.8465 0.84648283 2083 P14868;C9J7S3;C9JLC1;H7C278;C9JQM9 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 37.253 37.253 2;3 2.2018E-13 33594 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.94 116.02 1532600000 191420000 144910000 0 0 113970000 221000000 234060000 146800000 185550000 87738000 0 0 207170000 20635 2083 19401 184484;184485;184486;184487;184488;184489;184490;184491;184492;184493;184494;184495 235547;235548;235549;235550;235551;235552;235553;235554;235555;235556;235557;235558;235559 235554 13 IGSFDETCTR Unmodified 1184.5132 0.51318702 911 E9PER6;O15530;Q6A1A2 PDPK1;PDPK2P 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1;Putative 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 36.058 36.058 2 0.027126 31357 QUIQUE_C1403_190116_001 55.461 45.55 75139000 0 0 0 20697000 0 0 31697000 0 0 0 0 22744000 0 20636 911 19402 184496;184497;184498 235560;235561;235562 235560 3 IGSFGPQEDLLFLR Unmodified 1590.8406 0.84059282 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes no 0 0 0 1 1 140.31 140.31 2 0.0010859 144907 QUIQUE_C1277_190116_001 78.653 65.061 49837000 0 49837000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20637 2964 19403 184499;184500 235563;235564 235563 2 IGSFTIQNVFPQSDGDSSK Unmodified 2025.9643 0.96434936 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 120.76 120.76 2 4.3023E-29 125021 QUIQUE_C1277_190116_001 141.54 124.37 185650000 0 0 49019000 0 0 0 0 0 0 18735000 0 50041000 67852000 20638 1748 19404 184501;184502;184503;184504;184505;184506 235565;235566;235567;235568;235569;235570 235565 5 IGSGFDNIDIK Unmodified 1177.5979 0.59790293 2989 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1;H0Y8W7 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.582 77.582 2 0.00041853 78363 QUIQUE_C1368_190116_001 115.78 79.386 2663600000 284590000 258860000 245730000 206920000 210770000 213970000 238170000 193700000 161100000 117790000 286860000 0 245160000 20639 2989 19405 184507;184508;184509;184510;184511;184512;184513;184514;184515;184516;184517;184518 235571;235572;235573;235574;235575;235576;235577;235578;235579;235580;235581;235582;235583 235574 10 IGSGSFGTVYK Unmodified 1114.5659 0.56587452 453 H7C560;A0A2U3TZI2;A0A2R8Y8E0;P15056;H7C155;A0A2R8YDP5;P04049;H7C4S5;A0A2R8Y492;A0A2R8Y679 BRAF;RAF1 Serine/threonine-protein kinase B-raf;RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.576 51.576 2 0.0004904 50242 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.57 63.234 164710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45880000 59227000 59602000 20640 453 19406 184519;184520;184521;184522;184523 235584;235585;235586;235587;235588;235589 235586 6 IGSGYDNVDIK Unmodified 1179.5772 0.57716749 2682 Q5SQP8;P56545 CTBP2 C-terminal-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 49.407 49.407 2 0.0061313 47386 QUIQUE_C1438_190116_001 67.207 39.953 119480000 46330000 0 0 0 73152000 0 0 0 0 0 0 0 0 20641 2682 19407 184524;184525;184526 235590;235591;235592 235591 3 IGSLDNITHVPGGGNK Unmodified 1577.8162 0.81616898 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 55.263 55.263 2;3 9.7169E-37 53158 QUIQUE_C1368_190116_001 185.3 157.56 14248000000 1084600000 1098800000 809890000 836270000 842620000 828380000 706480000 1447100000 1274400000 424260000 942530000 1777200000 2175200000 20642 291;1247 19408 184527;184528;184529;184530;184531;184532;184533;184534;184535;184536;184537;184538;184539;184540;184541;184542;184543;184544;184545;184546;184547;184548;184549;184550;184551 235593;235594;235595;235596;235597;235598;235599;235600;235601;235602;235603;235604;235605;235606;235607;235608;235609;235610;235611;235612;235613;235614;235615;235616;235617;235618;235619;235620;235621;235622;235623;235624 235600 32 IGSLDNITHVPGGGNKK Unmodified 1705.9111 0.911132 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 3 3 3 3 2 37.741 37.741 2;3;4 1.4011E-12 34611 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.7 117.82 3145300000 115310000 172380000 125150000 157320000 45254000 59076000 144510000 407830000 371470000 0 394650000 744130000 408240000 20643 291;1247 19409 184552;184553;184554;184555;184556;184557;184558;184559;184560;184561;184562;184563;184564;184565;184566;184567;184568;184569;184570;184571;184572;184573;184574;184575;184576;184577 235625;235626;235627;235628;235629;235630;235631;235632;235633;235634;235635;235636;235637;235638;235639;235640;235641;235642;235643;235644;235645;235646;235647;235648;235649;235650 235639 26 IGSLIDVNQSK Unmodified 1172.6401 0.6401021 3798 Q96A72 MAGOHB Protein mago nashi homolog 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 55.43 55.43 2 0.00049492 53671 QUIQUE_C1277_190116_001 135.43 84.093 517590000 0 141280000 115300000 0 0 0 0 103670000 116860000 40480000 0 0 0 20644 3798 19410 184578;184579;184580;184581;184582;184583;184584 235651;235652;235653;235654;235655;235656;235657 235652 7 IGSSLYALGTQDSTDICK Unmodified 1927.9197 0.91970735 148 A0A0A0MRI2;Q9UNH7 SNX6 Sorting nexin-6;Sorting nexin-6, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.566 93.566 2 7.6473E-13 96890 QUIQUE_C1576_190116_001 158.25 147.35 690210000 0 0 108080000 0 88101000 87675000 110930000 0 0 0 122450000 62494000 110470000 20645 148 19411 184585;184586;184587;184588;184589;184590;184591 235658;235659;235660;235661;235662;235663;235664 235661 5 IGSTIFGER Unmodified 978.51345 0.51344502 1695 O94903 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.762 54.762 2 0.00049353 51531 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.5 83.886 1920400000 146790000 120350000 155690000 158120000 141440000 169240000 142470000 130990000 155810000 63631000 161820000 155640000 218450000 20646 1695 19412 184592;184593;184594;184595;184596;184597;184598;184599;184600;184601;184602;184603;184604 235665;235666;235667;235668;235669;235670;235671;235672;235673;235674;235675;235676;235677;235678;235679;235680 235677 15 IGSTIFGERDYSK Unmodified 1471.7307 0.73070802 1695 O94903 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes yes 0 0 1 1 53.784 53.784 3 0.019268 51448 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.79 28.623 24050000 0 0 0 0 0 0 0 24050000 0 0 0 0 0 20647 1695 19413 184605 235681 235681 1 IGSVAPDTINNHVK Unmodified 1463.7732 0.77324153 4439 Q9UHY1 NRBP1 Nuclear receptor-binding protein yes yes 0 0 0 1 31.564 31.564 2 0.06713 26800 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.714 19.471 14213000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14213000 0 0 20648 4439 19414 184606 235682 235682 1 IGSVWHR Unmodified 853.45587 0.45587056 4287 Q9NSY0;E9PR11 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 21.61 21.61 2 0.044891 14723 QUIQUE_C1218_190116_001 78.994 53.376 30467000 30467000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20649 4287 19415 184607 235683 235683 1 IGSYLSASTR Unmodified 1053.5455 0.54547343 949 E9PS17;E9PK59;Q96KG9;E9PPN3;A0A0A0MQX4;H0YCI6 SCYL1 N-terminal kinase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.208 37.208 2 0.021497 33513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.439 37.968 75266000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10049000 0 34221000 30995000 20650 949 19416 184608;184609;184610;184611 235684;235685;235686;235687 235684 4 IGTDIQDNK Unmodified 1002.4982 0.49818889 2073 P14324;A0A087X090 FDPS Farnesyl pyrophosphate synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.539 20.539 2 0.00049432 13453 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.56 86.117 3259300000 0 469100000 0 0 0 337130000 312880000 362990000 422290000 0 450480000 419520000 484920000 20651 2073 19417 184612;184613;184614;184615;184616;184617;184618;184619 235688;235689;235690;235691;235692;235693;235694;235695 235695 7 IGTETTEGAESAQPEAEELEATVPQEK Unmodified 2843.3196 0.31962198 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 2 2 3 3 2 2 2 2 3 1 2 2 3 96.978 96.978 2;3 5.4191E-44 99365 QUIQUE_C1277_190116_001 188.58 152.92 2379300000 241890000 205750000 176850000 187770000 173090000 163050000 123110000 207400000 148090000 81816000 186490000 194660000 289370000 20652 2530 19418 184620;184621;184622;184623;184624;184625;184626;184627;184628;184629;184630;184631;184632;184633;184634;184635;184636;184637;184638;184639;184640;184641;184642;184643;184644;184645;184646;184647;184648 235696;235697;235698;235699;235700;235701;235702;235703;235704;235705;235706;235707;235708;235709;235710;235711;235712;235713;235714;235715;235716;235717;235718;235719;235720;235721;235722;235723;235724;235725;235726;235727;235728;235729;235730;235731;235732;235733;235734;235735 235699 39 IGTIYEGASNIQLNTIAK Unmodified 1905.0207 0.020742027 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.57 102.57 2 1.7552E-05 104948 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.61 94.426 531580000 36965000 35620000 50496000 25366000 44780000 39445000 31540000 44017000 35926000 26051000 45161000 56513000 59704000 20653 2470 19419 184649;184650;184651;184652;184653;184654;184655;184656;184657;184658;184659;184660;184661 235736;235737;235738;235739;235740;235741;235742;235743;235744;235745;235746;235747;235748;235749 235748 13 IGTLELGAFDGLSR Unmodified 1447.7671 0.76709352 3885 Q96JA1 LRIG1 Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1 yes yes 0 0 0 1 124.9 124.9 2 0.0054438 127638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.214 46.911 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20654 3885 19420 184662 235750 235750 1 IGTNQMAVCAK Unmodified 1191.574 0.57401314 3054 Q14232 EIF2B1 Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.405 29.405 2 0.00049293 23791 QUIQUE_C1277_190116_001 108.81 81.67 85929000 0 22201000 0 30286000 0 0 0 0 0 0 0 33443000 0 20655 3054 19421 184663;184664;184665;184666;184667;184668 235751;235752;235753;235754;235755;235756 235752 6 IGTVMTFL Unmodified 880.47283 0.47282576 2301 P30046;J3KQ18;H7C342 DDT D-dopachrome decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 141.03 141.03 1 0.041656 145516 QUIQUE_C1277_190116_001 117.7 89.525 1268600000 0 275130000 0 0 0 0 162390000 363500000 0 0 0 0 467610000 20656 2301 19422 184669;184670;184671;184672 235757;235758;235759;235760 235757 0 IGTVTSGCPSPSLK Unmodified 1402.7126 0.71261511 331 A0A1B0GTB6;H0Y695;B3KTU4;A0A1B0GTA8;A0A1B0GTM2;A0A1B0GUH1;P48728;A0A1B0GV07;A0A1B0GWC4;A0A1B0GVP5 AMT Aminomethyltransferase;Aminomethyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 44.366 44.366 2 0.0075133 41393 QUIQUE_C1218_190116_001 75.819 46.286 32805000 32805000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20657 331 19423 184673 235761 235761 1 IGTYTGPLQHGIVYSGGSSDTICDLLGAK Unmodified 2979.4648 0.46478685 2552 P49902;Q5JUV6 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.69 131.69 3 3.9577E-66 135765 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.11 150.88 1219700000 80177000 101730000 72645000 105910000 97667000 72515000 85866000 116540000 88565000 36447000 133060000 110100000 118520000 20658 2552 19424 184674;184675;184676;184677;184678;184679;184680;184681;184682;184683;184684;184685;184686 235762;235763;235764;235765;235766;235767;235768;235769;235770;235771;235772;235773;235774;235775;235776;235777;235778;235779;235780 235778 19 IGVADVDMSR Unmodified 1061.5175 0.51754412 3712 Q8WW59 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235809;235810;235811;235812;235813;235814;235815;235816;235817;235818;235819;235820;235821;235822 235818 14 IGVFLCGPEALAETLSK Unmodified 1803.9441 0.94407161 1867 P04839 CYBB Cytochrome b-245 heavy chain yes yes 0 0 0 1 147.23 147.23 2 0.047126 155185 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.327 1.5533 232030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 232030000 0 0 20664 1867 19430 184726 235823 235823 1 IGVFSYGSGLAATLYSLK Unmodified 1845.9877 0.98765098 2858 Q01581 HMGCS1 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 154.82 154.82 2;3 5.8836E-10 158033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.46 86.845 170580000 0 0 0 0 0 0 0 0 22894000 0 13475000 95335000 38879000 20665 2858 19431 184727;184728;184729;184730;184731;184732;184733 235824;235825;235826;235827;235828;235829;235830 235824 6 IGVGAMTWSPLACGIVSGK Unmodified 1902.9696 0.96957485 2985 Q13303;Q5TG80 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.01 138.01 2 2.2818E-05 143671 QUIQUE_C1218_190116_001 94.551 80.199 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235883;235884;235885;235886;235887;235888;235889;235890;235891;235892;235893;235894;235895;235896 235896 14 IGYIYALLFVNK Unmodified 1412.8068 0.80677349 1555 O43813;E9PHS0 LANCL1 LanC-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 151.92 151.92 2 0.00053855 157575 QUIQUE_C1218_190116_001 102.95 84.507 437460000 43572000 62714000 0 38959000 0 42726000 80150000 120810000 0 48525000 0 0 0 20670 1555 19436 184787;184788;184789;184790;184791;184792;184793 235897;235898;235899;235900;235901;235902;235903 235897 6 IGYIYALLFVNKNFGVEK Unmodified 2087.1455 0.14554861 1555 O43813;E9PHS0 LANCL1 LanC-like protein 1 yes no 0 0 1 1 149.58 149.58 3 0.0045008 154328 QUIQUE_DMIX7_190116_001 38.824 29.409 27333000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27333000 0 20671 1555 19437 184794 235904 235904 1 IGYLGAMLLLDER Unmodified 1462.7854 0.78538612 1548 O43747;H3BNR4;H3BR36;H3BUN9;H3BN71;B4DGE1;H3BRM7 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 146.69 146.69 2 0.011752 151401 QUIQUE_C1277_190116_001 84.658 71.567 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A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 0 1 1 161.24 161.24 3 7.2956E-14 168526 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.356 64.401 551670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 292560000 259100000 0 20675 469 19439 184808;184809 235919;235920;235921 235919 3 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK Oxidation (M) 3582.6588 0.65881199 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.88 166.88 3 3.4265E-09 168754 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.087 52.874 2282700000 182100000 226670000 0 248030000 105890000 173180000 167760000 242270000 315090000 0 336950000 284740000 0 20676 2794 19440 184810;184811;184812;184813;184814;184815;184816;184817;184818;184819 235922;235923;235924;235925;235926;235927;235928;235929;235930;235931 235928 2236;2237 10 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK Unmodified 3566.6639 0.66389736 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 169.5 169.5 2;3;4 3.1537E-36 176778 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.22 148.74 1981700000 164240000 0 652840000 17847000 0 0 0 18008000 664030000 0 33818000 41480000 389440000 20677 2794 19440 184820;184821;184822;184823;184824;184825;184826;184827;184828 235932;235933;235934;235935;235936;235937;235938;235939;235940 235938 8 IGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK 2 Oxidation (M) 3598.6537 0.65372661 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 2 0 1 1 161.46 161.46 3 1.5229E-05 166498 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.247 39.433 341490000 0 0 0 0 0 0 0 0 178600000 0 162880000 0 0 20678 2794 19440 184829;184830 235941;235942 235941 2236;2237 2 IGYPKPALLHSTFFPALQGAQTK Unmodified 2484.3529 0.35291562 2213 P23381;H0YJP3 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 1 1 2 106.81 106.81 4 0.00039189 111216 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.737 39.43 161660000 0 0 0 0 0 0 0 26252000 0 0 135410000 0 0 20679 2213 19441 184831;184832;184833 235943;235944;235945;235946 235944 2 IGYSSPLTLSDQSSK Unmodified 1581.7886 0.78861683 1577 O60488 ACSL4 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 78.318 78.318 2 0.023622 78817 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.023 35.964 123630000 30563000 29982000 0 0 0 24995000 0 0 0 16123000 0 21967000 0 20680 1577 19442 184834;184835;184836;184837;184838 235947;235948;235949;235950;235951 235951 5 IGYSSPQTLADQSSK Unmodified 1580.7682 0.76821574 1737 O95573 ACSL3 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 53.403 53.403 2 0.0013607 51120 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.288 71.17 163490000 39791000 30060000 0 0 0 0 0 0 0 0 59320000 0 34323000 20681 1737 19443 184839;184840;184841;184842;184843;184844 235952;235953;235954;235955;235956;235957 235957 6 IHAAIVEGGAFFQGR Unmodified 1571.8209 0.82086043 4705 yes no 0 0 0 1 3 1 3 2 3 1 1 91.568 91.568 2;3 0.0062304 82797 QUIQUE_C1438_190116_001 56.783 32.318 880830000 25478000 144350000 49343000 115470000 139040000 0 293240000 0 0 0 82815000 31093000 0 + 20682 4705 19444 184845;184846;184847;184848;184849;184850;184851;184852;184853;184854;184855;184856;184857;184858;184859 235958;235959;235960;235961;235962;235963;235964;235965;235966;235967;235968;235969;235970;235971;235972;235973 235966 14 IHACLYFIAPTGHSLK Unmodified 1826.9502 0.95016004 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 0 1 1 2 2 3 3 3 3 3 72.293 72.293 2;3;4 4.4917E-36 72728 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.92 152.5 5677800000 0 204090000 143390000 0 256500000 0 289290000 1114500000 907050000 0 1023900000 801450000 937580000 20683 820 19445 184860;184861;184862;184863;184864;184865;184866;184867;184868;184869;184870;184871;184872;184873;184874;184875;184876;184877;184878;184879;184880 235974;235975;235976;235977;235978;235979;235980;235981;235982;235983;235984;235985;235986;235987;235988;235989;235990;235991;235992;235993;235994;235995;235996;235997;235998;235999;236000;236001;236002 235986 29 IHAEFVQQK Unmodified 1098.5822 0.58219329 2148 P19474 TRIM21 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21 yes yes 0 0 0 1 19.673 19.673 2 0.015284 12598 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.46 47.853 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20684 2148 19446 184881 236003 236003 1 IHAEPVIHFHK Unmodified 1326.7197 0.71968982 3507 Q86WG5;H0Y767 SBF2 Myotubularin-related protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 20.353 20.353 3 0.017416 13017 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.714 28.07 98547000 27526000 0 0 34851000 0 0 0 0 0 0 36169000 0 0 20685 3507 19447 184882;184883;184884 236004;236005;236006 236006 3 IHAHFTGLR Unmodified 1050.5723 0.5722973 1274 J3KQ12;Q96G97 BSCL2 Seipin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.787 18.787 3 1.2757E-05 11259 QUIQUE_C1563_190116_001 133.98 100.18 221040000 0 0 0 33358000 24651000 27719000 30951000 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14 IHCLENVDK Unmodified 1126.5441 0.54409322 2851;1472;2021 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4 SPTBN1;SPTB;SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 17.842 17.842 2;3 2.7104E-06 10529 QUIQUE_DMIX3_190116_001 158.76 92.683 22359000000 2364000000 1893300000 1509200000 1620300000 2551700000 1176600000 1881000000 1632400000 1846100000 599340000 2297200000 1732200000 1256000000 20689 2851;2021;1472 19451 184908;184909;184910;184911;184912;184913;184914;184915;184916;184917;184918;184919;184920;184921;184922;184923;184924;184925;184926;184927;184928;184929;184930;184931;184932 236032;236033;236034;236035;236036;236037;236038;236039;236040;236041;236042;236043;236044;236045;236046;236047;236048;236049;236050;236051;236052;236053;236054;236055;236056;236057;236058;236059;236060;236061;236062;236063;236064 236055 33 IHCTQTLLEGDGPK Unmodified 1567.7664 0.7664416 2292 P29762 CRABP1 Cellular retinoic acid-binding protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 35.312 35.312 2;3 9.9588E-07 31530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.38 102.96 5030200000 444580000 518880000 285350000 456330000 387630000 311340000 579500000 318530000 357370000 34539000 451580000 306890000 577680000 20690 2292 19452 184933;184934;184935;184936;184937;184938;184939;184940;184941;184942;184943;184944;184945;184946;184947;184948;184949;184950;184951;184952;184953;184954;184955;184956;184957 236065;236066;236067;236068;236069;236070;236071;236072;236073;236074;236075;236076;236077;236078;236079;236080;236081;236082;236083;236084;236085;236086;236087;236088;236089;236090;236091 236081 20 IHDPQLLTER Unmodified 1220.6513 0.65133548 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 35.173 35.173 2;3 0.00076476 30344 QUIQUE_C1403_190116_001 77.379 46.194 1862900000 117190000 97420000 125820000 215140000 175970000 123440000 115260000 125450000 232250000 58607000 146990000 189340000 140070000 20691 2083 19453 184958;184959;184960;184961;184962;184963;184964;184965;184966;184967;184968;184969;184970;184971;184972;184973;184974 236092;236093;236094;236095;236096;236097;236098;236099;236100;236101;236102;236103;236104;236105;236106;236107;236108;236109;236110;236111 236098 20 IHEAAVQELR Unmodified 1164.6251 0.62512073 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 1 1 2 2 22.515 22.515 2;3 0.0011424 15699 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 47.238 806330000 86071000 88303000 107290000 36800000 58072000 56836000 92007000 0 54479000 0 37536000 91601000 97337000 20692 3459 19454 184975;184976;184977;184978;184979;184980;184981;184982;184983;184984;184985;184986;184987;184988;184989;184990;184991;184992 236112;236113;236114;236115;236116;236117;236118;236119;236120;236121;236122;236123;236124;236125;236126;236127;236128;236129;236130;236131;236132;236133 236128 22 IHEAIIQSPPIDYFDVFK Unmodified 2131.099 0.098992348 4192 Q9H993;F5GZY1 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.38 140.38 3 7.7476E-05 147250 QUIQUE_C1438_190116_001 82.01 73.361 578860000 0 59010000 54082000 0 81101000 73293000 64479000 51163000 53244000 0 74504000 67984000 0 20693 4192 19455 184993;184994;184995;184996;184997;184998;184999;185000;185001 236134;236135;236136;236137;236138;236139;236140;236141;236142;236143;236144;236145;236146 236137 12 IHEDIFDIIDR Unmodified 1384.6987 0.69867961 2209;4270 P23258;K7EIS0;K7EKE5;Q9NRH3 TUBG1;TUBG2 Tubulin gamma-1 chain;Tubulin gamma chain;Tubulin gamma-2 chain no no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 112.89 112.89 2;3 0.00012935 115904 QUIQUE_C1403_190116_001 88.441 75.115 527650000 62116000 0 42924000 53784000 49837000 159790000 61603000 25141000 27050000 45404000 0 0 0 20694 2209;4270 19456 185002;185003;185004;185005;185006;185007;185008;185009;185010;185011;185012;185013;185014;185015;185016;185017;185018;185019;185020 236147;236148;236149;236150;236151;236152;236153;236154;236155;236156;236157;236158;236159;236160;236161;236162;236163;236164;236165 236152 19 IHEDKHYPCTLVGTWNTWYGEQDQAVHLWR Unmodified 3738.7426 0.74263347 1622 O75323;H7C333 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes no 0 0 1 2 2 1 2 122.78 122.78 4;5;6 2.2005E-30 127562 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.006 87.909 694030000 0 0 0 0 0 0 0 0 134790000 0 247360000 186490000 125400000 20695 1622 19457 185021;185022;185023;185024;185025;185026;185027 236166;236167;236168;236169;236170;236171;236172;236173;236174;236175 236167 10 IHEDSTGGIYTVGVTTR Unmodified 1804.8955 0.89554151 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 2 2 1 55.475 55.475 2;3 2.3943E-44 53918 QUIQUE_C1277_190116_001 171.36 129.82 892910000 61656000 115910000 82552000 106600000 55752000 69913000 69149000 36123000 37431000 48412000 77366000 75247000 56791000 20696 356 19458 185028;185029;185030;185031;185032;185033;185034;185035;185036;185037;185038;185039;185040;185041;185042;185043;185044;185045;185046 236176;236177;236178;236179;236180;236181;236182;236183;236184;236185;236186;236187;236188;236189;236190;236191;236192;236193;236194;236195;236196;236197 236179 22 IHEEEVRELQEQLAR Unmodified 1877.9595 0.95953875 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 1 1 2 1 3 2 3 3 3 68.911 68.911 2;3;4 2.2713E-145 69685 QUIQUE_DMIX1_190116_001 255.23 237.42 46623000000 0 88713000 96418000 42866000 432960000 0 185630000 24243000000 4938100000 0 2481000000 7342700000 6772100000 20697 389;395;1336 19459 185047;185048;185049;185050;185051;185052;185053;185054;185055;185056;185057;185058;185059;185060;185061;185062;185063;185064;185065;185066 236198;236199;236200;236201;236202;236203;236204;236205;236206;236207;236208;236209;236210;236211;236212;236213;236214;236215;236216;236217;236218;236219;236220;236221;236222;236223;236224;236225;236226;236227;236228;236229;236230;236231;236232;236233;236234;236235;236236;236237 236211 40 IHEGCEEPATHNALAK Unmodified 1775.8261 0.82608174 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 15.993 15.993 2;3;4 3.0076E-185 8272 QUIQUE_DMIX5_190116_001 263.74 216.89 24959000000 2060400000 2647500000 2083500000 2323300000 3036300000 1666000000 2696400000 963890000 1090900000 384680000 2097900000 1762900000 2145400000 20698 50 19460 185067;185068;185069;185070;185071;185072;185073;185074;185075;185076;185077;185078;185079;185080;185081;185082;185083;185084;185085;185086;185087;185088;185089;185090;185091;185092;185093;185094;185095;185096;185097;185098;185099;185100;185101;185102;185103;185104;185105 236238;236239;236240;236241;236242;236243;236244;236245;236246;236247;236248;236249;236250;236251;236252;236253;236254;236255;236256;236257;236258;236259;236260;236261;236262;236263;236264;236265;236266;236267;236268;236269;236270;236271;236272;236273;236274;236275;236276;236277;236278;236279;236280;236281;236282;236283;236284;236285;236286;236287;236288;236289;236290;236291 236283 54 IHEMLQPGQDQ Unmodified 1294.5976 0.59758535 3993 Q9BQE5;J3KQL8 APOL2 Apolipoprotein L2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 37.145 37.145 2 0.0011822 33103 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.819 61.565 170200000 0 0 46552000 27413000 0 0 0 29400000 0 0 66831000 0 0 20699 3993 19461 185106;185107;185108;185109;185110 236292;236293;236294;236295;236296 236295 4 IHEQGLIAILDVEPQALK Unmodified 1986.115 0.11497676 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.02 129.02 2;3 3.0238E-20 134854 QUIQUE_C1218_190116_001 134.9 111.3 497350000 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type yes no 0 0 0 1 1 1 142.61 142.61 4 3.2419E-57 149580 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.23 110.93 281480000 0 0 0 0 0 0 0 76164000 0 0 75623000 0 129690000 20702 3952 19464 185133;185134;185135 236326;236327;236328;236329;236330;236331 236328 6 IHFNPPLPMMR Unmodified 1351.6893 0.68931767 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 2 2 88.851 88.851 2;3 8.6219E-05 90821 QUIQUE_C1403_190116_001 119.68 108.15 2588100000 59177000 259950000 158730000 140830000 251900000 85466000 271470000 147370000 293540000 0 331440000 304940000 283300000 20703 2261 19465 185136;185137;185138;185139;185140;185141;185142;185143;185144;185145;185146;185147;185148;185149;185150;185151;185152;185153;185154 236332;236333;236334;236335;236336;236337;236338;236339;236340;236341;236342;236343;236344;236345;236346;236347;236348;236349;236350;236351;236352;236353;236354;236355;236356;236357;236358;236359;236360;236361;236362 236338 30 IHFNPPLPMMR Oxidation (M) 1367.6842 0.68423229 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 1 0 1 2 4 1 3 2 1 73.985 73.985 3 0.0035146 71803 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.102 52.191 839570000 0 0 0 35454000 0 0 0 122090000 249520000 21191000 201980000 118010000 91318000 20704 2261 19465 185155;185156;185157;185158;185159;185160;185161;185162;185163;185164;185165;185166;185167;185168 236363;236364;236365;236366;236367;236368;236369;236370;236371;236372;236373;236374;236375;236376 236366 1625;1626 13 IHFNPPLPMMR 2 Oxidation (M) 1383.6791 0.67914691 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 2 0 2 1 57.203 57.203 2;3 0.016826 53070 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.436 45.286 216060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 136890000 0 79172000 0 20705 2261 19465 185169;185170;185171 236377;236378;236379;236380 236377 1625;1626 4 IHFPEALGHVALR Unmodified 1458.8096 0.80956746 1418 O00562 PITPNM1 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1 yes yes 0 0 0 1 75.76 75.76 4 0.010975 76330 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236615 349 IHFPLVTYAPIISAEK Unmodified 1798.0029 0.0029071185 688 C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 0 0 2 3 3 2 2 3 2 3 3 3 4 2 2 120.56 120.56 2;3 1.7321E-05 118437 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.57 85.47 6704800000 616640000 510300000 517370000 440040000 417400000 470370000 475510000 322700000 761880000 191460000 1143500000 408540000 429070000 20708 688 19468 185298;185299;185300;185301;185302;185303;185304;185305;185306;185307;185308;185309;185310;185311;185312;185313;185314;185315;185316;185317;185318;185319;185320;185321;185322;185323;185324;185325;185326;185327;185328;185329;185330;185331 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0 20716 3411 19476 185401 236906;236907 236906 2 IHGLLEAGR Unmodified 964.54541 0.54541385 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 26.769 26.769 2 0.0074526 20823 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.548 54.946 148050000 0 0 0 0 0 0 0 30268000 28420000 8563400 56788000 24012000 0 20717 1472 19477 185402;185403;185404;185405;185406 236908;236909;236910;236911;236912;236913 236911 6 IHGQNVPFDAVVVDK Unmodified 1636.8573 0.85730551 1702 O94985;A0A3B3ITY6 CLSTN1 Calsyntenin-1;Soluble Alc-alpha;CTF1-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 66.242 66.242 2;3 0.0063548 66434 QUIQUE_C1438_190116_001 73.435 58.745 48298000 0 0 0 0 20298000 0 0 0 0 12729000 0 15271000 0 20718 1702 19478 185407;185408;185409 236914;236915;236916 236914 2 IHGTEEGQQILK Unmodified 1351.7096 0.70957864 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 25.654 25.654 3 0.025461 19570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 24.229 6.8613 34988000 0 0 0 0 0 0 0 34988000 0 0 0 0 0 20719 3091 19479 185410 236917;236918 236917 2 IHGVLYYVEHR Unmodified 1384.7252 0.72516913 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.087 62.087 3 0.00013077 61824 QUIQUE_C1576_190116_001 97.456 82.763 219190000 0 0 43925000 38900000 22732000 43147000 41146000 0 0 0 29343000 0 0 20720 3239 19480 185411;185412;185413;185414;185415;185416;185417 236919;236920;236921;236922;236923;236924;236925 236924 7 IHGVLYYVEHRDDELYILTNVGEPTEFK Unmodified 3348.6667 0.66665778 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 1 2 139.42 139.42 4;5 2.5849E-08 144038 QUIQUE_DMIX7_190116_001 59.282 52.622 111340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 111340000 0 20721 3239 19481 185418;185419 236926;236927 236926 2 IHHATPPQAQPEVK Unmodified 1551.8158 0.81577505 3257 Q53HC0 CCDC92 Coiled-coil domain-containing protein 92 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 12.684 12.684 3 0.00024602 4912 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.96 62.886 93300000 11389000 0 0 0 3182800 0 4157800 25961000 8543900 0 8611500 31454000 0 20722 3257 19482 185420;185421;185422;185423;185424;185425;185426;185427 236928;236929;236930;236931;236932;236933;236934;236935 236935 8 IHHDVNELLSLLR Unmodified 1557.8627 0.86272524 4013 Q9BSJ2;F2Z2B9;R4GMM4 TUBGCP2 Gamma-tubulin complex component 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 107.36 107.36 3 0.00044558 111567 QUIQUE_C1438_190116_001 62.162 47.371 97743000 0 0 0 18244000 26282000 17111000 0 25244000 0 10862000 0 0 0 20723 4013 19483 185428;185429;185430;185431;185432 236936;236937;236938;236939;236940 236937 4 IHHELNQFCSVHTLQEVYIELFDQIDENLK Unmodified 3710.8039 0.80389632 1696 O94905;E5RHW4;E5RJ09 ERLIN2 Erlin-2 yes no 0 0 0 1 164.18 164.18 4 7.8386E-22 168229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.489 80.821 73782000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 73782000 0 20724 1696 19484 185433 236941 236941 0 IHHPSLPASGR Unmodified 1170.6258 0.62578944 185 A0A0G2JKZ1;A0A0A0MSV9;O15533;A2AB90;A0A0G2JH37;A0A0A0MT98 TAPBP Tapasin yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 14.239 14.239 3 0.0050409 7617 QUIQUE_C1368_190116_001 45.879 38.636 203440000 23279000 2322000 64302000 0 0 26476000 30256000 0 0 17789000 39017000 0 0 20725 185 19485 185434;185435;185436;185437;185438;185439;185440;185441;185442 236942;236943;236944;236945;236946;236947;236948;236949;236950 236944 6 IHIDLPNEQAR Unmodified 1304.6837 0.68369824 124 A0A087X2I1;P62333 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 53.071 53.071 3 0.00026491 51700 QUIQUE_C1218_190116_001 76.143 59.117 202640000 38068000 36294000 34576000 49343000 31702000 0 0 0 0 12660000 0 0 0 20726 124 19486 185443;185444;185445;185446;185447;185448;185449;185450;185451 236951;236952;236953;236954;236955;236956;236957;236958;236959;236960 236951 8 IHILSFLSGLAECR Unmodified 1614.8552 0.85519702 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 136.3 136.3 3 9.8266E-05 142201 QUIQUE_C1576_190116_001 78.486 66.34 117150000 0 0 0 0 0 14282000 48584000 0 0 0 26195000 28093000 0 20727 506 19487 185452;185453;185454;185455;185456 236961;236962;236963;236964;236965 236963 3 IHIMPSLNPDGFEK Unmodified 1596.797 0.79701344 2113 P16870;D6RF88;C9JE88;D6R930 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 88.611 88.611 2 0.00024709 90289 QUIQUE_C1277_190116_001 130.56 115.87 199720000 49458000 69056000 0 49126000 32080000 0 0 0 0 0 0 0 0 20728 2113 19488 185457;185458;185459;185460;185461;185462;185463;185464 236966;236967;236968;236969;236970;236971;236972;236973 236967 8 IHIPFISK Unmodified 953.56984 0.56983769 2717 P61201;B4DIH5;H0YMC2 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 82.383 82.383 2 0.0192 84954 QUIQUE_C1218_190116_001 78.728 47.724 159280000 43100000 17100000 0 14639000 20095000 13337000 0 0 20712000 7744200 0 0 22556000 20729 2717 19489 185465;185466;185467;185468;185469;185470;185471;185472;185473;185474;185475;185476 236974;236975;236976;236977;236978;236979;236980;236981;236982;236983;236984;236985;236986;236987;236988;236989 236975 16 IHISVSEPIIPFR Unmodified 1506.8558 0.85584895 3454 Q7Z2Z2 EFTUD1 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.7 102.7 3 0.00046782 107358 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.692 61.325 108230000 0 17037000 0 0 14989000 10869000 13996000 0 15093000 0 16082000 0 20166000 20730 3454 19490 185477;185478;185479;185480;185481;185482;185483;185484 236990;236991;236992;236993;236994;236995;236996;236997;236998 236996 8 IHLAVTEMASLFPK Unmodified 1555.8432 0.84323535 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QL89 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 120.23 120.23 3 0.00012368 125661 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.705 63.669 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20731 245 19491 185485;185486;185487;185488;185489;185490;185491 236999;237000;237001;237002;237003;237004;237005 237005 7 IHLDDANESDHFENIQSTNWQTMR Unmodified 2900.2784 0.27838306 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 2 94.058 94.058 3;4 2.8843E-63 97330 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.33 151.95 895770000 120600000 85353000 69247000 104880000 55209000 60755000 112470000 47346000 62585000 34221000 143110000 0 0 20732 438;2509 19492 185492;185493;185494;185495;185496;185497;185498;185499;185500;185501;185502;185503;185504;185505;185506;185507;185508 237006;237007;237008;237009;237010;237011;237012;237013;237014;237015;237016;237017;237018;237019;237020;237021;237022;237023;237024 237024 19 IHLDDANESDHFENIQSTNWQTMR Oxidation (M) 2916.2733 0.27329769 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 1 0 2 82.614 82.614 3;4 0.00052614 84357 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.813 40.782 41508000 0 0 0 0 0 0 0 0 41508000 0 0 0 0 20733 438;2509 19492 185509;185510 237025;237026 237025 315 2 IHLFDIDVPGK Unmodified 1252.6816 0.68157298 4256 Q9NQR4;H7C579 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 103.52 103.52 3 8.9846E-05 107684 QUIQUE_C1218_190116_001 98.048 79.303 129030000 40100000 0 0 22629000 12774000 0 21631000 16018000 0 15874000 0 0 0 20734 4256 19493 185511;185512;185513;185514;185515;185516;185517;185518;185519;185520;185521;185522;185523;185524;185525;185526;185527 237027;237028;237029;237030;237031;237032;237033;237034;237035;237036;237037;237038;237039;237040;237041;237042;237043 237027 15 IHLISTQSAIPYALR Unmodified 1681.9515 0.95154025 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 2 2 2 1 93.768 93.768 2;3 6.9941E-10 97158 QUIQUE_C1438_190116_001 113.69 106.65 3500400000 154800000 360570000 141290000 0 348770000 0 357730000 306230000 271700000 178000000 863330000 0 518000000 20735 710 19494 185528;185529;185530;185531;185532;185533;185534;185535;185536;185537;185538;185539;185540;185541;185542;185543;185544;185545 237044;237045;237046;237047;237048;237049;237050;237051;237052;237053;237054;237055;237056;237057;237058;237059;237060;237061 237049 12 IHLLAAR Unmodified 792.49701 0.49700709 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 22.28 22.28 2 0.043299 15617 QUIQUE_C1438_190116_001 80.377 33.332 47349000 0 0 0 0 22305000 0 25044000 0 0 0 0 0 0 20736 4014 19495 185546;185547;185548 237062;237063;237064 237062 3 IHLNSQFPGTQR Unmodified 1396.7211 0.72114638 132 A0A0A0MQU4;Q96I15;H7C3V9;H7C277;H7C1N7;H7C4A1 SCLY Selenocysteine lyase yes no 0 0 0 1 42.135 42.135 3 0.00098273 38531 QUIQUE_C1277_190116_001 54.772 40.49 23513000 0 23513000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20737 132 19496 185549 237065;237066 237066 2 IHLPETVEQLR Unmodified 1333.7354 0.73539946 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 68.512 68.512 3 0.0088676 68745 QUIQUE_C1218_190116_001 37.6 24.011 88300000 56119000 0 0 0 0 0 0 0 32180000 0 0 0 0 20738 472;1460 19497 185550;185551;185552;185553 237067;237068;237069;237070;237071 237067 5 IHMGSCAENTAK Unmodified 1317.5806 0.58055508 2232 P24752 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 12.859 12.859 2;3 3.7729E-05 3265 QUIQUE_C1277_190116_001 127.7 24.006 899970000 0 248740000 0 0 0 0 0 191710000 112440000 4628600 0 342450000 0 20739 2232 19498 185554;185555;185556;185557;185558;185559 237072;237073;237074;237075;237076;237077 237072 5 IHMPAALVANLCDDR Unmodified 1694.8232 0.82324497 3643 Q8NE62;C9JYW4;C9J7D8 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 92.954 92.954 2;3 0.0004661 95818 QUIQUE_C1218_190116_001 78.548 56.015 84264000 61544000 0 0 0 0 22719000 0 0 0 0 0 0 0 20740 3643 19499 185560;185561;185562 237078;237079;237080 237079 3 IHNAENIQPGEQK Unmodified 1476.7321 0.732105 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 14.667 14.667 2;3 2.0073E-52 6097 QUIQUE_C1563_190116_001 196.11 163.79 721520000 65178000 53583000 68085000 88440000 107060000 34767000 64176000 17846000 51207000 0 71337000 27748000 72093000 20741 922 19500 185563;185564;185565;185566;185567;185568;185569;185570;185571;185572;185573;185574;185575;185576;185577;185578;185579;185580;185581;185582;185583 237081;237082;237083;237084;237085;237086;237087;237088;237089;237090;237091;237092;237093;237094;237095;237096;237097;237098;237099;237100;237101;237102;237103 237093 23 IHNFGLIQEK Unmodified 1197.6506 0.6506072 2539 P49748;J3KSR4 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 3 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 44.485 44.485 2;3 2.4277E-23 41922 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.26 139.55 1302500000 176790000 117480000 95192000 50118000 107840000 0 99989000 234130000 81564000 144690000 0 80330000 114330000 20742 2539 19501 185584;185585;185586;185587;185588;185589;185590;185591;185592;185593;185594;185595;185596;185597;185598;185599;185600;185601 237104;237105;237106;237107;237108;237109;237110;237111;237112;237113;237114;237115;237116;237117;237118;237119;237120;237121;237122 237114 16 IHNGESMSYLFR Unmodified 1452.682 0.68198369 1565 O60256;I3L0S1 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 64.515 64.515 3 0.0069943 63391 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.875 6.6179 28217000 0 0 0 0 0 0 0 28217000 0 0 0 0 0 20743 1565 19502 185602 237123 237123 1 IHNLALNCCTQLADLYR Unmodified 2074.0088 0.0088139074 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 96.89 96.89 2;3 0.00011398 100603 QUIQUE_C1576_190116_001 82.259 68.427 608160000 0 0 61848000 63218000 55495000 0 84444000 69590000 0 0 68265000 69213000 136090000 20744 2636 19503 185603;185604;185605;185606;185607;185608;185609;185610;185611 237124;237125;237126;237127;237128;237129;237130;237131;237132;237133;237134;237135 237128 10 IHNLIPVMLR Unmodified 1204.7114 0.71143332 3657 Q8NI60 ADCK3 Atypical kinase ADCK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 79.758 79.758 3 0.027896 81380 QUIQUE_C1368_190116_001 54.608 44.084 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20745 3657 19504 185612 237136 237136 1 IHNLTAYLQTLHR Unmodified 1578.8631 0.86305959 65;4141 A0A087WXL6;B7Z879;A0A087X2J4;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 72.137 72.137 3;4 5.702E-05 73736 QUIQUE_C1218_190116_001 95.264 86.444 855840000 85596000 62226000 64177000 59106000 71345000 57436000 75449000 40155000 82514000 15376000 67671000 82444000 92341000 20746 65;4141 19505 185613;185614;185615;185616;185617;185618;185619;185620;185621;185622;185623;185624;185625;185626;185627;185628;185629;185630;185631;185632;185633;185634;185635 237137;237138;237139;237140;237141;237142;237143;237144;237145;237146;237147;237148;237149;237150;237151;237152;237153;237154;237155;237156;237157;237158;237159;237160;237161;237162;237163;237164 237138 27 IHNPDEPETR Unmodified 1206.5629 0.56291441 3524 Q86YS7 C2CD5 C2 domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 11.203 11.203 3 0.0067393 3709 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.347 44.771 6462400 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73416000 81999000 20750 2810 19509 185643;185644;185645;185646;185647;185648;185649;185650;185651 237172;237173;237174;237175;237176;237177;237178;237179;237180;237181 237172 7 IHPTSVISGYR Unmodified 1228.6564 0.65642086 2132 P17987;E7ERF2;F5H136;F5H676 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 37.414 37.414 2;3 0.0042567 33024 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.906 66.751 2791400000 198270000 201340000 220700000 171310000 397350000 348850000 430150000 146050000 168440000 133820000 0 177470000 197610000 20751 2132 19510 185652;185653;185654;185655;185656;185657;185658;185659;185660;185661;185662;185663;185664;185665;185666;185667 237182;237183;237184;237185;237186;237187;237188;237189;237190;237191;237192;237193;237194;237195;237196;237197;237198 237196 10 IHPVDKLTIQGLK Unmodified 1460.8715 0.87149901 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 3 1 52.641 52.641 2;3 0.00035715 50568 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.52 73.051 367950000 0 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1 1 115.93 115.93 3 0.001451 121229 QUIQUE_C1576_190116_001 54.764 45.234 119800000 0 0 39243000 0 0 0 50590000 0 0 0 0 0 29972000 20755 4227 19514 185684;185685;185686 237217;237218;237219 237218 3 IHQESELHSYLSR Unmodified 1597.7849 0.78486885 4509 Q9UNE7;H3BTA3;H3BUD0;H3BS86 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 2 2 2 35.439 35.439 2;3 0.00032758 30765 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.904 47.725 995350000 139730000 115140000 0 0 96181000 136500000 123210000 76296000 110950000 0 118260000 79088000 0 20756 4509 19515 185687;185688;185689;185690;185691;185692;185693;185694;185695;185696;185697;185698;185699;185700;185701;185702;185703 237220;237221;237222;237223;237224;237225;237226;237227;237228;237229;237230;237231;237232;237233;237234;237235;237236 237235 17 IHQIEYAMEAVK Unmodified 1430.7228 0.72278587 2244 P25786;B4DEV8 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1;Proteasome subunit alpha type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 58.513 58.513 2;3 1.004E-09 57577 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2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 78.932 78.932 4 0.059043 79998 QUIQUE_DMIX3_190116_001 20.064 11.017 74273000 0 0 0 0 0 0 0 0 74273000 0 0 0 0 20759 2486 19518 185733 237270 237270 1 IHQTLHLLMCFK Oxidation (M) 1555.8003 0.80032468 4736 yes yes 0 1 0 2 3 4 2 2 2 3 4 4 2 3 2 4 71.175 71.175 2 0.0056624 74300 QUIQUE_C1218_190116_001 68.224 46.851 42627000000 1179800000 1925500000 4261400000 1631300000 2489900000 1895900000 3947300000 4938300000 6987100000 1047900000 3419000000 2758900000 6145100000 + 20760 4736 19519 185734;185735;185736;185737;185738;185739;185740;185741;185742;185743;185744;185745;185746;185747;185748;185749;185750;185751;185752;185753;185754;185755;185756;185757;185758;185759;185760;185761;185762;185763;185764;185765;185766;185767;185768;185769;185770 237271;237272;237273;237274;237275;237276;237277;237278;237279;237280;237281;237282;237283;237284;237285;237286;237287;237288;237289;237290;237291;237292;237293;237294;237295;237296;237297;237298;237299;237300;237301;237302;237303;237304;237305;237306;237307;237308;237309;237310;237311;237312;237313;237314 237272 3097 39 IHSDTFASGGER Unmodified 1275.5844 0.58437813 3155 Q15750 TAB1 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.677 16.677 3 0.0051337 8904 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.7 45.378 129630000 17263000 17356000 22828000 0 0 0 22556000 0 0 10208000 39423000 0 0 20761 3155 19520 185771;185772;185773;185774;185775;185776 237315;237316;237317;237318;237319;237320 237320 5 IHSEVVEDTEAVSAVQQLLDDER Unmodified 2581.2508 0.25075456 3858 Q96GA7;H0YID3 SDSL Serine dehydratase-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 138.29 138.29 3 0.00015088 145017 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.648 44.374 351870000 0 0 0 0 59204000 0 0 62991000 94689000 0 51705000 0 83278000 20762 3858 19521 185777;185778;185779;185780;185781 237321;237322;237323;237324;237325 237324 3 IHSGEKPYECPNCK Unmodified 1717.7552 0.75522498 360 A0A1B0GWI0;A0A1B0GVV8;A0A1B0GW50;A0JP08;O60315;A0A1X7SC99;E7EUW9;H0YMD3;H0YMN2;H0YND9;U3KQ51;E7ESP8;P37275;F6TDF5 ZEB2;ZEB1 Zinc finger E-box-binding homeobox 2;Zinc finger E-box-binding homeobox 1 yes no 0 0 1 1 10.877 10.877 3 0.050686 3246 QUIQUE_DMIX8_190116_001 31.881 27.413 3154600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3154600 20763 360 19522 185782 237326 237326 1 IHSLTHLDSVTK Unmodified 1349.7303 0.73031409 2481 P46736;A0A087WZR3;H9KVA9;A0A0D9SF50 BRCC3 Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36 yes no 0 0 0 1 23.245 23.245 3 0.0038492 16704 QUIQUE_C1368_190116_001 56.956 34.724 74922000 0 0 74922000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20764 2481 19523 185783 237327 237327 1 IHTSLIGCIK Unmodified 1140.6325 0.6325143 305;4602 A0A0J9YYF7;Q86T65;Q9Y4D1 DAAM2;DAAM1 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2;Disheveled-associated activator of morphogenesis 1 no no 0 0 0 1 2 2 41.231 41.231 3 0.0026736 37487 QUIQUE_C1277_190116_001 54.191 28.569 25910000 0 25910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20765 305;4602 19524 185784;185785;185786;185787;185788 237328;237329;237330;237331;237332 237328 5 IHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMK Oxidation (M) 3007.3779 0.37790287 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 1 0 1 2 1 1 3 1 101.22 101.22 3;4 1.0322E-12 103116 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.463 88.369 865250000 95185000 221470000 0 79443000 115210000 0 0 234150000 119790000 0 0 0 0 20766 2121 19525 185789;185790;185791;185792;185793;185794;185795;185796;185797 237333;237334;237335;237336;237337;237338;237339;237340;237341 237339 1450 8 IHTYGSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMK Unmodified 2991.383 0.38298825 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 0 2 3 1 1 1 1 3 3 3 2 1 4 109.96 109.96 3;4;5 1.2714E-46 113496 QUIQUE_C1277_190116_001 145.77 143.35 3181000000 153610000 386270000 60321000 146580000 70363000 79889000 354280000 430470000 503960000 0 296450000 193570000 505230000 20767 2121 19525 185798;185799;185800;185801;185802;185803;185804;185805;185806;185807;185808;185809;185810;185811;185812;185813;185814;185815;185816;185817;185818;185819;185820;185821;185822 237342;237343;237344;237345;237346;237347;237348;237349;237350;237351;237352;237353;237354;237355;237356;237357;237358;237359;237360;237361;237362;237363;237364;237365;237366;237367;237368;237369;237370;237371;237372;237373;237374;237375;237376;237377;237378;237379;237380 237345 35 IHTYSSPTFCDHCGSLLYGLIHQGMK Unmodified 3021.3936 0.39355294 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 0 0 0 1 109.76 109.76 4 2.0187E-05 113020 QUIQUE_C1277_190116_001 50.215 43.711 67201000 0 67201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20768 1894 19526 185823 237381 237381 1 IHVCLYFIAPTGHSLK Unmodified 1854.9815 0.98146017 594 B1AMS2;Q14141 SEPT6 Septin-6 yes no 0 0 0 1 87.62 87.62 3 0.067658 89246 QUIQUE_DMIX7_190116_001 26.21 17.267 102880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 102880000 0 20769 594 19527 185824 237382 237382 1 IHVCLYFITPTGHSLK Unmodified 1884.992 0.99202486 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;C9JV02;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 0 2 3 2 3 2 89.273 89.273 2;3;4 0.00011126 91324 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.709 49.951 746330000 0 0 0 0 0 0 0 141460000 194640000 0 167080000 116800000 126350000 20770 535;3739 19528 185825;185826;185827;185828;185829;185830;185831;185832;185833;185834;185835;185836 237383;237384;237385;237386;237387;237388;237389;237390;237391;237392;237393;237394;237395;237396 237387 13 IHVFYIDYGNR Unmodified 1395.6935 0.69353465 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 83.868 83.868 2;3 6.4257E-05 85050 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.143 86.19 1204900000 81995000 101230000 110610000 103760000 71890000 46825000 95181000 117430000 119370000 36341000 142950000 104670000 72613000 20771 3432 19529 185837;185838;185839;185840;185841;185842;185843;185844;185845;185846;185847;185848;185849;185850;185851;185852;185853;185854;185855;185856;185857;185858;185859;185860;185861 237397;237398;237399;237400;237401;237402;237403;237404;237405;237406;237407;237408;237409;237410;237411;237412;237413;237414;237415;237416;237417;237418;237419;237420;237421;237422;237423;237424;237425;237426;237427 237415 31 IHVIDHSGAR Unmodified 1103.5836 0.58359027 3951 Q99426;K7EP07;K7EK42 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes no 0 0 0 1 10.342 10.342 3 0.00012412 2772 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.095 77.093 9994400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9994400 0 0 0 20772 3951 19530 185862 237428 237428 1 IHVLEAQDLIAK Unmodified 1348.7715 0.77145062 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 2 74.317 74.317 2;3 0.0021794 75240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.445 64.977 246170000 0 0 37860000 95257000 38277000 0 35032000 0 0 0 0 0 39749000 20773 4014 19531 185863;185864;185865;185866;185867;185868;185869;185870;185871;185872;185873;185874;185875;185876;185877 237429;237430;237431;237432;237433;237434;237435;237436;237437;237438;237439;237440;237441;237442;237443;237444;237445;237446 237437 18 IHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIR Unmodified 3990.1295 0.1295112 2658 P55072;C9IZA5;C9JUP7 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes no 0 0 2 2 1 168.88 168.88 5 2.0043E-57 176154 QUIQUE_DMIX5_190116_001 124.66 119.21 415950000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 389530000 26423000 0 20774 2658 19532 185878;185879;185880 237447;237448;237449 237447 2 IHVQSSSDSSDEPAEK Unmodified 1714.7646 0.76458692 898 E9PBM2;Q8WUF8;B4DMI0 FAM172A Protein FAM172A yes no 0 0 0 1 15.596 15.596 3 0.048336 7825 QUIQUE_C1218_190116_001 17.931 12.036 16627000 16627000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20775 898 19533 185881 237450 237450 1 IHVQSSSDSSDEPAEKR Unmodified 1870.8657 0.86569795 898 E9PBM2;Q8WUF8;B4DMI0 FAM172A Protein FAM172A yes no 0 0 1 1 1 1 1 10.839 10.839 3 0.0060981 3085 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185914;185915;185916;185917;185918;185919;185920;185921;185922;185923;185924;185925;185926;185927;185928;185929;185930;185931;185932;185933;185934;185935;185936;185937;185938;185939;185940;185941;185942;185943 237488;237489;237490;237491;237492;237493;237494;237495;237496;237497;237498;237499;237500;237501;237502;237503;237504;237505;237506;237507;237508;237509;237510;237511;237512;237513;237514;237515;237516;237517;237518;237519;237520;237521;237522;237523;237524;237525;237526;237527;237528;237529;237530;237531;237532;237533;237534;237535;237536;237537;237538;237539;237540;237541;237542;237543 237526 56 IHVYGYSMAYGPAQHAISTEK Oxidation (M) 2338.1052 0.10521671 4277 Q9NRX4 PHPT1 14 kDa phosphohistidine phosphatase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.36 60.36 3;4 8.1703E-20 59644 QUIQUE_C1277_190116_001 128.29 120.11 817590000 0 77587000 95026000 44503000 56958000 64767000 83858000 40906000 87038000 101460000 72272000 0 93220000 20781 4277 19538 185944;185945;185946;185947;185948;185949;185950;185951;185952;185953;185954 237544;237545;237546;237547;237548;237549;237550;237551;237552;237553;237554;237555;237556 237545 2896 13 IHWESASLLR Unmodified 1210.6459 0.64585618 1803 P01024;M0QYC8 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 68.358 68.358 2;3 0.00010402 68568 QUIQUE_C1277_190116_001 109.29 88.987 376890000 29587000 29408000 59657000 0 50026000 27735000 19190000 0 17744000 42353000 63657000 0 37534000 20782 1803 19539 185955;185956;185957;185958;185959;185960;185961;185962;185963;185964;185965;185966;185967;185968;185969;185970;185971 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185974;185975;185976;185977;185978;185979;185980;185981;185982;185983;185984;185985;185986;185987;185988;185989;185990;185991;185992;185993;185994;185995;185996;185997;185998 237585;237586;237587;237588;237589;237590;237591;237592;237593;237594;237595;237596;237597;237598;237599;237600;237601;237602;237603;237604;237605;237606;237607;237608;237609;237610;237611;237612;237613;237614 237593 29 IHYLDTTTLIEPAPR Unmodified 1738.9254 0.92538508 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 86.378 86.378 2;3 7.4416E-06 87987 QUIQUE_C1403_190116_001 142.47 117.43 1381600000 193440000 199850000 0 253850000 57684000 53808000 61779000 0 79031000 86255000 337270000 58652000 0 20785 2480 19542 185999;186000;186001;186002;186003;186004;186005;186006;186007;186008;186009;186010;186011 237615;237616;237617;237618;237619;237620;237621;237622;237623;237624;237625;237626;237627 237618 12 IHYLDTTTLIEPVSR Unmodified 1756.9359 0.93594977 2479 P46108;I3L297 CRK Adapter molecule crk 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186038;186039;186040;186041;186042;186043;186044;186045;186046;186047;186048 237656;237657;237658;237659;237660;237661;237662;237663;237664;237665;237666;237667 237658 12 IIAATFLFKWWDNLNHLNQFVDHEK Unmodified 3098.5767 0.57666098 3032 Q13907 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 83.419 83.419 5 0.055216 86432 QUIQUE_C1438_190116_001 18.403 12.175 236720000 0 0 0 0 61519000 0 48799000 0 0 0 47177000 22107000 57121000 20788 3032 19545 186049;186050;186051;186052;186053 237668;237669;237670;237671;237672 237668 5 IIADADATVK Unmodified 1015.555 0.55497548 2225 P24043 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 39.945 39.945 2 0.037924 34108 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.854 14.834 57870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57870000 0 0 0 20789 2225 19546 186054 237673 237673 1 IIADIFEYTAK Unmodified 1282.6809 0.68090428 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 114.79 114.79 2 0.0010999 119829 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.108 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754090000 962830000 896650000 721110000 963340000 20792 1777 19549 186071;186072;186073;186074;186075;186076;186077;186078;186079;186080;186081;186082;186083 237690;237691;237692;237693;237694;237695;237696;237697;237698;237699;237700;237701;237702;237703;237704;237705;237706;237707;237708;237709;237710;237711;237712;237713;237714;237715;237716 237708 27 IIAEGANGPTTPEADKIFLER Unmodified 2241.1641 0.1641118 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 3 3 2 3 2 2 3 91.319 91.319 2;3 0 93097 QUIQUE_DMIX3_190116_001 301.48 255.32 43456000000 1864500000 1927400000 2851900000 2300500000 2849600000 1756300000 2405300000 6568300000 4851000000 898060000 5455000000 4993800000 4734500000 20793 1777 19550 186084;186085;186086;186087;186088;186089;186090;186091;186092;186093;186094;186095;186096;186097;186098;186099;186100;186101;186102;186103;186104;186105;186106;186107;186108;186109;186110;186111;186112;186113 237717;237718;237719;237720;237721;237722;237723;237724;237725;237726;237727;237728;237729;237730;237731;237732;237733;237734;237735;237736;237737;237738;237739;237740;237741;237742;237743;237744;237745;237746;237747;237748;237749;237750;237751;237752;237753;237754;237755;237756;237757;237758;237759;237760;237761;237762;237763;237764;237765;237766;237767;237768;237769;237770;237771;237772;237773;237774;237775;237776;237777 237756 59 IIAFVGSPVEDNEK Unmodified 1516.7773 0.77732386 2655 Q5VWC4;P55036;A6PVX3 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 yes no 0 0 0 1 84.252 84.252 2 0.0030712 85741 QUIQUE_C1277_190116_001 82.171 49.648 32933000 0 32933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20794 2655 19551 186114 237778 237778 0 IIAFVGSPVEDNEKDLVK Unmodified 1972.0517 0.051707805 2655 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protein Sec31A yes no 0 0 2 1 32.743 32.743 4 0.00084534 27734 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.03 31.091 44414000 0 0 0 0 0 0 0 44414000 0 0 0 0 0 20797 821 19554 186132 237796;237797 237796 2 IIAHFLIQQYLK Unmodified 1485.8708 0.87077073 2477 P46063 RECQL ATP-dependent DNA helicase Q1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 108.69 108.69 3 0.00015644 107216 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.38 91.192 25425000 0 0 18245000 0 0 0 0 0 0 7180000 0 0 0 20798 2477 19555 186133;186134;186135;186136 237798;237799;237800;237801 237800 4 IIALDGDTK Unmodified 944.51786 0.51786169 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 40.862 40.862 1;2 0.00017684 37961 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.88 86.323 12559000000 1194000000 1031400000 1257200000 871780000 1124400000 917360000 831900000 674280000 939100000 1023000000 1095100000 915740000 683750000 20799 2288 19556 186137;186138;186139;186140;186141;186142;186143;186144;186145;186146;186147;186148;186149;186150;186151 237802;237803;237804;237805;237806;237807;237808;237809;237810;237811;237812;237813;237814;237815;237816;237817;237818;237819;237820;237821;237822;237823;237824;237825;237826;237827;237828;237829;237830;237831 237822 28 IIALGHSGFEMDK Unmodified 1416.7071 0.7071358 2183 P21589;Q96B60 NT5E 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 1 69.35 69.35 3 0.0081988 70521 QUIQUE_C1438_190116_001 39.509 23.97 78591000 0 0 0 0 35263000 0 0 0 0 0 43327000 0 0 20800 2183 19557 186152;186153 237832;237833;237834 237833 3 IIALGPTGAQFLSPVIVEIPHFASHGR Unmodified 2826.5545 0.55446898 2103 P16157;H0YBS0 ANK1 Ankyrin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 144.4 144.4 4 5.5756E-19 151109 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.468 82.499 273680000 44276000 47455000 44270000 0 42383000 0 0 0 0 0 95292000 0 0 20801 2103 19558 186154;186155;186156;186157;186158 237835;237836;237837;237838;237839;237840 237840 6 IIALPHDNR Unmodified 1047.5825 0.58252764 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.283 28.283 3 0.0069791 22515 QUIQUE_C1438_190116_001 52.579 37.641 481600000 59625000 73435000 66514000 0 49325000 50620000 0 0 44416000 0 71972000 65697000 0 20802 498 19559 186159;186160;186161;186162;186163;186164;186165;186166 237841;237842;237843;237844;237845;237846;237847;237848;237849;237850 237845 10 IIAMGLLLPFSDCFR Unmodified 1751.9103 0.91026906 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 167.27 167.27 2 0.00092216 169025 QUIQUE_C1563_190116_001 73.067 47.63 69616000 0 0 0 0 0 69616000 0 0 0 0 0 0 0 20803 4340 19560 186167 237851 237851 1 IIAPANLER Unmodified 995.57638 0.57637963 226 E7EW77;E7EP65;A0A0C4DG21;F8WAL6;Q9NYB9;E9PEZ7;B7Z836 ABI2 Abl interactor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.091 46.091 2 0.0097087 42669 QUIQUE_C1368_190116_001 75.213 32.089 581190000 73426000 70137000 78791000 72560000 44033000 70398000 64778000 0 0 29102000 30694000 24944000 22328000 20804 226 19561 186168;186169;186170;186171;186172;186173;186174;186175;186176;186177;186178 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muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 23.863 23.863 2 0.019551 18392 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.7 39.95 282430000000 26803000000 24196000000 0 25166000000 25439000000 23204000000 28236000000 19810000000 20792000000 19155000000 23179000000 21548000000 24905000000 20806 548;2696;2759;2788;2792;3261 19563 186193;186194;186195;186196;186197;186198;186199;186200;186201;186202;186203;186204;186205 237880;237881;237882;237883;237884;237885;237886;237887;237888;237889;237890;237891;237892;237893;237894;237895;237896;237897;237898;237899;237900;237901;237902;237903;237904;237905;237906;237907;237908;237909;237910;237911;237912;237913;237914;237915 237899 36 IIAQCLNK Unmodified 958.52699 0.52698659 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.359 24.359 2 0.0036102 18001 QUIQUE_C1438_190116_001 114.54 54.93 3423200000 0 338600000 286050000 0 290780000 223920000 311460000 264110000 320740000 157150000 454340000 426130000 349930000 20807 1620 19564 186206;186207;186208;186209;186210;186211;186212;186213;186214;186215;186216 237916;237917;237918;237919;237920;237921;237922;237923;237924;237925;237926;237927;237928;237929;237930 237918 14 IIATAVCHTDAYTLSGADPEGCFPVILGHEGAGIVESVGEGVTK Unmodified 4497.1832 0.18321562 2028 P11766;D6RFE4;D6R9G2 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes no 0 0 0 4 6 4 8 6 4 6 5 5 3 3 5 5 148.28 148.28 4;5 3.7809E-130 151393 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.46 146.76 6920800000 467250000 591230000 521670000 773920000 539400000 464060000 825240000 509700000 481800000 195920000 323240000 525170000 702190000 20808 2028 19565 186217;186218;186219;186220;186221;186222;186223;186224;186225;186226;186227;186228;186229;186230;186231;186232;186233;186234;186235;186236;186237;186238;186239;186240;186241;186242;186243;186244;186245;186246;186247;186248;186249;186250;186251;186252;186253;186254;186255;186256;186257;186258;186259;186260;186261;186262;186263;186264;186265;186266;186267;186268;186269;186270;186271;186272;186273;186274;186275;186276;186277;186278;186279;186280 237931;237932;237933;237934;237935;237936;237937;237938;237939;237940;237941;237942;237943;237944;237945;237946;237947;237948;237949;237950;237951;237952;237953;237954;237955;237956;237957;237958;237959;237960;237961;237962;237963;237964;237965;237966;237967;237968;237969;237970;237971;237972;237973;237974;237975;237976;237977;237978;237979;237980;237981;237982;237983;237984;237985;237986;237987;237988;237989;237990;237991;237992;237993;237994;237995;237996;237997;237998 237977 63 IIAVSFPSTANEENFR Unmodified 1793.8948 0.89481323 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;E7EMG1;E7ERH1;C9JI43;C9JFT7;C9J8K5 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 1 106.29 106.29 2 0.00062496 108644 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.189 72.935 82645000 0 27740000 0 0 0 0 0 54905000 0 0 0 0 0 20809 422 19566 186281;186282 237999;238000 238000 2 IICAQQCSGR Unmodified 1191.5489 0.54886102 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8;A0A1W2PRR9 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 16.927 16.927 2 0.00069041 9472 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.69 85.562 52367000 19379000 0 0 0 0 0 0 26189000 0 6798400 0 0 0 20810 1789 19567 186283;186284;186285 238001;238002;238003 238002 3 IICDLVEEK Unmodified 1117.5689 0.56891099 1014 F5H6E2;O00159 MYO1C Unconventional myosin-Ic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.037 58.037 2 0.016747 56378 QUIQUE_C1277_190116_001 68.625 34.983 177070000 47769000 50190000 0 0 37892000 0 0 28698000 0 12519000 0 0 0 20811 1014 19568 186286;186287;186288;186289;186290;186291 238004;238005;238006;238007;238008;238009 238005 6 IICILSHPIK Unmodified 1192.7002 0.70019993 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 58.704 58.704 2;3 0.00032039 56654 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.89 102.69 37222000000 2898700000 2938200000 3181600000 2822500000 3247500000 2371900000 3395600000 2601500000 2849400000 1726800000 2895900000 3259500000 3032800000 20812 2328 19569 186292;186293;186294;186295;186296;186297;186298;186299;186300;186301;186302;186303;186304;186305;186306;186307;186308;186309;186310;186311;186312;186313;186314;186315;186316;186317;186318 238010;238011;238012;238013;238014;238015;238016;238017;238018;238019;238020;238021;238022;238023;238024;238025;238026;238027;238028;238029;238030;238031;238032;238033;238034;238035;238036;238037;238038;238039;238040;238041;238042;238043;238044;238045;238046;238047;238048;238049;238050;238051;238052;238053;238054;238055;238056;238057;238058;238059;238060 238060 48 IICQGFTGK Unmodified 1022.5219 0.52190122 2625 P53597;H7C233 SUCLG1 Succinyl-CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.923 32.923 2 0.00045345 27950 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.4 93.875 5098600000 459860000 502000000 416090000 0 379790000 378890000 464740000 300930000 404980000 167180000 613380000 461580000 549150000 20813 2625 19570 186319;186320;186321;186322;186323;186324;186325;186326;186327;186328;186329;186330 238061;238062;238063;238064;238065;238066;238067;238068;238069;238070;238071;238072 238069 12 IIDAALR Unmodified 770.46504 0.46503826 2170 P20674;H3BNX8;H3BRM5;H3BV69 COX5A Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.125 34.125 2 0.00011419 29639 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.15 50.277 8268700000 1005400000 868130000 868510000 448080000 687410000 660000000 744690000 0 634770000 176580000 812780000 693440000 668940000 20814 2170 19571 186331;186332;186333;186334;186335;186336;186337;186338;186339;186340;186341;186342 238073;238074;238075;238076;238077;238078;238079;238080;238081;238082;238083;238084;238085;238086 238081 14 IIDCAFTVTFNPK Unmodified 1524.7647 0.76465068 2570 P50579;F8VRR3;F8VQZ7;G3V1U3 METAP2 Methionine aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 108.01 108.01 2 0.0038031 111685 QUIQUE_C1368_190116_001 70.412 47.092 104630000 0 0 29471000 0 36164000 0 0 38989000 0 0 0 0 0 20815 2570 19572 186343;186344;186345;186346 238087;238088;238089;238090 238087 4 IIDDSEITKEDDALWPPPDR Unmodified 2324.1172 0.11722119 3798 Q96A72;F5H6N1 MAGOHB Protein mago nashi homolog 2 no no 0 0 1 1 1 111.28 111.28 3 1.2087E-05 115297 QUIQUE_C1218_190116_001 49.865 45.416 118890000 68404000 0 0 0 0 0 0 0 0 50483000 0 0 0 20816 3798 19573 186347;186348 238091;238092;238093 238092 3 IIDEDFELTER Unmodified 1378.6616 0.6616254 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.921 88.921 2 0.00020843 90805 QUIQUE_C1277_190116_001 123.63 100.31 782940000 59212000 70662000 84677000 58045000 61134000 53270000 84489000 61013000 76664000 0 78620000 95156000 0 20817 3154 19574 186349;186350;186351;186352;186353;186354;186355;186356;186357;186358;186359 238094;238095;238096;238097;238098;238099;238100;238101;238102;238103;238104 238095 10 IIDELNVKPEGTR Unmodified 1482.8042 0.80420731 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 2 2 1 1 48.8 48.8 2;3 0.00033145 46275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.412 68.862 2265700000 39411000 0 188740000 64501000 428340000 319340000 159060000 33287000 213460000 132560000 242750000 188980000 255250000 20818 2037 19575 186360;186361;186362;186363;186364;186365;186366;186367;186368;186369;186370;186371;186372;186373;186374;186375;186376 238105;238106;238107;238108;238109;238110;238111;238112;238113;238114;238115;238116;238117;238118;238119;238120;238121;238122;238123;238124 238117 18 IIDEVVNK Unmodified 928.52295 0.52294707 1752 O95816 BAG2 BAG family molecular chaperone regulator 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 31.457 31.457 2 0.033644 26130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.567 26.593 47403000 0 0 0 0 0 0 0 30571000 0 16832000 0 0 0 20819 1752 19576 186377;186378;186379 238125;238126;238127 238125 3 IIDFGFAR Unmodified 937.50215 0.50215205 1647 O75582;A0A0A6YYC0;E9PJN1;O75676 RPS6KA5;RPS6KA4 Ribosomal protein S6 kinase alpha-5;Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 95.231 95.231 2 0.018657 92872 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.597 59.315 70455000 0 0 0 15519000 21870000 0 0 0 0 11798000 0 0 21267000 20820 1647 19577 186380;186381;186382;186383 238128;238129;238130;238131;238132 238131 5 IIDGGSGYLCEMEPVAHFGLGK Unmodified 2349.1133 0.11333856 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79;Q5T4F6 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 0 1 125.87 125.87 3 0.002379 129817 QUIQUE_C1277_190116_001 23.653 16.93 73962000 0 73962000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20821 218 19578 186384 238133 238133 1 IIDGLLVMR Unmodified 1028.6052 0.60523691 738 C9JQD4;O43447;H0YEL5 PPIH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.18 102.18 2 0.00057338 104970 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.82 86.079 397340000 33433000 35593000 38537000 31267000 33658000 27018000 29910000 28408000 28254000 0 37933000 27780000 45544000 20822 738 19579 186385;186386;186387;186388;186389;186390;186391;186392;186393;186394;186395;186396;186397 238134;238135;238136;238137;238138;238139;238140;238141;238142;238143;238144;238145;238146 238142 13 IIDISDVFR Unmodified 1076.5866 0.58660996 3393 Q6PI48;A0A3B3IT01;A0A3B3ISK7;A0A3B3IS01;A0A3B3ITS3;A0A3B3IS54;A0A3B3ITK9 DARS2 Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.81 125.81 2 1.5312E-06 128452 QUIQUE_C1563_190116_001 174.27 137.25 506360000 45989000 38270000 40630000 46188000 40958000 35849000 44464000 41509000 44685000 27114000 54901000 45809000 0 20823 3393 19580 186398;186399;186400;186401;186402;186403;186404;186405;186406;186407;186408;186409 238147;238148;238149;238150;238151;238152;238153;238154;238155;238156;238157;238158;238159;238160;238161;238162;238163;238164;238165;238166;238167 238159 21 IIDKNGIHDLDNISFPK Unmodified 1938.0211 0.021076378 2538 P49721;A0A087WVV1 PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 85.683 85.683 3;4 0.0059234 86969 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.697 29.171 236090000 0 0 0 0 0 0 0 116340000 0 0 43931000 37491000 38323000 20824 2538 19581 186410;186411;186412;186413;186414 238168;238169;238170;238171;238172 238169 5 IIDLGYAK Unmodified 891.50657 0.50656873 1457;1481 O15111;O14920;G3V105;E5RGW5 CHUK;IKBKB Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha;Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 57.67 57.67 2 0.028944 55818 QUIQUE_C1368_190116_001 68.312 34.797 97669000 0 0 40496000 39905000 0 0 0 0 17268000 0 0 0 0 20825 1481;1457 19582 186415;186416;186417 238173;238174;238175 238173 3 IIDLLENGK Unmodified 1013.5757 0.57571092 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.304 73.304 2 0.0004994 74459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.08 58.468 295110000 0 0 0 0 0 0 0 43675000 0 0 133050000 118380000 0 20826 3390 19583 186418;186419;186420;186421;186422;186423;186424;186425;186426 238176;238177;238178;238179;238180;238181;238182;238183;238184 238183 9 IIDQSSNVEIASFPIYK Unmodified 1922.9989 0.99894395 231 A0A0C4DG54;Q5R372;A0A0U1RQY6 RABGAP1L Rab GTPase-activating protein 1-like yes no 0 0 0 1 117.01 117.01 2 7.2914E-05 120799 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.018 74.815 23863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23863000 0 20827 231 19584 186427 238185 238185 1 IIDTPISEMGFAGIAVGAAMAGLR Unmodified 2360.2232 0.22322336 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 171.78 171.78 2;3 1.6146E-74 176149 QUIQUE_C1218_190116_001 172.1 158.07 350920000 62240000 44680000 46864000 39622000 23591000 72861000 18090000 5758600 0 13654000 23559000 0 0 20828 2013 19585 186428;186429;186430;186431;186432;186433;186434;186435;186436;186437;186438;186439;186440;186441;186442;186443 238186;238187;238188;238189;238190;238191;238192;238193;238194;238195;238196;238197;238198;238199;238200;238201;238202 238187 17 IIDTPQFQR Unmodified 1116.5928 0.59275797 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90;A0A2R8YF51;A0A2R8Y5D2;A0A2R8Y586;A0A2R8Y6J9 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 1 1 54.517 54.517 2 0.013393 53093 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.998 38.709 77035000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77035000 20829 4598 19586 186444;186445;186446 238203;238204;238205 238205 3 IIDVVYNASNNELVR Unmodified 1717.8999 0.89989861 2744 Q5JR95;P62241 RPS8 40S ribosomal protein S8 yes no 0 0 0 1 1 1 96.874 96.874 2 4.7219E-06 99123 QUIQUE_C1403_190116_001 109.6 82.926 78430000 0 0 0 32114000 46316000 0 0 0 0 0 0 0 0 20830 2744 19587 186447;186448;186449 238206;238207;238208 238206 3 IIEAEESR Unmodified 945.47673 0.47672516 4306 Q9NVH1 DNAJC11 DnaJ homolog subfamily C member 11 yes yes 0 0 0 1 17.534 17.534 2 0.024339 10301 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.485 17.935 26157000 0 0 0 0 0 0 0 26157000 0 0 0 0 0 20831 4306 19588 186450 238209 238209 1 IIEAMGFTGPLK Unmodified 1275.6897 0.68969482 589 B1AKV2;B1AKV6;B1AKV3;Q9NVA1;F8WCR2;B1AKV4;F6UTR7 UQCC1 Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 1 yes no 0 0 0 1 100.05 100.05 2 0.058229 103509 QUIQUE_C1368_190116_001 43.297 11.537 22414000 0 0 22414000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20832 589 19589 186451 238210 238210 1 IIEDCSNSEDTIK Unmodified 1522.6821 0.68210284 1414 O00507 USP9Y Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y yes yes 0 0 0 1 27.959 27.959 2 0.00015705 22548 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.23 2.6039 34291000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34291000 0 0 20833 1414 19590 186452 238211 238211 1 IIEDCSNSEETVK Unmodified 1522.6821 0.68210284 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.089 28.089 2 0.00027026 22118 QUIQUE_C1368_190116_001 112.15 8.9268 197720000 0 0 26069000 27949000 35392000 0 34477000 0 0 0 0 33755000 40077000 20834 3777 19591 186453;186454;186455;186456;186457;186458;186459;186460 238212;238213;238214;238215;238216;238217;238218;238219 238212 8 IIEDQQESLNK Unmodified 1315.662 0.66195975 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.849 28.849 2 2.8422E-18 22869 QUIQUE_C1563_190116_001 197.27 133.79 4149000000 334230000 358390000 383160000 298780000 280530000 304320000 296580000 263590000 350360000 129820000 462640000 331180000 355450000 20835 1890 19592 186461;186462;186463;186464;186465;186466;186467;186468;186469;186470;186471;186472;186473 238220;238221;238222;238223;238224;238225;238226;238227;238228;238229;238230;238231;238232;238233 238225 14 IIEEAPAPGIK Unmodified 1136.6441 0.64412484 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8;G5E9X5 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.467 46.467 2 0.00050258 43763 QUIQUE_C1576_190116_001 109.71 74.906 1023100000 80692000 80510000 128350000 75939000 84496000 91194000 76526000 63531000 88283000 65097000 92882000 95634000 0 20836 3933 19593 186474;186475;186476;186477;186478;186479;186480;186481;186482;186483;186484;186485;186486 238234;238235;238236;238237;238238;238239;238240;238241;238242;238243;238244;238245;238246;238247;238248;238249;238250;238251 238242 18 IIEETLALK Unmodified 1028.6118 0.61176208 1486 O15144;C9JTV5;G5E9J0;G5E9S7 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 3 2 1 1 1 2 70.675 70.675 1;2 0.005957 67186 QUIQUE_C1403_190116_001 150.4 83.406 4712200000 354640000 391490000 544110000 413010000 391240000 304260000 451940000 360890000 385660000 197840000 495870000 0 421260000 20837 1486 19594 186487;186488;186489;186490;186491;186492;186493;186494;186495;186496;186497;186498;186499;186500;186501;186502;186503;186504 238252;238253;238254;238255;238256;238257;238258;238259;238260;238261;238262;238263;238264;238265;238266;238267;238268;238269 238257 7 IIEIAACHSTHTSAAK Unmodified 1708.8567 0.85665359 624 B4DWG0;O95199 RCBTB2 RCC1 and BTB domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.417 19.417 3 1.2951E-13 11959 QUIQUE_C1563_190116_001 118.47 92.752 189930000 0 0 0 45609000 28359000 58086000 57872000 0 0 0 0 0 0 20838 624 19595 186505;186506;186507;186508 238270;238271;238272;238273 238272 4 IIELDDKGQVVR Unmodified 1383.7722 0.7721789 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 48.946 48.946 2;3 0.00031989 46986 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.85 58.424 2066700000 0 0 341490000 162550000 151910000 0 118620000 239920000 357030000 91497000 196100000 217130000 190440000 20839 1670 19596 186509;186510;186511;186512;186513;186514;186515;186516;186517;186518;186519;186520;186521;186522;186523;186524;186525;186526 238274;238275;238276;238277;238278;238279;238280;238281;238282;238283;238284;238285;238286;238287;238288;238289;238290;238291;238292 238284 15 IIELLNVTELTQNALINDELVEWK Unmodified 2809.5113 0.51132634 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 171.09 171.09 3 4.5092E-09 178476 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.949 74.996 49839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49839000 0 0 20840 2444 19597 186527 238293 238293 1 IIELSQTTAK Unmodified 1102.6234 0.6233894 1241 H9KV31;O15394 NCAM2 Neural cell adhesion molecule 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.689 37.689 2 0.00023561 33432 QUIQUE_C1403_190116_001 117.89 57.102 1798200000 116380000 153130000 189070000 156570000 135040000 128360000 206070000 111990000 118960000 78766000 148520000 88926000 166380000 20841 1241 19598 186528;186529;186530;186531;186532;186533;186534;186535;186536;186537;186538;186539;186540 238294;238295;238296;238297;238298;238299;238300;238301;238302;238303;238304;238305;238306 238297 11 IIENAENEYQTAISENYQTMSDTTFK Unmodified 3039.3655 0.36552632 2617 P52907 CAPZA1 F-actin-capping protein subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.09 132.09 3 2.0809E-46 136284 QUIQUE_C1277_190116_001 144.29 132.76 750150000 59894000 54449000 87775000 93053000 59642000 0 54905000 83569000 56391000 0 57707000 63886000 78884000 20842 2617 19599 186541;186542;186543;186544;186545;186546;186547;186548;186549;186550;186551 238307;238308;238309;238310;238311;238312;238313;238314;238315;238316;238317;238318 238308 12 IIEQVLER Unmodified 998.57605 0.57604528 4139 Q9H267;A0A2R8YDQ0;F5H008 VPS33B Vacuolar protein sorting-associated protein 33B yes no 0 0 0 1 56.606 56.606 2 0.024959 51718 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.922 5.1231 8974100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8974100 0 0 0 20843 4139 19600 186552 238319 238319 1 IIESIIEESQK Unmodified 1287.6922 0.69219725 3277 Q5JSH3 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 72.418 72.418 2 0.0010624 72566 QUIQUE_C1277_190116_001 90.696 59.622 241590000 51242000 50806000 0 48435000 0 0 0 42950000 48153000 0 0 0 0 20844 3277 19601 186553;186554;186555;186556;186557 238320;238321;238322;238323;238324 238321 5 IIETLTQQLQAK Unmodified 1384.7926 0.79257999 4438 Q9UHV9 PFDN2 Prefoldin subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.351 78.351 2 4.8127E-14 78921 QUIQUE_DMIX8_190116_001 163.32 115.72 1815200000 165930000 164490000 159000000 138800000 160600000 134790000 157390000 102100000 135560000 50015000 156970000 129800000 159770000 20845 4438 19602 186558;186559;186560;186561;186562;186563;186564;186565;186566;186567;186568;186569;186570 238325;238326;238327;238328;238329;238330;238331;238332;238333;238334;238335;238336;238337;238338;238339;238340;238341;238342;238343 238343 19 IIETPGIR Unmodified 897.52837 0.5283668 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 40.436 40.436 2 0.039123 37013 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.55 36.867 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20846 2452 19603 186571;186572;186573;186574;186575;186576;186577;186578;186579;186580;186581 238344;238345;238346;238347;238348;238349;238350;238351;238352;238353;238354 238353 11 IIEVVDAIMTTAQSHQR Oxidation (M) 1926.9833 0.98331066 2861 Q01813;Q5VSR5 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 1 2 86.763 86.763 2;3 2.5583E-09 87383 QUIQUE_C1403_190116_001 99.011 75.635 517830000 60061000 77556000 83713000 87083000 0 71607000 53446000 0 0 84368000 0 0 0 20847 2861 19604 186582;186583;186584;186585;186586;186587;186588;186589;186590 238355;238356;238357;238358;238359;238360;238361;238362;238363 238359 2331 8 IIEVVDAIMTTAQSHQR Unmodified 1910.9884 0.98839604 2861 Q01813;Q5VSR5 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 3 2 2 2 2 3 2 117.43 117.43 2;3 5.8193E-30 122042 QUIQUE_C1576_190116_001 151.66 128.29 9476800000 722450000 875710000 934570000 837750000 671640000 629390000 779170000 489160000 644140000 294000000 941530000 854460000 802880000 20848 2861 19604 186591;186592;186593;186594;186595;186596;186597;186598;186599;186600;186601;186602;186603;186604;186605;186606;186607;186608;186609;186610;186611;186612;186613;186614;186615;186616;186617;186618;186619 238364;238365;238366;238367;238368;238369;238370;238371;238372;238373;238374;238375;238376;238377;238378;238379;238380;238381;238382;238383;238384;238385;238386;238387;238388;238389;238390;238391;238392;238393;238394;238395;238396;238397;238398;238399;238400;238401;238402;238403;238404;238405;238406;238407;238408;238409;238410;238411;238412;238413;238414;238415;238416;238417 238389 52 IIFALPGNPVSAVVTCNLFVVPALR Unmodified 2666.4982 0.49819965 998 F5H039;Q9NQX3;H0YJR5 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 170.96 170.96 2;3 6.503E-84 172512 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.87 129.79 967350000 28257000 77314000 92399000 13937000 60559000 60368000 43560000 66281000 110870000 6906900 172040000 199880000 34984000 20849 998 19605 186620;186621;186622;186623;186624;186625;186626;186627;186628;186629;186630;186631;186632;186633;186634;186635 238418;238419;238420;238421;238422;238423;238424;238425;238426;238427;238428;238429;238430;238431;238432;238433 238425 16 IIFEDDR Unmodified 906.4447 0.44469675 2546 P49773;D6REP8;D6RE99;D6RD60;D6RC06 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.55 48.55 2 0.019305 46896 QUIQUE_C1218_190116_001 114.19 79.08 8190900000 946670000 913090000 661580000 0 672230000 612080000 702270000 578470000 657810000 244450000 720290000 669630000 812300000 20850 2546 19606 186636;186637;186638;186639;186640;186641;186642;186643;186644;186645;186646;186647 238434;238435;238436;238437;238438;238439;238440;238441;238442;238443;238444;238445;238446 238434 13 IIFEDDRCLAFHDISPQAPTHFLVIPK Unmodified 3178.6274 0.62737592 2546 P49773;D6REP8;D6RE99;D6RD60 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes no 0 0 1 2 128.09 128.09 4;5 0.0042203 130595 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.958 13.982 304050000 0 0 0 0 0 0 0 304050000 0 0 0 0 0 20851 2546 19607 186648;186649 238447;238448 238447 2 IIFIIGGPGSGK Unmodified 1157.6808 0.6808447 4656 Q9Y6K8;H0YEZ1 AK5 Adenylate kinase isoenzyme 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.521 96.521 2 0.003394 97783 QUIQUE_C1563_190116_001 95.523 69.139 764720000 85241000 55887000 46550000 49089000 62239000 64489000 68270000 31782000 39498000 34521000 67408000 79092000 80648000 20852 4656 19608 186650;186651;186652;186653;186654;186655;186656;186657;186658;186659;186660;186661;186662 238449;238450;238451;238452;238453;238454;238455;238456;238457;238458;238459;238460;238461;238462 238454 7 IIFSPVAPK Unmodified 970.58515 0.5851534 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.227 66.227 2 0.021021 66091 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.464 47.243 543780000 57860000 55392000 0 46536000 57067000 56097000 48705000 34576000 31327000 0 61492000 40935000 53792000 20853 1497 19609 186663;186664;186665;186666;186667;186668;186669;186670;186671;186672;186673 238463;238464;238465;238466;238467;238468;238469;238470;238471;238472;238473;238474 238472 11 IIFVVGGPGSGK Unmodified 1129.6495 0.64954457 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.57 74.57 2 5.2864E-05 75053 QUIQUE_C1368_190116_001 153.05 114.25 16677000000 1331700000 1083600000 1021900000 1064200000 1176700000 1091800000 1070100000 1497000000 1808000000 939410000 1563600000 1474000000 1554600000 20854 1791 19610 186674;186675;186676;186677;186678;186679;186680;186681;186682;186683;186684;186685;186686 238475;238476;238477;238478;238479;238480;238481;238482;238483;238484;238485;238486;238487;238488;238489;238490;238491;238492;238493;238494;238495;238496;238497;238498;238499 238477 25 IIFYSLIKPSINEK Unmodified 1663.9549 0.95489429 3554 Q8IYB8;B1AR60 SUPV3L1 ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 101.98 101.98 3 0.018272 105172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.555 31.915 10585000 0 0 0 0 0 0 0 0 10585000 0 0 0 0 20855 3554 19611 186687 238500 238500 1 IIGATDSCGDLMFLMK Unmodified 1770.8354 0.83544914 2471 P45973 CBX5 Chromobox protein homolog 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.66 137.66 2 0.00030496 143481 QUIQUE_C1218_190116_001 100.56 83.533 408430000 50081000 45971000 24879000 35141000 39284000 49199000 34226000 0 53377000 15978000 60296000 0 0 20856 2471 19612 186688;186689;186690;186691;186692;186693;186694;186695;186696;186697 238501;238502;238503;238504;238505;238506;238507;238508;238509;238510;238511 238501 8 IIGATDSSGELMFLMK Unmodified 1711.8525 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238535 415 1 IIGAVDQIQLTQAQLEER Unmodified 2024.0902 0.090218576 3376 Q6NZI2 PTRF Polymerase I and transcript release factor yes yes 0 0 0 2 3 2 3 2 2 1 2 2 2 1 2 1 111.85 111.85 2;3 1.222E-17 114961 QUIQUE_C1277_190116_001 175.74 152.52 1727500000 151650000 212460000 52841000 275090000 280070000 88705000 70764000 28314000 117250000 139900000 91802000 148600000 70056000 20859 3376 19614 186713;186714;186715;186716;186717;186718;186719;186720;186721;186722;186723;186724;186725;186726;186727;186728;186729;186730;186731;186732;186733;186734;186735;186736;186737 238537;238538;238539;238540;238541;238542;238543;238544;238545;238546;238547;238548;238549;238550;238551;238552;238553;238554;238555;238556;238557;238558;238559;238560;238561;238562;238563;238564;238565;238566;238567;238568 238540 27 IIGFGSALLEEVDPNPANFVGAGIIHTK Unmodified 2878.5229 0.52289408 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2 158.62 158.62 2;3;4 2.5513E-24 153548 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238715;238716;238717;238718;238719;238720;238721;238722;238723;238724;238725;238726;238727;238728;238729;238730;238731;238732;238733;238734;238735;238736;238737;238738;238739;238740;238741;238742;238743;238744;238745;238746;238747;238748;238749;238750;238751;238752;238753;238754;238755;238756 238746 41 IIHEDGYSEDECK Unmodified 1593.6617 0.66170175 1953 P08754 GNAI3 Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 2 22.994 22.994 2;3 2.2981E-23 16837 QUIQUE_C1218_190116_001 170.52 147.88 1658800000 30096000 154680000 306640000 199110000 177050000 39367000 292920000 0 38332000 14483000 103730000 106700000 195740000 20873 1953 19627 186897;186898;186899;186900;186901;186902;186903;186904;186905;186906;186907;186908;186909;186910;186911;186912;186913;186914;186915 238757;238758;238759;238760;238761;238762;238763;238764;238765;238766;238767;238768;238769;238770;238771;238772;238773;238774;238775;238776 238757 16 IIHEDGYSEEECR Unmodified 1635.6835 0.68349983 1870 P04899 GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 28.81 28.81 2;3 2.8219E-10 19560 QUIQUE_C1368_190116_001 171.62 164.24 8478000000 500890000 685870000 726720000 904060000 674200000 753070000 923000000 405010000 440150000 303340000 725490000 481330000 954890000 20874 1870 19628 186916;186917;186918;186919;186920;186921;186922;186923;186924;186925;186926;186927;186928;186929;186930;186931;186932;186933;186934;186935;186936;186937;186938;186939;186940;186941;186942 238777;238778;238779;238780;238781;238782;238783;238784;238785;238786;238787;238788;238789;238790;238791;238792;238793;238794;238795;238796;238797;238798;238799;238800;238801;238802;238803;238804;238805 238783 22 IIHGAGYSEEDK Unmodified 1317.6201 0.62009493 2294 P29992 GNA11 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 yes yes 0 0 0 1 1 16.657 16.657 3 0.0061946 9331 QUIQUE_C1218_190116_001 37.94 27.014 20392000 10901000 0 0 0 0 9490700 0 0 0 0 0 0 0 20875 2294 19629 186943;186944 238806;238807 238806 2 IIHGAGYSEEDKR Unmodified 1473.7212 0.72120596 2294 P29992 GNA11 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 yes yes 0 0 1 3 2 3 4 3 2 3 3 3 3 3 12.732 12.732 2;3;4 1.4876E-13 5111 QUIQUE_C1368_190116_001 155.86 142.18 4709900000 238410000 254840000 502290000 0 329490000 666900000 35269000 413910000 485990000 0 234930000 722620000 825180000 20876 2294 19630 186945;186946;186947;186948;186949;186950;186951;186952;186953;186954;186955;186956;186957;186958;186959;186960;186961;186962;186963;186964;186965;186966;186967;186968;186969;186970;186971;186972;186973;186974;186975;186976 238808;238809;238810;238811;238812;238813;238814;238815;238816;238817;238818;238819;238820;238821;238822;238823;238824;238825;238826;238827;238828;238829;238830;238831;238832;238833;238834;238835;238836;238837;238838;238839;238840 238814 28 IIHGQDFDQR Unmodified 1227.5996 0.59963426 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 2 22.058 22.058 2;3 0.0017865 15018 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.197 60.53 2066200000 0 0 102020000 0 0 289710000 111660000 96917000 428810000 111590000 412190000 77342000 435990000 20877 3063 19631 186977;186978;186979;186980;186981;186982;186983;186984;186985;186986;186987;186988 238841;238842;238843;238844;238845;238846;238847;238848;238849;238850;238851;238852;238853;238854;238855 238851 14 IIHGSGYSDEDKR Unmodified 1475.7005 0.70047052 2556 P50148;B1AM21 GNAQ Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 10.57 10.57 2;3 4.6368E-06 2834 QUIQUE_C1403_190116_001 128.01 6.1164 237370000 8496000 0 0 35363000 0 0 0 17420000 35168000 103280000 0 37633000 0 20878 2556 19632 186989;186990;186991;186992;186993;186994;186995 238856;238857;238858;238859;238860;238861;238862;238863 238857 8 IIHGSGYSDEDRK Unmodified 1475.7005 0.70047052 1758 O95837 GNA14 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-14 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 10.537 10.537 3 0.00017938 2797 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.933 7.6205 1276200000 0 0 0 365690000 146820000 0 0 244600000 0 0 0 519070000 0 20879 1758 19633 186996;186997;186998;186999 238864;238865;238866;238867 238867 3 IIHSGGFNLEACK Unmodified 1444.7133 0.71328381 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 45.7 45.7 2;3 0.00054489 42183 QUIQUE_C1403_190116_001 89.266 61.253 795380000 109240000 128880000 181940000 187350000 0 48213000 0 60765000 33869000 0 45127000 0 0 20880 2142 19634 187000;187001;187002;187003;187004;187005;187006;187007;187008 238868;238869;238870;238871;238872;238873;238874;238875;238876 238871 8 IIIANPETK Unmodified 997.5808 0.5807963 315 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4 DIP2C Disco-interacting protein 2 homolog C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 37.576 37.576 2 0.048374 33525 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.193 17.396 125650000 0 25272000 0 0 17507000 0 17937000 0 19451000 0 24730000 20757000 0 20881 315 19635 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238900;238901;238902;238903 238901 4 IIIDNMYYPVTLDVLHQIFSK Unmodified 2521.3291 0.32906864 4471 Q9UKA9 PTBP2 Polypyrimidine tract-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 168.57 168.57 3 8.1031E-07 173748 QUIQUE_C1368_190116_001 81.12 73.499 516130000 0 0 66246000 0 0 0 53639000 95638000 57175000 0 144500000 0 98926000 20884 4471 19638 187035;187036;187037;187038;187039;187040 238904;238905;238906;238907;238908;238909 238904 6 IIIDNMYYPVTLDVLHQIFSK Oxidation (M) 2537.324 0.32398326 4471 Q9UKA9 PTBP2 Polypyrimidine tract-binding protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 167.13 167.13 3 9.8973E-07 169059 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.568 71.946 100290000 0 0 0 55875000 0 0 0 44413000 0 0 0 0 0 20885 4471 19638 187041;187042 238910;238911 238911 2977 2 IIILYDDDER Unmodified 1263.6347 0.63468237 4079 Q9BYV8 CEP41 Centrosomal protein of 41 kDa yes yes 0 0 0 1 83.242 83.242 2 0.051864 84061 QUIQUE_C1368_190116_001 47.198 6.6086 415980000 0 0 415980000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20886 4079 19639 187043 238912 238912 1 IIIPEIQK Unmodified 952.59572 0.59571809 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 71.543 71.543 2 0.016736 71982 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.671 28.122 191740000 0 0 0 0 0 0 0 60910000 62636000 0 0 68191000 0 20887 2657 19640 187044;187045;187046 238913;238914;238915 238913 3 IIIPQDVGLTILK Unmodified 1421.8858 0.8857521 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 132.94 132.94 2;3 4.0114E-07 129769 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.63 110.27 7045700000 622290000 719330000 565320000 511050000 577900000 602940000 695300000 361680000 404630000 316900000 632560000 492080000 543720000 20888 335;1521 19641 187047;187048;187049;187050;187051;187052;187053;187054;187055;187056;187057;187058;187059;187060;187061;187062;187063 238916;238917;238918;238919;238920;238921;238922;238923;238924;238925;238926;238927;238928;238929;238930;238931;238932;238933;238934;238935;238936 238933 18 IIITVVEEQEQK Unmodified 1427.7872 0.78716026 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238983 0 IIKDFMIQGGDPTGTGR Unmodified 1804.9142 0.91416847 4587 Q9Y3C6 PPIL1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 yes yes 0 0 1 1 1 74.504 74.504 2 0.013692 74021 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.173 61.975 31243000 0 0 0 0 0 0 0 31243000 0 0 0 0 0 20891 4587 19644 187084;187085 238984;238985 238984 2 IIKDHLLEESTFAPYIDDLSEEQR Unmodified 2860.4131 0.41306886 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 127.32 127.32 3;4 1.2631E-12 130449 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.21 82.691 531680000 0 37096000 0 49639000 19389000 0 0 167470000 68784000 0 0 0 189300000 20892 3199 19645 187086;187087;187088;187089;187090;187091;187092;187093 238986;238987;238988;238989;238990;238991;238992;238993;238994;238995 238991 10 IIKPCNHVLSLSFPIR Unmodified 1893.0659 0.065858501 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 86.613 86.613 2;3;4 1.8574E-29 88220 QUIQUE_C1277_190116_001 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19647 187132;187133 239093;239094 239093 2 IILAAFR Unmodified 802.50651 0.50650915 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.58 74.58 2 0.0098498 75352 QUIQUE_C1277_190116_001 148.12 61.773 1941000000 176830000 202260000 154180000 122240000 178740000 118460000 160620000 139310000 145510000 97720000 152610000 148590000 143890000 20895 4443 19648 187134;187135;187136;187137;187138;187139;187140;187141;187142;187143;187144;187145;187146 239095;239096;239097;239098;239099;239100;239101;239102;239103;239104;239105;239106;239107;239108 239096 14 IILDEAALHLSDK Unmodified 1436.7875 0.78749461 3814 Q96BY7 ATG2B Autophagy-related protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 86.916 86.916 3 0.023712 88753 QUIQUE_C1277_190116_001 28.146 14.182 16477000 0 16477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20896 3814 19649 187147 239109 239109 1 IILDLISESPIK Unmodified 1339.7963 0.79626839 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 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187194;187195;187196;187197;187198;187199;187200;187201;187202;187203;187204;187205;187206;187207;187208;187209;187210;187211;187212;187213;187214 239186;239187;239188;239189;239190;239191;239192;239193;239194;239195;239196;239197;239198;239199;239200;239201;239202;239203;239204;239205;239206;239207;239208;239209;239210;239211 239204 26 IILLAEGR Unmodified 883.5491 0.54910224 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.085 61.085 2 0.0013514 59899 QUIQUE_C1403_190116_001 143 39.718 3525000000 447910000 322000000 299690000 279700000 297360000 291810000 279640000 295350000 248960000 151000000 337790000 273790000 0 20904 2219 19657 187215;187216;187217;187218;187219;187220;187221;187222;187223;187224;187225;187226 239212;239213;239214;239215;239216;239217;239218;239219;239220;239221;239222;239223;239224;239225;239226 239217 14 IILLFDAHK Unmodified 1068.6332 0.63316622 4352;4175;4138 Q9NZN3;Q9H223;Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4;C9JDQ8 EHD3;EHD4;EHD1 EH 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187268;187269;187270;187271;187272;187273;187274 239280;239281;239282;239283;239284;239285;239286 239285 7 IILNTAVAEFFK Unmodified 1364.7704 0.77038799 4193 Q9H9A5;H7C1X9 CNOT10 CCR4-NOT transcription complex subunit 10 yes no 0 0 0 1 1 141.98 141.98 2 0.00052266 147049 QUIQUE_C1218_190116_001 96.89 73.461 17380000 17380000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20909 4193 19662 187275;187276 239287;239288 239287 2 IILNWDQVK Unmodified 1127.6339 0.63389451 3540 Q8IWV2 CNTN4 Contactin-4 yes yes 0 0 0 1 92.798 92.798 2 0.025868 95756 QUIQUE_C1368_190116_001 58.981 30.807 24439000 0 0 24439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20910 3540 19663 187277 239289 239289 1 IILPPEK Unmodified 808.50584 0.50584045 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 38.034 38.034 2 0.061637 35162 QUIQUE_C1563_190116_001 68.7 36.583 261920000 0 0 0 0 0 45008000 0 0 0 0 106940000 0 109970000 20911 2529 19664 187278;187279;187280 239290;239291;239292 239290 3 IILPPEKELAMPGEDLK Unmodified 1892.0329 0.032886618 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 99.795 99.795 3 0.0071681 101323 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.754 36.9 24879000 0 0 0 0 0 0 0 24879000 0 0 0 0 0 20912 2529 19665 187281 239293 239293 1 IILQDEDVTTK Unmodified 1273.6765 0.67654718 4452;2593 Q9UIW2;P51805 PLXNA1;PLXNA3 Plexin-A1;Plexin-A3 no no 0 0 0 1 1 52.955 52.955 2 0.010988 51244 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.78 40.878 117240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60360000 56877000 0 20913 4452;2593 19666 187282;187283 239294;239295;239296 239295 3 IILTARPFR Unmodified 1085.6709 0.67094871 3084;956 E9PKU7;E9PNH1;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 1 1 1 1 51.293 51.293 3 0.0082926 49395 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.439 38.683 80186000 0 0 0 0 0 0 0 0 20791000 0 31157000 28238000 0 20914 956;3084 19667 187284;187285;187286 239297;239298;239299 239299 1 IILVIGGPGSGK Unmodified 1109.6808 0.6808447 4656 Q9Y6K8;E9PQQ8 AK5 Adenylate kinase isoenzyme 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 75.763 75.763 2 0.010107 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0 0 0 1 1 1 74.087 74.087 3 0.0073128 75006 QUIQUE_C1576_190116_001 67.334 59.766 16862000 0 0 0 16862000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20918 3200 19671 187297;187298;187299 239310;239311;239312 239311 3 IIMLFTDGGEER Unmodified 1379.6755 0.67550132 2640 P54289 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.96 102.96 2 4.2751E-06 107387 QUIQUE_C1438_190116_001 136.63 97.613 1214200000 89285000 118270000 111240000 105670000 108010000 77110000 127790000 73623000 67964000 32556000 103150000 103110000 96407000 20919 2640 19672 187300;187301;187302;187303;187304;187305;187306;187307;187308;187309;187310;187311;187312 239313;239314;239315;239316;239317;239318;239319;239320;239321;239322;239323;239324;239325;239326;239327;239328 239319 15 IIMPPSALDQLSR Unmodified 1439.7806 0.7806351 3764 Q92890;C9J6N9 UFD1L Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog yes no 0 0 0 1 1 2 108.17 108.17 2 0.0072243 110620 QUIQUE_C1277_190116_001 67.385 40.27 18844000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18844000 0 0 0 20920 3764 19673 187313;187314;187315;187316 239329;239330;239331;239332 239329 4 IIMTSSASGIYGNFGQANYSAAK Unmodified 2350.1263 0.12634609 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8Y7W2 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 105.4 105.4 2;3 2.3301E-30 109895 QUIQUE_C1218_190116_001 173.36 160.22 763240000 32919000 50543000 47023000 45767000 32582000 27730000 32352000 44359000 54332000 16468000 170380000 64025000 144770000 20921 455 19674 187317;187318;187319;187320;187321;187322;187323;187324;187325;187326;187327;187328;187329;187330;187331 239333;239334;239335;239336;239337;239338;239339;239340;239341;239342;239343;239344;239345;239346;239347 239333 15 IINADSEDPK Unmodified 1100.535 0.53496832 2389 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239370;239371;239372;239373;239374;239375;239376;239377;239378;239379;239380;239381;239382;239383;239384;239385;239386;239387;239388;239389;239390;239391;239392;239393;239394;239395;239396;239397;239398;239399;239400;239401;239402;239403;239404;239405;239406;239407;239408;239409;239410;239411;239412;239413;239414;239415;239416;239417;239418;239419;239420;239421;239422;239423;239424 239381 54 IINDGAAILR Unmodified 1054.6135 0.61349341 2508 P48454;G3V111;H0YB02 PPP3CC Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.26 58.26 2 0.006665 56913 QUIQUE_C1368_190116_001 74.301 19.752 400980000 46881000 51713000 38916000 0 47914000 28021000 41300000 0 32051000 0 32223000 45323000 36636000 20926 2508 19679 187384;187385;187386;187387;187388;187389;187390;187391;187392;187393 239425;239426;239427;239428;239429;239430;239431;239432;239433;239434 239427 8 IINDLLQSLR Unmodified 1183.6925 0.69247202 3770 Q92945;A0A087WTP3 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.61 110.61 2 6.8311E-05 115848 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.02 86.469 2297500000 192650000 203360000 163610000 197460000 188800000 147580000 159790000 167560000 188960000 69659000 212730000 170790000 234590000 20927 3770 19680 187394;187395;187396;187397;187398;187399;187400;187401;187402;187403;187404;187405;187406 239435;239436;239437;239438;239439;239440;239441;239442;239443;239444;239445;239446;239447;239448;239449;239450;239451;239452;239453;239454 239451 20 IINEGAAILR Unmodified 1068.6291 0.62914348 2107 P16298;Q5F2F8 PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.401 59.401 2 0.0001462 58587 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.05 58.502 2548800000 262090000 258040000 245280000 225670000 209500000 140090000 240750000 151020000 0 115040000 244940000 218660000 237770000 20928 2107 19681 187407;187408;187409;187410;187411;187412;187413;187414;187415;187416;187417;187418 239455;239456;239457;239458;239459;239460;239461;239462;239463;239464;239465;239466;239467 239465 13 IINEPTAAAIAYGLDK Unmodified 1658.8879 0.88793694 2010;2007;2643;2362 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PI65;Q53FA3;P34931;P11021;P54652 HSPA8;HSPA1L;HSPA5;HSPA2 Heat shock cognate 71 kDa protein;Heat shock 70 kDa protein 1-like;78 kDa glucose-regulated protein;Heat shock-related 70 kDa protein 2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 110.43 110.43 2;3 2.9623E-29 111044 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.64 144.1 59199000000 5927000000 5767200000 5557200000 5860600000 4851800000 5614800000 5671000000 2243400000 3210700000 3148400000 3882900000 3494400000 3969800000 20929 2010;2362;2007;2643 19682 187419;187420;187421;187422;187423;187424;187425;187426;187427;187428;187429;187430;187431;187432;187433;187434;187435;187436;187437;187438;187439;187440;187441;187442;187443;187444;187445 239468;239469;239470;239471;239472;239473;239474;239475;239476;239477;239478;239479;239480;239481;239482;239483;239484;239485;239486;239487;239488;239489;239490;239491;239492;239493;239494;239495;239496;239497;239498;239499;239500;239501;239502;239503;239504;239505;239506;239507;239508;239509;239510;239511;239512;239513;239514;239515;239516;239517;239518;239519;239520;239521 239501 54 IINEPTAAAIAYGLDKK Unmodified 1786.9829 0.98289996 2010;2643 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PI65;P54652 HSPA8;HSPA2 Heat shock cognate 71 kDa protein;Heat shock-related 70 kDa protein 2 no no 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 3 3 3 88.15 88.15 2;3 1.0936E-10 89893 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.67 106.56 36126000000 1446200000 2300200000 1802900000 2043500000 2573200000 1197200000 2356000000 3447000000 3672200000 1039500000 5514600000 4764300000 3969400000 20930 2010;2643 19683 187446;187447;187448;187449;187450;187451;187452;187453;187454;187455;187456;187457;187458;187459;187460;187461;187462;187463;187464;187465;187466;187467;187468;187469;187470;187471;187472;187473;187474;187475 239522;239523;239524;239525;239526;239527;239528;239529;239530;239531;239532;239533;239534;239535;239536;239537;239538;239539;239540;239541;239542;239543;239544;239545;239546;239547;239548;239549;239550;239551;239552;239553;239554;239555;239556;239557;239558;239559;239560;239561;239562;239563;239564;239565;239566;239567;239568;239569;239570;239571;239572;239573;239574;239575;239576;239577;239578;239579;239580;239581;239582;239583;239584;239585;239586;239587;239588;239589;239590;239591;239592;239593;239594 239566 73 IINEPTAAAIAYGLDKR Unmodified 1814.989 0.98904797 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 92.224 92.224 2;3 1.099E-09 94067 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.56 97.621 681360000 39901000 49801000 41673000 35401000 56436000 22206000 47887000 38970000 74805000 17864000 126550000 62367000 67498000 20931 2007 19684 187476;187477;187478;187479;187480;187481;187482;187483;187484;187485;187486;187487;187488;187489;187490;187491;187492;187493;187494;187495;187496;187497;187498 239595;239596;239597;239598;239599;239600;239601;239602;239603;239604;239605;239606;239607;239608;239609;239610;239611;239612;239613;239614;239615;239616;239617 239609 23 IINEPTAAAIAYGLDR Unmodified 1686.8941 0.89408495 282;2117 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;P17066 HSPA1B;HSPA1A;HSPA6 Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 6 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 4 2 2 111.05 111.05 2;3 1.2594E-44 113699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 184.21 141.49 31520000000 2777900000 2932700000 2466100000 1451100000 3189500000 1915700000 1695500000 2782600000 3344400000 1623500000 2248400000 2733300000 2359200000 20932 282;2117 19685 187499;187500;187501;187502;187503;187504;187505;187506;187507;187508;187509;187510;187511;187512;187513;187514;187515;187516;187517;187518;187519;187520;187521;187522;187523;187524;187525;187526 239618;239619;239620;239621;239622;239623;239624;239625;239626;239627;239628;239629;239630;239631;239632;239633;239634;239635;239636;239637;239638;239639;239640;239641;239642;239643;239644;239645;239646;239647;239648;239649;239650;239651;239652;239653;239654;239655;239656;239657;239658;239659;239660;239661;239662;239663;239664;239665;239666;239667;239668;239669;239670;239671;239672;239673;239674;239675;239676;239677 239652 59 IINEVKPTEIYNLGAQSHVK Unmodified 2252.2165 0.21648172 1583 O60547 GMDS GDP-mannose 4,6 dehydratase yes yes 0 0 1 1 1 71.737 71.737 4 0.0019268 72735 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.221 17.536 135800000 0 0 0 0 0 0 52263000 0 0 0 83537000 0 0 20933 1583 19686 187527;187528 239678;239679;239680 239680 3 IINEVSKPLAHHIPVEK Unmodified 1923.0942 0.094181742 559 A8K878;P55145 MANF Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor yes no 0 0 1 1 1 1 39.56 39.56 4 0.0030637 34694 QUIQUE_C1277_190116_001 38.017 28.105 112440000 40138000 52578000 0 0 0 0 0 0 0 19723000 0 0 0 20934 559 19687 187529;187530;187531 239681;239682;239683 239682 3 IINLCENADQAHFDLALAR Unmodified 2183.0793 0.079336314 4385 Q9P2D3 HEATR5B HEAT repeat-containing protein 5B yes yes 0 0 0 1 95.546 95.546 3 0.047139 96638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.146 16.863 76747000 0 0 0 0 0 0 0 76747000 0 0 0 0 0 20935 4385 19688 187532 239684 239684 1 IINLLGFPGDR Unmodified 1213.6819 0.68190733 3598 Q8N584 TTC39C Tetratricopeptide repeat protein 39C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 122.42 122.42 2 0.00049397 126893 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.65 58.4 154380000 0 22174000 0 13806000 13660000 0 0 15032000 16084000 7166200 66457000 0 0 20936 3598 19689 187533;187534;187535;187536;187537;187538;187539;187540 239685;239686;239687;239688;239689;239690;239691;239692 239689 8 IINNTENLVR Unmodified 1184.6513 0.65133548 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.015 41.015 2 3.7247E-23 36890 QUIQUE_C1563_190116_001 190.26 159.58 30374000000 2321300000 2079400000 1691900000 2269100000 2115100000 2425800000 1864000000 3392200000 2851800000 1351500000 2908100000 2341800000 2762300000 20937 4639 19690 187541;187542;187543;187544;187545;187546;187547;187548;187549;187550;187551;187552;187553 239693;239694;239695;239696;239697;239698;239699;239700;239701;239702;239703;239704;239705;239706;239707;239708;239709;239710;239711;239712;239713;239714;239715;239716;239717;239718 239704 26 IINPMGLLVEELK Unmodified 1467.8371 0.83708734 4198 Q9H9J2 MRPL44 39S ribosomal protein L44, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.25 159.25 2 0.008379 165290 QUIQUE_C1576_190116_001 62.303 47.037 101030000 0 13202000 22248000 12633000 0 10580000 15608000 0 0 0 26760000 0 0 20938 4198 19691 187554;187555;187556;187557;187558;187559;187560 239719;239720;239721;239722;239723;239724;239725;239726 239724 7 IINPMGLLVEELKK Unmodified 1595.9321 0.93205036 4198 Q9H9J2 MRPL44 39S ribosomal protein L44, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 142.39 142.39 3 0.0033004 145391 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.709 52.805 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20939 4198 19692 187561 239727 239727 1 IINTPEVVR Unmodified 1039.6026 0.60259438 4175 Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4;C9JDQ8 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 44.068 44.068 2 0.0087437 41588 QUIQUE_C1438_190116_001 77.923 21.801 341370000 65027000 0 0 0 104520000 0 0 56061000 0 0 0 43705000 72058000 20940 4175 19693 187562;187563;187564;187565;187566;187567;187568;187569;187570 239728;239729;239730;239731;239732;239733;239734;239735;239736 239731 7 IIPAIATTTAAVVGLVCLELYK Unmodified 2315.3174 0.31744132 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 3 4 2 2 5 1 4 5 7 1 8 6 4 175.14 175.14 2;3 5.0872E-17 181007 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.68 146.74 5216100000 140060000 124370000 236600000 196110000 425210000 68775000 1109000000 418280000 575940000 39749000 838770000 617160000 426170000 20941 2197 19694 187571;187572;187573;187574;187575;187576;187577;187578;187579;187580;187581;187582;187583;187584;187585;187586;187587;187588;187589;187590;187591;187592;187593;187594;187595;187596;187597;187598;187599;187600;187601;187602;187603;187604;187605;187606;187607;187608;187609;187610;187611;187612;187613;187614;187615;187616;187617;187618;187619;187620;187621;187622 239737;239738;239739;239740;239741;239742;239743;239744;239745;239746;239747;239748;239749;239750;239751;239752;239753;239754;239755;239756;239757;239758;239759;239760;239761;239762;239763;239764;239765;239766;239767;239768;239769;239770;239771;239772;239773;239774;239775;239776;239777;239778;239779;239780;239781;239782;239783;239784;239785;239786;239787;239788;239789;239790;239791;239792;239793;239794 239783 40 IIPAIATTTATVSGLVALEMIK Unmodified 2212.2752 0.27524215 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 168.88 168.88 2;3 5.3316E-05 173730 QUIQUE_C1218_190116_001 82.651 75.286 386140000 46618000 0 0 44028000 35799000 58611000 35174000 0 0 20898000 41681000 42011000 61317000 20942 514 19695 187623;187624;187625;187626;187627;187628;187629;187630;187631;187632 239795;239796;239797;239798;239799;239800;239801;239802;239803;239804 239796 3 IIPAVASTNAVIAAVCATEVFK Unmodified 2244.2188 0.21878991 3664 Q8TBC4;F8W8D4 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 0 2 3 2 3 2 2 2 2 1 1 2 162.59 162.59 2;3 1.0312E-08 164754 QUIQUE_C1563_190116_001 95.347 87.982 717590000 67361000 67468000 70621000 99446000 54983000 45573000 0 49491000 108660000 0 65630000 45738000 42619000 20943 3664 19696 187633;187634;187635;187636;187637;187638;187639;187640;187641;187642;187643;187644;187645;187646;187647;187648;187649;187650;187651;187652;187653;187654 239805;239806;239807;239808;239809;239810;239811;239812;239813;239814;239815;239816;239817;239818;239819;239820;239821;239822;239823;239824;239825;239826;239827;239828;239829 239820 23 IIPGADADVVVWDPEATK Unmodified 1894.9676 0.96764382 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 3 1 2 2 1 122.53 122.53 2;3 3.602E-08 125673 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.66 116.12 8000000000 746970000 707550000 673440000 553230000 604710000 493130000 621410000 531260000 686260000 223070000 901820000 710100000 547080000 20944 3984 19697 187655;187656;187657;187658;187659;187660;187661;187662;187663;187664;187665;187666;187667;187668;187669;187670;187671;187672;187673;187674;187675;187676;187677;187678 239830;239831;239832;239833;239834;239835;239836;239837;239838;239839;239840;239841;239842;239843;239844;239845;239846;239847;239848;239849;239850;239851;239852;239853;239854;239855;239856;239857;239858;239859;239860;239861;239862;239863;239864;239865 239852 32 IIPGFMCQGGDFTR Oxidation (M) 1613.733 0.73303298 2772 P62937;F8WE65;C9J5S7;P0DN26;A0A0H2UH34;A0A0B4J2A2;A0A075B767;A0A075B759;Q9Y536;F5H284 PPIA;PPIAL4C;PPIAL4E;PPIAL4A;PPIAL4D Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4A/B/C;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4D yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 3 87.926 87.926 2 0.00010609 89571 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.86 98.285 42905000000 2689700000 3544800000 2659100000 2411200000 2515000000 2579000000 2278000000 3956600000 3755500000 2305500000 4593400000 4760300000 4856400000 20945 2772 19698 187679;187680;187681;187682;187683;187684;187685;187686;187687;187688;187689;187690;187691;187692;187693;187694;187695;187696;187697;187698;187699;187700;187701;187702;187703;187704;187705;187706 239866;239867;239868;239869;239870;239871;239872;239873;239874;239875;239876;239877;239878;239879;239880;239881;239882;239883;239884;239885;239886;239887;239888;239889;239890;239891;239892;239893;239894;239895;239896;239897;239898;239899;239900;239901 239890 2206 35 IIPGFMCQGGDFTR Unmodified 1597.7381 0.73811836 2772 P62937;F8WE65;C9J5S7;P0DN26;A0A0H2UH34;A0A0B4J2A2;A0A075B767;A0A075B759;Q9Y536;F5H284 PPIA;PPIAL4C;PPIAL4E;PPIAL4A;PPIAL4D Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4A/B/C;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4D yes no 0 0 0 2 2 4 2 2 2 3 2 2 2 2 3 3 105.23 105.23 2;3 1.7001E-07 110333 QUIQUE_C1218_190116_001 113.63 101.05 34435000000 97696000 5920500000 102640000 4330600000 3783400000 3997600000 83356000 3336000000 3369600000 1157800000 4274100000 71578000 3910400000 20946 2772 19698 187707;187708;187709;187710;187711;187712;187713;187714;187715;187716;187717;187718;187719;187720;187721;187722;187723;187724;187725;187726;187727;187728;187729;187730;187731;187732;187733;187734;187735;187736;187737 239902;239903;239904;239905;239906;239907;239908;239909;239910;239911;239912;239913;239914;239915;239916;239917;239918;239919;239920;239921;239922;239923;239924;239925;239926;239927;239928;239929;239930;239931;239932;239933;239934;239935;239936;239937;239938;239939;239940;239941;239942;239943;239944;239945 239903 44 IIPGGAAAQDGR Unmodified 1124.5938 0.5938206 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19;K7EKP9;C9JYG3;A0A3B3ITI9;O14909;K7EKU8;C9JWP9;A0A3B3ISL1;A0A3B3IRP2 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.681 23.681 2 0.0024876 17182 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.841 51.318 725850000 114250000 101080000 119380000 0 81392000 0 0 0 0 51197000 85198000 85827000 87535000 20947 487 19699 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protein no no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 51.236 51.236 2;3 6.1863E-79 48750 QUIQUE_C1277_190116_001 205.96 178.53 2027500000 367610000 364150000 0 239380000 0 205140000 0 219060000 210520000 134200000 0 287430000 0 20962 1108;1404 19714 187878;187879;187880;187881;187882;187883;187884;187885;187886;187887;187888;187889;187890 240145;240146;240147;240148;240149;240150;240151;240152;240153;240154;240155;240156;240157;240158;240159 240148 15 IIQHLVPASFR Unmodified 1279.7401 0.74009091 4020 Q9BTE3 MCMBP Mini-chromosome maintenance complex-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.151 60.151 3 0.0069349 59131 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.976 21.604 65959000 11852000 0 14658000 21034000 0 0 0 0 18416000 0 0 0 0 20963 4020 19715 187891;187892;187893;187894;187895 240160;240161;240162;240163;240164 240164 5 IIQLIEGK Unmodified 912.56442 0.56441796 1761 O95861;A6NF51 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.673 57.673 2 0.0075036 57618 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240180;240181;240182;240183;240184;240185;240186;240187;240188;240189;240190;240191;240192;240193;240194;240195;240196;240197 240188 17 IIQQAGQVWFPDSAFK Unmodified 1833.9414 0.94136949 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes no 0 0 0 1 1 124 124 2 0.00060856 126496 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.479 62.078 89382000 39272000 0 0 0 0 0 0 50110000 0 0 0 0 0 20966 2964 19718 187922;187923 240198;240199 240199 2 IIQSLLDEFWK Unmodified 1390.7497 0.74965254 834 E5RG91;Q8NEZ2 VPS37A Vacuolar protein sorting-associated protein 37A yes no 0 0 0 1 151.46 151.46 2 0.0045751 155951 QUIQUE_C1277_190116_001 81.972 37.623 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20967 834 19719 187924 240200 240200 1 IIQTPGLWESENQNK Unmodified 1755.8792 0.87916317 4237 Q9NP72;A0A087X163;Q5W0J0 RAB18 Ras-related protein Rab-18 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.685 80.685 2 1.874E-18 82529 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.71 119.6 1605300000 128630000 105230000 150060000 113140000 119340000 153060000 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240388;240389;240390;240391;240392;240393;240394;240395;240396;240397;240398;240399;240400;240401;240402;240403 240395 16 IISQHQAVIIATQSAQVLLEK Unmodified 2289.3056 0.30563108 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 131.21 131.21 3 4.7576E-07 133981 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.251 78.041 27038000 0 0 0 0 0 0 0 27038000 0 0 0 0 0 20982 2882 19734 188071 240404;240405 240404 2 IISSDRDLLAVVFYGTEK Unmodified 2025.0783 0.078256906 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 137.2 137.2 2;3 8.5605E-18 143809 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.2 110.88 1354300000 0 83881000 83792000 0 82250000 28749000 101420000 29954000 171070000 36636000 322400000 299700000 114440000 20983 2050 19735 188072;188073;188074;188075;188076;188077;188078;188079;188080;188081;188082;188083;188084 240406;240407;240408;240409;240410;240411;240412;240413;240414;240415;240416;240417;240418;240419;240420 240416 13 IISSDRDLLAVVFYGTEKDK Unmodified 2268.2002 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14.762 2 1.1902E-08 6848 QUIQUE_DMIX4_190116_001 156.92 99.358 1865000000 36000000 130390000 0 58885000 0 148710000 0 827270000 194360000 450030000 0 0 19395000 20989 2261 19741 188163;188164;188165;188166;188167;188168;188169;188170 240505;240506;240507;240508;240509;240510;240511;240512 240511 7 IISVNSVDLR Unmodified 1114.6346 0.63462279 2954 Q12959;A0A0C4DFT3;E7EQD7 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 72.977 72.977 2 0.0021478 73923 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.52 54.555 221890000 0 0 0 0 0 0 0 0 64697000 0 98780000 58414000 0 20990 2954 19742 188171;188172;188173 240513;240514;240515;240516 240514 4 IISYAQGFMLLR Oxidation (M) 1426.7643 0.76425675 2602 P52209;K7ELN9 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.46 119.46 2 0.00062678 123176 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.136 62.802 1036500000 44881000 0 61030000 49193000 63706000 26287000 55529000 172960000 147450000 85249000 178410000 0 151800000 20991 2602 19743 188174;188175;188176;188177;188178;188179;188180;188181;188182;188183;188184 240517;240518;240519;240520;240521;240522;240523;240524;240525;240526;240527;240528 240525 2053 11 IISYAQGFMLLR Unmodified 1410.7693 0.76934213 2602 P52209;K7ELN9 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 131.58 131.58 2 6.9234E-05 138124 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.44 139.73 1498500000 0 0 0 0 0 0 0 488760000 0 0 362260000 351580000 295940000 20992 2602 19743 188185;188186;188187;188188;188189;188190 240529;240530;240531;240532;240533;240534;240535 240533 7 IITAESGKPLK Unmodified 1155.6863 0.68632401 2588 P51649 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 18.948 18.948 2;3 0.00085335 11713 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.781 54.538 13367000000 1162100000 1162000000 463430000 899810000 1037000000 1131500000 1198000000 961050000 1120900000 380800000 1645300000 1211700000 993020000 20993 2588 19744 188191;188192;188193;188194;188195;188196;188197;188198;188199;188200;188201;188202;188203;188204;188205;188206;188207;188208;188209;188210;188211;188212;188213;188214;188215 240536;240537;240538;240539;240540;240541;240542;240543;240544;240545;240546;240547;240548;240549;240550;240551;240552;240553;240554;240555;240556;240557;240558;240559;240560 240553 11 IITEGASILR Unmodified 1071.6288 0.62880913 2915 Q08209;E9PPC8;E9PK68 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.459 63.459 2 0.00057903 63948 QUIQUE_C1218_190116_001 124.23 68.22 5406300000 504030000 508720000 406400000 483610000 429130000 403020000 441100000 440160000 285770000 290960000 389660000 398340000 425360000 20994 2915 19745 188216;188217;188218;188219;188220;188221;188222;188223;188224;188225;188226;188227;188228 240561;240562;240563;240564;240565;240566;240567;240568;240569;240570;240571;240572;240573;240574;240575;240576;240577;240578 240562 11 IITEGFEAAK Unmodified 1077.5706 0.57062555 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.231 50.231 2 0.00019822 48865 QUIQUE_C1218_190116_001 119.21 30.069 5600100000 467430000 514290000 486470000 474890000 411770000 430530000 450580000 392360000 387950000 223060000 488190000 421110000 451470000 20995 2424 19746 188229;188230;188231;188232;188233;188234;188235;188236;188237;188238;188239;188240;188241 240579;240580;240581;240582;240583;240584;240585;240586;240587;240588;240589;240590;240591;240592;240593;240594 240579 16 IITGGAAAQDGR Unmodified 1128.5887 0.58873523 2954 Q12959;A0A0C4DFT3;E7EQD7;B4E2H8;H7C166;C9IYP1 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.413 19.413 2 0.00020546 12538 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.4 46.902 1249700000 0 100540000 136860000 121070000 118960000 0 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yes yes 0 0 1 1 133.42 133.42 4 1.3713E-13 129710 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.707 63.08 131940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131940000 0 0 0 + 20999 761 19749 188327 240741 240741 1 IITITGTQDQIQNAQYLLQNSVK Unmodified 2588.381 0.38098087 2735 P61978 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 142.16 142.16 2;3 4.7683E-160 147772 QUIQUE_C1368_190116_001 287.85 268.57 31693000000 2196000000 2666600000 2338800000 2802200000 3198800000 2178400000 2146000000 2380700000 2981800000 831480000 3122300000 2631700000 2217700000 21000 2735 19750 188328;188329;188330;188331;188332;188333;188334;188335;188336;188337;188338;188339;188340;188341;188342;188343;188344;188345;188346;188347;188348;188349;188350;188351;188352 240742;240743;240744;240745;240746;240747;240748;240749;240750;240751;240752;240753;240754;240755;240756;240757;240758;240759;240760;240761;240762;240763;240764;240765;240766;240767;240768;240769;240770;240771;240772;240773;240774;240775;240776;240777;240778;240779;240780;240781;240782;240783 240752 41 IITLAGPTNAIFK Unmodified 1357.7969 0.79693709 3131;1044 F8VZX2;H3BRU6;F8W0G4;F8VXH9;F8W1G6;Q15366 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 110.53 110.53 2 0.00054051 112887 QUIQUE_C1563_190116_001 119.16 97.069 8215500000 711550000 673330000 701260000 666210000 677360000 711260000 660910000 0 722380000 261350000 888320000 774780000 766800000 21001 1044;3131 19751 188353;188354;188355;188356;188357;188358;188359;188360;188361;188362;188363;188364;188365 240784;240785;240786;240787;240788;240789;240790;240791;240792;240793;240794;240795;240796;240797;240798;240799;240800 240792 17 IITLEEGDIILTGTPK Unmodified 1711.9608 0.96076753 3383 Q6P587 FAHD1 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 2 2 126.85 126.85 2;3 3.997E-13 123445 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.32 108.1 2209800000 204260000 189020000 225420000 149080000 176380000 192190000 174490000 21289000 125920000 50031000 160960000 231590000 309220000 21002 3383 19752 188366;188367;188368;188369;188370;188371;188372;188373;188374;188375;188376;188377;188378;188379;188380;188381;188382;188383;188384;188385;188386;188387;188388;188389;188390;188391 240801;240802;240803;240804;240805;240806;240807;240808;240809;240810;240811;240812;240813;240814;240815;240816;240817;240818;240819;240820;240821;240822;240823;240824;240825;240826;240827;240828;240829;240830;240831;240832;240833 240824 31 IITLQEEMER Unmodified 1260.6384 0.63838754 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.345 74.345 2 0.00072522 76561 QUIQUE_C1218_190116_001 107.15 95.664 1259200000 142610000 86562000 141150000 126810000 105320000 104870000 139890000 0 0 0 100740000 138500000 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240847;240848;240849;240850;240851;240852;240853;240854;240855;240856;240857;240858;240859;240860;240861;240862;240863;240864;240865;240866;240867;240868;240869;240870;240871;240872;240873;240874;240875 240861 29 IITMLPTSINAIEAYSGANGILK Unmodified 2389.2927 0.29268313 2338 P31937;H7BZL2 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2 158.24 158.24 2;3 1.678E-13 160773 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.38 102.72 553670000 0 0 41413000 51485000 22602000 30339000 21380000 75529000 66541000 12825000 75911000 79417000 76226000 21006 2338 19755 188417;188418;188419;188420;188421;188422;188423;188424;188425;188426;188427;188428;188429;188430;188431 240876;240877;240878;240879;240880;240881;240882;240883;240884;240885;240886;240887;240888;240889;240890;240891;240892 240883 17 IITSEAQELGDTTTLEDPSIIAEILSVYQK Unmodified 3276.6864 0.68644975 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 171.12 171.12 3;4 6.3865E-54 172656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.69 126.97 756900000 80327000 0 0 44161000 0 0 0 119650000 0 0 417990000 0 94775000 21007 4296 19756 188432;188433;188434;188435;188436;188437 240893;240894;240895;240896;240897;240898 240895 6 IITSELYR Unmodified 993.5495 0.54949617 508 A0A3B3IUB1;Q13144;A0A3B3ISX3;A0A3B3ITG6;A0A3B3IS56;A0A3B3IRP4;A0A3B3IUF2;A0A3B3ISM8;A0A3B3ITK8;A0A3B3IST9;A0A3B3ISI2;A0A3B3ISS1;A0A3B3ISV1;A0A3B3ITQ2 EIF2B5 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon yes no 0 0 0 1 53.509 53.509 2 0.032902 51350 QUIQUE_C1403_190116_001 65.038 7.4786 27191000 0 0 0 27191000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21008 508 19757 188438 240899 240899 1 IITTDFPLYFVIMSR Unmodified 1814.9641 0.96407877 2103 P16157;H0YBS0 ANK1 Ankyrin-1 yes no 0 0 0 1 167.45 167.45 2 1.4965E-06 174922 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.01 90.072 236360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 236360000 0 0 21009 2103 19758 188439 240900 240900 1 IITTGELAPQETTITEIK Unmodified 1957.0619 0.06193814 4656 Q9Y6K8 AK5 Adenylate kinase isoenzyme 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 99.401 99.401 2 6.4291E-07 101865 QUIQUE_C1277_190116_001 103.11 80.23 623550000 109700000 101640000 79754000 81436000 0 0 0 53189000 56567000 45472000 95797000 0 0 21010 4656 19759 188440;188441;188442;188443;188444;188445;188446;188447 240901;240902;240903;240904;240905;240906;240907;240908 240902 8 IITTTNLHPVK Unmodified 1235.7238 0.72377215 3531 Q8IV38;G3V0G5 ANKMY2 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 29.364 29.364 2;3 0.0016749 24827 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.314 45.827 684280000 0 97336000 91666000 78147000 83227000 69582000 0 81726000 83862000 0 0 0 98732000 21011 3531 19760 188448;188449;188450;188451;188452;188453;188454;188455;188456;188457 240909;240910;240911;240912;240913;240914;240915;240916;240917;240918 240916 6 IITVEKHPDADSLYVEK Unmodified 1956.0204 0.020407676 2641 P54577 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 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beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 53.179 53.179 2 0.050661 51801 QUIQUE_C1438_190116_001 74.415 16.952 222940000 0 0 0 0 75284000 0 89039000 0 0 58612000 0 0 0 21015 2787 19764 188469;188470;188471 240930;240931;240932 240930 3 IIVDELKQEVISTSSK Unmodified 1787.988 0.98804492 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;H0Y8W2;D6REE5;H0YAM7;D6RF23;H0Y9P0 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 91.918 91.918 2;3 1.322E-35 93898 QUIQUE_C1368_190116_001 167.59 142.74 7100000000 425820000 553980000 630150000 518830000 596130000 437890000 544840000 491010000 650620000 142280000 808250000 568150000 732050000 21016 2787 19765 188472;188473;188474;188475;188476;188477;188478;188479;188480;188481;188482;188483;188484;188485;188486;188487;188488;188489;188490;188491;188492;188493;188494;188495;188496;188497 240933;240934;240935;240936;240937;240938;240939;240940;240941;240942;240943;240944;240945;240946;240947;240948;240949;240950;240951;240952;240953;240954;240955;240956;240957;240958;240959;240960;240961;240962 240938 30 IIVDTYGGWGAHGGGAFSGK Unmodified 1948.9432 0.94316041 2329 P31153;Q00266 MAT2A;MAT1A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2;S-adenosylmethionine synthase isoform type-1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 2 86.988 86.988 2;3 5.3835E-38 88806 QUIQUE_C1368_190116_001 157.38 132.17 1830900000 150000000 143680000 200170000 202740000 124580000 157840000 120930000 94663000 169570000 48310000 107700000 134490000 176260000 21017 2329 19766 188498;188499;188500;188501;188502;188503;188504;188505;188506;188507;188508;188509;188510;188511;188512;188513;188514;188515;188516;188517 240963;240964;240965;240966;240967;240968;240969;240970;240971;240972;240973;240974;240975;240976;240977;240978;240979;240980;240981;240982;240983 240968 19 IIVEKPFGR Unmodified 1057.6284 0.6284152 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.747 39.747 3 0.000335 36857 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.11 58.044 2070200000 135490000 140290000 187990000 188130000 187330000 157110000 145190000 153200000 151350000 81871000 193500000 151660000 197140000 21018 2024 19767 188518;188519;188520;188521;188522;188523;188524;188525;188526;188527;188528;188529;188530 240984;240985;240986;240987;240988;240989;240990;240991;240992;240993;240994;240995;240996;240997;240998;240999;241000;241001;241002;241003 240996 20 IIVENLFYPVTLDVLHQIFSK Unmodified 2487.3777 0.37773339 322 A0A0U1RRM4;P26599;A6NLN1;K7EKJ7;K7EK45;A0A087WU68 PTBP1 Polypyrimidine tract-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 172.6 172.6 3 1.8577E-19 176177 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.95 93.754 1422400000 0 0 0 19761000 47526000 12095000 389190000 0 164480000 0 423840000 365480000 0 21019 322 19768 188531;188532;188533;188534;188535;188536;188537 241004;241005;241006;241007;241008;241009;241010;241011;241012 241012 7 IIVFSACR Unmodified 964.51642 0.51642191 2912 Q07960;H0YE29;E9PNR6 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 58.5 58.5 2 0.0067077 57585 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.75 62.604 437330000 0 0 75091000 0 81066000 53636000 0 0 70736000 18937000 60844000 77021000 0 21020 2912 19769 188538;188539;188540;188541;188542;188543;188544 241013;241014;241015;241016;241017;241018;241019;241020;241021 241018 8 IIVHTVQSQDR Unmodified 1294.6993 0.69934831 1481 O15111 CHUK Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 18.393 18.393 2;3 0.0071295 10896 QUIQUE_C1218_190116_001 47.971 31.198 21662000 21662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21021 1481 19770 188545;188546 241022;241023 241022 2 IIVLGLLPR Unmodified 992.67464 0.67463711 2798 P68402;J3KNE3 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 118.31 118.31 2 4.0111E-08 122470 QUIQUE_DMIX3_190116_001 167.25 163.27 8226200000 688930000 717920000 651800000 592650000 758620000 604870000 531830000 660790000 630690000 237770000 717600000 665060000 767660000 21022 2798 19771 188547;188548;188549;188550;188551;188552;188553;188554;188555;188556;188557;188558;188559;188560;188561 241024;241025;241026;241027;241028;241029;241030;241031;241032;241033;241034;241035;241036;241037;241038;241039;241040;241041;241042;241043;241044;241045;241046;241047;241048;241049;241050;241051;241052;241053;241054;241055;241056;241057;241058;241059;241060;241061;241062;241063;241064;241065 241047 42 IIVMSFPLDNVDIGFR Unmodified 1834.9651 0.9651414 1607 O75061;S4R305 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.18 160.18 2 3.7997E-13 164084 QUIQUE_C1277_190116_001 167.18 141.96 545520000 45900000 58763000 47813000 35448000 56185000 34553000 59024000 0 0 20004000 0 134160000 53676000 21023 1607 19772 188562;188563;188564;188565;188566;188567;188568;188569;188570;188571;188572 241066;241067;241068;241069;241070;241071;241072;241073;241074;241075;241076;241077;241078;241079 241067 14 IIVPLNNR Unmodified 937.5709 0.57090032 817 D6RHJ6;D6RD17;P01591;C9JA05 JCHAIN;IGJ Immunoglobulin J chain yes no 0 0 0 1 46.76 46.76 2 0.036566 44079 QUIQUE_C1368_190116_001 62.714 27.89 15786000 0 0 15786000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21024 817 19773 188573 241080 241080 1 IIWELIK Unmodified 913.56369 0.56368968 1662 O75874;C9J4N6;C9JJE5;C9JLU6 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.93 109.93 2 0.019583 114212 QUIQUE_C1576_190116_001 128.38 47.827 2354300000 145390000 152310000 176780000 207610000 176400000 173050000 197500000 224340000 174880000 109800000 200180000 203320000 212760000 21025 1662 19774 188574;188575;188576;188577;188578;188579;188580;188581;188582;188583;188584;188585;188586 241081;241082;241083;241084;241085;241086;241087;241088;241089;241090;241091;241092;241093;241094;241095;241096;241097;241098;241099;241100;241101;241102;241103;241104;241105;241106;241107;241108;241109 241094 29 IIWQFIK Unmodified 946.56402 0.56402403 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.87 107.87 2 0.019813 112356 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.87 81.769 14428000000 1004900000 1181300000 1248500000 934290000 1017000000 1021400000 997710000 1152000000 1252900000 400410000 1527000000 1439800000 1250800000 21026 2518 19775 188587;188588;188589;188590;188591;188592;188593;188594;188595;188596;188597;188598;188599 241110;241111;241112;241113;241114;241115;241116;241117;241118;241119;241120;241121;241122;241123;241124;241125;241126;241127;241128;241129;241130;241131;241132;241133;241134;241135;241136;241137;241138;241139;241140;241141 241134 32 IIYFQDEGSLTK Unmodified 1412.7187 0.71874635 4222 Q9HCB6 SPON1 Spondin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 86.067 86.067 2 0.031029 87757 QUIQUE_C1277_190116_001 57.019 32.165 137260000 38023000 31254000 0 0 0 36754000 0 0 31224000 0 0 0 0 21027 4222 19776 188600;188601;188602;188603 241142;241143;241144;241145 241143 3 IIYGGSVTGATCK Unmodified 1325.6649 0.66493664 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 0 2 1 3 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 43.117 43.117 2 9.8303E-05 39358 QUIQUE_C1368_190116_001 127.42 117.19 53988000000 5350400000 5091500000 4300600000 4788100000 4673900000 3460200000 5082900000 3243000000 3020800000 1737000000 4767900000 3937600000 4533900000 21028 2688 19777 188604;188605;188606;188607;188608;188609;188610;188611;188612;188613;188614;188615;188616;188617;188618;188619;188620;188621;188622;188623 241146;241147;241148;241149;241150;241151;241152;241153;241154;241155;241156;241157;241158;241159;241160;241161;241162;241163;241164;241165;241166;241167;241168;241169;241170;241171;241172;241173;241174;241175;241176;241177;241178;241179;241180;241181;241182;241183;241184;241185;241186;241187;241188;241189;241190;241191 241156 46 IIYIVHDEVK Unmodified 1227.6863 0.68632401 2245 P25788;G3V4X5 PSMA3 Proteasome subunit alpha type-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.335 46.335 2;3 0.014615 44298 QUIQUE_C1218_190116_001 47.844 33.282 627360000 268330000 242510000 50481000 36500000 0 0 29540000 0 0 0 0 0 0 21029 2245 19778 188624;188625;188626;188627;188628 241192;241193;241194;241195;241196 241192 3 IIYIVHDEVKDK Unmodified 1470.8082 0.80823006 2245 P25788;G3V4X5 PSMA3 Proteasome subunit alpha type-3 yes no 0 0 1 1 2 3 2 1 2 2 1 1 1 34.942 34.942 2;3;4 0.00072437 30262 QUIQUE_C1277_190116_001 140.07 71.848 795230000 24043000 97644000 141100000 99741000 36906000 0 80905000 110670000 63294000 0 92976000 47949000 0 21030 2245 19779 188629;188630;188631;188632;188633;188634;188635;188636;188637;188638;188639;188640;188641;188642;188643;188644 241197;241198;241199;241200;241201;241202;241203;241204;241205;241206;241207;241208;241209;241210;241211;241212;241213 241199 17 IIYLNQLLQEDSLNVADLTSLR Unmodified 2530.3643 0.36426817 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 2 167.79 167.79 2;3 6.1832E-147 174873 QUIQUE_DMIX5_190116_001 283.54 268.57 4868400000 301930000 334880000 424830000 323250000 513380000 0 244450000 849910000 243300000 107940000 559210000 604020000 361330000 21031 114 19780 188645;188646;188647;188648;188649;188650;188651;188652;188653;188654;188655;188656;188657;188658;188659;188660;188661;188662;188663;188664 241214;241215;241216;241217;241218;241219;241220;241221;241222;241223;241224;241225;241226;241227;241228;241229;241230;241231;241232;241233;241234;241235 241231 22 IIYSHFTCATDTENIR Unmodified 1939.9098 0.90981137 2294;2556 P50148;P29992;K7EL62 GNAQ;GNA11 Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 64.681 64.681 2;3 3.4394E-54 64011 QUIQUE_C1277_190116_001 220.66 197.05 1903500000 197540000 206020000 267830000 270340000 177850000 281450000 192570000 0 56775000 123830000 46285000 82982000 0 21032 2556;2294 19781 188665;188666;188667;188668;188669;188670;188671;188672;188673;188674;188675;188676;188677;188678;188679;188680;188681;188682;188683;188684 241236;241237;241238;241239;241240;241241;241242;241243;241244;241245;241246;241247;241248;241249;241250;241251;241252;241253;241254;241255;241256;241257 241241 22 IKAEYEGDGIPTVFVAVAGR Unmodified 2091.1001 0.10005498 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 112.44 112.44 2 8.4409E-196 116259 QUIQUE_DMIX3_190116_001 257.35 228.05 600650000 0 56190000 46394000 35441000 55832000 37583000 0 0 125390000 0 148730000 95097000 0 21033 2195 19782 188685;188686;188687;188688;188689;188690;188691;188692;188693 241258;241259;241260;241261;241262;241263;241264;241265;241266;241267;241268 241265 11 IKAPGFAHLAGLDK Unmodified 1436.814 0.81398414 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 62.088 62.088 4 0.0022317 61812 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.196 56.133 81762000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46339000 35423000 0 21034 1620 19783 188694;188695 241269;241270 241269 2 IKDAFDRNPELQNLLLDDFFK Unmodified 2550.3118 0.31183867 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 2 1 2 1 1 2 3 2 3 2 1 145.82 145.82 2;3;4 2.1212E-52 149150 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.74 122.37 3921000000 0 55155000 138770000 87140000 79842000 0 177120000 824760000 611300000 0 931180000 755310000 260430000 21035 2602 19784 188696;188697;188698;188699;188700;188701;188702;188703;188704;188705;188706;188707;188708;188709;188710;188711;188712;188713 241271;241272;241273;241274;241275;241276;241277;241278;241279;241280;241281;241282;241283;241284;241285;241286;241287;241288 241280 13 IKDEFQLLQAQYHSLK Unmodified 1960.0418 0.04181182 2913 Q08117;K7ELE3 AES Amino-terminal enhancer of split yes no 0 0 1 1 1 2 1 86.313 86.313 3;4 0.00046627 88316 QUIQUE_C1277_190116_001 66.913 49.834 163620000 0 50211000 32331000 56646000 0 24435000 0 0 0 0 0 0 0 21036 2913 19785 188714;188715;188716;188717;188718 241289;241290;241291;241292;241293;241294 241290 6 IKDIAWTEDSKR Unmodified 1460.7623 0.7623425 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 27.27 27.27 2;3;4 0.00043605 20771 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.17 116.23 2947000000 102560000 97563000 0 0 0 0 0 331560000 246920000 0 883410000 448900000 836120000 21037 1609 19786 188719;188720;188721;188722;188723;188724;188725;188726;188727 241295;241296;241297;241298;241299;241300;241301;241302;241303;241304 241304 8 IKDLAHQFTQVQR Unmodified 1582.858 0.85797422 2283 P28907;H0Y950 CD38 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 2 3 1 1 3 3 2 40.56 40.56 2;3;4 1.0599E-30 37041 QUIQUE_DMIX3_190116_001 182.1 148.35 1760100000 80863000 84516000 320490000 0 40089000 47213000 123090000 227080000 72989000 46264000 295560000 265830000 156140000 21038 2283 19787 188728;188729;188730;188731;188732;188733;188734;188735;188736;188737;188738;188739;188740;188741;188742;188743;188744;188745;188746;188747;188748 241305;241306;241307;241308;241309;241310;241311;241312;241313;241314;241315;241316;241317;241318;241319;241320;241321;241322;241323;241324;241325;241326;241327 241318 20 IKDLGQFYAGLSAESYPIIK Unmodified 2212.178 0.17797095 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 130.51 130.51 3 4.4245E-05 133572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.294 68.537 100240000 0 0 0 0 0 0 0 46330000 53910000 0 0 0 0 21039 3445 19788 188749;188750 241328;241329;241330 241329 3 IKDLLQQMEEGLK Unmodified 1543.828 0.82797922 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.39 110.39 3 0.0018218 114650 QUIQUE_C1576_190116_001 73.415 61.496 1345500000 0 146850000 0 153170000 90752000 97060000 140030000 134350000 125000000 42266000 136230000 128510000 151310000 21040 4281 19789 188751;188752;188753;188754;188755;188756;188757;188758;188759;188760;188761 241331;241332;241333;241334;241335;241336;241337;241338;241339;241340;241341;241342;241343 241336 11 IKDLSTVEALQNLK Unmodified 1570.893 0.89302232 4022 Q9BTT0;E9PPH5 ANP32E Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 81.976 81.976 2;3 2.193E-21 83311 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.22 110.95 1330800000 78070000 84586000 0 51432000 44211000 0 91073000 176200000 197050000 0 218520000 185910000 203790000 21041 4022 19790 188762;188763;188764;188765;188766;188767;188768;188769;188770;188771;188772;188773;188774;188775;188776;188777;188778;188779 241344;241345;241346;241347;241348;241349;241350;241351;241352;241353;241354;241355;241356;241357;241358;241359;241360;241361;241362 241354 16 IKDPDASKPEDWDER Unmodified 1799.8326 0.83260691 2268 P27797;K7EJB9 CALR Calreticulin yes no 0 0 2 2 1 2 1 1 1 2 3 2 3 2 1 1 35.512 35.512 2;3;4 5.8979E-06 30689 QUIQUE_C1277_190116_001 97.836 92.258 11378000000 1261200000 990540000 809670000 861770000 957950000 889160000 1135500000 915650000 849830000 512930000 1094700000 506770000 592190000 21042 2268 19791 188780;188781;188782;188783;188784;188785;188786;188787;188788;188789;188790;188791;188792;188793;188794;188795;188796;188797;188798;188799;188800;188801 241363;241364;241365;241366;241367;241368;241369;241370;241371;241372;241373;241374;241375;241376;241377;241378;241379;241380;241381;241382;241383;241384;241385;241386;241387;241388;241389 241366 23 IKDYLLMEEEFIR Unmodified 1697.8698 0.86984404 2742 P62191 PSMC1 26S protease regulatory subunit 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 119.77 119.77 3 0.0045579 125103 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.709 42.458 199770000 0 26347000 0 52187000 0 0 0 23406000 0 0 57206000 40620000 0 21043 2742 19792 188802;188803;188804;188805;188806 241390;241391;241392;241393;241394 241393 4 IKEDEDDKTVLDLAVVLFETATLR Unmodified 2732.4484 0.44839173 2079 P14625;H0YIV0 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 3 4 2 171.17 171.17 3;4 1.924E-113 178281 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.55 179.6 5197700000 137280000 411620000 50928000 47067000 202240000 0 431850000 282880000 729750000 25971000 1695900000 996960000 185270000 21044 2079 19793 188807;188808;188809;188810;188811;188812;188813;188814;188815;188816;188817;188818;188819;188820;188821;188822;188823;188824;188825;188826;188827;188828;188829 241395;241396;241397;241398;241399;241400;241401;241402;241403;241404;241405;241406;241407;241408;241409;241410;241411;241412;241413;241414;241415;241416;241417 241409 21 IKEDNFFQVSK Unmodified 1353.6929 0.69286595 3785 Q969G6 RFK Riboflavin kinase yes yes 0 0 1 1 55.969 55.969 3 0.039643 53784 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34 15.376 56975000 0 0 0 0 0 0 0 56975000 0 0 0 0 0 21045 3785 19794 188830 241418;241419 241418 2 IKEEMNEDHSTPK Unmodified 1556.7141 0.71407167 4147 Q9H2K8;G3V1Q8 TAOK3 Serine/threonine-protein kinase TAO3 yes no 0 0 1 1 10.558 10.558 3 0.013214 3030 QUIQUE_C1403_190116_001 40.941 28.559 9282000 0 0 0 9282000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21046 4147 19795 188831 241420 241420 1 IKELKPEQETTPR Unmodified 1567.857 0.85697116 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 16.597 16.597 3 0.00013199 8757 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.12 87.71 584950000 0 54287000 0 48639000 36172000 0 0 142600000 0 0 0 113050000 190190000 21047 4172 19796 188832;188833;188834;188835;188836;188837 241421;241422;241423;241424;241425;241426 241425 3 IKELQNAGDR Unmodified 1142.6044 0.60438529 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 13.689 13.689 3 0.0020815 5900 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.114 66.353 56198000 0 0 0 0 0 0 0 56198000 0 0 0 0 0 21048 3117 19797 188838 241427 241427 1 IKELTSTCSPIISK Unmodified 1575.8542 0.85419397 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 43.442 43.442 2 8.5961E-05 41077 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.42 87.857 68876000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38627000 0 30249000 21049 2363 19798 188839;188840 241428;241429 241428 2 IKELTSTCSPIISKPK Unmodified 1801.0019 0.0019208405 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 2 1 1 2 1 34.506 34.506 2;3 7.4424E-05 29770 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.74 93.111 401390000 0 0 0 0 0 0 36283000 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2;3;4 3.2201E-20 30203 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.67 102.79 5882300000 298030000 0 56325000 41019000 989350000 75350000 120430000 495860000 1033600000 186300000 993160000 751310000 841530000 21061 1960 19810 188892;188893;188894;188895;188896;188897;188898;188899;188900;188901;188902;188903;188904;188905;188906;188907;188908;188909;188910;188911;188912;188913;188914;188915 241484;241485;241486;241487;241488;241489;241490;241491;241492;241493;241494;241495;241496;241497;241498;241499;241500;241501;241502;241503;241504;241505;241506;241507;241508;241509;241510 241496 24 IKIEEDYAK Unmodified 1107.5812 0.58119023 1597 O60861 GAS7 Growth arrest-specific protein 7 yes yes 0 0 1 1 28.021 28.021 3 0.015836 22153 QUIQUE_C1576_190116_001 60.518 28.189 37667000 0 0 0 0 0 0 37667000 0 0 0 0 0 0 21062 1597 19811 188916 241511 241511 1 IKLDVPEDLR Unmodified 1196.6765 0.6764876 561 R9WNI0;A8MQB8;G3V0J0;Q06787;Q8IXW7;A0A087WXI3;A0A087WY29 FMR1 Fragile X mental retardation protein 1 yes no 0 0 1 1 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241515;241516;241517;241518;241519;241520;241521;241522;241523;241524;241525;241526;241527;241528 241524 12 IKPHLMSQELPEDWDKQPVK Unmodified 2417.2413 0.24131626 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 65.708 65.708 3;4 1.7767E-05 65412 QUIQUE_C1576_190116_001 74.698 56.403 1426500000 0 49674000 36557000 41223000 0 55280000 758910000 29914000 0 0 0 0 454960000 21066 1917 19815 188932;188933;188934;188935;188936;188937;188938;188939 241529;241530;241531;241532;241533;241534;241535;241536 241534 8 IKPKPVEVQVVTHHMQR Unmodified 2025.1306 0.13058402 4374 Q9P1U1 ACTR3B Actin-related protein 3B yes yes 0 0 2 1 22.435 22.435 4 0.047703 16061 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.667 29.805 47291000 0 0 0 0 0 0 0 47291000 0 0 0 0 0 21067 4374 19816 188940 241537 241537 1 IKPKPVEVQVVTHHMQR Oxidation (M) 2041.1255 0.12549865 4374 Q9P1U1 ACTR3B Actin-related protein 3B yes yes 0 1 2 1 1 1 15.086 15.086 4 0.00018756 7435 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.428 77.399 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Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 81.717 81.717 2;3 0.0003525 82420 QUIQUE_C1403_190116_001 89.663 80.213 2631900000 161170000 244380000 193750000 200080000 346140000 166530000 241460000 205360000 223570000 71921000 176950000 121040000 279520000 21070 2640 19818 188965;188966;188967;188968;188969;188970;188971;188972;188973;188974;188975;188976;188977;188978;188979;188980;188981 241572;241573;241574;241575;241576;241577;241578;241579;241580;241581;241582;241583;241584;241585;241586;241587;241588;241589 241575 16 IKPVLMMNK Unmodified 1072.6137 0.61369311 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 34.337 34.337 3 0.0099038 30512 QUIQUE_C1218_190116_001 57.859 42.229 322710000 52461000 78528000 0 0 0 36692000 0 0 0 21787000 133240000 0 0 21071 2058 19819 188982;188983;188984;188985;188986 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14.472 3 0.0037403 6666 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.515 35.516 24389000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24389000 0 0 21077 1728 19824 189049 241679 241679 1 IKSDYAQLLEDMQNAFR Unmodified 2040.9939 0.99387535 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 147.73 147.73 2;3 1.2567E-11 154535 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.29 124.91 2048700000 0 0 0 0 0 0 0 403250000 281360000 0 575090000 410560000 378430000 21078 2414 19825 189050;189051;189052;189053;189054;189055;189056;189057;189058;189059 241680;241681;241682;241683;241684;241685;241686;241687;241688;241689;241690;241691;241692 241687 13 IKSDYAQLLEDMQNAFR Oxidation (M) 2056.9888 0.98878997 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 1 1 1 102.11 102.11 3 0.0079951 106858 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.831 46.644 128560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60628000 67935000 0 21079 2414 19825 189060;189061 241693;241694 241693 1824 2 IKTDGAAPNVAPSDVGGGGGR Unmodified 1894.9497 0.94970235 2948 Q12860 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ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes yes 0 0 1 3 3 1 3 3 1 3 3 3 2 2 1 3 103.13 103.13 2;3;4 1.2787E-272 106070 QUIQUE_C1277_190116_001 290.62 255.02 11320000000 725980000 965990000 207070000 247580000 937870000 588650000 868020000 1328400000 1162500000 294050000 1269800000 1232600000 1491200000 21082 2028 19828 189085;189086;189087;189088;189089;189090;189091;189092;189093;189094;189095;189096;189097;189098;189099;189100;189101;189102;189103;189104;189105;189106;189107;189108;189109;189110;189111;189112;189113;189114;189115 241723;241724;241725;241726;241727;241728;241729;241730;241731;241732;241733;241734;241735;241736;241737;241738;241739;241740;241741;241742;241743;241744;241745;241746;241747;241748;241749;241750;241751;241752;241753;241754;241755;241756 241728 28 IKVDFVIPK Unmodified 1057.6536 0.65356732 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 1 1 1 1 73.627 73.627 3 0.038057 73572 QUIQUE_C1368_190116_001 42.336 12.592 148350000 0 47026000 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QUIQUE_DMIX1_190116_001 31.597 18.641 3436700 0 0 0 0 0 0 0 3436700 0 0 0 0 0 21086 673 19832 189125 241766 241766 1 IKVGDPAEDFGTFFSAVIDAK Unmodified 2226.1209 0.12085 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 159.96 159.96 3 1.0329E-06 162503 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.395 79.043 219360000 0 0 0 0 0 0 0 57851000 0 0 116400000 0 45112000 21087 2295 19833 189126;189127;189128 241767;241768;241769 241767 3 IKVPVDWSK Unmodified 1070.6124 0.61243078 181 A0A0A0MSQ0;P13797;H7C4N2 PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 1 1 54.1 54.1 3 0.029729 52685 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.425 27.587 25311000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25311000 21088 181 19834 189129 241770 241770 1 IKWGDAGAEYVVESTGVFTTMEK Unmodified 2517.2097 0.20974136 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 3 1 2 1 1 139.5 139.5 2;3 7.4835E-73 141968 QUIQUE_DMIX1_190116_001 206.98 195.06 948660000 0 0 0 0 0 0 0 352890000 94320000 0 246570000 124290000 130580000 21089 1863 19835 189130;189131;189132;189133;189134;189135;189136;189137 241771;241772;241773;241774;241775;241776;241777;241778;241779;241780;241781;241782;241783 241774 13 IKYPENFFLLR Unmodified 1438.7973 0.79727144 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;C9J9S3;C9JP48;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;A0A087WYY5;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 2 1 107.82 107.82 2;3 1.1735E-12 112531 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.86 123.51 5482200000 192470000 474650000 243700000 314480000 252750000 184270000 468180000 597570000 701360000 99260000 722260000 738930000 492270000 21090 2740;1041;2739 19836 189138;189139;189140;189141;189142;189143;189144;189145;189146;189147;189148;189149;189150;189151;189152;189153;189154;189155;189156;189157;189158 241784;241785;241786;241787;241788;241789;241790;241791;241792;241793;241794;241795;241796;241797;241798;241799;241800;241801;241802;241803;241804;241805;241806;241807;241808;241809;241810;241811;241812;241813 241808 29 ILAAALTECHR Unmodified 1253.655 0.65504065 2476 P46060 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 40.052 40.052 3 0.040744 34291 QUIQUE_DMIX4_190116_001 36.952 21.75 21435000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21435000 0 0 0 21091 2476 19837 189159 241814 241814 1 ILAAALTQHNGDAAASLTVAEQYVSAFSK Unmodified 2946.5087 0.50870058 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.08 151.08 3 1.1986E-27 156796 QUIQUE_C1368_190116_001 107.19 100.61 573310000 0 47472000 70285000 0 0 28017000 58566000 0 98296000 12898000 107360000 79622000 70801000 21092 4466 19838 189160;189161;189162;189163;189164;189165;189166;189167;189168;189169 241815;241816;241817;241818;241819;241820;241821;241822;241823;241824;241825;241826 241816 11 ILAAIIMK Unmodified 871.5565 0.55649581 2664 P55265;A0A3B3IRQ9;H0YCK3 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 76.172 76.172 2 0.048305 77371 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.269 40.376 25337000 0 0 15327000 0 0 10010000 0 0 0 0 0 0 0 21093 2664 19839 189170;189171;189172 241827;241828;241829 241829 3 ILAAILHLGNLK Unmodified 1274.8074 0.8074422 1302 K7EIG7;J3QRN6;O94832;J3KRL0 MYO1D Unconventional myosin-Id yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.42 103.42 3 0.00049716 105619 QUIQUE_C1277_190116_001 79.659 68.091 13949000 0 9651300 0 0 0 0 0 0 0 4297900 0 0 0 21094 1302 19840 189173;189174;189175;189176;189177;189178;189179 241830;241831;241832;241833;241834;241835;241836 241831 7 ILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPR Unmodified 2387.2557 0.25572077 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;E9PS95 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 0 1 1 1 76.953 76.953 3 0.0063351 78556 QUIQUE_C1218_190116_001 29.745 21.941 125240000 66361000 58876000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21095 4190 19841 189180;189181;189182 241837;241838;241839 241837 3 ILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPRPTATQLTR Unmodified 3255.7324 0.73238636 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;E9PS95 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 81.111 81.111 3;4 3.9516E-114 82031 QUIQUE_C1368_190116_001 175.39 169.96 1324600000 122730000 167500000 71444000 59910000 46560000 30330000 68513000 140040000 142470000 0 99838000 200520000 174700000 21096 4190 19842 189183;189184;189185;189186;189187;189188;189189;189190;189191;189192;189193;189194;189195;189196;189197;189198;189199;189200;189201 241840;241841;241842;241843;241844;241845;241846;241847;241848;241849;241850;241851;241852;241853;241854;241855;241856;241857;241858;241859;241860;241861;241862;241863;241864 241844 25 ILACAPLYHWR Unmodified 1398.7231 0.72306064 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.04 78.04 3 0.00019458 78984 QUIQUE_C1277_190116_001 98.048 80.383 819850000 57059000 61806000 0 66167000 100720000 0 116700000 60144000 63919000 19460000 85382000 78038000 110460000 21097 1909 19843 189202;189203;189204;189205;189206;189207;189208;189209;189210;189211;189212 241865;241866;241867;241868;241869;241870;241871;241872;241873;241874;241875;241876;241877 241868 10 ILACDDLDEAAR Unmodified 1360.6293 0.62927941 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;A0A0U1RQL1 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.298 62.298 2 0.00019029 62613 QUIQUE_C1218_190116_001 123.63 109.86 4968900000 545240000 441810000 517560000 407650000 418860000 503100000 605730000 0 0 0 548730000 485740000 494430000 21098 445 19844 189213;189214;189215;189216;189217;189218;189219;189220;189221;189222 241878;241879;241880;241881;241882;241883;241884;241885;241886;241887;241888 241878 10 ILACNDPGRR Unmodified 1170.5928 0.59277475 1184 H3BNU1;Q9ULP9;H3BV07;A0A2R8Y518 TBC1D24 TBC1 domain family member 24 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 13.901 13.901 3 0.016628 5632 QUIQUE_DMIX8_190116_001 36.585 12.555 219710000 0 0 13827000 0 5686100 0 0 102580000 54782000 0 6123800 0 36709000 21099 1184 19845 189223;189224;189225;189226;189227;189228 241889;241890;241891;241892;241893;241894 241894 6 ILADLEDYLNELWEDKEGK Unmodified 2292.1162 0.11615855 645 Q99613;B5ME19;H3BPE4;H3BPE3;H3BTY8 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 161.03 161.03 3 4.6231E-05 165545 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.049 68.044 236840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 116700000 120140000 0 21100 645 19846 189229;189230;189231 241895;241896;241897 241897 3 ILADLEEENR Unmodified 1200.5986 0.59863121 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304 DMD Dystrophin yes no 0 0 0 1 1 1 54.267 54.267 2 0.00091587 53009 QUIQUE_C1218_190116_001 104.2 82.753 201560000 94155000 0 0 0 0 0 0 0 0 41185000 0 0 66225000 21101 8 19847 189232;189233;189234 241898;241899;241900 241898 3 ILADLEEENRNLQAEYDR Unmodified 2190.0553 0.055289633 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304 DMD Dystrophin yes no 0 0 1 1 94.49 94.49 3 0.0077838 95654 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.102 45.16 91903000 0 0 0 0 0 0 0 91903000 0 0 0 0 0 21102 8 19848 189235 241901 241901 0 ILADPLDQMK Unmodified 1142.6005 0.60054547 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 86.964 86.964 2 0.012136 88835 QUIQUE_C1218_190116_001 66.299 42.87 86785000 86785000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21103 3199 19849 189236 241902 241902 1 ILAEADGLSTNHWLIGTDK Unmodified 2053.048 0.04801941 4455 Q9UJ70;H7C3G9;H7C1L7;H0YEB7 NAGK 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241955;241956;241957;241958;241959;241960;241961;241962;241963;241964;241965;241966;241967;241968;241969;241970;241971 241958 17 ILAGDVETHAEMVHSAFQAQR Oxidation (M) 2325.1172 0.11717838 2422 P40123;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385;F8WEW0 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 1 0 1 77.91 77.91 4 9.7215E-07 73994 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.467 69.221 26960000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26960000 0 0 0 21107 2422 19852 189289 241972 241972 1847 1 ILAGDYEFDSPYWDDISQAAK Unmodified 2403.0907 0.090672086 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 147.45 147.45 2;3 5.5935E-66 152362 QUIQUE_DMIX3_190116_001 177.21 152.28 1412200000 116990000 152560000 177020000 107500000 170350000 89833000 120910000 85155000 69221000 29281000 110720000 122910000 59773000 21108 872;3632 19853 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242001;242002;242003;242004;242005;242006;242007;242008;242009;242010;242011;242012;242013;242014;242015;242016;242017;242018;242019;242020;242021;242022;242023 242008 21 ILAGLLR Unmodified 754.50651 0.50650915 3914 Q96P48 ARAP1 Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 69.259 69.259 2 0.038919 68598 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.185 21.846 8017000 0 0 0 0 0 0 0 8017000 0 0 0 0 0 21110 3914 19855 189329 242024 242024 1 ILAGPAGDSNVVK Unmodified 1239.6823 0.68230126 1861 P04275 VWF von Willebrand factor;von Willebrand antigen 2 yes yes 0 0 0 1 1 43.816 43.816 2 0.041101 41114 QUIQUE_C1218_190116_001 56.359 27.632 107580000 33686000 0 0 0 73891000 0 0 0 0 0 0 0 0 21111 1861 19856 189330;189331 242025;242026 242025 1 ILAGSADSEGVAAPR Unmodified 1412.726 0.72595699 4434 Q9UHG2 PCSK1N ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN yes yes 0 0 0 1 2 1 45.06 45.06 2 0.00019611 41663 QUIQUE_C1218_190116_001 85.845 45.843 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242073;242074;242075;242076;242077;242078;242079;242080;242081;242082;242083;242084;242085;242086;242087;242088;242089;242090;242091;242092;242093;242094;242095;242096;242097;242098;242099;242100;242101;242102;242103;242104 242075 2415;2416 31 ILALAPTFEMNPMK Unmodified 1574.8201 0.82005707 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 127.85 127.85 2 7.1429E-05 134414 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.23 84.225 380840000 0 0 0 0 255690000 0 0 0 0 0 125150000 0 0 21116 2948 19860 189399;189400 242105;242106 242106 2 ILALAPTFEMNPMK 2 Oxidation (M) 1606.8099 0.80988632 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 2 0 1 93.101 93.101 2 0.012004 89936 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.174 39.943 116670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 116670000 0 0 0 21117 2948 19860 189401 242107 242107 2415;2416 1 ILALCMGNHELYMR Oxidation (M) 1735.8208 0.82080213 2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 MSN;RDX Moesin;Radixin no no 0 1 0 2 2 1 1 1 2 3 2 3 2 2 77.753 77.753 2;3 5.9651E-05 79510 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.264 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189423;189424;189425;189426;189427;189428;189429;189430;189431;189432;189433;189434;189435;189436;189437;189438;189439;189440 242133;242134;242135;242136;242137;242138;242139;242140;242141;242142;242143;242144;242145;242146;242147;242148;242149;242150;242151;242152;242153;242154;242155;242156;242157;242158;242159;242160 242155 27 ILALCMGNHELYMR 2 Oxidation (M) 1751.8157 0.81571675 2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 MSN;RDX Moesin;Radixin no no 0 2 0 1 62.184 62.184 3 0.011976 61668 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.621 36.677 104050000 0 0 0 0 0 0 0 0 104050000 0 0 0 0 21120 2248;434 19861 189441 242161 242161 310;311 1 ILALDCGLK Unmodified 1001.558 0.55795237 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.372 71.372 2 0.023629 72047 QUIQUE_C1438_190116_001 60.59 33.628 69244000 0 21789000 0 0 22574000 0 0 0 0 6581400 0 18300000 0 21121 1029 19862 189442;189443;189444;189445 242162;242163;242164;242165 242163 4 ILALQENFLLQFK Unmodified 1575.9025 0.90246479 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 3 1 150.31 150.31 2 1.5391E-13 154893 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.99 118.69 801180000 0 63951000 67956000 0 0 0 88591000 95770000 162260000 18988000 110320000 124170000 69174000 21122 1678 19863 189446;189447;189448;189449;189450;189451;189452;189453;189454;189455;189456;189457;189458;189459;189460 242166;242167;242168;242169;242170;242171;242172;242173;242174;242175;242176;242177;242178;242179;242180;242181;242182;242183;242184;242185;242186;242187;242188;242189;242190;242191 242179 26 ILALSQNEPK Unmodified 1111.6237 0.62372375 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.504 41.504 2 0.00033205 37808 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.76 81.699 1078500000 97460000 104790000 83816000 74807000 92641000 73057000 76573000 72007000 86413000 37152000 100020000 82819000 96932000 21123 4668 19864 189461;189462;189463;189464;189465;189466;189467;189468;189469;189470;189471;189472;189473 242192;242193;242194;242195;242196;242197;242198;242199;242200;242201;242202;242203;242204;242205;242206 242205 13 ILAPPGGR Unmodified 779.46537 0.46537261 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 23.86 23.86 2 0.015681 16975 QUIQUE_C1368_190116_001 84.359 16.598 1297400000 0 225990000 261140000 378180000 0 0 0 0 0 0 432070000 0 0 21124 3984 19865 189474;189475;189476;189477 242207;242208;242209;242210;242211 242208 5 ILAQATSDLVNAIK Unmodified 1455.8297 0.82969378 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.31 109.31 2 2.4309E-22 112526 QUIQUE_C1277_190116_001 163.84 136.54 1998400000 118380000 161320000 191550000 154800000 202030000 83590000 153110000 132140000 180180000 49553000 244420000 175600000 151730000 21125 4600 19866 189478;189479;189480;189481;189482;189483;189484;189485;189486;189487;189488;189489;189490 242212;242213;242214;242215;242216;242217;242218;242219;242220;242221;242222;242223;242224;242225;242226;242227;242228;242229;242230 242214 19 ILAQITGTEHLK Unmodified 1322.7558 0.75580056 3865 Q96HC4;H0Y8Y3;H0YBI4 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 48.228 48.228 2;3 0.0087825 45521 QUIQUE_C1277_190116_001 33.751 17.811 601140000 0 61493000 0 83886000 98015000 90696000 0 55744000 74897000 55889000 0 34365000 46157000 21126 3865 19867 189491;189492;189493;189494;189495;189496;189497;189498;189499;189500 242231;242232;242233;242234;242235;242236;242237;242238;242239;242240 242231 10 ILASDKPYILAEELR Unmodified 1729.9614 0.96143623 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 97.428 97.428 2;3 1.8927E-05 99817 QUIQUE_C1277_190116_001 111.79 81.986 381720000 177370000 49023000 39395000 35732000 35225000 0 44973000 0 0 0 0 0 0 21127 2381 19868 189501;189502;189503;189504;189505;189506;189507 242241;242242;242243;242244;242245;242246;242247 242243 7 ILASDKPYILAEELRR Unmodified 1886.0625 0.062547262 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 2 2 1 1 82.318 82.318 3;4 2.3838E-19 83396 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.56 99.889 117900000 0 0 0 0 0 0 0 70397000 20402000 0 0 0 27103000 21128 2381 19869 189508;189509;189510;189511 242248;242249;242250;242251 242249 4 ILASFFGELLGQEIDPLR Unmodified 2017.0884 0.088427662 660 B7Z4W5;Q16773;Q5T278;Q5T276;Q5T277 CCBL1 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 170.76 170.76 2;3 2.1815E-14 172418 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.05 113.8 656150000 44586000 42607000 0 0 78767000 0 128630000 53329000 65493000 5214100 109480000 51458000 76589000 21129 660 19870 189512;189513;189514;189515;189516;189517;189518;189519;189520;189521;189522;189523;189524;189525;189526;189527 242252;242253;242254;242255;242256;242257;242258;242259;242260;242261;242262;242263;242264;242265;242266;242267;242268;242269;242270 242263 18 ILASPVELALVVMK Unmodified 1481.8891 0.88912291 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.36 156.36 2 5.4499E-05 161185 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.52 100.61 320840000 32060000 20474000 25601000 25889000 33314000 24885000 23683000 23003000 28706000 0 36106000 27866000 19249000 21130 4334 19871 189528;189529;189530;189531;189532;189533;189534;189535;189536;189537;189538;189539 242271;242272;242273;242274;242275;242276;242277;242278;242279;242280;242281;242282;242283 242279 8 ILASTQFEPTAAR Unmodified 1403.7409 0.74087877 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.388 62.388 2 8.0251E-06 62380 QUIQUE_C1438_190116_001 152.54 120.67 981740000 71129000 72150000 133120000 93250000 120960000 75853000 47891000 0 95854000 0 84011000 101200000 86325000 21131 4336 19872 189540;189541;189542;189543;189544;189545;189546;189547;189548;189549;189550 242284;242285;242286;242287;242288;242289;242290;242291;242292;242293;242294;242295 242288 12 ILATGANVILTTGGIDDMCLK Oxidation (M) 2191.1228 0.12284061 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 1 0 1 1 119.54 119.54 2 1.3888E-07 123942 QUIQUE_C1368_190116_001 97.203 82.042 29394000 0 0 18030000 0 0 0 0 0 0 11364000 0 0 0 21132 2132 19873 189551;189552 242296;242297;242298 242296 1468 3 ILATPPQEDAPSVDIANIR Unmodified 2019.0637 0.063669474 2288 P29401;A0A0B4J1R6;E9PFF2 TKT Transketolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 105.4 105.4 2;3 2.531E-63 110307 QUIQUE_DMIX5_190116_001 194.7 185.16 34995000000 2889400000 2591900000 3150900000 2607900000 2938900000 2607100000 2295700000 2081800000 2872800000 1581500000 3727200000 2851900000 2797700000 21133 2288 19874 189553;189554;189555;189556;189557;189558;189559;189560;189561;189562;189563;189564;189565;189566;189567;189568;189569;189570;189571;189572;189573;189574;189575;189576;189577;189578;189579;189580 242299;242300;242301;242302;242303;242304;242305;242306;242307;242308;242309;242310;242311;242312;242313;242314;242315;242316;242317;242318;242319;242320;242321;242322;242323;242324;242325;242326;242327;242328;242329;242330;242331;242332;242333;242334;242335;242336;242337;242338;242339;242340;242341;242342;242343;242344;242345;242346;242347;242348;242349;242350;242351 242340 53 ILAVNSVGLEDVMHEDAVAALK Unmodified 2293.1988 0.19878275 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19;K7EKP9;C9JYG3;A0A3B3ITI9;O14909;K7EKU8 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 135.35 135.35 3 0.011906 140809 QUIQUE_C1576_190116_001 30.21 21.82 62643000 0 0 0 0 0 0 62643000 0 0 0 0 0 0 21134 487 19875 189581 242352 242352 1 ILAVTDFEPTQAR Unmodified 1459.7671 0.76709352 3377 Q6P179;D6RGW0 ERAP2 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 96.536 96.536 2 0.015509 99788 QUIQUE_C1368_190116_001 72.006 52.763 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21135 3377 19876 189582 242353 242353 1 ILAYDEK Unmodified 850.44363 0.44363412 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 27.361 27.361 2 0.038851 21548 QUIQUE_C1403_190116_001 84.244 26.78 161770000 0 0 85398000 76376000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21136 914 19877 189583;189584 242354;242355 242355 2 ILAYDETTQK Unmodified 1180.5976 0.59756858 3603 Q8N608 DPP10 Inactive dipeptidyl peptidase 10 yes yes 0 0 0 1 1 35.834 35.834 2 0.0015194 31423 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.668 57.646 166340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 105960000 60376000 0 21137 3603 19878 189585;189586 242356;242357 242356 2 ILCEELGAPANSAVNCVPLEDFGGHHPDPNLTYAADLVETMK Unmodified 4564.1349 0.13488522 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 150.33 150.33 4 4.2754E-56 154592 QUIQUE_C1277_190116_001 105.37 97.679 1916700000 226260000 217890000 0 340750000 290280000 180180000 223670000 68705000 66183000 0 112570000 0 190170000 21138 2400 19879 189587;189588;189589;189590;189591;189592;189593;189594;189595;189596;189597 242358;242359;242360;242361;242362;242363;242364;242365;242366;242367;242368;242369 242360 12 ILCEELGAPANSAVNCVPLEDFGGHHPDPNLTYAADLVETMK Oxidation (M) 4580.1298 0.12979984 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 1 0 1 1 139.41 139.41 4 4.8086E-05 143602 QUIQUE_C1277_190116_001 45.084 43.879 153370000 0 89232000 0 0 0 64139000 0 0 0 0 0 0 0 21139 2400 19879 189598;189599 242370;242371 242370 1808 2 ILCFYGPPGVGK Unmodified 1306.6744 0.67437911 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.582 93.582 2 0.00052022 95475 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.551 54.246 1344200000 110630000 99316000 144990000 84880000 89798000 98960000 109400000 83118000 110640000 0 145480000 126640000 140310000 21140 1324 19880 189600;189601;189602;189603;189604;189605;189606;189607;189608;189609;189610;189611 242372;242373;242374;242375;242376;242377;242378;242379;242380;242381;242382;242383 242379 11 ILCLFRPQSGR Unmodified 1345.7289 0.7288743 1133 H0Y8X4;O43598 DNPH1 2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 59.703 59.703 2;3 0.00071071 58875 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.862 56.452 2621600000 85630000 148910000 183890000 107060000 212320000 82142000 171370000 229960000 247200000 93853000 435540000 327010000 296780000 21141 1133 19881 189612;189613;189614;189615;189616;189617;189618;189619;189620;189621;189622;189623;189624;189625;189626;189627 242384;242385;242386;242387;242388;242389;242390;242391;242392;242393;242394;242395;242396;242397;242398;242399;242400;242401;242402 242397 15 ILCPFDADGHYFIDR Unmodified 1837.8458 0.84575455 3706 Q8WVF5 KCTD4 BTB/POZ domain-containing protein KCTD4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 110.67 110.67 3 0.00044207 114225 QUIQUE_C1277_190116_001 69.331 61.417 87784000 0 22258000 25735000 0 17533000 0 22259000 0 0 0 0 0 0 21142 3706 19882 189628;189629;189630;189631 242403;242404;242405;242406 242403 3 ILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAMVLLGAK Unmodified 3227.6141 0.6141104 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 168.35 168.35 3 6.3692E-36 175553 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.83 103.07 1449400000 0 0 0 0 0 0 66169000 149900000 76056000 0 337380000 196560000 623310000 21143 2564 19883 189632;189633;189634;189635;189636;189637 242407;242408;242409;242410;242411;242412 242410 6 ILCQEEQDAYR Unmodified 1423.6402 0.64017845 2481 P46736;X6RJS7;A0A087WZR3;H9KVA9;A0A0D9SF50 BRCC3 Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 40.729 40.729 2 0.00074623 36558 QUIQUE_C1277_190116_001 96.331 84.841 195970000 41904000 43707000 0 59775000 0 37439000 0 0 0 13146000 0 0 0 21144 2481 19884 189638;189639;189640;189641;189642 242413;242414;242415;242416;242417 242414 5 ILCQEEQDAYRR Unmodified 1579.7413 0.74128948 2481 P46736;X6RJS7;A0A087WZR3;H9KVA9;A0A0D9SF50 BRCC3 Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36 yes no 0 0 1 1 30.307 30.307 3 0.020842 25007 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.878 12.78 28526000 0 0 0 0 0 0 0 28526000 0 0 0 0 0 21145 2481 19885 189643 242418 242418 1 ILDAAGANLK Unmodified 984.5604 0.56039521 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 41.996 41.996 1;2 1.1391E-12 39229 QUIQUE_DMIX1_190116_001 197.66 104.97 7150600000 487950000 473820000 602630000 593350000 493250000 522760000 544910000 481100000 670380000 235390000 817060000 607900000 620050000 21146 4405 19886 189644;189645;189646;189647;189648;189649;189650;189651;189652;189653;189654;189655;189656;189657;189658;189659;189660;189661;189662;189663;189664;189665 242419;242420;242421;242422;242423;242424;242425;242426;242427;242428;242429;242430;242431;242432;242433;242434;242435;242436;242437;242438;242439;242440 242432 7 ILDAVVAQEPLHR Unmodified 1459.8147 0.81471242 3099 Q15029;K7EP67;K7EJ74 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes no 0 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189689;189690;189691;189692;189693;189694;189695;189696;189697;189698;189699 242466;242467;242468;242469;242470;242471;242472;242473;242474;242475;242476;242477;242478;242479;242480;242481 242472 16 ILDDDTIITTLENLKR Unmodified 1872.0204 0.020407676 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;A0A2R8Y542 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 142.24 142.24 2;3 1.8605E-11 147151 QUIQUE_DMIX8_190116_001 121.99 103.62 2409000000 20211000 48440000 169900000 79518000 96662000 62569000 93336000 367620000 369970000 41093000 464360000 335020000 260250000 21149 3053 19889 189700;189701;189702;189703;189704;189705;189706;189707;189708;189709;189710;189711;189712;189713;189714 242482;242483;242484;242485;242486;242487;242488;242489;242490;242491;242492;242493;242494;242495;242496;242497;242498;242499 242499 13 ILDDEAAQELMPVVAGAVFTLTAHLSQAVLTEQK Unmodified 3607.8807 0.88074966 3742 Q92621 NUP205 Nuclear pore complex protein Nup205 yes yes 0 0 0 1 179.53 179.53 4 0.0084808 186241 QUIQUE_DMIX5_190116_001 25.688 16.998 7941600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7941600 0 0 21150 3742 19890 189715 242500 242500 1 ILDDLSPR Unmodified 927.50255 0.50254598 669 B7ZKJ8;Q14624;H7C0L5 ITIH4 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 yes no 0 0 0 1 56.372 56.372 2 0.061928 51457 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.786 18.081 23790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23790000 0 0 0 21151 669 19891 189716 242501 242501 1 ILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVR Unmodified 3886.8216 0.82159657 2414 P38606;C9JVW8 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 1 2 2 4 1 3 1 1 1 1 1 1 1 155.92 155.92 3;4 0 160226 QUIQUE_C1277_190116_001 265.77 256.27 2661200000 69858000 932500000 0 663650000 79036000 438780000 64813000 50950000 61295000 46135000 93893000 78411000 81892000 21152 2414 19892 189717;189718;189719;189720;189721;189722;189723;189724;189725;189726;189727;189728;189729;189730;189731;189732;189733;189734;189735 242502;242503;242504;242505;242506;242507;242508;242509;242510;242511;242512;242513;242514;242515;242516;242517;242518;242519;242520;242521;242522;242523;242524;242525;242526 242508 25 ILDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVR Oxidation (M) 3902.8165 0.8165112 2414 P38606;C9JVW8 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 1 1 1 2 1 1 1 1 140.09 140.09 4 7.4738E-32 144227 QUIQUE_C1277_190116_001 86.081 81.68 425120000 0 77127000 109860000 0 0 0 53961000 0 0 39935000 0 55282000 88949000 21153 2414 19892 189736;189737;189738;189739;189740;189741;189742 242527;242528;242529;242530;242531;242532;242533;242534;242535 242527 1825 9 ILDEIEEHNIK Unmodified 1351.6983 0.69834526 640;3097 B5MCX3;C9J2Q4;H7C2Y0;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 52.892 52.892 2;3 2.9129E-12 50957 QUIQUE_C1368_190116_001 157.96 78.05 20923000000 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72417000 46568000 81811000 21155 1254 19894 189769;189770;189771;189772;189773;189774;189775;189776;189777;189778;189779;189780;189781 242582;242583;242584;242585;242586;242587;242588;242589;242590;242591;242592;242593;242594;242595;242596 242583 13 ILDGGNPFLDVPQALSATTYK Unmodified 2219.1474 0.1473991 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 149.74 149.74 2;3 4.1325E-07 152695 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.38 104.11 170600000 0 0 0 0 0 0 0 55369000 34541000 0 0 46313000 34373000 21156 3997 19895 189782;189783;189784;189785;189786 242597;242598;242599;242600;242601;242602 242597 6 ILDHQQQMTVLDQTK Unmodified 1796.9091 0.90908309 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 55.023 55.023 2;3 5.8285E-79 53608 QUIQUE_C1576_190116_001 206.46 181.03 226770000 23244000 24667000 26126000 0 0 21829000 90553000 40346000 0 0 0 0 0 21157 4606 19896 189787;189788;189789;189790;189791;189792;189793;189794 242603;242604;242605;242606;242607;242608;242609;242610 242608 8 ILDIDIPMSVGIIDPR Unmodified 1765.9648 0.96480705 2945 Q12800;F8VWL0;F8VX55 TFCP2 Alpha-globin transcription factor CP2 yes no 0 0 0 1 1 155.63 155.63 2 0.0021501 163118 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.522 56.564 42328000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24085000 18243000 0 21158 2945 19897 189795;189796 242611;242612;242613 242612 3 ILDIDNVDLAMGK Unmodified 1415.733 0.7330162 1535 O43615 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes yes 0 0 0 1 1 1 117.84 117.84 2 0.0031632 123874 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.841 50.811 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21159 1535 19898 189797;189798;189799 242614;242615;242616 242615 3 ILDIGLAYINHLVER Unmodified 1737.9778 0.977755 2541 P49754 VPS41 Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog yes yes 0 0 0 1 141.95 141.95 3 0.044498 146492 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.7 21.779 25692000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25692000 0 21160 2541 19899 189800 242617 242617 1 ILDILGETCK Unmodified 1160.6111 0.61111015 3138;3045 Q15424;Q14151 SAFB;SAFB2 Scaffold attachment factor B1;Scaffold attachment factor B2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 88.438 88.438 2 0.009586 91652 QUIQUE_C1438_190116_001 70.028 36.232 219060000 0 55982000 0 43850000 39494000 36476000 0 0 0 0 0 0 43259000 21161 3138;3045 19900 189801;189802;189803;189804;189805;189806;189807 242618;242619;242620;242621;242622;242623;242624 242621 5 ILDKCNEIINWLDK Unmodified 1772.9131 0.91310583 2010;558 A8K7Q2;E9PS65;E9PM13;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 1 2 1 1 2 114.08 114.08 2;3 9.2868E-05 117158 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.734 61.013 418260000 0 0 0 0 0 0 0 68549000 109370000 0 174450000 65885000 0 21162 558;2010 19901 189808;189809;189810;189811;189812;189813 242625;242626;242627;242628;242629;242630 242626 5 ILDKCQEVINWLDR Unmodified 1800.9193 0.91925384 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 1 1 110.81 110.81 3 0.00051321 113136 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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189816;189817;189818;189819;189820;189821;189822;189823;189824;189825;189826;189827;189828;189829;189830;189831;189832;189833;189834;189835;189836;189837;189838;189839;189840;189841;189842;189843;189844;189845;189846;189847;189848;189849;189850;189851;189852;189853;189854;189855;189856;189857;189858;189859;189860;189861;189862;189863;189864;189865;189866 242633;242634;242635;242636;242637;242638;242639;242640;242641;242642;242643;242644;242645;242646;242647;242648;242649;242650;242651;242652;242653;242654;242655;242656;242657;242658;242659;242660;242661;242662;242663;242664;242665;242666;242667;242668;242669;242670;242671;242672;242673;242674;242675;242676;242677;242678;242679;242680;242681;242682;242683;242684;242685;242686;242687;242688;242689;242690;242691;242692;242693;242694;242695;242696;242697;242698;242699;242700;242701;242702;242703;242704;242705;242706;242707;242708;242709;242710;242711;242712;242713;242714;242715;242716;242717;242718;242719;242720;242721;242722;242723;242724;242725;242726;242727;242728;242729;242730;242731;242732;242733;242734;242735;242736;242737;242738;242739;242740;242741;242742;242743;242744;242745;242746;242747;242748;242749;242750;242751;242752;242753;242754;242755;242756;242757;242758;242759;242760;242761;242762;242763;242764;242765;242766;242767;242768;242769;242770;242771;242772;242773;242774;242775;242776;242777 242753 145 ILDLIESGK Unmodified 986.56481 0.56481189 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 74.644 74.644 2 0.008597 71261 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.334 42.979 1482800000 223640000 161230000 146790000 212970000 158170000 203840000 160900000 0 0 215290000 0 0 0 21166 1776 19905 189867;189868;189869;189870;189871;189872;189873;189874 242778;242779;242780;242781;242782;242783;242784;242785 242785 8 ILDLIESGKK Unmodified 1114.6598 0.65977491 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.489 47.489 3 0.00033117 44448 QUIQUE_C1368_190116_001 101.97 73.266 4701500000 177280000 255700000 283560000 318370000 396800000 272060000 336420000 503340000 507170000 125480000 639400000 492350000 393600000 21167 1776 19906 189875;189876;189877;189878;189879;189880;189881;189882;189883;189884;189885;189886;189887 242786;242787;242788;242789;242790;242791;242792;242793;242794;242795;242796;242797;242798;242799;242800 242788 14 ILDLVISCFK Unmodified 1206.6682 0.6682311 413 A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RB22;D6RJE6;A0A2R8Y4X6;A0A2R8Y5E8 HARS2 Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 128.83 128.83 2 0.0044813 125270 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.629 59.257 10012000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10012000 0 0 0 21168 413 19907 189888 242801 242801 1 ILDNLMEMK Unmodified 1105.5512 0.55115243 3708 Q8WVM8 SCFD1 Sec1 family domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.558 95.558 2 0.0050274 96887 QUIQUE_C1563_190116_001 87.639 61.7 187580000 24803000 0 19434000 19708000 20444000 19694000 21411000 0 0 0 21222000 17325000 23540000 21169 3708 19908 189889;189890;189891;189892;189893;189894;189895;189896;189897;189898 242802;242803;242804;242805;242806;242807;242808;242809;242810;242811;242812 242806 11 ILDNTSEPQPGEAR Unmodified 1525.7372 0.73724996 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.816 36.816 2 2.7201E-22 32266 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189913;189914;189915;189916;189917;189918;189919;189920 242827;242828;242829;242830;242831;242832;242833;242834;242835 242827 6 ILDQSEAEK Unmodified 1031.5135 0.5135046 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.667 19.667 2 0.00025853 12445 QUIQUE_DMIX7_190116_001 137.9 75.189 781120000 120940000 0 0 0 0 0 143090000 0 0 92840000 235360000 80509000 108390000 21173 3086 19912 189921;189922;189923;189924;189925;189926 242836;242837;242838;242839;242840;242841 242840 2 ILDSAEFIK Unmodified 1034.5648 0.56481189 2805 P78347 GTF2I General transcription factor II-I yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 78.03 78.03 2 0.010177 80027 QUIQUE_C1438_190116_001 74.486 34.944 292950000 59235000 55391000 0 41049000 42743000 0 0 0 0 0 0 44832000 49702000 21174 2805 19913 189927;189928;189929;189930;189931;189932;189933 242842;242843;242844;242845;242846;242847;242848;242849 242847 6 ILDSVGIEADDDRLNK Unmodified 1771.8952 0.89520716 1887 P05387 RPLP2 60S acidic ribosomal protein P2 yes yes 0 0 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transfer protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 89.438 89.438 2 0.012404 93206 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.379 28.379 29609000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29609000 0 0 21177 1418 19916 189959;189960;189961 242876;242877;242878;242879 242878 4 ILDVASLEVLNEVNRR Unmodified 1839.0214 0.021410729 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 1 1 118.39 118.39 3 0.045613 124633 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.956 10.592 24295000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24295000 0 0 21178 3740 19917 189962 242880 242880 1 ILDVGCGGGLLTEPLGR Unmodified 1725.9084 0.90835481 4347 Q9NZJ6 COQ3 Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 123.52 123.52 2 0.0002738 129577 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.22 76.236 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21179 4347 19918 189963;189964 242881;242882 242882 2 ILDVLEEIPK Unmodified 1167.6751 0.67509062 3191 Q16718;A0A087X1G1;H7BYD0;F8WAS3;C9IZN5 NDUFA5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.72 121.72 2 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242962;242963;242964;242965;242966;242967;242968;242969;242970;242971;242972;242973;242974;242975 242963 13 ILEAHQNVAQMSLIEAK Oxidation (M) 1909.9931 0.99314707 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8;H0YJB6 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 1 0 1 55.808 55.808 3 0.0026905 50861 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.907 37.863 17878000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17878000 0 0 0 21186 3800 19924 190038 242976 242976 2739 1 ILEDLNVDEFEEIFK Unmodified 1851.9142 0.91421127 3921 Q96PY5;C9IZY8 FMNL2 Formin-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 164.15 164.15 2 1.2252E-08 169381 QUIQUE_C1218_190116_001 140.08 115.7 412310000 54358000 67405000 0 0 75707000 18779000 0 53565000 0 0 142490000 0 0 21187 3921 19925 190039;190040;190041;190042;190043;190044;190045;190046 242977;242978;242979;242980;242981;242982;242983;242984;242985 242977 9 ILEDNSIPQVK Unmodified 1254.682 0.68196691 2013 P11177 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.196 62.196 2 2.1417E-08 61363 QUIQUE_C1403_190116_001 155.42 108.99 6851200000 617830000 509360000 607740000 482570000 428860000 581010000 607300000 421910000 554870000 204820000 634500000 533970000 666420000 21188 2013 19926 190047;190048;190049;190050;190051;190052;190053;190054;190055;190056;190057;190058;190059;190060 242986;242987;242988;242989;242990;242991;242992;242993;242994;242995;242996;242997;242998;242999;243000;243001;243002;243003;243004;243005;243006;243007;243008;243009;243010;243011;243012;243013;243014;243015;243016 242995 31 ILEDQEENPLPAALVQPHTGK Unmodified 2298.1856 0.18557552 1723 O95336;M0R1L2 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 3 1 3 2 1 2 4 1 90.296 90.296 2;3 1.8563E-42 92771 QUIQUE_C1368_190116_001 179.79 159.41 3872800000 236800000 230400000 264620000 266160000 348120000 197020000 276440000 423210000 274000000 182350000 324190000 537970000 311530000 21189 1723 19927 190061;190062;190063;190064;190065;190066;190067;190068;190069;190070;190071;190072;190073;190074;190075;190076;190077;190078;190079;190080;190081;190082;190083;190084;190085 243017;243018;243019;243020;243021;243022;243023;243024;243025;243026;243027;243028;243029;243030;243031;243032;243033;243034;243035;243036;243037;243038;243039;243040;243041;243042;243043;243044;243045;243046;243047;243048;243049;243050;243051;243052;243053;243054;243055;243056 243026 40 ILEEPHPLMFQK Unmodified 1480.7748 0.77482144 1540 O43665 RGS10 Regulator of G-protein signaling 10 yes yes 0 0 0 1 72.805 72.805 3 0.035509 73133 QUIQUE_C1277_190116_001 34.501 19.299 30623000 0 30623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21190 1540 19928 190086 243057 243057 0 ILEFFGLK Unmodified 965.5586 0.5586043 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3;I3L398;I3L4M2 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.02 126.02 2 0.0036392 130544 QUIQUE_C1277_190116_001 117.17 56.208 3056800000 286280000 277120000 253390000 289120000 301640000 281800000 237720000 121810000 209290000 108640000 258980000 206750000 224210000 21191 1917 19929 190087;190088;190089;190090;190091;190092;190093;190094;190095;190096;190097;190098;190099 243058;243059;243060;243061;243062;243063;243064;243065;243066;243067;243068;243069;243070;243071;243072;243073;243074;243075;243076;243077;243078;243079;243080;243081;243082;243083;243084 243061 27 ILEFFGLKK Unmodified 1093.6536 0.65356732 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3;I3L398;I3L4M2 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 88.904 88.904 3 0.0041268 90622 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.419 40.889 140520000 0 0 0 0 0 0 0 34762000 26382000 0 26727000 21763000 30887000 21192 1917 19930 190100;190101;190102;190103;190104 243085;243086;243087;243088;243089;243090 243089 6 ILEFIAVSQLR Unmodified 1287.7551 0.75507227 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.86 124.86 2 0.00067123 130464 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QUIQUE_C1277_190116_001 94.662 16.914 737080000 0 208170000 0 0 145850000 0 0 0 118560000 79988000 0 184510000 0 21195 921 19933 190119;190120;190121;190122;190123 243108;243109;243110;243111;243112;243113;243114 243108 7 ILEHDDVSYLK Unmodified 1330.6769 0.67688153 3907 Q96MZ0;H0Y6A7;H0UIB3;Q5TE61 GDAP1L1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1 yes no 0 0 0 1 51.806 51.806 2 0.0045695 49544 QUIQUE_C1277_190116_001 76.572 44.252 31253000 0 31253000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21196 3907 19934 190124 243115;243116 243115 2 ILEHFLETIR Unmodified 1269.7081 0.70812208 653 B7Z278;Q8WZA2 RAPGEF4 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 no no 0 0 0 1 1 1 96.197 96.197 3 0.0035252 98921 QUIQUE_C1218_190116_001 58.676 34.333 12011000 12011000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21197 653 19935 190125;190126;190127 243117;243118;243119 243117 3 ILEIEDLFSSLK Unmodified 1405.7704 0.77044757 3583 Q8N3R9;G3V2H1 MPP5 MAGUK p55 subfamily member 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.59 159.59 2 9.3912E-06 162009 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.28 74.721 444170000 28689000 35919000 31483000 19847000 31340000 46729000 39618000 32953000 50926000 8660500 41231000 33579000 43199000 21198 3583 19936 190128;190129;190130;190131;190132;190133;190134;190135;190136;190137;190138;190139;190140 243120;243121;243122;243123;243124;243125;243126;243127;243128;243129;243130;243131;243132;243133;243134 243128 15 ILELDQELIK Unmodified 1212.6966 0.69655434 3762 Q92878;A0A1W2PQ90;E7EN38;E7ESD9 RAD50 DNA repair protein RAD50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.94 102.94 2 0.0055595 106073 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.496 44.688 227470000 35186000 0 28150000 16302000 18933000 16590000 18331000 22199000 28993000 12610000 16134000 0 14041000 21199 3762 19937 190141;190142;190143;190144;190145;190146;190147;190148;190149;190150;190151 243135;243136;243137;243138;243139;243140;243141;243142;243143;243144;243145 243142 7 ILELDQFK Unmodified 1004.5542 0.5542472 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.995 88.995 2 0.0036109 90793 QUIQUE_C1403_190116_001 114.6 25.66 2861500000 266350000 0 332710000 215300000 215710000 224180000 254540000 154580000 214450000 157620000 322190000 294360000 209480000 21200 2050 19938 190152;190153;190154;190155;190156;190157;190158;190159;190160;190161;190162;190163 243146;243147;243148;243149;243150;243151;243152;243153;243154;243155;243156;243157;243158;243159 243149 14 ILELIQSGVAEGAK Unmodified 1426.8031 0.80314468 1169 H0YMG7;O94788 ALDH1A2 Retinal dehydrogenase 2 yes no 0 0 0 1 94.318 94.318 2 0.010564 96136 QUIQUE_C1403_190116_001 72.34 37.071 27389000 0 0 0 27389000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21201 1169 19939 190164 243160 243160 1 ILELLRPDPNTGK Unmodified 1464.83 0.83002813 3135 Q15393;I3L4G7 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 70.209 70.209 2;3 0.00029949 70460 QUIQUE_C1368_190116_001 83.204 61.572 531660000 0 55724000 61789000 0 85218000 54936000 49095000 0 43143000 21309000 55429000 48341000 56678000 21202 3135 19940 190165;190166;190167;190168;190169;190170;190171;190172;190173;190174;190175;190176;190177 243161;243162;243163;243164;243165;243166;243167;243168;243169;243170;243171;243172;243173;243174;243175 243164 15 ILELNQEDFSVVVEPGVTR Unmodified 2143.1161 0.11609898 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 135.93 135.93 2 1.0318E-07 138799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.07 102.03 31014000 0 0 0 0 0 0 0 20167000 0 10847000 0 0 0 21203 3511 19941 190178;190179 243176;243177 243176 1 ILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFR Oxidation (M) 2966.4808 0.48077127 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 1 2 2 2 2 2 3 1 2 2 2 2 2 2 108.95 108.95 3;4 2.1428E-77 111970 QUIQUE_DMIX8_190116_001 164.43 131.24 5904000000 351220000 543530000 496360000 345830000 461670000 345660000 102120000 362740000 617740000 275480000 859030000 651140000 491440000 21204 3050 19942 190180;190181;190182;190183;190184;190185;190186;190187;190188;190189;190190;190191;190192;190193;190194;190195;190196;190197;190198;190199;190200;190201;190202;190203;190204;190205 243178;243179;243180;243181;243182;243183;243184;243185;243186;243187;243188;243189;243190;243191;243192;243193;243194;243195;243196;243197;243198;243199;243200;243201;243202;243203;243204;243205;243206;243207;243208;243209;243210;243211;243212;243213;243214;243215;243216;243217;243218;243219;243220 243220 2477 43 ILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFR Unmodified 2950.4859 0.48585664 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 1 3 2 2 2 2 2 2 2 3 1 4 3 3 122 122 2;3;4 1.057E-64 124903 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.59 138.83 25227000000 1908200000 2377300000 2059400000 1803300000 1560600000 1421900000 1995900000 2131100000 2098800000 298320000 2360300000 3015600000 2196000000 21205 3050 19942 190206;190207;190208;190209;190210;190211;190212;190213;190214;190215;190216;190217;190218;190219;190220;190221;190222;190223;190224;190225;190226;190227;190228;190229;190230;190231;190232;190233;190234;190235;190236 243221;243222;243223;243224;243225;243226;243227;243228;243229;243230;243231;243232;243233;243234;243235;243236;243237;243238;243239;243240;243241;243242;243243;243244;243245;243246;243247;243248;243249;243250;243251;243252;243253;243254;243255;243256;243257;243258;243259;243260;243261;243262;243263;243264;243265;243266;243267;243268;243269;243270;243271;243272;243273;243274;243275;243276;243277;243278;243279;243280;243281;243282 243258 62 ILENEKDLEEAEEYK Unmodified 1850.8786 0.87855405 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 3 1 1 1 1 1 69.679 69.679 2;3 3.1905E-78 69392 QUIQUE_C1368_190116_001 222.74 188.85 296740000 43387000 0 38037000 57297000 0 0 46228000 0 0 23701000 45784000 42307000 0 21206 843 19943 190237;190238;190239;190240;190241;190242;190243;190244;190245;190246;190247;190248;190249;190250;190251 243283;243284;243285;243286;243287;243288;243289;243290;243291;243292;243293;243294;243295;243296;243297 243285 14 ILENEKDLEEAEEYKEAR Unmodified 2207.0594 0.059371958 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 0 2 1 1 1 2 2 2 2 1 61.595 61.595 3;4 6.6824E-10 60863 QUIQUE_C1277_190116_001 100.77 75.989 1667400000 0 78892000 50815000 0 0 0 84984000 342030000 355930000 0 311050000 266780000 176910000 21207 843 19944 190252;190253;190254;190255;190256;190257;190258;190259;190260;190261;190262;190263 243298;243299;243300;243301;243302;243303;243304;243305;243306;243307;243308;243309 243298 9 ILENPQSLSDPNNYHEFCR Unmodified 2332.0542 0.054243775 4447 Q9UIA9;E7ESC6 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 90.684 90.684 3 0.018361 93309 QUIQUE_C1576_190116_001 33.667 24.62 253030000 62837000 0 0 0 0 0 48278000 72631000 0 0 69281000 0 0 21208 4447 19945 190264;190265;190266;190267 243310;243311;243312;243313 243311 4 ILENVEVK Unmodified 942.5386 0.53859714 2926 Q08752 PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D yes yes 0 0 0 1 1 41.592 41.592 2 0.018957 38186 QUIQUE_C1218_190116_001 79.116 16.274 99966000 49552000 0 0 50414000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21209 2926 19946 190268;190269 243314;243315 243314 2 ILEPGLNILIPVLDR Unmodified 1674.008 0.0079924964 4466 Q9UJZ1 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 159.91 159.91 2;3 0.00021855 165383 QUIQUE_C1368_190116_001 102.97 77.311 3059600000 225830000 202570000 260840000 151640000 344580000 192210000 207100000 139400000 236640000 173030000 303980000 247190000 374560000 21210 4466 19947 190270;190271;190272;190273;190274;190275;190276;190277;190278;190279;190280;190281;190282;190283;190284;190285;190286;190287;190288;190289;190290;190291;190292;190293 243316;243317;243318;243319;243320;243321;243322;243323;243324;243325;243326;243327;243328;243329;243330;243331;243332;243333;243334;243335;243336;243337;243338;243339;243340;243341;243342 243322 26 ILEPPEGQDEGVWK Unmodified 1595.7831 0.78313752 4746 S4R3N1;Q9Y3A3 HSPE1-MOB4;MOB4 MOB-like protein phocein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.97 83.97 2 4.6676E-09 85656 QUIQUE_C1277_190116_001 138.71 124.78 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21211 4746 19948 190294;190295;190296;190297;190298 243343;243344;243345;243346;243347 243344 5 ILEQEAGMLLPR Unmodified 1368.7435 0.74352131 1450 O14841;A0A087WY99 OPLAH 5-oxoprolinase yes no 0 0 0 2 106.08 106.08 2 0.031757 109454 QUIQUE_C1218_190116_001 54.066 39.387 18766000 18766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21212 1450 19949 190299;190300 243348;243349 243349 2 ILEQEEEEEQAGKPGEPSK Unmodified 2126.0015 0.0015227276 4063 Q9BXP5 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.408 36.408 3 2.8642E-28 31949 QUIQUE_C1438_190116_001 122.57 95.761 800650000 54131000 86706000 68509000 63848000 113910000 77198000 58809000 47900000 96504000 37683000 54411000 41043000 0 21213 4063 19950 190301;190302;190303;190304;190305;190306;190307;190308;190309;190310;190311;190312 243350;243351;243352;243353;243354;243355;243356;243357;243358;243359;243360;243361;243362;243363;243364 243356 15 ILEQEEEEEQAGKPGEPSKK Unmodified 2254.0965 0.096485745 4063 Q9BXP5 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes yes 0 0 2 1 25.942 25.942 3 0.030108 19936 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.702 21.909 26400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26400000 0 21214 4063 19951 190313 243365 243365 1 ILEQENEHLNQTVSSLR Unmodified 2009.0178 0.017781914 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YGU1;A0A087WXD9;A0A2R8YG52;A0A2R8Y6B2;A0A2R8Y7D9 CCDC88A Girdin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.009 72.009 3 4.7707E-31 72179 QUIQUE_C1277_190116_001 143.02 116.21 380740000 53157000 50761000 45926000 40417000 0 0 0 43661000 50478000 16275000 0 41971000 38091000 21215 473 19952 190314;190315;190316;190317;190318;190319;190320;190321;190322 243366;243367;243368;243369;243370;243371;243372;243373;243374 243367 6 ILEQMAESVLSLHVPR Unmodified 1820.9819 0.9818541 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 135.59 135.59 3 4.4294E-06 138643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.53 84.998 584010000 56818000 74470000 28443000 47078000 34236000 0 68612000 55402000 77051000 12444000 68263000 61195000 0 21216 3916 19953 190323;190324;190325;190326;190327;190328;190329;190330;190331;190332;190333;190334 243375;243376;243377;243378;243379;243380;243381;243382;243383;243384;243385;243386;243387 243381 11 ILESELLR Unmodified 971.56515 0.56514624 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 69.733 69.733 2 0.03991 69622 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.953 18.532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21217 3997 19954 190335 243388 243388 1 ILETLYTLGK Unmodified 1149.6645 0.66452593 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19958 190340;190341 243393;243394 243393 2 ILEVNHVNVEGATHK Unmodified 1658.874 0.87401821 3899 Q96L92 SNX27 Sorting nexin-27 yes yes 0 0 0 1 31.715 31.715 3 0.052568 26789 QUIQUE_C1368_190116_001 29.844 6.3553 156000000 0 0 156000000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21222 3899 19959 190342 243395 243395 1 ILEVVNQIQDEER Unmodified 1583.8155 0.81550028 1699 O94919 ENDOD1 Endonuclease domain-containing 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.588 91.588 2 4.8594E-41 93422 QUIQUE_DMIX7_190116_001 188.28 124.46 1598200000 123090000 152940000 155720000 168420000 89056000 135080000 137560000 0 157170000 57197000 173120000 106360000 142440000 21223 1699 19960 190343;190344;190345;190346;190347;190348;190349;190350;190351;190352;190353;190354 243396;243397;243398;243399;243400;243401;243402;243403;243404;243405;243406;243407;243408;243409;243410;243411;243412;243413 243411 17 ILEWIEGK Unmodified 986.54368 0.54368251 1607 O75061 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes yes 0 0 0 1 1 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87.438 87.438 2 6.1234E-66 87098 QUIQUE_C1368_190116_001 202.65 166.71 17823000000 1908500000 1999600000 1337600000 999580000 1121100000 1444300000 1297800000 1335300000 1302600000 967960000 1654400000 1350400000 1104100000 21242 1351;2243 19979 190523;190524;190525;190526;190527;190528;190529;190530;190531;190532;190533;190534;190535;190536;190537;190538;190539;190540;190541;190542;190543;190544;190545;190546;190547;190548;190549;190550;190551;190552;190553;190554;190555;190556;190557;190558;190559;190560;190561;190562;190563;190564;190565;190566;190567;190568;190569;190570;190571;190572;190573 243637;243638;243639;243640;243641;243642;243643;243644;243645;243646;243647;243648;243649;243650;243651;243652;243653;243654;243655;243656;243657;243658;243659;243660;243661;243662;243663;243664;243665;243666;243667;243668;243669;243670;243671;243672;243673;243674;243675;243676;243677;243678;243679;243680;243681;243682;243683;243684;243685;243686;243687;243688;243689;243690;243691;243692;243693;243694;243695;243696;243697;243698;243699;243700;243701;243702;243703;243704;243705;243706;243707;243708;243709;243710;243711;243712;243713;243714;243715;243716;243717;243718;243719;243720;243721;243722 243652 86 ILGAWLAEETSSLR Unmodified 1544.8199 0.81985738 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 0 6 5 2 3 3 4 3 6 2 5 3 3 3 121.11 121.11 2;3 1.0801E-22 146092 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.59 105.62 6600600000 555330000 512430000 389210000 351260000 781630000 271920000 1227700000 252690000 228600000 362250000 649120000 556720000 461740000 21243 4393 19980 190574;190575;190576;190577;190578;190579;190580;190581;190582;190583;190584;190585;190586;190587;190588;190589;190590;190591;190592;190593;190594;190595;190596;190597;190598;190599;190600;190601;190602;190603;190604;190605;190606;190607;190608;190609;190610;190611;190612;190613;190614;190615;190616;190617;190618;190619;190620;190621 243723;243724;243725;243726;243727;243728;243729;243730;243731;243732;243733;243734;243735;243736;243737;243738;243739;243740;243741;243742;243743;243744;243745;243746;243747;243748;243749;243750;243751;243752;243753;243754;243755;243756;243757;243758;243759;243760;243761;243762;243763;243764;243765;243766;243767;243768;243769;243770;243771;243772;243773;243774;243775;243776;243777;243778;243779;243780;243781;243782;243783;243784;243785;243786;243787;243788;243789;243790;243791 243789 68 ILGAWLAEETSSLRK Unmodified 1672.9148 0.91482039 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 117.74 117.74 2;3 1.0611E-13 120597 QUIQUE_DMIX5_190116_001 140.82 118.63 1091700000 18187000 60556000 0 54947000 111570000 31525000 0 169180000 190320000 10902000 336650000 43953000 63907000 21244 4393 19981 190622;190623;190624;190625;190626;190627;190628;190629;190630;190631;190632;190633;190634 243792;243793;243794;243795;243796;243797;243798;243799;243800;243801;243802;243803;243804;243805;243806;243807;243808;243809;243810 243806 17 ILGDINSDFTR Unmodified 1249.6303 0.63026569 2833 P86791;P86790 CCZ1;CCZ1B Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog;Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B yes no 0 0 0 1 1 84.491 84.491 2 0.026337 86659 QUIQUE_C1368_190116_001 58.699 25.807 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21245 2833 19982 190635;190636 243811;243812 243811 2 ILGDPEALR Unmodified 982.54475 0.54474515 3146 Q15582;H0Y8L3;S4R3C6;H0Y9D7 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 0 1 18.293 18.293 2 0.041258 10976 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.166 16.146 155160000 0 0 0 0 0 0 0 155160000 0 0 0 0 0 21246 3146 19983 190637 243813 243813 1 ILGEELGFASLHDLQLLGK Unmodified 2052.1255 0.12554145 1854 P04114;A8MUN2 APOB Apolipoprotein B-100;Apolipoprotein B-48 yes no 0 0 0 1 152.85 152.85 3 0.0079052 155376 QUIQUE_C1563_190116_001 32.565 23.948 16550000 0 0 0 0 0 16550000 0 0 0 0 0 0 0 21247 1854 19984 190638 243814 243814 1 ILGEGFFGEVYEGVYTNHK Unmodified 2158.0371 0.037120373 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 135.29 135.29 3 0.00044781 141101 QUIQUE_C1218_190116_001 60.034 38.501 167150000 34528000 0 0 38829000 0 0 59175000 0 0 0 0 34613000 0 21248 3060 19985 190639;190640;190641;190642 243815;243816;243817;243818 243815 4 ILGEVISALK Unmodified 1041.6434 0.64339656 3865 Q96HC4;A0A0A0MSP3 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 0 1 101.76 101.76 2 0.0548 98584 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.299 13.896 14397000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14397000 0 0 0 21249 3865 19986 190643 243819 243819 0 ILGFSTSAK Unmodified 922.51238 0.51238239 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 83.406 83.406 2 0.023392 84799 QUIQUE_C1277_190116_001 60.76 3.5824 63091000 0 22023000 0 0 0 0 18088000 0 0 0 0 22980000 0 21250 3422 19987 190644;190645;190646 243820;243821;243822 243820 3 ILGGHLDAK Unmodified 922.52362 0.52361577 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;A0A087WU08;P00739;A0A0A0MRD9 HP;HPR Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain;Haptoglobin-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 20.524 20.524 1;2 0.0015563 13084 QUIQUE_C1563_190116_001 102.51 35.521 2080800000 0 0 0 0 0 251600000 0 238780000 0 264000000 1326400000 0 0 21251 1793 19988 190647;190648;190649;190650;190651 243823;243824;243825;243826;243827 243823 3 ILGGSVLHLVLALR Unmodified 1459.9239 0.92386894 3166 Q15843 NEDD8 NEDD8 yes yes 0 0 0 1 1 2 3 2 2 1 151.16 151.16 2;3 0.00029253 157069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.466 76.904 211600000 9893500 0 0 0 0 0 0 10702000 62412000 0 85376000 20287000 22931000 21252 3166 19989 190652;190653;190654;190655;190656;190657;190658;190659;190660;190661;190662;190663 243828;243829;243830;243831;243832;243833;243834;243835;243836;243837;243838;243839 243830 11 ILGGVISAISEAAAQYNPEPPDMEVSATELMNILNK Unmodified 3784.8903 0.89032807 1323 K7EKD8 CAPNS1 yes yes 0 0 0 1 171.13 171.13 3 6.8505E-09 176014 QUIQUE_C1368_190116_001 54.583 52.921 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21253 1323 19990 190664 243840 243840 1 ILGGVISAISEAAAQYNPEPPPPR Unmodified 2446.2856 0.28562392 247 A0A0C4DGQ5;P04632;K7ELJ7;A0A075B7C0;K7EM73;K7EIV0 CAPNS1 Calpain small subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 1 2 1 3 3 2 1 1 2 154.66 154.66 2;3;4 2.7592E-63 159069 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.67 152.28 3781400000 122790000 184050000 216110000 326630000 274230000 402890000 151050000 468590000 638240000 220370000 49203000 218470000 508760000 21254 247 19991 190665;190666;190667;190668;190669;190670;190671;190672;190673;190674;190675;190676;190677;190678;190679;190680;190681;190682;190683;190684;190685;190686 243841;243842;243843;243844;243845;243846;243847;243848;243849;243850;243851;243852;243853;243854;243855;243856;243857;243858;243859;243860;243861;243862;243863;243864;243865;243866;243867;243868;243869;243870;243871;243872;243873;243874;243875;243876;243877 243864 35 ILGILALIDEGETDWK Unmodified 1784.956 0.95601651 4150 Q9H2U2;D6R967;H0Y9D8 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 168.41 168.41 2;3 2.8286E-24 172056 QUIQUE_C1277_190116_001 191.53 172.78 2320000000 16423000 197060000 423820000 58212000 246290000 49959000 172160000 158870000 216640000 22275000 229030000 238430000 290810000 21255 4150 19992 190687;190688;190689;190690;190691;190692;190693;190694;190695;190696;190697;190698;190699;190700;190701;190702;190703;190704;190705 243878;243879;243880;243881;243882;243883;243884;243885;243886;243887;243888;243889;243890;243891;243892;243893;243894;243895;243896;243897 243879 20 ILGIPVIVTEQYPK Unmodified 1568.9178 0.91778051 3821 Q96CN7;D6RGE2 ISOC1 Isochorismatase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.95 128.95 2 0.0014119 131886 QUIQUE_C1563_190116_001 87.568 74.952 1678000000 152520000 141340000 142910000 129520000 131690000 109450000 0 161760000 151840000 56755000 180850000 149920000 169420000 21256 3821 19993 190706;190707;190708;190709;190710;190711;190712;190713;190714;190715;190716;190717 243898;243899;243900;243901;243902;243903;243904;243905;243906;243907;243908;243909;243910;243911;243912;243913;243914 243906 16 ILGKPVMER Oxidation (M) 1057.5954 0.59540051 3064 Q14353 GAMT Guanidinoacetate N-methyltransferase yes yes 0 1 1 1 1 1 1 14.725 14.725 3 0.01356 6903 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.276 52.438 188130000 0 0 0 16314000 0 0 0 61528000 58944000 0 0 51348000 0 21257 3064 19994 190718;190719;190720;190721 243915;243916;243917;243918 243917 2519 4 ILGLAIESQDAGIK Unmodified 1426.8031 0.80314468 1177 H3BNE1;H3BR18;H3BM38;H3BPJ0;O00161 SNAP23 Synaptosomal-associated protein;Synaptosomal-associated protein 23 yes no 0 0 0 1 1 1 1 101.09 101.09 2 0.0035187 105484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.201 58.331 133380000 0 0 47984000 31952000 0 25805000 0 0 0 0 27638000 0 0 21258 1177 19995 190722;190723;190724;190725 243919;243920;243921;243922 243922 2 ILGLGDLGCYGMGIPVGK Unmodified 1818.9372 0.93721209 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 148.74 148.74 2 0.0002753 155916 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.89 80.516 554230000 0 0 144890000 142880000 0 0 130940000 0 0 0 135530000 0 0 21259 3198 19996 190726;190727;190728;190729 243923;243924;243925;243926 243926 4 ILGLGDLGCYGMGIPVGK Oxidation (M) 1834.9321 0.93212672 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 1 0 1 1 1 135.65 135.65 2 0.0049683 138767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.7 35.041 203270000 0 0 0 0 0 0 0 37928000 0 0 0 84344000 80993000 21260 3198 19996 190730;190731;190732 243927;243928;243929 243927 2627 2 ILGLGDLGVYGMGIPVGK Unmodified 1757.975 0.97497781 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PQT3;A0A1W2PQY8;A0A1W2PQ37;A0A1W2PQF8 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.51 155.51 2 1.4807E-10 158055 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.54 91.686 1055600000 94519000 93443000 86705000 84128000 61058000 99906000 74951000 53161000 30835000 15890000 102440000 86175000 172370000 21261 374 19997 190733;190734;190735;190736;190737;190738;190739;190740;190741;190742;190743;190744;190745 243930;243931;243932;243933;243934;243935;243936;243937;243938;243939;243940;243941;243942;243943 243937 14 ILGLGDLGVYGMGIPVGK Oxidation (M) 1773.9699 0.96989243 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PQT3;A0A1W2PQY8;A0A1W2PQ37;A0A1W2PQF8 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 141.9 141.9 2 0.00017813 146483 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.441 72.187 217010000 0 0 0 0 0 23001000 0 32415000 0 30394000 47686000 43590000 39926000 21262 374 19997 190746;190747;190748;190749;190750;190751;190752 243944;243945;243946;243947;243948;243949;243950 243949 267 7 ILGLLAAMLPPLK Unmodified 1348.8516 0.8516152 1508 O43149;I3L141 ZZEF1 Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 163.57 163.57 2 0.00095476 168250 QUIQUE_C1218_190116_001 83.005 75.359 5017200 5017200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21263 1508 19998 190753 243951;243952 243951 2 ILGLLDAYLK Unmodified 1117.6747 0.67469669 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.86 140.86 2 0.00032039 147168 QUIQUE_C1218_190116_001 114.89 69.176 7723500000 695970000 650320000 588140000 586490000 658000000 962300000 508820000 487600000 467110000 383570000 620200000 572330000 542650000 21264 2255 19999 190754;190755;190756;190757;190758;190759;190760;190761;190762;190763;190764;190765;190766 243953;243954;243955;243956;243957;243958;243959;243960;243961;243962;243963;243964;243965;243966;243967;243968;243969;243970;243971 243953 19 ILGPGLNK Unmodified 810.49634 0.49633839 2770 P62906 RPL10A 60S ribosomal protein L10a yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.638 31.638 2 0.0085572 26867 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.883 47.117 403940000 0 0 96373000 89222000 0 57346000 0 0 58494000 0 54440000 48068000 0 21265 2770 20000 190767;190768;190769;190770;190771;190772;190773;190774 243972;243973;243974;243975;243976;243977;243978;243979 243977 8 ILGPQGNTIK Unmodified 1039.6026 0.60259438 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.361 31.361 2 0.013841 25370 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.177 41.183 2608500000 222360000 256370000 222390000 187070000 192770000 137140000 178350000 169600000 248760000 72630000 263610000 236900000 220570000 21266 2908 20001 190775;190776;190777;190778;190779;190780;190781;190782;190783;190784;190785;190786;190787 243980;243981;243982;243983;243984;243985;243986;243987;243988;243989;243990;243991;243992 243992 9 ILGPQGNTIKR Unmodified 1195.7037 0.70370541 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 20.668 20.668 3 0.013893 13421 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.144 21.884 158640000 0 0 0 0 0 0 0 50726000 0 0 47168000 43637000 17104000 21267 2908 20002 190788;190789;190790;190791 243993;243994;243995;243996 243994 4 ILGQEGDASYLASEISTWDGVIVTPSEK Unmodified 2964.4604 0.46041298 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 163.19 163.19 3 4.0463E-31 167687 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.21 106.31 1060300000 84652000 87312000 104150000 136220000 0 92292000 0 114500000 147180000 49097000 0 137930000 106970000 21268 626 20003 190792;190793;190794;190795;190796;190797;190798;190799;190800;190801;190802 243997;243998;243999;244000;244001;244002;244003;244004;244005;244006;244007;244008;244009;244010;244011 244006 15 ILGQQVPYATK Unmodified 1216.6816 0.68157298 2390 P36222;H0Y3U8 CHI3L1 Chitinase-3-like protein 1 yes no 0 0 0 1 57.621 57.621 2 0.052516 52858 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.518 19.489 20677000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20677000 0 0 0 21269 2390 20004 190803 244012 244012 0 ILGSGISSSSVLHGMVFK Unmodified 1817.971 0.97095506 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 107.05 107.05 2;3 5.4784E-19 111082 QUIQUE_C1576_190116_001 172.99 140.98 4489100000 264840000 344870000 432350000 286460000 491610000 381260000 462920000 169110000 291770000 69462000 560310000 389440000 344720000 21270 2572 20005 190804;190805;190806;190807;190808;190809;190810;190811;190812;190813;190814;190815;190816;190817;190818;190819;190820;190821;190822;190823;190824;190825;190826 244013;244014;244015;244016;244017;244018;244019;244020;244021;244022;244023;244024;244025;244026;244027;244028;244029;244030;244031;244032;244033;244034;244035;244036;244037;244038;244039;244040;244041;244042;244043;244044;244045;244046 244030 34 ILGSGISSSSVLHGMVFK Oxidation (M) 1833.9659 0.96586969 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 1 0 1 1 87.07 87.07 3 0.027875 90443 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.52 26.265 52103000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52103000 0 0 21271 2572 20005 190827;190828 244047;244048 244048 1 ILGTAGTEEGQK Unmodified 1202.6143 0.61428128 2917 Q08257;A6NP24;C9JH92 CRYZ Quinone oxidoreductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.564 21.564 2 5.3581E-08 15094 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.94 77.443 1775600000 134140000 95495000 170580000 150040000 195290000 132730000 0 177400000 132710000 146460000 224090000 0 216640000 21272 2917 20006 190829;190830;190831;190832;190833;190834;190835;190836;190837;190838;190839;190840 244049;244050;244051;244052;244053;244054;244055;244056;244057;244058;244059;244060 244055 10 ILGYINTGK Unmodified 977.55458 0.55458155 1875 P05091;S4R3S4 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 3 1 1 1 2 1 1 1 52.352 52.352 2 7.6246E-07 50297 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.58 92.802 6278700000 633190000 502630000 662820000 452520000 540010000 419910000 452720000 426760000 402190000 171720000 549950000 532430000 531900000 21273 1875 20007 190841;190842;190843;190844;190845;190846;190847;190848;190849;190850;190851;190852;190853;190854;190855;190856 244061;244062;244063;244064;244065;244066;244067;244068;244069;244070;244071;244072;244073;244074;244075;244076;244077;244078;244079;244080;244081;244082;244083;244084;244085;244086;244087;244088 244081 27 ILGYINTGKQEGAK Unmodified 1490.8093 0.80929269 1875 P05091;S4R3S4 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 36.173 36.173 2;3 0.0073179 31609 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.342 41.23 161710000 0 0 0 0 0 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244102;244103;244104;244105;244106;244107;244108;244109;244110;244111;244112 244105 10 ILHCLGLAEEIQK Unmodified 1522.8177 0.81774888 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 70.363 70.363 2;3 8.5422E-13 70123 QUIQUE_C1368_190116_001 174.98 143.49 1798400000 77730000 82038000 86402000 82608000 95389000 71362000 79404000 86733000 87075000 120470000 287370000 297240000 344580000 21277 2620 20011 190879;190880;190881;190882;190883;190884;190885;190886;190887;190888;190889;190890;190891;190892;190893;190894;190895 244113;244114;244115;244116;244117;244118;244119;244120;244121;244122;244123;244124;244125;244126;244127;244128;244129;244130;244131 244116 18 ILHDVELLSSLALAR Unmodified 1648.9512 0.9512059 4292 Q9NTJ4 MAN2C1 Alpha-mannosidase 2C1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 127.17 127.17 2;3 4.9972E-05 131346 QUIQUE_C1403_190116_001 86.944 80.862 322460000 0 0 0 25857000 41122000 0 42279000 34525000 35982000 17346000 36842000 33461000 55043000 21278 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244171;244172;244173;244174;244175;244176;244177;244178;244179;244180;244181;244182;244183;244184;244185;244186;244187 244181 17 ILHILGSIR Unmodified 1020.6444 0.64439961 4337 Q9NZ32;V9GYX7 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 61.637 61.637 2 0.06278 60002 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.198 13.459 20345000 0 0 0 0 0 0 0 20345000 0 0 0 0 0 21283 4337 20017 190945 244188 244188 1 ILHLLGQEGPK Unmodified 1203.6976 0.69755739 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.009 48.009 2;3 0.00040205 45522 QUIQUE_C1218_190116_001 85.821 70.282 205540000 35014000 58454000 36545000 0 0 15506000 0 42747000 0 17272000 0 0 0 21284 4645 20018 190946;190947;190948;190949;190950;190951 244189;244190;244191;244192;244193;244194;244195 244189 7 ILHLLTQEALSIHGVK Unmodified 1771.0356 0.03560423 2650 P54886 ALDH18A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase;Glutamate 5-kinase;Gamma-glutamyl phosphate reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 86.29 86.29 4 0.0079877 88058 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3574 Q8N1F7;H3BVG0;H3BM93;H3BMX0;H3BP95 NUP93 Nuclear pore complex protein Nup93 yes no 0 0 0 1 1 143.81 143.81 3 3.3218E-09 149605 QUIQUE_C1368_190116_001 58.776 47.873 58485000 0 0 25347000 0 0 0 0 0 0 0 0 33138000 0 21290 3574 20024 190978;190979 244223;244224 244223 2 ILHVDNHIGISIAGLTADAR Unmodified 2085.1331 0.13308644 2244 P25786;F5GX11;B4DEV8 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1;Proteasome subunit alpha type yes no 0 0 0 3 1 2 1 1 2 1 1 2 1 103.6 103.6 2;3;4 1.3127E-05 108204 QUIQUE_C1218_190116_001 103.13 82.75 1514800000 237510000 133940000 243940000 63493000 0 86763000 0 346700000 100980000 0 111850000 109610000 80018000 21291 2244 20025 190980;190981;190982;190983;190984;190985;190986;190987;190988;190989;190990;190991;190992;190993;190994 244225;244226;244227;244228;244229;244230;244231;244232;244233;244234;244235;244236;244237;244238;244239;244240;244241 244226 16 ILHVNGFNGEGGEEDPQAAR Unmodified 2108.9875 0.98754442 2778 P63092;Q5JWF2;S4R3E3;Q5JWE9;S4R3V9;Q5JWD1;H0Y7E8 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 1 56.169 56.169 3 0.00073963 55602 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.015 26.535 42623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42623000 0 0 21292 2778 20026 190995 244242 244242 1 ILIADSNNQCVQIFSNDGQFK Unmodified 2410.1587 0.15870885 4091 Q9C040 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 2 121.57 121.57 2;3 0.0016504 118251 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.265 58.837 72203000 0 0 0 52719000 0 0 0 0 0 19484000 0 0 0 21293 4091 20027 190996;190997;190998;190999;191000 244243;244244;244245;244246;244247 244247 3 ILIAIALIK Unmodified 966.68414 0.68413916 3535 Q8IWA5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 122.61 122.61 2 0.0012555 119688 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.39 68.37 25021000 0 0 18431000 0 0 0 0 0 0 6590000 0 0 0 21294 3535 20028 191001;191002;191003;191004;191005;191006;191007;191008;191009 244248;244249;244250;244251;244252;244253;244254;244255;244256;244257;244258 244254 11 ILIAKPIMFR Unmodified 1200.7417 0.74167082 4508 Q9UN86 G3BP2 Ras GTPase-activating protein-binding protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 78.179 78.179 3 0.027239 78360 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.735 44.884 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21295 4508 20029 191010;191011;191012 244259;244260;244261 244261 3 ILIANTGMDTDK Unmodified 1290.649 0.64895222 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.171 58.171 2 2.5569E-21 58113 QUIQUE_C1218_190116_001 177.06 133.26 1094000000 281070000 249270000 198410000 206660000 0 158610000 0 0 0 0 0 0 0 21296 2810 20030 191013;191014;191015;191016;191017 244262;244263;244264;244265;244266 244262 5 ILIANTGMDTDKIK Unmodified 1531.828 0.82797922 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 2 2 64.365 64.365 2;3 0.00065421 63559 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.646 67.286 2154600000 92644000 144180000 124780000 97446000 142800000 49464000 188460000 245840000 149770000 27718000 312190000 264760000 314530000 21297 2810 20031 191018;191019;191020;191021;191022;191023;191024;191025;191026;191027;191028;191029;191030;191031;191032;191033;191034;191035;191036;191037 244267;244268;244269;244270;244271;244272;244273;244274;244275;244276;244277;244278;244279;244280;244281;244282;244283;244284;244285;244286;244287;244288 244285 20 ILIANTGMDTDKIK Oxidation (M) 1547.8229 0.82289384 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 1 1 1 1 42.221 42.221 3 0.0086059 38311 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.309 37.535 87527000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 87527000 0 0 21298 2810 20031 191038;191039 244289;244290 244289 2258 1 ILIDTGEPAIPEYISCLK Unmodified 2031.0598 0.05982965 3255 Q53H82 LACTB2 Beta-lactamase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 140.3 140.3 2 0.00036803 136587 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.22 78.665 112000000 0 0 0 0 0 0 0 38551000 0 15540000 0 0 57907000 21299 3255 20032 191040;191041;191042 244291;244292;244293 244292 2 ILIEDSDQNLK Unmodified 1286.6718 0.67179615 1437;437 A0A2R8Y611;O14617;A0A2R8Y4J3 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 1 57.443 57.443 2 0.044538 56253 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.064 15.916 102350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 102350000 0 21300 437;1437 20033 191043 244294 244294 1 ILIEDWK Unmodified 915.50657 0.50656873 1329 K7ELL7;P14314;K7EPW7 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.161 81.161 2 0.019482 81036 QUIQUE_C1563_190116_001 111.28 58.595 970060000 190850000 174040000 157300000 148700000 0 163470000 135710000 0 0 0 0 0 0 21301 1329 20034 191044;191045;191046;191047;191048;191049 244295;244296;244297;244298;244299;244300;244301;244302;244303 244301 9 ILIEELR Unmodified 884.53312 0.53311783 4455 Q9UJ70;H7C3G9;C9JEV6;H7C1L7;H0YEB7;H0YE82 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.17 73.17 2 0.019482 74714 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.28 25.192 1654200000 155100000 157120000 153490000 160490000 134230000 135540000 143260000 0 138180000 0 164090000 154200000 158510000 21302 4455 20035 191050;191051;191052;191053;191054;191055;191056;191057;191058;191059;191060 244304;244305;244306;244307;244308;244309;244310;244311;244312;244313;244314;244315 244313 12 ILIGNPGCTYK Unmodified 1234.638 0.63799361 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUC3;A0A1B0GV98;A0A1B0GTC5;A0A1B0GU26;A0A1B0GTY1 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 1 55.865 55.865 2 0.03264 54985 QUIQUE_C1218_190116_001 50.284 10.239 102830000 48032000 0 0 0 54801000 0 0 0 0 0 0 0 0 21303 334 20036 191061;191062 244316;244317 244316 2 ILIGPCCATANLEAK Unmodified 1629.8218 0.82184798 3474 Q7Z7G8 VPS13B Vacuolar protein sorting-associated protein 13B yes yes 0 0 0 1 26.222 26.222 4 0.05462 20033 QUIQUE_C1563_190116_001 27.649 12.104 34886000 0 0 0 0 0 34886000 0 0 0 0 0 0 0 21304 3474 20037 191063 244318 244318 1 ILIGSSFPLSGGR Unmodified 1302.7296 0.7295858 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.56 102.56 2 5.9865E-10 105569 QUIQUE_C1368_190116_001 161.17 114.75 13471000000 926620000 536880000 1018700000 1168900000 1002600000 1185700000 1334300000 1021300000 1118500000 720560000 1322100000 521540000 1593500000 21305 4560 20038 191064;191065;191066;191067;191068;191069;191070;191071;191072;191073;191074;191075;191076 244319;244320;244321;244322;244323;244324;244325;244326;244327;244328;244329;244330;244331;244332;244333;244334;244335;244336;244337;244338;244339;244340;244341;244342;244343;244344 244323 26 ILIGYSR Unmodified 820.48069 0.48068833 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.901 46.901 2 0.020425 44573 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.24 30.49 598650000 58051000 0 102920000 0 0 0 0 120590000 150110000 0 166980000 0 0 21306 57 20039 191077;191078;191079;191080;191081 244345;244346;244347;244348;244349;244350;244351 244348 7 ILIIGESGVGK Unmodified 1084.6492 0.64921022 4237 Q9NP72;A0A087X163;Q5W0J0 RAB18 Ras-related protein Rab-18 yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.614 71.614 2 0.024786 68347 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.327 28.073 437120000 0 148640000 0 0 0 0 0 0 110350000 80205000 0 97925000 0 21307 4237 20040 191082;191083;191084;191085 244352;244353;244354;244355 244354 3 ILILGLDGAGK Unmodified 1068.6543 0.6542956 2426 P40616;F8VYN9;F8VP99;F8VP63 ARL1 ADP-ribosylation factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 99.533 99.533 2 0.0017273 100825 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.749 47.942 70544000 0 0 0 0 0 0 0 47649000 0 22896000 0 0 0 21308 2426 20041 191086;191087 244356;244357 244356 2 ILINTDIGLPNGLTFDPFSK Unmodified 2174.1623 0.16232089 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 163.76 163.76 2;3 0.0038204 170307 QUIQUE_C1438_190116_001 43.534 37.72 67109000 0 0 0 0 21329000 0 0 0 29852000 0 15928000 0 0 21309 3042 20042 191088;191089;191090;191091;191092 244358;244359;244360;244361;244362 244358 5 ILIPALMVTAEK Unmodified 1297.7679 0.76794515 2361 P34913;E5RFU2;E5RFH6 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.2 121.2 2 0.00052991 118592 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.653 79.866 528610000 57106000 46223000 52884000 45041000 35134000 48673000 44988000 0 47063000 26794000 40160000 37545000 46994000 21310 2361 20043 191093;191094;191095;191096;191097;191098;191099;191100;191101;191102;191103;191104 244363;244364;244365;244366;244367;244368;244369;244370;244371;244372;244373;244374;244375;244376;244377;244378;244379;244380;244381 244376 19 ILIPWLLSPESLDIK Unmodified 1736.0124 0.012409172 3720 Q8WXF7 ATL1 Atlastin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 3 2 167.97 167.97 2;3 4.5412E-07 169944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.8 102.13 2916900000 276190000 277460000 230350000 241360000 237440000 35391000 300490000 116400000 202620000 47176000 365270000 279520000 307210000 21311 3720 20044 191105;191106;191107;191108;191109;191110;191111;191112;191113;191114;191115;191116;191117;191118;191119;191120;191121;191122;191123;191124;191125;191126;191127;191128;191129;191130 244382;244383;244384;244385;244386;244387;244388;244389;244390;244391;244392;244393;244394;244395;244396;244397;244398;244399;244400;244401;244402;244403;244404;244405;244406;244407 244396 26 ILIPWLLSPESLDIKEINGNK Unmodified 2391.3413 0.34134788 3720 Q8WXF7 ATL1 Atlastin-1 yes yes 0 0 1 1 157.41 157.41 3 0.0031854 160069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.415 38.127 26672000 0 0 0 0 0 0 0 26672000 0 0 0 0 0 21312 3720 20045 191131 244408 244408 1 ILIRPMYSNPPLNGAR Oxidation (M) 1826.9825 0.9825228 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 1 1 61.111 61.111 3 0.00020218 60504 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.912 65.184 247890000 0 0 0 0 0 0 0 0 124230000 0 0 0 123660000 21313 1788 20046 191132;191133;191134;191135 244409;244410;244411;244412 244411 1003 4 ILIRPMYSNPPLNGAR Unmodified 1810.9876 0.98760818 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 72.899 72.899 3 0.00027426 74362 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.175 65.284 352160000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 204380000 147780000 0 21314 1788 20046 191136;191137 244413;244414;244415;244416 244414 4 ILISLATGHR Unmodified 1079.6451 0.64512789 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 49.15 49.15 3 0.00012815 47925 QUIQUE_C1218_190116_001 111.61 83.398 7784000000 857780000 660660000 882430000 680780000 688410000 671980000 670270000 255750000 468910000 478770000 528620000 490910000 448690000 21315 845;1936 20047 191138;191139;191140;191141;191142;191143;191144;191145;191146;191147;191148;191149;191150;191151;191152 244417;244418;244419;244420;244421;244422;244423;244424;244425;244426;244427;244428;244429;244430;244431;244432;244433;244434;244435;244436;244437;244438;244439;244440;244441;244442;244443;244444;244445;244446;244447;244448;244449;244450;244451;244452 244418 36 ILISLATGHREEGGENLDQAR Unmodified 2278.1666 0.16657142 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 1 2 1 1 2 3 1 1 2 61.341 61.341 2;3;4 4.81E-10 61064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.18 74.482 3603900000 83864000 139440000 202130000 0 0 78864000 0 788690000 1094700000 0 476250000 0 740010000 21316 845;1936 20048 191153;191154;191155;191156;191157;191158;191159;191160;191161;191162;191163;191164;191165;191166 244453;244454;244455;244456;244457;244458;244459;244460;244461;244462;244463;244464;244465;244466;244467;244468 244459 14 ILITIVEEVETLR Unmodified 1526.892 0.89195969 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 4 1 2 3 3 2 4 8 3 13 8 3 152.84 152.84 2;3 2.6816E-23 147899 QUIQUE_DMIX4_190116_001 169.37 142.78 4101900000 102630000 209390000 159530000 68908000 146750000 185760000 293130000 334280000 699450000 118300000 702630000 942050000 139100000 21317 3117 20049 191167;191168;191169;191170;191171;191172;191173;191174;191175;191176;191177;191178;191179;191180;191181;191182;191183;191184;191185;191186;191187;191188;191189;191190;191191;191192;191193;191194;191195;191196;191197;191198;191199;191200;191201;191202;191203;191204;191205;191206;191207;191208;191209;191210;191211;191212;191213;191214;191215;191216;191217;191218;191219;191220;191221;191222 244469;244470;244471;244472;244473;244474;244475;244476;244477;244478;244479;244480;244481;244482;244483;244484;244485;244486;244487;244488;244489;244490;244491;244492;244493;244494;244495;244496;244497;244498;244499;244500;244501;244502;244503;244504;244505;244506;244507;244508;244509;244510;244511;244512;244513;244514;244515;244516;244517;244518;244519;244520;244521;244522;244523;244524;244525;244526;244527;244528;244529;244530;244531;244532;244533;244534;244535;244536;244537;244538;244539;244540;244541;244542;244543;244544;244545;244546;244547;244548;244549;244550 244517 72 ILITIVEEVETLRQER Unmodified 1940.0942 0.094241321 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 136.77 136.77 3 0.004312 140387 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.601 18.735 131630000 0 0 0 0 0 0 0 85789000 0 0 45836000 0 0 21318 3117 20050 191223;191224 244551;244552 244551 1 ILITTVPPNLR Unmodified 1235.7602 0.76015765 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 0 5 3 3 3 2 3 2 4 3 2 5 2 4 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0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 100.88 100.88 2 8.1306E-08 98214 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.69 82.577 805530000 91098000 32702000 53260000 64726000 35166000 64515000 42508000 68534000 79338000 57933000 76963000 78857000 59926000 21320 2993 20052 191266;191267;191268;191269;191270;191271;191272;191273;191274;191275;191276;191277;191278;191279;191280 244605;244606;244607;244608;244609;244610;244611;244612;244613;244614;244615;244616;244617;244618;244619;244620 244617 15 ILIWSGR Unmodified 843.49667 0.49667274 1052 F8W7Q4;Q96A26;E9PH05 FAM162A Protein FAM162A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 74.408 74.408 2 0.023465 74954 QUIQUE_C1576_190116_001 100.07 45.53 506910000 108090000 55656000 0 0 0 72285000 57573000 50853000 0 0 87234000 75221000 0 21321 1052 20053 191281;191282;191283;191284;191285;191286;191287 244621;244622;244623;244624;244625;244626;244627;244628;244629 244626 9 ILIYNRPNMEAVPLAPGR Unmodified 2023.1037 0.10370057 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.019 92.019 3 0.00037378 94074 QUIQUE_C1368_190116_001 70.96 51.668 614400000 39393000 0 75252000 62408000 62323000 58294000 32676000 33238000 50643000 12048000 72282000 58564000 57276000 21322 205 20054 191288;191289;191290;191291;191292;191293;191294;191295;191296;191297;191298;191299 244630;244631;244632;244633;244634;244635;244636;244637;244638;244639;244640;244641;244642;244643 244631 13 ILKDNLAILEK Unmodified 1268.7704 0.77038799 4199 Q9H9S4;B7ZBJ5;B7ZBJ6;B7ZBJ7 CAB39L Calcium-binding protein 39-like yes no 0 0 1 1 1 65.961 65.961 3 0.00030188 64912 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.021 38.72 30679000 0 0 0 0 0 0 0 30679000 0 0 0 0 0 21323 4199 20055 191300;191301 244644;244645 244644 2 ILKEDILNYLEK Unmodified 1489.8392 0.83919583 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 106.27 106.27 2;3 0.0003589 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244682;244683;244684;244685;244686;244687;244688;244689;244690;244691;244692;244693;244694;244695;244696;244697;244698;244699;244700;244701;244702;244703;244704;244705;244706;244707;244708;244709;244710;244711;244712;244713;244714;244715;244716;244717;244718;244719;244720;244721;244722;244723;244724;244725;244726;244727;244728;244729;244730;244731;244732;244733;244734;244735;244736;244737;244738;244739;244740;244741;244742;244743;244744;244745;244746;244747;244748;244749;244750;244751;244752;244753;244754;244755;244756;244757;244758;244759;244760;244761;244762;244763;244764;244765;244766;244767;244768;244769;244770;244771;244772;244773;244774;244775;244776;244777;244778;244779;244780;244781;244782;244783;244784;244785;244786;244787;244788;244789;244790;244791;244792;244793;244794;244795;244796;244797;244798;244799;244800;244801;244802;244803;244804;244805;244806;244807;244808;244809;244810;244811;244812;244813;244814;244815;244816;244817;244818;244819;244820;244821;244822;244823;244824;244825;244826;244827;244828;244829;244830;244831;244832;244833;244834;244835;244836;244837;244838 244687 157 ILLAELEQLKGQGK Unmodified 1538.9032 0.90319307 1952 P08670;B0YJC4;A0A1B0GTT5 VIM Vimentin yes no 0 0 1 1 2 1 2 3 2 8 5 1 4 4 6 106.01 106.01 2;3 9.8469E-19 92547 QUIQUE_DMIX8_190116_001 158.2 87.791 22508000000 24909000 0 71718000 97682000 1001800000 75107000 362280000 3826300000 3777500000 14127000 5026900000 4396800000 3832800000 21327 1952 20059 191434;191435;191436;191437;191438;191439;191440;191441;191442;191443;191444;191445;191446;191447;191448;191449;191450;191451;191452;191453;191454;191455;191456;191457;191458;191459;191460;191461;191462;191463;191464;191465;191466;191467;191468;191469;191470;191471;191472 244839;244840;244841;244842;244843;244844;244845;244846;244847;244848;244849;244850;244851;244852;244853;244854;244855;244856;244857;244858;244859;244860;244861;244862;244863;244864;244865;244866;244867;244868;244869;244870;244871;244872;244873;244874;244875;244876;244877;244878;244879;244880;244881;244882;244883;244884;244885;244886;244887;244888;244889;244890;244891;244892 244888 48 ILLANFLAQTEALMR Oxidation (M) 1718.9389 0.93892665 199;790 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 1 0 2 2 2 2 2 4 2 3 2 2 2 2 1 150 150 2;3 6.9026E-07 156801 QUIQUE_C1438_190116_001 119.45 95.067 8237700000 913740000 831140000 517260000 481070000 820190000 686150000 462640000 505820000 719290000 281210000 824130000 860080000 334970000 + 21328 199;790 20060 191473;191474;191475;191476;191477;191478;191479;191480;191481;191482;191483;191484;191485;191486;191487;191488;191489;191490;191491;191492;191493;191494;191495;191496;191497;191498;191499;191500 244893;244894;244895;244896;244897;244898;244899;244900;244901;244902;244903;244904;244905;244906;244907;244908;244909;244910;244911;244912;244913;244914;244915;244916;244917;244918;244919;244920;244921;244922;244923;244924;244925;244926;244927;244928;244929;244930;244931;244932;244933;244934;244935;244936;244937;244938 244910 119 46 ILLANFLAQTEALMR Unmodified 1702.944 0.94401203 199;790 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 167.95 167.95 2;3 7.9195E-112 172841 QUIQUE_C1368_190116_001 177.81 167.33 39160000000 3037700000 3635600000 1540100000 2359200000 2659100000 5697200000 2069900000 2162900000 1890800000 528310000 6364300000 5070000000 2144600000 + 21329 199;790 20060 191501;191502;191503;191504;191505;191506;191507;191508;191509;191510;191511;191512;191513;191514;191515;191516;191517;191518;191519;191520;191521;191522;191523;191524;191525;191526;191527;191528 244939;244940;244941;244942;244943;244944;244945;244946;244947;244948;244949;244950;244951;244952;244953;244954;244955;244956;244957;244958;244959;244960;244961;244962;244963;244964;244965;244966;244967;244968;244969 244945 30 ILLAVNGK Unmodified 826.52764 0.52763852 1488 O15173 PGRMC2 Membrane-associated progesterone receptor component 2 yes yes 0 0 0 1 1 42.002 42.002 2 0.035663 38335 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.287 21.785 67065000 0 0 0 0 0 0 0 0 48847000 18218000 0 0 0 21330 1488 20061 191529;191530 244970;244971 244970 2 ILLDHEKEWK Unmodified 1309.703 0.7030367 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 35.105 35.105 2;3 0.049121 31173 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.189 37.976 116970000 0 0 0 0 0 0 0 0 54092000 0 17213000 45665000 0 21331 2638 20062 191531;191532;191533 244972;244973;244974 244972 3 ILLDQGQTHSVETPYGSVTFTVYGTPK Unmodified 2937.476 0.47600347 4506 Q9UN36;G3V2I9;G3V5S0;G3V383;G3V5P9;G3V2S0;G3V552;G3V3P6;G3V4T9;G3V2T2;G3V3P1;G3V3D5;G3V358;G3V5B5;G3V3L1 NDRG2 Protein NDRG2 yes no 0 0 0 1 1 136.23 136.23 3 4.6302E-20 140723 QUIQUE_C1403_190116_001 93.446 80.769 75991000 0 0 33276000 42715000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21332 4506 20063 191534;191535 244975;244976 244976 2 ILLDQGQTHSVETPYGSVTFTVYGTPKPK Unmodified 3162.6237 0.62373033 4506 Q9UN36;G3V2I9;G3V5S0;G3V383;G3V5P9;G3V2S0;G3V552;G3V3P6;G3V4T9;G3V2T2;G3V3P1;G3V3D5;G3V358;G3V5B5;G3V3L1 NDRG2 Protein NDRG2 yes no 0 0 1 1 2 3 3 1 5 117.22 117.22 3;4 3.0566E-15 122069 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.322 66.218 1561500000 0 0 0 0 0 0 67552000 300570000 338980000 0 304790000 196510000 353080000 21333 4506 20064 191536;191537;191538;191539;191540;191541;191542;191543;191544;191545;191546;191547;191548;191549;191550 244977;244978;244979;244980;244981;244982;244983;244984;244985;244986;244987;244988;244989;244990;244991;244992;244993;244994;244995;244996;244997;244998 244985 22 ILLDQVEEAVADFDECIR Unmodified 2134.0252 0.025235058 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.04 170.04 3 2.4647E-11 174754 QUIQUE_C1368_190116_001 118.72 109.9 3226700000 212770000 399300000 132710000 177230000 118540000 170540000 393370000 107760000 494500000 51699000 434460000 216550000 317290000 21334 1689 20065 191551;191552;191553;191554;191555;191556;191557;191558;191559;191560;191561;191562;191563 244999;245000;245001;245002;245003;245004;245005;245006;245007;245008;245009;245010;245011;245012;245013 245001 15 ILLEAAR Unmodified 784.48069 0.48068833 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.529 37.529 2 0.0034246 34255 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.34 68.673 10866000000 732570000 829150000 955310000 831180000 699400000 781050000 858590000 1014400000 876950000 422590000 1039700000 871030000 953780000 21335 2522 20066 191564;191565;191566;191567;191568;191569;191570;191571;191572;191573;191574;191575;191576 245014;245015;245016;245017;245018;245019;245020;245021;245022;245023;245024;245025;245026;245027;245028;245029;245030;245031;245032;245033;245034;245035;245036 245025 23 ILLELLNQMDGFDQNVNVK Unmodified 2202.1355 0.13545421 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 160.64 160.64 2;3 1.4416E-08 165601 QUIQUE_C1368_190116_001 141.54 112.19 309020000 75314000 0 56484000 28864000 0 0 0 0 59645000 0 0 88710000 0 21336 2466 20067 191577;191578;191579;191580;191581;191582 245037;245038;245039;245040;245041;245042;245043;245044 245040 7 ILLEPYK Unmodified 874.51641 0.51640513 1747 O95749;A0A2R8YE82;C9J6G3;C9J7M1;A0A2R8Y7P7 GGPS1 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.745 57.745 2 0.045326 56072 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.616 54.112 100550000 0 0 0 0 0 0 0 23575000 27482000 12753000 0 0 36743000 21337 1747 20068 191583;191584;191585;191586 245045;245046;245047;245048 245046 4 ILLHHAANSVK Unmodified 1201.6931 0.69314072 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 3 1 2 2 1 2 2 1 2 13.658 13.658 2;3 2.4985E-18 5758 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.47 117.99 3273300000 32194000 215810000 7225300 22950000 0 430920000 7784400 1937400000 174610000 201970000 0 242480000 0 21338 2588 20069 191587;191588;191589;191590;191591;191592;191593;191594;191595;191596;191597;191598;191599;191600;191601;191602;191603 245049;245050;245051;245052;245053;245054;245055;245056;245057;245058;245059;245060;245061;245062;245063;245064;245065;245066 245061 14 ILLIFEGTNEILR Unmodified 1529.8817 0.88172935 4186 Q9H845;H0Y8Z9 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 144.82 144.82 2 0.00071376 148969 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.256 59.137 302080000 27343000 24585000 20628000 15028000 26561000 17295000 21547000 28628000 44636000 7507100 0 47385000 20936000 21339 4186 20070 191604;191605;191606;191607;191608;191609;191610;191611;191612;191613;191614;191615;191616 245067;245068;245069;245070;245071;245072;245073;245074;245075;245076;245077;245078;245079 245078 12 ILLITEDLK Unmodified 1056.6431 0.64306221 2926 Q08752 PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.639 96.639 2 0.0081912 97669 QUIQUE_C1563_190116_001 79.474 56.545 326180000 0 47245000 0 31948000 0 47696000 0 34524000 43418000 21895000 0 43285000 56170000 21340 2926 20071 191617;191618;191619;191620;191621;191622;191623;191624 245080;245081;245082;245083;245084;245085;245086;245087;245088 245082 8 ILLLEAGPK Unmodified 952.59572 0.59571809 4574 Q9Y2Z9;G3V434;G3V4A6 COQ6 Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 73.306 73.306 2 0.0068412 73779 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.265 37.547 288240000 32327000 22564000 21895000 12255000 83715000 19205000 21202000 19721000 25248000 0 0 30114000 0 21341 4574 20072 191625;191626;191627;191628;191629;191630;191631;191632;191633;191634;191635;191636 245089;245090;245091;245092;245093;245094;245095;245096;245097;245098;245099;245100 245098 10 ILLLEQFFLPHSR Unmodified 1611.9137 0.91369818 4371 Q9P0Z9 PIPOX Peroxisomal sarcosine oxidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 145.11 145.11 3 7.0099E-05 151882 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.24 104.19 186610000 0 26344000 0 16362000 43438000 0 0 48251000 0 0 52217000 0 0 21342 4371 20073 191637;191638;191639;191640;191641 245101;245102;245103;245104;245105;245106 245106 5 ILLLGEAQVGK Unmodified 1139.6914 0.69140938 3547 Q8IXI1;H3BST5;I3L2C6;H3BMP9;H3BVI5;H3BUX4 RHOT2 Mitochondrial Rho GTPase 2 yes no 0 0 0 1 1 85.087 85.087 2 0.045417 87022 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.462 14.142 66097000 0 0 0 0 0 0 0 0 25156000 0 40941000 0 0 21343 3547 20074 191642;191643 245107;245108 245107 2 ILLLGLDNAGK Unmodified 1125.6758 0.67575932 2393 P36405 ARL3 ADP-ribosylation factor-like protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.71 100.71 2 2.9849E-18 103610 QUIQUE_C1368_190116_001 169.12 89.526 5283300000 451410000 382150000 373330000 313270000 444810000 384120000 465530000 498570000 458590000 148710000 393450000 469320000 500070000 21344 2393 20075 191644;191645;191646;191647;191648;191649;191650;191651;191652;191653;191654;191655;191656 245109;245110;245111;245112;245113;245114;245115;245116;245117;245118;245119;245120;245121;245122;245123;245124;245125;245126 245112 18 ILLLGTAVESAWGDEQSAFR Unmodified 2162.1008 0.10078326 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 155.97 155.97 2;3 0.0018474 160779 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.989 48.706 32905000 0 0 11181000 0 0 0 0 0 21723000 0 0 0 0 21345 2123 20076 191657;191658;191659;191660;191661;191662;191663;191664 245127;245128;245129;245130;245131;245132;245133;245134 245132 7 ILLLITSSHSDYCR Unmodified 1676.8556 0.85559095 3327 Q5TFE4;H0YDA5 NT5DC1 5'-nucleotidase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.312 79.312 3 0.0011327 80157 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.115 48.977 3240200000 33989000 0 0 20840000 0 29727000 48517000 41178000 37923000 0 3028100000 0 0 21346 3327 20077 191665;191666;191667;191668;191669;191670;191671;191672;191673 245135;245136;245137;245138;245139;245140;245141;245142;245143 245141 6 ILLLNEMEK Unmodified 1101.6104 0.61038187 2377 P35573;A0A1C7CYW1 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 90.351 90.351 2 0.0086479 92587 QUIQUE_C1368_190116_001 78.192 31.766 319730000 0 66216000 44983000 0 61179000 46668000 0 0 0 26352000 74331000 0 0 21347 2377 20078 191674;191675;191676;191677;191678;191679 245144;245145;245146;245147;245148;245149 245145 4 ILLLNEMEKLEK Unmodified 1471.832 0.83200197 2377 P35573;A0A1C7CYW1 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 107.62 107.62 3 0.00086471 110509 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.265 43.968 132680000 0 0 0 0 0 0 0 40525000 23502000 0 25239000 18039000 25377000 21348 2377 20079 191680;191681;191682;191683;191684;191685 245150;245151;245152;245153;245154;245155;245156 245150 6 ILLMGLR Unmodified 814.50988 0.50987997 4213 Q9HB90 RRAGC Ras-related GTP-binding protein C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.459 85.459 2 0.019765 88356 QUIQUE_C1218_190116_001 120.76 90.686 412670000 40364000 0 0 0 48054000 34281000 42857000 37541000 34643000 13120000 65483000 44453000 51873000 21349 4213 20080 191686;191687;191688;191689;191690;191691;191692;191693;191694;191695 245157;245158;245159;245160;245161;245162;245163;245164;245165;245166 245157 10 ILLNACCPGWVR Unmodified 1457.7272 0.72715974 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.688 94.688 2 3.9595E-20 96786 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.21 128.7 18813000000 1109700000 1272500000 1207700000 1543000000 1627200000 1627700000 1733100000 1539600000 1668200000 624990000 1297300000 1521000000 2041400000 21350 2102 20081 191696;191697;191698;191699;191700;191701;191702;191703;191704;191705;191706;191707;191708 245167;245168;245169;245170;245171;245172;245173;245174;245175;245176;245177;245178;245179;245180;245181;245182;245183;245184;245185;245186;245187;245188;245189;245190 245180 24 ILLNYLPLER Unmodified 1242.7336 0.73360855 4305 Q9NVG8 TBC1D13 TBC1 domain family member 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 121.22 121.22 2 0.0016104 125167 QUIQUE_C1277_190116_001 107.47 43.979 127560000 0 29455000 0 24089000 27645000 16543000 0 29828000 0 0 0 0 0 21351 4305 20082 191709;191710;191711;191712;191713 245191;245192;245193;245194;245195;245196;245197 245192 6 ILLQGTPVAQMTEDAVDAER Unmodified 2156.0783 0.078333261 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 134.42 134.42 2;3 0.00030664 140819 QUIQUE_C1438_190116_001 116.96 16.419 185310000 0 46216000 0 0 52376000 0 71118000 0 0 15602000 0 0 0 21352 1803 20083 191714;191715;191716;191717 245198;245199;245200;245201 245199 1 ILLSHFNWDK Unmodified 1271.6663 0.66625727 4613 Q9Y4X5;H3BSK4;H3BNB9 ARIH1 E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 81.051 81.051 3 0.0010176 82398 QUIQUE_C1277_190116_001 73.781 40.557 187300000 32261000 27102000 20040000 30684000 28923000 24903000 23388000 0 0 0 0 0 0 21353 4613 20084 191718;191719;191720;191721;191722;191723;191724;191725;191726;191727 245202;245203;245204;245205;245206;245207;245208;245209;245210;245211;245212 245203 11 ILLSSGR Unmodified 744.44939 0.4493882 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 25.296 25.296 2 0.038783 18896 QUIQUE_C1277_190116_001 148.28 0 535890000 0 298710000 0 237180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21354 2810 20085 191728;191729 245213;245214 245213 0 ILLSSTESR Unmodified 1004.5502 0.55022446 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 30.943 30.943 2 0.009778 25786 QUIQUE_C1277_190116_001 75.043 12.329 148510000 0 29271000 0 22020000 29328000 0 0 0 0 0 36476000 31414000 0 21355 3423 20086 191730;191731;191732;191733;191734 245215;245216;245217;245218;245219 245215 5 ILLSWVR Unmodified 885.54362 0.54362294 2486;8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;Q4G0X0;P46939 DMD;UTRN Dystrophin;Utrophin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.546 95.546 2 0.01933 97891 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.54 28.196 204970000 0 0 0 16572000 20301000 0 0 32124000 34724000 0 36116000 32269000 32860000 21356 8;2486 20087 191735;191736;191737;191738;191739;191740;191741 245220;245221;245222;245223;245224;245225;245226 245222 7 ILLTEPPMNPTK Oxidation (M) 1368.7323 0.73228792 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.689 58.689 2 3.2169E-05 57398 QUIQUE_C1403_190116_001 128.91 113.65 1404400000 95639000 103610000 106160000 112790000 0 81712000 93813000 169370000 160300000 113380000 192870000 0 174760000 21357 2715 20088 191742;191743;191744;191745;191746;191747;191748;191749;191750;191751;191752 245227;245228;245229;245230;245231;245232;245233;245234;245235;245236;245237;245238;245239;245240 245230 2147 14 ILLTEPPMNPTK Unmodified 1352.7374 0.7373733 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 76.493 76.493 2 1.9008E-09 76919 QUIQUE_C1368_190116_001 150.61 119.53 3350100000 373580000 381760000 291240000 280620000 276300000 228330000 263330000 229950000 199310000 72666000 277610000 242350000 233070000 21358 2715 20088 191753;191754;191755;191756;191757;191758;191759;191760;191761;191762;191763;191764;191765;191766;191767;191768;191769 245241;245242;245243;245244;245245;245246;245247;245248;245249;245250;245251;245252;245253;245254;245255;245256;245257;245258;245259;245260;245261;245262;245263;245264;245265;245266 245246 24 ILLTLGIR Unmodified 897.60114 0.60113781 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119;A0A087X2B6 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.574 96.574 2 0.0035431 99142 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.3 2.9189 309080000 45004000 0 0 0 44232000 37147000 26047000 41536000 31107000 0 55798000 0 28204000 21359 3571 20089 191770;191771;191772;191773;191774;191775;191776;191777 245267;245268;245269;245270;245271;245272;245273;245274 245272 6 ILLTNIR Unmodified 841.53854 0.53853756 2963 Q13057;K7EN91;K7ES73;K7ESK6 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.117 56.117 2 0.019658 54329 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.22 8.6856 555830000 97950000 0 0 90592000 0 0 0 80542000 0 0 99463000 100080000 87206000 21360 2963 20090 191778;191779;191780;191781;191782;191783 245275;245276;245277;245278;245279;245280;245281 245280 7 ILLTPPEHLER Unmodified 1316.7452 0.74523587 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;J3QQX3;J3QKZ8 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 60.048 60.048 3 0.0086541 59088 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.435 43.626 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21361 2198 20091 191784;191785;191786;191787;191788;191789 245282;245283;245284;245285;245286;245287 245287 6 ILLTQENPFFR Unmodified 1376.7452 0.74523587 2931 Q08J23 NSUN2 tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 121.71 121.71 2 0.0026523 125622 QUIQUE_C1277_190116_001 119.21 66.729 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21362 2931 20092 191790;191791 245288;245289 245288 2 ILLVGEPR Unmodified 895.5491 0.54910224 3548 Q8IXI2;J3KSR5 RHOT1 Mitochondrial Rho GTPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.876 57.876 2 0.01729 56417 QUIQUE_C1277_190116_001 81.784 26.343 361810000 29245000 26883000 27577000 30954000 27925000 30997000 33189000 27500000 25445000 14053000 36343000 29463000 22232000 21363 3548 20093 191792;191793;191794;191795;191796;191797;191798;191799;191800;191801;191802;191803;191804 245290;245291;245292;245293;245294;245295;245296;245297;245298;245299;245300;245301;245302 245291 13 ILLVGYPPFWDEDQHR Unmodified 1983.9843 0.98429694 1135 H0Y9C2 CAMK2D yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 133.32 133.32 3 4.2596E-05 130229 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.207 80.868 146750000 0 0 43949000 49103000 0 0 24923000 0 0 28779000 0 0 0 21364 1135 20094 191805;191806;191807;191808;191809 245303;245304;245305;245306;245307;245308 245308 5 ILLVIDDAHTDWSK Unmodified 1624.8461 0.84607213 1471 O14994;Q4TT46;A6ZJ82 SYN3 Synapsin-3 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 100.61 100.61 2;3 2.9387E-05 104762 QUIQUE_C1218_190116_001 110.08 82.979 944010000 101930000 141170000 86838000 103650000 0 57209000 148390000 0 52946000 36340000 116090000 99436000 0 21365 1471 20095 191810;191811;191812;191813;191814;191815;191816;191817;191818;191819;191820;191821;191822;191823;191824 245309;245310;245311;245312;245313;245314;245315;245316;245317;245318;245319;245320;245321;245322;245323;245324 245310 13 ILLWDTR Unmodified 915.5178 0.51780212 3991 Q9BQA1;H0Y711 WDR77 Methylosome protein 50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 92.537 92.537 2 0.020425 93851 QUIQUE_C1563_190116_001 108.24 51.728 599150000 0 0 105050000 0 0 88496000 110600000 83382000 0 0 0 101710000 109900000 21366 3991 20096 191825;191826;191827;191828;191829;191830 245325;245326;245327;245328;245329;245330;245331;245332 245326 8 ILLYISQQQPVTVAR Unmodified 1727.9934 0.99340506 190 A0A0A0MT60;Q5T1M5;X6RKW4 FKBP15 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;FK506-binding protein 15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 99.85 99.85 2 1.469E-12 104497 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.84 99.34 97955000 0 0 0 0 0 0 0 0 29205000 0 31006000 0 37743000 21367 190 20097 191831;191832;191833;191834 245333;245334;245335;245336 245335 4 ILMAAPGMAIPPFIMNTLEK Oxidation (M) 2173.1349 0.13492562 4195 Q9H9B4 SFXN1 Sideroflexin-1 yes yes 0 1 0 1 3 2 158.09 158.09 2;3 3.5225E-12 164039 QUIQUE_C1368_190116_001 113.61 100.02 140320000 19068000 76905000 44347000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21368 4195 20098 191835;191836;191837;191838;191839;191840 245337;245338;245339;245340;245341;245342 245341 2879;2880 6 ILMAAPGMAIPPFIMNTLEK Unmodified 2157.14 0.140011 4195 Q9H9B4 SFXN1 Sideroflexin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 1 2 1 2 3 3 165.73 165.73 2;3 9.6278E-47 169621 QUIQUE_C1277_190116_001 160.69 140.22 2313500000 222870000 234170000 237610000 233110000 64149000 78437000 316860000 57264000 152930000 15364000 273290000 215330000 212080000 21369 4195 20098 191841;191842;191843;191844;191845;191846;191847;191848;191849;191850;191851;191852;191853;191854;191855;191856;191857;191858;191859;191860;191861;191862;191863;191864 245343;245344;245345;245346;245347;245348;245349;245350;245351;245352;245353;245354;245355;245356;245357;245358;245359;245360;245361;245362;245363;245364;245365;245366;245367;245368;245369;245370;245371;245372;245373 245347 29 ILMAIDSELVDR Unmodified 1373.7225 0.72245152 1534 O43592;F8WDU6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.4 109.4 2 7.2345E-05 114277 QUIQUE_C1218_190116_001 123.75 102.88 250230000 38208000 0 28236000 25769000 26238000 33868000 27194000 0 20468000 24629000 0 0 25620000 21370 1534 20099 191865;191866;191867;191868;191869;191870;191871;191872;191873 245374;245375;245376;245377;245378;245379;245380;245381;245382;245383;245384 245375 9 ILMAINGK Unmodified 858.49971 0.49970921 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.782 44.782 2 0.015866 41564 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.064 37.297 685080000 106120000 74450000 0 55644000 58527000 0 0 85848000 68321000 66127000 86097000 83944000 0 21371 1391 20100 191874;191875;191876;191877;191878;191879;191880;191881;191882;191883 245385;245386;245387;245388;245389;245390;245391;245392;245393;245394;245395;245396;245397;245398 245394 14 ILMDKPEMNVVLK Unmodified 1528.8357 0.83570714 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 1 2 1 1 78.919 78.919 2;3 3.4697E-05 79699 QUIQUE_C1368_190116_001 102.73 69.142 3325300000 397620000 355660000 335610000 331970000 287190000 284390000 0 353770000 0 95953000 344050000 247580000 291510000 21372 959 20101 191884;191885;191886;191887;191888;191889;191890;191891;191892;191893;191894;191895;191896;191897;191898;191899 245399;245400;245401;245402;245403;245404;245405;245406;245407;245408;245409;245410;245411;245412;245413;245414;245415;245416 245403 15 ILMDSPEDADLFHSEEIK Unmodified 2087.9721 0.97213685 4599 Q9Y478;F5H4Y8 PRKAB1 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 107.86 107.86 3 0.016487 110812 QUIQUE_C1403_190116_001 35.625 27.404 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type I-beta regulatory subunit no no 0 1 0 1 26.792 26.792 2 0.054567 20965 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.721 22.983 74026000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74026000 21375 2002;2330 20103 191907 245424 245424 1 ILMLGLDAAGK Unmodified 1100.6264 0.62636629 2753 P62330 ARF6 ADP-ribosylation factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.807 97.807 2 0.0017273 100156 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.749 49.909 911280000 62238000 64681000 86809000 75559000 49561000 74118000 92827000 49518000 83994000 23212000 98904000 67122000 82732000 21376 2753 20104 191908;191909;191910;191911;191912;191913;191914;191915;191916;191917;191918;191919;191920 245425;245426;245427;245428;245429;245430;245431;245432;245433;245434;245435;245436;245437;245438;245439;245440 245439 13 ILMPSLSPTMEEGNIVK Unmodified 1857.958 0.95800712 1399 O00330 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.59 119.59 2 2.7855E-05 125302 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.02 77.143 492800000 0 0 0 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factor 1;ADP-ribosylation factor 3;ADP-ribosylation factor 4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.202 64.202 2 0.011203 63211 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.216 42.661 1655800000 156560000 249540000 307250000 0 0 0 263890000 0 186810000 0 267750000 0 224040000 21379 2828;2827;2134 20106 191937;191938;191939;191940;191941;191942;191943;191944 245458;245459;245460;245461;245462;245463;245464;245465 245465 1474 7 ILNAHMDSLQWIDQNSALLQR Unmodified 2465.2485 0.24852691 1362 M0QXN5;P37198 NUP62 Nuclear pore glycoprotein p62 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 129.64 129.64 3 3.4132E-07 135821 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.107 76.746 295080000 0 0 37444000 50213000 39368000 39516000 0 41226000 41737000 0 45573000 0 0 21380 1362 20107 191945;191946;191947;191948;191949;191950;191951 245466;245467;245468;245469;245470;245471;245472;245473 245473 5 ILNCDTITQVK Unmodified 1303.6806 0.6805867 4227 Q9HCM2 PLXNA4 Plexin-A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 56.326 56.326 2 0.030078 54592 QUIQUE_C1368_190116_001 51.276 29.19 65352000 0 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Unmodified 917.53345 0.53345218 4420 Q9UG56;H0Y7P7;B1AKM8;B1AKM6 PISD Phosphatidylserine decarboxylase proenzyme;Phosphatidylserine decarboxylase alpha chain;Phosphatidylserine decarboxylase beta chain yes no 0 0 0 1 60.588 60.588 2 0.028082 59764 QUIQUE_C1218_190116_001 69.093 15.037 18649000 18649000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21387 4420 20114 191978 245500 245500 1 ILNFLMHPK Unmodified 1111.6212 0.62122133 2384 P35659;B4DFG0;D6RDA2;H0Y8X0 DEK Protein DEK yes no 0 0 0 1 71.644 71.644 3 0.046107 72038 QUIQUE_DMIX3_190116_001 28.096 20.539 8351900 0 0 0 0 0 0 0 0 8351900 0 0 0 0 21388 2384 20115 191979 245501 245501 1 ILNHVLQHAEPGNAQSVLEAIDTYCEQK Unmodified 3176.5561 0.55606148 2189 P21964;E7EMS6;E7EUU8;F8WBW9 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 0 2 1 2 3 1 1 1 1 121.5 121.5 3;4 5.6598E-54 126808 QUIQUE_C1218_190116_001 143.08 132.37 1220600000 111540000 71272000 0 377110000 0 304350000 0 42821000 0 137810000 125330000 50407000 0 21389 2189 20116 191980;191981;191982;191983;191984;191985;191986;191987;191988;191989;191990;191991 245502;245503;245504;245505;245506;245507;245508;245509;245510;245511;245512;245513;245514;245515 245502 11 ILNIFGVIK Unmodified 1015.643 0.64300263 1837 P02786;G3V0E5 TFRC Transferrin receptor protein 1;Transferrin receptor protein 1, serum form yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.76 126.76 2 0.0032955 130603 QUIQUE_C1403_190116_001 91.626 54.606 220810000 17329000 17671000 21317000 22718000 28839000 8597100 19068000 10877000 0 0 26795000 18367000 29227000 21390 1837 20117 191992;191993;191994;191995;191996;191997;191998;191999;192000;192001;192002;192003 245516;245517;245518;245519;245520;245521;245522;245523;245524;245525;245526;245527;245528;245529 245521 14 ILNILTNK Unmodified 927.57532 0.57531699 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.508 65.508 2 0.013835 64531 QUIQUE_C1277_190116_001 86.794 24.077 60578000 0 25127000 0 0 0 23929000 0 0 0 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192015;192016;192017;192018;192019;192020;192021;192022;192023;192024;192025;192026;192027;192028;192029;192030;192031;192032;192033;192034;192035;192036;192037;192038;192039 245541;245542;245543;245544;245545;245546;245547;245548;245549;245550;245551;245552;245553;245554;245555;245556;245557;245558;245559;245560;245561;245562;245563;245564;245565;245566;245567;245568;245569;245570 245543 28 ILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLK Unmodified 2473.2238 0.22375194 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 0 1 1 2 2 82.394 82.394 3;4 3.3837E-08 84788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.352 79.164 1505200000 0 0 75273000 0 0 0 0 0 574540000 0 855420000 0 0 21394 1796 20121 192040;192041;192042;192043;192044 245571;245572;245573;245574;245575 245575 5 ILNNSGLPITSAIDLEDAAK Unmodified 2054.0895 0.089549874 3878 Q96I99;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.93 130.93 2 7.6095E-09 134901 QUIQUE_C1277_190116_001 136.17 115.22 1485200000 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245623;245624;245625;245626;245627;245628;245629;245630;245631;245632;245633;245634;245635;245636;245637;245638;245639;245640 245631 15 ILPEEITNLR Unmodified 1196.6765 0.6764876 4194 Q9H9A6 LRRC40 Leucine-rich repeat-containing protein 40 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.506 90.506 2 0.0018596 89225 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.162 78.012 535710000 84266000 49660000 38800000 43446000 48179000 42804000 49686000 29530000 42580000 0 48600000 58155000 0 21403 4194 20130 192101;192102;192103;192104;192105;192106;192107;192108;192109;192110;192111;192112 245641;245642;245643;245644;245645;245646;245647;245648;245649;245650;245651;245652;245653 245651 12 ILPEIIPILEEGLR Unmodified 1603.9549 0.95489429 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 162.79 162.79 2;3 0.0057688 167338 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.088 43.359 99589000 4784200 0 28543000 8281000 26219000 0 0 0 8944700 0 22817000 0 0 21404 3740 20131 192113;192114;192115;192116;192117;192118;192119;192120 245654;245655;245656;245657;245658;245659;245660;245661 245660 7 ILPEQGLMLTGSADK Unmodified 1571.8229 0.82289384 4541 Q9Y263;E5RIM3;H0YAU9 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes no 0 0 0 1 1 1 93.364 93.364 2 2.6126E-05 94304 QUIQUE_C1403_190116_001 107.18 78.218 28530000 28530000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21405 4541 20132 192121;192122;192123 245662;245663;245664 245663 3 ILPEYLSNWTMEK Unmodified 1622.8014 0.80143012 1756 O95831;E9PMA0 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 126.16 126.16 2 0.0083393 131391 QUIQUE_C1218_190116_001 61.435 44.493 210840000 84913000 0 0 0 0 0 0 53336000 0 0 0 72590000 0 21406 1756 20133 192124;192125;192126 245665;245666;245667 245665 3 ILPEYLSNWTMEK Oxidation (M) 1638.7963 0.79634474 1756 O95831;E9PMA0 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 115.05 115.05 2 0.036513 121088 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.955 29.734 59196000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59196000 0 0 21407 1756 20133 192127 245668 245668 1 ILPGGSAEQTGK Unmodified 1156.6088 0.60880197 4665 Q9Y6V0;H7C261;H7C114 PCLO Protein piccolo yes no 0 0 0 1 1 1 1 20.507 20.507 2 0.00092087 13187 QUIQUE_C1277_190116_001 85.355 56.206 87879000 0 32697000 28483000 0 0 26699000 0 0 0 0 0 0 0 21408 4665 20134 192128;192129;192130;192131 245669;245670;245671;245672 245669 4 ILPHVYPIR Unmodified 1106.66 0.66004968 3389 Q6PCB7 SLC27A1 Long-chain fatty acid transport protein 1 yes yes 0 0 0 1 54.319 54.319 3 0.030742 52799 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.956 10.687 7667100 0 0 0 0 0 0 0 0 7667100 0 0 0 0 21409 3389 20135 192132 245673 245673 1 ILPIMFASLYK Unmodified 1294.7359 0.73591674 3118 Q15172 PPP2R5A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.12 141.12 2 0.0018019 147699 QUIQUE_C1438_190116_001 82.287 67.618 220010000 19479000 20955000 20482000 0 30020000 0 18621000 13968000 24457000 9314500 15840000 25700000 21173000 21410 3118 20136 192133;192134;192135;192136;192137;192138;192139;192140;192141;192142;192143 245674;245675;245676;245677;245678;245679;245680;245681;245682;245683;245684;245685 245677 12 ILPIMFPSLYR Unmodified 1348.7577 0.75771481 1163 H0YJ75;Q13362;Q96B13;H0YN84 PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.66 143.66 2 0.0011036 148643 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.502 75.715 332240000 0 38377000 23372000 22753000 25424000 20685000 34231000 26051000 28093000 8616900 37536000 38397000 28705000 21411 1163 20137 192144;192145;192146;192147;192148;192149;192150;192151;192152;192153;192154;192155 245686;245687;245688;245689;245690;245691;245692;245693;245694;245695;245696;245697;245698;245699 245693 14 ILPLQVRLCPDR Unmodified 1478.8392 0.83915303 520 H0Y5G7;A2RRP1 NBAS Neuroblastoma-amplified sequence yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 3 1 1 1 146.91 146.91 3 0.016741 152734 QUIQUE_C1368_190116_001 38.783 7.8932 404060000 0 31158000 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245730;245731;245732;245733;245734;245735;245736;245737;245738;245739;245740;245741;245742;245743;245744;245745;245746;245747;245748;245749;245750;245751;245752;245753;245754;245755;245756;245757 245738 27 ILPTHTEPR Unmodified 1062.5822 0.58219329 4216 Q9HBI6;V9GYP6 CYP4F11 Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 15.319 15.319 3 0.0096545 7484 QUIQUE_C1368_190116_001 55.461 44.242 70264000 0 0 18565000 15833000 0 0 0 0 0 0 22566000 0 13300000 21417 4216 20143 192202;192203;192204;192205 245758;245759;245760;245761 245758 4 ILPTLEAVAALGNK Unmodified 1408.829 0.8289655 626 B4DY09;Q12905;X6R6Z1 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 122.87 122.87 2;3 6.6293E-05 126716 QUIQUE_C1277_190116_001 108.17 95.292 4925800000 426510000 491980000 390440000 345630000 423860000 319700000 376940000 348230000 349490000 128560000 527250000 416100000 381080000 21418 626 20144 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ILQAIQLLPK Unmodified 1135.7329 0.73288027 1160 H0YI72;Q7Z6G8 ANKS1B Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain-containing protein 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.29 105.29 2 0.0015824 108854 QUIQUE_C1277_190116_001 95.909 76.132 198830000 24813000 25329000 0 18407000 16247000 0 19455000 0 14188000 6473400 23779000 27611000 22524000 21426 1160 20152 192260;192261;192262;192263;192264;192265;192266;192267;192268;192269;192270;192271;192272 245822;245823;245824;245825;245826;245827;245828;245829;245830;245831;245832;245833;245834;245835;245836;245837 245825 16 ILQALHECLAALPR Unmodified 1603.8868 0.8868315 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 1 95.557 95.557 3 0.0099122 98679 QUIQUE_C1218_190116_001 40.315 31.931 32927000 16809000 16119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21427 212 20153 192273;192274 245838;245839 245838 2 ILQAVNFPFLVK Unmodified 1387.8228 0.82275791 2126 P17612;Q15136;K7ERP6 PRKACA;KIN27 cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.97 137.97 2 7.5263E-06 142861 QUIQUE_C1368_190116_001 133.23 96.839 2676000000 178430000 250910000 274440000 250090000 248510000 0 244510000 177540000 235750000 91363000 271070000 207360000 246080000 21428 2126 20154 192275;192276;192277;192278;192279;192280;192281;192282;192283;192284;192285;192286 245840;245841;245842;245843;245844;245845;245846;245847;245848;245849;245850;245851 245842 11 ILQAVNFPFLVR Unmodified 1415.8289 0.82890592 167 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1 PRKACB cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.57 140.57 2 1.7802E-07 145257 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.35 115.32 3574500000 293470000 317270000 253620000 235850000 276160000 190770000 243450000 318680000 306750000 150140000 351010000 312350000 325020000 21429 167 20155 192287;192288;192289;192290;192291;192292;192293;192294;192295;192296;192297;192298;192299 245852;245853;245854;245855;245856;245857;245858;245859;245860;245861;245862;245863;245864;245865;245866;245867;245868;245869 245869 18 ILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVR Unmodified 2960.5104 0.51043191 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 2 2 167.6 167.6 3;4 1.462E-109 171559 QUIQUE_DMIX7_190116_001 185.7 178.83 1822600000 57610000 140460000 241500000 66584000 78873000 137100000 74054000 142840000 224930000 10125000 428530000 219990000 0 21430 1492 20156 192300;192301;192302;192303;192304;192305;192306;192307;192308;192309;192310;192311;192312;192313;192314;192315;192316;192317 245870;245871;245872;245873;245874;245875;245876;245877;245878;245879;245880;245881;245882;245883;245884;245885;245886;245887 245886 17 ILQDDIESLMPIVYTPTVGLACSQYGHIFR Unmodified 3435.7207 0.72068396 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PQT3;A0A1W2PQY8;A0A1W2PQ37;A0A1W2PQF8;A0A1W2PR68;A0A1W2PRS2;A0A1W2PRY9;A0A1W2PQH4;A0A1W2PPY2 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 0 0 1 164.58 164.58 3 0.0021801 172044 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.916 39.809 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21431 374 20157 192318 245888 245888 1 ILQDGGLQVVEK Unmodified 1297.7242 0.72416608 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34;A0A286YFF3;A0A286YFK5 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 65.063 65.063 2 8.4018E-06 65241 QUIQUE_C1218_190116_001 132.32 74.359 16606000000 1277300000 1264100000 1490700000 1096500000 1266500000 1374600000 1264600000 1356000000 1354600000 789290000 1365200000 1294200000 1412300000 21432 404 20158 192319;192320;192321;192322;192323;192324;192325;192326;192327;192328;192329;192330;192331;192332;192333;192334 245889;245890;245891;245892;245893;245894;245895;245896;245897;245898;245899;245900;245901;245902;245903;245904;245905;245906;245907;245908;245909;245910;245911;245912;245913 245890 25 ILQDIASGSHPFSQVLK Unmodified 1838.989 0.98904797 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 91.459 91.459 2;3 1.5738E-10 92749 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.152 76.97 4712000000 556010000 335270000 448590000 332590000 209600000 369830000 324940000 357520000 413130000 271200000 399650000 369560000 324070000 21433 2280 20159 192335;192336;192337;192338;192339;192340;192341;192342;192343;192344;192345;192346;192347;192348 245914;245915;245916;245917;245918;245919;245920;245921;245922;245923;245924;245925;245926;245927;245928;245929;245930;245931 245924 18 ILQDSLGGNCR Unmodified 1231.5979 0.5979197 2355;1568;2946 P33176;C9JWB9;O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840;J3KNA1 KIF5B;KIF5C;KIF5A Kinesin-1 heavy chain;Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.348 37.348 2 0.00097519 32325 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.062 45.637 2113500000 194240000 122520000 197400000 185190000 164680000 155390000 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20162 192370;192371;192372 245953;245954;245955 245953 3 ILQEDPTNTAAR Unmodified 1327.6732 0.67319314 3094 Q15006;H0YAS9 EMC2 ER membrane protein complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.486 31.486 2 0.00052036 26152 QUIQUE_C1403_190116_001 96.015 41.466 618500000 54805000 53267000 67870000 49758000 38647000 46476000 48578000 0 56476000 19049000 79461000 45208000 58905000 21437 3094 20163 192373;192374;192375;192376;192377;192378;192379;192380;192381;192382;192383;192384;192385 245956;245957;245958;245959;245960;245961;245962;245963;245964;245965;245966;245967;245968;245969 245959 14 ILQEGVDPK Unmodified 997.54441 0.5444108 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.634 26.634 2 0.0063921 21275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.498 55.349 3965000000 0 508420000 0 548680000 0 497100000 0 381390000 523530000 274080000 701850000 0 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dipeptidyl peptidase 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.952 19.952 2 0.031782 12444 QUIQUE_C1277_190116_001 89.673 20.241 299730000 51347000 51657000 59070000 0 51094000 49538000 0 0 0 0 0 37028000 0 21441 3603 20167 192408;192409;192410;192411;192412;192413 245992;245993;245994;245995;245996;245997 245993 6 ILQEIHRR Unmodified 1063.6251 0.62506115 3603 Q8N608 DPP10 Inactive dipeptidyl peptidase 10 yes yes 0 0 1 1 12.551 12.551 3 0.016293 4739 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.786 23.624 3135600 0 0 0 0 0 0 0 3135600 0 0 0 0 0 21442 3603 20168 192414 245998 245998 1 ILQELPSVSQETLK Unmodified 1583.877 0.8770379 3942 Q96ST2;A0A1B0GW95 IWS1 Protein IWS1 homolog yes no 0 0 0 1 90.591 90.591 2 0.022108 92997 QUIQUE_C1218_190116_001 53.013 29.408 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21443 3942 20169 192415 245999 245999 1 ILQEYITQEGHK Unmodified 1457.7514 0.75144346 4065 Q9BXS5;E7ENJ6;K7EJL1;K7EPJ8;A0A087WZX7 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 45.499 45.499 2;3 0.00044118 42947 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.46 117.16 845240000 59670000 56547000 0 146710000 172490000 25808000 49429000 37265000 0 16662000 188740000 45026000 46891000 21444 4065 20170 192416;192417;192418;192419;192420;192421;192422;192423;192424;192425;192426;192427;192428;192429;192430;192431;192432;192433;192434;192435;192436 246000;246001;246002;246003;246004;246005;246006;246007;246008;246009;246010;246011;246012;246013;246014;246015;246016;246017;246018;246019;246020;246021;246022 246010 23 ILQGAPEILDR Unmodified 1223.6874 0.68738664 3484 Q86TP1;A0A3B3ITN0 PRUNE Protein prune homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 79.711 79.711 2 0.0025514 81860 QUIQUE_C1438_190116_001 100.48 51.059 326070000 42714000 52318000 35139000 38443000 39765000 37855000 0 0 39293000 0 0 40542000 0 21445 3484 20171 192437;192438;192439;192440;192441;192442;192443;192444 246023;246024;246025;246026;246027;246028;246029;246030 246027 1 ILQHFHSESK Unmodified 1224.6251 0.62512073 3622 Q8NB37;H0YE25;H0YF25;E9PLI5 PDDC1 Parkinson disease 7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 10.881 10.881 3 0.039489 3343 QUIQUE_DMIX4_190116_001 29.063 12.037 2654500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2654500 0 0 0 21446 3622 20172 192445 246031 246031 1 ILQHSHGIEEER Unmodified 1446.7215 0.72154031 3773 V9GYM8;Q92974 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 2 3 1 2 1 2 3 1 13.96 13.96 2;3;4 0.0014495 5709 QUIQUE_C1563_190116_001 65.563 49.807 598030000 65361000 129880000 49556000 50526000 15590000 146680000 105850000 0 0 0 0 0 34587000 21447 3773 20173 192446;192447;192448;192449;192450;192451;192452;192453;192454;192455;192456;192457;192458;192459;192460 246032;246033;246034;246035;246036;246037;246038;246039;246040;246041;246042;246043;246044;246045;246046 246041 8 ILQHSHGIEEERQDLTTALGLVK Unmodified 2586.3766 0.37656419 3773 V9GYM8;Q92974 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 1 1 93.313 93.313 4 0.068235 95409 QUIQUE_DMIX7_190116_001 19.76 12.99 55763000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55763000 0 21448 3773 20174 192461 246047 246047 1 ILQISPEGPLQGRR Unmodified 1562.8893 0.88927434 457 A0A2R8YD85;Q96BY6 DOCK10 Dedicator of cytokinesis protein 10 yes no 0 0 1 1 66.653 66.653 3 0.050825 66150 QUIQUE_C1277_190116_001 29.689 1.7058 26951000 0 26951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21449 457 20175 192462 246048 246048 1 ILQLCMGNHELYMR Unmodified 1776.8474 0.84735123 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 94.447 94.447 2;3 1.0714E-29 96832 QUIQUE_C1368_190116_001 171.29 144.76 3446900000 337450000 540320000 151510000 259640000 254350000 163740000 330420000 236540000 176820000 50665000 436060000 275840000 233540000 21450 859 20176 192463;192464;192465;192466;192467;192468;192469;192470;192471;192472;192473;192474;192475;192476;192477;192478 246049;246050;246051;246052;246053;246054;246055;246056;246057;246058;246059;246060;246061;246062;246063;246064;246065;246066;246067 246055 19 ILQLCMGNHELYMR Oxidation (M) 1792.8423 0.84226585 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 3 1 2 4 1 77.523 77.523 2;3 6.2766E-06 75234 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.17 88.893 900500000 0 0 0 49370000 52417000 0 48814000 0 314340000 31156000 48906000 275810000 79688000 21451 859 20176 192479;192480;192481;192482;192483;192484;192485;192486;192487;192488;192489;192490;192491;192492;192493;192494 246068;246069;246070;246071;246072;246073;246074;246075;246076;246077;246078;246079;246080;246081;246082;246083;246084;246085;246086 246072 514;515 17 ILQLGPPGTK Unmodified 1022.6124 0.61243078 2856 Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 55.721 55.721 2 0.00076103 53659 QUIQUE_C1563_190116_001 106.6 55.027 2152400000 227340000 0 237110000 181180000 194990000 151560000 251800000 147600000 134710000 80542000 181820000 200390000 163330000 21452 2856 20177 192495;192496;192497;192498;192499;192500;192501;192502;192503;192504;192505;192506;192507 246087;246088;246089;246090;246091;246092;246093;246094;246095;246096;246097;246098;246099;246100;246101 246092 14 ILQLVATGAVR Unmodified 1139.7026 0.70264277 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;H7C0R3;A0A0U1RQQ5;A0A1B0GTT3 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 74.642 74.642 2 0.00044387 75574 QUIQUE_C1438_190116_001 104.2 45.283 189150000 37148000 39145000 0 0 37719000 0 0 26150000 0 18712000 0 30280000 0 21453 2496 20178 192508;192509;192510;192511;192512;192513 246102;246103;246104;246105;246106;246107 246104 5 ILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEK Oxidation (M) 3432.7408 0.74081028 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 1 1 1 167.28 167.28 3 5.2902E-126 174655 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.17 182.85 114320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 114320000 0 0 21454 2527 20179 192514 246108 246108 1961 1 ILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDVVITEK Unmodified 3416.7459 0.74589566 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 1 1 168.82 168.82 3 1.0851E-23 176217 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Unmodified 1482.8558 0.85584895 1119 H0Y465;P21359;J3KSB5 NF1 Neurofibromin;Neurofibromin truncated yes no 0 0 0 1 83.32 83.32 3 0.058241 85039 QUIQUE_DMIX3_190116_001 29.979 19.927 13889000 0 0 0 0 0 0 0 0 13889000 0 0 0 0 21458 1119 20182 192529 246125 246125 1 ILQSLSAAQELDPLTVR Unmodified 1853.0258 0.025827405 1729 O95396 MOCS3 Adenylyltransferase and sulfurtransferase MOCS3;Molybdopterin-synthase adenylyltransferase;Molybdopterin-synthase sulfurtransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 126.68 126.68 2 0.00054705 129977 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.987 57.776 155340000 0 0 0 0 41034000 0 0 32192000 19631000 0 0 0 62478000 21459 1729 20183 192530;192531;192532;192533 246126;246127;246128;246129;246130 246127 5 ILQVSFK Unmodified 833.50109 0.50108942 3152 Q15717 ELAVL1 ELAV-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 58.468 58.468 2 0.057389 57172 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.912 10.554 178340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98422000 0 79918000 21460 3152 20184 192534;192535 246131;246132 246132 2 ILREEGPSAFWK Unmodified 1431.751 0.75104953 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 1 1 69.254 69.254 3 0.030416 68961 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.357 31.957 49268000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49268000 0 21461 1655 20185 192536 246133 246133 1 ILRPALLPGEEIVCEGLR Unmodified 2034.1296 0.12958097 3507 Q86WG5 SBF2 Myotubularin-related protein 13 yes yes 0 0 1 1 115.25 115.25 3 0.053145 121203 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.37 23.313 28063000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28063000 0 0 21462 3507 20186 192537 246134 246134 1 ILRPGGCLFLK Unmodified 1272.7376 0.73764807 1208 H3BV90;Q6FI81;H3BUG4;H3BT65;H3BQ23;H3BPG7 CIAPIN1 Anamorsin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.69 66.69 3 0.0034493 66280 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.353 32.666 422420000 45023000 61972000 0 55152000 62585000 0 50293000 17631000 0 0 45244000 41872000 42645000 21463 1208 20187 192538;192539;192540;192541;192542;192543;192544;192545;192546 246135;246136;246137;246138;246139;246140;246141;246142;246143;246144 246143 9 ILSAENIPNLPPGGGLAGK Unmodified 1817.0047 0.0046980325 1652 O75688;C9JIR6;A0A3B3IS24;B8ZZF0 PPM1B Protein phosphatase 1B yes no 0 0 0 1 104.2 104.2 2 0.0029863 107410 QUIQUE_C1277_190116_001 55.188 48.755 14094000 0 14094000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21464 1652 20188 192547 246145 246145 1 ILSAITQPMVVVAIVGLYR Unmodified 2042.1962 0.19620397 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 yes yes 0 0 0 2 168.04 168.04 2;3 0.0021931 175409 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.314 41.897 37013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37013000 0 0 21465 2350 20189 192548;192549 246146;246147 246147 2 ILSCGEVIHVK Unmodified 1253.6802 0.68019277 4150 Q9H2U2;D6R967;H0Y9D8;D6RGV9 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 1 43.448 43.448 2;3 0.0019677 40890 QUIQUE_C1218_190116_001 73.781 66.744 1106000000 102070000 133310000 0 97934000 0 0 135170000 85225000 115960000 60336000 0 194380000 181660000 21466 4150 20190 192550;192551;192552;192553;192554;192555;192556;192557;192558;192559;192560 246148;246149;246150;246151;246152;246153;246154;246155;246156;246157;246158 246148 8 ILSDDVPIR Unmodified 1026.571 0.5709599 2646 P54725;K7ENJ0;K7ELW1 RAD23A UV excision repair protein RAD23 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.963 61.963 2 0.0022276 60972 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.531 56.739 1884800000 179500000 194550000 179740000 180510000 202330000 161750000 186360000 99973000 138440000 0 175070000 0 186540000 21467 2646 20191 192561;192562;192563;192564;192565;192566;192567;192568;192569;192570;192571;192572 246159;246160;246161;246162;246163;246164;246165;246166;246167;246168;246169;246170;246171 246171 10 ILSDVTHSAVFGVPASK Unmodified 1726.9254 0.92538508 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 82.231 82.231 2;3 4.4179E-30 84587 QUIQUE_C1218_190116_001 153.38 133.62 457770000 77503000 55724000 36027000 85649000 30295000 0 0 58369000 40178000 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116.14 2 0.0041512 119484 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.028 44.454 251200000 54971000 0 0 0 42880000 0 72634000 0 26811000 0 0 53910000 0 21471 2632 20195 192591;192592;192593;192594;192595;192596;192597;192598;192599;192600 246190;246191;246192;246193;246194;246195;246196;246197;246198;246199;246200 246200 11 ILSGNLPK Unmodified 840.5069 0.50690308 3331 Q5VIR6;F6VX93;E7EVT8 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 0 1 32.894 32.894 2 0.020821 28529 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.134 30.252 44610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44610000 0 0 21472 3331 20196 192601 246201 246201 1 ILSGPFVQK Unmodified 987.57532 0.57531699 2194 P22102;A0A140TA71 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 56.26 56.26 2 0.036047 53334 QUIQUE_C1563_190116_001 54.611 15.793 64229000 0 0 0 27045000 0 24731000 0 0 0 12453000 0 0 0 21473 2194 20197 192602;192603;192604 246202;246203;246204 246203 2 ILSGQEEGVFGWVTANYLLENFIK Unmodified 2726.3956 0.3955683 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 174.77 174.77 2;3 9.0701E-06 178739 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.257 62.987 50560000 0 0 0 0 0 0 21911000 15811000 12838000 0 0 0 0 21474 4626 20198 192605;192606;192607 246205;246206;246207 246207 3 ILSGRPPLGFLNPR Unmodified 1535.8936 0.89363144 467 A0A2R8YGD1;O14773;A0A2R8Y7U1;A0A2R8YD45 TPP1 Tripeptidyl-peptidase 1 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 87.821 87.821 2;3 1.4071E-14 89813 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.17 87.908 2914800000 155120000 192640000 386510000 178540000 304720000 178170000 212750000 123150000 194230000 112720000 307820000 234700000 333740000 21475 467 20199 192608;192609;192610;192611;192612;192613;192614;192615;192616;192617;192618;192619;192620;192621;192622;192623;192624;192625;192626;192627 246208;246209;246210;246211;246212;246213;246214;246215;246216;246217;246218;246219;246220;246221;246222;246223;246224;246225;246226;246227;246228;246229;246230;246231;246232;246233;246234;246235;246236;246237;246238;246239;246240;246241;246242;246243;246244;246245;246246;246247;246248;246249;246250;246251;246252;246253;246254;246255;246256;246257;246258;246259;246260;246261;246262;246263 246238 56 ILSHGGFR Unmodified 885.48209 0.48208531 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 0 1 1 17.847 17.847 2 0.035663 10134 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.287 20.514 33438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33438000 0 0 0 21476 626 20200 192628;192629 246264;246265 246265 2 ILSHGGFRK Unmodified 1013.577 0.57704833 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 1 1 1 37.825 37.825 2 0.012115 33967 QUIQUE_C1218_190116_001 79.469 0.40986 530820000 248500000 282330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21477 626 20201 192630;192631 246266;246267 246266 2 ILSIDGGGTR Unmodified 987.53491 0.53490874 230 A0A0C4DG51;Q9NP80 PNPLA8 Calcium-independent phospholipase A2-gamma yes no 0 0 0 1 40.966 40.966 2 0.022467 37203 QUIQUE_C1277_190116_001 69.825 17.141 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21478 230 20202 192632 246268 246268 1 ILSIGGGAGEIDLQILSK Unmodified 1783.0091 0.0091147084 2555 P50135 HNMT Histamine N-methyltransferase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 140.23 140.23 2 8.0667E-18 143541 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.68 122.48 923990000 59946000 62348000 29279000 0 41285000 85791000 34056000 177880000 156290000 39300000 58430000 55792000 123590000 21479 2555 20203 192633;192634;192635;192636;192637;192638;192639;192640;192641;192642;192643;192644;192645;192646;192647;192648;192649;192650;192651 246269;246270;246271;246272;246273;246274;246275;246276;246277;246278;246279;246280;246281;246282;246283;246284;246285;246286;246287;246288;246289 246279 16 ILSISADIETIGEILK Unmodified 1713.9764 0.9764176 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 1 1 2 1 166.9 166.9 2;3 1.9341E-20 171979 QUIQUE_C1368_190116_001 146.07 113.55 3682700000 380410000 389390000 385040000 173680000 371230000 273530000 523240000 81032000 237710000 138300000 168950000 408750000 151430000 21480 2735;3319 20204 192652;192653;192654;192655;192656;192657;192658;192659;192660;192661;192662;192663;192664;192665;192666;192667;192668;192669;192670;192671;192672;192673;192674;192675 246290;246291;246292;246293;246294;246295;246296;246297;246298;246299;246300;246301;246302;246303;246304;246305;246306;246307;246308;246309;246310;246311;246312;246313;246314;246315 246296 21 ILSISADIETIGEILKK Unmodified 1842.0714 0.071380614 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 1 2 4 4 1 3 2 2 4 2 1 6 2 3 154.66 154.66 2;3 1.1623E-30 156742 QUIQUE_C1563_190116_001 134.85 118.72 7608500000 405300000 1048000000 321580000 306800000 395450000 326440000 240570000 748840000 673860000 65016000 1136100000 846660000 1093800000 21481 2735;3319 20205 192676;192677;192678;192679;192680;192681;192682;192683;192684;192685;192686;192687;192688;192689;192690;192691;192692;192693;192694;192695;192696;192697;192698;192699;192700;192701;192702;192703;192704;192705;192706;192707;192708;192709;192710;192711 246316;246317;246318;246319;246320;246321;246322;246323;246324;246325;246326;246327;246328;246329;246330;246331;246332;246333;246334;246335;246336;246337;246338;246339;246340;246341;246342;246343;246344;246345;246346;246347;246348;246349;246350;246351;246352;246353;246354;246355;246356;246357;246358;246359;246360;246361 246332 41 ILSLCPEIK Unmodified 1071.5998 0.59981719 1695 O94903;E5RFX7;E5RG77;H0YBG2 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes no 0 0 0 1 78.06 78.06 2 0.043726 79063 QUIQUE_C1218_190116_001 52.482 11.453 105240000 105240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21482 1695 20206 192712 246362 246362 1 ILSLLEGQK Unmodified 999.59645 0.59644637 2587 P51648;J3QRD1;I3L1M4;J3QS00 ALDH3A2 Fatty aldehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.606 70.606 2 0.0021912 70897 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.909 49.894 346870000 31603000 28156000 45889000 0 24240000 32119000 30221000 31145000 40056000 17585000 37649000 0 28207000 21483 2587 20207 192713;192714;192715;192716;192717;192718;192719;192720;192721;192722;192723 246363;246364;246365;246366;246367;246368;246369;246370;246371;246372;246373 246372 11 ILSNESLVQENLYFQR Unmodified 1952.0003 0.0003409361 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 3 1 1 3 2 3 4 2 3 2 4 3 2 114.13 114.13 2;3 1.4895E-185 117724 QUIQUE_C1368_190116_001 322.9 298.04 8871700000 584900000 269410000 567790000 702420000 616440000 771210000 958270000 769370000 882440000 431320000 896080000 700090000 721910000 21484 4560 20208 192724;192725;192726;192727;192728;192729;192730;192731;192732;192733;192734;192735;192736;192737;192738;192739;192740;192741;192742;192743;192744;192745;192746;192747;192748;192749;192750;192751;192752;192753;192754;192755;192756 246374;246375;246376;246377;246378;246379;246380;246381;246382;246383;246384;246385;246386;246387;246388;246389;246390;246391;246392;246393;246394;246395;246396;246397;246398;246399;246400;246401;246402;246403;246404;246405;246406;246407;246408;246409;246410;246411;246412;246413;246414;246415;246416;246417;246418;246419;246420;246421;246422;246423;246424;246425;246426;246427;246428;246429;246430 246380 51 ILSNVFCLIK Unmodified 1205.6842 0.68421552 1124 H0Y599;Q8N1I0;F5GXW1;H0Y7H7 DOCK4 Dedicator of cytokinesis protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 124.86 124.86 2 0.0274 131015 QUIQUE_C1438_190116_001 55.37 3.4209 95769000 0 0 50147000 0 45622000 0 0 0 0 0 0 0 0 21485 1124 20209 192757;192758;192759 246431;246432;246433 246432 3 ILSSDDYGK Unmodified 996.47639 0.47639081 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.258 27.258 2 0.0010141 21711 QUIQUE_C1218_190116_001 107.66 83.033 5262600000 921320000 711040000 314910000 425610000 471720000 298320000 293070000 429880000 253120000 548680000 322840000 0 272070000 21486 2851 20210 192760;192761;192762;192763;192764;192765;192766;192767;192768;192769;192770;192771 246434;246435;246436;246437;246438;246439;246440;246441;246442;246443;246444;246445;246446;246447;246448;246449;246450 246434 17 ILSSDDYGKDLTSVMR Unmodified 1798.8771 0.87711426 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 93.56 93.56 2;3 1.7925E-23 96974 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.78 136.02 2853000000 0 0 0 0 54888000 0 0 877210000 0 0 746460000 639620000 534820000 21487 2851 20211 192772;192773;192774;192775;192776;192777;192778;192779;192780 246451;246452;246453;246454;246455;246456;246457;246458;246459;246460 246454 6 ILSSDDYGKDLTSVMR Oxidation (M) 1814.872 0.87202888 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 1 70.072 70.072 3 0.00075894 69746 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.208 50.994 259630000 0 0 0 0 0 0 0 113520000 0 0 0 146110000 0 21488 2851 20211 192781;192782 246461;246462 246461 2302 1 ILSTIDRELLKPNASVALHK Unmodified 2217.2845 0.28450171 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 2 2 72.746 72.746 4;5 0.022315 72192 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.689 19.097 114870000 0 0 0 0 0 0 0 114870000 0 0 0 0 0 21489 2466 20212 192783;192784 246463;246464 246464 2 ILSVSPIQAEQELEDLVAVDLQWSKPTSENLGHGYFK Unmodified 4140.1055 0.10554087 4205 Q9HAT2 SIAE Sialate O-acetylesterase yes yes 0 0 1 1 167.97 167.97 4 0.0008655 175365 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.884 24.298 112490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112490000 0 0 21490 4205 20213 192785 246465 246465 0 ILTATIENNR Unmodified 1143.6248 0.62478638 760;777 K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;K7EMD9;CON__P13646-1 KRT13 Keratin, type I cytoskeletal 13 no no 0 0 0 1 1 39.299 39.299 2 0.013307 35196 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.948 41.881 190620000 0 0 0 0 0 0 0 0 122900000 67718000 0 0 0 + 21491 760;777 20214 192786;192787 246466;246467 246466 0 ILTDEAVSGWK Unmodified 1217.6292 0.62920306 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 1 1 77.808 77.808 2 0.015101 79163 QUIQUE_C1218_190116_001 78.556 42.684 47605000 0 0 0 0 0 0 0 47605000 0 0 0 0 0 21492 3777 20215 192788;192789;192790 246468;246469;246470 246468 3 ILTDIMWPIIAK Unmodified 1412.8101 0.81014431 2963 Q13057 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.06 150.06 2 0.00051901 155776 QUIQUE_C1218_190116_001 95.502 64.08 732120000 84905000 73895000 121160000 74509000 0 80468000 0 73607000 0 41399000 99317000 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subunit alpha type-6 yes no 0 0 0 1 127.01 127.01 3 1.0004E-10 123400 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.882 76.517 26295000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26295000 0 0 0 21495 1091 20218 192816 246506 246506 1 ILTEAEIDAHLVALAERD Unmodified 1978.0371 0.037120373 1091 G3V5Z7;P60900;H0YJC4 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 2 2 130.15 130.15 3 1.1869E-14 134868 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.89 97.301 710990000 53311000 53600000 54192000 62059000 57335000 50979000 40999000 86812000 48730000 39398000 74468000 89107000 0 21496 1091 20219 192817;192818;192819;192820;192821;192822;192823;192824;192825;192826;192827;192828;192829;192830;192831;192832;192833 246507;246508;246509;246510;246511;246512;246513;246514;246515;246516;246517;246518;246519;246520;246521;246522;246523;246524;246525;246526;246527;246528;246529 246529 23 ILTFDQLALDSPK Unmodified 1459.7922 0.79224564 1079 G3V203;H0YHA7;J3QQ67;Q07020;F8VUA6 RPL18 60S ribosomal protein L18 yes no 0 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246532;246533;246534;246535;246536;246537;246538;246539;246540;246541;246542;246543;246544;246545;246546;246547 246540 15 ILTGGADKNVVVFDK Unmodified 1574.8668 0.86680757 4502 Q9UMS4 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes yes 0 0 1 1 61.892 61.892 2 0.027174 60418 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.03 45.794 30848000 0 0 0 0 0 0 0 30848000 0 0 0 0 0 21500 4502 20223 192849 246548 246548 1 ILTIEIK Unmodified 828.53206 0.5320552 4416 Q9UDY4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes yes 0 0 0 1 1 67.598 67.598 2 0.064916 67998 QUIQUE_C1576_190116_001 66.993 8.8259 50814000 0 0 0 0 0 0 24162000 0 0 0 26652000 0 0 21501 4416 20224 192850;192851 246549;246550 246549 2 ILTIEVK Unmodified 814.51641 0.51640513 2241 P25685;M0R080;M0QYT3;M0QXK0 DNAJB1 DnaJ homolog subfamily B member 1 yes no 0 0 0 1 1 54.169 54.169 2 0.055848 51830 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.715 22.954 143050000 0 0 0 0 0 0 0 55606000 87440000 0 0 0 0 21502 2241 20225 192852;192853 246551;246552 246552 2 ILTLEPTALTICPIPK Unmodified 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Exportin-7 yes no 0 0 1 1 1 94.972 94.972 3 0.018701 96560 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.557 32.923 77526000 0 0 0 0 0 0 0 45527000 0 0 0 31999000 0 21505 4447 20228 192877;192878 246576;246577 246576 1 ILTLSQIGR Unmodified 999.60768 0.60767976 3177 Q16401 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 74.417 74.417 2 0.042881 73768 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.716 11.214 105220000 58003000 0 0 0 0 0 0 47217000 0 0 0 0 0 21506 3177 20229 192879;192880 246578;246579 246579 2 ILTNSNLPEEELDFFEILR Unmodified 2291.1685 0.16852848 1139 H0YAV9;Q9UIV1;H0YBT3 CNOT7 CCR4-NOT transcription complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 167.39 167.39 2 1.087E-05 172428 QUIQUE_C1368_190116_001 126.95 105.39 114890000 0 31595000 32133000 0 0 14771000 0 20071000 0 0 0 0 16324000 21507 1139 20230 192881;192882;192883;192884;192885 246580;246581;246582;246583;246584 246581 4 ILTPALK Unmodified 754.49528 0.49527576 2685 P57772 EEFSEC Selenocysteine-specific elongation factor yes yes 0 0 0 1 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ILTTASSHEFEHTKK Unmodified 1727.8842 0.88424855 3202;735 C9JNZ1;C9JVG3;C9JWG0;C9JQU9;C9JUW1;C9JTZ5;F2Z3H1;Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase no no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 3 2 2 3 2 15.524 15.524 2;3;4 3.4931E-29 7839 QUIQUE_DMIX3_190116_001 179.35 143.39 5483200000 194570000 240200000 287230000 343590000 312270000 135640000 606610000 745590000 639730000 128750000 479600000 734900000 634570000 21516 735;3202 20239 192975;192976;192977;192978;192979;192980;192981;192982;192983;192984;192985;192986;192987;192988;192989;192990;192991;192992;192993;192994;192995;192996;192997;192998;192999;193000;193001 246688;246689;246690;246691;246692;246693;246694;246695;246696;246697;246698;246699;246700;246701;246702;246703;246704;246705;246706;246707;246708;246709;246710;246711;246712;246713;246714 246704 27 ILTTGFSR Unmodified 893.49707 0.49706667 2327 P31146;H3BRY3;H3BTU6;H3BRJ0 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 42.756 42.756 2 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Unmodified 1102.6499 0.64987892 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;A0A140T9X3;H0Y400 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 101.42 101.42 2 6.5314E-13 104218 QUIQUE_C1277_190116_001 167.9 86.605 5303800000 474500000 547020000 432020000 354220000 460250000 457270000 382290000 383780000 356560000 174110000 517220000 423480000 341070000 21524 3027 20246 193093;193094;193095;193096;193097;193098;193099;193100;193101;193102;193103;193104;193105;193106 246838;246839;246840;246841;246842;246843;246844;246845;246846;246847;246848;246849;246850;246851;246852;246853;246854;246855;246856;246857;246858;246859;246860;246861;246862;246863 246842 26 ILVDALQK Unmodified 898.54877 0.54876789 333 B7Z1I9;A0A1B0GTB0;A0A1B0GTU8;A0A1B0GUT7;A0A1B0GVW0;O75787;A0A1B0GWD6;A0A1B0GVI9;A0A1B0GVC7;A0A1B0GWJ8;H7C3E1;B7Z413;A0A1B0GVB9;A0A1C7CYW4;A0A1B0GU12 ATP6AP2 Renin receptor yes no 0 0 0 1 56.057 56.057 2 0.041319 54381 QUIQUE_C1277_190116_001 82.305 41.732 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.931 63.931 2 0.0060722 60962 QUIQUE_DMIX4_190116_001 129.68 38.906 1605900000 0 346030000 215320000 0 273610000 0 283710000 0 289610000 197650000 0 0 0 21536 3926 20258 193216;193217;193218;193219;193220;193221 246987;246988;246989;246990;246991;246992 246992 4 ILVLDDTNHER Unmodified 1323.6783 0.67827852 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0;K7EN66 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 41.137 41.137 2;3 3.1025E-18 38107 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.8 137.72 40703000000 3973200000 4185500000 4112900000 2979100000 3585100000 2751000000 4160300000 2101700000 2197100000 1621200000 4628300000 2013200000 2394300000 21537 1969 20259 193222;193223;193224;193225;193226;193227;193228;193229;193230;193231;193232;193233;193234;193235;193236;193237;193238;193239;193240;193241;193242;193243;193244;193245;193246;193247;193248 246993;246994;246995;246996;246997;246998;246999;247000;247001;247002;247003;247004;247005;247006;247007;247008;247009;247010;247011;247012;247013;247014;247015;247016;247017;247018;247019;247020;247021;247022;247023;247024;247025;247026;247027;247028;247029;247030;247031;247032;247033;247034;247035 247020 43 ILVLDDTNHERER Unmodified 1608.822 0.82198264 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0;K7EN66 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 0 1 2 3 1 2 31.565 31.565 2;3;4 0.0015661 26237 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.93 73.43 708490000 0 0 0 0 0 0 0 189060000 346520000 0 89353000 83564000 0 21538 1969 20260 193249;193250;193251;193252;193253;193254;193255;193256 247036;247037;247038;247039;247040;247041;247042;247043 247041 7 ILVNMAAGQVSIR Unmodified 1370.7704 0.77040476 4313 Q9NWU1;C9J2G3;C9JQQ2 OXSM 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 92.73 92.73 2 0.060941 94189 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.302 34.282 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21539 4313 20261 193257;193258 247044;247045 247044 2 ILVPAAWCTVGRD Unmodified 1456.7497 0.74966932 3468 Q7Z6G3;H3BQC7 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 107.01 107.01 2 0.00056316 109021 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.616 59.105 162230000 0 0 0 0 0 0 0 47935000 61567000 0 0 52725000 0 21540 3468 20262 193259;193260;193261;193262 247046;247047;247048;247049 247047 4 ILVPEGTR Unmodified 883.51272 0.51271674 1997 P10515;H0YDD4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.262 33.262 2 0.0036323 29070 QUIQUE_C1218_190116_001 116.54 75.04 4938600000 452610000 428880000 583370000 381100000 388990000 500120000 546420000 0 0 0 586890000 471070000 599120000 21541 1997 20263 193263;193264;193265;193266;193267;193268;193269;193270;193271;193272 247050;247051;247052;247053;247054;247055;247056;247057;247058;247059 247050 6 ILVPIQQVLK Unmodified 1149.7485 0.74853033 2516 P48723 HSPA13 Heat shock 70 kDa protein 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 102.85 102.85 2 0.030743 106748 QUIQUE_C1218_190116_001 75.243 62.247 121980000 59396000 0 0 34751000 0 0 0 27838000 0 0 0 0 0 21542 2516 20264 193273;193274;193275 247060;247061;247062 247060 1 ILVPLVLLR Unmodified 1034.7216 0.7215873 4062 Q9BXK5;A0A087WX97 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.44 135.44 2 0.00049784 139729 QUIQUE_C1277_190116_001 114.19 114.19 1016100000 74561000 83317000 92539000 76829000 93470000 67097000 68892000 0 96483000 52135000 103360000 102870000 104540000 21543 4062 20265 193276;193277;193278;193279;193280;193281;193282;193283;193284;193285;193286;193287 247063;247064;247065;247066;247067;247068;247069;247070;247071;247072;247073;247074;247075;247076 247064 14 ILVPVEVIKPITLK Unmodified 1561.0219 0.021851647 4227 Q9HCM2 PLXNA4 Plexin-A4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 112.27 112.27 3 0.0014898 115206 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Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 172.89 172.89 3 5.3576E-37 177091 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.78 139.12 216250000 0 10086000 0 0 0 0 0 88088000 52963000 0 65114000 0 0 21547 3037 20269 193306;193307;193308;193309 247096;247097;247098;247099 247098 4 ILVSCNNQQDLQEWVEHLQK Unmodified 2480.2118 0.21180705 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5;F6SJA5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.16 124.16 3 1.5518E-05 130002 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.783 67.134 1034700000 104510000 111490000 110660000 0 107920000 93954000 0 84008000 81641000 41416000 100000000 94331000 104760000 21548 465 20270 193310;193311;193312;193313;193314;193315;193316;193317;193318;193319;193320 247100;247101;247102;247103;247104;247105;247106;247107;247108;247109;247110;247111 247109 12 ILVTGGSGLVGK Unmodified 1099.6601 0.66010926 3020 Q13630;E9PKL9;E9PP14;A0A0J9YX13;E9PLH9;E9PP60 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.016 57.016 2 0.01494 56655 QUIQUE_C1218_190116_001 70.399 23.201 513570000 65489000 83216000 0 59661000 0 0 62430000 56712000 43996000 0 80393000 61676000 0 21549 3020 20271 193321;193322;193323;193324;193325;193326;193327;193328 247112;247113;247114;247115;247116;247117;247118;247119 247112 3 ILVTLLHTLER Unmodified 1306.7973 0.79727144 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 2 2 1 3 2 3 2 1 2 2 2 3 2 98.073 98.073 2;3 1.0391E-24 101001 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.41 125.88 3573100000 191180000 270960000 123190000 220880000 313320000 201890000 304070000 121620000 260910000 102570000 562540000 513150000 386810000 21550 4054 20272 193329;193330;193331;193332;193333;193334;193335;193336;193337;193338;193339;193340;193341;193342;193343;193344;193345;193346;193347;193348;193349;193350;193351;193352;193353;193354;193355 247120;247121;247122;247123;247124;247125;247126;247127;247128;247129;247130;247131;247132;247133;247134;247135;247136;247137;247138;247139;247140;247141;247142;247143;247144;247145;247146;247147;247148;247149;247150;247151;247152;247153;247154;247155;247156;247157;247158;247159;247160;247161;247162;247163;247164;247165;247166 247146 45 ILVTSNDSR Unmodified 1003.5298 0.52982336 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 1 20.219 20.219 2 0.0085323 13218 QUIQUE_C1368_190116_001 78.516 28.39 80790000 0 0 80790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21551 3277 20273 193356;193357 247167;247168 247167 2 ILVVIEPLLIDEDYYAR Unmodified 2033.1085 0.1084944 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 161.3 161.3 2;3 2.5473E-17 163705 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.94 115.19 82257000 0 0 0 0 0 0 0 41748000 30455000 10054000 0 0 0 21552 1644 20274 193358;193359;193360;193361 247169;247170;247171;247172 247170 4 ILVVVLQEK Unmodified 1039.6641 0.664132 4180 Q9H6U6 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2911 20277 193364 247175 247175 1 ILWQGTEDLSVPGVEHEAR Unmodified 2135.0647 0.064732107 1560 O43924;B8ZZK5;C9IZ52 PDE6D Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 104.83 104.83 2;3 6.2544E-06 108386 QUIQUE_C1368_190116_001 95.094 86.735 1629800000 111720000 92964000 115460000 100940000 131110000 77752000 129060000 138350000 174640000 0 140030000 170320000 247440000 21556 1560 20278 193365;193366;193367;193368;193369;193370;193371;193372;193373;193374;193375;193376;193377 247176;247177;247178;247179;247180;247181;247182;247183;247184;247185;247186;247187;247188 247178 12 ILWVQAMYR Unmodified 1178.627 0.62703499 4494;981;1154 F1T0E5;C9IYE1;A0A087X1P3;Q86UW7;F8W8P5;H7BYR4;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS;CADPS2 Calcium-dependent secretion activator 2;Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.56 109.56 2 2.6202E-06 112323 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.51 84.828 364010000 37050000 44266000 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light polypeptide 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.405 57.405 2 6.6384E-05 56106 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.71 126.5 3125700000 256640000 335950000 326480000 233160000 262220000 270680000 262140000 183000000 217200000 58994000 260650000 192340000 266300000 21571 2080;1048 20291 193517;193518;193519;193520;193521;193522;193523;193524;193525;193526;193527;193528;193529 247357;247358;247359;247360;247361;247362;247363;247364;247365;247366;247367;247368;247369;247370;247371;247372;247373 247371 16 ILYSQCGDVMR Oxidation (M) 1356.6166 0.61660624 1048;2080 P14649;F8W1I5;F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;F8VPF3 MYL6B;MYL6 Myosin light chain 6B;Myosin light polypeptide 6 no no 0 1 0 1 39.167 39.167 2 0.048184 35051 QUIQUE_C1277_190116_001 47.187 33.834 103180000 0 103180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21572 2080;1048 20291 193530 247374 247374 1 ILYTWTPGTLLHYGR Unmodified 1789.9515 0.95154025 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.792 30.792 2 0.00042928 25325 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.74 90.439 1520300000 147940000 159370000 174350000 139800000 0 140560000 149950000 103970000 114790000 0 142090000 145300000 102130000 21575 2050 20294 193553;193554;193555;193556;193557;193558;193559;193560;193561;193562;193563 247404;247405;247406;247407;247408;247409;247410;247411;247412;247413;247414;247415;247416;247417 247416 12 IMATSGVVAVR Unmodified 1102.6169 0.61686423 1060 F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 47.948 47.948 2 0.013011 45515 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.621 35.548 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21576 1060 20295 193564;193565 247418;247419 247419 2 IMCCVAQQASEK Unmodified 1423.6258 0.62579071 1283 J3KR97;Q9BTW9;A0A0J9YWI5;A0A0J9YVR1 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.292 30.292 2 0.00016342 25540 QUIQUE_C1218_190116_001 103.26 88.582 74423000 0 33247000 0 0 27459000 0 0 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transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 1 0 2 168.04 168.04 2;3 0.00019607 161971 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.009 48.3 8737200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8737200 0 0 0 21580 2427 20298 193579;193580 247433;247434 247433 1852 2 IMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGK Unmodified 3035.5929 0.59294748 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.33 166.33 3 2.094E-31 171926 QUIQUE_C1576_190116_001 120.6 109.59 969660000 42960000 55363000 73996000 37160000 45828000 88803000 75099000 85080000 107270000 12724000 111880000 95061000 138420000 21581 2427 20299 193581;193582;193583;193584;193585;193586;193587;193588;193589;193590;193591;193592;193593 247435;247436;247437;247438;247439;247440;247441;247442;247443;247444;247445;247446;247447;247448;247449;247450;247451 247445 16 IMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGK Oxidation (M) 3051.5879 0.5878621 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 1 1 1 160.99 160.99 3 0.00032357 166562 QUIQUE_C1368_190116_001 45.957 43.436 26919000 0 0 26919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21582 2427 20299 193594 247452 247452 1852 1 IMDLLGDQVK Unmodified 1130.6005 0.60054547 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.077 89.077 2 0.00028766 92177 QUIQUE_C1218_190116_001 116.05 68.969 1853000000 149390000 180490000 167990000 168070000 143350000 153430000 149210000 105490000 100830000 53311000 204060000 159920000 117450000 21583 2179 20300 193595;193596;193597;193598;193599;193600;193601;193602;193603;193604;193605;193606;193607 247453;247454;247455;247456;247457;247458;247459;247460;247461;247462;247463;247464;247465;247466;247467;247468;247469;247470;247471;247472;247473 247454 21 IMDLLGDQVK Oxidation (M) 1146.5955 0.59546009 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 1 0 1 67.565 67.565 2 0.033579 63517 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.064 28.68 35469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35469000 0 0 0 21584 2179 20300 193608 247474 247474 1 IMDLLGDR Unmodified 931.4797 0.47970205 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.955 79.955 2 0.00070147 77220 QUIQUE_DMIX4_190116_001 150.84 59.253 5982200000 508410000 501290000 505280000 479420000 331680000 419970000 335910000 527020000 559430000 233310000 660880000 461030000 458620000 21585 2261 20301 193609;193610;193611;193612;193613;193614;193615;193616;193617;193618;193619;193620;193621 247475;247476;247477;247478;247479;247480;247481;247482;247483;247484;247485;247486;247487;247488;247489;247490;247491;247492;247493;247494;247495;247496;247497;247498;247499;247500;247501;247502 247493 28 IMDLLGDR Oxidation (M) 947.47462 0.47461667 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 54.339 54.339 2 0.010074 52306 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.114 55.323 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247509;247510;247511;247512;247513;247514;247515;247516;247517;247518;247519;247520;247521;247522;247523;247524 247517 1113 14 IMDPNIVGSEHYDVAR Unmodified 1814.8621 0.8621329 1900 P06576;H0YH81 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 2 2 1 72.652 72.652 2;3 2.7303E-19 72494 QUIQUE_C1403_190116_001 168.61 144.26 40742000000 4584800000 4194600000 4856600000 3431600000 2570500000 3988700000 525060000 3021500000 3464100000 1062700000 4811500000 3712900000 517080000 21589 1900 20303 193644;193645;193646;193647;193648;193649;193650;193651;193652;193653;193654;193655;193656;193657;193658;193659;193660;193661;193662;193663;193664;193665;193666;193667;193668 247525;247526;247527;247528;247529;247530;247531;247532;247533;247534;247535;247536;247537;247538;247539;247540;247541;247542;247543;247544;247545;247546;247547;247548;247549;247550;247551;247552 247534 23 IMDQAITVGAPVIGLNDSGGAR Unmodified 2154.1103 0.11030209 739 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IMNTFSVVPSPK Unmodified 1318.6955 0.69550848 2797;1862;1922;3006;1364 P04350;M0R2D3;Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;G3V2A3;M0QYM7;M0R042 TUBB4A;TUBB;TUBB4B;TUBB3 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain no no 0 0 0 1 3 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 91.237 91.237 2;3 6.2086E-10 84890 QUIQUE_C1438_190116_001 156.12 100.11 115850000000 8333900000 10606000000 8442700000 8398700000 8507700000 7093400000 10818000000 9064000000 9094100000 2353200000 12241000000 9095200000 11806000000 21634 1862;1922;2797;3006;1364 20339 194111;194112;194113;194114;194115;194116;194117;194118;194119;194120;194121;194122;194123;194124;194125;194126;194127;194128 248135;248136;248137;248138;248139;248140;248141;248142;248143;248144;248145;248146;248147;248148;248149;248150;248151;248152;248153;248154;248155;248156;248157;248158;248159;248160;248161;248162;248163;248164;248165;248166;248167;248168;248169;248170;248171;248172;248173;248174;248175;248176;248177;248178;248179;248180;248181;248182;248183;248184;248185;248186;248187;248188;248189;248190;248191;248192;248193;248194;248195 248157 61 IMNVIGEPIDER Oxidation (M) 1400.697 0.69696505 1900 P06576;H0YH81;F8W079 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 1 0 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 65.4 65.4 2 7.3854E-06 63979 QUIQUE_DMIX8_190116_001 134.59 121.24 6604600000 722080000 679760000 468300000 509320000 534240000 707580000 289690000 294500000 645870000 236940000 492850000 638140000 385300000 21635 1900 20340 194129;194130;194131;194132;194133;194134;194135;194136;194137;194138;194139;194140;194141;194142;194143;194144;194145;194146;194147;194148;194149 248196;248197;248198;248199;248200;248201;248202;248203;248204;248205;248206;248207;248208;248209;248210;248211;248212;248213;248214;248215;248216;248217;248218;248219;248220;248221;248222;248223;248224;248225;248226;248227;248228 248228 1114 33 IMNVIGEPIDER Unmodified 1384.7021 0.70205043 1900 P06576;H0YH81;F8W079 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.078 83.078 2 1.4751E-07 85792 QUIQUE_C1218_190116_001 147.95 115.11 31218000000 3279500000 2722700000 3357700000 2184900000 1753300000 2818500000 2699400000 1226000000 2300000000 925740000 3206800000 2309900000 2433100000 21636 1900 20340 194150;194151;194152;194153;194154;194155;194156;194157;194158;194159;194160;194161;194162 248229;248230;248231;248232;248233;248234;248235;248236;248237;248238;248239;248240;248241;248242;248243;248244;248245;248246;248247;248248 248229 20 IMNVIGEPIDERGPIK Oxidation (M) 1795.9502 0.95021962 1900 P06576;H0YH81;F8W079 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 1 1 1 68.713 68.713 2 3.4375E-06 67872 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.86 91.862 29542000 0 0 0 0 0 0 0 29542000 0 0 0 0 0 21637 1900 20341 194163 248249 248249 1114 1 IMNVIGEPIDERGPIK Unmodified 1779.9553 0.955305 1900 P06576;H0YH81;F8W079 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 81.422 81.422 3 9.422E-05 82346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.355 79.07 2764900000 0 0 0 0 0 0 0 1016500000 643140000 0 258690000 410720000 435850000 21638 1900 20341 194164;194165;194166;194167;194168 248250;248251;248252;248253;248254 248250 4 IMPLEDMNEFTTHILEVINAHMVLSK Unmodified 3024.5123 0.51227109 2097 P15927;Q5TEJ7 RPA2 Replication protein A 32 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 170.23 170.23 4 9.4129E-08 174248 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.694 45.952 171510000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58718000 112790000 0 21639 2097 20342 194169;194170 248255;248256 248256 2 IMPTEKEPAR Oxidation (M) 1186.6016 0.6016081 3964 Q99624 SLC38A3 Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3 yes yes 0 1 1 1 1 10.576 10.576 3 0.060134 3066 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.879 30.735 18126000 0 0 0 0 0 0 0 0 9512700 0 0 8613400 0 21640 3964 20343 194171;194172 248257;248258 248257 2 IMPTEKEPAR Unmodified 1170.6067 0.60669348 3964 Q99624 SLC38A3 Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3 yes yes 0 0 1 1 1 16.157 16.157 3 0.013695 8573 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.785 41.116 31354000 0 0 0 0 0 0 0 0 16258000 0 15096000 0 0 21641 3964 20343 194173;194174 248259;248260 248259 2 IMQQMSDHR Unmodified 1144.5117 0.51174723 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 14.671 14.671 2;3 0.0017963 6781 QUIQUE_C1576_190116_001 114.5 97.943 12385000000 1254400000 1363700000 1076200000 1534600000 656920000 2932000000 628050000 133900000 1155700000 498480000 284780000 162670000 704190000 21642 1684 20344 194175;194176;194177;194178;194179;194180;194181;194182;194183;194184;194185;194186;194187;194188;194189;194190;194191;194192;194193;194194;194195;194196 248261;248262;248263;248264;248265;248266;248267;248268;248269;248270;248271;248272;248273;248274;248275;248276;248277;248278;248279;248280;248281;248282;248283;248284 248273 18 IMQQMSDHR Oxidation (M) 1160.5067 0.50666186 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 0 1 13.256 13.256 3 0.0056402 5328 QUIQUE_C1563_190116_001 62.823 54.898 4301500 0 0 0 0 0 4301500 0 0 0 0 0 0 0 21643 1684 20344 194197 248285 248285 922;923 1 IMQQMSDHRYDK Unmodified 1550.697 0.69698182 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 1 2 3 2 3 2 3 3 3 3 3 3 3 3 18.59 18.59 2;3;4 4.5503E-13 11541 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.19 135.63 24561000000 254310000 1800600000 735190000 1291600000 813570000 1019700000 1708500000 2925500000 3269500000 328290000 3641700000 3399000000 3373300000 21644 1684 20345 194198;194199;194200;194201;194202;194203;194204;194205;194206;194207;194208;194209;194210;194211;194212;194213;194214;194215;194216;194217;194218;194219;194220;194221;194222;194223;194224;194225;194226;194227;194228;194229;194230;194231;194232;194233 248286;248287;248288;248289;248290;248291;248292;248293;248294;248295;248296;248297;248298;248299;248300;248301;248302;248303;248304;248305;248306;248307;248308;248309;248310;248311;248312;248313;248314;248315;248316;248317;248318;248319;248320;248321;248322;248323 248308 36 IMQQMSDHRYDK Oxidation (M) 1566.6919 0.69189644 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 1 2 3 2 1 2 1 2 3 2 11.431 11.431 2;3;4 0.00050733 2645 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.059 79.709 756820000 0 0 43972000 22964000 99969000 0 18468000 0 212440000 16883000 138820000 111690000 91608000 21645 1684 20345 194234;194235;194236;194237;194238;194239;194240;194241;194242;194243;194244;194245;194246;194247;194248;194249;194250;194251 248324;248325;248326;248327;248328;248329;248330;248331;248332;248333;248334;248335;248336;248337;248338;248339;248340;248341;248342;248343;248344;248345 248338 922;923 22 IMQSSSEVGYDAMAGDFVNMVEK Oxidation (M) 2523.0968 0.096761796 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.19 142.19 2 3.8754E-50 148988 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.37 144.4 506970000 26045000 31947000 57015000 30497000 23581000 36707000 32949000 40515000 43946000 0 68445000 54704000 60623000 21646 2004 20346 194252;194253;194254;194255;194256;194257;194258;194259;194260;194261;194262;194263 248346;248347;248348;248349;248350;248351;248352;248353;248354;248355;248356;248357 248355 1278 12 IMQSSSEVGYDAMAGDFVNMVEK Unmodified 2507.1018 0.10184717 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 2 1 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 146 146 2;3 3.1102E-23 148712 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.41 148.69 2411600000 253990000 289620000 132280000 72708000 164250000 79737000 273270000 165300000 270450000 56056000 133960000 265880000 254070000 21647 2004 20346 194264;194265;194266;194267;194268;194269;194270;194271;194272;194273;194274;194275;194276;194277;194278;194279;194280;194281;194282;194283;194284;194285;194286 248358;248359;248360;248361;248362;248363;248364;248365;248366;248367;248368;248369;248370;248371;248372;248373;248374;248375;248376;248377;248378;248379;248380;248381 248371 22 IMQVVDEK Unmodified 960.49502 0.49501776 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GW48;A0A1B0GVJ1;A0A1B0GVE7;A0A1B0GU62;A0A1B0GU06;A0A1B0GV95;A0A1B0GUJ3;A0A1B0GVA3;A0A1B0GW66 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 30.515 30.515 2 0.0065537 25739 QUIQUE_C1218_190116_001 101.33 44.225 314690000 78974000 150860000 84858000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21648 341 20347 194287;194288;194289;194290;194291 248382;248383;248384;248385;248386 248382 4 IMQVVDEK Oxidation (M) 976.48993 0.48993238 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GW48;A0A1B0GVJ1;A0A1B0GVE7;A0A1B0GU62;A0A1B0GU06;A0A1B0GV95;A0A1B0GUJ3;A0A1B0GVA3;A0A1B0GW66 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 1 0 1 18.696 18.696 2 0.058003 10862 QUIQUE_C1277_190116_001 55.872 30.574 50684000 0 50684000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21649 341 20347 194292 248387 248387 1 IMRPDDANVAGNVHGGTILK Oxidation (M) 2093.0688 0.068771627 1379 O00154 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.421 47.421 3 0.00012746 44539 QUIQUE_C1218_190116_001 70.917 56.445 394740000 155550000 66928000 0 50445000 52822000 0 36429000 0 0 32569000 0 0 0 21650 1379 20348 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194314;194315 248410;248411 248410 1 IMRPTDVPDTGLLCDLLWSDPDKDVQGWGENDR Unmodified 3812.7774 0.77742357 2740 P62140 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 155.39 155.39 4 1.5501E-65 159391 QUIQUE_C1277_190116_001 138.84 133.58 611240000 56584000 95003000 113210000 86830000 0 81155000 101040000 0 0 0 0 77429000 0 21653 2740 20350 194316;194317;194318;194319;194320;194321;194322 248412;248413;248414;248415;248416;248417;248418;248419 248413 8 IMSIPNLR Unmodified 942.53207 0.53207197 4461 Q9UJW0 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes yes 0 0 0 1 77.035 77.035 2 0.028516 77531 QUIQUE_C1277_190116_001 68.7 18.574 41045000 0 41045000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21654 4461 20351 194323 248420 248420 1 IMSIVDPNR Unmodified 1043.5434 0.54336494 2047;1242 H9KV75;H0YJW3;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.748 54.748 2 0.0010141 53916 QUIQUE_C1438_190116_001 107.66 88.882 795210000 0 0 99924000 107540000 117420000 69050000 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[glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 1 1 1 108.73 108.73 2 0.0034377 114247 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.911 87.958 61801000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61801000 0 0 21663 2554 20357 194373;194374 248479;248480 248480 2 IMYLSEAYFR Unmodified 1291.6271 0.62709457 4660 Q9Y6N5;H3BNX3;H3BMS6 SQRDL Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 110.98 110.98 2 0.0019711 116099 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.11 79.948 141030000 0 0 40291000 41452000 0 0 0 0 29051000 0 30232000 0 0 21664 4660 20358 194375;194376;194377;194378;194379;194380;194381;194382 248481;248482;248483;248484;248485;248486;248487;248488 248486 8 IMYSHLVDYFPEYDGPQR Unmodified 2229.0201 0.0200901 2556 P50148 GNAQ Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 119.62 119.62 3 5.7079E-18 123332 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.43 92.067 1848400000 120000000 152450000 208900000 150350000 92679000 106890000 151010000 111590000 145120000 0 329740000 134460000 145230000 21665 2556 20359 194383;194384;194385;194386;194387;194388;194389;194390;194391;194392;194393;194394;194395;194396 248489;248490;248491;248492;248493;248494;248495;248496;248497;248498;248499;248500;248501;248502;248503;248504;248505;248506;248507;248508 248506 19 IMYSHLVDYFPEYDGPQR Oxidation (M) 2245.015 0.015004722 2556 P50148 GNAQ Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 1 112.52 112.52 3 0.00014484 115811 QUIQUE_C1277_190116_001 71.697 63.705 182730000 0 35976000 0 32334000 35138000 43350000 0 35936000 0 0 0 0 0 21666 2556 20359 194397;194398;194399;194400;194401;194402;194403 248509;248510;248511;248512;248513;248514;248515;248516 248510 1995 6 IMYTVFEHTFHVR Unmodified 1678.829 0.82898227 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 2 3 3 2 1 2 1 2 2 2 2 2 87.367 87.367 2;3;4 1.5534E-17 89617 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.08 120.98 1423500000 0 90331000 217400000 109310000 56104000 25841000 137760000 0 76385000 53723000 312860000 179180000 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194430;194431;194432;194433;194434;194435;194436;194437;194438 248544;248545;248546;248547;248548;248549;248550;248551;248552 248552 7 INAAIQDMPESEEIAQLLSGSYIHYFHCLR Oxidation (M) 3520.6755 0.67552468 3887 Q96JB5;J3QQY1;J3QS62;J3KRK4;J3KS63;J3KRI2;J3QL95 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 1 0 1 1 155.89 155.89 4 1.3149E-37 160214 QUIQUE_C1277_190116_001 112.11 97.406 90268000 0 50511000 0 0 0 39757000 0 0 0 0 0 0 0 21670 3887 20362 194439;194440 248553;248554 248553 2759 2 INAAIQDMPESEEIAQLLSGSYIHYFHCLR Unmodified 3504.6806 0.68061006 3887 Q96JB5;J3QQY1;J3QS62;J3KRK4;J3KS63;J3KRI2;J3QL95 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 0 0 1 162.41 162.41 4 0.00021605 167871 QUIQUE_C1576_190116_001 37.62 31.717 60176000 0 0 0 0 0 0 60176000 0 0 0 0 0 0 21671 3887 20362 194441 248555 248555 1 INAANIATDDER Unmodified 1301.6212 0.62115757 2074 P14415;I3L3J8 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.137 39.137 2 3.499E-45 35847 QUIQUE_C1218_190116_001 196.27 163.01 3790300000 749320000 545980000 493420000 552370000 0 534460000 470920000 0 0 225450000 0 218430000 0 21672 2074 20363 194442;194443;194444;194445;194446;194447;194448;194449;194450;194451 248556;248557;248558;248559;248560;248561;248562;248563;248564;248565;248566 248556 11 INAANIATDDERDK Unmodified 1544.7431 0.74306362 2074 P14415;I3L3J8 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 28.554 28.554 2;3 8.9217E-36 22835 QUIQUE_DMIX4_190116_001 179.19 150.24 4289000000 200200000 220660000 1132400000 0 750310000 130510000 974220000 78647000 175560000 49833000 250860000 139670000 186210000 21673 2074 20364 194452;194453;194454;194455;194456;194457;194458;194459;194460;194461;194462;194463;194464;194465;194466 248567;248568;248569;248570;248571;248572;248573;248574;248575;248576;248577;248578;248579;248580;248581;248582;248583 248579 17 INAANIATDDERDKFAGR Unmodified 1975.9712 0.97116607 2074 P14415;I3L3J8 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes no 0 0 2 1 2 1 2 4 3 3 3 3 49.053 49.053 2;3;4 2.7198E-45 47303 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.95 139.7 7197900000 0 100620000 170850000 81151000 0 0 313050000 2089000000 1279300000 0 1149600000 1020600000 993660000 21674 2074 20365 194467;194468;194469;194470;194471;194472;194473;194474;194475;194476;194477;194478;194479;194480;194481;194482;194483;194484;194485;194486;194487;194488 248584;248585;248586;248587;248588;248589;248590;248591;248592;248593;248594;248595;248596;248597;248598;248599;248600;248601;248602;248603;248604;248605;248606;248607;248608;248609;248610 248593 26 INAANYASVK Unmodified 1049.5506 0.55055881 3881 Q96IU4;F8W9U3;B4DQI4 ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.421 32.421 2 0.0020911 27664 QUIQUE_C1218_190116_001 91.867 50.365 1474500000 276130000 0 0 198070000 216420000 178480000 163440000 0 0 0 0 169000000 272960000 21675 3881 20366 194489;194490;194491;194492;194493;194494;194495;194496 248611;248612;248613;248614;248615;248616;248617;248618 248611 4 INAEFLR Unmodified 861.47085 0.47085192 3125 Q15276;I3L2B8 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 0 1 1 55.212 55.212 2 0.026025 53404 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.777 40.72 70802000 0 0 0 0 0 37324000 0 33478000 0 0 0 0 0 21676 3125 20367 194497;194498 248619;248620 248620 2 INAGLNVIGIPSEIISPK Unmodified 1834.0564 0.056399252 3633 Q8NCN5;A8MT40;H3BQG3 PDPR Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 138.7 138.7 2 0.018218 143157 QUIQUE_C1277_190116_001 43.798 27.544 34810000 0 34810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21677 3633 20368 194499 248621 248621 1 INAGMLAQFIDKPVCFVGR Unmodified 2135.102 0.10198601 2373 P35244 RPA3 Replication protein A 14 kDa subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 140.2 140.2 3 1.1336E-05 145922 QUIQUE_C1368_190116_001 100.77 84.088 301520000 0 46197000 43018000 0 0 0 0 0 93623000 0 0 118680000 0 21678 2373 20369 194500;194501;194502;194503 248622;248623;248624;248625 248623 4 INALTAASEAACLIVSVDETIK Unmodified 2288.1934 0.19336302 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 4 1 1 4 1 2 3 1 1 4 1 2 171.7 171.7 2;3 4.2198E-55 175886 QUIQUE_C1368_190116_001 164.94 154.69 5484800000 317360000 971880000 383630000 171150000 468870000 93557000 689600000 233610000 307990000 118690000 747430000 739950000 241070000 21679 3977 20370 194504;194505;194506;194507;194508;194509;194510;194511;194512;194513;194514;194515;194516;194517;194518;194519;194520;194521;194522;194523;194524;194525;194526;194527;194528;194529 248626;248627;248628;248629;248630;248631;248632;248633;248634;248635;248636;248637;248638;248639;248640;248641;248642;248643;248644;248645;248646;248647;248648;248649;248650;248651;248652 248632 22 INALTAASEAACLIVSVDETIKNPR Unmodified 2655.3902 0.39016535 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 166.13 166.13 3;4 7.5847E-29 168098 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.29 109.97 2512200000 0 57914000 0 35260000 121690000 0 60866000 473690000 231310000 0 425740000 678920000 426780000 21680 3977 20371 194530;194531;194532;194533;194534;194535;194536;194537;194538;194539 248653;248654;248655;248656;248657;248658;248659;248660;248661;248662;248663 248657 11 INAQLPLTDK Unmodified 1111.6237 0.62372375 1355 K7ESP4;Q8WVC6 DCAKD Dephospho-CoA kinase domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.72 57.72 2 0.0023102 55785 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.64 73.871 222640000 36697000 0 23842000 41872000 0 0 0 30335000 57367000 0 0 0 32530000 21681 1355 20372 194540;194541;194542;194543;194544;194545 248664;248665;248666;248667;248668;248669 248669 6 INAVVETGR Unmodified 957.52434 0.52434406 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.033 24.033 2 7.3289E-10 17791 QUIQUE_C1218_190116_001 176.09 52.397 9517500000 1331800000 0 0 1393500000 0 858390000 1272700000 563600000 1200800000 667350000 0 1130400000 1099000000 21682 2851 20373 194546;194547;194548;194549;194550;194551;194552;194553;194554 248670;248671;248672;248673;248674;248675;248676;248677;248678;248679;248680 248670 10 INAVVETGRR Unmodified 1113.6255 0.62545508 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 16.07 16.07 2;3 0.00033989 8262 QUIQUE_DMIX8_190116_001 135.71 72.293 4498300000 0 48414000 46434000 34717000 229180000 0 106550000 705780000 1001700000 0 889750000 958360000 477400000 21683 2851 20374 194555;194556;194557;194558;194559;194560;194561;194562;194563;194564;194565;194566;194567;194568;194569;194570 248681;248682;248683;248684;248685;248686;248687;248688;248689;248690;248691;248692;248693;248694;248695;248696 248696 15 INAWDLYYYMTQTEELK Unmodified 2180.0136 0.013607739 4078 Q9BYT8;E9PCB6;H0YAK4 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 166.14 166.14 3 0.0010051 170708 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.906 50.783 26275000 0 0 0 0 0 0 0 8116900 18158000 0 0 0 0 21684 4078 20375 194571;194572 248697;248698 248698 2 INCLEGTHEFFEAIGFQK Unmodified 2139.0095 0.0095254139 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 1 1 2 134.13 134.13 2;3 8.493E-54 138403 QUIQUE_C1277_190116_001 206.63 185.77 1008600000 134410000 173680000 137870000 75192000 71775000 81350000 0 103020000 67576000 43075000 0 120680000 0 21685 4088 20376 194573;194574;194575;194576;194577;194578;194579;194580;194581;194582;194583;194584;194585;194586;194587;194588 248699;248700;248701;248702;248703;248704;248705;248706;248707;248708;248709;248710;248711;248712;248713;248714;248715;248716 248703 18 INCPVYITK Unmodified 1106.5794 0.57941609 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.249 45.249 2 1.0903E-06 43152 QUIQUE_C1218_190116_001 156.51 107.15 24344000000 2390600000 2391100000 2339700000 2334700000 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52965 QUIQUE_C1576_190116_001 104.32 79.532 581890000 46802000 87102000 106390000 74512000 56352000 0 77918000 15467000 0 0 36648000 31458000 49236000 21688 3246 20379 194614;194615;194616;194617;194618;194619;194620;194621;194622;194623;194624 248745;248746;248747;248748;248749;248750;248751;248752;248753;248754;248755;248756;248757;248758 248751 14 INDDDSFTTFFSETGNGK Unmodified 1993.8541 0.85413021 688 C9J2C0;Q9NY65 TUBA8 Tubulin alpha-8 chain yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.13 126.13 2 4.9505E-64 128761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.35 170.79 776470000 83003000 69213000 50964000 75011000 45135000 57377000 46041000 80546000 80317000 35289000 102280000 0 51298000 21689 688 20380 194625;194626;194627;194628;194629;194630;194631;194632;194633;194634;194635;194636;194637 248759;248760;248761;248762;248763;248764;248765;248766;248767;248768;248769;248770;248771;248772 248767 12 INDDLISEFPDK Unmodified 1404.6773 0.67727546 2954;655 Q12959;A0A0C4DFT3;B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;B5MCC5;H7C325;F8W750 DLG1;DLG2 Disks large homolog 1;Disks large homolog 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.585 99.585 2 7.7749E-14 102419 QUIQUE_C1368_190116_001 185.77 156.3 1352800000 170050000 165990000 111530000 119390000 116330000 149150000 103760000 63319000 84208000 74627000 0 83550000 110940000 21690 2954;655 20381 194638;194639;194640;194641;194642;194643;194644;194645;194646;194647;194648;194649 248773;248774;248775;248776;248777;248778;248779;248780;248781;248782;248783;248784;248785;248786;248787;248788;248789 248776 17 INDDLISEFPDKFGSCVPHTTRPK Unmodified 2772.3541 0.35411419 2954;655 Q12959;A0A0C4DFT3;B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;B5MCC5;H7C325;F8W750 DLG1;DLG2 Disks large homolog 1;Disks large homolog 2 no no 0 0 2 1 1 1 92.454 92.454 5 6.9389E-07 95545 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.614 58.155 142150000 0 0 0 0 0 0 0 51132000 0 0 53509000 37505000 0 21691 2954;655 20382 194650;194651;194652 248790;248791;248792 248791 3 INDRFEFPEQLPLDEFLQK Unmodified 2377.1954 0.19541193 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.83 148.83 3 0.0012176 153328 QUIQUE_C1277_190116_001 58.339 46.717 828980000 68082000 78954000 70527000 38393000 93320000 52507000 0 50934000 78784000 0 112560000 80890000 104030000 21692 3778 20383 194653;194654;194655;194656;194657;194658;194659;194660;194661;194662;194663 248793;248794;248795;248796;248797;248798;248799;248800;248801;248802;248803;248804;248805 248794 10 INDVICLPVER Unmodified 1326.6966 0.69657112 3543 Q8IWZ6 BBS7 Bardet-Biedl syndrome 7 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 91.806 91.806 2 0.0045395 92879 QUIQUE_C1563_190116_001 82.417 51.847 103390000 0 0 34898000 34284000 0 0 34204000 0 0 0 0 0 0 21693 3543 20384 194664;194665;194666;194667;194668 248806;248807;248808;248809;248810 248809 4 INEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGK Oxidation (M) 3395.6119 0.6119046 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87;D6RBK5 MATR3 Matrin-3 yes no 0 1 0 1 168.72 168.72 3 2.099E-14 172752 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.404 72.4 31008000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31008000 0 21694 307 20385 194669 248811 248811 227 1 INEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVR Oxidation (M) 3747.8342 0.8341934 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87;D6RBK5 MATR3 Matrin-3 yes no 0 1 1 1 163.43 163.43 3 6.0707E-10 165703 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.403 58.996 25761000 0 0 0 0 0 0 0 25761000 0 0 0 0 0 21695 307 20386 194670 248812 248812 227 1 INEAFIEMATTEDAQAAVDYYTTTPALVFGKPVR Unmodified 3731.8393 0.83927877 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87;D6RBK5 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 1 1 2 1 1 166.16 166.16 3;4 2.9315E-40 168128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.91 97.851 208230000 0 0 0 0 0 0 0 36595000 82887000 0 51751000 0 37001000 21696 307 20386 194671;194672;194673;194674;194675 248813;248814;248815;248816;248817 248813 5 INEAIVAVQAIIADPK Unmodified 1663.9509 0.95087155 4535 Q9Y224 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 137.57 137.57 2;3 0.00016072 133955 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.689 83.549 841310000 83987000 104020000 72509000 61176000 74078000 67486000 58304000 72493000 75754000 33377000 0 68591000 69530000 21697 4535 20387 194676;194677;194678;194679;194680;194681;194682;194683;194684;194685;194686;194687;194688 248818;248819;248820;248821;248822;248823;248824;248825;248826;248827;248828;248829;248830;248831;248832 248830 15 INEAVECLLSLK Unmodified 1387.7381 0.73810158 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 123.51 123.51 2 0.00058203 126698 QUIQUE_C1403_190116_001 96.229 57.425 168690000 93904000 0 0 0 0 0 0 74786000 0 0 0 0 0 21698 1929 20388 194689;194690;194691 248833;248834;248835 248834 3 INEGFDLLHSGK Unmodified 1328.6725 0.67246486 1774 P00325;D6RHZ6;V9HW50;P07327 ADH1B;HEL-S-117;ADH1A Alcohol dehydrogenase 1B;Alcohol dehydrogenase 1A yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 66.5 66.5 2;3 8.5038E-07 65996 QUIQUE_C1368_190116_001 140.49 77.939 671860000 0 71821000 135330000 48191000 41880000 121000000 63052000 48507000 12755000 20700000 45889000 24052000 38688000 21699 1774 20389 194692;194693;194694;194695;194696;194697;194698;194699;194700;194701;194702;194703;194704;194705;194706;194707 248836;248837;248838;248839;248840;248841;248842;248843;248844;248845;248846;248847;248848;248849;248850;248851;248852;248853 248839 18 INEGLEHLAK Unmodified 1122.6033 0.60332266 3973 Q99747;J3QS28;J3QKW4 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 28.38 28.38 2;3 2.9596E-05 22499 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.84 77.526 4920200000 451900000 485420000 461300000 422980000 414240000 399760000 515580000 333120000 385030000 175490000 202530000 444280000 228520000 21700 3973 20390 194708;194709;194710;194711;194712;194713;194714;194715;194716;194717;194718;194719;194720;194721;194722;194723;194724;194725;194726;194727;194728;194729;194730;194731 248854;248855;248856;248857;248858;248859;248860;248861;248862;248863;248864;248865;248866;248867;248868;248869;248870;248871;248872;248873;248874;248875;248876;248877;248878 248875 19 INEILSNALK Unmodified 1113.6394 0.63937381 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R019 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.646 73.646 2 0.00032041 75019 QUIQUE_C1218_190116_001 134.26 79.484 4543300000 375450000 395600000 429460000 371120000 388280000 326300000 417060000 293320000 319050000 146890000 413390000 319340000 348030000 21701 2603 20391 194732;194733;194734;194735;194736;194737;194738;194739;194740;194741;194742;194743;194744 248879;248880;248881;248882;248883;248884;248885;248886;248887;248888;248889;248890;248891;248892;248893;248894;248895;248896 248879 17 INEILSNALKR Unmodified 1269.7405 0.74048484 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R019 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 1 1 1 57.666 57.666 3 0.00027293 56752 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.962 44.072 66658000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29508000 37150000 0 21702 2603 20392 194745;194746 248897;248898;248899 248897 3 INEKPQVIADYESGR Unmodified 1717.8635 0.8635131 1598 O60869 EDF1 Endothelial differentiation-related factor 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 50.266 50.266 2;3 0.00089874 47832 QUIQUE_C1277_190116_001 109 88.22 145770000 24509000 24984000 0 96278000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21703 1598 20393 194747;194748;194749;194750 248900;248901;248902;248903 248901 3 INEMVHFDLPGQEER Unmodified 1812.8465 0.84648283 1112 H0Y2W2;Q5SV16 ATAD3A no no 0 0 0 1 1 1 90.627 90.627 3 0.00029623 92545 QUIQUE_C1368_190116_001 58.159 45.666 127230000 53879000 0 42141000 0 0 0 31214000 0 0 0 0 0 0 21704 1112 20394 194751;194752;194753 248904;248905;248906;248907 248906 4 INEMVHFDLPGQEER Oxidation (M) 1828.8414 0.84139745 1112 H0Y2W2;Q5SV16 ATAD3A no no 0 1 0 1 77.209 77.209 3 0.034188 73426 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.378 25.56 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21705 1112 20394 194754 248908 248908 1 INEMVNR Unmodified 874.43309 0.43308621 4455 Q9UJ70;H7C3G9;H7C1L7;H0YEB7 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 18.927 18.927 2 0.053305 11795 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.039 44.932 94611000 0 0 0 0 0 0 0 0 94611000 0 0 0 0 21706 4455 20395 194755 248909 248909 1 INENDPEYIR Unmodified 1261.5939 0.59388018 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.791 40.791 2 1.0358E-07 36714 QUIQUE_DMIX8_190116_001 155.07 134.17 3166700000 200860000 239730000 0 312790000 291560000 260590000 0 338640000 344050000 227490000 306740000 256490000 387790000 21707 4418 20396 194756;194757;194758;194759;194760;194761;194762;194763;194764;194765;194766 248910;248911;248912;248913;248914;248915;248916;248917;248918;248919;248920;248921;248922;248923;248924;248925;248926;248927 248927 18 INESTQNWHQLENIGNFIK Unmodified 2284.1236 0.12364397 2599 P51911;B7Z7E1;K7EQ72;K7ENC5;K7ERK4;K7ESJ2 CNN1 Calponin-1;Calponin;Transgelin yes no 0 0 0 1 117.63 117.63 2 0.00010019 123466 QUIQUE_C1438_190116_001 107.14 94.608 17933000 0 0 0 0 17933000 0 0 0 0 0 0 0 0 21708 2599 20397 194767 248928 248928 1 INEWLTLVEK Unmodified 1243.6812 0.68123863 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 117.77 117.77 2 0.0050848 123825 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.681 73.53 550390000 0 0 0 0 0 0 0 181040000 207970000 0 161380000 0 0 21709 3053 20398 194768;194769;194770 248929;248930;248931 248931 2 INFDDNAEFR Unmodified 1239.552 0.55201537 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.285 74.285 2 0.00019785 75725 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.68 90.121 892240000 0 0 120070000 96454000 73618000 67933000 62506000 88983000 81102000 0 107970000 89818000 103790000 21710 3878 20399 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10 INLSLSALGNVISALVDGK Unmodified 1883.0728 0.072777598 1476 O15066 KIF3B Kinesin-like protein KIF3B;Kinesin-like protein KIF3B, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 173.69 173.69 2 1.6126E-28 177315 QUIQUE_DMIX7_190116_001 146.47 131.78 135430000 0 0 0 0 0 0 0 13408000 19637000 0 55555000 46829000 0 21732 1476 20421 194904;194905;194906;194907 249095;249096;249097;249098 249098 4 INLSLSTLGNVISALVDGK Unmodified 1913.0833 0.083342284 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 1 1 173.49 173.49 2 2.1933E-08 177410 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.14 68.996 102860000 0 0 0 0 47712000 0 0 0 0 0 0 0 55152000 21733 88 20422 194908;194909 249099;249100 249100 0 INLVAAIFSAPAFPAAVSSMK Unmodified 2104.1391 0.13908302 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 167.92 167.92 2;3 0.00014855 172687 QUIQUE_C1218_190116_001 65.704 42.826 68333000 17022000 0 0 0 0 0 0 51311000 0 0 0 0 0 21734 3997 20423 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194925;194926;194927;194928;194929;194930;194931;194932;194933;194934;194935;194936 249119;249120;249121;249122;249123;249124;249125;249126;249127;249128;249129;249130;249131;249132 249125 14 INLWHLEITDR Unmodified 1408.7463 0.7462985 2781;3349 Q66LE6;P63151 PPP2R2D;PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 105.14 105.14 2;3 2.1687E-06 108263 QUIQUE_C1368_190116_001 145.91 123.19 2702600000 229480000 274600000 226740000 158660000 218410000 222010000 159040000 160090000 177090000 75734000 352420000 237770000 210540000 21737 3349;2781 20426 194937;194938;194939;194940;194941;194942;194943;194944;194945;194946;194947;194948;194949;194950;194951;194952;194953;194954;194955;194956;194957;194958;194959;194960;194961;194962 249133;249134;249135;249136;249137;249138;249139;249140;249141;249142;249143;249144;249145;249146;249147;249148;249149;249150;249151;249152;249153;249154;249155;249156;249157;249158;249159;249160;249161;249162;249163;249164;249165 249138 33 INMAHLCIAGSHAVNGVAR Unmodified 1989.9989 0.99891792 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 3 1 59.448 59.448 3;4 0.00054445 58502 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.644 50.705 206450000 0 0 0 0 0 0 57943000 81035000 67472000 0 0 0 0 21738 2017 20427 194963;194964;194965;194966;194967 249166;249167;249168;249169;249170;249171;249172 249171 7 INMAHLCVIGSHAVNGVAR Oxidation (M) 2034.0251 0.025132674 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 47.255 47.255 3;4 4.4178E-46 45085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.45 147.27 490710000 87234000 0 0 0 0 0 0 212230000 104160000 0 0 0 87079000 21739 2016 20428 194968;194969;194970;194971;194972;194973 249173;249174;249175;249176;249177;249178;249179 249174 1323 6 INMAHLCVIGSHAVNGVAR Unmodified 2018.0302 0.030218052 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 69.914 69.914 3;4 1.4961E-55 70302 QUIQUE_C1277_190116_001 152.01 127.22 2518300000 113420000 140670000 268700000 206370000 98247000 250350000 215500000 189370000 279270000 25511000 264340000 240370000 226210000 21740 2016 20428 194974;194975;194976;194977;194978;194979;194980;194981;194982;194983;194984;194985;194986;194987;194988;194989;194990;194991;194992;194993;194994 249180;249181;249182;249183;249184;249185;249186;249187;249188;249189;249190;249191;249192;249193;249194;249195;249196;249197;249198;249199;249200;249201;249202;249203;249204;249205;249206;249207;249208;249209 249181 28 INMLVIELK Unmodified 1071.6362 0.63620269 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.29 112.29 2 0.0007965 116324 QUIQUE_C1368_190116_001 109.71 90.909 437790000 0 17617000 53150000 22925000 0 22892000 43747000 0 88045000 21336000 57501000 71783000 38796000 21741 3053 20429 194995;194996;194997;194998;194999;195000;195001;195002;195003;195004 249210;249211;249212;249213;249214;249215;249216;249217;249218;249219;249220;249221;249222 249212 13 INMNGINNSSGMVDAR Unmodified 1691.7719 0.77193768 3164 Q15819;G3V113 UBE2V2 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.584 66.584 2 2.9774E-37 66173 QUIQUE_C1403_190116_001 177.1 142.72 446610000 39777000 43396000 46991000 37612000 31825000 31926000 27595000 0 45019000 0 55865000 38516000 48084000 21742 3164 20430 195005;195006;195007;195008;195009;195010;195011;195012;195013;195014;195015 249223;249224;249225;249226;249227;249228;249229;249230;249231;249232;249233;249234 249226 11 INMNGVNSSNGVVDPR Unmodified 1671.7999 0.79986699 1244 I3L0A0;Q13404;G3V2F7;A0A0A0MSL3 TMEM189-UBE2V1;UBE2V1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 yes no 0 0 0 1 59.075 59.075 2 0.012551 57733 QUIQUE_C1277_190116_001 64.534 48.962 49130000 0 49130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21743 1244 20431 195016 249235 249235 1 INMNGVNSSNGVVDPR Oxidation (M) 1687.7948 0.79478161 1244 I3L0A0;Q13404;G3V2F7;A0A0A0MSL3 TMEM189-UBE2V1;UBE2V1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 yes no 0 1 0 1 37.427 37.427 2 0.015835 33155 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.903 63.331 31742000 0 0 0 0 0 0 0 31742000 0 0 0 0 0 21744 1244 20431 195017 249236 249236 0 INMVEELEK Unmodified 1103.5533 0.55326092 3103 Q15046 KARS Lysine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 76.203 76.203 2 0.029484 77132 QUIQUE_C1218_190116_001 56.432 32.277 51219000 51219000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21745 3103 20432 195018 249237 249237 1 INNACFEAVVVTNTIPQEDK Unmodified 2261.0998 0.099796984 591 B1ALA9;P60891;B7ZB02 PRPS1 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 110.45 110.45 2;3 6.5819E-24 115095 QUIQUE_C1576_190116_001 180.11 171.38 1661200000 183810000 196400000 99779000 193680000 79696000 176610000 98799000 43330000 161790000 89347000 196110000 67377000 74442000 21746 591 20433 195019;195020;195021;195022;195023;195024;195025;195026;195027;195028;195029;195030;195031;195032;195033;195034;195035;195036;195037;195038 249238;249239;249240;249241;249242;249243;249244;249245;249246;249247;249248;249249;249250;249251;249252;249253;249254;249255;249256;249257;249258;249259;249260;249261;249262 249251 25 INNACFEAVVVTNTIPQEDKMK Oxidation (M) 2536.2302 0.23015923 591 B1ALA9;P60891;B7ZB02 PRPS1 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1 yes no 0 1 1 1 1 92.112 92.112 3 0.0023253 95626 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.35 18.402 172240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92451000 79785000 0 21747 591 20434 195039;195040 249263;249264 249263 387 1 INNAHTIGCNAVSWAPAVVPGSLIDHPSGQKPNYIK Unmodified 3824.9421 0.94206156 2669 P55735;A8MXL6 SEC13 Protein SEC13 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 99.015 99.015 5 3.3677E-07 102097 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.942 46.626 245870000 0 0 0 0 0 0 0 0 83013000 0 0 83528000 79329000 21748 2669 20435 195041;195042;195043 249265;249266;249267 249265 3 INNFSADIK Unmodified 1020.524 0.52400971 181 A0A0A0MSQ0;P13797 PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 43.666 43.666 2 0.015897 40825 QUIQUE_C1438_190116_001 66.504 42.302 238250000 53004000 0 33024000 0 45399000 36368000 0 0 39850000 0 0 0 30607000 21749 181 20436 195044;195045;195046;195047;195048;195049 249268;249269;249270;249271;249272;249273 249270 5 INNMHLDIENEVNNEMANR Unmodified 2269.0216 0.021563438 4121 Q9H0Q0 FAM49A Protein FAM49A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 94.842 94.842 3 0.00010221 96853 QUIQUE_C1403_190116_001 70.837 62.018 215730000 36158000 0 46644000 40672000 0 0 0 60324000 31929000 0 0 0 0 21750 4121 20437 195050;195051;195052;195053;195054 249274;249275;249276;249277;249278;249279 249276 6 INNPELLGQYMIDAGTEFGPGTAYGNALIK Unmodified 3166.5645 0.5645009 55 A0A087WW40;Q9Y371 SH3GLB1 Endophilin-B1 yes no 0 0 0 1 163.88 163.88 3 5.6011E-09 165900 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.858 54.889 62494000 0 0 0 0 0 0 0 62494000 0 0 0 0 0 21751 55 20438 195055 249280 249280 1 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195070;195071;195072;195073;195074;195075;195076;195077;195078;195079;195080;195081;195082;195083;195084;195085;195086;195087;195088;195089;195090 249297;249298;249299;249300;249301;249302;249303;249304;249305;249306;249307;249308;249309;249310;249311;249312;249313;249314;249315;249316;249317 249298 20 INPDGSQSVVEVPYAR Unmodified 1729.8635 0.8635131 1045 F8W031;F8VXJ7;F8W1K5 CNPY2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.536 78.536 2 6.6937E-08 79270 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.29 74.349 1143800000 90529000 108700000 89614000 78375000 125570000 90810000 89241000 60781000 93037000 36273000 115970000 87777000 77107000 21754 1045 20441 195091;195092;195093;195094;195095;195096;195097;195098;195099;195100;195101;195102;195103 249318;249319;249320;249321;249322;249323;249324;249325;249326;249327;249328;249329;249330;249331;249332 249332 13 INPELNQK Unmodified 954.51345 0.51344502 2606 P52564;P46734 MAP2K6;MAP2K3 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6;Dual specificity 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Unmodified 1209.6466 0.64658446 2116 P17050 NAGA Alpha-N-acetylgalactosaminidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.711 56.711 2 0.0051859 55248 QUIQUE_C1277_190116_001 88.392 56.072 261930000 0 42369000 53491000 0 46045000 0 0 37731000 0 0 39617000 0 42678000 21761 2116 20447 195173;195174;195175;195176;195177;195178 249418;249419;249420;249421;249422;249423 249418 4 INQDPQVMLAPLISIALK Oxidation (M) 1979.1125 0.11253392 2400 P36871 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 150.17 150.17 2;3 1.5332E-07 154732 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.44 96.759 2359700000 116370000 190750000 138520000 100620000 117850000 98266000 101060000 244560000 241490000 247120000 338850000 171480000 252780000 21762 2400 20448 195179;195180;195181;195182;195183;195184;195185;195186;195187;195188;195189;195190;195191;195192;195193;195194;195195 249424;249425;249426;249427;249428;249429;249430;249431;249432;249433;249434;249435;249436;249437;249438;249439;249440;249441;249442;249443 249436 1809 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2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 87.335 87.335 3 7.4769E-05 89029 QUIQUE_C1403_190116_001 66.874 59.07 184740000 0 0 0 36124000 45856000 30440000 0 0 0 0 72322000 0 0 21764 2564 20449 195224;195225;195226;195227;195228 249498;249499;249500;249501;249502 249498 5 INQFYGAPTAVR Unmodified 1335.6935 0.69353465 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.123 62.123 2 1.5134E-09 60935 QUIQUE_C1403_190116_001 152.28 99.11 1645300000 130340000 154470000 135440000 120790000 136870000 132490000 108080000 102410000 140040000 67944000 146060000 157370000 113010000 21765 4296 20450 195229;195230;195231;195232;195233;195234;195235;195236;195237;195238;195239;195240;195241 249503;249504;249505;249506;249507;249508;249509;249510;249511;249512;249513;249514;249515;249516;249517;249518;249519 249509 14 INQGWLDSSR Unmodified 1174.5731 0.57308516 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8;G3V3J0 FERMT2 Fermitin family homolog 2 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249540 15 INQMATAPDSQR Unmodified 1330.6299 0.62994811 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 22.681 22.681 2 0.00054247 15789 QUIQUE_C1403_190116_001 93.096 66.712 69028000 0 0 0 29220000 0 25058000 0 14750000 0 0 0 0 0 21768 4532 20453 195267;195268;195269;195270;195271 249548;249549;249550;249551;249552;249553 249550 5 INQMATAPDSQR Oxidation (M) 1346.6249 0.62486274 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 15.2 15.2 2 0.00057474 7357 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.973 70.597 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21769 4532 20453 195272;195273 249554;249555 249555 2996 2 INQQEEPGFEVITR Unmodified 1658.8264 0.82639932 3669;706 C9JA93;Q8TC07 TBC1D15 TBC1 domain family member 15 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 77.754 77.754 2 1.9115E-07 77425 QUIQUE_C1563_190116_001 111.63 86.413 196530000 43528000 47472000 55906000 0 0 0 0 0 0 0 0 49623000 0 21770 706;3669 20454 195274;195275;195276;195277;195278 249556;249557;249558;249559;249560 249559 5 INREQFWEQAK Unmodified 1447.7208 0.72081203 3186 Q16643;D6R9W4 DBN1 Drebrin yes no 0 0 1 1 46.662 46.662 2 0.041687 43508 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.603 35.181 23688000 0 0 0 0 0 0 0 23688000 0 0 0 0 0 21771 3186 20455 195279 249561 249561 1 INRPMLQAALMLR Unmodified 1525.8585 0.85850826 2361 P34913;E5RFU2;H0YAW7;E5RI53 EPHX2 Bifunctional epoxide hydrolase 2;Cytosolic epoxide hydrolase 2;Lipid-phosphate phosphatase yes no 0 0 1 1 1 91.908 91.908 3 0.019078 93704 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.581 17.949 43526000 0 0 0 0 0 0 0 14075000 29452000 0 0 0 0 21772 2361 20456 195280;195281 249562;249563 249563 2 INSANGLEIK Unmodified 1057.5768 0.57677356 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.714 35.714 2 0.0018689 30660 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.111 41.256 673990000 0 82394000 78560000 70289000 0 62336000 91924000 46233000 79529000 30311000 0 57881000 74537000 21773 1175 20457 195282;195283;195284;195285;195286;195287;195288;195289;195290;195291 249564;249565;249566;249567;249568;249569;249570;249571;249572;249573 249571 7 INSCFSANTVEEIIENLQQDGSSFALEQLK Unmodified 3383.6191 0.61911524 3373 Q6NVY1;B9A058;F8W8A6;H7C1A5 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 174.08 174.08 3 1.2935E-08 178265 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.05 48.439 49152000 0 0 0 0 0 0 0 0 49152000 0 0 0 0 21774 3373 20458 195292 249574 249574 1 INSDDSNLYLTASK Unmodified 1539.7417 0.74166663 753 C9JY26;Q9BZG1 RAB34 Ras-related protein Rab-34 yes no 0 0 0 1 60.478 60.478 2 0.030863 59927 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.013 32.701 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21775 753 20459 195293 249575 249575 1 INSENADALAQLLTLAR Unmodified 1811.9741 0.97412619 3541 Q8IWV7 UBR1 E3 ubiquitin-protein ligase UBR1 yes yes 0 0 0 1 1 1 151.77 151.77 2 0.00026989 156997 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.823 62.951 23119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23119000 21776 3541 20460 195294;195295;195296 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16.661 2;3 0.00043854 8708 QUIQUE_C1576_190116_001 119.62 84.179 3033000000 137530000 313930000 263670000 115960000 305360000 0 343320000 479300000 184540000 0 0 149120000 740250000 21779 2857 20463 195311;195312;195313;195314;195315;195316;195317;195318;195319;195320;195321;195322;195323;195324;195325;195326;195327;195328 249596;249597;249598;249599;249600;249601;249602;249603;249604;249605;249606;249607;249608;249609;249610;249611;249612;249613 249607 12 INSNYEFCDTYPAIIVVPTSVKDDDLSK Unmodified 3202.538 0.53801137 1061 F8WA39;Q13613;H0YDX3;Q8NEC6 MTMR1 Myotubularin-related protein 1 yes no 0 0 1 1 1 134.45 134.45 3 0.0003762 140073 QUIQUE_C1576_190116_001 43.992 41.961 95466000 0 46745000 0 0 0 0 48721000 0 0 0 0 0 0 21780 1061 20464 195329;195330 249614;249615 249615 2 INSQNQPTGIHR Unmodified 1363.6957 0.69565991 2862 Q01968;A0A2R8YG38 OCRL Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1 yes no 0 0 0 1 14.657 14.657 3 0.0031956 6746 QUIQUE_C1218_190116_001 59.57 43.432 26586000 26586000 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249620;249621;249622;249623;249624;249625;249626;249627;249628 249622 9 INTLGWTSR Unmodified 1046.5509 0.55089316 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.986 59.986 2 0.0091866 59485 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.679 22.474 254030000 0 38058000 67941000 0 0 0 40934000 0 0 0 39232000 32763000 35099000 21785 2456 20469 195343;195344;195345;195346;195347;195348 249629;249630;249631;249632;249633;249634 249632 6 INTLKEENTQEAAVLNGVS Unmodified 2029.0328 0.032763277 625 B4DXZ6;P51114 FXR1 Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 yes no 0 0 1 1 76.567 76.567 3 0.030317 72623 QUIQUE_DMIX4_190116_001 25.198 14.917 83485000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83485000 0 0 0 21786 625 20470 195349 249635 249635 1 INTQEYLDVLGR Unmodified 1419.7358 0.73579339 2640;715 P54289;C9JE82;C9JVC9;Q9NY47 CACNA2D1;CACNA2D2 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.39 109.39 2 2.9711E-37 113009 QUIQUE_C1368_190116_001 188.49 138.67 695090000 133420000 128020000 117850000 102030000 0 94292000 0 0 0 38958000 25389000 27040000 28101000 21787 2640;715 20471 195350;195351;195352;195353;195354;195355;195356;195357;195358;195359;195360 249636;249637;249638;249639;249640;249641;249642;249643;249644;249645;249646;249647;249648;249649 249638 14 INTQEYLDVLGRPMVLAGDK Oxidation (M) 2247.1569 0.15691793 2640 P54289 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 114.78 114.78 3 0.001774 120072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.763 50.554 312610000 0 0 0 0 0 0 0 74320000 0 0 90243000 66704000 81345000 21788 2640 20472 195361;195362;195363;195364 249650;249651;249652;249653 249651 2079 3 INTQEYLDVLGRPMVLAGDK Unmodified 2231.162 0.16200331 2640 P54289 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes yes 0 0 1 1 1 129.63 129.63 3 2.2863E-06 132943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.271 81.256 117850000 0 0 0 0 0 0 0 56618000 0 0 61235000 0 0 21789 2640 20472 195365;195366 249654;249655;249656 249654 3 INVCVGQK Unmodified 916.48004 0.4800364 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.922 23.922 2 0.0031816 17165 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.96 58.243 674560000 86936000 83630000 126480000 89662000 0 52811000 73869000 0 0 0 78337000 0 82842000 21790 498 20473 195367;195368;195369;195370;195371;195372;195373;195374 249657;249658;249659;249660;249661;249662;249663;249664;249665;249666 249666 9 INVCYWR Unmodified 1009.4804 0.48037075 4371 Q9P0Z9;K7EJU8 PIPOX Peroxisomal sarcosine oxidase yes no 0 0 0 1 68.474 68.474 2 0.024661 68619 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.596 77.314 29137000 0 0 0 0 0 0 0 0 29137000 0 0 0 0 21791 4371 20474 195375 249667 249667 1 INVELSTK Unmodified 902.5073 0.50729701 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 37.042 37.042 2 0.017978 32964 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.684 33.871 80978000 0 0 0 0 0 43162000 0 37816000 0 0 0 0 0 21792 3919 20475 195376;195377 249668;249669;249670 249669 3 INVFMAVPTIYTK Unmodified 1495.8109 0.81087259 3238 Q4G176;A0A3B3ISK9;F5H5A1;F5H362;F5H755;H0YGC7;F5H2G6;F5H3B2;H0YH37 ACSF3 Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 131.96 131.96 2 0.0084 134855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.344 37.739 14427000 0 0 0 0 0 0 0 14427000 0 0 0 0 0 21793 3238 20476 195378 249671 249671 1 INVLAAQYQSLLNSYGEPVDDK Unmodified 2436.2173 0.21726958 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 143.94 143.94 2;3 7.8783E-66 150646 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249702;249703;249704;249705;249706;249707;249708;249709;249710;249711;249712;249713;249714 249710 13 INVLHKPPYEHPK Unmodified 1570.862 0.86199696 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 19.241 19.241 4 0.0021628 12193 QUIQUE_C1218_190116_001 51.546 41.425 136540000 52114000 53737000 30685000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21796 1497 20479 195412;195413;195414 249715;249716;249717 249715 3 INVLPLGSGAIAGNPLGVDR Unmodified 1932.0793 0.079259959 1864 P04424;F8W943 ASL Argininosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 132.59 132.59 2;3 9.7762E-18 135786 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.38 141.25 819250000 64953000 74480000 92612000 0 52027000 71140000 62713000 70160000 91396000 0 78560000 66983000 94223000 21797 1864 20480 195415;195416;195417;195418;195419;195420;195421;195422;195423;195424;195425;195426 249718;249719;249720;249721;249722;249723;249724;249725;249726;249727;249728;249729 249724 10 INVNEIFYDLVR Unmodified 1493.7878 0.78782897 2719;2765 P61224;A6NIZ1;F5H823;B7ZB78;F5GZG1;P62834 RAP1B;RAP1A Ras-related protein Rap-1b;Ras-related protein Rap-1b-like protein;Ras-related protein Rap-1A no no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 158.67 158.67 2;3 6.6137E-20 163137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.74 147.27 12354000000 747970000 22798000 2652400000 1324900000 812590000 1152100000 1309000000 836560000 1048000000 358080000 820620000 546910000 721930000 21798 2719;2765 20481 195427;195428;195429;195430;195431;195432;195433;195434;195435;195436;195437;195438;195439;195440;195441;195442;195443;195444;195445;195446;195447;195448;195449;195450;195451 249730;249731;249732;249733;249734;249735;249736;249737;249738;249739;249740;249741;249742;249743;249744;249745;249746;249747;249748;249749;249750;249751;249752;249753;249754;249755;249756;249757;249758 249748 29 INVPVPQFGGGDPADIIHDFQR Unmodified 2391.1971 0.19714326 4260 Q9NQX7;E7EUS6;C9JG41;B8ZZM6;F5H4I5 ITM2C Integral membrane protein 2C;CT-BRI3 yes no 0 0 0 1 1 144 144 3 1.8809E-05 148681 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.19 59.389 106940000 0 63373000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43568000 0 21799 4260 20482 195452;195453 249759;249760 249760 1 INVSEYTYR Unmodified 1143.556 0.55603812 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.088 58.088 2 0.0026365 56667 QUIQUE_C1277_190116_001 93.143 32.383 691810000 0 84404000 68028000 0 82725000 74288000 0 67935000 103230000 35883000 98671000 76649000 0 21800 2867 20483 195454;195455;195456;195457;195458;195459;195460;195461;195462;195463 249761;249762;249763;249764;249765;249766;249767;249768;249769;249770 249762 10 INVSGLTTK Unmodified 931.53385 0.53384611 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 39.456 39.456 1;2 2.6659E-07 34842 QUIQUE_DMIX4_190116_001 161.79 121.69 12015000000 1009300000 979270000 941080000 898620000 903590000 739120000 1107900000 734140000 733780000 293250000 1439900000 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17 IPADVDPLTITSSLSSDGVLTVNGPR Unmodified 2623.3705 0.37047576 977 E9PR44;P02511;A0A024R3B9;E9PNH7;H0YCW8 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 0 0 0 5 7 3 6 6 5 11 5 10 6 16 9 10 159.99 159.99 2;3 4.482E-143 159879 QUIQUE_C1368_190116_001 267.22 249.72 8318600000 291080000 973580000 341460000 629350000 573310000 756580000 870390000 460800000 525260000 643850000 892280000 608500000 752120000 21815 977 20498 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IPAEVLILNSIVLPHK Unmodified 1755.0658 0.065841726 3880 Q96IJ6 GMPPA Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.53 140.53 3 1.6851E-07 144563 QUIQUE_C1403_190116_001 115.1 111.48 498350000 32855000 45646000 34738000 46275000 37445000 0 43744000 41164000 54615000 24922000 49603000 41235000 46111000 21816 3880 20499 195834;195835;195836;195837;195838;195839;195840;195841;195842;195843;195844;195845;195846 250366;250367;250368;250369;250370;250371;250372;250373;250374;250375;250376;250377;250378;250379;250380;250381;250382 250369 15 IPAFLNVVDIAGLVK Unmodified 1567.9338 0.93376492 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JTK6 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 3 2 162.79 162.79 2;3 1.1294E-18 166943 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.24 119.94 9633700000 712850000 747640000 811920000 628660000 628670000 0 825490000 669790000 821540000 205240000 1509700000 1290100000 782160000 21817 1276 20500 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250412;250413;250414;250415;250416;250417;250418;250419;250420;250421;250422;250423;250424;250425;250426;250427;250428;250429;250430;250431;250432;250433;250434;250435;250436;250437 250425 26 IPALDLLIK Unmodified 994.64267 0.64266828 2813 P78527;F5GX40 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.18 122.18 2 0.019339 119216 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.673 33.253 12647000 0 0 0 0 5052600 0 0 0 0 7594800 0 0 0 21819 2813 20502 195895;195896;195897;195898;195899;195900 250438;250439;250440;250441;250442;250443 250443 6 IPAMTIAK Unmodified 843.48881 0.48881017 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.358 42.358 2 0.0036758 39817 QUIQUE_C1218_190116_001 120.49 45.771 17352000000 1694700000 1504900000 2028800000 1588600000 1098600000 0 1702700000 1051100000 1429700000 500300000 1861000000 1377600000 1514100000 21820 2004 20503 195901;195902;195903;195904;195905;195906;195907;195908;195909;195910;195911;195912 250444;250445;250446;250447;250448;250449;250450;250451;250452;250453;250454;250455 250444 10 IPANLLDQFER Unmodified 1314.6932 0.6932003 1424 O14490;Q6IS01 DLGAP1 Disks large-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.13 110.13 2 0.00081872 112526 QUIQUE_C1563_190116_001 94.804 72.718 283260000 45128000 35396000 25997000 0 0 31019000 29937000 0 30315000 0 51019000 0 34448000 21821 1424 20504 195913;195914;195915;195916;195917;195918;195919;195920;195921;195922;195923;195924 250456;250457;250458;250459;250460;250461;250462;250463;250464;250465;250466;250467;250468 250461 11 IPASWTNPSGK Unmodified 1156.5877 0.58767259 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 47.89 47.89 2 0.0052276 45880 QUIQUE_C1576_190116_001 81.338 49.403 168380000 0 0 0 0 51607000 0 78966000 0 0 0 0 0 37804000 21822 2285 20505 195925;195926;195927 250469;250470;250471 250470 3 IPCLIVAAK Unmodified 983.58377 0.58377319 3548 Q8IXI2;H7BXZ6;K7EIQ7;J3QLG2;K7EP86 RHOT1 Mitochondrial Rho GTPase 1;Mitochondrial Rho GTPase yes no 0 0 0 1 1 1 66.779 66.779 2 0.04706 67947 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.757 40.9 23050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23050000 21823 3548 20506 195928;195929;195930 250472;250473;250474 250472 3 IPCVDAGLISPLVQLLNSK Unmodified 2036.134 0.13399765 2605;827 P52306;D6RHH8;D6RHZ7 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 167.67 167.67 2;3 3.5481E-86 171173 QUIQUE_C1277_190116_001 248.68 229.04 9965200000 864750000 1631800000 1293600000 612390000 670740000 62172000 1136700000 313970000 500310000 173960000 1232900000 576800000 895110000 21824 2605;827 20507 195931;195932;195933;195934;195935;195936;195937;195938;195939;195940;195941;195942;195943;195944;195945;195946;195947;195948;195949;195950;195951;195952;195953;195954;195955;195956 250475;250476;250477;250478;250479;250480;250481;250482;250483;250484;250485;250486;250487;250488;250489;250490;250491;250492;250493;250494;250495;250496;250497;250498;250499;250500 250477 25 IPCVDAGLISPLVQLLNSKDQEVLLQTGR Unmodified 3175.7275 0.7274839 2605;827 P52306;D6RHH8;D6RHZ7 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 0 0 1 1 2 1 1 166.01 166.01 3;4 2.8244E-144 170440 QUIQUE_DMIX8_190116_001 200.47 183.8 459050000 0 0 0 0 0 0 0 139690000 89625000 0 0 85654000 144080000 21825 2605;827 20508 195957;195958;195959;195960;195961 250501;250502;250503;250504;250505;250506;250507 250507 7 IPDEELR Unmodified 870.4447 0.44469675 3982;3981 Q99962;Q99961 SH3GL2;SH3GL1 Endophilin-A1;Endophilin-A2 no no 0 0 0 1 30.258 30.258 2 0.019482 25487 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.28 22.544 362120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 362120000 21826 3982;3981 20509 195962 250508 250508 1 IPDEFDNDPILVQQLR Unmodified 1910.9738 0.97379183 3231 Q3ZCQ8;M0R047 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 127.81 127.81 2;3 3.0484E-05 132985 QUIQUE_C1218_190116_001 122.42 105.06 985010000 107240000 0 101860000 95257000 80541000 69014000 101250000 0 92938000 33557000 124730000 89143000 89474000 21827 3231 20510 195963;195964;195965;195966;195967;195968;195969;195970;195971;195972;195973;195974;195975;195976 250509;250510;250511;250512;250513;250514;250515;250516;250517;250518;250519;250520;250521;250522;250523;250524 250509 15 IPDEIIDMVKEEVVAK Unmodified 1826.97 0.96995201 4614 U3KQK1;V9GZ56;Q9Y4Z0 LSM4 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 133.39 133.39 3 1.4913E-05 136633 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.451 82.707 237110000 0 0 0 0 20344000 0 0 36543000 39590000 0 55925000 46543000 38167000 21828 4614 20511 195977;195978;195979;195980;195981;195982;195983 250525;250526;250527;250528;250529;250530;250531 250526 7 IPDIVLWPTCHDDVVK Unmodified 1905.9659 0.96586969 362 A0A1B0GWA2;A0A2R8YEL0;O00116 AGPS Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.96 116.96 3 0.00025572 120600 QUIQUE_C1403_190116_001 58.09 53.61 189900000 26097000 38180000 30380000 28695000 0 0 0 0 0 0 0 26815000 39734000 21829 362 20512 195984;195985;195986;195987;195988;195989 250532;250533;250534;250535;250536;250537 250535 5 IPDPEAVKPDDWDEDAPAK Unmodified 2106.9746 0.9745797 2269 P27824;D6RGY2 CANX Calnexin yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 81.993 81.993 2;3 9.8724E-63 83145 QUIQUE_DMIX3_190116_001 181.58 171.4 5413000000 53329000 45772000 651470000 942830000 37218000 574470000 741060000 364990000 640080000 18163000 538730000 312400000 492500000 21830 2269 20513 195990;195991;195992;195993;195994;195995;195996;195997;195998;195999;196000;196001;196002;196003;196004;196005;196006;196007;196008;196009;196010 250538;250539;250540;250541;250542;250543;250544;250545;250546;250547;250548;250549;250550;250551;250552;250553;250554;250555;250556;250557;250558;250559;250560;250561;250562;250563;250564;250565;250566;250567;250568 250557 30 IPDPSTWNLNPDASYVYYCANETVHGVEFDFIPDVK Unmodified 4171.915 0.91496291 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 167.37 167.37 3;4 2.8197E-127 174585 QUIQUE_DMIX5_190116_001 170.19 156.95 1280000000 0 0 0 0 0 0 96377000 36417000 257770000 0 497450000 304790000 87214000 21831 4639 20514 196011;196012;196013;196014;196015;196016;196017;196018 250569;250570;250571;250572;250573;250574;250575;250576 250572 7 IPDQLVILDMK Unmodified 1283.7159 0.71590958 2542 P49755;G3V2K7 TMED10 Transmembrane emp24 domain-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.7 118.7 2 3.4207E-05 122859 QUIQUE_C1368_190116_001 138.76 110.36 607970000 59427000 42846000 59718000 60453000 48151000 45765000 56311000 55661000 52074000 25043000 0 52465000 50056000 21832 2542 20515 196019;196020;196021;196022;196023;196024;196025;196026;196027;196028;196029;196030 250577;250578;250579;250580;250581;250582;250583;250584;250585;250586;250587;250588;250589;250590;250591;250592;250593 250580 16 IPDQLVILDMK Oxidation (M) 1299.7108 0.7108242 2542 P49755;G3V2K7 TMED10 Transmembrane emp24 domain-containing protein 10 yes no 0 1 0 1 95.873 95.873 2 0.037576 100210 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.688 42.451 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21833 2542 20515 196031 250594 250594 1 IPDRPYSLFEGMAGAIHFLSDVLGPETSR Oxidation (M) 3190.5757 0.57573428 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 1 1 1 1 1 155.22 155.22 4 1.7155E-15 162714 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.566 71.906 99394000 0 35457000 0 0 0 0 0 0 29942000 0 33994000 0 0 21834 4281 20516 196032;196033;196034 250595;250596;250597;250598 250598 2898 4 IPDRPYSLFEGMAGAIHFLSDVLGPETSR Unmodified 3174.5808 0.58081966 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 171.04 171.04 4 1.7996E-55 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Q5SW79;E5RIH6;E5RJT5;E5RFU8 CEP170 Centrosomal protein of 170 kDa yes no 0 0 0 1 1 73.19 73.19 2 0.0093328 73191 QUIQUE_C1368_190116_001 70.399 45.879 70930000 0 0 43442000 0 0 0 0 27488000 0 0 0 0 0 21855 3298 20536 196191;196192 250830;250831;250832 250831 3 IPETYPFNPPK Unmodified 1301.6656 0.66558856 2711 P61086;D6RDM7 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 3 75.085 75.085 2 0.0042368 76337 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.205 57.807 380050000 0 147750000 149250000 0 0 83048000 0 0 0 0 0 0 0 21856 2711 20537 196193;196194;196195;196196;196197;196198;196199;196200;196201;196202;196203;196204 250833;250834;250835;250836;250837;250838;250839;250840;250841;250842;250843;250844;250845;250846 250843 13 IPEVHHISQDPLHYSIASVSASQK Unmodified 2642.3453 0.34526406 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;H0YB62;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 2 2 2 2 3 1 2 2 2 2 1 1 73.494 73.494 3;4 1.1997E-101 73633 QUIQUE_DMIX3_190116_001 192.58 169.83 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Unmodified 2458.209 0.20901308 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 143.8 143.8 3 0.0011061 149501 QUIQUE_C1368_190116_001 47.499 40.387 60220000 0 0 29257000 0 0 0 0 0 30964000 0 0 0 0 21859 4278 20540 196234;196235;196236 250884;250885;250886 250884 3 IPFFMSTECEHLIR Unmodified 1778.8484 0.84839709 4561 Q9Y2K2;H7C3X8;H0Y4E8 SIK3 Serine/threonine-protein kinase SIK3 yes no 0 0 0 1 109.7 109.7 3 0.047257 113497 QUIQUE_C1218_190116_001 23.135 12.796 17181000 17181000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21860 4561 20541 196237 250887 250887 1 IPFGIFSR Unmodified 935.52289 0.52288749 4527 Q9UQ13;X6RI37 SHOC2 Leucine-rich repeat protein SHOC-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.26 104.26 2 0.0075036 107260 QUIQUE_C1403_190116_001 97.798 65.863 144940000 0 13061000 15290000 14344000 20918000 13203000 12252000 0 0 0 18416000 17437000 20021000 21861 4527 20542 196238;196239;196240;196241;196242;196243;196244;196245;196246;196247;196248 250888;250889;250890;250891;250892;250893;250894;250895;250896;250897;250898 250890 11 IPFKPDGVYIEEVLSK Unmodified 1832.9924 0.99240201 3324 Q5TC84 OGFRL1 Opioid growth factor receptor-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.46 121.46 3 2.0147E-06 125104 QUIQUE_C1403_190116_001 92.551 82.212 373070000 46495000 33322000 31711000 40601000 42875000 25773000 31796000 0 54581000 14657000 0 51261000 0 21862 3324 20543 196249;196250;196251;196252;196253;196254;196255;196256;196257;196258;196259;196260 250899;250900;250901;250902;250903;250904;250905;250906;250907;250908;250909;250910 250902 12 IPFTDIYIGGAPPEILQSR Unmodified 2086.1099 0.10989139 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 2 145.79 145.79 2;3 1.0842E-16 152625 QUIQUE_C1438_190116_001 128.22 97.785 54797000 0 0 0 0 54797000 0 0 0 0 0 0 0 0 21863 130 20544 196261;196262 250911;250912 250911 2 IPFYLQPHASSGAK Unmodified 1514.7882 0.78816332 3659 Q8TAF3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes yes 0 0 0 1 1 54.455 54.455 3 0.033736 50065 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.548 30.144 38170000 0 38170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21864 3659 20545 196263;196264 250913;250914 250914 2 IPFYMSTDCENLLK Unmodified 1729.8055 0.80552922 900 E9PC69;Q7KZI7;E7ETY4 MARK2 Serine/threonine-protein kinase MARK2 no no 0 0 0 1 1 1 1 122.23 122.23 2 0.0075577 126117 QUIQUE_C1403_190116_001 95.618 73.085 158830000 0 57928000 52486000 48412000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21865 900 20546 196265;196266;196267;196268 250915;250916;250917;250918 250917 3 IPGDQVVSVVFIK Unmodified 1399.8075 0.80750177 2834 P98160;A0A3B3IT11 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.22 119.22 2 0.0041095 121983 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.554 39.366 515320000 25387000 39836000 45392000 0 50337000 25741000 18160000 68140000 66846000 0 82611000 53222000 39648000 21866 2834 20547 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196304;196305;196306;196307;196308;196309;196310 250958;250959;250960;250961;250962;250963;250964 250958 7 IPGIYVLSLEIGK Unmodified 1400.8279 0.82790287 406 A0A2C9F2P4;A0A286YFF7;P50897;Q5T0S4;A0A286YFE3;A0A286YFL8;E9PK48;E9PIA8 PPT1 Palmitoyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.09 141.09 2 4.1245E-10 144392 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.11 112.92 1224300000 138060000 109550000 72989000 58765000 104280000 108360000 100990000 60574000 86683000 36269000 103270000 139500000 104950000 21872 406 20553 196311;196312;196313;196314;196315;196316;196317;196318;196319;196320;196321;196322;196323 250965;250966;250967;250968;250969;250970;250971;250972;250973;250974;250975;250976;250977;250978;250979;250980;250981 250973 14 IPGLLGVFQK Unmodified 1070.6488 0.64881629 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.39 115.39 2 0.0086135 118956 QUIQUE_C1368_190116_001 85.212 71.054 248240000 44764000 0 43203000 0 34804000 40856000 37109000 0 0 19948000 0 0 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2096.0725 0.072460022 42 A0A087WUT6;O60841 EIF5B Eukaryotic translation initiation factor 5B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.62 114.62 3 2.2497E-11 118105 QUIQUE_C1403_190116_001 112.3 103.44 619030000 50007000 58656000 50955000 51495000 43732000 51873000 49743000 55613000 58925000 0 53999000 45341000 48694000 21875 42 20556 196343;196344;196345;196346;196347;196348;196349;196350;196351;196352;196353;196354;196355 251002;251003;251004;251005;251006;251007;251008;251009;251010;251011;251012;251013;251014;251015;251016;251017;251018;251019;251020 251007 19 IPGSPPESMGR Unmodified 1126.5441 0.54409322 2560;3300 P50395;Q5SX87;V9GYF8;Q5SX90;V9GYJ7;Q5SX86 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 0 0 1 1 1 35.241 35.241 2 0.0056344 30736 QUIQUE_C1368_190116_001 68.893 35.894 337830000 0 0 143240000 0 0 0 124580000 0 70011000 0 0 0 0 21876 2560;3300 20557 196356;196357;196358 251021;251022;251023 251021 3 IPHECLVIGALESAFK Unmodified 1782.9338 0.93384128 4493 Q9ULR3 PPM1H Protein phosphatase 1H yes yes 0 0 0 1 1 1 131.27 131.27 3 0.00071449 137763 QUIQUE_C1438_190116_001 62.861 57.017 66686000 0 0 0 22191000 19020000 0 0 0 0 0 25474000 0 0 21877 4493 20558 196359;196360;196361 251024;251025;251026 251025 2 IPHEFHTSMK Unmodified 1225.5914 0.59137776 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 19.668 19.668 3 0.00075308 12574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.171 68.471 153670000 0 0 0 0 0 0 0 0 77143000 0 38757000 0 37770000 21878 16;1475 20559 196362;196363;196364 251027;251028;251029 251028 3 IPHFGYCDEIDLTELVK Unmodified 2047.9925 0.99247837 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 134.64 134.64 3 7.4041E-05 140067 QUIQUE_C1218_190116_001 87.647 78.067 454110000 78237000 65509000 0 58813000 61371000 67086000 95794000 0 0 27297000 0 0 0 21879 2014 20560 196365;196366;196367;196368;196369;196370;196371 251030;251031;251032;251033;251034;251035;251036;251037 251030 8 IPHGDPQSLDPPEVSNAK Unmodified 1899.9327 0.9326553 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 50.995 50.995 3 0.0061957 46581 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.633 26.14 463460000 89083000 0 0 110010000 0 0 127560000 0 0 39197000 0 0 97605000 21880 914 20561 196372;196373;196374;196375;196376 251038;251039;251040;251041;251042 251041 2 IPHGVSGVQDR Unmodified 1163.6047 0.60471964 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 18.975 18.975 2;3 0.00058693 11462 QUIQUE_C1403_190116_001 99.688 75.466 15205000000 465760000 1961200000 488420000 1612100000 1426700000 1072000000 2001700000 1128600000 1546300000 922180000 551120000 1682700000 346280000 21881 3984 20562 196377;196378;196379;196380;196381;196382;196383;196384;196385;196386;196387;196388;196389;196390;196391;196392;196393;196394;196395;196396;196397 251043;251044;251045;251046;251047;251048;251049;251050;251051;251052;251053;251054;251055;251056;251057;251058;251059;251060;251061;251062;251063;251064;251065;251066 251048 20 IPHLAIHLQR Unmodified 1196.7142 0.71421051 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6;C9JBE1;F8WAN0;E7EPX3;B9ZVU2;C9J1E2;C9JRG3 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 46.326 46.326 3 0.00052352 43660 QUIQUE_C1218_190116_001 90.761 75.132 209120000 35765000 48556000 0 31994000 0 30735000 0 47044000 0 15029000 0 0 0 21882 1 20563 196398;196399;196400;196401;196402;196403;196404;196405;196406;196407;196408;196409;196410;196411;196412 251067;251068;251069;251070;251071;251072;251073;251074;251075;251076;251077;251078;251079;251080;251081;251082;251083 251067 17 IPIAGTVVTR Unmodified 1025.6233 0.62332982 3105 Q15052 ARHGEF6 Rho guanine nucleotide exchange factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 51.785 51.785 2 0.033515 50230 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.327 16.932 196790000 0 0 54373000 0 0 0 0 0 0 0 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196418;196419;196420;196421;196422;196423;196424;196425;196426 251090;251091;251092;251093;251094;251095;251096;251097;251098;251099;251100 251090 7 IPIFSAAGLPHNEIAAQICR Unmodified 2177.1415 0.14154264 2175;731 P21281;C9JL73;P15313;C9JNS9 ATP6V1B2;ATP6V1B1 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform;V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 114.33 114.33 2;3 8.2837E-66 118490 QUIQUE_C1368_190116_001 184.15 168.73 29957000000 2172300000 2802700000 2416700000 2317900000 2031800000 2335300000 2447100000 2354900000 2056600000 731980000 2943100000 2811500000 2535300000 21886 2175;731 20567 196427;196428;196429;196430;196431;196432;196433;196434;196435;196436;196437;196438;196439;196440;196441;196442;196443;196444;196445;196446;196447;196448;196449;196450;196451;196452;196453 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Unmodified 2329.1446 0.14463869 3751 Q92734;C9JJP5;C9JUE0;C9JTY3 TFG Protein TFG yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 135.17 135.17 2;3 4.6241E-05 141796 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.311 74.658 2417000000 253220000 249150000 240170000 0 230410000 190420000 230870000 154310000 0 0 422030000 253730000 192690000 21888 3751 20569 196467;196468;196469;196470;196471;196472;196473;196474;196475;196476;196477;196478 251162;251163;251164;251165;251166;251167;251168;251169;251170;251171;251172;251173;251174;251175 251174 10 IPILFFANK Unmodified 1061.6274 0.62735256 4120 Q9H0F7;A0A0J9YXT0;H7C5H6 ARL6 ADP-ribosylation factor-like protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.83 121.83 2 0.0029423 125695 QUIQUE_C1368_190116_001 105.39 56.829 78169000 20783000 0 19262000 15868000 0 0 0 0 18463000 3793300 0 0 0 21889 4120 20570 196479;196480;196481;196482;196483;196484;196485;196486;196487;196488;196489;196490;196491 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mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.056 92.056 3 5.9852E-12 94218 QUIQUE_C1368_190116_001 120.9 113.07 1373400000 0 0 181370000 0 162570000 140790000 146760000 100200000 147280000 67367000 132290000 148190000 146640000 21909 3933 20590 196618;196619;196620;196621;196622;196623;196624;196625;196626;196627;196628 251409;251410;251411;251412;251413;251414;251415;251416;251417;251418;251419 251409 11 IPLTICFPEYK Unmodified 1379.7159 0.71590958 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 120.24 120.24 2 4.7358E-09 124477 QUIQUE_C1368_190116_001 182.65 122.21 745210000 68707000 62196000 85543000 78075000 63798000 59367000 80714000 0 51656000 27996000 61125000 41376000 64658000 21910 2142 20591 196629;196630;196631;196632;196633;196634;196635;196636;196637;196638;196639;196640;196641 251420;251421;251422;251423;251424;251425;251426;251427;251428;251429;251430;251431;251432;251433;251434;251435;251436;251437;251438;251439;251440;251441;251442;251443;251444 251424 25 IPMPDFDLHLK Unmodified 1324.6849 0.6849438 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 109.07 109.07 3 0.0039105 111204 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.57 48.357 66203000 0 0 0 0 0 0 32821000 33382000 0 0 0 0 0 21911 2935 20592 196642;196643 251445;251446 251446 1 IPMPDFDLHLK Oxidation (M) 1340.6799 0.67985842 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 1 0 1 89.85 89.85 3 0.0070047 90828 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.255 42.516 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21912 2935 20592 196644 251447 251447 2402 1 IPMPVNFNEPLSMLQR Unmodified 1884.959 0.95901017 2192;172 P22059;H0YCV6;A0A0A0MSB4;Q6ZN50;Q969R2;H7C368;H7C428;H7C1R2 OSBP;OSBP2 Oxysterol-binding protein 1;Oxysterol-binding protein;Oxysterol-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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Unmodified 1979.0768 0.076800343 1491 O15217 GSTA4 Glutathione S-transferase A4 yes yes 0 0 0 2 3 2 1 2 1 2 1 2 1 1 2 1 169.33 169.33 2;3 4.5631E-13 174166 QUIQUE_C1368_190116_001 159.52 128.09 557130000 32043000 59840000 58912000 28417000 82106000 5642700 71587000 7719200 63916000 3487500 42907000 74797000 25756000 21918 1491 20598 196676;196677;196678;196679;196680;196681;196682;196683;196684;196685;196686;196687;196688;196689;196690;196691;196692;196693;196694;196695;196696 251484;251485;251486;251487;251488;251489;251490;251491;251492;251493;251494;251495;251496;251497;251498;251499;251500;251501;251502;251503;251504;251505 251489 19 IPNIYAIGDVVAGPMLAHK Unmodified 1978.071 0.071003459 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 4 2 2 3 1 2 2 2 1 1 2 2 2 137.91 137.91 2;3 1.0161E-22 144193 QUIQUE_C1218_190116_001 103.5 94.677 4294800000 430630000 302550000 456730000 350270000 284780000 310440000 378370000 276410000 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Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 174.77 174.77 2;3 6.6464E-05 178991 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.34 102.98 55201000 0 0 0 0 0 0 0 0 7288300 0 15012000 32901000 0 21951 614 20627 197055;197056;197057 252006;252007;252008;252009 252007 4 IPTYNISVVGLSGTEK Unmodified 1676.8985 0.89850163 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 105.69 105.69 2 0.00056132 108948 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.078 65.759 116830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68095000 48738000 0 21952 4278 20628 197058;197059;197060 252010;252011;252012 252012 3 IPVAFPSGDASSLSK Unmodified 1474.7668 0.76675917 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 85.334 85.334 2 8.0124E-06 87988 QUIQUE_C1218_190116_001 105.65 88.213 1044600000 80734000 87581000 79834000 68149000 82014000 69424000 94275000 66065000 67166000 31329000 99572000 124950000 93539000 21953 3684 20629 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53.4 2 0.043201 51580 QUIQUE_C1368_190116_001 80.462 53.325 6962500000 0 1597700000 1352200000 1276000000 1321600000 1415000000 0 0 0 0 0 0 0 21963 529;4168 20639 197148;197149;197150;197151;197152 252143;252144;252145;252146;252147 252144 5 IPVPILPGLPMNNHGNYIVR Unmodified 2213.2143 0.21431365 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 125.41 125.41 3 1.0242E-06 130760 QUIQUE_C1218_190116_001 89.484 80.665 80669000 43630000 0 0 0 0 0 37039000 0 0 0 0 0 0 21964 3169 20640 197153;197154 252148;252149 252148 2 IPVPILPGLPMNNHGNYIVR Oxidation (M) 2229.2092 0.20922827 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 115.07 115.07 3 0.0047948 111804 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.962 32.143 23801000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23801000 0 0 0 21965 3169 20640 197155 252150 252150 2604 1 IPVPQQVAR Unmodified 1006.5924 0.59236404 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, 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252378;252379;252380;252381;252382;252383;252384;252385;252386;252387;252388;252389;252390;252391;252392;252393;252394 252379 16 IQAVIDSGVCR Unmodified 1216.6234 0.62340617 1587 O60684;O15131;Q5TFJ7 KPNA6;KPNA5 Importin subunit alpha-7;Importin subunit alpha-6 yes no 0 0 0 1 1 1 2 47.591 47.591 2 0.0009083 42359 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.111 54.148 585010000 0 180690000 0 179410000 0 0 0 196330000 0 28586000 0 0 0 21995 1587 20669 197361;197362;197363;197364;197365 252395;252396;252397;252398;252399;252400 252399 6 IQAYDYLECSAK Unmodified 1459.6653 0.66533057 2760 P62745 RHOB Rho-related GTP-binding protein RhoB yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 77.957 77.957 2 0.00065806 78191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.29 87.02 517820000 0 121860000 0 137480000 0 83341000 0 92985000 0 82150000 0 0 0 21996 2760 20670 197366;197367;197368;197369;197370 252401;252402;252403;252404;252405;252406;252407;252408 252406 8 IQDALSTVLQYAEDVLSGK Unmodified 2049.063 0.063000772 1396 O00303;H0YDT6 EIF3F Eukaryotic 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252522 142 IQDLEHHLGLALNEVQAAK Unmodified 2098.1171 0.11710203 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 93.188 93.188 4 0.0093869 95415 QUIQUE_C1277_190116_001 36.679 21.287 55602000 0 28235000 0 27367000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22003 4596 20677 197523;197524 252602;252603 252602 2 IQDLKPQCVVFLNIPR Unmodified 1939.0713 0.07133781 965 E9PNL8;Q13574;H0YDN6 DGKZ Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase zeta yes no 0 0 1 1 110.93 110.93 3 0.027099 113953 QUIQUE_C1403_190116_001 40.237 33.917 20754000 0 0 0 20754000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22004 965 20678 197525 252604 252604 1 IQDLSLLYQLFSR Unmodified 1594.8719 0.87189295 1310 K4DI93;Q13620 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 2 1 165.05 165.05 2;3 8.3135E-08 167145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.63 129.21 415330000 7375400 36942000 30615000 23690000 73550000 0 36986000 32194000 40412000 0 49097000 47722000 36744000 22005 1310 20679 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0.69961417 618 B4DLN1;P52815 MRPL12 39S ribosomal protein L12, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 161.36 161.36 3 4.1536E-10 166139 QUIQUE_C1218_190116_001 60.381 49.174 86975000 55362000 0 0 31613000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22008 618 20682 197550;197551 252629;252630 252629 2 IQDWYDKK Unmodified 1094.5397 0.53965977 780 CON__P35527;P35527 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 1 1 2 27.931 27.931 2;3 0.011242 21193 QUIQUE_C1403_190116_001 84.498 53.886 301330000 0 0 0 91781000 0 0 0 0 0 209550000 0 0 0 + 22009 780 20683 197552;197553;197554 252631;252632;252633;252634;252635 252632 5 IQEAASQGLK Unmodified 1043.5611 0.56112349 3085 Q14699;G3XAJ6;C9JHG2 RFTN1 Raftlin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 18.317 18.317 2 0.0016283 10755 QUIQUE_C1563_190116_001 95.358 21.742 142920000 0 0 0 0 20738000 35822000 0 0 29062000 0 39366000 17935000 0 22010 3085 20684 197555;197556;197557;197558;197559 252636;252637;252638;252639;252640 252637 4 IQEAGTEVVK Unmodified 1072.5764 0.57643921 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.238 22.238 2 0.00029718 15234 QUIQUE_C1277_190116_001 115.71 44.802 48143000000 5950500000 4106100000 4666700000 3400300000 4126100000 3088300000 4461600000 3224100000 3468300000 2059900000 5234100000 0 4357000000 22011 2431 20685 197560;197561;197562;197563;197564;197565;197566;197567;197568;197569;197570;197571 252641;252642;252643;252644;252645;252646;252647;252648;252649;252650;252651;252652;252653 252642 6 IQEDPSLCGDKPSISAVTVELSK Unmodified 2472.2418 0.24176977 4360 Q9P000 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes yes 0 0 1 1 99.264 99.264 3 0.054188 100852 QUIQUE_DMIX1_190116_001 31.775 17.466 39678000 0 0 0 0 0 0 0 39678000 0 0 0 0 0 22012 4360 20686 197572 252654 252654 0 IQEDYLR Unmodified 935.47125 0.47124585 3923 Q96Q11 TRNT1 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 37.848 37.848 2 0.045326 34240 QUIQUE_C1438_190116_001 78.616 32.6 47052000 0 0 0 0 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heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 109.7 109.7 2;3 7.8438E-28 112121 QUIQUE_DMIX1_190116_001 182.35 112.26 3400500000 68505000 84378000 175880000 77713000 125440000 0 305070000 565750000 505190000 41787000 478820000 598300000 373630000 22020 2004 20694 197664;197665;197666;197667;197668;197669;197670;197671;197672;197673;197674;197675;197676;197677;197678;197679;197680 252787;252788;252789;252790;252791;252792;252793;252794;252795;252796;252797;252798;252799;252800;252801;252802;252803;252804;252805;252806;252807;252808;252809 252797 22 IQEIQTFR Unmodified 1033.5556 0.55564418 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;F8WDB9 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.552 46.552 2 0.0013841 43943 QUIQUE_C1438_190116_001 142.64 75.61 2212300000 341730000 257290000 298840000 269440000 212820000 0 293590000 190100000 0 115460000 0 232980000 0 22021 2422 20695 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20719 197858 253030 253030 1 IQFKPDDGTTPER Unmodified 1502.7365 0.73652168 909 E9PEB5;Q96AE4 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.673 34.673 2;3 0.003262 29813 QUIQUE_C1403_190116_001 105.2 71.979 451970000 62374000 53193000 39122000 53109000 0 244180000 0 0 0 0 0 0 0 22046 909 20720 197859;197860;197861;197862;197863;197864 253031;253032;253033;253034;253035;253036 253034 6 IQFNDLQSLLCATLQNVLR Unmodified 2245.1889 0.18888676 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 2 176.03 176.03 2;3 4.2106E-55 179454 QUIQUE_DMIX7_190116_001 216.15 187.85 2693400000 75265000 21592000 0 0 0 0 126470000 60093000 621840000 1462000 553260000 1051300000 182170000 22047 3090 20721 197865;197866;197867;197868;197869;197870;197871;197872;197873;197874;197875;197876;197877;197878;197879 253037;253038;253039;253040;253041;253042;253043;253044;253045;253046;253047;253048;253049;253050;253051;253052 253050 16 IQFPIEMSMPWILTDHILETK Unmodified 2541.3011 0.30113933 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 167.7 167.7 3 1.1892E-06 171642 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.708 74.726 713560000 25174000 0 0 37195000 40706000 0 121410000 0 44556000 0 183580000 142380000 118560000 22048 292;882;3442 20722 197880;197881;197882;197883;197884;197885;197886;197887 253053;253054;253055;253056;253057;253058;253059;253060 253059 8 IQFSVPAPPSQLDPR Unmodified 1650.873 0.87295558 4412 Q9UD71;J3KSJ8;J3KT77 PPP1R1B Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 110.2 110.2 2 1.8011E-07 113194 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.96 95.523 658180000 37501000 50639000 0 79559000 71808000 56546000 0 60942000 96325000 19008000 75573000 0 110280000 22049 4412 20723 197888;197889;197890;197891;197892;197893;197894;197895;197896;197897;197898;197899 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Unmodified 1489.7466 0.74663285 4368 Q9P0K9 FRRS1L DOMON domain-containing protein FRRS1L yes yes 0 0 0 1 68.468 68.468 3 0.0085927 68615 QUIQUE_C1218_190116_001 49.448 42.971 25834000 25834000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22061 4368 20735 197981 253169 253169 1 IQHGSGFGIEFNATDALR Unmodified 1931.949 0.94897407 1651 O75663 TIPRL TIP41-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.672 96.672 3 9.8466E-05 99244 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.281 53.571 389150000 49486000 0 33500000 34609000 51101000 0 55759000 0 40158000 27215000 41996000 55326000 0 22062 1651 20736 197982;197983;197984;197985;197986;197987;197988;197989;197990;197991 253170;253171;253172;253173;253174;253175;253176;253177;253178;253179 253176 9 IQHILCTGNLCTK Unmodified 1556.7803 0.78031752 4403 Q9UBQ0;F8VXU5 VPS29 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 42.208 42.208 2;3 6.3788E-13 39145 QUIQUE_C1277_190116_001 155.48 134.02 2952900000 233590000 309880000 200670000 76096000 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26-hydroxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 87.471 87.471 3 0.042089 84989 QUIQUE_DMIX4_190116_001 27.263 0.66536 574780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 574780000 0 0 0 22065 2871 20739 198023 253218 253218 1 IQHPSNVLHFFNAPLEVTEENFFEICDELGVK Unmodified 3771.8243 0.82429741 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 0 0 1 1 2 165.92 165.92 3;4 2.431E-88 169848 QUIQUE_DMIX7_190116_001 160.43 154.48 656690000 0 0 0 0 0 0 0 0 44706000 0 118460000 493520000 0 22066 2082 20740 198024;198025;198026;198027 253219;253220;253221;253222;253223;253224 253223 6 IQHSITAQDHQPTPDSCIISMVVGQLK Oxidation (M) 3018.4903 0.4902901 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 105.66 105.66 3;4 1.2508E-12 108824 QUIQUE_C1277_190116_001 71.149 68.086 391020000 42482000 88240000 65065000 0 0 0 64247000 0 0 0 43969000 0 87014000 22067 2734 20741 198028;198029;198030;198031;198032;198033;198034 253225;253226;253227;253228;253229;253230;253231 253226 2166 7 IQHSITAQDHQPTPDSCIISMVVGQLK Unmodified 3002.4954 0.49537547 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 123.09 123.09 3;4 7.408E-79 128889 QUIQUE_C1218_190116_001 167.67 159.6 6439700000 350370000 622510000 519580000 181430000 340470000 381660000 521370000 469060000 667160000 152850000 682330000 590590000 960300000 22068 2734 20741 198035;198036;198037;198038;198039;198040;198041;198042;198043;198044;198045;198046;198047;198048;198049;198050;198051;198052;198053;198054;198055;198056;198057;198058 253232;253233;253234;253235;253236;253237;253238;253239;253240;253241;253242;253243;253244;253245;253246;253247;253248;253249;253250;253251;253252;253253;253254;253255;253256;253257;253258;253259;253260;253261;253262;253263;253264;253265;253266;253267 253233 36 IQHTVTASVR Unmodified 1110.6146 0.61455605 1861 P04275 VWF von Willebrand factor;von Willebrand antigen 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 14.174 14.174 3 0.0079525 5788 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NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 60.468 60.468 2;3 0.00022915 60430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.502 74.802 621600000 0 0 0 0 0 0 0 134240000 222680000 0 31518000 45792000 187370000 22074 620 20747 198091;198092;198093;198094;198095;198096;198097 253304;253305;253306;253307;253308;253309;253310 253304 6 IQLEEDISKK Unmodified 1201.6554 0.65541781 796 CON__Q8N1A0;Q8N1A0 KRT222 Keratin-like protein KRT222 yes no 0 0 1 1 91.66 91.66 2 0.025513 94156 QUIQUE_C1218_190116_001 61.962 32.586 34458000 34458000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 22075 796 20748 198098 253311 253311 1 IQLEHHISPGDFPDCQK Unmodified 2019.9473 0.94725951 4353 Q9NZN4 EHD2 EH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.553 56.553 3 0.00026259 55019 QUIQUE_C1277_190116_001 67.645 57.16 334650000 39201000 65990000 45443000 70435000 77397000 0 0 0 0 0 36189000 0 0 22076 4353 20749 198099;198100;198101;198102;198103;198104 253312;253313;253314;253315;253316;253317;253318 253313 7 IQLEQVQEWK Unmodified 1299.6823 0.68230126 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.822 80.822 2 2.8395E-05 80885 QUIQUE_C1563_190116_001 169.44 76.01 2393300000 199200000 223700000 0 180670000 211590000 184130000 210470000 192220000 192260000 91846000 245830000 222840000 238550000 22077 890;3052 20750 198105;198106;198107;198108;198109;198110;198111;198112;198113;198114;198115;198116;198117 253319;253320;253321;253322;253323;253324;253325;253326;253327;253328;253329;253330;253331;253332;253333;253334 253327 14 IQLHSSQVLR Unmodified 1179.6724 0.67240528 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 2 1 3 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 27.743 27.743 2;3 9.7072E-05 22140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.523 43.268 1042000000 129650000 100470000 75021000 120760000 64150000 93439000 109840000 85629000 125560000 52104000 0 85417000 0 22078 855;928 20751 198118;198119;198120;198121;198122;198123;198124;198125;198126;198127;198128;198129;198130;198131;198132;198133;198134;198135;198136;198137 253335;253336;253337;253338;253339;253340;253341;253342;253343;253344;253345;253346;253347;253348;253349;253350;253351;253352;253353;253354;253355;253356;253357;253358;253359;253360 253355 25 IQLIFER Unmodified 917.53345 0.53345218 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 1 83.712 83.712 2 0.031943 83267 QUIQUE_C1563_190116_001 89.55 8.2531 114930000 46118000 0 0 0 0 51292000 0 0 0 17524000 0 0 0 22079 3098 20752 198138;198139;198140 253361;253362;253363 253362 3 IQLINNMLDK Oxidation (M) 1216.6486 0.64855829 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.338 62.338 2 6.8593E-12 61815 QUIQUE_C1277_190116_001 166.16 55.154 4590000000 630200000 764490000 811170000 665600000 501820000 0 0 0 405040000 0 493630000 318080000 0 22080 1790 20753 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regulatory subunit 13 yes no 0 0 0 1 166.23 166.23 2 0.011053 169243 QUIQUE_C1403_190116_001 57.348 32.495 11412000 0 0 0 11412000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22085 4512 20756 198169 253404 253404 1 IQLLCLMEMTFTRPANHR Unmodified 2230.1173 0.1173185 4512 Q9UNM6;A0A087WUL9;E9PL38 PSMD13 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 yes no 0 0 1 1 1 1 1 135.62 135.62 4 4.3992E-14 139350 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.69 87.211 110590000 0 0 0 0 0 0 0 25962000 25659000 0 32105000 26868000 0 22086 4512 20757 198170;198171;198172;198173 253405;253406;253407;253408 253405 3 IQLLDLPGIIEGAK Unmodified 1478.8708 0.87083031 4549 Q9Y295 DRG1 Developmentally-regulated GTP-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 150.68 150.68 2 0.00071895 155916 QUIQUE_C1368_190116_001 99.752 70.794 119610000 26594000 27295000 18267000 31783000 0 0 0 0 0 0 0 15676000 0 22087 4549 20758 198174;198175;198176;198177;198178 253409;253410;253411;253412;253413 253411 5 IQLLVFK Unmodified 859.55312 0.55312499 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.446 97.446 2 0.024661 101779 QUIQUE_C1438_190116_001 97.596 35.258 414280000 0 0 0 46235000 44298000 0 43760000 46004000 44501000 0 63080000 61721000 64676000 22088 574 20759 198179;198180;198181;198182;198183;198184;198185;198186 253414;253415;253416;253417;253418;253419;253420;253421;253422 253416 9 IQLPSEK Unmodified 813.45962 0.45961853 2694 P60520;H3BSM5;H3BQ50 GABARAPL2 Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 31.477 31.477 2 0.024658 26549 QUIQUE_C1403_190116_001 97.602 37.244 349150000 0 0 0 99263000 130570000 0 0 0 0 0 0 119320000 0 22089 2694 20760 198187;198188;198189 253423;253424;253425 253423 3 IQLPVVMHTEAEDVSLR Unmodified 1936.0088 0.0087971324 261 A0A0R4J2G7;A0A0D9SEP4;A0A1D5RMU6;E7ERL8;Q9ULB1;A0A0U1RRK7;F5GYC7;F8WB18 NRXN1 Neurexin-1 yes no 0 0 0 1 1 101.93 101.93 3 0.01002 104852 QUIQUE_C1277_190116_001 39.863 9.7298 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4461 Q9UJW0 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes yes 0 0 0 1 123.51 123.51 2 0.045252 126934 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.574 50.884 192690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 192690000 0 22093 4461 20764 198202 253439 253439 0 IQLVEEELDR Unmodified 1242.6456 0.6455814 63;3271;435;2791;1260;1019;1908;3424;1164;557;3325 J3KN67;K7EP68;P06753;Q6ZN40;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;A0A2R8YEU4;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;Q5HYB6;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951;F5H7S3;B7Z596;H0YKJ4;H0YK48;A0A087WWU8;D6R904 TPM3;TPM4;TPM1;DKFZp686J1372;TPM2b;TPM2 Tropomyosin alpha-3 chain;Tropomyosin alpha-4 chain;Tropomyosin beta chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 77.234 77.234 2 7.6808E-19 78548 QUIQUE_C1277_190116_001 186.25 108.57 16854000000 1542400000 1880300000 1435700000 1359900000 1578400000 1416300000 1444100000 901570000 1348000000 861930000 1027200000 1030300000 1027900000 + 22094 1260;1908;3424;435;2791;3271;557;3325;1019;1164;63 20765 198203;198204;198205;198206;198207;198208;198209;198210;198211;198212;198213;198214;198215;198216 253440;253441;253442;253443;253444;253445;253446;253447;253448;253449;253450;253451;253452;253453;253454;253455;253456;253457;253458;253459;253460;253461;253462;253463;253464;253465;253466;253467;253468;253469;253470 253446 31 IQLVEEELDRAQER Unmodified 1726.885 0.88497683 63;3271;435;2791;1260;1019;1908;3424;1164;557;3325 J3KN67;K7EP68;P06753;Q6ZN40;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;A0A2R8YEU4;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;Q5HYB6;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951;F5H7S3;B7Z596;H0YKJ4;H0YK48;A0A087WWU8;D6R904 TPM3;TPM4;TPM1;DKFZp686J1372;TPM2b;TPM2 Tropomyosin alpha-3 chain;Tropomyosin alpha-4 chain;Tropomyosin beta chain no no 0 0 1 2 1 2 2 1 75.244 75.244 2;3 3.5406E-132 75988 QUIQUE_DMIX3_190116_001 207.66 186.24 945350000 0 0 0 0 0 0 0 214190000 80199000 0 328980000 238130000 83856000 + 22095 1260;1908;3424;435;2791;3271;557;3325;1019;1164;63 20766 198217;198218;198219;198220;198221;198222;198223;198224 253471;253472;253473;253474;253475;253476;253477;253478;253479;253480;253481;253482 253475 12 IQMLDDTQEAFEVPQR Unmodified 1918.9095 0.90947702 734;357 A0A1B0GV68;M0QYB0;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 109.74 109.74 2;3 5.4259E-15 115046 QUIQUE_C1218_190116_001 172.99 150.76 36020000 0 0 36020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22096 357;734 20767 198225;198226 253483;253484;253485 253483 3 IQMSNLMNQAR 2 Oxidation (M) 1336.6228 0.62275425 2397 P36543;C9J8H1 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.077 19.077 2 0.00068034 11810 QUIQUE_C1368_190116_001 109.71 78.641 402840000 33916000 61384000 51348000 38300000 0 24009000 37284000 29413000 0 28022000 58266000 0 40901000 22097 2397 20768 198227;198228;198229;198230;198231;198232;198233;198234;198235;198236 253486;253487;253488;253489;253490;253491;253492;253493;253494;253495;253496;253497 253489 1800;1801 12 IQMSNLMNQAR Oxidation (M) 1320.6278 0.62783962 2397 P36543;C9J8H1 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 36.022 36.022 2 3.7904E-05 30907 QUIQUE_C1218_190116_001 138.98 113.12 982140000 138040000 95779000 70197000 74965000 0 0 71372000 169470000 49186000 0 79495000 233640000 0 22098 2397 20768 198237;198238;198239;198240;198241;198242;198243;198244;198245;198246;198247;198248;198249;198250 253498;253499;253500;253501;253502;253503;253504;253505;253506;253507;253508;253509;253510;253511;253512 253498 1800;1801 15 IQMSNLMNQAR Unmodified 1304.6329 0.632925 2397 P36543;C9J8H1 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.237 67.237 2 1.9867E-37 66793 QUIQUE_C1403_190116_001 202.28 172.81 6230100000 549740000 565570000 614360000 506520000 460280000 423360000 568220000 375370000 363450000 147820000 637990000 478290000 539120000 22099 2397 20768 198251;198252;198253;198254;198255;198256;198257;198258;198259;198260;198261;198262;198263 253513;253514;253515;253516;253517;253518;253519;253520;253521;253522;253523;253524;253525;253526;253527;253528;253529;253530 253517 18 IQNAGGSVMIQR Unmodified 1272.6609 0.66085431 2387;1652 O75688;C9JIR6;A0A3B3IS24;B8ZZF0;P35813;E9PKB5 PPM1B;PPM1A Protein phosphatase 1B;Protein phosphatase 1A no no 0 0 0 1 1 35.096 35.096 2 0.0023409 31052 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.509 41.336 108380000 0 0 0 0 0 0 0 0 48576000 0 0 0 59803000 22100 1652;2387 20769 198264;198265 253531;253532 253531 2 IQNFLNEFK Unmodified 1151.5975 0.597509 3661 Q8TB03 CXorf38 Uncharacterized protein CXorf38 yes yes 0 0 0 1 1 1 98.079 98.079 2 0.00048805 100047 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.89 62.028 32097000 0 0 0 0 0 0 0 17236000 0 0 0 14861000 0 22101 3661 20770 198266;198267;198268 253533;253534;253535 253534 3 IQNGAQGIR Unmodified 955.51993 0.51992738 905 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P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.381 71.381 2 0.0017172 72094 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.744 47.49 8363400000 773600000 0 762080000 729180000 709950000 539280000 848310000 662530000 673470000 0 939790000 800390000 924840000 22109 2777 20778 198317;198318;198319;198320;198321;198322;198323;198324;198325;198326;198327 253592;253593;253594;253595;253596;253597;253598;253599;253600;253601;253602 253599 9 IQPGNPSCTDLELSLK Unmodified 1770.8822 0.88219964 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 90.212 90.212 2 0.00061968 90840 QUIQUE_C1563_190116_001 75.102 62.335 449600000 0 0 0 134260000 0 162140000 153200000 0 0 0 0 0 0 22110 2938 20779 198328;198329;198330 253603;253604;253605 253604 2 IQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGK Unmodified 3052.5539 0.55393621 2051 P13010;C9JZ81 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.41 172.41 3 1.1979E-44 176520 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.85 123.88 15956000000 480760000 1002600000 1198600000 385720000 1067400000 305530000 801430000 1061300000 1104100000 38102000 1876900000 2676800000 3956800000 22111 2051 20780 198331;198332;198333;198334;198335;198336;198337;198338;198339;198340;198341;198342;198343 253606;253607;253608;253609;253610;253611;253612;253613;253614;253615;253616;253617;253618;253619;253620;253621 253616 16 IQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGK Oxidation (M) 3068.5489 0.54885083 2051 P13010;C9JZ81 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 1 0 1 1 163.25 163.25 3 1.7845E-12 166863 QUIQUE_C1403_190116_001 66.925 58.416 257890000 0 0 0 171640000 0 86248000 0 0 0 0 0 0 0 22112 2051 20780 198344;198345 253622;253623 253622 1370 2 IQPGSQQADFLDALIVSMDVIQHETIGKK Unmodified 3180.6489 0.64889923 2051 P13010;C9JZ81 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 0 1 1 1 167.2 167.2 4 8.452E-38 171306 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.42 119.93 338380000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 182690000 155690000 0 22113 2051 20781 198346;198347 253624;253625 253625 2 IQPNDGPVFYK Unmodified 1276.6452 0.64518747 3849 Q96F85;B8ZZB8 CNRIP1 CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 59.58 59.58 2 0.00047864 57838 QUIQUE_C1368_190116_001 107.47 70.908 13755000000 1037300000 1194000000 1199200000 979410000 1112200000 861560000 1148600000 954990000 977510000 405770000 1484900000 1140300000 1259600000 22114 3849 20782 198348;198349;198350;198351;198352;198353;198354;198355;198356;198357;198358;198359;198360;198361;198362;198363;198364 253626;253627;253628;253629;253630;253631;253632;253633;253634;253635;253636;253637;253638;253639;253640;253641;253642;253643;253644 253630 19 IQPSGGTNINEALLR Unmodified 1581.8475 0.84746911 2153 Q5T985;P19823;CON__Q9TRI1 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 73.562 73.562 2 5.9864E-07 74964 QUIQUE_C1438_190116_001 119.39 86.387 330960000 30899000 0 46911000 50151000 78909000 43014000 0 0 0 0 0 33870000 47210000 22115 2153 20783 198365;198366;198367;198368;198369;198370;198371;198372 253645;253646;253647;253648;253649;253650;253651;253652 253648 8 IQPSNTLELLVTGLLPK Unmodified 1835.0768 0.076800343 3606 Q8N6C5 IGSF1 Immunoglobulin superfamily member 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 2 2 167.83 167.83 2;3 0.00042406 173777 QUIQUE_C1438_190116_001 98.531 93.831 646520000 81154000 72285000 0 31907000 69506000 44929000 47072000 65573000 209590000 24501000 0 0 0 22116 3606 20784 198373;198374;198375;198376;198377;198378;198379;198380;198381;198382;198383;198384;198385;198386 253653;253654;253655;253656;253657;253658;253659;253660;253661;253662;253663;253664;253665;253666 253657 11 IQPYYALQHSFFK Unmodified 1640.8351 0.83511351 441 A0A2R8YDF3;A0A2R8Y6L5;A0A2R8Y6I6;Q13627 DYRK1A Dual specificity tyrosine-phosphorylation-regulated kinase 1A yes no 0 0 0 1 103.79 103.79 3 0.00061089 105699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.895 55.824 21148000 0 0 0 0 0 0 0 21148000 0 0 0 0 0 22117 441 20785 198387 253667;253668 253667 2 IQQDADSVITVGR Unmodified 1400.726 0.72595699 4159 Q9H3P7 ACBD3 Golgi resident protein GCP60 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.147 57.147 2 0.00059456 55567 QUIQUE_C1368_190116_001 103.22 47.653 329480000 33008000 31680000 46511000 47768000 45800000 48212000 33373000 0 0 0 0 0 43127000 22118 4159 20786 198388;198389;198390;198391;198392;198393;198394;198395 253669;253670;253671;253672;253673;253674;253675;253676;253677;253678 253672 9 IQQEIAVQNPLVSER Unmodified 1722.9264 0.92644771 1282 J3KR44;Q96FW1;F5GYN4;F5GYJ8 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 85.764 85.764 2;3 9.3907E-66 88978 QUIQUE_C1218_190116_001 234.41 176.04 5620300000 415600000 536140000 455330000 449860000 524050000 469840000 449640000 306170000 393610000 177600000 494980000 432390000 515100000 22119 1282 20787 198396;198397;198398;198399;198400;198401;198402;198403;198404;198405;198406;198407;198408;198409;198410;198411;198412;198413;198414;198415;198416;198417 253679;253680;253681;253682;253683;253684;253685;253686;253687;253688;253689;253690;253691;253692;253693;253694;253695;253696;253697;253698;253699;253700;253701;253702;253703;253704;253705;253706;253707;253708;253709;253710;253711;253712;253713;253714;253715 253680 35 IQQELQTAK Unmodified 1057.5768 0.57677356 980 E9PSI1;E9PQI5;E9PQ80;Q9BY43;H0YI89 CHMP4A Charged multivesicular body protein 4a yes no 0 0 0 1 17.48 17.48 2 0.024423 9929 QUIQUE_C1368_190116_001 60.019 11.515 12357000 0 0 12357000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22120 980 20788 198418 253716 253716 1 IQQIAEGEK Unmodified 1014.5346 0.53457439 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3;K7EKW9 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 17.853 17.853 2 6.9898E-05 10400 QUIQUE_DMIX4_190116_001 145.63 13.348 241390000 37283000 54355000 0 37292000 0 38433000 0 0 37225000 36800000 0 0 0 22121 3057 20789 198419;198420;198421;198422;198423;198424 253717;253718;253719;253720;253721;253722 253722 6 IQQIIEGK Unmodified 927.53893 0.53893149 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.081 26.081 2 0.0019037 19611 QUIQUE_C1563_190116_001 138.83 78.532 1966200000 179940000 168920000 171940000 175630000 0 155730000 190410000 139060000 156450000 69665000 224780000 149700000 184000000 22122 831;1569 20790 198425;198426;198427;198428;198429;198430;198431;198432;198433;198434;198435;198436 253723;253724;253725;253726;253727;253728;253729;253730;253731;253732;253733;253734 253727 10 IQQLAISGLK Unmodified 1069.6495 0.64954457 2632;4566 Q9Y2T2;H0YBM0;P53677;E5RJ52 AP3M1;AP3M2 AP-3 complex subunit mu-1;AP-3 complex subunit mu-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.727 66.727 2 0.00059898 65819 QUIQUE_DMIX8_190116_001 109.11 10.587 1353700000 143410000 140690000 101860000 103200000 94955000 83043000 85349000 114800000 88832000 39514000 146670000 118730000 92596000 22123 4566;2632 20791 198437;198438;198439;198440;198441;198442;198443;198444;198445;198446;198447;198448;198449 253735;253736;253737;253738;253739;253740;253741;253742;253743;253744;253745;253746;253747 253747 12 IQQLFWMNDSFR Unmodified 1583.7555 0.75548298 3236 Q4G0P3;J3QQJ7 HYDIN Hydrocephalus-inducing protein homolog yes no 0 0 0 1 1 2 1 111.77 111.77 2;3 0.0035981 109316 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.879 9.5759 500310000 0 0 0 37612000 0 33618000 0 0 0 403670000 0 0 25415000 22124 3236 20792 198450;198451;198452;198453;198454 253748;253749;253750;253751;253752 253750 5 IQQLLNTLK Unmodified 1069.6495 0.64954457 4380;3080 Q9P265;Q14689 DIP2B;DIP2A Disco-interacting protein 2 homolog B;Disco-interacting protein 2 homolog A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.235 64.235 2 0.0026365 63002 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.143 13.669 30750000 0 0 0 0 0 0 0 30750000 0 0 0 0 0 22125 4380;3080 20793 198455;198456;198457;198458;198459 253753;253754;253755;253756;253757 253754 5 IQQLTALGAAQATAK Unmodified 1483.8358 0.83584179 3955 Q99471;H3BPF6;H3BMQ1 PFDN5 Prefoldin subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.222 64.222 2 0.000144 62950 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.101 55.686 1053500000 151880000 116970000 0 81945000 106770000 0 104930000 101120000 103020000 0 145150000 0 141750000 22126 3955 20794 198460;198461;198462;198463;198464;198465;198466;198467;198468;198469 253758;253759;253760;253761;253762;253763;253764;253765;253766;253767 253767 9 IQQLTEEIGR Unmodified 1185.6354 0.63535107 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 1 52.775 52.775 2 0.016095 51568 QUIQUE_C1218_190116_001 82.287 26.611 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22127 2041 20795 198470;198471 253768;253769 253768 2 IQQLVNTLK Unmodified 1055.6339 0.63389451 315 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4 DIP2C Disco-interacting protein 2 homolog C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.311 47.311 2 0.0061041 45144 QUIQUE_C1218_190116_001 85.161 44.588 97923000 17214000 0 22654000 0 16594000 0 0 25549000 0 0 0 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174471 QUIQUE_DMIX7_190116_001 196.15 171.81 2190200000 226020000 108980000 53293000 50182000 149160000 14946000 187360000 381420000 354120000 15766000 292600000 274370000 82032000 22157 591;2030 20824 198700;198701;198702;198703;198704;198705;198706;198707;198708;198709;198710;198711;198712;198713;198714;198715;198716;198717;198718;198719;198720;198721;198722;198723;198724 254029;254030;254031;254032;254033;254034;254035;254036;254037;254038;254039;254040;254041;254042;254043;254044;254045;254046;254047;254048;254049;254050;254051;254052;254053;254054;254055 254054 25 IQVIDISMILAEAIRR Unmodified 1840.0604 0.060438772 591;2030 B1ALA9;P60891;B7ZB02;H7C540;P11908 PRPS1;PRPS2 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1;Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2 no no 0 0 1 1 161.3 161.3 3 0.00016727 163665 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.89 34.338 52665000 0 0 0 0 0 0 0 52665000 0 0 0 0 0 22158 591;2030 20825 198725 254056 254056 1 IQVLGSLVSLEMGK Oxidation (M) 1488.8222 0.82216556 336 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254106;254107;254108;254109;254110;254111;254112;254113;254114;254115;254116;254117;254118;254119;254120;254121 254107 16 IQVLQQQADDAEERAER Unmodified 1997.9766 0.97664538 63;3271 Q5HYB6;D6RFM2;A0A087WWU8;D6R904 DKFZp686J1372;TPM3 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 56.999 56.999 3 5.1603E-11 54721 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.34 102.43 657820000 0 0 0 0 0 0 0 119540000 80368000 0 139700000 111080000 207130000 22162 3271;63 20828 198773;198774;198775;198776;198777 254122;254123;254124;254125;254126;254127 254127 6 IQVLVEPDHFK Unmodified 1323.7187 0.71868677 2131 P17931 LGALS3 Galectin-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 1 2 64.752 64.752 2;3 7.4721E-13 64481 QUIQUE_C1277_190116_001 166.07 109.34 4719600000 459230000 373230000 389040000 479860000 556630000 452990000 232950000 277870000 443020000 143360000 288540000 117570000 505330000 22163 2131 20829 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IQVYHEEPECKPSSSSTIFR Unmodified 2393.1322 0.13215975 4689 yes yes 0 0 1 1 1 88.768 88.768 3 0.00047701 90370 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.704 8.8484 139380000 0 0 0 0 0 0 0 73677000 0 0 0 0 65699000 + 22170 4689 20836 198898;198899 254269;254270;254271 254270 3 IQYQLVDISQDNALR Unmodified 1774.9214 0.92136233 4142 Q9H299;Q5T123 SH3BGRL3 SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 108.99 108.99 2;3 0.0040511 105951 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.03 14.037 407290000 211580000 0 152040000 0 0 0 0 0 0 43666000 0 0 0 22171 4142 20837 198900;198901;198902 254272;254273;254274 254274 2 IQYQLVDISQDNALRDEMR Unmodified 2306.1325 0.1324941 4142 Q9H299;Q5T123 SH3BGRL3 SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3 yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 110.75 110.75 2;3 3.712E-35 115680 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.33 151.1 4500000000 213080000 348030000 332250000 103200000 198180000 163420000 311710000 479160000 485280000 86233000 710530000 519120000 549840000 22172 4142 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254462;254463;254464;254465;254466;254467 254464 5 IRELEGHISDLQEDLDSER Unmodified 2253.0873 0.087318043 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 1 84.719 84.719 3;4 0.00010731 85999 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.987 70.699 45562000 0 16504000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29058000 0 22189 2385 20853 199064;199065 254468;254469;254470 254470 3 IRELESMIGIDPGNR Unmodified 1698.8723 0.87230365 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 1 1 1 89.57 89.57 3 0.00036941 90971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.391 58.69 115950000 0 0 0 0 0 0 0 54190000 0 0 0 61764000 0 22190 1140;3457 20854 199066;199067 254471;254472;254473 254471 3 IRELESQISELQEDLESER Unmodified 2302.1288 0.12884851 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 125.16 125.16 2;3 0.00041628 131434 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.25 56.541 537240000 0 67678000 70641000 0 0 0 0 0 107910000 0 157690000 0 133310000 22191 2378 20855 199068;199069;199070;199071;199072;199073 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nuclear ribonucleoprotein D0 yes no 0 0 1 1 1 1 134.41 134.41 2;3 0.00049868 139229 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.488 52.684 208340000 0 0 0 0 0 0 0 0 115110000 0 0 93235000 0 22194 3041 20858 199087;199088;199089 254495;254496;254497 254496 3 IRGETLGIIGLGR Unmodified 1353.8092 0.80923311 2989 Q13363;D6RAX2 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 78.257 78.257 2;3 0.0034097 78938 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.47 30.354 463740000 0 42207000 0 0 0 0 0 138680000 64996000 0 112230000 105620000 0 22195 2989 20859 199090;199091;199092;199093;199094;199095 254498;254499;254500;254501;254502;254503;254504;254505 254500 6 IRGETLGLIGFGR Unmodified 1387.7936 0.79358304 2682 Q5SQP8;P56545 CTBP2 C-terminal-binding protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 86.668 86.668 3 0.002502 88359 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.563 60.511 69655000 0 0 0 0 0 0 0 26146000 18244000 0 25265000 0 0 22196 2682 20860 199096;199097;199098 254506;254507;254508 254506 3 IRIDAMHGVVGPYVK Unmodified 1653.9025 0.90248157 2400 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IRLENEIQTYR Unmodified 1433.7627 0.76267685 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 54.976 54.976 2;3 0.0002052 53689 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.27 73.621 5190500000 103360000 135640000 203240000 263700000 328490000 109100000 230580000 203050000 254900000 392380000 794910000 1180100000 991060000 + 22202 776 20866 199137;199138;199139;199140;199141;199142;199143;199144;199145;199146;199147;199148;199149;199150;199151;199152;199153;199154;199155;199156;199157 254551;254552;254553;254554;254555;254556;254557;254558;254559;254560;254561;254562;254563;254564;254565;254566;254567;254568;254569;254570;254571;254572;254573;254574;254575;254576 254565 24 IRLPYELQK Unmodified 1158.6761 0.67609367 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 59.125 59.125 3 0.0081212 58247 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.708 49.02 292390000 0 0 0 0 30126000 0 0 0 60165000 0 88299000 63076000 50725000 22203 1748 20867 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254608 47 IRPGEQEQYESTIGFK Unmodified 1880.9268 0.92684164 449 A0A3B3ITP0;A0A2R8Y7Y3;Q4VB86;A0A2R8YD30;A0A2U3TZH6;P11171;A0A2R8Y6D0;A0A2R8Y420;A0A2R8Y7N0;A0A2R8YFR9;A0A2R8Y6G5;A0A2R8Y570;A0A2R8Y5G2;A0A2R8Y5Z6;A0A3B3IU06;A0A1B0GWG0;A0A3B3IUD6;A0A2R8YCW8;A0A2R8Y4N6 EPB41 Protein 4.1 yes no 0 0 1 1 1 1 61.15 61.15 3 0.00020775 60366 QUIQUE_C1403_190116_001 66.022 59.754 155280000 0 0 0 51845000 0 0 0 0 0 0 0 52784000 50655000 22207 449 20871 199207;199208;199209 254648;254649;254650 254648 3 IRPGEVLFR Unmodified 1085.6346 0.63456321 399 H0YN11;A0A286YET3;Q6ZNW5 GDPGP1 GDP-D-glucose phosphorylase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.221 51.221 3 0.00095774 49047 QUIQUE_C1277_190116_001 103.7 73.446 86097000 16139000 16889000 0 20871000 0 12481000 0 0 0 0 0 19717000 0 22208 399 20872 199210;199211;199212;199213;199214;199215;199216 254651;254652;254653;254654;254655;254656;254657;254658 254652 8 IRPGEYEQFESTIGFK Unmodified 1899.9367 0.93667805 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 97.849 97.849 2;3 2.1769E-23 99710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.85 125.19 5035800000 114470000 451140000 116390000 538390000 0 345040000 643000000 495730000 406710000 273790000 527110000 549090000 574900000 22209 4172 20873 199217;199218;199219;199220;199221;199222;199223;199224;199225;199226;199227;199228;199229;199230;199231;199232;199233;199234;199235;199236;199237 254659;254660;254661;254662;254663;254664;254665;254666;254667;254668;254669;254670;254671;254672;254673;254674;254675;254676;254677;254678;254679;254680;254681;254682;254683;254684;254685;254686 254670 27 IRPHIATLR Unmodified 1075.6614 0.66144666 976 E9PR38;H0YEH2;Q5T1Z4;Q5T1Z8;Q14671;H0YDK8 PUM1 Pumilio homolog 1 yes no 0 0 1 1 1 1 18.471 18.471 3 0.02892 11207 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.591 32.888 70493000 0 0 0 0 19219000 0 0 24980000 26294000 0 0 0 0 22210 976 20874 199238;199239;199240 254687;254688;254689 254689 3 IRPLTSLDHPQSPFYDPEGGSITQVAR Unmodified 2980.5043 0.5042839 4222 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199267;199268;199269;199270;199271;199272;199273;199274;199275;199276;199277;199278;199279;199280;199281;199282;199283;199284;199285;199286;199287;199288;199289;199290;199291;199292 254722;254723;254724;254725;254726;254727;254728;254729;254730;254731;254732;254733;254734;254735;254736;254737;254738;254739;254740;254741;254742;254743;254744;254745;254746;254747;254748;254749;254750;254751;254752;254753;254754;254755;254756;254757;254758;254759 254746 34 IRVDILENQAMDVSNQLAR Unmodified 2184.1321 0.13210017 141;2883 A0A0A0MR85;A6NNT0;Q03013 GSTM4 Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 1 1 123.53 123.53 3 0.0019848 126253 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.206 39.191 29974000 0 0 0 0 0 0 0 29974000 0 0 0 0 0 22216 141;2883 20879 199293 254760 254760 1 IRVDILENQVMDNHMELVR Unmodified 2323.1777 0.17767015 481 A0A3B3IRM5;P46439 GSTM5 Glutathione S-transferase Mu 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 112.38 112.38 3;4 0.00010427 115664 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.511 71.223 159800000 27234000 0 0 0 0 0 0 43971000 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HSP90AB1;HSP90AB3P;HSP90AB2P;HSP90AA1;HSP90AB4P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3;Putative heat shock protein HSP 90-beta 2;Heat shock protein HSP 90-alpha;Putative heat shock protein HSP 90-beta 4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 36.568 36.568 2;3 5.8711E-08 32063 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.38 112.22 2187200000 0 167840000 0 137580000 333980000 124860000 227520000 114540000 196770000 39081000 248940000 166410000 429690000 22220 1938;3264;1931;3263 20883 199311;199312;199313;199314;199315;199316;199317;199318;199319;199320;199321;199322 254778;254779;254780;254781;254782;254783;254784;254785;254786;254787;254788;254789;254790 254787 5 IRYESLTDPSKLDSGK Unmodified 1807.9316 0.93159267 1931;1938;3264 P08238;Q58FF7;Q58FF8;P07900;G3V2J8 HSP90AB1;HSP90AB3P;HSP90AB2P;HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3;Putative heat shock protein HSP 90-beta 2;Heat shock protein HSP 90-alpha no no 0 0 2 1 53.642 53.642 3 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2134.9875 0.98746934 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 3 143.84 143.84 2;3 6.4515E-134 148017 QUIQUE_C1277_190116_001 225.32 194.99 1808700000 191240000 227240000 198270000 141340000 0 171480000 227910000 92509000 115050000 37890000 125460000 106950000 173300000 22224 4226 20887 199338;199339;199340;199341;199342;199343;199344;199345;199346;199347;199348;199349;199350;199351;199352;199353;199354;199355;199356;199357;199358;199359;199360 254807;254808;254809;254810;254811;254812;254813;254814;254815;254816;254817;254818;254819;254820;254821;254822;254823;254824;254825;254826;254827;254828;254829;254830 254810 23 ISAFGYLECSAK Unmodified 1344.6384 0.63838754 1937 Q5JR08;P08134;E9PQH6 RHOC Rho-related GTP-binding protein RhoC yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.975 91.975 2 0.00051669 92864 QUIQUE_C1563_190116_001 94.616 88.013 831300000 0 0 242060000 215230000 0 186330000 187690000 0 0 0 0 0 0 22225 1937 20888 199361;199362;199363;199364 254831;254832;254833;254834 254833 2 ISALALLK Unmodified 827.54804 0.54803961 3767 Q92905 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.68 85.68 2 0.0044957 86878 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.92 45.623 1319400000 114050000 114260000 93520000 87614000 114990000 93619000 104790000 84917000 96728000 51183000 129230000 105500000 129010000 22226 3767 20889 199365;199366;199367;199368;199369;199370;199371;199372;199373;199374;199375;199376;199377;199378 254835;254836;254837;254838;254839;254840;254841;254842;254843;254844;254845;254846;254847;254848;254849;254850;254851;254852 254844 18 ISALNIVGDLLR Unmodified 1282.7609 0.76088593 544 A6NIZ0;Q9GZM8;Q9NXR1;I3L2R3;I3L2T8;I3L533;I3L2R9;I3L522;J3QSD2;J3QRZ1 NDEL1;NDE1 Nuclear distribution protein nudE-like 1;Nuclear distribution protein nudE homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.24 153.24 2 1.1933E-06 157899 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.86 92.255 869540000 38881000 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254868;254869;254870;254871;254872;254873;254874;254875;254876;254877;254878;254879;254880;254881;254882;254883;254884;254885;254886;254887;254888;254889;254890;254891;254892;254893;254894;254895;254896;254897;254898 254891 30 ISALQSAGVVVSMSPAQLGTTIYKEFEK Unmodified 2953.5471 0.54705992 2625 P53597 SUCLG1 Succinyl-CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 158.98 158.98 3 7.3698E-38 161701 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.46 106.37 209040000 0 0 0 0 0 0 0 72912000 26119000 0 46252000 63761000 0 22229 2625 20892 199417;199418;199419;199420;199421 254899;254900;254901;254902;254903;254904 254900 6 ISAPNVDFNLEGPK Unmodified 1499.762 0.76200815 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 99.356 99.356 2 0.061114 100965 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.951 31.735 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22230 2935 20893 199422 254905 254905 1 ISAPTQEEKDEWIK Unmodified 1672.8308 0.83081599 270 A0A0D9SFG6;Q99418 CYTH2 Cytohesin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 56.255 56.255 3 0.00087599 54371 QUIQUE_C1403_190116_001 62.377 40.056 171010000 32178000 43471000 55337000 40020000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22231 270 20894 199423;199424;199425;199426 254906;254907;254908;254909 254909 3 ISATEDTPEAEGEVPELYHQR Unmodified 2370.0975 0.097548378 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GUH6 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.414 76.414 3 5.1897E-07 77301 QUIQUE_C1368_190116_001 82.975 71.53 622520000 0 65558000 65236000 55586000 78218000 61364000 75361000 55516000 0 0 85634000 0 80048000 22232 348 20895 199427;199428;199429;199430;199431;199432;199433;199434;199435;199436;199437;199438 254910;254911;254912;254913;254914;254915;254916;254917;254918;254919;254920;254921;254922 254912 13 ISATSIFFESMPYK Unmodified 1619.7905 0.79053108 2360;2359 P34896;G3V2D2;P34897;G3V2Y4;G3V5L0;G3V4W5;G3V540 SHMT1;SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic;Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial;Serine hydroxymethyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 136.83 136.83 2 7.7109E-06 142156 QUIQUE_C1368_190116_001 121.08 96.733 677540000 0 0 125640000 0 85506000 96061000 0 0 104350000 0 80391000 77990000 107600000 22233 2359;2360 20896 199439;199440;199441;199442;199443;199444;199445 254923;254924;254925;254926;254927;254928;254929;254930;254931;254932 254923 10 ISAVAFR Unmodified 762.43882 0.43882351 4095 Q9C0D3;A8DPD7 ZYG11B Protein zyg-11 homolog B yes no 0 0 0 1 1 97.251 97.251 2 0.043299 99782 QUIQUE_C1277_190116_001 80.377 43.79 11649000 0 11649000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22234 4095 20897 199446;199447 254933;254934 254933 2 ISAVSVAER Unmodified 930.51345 0.51344502 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.818 29.818 2 0.00040242 24069 QUIQUE_C1563_190116_001 121.09 38.421 837000000 169140000 140720000 0 111720000 149520000 135500000 130410000 0 0 0 0 0 0 22235 2916 20898 199448;199449;199450;199451;199452;199453 254935;254936;254937;254938;254939;254940 254939 4 ISAWHNNVEK Unmodified 1196.5938 0.5938206 3059 Q14258 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes yes 0 0 0 1 1 19.737 19.737 3 0.02041 12680 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.533 23.166 81028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55401000 0 25627000 22236 3059 20899 199454;199455 254941;254942 254941 2 ISDAELEAELEK Unmodified 1345.6613 0.66129105 3702 Q8WUX9 CHMP7 Charged multivesicular body protein 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 88.712 88.712 2 0.0010532 90127 QUIQUE_C1403_190116_001 92.445 55.751 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22237 3702 20900 199456;199457;199458 254943;254944;254945 254944 3 ISDDLMQK Unmodified 948.45863 0.45863226 1516 O43242;H0YGV8 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.519 35.519 2 0.0079363 31164 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.19 49.355 217100000 34214000 33411000 28497000 0 0 33086000 0 0 23642000 0 35304000 28947000 0 22238 1516 20901 199459;199460;199461;199462;199463;199464;199465 254946;254947;254948;254949;254950;254951;254952 254950 7 ISDDTPLEMMTSPR Unmodified 1591.7222 0.72219352 4180 Q9H6U6;K7ESE9 BCAS3 Breast carcinoma-amplified sequence 3 yes no 0 0 0 1 104.4 104.4 2 0.025935 107912 QUIQUE_C1218_190116_001 51.875 37.717 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22239 4180 20902 199466 254953 254953 1 ISDEDWDIIHR Unmodified 1397.6575 0.65754307 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8YF45 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 81.009 81.009 2;3 3.0034E-12 82108 QUIQUE_C1368_190116_001 135.55 109.11 3031800000 166640000 281850000 300620000 245740000 214620000 163480000 273790000 174290000 234740000 68868000 343470000 277590000 286040000 22240 455 20903 199467;199468;199469;199470;199471;199472;199473;199474;199475;199476;199477;199478;199479;199480;199481;199482;199483;199484;199485;199486;199487;199488;199489;199490 254954;254955;254956;254957;254958;254959;254960;254961;254962;254963;254964;254965;254966;254967;254968;254969;254970;254971;254972;254973;254974;254975;254976;254977;254978;254979;254980;254981;254982;254983;254984;254985;254986;254987;254988;254989 254962 34 ISDFGQMASGLNIDDR Oxidation (M) 1753.7941 0.79411291 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.085 85.085 2 3.9881E-36 87586 QUIQUE_C1218_190116_001 174.05 142.86 636920000 92676000 52612000 79962000 60384000 52950000 92455000 78659000 28992000 0 34494000 63733000 0 0 22241 2009 20904 199491;199492;199493;199494;199495;199496;199497;199498;199499;199500 254990;254991;254992;254993;254994;254995;254996;254997;254998;254999 254990 1299 10 ISDFGQMASGLNIDDR Unmodified 1737.7992 0.79919829 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 112.06 112.06 2 6.8753E-10 115248 QUIQUE_C1277_190116_001 135.58 111.24 388630000 84361000 0 91228000 0 0 121270000 0 0 0 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255113;255114;255115;255116;255117;255118;255119 255116 7 ISEEDELDTK Unmodified 1177.535 0.5350279 3114 Q15121;B1AKZ5 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 32.664 32.664 1;2 6.6756E-18 28401 QUIQUE_C1438_190116_001 182.76 137.08 19526000000 1704800000 1804600000 1738900000 1367300000 1556200000 1717000000 1396100000 1154100000 1466700000 631790000 1973500000 1180000000 1835100000 22257 3114 20918 199606;199607;199608;199609;199610;199611;199612;199613;199614;199615;199616;199617;199618;199619;199620 255120;255121;255122;255123;255124;255125;255126;255127;255128;255129;255130;255131;255132;255133;255134;255135;255136;255137;255138;255139;255140;255141;255142;255143;255144;255145 255128 25 ISEELTDVDSPLPHYR Unmodified 1869.9109 0.91085723 611 B4DIZ1;Q8TAM6;C9JN04;C9J6B4;F8WAQ2;C9J8X3;B8ZZ94 ERMN Ermin yes no 0 0 0 2 1 1 84.897 84.897 2;3 0.00064184 87642 QUIQUE_C1218_190116_001 97.138 74.182 188070000 140800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47276000 0 0 22258 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Unmodified 1190.6143 0.61428128 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 12.812 12.812 2;3 9.9135E-07 3272 QUIQUE_C1277_190116_001 172.27 114.69 4076200000 118350000 1235500000 46762000 0 17175000 418950000 0 837830000 438600000 54819000 0 746170000 162070000 22261 2886 20922 199641;199642;199643;199644;199645;199646;199647;199648;199649;199650;199651;199652;199653;199654;199655;199656;199657;199658;199659 255168;255169;255170;255171;255172;255173;255174;255175;255176;255177;255178;255179;255180;255181;255182;255183;255184;255185;255186 255170 18 ISELDAFLKEPALNEANLSNLK Unmodified 2428.285 0.28495522 2901 Q06323 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.76 137.76 3 2.739E-27 134246 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.94 101.93 1841200000 118750000 113830000 241190000 162100000 158570000 94622000 113640000 131240000 166410000 64710000 225610000 97859000 152610000 22262 2901 20923 199660;199661;199662;199663;199664;199665;199666;199667;199668;199669;199670;199671;199672 255187;255188;255189;255190;255191;255192;255193;255194;255195;255196;255197;255198;255199 255196 12 ISELEGNLQTLR Unmodified 1371.7358 0.73579339 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 1 76.515 76.515 2 0.00084635 78519 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.879 37.461 185690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90151000 0 95537000 22263 800 20924 199673;199674 255200;255201;255202 255200 3 ISELGAGNGGVVFK Unmodified 1346.7194 0.71941505 2875 Q02750 MAP2K1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.41 73.41 2 1.9369E-13 73805 QUIQUE_C1277_190116_001 145.25 109.8 2424700000 182170000 208470000 166470000 182990000 169990000 176640000 157460000 196890000 170320000 90084000 270760000 225850000 226600000 22264 2875 20925 199675;199676;199677;199678;199679;199680;199681;199682;199683;199684;199685;199686;199687 255203;255204;255205;255206;255207;255208;255209;255210;255211;255212;255213;255214;255215;255216 255205 12 ISELGAGNGGVVTK Unmodified 1300.6987 0.69867961 2395 P36507 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.594 39.594 2 0.00019123 35420 QUIQUE_C1563_190116_001 93.839 60.999 874340000 0 61139000 81275000 73042000 0 75645000 75462000 119800000 100370000 43868000 117710000 126040000 0 22265 2395 20926 199688;199689;199690;199691;199692;199693;199694;199695;199696;199697 255217;255218;255219;255220;255221;255222;255223;255224;255225;255226;255227;255228 255222 10 ISELSGCTPDPR Unmodified 1330.6187 0.61871473 750 C9JVN9;Q9H9P8 L2HGDH L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 41.751 41.751 2 0.00052804 38513 QUIQUE_C1368_190116_001 98.943 78.639 26949000 0 0 26949000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22266 750 20927 199698;199699 255229;255230;255231 255230 3 ISELTSELTDER Unmodified 1391.678 0.67800374 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 71.069 71.069 2 8.4595E-10 70070 QUIQUE_C1563_190116_001 155.15 98.587 136620000 0 0 0 0 0 65779000 0 0 0 0 0 70837000 0 22267 271 20928 199700;199701 255232;255233 255232 2 ISENYSDKSDIENADESSSSILKPLISPAAER Unmodified 3464.6795 0.67946689 4662 Q9Y6R1;A0A1W2PNW8;A0A1W2PRU6 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes no 0 0 2 1 1 104.59 104.59 4 0.00143 109332 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.044 25.763 305320000 0 0 0 0 0 0 0 0 155580000 0 149740000 0 0 22268 4662 20929 199702;199703 255234;255235 255235 2 ISEQFSAMFR Unmodified 1214.5754 0.57539335 4033 Q9BUF5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes yes 0 0 0 1 1 1 94.457 94.457 2 0.012155 96172 QUIQUE_C1403_190116_001 66.27 33.915 18201000 0 0 0 18201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22269 4033 20930 199704;199705;199706 255236;255237;255238 255237 3 ISEQFTAMFR Oxidation (M) 1244.586 0.58595803 3030;4044;2797;1862;1922;3006 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beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 6 8 10 4 6 3 9 9 6 3 15 11 10 112.36 112.36 2 1.2572E-150 97654 QUIQUE_DMIX4_190116_001 276.04 175.59 173290000000 14192000000 17093000000 14080000000 12606000000 12439000000 11217000000 16650000000 15571000000 11765000000 4803700000 14241000000 14325000000 14306000000 22271 1862;1922;2797;3006;3030;4044 20931 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255475 172 ISEQTYQLSR Unmodified 1223.6146 0.61461563 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.788 40.788 2 5.5605E-14 37357 QUIQUE_C1277_190116_001 192.14 136.13 11959000000 1608500000 1204800000 878330000 983310000 984470000 692770000 1051300000 728280000 598480000 616290000 860830000 1027000000 724960000 22272 273;342 20932 199862;199863;199864;199865;199866;199867;199868;199869;199870;199871;199872;199873;199874 255538;255539;255540;255541;255542;255543;255544;255545;255546;255547;255548;255549;255550;255551;255552;255553;255554;255555;255556;255557;255558;255559;255560 255541 23 ISESGQFSDGLEDR Unmodified 1538.6849 0.68488004 3671 Q8TC26 TMEM163 Transmembrane protein 163 yes yes 0 0 0 1 61.286 61.286 2 2.256E-07 60153 QUIQUE_C1403_190116_001 108.37 90.508 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22273 3671 20933 199875 255561 255561 1 ISEVLGGSGYNSDR Unmodified 1452.6845 0.68448611 867 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carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 25.545 25.545 2 0.013348 19150 QUIQUE_C1277_190116_001 87.435 55.593 24708000 0 24708000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22308 3778 20964 200159 255910 255910 1 ISHLVLPVQPENALK Unmodified 1656.9563 0.95629128 178 A0A0A0MSK5;J3KN66;Q5JTV8 TOR1AIP1 Torsin-1A-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.83 82.83 3 0.0065862 85374 QUIQUE_C1218_190116_001 46.408 41.517 209610000 43007000 30253000 25612000 29692000 28863000 28990000 23198000 0 0 0 0 0 0 22309 178 20965 200160;200161;200162;200163;200164;200165;200166 255911;255912;255913;255914;255915;255916;255917 255911 7 ISHSYAEIEQTITLDHSEGFSVLQEELCTAQHK Unmodified 3799.7999 0.79993315 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;Q01484;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.9 132.9 4;5 2.2267E-21 137176 QUIQUE_C1277_190116_001 81.446 76.778 1092000000 48339000 72685000 232820000 0 135920000 118520000 160120000 0 72687000 20441000 174630000 0 55857000 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255930;255931;255932;255933;255934;255935;255936;255937;255938;255939;255940;255941;255942;255943;255944 255940 14 ISIEMHGTLEDQLSHLR Unmodified 1977.9942 0.9942097 2047;1242 H9KV75;H0YJW3;H0YJ11;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 100.12 100.12 3;4 2.2548E-53 104411 QUIQUE_C1218_190116_001 155.1 131.62 871360000 163870000 102090000 78814000 79522000 99787000 61473000 135460000 0 0 0 47134000 103210000 0 22313 1242;2047 20969 200192;200193;200194;200195;200196;200197;200198;200199;200200;200201;200202 255945;255946;255947;255948;255949;255950;255951;255952;255953;255954;255955;255956 255946 10 ISIEMHGTLEDQLSHLR Oxidation (M) 1993.9891 0.98912432 2047;1242 H9KV75;H0YJW3;H0YJ11;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 1 0 1 84.831 84.831 4 0.0037508 86043 QUIQUE_C1403_190116_001 46.249 37.699 32591000 0 0 0 32591000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22314 1242;2047 20969 200203 255957 255957 714 1 ISIEMNGTLEDQLSHLK Unmodified 1926.9721 0.97207728 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 116.72 116.72 2;3 6.9071E-05 114454 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.707 71.919 886290000 99547000 94286000 79629000 0 130490000 66853000 70797000 74671000 80407000 0 110580000 79030000 0 22315 1228;1544 20970 200204;200205;200206;200207;200208;200209;200210;200211;200212;200213;200214;200215;200216;200217 255958;255959;255960;255961;255962;255963;255964;255965;255966;255967;255968;255969;255970;255971;255972;255973 255969 16 ISIENSEEALTVHAPFPAAHPASR Unmodified 2543.2769 0.27685015 4643 Q9Y653;H3BRH0;H3BNH4;H3BV52;H3BSN7;H3BV72;H3BRA1;H3BT88;H3BUI6;H3BSB8;H3BRI2;A0A1B0GX62;H3BMF8;H3BUH2;H3BM73;H3BS94;H3BRZ4;H3BVA0;H3BMY9;H3BTH7;H3BRI7;H3BQZ1;H3BVD3;H3BUU6;H3BQ46;H3BP67;H3BVE9;H3BQJ9;H3BNN3;H3BPA6;H3BTK9;H3BSP5 GPR56;ADGRG1 G-protein coupled receptor 56;GPR56 N-terminal fragment;GPR56 C-terminal fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 89.638 89.638 3;4 0.00062362 93076 QUIQUE_C1218_190116_001 41.491 34.298 563630000 84383000 70385000 0 91754000 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Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 101.37 101.37 3 0.00072474 103327 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.115 54.489 151700000 0 0 0 0 0 0 0 90821000 0 0 60881000 0 0 22319 2935 20974 200233;200234;200235;200236;200237 255990;255991;255992;255993;255994;255995;255996 255992 7 ISIPDVGLHLK Unmodified 1190.7023 0.70230842 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 93.252 93.252 3 0.00053964 95106 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.029 52.971 406920000 19661000 21234000 15412000 24732000 31518000 29832000 22767000 83199000 34719000 15962000 30382000 29453000 48049000 22320 2935 20975 200238;200239;200240;200241;200242;200243;200244;200245;200246;200247;200248;200249;200250;200251;200252 255997;255998;255999;256000;256001;256002;256003;256004;256005;256006;256007;256008;256009;256010;256011;256012;256013;256014 256007 18 ISIPVDISDSDMMLNIINSSITTK Oxidation (M) 2622.3132 0.31322016 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;E9PM09;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 1 0 1 1 165.41 165.41 3 5.7466E-05 170453 QUIQUE_C1218_190116_001 49.638 36.987 54115000 42070000 0 0 0 0 0 0 0 0 12045000 0 0 0 22321 2527;3303 20976 200253;200254 256015;256016 256015 1962;1963 2 ISIPVDISDSDMMLNIINSSITTK Unmodified 2606.3183 0.31830554 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;E9PM09;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 169.05 169.05 2;3 5.0877E-18 173704 QUIQUE_C1218_190116_001 141.13 129.86 2962500000 243530000 251270000 433370000 26772000 191560000 127430000 99152000 280290000 314190000 52417000 351850000 256570000 334140000 22322 2527;3303 20976 200255;200256;200257;200258;200259;200260;200261;200262;200263;200264;200265;200266;200267;200268;200269;200270;200271;200272;200273;200274;200275;200276;200277;200278 256017;256018;256019;256020;256021;256022;256023;256024;256025;256026;256027;256028;256029;256030;256031;256032;256033;256034;256035;256036;256037;256038;256039;256040;256041 256018 25 ISISTSGGSFR Unmodified 1110.5669 0.56693715 778 CON__P13647;P13647;F8VV57 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.662 54.662 2 0.0017273 53475 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 57.827 225670000 0 0 0 0 0 0 0 0 39510000 69282000 57616000 0 59266000 + 22323 778 20977 200279;200280;200281;200282 256042;256043;256044;256045;256046;256047 256046 6 ISITEGIER Unmodified 1016.5502 0.55022446 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 57.042 57.042 2 0.023842 55245 QUIQUE_C1403_190116_001 60.436 15.355 37038000 0 0 0 37038000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22324 2096 20978 200283 256048 256048 1 ISIVEALTLLNNHK Unmodified 1563.8984 0.89844205 4362 Q9P032 NDUFAF4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.07 138.07 3 1.3354E-29 141347 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67594000 0 112160000 112100000 57741000 22327 4418 20981 200306;200307;200308;200309;200310;200311 256074;256075;256076;256077;256078;256079;256080 256074 6 ISKPDLKPFTPEVR Unmodified 1625.9141 0.91409211 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 58.061 58.061 3 0.015267 56120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.102 54.547 89641000 0 0 0 0 0 0 0 89641000 0 0 0 0 0 22328 921 20982 200312 256081 256081 1 ISKPGAVSTPVK Unmodified 1182.6972 0.69722304 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 1 1 18.987 18.987 3 0.026381 11970 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.333 35.64 104670000 0 0 0 0 0 0 0 0 104670000 0 0 0 0 22329 1074 20983 200313 256082 256082 0 ISLADIAQK Unmodified 957.5495 0.54949617 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.475 71.475 2 5.8967E-05 71645 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.27 37.341 564120000 59134000 63624000 56213000 57408000 32598000 36219000 0 56476000 54045000 39361000 51475000 57570000 0 22330 1516 20984 200314;200315;200316;200317;200318;200319;200320;200321;200322;200323;200324 256083;256084;256085;256086;256087;256088;256089;256090;256091;256092;256093;256094;256095;256096;256097 256090 14 ISLAIPNLGNTSQQEYK Unmodified 1874.9738 0.97379183 3096 Q15018 FAM175B BRISC complex subunit Abro1 yes yes 0 0 0 1 108.4 108.4 2 0.0092511 110388 QUIQUE_C1563_190116_001 56.205 44.672 23569000 0 0 0 0 0 23569000 0 0 0 0 0 0 0 22331 3096 20985 200325 256098 256098 1 ISLAPTDVK Unmodified 942.5386 0.53859714 3714 Q8WWM7;H3BUF6 ATXN2L Ataxin-2-like protein yes no 0 0 0 1 46.703 46.703 2 0.057023 43426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.794 18.609 26990000 0 0 0 0 0 0 0 26990000 0 0 0 0 0 22332 3714 20986 200326 256099 256099 1 ISLEEENRQIHK Unmodified 1494.7791 0.77905519 4704 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 154.71 154.71 3 0.0082037 161408 QUIQUE_C1438_190116_001 45.879 3.0698 200820000 0 0 0 0 24678000 39224000 0 35942000 39158000 0 30811000 0 31007000 + 22333 4704 20987 200327;200328;200329;200330;200331;200332 256100;256101;256102;256103;256104;256105 256100 6 ISLEEQLKK Unmodified 1086.6285 0.62847478 3125 Q15276;K7ENJ9 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.891 34.891 3 0.0036412 30505 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.375 30.661 101950000 0 0 0 0 0 0 0 22861000 23824000 0 0 29934000 25331000 22334 3125 20988 200333;200334;200335;200336;200337;200338;200339 256106;256107;256108;256109;256110;256111;256112;256113 256110 8 ISLEIMTLQPR Unmodified 1299.7221 0.72205759 3057 Q14254 FLOT2 Flotillin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 114.05 114.05 2 0.014535 117730 QUIQUE_C1368_190116_001 58.474 33.262 99075000 30004000 0 39460000 0 0 0 29611000 0 0 0 0 0 0 22335 3057 20989 200340;200341;200342 256114;256115;256116 256115 3 ISLENVGCASQIGK Unmodified 1474.745 0.74497787 136 A0A0A0MQZ4;Q8N3J5;V9GYZ5;V9GYS8 PPM1K Protein phosphatase 1K, mitochondrial yes no 0 0 0 1 74.6 74.6 2 0.0037405 76416 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.488 42.475 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22336 136 20990 200343 256117 256117 1 ISLEVQLEQLRPFSHL Unmodified 1908.0469 0.046897198 3829 Q96D71;E9PMG1;H0YDT0 REPS1 RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 140.45 140.45 3 0.035664 143457 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.583 20.302 13337000 0 0 0 0 0 0 0 13337000 0 0 0 0 0 22337 3829 20991 200344 256118 256118 1 ISLGLPVGAVINCADNTGAK Unmodified 1969.0303 0.030260856 2764 P62829;C9JD32;B9ZVP7;J3KT29 RPL23 60S ribosomal protein L23 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.53 125.53 2 1.1326E-06 128513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.15 97.593 572300000 53245000 60302000 67402000 82633000 36823000 0 0 38197000 65638000 0 49831000 59907000 58321000 22338 2764 20992 200345;200346;200347;200348;200349;200350;200351;200352;200353;200354;200355 256119;256120;256121;256122;256123;256124;256125;256126;256127;256128;256129;256130;256131;256132 256127 14 ISLIQIFR Unmodified 988.60695 0.60695147 3381 Q6P2Q9;I3L3Z8 PRPF8 Pre-mRNA-processing-splicing factor 8 yes no 0 0 0 1 124.19 124.19 2 0.059844 129344 QUIQUE_C1576_190116_001 119.57 70.207 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22339 3381 20993 200356 256133 256133 1 ISLLLDPGSFVESDMFVEHR Unmodified 2290.1304 0.13036883 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E7ENC1;H7C5C9;C9JVY9 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.9 154.9 3 6.7972E-10 160802 QUIQUE_C1218_190116_001 110.77 97.88 1003600000 92563000 83446000 120230000 63190000 56058000 82728000 92103000 72647000 111370000 24655000 133920000 0 70709000 22340 739 20994 200357;200358;200359;200360;200361;200362;200363;200364;200365;200366;200367;200368 256134;256135;256136;256137;256138;256139;256140;256141;256142;256143;256144;256145;256146;256147;256148;256149;256150;256151;256152 256135 19 ISLLLIQSWLEPVQFLR Unmodified 2054.1928 0.19283315 493 A0A3B3ISS9;P01241 GH1 Somatotropin yes no 0 0 0 1 1 174.13 174.13 2 5.0725E-23 178137 QUIQUE_C1218_190116_001 147.71 139.84 33168000 11189000 0 0 0 0 0 21979000 0 0 0 0 0 0 22341 493 20995 200369;200370 256153;256154;256155;256156 256154 4 ISLLNSEK Unmodified 902.5073 0.50729701 426 A0A2R8Y566;Q9P260;A0A075B785 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 0 1 1 39.063 39.063 2 0.03696 35092 QUIQUE_C1403_190116_001 62.464 14.291 59641000 0 0 0 32862000 0 26779000 0 0 0 0 0 0 0 22342 426 20996 200371;200372 256157;256158 256157 2 ISLNSLCYGDMDK Unmodified 1514.6745 0.67451505 1611 O75131;A0A087WYQ3;H0YB26 CPNE3 Copine-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 96.459 96.459 2 0.0090996 100690 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.652 65.085 186700000 0 0 0 0 51004000 0 0 0 0 0 56698000 0 78999000 22343 1611 20997 200373;200374;200375;200376;200377 256159;256160;256161;256162;256163 256161 3 ISLNSLCYGDMDK Oxidation (M) 1530.6694 0.66942967 1611 O75131;A0A087WYQ3;H0YB26 CPNE3 Copine-3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 81.913 81.913 2 0.0018952 84434 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.692 52.178 174840000 0 0 0 0 0 0 0 31240000 0 0 52959000 30357000 60286000 22344 1611 20997 200378;200379;200380;200381 256164;256165;256166;256167;256168;256169 256166 873 6 ISLPDGGSCLCTAWPRR Unmodified 1944.9298 0.9298353 4049 Q9BVQ7 SPATA5L1 Spermatogenesis-associated protein 5-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 155.88 155.88 4 0.018369 158143 QUIQUE_C1563_190116_001 25.319 15.123 524870000 0 0 98266000 0 84190000 61747000 108170000 0 0 30493000 0 142000000 0 22345 4049 20998 200382;200383;200384;200385;200386;200387 256170;256171;256172;256173;256174;256175;256176 256172 7 ISLPESLK Unmodified 885.51713 0.51713341 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 64.546 64.546 2 0.032564 63763 QUIQUE_C1218_190116_001 65.252 9.576 116680000 62446000 0 0 0 0 0 0 0 0 54237000 0 0 0 22346 1803 20999 200388;200389 256177;256178 256177 2 ISLPGQMAGTPITPLK Unmodified 1622.9066 0.90656389 4189 Q9H8Y8 GORASP2 Golgi reassembly-stacking protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 107.54 107.54 2 0.011362 110619 QUIQUE_C1277_190116_001 55.314 41.795 90702000 0 41276000 0 0 0 49426000 0 0 0 0 0 0 0 22347 4189 21000 200390;200391 256179;256180 256179 2 ISLPLGSEERPFLR Unmodified 1612.8937 0.89369102 1264 J3KNP4;Q9NPR2;H0YMR1;H0YLN3;H0YMD6 SEMA4B Semaphorin-4B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.448 96.448 3 6.1794E-06 99100 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.498 53.716 378790000 31023000 33828000 42557000 29802000 36145000 0 0 33488000 0 0 67060000 54666000 50221000 22348 1264 21001 200392;200393;200394;200395;200396;200397;200398;200399;200400;200401 256181;256182;256183;256184;256185;256186;256187;256188;256189;256190 256187 10 ISLPLPNFSSLNLR Unmodified 1569.8879 0.88787736 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 0 0 3 6 4 6 4 8 3 3 5 4 2 3 3 147.31 147.31 2;3 5.0678E-87 154386 QUIQUE_DMIX5_190116_001 180.61 159.88 71265000000 4090100000 5156500000 4905200000 314970000 7381700000 12516000000 3847800000 6242200000 6960700000 2587000000 5221300000 5526600000 6514700000 22349 1952 21002 200402;200403;200404;200405;200406;200407;200408;200409;200410;200411;200412;200413;200414;200415;200416;200417;200418;200419;200420;200421;200422;200423;200424;200425;200426;200427;200428;200429;200430;200431;200432;200433;200434;200435;200436;200437;200438;200439;200440;200441;200442;200443;200444;200445;200446;200447;200448;200449;200450;200451;200452;200453;200454;200455 256191;256192;256193;256194;256195;256196;256197;256198;256199;256200;256201;256202;256203;256204;256205;256206;256207;256208;256209;256210;256211;256212;256213;256214;256215;256216;256217;256218;256219;256220;256221;256222;256223;256224;256225;256226;256227;256228;256229;256230;256231;256232;256233;256234;256235;256236;256237;256238;256239;256240;256241;256242;256243;256244;256245;256246;256247;256248;256249;256250;256251;256252;256253;256254;256255;256256;256257;256258;256259;256260;256261;256262;256263;256264;256265;256266;256267;256268;256269;256270;256271;256272;256273;256274;256275;256276;256277;256278;256279;256280;256281;256282;256283;256284;256285;256286;256287;256288;256289;256290;256291;256292;256293;256294;256295;256296;256297;256298;256299;256300;256301;256302 256279 104 ISLPVILMDETLK Unmodified 1470.8368 0.83675299 2112 P16615;H7C5W9;A0A0C4DH86 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 148.63 148.63 2 0.0038316 151336 QUIQUE_C1563_190116_001 69.01 52.378 165770000 0 28660000 40421000 0 0 25209000 0 24968000 0 0 46512000 0 0 22350 2112 21003 200456;200457;200458;200459;200460 256303;256304;256305;256306;256307 256305 5 ISLQAIQQLVR Unmodified 1267.7612 0.76122028 1653 O75694;E9PF10 NUP155 Nuclear pore complex protein Nup155 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.24 122.24 2 0.0035676 127633 QUIQUE_C1218_190116_001 73.573 54.302 221950000 27724000 29985000 0 31434000 31517000 22685000 0 22038000 0 0 0 31834000 24734000 22351 1653 21004 200461;200462;200463;200464;200465;200466;200467;200468;200469;200470 256308;256309;256310;256311;256312;256313;256314;256315;256316;256317 256308 9 ISLQDLSK Unmodified 902.5073 0.50729701 1327 K7EL81;Q9BZL4 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 1 65.516 65.516 2 0.029847 65038 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.494 10.773 31005000 0 0 0 0 0 0 12458000 0 0 0 0 0 18547000 22352 1327 21005 200471;200472 256318;256319 256319 2 ISLSGVHHFAR Unmodified 1222.6571 0.65708956 1702 O94985;Q5SR54 CLSTN1 Calsyntenin-1;Soluble Alc-alpha;CTF1-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 28.48 28.48 3 0.00071391 23290 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.5 34.07 174870000 0 0 23841000 0 38944000 0 0 0 0 0 38407000 28313000 45367000 22353 1702 21006 200473;200474;200475;200476;200477 256320;256321;256322;256323;256324 256323 5 ISLSPEYVFSVSTFR Unmodified 1730.8879 0.88793694 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 143.93 143.93 2;3 5.3098E-06 140063 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.08 90.525 1719200000 127970000 0 109170000 175510000 278570000 205200000 117660000 156140000 156580000 79085000 21784000 157350000 134210000 22354 2037 21007 200478;200479;200480;200481;200482;200483;200484;200485;200486;200487;200488;200489;200490;200491;200492;200493;200494 256325;256326;256327;256328;256329;256330;256331;256332;256333;256334;256335;256336;256337;256338;256339;256340;256341;256342;256343;256344;256345;256346;256347;256348;256349 256345 25 ISLVEAGVTR Unmodified 1043.5975 0.597509 524 A4D126 ISPD Isoprenoid synthase domain-containing protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 57.951 57.951 2 0.017593 57524 QUIQUE_C1218_190116_001 61.691 8.5249 120810000 15879000 18377000 21410000 0 0 0 0 15840000 0 0 32976000 16330000 0 22355 524 21008 200495;200496;200497;200498;200499;200500;200501 256350;256351;256352;256353;256354;256355;256356 256350 7 ISMAAYVSGELEHVTR Unmodified 1761.872 0.8719693 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 2 2 1 3 2 1 1 1 1 1 2 3 1 115.47 115.47 2;3 6.541E-06 121063 QUIQUE_C1218_190116_001 83.418 72.63 1660700000 145970000 156770000 162270000 239670000 167280000 90614000 119330000 86668000 110380000 63046000 96674000 104340000 117670000 22356 2129 21009 200502;200503;200504;200505;200506;200507;200508;200509;200510;200511;200512;200513;200514;200515;200516;200517;200518;200519;200520;200521;200522 256357;256358;256359;256360;256361;256362;256363;256364;256365;256366;256367;256368;256369;256370;256371;256372;256373;256374;256375;256376;256377;256378;256379;256380;256381;256382;256383;256384;256385;256386 256358 30 ISMADVK Unmodified 762.39458 0.39457544 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 1 1 31.78 31.78 2 0.061225 26471 QUIQUE_C1368_190116_001 68.915 9.9338 104120000 0 0 58999000 0 0 0 45116000 0 0 0 0 0 0 22357 194 21010 200523;200524 256387;256388 256387 2 ISMLYMAK Unmodified 955.4871 0.48709561 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 0 1 1 68.815 68.815 2 0.029489 69394 QUIQUE_C1277_190116_001 105.39 74.101 79726000 0 35564000 0 0 0 0 0 0 0 0 44162000 0 0 22358 515 21011 200525;200526 256389;256390 256389 1 ISMPDFDLHLK Unmodified 1314.6642 0.66420836 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 107.58 107.58 2;3 0.00085337 109868 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.408 56.931 1074100000 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1257.6639 0.663874 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 113.5 113.5 2 0.0049661 110365 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.1 8.4502 237470000 80577000 0 21483000 0 0 103510000 0 31897000 0 0 0 0 0 22376 2935 21028 200602;200603;200604;200605;200606;200607;200608 256477;256478;256479;256480;256481;256482;256483;256484 256482 7 ISMPEVDLNLKGPK Unmodified 1539.8331 0.8330646 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 90.531 90.531 3 0.042893 91258 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.546 7.0898 31514000 0 0 0 0 0 0 0 31514000 0 0 0 0 0 22377 2935 21029 200609 256485 256485 0 ISMPGFKGEGPDVDVNLPK Unmodified 1999.0085 0.0084627814 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 104.03 104.03 3 0.05727 105968 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.408 15.659 47306000 0 0 0 0 0 0 0 47306000 0 0 0 0 0 22378 2935 21030 200610 256486 256486 1 ISMQDVDLSLGSPK Unmodified 1488.7494 0.74939455 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 105.35 105.35 2 0.00082922 108932 QUIQUE_C1218_190116_001 85.845 68.036 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22379 2935 21031 200611 256487 256487 1 ISMSEVDLNVAAPK Unmodified 1472.7545 0.75447993 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 94.982 94.982 2 0.060223 97747 QUIQUE_C1218_190116_001 45.879 28.443 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22380 2935 21032 200612 256488 256488 1 ISMSHEEEPLGTAGPLALAR Unmodified 2078.0466 0.046639202 4628 Q9Y5P6 GMPPB Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.963 91.963 3 0.00032728 94010 QUIQUE_C1403_190116_001 58.848 56.325 409070000 0 40931000 51106000 63692000 43828000 0 0 0 55236000 0 89184000 65092000 0 22381 4628 21033 200613;200614;200615;200616;200617;200618;200619 256489;256490;256491;256492;256493;256494;256495 256491 7 ISMSHEEEPLGTAGPLALAR Oxidation (M) 2094.0416 0.041553824 4628 Q9Y5P6 GMPPB Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta yes yes 0 1 0 1 79.77 79.77 3 0.0017033 76041 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.288 38.366 14769000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14769000 0 0 0 22382 4628 21033 200620 256496 256496 3051 1 ISNAQLQTELVEILK Unmodified 1697.9564 0.95635086 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.28 143.28 2 2.2793E-06 149832 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.07 92.291 546420000 53090000 49342000 64924000 49217000 43373000 46898000 57255000 0 62172000 22910000 48938000 48295000 0 22383 3779 21034 200621;200622;200623;200624;200625;200626;200627;200628;200629;200630;200631 256497;256498;256499;256500;256501;256502;256503;256504;256505;256506;256507;256508 256507 12 ISNFLLEK Unmodified 962.54368 0.54368251 2955 Q12965;H0YLJ4 MYO1E Unconventional myosin-Ie no no 0 0 0 1 70.831 70.831 2 0.044348 70653 QUIQUE_C1403_190116_001 78.377 40.055 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22384 2955 21035 200632 256509 256509 1 ISNGGLEEGKPVDLVLSCVDNFEAR Unmodified 2717.333 0.3330444 4110 Q9GZZ9;E7EQ61;E7EWE1;C9JRV9 UBA5 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 yes no 0 0 1 1 139.78 139.78 3 0.00064942 142871 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.6 37.877 136670000 0 0 0 0 0 0 0 136670000 0 0 0 0 0 22385 4110 21036 200633 256510 256510 1 ISNIPDEYFK Unmodified 1224.6027 0.60265396 2597 P51884;CON__Q05443 LUM Lumican yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.364 81.364 2 0.0017025 82112 QUIQUE_C1403_190116_001 98.044 60.495 307530000 46053000 0 48053000 76109000 77244000 0 41238000 0 0 18836000 0 0 0 22386 2597 21037 200634;200635;200636;200637;200638;200639 256511;256512;256513;256514;256515;256516 256513 5 ISNIPSLIFLDATTGK Unmodified 1688.9349 0.93488713 3356 Q6DKJ4 NXN Nucleoredoxin yes yes 0 0 0 1 1 1 144.84 144.84 2 0.027808 150427 QUIQUE_C1368_190116_001 54.343 34.136 95731000 0 50219000 27161000 0 18351000 0 0 0 0 0 0 0 0 22387 3356 21038 200640;200641;200642 256517;256518;256519 256518 2 ISNITCDSFK Unmodified 1183.5543 0.55432356 3850 Q96FC7 PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.402 49.402 2 1.8659E-05 47061 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.2 63.993 4532600000 320130000 419400000 0 410190000 410140000 495170000 0 330040000 411870000 196040000 511740000 454050000 573850000 22388 3850 21039 200643;200644;200645;200646;200647;200648;200649;200650;200651;200652;200653 256520;256521;256522;256523;256524;256525;256526;256527;256528;256529;256530;256531 256528 11 ISNITVEQR Unmodified 1058.572 0.57202253 794 CON__Q7Z3Y9;Q7Z3Y9 KRT26 Keratin, type I cytoskeletal 26 yes no 0 0 0 1 1 1 25.041 25.041 2 0.023392 18356 QUIQUE_C1403_190116_001 60.76 15.042 131400000 0 44319000 0 44585000 0 0 0 42494000 0 0 0 0 0 + 22389 794 21040 200654;200655;200656 256532;256533;256534 256533 3 ISNIVHISNLVR Unmodified 1363.7936 0.79358304 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3;G3V3B0 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 67.429 67.429 3 0.042948 67403 QUIQUE_C1277_190116_001 34.179 28.459 200660000 36647000 33859000 38732000 0 41761000 0 23966000 0 0 0 25695000 0 0 22390 4745 21041 200657;200658;200659;200660;200661;200662 256535;256536;256537;256538;256539;256540 256536 6 ISNIVHISNLVRPFTLGQLK Unmodified 2248.3056 0.3055715 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3;G3V3B0 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 1 1 117.28 117.28 4 0.010211 123503 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.246 22.374 41493000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41493000 0 0 22391 4745 21042 200663 256541 256541 1 ISNLLSDYGYHLR Unmodified 1549.7889 0.7888916 378 C9J4M6;A0A1W2PPT5;C9J2Y9;P30876 POLR2B DNA-directed RNA polymerase;DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.824 92.824 3 0.00013136 96403 QUIQUE_C1218_190116_001 73.927 54.187 280710000 26998000 24396000 32165000 26809000 23236000 15617000 23890000 19913000 0 9759900 32872000 26236000 18821000 22392 378 21043 200664;200665;200666;200667;200668;200669;200670;200671;200672;200673;200674;200675;200676 256542;256543;256544;256545;256546;256547;256548;256549;256550;256551;256552;256553;256554;256555;256556 256542 15 ISNPWQSPSGTLPALR Unmodified 1722.9053 0.90531834 3005 Q13505;A0A0C4DFQ1 MTX1 Metaxin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 108.82 108.82 2 1.2467E-05 111132 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.89 84.415 190040000 0 0 0 0 0 0 0 54941000 66336000 0 0 68759000 0 22393 3005 21044 200677;200678;200679 256557;256558;256559;256560 256557 4 ISNQVDLSNVCAQYR Unmodified 1765.8417 0.8417318 1653 O75694;E9PF10 NUP155 Nuclear pore complex protein Nup155 yes no 0 0 0 1 1 1 79.783 79.783 2 1.0469E-08 80821 QUIQUE_C1277_190116_001 124.21 108.62 28323000 0 28323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22394 1653 21045 200680;200681;200682 256561;256562;256563 256561 3 ISNSSEFSAK Unmodified 1068.5088 0.50875357 616 B4DKF8;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.047 20.047 2 0.0012409 12767 QUIQUE_C1368_190116_001 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256576;256577;256578;256579;256580;256581;256582;256583;256584;256585;256586;256587;256588;256589;256590;256591;256592;256593 256580 17 ISNYGWDQSDK Unmodified 1311.5731 0.57314474 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 49.219 49.219 2 0.00045455 47562 QUIQUE_C1438_190116_001 126.31 104.81 482750000 0 0 139550000 0 118740000 0 129250000 0 0 0 95205000 0 0 22397 4212 21048 200712;200713;200714;200715 256594;256595;256596;256597;256598 256595 5 ISNYGWDQSDKFVK Unmodified 1685.8049 0.80493559 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 70.651 70.651 2;3 0.0023683 70866 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.179 57.84 686090000 0 0 0 0 0 0 0 181060000 116060000 0 110190000 123910000 154860000 22398 4212 21049 200716;200717;200718;200719;200720;200721 256599;256600;256601;256602;256603;256604 256599 5 ISPDAWQVCAEALAQR Unmodified 1813.8781 0.87811731 1534 O43592;F8WDU6;F5GYW6 XPOT Exportin-T yes no 0 0 0 1 119.52 119.52 3 0.009837 123953 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[glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 120.19 120.19 3 0.00042955 124597 QUIQUE_C1218_190116_001 59.513 52.455 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22412 2554 21063 200828 256733 256733 1 ISQMPVILTPLHFDRDPLQK Unmodified 2347.2722 0.27222246 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.54 118.54 4 4.593E-18 122767 QUIQUE_C1368_190116_001 98.443 84.855 377280000 31030000 45359000 29687000 41288000 30763000 0 26671000 42550000 32937000 13689000 49850000 0 33451000 22413 2554 21064 200829;200830;200831;200832;200833;200834;200835;200836;200837;200838;200839 256734;256735;256736;256737;256738;256739;256740;256741;256742;256743;256744;256745;256746;256747 256737 12 ISQNFLSSINEDIDPR Unmodified 1846.9061 0.9061062 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3L1U8 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 124.39 124.39 2 0.00036823 128403 QUIQUE_C1368_190116_001 83.617 65.04 418220000 82699000 0 77604000 0 0 53213000 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256764 8 ISQTVEILK Unmodified 1029.607 0.60701105 3970;1092 G3XAH0;B4DJ62;C9JM82;E7EPG2;F8W9E5;Q99719;E7EX32;E7EQM7 SEPT5 Septin-5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.652 51.652 2 3.6326E-05 49711 QUIQUE_C1576_190116_001 167.33 73.027 6128500000 617800000 570980000 540970000 501940000 489180000 413740000 484090000 314290000 343210000 186040000 561340000 546620000 558340000 22417 1092;3970 21068 200861;200862;200863;200864;200865;200866;200867;200868;200869;200870;200871;200872;200873 256770;256771;256772;256773;256774;256775;256776;256777;256778;256779;256780;256781;256782 256776 9 ISQTYQQQYGR Unmodified 1370.6579 0.65787742 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.689 27.689 2 1.8927E-70 21496 QUIQUE_DMIX5_190116_001 232.46 172.02 1519000000 97816000 98428000 121690000 99530000 113740000 101550000 99597000 127880000 127230000 80009000 112530000 150230000 188740000 22418 1968 21069 200874;200875;200876;200877;200878;200879;200880;200881;200882;200883;200884;200885;200886 256783;256784;256785;256786;256787;256788;256789;256790;256791;256792;256793;256794;256795;256796 256793 14 ISRDELLQVLR Unmodified 1340.7776 0.77759863 3966 Q99653 CHP1 Calcineurin B homologous protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.973 91.973 3 0.00029269 94156 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.403 34.933 254980000 0 26580000 14171000 16728000 17224000 0 25252000 22159000 34030000 0 38193000 27733000 32914000 22419 3966 21070 200887;200888;200889;200890;200891;200892;200893;200894;200895;200896;200897 256797;256798;256799;256800;256801;256802;256803;256804;256805;256806;256807 256804 11 ISREECDKYALQSQQR Unmodified 2009.9589 0.95888683 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 22.616 22.616 3;4 3.0895E-19 15772 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.63 104.49 377130000 0 0 0 0 0 0 0 89479000 66997000 0 87145000 75740000 57764000 22420 2453 21071 200898;200899;200900;200901;200902 256808;256809;256810;256811;256812 256810 5 ISSALHFCR Unmodified 1089.5389 0.53894826 3847 Q96EY8;S4R3P5 MMAB Cob(I)yrinic acid a,c-diamide adenosyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.632 32.632 3 0.0020026 27739 QUIQUE_C1218_190116_001 85.731 72.377 234760000 33373000 34314000 0 0 33090000 0 0 10610000 31760000 12053000 44844000 0 34721000 22421 3847 21072 200903;200904;200905;200906;200907;200908;200909;200910 256813;256814;256815;256816;256817;256818;256819;256820;256821 256813 8 ISSDLDGHPVPK Unmodified 1263.6459 0.64591575 2288 P29401;E9PFF2;F8W888 TKT Transketolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 27.796 27.796 2;3 1.3913E-05 22624 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.41 87.814 17045000000 1357200000 1253600000 1285100000 1453100000 1432500000 1338500000 1303000000 1260400000 1689600000 901120000 1355600000 1361100000 1054400000 22422 2288 21073 200911;200912;200913;200914;200915;200916;200917;200918;200919;200920;200921;200922;200923;200924;200925;200926;200927;200928;200929;200930;200931;200932;200933;200934;200935;200936 256822;256823;256824;256825;256826;256827;256828;256829;256830;256831;256832;256833;256834;256835;256836;256837;256838;256839;256840;256841;256842;256843;256844;256845;256846;256847;256848;256849;256850;256851;256852;256853;256854;256855;256856;256857 256844 33 ISSHIPLIIQFFMLQTYGQQLQK Oxidation (M) 2748.4673 0.46729345 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 161.67 161.67 3 7.623E-05 166930 QUIQUE_C1368_190116_001 52.095 46.301 43344000 0 0 43344000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22423 2168 21074 200937 256858;256859 256858 1516 2 ISSHIPLIIQFFMLQTYGQQLQK Unmodified 2732.4724 0.47237883 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 167.54 167.54 3 2.8816E-63 172813 QUIQUE_C1368_190116_001 166.29 155.3 451970000 0 0 63891000 0 0 0 0 0 0 0 388080000 0 0 22424 2168 21074 200938;200939 256860;256861 256860 2 ISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMR Oxidation (M) 3625.6786 0.67857793 2288 P29401;E9PFF2;F8W888 TKT Transketolase yes no 0 1 0 1 1 2 1 141.3 141.3 3;4 3.68E-39 146198 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.86 92.026 1362400000 0 174070000 0 0 0 0 0 282860000 558210000 0 347290000 0 0 22425 2288 21075 200940;200941;200942;200943;200944 256862;256863;256864;256865;256866 256865 1669 5 ISSIQATTAAGSGHPTSCCSAAEIMAVLFFHTMR Unmodified 3609.6837 0.6836633 2288 P29401;E9PFF2;F8W888 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 150.63 150.63 3;4 1.0809E-29 157179 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.858 85.372 2612400000 0 117390000 150850000 59544000 27537000 34344000 159280000 312730000 349080000 31911000 492800000 483650000 393280000 22426 2288 21075 200945;200946;200947;200948;200949;200950;200951;200952;200953;200954;200955;200956;200957;200958 256867;256868;256869;256870;256871;256872;256873;256874;256875;256876;256877;256878;256879;256880;256881;256882;256883;256884;256885;256886;256887;256888 256886 22 ISSIQSIVPALEIANAHR Unmodified 1918.0636 0.063609895 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 116.04 116.04 2;3 2.1905E-54 119592 QUIQUE_C1368_190116_001 183.23 169.6 28541000000 2252000000 2090800000 2612700000 2543900000 1871400000 2748100000 2494700000 1658700000 2183900000 1150900000 1757300000 2850400000 2326000000 22427 2004 21076 200959;200960;200961;200962;200963;200964;200965;200966;200967;200968;200969;200970;200971;200972;200973;200974;200975;200976;200977;200978;200979;200980;200981;200982;200983;200984 256889;256890;256891;256892;256893;256894;256895;256896;256897;256898;256899;256900;256901;256902;256903;256904;256905;256906;256907;256908;256909;256910;256911;256912;256913;256914;256915;256916;256917;256918;256919;256920;256921;256922;256923;256924;256925;256926;256927;256928;256929;256930;256931;256932;256933;256934;256935;256936;256937;256938;256939;256940;256941;256942;256943;256944;256945;256946;256947;256948;256949;256950;256951;256952;256953;256954;256955;256956;256957;256958;256959;256960;256961;256962;256963 256903 75 ISSIYAR Unmodified 808.4443 0.44430282 3079 Q14683;G8JLG1;V9GY57 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 0 1 24.203 24.203 2 0.040382 17888 QUIQUE_C1368_190116_001 82.913 38.221 26046000 0 0 26046000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22428 3079 21077 200985 256964 256964 1 ISSLDQLVEGESYVCGSIEPFK Unmodified 2456.1781 0.17810688 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 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257000;257001;257002;257003;257004;257005;257006;257007;257008 257000 5 ISSPLFNTK Unmodified 1005.5495 0.54949617 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 57.731 57.731 2 0.0091866 57080 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.679 28.118 72388000 0 0 28021000 0 0 0 0 0 0 0 44367000 0 0 22434 1497 21083 201027;201028;201029;201030 257009;257010;257011;257012 257012 4 ISSPNTELSTQK Unmodified 1303.662 0.66195975 4682 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 20.16 20.16 2 0.00046392 12667 QUIQUE_C1277_190116_001 109.11 26.831 553400000 0 66684000 63461000 0 106700000 0 133870000 85158000 0 17731000 0 79794000 0 + 22435 4682 21084 201031;201032;201033;201034;201035;201036;201037;201038 257013;257014;257015;257016;257017;257018;257019;257020 257013 5 ISSPTETER Unmodified 1018.4931 0.49310351 2344 P31949 S100A11 Protein S100-A11;Protein S100-A11, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.637 16.637 2 0.00011524 8925 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Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.48 122.48 4 2.7472E-05 127592 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.629 32.599 378310000 67212000 71747000 0 50187000 0 0 0 0 65750000 0 70537000 52882000 0 22455 1868 21104 201213;201214;201215;201216;201217;201218 257247;257248;257249;257250;257251;257252;257253 257252 5 ISVLQNNYEK Unmodified 1206.6245 0.62445203 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.695 47.695 2 0.00032041 45495 QUIQUE_C1218_190116_001 122.28 72.863 663030000 50316000 47599000 60220000 48046000 71792000 38812000 64005000 49771000 49762000 0 70351000 60468000 51886000 22456 3108 21105 201219;201220;201221;201222;201223;201224;201225;201226;201227;201228;201229;201230 257254;257255;257256;257257;257258;257259;257260;257261;257262;257263;257264;257265;257266 257254 11 ISVMGGEQAANVLATITK Unmodified 1801.9608 0.96078431 4223 Q9HCC0;D6RD67 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.63 133.63 2 0.00019671 138098 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.61 85.411 684570000 80837000 67312000 73599000 0 68133000 112100000 0 74005000 101770000 20469000 0 0 86338000 22457 4223 21106 201231;201232;201233;201234;201235;201236;201237;201238;201239 257267;257268;257269;257270;257271;257272;257273;257274;257275;257276 257274 9 ISVMGGEQAANVLATITK Oxidation (M) 1817.9557 0.95569893 4223 Q9HCC0;D6RD67 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 118.31 118.31 2 0.0014038 121679 QUIQUE_C1277_190116_001 64.04 40.813 190710000 0 71733000 0 84137000 0 0 0 0 0 34840000 0 0 0 22458 4223 21106 201240;201241;201242;201243 257277;257278;257279;257280 257277 2884 3 ISVNDFIIK Unmodified 1047.5964 0.59644637 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.25 110.25 1;2 0.00050563 115642 QUIQUE_C1438_190116_001 127.56 74.849 4813400000 417910000 314190000 429720000 314990000 336020000 384370000 448040000 279010000 408100000 175470000 505460000 398990000 401120000 22459 1997 21107 201244;201245;201246;201247;201248;201249;201250;201251;201252;201253;201254;201255;201256;201257 257281;257282;257283;257284;257285;257286;257287;257288;257289;257290;257291;257292;257293;257294;257295;257296;257297;257298 257287 17 ISVNNVLPVFDNLMQQK Oxidation (M) 1974.0244 0.024447197 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19;F8WD96;F8W787 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 1 0 3 3 2 2 2 2 2 2 2 4 2 1 1 134.83 134.83 2;3 7.3984E-11 140850 QUIQUE_C1218_190116_001 121.01 102.88 2960800000 283370000 373160000 265750000 95174000 239870000 134910000 228200000 284210000 276760000 394100000 59171000 135120000 191030000 22460 358 21108 201258;201259;201260;201261;201262;201263;201264;201265;201266;201267;201268;201269;201270;201271;201272;201273;201274;201275;201276;201277;201278;201279;201280;201281;201282;201283;201284;201285 257299;257300;257301;257302;257303;257304;257305;257306;257307;257308;257309;257310;257311;257312;257313;257314;257315;257316;257317;257318;257319;257320;257321;257322;257323;257324;257325;257326;257327;257328;257329;257330 257301 252 30 ISVNNVLPVFDNLMQQK Unmodified 1958.0295 0.029532575 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19;F8WD96;F8W787 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 152.17 152.17 2;3 2.6234E-44 159059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 219.43 189.89 13664000000 1016000000 1138300000 1154200000 897490000 1118900000 1227800000 1334400000 761430000 797570000 411260000 1315600000 1555500000 935370000 22461 358 21108 201286;201287;201288;201289;201290;201291;201292;201293;201294;201295;201296;201297;201298;201299;201300;201301;201302;201303;201304;201305;201306;201307;201308;201309;201310 257331;257332;257333;257334;257335;257336;257337;257338;257339;257340;257341;257342;257343;257344;257345;257346;257347;257348;257349;257350;257351;257352;257353;257354;257355;257356;257357;257358;257359;257360;257361;257362;257363;257364 257359 34 ISVPVHSFASLNIK Unmodified 1510.8508 0.85076357 2435 P41219;H7C5W5 PRPH Peripherin yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 88.288 88.288 2;3 0.0001369 90042 QUIQUE_C1368_190116_001 79.639 72.6 606710000 40642000 0 83577000 0 0 34023000 0 178460000 47679000 69721000 84090000 0 68517000 22462 2435 21109 201311;201312;201313;201314;201315;201316;201317;201318;201319 257365;257366;257367;257368;257369;257370;257371;257372;257373;257374;257375;257376;257377;257378 257366 13 ISVSFYHVK Unmodified 1078.5811 0.58113065 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 0 1 1 53.199 53.199 2 0.016345 50711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.88 21.113 81375000 41487000 0 0 0 0 0 0 39887000 0 0 0 0 0 22463 2674 21110 201320;201321 257379;257380;257381 257380 3 ISVTQPDSIVGIVAVDK Unmodified 1739.9669 0.96691554 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.27 119.27 2 0.00022777 123394 QUIQUE_C1368_190116_001 118.76 95.537 489430000 27396000 29980000 48800000 29444000 39168000 60044000 37728000 48397000 46563000 27707000 0 39022000 55178000 22464 3420 21111 201322;201323;201324;201325;201326;201327;201328;201329;201330;201331;201332;201333 257382;257383;257384;257385;257386;257387;257388;257389;257390;257391;257392;257393 257384 12 ISVVNVNPTNIRPHSDTPEIR Unmodified 2357.2452 0.24515609 4473 Q9UKE5 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 70.785 70.785 4 0.0026425 69552 QUIQUE_C1563_190116_001 29.118 22.019 183110000 46614000 0 0 56379000 44351000 35768000 0 0 0 0 0 0 0 22465 4473 21112 201334;201335;201336;201337 257394;257395;257396;257397 257397 4 ISVVWNDDSSSTLTIYNANIDDAGIYK Unmodified 2973.4244 0.42436183 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 159.4 159.4 3 7.7978E-09 161292 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.152 58.186 38270000 0 0 0 0 18214000 0 0 20056000 0 0 0 0 0 22466 1218;28;2057 21113 201338;201339;201340 257398;257399;257400 257399 3 ISVYYNEASSHK Unmodified 1396.6623 0.6622941 3006 Q13509;A0A0B4J269;G3V5W4;G3V2R8;G3V3R4;G3V2N6 TUBB3 Tubulin beta-3 chain yes no 0 0 0 3 4 4 3 4 4 4 4 4 2 2 4 3 27.806 27.806 2;3 1.3727E-54 22770 QUIQUE_DMIX3_190116_001 207.83 197 146740000000 12505000000 12468000000 11423000000 11174000000 11133000000 9237000000 12853000000 9129400000 10919000000 4084300000 13951000000 11633000000 16233000000 22467 3006 21114 201341;201342;201343;201344;201345;201346;201347;201348;201349;201350;201351;201352;201353;201354;201355;201356;201357;201358;201359;201360;201361;201362;201363;201364;201365;201366;201367;201368;201369;201370;201371;201372;201373;201374;201375;201376;201377;201378;201379;201380;201381;201382;201383;201384;201385 257401;257402;257403;257404;257405;257406;257407;257408;257409;257410;257411;257412;257413;257414;257415;257416;257417;257418;257419;257420;257421;257422;257423;257424;257425;257426;257427;257428;257429;257430;257431;257432;257433;257434;257435;257436;257437;257438;257439;257440;257441;257442;257443;257444;257445;257446;257447;257448;257449;257450;257451;257452;257453;257454;257455;257456;257457;257458;257459;257460;257461;257462;257463;257464;257465;257466;257467;257468;257469;257470;257471;257472;257473;257474;257475;257476;257477;257478;257479;257480;257481;257482;257483;257484 257461 80 ISVYYNEATGGK Unmodified 1300.6299 0.62993134 1922 Q5JP53;P07437 TUBB Tubulin beta chain yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 49.87 49.87 2 1.4786E-37 47290 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.26 149.66 80878000000 6037500000 6497400000 7171600000 6031100000 6826800000 5282700000 7547700000 6443400000 6629400000 2897800000 6229700000 5814900000 7467700000 22468 1922 21115 201386;201387;201388;201389;201390;201391;201392;201393;201394;201395;201396;201397;201398;201399;201400;201401;201402;201403;201404;201405;201406;201407 257485;257486;257487;257488;257489;257490;257491;257492;257493;257494;257495;257496;257497;257498;257499;257500;257501;257502;257503;257504;257505;257506;257507;257508;257509;257510;257511;257512;257513;257514;257515;257516;257517;257518;257519;257520;257521;257522;257523;257524;257525;257526;257527;257528;257529 257511 43 ISWEMDSK Unmodified 994.44298 0.44298219 3850 Q96FC7 PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 59.308 59.308 2 0.021033 57988 QUIQUE_C1277_190116_001 110.81 81.469 134090000 0 134090000 0 0 0 0 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147.72 147.72 2 3.5236E-56 154412 QUIQUE_C1438_190116_001 169.79 158.56 207360000 0 0 65294000 0 40166000 31392000 0 33528000 0 0 0 36975000 0 22475 1526 21120 201432;201433;201434;201435;201436;201437 257554;257555;257556;257557;257558;257559;257560;257561 257556 8 ISYGNDALMPSLTETK Unmodified 1738.8448 0.8447515 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 1 101.25 101.25 2 0.0043658 104519 QUIQUE_C1218_190116_001 57.434 47.43 24737000 24737000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22476 147 21121 201438 257562 257562 1 ISYKDALDR Unmodified 1079.5611 0.56112349 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 41.42 41.42 3 0.0087474 37870 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.399 28.972 279580000 0 0 0 0 0 0 0 118780000 52050000 0 52101000 56657000 0 22477 3117 21122 201439;201440;201441;201442 257563;257564;257565;257566;257567 257564 4 ISYSNPVR Unmodified 934.48723 0.48723027 1725 O95352 ATG7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes yes 0 0 0 1 1 31.916 31.916 2 0.031896 26448 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.676 27.258 159020000 77489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 81527000 0 22478 1725 21123 201443;201444 257568;257569 257569 2 ITAAEALK Unmodified 815.47527 0.4752686 4533 Q9UQM7 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.886 26.886 2 0.0039847 20853 QUIQUE_C1277_190116_001 110.81 35.497 12320000000 1696700000 1801500000 1000700000 1111000000 1179600000 834200000 1351100000 0 614880000 398760000 1202500000 1128700000 0 22479 4533 21124 201445;201446;201447;201448;201449;201450;201451;201452;201453;201454;201455 257570;257571;257572;257573;257574;257575;257576;257577;257578;257579;257580 257571 6 ITAAQHSVTGSAVSK Unmodified 1455.7682 0.76815616 3002 Q13492;E9PK13;E9PJT1 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 16.168 16.168 2;3 2.6884E-07 8714 QUIQUE_C1218_190116_001 120.63 94.769 684470000 131490000 107870000 0 59346000 44277000 0 0 139310000 0 44855000 157330000 0 0 22480 3002 21125 201456;201457;201458;201459;201460;201461;201462;201463;201464 257581;257582;257583;257584;257585;257586;257587;257588;257589 257581 6 ITADGAHFELR Unmodified 1228.62 0.62003536 1295 J3QK89;Q8IWX8 CHERP Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.449 51.449 3 0.0041841 49387 QUIQUE_C1576_190116_001 50.275 21.317 165810000 33998000 0 17509000 17049000 0 23726000 21672000 14703000 0 12139000 0 25010000 0 22481 1295 21126 201465;201466;201467;201468;201469;201470;201471;201472 257590;257591;257592;257593;257594;257595;257596;257597 257594 8 ITADLLSNGIDVYPQK Unmodified 1745.92 0.91996535 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.29 114.29 2 1.038E-18 117619 QUIQUE_C1277_190116_001 179.35 127.08 2920900000 373000000 338120000 430520000 359780000 314410000 406880000 343170000 161740000 0 193290000 0 0 0 22482 4432 21127 201473;201474;201475;201476;201477;201478;201479;201480;201481 257598;257599;257600;257601;257602;257603;257604;257605;257606;257607;257608 257599 10 ITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDR Unmodified 2868.3301 0.33012709 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.28 124.28 3 3.2617E-98 126946 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.53 163.22 1065100000 56572000 96163000 106300000 90550000 90263000 68092000 67813000 112220000 126020000 41479000 0 121290000 88302000 22483 4432 21128 201482;201483;201484;201485;201486;201487;201488;201489;201490;201491;201492;201493 257609;257610;257611;257612;257613;257614;257615;257616;257617;257618;257619;257620;257621;257622;257623;257624;257625;257626;257627;257628 257621 20 ITADLLSNGIDVYPQKEFDEDSEDRLVNEK Unmodified 3451.6631 0.66308855 4432 Q9UHD8 SEPT9 Septin-9 yes yes 0 0 2 2 3 2 2 2 121.49 121.49 3;4 2.3333E-176 127439 QUIQUE_DMIX5_190116_001 206.03 175.93 1782500000 0 0 0 0 0 0 0 469480000 269200000 0 423190000 355480000 265180000 22484 4432 21129 201494;201495;201496;201497;201498;201499;201500;201501;201502;201503;201504 257629;257630;257631;257632;257633;257634;257635;257636;257637;257638;257639;257640;257641;257642 257635 12 ITADQALK Unmodified 858.48108 0.48108226 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.353 23.353 2 0.007181 17231 QUIQUE_C1218_190116_001 98.997 42.982 1793700000 575790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 605720000 612200000 0 22485 412;3299 21130 201505;201506;201507;201508;201509;201510;201511;201512 257643;257644;257645;257646;257647;257648;257649;257650 257643 8 ITAEEAISHEWISGNAASDK Unmodified 2128.0073 0.0072768075 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 94.282 94.282 2;3 3.0023E-243 96211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 278.2 258.68 2285400000 324280000 232770000 258220000 314240000 222100000 256050000 109670000 38828000 94921000 0 116990000 188260000 129020000 22486 872;3632 21131 201513;201514;201515;201516;201517;201518;201519;201520;201521;201522;201523;201524;201525;201526;201527;201528 257651;257652;257653;257654;257655;257656;257657;257658;257659;257660;257661;257662;257663;257664;257665;257666;257667;257668;257669 257662 19 ITAEEMYDIFGK Unmodified 1415.6643 0.66426794 4585 Q9Y3B4 SF3B6 Splicing factor 3B subunit 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.16 132.16 2 0.00048665 136548 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.24 96.721 388420000 61197000 82006000 0 0 0 57066000 0 35693000 48025000 0 61220000 0 43213000 22487 4585 21132 201529;201530;201531;201532;201533;201534;201535;201536;201537;201538 257670;257671;257672;257673;257674;257675;257676;257677;257678;257679;257680;257681;257682 257681 12 ITAFIVER Unmodified 947.54402 0.54401687 4186 Q9H845;H0Y8Z9 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 63.745 63.745 2 0.027967 64111 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.198 6.5393 31116000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31116000 0 0 22488 4186 21133 201539 257683;257684 257683 2 ITAFVVER Unmodified 933.52837 0.5283668 2539 P49748 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.139 55.139 2 0.012053 52966 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.142 51.415 1574900000 146040000 0 0 0 134080000 127230000 154330000 155300000 217500000 82720000 204460000 157330000 195900000 22489 2539 21134 201540;201541;201542;201543;201544;201545;201546;201547;201548;201549 257685;257686;257687;257688;257689;257690;257691;257692;257693;257694 257690 9 ITAHLVHELR Unmodified 1187.6775 0.67749065 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 23.129 23.129 2;3 0.00021235 16198 QUIQUE_C1403_190116_001 118.71 89.563 6119200000 448010000 436450000 195410000 578780000 597790000 492030000 717590000 282480000 416620000 185780000 747280000 450090000 570900000 22490 2453 21135 201550;201551;201552;201553;201554;201555;201556;201557;201558;201559;201560;201561;201562;201563;201564;201565;201566;201567;201568;201569;201570;201571;201572;201573;201574 257695;257696;257697;257698;257699;257700;257701;257702;257703;257704;257705;257706;257707;257708;257709;257710;257711;257712;257713;257714;257715;257716;257717;257718;257719;257720;257721 257701 20 ITAHLVHELRR Unmodified 1343.7786 0.77860168 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 19.047 19.047 2;3 0.00025675 12357 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.951 41.622 1343900000 0 0 0 0 41315000 0 29653000 297480000 244490000 0 241990000 246050000 242960000 22491 2453 21136 201575;201576;201577;201578;201579;201580;201581;201582;201583 257722;257723;257724;257725;257726;257727;257728;257729;257730 257724 9 ITALDEFATK Unmodified 1107.5812 0.58119023 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 76.009 76.009 1;2 2.0021E-17 77989 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.05 70.143 21168000000 1929100000 2266800000 1885400000 1599000000 2122300000 1470600000 2076200000 0 2283700000 0 2867800000 0 2667400000 22492 267;275;3025 21137 201584;201585;201586;201587;201588;201589;201590;201591;201592;201593;201594;201595;201596;201597 257731;257732;257733;257734;257735;257736;257737;257738;257739;257740;257741;257742;257743;257744;257745;257746;257747;257748 257744 16 ITALLVAGSR Unmodified 999.60768 0.60767976 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 59.326 59.326 2 0.0044838 57442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.755 54.928 17605000 0 0 0 0 0 0 0 17605000 0 0 0 0 0 22493 77 21138 201598 257749 257749 1 ITAMDTEDQGVK Unmodified 1306.6075 0.60748134 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7EIJ4 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.625 33.625 2 0.0005697 29196 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.538 54.99 120950000 0 45970000 0 0 0 0 0 24476000 35558000 14943000 0 0 0 22494 665 21139 201599;201600;201601;201602;201603 257750;257751;257752;257753;257754;257755 257752 5 ITAPTHVPLQYIGPNQPR Unmodified 2001.0796 0.07959431 1358 M0QWZ7;Q9NP81;M0R2C6;M0R259;M0QX29 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 77.849 77.849 3 0.00026758 79533 QUIQUE_C1218_190116_001 65.231 51.284 342060000 76834000 0 0 0 0 58934000 91161000 50567000 64564000 0 0 0 0 22495 1358 21140 201604;201605;201606;201607;201608 257756;257757;257758;257759;257760 257756 3 ITASEALK Unmodified 831.47018 0.47018322 896;803;1135 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.986 22.986 2 0.0056294 16450 QUIQUE_C1277_190116_001 104.75 47.412 1769700000 0 414890000 0 0 344720000 289370000 0 0 0 0 337910000 0 382830000 22496 803;896;1135 21141 201609;201610;201611;201612;201613 257761;257762;257763;257764;257765 257761 5 ITASLCDLK Unmodified 1019.5321 0.53213155 2858 Q01581 HMGCS1 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 56.684 56.684 2 0.027639 55099 QUIQUE_C1277_190116_001 57.708 24.868 37216000 0 37216000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22497 2858 21142 201614 257766 257766 1 ITAVDKTEDSLEGCLDCLLQALAQNNTETSEK Unmodified 3565.6764 0.67637212 2605 P52306;D6RB97 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 169.19 169.19 3;4 3.6764E-88 176502 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.75 154.84 2017100000 0 0 0 0 321660000 0 169910000 0 233130000 0 379960000 693460000 219030000 22498 2605 21143 201615;201616;201617;201618;201619;201620;201621 257767;257768;257769;257770;257771;257772;257773 257770 6 ITCIYDPLGTISEEDLPNLFFPK Unmodified 2681.3299 0.3298565 3410 Q6UWY5 OLFML1 Olfactomedin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 170.1 170.1 2;3 2.17E-09 173559 QUIQUE_C1277_190116_001 84.107 76.995 180820000 28216000 42335000 0 27837000 0 0 36402000 0 0 8812800 0 0 37221000 22499 3410 21144 201622;201623;201624;201625;201626;201627;201628;201629 257774;257775;257776;257777;257778;257779;257780;257781 257775 7 ITCLCQVPQNAANR Unmodified 1643.7872 0.78719381 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 48.785 48.785 2;3 7.3835E-37 47310 QUIQUE_C1218_190116_001 182.64 163.89 3957700000 203680000 339820000 458000000 361280000 400330000 355360000 324140000 179450000 238130000 106210000 246940000 282020000 462360000 22500 2533 21145 201630;201631;201632;201633;201634;201635;201636;201637;201638;201639;201640;201641;201642;201643;201644;201645;201646 257782;257783;257784;257785;257786;257787;257788;257789;257790;257791;257792;257793;257794;257795;257796;257797;257798;257799;257800;257801 257784 20 ITCMNPSAYQR Oxidation (M) 1355.5962 0.59620515 912 E9PF17;P13611 VCAN Versican core protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.153 24.153 2 0.00047658 17698 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.3 102.95 658630000 0 18961000 0 0 0 0 0 102210000 115490000 0 118350000 185820000 117800000 22501 912 21146 201647;201648;201649;201650;201651;201652;201653;201654;201655 257802;257803;257804;257805;257806;257807;257808;257809;257810 257806 560 9 ITCMNPSAYQR Unmodified 1339.6013 0.60129052 912 E9PF17;P13611 VCAN Versican core protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.912 41.912 2 0.000179 37923 QUIQUE_C1368_190116_001 125.97 106.9 1016700000 0 86548000 99212000 0 0 79218000 116890000 153890000 129460000 0 129020000 117100000 105400000 22502 912 21146 201656;201657;201658;201659;201660;201661;201662;201663;201664;201665;201666 257811;257812;257813;257814;257815;257816;257817;257818;257819;257820;257821;257822;257823;257824;257825 257814 13 ITCTCEVENRPK Unmodified 1505.6966 0.69664747 2095 P15882 CHN1 N-chimaerin yes yes 0 0 1 1 1 1 15.822 15.822 3 0.0032977 8174 QUIQUE_C1277_190116_001 84.718 64.708 47196000 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USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 16.898 16.898 3 0.034167 9066 QUIQUE_DMIX8_190116_001 36.557 15.687 114400000 0 0 0 0 0 0 0 58244000 0 0 0 0 56153000 22507 3778 21151 201676;201677 257835;257836 257836 2 ITDFGLAK Unmodified 863.47527 0.4752686 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 1 54.884 54.884 2 0.026319 52407 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.69 14.143 76760000 0 0 0 0 0 0 0 53922000 0 22837000 0 0 0 22508 1789 21152 201678;201679 257837;257838 257837 2 ITDFGMCK Unmodified 970.42522 0.42522364 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.311 45.311 2 0.014079 43201 QUIQUE_C1218_190116_001 86.472 74.041 184300000 35757000 0 32716000 34564000 25548000 20837000 34873000 0 0 0 0 0 0 22509 1877 21153 201680;201681;201682;201683;201684;201685 257839;257840;257841;257842;257843;257844;257845 257839 7 ITDGTMLQAIER Unmodified 1346.6864 0.68640036 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 89.071 89.071 2 0.013812 89989 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.633 20.757 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22510 4396 21154 201686 257846 257846 1 ITDLANLSAANHDAAIFPGGFGAAK Unmodified 2441.2339 0.2339227 215 P0DPI2;A0A0B4J2D5;A0A096LPI6;A0A096LNH5;H7C1F6;H7C2G3;A0A0B4J2H4;F2Z2Q0;A0A096LP12;A0A096LP73;A0A2R8YDR7;A0A2R8Y6K9;A0A096LNJ1 C21orf33 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 119.78 119.78 2;3 1.8571E-113 123552 QUIQUE_DMIX3_190116_001 230.29 218.58 17604000000 1319200000 1458400000 1572600000 1008700000 1215900000 1296900000 1157000000 1202300000 1143300000 411090000 2940800000 1343300000 1534200000 22511 215 21155 201687;201688;201689;201690;201691;201692;201693;201694;201695;201696;201697;201698;201699;201700;201701;201702;201703;201704;201705;201706;201707;201708;201709;201710;201711;201712 257847;257848;257849;257850;257851;257852;257853;257854;257855;257856;257857;257858;257859;257860;257861;257862;257863;257864;257865;257866;257867;257868;257869;257870;257871;257872;257873;257874;257875;257876;257877;257878 257867 32 ITDLYTDLR Unmodified 1108.5764 0.57643921 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 75.542 75.542 2 8.1346E-22 76340 QUIQUE_C1368_190116_001 190.26 121.84 5837200000 0 0 0 0 0 0 0 0 1541900000 0 1637400000 1303300000 1354600000 22512 2851 21156 201713;201714;201715;201716;201717;201718 257879;257880;257881;257882;257883;257884;257885 257880 7 ITDLYTDLRDGR Unmodified 1436.726 0.72595699 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 70.643 70.643 2;3 3.8152E-05 71310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.98 96.217 1389800000 0 0 0 0 24261000 0 0 504970000 302360000 0 144360000 246690000 167110000 22513 2851 21157 201719;201720;201721;201722;201723;201724;201725;201726 257886;257887;257888;257889;257890;257891;257892;257893;257894;257895 257888 10 ITDMALEYVACDLHR Unmodified 1805.844 0.84403999 3587 Q8N461 FBXL16 F-box/LRR-repeat protein 16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 109.1 109.1 3 2.5159E-05 112366 QUIQUE_C1277_190116_001 71.08 56.158 68881000 0 37866000 0 31015000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22514 3587 21158 201727;201728;201729;201730 257896;257897;257898;257899;257900 257898 5 ITDPQYFLDTPQQAAAILQK Unmodified 2260.1739 0.17394821 1025 F6UJY1;Q5T013;E7EWH8;J9JIE9;A0A0A0MTR5;H0YB70;F6UJY9;H0YB18 HYI Putative hydroxypyruvate isomerase;Hydroxypyruvate isomerase yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 139.89 139.89 2;3 8.762E-07 142860 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.93 110.57 911110000 43288000 43307000 140550000 51607000 136090000 33167000 38477000 64241000 68947000 13717000 63059000 52133000 162520000 22515 1025 21159 201731;201732;201733;201734;201735;201736;201737;201738;201739;201740;201741;201742;201743;201744;201745;201746 257901;257902;257903;257904;257905;257906;257907;257908;257909;257910;257911;257912;257913;257914;257915;257916;257917 257910 13 ITDSAGHILYSK Unmodified 1303.6772 0.67721588 2542 P49755;G3V2K7 TMED10 Transmembrane emp24 domain-containing protein 10 yes no 0 0 0 1 1 32.958 32.958 2 0.0038538 28820 QUIQUE_C1438_190116_001 81.923 46.628 283820000 0 0 0 0 102440000 0 0 0 0 0 181380000 0 0 22516 2542 21160 201747;201748 257918;257919 257918 2 ITDTGLSYLSTMSSLR Unmodified 1743.8713 0.8713006 3587 Q8N461 FBXL16 F-box/LRR-repeat protein 16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 126.81 126.81 2 3.9298E-05 132083 QUIQUE_C1218_190116_001 99.498 77.47 101930000 0 0 0 53947000 0 47979000 0 0 0 0 0 0 0 22517 3587 21161 201749;201750;201751;201752 257920;257921;257922;257923 257920 4 ITDVALDFWR Unmodified 1234.6346 0.63462279 1438 O14656 TOR1A Torsin-1A yes yes 0 0 0 1 129.21 129.21 2 0.063916 125641 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201756;201757;201758;201759;201760;201761 257927;257928;257929;257930;257931;257932 257927 6 ITEEFLGK Unmodified 935.4964 0.49639797 912 E9PF17;P13611 VCAN Versican core protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 52.789 52.789 2 0.0036109 51036 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.6 67.535 642910000 0 0 0 0 0 0 0 223520000 114740000 86189000 98096000 120360000 0 22522 912 21166 201762;201763;201764;201765;201766;201767;201768;201769 257933;257934;257935;257936;257937;257938;257939;257940;257941;257942;257943;257944;257945 257937 13 ITEGDVVVGIASSGLHSNGFSLVR Unmodified 2413.2601 0.26013745 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 134.76 134.76 3 3.0541E-06 137923 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.046 46.503 179130000 0 0 0 0 40150000 0 0 42459000 55080000 0 0 0 41439000 22523 2194 21167 201770;201771;201772;201773 257946;257947;257948;257949 257947 3 ITEGVPQLLIVLTADR Unmodified 1737.0036 0.0036354 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 3 1 2 1 1 2 2 1 155.92 155.92 2;3 6.5235E-08 158595 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.38 89.426 1131100000 109780000 20123000 22082000 101160000 224740000 173590000 29434000 104470000 35927000 36242000 128720000 111640000 33149000 22524 2037 21168 201774;201775;201776;201777;201778;201779;201780;201781;201782;201783;201784;201785;201786;201787;201788;201789;201790;201791;201792;201793;201794 257950;257951;257952;257953;257954;257955;257956;257957;257958;257959;257960;257961;257962;257963;257964;257965;257966;257967;257968;257969;257970;257971;257972 257964 17 ITEIIPVTGPR Unmodified 1194.6972 0.69722304 4227 Q9HCM2 PLXNA4 Plexin-A4 yes yes 0 0 0 1 74.169 74.169 2 0.017019 75947 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.823 32.982 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22525 4227 21169 201795 257973 257973 1 ITEIYEGTSEIQR Unmodified 1537.7624 0.76240208 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.523 63.523 2 2.976E-53 62745 QUIQUE_DMIX3_190116_001 203.94 168.43 825680000 81596000 0 95566000 89152000 0 0 0 104440000 131460000 0 145690000 71709000 106060000 22526 2105 21170 201796;201797;201798;201799;201800;201801;201802;201803;201804 257974;257975;257976;257977;257978;257979;257980;257981;257982;257983;257984;257985;257986 257980 11 ITELFAVALPQLLAK Unmodified 1625.9756 0.97562974 3584 Q8N3U4 STAG2 Cohesin subunit SA-2 yes yes 0 0 0 1 1 157.82 157.82 2 0.0019408 162269 QUIQUE_C1277_190116_001 66.595 50.705 29528000 0 10744000 0 0 18784000 0 0 0 0 0 0 0 0 22527 3584 21171 201805;201806 257987;257988 257987 2 ITELTDENVK Unmodified 1160.5925 0.5924832 2147 P19387;H3BRR2 POLR2C DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 35.689 35.689 2 0.0067527 30477 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.173 28.044 127150000 0 0 0 0 37865000 37542000 0 0 0 18016000 0 0 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2955 Q12965;H0YN00 MYO1E Unconventional myosin-Ie yes no 0 0 0 1 15.396 15.396 3 0.0044161 8075 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.559 6.9699 1299600000 0 0 0 0 0 0 0 0 1299600000 0 0 0 0 22531 2955 21175 201826 258009 258009 1 ITEQLIEAINNGDFEAYTK Unmodified 2168.0637 0.063729054 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1 138.9 138.9 2;3 8.1454E-46 144407 QUIQUE_C1218_190116_001 212.11 201.17 3341400000 162430000 435030000 224420000 213870000 0 116360000 226590000 367200000 242560000 186770000 461250000 445800000 259100000 22532 412;3299 21176 201827;201828;201829;201830;201831;201832;201833;201834;201835;201836;201837;201838;201839;201840;201841;201842;201843 258010;258011;258012;258013;258014;258015;258016;258017;258018;258019;258020;258021;258022;258023;258024;258025;258026;258027 258010 16 ITEQPLKEEEDEDRK Unmodified 1857.8956 0.89560109 611 B4DIZ1;Q8TAM6;C9JN04;C9J6B4 ERMN Ermin yes no 0 0 2 1 2 1 1 21.509 21.509 3;4 5.6563E-05 14597 QUIQUE_C1576_190116_001 95.347 72.545 359280000 77987000 176850000 0 0 0 0 78782000 0 0 25660000 0 0 0 22533 611 21177 201844;201845;201846;201847;201848 258028;258029;258030;258031;258032 258031 5 ITESDLSQLTASIR Unmodified 1532.8046 0.80460124 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 115.72 115.72 2 6.0822E-07 119544 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.16 107.87 614480000 0 0 0 0 63826000 0 157150000 0 88455000 0 104880000 67373000 132790000 22534 3061 21178 201849;201850;201851;201852;201853;201854 258033;258034;258035;258036;258037;258038;258039;258040 258036 7 ITESEEVVSR Unmodified 1147.5721 0.57208211 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.542 26.542 2 1.0358E-07 20627 QUIQUE_C1438_190116_001 155.07 104.46 7400100000 522730000 631250000 647300000 726890000 887930000 557650000 637140000 431250000 485680000 273860000 738860000 477830000 381760000 22535 1819;3223 21179 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no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 53.862 53.862 2;3 3.4981E-12 51876 QUIQUE_C1277_190116_001 182.76 132.72 7572300000 530120000 705380000 628740000 585620000 732340000 427700000 856780000 428560000 514900000 163850000 612780000 591210000 794320000 22539 2777;2938 21183 201894;201895;201896;201897;201898;201899;201900;201901;201902;201903;201904;201905;201906;201907;201908;201909;201910;201911;201912;201913;201914;201915;201916;201917;201918;201919 258102;258103;258104;258105;258106;258107;258108;258109;258110;258111;258112;258113;258114;258115;258116;258117;258118;258119;258120;258121;258122;258123;258124;258125;258126;258127;258128;258129;258130;258131;258132 258108 31 ITEYMEHVYLIHR Unmodified 1702.8501 0.85011165 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;A0A2R8YG95;E7ET92;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0;A0A2R8YG53 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 0 1 1 70.814 70.814 4 0.002237 70289 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PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 1 0 1 1 159.99 159.99 3 4.2339E-09 166371 QUIQUE_C1438_190116_001 81.949 74.918 69819000 0 0 0 27087000 42732000 0 0 0 0 0 0 0 0 22560 2031;596 21202 202107;202108 258354;258355 258355 392 2 ITGMLLEIDNSELLHMLESPESLR Unmodified 2739.3823 0.38230278 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAS6;H0YB75;H0YAS7;H0YER0;H0Y6X6;B1ANR0;Q13310;H0Y5F5 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 1 165.77 165.77 3 1.4494E-06 170016 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.552 53.608 160790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 160790000 0 22561 2031;596 21202 202109 258356 258356 0 ITGQLESLESR Unmodified 1231.6408 0.64083038 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;A0A0A6YYJ5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 54.259 54.259 2 0.00371 53099 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.538 57.094 114660000 0 0 0 0 0 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258396;258397;258398;258399;258400;258401;258402;258403;258404;258405;258406;258407;258408;258409;258410;258411;258412;258413;258414;258415;258416;258417;258418;258419;258420;258421;258422;258423 258414 28 ITHQELEDLGVSR Unmodified 1495.7631 0.76307078 433 A0A2R8Y5R2;A0A2R8YDB6;A0A2R8Y7K8;A0A2R8YFM1;A0A2R8Y5S6;A0A2R8Y622;A0A2R8YGJ7;A0A2U3TZH5;A0A2R8Y700;A0A2R8Y7A1;A0A2R8YED7;Q8WXI2;A0A2R8YE65 CNKSR2 Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2 yes no 0 0 0 1 1 1 58.054 58.054 3 0.015541 53795 QUIQUE_DMIX4_190116_001 33.265 18.579 28314000 18271000 0 0 0 0 0 0 0 0 10043000 0 0 0 22569 433 21210 202168;202169;202170 258424;258425;258426 258426 3 ITHSPLTICFPEYTGANK Unmodified 2048.0037 0.0037117545 1870 P04899 GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 3 2 2 3 2 2 3 1 2 2 2 2 2 94.981 94.981 2;3 1.9722E-162 97497 QUIQUE_C1368_190116_001 298.82 267.95 4849000000 523280000 465590000 483740000 570840000 440760000 495880000 578060000 154800000 195880000 212910000 196360000 200390000 330500000 22570 1870 21211 202171;202172;202173;202174;202175;202176;202177;202178;202179;202180;202181;202182;202183;202184;202185;202186;202187;202188;202189;202190;202191;202192;202193;202194;202195;202196;202197;202198 258427;258428;258429;258430;258431;258432;258433;258434;258435;258436;258437;258438;258439;258440;258441;258442;258443;258444;258445;258446;258447;258448;258449;258450;258451;258452;258453;258454;258455;258456;258457;258458;258459;258460;258461;258462;258463;258464;258465;258466;258467;258468;258469;258470 258437 43 ITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSK Unmodified 3303.5758 0.57579386 1870 P04899 GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 2 115.5 115.5 3;4 2.0509E-78 120782 QUIQUE_DMIX5_190116_001 165.42 159.64 3744300000 90064000 0 185560000 0 216800000 126260000 262010000 477840000 446940000 0 720720000 532350000 685760000 22571 1870 21212 202199;202200;202201;202202;202203;202204;202205;202206;202207;202208;202209;202210;202211;202212;202213;202214;202215 258471;258472;258473;258474;258475;258476;258477;258478;258479;258480;258481;258482;258483;258484;258485;258486;258487;258488;258489;258490;258491;258492;258493;258494;258495;258496;258497;258498;258499;258500;258501 258494 31 ITHYFIDLNK Unmodified 1262.6659 0.66592292 3850 Q96FC7 PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.686 64.686 2;3 0.00016912 63952 QUIQUE_C1403_190116_001 92.611 64.405 2030600000 224170000 183910000 208880000 170990000 179660000 252160000 179670000 101850000 99612000 90475000 117560000 108540000 113120000 22572 3850 21213 202216;202217;202218;202219;202220;202221;202222;202223;202224;202225;202226;202227;202228;202229 258502;258503;258504;258505;258506;258507;258508;258509;258510;258511;258512;258513;258514;258515;258516;258517;258518;258519 258509 15 ITHYFIDLNKK Unmodified 1390.7609 0.76088593 3850 Q96FC7 PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 2 43.997 43.997 2;3 5.5109E-07 40557 QUIQUE_C1403_190116_001 117.45 91.035 2241600000 104750000 102330000 104950000 83213000 199590000 100330000 236950000 265330000 153670000 42819000 125100000 349620000 372960000 22573 3850 21214 202230;202231;202232;202233;202234;202235;202236;202237;202238;202239;202240;202241;202242;202243;202244;202245;202246 258520;258521;258522;258523;258524;258525;258526;258527;258528;258529;258530;258531;258532;258533;258534;258535;258536 258523 16 ITIADCGQLE Unmodified 1118.5278 0.52777445 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.349 83.349 2 1.7615E-05 84150 QUIQUE_C1403_190116_001 159.2 134.3 2367000000 412320000 408030000 0 332780000 261850000 387870000 230750000 152130000 181240000 0 0 0 0 22574 2772 21215 202247;202248;202249;202250;202251;202252;202253;202254 258537;258538;258539;258540;258541;258542;258543;258544;258545 258540 5 ITIEILK Unmodified 828.53206 0.5320552 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 76.877 76.877 2 0.038851 79010 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.244 7.3971 24740000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24740000 0 0 22575 3891 21216 202255 258546 258546 1 ITIEPGTSYR Unmodified 1135.5873 0.58733824 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.72 48.72 2 0.0036412 46279 QUIQUE_C1576_190116_001 83.647 47.077 554640000 43317000 68322000 38726000 51577000 48588000 45931000 55715000 0 55358000 27659000 70300000 49150000 0 22576 987 21217 202256;202257;202258;202259;202260;202261;202262;202263;202264;202265;202266;202267 258547;258548;258549;258550;258551;258552;258553;258554;258555;258556;258557;258558;258559;258560 258554 13 ITIGQAPTEK Unmodified 1056.5815 0.58152458 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 33.093 33.093 2 0.0088046 27171 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.608 66.458 95067000 0 0 0 0 0 0 0 55311000 0 39757000 0 0 0 22577 1005;2027 21218 202268;202269 258561;258562 258562 1 ITIGVYDPCNLAQYPGWPLR Unmodified 2332.1674 0.16742304 1725 O95352;H7C059 ATG7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes no 0 0 0 1 1 154.35 154.35 2 9.6407E-05 158045 QUIQUE_C1403_190116_001 83.314 75.59 23975000 0 0 0 23975000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22578 1725 21219 202270;202271 258563;258564 258563 2 ITIPVQTFSNLQIR Unmodified 1628.925 0.92499115 395;1336;389;1342 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1W2PPA3;A0A1W2PS58;A0A1X7SBR3;K7EPT8;K7EMP8;P14136;K7EPI4 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 15 20 29 22 15 30 19 23 38 22 26 23 30 155.11 155.11 1;2;3 0 128813 QUIQUE_DMIX8_190116_001 317.31 235.97 1014100000000 58433000000 67346000000 70948000000 77577000000 64438000000 87823000000 72713000000 72897000000 79830000000 66168000000 70011000000 76089000000 149840000000 22579 389;395;1336;1342 21220 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259028 459 ITIPVQTFSNLQIRETSLDTK Unmodified 2403.3009 0.30093963 1336;389;1342 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1W2PPA3;K7EMP8;P14136;K7EPI4 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 1 120.04 120.04 3 6.3194E-07 115758 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.231 81.16 1090700000 39553000 76160000 88380000 51696000 75696000 136750000 110440000 68776000 201690000 36668000 115580000 0 89301000 22580 389;1336;1342 21221 202584;202585;202586;202587;202588;202589;202590;202591;202592;202593;202594;202595;202596;202597;202598;202599;202600;202601;202602 259055;259056;259057;259058;259059;259060;259061;259062;259063;259064;259065;259066;259067;259068;259069;259070;259071;259072;259073;259074;259075 259071 20 ITITNDQNR Unmodified 1073.5465 0.54653606 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.092 20.092 2 5.9642E-57 13352 QUIQUE_C1218_190116_001 231.06 142.32 7578200000 906890000 0 768550000 911530000 0 848300000 823610000 501380000 596820000 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259099;259100;259101;259102;259103;259104;259105;259106;259107;259108;259109;259110;259111;259112;259113;259114;259115;259116;259117;259118;259119 259101 695 21 ITLDNAYMEK Unmodified 1196.5747 0.57472465 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;H3BT25;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.533 64.533 2 6.4605E-05 61407 QUIQUE_DMIX4_190116_001 141.48 114.23 39673000000 4250100000 3730600000 3698600000 3905400000 2255300000 2426900000 2677300000 3081400000 2851900000 1321700000 3442000000 3165000000 2867100000 22586 1203;2077 21226 202637;202638;202639;202640;202641;202642;202643;202644;202645;202646;202647;202648;202649 259120;259121;259122;259123;259124;259125;259126;259127;259128;259129;259130;259131;259132;259133;259134;259135;259136;259137;259138;259139;259140;259141;259142;259143 259133 24 ITLESFLAWK Unmodified 1206.6649 0.66486028 3696 Q8WU90 ZC3H15 Zinc finger CCCH domain-containing protein 15 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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259195;259196;259197;259198;259199;259200;259201;259202;259203;259204;259205;259206;259207;259208;259209;259210;259211;259212;259213;259214;259215;259216;259217;259218;259219;259220;259221;259222;259223 259198 29 ITLPVDFVTADKFDENAK Unmodified 2022.031 0.030972363 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 3 2 2 3 3 2 2 2 2 120.13 120.13 2;3 1.9548E-121 125815 QUIQUE_DMIX5_190116_001 274.39 214.85 93407000000 8246500000 7770200000 7650700000 7047500000 6834300000 6809700000 6754000000 7716400000 7414400000 2657100000 9328400000 7651600000 7526000000 22594 1790 21234 202703;202704;202705;202706;202707;202708;202709;202710;202711;202712;202713;202714;202715;202716;202717;202718;202719;202720;202721;202722;202723;202724;202725;202726;202727;202728;202729;202730;202731;202732 259224;259225;259226;259227;259228;259229;259230;259231;259232;259233;259234;259235;259236;259237;259238;259239;259240;259241;259242;259243;259244;259245;259246;259247;259248;259249;259250;259251;259252;259253;259254;259255;259256;259257;259258;259259;259260;259261;259262;259263;259264;259265;259266;259267;259268;259269;259270;259271;259272;259273;259274;259275;259276 259269 52 ITLQDVVSHSK Unmodified 1225.6667 0.6666512 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 62.278 62.278 2;3 0.0018058 61031 QUIQUE_C1403_190116_001 55.04 46.641 267760000 17076000 23918000 52730000 86934000 0 28255000 0 27379000 31465000 0 0 0 0 22595 2487 21235 202733;202734;202735;202736;202737;202738;202739;202740 259277;259278;259279;259280;259281;259282;259283;259284;259285 259280 8 ITLTCGR Unmodified 819.42727 0.42727255 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 0 1 23.732 23.732 2 0.067202 17227 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.803 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ITMPIAFNEPLSFLQR Unmodified 1875.9917 0.99169051 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YG95;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0;A0A2R8YG53 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 158.16 158.16 2;3 0.00029855 163335 QUIQUE_C1368_190116_001 95.273 79.734 537600000 18574000 61138000 61142000 57994000 14126000 29815000 50425000 0 66574000 0 58957000 56793000 62057000 22601 454 21240 202780;202781;202782;202783;202784;202785;202786;202787;202788;202789;202790;202791;202792;202793;202794 259335;259336;259337;259338;259339;259340;259341;259342;259343;259344;259345;259346;259347;259348;259349;259350;259351 259337 16 ITMPVIFNEPLSFLQR Unmodified 1904.023 0.022990634 4066 Q9BXW6 OSBPL1A Oxysterol-binding protein-related protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 163.88 163.88 2;3 1.4674E-25 169171 QUIQUE_C1218_190116_001 158.42 135.94 1335100000 95836000 98198000 103560000 76559000 118970000 87591000 156410000 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259761;259762;259763;259764;259765 259765 5 ITSADGHIESSALLK Unmodified 1540.8097 0.80968662 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.721 50.721 2;3 0.00019611 48488 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.845 33.918 227560000 0 37090000 0 0 0 29816000 0 0 33156000 41228000 0 0 86272000 22637 3597 21274 203124;203125;203126;203127;203128;203129 259766;259767;259768;259769;259770;259771;259772;259773;259774 259771 9 ITSAPDMEDILTESEIK Unmodified 1890.9132 0.91322499 3961 Q99598;C4P0D6;C4P0D8;C4P0D4 TSNAX;DISC1 Translin-associated protein X yes no 0 0 0 1 128.72 128.72 2 0.00036818 135598 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.66 83.331 102210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 102210000 0 0 22638 3961 21275 203130 259775 259775 1 ITSAPDMEDILTESEIKLDGVR Unmodified 2431.2152 0.21522067 3961 Q99598;C4P0D6;C4P0D8;C4P0D4 TSNAX;DISC1 Translin-associated protein X yes no 0 0 1 1 1 1 1 140.17 140.17 3 1.9026E-11 147106 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.85 102.86 305190000 0 0 0 0 0 0 0 83252000 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yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 158.6 158.6 2;3 9.9697E-80 161106 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.89 132.85 10727000000 576210000 821730000 1738300000 809110000 520050000 849280000 667780000 1265000000 1078300000 291690000 757180000 570930000 781350000 22643 2195 21280 203169;203170;203171;203172;203173;203174;203175;203176;203177;203178;203179;203180;203181;203182;203183;203184;203185;203186;203187;203188;203189;203190;203191;203192;203193 259820;259821;259822;259823;259824;259825;259826;259827;259828;259829;259830;259831;259832;259833;259834;259835;259836;259837;259838;259839;259840;259841;259842;259843;259844;259845;259846;259847 259834 28 ITSDEPLTK Unmodified 1002.5233 0.523341 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2;B1AHE4 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.653 21.653 2 0.002045 14291 QUIQUE_C1277_190116_001 97.431 38.449 643650000 106730000 77636000 58881000 68729000 58841000 101450000 46244000 0 0 42110000 47362000 35663000 0 22644 4392 21281 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21283 203218 259875 259875 1 ITSEALLVTQQLVK Unmodified 1541.9029 0.90285872 3499 Q86VP6;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 110.38 110.38 2;3 3.5527E-05 113956 QUIQUE_C1368_190116_001 112.44 104.99 6541300000 628260000 568750000 480070000 531160000 570190000 439160000 564520000 557670000 585400000 235760000 782730000 501630000 96028000 22647 3499 21284 203219;203220;203221;203222;203223;203224;203225;203226;203227;203228;203229;203230;203231;203232;203233;203234;203235;203236;203237;203238;203239;203240;203241 259876;259877;259878;259879;259880;259881;259882;259883;259884;259885;259886;259887;259888;259889;259890;259891;259892;259893;259894;259895;259896;259897;259898;259899;259900;259901;259902;259903;259904 259884 26 ITSEIPQTER Unmodified 1172.6037 0.60371659 2823 P82979;F8VZQ9;H0YHG0 SARNP SAP domain-containing ribonucleoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.189 31.189 2 0.0015737 25689 QUIQUE_C1403_190116_001 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 86.345 86.345 2 0.00023077 89613 QUIQUE_C1438_190116_001 117.7 70.095 1870400000 165430000 194130000 208780000 162290000 175580000 142430000 173920000 0 117340000 73975000 167250000 126390000 162870000 22652 4530 21289 203276;203277;203278;203279;203280;203281;203282;203283;203284;203285;203286;203287;203288;203289 259961;259962;259963;259964;259965;259966;259967;259968;259969;259970;259971;259972;259973;259974;259975;259976;259977;259978 259967 16 ITSGPFEPDLYKSEMEVQDAELK Unmodified 2625.252 0.25200011 4530 Q9UQ80 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes yes 0 0 1 1 120.11 120.11 3 2.2765E-05 122572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.234 38.8 89903000 0 0 0 0 0 0 0 89903000 0 0 0 0 0 22653 4530 21290 203290 259979 259979 1 ITSLTQLTDNLTVLK Unmodified 1658.9455 0.94545182 2962 Q13049;Q5JVY0 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes no 0 0 0 1 1 1 135.03 135.03 2 1.51E-05 139564 QUIQUE_C1277_190116_001 93.959 71.042 52885000 0 21541000 15399000 0 0 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1446.7276 0.72759647 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 63.631 63.631 2 0.0037575 62612 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.187 51.215 221350000 0 0 0 0 0 0 0 0 89472000 59968000 0 71911000 0 22657 2273 21293 203306;203307;203308;203309 259999;260000;260001;260002 260000 1640 4 ITSTIEDPSIFGHVEEMLK Unmodified 2145.0664 0.066371591 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 136.66 136.66 3 0.0052859 141140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 40.968 32.367 113950000 0 0 0 0 0 0 0 0 87644000 26302000 0 0 0 22658 205 21294 203310;203311 260003;260004 260003 1 ITTGAQDDLRK Unmodified 1216.6412 0.64116473 4612 Q9Y4W6 AFG3L2 AFG3-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 2 1 2 1 1 16.253 16.253 2;3 0.00067458 8401 QUIQUE_C1403_190116_001 105.36 54.023 731290000 15714000 55681000 16884000 82079000 32290000 48927000 91006000 48547000 93864000 19748000 102960000 60874000 62717000 22659 4612 21295 203312;203313;203314;203315;203316;203317;203318;203319;203320;203321;203322;203323;203324;203325;203326;203327;203328;203329 260005;260006;260007;260008;260009;260010;260011;260012;260013;260014;260015;260016;260017;260018;260019;260020;260021;260022 260010 17 ITTGSSSAGTQSSTSNR Unmodified 1640.7602 0.76017024 1467 O14974;H0YHI8;A0A3B3ISH4 PPP1R12A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.906 10.906 2 1.7311E-44 3024 QUIQUE_DMIX8_190116_001 212.59 197.21 319970000 18353000 0 35668000 32907000 45894000 0 22278000 34764000 39272000 7538700 27300000 27623000 28370000 22660 1467 21296 203330;203331;203332;203333;203334;203335;203336;203337;203338;203339;203340 260023;260024;260025;260026;260027;260028;260029;260030;260031;260032;260033;260034;260035 260035 12 ITTHFELK Unmodified 987.53893 0.53893149 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 34.386 34.386 2 0.02824 29783 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.95 31.791 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phosphatase S yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.349 60.349 3 0.00015134 59302 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.032 47.369 135820000 25822000 31075000 31202000 0 0 22471000 0 0 25247000 0 0 0 0 22666 2987 21302 203374;203375;203376;203377;203378 260073;260074;260075;260076;260077 260077 3 ITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPK Unmodified 4525.1087 0.1086965 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3 no no 0 0 0 1 170.13 170.13 3 0.00020616 177511 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.533 36.997 46018000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46018000 0 0 22667 897;2263 21303 203379 260078 260078 1 ITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPK Oxidation (M) 4541.1036 0.10361112 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3 no no 0 1 0 1 168.94 168.94 3 5.0811E-08 173180 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.231 54.983 21762000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21762000 22668 897;2263 21303 203380 260079 260079 536 1 ITVFGSGIGASCVSLLTLSHHSEGLFQR Unmodified 2972.5178 0.51782548 4341 Q9NZ94;E7EVK0;A0A087WW27 NLGN3 Neuroligin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 135.45 135.45 4 0.00022118 140596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.939 30.936 179750000 0 0 0 0 0 0 0 0 44888000 0 51062000 52130000 31671000 22669 4341 21304 203381;203382;203383;203384 260080;260081;260082;260083 260080 2 ITVLEALR Unmodified 913.55967 0.55966693 1112 H0Y2W2;Q5T2N8;Q5T9A4 ATAD3A;ATAD3C;ATAD3B ATPase family AAA domain-containing protein 3C;ATPase family AAA domain-containing protein 3B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.456 82.456 2 0.021411 85164 QUIQUE_C1438_190116_001 75.189 22.553 375640000 0 0 0 47971000 36596000 0 59622000 0 0 0 86193000 73746000 71510000 22670 1112 21305 203385;203386;203387;203388;203389;203390 260084;260085;260086;260087;260088;260089 260085 6 ITVLQLSALLK Unmodified 1197.7697 0.76965971 3312 Q5T4S7;A0A0A0MSW0 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 141.25 141.25 2 0.0018611 147075 QUIQUE_C1576_190116_001 96.342 86.984 77290000 13348000 0 0 0 0 0 17159000 0 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260127;260128;260129;260130;260131;260132;260133;260134;260135;260136;260137;260138;260139;260140;260141;260142;260143;260144;260145;260146;260147;260148;260149;260150;260151;260152;260153;260154;260155;260156;260157;260158;260159 260133 33 ITVPLVSEVQIAQLR Unmodified 1664.9825 0.98250603 69 H7BXI1;A0A087WXU3;A0FGR8 ESYT2 Extended synaptotagmin-2 yes no 0 0 0 1 133.1 133.1 2 0.0010244 138533 QUIQUE_C1368_190116_001 76.655 68.35 30482000 0 0 30482000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22676 69 21311 203440 260160 260160 1 ITVTLLHETGSHIR Unmodified 1575.8733 0.87328993 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.378 47.378 3 6.457E-11 45149 QUIQUE_C1218_190116_001 109.83 93.11 578250000 57554000 56360000 57737000 56232000 52044000 38500000 57033000 0 41506000 21808000 48227000 49171000 42079000 22677 497 21312 203441;203442;203443;203444;203445;203446;203447;203448;203449;203450;203451;203452 260161;260162;260163;260164;260165;260166;260167;260168;260169;260170;260171;260172;260173;260174 260161 14 ITVTSEVPFSK Unmodified 1206.6496 0.64960415 1315 K7EJT5;K7EP65;K7EKS7;K7ELC4;K7EMH1;K7ERI7;P35268 RPL22 60S ribosomal protein L22 yes no 0 0 0 1 1 1 73.58 73.58 2 0.0021332 74470 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.231 41.938 234260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27997000 118880000 87385000 0 22678 1315 21313 203453;203454;203455 260175;260176;260177;260178 260177 4 ITVVDALHEIPVK Unmodified 1432.829 0.8289655 3175 Q16270 IGFBP7 Insulin-like growth factor-binding protein 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.31 106.31 3 0.00013048 109652 QUIQUE_C1277_190116_001 91.62 78.502 110340000 0 26081000 33774000 19458000 21767000 0 0 0 0 9260800 0 0 0 22679 3175 21314 203456;203457;203458;203459;203460;203461;203462;203463 260179;260180;260181;260182;260183;260184;260185;260186 260180 8 ITVVDDADTVELCGALK Unmodified 1817.9081 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1054;261055;261056;261057;261058;261059;261060;261061;261062;261063;261064;261065;261066;261067;261068;261069;261070;261071;261072;261073;261074;261075;261076;261077;261078;261079;261080;261081;261082;261083;261084;261085;261086;261087;261088;261089;261090;261091;261092;261093;261094;261095;261096;261097;261098;261099;261100;261101;261102;261103;261104;261105;261106;261107;261108;261109;261110;261111;261112;261113;261114;261115;261116;261117;261118;261119;261120;261121;261122 261048 716 ITVWLDLLKPIVK Unmodified 1536.9643 0.96433677 734;357 A0A1B0GV68;M0QYB0;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 144.45 144.45 2;3 0.0002571 148534 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.763 74.049 1476800000 72640000 127070000 200190000 104880000 120370000 43612000 134850000 95574000 164010000 54045000 133280000 156290000 69966000 22685 357;734 21318 204225;204226;204227;204228;204229;204230;204231;204232;204233;204234;204235;204236;204237;204238 261123;261124;261125;261126;261127;261128;261129;261130;261131;261132;261133;261134;261135;261136;261137;261138 261136 16 ITVYEALNHPWLK Unmodified 1582.8508 0.85076357 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 112.45 112.45 2 0.0049485 116110 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.207 47.853 71590000 0 0 0 0 0 0 35514000 0 36076000 0 0 0 0 22686 472;1460 21319 204239;204240;204241 261139;261140;261141 261140 3 ITWDELAASGLPSCDAAVNLAGENILNPLR Unmodified 3179.5921 0.59211263 4269 Q9NRG7 SDR39U1 Epimerase family protein SDR39U1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.91 167.91 3 7.6572E-36 171045 QUIQUE_C1403_190116_001 103.33 97.034 799500000 134440000 71532000 0 62897000 101700000 101290000 79246000 0 80918000 10448000 0 91798000 65237000 22687 4269 21320 204242;204243;204244;204245;204246;204247;204248;204249;204250;204251 261142;261143;261144;261145;261146;261147;261148;261149;261150;261151;261152 261144 11 ITWLEGTEASLSCVAHGVPPPDVICVR Unmodified 2962.4681 0.46809809 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.06 151.06 3 1.4664E-44 156374 QUIQUE_C1368_190116_001 135.62 115.64 557020000 47042000 80489000 94683000 46035000 86278000 0 84756000 0 0 0 42491000 0 75242000 22688 4500 21321 204252;204253;204254;204255;204256;204257;204258;204259;204260 261153;261154;261155;261156;261157;261158;261159;261160;261161;261162;261163 261155 10 ITWNTWK Unmodified 947.4865 0.48650199 4106 Q9GZT8;E7EXA3;Q6X734;B8ZZI0;C9JN42 NIF3L1 NIF3-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 75.012 75.012 2 0.019305 74817 QUIQUE_C1403_190116_001 114.19 59.66 252310000 0 0 0 59062000 0 0 52156000 58427000 35404000 0 0 47261000 0 22689 4106 21322 204261;204262;204263;204264;204265 261164;261165;261166;261167;261168 261164 5 ITWSIIR Unmodified 887.52289 0.52288749 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.154 88.154 2 0.0099023 91246 QUIQUE_C1438_190116_001 144.29 77.301 7700300000 628360000 736280000 544280000 428990000 678680000 493440000 592200000 447760000 500320000 417960000 792890000 746030000 693110000 22690 2414 21323 204266;204267;204268;204269;204270;204271;204272;204273;204274;204275;204276;204277;204278 261169;261170;261171;261172;261173;261174;261175;261176;261177;261178;261179;261180;261181;261182;261183;261184;261185;261186;261187;261188;261189;261190;261191;261192;261193;261194;261195;261196 261177 28 ITWSNPPAQGAR Unmodified 1296.6575 0.65748349 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.82 45.82 2 2.107E-09 43261 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.72 133.52 12799000000 1042000000 1035100000 1151100000 972980000 763210000 915510000 1200200000 785010000 797760000 275310000 1547800000 1126100000 1186700000 22691 2120 21324 204279;204280;204281;204282;204283;204284;204285;204286;204287;204288;204289;204290;204291 261197;261198;261199;261200;261201;261202;261203;261204;261205;261206;261207;261208;261209;261210;261211;261212;261213;261214;261215 261209 19 ITYGETGGNSPVQEFTVPGSK Unmodified 2167.0433 0.043327963 1833 P02751;H0Y7Z1 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes no 0 0 0 1 96.94 96.94 2 1.8736E-05 99126 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261246;261247;261248;261249;261250;261251;261252;261253;261254;261255;261256;261257;261258;261259;261260;261261;261262;261263;261264;261265;261266;261267;261268;261269;261270;261271;261272;261273;261274;261275;261276;261277;261278;261279;261280;261281;261282;261283;261284;261285;261286;261287;261288;261289 261248 43 IVADQLCAK Unmodified 1016.5325 0.5324659 2635 P53990;H3BMU1;H3BUI0;H3BQF7;J3KR23 IST1 IST1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.924 31.924 2 0.00053564 27502 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.17 72.953 1340200000 0 166640000 0 179870000 158840000 157700000 162390000 171970000 0 0 187810000 155010000 0 22699 2635 21331 204350;204351;204352;204353;204354;204355;204356;204357 261290;261291;261292;261293;261294;261295;261296;261297 261295 8 IVAECNAVR Unmodified 1030.523 0.52296385 2250;2369 P35221;G3XAM7;H0YBB8;P26232 CTNNA1;CTNNA2 Catenin alpha-1;Catenin alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.054 20.054 2 0.00045652 12498 QUIQUE_DMIX8_190116_001 117.18 52.419 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261311;261312;261313;261314;261315;261316;261317;261318;261319;261320;261321;261322;261323;261324;261325;261326;261327;261328;261329;261330;261331;261332 261311 22 IVAEHNQFSLGIK Unmodified 1454.7882 0.78816332 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 no no 0 0 0 1 58.575 58.575 3 0.065756 56775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.552 28.633 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22702 228 21334 204384 261333 261333 1 IVAELQDK Unmodified 914.5073 0.50729701 1416 O00534;B4DHS6 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.055 27.055 2 0.01159 20715 QUIQUE_C1368_190116_001 89.752 33.205 211560000 0 32652000 37361000 39794000 0 36891000 0 39729000 0 25134000 0 0 0 22703 1416 21335 204385;204386;204387;204388;204389;204390 261334;261335;261336;261337;261338;261339 261335 6 IVAERPGTNSTGPAPMAPPR Unmodified 2018.0367 0.036743217 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.945 41.945 3 7.293E-10 38362 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204402;204403;204404;204405;204406;204407;204408;204409;204410;204411;204412;204413;204414;204415;204416;204417;204418;204419;204420;204421;204422 261351;261352;261353;261354;261355;261356;261357;261358;261359;261360;261361;261362;261363;261364;261365;261366;261367;261368;261369;261370;261371;261372;261373;261374;261375;261376;261377;261378;261379;261380 261353 29 IVAFADAAVEPIDFPIAPVYAASMVLK Oxidation (M) 2833.4976 0.49759053 2232 P24752 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 168.76 168.76 2 3.6038E-23 162650 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.015 90.699 95343000 0 0 0 0 0 0 0 20911000 44537000 11473000 18422000 0 0 22707 2232 21337 204423;204424;204425;204426;204427 261381;261382;261383;261384;261385 261384 1589 5 IVAFENAFER Unmodified 1194.6033 0.60332266 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 88.995 88.995 2 0.0039331 90379 QUIQUE_C1403_190116_001 82.645 55.683 909900000 108080000 0 0 106150000 133460000 0 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65.478 2 0.05526 64896 QUIQUE_C1368_190116_001 72.021 39.51 95349000 0 0 23521000 0 0 0 0 27549000 18169000 0 26109000 0 0 22711 948 21341 204443;204444;204445;204446 261401;261402;261403;261404 261401 4 IVALNAHTFLR Unmodified 1253.7244 0.72444085 2193 P22087;M0R0P1;M0R299;M0QXL5;M0R2Q4 FBL rRNA 2'-O-methyltransferase fibrillarin no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.045 72.045 2;3 5.2036E-05 71895 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.06 80.382 675110000 44851000 67744000 85430000 33081000 45548000 41114000 54998000 55080000 62250000 16380000 68712000 49015000 50905000 22712 2193 21342 204447;204448;204449;204450;204451;204452;204453;204454;204455;204456;204457;204458;204459;204460 261405;261406;261407;261408;261409;261410;261411;261412;261413;261414;261415;261416;261417;261418;261419 261418 15 IVALSSSLSNAK Unmodified 1188.6714 0.67140222 1650 O75643;B4E0P5 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.302 51.302 2 0.0034007 49357 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.775 64.485 428490000 56486000 39020000 25649000 28675000 40232000 25925000 30045000 34695000 47836000 0 53564000 46365000 0 22713 1650 21343 204461;204462;204463;204464;204465;204466;204467;204468;204469;204470;204471 261420;261421;261422;261423;261424;261425;261426;261427;261428;261429;261430 261429 4 IVAPELYIAVGISGAIQHLAGMK Unmodified 2350.3083 0.30827362 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL83;H0YM12 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 170.19 170.19 3 7.4836E-08 173668 QUIQUE_C1277_190116_001 75.064 61.876 1867100000 51569000 51913000 62673000 35383000 119350000 0 106930000 0 257800000 0 600740000 504860000 75918000 22714 2067 21344 204472;204473;204474;204475;204476;204477;204478;204479;204480;204481;204482 261431;261432;261433;261434;261435;261436;261437;261438;261439;261440;261441 261432 7 IVAPELYIAVGISGAIQHLAGMK Oxidation (M) 2366.3032 0.30318824 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL83;H0YM12 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 166.64 166.64 3 5.5434E-11 170263 QUIQUE_C1277_190116_001 88.176 79.786 608710000 0 103470000 89220000 91823000 109700000 0 0 76649000 110990000 26864000 0 0 0 22715 2067 21344 204483;204484;204485;204486;204487;204488;204489 261442;261443;261444;261445;261446;261447;261448 261442 1392 7 IVAPISDSPKPPPQR Unmodified 1600.8937 0.89369102 1723 O95336;M0R261 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 3 3 2 1 1 38.348 38.348 2;3 1.0162E-12 34031 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.53 111.7 2999500000 234350000 196250000 253420000 207530000 214480000 161160000 209740000 248880000 278800000 163490000 332680000 208690000 290050000 22716 1723 21345 204490;204491;204492;204493;204494;204495;204496;204497;204498;204499;204500;204501;204502;204503;204504;204505;204506;204507;204508;204509;204510 261449;261450;261451;261452;261453;261454;261455;261456;261457;261458;261459;261460;261461;261462;261463;261464;261465;261466;261467;261468;261469;261470;261471;261472;261473;261474;261475;261476;261477;261478;261479;261480;261481;261482;261483;261484;261485;261486;261487;261488;261489;261490;261491;261492;261493;261494 261483 44 IVAPPGGR Unmodified 765.44972 0.44972255 365;3050;3051 Q14194;E9PD68;A0A1C7CYX9;Q16555;Q14195;H0YBT4 CRMP1;DPYSL2;DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 1;Dihydropyrimidinase-related protein 2;Dihydropyrimidinase-related protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.825 17.825 2 0.0050828 10753 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.76 63.988 8526300000 330070000 472020000 77169000 578870000 126930000 502490000 103560000 3044400000 825900000 1514600000 80513000 576000000 293810000 22717 3050;365;3051 21346 204511;204512;204513;204514;204515;204516;204517;204518;204519;204520;204521;204522;204523 261495;261496;261497;261498;261499;261500;261501;261502;261503;261504;261505;261506;261507;261508;261509;261510;261511;261512;261513;261514;261515;261516;261517;261518 261509 24 IVASTLSNPELFEEWTGNVK Unmodified 2233.1267 0.12666366 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 140.91 140.91 2;3 7.3466E-244 147085 QUIQUE_C1576_190116_001 334.65 286.66 26896000000 2264000000 2348500000 2457300000 1931400000 2141800000 1789800000 1952000000 2120800000 1719200000 863050000 3041200000 2352000000 1915200000 22718 2120 21347 204524;204525;204526;204527;204528;204529;204530;204531;204532;204533;204534;204535;204536;204537;204538;204539;204540;204541;204542;204543;204544;204545;204546;204547;204548;204549 261519;261520;261521;261522;261523;261524;261525;261526;261527;261528;261529;261530;261531;261532;261533;261534;261535;261536;261537;261538;261539;261540;261541;261542;261543;261544;261545;261546;261547;261548;261549;261550;261551;261552;261553;261554;261555;261556;261557;261558;261559;261560;261561;261562;261563 261540 45 IVATKPLYVALAQR Unmodified 1541.9293 0.92934824 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;Q9H361;H0YB86 PABPC1;PABPC3 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 3 yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 71.374 71.374 2;3 8.6015E-06 71031 QUIQUE_C1403_190116_001 100.55 89.554 2483800000 146380000 197350000 52937000 193270000 192980000 64328000 54048000 275170000 301660000 85921000 352080000 272390000 295310000 22719 2031 21348 204550;204551;204552;204553;204554;204555;204556;204557;204558;204559;204560;204561;204562;204563;204564;204565;204566;204567;204568;204569;204570;204571;204572 261564;261565;261566;261567;261568;261569;261570;261571;261572;261573;261574;261575;261576;261577;261578;261579;261580;261581;261582;261583;261584;261585;261586;261587;261588;261589 261569 25 IVAVTGAEAQK Unmodified 1085.6081 0.60807369 2533 P49588;H3BPK7 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.828 22.828 2 0.00016436 15920 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.03 96.587 5733100000 571370000 487710000 573360000 486840000 0 468210000 0 424620000 528220000 270190000 698220000 535810000 688590000 22720 2533 21349 204573;204574;204575;204576;204577;204578;204579;204580;204581;204582;204583 261590;261591;261592;261593;261594;261595;261596;261597;261598;261599;261600;261601 261601 5 IVAYSSMILFTSLNHER Unmodified 1980.0139 0.01388251 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 121.57 121.57 3 1.3608E-10 125867 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.39 101.84 218170000 0 0 0 0 0 0 0 33401000 44609000 0 59658000 41508000 38999000 22721 4392 21350 204584;204585;204586;204587;204588;204589 261602;261603;261604;261605;261606;261607 261604 6 IVCTPGQGLGDLR Unmodified 1384.7133 0.71328381 4625 Q9Y5L0;C9J7E5;E9PFH4 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.445 67.445 2 0.001457 68194 QUIQUE_C1218_190116_001 90.913 51.891 217010000 69165000 48632000 54802000 44408000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22722 4625 21351 204590;204591;204592;204593 261608;261609;261610;261611;261612 261608 3 IVDAVIQEHQPSVLLELGAYCGYSAVR Unmodified 2986.5222 0.52224215 2189 P21964;E7EMS6;E7EUU8;F8WBW9 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.37 137.37 3 8.6134E-37 142139 QUIQUE_DMIX8_190116_001 124.28 117.85 1179000000 0 83831000 105040000 86724000 82314000 90436000 97666000 96258000 113860000 32992000 119300000 124900000 145710000 22723 2189 21352 204594;204595;204596;204597;204598;204599;204600;204601;204602;204603;204604;204605 261613;261614;261615;261616;261617;261618;261619;261620;261621;261622;261623;261624;261625;261626;261627;261628;261629 261629 17 IVDDEEYEKK Unmodified 1266.598 0.59796251 1015 F5H6L7;Q9UPR5 SLC8A2 Sodium/calcium exchanger 2 yes no 0 0 1 1 17.378 17.378 3 0.053673 9987 QUIQUE_C1438_190116_001 24.152 15.213 16551000 0 0 0 0 16551000 0 0 0 0 0 0 0 0 22724 1015 21353 204606 261630 261630 1 IVDDLKDEAEQYRK Unmodified 1720.8632 0.86317875 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 2 1 1 47.917 47.917 3 0.022235 46165 QUIQUE_C1438_190116_001 62.287 44.659 60094000 0 0 0 0 29328000 0 0 0 0 0 0 30766000 0 22725 1644 21354 204607;204608 261631;261632 261631 2 IVDDWANDGWGLK Unmodified 1487.7045 0.70449327 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.77 116.77 2 8.8794E-06 120564 QUIQUE_C1277_190116_001 146.11 110.16 2180600000 251330000 166230000 220080000 345320000 90107000 256090000 235350000 89564000 126540000 0 191630000 76217000 132130000 22726 2269 21355 204609;204610;204611;204612;204613;204614;204615;204616;204617;204618;204619;204620 261633;261634;261635;261636;261637;261638;261639;261640;261641;261642;261643;261644;261645;261646;261647;261648 261635 14 IVDDWANDGWGLKK Unmodified 1615.7995 0.79945628 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 88.474 88.474 3 2.773E-07 89793 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.69 115.22 1200200000 42057000 0 90843000 86048000 56493000 51031000 69226000 187370000 150630000 20778000 203380000 120180000 122130000 22727 2269 21356 204621;204622;204623;204624;204625;204626;204627;204628;204629;204630;204631;204632;204633;204634 261649;261650;261651;261652;261653;261654;261655;261656;261657;261658;261659;261660;261661;261662;261663;261664;261665;261666 261658 17 IVDILYATDEGFVIPDEGGPQEEQEEY Unmodified 3054.387 0.38697327 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 0 1 1 168.46 168.46 3 0.032415 172567 QUIQUE_DMIX7_190116_001 23.209 20.339 90947000 0 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21360 204643;204644;204645;204646;204647;204648 261675;261676;261677;261678;261679;261680 261677 6 IVDNVRPDR Unmodified 1082.5833 0.58325592 234 A0A0C4DG89;Q7L014 DDX46 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 yes no 0 0 1 1 1 1 16.052 16.052 3 0.0013091 8564 QUIQUE_C1218_190116_001 87.308 50.116 100610000 26093000 28412000 0 0 0 0 0 0 0 0 46108000 0 0 22732 234 21361 204649;204650;204651 261681;261682;261683 261681 3 IVDQIRPDR Unmodified 1110.6146 0.61455605 381;1290 J3KTA4;P17844;J3KRZ1;J3QSF1;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 21.297 21.297 2;3 0.0049739 14312 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.643 37.132 483460000 82515000 0 0 0 0 79261000 58965000 0 124210000 0 138500000 0 0 22733 1290;381 21362 204652;204653;204654;204655;204656;204657 261684;261685;261686;261687;261688;261689 261689 5 IVDQLQQLMQVYDLAALR Unmodified 2116.1351 0.13506028 525 C9J1X0;A4D1P6 WDR91 WD repeat-containing protein 91 yes no 0 0 0 2 1 1 167.33 167.33 2;3 1.3082E-23 171934 QUIQUE_C1218_190116_001 173.06 140.63 103300000 43270000 22222000 0 37809000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22734 525 21363 204658;204659;204660;204661 261690;261691;261692;261693;261694 261691 5 IVDRIDNDGDGFVTTEELK Unmodified 2135.0382 0.038242585 3128 Q15293 RCN1 Reticulocalbin-1 yes yes 0 0 1 1 84.749 84.749 3 0.052463 87877 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.767 22.944 78070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 78070000 0 0 22735 3128 21364 204662 261695 261695 1 IVDSGVQTDDEDATDR Unmodified 1734.7544 0.75441616 4665 Q9Y6V0;E9PE96 PCLO Protein piccolo yes no 0 0 0 1 35.699 35.699 2 0.0046975 31352 QUIQUE_C1368_190116_001 84.365 73.265 20821000 0 0 20821000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22736 4665 21365 204663 261696 261696 0 IVDVIGEK Unmodified 871.50148 0.50148335 2069 P13861;H7C4A9 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 39.277 39.277 2 0.0044718 35856 QUIQUE_C1218_190116_001 109.01 44.209 1056100000 232340000 0 0 0 0 0 239150000 0 0 93628000 0 213240000 277710000 22737 2069 21366 204664;204665;204666;204667;204668 261697;261698;261699;261700;261701 261697 5 IVEAAENEYQTAISENYQTMSDTTFK Unmodified 2982.3441 0.34406259 2492 P47755 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.55 130.55 2;3 2.5423E-103 134665 QUIQUE_C1277_190116_001 244.08 232.31 1525600000 110140000 130010000 135410000 116890000 105140000 145130000 91941000 151240000 114490000 69984000 143340000 121740000 90090000 22738 2492 21367 204669;204670;204671;204672;204673;204674;204675;204676;204677;204678;204679;204680;204681;204682 261702;261703;261704;261705;261706;261707;261708;261709;261710;261711;261712;261713;261714;261715;261716 261705 13 IVEAANK Unmodified 743.41775 0.41775372 3572 Q8N183;H0YA50 NDUFAF2 Mimitin, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.209 28.209 2 0.040019 22238 QUIQUE_C1368_190116_001 83.229 83.229 18392000000 0 0 3866200000 0 0 2902400000 0 0 2306700000 0 3850300000 2610200000 2856500000 22739 3572 21368 204683;204684;204685;204686;204687;204688 261717;261718;261719;261720;261721;261722 261717 6 IVEDAVEQGVLK Unmodified 1298.7082 0.70818166 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;H0YB62;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 66.457 66.457 2 0.00092205 62996 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.13 60.275 206340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 102830000 0 0 103520000 22740 1140;3457 21369 204689;204690 261723;261724 261723 0 IVEEALEAVK Unmodified 1099.6125 0.61249036 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 68.499 68.499 2 0.0031639 69354 QUIQUE_C1438_190116_001 85.862 38.513 1080500000 0 306620000 0 262580000 205010000 0 0 0 0 0 0 306310000 0 22741 2250 21370 204691;204692;204693;204694 261725;261726;261727;261728 261727 3 IVEEPQSNR Unmodified 1070.5356 0.53563702 1746 O95747 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes yes 0 0 0 1 1 1 14.874 14.874 2 0.00045846 6666 QUIQUE_C1563_190116_001 117.04 68.532 264000000 0 74717000 0 0 0 95126000 0 0 94160000 0 0 0 0 22742 1746 21371 204695;204696;204697 261729;261730;261731 261730 2 IVEFHHNHIGQTPAESDFQLLEIAR Unmodified 2900.4569 0.45693978 734;357 A0A1B0GV68;M0R262;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 2 2 2 3 2 1 1 1 1 2 2 98.7 98.7 3;4;5 4.8217E-30 102094 QUIQUE_C1576_190116_001 129.78 117 1643900000 57921000 120590000 189210000 207430000 109380000 140190000 234510000 60133000 76669000 48790000 97759000 163490000 137860000 22743 357;734 21372 204698;204699;204700;204701;204702;204703;204704;204705;204706;204707;204708;204709;204710;204711;204712;204713;204714;204715;204716;204717;204718 261732;261733;261734;261735;261736;261737;261738;261739;261740;261741;261742;261743;261744;261745;261746;261747;261748;261749;261750;261751;261752;261753;261754 261745 22 IVEFLQSFDEITAMTGDGVNDAPALK Unmodified 2780.3579 0.35786216 2112 P16615;H7C5W9 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes no 0 0 0 1 166.67 166.67 3 0.00073396 168316 QUIQUE_C1563_190116_001 38.006 31.131 35766000 0 0 0 0 0 35766000 0 0 0 0 0 0 0 22744 2112 21373 204719 261755 261755 1 IVEGILK Unmodified 770.49019 0.49019038 3132 Q15370;B8ZZU8;I3L0M9;A0A0B4J296 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 42.979 42.979 2 0.021705 39857 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.11 43.753 816050000 0 196580000 0 182600000 0 0 0 0 206830000 0 230040000 0 0 22745 3132 21374 204720;204721;204722;204723 261756;261757;261758;261759 261758 4 IVEGISQPIWLVSDTR Unmodified 1811.9781 0.97814893 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 129.43 129.43 2 2.0569E-29 134900 QUIQUE_C1218_190116_001 162.22 147.35 1117500000 98324000 77903000 129660000 92080000 99523000 119170000 94627000 33185000 65846000 51359000 107020000 55677000 93091000 22746 3116 21375 204724;204725;204726;204727;204728;204729;204730;204731;204732;204733;204734;204735;204736;204737;204738 261760;261761;261762;261763;261764;261765;261766;261767;261768;261769;261770;261771;261772;261773;261774;261775 261760 16 IVEGISQPIWLVSDTRR Unmodified 1968.0793 0.079259959 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 106.35 106.35 3 2.1151E-10 110024 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.455 70.317 201830000 0 0 0 0 0 0 0 34467000 47311000 0 43413000 40736000 35902000 22747 3116 21376 204739;204740;204741;204742;204743 261776;261777;261778;261779;261780;261781 261777 6 IVEHQVLMK Unmodified 1095.6111 0.61105057 3182 Q16566 CAMK4 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 21.02 21.02 3 0.0033733 14155 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.607 59.817 97000000 0 24719000 26845000 0 0 0 0 0 0 0 27733000 17703000 0 22748 3182 21377 204744;204745;204746;204747;204748 261782;261783;261784;261785;261786 261785 5 IVEIDAHIGCAMSGLIADAK Unmodified 2083.0442 0.044196361 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 0 1 1 126.42 126.42 3 0.00029061 130617 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.397 30.319 17525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17525000 0 22749 2273 21378 204749;204750 261787;261788 261788 2 IVEIGDENATLDGTDVLFTGR Unmodified 2234.1067 0.1066565 1762 O95865;A0A140T971;Q5SSV3;Q5SRR8;H0Y7N1 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes no 0 0 0 3 2 2 2 1 2 2 4 1 1 2 2 1 137.52 137.52 2;3 1.3078E-98 142225 QUIQUE_DMIX3_190116_001 268.5 241.96 3098800000 263110000 270060000 242510000 233160000 221790000 236090000 197820000 358070000 221990000 109510000 213040000 304130000 227530000 22750 1762 21379 204751;204752;204753;204754;204755;204756;204757;204758;204759;204760;204761;204762;204763;204764;204765;204766;204767;204768;204769;204770;204771;204772;204773;204774;204775 261789;261790;261791;261792;261793;261794;261795;261796;261797;261798;261799;261800;261801;261802;261803;261804;261805;261806;261807;261808;261809;261810;261811;261812;261813;261814;261815;261816;261817;261818;261819;261820;261821;261822 261814 30 IVEIPFNSTNK Unmodified 1260.6714 0.67140222 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.77 70.77 2 0.00016107 67990 QUIQUE_DMIX4_190116_001 127.4 96.324 2360000000 188380000 0 319650000 217200000 242630000 158210000 230510000 196990000 220450000 80031000 308910000 197020000 0 22751 1872 21380 204776;204777;204778;204779;204780;204781;204782;204783;204784;204785;204786 261823;261824;261825;261826;261827;261828;261829;261830;261831;261832;261833 261831 7 IVELMGR Unmodified 816.45276 0.45275902 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 45.926 45.926 2 0.0098368 43052 QUIQUE_C1277_190116_001 149.06 87.063 810230000 121080000 109050000 0 124870000 0 0 112970000 70415000 0 0 168670000 0 103180000 22752 2463 21381 204787;204788;204789;204790;204791;204792;204793 261834;261835;261836;261837;261838;261839;261840 261835 7 IVELPAPADFLSLSSETKPK Unmodified 2141.162 0.16198654 3379 Q6P2E9 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 131.76 131.76 3 0.030733 134952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.26 25.551 51114000 0 0 0 0 0 0 0 27132000 0 0 0 0 23982000 22753 3379 21382 204794;204795;204796 261841;261842;261843 261842 3 IVELVEQR Unmodified 984.5604 0.56039521 754 C9JY79;Q9H254;M0QZQ3;M0R1V6 SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 yes no 0 0 0 1 43.958 43.958 2 0.0392 41579 QUIQUE_C1438_190116_001 89.296 15.679 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22754 754 21383 204797 261844 261844 1 IVENSDAVTEILNNAELLK Unmodified 2084.1001 0.10011456 3177 Q16401 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 150.33 150.33 2;3 1.345E-28 155589 QUIQUE_C1368_190116_001 184.99 147.56 617320000 67970000 68843000 137750000 76401000 0 55000000 0 70002000 0 34671000 47774000 0 58907000 22755 3177 21384 204798;204799;204800;204801;204802;204803;204804;204805;204806;204807 261845;261846;261847;261848;261849;261850;261851;261852;261853;261854;261855 261848 9 IVEQDTMPPK Oxidation (M) 1172.5747 0.57472465 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A2R8YDH3;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 1 0 1 1 19.472 19.472 2 0.0084941 12164 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.573 57.115 64552000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25461000 0 39091000 0 22756 266;1504 21385 204808;204809 261856;261857;261858 261856 152 3 IVESDVGDSFYIR Unmodified 1498.7304 0.73037367 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 93.214 93.214 2 0.033343 97385 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.691 27.692 44577000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44577000 0 0 22757 1074 21386 204810;204811 261859;261860 261860 1 IVESLSLLK Unmodified 1000.6168 0.61684746 1569 O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4;A0A2R8Y5G3;C9JY58;A0A2R8Y5E2;H7C321 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 82.967 82.967 2 0.052818 84520 QUIQUE_C1218_190116_001 49.96 21.538 28638000 28638000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22758 1569 21387 204812 261861 261861 1 IVESYQIR Unmodified 1006.5447 0.54474515 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.156 39.156 2 0.0084554 34765 QUIQUE_C1368_190116_001 94.262 66.088 6088000000 534610000 569030000 702850000 0 593340000 424040000 760760000 381200000 516670000 0 576930000 497100000 531420000 22759 2948 21388 204813;204814;204815;204816;204817;204818;204819;204820;204821;204822;204823 261862;261863;261864;261865;261866;261867;261868;261869;261870;261871;261872;261873;261874;261875 261864 13 IVETQNEEYPHTFQVSGK Unmodified 2105.0065 0.006548526 656 F8W1R0;B7Z493;E9PJX4;F8VWL3;Q96M96 FGD4 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 56.963 56.963 3 0.0022003 56422 QUIQUE_C1218_190116_001 44.089 35.594 101280000 27759000 0 42811000 0 0 0 0 0 30710000 0 0 0 0 22760 656 21389 204824;204825;204826 261876;261877;261878 261876 3 IVEVDVDANSLNSNDVFVLK Unmodified 2189.1216 0.12157828 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 1 136.07 136.07 2 0.00011365 132312 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.548 41.343 21745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21745000 0 0 0 22761 4664 21390 204827 261879 261879 1 IVEVFDIGPK Unmodified 1115.6227 0.62266112 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 1 1 96.873 96.873 2 0.04206 101025 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.473 10.827 63755000 0 0 0 0 22283000 0 0 0 21861000 0 19611000 0 0 22762 90 21391 204828;204829;204830 261880;261881;261882 261882 3 IVEVGPR Unmodified 768.44939 0.4493882 2388 P35914;H0Y2L7;G5E9S9;B7Z4D4;B7Z212;Q8TB92 HMGCL;HMGCLL1 Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial;3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 21.952 21.952 2 0.023846 15116 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.279 33.381 718470000 83005000 91242000 0 110530000 0 100200000 108710000 0 86593000 42695000 95497000 0 0 22763 2388 21392 204831;204832;204833;204834;204835;204836;204837;204838 261883;261884;261885;261886;261887;261888;261889;261890 261889 8 IVEVLLIK Unmodified 925.6212 0.62120455 3840 Q96E39;A0A1B0GUK8 RBMXL1 RNA binding motif protein, X-linked-like-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.343 89.343 2 0.0036009 90729 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.7 21.79 503560000 43908000 40100000 47158000 34284000 39016000 33903000 34801000 36978000 45111000 13435000 51241000 49387000 34234000 22764 3840 21393 204839;204840;204841;204842;204843;204844;204845;204846;204847;204848;204849;204850;204851 261891;261892;261893;261894;261895;261896;261897;261898;261899;261900;261901;261902;261903 261898 13 IVEVLLMK Unmodified 943.57763 0.57762518 2412 P38159;H3BT71;H0Y6E7;H3BR27;O75526 RBMX;RBMXL2 RNA-binding motif protein, X chromosome;RNA-binding motif protein, X chromosome, N-terminally processed;RNA-binding motif protein, X-linked-like-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.154 86.154 2 0.0036009 88564 QUIQUE_C1576_190116_001 113.7 76.05 1652300000 140400000 154800000 141770000 103220000 118010000 118370000 107720000 132710000 134340000 40757000 196880000 148770000 114590000 22765 2412 21394 204852;204853;204854;204855;204856;204857;204858;204859;204860;204861;204862;204863;204864 261904;261905;261906;261907;261908;261909;261910;261911;261912;261913;261914;261915;261916;261917;261918;261919;261920 261913 17 IVEVNGVCMEGK Oxidation (M) 1349.6319 0.63192195 1441 O14745 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.615 34.615 2 0.00061755 30768 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.171 72.141 319390000 38816000 0 32747000 0 0 0 0 34608000 43269000 29938000 33775000 58801000 47432000 22766 1441 21395 204865;204866;204867;204868;204869;204870;204871;204872 261921;261922;261923;261924;261925;261926;261927;261928;261929;261930 261924 805 10 IVEVNGVCMEGK Unmodified 1333.637 0.63700733 1441 O14745 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes yes 0 0 0 1 1 2 54.793 54.793 2 4.337E-28 53247 QUIQUE_C1218_190116_001 182.71 163.73 218100000 106610000 0 0 0 0 0 0 66319000 0 45167000 0 0 0 22767 1441 21395 204873;204874;204875;204876 261931;261932;261933;261934 261931 3 IVEWNGK Unmodified 844.4443 0.44430282 394 A0A1W2PS43;Q14108;A0A1W2PPX5;A0A1W2PQR6;A0A1W2PQB7;A0A1W2PRS1;A0A1W2PRF6;A0A1W2PPU6 SCARB2 Lysosome membrane protein 2 yes no 0 0 0 1 31.599 31.599 2 0.044362 25379 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.454 37.951 18980000 0 0 0 0 0 0 0 0 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122.13 2 2.5271E-37 125007 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.02 171.06 499230000 39908000 45017000 0 0 43215000 37140000 36152000 37836000 62170000 0 71392000 56122000 70276000 22773 4455 21400 204910;204911;204912;204913;204914;204915;204916;204917;204918;204919;204920;204921 261970;261971;261972;261973;261974;261975;261976;261977;261978;261979;261980;261981 261976 12 IVFEDGNINVNK Unmodified 1360.6987 0.69867961 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 75.976 75.976 2 0.00011368 77106 QUIQUE_C1576_190116_001 142.92 110.99 19486000000 1881400000 1831900000 1359900000 1528100000 1477600000 1339800000 1486800000 1480400000 1489100000 1027000000 1713800000 1522900000 1347500000 22774 3050 21401 204922;204923;204924;204925;204926;204927;204928;204929;204930;204931;204932;204933;204934;204935 261982;261983;261984;261985;261986;261987;261988;261989;261990;261991;261992;261993;261994;261995;261996;261997;261998;261999;262000;262001;262002;262003;262004;262005;262006;262007;262008;262009;262010;262011;262012;262013 261995 31 IVFLDTQPILSPSILDHLINNDR Unmodified 2632.4225 0.42245175 4126 Q9H0W8 SMG9 Protein SMG9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 162.56 162.56 3 5.386E-06 167094 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.98 69.534 117940000 0 35829000 0 0 0 0 0 24397000 0 16524000 0 0 41194000 22775 4126 21402 204936;204937;204938;204939 262014;262015;262016;262017 262017 2 IVFLEEASQQEK Unmodified 1419.7246 0.72456001 4567 Q9Y2T3 GDA Guanine deaminase yes yes 0 0 0 1 2 2 3 1 1 2 1 1 1 1 2 2 75.846 75.846 2 2.0242E-37 77632 QUIQUE_C1218_190116_001 190.88 151.86 12761000000 860040000 920420000 1171400000 1216700000 724870000 923240000 1187700000 1021400000 911440000 457410000 1029100000 1037000000 1300800000 22776 4567 21403 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P35749;P35580 MYH11;MYH10 Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 70.854 70.854 2 0.019281 70717 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.85 82.542 1006200000 158500000 234680000 0 0 0 0 116830000 96531000 0 74427000 121110000 204130000 0 22778 2385;2379 21405 204965;204966;204967;204968;204969;204970;204971 262053;262054;262055;262056;262057;262058;262059 262056 7 IVFSGNLFQHQEDSKK Unmodified 1875.9479 0.94791144 3948 Q96TA1 FAM129B Niban-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 58.95 58.95 4 0.030524 58032 QUIQUE_C1277_190116_001 24.481 18.821 59494000 0 26423000 0 0 33071000 0 0 0 0 0 0 0 0 22779 3948 21406 204972;204973 262060;262061 262060 2 IVFSPEEAK Unmodified 1018.5335 0.53351176 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;A0A2R8Y5P6;A0A2R8Y6E6;A0A0U1RQF8 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.841 46.841 2 0.00046275 44746 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.73 76.622 4570800000 605850000 394190000 296650000 286260000 317510000 399150000 337810000 336940000 318100000 155160000 429030000 354510000 339690000 22780 445 21407 204974;204975;204976;204977;204978;204979;204980;204981;204982;204983;204984;204985;204986 262062;262063;262064;262065;262066;262067;262068;262069;262070;262071;262072;262073;262074;262075;262076 262069 15 IVFVTGNAK Unmodified 947.54402 0.54401687 4070 Q9BY32 ITPA Inosine triphosphate pyrophosphatase yes yes 0 0 0 1 2 39.898 39.898 2 0.020752 35925 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.241 46.055 39643000 0 0 39643000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22781 4070 21408 204987;204988;204989 262077;262078;262079 262079 3 IVGCTHITAQTAVLIETLCALGAQCR Unmodified 2855.4456 0.44558851 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 3 2 3 2 1 2 2 3 154.05 154.05 3;4 6.5513E-58 157748 QUIQUE_C1277_190116_001 157.3 139.2 6612500000 232950000 460910000 303880000 497490000 446070000 721220000 555030000 633480000 529820000 257810000 409290000 716020000 848510000 22782 1558 21409 204990;204991;204992;204993;204994;204995;204996;204997;204998;204999;205000;205001;205002;205003;205004;205005;205006;205007;205008;205009;205010;205011;205012;205013;205014;205015 262080;262081;262082;262083;262084;262085;262086;262087;262088;262089;262090;262091;262092;262093;262094;262095;262096;262097;262098;262099;262100;262101;262102;262103;262104;262105;262106;262107;262108;262109;262110;262111;262112;262113;262114;262115;262116;262117;262118;262119;262120;262121;262122;262123 262083 42 IVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCR Unmodified 2770.3928 0.39282466 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.18 144.18 3 8.4555E-20 150513 QUIQUE_C1438_190116_001 103.67 96.396 2720900000 228060000 295630000 0 226550000 307920000 321430000 222820000 172790000 223440000 66250000 318230000 0 337840000 22783 1131;3868 21410 205016;205017;205018;205019;205020;205021;205022;205023;205024;205025;205026;205027 262124;262125;262126;262127;262128;262129;262130;262131;262132;262133;262134;262135;262136;262137;262138 262128 14 IVGCTHITAQTAVLMETLGALGAQCR Oxidation (M) 2786.3877 0.38773928 3868;1131 H0Y8B3;C9K0S0;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 1 0 1 1 1 128.59 128.59 3 7.4811E-08 133964 QUIQUE_C1218_190116_001 75.896 68.449 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22784 1131;3868 21410 205028;205029;205030 262139;262140;262141 262139 659 3 IVGDLAQFMVQNGLSR Unmodified 1746.9087 0.90868916 2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.6 137.6 3 4.5592E-07 144457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.38 98.675 198450000 0 24079000 0 0 32242000 0 0 34227000 30601000 0 40416000 36884000 0 22785 2026 21411 205031;205032;205033;205034;205035;205036;205037 262142;262143;262144;262145;262146;262147;262148;262149;262150 262149 9 IVGHLTHALK Unmodified 1087.6502 0.65021327 2232 P24752 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 1 15.74 15.74 2;3 0.0001806 8087 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.14 84.732 6353100000 319340000 352950000 611980000 512660000 629740000 271570000 661430000 538960000 653470000 100250000 932350000 572100000 196290000 22786 2232 21412 205038;205039;205040;205041;205042;205043;205044;205045;205046;205047;205048;205049;205050;205051;205052;205053;205054;205055;205056 262151;262152;262153;262154;262155;262156;262157;262158;262159;262160;262161;262162;262163;262164;262165;262166;262167;262168;262169;262170;262171;262172 262166 16 IVGLDQVTGMTETAFGSAYK Unmodified 2087.0245 0.024506776 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 144.83 144.83 2;3 1.8653E-29 152021 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.9 126.99 842110000 76105000 68272000 79429000 105890000 0 47343000 0 71128000 73045000 17826000 145830000 82074000 75171000 22787 2379 21413 205057;205058;205059;205060;205061;205062;205063;205064;205065;205066;205067;205068;205069;205070 262173;262174;262175;262176;262177;262178;262179;262180;262181;262182;262183;262184;262185;262186;262187;262188;262189 262185 15 IVGLDQVTGMTETAFGSAYK Oxidation (M) 2103.0194 0.019421398 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 123.14 123.14 2 1.3416E-18 125695 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.24 107.7 130770000 0 0 0 25129000 0 0 16662000 23303000 46634000 19042000 0 0 0 22788 2379 21413 205071;205072;205073;205074;205075;205076 262190;262191;262192;262193;262194;262195 262193 1783 6 IVGPSGAAVPCK Unmodified 1154.6118 0.61177885 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 34.509 34.509 2 0.00052569 29499 QUIQUE_C1403_190116_001 98.044 80.648 997170000 60223000 72743000 85495000 87758000 133050000 59110000 84180000 49444000 57371000 39773000 106820000 88030000 73180000 22789 2178 21414 205077;205078;205079;205080;205081;205082;205083;205084;205085;205086;205087;205088;205089;205090 262196;262197;262198;262199;262200;262201;262202;262203;262204;262205;262206;262207;262208;262209;262210;262211;262212;262213 262202 17 IVGQIIPAIATTTAAVAGLLGLELYK Unmodified 2595.5251 0.52512591 2437 P41226 UBA7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 7 yes yes 0 0 0 1 179.58 179.58 3 0.054336 186243 QUIQUE_DMIX5_190116_001 19.492 19.255 10118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10118000 0 0 22790 2437 21415 205091 262214 262214 1 IVGSKPLYVALAQR Unmodified 1513.898 0.89804812 596 B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;H0YEU6 PABPC4 Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 65.7 65.7 3 0.020973 64388 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.79 39.104 112920000 0 0 0 0 18786000 0 0 34316000 0 0 0 0 59817000 22791 596 21416 205092;205093;205094 262215;262216;262217 262217 3 IVGWYHTGPK Unmodified 1156.6029 0.60292873 2589 P51665;H3BNT7;H3BTM8 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 1 2 35.418 35.418 2;3 0.0032668 32015 QUIQUE_C1218_190116_001 67.726 52.096 1040300000 154320000 95582000 169780000 163290000 45587000 152230000 0 0 62560000 0 196940000 0 0 22792 2589 21417 205095;205096;205097;205098;205099;205100;205101;205102;205103;205104;205105;205106;205107 262218;262219;262220;262221;262222;262223;262224;262225;262226;262227;262228;262229;262230;262231 262219 11 IVGYFVSGCDPSIMGIGPVPAISGALK Oxidation (M) 2720.3917 0.39174525 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 2 2 1 150.21 150.21 2;3 9.0619E-19 155413 QUIQUE_C1368_190116_001 92.575 84.984 276810000 57627000 55233000 83491000 0 0 73930000 0 0 0 6529500 0 0 0 22793 2453 21418 205108;205109;205110;205111;205112;205113;205114;205115 262232;262233;262234;262235;262236;262237;262238;262239;262240;262241;262242 262238 1876 11 IVGYFVSGCDPSIMGIGPVPAISGALK Unmodified 2704.3968 0.39683063 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 159.17 159.17 2;3 1.0272E-23 165205 QUIQUE_C1576_190116_001 132.59 128.2 2894000000 204490000 189510000 337040000 240580000 275500000 185870000 278130000 142280000 194210000 50968000 351030000 229180000 215270000 22794 2453 21418 205116;205117;205118;205119;205120;205121;205122;205123;205124;205125;205126;205127;205128;205129;205130;205131;205132;205133;205134;205135;205136;205137;205138;205139;205140;205141 262243;262244;262245;262246;262247;262248;262249;262250;262251;262252;262253;262254;262255;262256;262257;262258;262259;262260;262261;262262;262263;262264;262265;262266;262267;262268;262269;262270;262271;262272 262258 30 IVGYFVSGCDPSIMGIGPVPAISGALKK Unmodified 2832.4918 0.49179365 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 144.13 144.13 3;4 0.0033833 148443 QUIQUE_DMIX7_190116_001 29.346 26.939 124330000 0 0 0 0 0 0 0 9425300 0 0 0 114900000 0 22795 2453 21419 205142;205143 262273;262274 262274 2 IVGYVLAK Unmodified 861.53239 0.53238955 2438 P41227;F8W808;A8MWP7;Q9BSU3 NAA10;NAA11 N-alpha-acetyltransferase 10;N-alpha-acetyltransferase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.054 49.054 2 0.01997 46453 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.496 50.009 257080000 27483000 30242000 25524000 30277000 30695000 24602000 29782000 26401000 32076000 0 0 0 0 22796 2438 21420 205144;205145;205146;205147;205148;205149;205150;205151;205152 262275;262276;262277;262278;262279;262280;262281;262282;262283 262283 9 IVHAFDMEDLGDK Oxidation (M) 1504.6868 0.68679429 4338 Q9NZ45 CISD1 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1 yes yes 0 1 0 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 49.876 49.876 2;3 0.0003716 48011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.84 97.246 557290000 98123000 0 0 0 0 0 37648000 30065000 39452000 53968000 216490000 32942000 48598000 22797 4338 21421 205153;205154;205155;205156;205157;205158;205159;205160;205161;205162;205163;205164;205165;205166 262284;262285;262286;262287;262288;262289;262290;262291;262292;262293;262294;262295;262296;262297 262294 2910 13 IVHAFDMEDLGDK Unmodified 1488.6919 0.69187967 4338 Q9NZ45 CISD1 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 76.991 76.991 2;3 8.814E-06 78100 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.51 106.97 5993000000 625810000 549710000 593480000 244960000 196500000 336070000 461290000 352620000 589970000 127350000 797780000 567740000 549700000 22798 4338 21421 205167;205168;205169;205170;205171;205172;205173;205174;205175;205176;205177;205178;205179;205180;205181;205182;205183;205184;205185;205186;205187;205188;205189;205190;205191;205192 262298;262299;262300;262301;262302;262303;262304;262305;262306;262307;262308;262309;262310;262311;262312;262313;262314;262315;262316;262317;262318;262319;262320;262321;262322;262323;262324;262325;262326;262327;262328;262329;262330;262331;262332;262333;262334 262327 37 IVHAFDMEDLGDKAVYCR Unmodified 2137.9925 0.99249514 4338 Q9NZ45 CISD1 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 89.496 89.496 4 0.00018747 90200 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.962 58.468 69045000 0 0 0 0 0 0 0 69045000 0 0 0 0 0 22799 4338 21422 205193 262335 262335 1 IVHDLISR Unmodified 951.55016 0.55016488 3947 Q96T76;Q5T454;B0QZ77 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 24.366 24.366 2 0.065856 18132 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.854 22.956 30550000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30550000 22800 3947 21423 205194 262336 262336 1 IVHIANDLFLQEQK Unmodified 1666.9043 0.90425571 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 83.692 83.692 3 0.0023081 85040 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.81 23.397 104580000 0 0 0 29318000 0 23127000 0 26642000 0 0 0 0 25491000 22801 550 21424 205195;205196;205197;205198 262337;262338;262339;262340 262339 2 IVHLQETCDLGK Unmodified 1411.7129 0.71294946 4078 Q9BYT8;E9PCB6 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.734 37.734 2 0.00094714 33810 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.817 57.928 210170000 23925000 23113000 32902000 22501000 0 0 0 22344000 21929000 0 35320000 0 28137000 22802 4078 21425 205199;205200;205201;205202;205203;205204;205205;205206;205207;205208 262341;262342;262343;262344;262345;262346;262347;262348;262349;262350;262351 262348 11 IVIDFDSINSR Unmodified 1277.6616 0.66156582 2349 P32321 DCTD Deoxycytidylate deaminase yes yes 0 0 0 1 1 101.21 101.21 2 0.009375 97835 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.283 39.855 49663000 31685000 0 0 0 0 0 0 0 0 17978000 0 0 0 22803 2349 21426 205209;205210 262352;262353 262353 2 IVIDFDSINSRPSQK Unmodified 1717.8999 0.89989861 2349 P32321 DCTD Deoxycytidylate deaminase yes yes 0 0 1 1 1 77.036 77.036 3 7.2012E-06 78310 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.729 65.133 95936000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52158000 0 43778000 22804 2349 21427 205211;205212 262354;262355 262355 2 IVIFTQGR Unmodified 932.54435 0.54435122 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 55.374 55.374 2 0.039684 53603 QUIQUE_C1277_190116_001 90.777 57.261 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22805 2663 21428 205213;205214;205215;205216;205217;205218 262356;262357;262358;262359;262360;262361 262357 6 IVIGMDVAASEFYR Oxidation (M) 1585.781 0.78102903 1955 P09104;F5H0C8;U3KQP4 ENO2 Gamma-enolase;Enolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.08 102.08 2 0.00029813 106257 QUIQUE_C1218_190116_001 107.18 71.232 3863500000 356100000 489930000 381640000 0 351870000 351360000 312260000 238920000 263290000 198520000 277680000 348280000 293660000 22806 1955 21429 205219;205220;205221;205222;205223;205224;205225;205226;205227;205228;205229;205230 262362;262363;262364;262365;262366;262367;262368;262369;262370;262371;262372;262373;262374;262375;262376;262377;262378;262379;262380;262381;262382;262383;262384;262385;262386;262387;262388;262389;262390;262391;262392 262363 1208 31 IVIGMDVAASEFYR Unmodified 1569.7861 0.78611441 1955 P09104;F5H0C8;U3KQP4 ENO2 Gamma-enolase;Enolase yes no 0 0 0 8 8 12 3 7 4 7 6 15 5 19 11 11 135.38 135.38 2;3 4.9458E-11 134128 QUIQUE_C1218_190116_001 161.62 135.5 6625300000 786240000 231360000 261030000 242070000 432510000 370810000 606620000 543910000 840660000 173770000 1329000000 303730000 503510000 22807 1955 21429 205231;205232;205233;205234;205235;205236;205237;205238;205239;205240;205241;205242;205243;205244;205245;205246;205247;205248;205249;205250;205251;205252;205253;205254;205255;205256;205257;205258;205259;205260;205261;205262;205263;205264;205265;205266;205267;205268;205269;205270;205271;205272;205273;205274;205275;205276;205277;205278;205279;205280;205281;205282;205283;205284;205285;205286;205287;205288;205289;205290;205291;205292;205293;205294;205295;205296;205297;205298;205299;205300;205301;205302;205303;205304;205305;205306;205307;205308;205309;205310;205311;205312;205313;205314;205315;205316;205317;205318;205319;205320;205321;205322;205323;205324;205325;205326;205327;205328;205329;205330;205331;205332;205333;205334;205335;205336;205337;205338;205339;205340;205341;205342;205343;205344;205345;205346 262393;262394;262395;262396;262397;262398;262399;262400;262401;262402;262403;262404;262405;262406;262407;262408;262409;262410;262411;262412;262413;262414;262415;262416;262417;262418;262419;262420;262421;262422;262423;262424;262425;262426;262427;262428;262429;262430;262431;262432;262433;262434;262435;262436;262437;262438;262439;262440;262441;262442;262443;262444;262445;262446;262447;262448;262449;262450;262451;262452;262453;262454;262455;262456;262457;262458;262459;262460;262461;262462;262463;262464;262465;262466;262467;262468;262469;262470;262471;262472;262473;262474;262475;262476;262477;262478;262479;262480;262481;262482;262483;262484;262485;262486;262487;262488;262489;262490;262491;262492;262493;262494;262495;262496;262497;262498;262499;262500;262501;262502;262503;262504;262505;262506;262507;262508;262509;262510;262511;262512;262513;262514;262515;262516;262517;262518;262519;262520;262521;262522;262523;262524;262525;262526;262527;262528;262529;262530;262531;262532;262533;262534;262535;262536;262537;262538;262539;262540;262541;262542;262543;262544;262545;262546;262547;262548;262549;262550;262551;262552;262553;262554;262555;262556;262557;262558;262559;262560;262561;262562;262563;262564;262565;262566;262567;262568;262569;262570;262571;262572;262573;262574;262575;262576;262577;262578;262579 262396 179 IVIGYQSHADTATK Unmodified 1502.7729 0.77290718 1904 P06730;D6RBW1 EIF4E Eukaryotic translation initiation factor 4E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 30.654 30.654 2;3 7.1306E-08 24791 QUIQUE_C1368_190116_001 91.024 66.833 2095000000 170840000 164920000 0 172670000 200560000 145370000 179580000 202750000 222290000 15769000 186380000 198660000 235230000 22808 1904 21430 205347;205348;205349;205350;205351;205352;205353;205354;205355;205356;205357;205358;205359;205360;205361;205362;205363;205364;205365;205366 262580;262581;262582;262583;262584;262585;262586;262587;262588;262589;262590;262591;262592;262593;262594;262595;262596;262597;262598;262599 262582 18 IVILEYQPSK Unmodified 1188.6754 0.67542497 3135 Q15393;J3QRB2;J3QL37 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 75.496 75.496 2 0.0085633 75761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.136 64.708 186330000 0 0 45222000 51518000 0 49449000 0 40137000 0 0 0 0 0 22809 3135 21431 205367;205368;205369;205370 262600;262601;262602;262603 262603 2 IVILLCGR Unmodified 942.56846 0.56845748 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 76.597 76.597 2 0.046296 76923 QUIQUE_C1277_190116_001 76.847 27.488 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22810 4631 21432 205371;205372;205373;205374;205375 262604;262605;262606;262607;262608 262605 5 IVILPDYLEIAR Unmodified 1413.8232 0.82315184 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.32 138.32 2 3.2589E-05 142747 QUIQUE_C1277_190116_001 150.08 110.03 6617100000 547260000 500520000 634970000 434660000 598230000 520450000 574900000 425950000 407760000 216160000 663820000 481790000 610600000 22811 2472 21433 205376;205377;205378;205379;205380;205381;205382;205383;205384;205385;205386;205387;205388 262609;262610;262611;262612;262613;262614;262615;262616;262617;262618;262619;262620;262621;262622;262623;262624;262625;262626;262627 262611 17 IVIPLIEEASK Unmodified 1210.7173 0.71728978 2648 P54750 PDE1A Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A yes yes 0 0 0 1 110.74 110.74 2 0.019301 107396 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.297 42.211 11195000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11195000 0 0 0 22812 2648 21434 205389 262628 262628 1 IVISDFHLAK Unmodified 1141.6495 0.64954457 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24;C9JSB2 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 72.458 72.458 2;3 0.00020264 72725 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.111 47.95 2520000000 315410000 316800000 301570000 201060000 193890000 174160000 202290000 163780000 123020000 0 232920000 182900000 112230000 22813 872;3632 21435 205390;205391;205392;205393;205394;205395;205396;205397;205398;205399;205400;205401;205402;205403;205404;205405;205406 262629;262630;262631;262632;262633;262634;262635;262636;262637;262638;262639;262640;262641;262642;262643;262644;262645;262646;262647 262640 17 IVISQLNPYTLR Unmodified 1415.8136 0.81364979 849 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2 2 2 2 1 2 2 2 97.973 97.973 2;3 4.0515E-75 101883 QUIQUE_DMIX5_190116_001 198.74 166.67 5334300000 430060000 452430000 485100000 444070000 386230000 489950000 516760000 422970000 352500000 145690000 415440000 383890000 409230000 22816 143;560;4559 21438 205418;205419;205420;205421;205422;205423;205424;205425;205426;205427;205428;205429;205430;205431;205432;205433;205434;205435;205436;205437;205438;205439;205440;205441;205442 262660;262661;262662;262663;262664;262665;262666;262667;262668;262669;262670;262671;262672;262673;262674;262675;262676;262677;262678;262679;262680;262681;262682;262683;262684;262685;262686;262687;262688 262683 29 IVITGDGDIDHDQALAQAIR Unmodified 2120.0862 0.086195831 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;E9PPC9;O43491;Q6R5J7;Q6ZSX4 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 0 3 2 3 4 4 4 4 3 4 2 4 3 3 96.377 96.377 2;3 2.5487E-87 99312 QUIQUE_DMIX5_190116_001 241.89 205.05 6801000000 309850000 393200000 718440000 780900000 533540000 837340000 568890000 536970000 534780000 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1681.8635 0.8635131 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 7 6 7 6 5 4 8 9 7 7 6 8 8 66.904 66.904 2;3 3.0543E-66 64781 QUIQUE_C1368_190116_001 210.79 201.1 164520000000 12815000000 13889000000 16858000000 13380000000 11431000000 11900000000 14536000000 10797000000 12007000000 6934900000 13830000000 12508000000 13638000000 22829 365 21451 205582;205583;205584;205585;205586;205587;205588;205589;205590;205591;205592;205593;205594;205595;205596;205597;205598;205599;205600;205601;205602;205603;205604;205605;205606;205607;205608;205609;205610;205611;205612;205613;205614;205615;205616;205617;205618;205619;205620;205621;205622;205623;205624;205625;205626;205627;205628;205629;205630;205631;205632;205633;205634;205635;205636;205637;205638;205639;205640;205641;205642;205643;205644;205645;205646;205647;205648;205649;205650;205651;205652;205653;205654;205655;205656;205657;205658;205659;205660;205661;205662;205663;205664;205665;205666;205667;205668;205669 262871;262872;262873;262874;262875;262876;262877;262878;262879;262880;262881;262882;262883;262884;262885;262886;262887;262888;262889;262890;262891;262892;262893;262894;262895;262896;262897;262898;262899;262900;262901;262902;262903;262904;262905;262906;262907;262908;262909;262910;262911;262912;262913;262914;262915;262916;262917;262918;262919;262920;262921;262922;262923;262924;262925;262926;262927;262928;262929;262930;262931;262932;262933;262934;262935;262936;262937;262938;262939;262940;262941;262942;262943;262944;262945;262946;262947;262948;262949;262950;262951;262952;262953;262954;262955;262956;262957;262958;262959;262960;262961;262962;262963;262964;262965;262966;262967;262968;262969;262970;262971;262972;262973;262974;262975;262976;262977;262978;262979;262980;262981;262982;262983;262984;262985;262986;262987;262988;262989;262990;262991;262992;262993;262994;262995;262996;262997;262998;262999;263000;263001;263002;263003;263004;263005;263006;263007;263008;263009;263010;263011;263012;263013;263014;263015;263016;263017;263018;263019;263020;263021;263022;263023;263024;263025;263026;263027;263028;263029;263030;263031;263032;263033;263034;263035;263036;263037;263038;263039;263040;263041;263042;263043;263044;263045;263046;263047;263048;263049;263050;263051;263052;263053;263054;263055;263056;263057;263058;263059;263060;263061;263062;263063 262908 182 IVLELFADIVPK Unmodified 1355.8064 0.80643914 2926 Q08752 PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 156.56 156.56 2 0.0055097 163902 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.573 67.56 106980000 0 0 0 0 13061000 0 0 18411000 18943000 0 20032000 20034000 16495000 22830 2926 21452 205670;205671;205672;205673;205674;205675;205676 263064;263065;263066;263067;263068;263069;263070 263068 5 IVLENSSR Unmodified 916.49779 0.49779495 3280;3732 Q92556;H7C0S6;H7C3P3;Q5JVZ5;Q96JJ3;H0YCM7;Q5JVZ8 ELMO1;ELMO2 Engulfment and cell motility protein 1;Engulfment and cell motility protein 2 no no 0 0 0 1 20.043 20.043 2 0.032564 13133 QUIQUE_C1563_190116_001 65.252 15.894 594280000 0 0 0 0 0 594280000 0 0 0 0 0 0 0 22831 3732;3280 21453 205677 263071 263071 1 IVLFDTLLEEYSVLNK Unmodified 1895.0292 0.029181449 1661 O75844 ZMPSTE24 CAAX prenyl protease 1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 169.19 169.19 2 1.8217E-09 173545 QUIQUE_C1218_190116_001 127.37 97.566 13715000 13715000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22832 1661 21454 205678;205679 263072;263073 263072 2 IVLGAILLASK Unmodified 1096.722 0.72198123 3635 Q8ND76;H7C0P7;Q8N7R7;Q5T2Q4 CCNY;CCNYL1;CCNYL2 Cyclin-Y;Cyclin-Y-like protein 1;Cyclin-Y-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.73 116.73 2 0.0059223 122174 QUIQUE_C1218_190116_001 67.726 44.297 364330000 33456000 28919000 31374000 29941000 35582000 29820000 32794000 22752000 28203000 14418000 23432000 26126000 27510000 22833 3635 21455 205680;205681;205682;205683;205684;205685;205686;205687;205688;205689;205690;205691;205692 263074;263075;263076;263077;263078;263079;263080;263081;263082;263083;263084;263085;263086;263087;263088 263074 14 IVLGGTTVHNTK Unmodified 1238.6983 0.69828568 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.329 20.329 2 0.00079055 12826 QUIQUE_C1277_190116_001 94.692 58.297 544120000 64333000 75267000 54412000 57532000 51241000 50589000 69259000 0 53781000 14281000 0 53422000 0 22834 4276 21456 205693;205694;205695;205696;205697;205698;205699;205700;205701;205702 263089;263090;263091;263092;263093;263094;263095;263096;263097;263098 263090 8 IVLGQEQDSYGGK Unmodified 1392.6885 0.68850885 1827 P02743 APCS Serum amyloid P-component;Serum amyloid P-component(1-203) yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.48 45.48 2 7.2594E-08 43150 QUIQUE_C1218_190116_001 167.67 153.9 659990000 99160000 39677000 27649000 30802000 52947000 57141000 41584000 0 91665000 0 120560000 38759000 60040000 22835 1827 21457 205703;205704;205705;205706;205707;205708;205709;205710;205711;205712;205713;205714 263099;263100;263101;263102;263103;263104;263105;263106;263107;263108;263109;263110;263111;263112;263113 263099 14 IVLLAEGR Unmodified 869.53345 0.53345218 3868;1131 H0Y8B3;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.064 53.064 2 0.00036995 50833 QUIQUE_C1403_190116_001 158.12 58.05 3706700000 472610000 352570000 269410000 369480000 360180000 328400000 228120000 318580000 209340000 203790000 293230000 300960000 0 22836 1131;3868 21458 205715;205716;205717;205718;205719;205720;205721;205722;205723;205724;205725;205726 263114;263115;263116;263117;263118;263119;263120;263121;263122;263123;263124;263125;263126;263127;263128;263129;263130;263131;263132 263119 19 IVLLDSSLEYK Unmodified 1278.7071 0.70711903 2527;3303 P49368;B4DUR8;Q5SZX6 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.36 101.36 2 0.0011449 105714 QUIQUE_C1438_190116_001 103.7 83.913 3549100000 259500000 259300000 315540000 237070000 269670000 307180000 327300000 173620000 256670000 181460000 408070000 305480000 248270000 22837 2527;3303 21459 205727;205728;205729;205730;205731;205732;205733;205734;205735;205736;205737;205738;205739 263133;263134;263135;263136;263137;263138;263139;263140;263141;263142;263143;263144;263145;263146;263147;263148;263149;263150 263140 18 IVLLDSSLEYKK Unmodified 1406.8021 0.80208205 2527;3303 P49368;B4DUR8;Q5SZX6 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 1 1 1 1 1 74.52 74.52 3 0.00013699 75030 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.597 57.501 151800000 0 0 0 0 0 0 0 74321000 41942000 0 0 35535000 0 22838 2527;3303 21460 205740;205741;205742;205743 263151;263152;263153;263154;263155 263152 5 IVLNGIDLK Unmodified 983.60153 0.60153174 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.5 85.5 2 0.01218 87010 QUIQUE_C1277_190116_001 71.692 13.525 266240000 25306000 27924000 21859000 0 24366000 22569000 26913000 32580000 25599000 12321000 0 25162000 21644000 22839 1497 21461 205744;205745;205746;205747;205748;205749;205750;205751;205752;205753;205754 263156;263157;263158;263159;263160;263161;263162;263163;263164;263165;263166;263167;263168 263158 13 IVLPMHSFAQLR Unmodified 1410.7806 0.78057552 2511 P48553 TRAPPC10 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.625 89.625 3 0.0025123 92425 QUIQUE_C1438_190116_001 52.555 43.192 66726000 0 17267000 0 0 18712000 0 17522000 13225000 0 0 0 0 0 22840 2511 21462 205755;205756;205757;205758;205759;205760;205761;205762 263169;263170;263171;263172;263173;263174;263175;263176 263171 8 IVLQIDNAR Unmodified 1040.5978 0.59784335 773;771 CON__P05784;CON__P08727;P08727;C9JM50;CON__P19001 KRT19 Keratin, type I cytoskeletal 19 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.869 54.869 2 0.001153 52482 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.36 33.317 187170000 0 0 18172000 0 0 0 0 41144000 38110000 0 0 32634000 57108000 + 22841 771;773 21463 205763;205764;205765;205766;205767 263177;263178;263179;263180;263181;263182 263182 6 IVLQNGAHEVFNHR Unmodified 1632.8485 0.84847216 2917 Q08257;A6NP24;C9JH92 CRYZ Quinone oxidoreductase yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 37.447 37.447 3;4 6.7509E-05 34066 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.498 59.835 762520000 71070000 0 0 90524000 122110000 0 0 236380000 146890000 0 0 95551000 0 22842 2917 21464 205768;205769;205770;205771;205772;205773;205774;205775 263183;263184;263185;263186;263187;263188;263189;263190;263191 263187 7 IVLTNPVCTEVGEK Unmodified 1557.8072 0.80724378 2432 P41091;Q2VIR3 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.725 77.725 2 4.8923E-14 78394 QUIQUE_C1277_190116_001 144.17 117.57 1153800000 95380000 107030000 91393000 98714000 80398000 75662000 87945000 82229000 87608000 40265000 105320000 103680000 98203000 22843 2432 21465 205776;205777;205778;205779;205780;205781;205782;205783;205784;205785;205786;205787;205788;205789 263192;263193;263194;263195;263196;263197;263198;263199;263200;263201;263202;263203;263204;263205;263206;263207 263193 16 IVLVDDSIVR Unmodified 1127.655 0.65502388 2899 Q06203 PPAT Amidophosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 86.582 86.582 2 0.0051889 82965 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.334 28.917 168660000 57665000 0 0 0 0 0 0 67859000 0 43135000 0 0 0 22844 2899 21466 205790;205791;205792 263208;263209;263210 263210 1 IVMEAIQQASVAK Unmodified 1386.7541 0.754086 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 72.045 72.045 2 0.00053027 72925 QUIQUE_C1368_190116_001 117.83 79.528 75668000 0 0 44019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31649000 22845 3675 21467 205793;205794;205795 263211;263212;263213;263214 263211 4 IVMFTIDIGEAPK Unmodified 1432.7636 0.76358805 989 F5GX39;Q15363;E7EQ72 TMED2 Transmembrane emp24 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 2 1 2 132.43 132.43 2 0.0015623 135321 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.658 63.788 110170000 0 0 0 0 0 0 0 24434000 27510000 0 0 58230000 0 22846 989 21468 205796;205797;205798;205799;205800 263215;263216;263217;263218;263219 263216 4 IVMLVNENPLLTEEAALNK Unmodified 2110.1344 0.13439158 3531 Q8IV38;G3V0G5 ANKMY2 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.56 139.56 2 2.4273E-09 144704 QUIQUE_C1368_190116_001 147.26 124.68 438390000 34815000 43693000 40591000 27939000 31114000 36199000 40979000 32577000 31216000 0 48662000 38701000 31906000 22847 3531 21469 205801;205802;205803;205804;205805;205806;205807;205808;205809;205810;205811;205812 263220;263221;263222;263223;263224;263225;263226;263227;263228;263229;263230;263231;263232 263222 12 IVNDDQSFYADIYMEDGLIK Oxidation (M) 2364.0831 0.083143867 365;3051 A0A1C7CYX9;Q16555;E5RFU4;Q14195;D6RF19 DPYSL2;DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 2;Dihydropyrimidinase-related protein 3 no no 0 1 0 3 2 3 2 1 2 1 2 2 2 3 2 1 138.46 138.46 2;3 1.7879E-66 143151 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.56 169.45 7013000000 525130000 566180000 728030000 535610000 362380000 580690000 418980000 503170000 707350000 512140000 735610000 449860000 387840000 22848 365;3051 21470 205813;205814;205815;205816;205817;205818;205819;205820;205821;205822;205823;205824;205825;205826;205827;205828;205829;205830;205831;205832;205833;205834;205835;205836;205837;205838 263233;263234;263235;263236;263237;263238;263239;263240;263241;263242;263243;263244;263245;263246;263247;263248;263249;263250;263251;263252;263253;263254;263255;263256;263257;263258;263259;263260;263261;263262;263263;263264;263265;263266;263267;263268;263269;263270;263271;263272;263273;263274;263275;263276;263277;263278;263279;263280;263281;263282;263283;263284;263285 263266 261 53 IVNDDQSFYADIYMEDGLIK Unmodified 2348.0882 0.088229245 365;3051 A0A1C7CYX9;Q16555;E5RFU4;Q14195;D6RF19 DPYSL2;DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 2;Dihydropyrimidinase-related protein 3 no no 0 0 0 4 4 5 2 4 4 7 7 8 3 28 14 8 153.46 153.46 2;3 1.26E-87 152255 QUIQUE_C1218_190116_001 202.25 188.5 10217000000 732900000 513770000 628810000 315040000 563680000 506070000 690970000 904070000 1058800000 286480000 1797400000 1202200000 1016800000 22849 365;3051 21470 205839;205840;205841;205842;205843;205844;205845;205846;205847;205848;205849;205850;205851;205852;205853;205854;205855;205856;205857;205858;205859;205860;205861;205862;205863;205864;205865;205866;205867;205868;205869;205870;205871;205872;205873;205874;205875;205876;205877;205878;205879;205880;205881;205882;205883;205884;205885;205886;205887;205888;205889;205890;205891;205892;205893;205894;205895;205896;205897;205898;205899;205900;205901;205902;205903;205904;205905;205906;205907;205908;205909;205910;205911;205912;205913;205914;205915;205916;205917;205918;205919;205920;205921;205922;205923;205924;205925;205926;205927;205928;205929;205930;205931;205932;205933;205934;205935;205936 263286;263287;263288;263289;263290;263291;263292;263293;263294;263295;263296;263297;263298;263299;263300;263301;263302;263303;263304;263305;263306;263307;263308;263309;263310;263311;263312;263313;263314;263315;263316;263317;263318;263319;263320;263321;263322;263323;263324;263325;263326;263327;263328;263329;263330;263331;263332;263333;263334;263335;263336;263337;263338;263339;263340;263341;263342;263343;263344;263345;263346;263347;263348;263349;263350;263351;263352;263353;263354;263355;263356;263357;263358;263359;263360;263361;263362;263363;263364;263365;263366;263367;263368;263369;263370;263371;263372;263373;263374;263375;263376;263377;263378;263379;263380;263381;263382;263383;263384;263385;263386;263387;263388;263389;263390;263391;263392;263393;263394;263395;263396;263397;263398;263399;263400;263401;263402;263403;263404;263405;263406;263407;263408;263409;263410;263411;263412;263413;263414;263415;263416;263417;263418;263419;263420;263421;263422;263423;263424;263425;263426;263427;263428;263429;263430;263431;263432;263433;263434;263435;263436;263437;263438;263439;263440;263441;263442;263443;263444;263445;263446;263447;263448;263449;263450;263451;263452;263453;263454 263287 157 IVNDDQSFYADVHVEDGLIK Unmodified 2276.0961 0.096091815 1430 O14531 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes yes 0 0 0 2 1 1 111.03 111.03 3 0.00022259 114378 QUIQUE_C1277_190116_001 61.767 45.461 246120000 93467000 82784000 0 0 0 0 0 0 0 69871000 0 0 0 22850 1430 21471 205937;205938;205939;205940 263455;263456;263457;263458 263457 2 IVNFLLQHSAK Unmodified 1268.7241 0.7241065 2953 Q12955 ANK3 Ankyrin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 59.658 59.658 3 0.0036819 58981 QUIQUE_C1277_190116_001 58.17 41.228 82846000 0 22973000 0 0 0 0 0 0 0 0 25172000 34701000 0 22851 2953 21472 205941;205942;205943 263459;263460;263461 263459 3 IVNGWQVEEADDWLR Unmodified 1828.8744 0.87441214 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 2 3 2 2 2 133.22 133.22 2;3 8.2054E-54 136529 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.15 172.34 6685700000 416710000 419210000 498180000 315380000 442900000 387040000 582110000 611990000 716850000 212370000 802280000 633850000 646830000 22852 2016 21473 205944;205945;205946;205947;205948;205949;205950;205951;205952;205953;205954;205955;205956;205957;205958;205959;205960;205961;205962;205963;205964;205965;205966;205967;205968 263462;263463;263464;263465;263466;263467;263468;263469;263470;263471;263472;263473;263474;263475;263476;263477;263478;263479;263480;263481;263482;263483;263484;263485;263486;263487;263488;263489;263490;263491;263492 263477 29 IVNHPTMLQDPDVR Unmodified 1633.8246 0.82462518 3015 Q13596;H0YK42 SNX1 Sorting nexin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.897 47.897 3 0.00022842 45150 QUIQUE_C1576_190116_001 61.657 45.878 819550000 69160000 104320000 79998000 128840000 79969000 86993000 88821000 0 0 93726000 87731000 0 0 22853 3015 21474 205969;205970;205971;205972;205973;205974;205975;205976;205977 263493;263494;263495;263496;263497;263498;263499;263500;263501 263499 9 IVNLLNDLYTR Unmodified 1332.7402 0.74015049 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685;D6RC99 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 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Q9UL15;G3V274 BAG5 BAG family molecular chaperone regulator 5 yes no 0 0 0 1 1 170.15 170.15 3 0.0004172 174316 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.162 40.032 60029000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33961000 26068000 22863 4481 21484 206055;206056 263590;263591 263591 2 IVPGGVVTDPEALQAPNVDWLR Unmodified 2345.2379 0.23794545 3588 Q8N465;G5E9E8;F8WCF9 D2HGDH D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 2 2 143.94 143.94 2;3 6.5875E-09 146794 QUIQUE_C1563_190116_001 125.53 117.62 417580000 24327000 0 25010000 0 35484000 54980000 55880000 38427000 25288000 0 38235000 61258000 58694000 22864 3588 21485 206057;206058;206059;206060;206061;206062;206063;206064;206065;206066;206067;206068;206069;206070;206071;206072 263592;263593;263594;263595;263596;263597;263598;263599;263600;263601;263602;263603;263604;263605;263606;263607;263608 263597 17 IVPGQFLAVDPK Unmodified 1282.7285 0.72852317 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.86 93.86 2 0.01104 95064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.426 44.757 405620000 61255000 70574000 0 0 0 66720000 0 63951000 0 22894000 0 63609000 56618000 22865 3135 21486 206073;206074;206075;206076;206077;206078;206079 263609;263610;263611;263612;263613;263614;263615 263612 5 IVPIGQPSQR Unmodified 1093.6244 0.62439245 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;E7EMG1;E7ERH1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 30.821 30.821 2 0.039905 25766 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.193 28.806 53821000 0 0 0 0 0 0 0 0 53821000 0 0 0 0 22866 422 21487 206080 263616 263616 1 IVPLAWNPR Unmodified 1064.6131 0.61309948 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 81.336 81.336 2 0.039064 83164 QUIQUE_C1368_190116_001 64.757 56.417 364090000 0 0 91229000 0 0 0 0 0 0 0 203340000 0 69514000 22867 2807 21488 206081;206082;206083 263617;263618;263619 263617 3 IVPNVLLEQGK Unmodified 1208.7129 0.71287311 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;H0YIC4 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.98 74.98 2 2.2655E-05 76860 QUIQUE_C1218_190116_001 163.32 152.15 13072000000 1194900000 970760000 894430000 861980000 935060000 812240000 987100000 1179200000 1129500000 427980000 1360700000 1266000000 1052300000 22868 612 21489 206084;206085;206086;206087;206088;206089;206090;206091;206092;206093;206094;206095;206096 263620;263621;263622;263623;263624;263625;263626;263627;263628;263629;263630;263631;263632;263633;263634;263635;263636;263637;263638;263639;263640;263641;263642;263643;263644;263645;263646;263647;263648;263649;263650;263651;263652;263653;263654;263655;263656;263657;263658;263659;263660;263661;263662;263663 263622 44 IVPVDIYIPGCPPTAEALLYGILQLQR Unmodified 3008.6409 0.64090072 1619 O75251 NDUFS7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 174.06 174.06 2;3 4.0163E-24 181232 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.387 93.024 812400000 0 0 0 0 25938000 0 324430000 50351000 140430000 0 169470000 33183000 68595000 22869 1619 21490 206097;206098;206099;206100;206101;206102;206103;206104;206105 263664;263665;263666;263667;263668;263669;263670;263671;263672;263673 263670 10 IVPVEITISLLK Unmodified 1323.8377 0.83773927 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.17 140.17 2 0.00055081 147148 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.24 39.228 2479200000 154500000 159350000 243560000 119120000 141010000 161740000 172440000 261610000 373400000 0 279440000 199250000 213830000 22870 2306 21491 206106;206107;206108;206109;206110;206111;206112;206113;206114;206115;206116;206117 263674;263675;263676;263677;263678;263679;263680;263681;263682;263683;263684;263685;263686;263687;263688;263689;263690;263691;263692;263693;263694;263695;263696 263692 23 IVPVEITISLLKR Unmodified 1479.9389 0.9388503 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 0 1 1 119.05 119.05 3 0.024165 125364 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.487 32.446 19575000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19575000 0 0 22871 2306 21492 206118 263697 263697 1 IVQAEGEAEAAK Unmodified 1214.6143 0.61428128 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.929 19.929 2 2.9925E-06 12369 QUIQUE_C1277_190116_001 137.98 83.819 11531000000 1158500000 769460000 1029100000 968230000 810620000 667610000 1117000000 729430000 867540000 387880000 973810000 969310000 1082100000 22872 1272 21493 206119;206120;206121;206122;206123;206124;206125;206126;206127;206128;206129;206130;206131 263698;263699;263700;263701;263702;263703;263704;263705;263706;263707;263708;263709;263710 263699 13 IVQATTLLTMDK Unmodified 1332.7323 0.73228792 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;A8MQ02;H0YA98 MLLT4 Afadin yes no 0 0 0 1 1 1 89.078 89.078 2 0.0021688 91454 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.456 46.11 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22873 1258 21494 206132;206133;206134 263711;263712;263713 263711 3 IVQEFGK Unmodified 819.44905 0.44905385 1739 O95630;C9JK83;F5H5B9 STAMBP STAM-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.675 23.675 2 0.035909 16667 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.512 32.991 280620000 0 37743000 0 0 32919000 32683000 0 41809000 29982000 20294000 34942000 0 50250000 22874 1739 21495 206135;206136;206137;206138;206139;206140;206141;206142 263714;263715;263716;263717;263718;263719;263720;263721 263721 8 IVQELPQLLDAR Unmodified 1393.7929 0.79291434 195 A0A0R4J2G3;A0A0A0MTJ9;Q6PIU2 NCEH1 Neutral cholesterol ester hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 105.18 105.18 2 0.0029513 107553 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.499 42.078 258950000 59339000 0 51517000 0 0 35943000 0 47534000 0 0 0 0 64619000 22875 195 21496 206143;206144;206145;206146;206147 263722;263723;263724;263725;263726;263727;263728 263727 4 IVQFSPSGK Unmodified 961.52328 0.52328142 2140 P19021;H7BYD9 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 33.778 33.778 2 0.00046932 28401 QUIQUE_C1368_190116_001 116.25 46.818 224740000 31990000 41896000 44280000 40913000 0 0 34377000 0 0 0 0 31283000 0 22876 2140 21497 206148;206149;206150;206151;206152;206153;206154;206155;206156;206157;206158 263729;263730;263731;263732;263733;263734;263735;263736;263737;263738;263739 263731 11 IVQIPFCGEIDCEDWIKK Unmodified 2249.0861 0.086061175 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 120.27 120.27 3;4 0.0023322 131764 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.314 39.82 386870000 0 0 35287000 0 0 0 81299000 0 61037000 0 75831000 62990000 70423000 22877 1929 21498 206159;206160;206161;206162;206163;206164;206165 263740;263741;263742;263743;263744;263745;263746;263747 263743 8 IVQLGGSNAQR Unmodified 1141.6204 0.62036971 3289 Q5R3I4;H7C089 TTC38 Tetratricopeptide repeat protein 38 yes no 0 0 0 1 1 23.04 23.04 2 0.043381 16609 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.216 27.336 101950000 0 0 0 0 0 0 0 0 39546000 0 62403000 0 0 22878 3289 21499 206166;206167 263748;263749 263749 0 IVQLLAGVADQTK Unmodified 1354.782 0.78201531 1655 O75746;F8W9J0;H0YFB2;B4DGK6 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 1 2 1 1 1 3 2 2 1 88.437 88.437 2;3 4.6293E-08 89672 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.78 61.679 2918500000 268750000 293340000 224110000 221350000 146900000 199770000 207230000 173080000 204020000 189570000 326820000 238270000 225270000 22879 1655 21500 206168;206169;206170;206171;206172;206173;206174;206175;206176;206177;206178;206179;206180;206181;206182;206183;206184;206185;206186;206187 263750;263751;263752;263753;263754;263755;263756;263757;263758;263759;263760;263761;263762;263763;263764;263765;263766;263767;263768;263769;263770;263771;263772;263773 263761 23 IVQMTEAEVR Oxidation (M) 1190.5965 0.59652272 2740 P62140;C9J9S3;C9JP48 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.841 20.841 2 0.00017421 14007 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.13 102.14 522460000 59374000 91144000 78292000 0 0 0 0 38471000 64235000 35387000 85694000 0 69860000 22880 2740 21501 206188;206189;206190;206191;206192;206193;206194;206195 263774;263775;263776;263777;263778;263779;263780;263781 263779 2172 8 IVQMTEAEVR Unmodified 1174.6016 0.6016081 2740 P62140;C9J9S3;C9JP48 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.182 42.182 2 2.455E-08 39770 QUIQUE_C1218_190116_001 157.91 70.588 2708600000 304250000 261130000 237270000 250890000 215980000 0 205090000 272110000 210460000 101700000 243410000 250990000 155370000 22881 2740 21501 206196;206197;206198;206199;206200;206201;206202;206203;206204;206205;206206;206207 263782;263783;263784;263785;263786;263787;263788;263789;263790;263791;263792;263793;263794;263795;263796;263797 263782 16 IVQNAIIQTIGFFGSNLPDYQR Unmodified 2493.3016 0.30160833 353 A0A1B0GUZ7;Q14156 EFR3A Protein EFR3 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 165.19 165.19 3 2.5855E-05 170461 QUIQUE_C1368_190116_001 39.659 38.347 11587000 0 0 11587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22882 353 21502 206208;206209;206210 263798;263799;263800 263798 3 IVQQIAILMGCAILPHLR Unmodified 2045.1642 0.16419234 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 153.53 153.53 3 0.00018331 158743 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.485 64.775 117240000 0 0 0 0 0 0 0 20004000 19187000 0 33908000 25409000 18728000 22883 1644 21503 206211;206212;206213;206214;206215 263801;263802;263803;263804;263805;263806 263803 5 IVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGK Unmodified 2889.4331 0.43309279 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 96.023 96.023 3 2.9352E-11 97771 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.944 76.62 132500000 0 0 0 0 0 0 0 45226000 0 0 0 38204000 49075000 22884 1242;2047 21504 206216;206217;206218;206219 263807;263808;263809;263810;263811 263807 5 IVQVALNGLENILR Unmodified 1550.9144 0.91442646 1587;2604 P52294;O60684;O15131 KPNA1;KPNA6;KPNA5 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed;Importin subunit alpha-7;Importin subunit alpha-6 no no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 1 1 140.79 140.79 2;3 1.7614E-06 146678 QUIQUE_C1218_190116_001 116.55 92.56 805170000 63092000 100700000 72527000 0 110310000 0 65656000 105160000 0 51401000 94395000 141940000 0 22885 2604;1587 21505 206220;206221;206222;206223;206224;206225;206226;206227;206228;206229;206230;206231;206232;206233;206234 263812;263813;263814;263815;263816;263817;263818;263819;263820;263821;263822;263823;263824;263825;263826 263813 12 IVQVVTAEAVAVLK Unmodified 1438.8759 0.87591569 2009 P11137;E7EV03;H7BZB9 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 3 2 1 2 1 3 1 1 1 1 1 2 2 109.67 109.67 2;3 8.0104E-05 113015 QUIQUE_C1403_190116_001 115.57 88.27 1769200000 168380000 190620000 119740000 174150000 103900000 215380000 56722000 235160000 134890000 51236000 111550000 70143000 137300000 22886 2009 21506 206235;206236;206237;206238;206239;206240;206241;206242;206243;206244;206245;206246;206247;206248;206249;206250;206251;206252;206253;206254;206255 263827;263828;263829;263830;263831;263832;263833;263834;263835;263836;263837;263838;263839;263840;263841;263842;263843;263844;263845;263846;263847;263848;263849;263850;263851;263852;263853;263854;263855;263856;263857;263858;263859;263860;263861;263862;263863;263864;263865;263866;263867;263868 263839 41 IVQVVTAEAVAVLKGEQEK Unmodified 2010.1361 0.13610614 2009 P11137;E7EV03;H7BZB9 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 1 108.53 108.53 3 0.011581 110600 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.188 44.369 41475000 0 0 0 0 0 0 0 41475000 0 0 0 0 0 22887 2009 21507 206256;206257 263869;263870 263869 1 IVRCHEHTEILTVSGELLFFR Unmodified 2555.3319 0.33186261 485 A0A3B3IRV3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 76.216 76.216 3;4 0.0091667 77082 QUIQUE_C1277_190116_001 38.824 14.23 529440000 0 81823000 213480000 0 0 68794000 0 0 0 0 165340000 0 0 22888 485 21508 206258;206259;206260;206261 263871;263872;263873;263874 263871 4 IVSAGEQQSPQPVSSALSWPITGGR Unmodified 2551.3031 0.3030649 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 2 119.6 119.6 2;3 6.776E-14 124002 QUIQUE_C1368_190116_001 115.15 104.1 1024100000 0 49121000 41775000 0 0 98109000 132740000 118360000 161200000 0 172880000 98973000 150930000 22889 57 21509 206262;206263;206264;206265;206266;206267;206268;206269;206270;206271;206272;206273;206274;206275 263875;263876;263877;263878;263879;263880;263881;263882;263883;263884;263885;263886;263887;263888;263889;263890;263891;263892 263876 17 IVSCGNAIIAELLR Unmodified 1527.8443 0.84429799 2942 Q12768 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 139.44 139.44 2 0.00033439 142936 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.47 64.943 120180000 0 0 22844000 0 0 0 34082000 28254000 0 0 0 34996000 0 22890 2942 21510 206276;206277;206278;206279 263893;263894;263895;263896 263895 2 IVSGEAESVEVTPENLQDFVGKPVFTVER Unmodified 3174.6085 0.6084742 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ERR6 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.37 138.37 3 9.0237E-66 143986 QUIQUE_C1218_190116_001 157.11 149.21 2341500000 178040000 140580000 214690000 137990000 157960000 188400000 191150000 179360000 0 54285000 309460000 279650000 309960000 22891 1324 21511 206280;206281;206282;206283;206284;206285;206286;206287;206288;206289;206290;206291 263897;263898;263899;263900;263901;263902;263903;263904;263905;263906;263907;263908 263897 12 IVSGIITPIHEQWEK Unmodified 1748.9461 0.94612052 3288 Q5QPM7;Q92530;Q5QPM9 PSMF1 Proteasome inhibitor PI31 subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 3 1 1 1 83.702 83.702 2;3 1.4707E-06 84748 QUIQUE_C1403_190116_001 101.36 90.095 3127200000 226030000 206150000 240570000 230270000 248930000 205450000 233380000 253920000 294280000 101550000 297450000 254900000 334330000 22892 3288 21512 206292;206293;206294;206295;206296;206297;206298;206299;206300;206301;206302;206303;206304;206305;206306;206307 263909;263910;263911;263912;263913;263914;263915;263916;263917;263918;263919;263920;263921;263922;263923;263924;263925;263926;263927;263928 263913 19 IVSLFAEHNDLQYAAPGGLIGVGTK Unmodified 2569.354 0.35403784 2432 P41091;Q2VIR3 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 129.99 129.99 2;3 1.8874E-07 134176 QUIQUE_C1277_190116_001 58.272 53.822 1291200000 178180000 208080000 267650000 226850000 0 174150000 236250000 0 0 0 0 0 0 22893 2432 21513 206308;206309;206310;206311;206312;206313;206314 263929;263930;263931;263932;263933;263934;263935 263930 6 IVSLPECFNSPYGAK Unmodified 1680.8181 0.81814282 4256 Q9NQR4;H7C579;F8WF70 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.218 99.218 2 1.1454E-05 102044 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.72 93.165 2186200000 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P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 113.02 113.02 2 0.00045682 114531 QUIQUE_C1563_190116_001 93.058 74.278 1018400000 39459000 96779000 93862000 65651000 98050000 88210000 95452000 34350000 105430000 41773000 56993000 108860000 93543000 22897 2658 21517 206330;206331;206332;206333;206334;206335;206336;206337;206338;206339;206340;206341;206342;206343;206344;206345;206346;206347;206348;206349;206350;206351 263955;263956;263957;263958;263959;263960;263961;263962;263963;263964;263965;263966;263967;263968;263969;263970;263971;263972;263973;263974;263975;263976;263977 263964 2098 20 IVSQLLTLMDGLK Unmodified 1429.8214 0.82143728 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 151.43 151.43 2;3 9.2656E-12 147508 QUIQUE_DMIX4_190116_001 178.81 122.08 11095000000 686120000 943340000 1190800000 746090000 1181000000 886350000 863730000 756460000 795300000 862030000 797670000 599270000 786770000 22898 2658 21517 206352;206353;206354;206355;206356;206357;206358;206359;206360;206361;206362;206363;206364;206365;206366;206367;206368;206369;206370;206371;206372;206373;206374;206375;206376;206377;206378;206379 263978;263979;263980;263981;263982;263983;263984;263985;263986;263987;263988;263989;263990;263991;263992;263993;263994;263995;263996;263997;263998;263999;264000;264001;264002;264003;264004;264005;264006;264007;264008;264009;264010;264011;264012;264013;264014;264015;264016;264017;264018 264008 39 IVSQPQPAR Unmodified 994.55598 0.55597854 3545 Q8IX12;A0A0C4DGG8;F5H1H2;F5H2E6;F5H3E1 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.88 14.88 2 0.0013644 6322 QUIQUE_C1563_190116_001 104.37 53.4 319490000 33222000 44267000 0 0 30509000 34435000 26686000 27728000 35217000 0 25700000 33970000 27755000 22899 3545 21518 206380;206381;206382;206383;206384;206385;206386;206387;206388;206389;206390;206391;206392 264019;264020;264021;264022;264023;264024;264025;264026;264027;264028;264029;264030;264031 264024 13 IVSRPEELR Unmodified 1097.6193 0.61930707 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 1 1 1 1 21.078 21.078 3 0.014943 14680 QUIQUE_C1218_190116_001 61.48 39.436 141240000 60664000 0 0 49960000 0 0 0 0 0 0 30613000 0 0 22900 2527 21519 206393;206394;206395 264032;264033;264034 264032 3 IVSRPEELREDDVGTGAGLLEIK Unmodified 2495.3231 0.32313164 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 90.73 90.73 3;4 1.2299E-62 93488 QUIQUE_C1576_190116_001 163.72 140.27 5637300000 659080000 463280000 214620000 469310000 705270000 436570000 527820000 190000000 136770000 302850000 723210000 398910000 409550000 22901 2527 21520 206396;206397;206398;206399;206400;206401;206402;206403;206404;206405;206406;206407;206408;206409;206410;206411;206412;206413;206414;206415;206416;206417;206418 264035;264036;264037;264038;264039;264040;264041;264042;264043;264044;264045;264046;264047;264048;264049;264050;264051;264052;264053;264054;264055;264056;264057;264058;264059;264060;264061;264062;264063;264064;264065;264066;264067;264068;264069;264070 264051 31 IVSSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVK Unmodified 2849.4164 0.41636332 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 3 2 167.69 167.69 2;3 8.096E-46 171284 QUIQUE_C1277_190116_001 98.299 92.004 1933300000 182890000 192750000 157860000 39238000 51769000 111460000 60799000 76356000 365390000 8279400 143940000 330260000 212290000 22902 1749 21521 206419;206420;206421;206422;206423;206424;206425;206426;206427;206428;206429;206430;206431;206432;206433;206434;206435;206436;206437;206438;206439 264071;264072;264073;264074;264075;264076;264077;264078;264079;264080;264081;264082;264083;264084;264085;264086;264087;264088;264089;264090;264091;264092 264074 21 IVSSSDVGHDEYSTQSLVK Unmodified 2049.9855 0.98547873 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 58.248 58.248 2;3 1.0469E-241 56886 QUIQUE_DMIX3_190116_001 273.38 264.79 41832000000 3417900000 4148600000 3131300000 3461500000 3777600000 3474300000 2920300000 3417500000 3530600000 1605500000 3607500000 3284200000 2054800000 22903 2851 21522 206440;206441;206442;206443;206444;206445;206446;206447;206448;206449;206450;206451;206452;206453;206454;206455;206456;206457;206458;206459;206460;206461;206462;206463;206464;206465 264093;264094;264095;264096;264097;264098;264099;264100;264101;264102;264103;264104;264105;264106;264107;264108;264109;264110;264111;264112;264113;264114;264115;264116;264117;264118;264119;264120;264121;264122;264123;264124;264125;264126;264127;264128;264129;264130 264117 38 IVSSSDVGHDEYSTQSLVKK Unmodified 2178.0804 0.080441751 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 45.228 45.228 3 7.2709E-07 41983 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.213 59.884 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22904 2851 21523 206466 264131 264131 1 IVSWLEYESSFSNEEAQK Unmodified 2144.9902 0.99022976 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 128.58 128.58 2 7.758E-05 132828 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.295 80.682 77686000 0 0 0 0 0 0 0 0 49908000 0 0 27778000 0 22905 2876 21524 206467;206468;206469;206470 264132;264133;264134;264135 264135 4 IVSWSQVGVEPSIMGIGPIPAIK Unmodified 2377.3079 0.30793927 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 156.61 156.61 2;3 2.9037E-50 163199 QUIQUE_C1438_190116_001 153.09 142.14 2078300000 160440000 201390000 124740000 172160000 156740000 98703000 90095000 194870000 215430000 40047000 285660000 177500000 160530000 22906 4054 21525 206471;206472;206473;206474;206475;206476;206477;206478;206479;206480;206481;206482;206483;206484;206485;206486;206487;206488;206489;206490;206491;206492;206493;206494;206495 264136;264137;264138;264139;264140;264141;264142;264143;264144;264145;264146;264147;264148;264149;264150;264151;264152;264153;264154;264155;264156;264157;264158;264159;264160;264161;264162;264163 264148 26 IVSYQVIGEDNVAVPSHLYK Unmodified 2230.1634 0.16338352 4552 Q9Y2C4 EXOG Nuclease EXOG, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 99.507 99.507 3 0.023229 102667 QUIQUE_C1218_190116_001 29.118 20.299 51844000 51844000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22907 4552 21526 206496 264164 264164 1 IVTDSDSKTEELR Unmodified 1491.7417 0.74166663 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 1 1 22.549 22.549 3 0.049752 15965 QUIQUE_DMIX5_190116_001 30.483 2.5139 47977000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47977000 0 0 22908 4145 21527 206497 264165 264165 1 IVTGGSDNHLILVDLR Unmodified 1720.9472 0.94718315 2359 P34896 SHMT1 Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 91.537 91.537 3 0.00015387 92619 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.285 60.19 37639000 0 0 0 0 0 0 0 37639000 0 0 0 0 0 22909 2359 21528 206498;206499;206500 264166;264167;264168;264169 264169 4 IVTITGPTDAIFK Unmodified 1374.7759 0.7758673 916 E9PFP8;P57721;J3QT27 PCBP3 Poly(rC)-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.82 106.82 2 0.00025066 111872 QUIQUE_C1218_190116_001 112.83 87.448 2031000000 203730000 240110000 183010000 153620000 154760000 170410000 141280000 147690000 153430000 0 185350000 146070000 151510000 22910 916 21529 206501;206502;206503;206504;206505;206506;206507;206508;206509;206510;206511;206512 264170;264171;264172;264173;264174;264175;264176;264177;264178;264179;264180;264181;264182;264183;264184;264185;264186;264187;264188 264170 19 IVTLAPELGR Unmodified 1067.6339 0.63389451 505 A0A3B3IU33;Q9Y303;H3BQ15 AMDHD2 Putative N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase yes no 0 0 0 1 1 1 75.019 75.019 2 0.017729 75918 QUIQUE_C1218_190116_001 61.582 30.508 62042000 26379000 0 0 0 0 0 0 35662000 0 0 0 0 0 22911 505 21530 206513;206514;206515 264189;264190;264191 264189 2 IVTLFSDFKPYK Unmodified 1456.7966 0.79660274 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 102.11 102.11 2;3 0.00041137 105976 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.522 50.393 417060000 24471000 30882000 45896000 32925000 0 0 0 48780000 63868000 26672000 35074000 40428000 68061000 22912 3420 21531 206516;206517;206518;206519;206520;206521;206522;206523;206524;206525;206526 264192;264193;264194;264195;264196;264197;264198;264199;264200;264201;264202 264200 11 IVTLTPFCTIANK Unmodified 1476.801 0.80103619 3428 Q709C8;A0A3B3IU50 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 103.14 103.14 2 0.039744 106686 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.406 31.733 27269000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27269000 22913 3428 21532 206527 264203 264203 1 IVTSASTDLQDYTYYFVPAPWLSVK Unmodified 2863.432 0.43201339 1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1;E9PR62;A0A0G2JRF9;A0A0G2JQA4;A0A0G2JRS3;E9PNC4 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 167.95 167.95 2;3 4.5572E-19 172643 QUIQUE_C1218_190116_001 144.97 139.07 3107200000 211450000 200620000 298010000 213650000 241970000 221640000 250380000 325100000 249710000 41707000 384490000 287110000 181390000 22914 1701 21533 206528;206529;206530;206531;206532;206533;206534;206535;206536;206537;206538;206539;206540;206541;206542;206543;206544;206545;206546;206547;206548;206549;206550;206551;206552 264204;264205;264206;264207;264208;264209;264210;264211;264212;264213;264214;264215;264216;264217;264218;264219;264220;264221;264222;264223;264224;264225;264226;264227;264228;264229;264230;264231;264232;264233 264205 30 IVTSEEVIIR Unmodified 1157.6656 0.66558856 4641 Q9Y639;Q9UFM8;H3BQ94 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.871 59.871 2 3.9139E-05 59753 QUIQUE_C1218_190116_001 170.24 135.43 3273200000 323640000 351120000 267440000 269950000 245700000 228070000 231600000 247040000 232660000 164610000 244370000 227880000 239140000 22915 4641 21534 206553;206554;206555;206556;206557;206558;206559;206560;206561;206562;206563;206564;206565 264234;264235;264236;264237;264238;264239;264240;264241;264242;264243;264244;264245;264246;264247;264248;264249;264250;264251;264252;264253;264254;264255;264256;264257;264258;264259;264260;264261;264262 264235 29 IVTVNSILGIISVPLSIGYCASK Unmodified 2403.3447 0.3447187 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJR8 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 172.05 172.05 3 5.9042E-14 179335 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.92 91.859 171190000 0 0 0 0 0 0 0 25309000 48976000 0 60702000 22394000 13811000 22916 4581 21535 206566;206567;206568;206569;206570 264263;264264;264265;264266;264267;264268 264265 6 IVVAGNNEDVSFSR Unmodified 1505.7474 0.74742071 4109;162 A0A0A0MS29;Q9GZY8;C9JHF5 MFF Mitochondrial fission factor no no 0 0 0 1 69.164 69.164 2 0.00046859 64961 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.658 67.633 12424000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12424000 0 0 0 22917 162;4109 21536 206571 264269 264269 1 IVVAGNNEDVSFSRPADLDLIQSTPFKPLALK Unmodified 3453.8508 0.85077016 4109;162 A0A0A0MS29;Q9GZY8;C9JHF5 MFF Mitochondrial fission factor no no 0 0 2 1 1 1 1 136.51 136.51 4 0.00056194 143147 QUIQUE_C1438_190116_001 36.202 30.827 313180000 0 0 0 0 46588000 0 61730000 0 99174000 0 0 0 105690000 22918 162;4109 21537 206572;206573;206574;206575 264270;264271;264272;264273 264270 4 IVVAMAK Unmodified 730.44113 0.4411317 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 26.234 26.234 2 0.064915 20178 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.994 1.6626 362920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 362920000 0 22919 2305 21538 206576 264274;264275 264274 2 IVVEHIIMKPACPLFVR Unmodified 2021.1318 0.13182958 2683 P57088 TMEM33 Transmembrane protein 33 yes yes 0 0 1 1 1 93.282 93.282 4 0.01075 95427 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.639 44.145 46397000 0 0 0 0 0 0 0 20583000 25815000 0 0 0 0 22920 2683 21539 206577;206578 264276;264277 264277 1 IVVELPHSVNSK Unmodified 1320.7402 0.74015049 3592 Q8N4Q0 ZADH2 Zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 50.641 50.641 3 0.00031778 49513 QUIQUE_C1218_190116_001 83.617 53.81 135900000 32478000 19342000 0 15528000 18624000 0 18251000 0 15297000 0 0 16377000 0 22921 3592 21540 206579;206580;206581;206582;206583;206584;206585;206586 264278;264279;264280;264281;264282;264283;264284;264285 264278 8 IVVFQYSDGK Unmodified 1154.5972 0.59717465 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.307 69.307 2 0.0052095 68354 QUIQUE_C1563_190116_001 78.264 47.76 1000800000 131880000 0 107540000 92721000 109050000 85945000 0 107020000 113920000 0 144370000 0 108340000 22922 3179 21541 206587;206588;206589;206590;206591;206592;206593;206594;206595 264286;264287;264288;264289;264290;264291;264292;264293;264294;264295;264296;264297;264298 264292 13 IVVHCNNNQDFQEWLEQLNR Unmodified 2555.1976 0.19755397 3105 Q15052 ARHGEF6 Rho guanine nucleotide exchange factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 125.44 125.44 3 5.7739E-15 131338 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.4 107.07 349690000 0 0 0 0 0 0 76037000 0 84763000 0 53636000 73096000 62162000 22923 3105 21542 206596;206597;206598;206599;206600;206601 264299;264300;264301;264302;264303;264304;264305 264302 6 IVVHLHPAPPNKEPGPFQSSK Unmodified 2278.2222 0.2222358 3498 Q86VN1;A0A3B3ISW7 VPS36 Vacuolar protein-sorting-associated protein 36 yes no 0 0 1 1 42.341 42.341 4 0.017305 39311 QUIQUE_DMIX3_190116_001 18.947 10.659 43537000 0 0 0 0 0 0 0 0 43537000 0 0 0 0 22924 3498 21543 206602 264306 264306 1 IVVLLQR Unmodified 839.55927 0.559273 2901 Q06323;H0YLU2 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.634 57.634 2 0.024639 55157 QUIQUE_C1563_190116_001 97.64 58.822 3757500000 241880000 211350000 444030000 317430000 349180000 244480000 205720000 277520000 318870000 0 519340000 276040000 351730000 22925 2901 21544 206603;206604;206605;206606;206607;206608;206609;206610;206611;206612;206613;206614 264307;264308;264309;264310;264311;264312;264313;264314;264315;264316;264317;264318;264319;264320 264314 10 IVVNLTGR Unmodified 870.5287 0.52870115 1182;1252 H3BN98;I3L246;I3L3P7;P62244 RPS15A 40S ribosomal protein S15a no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.672 48.672 2 0.0081139 46531 QUIQUE_C1576_190116_001 95.531 28.499 1202600000 0 110800000 138240000 56871000 106870000 0 90758000 120940000 134380000 0 164690000 142810000 136210000 22926 1182;1252 21545 206615;206616;206617;206618;206619;206620;206621;206622;206623;206624 264321;264322;264323;264324;264325;264326;264327;264328;264329;264330 264325 10 IVVPPLPGK Unmodified 918.59024 0.59023878 95 A0A087X0R6;Q9UMY4 SNX12 Sorting nexin-12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.89 67.89 2 0.012464 68825 QUIQUE_C1438_190116_001 71.296 45.846 1182500000 0 124300000 110750000 104550000 112220000 106310000 0 105870000 111880000 44451000 117040000 114850000 130250000 22927 95 21546 206625;206626;206627;206628;206629;206630;206631;206632;206633;206634;206635 264331;264332;264333;264334;264335;264336;264337;264338;264339;264340;264341;264342;264343;264344 264334 14 IVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQR Unmodified 2586.3694 0.36935355 2002 P10644;K7EM13 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 171.45 171.45 2;3 4.0104E-19 172878 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.79 103.89 379650000 30028000 0 11180000 0 43693000 0 0 53015000 166410000 0 0 34866000 40457000 22928 2002 21547 206636;206637;206638;206639;206640;206641;206642;206643 264345;264346;264347;264348;264349;264350;264351;264352;264353;264354 264348 10 IVVVTAGVR Unmodified 912.57565 0.57565135 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 3 2 1 1 1 3 3 1 1 2 3 41.877 41.877 2 3.7239E-09 36277 QUIQUE_DMIX4_190116_001 170.73 84.639 39396000000 3892700000 3056500000 2970600000 2768400000 3577100000 2676200000 2788000000 3439200000 2683700000 2312300000 3235600000 3106300000 2889200000 22929 1915 21548 206644;206645;206646;206647;206648;206649;206650;206651;206652;206653;206654;206655;206656;206657;206658;206659;206660;206661;206662;206663;206664;206665;206666;206667;206668 264355;264356;264357;264358;264359;264360;264361;264362;264363;264364;264365;264366;264367;264368;264369;264370;264371;264372;264373;264374;264375;264376;264377;264378;264379;264380;264381;264382;264383;264384;264385;264386;264387;264388;264389;264390;264391;264392;264393;264394;264395;264396;264397;264398;264399;264400;264401;264402;264403;264404;264405;264406;264407;264408;264409;264410;264411;264412;264413;264414;264415;264416;264417;264418;264419;264420;264421;264422;264423;264424;264425;264426;264427;264428;264429;264430;264431;264432;264433;264434;264435;264436;264437 264417 82 IVVVWVGTNNHGHTAEQVTGGIK Unmodified 2415.2659 0.26589153 3110 Q15102;M0R389;M0QZT2 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 3 2 2 2 69.33 69.33 3;4 6.8207E-31 68523 QUIQUE_DMIX8_190116_001 134.29 126.49 3542500000 272270000 298230000 170980000 119740000 371730000 238300000 0 356450000 341460000 175890000 387400000 442260000 367830000 22930 3110 21549 206669;206670;206671;206672;206673;206674;206675;206676;206677;206678;206679;206680;206681;206682;206683;206684;206685;206686;206687;206688;206689;206690;206691;206692;206693;206694 264438;264439;264440;264441;264442;264443;264444;264445;264446;264447;264448;264449;264450;264451;264452;264453;264454;264455;264456;264457;264458;264459;264460;264461;264462;264463;264464;264465;264466;264467 264465 24 IVVYNQPYINYSR Unmodified 1627.8358 0.83584179 4642 Q9Y646;E5RJA8 CPQ Carboxypeptidase Q yes no 0 0 0 1 84.106 84.106 2 0.0099309 86103 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.297 47.384 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22931 4642 21550 206695 264468 264468 1 IVWLQEK Unmodified 914.52255 0.52255314 2615 P52888;K7EKB6 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 1 63.553 63.553 2 0.030492 62280 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.661 41.303 61444000 0 0 0 0 0 0 0 0 35614000 25830000 0 0 0 22932 2615 21551 206696;206697 264469;264470;264471 264470 3 IVWVCDGR Unmodified 1003.4909 0.49093544 204 A0A0A6YYL4;P57737 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 0 1 1 57.712 57.712 2 0.020103 57316 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.282 35.63 90440000 0 0 0 0 0 43327000 0 0 0 0 47113000 0 0 22933 204 21552 206698;206699 264472;264473 264473 2 IVYCTMEVEGGEK Unmodified 1513.6793 0.67926607 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.634 85.634 2;3 0.00040816 57728 QUIQUE_C1218_190116_001 95.81 68.712 209660000 55171000 0 27277000 0 17694000 49054000 31375000 0 0 29086000 0 0 0 22934 981;4494 21553 206700;206701;206702;206703;206704;206705;206706;206707 264474;264475;264476;264477;264478;264479;264480;264481;264482 264474 9 IVYGHLDDPASQEIER Unmodified 1840.8955 0.89554151 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 65.968 65.968 2;3 1.8747E-54 67007 QUIQUE_C1218_190116_001 225.63 198.96 32939000000 2886800000 2683800000 2479900000 1873600000 2086300000 2368400000 3104100000 2162000000 2850600000 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alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 141.99 141.99 2 5.7924E-23 145843 QUIQUE_C1403_190116_001 146.16 136.1 27696000 0 0 0 27696000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22937 2897 21556 206736 264534 264534 1 IVYPTEK Unmodified 848.46437 0.46436956 3087 Q14847;F6S2S5;K7ESD6 LASP1 LIM and SH3 domain protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.778 24.778 2 0.020425 18813 QUIQUE_C1218_190116_001 108.24 75.267 2989900000 389600000 356980000 382500000 0 0 298020000 0 375080000 0 133830000 464520000 0 589370000 22938 3087 21557 206737;206738;206739;206740;206741;206742;206743;206744 264535;264536;264537;264538;264539;264540;264541;264542;264543;264544;264545 264535 11 IVYVNEK Unmodified 863.47527 0.4752686 2113 P16870;D6RF88;C9JE88;D6R930 CPE Carboxypeptidase E yes no 0 0 0 1 1 1 21.818 21.818 2 0.033929 15214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.029 50.383 471670000 0 0 0 0 0 0 0 0 172020000 0 58020000 241620000 0 22939 2113 21558 206745;206746;206747 264546;264547;264548 264546 3 IVYYLMNIHVQPR Unmodified 1644.881 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264583;264584;264585;264586;264587;264588;264589;264590;264591;264592;264593;264594;264595;264596;264597;264598;264599;264600;264601;264602;264603;264604;264605;264606;264607;264608;264609;264610;264611;264612;264613;264614;264615;264616;264617;264618;264619;264620;264621;264622;264623;264624;264625 264608 41 IWCFGPDGTGPNILTDITK Unmodified 2104.0299 0.029926505 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.5 152.5 2 1.3463E-45 157912 QUIQUE_C1368_190116_001 188.13 170.92 2367400000 220210000 218880000 304650000 297210000 230620000 224270000 206890000 93249000 138400000 74417000 203730000 0 154900000 22943 2058 21562 206797;206798;206799;206800;206801;206802;206803;206804;206805;206806;206807;206808 264626;264627;264628;264629;264630;264631;264632;264633;264634;264635;264636;264637;264638;264639;264640;264641 264628 16 IWCSDPSPGIVAFPR Unmodified 1700.8345 0.83446158 3184 Q16620 NTRK2 BDNF/NT-3 growth factors receptor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 113.51 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2449 P42566;B1AUU8;S4R3U1 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 0 0 0 1 1 78.48 78.48 2 0.030337 78940 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.841 47.62 21606000 0 21606000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22946 2449 21565 206832;206833 264674;264675 264675 2 IWDLEGK Unmodified 859.44397 0.44396847 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;H0Y8W2;D6REE5;H0YAM7;D6RF23;H0Y9P0 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 64.534 64.534 2 0.019688 65018 QUIQUE_C1218_190116_001 110.61 10.545 1548200000 231800000 251590000 312100000 230810000 0 0 0 0 199320000 93544000 0 229070000 0 22947 2787 21566 206834;206835;206836;206837;206838;206839;206840 264676;264677;264678;264679;264680;264681;264682;264683 264676 8 IWDLNMENRPVETYQVHEYLR Unmodified 2704.3068 0.30677007 2781 P63151;E5RFR9 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes no 0 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IWDLQAGADR Unmodified 1143.5673 0.5672715 204 A0A0A6YYL4;P57737 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 71.535 71.535 2 0.023562 71053 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.916 23.653 79236000 0 42160000 0 0 0 0 0 37076000 0 0 0 0 0 22950 204 21568 206867;206868;206869 264717;264718;264719 264719 3 IWDMTPVVGCSLATGFSPH Unmodified 2073.9652 0.96521776 3536 Q8IWB7 WDFY1 WD repeat and FYVE domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 147.07 147.07 2 0.00049543 152066 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.898 91.528 632140000 0 0 178530000 0 0 0 193680000 0 67843000 0 102530000 89557000 0 22951 3536 21569 206870;206871;206872;206873;206874 264720;264721;264722;264723;264724;264725 264725 6 IWDTTQK Unmodified 890.44978 0.44978213 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 23.417 23.417 2 0.019281 16607 QUIQUE_C1403_190116_001 113.85 40.806 1409700000 0 0 86013000 315890000 0 0 0 320990000 0 324610000 0 362240000 0 22952 1609 21570 206875;206876;206877;206878;206879 264726;264727;264728;264729;264730 264727 5 IWDTTQKEHLLK Unmodified 1510.8144 0.81437807 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 3 2 2 1 1 39.169 39.169 2;3;4 6.9134E-09 34445 QUIQUE_DMIX8_190116_001 154.24 110.47 1065200000 0 0 0 0 0 0 0 565820000 158830000 0 205560000 48676000 86335000 22953 1609 21571 206880;206881;206882;206883;206884;206885;206886;206887;206888 264731;264732;264733;264734;264735;264736;264737;264738;264739;264740 264739 7 IWDVSVNSVVSTFPMGSTVLDQQLGCLWQK Unmodified 3393.6737 0.67373377 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 170.92 170.92 3 7.988E-56 178309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 140.09 131.5 318430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 195050000 123380000 0 22954 1609 21572 206889;206890 264741;264742 264741 2 IWDVVEK Unmodified 887.47527 0.4752686 1803 P01024;CON__Q2UVX4 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 58.507 58.507 2 0.063019 53938 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.981 28.762 59593000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59593000 0 0 0 22955 1803 21573 206891 264743;264744 264743 2 IWEIPEGGLKR Unmodified 1296.719 0.71902112 4526 Q9UQ03 CORO2B Coronin-2B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 72.688 72.688 2;3 0.00036286 73045 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.652 57.45 1617000000 0 52119000 69873000 40229000 63237000 0 64972000 247950000 260070000 0 290320000 275690000 252570000 22956 4526 21574 206892;206893;206894;206895;206896;206897;206898;206899;206900;206901;206902;206903;206904;206905;206906;206907;206908 264745;264746;264747;264748;264749;264750;264751;264752;264753;264754;264755;264756;264757;264758;264759;264760;264761;264762;264763;264764;264765;264766 264753 22 IWEQIQPDLHTNDECVATYK Unmodified 2459.1427 0.14272443 2950 Q12904 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.496 93.496 3 1.0627E-30 95163 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.11 106.48 818000000 68902000 73586000 78112000 74040000 65566000 68053000 71662000 67450000 0 33383000 76427000 62337000 78482000 22957 2950 21575 206909;206910;206911;206912;206913;206914;206915;206916;206917;206918;206919;206920 264767;264768;264769;264770;264771;264772;264773;264774;264775;264776;264777;264778;264779;264780 264775 14 IWEVELINVLK Unmodified 1354.786 0.78603805 1160 H0YI72;Q7Z6G8 ANKS1B Ankyrin repeat and sterile alpha motif domain-containing protein 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 149.58 149.58 2 0.0011548 152448 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.247 45.112 72043000 19619000 17070000 12049000 0 0 0 13183000 10120000 0 0 0 0 0 22958 1160 21576 206921;206922;206923;206924;206925 264781;264782;264783;264784;264785 264785 3 IWGDCTVR Unmodified 1005.4702 0.4702 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 44.853 44.853 2 0.018737 42404 QUIQUE_C1576_190116_001 79.469 65.056 457790000 0 0 117970000 0 0 0 143580000 67216000 0 0 0 0 129030000 22959 2534 21577 206926;206927;206928;206929 264786;264787;264788;264789;264790 264788 5 IWGEDLR Unmodified 887.45012 0.45011648 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.026 64.026 2 0.019293 62840 QUIQUE_C1368_190116_001 114.02 75.205 389340000 0 0 80321000 96167000 0 0 0 0 0 38537000 71680000 0 102630000 22960 2465 21578 206930;206931;206932;206933;206934 264791;264792;264793;264794;264795;264796 264791 6 IWHHSFYNELR Unmodified 1500.7262 0.72623176 2759 P62736;P63267;C9JFL5;F6UVQ4;F6QUT6 ACTA2;ACTG2 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle yes no 0 0 0 2 3 3 3 2 2 3 3 3 3 3 3 2 47.019 47.019 2;3;4 3.885E-21 45116 QUIQUE_C1277_190116_001 152.07 136.53 21321000000 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Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;POTE ankyrin domain family member F;POTE ankyrin domain family member J;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 0 11 10 12 11 6 8 15 8 8 8 9 11 11 52.034 52.034 2;3;4 7.1495E-47 42788 QUIQUE_DMIX8_190116_001 177.44 156.49 303540000000 26632000000 16883000000 33808000000 24721000000 15514000000 20754000000 33599000000 13169000000 23662000000 7024300000 34327000000 30136000000 23311000000 22962 447;548;1333;2696;2788;2792;526;1984;3401 21580 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265165 341 IWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPK Unmodified 3451.7677 0.76770923 2792;548 A6NL76;P68032;P68133 ACTA1;ACTC1 Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 1 1 2 1 1 1 111.99 111.99 4;5 3.4018E-05 115743 QUIQUE_C1563_190116_001 46.399 36.429 492380000 0 0 144050000 0 135780000 52831000 121340000 0 0 0 0 38389000 0 22963 548;2792 21581 207098;207099;207100;207101;207102;207103 265192;265193;265194;265195;265196;265197 265195 4 IWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEATLNPK Unmodified 3453.7834 0.78335929 526 A5A3E0 POTEF POTE ankyrin domain family member F yes yes 0 0 1 1 111.59 111.59 5 0.036303 115954 QUIQUE_C1368_190116_001 31.41 27.917 54303000 0 0 54303000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22964 526 21582 207104 265198 265198 0 IWHSSTYR Unmodified 1048.509 0.50902834 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 17.518 17.518 2;3 0.0023231 9761 QUIQUE_C1277_190116_001 85.161 68.958 566780000 0 94315000 29415000 44249000 30977000 76845000 25421000 105150000 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265250;265251;265252;265253;265254;265255;265256;265257;265258;265259 265252 10 IWPYVYAFLQTK Unmodified 1527.8126 0.81258715 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 151.74 151.74 2;3 0.0070279 156253 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.48 52.198 121300000 36792000 0 0 0 50840000 33673000 0 0 0 0 0 0 0 22973 4450 21591 207164;207165;207166;207167;207168;207169 265260;265261;265262;265263;265264;265265 265265 6 IWPYVYTLFSNK Unmodified 1529.7919 0.79185171 2259 P27144;D3DQ64 AK4 Adenylate kinase 4, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.71 147.71 2 0.0023187 154004 QUIQUE_C1576_190116_001 75.652 57.788 723150000 0 0 0 0 0 0 76251000 120760000 135800000 0 123430000 125480000 141420000 22974 2259 21592 207170;207171;207172;207173;207174;207175 265266;265267;265268;265269;265270;265271;265272;265273;265274;265275;265276 265266 11 IWQEEVSR Unmodified 1045.5193 0.51925868 2942 Q12768;E7EQI7 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes no 0 0 0 1 1 1 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Q9NQW7;Q5T6H7;Q5T6H2;Q5T6H3 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.325 20.325 3 0.012652 12799 QUIQUE_C1563_190116_001 71.501 42.352 731440000 143830000 0 0 143040000 141750000 105570000 123010000 0 0 0 74237000 0 0 22980 4259 21598 207208;207209;207210;207211;207212;207213 265315;265316;265317;265318;265319;265320 265318 6 IWTHPGWSPLK Unmodified 1320.6979 0.69789175 1512 O43172 PRPF4 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 73.696 73.696 3 0.00060286 73645 QUIQUE_C1277_190116_001 67.385 49.326 109980000 26247000 32454000 0 0 0 0 0 18616000 0 0 0 32658000 0 22981 1512 21599 207214;207215;207216;207217 265321;265322;265323;265324 265322 4 IWTSYTEYVFCR Unmodified 1623.7392 0.73916421 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 0 1 125.65 125.65 2 0.017723 130812 QUIQUE_C1576_190116_001 60.398 45.707 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22982 3827 21600 207218 265325 265325 1 IWTSYTEYVFCRE Unmodified 1752.7818 0.78175731 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 1 1 1 126.76 126.76 2 0.0023416 130803 QUIQUE_C1368_190116_001 84.658 57.985 30062000 0 0 0 30062000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22983 3827 21601 207219;207220 265326;265327 265326 2 IWVYDVGELAVPHNDEWTR Unmodified 2298.1069 0.10693127 1435 O14576 DYNC1I1 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 136.43 136.43 2;3 3.1926E-10 141032 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.86 109.38 365480000 0 121510000 0 0 0 0 176580000 0 0 48449000 0 0 18949000 22984 1435 21602 207221;207222;207223;207224;207225;207226;207227 265328;265329;265330;265331;265332;265333;265334 265331 6 IWYLLDGK Unmodified 1006.5488 0.54876789 4072 Q9BYD1;E5RFI2 MRPL13 39S ribosomal protein L13, mitochondrial yes no 0 0 0 1 109.81 109.81 2 0.020421 113200 QUIQUE_C1277_190116_001 76.774 61.335 10265000 0 10265000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22985 4072 21603 207228 265335 265335 1 IYADTFGDINYQEFAK Unmodified 1893.8785 0.87849447 3099 Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.59 126.59 2 5.6307E-10 130300 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.24 94.273 444190000 53124000 51609000 54643000 47290000 0 48407000 58278000 58021000 0 24979000 0 0 47841000 22986 3099 21604 207229;207230;207231;207232;207233;207234;207235;207236;207237;207238;207239 265336;265337;265338;265339;265340;265341;265342;265343;265344;265345;265346 265345 11 IYAEDPSNNFMPVAGPLVHLSTPR Unmodified 2624.3057 0.30570743 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8;G5E9X5 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 127.1 127.1 3 1.0498E-08 131688 QUIQUE_C1368_190116_001 78.717 75.517 456960000 53592000 72078000 77264000 73393000 0 62522000 0 0 63722000 0 0 54391000 0 22987 3933 21605 207240;207241;207242;207243;207244;207245;207246 265347;265348;265349;265350;265351;265352;265353;265354;265355;265356 265351 9 IYAEDPSNNFMPVAGPLVHLSTPR Oxidation (M) 2640.3006 0.30062206 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8;G5E9X5 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 110.92 110.92 3 5.1174E-05 114842 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.426 46.622 31058000 0 0 0 0 0 0 0 0 31058000 0 0 0 0 22988 3933 21605 207247 265357 265357 2779 1 IYAGTGALEGK Unmodified 1078.5659 0.56587452 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.453 38.453 2 0.004995 33983 QUIQUE_C1368_190116_001 70.028 31.237 811170000 247280000 0 183180000 0 0 0 0 144680000 0 0 0 236030000 0 22989 723 21606 207248;207249;207250;207251;207252;207253;207254 265358;265359;265360;265361;265362;265363;265364 265359 6 IYAMGGGSYGK Unmodified 1102.5117 0.51173046 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 0 1 40.639 40.639 2 0.048386 36787 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.022 27.044 29976000 0 0 0 0 0 0 0 29976000 0 0 0 0 0 22990 4143 21607 207255 265365 265365 1 IYAMHWGTDSR Oxidation (M) 1351.5979 0.5979197 2767;2769 P62873;F6UT28;B1AKQ8;F6X3N5;P62879;C9JXA5;E7EP32;C9JIS1;C9JZN1 GNB1;GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 no no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 31.44 31.44 2;3 0.0006045 27580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.82 70.866 10741000000 1090800000 1129800000 821150000 674290000 630870000 656460000 803040000 595770000 803150000 415570000 1232700000 816390000 1070700000 22991 2767;2769 21608 207256;207257;207258;207259;207260;207261;207262;207263;207264;207265;207266;207267;207268;207269;207270;207271;207272;207273;207274;207275;207276;207277;207278;207279;207280;207281 265366;265367;265368;265369;265370;265371;265372;265373;265374;265375;265376;265377;265378;265379;265380;265381;265382;265383;265384;265385;265386;265387;265388;265389;265390;265391;265392;265393 265381 2197 25 IYAMHWGTDSR Unmodified 1335.603 0.60300508 2767;2769 P62873;F6UT28;B1AKQ8;F6X3N5;P62879;C9JXA5;E7EP32;C9JIS1;C9JZN1 GNB1;GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 55.42 55.42 2;3 1.8651E-05 54471 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.45 125.24 57060000000 4480000000 5583500000 5769600000 4828300000 4019900000 4424600000 5780000000 3105700000 3439200000 1575400000 5542400000 4005900000 4505200000 22992 2767;2769 21608 207282;207283;207284;207285;207286;207287;207288;207289;207290;207291;207292;207293;207294;207295;207296;207297;207298;207299;207300;207301;207302;207303;207304;207305;207306;207307 265394;265395;265396;265397;265398;265399;265400;265401;265402;265403;265404;265405;265406;265407;265408;265409;265410;265411;265412;265413;265414;265415;265416;265417;265418;265419;265420;265421;265422;265423;265424;265425;265426;265427;265428;265429;265430;265431;265432;265433;265434;265435;265436;265437;265438;265439;265440;265441;265442;265443 265423 50 IYAMHWGYDSR Unmodified 1397.6187 0.61865515 4207 Q9HAV0;C9JD14 GNB4 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 70.249 70.249 2;3 0.0063386 70229 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.692 44.606 1401900000 136090000 180540000 149140000 108410000 98672000 77439000 141430000 0 126400000 74443000 151770000 115510000 42063000 22993 4207 21609 207308;207309;207310;207311;207312;207313;207314;207315;207316;207317;207318;207319;207320;207321;207322;207323 265444;265445;265446;265447;265448;265449;265450;265451;265452;265453;265454;265455;265456;265457;265458;265459;265460;265461;265462 265459 18 IYANFFPYGDASK Unmodified 1491.7034 0.70343063 2407;2826 P37235;E9PC71;P84074 HPCAL1;HPCA Hippocalcin-like protein 1;Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 108.36 108.36 2 0.0025987 112149 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.781 66.808 1097300000 0 0 0 0 193690000 0 255080000 0 116250000 0 155210000 174120000 202980000 22994 2407;2826 21610 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265624;265625;265626;265627;265628;265629;265630;265631;265632;265633;265634;265635;265636;265637;265638;265639;265640;265641;265642;265643;265644;265645;265646;265647;265648;265649;265650;265651;265652;265653;265654;265655;265656;265657;265658;265659;265660;265661 265646 34 IYELDLRPVDAK Unmodified 1430.7769 0.77692993 179 A0A0A0MSK6;Q13017 ARHGAP5 Rho GTPase-activating protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 77.032 77.032 3 0.014072 77521 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.822 35.106 74374000 0 0 0 0 0 0 31608000 0 0 0 0 42765000 0 23008 179 21624 207489;207490;207491 265662;265663;265664 265664 3 IYELTVLK Unmodified 977.57973 0.57973367 250 A0A0C4DGR1;B4DHA8;M0QY66;Q9BZC1;F6UBL3;Q96J87 CELF4;CELF6 CUGBP Elav-like family member 4;CUGBP Elav-like family member 6 no no 0 0 0 1 82.479 82.479 2 0.046015 83980 QUIQUE_C1218_190116_001 56.721 29.837 38316000 38316000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23009 250 21625 207492 265665 265665 1 IYESHVGISSHEGK Unmodified 1541.7474 0.74742071 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 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Unmodified 2732.2177 0.21768029 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 2 3 2 3 2 3 4 1 9 2 2 142.99 142.99 3 5.1492E-57 129003 QUIQUE_C1563_190116_001 121.35 113.9 1246600000 0 52389000 173620000 137950000 0 118290000 41333000 75002000 53200000 0 347890000 153640000 93281000 23013 2261 21629 207505;207506;207507;207508;207509;207510;207511;207512;207513;207514;207515;207516;207517;207518;207519;207520;207521;207522;207523;207524;207525;207526;207527;207528;207529;207530;207531;207532;207533;207534;207535;207536;207537;207538 265679;265680;265681;265682;265683;265684;265685;265686;265687;265688;265689;265690;265691;265692;265693;265694;265695;265696;265697;265698;265699;265700;265701;265702;265703;265704;265705;265706;265707;265708;265709;265710;265711;265712;265713 265687 27 IYFGGLPTLR Unmodified 1135.639 0.63897988 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 113.36 113.36 2 0.042123 117826 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.582 20.186 56145000 13459000 12679000 0 0 0 0 0 0 0 17902000 12106000 0 0 23014 2225 21630 207539;207540;207541;207542 265714;265715;265716;265717 265717 4 IYFLLVR Unmodified 922.56402 0.56402403 3234;1635 Q4G0F5;O75436;S4R3Q6 VPS26B;VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26B;Vacuolar protein sorting-associated protein 26A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.12 111.12 2 0.019338 114550 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.67 92.965 764290000 72704000 84678000 57378000 46421000 58879000 46815000 90483000 0 60812000 42718000 89204000 59300000 54898000 23015 3234;1635 21631 207543;207544;207545;207546;207547;207548;207549;207550;207551;207552;207553;207554;207555 265718;265719;265720;265721;265722;265723;265724;265725;265726;265727;265728;265729;265730;265731 265727 14 IYFLSTEDLPR Unmodified 1352.6976 0.69761697 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 110 110 2;3 0.00034234 118980 QUIQUE_C1277_190116_001 118.18 63.628 2758300000 238170000 294360000 311960000 281410000 260540000 210920000 396390000 0 0 84851000 236280000 181130000 262310000 23016 914 21632 207556;207557;207558;207559;207560;207561;207562;207563;207564;207565;207566;207567;207568 265732;265733;265734;265735;265736;265737;265738;265739;265740;265741;265742;265743;265744;265745;265746;265747;265748;265749;265750;265751;265752;265753 265735 21 IYFMAGSSR Unmodified 1030.4906 0.49060109 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.304 56.304 2 0.023629 54565 QUIQUE_C1403_190116_001 60.59 52.68 1107600000 0 0 0 219190000 180090000 173180000 0 0 126310000 0 238260000 170570000 0 23017 2079 21633 207569;207570;207571;207572;207573;207574 265754;265755;265756;265757;265758;265759 265754 6 IYFMAGSSR Oxidation (M) 1046.4855 0.48551571 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 1 0 1 36.641 36.641 2 0.061924 32297 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.127 26.698 99065000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99065000 0 23018 2079 21633 207575 265760 265760 1 IYFTDSSSK Unmodified 1046.492 0.49204087 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 0 1 1 36.972 36.972 2 0.032665 31622 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.549 9.1236 143440000 0 104140000 0 0 0 0 0 0 0 39296000 0 0 0 23019 4234 21634 207576;207577 265761;265762 265762 2 IYGADDIELLPEAQHK Unmodified 1810.9101 0.91012895 2027;1005 F5H2F4;V9GYY3;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 2 2 2 1 1 2 95.121 95.121 2;3 1.6247E-09 96959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.86 146.7 2914600000 286080000 222430000 324800000 288560000 206190000 56442000 348730000 276040000 240810000 0 86810000 211210000 366530000 23020 1005;2027 21635 207578;207579;207580;207581;207582;207583;207584;207585;207586;207587;207588;207589;207590;207591;207592;207593;207594;207595;207596 265763;265764;265765;265766;265767;265768;265769;265770;265771;265772;265773;265774;265775;265776;265777;265778;265779;265780;265781;265782;265783;265784;265785 265779 19 IYGAPGVEFTGLHR Unmodified 1515.7834 0.78341229 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 82.235 82.235 2;3 9.9552E-11 83209 QUIQUE_C1277_190116_001 101.53 92.497 3502400000 208950000 204050000 278400000 192440000 259910000 183560000 275010000 308140000 404720000 162560000 369080000 336970000 318670000 23021 57 21636 207597;207598;207599;207600;207601;207602;207603;207604;207605;207606;207607;207608;207609;207610;207611;207612;207613;207614 265786;265787;265788;265789;265790;265791;265792;265793;265794;265795;265796;265797;265798;265799;265800;265801;265802;265803;265804;265805;265806;265807;265808;265809;265810 265787 24 IYGESADAVKK Unmodified 1179.6136 0.61355299 625 B4DXZ6;P51114;E7EU85;E9PFF5 FXR1 Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 yes no 0 0 1 1 18.047 18.047 3 0.033042 10844 QUIQUE_DMIX3_190116_001 28.903 17.998 16316000 0 0 0 0 0 0 0 0 16316000 0 0 0 0 23022 625 21637 207615 265811 265811 1 IYGFYDECK Unmodified 1193.5063 0.50631073 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;H0Y3Y6;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;P62136 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.256 73.256 2 0.0012367 73693 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.57 99.465 3452200000 302780000 334660000 327660000 289380000 237710000 308350000 349640000 0 247920000 128850000 324390000 265320000 335530000 23023 2740;1041;2739 21638 207616;207617;207618;207619;207620;207621;207622;207623;207624;207625;207626;207627 265812;265813;265814;265815;265816;265817;265818;265819;265820;265821;265822;265823 265822 5 IYGFYDECKR Unmodified 1349.6074 0.60742176 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;H0Y3Y6;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;P62136 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.46 51.46 3 0.0015392 50237 QUIQUE_C1218_190116_001 64.82 51.812 1352100000 100150000 128720000 133860000 0 136380000 110400000 150790000 125220000 0 33316000 168110000 117060000 148090000 23024 2740;1041;2739 21639 207628;207629;207630;207631;207632;207633;207634;207635;207636;207637;207638 265824;265825;265826;265827;265828;265829;265830;265831;265832;265833;265834 265824 8 IYGISFPDPK Unmodified 1135.5914 0.59136099 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.03 102.03 2 0.0036016 99567 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.783 67.013 979600000 79432000 91397000 75183000 91928000 82791000 0 77324000 75942000 72242000 31115000 98259000 105020000 98964000 23025 2253 21640 207639;207640;207641;207642;207643;207644;207645;207646;207647;207648;207649;207650 265835;265836;265837;265838;265839;265840;265841;265842;265843;265844;265845;265846;265847;265848;265849 265846 14 IYGLGSLALYEK Unmodified 1325.7231 0.72310344 2396 P36542 ATP5C1 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.35 116.35 2 5.2965E-07 120486 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.89 111 8968700000 773990000 675370000 695160000 546050000 492810000 625580000 798980000 598210000 757010000 287730000 1090600000 863880000 763330000 23026 2396 21641 207651;207652;207653;207654;207655;207656;207657;207658;207659;207660;207661;207662;207663 265850;265851;265852;265853;265854;265855;265856;265857;265858;265859;265860;265861;265862;265863;265864;265865;265866;265867;265868;265869;265870;265871;265872 265863 23 IYGNFFPYGDASK Unmodified 1477.6878 0.68778057 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1;E5RJJ6;E5RGZ0;E5RI95;A0A1B0GXG3;E5RHE8;E5RI78;E5RHC8;E5RIG4;E5RIA5;E5RK89;E5RFL9;E5RJT1 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.87 104.87 2 0.00177 107841 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.541 59.229 1084900000 163980000 0 113520000 0 134890000 0 180370000 64213000 140890000 58569000 0 120010000 108450000 23027 2726 21642 207664;207665;207666;207667;207668;207669;207670;207671;207672 265873;265874;265875;265876;265877;265878;265879;265880;265881;265882 265879 5 IYGNQDTSSQLK Unmodified 1352.6572 0.65720872 2153 Q5T985;P19823 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 0 1 1 27.887 27.887 2 0.0008969 21872 QUIQUE_C1563_190116_001 102.06 69.221 63858000 0 0 0 0 36287000 27571000 0 0 0 0 0 0 0 23028 2153 21643 207673;207674 265883;265884 265884 2 IYGPSDSASR Unmodified 1051.4934 0.49343786 3411 Q6UX71 PLXDC2 Plexin domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 20.427 20.427 2 0.024311 13280 QUIQUE_C1403_190116_001 68.657 34.919 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23029 3411 21644 207675 265885 265885 1 IYGQACATYESASLR Unmodified 1688.7828 0.78281994 2462 P43155;H0Y4Z7 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.422 65.422 2 4.0572E-18 64321 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.39 113.72 900190000 102390000 75731000 100320000 90202000 79238000 70293000 0 47345000 73676000 34363000 59702000 79189000 87735000 23030 2462 21645 207676;207677;207678;207679;207680;207681;207682;207683;207684;207685;207686;207687 265886;265887;265888;265889;265890;265891;265892;265893;265894;265895;265896;265897 265897 11 IYHLPDAESDEDEDFKEQTR Unmodified 2436.0717 0.071727558 640;3097 B5MCX3;H7C2Y0;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 1 1 2 1 2 1 2 66.56 66.56 3;4 3.3752E-09 64705 QUIQUE_C1563_190116_001 86.727 83.452 473700000 0 63600000 144330000 57076000 0 135080000 0 0 0 0 42699000 30920000 0 23031 640;3097 21646 207688;207689;207690;207691;207692;207693;207694;207695;207696 265898;265899;265900;265901;265902;265903;265904;265905;265906 265902 8 IYHPNIDEK Unmodified 1127.5611 0.56112349 2793 P68036;A0A1B0GUS4 UBE2L3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 23.447 23.447 2;3 0.0058599 16280 QUIQUE_C1368_190116_001 63.184 43.831 4429600000 526030000 400910000 481090000 520780000 149430000 382850000 483800000 156660000 364590000 121290000 563290000 278850000 0 23032 2793 21647 207697;207698;207699;207700;207701;207702;207703;207704;207705;207706;207707;207708;207709;207710;207711;207712;207713;207714;207715;207716 265907;265908;265909;265910;265911;265912;265913;265914;265915;265916;265917;265918;265919;265920;265921;265922;265923;265924;265925;265926;265927 265911 15 IYHPNINSNGSICLDILR Unmodified 2098.063 0.062957968 131;54 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chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 143.25 143.25 2 0.0032312 146150 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.625 63.761 522430000 94488000 109960000 0 89801000 0 0 129070000 99114000 0 0 0 0 0 23038 1909 21653 207773;207774;207775;207776;207777 265998;265999;266000;266001;266002 266002 0 IYIPLPEEAAR Unmodified 1270.6921 0.69213767 4507 Q9UN37 VPS4A Vacuolar protein sorting-associated protein 4A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.187 95.187 2 0.010789 97244 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.148 61.522 859540000 0 95864000 83698000 89931000 92239000 0 103540000 65784000 85434000 33079000 110960000 0 99016000 23039 4507 21654 207778;207779;207780;207781;207782;207783;207784;207785;207786;207787 266003;266004;266005;266006;266007;266008;266009;266010;266011;266012 266008 5 IYIPLPEPHAR Unmodified 1304.7241 0.7241065 1625 O75351 VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4B yes yes 0 0 0 1 72.809 72.809 3 0.041973 73103 QUIQUE_C1218_190116_001 26.412 16.103 33439000 33439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23040 1625 21655 207788 266013 266013 1 IYIPLPTAK Unmodified 1014.6114 0.61136815 4051 Q9BW62 KATNAL1 Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.033 86.033 2 0.022113 87656 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.679 41.054 130020000 21571000 0 23488000 17739000 0 0 0 11719000 19027000 8895200 27577000 0 0 23041 4051 21656 207789;207790;207791;207792;207793;207794;207795 266014;266015;266016;266017;266018;266019;266020 266018 6 IYIQAHIDR Unmodified 1127.6087 0.60874239 1894 P05771 PRKCB Protein kinase C beta type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.208 35.208 3 0.0075721 30095 QUIQUE_C1403_190116_001 51.445 37.752 338090000 68392000 71834000 0 48482000 0 30636000 70733000 0 0 25351000 0 22666000 0 23042 1894 21657 207796;207797;207798;207799;207800;207801;207802 266021;266022;266023;266024;266025;266026;266027;266028;266029;266030;266031 266024 11 IYISGMAPR Unmodified 1006.527 0.52698659 1848 P04004;H0YJW9 VTN Vitronectin;Vitronectin V65 subunit;Vitronectin V10 subunit;Somatomedin-B yes no 0 0 0 1 1 53.679 53.679 2 0.019489 52014 QUIQUE_C1277_190116_001 63.565 26.978 66682000 0 37369000 0 0 29313000 0 0 0 0 0 0 0 0 23043 1848 21658 207803;207804 266032;266033 266032 2 IYITLTGVHQVPTENVQVHFTER Unmodified 2680.3973 0.39729963 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 103.38 103.38 3;4 5.4092E-12 107843 QUIQUE_C1218_190116_001 97.974 90.578 7624500000 529140000 1371900000 356530000 289770000 493860000 268240000 459030000 960630000 554390000 70912000 927030000 933660000 409470000 23044 4212 21659 207805;207806;207807;207808;207809;207810;207811;207812;207813;207814;207815;207816;207817;207818;207819;207820;207821;207822;207823;207824;207825;207826;207827;207828;207829 266034;266035;266036;266037;266038;266039;266040;266041;266042;266043;266044;266045;266046;266047;266048;266049;266050;266051;266052;266053;266054;266055;266056;266057;266058;266059;266060;266061;266062 266034 24 IYKVPSTEAEALASSLMGLFEK Unmodified 2383.2345 0.23449955 2560;3300 P50395;Q5SX87;V9GYF8;Q5SX90;Q5SX86 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 0 1 1 1 165.21 165.21 3 2.9759E-15 172541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.583 86.583 273980000 0 0 0 0 0 0 0 95551000 0 0 178430000 0 0 23045 2560;3300 21660 207830;207831 266063;266064;266065 266065 3 IYKVPSTETEALASNLMGMFEK Unmodified 2458.2124 0.2123839 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 1 1 1 149.63 149.63 3 3.6108E-07 155282 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.413 72.912 193880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 133010000 0 60867000 23046 2328 21661 207832;207833 266066;266067;266068 266068 3 IYLDMLNVYK Unmodified 1270.6631 0.66314572 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 123 123 2 0.0097252 127182 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.825 66.829 194890000 0 0 0 0 0 0 0 0 63112000 0 0 69318000 62458000 23047 1470 21662 207834;207835;207836;207837 266069;266070;266071;266072 266071 3 IYLGQLECFSLGNLDAK Unmodified 1939.9713 0.97134899 1583 O60547 GMDS GDP-mannose 4,6 dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 146.62 146.62 2 0.0001231 150978 QUIQUE_C1277_190116_001 117.7 104.28 171760000 0 51067000 35328000 52744000 0 0 0 0 0 0 0 0 32616000 23048 1583 21663 207838;207839;207840;207841 266073;266074;266075;266076;266077 266073 5 IYLPYLHEWK Unmodified 1360.718 0.71795849 1009 F5H442;Q99816 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 3 2 1 2 3 2 101.25 101.25 2;3 0.00058217 104377 QUIQUE_C1277_190116_001 98.044 61.71 496460000 34461000 34307000 41849000 44180000 41798000 0 33758000 0 44540000 0 59756000 41819000 120000000 23049 1009 21664 207842;207843;207844;207845;207846;207847;207848;207849;207850;207851;207852;207853;207854;207855;207856;207857;207858;207859;207860 266078;266079;266080;266081;266082;266083;266084;266085;266086;266087;266088;266089;266090;266091;266092;266093;266094;266095;266096;266097 266079 20 IYLQPGR Unmodified 845.47594 0.4759373 2153 Q5T985;P19823;Q5T987 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 0 1 30.105 30.105 2 0.029287 24957 QUIQUE_C1438_190116_001 91.584 50.664 36601000 0 0 0 0 36601000 0 0 0 0 0 0 0 0 23050 2153 21665 207861 266098 266098 1 IYLTADNLVLNLQDESFTR Unmodified 2224.1376 0.1375627 1272 J3KPX7;Q99623 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 3 2 150.99 150.99 2;3 1.2967E-99 155170 QUIQUE_C1277_190116_001 250.89 230.05 4588700000 337250000 356650000 399810000 308510000 290520000 191540000 269290000 424020000 529090000 50355000 594250000 435470000 401980000 23051 1272 21666 207862;207863;207864;207865;207866;207867;207868;207869;207870;207871;207872;207873;207874;207875;207876;207877;207878;207879;207880;207881;207882;207883;207884;207885;207886 266099;266100;266101;266102;266103;266104;266105;266106;266107;266108;266109;266110;266111;266112;266113;266114;266115;266116;266117;266118;266119;266120;266121;266122;266123;266124 266103 25 IYLTLLR Unmodified 890.55894 0.55893865 4020 Q9BTE3 MCMBP Mini-chromosome maintenance complex-binding protein yes yes 0 0 0 1 93.628 93.628 2 0.051092 96544 QUIQUE_C1368_190116_001 74.191 24.784 11335000 0 0 11335000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23052 4020 21667 207887 266125 266125 1 IYLYLTK Unmodified 912.53206 0.5320552 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 73.5 73.5 2 0.019738 74842 QUIQUE_C1218_190116_001 123.99 9.4029 476130000 144990000 0 0 0 0 101750000 0 0 0 91929000 0 137460000 0 23053 2440 21668 207888;207889;207890;207891 266126;266127;266128;266129 266126 2 IYLYTHLK Unmodified 1049.591 0.59096706 1566 O60268;H3BMU3;H3BNA7 KIAA0513 Uncharacterized protein KIAA0513 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 44.775 44.775 2;3 0.01279 41255 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.833 37.021 576470000 166610000 66507000 0 62530000 0 0 0 71656000 0 0 0 133310000 75857000 23054 1566 21669 207892;207893;207894;207895;207896;207897;207898;207899;207900 266130;266131;266132;266133;266134;266135;266136;266137;266138;266139 266137 10 IYLYTLNDNAR Unmodified 1354.6881 0.68811492 1833 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266171;266172;266173;266174;266175;266176;266177;266178;266179;266180;266181;266182;266183;266184;266185;266186;266187;266188;266189;266190;266191;266192;266193;266194;266195;266196;266197;266198;266199;266200;266201;266202;266203;266204;266205 266176 35 IYPEEMIQTGISAIDGMNSIAR Oxidation (M) 2424.1665 0.16649634 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 1 0 1 2 2 1 1 3 1 1 1 1 154.62 154.62 2;3 7.3252E-09 162214 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.439 80.522 562820000 0 88180000 158940000 47395000 0 0 31304000 74953000 28849000 75340000 29430000 0 28428000 23063 2175 21677 207958;207959;207960;207961;207962;207963;207964;207965;207966;207967;207968;207969;207970;207971 266206;266207;266208;266209;266210;266211;266212;266213;266214;266215;266216;266217;266218;266219 266218 1526 14 IYPFWTPDIPLSSYVK Unmodified 1924.9975 0.99748739 3289 Q5R3I4;H7C2L7;A9UJP8 TTC38 Tetratricopeptide repeat protein 38 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.49 158.49 2 0.000546 163660 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266305;266306;266307;266308;266309;266310;266311;266312;266313;266314;266315;266316;266317;266318;266319;266320;266321;266322;266323;266324;266325;266326;266327;266328;266329;266330;266331;266332;266333;266334;266335;266336;266337;266338;266339;266340;266341;266342;266343;266344;266345;266346;266347;266348;266349 266339 45 IYQTFVALAAQLQSIHENVK Unmodified 2272.2216 0.2215671 1215 Q5JRG1;H7BYF2;Q9BVL2 NUPL1 Nucleoporin p58/p45 yes no 0 0 0 1 1 140.57 140.57 3 5.0635E-05 143637 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.361 8.7264 156510000 0 0 0 0 0 71603000 0 84904000 0 0 0 0 0 23080 1215 21693 208077;208078 266350;266351 266351 2 IYQYVINK Unmodified 1039.5702 0.57023162 476 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;A0A3B3ITB8;A0A3B3ITH9 CTPS1 CTP synthase 1 yes no 0 0 0 1 1 46.904 46.904 2 0.035663 44845 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.287 8.8507 314840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 194300000 120540000 0 23081 476 21694 208079;208080 266352;266353 266352 2 IYSFGLGGR Unmodified 968.50797 0.50796571 3957 Q99523 SORT1 Sortilin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 76.951 76.951 2 0.00068043 77244 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.81 74.927 255650000 33314000 40028000 37082000 44735000 0 0 0 30109000 0 0 0 29287000 41097000 23082 3957 21695 208081;208082;208083;208084;208085;208086;208087 266354;266355;266356;266357;266358;266359;266360;266361;266362 266362 8 IYSHSLLPVLR Unmodified 1296.7554 0.75540662 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 74.386 74.386 3 9.5717E-16 75041 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.1 129.1 254350000 0 0 0 38508000 45095000 0 37866000 0 0 25112000 58546000 49225000 0 23083 2194 21696 208088;208089;208090;208091;208092;208093;208094;208095;208096;208097;208098;208099 266363;266364;266365;266366;266367;266368;266369;266370;266371;266372;266373;266374 266371 12 IYSLSSQPIDHEGIK Unmodified 1685.8625 0.86245047 3415 Q6VY07;E9PPK2;H0YF56 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 60.897 60.897 2;3 1.3637E-05 60564 QUIQUE_C1438_190116_001 117.98 92.037 1081500000 39656000 37828000 0 139130000 154550000 123010000 33217000 112830000 0 46116000 139870000 99780000 155550000 23084 3415 21697 208100;208101;208102;208103;208104;208105;208106;208107;208108;208109;208110;208111;208112;208113;208114;208115;208116;208117 266375;266376;266377;266378;266379;266380;266381;266382;266383;266384;266385;266386;266387;266388;266389;266390;266391;266392 266380 17 IYSNNQYAR Unmodified 1127.536 0.53597137 2930 Q08AM6 VAC14 Protein VAC14 homolog yes yes 0 0 0 1 20.325 20.325 2 0.0079223 13030 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.229 28.657 39518000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39518000 0 0 0 23085 2930 21698 208118 266393 266393 1 IYSSEAIK Unmodified 909.48075 0.48074791 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 22.436 22.436 2 0.030614 15567 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yes no 0 0 0 1 48.633 48.633 2 0.049584 46386 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.96 12.515 34786000 0 0 0 0 0 0 0 0 34786000 0 0 0 0 23089 1607 21702 208122 266397 266397 1 IYSTLAGTR Unmodified 980.5291 0.52909508 1655;4459 O75746;Q9UJS0 SLC25A12;SLC25A13 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1;Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 31.622 31.622 2 0.0071305 26707 QUIQUE_C1438_190116_001 82.452 46.267 1504100000 363410000 236750000 262150000 242950000 163350000 0 235510000 0 0 0 0 0 0 23090 1655;4459 21703 208123;208124;208125;208126;208127;208128;208129 266398;266399;266400;266401;266402;266403;266404;266405 266403 8 IYSYVVSR Unmodified 985.52328 0.52328142 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 45 45 2 0.010748 41765 QUIQUE_C1277_190116_001 90.862 43.112 48744000 0 48744000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23091 3822 21704 208130;208131;208132 266406;266407;266408 266406 3 IYSYVVSRPQPR Unmodified 1463.7885 0.78849767 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 1 1 40.168 40.168 3 0.0040162 36199 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.693 31.463 62668000 0 0 0 0 0 0 0 62668000 0 0 0 0 0 23092 3822 21705 208133 266409 266409 1 IYTFNKDQDR Unmodified 1298.6255 0.62551466 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 24.774 24.774 2;3 0.00096323 18329 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.1 104.18 133210000 0 0 0 0 0 0 0 43706000 0 0 42415000 0 47088000 23093 4088 21706 208134;208135;208136;208137 266410;266411;266412;266413 266412 4 IYTLFLQR Unmodified 1052.6019 0.6018661 1690 O94830;H0YF30 DDHD2 Phospholipase DDHD2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.349 97.349 2 0.0036478 95316 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.48 67.523 255460000 20154000 22517000 15979000 16866000 23000000 20938000 25097000 21455000 23654000 10618000 0 28670000 26515000 23094 1690 21707 208138;208139;208140;208141;208142;208143;208144;208145;208146;208147;208148;208149;208150 266414;266415;266416;266417;266418;266419;266420;266421;266422;266423;266424;266425;266426 266423 13 IYTYQWR Unmodified 1028.508 0.50796571 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.284 65.284 2 0.019806 64730 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.23 86.076 789650000 68065000 71805000 81578000 51627000 107070000 49654000 59588000 73001000 75009000 33910000 0 62625000 55711000 23095 2075 21708 208151;208152;208153;208154;208155;208156;208157;208158;208159;208160;208161;208162 266427;266428;266429;266430;266431;266432;266433;266434;266435;266436;266437;266438 266435 12 IYVASVHQDLSDDDIK Unmodified 1816.8843 0.88430813 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;E9PN18 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 67.349 67.349 2;3 2.1156E-24 66924 QUIQUE_C1403_190116_001 153.38 129.66 820580000 73663000 101660000 135200000 130080000 96155000 71031000 0 0 61326000 45698000 105760000 0 0 23096 295 21709 208163;208164;208165;208166;208167;208168;208169;208170;208171;208172;208173;208174;208175;208176;208177 266439;266440;266441;266442;266443;266444;266445;266446;266447;266448;266449;266450;266451;266452;266453;266454;266455 266446 16 IYVDDGLISLQVK Unmodified 1461.8079 0.80789571 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 3 3 2 3 2 2 2 3 2 3 4 3 2 118.27 118.27 1;2;3 4.3835E-33 124916 QUIQUE_C1218_190116_001 231.05 138.21 60632000000 5521500000 4245600000 4204200000 4526100000 3024100000 2491400000 5526800000 4596800000 3650800000 3754300000 9318900000 6227600000 3544300000 23097 1203;2077 21710 208178;208179;208180;208181;208182;208183;208184;208185;208186;208187;208188;208189;208190;208191;208192;208193;208194;208195;208196;208197;208198;208199;208200;208201;208202;208203;208204;208205;208206;208207;208208;208209;208210;208211 266456;266457;266458;266459;266460;266461;266462;266463;266464;266465;266466;266467;266468;266469;266470;266471;266472;266473;266474;266475;266476;266477;266478;266479;266480;266481;266482;266483;266484;266485;266486;266487;266488;266489;266490;266491;266492;266493;266494;266495;266496;266497;266498;266499;266500;266501;266502;266503;266504;266505;266506;266507;266508;266509;266510;266511;266512;266513;266514 266460 55 IYVGNASVAQDIPK Unmodified 1473.7827 0.78274359 2580 P51452 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.771 76.771 2 0.00067128 77024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.55 80.564 1199100000 160890000 150780000 95025000 109640000 0 145030000 0 151010000 147720000 70378000 0 0 168580000 23098 2580 21711 208212;208213;208214;208215;208216;208217;208218;208219;208220 266515;266516;266517;266518;266519;266520;266521;266522;266523 266520 7 IYVGNLPPDIR Unmodified 1255.6925 0.69247202 1294 J3KTL2;Q07955;J3QQV5;J3KSW7 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 2 85.631 85.631 2 0.004103 88167 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.243 43.082 336830000 27802000 45392000 0 0 0 0 0 49640000 37549000 0 126480000 0 49972000 23099 1294 21712 208221;208222;208223;208224;208225;208226;208227;208228;208229;208230;208231;208232 266524;266525;266526;266527;266528;266529;266530;266531;266532;266533;266534;266535;266536 266531 12 IYVGNLPTDVR Unmodified 1245.6717 0.67173657 2980 Q13242;H0YIB4;S4R3G0 SRSF9 Serine/arginine-rich splicing factor 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.043 76.043 2 0.0009257 75734 QUIQUE_C1563_190116_001 92.838 67.279 851190000 102020000 0 112530000 0 0 69006000 0 98743000 111970000 0 151650000 110510000 94758000 23100 2980 21713 208233;208234;208235;208236;208237;208238;208239;208240;208241 266537;266538;266539;266540;266541;266542;266543;266544;266545;266546 266539 10 IYVISLAEPR Unmodified 1159.6601 0.66010926 2083 P14868;C9J7S3;C9JLC1;C9JQM9 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 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208255;208256;208257;208258;208259;208260;208261;208262;208263;208264;208265;208266;208267 266571;266572;266573;266574;266575;266576;266577;266578;266579;266580;266581;266582;266583 266578 13 IYVMPWIPYR Oxidation (M) 1352.6951 0.69511455 1698 O94910 LPHN1 Latrophilin-1 yes yes 0 1 0 1 1 27.847 27.847 3 0.03507 21927 QUIQUE_C1277_190116_001 48.283 14.322 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23103 1698 21716 208268;208269 266584;266585 266584 2 IYVMPWIPYR Unmodified 1336.7002 0.70019993 1698 O94910 LPHN1 Latrophilin-1 yes yes 0 0 0 1 134.96 134.96 2 0.012889 141843 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.55 60.463 20545000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20545000 0 0 23104 1698 21716 208270 266586 266586 0 IYVSANSGAR Unmodified 1036.5302 0.53015772 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes no 0 0 0 1 1 20.308 20.308 2 0.028317 13429 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.064 18.043 57731000 0 0 0 0 32668000 0 0 0 0 0 0 25063000 0 23105 2964 21717 208271;208272 266587;266588 266588 2 IYVVDVGSEPR Unmodified 1232.6401 0.6401021 2978 Q13228;A6PVX1;F2Z2W8;F8WCR4 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 3 66.247 66.247 2 0.0012539 65497 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.4 74.323 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23106 2978 21718 208273;208274;208275;208276;208277;208278;208279;208280;208281;208282;208283;208284;208285;208286;208287;208288;208289;208290;208291;208292;208293;208294;208295 266589;266590;266591;266592;266593;266594;266595;266596;266597;266598;266599;266600;266601;266602;266603;266604;266605;266606;266607;266608;266609;266610;266611 266610 23 IYYLSLEFYMGR Oxidation (M) 1569.7538 0.75375164 2016;2017 P11216;P11217 PYGB;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 1 0 1 134.67 134.67 2 0.046959 130958 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.908 35.877 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23107 2016;2017 21719 208296 266612 266612 1 IYYVDHFTR Unmodified 1212.5928 0.59275797 3884 Q96J02 ITCH E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.518 56.518 3 0.0010332 55515 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.087 78.924 321870000 0 35484000 35887000 36969000 32064000 23662000 34505000 19148000 22687000 0 30495000 22460000 28506000 23108 3884 21720 208297;208298;208299;208300;208301;208302;208303;208304;208305;208306;208307 266613;266614;266615;266616;266617;266618;266619;266620;266621;266622;266623;266624;266625 266621 13 KAAALEFLNR Unmodified 1131.64 0.64004252 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 53.594 53.594 2;3 0.00069923 51092 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.06 77.107 1386200000 204780000 132560000 86399000 106220000 129610000 81668000 112460000 86082000 0 87398000 97905000 163010000 98096000 23109 2343 21721 208308;208309;208310;208311;208312;208313;208314;208315;208316;208317;208318;208319;208320;208321 266626;266627;266628;266629;266630;266631;266632;266633;266634;266635;266636;266637;266638;266639;266640;266641;266642 266641 11 KAAALEFLNRFEEAK Unmodified 1735.9257 0.92571943 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 2 1 1 92.219 92.219 3 0.0015504 92899 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.726 65.441 49629000 0 0 0 0 0 0 0 49629000 0 0 0 0 0 23110 2343 21722 208322;208323 266643;266644 266644 2 KAAAPAPEEEMDECEQALAAEPK Unmodified 2484.1149 0.1148547 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 80.758 80.758 3 1.5311E-23 82073 QUIQUE_C1277_190116_001 124.14 116.52 633070000 58687000 71792000 70945000 76050000 56587000 77122000 47413000 0 0 0 60455000 57553000 56469000 23111 2255 21723 208324;208325;208326;208327;208328;208329;208330;208331;208332;208333;208334 266645;266646;266647;266648;266649;266650;266651;266652;266653;266654;266655;266656 266646 10 KAAAPAPEEEMDECEQALAAEPK Oxidation (M) 2500.1098 0.10976932 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 1 1 1 82.74 82.74 3 0.00024535 83261 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.827 45.95 105690000 0 0 0 0 0 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74013000 23114 1836 21725 208356;208357;208358;208359;208360;208361;208362;208363 266678;266679;266680;266681;266682;266683;266684;266685 266685 8 KAAGIDEQENWHEGK Unmodified 1710.7962 0.79616182 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 1 1 21.073 21.073 3 0.043284 14002 QUIQUE_C1218_190116_001 19.162 7.7231 49640000 49640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23115 2282 21726 208364 266686 266686 1 KAAGIDEQENWHEGKENIR Unmodified 2223.0669 0.066857372 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 26.382 26.382 3;4 1.6186E-45 21469 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.71 124.92 931000000 22194000 67677000 62779000 0 54570000 31129000 35916000 249370000 83414000 0 144040000 58937000 120980000 23116 2282 21727 208365;208366;208367;208368;208369;208370;208371;208372;208373;208374;208375;208376;208377;208378 266687;266688;266689;266690;266691;266692;266693;266694;266695;266696;266697;266698;266699;266700 266694 13 KAALCAVHVIR Unmodified 1236.7125 0.71249595 1548 O43747;H3BNR4;H3BR36;H3BUN9 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 20.842 20.842 3 0.0013519 13909 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.672 58.92 105110000 0 0 0 0 0 0 0 0 26756000 0 25040000 26683000 26634000 23117 1548 21728 208379;208380;208381;208382 266701;266702;266703;266704 266702 4 KAALEAQNALHNIK Unmodified 1519.8471 0.84707518 299 V9GYD9;Q5VZZ6;A0A0J9YX66;A0A1B0GU44;E9PC62;A0A1B0GUN8;A0A0J9YXJ0;O95319 CELF2 CUGBP Elav-like family member 2 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 2 2 2 1 26.595 26.595 2;3 0.00016173 20053 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.68 55.951 1414900000 121170000 198860000 108440000 105440000 106090000 81323000 119000000 156220000 0 0 183590000 160250000 74559000 23118 299 21729 208383;208384;208385;208386;208387;208388;208389;208390;208391;208392;208393;208394;208395;208396;208397;208398;208399;208400 266705;266706;266707;266708;266709;266710;266711;266712;266713;266714;266715;266716;266717;266718;266719;266720;266721;266722 266718 17 KAALEAQNALHNMK Oxidation (M) 1553.7984 0.79841043 1106 G5EA30;Q92879;E9PQK4;E9PSH0;E9PKU1 CELF1 CUGBP Elav-like family member 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 14.153 14.153 3 0.0028922 6216 QUIQUE_C1368_190116_001 57.475 52.56 56098000 0 14935000 20445000 0 0 0 13291000 0 0 7427400 0 0 0 23119 1106 21730 208401;208402;208403;208404 266723;266724;266725;266726 266724 638 4 KAALEEVER Unmodified 1043.5611 0.56112349 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 1 16.779 16.779 2 0.01558 8755 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.985 48.248 142550000 0 0 0 0 0 0 0 107800000 0 34747000 0 0 0 23120 3117 21731 208405;208406 266727;266728 266728 2 KAAVEALQSQALHATSQQPLR Unmodified 2246.2131 0.21312768 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 60.716 60.716 3;4 3.2116E-27 56856 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.49 135.2 2053600000 122010000 196610000 148760000 167060000 243830000 200210000 138320000 84200000 161180000 201570000 109880000 70630000 209390000 23121 535;3739 21732 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6 KADCTITMADSDFLALMTGK Unmodified 2188.0214 0.021412008 2196 P22307;H0YF61 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 1 1 143.44 143.44 3 0.035956 146442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 13.941 12.675 40775000 0 0 0 0 0 0 0 40775000 0 0 0 0 0 23129 2196 21740 208507 266872 266872 1 KADGPPGPHDGGDRPSAEAR Unmodified 1985.9304 0.93036389 3240 Q4KMP7 TBC1D10B TBC1 domain family member 10B yes yes 0 0 2 1 1 10.484 10.484 4 5.1083E-05 2778 QUIQUE_C1218_190116_001 72.086 63.039 12797000 5289600 7507100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23130 3240 21741 208508;208509 266873;266874 266873 2 KADGSYAAWLSR Unmodified 1323.6571 0.65714914 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 62.034 62.034 3 0.00013814 61391 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.312 61.566 168950000 0 0 0 18478000 37424000 0 0 16879000 0 0 58905000 37263000 0 23131 290;327;328 21742 208510;208511;208512;208513;208514;208515;208516;208517 266875;266876;266877;266878;266879;266880;266881;266882 266881 6 KADIGVAMGIAGSDVSK Unmodified 1617.8396 0.83960654 1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26 ATP1A1;ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 no no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 2 65.841 65.841 2;3 0.00030903 65610 QUIQUE_C1368_190116_001 65.085 52.939 640650000 18574000 33020000 147890000 29534000 94533000 24768000 128290000 43641000 21268000 23049000 31219000 0 44867000 23132 1872;1371 21743 208518;208519;208520;208521;208522;208523;208524;208525;208526;208527;208528;208529;208530;208531;208532;208533;208534;208535 266883;266884;266885;266886;266887;266888;266889;266890;266891;266892;266893;266894;266895;266896;266897;266898;266899;266900 266887 18 KADLNTITESSAALQNLIEGSEPILEER Unmodified 3040.5564 0.55643863 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 157.86 157.86 3 2.0644E-15 163340 QUIQUE_C1368_190116_001 80.439 62.345 258960000 0 0 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3 1.0238E-10 150180 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.68 72.247 460410000 0 115870000 77799000 0 0 0 0 73116000 56709000 51873000 85039000 0 0 23135 4128 21746 208561;208562;208563;208564;208565;208566;208567 266929;266930;266931;266932;266933;266934;266935;266936 266936 2868 7 KADVGFAMGIAGTDVAK Unmodified 1649.8447 0.84469192 2158;2222;470 H0Y7S3;A0A2U3U055;A0A2U3TZI3;Q01814;A0A2R8Y4R4;Q16720;A0A2R8Y535;P20020;E7ERY9;P23634 ATP2B2;ATP2B3;ATP2B1;ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1;Calcium-transporting ATPase;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 no no 0 0 1 1 77.265 77.265 2 0.00069106 78589 QUIQUE_C1368_190116_001 78.615 55.497 48709000 0 0 48709000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23136 470;2158;2222 21747 208568 266937 266937 1 KADYQAVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFR Unmodified 3475.5063 0.50631313 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 163.86 163.86 3 9.0585E-31 169578 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1184.6765 0.6764876 78 A0A087WYP2;Q8IZQ5 C11orf31;SELH Selenoprotein H yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.373 20.373 2 0.0007734 13615 QUIQUE_C1218_190116_001 104.26 54.481 1114900000 116550000 124160000 0 0 0 160270000 144100000 129330000 151410000 47253000 153580000 88284000 0 23140 78 21751 208586;208587;208588;208589;208590;208591;208592;208593;208594 266957;266958;266959;266960;266961;266962;266963;266964;266965 266957 9 KAEAFQLYQEAAQLDMLLEK Unmodified 2338.1879 0.18788371 1673 O75955;A0A140T9R1;A0A140T9W4;A0A140T974 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 151.05 151.05 2;3 5.7812E-55 158025 QUIQUE_DMIX5_190116_001 165.02 144.43 830930000 51707000 65722000 86937000 0 92760000 34149000 87559000 72683000 0 21474000 103570000 68863000 145510000 23141 1673 21752 208595;208596;208597;208598;208599;208600;208601;208602;208603;208604;208605;208606 266966;266967;266968;266969;266970;266971;266972;266973;266974;266975;266976;266977;266978;266979;266980;266981;266982;266983;266984 266980 19 KAEAFQLYQEAAQLDMLLEK Oxidation (M) 2354.1828 0.18279833 1673 O75955;A0A140T9R1;A0A140T9W4;A0A140T974 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 1 1 1 150.21 150.21 3 0.0062632 145692 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.137 32.425 13146000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13146000 0 0 0 23142 1673 21752 208607 266985 266985 908 1 KAEAGAGSATEFQFR Unmodified 1568.7583 0.75831975 2482 P46783;Q9NQ39 RPS10;RPS10P5 40S ribosomal protein S10;Putative 40S ribosomal protein S10-like yes no 0 0 1 2 1 42.97 42.97 2;3 0.00030348 39499 QUIQUE_C1403_190116_001 85.45 64.662 108470000 0 0 0 108470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23143 2482 21753 208608;208609;208610 266986;266987;266988 266987 3 KAEALAQISAAFEDLEQALQQR Unmodified 2429.2551 0.25505207 1631 O75382;A0A1W2PPI7;E9PMK8 TRIM3 Tripartite motif-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.71 166.71 3 1.0418E-54 170486 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Unmodified 1813.7966 0.79661533 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 14.064 14.064 3 0.00032323 5777 QUIQUE_C1563_190116_001 64.89 60.363 111500000 19445000 26328000 24118000 0 12340000 29273000 0 0 0 0 0 0 0 23146 4331 21756 208640;208641;208642;208643;208644 267019;267020;267021;267022;267023 267023 5 KAEEDPEAADSGEPQNKR Unmodified 1969.8977 0.89772636 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 10.339 10.339 3 3.5242E-30 2714 QUIQUE_C1438_190116_001 151.87 130.02 52641000 5744000 0 0 0 13232000 0 0 14548000 14893000 0 4223900 0 0 23147 4331 21757 208645;208646;208647;208648;208649 267024;267025;267026;267027;267028 267025 4 KAEEEHLGILGPQLHADVGDK Unmodified 2255.1546 0.15460975 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 58.353 58.353 3;4 9.1913E-07 57484 QUIQUE_C1438_190116_001 69.088 66.287 1168200000 79823000 81631000 73487000 88389000 421430000 71591000 59492000 0 0 101620000 139100000 0 51690000 23148 1784 21758 208650;208651;208652;208653;208654;208655;208656;208657;208658;208659;208660;208661;208662 267029;267030;267031;267032;267033;267034;267035;267036;267037;267038;267039;267040;267041 267034 12 KAEEEHLGILGPQLHADVGDKVK Unmodified 2482.318 0.31798668 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 2 1 54.074 54.074 4 0.00048027 53088 QUIQUE_C1438_190116_001 46.403 40.023 45763000 0 0 0 0 45763000 0 0 0 0 0 0 0 0 23149 1784 21759 208663 267042 267042 1 KAEEELGELEAK Unmodified 1344.6773 0.67727546 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.728 34.728 2 2.0736E-14 29615 QUIQUE_C1368_190116_001 166.7 98.047 300600000 48768000 44536000 35882000 43508000 37253000 0 54672000 0 0 0 35984000 0 0 23150 4532 21760 208664;208665;208666;208667;208668;208669;208670;208671;208672 267043;267044;267045;267046;267047;267048;267049;267050;267051 267045 9 KAEEIANEMIEAAK Unmodified 1545.7709 0.77085827 2533 P49588;H3BPK7 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 1 67.998 67.998 2;3 1.1108E-86 67651 QUIQUE_C1277_190116_001 220.4 188.39 2675900000 294150000 340760000 299340000 279740000 120010000 0 103790000 230020000 278050000 89179000 263410000 217880000 159590000 23151 2533 21761 208673;208674;208675;208676;208677;208678;208679;208680;208681;208682;208683;208684;208685;208686;208687;208688;208689;208690;208691;208692;208693 267052;267053;267054;267055;267056;267057;267058;267059;267060;267061;267062;267063;267064;267065;267066;267067;267068;267069;267070;267071;267072;267073;267074;267075;267076;267077;267078;267079 267057 28 KAEELIQQEHADQAEIR Unmodified 2007.0021 0.0021318501 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 37.514 37.514 2;3 3.2567E-38 32882 QUIQUE_C1368_190116_001 138.23 118.14 407820000 28450000 0 126080000 31205000 0 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208706;208707;208708;208709;208710;208711;208712;208713;208714;208715;208716;208717;208718;208719;208720;208721;208722;208723;208724;208725;208726;208727;208728;208729;208730;208731 267092;267093;267094;267095;267096;267097;267098;267099;267100;267101;267102;267103;267104;267105;267106;267107;267108;267109;267110;267111;267112;267113;267114;267115;267116;267117;267118;267119;267120;267121 267094 29 KAEIMESIKR Unmodified 1203.6645 0.66454271 3079 Q14683;G8JLG1 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 2 1 18.28 18.28 3 0.052484 11065 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.744 58.999 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23155 3079 21765 208732 267122 267122 1 KAELLDNEKPAAVVAPITTGYTVK Unmodified 2527.3898 0.38975464 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.728 83.728 3 1.65E-05 85115 QUIQUE_C1277_190116_001 64.289 60.891 1751600000 128600000 158280000 127970000 170880000 178680000 0 164520000 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23158 4430 21768 208754;208755 267144;267145 267144 1 KAEPQELLQLDGYTVDYTDPQPGLEGGR Unmodified 3088.4989 0.49892375 4494;981;1154 F1T0E5;H0YFP0;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 127.31 127.31 3 6.1625E-37 131418 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.96 115.93 883120000 79007000 97497000 80391000 62630000 79687000 0 72451000 91955000 81635000 32560000 109230000 96081000 0 23159 981;1154;4494 21769 208756;208757;208758;208759;208760;208761;208762;208763;208764;208765;208766;208767 267146;267147;267148;267149;267150;267151;267152;267153;267154;267155;267156;267157;267158;267159;267160 267155 14 KAESGWFHVEEDR Unmodified 1588.727 0.72701962 1546 O43719;Q5H919;Q5H918 HTATSF1 HIV Tat-specific factor 1 yes no 0 0 1 1 42.408 42.408 3 0.016084 38621 QUIQUE_C1563_190116_001 35.659 23.513 42490000 0 0 0 0 0 42490000 0 0 0 0 0 0 0 23160 1546 21770 208768 267161 267161 1 KAESPVKEEAVAEVVTITK Unmodified 2027.115 0.11503634 869 E7ESP9;P07197 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 2 1 65.559 65.559 3 0.04682 64761 QUIQUE_C1277_190116_001 45.423 17.573 96594000 0 96594000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23161 869 21771 208769 267162 267162 1 KAEVNTIPGFDGVVK Unmodified 1572.8512 0.8511575 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.49 70.49 2 1.5897E-05 71824 QUIQUE_C1218_190116_001 131.08 109.09 358250000 39735000 32492000 57012000 41619000 38346000 26703000 43832000 0 33980000 0 44528000 0 0 23162 1881 21772 208770;208771;208772;208773;208774;208775;208776;208777;208778 267163;267164;267165;267166;267167;267168;267169;267170;267171;267172 267163 10 KAEVTLDGVWPTDK Unmodified 1557.8039 0.80387296 2619 P52948;A0A3B3ITD8 NUP98 Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96;Nuclear pore complex protein Nup98;Nuclear pore complex protein Nup96 yes no 0 0 1 1 79.021 79.021 3 0.026686 80254 QUIQUE_C1218_190116_001 26.929 18.614 21204000 21204000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23163 2619 21773 208779 267173 267173 1 KAFPEHLYQR Unmodified 1287.6724 0.67240528 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 22.023 22.023 2;3 0.00046916 15140 QUIQUE_C1277_190116_001 122.96 108.02 10680000000 1017800000 840770000 903740000 684730000 128070000 90264000 1193600000 802210000 965060000 395860000 1318200000 1125600000 1214500000 23164 3050 21774 208780;208781;208782;208783;208784;208785;208786;208787;208788;208789;208790;208791;208792;208793;208794;208795;208796;208797;208798;208799;208800;208801;208802;208803 267174;267175;267176;267177;267178;267179;267180;267181;267182;267183;267184;267185;267186;267187;267188;267189;267190;267191;267192;267193;267194;267195;267196;267197;267198;267199;267200;267201;267202;267203;267204;267205;267206;267207;267208;267209;267210;267211;267212;267213;267214;267215;267216;267217 267179 44 KAFSGYLGTDQSK Unmodified 1400.6936 0.69359423 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 33.388 33.388 2;3 1.3886E-158 29452 QUIQUE_DMIX1_190116_001 269.93 232.74 3228500000 129770000 135750000 232960000 272460000 178230000 60551000 307990000 365140000 210660000 109750000 386080000 397890000 441290000 23165 2003 21775 208804;208805;208806;208807;208808;208809;208810;208811;208812;208813;208814;208815;208816;208817;208818;208819;208820;208821;208822;208823;208824;208825;208826;208827 267218;267219;267220;267221;267222;267223;267224;267225;267226;267227;267228;267229;267230;267231;267232;267233;267234;267235;267236;267237;267238;267239;267240;267241;267242;267243 267233 25 KAGQVFLEELGNHK Unmodified 1568.8311 0.83109076 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 49.524 49.524 2;3 1.936E-71 48031 QUIQUE_DMIX1_190116_001 234.24 210.25 10384000000 1084900000 899500000 1269500000 384640000 795870000 504670000 1024300000 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208875;208876;208877;208878 267299;267300;267301;267302 267300 4 KAHEILPNLVCCSAK Unmodified 1738.8858 0.88584523 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 44.113 44.113 3 0.00020697 40148 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.246 39.171 362730000 43047000 0 0 0 70947000 0 83283000 41852000 0 0 0 51707000 71891000 23171 2572 21781 208879;208880;208881;208882;208883;208884;208885 267303;267304;267305;267306;267307;267308;267309 267309 6 KAHQLWLSVEALK Unmodified 1521.8667 0.86674799 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 1 1 3 1 2 1 2 1 3 1 3 3 3 68.589 68.589 2;3;4 1.2504E-08 68904 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.24 112.61 1787400000 0 0 201160000 88919000 128740000 47860000 215860000 96310000 214150000 16861000 281120000 265210000 231190000 23172 693;3205 21782 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208914 267342 267342 1 KALDDMISTLK Unmodified 1233.6639 0.663874 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;E9PM09;Q5SZX9;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 1 1 73.904 73.904 3 0.0094041 69967 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.081 33.879 7459700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7459700 0 0 0 23175 2527;3303 21785 208915 267343 267343 1 KALDLESLSLLGFVYK Unmodified 1795.0131 0.013137454 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 1 2 1 149.63 149.63 2;3 2.7818E-10 157047 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.97 104.94 107750000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 97274000 0 10478000 23176 1975 21786 208916;208917;208918 267344;267345;267346;267347 267344 4 KALEAAQIIIDVLQLPMSK Unmodified 2080.1966 0.1965979 2924 Q08623;E7EVH9 HDHD1 Pseudouridine-5'-phosphatase yes no 0 0 1 1 1 165.93 165.93 3 5.0178E-05 170477 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.55 72.056 63228000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39792000 0 23436000 23177 2924 21787 208919;208920 267348;267349 267349 1 KALEELATK Unmodified 1001.5757 0.57571092 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 1 1 18.794 18.794 2 0.030251 11481 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.869 33.492 32592000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32592000 0 23178 4050 21788 208921 267350 267350 1 KALEELATKR Unmodified 1157.6768 0.67682195 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 2 1 15.476 15.476 3 0.036878 7769 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.918 48.944 44942000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44942000 0 0 23179 4050 21789 208922 267351 267351 1 KALEGLQYPFAVTSYGK Unmodified 1870.9829 0.98289996 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 98.813 98.813 3 0.0013901 103072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.368 44.58 164050000 0 0 0 0 0 0 0 0 48311000 0 39042000 36511000 40183000 23180 2075 21790 208923;208924;208925;208926 267352;267353;267354;267355;267356 267354 5 KALELDQER Unmodified 1100.5826 0.58258722 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 1 1 18.846 18.846 3 0.022476 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KAPDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQER Unmodified 3716.7709 0.77089841 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 1 1 128.14 128.14 4 0.00012654 132624 QUIQUE_C1218_190116_001 36.709 31.754 76812000 76812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23189 1824 21799 208975 267407 267407 1 KAPDAGGCLHADPDLGVLCPTGCQLQEALLQQERPIR Unmodified 4083.0088 0.0088372675 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 122.61 122.61 4;5 6.2205E-54 126976 QUIQUE_C1368_190116_001 103.41 99.01 3288700000 191990000 545290000 383790000 457050000 643710000 95955000 468720000 0 32299000 0 124220000 53226000 292480000 23190 1824 21800 208976;208977;208978;208979;208980;208981;208982;208983;208984;208985;208986;208987;208988;208989;208990;208991;208992;208993;208994 267408;267409;267410;267411;267412;267413;267414;267415;267416;267417;267418;267419;267420;267421;267422;267423;267424;267425;267426;267427;267428;267429;267430;267431;267432;267433;267434 267416 27 KAPDFVFYAPR Unmodified 1309.6819 0.68190733 859;2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 74.8 74.8 2;3 0.00011677 75978 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.687 68.337 6397800000 241650000 245030000 546040000 344480000 524250000 452350000 519560000 366720000 760160000 421630000 620010000 695390000 660560000 23191 2248;434;859 21801 208995;208996;208997;208998;208999;209000;209001;209002;209003;209004;209005;209006;209007;209008;209009;209010;209011;209012;209013;209014;209015;209016 267435;267436;267437;267438;267439;267440;267441;267442;267443;267444;267445;267446;267447;267448;267449;267450;267451;267452;267453;267454;267455;267456;267457;267458;267459;267460;267461;267462;267463;267464;267465;267466;267467;267468;267469;267470;267471;267472;267473;267474;267475;267476;267477;267478;267479 267457 45 KAPGFGGFGSSAVSGGSTAAMITETIIETDKPK Unmodified 3211.6071 0.60709399 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 2 1 1 134.16 134.16 3;4 6.8679E-10 138081 QUIQUE_C1403_190116_001 62.383 56.603 103010000 0 0 0 63077000 0 0 0 0 0 0 0 0 39936000 23192 2506 21802 209017;209018 267480;267481;267482 267481 3 KAPLLASDSSSSGGSHSEDGDQK Unmodified 2259.0251 0.025111716 1615 O75170;T1ECW5;A0A0A0MSJ8 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes no 0 0 1 2 1 2 2 14.903 14.903 3;4 5.0577E-08 7395 QUIQUE_C1218_190116_001 55.228 46.579 101950000 22461000 0 0 19168000 0 0 0 23850000 0 0 0 0 36474000 23193 1615 21803 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209034;209035;209036;209037;209038;209039;209040;209041;209042;209043;209044;209045;209046;209047;209048;209049;209050;209051;209052;209053;209054;209055;209056;209057;209058;209059;209060;209061;209062;209063;209064;209065 267502;267503;267504;267505;267506;267507;267508;267509;267510;267511;267512;267513;267514;267515;267516;267517;267518;267519;267520;267521;267522;267523;267524;267525;267526;267527;267528;267529;267530;267531;267532;267533;267534;267535;267536;267537;267538;267539 267511 31 KAQALQEECGYLR Unmodified 1564.7668 0.76677595 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 1 36.721 36.721 2;3 1.1094E-23 33133 QUIQUE_DMIX1_190116_001 175.15 158.13 353870000 33192000 135810000 40680000 0 0 0 0 22467000 50323000 0 71397000 0 0 23196 2033 21806 209066;209067;209068;209069;209070;209071;209072;209073;209074;209075;209076 267540;267541;267542;267543;267544;267545;267546;267547;267548;267549;267550 267546 10 KAQDEGLLSDVVPFK Unmodified 1644.8723 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267569;267570;267571;267572;267573;267574 267573 1 KAQPAQPADEPAEK Unmodified 1478.7365 0.73652168 2244 P25786;F5GX11 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1 yes no 0 0 1 1 10.45 10.45 3 0.053905 2893 QUIQUE_C1277_190116_001 22.154 10.178 2471600 0 2471600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23199 2244 21809 209098 267575 267575 1 KAQQELEEQTR Unmodified 1358.679 0.6790068 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 11.21 11.21 2;3 1.5092E-05 3597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.55 100.01 79007000 0 0 0 3442000 0 0 0 30158000 7130500 32541000 0 5734900 0 23200 2248 21810 209099;209100;209101;209102;209103;209104;209105 267576;267577;267578;267579;267580;267581;267582;267583;267584 267579 9 KAQQELEEQTRR Unmodified 1514.7801 0.78011783 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 2 10.331 10.331 2;3;4 2.6246E-65 2668 QUIQUE_DMIX7_190116_001 188.48 162.94 1365200000 49522000 3095200 0 23580000 39395000 0 0 335620000 0 45350000 0 868600000 0 23201 2248 21811 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TF Serotransferrin yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 35.561 35.561 2;3 0.0036921 31402 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.235 44.273 693950000 0 0 27666000 0 232860000 31728000 0 0 42024000 0 135970000 55080000 168620000 23207 1838 21817 209178;209179;209180;209181;209182;209183;209184;209185;209186 267683;267684;267685;267686;267687;267688;267689;267690;267691 267689 8 KATDAEADVASLNR Unmodified 1459.7267 0.72668527 3424;557;3325 Q6ZN40;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951 TPM1;TPM2b;TPM2 Tropomyosin beta chain no no 0 0 1 1 35.585 35.585 2 0.00048876 31613 QUIQUE_C1438_190116_001 101.53 82.752 53564000 0 0 0 0 53564000 0 0 0 0 0 0 0 0 + 23208 3424;557;3325 21818 209187 267692 267692 1 KATLELTHNWGTEDDETQSYHNGNSDPR Unmodified 3214.4188 0.41877595 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 1 3 3 3 1 2 3 3 2 2 2 3 54.275 54.275 3;4;5 3.4667E-27 52552 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.875 74.095 4306900000 167340000 215380000 200340000 151050000 378670000 0 467190000 814680000 272550000 0 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267889 12 KAYQEELSR Unmodified 1122.5669 0.56693715 4144 Q9H2D6 TRIOBP TRIO and F-actin-binding protein yes yes 0 0 1 1 18.555 18.555 3 0.051568 11224 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.448 10.375 19179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19179000 23227 4144 21837 209359 267898 267898 0 KAYSTTSIASVAGLTAAAYR Unmodified 2001.0531 0.053104788 3519 Q86Y39;K7EQ77;K7EK78;K7EP35;K7EMT4 NDUFA11 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 yes no 0 0 1 2 1 93.597 93.597 2;3 3.1426E-57 96544 QUIQUE_DMIX5_190116_001 176.94 162.98 134360000 0 0 0 0 0 0 0 86226000 0 0 48131000 0 0 23228 3519 21838 209360;209361;209362 267899;267900;267901 267901 2 KAYWQVHLDQVEVASGLTLCK Unmodified 2444.2522 0.2522153 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 1 1 2 2 2 113.05 113.05 2;3;4 1.2748E-07 116565 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.76 56.745 632710000 0 0 0 0 0 0 0 71383000 0 0 148510000 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267942 3 KCIGGVIFFHETLYQK Unmodified 1939.0026 0.0025895425 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 2 3 3 3 2 82.002 82.002 2;3;4 1.0813E-35 84134 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.13 187.6 1118100000 0 0 32299000 0 0 0 0 160820000 190270000 0 307540000 276190000 151010000 23234 1978 21844 209404;209405;209406;209407;209408;209409;209410;209411;209412;209413;209414;209415;209416;209417 267946;267947;267948;267949;267950;267951;267952;267953;267954;267955;267956;267957;267958;267959;267960;267961 267954 15 KCLELFTELAEDKENYK Unmodified 2129.0351 0.035071462 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 2 1 1 1 1 89.258 89.258 3 5.7344E-16 90597 QUIQUE_C1563_190116_001 120.99 105.8 549330000 0 138300000 106080000 0 179680000 125270000 0 0 0 0 0 0 0 23235 1931 21845 209418;209419;209420;209421 267962;267963;267964;267965;267966 267966 5 KCSTSSLLEACTFR Unmodified 1658.7756 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1304.6096 0.60958983 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;G3V2P7 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 18.887 18.887 2;3 3.2447E-12 11309 QUIQUE_C1576_190116_001 179.72 105.26 485580000 45970000 128920000 36718000 0 0 0 139640000 99678000 0 34662000 0 0 0 23242 1050 21852 209482;209483;209484;209485;209486;209487;209488;209489;209490 268038;268039;268040;268041;268042;268043;268044;268045;268046;268047 268042 9 KDDFVLDSEYLVTLLVVVPK Unmodified 2291.2665 0.26645161 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 1 1 171.41 171.41 3 0.04125 175786 QUIQUE_DMIX3_190116_001 25.329 17.337 43934000 0 0 0 0 0 0 0 0 43934000 0 0 0 0 23243 2176 21853 209491 268048 268048 1 KDDGGIIICEAQNQALPSGHSK Unmodified 2337.1383 0.13830776 3655 Q8NFZ8 CADM4 Cell adhesion molecule 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.782 61.782 3 1.4144E-05 61106 QUIQUE_C1277_190116_001 63.272 58.722 520120000 0 63603000 53814000 72233000 70617000 0 112330000 32401000 0 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2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 123.5 123.5 2;3 1.0771E-08 129356 QUIQUE_C1218_190116_001 129.89 99 688840000 57390000 31226000 80838000 47925000 42932000 33709000 78439000 15923000 31491000 12224000 108580000 63307000 84856000 23265 2338 21874 209670;209671;209672;209673;209674;209675;209676;209677;209678;209679;209680;209681;209682;209683;209684;209685;209686;209687;209688 268251;268252;268253;268254;268255;268256;268257;268258;268259;268260;268261;268262;268263;268264;268265;268266;268267;268268;268269;268270;268271 268251 21 KDFVLHDPEAR Unmodified 1325.6728 0.67279921 3603 Q8N608;C9J4M8;J3KQK8;J3KPP1 DPP10 Inactive dipeptidyl peptidase 10 yes no 0 0 1 1 27.756 27.756 3 0.024946 21978 QUIQUE_C1576_190116_001 32.624 15.456 74219000 0 0 0 0 0 0 74219000 0 0 0 0 0 0 23266 3603 21875 209689 268272 268272 1 KDGLALGPGPFVTALEYATDTK Unmodified 2263.1736 0.17361385 4123 Q9H0R4;K7ER15 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 150.35 150.35 3 1.235E-05 154789 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.61 50.395 113350000 0 0 0 0 0 67193000 35856000 0 0 10301000 0 0 0 23267 4123 21876 209690;209691;209692;209693;209694 268273;268274;268275;268276;268277 268277 4 KDGLVSLLTTSEGADEPQR Unmodified 2015.0171 0.017113212 2583 P51570;K7ERJ9 GALK1 Galactokinase yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 89.021 89.021 2;3 4.3207E-11 90638 QUIQUE_DMIX7_190116_001 143.88 122.92 1518500000 77346000 124970000 160900000 95191000 128650000 95403000 163180000 81211000 115470000 61436000 145640000 111240000 157830000 23268 2583 21877 209695;209696;209697;209698;209699;209700;209701;209702;209703;209704;209705;209706;209707;209708;209709;209710;209711;209712;209713;209714;209715;209716 268278;268279;268280;268281;268282;268283;268284;268285;268286;268287;268288;268289;268290;268291;268292;268293;268294;268295;268296;268297;268298;268299;268300 268298 21 KDGNASGTTLLEALDCILPPTR Unmodified 2341.1948 0.19476 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 0 1 1 1 1 149.34 149.34 3 1.8307E-05 153476 QUIQUE_C1277_190116_001 44.863 34.18 90204000 25725000 29019000 0 0 0 35460000 0 0 0 0 0 0 0 23269 2794 21878 209717;209718;209719 268301;268302;268303 268302 3 KDGNASGTTLLEALDCILPPTRPTDK Unmodified 2782.4171 0.41710838 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 135.75 135.75 3;4 3.2106E-29 141569 QUIQUE_C1218_190116_001 129.62 123.18 3192000000 549270000 516490000 405270000 442980000 145940000 240150000 227030000 0 73484000 0 350480000 79578000 161330000 23270 2794 21879 209720;209721;209722;209723;209724;209725;209726;209727;209728;209729;209730;209731;209732;209733;209734 268304;268305;268306;268307;268308;268309;268310;268311;268312;268313;268314;268315;268316;268317;268318;268319;268320;268321;268322 268307 18 KDGTHVVENVDATHIGK Unmodified 1818.9224 0.92242497 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 22.958 22.958 3;4 3.3529E-05 16170 QUIQUE_C1277_190116_001 75.682 63.164 795150000 35372000 48918000 93055000 270060000 86715000 0 68842000 22677000 0 0 98918000 0 70596000 23271 1785 21880 209735;209736;209737;209738;209739;209740;209741;209742;209743;209744 268323;268324;268325;268326;268327;268328;268329;268330;268331;268332;268333 268324 11 KDHADVSNQLYACYAIGK Unmodified 2051.9735 0.97347426 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 0 1 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 62.209 62.209 2;3;4 8.851E-182 61523 QUIQUE_DMIX1_190116_001 256.52 239.31 1638000000 105780000 180680000 104080000 123920000 114190000 125150000 153410000 140380000 116140000 61279000 139710000 114810000 158500000 23272 2175 21881 209745;209746;209747;209748;209749;209750;209751;209752;209753;209754;209755;209756;209757;209758;209759;209760;209761;209762;209763;209764;209765;209766;209767;209768;209769;209770;209771;209772 268334;268335;268336;268337;268338;268339;268340;268341;268342;268343;268344;268345;268346;268347;268348;268349;268350;268351;268352;268353;268354;268355;268356;268357;268358;268359;268360;268361;268362;268363;268364;268365 268351 32 KDHEEWICTINNISK Unmodified 1885.8992 0.89924668 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 69.875 69.875 2;3 0.000923 70876 QUIQUE_C1438_190116_001 76.728 62.919 68230000 0 0 0 0 0 0 44111000 0 0 0 24119000 0 0 23273 4475 21882 209773;209774;209775 268366;268367;268368 268366 3 KDHPFGFVAVPTK Unmodified 1441.7718 0.77178497 577 H3BQQ9;B0QYN7;P63279;H3BPC4 UBE2I SUMO-conjugating enzyme UBC9 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 52.029 52.029 2;3 5.9197E-06 50052 QUIQUE_C1277_190116_001 127.17 113.06 1598600000 87903000 186060000 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154490000 169890000 83069000 118220000 132340000 101130000 229450000 63610000 74382000 45599000 131810000 0 134120000 23276 869 21885 209794;209795;209796;209797;209798;209799;209800;209801;209802;209803;209804;209805;209806;209807;209808 268387;268388;268389;268390;268391;268392;268393;268394;268395;268396;268397;268398;268399;268400;268401;268402 268397 12 KDIENQYETQITQIEHEVSSSGQEVQSSAK Unmodified 3391.6016 0.60155092 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 1 1 1 121.95 121.95 4 6.1061E-09 119086 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.641 54.229 198340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 78557000 0 0 119780000 + 23277 780 21886 209809;209810 268403;268404 268403 2 KDIPSFER Unmodified 990.51345 0.51344502 2512 R4GMR5;P48556;K7EJR3 PSMD8 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 yes no 0 0 1 1 1 25.582 25.582 2 0.034063 19643 QUIQUE_C1277_190116_001 73.665 12.983 69778000 0 36230000 33549000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23278 2512 21887 209811;209812 268405;268406 268405 2 KDITAALAAER Unmodified 1157.6404 0.64043645 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 1 2 1 1 1 38.511 38.511 2;3 0.0089176 35061 QUIQUE_C1218_190116_001 67.726 35.371 194780000 82578000 31296000 0 39865000 0 0 41044000 0 0 0 0 0 0 23279 269;2893 21888 209813;209814;209815;209816;209817 268407;268408;268409;268410;268411 268407 5 KDLEEAGGLGTEFSELPGK Unmodified 1975.9739 0.97385141 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.46 92.46 3 0.0021349 95869 QUIQUE_C1438_190116_001 43.598 34.193 298350000 22415000 0 0 0 30730000 0 0 0 0 19789000 115170000 32089000 78152000 23280 2515 21889 209818;209819;209820;209821;209822;209823 268412;268413;268414;268415;268416;268417 268413 3 KDLEQIFCQFDPK Unmodified 1666.8025 0.80249275 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 116.65 116.65 3 0.0019556 121646 QUIQUE_C1218_190116_001 46.66 40.628 30676000 11687000 0 18988000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23281 4487 21890 209824;209825 268418;268419 268418 2 KDLLPSDMAVALLEAQAGTGHIIDPATSAR Unmodified 3060.5914 0.59138435 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 146.98 146.98 4 2.7394E-13 152418 QUIQUE_C1368_190116_001 67.055 60.894 180100000 0 0 69909000 0 42786000 0 67408000 0 0 0 0 0 0 23282 3117 21891 209826;209827;209828 268420;268421;268422 268420 3 KDLNSDMDSILASLK Unmodified 1648.8342 0.83418681 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.93 126.93 3 3.2562E-06 130983 QUIQUE_C1403_190116_001 81.428 69.988 188790000 19500000 14862000 28207000 17897000 0 18475000 0 0 26198000 0 30806000 15849000 16999000 23283 1153 21892 209829;209830;209831;209832;209833;209834;209835;209836;209837 268423;268424;268425;268426;268427;268428;268429;268430;268431;268432 268426 9 KDLTEYLSR Unmodified 1123.5873 0.58733824 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 0 1 2 53.311 53.311 3 0.046034 51561 QUIQUE_C1368_190116_001 47.302 22.526 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23284 39 21893 209838;209839 268433;268434 268433 2 KDLYANNVLSGGTTMYPGIADR Unmodified 2355.1529 0.15289519 2792;2759 P62736;P63267;P68032 ACTA2;ACTG2;ACTC1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1 no no 0 0 1 2 2 1 100.48 100.48 2;3 9.28E-77 102698 QUIQUE_C1277_190116_001 180.39 153.86 658230000 228650000 325380000 0 104210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23285 2759;2792 21894 209840;209841;209842;209843;209844 268435;268436;268437;268438;268439;268440 268439 5 KDLYANTVLSGGTTMYPGIADR Oxidation (M) 2358.1526 0.15256084 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 1 1 1 2 2 2 1 1 1 2 2 2 2 2 1 91.943 91.943 2;3 2.0027E-129 94978 QUIQUE_C1218_190116_001 221.47 201.09 12993000000 200930000 1427600000 1918200000 1357800000 166020000 134500000 147130000 1006300000 1323400000 1180600000 2364600000 1513400000 252830000 23286 447;2696;2788 21895 209845;209846;209847;209848;209849;209850;209851;209852;209853;209854;209855;209856;209857;209858;209859;209860;209861;209862;209863;209864;209865 268441;268442;268443;268444;268445;268446;268447;268448;268449;268450;268451;268452;268453;268454;268455;268456;268457;268458;268459;268460;268461;268462;268463;268464;268465;268466;268467 268441 320 27 KDLYANTVLSGGTTMYPGIADR Unmodified 2342.1576 0.15764621 2788;2696;447 A0A2R8Y793;P60709;P63261 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 2 2 3 2 2 3 2 2 2 2 2 103.69 103.69 2;3 0 106558 QUIQUE_C1368_190116_001 339.11 326.01 37177000000 3856000000 3837900000 4272900000 4276100000 2627500000 2947600000 3198200000 1703900000 1836800000 742720000 3589500000 1913400000 2374100000 23287 447;2696;2788 21895 209866;209867;209868;209869;209870;209871;209872;209873;209874;209875;209876;209877;209878;209879;209880;209881;209882;209883;209884;209885;209886;209887;209888;209889;209890;209891;209892;209893 268468;268469;268470;268471;268472;268473;268474;268475;268476;268477;268478;268479;268480;268481;268482;268483;268484;268485;268486;268487;268488;268489;268490;268491;268492;268493;268494;268495;268496;268497;268498;268499;268500;268501;268502;268503;268504;268505;268506;268507;268508;268509;268510;268511;268512;268513;268514;268515;268516;268517;268518;268519;268520;268521 268477 54 KDNDFIYHDR Unmodified 1321.6051 0.60511357 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 20.357 20.357 2;3 1.0042E-13 12968 QUIQUE_C1277_190116_001 169.58 132.82 2358500000 59961000 297810000 257580000 252450000 303770000 241530000 243240000 32971000 273570000 0 72034000 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Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 1 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 125.73 125.73 2;3 4.9355E-104 131089 QUIQUE_C1218_190116_001 256.81 218.79 6749100000 752100000 663410000 596400000 563660000 628140000 459270000 730910000 305520000 399930000 253740000 493260000 470280000 432460000 23291 50 21899 209917;209918;209919;209920;209921;209922;209923;209924;209925;209926;209927;209928;209929;209930;209931;209932;209933;209934;209935;209936;209937;209938;209939;209940;209941;209942;209943 268546;268547;268548;268549;268550;268551;268552;268553;268554;268555;268556;268557;268558;268559;268560;268561;268562;268563;268564;268565;268566;268567;268568;268569;268570;268571;268572;268573;268574;268575;268576;268577;268578;268579;268580;268581;268582;268583;268584;268585;268586;268587;268588;268589;268590;268591;268592;268593;268594;268595;268596 268547 51 KDPELWGSVLLESNPYRR Unmodified 2158.1171 0.11710203 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 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210336;210337;210338;210339;210340;210341;210342;210343;210344;210345;210346;210347;210348;210349;210350;210351;210352;210353;210354;210355;210356;210357;210358;210359;210360;210361;210362;210363;210364 269074;269075;269076;269077;269078;269079;269080;269081;269082;269083;269084;269085;269086;269087;269088;269089;269090;269091;269092;269093;269094;269095;269096;269097;269098;269099;269100;269101;269102;269103;269104;269105;269106;269107;269108;269109;269110;269111;269112;269113;269114;269115;269116;269117;269118;269119;269120;269121;269122;269123;269124;269125;269126 269079 51 KEDLYLKPIQR Unmodified 1401.798 0.79799972 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 32.222 32.222 2;3 0.00045754 27223 QUIQUE_C1277_190116_001 142.71 126.95 2249000000 0 388770000 642150000 0 407710000 31221000 68735000 328710000 336260000 0 45453000 0 0 23338 2058 21943 210365;210366;210367;210368;210369;210370;210371;210372;210373 269127;269128;269129;269130;269131;269132;269133;269134;269135 269127 4 KEDMTYAVR Unmodified 1111.5332 0.53319418 1294 J3KTL2;Q07955;J3KSR8 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 20.296 20.296 2;3 8.6959E-05 13443 QUIQUE_DMIX4_190116_001 146.27 73.783 3032800000 223250000 389310000 300530000 318180000 281580000 109570000 272980000 61181000 267660000 55946000 411510000 266740000 74327000 23339 1294 21944 210374;210375;210376;210377;210378;210379;210380;210381;210382;210383;210384;210385;210386;210387;210388;210389;210390;210391;210392;210393;210394;210395;210396 269136;269137;269138;269139;269140;269141;269142;269143;269144;269145;269146;269147;269148;269149;269150;269151;269152;269153;269154;269155;269156;269157;269158 269152 22 KEDQGIYTCVATNILGK Unmodified 1908.9615 0.96151259 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 1 3 2 2 2 1 2 1 1 1 1 95.104 95.104 2;3 1.7727E-52 98981 QUIQUE_C1218_190116_001 216 175.41 1830100000 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269183;269184;269185;269186;269187;269188;269189;269190;269191;269192;269193;269194;269195;269196;269197;269198;269199;269200;269201;269202;269203;269204;269205;269206;269207;269208;269209;269210 269186 26 KEEEASFWK Unmodified 1152.5451 0.54513908 4163 Q9H425;E5RI90 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes no 0 0 1 1 33.748 33.748 2 0.040966 29498 QUIQUE_C1438_190116_001 75.509 35.846 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23342 4163 21947 210431 269211 269211 1 KEEEAVLVGGEWSPSLDGLDPQADPQVLVR Unmodified 3232.6252 0.6251869 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119;E5RHJ4 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 140.5 140.5 3 1.188E-30 143255 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.312 86.185 171570000 47152000 55727000 0 0 0 0 0 43128000 0 25565000 0 0 0 23343 3571 21948 210432;210433;210434;210435 269212;269213;269214;269215 269214 4 KEEECESYTVR Unmodified 1428.6191 0.61910866 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 16.937 16.937 2;3 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3048 21951 210456;210457;210458 269236;269237;269238 269236 3 KEEEKEELMEWWK Unmodified 1792.8342 0.83418681 2113 P16870 CPE Carboxypeptidase E yes yes 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 83.706 83.706 2;3 0.0016802 86595 QUIQUE_C1218_190116_001 78.505 72.379 820150000 101790000 98879000 97846000 21680000 51791000 49048000 94176000 68738000 64323000 0 0 74764000 97123000 23347 2113 21952 210459;210460;210461;210462;210463;210464;210465;210466;210467;210468;210469;210470 269239;269240;269241;269242;269243;269244;269245;269246;269247;269248;269249;269250 269239 8 KEEELQAALAR Unmodified 1256.6725 0.67246486 2378;3459;2385 P35579;P35749;Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH9;MYH11;MYH14 Myosin-9;Myosin-11;Myosin-14 no no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 2 33.966 33.966 2;3 6.5046E-46 29265 QUIQUE_C1277_190116_001 205.59 172.75 2479200000 139090000 201280000 191830000 303820000 268970000 145310000 194490000 168210000 151950000 98463000 209440000 226170000 180190000 23348 2378;2385;3459 21953 210471;210472;210473;210474;210475;210476;210477;210478;210479;210480;210481;210482;210483;210484;210485;210486;210487;210488;210489 269251;269252;269253;269254;269255;269256;269257;269258;269259;269260;269261;269262;269263;269264;269265;269266;269267;269268;269269;269270;269271 269254 21 KEEELQGALAR Unmodified 1242.6568 0.65681479 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 25.633 25.633 2;3 2.0699E-05 19514 QUIQUE_C1218_190116_001 142.71 111.64 529760000 52945000 186440000 0 86596000 0 0 0 53165000 81293000 17611000 0 51707000 0 23349 2379 21954 210490;210491;210492;210493;210494;210495;210496;210497 269272;269273;269274;269275;269276;269277;269278;269279;269280;269281 269273 9 KEEITGTLR Unmodified 1045.5768 0.57677356 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 18.395 18.395 2 0.023309 11032 QUIQUE_C1218_190116_001 66.692 36.507 206310000 50454000 91759000 0 0 0 0 0 0 64101000 0 0 0 0 23350 4600 21955 210498;210499;210500 269282;269283;269284 269282 3 KEELIGIAYNR Unmodified 1304.7089 0.70885036 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8;H0YJB6 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 54.757 54.757 2;3 0.0012106 52385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.804 17.127 224980000 52267000 29851000 0 0 33973000 0 0 43979000 0 64911000 0 0 0 23351 3800 21956 210501;210502;210503;210504;210505;210506;210507;210508;210509;210510 269285;269286;269287;269288;269289;269290;269291;269292;269293;269294 269291 9 KEELMFFLWAPELAPLK Unmodified 2061.1009 0.1009066 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 162.29 162.29 2;3 1.4797E-16 164626 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.54 135.4 2191100000 19903000 34802000 43282000 17203000 24885000 14385000 88751000 209830000 484150000 16757000 687490000 401040000 148630000 23352 2702 21957 210511;210512;210513;210514;210515;210516;210517;210518;210519;210520;210521;210522;210523;210524;210525;210526 269295;269296;269297;269298;269299;269300;269301;269302;269303;269304;269305;269306;269307;269308;269309;269310 269303 16 KEELMFFLWAPELAPLK Oxidation (M) 2077.0958 0.095821226 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 0 1 1 1 1 1 1 153.42 153.42 2 7.9407E-09 156376 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.927 86.248 136420000 0 0 0 0 0 0 79588000 0 56828000 0 0 0 0 23353 2702 21957 210527;210528;210529;210530 269311;269312;269313;269314 269313 2137 4 KEELTLEGIK Unmodified 1158.6496 0.64960415 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 45.487 45.487 2;3 0.00020856 41933 QUIQUE_C1563_190116_001 121.93 81.98 4347800000 382530000 434850000 383100000 382800000 377050000 427300000 380530000 76989000 310930000 111190000 460460000 210580000 409510000 23354 3055 21958 210531;210532;210533;210534;210535;210536;210537;210538;210539;210540;210541;210542;210543;210544;210545;210546;210547;210548;210549;210550;210551;210552;210553 269315;269316;269317;269318;269319;269320;269321;269322;269323;269324;269325;269326;269327;269328;269329;269330;269331;269332;269333;269334;269335;269336;269337;269338;269339;269340;269341;269342;269343;269344 269329 30 KEELTLEGIR Unmodified 1186.6558 0.65575216 2697 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3KTN0 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 49.531 49.531 2;3 7.7093E-05 47688 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.66 34.596 1562900000 91192000 0 252030000 107090000 184660000 72567000 0 160090000 91783000 86073000 197370000 131000000 189000000 23355 2697 21959 210554;210555;210556;210557;210558;210559;210560;210561;210562;210563;210564;210565;210566;210567;210568;210569;210570;210571 269345;269346;269347;269348;269349;269350;269351;269352;269353;269354;269355;269356;269357;269358;269359;269360;269361;269362;269363;269364 269354 11 KEELVAEQALK Unmodified 1256.6976 0.69761697 873 E7ETZ4;Q9Y6E2;B5MCE7;B5MCH7 BZW2 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.766 28.766 2 0.0049752 23682 QUIQUE_C1218_190116_001 74.077 0 244260000 34985000 0 42429000 56281000 0 41851000 55365000 0 0 13346000 0 0 0 23356 873 21960 210572;210573;210574;210575;210576;210577 269365;269366;269367;269368;269369;269370;269371 269365 7 KEENLADWYSQVITK Unmodified 1822.9101 0.91012895 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 111.47 111.47 2;3 5.0517E-14 116176 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.09 138.42 321670000 48337000 40353000 0 40697000 47713000 26623000 0 12448000 29399000 29731000 0 46370000 0 23357 1929 21961 210578;210579;210580;210581;210582;210583;210584;210585;210586;210587;210588;210589;210590;210591;210592;210593 269372;269373;269374;269375;269376;269377;269378;269379;269380;269381;269382;269383;269384;269385;269386;269387;269388 269387 16 KEEQEVQATLESEEVDLNAGLHGNWTLENAK Unmodified 3480.6645 0.66448553 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 1 1 131.42 131.42 4 9.2404E-14 134198 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.632 65.313 55301000 0 0 0 0 0 0 0 55301000 0 0 0 0 0 23358 2916 21962 210594 269389 269389 1 KEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGK Unmodified 4504.2009 0.2009146 451 A0A2R8Y811;P62263;E5RH77 RPS14 40S ribosomal protein S14 yes no 0 0 1 1 160.91 160.91 4 0.0001417 168457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.12 35.415 50166000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50166000 0 0 23359 451 21963 210595 269390 269390 1 KEETQPPVALKK Unmodified 1366.782 0.78201531 3631 Q8NC51 SERBP1 Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein yes yes 0 0 2 1 1 1 12.804 12.804 3 0.046713 6291 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0.59242362 2112 P16615;H7C5W9;O14983;Q93084 ATP2A2;ATP2A1;ATP2A3 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3 yes no 0 0 1 1 58.635 58.635 3 0.043967 58406 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.937 20.694 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23365 2112 21969 210635 269435 269435 1 KEGDLIAAQAR Unmodified 1170.6357 0.63568542 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 1 1 1 1 1 1 22.229 22.229 2;3 0.0022329 14295 QUIQUE_C1403_190116_001 103.01 66.245 22788000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22788000 0 0 0 23366 1819;3223 21970 210636;210637;210638;210639;210640 269436;269437;269438;269439;269440 269437 5 KEGDLPPLWWYIVTRPR Unmodified 2125.1473 0.14727994 4658 Q9Y6M9;E9PH64 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 2 1 1 1 135.85 135.85 3;4 4.6982E-12 142644 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.25 114.63 80995000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51843000 16485000 12666000 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ERF3A no no 0 0 1 1 36.801 36.801 3 0.017541 32737 QUIQUE_DMIX8_190116_001 23.046 17.59 42762000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42762000 23376 2089 21980 210772 269622 269622 1 KEIADYLAAGKDER Unmodified 1577.8049 0.80493559 2635 P53990;H3BMU1;H3BUI0;H3BQF7;F5GXM3;H3BRE2;H3BPP6 IST1 IST1 homolog yes no 0 0 2 1 1 2 45.062 45.062 3 0.011069 41709 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.866 41.711 50605000 0 0 0 0 0 0 0 50605000 0 0 0 0 0 23377 2635 21981 210773;210774;210775;210776 269623;269624;269625;269626 269623 4 KEIEDAAQFATADPEPPLEELGYHIYSSDPPFEVR Unmodified 3959.8741 0.87414395 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 1 1 3 1 1 1 1 1 2 1 146.94 146.94 4 3.7246E-07 152897 QUIQUE_C1368_190116_001 48.265 42.169 1222700000 127220000 245020000 117080000 0 0 0 122040000 0 88113000 43745000 160280000 199600000 119620000 23378 1943 21982 210777;210778;210779;210780;210781;210782;210783;210784;210785;210786;210787;210788 269627;269628;269629;269630;269631;269632;269633;269634;269635;269636;269637;269638;269639 269631 9 KEIEMHSINDK Unmodified 1342.6551 0.65510023 1348 K7ERC8;Q06136;K7EQS7 KDSR 3-ketodihydrosphingosine reductase yes no 0 0 1 1 1 1 1 15.263 15.263 3 0.0028477 7449 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.932 53.522 90247000 30939000 0 0 35463000 0 0 0 0 23844000 0 0 0 0 23379 1348 21983 210789;210790;210791;210792 269640;269641;269642;269643 269643 4 KEIEVDSSPSVLEILDTAGTEQFASMR Unmodified 2951.4434 0.44338271 2720;1991;4595 P61225;F6U784;Q9Y3L5;P10114 RAP2B;RAP2A;RAP2C Ras-related protein Rap-2b;Ras-related protein Rap-2c;Ras-related protein Rap-2a no no 0 0 1 1 2 1 152.48 152.48 3 9.2079E-45 157059 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.41 114.73 84508000 0 0 0 0 0 31999000 0 52509000 0 0 0 0 0 23380 2720;4595;1991 21984 210793;210794;210795;210796 269644;269645;269646;269647 269647 3 KEIHTVPDMGK Unmodified 1253.6438 0.64380726 3123 Q15257;A6PVN5;Q5T949;Q5T948;Q68CR8;A6PVN6 PPP2R4;DKFZp781M17165 Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 15.405 15.405 3 0.0010489 7652 QUIQUE_C1368_190116_001 72.531 51.418 1458400000 0 0 382950000 0 357510000 0 0 0 0 90748000 0 339520000 287710000 23381 3123 21985 210797;210798;210799;210800;210801 269648;269649;269650;269651;269652 269648 5 KELEEDFIK Unmodified 1149.5918 0.59175492 3040 Q14019;H3BT58 COTL1 Coactosin-like protein yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 45.454 45.454 2;3 2.6625E-07 42161 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.88 74.735 2601300000 371190000 329420000 125200000 99497000 0 0 265230000 331520000 195620000 235360000 363900000 284390000 0 23382 3040 21986 210802;210803;210804;210805;210806;210807;210808;210809;210810;210811;210812;210813;210814;210815;210816;210817;210818 269653;269654;269655;269656;269657;269658;269659;269660;269661;269662;269663;269664;269665;269666;269667;269668;269669;269670 269668 14 KELENLATSLEHYK Unmodified 1673.8625 0.86245047 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.697 68.697 3 7.3874E-05 68101 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.47 56.957 364530000 47477000 0 47908000 0 50272000 0 66094000 0 0 21570000 58552000 0 72653000 23383 348 21987 210819;210820;210821;210822;210823;210824;210825;210826 269671;269672;269673;269674;269675;269676;269677;269678;269679;269680 269679 10 KELEQIFCQFDSK Unmodified 1670.7974 0.79740737 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 94.197 94.197 2;3 0.00010997 96570 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.679 52.46 386040000 30572000 42828000 90910000 36821000 29313000 43596000 36621000 0 0 0 35022000 0 40360000 23384 903;2869 21988 210827;210828;210829;210830;210831;210832;210833;210834;210835;210836;210837 269681;269682;269683;269684;269685;269686;269687;269688;269689;269690;269691;269692 269692 11 KELEQVCNPIISGLYQGAGGPGPGGFGAQGPK Unmodified 3182.5819 0.5818823 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 1 1 2 120.39 120.39 3 1.1381E-36 118077 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.48 98.882 107370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52186000 55184000 0 0 23385 282 21989 210838;210839;210840 269693;269694;269695 269693 3 KELGLTEQDIIDLPALFK Unmodified 2042.13 0.12995813 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 149.8 149.8 2;3 2.9856E-05 156630 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.19 107.58 1251900000 23894000 30186000 74300000 100660000 93111000 0 118220000 110170000 232380000 60424000 148710000 90460000 169350000 23386 4560 21990 210841;210842;210843;210844;210845;210846;210847;210848;210849;210850;210851;210852;210853;210854 269696;269697;269698;269699;269700;269701;269702;269703;269704;269705;269706;269707;269708;269709;269710;269711 269708 16 KELIINEILVMK Unmodified 1441.8578 0.85782279 2974 Q13177;H7C1X3 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 107.03 107.03 2;3 0.00016707 110110 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.202 84.369 305310000 0 0 53718000 0 28694000 13537000 0 26147000 40851000 0 58823000 35452000 48082000 23387 2974 21991 210855;210856;210857;210858;210859;210860;210861;210862;210863;210864;210865;210866;210867;210868 269712;269713;269714;269715;269716;269717;269718;269719;269720;269721;269722;269723;269724;269725;269726 269720 15 KELIINEILVMR Unmodified 1469.864 0.8639708 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 111.1 111.1 2;3 0.0001143 113195 QUIQUE_C1563_190116_001 111.53 97.85 947230000 64261000 98913000 53194000 42284000 53439000 59772000 89230000 35751000 94979000 20836000 87964000 81776000 164830000 23388 2970;120 21992 210869;210870;210871;210872;210873;210874;210875;210876;210877;210878;210879;210880;210881;210882;210883 269727;269728;269729;269730;269731;269732;269733;269734;269735;269736;269737;269738;269739;269740;269741;269742;269743;269744;269745;269746 269735 20 KELIINEILVMR Oxidation (M) 1485.8589 0.85888542 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 1 1 1 1 92.769 92.769 3 0.0084333 90410 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.211 37.532 38490000 0 0 0 0 26883000 0 0 0 0 11607000 0 0 0 23389 2970;120 21992 210884;210885 269747;269748 269748 74 2 KELIPTEEALR Unmodified 1297.7242 0.72416608 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 50.916 50.916 3 0.0028909 49262 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.934 33.021 81978000 0 0 0 0 0 0 0 12997000 31458000 0 37523000 0 0 23390 3117 21993 210886;210887;210888 269749;269750;269751 269749 3 KELIVDAEDTWIR Unmodified 1586.8304 0.83042206 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 94.469 94.469 2;3 4.4772E-08 96381 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.07 92.134 537610000 0 42026000 0 0 29388000 26682000 74145000 55648000 42731000 27485000 77269000 70865000 91373000 23391 3753 21994 210889;210890;210891;210892;210893;210894;210895;210896;210897;210898;210899;210900;210901 269752;269753;269754;269755;269756;269757;269758;269759;269760;269761;269762;269763;269764;269765 269758 13 KELNYFAK Unmodified 1011.5389 0.53893149 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.455 24.455 2 0.0034686 19241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.8 72.532 3416400000 0 324710000 0 343640000 0 0 539860000 383160000 0 104510000 619890000 489340000 611330000 23392 1790 21995 210902;210903;210904;210905;210906;210907;210908;210909 269766;269767;269768;269769;269770;269771;269772;269773;269774;269775;269776;269777;269778 269771 13 KELPQDLEGAR Unmodified 1254.6568 0.65681479 1674 O75962;E7EWP2;F5H228 TRIO Triple functional domain protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 12.248 12.248 3 0.022139 3275 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210918;210919;210920;210921;210922;210923;210924;210925 269787;269788;269789;269790;269791;269792;269793;269794 269788 8 KELSDIALR Unmodified 1043.5975 0.597509 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 36.363 36.363 2 0.003298 32561 QUIQUE_C1218_190116_001 95.502 35.065 856680000 220670000 0 248610000 0 0 0 0 0 0 99294000 288100000 0 0 23396 1978 21999 210926;210927;210928;210929 269795;269796;269797;269798 269795 1 KELSLLVLLPDDGVELSTVEK Unmodified 2296.2777 0.27774457 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 1 1 144.39 144.39 3 0.054788 152132 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.299 19.015 38763000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38763000 0 0 23397 2564 22000 210930 269799 269799 0 KENCPACSQLPQNIQFSPSAK Unmodified 2403.1311 0.13111389 3664 Q8TBC4;F8W8D4 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 1 1 68.107 68.107 3 0.01599 68700 QUIQUE_C1576_190116_001 29.333 21.8 35946000 0 0 0 0 0 0 35946000 0 0 0 0 0 0 23398 3664 22001 210931 269800 269800 1 KENEEWICAINNISR Unmodified 1874.8945 0.89449566 3645 Q8NEU8 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes yes 0 0 1 1 1 1 95.872 95.872 3 0.034477 98306 QUIQUE_C1403_190116_001 27.983 20.391 114990000 0 0 0 38970000 0 36805000 0 0 0 0 39219000 0 0 23399 3645 22002 210932;210933;210934 269801;269802;269803 269801 1 KENPLQFK Unmodified 1002.5498 0.54983053 859;434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E9PNV3;A0A2R8Y5P0;E9PQ82;E7EQR4;P15311 RDX;EZR Radixin;Ezrin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.727 22.727 2 1.9785E-21 15826 QUIQUE_C1277_190116_001 199.29 152.24 7256600000 640970000 585980000 523100000 611190000 523570000 431080000 558430000 371810000 678710000 314530000 752480000 592860000 671850000 23400 434;859 22003 210935;210936;210937;210938;210939;210940;210941;210942;210943;210944;210945;210946;210947 269804;269805;269806;269807;269808;269809;269810;269811;269812;269813;269814;269815;269816 269805 7 KEPAVLELEGK Unmodified 1211.6762 0.67615325 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 41.798 41.798 2;3 0.0037989 37867 QUIQUE_C1403_190116_001 104.82 66.048 3165300000 484600000 281610000 581100000 337750000 0 320630000 313680000 69903000 164590000 76731000 368140000 166570000 0 23401 2857 22004 210948;210949;210950;210951;210952;210953;210954;210955;210956;210957;210958;210959;210960;210961;210962 269817;269818;269819;269820;269821;269822;269823;269824;269825;269826;269827;269828;269829;269830;269831 269822 7 KEPAVLELEGKK Unmodified 1339.7711 0.77111627 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 24.934 24.934 3 0.0092091 19071 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.357 70.408 1497800000 0 213510000 125400000 0 0 0 0 0 425860000 0 502780000 230220000 0 23402 2857 22005 210963;210964;210965;210966;210967 269832;269833;269834;269835;269836 269834 1 KEPEPKDEVLQQK Unmodified 1566.8253 0.82533668 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 16.929 16.929 2;3 0.0017038 10126 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.866 77.261 1305800000 0 98945000 77195000 64900000 90087000 80084000 107230000 201520000 114290000 0 204370000 98152000 169010000 23403 921 22006 210968;210969;210970;210971;210972;210973;210974;210975;210976;210977;210978;210979 269837;269838;269839;269840;269841;269842;269843;269844;269845;269846;269847;269848 269844 10 KEPFELEAFYTNLHEVPYPDAR Unmodified 2664.286 0.28601785 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 127.26 127.26 3;4 3.796E-08 132883 QUIQUE_C1218_190116_001 82.593 77.793 1018900000 51300000 178590000 62906000 43698000 90840000 68150000 66210000 135780000 64290000 20109000 67136000 76704000 93176000 23404 1748 22007 210980;210981;210982;210983;210984;210985;210986;210987;210988;210989;210990;210991;210992;210993;210994 269849;269850;269851;269852;269853;269854;269855;269856;269857;269858;269859;269860;269861;269862;269863;269864;269865;269866;269867;269868;269869;269870 269850 20 KEPFFHGHDNYDQLVR Unmodified 2000.9493 0.94930842 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2 CSNK2A1 Casein kinase II subunit alpha yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 50.794 50.794 3;4 1.1558E-05 49084 QUIQUE_C1438_190116_001 97.631 76.098 1065000000 133270000 40792000 73524000 0 130340000 62021000 107570000 0 65599000 0 201750000 109510000 140600000 23405 456 22008 210995;210996;210997;210998;210999;211000;211001;211002;211003;211004;211005;211006;211007 269871;269872;269873;269874;269875;269876;269877;269878;269879;269880;269881;269882;269883;269884 269876 13 KEPFTLEAYYSSPQDLPYPDPAIAQFSVQK Unmodified 3428.6816 0.68163914 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 145.5 145.5 3 1.6425E-19 148032 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.152 62.203 355810000 0 0 0 72456000 0 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dynein 1 intermediate chain 1 no no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 19.052 19.052 2;3 0.00012791 12248 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.09 89.272 702460000 0 72129000 83593000 140530000 78799000 61969000 0 0 34848000 0 47732000 38518000 144350000 23409 690;1435 22012 211021;211022;211023;211024;211025;211026;211027;211028;211029;211030;211031;211032;211033;211034;211035;211036;211037;211038;211039 269899;269900;269901;269902;269903;269904;269905;269906;269907;269908;269909;269910;269911;269912;269913;269914;269915;269916;269917 269908 19 KEPVQDDSDLDRK Unmodified 1543.7478 0.74781464 1435;690 C9J3E7;E5RJ75;E5RFE1;O14576 DYNC1I1 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1 no no 0 0 2 1 1 1 1 1 12.997 12.997 3 0.0017002 5170 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.764 63.971 151890000 22492000 0 0 0 0 8412300 0 41949000 0 0 0 19220000 59818000 23410 690;1435 22013 211040;211041;211042;211043;211044 269918;269919;269920;269921;269922 269921 5 KEQEFPVEPVGEK Unmodified 1514.7617 0.76167379 1610 O75116;E9PF63;Q14DU5 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22017 211071;211072;211073;211074;211075;211076;211077;211078;211079;211080;211081;211082;211083;211084;211085;211086;211087;211088;211089;211090;211091;211092;211093;211094;211095;211096;211097;211098;211099;211100 269953;269954;269955;269956;269957;269958;269959;269960;269961;269962;269963;269964;269965;269966;269967;269968;269969;269970;269971;269972;269973;269974;269975;269976;269977;269978;269979;269980;269981;269982;269983;269984;269985;269986;269987;269988;269989;269990;269991;269992;269993;269994;269995;269996;269997;269998;269999;270000;270001;270002;270003;270004 269988 52 KESPLLFK Unmodified 960.56442 0.56441796 2248 P26038;V9GZ54 MSN Moesin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.361 31.361 2 0.0004044 25728 QUIQUE_C1368_190116_001 160.63 89.288 1813900000 268290000 170130000 254060000 270870000 158680000 155640000 205820000 0 170490000 0 0 159930000 0 23416 2248 22018 211101;211102;211103;211104;211105;211106;211107;211108;211109 270005;270006;270007;270008;270009;270010;270011;270012;270013;270014;270015 270008 11 KESYSALMR Unmodified 1083.5383 0.53827956 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 25.891 25.891 2;3 0.0029948 20444 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.635 46.932 372070000 50930000 0 0 0 0 26962000 0 191760000 0 0 102430000 0 0 23417 3117 22019 211110;211111;211112;211113;211114;211115;211116 270016;270017;270018;270019;270020;270021;270022 270018 5 KESYSIYVYK Unmodified 1278.6496 0.64960415 1910 Q8N257;Q16778;P33778;P23527;P06899;Q6DRA6;Q6DN03 HIST3H2BB;HIST2H2BE;HIST1H2BB;HIST1H2BO;HIST1H2BJ;HIST2H2BD;HIST2H2BC Histone H2B type 3-B;Histone H2B type 2-E;Histone H2B type 1-B;Histone H2B type 1-O;Histone H2B type 1-J;Putative histone H2B type 2-D;Putative histone H2B type 2-C yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 46.151 46.151 2;3 9.8063E-14 43643 QUIQUE_C1277_190116_001 169.76 147.67 7383900000 740560000 700530000 402550000 430750000 818130000 69596000 946410000 530560000 621140000 87564000 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ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 75.299 75.299 3 0.0060991 76183 QUIQUE_C1218_190116_001 52.49 31.79 11361000 11361000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23422 2253 22024 211161;211162 270075;270076 270075 2 KETNNAAIIMK Unmodified 1231.6595 0.65945733 2703 P60983;G3V4P8 GMFB Glia maturation factor beta yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 2 1 19.295 19.295 2;3 0.00045702 12207 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.22 86.809 521080000 48497000 56649000 48928000 36783000 23319000 51852000 65963000 0 36008000 14288000 36573000 52282000 49935000 23423 2703 22025 211163;211164;211165;211166;211167;211168;211169;211170;211171;211172;211173;211174;211175;211176;211177;211178;211179;211180 270077;270078;270079;270080;270081;270082;270083;270084;270085;270086;270087;270088;270089;270090;270091;270092;270093;270094 270088 18 KEVCQLLPFLVR Unmodified 1500.8487 0.84865508 4393 Q9UBB6;H7C2R2 NCDN Neurochondrin yes no 0 0 1 1 1 1 1 109.31 109.31 3 0.0085538 112472 QUIQUE_C1368_190116_001 48.044 39.224 71231000 19097000 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1281.6863 0.68634078 759 C9JZR2;O60716;E9PKY0 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 17.095 17.095 3 0.00012629 9172 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.301 56.886 181880000 0 0 0 0 29511000 0 0 32380000 31896000 0 0 32651000 55446000 23427 759 22029 211200;211201;211202;211203;211204 270115;270116;270117;270118;270119;270120 270120 5 KEWDLKPIADR Unmodified 1369.7354 0.73539946 2295 P30038;Q5TF55 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 42.015 42.015 2;3 0.00016663 38751 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.71 109.23 5098500000 105320000 93513000 758960000 690960000 478660000 786110000 0 488210000 81928000 229840000 524180000 359130000 501660000 23428 2295 22030 211205;211206;211207;211208;211209;211210;211211;211212;211213;211214;211215;211216;211217;211218;211219;211220;211221;211222 270121;270122;270123;270124;270125;270126;270127;270128;270129;270130;270131;270132;270133;270134;270135;270136;270137;270138;270139;270140;270141;270142 270136 14 KEWSGLLEELAR Unmodified 1429.7565 0.75652884 2861 Q01813;Q5VSR5;V9GYV7 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 107.84 107.84 2;3 7.873E-07 110796 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.24 81.973 2439200000 113610000 144490000 236290000 259290000 215110000 169190000 231090000 86685000 185540000 71199000 214410000 256710000 255530000 23429 2861 22031 211223;211224;211225;211226;211227;211228;211229;211230;211231;211232;211233;211234;211235;211236;211237;211238;211239;211240;211241;211242;211243;211244;211245 270143;270144;270145;270146;270147;270148;270149;270150;270151;270152;270153;270154;270155;270156;270157;270158;270159;270160;270161;270162;270163;270164;270165;270166;270167;270168;270169;270170;270171;270172;270173;270174 270173 31 KEYGGLDVLVNNAGIAFK Unmodified 1907.0153 0.015262719 2102 P16152;E9PQ63;A8MTM1 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 120.86 120.86 2;3 2.5568E-76 125848 QUIQUE_C1576_190116_001 239.75 208.32 6859400000 389730000 408330000 590220000 449020000 613520000 539190000 692220000 452950000 685770000 200010000 613290000 557980000 667170000 23430 2102 22032 211246;211247;211248;211249;211250;211251;211252;211253;211254;211255;211256;211257;211258;211259;211260;211261;211262;211263;211264;211265;211266;211267;211268;211269;211270;211271 270175;270176;270177;270178;270179;270180;270181;270182;270183;270184;270185;270186;270187;270188;270189;270190;270191;270192;270193;270194;270195;270196;270197;270198;270199;270200;270201;270202;270203;270204;270205;270206;270207;270208;270209;270210;270211;270212 270191 38 KFAEAFEAIPR Unmodified 1277.6768 0.67682195 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 1 1 1 3 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 67.992 67.992 3 0.0010371 69013 QUIQUE_C1218_190116_001 61.435 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20660000 0 23575000 23272000 27984000 23433 2324 22035 211293;211294;211295;211296;211297;211298;211299 270234;270235;270236;270237;270238;270239;270240;270241 270235 7 KFCTTGIDGAMTIWDFK Unmodified 1989.9329 0.932855 3752 Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A yes yes 0 0 1 1 128.33 128.33 2 0.0054973 131974 QUIQUE_C1403_190116_001 75.669 65.881 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23434 3752 22036 211300 270242 270242 1 KFDAISAELLNWILK Unmodified 1759.9873 0.98725705 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 1 1 164.37 164.37 3 0.038226 171836 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.152 21.667 19939000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19939000 0 0 23435 2486 22037 211301 270243 270243 1 KFDDFQK Unmodified 926.44978 0.44978213 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 20.311 20.311 2 0.028856 12741 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.18 79.043 794860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 794860000 0 0 0 23436 267;275;3025 22038 211302 270244 270244 1 KFDELLHLASR 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270335;270336;270337;270338;270339;270340;270341;270342;270343;270344;270345;270346;270347;270348;270349;270350;270351;270352;270353;270354;270355;270356;270357;270358;270359;270360;270361;270362;270363;270364;270365;270366;270367;270368;270369;270370;270371;270372;270373;270374;270375;270376;270377;270378;270379;270380;270381;270382;270383;270384;270385;270386;270387;270388;270389;270390;270391;270392;270393;270394;270395;270396;270397;270398 270373 58 KFDLNSPWEAFPVYR Unmodified 1867.9257 0.92571943 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 132.96 132.96 2;3 6.145E-45 139203 QUIQUE_DMIX5_190116_001 216.84 191.99 4877000000 471930000 553190000 332920000 268030000 255310000 270390000 534050000 360240000 323990000 84367000 694820000 360200000 367530000 23443 1639 22045 211413;211414;211415;211416;211417;211418;211419;211420;211421;211422;211423;211424;211425;211426;211427;211428;211429;211430 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270423 32 KFDVNTSAVQVLIEHIGNLDR Unmodified 2367.2547 0.25465814 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 1 3 3 4 2 5 2 3 2 3 2 4 3 4 146.27 146.27 2;3;4 1.7662E-126 151048 QUIQUE_DMIX3_190116_001 269.49 245.66 49779000000 3966300000 3140200000 4098300000 8761500000 5162400000 1204200000 4272400000 3189200000 5137500000 741880000 3515100000 3075800000 3514400000 23445 50 22047 211456;211457;211458;211459;211460;211461;211462;211463;211464;211465;211466;211467;211468;211469;211470;211471;211472;211473;211474;211475;211476;211477;211478;211479;211480;211481;211482;211483;211484;211485;211486;211487;211488;211489;211490;211491;211492;211493;211494;211495 270450;270451;270452;270453;270454;270455;270456;270457;270458;270459;270460;270461;270462;270463;270464;270465;270466;270467;270468;270469;270470;270471;270472;270473;270474;270475;270476;270477;270478;270479;270480;270481;270482;270483;270484;270485;270486;270487;270488;270489;270490;270491;270492;270493;270494;270495;270496;270497;270498;270499;270500;270501;270502;270503;270504;270505;270506;270507;270508;270509;270510;270511;270512;270513;270514;270515;270516 270495 63 KFEDATVQSDMK Oxidation (M) 1413.6446 0.64459513 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 1 1 1 1 2 1 17.308 17.308 2;3 3.9006E-14 10190 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.24 139.19 620210000 0 0 0 0 0 0 0 68113000 142150000 231110000 178830000 0 0 23446 2643 22048 211496;211497;211498;211499;211500 270517;270518;270519;270520;270521 270517 2082 4 KFEDATVQSDMK Unmodified 1397.6497 0.6496805 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 28.714 28.714 2 9.2786E-07 22767 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270540;270541;270542;270543;270544;270545;270546;270547;270548;270549;270550;270551;270552;270553;270554;270555;270556;270557;270558;270559;270560;270561;270562;270563;270564 270562 168 18 KFEEFQTDMAAHEER Unmodified 1866.8207 0.82066201 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 3 3 3 3 4 3 3 3 3 3 3 3 3 46.79 46.79 2;3;4 1.9412E-164 43701 QUIQUE_DMIX5_190116_001 254.1 241.89 23206000000 3947300000 2297000000 2063200000 1673300000 1084200000 1773400000 1984300000 1465300000 1532000000 677270000 1524200000 1274300000 1910300000 23452 267;275;3025 22052 211541;211542;211543;211544;211545;211546;211547;211548;211549;211550;211551;211552;211553;211554;211555;211556;211557;211558;211559;211560;211561;211562;211563;211564;211565;211566;211567;211568;211569;211570;211571;211572;211573;211574;211575;211576;211577;211578;211579;211580 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Unmodified 1378.7092 0.70924429 4068 Q9BXX0 EMILIN2 EMILIN-2 yes yes 0 0 1 1 18.033 18.033 2 0.0038623 10762 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.009 38.961 15164000 0 0 0 0 0 0 0 15164000 0 0 0 0 0 23493 4068 22092 211963 271061 271061 1 KFQGIKHECQANGPEDLNR Unmodified 2240.0756 0.075647919 2702 P60981 DSTN Destrin yes yes 0 0 2 1 22.1 22.1 4 0.0072487 15391 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.382 39.624 44859000 0 0 0 0 0 0 0 44859000 0 0 0 0 0 23494 2702 22093 211964 271062 271062 1 KFSLAATR Unmodified 892.51305 0.51305109 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 20.283 20.283 2 0.02681 13302 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.438 14.635 766750000 0 228910000 0 87343000 0 0 0 276680000 173820000 0 0 0 0 23495 4356 22094 211965;211966;211967;211968 271063;271064;271065;271066 271066 4 KFSLDALITHVLPFEK Unmodified 1857.04 0.040020906 1774 P00325;D6RHZ6;V9HW50;P07327 ADH1B;HEL-S-117;ADH1A Alcohol dehydrogenase 1B;Alcohol dehydrogenase 1A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.32 141.32 3 8.2435E-07 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USP5;USP13 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13 no no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 114.83 114.83 2;3 0.0001503 119713 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.045 62.915 547130000 0 61648000 37416000 25403000 58858000 25200000 94898000 52125000 30145000 9509400 117860000 0 34065000 23499 2472;1239 22098 211982;211983;211984;211985;211986;211987;211988;211989;211990;211991;211992;211993;211994;211995;211996;211997;211998;211999 271081;271082;271083;271084;271085;271086;271087;271088;271089;271090;271091;271092;271093;271094;271095;271096;271097;271098;271099;271100 271097 20 KFTTDDSICVLGISK Unmodified 1682.8549 0.85492225 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 83.976 83.976 2 2.2225E-05 85976 QUIQUE_C1576_190116_001 94.09 74.958 211200000 32051000 31583000 38868000 33776000 0 0 42098000 32820000 0 0 0 0 0 23500 2861 22099 212000;212001;212002;212003;212004;212005 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Syntaxin-1B yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 58.128 58.128 2;3 1.0781E-65 56927 QUIQUE_C1576_190116_001 202.15 168.92 4861100000 365710000 576170000 585110000 488090000 385330000 326470000 599630000 233620000 294330000 109530000 444320000 105350000 347410000 23503 2721 22102 212024;212025;212026;212027;212028;212029;212030;212031;212032;212033;212034;212035;212036;212037;212038;212039;212040;212041;212042;212043;212044;212045;212046;212047;212048 271129;271130;271131;271132;271133;271134;271135;271136;271137;271138;271139;271140;271141;271142;271143;271144;271145;271146;271147;271148;271149;271150;271151;271152;271153;271154;271155;271156;271157 271144 25 KFVEVMTEYNATQSK Oxidation (M) 1789.8557 0.85565053 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.701 39.701 2 3.443E-35 35653 QUIQUE_C1368_190116_001 171.95 139.35 201260000 0 0 67172000 32214000 0 0 42677000 0 0 0 30718000 0 28477000 23504 2721 22102 212049;212050;212051;212052;212053;212054 271158;271159;271160;271161;271162;271163 271159 2155 6 KFVGGSGQVSER Unmodified 1249.6415 0.64149908 2261;2179 P21397;P27338 MAOA;MAOB Amine oxidase [flavin-containing] A;Amine oxidase [flavin-containing] B no no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 14.485 14.485 2;3 7.1153E-06 6276 QUIQUE_C1277_190116_001 112.84 89.121 11753000000 1057900000 1104000000 763190000 943450000 1069000000 460520000 1067600000 1432600000 0 220720000 699550000 1604900000 1329400000 23505 2179;2261 22103 212055;212056;212057;212058;212059;212060;212061;212062;212063;212064;212065;212066;212067;212068;212069;212070;212071;212072;212073;212074;212075 271164;271165;271166;271167;271168;271169;271170;271171;271172;271173;271174;271175;271176;271177;271178;271179;271180;271181;271182;271183;271184 271167 14 KFVIKPIDK Unmodified 1086.6801 0.68011642 859;2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 21.351 21.351 3 0.017573 14970 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271209;271210;271211;271212;271213;271214;271215;271216;271217;271218;271219;271220;271221;271222;271223;271224;271225;271226;271227;271228;271229;271230;271231;271232;271233;271234 271234 25 KFYPLEIDYGQDEEAVK Unmodified 2042.9837 0.98368782 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 1 1 98.886 98.886 3 0.028216 95469 QUIQUE_DMIX4_190116_001 19.791 16.187 31777000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31777000 0 0 0 23511 1974 22109 212119 271235 271235 1 KFYPLEIDYGQDEEAVKK Unmodified 2171.0787 0.078650837 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 2 1 1 80.784 80.784 3 0.025423 80970 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.611 42.196 35172000 0 0 0 0 0 0 0 35172000 0 0 0 0 0 23512 1974 22110 212120;212121 271236;271237 271236 2 KGADIMYTGTVDCWR Unmodified 1771.8022 0.80217518 2038;2039 P12235;P12236 SLC25A4;SLC25A6 ADP/ATP translocase 1;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 79.643 79.643 2;3 5.079E-09 80461 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271364 17 KGDIFLVR Unmodified 946.56 0.56000128 2658 P55072;C9IZA5;C9JUP7 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.295 42.295 2 0.0088832 37748 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.35 76.47 5916400000 588680000 685000000 617050000 714730000 0 648540000 0 802760000 804660000 285870000 0 769120000 0 23524 2658 22121 212244;212245;212246;212247;212248;212249;212250;212251;212252 271379;271380;271381;271382;271383;271384;271385;271386;271387 271386 1 KGDIIQLQR Unmodified 1069.6244 0.62439245 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 28.431 28.431 2;3 0.0074657 22693 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.423 27.553 387400000 0 0 70075000 32073000 0 38067000 29216000 0 48077000 0 99937000 46974000 22979000 23525 1929 22122 212253;212254;212255;212256;212257;212258;212259;212260;212261 271388;271389;271390;271391;271392;271393;271394;271395;271396 271394 9 KGDILTLLNSTNK Unmodified 1415.7984 0.79839365 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 87.961 87.961 2;3 1.792E-06 82149 QUIQUE_C1277_190116_001 124.45 109.06 12835000000 1358800000 1422300000 1391800000 1201200000 1290400000 1138300000 1196400000 305230000 619510000 668450000 799500000 618530000 824760000 23526 267;275;3025 22123 212262;212263;212264;212265;212266;212267;212268;212269;212270;212271;212272;212273;212274;212275;212276;212277;212278;212279;212280;212281;212282;212283;212284;212285;212286;212287;212288;212289 271397;271398;271399;271400;271401;271402;271403;271404;271405;271406;271407;271408;271409;271410;271411;271412;271413;271414;271415;271416;271417;271418;271419;271420;271421;271422;271423;271424;271425;271426;271427;271428;271429;271430;271431;271432;271433;271434;271435;271436;271437;271438;271439;271440;271441;271442;271443;271444;271445;271446;271447;271448;271449;271450;271451;271452;271453;271454;271455;271456;271457 271405 60 KGDILTLLNSTNKDWWK Unmodified 2031.0789 0.078925608 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 3 2 3 3 3 125.6 125.6 2;3;4 9.8127E-53 130867 QUIQUE_DMIX5_190116_001 207.4 164.32 12610000000 101540000 554890000 385940000 361760000 737860000 125120000 525980000 1789300000 2439200000 99390000 1815900000 1686600000 1986200000 23527 267;275;3025 22124 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271523;271524;271525;271526;271527;271528;271529;271530;271531;271532;271533;271534;271535;271536;271537;271538;271539 271535 14 KGDTFSCMVGHEALPLAFTQK Unmodified 2336.1293 0.12932297 401;287 A0A0G2JMB2;A0A286YEY1;P01876 IGHA1 Ig alpha-1 chain C region no no 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 101.46 101.46 3;4 1.7502E-10 105440 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.5 105.11 2431800000 0 177210000 67195000 233730000 393140000 110530000 113230000 222040000 0 123730000 402000000 268660000 320310000 23531 287;401 22128 212350;212351;212352;212353;212354;212355;212356;212357;212358;212359;212360;212361;212362;212363;212364;212365;212366;212367;212368;212369 271540;271541;271542;271543;271544;271545;271546;271547;271548;271549;271550;271551;271552;271553;271554;271555;271556;271557;271558;271559;271560;271561;271562;271563;271564;271565;271566;271567;271568 271559 29 KGDTFSCMVGHEALPLAFTQK Oxidation (M) 2352.1242 0.1242376 401;287 A0A0G2JMB2;A0A286YEY1;P01876 IGHA1 Ig alpha-1 chain C region no no 0 1 1 1 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Pyruvate kinase PKM;Pyruvate kinase no no 0 1 2 2 2 1 2 2 1 100.16 100.16 2;3;4 1.9321E-10 102277 QUIQUE_DMIX8_190116_001 108.25 98.794 3029200000 0 0 0 0 0 0 0 594530000 767010000 84417000 494950000 772460000 315880000 23538 2077 22133 212431;212432;212433;212434;212435;212436;212437;212438;212439;212440 271644;271645;271646;271647;271648;271649;271650;271651;271652;271653;271654;271655;271656;271657;271658;271659 271659 1401 15 KGDYIEAESSYSR Unmodified 1503.6842 0.68415175 3962 Q99614 TTC1 Tetratricopeptide repeat protein 1 yes yes 0 0 1 1 33.093 33.093 2 0.026641 28264 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.674 34.823 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23539 3962 22134 212441 271660 271660 1 KGEDEDKGPPCGPVNCNEK Unmodified 2128.9154 0.91536703 2901 Q06323;H0YLU2 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 16.641 16.641 3;4 2.0364E-54 8571 QUIQUE_C1277_190116_001 173.21 163.46 317360000 22980000 42192000 42047000 110130000 0 0 37629000 11259000 0 0 51124000 0 0 23540 2901 22135 212442;212443;212444;212445;212446;212447;212448;212449 271661;271662;271663;271664;271665;271666;271667;271668 271662 8 KGEDVLGSVR Unmodified 1058.572 0.57202253 2677 P56192;F5H2V6 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 24.621 24.621 2;3 0.0026395 18644 QUIQUE_C1218_190116_001 55.806 30.931 252510000 26025000 35811000 19684000 0 0 0 78137000 0 0 0 63436000 29412000 0 23541 2677 22136 212450;212451;212452;212453;212454;212455;212456;212457 271669;271670;271671;271672;271673;271674;271675;271676;271677;271678 271669 9 KGEEVTPISAIR Unmodified 1298.7194 0.71941505 143;4559;560;298 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;A0A0J9YW26;A8K968;A0A0J9YW31;Q9Y2J2;A0A0J9YWE1;A0A0J9YWN0 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 37.971 37.971 2;3 0.00013933 34068 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.539 77.307 7171500000 646380000 576480000 197670000 776120000 264520000 747810000 646360000 577540000 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271703;271704;271705;271706;271707;271708;271709;271710;271711;271712;271713;271714;271715;271716;271717;271718;271719 271712 14 KGEGDAATEQAAPQAPASSEEK Unmodified 2170.9978 0.99783433 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 1 3 3 3 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 21.479 21.479 2;3 4.4239E-130 14006 QUIQUE_DMIX7_190116_001 262.5 237.65 14775000000 1127400000 1705900000 1800300000 1790000000 1746000000 1390700000 1867300000 300490000 353030000 321390000 1013500000 417330000 941940000 23544 2128 22139 212494;212495;212496;212497;212498;212499;212500;212501;212502;212503;212504;212505;212506;212507;212508;212509;212510;212511;212512;212513;212514;212515;212516;212517;212518;212519;212520;212521;212522;212523;212524;212525;212526 271720;271721;271722;271723;271724;271725;271726;271727;271728;271729;271730;271731;271732;271733;271734;271735;271736;271737;271738;271739;271740;271741;271742;271743;271744;271745;271746;271747;271748;271749;271750;271751;271752;271753 271751 34 KGEGTTTAEAAPATGSKPDEPGK Unmodified 2199.0655 0.065519968 2128 P17677 GAP43 Neuromodulin yes yes 0 0 2 3 4 6 4 4 3 4 3 3 3 3 3 3 15.192 15.192 2;3;4 3.726E-178 6854 QUIQUE_C1277_190116_001 238.94 212.81 42163000000 3602900000 3227400000 6983600000 6794900000 5035500000 1554300000 6320400000 1140100000 1190200000 1116200000 1729100000 1552900000 1916100000 23545 2128 22140 212527;212528;212529;212530;212531;212532;212533;212534;212535;212536;212537;212538;212539;212540;212541;212542;212543;212544;212545;212546;212547;212548;212549;212550;212551;212552;212553;212554;212555;212556;212557;212558;212559;212560;212561;212562;212563;212564;212565;212566;212567;212568;212569;212570;212571;212572 271754;271755;271756;271757;271758;271759;271760;271761;271762;271763;271764;271765;271766;271767;271768;271769;271770;271771;271772;271773;271774;271775;271776;271777;271778;271779;271780;271781;271782;271783;271784;271785;271786;271787;271788;271789;271790;271791;271792;271793;271794;271795;271796;271797;271798;271799;271800;271801 271759 48 KGEGYSNPNEGATVEIHLEGR Unmodified 2256.0771 0.077087707 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 53.801 53.801 3 3.8373E-08 52318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.881 84.578 228430000 0 0 0 0 0 101580000 0 82664000 0 0 44188000 0 0 23546 2998 22141 212573;212574;212575;212576;212577 271802;271803;271804;271805;271806;271807 271806 6 KGEHICLIR Unmodified 1124.6124 0.61244756 1580 O60504;H0YB51;E5RJP2 SORBS3 Vinexin yes no 0 0 1 1 1 1 18.719 18.719 3 0.014032 11176 QUIQUE_C1403_190116_001 64.04 42.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23547 1580 22142 212578;212579;212580 271808;271809;271810 271809 3 KGEIFELK Unmodified 962.54368 0.54368251 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7ERB2;K7EN71;K7EJX1;A0A087WXS3;K7EKZ5;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.898 39.898 2 4.7255E-06 35386 QUIQUE_DMIX4_190116_001 172.94 81.039 9871700000 824370000 892790000 752270000 806620000 844830000 692130000 970310000 582630000 691930000 250220000 861610000 727310000 974700000 23548 2777;2938 22143 212581;212582;212583;212584;212585;212586;212587;212588;212589;212590;212591;212592;212593 271811;271812;271813;271814;271815;271816;271817;271818;271819;271820;271821;271822;271823;271824;271825;271826;271827;271828 271823 17 KGEILVIIEKPEEQWWSAR Unmodified 2310.2372 0.23721716 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 2 1 119.17 119.17 3 0.0018829 125455 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.236 76.359 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23549 2480 22144 212594 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B;Fibrinogen beta chain yes no 0 1 2 1 1 1 56.465 56.465 3 0.003624 54625 QUIQUE_C1403_190116_001 56.055 52.027 118120000 0 39664000 0 38960000 39497000 0 0 0 0 0 0 0 0 23567 1824 22159 212782;212783;212784 272075;272076;272077 272076 1047 3 KGGLIGLAACSIALGK Unmodified 1527.8807 0.88068349 2930 Q08AM6;H3BUU8 VAC14 Protein VAC14 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.675 97.675 3 0.00062067 100070 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.559 45.181 135090000 0 0 0 0 0 0 17341000 21792000 18744000 0 21125000 29317000 26777000 23568 2930 22160 212785;212786;212787;212788;212789;212790;212791 272078;272079;272080;272081;272082;272083;272084 272083 7 KGIIRPGTAFELLEAQAATGYVIDPIK Unmodified 2870.5906 0.59057971 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 2 1 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 139.54 139.54 3;4 9.4249E-36 143692 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.52 120.55 2556100000 49703000 128110000 230230000 67073000 80309000 77113000 64264000 388170000 451790000 69207000 497630000 379300000 73199000 23569 3117 22161 212792;212793;212794;212795;212796;212797;212798;212799;212800;212801;212802;212803;212804;212805;212806;212807;212808;212809;212810;212811;212812;212813;212814;212815 272085;272086;272087;272088;272089;272090;272091;272092;272093;272094;272095;272096;272097;272098;272099;272100;272101;272102;272103;272104;272105;272106;272107;272108;272109;272110;272111;272112;272113;272114;272115;272116;272117;272118 272116 34 KGILVMNTPNGNSLSAAELTCGMIMCLAR Unmodified 3121.5215 0.52147234 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YF78 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 1 1 2 152.35 152.35 3 2.1108E-08 155539 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.351 45.719 240140000 0 0 0 0 0 0 0 58673000 56361000 0 59345000 65760000 0 23570 404 22162 212816;212817;212818;212819;212820;212821 272119;272120;272121;272122;272123;272124 272119 6 KGIVDQSQQAYQEAFEISK Unmodified 2168.075 0.074962442 2780 P63104;B0AZS6;B7Z2E6;H0YB80 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 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4590 Q9Y3D6 FIS1 Mitochondrial fission 1 protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.91 123.91 3 0.001234 128428 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.176 59.917 25252000 0 0 15500000 0 0 9751800 0 0 0 0 0 0 0 23573 4590 22165 212850;212851;212852;212853;212854;212855;212856;212857;212858 272156;272157;272158;272159;272160;272161;272162;272163;272164 272162 9 KGIVNEQFLLQR Unmodified 1443.8198 0.8197978 2539 P49748;J3QRJ8 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 70.92 70.92 2;3 0.0011545 70934 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.342 39.137 114110000 0 0 0 0 0 0 0 26373000 39810000 15469000 32457000 0 0 23574 2539 22166 212859;212860;212861;212862 272165;272166;272167;272168 272165 2 KGKDQSGEVLSSV Unmodified 1332.6885 0.68850885 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 0 2 1 1 25.01 25.01 2 0.013023 19194 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.813 75.061 264760000 108840000 0 0 0 0 0 0 155920000 0 0 0 0 0 23575 2661 22167 212863;212864 272169;272170 272170 1 KGLDPYNVLAPK Unmodified 1313.7343 0.73433683 2000 P10606 COX5B Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 66.666 66.666 2;3 1.1989E-06 66425 QUIQUE_C1368_190116_001 145.99 127.68 12006000000 1456600000 1555500000 1187500000 753800000 1067800000 917380000 942080000 691460000 764680000 177030000 967210000 777040000 747870000 23576 2000 22168 212865;212866;212867;212868;212869;212870;212871;212872;212873;212874;212875;212876;212877;212878;212879;212880;212881;212882;212883;212884;212885;212886;212887;212888;212889;212890 272171;272172;272173;272174;272175;272176;272177;272178;272179;272180;272181;272182;272183;272184;272185;272186;272187;272188;272189;272190;272191;272192;272193;272194;272195;272196;272197;272198;272199;272200;272201;272202;272203;272204;272205;272206;272207;272208;272209;272210;272211;272212;272213;272214;272215;272216;272217;272218;272219 272180 49 KGLEEPHTCGR Unmodified 1282.6088 0.60881874 346 A0A1B0GTW6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 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KGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSK Unmodified 2530.2856 0.28562392 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 113.34 113.34 2;3;4 8.9536E-18 118296 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.27 123.54 12257000000 394890000 1033800000 1044500000 948640000 870670000 574680000 1004400000 947570000 1262700000 391860000 1387100000 1131100000 1265100000 23596 3050 22188 213058;213059;213060;213061;213062;213063;213064;213065;213066;213067;213068;213069;213070;213071;213072;213073;213074;213075;213076;213077;213078;213079;213080;213081;213082;213083 272428;272429;272430;272431;272432;272433;272434;272435;272436;272437;272438;272439;272440;272441;272442;272443;272444;272445;272446;272447;272448;272449;272450;272451;272452;272453;272454;272455;272456;272457;272458 272454 26 KGPPVPPPPK Unmodified 1012.607 0.60695147 1412 O00499 BIN1 Myc box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.611 15.611 2 0.0038632 7384 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272571;272572;272573;272574;272575;272576;272577;272578;272579;272580;272581;272582;272583;272584;272585;272586;272587;272588;272589;272590;272591;272592;272593;272594;272595;272596;272597;272598;272599;272600;272601;272602;272603;272604;272605;272606;272607;272608;272609;272610;272611;272612;272613;272614;272615;272616;272617;272618;272619;272620;272621;272622;272623;272624;272625;272626;272627;272628;272629;272630;272631;272632;272633;272634;272635;272636;272637;272638;272639;272640;272641;272642;272643;272644;272645;272646;272647;272648;272649;272650;272651;272652;272653;272654;272655;272656;272657 272588 86 KGSLESPATDVFGSTEEGEKR Unmodified 2223.0655 0.065519968 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 52.919 52.919 3;4 3.1742E-34 51843 QUIQUE_C1218_190116_001 124.76 115.28 690900000 89279000 55577000 188490000 74801000 71684000 52831000 77944000 0 0 0 0 80300000 0 23609 1389 22201 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273432;273433;273434;273435;273436;273437;273438;273439;273440;273441;273442;273443;273444;273445;273446;273447;273448;273449;273450;273451;273452;273453;273454;273455;273456;273457;273458;273459;273460;273461 273448 29 KHEAIETDIVAYSGR Unmodified 1687.8529 0.85294842 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 48.059 48.059 2;3 1.4112E-28 45571 QUIQUE_C1277_190116_001 159.08 132.41 854010000 60586000 96254000 91632000 54767000 110960000 69643000 99019000 63544000 33315000 0 93965000 80320000 0 23662 1472 22250 213874;213875;213876;213877;213878;213879;213880;213881;213882;213883;213884;213885;213886;213887;213888;213889;213890;213891;213892 273462;273463;273464;273465;273466;273467;273468;273469;273470;273471;273472;273473;273474;273475;273476;273477;273478;273479;273480 273464 19 KHEALMSDLSAYGSSIQALR Oxidation (M) 2192.0896 0.089566649 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 4 5 6 5 3 4 1 6 5 5 5 6 4 81.809 81.809 2;3;4 1.4898E-101 83298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 213.49 198.8 7593700000 226320000 603100000 736850000 445090000 248210000 391660000 30347000 790140000 1029500000 314110000 913130000 1125400000 739900000 23663 267;275;3025 22251 213893;213894;213895;213896;213897;213898;213899;213900;213901;213902;213903;213904;213905;213906;213907;213908;213909;213910;213911;213912;213913;213914;213915;213916;213917;213918;213919;213920;213921;213922;213923;213924;213925;213926;213927;213928;213929;213930;213931;213932;213933;213934;213935;213936;213937;213938;213939;213940;213941;213942;213943;213944;213945;213946;213947;213948;213949;213950;213951 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273853;273854 273854 2 KHNLCGETEEEKIR Unmodified 1741.8417 0.8417318 1965;141;2883;481 A0A0A0MR85;A6NNT0;A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1;P09488;E7EWW9;B9ZVX7;H3BRM6;Q03013 GSTM4;GSTM5;GSTM1 Glutathione S-transferase Mu 5;Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 2 1 1 3 2 1 1 13.529 13.529 2;3;4 6.7139E-170 5837 QUIQUE_DMIX1_190116_001 238.01 213.07 1183400000 57807000 0 0 0 17714000 0 0 925700000 126600000 0 21352000 0 34267000 23683 141;481;1965;2883 22268 214198;214199;214200;214201;214202;214203;214204;214205;214206 273855;273856;273857;273858;273859;273860;273861;273862;273863 273857 9 KHNMCGETEEEKIR Unmodified 1759.7982 0.79815243 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 2 1 2 1 1 1 2 1 10.412 10.412 3;4 7.1828E-116 2650 QUIQUE_C1438_190116_001 200.16 165.71 361070000 15430000 28233000 0 7641800 42272000 0 0 77227000 61036000 0 0 129230000 0 23684 2174 22269 214207;214208;214209;214210;214211;214212;214213;214214;214215 273864;273865;273866;273867;273868;273869;273870;273871;273872 273868 8 KHNMCGETEEEKIR Oxidation (M) 1775.7931 0.79306705 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 1 2 1 1 11.382 11.382 4 0.00024424 3613 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.412 83.683 15911000 0 0 0 0 7847500 0 0 0 8063600 0 0 0 0 23685 2174 22269 214216;214217 273873;273874 273874 1521 0 KHNNCMASHLTPAVYAR Oxidation (M) 1984.936 0.93598332 2046 P12532;F8WCN3;C9JSQ1;C9J995;C9J8F6;C9JT96;C9JJX8;C9J6W7 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 1 1 1 16.208 16.208 4 0.0030215 8612 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.423 38.893 46128000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46128000 0 0 23686 2046 22270 214218 273875 273875 1357 1 KHPDADSLYVEEVDVGEIAPR Unmodified 2338.1441 0.14410464 2950 Q12904 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 92.073 92.073 3;4 3.9881E-08 95066 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.48 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273899;273900;273901;273902;273903;273904;273905;273906;273907;273908;273909;273910;273911;273912;273913;273914;273915;273916;273917;273918 273900 15 KHPDSSVNFAEFSK Unmodified 1591.7631 0.76307078 2252 P26583;D6R9A6 HMGB2 High mobility group protein B2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 39.103 39.103 3 0.0023569 36097 QUIQUE_C1218_190116_001 41.542 31.696 199370000 56943000 0 0 0 0 27199000 0 0 72231000 0 42996000 0 0 23689 2252 22273 214256;214257;214258;214259 273919;273920;273921;273922 273919 4 KHPEPFFALAK Unmodified 1283.7026 0.70264277 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0;F8WCF4 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 41.814 41.814 3 0.00079584 36783 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.344 52.34 473060000 60220000 0 0 0 0 0 96626000 62835000 0 0 152030000 0 101350000 23690 3549 22274 214260;214261;214262;214263;214264 273923;273924;273925;273926;273927;273928 273928 5 KHPEVDVLINFASLR Unmodified 1736.9574 0.95735391 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase 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71.951 71.951 3 0.027039 71435 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.368 16.671 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23707 310;830 22290 214518 274257 274257 1 KIAVVEEDGREDK Unmodified 1486.7627 0.76273643 1078 G3V200;O75334;H0YHK3 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 2 1 15.058 15.058 3 0.016962 7227 QUIQUE_C1576_190116_001 68.034 59.719 20376000 0 0 0 0 0 0 20376000 0 0 0 0 0 0 23708 1078 22291 214519 274258 274258 1 KICALDDNVCMAFAGLTADAR Unmodified 2311.0759 0.075907195 1448 O14818 PSMA7 Proteasome subunit alpha type-7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.06 126.06 3 9.7103E-08 130556 QUIQUE_C1277_190116_001 68.762 60.673 214730000 0 27494000 0 0 0 0 0 46494000 63155000 0 39712000 0 37875000 23709 1448 22292 214520;214521;214522;214523;214524;214525 274259;274260;274261;274262;274263;274264;274265 274259 5 KICTVSENFLR Unmodified 1365.7075 0.70747015 2590 P51674;D6R9D2 GPM6A Neuronal membrane glycoprotein M6-a yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 2 51.751 51.751 2;3 0.00076149 50058 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.75 57.072 13250000000 602610000 962100000 911720000 1420600000 515620000 489330000 1526800000 1557900000 904070000 89696000 1436800000 1411600000 1421600000 23710 2590 22293 214526;214527;214528;214529;214530;214531;214532;214533;214534;214535;214536;214537;214538;214539;214540;214541;214542;214543;214544;214545 274266;274267;274268;274269;274270;274271;274272;274273;274274;274275;274276;274277;274278;274279;274280;274281;274282;274283;274284;274285;274286 274277 13 KIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIR Unmodified 2507.2041 0.20407913 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 88.683 88.683 2;3 3.0815E-25 91386 QUIQUE_C1576_190116_001 151.48 131.38 1462000000 87455000 98790000 87817000 97943000 133440000 81968000 124700000 118550000 121240000 66405000 124430000 132560000 186760000 23711 2135 22294 214546;214547;214548;214549;214550;214551;214552;214553;214554;214555;214556;214557;214558;214559;214560 274287;274288;274289;274290;274291;274292;274293;274294;274295;274296;274297;274298;274299;274300;274301;274302;274303;274304;274305;274306;274307;274308;274309 274299 20 KIDASQTEFEK Unmodified 1294.6405 0.64049603 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y8V7;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 1 1 1 23.125 23.125 2 0.0049652 16826 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.094 39.373 100780000 0 0 0 0 0 33111000 0 0 67669000 0 0 0 0 23712 821 22295 214561;214562 274310;274311 274311 2 KIDDLIGDLVQR Unmodified 1383.7722 0.7721789 4669 Q9Y6X5 ENPP4 Bis(5'-adenosyl)-triphosphatase ENPP4 yes yes 0 0 1 1 1 108.46 108.46 3 0.0011099 113066 QUIQUE_C1218_190116_001 73.273 52.044 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23713 4669 22296 214563;214564 274312;274313 274312 2 KIDGDTIIFSNVQER Unmodified 1733.8948 0.89481323 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 77.258 77.258 2;3 1.8095E-08 77614 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.16 126.12 4667500000 320340000 454690000 140040000 339660000 395400000 284640000 423290000 346440000 494590000 199630000 350130000 494370000 424260000 23714 756 22297 214565;214566;214567;214568;214569;214570;214571;214572;214573;214574;214575;214576;214577;214578;214579;214580;214581;214582;214583;214584;214585;214586;214587;214588;214589;214590 274314;274315;274316;274317;274318;274319;274320;274321;274322;274323;274324;274325;274326;274327;274328;274329;274330;274331;274332;274333;274334;274335;274336;274337;274338;274339;274340;274341;274342;274343;274344;274345 274332 31 KIDGLLIDQIQR Unmodified 1410.8195 0.81946344 1101 G5E9W7;G5E9V5;P82650;H7C5L9 MRPS22 28S ribosomal protein S22, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.892 82.892 3 0.0029044 84149 QUIQUE_C1368_190116_001 48.659 40.275 26157000 12215000 0 13942000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23715 1101 22298 214591;214592;214593;214594;214595;214596 274346;274347;274348;274349;274350;274351 274347 6 KIDGQQTIIACIESHQFQAK Unmodified 2314.174 0.17396498 2492 P47755;F8W9N7;A0A0D9SET8 CAPZA2 F-actin-capping protein subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.674 93.674 3 2.1161E-25 95848 QUIQUE_C1403_190116_001 139.81 124.09 4088900000 0 371290000 498770000 342490000 311040000 318100000 335110000 396730000 335940000 173050000 380220000 266230000 359970000 23716 2492 22299 214597;214598;214599;214600;214601;214602;214603;214604;214605;214606;214607;214608;214609 274352;274353;274354;274355;274356;274357;274358;274359;274360;274361;274362;274363;274364;274365;274366;274367;274368;274369;274370;274371;274372;274373 274358 22 KIDLSHVTSK Unmodified 1126.6346 0.63462279 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 2 19.385 19.385 2;3 0.00041927 11972 QUIQUE_C1403_190116_001 90.913 57.169 4463200000 382640000 436580000 96501000 613690000 0 439970000 0 801720000 436070000 114170000 188630000 431990000 521250000 23717 2009 22300 214610;214611;214612;214613;214614;214615;214616;214617;214618;214619;214620;214621;214622;214623;214624 274374;274375;274376;274377;274378;274379;274380;274381;274382;274383;274384;274385;274386;274387;274388 274377 13 KIDQEGKIPDETLEK Unmodified 1741.9098 0.90979459 4186 Q9H845;D6RCD8 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 2 1 32.597 32.597 3 0.058569 27900 QUIQUE_DMIX8_190116_001 35.089 17.388 46152000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46152000 23718 4186 22301 214625 274389 274389 1 KIDQNWYEGEHHGR Unmodified 1767.8077 0.80772956 1693 O94875;H7C1R7 SORBS2 Sorbin and SH3 domain-containing protein 2 no no 0 0 1 1 1 20.029 20.029 4 0.0046176 12537 QUIQUE_C1277_190116_001 46.964 41.422 137740000 0 99993000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37745000 0 23719 1693 22302 214626;214627 274390;274391;274392 274390 3 KIEALLNLPR Unmodified 1165.7183 0.71829284 747 C9JU35;Q9NPL8 TIMMDC1 Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.279 71.279 3 0.0022789 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214756;214757;214758;214759;214760;214761;214762;214763;214764;214765;214766;214767 274549;274550;274551;274552;274553;274554;274555;274556;274557;274558;274559;274560;274561 274554 13 KIEFVVVGPEAPLAAGIVGNLR Unmodified 2248.2943 0.29433811 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.53 140.53 3 7.0674E-06 146964 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.644 58.356 1185500000 72467000 74644000 67146000 42731000 84313000 55937000 75839000 159620000 125930000 16293000 182660000 113610000 114360000 23729 2194 22311 214768;214769;214770;214771;214772;214773;214774;214775;214776;214777;214778;214779;214780 274562;274563;274564;274565;274566;274567;274568;274569;274570;274571;274572;274573;274574;274575;274576 274573 12 KIEIDNGDELTADFLYEEVHPK Unmodified 2574.249 0.24896364 2943 Q12792 TWF1 Twinfilin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 122.74 122.74 4 0.00017131 128820 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.728 43.761 185250000 0 0 0 0 0 0 0 0 54589000 0 51713000 36444000 42507000 23730 2943 22312 214781;214782;214783;214784 274577;274578;274579;274580 274578 4 KIEIGDGAELTAEFLYDEVHPK Unmodified 2473.2377 0.23767067 3365 Q6IBS0 TWF2 Twinfilin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.45 138.45 4 0.00087072 143027 QUIQUE_C1277_190116_001 41.482 34.036 227140000 0 48030000 35780000 38043000 36900000 0 0 0 0 0 42828000 25559000 0 23731 3365 22313 214785;214786;214787;214788;214789;214790 274581;274582;274583;274584;274585;274586;274587 274581 7 KIENIHIGEK Unmodified 1179.6612 0.66117189 1386 O00203;H0YBD0 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 17.584 17.584 3 0.040386 10326 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.616 17.93 35577000 0 0 0 0 0 0 0 35577000 0 0 0 0 0 23732 1386 22314 214791 274588 274588 0 KIENLCAMGFDR Unmodified 1452.6854 0.6853545 2711 P61086;D6RDM7 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes no 0 0 1 1 65.31 65.31 3 0.028868 64219 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.813 28.268 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23733 2711 22315 214792 274589 274589 1 KIENLQEQLR Unmodified 1269.7041 0.70409934 1479;1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2;O15083;H7C4G9 ERC1;ERC2 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1;ERC protein 2 no no 0 0 1 1 33.09 33.09 2 0.013252 28105 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.287 46.992 29350000 0 0 0 0 0 0 0 29350000 0 0 0 0 0 23734 1107;1479 22316 214793 274590 274590 1 KIENSELLDK Unmodified 1187.6398 0.63976774 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 1 1 23.451 23.451 2 0.01381 16762 QUIQUE_C1403_190116_001 70.389 39.471 17807000 0 0 0 17807000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23735 3453 22317 214794 274591 274591 1 KIENVPTGPNNKPK Unmodified 1534.8467 0.84674083 738 C9JQD4;O43447;H0YEL5 PPIH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase H yes no 0 0 2 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 11.973 11.973 3 0.00021691 5297 QUIQUE_C1218_190116_001 117.48 76.927 245180000 15571000 0 17429000 0 21407000 95022000 13787000 15679000 15814000 0 27584000 3768400 19118000 23736 738 22318 214795;214796;214797;214798;214799;214800;214801;214802;214803;214804;214805;214806;214807 274592;274593;274594;274595;274596;274597;274598;274599;274600;274601;274602;274603;274604;274605;274606;274607;274608 274592 17 KIEPEAVLQTR Unmodified 1282.7245 0.72450043 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.766 42.766 2 0.0017026 39545 QUIQUE_C1403_190116_001 93.096 55.904 765930000 62955000 73913000 36710000 90365000 74868000 52441000 80635000 66445000 58577000 0 67009000 44201000 57806000 23737 1230;4172;346 22319 214808;214809;214810;214811;214812;214813;214814;214815;214816;214817;214818;214819 274609;274610;274611;274612;274613;274614;274615;274616;274617;274618;274619;274620;274621 274613 11 KIEPELDGSAQVTSHDASTNGLINFIK Unmodified 2883.4614 0.46141603 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 1 2 2 3 2 2 3 2 2 2 2 3 4 2 105.27 105.27 3;4 8.7912E-236 107559 QUIQUE_DMIX1_190116_001 247.74 231.02 9893300000 889530000 978260000 395120000 572420000 741580000 229490000 463240000 1024700000 903550000 258750000 1123600000 1471900000 841270000 23738 199 22320 214820;214821;214822;214823;214824;214825;214826;214827;214828;214829;214830;214831;214832;214833;214834;214835;214836;214837;214838;214839;214840;214841;214842;214843;214844;214845;214846;214847;214848;214849;214850 274622;274623;274624;274625;274626;274627;274628;274629;274630;274631;274632;274633;274634;274635;274636;274637;274638;274639;274640;274641;274642;274643;274644;274645;274646;274647;274648;274649;274650;274651;274652;274653;274654;274655;274656;274657;274658;274659;274660;274661;274662;274663;274664;274665;274666;274667;274668;274669;274670;274671;274672;274673;274674;274675;274676;274677;274678;274679;274680;274681 274658 60 KIEPELDGSSPVTSHDSSTNGLINFIK Unmodified 2884.4454 0.44543162 790 CON__Q3ZBD7 yes yes 0 0 1 4 3 2 4 2 1 3 3 4 2 2 3 3 108.25 108.25 3;4 7.7415E-37 114401 QUIQUE_C1218_190116_001 124.28 98.764 5305700000 780710000 618520000 272110000 513250000 440060000 140280000 340160000 353910000 404420000 106660000 452110000 493210000 390330000 + 23739 790 22321 214851;214852;214853;214854;214855;214856;214857;214858;214859;214860;214861;214862;214863;214864;214865;214866;214867;214868;214869;214870;214871;214872;214873;214874;214875;214876;214877;214878;214879;214880;214881;214882;214883;214884;214885;214886 274682;274683;274684;274685;274686;274687;274688;274689;274690;274691;274692;274693;274694;274695;274696;274697;274698;274699;274700;274701;274702;274703;274704;274705;274706;274707;274708;274709;274710;274711;274712;274713;274714;274715;274716;274717;274718;274719;274720;274721;274722;274723;274724;274725;274726;274727;274728;274729;274730;274731;274732;274733;274734;274735;274736;274737;274738 274687 56 KIEQELTAAK Unmodified 1129.6343 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274953 304 KIESLMDEIEFLK Unmodified 1593.8324 0.8323959 2435 P41219;F8W835 PRPH Peripherin yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 132.01 132.01 2;3 0.00011132 134860 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.464 84.85 325810000 16773000 0 138560000 0 0 29086000 14957000 54356000 20079000 17119000 34875000 0 0 23742 2435 22324 215074;215075;215076;215077;215078;215079;215080;215081;215082 275075;275076;275077;275078;275079;275080;275081;275082;275083 275080 8 KIESLMDEIEFLKK Unmodified 1721.9274 0.92735891 2435 P41219;F8W835 PRPH Peripherin yes no 0 0 2 1 1 109.72 109.72 3 0.0030512 112482 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.498 72.54 109740000 0 0 32844000 0 0 0 0 76895000 0 0 0 0 0 23743 2435 22325 215083;215084 275084;275085 275085 1 KIEVGAFNGLPSLNTLELFDNR Unmodified 2446.2856 0.28562392 4289 Q9NT99;M0R2G0 LRRC4B Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes no 0 0 1 1 1 150.97 150.97 3 3.0746E-05 153848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.766 50.507 82484000 0 0 0 0 0 0 0 21515000 60969000 0 0 0 0 23744 4289 22326 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1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 161.69 161.69 3;4 6.774E-10 164091 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.226 54.417 399930000 0 0 0 0 0 0 0 112040000 43444000 0 152260000 50580000 41606000 23758 2794 22340 215145;215146;215147;215148;215149;215150 275156;275157;275158;275159;275160;275161;275162 275156 7 KIGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK Oxidation (M) 3710.7538 0.753775 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 1 1 1 2 155.32 155.32 3 1.0443E-09 163172 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.78 52.775 205230000 0 0 0 0 0 0 0 0 54563000 0 150660000 0 0 23759 2794 22340 215151;215152;215153 275163;275164;275165 275165 2236;2237 3 KIGYNPDTVAFVPISGWNGDNMLEPSANMPWFK 2 Oxidation (M) 3726.7487 0.74868963 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 2 1 1 147.57 147.57 3 7.084E-06 155027 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.349 40.344 46763000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46763000 0 0 23760 2794 22340 215154 275166 275166 2236;2237 1 KIHEEEVRELQEQLAR Unmodified 2006.0545 0.054501772 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 1 1 4 4 2 2 2 54.761 54.761 2;3;4;5 5.0585E-35 53959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.16 135.6 39581000000 0 0 65973000 0 52411000 0 0 20315000000 7884600000 0 1729900000 2756100000 6776500000 23761 389;395;1336 22341 215155;215156;215157;215158;215159;215160;215161;215162;215163;215164;215165;215166;215167;215168;215169;215170 275167;275168;275169;275170;275171;275172;275173;275174;275175;275176;275177;275178;275179;275180;275181;275182;275183;275184;275185;275186;275187;275188;275189 275170 21 KIHGEIDIK Unmodified 1051.6026 0.60259438 2125 P17600;A0A1W2PS00 SYN1 Synapsin-1 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 2 1 14.624 14.624 2;3 0.0018922 6308 QUIQUE_C1277_190116_001 80.755 50.501 619470000 50118000 53489000 78420000 19404000 45688000 0 43557000 8369000 20025000 209630000 34757000 40617000 15395000 23762 2125 22342 215171;215172;215173;215174;215175;215176;215177;215178;215179;215180;215181;215182;215183;215184;215185;215186;215187;215188;215189 275190;275191;275192;275193;275194;275195;275196;275197;275198;275199;275200;275201;275202;275203;275204;275205;275206;275207;275208;275209 275192 19 KIHLFDIDVPGK Unmodified 1380.7765 0.776536 4256 Q9NQR4;H7C579 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 81.09 81.09 3 0.00022226 82001 QUIQUE_C1403_190116_001 86.911 71.749 561640000 70383000 46139000 59502000 52130000 64630000 72521000 50035000 59601000 0 25487000 61208000 0 0 23763 4256 22343 215190;215191;215192;215193;215194;215195;215196;215197;215198;215199;215200;215201 275210;275211;275212;275213;275214;275215;275216;275217;275218;275219;275220;275221;275222;275223 275214 13 KIHLTENGIR Unmodified 1179.6724 0.67240528 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 19.022 19.022 3 0.0032681 11531 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.955 47.613 82110000 0 0 0 0 0 0 0 20903000 0 7313000 23913000 29981000 0 23764 4389 22344 215202;215203;215204;215205 275224;275225;275226;275227 275227 2 KIHPQTIIAGWR Unmodified 1418.8147 0.81465284 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 49.235 49.235 2;3 0.00014079 47340 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.182 57.066 758010000 0 0 0 0 0 0 0 206140000 144410000 32793000 205880000 168790000 0 23765 2810 22345 215206;215207;215208;215209;215210;215211 275228;275229;275230;275231;275232;275233;275234;275235 275229 8 KIIPTLEEYQHYK Unmodified 1660.8825 0.88245763 3319 Q5T6W2 HNRNPK yes yes 0 0 1 1 1 2 57.02 57.02 3 0.00010468 56631 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.009 55.853 129820000 0 0 0 0 0 0 29937000 35213000 0 0 64668000 0 0 23766 3319 22346 215212;215213;215214;215215 275236;275237;275238;275239 275237 2 KIITSEAQELGDTTTLEDPSIIAEILSVYQK Unmodified 3404.7814 0.78141277 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 165.16 165.16 3 0.00010697 167293 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.653 30.036 69066000 0 0 0 0 0 0 0 45193000 0 0 0 23874000 0 23767 4296 22347 215216;215217 275240;275241;275242 275240 3 KIIVDTYGGWGAHGGGAFSGK Unmodified 2077.0381 0.038123426 2329 P31153;Q00266 MAT2A;MAT1A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2;S-adenosylmethionine synthase isoform type-1 yes no 0 0 1 1 69.998 69.998 3 0.00075262 71117 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.215 32.933 58540000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58540000 0 0 23768 2329 22348 215218 275243 275243 1 KIIVFSACR Unmodified 1092.6114 0.61138492 2912 Q07960;H0YE29;E9PNR6 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 1 1 25.843 25.843 3 0.054501 19365 QUIQUE_C1576_190116_001 33.263 22.098 355000000 0 0 0 0 0 0 355000000 0 0 0 0 0 0 23769 2912 22349 215219 275244 275244 1 KIIWEDIFPK Unmodified 1287.7227 0.72270951 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 1 1 109.47 109.47 3 0.013097 115111 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.894 36.028 11970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11970000 0 0 23770 2377 22350 215220 275245 275245 1 KILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPR Unmodified 2515.3507 0.35068379 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;E9PS95 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 1 1 1 62.516 62.516 3 2.8908E-08 62220 QUIQUE_C1576_190116_001 63.701 55.709 34064000 0 0 0 0 0 0 34064000 0 0 0 0 0 0 23771 4190 22351 215221;215222 275246;275247 275247 2 KILAAQGQLSAQGGAQPSVEAPAAPRPTATQLTR Unmodified 3383.8273 0.82734937 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;E9PS95 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 2 1 69.958 69.958 4 1.3315E-14 71084 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.073 65.783 93623000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 93623000 0 0 23772 4190 22352 215223 275248 275248 1 KILAIELENLK Unmodified 1282.786 0.78603805 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 80.295 80.295 3 0.01273 81675 QUIQUE_C1403_190116_001 32.518 27.532 128820000 0 0 18127000 18422000 0 0 30847000 0 0 0 35473000 0 25950000 23773 515 22353 215224;215225;215226;215227;215228 275249;275250;275251;275252;275253 275250 5 KILATPPQEDAPSVDIANIR Unmodified 2147.1586 0.15863249 2288 P29401;A0A0B4J1R6;E9PFF2 TKT Transketolase yes no 0 0 1 1 86.529 86.529 3 0.055805 88778 QUIQUE_DMIX8_190116_001 12.289 3.58 40095000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40095000 23774 2288 22354 215229 275254 275254 1 KILDSVGIEADDDRLNK Unmodified 1899.9902 0.99017018 1887 P05387 RPLP2 60S acidic ribosomal protein P2 yes yes 0 0 2 1 60.278 60.278 3 0.024046 60400 QUIQUE_C1438_190116_001 39.432 24.857 40249000 0 0 0 0 40249000 0 0 0 0 0 0 0 0 23775 1887 22355 215230 275255 275255 1 KILEVHIDK Unmodified 1093.6495 0.64954457 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 19.784 19.784 3 0.024466 9696 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215241;215242;215243;215244;215245;215246;215247;215248;215249;215250;215251;215252;215253;215254;215255;215256;215257;215258;215259;215260 275267;275268;275269;275270;275271;275272;275273;275274;275275;275276;275277;275278;275279;275280;275281;275282;275283;275284;275285;275286;275287;275288;275289;275290 275290 17 KILQDGGLQVVEK Unmodified 1425.8191 0.81912909 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34;A0A286YFF3;A0A286YFK5 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 2 2 1 48.683 48.683 2;3 1.5706E-16 47336 QUIQUE_C1218_190116_001 192.15 97.455 5507100000 127070000 454600000 570190000 376400000 246480000 181710000 269360000 529500000 822220000 82765000 693950000 681770000 471080000 23779 404 22359 215261;215262;215263;215264;215265;215266;215267;215268;215269;215270;215271;215272;215273;215274;215275;215276;215277;215278;215279;215280 275291;275292;275293;275294;275295;275296;275297;275298;275299;275300;275301;275302;275303;275304;275305;275306;275307;275308;275309;275310;275311;275312;275313;275314 275291 22 KINQLPEAER Unmodified 1196.6513 0.65133548 4113 Q9H061;E9PI90 TMEM126A Transmembrane protein 126A yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 19.634 19.634 2;3 0.0013272 12434 QUIQUE_DMIX7_190116_001 104.48 56.569 400270000 37764000 0 40096000 71218000 26726000 42969000 34714000 36276000 47829000 0 38102000 24574000 0 23780 4113 22360 215281;215282;215283;215284;215285;215286;215287;215288;215289;215290;215291;215292;215293;215294 275315;275316;275317;275318;275319;275320;275321;275322;275323;275324;275325;275326;275327;275328 275328 13 KIPGISSTGVGDGGNELGMGK Unmodified 1972.9888 0.98878997 3457;1140 H0YB09;H0YB62;H0YB11;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 1 1 74.719 74.719 3 0.051821 75755 QUIQUE_C1218_190116_001 18.251 11.523 65622000 65622000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23781 1140;3457 22361 215295 275329 275329 0 KIPGISSTGVGDGGNELGMGK Oxidation (M) 1988.9837 0.98370459 3457;1140 H0YB09;H0YB62;H0YB11;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 1 1 1 60.914 60.914 3 0.00073916 59275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.095 47.989 50069000 0 0 0 0 0 0 0 50069000 0 0 0 0 0 23782 1140;3457 22361 215296 275330 275330 663 1 KIPGIYVLSLEIGK Unmodified 1528.9229 0.92286588 406 A0A2C9F2P4;A0A286YFF7;P50897;Q5T0S4;A0A286YFE3;A0A286YFL8;E9PK48;E9PIA8 PPT1 Palmitoyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 2 1 118.64 118.64 2;3 0.0022992 122495 QUIQUE_C1403_190116_001 57.414 54.614 1348700000 74535000 67827000 0 66770000 90444000 0 171100000 88257000 70640000 34616000 319410000 270020000 95042000 23783 406 22362 215297;215298;215299;215300;215301;215302;215303;215304;215305;215306;215307;215308;215309;215310;215311 275331;275332;275333;275334;275335;275336;275337;275338;275339;275340;275341;275342;275343;275344;275345;275346;275347;275348;275349;275350;275351 275335 17 KIPHECLVIGALESAFK Unmodified 1911.0288 0.028804293 4493 Q9ULR3 PPM1H Protein phosphatase 1H yes yes 0 0 1 2 1 1 113.65 113.65 4 0.0020271 117723 QUIQUE_C1277_190116_001 47.204 36.828 50404000 0 27622000 0 0 0 8018400 0 0 0 0 0 0 14764000 23784 4493 22363 215312;215313;215314;215315 275352;275353;275354;275355 275353 4 KIPNPDFFEDLEPFR Unmodified 1862.9203 0.9202997 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 137.14 137.14 3 4.1675E-07 133711 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.68 80.379 1548000000 153410000 0 191070000 187110000 0 144080000 0 162920000 173560000 93247000 187030000 108940000 146590000 23785 2269 22364 215316;215317;215318;215319;215320;215321;215322;215323;215324;215325;215326 275356;275357;275358;275359;275360;275361;275362;275363;275364;275365;275366;275367;275368;275369;275370;275371;275372;275373;275374;275375;275376;275377;275378;275379;275380;275381;275382;275383 275375 28 KIQALQQQADEAEDR Unmodified 1741.8595 0.85949036 435;2791 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lineage cell-specific protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.634 71.634 3 0.00024234 71842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.991 36.345 453890000 0 38446000 40903000 60859000 32623000 0 0 51020000 51895000 24857000 83675000 0 69615000 23802 2072 22381 215489;215490;215491;215492;215493;215494;215495;215496;215497 275572;275573;275574;275575;275576;275577;275578;275579;275580 275576 9 KISSIQSIVPALEIANAHR Unmodified 2046.1586 0.15857291 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 3 2 4 3 3 96.154 96.154 2;3;4 1.9331E-36 99152 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.57 147.85 4626600000 105910000 258270000 338650000 191490000 295190000 156780000 284250000 427750000 562220000 102140000 714560000 570250000 619170000 23803 2004 22382 215498;215499;215500;215501;215502;215503;215504;215505;215506;215507;215508;215509;215510;215511;215512;215513;215514;215515;215516;215517;215518;215519;215520;215521;215522;215523;215524;215525;215526;215527 275581;275582;275583;275584;275585;275586;275587;275588;275589;275590;275591;275592;275593;275594;275595;275596;275597;275598;275599;275600;275601;275602;275603;275604;275605;275606;275607;275608;275609;275610;275611;275612;275613;275614;275615;275616;275617;275618;275619;275620;275621;275622;275623;275624;275625;275626;275627;275628;275629 275606 49 KITIADCGQLE Unmodified 1246.6227 0.62273747 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.625 57.625 2 0.00016812 55747 QUIQUE_C1403_190116_001 131.22 100.65 36252000000 3253900000 3744300000 3474900000 3194600000 3046400000 3457200000 2983200000 1671800000 1885300000 1142100000 2960700000 2392400000 3045000000 23804 2772 22383 215528;215529;215530;215531;215532;215533;215534;215535;215536;215537;215538;215539;215540;215541;215542 275630;275631;275632;275633;275634;275635;275636;275637;275638;275639;275640;275641;275642;275643;275644;275645;275646;275647;275648;275649;275650;275651;275652;275653;275654;275655;275656;275657;275658;275659;275660;275661 275639 32 KITIGQAPTEK Unmodified 1184.6765 0.6764876 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 1 1 20.189 20.189 2 0.0081261 12870 QUIQUE_C1403_190116_001 68.786 2.1664 162700000 0 0 0 162700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23805 1005;2027 22384 215543 275662 275662 1 KIVDQIRPDR Unmodified 1238.7095 0.70951906 381;1290 J3KTA4;P17844;J3KRZ1;J3QSF1;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 2 1 1 1 19.416 19.416 3 0.03798 12235 QUIQUE_C1218_190116_001 61.353 45.814 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40389 QUIQUE_C1277_190116_001 100.98 69.98 84918000 0 27948000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56971000 23810 2504 22389 215592;215593 275717;275718 275717 2 KIWMVDSK Unmodified 1005.5317 0.53173762 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 1 1 1 1 1 35.846 35.846 2 0.0054193 31922 QUIQUE_C1277_190116_001 125.53 93.174 253400000 0 72005000 0 0 42067000 0 0 0 0 0 74351000 0 64975000 23811 3198 22390 215594;215595;215596;215597 275719;275720;275721;275722 275719 4 KIYEDGDDDMKR Unmodified 1483.6613 0.66130782 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 2 1 1 1 16.536 16.536 3 0.0026023 9167 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.959 77.192 96905000 0 41244000 0 0 0 0 0 55661000 0 0 0 0 0 23812 4212 22391 215598;215599;215600 275723;275724;275725 275724 3 KIYFTDSSSK Unmodified 1174.587 0.58700389 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.551 20.551 2 0.0013358 14026 QUIQUE_C1218_190116_001 104.39 69.502 543020000 85959000 86620000 0 67639000 39450000 65220000 0 0 57467000 25658000 0 72874000 42137000 23813 4234 22392 215601;215602;215603;215604;215605;215606;215607;215608;215609 275726;275727;275728;275729;275730;275731;275732;275733;275734 275726 8 KIYQNIQDGSLDLNAAESGVQHKPSAPQGGR Unmodified 3277.644 0.64396528 2713 P61106 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes yes 0 0 2 1 1 2 1 2 1 2 2 1 1 1 1 65.468 65.468 3;4;5 7.409E-137 63956 QUIQUE_DMIX8_190116_001 188.97 179.15 2414300000 49756000 139100000 146530000 157800000 257840000 119380000 505100000 205700000 165970000 0 150820000 136110000 380210000 23814 2713 22393 215610;215611;215612;215613;215614;215615;215616;215617;215618;215619;215620;215621;215622;215623;215624;215625 275735;275736;275737;275738;275739;275740;275741;275742;275743;275744;275745;275746;275747;275748;275749;275750;275751;275752;275753;275754 275754 20 KIYSTLAGTR Unmodified 1108.6241 0.6240581 1655;4459 O75746;Q9UJS0 SLC25A12;SLC25A13 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1;Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 no no 0 0 1 1 1 1 1 21.574 21.574 2 0.0050984 14700 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.265 37.914 307750000 0 57409000 0 0 0 0 0 0 92737000 44967000 0 112640000 0 23815 1655;4459 22394 215626;215627;215628;215629 275755;275756;275757;275758 275756 4 KKDALLSALSIQNYHLECNETK Unmodified 2574.3112 0.31118674 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 84.774 84.774 3;4 3.4205E-08 86823 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.762 74.078 747630000 0 0 0 0 0 0 0 0 132200000 0 258340000 206020000 151080000 23816 2851 22395 215630;215631;215632;215633;215634 275759;275760;275761;275762;275763 275760 5 KKDEELSSALEK Unmodified 1375.7195 0.71947463 1009 F5H442;Q99816 TSG101 Tumor susceptibility gene 101 protein yes no 0 0 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 17.998 17.998 2;3 0.0024145 10816 QUIQUE_C1218_190116_001 122.46 56.189 822580000 29222000 123780000 14574000 92942000 103480000 0 0 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22398 215655;215656;215657;215658;215659;215660;215661;215662;215663;215664;215665;215666;215667 275785;275786;275787;275788;275789;275790;275791;275792;275793;275794;275795;275796;275797;275798;275799;275800;275801;275802 275798 15 KKELEEEVNNFQK Unmodified 1633.8312 0.83115034 820 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;H0Y961;H0Y9G8 SEPT11 Septin-11 yes no 0 0 2 1 1 2 1 2 27.63 27.63 2;3 1.0199E-16 21349 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.51 107.41 1018500000 0 0 0 0 0 0 0 57085000 212290000 0 357990000 111540000 279630000 23820 820 22399 215668;215669;215670;215671;215672;215673;215674 275803;275804;275805;275806;275807;275808;275809 275809 5 KKELEEIVQPIISK Unmodified 1652.9713 0.97127264 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 2 1 2 1 61.972 61.972 2;3 1.0294E-12 61648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.61 129.36 625980000 0 0 0 0 0 0 0 177280000 0 0 404380000 0 44321000 23821 2007 22400 215675;215676;215677;215678 275810;275811;275812;275813 275811 3 KKEPAITSQNSPEAR Unmodified 1654.8638 0.86384745 379 A0A1W2PRL9;A0A1W2PPZ5;P23193;E5RIS7 TCEA1 Transcription elongation factor A protein 1 yes no 0 0 2 2 1 1 1 10.31 10.31 3;4 2.6852E-05 2725 QUIQUE_C1403_190116_001 94.487 56.874 51776000 16086000 0 0 4448600 0 0 0 0 0 3957400 0 27284000 0 23822 379 22401 215679;215680;215681;215682;215683 275814;275815;275816;275817;275818 275816 5 KKEPQISTTTHYNR Unmodified 1701.8798 0.87983187 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 2 1 1 1 1 10.281 10.281 4 0.00012491 2712 QUIQUE_C1218_190116_001 79.004 72.171 192190000 27778000 0 0 0 0 0 0 38649000 0 14564000 0 111200000 0 23823 2217 22402 215684;215685;215686;215687 275819;275820;275821;275822;275823 275819 5 KKEPVGDDESVPENVLSFDDLTADALANLK Unmodified 3228.6038 0.60378275 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 147.62 147.62 3;4 1.0431E-52 150711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.04 99.834 469960000 0 58764000 0 0 0 0 70024000 110270000 80195000 74949000 0 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Q96KP4;J3QKT2;J3QRA8;J3QRH4;J3KRJ8 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 2 1 19.592 19.592 3 0.042899 12698 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.355 69.217 367990000 0 0 0 0 0 0 0 367990000 0 0 0 0 0 23830 3897 22409 215716 275858 275858 0 KKPFVYTQGQAVLNR Unmodified 1747.9733 0.97333832 4169 Q9H4A4;A6NKB8;A0A087WU27;C9JMZ3;A0A087WUS4 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 2 1 1 38.568 38.568 3 0.020817 34949 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.831 40.914 164000000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68774000 95224000 0 23831 4169 22410 215717;215718 275859;275860 275860 1 KKPPPDEIYVR Unmodified 1340.7452 0.74523587 1491 O15217 GSTA4 Glutathione S-transferase A4 yes yes 0 0 2 1 1 1 16.1 16.1 3 0.01042 8354 QUIQUE_C1403_190116_001 77.062 67.375 41048000 0 0 19105000 21942000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23832 1491 22411 215719;215720;215721 275861;275862;275863 275863 3 KKPTPIQLNPAPDGSAVNGTSSAETNLEALQK Unmodified 3275.6997 0.69974882 2875 Q02750 MAP2K1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 yes yes 0 0 2 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O-methyltransferase yes no 0 0 2 1 1 114.09 114.09 4 0.00037502 119696 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.275 48.86 71102000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39707000 31395000 0 23836 2189 22415 215736;215737 275878;275879 275878 2 KLAAGHELQPLAIVDQR Unmodified 1858.0425 0.042480522 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 1 1 33.002 33.002 4 0.02378 27945 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.536 23.808 56925000 0 0 0 0 0 0 0 56925000 0 0 0 0 0 23837 2123 22416 215738 275880 275880 1 KLAAGHELQPLAIVDQRPSSR Unmodified 2285.2604 0.26041222 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 2 1 54.309 54.309 4 0.0062073 52881 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.808 36.664 291860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 291860000 23838 2123 22417 215739 275881 275881 0 KLAAVTYNGVDNNK Unmodified 1505.7838 0.78380622 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4 SEPT7 Septin-7 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 26.902 26.902 2;3 5.0206E-10 21412 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.13 106.28 113440000 15570000 0 0 0 0 0 0 24018000 0 10682000 40214000 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276060 13 KLAVNMVPFPR Oxidation (M) 1286.7169 0.71691263 3030;4044;2797;1862;1922;3006;4033;3230;4171 P04350;Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;Q13885;Q3ZCM7;A0A075B736;Q5SQY0;A6NNZ2;Q9BUF5;K7ESM5;Q9BVA1;Q9H4B7;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000025008 TUBB4A;TUBB;TUBB4B;TUBB3;TUBB2A;TUBB8;TUBB6;TUBB2B;TUBB1 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-8 chain;Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334;Tubulin beta-6 chain;Tubulin beta-2B chain;Tubulin beta-1 chain no no 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 1 3 56.632 56.632 2;3 0.00015754 55226 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.06 93.107 3928100000 105150000 171160000 219390000 132180000 201520000 86524000 290710000 258330000 366260000 271660000 802350000 389750000 633130000 + 23854 1862;1922;2797;3006;3030;3230;4033;4044;4171 22432 215879;215880;215881;215882;215883;215884;215885;215886;215887;215888;215889;215890;215891;215892;215893;215894;215895;215896;215897;215898;215899 276061;276062;276063;276064;276065;276066;276067;276068;276069;276070;276071;276072;276073;276074;276075;276076;276077;276078;276079;276080;276081;276082;276083;276084;276085;276086;276087;276088;276089;276090;276091;276092;276093;276094;276095;276096;276097;276098;276099;276100;276101;276102 276090 1078 40 KLAVNMVPFPR Unmodified 1270.722 0.72199801 3030;4044;2797;1862;1922;3006;4033;3230;4171 P04350;Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;Q13885;Q3ZCM7;A0A075B736;Q5SQY0;A6NNZ2;Q9BUF5;K7ESM5;Q9BVA1;Q9H4B7;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000025008 TUBB4A;TUBB;TUBB4B;TUBB3;TUBB2A;TUBB8;TUBB6;TUBB2B;TUBB1 Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-8 chain;Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334;Tubulin beta-6 chain;Tubulin beta-2B chain;Tubulin beta-1 chain no no 0 0 1 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276145 276145 1 KLAYVAAGDLAPINAFIGGLAAQEVMK Unmodified 2730.4779 0.47785814 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 158.94 158.94 3 2.6412E-31 163865 QUIQUE_DMIX8_190116_001 118.43 111.63 776280000 0 0 0 0 0 0 0 136180000 91324000 0 237890000 157350000 153540000 23857 2197 22434 215929;215930;215931;215932;215933 276146;276147;276148;276149;276150;276151;276152 276152 7 KLCELYAK Unmodified 1023.5423 0.54230231 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.38 19.38 2 0.03923 13473 QUIQUE_C1368_190116_001 131.22 0 152870000 0 0 0 37140000 0 55046000 0 60689000 0 0 0 0 0 23858 2261 22435 215934;215935;215936;215937;215938;215939;215940 276153;276154;276155;276156;276157;276158;276159 276153 7 KLCQGLFFR Unmodified 1167.6223 0.62228396 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 1 1 59.02 59.02 3 0.025686 58801 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.269 17.044 16350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16350000 0 0 23859 89 22436 215941 276160 276160 1 KLDAGNQLALIEELHK Unmodified 1790.989 0.98904797 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 1 1 86.373 86.373 3 0.0036569 89765 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.083 29.125 45423000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45423000 0 0 23860 3740 22437 215942 276161 276161 1 KLDALCNIHENIR Unmodified 1594.825 0.82495953 2630 P53621;A0A3B3IS84;A0A3B3IT15;A0A3B3ISC6;A0A3B3IU89;A0A3B3ITV3 COPA Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 1 1 1 2 44.592 44.592 3 0.0004262 41226 QUIQUE_C1368_190116_001 72.175 50.618 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23861 2630 22438 215943;215944;215945;215946 276162;276163;276164;276165 276162 4 KLDDFVETGDIR Unmodified 1406.7042 0.70415892 394 A0A1W2PS43;Q14108;A0A1W2PPX5;A0A1W2PQR6;A0A1W2PQB7;A0A1W2PRS1;A0A1W2PRF6;A0A1W2PPU6 SCARB2 Lysosome membrane protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.155 72.155 3 0.001203 72260 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.809 55 534710000 40707000 0 62426000 41802000 51607000 34636000 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KLDGETTDLQDQIAELQAQIDELK Unmodified 2713.3658 0.36578431 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.84 157.84 3 3.9369E-75 161722 QUIQUE_C1403_190116_001 172.49 159.02 1444000000 192210000 0 0 258950000 175910000 0 210700000 89492000 149910000 0 227300000 139530000 0 23866 2379 22443 216002;216003;216004;216005;216006;216007;216008;216009 276231;276232;276233;276234;276235;276236;276237;276238;276239;276240;276241;276242;276243;276244 276234 14 KLDGETTDLQDQIAELQAQIDELKLQLAK Unmodified 3266.7246 0.72456659 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 2 1 163.46 163.46 4 0.04197 165637 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.678 19.573 60646000 0 0 0 0 0 0 0 60646000 0 0 0 0 0 23867 2379 22444 216010 276245 276245 1 KLDGFPLLR Unmodified 1057.6284 0.6284152 1972 P09661;H0YKK0 SNRPA1 U2 small nuclear ribonucleoprotein A' yes no 0 0 1 1 1 77.555 77.555 3 0.033987 79447 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.203 14.73 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23868 1972 22445 216011;216012 276246;276247 276247 2 KLDLDNSGSLSVEEFMSLPELQQNPLVQR Unmodified 3285.6551 0.65510682 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3 PPP3R1 Calcineurin subunit B type 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.68 159.68 3 1.737E-24 165200 QUIQUE_C1218_190116_001 93.949 89.252 331240000 48012000 48301000 42263000 0 74087000 0 0 0 0 0 63545000 55027000 0 23869 801 22446 216013;216014;216015;216016;216017;216018 276248;276249;276250;276251;276252;276253;276254 276248 6 KLDLEAWFPGSGAFR Unmodified 1692.8624 0.86239089 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 2 136.35 136.35 2;3 1.5733E-12 142385 QUIQUE_C1218_190116_001 163.51 137.46 1443000000 170200000 0 86950000 65247000 79433000 0 72486000 0 270290000 42554000 287890000 137690000 230220000 23870 2534 22447 216019;216020;216021;216022;216023;216024;216025;216026;216027;216028;216029;216030;216031;216032 276255;276256;276257;276258;276259;276260;276261;276262;276263;276264;276265;276266;276267;276268;276269 276256 14 KLDLFANVVHVK Unmodified 1381.8082 0.80817048 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 73.65 73.65 2;3 1.4281E-06 73984 QUIQUE_C1277_190116_001 109.72 71.007 4389200000 445050000 395700000 391840000 282000000 280400000 294320000 514930000 181800000 400770000 144270000 377920000 301870000 378310000 23871 86 22448 216033;216034;216035;216036;216037;216038;216039;216040;216041;216042;216043;216044;216045;216046;216047;216048;216049 276270;276271;276272;276273;276274;276275;276276;276277;276278;276279;276280;276281;276282;276283;276284;276285;276286;276287 276272 17 KLDLSNVQSK Unmodified 1130.6295 0.62953741 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 1 1 1 23.388 23.388 2;3 1.9969E-39 16747 QUIQUE_DMIX4_190116_001 211.86 97.005 6035500000 425330000 466060000 308520000 700510000 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45.111 45.111 2;3 2.0489E-07 42344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.31 117.92 488310000 0 43169000 91345000 41348000 42665000 33162000 36863000 0 61704000 0 103040000 35010000 0 23874 3108 22451 216077;216078;216079;216080;216081;216082;216083;216084;216085;216086;216087;216088;216089;216090 276316;276317;276318;276319;276320;276321;276322;276323;276324;276325;276326;276327;276328;276329 276326 14 KLDPELHLDIK Unmodified 1319.7449 0.74490152 626 B4DY09;Q12905 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.13 56.13 2;3 0.00024307 55425 QUIQUE_C1218_190116_001 89.44 53.156 1378400000 418060000 442350000 0 53017000 56441000 49545000 42476000 41993000 60373000 86502000 50720000 41245000 35724000 23875 626 22452 216091;216092;216093;216094;216095;216096;216097;216098;216099;216100;216101;216102;216103;216104 276330;276331;276332;276333;276334;276335;276336;276337;276338;276339;276340;276341;276342;276343;276344;276345;276346;276347 276331 16 KLDPGSEETQTLVR Unmodified 1571.8155 0.81550028 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 41.266 41.266 2;3 7.1416E-22 37288 QUIQUE_C1563_190116_001 159.64 124.92 8806500000 762820000 790150000 538040000 670150000 725700000 700590000 662480000 698300000 658170000 235330000 1025600000 614850000 724400000 23876 2255 22453 216105;216106;216107;216108;216109;216110;216111;216112;216113;216114;216115;216116;216117;216118;216119;216120;216121;216122;216123;216124;216125;216126;216127;216128;216129;216130 276348;276349;276350;276351;276352;276353;276354;276355;276356;276357;276358;276359;276360;276361;276362;276363;276364;276365;276366;276367;276368;276369;276370;276371;276372;276373;276374;276375 276358 23 KLDQVSQFGCR Unmodified 1336.6558 0.65576893 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 32.344 32.344 2;3 0.016544 27225 QUIQUE_C1403_190116_001 61.593 28.216 339790000 49268000 0 0 28864000 74761000 24189000 47488000 0 33621000 0 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276386;276387;276388;276389;276390;276391;276392;276393;276394;276395;276396;276397;276398;276399;276400;276401;276402;276403;276404;276405;276406;276407;276408;276409;276410;276411;276412;276413;276414;276415;276416;276417;276418;276419;276420;276421;276422 276411 35 KLDVEEPDSANSSFYSTR Unmodified 2043.9385 0.93852854 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 65.631 65.631 2;3 0.0019076 65213 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.371 38.583 88070000 0 0 36593000 21432000 0 0 0 30045000 0 0 0 0 0 23879 3091 22456 216159;216160;216161;216162 276423;276424;276425;276426 276425 3 KLDVSIEMPEELDISQLR Unmodified 2114.0929 0.092920692 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 132.25 132.25 2;3 0.00072758 135377 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.8 57.526 1261200000 0 130770000 77970000 92280000 122390000 70717000 114090000 181240000 108740000 0 145390000 122890000 94683000 23880 2472 22457 216163;216164;216165;216166;216167;216168;216169;216170;216171;216172;216173;216174 276427;276428;276429;276430;276431;276432;276433;276434;276435;276436;276437;276438;276439 276434 9 KLDVSIEMPEELDISQLR Oxidation (M) 2130.0878 0.087835314 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 1 1 1 113.84 113.84 3 0.014158 116117 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.384 34.855 41331000 0 0 0 0 0 0 0 41331000 0 0 0 0 0 23881 2472 22457 216175 276440 276440 0 KLDVTIEPSEEPLFPADELYGIVGANLK Unmodified 3056.5958 0.59578425 4223 Q9HCC0;D6RD67;D6RDF7;D6R9R1 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 160.08 160.08 3 9.0238E-06 164941 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.783 41.172 489710000 0 0 0 58968000 0 0 0 0 147040000 0 135160000 148550000 0 23882 4223 22458 216176;216177;216178;216179 276441;276442;276443;276444;276445 276442 5 KLDYGQHVVAGTPGR Unmodified 1596.8372 0.83723877 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 28.291 28.291 3 1.6959E-06 22974 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.751 70.77 592920000 125960000 106970000 0 120440000 0 0 0 100280000 139280000 0 0 0 0 23883 2416 22459 216180;216181;216182;216183;216184 276446;276447;276448;276449;276450;276451;276452 276450 7 KLEAAEDIAYQLSR Unmodified 1605.8362 0.83623572 2370 P35232 PHB Prohibitin yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 87.071 87.071 2;3 5.3658E-14 88833 QUIQUE_C1277_190116_001 167.98 131.56 4718400000 425070000 472300000 569690000 391800000 420750000 378790000 435480000 342330000 285520000 156010000 330020000 257510000 253140000 23884 2370 22460 216185;216186;216187;216188;216189;216190;216191;216192;216193;216194;216195;216196;216197;216198;216199;216200;216201;216202;216203;216204;216205;216206 276453;276454;276455;276456;276457;276458;276459;276460;276461;276462;276463;276464;276465;276466;276467;276468;276469;276470;276471;276472;276473;276474;276475;276476;276477;276478;276479;276480 276458 27 KLEADSLEVK Unmodified 1130.6183 0.61830402 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.371 29.371 2 0.0090244 23620 QUIQUE_C1576_190116_001 75.197 22.472 484070000 64936000 64896000 70666000 63493000 71454000 58629000 71452000 0 0 18542000 0 0 0 23885 3108 22461 216207;216208;216209;216210;216211;216212;216213;216214 276481;276482;276483;276484;276485;276486;276487;276488 276487 8 KLEAQVQELQSK Unmodified 1399.7671 0.76709352 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 30.153 30.153 2 5.5618E-07 24901 QUIQUE_C1438_190116_001 173.04 146.59 258380000 39228000 78983000 41908000 55426000 42830000 0 0 0 0 0 0 0 0 23886 2385 22462 216215;216216;216217;216218;216219 276489;276490;276491;276492;276493;276494 276494 6 KLEATIIGEWVK Unmodified 1385.7919 0.79185171 4436 Q9UHL4;R4GMR2 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 95.994 95.994 2;3 0.00065446 99759 QUIQUE_C1438_190116_001 61.11 23.93 658180000 28474000 104590000 0 71365000 83177000 29986000 81301000 48255000 0 19030000 0 79450000 112550000 23887 4436 22463 216220;216221;216222;216223;216224;216225;216226;216227;216228;216229;216230;216231;216232;216233;216234;216235;216236 276495;276496;276497;276498;276499;276500;276501;276502;276503;276504;276505;276506;276507;276508;276509;276510;276511;276512;276513 276501 19 KLECTLPDGTGR Unmodified 1345.666 0.66599927 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 1 1 29.395 29.395 3 0.062491 24095 QUIQUE_C1438_190116_001 21.06 11.008 51377000 0 0 0 0 51377000 0 0 0 0 0 0 0 0 23888 3042 22464 216237 276514 276514 1 KLEDPDDSSPGK Unmodified 1286.599 0.59902514 3245 Q52LD8;C9J6C2 RFTN2 Raftlin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 13.963 13.963 2 0.00019637 6208 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.32 115.09 43283000 6220800 0 0 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P22307;H0YF61 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.318 36.318 2 8.56E-37 32122 QUIQUE_DMIX3_190116_001 196.48 138.89 1540200000 130030000 133390000 239470000 110220000 197060000 126110000 138140000 72269000 122590000 36307000 107900000 0 126730000 23891 2196 22467 216267;216268;216269;216270;216271;216272;216273;216274;216275;216276;216277;216278 276549;276550;276551;276552;276553;276554;276555;276556;276557;276558;276559;276560;276561;276562 276559 13 KLEEEQIILEDQNCK Unmodified 1887.9248 0.92479273 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 58.889 58.889 2;3 0 57360 QUIQUE_C1368_190116_001 326.81 298.63 1134200000 84658000 117990000 164930000 182820000 173220000 81947000 133100000 0 0 0 47866000 96796000 50933000 23892 2378 22468 216279;216280;216281;216282;216283;216284;216285;216286;216287;216288;216289;216290;216291;216292;216293;216294;216295;216296;216297 276563;276564;276565;276566;276567;276568;276569;276570;276571;276572;276573;276574;276575;276576;276577;276578;276579;276580;276581;276582;276583;276584;276585 276569 22 KLEEIIHQITNVEALIAR Unmodified 2089.1895 0.18953869 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 142.89 142.89 3;4 5.7177E-47 147733 QUIQUE_C1277_190116_001 150.68 142.39 1020700000 120150000 135790000 42701000 61966000 114130000 0 97326000 0 116240000 18633000 203130000 69480000 41117000 23893 3102 22469 216298;216299;216300;216301;216302;216303;216304;216305;216306;216307;216308;216309;216310 276586;276587;276588;276589;276590;276591;276592;276593;276594;276595;276596;276597;276598 276587 8 KLEELELDEQQK Unmodified 1500.7672 0.7671531 2395 P36507;A0A1B0GUL7 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 43.818 43.818 2;3 1.8625E-45 41645 QUIQUE_C1218_190116_001 202.05 149.57 724040000 89824000 41403000 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mitogen-activated protein kinase kinase 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 47.764 47.764 2;3 9.6346E-14 45920 QUIQUE_C1218_190116_001 179.6 142.91 5076000000 433770000 475650000 382520000 494100000 462820000 504990000 452200000 280440000 152230000 193690000 599920000 379930000 263730000 23896 2875 22472 216342;216343;216344;216345;216346;216347;216348;216349;216350;216351;216352;216353;216354;216355;216356;216357;216358;216359;216360;216361;216362;216363;216364;216365 276632;276633;276634;276635;276636;276637;276638;276639;276640;276641;276642;276643;276644;276645;276646;276647;276648;276649;276650;276651;276652;276653;276654;276655;276656;276657;276658;276659;276660;276661;276662;276663 276633 32 KLEELELDEQQRK Unmodified 1656.8683 0.86826413 2875 Q02750 MAP2K1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 yes yes 0 0 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 31.073 31.073 2;3 5.1723E-25 25637 QUIQUE_DMIX5_190116_001 177.36 10.136 1271800000 0 135330000 0 82436000 112330000 0 106380000 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0.05278 74090 QUIQUE_C1403_190116_001 52.6 19.707 32865000 0 0 0 32865000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23900 499 22476 216382 276681 276681 1 KLEFDISEDEIFTSLTAAR Unmodified 2184.095 0.095029182 4123 Q9H0R4;K7ER15;K7EQD2;K7EMY7;A0A1B0GXB1;K7EJQ8 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 147.29 147.29 2;3 3.8516E-07 152178 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.56 101.87 105820000 0 0 0 0 0 0 0 0 85669000 20153000 0 0 0 23901 4123 22477 216383;216384 276682;276683 276682 1 KLEFVPTNLHIQR Unmodified 1593.8991 0.89911075 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.381 67.381 3 0.0012112 66679 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.171 54.426 541040000 72295000 69538000 58567000 54513000 0 27688000 43801000 60890000 58154000 22240000 0 73359000 0 23902 3916 22478 216385;216386;216387;216388;216389;216390;216391;216392;216393;216394 276684;276685;276686;276687;276688;276689;276690;276691;276692;276693 276693 8 KLEGDASDFHEQIADLQAQIAELK Unmodified 2668.3344 0.33442461 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 137.7 137.7 4 4.6522E-07 141872 QUIQUE_C1277_190116_001 66.886 56.197 347270000 59330000 110470000 67000000 0 0 0 0 0 28449000 0 0 82019000 0 23903 2385 22479 216395;216396;216397;216398;216399 276694;276695;276696;276697;276698;276699;276700 276696 6 KLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELK Unmodified 2614.3338 0.3337559 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 156.76 156.76 2;3 6.3337E-40 162215 QUIQUE_C1368_190116_001 170.5 142.2 1956800000 0 0 233810000 409390000 193170000 0 196340000 0 172200000 97104000 277830000 159880000 217080000 23904 2378 22480 216400;216401;216402;216403;216404;216405;216406;216407;216408;216409 276701;276702;276703;276704;276705;276706;276707;276708;276709;276710 276701 4 KLEHLITELVHQR Unmodified 1614.9206 0.92057447 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 2 3 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 61.662 61.662 2;3;4 6.9266E-24 61482 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216434;216435;216436;216437;216438;216439;216440;216441;216442;216443;216444;216445;216446;216447;216448;216449;216450;216451;216452;216453;216454;216455;216456;216457;216458;216459;216460;216461;216462;216463;216464;216465;216466;216467;216468;216469;216470;216471;216472;216473;216474;216475;216476;216477;216478;216479;216480;216481;216482;216483;216484;216485;216486;216487 276737;276738;276739;276740;276741;276742;276743;276744;276745;276746;276747;276748;276749;276750;276751;276752;276753;276754;276755;276756;276757;276758;276759;276760;276761;276762;276763;276764;276765;276766;276767;276768;276769;276770;276771;276772;276773;276774;276775;276776;276777;276778;276779;276780;276781;276782;276783;276784;276785;276786;276787;276788;276789;276790;276791;276792;276793;276794;276795;276796 276759 52 KLELDILPLQEANAELSEK Unmodified 2152.1627 0.16271482 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 129.93 129.93 3 0.0066907 132644 QUIQUE_C1563_190116_001 38.942 30.123 157230000 0 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ATPase yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 20.341 20.341 2;3 1.6344E-05 13462 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.5 115.49 2857300000 0 92033000 63509000 81685000 83270000 36114000 0 67123000 791330000 82637000 150620000 699870000 709120000 23923 1245 22499 216655;216656;216657;216658;216659;216660;216661;216662;216663;216664;216665;216666;216667 277033;277034;277035;277036;277037;277038;277039;277040;277041;277042;277043;277044;277045 277039 12 KLFDTLNEDLFQK Unmodified 1609.8352 0.83517309 2516 P48723 HSPA13 Heat shock 70 kDa protein 13 yes yes 0 0 1 1 1 110.92 110.92 3 0.016509 114197 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.809 16.734 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23924 2516 22500 216668;216669 277046;277047 277047 2 KLFEAEEQDLFK Unmodified 1495.7559 0.75586013 4175 Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4;C9JDQ8 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 87.722 87.722 3 0.00047513 89162 QUIQUE_C1403_190116_001 78.964 71.925 65036000 0 22515000 0 26874000 0 15648000 0 0 0 0 0 0 0 23925 4175 22501 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277062;277063;277064;277065;277066;277067;277068;277069;277070;277071;277072;277073;277074;277075 277073 13 KLFIGGLSFETTDDSLR Unmodified 1897.9785 0.97854286 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 1 1 1 1 116.52 116.52 3 0.00013554 121095 QUIQUE_C1368_190116_001 76.378 69.428 185630000 0 0 84162000 0 0 0 66251000 0 0 0 0 0 35219000 23928 2601 22504 216696;216697;216698 277076;277077;277078;277079;277080 277078 5 KLFIGGLSFETTDDSLREHFEK Unmodified 2568.286 0.28601785 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 2 108.66 108.66 3;4 2.6265E-19 113477 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.18 108.89 2370400000 0 103330000 99341000 76503000 0 0 118350000 261000000 339060000 0 613550000 446260000 312990000 23929 2601 22505 216699;216700;216701;216702;216703;216704;216705;216706;216707;216708;216709;216710;216711;216712 277081;277082;277083;277084;277085;277086;277087;277088;277089;277090;277091;277092;277093;277094;277095;277096;277097 277093 16 KLFIGGLSFETTDESLR Unmodified 1911.9942 0.99419293 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8VTQ5;F8W646 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 114.82 114.82 2;3 1.2725E-07 119811 QUIQUE_DMIX5_190116_001 140.27 104.63 3321100000 165470000 308760000 366500000 165910000 273190000 159440000 275020000 239660000 274800000 44779000 424020000 361610000 261900000 23930 1049 22506 216713;216714;216715;216716;216717;216718;216719;216720;216721;216722;216723;216724;216725;216726;216727;216728;216729;216730;216731;216732;216733;216734 277098;277099;277100;277101;277102;277103;277104;277105;277106;277107;277108;277109;277110;277111;277112;277113;277114;277115;277116;277117;277118;277119;277120;277121 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dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 16.381 16.381 3;4 0.0073622 9046 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.077 33.819 244470000 0 0 0 0 0 0 0 0 49585000 0 90992000 51279000 52616000 23959 3053 22534 217058;217059;217060;217061;217062 277539;277540;277541;277542;277543 277539 5 KLHYNEGLNIK Unmodified 1327.7248 0.72483478 848 E7EMN6;P41236;Q6NXS1 PPP1R2;PPP1R2P3 Protein phosphatase inhibitor 2;Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3 yes no 0 0 1 1 24.733 24.733 3 0.051486 18499 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.063 19.058 39602000 0 0 0 0 0 0 0 39602000 0 0 0 0 0 23960 848 22535 217063 277544 277544 1 KLIDALIENFLQPSK Unmodified 1727.9822 0.98217168 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 1 1 149.92 149.92 3 0.032796 154662 QUIQUE_DMIX7_190116_001 21.233 14.031 6373900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6373900 0 23961 3390 22536 217064 277545 277545 1 KLIELQAGK Unmodified 998.61243 0.61243078 1329 K7ELL7;P14314;K7EPW7 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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attachment protein yes no 0 0 2 1 1 101.93 101.93 4 0.00060807 104767 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.099 36.376 220230000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76239000 144000000 0 23971 4128 22546 217141;217142 277632;277633 277633 2 KLLEAHEEQNVDSYTESVK Unmodified 2218.0754 0.075356373 2651 P54920;M0R0Y2;M0R213 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.814 50.814 3 0.00064255 49102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.017 46.647 571160000 64897000 0 0 61373000 68263000 0 102250000 35892000 55048000 0 64518000 49719000 69202000 23972 2651 22547 217143;217144;217145;217146;217147;217148;217149;217150;217151 277634;277635;277636;277637;277638;277639;277640;277641;277642;277643;277644 277639 11 KLLEAHEEQNVDSYTESVKEYDSISR Unmodified 3068.4575 0.45745287 2651 P54920;M0R0Y2;M0R213 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 2 1 80.553 80.553 4 1.5781E-07 80804 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.282 47.971 70658000 0 0 0 0 0 0 0 70658000 0 0 0 0 0 23973 2651 22548 217152 277645 277645 1 KLLEAQSHFR Unmodified 1227.6724 0.67240528 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A1B0GUH3;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 1 1 19.791 19.791 2;3 0.00054095 12163 QUIQUE_C1576_190116_001 81.865 47.144 2969100000 246810000 0 302710000 356390000 0 253790000 430980000 465330000 0 84509000 368990000 0 459560000 23974 267;275;3025 22549 217153;217154;217155;217156;217157;217158;217159;217160;217161;217162;217163;217164 277646;277647;277648;277649;277650;277651;277652;277653;277654;277655;277656;277657;277658 277652 13 KLLEATELK Unmodified 1043.6227 0.62266112 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.101 30.101 2 3.4095E-06 24933 QUIQUE_DMIX3_190116_001 191.67 77.778 9753700000 0 0 966280000 891920000 1113700000 721900000 0 930020000 1177700000 376520000 1259600000 1012800000 1303200000 23975 267;275;3025 22550 217165;217166;217167;217168;217169;217170;217171;217172;217173;217174 277659;277660;277661;277662;277663;277664;277665;277666;277667;277668 277664 0 KLLEGEENR Unmodified 1086.5669 0.56693715 395;1336;389;1342 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;A0A1W2PPA3;A0A1W2PS58;A0A1W2PQU7;A0A1X7SBR3;K7EPT8;K7EMP8;P14136;K7EPI4 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 13.918 13.918 2;3 0.00040673 6208 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.62 70.751 10726000000 18265000 80728000 31657000 20499000 0 34291000 32187000 58544000 41969000 10388000000 0 19465000 0 23976 389;395;1336;1342 22551 217175;217176;217177;217178;217179;217180;217181;217182;217183;217184;217185;217186 277669;277670;277671;277672;277673;277674;277675;277676;277677;277678;277679;277680;277681;277682;277683;277684 277679 14 KLLEGEENRITIPVQTFSNLQIR Unmodified 2697.4814 0.48136361 395;1336;389;1342 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1W2PPA3;A0A1W2PS58;A0A1X7SBR3;K7EPT8;K7EMP8;P14136;K7EPI4 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 5 4 2 3 3 113.39 113.39 2;3;4 4.7223E-112 117241 QUIQUE_DMIX1_190116_001 199.89 180.35 9300100000 0 0 0 0 0 0 0 6962400000 1088200000 0 182650000 548530000 518310000 23977 389;395;1336;1342 22552 217187;217188;217189;217190;217191;217192;217193;217194;217195;217196;217197;217198;217199;217200;217201;217202;217203 277685;277686;277687;277688;277689;277690;277691;277692;277693;277694;277695;277696;277697;277698;277699;277700;277701;277702;277703;277704;277705;277706;277707;277708;277709;277710;277711 277692 25 KLLEGEESR Unmodified 1059.556 0.55603812 1952;2435;772 P08670;B0YJC4;B0YJC5;CON__P05787;P05787;CON__Q9H552;CON__Q9DCV7;CON__Q3KNV1;CON__P08729;P08729;P41219;H7C5W5 VIM;KRT8;KRT7;PRPH Vimentin;Keratin, type II cytoskeletal 8;Keratin, type II cytoskeletal 7;Peripherin no no 0 0 1 2 14.084 14.084 2;3 1.1325E-05 6237 QUIQUE_DMIX4_190116_001 185.58 136.82 315010000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 315010000 0 0 0 + 23978 1952;772;2435 22553 217204;217205 277712;277713 277713 1 KLLEGEETR Unmodified 1073.5717 0.57168818 869;1916;3176 P07196;E7ESP9;P07197;E7EMV2;Q16352 NEFL;NEFM;INA Neurofilament light polypeptide;Neurofilament medium polypeptide;Alpha-internexin no no 0 0 1 1 2 1 15.372 15.372 2;3 0.0058262 7915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.36 66.94 411810000 0 14009000 0 0 0 0 0 125690000 0 272110000 0 0 0 23979 1916;869;3176 22554 217206;217207;217208;217209 277714;277715;277716;277717 277715 3 KLLELIGHAVAHLK Unmodified 1540.9453 0.94533266 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 1 1 82.602 82.602 4 0.059135 85465 QUIQUE_DMIX5_190116_001 22.129 17.328 15323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15323000 0 0 23980 119 22555 217210 277718 277718 1 KLLELLWNK Unmodified 1155.7016 0.70158014 3767 Q92905 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.729 92.729 3 0.011541 95703 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.897 58.999 21573000 0 0 0 0 0 0 0 8640300 0 0 0 0 12933000 23981 3767 22556 217211;217212;217213;217214;217215;217216 277719;277720;277721;277722;277723;277724 277723 6 KLLHSFLAK Unmodified 1055.6492 0.64915064 4575 Q9Y305;H7C5Q2;C9J7L8 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 24.955 24.955 3 0.025686 18403 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.39 36.684 233490000 0 36277000 0 0 0 0 0 0 0 0 147950000 49264000 0 23982 4575 22557 217217;217218;217219 277725;277726;277727 277727 2 KLLIIGTTSR Unmodified 1100.6917 0.69174374 1245 I3L0N3;P46459;I3L2G1;K7EQD6 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 38.918 38.918 2;3 1.1377E-13 34831 QUIQUE_C1438_190116_001 168.54 105.06 2372000000 42324000 212950000 44990000 93873000 122040000 0 221060000 304780000 263800000 52009000 411470000 221730000 380960000 23983 1245 22558 217220;217221;217222;217223;217224;217225;217226;217227;217228;217229;217230;217231;217232;217233;217234;217235;217236;217237;217238 277728;277729;277730;277731;277732;277733;277734;277735;277736;277737;277738;277739;277740;277741;277742;277743;277744;277745;277746;277747;277748 277734 13 KLLLGPNGPAVAAAGDLTSEEEEGQSLWSSILSEVSTR Unmodified 3910.98 0.98000601 1515 O43237;B4E2E0;H3BUM4 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 1 2 1 169.09 169.09 3;4 4.1629E-11 176457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.331 59.372 189750000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 159720000 30033000 0 23984 1515 22559 217239;217240;217241 277749;277750;277751 277749 3 KLLPLVSDEVFIR Unmodified 1527.9025 0.90246479 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 113.57 113.57 2;3 0.00013373 115893 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.19 87.827 103020000 23020000 0 0 13881000 0 0 0 55425000 0 10690000 0 0 0 23985 2016 22560 217242;217243;217244;217245;217246;217247 277752;277753;277754;277755;277756;277757;277758;277759 277757 7 KLLTVNPEHR Unmodified 1205.6881 0.68805534 3494 Q86UX6 STK32C Serine/threonine-protein kinase 32C 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277764;277765;277766;277767;277768;277769;277770;277771;277772;277773;277774;277775;277776;277777;277778;277779;277780;277781;277782 277782 12 KLMHQAALLGQALQDSR Unmodified 1879.0098 0.0098001854 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9;E9PKD3;A0A0B4J225;E9PIZ5 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 2 1 1 66.401 66.401 3;4 0.00011938 66155 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.634 63.451 183400000 0 25803000 0 0 0 0 0 89446000 39965000 0 0 28184000 0 23989 22 22564 217268;217269;217270;217271;217272 277783;277784;277785;277786;277787 277785 4 KLMHVAYEEFEK Unmodified 1522.749 0.74900062 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 2 2 46.069 46.069 2;3 0.0099929 43627 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.439 49.574 181090000 0 0 97455000 0 0 0 0 0 83637000 0 0 0 0 23990 3053 22565 217273;217274;217275;217276 277788;277789;277790;277791 277791 3 KLMLDLNK Unmodified 973.56304 0.56303775 2660 P55084;F5GZQ3 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 38.796 38.796 2 0.016708 35101 QUIQUE_C1576_190116_001 90.135 18.644 751220000 0 85553000 106810000 0 0 0 105920000 0 114310000 0 124280000 109830000 104520000 23991 2660 22566 217277;217278;217279;217280;217281;217282;217283 277792;277793;277794;277795;277796;277797;277798;277799;277800;277801 277796 10 KLMVALAK Oxidation (M) 888.54666 0.5466594 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;A6NMY6;H0YKS4;H0YNP5;H0YN28;H0YL33;H0YNA0;H0YN52 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 1 1 1 19.125 19.125 2 0.048793 11511 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.324 22.785 33593000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33593000 0 0 0 23992 1920 22567 217284 277802 277802 1 KLMVEPLQAILIR Unmodified 1522.9269 0.9269054 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 113.71 113.71 3 0.00039008 117676 QUIQUE_C1277_190116_001 79.466 66.33 33559000 0 8745100 0 0 0 0 0 0 12619000 0 0 12195000 0 23993 196 22568 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277808;277809;277810;277811;277812;277813;277814;277815;277816;277817;277818;277819;277820;277821;277822;277823;277824;277825;277826;277827;277828;277829;277830;277831;277832;277833;277834;277835;277836;277837;277838;277839;277840;277841 277821 31 KLNECLQEVYEPDWPGR Unmodified 2131.9997 0.99968901 1412 O00499 BIN1 Myc box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 96.777 96.777 3 3.2704E-05 100632 QUIQUE_C1218_190116_001 92.264 86.45 269090000 54566000 45921000 37287000 41736000 34292000 55287000 0 0 0 0 0 0 0 23996 1412 22571 217316;217317;217318;217319;217320;217321 277842;277843;277844;277845;277846;277847;277848 277843 7 KLNECLQEVYEPDWPGRDEANK Unmodified 2689.2442 0.24422939 1412 O00499 BIN1 Myc box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 85.03 85.03 3 7.616E-08 87330 QUIQUE_C1277_190116_001 92.551 85.275 235320000 0 63209000 0 0 0 0 115930000 0 0 0 56181000 0 0 23997 1412 22572 217322;217323;217324 277849;277850;277851 277849 3 KLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLK Unmodified 2910.4334 0.43342714 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 109.83 109.83 3 7.0127E-195 114896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 233.5 221.53 896700000 0 62622000 73950000 0 76455000 49608000 64339000 94657000 106030000 0 181840000 87917000 99283000 23998 1796 22573 217325;217326;217327;217328;217329;217330;217331;217332;217333;217334;217335 277852;277853;277854;277855;277856;277857;277858;277859;277860;277861;277862;277863;277864;277865;277866;277867 277862 16 KLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLK Oxidation (M) 2926.4283 0.42834177 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 1 2 1 2 1 1 1 1 98.519 98.519 3;4 3.6578E-10 100824 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.059 70.745 469290000 0 0 0 0 32928000 0 0 121030000 67245000 0 102390000 70785000 74912000 23999 1796 22573 217336;217337;217338;217339;217340;217341;217342 277868;277869;277870;277871;277872;277873;277874 277869 1021 7 KLNFQAFAELCR Unmodified 1495.7606 0.76056836 3013 Q13572;G3V5A3;G3V588;G3V3C0 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 1 1 2 95.907 95.907 3 0.00010551 97033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.165 65.259 18417000 0 0 0 0 0 0 0 18417000 0 0 0 0 0 24000 3013 22574 217343;217344;217345 277875;277876;277877 277877 3 KLNGLADLEACIK Unmodified 1443.7755 0.77554972 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 1 1 86.923 86.923 3 0.059861 88647 QUIQUE_DMIX7_190116_001 16.735 10.258 22012000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22012000 0 24001 3239 22575 217346 277878 277878 1 KLNNLTFLYLDHNALESVPLNLPESLR Unmodified 3122.6764 0.67643461 2172 P20774 OGN Mimecan yes yes 0 0 1 1 1 1 148.36 148.36 4 1.6762E-12 154388 QUIQUE_C1576_190116_001 67.33 61.55 246920000 0 0 0 120210000 26215000 0 100490000 0 0 0 0 0 0 24002 2172 22576 217347;217348;217349 277879;277880;277881 277881 3 KLNQALLDLHALGSAR Unmodified 1718.9792 0.97915198 1840 P02792 FTL Ferritin light chain yes yes 0 0 1 3 3 2 3 3 3 3 3 5 3 3 3 4 79.144 79.144 2;3;4 4.2193E-30 76883 QUIQUE_DMIX5_190116_001 200.16 157.82 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Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.405 59.405 3 0.00049488 58548 QUIQUE_C1277_190116_001 71.344 64.927 327600000 90934000 77152000 82569000 0 0 0 76946000 0 0 0 0 0 0 24006 4309 22580 217413;217414;217415;217416;217417;217418 277971;277972;277973;277974;277975;277976 277972 4 KLPEELGR Unmodified 940.53418 0.53418046 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.268 22.268 2 0.0071818 15362 QUIQUE_C1277_190116_001 107.59 64.527 6129100000 0 612600000 523420000 482470000 687000000 411400000 641830000 387510000 520540000 0 711950000 519640000 630770000 24007 2851 22581 217419;217420;217421;217422;217423;217424;217425;217426;217427;217428;217429 277977;277978;277979;277980;277981;277982;277983;277984;277985;277986;277987 277977 11 KLPEELGRDQNTVETLQR Unmodified 2125.1127 0.11274493 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 2 2 1 56.154 56.154 3;4 0.00093292 54122 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278029 2 KLPPLPLTLALGAFLNHR Unmodified 1970.1829 0.18293717 1769 O96008 TOMM40 Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 149.12 149.12 3 1.271E-07 155650 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.39 94.622 158310000 0 0 0 0 0 0 0 44822000 33574000 0 79917000 0 0 24013 1769 22587 217470;217471;217472 278031;278032;278033;278034;278035 278035 5 KLPSVEGLHAIVVSDR Unmodified 1718.9679 0.9679186 4426 Q9UHA4 LAMTOR3 Ragulator complex protein LAMTOR3 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 75.531 75.531 3 6.6807E-05 75673 QUIQUE_C1576_190116_001 69.979 59.64 271660000 45971000 64735000 48061000 0 0 52830000 0 0 37044000 23017000 0 0 0 24014 4426 22588 217473;217474;217475;217476;217477;217478;217479;217480;217481 278036;278037;278038;278039;278040;278041;278042;278043;278044;278045;278046 278042 11 KLPSVEGLHAIVVSDRDGVPVIK Unmodified 2427.3849 0.38494403 4426 Q9UHA4 LAMTOR3 Ragulator complex protein LAMTOR3 yes yes 0 0 2 1 96.413 96.413 4 0.05356 99060 QUIQUE_DMIX8_190116_001 25.408 24.227 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protein 51 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 110.61 110.61 2;3 0.00013548 115287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.911 85.356 171140000 0 0 0 13766000 0 0 17912000 21178000 23425000 6916800 47556000 17865000 22523000 24028 4449 22602 217554;217555;217556;217557;217558;217559;217560;217561;217562;217563;217564;217565 278138;278139;278140;278141;278142;278143;278144;278145;278146;278147;278148;278149 278146 11 KLQIQCVVEDDK Unmodified 1473.7497 0.7497289 979;2291;2229 E9PRY8;H0YE72;H0YE58;P29692;E9PQZ1;E9PK01;P24534 EEF1D;EEF1B2 Elongation factor 1-delta;Elongation factor 1-beta no no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 47.566 47.566 2;3 3.8289E-10 45256 QUIQUE_C1218_190116_001 157.68 111.22 262670000 32137000 57099000 39431000 38076000 19319000 76607000 0 0 0 0 0 0 0 24029 979;2291;2229 22603 217566;217567;217568;217569;217570;217571;217572;217573;217574;217575 278150;278151;278152;278153;278154;278155;278156;278157;278158;278159 278150 10 KLQLQNQESVR Unmodified 1341.7365 0.7364621 103 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278229;278230;278231;278232;278233;278234;278235;278236;278237;278238;278239;278240;278241;278242;278243 278238 14 KLSSWVLLMK Oxidation (M) 1219.6999 0.69986558 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 1 1 1 68.016 68.016 2 0.063997 68299 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.201 37.426 141240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 141240000 24042 4;1799 22614 217653 278244 278244 4 0 KLSTIALALGVER Unmodified 1369.8293 0.82929985 2309 P30153;C9J9C1;P30154;E9PPI5;E9PNM7;E9PHZ6 PPP2R1A;PPP2R1B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 82.663 82.663 2;3 0.00039934 83177 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.937 39.024 1120800000 110830000 71794000 54355000 47436000 49405000 51127000 66215000 154440000 162740000 21063000 176670000 74250000 80499000 24043 2309 22615 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278265;278266;278267;278268;278269;278270;278271;278272;278273 278267 9 KLTEIINTQHENVK Unmodified 1665.905 0.90498399 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 27.495 27.495 3 5.6287E-05 21354 QUIQUE_C1368_190116_001 92.265 74.521 254920000 0 0 44926000 92381000 37055000 0 0 0 80553000 0 0 0 0 24046 2184 22618 217680;217681;217682;217683;217684;217685 278274;278275;278276;278277;278278;278279 278274 5 KLTFDTHALVQDLETHGFDK Unmodified 2314.1594 0.15936077 4105 Q9GZT6;E9PPJ7;J3KN19;E9PKQ5 CCDC90B Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial yes no 0 0 1 1 117.07 117.07 4 0.010368 120907 QUIQUE_C1277_190116_001 21.701 18.313 22714000 0 22714000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24047 4105 22619 217686 278280 278280 1 KLTFEYR Unmodified 955.51272 0.51271674 3123 Q15257;A6PVN5;F6WIT2;Q5T949;Q5T948;A6PVN9;A6PVN6;A6PVN8;A6PVN7 PPP2R4 Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator yes no 0 0 1 1 1 1 1 32.373 32.373 2 0.036844 26671 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278326;278327;278328;278329;278330;278331;278332;278333;278334;278335;278336;278337;278338;278339;278340;278341;278342;278343;278344;278345;278346;278347;278348;278349 278349 24 KLTSEEIEAK Unmodified 1146.6132 0.61321864 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 1 1 1 16.632 16.632 3 0.013273 8650 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.806 34.834 33422000 0 0 0 0 0 0 0 17811000 0 15612000 0 0 0 24055 3779 22626 217744;217745 278350;278351 278351 1 KLTWLHYLCTGEVK Unmodified 1746.9127 0.9127119 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 1 1 1 86.229 86.229 3 0.037863 88223 QUIQUE_DMIX3_190116_001 32.995 22.798 90209000 0 0 0 0 0 0 0 0 40282000 0 0 49927000 0 24056 196 22627 217746;217747 278352;278353 278352 2 KLVAASQAALGL Unmodified 1140.6867 0.68665836 769 CON__P02768-1;P02768;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 73.673 73.673 2 0.006382 74976 QUIQUE_C1438_190116_001 105.4 69.063 817230000 0 0 0 147340000 272760000 0 0 0 78911000 35858000 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muscle yes yes 0 0 1 1 110.67 110.67 3 0.055311 113664 QUIQUE_C1403_190116_001 27.149 18.053 17911000 0 0 0 17911000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24083 2068 22654 217962 278602 278602 1 KLYHSEAFTVNFGDTEEAKK Unmodified 2313.1277 0.12772629 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;G3V2B9;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 2 1 55.405 55.405 4 0.0045656 53845 QUIQUE_C1218_190116_001 45.992 32.364 46647000 46647000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24084 4;1799 22655 217963 278603 278603 1 KLYYQQLK Unmodified 1082.6124 0.61243078 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 24.017 24.017 2 0.005315 18223 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.1 71.45 195770000 0 0 30347000 0 0 0 0 0 50686000 0 38367000 76370000 0 24085 3778 22656 217964;217965;217966;217967;217968 278604;278605;278606;278607;278608;278609 278606 6 KMADLHAVPR Unmodified 1136.6124 0.61244756 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 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yes 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 116.05 116.05 3;4 6.3366E-27 114080 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.19 99.289 1310300000 81898000 0 0 134310000 0 0 72456000 142630000 253330000 85349000 132960000 183090000 224330000 24090 1558 22660 218000;218001;218002;218003;218004;218005;218006;218007;218008;218009;218010;218011;218012 278643;278644;278645;278646;278647;278648;278649;278650;278651;278652;278653;278654;278655;278656 278651 850 14 KMDEYVASLHLPSFDAHLTELTDDQAK Unmodified 3073.4703 0.47026616 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 3 125.24 125.24 3;4;5 2.7646E-118 129169 QUIQUE_C1403_190116_001 188.8 174.73 4554900000 77020000 425430000 451040000 258250000 0 661720000 477430000 317380000 501990000 133860000 469980000 65960000 714870000 24091 1558 22660 218013;218014;218015;218016;218017;218018;218019;218020;218021;218022;218023;218024;218025;218026;218027;218028;218029;218030;218031;218032;218033 278657;278658;278659;278660;278661;278662;278663;278664;278665;278666;278667;278668;278669;278670;278671;278672;278673;278674;278675;278676;278677;278678;278679;278680;278681;278682;278683;278684;278685;278686;278687;278688;278689 278666 28 KMDEYVASLHLPTFDAHLTELTDEQAK Unmodified 3101.5016 0.50156629 3868;1131 H0Y8B3;Q96HN2 AHCYL2 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 125.64 125.64 3;4;5 2.1315E-26 129765 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.85 94.266 685100000 176580000 0 29447000 0 0 0 30268000 137160000 187640000 46916000 45459000 31631000 0 24092 1131;3868 22661 218034;218035;218036;218037;218038;218039;218040;218041;218042;218043;218044;218045 278690;278691;278692;278693;278694;278695;278696;278697;278698;278699;278700;278701;278702;278703 278698 12 KMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFR Oxidation (M) 3244.4825 0.48254668 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 1 1 172.36 172.36 3 0.00028868 179711 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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278712;278713;278714;278715;278716;278717;278718;278719;278720;278721;278722;278723;278724;278725;278726 278723 14 KMEAPPDGAADLVPLDR Unmodified 1793.8982 0.89818405 3316 Q5T5Y3 CAMSAP1 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 76.991 76.991 3 0.0098516 77482 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.301 13.977 198440000 0 0 67706000 47581000 0 64923000 0 0 0 18234000 0 0 0 24096 3316 22665 218069;218070;218071;218072;218073 278727;278728;278729;278730;278731 278730 1 KMEDSVGCLETAEEVKR Unmodified 1979.9292 0.92922618 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.21 49.21 3 4.0072E-22 46265 QUIQUE_C1368_190116_001 145.91 135.45 650400000 0 58861000 62280000 77946000 95031000 46030000 63421000 66178000 36185000 0 0 59414000 85053000 24097 2378 22666 218074;218075;218076;218077;218078;218079;218080;218081;218082;218083 278732;278733;278734;278735;278736;278737;278738;278739;278740;278741 278733 10 KMEMEMEQVFEMK Oxidation (M) 1704.7231 0.7231215 3171 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278812;278813;278814;278815;278816;278817;278818;278819;278820;278821;278822;278823;278824;278825;278826;278827;278828;278829;278830;278831;278832;278833;278834;278835;278836;278837;278838;278839;278840;278841;278842;278843;278844;278845;278846;278847;278848;278849 278840 37 KNDIPFELR Unmodified 1130.6084 0.60840804 2323 P30711;A0A0G2JRQ5;A0A0G2JQD2;A0A0G2JQM0;A0A0G2JRN4;A0A0G2JMS2;A0A0G2JQD8;A0A0G2JRG0;A0A1B0GXB6;A0A0G2JRJ5 GSTT1 Glutathione S-transferase theta-1 yes no 0 0 1 3 1 2 1 2 2 1 2 58.566 58.566 2;3 0.00011812 56419 QUIQUE_C1563_190116_001 97.857 83.04 1069200000 0 0 0 316840000 37330000 169380000 35704000 142930000 0 104280000 0 102870000 159830000 24117 2323 22683 218177;218178;218179;218180;218181;218182;218183;218184;218185;218186;218187;218188;218189;218190 278850;278851;278852;278853;278854;278855;278856;278857;278858;278859;278860;278861;278862;278863;278864;278865;278866;278867;278868 278855 18 KNELFSNL Unmodified 963.50255 0.50254598 1441 O14745 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) 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278878;278879;278880;278881;278882;278883;278884;278885;278886;278887;278888;278889;278890;278891;278892;278893;278894;278895;278896;278897;278898;278899;278900;278901;278902 278894 25 KNFATSLYSMIK Oxidation (M) 1417.7275 0.72753689 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 1 1 1 1 1 72.262 72.262 2 0.006986 71949 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.34 40.706 83083000 0 0 0 0 0 0 0 27282000 0 14896000 40904000 0 0 24120 1954 22685 218218;218219;218220 278903;278904;278905 278905 1203 2 KNFESLSEAFSVASAAAVLSHNR Unmodified 2434.2241 0.2240863 1869 P04844;Q5JYR7;Q5JYR4;F2Z3K5 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 1 1 2 128.54 128.54 4 0.0022049 132953 QUIQUE_C1403_190116_001 35.918 34.03 42962000 0 0 0 11862000 0 0 0 0 31100000 0 0 0 0 24121 1869 22686 218221;218222;218223 278906;278907;278908 278906 3 KNFEWVAER Unmodified 1177.588 0.58800695 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein 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3;4 1.8134E-64 145493 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.06 142.45 835410000 42544000 26740000 40126000 0 58705000 0 86800000 108430000 121640000 0 185920000 94674000 69831000 24127 2220 22691 218237;218238;218239;218240;218241;218242;218243;218244;218245;218246;218247;218248 278924;278925;278926;278927;278928;278929;278930;278931;278932;278933;278934;278935;278936 278932 13 KNILDSKPTANK Unmodified 1327.746 0.74596415 4495 Q9ULV4;B4E3S0;H0YHL7 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 2 1 1 12.316 12.316 3 3.8148E-05 5447 QUIQUE_C1403_190116_001 108.72 56.161 10518000 0 0 0 1306300 0 9211700 0 0 0 0 0 0 0 24128 4495 22692 218249;218250 278937;278938 278937 1 KNILLTIGSYK Unmodified 1248.7442 0.74417324 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 1 1 71.389 71.389 3 0.021191 72784 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.845 26.891 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24129 1029 22693 218251 278939 278939 1 KNLDSTTVAVHGEEIYCK Unmodified 2062.9994 0.99935466 2177 P21291;E9PS42;E9PND2 CSRP1 Cysteine and glycine-rich protein 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 45.868 45.868 2;3 6.7679E-105 43054 QUIQUE_C1277_190116_001 228.19 211.65 3876900000 204620000 321160000 302780000 266970000 0 0 293200000 374240000 488820000 131000000 477400000 457100000 559560000 24130 2177 22694 218252;218253;218254;218255;218256;218257;218258;218259;218260;218261;218262;218263;218264;218265;218266;218267 278940;278941;278942;278943;278944;278945;278946;278947;278948;278949;278950;278951;278952;278953;278954;278955 278942 16 KNPAVQAGSIVVLQGGEETQR Unmodified 2180.1549 0.1549441 2049 P12955 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 65.37 65.37 3 0.00072506 64452 QUIQUE_C1403_190116_001 58.107 48.148 180310000 37505000 50724000 39271000 52811000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24131 2049 22695 218268;218269;218270;218271 278956;278957;278958;278959 278959 0 KNPDSQYGELIEK Unmodified 1519.7518 0.75183739 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase 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278984;278985;278986;278987;278988;278989;278990 278990 7 KNPFGLVPVLENSQGQLIYESAITCEYLDEAYPGKK Unmodified 4070.0347 0.034684117 2812 P78417;Q5TA02;Q5TA01 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 155.18 155.18 4 3.2003E-23 162429 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.829 76.546 952850000 0 0 79018000 0 146280000 0 0 0 110260000 0 158810000 194840000 263650000 24134 2812 22698 218299;218300;218301;218302;218303;218304 278991;278992;278993;278994;278995;278996;278997;278998 278996 8 KNPGVGNGDDEAAELMQQVNVLK Unmodified 2425.1907 0.19073726 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 1 1 115.79 115.79 3 0.023365 119404 QUIQUE_C1403_190116_001 30.268 22.276 48375000 0 0 0 48375000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24135 3150 22699 218305 278999 278999 0 KNPMALYILK Unmodified 1189.6893 0.68930089 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 68.386 68.386 2;3 4.2869E-05 68421 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.02 88.796 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279174;279175;279176;279177;279178;279179;279180;279181;279182;279183;279184;279185;279186;279187;279188;279189;279190;279191;279192;279193;279194;279195;279196;279197;279198;279199;279200;279201;279202;279203;279204;279205;279206;279207;279208;279209;279210;279211;279212;279213;279214;279215;279216;279217 279182 42 KPAEDEWGKTPDAMK Oxidation (M) 1717.7981 0.79813565 1840 P02792 FTL Ferritin light chain yes yes 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 19.399 19.399 2;3 7.2311E-33 12378 QUIQUE_DMIX3_190116_001 169.3 138.9 1405900000 0 0 0 0 77451000 0 73365000 122160000 672200000 0 47572000 126790000 286410000 24153 1840 22715 218477;218478;218479;218480;218481;218482;218483;218484;218485 279218;279219;279220;279221;279222;279223;279224;279225;279226 279222 1058 9 KPAEDEWGKTPDAMK Unmodified 1701.8032 0.80322103 1840 P02792 FTL Ferritin light chain yes yes 0 0 2 3 2 1 1 30.042 30.042 2;3;4 2.7971E-22 24497 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.32 151.45 1390000000 0 0 0 0 0 0 0 245800000 765590000 0 194550000 0 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218514;218515;218516;218517;218518;218519;218520;218521;218522;218523;218524;218525;218526;218527;218528;218529;218530;218531;218532;218533;218534;218535;218536;218537;218538;218539;218540 279260;279261;279262;279263;279264;279265;279266;279267;279268;279269;279270;279271;279272;279273;279274;279275;279276;279277;279278;279279;279280;279281;279282;279283;279284;279285;279286;279287;279288;279289;279290;279291;279292;279293;279294;279295;279296;279297;279298;279299;279300;279301;279302;279303;279304;279305;279306;279307;279308;279309;279310;279311 279296 52 KPDCDDWESGLNAMECALHLEK Oxidation (M) 2633.1196 0.1196225 1841 P02794;G3V192;G3V1D1;E9PPQ4 FTH1 Ferritin heavy chain;Ferritin heavy chain, N-terminally processed;Ferritin yes no 0 1 1 1 92.524 92.524 3 1.9678E-05 95456 QUIQUE_C1368_190116_001 75.539 72.657 39291000 0 0 39291000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24163 1841 22723 218541 279312 279312 1059 0 KPDDLPAFPLFSAFGR Unmodified 1776.9199 0.91990577 3535 Q8IWA5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 2 2 1 1 1 145.89 145.89 2;3 4.3726E-06 141791 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.53 76.346 777810000 0 52056000 147320000 52562000 51894000 0 78059000 97643000 146640000 90289000 0 61350000 0 24164 3535 22724 218542;218543;218544;218545;218546;218547;218548;218549;218550;218551;218552;218553;218554;218555;218556;218557;218558 279313;279314;279315;279316;279317;279318;279319;279320;279321;279322;279323;279324;279325;279326;279327;279328;279329;279330;279331;279332 279326 18 KPDHVPISSEDER Unmodified 1507.7267 0.72668527 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 15.042 15.042 2;3 0.0012148 7212 QUIQUE_C1403_190116_001 93.096 74.784 577720000 67918000 57838000 0 73129000 0 71432000 95807000 0 71482000 0 80428000 59685000 0 24165 514 22725 218559;218560;218561;218562;218563;218564;218565;218566;218567;218568 279333;279334;279335;279336;279337;279338;279339;279340;279341;279342 279336 9 KPDSMVTNSSTENEA Unmodified 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279349;279350;279351;279352;279353;279354;279355;279356;279357;279358;279359;279360;279361;279362;279363;279364;279365;279366 279356 12 KPDTIEVQQMK Oxidation (M) 1331.6755 0.67550132 859;2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 1 1 1 14.522 14.522 2 0.0080109 6730 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.887 40.566 25733000 0 0 0 0 0 0 0 0 25733000 0 0 0 0 24168 2248;434;859 22727 218593 279367 279367 312 1 KPEDEVLICIQQRPK Unmodified 1851.9877 0.98766776 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 2 1 55.802 55.802 3 0.058468 54413 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.305 40.108 66832000 0 0 0 0 0 0 0 0 66832000 0 0 0 0 24169 877 22728 218594 279368 279368 1 KPEDVLDDDDAGSAPLK Unmodified 1783.8476 0.84758827 2383 P35613;A0A087WUV8 BSG Basigin yes no 0 0 1 1 57.756 57.756 3 8.757E-05 56421 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.29 47.031 71569000 0 0 0 0 0 0 0 0 71569000 0 0 0 0 24170 2383 22729 218595 279369 279369 1 KPEDWDEEMDGEWEPPVIQNPEYK Unmodified 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cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 48.6 48.6 2;3 0.00059041 45418 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.358 55.291 334100000 0 0 62995000 0 35179000 24032000 23361000 0 28473000 42646000 55917000 27445000 34054000 24183 2213 22741 218712;218713;218714;218715;218716;218717;218718;218719;218720;218721;218722 279578;279579;279580;279581;279582;279583;279584;279585;279586;279587;279588;279589;279590;279591 279591 13 KPGDLSDELR Unmodified 1128.5775 0.57750184 2996 Q13435;E9PPJ0;H0YEX5 SF3B2 Splicing factor 3B subunit 2 yes no 0 0 1 1 31.758 31.758 2 0.013757 27204 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.441 42.268 62298000 0 0 0 0 0 0 0 0 62298000 0 0 0 0 24184 2996 22742 218723 279592 279592 1 KPGGFDISLFYR Unmodified 1398.7296 0.7295858 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 1 107.44 107.44 2;3 2.1708E-07 109688 QUIQUE_C1563_190116_001 119.45 86.925 1549800000 117710000 86674000 127050000 134660000 171380000 77562000 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279976;279977;279978;279979;279980;279981;279982;279983;279984;279985;279986;279987;279988;279989;279990;279991;279992;279993;279994;279995;279996;279997;279998;279999;280000;280001;280002;280003;280004;280005;280006;280007;280008;280009;280010;280011;280012;280013;280014;280015;280016;280017;280018;280019;280020;280021;280022;280023;280024;280025;280026;280027;280028;280029;280030;280031;280032;280033;280034;280035;280036;280037;280038;280039;280040;280041;280042;280043;280044;280045;280046;280047;280048;280049;280050;280051;280052;280053;280054;280055;280056;280057;280058;280059;280060;280061;280062;280063;280064;280065;280066;280067;280068;280069;280070;280071;280072;280073;280074;280075;280076;280077;280078;280079;280080;280081;280082;280083;280084;280085;280086;280087;280088;280089;280090;280091;280092;280093;280094;280095;280096;280097;280098;280099;280100;280101;280102;280103;280104;280105;280106;280107;280108;280109;280110;280111;280112;280113;280114;280115;280116;280117;280118;280119;280120;280121;280122;280123;280124;280125;280126;280127;280128;280129;280130;280131;280132;280133;280134;280135;280136;280137;280138;280139;280140;280141;280142;280143;280144;280145;280146;280147;280148;280149;280150;280151;280152;280153;280154;280155;280156;280157;280158;280159;280160;280161;280162;280163;280164;280165;280166;280167;280168;280169;280170;280171;280172;280173;280174;280175;280176;280177;280178;280179;280180;280181;280182;280183;280184;280185;280186;280187;280188;280189;280190;280191;280192;280193;280194;280195;280196;280197;280198;280199;280200;280201;280202;280203;280204;280205;280206;280207;280208;280209;280210;280211;280212;280213;280214;280215;280216;280217;280218;280219;280220;280221;280222;280223;280224;280225;280226;280227;280228;280229;280230;280231;280232;280233;280234;280235;280236;280237;280238;280239;280240;280241;280242;280243;280244;280245;280246;280247;280248;280249;280250;280251;280252;280253;280254;280255;280256;280257;280258;280259;280260;280261;280262;280263;280264;280265;280266;280267;280268;280269;280270;280271;280272;280273;280274;280275;280276;280277;280278;280279;280280;280281;280282;280283;280284;280285;280286;280287;280288;280289;280290;280291;280292 280111 277 KPLVLCGDLNVAHEEIDLR Unmodified 2190.1467 0.1466876 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;H7C4A8 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 3 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 93.208 93.208 2;3;4 8.6427E-100 95417 QUIQUE_C1277_190116_001 211.17 190.22 2840800000 349330000 411060000 269010000 212470000 269420000 190080000 239950000 50869000 155510000 69769000 234170000 175910000 213270000 24220 2266 22776 219321;219322;219323;219324;219325;219326;219327;219328;219329;219330;219331;219332;219333;219334;219335;219336;219337;219338;219339;219340;219341;219342;219343;219344;219345;219346 280293;280294;280295;280296;280297;280298;280299;280300;280301;280302;280303;280304;280305;280306;280307;280308;280309;280310;280311;280312;280313;280314;280315;280316;280317;280318;280319;280320;280321;280322;280323;280324 280299 32 KPLVLCGDLNVAHEEIDLRNPK Unmodified 2529.3373 0.33734191 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 81.86 81.86 4 0.022052 82092 QUIQUE_DMIX1_190116_001 20.199 13.429 69825000 0 0 0 0 0 0 0 69825000 0 0 0 0 0 24221 2266 22777 219347 280325 280325 1 KPMSLASGLVPAAPPK Unmodified 1562.8854 0.88543452 880 E7EVA0;P27816;B5MEG9 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 1 2 2 2 2 65.468 65.468 2;3 0.00016175 65099 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.99 86.001 399360000 0 0 0 86750000 0 0 0 69707000 87445000 0 0 0 155460000 24222 880 22778 219348;219349;219350;219351;219352;219353;219354;219355 280326;280327;280328;280329;280330;280331;280332;280333;280334 280330 9 KPMSLASGLVPAAPPK Oxidation (M) 1578.8803 0.88034914 880 E7EVA0;P27816;B5MEG9 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 1 1 1 51.609 51.609 2 0.053797 49880 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.098 45.143 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24223 880 22778 219356 280335 280335 1 KPMVLGHEASGTVEK Oxidation (M) 1597.8134 0.81339179 2848 Q00796;H0YLA4;H0YKB3 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 14.977 14.977 2;3 1.095E-24 6146 QUIQUE_C1563_190116_001 156 140.18 1324000000 46515000 74998000 85624000 74704000 73150000 93073000 66113000 59642000 172480000 88612000 205340000 156000000 127760000 24224 2848 22779 219357;219358;219359;219360;219361;219362;219363;219364;219365;219366;219367;219368;219369;219370 280336;280337;280338;280339;280340;280341;280342;280343;280344;280345;280346;280347;280348;280349;280350;280351 280342 2275 16 KPMVLGHEASGTVEK Unmodified 1581.8185 0.81847717 2848 Q00796;H0YLA4;H0YKB3 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 1 2 2 1 18.463 18.463 2;3 2.886E-06 11482 QUIQUE_C1218_190116_001 101.62 92.571 1750800000 114740000 221230000 141940000 156810000 106880000 136500000 259760000 97328000 171230000 0 175770000 0 168610000 24225 2848 22779 219371;219372;219373;219374;219375;219376;219377;219378;219379;219380;219381;219382;219383;219384;219385;219386;219387 280352;280353;280354;280355;280356;280357;280358;280359;280360;280361;280362;280363;280364;280365;280366;280367;280368;280369 280352 14 KPMVVLGSSALQR Unmodified 1384.7861 0.78605483 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 48.493 48.493 2;3 1.4321E-05 46468 QUIQUE_C1277_190116_001 114.72 93.325 1688900000 286670000 149820000 193280000 146490000 105780000 122530000 164140000 0 0 0 269250000 104550000 146370000 24226 2280 22780 219388;219389;219390;219391;219392;219393;219394;219395;219396;219397;219398;219399 280370;280371;280372;280373;280374;280375;280376;280377;280378;280379;280380;280381;280382 280373 4 KPMVVLGSSALQR Oxidation (M) 1400.781 0.78096945 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 1 1 36.192 36.192 2 0.058573 32096 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.903 34.123 69581000 0 0 0 0 0 0 0 0 69581000 0 0 0 0 24227 2280 22780 219400 280383 280383 0 KPNSFVAVSVTTPPQAFWTK Unmodified 2204.163 0.16298959 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 1 1 1 109.65 109.65 3 0.0017133 114431 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.75 33.791 59547000 0 0 0 0 0 0 0 28064000 0 0 31483000 0 0 24228 3916 22781 219401;219402 280384;280385 280385 2 KPNTVSTSHSGSFAPNNPDLAK Unmodified 2268.1135 0.11347321 985 F2Z357;J3KPC5;P47736;A0A0A0MQY8;X6R8W7 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 1 1 1 28.389 28.389 3;4 0.013282 22451 QUIQUE_C1563_190116_001 27.408 22.315 42170000 0 0 0 0 0 42170000 0 0 0 0 0 0 0 24229 985 22782 219403;219404 280386;280387 280386 2 KPPDDTTALAPLFGPPLESAFDEQK Unmodified 2683.3381 0.338113 3996 Q9BQI5;F6R8P8 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 142.9 142.9 3 9.0195E-08 146704 QUIQUE_C1403_190116_001 62.028 54.916 174640000 57024000 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0 0 1 1 2 2 1 2 1 114.27 114.27 3;4 1.6184E-23 119104 QUIQUE_C1438_190116_001 93.804 74.426 705420000 68123000 0 153820000 0 146150000 133920000 127260000 76149000 0 0 0 0 0 24237 98;3487 22790 219463;219464;219465;219466;219467;219468;219469;219470;219471 280450;280451;280452;280453;280454;280455;280456;280457;280458;280459;280460;280461;280462;280463;280464 280458 13 KPSEEEYVIR Unmodified 1248.635 0.63501672 3105 Q15052 ARHGEF6 Rho guanine nucleotide exchange factor 6 yes yes 0 0 1 1 24.515 24.515 2 0.019608 18307 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.157 45.531 34745000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34745000 24238 3105 22791 219472 280465 280465 1 KPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLR Unmodified 2910.4571 0.45705894 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 2 2 1 1 156.27 156.27 2;3;4 6.2662E-240 162179 QUIQUE_C1576_190116_001 309.83 271.46 9475400000 1400200000 0 0 898460000 1694400000 0 29598000 943610000 985260000 527280000 918840000 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280572;280573;280574;280575;280576;280577;280578;280579;280580;280581;280582;280583;280584;280585;280586;280587;280588;280589;280590;280591;280592;280593;280594;280595 280585 23 KPVEEYANCHLAR Unmodified 1585.7671 0.7671103 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 1 2 2 2 3 3 2 1 1 1 2 2 1 1 21.919 21.919 2;3;4 1.7655E-10 15801 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.98 131.59 5407000000 552250000 413330000 594060000 478580000 1799100000 329860000 379460000 93746000 112890000 129140000 63845000 159270000 301540000 24250 1838 22803 219584;219585;219586;219587;219588;219589;219590;219591;219592;219593;219594;219595;219596;219597;219598;219599;219600;219601;219602;219603;219604;219605;219606 280596;280597;280598;280599;280600;280601;280602;280603;280604;280605;280606;280607;280608;280609;280610;280611;280612;280613;280614;280615;280616;280617;280618;280619;280620;280621 280613 24 KPVEGYDISFLITNFHTEQMYK Unmodified 2659.2992 0.29922507 1063 F8WCF6;P59998;R4GN08 ARPC4-TTLL3;ARPC4 Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 132.18 132.18 3;4 1.6936E-20 138017 QUIQUE_C1218_190116_001 122.47 107.53 1494200000 138550000 126010000 183380000 123750000 27605000 89355000 194660000 0 94003000 0 252920000 218150000 45850000 24251 1063 22804 219607;219608;219609;219610;219611;219612;219613;219614;219615;219616;219617;219618;219619;219620;219621;219622;219623;219624;219625 280622;280623;280624;280625;280626;280627;280628;280629;280630;280631;280632;280633;280634;280635;280636;280637;280638;280639;280640;280641;280642;280643;280644;280645;280646;280647 280624 25 KPVEGYDISFLITNFHTEQMYK Oxidation (M) 2675.2941 0.2941397 1063 F8WCF6;P59998;R4GN08 ARPC4-TTLL3;ARPC4 Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.7 123.7 3 1.3795E-08 127940 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.872 79.306 1019400000 0 71963000 154430000 0 0 0 120970000 91433000 129150000 0 186140000 135130000 130200000 24252 1063 22804 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0.061954915 3738 Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 121.82 121.82 2;3 2.222E-27 125791 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.88 122.11 2235900000 262850000 250990000 171980000 248700000 252930000 247630000 231480000 55152000 84314000 55357000 106380000 116820000 151310000 24255 3738 22807 219646;219647;219648;219649;219650;219651;219652;219653;219654;219655;219656;219657;219658;219659;219660;219661;219662;219663;219664;219665 280673;280674;280675;280676;280677;280678;280679;280680;280681;280682;280683;280684;280685;280686;280687;280688;280689;280690;280691;280692;280693;280694;280695;280696;280697;280698 280692 26 KPVTVSPTTPTSPTEGEAS Unmodified 1884.9317 0.93165225 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.055 43.055 2 5.0229E-22 40229 QUIQUE_C1218_190116_001 134.21 117.26 255070000 29479000 0 0 39993000 0 0 0 32339000 0 25617000 58614000 31358000 37667000 24256 4653 22808 219666;219667;219668;219669;219670;219671;219672;219673;219674 280699;280700;280701;280702;280703;280704;280705;280706;280707 280699 8 KPVVDCVVSVPCFYTDAER Unmodified 2240.0606 0.060574706 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 1 2 103.73 103.73 2;3 2.2335E-22 107287 QUIQUE_C1218_190116_001 120.71 107.57 178690000 178690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24257 2363 22809 219675;219676 280708;280709 280709 2 KPVVPGHVLVCPLRPVER Unmodified 2051.1826 0.18261959 2547 P49789;E9PBZ0 FHIT Bis(5'-adenosyl)-triphosphatase yes no 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 50.281 50.281 3;4 0.0011772 47772 QUIQUE_C1438_190116_001 45.704 40.802 617010000 83083000 34579000 0 89819000 85212000 56720000 0 46176000 87364000 0 92821000 41238000 0 24258 2547 22810 219677;219678;219679;219680;219681;219682;219683;219684;219685;219686 280710;280711;280712;280713;280714;280715;280716;280717;280718;280719 280714 9 KPWLAYPHYKPPEK Unmodified 1752.9352 0.9351619 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 2 1 1 41.637 41.637 4 0.0046199 38218 QUIQUE_C1277_190116_001 39.143 29.298 153080000 0 75150000 0 0 0 0 0 0 0 0 77927000 0 0 24259 4435 22811 219687;219688 280720;280721 280720 2 KPWWWHLR Unmodified 1207.6403 0.64031729 1988 P0DN79;P35520;H7C2H4 CBS Cystathionine beta-synthase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 68.921 68.921 3 0.0015024 68649 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.114 83.285 85222000 0 0 0 0 0 0 0 0 26251000 7838300 25005000 26128000 0 24260 1988 22812 219689;219690;219691;219692;219693;219694 280722;280723;280724;280725;280726;280727;280728 280724 7 KPYIWEYSR Unmodified 1240.6241 0.6240581 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 55.144 55.144 2;3 0.014589 52825 QUIQUE_C1563_190116_001 74.92 56.934 115420000 0 0 56941000 11078000 0 47400000 0 0 0 0 0 0 0 24261 1929 22813 219695;219696;219697 280729;280730;280731 280731 2 KPYNPILGETFR Unmodified 1433.7667 0.76669959 4083 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2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 3 2 3 3 2 2 1 2 2 2 2 2 2 30.383 30.383 2;3 5.7142E-29 24253 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.51 145.3 2392600000 150860000 180620000 252350000 256220000 206840000 82677000 102070000 175290000 251880000 53159000 229370000 209380000 241890000 24277 2851 22828 219856;219857;219858;219859;219860;219861;219862;219863;219864;219865;219866;219867;219868;219869;219870;219871;219872;219873;219874;219875;219876;219877;219878;219879;219880;219881;219882;219883 280921;280922;280923;280924;280925;280926;280927;280928;280929;280930;280931;280932;280933;280934;280935;280936;280937;280938;280939;280940;280941;280942;280943;280944;280945;280946;280947;280948;280949;280950 280942 2303;2304 26 KQEDFMTTMDANEEK Unmodified 1815.7655 0.7655149 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 53.317 53.317 2;3 0 50665 QUIQUE_DMIX8_190116_001 361.96 274.4 4855700000 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modifier-activating enzyme 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 129.54 129.54 3 1.3152E-06 132092 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.222 67.19 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24280 4110 22830 219912;219913;219914 280987;280988;280989 280989 3 KQEELQQLEQQR Unmodified 1555.7954 0.79543354 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 33.46 33.46 2;3 3.3505E-65 28416 QUIQUE_C1277_190116_001 215.08 177.52 3465700000 132740000 279330000 280170000 173760000 324960000 180460000 262960000 334920000 451270000 193700000 437670000 282550000 131220000 24281 3117 22831 219915;219916;219917;219918;219919;219920;219921;219922;219923;219924;219925;219926;219927;219928;219929;219930;219931;219932;219933;219934;219935;219936;219937;219938;219939;219940 280990;280991;280992;280993;280994;280995;280996;280997;280998;280999;281000;281001;281002;281003;281004;281005;281006;281007;281008;281009;281010;281011;281012;281013;281014;281015;281016;281017;281018;281019;281020 280995 30 KQEGTPEGLYL Unmodified 1233.6241 0.62411768 2742 P62191 PSMC1 26S protease regulatory subunit 4 yes yes 0 0 1 1 68.422 68.422 2 0.02328 69403 QUIQUE_C1438_190116_001 63.419 38.329 34427000 0 0 0 0 34427000 0 0 0 0 0 0 0 0 24282 2742 22832 219941 281021;281022 281022 2 KQELEEICHDLEAR Unmodified 1768.8414 0.84139745 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 2 3 3 4 1 2 1 1 65.41 65.41 2;3;4 4.0234E-11 65630 QUIQUE_C1438_190116_001 139.46 117.83 1418900000 19189000 0 252690000 299940000 346900000 107120000 192520000 0 148160000 52403000 0 0 0 24283 2378 22833 219942;219943;219944;219945;219946;219947;219948;219949;219950;219951;219952;219953;219954;219955;219956;219957;219958 281023;281024;281025;281026;281027;281028;281029;281030;281031;281032;281033;281034;281035;281036;281037;281038;281039 281031 17 KQELEEILHDLESR Unmodified 1737.8897 0.88972785 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 3 2 2 113.41 113.41 2;3;4 1.8776E-05 117503 QUIQUE_C1403_190116_001 115.82 97.452 2237900000 131280000 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chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.495 16.495 2 8.9376E-05 8507 QUIQUE_C1277_190116_001 160.77 108.29 192310000 19002000 30220000 21729000 21914000 24861000 0 19237000 18065000 0 0 37285000 0 0 24288 533 22838 220004;220005;220006;220007;220008;220009;220010;220011 281097;281098;281099;281100;281101;281102;281103;281104 281098 8 KQELSEAEQATR Unmodified 1388.6896 0.68957148 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 17.013 17.013 2;3 2.0812E-37 9089 QUIQUE_C1277_190116_001 192.44 130.44 942600000 53150000 51415000 114080000 44735000 133850000 37875000 76035000 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281124;281125;281126;281127;281128;281129 281126 3 KQEVDLQQLIR Unmodified 1368.7725 0.77251325 1573 O60443;C9JSR4 DFNA5 Non-syndromic hearing impairment protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 71.408 71.408 3 0.0021273 70789 QUIQUE_C1277_190116_001 48.442 30.107 59588000 0 38715000 0 0 0 0 0 0 0 20873000 0 0 0 24292 1573 22842 220037;220038;220039 281130;281131;281132;281133 281131 4 KQEVQAWDGEVR Unmodified 1443.7106 0.71064128 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 1 1 1 34.441 34.441 2;3 1.0742E-37 29656 QUIQUE_DMIX7_190116_001 194.17 161.85 3191200000 250370000 275830000 260150000 330550000 356580000 236290000 412220000 218720000 262570000 106220000 186260000 110890000 184570000 24293 2472 22843 220040;220041;220042;220043;220044;220045;220046;220047;220048;220049;220050;220051;220052;220053;220054;220055;220056;220057;220058;220059;220060;220061;220062;220063 281134;281135;281136;281137;281138;281139;281140;281141;281142;281143;281144;281145;281146;281147;281148;281149;281150;281151;281152;281153;281154;281155;281156;281157;281158;281159 281158 25 KQEWIQAIHSTIHLLK Unmodified 1944.0945 0.094516093 4425 Q9UH65;E7EMB1;E9PJM7 SWAP70 Switch-associated protein 70 yes no 0 0 1 1 1 89.553 89.553 4 0.0025632 93092 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.14 28.482 63142000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35905000 0 27237000 24294 4425 22844 220064;220065 281160;281161 281160 2 KQEYLEVQR Unmodified 1191.6248 0.62478638 1464 O14964;I3L1E3 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 22.114 22.114 2;3 0.00065683 14925 QUIQUE_DMIX8_190116_001 118.07 65.283 534190000 65358000 0 0 48738000 24878000 37830000 50691000 80834000 45483000 0 62629000 50449000 67303000 24295 1464 22845 220066;220067;220068;220069;220070;220071;220072;220073;220074;220075;220076;220077;220078;220079 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281401;281402;281403;281404;281405;281406;281407;281408;281409 281408 9 KQIQFADDMQEFTK Unmodified 1727.8189 0.8188711 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 2 80.119 80.119 2;3 2.3634E-17 81093 QUIQUE_DMIX3_190116_001 152.4 131.03 1743700000 0 0 0 388730000 0 0 0 266250000 329140000 0 0 0 759550000 24306 1558 22854 220260;220261;220262;220263;220264;220265;220266 281410;281411;281412;281413;281414;281415;281416;281417 281414 8 KQIQFADDMQEFTKFPTK Unmodified 2201.0827 0.082690357 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 2 2 97.57 97.57 3;4 4.2847E-11 98893 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.78 97.43 128950000 0 0 0 0 0 0 0 128950000 0 0 0 0 0 24307 1558 22855 220267;220268 281418;281419 281418 1 KQISNLQQSISDAEQR Unmodified 1843.9388 0.93880331 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 1 1 1 53.536 53.536 2;3 3.1848E-12 50104 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.39 126.24 45288000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45288000 0 0 0 + 24308 1859 22856 220269;220270 281420;281421 281421 2 KQITMEELVR Unmodified 1245.6751 0.67510739 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 50.467 50.467 2;3 0.00011883 48619 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.142 53.718 1475600000 78370000 108350000 110420000 104140000 65026000 94924000 0 144480000 370670000 0 144830000 140070000 114310000 24309 3117 22857 220271;220272;220273;220274;220275;220276;220277;220278;220279;220280;220281;220282 281422;281423;281424;281425;281426;281427;281428;281429;281430;281431;281432;281433 281431 11 KQITMEELVR Oxidation (M) 1261.67 0.67002202 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 1 2 2 2 2 1 23.01 23.01 2;3 0.0026636 16574 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.321 38.36 436600000 0 0 0 0 0 0 0 94257000 134380000 0 99718000 83250000 24995000 24310 3117 22857 220283;220284;220285;220286;220287;220288;220289;220290;220291 281434;281435;281436;281437;281438;281439;281440;281441;281442 281437 2564 8 KQIWTLEQPPDEAGSAAVCLR Unmodified 2368.1845 0.18452967 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.735 97.735 3 1.4022E-05 99780 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.894 58.706 489380000 0 59274000 0 43431000 0 0 0 77505000 64849000 0 70211000 75496000 98617000 24311 3187 22858 220292;220293;220294;220295;220296;220297;220298 281443;281444;281445;281446;281447;281448;281449 281445 7 KQLADETLLK Unmodified 1157.6656 0.66558856 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 1 1 34.571 34.571 2 0.024395 29741 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.496 36.014 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24312 2171 22859 220299;220300 281450;281451 281451 2 KQLQDEMLR Unmodified 1159.6019 0.60194245 1819;3223 P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 1 1 1 28.02 28.02 3 0.05059 21629 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.958 13.814 68067000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23656000 44411000 0 0 24313 1819;3223 22860 220301;220302 281452;281453 281453 2 KQNDVFGEAEQ Unmodified 1263.5731 0.57314474 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 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281587 35 KQSNPLLIHVDTK Unmodified 1491.8409 0.84092717 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 1 2 1 1 33.76 33.76 3 0.0013847 28944 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.46 48.849 105140000 0 0 0 0 41309000 0 0 0 0 0 34353000 29482000 0 24327 2503 22872 220424;220425;220426;220427 281604;281605;281606;281607 281606 4 KQSTDEEVTSLAK Unmodified 1434.7202 0.72020291 379 A0A1W2PRL9;A0A1W2PPZ5;P23193;E5RIS7;E5RJ93 TCEA1 Transcription elongation factor A protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.259 24.259 2 5.1456E-06 18164 QUIQUE_C1218_190116_001 136.93 88.841 58095000 0 0 30257000 0 0 0 0 27837000 0 0 0 0 0 24328 379 22873 220428;220429;220430;220431;220432;220433;220434 281608;281609;281610;281611;281612;281613;281614 281608 7 KQSVEDILK Unmodified 1058.5972 0.59717465 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 32.513 32.513 2;3 0.0029417 27189 QUIQUE_C1563_190116_001 98.009 52.037 2369200000 244200000 243260000 67910000 64351000 204450000 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220513;220514;220515;220516;220517;220518;220519;220520;220521;220522;220523;220524;220525;220526;220527;220528;220529;220530;220531;220532 281700;281701;281702;281703;281704;281705;281706;281707;281708;281709;281710;281711;281712;281713;281714;281715;281716;281717;281718;281719;281720 281713 18 KQVEEIFNLK Unmodified 1246.6921 0.69213767 2805 P78347 GTF2I General transcription factor II-I yes yes 0 0 1 1 58.555 58.555 2 0.050072 57609 QUIQUE_C1368_190116_001 64.841 12.892 18116000 0 0 18116000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24335 2805 22880 220533 281721 281721 1 KQVEILNR Unmodified 998.58728 0.58727866 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 1 1 18.501 18.501 2 0.034142 11303 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.616 21.881 14634000 0 0 0 0 0 0 0 14634000 0 0 0 0 0 24336 1912 22881 220534 281722 281722 1 KQVRPMLLVDDR Unmodified 1468.8184 0.81841759 4123 Q9H0R4;K7ER15;K7EQD2;K7EMY7;A0A1B0GXB1;K7EJQ8 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 0 2 1 34.247 34.247 3 0.063674 29876 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.314 33.658 45437000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45437000 0 0 24337 4123 22882 220535 281723 281723 1 KQWLQEVK Unmodified 1057.592 0.59202969 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 1 28.405 28.405 2;3 0.0086751 22199 QUIQUE_C1403_190116_001 103.87 64.91 3365800000 873550000 182140000 429950000 319930000 0 427190000 332030000 0 0 73450000 587460000 140100000 0 24338 1788 22883 220536;220537;220538;220539;220540;220541;220542;220543;220544;220545;220546;220547 281724;281725;281726;281727;281728;281729;281730;281731;281732;281733;281734;281735 281728 4 KQYPISLVLAPTR Unmodified 1484.8715 0.87149901 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;A0A2R8YDH3;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 1 1 1 80.274 80.274 3 0.00048973 81101 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.294 40.471 30689000 0 0 0 0 0 0 0 14762000 0 0 0 15928000 0 24339 266;1504 22884 220548;220549 281736;281737 281736 2 KREDAEHNLVLFR Unmodified 1625.8638 0.86378788 2435 P41219;F8W835 PRPH Peripherin yes no 0 0 2 1 2 1 2 2 1 1 1 35.892 35.892 3;4 0.00019751 31464 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.479 63.563 784060000 47524000 0 200090000 0 0 46927000 0 234210000 98998000 64062000 59667000 0 32578000 24340 2435 22885 220550;220551;220552;220553;220554;220555;220556;220557;220558;220559;220560 281738;281739;281740;281741;281742;281743;281744;281745;281746;281747;281748;281749;281750 281748 13 KREELAHFSNSSSNSGK Unmodified 1876.9028 0.90275216 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein no no 0 0 2 1 1 10.423 10.423 4 0.00020746 2663 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.656 73.571 28146000 0 6229000 0 0 0 0 0 21917000 0 0 0 0 0 24341 1058 22886 220561;220562 281751;281752 281752 2 KRPDEVPDDDEPAGPMK Unmodified 1894.8731 0.87309151 4641 Q9Y639;H3BU51 NPTN Neuroplastin yes no 0 0 2 1 1 1 28.379 28.379 3 0.0037708 22503 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.223 34.122 169070000 0 0 62020000 0 0 0 0 0 0 0 63915000 0 43132000 24342 4641 22887 220563;220564;220565 281753;281754;281755 281755 3 KRPDEVPDDDEPAGPMK Oxidation (M) 1910.868 0.86800613 4641 Q9Y639;H3BU51 NPTN Neuroplastin yes no 0 1 2 1 1 1 20.166 20.166 3 0.00020663 13307 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.502 86.647 173420000 0 0 0 0 0 0 0 42350000 71018000 0 60057000 0 0 24343 4641 22887 220566;220567;220568 281756;281757;281758 281757 3058 3 KRPETVATQFK Unmodified 1303.7248 0.72483478 1014 F5H6E2;O00159 MYO1C Unconventional myosin-Ic yes no 0 0 2 1 14.674 14.674 3 0.045436 6822 QUIQUE_C1218_190116_001 58.511 45.716 53155000 53155000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24344 1014 22888 220569 281759 281759 0 KRPLETPPEVVCTK Unmodified 1652.892 0.89197646 4515 Q9UNW9 NOVA2 RNA-binding protein Nova-2 yes yes 0 0 2 1 1 26.661 26.661 3 0.03626 20037 QUIQUE_C1403_190116_001 40.211 32.235 105630000 55476000 0 0 50151000 0 0 0 0 0 0 0 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281921;281922;281923;281924;281925;281926;281927;281928;281929;281930;281931;281932;281933;281934;281935;281936;281937;281938;281939;281940;281941;281942;281943;281944;281945;281946;281947;281948;281949;281950;281951;281952;281953;281954;281955;281956;281957;281958;281959;281960;281961;281962;281963;281964;281965;281966;281967;281968;281969;281970;281971;281972;281973;281974;281975;281976;281977;281978;281979;281980;281981;281982;281983;281984;281985;281986;281987;281988 281934 68 KSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWFEGK Unmodified 3270.4881 0.48808429 4495 Q9ULV4;B4E3S0;H0YHL7 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 162.07 162.07 3 3.0487E-45 165900 QUIQUE_C1277_190116_001 134.67 119.74 1989800000 108980000 226030000 184870000 102670000 119320000 97896000 208690000 233800000 139940000 19535000 208330000 173860000 165830000 24359 4495 22902 220736;220737;220738;220739;220740;220741;220742;220743;220744;220745;220746;220747;220748;220749;220750 281989;281990;281991;281992;281993;281994;281995;281996;281997;281998;281999;282000;282001;282002;282003;282004;282005;282006;282007 281990 19 KSDLFQDDLYPDTAGPEAALEAEEWVSGR Unmodified 3208.4837 0.48366762 3999 Q9BR76 CORO1B Coronin-1B yes yes 0 0 1 1 1 1 155.63 155.63 3 8.4593E-09 162299 QUIQUE_C1438_190116_001 62.393 56.963 444110000 0 112840000 0 0 183170000 0 148090000 0 0 0 0 0 0 24360 3999 22903 220751;220752;220753 282008;282009;282010 282009 2 KSDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGR Unmodified 3172.5353 0.53530926 2327 P31146 CORO1A Coronin-1A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.5 155.5 3 1.89E-65 160722 QUIQUE_DMIX8_190116_001 149.84 140.13 7518600000 551320000 595850000 541580000 1420600000 499590000 292180000 531400000 556770000 469690000 157130000 696760000 646740000 558970000 24361 2327 22904 220754;220755;220756;220757;220758;220759;220760;220761;220762;220763;220764;220765;220766 282011;282012;282013;282014;282015;282016;282017;282018;282019;282020;282021;282022;282023;282024;282025;282026;282027;282028;282029;282030;282031;282032;282033;282034 282034 24 KSDLHPTLPAGR Unmodified 1290.7044 0.70443369 4303 Q9NV96 TMEM30A Cell cycle control protein 50A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.583 19.583 3 0.00020321 12430 QUIQUE_C1438_190116_001 82.278 60.25 526740000 0 108050000 83684000 76661000 78531000 59087000 0 66271000 54451000 0 0 0 0 24362 4303 22905 220767;220768;220769;220770;220771;220772;220773 282035;282036;282037;282038;282039;282040;282041;282042 282039 7 KSDVEAIFSK Unmodified 1122.5921 0.59208927 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V555;G3V575;G3V5X6;G3V3K6;G3V251;A0A0G2JPF8;A0A0G2JNQ3;P0DMR1;O60812;B7ZW38;B2RXH8;B4DSU6;G3V4M8;G3V2H6 HNRNPC;HNRNPCL4;HNRNPCL1;HNRNPCL3;HNRNPCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 4;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.471 43.471 2 0.00047487 40970 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.12 46.548 6482700000 522350000 565530000 452590000 398200000 601840000 464500000 478820000 488200000 465030000 168560000 767220000 531260000 578610000 24363 598 22906 220774;220775;220776;220777;220778;220779;220780;220781;220782;220783;220784;220785;220786 282043;282044;282045;282046;282047;282048;282049;282050;282051;282052;282053;282054;282055;282056 282050 12 KSDVETIFSK Unmodified 1152.6027 0.60265396 3287 Q5QPL9;Q9UKM9;Q5QPM2;Q5QPM1 RALY RNA-binding protein Raly yes no 0 0 1 1 40.524 40.524 2 0.015757 37162 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.737 38.861 42078000 0 0 0 0 0 0 0 0 42078000 0 0 0 0 24364 3287 22907 220787 282057 282057 1 KSDVNAIIHYLK Unmodified 1399.7823 0.78234966 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 63.456 63.456 2;3 0.0049102 62093 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Unmodified 3344.6235 0.62347234 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 171.78 171.78 3 5.9678E-06 179156 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.669 44.162 62741000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62741000 0 0 24371 2440 22914 220814 282085;282086 282086 2 KSEMESVLAQLDNYGQQELADLFVNYNVK Oxidation (M) 3360.6184 0.61838696 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 1 1 1 167.92 167.92 3 0.00011694 175239 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.612 41.474 70062000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70062000 0 0 24372 2440 22914 220815 282087 282087 1862 0 KSESEVEEAAAIIAQRPDNPR Unmodified 2309.1612 0.16115169 3186 Q16643;D6R9W4;D6R9Q9 DBN1 Drebrin yes no 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 1 78.687 78.687 3;4 1.1631E-12 79204 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.64 93.606 4119000000 279990000 414210000 367720000 362820000 357330000 304030000 453020000 370010000 188290000 119510000 390090000 285970000 225990000 24373 3186 22915 220816;220817;220818;220819;220820;220821;220822;220823;220824;220825;220826;220827;220828;220829;220830;220831;220832;220833;220834;220835;220836 282088;282089;282090;282091;282092;282093;282094;282095;282096;282097;282098;282099;282100;282101;282102;282103;282104;282105;282106;282107;282108;282109;282110;282111;282112;282113;282114;282115 282107 26 KSEYLLPVAPSKPTAPIFLQGLSDLK Unmodified 2811.5786 0.57861804 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 2 1 131.9 131.9 4 0.0016363 136618 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.543 31.551 41495000 0 0 0 0 0 0 0 0 41495000 0 0 0 0 24374 3154 22916 220837 282116 282116 1 KSFASLFSD Unmodified 1000.4866 0.48656157 2125;3755;1471 P17600;A0A1W2PSE9;Q92777;O14994;A0A0A0MR68 SYN1;SYN2;SYN3 Synapsin-1;Synapsin-2;Synapsin-3 no no 0 0 1 1 93.63 93.63 2 0.059741 97588 QUIQUE_C1438_190116_001 53.404 38.183 23452000 0 0 0 0 23452000 0 0 0 0 0 0 0 0 24375 2125;3755;1471 22917 220838 282117 282117 1 KSFEQISANITK Unmodified 1364.73 0.72997974 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VP00 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.286 42.286 2 4.626E-37 39039 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.97 125.74 2220100000 158110000 182770000 127200000 181320000 170380000 165210000 192670000 178010000 189220000 0 292960000 165580000 216700000 24376 452 22918 220839;220840;220841;220842;220843;220844;220845;220846;220847;220848;220849;220850 282118;282119;282120;282121;282122;282123;282124;282125;282126;282127;282128;282129;282130;282131;282132;282133;282134 282128 17 KSIDSNPYDTDK Unmodified 1381.6361 0.63613893 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 19.455 19.455 2 0.0071522 12325 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.69 59.99 30220000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30220000 0 24377 1245 22919 220851 282135 282135 1 KSIPHITSDR Unmodified 1152.6251 0.62512073 3050 Q14194 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes yes 0 0 1 1 11.351 11.351 3 0.0084794 3725 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.879 26.636 2769500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2769500 0 0 0 24378 3050 22920 220852 282136;282137 282137 2 KSIQGDGEGDGDLK Unmodified 1417.6685 0.66850169 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 2 14.966 14.966 2;3 0.0001488 7257 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.48 102.92 467450000 18086000 79458000 13963000 70543000 0 0 42485000 0 19007000 0 132640000 29190000 62069000 24379 4128 22921 220853;220854;220855;220856;220857;220858;220859;220860;220861;220862;220863;220864;220865 282138;282139;282140;282141;282142;282143;282144;282145;282146;282147;282148;282149;282150 282146 10 KSLADEAEVHLK Unmodified 1338.7143 0.71432967 1597 O60861 GAS7 Growth arrest-specific protein 7 yes yes 0 0 1 1 1 1 36.386 36.386 3 0.022208 31934 QUIQUE_C1403_190116_001 39.033 31.831 66659000 0 0 0 21101000 0 22054000 23504000 0 0 0 0 0 0 24380 1597 22922 220866;220867;220868 282151;282152;282153 282151 3 KSLSQQLDCPAGK Unmodified 1430.7188 0.71876312 3036 Q14005;H0YKB7;H3BT15;H0YLL1 IL16 Pro-interleukin-16;Interleukin-16 yes no 0 0 1 1 42.829 42.829 2 0.040615 39203 QUIQUE_C1403_190116_001 48.284 6.2533 57467000 0 0 0 57467000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24381 3036 22923 220869 282154 282154 1 KSNAHYNLQNAFNLAEQHLGLTK Unmodified 2610.3303 0.3302827 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 3 3 3 105.73 105.73 3;4;5 2.0314E-12 108495 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.964 92.517 1472300000 42906000 107950000 47505000 94971000 0 0 71370000 28980000 181200000 22569000 249130000 338730000 287040000 24382 2851 22924 220870;220871;220872;220873;220874;220875;220876;220877;220878;220879;220880;220881;220882;220883;220884;220885;220886;220887;220888;220889 282155;282156;282157;282158;282159;282160;282161;282162;282163;282164;282165;282166;282167;282168;282169;282170;282171;282172;282173;282174;282175;282176;282177;282178 282175 22 KSNFAEALAAHK Unmodified 1285.6779 0.67788459 1917 P07237;H7BZ94;I3L312;I3NI03;I3L0S0;I3L3P5;I3L3U6;I3L514;I3L1Y5 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 22.839 22.839 2;3 0.00041375 16652 QUIQUE_C1218_190116_001 93.614 85.215 1856500000 144980000 158630000 201710000 180770000 205010000 144930000 258280000 70570000 159420000 43908000 30572000 0 257770000 24383 1917 22925 220890;220891;220892;220893;220894;220895;220896;220897;220898;220899;220900;220901;220902;220903;220904;220905 282179;282180;282181;282182;282183;282184;282185;282186;282187;282188;282189;282190;282191;282192;282193;282194 282180 7 KSNFSNSADDIK Unmodified 1324.6259 0.62590859 2471 P45973 CBX5 Chromobox protein homolog 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 17.016 17.016 2 0.00076735 8868 QUIQUE_C1277_190116_001 104.59 64.241 34560000 0 18516000 0 0 0 0 0 16043000 0 0 0 0 0 24384 2471 22926 220906;220907;220908 282195;282196;282197 282195 3 KSNIHCNTIAPNAGSR Unmodified 1738.8533 0.85329954 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;A0A2R8Y7W2 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 10.701 10.701 3;4 8.1312E-08 2919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.51 81.487 223220000 0 0 42906000 29852000 23319000 0 15446000 0 0 0 51819000 21949000 37929000 24385 455 22927 220909;220910;220911;220912;220913;220914;220915;220916;220917;220918;220919 282198;282199;282200;282201;282202;282203;282204;282205;282206;282207;282208;282209;282210 282206 13 KSNQIPTEVR Unmodified 1170.6357 0.63568542 4056 Q9BWH2 FUNDC2 FUN14 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 16.187 16.187 2 0.02414 8200 QUIQUE_C1277_190116_001 82.417 44.113 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24386 4056 22928 220920;220921 282211;282212 282211 2 KSPESVALIWER Unmodified 1413.7616 0.76161421 4296 Q9NUB1;Q5TF43 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 75.81 75.81 3 0.0062132 76814 QUIQUE_C1576_190116_001 41.227 25.84 122600000 0 40725000 0 0 0 0 24405000 0 0 22015000 0 0 35460000 24387 4296 22929 220922;220923;220924;220925 282213;282214;282215;282216;282217 282214 4 KSPLSWIEEK Unmodified 1215.6499 0.6499385 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 70.969 70.969 2 0.028842 71253 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.672 55.766 161110000 0 0 44628000 39867000 0 0 0 0 0 0 0 0 76613000 24388 2620 22930 220926;220927;220928;220929 282218;282219;282220;282221;282222 282222 5 KSPLTICFPEYTGPNTYEDAAAYIQAQFESK Unmodified 3538.6603 0.66025178 1963 P09471;A0A1W2PP38;A0A1W2PQ24;H3BNR5 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 160.64 160.64 3 1.7348E-46 166043 QUIQUE_C1218_190116_001 124.12 118.45 1571000000 94449000 67272000 0 39418000 102120000 79068000 232450000 117030000 113550000 16327000 211760000 258930000 238670000 24389 1963 22931 220930;220931;220932;220933;220934;220935;220936;220937;220938;220939;220940;220941;220942;220943 282223;282224;282225;282226;282227;282228;282229;282230;282231;282232;282233;282234;282235;282236;282237;282238;282239 282224 14 KSPSSDSWTCADTSTER Unmodified 1913.8061 0.80613416 3610 Q8N6T3;F8VWH9;E5RHH7;H0YIQ0 ARFGAP1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 1 1 29.09 29.09 3 0.055559 23358 QUIQUE_C1403_190116_001 26.119 20.577 23889000 0 0 0 23889000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24390 3610 22932 220944 282240 282240 1 KSPYLPSAHR Unmodified 1154.6196 0.61964142 2209;4270 P23258;Q9NRH3 TUBG1;TUBG2 Tubulin gamma-1 chain;Tubulin gamma-2 chain no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 13.799 13.799 3 0.0013821 6105 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.103 45.663 106630000 0 27768000 0 6286300 0 16477000 0 45967000 0 0 0 10133000 0 24391 2209;4270 22933 220945;220946;220947;220948;220949;220950;220951 282241;282242;282243;282244;282245;282246;282247;282248 282244 8 KSQIFSTASDNQPTVTIK Unmodified 1964.0215 0.021470309 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 57.182 57.182 2;3 1.1978E-13 56673 QUIQUE_C1438_190116_001 128.9 114.21 132750000 0 0 0 0 24338000 0 20430000 0 50481000 0 37504000 0 0 24392 2007 22934 220952;220953;220954;220955 282249;282250;282251;282252 282249 4 KSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNK Unmodified 2917.4862 0.48617422 2915;2107 Q08209;E7ETC2;P16298;Q5F2F8 PPP3CA;PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform no no 0 0 1 1 1 1 1 1 157.8 157.8 3 2.9432E-10 161969 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.63 68.266 367500000 0 0 0 0 0 0 0 94412000 42329000 0 100890000 81611000 48264000 24393 2915;2107 22935 220956;220957;220958;220959;220960 282253;282254;282255;282256;282257;282258;282259 282257 7 KSQVFSTAADGQTQVEIK Unmodified 1935.9902 0.99017018 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 51.389 51.389 3 1.2354E-07 46540 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.573 66.292 13176000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13176000 0 0 0 24394 2415 22936 220961 282260 282260 1 KSTAALEEDAQILK Unmodified 1515.8144 0.81443765 465;3105 Q15052;B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E9PDQ5 ARHGEF6;ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 6;Rho guanine nucleotide exchange factor 7 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 51.764 51.764 2 1.2313E-07 49673 QUIQUE_C1403_190116_001 130.15 83.548 108010000 0 0 0 31991000 43681000 32340000 0 0 0 0 0 0 0 24395 3105;465 22937 220962;220963;220964;220965;220966 282261;282262;282263;282264;282265 282262 5 KSTVLQQQYNR Unmodified 1363.7208 0.72081203 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 16.951 16.951 2;3 1.4434E-05 10087 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.77 108.39 407150000 0 0 0 24113000 0 0 0 26163000 85999000 15662000 108310000 49022000 97883000 24396 4600 22938 220967;220968;220969;220970;220971;220972;220973;220974;220975;220976;220977 282266;282267;282268;282269;282270;282271;282272;282273;282274;282275;282276;282277 282267 12 KSVFEEEVR Unmodified 1121.5717 0.57168818 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 1 1 28.783 28.783 2 0.051329 22888 QUIQUE_C1563_190116_001 54.982 31.553 53238000 0 0 0 0 0 53238000 0 0 0 0 0 0 0 24397 2886 22939 220978 282278 282278 1 KSVMSLAEAGK Unmodified 1119.5958 0.59579444 2201 P22676;H3BN14 CALB2 Calretinin yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 27.401 27.401 2;3 0.00064825 22451 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.69 47.252 553950000 0 88265000 0 47917000 61242000 0 0 73435000 96774000 0 64109000 63404000 58808000 24398 2201 22940 220979;220980;220981;220982;220983;220984;220985;220986;220987 282279;282280;282281;282282;282283;282284;282285;282286;282287 282283 8 KSVMSLAEAGK Oxidation (M) 1135.5907 0.59070906 2201 P22676;H3BN14 CALB2 Calretinin yes no 0 1 1 1 14.901 14.901 2 0.027464 7183 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.739 35.219 16363000 0 0 0 0 0 0 0 16363000 0 0 0 0 0 24399 2201 22940 220988 282288 282288 1560 1 KSVPSETVVEDSR Unmodified 1431.7205 0.72053726 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 21.109 21.109 2 0.0013437 13709 QUIQUE_C1563_190116_001 83.314 61.942 107420000 0 0 0 0 0 31520000 0 33042000 0 0 0 0 42858000 24400 2009 22941 220989;220990;220991;220992;220993 282289;282290;282291;282292;282293;282294 282290 6 KSWLHNDLK Unmodified 1139.6087 0.60874239 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 19.696 19.696 2;3 0.0062726 12245 QUIQUE_C1368_190116_001 52.579 25.792 579820000 138670000 110070000 123700000 122700000 0 28429000 32698000 0 0 0 23555000 0 0 24401 2280 22942 220994;220995;220996;220997;220998;220999;221000;221001;221002;221003;221004 282295;282296;282297;282298;282299;282300;282301;282302;282303;282304;282305 282298 11 KTAAELLQSQGSQAGGSQTLK Unmodified 2102.0968 0.096760517 594 B1AMS2;Q14141 SEPT6 Septin-6 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 51.084 51.084 2;3 3.647E-259 49756 QUIQUE_C1218_190116_001 276.38 216.22 1286800000 163660000 0 89191000 170190000 165480000 0 162980000 39356000 72621000 38126000 130120000 115860000 139250000 24402 594 22943 221005;221006;221007;221008;221009;221010;221011;221012;221013;221014;221015;221016;221017;221018;221019;221020;221021;221022;221023;221024 282306;282307;282308;282309;282310;282311;282312;282313;282314;282315;282316;282317;282318;282319;282320;282321;282322;282323;282324;282325 282307 18 KTAAELLQSQGSQAGGSQTLKR Unmodified 2258.1979 0.19787154 594 B1AMS2;Q14141 SEPT6 Septin-6 yes no 0 0 2 2 1 1 1 1 41.15 41.15 3;4 1.2141E-53 37857 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.31 121.02 166180000 0 0 0 0 0 0 0 129770000 0 0 0 36408000 0 24403 594 22944 221025;221026;221027;221028;221029;221030 282326;282327;282328;282329;282330;282331 282327 6 KTAGEHLGVTFR Unmodified 1314.7044 0.70443369 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;Q14168;E5RI47;A0A087WVY2 MPP2 MAGUK p55 subfamily member 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 22.305 22.305 3 0.026507 15331 QUIQUE_C1368_190116_001 37.248 22.967 178520000 0 0 45006000 0 0 0 0 35448000 44323000 0 53740000 0 0 24404 159 22945 221031;221032;221033;221034 282332;282333;282334;282335 282332 4 KTAHSFEQVLTDITDAIK Unmodified 2016.0528 0.052770437 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 130.09 130.09 3;4 0.00035461 134746 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.618 50.151 247600000 0 0 0 40909000 26416000 0 0 0 86231000 0 0 26722000 67320000 24405 1478;3342 22946 221035;221036;221037;221038;221039;221040;221041 282336;282337;282338;282339;282340;282341;282342;282343;282344 282340 9 KTAHSFEQVLTDITEAIK Unmodified 2030.0684 0.068420501 3596;363 H3BLV5;A0A1B0GWD1;A8K340;O43602;Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCX;DCLK2 Neuronal migration protein doublecortin;Serine/threonine-protein kinase DCLK2 no no 0 0 1 1 129.58 129.58 3 0.0030733 134461 QUIQUE_DMIX8_190116_001 42.118 39.02 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24406 363;3596 22947 221042 282345 282345 1 KTANDMIHAENMR Unmodified 1529.7079 0.70788086 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.816 21.816 3 0.00018161 14691 QUIQUE_C1403_190116_001 78.814 65.41 1110900000 0 0 132610000 105990000 116680000 102030000 113720000 123760000 169390000 0 114430000 132250000 0 24407 2248 22948 221043;221044;221045;221046;221047;221048;221049;221050;221051;221052;221053 282346;282347;282348;282349;282350;282351;282352;282353;282354;282355;282356;282357;282358;282359 282350 14 KTANDMIHAENMR Oxidation (M) 1545.7028 0.70279548 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 1 1 1 1 1 1 3 13.794 13.794 2;3 0.0020942 7846 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.499 52.157 321660000 0 0 0 66322000 10234000 0 5705500 65690000 173710000 0 0 0 0 24408 2248 22948 221054;221055;221056;221057;221058;221059;221060 282360;282361;282362;282363;282364;282365;282366 282363 1606;1607 7 KTATALLESPLSATVEDALQSFLK Unmodified 2532.3687 0.36868485 3949 Q96TC7;H0YMB1 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.12 169.12 3 2.2876E-19 172727 QUIQUE_C1277_190116_001 120.44 113.19 415970000 14066000 23364000 84709000 9129200 27582000 0 28632000 26064000 68024000 3650900 91281000 39466000 0 24409 3949 22949 221061;221062;221063;221064;221065;221066;221067;221068;221069;221070;221071 282367;282368;282369;282370;282371;282372;282373;282374;282375;282376;282377 282368 10 KTCAYTNHTVLPEALER Unmodified 2001.9942 0.9942097 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 3 47.902 47.902 2;3;4 0.00011442 45702 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.208 59.553 797120000 0 29043000 64718000 0 34729000 0 0 155810000 160050000 0 41137000 131540000 180090000 24410 2016 22950 221072;221073;221074;221075;221076;221077;221078;221079;221080;221081;221082;221083;221084 282378;282379;282380;282381;282382;282383;282384;282385;282386;282387;282388;282389;282390;282391;282392 282384 13 KTCGDVLDNLK Unmodified 1261.6336 0.63363651 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 1 1 1 1 39.067 39.067 2 0.0028461 35306 QUIQUE_C1576_190116_001 81.525 46.203 64469000 0 0 0 35490000 0 0 28979000 0 0 0 0 0 0 24411 2613 22951 221085;221086;221087 282393;282394;282395 282395 3 KTDDVEAMSSQPALALDER Unmodified 2074.9841 0.98409852 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 76.359 76.359 2;3 1.2774E-115 76933 QUIQUE_C1277_190116_001 266.17 235.73 2858500000 191050000 174740000 177370000 144660000 198130000 162370000 126760000 338860000 301430000 66178000 354300000 172530000 450150000 24412 2483 22952 221088;221089;221090;221091;221092;221093;221094;221095;221096;221097;221098;221099;221100;221101;221102;221103;221104;221105;221106;221107;221108;221109;221110;221111 282396;282397;282398;282399;282400;282401;282402;282403;282404;282405;282406;282407;282408;282409;282410;282411;282412;282413;282414;282415;282416;282417;282418;282419;282420;282421 282399 23 KTDDVEAMSSQPALALDER Oxidation (M) 2090.979 0.97901315 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 1 1 1 55.272 55.272 3 3.0301E-05 53425 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.748 77.274 127690000 0 0 0 0 0 0 0 61575000 66111000 0 0 0 0 24413 2483 22952 221112;221113 282422;282423;282424;282425 282423 1915 4 KTDPWSLLAVLGAPVPSDLQAQR Unmodified 2461.3329 0.33290846 3142 Q15477;B4E0B4 SKIV2L Helicase SKI2W yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 157.46 157.46 3 2.8662E-06 159940 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.853 62.094 166360000 28099000 31153000 0 0 26138000 0 0 30862000 0 7012500 0 0 43092000 24414 3142 22953 221114;221115;221116;221117;221118;221119 282426;282427;282428;282429;282430;282431 282429 6 KTDYECTGSNATYHGAK Unmodified 1901.8214 0.82139029 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 14.805 14.805 3;4 9.224E-45 6823 QUIQUE_C1368_190116_001 168.55 155.84 881020000 68324000 122820000 75672000 178880000 96691000 87726000 74840000 16696000 0 0 0 77922000 81446000 24415 855;928 22954 221120;221121;221122;221123;221124;221125;221126;221127;221128;221129;221130;221131;221132 282432;282433;282434;282435;282436;282437;282438;282439;282440;282441;282442;282443;282444 282436 11 KTEAPAAPAAQETK Unmodified 1411.7307 0.73070802 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 3 2 3 2 1 1 1 3 1 2 11.421 11.421 2;3 3.1982E-46 3536 QUIQUE_C1576_190116_001 211.77 150.12 2826700000 62817000 203380000 300350000 208640000 434420000 1018800000 339990000 12492000 11628000 6338200 101350000 24750000 101760000 24416 2817 22955 221133;221134;221135;221136;221137;221138;221139;221140;221141;221142;221143;221144;221145;221146;221147;221148;221149;221150;221151;221152;221153;221154;221155;221156;221157 282445;282446;282447;282448;282449;282450;282451;282452;282453;282454;282455;282456;282457;282458;282459;282460;282461;282462;282463;282464;282465;282466;282467;282468;282469;282470;282471;282472;282473;282474;282475;282476;282477 282467 29 KTEEAGDEIETFGLGVTYEQALAK Unmodified 2598.2701 0.27009301 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 125.32 125.32 3 7.2599E-41 129497 QUIQUE_C1368_190116_001 145.89 126.85 1594100000 153420000 147040000 169320000 148910000 165110000 198080000 128600000 196920000 52758000 0 0 98780000 135170000 24417 2009 22956 221158;221159;221160;221161;221162;221163;221164;221165;221166;221167;221168;221169;221170;221171;221172;221173;221174 282478;282479;282480;282481;282482;282483;282484;282485;282486;282487;282488;282489;282490;282491;282492;282493;282494;282495;282496;282497;282498;282499;282500;282501;282502;282503 282484 25 KTEELEEESFPER Unmodified 1621.7471 0.74714594 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid hormone receptor-associated protein 3 yes no 0 0 1 1 44.376 44.376 3 0.00041807 41088 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.79 50.939 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24418 504 22957 221175 282504 282504 1 KTENWLSEWWLK Unmodified 1618.8144 0.81437807 2462 P43155 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 130.33 130.33 2;3 0.00077942 134877 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.86 89.095 654180000 0 32174000 49141000 41843000 0 28175000 0 40518000 117120000 0 100250000 124690000 120270000 24419 2462 22958 221176;221177;221178;221179;221180;221181;221182;221183;221184;221185;221186;221187;221188 282505;282506;282507;282508;282509;282510;282511;282512;282513;282514;282515;282516;282517 282511 9 KTEPATGFIDGDLIESFLDISR Unmodified 2423.222 0.22202061 3179 Q16531 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes yes 0 0 1 1 165.07 165.07 3 2.2156E-05 168963 QUIQUE_C1277_190116_001 60.133 52.511 34880000 0 34880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24420 3179 22959 221189 282518 282518 1 KTEPATGFIDGDLIESFLDISRPK Unmodified 2648.3697 0.36974748 3179 Q16531 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes yes 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 2 1 1 154.46 154.46 3;4 7.9734E-24 161018 QUIQUE_C1438_190116_001 123.2 116.43 3173700000 233460000 439680000 311480000 325610000 198490000 132900000 175320000 96790000 488430000 74043000 369250000 135640000 192630000 24421 3179 22960 221190;221191;221192;221193;221194;221195;221196;221197;221198;221199;221200;221201;221202;221203;221204;221205;221206;221207;221208;221209;221210 282519;282520;282521;282522;282523;282524;282525;282526;282527;282528;282529;282530;282531;282532;282533;282534;282535;282536;282537;282538;282539;282540;282541;282542;282543;282544;282545;282546;282547;282548 282531 29 KTESFQNAQAGSNPK Unmodified 1605.7747 0.7746981 3746 Q92667;I3L0W0;I3NI36 AKAP1 A-kinase anchor protein 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 12.849 12.849 3 4.0002E-06 4987 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.781 60.926 21720000 5555700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2594500 13570000 0 24422 3746 22961 221211;221212;221213 282549;282550;282551 282551 3 KTESIDVMDAVGSNIVVSTR Unmodified 2120.0783 0.078333261 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 104.93 104.93 3 0.0016395 101969 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.229 32.637 104530000 0 0 0 0 0 0 57401000 0 0 16050000 0 31080000 0 24423 2280 22962 221214;221215;221216 282552;282553;282554 282553 3 KTEVLMENFR Unmodified 1265.6438 0.64380726 4542 Q9Y265;E7ETR0 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 47.175 47.175 2;3 0.028182 44015 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.518 34.959 206600000 39995000 0 37415000 0 0 0 32125000 19372000 0 12590000 40550000 24553000 0 24424 4542 22963 221217;221218;221219;221220;221221;221222;221223;221224 282555;282556;282557;282558;282559;282560;282561;282562 282562 7 KTEVVMNSQQTPVGTPK Unmodified 1842.9509 0.9509479 1656 O75781 PALM Paralemmin-1 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 2 31.307 31.307 2;3 5.6007E-104 26691 QUIQUE_C1218_190116_001 277.82 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yes 0 0 2 1 1 31.626 31.626 3 0.0028747 26566 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.788 53.558 140430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86430000 53995000 0 24439 2007 22978 221374;221375 282742;282743 282742 2 KTLLSNLEEAK Unmodified 1244.6976 0.69761697 2005 P10909;H0YLK8;E7ERK6;E7ETB4;E5RG36;E5RGB0;E5RH61;E5RJZ5 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 1 49.65 49.65 2;3 0.0014709 48510 QUIQUE_C1218_190116_001 68.548 38.622 944000000 164000000 64164000 68191000 109800000 131560000 59520000 121900000 53610000 44106000 0 0 84911000 42227000 24440 2005 22979 221376;221377;221378;221379;221380;221381;221382;221383;221384;221385;221386;221387;221388;221389;221390;221391 282744;282745;282746;282747;282748;282749;282750;282751;282752;282753;282754;282755;282756;282757;282758;282759 282745 13 KTLLSNLEEAKK Unmodified 1372.7926 0.79257999 2005 P10909;H0YLK8;E7ERK6;E7ETB4;E5RG36;E5RGB0;E5RH61;E5RJZ5 CLU Clusterin;Clusterin beta chain;Clusterin alpha chain yes no 0 0 2 1 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protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 105.32 105.32 3 0.007414 110156 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.915 41.478 64673000 0 0 0 0 0 0 0 0 14489000 0 23169000 15370000 11644000 24468 92 23007 221643;221644;221645;221646 283068;283069;283070;283071 283069 3 KTTVLDVMR Unmodified 1061.5903 0.59031513 2209;4270 P23258;Q9NRH3 TUBG1;TUBG2 Tubulin gamma-1 chain;Tubulin gamma-2 chain no no 0 0 1 1 1 1 37.814 37.814 3 0.019752 34556 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.561 23.406 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24469 2209;4270 23008 221647;221648;221649 283072;283073;283074 283072 3 KTVAGIIVEPIQSEGGDNHASDDFFR Unmodified 2801.362 0.36203634 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 102.57 102.57 3;4 1.0107E-17 105670 QUIQUE_C1368_190116_001 97.295 91.068 878210000 63105000 83575000 45035000 99448000 0 56404000 52731000 62014000 38100000 0 148960000 184200000 44635000 24470 1198 23009 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283198;283199;283200;283201;283202;283203;283204;283205;283206;283207;283208;283209;283210;283211;283212;283213;283214;283215;283216;283217;283218;283219;283220;283221;283222;283223;283224;283225;283226;283227;283228;283229;283230;283231;283232;283233;283234;283235;283236;283237;283238;283239;283240;283241;283242;283243;283244;283245;283246;283247;283248;283249;283250;283251;283252;283253;283254;283255;283256;283257;283258;283259;283260;283261;283262;283263;283264;283265;283266;283267;283268;283269;283270;283271;283272;283273;283274;283275;283276;283277;283278;283279;283280;283281 283210 78 KVADLYELVQYAGNIIPR Unmodified 2061.1259 0.1258758 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.89 157.89 3 7.949E-06 162675 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.579 88.018 352190000 0 0 0 0 59874000 0 43062000 28803000 0 0 123040000 32996000 64411000 24482 3926 23020 221791;221792;221793;221794;221795;221796;221797;221798 283282;283283;283284;283285;283286;283287;283288;283289;283290;283291 283291 10 KVAELEEEQSQGSSSYSDWVK Unmodified 2385.0972 0.097214027 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 76.378 76.378 2;3 1.0556E-34 76814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.14 166.51 627790000 0 0 0 0 0 0 0 125300000 84048000 0 154650000 165420000 98385000 24483 921 23021 221799;221800;221801;221802;221803;221804;221805;221806;221807 283292;283293;283294;283295;283296;283297;283298;283299;283300 283296 9 KVAGMDVELTVEER Oxidation (M) 1590.7923 0.792322 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1;K7EIT4 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 45.011 45.011 2 0.0034406 41861 QUIQUE_C1438_190116_001 74.46 56.596 195540000 0 81733000 0 0 88785000 0 0 25020000 0 0 0 0 0 24484 2745 23022 221808;221809;221810;221811;221812 283301;283302;283303;283304;283305;283306 283303 2176 6 KVAGMDVELTVEER Unmodified 1574.7974 0.79740737 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1;K7EIT4 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 1 1 1 1 1 70.828 70.828 3 0.0055734 71105 QUIQUE_DMIX8_190116_001 49.188 29.433 93443000 0 0 0 0 0 28900000 0 0 0 0 27411000 0 37133000 24485 2745 23022 221813;221814;221815;221816 283307;283308;283309;283310 283310 3 KVAHSDKPGSTSTASFR Unmodified 1774.8962 0.89621022 4369 Q9P0L0 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes yes 0 0 2 1 10.409 10.409 4 0.0011278 2772 QUIQUE_C1563_190116_001 44.598 38.958 7127000 0 0 0 0 0 7127000 0 0 0 0 0 0 0 24486 4369 23023 221817 283311;283312 283311 2 KVAVAAASKPHVEIR Unmodified 1574.9257 0.92565985 2292 P29762;B5MCB5 CRABP1 Cellular retinoic acid-binding protein 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 17.043 17.043 3;4 7.3862E-06 10271 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.222 71.06 1330500000 79159000 0 42464000 29627000 27197000 0 55422000 182820000 138180000 0 294930000 92688000 388020000 24487 2292 23024 221818;221819;221820;221821;221822;221823;221824;221825;221826;221827;221828;221829;221830 283313;283314;283315;283316;283317;283318;283319;283320;283321;283322;283323;283324;283325;283326 283318 12 KVAVFFSNTPTR Unmodified 1365.7405 0.74048484 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 47.314 47.314 2;3 0.00015731 44652 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.961 76.589 525180000 0 0 0 0 0 0 0 73658000 114950000 26500000 134700000 127460000 47907000 24488 2037 23025 221831;221832;221833;221834;221835;221836;221837;221838;221839 283327;283328;283329;283330;283331;283332;283333;283334;283335;283336 283333 9 KVAVPYSPAAGVDFELESFSER Unmodified 2397.1852 0.18524117 2113 P16870 CPE Carboxypeptidase E yes yes 0 0 1 1 126.92 126.92 3 0.0095555 129660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.5 18.313 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24489 2113 23026 221840 283337 283337 1 KVCGDSDKGFVVINQK Unmodified 1792.9142 0.91416847 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 2 1 1 1 29.241 29.241 2;3 1.0047E-06 25090 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.99 50.975 209410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 125360000 84052000 0 24490 2424 23027 221841;221842;221843 283338;283339;283340 283338 3 KVCIVGSGNWGSAIAK Unmodified 1645.861 0.86101068 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 64.616 64.616 3 0.0119 64582 QUIQUE_DMIX8_190116_001 31.111 12.279 33945000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33945000 24491 2184 23028 221844 283341 283341 1 KVDAVFVGTGDLFAAMLLAWTHK Unmodified 2489.3141 0.31408728 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 1 2 2 168.79 168.79 3;4 6.4164E-11 176168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.791 65.785 172720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 103140000 69577000 0 24492 1423 23029 221845;221846;221847;221848 283342;283343;283344;283345 283342 2 KVDDDLGTIESLEEAK Unmodified 1760.868 0.86798936 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 91.565 91.565 2;3 1.1208E-06 93989 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.259 44.541 144520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79034000 37697000 27792000 24493 2379 23030 221849;221850;221851;221852;221853 283346;283347;283348;283349;283350 283349 3 KVDEAIALFQK Unmodified 1260.7078 0.70778773 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 65.562 65.562 2;3 0.00092328 65142 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.898 59.888 705600000 124810000 136730000 109610000 29741000 97158000 20334000 20490000 31982000 107630000 0 0 27117000 0 24494 2254 23031 221854;221855;221856;221857;221858;221859;221860;221861;221862;221863;221864;221865;221866;221867 283351;283352;283353;283354;283355;283356;283357;283358;283359;283360;283361;283362;283363;283364;283365 283362 14 KVDIEVLSVLASLGASVHK Unmodified 1964.1306 0.13062683 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A0A6YY92;A0A096LNY6;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY5;A0A096LP92;A0A096LPA2 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.03 143.03 3 4.7532E-05 147749 QUIQUE_C1277_190116_001 76.704 72.178 296730000 0 29705000 0 0 67287000 0 0 58530000 53892000 8486300 44111000 34723000 0 24495 338 23032 221868;221869;221870;221871;221872;221873;221874;221875 283366;283367;283368;283369;283370;283371;283372;283373 283366 7 KVDIIADAAYSIFQKPK Unmodified 1906.0564 0.056399252 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 2 3 3 1 2 2 3 1 3 3 1 2 1 1 107.38 107.38 2;3;4 6.1715E-29 110286 QUIQUE_C1403_190116_001 156.17 127.41 6168700000 398780000 479020000 599650000 386500000 403150000 450760000 404690000 520880000 707570000 108400000 577420000 497690000 634230000 24496 3421 23033 221876;221877;221878;221879;221880;221881;221882;221883;221884;221885;221886;221887;221888;221889;221890;221891;221892;221893;221894;221895;221896;221897;221898;221899;221900;221901 283374;283375;283376;283377;283378;283379;283380;283381;283382;283383;283384;283385;283386;283387;283388;283389;283390;283391;283392;283393;283394;283395;283396;283397;283398;283399;283400;283401;283402;283403;283404;283405;283406;283407;283408;283409;283410 283386 36 KVDKIEELDQENEAALENGIK Unmodified 2384.2071 0.20709883 307 A0A0R4J2E8;P43243;D6REM6;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 2 1 78.131 78.131 3 0.020015 78158 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.72 26.533 38629000 0 0 0 0 0 0 0 38629000 0 0 0 0 0 24497 307 23034 221902 283411 283411 1 KVDKNDEAEYICIAENK Unmodified 2037.9677 0.96772018 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 2 3 2 3 3 3 2 1 1 1 1 1 1 52.749 52.749 2;3;4 1.8989E-201 50873 QUIQUE_C1277_190116_001 270.26 240.92 4088800000 456620000 684980000 876950000 589090000 676200000 202250000 138370000 0 86792000 31305000 128540000 77559000 140100000 24498 1218;28;2057 23035 221903;221904;221905;221906;221907;221908;221909;221910;221911;221912;221913;221914;221915;221916;221917;221918;221919;221920;221921;221922;221923;221924 283412;283413;283414;283415;283416;283417;283418;283419;283420;283421;283422;283423;283424;283425;283426;283427;283428;283429;283430;283431;283432;283433;283434;283435;283436 283416 25 KVDLSQPLIATCR Unmodified 1499.813 0.81299786 3193 Q16762 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 2 2 2 60.718 60.718 2;3 6.4615E-06 59063 QUIQUE_C1563_190116_001 98 83.97 2510300000 230190000 110030000 323860000 130930000 126990000 114340000 0 239850000 321410000 18292000 280750000 299630000 313970000 24499 3193 23036 221925;221926;221927;221928;221929;221930;221931;221932;221933;221934;221935;221936;221937;221938;221939;221940;221941;221942;221943 283437;283438;283439;283440;283441;283442;283443;283444;283445;283446;283447;283448;283449;283450;283451;283452;283453;283454;283455 283444 15 KVDPVSSDKVDPVFPR Unmodified 1783.9468 0.9468488 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 51.328 51.328 3;4 5.249E-24 49471 QUIQUE_C1277_190116_001 121.03 101.21 1027100000 0 114920000 131970000 155880000 150960000 110700000 103250000 71636000 60570000 0 75183000 52085000 0 24500 3452 23037 221944;221945;221946;221947;221948;221949;221950;221951;221952;221953;221954 283456;283457;283458;283459;283460;283461;283462;283463;283464;283465;283466 283456 9 KVDSSVLGSLSSVPLTGFSFSPGNSSLFGK Unmodified 3000.5444 0.54441738 4478 Q9UKX7 NUP50 Nuclear pore complex protein Nup50 yes yes 0 0 1 1 157.56 157.56 3 0.00017276 160084 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.269 35.987 35295000 0 0 0 0 0 0 0 35295000 0 0 0 0 0 24501 4478 23038 221955 283467 283467 1 KVDTHIHAAACMNQK Unmodified 1722.8294 0.82939298 2853 Q01432;E9PKC5;P23109 AMPD3;AMPD1 AMP deaminase 3;AMP deaminase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 14.624 14.624 4 7.1955E-05 6620 QUIQUE_C1368_190116_001 60.549 56.068 44354000 6252200 0 12406000 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0 0 1 1 1 35.061 35.061 3 0.020808 30361 QUIQUE_C1368_190116_001 38.337 26.36 45614000 0 0 25475000 0 0 0 0 0 0 0 0 20139000 0 24513 3091 23050 222088;222089 283640;283641 283640 2 KVEEVLEEEEEEYVVEK Unmodified 2108.0049 0.004876771 642 B5MD17;J3KS05;P83916;K7ELA4;C9JWS9 CBX1 Chromobox protein homolog 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 93.368 93.368 2;3 2.2165E-122 95442 QUIQUE_C1277_190116_001 232.93 204.17 219050000 0 37927000 29125000 36978000 0 47117000 0 0 0 41203000 0 26701000 0 24514 642 23051 222090;222091;222092;222093;222094;222095;222096 283642;283643;283644;283645;283646;283647;283648;283649 283642 8 KVEEVVYDLSIR Unmodified 1448.7875 0.78749461 924 E9PGT1;Q15631 TSN Translin yes no 0 0 1 3 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 78.923 78.923 2;3 0.00024822 79643 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.892 56.925 1683300000 191590000 155960000 154400000 143380000 145400000 54756000 102140000 198420000 241050000 81648000 214560000 0 0 24515 924 23052 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283680 407 24 KVENEDMNKDQILLEK Unmodified 1944.9826 0.98264196 640;3097 B5MCX3;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 40.273 40.273 2;3 1.5379E-163 37443 QUIQUE_DMIX1_190116_001 276.59 232.04 6741900000 107480000 120720000 1968700000 988520000 95929000 126530000 148430000 467280000 918960000 0 190100000 120780000 1488600000 24517 640;3097 23053 222137;222138;222139;222140;222141;222142;222143;222144;222145;222146;222147;222148;222149;222150;222151;222152;222153 283699;283700;283701;283702;283703;283704;283705;283706;283707;283708;283709;283710;283711;283712;283713;283714;283715;283716;283717;283718 283709 20 KVESLLDELAFVR Unmodified 1517.8453 0.84534384 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 3 1 2 1 2 2 1 1 129.28 129.28 2;3 4.0545E-53 133760 QUIQUE_DMIX3_190116_001 163.51 156.88 15147000000 2659800000 2044600000 1329100000 1064600000 624370000 1436600000 1009500000 1287100000 384190000 424020000 1538100000 623160000 721320000 24518 3176 23054 222154;222155;222156;222157;222158;222159;222160;222161;222162;222163;222164;222165;222166;222167;222168;222169;222170;222171;222172;222173;222174;222175 283719;283720;283721;283722;283723;283724;283725;283726;283727;283728;283729;283730;283731;283732;283733;283734;283735;283736;283737;283738;283739;283740;283741;283742;283743;283744;283745;283746;283747;283748;283749;283750;283751;283752;283753;283754;283755;283756 283744 37 KVESLQEEIAFLK Unmodified 1532.845 0.84500949 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 1 7 5 9 7 7 3 3 4 2 2 4 2 8 139.12 139.12 2;3 3.2393E-65 102217 QUIQUE_C1438_190116_001 213.73 175.17 152970000000 9303200000 10359000000 15464000000 15550000000 15569000000 14836000000 12547000000 7798100000 11685000000 5373300000 12052000000 9911700000 12521000000 24519 1952 23055 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283757;283758;283759;283760;283761;283762;283763;283764;283765;283766;283767;283768;283769;283770;283771;283772;283773;283774;283775;283776;283777;283778;283779;283780;283781;283782;283783;283784;283785;283786;283787;283788;283789;283790;283791;283792;283793;283794;283795;283796;283797;283798;283799;283800;283801;283802;283803;283804;283805;283806;283807;283808;283809;283810;283811;283812;283813;283814;283815;283816;283817;283818;283819;283820;283821;283822;283823;283824;283825;283826;283827;283828;283829;283830;283831;283832;283833;283834;283835;283836;283837;283838;283839;283840;283841;283842;283843;283844;283845;283846;283847;283848;283849;283850;283851;283852;283853;283854;283855;283856;283857;283858;283859;283860 283796 102 KVESLQEEIAFLKK Unmodified 1660.94 0.93997251 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 3 3 1 2 2 3 77.771 77.771 2;3;4 1.4178E-57 79407 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.87 175.56 15908000000 145780000 209210000 376390000 327290000 50452000 119930000 457360000 3115600000 2883500000 0 3617000000 2274900000 2331100000 24520 1952 23056 222239;222240;222241;222242;222243;222244;222245;222246;222247;222248;222249;222250;222251;222252;222253;222254;222255;222256;222257;222258;222259;222260;222261;222262 283861;283862;283863;283864;283865;283866;283867;283868;283869;283870;283871;283872;283873;283874;283875;283876;283877;283878;283879;283880;283881;283882;283883;283884;283885;283886;283887;283888 283874 23 KVESTGAVPEFK Unmodified 1290.682 0.68196691 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 30.233 30.233 2 0.00078467 25162 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.63 63.564 27619000 0 0 0 0 0 0 0 0 27619000 0 0 0 0 24521 3421 23057 222263;222264;222265;222266 283889;283890;283891;283892 283889 4 KVESTGAVPEFKEEK Unmodified 1676.8621 0.86211612 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 1 2 1 24.155 24.155 2;3 5.7394E-78 17309 QUIQUE_DMIX7_190116_001 211.83 140.27 1104600000 0 95619000 0 0 25819000 56514000 0 192800000 316170000 0 35553000 339610000 42567000 24522 3421 23058 222267;222268;222269;222270;222271;222272;222273;222274;222275;222276 283893;283894;283895;283896;283897;283898;283899;283900;283901;283902;283903 283902 10 KVETDHIVAAVGLEPNVELAK Unmodified 2231.2161 0.21614737 1756 O95831;E9PMA0 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.239 86.239 3 1.4797E-06 87889 QUIQUE_C1368_190116_001 75.797 66.978 1170100000 99468000 0 139840000 100500000 90634000 104790000 86554000 70988000 101980000 50054000 138440000 104310000 82566000 24523 1756 23059 222277;222278;222279;222280;222281;222282;222283;222284;222285;222286;222287;222288 283904;283905;283906;283907;283908;283909;283910;283911;283912;283913;283914;283915;283916;283917;283918 283906 15 KVETITIIYDCEGLGLK Unmodified 1951.0336 0.033614899 1680 O76054;B3KRD8;C9JZI9 SEC14L2 SEC14-like protein 2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 107.7 107.7 2;3 5.6979E-13 110905 QUIQUE_C1403_190116_001 94.882 83.837 1714400000 88282000 174990000 192610000 147270000 23168000 150140000 156120000 87636000 147530000 62120000 224280000 155190000 105090000 24524 1680 23060 222289;222290;222291;222292;222293;222294;222295;222296;222297;222298;222299;222300;222301;222302;222303;222304;222305;222306;222307;222308;222309 283919;283920;283921;283922;283923;283924;283925;283926;283927;283928;283929;283930;283931;283932;283933;283934;283935;283936;283937;283938;283939;283940;283941;283942;283943;283944 283925 26 KVETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGENTK Oxidation (M) 3081.6056 0.60563743 1879 P05155;H9KV48;E9PGN7 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 1 1 1 174.87 174.87 3 0.00016676 182071 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.432 35.137 35146000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35146000 0 0 24525 1879 23061 222310 283945 283945 1104 0 KVFANPEDCVAFGK Unmodified 1580.7657 0.76571331 2001 P10620;F5H7F6;F5H6X2 MGST1 Microsomal glutathione S-transferase 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 61.632 61.632 2;3 0.00020057 61215 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.79 79.464 378450000 0 0 0 0 0 0 0 0 42208000 0 186620000 40063000 109560000 24526 2001 23062 222311;222312;222313;222314;222315 283946;283947;283948;283949;283950;283951;283952;283953 283946 7 KVFDPVPVGVTK Unmodified 1284.7442 0.74417324 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 1 1 54.499 54.499 2 0.019933 52383 QUIQUE_C1277_190116_001 68.536 55.183 32375000 0 32375000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24527 2916 23063 222316 283954 283954 1 KVFFNILEEAR Unmodified 1364.7452 0.74523587 4544 Q9Y276;C9J8G3;C9J1S9 BCS1L Mitochondrial chaperone BCS1 yes no 0 0 1 1 94.293 94.293 3 0.065941 95568 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.805 6.7928 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24528 4544 23064 222317 283955 283955 1 KVFIEDVSR Unmodified 1091.5975 0.597509 1797 P00966;Q5T6L6;Q5T6L5 ASS1 Argininosuccinate synthase yes no 0 0 1 1 1 33.661 33.661 3 0.009009 28728 QUIQUE_C1403_190116_001 46.406 22.884 27896000 0 0 0 27896000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24529 1797 23065 222318;222319 283956;283957 283956 2 KVFVGGLSPDTSEEQIK Unmodified 1832.952 0.95199376 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 0 1 1 64.378 64.378 3 0.015076 63658 QUIQUE_C1403_190116_001 32.181 21.523 24117000 0 0 0 24117000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24530 39 23066 222320 283958 283958 0 KVGYTPDWIFLLR Unmodified 1606.8871 0.88714908 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 135.73 135.73 2;3 4.1833E-31 141995 QUIQUE_DMIX5_190116_001 178.67 157.93 3037000000 0 17834000 0 22563000 34646000 9981700 49429000 424950000 338300000 29380000 903090000 641320000 565490000 24531 50;2631 23067 222321;222322;222323;222324;222325;222326;222327;222328;222329;222330;222331;222332;222333;222334;222335;222336 283959;283960;283961;283962;283963;283964;283965;283966;283967;283968;283969;283970;283971;283972;283973;283974;283975;283976;283977;283978;283979 283972 20 KVHVIFNYK Unmodified 1146.655 0.6549643 2268 P27797;K7EJB9 CALR Calreticulin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 25.239 25.239 2;3 0.00017264 20891 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.933 84.44 6451500000 189170000 475010000 240810000 446200000 429720000 280080000 579120000 413640000 755870000 225140000 936170000 377960000 1102600000 24532 2268 23068 222337;222338;222339;222340;222341;222342;222343;222344;222345;222346;222347;222348;222349;222350 283980;283981;283982;283983;283984;283985;283986;283987;283988;283989;283990;283991;283992;283993;283994;283995;283996;283997;283998;283999;284000 283990 21 KVICIPK Unmodified 856.52044 0.52044465 2076 P14550 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes yes 0 0 1 1 19.06 19.06 2 0.037756 11381 QUIQUE_C1277_190116_001 95.793 44.757 88010000 0 88010000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24533 2076 23069 222351 284001 284001 1 KVIEEQLEPAVEK Unmodified 1510.8243 0.82427405 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 41.549 41.549 2;3 1.4649E-09 38471 QUIQUE_C1218_190116_001 141.34 113.33 115970000 28805000 0 0 0 0 22488000 26524000 0 22054000 16099000 0 0 0 24534 2452 23070 222352;222353;222354;222355;222356;222357 284002;284003;284004;284005;284006;284007 284002 6 KVIGIECSSISDYAVK Unmodified 1767.9077 0.9076861 953 E9PKG1;Q99873;E9PQ98;E9PIX6;H0YDE4;E9PNR9;E9PMW9 PRMT1 Protein arginine N-methyltransferase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 74.995 74.995 3 0.0034869 74577 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.507 25.29 69284000 29752000 0 0 0 0 0 0 39532000 0 0 0 0 0 24535 953 23071 222358;222359;222360 284008;284009;284010 284009 3 KVIQELVDTEK Unmodified 1300.7238 0.72383172 955 E9PKT1;Q8IVF5;E9PMZ8;H7C5V6 TIAM2 T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 2 yes no 0 0 1 1 38.162 38.162 2 0.0088632 34155 QUIQUE_C1218_190116_001 67.548 46.576 22449000 22449000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24536 955 23072 222361 284011;284012 284012 2 KVITMFVQR Unmodified 1120.6427 0.64268505 2051 P13010;C9JZ81;H7C0H9 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 42.86 42.86 2;3 0.011412 39859 QUIQUE_C1277_190116_001 52.579 34.759 158490000 0 21878000 0 0 0 0 0 43914000 28076000 0 0 31829000 32793000 24537 2051 23073 222362;222363;222364;222365;222366 284013;284014;284015;284016;284017 284013 5 KVIVGGVDLLAK Unmodified 1210.7649 0.76490868 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496;H7C2F6 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 1 1 1 68.18 68.18 3 0.0085189 67942 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.083 27.266 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24538 88 23074 222367;222368 284018;284019 284018 2 KVIYPTDSR Unmodified 1077.5819 0.58185893 3535 Q8IWA5;K7ER17 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 1 1 16.654 16.654 2 0.01281 8964 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.149 53.994 13251000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13251000 0 0 0 24539 3535 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284031;284032;284033;284034;284035;284036;284037;284038;284039;284040;284041;284042;284043;284044;284045;284046;284047;284048;284049;284050;284051;284052;284053;284054;284055;284056;284057;284058;284059;284060;284061;284062;284063;284064;284065;284066;284067;284068;284069;284070;284071;284072;284073;284074;284075;284076;284077;284078;284079;284080;284081;284082;284083;284084;284085;284086;284087;284088;284089;284090;284091;284092;284093;284094;284095;284096;284097;284098;284099;284100;284101;284102;284103;284104;284105;284106;284107;284108 284093 76 KVLGDYDIK Unmodified 1049.5757 0.57571092 3755 Q92777 SYN2 Synapsin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 33.36 33.36 2 0.00074595 28697 QUIQUE_C1277_190116_001 113.71 68.026 844770000 150610000 208620000 191290000 0 185430000 108820000 0 0 0 0 0 0 0 24544 3755 23079 222424;222425;222426;222427;222428 284109;284110;284111;284112;284113;284114 284111 5 KVLGLQDTITAELVVIEDAAEPK Unmodified 2451.3472 0.34722112 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 163.14 163.14 3 5.3076E-12 166581 QUIQUE_C1403_190116_001 97.509 89.612 206870000 27170000 25658000 14032000 28226000 24117000 37436000 50229000 0 0 0 0 0 0 24545 1656 23080 222429;222430;222431;222432;222433;222434;222435 284115;284116;284117;284118;284119;284120;284121;284122 284119 8 KVLIIGGGDGGVLR Unmodified 1352.814 0.81398414 2150 P19623;K7ESL0 SRM Spermidine synthase yes no 0 0 1 1 1 64.687 64.687 2 0.01014 63404 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.82 60.058 20290000 0 0 0 0 0 0 0 20290000 0 0 0 0 0 24546 2150 23081 222436;222437 284123;284124 284124 2 KVLISDSLDPCCR Unmodified 1561.7592 0.75924773 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34;A0A286YFF3;A0A286YFK5 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 3 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 57.447 57.447 2;3 0.00027774 56217 QUIQUE_C1277_190116_001 144.7 135.74 2304400000 115640000 235600000 236130000 154490000 222810000 93466000 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284351;284352;284353;284354;284355;284356;284357;284358;284359;284360;284361;284362;284363;284364;284365;284366;284367;284368;284369;284370;284371;284372;284373;284374;284375;284376;284377;284378;284379;284380;284381;284382;284383;284384;284385;284386;284387;284388;284389;284390;284391;284392;284393;284394;284395;284396;284397;284398;284399;284400;284401;284402;284403 284351 53 KVQFAPEKPGPQPSAETTR Unmodified 2067.0749 0.074902863 2347 P32121;K7ENA6;I3L412 ARRB2 Beta-arrestin-2 yes no 0 0 2 1 1 27.192 27.192 3 0.0081008 21795 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.009 44.518 49301000 0 0 0 0 0 0 0 30181000 0 0 0 19120000 0 24565 2347 23100 222632;222633 284404;284405 284404 2 KVQGGALEDSQLVAGVAFK Unmodified 1916.0367 0.036726442 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 88.251 88.251 3 0.0021166 90240 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.098 22.67 168650000 0 0 0 0 47726000 0 33711000 0 39334000 0 0 0 47880000 24566 3977 23101 222634;222635;222636;222637 284406;284407;284408;284409 284408 3 KVQHQDALQISDVVMASLLR Unmodified 2250.2154 0.21543586 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 1 128.11 128.11 3;4 2.9869E-07 131765 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.837 76.779 662160000 0 35656000 0 0 33515000 0 32567000 136060000 154150000 0 132840000 66575000 70797000 24567 3090 23102 222638;222639;222640;222641;222642;222643;222644;222645;222646;222647;222648;222649;222650;222651 284410;284411;284412;284413;284414;284415;284416;284417;284418;284419;284420;284421;284422;284423 284416 14 KVQQELSRPGMLEMLLPGQPEAVAR Unmodified 2776.4728 0.47278954 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7;A0A2R8Y6Q7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 2 1 1 107.46 107.46 3 1.2359E-07 112849 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.231 55.429 26609000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26609000 0 0 24568 2513 23103 222652;222653 284424;284425 284425 2 KVQSLQDEVAFLR Unmodified 1531.8358 0.83584179 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 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Unmodified 2125.0916 0.091615559 2528 P49407;E9PM35 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes no 0 0 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 23.391 23.391 2;3;4 1.4956E-05 16637 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.67 81.301 5670200000 317210000 293330000 971360000 330020000 518460000 228490000 518640000 261030000 502040000 125180000 459240000 657450000 487790000 24571 2528 23106 222675;222676;222677;222678;222679;222680;222681;222682;222683;222684;222685;222686;222687;222688;222689 284452;284453;284454;284455;284456;284457;284458;284459;284460;284461;284462;284463;284464;284465;284466;284467;284468;284469;284470 284466 18 KVSPHSGVVALTKPVPEPR Unmodified 1997.1422 0.14219457 583 B1AHL2 FBLN1 Fibulin-1 yes yes 0 0 2 1 29.196 29.196 4 0.040277 23932 QUIQUE_DMIX3_190116_001 22.902 19.261 25208000 0 0 0 0 0 0 0 0 25208000 0 0 0 0 24572 583 23107 222690 284471 284471 1 KVSQPIEGHAASFAQFK Unmodified 1843.9581 0.95808219 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 1 2 2 2 3 3 1 2 3 3 2 2 2 1 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1 yes yes 0 0 1 1 12.264 12.264 3 0.005216 4498 QUIQUE_DMIX4_190116_001 44.616 28.083 1001800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1001800 0 0 0 24575 2192 23110 222720 284502 284502 1 KVTHAVVTVPAYFNDAQR Unmodified 2015.0589 0.058858868 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 2 58.075 58.075 3;4 0.00011252 56994 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.525 52.403 347650000 0 0 38046000 0 104760000 39780000 37414000 0 0 15750000 42884000 0 69022000 24576 2007 23111 222721;222722;222723;222724;222725;222726;222727;222728;222729;222730;222731;222732 284503;284504;284505;284506;284507;284508;284509;284510;284511;284512;284513;284514 284512 9 KVTILELFR Unmodified 1117.6859 0.68593008 2011 P11166 SLC2A1 Solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 1 yes yes 0 0 1 1 95.801 95.801 3 0.053837 100133 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.161 34.789 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24577 2011 23112 222733 284515 284515 1 KVTQLDLDGPK Unmodified 1212.6714 0.67140222 2997 Q13442 PDAP1 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 31.404 31.404 2;3 0.0074841 26103 QUIQUE_C1403_190116_001 83.869 61.227 418160000 44007000 47205000 0 84256000 106130000 33931000 0 0 74017000 0 28610000 0 0 24578 2997 23113 222734;222735;222736;222737;222738;222739;222740;222741;222742;222743 284516;284517;284518;284519;284520;284521;284522;284523;284524;284525 284518 8 KVTSLDELLEGESYVCASNEPFR Unmodified 2642.2534 0.25339709 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 1 1 134.81 134.81 3 0.003006 140443 QUIQUE_C1576_190116_001 36.13 28.854 69142000 0 0 0 0 0 0 69142000 0 0 0 0 0 0 24579 3596 23114 222744 284526 284526 1 KVTSVVFHPSQDLVFSASPDATIR Unmodified 2600.3599 0.3598515 4502 Q9UMS4 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 96.334 96.334 3;4 4.2612E-07 98325 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.981 63.265 1717400000 118900000 166360000 97097000 138750000 165210000 46923000 59048000 175980000 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A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 23.267 23.267 2 0.0015676 16201 QUIQUE_C1403_190116_001 103.34 80.602 218530000 38876000 39432000 51665000 53831000 0 0 0 0 0 34723000 0 0 0 24582 295 23117 222778;222779;222780;222781;222782;222783;222784;222785;222786 284567;284568;284569;284570;284571;284572;284573;284574;284575 284570 9 KVVDYSQFQESDDADEDYGR Unmodified 2364.9982 0.99822826 4130 Q9H1E3 NUCKS1 Nuclear ubiquitous casein and cyclin-dependent kinase substrate 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 70.165 70.165 3 2.5438E-06 70314 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.665 73.171 268200000 64384000 0 0 0 82820000 0 0 0 0 0 0 44628000 76363000 24583 4130 23118 222787;222788;222789;222790 284576;284577;284578;284579 284578 4 KVVEDIEYLK Unmodified 1234.6809 0.68090428 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;H7C2W5;H7C1Y7;H7C2X4 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 51.836 51.836 2;3 0.014687 49012 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.347 43.412 1007100000 0 231560000 0 180940000 0 221260000 166810000 0 0 0 0 206510000 0 24584 64 23119 222791;222792;222793;222794;222795;222796;222797;222798 284580;284581;284582;284583;284584;284585;284586;284587;284588 284588 7 KVVETEDAYK Unmodified 1180.5976 0.59756858 3126 Q15286;F5H157 RAB35 Ras-related protein Rab-35 yes no 0 0 1 1 1 14.727 14.727 2 0.0027668 7207 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.098 58.926 66496000 0 0 0 0 0 35118000 0 0 0 31378000 0 0 0 24585 3126 23120 222799;222800 284589;284590 284590 2 KVVGCSCVVVK Unmodified 1233.6573 0.65734884 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 18.525 18.525 3 0.0014574 11453 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.676 50.004 299530000 0 71760000 70485000 0 0 0 0 67453000 89832000 0 0 0 0 24586 2240 23121 222801;222802;222803;222804 284591;284592;284593;284594 284593 4 KVVGDVAYDEAK Unmodified 1292.6612 0.66123147 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 1 1 1 1 1 1 23.228 23.228 2 4.1623E-05 16742 QUIQUE_C1403_190116_001 140.14 91.718 515630000 0 0 175900000 112270000 0 81152000 0 0 75027000 0 0 71292000 0 24587 1005;2027 23122 222805;222806;222807;222808;222809 284595;284596;284597;284598;284599 284596 1 KVVQSLEQTAR Unmodified 1257.7041 0.70409934 924 E9PGT1;Q15631;H7C1D4;A0A0J9YVW2 TSN Translin yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 19.102 19.102 2;3 0.00033202 12005 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.568 62.714 2038000000 87477000 76244000 277120000 192760000 163560000 113900000 113330000 189040000 258680000 0 234820000 215920000 115180000 24588 924 23123 222810;222811;222812;222813;222814;222815;222816;222817;222818;222819;222820;222821;222822;222823;222824;222825;222826;222827;222828 284600;284601;284602;284603;284604;284605;284606;284607;284608;284609;284610;284611;284612;284613;284614;284615;284616;284617;284618;284619;284620 284615 21 KVVVCDNGTGFVK Unmodified 1421.7337 0.7336849 2715 P61160;A0A1B0GWD0;A0A1B0GWH0 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.622 33.622 2 0.00071932 28710 QUIQUE_C1438_190116_001 96.604 79.887 22329000 22329000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24589 2715 23124 222829;222830;222831;222832;222833;222834;222835;222836;222837 284621;284622;284623;284624;284625;284626;284627;284628;284629 284624 9 KVVVEQLNLLVK Unmodified 1380.8704 0.87043638 2365 P34949;H3BPB8;F5GX71;H3BMZ9;H3BPP3;H3BP57;H3BUZ9;H3BT48 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 79.694 79.694 2;3 0.00011405 81296 QUIQUE_C1576_190116_001 91.961 81.636 1257300000 0 175390000 98742000 86302000 91125000 87935000 153410000 98350000 89592000 52765000 135540000 103050000 85053000 24590 2365 23125 222838;222839;222840;222841;222842;222843;222844;222845;222846;222847;222848;222849;222850;222851 284630;284631;284632;284633;284634;284635;284636;284637;284638;284639;284640;284641;284642;284643;284644 284636 9 KVVVVVPNEEDWK Unmodified 1539.8297 0.82969378 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 1 1 1 68.915 68.915 2 0.000994 69045 QUIQUE_C1218_190116_001 86.243 71.552 49463000 49463000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24591 3208 23126 222852;222853 284645;284646 284645 2 KVVVVVPNEEDWKK Unmodified 1667.9247 0.9246568 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 2 1 1 50.914 50.914 3 0.010346 48526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.235 60.13 159750000 0 69965000 0 0 0 0 0 89787000 0 0 0 0 0 24592 3208 23127 222854;222855 284647;284648 284648 2 KVVYENAYGQFIGPHR Unmodified 1876.9584 0.95841654 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9;E9PKD3 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 57.994 57.994 3 0.021778 57427 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.473 24.858 190070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 116200000 0 73873000 24593 22 23128 222856;222857 284649;284650 284649 2 KVWFPHELDGQGARPHYTEER Unmodified 2551.2357 0.23565403 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 50.846 50.846 5 0.043552 48961 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.901 17.625 57376000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57376000 24594 921 23129 222858 284651 284651 1 KVWYEWAVTAPVCSAIHNPTGR Unmodified 2541.2587 0.25869766 1440 O14744;H7BZ44 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 108.36 108.36 3 2.1823E-05 112196 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.569 61.152 59077000 0 0 0 0 0 0 0 0 59077000 0 0 0 0 24595 1440 23130 222859;222860 284652;284653 284652 1 KVYDQMPEPR Oxidation (M) 1277.6074 0.60742176 1619 O75251;F5H5N1;F5GXJ1 NDUFS7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial yes no 0 1 1 1 15.33 15.33 2 0.053857 7674 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.841 49.58 15388000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15388000 0 0 24596 1619 23131 222861 284654 284654 0 KWDLSELPK Unmodified 1114.6023 0.60226003 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 1 1 1 73.02 73.02 3 0.056796 73780 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.556 16.856 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24597 381 23132 222862;222863 284655;284656 284656 2 KWDTCAPEVILHAVGGK Unmodified 1879.9615 0.96145301 1761 O95861;A6NF51 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 98.446 98.446 3 0.00098934 101862 QUIQUE_C1576_190116_001 56.215 50.555 436280000 0 72060000 0 72884000 84769000 0 114130000 0 0 0 0 0 92443000 24598 1761 23133 222864;222865;222866;222867;222868 284657;284658;284659;284660;284661 284660 4 KWEAVHAAEQR Unmodified 1323.6684 0.66838253 280 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Unmodified 2046.9395 0.93953159 167 A0A0A0MS54;P22694;B1APG2;B1APF8;B1APF9;B1APG3;B1APG1 PRKACB cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta no no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 75.4 75.4 2;3 4.9443E-105 75928 QUIQUE_DMIX3_190116_001 252.43 222.49 1806300000 0 171870000 164330000 91407000 149620000 81945000 167130000 148850000 238170000 51737000 197200000 197930000 146160000 24602 167 23137 222877;222878;222879;222880;222881;222882;222883;222884;222885;222886;222887;222888;222889;222890;222891;222892;222893;222894;222895;222896;222897 284670;284671;284672;284673;284674;284675;284676;284677;284678;284679;284680;284681;284682;284683;284684;284685;284686;284687;284688;284689;284690 284684 17 KWEQDPETFLIIIK Unmodified 1758.9556 0.95562257 3373 Q6NVY1;B8ZZZ0 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 127.04 127.04 2;3 1.4422E-18 133262 QUIQUE_DMIX5_190116_001 156.6 128.95 295820000 0 0 0 0 0 0 57060000 0 72835000 0 116490000 0 49427000 24603 3373 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chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain no no 0 0 1 1 2 31.847 31.847 2;3 2.2769E-09 26999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.67 134.74 482760000 201990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 280770000 0 0 24605 2312;2313 23140 222917;222918;222919 284719;284720;284721;284722 284722 4 KWFPYFLVR Unmodified 1254.6913 0.6913498 1159 H0YI09;Q9H8H3;F8VQX6 METTL7A Methyltransferase-like protein 7A yes no 0 0 1 1 1 110.34 110.34 3 0.0037521 113834 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.563 48.839 19806000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19806000 0 24606 1159 23141 222920;222921 284723;284724 284724 2 KWLPELVEHAK Unmodified 1348.7503 0.75032125 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 1 2 4 5 2 2 2 2 3 1 2 3 1 52.411 52.411 2;3 7.7491E-05 48910 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.4 93.887 10511000000 591510000 639100000 939910000 724030000 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284809;284810;284811;284812;284813;284814;284815;284816;284817 284811 5 KYAGGVAEYR Unmodified 1112.5615 0.56145784 61 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YMB3;H0YLV5;H0YK13;H0YLB8;H0YK71 GMPR2 GMP reductase;GMP reductase 2 yes no 0 0 1 1 17.584 17.584 3 0.040113 10152 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.395 20.931 39628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39628000 0 0 24617 61 23152 223004 284818 284818 0 KYAHLVDVGQVGVNVPIPVPLPMFSFTGSR Unmodified 3223.7216 0.72161066 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 154.48 154.48 3;4 5.2566E-25 161749 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.785 81.241 1469100000 0 0 0 0 0 0 0 329770000 397860000 0 641860000 99638000 0 24618 2870 23153 223005;223006;223007;223008;223009;223010;223011 284819;284820;284821;284822;284823;284824;284825;284826 284825 8 KYAHLVDVGQVGVNVPIPVPLPMFSFTGSR Oxidation (M) 3239.7165 0.71652528 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 1 1 1 1 147.26 147.26 3;4 4.2923E-11 150464 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.536 57.068 169210000 0 0 0 0 0 0 0 67987000 101220000 0 0 0 0 24619 2870 23153 223012;223013 284827;284828 284827 2352 1 KYAPTEAQLNAVDALIDSMSLAK Unmodified 2448.257 0.25702591 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 151.45 151.45 2;3 2.2041E-50 158453 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.6 138.95 850150000 48134000 106580000 80374000 50643000 69289000 0 0 130970000 0 0 268940000 0 95212000 24620 2051 23154 223014;223015;223016;223017;223018;223019;223020;223021;223022 284829;284830;284831;284832;284833;284834;284835;284836;284837;284838;284839 284837 10 KYAVLYQPLFDK Unmodified 1483.8075 0.80750177 1010;1033 F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;F8W020;F8W0J6;H0YH88;H0YHC3;F8VXI6;F8VUX1;F8VVB5;F8W118;F8VV59;F8VRJ2;B7Z9C2 NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.558 86.558 2 0.00027755 89230 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.74 99.067 783750000 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maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 62.242 62.242 3 0.019933 60853 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.024 28.691 37771000 0 0 0 0 0 0 0 15140000 0 0 0 0 22631000 24631 4532 23165 223094;223095 284918;284919;284920 284919 3 KYEDEINKR Unmodified 1193.6041 0.60405094 781;782;775 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908;CON__P12035;P12035 KRT2;KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 0 2 1 1 11.28 11.28 3 9.0668E-26 3704 QUIQUE_DMIX4_190116_001 205.83 161.51 143770000 0 0 0 0 0 0 0 27579000 0 116190000 0 0 0 + 24632 781;782;775 23166 223096;223097 284921;284922;284923 284923 2 KYEDICPSTHNMDVPNIK Oxidation (M) 2175.9929 0.99288907 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14;F8WCJ1;C9J7B5;C9J4W5;Q9GZV4 EIF5A;EIF5AL1;EIF5A2 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like;Eukaryotic translation initiation factor 5A-2 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.054 46.054 3 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223107;223108;223109;223110;223111;223112;223113;223114;223115;223116;223117;223118;223119;223120;223121 284933;284934;284935;284936;284937;284938;284939;284940;284941;284942;284943;284944;284945;284946;284947;284948;284949;284950 284947 18 KYEDICPSTHNMDVPNIKR Unmodified 2316.0991 0.099085478 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14;F8WCJ1;C9J7B5;C9J4W5;Q9GZV4 EIF5A;EIF5AL1;EIF5A2 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like;Eukaryotic translation initiation factor 5A-2 yes no 0 0 2 1 51.425 51.425 4 0.0063268 48864 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.237 40.886 57526000 0 0 0 0 0 0 0 57526000 0 0 0 0 0 24635 2786 23168 223122 284951;284952 284951 2 KYEEIDNAPEER Unmodified 1491.6842 0.68415175 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 24.197 24.197 2;3 1.1702E-09 17696 QUIQUE_DMIX3_190116_001 173.04 156.9 4934000000 456360000 324630000 529770000 430870000 361630000 279900000 471040000 288340000 379100000 94904000 509900000 325700000 481830000 24636 2529 23169 223123;223124;223125;223126;223127;223128;223129;223130;223131;223132;223133;223134;223135;223136;223137;223138;223139;223140;223141;223142;223143;223144;223145 284953;284954;284955;284956;284957;284958;284959;284960;284961;284962;284963;284964;284965;284966;284967;284968;284969;284970;284971;284972;284973;284974;284975;284976;284977;284978;284979 284970 25 KYEFGESDLR Unmodified 1242.5881 0.58806652 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 42.364 42.364 2;3 0.0034033 38357 QUIQUE_C1368_190116_001 107.95 75.731 1096000000 0 0 128270000 87513000 61264000 92134000 93756000 74428000 73221000 39882000 143280000 161650000 140610000 24637 3053 23170 223146;223147;223148;223149;223150;223151;223152;223153;223154;223155;223156;223157;223158;223159 284980;284981;284982;284983;284984;284985;284986;284987;284988;284989;284990;284991;284992;284993;284994;284995;284996;284997;284998 284981 19 KYEMFAQTLQQSR Unmodified 1628.7981 0.79807608 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 61.287 61.287 2;3 1.1312E-07 60040 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.69 152.67 4844200000 309180000 363730000 311800000 401920000 0 295810000 371960000 396090000 304190000 93694000 639420000 553060000 803290000 24638 2658 23171 223160;223161;223162;223163;223164;223165;223166;223167;223168;223169;223170;223171;223172;223173;223174 284999;285000;285001;285002;285003;285004;285005;285006;285007;285008;285009;285010;285011;285012;285013;285014;285015 285014 14 KYEMFAQTLQQSR Oxidation (M) 1644.793 0.7929907 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 46.694 46.694 2;3 5.8332E-08 43278 QUIQUE_C1368_190116_001 138.75 119.15 1656100000 0 180480000 74344000 42785000 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1727.809 0.80897511 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;C9JJD0;C9JKG6;E9PCY0;C9JZA4;C9JTE5;C9JJN7;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 2 55.204 55.204 3;4 0.023644 53940 QUIQUE_DMIX5_190116_001 25.542 17.951 52968000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28630000 24337000 0 24642 890;3052 23174 223197;223198;223199 285039;285040;285041 285039 3 KYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGK Unmodified 2634.333 0.33296804 1525 O43390 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 102.18 102.18 3 0.00020722 104706 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.6 36.978 329700000 0 0 0 0 56756000 47554000 0 69210000 0 0 0 75244000 80935000 24643 1525 23175 223200;223201;223202;223203;223204 285042;285043;285044;285045;285046;285047;285048 285046 6 KYGNANVWK Unmodified 1078.556 0.55597854 2758;2789 P62714;E5RHC1;E7ESG8;E5RFI3;E5RHP4;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 19.833 19.833 2;3 0.0024679 12699 QUIQUE_C1438_190116_001 61.582 30.204 469940000 28420000 0 87595000 51858000 42922000 0 153340000 41799000 0 0 64000000 0 0 24644 2758;2789 23176 223205;223206;223207;223208;223209;223210;223211;223212 285049;285050;285051;285052;285053;285054;285055;285056 285052 6 KYIEDAIGESAK Unmodified 1322.6718 0.67179615 4391 Q9P2U7;M0R1S5 SLC17A7 Vesicular glutamate transporter 1 yes no 0 0 1 1 1 1 36.081 36.081 2 0.0075904 32175 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.187 42.264 89189000 0 0 23475000 0 0 0 0 0 0 0 38015000 0 27699000 24645 4391 23177 223213;223214;223215 285057;285058;285059;285060 285058 3 KYILGNPLTPGVTQGPQIDK Unmodified 2138.1736 0.17355427 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 87.593 87.593 3 0.0013428 90437 QUIQUE_C1218_190116_001 42.172 23.136 242820000 57904000 0 0 48129000 43073000 70415000 0 0 0 23297000 0 0 0 24646 1776 23178 223216;223217;223218;223219;223220 285061;285062;285063;285064;285065;285066 285062 6 KYILGNPLTPGVTQGPQIDKEQYDK Unmodified 2801.46 0.45995947 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 83.176 83.176 3;4 8.0043E-98 84596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 183.31 173.49 2527000000 125090000 203880000 257590000 87893000 234190000 223000000 268080000 242050000 127410000 94085000 327670000 241450000 94641000 24647 1776 23179 223221;223222;223223;223224;223225;223226;223227;223228;223229;223230;223231;223232;223233;223234;223235;223236;223237;223238;223239;223240;223241;223242;223243 285067;285068;285069;285070;285071;285072;285073;285074;285075;285076;285077;285078;285079;285080;285081;285082;285083;285084;285085;285086;285087;285088;285089;285090;285091;285092;285093 285084 21 KYLGQLHYLQSR Unmodified 1504.815 0.81504677 4161 Q9H3S7;C9JD91 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes no 0 0 1 1 1 39.095 39.095 3 0.039794 35883 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.767 31.234 75367000 0 0 0 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Unmodified 1424.697 0.69696505 2585 P51572;A0A2R8Y5M6;C9JMD7;C9JSP1;C9JQ75;C9J0M4 BCAP31 B-cell receptor-associated protein 31 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.455 13.455 3 1.6015E-23 5722 QUIQUE_C1576_190116_001 149.58 126.1 420750000 24097000 0 21994000 0 35687000 0 53705000 67381000 37939000 5711100 55011000 36343000 82886000 24651 2585 23183 223265;223266;223267;223268;223269;223270;223271;223272;223273;223274 285116;285117;285118;285119;285120;285121;285122;285123;285124;285125;285126 285120 11 KYMLSVDNLK Unmodified 1209.6427 0.64274463 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 55.626 55.626 2 0.006482 53966 QUIQUE_C1368_190116_001 81.099 54.642 214450000 0 73435000 74972000 0 0 0 0 0 0 0 0 34215000 31830000 24652 269;2893 23184 223275;223276;223277;223278;223279;223280 285127;285128;285129;285130;285131;285132 285128 5 KYNDALIISEHAR Unmodified 1528.7998 0.79979063 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 1 1 34.969 34.969 3 0.057583 30810 QUIQUE_DMIX3_190116_001 28.64 12.29 25668000 0 0 0 0 0 0 0 0 25668000 0 0 0 0 24653 1750 23185 223281 285133 285133 1 KYNDIYKPLLAK Unmodified 1464.8341 0.83405088 3912 Q96NT1 NAP1L5 Nucleosome assembly protein 1-like 5 yes yes 0 0 2 1 1 48.399 48.399 3 0.0063818 44766 QUIQUE_C1277_190116_001 80.17 74.686 58739000 0 45908000 0 0 0 0 0 0 0 12831000 0 0 0 24654 3912 23186 223282;223283 285134;285135 285134 2 KYNPTWHCIVGR Unmodified 1529.7562 0.75615168 2782;3852 P63167;Q96FJ2 DYNLL1;DYNLL2 Dynein light chain 1, cytoplasmic;Dynein light chain 2, cytoplasmic no no 0 0 1 1 2 1 1 40.435 40.435 2;3 0.00011749 37831 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.407 78.026 1030800000 0 0 0 0 0 0 117360000 174170000 0 0 0 320810000 418460000 24655 2782;3852 23187 223284;223285;223286;223287;223288 285136;285137;285138;285139;285140;285141;285142 285138 7 KYNTDCVQGLTHSK Unmodified 1649.7832 0.78315429 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 22.865 22.865 2;3 2.5524E-58 16053 QUIQUE_DMIX5_190116_001 202.29 179.96 3026800000 101740000 196840000 395030000 263550000 287320000 141630000 451470000 142850000 197590000 40991000 318500000 142870000 346450000 24656 1371 23188 223289;223290;223291;223292;223293;223294;223295;223296;223297;223298;223299;223300;223301;223302;223303;223304;223305;223306;223307;223308 285143;285144;285145;285146;285147;285148;285149;285150;285151;285152;285153;285154;285155;285156;285157;285158;285159;285160;285161;285162;285163;285164 285161 22 KYPNKYESIIATLCENLDSLDEPDAR Unmodified 3053.4652 0.46518078 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 142.67 142.67 4 9.4859E-08 146341 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.032 55.079 505670000 40090000 66791000 0 0 0 0 0 46500000 73114000 0 109120000 103970000 66090000 24657 2777 23189 223309;223310;223311;223312;223313;223314;223315 285165;285166;285167;285168;285169;285170;285171;285172;285173;285174 285168 7 KYPNVFK Unmodified 894.49634 0.49633839 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 24.167 24.167 2 0.032095 18110 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.11 32.162 431100000 0 0 0 0 0 0 0 110650000 179270000 0 141180000 0 0 24658 1558 23190 223316;223317;223318 285175;285176;285177 285176 3 KYPVAHFIDQTLK Unmodified 1558.8508 0.85076357 1879 P05155;H9KV48;E9PGN7;H0YCA1 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 0 1 1 54.398 54.398 3 0.068539 53440 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.096 0 37299000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37299000 0 0 24659 1879 23191 223319 285178 285178 1 KYPYWPHQPIENL Unmodified 1683.8409 0.84092717 1672 O75947 ATP5H ATP synthase subunit d, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 2 1 2 2 2 3 2 1 2 2 2 89.976 89.976 2;3 9.1685E-08 92417 QUIQUE_DMIX3_190116_001 136.94 114.04 3096500000 417850000 120070000 306010000 122270000 241820000 265670000 253270000 220540000 240900000 50344000 332060000 250920000 274730000 24660 1672 23192 223320;223321;223322;223323;223324;223325;223326;223327;223328;223329;223330;223331;223332;223333;223334;223335;223336;223337;223338;223339;223340;223341;223342;223343 285179;285180;285181;285182;285183;285184;285185;285186;285187;285188;285189;285190;285191;285192;285193;285194;285195;285196;285197;285198;285199;285200;285201;285202;285203;285204;285205;285206;285207;285208;285209;285210;285211;285212;285213;285214;285215;285216;285217;285218;285219;285220;285221 285210 43 KYQILNNEVFAILNK Unmodified 1806.004 0.003969751 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 121.29 121.29 3 0.0015157 124322 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.796 47.009 186800000 21097000 32379000 0 0 0 0 0 39873000 0 0 0 35522000 57930000 24661 882 23193 223344;223345;223346;223347;223348 285222;285223;285224;285225;285226;285227 285225 5 KYQLNLPPYPDTECVYR Unmodified 2155.0408 0.040825542 3634 Q8NCW5 APOA1BP NAD(P)H-hydrate epimerase yes yes 0 0 1 1 96.663 96.663 3 0.013973 97893 QUIQUE_C1563_190116_001 44.567 35.923 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24662 3634 23194 223349 285228 285228 1 KYQVDLSK Unmodified 979.53385 0.53384611 590 B1AKY9;P50993 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 19.481 19.481 2 0.0053241 12600 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.66 49.394 1112600000 0 169030000 0 148040000 0 0 0 363750000 275670000 0 0 156100000 0 24663 590 23195 223350;223351;223352;223353;223354 285229;285230;285231;285232;285233 285231 5 KYSDASDCHGEDSQAFCEK Unmodified 2232.8688 0.86881077 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.618 22.618 3 9.9239E-12 15868 QUIQUE_C1277_190116_001 117.03 113.16 263440000 0 29980000 37487000 0 48241000 0 28735000 0 0 0 69150000 0 49849000 24664 1802 23196 223355;223356;223357;223358;223359;223360 285234;285235;285236;285237;285238;285239 285234 6 KYSDVEVPASVTGYSFASDGDSGTCSPLR Unmodified 3051.3768 0.37675971 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;H0Y9H2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.46 108.46 3 1.8516E-19 110483 QUIQUE_C1563_190116_001 88.395 81.891 678100000 0 60417000 41529000 68551000 81426000 63534000 54686000 63028000 69519000 0 0 68298000 107120000 24665 854 23197 223361;223362;223363;223364;223365;223366;223367;223368;223369;223370;223371;223372 285240;285241;285242;285243;285244;285245;285246;285247;285248;285249;285250;285251;285252;285253 285247 14 KYSNEDTLSVALPYFWEHFDK Unmodified 2588.2224 0.22235496 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 1 2 1 1 139.93 139.93 3;4 0.00017372 144826 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.826 49.834 151640000 0 82938000 0 0 0 0 0 0 44796000 0 0 0 23903000 24666 2255 23198 223373;223374;223375;223376 285254;285255;285256;285257;285258 285257 5 KYSPGYNTEVGDK Unmodified 1456.6834 0.68342347 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 20.641 20.641 2;3 5.3871E-10 13553 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.5 114.09 870230000 124280000 92725000 99552000 44822000 57354000 66672000 85047000 0 33831000 11194000 109960000 79004000 65784000 24667 64 23199 223377;223378;223379;223380;223381;223382;223383;223384;223385;223386;223387;223388;223389;223390;223391;223392;223393;223394;223395;223396;223397 285259;285260;285261;285262;285263;285264;285265;285266;285267;285268;285269;285270;285271;285272;285273;285274;285275;285276;285277;285278;285279;285280;285281;285282;285283 285278 25 KYSQFINFPIYVWSSK Unmodified 2006.0302 0.030184502 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 1 1 1 1 135.95 135.95 3 0.00243 139690 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.852 30.665 108100000 0 0 0 0 0 0 0 34308000 0 0 48465000 25327000 0 24668 2079 23200 223398;223399;223400 285284;285285;285286 285284 3 KYTEQITNEK Unmodified 1252.6299 0.62993134 3191 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285307;285308;285309;285310;285311;285312;285313 285307 7 KYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPK Unmodified 3225.6479 0.64789617 1866 P04792 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.92 128.92 3 7.0224E-119 132000 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.72 167.51 3266700000 115630000 267610000 381970000 235970000 219550000 281590000 281710000 260620000 293440000 105810000 285520000 247760000 289520000 24671 1866 23203 223426;223427;223428;223429;223430;223431;223432;223433;223434;223435;223436;223437;223438 285314;285315;285316;285317;285318;285319;285320;285321;285322;285323;285324;285325;285326;285327;285328;285329;285330;285331;285332;285333;285334;285335;285336;285337;285338;285339;285340;285341;285342;285343;285344;285345;285346;285347;285348;285349;285350;285351;285352;285353 285338 40 KYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPK Oxidation (M) 3241.6428 0.6428108 1866 P04792 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes yes 0 1 1 1 2 122.21 122.21 3 6.6918E-14 119311 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GSTM4;GSTM1;GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4;Glutathione S-transferase Mu 2 no no 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 34.86 34.86 2;3 9.0779E-07 31093 QUIQUE_C1218_190116_001 143 131.51 3151800000 238820000 149420000 212980000 307520000 90836000 324520000 157870000 955170000 338780000 28059000 154980000 0 192830000 24674 141;1965;2883;2277 23204 223454;223455;223456;223457;223458;223459;223460;223461;223462;223463;223464;223465;223466;223467;223468 285370;285371;285372;285373;285374;285375;285376;285377;285378;285379;285380;285381;285382;285383;285384;285385;285386;285387;285388;285389 285371 19 KYTMGDAPDYDRSQWLNEK Unmodified 2316.0481 0.048095765 2277;1965;141;2883 A0A0A0MR85;P09488;E7EWW9;B9ZVX7;H3BQT3;Q03013;P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM4;GSTM1;GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4;Glutathione S-transferase Mu 2 no no 0 0 2 1 71.416 71.416 3 5.7641E-22 70770 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.61 119.07 43983000 0 0 0 0 0 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285392;285393;285394;285395;285396;285397;285398;285399;285400;285401;285402;285403;285404;285405;285406;285407;285408;285409;285410;285411;285412;285413;285414;285415;285416;285417;285418;285419;285420 285400 25 KYVLDDLIVAK Unmodified 1275.7438 0.74383889 1585 O60645;D6RB59;H0Y995 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 1 1 85.891 85.891 2 0.04416 87218 QUIQUE_C1403_190116_001 64.103 39.982 14426000 0 0 0 14426000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24678 1585 23208 223491 285421 285421 1 KYVQDILQEQLAESVYR Unmodified 2081.0793 0.079319539 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 1 1 114.19 114.19 3 0.0085346 117655 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.432 35.993 80849000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80849000 0 24679 699 23209 223492 285422 285422 1 KYWLTCFEEALDGVVK Unmodified 1956.9655 0.96553533 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 153.82 153.82 3 0.00018448 160230 QUIQUE_C1438_190116_001 74.12 64.199 107330000 14136000 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LAAAILGGVDQIHIKPGAK Unmodified 1871.0993 0.09926712 2193 P22087;M0R0P1;M0R299;M0QXL5;M0R2Q4;M0R2U2;M0R1H0;M0R2B0 FBL rRNA 2'-O-methyltransferase fibrillarin yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 79.591 79.591 3;4 1.2036E-05 81064 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.211 90.506 335520000 33813000 0 35078000 0 30335000 62888000 33814000 33159000 28161000 14671000 33023000 30584000 0 24685 2193 23215 223529;223530;223531;223532;223533;223534;223535;223536;223537;223538;223539;223540;223541 285469;285470;285471;285472;285473;285474;285475;285476;285477;285478;285479;285480;285481;285482 285481 13 LAAAQADMESSK Oxidation (M) 1236.5656 0.56561652 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 1 0 1 13.692 13.692 2 0.0015895 5572 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.972 50.743 8781900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8781900 0 0 0 24686 3194 23216 223542 285483 285483 2618 1 LAAAQADMESSK Unmodified 1220.5707 0.5707019 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 0 1 1 22.455 22.455 2 0.00051879 15682 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.93 81.086 101440000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48728000 0 0 52716000 24687 3194 23216 223543;223544 285484;285485 285484 2 LAAAQADMESSKEPGLFDVVIINDSLDQAYAELK Unmodified 3650.8026 0.80255892 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 1 1 1 1 164.91 164.91 3 3.7182E-38 172240 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.185 84.64 131100000 0 0 0 0 0 0 0 40696000 0 0 41994000 0 48408000 24688 3194 23217 223545;223546;223547 285486;285487;285488 285487 3 LAAAWDALIVRPVR Unmodified 1549.9093 0.9092815 1200 H3BRS6;Q9BRR6;H3BTH4;H3BN66 ADPGK ADP-dependent glucokinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 107.4 107.4 3 0.0099626 110688 QUIQUE_C1403_190116_001 53.001 33.247 35867000 0 0 0 15340000 0 0 0 0 0 0 0 20528000 0 24689 1200 23218 223548;223549;223550;223551;223552 285489;285490;285491;285492;285493;285494 285490 6 LAACFLDSMATLGLAAYGYGIR Unmodified 2333.1548 0.15480944 2016;2017;948 P11216;E9PK47;P06737;P11217 PYGB;PYGL;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 4 2 3 3 2 2 169.43 169.43 2;3 4.3406E-66 174538 QUIQUE_C1576_190116_001 228.8 203.16 6686200000 132960000 326490000 332350000 111850000 579570000 115220000 937920000 684610000 707690000 0 1020300000 1114800000 622510000 24690 2016;948;2017 23219 223553;223554;223555;223556;223557;223558;223559;223560;223561;223562;223563;223564;223565;223566;223567;223568;223569;223570;223571;223572;223573;223574;223575;223576;223577;223578;223579 285495;285496;285497;285498;285499;285500;285501;285502;285503;285504;285505;285506;285507;285508;285509;285510;285511;285512;285513;285514;285515;285516;285517;285518;285519;285520;285521;285522;285523;285524;285525;285526;285527 285509 32 LAACFLDSMATLGLAAYGYGIR Oxidation (M) 2349.1497 0.14972406 2016;2017;948 P11216;E9PK47;P06737;P11217 PYGB;PYGL;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 1 0 1 1 1 2 157.58 157.58 2;3 3.5497E-05 155505 QUIQUE_C1277_190116_001 79.875 58.116 265360000 0 0 0 53732000 0 0 0 211630000 0 0 0 0 0 24691 2016;948;2017 23219 223580;223581;223582;223583;223584 285528;285529;285530;285531;285532 285529 576 3 LAACVNLIPQITSIYEWK Unmodified 2118.1183 0.11834758 1601 O60888;C9IZG4;C9IZQ5 CUTA Protein CutA yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 2 1 2 157.8 157.8 2;3 2.3187E-23 162845 QUIQUE_DMIX3_190116_001 167.44 149.37 2745700000 186580000 224770000 211890000 154900000 156450000 83351000 130320000 265910000 369140000 67093000 456110000 194730000 244470000 24692 1601 23220 223585;223586;223587;223588;223589;223590;223591;223592;223593;223594;223595;223596;223597;223598;223599;223600;223601;223602;223603;223604;223605;223606 285533;285534;285535;285536;285537;285538;285539;285540;285541;285542;285543;285544;285545;285546;285547;285548;285549;285550;285551;285552;285553;285554;285555;285556;285557;285558;285559 285550 26 LAADAGTFLSR Unmodified 1120.5877 0.58767259 55 A0A087WW40;Q9Y371 SH3GLB1 Endophilin-B1 yes no 0 0 0 1 1 71.752 71.752 2 0.00043381 71489 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.26 79.732 193230000 0 0 0 0 0 0 108550000 84672000 0 0 0 0 0 24693 55 23221 223607;223608 285560;285561;285562 285561 3 LAADDFR Unmodified 806.39227 0.39226725 776;763;774;760;773;789;771;785 CON__P13645;P13645;CON__P02535-1;CON__Q7Z3Y7;Q7Z3Y7;CON__Q148H6;CON__Q2M2I5;Q2M2I5;CON__Q14532;CON__A2AB72;CON__O76015;CON__O76013;CON__O76014;Q14532;O76014;O76015;O76013;CON__P02533;P02533;CON__Q6IFX2;CON__A2A4G1;K7EPJ9;CON__P08779;P08779;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8;K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;K7EMD9;CON__P05784;CON__P08727;P08727;C9JM50;CON__P19001;CON__Q14525;Q14525;CON__Q9UE12;CON__Q15323;Q15323 KRT10;KRT28;KRT24;KRT32;KRT37;KRT38;KRT36;KRT14;KRT17;KRT16;KRT13;KRT19;KRT33B;KRT31 Keratin, type I cytoskeletal 10;Keratin, type I cytoskeletal 28;Keratin, type I cytoskeletal 24;Keratin, type I cuticular Ha2;Keratin, type I cuticular Ha7;Keratin, type I cuticular Ha8;Keratin, type I cuticular Ha6;Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16;Keratin, type I cytoskeletal 13;Keratin, type I cytoskeletal 19;Keratin, type I cuticular Ha3-II;Keratin, type I cuticular Ha1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 37.022 37.022 2 0.019482 33021 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.28 54.768 6064900000 764300000 472370000 0 552340000 0 432740000 0 0 0 1538300000 1009100000 0 1295700000 + 24694 776;763;774;789;760;771;773;785 23222 223609;223610;223611;223612;223613;223614;223615 285563;285564;285565;285566;285567;285568;285569;285570 285569 8 LAADFENSVR Unmodified 1120.5513 0.55128709 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 52.573 52.573 2 0.00020677 50319 QUIQUE_C1368_190116_001 124.23 92.296 566990000 0 0 101850000 0 0 0 61547000 83586000 67521000 0 206560000 45932000 0 24695 1975 23223 223616;223617;223618;223619;223620;223621 285571;285572;285573;285574;285575;285576;285577;285578;285579 285572 9 LAADPSVVNLGQGFPDISPPTYVK Unmodified 2484.29 0.2900406 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 142.92 142.92 2;3 3.7609E-11 145606 QUIQUE_C1563_190116_001 120.66 108.97 296680000 25934000 39326000 42360000 25108000 0 111270000 0 0 0 0 0 0 52675000 24696 3422 23224 223622;223623;223624;223625;223626;223627;223628 285580;285581;285582;285583;285584;285585;285586;285587 285585 8 LAADPSVVNLGQGFPDISPPTYVKEELSK Unmodified 3070.5863 0.5862822 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 1 1 1 143.46 143.46 3 0.0059467 146846 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.843 26.838 98691000 0 0 0 0 0 0 0 61794000 0 0 0 0 36897000 24697 3422 23225 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LAAIAESGVER Unmodified 1114.5982 0.59823728 2275 P28072 PSMB6 Proteasome subunit beta type-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.195 39.195 2 1.7851E-05 34943 QUIQUE_C1368_190116_001 140.83 89.048 2971600000 282390000 253590000 269030000 222260000 223640000 192750000 287140000 0 209090000 103700000 318250000 285760000 323990000 24710 2275 23237 223751;223752;223753;223754;223755;223756;223757;223758;223759;223760;223761;223762 285734;285735;285736;285737;285738;285739;285740;285741;285742;285743;285744;285745;285746;285747;285748 285737 15 LAAIGEATR Unmodified 900.50288 0.50288033 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.232 26.232 2 0.0010802 20045 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.75 71.51 8193900000 633740000 538450000 637940000 234920000 577460000 239190000 499500000 931680000 1000100000 393090000 1213700000 802460000 491690000 24711 3117 23238 223763;223764;223765;223766;223767;223768;223769;223770;223771;223772;223773;223774;223775 285749;285750;285751;285752;285753;285754;285755;285756;285757;285758;285759;285760;285761 285759 10 LAAIQQVLNAQK Unmodified 1295.7561 0.75613491 647 B5MED8;Q96PQ0 SORCS2 VPS10 domain-containing receptor SorCS2 yes no 0 0 0 1 1 77.153 77.153 2 0.011047 78235 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.149 56.156 29432000 0 0 0 0 0 0 0 0 29432000 0 0 0 0 24712 647 23239 223776;223777 285762;285763 285763 2 LAAISGPEDGEIHPEICR Unmodified 1962.9469 0.94692516 3370 Q6MZT1 RGS7BP Regulator of G-protein signaling 7-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 72.782 72.782 3 0.00081617 72991 QUIQUE_C1277_190116_001 41.348 31.977 184480000 0 140730000 0 0 0 0 43744000 0 0 0 0 0 0 24713 3370 23240 223778;223779;223780 285764;285765;285766 285765 3 LAALADQWQFLVQK Unmodified 1629.8879 0.88787736 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 3 2 2 4 3 3 137.09 137.09 2;3 1.3529E-17 142880 QUIQUE_C1218_190116_001 185.14 167.33 34070000000 2409500000 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1 1 1 2 58.034 58.034 3;4 2.0058E-36 58069 QUIQUE_C1218_190116_001 145.04 124.79 748720000 60366000 65962000 66740000 54675000 60860000 91932000 0 55094000 69249000 13204000 68825000 0 141820000 24723 1283 23250 223870;223871;223872;223873;223874;223875;223876;223877;223878;223879;223880;223881 285928;285929;285930;285931;285932;285933;285934;285935;285936;285937;285938;285939;285940;285941;285942 285928 15 LAAQFIPK Unmodified 886.52764 0.52763852 1073 G3V1C3;Q9BZZ5;E9PQK6 API5 Apoptosis inhibitor 5 yes no 0 0 0 1 52.663 52.663 2 0.040732 50962 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.244 43.017 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24724 1073 23251 223882 285943 285943 1 LAAQSCALSLVR Unmodified 1287.6969 0.69690547 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 72.602 72.602 2 3.416E-07 72829 QUIQUE_DMIX7_190116_001 145.89 42.323 1457000000 0 183380000 0 138220000 178760000 127030000 170000000 0 139780000 0 175270000 207170000 137350000 24725 2916 23252 223883;223884;223885;223886;223887;223888;223889;223890;223891;223892 285944;285945;285946;285947;285948;285949;285950;285951;285952;285953 285952 8 LAAQVLGLLLEK Unmodified 1266.7911 0.79112343 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 138.98 138.98 2 0.0023321 143243 QUIQUE_C1277_190116_001 75.566 59.924 130820000 0 34786000 22661000 0 33123000 0 29540000 0 0 10714000 0 0 0 24726 934 23253 223893;223894;223895;223896;223897 285954;285955;285956;285957;285958 285954 5 LAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAER Unmodified 3185.5849 0.58491876 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 1 1 2 162.33 162.33 3;4 1.2218E-19 167779 QUIQUE_C1218_190116_001 77.149 67.002 1716300000 107020000 207770000 166630000 96787000 21242000 0 282950000 133180000 249320000 16701000 158080000 0 276600000 24727 2105 23254 223898;223899;223900;223901;223902;223903;223904;223905;223906;223907;223908;223909;223910;223911;223912;223913;223914;223915 285959;285960;285961;285962;285963;285964;285965;285966;285967;285968;285969;285970;285971;285972;285973;285974;285975;285976;285977;285978;285979;285980 285961 19 LAASFQSMEVR Unmodified 1237.6125 0.61250714 3441 Q7L523 RRAGA Ras-related GTP-binding protein A no no 0 0 0 1 70.042 70.042 2 0.024024 70068 QUIQUE_C1277_190116_001 70.399 37.506 36121000 0 36121000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24728 3441 23255 223916 285981 285981 0 LAASGEGGLQELSGHFENQK Unmodified 2070.997 0.99704647 3186 Q16643;D6RFI1 DBN1 Drebrin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 78.774 78.774 2;3 0 81172 QUIQUE_C1218_190116_001 323.28 281.8 10442000000 741580000 907900000 875410000 751740000 822610000 714060000 892010000 765830000 813300000 287030000 1039600000 792460000 1038300000 24729 3186 23256 223917;223918;223919;223920;223921;223922;223923;223924;223925;223926;223927;223928;223929;223930;223931;223932;223933;223934;223935;223936;223937;223938;223939;223940;223941;223942 285982;285983;285984;285985;285986;285987;285988;285989;285990;285991;285992;285993;285994;285995;285996;285997;285998;285999;286000;286001;286002;286003;286004;286005;286006;286007;286008;286009;286010;286011;286012;286013;286014;286015;286016;286017;286018 285986 37 LAASLDGAR Unmodified 872.47158 0.4715802 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 26.972 26.972 2 0.013518 21543 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.825 23.474 146190000 0 0 0 0 82457000 0 0 0 63731000 0 0 0 0 24730 1492 23257 223943;223944 286019;286020;286021 286021 3 LAASTEPQGPR Unmodified 1125.5778 0.57783619 1002 F5H8G1;F5H1Z6;F5H8H3;Q9Y365;F5GWK5;F5H0V7;F5GY11;F5GY07;F5H5A8;F5H3G8 STARD10 PCTP-like protein yes no 0 0 0 1 19.561 19.561 2 0.02991 12103 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.355 58.261 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24731 1002 23258 223945 286022 286022 1 LAATAVGGGFFLLQLANHTGYIK Unmodified 2361.2845 0.28450171 4056 Q9BWH2 FUNDC2 FUN14 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 150 150 3 6.0034E-12 156771 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.917 67.819 180460000 0 0 0 22807000 0 0 0 29479000 31669000 0 66166000 30342000 0 24732 4056 23259 223946;223947;223948;223949;223950;223951 286023;286024;286025;286026;286027;286028 286027 6 LAATEQYHQVLCPGPSQDDPLHPLNK Unmodified 2927.4236 0.42359074 3359 Q6GMV2;C9IYN9 SMYD5 SET and MYND domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 82.009 82.009 4 0.0024989 83250 QUIQUE_C1368_190116_001 34.125 27.897 496000000 0 59721000 71695000 87846000 61092000 73347000 142300000 0 0 0 0 0 0 24733 3359 23260 223952;223953;223954;223955;223956;223957 286029;286030;286031;286032;286033;286034;286035 286031 7 LAATNALLNSLEFTK Unmodified 1604.8774 0.87737225 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 130.08 130.08 2;3 6.9949E-80 133414 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286061;286062;286063;286064;286065;286066;286067;286068;286069;286070;286071;286072;286073;286074;286075;286076;286077 286072 16 LAAVALINAAIQK Unmodified 1294.7973 0.79727144 2487 P46940;A0A0J9YXZ5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 116.55 116.55 2;3 0.00042009 120072 QUIQUE_C1277_190116_001 96.331 67.604 319700000 40389000 38883000 78379000 51234000 51238000 36631000 0 0 0 22950000 0 0 0 24736 2487 23263 223995;223996;223997;223998;223999;224000;224001;224002;224003;224004 286078;286079;286080;286081;286082;286083;286084;286085;286086;286087;286088 286080 10 LAAVDATVNQVLASR Unmodified 1526.8417 0.84165545 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 107.42 107.42 2;3 1.3169E-10 112094 QUIQUE_C1438_190116_001 122.33 98.95 4383600000 330100000 334420000 470960000 355720000 405970000 362340000 422150000 245350000 285510000 154600000 393690000 321160000 301660000 24737 3109 23264 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P02545;H0YAB0;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 67.313 67.313 2 1.6074E-09 69285 QUIQUE_C1218_190116_001 174.52 60.63 8115100000 709850000 685060000 776660000 693330000 851350000 576960000 530280000 465100000 837880000 270950000 707150000 499550000 511000000 24744 1819;3223 23271 224060;224061;224062;224063;224064;224065;224066;224067;224068;224069;224070;224071;224072;224073 286167;286168;286169;286170;286171;286172;286173;286174;286175;286176;286177;286178;286179;286180;286181 286167 15 LADDLGFEFFEASAK Unmodified 1658.7828 0.78280317 1743 O95716 RAB3D Ras-related protein Rab-3D yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 146.13 146.13 2 1.0244E-09 150747 QUIQUE_C1277_190116_001 115.14 101.78 180910000 0 0 31665000 0 34771000 0 0 0 0 0 43911000 35101000 35466000 24745 1743 23272 224074;224075;224076;224077;224078;224079 286182;286183;286184;286185;286186;286187;286188 286182 7 LADDVDLEQVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIR Unmodified 3671.785 0.78495179 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 2 2 3 3 2 2 2 3 3 3 3 2 2 144.83 144.83 3;4;5 7.5832E-215 151373 QUIQUE_C1438_190116_001 215.27 206.21 20787000000 2172100000 1071100000 1433700000 1931400000 2433700000 726440000 1920400000 1801800000 1309000000 1171500000 1545900000 1562300000 1708000000 24746 2658 23273 224080;224081;224082;224083;224084;224085;224086;224087;224088;224089;224090;224091;224092;224093;224094;224095;224096;224097;224098;224099;224100;224101;224102;224103;224104;224105;224106;224107;224108;224109;224110;224111 286189;286190;286191;286192;286193;286194;286195;286196;286197;286198;286199;286200;286201;286202;286203;286204;286205;286206;286207;286208;286209;286210;286211;286212;286213;286214;286215;286216;286217;286218;286219;286220;286221;286222;286223;286224;286225;286226;286227;286228;286229;286230;286231;286232;286233;286234;286235;286236 286208 47 LADEINSIIDYVEDIQTK Unmodified 2078.0419 0.041930979 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 168.47 168.47 3 0.00059866 173019 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.022 55.265 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24747 2225 23274 224112 286237 286237 1 LADEQLSSVIQDMAVR Unmodified 1773.8931 0.89309867 3651 Q8NFV4 ABHD11 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 133.97 133.97 2 2.8401E-07 138328 QUIQUE_C1277_190116_001 129.37 98.805 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24748 3651 23275 224113;224114;224115;224116;224117;224118;224119 286238;286239;286240;286241;286242;286243;286244 286239 7 LADFALLCLDGK Unmodified 1334.6904 0.69042311 857 E7EQB2;E7ER44;P02788 LTF Lactotransferrin;Lactoferricin-H;Kaliocin-1;Lactoferroxin-A;Lactoferroxin-B;Lactoferroxin-C yes no 0 0 0 1 1 128.4 128.4 2 0.00053227 134799 QUIQUE_C1438_190116_001 116.77 88.039 54501000 0 0 0 0 34475000 0 0 0 20027000 0 0 0 0 24749 857 23276 224120;224121 286245;286246;286247 286246 3 LADFGLAR Unmodified 861.47085 0.47085192 2844;2905;2029;1017;875 Q00535;A0A2R8YEB7;K7ELV5;E5RIU6;K7EJ83;A0A087WZZ9;E7ESI2;A0A2R8Y644;A0A024QZP7;Q9BVE2;G3V5T9;A0A087X209;A0A2R8YD28;A0A2R8YF61;A0A2R8Y7W5;J3QSD7;A0A2R8Y4Z0;P06493;P24941;Q00526;Q00534;P50750;Q9NYV4;Q14004;Q07002;E7EUK8;O94921;F5H6Z0;Q00537;P11802;F8VYH9;F8VTV8;F8VWX7;F8VZ51;F8VXD2;F8VZZ0 CDK5;CDK3;CDK1;CDK2;CDC2;CDK13;CDK12;CDK6;CDK9;CDK18;CDK14;CDK17;CDK4 Cyclin-dependent-like kinase 5;Cyclin-dependent kinase 1;Cyclin-dependent kinase 2;Cyclin-dependent kinase 3;Cyclin-dependent kinase 6;Cyclin-dependent kinase 9;Cyclin-dependent kinase 12;Cyclin-dependent kinase 13;Cyclin-dependent kinase 18;Cyclin-dependent kinase 14;Cyclin-dependent kinase 17;Cyclin-dependent kinase 4 no no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 2 62.792 62.792 2 0.0036204 64028 QUIQUE_C1218_190116_001 115.46 0 4060500000 374570000 437660000 264050000 411300000 426390000 265600000 267610000 349330000 211310000 61928000 293000000 265890000 431850000 24750 2844;2905;875;1017;2029 23277 224122;224123;224124;224125;224126;224127;224128;224129;224130;224131;224132;224133;224134;224135;224136;224137;224138;224139;224140 286248;286249;286250;286251;286252;286253;286254;286255;286256;286257;286258;286259;286260;286261;286262;286263;286264;286265;286266;286267;286268;286269;286270;286271;286272;286273 286249 25 LADFGMCK Unmodified 940.41466 0.41465895 2868 Q02156;P24723;A0A1W2PPU0 PRKCE;PRKCH Protein kinase C epsilon type;Protein kinase C eta type no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.612 47.612 2 0.0085241 45234 QUIQUE_C1218_190116_001 94.006 0 1797400000 318740000 361600000 0 373670000 0 297610000 0 0 144910000 72263000 0 0 228630000 24751 2868 23278 224141;224142;224143;224144;224145;224146;224147 286274;286275;286276;286277;286278;286279;286280;286281 286274 7 LADFGTCMK Unmodified 1041.4623 0.46233743 1610;2999 Q13464;A0A0U1RQV4;O75116;D6REE7 ROCK1;ROCK2 Rho-associated protein kinase 1;Rho-associated protein kinase 2 no no 0 0 0 1 1 51.398 51.398 2 0.024347 49399 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subunit;Serine/threonine-protein kinase 26;Serine/threonine-protein kinase 25 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 86.09 86.09 3 0.000163 87776 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.445 46.562 417750000 0 51641000 0 0 0 0 0 96663000 86942000 0 94543000 87962000 0 24754 622;629 23281 224152;224153;224154;224155;224156 286286;286287;286288;286289;286290 286288 4 LADFGVLHR Unmodified 1026.5611 0.56106391 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 57.458 57.458 2 0.0090557 56866 QUIQUE_C1218_190116_001 77.046 34.818 222520000 48980000 57175000 56916000 44162000 0 0 0 0 0 15287000 0 0 0 24755 2253 23282 224157;224158;224159;224160;224161 286291;286292;286293;286294;286295 286291 3 LADFHANCR Unmodified 1102.4978 0.49781173 1407 O00451 GFRA2 GDNF family receptor alpha-2 yes yes 0 0 0 1 19.057 19.057 3 0.053306 11728 QUIQUE_C1368_190116_001 33.426 25.777 47814000 0 0 47814000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24756 1407 23283 224162 286296 286296 1 LADIDKDGMLDDDEFALANHLIK Unmodified 2571.2527 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286309;286310;286311;286312;286313;286314 286309 6 LADKVNSSWQR Unmodified 1302.668 0.66804818 1695 O94903;E5RFX7;E5RG77;H0YBG2 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 25.794 25.794 2;3 0.0037792 18447 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.65 57.074 539160000 0 0 0 0 0 0 0 140650000 80655000 0 152380000 62738000 102730000 24760 1695 23287 224179;224180;224181;224182;224183;224184;224185;224186 286315;286316;286317;286318;286319;286320;286321;286322;286323 286321 7 LADLASDLLLQYLLQGGAR Unmodified 2029.1208 0.12079042 1493 O15240 VGF Neurosecretory protein VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes yes 0 0 0 2 1 171.3 171.3 2;3 1.1091E-11 174021 QUIQUE_C1403_190116_001 154.36 107.98 164190000 0 0 0 96668000 67524000 0 0 0 0 0 0 0 0 24761 1493 23288 224187;224188;224189 286324;286325;286326 286324 2 LADLFGWSQLIYNHITTR Unmodified 2147.1164 0.11637375 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 2 160.58 160.58 2;3 6.3402E-40 163006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 194.48 153.9 25550000000 1164100000 1772200000 2212500000 1191200000 1315800000 1336700000 2076800000 1466600000 2434900000 491340000 4083900000 3757600000 2246300000 24762 854 23289 224190;224191;224192;224193;224194;224195;224196;224197;224198;224199;224200;224201;224202;224203;224204;224205;224206;224207;224208;224209 286327;286328;286329;286330;286331;286332;286333;286334;286335;286336;286337;286338;286339;286340;286341;286342;286343;286344;286345;286346;286347;286348;286349;286350;286351;286352;286353;286354;286355;286356;286357;286358 286342 30 LADLIER Unmodified 828.47052 0.47051757 1875;1776 P00352;Q5SYQ9;Q5SYQ8;Q5SYQ7;P05091;F8VP50 ALDH1A1;ALDH2 Retinal dehydrogenase 1;Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.436 46.436 2 0.01947 42482 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.54 8.3043 17760000000 1437100000 1378500000 1804700000 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63.711 63.711 2 4.9394E-05 62676 QUIQUE_C1368_190116_001 143.37 89.88 2375200000 256660000 248370000 235190000 216760000 0 205540000 0 198530000 251310000 0 287870000 216570000 258380000 24786 4261 23310 224649;224650;224651;224652;224653;224654;224655;224656;224657;224658;224659 287040;287041;287042;287043;287044;287045;287046;287047;287048;287049;287050;287051;287052;287053;287054;287055;287056 287042 17 LAEAQTYLDK Unmodified 1150.587 0.58700389 1975 P09914;Q5T764 IFIT1;IFIT1B Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1;Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1B yes no 0 0 0 1 45.255 45.255 2 0.0016837 42932 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.692 48.974 47907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47907000 0 0 24787 1975 23311 224660 287057 287057 1 LAEAQTYLDKVENICK Unmodified 1893.9506 0.95061355 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 1 1 94.431 94.431 2;3 1.1638E-13 96435 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.19 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2010.9283 0.9282982 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YCH5;H0YD77;H0YEC5 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 63.87 63.87 2 8.6897E-58 63779 QUIQUE_DMIX5_190116_001 177.21 159.49 651060000 44848000 43784000 43810000 62300000 38785000 56321000 65033000 37801000 51597000 36238000 54055000 44758000 71728000 24791 798 23315 224680;224681;224682;224683;224684;224685;224686;224687;224688;224689;224690;224691;224692;224693 287082;287083;287084;287085;287086;287087;287088;287089;287090;287091;287092;287093;287094;287095;287096 287093 15 LAEDEAFQR Unmodified 1077.5091 0.50908792 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.65 37.65 2 0.00051151 33687 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.61 87.105 5044800000 476170000 497410000 608330000 179890000 356570000 0 0 537010000 783860000 284800000 733170000 587540000 0 24792 3117 23316 224694;224695;224696;224697;224698;224699;224700;224701;224702;224703;224704;224705 287097;287098;287099;287100;287101;287102;287103;287104;287105;287106;287107;287108 287104 8 LAEDEAFQRR Unmodified 1233.6102 0.61019895 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 2 1 25.737 25.737 2;3 0.0050141 20205 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.518 38.287 444020000 0 0 74297000 0 0 0 0 254640000 0 0 0 115080000 0 24793 3117 23317 224706;224707;224708;224709 287109;287110;287111;287112 287111 4 LAEDILNTMFDTSYSK Unmodified 1846.8659 0.86588087 2961 Q13045;K7EQZ7 FLII Protein flightless-1 homolog no no 0 0 0 1 145.34 145.34 2 0.0021219 152266 QUIQUE_C1438_190116_001 63.76 55.455 15281000 0 0 0 0 15281000 0 0 0 0 0 0 0 0 24794 2961 23318 224710 287113 287113 1 LAEELGR Unmodified 786.42357 0.42356738 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7;A0A3B3ITA2 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 23.901 23.901 2 0.023846 17747 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.279 20.285 28060000 0 0 0 0 0 0 0 0 28060000 0 0 0 0 24795 2322 23319 224711 287114 287114 1 LAEENPDLQEAYIAK Unmodified 1702.8414 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0.86832371 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 1 1 1 53.345 53.345 3 0.0021905 51763 QUIQUE_C1576_190116_001 60.489 42.474 177330000 0 47909000 77987000 0 0 0 51436000 0 0 0 0 0 0 24798 3459 23322 224733;224734;224735;224736 287138;287139;287140;287141;287142 287141 4 LAEGFPLPLLK Unmodified 1196.7169 0.71689585 2136 P18428 LBP Lipopolysaccharide-binding protein yes yes 0 0 0 1 130.99 130.99 2 0.023678 127319 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.756 44.542 14250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14250000 0 0 0 24799 2136 23323 224737 287143 287143 1 LAEIGAPIQGNREELVER Unmodified 1993.0593 0.059252799 2996 Q13435;E9PPJ0;H0YCG1;E9PJ04;E9PJT3 SF3B2 Splicing factor 3B subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 70.206 70.206 3 0.00014789 71064 QUIQUE_C1438_190116_001 84.653 62.439 324210000 0 0 0 0 47228000 0 0 63911000 73180000 0 73547000 66347000 0 24800 2996 23324 224738;224739;224740;224741;224742 287144;287145;287146;287147;287148 287144 5 LAEIHGVPR Unmodified 990.56106 0.56106391 1430 O14531 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 25.363 25.363 2 0.018516 19206 QUIQUE_C1277_190116_001 64.265 39.37 50250000 0 50250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24801 1430 23325 224743;224744 287149;287150 287150 2 LAEIIWQNR Unmodified 1141.6244 0.62439245 2592;1320 K7EK35;P42229;P51692 STAT5A;STAT5B Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A;Signal transducer and activator of transcription 5B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.749 81.749 2 0.00033092 82636 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.16 74.156 230500000 42014000 48514000 0 32217000 0 0 0 36364000 33723000 0 0 0 37665000 24802 1320;2592 23326 224745;224746;224747;224748;224749;224750;224751 287151;287152;287153;287154;287155;287156;287157 287154 7 LAEIMNR Unmodified 845.44292 0.44292261 1610;2999 Q13464;A0A0U1RQV4;O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK1;ROCK2 Rho-associated protein kinase 1;Rho-associated protein kinase 2 no no 0 0 0 1 30.745 30.745 2 0.043803 25878 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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77.923 56.395 28773000 0 28773000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24813 3919 23336 224852 287293 287293 1 LAELSDYRR Unmodified 1121.5829 0.58292157 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 31.711 31.711 2;3 0.0085937 26409 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.549 28.76 186540000 0 22531000 0 0 30888000 22414000 0 45584000 0 15330000 49788000 0 0 24814 3919 23337 224853;224854;224855;224856;224857;224858;224859;224860 287294;287295;287296;287297;287298;287299;287300;287301;287302;287303;287304 287303 10 LAELVIEVLQQNEEHHAEGK Unmodified 2285.1652 0.16517443 1236 H7C4T6 CADPS yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 109.92 109.92 3;4 7.2273E-05 113128 QUIQUE_C1277_190116_001 66.636 56.641 990390000 119570000 147260000 140660000 112530000 0 54665000 89020000 81055000 0 33442000 124540000 87646000 0 24815 1236 23338 224861;224862;224863;224864;224865;224866;224867;224868;224869;224870;224871;224872 287305;287306;287307;287308;287309;287310;287311;287312;287313;287314;287315;287316 287306 9 LAEMPADSGYPAYLGAR Oxidation (M) 1796.8403 0.84033482 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 80.317 80.317 2 8.1514E-53 81271 QUIQUE_DMIX1_190116_001 181.66 166.78 1720500000 87692000 127070000 119390000 69892000 87689000 73259000 94782000 130810000 158080000 111980000 247950000 198900000 212960000 24816 2414 23339 224873;224874;224875;224876;224877;224878;224879;224880;224881;224882;224883;224884;224885;224886 287317;287318;287319;287320;287321;287322;287323;287324;287325;287326;287327;287328;287329;287330;287331;287332;287333;287334;287335;287336;287337;287338;287339;287340;287341 287331 1826 25 LAEMPADSGYPAYLGAR Unmodified 1780.8454 0.8454202 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 97.597 97.597 2;3 3.4511E-10 101719 QUIQUE_DMIX5_190116_001 144.65 138.21 8993300000 779160000 865640000 906150000 793940000 617880000 618240000 841040000 433840000 479160000 234350000 880930000 687900000 855080000 24817 2414 23339 224887;224888;224889;224890;224891;224892;224893;224894;224895;224896;224897;224898;224899;224900 287342;287343;287344;287345;287346;287347;287348;287349;287350;287351;287352;287353;287354;287355;287356;287357;287358;287359;287360;287361;287362;287363;287364;287365;287366;287367 287364 26 LAENFCVCHLATGDMLR Unmodified 2005.9172 0.91722171 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;G3V213 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 100.34 100.34 3 1.6755E-30 102648 QUIQUE_C1403_190116_001 123.36 113.8 358400000 41517000 65010000 71050000 72841000 0 62295000 45684000 0 0 0 0 0 0 24818 1047 23340 224901;224902;224903;224904;224905;224906 287368;287369;287370;287371;287372;287373;287374 287371 6 LAENIDAQLK Unmodified 1113.603 0.60298831 1362 M0QXN5;P37198 NUP62 Nuclear pore glycoprotein p62 yes no 0 0 0 1 51.269 51.269 2 0.058561 46363 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P14923;C9JTX4;C9J826;C9JK18;C9JKY1 JUP Junction plakoglobin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.81 57.81 2 0.027619 55356 QUIQUE_C1563_190116_001 57.722 9.979 142690000 0 18440000 17524000 42431000 0 20415000 0 0 0 22765000 21112000 0 0 24823 2084 23345 224914;224915;224916;224917;224918;224919 287382;287383;287384;287385;287386;287387 287385 4 LAEPSQMLK Unmodified 1015.5372 0.53721693 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y5Z1;E7EMJ5 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.738 46.738 2 0.0038413 43545 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.37 33.823 1049300000 0 146040000 120200000 145310000 112240000 0 118480000 0 93996000 0 109050000 90716000 113270000 24824 425 23346 224920;224921;224922;224923;224924;224925;224926;224927;224928 287388;287389;287390;287391;287392;287393;287394;287395;287396 287396 8 LAEPSQMLK Oxidation (M) 1031.5321 0.53213155 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y5Z1;E7EMJ5 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 1 0 1 24.846 24.846 2 0.014709 18810 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.379 12.03 136970000 0 0 0 0 0 0 0 136970000 0 0 0 0 0 24825 425 23346 224929 287397 287397 1 LAEQAERYDDMAAAMK Oxidation (M) 1827.8131 0.81313379 2341;2736 P31946;Q4VY20;Q4VY19;A0A0J9YWE8;P61981 YWHAB;YWHAG 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed no no 0 1 1 1 46.085 46.085 2 0.046937 42946 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.936 26.373 22533000 0 0 0 0 0 0 0 22533000 0 0 0 0 0 24826 2341;2736 23347 224930 287398 287398 1744 1 LAEQAERYDDMAAAMK Unmodified 1811.8182 0.81821917 2341;2736 P31946;Q4VY20;Q4VY19;A0A0J9YWE8;P61981 YWHAB;YWHAG 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 1 66.624 66.624 2;3 6.3957E-07 66113 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.53 85.112 554560000 0 0 0 0 0 0 0 456590000 97974000 0 0 0 0 24827 2341;2736 23347 224931;224932;224933;224934;224935 287399;287400;287401;287402;287403;287404 287400 6 LAEQAERYDDMAACMK Oxidation (M) 1916.8067 0.80666821 2780 P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 1 1 1 43.13 43.13 3 0.013611 39601 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.545 42.004 31439000 0 0 0 0 0 0 0 31439000 0 0 0 0 0 24828 2780 23348 224936 287405 287405 2226;2227 1 LAEQAERYDDMAACMK Unmodified 1900.8118 0.81175358 2780 P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 1 2 1 2 63.032 63.032 2;3 0.0013248 61858 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.728 71.849 482430000 0 0 0 0 0 0 0 363380000 0 0 0 119040000 0 24829 2780 23348 224937;224938;224939;224940;224941 287406;287407;287408;287409;287410 287407 5 LAEQAERYDDMASAMK Unmodified 1827.8131 0.81313379 2891 Q04917;F8WEB6;A2IDB1 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 1 2 63.837 63.837 2;3 1.958E-05 62623 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.135 20.245 54687000 0 0 0 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287415;287416;287417;287418;287419;287420;287421;287422;287423;287424;287425;287426;287427;287428;287429;287430;287431;287432;287433;287434;287435;287436;287437;287438;287439;287440;287441;287442;287443;287444 287431 29 LAEQAERYDEMVESMK Oxidation (M) 1943.8605 0.86047792 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 1 1 62.563 62.563 2 0.010366 61243 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.563 60.511 24202000 0 0 0 0 0 0 0 24202000 0 0 0 0 0 24833 2745 23351 224966 287445 287445 2177;2178 1 LAEQAERYDEMVESMKK 2 Oxidation (M) 2087.9504 0.95035555 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 2 2 1 1 1 32.829 32.829 3 0.0057721 27939 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.813 53.408 170610000 0 0 0 0 0 0 0 62618000 46920000 0 0 0 61068000 24834 2745 23352 224967;224968;224969 287446;287447;287448 287447 2177;2178 3 LAEQAERYDEMVESMKK Oxidation (M) 2071.9554 0.95544093 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 2 1 49.567 49.567 3 0.00072204 46794 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dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 164.34 164.34 3 2.2833E-09 169092 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.076 51.204 91150000 0 0 0 0 0 0 0 0 37817000 0 0 53333000 0 24861 4487 23376 225192;225193 287739;287740;287741 287739 3 LAFYPNQDGDILR Unmodified 1520.7623 0.7623425 1057 F8W9S7;Q14C86 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 106.55 106.55 2 0.0019889 108985 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.692 79.063 263540000 0 0 0 42974000 59232000 0 0 47337000 0 0 69409000 44590000 0 24862 1057 23377 225194;225195;225196;225197;225198 287742;287743;287744;287745;287746;287747;287748 287746 7 LAGANPAVITCDELLLGHEK Unmodified 2120.0936 0.093589394 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 101.7 101.7 3 0.04429 105218 QUIQUE_C1368_190116_001 32.833 24.041 32952000 0 0 32952000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24863 2813 23378 225199 287749 287749 0 LAGATLLIFANK Unmodified 1230.7336 0.73360855 2392 P36404 ARL2 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287985 15 LAGIQEFQDK Unmodified 1147.5873 0.58733824 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 59.754 59.754 2 0.00023561 59328 QUIQUE_C1576_190116_001 117.89 92.331 251290000 0 0 86481000 0 81330000 0 83477000 0 0 0 0 0 0 24880 723 23395 225402;225403;225404 287989;287990;287991;287992;287993 287992 5 LAGKENITEDEAK Unmodified 1416.7096 0.70963822 3336 Q5VW32;F5GXQ0;Q5VW33 BROX BRO1 domain-containing protein BROX yes no 0 0 1 2 1 1 1 18.439 18.439 2;3 0.0025211 11428 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.82 67.338 188100000 0 0 0 0 0 0 0 68017000 38486000 0 38978000 42617000 0 24881 3336 23396 225405;225406;225407;225408;225409 287994;287995;287996;287997;287998 287994 4 LAGLALPR Unmodified 809.51232 0.51232281 4046 Q9BVJ7 DUSP23 Dual specificity protein phosphatase 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.102 66.102 2 0.0036102 65805 QUIQUE_C1277_190116_001 114.54 39.229 297960000 22892000 24729000 29933000 23764000 29612000 28646000 0 26522000 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288224;288225;288226;288227;288228;288229;288230;288231;288232;288233;288234;288235;288236;288237;288238;288239;288240;288241;288242;288243;288244;288245;288246;288247;288248;288249;288250;288251;288252;288253;288254;288255;288256;288257;288258;288259;288260 288253 29 LAIGFSTVQK Unmodified 1062.6073 0.6073454 261 A0A0R4J2G7;A0A0D9SEP4;A0A1D5RMU6;E7ERL8;Q9ULB1;A0A0U1RRK7;A0A0D9SEM5;P58400;A0A0D9SF36;A0A1B0GUQ1 NRXN1 Neurexin-1;Neurexin-1-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.591 68.591 2 0.0012588 68514 QUIQUE_C1277_190116_001 99.802 66.006 466970000 43481000 38566000 44843000 34857000 32430000 24924000 42977000 24238000 41997000 16963000 44963000 45460000 31271000 24901 261 23416 225594;225595;225596;225597;225598;225599;225600;225601;225602;225603;225604;225605;225606 288261;288262;288263;288264;288265;288266;288267;288268;288269;288270;288271;288272;288273;288274 288262 14 LAIIEYMPLLAGQLGVEFFDEK Unmodified 2495.3022 0.30218519 2309 P30153;B3KQV6;P30154 PPP2R1A;PPP2R1B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 175.75 175.75 3 1.9762E-08 182758 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.644 68.662 39842000 0 0 0 0 0 0 0 0 8042700 0 21075000 10724000 0 24902 2309 23417 225607;225608;225609 288275;288276;288277 288276 3 LAIIPGGGGTQR Unmodified 1138.6459 0.64585618 3026 Q13825 AUH Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 51.314 51.314 2 0.0070983 49821 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.04 45.905 531970000 0 0 111170000 94671000 120870000 0 0 80140000 0 0 0 0 125120000 24903 3026 23418 225610;225611;225612;225613;225614 288278;288279;288280;288281;288282 288281 4 LAIKLPDDQIPK Unmodified 1349.7919 0.79185171 2861 Q01813;B1APP6 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 1 1 78.718 78.718 3 0.0041733 78952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.03 51.066 97456000 0 0 0 0 0 0 0 97456000 0 0 0 0 0 24904 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288350;288351;288352;288353;288354;288355;288356;288357 288350 7 LAIVLFTK Unmodified 903.57934 0.57933974 3626 Q8NBN7;G8JLA1 RDH13 Retinol dehydrogenase 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.987 97.987 2 0.021397 102207 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.213 41.697 86563000 0 12706000 13444000 0 16427000 0 0 0 0 0 26340000 0 17647000 24914 3626 23429 225677;225678;225679;225680;225681 288358;288359;288360;288361;288362 288361 5 LAIWDTAGQER Unmodified 1258.6306 0.63060004 4237 Q9NP72 RAB18 Ras-related protein Rab-18 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.345 77.345 2 0.00021182 78212 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.35 77.675 2079100000 179350000 157270000 208860000 204420000 160990000 0 201820000 158040000 203390000 90387000 212340000 130610000 171610000 24915 4237 23430 225682;225683;225684;225685;225686;225687;225688;225689;225690;225691;225692;225693 288363;288364;288365;288366;288367;288368;288369;288370;288371;288372;288373;288374;288375;288376 288372 14 LALADAGDTVEDANFVEAMADAGILR Unmodified 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288403;288404;288405;288406;288407;288408;288409;288410;288411 288403 8 LALDIEIATYRK Unmodified 1404.7977 0.79766537 395;1336;389;772;1342;779 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;A0A1W2PS58;A0A1W2PQU7;CON__Q6KB66-1;Q6KB66;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136;K7EPI4;CON__P05787;P05787;CON__H-INV:HIT000292931;CON__Q9DCV7;CON__Q3KNV1;CON__P08729;P08729;CON__P19013;P19013 GFAP;KRT80;KRT8;KRT7;KRT4 Keratin, type II cytoskeletal 80;Glial fibrillary acidic protein;Keratin, type II cytoskeletal 8;Keratin, type II cytoskeletal 7;Keratin, type II cytoskeletal 4 no no 0 0 1 1 2 2 1 1 7 9 2 12 7 4 96.798 96.798 2;3 1.771E-28 89459 QUIQUE_DMIX7_190116_001 185.6 147.3 13325000000 0 49823000 86061000 0 43160000 61205000 56145000 3512300000 2890100000 66738000 3123300000 2448000000 988110000 + 24921 389;395;1336;1342;772;779 23436 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P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 0 26 30 59 23 44 42 86 61 106 11 87 89 71 150.52 150.52 1;2;3 1.0441E-102 119935 QUIQUE_C1277_190116_001 274.95 0 298420000000 11353000000 15874000000 23756000000 23427000000 26342000000 24369000000 29968000000 13895000000 55904000000 5144000000 37914000000 11905000000 18571000000 + 24922 1859 23437 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288567 838 LALDMEIHAYR Unmodified 1330.6704 0.67035637 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 2 3 3 3 3 3 2 1 1 3 1 1 80.361 80.361 2;3 0.00012794 81667 QUIQUE_C1277_190116_001 98.943 76.897 1218900000 87655000 97181000 109230000 128340000 143150000 113700000 158250000 72201000 98467000 51548000 85861000 73307000 0 24923 1819;3223 23438 226511;226512;226513;226514;226515;226516;226517;226518;226519;226520;226521;226522;226523;226524;226525;226526;226527;226528;226529;226530;226531;226532;226533;226534;226535;226536;226537 289442;289443;289444;289445;289446;289447;289448;289449;289450;289451;289452;289453;289454;289455;289456;289457;289458;289459;289460;289461;289462;289463;289464;289465;289466;289467;289468;289469;289470;289471;289472;289473;289474;289475;289476;289477;289478;289479;289480;289481;289482;289483;289484 289446 42 LALDMEIHAYR Oxidation (M) 1346.6653 0.66527099 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 1 0 1 1 62.459 62.459 3 0.027194 62912 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.844 32.299 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24924 1819;3223 23438 226538;226539 289485;289486 289485 2 LALDMEIHAYRK Unmodified 1458.7653 0.76531938 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 1 2 1 1 58.336 58.336 3;4 0.00050405 56866 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.385 54.377 84112000 0 0 0 0 0 0 0 52341000 11717000 0 0 20054000 0 24925 1819;3223 23439 226540;226541;226542;226543 289487;289488;289489;289490;289491 289487 4 LALDMEINAYR Unmodified 1307.6544 0.65437195 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 3 2 2 1 2 1 2 3 1 103.97 103.97 2 5.8078E-06 108352 QUIQUE_C1218_190116_001 146.69 81.447 865330000 100200000 97139000 114490000 64126000 113290000 101180000 59351000 0 35903000 44434000 52795000 43174000 39255000 24926 2886 23440 226544;226545;226546;226547;226548;226549;226550;226551;226552;226553;226554;226555;226556;226557;226558;226559;226560;226561;226562;226563;226564;226565;226566 289492;289493;289494;289495;289496;289497;289498;289499;289500;289501;289502;289503;289504;289505;289506;289507;289508;289509;289510;289511;289512;289513;289514;289515;289516;289517;289518;289519;289520;289521;289522;289523;289524;289525;289526 289492 34 LALDMEINAYR Oxidation (M) 1323.6493 0.64928657 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 1 0 1 1 86.703 86.703 2 0.018412 88804 QUIQUE_C1368_190116_001 57.55 40.425 66932000 0 0 36208000 0 30724000 0 0 0 0 0 0 0 0 24927 2886 23440 226567;226568 289527;289528 289527 2 LALDMEINAYRK Unmodified 1435.7493 0.74933497 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 1 1 1 78.1 78.1 3 0.0053477 80168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.224 44.83 126050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69784000 56265000 0 24928 2886 23441 226569;226570 289529;289530 289529 0 LALDVEIATYR Unmodified 1262.6871 0.68705229 781;782;778;764;792;775 CON__P35908;H0YID6;CON__REFSEQ:XP_932229;CON__P35908v2;P35908;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__P13647;P13647;H0YI76;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2;CON__P12035;P12035 KRT79;KRT2;KRT6C;KRT6A;KRT5;KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 5;Keratin, type II cytoskeletal 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 3 1 106.41 106.41 2 0.00074572 110804 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.342 47.182 338310000 27765000 0 0 19305000 0 0 0 36022000 19635000 60316000 0 89973000 85294000 + 24929 781;782;764;778;792;775 23442 226571;226572;226573;226574;226575;226576;226577;226578;226579;226580;226581 289531;289532;289533;289534;289535;289536;289537;289538;289539;289540;289541;289542 289536 10 LALDYGIK Unmodified 891.50657 0.50656873 2704 P61006 RAB8A Ras-related protein Rab-8A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 68.436 68.436 2 0.036654 69680 QUIQUE_C1218_190116_001 62.659 0 163190000 49126000 0 0 0 0 39191000 0 50322000 0 24546000 0 0 0 24930 2704 23443 226582;226583;226584;226585 289543;289544;289545;289546 289543 4 LALEAEK Unmodified 772.43307 0.43306943 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 23.271 23.271 2 0.042242 17023 QUIQUE_C1218_190116_001 81.297 8.2579 371490000 107970000 139020000 0 124500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24931 2640 23444 226586;226587;226588 289547;289548;289549 289547 3 LALEAEVSELR Unmodified 1228.6663 0.66631685 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.735 93.735 2 0.00023661 95577 QUIQUE_C1403_190116_001 121.5 56.256 623740000 54008000 49996000 54917000 49126000 57020000 58718000 61784000 42599000 0 27504000 70104000 41098000 56873000 24932 3459 23445 226589;226590;226591;226592;226593;226594;226595;226596;226597;226598;226599;226600 289550;289551;289552;289553;289554;289555;289556;289557;289558;289559;289560;289561;289562;289563 289553 11 LALEDGCGPGPGPPR Unmodified 1491.714 0.7140121 3900 Q96LD4 TRIM47 Tripartite motif-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.439 58.439 2 0.00065425 57540 QUIQUE_C1576_190116_001 83.397 64.082 311220000 36042000 45762000 41329000 36419000 0 29566000 44523000 31333000 0 0 0 0 46242000 24933 3900 23446 226601;226602;226603;226604;226605;226606;226607;226608;226609;226610 289564;289565;289566;289567;289568;289569;289570;289571;289572;289573 289570 9 LALEETGTEVK Unmodified 1188.6238 0.62378333 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.784 45.784 2 7.9438E-05 43738 QUIQUE_C1218_190116_001 147.2 96.593 3305600000 762040000 490180000 347880000 0 250600000 447230000 317840000 0 132060000 250210000 183120000 0 124430000 24934 4393 23447 226611;226612;226613;226614;226615;226616;226617;226618;226619;226620 289574;289575;289576;289577;289578;289579;289580;289581;289582;289583 289574 6 LALEETGTEVKEDVVTACYALMELGIQECTR Oxidation (M) 3543.6783 0.67828638 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 1 1 1 161.83 161.83 3 2.145E-08 165882 QUIQUE_C1277_190116_001 60.348 55.028 29977000 0 29977000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24935 4393 23448 226621 289584 289584 2930 1 LALEETGTEVKEDVVTACYALMELGIQECTR Unmodified 3527.6834 0.68337176 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 1 1 2 1 1 166.33 166.33 3;4 5.349E-13 171811 QUIQUE_C1576_190116_001 68.101 54.048 288290000 0 44652000 0 0 0 0 125380000 0 0 0 46753000 71511000 0 24936 4393 23448 226622;226623;226624;226625;226626 289585;289586;289587;289588;289589 289586 5 LALEGVEK Unmodified 857.48583 0.48583328 3145 Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.305 38.305 2 0.021397 34588 QUIQUE_C1576_190116_001 75.213 5.2142 2358900000 0 0 386620000 0 384800000 0 450780000 226170000 350430000 129450000 0 0 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Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 165.03 165.03 2;3 1.0526E-08 169574 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.08 96.143 333110000 0 0 0 0 0 16516000 24619000 53487000 97978000 11154000 47085000 82273000 0 24944 3053 23456 226681;226682;226683;226684;226685;226686;226687;226688;226689;226690;226691 289648;289649;289650;289651;289652;289653;289654;289655;289656;289657;289658 289653 8 LALETALMYGAK Unmodified 1279.6846 0.68460945 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.17 105.17 2 0.00011984 108427 QUIQUE_C1277_190116_001 105.4 67.921 352630000 0 0 0 121270000 55285000 0 0 44582000 28670000 0 60592000 42230000 0 24945 1785 23457 226692;226693;226694;226695;226696;226697;226698;226699;226700;226701 289659;289660;289661;289662;289663;289664;289665;289666;289667;289668 289660 10 LALETALMYGAK Oxidation (M) 1295.6795 0.67952407 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 1 0 1 1 92.513 92.513 2 0.010839 93743 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protein 1 yes yes 0 0 1 1 111.16 111.16 4 0.0057373 114665 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.172 31.914 53564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53564000 0 24975 4551 23485 226860 289843 289843 0 LALSNVAPLTGNVYSGFGFHSAQDSALLYYR Unmodified 3330.6673 0.66732648 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 148.26 148.26 3 1.0302E-11 153419 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.301 54.397 36303000 0 0 0 0 0 0 0 0 36303000 0 0 0 0 24976 1492 23486 226861 289844 289844 0 LALSQNQQSSGAAGPTGK Unmodified 1713.8646 0.86457574 1270 J3KPP4;O95232;D6RDI2 LUC7L3 Luc7-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 29.998 29.998 2 8.0663E-14 24360 QUIQUE_C1368_190116_001 135.58 108.91 190760000 24412000 28816000 0 0 0 30967000 0 0 0 0 36763000 31797000 38008000 24977 1270 23487 226862;226863;226864;226865;226866;226867;226868;226869 289845;289846;289847;289848;289849;289850;289851;289852 289847 7 LALTEWLQEFGVPHQYSSR Unmodified 2260.1277 0.12766671 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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289970;289971;289972;289973;289974;289975;289976;289977;289978;289979;289980;289981;289982;289983;289984;289985;289986;289987;289988;289989;289990;289991;289992;289993;289994;289995;289996;289997;289998;289999;290000;290001;290002;290003;290004;290005;290006;290007;290008 289997 36 LALWEGR Unmodified 843.46029 0.46028724 734 C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.35 67.35 2 0.024915 67058 QUIQUE_C1368_190116_001 97.071 19.323 257160000 0 0 75847000 50271000 0 0 0 0 32182000 0 46093000 52766000 0 24984 734 23493 226976;226977;226978;226979;226980 290009;290010;290011;290012;290013;290014 290010 6 LALYNLLAYVK Unmodified 1279.754 0.75400964 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.22 150.22 2 0.00015645 154619 QUIQUE_C1403_190116_001 152.63 130.78 583840000 32030000 42566000 61332000 40321000 33874000 24437000 41700000 37465000 50769000 12950000 98593000 56145000 51661000 24985 2986 23494 226981;226982;226983;226984;226985;226986;226987;226988;226989;226990;226991;226992;226993 290015;290016;290017;290018;290019;290020;290021;290022;290023;290024;290025;290026;290027;290028;290029;290030;290031;290032 290019 18 LALYQTAIESAR Unmodified 1334.7194 0.71941505 3378 Q6P1N0 CC2D1A Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.714 83.714 2 0.00060022 85012 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.86 86.76 239470000 0 18867000 22377000 28426000 0 27451000 0 28009000 27250000 0 28789000 30001000 28297000 24986 3378 23495 226994;226995;226996;226997;226998;226999;227000;227001;227002;227003 290033;290034;290035;290036;290037;290038;290039;290040;290041;290042 290041 10 LALYTACGGVNPQQCLPVLLDVGTNNEELLRDPLYIGLK Unmodified 4326.2392 0.23921436 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 166.2 166.2 3;4 2.2846E-17 168152 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.279 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no 0 0 1 1 1 1 168.77 168.77 3 7.0561E-09 173296 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.95 106.86 378360000 0 0 0 0 0 0 0 0 159320000 0 104510000 114540000 0 24990 3720 23498 227020;227021;227022 290059;290060;290061 290059 3 LAMLEEDLLALK Unmodified 1357.7527 0.75268901 3373 Q6NVY1;F8W8A6 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.68 138.68 2 0.00072798 143883 QUIQUE_C1368_190116_001 107.79 72.277 1990400000 166160000 206370000 199650000 101060000 185800000 166690000 0 127580000 246360000 66573000 170520000 194560000 159040000 24991 3373 23499 227023;227024;227025;227026;227027;227028;227029;227030;227031;227032;227033;227034 290062;290063;290064;290065;290066;290067;290068;290069;290070;290071;290072;290073 290064 10 LAMLEEDLLALK Oxidation (M) 1373.7476 0.74760363 3373 Q6NVY1;F8W8A6 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 128.16 128.16 2 0.0076067 132433 QUIQUE_C1368_190116_001 64.841 43.393 191130000 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290079;290080;290081;290082;290083;290084;290085;290086;290087;290088;290089;290090;290091;290092;290093;290094;290095;290096;290097;290098;290099;290100;290101;290102;290103;290104;290105;290106;290107;290108;290109;290110;290111;290112;290113;290114;290115;290116;290117;290118;290119;290120;290121;290122;290123;290124;290125;290126 290107 1122;1123 47 LAMQEFMILPVGAANFR Oxidation (M) 1922.9747 0.97466023 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 1 0 9 7 7 4 5 7 5 6 8 6 6 5 4 145.06 145.06 2;3 5.5596E-63 144254 QUIQUE_DMIX8_190116_001 190.53 174.39 48201000000 3249900000 3190100000 4271500000 1933500000 3644600000 3330100000 2610900000 3905700000 5685000000 1921400000 5296200000 4649700000 4512000000 24994 1906 23500 227065;227066;227067;227068;227069;227070;227071;227072;227073;227074;227075;227076;227077;227078;227079;227080;227081;227082;227083;227084;227085;227086;227087;227088;227089;227090;227091;227092;227093;227094;227095;227096;227097;227098;227099;227100;227101;227102;227103;227104;227105;227106;227107;227108;227109;227110;227111;227112;227113;227114;227115;227116;227117;227118;227119;227120;227121;227122;227123;227124;227125;227126;227127;227128;227129;227130;227131;227132;227133;227134;227135;227136;227137;227138;227139;227140;227141;227142;227143 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Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 121.51 121.51 2 0.0019785 125542 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.143 49.028 2344600000 206120000 0 0 290310000 0 0 439380000 258200000 393920000 175650000 295470000 285530000 0 25000 345 23503 227296;227297;227298;227299;227300;227301;227302;227303;227304 290457;290458;290459;290460;290461;290462;290463;290464;290465;290466;290467 290463 10 LANFASLSDLHK Unmodified 1314.6932 0.6932003 568 A8MXV4 NUDT19 Nucleoside diphosphate-linked moiety X motif 19, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 73.223 73.223 3 0.0094985 73859 QUIQUE_C1218_190116_001 40.287 24.344 28677000 28677000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25001 568 23504 227305 290468 290468 1 LANILFTQELAR Unmodified 1387.7823 0.78234966 3670 Q8TC12;G3V2G6;G3V234;H0YJ46;H0YJ10;H0YIZ8 RDH11 Retinol dehydrogenase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.26 112.26 2 0.00047172 116126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.47 79.383 550050000 0 0 63639000 62172000 40979000 68841000 68627000 0 72091000 27449000 74683000 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290511;290512;290513;290514;290515 290511 4 LANVENVFHPVECSYCHSESMMGFR Unmodified 2999.2823 0.28228793 4608 Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.5 110.5 4 9.4237E-11 113386 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.837 76.429 501760000 46102000 66651000 51497000 48186000 0 0 68019000 42125000 47273000 0 38817000 29417000 63672000 25007 4608 23510 227348;227349;227350;227351;227352;227353;227354;227355;227356;227357 290516;290517;290518;290519;290520;290521;290522;290523;290524;290525;290526 290522 11 LANVMMGPYR Oxidation (M) 1166.5576 0.55763479 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 53.204 53.204 2 0.0013154 50786 QUIQUE_C1277_190116_001 101.6 67.415 211850000 28167000 39218000 0 29588000 36757000 0 0 47960000 0 30166000 0 0 0 25008 2135 23511 227358;227359;227360;227361;227362;227363;227364;227365;227366 290527;290528;290529;290530;290531;290532;290533;290534;290535;290536;290537 290528 1477;1478 10 LANVMMGPYR Unmodified 1150.5627 0.56272017 2135 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290545;290546;290547;290548;290549;290550;290551;290552;290553;290554;290555 290549 7 LANVQLLDTDGGFVHSDGAISCHDMFDFLHLTGGGYAK Oxidation (M) 4093.8939 0.89385031 2798 P68402;J3KNE3 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes no 0 1 0 1 1 138.19 138.19 4;5 6.0365E-55 142862 QUIQUE_C1277_190116_001 109.49 105 282700000 0 152720000 129990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25012 2798 23512 227385;227386 290556;290557 290556 2247 2 LAPDFDKIVESLSLLK Unmodified 1787.0081 0.0080520759 1569 O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4;A0A2R8Y5G3;C9JY58;A0A2R8Y5E2;H7C321 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 1 2 1 1 158.15 158.15 3 2.608E-07 160795 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.754 72.507 173650000 0 0 0 0 0 0 0 40276000 34007000 0 34432000 28419000 36519000 25013 1569 23513 227387;227388;227389;227390;227391;227392 290558;290559;290560;290561;290562;290563;290564 290558 7 LAPEFAK Unmodified 774.42759 0.42759012 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.596 28.596 2 0.031782 23553 QUIQUE_C1438_190116_001 89.673 50.455 60801000000 3454200000 3531900000 4527500000 5010100000 4319800000 4297400000 4420600000 0 7153400000 2586800000 7573900000 5422800000 8502800000 25014 2298 23514 227393;227394;227395;227396;227397;227398;227399;227400;227401;227402;227403;227404 290565;290566;290567;290568;290569;290570;290571;290572;290573;290574;290575;290576;290577;290578;290579;290580;290581;290582;290583;290584;290585;290586;290587 290574 23 LAPEVLEDLVQNTEFSEQELK Unmodified 2430.2166 0.21660088 4498 Q9UM19;B4DGW9 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 157.53 157.53 2;3 3.8927E-259 161875 QUIQUE_C1277_190116_001 274.45 234.42 7049300000 809850000 780550000 664100000 435480000 500930000 587020000 608940000 289780000 588050000 134110000 605800000 588910000 455800000 25015 4498 23515 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227644;227645;227646;227647;227648;227649;227650;227651;227652;227653;227654;227655;227656 291001;291002;291003;291004;291005;291006;291007;291008;291009;291010;291011;291012;291013 291004 13 LAQALHEMREQHDAQVR Oxidation (M) 2047.0018 0.0017546946 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 1 1 1 14.56 14.56 3 0.0066347 6763 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.522 34.946 14459000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14459000 0 0 25037 2171 23536 227657 291014 291014 1520 1 LAQANGWGVMVSHR Oxidation (M) 1540.7569 0.75687996 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 43.699 43.699 2;3 0.0014209 40881 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.597 27.145 3442400000 56413000 91298000 0 102820000 159110000 0 0 601970000 687800000 325850000 795260000 421930000 199990000 25038 1906 23537 227658;227659;227660;227661;227662;227663;227664;227665;227666;227667;227668;227669;227670;227671;227672 291015;291016;291017;291018;291019;291020;291021;291022;291023;291024;291025;291026;291027;291028;291029 291022 1124 13 LAQANGWGVMVSHR Unmodified 1524.762 0.76196534 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 59.62 59.62 2;3 4.2377E-22 59370 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.67 140.39 47875000000 2805100000 3342400000 3736000000 3608200000 3060900000 1875300000 876880000 5186300000 5609900000 1904600000 6620600000 4291400000 4957300000 25039 1906 23537 227673;227674;227675;227676;227677;227678;227679;227680;227681;227682;227683;227684;227685;227686;227687;227688;227689;227690;227691;227692;227693;227694;227695;227696;227697 291030;291031;291032;291033;291034;291035;291036;291037;291038;291039;291040;291041;291042;291043;291044;291045;291046;291047;291048;291049;291050;291051;291052;291053;291054;291055;291056;291057;291058;291059;291060;291061;291062;291063;291064;291065;291066;291067;291068;291069;291070;291071;291072;291073;291074;291075;291076;291077;291078;291079;291080;291081 291055 52 LAQAPGLR Unmodified 824.48684 0.48683634 4232 Q9HCU4 CELSR2 Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 2 yes yes 0 0 0 1 24.903 24.903 2 0.06398 18447 QUIQUE_C1576_190116_001 52.299 13.278 43308000 0 0 0 0 0 0 43308000 0 0 0 0 0 0 25040 4232 23538 227698 291082 291082 1 LAQAWFNTHR Unmodified 1242.6258 0.62578944 3794 Q96A33 CCDC47 Coiled-coil domain-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 48.011 48.011 3 0.016925 45668 QUIQUE_C1218_190116_001 36.671 27.025 134180000 32282000 0 0 36829000 37678000 0 0 27395000 0 0 0 0 0 25041 3794 23539 227699;227700;227701;227702;227703 291083;291084;291085;291086;291087 291083 5 LAQDFLDSQNLSAYNTR Unmodified 1954.9385 0.93846896 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180;E9PQ14;E9PKK8;E9PPK9;E9PNX5 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.01 107.01 2 5.5748E-38 109320 QUIQUE_DMIX1_190116_001 204.35 164.56 946300000 91707000 73280000 78071000 74081000 72954000 52718000 91685000 68662000 60857000 45392000 69751000 73440000 93698000 25042 4330 23540 227704;227705;227706;227707;227708;227709;227710;227711;227712;227713;227714;227715;227716 291088;291089;291090;291091;291092;291093;291094;291095;291096;291097;291098;291099;291100;291101 291095 14 LAQDGAHVVVSSR Unmodified 1337.7052 0.70516197 4027 Q9BTZ2;F5GWZ1 DHRS4 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 21.101 21.101 2;3 1.0437E-09 14485 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.91 112.21 976670000 39575000 40441000 144710000 135240000 184980000 151920000 51889000 22118000 61131000 0 75259000 0 69400000 25043 4027 23541 227717;227718;227719;227720;227721;227722;227723;227724;227725;227726;227727;227728;227729;227730;227731;227732;227733 291102;291103;291104;291105;291106;291107;291108;291109;291110;291111;291112;291113;291114;291115;291116;291117;291118;291119;291120 291115 18 LAQDPFPLYPGEVLEK Unmodified 1814.9455 0.94545182 3086 Q14764;H3BQK6;H3BRL2;H3BUK7;H3BNF6 MVP Major vault protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 132.16 132.16 2 0.00051849 135162 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291143;291144;291145;291146;291147;291148;291149;291150;291151;291152;291153;291154;291155;291156;291157;291158;291159;291160;291161;291162;291163;291164;291165;291166;291167;291168;291169;291170;291171;291172;291173;291174;291175;291176;291177;291178;291179;291180;291181;291182;291183;291184 291154 42 LAQENGWGVMVSHR Oxidation (M) 1598.7624 0.76235927 1955 P09104;F5H0C8 ENO2 Gamma-enolase;Enolase yes no 0 1 0 1 2 1 1 44.96 44.96 2;3 0.00011911 41693 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.854 75.269 533870000 0 52432000 0 0 0 0 0 326940000 116520000 37983000 0 0 0 25048 1955 23545 227788;227789;227790;227791;227792 291185;291186;291187;291188;291189 291187 1211 3 LAQEQGGGDNSLLVR Unmodified 1555.7954 0.79543354 4449 Q9UID3 VPS51 Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 51.652 51.652 2 2.7363E-07 49825 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.09 62.111 124730000 60769000 0 0 0 0 0 24414000 0 0 0 0 0 39550000 25049 4449 23546 227793;227794;227795;227796;227797;227798 291190;291191;291192;291193;291194;291195;291196 291192 7 LAQFVEHWK Unmodified 1156.6029 0.60292873 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 3 52.438 52.438 1;2;3 0.00014966 51039 QUIQUE_C1438_190116_001 126.62 105.09 28464000000 2732500000 2700600000 1424500000 1324800000 2326900000 1142100000 2174100000 2638200000 924590000 1009400000 4527700000 1086600000 4451600000 25050 267;275;3025 23547 227799;227800;227801;227802;227803;227804;227805;227806;227807;227808;227809;227810;227811;227812;227813;227814;227815;227816;227817;227818;227819;227820;227821;227822;227823 291197;291198;291199;291200;291201;291202;291203;291204;291205;291206;291207;291208;291209;291210;291211;291212;291213;291214;291215;291216;291217;291218;291219;291220;291221;291222;291223;291224;291225;291226;291227;291228;291229 291211 32 LAQGEYVAPEK Unmodified 1203.6136 0.61355299 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.648 28.648 2 0.00054948 23389 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.48 49.773 717340000 0 87235000 103740000 94068000 0 0 0 0 90945000 0 120420000 120680000 100250000 25051 4476 23548 227824;227825;227826;227827;227828;227829;227830 291230;291231;291232;291233;291234;291235;291236 291233 7 LAQGHTTVDELAR Unmodified 1409.7263 0.72629134 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 1 1 1 2 1 2 2 28.333 28.333 2;3 2.2661E-41 22439 QUIQUE_C1563_190116_001 220.5 190.24 10065000000 363780000 766310000 585330000 440090000 604370000 565470000 614380000 1114000000 1191400000 496700000 1019000000 1196200000 1108000000 25052 3117 23549 227831;227832;227833;227834;227835;227836;227837;227838;227839;227840;227841;227842;227843;227844;227845;227846;227847;227848;227849;227850 291237;291238;291239;291240;291241;291242;291243;291244;291245;291246;291247;291248;291249;291250;291251;291252;291253;291254;291255;291256;291257;291258;291259;291260 291247 23 LAQHEAGLMDLR Unmodified 1352.6871 0.68706906 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 49.43 49.43 3 0.053778 47064 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.708 14.272 28289000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28289000 0 25053 1492 23550 227851 291261 291261 1 LAQIHIQQQDQCVEITEESK Unmodified 2396.1642 0.16418816 1669 O75935;X6RCK5 DCTN3 Dynactin subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.056 73.056 3 2.6485E-23 74455 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.96 114.55 405430000 35167000 50965000 93290000 0 43969000 66978000 0 39762000 0 29793000 0 45505000 0 25054 1669 23551 227852;227853;227854;227855;227856;227857;227858;227859;227860 291262;291263;291264;291265;291266;291267;291268;291269;291270 291268 8 LAQLEEAK Unmodified 900.49165 0.49164694 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.602 21.602 1;2 0.0036031 14675 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.89 28.624 7924300000 1251400000 834800000 724330000 462230000 641430000 588960000 540430000 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291297;291298 291297 2 LAQLSDPER Unmodified 1027.5298 0.52982336 4737 yes yes 0 0 0 1 24.804 24.804 2 0.052219 18050 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.127 7.003 27594000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27594000 0 0 0 + 25058 4737 23555 227882 291299 291299 1 LAQLVEK Unmodified 799.48035 0.48035398 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.932 22.932 2 0.019682 16316 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.63 23.051 495910000 73066000 0 0 78101000 0 0 0 66349000 98654000 0 0 99302000 80438000 25059 1384 23556 227883;227884;227885;227886;227887;227888 291300;291301;291302;291303;291304;291305 291303 6 LAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDR Unmodified 3128.5059 0.50594016 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 2 152.69 152.69 3;4 2.9758E-05 157546 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.237 41.142 214460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70311000 144150000 0 25060 50 23557 227889;227890;227891 291306;291307;291308 291307 2 LAQMCGLHIVVHADELEELINYYQDR Oxidation (M) 3144.5009 0.50085478 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 0 2 145.67 145.67 3;4 2.8066E-05 150325 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.286 42.743 89458000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89458000 0 25061 50 23557 227892;227893 291309;291310 291309 33 2 LAQMFSDMVLK Unmodified 1281.6461 0.64611545 1837 P02786;G3V0E5 TFRC Transferrin receptor protein 1;Transferrin receptor protein 1, serum form yes no 0 0 0 1 111.44 111.44 2 0.030682 116850 QUIQUE_C1438_190116_001 57.108 36.587 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25062 1837 23558 227894 291311 291311 1 LAQMSICSSLAR Oxidation (M) 1351.6588 0.6588054 1761 O95861;A6NF51;F8VVW8;F8VZG4;F8W1J0 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 1 0 1 1 46.793 46.793 2 0.0093968 44664 QUIQUE_C1218_190116_001 63.073 40.333 127930000 72834000 0 55092000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25063 1761 23559 227895;227896 291312;291313 291312 960 2 LAQMSICSSLAR Unmodified 1335.6639 0.66389078 1761 O95861;A6NF51;F8VVW8;F8VZG4;F8W1J0 BPNT1 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.945 70.945 2 6.8328E-05 69958 QUIQUE_C1563_190116_001 151.22 112.91 802170000 0 96071000 0 108790000 0 79029000 0 122650000 77145000 37946000 90617000 81848000 108070000 25064 1761 23559 227897;227898;227899;227900;227901;227902;227903;227904;227905;227906;227907;227908;227909 291314;291315;291316;291317;291318;291319;291320;291321;291322;291323;291324;291325;291326 291319 12 LAQNILSYLDLK Unmodified 1389.7868 0.78676633 4481 Q9UL15 BAG5 BAG family molecular chaperone regulator 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.38 140.38 2 1.4523E-09 146961 QUIQUE_C1438_190116_001 152.54 123.38 535080000 45284000 62514000 47742000 86997000 44692000 0 42132000 36932000 0 19446000 57105000 44475000 47761000 25065 4481 23560 227910;227911;227912;227913;227914;227915;227916;227917;227918;227919;227920 291327;291328;291329;291330;291331;291332;291333;291334;291335;291336;291337;291338;291339;291340 291334 13 LAQNPLFWK Unmodified 1115.6128 0.61276513 3250 Q53FT3;A0A087WYW7 C11orf73 Protein Hikeshi yes no 0 0 0 1 1 1 91.944 91.944 2 0.014839 94339 QUIQUE_C1277_190116_001 67.981 38.605 151300000 0 50160000 0 0 0 0 49734000 0 0 0 0 0 51409000 25066 3250 23561 227921;227922;227923 291341;291342;291343 291341 3 LAQPYVGVFLK Unmodified 1233.7121 0.71214483 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7EQF8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.78 103.78 2 0.0042022 107233 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.069 77.066 1176600000 0 72688000 106730000 66339000 80115000 0 110300000 129670000 143780000 0 177690000 150680000 138650000 25067 1324 23562 227924;227925;227926;227927;227928;227929;227930;227931;227932;227933 291344;291345;291346;291347;291348;291349;291350;291351;291352;291353;291354 291350 8 LAQQGSDLIVPAGGQR Unmodified 1608.8584 0.85836815 2622 P53367 ARFIP1 Arfaptin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 58.076 58.076 2 0.00021602 57119 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.803 63.586 167830000 0 0 0 0 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227951;227952;227953;227954;227955;227956;227957;227958;227959 291373;291374;291375;291376;291377;291378;291379;291380;291381;291382 291382 9 LAQQQAAAAAAAAAAASQQGSAK Unmodified 2054.0505 0.050479026 4086 Q9BZK7;A0A0D9SF63;A0A1B0GUU2;F8W9D8;C9IYU9;C9JLJ1;C9JCK0;C9JBN1;A0A0D9SF25 TBL1XR1 F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 76.927 76.927 3 0.0040789 77710 QUIQUE_C1403_190116_001 22.739 9.3118 208570000 0 0 47438000 44641000 0 0 0 0 30924000 0 48199000 0 37365000 25071 4086 23566 227960;227961;227962;227963;227964 291383;291384;291385;291386;291387 291384 2 LAQQQAALLMQQEER Unmodified 1755.8938 0.89376737 2996 Q13435;E9PPJ0;H0YCG1;E9PJ04;E9PJT3 SF3B2 Splicing factor 3B subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 75.866 75.866 2 1.7348E-06 76530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.55 97.694 39554000 0 0 0 0 39554000 0 0 0 0 0 0 0 0 25072 2996 23567 227965;227966;227967 291388;291389;291390 291390 2 LAQQSQALQELISELDR Unmodified 1941.0167 0.016719282 2148 P19474 TRIM21 E3 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227974;227975;227976;227977;227978;227979;227980;227981;227982;227983;227984;227985;227986;227987;227988;227989;227990;227991;227992;227993;227994;227995;227996;227997;227998;227999 291398;291399;291400;291401;291402;291403;291404;291405;291406;291407;291408;291409;291410;291411;291412;291413;291414;291415;291416;291417;291418;291419;291420;291421;291422;291423;291424;291425;291426;291427;291428 291402 29 LAQSEYQLLADIIPEHHQK Unmodified 2232.1539 0.15388147 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 106.42 106.42 4 0.051793 111765 QUIQUE_DMIX5_190116_001 12.82 8.3819 39369000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39369000 0 0 25076 173 23571 228000 291429 291429 1 LAQTFSPSIDILK Unmodified 1431.7973 0.79733102 3557 Q8IYQ7 THNSL1 Threonine synthase-like 1 yes yes 0 0 0 1 112.15 112.15 2 0.0076546 114181 QUIQUE_C1563_190116_001 62.466 44.993 32419000 0 0 0 0 0 32419000 0 0 0 0 0 0 0 25077 3557 23572 228001 291430 291430 1 LAQTLSTQLFQMVHTQR Unmodified 2001.0466 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N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.9 31.9 2 0.00062229 26959 QUIQUE_C1277_190116_001 98.943 65.392 928090000 103080000 75150000 81846000 71990000 70442000 55564000 43194000 53334000 72662000 26937000 106520000 71013000 96366000 25080 2641 23575 228020;228021;228022;228023;228024;228025;228026;228027;228028;228029;228030;228031;228032 291453;291454;291455;291456;291457;291458;291459;291460;291461;291462;291463;291464;291465;291466;291467;291468;291469 291455 17 LASALAGLIAK Unmodified 1026.6437 0.64373091 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 89.428 89.428 2 0.06322 92989 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.59 24.749 23863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23863000 0 0 25081 2882 23576 228033 291470 291470 0 LASALDLPLLR Unmodified 1180.718 0.71795849 2942 Q12768;E7EQI7 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 126.14 126.14 2 0.0002806 129814 QUIQUE_C1403_190116_001 120.12 99.249 211870000 15091000 16470000 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3.2581E-46 172952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.17 113.26 330700000 11488000 41159000 62690000 20575000 36042000 0 26251000 47004000 85492000 0 0 0 0 25089 4465 23584 228081;228082;228083;228084;228085;228086;228087;228088 291529;291530;291531;291532;291533;291534;291535;291536;291537 291535 9 LASEAKPAAVAAENEEIGSHIK Unmodified 2234.1543 0.1542754 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 50.598 50.598 3 6.2195E-06 48796 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.316 64.324 315040000 0 0 0 0 55417000 0 0 77079000 0 0 118470000 0 64081000 25090 4600 23585 228089;228090;228091;228092 291538;291539;291540;291541 291540 3 LASEEPPDDEEALATIR Unmodified 1854.8847 0.88470206 4392 Q9UBB4;B1AHE4 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.605 86.605 2 6.2785E-53 88104 QUIQUE_DMIX3_190116_001 182.1 135.37 946180000 59846000 122620000 66842000 66645000 76162000 69415000 74486000 59109000 75183000 36834000 81021000 75997000 82022000 25091 4392 23586 228093;228094;228095;228096;228097;228098;228099;228100;228101;228102;228103;228104;228105;228106 291542;291543;291544;291545;291546;291547;291548;291549;291550;291551;291552;291553;291554;291555;291556;291557;291558;291559;291560;291561;291562;291563;291564;291565;291566 291559 25 LASEILMQNWDAAMEDLTR Unmodified 2206.0398 0.039839264 2690 P60228;E5RGA2;E5RHS5 EIF3E Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 166.97 166.97 2;3 1.0081E-85 169082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.11 174.56 404950000 23308000 29156000 49265000 0 31189000 0 0 78007000 0 0 108620000 29069000 56343000 25092 2690 23587 228107;228108;228109;228110;228111;228112;228113;228114;228115;228116;228117 291567;291568;291569;291570;291571;291572;291573;291574;291575;291576;291577;291578;291579;291580 291576 10 LASELLEWIR Unmodified 1228.6816 0.68157298 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.28 138.28 2 1.7387E-07 144270 QUIQUE_C1576_190116_001 175.51 131.71 848590000 101960000 93285000 96825000 68463000 78330000 53919000 106040000 0 31553000 21319000 78702000 67190000 51005000 25093 2381 23588 228118;228119;228120;228121;228122;228123;228124;228125;228126;228127;228128;228129 291581;291582;291583;291584;291585;291586;291587;291588;291589;291590;291591;291592;291593;291594;291595;291596;291597 291589 17 LASEYNWGGPESSDKGDPFATLSAR Unmodified 2654.2249 0.22487416 949 E9PS17;E9PK59;Q96KG9;E9PPN3;H0YDH0 SCYL1 N-terminal kinase-like protein yes no 0 0 1 1 2 112.7 112.7 3 1.6801E-19 114982 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.06 101.61 48022000 0 0 0 0 0 0 0 48022000 0 0 0 0 0 25094 949 23589 228130;228131;228132 291598;291599;291600 291599 3 LASFYER Unmodified 884.43922 0.43921744 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.055 41.055 2 0.023173 37513 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.67 56.25 10496000000 0 1316600000 1145500000 0 1000000000 866670000 899240000 851060000 856270000 648430000 975780000 1096300000 839750000 25095 2414 23590 228133;228134;228135;228136;228137;228138;228139;228140;228141;228142;228143 291601;291602;291603;291604;291605;291606;291607;291608;291609;291610;291611;291612;291613;291614;291615;291616;291617;291618 291611 18 LASGCDGSEIPDEVK Unmodified 1575.7087 0.70865195 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 55.434 55.434 2 3.0188E-06 54108 QUIQUE_C1218_190116_001 140.14 122.08 451740000 88990000 95379000 70859000 0 0 76157000 0 41411000 50923000 28018000 0 0 0 25096 4417 23591 228144;228145;228146;228147;228148;228149;228150 291619;291620;291621;291622;291623;291624;291625 291619 7 LASGETVAAFCLTEPSSGSDAASIR Unmodified 2496.1802 0.18023215 2539 P49748 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 1 1 110.38 110.38 2;3 6.6207E-57 114027 QUIQUE_C1368_190116_001 200.94 182.8 536640000 71413000 0 90670000 61491000 0 83720000 71556000 0 73523000 26630000 0 25836000 31797000 25097 2539 23592 228151;228152;228153;228154;228155;228156;228157;228158;228159;228160;228161;228162;228163;228164;228165 291626;291627;291628;291629;291630;291631;291632;291633;291634;291635;291636;291637;291638;291639;291640;291641 291629 16 LASGVEGSDIPDDGK Unmodified 1458.6838 0.6838174 1746 O95747 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.524 45.524 2 7.1361E-12 40973 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.76 108.9 600330000 73621000 51986000 69440000 91385000 43221000 83936000 58480000 0 32776000 0 0 45084000 50406000 25098 1746 23593 228166;228167;228168;228169;228170;228171;228172;228173;228174;228175;228176 291642;291643;291644;291645;291646;291647;291648;291649;291650;291651;291652 291650 11 LASHLNLAMCHLK Unmodified 1506.7799 0.77992359 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 3 1 1 2 45.4 45.4 3;4 0.0016263 42314 QUIQUE_C1576_190116_001 48.229 36.437 968150000 62386000 71251000 71488000 51770000 116010000 101660000 187090000 129000000 0 32106000 58908000 86484000 0 25099 2876 23594 228177;228178;228179;228180;228181;228182;228183;228184;228185;228186;228187;228188;228189;228190;228191 291653;291654;291655;291656;291657;291658;291659;291660;291661;291662;291663;291664;291665;291666;291667;291668;291669;291670;291671;291672 291663 20 LASIFSGTGADPVVSAK Unmodified 1618.8566 0.85663681 1407 O00451;E5RGR6 GFRA2 GDNF family receptor alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 95.69 95.69 2 0.00070391 99541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.858 76.481 119810000 0 39621000 0 0 0 0 28448000 0 0 0 51740000 0 0 25100 1407 23595 228192;228193;228194;228195 291673;291674;291675;291676 291675 4 LASILTSAAR Unmodified 1001.5869 0.58694431 2963 Q13057;K7EN91;K7ES73;K7ESK6;K7EP09;K7EPT0 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 52.727 52.727 2 0.010045 50332 QUIQUE_C1563_190116_001 93.649 44.059 448780000 0 0 121640000 121220000 91420000 114500000 0 0 0 0 0 0 0 25101 2963 23596 228196;228197;228198;228199 291677;291678;291679;291680 291680 1 LASIYAAQNR Unmodified 1105.588 0.58800695 3357 Q6DKK2 TTC19 Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 34.002 34.002 2 0.043594 29493 QUIQUE_C1403_190116_001 49.96 15.153 63115000 0 0 0 25182000 0 0 0 0 0 0 0 0 37933000 25102 3357 23597 228200;228201 291681;291682 291681 2 LASLEELKR Unmodified 1057.6132 0.61315906 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 1 1 2 2 37.396 37.396 3 0.0075229 33905 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.841 22.492 57769000 0 0 0 38622000 0 0 0 0 0 0 0 0 19147000 25103 2096 23598 228202;228203;228204;228205;228206 291683;291684;291685;291686;291687 291685 4 LASLGLK Unmodified 700.44833 0.44832557 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 36.509 36.509 2 0.049128 32181 QUIQUE_C1438_190116_001 75.311 0 145990000 34118000 45250000 29604000 0 37015000 0 0 0 0 0 0 0 0 25104 3871 23599 228207;228208;228209;228210 291688;291689;291690;291691 291691 4 LASLMNLGMSSSLNQQGAHSALSSASTSSHNLQSIFNIGSR Unmodified 4203.0437 0.043702449 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991;D6R8Z5;D6RCM3;D6REK4 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 138.86 138.86 3;4 1.0555E-244 142246 QUIQUE_DMIX1_190116_001 215.7 206.81 1124700000 0 0 0 0 51826000 0 0 298320000 164890000 0 214400000 138860000 256370000 25105 307 23600 228211;228212;228213;228214;228215;228216;228217 291692;291693;291694;291695;291696;291697;291698 291693 7 LASLMNLGMSSSLNQQGAHSALSSASTSSHNLQSIFNIGSR Oxidation (M) 4219.0386 0.038617071 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991;D6R8Z5;D6RCM3;D6REK4 MATR3 Matrin-3 yes no 0 1 0 1 131.95 131.95 4 3.9414E-143 138818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 173.94 161.35 150650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 150650000 0 0 25106 307 23600 228218 291699 291699 228 1 LASLTPGFSGADVANVCNEAALIAAR Unmodified 2587.3064 0.30643572 4612 Q9Y4W6 AFG3L2 AFG3-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 143.57 143.57 2;3 2.1362E-30 149491 QUIQUE_C1218_190116_001 125.52 98.494 333050000 0 83344000 51888000 44592000 0 65087000 37885000 0 50259000 0 0 0 0 25107 4612 23601 228219;228220;228221;228222;228223;228224;228225;228226 291700;291701;291702;291703;291704;291705;291706;291707 291700 8 LASMLETLR Unmodified 1032.5638 0.56376603 937 E9PIE3;Q969G5 PRKCDBP Protein kinase C delta-binding protein yes no 0 0 0 1 1 77.293 77.293 2 0.045954 79266 QUIQUE_C1438_190116_001 51.864 7.0971 52533000 0 0 0 0 52533000 0 0 0 0 0 0 0 0 25108 937 23602 228227;228228 291708;291709 291708 2 LASNYISK Unmodified 894.48108 0.48108226 3351 Q68D91 MBLAC2 Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 23.749 23.749 2 0.057844 17401 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.754 21.399 39874000 0 0 0 0 0 0 0 39874000 0 0 0 0 0 25109 3351 23603 228229 291710 291710 1 LASPIHPDVVMLIAFPGDILMR Unmodified 2404.3011 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amino acid transporter 2;Amino acid transporter no no 0 1 0 1 1 1 1 2 1 160.07 160.07 3 4.2311E-06 163476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.352 63.582 855240000 0 27059000 50959000 134900000 0 0 0 196490000 0 0 216500000 229340000 0 25111 2458;417 23604 228242;228243;228244;228245;228246;228247;228248 291723;291724;291725;291726;291727;291728;291729;291730 291726 297;298 8 LASPIHPDVVMLIAFPGDILMR 2 Oxidation (M) 2436.2909 0.29090899 2458;417 P43004;A0A2R8YFE3;A0A2U3TZS7;A0A2R8Y4W1;A0A2R8Y860;A0A2R8YD46;A0A2U3U0E3;A0A2R8YG01;A0A163QEF0;H0YEK4;A0A2R8Y6B8;A0A2R8Y6J5;A0A2R8Y862;A0A2R8Y740;A0A2R8Y5Y1;A0A2R8Y642;C9J9N5;A0A2R8YH93;A0A2R8Y4D1 SLC1A2 Excitatory amino acid transporter 2;Amino acid transporter no no 0 2 0 1 1 1 1 153.01 153.01 3 2.0996E-05 157912 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.522 57.245 221660000 0 0 0 0 0 0 0 42584000 65927000 0 59459000 53691000 0 25112 2458;417 23604 228249;228250;228251;228252 291731;291732;291733;291734 291732 297;298 4 LASPSGSTSSGLEVVAPEGTSAPGGGPGTLDDSATICR Unmodified 3557.6791 0.67914932 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 0 1 1 110.62 110.62 3 1.8955E-11 114510 QUIQUE_C1218_190116_001 65.08 55.283 46148000 46148000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25113 2983 23605 228253;228254 291735;291736 291735 2 LASQANIAQVLAELK Unmodified 1567.8934 0.89335667 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 135.43 135.43 2;3 1.9405E-60 132488 QUIQUE_DMIX4_190116_001 202.29 170.45 12768000000 1112800000 1218300000 1132100000 1212200000 1363300000 973230000 1149300000 586200000 921740000 655160000 86929000 1156500000 1200100000 25114 2777;2938 23606 228255;228256;228257;228258;228259;228260;228261;228262;228263;228264;228265;228266;228267;228268;228269;228270;228271;228272;228273;228274;228275;228276;228277;228278;228279 291737;291738;291739;291740;291741;291742;291743;291744;291745;291746;291747;291748;291749;291750;291751;291752;291753;291754;291755;291756;291757;291758;291759;291760;291761;291762;291763;291764 291759 24 LASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVR Unmodified 2991.5553 0.55531642 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 1 2 170.79 170.79 3;4 4.5716E-126 178165 QUIQUE_DMIX5_190116_001 190.19 178.11 458160000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 458160000 0 0 25115 2777;2938 23607 228280;228281 291765;291766 291766 2 LASQANIAQVLAELKEYATEVDVDFVRK Unmodified 3119.6503 0.65027944 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 2 1 167.15 167.15 4 1.6525E-18 169096 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.849 80.129 37789000 0 0 0 0 0 0 0 37789000 0 0 0 0 0 25116 2777;2938 23608 228282 291767 291767 1 LASQGDSISSQLGPIHPPPR Unmodified 2056.0702 0.070151836 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R0I5 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 69.894 69.894 3 8.441E-07 69807 QUIQUE_C1277_190116_001 90.654 76.194 41944000 0 41944000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25117 3770 23609 228283;228284;228285;228286;228287;228288 291768;291769;291770;291771;291772;291773 291769 6 LASQLGVYK Unmodified 977.55458 0.55458155 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;I3L2P5;A0A0G2JRJ1;I3L3W0 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.865 40.865 2 0.00164 37260 QUIQUE_C1576_190116_001 101.64 48.96 1023300000 102560000 95538000 85337000 89408000 0 88078000 90374000 109660000 69782000 63943000 74063000 73208000 81392000 25118 366 23610 228289;228290;228291;228292;228293;228294;228295;228296;228297;228298;228299;228300 291774;291775;291776;291777;291778;291779;291780;291781;291782;291783;291784;291785;291786 291780 12 LASQNFSYGVTEMYK Unmodified 1736.808 0.80797206 750 C9JVN9;Q9H9P8 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phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 22.937 22.937 2 0.023146 16273 QUIQUE_C1438_190116_001 57.249 41.402 90548000 52572000 0 0 0 37975000 0 0 0 0 0 0 0 0 25122 1467 23614 228346;228347 291860;291861 291861 2 LASVLGSEPSLDSEVTSK Unmodified 1817.9258 0.92583859 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180;E9PQ14 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 93.46 93.46 2 1.3955E-08 90109 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.08 99.724 40736000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40736000 0 0 0 25123 4330 23615 228348 291862 291862 1 LASVLLYSDYGIGEVPVEPLDVPLPSTIRPASPVAGSPK Unmodified 4003.1558 0.15578553 2963 Q13057;K7EN91 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 1 2 157.58 157.58 3;4 2.1199E-06 160107 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.465 51.061 69021000 0 0 0 0 0 0 0 69021000 0 0 0 0 0 25124 2963 23616 228349;228350 291863;291864 291864 2 LASVPAGGAVAVSAAPGSAAPAAGSAPAAAEEK Unmodified 2773.4246 0.4246366 1887 P05387;H0YDD8 RPLP2 60S acidic ribosomal protein P2 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Unmodified 1382.7518 0.75177781 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 55.283 55.283 2;3 0.00071621 53776 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.924 49.52 277870000 0 0 0 0 55978000 0 0 47680000 64894000 0 0 47703000 61614000 25135 3779 23626 228479;228480;228481;228482;228483;228484;228485;228486;228487 292026;292027;292028;292029;292030;292031;292032;292033;292034;292035;292036 292029 10 LATELYHQK Unmodified 1101.5819 0.58185893 2900 Q06210 GFPT1 Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 21.19 21.19 3 0.0036386 14422 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.332 49.917 473500000 51949000 0 0 0 86720000 52770000 70228000 25038000 50630000 0 90643000 45525000 0 25136 2900 23627 228488;228489;228490;228491;228492;228493;228494;228495 292037;292038;292039;292040;292041;292042;292043;292044;292045 292042 9 LATFVTQALIQLYAR Unmodified 1706.9719 0.97194134 4447 Q9UIA9;E7ESC6;H0YBE1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 156.99 156.99 2 0.0036559 162042 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292234 6 LATMMVQGQEYEAGGSVIHPLNLHMK Unmodified 2853.3976 0.39757568 4435 Q9UHG3;F8W8W4 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 101.76 101.76 3 6.4758E-11 104545 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.807 72.731 59598000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59598000 0 25146 4435 23636 228606;228607;228608 292235;292236;292237 292237 3 LATMPPMVEGEGLASR Unmodified 1657.8168 0.81676261 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 94.057 94.057 2;3 1.7633E-13 94929 QUIQUE_C1563_190116_001 137.16 117.4 2001000000 229740000 221620000 214720000 169360000 0 166030000 264320000 124170000 0 50809000 221600000 164150000 174450000 25147 902;1255;2856;1134 23637 228609;228610;228611;228612;228613;228614;228615;228616;228617;228618;228619;228620;228621;228622;228623;228624;228625;228626;228627 292238;292239;292240;292241;292242;292243;292244;292245;292246;292247;292248;292249;292250;292251;292252;292253;292254;292255;292256;292257;292258;292259;292260;292261;292262;292263;292264;292265;292266;292267;292268;292269;292270;292271;292272 292257 35 LATMPPMVEGEGLASR Oxidation (M) 1673.8117 0.81167723 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.161 73.161 2 1.36E-09 73633 QUIQUE_C1277_190116_001 128.67 110.87 790300000 0 91789000 0 70678000 46718000 44006000 66954000 0 81703000 63426000 111100000 100540000 113380000 25148 902;1255;2856;1134 23637 228628;228629;228630;228631;228632;228633;228634;228635;228636;228637 292273;292274;292275;292276;292277;292278;292279;292280;292281;292282;292283;292284;292285;292286;292287 292274 542;543 15 LATMPPMVEGEGLASR 2 Oxidation (M) 1689.8066 0.80659185 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 2 0 1 1 1 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292292;292293;292294;292295;292296;292297;292298;292299;292300;292301 292300 7 LATPEDKQDIDK Unmodified 1371.6882 0.6881745 3970 Q99719;E7EX32;E7EQM7 SEPT5 Septin-5 yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 1 2 2 2 2 20.11 20.11 2;3 1.6238E-13 12834 QUIQUE_C1368_190116_001 165.63 95.678 3210200000 121360000 505790000 107790000 447660000 119290000 100900000 361200000 67401000 304300000 0 319010000 272700000 482770000 25152 3970 23640 228651;228652;228653;228654;228655;228656;228657;228658;228659;228660;228661;228662;228663;228664;228665;228666;228667;228668;228669 292302;292303;292304;292305;292306;292307;292308;292309;292310;292311;292312;292313;292314;292315;292316;292317;292318;292319;292320;292321;292322 292306 20 LATPEDKQDIDKQYVGFATLPNQVHR Unmodified 2982.5199 0.51993397 3970 Q99719;E7EX32;E7EQM7 SEPT5 Septin-5 yes no 0 0 2 1 1 82.18 82.18 5 0.020891 82811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.827 19.923 200910000 0 0 0 0 0 0 0 115080000 0 0 0 85830000 0 25153 3970 23641 228670;228671 292323;292324 292323 1 LATPGLMIR Oxidation (M) 986.55829 0.55828672 2074 P14415 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes yes 0 1 0 1 60.271 60.271 2 0.022051 59697 QUIQUE_C1218_190116_001 64.207 24.561 68781000 68781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25154 2074 23642 228672 292325 292325 1 LATPGLMIR Unmodified 970.56337 0.5633721 2074 P14415 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.794 70.794 2 0.00040237 70810 QUIQUE_C1576_190116_001 121.99 59.275 2545300000 584760000 372440000 0 427260000 218980000 350140000 285970000 80665000 0 56600000 168510000 0 0 25155 2074 23642 228673;228674;228675;228676;228677;228678;228679;228680;228681 292326;292327;292328;292329;292330;292331;292332;292333;292334;292335;292336 292333 10 LATPGLMIRPK Unmodified 1195.7111 0.71109897 2074 P14415 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 51.845 51.845 2;3 0.00029171 50181 QUIQUE_DMIX7_190116_001 87.298 83.978 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292419 2449 69 LATPTYGDLNHLVSATMSGVTTSLR Unmodified 2604.3218 0.32175143 3006 Q13509;A0A0B4J269;G3V2A3 TUBB3 Tubulin beta-3 chain yes no 0 0 0 3 5 5 6 6 6 4 5 5 6 3 3 6 153.94 153.94 2;3;4 0 159314 QUIQUE_C1218_190116_001 358.57 332.85 251780000000 11222000000 34694000000 13392000000 28067000000 16005000000 18356000000 14454000000 12435000000 13372000000 3918200000 12835000000 24346000000 48683000000 25159 3006 23644 228750;228751;228752;228753;228754;228755;228756;228757;228758;228759;228760;228761;228762;228763;228764;228765;228766;228767;228768;228769;228770;228771;228772;228773;228774;228775;228776;228777;228778;228779;228780;228781;228782;228783;228784;228785;228786;228787;228788;228789;228790;228791;228792;228793;228794;228795;228796;228797;228798;228799;228800;228801;228802;228803;228804;228805;228806;228807;228808;228809;228810;228811;228812 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2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 2 160.75 160.75 2;3 6.0406E-24 166186 QUIQUE_C1218_190116_001 140.08 119.96 241200000 40746000 19929000 27536000 0 0 15560000 0 52682000 34122000 7830400 0 0 42794000 25162 2319 23647 228841;228842;228843;228844;228845;228846;228847;228848;228849;228850;228851;228852 292574;292575;292576;292577;292578;292579;292580;292581;292582;292583;292584;292585 292574 11 LATTILQHWK Unmodified 1209.687 0.68699271 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 62.017 62.017 3 0.011038 61296 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.927 35.673 54783000 0 0 0 0 0 0 0 0 27109000 0 0 27674000 0 25163 2813 23648 228853;228854 292586;292587;292588;292589 292586 4 LATTLWLR Unmodified 972.57565 0.57565135 3630 Q8NC44;F8WE68;F8WAL5 FAM134A Protein FAM134A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.115 89.115 2 0.0036775 90333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.65 53.61 130290000 17337000 21562000 19073000 0 0 16512000 0 20107000 24163000 11534000 0 0 0 25164 3630 23649 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292726 610 LAVEAVLR Unmodified 869.53345 0.53345218 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.994 62.994 2 0.00017659 62373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.34 34.857 2165900000 190400000 167930000 135510000 122010000 194730000 133970000 175870000 185560000 149610000 114070000 242450000 176910000 176870000 25170 2810 23655 229398;229399;229400;229401;229402;229403;229404;229405;229406;229407;229408;229409;229410 293346;293347;293348;293349;293350;293351;293352;293353;293354;293355;293356;293357;293358;293359;293360;293361;293362;293363;293364;293365 293358 20 LAVEILNK Unmodified 898.54877 0.54876789 2149 P19525;C9JZT2;F8WBH4 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.126 60.126 2 0.010748 59403 QUIQUE_C1277_190116_001 90.862 33.527 405100000 0 46668000 60847000 46638000 0 36657000 0 0 58042000 0 96371000 0 59878000 25171 2149 23656 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membrane calcium-transporting ATPase 1;Calcium-transporting ATPase;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 no no 0 0 0 1 30.235 30.235 2 0.060613 25205 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.234 18.695 53024000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53024000 0 0 25183 470;2158;2222 23667 229638 293716 293716 1 LAVTSYNDIQDLMDSGNK Unmodified 1982.9255 0.92552101 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;F8W8V9;H7C0K6 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 124.68 124.68 2 3.2822E-14 131118 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.64 100.11 43281000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43281000 0 0 25184 497 23668 229639;229640 293717;293718 293718 1 LAVVDEWR Unmodified 986.51853 0.5185304 3652 Q8NFW8 CMAS N-acylneuraminate cytidylyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.235 75.235 2 0.018262 76172 QUIQUE_C1277_190116_001 80.229 53.365 432340000 58262000 47738000 65087000 53198000 37389000 65188000 0 0 0 0 45395000 31020000 29060000 25185 3652 23669 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167.29 3 1.0503E-05 171934 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.544 89.351 184640000 0 0 0 0 0 0 0 0 58331000 0 48796000 55580000 21936000 25190 3777 23674 229680;229681;229682;229683 293765;293766;293767;293768 293765 4 LAWGQPVGLR Unmodified 1095.6189 0.61891314 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;H7C0R3;A0A0U1RQX5;A0A0U1RRC8;A0A0U1RQX9 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.453 83.453 2 0.003115 84684 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.352 69.458 449850000 0 0 67063000 45858000 55246000 38408000 0 51406000 53095000 0 64774000 0 74000000 25191 2496 23675 229684;229685;229686;229687;229688;229689;229690;229691 293769;293770;293771;293772;293773;293774;293775;293776;293777;293778 293778 7 LAWPPLLTADSGYYVLELVPSAQPGAAR Unmodified 2954.5542 0.55419421 3388 Q6PCB0 VWA1 von Willebrand factor A domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 170.51 170.51 3 0.00031916 172338 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.625 34.049 35432000 0 0 0 0 0 0 0 35432000 0 0 0 0 0 25192 3388 23676 229692 293779 293779 1 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Oxidation (M) 2618.3778 0.37780975 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 167.07 167.07 2;3 3.2417E-29 171896 QUIQUE_C1218_190116_001 126.63 108.93 1411400000 20101000 43876000 47678000 39898000 39786000 21174000 29951000 430030000 324770000 15610000 220640000 41076000 136790000 25201 2197 23685 229769;229770;229771;229772;229773;229774;229775;229776;229777;229778;229779;229780;229781;229782;229783;229784 293870;293871;293872;293873;293874;293875;293876;293877;293878;293879;293880;293881;293882;293883;293884;293885;293886 293870 1547 17 LAYVAAGDLAPINAFIGGLAAQEVMK Unmodified 2602.3829 0.38289512 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 169.15 169.15 2;3 1.597E-29 162901 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.39 114.49 8738500000 403890000 896520000 554920000 84228000 940680000 400410000 1118200000 779170000 835080000 117990000 943570000 782980000 880890000 25202 2197 23685 229785;229786;229787;229788;229789;229790;229791;229792;229793;229794;229795;229796;229797;229798;229799;229800;229801;229802;229803;229804;229805;229806;229807;229808;229809 293887;293888;293889;293890;293891;293892;293893;293894;293895;293896;293897;293898;293899;293900;293901;293902;293903;293904;293905;293906;293907;293908;293909;293910;293911;293912;293913 293906 27 LAYYSTVQHK Unmodified 1208.619 0.61897272 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;A0A0G2JQS7;D6RJF3 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 23.102 23.102 2;3 0.0012409 16127 QUIQUE_C1563_190116_001 100.02 79.147 765000000 28040000 76012000 96052000 0 103930000 43326000 101890000 27210000 138100000 9830500 0 34421000 106180000 25203 4304 23686 229810;229811;229812;229813;229814;229815;229816;229817;229818;229819;229820;229821 293914;293915;293916;293917;293918;293919;293920;293921;293922;293923;293924;293925 293918 11 LCAAAASILGK Unmodified 1073.5903 0.59031513 2301 P30046;J3KQ18;B5MC82;A6NHG4 DDT;DDTL D-dopachrome decarboxylase;D-dopachrome decarboxylase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.404 64.404 2 0.0021332 64273 QUIQUE_C1277_190116_001 80.231 54.059 3216200000 387870000 392670000 0 249770000 307670000 374000000 396480000 107990000 211140000 188930000 274470000 0 325210000 25204 2301 23687 229822;229823;229824;229825;229826;229827;229828;229829;229830;229831;229832 293926;293927;293928;293929;293930;293931;293932;293933;293934;293935;293936 293927 8 LCAAAASILGKPADR Unmodified 1512.8082 0.80824683 2301 P30046;J3KQ18;B5MC82;A6NHG4 DDT;DDTL D-dopachrome decarboxylase;D-dopachrome decarboxylase-like protein yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 1 55.473 55.473 2;3 7.3901E-05 53734 QUIQUE_C1403_190116_001 89.541 69.963 3187700000 0 194620000 140010000 73669000 0 55735000 220380000 527410000 484440000 34343000 578800000 389580000 488750000 25205 2301 23688 229833;229834;229835;229836;229837;229838;229839;229840;229841;229842;229843;229844;229845;229846;229847;229848;229849 293937;293938;293939;293940;293941;293942;293943;293944;293945;293946;293947;293948;293949;293950;293951;293952;293953 293941 14 LCAAHLPTESDAPNHYQAVCR Unmodified 2409.0954 0.095397083 2929 Q08AE8;K7EQR2;K7ENV1;C9JYR7 SPIRE1 Protein spire homolog 1 yes no 0 0 0 1 153.58 153.58 3 0.062157 158235 QUIQUE_DMIX7_190116_001 22.01 13.41 79791000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79791000 0 25206 2929 23689 229850 293954 293954 1 LCALLYGDAEKPAESGGSQPPR Unmodified 2315.1216 0.12159506 2894 Q05329;Q5VZ31 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.906 65.906 3 6.3898E-28 65657 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.73 97.943 1667900000 160140000 152220000 116520000 116210000 102940000 163730000 158650000 122180000 115930000 38266000 103820000 119730000 197570000 25207 2894 23690 229851;229852;229853;229854;229855;229856;229857;229858;229859;229860;229861;229862;229863 293955;293956;293957;293958;293959;293960;293961;293962;293963;293964;293965;293966;293967;293968;293969;293970;293971;293972;293973;293974;293975;293976 293971 22 LCAQEAEALR Unmodified 1159.5656 0.56555694 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 41.625 41.625 2 0.0040451 37868 QUIQUE_C1563_190116_001 100.98 62.851 391550000 0 54331000 83124000 61340000 53028000 108710000 0 0 0 0 0 0 31021000 25208 16;1475 23691 229864;229865;229866;229867;229868;229869 293977;293978;293979;293980;293981;293982;293983 293981 7 LCAQEAEALRR Unmodified 1315.6667 0.66666797 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 1 1 29.737 29.737 3 0.0037668 24627 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.676 28.345 88017000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 88017000 0 0 25209 16;1475 23692 229870 293984 293984 1 LCATQFNNIFFLD Unmodified 1601.7548 0.75481428 2833 P86791;P86790 CCZ1;CCZ1B Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog;Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 168.01 168.01 2 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294023;294024;294025;294026;294027;294028 294025 6 LCCTGQWEDAQK Unmodified 1494.6231 0.62314818 891;3518 E9PAM4;H7BY76;Q86XE5 HOGA1 4-hydroxy-2-oxoglutarate aldolase, mitochondrial no no 0 0 0 1 40.733 40.733 2 0.0040924 37288 QUIQUE_C1368_190116_001 84.17 74.217 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25215 891;3518 23698 229906 294029 294029 1 LCDAVAVLLNMR Unmodified 1373.7159 0.71592635 2507 P48449;A0A0G2JQD0 LSS Lanosterol synthase yes no 0 0 0 1 1 1 138.78 138.78 2 0.010722 143617 QUIQUE_C1403_190116_001 65.347 0.041704 36541000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36541000 25216 2507 23699 229907;229908;229909 294030;294031;294032 294031 3 LCDCPGLIFPSLLPR Unmodified 1756.9004 0.90043266 2401 P36915;A0A140T8Y2 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 147.03 147.03 2 1.2002E-05 154105 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.82 100.4 304910000 0 0 0 0 0 0 106810000 31061000 48256000 0 58169000 60620000 0 25217 2401 23700 229910;229911;229912;229913;229914;229915;229916;229917 294033;294034;294035;294036;294037;294038;294039;294040 294039 8 LCDDGPQLPTSPR Unmodified 1454.6824 0.68237762 1580 O60504;H0YAZ3;H0YB51 SORBS3 Vinexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.807 57.807 2 9.3674E-09 56963 QUIQUE_C1576_190116_001 143.97 110.71 383320000 33276000 33524000 41435000 40197000 39564000 33992000 37535000 30743000 28206000 0 33131000 31719000 0 25218 1580 23701 229918;229919;229920;229921;229922;229923;229924;229925;229926;229927;229928 294041;294042;294043;294044;294045;294046;294047;294048;294049;294050;294051;294052 294047 9 LCDEQLSSQSHYDFGLR Unmodified 2053.9164 0.91635331 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 82.617 82.617 2;3 6.5139E-63 84983 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.4 175.2 1144700000 0 43691000 188750000 92149000 0 17062000 0 105590000 145700000 66991000 179400000 160340000 145040000 25219 3053 23702 229929;229930;229931;229932;229933;229934;229935;229936;229937;229938;229939;229940;229941 294053;294054;294055;294056;294057;294058;294059;294060;294061;294062;294063;294064;294065 294061 11 LCDFGISGQLVDSIAK Unmodified 1721.8658 0.86582129 2474 P45985 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.12 134.12 2 0.00025408 138363 QUIQUE_C1403_190116_001 92.925 77.296 487380000 0 176420000 0 0 0 108510000 0 0 202440000 0 0 0 0 25220 2474 23703 229942;229943;229944;229945;229946;229947;229948;229949;229950 294066;294067;294068;294069;294070;294071;294072;294073;294074;294075 294069 9 LCDFGSAK Unmodified 896.4062 0.40620276 2550;2551 P49840;A8MT37;P49841;A0A3B3ITW1 GSK3A;GSK3B Glycogen synthase kinase-3 alpha;Glycogen synthase kinase-3 beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.599 24.599 2 0.0036031 18093 QUIQUE_C1277_190116_001 113.89 53.531 526310000 107990000 105020000 0 77099000 80606000 83610000 0 0 71984000 0 0 0 0 25221 2550;2551 23704 229951;229952;229953;229954;229955;229956 294076;294077;294078;294079;294080;294081 294077 5 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230000;230001;230002;230003;230004;230005;230006;230007;230008;230009;230010;230011;230012;230013;230014;230015;230016;230017;230018;230019;230020;230021;230022;230023;230024 294132;294133;294134;294135;294136;294137;294138;294139;294140;294141;294142;294143;294144;294145;294146;294147;294148;294149;294150;294151;294152;294153;294154;294155;294156;294157;294158;294159;294160;294161;294162;294163;294164;294165;294166;294167;294168;294169;294170 294165 37 LCEGSSFR Unmodified 954.42292 0.42291545 3280 Q5JVZ5;Q96JJ3;H0YCM7;Q5JW01 ELMO2 Engulfment and cell motility protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.823 22.823 2 0.026319 15728 QUIQUE_C1277_190116_001 70.69 18.007 302090000 0 83753000 0 0 0 52526000 0 0 0 31471000 63344000 70999000 0 25228 3280 23711 230025;230026;230027;230028;230029 294171;294172;294173;294174;294175 294171 5 LCEIFTR Unmodified 937.46914 0.46913736 310;830;1060 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;E3W994;J3KR49;O75122;F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP2;CLASP1 CLIP-associating protein 2;CLIP-associating protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 54.643 54.643 2 0.04818 53471 QUIQUE_C1576_190116_001 76.134 22.949 204640000 0 0 0 0 0 0 69640000 0 60440000 0 0 74564000 0 25229 310;830;1060 23712 230030;230031;230032 294176;294177;294178 294176 3 LCELLSAQF Unmodified 1079.5321 0.53213155 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 1 1 130.9 130.9 1;2 0.0060178 137313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.359 69.861 163160000 0 0 0 0 0 0 80086000 0 0 0 40760000 42309000 0 25230 1701 23713 230033;230034;230035;230036 294179;294180;294181;294182 294181 2 LCELTIPLAIENFLR Unmodified 1800.9808 0.98079147 814 D6RCC4;D6RCC9;Q8NEC7;D6R9W2 GSTCD Glutathione S-transferase C-terminal domain-containing protein yes no 0 0 0 1 168.99 168.99 2 0.0045213 170908 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.848 59.69 8247700 0 0 0 0 0 0 0 8247700 0 0 0 0 0 25231 814 23714 230037 294183 294183 1 LCELYAK Unmodified 895.44734 0.44733929 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 2 29.59 29.59 2 0.019333 25667 QUIQUE_C1218_190116_001 114.59 0 8350200000 685990000 978570000 962660000 133350000 748340000 863370000 775880000 664820000 1125200000 325620000 144250000 942230000 0 25232 2261 23715 230038;230039;230040;230041;230042;230043;230044;230045;230046;230047;230048;230049;230050;230051;230052;230053;230054 294184;294185;294186;294187;294188;294189;294190;294191;294192;294193;294194;294195;294196;294197;294198;294199;294200;294201;294202 294185 19 LCENIAGHLK Unmodified 1153.5914 0.59137776 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 29.637 29.637 2;3 0.0095482 24386 QUIQUE_C1277_190116_001 77.379 56.509 1682200000 40104000 219970000 193880000 235140000 126660000 122870000 204690000 0 194810000 0 65814000 218620000 59648000 25233 1849 23716 230055;230056;230057;230058;230059;230060;230061;230062;230063;230064;230065;230066;230067;230068;230069;230070;230071 294203;294204;294205;294206;294207;294208;294209;294210;294211;294212;294213;294214;294215;294216;294217;294218;294219 294205 9 LCETVMAQILEHLK Unmodified 1683.8688 0.86879818 3458 Q7Z3J2;E7EWW0;C9J7I2;F5H7K1;H3BV68 C16orf62 UPF0505 protein C16orf62 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 136.46 136.46 3 0.0011294 142361 QUIQUE_C1218_190116_001 55.213 49.433 119690000 16853000 0 0 20503000 19199000 0 0 0 15800000 0 0 25202000 22128000 25234 3458 23717 230072;230073;230074;230075;230076;230077 294220;294221;294222;294223;294224;294225 294220 5 LCFEGLR Unmodified 893.44292 0.44292261 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.921 65.921 2 0.0096243 65920 QUIQUE_C1277_190116_001 150.07 59.129 5560000000 299660000 378060000 487640000 196230000 399420000 231550000 648090000 558930000 519480000 199680000 675340000 527520000 438410000 25235 3117 23718 230078;230079;230080;230081;230082;230083;230084;230085;230086;230087;230088;230089;230090 294226;294227;294228;294229;294230;294231;294232;294233;294234;294235;294236;294237;294238 294227 13 LCFKENAEQGEVDMESHR Unmodified 2177.947 0.94700151 2071 P14209 CD99 CD99 antigen yes yes 0 0 1 1 52.43 52.43 3 0.0086495 50023 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.876 35.06 27125000 0 0 0 0 0 0 0 27125000 0 0 0 0 0 25236 2071 23719 230091 294239 294239 1 LCFSTAQHAS Unmodified 1120.4971 0.49714303 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.247 34.247 2 0.00030342 30252 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.49 107.55 3171200000 261990000 336050000 189640000 292260000 295180000 206590000 230200000 194030000 229220000 102810000 268810000 293150000 271320000 25237 2082 23720 230092;230093;230094;230095;230096;230097;230098;230099;230100;230101;230102;230103;230104 294240;294241;294242;294243;294244;294245;294246;294247;294248;294249;294250;294251;294252;294253;294254;294255 294249 14 LCFVGLMSMIDPPR Unmodified 1634.7983 0.79827577 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.99 158.99 2 0.00019577 165811 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.55 103.12 271780000 41616000 20752000 71791000 28737000 0 0 0 34127000 0 0 74752000 0 0 25238 590 23721 230105;230106;230107;230108;230109;230110;230111 294256;294257;294258;294259;294260;294261;294262 294262 7 LCGDLVSCFQER Unmodified 1482.6595 0.65953368 241 A0A0C4DGG1;Q9UKS6;E9PIY1;E9PJ75;E9PNM9;E9PJ33 PACSIN3 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3 yes no 0 0 0 1 1 90.152 90.152 2 0.012741 87215 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.721 50.941 51214000 0 32614000 0 0 0 0 0 0 0 18599000 0 0 0 25239 241 23722 230112;230113 294263;294264;294265 294264 3 LCGDTSLNNMQR Oxidation (M) 1423.6184 0.61839715 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.217 23.217 2 4.4028E-05 16331 QUIQUE_C1368_190116_001 127.76 103.54 312010000 31977000 37958000 43318000 37437000 46446000 33339000 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Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.61 115.61 3 9.1913E-05 120516 QUIQUE_C1438_190116_001 89.629 77.938 260540000 18978000 21555000 34974000 23154000 21375000 24056000 26524000 23806000 25313000 10606000 30194000 0 0 25243 3555 23725 230138;230139;230140;230141;230142;230143;230144;230145;230146;230147;230148;230149 294292;294293;294294;294295;294296;294297;294298;294299;294300;294301;294302;294303 294296 10 LCIAMIDTGK Unmodified 1120.5621 0.56205147 108 A0A087X1H5;Q15057;A0A0U1RQT1 ACAP2 Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 82.146 82.146 2 0.018027 85020 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.614 28.613 21173000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21173000 0 0 25244 108 23726 230150;230151 294304;294305 294304 2 LCIGNITNKK Unmodified 1159.6383 0.63832796 387 F5GYH1;A0A1W2PRM0;A0A1W2PRL5;A0A1W2PR09;Q8NC96;A0A1W2PNT6;F5H2U7 NECAP1 Adaptin ear-binding coat-associated protein 1 yes no 0 0 1 1 1 29.712 29.712 3 0.0036764 23829 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LCLLLTLPR Unmodified 1097.6631 0.66308614 145 A0A0A0MRE6;O94967;E9PR96;E9PN15;E9PNF6 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.83 121.83 2 0.04116 127789 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.296 67.717 210600000 0 0 0 0 86286000 0 48086000 0 0 0 26819000 49408000 0 25248 145 23730 230167;230168;230169;230170 294321;294322;294323;294324 294323 2 LCLPSFDKLELLECIR Unmodified 2005.0377 0.03765442 601 M0QZP4;B3KSI3;M0QZ10;M0QXF9;O15382 BCAT2 Branched-chain-amino-acid aminotransferase;Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 146.15 146.15 3 1.08E-05 150599 QUIQUE_C1403_190116_001 101.39 85.568 200050000 0 0 24230000 39775000 33247000 0 26782000 0 0 0 45732000 0 30282000 25249 601 23731 230171;230172;230173;230174;230175;230176 294325;294326;294327;294328;294329;294330 294326 6 LCLQQGQLCEPLPSLAESR Unmodified 2198.0824 0.082372781 3418 Q6XQN6;G5E977 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 1 1 113.82 113.82 2;3 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mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 66.396 66.396 3 0.0025504 66088 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.275 50.056 262670000 0 42659000 0 41660000 0 0 0 0 0 22578000 0 58153000 97620000 25252 374 23734 230200;230201;230202;230203;230204 294356;294357;294358;294359;294360;294361 294360 5 LCMGSGLNLCEPNNK Unmodified 1705.7586 0.7585958 1838 P02787;H7C5E8 TF Serotransferrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 78.731 78.731 2 4.5932E-13 79463 QUIQUE_C1277_190116_001 185.18 167.74 705930000 72505000 144470000 0 118790000 257870000 100910000 0 0 0 11370000 0 0 0 25253 1838 23735 230205;230206;230207;230208;230209;230210 294362;294363;294364;294365;294366;294367 294363 5 LCMGSGLNLCEPNNK Oxidation (M) 1721.7535 0.75351042 1838 P02787;H7C5E8 TF Serotransferrin yes no 0 1 0 1 1 1 1 53.32 53.32 2 1.6936E-05 51857 QUIQUE_C1438_190116_001 95.477 81.319 102350000 0 0 0 30989000 41754000 0 0 0 0 0 0 29603000 0 25254 1838 23735 230211;230212;230213;230214 294368;294369;294370;294371 294369 1054 4 LCMGSLHWLEEAEK Unmodified 1701.7855 0.78546248 3486 Q86TV6;Q6PIF1;H0YJP9 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes no 0 0 0 1 1 106.3 106.3 3 0.0025601 109453 QUIQUE_C1277_190116_001 49.188 40.587 43860000 0 28667000 0 15193000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25255 3486 23736 230215;230216 294372;294373 294372 2 LCMSLMQNK Unmodified 1123.5188 0.51880645 3954 Q99460;A0A087WW66;C9J9M4;H7BZR6 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.989 59.989 2 0.015343 58451 QUIQUE_C1368_190116_001 67.277 37.918 197230000 43521000 51664000 39976000 0 35150000 0 0 0 26922000 0 0 0 0 25256 3954 23737 230217;230218;230219;230220;230221 294374;294375;294376;294377;294378 294376 5 LCNDFLK Unmodified 908.44259 0.44258826 1566 O60268;H3BMU3;H3BNA7 KIAA0513 Uncharacterized protein KIAA0513 yes no 0 0 0 1 49.482 49.482 2 0.061471 47978 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.787 26.312 49482000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49482000 0 0 25257 1566 23738 230222 294379 294379 1 LCNDLMNCVQER Oxidation (M) 1566.6589 0.65888176 4069 Q9BY11 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes yes 0 1 0 2 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 2 44.877 44.877 2 0.00061271 42029 QUIQUE_C1277_190116_001 94.616 73.746 680230000 91083000 74331000 0 52571000 63329000 0 52676000 0 100340000 37295000 64622000 74212000 69768000 25258 4069 23739 230223;230224;230225;230226;230227;230228;230229;230230;230231;230232;230233;230234;230235;230236;230237;230238;230239;230240;230241 294380;294381;294382;294383;294384;294385;294386;294387;294388;294389;294390;294391;294392;294393;294394;294395;294396;294397;294398 294382 2848 18 LCNDLMNCVQER Unmodified 1550.664 0.66396713 4069 Q9BY11 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.743 69.743 2 5.2304E-07 69660 QUIQUE_C1403_190116_001 143.96 119.58 3985000000 401800000 411190000 390840000 336030000 311680000 317020000 378450000 190520000 167050000 90443000 341300000 296070000 352620000 25259 4069 23739 230242;230243;230244;230245;230246;230247;230248;230249;230250;230251;230252;230253;230254 294399;294400;294401;294402;294403;294404;294405;294406;294407;294408;294409;294410;294411;294412;294413;294414;294415 294406 17 LCNECADGSFHLSTR Unmodified 1765.7512 0.75120224 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.835 47.835 3 0.00035706 45638 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.814 54.305 227440000 19378000 53272000 40727000 0 46431000 35252000 0 32375000 0 0 0 0 0 25260 2834 23740 230255;230256;230257;230258;230259;230260;230261 294416;294417;294418;294419;294420;294421;294422 294422 7 LCNYLSHHLTISPQSGNFR Unmodified 2243.0906 0.090569702 819 D6REB4;Q9H074;D6RJ02;D6RJF2;D6R9H8 PAIP1 Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 73.289 73.289 3;4 0.00087375 73617 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.412 51.313 705730000 0 76362000 0 96319000 118020000 55012000 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294439 12 LCPQFLQLASANTAR Unmodified 1688.8668 0.86682434 1739 O95630;C9JK83 STAMBP STAM-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.28 103.28 2 0.00058169 105844 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.695 38.504 320800000 0 33367000 40222000 31593000 30813000 35013000 44908000 0 0 0 33914000 37975000 32995000 25264 1739 23744 230285;230286;230287;230288;230289;230290;230291;230292;230293 294447;294448;294449;294450;294451;294452;294453;294454;294455 294454 6 LCPTHADSLNNLANIK Unmodified 1779.8938 0.89376737 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.409 64.409 3 0.00041008 64035 QUIQUE_C1277_190116_001 46.823 35.968 387470000 36018000 65384000 49344000 56364000 54937000 0 48925000 0 0 0 35940000 40557000 0 25265 1497 23745 230294;230295;230296;230297;230298;230299;230300;230301 294456;294457;294458;294459;294460;294461;294462;294463 294457 8 LCQCSDNIDPNAVGNCNR Unmodified 2105.8677 0.86770533 2008 P11047 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LCQSFQTFSICYAETGLLGAHFVCDR Unmodified 3079.399 0.39903225 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 149.61 149.61 3 2.2043E-14 154760 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.404 78.744 74363000 0 0 0 0 0 0 0 0 32056000 0 0 42307000 0 25272 2337 23752 230322;230323 294487;294488;294489 294487 3 LCSAHGVLVPGGFGVR Unmodified 1624.8508 0.85078035 476 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;B4E1E0 CTPS1 CTP synthase 1;CTP synthase yes no 0 0 0 1 1 1 73.941 73.941 2;3 0.0052812 73683 QUIQUE_C1403_190116_001 72.652 57.023 103030000 0 0 0 0 0 0 70667000 32366000 0 0 0 0 0 25273 476 23753 230324;230325;230326 294490;294491;294492 294490 3 LCSDLMNCLHER Unmodified 1546.6691 0.66905251 4510 Q9UNF0;A0A0U1RR22;B0QYG7;B0QYG8 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 65.862 65.862 2;3 7.2345E-05 65471 QUIQUE_C1368_190116_001 123.75 109.98 641100000 68662000 34998000 30543000 28353000 125880000 78665000 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230343;230344;230345;230346;230347;230348;230349;230350;230351;230352;230353;230354 294509;294510;294511;294512;294513;294514;294515;294516;294517;294518;294519;294520 294520 11 LCSGVLGTVVHGK Unmodified 1325.7126 0.71255553 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 2 2 1 2 49.221 49.221 2;3 0.0018703 47517 QUIQUE_C1218_190116_001 100.92 84.289 3205800000 342340000 377620000 363710000 266970000 234690000 358620000 287500000 298980000 345330000 20218000 0 309800000 0 25277 4650 23757 230355;230356;230357;230358;230359;230360;230361;230362;230363;230364;230365;230366;230367;230368;230369;230370;230371 294521;294522;294523;294524;294525;294526;294527;294528;294529;294530;294531;294532;294533;294534;294535;294536;294537;294538 294521 7 LCSLFYTNEEVAK Unmodified 1572.7494 0.74939455 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;B3KM87;Q68E03 MATR3;DKFZp686L22104 Matrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.219 86.219 2 6.8145E-10 87736 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.89 92.445 3701300000 258830000 380150000 280600000 231640000 312150000 255180000 284190000 311470000 299340000 90764000 353790000 308270000 334890000 25278 307 23758 230372;230373;230374;230375;230376;230377;230378;230379;230380;230381;230382;230383;230384 294539;294540;294541;294542;294543;294544;294545;294546;294547;294548;294549;294550;294551;294552 294547 14 LCSLLDSEDYNTCEGAFGALQK Unmodified 2490.1043 0.10429001 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 129.75 129.75 2 1.5885E-65 133719 QUIQUE_C1277_190116_001 169.4 132.55 81772000 0 28677000 0 0 0 18033000 35062000 0 0 0 0 0 0 25279 3772 23759 230385;230386;230387 294553;294554;294555 294553 2 LCSLYENDCIFDK Unmodified 1675.7222 0.72219352 2781;3349;2839;4568 Q66LE6;H0YA16;P63151;E5RFR9;Q9Y2T4;Q00005 PPP2R2D;PPP2R2B;PPP2R2A;PPP2R2C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.604 97.604 2 0.0018413 98979 QUIQUE_C1563_190116_001 77.062 50.276 137880000 0 19031000 28829000 29940000 0 37169000 22914000 0 0 0 0 0 0 25280 3349;2781;4568;2839 23760 230388;230389;230390;230391;230392 294556;294557;294558;294559;294560 294559 5 LCSSCGLPLGK Unmodified 1190.5788 0.57876417 4520 Q9UPQ0;D6RD46;E7EPK0;E9PDJ9;H0Y8P3;G5EA03 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 49.434 49.434 2 0.012009 47316 QUIQUE_C1218_190116_001 60.828 26.642 57258000 26644000 30614000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25281 4520 23761 230393;230394 294561;294562 294561 2 LCTFILK Unmodified 893.50446 0.50446024 2653 P55010;H0YLZ1;H0YN40 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 71.297 71.297 2 0.019773 71541 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.34 61.577 715530000 65565000 93319000 61111000 0 87200000 0 0 0 129080000 0 130320000 0 148930000 25282 2653 23762 230395;230396;230397;230398;230399;230400;230401 294563;294564;294565;294566;294567;294568;294569;294570;294571;294572 294569 10 LCTMGPGKVFGELAILYNCTR Unmodified 2399.18 0.17997834 3035 Q13976 PRKG1 cGMP-dependent protein kinase 1 no no 0 0 1 1 75.106 75.106 4 0.051477 76362 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.011 15.823 550570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 550570000 25283 3035 23763 230402 294573 294573 1 LCTQLEGLQSTVTGHVER Unmodified 2027.0106 0.010588046 3379 Q6P2E9 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 84.267 84.267 3 8.5775E-05 85005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.238 73.667 187630000 45517000 58881000 0 0 0 0 0 39416000 43814000 0 0 0 0 25284 3379 23764 230403;230404;230405;230406 294574;294575;294576;294577 294576 4 LCTSATESEVAR Unmodified 1322.6136 0.61362935 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.297 27.297 2 9.0049E-07 21056 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.16 110.35 6620600000 750860000 702970000 732620000 476940000 467270000 670750000 540120000 29557000 443730000 0 776200000 558210000 471340000 25285 2337 23765 230407;230408;230409;230410;230411;230412;230413;230414;230415;230416;230417;230418 294578;294579;294580;294581;294582;294583;294584;294585;294586;294587;294588;294589;294590 294589 13 LCTSVTESEVAR Unmodified 1350.6449 0.64492948 1636 O75439;G3V0E4 PMPCB Mitochondrial-processing peptidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 40.519 40.519 2 0.017643 36996 QUIQUE_C1403_190116_001 60.434 40.647 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25286 1636 23766 230419;230420 294591;294592 294591 2 LCTVATLR Unmodified 932.51134 0.51133653 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;A0A087WWT3;H7C013 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 2 2 35.876 35.876 2 5.2577E-06 32254 QUIQUE_C1368_190116_001 170.06 93.213 64848000000 6048300000 6623900000 3161900000 7266300000 11207000000 5189800000 4972700000 668380000 3093500000 1390700000 4207400000 4559700000 6457800000 + 25287 769 23767 230421;230422;230423;230424;230425;230426;230427;230428;230429;230430;230431;230432;230433;230434;230435;230436;230437;230438 294593;294594;294595;294596;294597;294598;294599;294600;294601;294602;294603;294604;294605;294606;294607;294608;294609;294610;294611;294612;294613;294614;294615;294616;294617 294596 23 LCVLNEILGTER Unmodified 1415.7442 0.74424959 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 124.85 124.85 2 0.0080138 129380 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.726 43.876 30922000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30922000 25288 3676 23768 230439;230440;230441;230442;230443;230444;230445 294618;294619;294620;294621;294622;294623;294624 294623 7 LCVPAMNVNDSVTK Oxidation (M) 1562.7433 0.74326331 1558;3868;1131 H0Y8B3;O43865;Q96HN2 AHCYL2;AHCYL1 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 2;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.84 51.84 2 0.0023639 49157 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.653 53.462 2823800000 194220000 320800000 0 219500000 255680000 0 212320000 316600000 249850000 217480000 434440000 0 402950000 25289 1131;1558;3868 23769 230446;230447;230448;230449;230450;230451;230452;230453;230454;230455 294625;294626;294627;294628;294629;294630;294631;294632;294633;294634;294635 294635 660 10 LCVPAMNVNDSVTK Unmodified 1546.7483 0.74834869 1558;3868;1131 H0Y8B3;O43865;Q96HN2 AHCYL2;AHCYL1 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 2;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 79.047 79.047 2 0.00021334 81130 QUIQUE_C1438_190116_001 92.866 73.551 6133800000 523880000 553310000 471070000 583200000 467840000 557960000 538000000 356090000 400780000 159220000 566730000 416920000 538840000 25290 1131;1558;3868 23769 230456;230457;230458;230459;230460;230461;230462;230463;230464;230465;230466;230467;230468;230469 294636;294637;294638;294639;294640;294641;294642;294643;294644;294645;294646;294647;294648;294649;294650;294651;294652;294653;294654;294655;294656;294657;294658;294659;294660;294661 294646 26 LCVQNSPQEAR Unmodified 1300.6194 0.61938343 887 E9PID8;E7EWR4;P33240;A0A0A0MT56 CSTF2 Cleavage stimulation factor subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.234 22.234 2 0.00048894 15967 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.43 86.985 178920000 40216000 38358000 47584000 0 0 0 0 52765000 0 0 0 0 0 25291 887 23770 230470;230471;230472;230473 294662;294663;294664;294665 294665 4 LCWFLDEAAAR Unmodified 1350.6391 0.63905624 1723 O95336;M0R1L2 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.11 120.11 2 0.00124 123717 QUIQUE_C1277_190116_001 87.913 69.133 2743900000 223400000 221870000 281290000 251800000 246870000 243420000 265710000 258710000 0 112190000 0 308850000 329740000 25292 1723 23771 230474;230475;230476;230477;230478;230479;230480;230481;230482;230483;230484 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LDAEPRPPPTQEAA Unmodified 1490.7365 0.73652168 4547 Q9Y285;K7ER00 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 41.778 41.778 2 0.0012923 38528 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.191 70.872 470080000 0 106010000 53345000 0 0 100750000 0 0 73880000 0 136100000 0 0 25309 4547 23785 231933;231934;231935;231936;231937;231938;231939 296789;296790;296791;296792;296793;296794;296795;296796 296794 8 LDAFIEALHQEK Unmodified 1412.73 0.72997974 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 1 1 77.468 77.468 2;3 0.00020154 79100 QUIQUE_C1438_190116_001 84.605 69.919 1971200000 263020000 271970000 167070000 51562000 195530000 122660000 189190000 39683000 200070000 0 182320000 130340000 157820000 25310 831;1569 23786 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232150;232151;232152;232153;232154 297047;297048;297049;297050;297051 297047 5 LDDKDLFSK Unmodified 1079.5499 0.5498901 4401 Q9UBL6 CPNE7 Copine-7 yes yes 0 0 1 1 47.245 47.245 3 0.011446 42016 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.654 39.778 5777900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5777900 0 0 0 25340 4401 23816 232155 297052 297052 1 LDDLFLK Unmodified 862.48002 0.48001963 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 116.36 116.36 2 0.030069 119430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.986 2.9568 86850000 18192000 0 0 0 0 0 0 12609000 19100000 0 16011000 0 20940000 25341 2452 23817 232156;232157;232158;232159;232160;232161;232162 297053;297054;297055;297056;297057;297058;297059;297060 297055 8 LDDLFLKR Unmodified 1018.5811 0.58113065 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 59.413 59.413 2 0.026115 58119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.191 41.528 65910000 0 0 0 0 0 0 0 21307000 22549000 0 0 22054000 0 25342 2452 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LDDLVSTGK Unmodified 946.49713 0.49712625 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.618 35.618 2 0.0050983 31024 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.476 33.319 1810500000 151470000 151020000 153450000 126970000 174060000 129070000 152560000 97541000 139720000 0 228100000 145960000 160590000 25345 3726 23821 232180;232181;232182;232183;232184;232185;232186;232187;232188;232189;232190;232191 297082;297083;297084;297085;297086;297087;297088;297089;297090;297091;297092;297093;297094;297095;297096;297097;297098 297094 15 LDDMSSIVQK Unmodified 1134.5591 0.55907458 939 E9PIN3;Q9UBU9 NXF1 Nuclear RNA export factor 1 no no 0 0 0 1 1 20.48 20.48 2 0.018855 13331 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.682 24.235 787070000 0 0 0 0 0 0 0 335420000 0 0 451650000 0 0 25346 939 23822 232192;232193 297099;297100 297100 1 LDDQIFLNR Unmodified 1132.5877 0.58767259 3568 Q8N122 RPTOR Regulatory-associated protein of mTOR yes yes 0 0 0 1 1 1 85.446 85.446 2 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297173;297174;297175;297176;297177;297178;297179;297180;297181;297182;297183;297184;297185;297186;297187;297188;297189;297190;297191;297192;297193;297194;297195 297173 22 LDEESLAELSSLSVLR Unmodified 1759.9204 0.92035928 3885 Q96JA1 LRIG1 Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 149.21 149.21 2 0.00060903 155371 QUIQUE_C1576_190116_001 93.011 77.121 38561000 0 18668000 0 0 0 0 19893000 0 0 0 0 0 0 25356 3885 23832 232267;232268 297196;297197 297197 2 LDEGTPPEPK Unmodified 1081.5292 0.52915466 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1;H0YN01 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 24.116 24.116 2 0.010719 17874 QUIQUE_C1438_190116_001 68.371 40.264 107000000 0 0 0 0 62887000 0 24306000 0 19812000 0 0 0 0 25357 4606 23833 232269;232270;232271;232272;232273;232274 297198;297199;297200;297201;297202;297203 297198 5 LDEGTVQWIVDQAAAK Unmodified 1742.8839 0.88391419 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 140.3 140.3 3 0.036788 147593 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mitochondrial yes yes 0 0 0 2 3 2 2 2 3 2 1 2 2 2 2 1 125.32 125.32 2;3 3.9125E-20 129101 QUIQUE_C1403_190116_001 172.27 60.82 3941300000 434220000 350380000 266420000 234500000 320040000 234980000 350900000 216290000 330700000 100520000 484490000 371080000 246780000 25364 1620 23839 232299;232300;232301;232302;232303;232304;232305;232306;232307;232308;232309;232310;232311;232312;232313;232314;232315;232316;232317;232318;232319;232320;232321;232322;232323;232324 297229;297230;297231;297232;297233;297234;297235;297236;297237;297238;297239;297240;297241;297242;297243;297244;297245;297246;297247;297248;297249;297250;297251;297252;297253;297254;297255;297256;297257;297258;297259;297260;297261;297262;297263;297264;297265;297266;297267;297268 297239 38 LDELRDEGK Unmodified 1073.5353 0.53530267 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 16.427 16.427 2;3 5.4282E-09 9165 QUIQUE_DMIX1_190116_001 175.91 92.648 13391000000 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calcium channel subunit alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 101.87 101.87 2 0.0015721 105315 QUIQUE_C1368_190116_001 96.034 52.264 249490000 0 0 31895000 0 42524000 0 52363000 0 27196000 0 48770000 0 46739000 25382 715 23855 232478;232479;232480;232481;232482;232483;232484;232485 297476;297477;297478;297479;297480;297481;297482;297483;297484 297478 7 LDFKDVLLRPK Unmodified 1342.7973 0.79727144 2405;61 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YMB3;H0YLV5;H0YNH0;H0YMR9;H0YMV5;A0A0B4J281;H0YMG3;H0YKK3;H0YN74;P36959 GMPR2;GMPR GMP reductase;GMP reductase 2;GMP reductase 1 no no 0 0 2 1 1 1 1 1 80.419 80.419 3 0.00082144 81537 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.85 97.795 745880000 0 0 0 0 0 0 0 165440000 180960000 0 106330000 110520000 182630000 25383 61;2405 23856 232486;232487;232488;232489;232490 297485;297486;297487;297488;297489 297485 5 LDFLIPLSK Unmodified 1044.6219 0.62193284 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.55 126.55 2 0.0010237 132295 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.57 20.098 781070000 69530000 49839000 66618000 58493000 69697000 60476000 59206000 36676000 64047000 43647000 76307000 62990000 63546000 25384 438;2509 23857 232491;232492;232493;232494;232495;232496;232497;232498;232499;232500;232501;232502;232503 297490;297491;297492;297493;297494;297495;297496;297497;297498;297499;297500;297501;297502;297503 297501 14 LDFLRPYTVPNK Unmodified 1461.798 0.79799972 3952 Q99436 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.207 85.207 3 0.011194 87063 QUIQUE_C1277_190116_001 55.04 30.345 1057700000 89941000 114730000 98029000 91201000 133160000 0 89661000 103080000 100610000 35859000 111320000 90090000 0 25385 3952 23858 232504;232505;232506;232507;232508;232509;232510;232511;232512;232513;232514 297504;297505;297506;297507;297508;297509;297510;297511;297512;297513;297514 297505 8 LDFLRPYTVPNKK Unmodified 1589.893 0.89296274 3952 Q99436 PSMB7 Proteasome subunit beta type-7 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 62.955 62.955 3 0.00039699 62689 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.69 78.479 514780000 0 0 0 0 0 0 0 104120000 90662000 0 126260000 102550000 91172000 25386 3952 23859 232515;232516;232517;232518;232519 297515;297516;297517;297518;297519;297520;297521;297522 297519 8 LDFMGWLGAIQK Unmodified 1377.7115 0.7114929 3914 Q96P48;E7EU13;A0A0A0MSJ2;F5GWN4;F8WBT0 ARAP1 Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 159.9 159.9 2 0.0025157 165264 QUIQUE_C1368_190116_001 91.867 61.612 43278000 0 0 13453000 8202100 0 6193400 0 0 0 0 15430000 0 0 25387 3914 23860 232520;232521;232522;232523;232524 297523;297524;297525;297526;297527 297524 5 LDFNGFYTER Unmodified 1260.5775 0.57750184 4013 Q9BSJ2;B3KTU7 TUBGCP2 Gamma-tubulin complex component 2 yes no 0 0 0 1 101.23 101.23 2 0.054242 102927 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.432 21.163 0 0 0 0 0 0 0 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0 0 25390 3504 23863 232539 297556 297556 1 LDFSMAEALNQEFLATR Unmodified 1954.9459 0.94586252 2435 P41219 PRPH Peripherin yes yes 0 0 0 1 1 159.9 159.9 2 0.00053206 154576 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.589 59.699 51640000 0 0 0 0 0 35103000 0 0 0 16537000 0 0 0 25391 2435 23864 232540;232541 297557;297558;297559 297559 2 LDFSMAEALNQEFLATR Oxidation (M) 1970.9408 0.94077715 2435 P41219 PRPH Peripherin yes yes 0 1 0 1 142.78 142.78 2 0.00019162 138781 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.926 76.364 9635400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9635400 0 0 0 25392 2435 23864 232542 297560 297560 1858 1 LDFTGNLIEDIEDGTFSK Unmodified 2012.9579 0.957867 2172 P20774;Q5TBF5 OGN Mimecan yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 168.27 168.27 2 6.3956E-54 170051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 229.97 203.19 811490000 57427000 0 216870000 79622000 110030000 0 204100000 34991000 0 24236000 0 84214000 0 25393 2172 23865 232543;232544;232545;232546;232547;232548;232549;232550 297561;297562;297563;297564;297565;297566;297567;297568;297569 297567 9 LDFTQFHR Unmodified 1062.5247 0.52467841 1522 O43310;K7EPK6;K7EK08 CTIF CBP80/20-dependent translation initiation factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 61.878 61.878 3 0.011593 61267 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.157 36.926 97402000 0 0 0 0 0 11978000 15636000 0 18509000 0 18622000 12915000 19742000 25394 1522 23866 232551;232552;232553;232554;232555;232556;232557;232558 297570;297571;297572;297573;297574;297575;297576;297577 297574 8 LDFTVEHDSLK Unmodified 1302.6456 0.6455814 101 A0A0G2JN29;A0A087X117;Q15155;A0A0G2JP90;A0A087WW46;J3KN36;P69849;Q5JPE7 NOMO1;NOMO3;NOMO2 Nodal modulator 1;Nodal modulator 3;Nodal modulator 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 62.675 62.675 2 0.0058121 62240 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.14 55.692 102040000 23352000 24973000 0 25757000 0 0 0 0 0 0 27957000 0 0 25395 101 23867 232559;232560;232561;232562;232563 297578;297579;297580;297581;297582 297581 5 LDFVLTSLVALR Unmodified 1345.7969 0.79693709 3949 Q96TC7;H0YLG5;H0YNE5 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 155.88 155.88 2 0.0016497 161787 QUIQUE_C1576_190116_001 79.974 66.204 104350000 11401000 0 8485300 0 14431000 14067000 18418000 0 22088000 0 0 15464000 0 25396 3949 23868 232564;232565;232566;232567;232568;232569;232570;232571;232572;232573 297583;297584;297585;297586;297587;297588;297589;297590;297591;297592 297587 9 LDFYQHSWLPAR Unmodified 1531.7572 0.75719754 4210 Q9HB07;F8VR84;F8VQQ3 C12orf10 UPF0160 protein MYG1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 3 2 98.879 98.879 2;3 4.7121E-05 101691 QUIQUE_C1368_190116_001 131.37 102.03 1409500000 108730000 117820000 133950000 104000000 84707000 50152000 86355000 86959000 130640000 19072000 122150000 177500000 187450000 25397 4210 23869 232574;232575;232576;232577;232578;232579;232580;232581;232582;232583;232584;232585;232586;232587;232588;232589;232590;232591;232592;232593;232594 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297620;297621;297622;297623;297624;297625;297626;297627;297628;297629;297630;297631;297632;297633;297634;297635;297636;297637;297638;297639;297640;297641;297642;297643;297644;297645;297646 297623 27 LDGCFSTPEER Unmodified 1309.5609 0.5608655 2116 P17050 NAGA Alpha-N-acetylgalactosaminidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 46.961 46.961 2 0.00082403 44165 QUIQUE_C1403_190116_001 94.692 77.256 126910000 0 29597000 30498000 29806000 0 0 0 0 0 0 0 0 37004000 25400 2116 23872 232609;232610;232611;232612 297647;297648;297649;297650;297651 297649 5 LDGEASINNR Unmodified 1087.5258 0.52580062 1730 O95433;H0YJG7;G3V3W9 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.368 22.368 2 0.00017973 15698 QUIQUE_C1218_190116_001 119.86 70.767 103990000000 9117200000 7757000000 11256000000 12788000000 0 10765000000 10095000000 0 10317000000 0 11667000000 9010300000 11218000000 25401 1730 23873 232613;232614;232615;232616;232617;232618;232619;232620;232621;232622 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chain-like 3 no no 0 0 1 2 4 3 4 4 4 4 4 4 2 4 4 5 52.251 52.251 2;3 8.7028E-18 50679 QUIQUE_C1277_190116_001 173.71 144.04 104620000000 246800000 1804900000 1527200000 957540000 7598000000 782380000 7256200000 11799000000 14228000000 371850000 18039000000 16591000000 23417000000 25424 1990;2795;2796;3430;3992;688;539 23895 232776;232777;232778;232779;232780;232781;232782;232783;232784;232785;232786;232787;232788;232789;232790;232791;232792;232793;232794;232795;232796;232797;232798;232799;232800;232801;232802;232803;232804;232805;232806;232807;232808;232809;232810;232811;232812;232813;232814;232815;232816;232817;232818;232819;232820;232821;232822;232823 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297941;297942;297943;297944;297945;297946;297947;297948;297949;297950;297951;297952;297953;297954;297955;297956 297943 13 LDIDSPPITAR Unmodified 1196.6401 0.6401021 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;H3BT25;H3BU13;H3BN34;H3BQZ3;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.224 72.224 2;3 1.7263E-18 72172 QUIQUE_C1277_190116_001 192.91 142.3 52949000000 4896300000 4339400000 4896200000 4064500000 3733300000 3140700000 3984000000 3936100000 4021600000 1825300000 5295400000 4285300000 4530300000 25432 1203;2077 23902 232873;232874;232875;232876;232877;232878;232879;232880;232881;232882;232883;232884;232885;232886 297957;297958;297959;297960;297961;297962;297963;297964;297965;297966;297967;297968;297969;297970;297971;297972;297973;297974;297975;297976;297977;297978;297979;297980;297981;297982;297983;297984;297985;297986;297987;297988;297989;297990;297991;297992;297993;297994 297960 38 LDIEEEAEEVRK Unmodified 1458.7202 0.72020291 4717 yes yes 0 0 1 2 1 127.26 127.26 2 0.00080107 131972 QUIQUE_C1218_190116_001 93.111 44.827 58107000 58107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 25433 4717 23903 232887;232888;232889 297995;297996;297997 297995 2 LDIEQYR Unmodified 935.47125 0.47124585 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.437 54.437 2 0.0099323 52806 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.11 75.055 1553600000 156480000 144280000 203370000 0 137570000 158470000 0 113040000 125830000 86753000 168590000 128180000 131020000 25434 2463 23904 232890;232891;232892;232893;232894;232895;232896;232897;232898;232899;232900 297998;297999;298000;298001;298002;298003;298004;298005;298006;298007;298008;298009;298010;298011 298005 13 LDIETGFHR Unmodified 1086.5458 0.54580778 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 51.605 51.605 3 0.0026496 50759 QUIQUE_C1218_190116_001 66.692 50.489 257580000 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protein 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 161.09 161.09 4;5 4.6727E-14 165873 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.07 91.917 931730000 0 129480000 0 0 0 0 259970000 0 62195000 0 204320000 275770000 0 25437 3499 23907 232928;232929;232930;232931;232932;232933;232934 298043;298044;298045;298046;298047;298048;298049 298046 3 LDIISEDISELQK Unmodified 1501.7876 0.78755419 3456 Q7Z3B4 NUP54 Nucleoporin p54 yes yes 0 0 0 1 122.9 122.9 2 0.018515 128001 QUIQUE_C1368_190116_001 58.274 12.301 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25438 3456 23908 232935 298050 298050 1 LDILDMFTEIK Unmodified 1336.6948 0.69483978 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.37 166.37 2 0.00054582 160445 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.7 47.137 720330000 76091000 72865000 73808000 0 61139000 48111000 67548000 49022000 63993000 14635000 81515000 66351000 45249000 25439 2320 23909 232936;232937;232938;232939;232940;232941;232942;232943;232944;232945;232946;232947 298051;298052;298053;298054;298055;298056;298057;298058;298059;298060;298061;298062 298059 12 LDILDQER Unmodified 1000.5189 0.51892433 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 63.556 63.556 1;2 0.0003973 63052 QUIQUE_C1277_190116_001 157.52 79.842 6015200000 0 755710000 687140000 689050000 582600000 700310000 615290000 0 427670000 341470000 370580000 398440000 446990000 25440 267;275;3025 23910 232948;232949;232950;232951;232952;232953;232954;232955;232956;232957;232958;232959;232960;232961;232962;232963 298063;298064;298065;298066;298067;298068;298069;298070;298071;298072;298073;298074;298075;298076;298077;298078;298079;298080;298081;298082;298083;298084;298085;298086 298064 16 LDILDTAGQEEFGAMR Oxidation (M) 1780.8302 0.83016406 1994;2737 P62070;E9PK85;P10301 RRAS2;RRAS Ras-related protein R-Ras2;Ras-related protein R-Ras no no 0 1 0 1 112.58 112.58 2 0.015984 115744 QUIQUE_C1403_190116_001 78.763 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alpha-2-2;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.077 98.077 2 0.0086631 100065 QUIQUE_C1403_190116_001 78.149 19.334 57237000 21244000 0 0 19289000 0 16704000 0 0 0 0 0 0 0 25465 715 23935 233156;233157;233158;233159;233160;233161;233162;233163 298342;298343;298344;298345;298346;298347;298348;298349 298343 8 LDLEAWFPGSGAFR Unmodified 1564.7674 0.76742787 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.16 156.16 2 0.0002053 160976 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.616 64.004 535430000 65023000 59902000 62953000 59728000 62121000 0 57383000 18008000 28325000 10674000 44743000 38398000 28169000 25466 2534 23936 233164;233165;233166;233167;233168;233169;233170;233171;233172;233173;233174;233175 298350;298351;298352;298353;298354;298355;298356;298357;298358;298359;298360;298361;298362;298363;298364 298360 14 LDLFANVVHVK Unmodified 1253.7132 0.71320746 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 94.788 94.788 2;3 0.00077027 96908 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.14 64.926 975440000 96650000 166740000 192860000 46224000 41411000 73893000 64170000 0 32624000 45204000 0 161920000 53749000 25467 86 23937 233176;233177;233178;233179;233180;233181;233182;233183;233184;233185;233186;233187;233188;233189;233190;233191;233192 298365;298366;298367;298368;298369;298370;298371;298372;298373;298374;298375;298376;298377;298378;298379;298380;298381;298382 298375 16 LDLFEISQPTEDLEFHGVMR Unmodified 2375.1467 0.14674718 1258 Q5TIG5;J3KN01;P55196;F8W9I4;E9PFY5 MLLT4 Afadin yes no 0 0 0 1 142.68 142.68 3 0.0023434 150061 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.788 36.187 56595000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56595000 0 0 25468 1258 23938 233193 298383 298383 0 LDLFSCLLR Unmodified 1135.606 0.6059652 3431;4092 Q76B58;Q9C0B6 BRINP3;BRINP2 BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3;BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 143.1 143.1 2 0.013659 145991 QUIQUE_C1563_190116_001 69.628 45.655 69737000 0 0 0 0 0 18693000 27698000 0 0 0 9612600 13733000 0 25469 3431;4092 23939 233194;233195;233196;233197;233198;233199;233200;233201 298384;298385;298386;298387;298388;298389;298390;298391 298386 8 LDLGEDYPSGK Unmodified 1192.5612 0.56118307 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 60.781 60.781 2 0.0023872 60422 QUIQUE_C1218_190116_001 78.655 22.645 212890000 33164000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 179730000 0 0 25470 1506 23940 233202;233203 298392;298393;298394 298392 3 LDLGSNEFTEVPEVLEQLSGLK Unmodified 2416.2373 0.23733632 3936 Q96RT1;B4DIP2 ERBB2IP Protein LAP2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 2 1 171.12 171.12 2;3 7.8783E-66 175907 QUIQUE_C1368_190116_001 220.6 186.92 689830000 12971000 33955000 65470000 0 53511000 0 140890000 43068000 88322000 0 138130000 94564000 18945000 25471 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298417;298418;298419;298420;298421;298422;298423;298424;298425;298426;298427;298428 298417 1802;1803 12 LDLIAQQMMPEVR Unmodified 1542.7898 0.78981957 2397 P36543 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 2 1 118.82 118.82 2;3 1.0925E-12 124488 QUIQUE_C1218_190116_001 153.12 137.53 4846000000 464170000 451370000 390650000 379940000 292620000 380620000 630350000 0 519640000 92495000 461750000 369840000 412580000 25474 2397 23943 233236;233237;233238;233239;233240;233241;233242;233243;233244;233245;233246;233247;233248;233249;233250;233251;233252;233253;233254;233255;233256 298429;298430;298431;298432;298433;298434;298435;298436;298437;298438;298439;298440;298441;298442;298443;298444;298445;298446;298447;298448;298449;298450;298451;298452;298453;298454;298455 298430 24 LDLIAQQMMPEVR 2 Oxidation (M) 1574.7796 0.77964882 2397 P36543 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes yes 0 2 0 1 1 1 1 1 72.295 72.295 2 0.0023548 72360 QUIQUE_DMIX8_190116_001 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36818000 0 0 25481 2690 23949 233311 298519 298519 1 LDLMDAGTDAMDVLMGR Unmodified 1822.8263 0.82634102 1108;1404 G8JLD5;O00429;F8VZ52 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 2 2 1 2 1 2 170.56 170.56 2;3 8.8915E-53 173956 QUIQUE_C1277_190116_001 180.18 148.34 2099500000 208670000 198410000 104720000 121590000 147450000 151370000 188920000 190570000 175090000 19952000 269110000 119410000 204270000 25482 1108;1404 23950 233312;233313;233314;233315;233316;233317;233318;233319;233320;233321;233322;233323;233324;233325;233326;233327;233328;233329;233330;233331 298520;298521;298522;298523;298524;298525;298526;298527;298528;298529;298530;298531;298532;298533;298534;298535;298536;298537;298538;298539;298540;298541;298542;298543 298522 24 LDLMDAGTDAMDVLMGR Oxidation (M) 1838.8213 0.82125564 1108;1404 G8JLD5;O00429;F8VZ52 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 1 0 2 2 2 3 2 1 2 1 1 3 1 1 3 162.46 162.46 2 7.8498E-30 167539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.68 135.14 388510000 17315000 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LDLMMNVNTR Unmodified 1205.5897 0.5896632 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 85.924 85.924 2 0.017483 86596 QUIQUE_C1563_190116_001 61.78 42.997 122910000 0 0 0 27019000 0 28977000 0 0 0 0 45522000 21388000 0 25488 3421 23954 233365;233366;233367;233368 298578;298579;298580;298581;298582 298580 5 LDLNDLAR Unmodified 928.49779 0.49779495 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.258 79.258 2 0.0032014 81351 QUIQUE_C1218_190116_001 160.63 74.118 4333500000 469090000 470900000 497390000 339130000 412890000 0 547930000 238500000 437490000 114270000 0 453120000 352790000 25489 1678 23955 233369;233370;233371;233372;233373;233374;233375;233376;233377;233378;233379 298583;298584;298585;298586;298587;298588;298589;298590;298591;298592;298593;298594;298595;298596;298597 298583 11 LDLPDLPLSDILK Unmodified 1450.8283 0.8282968 3284 Q5M775;J3KSG2 SPECC1 Cytospin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 159.53 159.53 2 0.0019503 161856 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epithelium-derived factor yes yes 0 0 0 1 160.04 160.04 2 0.00028457 164239 QUIQUE_C1277_190116_001 79.07 62.872 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25492 2403 23958 233403 298635 298635 1 LDLQYAK Unmodified 849.45962 0.45961853 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.325 42.325 2 0.01933 38084 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.06 20.985 6683700000 0 706360000 747930000 0 674250000 437120000 684510000 752370000 881490000 416160000 0 847360000 536160000 25493 3117 23959 233404;233405;233406;233407;233408;233409;233410;233411;233412;233413 298636;298637;298638;298639;298640;298641;298642;298643;298644;298645;298646 298644 11 LDLRDDKDTIEK Unmodified 1459.7518 0.75183739 2776 P63000;P15153;B1AH77;B1AH78;B1AH80 RAC1;RAC2 Ras-related C3 botulinum toxin substrate 1;Ras-related C3 botulinum toxin substrate 2 yes no 0 0 2 1 1 2 1 1 3 2 1 1 3 1 31.062 31.062 2;3;4 7.2719E-06 26709 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.02 80.537 6493700000 111040000 440740000 568120000 0 0 163440000 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233436;233437;233438;233439;233440;233441;233442;233443;233444;233445 298669;298670;298671;298672;298673;298674;298675;298676;298677;298678;298679 298678 10 LDLSQLGAVK Unmodified 1042.6023 0.60226003 1474 O15040 TECPR2 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 89.49 89.49 2 0.043709 91793 QUIQUE_C1368_190116_001 59.35 19.081 16199000 0 0 0 0 0 0 0 0 16199000 0 0 0 0 25497 1474 23963 233446;233447 298680;298681 298680 2 LDLTEKDYEILFK Unmodified 1625.8552 0.85523983 3757 Q92820 GGH Gamma-glutamyl hydrolase yes yes 0 0 1 2 119.98 119.98 2;3 7.6322E-13 126182 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.53 101.8 45861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45861000 0 0 25498 3757 23964 233448;233449 298682;298683 298682 2 LDLTGTSGTAVPAR Unmodified 1357.7201 0.72014333 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.117 61.117 2 2.4995E-32 60189 QUIQUE_DMIX7_190116_001 173.71 138.48 3987200000 495720000 486820000 436780000 418120000 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233463;233464;233465;233466;233467;233468;233469;233470;233471;233472;233473;233474;233475;233476;233477;233478;233479;233480;233481 298698;298699;298700;298701;298702;298703;298704;298705;298706;298707;298708;298709;298710;298711;298712;298713;298714;298715;298716;298717;298718 298714 21 LDLWNLNNDTEVPTASVAIEGASALNR Unmodified 2882.441 0.44101494 1435 O14576;A0A0A0MTG2 DYNC1I1 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 156.67 156.67 3 3.5242E-08 160587 QUIQUE_C1277_190116_001 58.47 51.359 350220000 69823000 100740000 0 0 0 55529000 86591000 0 0 37541000 0 0 0 25502 1435 23968 233482;233483;233484;233485;233486 298719;298720;298721;298722;298723 298720 4 LDMDIQEILNYISR Unmodified 1721.8658 0.86582129 197 A0A0A0MTP6;O15357 INPPL1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase 2 yes no 0 0 0 1 169.75 169.75 2 0.00031675 171622 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.87 84.66 11008000 0 0 0 0 0 0 0 11008000 0 0 0 0 0 25503 197 23969 233487 298724 298724 1 LDMEIER Unmodified 904.43242 0.43241751 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.006 50.006 2 0.028867 47450 QUIQUE_C1368_190116_001 91.906 48.906 287020000 0 0 78379000 0 30926000 44635000 45959000 0 0 0 0 53675000 33446000 25504 3053 23970 233488;233489;233490;233491;233492;233493 298725;298726;298727;298728;298729;298730;298731 298725 7 LDMYVLNPVK Oxidation (M) 1206.6318 0.63184559 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 71.065 71.065 2 0.0067252 71507 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.679 56.445 204830000 0 0 43596000 0 0 0 30127000 33701000 44097000 0 0 0 53306000 25505 921 23971 233494;233495;233496;233497;233498 298732;298733;298734;298735;298736;298737 298735 571 6 LDMYVLNPVKDSK Unmodified 1520.7909 0.79086543 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 82.386 82.386 3 0.00097037 82892 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81.833 2 0.011498 82933 QUIQUE_C1368_190116_001 72.643 37.835 59114000 0 0 31499000 10405000 0 0 0 0 0 17210000 0 0 0 25508 1187 23974 233519;233520;233521;233522;233523;233524;233525 298767;298768;298769;298770;298771;298772;298773 298767 7 LDNGGYYITTR Unmodified 1271.6146 0.61461563 1305;1898 J3QRU1;P07947;P06241;E5RFS5 YES1;FYN Non-specific protein-tyrosine kinase;Tyrosine-protein kinase Yes;Tyrosine-protein kinase Fyn no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 55.778 55.778 2 0.0040538 54526 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.496 45.897 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25509 1305;1898 23975 233526;233527;233528;233529;233530;233531 298774;298775;298776;298777;298778;298779 298778 6 LDNGQVGLYPANYVEAIQ Unmodified 1962.9687 0.96870646 4510 Q9UNF0 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.57 143.57 2 0.00023672 148435 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.38 78.317 471180000 0 43470000 0 62404000 56373000 38754000 38516000 66600000 50383000 0 56623000 0 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P09104;F5H0C8;F5H1C3 ENO2 Gamma-enolase;Enolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.696 89.696 2 1.616E-17 91850 QUIQUE_C1277_190116_001 153.34 136.43 1098200000 0 270570000 179710000 158160000 126200000 189960000 0 0 0 128660000 44932000 0 0 25517 1955 23982 233594;233595;233596;233597;233598;233599;233600;233601 298860;298861;298862;298863;298864;298865;298866;298867;298868 298861 1207 8 LDNLVAILDINR Unmodified 1367.7773 0.77726428 2288 P29401;A0A0B4J1R6;E9PFF2 TKT Transketolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 138.08 138.08 2;3 1.0784E-09 143919 QUIQUE_C1218_190116_001 154.15 134.16 18517000000 801560000 1626300000 1520100000 1222400000 1582700000 1351500000 1229000000 1300900000 2077400000 892880000 2036600000 1489700000 1385700000 25518 2288 23983 233602;233603;233604;233605;233606;233607;233608;233609;233610;233611;233612;233613;233614;233615;233616;233617;233618;233619;233620;233621;233622;233623;233624;233625;233626;233627;233628 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299066;299067;299068;299069;299070;299071;299072;299073;299074;299075;299076;299077;299078;299079;299080;299081;299082;299083 299075 17 LDPHLVLDQLR Unmodified 1317.7405 0.74048484 2378;2379 P35579;P35580 MYH9;MYH10 Myosin-9;Myosin-10 no no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 99.692 99.692 2;3 0.00012902 103041 QUIQUE_C1368_190116_001 103.91 91.99 3279600000 136360000 135460000 293620000 387940000 367450000 141910000 306510000 168080000 309100000 93477000 361740000 266910000 311070000 25535 2378;2379 23999 233770;233771;233772;233773;233774;233775;233776;233777;233778;233779;233780;233781;233782;233783;233784;233785;233786;233787;233788;233789;233790;233791 299084;299085;299086;299087;299088;299089;299090;299091;299092;299093;299094;299095;299096;299097;299098;299099;299100;299101;299102;299103;299104;299105;299106;299107;299108;299109;299110;299111;299112;299113;299114 299089 28 LDPHNHVLYSNR Unmodified 1463.727 0.72696004 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes 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Endothelial differentiation-related factor 1 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 2 10.36 10.36 3;4 0.00016293 2765 QUIQUE_C1403_190116_001 84.753 64.02 170570000 10969000 0 0 30637000 19139000 0 0 20351000 39690000 0 0 49783000 0 25562 1598 24024 234035;234036;234037;234038;234039;234040;234041;234042;234043;234044;234045 299442;299443;299444;299445;299446;299447;299448;299449;299450;299451;299452;299453;299454 299444 13 LDSELKNMQDMVEDYR 2 Oxidation (M) 2016.8769 0.87685626 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 2 1 1 1 53.955 53.955 2 6.6529E-05 52127 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.65 97.139 53884000 0 0 0 0 0 0 0 35529000 0 0 0 0 18355000 + 25563 1859 24025 234046;234047 299455;299456 299455 1071;1072 2 LDSGDLLQQAQEIR Unmodified 1584.8107 0.81074925 3418 Q6XQN6;G5E977;C9J8U2 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 108.01 108.01 2 6.4745E-14 110498 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.04 141.08 685200000 0 93910000 123790000 76935000 0 65893000 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mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 99.929 99.929 2 0.015256 44984 QUIQUE_C1218_190116_001 67.726 46.426 126320000 97115000 0 0 0 0 0 0 0 0 29208000 0 0 0 25571 2452 24033 234107;234108;234109;234110 299526;299527;299528;299529 299526 4 LDSSDIYNELK Unmodified 1295.6245 0.62451161 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.102 97.102 2 0.00047841 99296 QUIQUE_C1277_190116_001 101.97 74.232 65036000 31527000 33508000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25572 2285 24034 234111;234112;234113;234114;234115 299530;299531;299532;299533;299534 299531 5 LDSSETTMVK Oxidation (M) 1125.5224 0.52235473 4395 Q9UBE0;M0QX65;B3KNJ4;M0R054 SAE1 SUMO-activating enzyme subunit 1;SUMO-activating enzyme subunit 1, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 1 18.558 18.558 2 0.018334 11126 QUIQUE_C1218_190116_001 63.397 46.158 52158000 23765000 28392000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25573 4395 24035 234116;234117 299535;299536 299535 2 LDSSSEPFKK Unmodified 1136.5714 0.57135383 3151 Q15714 TSC22D1 TSC22 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Unmodified 1815.9982 0.99821567 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;F8VY04 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 162.6 162.6 2 0.00024953 169760 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.35 77.912 66829000 10786000 0 0 0 0 0 0 0 24288000 0 31755000 0 0 25576 1047 24038 234141;234142;234143 299576;299577;299578 299578 3 LDTAMWLSR Unmodified 1091.5434 0.54336494 2683 P57088;D6RAA6;J3KN43;D6RBY2 TMEM33 Transmembrane protein 33 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.139 94.139 2 0.0019343 96327 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.582 50.733 286400000 24810000 21455000 25749000 27424000 0 20246000 28485000 37619000 0 0 41596000 29165000 29853000 25577 2683 24039 234144;234145;234146;234147;234148;234149;234150;234151;234152;234153 299579;299580;299581;299582;299583;299584;299585;299586;299587;299588;299589 299588 10 LDTDDLDEIEK Unmodified 1304.5984 0.59835644 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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234427;234428;234429;234430;234431;234432;234433;234434;234435;234436;234437;234438;234439;234440;234441;234442;234443;234444;234445;234446;234447;234448;234449;234450 299897;299898;299899;299900;299901;299902;299903;299904;299905;299906;299907;299908;299909;299910;299911;299912;299913;299914;299915;299916;299917;299918;299919;299920;299921;299922;299923;299924;299925 299898 27 LDYGQHVVAGTPGR Unmodified 1468.7423 0.74227576 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 40.19 40.19 2;3 0.00012211 35673 QUIQUE_C1368_190116_001 72.417 49.299 1355700000 57245000 46565000 254430000 199380000 59794000 143380000 64951000 80395000 82817000 42756000 173900000 79782000 70260000 25619 2416 24078 234451;234452;234453;234454;234455;234456;234457;234458;234459;234460;234461;234462;234463;234464;234465;234466;234467;234468 299926;299927;299928;299929;299930;299931;299932;299933;299934;299935;299936;299937;299938;299939;299940;299941;299942;299943;299944;299945;299946;299947 299930 21 LDYHISVQNMMR Unmodified 1505.7119 0.7119036 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 3 2 1 2 2 2 87.605 87.605 2;3 6.1034E-20 89007 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.41 143.36 3646500000 437700000 529820000 330600000 222060000 314110000 330240000 318230000 145000000 265170000 31918000 286120000 231090000 204480000 25620 2230 24079 234469;234470;234471;234472;234473;234474;234475;234476;234477;234478;234479;234480;234481;234482;234483;234484;234485;234486;234487;234488;234489;234490;234491 299948;299949;299950;299951;299952;299953;299954;299955;299956;299957;299958;299959;299960;299961;299962;299963;299964;299965;299966;299967;299968;299969;299970;299971;299972 299962 24 LDYHISVQNMMR 2 Oxidation (M) 1537.7017 0.70173285 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) 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protein no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.748 72.748 3 0.00015758 73345 QUIQUE_C1277_190116_001 91.658 74.447 323400000 22486000 30925000 21102000 0 30128000 19501000 34903000 0 32947000 0 47136000 40396000 43880000 25631 264;910 24088 234583;234584;234585;234586;234587;234588;234589;234590;234591;234592 300094;300095;300096;300097;300098;300099;300100;300101;300102;300103;300104 300096 11 LEAAAQVR Unmodified 856.47667 0.47666558 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2;E9PP11;E9PJY4;E9PPD4;E9PJF9;E9PPZ2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 17.506 17.506 2 0.016536 9732 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.29 40.915 239630000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 239630000 0 0 0 25632 959 24089 234593 300105 300105 0 LEAADEGSGDVK Unmodified 1189.5463 0.54626129 2869;903;4487 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3;Q9ULD0 OGDH;OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial;2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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300507 352 LEAENNLAAYRQEADEATLAR Unmodified 2347.1404 0.14041625 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 5 1 1 3 3 4 89.257 89.257 2;3;4 4.2883E-54 90677 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.16 139.66 125670000000 310760000 217350000 377860000 127110000 839680000 76847000 596130000 40522000000 16767000000 42973000 24861000000 20467000000 20462000000 25648 389;395;1336 24105 234951;234952;234953;234954;234955;234956;234957;234958;234959;234960;234961;234962;234963;234964;234965;234966;234967;234968;234969;234970;234971;234972;234973;234974;234975;234976;234977 300640;300641;300642;300643;300644;300645;300646;300647;300648;300649;300650;300651;300652;300653;300654;300655;300656;300657;300658;300659;300660;300661;300662;300663;300664;300665;300666;300667;300668;300669;300670;300671;300672;300673;300674;300675;300676;300677;300678;300679;300680;300681;300682;300683;300684;300685;300686;300687;300688 300654 46 LEAFLGR Unmodified 804.44939 0.4493882 3901 Q96LD8 SENP8 Sentrin-specific protease 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.961 54.961 2 0.020578 53735 QUIQUE_C1277_190116_001 107.74 51.234 321360000 44930000 54801000 50276000 0 53245000 0 0 0 42298000 0 75807000 0 0 25649 3901 24106 234978;234979;234980;234981;234982;234983 300689;300690;300691;300692;300693;300694;300695 300690 7 LEAFLTQK Unmodified 948.52803 0.52803245 2395;2875 Q02750;P36507;A0A1B0GUL7 MAP2K1;MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1;Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 52.758 52.758 2 0.0044718 49852 QUIQUE_DMIX8_190116_001 109.01 53.571 2805600000 372210000 330860000 191510000 266280000 221910000 249500000 139410000 219330000 214100000 116120000 149790000 197900000 136650000 25650 2875;2395 24107 234984;234985;234986;234987;234988;234989;234990;234991;234992;234993;234994;234995;234996;234997;234998;234999 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1191.6724 0.67240528 937 E9PIE3;Q969G5 PRKCDBP Protein kinase C delta-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.266 33.266 3 0.0032442 28018 QUIQUE_C1277_190116_001 50.09 31.344 271260000 42153000 67744000 0 73909000 74405000 0 0 0 0 13052000 0 0 0 25665 937 24122 235095;235096;235097;235098;235099 300820;300821;300822;300823;300824 300821 3 LEAPDADELPK Unmodified 1196.5925 0.5924832 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 3 1 1 2 2 62.784 62.784 2 0.00043855 62111 QUIQUE_C1277_190116_001 103.7 73.446 2741900000 573030000 332850000 387960000 328630000 170320000 194850000 140720000 0 83601000 240930000 83343000 0 205660000 25666 3975 24123 235100;235101;235102;235103;235104;235105;235106;235107;235108;235109;235110;235111;235112;235113;235114;235115;235116;235117;235118;235119;235120 300825;300826;300827;300828;300829;300830;300831;300832;300833;300834;300835;300836;300837;300838;300839;300840;300841;300842;300843;300844;300845;300846;300847;300848;300849;300850;300851;300852;300853;300854;300855;300856;300857;300858;300859;300860;300861;300862;300863 300828 39 LEAPDADELPKGEFDPGQDTYQHPPK Unmodified 2893.3406 0.3406322 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 2 3 2 84.25 84.25 3;4 1.6507E-24 85338 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.85 113.74 5613100000 464910000 399840000 445480000 403280000 305080000 225410000 336520000 374800000 529330000 78801000 938710000 572950000 537990000 25667 3975 24124 235121;235122;235123;235124;235125;235126;235127;235128;235129;235130;235131;235132;235133;235134;235135;235136;235137;235138;235139;235140;235141;235142;235143;235144;235145;235146;235147 300864;300865;300866;300867;300868;300869;300870;300871;300872;300873;300874;300875;300876;300877;300878;300879;300880;300881;300882;300883;300884;300885;300886;300887;300888;300889;300890;300891;300892;300893;300894;300895;300896;300897;300898;300899;300900;300901;300902;300903;300904;300905;300906;300907;300908 300894 44 LEAPELPVK Unmodified 994.5699 0.56989727 78 A0A087WYP2;Q8IZQ5;H0YE28 C11orf31;SELH Selenoprotein H yes no 0 0 0 1 67.394 67.394 2 0.03011 66304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.258 21.366 16317000 0 0 0 0 0 0 0 16317000 0 0 0 0 0 25668 78 24125 235148 300909 300909 1 LEAPLEELR Unmodified 1068.5815 0.58152458 3177 Q16401;F2Z3J2 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.742 77.742 2 0.0079259 79900 QUIQUE_C1438_190116_001 80.219 43.662 882320000 0 0 108720000 77523000 100930000 90499000 0 78280000 97870000 0 141510000 89439000 97544000 25669 3177 24126 235149;235150;235151;235152;235153;235154;235155;235156;235157 300910;300911;300912;300913;300914;300915;300916;300917;300918 300912 5 LEAQHQALVTLWHQLHVDMK Oxidation (M) 2412.2372 0.23723394 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 2 1 1 2 2 2 1 97.878 97.878 3;4;5 7.0825E-10 101684 QUIQUE_C1218_190116_001 110.6 104.24 1617300000 347920000 84007000 0 0 0 0 0 348440000 435360000 208490000 140430000 52630000 0 25670 3117 24127 235158;235159;235160;235161;235162;235163;235164;235165;235166;235167;235168 300919;300920;300921;300922;300923;300924;300925;300926;300927;300928;300929 300919 2565 11 LEAQHQALVTLWHQLHVDMK Unmodified 2396.2423 0.24231932 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 3 1 2 1 3 3 3 2 2 1 1 110.13 110.13 3;4;5 4.381E-30 113525 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.04 128.72 6384900000 330620000 544830000 643910000 141880000 255960000 274750000 667690000 790270000 940520000 191450000 611550000 514950000 476540000 25671 3117 24127 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Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 40.777 40.777 2 0.0043417 37003 QUIQUE_C1277_190116_001 100.69 57.175 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25673 2385 24129 235203 300980 300980 1 LEASIER Unmodified 816.43413 0.43413207 4399 Q9UBI6 GNG12 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.125 22.125 2 0.019293 15878 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.02 34.569 609270000 0 0 122200000 0 112840000 0 83521000 109830000 0 31615000 0 0 149270000 25674 4399 24130 235204;235205;235206;235207;235208;235209 300981;300982;300983;300984;300985;300986 300984 6 LEASSGILEVLHCVLVESPEALNIIK Unmodified 2832.5307 0.53068157 1213 H7BY35;Q92736 RYR2 Ryanodine receptor 2 yes no 0 0 0 1 170.96 170.96 3 5.728E-20 174516 QUIQUE_C1277_190116_001 106.45 96.733 69348000 0 69348000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25675 1213 24131 235210 300987 300987 1 LEATINELV Unmodified 1000.5441 0.54407645 1999 P10599 TXN Thioredoxin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 114.84 114.84 1;2 0.0011468 118414 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24135 235247;235248;235249;235250;235251;235252;235253;235254;235255;235256;235257 301025;301026;301027;301028;301029;301030;301031;301032;301033;301034;301035;301036;301037 301030 13 LEAVLSTIFYQLNK Unmodified 1637.9029 0.90285872 4608 Q9Y4J8;K7ERZ2;K7ESB2;K7EJ84 DTNA Dystrobrevin alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 151.75 151.75 2;3 1.3769E-28 157811 QUIQUE_C1218_190116_001 171.62 147.76 1668200000 98119000 114740000 97060000 115210000 83370000 132010000 160230000 97477000 212020000 148680000 147180000 137220000 124870000 25681 4608 24136 235258;235259;235260;235261;235262;235263;235264;235265;235266;235267;235268;235269;235270;235271 301038;301039;301040;301041;301042;301043;301044;301045;301046;301047;301048;301049;301050;301051;301052;301053;301054;301055;301056;301057;301058;301059 301040 21 LEAVLSTIFYQLNKR Unmodified 1794.004 0.003969751 4608 Q9Y4J8;K7ERZ2;K7ESB2;K7EJ84 DTNA Dystrobrevin alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 136.77 136.77 3 2.8797E-07 141644 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301065;301066;301067;301068;301069;301070;301071;301072;301073;301074;301075;301076;301077;301078;301079;301080;301081;301082;301083;301084;301085;301086;301087;301088;301089;301090;301091;301092;301093 301088 25 LECADLLETR Unmodified 1218.5914 0.59143734 3393 Q6PI48;A0A3B3IT01;A0A3B3ISK7;A0A3B3IS01;A0A3B3ITK9 DARS2 Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 70.713 70.713 2 0.011602 69685 QUIQUE_C1563_190116_001 78.556 50.348 67846000 23147000 0 28125000 0 0 16574000 0 0 0 0 0 0 0 25684 3393 24139 235304;235305;235306;235307 301094;301095;301096;301097 301096 4 LECEINTYR Unmodified 1196.5496 0.54957253 785 CON__Q14525;Q14525;CON__Q9UE12;CON__Q15323;Q15323;CON__Q6NTB9;CON__O76009;O76009 KRT33B;KRT31;KRT33A Keratin, type I cuticular Ha3-II;Keratin, type I cuticular Ha1;Keratin, type I cuticular Ha3-I no no 0 0 0 1 1 41.35 41.35 2 0.0050274 37973 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.639 52.344 66294000 0 0 0 0 0 0 0 0 32917000 0 0 33376000 0 + 25685 785 24140 235308;235309 301098;301099 301098 2 LECGGGPWGNK Unmodified 1173.5237 0.52369213 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.246 37.246 2 5.799E-08 33855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.65 119.47 2437600000 153370000 160930000 242820000 261080000 192420000 224360000 257630000 163300000 162560000 49330000 229370000 170330000 170130000 25686 1776 24141 235310;235311;235312;235313;235314;235315;235316;235317;235318;235319;235320;235321;235322 301100;301101;301102;301103;301104;301105;301106;301107;301108;301109;301110;301111;301112;301113;301114;301115;301116;301117;301118;301119;301120;301121;301122;301123;301124;301125;301126;301127;301128;301129;301130 301118 31 LECQQALSHWLSNQVPR Unmodified 2065.0163 0.016342126 4377 Q9P227 ARHGAP23 Rho GTPase-activating protein 23 yes yes 0 0 0 1 166.52 166.52 3 0.059872 171104 QUIQUE_DMIX3_190116_001 15.022 7.3095 47538000 0 0 0 0 0 0 0 0 47538000 0 0 0 0 25687 4377 24142 235323 301131 301131 1 LECSEELGDLVK Unmodified 1390.665 0.66499622 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.17 84.17 2 1.528E-28 85319 QUIQUE_C1277_190116_001 185.29 133.44 1647400000 422990000 350340000 0 280990000 0 264280000 260600000 0 0 68239000 0 0 0 25688 50;2631 24143 235324;235325;235326;235327;235328;235329 301132;301133;301134;301135;301136;301137 301133 5 LECTNLYR Unmodified 1067.507 0.50697943 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 36.452 36.452 2 0.056145 32403 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.157 25.984 32630000 0 0 0 0 0 0 0 0 32630000 0 0 0 0 25689 1187 24144 235330 301138 301138 1 LEDAADVYR Unmodified 1050.4982 0.49818889 207 A0A0B4J1W3;Q9BXJ9 NAA15 N-alpha-acetyltransferase 15, NatA auxiliary subunit yes no 0 0 0 1 41.708 41.708 2 0.066018 36205 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.981 30.807 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25690 207 24145 235331 301139 301139 1 LEDALLR Unmodified 828.47052 0.47051757 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 47.746 47.746 2 0.025533 45129 QUIQUE_C1368_190116_001 95.793 18.298 484320000 0 0 209360000 0 0 131170000 0 0 0 0 0 0 143780000 25691 16;1475 24146 235332;235333;235334 301140;301141;301142 301140 3 LEDAPPVNQMVK Unmodified 1339.6806 0.6805867 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 57.336 57.336 2 0.0013491 56620 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.915 61.586 132420000 0 0 0 0 33750000 0 42111000 0 0 0 56557000 0 0 25692 699 24147 235335;235336;235337;235338;235339;235340;235341 301143;301144;301145;301146;301147;301148;301149 301149 6 LEDEFDMFALTR Unmodified 1485.681 0.68098063 1592 O60784 TOM1 Target of Myb protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.71 139.71 2 0.0015709 142872 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.72 46.114 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25693 1592 24148 235342;235343;235344;235345;235346;235347;235348;235349;235350;235351 301150;301151;301152;301153;301154;301155;301156;301157;301158;301159 301155 10 LEDEGGYFCQLYTEDTHHQIATLTVLVAPENPVVEVR Unmodified 4242.0579 0.057938755 3655 Q8NFZ8 CADM4 Cell adhesion molecule 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.77 151.77 4 8.3826E-11 156840 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.014 53.015 312990000 0 0 0 0 0 0 105220000 0 0 0 74247000 64454000 69068000 25694 3655 24149 235352;235353;235354;235355 301160;301161;301162;301163;301164;301165 301165 5 LEDFFAR Unmodified 896.43922 0.43921744 2024 P11413;E7EUI8;E9PD92;E7EM57 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 76.064 76.064 2 0.019774 75683 QUIQUE_C1563_190116_001 122.98 46.145 324480000 0 0 100180000 0 0 104670000 0 0 0 47213000 0 72415000 0 25695 2024 24150 235356;235357;235358;235359 301166;301167;301168;301169 301167 4 LEDFRDYR Unmodified 1112.5251 0.52507234 1544;2047;1242;2381;1313 H9KV75;O43707;P12814;P35609;F6THM6;K7EJH8 ACTN1;ACTN4;ACTN2 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1;Alpha-actinin-2 no no 0 0 1 1 43.219 43.219 3 0.037471 39565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.794 31.563 84442000 0 0 0 0 0 0 0 84442000 0 0 0 0 0 25696 1242;1544;2047;2381;1313 24151 235360 301170 301170 1 LEDGTEFDSSLPQNQPFVFSLGTGQVIK Unmodified 3052.5029 0.5029465 2256 P26885;F5H0N4 FKBP2 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP2;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 3 1 2 1 154.59 154.59 2;3 2.2354E-64 159346 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.07 178.02 1609700000 145270000 180290000 21263000 105820000 156640000 125340000 144330000 110260000 169360000 55416000 236170000 159500000 0 25697 2256 24152 235361;235362;235363;235364;235365;235366;235367;235368;235369;235370;235371;235372;235373;235374;235375;235376;235377;235378 301171;301172;301173;301174;301175;301176;301177;301178;301179;301180;301181;301182;301183;301184;301185;301186;301187;301188;301189;301190;301191;301192 301186 21 LEDILESINSIK Unmodified 1372.745 0.7449611 4584 Q9Y3A6 TMED5 Transmembrane emp24 domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 125.4 125.4 2 0.00051629 130915 QUIQUE_C1438_190116_001 94.465 66.452 98021000 28213000 0 0 0 46168000 0 23640000 0 0 0 0 0 0 25698 4584 24153 235379;235380;235381;235382;235383;235384;235385 301193;301194;301195;301196;301197;301198;301199 301196 6 LEDLASLVYLNESSVLHTLR Unmodified 2271.2111 0.21106199 271 A0A0D9SFK2;Q92614;H0YEV9 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 154.8 154.8 3 0.00040126 160194 QUIQUE_C1368_190116_001 76.118 71.185 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25699 271 24154 235386;235387;235388 301200;301201;301202 301201 3 LEDLEVIQHR Unmodified 1250.6619 0.66190017 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 49.538 49.538 2;3 2.2164E-14 47687 QUIQUE_C1438_190116_001 174.85 67.382 10233000000 1136800000 1212500000 1031700000 987320000 1107100000 858100000 938060000 102990000 577060000 522070000 623430000 505210000 630440000 25700 2851 24155 235389;235390;235391;235392;235393;235394;235395;235396;235397;235398;235399;235400;235401;235402;235403;235404;235405;235406;235407;235408;235409;235410;235411;235412;235413 301203;301204;301205;301206;301207;301208;301209;301210;301211;301212;301213;301214;301215;301216;301217;301218;301219;301220;301221;301222;301223;301224;301225;301226;301227;301228;301229;301230;301231;301232 301213 29 LEDLEVVQQR Unmodified 1227.6459 0.64591575 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.962 58.962 2 0.00020227 54767 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.07 84.681 544590000 145460000 104010000 0 115810000 0 0 0 33515000 0 42406000 103390000 0 0 25701 1472 24156 235414;235415;235416;235417;235418;235419 301233;301234;301235;301236;301237;301238;301239 301238 7 LEDLIVK Unmodified 828.49567 0.49566969 2232 P24752;H0YEL7 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.91 50.91 2 0.019305 46771 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.19 49.409 6462300000 613510000 510930000 635150000 482120000 578770000 460230000 580740000 0 551540000 230260000 646510000 551670000 620830000 25702 2232 24157 235420;235421;235422;235423;235424;235425;235426;235427;235428;235429;235430;235431 301240;301241;301242;301243;301244;301245;301246;301247;301248;301249;301250;301251;301252;301253;301254;301255 301251 16 LEDLIVKDGLTDVYNK Unmodified 1833.9724 0.97239485 2232 P24752;H0YEL7 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 99.339 99.339 3 0.00025391 100944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.349 65.41 42265000 0 0 0 0 0 0 0 42265000 0 0 0 0 0 25703 2232 24158 235432 301256 301256 1 LEDLLQDAQDEK Unmodified 1415.678 0.67800374 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.811 79.811 2 7.0311E-06 76965 QUIQUE_DMIX4_190116_001 133.75 105.74 2216800000 359780000 272910000 290060000 142170000 156900000 177320000 175430000 79293000 0 182770000 165600000 110260000 104240000 25704 3117 24159 235433;235434;235435;235436;235437;235438;235439;235440;235441;235442;235443;235444 301257;301258;301259;301260;301261;301262;301263;301264;301265;301266;301267;301268;301269;301270 301267 13 LEDLLQDAQDEKEQLNEYK Unmodified 2320.1071 0.10705043 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 3 2 2 2 2 2 2 1 110.15 110.15 2;3 5.2453E-151 114677 QUIQUE_C1218_190116_001 251.91 231.52 12967000000 567330000 705500000 1042600000 333020000 940340000 404190000 672070000 1651600000 1506100000 545740000 1876000000 1780500000 941620000 25705 3117 24160 235445;235446;235447;235448;235449;235450;235451;235452;235453;235454;235455;235456;235457;235458;235459;235460;235461;235462;235463;235464;235465;235466;235467;235468;235469 301271;301272;301273;301274;301275;301276;301277;301278;301279;301280;301281;301282;301283;301284;301285;301286;301287;301288;301289;301290;301291;301292;301293;301294;301295;301296;301297;301298;301299;301300;301301;301302;301303 301271 33 LEDLLQDAQDEKEQLNEYKGHLSGLAK Unmodified 3083.5411 0.54112292 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 2 2 1 1 1 1 114.38 114.38 4;5 5.8651E-54 118216 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.57 106.4 817520000 0 0 0 0 0 0 0 462170000 112860000 0 99305000 67055000 76126000 25706 3117 24161 235470;235471;235472;235473;235474;235475 301304;301305;301306;301307;301308;301309;301310;301311;301312;301313 301309 10 LEDLSESIVNDFAYMK Unmodified 1872.8815 0.88153093 2542 P49755 TMED10 Transmembrane emp24 domain-containing protein 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 150.93 150.93 2 0.00012644 156115 QUIQUE_C1368_190116_001 91.858 61.308 123490000 34953000 23451000 29964000 0 0 26759000 0 0 0 8366400 0 0 0 25707 2542 24162 235476;235477;235478;235479;235480 301314;301315;301316;301317;301318 301316 5 LEDLVCDVVDR Unmodified 1331.6391 0.63911582 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.009 97.009 2 0.0023872 94327 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.67 60.083 1976400000 259440000 225840000 245620000 231890000 0 194840000 169580000 48420000 88750000 117400000 165640000 114690000 114320000 25708 1553 24163 235481;235482;235483;235484;235485;235486;235487;235488;235489;235490;235491;235492 301319;301320;301321;301322;301323;301324;301325;301326;301327;301328;301329;301330 301327 3 LEDMEQALSPSVFK Unmodified 1592.7756 0.7756093 1879 P05155;E9PGN7 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 0 0 1 1 1 115.07 115.07 2 0.0002514 119308 QUIQUE_C1368_190116_001 107.18 89.311 183070000 0 0 67512000 44047000 71509000 0 0 0 0 0 0 0 0 25709 1879 24164 235493;235494;235495 301331;301332;301333 301331 2 LEDNDSAASDPDAETTAR Unmodified 1876.7923 0.79225823 4079 Q9BYV8;C9J9X8;C9JCX6;C9JXA0;F8WF85;C9J6R3 CEP41 Centrosomal protein of 41 kDa yes no 0 0 0 1 1 30.842 30.842 2 6.5444E-05 25549 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.939 69.335 35408000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16742000 18666000 25710 4079 24165 235496;235497 301334;301335 301335 2 LEDPDPGVQSAAVNVICELAR Unmodified 2252.1107 0.11069602 1437 O14617;A0A2R8Y4J3;A0A087WYN6 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 151.29 151.29 2;3 4.2308E-10 157028 QUIQUE_C1218_190116_001 104.06 93.68 446040000 65615000 81438000 17001000 51505000 77532000 12108000 40031000 0 27909000 6883800 39632000 26385000 0 25711 1437 24166 235498;235499;235500;235501;235502;235503;235504;235505;235506;235507;235508;235509;235510;235511;235512 301336;301337;301338;301339;301340;301341;301342;301343;301344;301345;301346;301347;301348;301349;301350;301351;301352;301353;301354 301337 19 LEDPHVDIIR Unmodified 1205.6404 0.64043645 4023 Q9BTV4 TMEM43 Transmembrane protein 43 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.924 54.924 3 0.013164 53087 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.5 23.562 106560000 19813000 0 28260000 25623000 0 14965000 0 17899000 0 0 0 0 0 25712 4023 24167 235513;235514;235515;235516;235517;235518 301355;301356;301357;301358;301359;301360 301360 6 LEDQLQGGQLEEVILQAEHELNLAR Unmodified 2844.4618 0.46175038 3191 Q16718;A0A087X1G1;H7BYD0;A0A087WXR5 NDUFA5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.59 166.59 3 4.7431E-57 171284 QUIQUE_C1218_190116_001 154.14 135.42 2195400000 176240000 343760000 220310000 95890000 234870000 0 197700000 79745000 139480000 20996000 304060000 0 382380000 25713 3191 24168 235519;235520;235521;235522;235523;235524;235525;235526;235527;235528;235529 301361;301362;301363;301364;301365;301366;301367;301368;301369;301370;301371;301372;301373;301374 301361 13 LEDRETVIK Unmodified 1101.603 0.60298831 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 19.127 19.127 3 0.045562 12056 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.463 6.205 141380000 0 0 0 0 0 0 0 0 141380000 0 0 0 0 25714 890;3052 24169 235530 301375 301375 0 LEDSLWVSLTDQHVQLPMAMTAENLAVK Unmodified 3138.573 0.57295709 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0;K7EJ68 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 157.89 157.89 3;4 5.7776E-37 163933 QUIQUE_C1576_190116_001 112.86 104.01 740960000 0 0 0 0 0 0 93773000 117440000 134450000 0 276160000 119130000 0 25715 2453 24170 235531;235532;235533;235534;235535;235536;235537;235538 301376;301377;301378;301379;301380;301381;301382;301383 301377 7 LEDSLWVSLTDQHVQLPMAMTAENLAVK Oxidation (M) 3154.5679 0.56787171 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0;K7EJ68 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 149.76 149.76 3 5.5117E-13 157006 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.569 66.909 103450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60841000 42605000 0 25716 2453 24170 235539;235540;235541 301384;301385;301386 301385 1877;1878 3 LEDSVTYHCSR Unmodified 1365.5983 0.59831364 630 E7ETN3;B4E1Z4;P00751;A0A0G2JH38 CFB Complement factor B;Complement factor B Ba fragment;Complement factor B Bb fragment yes no 0 0 0 1 1 1 21.181 21.181 2 0.0013466 14221 QUIQUE_C1438_190116_001 76.228 48.486 98416000 0 0 0 0 54232000 0 44184000 0 0 0 0 0 0 25717 630 24171 235542;235543;235544 301387;301388;301389 301387 3 LEDTENWLYEDGEDQPK Unmodified 2079.8909 0.89090965 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.66 99.66 2 1.9637E-53 102640 QUIQUE_C1368_190116_001 227.57 212.03 1550000000 110570000 116980000 113500000 139170000 132900000 92585000 148930000 132610000 133860000 48923000 138800000 105890000 135240000 25718 2363 24172 235545;235546;235547;235548;235549;235550;235551;235552;235553;235554;235555;235556;235557 301390;301391;301392;301393;301394;301395;301396;301397;301398;301399;301400;301401;301402;301403;301404;301405;301406;301407;301408 301394 19 LEDTYFDR Unmodified 1057.4716 0.47163978 2858 Q01581 HMGCS1 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 56.437 56.437 2 0.037693 54432 QUIQUE_C1403_190116_001 61.999 26.119 118010000 22719000 0 19116000 31786000 23513000 20875000 0 0 0 0 0 0 0 25719 2858 24173 235558;235559;235560;235561;235562 301409;301410;301411;301412;301413 301411 5 LEDVALQILLACPVSK Unmodified 1767.9805 0.98045712 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 148.23 148.23 2 0.010559 152916 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.864 62.825 21571000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21571000 0 25720 2452 24174 235563 301414 301414 1 LEDVLPLAFTR Unmodified 1272.7078 0.70778773 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;B0QZK4;Q5SWC8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.86 123.86 2 0.0050017 126404 QUIQUE_C1563_190116_001 88.681 65.941 890950000 35793000 46414000 92214000 59555000 96704000 84687000 76999000 71077000 70153000 28020000 97677000 32277000 99377000 25721 3297 24175 235564;235565;235566;235567;235568;235569;235570;235571;235572;235573;235574;235575;235576 301415;301416;301417;301418;301419;301420;301421;301422;301423;301424;301425;301426;301427;301428;301429 301421 10 LEEAEKAADESER Unmodified 1475.674 0.673981 63;435;2791;1260;1019;1908;3424;1164;557;3325 J3KN67;K7EP68;P06753;Q6ZN40;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;A0A2R8YEU4;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951;F5H7S3;B7Z596;H0YKJ4;H0YK48;A0A087WWU8;D6R904 TPM3;TPM4;TPM1;TPM2b;TPM2 Tropomyosin alpha-3 chain;Tropomyosin alpha-4 chain;Tropomyosin beta chain no no 0 0 1 1 1 18.108 18.108 2 0.003117 10517 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.803 67.381 64606000 0 0 0 0 0 0 0 22163000 0 0 42443000 0 0 + 25722 1260;1908;3424;435;2791;557;3325;1019;1164;63 24176 235577;235578 301430;301431 301431 2 LEEALENLCER Unmodified 1374.6449 0.64492948 306 A0A0J9YYJ0;Q8N129 CNPY4 Protein canopy homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.876 70.876 2 0.0028401 67763 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.573 64.151 321180000 0 0 0 54654000 0 0 0 0 61946000 19911000 66715000 64621000 53339000 25723 306 24177 235579;235580;235581;235582;235583;235584;235585;235586;235587 301432;301433;301434;301435;301436;301437;301438;301439;301440 301437 8 LEEAPGGQGRPEAGRPASEAR Unmodified 2134.0515 0.051541659 277 A0A0E3D6M1;A0A0D9SGI1;Q86UL8 MAGI2 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 2 yes no 0 0 2 1 18.607 18.607 4 0.022006 11451 QUIQUE_DMIX3_190116_001 32.695 13.142 45247000 0 0 0 0 0 0 0 0 45247000 0 0 0 0 25724 277 24178 235588 301441 301441 1 LEEAQAYLAAGQHDLVPHYYVESIADLTEGLED Unmodified 3658.7315 0.73150246 3859 Q96GD0;Q6ZT62;B1AHD3 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes no 0 0 0 2 1 1 1 162.28 162.28 3 6.678E-10 165159 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.971 53.053 242490000 0 0 0 0 0 0 0 71636000 58972000 0 63860000 0 48021000 25725 3859 24179 235589;235590;235591;235592;235593 301442;301443;301444;301445;301446 301443 5 LEEASLLHQFQADADDIDAWMLDILK Oxidation (M) 3015.4536 0.45355346 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 168.33 168.33 3;4 2.8529E-30 172799 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.27 117.19 1787600000 0 0 0 0 111880000 0 124660000 0 507950000 0 685190000 357890000 0 25726 2851 24180 235594;235595;235596;235597;235598;235599 301447;301448;301449;301450;301451;301452 301449 2308 6 LEECQPATENQR Unmodified 1473.6518 0.65180577 4377 Q9P227;A0A087WXU2 ARHGAP23 Rho GTPase-activating protein 23 yes no 0 0 0 1 1 18.85 18.85 2 0.0010478 11470 QUIQUE_C1576_190116_001 83.862 66.631 37415000 0 0 0 0 0 0 37415000 0 0 0 0 0 0 25727 4377 24181 235600;235601 301453;301454 301454 2 LEEDAEMK Unmodified 963.42191 0.4219124 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 0 1 1 20.302 20.302 2 0.021397 13051 QUIQUE_C1368_190116_001 75.213 50.214 90656000 0 0 21228000 0 0 69428000 0 0 0 0 0 0 0 25728 1890 24182 235602;235603 301455;301456 301455 2 LEEDISSSMTNSTAASRPPVTLR Unmodified 2461.2119 0.21186663 3131;1044 F8VZX2;H3BRU6;F8W0G4;F8VXH9;F8W1G6;H3BND9;Q15366 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.782 81.782 3 1.9415E-10 81985 QUIQUE_C1563_190116_001 85.248 72.018 282630000 0 50391000 39369000 61561000 35919000 75092000 0 0 0 20296000 0 0 0 25729 1044;3131 24183 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Unmodified 1206.5768 0.57683314 2196 P22307;H0YF61 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 0 1 47.309 47.309 2 0.022572 44648 QUIQUE_C1218_190116_001 57.708 36.408 152940000 152940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25732 2196 24186 235630 301485 301485 1 LEEEGQSLK Unmodified 1031.5135 0.5135046 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 21.01 21.01 2 0.00023201 13935 QUIQUE_C1368_190116_001 138.54 52.432 158380000000 16167000000 13352000000 17370000000 18700000000 10082000000 21264000000 15811000000 3116800000 7391300000 10947000000 9169400000 6716500000 8291400000 25733 389;395;1336 24187 235631;235632;235633;235634;235635;235636;235637;235638;235639;235640;235641;235642;235643;235644;235645;235646;235647 301486;301487;301488;301489;301490;301491;301492;301493;301494;301495;301496;301497;301498;301499;301500;301501;301502;301503;301504;301505;301506;301507;301508 301492 20 LEEEGQSLKDEMAR Oxidation (M) 1649.7567 0.75666477 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 1 1 6 8 16 14 5 6 4 9 10 6 6 8 6 33.764 33.764 1;2;3 3.8889E-57 16809 QUIQUE_C1368_190116_001 198.74 164.05 378070000000 21079000000 22594000000 67565000000 23989000000 19307000000 26078000000 19276000000 17991000000 35841000000 19479000000 23055000000 40289000000 41523000000 25734 389;395;1336 24188 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301525 276 134 LEEEGQSLKDEMAR Unmodified 1633.7618 0.76175015 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 8 9 15 6 8 13 10 7 16 7 9 8 13 56.461 56.461 1;2;3 3.1069E-214 41355 QUIQUE_DMIX7_190116_001 281.26 209.91 827220000000 45698000000 57765000000 73725000000 80212000000 57157000000 63665000000 64766000000 65247000000 75367000000 45188000000 61829000000 61533000000 75061000000 25735 389;395;1336 24188 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301880 248 LEEEINRR Unmodified 1057.5516 0.55162144 2137 P18433;Q5JWG0 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 14.885 14.885 3 0.0074398 6962 QUIQUE_C1576_190116_001 61.962 9.2462 63946000 25242000 0 14115000 17335000 0 0 7253700 0 0 0 0 0 0 25736 2137 24189 235881;235882;235883;235884 301911;301912;301913;301914 301914 4 LEEELEGMR Unmodified 1104.5121 0.51212439 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 71.071 71.071 2 0.049192 70090 QUIQUE_C1563_190116_001 50.966 14.396 19186000 0 0 0 0 0 19186000 0 0 0 0 0 0 0 25737 2096 24190 235885 301915 301915 1 LEEEQKEEEER Unmodified 1446.6474 0.6474319 3873 Q96HY6;A0A0A0MRX2 DDRGK1 DDRGK domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 14.063 14.063 4 0.059565 6220 QUIQUE_C1438_190116_001 32.008 8.3321 6709700 0 0 0 0 6709700 0 0 0 0 0 0 0 0 25738 3873 24191 235886 301916 301916 1 LEEEVALK Unmodified 929.50696 0.50696266 2508 P48454;G3V111;H0YB02 PPP3CC Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit 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Q9UNM6;A0A087WUL9;J3KNQ3;E9PL38;E9PQG3;E9PPD2;F8W8J6 PSMD13 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.243 32.243 2 0.020625 27151 QUIQUE_C1277_190116_001 107.59 33.155 622990000 0 101830000 0 102970000 0 84028000 114270000 0 0 0 122020000 97858000 0 25756 4512 24209 235957;235958;235959;235960;235961;235962 301998;301999;302000;302001;302002;302003 301998 5 LEEMGFK Unmodified 852.40514 0.40514012 820;594 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 43.564 43.564 2 0.036465 40239 QUIQUE_C1576_190116_001 86.086 31.561 557550000 0 160480000 0 0 0 151600000 135840000 0 33597000 76033000 0 0 0 25757 820;594 24210 235963;235964;235965;235966;235967 302004;302005;302006;302007;302008 302006 5 LEEMGFKDTDPDSKPFSLQETYEAK Unmodified 2904.3375 0.33752065 820;594 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 95.626 95.626 3 4.7135E-16 97804 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Unmodified 1760.9052 0.90524326 989 F5GX39;Q15363;E7EQ72 TMED2 Transmembrane emp24 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 155.54 155.54 3 0.041478 160456 QUIQUE_C1218_190116_001 20.954 15.899 12564000 12564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25761 989 24214 235984 302026 302026 1 LEEMLRPLVEEGLR Unmodified 1682.9025 0.90254115 2061 P13716;B7ZBK6 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 2 2 1 2 1 2 104.77 104.77 2;3 8.1043E-19 107040 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.51 78.711 1914200000 159810000 96656000 290240000 119180000 0 85995000 144720000 341850000 168740000 36470000 209030000 86056000 175480000 25762 2061 24215 235985;235986;235987;235988;235989;235990;235991;235992;235993;235994;235995;235996;235997;235998;235999;236000;236001;236002;236003;236004 302027;302028;302029;302030;302031;302032;302033;302034;302035;302036;302037;302038;302039;302040;302041;302042;302043;302044;302045;302046;302047 302038 20 LEEMLRPLVEEGLR Oxidation (M) 1698.8975 0.89745577 2061 P13716;B7ZBK6 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.499 83.499 3 0.0003238 81208 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.62 76.694 323740000 0 0 46597000 23341000 0 0 0 64780000 44934000 25994000 38185000 40655000 39255000 25763 2061 24215 236005;236006;236007;236008;236009;236010;236011;236012 302048;302049;302050;302051;302052;302053;302054;302055;302056 302053 1387 7 LEENHYNTYISK Unmodified 1509.71 0.70997257 1884 P05230 FGF1 Fibroblast growth factor 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 2 2 34.46 34.46 2;3 8.7288E-28 29319 QUIQUE_DMIX8_190116_001 190.46 134.2 1468900000 0 0 133750000 163240000 83134000 0 162280000 47485000 239390000 21947000 99505000 213060000 305140000 25764 1884 24216 236013;236014;236015;236016;236017;236018;236019;236020;236021;236022;236023;236024;236025;236026;236027;236028;236029 302057;302058;302059;302060;302061;302062;302063;302064;302065;302066;302067;302068;302069;302070;302071;302072;302073;302074;302075;302076 302076 20 LEENLPILQQPTEK Unmodified 1650.8829 0.88285156 1586 O60664;K7ERZ3;K7EL96;K7ER39 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 0 1 1 91.381 91.381 2 0.00074931 93245 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.134 71.22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25765 1586 24217 236030;236031 302077;302078 302077 2 LEEPTPAPSTSYSPQADSLR Unmodified 2145.0226 0.022592521 1074 G3V1L9;Q07157 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 75.375 75.375 2 1.0927E-09 75545 QUIQUE_C1403_190116_001 134.88 114.5 35069000 0 0 0 35069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25766 1074 24218 236032;236033 302079;302080 302080 2 LEEQDEFEK Unmodified 1165.5139 0.51389853 4293 Q9NTJ5;E9PGZ4;C9JV50 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.717 33.717 2 0.0021526 29218 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.311 35.722 57052000 0 0 0 0 0 25537000 0 0 0 0 31516000 0 0 25767 4293 24219 236034;236035;236036;236037;236038 302081;302082;302083;302084;302085;302086 302086 6 LEEQLENLIEFIR Unmodified 1644.8723 0.87228688 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 158.59 158.59 2;3 5.7797E-41 163287 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.81 65.08 2849300000 27018000 293170000 558470000 201980000 156560000 294330000 229010000 188120000 277880000 71399000 203150000 182980000 165220000 25768 3116 24220 236039;236040;236041;236042;236043;236044;236045;236046;236047;236048;236049;236050;236051;236052;236053;236054;236055;236056;236057;236058;236059;236060;236061 302087;302088;302089;302090;302091;302092;302093;302094;302095;302096;302097;302098;302099;302100;302101;302102;302103;302104;302105;302106;302107;302108;302109;302110;302111;302112 302103 22 LEEQLGR Unmodified 843.44503 0.4450311 3999 Q9BR76;A9Z1Z3 CORO1B;FER1L4 Coronin-1B;Fer-1-like protein 4 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 2 24.021 24.021 2 0.019342 14736 QUIQUE_C1438_190116_001 117.7 21.742 3579800000 466970000 0 49302000 0 546760000 329780000 476320000 129270000 87803000 423950000 94843000 546640000 428190000 25769 3999 24221 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Serpin B6 yes no 0 0 0 1 97.229 97.229 2 0.012814 93788 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.348 30.834 29128000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29128000 0 0 0 25774 2371 24226 236152 302228 302228 1 LEETKLEAVR Unmodified 1186.6558 0.65575216 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;Q14168;E5RI47;A0A087WVY2;E5RK50;E5RJK0;E5RK44;E5RI32;E5RIU3;A0A087X0C7;E5RFN8 MPP2 MAGUK p55 subfamily member 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 38.759 38.759 2;3 0.0056386 46382 QUIQUE_C1368_190116_001 58.699 10.855 867530000 68784000 68939000 107710000 96339000 0 64913000 82747000 95573000 64011000 0 89123000 80370000 49014000 25775 159 24227 236153;236154;236155;236156;236157;236158;236159;236160;236161;236162;236163;236164;236165;236166 302229;302230;302231;302232;302233;302234;302235;302236;302237;302238;302239;302240;302241;302242;302243;302244;302245 302233 17 LEETLAQFPLQPGK Unmodified 1569.8403 0.84025847 3922 Q96Q05;H0YBR0;A0A0J9YWK7 TRAPPC9 Trafficking protein particle complex subunit 9 yes no 0 0 0 1 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302251;302252;302253;302254;302255;302256;302257;302258;302259;302260;302261;302262;302263;302264;302265;302266;302267;302268;302269;302270;302271 302258 21 LEETQALLR Unmodified 1071.5924 0.59242362 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.092 52.092 2 0.0021582 50223 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.253 35.343 1847900000 192190000 0 205250000 0 0 179220000 224570000 147020000 154710000 81092000 246050000 211120000 206730000 25779 890;3052 24231 236185;236186;236187;236188;236189;236190;236191;236192;236193;236194 302272;302273;302274;302275;302276;302277;302278;302279;302280;302281 302276 9 LEEVFSEK Unmodified 979.48623 0.48622722 2627 P53609 PGGT1B Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 42.824 42.824 2 0.040193 39627 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.853 31.093 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25780 2627 24232 236195;236196;236197 302282;302283;302284 302284 3 LEEVLER Unmodified 886.476 0.47599688 754 C9JY79;Q9H254;M0QZQ3 SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 yes no 0 0 0 1 43.93 43.93 2 0.036465 41598 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.086 0 112500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112500000 0 0 25781 754 24233 236198 302285 302285 1 LEEVLTNKK Unmodified 1072.6128 0.61282471 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 17.745 17.745 2;3 0.0023004 10689 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.299 24.423 5002500000 292340000 532150000 329220000 361330000 378330000 157240000 325560000 504230000 417860000 199340000 292920000 371870000 840080000 25782 2812 24234 236199;236200;236201;236202;236203;236204;236205;236206;236207;236208;236209;236210;236211;236212;236213;236214;236215 302286;302287;302288;302289;302290;302291;302292;302293;302294;302295;302296;302297;302298;302299;302300;302301;302302 302294 16 LEEVMQELR Unmodified 1145.5751 0.575059 3999 Q9BR76 CORO1B Coronin-1B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 67.693 67.693 2 0.0050274 67605 QUIQUE_C1368_190116_001 87.639 30.462 298540000 0 102430000 196110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25783 3999 24235 236216;236217;236218;236219 302303;302304;302305;302306 302304 3 LEEVMQELR Oxidation (M) 1161.57 0.56997362 3999 Q9BR76 CORO1B Coronin-1B yes yes 0 1 0 1 39.599 39.599 2 0.010831 33961 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.827 24.972 22497000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22497000 0 0 0 25784 3999 24235 236220 302307 302307 2834 1 LEEVNLNNIR Unmodified 1212.6463 0.64625011 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.674 68.674 2 0.00013542 69291 QUIQUE_C1438_190116_001 141.39 73.631 1531600000 0 172180000 153930000 182720000 123740000 136480000 128960000 64952000 136530000 47936000 142330000 121390000 120440000 25785 2279 24236 236221;236222;236223;236224;236225;236226;236227;236228;236229;236230;236231;236232 302308;302309;302310;302311;302312;302313;302314;302315;302316;302317;302318;302319;302320;302321 302312 13 LEEVSPNLVR Unmodified 1154.6295 0.62953741 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.094 57.094 2 0.0015194 53194 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.668 44.186 3889300000 471850000 365550000 505630000 348410000 283780000 437450000 424810000 0 0 198690000 279110000 242410000 331630000 25786 2280 24237 236233;236234;236235;236236;236237;236238;236239;236240;236241;236242;236243 302322;302323;302324;302325;302326;302327;302328;302329;302330;302331;302332;302333 302330 12 LEEYTGTMMK Oxidation (M) 1217.5308 0.53081092 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 33.529 33.529 2 0.0012694 29171 QUIQUE_C1218_190116_001 102.07 77.173 239660000 46136000 111030000 64324000 0 0 0 0 0 0 18166000 0 0 0 25787 1678 24238 236244;236245;236246;236247;236248;236249 302334;302335;302336;302337;302338;302339 302334 915 4 LEEYTGTMMK Unmodified 1201.5359 0.5358963 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.357 50.357 2 0.0062419 48693 QUIQUE_C1576_190116_001 74.92 59.039 1495400000 0 0 225870000 0 147200000 193440000 217150000 0 0 0 287360000 209010000 215320000 25788 1678 24238 236250;236251;236252;236253;236254;236255;236256 302340;302341;302342;302343;302344;302345;302346 302343 7 LEFDLSPLNLDIGQVYK Unmodified 1963.0302 0.030244081 4271 Q9NRN7;E9PLW6;E9PNF3 AASDHPPT L-aminoadipate-semialdehyde dehydrogenase-phosphopantetheinyl transferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 160.75 160.75 2;3 9.6031E-10 167898 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.51 97.945 904020000 56242000 50907000 57236000 28547000 40155000 44016000 98217000 58432000 122370000 17956000 116640000 139720000 73581000 25789 4271 24239 236257;236258;236259;236260;236261;236262;236263;236264;236265;236266;236267;236268;236269;236270 302347;302348;302349;302350;302351;302352;302353;302354;302355;302356;302357;302358;302359;302360 302358 13 LEFENLVEETSHFVR Unmodified 1847.9054 0.90537792 4640 Q9Y625 GPC6 Glypican-6;Secreted glypican-6 yes yes 0 0 0 1 1 136.24 136.24 3 3.6407E-07 140330 QUIQUE_C1403_190116_001 116.96 103.84 47008000 0 0 0 29418000 17590000 0 0 0 0 0 0 0 0 25790 4640 24240 236271;236272 302361;302362 302361 1 LEFHNIETGIITER Unmodified 1670.8628 0.86278482 261 A0A0R4J2G7;A0A0D9SEP4;A0A1D5RMU6;E7ERL8;Q9ULB1;A0A0U1RRK7;F5GYC7;F8WB18 NRXN1 Neurexin-1 yes no 0 0 0 3 2 1 1 1 1 89.787 89.787 2;3 8.9891E-05 91710 QUIQUE_C1277_190116_001 104.95 87.326 228110000 31593000 46769000 0 31721000 41045000 0 0 0 0 0 0 33982000 43000000 25791 261 24241 236273;236274;236275;236276;236277;236278;236279;236280;236281 302363;302364;302365;302366;302367;302368;302369;302370;302371 302366 8 LEFHNIETGIMTEK Unmodified 1660.8131 0.81305744 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89 NRXN3 Neurexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.424 85.424 3 0.00036123 86925 QUIQUE_C1368_190116_001 62.759 54.715 428200000 67369000 65773000 64742000 46269000 32430000 0 51063000 15725000 0 11275000 0 33383000 40168000 25792 319 24242 236282;236283;236284;236285;236286;236287;236288;236289;236290;236291 302372;302373;302374;302375;302376;302377;302378;302379;302380;302381;302382 302374 10 LEFMHILTR Unmodified 1158.6219 0.62194961 2450 P42574 CASP3 Caspase-3;Caspase-3 subunit p17;Caspase-3 subunit p12 yes yes 0 0 0 1 1 1 91.379 91.379 3 0.0084891 93953 QUIQUE_C1438_190116_001 50.292 31.547 24359000 0 0 0 0 15174000 0 0 0 0 9184600 0 0 0 25793 2450 24243 236292;236293;236294 302383;302384;302385;302386 302385 4 LEFPAPYWDNITDSAK Unmodified 1865.8836 0.88357984 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70;A0A0U1RRD0 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 137.44 137.44 2 0.00015998 142385 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.17 92.28 478950000 0 0 0 0 0 0 0 0 219100000 0 0 259840000 0 25794 3596 24244 236295;236296 302387;302388 302387 2 LEFSIYPAPQVSTAVVEPYNSILTTHTTL Unmodified 3190.6438 0.64379707 737 C9JQ00 TUBA4A yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 2 162.57 162.57 2;3 8.9915E-32 166165 QUIQUE_C1403_190116_001 116.55 107.95 965680000 21738000 234870000 142060000 199110000 154900000 0 213000000 0 0 0 0 0 0 25795 737 24245 236297;236298;236299;236300;236301;236302;236303;236304;236305;236306 302389;302390;302391;302392;302393;302394;302395;302396;302397;302398 302394 10 LEGAEIEEFLR Unmodified 1304.6612 0.66123147 3580 Q8N3E9 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 120.43 120.43 2 0.00020843 123185 QUIQUE_C1563_190116_001 123.63 74.207 90848000 0 0 25973000 0 0 29632000 35242000 0 0 0 0 0 0 25796 3580 24246 236307;236308;236309;236310;236311;236312 302399;302400;302401;302402;302403;302404 302402 6 LEGALSEEPR Unmodified 1099.551 0.55095274 2103 P16157 ANK1 Ankyrin-1 yes yes 0 0 0 1 33.805 33.805 2 0.034505 28858 QUIQUE_C1277_190116_001 62.201 24.643 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25797 2103 24247 236313 302405 302405 1 LEGDAALNR Unmodified 957.48796 0.48795855 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 24.16 24.16 2 0.055932 17661 QUIQUE_C1403_190116_001 49.097 5.9732 95590000 0 0 0 95590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25798 4572 24248 236314 302406 302406 1 LEGDLKGPEVDIK Unmodified 1411.7559 0.75586013 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 56.283 56.283 2 0.00010955 54221 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.49 25.513 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25799 2935 24249 236315 302407 302407 1 LEGDLTGPSVGVEVPDVELECPDAK Unmodified 2624.2527 0.25272839 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 1 1 1 130.84 130.84 2 1.1499E-28 133667 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.14 156.59 66650000 0 0 0 0 29938000 0 0 36712000 0 0 0 0 0 25800 2935 24250 236316;236317;236318 302408;302409;302410 302410 3 LEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLR Unmodified 2664.2953 0.29526191 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 0 2 2 1 141.31 141.31 3 5.1301E-14 136719 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.656 47.781 212210000 89424000 85738000 0 0 0 0 0 0 0 37047000 0 0 0 25801 2414 24251 236319;236320;236321;236322;236323 302411;302412;302413;302414;302415 302415 4 LEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLR Oxidation (M) 2680.2902 0.29017653 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 1 0 1 130.72 130.72 3 1.1609E-07 126660 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.039 58.115 45388000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45388000 0 0 0 25802 2414 24251 236324 302416 302416 1827 1 LEGDNVNPESQLIQQSEQSESETAGSTK Unmodified 3004.3745 0.3745111 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 96.823 96.823 3 6.4845E-19 93428 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.145 63.496 19742000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19742000 0 0 0 25803 3777 24252 236325 302417 302417 1 LEGDSTDLSDQIAELQAQIAELK Unmodified 2486.2388 0.23879289 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 2 1 167.99 167.99 2;3 5.9375E-06 172526 QUIQUE_C1218_190116_001 106.35 98.63 153870000 118650000 0 0 0 0 0 0 0 0 35221000 0 0 0 25804 2378 24253 236326;236327;236328 302418;302419;302420 302419 3 LEGDTLIIPR Unmodified 1125.6394 0.63937381 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 79.687 79.687 2 0.029155 81755 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.299 40.194 199600000 0 0 0 0 80470000 0 0 42553000 0 0 52328000 0 24253000 25805 2834 24254 236329;236330;236331;236332 302421;302422;302423;302424 302423 4 LEGELKGPELDVK Unmodified 1425.7715 0.7715102 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 58.087 58.087 3 0.0029154 56145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.83 39.49 144250000 0 0 0 0 0 0 0 144250000 0 0 0 0 0 25806 2935 24255 236333 302425 302425 1 LEGFHTQISK Unmodified 1158.6033 0.60332266 2901 Q06323;H0YLU2;H0YKK6 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 30.609 30.609 2;3 3.9139E-05 25652 QUIQUE_C1277_190116_001 144.65 87.603 4665500000 138520000 277200000 642970000 513570000 465290000 320210000 171050000 243690000 438590000 0 558970000 385400000 510040000 25807 2901 24256 236334;236335;236336;236337;236338;236339;236340;236341;236342;236343;236344;236345;236346;236347;236348;236349;236350;236351;236352;236353;236354;236355 302426;302427;302428;302429;302430;302431;302432;302433;302434;302435;302436;302437;302438;302439;302440;302441;302442;302443;302444;302445;302446;302447;302448;302449 302428 22 LEGGEVDLKGPK Unmodified 1240.6663 0.66631685 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 30.858 30.858 3 0.051569 25773 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.343 42.106 61947000 0 0 0 0 0 0 0 61947000 0 0 0 0 0 25808 2935 24257 236356 302450 302450 0 LEGGSGGDSEVQR Unmodified 1289.5848 0.58477206 2743 P62195;J3QQM1 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.75 15.75 2 5.5006E-17 7991 QUIQUE_DMIX7_190116_001 159.09 133.95 2619400000 246640000 265240000 222210000 224140000 176300000 121260000 240270000 216830000 133080000 78603000 282040000 220520000 192270000 25809 2743 24258 236357;236358;236359;236360;236361;236362;236363;236364;236365;236366;236367;236368;236369 302451;302452;302453;302454;302455;302456;302457;302458;302459;302460;302461;302462;302463 302462 13 LEGIFFSCSTEFNTGKPPQDSPYGR Unmodified 2833.3017 0.30174427 3850 Q96FC7 PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 115.45 115.45 3 1.5011E-45 119102 QUIQUE_C1403_190116_001 142.42 130.9 1259300000 122450000 117330000 201970000 104600000 0 134390000 39157000 140760000 122950000 65889000 47966000 161800000 0 25810 3850 24259 236370;236371;236372;236373;236374;236375;236376;236377;236378;236379;236380;236381;236382 302464;302465;302466;302467;302468;302469;302470;302471;302472;302473;302474;302475;302476;302477;302478;302479;302480 302472 14 LEGIGQFHCR Unmodified 1215.5819 0.58187571 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 38.803 38.803 3 0.00096788 34999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.643 56.011 81196000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39845000 41351000 0 25811 1187 24260 236383;236384 302481;302482 302481 2 LEGILGGLGLR Unmodified 1096.6604 0.66044361 4012 Q9BSH5 HDHD3 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 119.78 119.78 2 0.00020083 123936 QUIQUE_C1218_190116_001 124.23 33.574 22628000 22628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25812 4012 24261 236385 302483 302483 1 LEGIPAYIVVPQTAPDCK Unmodified 1970.0183 0.018299186 4104 Q9GZT4;I3L4B4 SRR Serine racemase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.33 121.33 2 0.00056086 123967 QUIQUE_C1563_190116_001 92.856 80.089 171830000 30080000 0 0 37586000 0 45830000 0 0 0 16312000 0 0 42022000 25813 4104 24262 236386;236387;236388;236389;236390;236391;236392;236393 302484;302485;302486;302487;302488;302489;302490;302491;302492;302493 302491 10 LEGIPAYIVVPQTAPDCKK Unmodified 2098.1133 0.1132622 4104 Q9GZT4;I3L4B4 SRR Serine racemase yes no 0 0 1 1 98.688 98.688 3 0.0069595 101951 QUIQUE_DMIX8_190116_001 38.453 33.361 36357000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36357000 25814 4104 24263 236394 302494;302495 302494 2 LEGLLAFK Unmodified 889.5273 0.52730417 3026 Q13825 AUH Methylglutaconyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 92.752 92.752 2 0.018748 89437 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.451 32.53 20538000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20538000 0 0 0 25815 3026 24264 236395;236396;236397;236398;236399 302496;302497;302498;302499;302500;302501 302501 6 LEGLTDEINFLR Unmodified 1418.7405 0.74054442 772 CON__P05787;P05787;CON__H-INV:HIT000292931;F8VUG2;F8W1U3;F8VP67 KRT8 Keratin, type II cytoskeletal 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 131.77 131.77 2 7.8327E-10 135756 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.42 111.1 362860000 47699000 28373000 0 0 41458000 0 43590000 0 57257000 0 0 61097000 83386000 + 25816 772 24265 236400;236401;236402;236403;236404;236405;236406 302502;302503;302504;302505;302506;302507;302508;302509;302510 302509 9 LEGNMNEALEYYER Unmodified 1729.7618 0.76175015 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 98.988 98.988 2 1.4844E-17 103117 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.85 136.96 157410000 0 0 41557000 0 0 0 0 33058000 0 0 82796000 0 0 25817 1975 24266 236407;236408;236409 302511;302512;302513 302513 3 LEGNMNEALEYYER Oxidation (M) 1745.7567 0.75666477 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 1 0 1 71.057 71.057 2 0.00029924 72370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.214 87.782 37929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37929000 0 0 25818 1975 24266 236410 302514 302514 1245 1 LEGNSPQGSNQGVK Unmodified 1413.6848 0.68482046 2704 P61006 RAB8A Ras-related protein Rab-8A yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.59 13.59 2 5.7508E-14 5456 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.24 117.68 375730000 0 7126500 44515000 0 25916000 3766900 44754000 41652000 38117000 30025000 62218000 13221000 64416000 25819 2704 24267 236411;236412;236413;236414;236415;236416;236417;236418;236419;236420;236421;236422 302515;302516;302517;302518;302519;302520;302521;302522;302523;302524;302525;302526;302527 302527 13 LEGPDVSLK Unmodified 956.51786 0.51786169 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 49.924 49.924 2 0.040078 47371 QUIQUE_C1368_190116_001 53.493 25.007 123790000 0 0 35830000 56802000 31154000 0 0 0 0 0 0 0 0 25820 2935 24268 236423;236424;236425 302528;302529;302530 302528 3 LEGQGDVPTPK Unmodified 1139.5823 0.58225287 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.72 30.72 2 0.00045818 26112 QUIQUE_C1218_190116_001 119.68 99.126 687600000 74014000 60973000 0 88181000 0 79630000 87320000 0 57754000 27157000 62592000 73240000 76740000 25821 4572 24269 236426;236427;236428;236429;236430;236431;236432;236433;236434;236435 302531;302532;302533;302534;302535;302536;302537;302538;302539;302540;302541;302542;302543;302544;302545 302532 14 LEGQMGEDGNSIK Oxidation (M) 1392.6191 0.61910866 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 19.754 19.754 2 0.00034589 12642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.5 73.204 6673800000 478340000 0 716560000 678920000 597840000 0 604710000 537090000 742470000 424060000 675180000 500180000 718470000 25822 1218;28;112;2057 24270 236436;236437;236438;236439;236440;236441;236442;236443;236444;236445;236446;236447;236448;236449 302546;302547;302548;302549;302550;302551;302552;302553;302554;302555;302556;302557;302558;302559 302551 15 14 LEGQMGEDGNSIK Unmodified 1376.6242 0.62419403 2057;28;1218;112 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;A0A087X1V2;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.208 31.208 2 5.1646E-28 26279 QUIQUE_C1277_190116_001 179.19 147.26 6171800000 0 810260000 1044700000 943300000 0 0 0 0 831460000 0 892970000 512920000 1136200000 25823 1218;28;112;2057 24270 236450;236451;236452;236453;236454;236455;236456;236457 302560;302561;302562;302563;302564;302565;302566;302567 302560 7 LEGSAPTDVLDSLTTIPELK Unmodified 2098.1045 0.10453124 3495 Q86UX7 FERMT3 Fermitin family homolog 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 153.71 153.71 2 1.0843E-05 157655 QUIQUE_C1403_190116_001 90.367 67.131 65539000 0 0 0 49759000 0 15780000 0 0 0 0 0 0 0 25824 3495 24271 236458;236459;236460 302568;302569;302570;302571 302568 4 LEGSDVQLLEYEASAAGLIR Unmodified 2133.0954 0.095363533 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 3 1 2 2 2 156.35 156.35 2;3 1.0012E-47 163242 QUIQUE_DMIX5_190116_001 167.32 131.02 795230000 40487000 49760000 85884000 0 133410000 0 92266000 23450000 73921000 20776000 112650000 51607000 111010000 25825 4330 24272 236461;236462;236463;236464;236465;236466;236467;236468;236469;236470;236471;236472;236473;236474;236475;236476;236477;236478;236479 302572;302573;302574;302575;302576;302577;302578;302579;302580;302581;302582;302583;302584;302585;302586;302587;302588;302589;302590;302591;302592;302593;302594 302589 21 LEGTAGKTSRQESGALDVLNK Unmodified 2173.1339 0.1338743 4677 yes no 0 0 2 1 166.62 166.62 3 0.009063 171182 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.856 0 111900000 0 0 0 0 0 0 0 0 111900000 0 0 0 0 + 25826 4677 24273 236480 302595 302595 1 LEGTGLALSLR Unmodified 1128.6503 0.65027285 4661 Q9Y6N6 LAMC3 Laminin subunit gamma-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 85.238 85.238 2 0.0028943 87467 QUIQUE_C1438_190116_001 75.509 41.42 92640000 18640000 0 0 0 24581000 0 0 18698000 20780000 9941300 0 0 0 25827 4661 24274 236481;236482;236483;236484;236485;236486 302596;302597;302598;302599;302600;302601 302597 6 LEGTNVQEAQK Unmodified 1215.6095 0.60953025 3878 Q96I99;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.135 18.135 2 2.3681E-24 10560 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.76 125.59 2512400000 117840000 233030000 280170000 217910000 139400000 182780000 189180000 194760000 204440000 69018000 292100000 156050000 235730000 25828 3878 24275 236487;236488;236489;236490;236491;236492;236493;236494;236495;236496;236497;236498;236499 302602;302603;302604;302605;302606;302607;302608;302609;302610;302611;302612;302613;302614;302615 302613 13 LEGVDEATR Unmodified 988.48254 0.48253882 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 26.259 26.259 2 0.0018516 19476 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.442 52.375 675560000 0 94834000 0 167130000 55083000 54981000 0 35555000 41632000 20057000 87965000 59274000 59050000 25829 2198 24276 236500;236501;236502;236503;236504;236505;236506;236507;236508;236509;236510 302616;302617;302618;302619;302620;302621;302622;302623;302624;302625;302626;302627;302628;302629 302628 11 LEGVEGVAHIIDPK Unmodified 1475.7984 0.79839365 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.292 84.292 2;3 0.00052826 85621 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.335 41.372 1371400000 0 56609000 136730000 91159000 67319000 88606000 99403000 156890000 151360000 68378000 184750000 144150000 126070000 25830 3053 24277 236511;236512;236513;236514;236515;236516;236517;236518;236519;236520;236521;236522;236523;236524 302630;302631;302632;302633;302634;302635;302636;302637;302638;302639;302640;302641;302642;302643;302644;302645;302646;302647;302648;302649;302650;302651 302642 22 LEGVLAEVAQHYQDTLIR Unmodified 2054.0797 0.07965389 2487 P46940;A0A0J9YXZ5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.37 135.37 3 5.8237E-14 139459 QUIQUE_C1403_190116_001 126 117.91 1213900000 90363000 84796000 197970000 105010000 105570000 82311000 80821000 77703000 72353000 46927000 130370000 49156000 90550000 25831 2487 24278 236525;236526;236527;236528;236529;236530;236531;236532;236533;236534;236535;236536;236537 302652;302653;302654;302655;302656;302657;302658;302659;302660;302661;302662;302663;302664;302665 302655 14 LEGWEVFAK Unmodified 1077.5495 0.54949617 3519 Q86Y39 NDUFA11 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 101.35 101.35 2 0.0035378 104340 QUIQUE_C1368_190116_001 91.069 44.002 440520000 87166000 87332000 85902000 0 64051000 49465000 0 0 0 0 66605000 0 0 25832 3519 24279 236538;236539;236540;236541;236542;236543;236544 302666;302667;302668;302669;302670;302671;302672;302673 302668 7 LEGWEVFAKPK Unmodified 1302.6972 0.69722304 3519 Q86Y39 NDUFA11 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 78.054 78.054 2;3 0.0016984 79237 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.153 53.344 1804000000 85336000 120490000 103720000 52913000 98570000 53261000 118530000 230100000 132580000 23699000 197110000 309590000 278140000 25833 3519 24280 236545;236546;236547;236548;236549;236550;236551;236552;236553;236554;236555;236556;236557;236558;236559;236560 302674;302675;302676;302677;302678;302679;302680;302681;302682;302683;302684;302685;302686;302687;302688;302689;302690;302691;302692;302693;302694;302695;302696 302685 23 LEGWLSLPVR Unmodified 1168.6604 0.66044361 1610 O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.68 119.68 2 0.0035536 123482 QUIQUE_C1403_190116_001 83.948 47.553 447080000 34486000 36237000 36878000 27114000 33152000 25911000 46951000 29249000 28019000 12952000 52367000 48243000 35521000 25834 1610 24281 236561;236562;236563;236564;236565;236566;236567;236568;236569;236570;236571;236572;236573 302697;302698;302699;302700;302701;302702;302703;302704;302705;302706;302707;302708;302709;302710 302700 11 LEGYWGEAQSLCQAVDEHLR Unmodified 2360.0855 0.085543903 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.38 138.38 3 0.0011233 144981 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.318 47.451 626630000 81635000 71900000 65086000 33672000 76326000 0 0 51226000 42201000 0 73476000 95906000 35208000 25835 800 24282 236574;236575;236576;236577;236578;236579;236580;236581;236582;236583 302711;302712;302713;302714;302715;302716;302717;302718;302719;302720 302718 9 LEHAFCTETRPYNQGAR Unmodified 2048.9487 0.94865649 4039 Q9BV20 MRI1 Methylthioribose-1-phosphate isomerase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 29.377 29.377 3;4 0.00014329 23828 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.173 62.72 387920000 0 38966000 106770000 0 65435000 33925000 48405000 0 49974000 0 0 44440000 0 25836 4039 24283 236584;236585;236586;236587;236588;236589;236590;236591 302721;302722;302723;302724;302725;302726;302727;302728;302729 302729 9 LEHEEGAPCTAIR Unmodified 1481.6933 0.69327665 2905;1017 Q07002;A0A0A0MSJ6;D6RA44;F5H6Z0;Q00537 CDK18;CDK17 Cyclin-dependent kinase 18;Cyclin-dependent kinase 17 no no 0 0 0 1 23.855 23.855 3 0.027857 17143 QUIQUE_C1277_190116_001 31.722 18.916 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25837 2905;1017 24284 236592 302730 302730 1 LEHEQASQPTPEK Unmodified 1492.7158 0.71578623 4608;1367;1350 K7ERH7;M0QZ28;M0R021;E9PEY4;E7EVB6;O60941;Q9Y4J8 DTNA;DTNB Dystrobrevin;Dystrobrevin beta;Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 10.655 10.655 2;3 1.6125E-23 3015 QUIQUE_C1403_190116_001 191.53 154.18 966660000 59386000 0 136950000 131560000 96507000 0 96569000 40780000 107800000 42279000 83449000 53029000 118350000 25838 1350;1367;4608 24285 236593;236594;236595;236596;236597;236598;236599;236600;236601;236602;236603;236604;236605;236606;236607;236608;236609;236610;236611;236612;236613 302731;302732;302733;302734;302735;302736;302737;302738;302739;302740;302741;302742;302743;302744;302745;302746;302747;302748;302749;302750;302751;302752;302753;302754;302755;302756;302757;302758;302759 302738 29 LEHEYIHNFK Unmodified 1328.6513 0.65133548 3145;4524;1349 Q9UPY8;C9JB30;K7ERD8;K7EL66;M0QX52;K7ENB3;Q15555 MAPRE3;MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3;Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 23.822 23.822 2;3 4.6537E-08 17487 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.17 128.01 13995000000 1423000000 1053600000 1443600000 823260000 1116000000 565820000 1324300000 877370000 793930000 352680000 1490000000 1059700000 1672100000 25839 4524;1349;3145 24286 236614;236615;236616;236617;236618;236619;236620;236621;236622;236623;236624;236625;236626;236627;236628;236629;236630;236631;236632;236633;236634;236635;236636;236637;236638;236639 302760;302761;302762;302763;302764;302765;302766;302767;302768;302769;302770;302771;302772;302773;302774;302775;302776;302777;302778;302779;302780;302781;302782;302783;302784;302785;302786;302787;302788;302789;302790;302791;302792 302782 30 LEHEYIQNFK Unmodified 1319.651 0.65100113 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 3 2 3 2 2 2 1 1 40.506 40.506 2;3 5.9948E-23 36397 QUIQUE_C1563_190116_001 186.76 135.96 2781300000 315810000 314320000 194910000 115960000 280530000 94833000 241960000 266710000 237330000 182150000 390060000 146720000 0 25840 3150 24287 236640;236641;236642;236643;236644;236645;236646;236647;236648;236649;236650;236651;236652;236653;236654;236655;236656;236657;236658;236659;236660;236661;236662;236663 302793;302794;302795;302796;302797;302798;302799;302800;302801;302802;302803;302804;302805;302806;302807;302808;302809;302810;302811;302812;302813;302814;302815;302816;302817;302818;302819 302801 22 LEHFVSILLK Unmodified 1197.7121 0.71214483 3539 Q8IWT6 LRRC8A Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A yes yes 0 0 0 1 1 1 89.103 89.103 3 0.0080826 91202 QUIQUE_C1277_190116_001 76.943 42.222 15672000 0 0 0 15672000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25841 3539 24288 236664;236665;236666 302820;302821;302822 302820 3 LEHLITELVHQR Unmodified 1486.8256 0.82561145 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 3 1 1 1 61.981 61.981 3;4 0.0030168 62035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.528 57.98 130190000 0 16303000 72071000 0 0 0 0 21380000 20434000 0 0 0 0 25842 3053 24289 236667;236668;236669;236670;236671;236672;236673 302823;302824;302825;302826;302827;302828;302829 302828 5 LEHLTGNK Unmodified 910.48723 0.48723027 2999 Q13464;A0A0U1RQV4 ROCK1 Rho-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 30.992 30.992 2 0.042869 25904 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.716 25.074 22919000 0 0 0 0 0 0 0 22919000 0 0 0 0 0 25843 2999 24290 236674 302830 302830 1 LEHLYLNNNSIEK Unmodified 1585.81 0.81002097 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 50.3 50.3 2;3 0.00039709 46623 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.312 66.567 1920000000 138240000 207740000 137400000 105600000 172910000 115250000 475410000 0 98870000 95795000 118230000 124440000 130100000 25844 2598 24291 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302860;302861;302862;302863 302861 4 LEHTHFFSR Unmodified 1172.5727 0.57269123 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PJU8 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 22.096 22.096 2;3 0.0066567 14950 QUIQUE_C1368_190116_001 83.783 46.224 2021100000 0 177440000 357250000 230950000 282700000 170790000 348000000 290690000 55998000 65616000 0 41661000 0 25847 4127 24294 236705;236706;236707;236708;236709;236710;236711;236712;236713;236714;236715;236716;236717;236718;236719 302864;302865;302866;302867;302868;302869;302870;302871;302872;302873;302874;302875;302876;302877;302878 302867 15 LEHVLPNPQLLCCDNTQNDANTK Unmodified 2693.2537 0.25374822 3996 Q9BQI5;Q6ZV33 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 81.576 81.576 3 0.00011521 83350 QUIQUE_C1368_190116_001 56.298 49.634 34886000 0 0 34886000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25848 3996 24295 236720 302879 302879 0 LEHWYITGLR Unmodified 1286.6772 0.6771563 3428 Q709C8 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.637 79.637 3 0.00076476 81320 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.379 46.829 141950000 0 20253000 0 0 12290000 0 0 12817000 23951000 0 22159000 25649000 24830000 25849 3428 24296 236721;236722;236723;236724;236725;236726;236727;236728;236729;236730;236731 302880;302881;302882;302883;302884;302885;302886;302887;302888;302889;302890;302891;302892;302893 302889 14 LEIAPQIYGLR Unmodified 1271.7238 0.72377215 691 C9J3F6;Q92609 TBC1D5 TBC1 domain family member 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 105.93 105.93 2 0.0052386 108593 QUIQUE_C1403_190116_001 69.423 45.269 105320000 12896000 14956000 15057000 14274000 13771000 13360000 14552000 0 0 6451700 0 0 0 25850 691 24297 236732;236733;236734;236735;236736;236737;236738;236739 302894;302895;302896;302897;302898;302899;302900;302901 302897 8 LEICHEISEPR Unmodified 1381.666 0.66599927 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 47.896 47.896 3 0.054411 42751 QUIQUE_DMIX4_190116_001 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62105000 95841000 25853 2127 24300 236754;236755;236756;236757;236758;236759;236760;236761;236762;236763;236764;236765;236766 302922;302923;302924;302925;302926;302927;302928;302929;302930;302931;302932;302933;302934;302935 302932 14 LEICNLTPDTLTSDTYKK Unmodified 2111.0456 0.045636149 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 95.228 95.228 2;3 1.4533E-10 97049 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.58 98.736 3465300000 158230000 252020000 233990000 234020000 296390000 187990000 302350000 326670000 363240000 0 308730000 362610000 439030000 25854 2127 24301 236767;236768;236769;236770;236771;236772;236773;236774;236775;236776;236777;236778;236779;236780;236781;236782;236783;236784;236785;236786;236787;236788 302936;302937;302938;302939;302940;302941;302942;302943;302944;302945;302946;302947;302948;302949;302950;302951;302952;302953;302954;302955;302956;302957;302958;302959 302951 15 LEIDLLK Unmodified 842.51132 0.51131975 2144 P19320;E9PDD2;A0A087WTY4 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.56 104.56 3 0.0034716 108334 QUIQUE_C1576_190116_001 60.91 45.65 259850000 21488000 21269000 28806000 28003000 19757000 0 26888000 17305000 21619000 0 30374000 22823000 21513000 25860 4278 24307 236814;236815;236816;236817;236818;236819;236820;236821;236822;236823;236824 302993;302994;302995;302996;302997;302998;302999;303000;303001;303002;303003;303004;303005 303000 13 LEIGQDLIQVAVAQYADTVRPEFYFNTHPTK Unmodified 3562.8096 0.80963362 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 3 1 1 2 1 1 1 1 1 162.32 162.32 3;4 5.3982E-55 166858 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.16 133.9 2143000000 106350000 130450000 118920000 124910000 227820000 102910000 216260000 140940000 266850000 23433000 227190000 189140000 267840000 25861 2037 24308 236825;236826;236827;236828;236829;236830;236831;236832;236833;236834;236835;236836;236837;236838;236839;236840 303006;303007;303008;303009;303010;303011;303012;303013;303014;303015;303016;303017;303018;303019;303020;303021;303022;303023 303019 17 LEILQIHTK Unmodified 1093.6495 0.64954457 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 54.488 54.488 2;3 4.3078E-05 52060 QUIQUE_C1563_190116_001 147.19 92.636 13997000000 1220400000 1191500000 1125800000 1166900000 1231500000 914490000 1121400000 878130000 1185900000 458280000 1204700000 1001800000 1296100000 25862 2658 24309 236841;236842;236843;236844;236845;236846;236847;236848;236849;236850;236851;236852;236853;236854;236855;236856;236857;236858;236859;236860;236861;236862;236863;236864;236865;236866 303024;303025;303026;303027;303028;303029;303030;303031;303032;303033;303034;303035;303036;303037;303038;303039;303040;303041;303042;303043;303044;303045;303046;303047;303048;303049;303050;303051;303052 303035 28 LEILQQQLQVANEAR Unmodified 1751.953 0.95299681 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.603 99.603 2 4.0857E-44 102113 QUIQUE_C1277_190116_001 184.03 160.42 532360000 40250000 48704000 64090000 37054000 47236000 43051000 70535000 37922000 0 22165000 61845000 59504000 0 25863 3091 24310 236867;236868;236869;236870;236871;236872;236873;236874;236875;236876;236877 303053;303054;303055;303056;303057;303058;303059;303060;303061;303062;303063;303064 303054 12 LEIMEFVNFLK Unmodified 1381.7316 0.73155964 4612 Q9Y4W6;K7EP56 AFG3L2 AFG3-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 164.38 164.38 2 0.0010667 167669 QUIQUE_C1403_190116_001 90.629 70.109 92144000 27780000 20944000 0 13631000 0 0 29790000 0 0 0 0 0 0 25864 4612 24311 236878;236879;236880;236881;236882 303065;303066;303067;303068;303069 303068 4 LEINQPINCGESGR Unmodified 1585.7519 0.75185416 4709 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 19.354 19.354 2;3 0.0031371 9643 QUIQUE_C1403_190116_001 43.382 0 278090000 0 150140000 0 25222000 0 0 0 102720000 0 0 0 0 0 + 25865 4709 24312 236883;236884;236885;236886;236887;236888;236889 303070;303071;303072;303073;303074;303075;303076 303071 7 LEIPPPFRPR Unmodified 1220.703 0.70297712 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 74.606 74.606 3 0.00042772 76331 QUIQUE_C1218_190116_001 91.867 58.642 233310000 58856000 0 0 83779000 37044000 36169000 0 0 0 17465000 0 0 0 25866 1877 24313 236890;236891;236892;236893;236894;236895;236896;236897;236898;236899;236900;236901;236902;236903 303077;303078;303079;303080;303081;303082;303083;303084;303085;303086;303087;303088;303089;303090;303091;303092;303093;303094 303077 18 LEISDEFSEAIGALR Unmodified 1648.8308 0.83081599 4353 Q9NZN4 EHD2 EH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.83 149.83 2 1.6422E-09 154596 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.84 79.546 424330000 52418000 50394000 28644000 50648000 48033000 19670000 42920000 21818000 26378000 18844000 30958000 33608000 0 25867 4353 24314 236904;236905;236906;236907;236908;236909;236910;236911;236912;236913;236914;236915 303095;303096;303097;303098;303099;303100;303101;303102;303103;303104;303105;303106;303107;303108 303105 14 LEISEAVAPGTR Unmodified 1241.6616 0.66156582 110 A0A087X1P2;Q9UN70 PCDHGC3 Protocadherin gamma-C3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 60.057 60.057 2 0.011942 58404 QUIQUE_C1563_190116_001 58.37 28.295 96312000 0 0 24973000 0 0 13753000 0 29246000 28340000 0 0 0 0 25868 110 24315 236916;236917;236918;236919 303109;303110;303111;303112 303110 3 LEITMLSQGVSMLYSFFMPAAK Oxidation (M) 2479.2201 0.22011182 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 1 0 1 1 176.54 176.54 3 1.6056E-05 183483 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.792 56.992 41358000 0 0 0 0 0 0 0 0 13802000 0 27555000 0 0 25869 2197 24316 236920;236921 303113;303114 303114 1549;1550;1551 2 LEITMLSQGVSMLYSFFMPAAK 3 Oxidation (M) 2511.2099 0.20994106 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 3 0 1 168.36 168.36 3 0.0012578 162281 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.348 38.042 12219000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12219000 0 0 0 25870 2197 24316 236922 303115 303115 1549;1550;1551 1 LEIYVVTAEGLRPVK Unmodified 1685.9716 0.97160699 3179 Q16531;F5GY55;F5GZY8;F5GYG8;F5H198 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.34 104.34 3 3.8334E-06 106681 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.367 85.297 1111100000 101620000 76624000 82276000 65743000 107920000 74733000 96456000 64965000 103220000 41335000 123580000 81445000 91224000 25871 3179 24317 236923;236924;236925;236926;236927;236928;236929;236930;236931;236932;236933;236934;236935 303116;303117;303118;303119;303120;303121;303122;303123;303124;303125;303126;303127;303128;303129;303130;303131;303132;303133;303134;303135;303136 303135 21 LEKEEEEIR Unmodified 1173.5877 0.58773217 3480 Q86SE8 NPM2 Nucleoplasmin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 60.344 60.344 2 0.010859 59304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.43 59.322 214030000 0 0 0 0 68981000 103940000 0 41109000 0 0 0 0 0 25872 3480 24318 236936;236937;236938 303137;303138;303139 303139 3 LEKEEQDRLER Unmodified 1443.7318 0.73177065 3945 Q96T17 MAP7D2 MAP7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 2 1 2 1 2 1 13.94 13.94 3;4 0.0017283 5577 QUIQUE_C1277_190116_001 89.403 48.12 60840000 8132900 22011000 0 7488500 12498000 0 10709000 0 0 0 0 0 0 25873 3945 24319 236939;236940;236941;236942;236943;236944;236945 303140;303141;303142;303143;303144;303145;303146 303141 7 LEKELASQQEK Unmodified 1301.6827 0.68269519 232 A0A0G2JR20;A0A0C4DG71;A0A0G2JQM2;A0A0G2JR50;Q86SQ7 SDCCAG8 Serologically defined colon cancer antigen 8 yes no 0 0 1 1 1 39.728 39.728 2 0.013964 36255 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.219 13.868 206370000 0 0 0 0 0 0 121390000 0 84980000 0 0 0 0 25874 232 24320 236946;236947 303147;303148 303148 1 LEKHELIEFR Unmodified 1312.7139 0.71393574 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 37.048 37.048 2;3 0.00040247 33168 QUIQUE_DMIX7_190116_001 152.27 115.72 2984300000 66070000 142830000 83995000 0 193550000 0 155310000 0 350050000 0 959410000 522620000 510480000 25875 50;1314 24321 236948;236949;236950;236951;236952;236953;236954;236955;236956;236957;236958;236959 303149;303150;303151;303152;303153;303154;303155;303156;303157;303158;303159;303160;303161 303159 7 LEKHELIEFRR Unmodified 1468.815 0.81504677 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 2 2 27.198 27.198 3;4 0.0002369 21373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.215 82.743 208260000 0 0 0 0 0 0 0 208260000 0 0 0 0 0 25876 50;1314 24322 236960;236961 303162;303163 303163 2 LEKKEEEIER Unmodified 1301.6827 0.68269519 4678 yes no 0 0 2 1 46.573 46.573 3 0.0086277 41159 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.662 6.6322 132750000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 132750000 0 0 0 + 25877 4678 24323 236962 303164 303164 1 LEKPAKYDDIK Unmodified 1318.7133 0.71326704 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 2 2 18.143 18.143 2;3 0.019572 10449 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.57 47.215 444950000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 444950000 0 0 25878 1863 24324 236963;236964 303165;303166 303165 1 LELADYEAENLAR Unmodified 1505.7362 0.73618733 32 A0A0A0MRA9;B7Z2N1;A0A087WTW9;P49758;B7Z7N5 RGS6 Regulator of G-protein signaling 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.018 97.018 2 0.00055556 99177 QUIQUE_C1403_190116_001 104.52 68.579 421610000 75466000 0 96841000 57175000 0 72306000 0 0 0 0 61565000 58256000 0 25879 32 24325 236965;236966;236967;236968;236969;236970;236971;236972 303167;303168;303169;303170;303171;303172;303173;303174;303175 303170 8 LELADYEAESLAR Unmodified 1478.7253 0.72528829 2549 P49802 RGS7 Regulator of G-protein signaling 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 99.989 99.989 2 2.3911E-11 102130 QUIQUE_C1403_190116_001 149.31 96.518 624610000 79350000 54660000 66736000 65284000 55351000 67313000 107680000 43781000 0 35932000 0 48525000 0 25880 2549 24326 236973;236974;236975;236976;236977;236978;236979;236980;236981;236982;236983;236984;236985 303176;303177;303178;303179;303180;303181;303182;303183;303184;303185;303186;303187;303188;303189;303190;303191;303192;303193 303182 15 LELAFEYLMSK Unmodified 1342.6843 0.6842751 3101 Q15036 SNX17 Sorting nexin-17 yes yes 0 0 0 1 140.17 140.17 2 0.021603 145880 QUIQUE_C1368_190116_001 60.434 33.319 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25881 3101 24327 236986 303194 303194 1 LELAMLSFFEQFR Unmodified 1629.8225 0.82249991 4447 Q9UIA9;E7ESC6 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 169.61 169.61 2 1.6857E-07 173624 QUIQUE_DMIX7_190116_001 150.94 105.81 78133000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46936000 31197000 0 25882 4447 24328 236987;236988 303195;303196;303197;303198 303197 4 LELAQYR Unmodified 891.48142 0.48141661 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.449 45.449 2 0.0098368 42231 QUIQUE_C1368_190116_001 149.06 59.386 33564000000 0 2873000000 3836900000 2611200000 2194600000 3048700000 2957200000 2418800000 3299300000 0 4005900000 2992100000 3326300000 25883 2243 24329 236989;236990;236991;236992;236993;236994;236995;236996;236997;236998;236999 303199;303200;303201;303202;303203;303204;303205;303206;303207;303208;303209;303210 303201 12 LELEAYR Unmodified 892.46543 0.46543219 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 51.3 51.3 2 0.055583 49614 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.852 20.886 106700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62520000 44183000 0 25884 4331 24330 237000;237001 303211;303212 303211 2 LELEEAATPEGHAVR Unmodified 1620.8107 0.81074925 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 47.731 47.731 2;3 0.0034227 45712 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.693 53.755 156980000 0 0 0 0 0 0 0 0 47906000 0 65389000 0 43690000 25885 1492 24331 237002;237003;237004;237005 303213;303214;303215;303216 303215 3 LELEQTYQAK Unmodified 1221.6241 0.62411768 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.445 47.445 2 3.3235E-23 45162 QUIQUE_DMIX5_190116_001 218.06 122.53 6454000000 591120000 685120000 676770000 473620000 570830000 549800000 592020000 322330000 398120000 182160000 519020000 433930000 459170000 25886 2886 24332 237006;237007;237008;237009;237010;237011;237012;237013;237014;237015;237016;237017;237018 303217;303218;303219;303220;303221;303222;303223;303224;303225;303226;303227;303228;303229;303230;303231;303232;303233 303231 17 LELFLPEEYPMAAPK Oxidation (M) 1762.8852 0.88515975 2712 P61088;F8VSD4;F8VV71;F8VZ29 UBE2N Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.5 124.5 2 0.0021973 127136 QUIQUE_C1563_190116_001 67.153 52.181 5602800000 433820000 493580000 437680000 386890000 368730000 407010000 314130000 413570000 504280000 250340000 565730000 506980000 520060000 25887 2712 24333 237019;237020;237021;237022;237023;237024;237025;237026;237027;237028;237029;237030;237031 303234;303235;303236;303237;303238;303239;303240;303241;303242;303243;303244;303245;303246;303247;303248;303249 303240 2139 16 LELFLPEEYPMAAPK Unmodified 1746.8902 0.89024513 2712 P61088;F8VSD4;F8VV71;F8VZ29 UBE2N Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 138.07 138.07 2;3 0.0020992 143718 QUIQUE_C1218_190116_001 55.885 47.058 5285200000 796930000 725200000 35026000 651380000 0 0 661340000 474490000 0 0 721060000 491800000 727930000 25888 2712 24333 237032;237033;237034;237035;237036;237037;237038;237039;237040;237041;237042;237043;237044 303250;303251;303252;303253;303254;303255;303256;303257;303258;303259;303260;303261;303262;303263 303251 12 LELFPVELEK Unmodified 1215.6751 0.67509062 800;4489 Q9ULJ8;D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9A;PPP1R9B Neurabin-1;Neurabin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 123.29 123.29 2 0.0029277 125995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.815 59.77 403780000 0 103270000 0 106300000 89975000 0 0 64786000 0 39445000 0 0 0 25889 4489;800 24334 237045;237046;237047;237048;237049 303264;303265;303266;303267;303268 303267 5 LELGGVINTPQEK Unmodified 1396.7562 0.75619449 3543 Q8IWZ6 BBS7 Bardet-Biedl syndrome 7 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 78.48 78.48 2 0.011629 80709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.132 40.39 48996000 0 0 0 0 0 0 0 0 24444000 0 24552000 0 0 25890 3543 24335 237050;237051;237052 303269;303270;303271 303270 3 LELIDLLAR Unmodified 1054.6386 0.63864553 222 A0A2R8YCY2;A0A0C4DFX2;A0A286YFA9;A0A2R8Y5V8;Q5TBA9 FRY Protein furry homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.23 141.23 2 0.0012367 145885 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.57 62.444 51078000 11556000 0 0 0 0 0 7619500 7205000 14365000 0 10332000 0 0 25891 222 24336 237053;237054;237055;237056;237057;237058;237059;237060;237061;237062 303272;303273;303274;303275;303276;303277;303278;303279;303280;303281 303278 10 LELIPDVTIPPSIAQLTGLK Unmodified 2117.2348 0.23475755 3539 Q8IWT6 LRRC8A Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A yes yes 0 0 0 1 168.26 168.26 2 0.02152 171166 QUIQUE_C1403_190116_001 49.627 44.644 15227000 0 0 0 15227000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25892 3539 24337 237063 303282 303282 1 LELLAAYEEVIR Unmodified 1417.7817 0.78168095 3186 Q16643;D6R9W4;D6RFI1 DBN1 Drebrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 140.36 140.36 2;3 0.00012363 136913 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.68 88.748 2446400000 226540000 261020000 188050000 304870000 186650000 267100000 209290000 131300000 141040000 148910000 107960000 116380000 157250000 25893 3186 24338 237064;237065;237066;237067;237068;237069;237070;237071;237072;237073;237074;237075;237076;237077 303283;303284;303285;303286;303287;303288;303289;303290;303291;303292;303293;303294;303295;303296;303297;303298 303294 16 LELLECIR Unmodified 1044.5638 0.56376603 601 M0QZP4;B3KSI3;M0QZ10;M0QXF9;O15382 BCAT2 Branched-chain-amino-acid aminotransferase;Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 106 106 2 0.053491 108595 QUIQUE_C1403_190116_001 54.787 0 27612000 0 0 0 27612000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25894 601 24339 237078 303299 303299 1 LELLHPIIPEQSTFK Unmodified 1763.9822 0.98217168 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 105.39 105.39 2;3 1.797E-13 109761 QUIQUE_C1438_190116_001 120.7 111.15 2798300000 230410000 198080000 309340000 223770000 320600000 264730000 264150000 88951000 122180000 82704000 264470000 201990000 226960000 25895 4572 24340 237079;237080;237081;237082;237083;237084;237085;237086;237087;237088;237089;237090;237091;237092;237093;237094;237095;237096;237097;237098;237099 303300;303301;303302;303303;303304;303305;303306;303307;303308;303309;303310;303311;303312;303313;303314;303315;303316;303317;303318;303319;303320;303321 303307 21 LELLLQIANK Unmodified 1153.7071 0.70705945 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 110.82 110.82 2 0.0090201 113360 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.856 39.782 31497000 0 0 0 0 14210000 0 0 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237169;237170;237171;237172;237173;237174;237175;237176;237177;237178;237179;237180;237181 303396;303397;303398;303399;303400;303401;303402;303403;303404;303405;303406;303407;303408;303409;303410 303408 14 LELSVLYK Unmodified 963.56408 0.56408361 1282 J3KR44;Q96FW1;F5H6Q1;F5GYN4;F5GYJ8 OTUB1 Ubiquitin thioesterase OTUB1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 88.218 88.218 1;2 0.0064687 89951 QUIQUE_C1277_190116_001 101.64 36.84 2078700000 184940000 194600000 152130000 112680000 163830000 124790000 151410000 182270000 174730000 78310000 210590000 217120000 131300000 25910 1282 24355 237182;237183;237184;237185;237186;237187;237188;237189;237190;237191;237192;237193;237194;237195;237196;237197 303411;303412;303413;303414;303415;303416;303417;303418;303419;303420;303421;303422;303423;303424;303425;303426;303427;303428;303429;303430;303431;303432 303414 21 LELTEMAR Unmodified 961.49027 0.49026674 1895 P05937;E5RIZ8 CALB1 Calbindin yes no 0 0 0 1 1 58.563 58.563 2 0.022525 56813 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0.72073696 274 A0A0D9SG77;A0A1B0GVL3;Q05086 UBE3A Ubiquitin-protein ligase E3A yes no 0 0 0 1 47.167 47.167 2 0.011702 44280 QUIQUE_C1218_190116_001 56.432 26.688 146980000 146980000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25914 274 24359 237212 303453 303453 1 LEMIAMENPADLKK Unmodified 1601.8157 0.81569997 274 A0A0D9SG77;A0A1B0GVL3;Q05086 UBE3A Ubiquitin-protein ligase E3A yes no 0 0 1 1 1 1 79.677 79.677 3 0.0075212 82130 QUIQUE_C1438_190116_001 34.432 18.082 32497000 0 0 0 0 32497000 0 0 0 0 0 0 0 0 25915 274 24360 237213;237214;237215 303454;303455;303456 303455 3 LEMLEIIEAIYK Unmodified 1463.7946 0.79455383 4498 Q9UM19 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 167.83 167.83 2;3 7.1202E-07 172658 QUIQUE_C1368_190116_001 141.95 104.48 3675700000 396460000 360710000 297480000 158990000 198900000 82455000 360900000 209140000 444370000 48369000 413770000 541760000 162420000 25916 4498 24361 237216;237217;237218;237219;237220;237221;237222;237223;237224;237225;237226;237227;237228;237229;237230;237231;237232;237233 303457;303458;303459;303460;303461;303462;303463;303464;303465;303466;303467;303468;303469;303470;303471;303472;303473;303474 303461 18 LEMLEIIEAIYK Oxidation (M) 1479.7895 0.78946845 4498 Q9UM19 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes yes 0 1 0 1 1 1 2 2 1 137.48 137.48 2 0.00077479 143706 QUIQUE_C1576_190116_001 90.827 81.85 312080000 0 60156000 45205000 31742000 0 92393000 82579000 0 0 0 0 0 0 25917 4498 24361 237234;237235;237236;237237;237238;237239;237240;237241 303475;303476;303477;303478;303479;303480;303481;303482;303483;303484;303485;303486 303485 2985 12 LEMNLGLQK Oxidation (M) 1060.5587 0.55868065 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 2 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 38.178 38.178 2 0.00023741 34575 QUIQUE_C1438_190116_001 139.31 96.19 3525700000 355760000 425950000 185690000 99307000 181270000 86624000 147630000 201990000 572040000 210030000 265960000 241590000 551820000 25918 2851 24362 237242;237243;237244;237245;237246;237247;237248;237249;237250;237251;237252;237253;237254;237255;237256;237257;237258;237259 303487;303488;303489;303490;303491;303492;303493;303494;303495;303496;303497;303498;303499;303500;303501;303502;303503;303504;303505;303506;303507;303508;303509;303510;303511 303495 2309 23 LEMNLGLQK Unmodified 1044.5638 0.56376603 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 70.985 70.985 2 0.00028853 67569 QUIQUE_DMIX4_190116_001 137.18 64.946 2597200000 853670000 949340000 0 0 0 0 0 564960000 0 229190000 0 0 0 25919 2851 24362 237260;237261;237262;237263 303512;303513;303514;303515;303516 303516 3 LEMYGIR Unmodified 880.44767 0.44767364 734;357 A0A1B0GV68;M0R262;O94887;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1;FARP2 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2;FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 60.453 60.453 2 0.02103 58776 QUIQUE_C1368_190116_001 106.29 28.537 81064000 24592000 19933000 19214000 0 0 17326000 0 0 0 0 0 0 0 25920 357;734 24363 237264;237265;237266;237267 303517;303518;303519;303520 303519 4 LEMYNILK Unmodified 1022.5471 0.54705333 2253 P26639;D6R9F8;D6RCA5;D6RDJ6 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 91.095 91.095 2 0.0073368 95066 QUIQUE_C1218_190116_001 98.418 62.538 211300000 42953000 0 0 36314000 0 0 0 0 0 0 43937000 50430000 37670000 25921 2253 24364 237268;237269;237270;237271;237272;237273;237274;237275 303521;303522;303523;303524;303525;303526;303527;303528;303529;303530;303531;303532 303522 12 LEMYVLNPVK Oxidation (M) 1220.6475 0.64749566 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 67.292 67.292 2 0.00098142 66177 QUIQUE_C1563_190116_001 105.57 73.347 1141700000 45613000 64400000 146040000 47613000 69210000 45719000 51521000 84945000 122230000 0 117760000 104950000 241660000 25922 2483 24365 237276;237277;237278;237279;237280;237281;237282;237283;237284;237285;237286;237287;237288;237289 303533;303534;303535;303536;303537;303538;303539;303540;303541;303542;303543;303544;303545;303546;303547 303539 1916 13 LEMYVLNPVK Unmodified 1204.6526 0.65258104 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 94.364 94.364 1;2 0.00014047 96471 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.94 119.46 7585300000 451110000 553350000 551880000 280910000 559520000 428680000 724810000 613310000 593480000 205960000 876870000 864170000 881260000 25923 2483 24365 237290;237291;237292;237293;237294;237295;237296;237297;237298;237299;237300;237301;237302;237303;237304 303548;303549;303550;303551;303552;303553;303554;303555;303556;303557;303558;303559;303560;303561;303562;303563;303564;303565;303566 303566 17 LENCNYAVELGK Unmodified 1408.6657 0.66566492 2066;181 A0A0A0MSQ0;P13797;P13796 PLS3;LCP1 Plastin-3;Plastin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.391 60.391 2 0.00053447 60434 QUIQUE_C1438_190116_001 118.4 0 343380000 0 0 82280000 0 48736000 33878000 34278000 0 0 0 54647000 38197000 51359000 25924 181;2066 24366 237305;237306;237307;237308;237309;237310;237311 303567;303568;303569;303570;303571;303572;303573 303568 7 LENDGATALAEAFR Unmodified 1476.7209 0.72087161 2476 P46060 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 104.23 104.23 2 9.7201E-07 106841 QUIQUE_C1277_190116_001 122.33 87.939 255050000 53731000 49490000 0 50368000 0 45270000 0 34638000 0 21557000 0 0 0 25925 2476 24367 237312;237313;237314;237315;237316;237317;237318 303574;303575;303576;303577;303578;303579;303580;303581;303582 303576 9 LENDLEELALYQIQLLK Unmodified 2044.1092 0.10922268 2963 Q13057;K7EQ60 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 1 167.88 167.88 2;3 2.5673E-11 172552 QUIQUE_C1218_190116_001 120.77 115.19 560120000 104400000 60570000 52238000 55425000 76749000 32602000 61870000 0 37231000 35231000 28656000 0 15143000 25926 2963 24368 237319;237320;237321;237322;237323;237324;237325;237326;237327;237328;237329;237330;237331;237332;237333;237334;237335 303583;303584;303585;303586;303587;303588;303589;303590;303591;303592;303593;303594;303595;303596;303597;303598;303599;303600 303583 18 LENDQIESLR Unmodified 1215.6095 0.60953025 2677 P56192;H0YIP0;H0YHL6;H0YI94;H0YI27 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 51.369 51.369 2 0.00024591 50146 QUIQUE_C1218_190116_001 117.53 66.648 318810000 104510000 74521000 0 0 0 0 0 0 0 0 82943000 0 56837000 25927 2677 24369 237336;237337;237338;237339 303601;303602;303603;303604 303601 3 LENEIQTYR Unmodified 1164.5775 0.57750184 776 CON__P13645;P13645;CON__P02535-1 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.296 39.296 2 6.7607E-18 34810 QUIQUE_DMIX4_190116_001 187 144.4 7102300000 640660000 344840000 318380000 517860000 385230000 389330000 314750000 274820000 339760000 1494500000 499410000 739990000 842800000 + 25928 776 24370 237340;237341;237342;237343;237344;237345;237346;237347;237348;237349;237350;237351;237352 303605;303606;303607;303608;303609;303610;303611;303612;303613;303614;303615;303616;303617;303618 303615 13 LENEVEQR Unmodified 1015.4934 0.49343786 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 28.725 28.725 2 0.055944 22261 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.205 0.047769 52047000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52047000 0 0 0 25929 2041 24371 237353 303619;303620 303620 2 LENGEIETIAR Unmodified 1243.6408 0.64083038 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.912 52.912 2 0.00011218 51481 QUIQUE_C1438_190116_001 147.12 82.285 2126000000 182730000 191030000 170960000 180650000 191950000 185170000 175400000 175410000 209990000 87803000 240540000 0 134400000 25930 4234 24372 237354;237355;237356;237357;237358;237359;237360;237361;237362;237363;237364;237365 303621;303622;303623;303624;303625;303626;303627;303628;303629;303630;303631;303632;303633;303634 303625 13 LENGELEHIRPK Unmodified 1433.7627 0.76267685 3110 Q15102;M0R389;M0R1K3;M0QZT2;M0QXS6;M0R323 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 1 4 3 3 3 3 2 3 1 2 2 3 2 3 27.076 27.076 2;3;4 1.9751E-05 20977 QUIQUE_C1277_190116_001 155.26 92.681 3905700000 181570000 396630000 402570000 347250000 371600000 179370000 409630000 147800000 183620000 130720000 511960000 374550000 268400000 25931 3110 24373 237366;237367;237368;237369;237370;237371;237372;237373;237374;237375;237376;237377;237378;237379;237380;237381;237382;237383;237384;237385;237386;237387;237388;237389;237390;237391;237392;237393;237394;237395;237396;237397;237398;237399 303635;303636;303637;303638;303639;303640;303641;303642;303643;303644;303645;303646;303647;303648;303649;303650;303651;303652;303653;303654;303655;303656;303657;303658;303659;303660;303661;303662;303663;303664;303665;303666;303667;303668;303669;303670;303671 303641 30 LENLDSDVVQLR Unmodified 1399.7307 0.73070802 4565 Q9Y2S7;B4DEM9 POLDIP2 Polymerase delta-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 87.467 87.467 2 0.0050184 90106 QUIQUE_C1218_190116_001 83.869 52.447 475200000 146300000 132070000 196840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25932 4565 24374 237400;237401;237402 303672;303673;303674 303672 3 LENLEPEHEYK Unmodified 1399.662 0.66195975 15 M3ZCP1;A0A075B788;P08575;E9PKH0;A0A140TA77;A0A140TA68;A0A0G2JNW2 PTPRC Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C yes no 0 0 0 1 31.54 31.54 3 0.04088 26204 QUIQUE_C1403_190116_001 28.764 14.801 23519000 0 0 0 23519000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25933 15 24375 237403 303675 303675 1 LENLGIPEEELLR Unmodified 1523.8195 0.81952302 2860 Q01658 DR1 Protein Dr1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 118.69 118.69 2 0.002249 124663 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.76 47.789 276140000 0 87018000 0 0 0 0 0 0 49543000 0 97427000 0 42150000 25934 2860 24376 237404;237405;237406;237407 303676;303677;303678;303679 303678 4 LENLLLLDLQHNR Unmodified 1589.8889 0.88893999 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 106.76 106.76 2;3 1.7524E-10 104632 QUIQUE_DMIX4_190116_001 144.57 137.99 3222500000 229940000 331050000 187760000 382160000 296170000 121780000 704880000 108000000 138990000 138820000 210350000 188510000 184080000 25935 2598 24377 237408;237409;237410;237411;237412;237413;237414;237415;237416;237417;237418;237419;237420;237421;237422;237423;237424;237425;237426;237427;237428;237429;237430;237431;237432;237433 303680;303681;303682;303683;303684;303685;303686;303687;303688;303689;303690;303691;303692;303693;303694;303695;303696;303697;303698;303699;303700;303701;303702;303703;303704;303705;303706;303707;303708;303709;303710;303711;303712 303704 31 LENLVYYNR Unmodified 1182.6033 0.60332266 3632;872 E7ETR1;Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24;C9JSB2 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 62.584 62.584 2 0.00040385 62450 QUIQUE_C1576_190116_001 136.8 83.63 284370000 0 0 0 70455000 0 33052000 91068000 0 0 0 89792000 0 0 25936 872;3632 24378 237434;237435;237436;237437 303713;303714;303715;303716;303717;303718;303719;303720 303717 8 LENPDEACAVSQK Unmodified 1459.6613 0.66130782 3312 Q5T4S7 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 31.135 31.135 2 0.00048648 26324 QUIQUE_C1576_190116_001 90.653 67.913 89801000 0 0 21943000 0 0 25198000 27113000 0 0 0 0 15548000 0 25937 3312 24379 237438;237439;237440;237441 303721;303722;303723;303724 303723 4 LENSIIPVHK Unmodified 1148.6554 0.65535823 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1;B5MCY9;K7ERQ5;C9JME6 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 37.905 37.905 2;3 0.0022304 33129 QUIQUE_C1368_190116_001 91.087 57.825 170590000 32919000 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151270 QUIQUE_C1576_190116_001 116.35 91.789 148030000 0 0 0 0 54762000 0 44976000 0 0 0 48294000 0 0 25941 2427 24383 237454;237455;237456 303737;303738;303739;303740 303738 4 LENWTDASR Unmodified 1090.5043 0.5043369 4384 Q9P2B2 PTGFRN Prostaglandin F2 receptor negative regulator yes yes 0 0 0 1 28.368 28.368 2 0.057162 22419 QUIQUE_C1563_190116_001 48.756 13.948 20003000 0 0 0 0 0 20003000 0 0 0 0 0 0 0 25942 4384 24384 237457 303741 303741 1 LENYPIPEPGPNEVLLR Unmodified 1949.0258 0.025827405 2848 Q00796;H0YKB3 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 2 3 2 118.26 118.26 2;3 5.8727E-10 122325 QUIQUE_C1277_190116_001 146.67 132.99 3759500000 214270000 226920000 232150000 232790000 226610000 207870000 304070000 261470000 445340000 120830000 406810000 397120000 483220000 25943 2848 24385 237458;237459;237460;237461;237462;237463;237464;237465;237466;237467;237468;237469;237470;237471;237472;237473;237474;237475;237476;237477 303742;303743;303744;303745;303746;303747;303748;303749;303750;303751;303752;303753;303754;303755;303756;303757;303758;303759;303760;303761;303762;303763;303764;303765;303766;303767;303768;303769;303770;303771;303772;303773;303774;303775 303745 34 LEPDILLR Unmodified 967.57023 0.57023162 2854 Q01433;H0Y360;H0YCL9;E9PIJ1;E9PJF6 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.222 86.222 2 0.029396 87911 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.903 27.8 362290000 0 0 0 0 77864000 64245000 0 55120000 48950000 0 65767000 50339000 0 25944 2854 24386 237478;237479;237480;237481;237482;237483 303776;303777;303778;303779;303780;303781 303779 6 LEPEFFR Unmodified 936.47052 0.47051757 1124;3562 H0Y599;Q8N1I0;H0Y7H7;C9J7D9;Q8IZD9 DOCK4;DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 4;Dedicator of cytokinesis protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 74.875 74.875 2 0.021705 76467 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.11 46.648 107430000 0 0 23118000 0 0 0 23824000 0 0 0 34640000 0 25852000 25945 1124;3562 24387 237484;237485;237486;237487;237488 303782;303783;303784;303785;303786;303787 303785 6 LEPGGGAEAQAVR Unmodified 1253.6364 0.6364137 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 26.974 26.974 2 0.00036006 20564 QUIQUE_C1368_190116_001 109.42 66.173 655630000 0 0 69685000 102460000 73432000 75659000 158660000 0 101240000 74495000 0 0 0 25946 3061 24388 237489;237490;237491;237492;237493;237494;237495 303788;303789;303790;303791;303792;303793;303794;303795 303788 7 LEPGSVCAVFGLGGVGLAVIMGCK Unmodified 2390.216 0.21602949 2028 P11766;H0YAG8 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes no 0 0 0 1 1 170.12 170.12 3 1.8422E-05 172103 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.672 50.939 66869000 0 0 0 0 0 0 0 13158000 53711000 0 0 0 0 25947 2028 24389 237496;237497 303796;303797 303796 1 LEPHEGLLLR Unmodified 1175.6663 0.66625727 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195;F5GZI0 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 49.54 49.54 3 0.022696 45566 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.762 28.409 229430000 0 0 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303804;303805;303806;303807;303808;303809;303810;303811;303812;303813;303814;303815;303816;303817;303818;303819;303820 303820 17 LEPLLMQLDYSMK Unmodified 1579.799 0.79898728 3630 Q8NC44;C9J3K5;C9JIF3 FAM134A Protein FAM134A yes no 0 0 0 1 1 1 138.9 138.9 2 0.016661 143320 QUIQUE_C1403_190116_001 61.958 48.265 73853000 0 0 0 17682000 0 0 0 0 22199000 0 33972000 0 0 25951 3630 24393 237518;237519;237520 303821;303822;303823 303821 3 LEPLQAYHR Unmodified 1125.5931 0.59309232 4167 Q9H488 POFUT1 GDP-fucose protein O-fucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 34.528 34.528 3 0.0023526 30415 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.906 48.833 53489000 0 0 0 0 0 19469000 0 34020000 0 0 0 0 0 25952 4167 24394 237521;237522;237523;237524;237525 303824;303825;303826;303827;303828 303828 5 LEPNAQAQMYR Unmodified 1319.6292 0.62921983 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 39.214 39.214 2 2.1976E-11 35149 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.86 115.26 196690000 0 0 0 0 0 196690000 0 0 0 0 0 0 0 25953 1749 24395 237526;237527 303829;303830;303831 303831 3 LEPNLQAQMYR Unmodified 1361.6762 0.67617003 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 66.491 66.491 2 0.00017909 65755 QUIQUE_DMIX8_190116_001 125.96 94.027 449120000 0 0 0 30246000 0 0 104200000 0 98543000 0 134820000 0 81310000 25954 1701 24396 237528;237529;237530;237531;237532;237533 303832;303833;303834;303835;303836;303837;303838;303839;303840;303841 303841 10 LEPNLQAQMYR Oxidation (M) 1377.6711 0.67108465 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 1 0 1 1 49.729 49.729 2 0.045503 47453 QUIQUE_C1403_190116_001 61.679 27.292 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25955 1701 24396 237534;237535 303842;303843 303842 2 LEPPLIPFMPLLIK Unmodified 1619.9725 0.97245861 653 B7Z278;Q8WZA2;H7BYQ0 RAPGEF4 Rap guanine nucleotide exchange factor 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 168.67 168.67 2 0.01151 173356 QUIQUE_C1218_190116_001 55.084 42.508 54788000 20667000 0 13723000 8719000 0 0 0 0 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303854;303855;303856;303857;303858;303859;303860;303861;303862;303863;303864;303865;303866 303856 13 LEPQSMVWLPVLHR Oxidation (M) 1719.913 0.91304625 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304;F5GZY3;H0Y3E8 DMD Dystrophin yes no 0 1 0 1 102.74 102.74 3 0.0060405 106064 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.704 32.565 20104000 0 0 0 0 0 0 0 0 20104000 0 0 0 0 25959 8 24399 237557 303867 303867 8 1 LEPQVPEQWAELELIVQR Unmodified 2176.1528 0.15281883 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 157.89 157.89 3 0.0078876 162518 QUIQUE_C1218_190116_001 40.349 30.819 36403000 36403000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25960 2665 24400 237558 303868 303868 1 LEPRLVLDQLR Unmodified 1350.7983 0.79833407 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 77.748 77.748 3 0.042361 73983 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.44 38.114 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25961 3459 24401 237559 303869 303869 1 LEPSDLSEDSDYDSIWTAHSYR Unmodified 2585.1194 0.11940603 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.17 116.17 3 6.9402E-10 120460 QUIQUE_C1368_190116_001 101.29 94.187 285810000 0 33468000 47214000 35398000 0 49566000 0 0 0 0 72728000 0 47434000 25962 465 24402 237560;237561;237562;237563;237564;237565 303870;303871;303872;303873;303874;303875 303871 5 LEPVIMELER Unmodified 1227.6533 0.65330932 1594 O60825;F2Z2I2;Q5W015;Q5VX20;A0A1W2PR17;Q16875;I1Z9G3;P16118;H0Y483;Q4VBA9;Q66S35;Q16877 PFKFB2;PFKFB3;PFKFB1;PFKFB4 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase;6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase;6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 1;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase;6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 103.13 103.13 2 0.017884 100654 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.948 53.781 754600000 0 151780000 155670000 143080000 127520000 118560000 0 0 0 57984000 0 0 0 25963 1594 24403 237566;237567;237568;237569;237570;237571 303876;303877;303878;303879;303880;303881 303881 5 LEPVLSSNLAQR Unmodified 1325.7303 0.73031409 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.256 66.256 2 0.0031009 65426 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.067 53.713 448970000 0 0 0 0 0 60759000 51080000 0 82912000 0 83885000 89118000 81214000 25964 982 24404 237572;237573;237574;237575;237576;237577;237578 303882;303883;303884;303885;303886;303887;303888;303889 303889 6 LEQAAIVK Unmodified 870.51747 0.51746776 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 23.36 23.36 2 0.057269 16880 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.891 17.705 20087000 0 0 0 0 0 0 0 20087000 0 0 0 0 0 25965 2998 24405 237579 303890 303890 1 LEQDEYALR Unmodified 1135.551 0.55095274 2660 P55084;F5GZQ3 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.478 44.478 2 5.2243E-08 41896 QUIQUE_C1576_190116_001 166.96 98.539 3607700000 303960000 0 425640000 322700000 241700000 232210000 250000000 391880000 307510000 182460000 351250000 290140000 308280000 25966 2660 24406 237580;237581;237582;237583;237584;237585;237586;237587;237588;237589;237590;237591 303891;303892;303893;303894;303895;303896;303897;303898;303899;303900;303901;303902;303903;303904;303905;303906;303907;303908 303897 18 LEQDLQQMQAK Unmodified 1330.6551 0.65510023 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 1 38.625 38.625 2 0.0017845 35235 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.02 56.575 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25967 2041 24407 237592;237593 303909;303910 303909 2 LEQDQLWIGTK Unmodified 1329.6929 0.69286595 1197 H3BRL3;O14562 UBFD1 Ubiquitin domain-containing protein 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no 0 0 0 1 1 1 1 28.808 28.808 2 0.032469 23380 QUIQUE_C1576_190116_001 65.313 39.089 149480000 0 41663000 39160000 28376000 0 0 40279000 0 0 0 0 0 0 25971 4607 24411 237602;237603;237604;237605 303919;303920;303921;303922;303923 303923 5 LEQEHLLEDIAHVR Unmodified 1700.8846 0.8845829 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 84.663 84.663 3;4 2.0517E-18 82612 QUIQUE_DMIX4_190116_001 144.8 120.24 4797900000 464720000 463830000 335030000 257150000 443250000 262390000 604240000 288650000 252080000 148140000 527820000 294970000 455600000 25972 2033 24412 237606;237607;237608;237609;237610;237611;237612;237613;237614;237615;237616;237617;237618;237619;237620;237621;237622;237623;237624;237625;237626;237627;237628;237629;237630;237631 303924;303925;303926;303927;303928;303929;303930;303931;303932;303933;303934;303935;303936;303937;303938;303939;303940;303941;303942;303943;303944;303945;303946;303947;303948;303949;303950;303951;303952;303953 303946 28 LEQEIATYR Unmodified 1121.5717 0.57168818 763;774;760;777;773;789;796 CON__P02533;P02533;CON__Q6IFX2;CON__A2A4G1;CON__Q61782;A8MT21;A0A3B3IS58;CON__P35900;CON__Q9D312;P35900;CON__P08779;P08779;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8;K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;CON__P08727;P08727;CON__P19001;CON__P13646-1;CON__Q8N1A0;Q8N1A0 KRT14;KRT15;KRT20;KRT16;KRT13;KRT19;KRT222 Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 20;Keratin, type I cytoskeletal 16;Keratin, type I cytoskeletal 13;Keratin, type I cytoskeletal 19;Keratin-like protein KRT222 no no 0 0 0 1 1 42.295 42.295 2 7.0816E-05 37056 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.57 93.654 210020000 112030000 0 0 0 0 0 0 0 0 97989000 0 0 0 + 25973 763;774;789;760;773;777;796 24413 237632;237633 303954;303955 303955 1 LEQELFSGGNTGINFEK Unmodified 1881.9109 0.91085723 266;1504 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303981;303982;303983;303984;303985;303986;303987;303988;303989;303990;303991;303992;303993;303994;303995;303996;303997;303998;303999;304000;304001;304002;304003;304004;304005;304006 304001 24 LEQFVSILMASIPLPDK Oxidation (M) 1916.0329 0.032886618 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 157.75 157.75 2 0.0026613 161685 QUIQUE_C1277_190116_001 61.212 46.181 82601000 21602000 24700000 0 0 36299000 0 0 0 0 0 0 0 0 25978 1786 24417 237683;237684;237685;237686;237687 304007;304008;304009;304010;304011 304008 995 4 LEQFVSILMASIPLPDKAS Unmodified 2058.1071 0.10711419 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 170.07 170.07 2;3 1.6611E-21 174409 QUIQUE_DMIX3_190116_001 135.72 114.76 485530000 0 0 0 0 0 0 0 132940000 78878000 0 98605000 123730000 51380000 25979 1786 24418 237688;237689;237690;237691;237692;237693;237694 304012;304013;304014;304015;304016;304017;304018;304019 304014 8 LEQGENVFLQATDK Unmodified 1590.789 0.78895118 184 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77.373 2 0.0006769 77227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.9 47.313 160770000 0 0 0 51261000 0 0 0 67618000 0 41893000 0 0 0 25984 2377 24422 237775;237776;237777;237778;237779 304144;304145;304146;304147;304148 304146 5 LEQHVQALLR Unmodified 1205.6881 0.68805534 950 E9PK67;E9PNI7;Q53GL7;E9PJI2;E9PPV8;E9PPE7;E9PM86;E9PSE7;E9PIA6;E9PIK9 PARP10 Poly [ADP-ribose] polymerase 10 yes no 0 0 0 1 1 1 46.859 46.859 3 0.033004 43608 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.225 16.199 14599000 0 0 0 0 0 0 0 14599000 0 0 0 0 0 25985 950 24423 237780;237781;237782 304149;304150;304151 304149 3 LEQIAAEQK Unmodified 1028.5502 0.55022446 3287 Q5QPL9;Q9UKM9;Q5QPM0 RALY RNA-binding protein Raly yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.456 20.456 2 0.022178 13697 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.815 33.101 372810000 0 73618000 0 64583000 0 0 68963000 0 96932000 0 0 0 68719000 25986 3287 24424 237783;237784;237785;237786;237787 304152;304153;304154;304155;304156 304155 0 LEQIPEGSSK Unmodified 1086.5557 0.55570376 1058 F8W9U4 MAP4 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304185;304186;304187;304188;304189;304190;304191;304192;304193;304194;304195;304196;304197;304198;304199;304200;304201;304202;304203;304204;304205;304206;304207;304208;304209;304210;304211;304212;304213;304214 304191 23 LEQLFEMADQYQYQVVLVEPK Oxidation (M) 2585.2723 0.27234162 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 1 0 1 142.44 142.44 3 0.00017671 138823 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.093 50.381 39890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39890000 0 0 0 25991 1969 24428 237840 304215 304215 1238 1 LEQLFQDEVAK Unmodified 1318.6769 0.67688153 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.792 75.792 2 0.00045729 72933 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.61 79.672 2154600000 285920000 230300000 255970000 0 214130000 0 0 0 353570000 232680000 241390000 182990000 157630000 25992 3117 24429 237841;237842;237843;237844;237845;237846;237847;237848;237849 304216;304217;304218;304219;304220;304221;304222;304223;304224 304221 6 LEQLGAQR Unmodified 913.49813 0.49812931 2109 P16435;H0Y4R2 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 0 1 1 20.461 20.461 2 0.011743 13642 QUIQUE_C1218_190116_001 89.55 1.1999 158410000 87549000 70863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25993 2109 24430 237850;237851 304225;304226 304225 1 LEQLGIPR Unmodified 924.53927 0.53926584 2912 Q07960;H0YE29 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.552 55.552 2 0.0010608 53953 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.21 83.492 2325300000 184000000 177780000 221370000 198730000 200100000 148900000 208380000 160070000 162500000 85525000 217500000 153310000 207090000 25994 2912 24431 237852;237853;237854;237855;237856;237857;237858;237859;237860;237861;237862;237863;237864 304227;304228;304229;304230;304231;304232;304233;304234;304235;304236;304237;304238;304239;304240;304241;304242;304243;304244;304245;304246;304247 304243 21 LEQLILSDTGISSLHFPDAGIGCK Unmodified 2570.305 0.30503873 432 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237902;237903;237904;237905;237906;237907;237908;237909;237910;237911;237912;237913;237914;237915;237916;237917;237918;237919;237920;237921;237922;237923 304289;304290;304291;304292;304293;304294;304295;304296;304297;304298;304299;304300;304301;304302;304303;304304;304305;304306;304307;304308;304309;304310;304311 304302 18 LEQQACLSSK Unmodified 1162.5652 0.56522259 1004 F5H283;Q92563 SPOCK2 Testican-2 yes no 0 0 0 1 1 19.29 19.29 2 0.0013244 12442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.013 32.94 59456000 0 0 0 0 0 0 0 26032000 33425000 0 0 0 0 26003 1004 24439 237924;237925 304312;304313 304312 1 LEQQLVHVER Unmodified 1249.6779 0.67788459 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6;C9JBE1;F8WAN0;E7EPX3;B9ZVU2;C9J1E2;C9JRG3 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 32.005 32.005 3 0.0038275 26969 QUIQUE_C1403_190116_001 56.359 38.62 155020000 0 0 68401000 46924000 0 39696000 0 0 0 0 0 0 0 26004 1 24440 237926;237927;237928 304314;304315;304316 304315 3 LEQQLVHVERPILR Unmodified 1728.9999 0.99988743 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6;C9JBE1;F8WAN0;E7EPX3;B9ZVU2;C9J1E2;C9JRG3 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 56.79 56.79 3;4 1.3039E-14 55322 QUIQUE_C1277_190116_001 123.02 82.294 2178000000 136220000 215820000 228960000 213320000 192790000 178810000 209870000 0 183170000 74217000 235500000 121180000 188180000 26005 1 24441 237929;237930;237931;237932;237933;237934;237935;237936;237937;237938;237939;237940;237941;237942;237943;237944;237945;237946;237947;237948 304317;304318;304319;304320;304321;304322;304323;304324;304325;304326;304327;304328;304329;304330;304331;304332;304333;304334;304335;304336;304337;304338 304320 22 LEQSEAQLGR Unmodified 1129.5728 0.57275081 3767 Q92905 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.664 23.664 2 6.8046E-18 16974 QUIQUE_C1563_190116_001 182.69 91.647 1753800000 187870000 165130000 229180000 142450000 146010000 135800000 142610000 0 121390000 94415000 164150000 113010000 111750000 26006 3767 24442 237949;237950;237951;237952;237953;237954;237955;237956;237957;237958;237959;237960 304339;304340;304341;304342;304343;304344;304345;304346;304347;304348;304349;304350;304351 304345 11 LEQSMREETLLK Oxidation (M) 1491.7603 0.76029359 386 A0A1W2PQV4;H3BQL2 GOLGA8T yes no 0 1 1 1 52.138 52.138 2 0.0076338 47176 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.08 12.852 10353000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10353000 0 0 0 26007 386 24443 237961 304352 304352 273 1 LEQSTIVK Unmodified 916.52295 0.52294707 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.761 20.761 2 0.0059029 13476 QUIQUE_C1403_190116_001 103.74 24.623 687060000 143480000 110410000 0 118730000 0 156380000 81677000 0 0 76378000 0 0 0 26008 2876 24444 237962;237963;237964;237965;237966;237967 304353;304354;304355;304356;304357;304358 304355 5 LEQSYEALCELAAAR Unmodified 1722.8247 0.82468476 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 111.23 111.23 2 3.1193E-09 114655 QUIQUE_DMIX3_190116_001 153.38 97.021 706320000 90450000 103880000 59767000 30415000 69416000 0 0 62049000 63196000 52420000 69505000 57715000 47510000 26009 1472 24445 237968;237969;237970;237971;237972;237973;237974;237975;237976;237977;237978;237979 304359;304360;304361;304362;304363;304364;304365;304366;304367;304368;304369;304370;304371 304366 13 LEQVLSSMK Oxidation (M) 1049.5427 0.54269624 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 24.734 24.734 2 0.013635 18258 QUIQUE_C1368_190116_001 72.643 27.951 42489000 0 0 42489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26010 86 24446 237980 304372 304372 60 1 LEQVLSSMK Unmodified 1033.5478 0.54778161 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 48.144 48.144 2 0.01718 42980 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.224 17.376 18255000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18255000 0 0 0 26011 86 24446 237981 304373 304373 1 LEQVSSDEGIGTLAENLLEALR Unmodified 2356.2122 0.21218421 3312 Q5T4S7;X6R960 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 2 171.49 171.49 2;3 2.309E-05 175533 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.932 61.95 123690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 123690000 26012 3312 24447 237982;237983 304374;304375 304374 2 LEQYTSAIEGTK Unmodified 1338.6667 0.66671078 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.729 49.729 2 4.4275E-06 46762 QUIQUE_C1368_190116_001 136.48 85.13 1608400000 109660000 132040000 86030000 129060000 195860000 81496000 85880000 100700000 177850000 54430000 148810000 160630000 145920000 26013 926;889 24448 237984;237985;237986;237987;237988;237989;237990;237991;237992;237993;237994;237995;237996 304376;304377;304378;304379;304380;304381;304382;304383;304384;304385;304386;304387;304388;304389;304390;304391;304392;304393 304380 18 LERPLVDLPLLLDPPSYVPDTVDLTDDALAR Unmodified 3430.8236 0.82355235 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26;H0YA31 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 1 1 168.43 168.43 3 0.043281 171289 QUIQUE_C1403_190116_001 36.698 31.937 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26014 4304 24449 237997 304394 304394 1 LERPVIYIDQTR Unmodified 1501.8253 0.8252771 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 2 1 1 59.25 59.25 2;3 5.1285E-06 58434 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.8 97.074 9818300000 482760000 703690000 1095300000 642590000 934350000 554410000 915890000 651780000 880050000 321810000 1357300000 633480000 644930000 26015 2261 24450 237998;237999;238000;238001;238002;238003;238004;238005;238006;238007;238008;238009;238010;238011;238012;238013;238014;238015 304395;304396;304397;304398;304399;304400;304401;304402;304403;304404;304405;304406;304407;304408;304409;304410;304411;304412;304413;304414;304415;304416;304417;304418;304419;304420;304421;304422;304423;304424;304425;304426;304427;304428;304429;304430;304431;304432;304433 304417 38 LERYDECLAVYR Unmodified 1585.7559 0.75587691 1683 O76094;D6RDY6;R4GNC1 SRP72 Signal recognition particle subunit SRP72 yes no 0 0 1 1 1 20.618 20.618 3 0.020653 13914 QUIQUE_C1218_190116_001 48.741 1.7768 426790000 142310000 0 0 0 284470000 0 0 0 0 0 0 0 0 26016 1683 24451 238016;238017 304434;304435 304434 2 LESAAPPEPAPEPAPQPDPRPDSQPTPK Unmodified 2915.4301 0.43011591 3469 Q7Z6L0;A0A0G2JLL6;A0A1B0GTP1;A0A1B0GTE9 PRRT2 Proline-rich transmembrane protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.366 56.366 3 1.3756E-12 54680 QUIQUE_C1277_190116_001 72.499 65.85 658720000 0 70168000 116460000 101580000 81597000 48395000 96841000 0 0 21627000 0 0 122060000 26017 3469 24452 238018;238019;238020;238021;238022;238023;238024;238025 304436;304437;304438;304439;304440;304441;304442;304443;304444 304436 9 LESAQATFQAHR Unmodified 1357.6739 0.67386184 106 A0A087X1E4;P53365 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 26.304 26.304 2 0.010722 20091 QUIQUE_C1576_190116_001 65.347 36.26 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26018 106 24453 238026;238027;238028;238029 304445;304446;304447;304448 304448 4 LESCGVTSDNCR Unmodified 1396.5711 0.57111261 2055 P13489 RNH1 Ribonuclease inhibitor yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.934 19.934 2 6.7731E-55 12818 QUIQUE_DMIX7_190116_001 211.27 158.1 4265900000 402960000 313720000 467450000 468160000 457290000 324550000 607480000 124050000 166720000 119830000 221670000 217980000 374040000 26019 2055 24454 238030;238031;238032;238033;238034;238035;238036;238037;238038;238039;238040;238041;238042 304449;304450;304451;304452;304453;304454;304455;304456;304457;304458;304459;304460;304461 304460 13 LESDYEILER Unmodified 1265.6139 0.61394692 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24;Q5TCD1 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.758 77.758 2 0.0039027 79225 QUIQUE_C1576_190116_001 82.749 50.815 262390000 46258000 45921000 32403000 0 56379000 0 31300000 0 0 0 50124000 0 0 26020 2441 24455 238043;238044;238045;238046;238047;238048;238049 304462;304463;304464;304465;304466;304467;304468 304467 5 LESEEDVSQAFLEAVAEEKPHVKPYFSK Unmodified 3205.5819 0.5819251 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 129.15 129.15 5 8.7185E-09 133231 QUIQUE_C1403_190116_001 63.491 52.784 238740000 0 52103000 0 41394000 51718000 34708000 0 0 58815000 0 0 0 0 26021 3154 24456 238050;238051;238052;238053;238054 304469;304470;304471;304472;304473 304470 5 LESEETMVLEAHDAQGDVPVTVTVHDFPGK Unmodified 3249.55 0.54997304 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 112.99 112.99 4 0.028454 109883 QUIQUE_DMIX4_190116_001 20.592 14.689 40458000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40458000 0 0 0 26022 1803 24457 238055 304474 304474 1 LESEGSPETLTNLR Unmodified 1544.7682 0.76821574 4363 Q9P035;H3BS72;H3BPZ1;H3BRL8;H3BMZ1 HACD3 Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.608 67.608 2 5.1449E-22 68320 QUIQUE_C1218_190116_001 159.09 101.23 841840000 122180000 90811000 186720000 0 0 127390000 222950000 91791000 0 0 0 0 0 26023 4363 24458 238056;238057;238058;238059;238060;238061;238062;238063;238064;238065;238066;238067 304475;304476;304477;304478;304479;304480;304481;304482;304483;304484;304485;304486;304487;304488;304489 304476 15 LESEGSPETLTNLRK Unmodified 1672.8632 0.86317875 4363 Q9P035;H3BS72;H3BPZ1;H3BRL8;H3BMZ1 HACD3 Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 yes no 0 0 1 1 1 1 46.501 46.501 3 0.00068086 44145 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.65 49.963 97455000 0 0 0 0 0 0 0 30361000 19081000 0 48014000 0 0 26024 4363 24459 238068;238069;238070 304490;304491;304492 304490 2 LESEHPDQAQAILSR Unmodified 1692.8431 0.84311201 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 46.616 46.616 2;3 1.0207E-79 43392 QUIQUE_C1563_190116_001 213.18 181.75 6429700000 1168600000 762300000 709820000 635110000 558690000 637880000 463160000 173440000 390050000 328880000 304120000 297670000 0 26025 2851 24460 238071;238072;238073;238074;238075;238076;238077;238078;238079;238080;238081;238082;238083;238084;238085;238086;238087;238088;238089;238090;238091;238092;238093;238094 304493;304494;304495;304496;304497;304498;304499;304500;304501;304502;304503;304504;304505;304506;304507;304508;304509;304510;304511;304512;304513;304514;304515;304516;304517;304518;304519;304520;304521;304522;304523 304506 29 LESFMETGK Unmodified 1040.4848 0.48484701 1646 O75569 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.327 49.327 2 0.013527 46150 QUIQUE_C1563_190116_001 69.812 40.854 239370000 45313000 38704000 0 28216000 32475000 31924000 0 0 35264000 0 0 27479000 0 26026 1646 24461 238095;238096;238097;238098;238099;238100;238101 304524;304525;304526;304527;304528;304529;304530 304528 7 LESFWALR Unmodified 1020.5393 0.53926584 3575 Q8N1F8 STK11IP Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein yes yes 0 0 0 1 107.22 107.22 2 0.019858 112359 QUIQUE_C1438_190116_001 77.674 29.17 8806200 0 0 0 0 8806200 0 0 0 0 0 0 0 0 26027 3575 24462 238102 304531 304531 1 LESIATTLVSHK Unmodified 1297.7242 0.72416608 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 53.57 53.57 2;3 0.0011777 51702 QUIQUE_C1403_190116_001 52.79 44.277 71300000 0 0 34188000 37112000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26028 4390 24463 238103;238104;238105 304532;304533;304534 304534 3 LESIISGAALMADSSCTR Unmodified 1880.8972 0.89719777 2250;2369 P35221;G3XAM7;H0YBB8;P26232 CTNNA1;CTNNA2 Catenin alpha-1;Catenin alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 114.68 114.68 2;3 2.5774E-31 118473 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.8 138.53 1308800000 105500000 121590000 136720000 156550000 111910000 189310000 143700000 88198000 0 35896000 105360000 0 114030000 26029 2369;2250 24464 238106;238107;238108;238109;238110;238111;238112;238113;238114;238115;238116;238117 304535;304536;304537;304538;304539;304540;304541;304542;304543;304544;304545;304546;304547;304548;304549 304548 14 LESLLLCTLNDR Unmodified 1445.7548 0.75481428 920 E9PGC0;P20936 RASA1 Ras GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 113.57 113.57 2 0.014151 118126 QUIQUE_C1576_190116_001 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0 0 1 1 1 1 1 18.453 18.453 3 0.0099528 11258 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.448 21.121 164540000 0 57962000 46647000 0 0 0 0 23724000 36207000 0 0 0 0 26036 3557 24471 238175;238176;238177;238178;238179 304642;304643;304644;304645;304646 304646 4 LESTARPSESSEEFLEEEPEQR Unmodified 2578.1671 0.16708451 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 67.943 67.943 3 1.5074E-27 67864 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.32 104.84 252440000 0 0 0 0 0 0 0 67421000 47350000 0 41439000 51652000 44574000 26037 4668 24472 238180;238181;238182;238183;238184 304647;304648;304649;304650;304651;304652 304648 6 LESTLNYGMER Unmodified 1311.6129 0.61290107 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.492 58.492 2 0.00074572 57794 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.342 83.305 476650000 0 69681000 67463000 64294000 52542000 57593000 58888000 0 0 0 45475000 0 60710000 26038 2380 24473 238185;238186;238187;238188;238189;238190;238191;238192;238193 304653;304654;304655;304656;304657;304658;304659;304660;304661 304660 8 LESTLNYGMER Oxidation (M) 1327.6078 0.60781569 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 42.786 42.786 2 0.0034732 39666 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.294 37.001 157020000 0 0 0 0 0 0 0 28775000 33718000 18576000 44526000 31424000 0 26039 2380 24473 238194;238195;238196;238197;238198 304662;304663;304664;304665;304666;304667 304662 1786 6 LESTVLSILEAQASTLADEK Unmodified 2117.1103 0.1103449 4665 Q9Y6V0 PCLO Protein piccolo yes yes 0 0 0 1 1 163.27 163.27 3 0.0063994 168412 QUIQUE_C1218_190116_001 38.377 34.399 27550000 12142000 0 15407000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26040 4665 24474 238199;238200 304668;304669 304668 2 LESVHIILR Unmodified 1078.6499 0.64987892 4447 Q9UIA9;E7ESC6 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 53.63 53.63 2;3 0.0069166 51756 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.327 31.863 468720000 0 63881000 56807000 0 97484000 17898000 28444000 0 53959000 0 30454000 93919000 25871000 26041 4447 24475 238201;238202;238203;238204;238205;238206;238207;238208;238209;238210;238211 304670;304671;304672;304673;304674;304675;304676;304677;304678;304679;304680 304676 10 LESVSEDPTQLEEVEK Unmodified 1830.8735 0.87346867 949 E9PS17;E9PK59;Q96KG9;E9PPN3;A0A0A0MQX4;H0YDH0 SCYL1 N-terminal kinase-like protein yes no 0 0 0 1 81.22 81.22 2 1.7314E-08 83016 QUIQUE_C1368_190116_001 107.97 78.626 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26042 949 24476 238212 304681 304681 1 LESYWIEAQTLCHTVNEHLK Unmodified 2470.1951 0.19509435 4489 Q9ULJ8 PPP1R9A Neurabin-1 yes yes 0 0 0 2 119.99 119.99 4 0.06151 123941 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.625 24.003 55070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55070000 0 26043 4489 24477 238213;238214 304682;304683 304682 0 LETAVNLAWTAGNSNTR Unmodified 1816.9068 0.9067749 2185 P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 94.795 94.795 2 1.7719E-16 99556 QUIQUE_C1218_190116_001 160.69 126.81 471150000 77322000 54771000 62985000 51553000 44825000 70234000 0 21353000 0 30421000 57681000 0 0 26044 2185 24478 238215;238216;238217;238218;238219;238220;238221;238222;238223;238224;238225;238226;238227;238228;238229;238230 304684;304685;304686;304687;304688;304689;304690;304691;304692;304693;304694;304695;304696;304697;304698;304699;304700;304701;304702;304703;304704 304686 19 LETDILFGHR Unmodified 1199.6299 0.62987176 3859 Q96GD0;Q6ZT62;B1AHD3 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.242 77.242 3 4.7697E-05 77980 QUIQUE_C1368_190116_001 99.688 85.868 1446900000 195760000 177450000 160890000 135550000 110550000 198100000 136120000 43611000 20474000 85656000 91139000 0 91605000 26045 3859 24479 238231;238232;238233;238234;238235;238236;238237;238238;238239;238240;238241;238242 304705;304706;304707;304708;304709;304710;304711;304712;304713;304714;304715;304716;304717 304708 13 LETDPAIVINR Unmodified 1239.6823 0.68230126 4203 Q9HAB8 PPCS Phosphopantothenate--cysteine ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 71.919 71.919 2 0.030053 72301 QUIQUE_C1218_190116_001 53.751 20.911 53731000 53731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26046 4203 24480 238243;238244;238245 304718;304719;304720 304718 3 LETELGQPAER Unmodified 1241.6252 0.62518031 1716 O95248;H0Y5W8 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.841 37.841 2 0.00048057 33290 QUIQUE_C1563_190116_001 118.18 97.848 243690000 40914000 31805000 0 32254000 30895000 26127000 41586000 0 0 13386000 0 26728000 0 26047 1716 24481 238246;238247;238248;238249;238250;238251;238252;238253;238254;238255;238256 304721;304722;304723;304724;304725;304726;304727;304728;304729;304730;304731 304726 10 LETFLSLLVQNLAPAETHT Unmodified 2096.1154 0.11537069 2531 P49441 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 172.65 172.65 2;3 2.9058E-45 175929 QUIQUE_C1277_190116_001 212.9 185.8 2019100000 153440000 205330000 169670000 99308000 239020000 12063000 177310000 125840000 211520000 0 252730000 203880000 169020000 26048 2531 24482 238257;238258;238259;238260;238261;238262;238263;238264;238265;238266;238267;238268;238269;238270;238271;238272;238273;238274;238275;238276;238277;238278 304732;304733;304734;304735;304736;304737;304738;304739;304740;304741;304742;304743;304744;304745;304746;304747;304748;304749;304750;304751;304752;304753;304754 304735 22 LETGAPRPPATVTNAVSWR Unmodified 2022.0647 0.064672527 4065 Q9BXS5;E7ENJ6;K7EJL1;A0A087WZX7 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 79.021 79.021 3 9.4984E-23 80268 QUIQUE_C1277_190116_001 112.74 73.732 705060000 75316000 105100000 0 51844000 63258000 0 94742000 57940000 55761000 17979000 56261000 84353000 42506000 26049 4065 24483 238279;238280;238281;238282;238283;238284;238285;238286;238287;238288;238289;238290;238291;238292 304755;304756;304757;304758;304759;304760;304761;304762;304763;304764;304765;304766;304767;304768 304756 11 LETGQFLTFR Unmodified 1210.6346 0.63462279 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.17 101.17 2 1.8679E-11 103795 QUIQUE_DMIX7_190116_001 161.79 131.98 759670000 52037000 0 83892000 59425000 70472000 58368000 69981000 60211000 63567000 31557000 77062000 76562000 56534000 26050 514 24484 238293;238294;238295;238296;238297;238298;238299;238300;238301;238302;238303;238304;238305 304769;304770;304771;304772;304773;304774;304775;304776;304777;304778;304779;304780;304781;304782;304783 304782 15 LETHMTPEMFR Unmodified 1390.6373 0.63734168 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 62.555 62.555 2;3 0.00040348 62310 QUIQUE_C1438_190116_001 66.486 62.807 492470000 66623000 101400000 35073000 40893000 60975000 36815000 45965000 18883000 20932000 0 31703000 33205000 0 26051 2916 24485 238306;238307;238308;238309;238310;238311;238312;238313;238314;238315;238316;238317;238318;238319 304784;304785;304786;304787;304788;304789;304790;304791;304792;304793;304794;304795;304796;304797 304790 14 LETLGIGQR Unmodified 985.55564 0.55564418 4351 Q9NZL9 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 50.059 50.059 2 0.00050194 48007 QUIQUE_C1576_190116_001 113.89 32.508 532600000 0 97198000 103080000 107300000 0 0 115960000 63638000 0 45423000 0 0 0 26052 4351 24486 238320;238321;238322;238323;238324;238325 304798;304799;304800;304801;304802;304803 304801 5 LETLSLNNNHLR Unmodified 1422.7579 0.75792582 495 H3BSW0;A0A3B3ISV5;Q8N9N7 LRRC57 Leucine-rich repeat-containing protein 57 yes no 0 0 0 1 51.713 51.713 3 0.016675 46859 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.502 29.539 9929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9929000 0 0 0 26053 495 24487 238326 304804;304805 304804 2 LETLSNQNSDCK Unmodified 1407.63 0.63000769 1479 O15083;H7C4G9 ERC2 ERC protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.617 20.617 2 2.2783E-20 13953 QUIQUE_C1218_190116_001 174.41 155.17 616270000 52740000 44773000 53715000 57089000 58283000 49368000 71001000 20276000 30799000 21471000 60237000 48848000 47668000 26054 1479 24488 238327;238328;238329;238330;238331;238332;238333;238334;238335;238336;238337;238338;238339 304806;304807;304808;304809;304810;304811;304812;304813;304814;304815;304816;304817;304818 304806 13 LETLTALQAK Unmodified 1086.6285 0.62847478 654 B7Z2R7;Q5T8D3 ACBD5 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 59.685 59.685 2 0.029155 58692 QUIQUE_C1218_190116_001 66.299 30.943 20923000 20923000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26055 654 24489 238340 304819 304819 1 LETQPQEEYEIINVEVK Unmodified 2060.0314 0.031366293 3239 Q4J6C6;C9JMT4 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes no 0 0 0 1 108.57 108.57 2 0.0001468 110557 QUIQUE_C1563_190116_001 105.65 91.091 29017000 0 0 0 0 0 29017000 0 0 0 0 0 0 0 26056 3239 24490 238341 304820 304820 1 LETTQLLAK Unmodified 1015.5914 0.59136099 4269 Q9NRG7 SDR39U1 Epimerase family protein SDR39U1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.671 49.671 2 0.0064482 47437 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.368 30.211 1187300000 120650000 70353000 93098000 85678000 86669000 86200000 83328000 87612000 106500000 38930000 124980000 91842000 111460000 26057 4269 24491 238342;238343;238344;238345;238346;238347;238348;238349;238350;238351;238352;238353;238354 304821;304822;304823;304824;304825;304826;304827;304828;304829;304830;304831;304832;304833 304828 13 LETTSNQDNLAPITAK Unmodified 1714.8737 0.87374344 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.726 54.726 2 2.7366E-45 53562 QUIQUE_C1438_190116_001 186.16 162.78 1195500000 85543000 84556000 108440000 114400000 146050000 65897000 109640000 49120000 103310000 43034000 106760000 80490000 98272000 26058 2207 24492 238355;238356;238357;238358;238359;238360;238361;238362;238363;238364;238365;238366;238367 304834;304835;304836;304837;304838;304839;304840;304841;304842;304843;304844;304845;304846 304838 12 LETTWMTAVGLSEMAAEAAYQTGADQASITAR Oxidation (M) 3359.565 0.56497118 4261 Q9NR28;A0A024RBT2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 1 0 1 168.32 168.32 3 2.67E-06 173413 QUIQUE_C1368_190116_001 48.226 42.385 16570000 0 0 16570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26059 4261 24493 238368 304847 304847 2892 1 LETTWMTAVGLSEMAAEAAYQTGADQASITAR Unmodified 3343.5701 0.57005656 4261 Q9NR28;A0A024RBT2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 170.38 170.38 3;4 1.0949E-36 176635 QUIQUE_C1438_190116_001 105.54 94.635 290150000 0 0 22907000 0 41437000 9234600 36536000 17849000 38820000 0 0 96621000 26743000 26060 4261 24493 238369;238370;238371;238372;238373;238374;238375;238376;238377;238378 304848;304849;304850;304851;304852;304853;304854;304855;304856;304857;304858;304859 304850 11 LETVALPLQGLEDLAADR Unmodified 1923.0313 0.031306714 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 154.62 154.62 2 0.051037 162297 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.448 28.595 17795000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17795000 0 0 26061 1187 24494 238379 304860 304860 0 LETVGSIFSR Unmodified 1107.5924 0.59242362 1300 J3QLR8;Q9Y3D9 MRPS23 28S ribosomal protein S23, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 85.768 85.768 2 0.0031367 87257 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.02 59.914 107520000 34606000 0 0 0 0 0 0 21447000 17352000 0 34115000 0 0 26062 1300 24495 238380;238381;238382;238383;238384;238385 304861;304862;304863;304864;304865;304866 304865 4 LEVANLLLQK Unmodified 1139.6914 0.69140938 2953 Q12955 ANK3 Ankyrin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.01 106.01 2 0.0028756 108400 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.476 43.029 301960000 30603000 39723000 31362000 23356000 18929000 21926000 34780000 25117000 21593000 0 0 25631000 28943000 26063 2953 24496 238386;238387;238388;238389;238390;238391;238392;238393;238394;238395;238396;238397 304867;304868;304869;304870;304871;304872;304873;304874;304875;304876;304877;304878 304874 11 LEVAPISDIIAIK Unmodified 1380.8228 0.82281749 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12;H0YKF0 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.73 131.73 2 0.0016289 137343 QUIQUE_C1218_190116_001 94.616 59.924 5113200000 403180000 419790000 409840000 328930000 439470000 478150000 363750000 439890000 373920000 175100000 543210000 331460000 406520000 26064 2067 24497 238398;238399;238400;238401;238402;238403;238404;238405;238406;238407;238408;238409;238410 304879;304880;304881;304882;304883;304884;304885;304886;304887;304888;304889;304890;304891;304892;304893;304894;304895;304896;304897;304898;304899 304879 21 LEVAVLQESVAK Unmodified 1284.7289 0.7289171 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6;C9JIW4;H7C363 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.066 81.066 2 0.0019934 82912 QUIQUE_C1368_190116_001 84.17 58.125 434470000 0 140090000 0 0 0 65198000 0 0 61810000 0 89250000 0 78122000 26065 62 24498 238411;238412;238413;238414;238415;238416;238417 304900;304901;304902;304903;304904;304905;304906;304907 304902 8 LEVDAIVNAANSSLLGGGGVDGCIHR Unmodified 2593.2918 0.29184828 3990 Q9BQ69 MACROD1 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD1 yes yes 0 0 0 1 1 137.36 137.36 3 8.6025E-24 142759 QUIQUE_C1218_190116_001 112.86 97.919 113260000 50075000 63189000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26066 3990 24499 238418;238419 304908;304909 304908 2 LEVDIPLVK Unmodified 1024.6168 0.61684746 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;E9PKF8;H0YE22 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.89 101.89 2 0.0080372 104660 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.906 45.654 698010000 61117000 57379000 58778000 49226000 55327000 54596000 58124000 51058000 46861000 23711000 63121000 58073000 60640000 26067 798 24500 238420;238421;238422;238423;238424;238425;238426;238427;238428;238429;238430;238431;238432 304910;304911;304912;304913;304914;304915;304916;304917;304918;304919;304920;304921;304922;304923;304924;304925 304921 16 LEVDYSIGR Unmodified 1050.5346 0.53457439 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248 COPS7A COP9 signalosome complex subunit 7a yes no 0 0 0 1 67.847 67.847 2 0.031408 67591 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.743 28.196 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26068 4411 24501 238433 304926 304926 1 LEVEANNAFDQYR Unmodified 1567.7267 0.72668527 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 80.903 80.903 2 8.867E-06 81895 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.84 134.54 3412200000 251800000 248490000 275860000 249140000 253170000 248660000 250240000 210040000 257880000 159720000 415380000 267360000 324470000 26069 585;2493 24502 238434;238435;238436;238437;238438;238439;238440;238441;238442;238443;238444;238445;238446;238447 304927;304928;304929;304930;304931;304932;304933;304934;304935;304936;304937;304938;304939;304940 304935 13 LEVERDNLAQDLATVR Unmodified 1840.9643 0.96428978 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 3 3 2 4 3 3 4 6 10 3 6 11 6 88.74 88.74 2;3;4 5.9473E-131 90508 QUIQUE_C1438_190116_001 267.17 227.91 338230000000 1262900000 2144800000 4588600000 2138700000 4990100000 504100000 4130400000 63334000000 54714000000 198650000 75645000000 66322000000 58259000000 26070 389;395;1336 24503 238448;238449;238450;238451;238452;238453;238454;238455;238456;238457;238458;238459;238460;238461;238462;238463;238464;238465;238466;238467;238468;238469;238470;238471;238472;238473;238474;238475;238476;238477;238478;238479;238480;238481;238482;238483;238484;238485;238486;238487;238488;238489;238490;238491;238492;238493;238494;238495;238496;238497;238498;238499;238500;238501;238502;238503;238504;238505;238506;238507;238508;238509;238510;238511 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1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 150.21 150.21 3 0.0014832 157186 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.592 63.308 224360000 0 0 0 0 0 97275000 0 0 0 0 127080000 0 0 26072 1591 24505 238517;238518 305026;305027 305027 0 LEVIFADLAR Unmodified 1145.6445 0.64445919 4355 Q9NZQ3;H7C2K2 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.66 118.66 2 0.0017727 122090 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.649 64.5 344440000 27277000 31194000 32901000 26122000 32437000 31512000 29208000 28949000 31796000 14469000 0 31401000 27171000 26073 4355 24506 238519;238520;238521;238522;238523;238524;238525;238526;238527;238528;238529;238530;238531 305028;305029;305030;305031;305032;305033;305034;305035;305036;305037;305038;305039;305040 305039 13 LEVLTNLANETNIPTVLR Unmodified 2009.1157 0.11570504 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 140.7 140.7 2;3 2.4773E-32 147422 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305075 14 LEVNMQALK Unmodified 1044.5638 0.56376603 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 65.657 65.657 2 0.00034385 65187 QUIQUE_C1277_190116_001 135.84 51.599 93398000 0 93398000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26076 2385 24509 238565 305078 305078 1 LEVQAEEER Unmodified 1101.5302 0.5302173 4153 Q9H307 PNN Pinin yes yes 0 0 0 1 1 24.647 24.647 2 0.022113 18175 QUIQUE_C1277_190116_001 61.679 24.12 101060000 0 41251000 0 0 0 0 0 0 0 0 59807000 0 0 26077 4153 24510 238566;238567 305079;305080 305079 2 LEVQAEEERK Unmodified 1229.6252 0.62518031 4153 Q9H307 PNN Pinin yes yes 0 0 1 1 16.399 16.399 3 0.033504 8737 QUIQUE_C1218_190116_001 29.534 16.578 16082000 16082000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26078 4153 24511 238568 305081 305081 1 LEVSDDLENVCNWVVDTCLHK Unmodified 2544.1625 0.1624736 1652 O75688;C9JIR6;A0A3B3IS24 PPM1B Protein phosphatase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 150.83 150.83 3 0.00034351 155075 QUIQUE_C1277_190116_001 55.206 52.273 147880000 40815000 44032000 30269000 0 0 0 32762000 0 0 0 0 0 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971 24515 238575;238576;238577;238578;238579;238580;238581;238582;238583;238584;238585;238586;238587;238588;238589;238590;238591;238592;238593 305089;305090;305091;305092;305093;305094;305095;305096;305097;305098;305099;305100;305101;305102;305103;305104;305105;305106;305107;305108;305109;305110;305111;305112;305113 305094 22 LEWAIDEDELRK Unmodified 1515.7569 0.75692277 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 86.941 86.941 3 0.00082764 90031 QUIQUE_C1438_190116_001 72.937 53.359 205000000 0 0 0 0 40013000 0 0 31115000 49103000 0 0 44043000 40724000 26083 3997 24516 238594;238595;238596;238597;238598 305114;305115;305116;305117;305118;305119;305120 305114 7 LEWAVDDEEK Unmodified 1232.5561 0.55609769 616 B4DKF8;E5RJ29;Q9NYI0;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 PH and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.669 67.669 2 0.00048457 68660 QUIQUE_C1218_190116_001 110.88 90.553 230260000 58669000 0 45491000 80779000 45321000 0 0 0 0 0 0 0 0 26084 616 24517 238599;238600;238601;238602 305121;305122;305123;305124;305125 305121 5 LEWAVDDEEKKK Unmodified 1488.746 0.74602373 616 B4DKF8;E5RJ29;Q9NYI0;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 PH and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 2 1 30.753 30.753 3 0.030126 25555 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.401 41.852 63949000 0 0 0 0 0 0 0 63949000 0 0 0 0 0 26085 616 24518 238603 305126 305126 1 LEWLSLLSDAEK Unmodified 1402.7344 0.73439641 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.45 150.45 2 0.00052696 157046 QUIQUE_C1438_190116_001 113.69 76.993 497520000 63042000 42226000 71233000 55192000 47789000 21931000 43988000 21833000 24893000 14494000 28258000 36117000 26526000 26086 4014 24519 238604;238605;238606;238607;238608;238609;238610;238611;238612;238613;238614;238615;238616 305127;305128;305129;305130;305131;305132;305133;305134;305135;305136;305137;305138;305139;305140;305141;305142 305134 15 LEWPLTEVAEGVFETEAPGGYK Unmodified 2421.174 0.17400778 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 166.51 166.51 3 0.021124 171696 QUIQUE_C1368_190116_001 39.515 31.803 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26087 4220 24520 238617 305143 305143 1 LEWSPVHK Unmodified 994.52362 0.52361577 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 35.247 35.247 2 0.027083 30984 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.998 53.035 366470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 188410000 178060000 0 26088 4443 24521 238618;238619 305144;305145;305146 305146 3 LEWVYGYR Unmodified 1084.5342 0.53418046 1757;507 F8W717;A0A3B3IU69;O00423;G3V500;G3V3N9;K7ERR2;K7EIM1;K7EQR0;K7ERY9;K7EKU5;Q6ZMW3;Q05BV3;O95834;K7EIK7;A0A0C4DGQ7;C9JRL6 EML1;EML2;EML6;EML5 Echinoderm microtubule-associated protein-like 1;Echinoderm microtubule-associated protein-like 6;Echinoderm microtubule-associated protein-like 5;Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 90.433 90.433 2 0.0025487 93953 QUIQUE_C1218_190116_001 135.87 105.45 142730000 31358000 0 0 33908000 32475000 0 26441000 0 0 0 0 0 18547000 26089 507;1757 24522 238620;238621;238622;238623;238624;238625;238626 305147;305148;305149;305150;305151;305152;305153 305147 6 LEYCEALAMLR Unmodified 1367.6577 0.65774277 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.47 122.47 2 0.00047532 128380 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.15 58.36 2176100000 142130000 178530000 219660000 166120000 150710000 157960000 192250000 180220000 152170000 57716000 193970000 176510000 208190000 26090 2083 24523 238627;238628;238629;238630;238631;238632;238633;238634;238635;238636;238637;238638;238639 305154;305155;305156;305157;305158;305159;305160;305161;305162;305163;305164;305165;305166;305167;305168;305169;305170;305171;305172;305173 305168 20 LEYCEALAMLR Oxidation (M) 1383.6527 0.65265739 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 1 0 1 1 100.12 100.12 2 0.0076396 102096 QUIQUE_C1277_190116_001 66.435 39.32 60068000 0 26868000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33200000 0 26091 2083 24523 238640;238641 305174;305175 305174 1415 2 LEYCNPYR Unmodified 1113.4913 0.49132937 2203 P22830;K7ELX4;K7EJX5 FECH Ferrochelatase, mitochondrial;Ferrochelatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.927 45.927 2 0.0048393 42977 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.66 78.509 191330000 0 0 59782000 0 0 0 0 30507000 53936000 0 0 47108000 0 26092 2203 24524 238642;238643;238644;238645 305176;305177;305178;305179;305180 305179 5 LEYDAYR Unmodified 928.42905 0.42904669 106 A0A087X1E4;P53365 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 0 1 1 37.818 37.818 2 0.035447 33866 QUIQUE_C1438_190116_001 86.866 0 77736000 0 0 0 0 44501000 0 0 33235000 0 0 0 0 0 26093 106 24525 238646;238647 305181;305182 305181 2 LEYFTDILR Unmodified 1168.6128 0.61282471 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 120.79 120.79 2 0.014831 125257 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.993 14.238 32126000 0 0 0 0 0 0 0 0 32126000 0 0 0 0 26094 1510 24526 238648 305183 305183 1 LEYGDNAEK Unmodified 1037.4666 0.46655441 4535 Q9Y224;G3V4C6;H0YJB9 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 0 1 1 1 19.5 19.5 2 0.022221 12052 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.602 23.183 296600000 0 0 100890000 0 0 0 0 127990000 0 67719000 0 0 0 26095 4535 24527 238649;238650;238651 305184;305185;305186 305186 2 LEYGDNAEKYK Unmodified 1328.6248 0.62484596 4535 Q9Y224;G3V4C6;H0YJB9 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 1 1 10.557 10.557 3 0.017594 2950 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.399 21.193 62981000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62981000 0 0 0 26096 4535 24528 238652 305187 305187 1 LEYGGLGR Unmodified 863.45012 0.45011648 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.722 42.722 2 0.004682 40074 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.24 61.887 1836900000 169660000 153290000 107080000 147860000 0 116860000 171810000 189360000 161430000 76516000 201690000 172560000 168760000 26097 3835 24529 238653;238654;238655;238656;238657;238658;238659;238660;238661;238662;238663;238664 305188;305189;305190;305191;305192;305193;305194;305195;305196;305197;305198;305199 305194 10 LEYQLLLAK Unmodified 1089.6434 0.64339656 3543 Q8IWZ6;H0Y973 BBS7 Bardet-Biedl syndrome 7 protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.368 96.368 2 0.014585 100147 QUIQUE_C1438_190116_001 82.563 52.396 200340000 17383000 13440000 15467000 14400000 16367000 14156000 25001000 19052000 0 0 20983000 16888000 27207000 26098 3543 24530 238665;238666;238667;238668;238669;238670;238671;238672;238673;238674;238675 305200;305201;305202;305203;305204;305205;305206;305207;305208;305209;305210 305204 9 LEYSNFSIR Unmodified 1127.5611 0.56112349 2078 P14621;U3KQL2;U3KPX8 ACYP2 Acylphosphatase-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 78.4 78.4 2 0.0016397 80270 QUIQUE_C1576_190116_001 114.28 91.789 3080000000 0 0 0 317060000 0 532720000 549550000 0 0 0 827430000 0 853300000 26099 2078 24531 238676;238677;238678;238679;238680 305211;305212;305213;305214;305215;305216 305213 6 LEYSNFSIRY Unmodified 1290.6245 0.62445203 2078 P14621;U3KQL2;U3KPX8 ACYP2 Acylphosphatase-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 100.99 100.99 2 0.0024077 103725 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.358 63.003 611440000 0 0 0 0 0 0 0 206510000 71727000 0 61940000 141240000 130020000 26100 2078 24532 238681;238682;238683;238684;238685 305217;305218;305219;305220;305221;305222;305223;305224;305225 305223 9 LFAALLIK Unmodified 887.58443 0.58442512 4652 Q9Y6D6;E5RIF2;E5RHL7 ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 yes no 0 0 0 1 105.73 105.73 2 0.059034 108856 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.093 62.331 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26101 4652 24533 238686 305226 305226 1 LFAAYNEGIINLLEK Unmodified 1706.9243 0.92432245 3002 Q13492 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 147.5 147.5 2;3 1.1641E-05 153387 QUIQUE_C1218_190116_001 100.38 76.033 1449600000 107910000 133600000 127070000 103650000 143100000 125050000 109300000 169070000 115070000 41121000 94519000 94137000 85980000 26102 3002 24534 238687;238688;238689;238690;238691;238692;238693;238694;238695;238696;238697;238698;238699;238700;238701;238702;238703;238704;238705 305227;305228;305229;305230;305231;305232;305233;305234;305235;305236;305237;305238;305239;305240;305241;305242;305243;305244;305245;305246;305247;305248 305227 21 LFACEEHPSHK Unmodified 1353.6136 0.61356977 4481 Q9UL15 BAG5 BAG family molecular chaperone regulator 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 13.568 13.568 3 0.0014127 5370 QUIQUE_C1277_190116_001 93.561 71.991 82654000 25586000 0 0 0 20431000 2745800 24499000 0 9392900 0 0 0 0 26103 4481 24535 238706;238707;238708;238709;238710;238711 305249;305250;305251;305252;305253;305254;305255 305250 6 LFACYNDGVINLLEK Unmodified 1767.8866 0.88655673 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 136.76 136.76 2;3 6.1047E-24 141818 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1;Sulfate adenylyltransferase;Adenylyl-sulfate kinase yes yes 0 0 0 1 166.75 166.75 3 0.00011388 171330 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.002 54.105 44321000 0 0 0 0 0 0 0 0 44321000 0 0 0 0 26107 1517 24539 238768 305330 305330 1 LFAECHVINPSK Unmodified 1413.7075 0.70747015 4613 Q9Y4X5 ARIH1 E3 ubiquitin-protein ligase ARIH1 yes yes 0 0 0 1 44.981 44.981 3 0.039543 41768 QUIQUE_C1277_190116_001 35.118 20.132 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26108 4613 24540 238769 305331 305331 1 LFAELEIK Unmodified 961.54843 0.54843354 1671 O75937;S4R3J5 DNAJC8 DnaJ homolog subfamily C member 8 yes no 0 0 0 1 1 90.979 90.979 2 0.019703 94069 QUIQUE_C1218_190116_001 77.923 51.32 21391000 12655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8735600 0 26109 1671 24541 238770;238771 305332;305333 305332 2 LFAGDLR Unmodified 790.43374 0.43373813 4701 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.398 54.398 2 0.019338 53007 QUIQUE_C1438_190116_001 114.67 0 1666900000 0 167560000 153040000 167750000 178410000 128520000 127240000 139440000 158320000 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305465;305466;305467;305468;305469;305470;305471;305472;305473;305474;305475;305476;305477;305478;305479;305480;305481;305482;305483;305484;305485;305486;305487;305488;305489;305490;305491;305492;305493;305494;305495;305496;305497;305498;305499;305500;305501;305502 305477 37 LFCCFPNSMVVEHPEFLK Unmodified 2253.0421 0.042087871 311 A0A0U1RQL8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 124.2 124.2 3 2.4056E-06 128731 QUIQUE_C1277_190116_001 81.317 76.108 177720000 0 61840000 0 0 51721000 0 33674000 0 0 0 30485000 0 0 26122 311 24553 238918;238919;238920;238921 305503;305504;305505;305506;305507 305504 5 LFCDFGDEFEVLDTTGEEPK Unmodified 2347.0202 0.020209259 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 151.56 151.56 2 0.00019662 154110 QUIQUE_C1563_190116_001 91.812 80.198 19682000 0 0 0 0 0 19682000 0 0 0 0 0 0 0 26123 514 24554 238922 305508 305508 1 LFCIPVHGIR Unmodified 1210.6645 0.66448313 2286 P29218;H0YBL1 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 2 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198790000 610570000 687290000 571640000 26137 3926 24568 239009;239010;239011;239012;239013;239014;239015;239016;239017;239018;239019;239020;239021;239022;239023;239024;239025;239026;239027;239028;239029;239030;239031;239032;239033;239034;239035 305622;305623;305624;305625;305626;305627;305628;305629;305630;305631;305632;305633;305634;305635;305636;305637;305638;305639;305640;305641;305642;305643;305644;305645;305646;305647;305648;305649;305650;305651;305652;305653;305654;305655;305656;305657;305658;305659;305660;305661;305662;305663;305664;305665;305666;305667 305652 46 LFDMSGVR Unmodified 923.45349 0.4534873 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 70.399 70.399 2 0.025421 70797 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108 58.328 129320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38314000 58202000 32803000 26138 498 24569 239036;239037;239038 305668;305669;305670 305669 2 LFDNAMLR Oxidation (M) 994.4906 0.49060109 493 A0A3B3ISS9;P01241;P01242;B1A4G9;A0A087WXJ5 GH1;GH2 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305736 15 LFDSNNDGK Unmodified 1008.4512 0.45123869 1895 P05937;E5RIZ8 CALB1 Calbindin yes no 0 0 0 1 21.444 21.444 2 0.059758 14208 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.036 25.905 14735000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14735000 0 0 0 26145 1895 24575 239086 305738 305738 1 LFDSNNDGKLELTEMAR Unmodified 1951.9309 0.93094074 1895 P05937;E5RIZ8 CALB1 Calbindin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 91.031 91.031 3 1.2991E-17 93150 QUIQUE_C1368_190116_001 112.8 104.48 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26146 1895 24576 239087;239088;239089;239090;239091;239092;239093 305739;305740;305741;305742;305743;305744;305745 305740 7 LFDSTIADEGTWTLEDR Unmodified 1967.9113 0.91125116 3707 Q8WVJ2 NUDCD2 NudC domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 133.98 133.98 2 0.025141 138608 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.448 35.29 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26147 3707 24577 239094;239095 305746;305747 305747 2 LFDSTIADEGTWTLEDRK Unmodified 2096.0062 0.006214175 3707 Q8WVJ2 NUDCD2 NudC domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 109.99 109.99 3 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protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 96.037 96.037 2;3 1.3555E-13 98621 QUIQUE_C1277_190116_001 128.06 111.32 4509900000 388220000 253950000 349470000 223470000 153240000 214840000 256240000 476350000 582070000 101920000 676630000 478760000 354700000 26153 1947 24583 239128;239129;239130;239131;239132;239133;239134;239135;239136;239137;239138;239139;239140;239141;239142;239143;239144;239145;239146;239147;239148 305785;305786;305787;305788;305789;305790;305791;305792;305793;305794;305795;305796;305797;305798;305799;305800;305801;305802;305803;305804;305805;305806;305807;305808;305809;305810;305811;305812;305813;305814;305815;305816;305817 305789 31 LFEAEAQDLFR Unmodified 1337.6616 0.66156582 4138 Q9H223 EHD4 EH domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 118.66 118.66 2 0.00050204 123900 QUIQUE_C1438_190116_001 109.66 70.516 82709000 22522000 14632000 0 24164000 21391000 0 0 0 0 0 0 0 0 26154 4138 24584 239149;239150;239151;239152;239153 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305882;305883;305884;305885;305886;305887;305888;305889;305890;305891;305892;305893;305894;305895;305896;305897;305898 305883 16 LFEDLEFQQLER Unmodified 1565.7726 0.77257283 3492 Q86UU1;A0A087WZL0 PHLDB1 Pleckstrin homology-like domain family B member 1 yes no 0 0 0 1 129.05 129.05 2 0.0040185 135459 QUIQUE_C1438_190116_001 81.865 50.976 26195000 0 0 0 0 26195000 0 0 0 0 0 0 0 0 26161 3492 24591 239216 305899 305899 1 LFEELAMDVYDEVDRR Unmodified 1998.9357 0.93569177 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QLH1 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 151.61 151.61 3 3.2421E-14 156600 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.28 92.075 359850000 0 0 0 0 0 0 74720000 66876000 61363000 0 82877000 74012000 0 26162 245 24592 239217;239218;239219;239220;239221;239222;239223 305900;305901;305902;305903;305904;305905;305906;305907 305903 7 LFEELAMDVYDEVDRR Oxidation (M) 2014.9306 0.93060639 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QLH1 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 1 1 1 145.27 145.27 3 0.0026548 152806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.3 42.707 22306000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22306000 0 0 26163 245 24592 239224 305908 305908 141 1 LFEELGK Unmodified 834.44872 0.4487195 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.115 59.115 2 0.019293 58054 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.02 31.76 3253700000 262680000 246390000 256340000 257500000 287060000 183400000 280640000 253030000 243630000 135210000 291350000 250500000 305940000 26164 2363 24593 239225;239226;239227;239228;239229;239230;239231;239232;239233;239234;239235;239236;239237 305909;305910;305911;305912;305913;305914;305915;305916;305917;305918;305919;305920;305921;305922;305923;305924;305925;305926;305927;305928 305921 20 LFEELVR Unmodified 904.50182 0.5018177 1203 H3BTN5 PKM Pyruvate kinase no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.846 82.846 2 0.0099023 85440 QUIQUE_C1218_190116_001 144.29 51.602 16637000000 1912300000 1739700000 1665300000 1320000000 1227200000 1205500000 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305958;305959;305960;305961;305962;305963;305964;305965;305966;305967;305968;305969;305970;305971;305972 305971 15 LFEEPKPKPK Unmodified 1211.6914 0.69140938 734;357 A0A1B0GV68;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 2 1 15.164 15.164 3 0.039409 7234 QUIQUE_C1403_190116_001 59.426 35.677 37883000 0 0 0 37883000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26167 357;734 24596 239262 305973 305973 1 LFEETGHEDPITK Unmodified 1514.7253 0.72528829 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 0 1 48.811 48.811 3 0.0001219 43716 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.53 72.682 80042000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80042000 0 0 0 26168 3239 24597 239263 305974 305974 1 LFEFAGYDVLR Unmodified 1328.6765 0.6764876 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.67 136.67 2 0.0001841 141188 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.56 82.536 966190000 104160000 82081000 73565000 58632000 69725000 66013000 85077000 70829000 57849000 39614000 92114000 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LFEISDIVIKDSNTDVGAK Unmodified 2063.0787 0.078650837 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 1 1 116.52 116.52 3 9.616E-05 119014 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.386 56.634 30435000 0 0 0 0 0 0 0 30435000 0 0 0 0 0 26174 4284 24603 239306 306024 306024 1 LFEKPLDSQSIYQLIEISR Unmodified 2278.2209 0.2208984 2056 P13521 SCG2 Secretogranin-2;Secretoneurin;Manserin yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 145.04 145.04 2;3 0.00010913 150858 QUIQUE_C1218_190116_001 78.674 75.576 910510000 170100000 170620000 164980000 0 194710000 123620000 0 0 86463000 0 0 0 0 26175 2056 24604 239307;239308;239309;239310;239311;239312;239313;239314;239315 306025;306026;306027;306028;306029;306030;306031;306032;306033;306034;306035 306025 11 LFELDPLTGEWHYK Unmodified 1746.8617 0.86172219 4083 Q9BZF1 OSBPL8 Oxysterol-binding protein-related protein 8 yes yes 0 0 0 1 131.71 131.71 3 0.00034094 135404 QUIQUE_C1403_190116_001 77.912 70.401 21952000 0 0 0 21952000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26176 4083 24605 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transporter 2 yes no 0 0 0 1 1 72.581 72.581 2 0.053305 72843 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.039 26.688 56694000 0 0 0 0 0 0 0 19910000 0 0 36784000 0 0 26201 2859 24628 239525;239526 306298;306299 306298 2 LFFWMQEPK Unmodified 1224.6002 0.60015154 3172 Q16186 ADRM1 Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.5 127.5 2 0.0049084 132917 QUIQUE_C1218_190116_001 96.711 68.312 493840000 59514000 52620000 0 54191000 0 35989000 52429000 50385000 51084000 20283000 0 55847000 61494000 26202 3172 24629 239527;239528;239529;239530;239531;239532;239533;239534;239535;239536 306300;306301;306302;306303;306304;306305;306306;306307;306308;306309;306310;306311 306300 12 LFFWNSK Unmodified 940.48069 0.48068833 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.3 103.3 2 0.0099151 107281 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.37 55.786 1124400000 69590000 93542000 81621000 90688000 74876000 96886000 80931000 75290000 88091000 47754000 119770000 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19 LFIGGLSFETTDESLR Unmodified 1783.8992 0.89922991 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8VTQ5;F8W646 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 137.82 137.82 2 5.3593E-13 142700 QUIQUE_C1368_190116_001 156.71 131.86 6173000000 502610000 615460000 521420000 449270000 483840000 565800000 433450000 473440000 523090000 237550000 448390000 517640000 401110000 26232 1049 24659 239780;239781;239782;239783;239784;239785;239786;239787;239788;239789;239790;239791;239792;239793;239794 306656;306657;306658;306659;306660;306661;306662;306663;306664;306665;306666;306667;306668;306669;306670;306671;306672;306673;306674;306675;306676;306677;306678 306659 23 LFIGGLSFETTEESLR Unmodified 1797.9149 0.91487997 2200 P22626;A0A087WUI2 HNRNPA2B1 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 3 2 1 2 1 4 2 1 138.83 138.83 2;3 9.0166E-19 144856 QUIQUE_C1218_190116_001 174.84 134.12 14570000000 1361400000 1383000000 1147400000 1011100000 1137500000 1508700000 1105700000 1219700000 1129100000 521960000 946370000 1157300000 941260000 26233 2200 24660 239795;239796;239797;239798;239799;239800;239801;239802;239803;239804;239805;239806;239807;239808;239809;239810;239811;239812;239813;239814;239815;239816;239817;239818 306679;306680;306681;306682;306683;306684;306685;306686;306687;306688;306689;306690;306691;306692;306693;306694;306695;306696;306697;306698;306699;306700;306701;306702;306703;306704;306705;306706;306707;306708;306709;306710;306711;306712;306713;306714;306715;306716;306717;306718;306719;306720;306721;306722;306723;306724;306725;306726;306727;306728;306729;306730;306731;306732;306733;306734;306735 306681 55 LFIGMISK Unmodified 907.52011 0.5201103 1106 G5EA30;Q92879 CELF1 CUGBP Elav-like family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.903 85.903 2 0.030205 88534 QUIQUE_C1218_190116_001 67.169 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306751;306752;306753;306754;306755;306756;306757;306758;306759;306760;306761;306762;306763;306764;306765;306766;306767;306768;306769;306770;306771;306772;306773;306774;306775;306776;306777;306778;306779;306780;306781;306782;306783;306784;306785;306786;306787;306788;306789;306790;306791;306792;306793;306794;306795;306796;306797;306798;306799;306800;306801;306802;306803;306804;306805;306806;306807;306808;306809;306810;306811;306812;306813;306814;306815;306816;306817 306771 66 LFIIQACR Unmodified 1019.5586 0.55862107 2450 P42574 CASP3 Caspase-3;Caspase-3 subunit p17;Caspase-3 subunit p12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 72.241 72.241 2 0.0036102 72445 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.54 0 287960000 0 0 41739000 50922000 45897000 25701000 50032000 0 0 0 0 73667000 0 26238 2450 24665 239875;239876;239877;239878;239879;239880;239881 306818;306819;306820;306821;306822;306823;306824 306824 7 LFIQSLEGLLPR Unmodified 1384.8078 0.80783613 3328 Q5TH69 ARFGEF3 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 154.58 154.58 2 0.0026483 158733 QUIQUE_C1277_190116_001 74.376 62.783 42150000 11824000 11587000 0 0 10143000 8596500 0 0 0 0 0 0 0 26239 3328 24666 239882;239883;239884;239885 306825;306826;306827;306828;306829;306830 306827 6 LFISGLPFSCTK Unmodified 1368.7112 0.71115855 3098 Q15020;H0YHU8 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 122.62 122.62 2 0.010941 127232 QUIQUE_C1368_190116_001 59.542 39.213 118950000 0 24377000 28181000 0 0 0 18960000 0 24749000 0 0 0 22680000 26240 3098 24667 239886;239887;239888;239889;239890;239891 306831;306832;306833;306834;306835;306836;306837 306832 4 LFISGLPFSCTKEELEEICK Unmodified 2399.1753 0.17527011 3098 Q15020;H0YHU8 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 1 1 1 136.15 136.15 3 0.04786 140899 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.379 15.78 84373000 0 0 0 0 0 0 0 58507000 25867000 0 0 0 0 26241 3098 24668 239892;239893 306838;306839 306839 0 LFIVDAR Unmodified 832.48069 0.48068833 4516 Q9UNZ2 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.83 65.83 2 0.024915 62828 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.071 10.985 883610000 121900000 138280000 130990000 0 0 0 146810000 0 0 41485000 0 110910000 193240000 26242 4516 24669 239894;239895;239896;239897;239898;239899;239900 306840;306841;306842;306843;306844;306845;306846 306844 7 LFIVESNSSSSTR Unmodified 1425.71 0.70997257 2510 P48507 GCLM Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 53.633 53.633 2 0.0033803 51421 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.549 42.753 103570000 27125000 0 0 18757000 0 0 21310000 0 0 0 0 0 36377000 26243 2510 24670 239901;239902;239903;239904;239905;239906;239907;239908 306847;306848;306849;306850;306851;306852;306853;306854 306852 7 LFIYNPTTGEFLGR Unmodified 1626.8406 0.84059282 2645 P54709;H7C547;F8WBY4 ATP1B3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.72 132.72 2 2.903E-07 137257 QUIQUE_DMIX8_190116_001 121.9 87.366 1506400000 108590000 62113000 104940000 251660000 90823000 111250000 160150000 107660000 115110000 50687000 121380000 93234000 128750000 26244 2645 24671 239909;239910;239911;239912;239913;239914;239915;239916;239917;239918;239919;239920;239921 306855;306856;306857;306858;306859;306860;306861;306862;306863;306864;306865;306866;306867;306868;306869;306870 306870 14 LFKPGQEAVK Unmodified 1115.6339 0.63389451 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 20.697 20.697 3 0.023148 14467 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.08 18.439 405970000 0 0 0 144910000 177260000 0 0 83787000 0 0 0 0 0 26245 3627 24672 239922;239923;239924 306871;306872;306873;306874 306874 3 LFLAEFQSIPR Unmodified 1319.7238 0.72377215 15 M3ZCP1;A0A075B788;P08575;E9PKH0 PTPRC Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.87 122.87 2 0.00029658 127361 QUIQUE_C1368_190116_001 119.62 58.644 162930000 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6 yes no 0 0 0 1 1 84.164 84.164 2 0.036307 85274 QUIQUE_C1403_190116_001 49.715 25.76 26909000 0 0 0 10614000 0 0 0 0 0 0 0 16295000 0 26262 121 24687 240044;240045 307007;307008 307007 2 LFLNEDDK Unmodified 992.48148 0.48147619 1700 O94925;H7BZD1 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes no 0 0 0 1 24.241 24.241 2 0.043611 17615 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.246 4.4916 316730000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 316730000 0 0 0 26263 1700 24688 240046 307009 307009 1 LFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIK Oxidation (M) 2850.495 0.49496477 1700 O94925;H7BZD1 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.83 119.83 4 8.5026E-10 125493 QUIQUE_C1218_190116_001 74.074 71.029 600750000 80182000 60942000 59029000 0 37871000 89216000 0 0 78531000 0 92246000 102730000 0 26264 1700 24689 240047;240048;240049;240050;240051;240052;240053;240054 307010;307011;307012;307013;307014;307015;307016;307017;307018 307010 935 8 LFLNEDDKPHNPMVNAGAIVVTSLIK Unmodified 2834.5001 0.50005015 1700 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307059;307060;307061;307062;307063;307064;307065;307066;307067;307068;307069;307070;307071;307072;307073;307074;307075;307076;307077;307078;307079;307080;307081;307082 307080 24 LFLQHIHR Unmodified 1062.6087 0.60868281 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 0 1 28.665 28.665 3 0.065807 22953 QUIQUE_DMIX7_190116_001 33.439 18.501 19241000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19241000 0 26269 4278 24693 240097 307083 307083 1 LFLSVPTEEPLK Unmodified 1371.765 0.76496826 906 E9PD09;Q96HH9;D6REP5;B7Z4W8 GRAMD3 GRAM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 109.64 109.64 2 0.015307 113006 QUIQUE_C1277_190116_001 85.355 54.742 47756000 0 20652000 0 27103000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26270 906 24694 240098;240099;240100 307084;307085;307086 307084 2 LFLSYDYAVK Unmodified 1217.6332 0.6332258 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 100.98 100.98 2 0.011271 104632 QUIQUE_C1576_190116_001 67.563 46.099 364720000 0 0 0 0 0 103350000 124630000 0 0 0 136750000 0 0 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Unmodified 1388.7915 0.79151736 3199 Q16799;Q2NKQ5;A8MT72 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.24 160.24 2 0.00040768 165827 QUIQUE_C1218_190116_001 129.85 96.473 2542900000 386490000 262330000 204480000 352790000 165490000 242140000 207770000 100120000 206450000 100920000 129270000 184610000 0 26276 3199 24700 240138;240139;240140;240141;240142;240143;240144;240145;240146;240147;240148;240149 307130;307131;307132;307133;307134;307135;307136;307137;307138;307139;307140;307141;307142 307130 12 LFLVQLQEK Unmodified 1116.6543 0.6542956 1554 O43809;H3BND3 NUDT21 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 94.243 94.243 2 0.030992 95748 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.351 39.389 137880000 0 0 0 0 0 0 0 71202000 0 0 0 66674000 0 26277 1554 24701 240150;240151 307143;307144 307143 2 LFLYDLPEGK Unmodified 1193.6332 0.6332258 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 108.34 108.34 2 0.010962 105444 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.016 42.879 44149000 0 0 0 0 0 25440000 0 0 0 18709000 0 0 0 26278 4631 24702 240152;240153 307145;307146 307146 2 LFLYQILR Unmodified 1064.6383 0.6382516 1017 F5H6Z0;Q00537 CDK17 Cyclin-dependent kinase 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 126.18 126.18 2 0.041284 132110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.163 71.121 8520100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8520100 0 26279 1017 24703 240154;240155;240156;240157 307147;307148;307149;307150 307149 4 LFMAQALQEYNN Unmodified 1440.6708 0.6707503 600 B3KS98;O15372;A0A087WZK9 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 127.49 127.49 2 0.00052894 133530 QUIQUE_C1438_190116_001 122.52 114.47 323750000 42022000 48128000 40980000 0 39377000 38691000 37497000 0 0 0 35130000 41923000 0 26280 600 24704 240158;240159;240160;240161;240162;240163;240164;240165;240166 307151;307152;307153;307154;307155;307156;307157;307158;307159 307155 8 LFMEMNQK Unmodified 1039.4831 0.48307287 917;1163 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240169;240170;240171;240172;240173;240174;240175;240176;240177;240178;240179;240180;240181 307162;307163;307164;307165;307166;307167;307168;307169;307170;307171;307172;307173;307174;307175;307176;307177 307165 3062 16 LFMILWLK Unmodified 1062.63 0.6299951 4646 Q9Y696;A6PVS0;A0A2R8Y4M1;A0A2R8YGW2;A0A2R8Y615;O15247;Q9NZA1;Q96NY7 CLIC4;CLIC2;CLIC5;CLIC6 Chloride intracellular channel protein 4;Chloride intracellular channel protein 2;Chloride intracellular channel protein 5;Chloride intracellular channel protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 154 154 2 0.0069326 158396 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.919 66.991 56423000 0 0 0 0 0 0 8633600 0 10815000 0 15997000 20978000 0 26283 4646 24706 240182;240183;240184;240185 307178;307179;307180;307181 307181 4 LFMIYGK Unmodified 870.46735 0.46734645 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8YDU7;E7ET92 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 82.325 82.325 2 0.043299 84605 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1 1 1 1 1 1 1 132.19 132.19 2 0.008221 137790 QUIQUE_C1576_190116_001 99.919 52.071 206850000 0 0 19312000 21653000 21673000 16968000 24789000 16412000 12356000 16970000 23149000 17008000 16563000 26287 1395 24709 240199;240200;240201;240202;240203;240204;240205;240206;240207;240208;240209 307196;307197;307198;307199;307200;307201;307202;307203;307204;307205;307206 307200 779 11 LFMVLWLK Unmodified 1048.6143 0.61434504 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 146.53 146.53 2 0.017542 153851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.381 14.349 51267000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26536000 24731000 0 26288 1395 24709 240210;240211 307207;307208 307207 2 LFNAIIHR Unmodified 982.57123 0.57123467 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1;E9PKG0 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.371 49.371 2 0.000358 46947 QUIQUE_C1403_190116_001 158.38 100.21 3917800000 242400000 314730000 317160000 146370000 299150000 133640000 255930000 476120000 517780000 96307000 479670000 412830000 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cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 3 4 4 5 3 1 2 5 2 3 3 3 2 158.39 158.39 2;3 1.6842E-200 164200 QUIQUE_C1218_190116_001 245.96 212.82 6459500000 420680000 804170000 439460000 621540000 328100000 112280000 407090000 573390000 332780000 135880000 833860000 960950000 489280000 26294 2857;3307 24715 240251;240252;240253;240254;240255;240256;240257;240258;240259;240260;240261;240262;240263;240264;240265;240266;240267;240268;240269;240270;240271;240272;240273;240274;240275;240276;240277;240278;240279;240280;240281;240282;240283;240284;240285;240286;240287;240288;240289;240290 307251;307252;307253;307254;307255;307256;307257;307258;307259;307260;307261;307262;307263;307264;307265;307266;307267;307268;307269;307270;307271;307272;307273;307274;307275;307276;307277;307278;307279;307280;307281;307282;307283;307284;307285;307286;307287;307288;307289;307290;307291;307292;307293;307294;307295;307296;307297;307298;307299 307252 45 LFNHLSAVSESIQALGWVAMAPK Oxidation (M) 2484.2835 0.28351543 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 3 1 149.76 149.76 3 2.0819E-18 153271 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.27 111.87 1582300000 0 94601000 141060000 188080000 137540000 118090000 83805000 144280000 159070000 19381000 218290000 131920000 146180000 26295 2857;3307 24715 240291;240292;240293;240294;240295;240296;240297;240298;240299;240300;240301;240302;240303;240304;240305;240306;240307 307300;307301;307302;307303;307304;307305;307306;307307;307308;307309;307310;307311;307312;307313;307314;307315;307316;307317 307307 2328 14 LFNHPNIVPYR Unmodified 1368.7303 0.73025451 376 A0A1W2PPJ9;Q7RTN6;J3QS66;A0A1W2PQE8;A0A1W2PS04;A0A1W2PR00;A0A1W2PP78;A0A1W2PNV7;A0A1W2PPG2;A0A1W2PPM8;A0A1W2PQF1;J3QKR7;A0A1W2PQ20;A0A1W2PNV1;A0A1W2PPI1;J3KSK5;J3KSA2;A0A1W2PR44;A0A1W2PRW9;A0A1W2PR65;Q86YC8;J3QQS3;A0A1W2PRQ6;A0A1W2PQ00 STRADA STE20-related kinase adapter protein alpha yes no 0 0 0 1 62.299 62.299 3 0.043609 62602 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.844 36.518 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26296 376 24716 240308 307318 307318 1 LFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLK Unmodified 2636.2727 0.27269275 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;H0YE81;H0YD04 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 93.805 93.805 3;4 2.8269E-08 96127 QUIQUE_C1277_190116_001 80.786 72.499 1364200000 172150000 478240000 363500000 108250000 0 242100000 0 0 0 0 0 0 0 26297 1069 24717 240309;240310;240311;240312;240313;240314;240315 307319;307320;307321;307322;307323;307324;307325 307320 4 LFNISGHVNHPCTVEEEMSVPLKELIEK Unmodified 3248.621 0.62096992 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;H0YE81;H0YD04 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 122.05 122.05 4;5 0.0033364 127846 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.964 23.244 169220000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 66129000 66134000 36962000 26298 1069 24718 240316;240317;240318 307326;307327;307328 307326 3 LFNLVHQAYEVLSDPQTR Unmodified 2129.0906 0.090552927 4306 Q9NVH1;B1AK20;Q5TH61 DNAJC11 DnaJ homolog subfamily C member 11 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 138.39 138.39 2;3 3.2714E-06 144762 QUIQUE_C1438_190116_001 101.05 80.106 414750000 0 0 66343000 0 62362000 0 65369000 0 70382000 23655000 0 65595000 61046000 26299 4306 24719 240319;240320;240321;240322;240323;240324;240325;240326 307329;307330;307331;307332;307333;307334;307335;307336 307331 8 LFNQINIS Unmodified 947.50763 0.50763136 3767 Q92905 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 101.66 101.66 2 0.041021 105382 QUIQUE_C1218_190116_001 83.287 57.989 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26300 3767 24720 240327;240328;240329;240330 307337;307338;307339;307340 307337 4 LFNTSSDAVNLDR Unmodified 1450.7052 0.70522155 1223 H7BZK6;P62068 USP46 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46 yes no 0 0 0 1 1 73.926 73.926 2 7.7625E-05 74565 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.34 66.648 0 0 0 0 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307353;307354;307355;307356 307355 3 LFPDIPIGYSGHETGIAISVAAVALGAK Unmodified 2766.4956 0.4956167 4263 Q9NR45;Q5TBR1;Q5TBR0 NANS Sialic acid synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 159.64 159.64 3 3.3637E-31 163734 QUIQUE_C1277_190116_001 115.45 107.81 884900000 45763000 53506000 37998000 41344000 18801000 53690000 53513000 80327000 97072000 21300000 104120000 171030000 106430000 26304 4263 24724 240345;240346;240347;240348;240349;240350;240351;240352;240353;240354;240355;240356;240357;240358 307357;307358;307359;307360;307361;307362;307363;307364;307365;307366;307367;307368;307369;307370;307371;307372;307373;307374 307358 17 LFPDTPLALDANK Unmodified 1413.7504 0.75038083 2951 Q12906 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.52 107.52 2 0.00034605 111203 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.4 104.81 1291300000 106650000 103550000 126210000 109000000 96155000 103220000 87437000 74840000 106340000 41371000 124900000 117950000 93707000 26305 2951 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LFQVEYAIEAIK Unmodified 1422.7759 0.7758673 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 3 2 1 130.42 130.42 2;3 0.00051557 135056 QUIQUE_C1277_190116_001 111.06 77.794 3772300000 262300000 294630000 311680000 213770000 270710000 233580000 286160000 315030000 373150000 127110000 416230000 335640000 332260000 26337 2273 24757 240604;240605;240606;240607;240608;240609;240610;240611;240612;240613;240614;240615;240616;240617;240618;240619;240620;240621 307669;307670;307671;307672;307673;307674;307675;307676;307677;307678;307679;307680;307681;307682;307683;307684;307685;307686;307687;307688;307689;307690;307691;307692;307693;307694;307695;307696;307697;307698;307699;307700;307701 307673 33 LFQYASTDMDK Unmodified 1317.5911 0.59110299 262 H0YM62;D6RG14;D6RB91;A0A1B0GTW4;D6RG21;D6RCM6;Q05BX2;D6RJA7;A0A0D9SET2;D6R942;D6RC63;D8L7E9;D6RJG6;A0A0D9SFD0;A0A0R4J2G5;A0A1B0GV32;A0A0D9SGI5;Q06413;Q02078;Q14814;H0YKY6 MEF2A;MEF2C;MEF2D Myocyte-specific enhancer factor 2C;Myocyte-specific enhancer factor 2A;Myocyte-specific enhancer factor 2D yes no 0 0 0 1 1 65.262 65.262 2 0.056547 65422 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.978 35.77 17397000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17397000 0 0 26338 262 24758 240622;240623 307702;307703 307703 2 LFRPVAADGQLHTLGDLLK Unmodified 2063.1528 0.15275925 4136 Q9H1Y0;A0A1B0GV54;A0A1B0GUS1 ATG5 Autophagy protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 109.58 109.58 3;4 0.00025884 112727 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.998 54.085 162520000 0 43025000 31804000 19644000 0 0 0 35259000 0 0 0 0 32785000 26339 4136 24759 240624;240625;240626;240627;240628 307704;307705;307706;307707;307708 307707 4 LFSCEVDGKPQPSVK Unmodified 1689.8396 0.83960654 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 1 1 42.887 42.887 3 0.054691 39361 QUIQUE_C1277_190116_001 36.667 26.008 86478000 0 86478000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26340 4500 24760 240629 307709 307709 1 LFSCGADGTLK Unmodified 1167.5594 0.55940893 3684 Q8TDJ6;H0YLM8 DMXL2 DmX-like protein 2 yes no 0 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307952;307953;307954;307955;307956;307957;307958;307959;307960;307961;307962;307963;307964;307965;307966;307967;307968;307969;307970 307966 18 LFTLTALR Unmodified 933.56475 0.56475231 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;H7C0R3;A0A0U1RQQ5;A0A1B0GTT3 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.367 95.367 2 0.010167 97128 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.626 39.327 493480000 48909000 50324000 41592000 39805000 45138000 37046000 0 45482000 46572000 19524000 64795000 54296000 0 26373 2496 24792 240824;240825;240826;240827;240828;240829;240830;240831;240832;240833;240834 307971;307972;307973;307974;307975;307976;307977;307978;307979;307980;307981;307982;307983;307984 307978 13 LFTNFHR Unmodified 933.48209 0.48208531 2842 Q00169;F5GWE5;I3L4H1 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 32.083 32.083 2 0.017528 29182 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.8 0 824870000 45602000 114240000 58942000 0 0 70619000 77310000 76502000 130210000 41311000 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0.62062898 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 66.657 66.657 2 0.0010771 67142 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.111 71.604 157640000 0 0 0 0 0 0 0 0 60232000 0 54908000 0 42500000 26384 2539 24802 240902;240903;240904;240905 308061;308062;308063;308064 308061 1989 4 LFVEALGQIGPAPPLK Unmodified 1648.9552 0.95522864 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.71 130.71 2 1.309E-07 136377 QUIQUE_C1218_190116_001 107.06 87.294 235880000 23229000 21303000 0 22752000 23209000 14359000 0 25880000 19236000 0 31315000 25984000 28617000 26385 1029 24803 240906;240907;240908;240909;240910;240911;240912;240913;240914;240915 308065;308066;308067;308068;308069;308070;308071;308072;308073;308074;308075 308065 9 LFVEDSIHDEFVR Unmodified 1604.7835 0.78347187 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 96.961 96.961 2;3 1.2949E-12 99530 QUIQUE_C1368_190116_001 152.07 114.59 4901300000 200550000 297730000 785720000 302170000 358770000 605580000 369740000 345060000 310340000 153500000 470120000 328530000 373470000 26386 1665 24804 240916;240917;240918;240919;240920;240921;240922;240923;240924;240925;240926;240927;240928;240929;240930;240931;240932;240933;240934;240935;240936;240937;240938;240939;240940;240941 308076;308077;308078;308079;308080;308081;308082;308083;308084;308085;308086;308087;308088;308089;308090;308091;308092;308093;308094;308095;308096;308097;308098;308099;308100;308101;308102;308103;308104;308105;308106;308107;308108;308109;308110;308111;308112;308113;308114;308115;308116;308117;308118;308119 308084 43 LFVEDSIHDEFVRR Unmodified 1760.8846 0.8845829 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 1 2 82.163 82.163 3;4 0.015454 82521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.037 22.108 22293000 0 0 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ribonucleoproteins A2/B1 yes no 0 0 2 2 1 1 100.16 100.16 4;5 1.4543E-11 102228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.832 72.888 345970000 0 0 0 0 0 0 0 195370000 0 0 0 70396000 80208000 26391 2200 24809 240998;240999;241000;241001 308185;308186;308187;308188;308189 308187 5 LFVGGLDWSTTQETLR Unmodified 1821.9261 0.92611336 1319 K7EQ55;K7EK33;Q96EP5;K7EQ02 DAZAP1 DAZ-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.01 133.01 2 5.2907E-36 137378 QUIQUE_C1277_190116_001 172.13 147.62 1142800000 98508000 103910000 108170000 116700000 86433000 86551000 0 105750000 90555000 43256000 96307000 113680000 92963000 26392 1319 24810 241002;241003;241004;241005;241006;241007;241008;241009;241010;241011;241012;241013 308190;308191;308192;308193;308194;308195;308196;308197;308198;308199;308200;308201;308202;308203;308204;308205;308206 308192 17 LFVGGLK Unmodified 732.45341 0.45341094 2969 Q13151 HNRNPA0 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 49.022 49.022 2 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1-dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 154.53 154.53 2;3 2.2331E-08 160269 QUIQUE_C1218_190116_001 99.927 78.096 2836500000 163800000 210810000 289970000 220610000 240330000 191910000 203740000 199820000 222660000 79833000 304880000 229190000 278930000 26427 2024 24844 241346;241347;241348;241349;241350;241351;241352;241353;241354;241355;241356;241357;241358;241359;241360;241361;241362;241363;241364;241365;241366;241367;241368;241369;241370;241371 308634;308635;308636;308637;308638;308639;308640;308641;308642;308643;308644;308645;308646;308647;308648;308649;308650;308651;308652;308653;308654;308655;308656;308657;308658;308659;308660;308661;308662;308663;308664;308665;308666 308635 32 LFYQVAEYTFR Unmodified 1435.7136 0.71360139 547 A6NKZ2;P51606;H7C2G7;H7C317 RENBP N-acylglucosamine 2-epimerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.3 119.3 2 0.0010651 123124 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.4 82.755 951030000 58991000 83933000 90355000 78693000 63443000 64735000 49980000 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308736;308737;308738;308739;308740;308741;308742;308743;308744;308745;308746;308747;308748;308749;308750;308751;308752;308753;308754;308755;308756;308757;308758;308759;308760;308761 308742 22 LGACLAFLPEAFDFIAR Unmodified 1909.976 0.97604044 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 168.97 168.97 2;3 9.3588E-07 173376 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.67 113.8 982970000 0 0 0 0 162370000 0 0 146200000 198670000 19285000 238680000 165320000 52436000 26438 3515 24855 241456;241457;241458;241459;241460;241461;241462;241463;241464 308762;308763;308764;308765;308766;308767;308768;308769;308770 308765 6 LGACLAFLPEAFDFIARDPAETLHLSEPLGGK Unmodified 3454.7595 0.75951231 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 1 1 166.27 166.27 4 9.9316E-06 170871 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.149 42.444 54155000 0 0 0 0 0 0 0 0 54155000 0 0 0 0 26439 3515 24856 241465 308771 308771 1 LGADAVGMSTVPEVIVAR Oxidation (M) 1799.9451 0.94513424 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.881 95.881 2 3.5196E-64 97438 QUIQUE_DMIX1_190116_001 193.81 170.44 1222100000 59571000 74441000 90437000 65396000 95675000 51665000 54491000 122640000 128150000 46061000 151070000 111160000 171340000 26440 1786 24857 241466;241467;241468;241469;241470;241471;241472;241473;241474;241475;241476;241477;241478 308772;308773;308774;308775;308776;308777;308778;308779;308780;308781;308782;308783;308784 308779 996 12 LGADAVGMSTVPEVIVAR Unmodified 1783.9502 0.95021962 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 115.19 115.19 2;3 3.9705E-08 119151 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.26 109.2 1368200000 0 0 27320000 0 0 0 233580000 0 381180000 57619000 342060000 297250000 29160000 26441 1786 24857 241479;241480;241481;241482;241483;241484;241485;241486;241487 308785;308786;308787;308788;308789;308790;308791;308792;308793;308794 308789 8 LGADMEDVCGR Unmodified 1221.5118 0.51180681 1822 P02649;H0Y7L5;E9PEV4;E7ERP7 APOE Apolipoprotein E 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Unmodified 2513.2836 0.28357501 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 156.13 156.13 3 5.621E-11 161170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.553 73.561 24750000 0 0 0 0 0 0 0 0 24750000 0 0 0 0 26447 1971 24861 241520 308830 308830 1 LGAEVYHTLK Unmodified 1129.6132 0.61315906 1955 P09104 ENO2 Gamma-enolase yes yes 0 0 0 2 3 2 2 2 2 3 3 3 2 3 2 2 33.569 33.569 2;3 1.5559E-39 28747 QUIQUE_C1277_190116_001 211.45 126.95 75950000000 6064600000 9596100000 7259100000 4123600000 9223900000 4366700000 5951000000 4493600000 3943600000 2808300000 7869600000 5266100000 4983700000 26448 1955 24862 241521;241522;241523;241524;241525;241526;241527;241528;241529;241530;241531;241532;241533;241534;241535;241536;241537;241538;241539;241540;241541;241542;241543;241544;241545;241546;241547;241548;241549;241550;241551 308831;308832;308833;308834;308835;308836;308837;308838;308839;308840;308841;308842;308843;308844;308845;308846;308847;308848;308849;308850;308851;308852;308853;308854;308855;308856;308857;308858;308859;308860;308861;308862;308863;308864;308865;308866;308867;308868;308869;308870;308871;308872;308873;308874;308875;308876;308877;308878;308879;308880;308881;308882;308883;308884;308885;308886;308887;308888;308889;308890;308891;308892;308893;308894;308895;308896;308897;308898;308899 308839 69 LGAGALNAGSYASLEDTSDKLDGTASEDGR Unmodified 2940.3585 0.3584671 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 103.44 103.44 3 1.3148E-35 105385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.54 99.509 118750000 0 0 0 53736000 0 23911000 0 41104000 0 0 0 0 0 26449 310;830 24863 241552;241553;241554 308900;308901;308902 308902 2 LGAGGLASSAATAQR Unmodified 1329.7001 0.70007659 3979 Q99946 PRRT1 Proline-rich transmembrane protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.174 39.174 2 0.00041655 35359 QUIQUE_C1403_190116_001 97.911 79.6 52288000 0 0 0 30397000 21891000 0 0 0 0 0 0 0 0 26450 3979 24864 241555;241556;241557;241558;241559;241560 308903;308904;308905;308906;308907;308908 308906 6 LGAGPDGVEEIKR Unmodified 1339.7096 0.70957864 2594 P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17 RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 yes no 0 0 1 1 1 35.255 35.255 3 0.044402 30594 QUIQUE_C1403_190116_001 25.322 10.76 55039000 0 0 0 25461000 0 0 0 0 0 0 0 29577000 0 26451 2594 24865 241561;241562 308909;308910 308909 2 LGAGYPMGPFELLDYVGLDTTK Oxidation (M) 2372.161 0.16100026 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 1 2 1 1 2 1 2 1 1 2 2 167.13 167.13 2;3 5.5779E-15 171619 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.45 103.26 1284900000 125770000 45143000 47972000 125100000 126210000 65976000 92303000 38903000 148370000 38740000 103170000 109200000 218010000 26452 913 24866 241563;241564;241565;241566;241567;241568;241569;241570;241571;241572;241573;241574;241575;241576;241577;241578;241579;241580;241581 308911;308912;308913;308914;308915;308916;308917;308918;308919;308920;308921;308922;308923;308924;308925;308926;308927;308928;308929;308930;308931;308932 308924 566 19 LGAGYPMGPFELLDYVGLDTTK Unmodified 2356.1661 0.16608564 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQ78 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 170.38 170.38 2;3 9.5043E-11 174606 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.38 117.59 2721800000 87649000 258310000 180960000 102710000 205650000 202050000 226210000 0 311650000 0 509020000 441750000 195860000 26453 913 24866 241582;241583;241584;241585;241586;241587;241588;241589;241590;241591;241592;241593;241594;241595;241596;241597;241598;241599;241600;241601 308933;308934;308935;308936;308937;308938;308939;308940;308941;308942;308943;308944;308945;308946;308947;308948;308949;308950;308951;308952 308945 19 LGAIHSLVYK Unmodified 1099.639 0.63897988 1602 O60890 OPHN1 Oligophrenin-1 yes yes 0 0 0 1 1 43.096 43.096 3 0.027897 40290 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.875 19.196 37994000 0 0 0 0 0 0 18784000 19210000 0 0 0 0 0 26454 1602 24867 241602;241603 308953;308954 308954 2 LGAILTPNDGR Unmodified 1125.6142 0.6142217 799 D3DSM0 ITGB2 Integrin beta no no 0 0 0 1 1 52.55 52.55 2 0.0046776 49966 QUIQUE_C1403_190116_001 80.688 36.881 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26455 799 24868 241604;241605 308955;308956 308955 2 LGALGGAR Unmodified 713.41842 0.41842242 3949 Q96TC7;H0YLG5;H0YNE5;H0YLV7 RMDN3 Regulator of microtubule dynamics protein 3 yes no 0 0 0 1 19.684 19.684 2 0.036566 12153 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.714 15.912 17945000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17945000 0 0 0 26456 3949 24869 241606 308957 308957 1 LGALQGDPEALTLYR Unmodified 1615.857 0.85697116 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 108.98 108.98 2 0.00067187 112309 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.332 50.393 103560000 0 0 27718000 75842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26457 4378 24870 241607;241608;241609 308958;308959;308960 308960 3 LGALSGAAALGFASYGAHGAQFPDAYGK Unmodified 2667.3082 0.30815028 1339 K7ENI6;K7ERE1;Q8N2U0 TMEM256 Transmembrane protein 256 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.08 128.08 3 1.6299E-44 132162 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.56 119.94 821710000 67240000 67991000 0 0 0 0 68292000 81637000 158930000 33322000 148620000 104330000 91342000 26458 1339 24871 241610;241611;241612;241613;241614;241615;241616;241617;241618 308961;308962;308963;308964;308965;308966;308967;308968;308969 308965 8 LGAMTSMVCK Unmodified 1096.5079 0.50790741 4165 Q9H477 RBKS Ribokinase yes yes 0 0 0 1 48.174 48.174 2 0.013076 45591 QUIQUE_C1277_190116_001 65.305 50.636 25197000 0 25197000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26459 4165 24872 241619 308970 308970 1 LGANSGLHIIIFDEIDAICK Unmodified 2198.1405 0.14053959 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 146.05 146.05 2;3 3.704E-05 152317 QUIQUE_C1218_190116_001 71.073 61.909 859110000 104080000 0 85199000 0 0 62562000 120800000 0 0 58423000 127840000 159720000 140480000 26460 1245 24873 241620;241621;241622;241623;241624;241625;241626;241627;241628;241629 308971;308972;308973;308974;308975;308976;308977;308978;308979;308980 308971 8 LGANSLLDLVVFGR Unmodified 1472.8351 0.83511351 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3;H0Y8X1 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 3 2 2 2 2 162.49 162.49 2;3 4.5754E-18 168675 QUIQUE_C1438_190116_001 120.84 101 9974700000 600120000 610830000 639740000 527710000 757240000 565330000 751470000 544590000 1070400000 239280000 1162800000 1066700000 1438600000 26461 2326 24874 241630;241631;241632;241633;241634;241635;241636;241637;241638;241639;241640;241641;241642;241643;241644;241645;241646;241647;241648;241649;241650;241651;241652;241653;241654;241655 308981;308982;308983;308984;308985;308986;308987;308988;308989;308990;308991;308992;308993;308994;308995;308996;308997;308998;308999;309000;309001;309002;309003;309004;309005;309006;309007;309008;309009;309010;309011;309012;309013;309014;309015;309016;309017;309018;309019;309020 308995 39 LGAPENSGISTLER Unmodified 1442.7365 0.73652168 734;357 A0A1B0GV68;M0QYB0;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 61.731 61.731 2 0.0046869 60280 QUIQUE_C1563_190116_001 76.655 58.791 186850000 0 0 112840000 0 0 74008000 0 0 0 0 0 0 0 26462 357;734 24875 241656;241657 309021;309022 309022 1 LGAPLSGLQGLPECTR Unmodified 1667.8665 0.86648999 2566 P50479 PDLIM4 PDZ and LIM domain protein 4 yes yes 0 0 0 1 100.93 100.93 2 0.00118 103119 QUIQUE_C1403_190116_001 89.301 74.035 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no 0 0 0 2 2 1 35.567 35.567 2;3 0.0032481 30494 QUIQUE_C1368_190116_001 47.844 35.267 406360000 200730000 0 164020000 0 0 0 0 41603000 0 0 0 0 0 26465 3815;4036 24878 241676;241677;241678;241679;241680 309056;309057;309058;309059;309060 309059 4 LGAQLADLHLDNK Unmodified 1406.7518 0.75177781 4200 Q9HA64;I3L2G3;I3L139 FN3KRP Ketosamine-3-kinase yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 70.952 70.952 2;3 0.00079018 70913 QUIQUE_C1368_190116_001 58.32 47.107 917710000 115050000 84756000 89715000 92805000 81001000 100030000 98491000 0 51786000 0 74704000 66189000 63186000 26466 4200 24879 241681;241682;241683;241684;241685;241686;241687;241688;241689;241690;241691;241692;241693;241694;241695;241696;241697 309061;309062;309063;309064;309065;309066;309067;309068;309069;309070;309071;309072;309073;309074;309075;309076;309077;309078;309079;309080 309065 19 LGAQLADLHLDNKK Unmodified 1534.8467 0.84674083 4200 Q9HA64;I3L2G3;I3L139 FN3KRP Ketosamine-3-kinase yes no 0 0 1 1 3 3 3 3 2 2 2 1 1 2 2 51.162 51.162 2;3;4 0.00066261 49556 QUIQUE_C1277_190116_001 84.468 72.323 3561200000 171230000 422980000 365260000 343700000 484320000 299270000 342050000 235950000 51347000 80977000 372240000 0 391910000 26467 4200 24880 241698;241699;241700;241701;241702;241703;241704;241705;241706;241707;241708;241709;241710;241711;241712;241713;241714;241715;241716;241717;241718;241719;241720;241721;241722 309081;309082;309083;309084;309085;309086;309087;309088;309089;309090;309091;309092;309093;309094;309095;309096;309097;309098;309099;309100;309101;309102;309103;309104;309105;309106;309107 309084 19 LGAQSIQPTANLDR Unmodified 1482.7791 0.77905519 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.033 58.033 2 9.3057E-07 57117 QUIQUE_C1576_190116_001 122.69 46.359 926540000 85454000 101150000 90055000 108410000 77494000 75115000 84429000 43708000 40360000 23640000 73761000 65240000 57718000 26468 3060 24881 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241765;241766;241767;241768;241769;241770;241771 309156;309157;309158;309159;309160;309161;309162 309160 7 LGATDELWAPPSIASLLTAAVIDNIR Unmodified 2706.4592 0.45923119 223 F8W954;F8WF98;H7C2M8;C9JHL4;A0A0C4DFX9;Q9H3P2 NELFA Negative elongation factor A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 177.85 177.85 3 1.436E-08 181684 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.071 57.97 37171000 0 0 0 0 0 0 0 7275700 13190000 0 16706000 0 0 26473 223 24886 241772;241773;241774;241775;241776 309163;309164;309165;309166;309167 309165 5 LGATIDVEHSHVR Unmodified 1432.7423 0.74227576 3441 Q7L523;Q5VZM0 RRAGA;RRAGB Ras-related GTP-binding protein A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.335 28.335 3 0.00034547 23418 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.494 50.622 346180000 0 0 0 62368000 48029000 0 0 49302000 0 27177000 0 79423000 79878000 26474 3441 24887 241777;241778;241779;241780;241781;241782 309168;309169;309170;309171;309172;309173;309174;309175 309172 8 LGAVDESLSEETQK Unmodified 1504.7257 0.72568222 3867 Q96HE7;G3V3E6;G3V5B3 ERO1L ERO1-like protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 53.942 53.942 2 1.0333E-28 52664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.82 201.7 931660000 138580000 132490000 118380000 0 0 0 137400000 0 93978000 42387000 159050000 109400000 0 26475 3867 24888 241783;241784;241785;241786;241787;241788;241789;241790 309176;309177;309178;309179;309180;309181;309182;309183 309182 8 LGAVFNQVAFPLQYTPR Unmodified 1920.0258 0.025767826 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 138.37 138.37 2;3 7.985E-06 144311 QUIQUE_C1218_190116_001 67.846 58.799 252360000 35114000 0 22280000 19367000 24124000 27404000 0 18285000 26759000 0 27897000 23310000 27818000 26476 3135 24889 241791;241792;241793;241794;241795;241796;241797;241798;241799;241800;241801;241802 309184;309185;309186;309187;309188;309189;309190;309191;309192;309193;309194;309195;309196;309197 309184 14 LGAVGGSGFK Unmodified 891.48142 0.48141661 1707 O95163;F5H2T0 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 0 1 1 31.157 31.157 2 0.050737 25054 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.574 11.389 26500000 0 0 0 0 0 0 0 19226000 0 7273200 0 0 0 26477 1707 24890 241803;241804 309198;309199 309199 2 LGAVYDVSHYNALLK Unmodified 1661.8777 0.8777066 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 96.154 96.154 2;3 9.4311E-06 98746 QUIQUE_C1368_190116_001 92.939 82.658 2051200000 224040000 102000000 228480000 137910000 163400000 159620000 118850000 149270000 203650000 18967000 220800000 206240000 117980000 26478 2452 24891 241805;241806;241807;241808;241809;241810;241811;241812;241813;241814;241815;241816;241817;241818;241819;241820;241821;241822;241823;241824;241825;241826;241827 309200;309201;309202;309203;309204;309205;309206;309207;309208;309209;309210;309211;309212;309213;309214;309215;309216;309217;309218;309219;309220;309221;309222;309223;309224 309205 23 LGAVYGFVR Unmodified 980.54435 0.54435122 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.277 73.277 2 0.0020799 70725 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.068 65.778 893530000 83662000 88728000 74800000 65464000 79830000 59193000 90549000 71394000 66777000 30209000 100560000 82367000 0 26479 4088 24892 241828;241829;241830;241831;241832;241833;241834;241835;241836;241837;241838;241839 309225;309226;309227;309228;309229;309230;309231;309232;309233;309234;309235;309236;309237;309238;309239;309240 309238 16 LGCDWVATIFSR Unmodified 1423.6918 0.69182009 3691 Q8TF42 UBASH3B Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B yes yes 0 0 0 1 1 144.75 144.75 2 0.018668 152152 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.198 34.955 56811000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26126000 30685000 0 26480 3691 24893 241840;241841 309241;309242;309243 309242 3 LGCEEMEGYGPLK Unmodified 1481.6531 0.65305132 911 E9PER6;O15530;Q6A1A2 PDPK1;PDPK2P 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1;Putative 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 79.091 79.091 2 0.016883 80045 QUIQUE_C1277_190116_001 66.92 53.101 18014000 0 18014000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26481 911 24894 241842 309244 309244 1 LGCEVLGVSVDSQFTHLAWINTPR Unmodified 2698.3537 0.35372026 2346 P32119;A6NIW5 PRDX2 Peroxiredoxin-2 yes no 0 0 0 7 11 14 7 10 5 18 19 19 2 31 23 20 162.49 162.49 2;3;4 4.6722E-101 150063 QUIQUE_DMIX8_190116_001 207.53 196.06 19961000000 922040000 1747200000 1617500000 1060600000 1159500000 1189200000 1409700000 1667900000 1924400000 267870000 2805000000 2267400000 1922900000 26482 2346 24895 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309467 210 LGCFDHAQR Unmodified 1102.4978 0.49781173 4094 Q9C0C9;K7EQ12 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 0 1 18.471 18.471 3 0.049008 11055 QUIQUE_C1368_190116_001 55.461 43.693 51050000 0 0 51050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26483 4094 24896 242029 309489 309489 0 LGCFEIAK Unmodified 936.47389 0.47388839 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 55.41 55.41 2 0.020421 53540 QUIQUE_C1403_190116_001 76.774 51.324 276820000 77792000 74244000 0 48260000 0 0 0 0 0 0 0 0 76520000 26484 1579 24897 242030;242031;242032;242033 309490;309491;309492;309493;309494 309493 5 LGCGPEGER Unmodified 973.42873 0.42872911 2121;1894 P05771;I3L148;P17252 PRKCB;PRKCA Protein kinase C beta type;Protein kinase C alpha type no no 0 0 0 1 1 1 14.952 14.952 2 0.0038413 7165 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.37 27.064 257630000 0 0 0 0 0 0 0 41227000 0 216400000 0 0 0 26485 1894;2121 24898 242034;242035;242036 309495;309496;309497;309498 309498 4 LGCLIWEVFNGPLPR Unmodified 1769.9287 0.92869632 949 E9PS17;E9PK59;Q96KG9;E9PPN3 SCYL1 N-terminal kinase-like protein yes no 0 0 0 1 1 159.95 159.95 2 0.0030874 165121 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.5 51.838 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26486 949 24899 242037;242038 309499;309500 309499 2 LGCNAGVSPSFQQHCVASLATK Unmodified 2331.11 0.10998452 3013 Q13572;G3V4M9 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 66.685 66.685 3 0.031017 66620 QUIQUE_DMIX8_190116_001 31.067 15.645 46776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46776000 26487 3013 24900 242039 309501 309501 0 LGCPGFTLPEVKPNPVEGGASK Unmodified 2253.1464 0.14635325 2509 P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;A0A0C4DGB2 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.642 92.642 3 0.00065962 96598 QUIQUE_C1218_190116_001 47.281 39.835 361050000 53215000 0 0 52788000 0 0 0 53590000 64939000 0 82817000 53696000 0 26488 2509 24901 242040;242041;242042;242043;242044;242045 309502;309503;309504;309505;309506;309507 309502 6 LGCVASQNGEDAIK Unmodified 1460.6929 0.6929423 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 91.808 91.808 3 0.060438 92938 QUIQUE_DMIX1_190116_001 18.102 8.3574 16895000 0 0 0 0 0 0 0 16895000 0 0 0 0 0 26489 2868 24902 242046 309508 309508 1 LGCYFCNDVVAPGDSTR Unmodified 1929.8349 0.83493187 1725 O95352 ATG7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.041 89.041 2 8.0203E-07 92347 QUIQUE_C1218_190116_001 141.73 130.14 297410000 34729000 49378000 37367000 41505000 43788000 0 48341000 0 0 0 0 0 42298000 26490 1725 24903 242047;242048;242049;242050;242051;242052;242053;242054 309509;309510;309511;309512;309513;309514;309515;309516 309509 8 LGDAILSVNGTDLR Unmodified 1442.7729 0.77290718 2995 Q13425;H0YCS0;A0A140TA73;A0A0G2JM75;J3KT21 SNTB2 Beta-2-syntrophin yes no 0 0 0 1 96.972 96.972 2 0.069034 101379 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.391 27.152 39344000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39344000 0 0 26491 2995 24904 242055 309517 309517 1 LGDAQEMR Unmodified 918.42292 0.42291545 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 1 19.033 19.033 2 0.030205 11465 QUIQUE_C1563_190116_001 67.169 22.403 49882000 0 0 0 0 0 49882000 0 0 0 0 0 0 0 26492 4226 24905 242056;242057 309518;309519 309519 2 LGDATVVAK Unmodified 872.49673 0.49673232 4732 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 47.421 47.421 2 0.0012928 44228 QUIQUE_C1403_190116_001 105.04 43.683 1938200000 613490000 0 0 218970000 220990000 251960000 307110000 0 0 0 325690000 0 0 + 26493 4732 24906 242058;242059;242060;242061;242062;242063;242064 309520;309521;309522;309523;309524;309525;309526;309527 309522 7 LGDAVEQGVINNTVLGYFIGR Unmodified 2234.1695 0.16953153 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 165.61 165.61 2;3 3.9316E-128 170553 QUIQUE_C1368_190116_001 274.09 255.36 5096100000 447110000 374270000 692110000 331390000 414010000 259420000 384780000 349890000 340500000 189200000 468760000 449160000 395470000 26494 2440 24907 242065;242066;242067;242068;242069;242070;242071;242072;242073;242074;242075;242076;242077;242078;242079;242080;242081;242082;242083;242084;242085;242086;242087;242088;242089;242090 309528;309529;309530;309531;309532;309533;309534;309535;309536;309537;309538;309539;309540;309541;309542;309543;309544;309545;309546;309547;309548;309549;309550;309551;309552;309553;309554;309555;309556;309557;309558 309535 31 LGDAVIWGTGQLFQAQQDLLHR Unmodified 2465.2815 0.28154159 1071 G3V198;Q12769;E9PR16 NUP160 Nuclear pore complex protein Nup160 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.35 151.35 3 4.4238E-15 156784 QUIQUE_C1368_190116_001 114.72 98.004 363940000 21071000 26168000 37115000 28416000 42960000 0 30950000 19751000 41448000 0 35435000 46938000 33691000 26495 1071 24908 242091;242092;242093;242094;242095;242096;242097;242098;242099;242100;242101 309559;309560;309561;309562;309563;309564;309565;309566;309567;309568;309569;309570;309571;309572 309561 14 LGDDIDLIVR Unmodified 1127.6186 0.61863837 1500 O15371 EIF3D Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.537 98.537 2 0.010608 101336 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.838 59.997 328520000 0 0 36594000 34131000 44713000 0 0 21684000 34127000 0 60217000 48451000 48603000 26496 1500 24909 242102;242103;242104;242105;242106;242107;242108;242109 309573;309574;309575;309576;309577;309578;309579;309580 309580 4 LGDDLEPTLLLLLDR Unmodified 1694.9455 0.94545182 1614 O75155 CAND2 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 168.3 168.3 2 0.00033803 172000 QUIQUE_C1277_190116_001 81.709 72.964 396130000 40238000 95137000 44265000 37956000 55518000 0 0 0 0 11933000 46256000 64824000 0 26497 1614 24910 242110;242111;242112;242113;242114;242115;242116;242117 309581;309582;309583;309584;309585;309586;309587;309588 309582 8 LGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLK Unmodified 3870.9641 0.96414494 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 171.73 171.73 3 4.3662E-32 176134 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.253 22.396 258050000 0 0 11647000 0 28971000 0 0 0 28713000 0 48916000 120960000 18839000 26498 1478 24911 242118;242119;242120;242121;242122;242123 309589;309590;309591;309592;309593;309594 309591 6 LGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLK Unmodified 3870.9641 0.96414494 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 1 171.02 171.02 3 1.4413E-05 176077 QUIQUE_C1576_190116_001 46.32 12.043 79027000 0 6923600 0 0 0 0 29842000 0 0 0 0 42261000 0 26499 3596 24912 242124;242125;242126 309595;309596;309597 309596 3 LGDFPYVSILDPR Unmodified 1490.7769 0.77692993 1694 O94888;C9JAT7 UBXN7 UBX domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 143.7 143.7 2 0.025113 147906 QUIQUE_C1403_190116_001 49.5 30.406 267870000 0 45921000 0 46527000 0 0 52109000 30330000 0 15444000 35043000 42492000 0 26500 1694 24913 242127;242128;242129;242130;242131;242132;242133 309598;309599;309600;309601;309602;309603;309604 309599 7 LGDGLFLQCCEEVAELYPK Unmodified 2240.0493 0.049341318 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.23 146.23 2;3 7.5065E-36 152367 QUIQUE_C1218_190116_001 199.13 187.34 1353800000 115430000 176370000 135380000 94853000 84380000 117070000 117460000 0 113120000 29618000 106240000 133370000 130540000 26501 86 24914 242134;242135;242136;242137;242138;242139;242140;242141;242142;242143;242144;242145;242146;242147 309605;309606;309607;309608;309609;309610;309611;309612;309613;309614;309615;309616;309617;309618;309619;309620;309621;309622;309623;309624;309625;309626;309627 309606 23 LGDGLFLQCCR Unmodified 1337.622 0.62202597 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;E9PF84;H7C1W2;H0Y5Q7 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.373 89.373 2 3.778E-30 91194 QUIQUE_C1277_190116_001 193.41 171.96 4431900000 364840000 400710000 376670000 262420000 281790000 269290000 403720000 283740000 386780000 114180000 388980000 400560000 498250000 26502 2582 24915 242148;242149;242150;242151;242152;242153;242154;242155;242156;242157;242158;242159;242160 309628;309629;309630;309631;309632;309633;309634;309635;309636;309637;309638;309639;309640;309641;309642 309630 15 LGDICFSLR Unmodified 1079.5434 0.54336494 2182;1406 P21579;J3KQA0;O00445 SYT1;SYT5 Synaptotagmin-1;Synaptotagmin-5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.725 96.725 2 6.815E-09 100333 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.23 100.25 4879000000 507630000 548420000 469120000 407340000 445650000 470290000 542520000 194680000 316950000 136740000 0 457860000 381780000 26503 2182;1406 24916 242161;242162;242163;242164;242165;242166;242167;242168;242169;242170;242171;242172;242173 309643;309644;309645;309646;309647;309648;309649;309650;309651;309652;309653;309654;309655 309653 5 LGDLGLGR Unmodified 799.4552 0.45520186 3686 Q8TDX7;Q5TBH0 NEK7;NEK6 Serine/threonine-protein kinase Nek7 no no 0 0 0 1 1 50.614 50.614 2 0.01729 48490 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.784 17.007 76286000 0 0 0 0 0 0 0 0 35360000 0 0 40927000 0 26504 3686 24917 242174;242175 309656;309657 309656 2 LGDLNYLIYVFPDRPK Unmodified 1922.0302 0.030184501 2592 P51692 STAT5B Signal transducer and activator of transcription 5B yes yes 0 0 1 1 140.38 140.38 3 0.024938 146139 QUIQUE_C1576_190116_001 32.181 25.58 26074000 0 0 0 0 0 0 26074000 0 0 0 0 0 0 26505 2592 24918 242176 309658 309658 1 LGDLNYLIYVFPDRPKDEVYSK Unmodified 2643.3585 0.35845451 2592 P51692 STAT5B Signal transducer and activator of transcription 5B yes yes 0 0 2 1 1 1 1 131.6 131.6 4 1.646E-08 134822 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.464 68.599 153070000 0 24758000 30598000 0 0 0 0 49000000 48710000 0 0 0 0 26506 2592 24919 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242225;242226;242227;242228;242229;242230;242231;242232;242233;242234;242235;242236;242237;242238;242239;242240;242241;242242;242243;242244;242245;242246 309715;309716;309717;309718;309719;309720;309721;309722;309723;309724;309725;309726;309727;309728;309729;309730;309731;309732;309733;309734;309735;309736;309737;309738;309739;309740;309741;309742;309743;309744;309745;309746;309747;309748;309749;309750;309751;309752 309721 33 LGDLYEEEMRELR Oxidation (M) 1667.7825 0.78248559 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 1 1 1 1 1 1 72.405 72.405 3 0.0020819 72767 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.088 66.489 490400000 0 0 0 0 0 0 0 90871000 0 0 151000000 102000000 146530000 26513 1952 24925 242247;242248;242249;242250 309753;309754;309755;309756 309755 1198 4 LGDLYEEEMRELR Unmodified 1651.7876 0.78757097 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 0 1 1 1 92.248 92.248 3 4.7803E-05 93708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.69 79.587 101760000 0 0 0 0 0 0 0 76562000 25198000 0 0 0 0 26514 1952 24925 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310024;310025;310026;310027;310028;310029;310030;310031;310032;310033;310034;310035;310036;310037;310038;310039;310040;310041;310042;310043;310044;310045;310046;310047;310048;310049;310050;310051;310052;310053;310054;310055;310056;310057;310058;310059;310060;310061;310062;310063;310064;310065;310066;310067;310068;310069;310070;310071;310072;310073;310074;310075;310076;310077;310078;310079;310080;310081;310082;310083;310084;310085;310086;310087;310088;310089;310090;310091;310092;310093;310094;310095;310096;310097;310098;310099;310100;310101;310102;310103;310104;310105;310106;310107;310108;310109;310110;310111;310112;310113;310114;310115;310116;310117;310118;310119;310120;310121;310122;310123;310124;310125;310126;310127;310128;310129;310130;310131;310132;310133;310134;310135;310136;310137;310138;310139;310140;310141;310142;310143;310144;310145;310146;310147;310148;310149;310150;310151;310152;310153;310154;310155;310156;310157;310158;310159;310160;310161;310162;310163 310030 136 LGEHNIDVLEGNEQFINAAKIITHPNFNGNTLDNDIMLIK Unmodified 4474.2591 0.25909818 761 CON__P00761 yes yes 0 0 1 1 1 1 3 2 2 2 3 2 1 154.18 154.18 4;5 4.5181E-114 160309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.98 142.61 3675200000 118140000 0 0 90099000 131510000 1127900000 136320000 238410000 0 499100000 665190000 471410000 197140000 + 26541 761 24950 242516;242517;242518;242519;242520;242521;242522;242523;242524;242525;242526;242527;242528;242529;242530;242531;242532;242533 310164;310165;310166;310167;310168;310169;310170;310171;310172;310173;310174;310175;310176;310177;310178;310179;310180;310181;310182;310183;310184;310185;310186 310181 22 LGEHNIDVLEGNEQFINAAKIITHPNFNGNTLDNDIMLIK Oxidation (M) 4490.254 0.2540128 761 CON__P00761 yes yes 0 1 1 1 2 1 1 1 151.43 151.43 4;5 3.1056E-32 156397 QUIQUE_C1368_190116_001 88.573 80.704 368960000 0 169300000 59759000 61979000 0 0 35587000 0 0 42336000 0 0 0 + 26542 761 24950 242534;242535;242536;242537;242538;242539 310187;310188;310189;310190;310191;310192 310189 449 6 LGEHNIEVLEGNEQFINAAK Unmodified 2224.1124 0.11241058 304 H0Y8D1;A6XMV8;CON__P07477;A0A0J9YYC8;E7EQ64;A6XMV9;Q8NHM4;P07478;P07477 PRSS1;PRSS3P2;PRSS2 Putative trypsin-6;Trypsin-2;Trypsin-1;Alpha-trypsin chain 1;Alpha-trypsin chain 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.99 101.99 2 0.00090782 104727 QUIQUE_C1368_190116_001 79.633 36.844 8379600000 630520000 890880000 1005100000 759820000 572800000 701210000 853070000 395860000 444200000 1145900000 573880000 406410000 0 + 26543 304 24951 242540;242541;242542;242543;242544;242545;242546;242547;242548;242549;242550;242551 310193;310194;310195;310196;310197;310198;310199;310200;310201;310202;310203;310204;310205;310206;310207 310196 15 LGEIVTTIPTIGFNVETVEYK Unmodified 2322.2359 0.23587976 2827;2134;2828 P84085;C9J1Z8;P84077;P61204;F5H423;F5H0C7;P18085;C9JPM4 ARF5;ARF1;ARF3;ARF4 ADP-ribosylation factor 5;ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3;ADP-ribosylation factor 4 no no 0 0 0 2 2 1 3 2 1 2 2 2 2 2 2 2 151.07 151.07 2;3 4.6903E-14 146382 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.73 112.74 17932000000 1196400000 1703700000 528450000 1090600000 1348900000 619740000 1404500000 1811300000 2428100000 597340000 1947500000 1521800000 1733800000 26544 2828;2827;2134 24952 242552;242553;242554;242555;242556;242557;242558;242559;242560;242561;242562;242563;242564;242565;242566;242567;242568;242569;242570;242571;242572;242573;242574;242575;242576 310208;310209;310210;310211;310212;310213;310214;310215;310216;310217;310218;310219;310220;310221;310222;310223;310224;310225;310226;310227;310228;310229;310230;310231;310232;310233;310234;310235;310236;310237;310238;310239;310240;310241;310242;310243;310244;310245;310246;310247;310248;310249;310250;310251;310252 310239 45 LGELLFPSSLAGETLGSFSGLR Unmodified 2250.1896 0.18959827 186 A0A0A0MSW3;P35658;E9PKD2;B7ZAV2;H0Y837 NUP214 Nuclear pore complex protein Nup214 yes no 0 0 0 1 2 166.45 166.45 2;3 4.3028E-07 168588 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.81 68.371 45350000 0 0 0 0 0 0 0 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242590;242591;242592;242593;242594;242595;242596;242597;242598;242599;242600;242601;242602;242603 310267;310268;310269;310270;310271;310272;310273;310274;310275;310276;310277;310278;310279;310280;310281;310282;310283;310284;310285;310286;310287;310288;310289;310290;310291;310292;310293;310294;310295 310290 438 29 LGELPSWILMR Unmodified 1313.7166 0.71657828 729 C9JJT5;C9JU26;G3V325;P56134 ATP5J2-PTCD1;ATP5J2 ATP synthase subunit f, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.36 142.36 2 0.00011496 145439 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.11 76.124 4476600000 388540000 292760000 333280000 201960000 155940000 237140000 294470000 358870000 532070000 106280000 748080000 459940000 367310000 26548 729 24955 242604;242605;242606;242607;242608;242609;242610;242611;242612;242613;242614;242615;242616 310296;310297;310298;310299;310300;310301;310302;310303;310304;310305;310306;310307;310308;310309;310310;310311;310312;310313 310305 18 LGELQGEAASR Unmodified 1129.5728 0.57275081 2919 Q08378 GOLGA3 Golgin subfamily A member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.036 28.036 2 0.0028284 22351 QUIQUE_C1403_190116_001 94.692 50.884 120370000 0 0 20113000 0 0 0 0 0 0 0 61798000 38462000 0 26549 2919 24956 242617;242618;242619;242620;242621;242622;242623 310314;310315;310316;310317;310318;310319;310320;310321 310316 8 LGELTGTVK Unmodified 916.52295 0.52294707 1535 O43615;M0QXU7;M0R301 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.688 33.688 2 0.02663 28847 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.433 20.903 161510000 44300000 0 0 33680000 0 42691000 0 0 0 0 0 40837000 0 26550 1535 24957 242624;242625;242626;242627 310322;310323;310324;310325 310325 2 LGELVDGLVVPSALVTAILEAPVTEPR Unmodified 2757.5528 0.55279722 3573 Q8N1B4 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 176.13 176.13 3 8.9619E-24 179992 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.955 87.334 616340000 0 73113000 28402000 0 35478000 0 105680000 51700000 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311167 344 LGFSFVR Unmodified 824.45447 0.45447358 77;1567 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6;O60271;A0A087X2D8 MAPK8IP3;SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3;C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.368 83.368 2 0.017387 84314 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.94 99.97 342270000 0 0 34318000 0 44653000 0 32970000 29650000 31707000 15374000 66094000 50661000 36844000 26591 77;1567 24994 243338;243339;243340;243341;243342;243343;243344;243345;243346 311303;311304;311305;311306;311307;311308;311309;311310;311311 311311 9 LGFVAGVINR Unmodified 1044.608 0.60801411 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EPG4;K7EN36 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.36 80.36 2 6.859E-05 82258 QUIQUE_C1438_190116_001 140.98 110.8 2395700000 173350000 186020000 208390000 167690000 188690000 122730000 186960000 202240000 192390000 87591000 255080000 196520000 228020000 26592 3780 24995 243347;243348;243349;243350;243351;243352;243353;243354;243355;243356;243357;243358;243359 311312;311313;311314;311315;311316;311317;311318;311319;311320;311321;311322;311323;311324;311325;311326;311327;311328;311329;311330;311331;311332 311318 20 LGFYGLDESDLDK Unmodified 1470.6878 0.68784015 2869 Q02218;A0A0D9SFS3;C9J4G7 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.79 116.79 2 0.00010073 120370 QUIQUE_C1277_190116_001 118.28 104.51 732640000 88651000 73306000 114610000 81692000 81415000 84049000 69943000 44923000 54729000 39326000 0 0 0 26593 2869 24996 243360;243361;243362;243363;243364;243365;243366;243367;243368;243369 311333;311334;311335;311336;311337;311338;311339;311340;311341;311342;311343;311344;311345;311346;311347 311335 15 LGFYGLDESDLDKVFHLPTTTFIGGQESALPLR Unmodified 3635.8512 0.85116409 2869 Q02218;A0A0D9SFS3;C9J4G7 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 165.52 165.52 3;4 1.8897E-74 172790 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carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 94.783 94.783 2 0.037982 95892 QUIQUE_C1563_190116_001 38.674 29.186 19157000 0 0 0 0 0 19157000 0 0 0 0 0 0 0 26596 1029 24999 243392 311371 311371 1 LGGEILDYR Unmodified 1034.5397 0.53965977 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 75.306 75.306 2 0.0079449 71607 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.165 28.311 76090000 45359000 0 0 0 0 0 0 0 0 30731000 0 0 0 26597 3362 25000 243393;243394 311372;311373 311373 2 LGGEILDYRDLAALPK Unmodified 1742.9567 0.95668521 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 1 1 119.79 119.79 3 0.031281 122337 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.55 8.6334 36724000 0 0 0 0 0 0 0 36724000 0 0 0 0 0 26598 3362 25001 243395 311374 311374 1 LGGEVSCLVAGTK Unmodified 1289.6649 0.66493664 2067 P13804;H0YLU7;H0YKF0;J3KN60 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 66.497 66.497 2 9.252E-05 67626 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311406;311407;311408;311409;311410;311411;311412;311413;311414;311415;311416;311417;311418;311419;311420;311421;311422;311423;311424;311425;311426;311427;311428;311429;311430;311431 311428 22 LGGIGQFLAK Unmodified 1002.5862 0.58621603 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.928 86.928 2 0.0018537 88541 QUIQUE_C1368_190116_001 93.195 57.01 1134900000 0 163380000 124050000 94760000 167480000 104670000 129580000 0 125030000 49797000 0 176200000 0 26603 2916 25005 243448;243449;243450;243451;243452;243453;243454;243455;243456;243457 311432;311433;311434;311435;311436;311437;311438;311439;311440;311441;311442 311434 11 LGGINNILVPHQR Unmodified 1429.8154 0.81538112 4482 Q9UL18;Q5TA58 AGO1 Protein argonaute-1;Protein argonaute no no 0 0 0 1 66.43 66.43 3 0.0032045 65519 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.484 38.979 18472000 0 0 0 0 0 0 0 18472000 0 0 0 0 0 26604 4482 25006 243458 311443 311443 0 LGGLDTR Unmodified 730.39735 0.39735263 3573 Q8N1B4 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.503 22.503 2 0.019227 16261 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.08 23.18 1893100000 259370000 0 0 0 0 273910000 99664000 375090000 273150000 204180000 0 305340000 102360000 26605 3573 25007 243459;243460;243461;243462;243463;243464;243465;243466 311444;311445;311446;311447;311448;311449;311450;311451;311452;311453 311448 10 LGGLDVLEAEFSK Unmodified 1376.7187 0.71874635 3294 Q5SGD2 PPM1L Protein phosphatase 1L yes yes 0 0 0 1 1 1 139.05 139.05 2 0.0012931 144426 QUIQUE_C1218_190116_001 80.737 64.484 59277000 16897000 26188000 0 16192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26606 3294 25008 243467;243468;243469 311454;311455;311456 311454 3 LGGLTQAPGNPVLAVQINQDK Unmodified 2132.159 0.15896684 1338 K7ENG2;P26368 U2AF2 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 106.24 106.24 2;3 2.2505E-14 110673 QUIQUE_C1218_190116_001 152.11 117.36 1360100000 127330000 131640000 155020000 119250000 117340000 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P23528;G3V1A4;E9PK25 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 0 1 65.22 65.22 2 0.0024203 64941 QUIQUE_C1218_190116_001 80.24 34.904 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26611 2220 25013 243526 311527 311527 1 LGGSAVISLEGKPL Unmodified 1339.7711 0.77111627 2220 P23528;G3V1A4;E9PK25 CFL1 Cofilin-1 yes no 0 0 1 2 3 2 4 2 4 3 4 4 1 8 4 1 100.51 100.51 1;2 5.2767E-46 97161 QUIQUE_DMIX3_190116_001 237.84 203.63 19904000000 1488700000 1765900000 1324000000 1364600000 1296200000 2418300000 1167600000 1681700000 2182800000 844910000 1737400000 1440300000 1191100000 26612 2220 25014 243527;243528;243529;243530;243531;243532;243533;243534;243535;243536;243537;243538;243539;243540;243541;243542;243543;243544;243545;243546;243547;243548;243549;243550;243551;243552;243553;243554;243555;243556;243557;243558;243559;243560;243561;243562;243563;243564;243565;243566;243567;243568 311528;311529;311530;311531;311532;311533;311534;311535;311536;311537;311538;311539;311540;311541;311542;311543;311544;311545;311546;311547;311548;311549;311550;311551;311552;311553;311554;311555;311556;311557;311558;311559;311560;311561;311562;311563;311564;311565;311566;311567;311568;311569;311570;311571;311572;311573;311574;311575;311576;311577;311578;311579;311580;311581;311582;311583;311584;311585;311586;311587;311588;311589;311590;311591;311592;311593;311594;311595;311596;311597;311598;311599;311600;311601;311602;311603;311604;311605;311606;311607;311608;311609;311610;311611;311612;311613;311614;311615;311616;311617;311618 311582 81 LGGSLADSYLDEGFLLDK Unmodified 1911.9466 0.94657403 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 146.51 146.51 2 1.2518E-17 150606 QUIQUE_C1277_190116_001 136.3 105.97 1445900000 0 421570000 0 488130000 0 536210000 0 0 0 0 0 0 0 26613 2810 25015 243569;243570;243571 311619;311620;311621;311622 311620 4 LGGSLADSYLDEGFLLDKK Unmodified 2040.0415 0.041537049 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 126.73 126.73 2;3 2.7256E-45 132402 QUIQUE_C1218_190116_001 197.19 169.53 4728000000 270640000 350020000 317300000 345760000 323770000 281180000 421810000 351720000 437040000 71070000 611690000 450370000 495680000 26614 2810 25016 243572;243573;243574;243575;243576;243577;243578;243579;243580;243581;243582;243583;243584;243585;243586;243587;243588;243589;243590;243591;243592;243593;243594;243595 311623;311624;311625;311626;311627;311628;311629;311630;311631;311632;311633;311634;311635;311636;311637;311638;311639;311640;311641;311642;311643;311644;311645;311646;311647;311648;311649;311650 311623 25 LGGSLIVAFEGCPV Unmodified 1417.7275 0.72753689 2702 P60981 DSTN Destrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 154.15 154.15 2 0.019842 160087 QUIQUE_C1218_190116_001 54.436 41.858 158600000 0 31222000 0 0 0 0 29512000 40596000 0 17297000 0 0 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mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 51.759 51.759 2 6.2167E-08 50162 QUIQUE_C1277_190116_001 162.36 142.57 1707400000 0 273410000 234620000 197010000 0 155330000 265590000 0 0 0 211000000 162030000 208400000 26622 1779 25024 243657;243658;243659;243660;243661;243662;243663;243664;243665;243666;243667;243668;243669 311726;311727;311728;311729;311730;311731;311732;311733;311734;311735;311736;311737;311738;311739;311740;311741;311742;311743;311744;311745 311728 20 LGGTIDDCELVEGLVLTQK Unmodified 2059.0507 0.050721527 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 141.25 141.25 2;3 6.405E-63 145501 QUIQUE_C1403_190116_001 237.59 214.71 1359300000 181570000 109730000 99974000 128670000 119760000 117410000 114440000 60978000 60053000 99268000 81553000 79580000 106340000 26623 2573 25025 243670;243671;243672;243673;243674;243675;243676;243677;243678;243679;243680;243681;243682;243683;243684;243685 311746;311747;311748;311749;311750;311751;311752;311753;311754;311755;311756;311757;311758;311759;311760;311761;311762;311763;311764;311765;311766;311767 311752 20 LGHAETDEQLQNIISK Unmodified 1794.9112 0.91119158 1259 J3KN16;Q5VYK3;R4GMY1;R4GMY3 KIAA0368;ECM29 Proteasome-associated protein ECM29 homolog yes no 0 0 0 1 1 65.53 65.53 2 1.9245E-07 65194 QUIQUE_C1277_190116_001 105.65 87.84 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26624 1259 25026 243686;243687 311768;311769 311768 2 LGHELQQAGLK Unmodified 1192.6564 0.65642086 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.073 27.073 2;3 0.0012673 21002 QUIQUE_C1576_190116_001 87.485 59.311 205040000 47715000 43573000 31088000 0 0 24631000 31028000 0 0 0 27006000 0 0 26625 3091 25027 243688;243689;243690;243691;243692;243693;243694;243695;243696;243697;243698;243699 311770;311771;311772;311773;311774;311775;311776;311777;311778;311779;311780;311781 311777 12 LGHGLLAFFK Unmodified 1101.6335 0.63350057 877 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5 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 53.149 53.149 3;4 4.5152E-07 49386 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.704 68.615 139820000 0 59175000 0 0 0 51944000 0 0 0 28701000 0 0 0 26628 2472 25030 243725;243726;243727;243728;243729;243730;243731 311808;311809;311810;311811;311812;311813;311814 311814 5 LGHGLLSGEYSKPVPESGDGERVPEQK Unmodified 2864.4305 0.43045026 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 2 1 2 2 2 1 1 3 3 2 2 1 2 3 53.394 53.394 3;4;5 1.1337E-77 51225 QUIQUE_C1277_190116_001 164.43 156.26 2981000000 126610000 206910000 334650000 120890000 136190000 76506000 285340000 490900000 285900000 99875000 0 277140000 540060000 26629 2472 25031 243732;243733;243734;243735;243736;243737;243738;243739;243740;243741;243742;243743;243744;243745;243746;243747;243748;243749;243750;243751;243752;243753;243754;243755;243756 311815;311816;311817;311818;311819;311820;311821;311822;311823;311824;311825;311826;311827;311828;311829;311830;311831;311832;311833;311834;311835;311836;311837;311838;311839;311840;311841;311842;311843;311844;311845;311846 311817 31 LGHPDTLNQGEFK Unmodified 1454.7154 0.7153923 1901 P06702 S100A9 Protein S100-A9 yes yes 0 0 0 1 1 36.833 36.833 2 0.00044163 32838 QUIQUE_C1438_190116_001 118.9 91.601 92025000 0 0 0 45375000 46650000 0 0 0 0 0 0 0 0 26630 1901 25032 243757;243758 311847;311848 311848 2 LGHPEALSAGTGSPQPPSFTYAQQR Unmodified 2596.267 0.26701374 1114 H0Y2Y8;Q15942;H7C3D3 ZYX Zyxin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.854 78.854 3 4.7961E-14 79299 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.013 75.031 487370000 49420000 58256000 57677000 89537000 59350000 0 0 57720000 0 29059000 0 40333000 46018000 26631 1114 25033 243759;243760;243761;243762;243763;243764;243765;243766;243767 311849;311850;311851;311852;311853;311854;311855;311856;311857 311854 7 LGHVVMGNNAVSPYQQVIEK Unmodified 2182.1205 0.12047285 2690 P60228;E5RGA2;H0YAW4 EIF3E Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 76.381 76.381 3 0.00030086 76540 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.585 49.83 56345000 0 0 0 0 0 0 0 35942000 0 0 0 20403000 0 26632 2690 25034 243768;243769;243770;243771;243772;243773 311858;311859;311860;311861;311862;311863 311861 6 LGHYATQLQNTYDR Unmodified 1678.8063 0.80633258 2592 P51692;C9J4I3 STAT5B Signal transducer and activator of transcription 5B yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 45.62 45.62 2;3 8.4322E-06 43382 QUIQUE_C1277_190116_001 121.02 100.72 515440000 31418000 74692000 58853000 18037000 110690000 0 25393000 0 43557000 0 47182000 55151000 50471000 26633 2592 25035 243774;243775;243776;243777;243778;243779;243780;243781;243782;243783;243784;243785;243786 311864;311865;311866;311867;311868;311869;311870;311871;311872;311873;311874;311875;311876 311866 10 LGHYTDAIKDCEK Unmodified 1548.7242 0.72424243 3843 Q96EQ0;D6RFW1 SGTB Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta yes no 0 0 1 1 1 25.26 25.26 3 0.00035538 19879 QUIQUE_C1277_190116_001 75.483 63.568 156590000 0 62169000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 94417000 26634 3843 25036 243787;243788 311877;311878;311879 311877 3 LGIDDLVHFDFMDPPAPETLMR Unmodified 2528.208 0.20796723 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 167.64 167.64 3 0.0016237 172508 QUIQUE_C1368_190116_001 40.381 36.983 50862000 0 0 35221000 0 0 0 15641000 0 0 0 0 0 0 26635 1506 25037 243789;243790 311880;311881 311880 1 LGIEGLSLHNVLK Unmodified 1391.8136 0.81364979 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.13 101.13 3 0.00034235 104039 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.565 59.909 554230000 48642000 45861000 44116000 36348000 61039000 52413000 39441000 32455000 39260000 23997000 49555000 35176000 45927000 26636 4334 25038 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312048;312049;312050;312051;312052;312053;312054;312055;312056 312051 9 LGIPDAVSYIK Unmodified 1174.6598 0.6597749 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.79 106.79 2 0.0043565 110158 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.614 40.384 300530000 39484000 39718000 0 0 0 45327000 0 26123000 42117000 0 69596000 38161000 0 26655 1692 25057 243944;243945;243946;243947;243948;243949;243950 312057;312058;312059;312060;312061;312062;312063;312064 312062 8 LGIPMSVLMGANIASEVADEK Unmodified 2144.0857 0.085726824 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 157.01 157.01 2;3 4.9552E-05 162235 QUIQUE_C1368_190116_001 85.734 72.753 363550000 19241000 20711000 57585000 68093000 28657000 13441000 51799000 10145000 26423000 18468000 21578000 0 27408000 26656 2184 25058 243951;243952;243953;243954;243955;243956;243957;243958;243959;243960;243961;243962;243963;243964;243965;243966;243967 312065;312066;312067;312068;312069;312070;312071;312072;312073;312074;312075;312076;312077;312078;312079;312080;312081;312082;312083;312084 312069 19 LGIPVVCHLPGVGQNLQDHLEIYIQQACTR Unmodified 3427.7493 0.74929875 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 143.79 143.79 4 0.00016231 149320 QUIQUE_C1368_190116_001 25.645 20.486 183210000 0 0 183210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26657 3643 25059 243968 312085 312085 1 LGIQAEPLYR Unmodified 1158.6397 0.63970816 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 71.617 71.617 2 1.6182E-07 72276 QUIQUE_C1438_190116_001 175.44 142.6 5515800000 438500000 588040000 842690000 0 468750000 504350000 0 498440000 0 217930000 769140000 671770000 516210000 26658 921 25060 243969;243970;243971;243972;243973;243974;243975;243976;243977;243978;243979 312086;312087;312088;312089;312090;312091;312092;312093;312094;312095;312096 312090 10 LGIQTDDK Unmodified 888.45526 0.45526144 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 21.917 21.917 2 0.023483 15101 QUIQUE_C1438_190116_001 73.26 39.822 311590000 125610000 0 0 0 62963000 123020000 0 0 0 0 0 0 0 26659 1779 25061 243980;243981;243982 312097;312098;312099 312098 2 LGIQTDDKGHIIVDEFQNTNVK Unmodified 2483.2656 0.26561676 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 88.996 88.996 3;4 0.00012771 90667 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.342 46.884 1823700000 197170000 0 180390000 167790000 159860000 139130000 0 391400000 194520000 0 194430000 0 198970000 26660 1779 25062 243983;243984;243985;243986;243987;243988;243989;243990;243991;243992 312100;312101;312102;312103;312104;312105;312106;312107;312108;312109 312105 7 LGISNHTHVVVYDGEHLGSFYAPR Unmodified 2667.3194 0.31938366 3193 Q16762;B1AH48 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 82.936 82.936 4;5 1.6826E-12 84603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.123 88.17 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QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.05 82.261 2153800000 279980000 151910000 104790000 108190000 133020000 101260000 115830000 236040000 112590000 78810000 228040000 117810000 385560000 26663 2580 25065 244014;244015;244016;244017;244018;244019;244020;244021;244022;244023;244024;244025;244026;244027;244028;244029;244030 312135;312136;312137;312138;312139;312140;312141;312142;312143;312144;312145;312146;312147;312148;312149;312150;312151;312152;312153;312154 312148 12 LGITQLR Unmodified 799.49159 0.49158736 4547 Q9Y285;K7ER00;K7EPH2 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 0 0 0 1 1 1 46.561 46.561 2 0.01933 43728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.54 0 431010000 140590000 0 0 0 0 0 0 0 105190000 0 185230000 0 0 26664 4547 25066 244031;244032;244033 312155;312156;312157;312158 312158 4 LGITTIK Unmodified 744.47454 0.47454032 2563 P50440 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 38.447 38.447 2 0.067202 34922 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.803 7.5573 203130000 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 1899.801 0.80103201 2944 Q12797;E5RG29;E5RG56;E5RHJ2;E5RHK2;G3XAN5 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.12 110.12 2 5.6852E-18 113156 QUIQUE_C1403_190116_001 138.42 132.47 979930000 104750000 84175000 95780000 76343000 78913000 62443000 87457000 79571000 92820000 35328000 98921000 0 83427000 26668 2944 25070 244052;244053;244054;244055;244056;244057;244058;244059;244060;244061;244062;244063 312179;312180;312181;312182;312183;312184;312185;312186;312187;312188;312189;312190;312191 312182 13 LGIYTVLFER Unmodified 1209.6758 0.67575932 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.66 131.66 2 0.00034779 138097 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.75 108.03 3920900000 331190000 254390000 352120000 227830000 162190000 251550000 291810000 402980000 368840000 135650000 526030000 346610000 269670000 26669 2881 25071 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244080;244081;244082;244083;244084;244085;244086;244087;244088;244089;244090;244091;244092;244093;244094;244095;244096;244097;244098;244099 312216;312217;312218;312219;312220;312221;312222;312223;312224;312225;312226;312227;312228;312229;312230;312231;312232;312233;312234;312235;312236;312237 312229 18 LGLALNYSVFYYEIQNAPEQACHLAK Unmodified 3011.4851 0.48512836 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 1 3 2 2 2 2 2 5 2 4 3 2 153.76 153.76 2;3;4 4.8123E-102 157985 QUIQUE_DMIX3_190116_001 250.27 208.73 24652000000 929370000 1429700000 1414100000 1053900000 1208400000 849660000 2359600000 2231000000 2478200000 425650000 3837900000 3665200000 2769400000 26672 2736 25074 244100;244101;244102;244103;244104;244105;244106;244107;244108;244109;244110;244111;244112;244113;244114;244115;244116;244117;244118;244119;244120;244121;244122;244123;244124;244125;244126;244127;244128;244129;244130;244131 312238;312239;312240;312241;312242;312243;312244;312245;312246;312247;312248;312249;312250;312251;312252;312253;312254;312255;312256;312257;312258;312259;312260;312261;312262;312263;312264;312265;312266;312267;312268;312269;312270;312271;312272;312273;312274;312275;312276;312277;312278;312279;312280;312281;312282;312283;312284;312285;312286;312287;312288;312289;312290;312291;312292 312273 55 LGLAPQIQDLYGK Unmodified 1414.782 0.78201531 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YKA5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.59 108.59 2 0.00046758 110652 QUIQUE_C1563_190116_001 116.52 99.492 784760000 63460000 65701000 125130000 85862000 0 75073000 83507000 41278000 53631000 38267000 98995000 53861000 0 26673 2487 25075 244132;244133;244134;244135;244136;244137;244138;244139;244140;244141;244142 312293;312294;312295;312296;312297;312298;312299;312300;312301;312302;312303;312304 312297 10 LGLDDFESLK Unmodified 1135.5761 0.57610486 4555 Q9Y2H1;F5H7Z3;F5GY51;I3L0D0 STK38L Serine/threonine-protein kinase 38-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 115.89 115.89 2 0.00039296 119833 QUIQUE_DMIX8_190116_001 130.75 97.907 248350000 0 0 0 48431000 42207000 0 46399000 0 0 0 0 46992000 64326000 26674 4555 25076 244143;244144;244145;244146;244147;244148;244149 312305;312306;312307;312308;312309;312310;312311;312312 312312 8 LGLDEFNFIK Unmodified 1194.6285 0.62847478 2868 Q02156;E9PBI2 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.26 133.26 2 0.0013142 138053 QUIQUE_C1368_190116_001 99.136 59.068 539060000 55578000 66235000 49427000 49959000 32063000 47465000 63749000 25058000 0 21835000 47261000 38814000 41612000 26675 2868 25077 244150;244151;244152;244153;244154;244155;244156;244157;244158;244159;244160;244161 312313;312314;312315;312316;312317;312318;312319;312320;312321;312322;312323;312324;312325;312326 312315 13 LGLDEYLDKLK Unmodified 1305.718 0.71801807 3921 Q96PY5 FMNL2 Formin-like protein 2 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 106.82 106.82 2;3 0.00061781 109442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.113 85.459 39080000 0 0 0 0 0 0 0 15921000 0 0 23159000 0 0 26676 3921 25078 244162;244163;244164;244165;244166;244167 312327;312328;312329;312330;312331;312332 312327 6 LGLDFPNLPYLIDGAHK Unmodified 1881.9989 0.99888437 1965;141;2883;481 A0A0A0MR85;A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1;P09488;B9ZVX7;H3BRM6;Q03013 GSTM4;GSTM5;GSTM1 Glutathione S-transferase Mu 5;Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 3 1 2 1 1 145.31 145.31 2;3 1.2653E-13 150239 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.18 125.42 24746000000 2533300000 523330000 424340000 4956200000 453480000 1329200000 496910000 8123200000 4439400000 296820000 609120000 38937000 521420000 26677 141;481;1965;2883 25079 244168;244169;244170;244171;244172;244173;244174;244175;244176;244177;244178;244179;244180;244181;244182;244183;244184;244185;244186;244187;244188;244189;244190 312333;312334;312335;312336;312337;312338;312339;312340;312341;312342;312343;312344;312345;312346;312347;312348;312349;312350;312351;312352;312353;312354;312355;312356;312357;312358;312359;312360;312361;312362;312363;312364 312358 31 LGLDFPNLPYLIDGTHK Unmodified 1912.0094 0.0094490594 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 145.21 145.21 2;3 4.0401E-28 141438 QUIQUE_DMIX4_190116_001 172.1 140.46 30212000000 1911600000 2494400000 2295300000 3236600000 2564200000 2009100000 2611100000 2048000000 2420800000 861560000 2433000000 2126500000 3200100000 26678 2277 25080 244191;244192;244193;244194;244195;244196;244197;244198;244199;244200;244201;244202;244203;244204;244205;244206;244207;244208;244209;244210;244211;244212;244213;244214;244215;244216 312365;312366;312367;312368;312369;312370;312371;312372;312373;312374;312375;312376;312377;312378;312379;312380;312381;312382;312383;312384;312385;312386;312387;312388;312389;312390;312391;312392;312393;312394;312395;312396;312397;312398 312390 32 LGLDSEEDYYTPQK Unmodified 1656.7519 0.75189697 3678 Q8TD19 NEK9 Serine/threonine-protein kinase Nek9 yes yes 0 0 0 1 1 1 80.875 80.875 2 0.0012551 82525 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.062 59.589 47089000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47089000 26679 3678 25081 244217;244218;244219 312399;312400;312401 312401 3 LGLDYEER Unmodified 993.47673 0.47672516 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7;F5H3X6 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.539 52.539 2 0.0011662 51372 QUIQUE_C1218_190116_001 145.04 69.936 1767600000 221530000 180430000 166430000 123500000 138520000 121910000 118830000 177410000 110670000 0 153230000 129720000 125460000 26680 1272 25082 244220;244221;244222;244223;244224;244225;244226;244227;244228;244229;244230;244231 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312511;312512;312513;312514;312515;312516;312517;312518;312519;312520;312521;312522;312523;312524;312525;312526;312527;312528;312529;312530;312531;312532;312533;312534;312535;312536;312537;312538;312539;312540;312541;312542;312543;312544;312545;312546 312541 24 LGLHQVLQDLR Unmodified 1290.7408 0.74081919 279 H9KV28;A0A2R8Y5N1;A0A140T8Z0;A0A0G2JH68;O60610 DIAPH1 Protein diaphanous homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.849 86.849 3 0.00049168 88958 QUIQUE_C1277_190116_001 83.045 52.433 176350000 12638000 17170000 23752000 13822000 0 15734000 18386000 0 23108000 0 0 18277000 33464000 26690 279 25091 244339;244340;244341;244342;244343;244344;244345;244346;244347;244348 312547;312548;312549;312550;312551;312552;312553;312554;312555;312556;312557;312558;312559 312548 12 LGLHSLR Unmodified 794.47627 0.47627165 2827 P84077;P61204;H0YGG7 ARF1;ARF3 ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3 yes no 0 0 0 1 23.385 23.385 2 0.054258 16837 QUIQUE_DMIX7_190116_001 136.89 31.673 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312720;312721;312722;312723;312724;312725;312726;312727;312728;312729;312730;312731;312732;312733;312734;312735;312736;312737;312738;312739;312740;312741;312742;312743;312744;312745;312746;312747;312748;312749 312725 30 LGLQSLR Unmodified 785.47594 0.4759373 2134 P18085;C9JAK5;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.971 48.971 2 0.0083582 46209 QUIQUE_C1403_190116_001 153.61 46.061 2125100000 157630000 142360000 202240000 152110000 132950000 169140000 164070000 123140000 207390000 80970000 237970000 146660000 208470000 26715 2134 25115 244504;244505;244506;244507;244508;244509;244510;244511;244512;244513;244514;244515;244516 312750;312751;312752;312753;312754;312755;312756;312757;312758;312759;312760;312761;312762;312763;312764 312753 15 LGLQVVELPADESLPDCVFVEDVAVVCEETALITRPGAPSR Unmodified 4450.24 0.24000222 1684 O94760 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 2 3 4 3 170.88 170.88 3;4 3.0444E-84 174614 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Unmodified 1841.0267 0.026695803 4437 Q9UHQ9;H7C0R7 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 2 2 1 2 2 151.04 151.04 2;3 0.00069301 155689 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.997 52.795 1093500000 69966000 0 100100000 85193000 41822000 29990000 82567000 85311000 154080000 0 138000000 110690000 195730000 26734 4437 25132 244759;244760;244761;244762;244763;244764;244765;244766;244767;244768;244769;244770;244771;244772;244773;244774;244775;244776;244777 313068;313069;313070;313071;313072;313073;313074;313075;313076;313077;313078;313079;313080;313081;313082;313083;313084;313085;313086;313087 313080 18 LGMIAGGTGITPMLQLIR Oxidation (M) 1857.0216 0.021610425 4437 Q9UHQ9;H7C0R7 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes no 0 1 0 1 1 1 140.26 140.26 2 0.0032649 144778 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.106 29.957 144700000 0 0 0 0 0 0 0 49812000 54151000 0 0 40734000 0 26735 4437 25132 244778;244779;244780 313088;313089;313090 313090 2954 3 LGMLNTVSK Unmodified 961.52665 0.52665224 3983 Q99963 SH3GL3 Endophilin-A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 44.617 44.617 2 0.007419 41677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.642 20.747 98053000 0 42275000 0 0 0 0 0 0 0 0 55778000 0 0 26736 3983 25133 244781;244782;244783;244784;244785 313091;313092;313093;313094;313095;313096 313094 6 LGMLSPEGTCK Unmodified 1191.5628 0.56277975 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 48.705 48.705 2 0.023035 45982 QUIQUE_C1277_190116_001 70.929 51.834 49573000 0 49573000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26737 2524 25134 244786 313097 313097 0 LGMNLMNELK Unmodified 1161.5886 0.58860057 970 E9PPQ1;J3KNE7;Q16890;E9PNK6;E9PNQ9 TPD52L1 Tumor protein D53 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.14 100.14 2 1.189E-08 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313112 4 LGNDFMGITLASSQAVSNAR Unmodified 2051.0106 0.010588046 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 3 2 126 126 2;3 3.4403E-87 131456 QUIQUE_C1218_190116_001 196.95 169.85 2605200000 240720000 148750000 240560000 247770000 115900000 195170000 117080000 246590000 290270000 86590000 175560000 258530000 241740000 26741 4220 25138 244804;244805;244806;244807;244808;244809;244810;244811;244812;244813;244814;244815;244816;244817;244818;244819;244820;244821;244822;244823;244824;244825;244826;244827;244828 313116;313117;313118;313119;313120;313121;313122;313123;313124;313125;313126;313127;313128;313129;313130;313131;313132;313133;313134;313135;313136;313137;313138;313139;313140;313141;313142;313143;313144;313145;313146;313147;313148;313149;313150;313151;313152;313153;313154;313155 313117 40 LGNFFSPK Unmodified 908.4756 0.47560295 2487 P46940;A0A0J9YXZ5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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52.203 94236000 0 38007000 56229000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26750 2664 25147 244864;244865 313198;313199 313199 2 LGNSHQPEKPLVR Unmodified 1473.8052 0.80521036 1053 F8W7U8;P49959 MRE11A Double-strand break repair protein MRE11A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 13.326 13.326 3;4 0.002442 5744 QUIQUE_C1576_190116_001 62.042 42.437 144740000 0 0 0 0 30046000 0 18390000 25123000 22448000 0 11515000 37214000 0 26751 1053 25148 244866;244867;244868;244869;244870;244871;244872 313200;313201;313202;313203;313204;313205;313206 313201 7 LGNWLAVR Unmodified 927.52904 0.5290355 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 78.87 78.87 2 0.019665 79380 QUIQUE_C1277_190116_001 77.984 49.562 532480000 0 116860000 0 128450000 0 0 0 95782000 142020000 49375000 0 0 0 26752 345 25149 244873;244874;244875;244876;244877 313207;313208;313209;313210;313211 313207 4 LGNYAGAVQDCER Unmodified 1451.6463 0.64632646 1551 O43765;K7EMD6 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 42.65 42.65 2 0.00057964 39713 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.441 77.29 2216100000 0 0 279260000 534040000 0 0 107050000 0 581630000 215480000 0 400860000 97836000 26753 1551 25150 244878;244879;244880;244881;244882;244883;244884;244885 313212;313213;313214;313215;313216;313217;313218;313219 313218 7 LGPALATGNVVVMK Unmodified 1368.7799 0.77990682 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.76 85.76 2 0.0008927 87226 QUIQUE_DMIX8_190116_001 94.309 80.102 15819000000 1553400000 1293900000 1717000000 1132700000 1077400000 1073600000 1023200000 1169900000 1190800000 364060000 1567600000 1157600000 1498300000 26754 1875 25151 244886;244887;244888;244889;244890;244891;244892;244893;244894;244895;244896;244897;244898 313220;313221;313222;313223;313224;313225;313226;313227;313228;313229;313230;313231;313232;313233;313234;313235;313236 313236 17 LGPALATGNVVVMK Oxidation (M) 1384.7748 0.77482144 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 68.169 68.169 2 0.00032819 65283 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.827 58.573 806760000 0 0 333330000 0 0 187500000 0 0 0 73747000 0 0 212190000 26755 1875 25151 244899;244900;244901;244902 313237;313238;313239;313240;313241;313242;313243;313244;313245;313246 313244 1099 10 LGPAPLNLEVPTYEFTSDDMVIVG Oxidation (M) 2592.2669 0.26692189 2498 P47985 UQCRFS1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11 yes yes 0 1 0 1 1 167.97 167.97 2 6.0983E-06 172541 QUIQUE_C1218_190116_001 63.181 53.393 39006000 20053000 0 0 0 18953000 0 0 0 0 0 0 0 0 26756 2498 25152 244903;244904 313247;313248 313247 1926 2 LGPAPLNLEVPTYEFTSDDMVIVG Unmodified 2576.272 0.27200727 2498 P47985 UQCRFS1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 171.19 171.19 2;3 3.721E-07 172678 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.32 99.442 1145000000 69190000 61222000 32529000 0 0 0 155400000 202800000 232130000 0 166140000 225640000 0 26757 2498 25152 244905;244906;244907;244908;244909;244910;244911;244912;244913;244914;244915;244916;244917;244918;244919 313249;313250;313251;313252;313253;313254;313255;313256;313257;313258;313259;313260;313261;313262;313263 313257 15 LGPASAADTGSEAK Unmodified 1273.615 0.61500956 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 22.64 22.64 2 0.021659 15647 QUIQUE_C1277_190116_001 62.088 37.312 39497000 0 39497000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26758 4331 25153 244920 313264 313264 1 LGPASAADTGSEAKPGALAEGAAEPEPQR Unmodified 2747.3362 0.33621552 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.441 62.441 3 4.1619E-65 62268 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313285;313286;313287;313288;313289;313290;313291;313292;313293;313294;313295;313296;313297;313298;313299;313300;313301;313302;313303;313304;313305;313306;313307;313308;313309;313310;313311;313312;313313;313314;313315;313316;313317;313318;313319;313320;313321;313322;313323;313324;313325;313326;313327;313328;313329;313330;313331;313332;313333;313334;313335 313288 51 LGPGTRLSLAR Unmodified 1139.6775 0.67749065 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;K7EJK1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 41.698 41.698 3 0.013438 38045 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.225 33.136 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26764 389;395;1336 25159 244968 313336 313336 1 LGPHTVLTFIFLEQMNK Oxidation (M) 2003.055 0.055019043 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.09 135.09 3 9.3564E-05 139735 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.508 64.417 585890000 0 52012000 59249000 48726000 33354000 0 65980000 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P38117 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.902 42.902 2 0.0064474 40665 QUIQUE_C1218_190116_001 101.72 57.001 3859400000 429840000 405990000 342740000 351740000 0 289280000 371500000 439230000 399030000 0 458620000 0 371420000 26770 2411 25164 245007;245008;245009;245010;245011;245012;245013;245014;245015;245016 313384;313385;313386;313387;313388;313389;313390;313391;313392;313393 313384 8 LGPLVEQGR Unmodified 967.54508 0.5450795 1822 P02649;H0Y7L5;E9PEV4;E7ERP7 APOE Apolipoprotein E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.165 37.165 2 0.00098961 32421 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.9 71.135 4310900000 277470000 266960000 0 326660000 285650000 376230000 361320000 288920000 646040000 149450000 477630000 392120000 462490000 26771 1822 25165 245017;245018;245019;245020;245021;245022;245023;245024;245025;245026;245027;245028 313394;313395;313396;313397;313398;313399;313400;313401;313402;313403;313404;313405;313406;313407 313407 14 LGPNDQYK Unmodified 933.4556 0.45559579 1410 O00483 NDUFA4 Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.846 20.846 2 0.0036477 14081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.93 88.127 2788500000 241690000 321570000 229290000 0 0 0 0 396540000 0 0 620350000 485450000 493580000 26772 1410 25166 245029;245030;245031;245032;245033;245034;245035 313408;313409;313410;313411;313412;313413;313414;313415 313411 6 LGPNYLHIPVNCPYR Unmodified 1811.9141 0.91410889 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 3 88.733 88.733 2;3 7.3389E-08 90744 QUIQUE_C1368_190116_001 142.43 119.89 1735700000 35959000 253020000 221390000 41413000 248850000 24290000 169030000 65096000 106050000 0 175430000 185940000 209270000 26773 1849 25167 245036;245037;245038;245039;245040;245041;245042;245043;245044;245045;245046;245047;245048;245049;245050;245051;245052;245053;245054;245055;245056 313416;313417;313418;313419;313420;313421;313422;313423;313424;313425;313426;313427;313428;313429;313430;313431;313432;313433;313434;313435;313436;313437;313438;313439;313440;313441;313442;313443 313421 25 LGPSDYFGEIALLLNRPR Unmodified 2030.0949 0.094910023 2330 P31321;H7BYW5 PRKAR1B cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 2 161.6 161.6 3 2.1362E-13 168988 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.02 113.74 685000000 46839000 58891000 58002000 67521000 59974000 0 0 0 44059000 29235000 134470000 82844000 103160000 26774 2330 25168 245057;245058;245059;245060;245061;245062;245063;245064;245065;245066;245067;245068;245069;245070;245071;245072 313444;313445;313446;313447;313448;313449;313450;313451;313452;313453;313454;313455;313456;313457;313458;313459;313460;313461;313462 313458 18 LGPSDYFGEIALLMNR Unmodified 1794.8975 0.89745577 2002 P10644 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 168.7 168.7 2;3 0.010667 173441 QUIQUE_C1368_190116_001 66.262 50.009 35355000 5812700 0 29543000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26775 2002 25169 245073;245074 313463;313464 313464 1 LGPSDYFGEIALLMNRPR Oxidation (M) 2064.0462 0.046245271 2002 P10644 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes yes 0 1 1 1 1 137.39 137.39 3 0.021252 133713 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.382 38.52 68716000 31074000 0 0 0 0 0 0 0 0 37642000 0 0 0 26776 2002 25170 245075;245076 313465;313466 313466 2 LGPSDYFGEIALLMNRPR Unmodified 2048.0513 0.051330649 2002 P10644 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 155.93 155.93 3 9.8582E-18 161938 QUIQUE_C1218_190116_001 126.63 115.25 3269700000 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2;3 1.798E-31 44996 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.72 141.42 7021900000 346630000 370330000 518140000 346670000 398760000 378960000 256910000 601140000 768310000 667470000 901860000 698780000 767940000 26793 2288 25184 245171;245172;245173;245174;245175;245176;245177;245178;245179;245180;245181;245182;245183;245184;245185;245186;245187;245188;245189;245190;245191;245192;245193;245194;245195 313581;313582;313583;313584;313585;313586;313587;313588;313589;313590;313591;313592;313593;313594;313595;313596;313597;313598;313599;313600;313601;313602;313603;313604;313605;313606;313607;313608;313609;313610 313601 1670 29 LGQSDPAPLQHQMDIYQK Unmodified 2068.0048 0.004774387 2288 P29401;A0A0B4J1R6;E9PFF2 TKT Transketolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 68.475 68.475 2;3 1.0918E-53 68057 QUIQUE_C1277_190116_001 205.28 186.66 21743000000 2113400000 1817800000 2193800000 2207300000 1527900000 1612200000 1568700000 1362000000 1861500000 698050000 1750400000 1563100000 1466900000 26794 2288 25184 245196;245197;245198;245199;245200;245201;245202;245203;245204;245205;245206;245207;245208;245209;245210;245211;245212;245213;245214;245215;245216;245217;245218;245219;245220;245221 313611;313612;313613;313614;313615;313616;313617;313618;313619;313620;313621;313622;313623;313624;313625;313626;313627;313628;313629;313630;313631;313632;313633;313634;313635;313636;313637;313638;313639;313640;313641;313642;313643;313644;313645 313616 35 LGQSESQGPPR Unmodified 1154.568 0.56799978 1390 O00233;J3KN29;F5H5V4;F5GX23;F5H169 PSMD9 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9 yes no 0 0 0 1 15.359 15.359 2 1.5367E-05 7794 QUIQUE_DMIX8_190116_001 142.04 111.31 26654000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26654000 26795 1390 25185 245222 313646;313647 313647 2 LGQSVTTIPTVGFNVETVTYK Unmodified 2253.1893 0.18926392 2753 P62330 ARF6 ADP-ribosylation factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 1 128.21 128.21 2;3 5.7432E-08 134133 QUIQUE_C1438_190116_001 117.4 80.553 847870000 45612000 46538000 64905000 53379000 44289000 0 65558000 102520000 152720000 50000000 98230000 60448000 63660000 26796 2753 25186 245223;245224;245225;245226;245227;245228;245229;245230;245231;245232;245233;245234;245235;245236;245237 313648;313649;313650;313651;313652;313653;313654;313655;313656;313657;313658;313659;313660;313661;313662;313663 313652 16 LGQTPFDVADEGLVEHLELLQK Unmodified 2450.2693 0.26930515 1563 O60237;H7C4R6 PPP1R12B Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.43 150.43 3 1.9416E-08 153289 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.762 78.113 286280000 28198000 21299000 39155000 32042000 43411000 13896000 0 31832000 41383000 0 0 35067000 0 26797 1563 25187 245238;245239;245240;245241;245242;245243;245244;245245;245246 313664;313665;313666;313667;313668;313669;313670;313671;313672 313670 8 LGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQK Unmodified 3304.5663 0.56633461 985 F2Z357;J3KPC5;P47736;A0A0A0MQY8;X6R8W7 RAP1GAP Rap1 GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 172.97 172.97 3 0.00022777 176727 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.828 37.453 24135000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24135000 0 26798 985 25188 245247 313673 313673 0 LGQYASPTAK Unmodified 1034.5397 0.53965977 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 21.232 21.232 2 0.0093783 14876 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.332 27.463 92967000 0 0 0 0 70584000 0 0 22383000 0 0 0 0 0 26799 290;327;328 25189 245248;245249;245250 313674;313675;313676 313675 3 LGRPTLSSEVGIIICDIANPASLDEMAK Unmodified 2969.5202 0.52019324 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 164.98 164.98 3 1.0279E-23 167138 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.123 94.427 518100000 0 0 37801000 25874000 0 0 104190000 103050000 68444000 0 67235000 111520000 0 26800 3629 25190 245251;245252;245253;245254;245255;245256;245257 313677;313678;313679;313680;313681;313682;313683;313684;313685 313680 8 LGRPTLSSEVGIIICDIANPASLDEMAK Oxidation (M) 2985.5151 0.51510786 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 1 1 1 158.63 158.63 3 2.7091E-05 163128 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.674 47.187 26910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26910000 0 26801 3629 25190 245258 313686 313686 2703 1 LGSAADFLLDISETDLSSLTASIK Unmodified 2466.2741 0.27411576 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 174.63 174.63 3 7.55E-07 178639 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.853 59.66 27174000 0 0 0 0 0 0 0 5541100 21633000 0 0 0 0 26802 1628 25191 245259;245260 313687;313688 313688 2 LGSAHSEAENGVEEK Unmodified 1555.7114 0.71142914 906 E9PD09;Q96HH9;D6RFH3;D6R9P9 GRAMD3 GRAM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 2 16.325 16.325 3;4 0.046297 8444 QUIQUE_DMIX5_190116_001 19.271 0.85807 336340000 0 0 0 0 66062000 0 0 25889000 0 0 244390000 0 0 26803 906 25192 245261;245262;245263;245264 313689;313690;313691;313692 313691 4 LGSAMIGGFAGR Unmodified 1135.5808 0.58081308 140 A0A0A0MR39;Q9P2K5;A0A087WUT0 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 1 74.402 74.402 2 0.004044 74898 QUIQUE_C1277_190116_001 72.325 52.539 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26804 140 25193 245265;245266 313693;313694 313693 2 LGSAPEVLLVR Unmodified 1152.6867 0.68665836 1631 O75382;A0A1W2PPI7 TRIM3 Tripartite motif-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.105 83.105 2 0.0014915 85153 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.213 24.967 732040000 57322000 53176000 68230000 56053000 57056000 52781000 78859000 45990000 40888000 21668000 69768000 58601000 71653000 26805 1631 25194 245267;245268;245269;245270;245271;245272;245273;245274;245275;245276;245277;245278;245279 313695;313696;313697;313698;313699;313700;313701;313702;313703;313704;313705;313706;313707 313705 13 LGSAVVTR Unmodified 801.47085 0.47085192 2650 P54886 ALDH18A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase;Glutamate 5-kinase;Gamma-glutamyl phosphate reductase yes yes 0 0 0 1 19.172 19.172 2 0.013541 11643 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.181 26.823 16433000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16433000 0 0 0 26806 2650 25195 245280 313708 313708 1 LGSEGEDLIR Unmodified 1087.551 0.55095274 2459 P43007 SLC1A4 Neutral amino acid transporter A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 51.463 51.463 2 0.0062278 49629 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.941 21.188 229860000 0 73773000 0 0 0 0 0 0 91427000 0 0 0 64663000 26807 2459 25196 245281;245282;245283;245284;245285;245286;245287 313709;313710;313711;313712;313713;313714;313715 313713 7 LGSFGSITR Unmodified 936.50288 0.50288033 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 51.345 51.345 2 0.033312 49083 QUIQUE_C1403_190116_001 55.37 25.994 47083000 0 0 0 47083000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26808 3061 25197 245288 313716 313716 1 LGSFHELLLEPPKK Unmodified 1606.9083 0.90827845 952 H7BXH2;E9PKF6;Q5H9R7 PPP6R3 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3 yes no 0 0 1 1 70.055 70.055 4 0.030389 70266 QUIQUE_C1218_190116_001 20.279 8.3634 16018000 16018000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26809 952 25198 245289 313717 313717 1 LGSGDDISVFVIPLGGPGSYS Unmodified 2036.0102 0.01023692 3275 Q5JR12 PPM1J Protein phosphatase 1J yes yes 0 0 0 1 169.92 169.92 2 0.0066605 163713 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.14 54.229 4442400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4442400 0 0 0 26810 3275 25199 245290 313718 313718 1 LGSGDDISVYVIPLIHGNK Unmodified 1996.0629 0.062941193 4493 Q9ULR3 PPM1H Protein phosphatase 1H yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 129.5 129.5 2;3 1.5159E-11 134151 QUIQUE_C1368_190116_001 81.346 71.558 586390000 104400000 104540000 72246000 0 93876000 85770000 90617000 0 0 34940000 0 0 0 26811 4493 25200 245291;245292;245293;245294;245295;245296;245297;245298 313719;313720;313721;313722;313723;313724;313725;313726;313727 313722 9 LGSGPDGEPTIR Unmodified 1197.599 0.59896556 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 1 1 37.41 37.41 2 0.012174 33737 QUIQUE_C1438_190116_001 72.848 34.714 101270000 0 0 0 59264000 42006000 0 0 0 0 0 0 0 0 26812 1877 25201 245299;245300 313728;313729 313729 1 LGSGSVQAALAELVALPCLFTLQPR Unmodified 2610.4203 0.42034326 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 2 3 1 175.23 175.23 2;3;4 5.3874E-143 180164 QUIQUE_C1576_190116_001 212.69 190.84 2015000000 17234000 75609000 11816000 0 52888000 0 493230000 62484000 267200000 0 179570000 767980000 87004000 26813 1436 25202 245301;245302;245303;245304;245305;245306;245307;245308;245309;245310;245311;245312;245313;245314;245315;245316 313730;313731;313732;313733;313734;313735;313736;313737;313738;313739;313740;313741;313742;313743;313744;313745 313735 14 LGSIAIQGAIEK Unmodified 1198.6921 0.69213767 2232 P24752;H0YEL7;E9PRQ6 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 67.824 67.824 2 6.9785E-06 66376 QUIQUE_C1563_190116_001 133.81 86.621 4636300000 457030000 373040000 308350000 350440000 275250000 331680000 296740000 493760000 398780000 278020000 366070000 375160000 332000000 26814 2232 25203 245317;245318;245319;245320;245321;245322;245323;245324;245325;245326;245327;245328;245329;245330;245331 313746;313747;313748;313749;313750;313751;313752;313753;313754;313755;313756;313757;313758;313759;313760;313761;313762;313763;313764;313765;313766;313767;313768;313769 313755 24 LGSIFGLGLAYAGSNR Unmodified 1594.8467 0.84674083 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 134.37 134.37 2;3 6.3249E-05 138820 QUIQUE_DMIX8_190116_001 95.018 76.707 903450000 117990000 142910000 0 136460000 0 99291000 32692000 11285000 144580000 10125000 0 85370000 122740000 26815 2976 25204 245332;245333;245334;245335;245336;245337;245338;245339;245340;245341;245342;245343;245344 313770;313771;313772;313773;313774;313775;313776;313777;313778;313779;313780;313781;313782;313783 313783 14 LGSLIGLIVEEGEDWK Unmodified 1756.9247 0.92471638 1399 O00330;E9PLU0;E9PRI6 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 166.13 166.13 2;3 1.3879E-29 170940 QUIQUE_C1368_190116_001 164.13 103.7 290330000 30522000 14788000 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25207 245361;245362;245363;245364;245365;245366;245367;245368;245369;245370;245371 313804;313805;313806;313807;313808;313809;313810;313811;313812;313813;313814;313815 313811 12 LGSLSER Unmodified 760.40792 0.40791731 1586 O60664 PLIN3 Perilipin-3 yes yes 0 0 0 1 18.504 18.504 2 0.037418 10857 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.357 18.013 17505000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17505000 0 0 0 26819 1586 25208 245372 313816 313816 1 LGSLVDEFK Unmodified 1006.5335 0.53351176 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.184 83.184 2 0.0079449 84146 QUIQUE_C1403_190116_001 80.165 45.358 1669000000 249440000 222490000 288100000 186310000 162650000 0 0 0 134760000 0 264130000 0 161090000 26820 2050 25209 245373;245374;245375;245376;245377;245378;245379;245380 313817;313818;313819;313820;313821;313822;313823;313824;313825 313821 9 LGSLVDEFKELVYPPDYNPEGK Unmodified 2508.2424 0.2424217 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 1 1 152.02 152.02 3 4.2015E-05 157128 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.325 54.333 124980000 0 0 0 0 0 0 0 0 124980000 0 0 0 0 26821 2050 25210 245381 313826 313826 1 LGSLVENNER Unmodified 1129.5728 0.57275081 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.682 28.682 2 0.00017973 23984 QUIQUE_C1218_190116_001 119.86 87.722 1411100000 237500000 0 225370000 0 137270000 107640000 0 0 159300000 129520000 239240000 175230000 0 26822 645 25211 245382;245383;245384;245385;245386;245387;245388;245389 313827;313828;313829;313830;313831;313832;313833;313834 313827 6 LGSMILAFR Unmodified 1006.5634 0.5633721 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.55 101.55 2 0.00012156 104747 QUIQUE_C1368_190116_001 142.64 110.17 275700000 55499000 34062000 36729000 44132000 19241000 21749000 0 0 34034000 0 0 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313906;313907;313908;313909;313910;313911;313912;313913;313914;313915;313916;313917;313918;313919;313920;313921;313922 313907 17 LGSTIFVANLDFK Unmodified 1423.7711 0.77111627 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0;H0YN19 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 1 126.61 126.61 2 0.025888 133198 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.342 66.706 74347000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43275000 31072000 0 26833 140 25222 245468;245469 313923;313924 313923 1 LGSTVFVANLDYK Unmodified 1425.7504 0.75038083 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R019;M0R2T0;M0QYQ7 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.982 98.982 2 0.00067018 102286 QUIQUE_C1368_190116_001 100.72 86.952 2813700000 258800000 0 302920000 266620000 247550000 228470000 243350000 0 302970000 130320000 316750000 272920000 243070000 26834 2603 25223 245470;245471;245472;245473;245474;245475;245476;245477;245478;245479;245480 313925;313926;313927;313928;313929;313930;313931;313932;313933;313934;313935;313936;313937 313926 12 LGSVGQLSTTDLTGGTFTLSNIGSIGGTFAK Unmodified 2999.5451 0.54514566 2014 P11182 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 157.7 157.7 3 4.7374E-07 152526 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.895 49.391 20338000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20338000 0 0 0 26835 2014 25224 245481 313938 313938 1 LGSVSLIPLR Unmodified 1053.6546 0.65462995 3914 Q96P48;E7EU13;A0A0A0MSJ2;F5GWQ2;H0YGD1 ARAP1 Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 94.095 94.095 2 0.0080808 96072 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.23 48.075 45213000 0 0 0 0 0 0 10494000 13951000 14076000 6691600 0 0 0 26836 3914 25225 245482;245483;245484;245485 313939;313940;313941;313942 313941 4 LGSWLAIR Unmodified 914.53379 0.53378653 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.852 89.852 2 0.0036762 91569 QUIQUE_C1368_190116_001 120.52 89.853 503510000 43391000 51890000 62830000 57262000 0 46858000 70753000 59329000 0 33400000 0 77799000 0 26837 1074 25226 245486;245487;245488;245489;245490;245491;245492;245493;245494 313943;313944;313945;313946;313947;313948;313949;313950;313951;313952 313946 8 LGTAEIEDAIADHPAVPESAVIGYPHDIK Unmodified 3027.5189 0.51893091 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 122.7 122.7 4 1.6506E-24 126500 QUIQUE_C1277_190116_001 93.949 88.662 1697100000 288390000 362330000 0 0 0 0 244250000 86781000 193890000 0 330160000 191250000 0 26838 4296 25227 245495;245496;245497;245498;245499;245500;245501 313953;313954;313955;313956;313957;313958;313959 313954 7 LGTAMSHEIR Unmodified 1113.5601 0.56007764 2345 P32004;E7EVM4;E7EPI4 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes no 0 0 0 1 20.765 20.765 3 0.060678 13960 QUIQUE_C1438_190116_001 48.44 26.354 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26839 2345 25228 245502 313960 313960 1 LGTDDTVMK Oxidation (M) 994.46411 0.46411156 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.848 17.848 2 0.0092027 10566 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.684 60.202 673140000 89105000 0 80537000 40364000 59469000 81176000 47371000 46186000 77494000 0 71750000 79691000 0 26840 1678 25229 245503;245504;245505;245506;245507;245508;245509;245510;245511;245512 313961;313962;313963;313964;313965;313966;313967;313968;313969;313970;313971;313972 313970 916 12 LGTDDTVMK Unmodified 978.4692 0.46919694 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 30.369 30.369 2 0.012404 24727 QUIQUE_C1563_190116_001 71.379 35.194 1039700000 0 266850000 0 0 0 217010000 0 159330000 207540000 0 0 188920000 0 26841 1678 25229 245513;245514;245515;245516;245517 313973;313974;313975;313976;313977 313974 4 LGTDEISPR Unmodified 986.50327 0.50327426 1014 F5H6E2;O00159 MYO1C Unconventional myosin-Ic yes no 0 0 0 1 34.343 34.343 2 0.029001 29460 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313992;313993;313994;313995;313996;313997;313998;313999;314000;314001;314002;314003;314004;314005;314006;314007;314008;314009;314010;314011;314012;314013;314014;314015;314016;314017;314018;314019;314020;314021;314022;314023;314024;314025;314026;314027;314028;314029;314030;314031;314032;314033;314034;314035;314036;314037;314038;314039;314040;314041;314042;314043 314005 51 LGTGGFGNVIR Unmodified 1089.5931 0.59309232 1457 O14920;G3V105;E5RGW5;J3KNS5;E5RJH2;E5RGA0;E5RIW0;E5RFT3;E5RFG5 IKBKB Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.839 67.839 2 0.037441 67617 QUIQUE_C1576_190116_001 48.423 27.724 88833000 0 0 15170000 19140000 0 0 24438000 18010000 0 12075000 0 0 0 26847 1457 25234 245558;245559;245560;245561;245562 314044;314045;314046;314047;314048 314046 5 LGTGNYDVMTPMVDILMKLFR 2 Oxidation (M) 2445.2106 0.21060976 1273 J3KSW2;J3KQ09;X6R2I3;Q9UNA4 POLI DNA polymerase iota yes no 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 108.93 108.93 3 0.0005036 112473 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0.928958 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 160.32 160.32 4 1.4219E-54 163283 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.71 103.57 529250000 0 49293000 0 0 56750000 129080000 109710000 109480000 0 0 0 0 74949000 26850 2472 25237 245586;245587;245588;245589;245590;245591 314079;314080;314081;314082;314083;314084;314085 314084 1898;1899 7 LGTNMYSVNQPVETHVSGSSK Unmodified 2234.0637 0.063745829 3705 Q8WVF1;C9JF58 OSCP1 Protein OSCP1 no no 0 0 0 1 1 56.299 56.299 3 0.0024128 55118 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.476 26.791 85600000 0 0 41043000 0 0 0 0 0 0 0 0 44557000 0 26851 3705 25238 245592;245593 314086;314087 314087 2 LGTNVESVLQAIIER Unmodified 1640.9097 0.90973501 3586 Q8N442 GUF1 Translation factor GUF1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 157.74 157.74 2 1.0409E-05 162320 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.66 61.121 105400000 18132000 0 33671000 18018000 0 0 0 0 25590000 9991600 0 0 0 26852 3586 25239 245594;245595;245596;245597;245598 314088;314089;314090;314091;314092 314091 4 LGTPQQIAIAR Unmodified 1166.6772 0.6771563 882;3442 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576;H0YL50 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.731 53.731 2 0.00050975 51477 QUIQUE_C1403_190116_001 130.75 72.788 2219800000 215660000 203270000 205060000 184130000 201270000 121250000 193330000 186940000 204260000 80038000 0 196940000 227620000 26853 882;3442 25240 245599;245600;245601;245602;245603;245604;245605;245606;245607;245608;245609;245610 314093;314094;314095;314096;314097;314098;314099;314100;314101;314102;314103;314104;314105;314106;314107;314108;314109;314110;314111 314097 17 LGTQEYLQQLESHMK Unmodified 1803.8825 0.88253399 3379 Q6P2E9;I3L2F4 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes no 0 0 0 1 105.51 105.51 3 0.05821 108562 QUIQUE_C1277_190116_001 28.549 24.799 35985000 0 35985000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26854 3379 25241 245611 314112 314112 1 LGTQTFCSR Unmodified 1068.5022 0.50222841 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.206 30.206 2 0.0037409 24802 QUIQUE_C1576_190116_001 90.601 63.999 298070000 34034000 35063000 52723000 36771000 0 0 46742000 42221000 0 0 0 50519000 0 26855 4014 25242 245612;245613;245614;245615;245616;245617;245618 314113;314114;314115;314116;314117;314118;314119;314120 314117 8 LGTQTVPCNK Unmodified 1116.5597 0.55974328 2283 P28907;H0Y950 CD38 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.484 19.484 2 0.0008555 12115 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.14 62.012 1847900000 272350000 387390000 0 509770000 0 0 0 207220000 389260000 81886000 0 0 0 26856 2283 25243 245619;245620;245621;245622;245623;245624 314121;314122;314123;314124;314125;314126 314126 2 LGTSAEGAHLR Unmodified 1110.5782 0.57817054 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.354 17.354 3 0.0015637 9422 QUIQUE_C1277_190116_001 76.143 59.2 749090000 117220000 68106000 0 57540000 82737000 73686000 70777000 54794000 43173000 29913000 0 61930000 89208000 26857 3102 25244 245625;245626;245627;245628;245629;245630;245631;245632;245633;245634;245635 314127;314128;314129;314130;314131;314132;314133;314134;314135;314136;314137;314138 314128 7 LGTSDATGSLQGDSMTETVAENIVTSILK Unmodified 2937.4489 0.44886202 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 170.31 170.31 2;3 1.281E-108 174564 QUIQUE_DMIX3_190116_001 237.31 225.39 1298400000 73118000 85948000 92545000 168650000 74659000 219550000 63185000 153460000 25730000 23558000 196160000 111620000 10246000 26858 16;1475 25245 245636;245637;245638;245639;245640;245641;245642;245643;245644;245645;245646;245647;245648;245649;245650 314139;314140;314141;314142;314143;314144;314145;314146;314147;314148;314149;314150;314151;314152;314153 314148 15 LGTSDATGSLQGDSMTETVAENIVTSILK Oxidation (M) 2953.4438 0.44377664 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 1 0 1 165.5 165.5 3 0.00012043 159773 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.554 36.978 18619000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18619000 0 0 0 26859 16;1475 25245 245651 314154 314154 11 1 LGTTNYDDFLSFIHAVQDR Unmodified 2211.0596 0.059646729 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.84 151.84 3 4.2932E-23 154711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.31 112.12 1248900000 40212000 63831000 131330000 83313000 93314000 85477000 127750000 89899000 128840000 35768000 115590000 134600000 118970000 26860 506 25246 245652;245653;245654;245655;245656;245657;245658;245659;245660;245661;245662;245663;245664 314155;314156;314157;314158;314159;314160;314161;314162;314163;314164;314165;314166;314167;314168;314169 314164 15 LGVAGQWR Unmodified 885.48209 0.48208531 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974;D6RF53 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.677 45.677 2 0.00017658 42643 QUIQUE_C1277_190116_001 163.34 116.3 83402000000 6398000000 7030000000 6439600000 6296900000 5917100000 5450000000 7261200000 5242700000 6536000000 2202800000 8027700000 7248200000 9352000000 26861 1976 25247 245665;245666;245667;245668;245669;245670;245671;245672;245673;245674;245675;245676;245677 314170;314171;314172;314173;314174;314175;314176;314177;314178;314179;314180;314181;314182;314183;314184;314185;314186;314187;314188;314189;314190;314191 314173 21 LGVDISATK Unmodified 902.5073 0.50729701 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 43.846 43.846 2 0.004515 38808 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.819 55.081 148440000 41037000 33497000 0 0 0 28956000 0 0 0 44948000 0 0 0 26862 4284 25248 245678;245679;245680;245681 314192;314193;314194;314195;314196;314197 314197 6 LGVDTIAK Unmodified 815.47527 0.4752686 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.089 40.089 2 0.0081619 36831 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Unmodified 2618.2105 0.21048642 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 111.89 111.89 2;3 8.9001E-35 117019 QUIQUE_C1218_190116_001 133.71 122.1 2041100000 0 44327000 759730000 45630000 0 43456000 764350000 0 0 0 383620000 0 0 26867 2146 25253 245733;245734;245735;245736;245737;245738;245739;245740;245741;245742 314253;314254;314255;314256;314257;314258;314259;314260;314261;314262;314263;314264 314253 10 LGVFSEMEANFK Unmodified 1370.654 0.6540376 1527 O43427;H0YCE7;E9PSD3 FIBP Acidic fibroblast growth factor intracellular-binding protein yes no 0 0 0 1 1 120.43 120.43 2 0.0038918 123232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.067 58.86 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26868 1527 25254 245743;245744 314265;314266 314266 2 LGVGAATHVVIYDASDQGLYSAPR Unmodified 2459.2445 0.24448739 2238 P25325;B1AH49 MPST 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase;Sulfurtransferase yes no 0 0 0 1 103.56 103.56 3 0.019857 105118 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.466 19.451 36484000 0 0 0 0 0 0 0 36484000 0 0 0 0 0 26869 2238 25255 245745 314267 314267 0 LGVGVYPVK Unmodified 930.55385 0.55385327 4080 Q9BZ71 PITPNM3 Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3 yes yes 0 0 0 1 57.337 57.337 2 0.047518 56443 QUIQUE_C1218_190116_001 51.43 20.868 14191000 14191000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26870 4080 25256 245746 314268 314268 1 LGVHCITGQK Unmodified 1111.5808 0.58081308 3683 Q8TDC3;K7EN26 BRSK1 Serine/threonine-protein kinase BRSK1 yes no 0 0 0 1 1 20.512 20.512 2;3 0.0268 12840 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.081 31.785 33751000 33751000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26871 3683 25257 245747;245748 314269;314270 314270 2 LGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLK Unmodified 3667.8028 0.80279088 1775 P00338 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes yes 0 0 0 3 3 3 3 1 2 3 3 4 1 3 3 3 127.28 127.28 3;4;5 7.7493E-76 133223 QUIQUE_C1218_190116_001 147.54 137.15 13161000000 596900000 1192700000 1278000000 1765300000 292240000 521510000 1130200000 826670000 1079900000 48773000 1732900000 1172200000 1523700000 26872 1775 25258 245749;245750;245751;245752;245753;245754;245755;245756;245757;245758;245759;245760;245761;245762;245763;245764;245765;245766;245767;245768;245769;245770;245771;245772;245773;245774;245775;245776;245777;245778;245779;245780;245781;245782;245783 314271;314272;314273;314274;314275;314276;314277;314278;314279;314280;314281;314282;314283;314284;314285;314286;314287;314288;314289;314290;314291;314292;314293;314294;314295;314296;314297;314298;314299;314300;314301;314302;314303;314304;314305;314306;314307;314308;314309;314310;314311;314312;314313;314314;314315;314316;314317;314318;314319;314320;314321;314322;314323;314324 314275 54 LGVHPLSCHGWVLGEHGDSSVPVWSGMNVAGVSLK Oxidation (M) 3683.7977 0.7977055 1775 P00338 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 114.35 114.35 3;5 1.3065E-65 118620 QUIQUE_C1368_190116_001 132.42 122.71 653910000 38982000 75214000 58729000 0 0 0 0 0 0 0 329580000 151400000 0 26873 1775 25258 245784;245785;245786;245787;245788;245789 314325;314326;314327;314328;314329;314330;314331 314328 967 6 LGVIEDHSNR Unmodified 1138.5731 0.57308516 2079 P14625;Q58FF3 HSP90B1;HSP90B2P Endoplasmin;Putative endoplasmin-like protein yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 19.134 19.134 2;3 7.2911E-05 11664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.8 107.9 10920000000 1069600000 427440000 987260000 394860000 1201300000 1083700000 1221200000 667370000 942960000 449140000 1473200000 290490000 711620000 26874 2079 25259 245790;245791;245792;245793;245794;245795;245796;245797;245798;245799;245800;245801;245802;245803;245804;245805;245806;245807;245808;245809;245810;245811 314332;314333;314334;314335;314336;314337;314338;314339;314340;314341;314342;314343;314344;314345;314346;314347;314348;314349;314350;314351;314352;314353;314354 314351 14 LGVIGFAGLIGLLLAR Unmodified 1581.997 0.99703388 1229 H7C1U8;Q9BUR5;A0A0J9YWW6;A0A0J9YXS4 APOO Apolipoprotein O yes no 0 0 0 1 1 1 176.19 176.19 2 0.0021401 183187 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.763 80.503 167540000 0 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314361;314362;314363;314364;314365;314366;314367;314368;314369;314370;314371;314372;314373;314374;314375;314376;314377;314378 314369 15 LGVLLLWR Unmodified 968.61712 0.61712223 3937 Q96RY7 IFT140 Intraflagellar transport protein 140 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 131.58 131.58 2 0.041284 136199 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.163 62.228 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26878 3937 25263 245835;245836;245837 314379;314380;314381 314380 3 LGVLYWK Unmodified 877.50617 0.5061748 4040 Q9BV57 ADI1 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.75 88.75 2 0.043299 90451 QUIQUE_C1403_190116_001 80.377 64.21 253120000 0 0 32327000 28867000 19139000 22812000 0 28486000 30706000 0 24958000 29363000 36463000 26879 4040 25264 245838;245839;245840;245841;245842;245843;245844;245845;245846 314382;314383;314384;314385;314386;314387;314388;314389;314390;314391 314384 10 LGVMFPSLDTLVLANNHLNAIEEPDDSLAR Unmodified 3263.6496 0.64962751 3286 Q5QJ74;E9PNS0;A0A2R8YFB7 TBCEL Tubulin-specific chaperone cofactor E-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 160.04 160.04 3 0.0020217 162134 QUIQUE_C1563_190116_001 29.61 24.123 157420000 0 0 0 36031000 38159000 40406000 0 0 0 42828000 0 0 0 26880 3286 25265 245847;245848;245849;245850 314392;314393;314394;314395 314394 4 LGVNDCVLR Unmodified 1044.5386 0.53861391 3279 Q5JUW8;Q92796 DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 52.986 52.986 2 0.042086 51093 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.937 27.638 96991000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43291000 0 53700000 26881 3279 25266 245851;245852 314396;314397 314397 2 LGVNNISGIEEVNMFTNQGTVIHFNNPK Unmodified 3085.5291 0.52911844 2162 P20290 BTF3 Transcription factor BTF3 yes yes 0 0 0 1 135.85 135.85 3 6.0907E-09 143004 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.16 53.644 62090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62090000 0 0 26882 2162 25267 245853 314398 314398 1 LGVNNNQGVNIFNYQVATK Unmodified 2092.0702 0.070151836 4390 Q9P2R3;K7EPT2 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.77 109.77 2 4.1895E-86 113017 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314453;314454;314455;314456;314457;314458;314459;314460;314461;314462;314463;314464;314465;314466;314467;314468;314469;314470;314471;314472;314473;314474;314475;314476;314477;314478;314479;314480 314473 21 LGVRPSQGGEAPR Unmodified 1322.7055 0.70549632 1833 P02751 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes yes 0 0 1 1 1 16.554 16.554 3 0.023245 8949 QUIQUE_C1438_190116_001 61.423 38.948 117180000 0 0 0 0 75364000 41818000 0 0 0 0 0 0 0 26889 1833 25274 245924;245925 314481;314482 314481 1 LGVSANLPEEQLGALLAGMHTLLQQALR Unmodified 2942.6012 0.60116117 944 E9PJE4;Q9GZQ3;H0YEQ6 COMMD5 COMM domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 174.55 174.55 3 6.7551E-16 181745 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.216 70.566 75117000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75117000 0 0 26890 944 25275 245926 314483 314483 1 LGVSCEVIDLR Unmodified 1259.6544 0.65437195 2188 P21953 BCKDHB 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.35 90.35 2 0.0004357 93129 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314498;314499;314500;314501;314502;314503;314504;314505;314506;314507;314508;314509;314510;314511;314512;314513 314509 14 LGVTVLSR Unmodified 843.5178 0.51780212 1659 O75828 CBR3 Carbonyl reductase [NADPH] 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 49.298 49.298 2 1.7132E-21 47402 QUIQUE_DMIX1_190116_001 197.6 0 18757000000 1092800000 1178200000 1381300000 1320700000 1673000000 1388100000 1379900000 1599800000 1764900000 993960000 1682000000 1469100000 1832900000 26893 1659 25278 245955;245956;245957;245958;245959;245960;245961;245962;245963;245964;245965;245966;245967;245968 314514;314515;314516;314517;314518;314519;314520;314521;314522;314523;314524;314525;314526;314527;314528;314529;314530;314531;314532;314533;314534;314535;314536;314537;314538;314539 314528 26 LGVVYFLQYIR Unmodified 1369.7758 0.77580772 4409 Q9UBV2 SEL1L Protein sel-1 homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.64 151.64 2 0.00048076 156476 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.66 63.461 37589000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18730000 18859000 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314575;314576;314577;314578;314579;314580;314581;314582;314583;314584;314585;314586;314587;314588;314589;314590;314591;314592;314593;314594;314595;314596;314597;314598;314599;314600;314601;314602;314603;314604;314605;314606;314607 314605 26 LGWFDCQK Unmodified 1052.475 0.47495102 4447 Q9UIA9;E7ESC6;H0YBE1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 78.976 78.976 2 0.019543 79027 QUIQUE_C1403_190116_001 78.178 42.545 80785000 29184000 24752000 0 26849000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26898 4447 25283 246025;246026;246027;246028;246029 314608;314609;314610;314611;314612 314610 5 LGWFDCQKDDYVFR Unmodified 1847.8301 0.83010449 4447 Q9UIA9;E7ESC6;H0YBE1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 1 1 116.37 116.37 3 0.0014664 120008 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.588 65.483 24124000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24124000 0 26899 4447 25284 246030 314613 314613 1 LGWSIGPNHLIK Unmodified 1333.7507 0.7506556 3422 Q6YP21 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 83.213 83.213 2;3 0.0031632 85658 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LGYAGNTEPQFIIPSCIAIK Unmodified 2191.1347 0.13472593 2714 P61158 ACTR3 Actin-related protein 3 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 136.74 136.74 2;3 1.1875E-08 142229 QUIQUE_C1218_190116_001 104.55 96.234 3723800000 310630000 358760000 301050000 155140000 397130000 307970000 0 422920000 410330000 179670000 307270000 244110000 328860000 26902 2714 25287 246058;246059;246060;246061;246062;246063;246064;246065;246066;246067;246068;246069;246070;246071;246072;246073;246074;246075;246076;246077 314650;314651;314652;314653;314654;314655;314656;314657;314658;314659;314660;314661;314662;314663;314664;314665;314666;314667;314668;314669;314670 314650 21 LGYAGNTEPQFIIPSCIAIR Unmodified 2219.1409 0.14087394 4374 Q9P1U1 ACTR3B Actin-related protein 3B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.68 138.68 2 1.9171E-06 142933 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.32 104.44 478830000 37099000 51505000 44007000 37591000 38138000 30547000 39956000 32897000 27763000 0 51359000 44639000 43331000 26903 4374 25288 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LHDPEGMGIIPR Oxidation (M) 1349.6762 0.67617003 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 1 0 1 1 1 1 41.39 41.39 3 0.0055196 37991 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.569 41.423 198660000 0 0 0 0 0 0 0 34987000 45824000 0 0 46573000 71274000 26937 2355 25320 246415;246416;246417;246418 315078;315079;315080;315081 315079 1754 4 LHDPQLMGIIPR Unmodified 1388.7598 0.75984008 1568;2946 O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840 KIF5C;KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.556 83.556 3 0.0022918 85376 QUIQUE_C1576_190116_001 47.429 36.11 261220000 40245000 24007000 30232000 0 28064000 30357000 41349000 0 0 8272000 22596000 17057000 19041000 26938 1568;2946 25321 246419;246420;246421;246422;246423;246424;246425;246426;246427;246428 315082;315083;315084;315085;315086;315087;315088;315089;315090;315091 315087 9 LHDPQLMGIIPR Oxidation (M) 1404.7548 0.7547547 1568;2946 O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840 KIF5C;KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A no no 0 1 0 1 66.711 66.711 3 0.019513 66234 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.218 30.959 78452000 0 0 0 0 0 0 0 0 78452000 0 0 0 0 26939 1568;2946 25321 246429 315092 315092 1 LHDSISEEGFHYLVFDLVTGGELFEDIVAR Unmodified 3406.6721 0.67213709 412;3010;3299;896;803 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;E7EQE4;A0A2Q3DQE3;Q13555;Q5SWX3;Q13554;H7BXS4;E9PBE8;E7ETC9 CAMK2D;CAMK2B;CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 0 1 174.51 174.51 4 1.4154E-31 181617 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.27 96.947 79079000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79079000 0 0 26940 803;896;412;3299;3010 25322 246430 315093 315093 1 LHDSISEEGHHYLIFDLVTGGELFEDIVAR Unmodified 3410.6783 0.6782851 4533 Q9UQM7 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes yes 0 0 0 3 164.06 164.06 4;5 3.9097E-08 172115 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.55 48.231 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Unmodified 2445.2117 0.2117307 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 2 1 1 2 113.31 113.31 3;4 8.9633E-24 116770 QUIQUE_DMIX3_190116_001 133.93 120.06 1643200000 133960000 66641000 146620000 75125000 244490000 45909000 69836000 172130000 196140000 57801000 157580000 82272000 194660000 26946 2008 25328 246474;246475;246476;246477;246478;246479;246480;246481;246482;246483;246484;246485;246486;246487;246488;246489;246490;246491;246492;246493;246494 315140;315141;315142;315143;315144;315145;315146;315147;315148;315149;315150;315151;315152;315153;315154;315155;315156;315157;315158;315159;315160;315161;315162;315163;315164;315165;315166;315167;315168;315169;315170;315171;315172;315173;315174;315175 315165 36 LHEAVFLR Unmodified 983.55525 0.55525025 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 1 37.311 37.311 2 0.0071426 32984 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.139 57.637 70902000 0 0 0 0 0 0 0 0 51559000 19343000 0 0 0 26947 2885 25329 246495;246496 315176;315177 315176 2 LHEDDKEQDIADK Unmodified 1554.7162 0.71618016 2654 P55011;G3XAL9 SLC12A2 Solute carrier family 12 member 2 yes no 0 0 1 1 1 1 14.531 14.531 3 0.002 6816 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.507 73.284 93260000 0 0 0 0 0 0 0 0 47685000 0 45575000 0 0 26948 2654 25330 246497;246498;246499 315178;315179;315180 315180 1 LHEEEIQELQAQIQEQHVQIDVDVSKPDLTAALR Unmodified 3922.0072 0.0072238131 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 1 8 7 7 8 9 8 11 8 16 4 15 7 4 140.74 140.74 3;4;5 0 138654 QUIQUE_C1277_190116_001 251.9 244.03 68411000000 2306400000 5648100000 4879400000 6152700000 5867000000 4352700000 7470600000 5919200000 7468700000 521210000 7205700000 5422600000 5196400000 26949 1952 25331 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32.015 32.015 2;3 0.0019399 26319 QUIQUE_C1368_190116_001 98.523 73.629 424830000 0 48312000 81258000 67460000 47227000 0 0 47960000 65830000 15769000 0 51018000 0 26950 2254 25332 246612;246613;246614;246615;246616;246617;246618;246619;246620;246621 315305;315306;315307;315308;315309;315310;315311;315312;315313;315314 315308 9 LHEENFEITTLR Unmodified 1500.7573 0.75725712 3923 Q96Q11 TRNT1 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 69.908 69.908 2;3 0.00088679 70764 QUIQUE_C1218_190116_001 73.273 60.155 77812000 20885000 0 0 27485000 0 0 29442000 0 0 0 0 0 0 26951 3923 25333 246622;246623;246624;246625;246626;246627;246628;246629 315315;315316;315317;315318;315319;315320;315321;315322 315315 7 LHEICCSWVK Unmodified 1330.6162 0.61621231 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 46.146 46.146 2;3 9.1207E-31 43630 QUIQUE_C1277_190116_001 203.35 169.26 2140200000 113190000 256210000 187290000 159530000 171560000 133820000 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Unmodified 1768.8519 0.85194536 3438 Q7L266 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 141.26 141.26 2 5.131E-66 146517 QUIQUE_C1368_190116_001 198.58 178.2 2271500000 166640000 150750000 173260000 159370000 149180000 171170000 119670000 272150000 219940000 103660000 255850000 165270000 164580000 26959 3438 25339 246915;246916;246917;246918;246919;246920;246921;246922;246923;246924;246925;246926;246927;246928 315783;315784;315785;315786;315787;315788;315789;315790;315791;315792;315793;315794;315795;315796;315797;315798;315799;315800;315801;315802;315803;315804;315805;315806;315807;315808;315809;315810;315811;315812;315813 315787 31 LHGAWTLHEDPR Unmodified 1430.7055 0.70549632 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 1 32.165 32.165 3 0.0022044 26627 QUIQUE_C1368_190116_001 45.764 38.562 138920000 0 40204000 98719000 0 0 0 0 0 0 0 0 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246963;246964;246965;246966;246967;246968;246969;246970;246971;246972;246973;246974;246975;246976;246977 315862;315863;315864;315865;315866;315867;315868;315869;315870;315871;315872;315873;315874;315875;315876 315866 13 LHGSPGHAFTLVGR Unmodified 1447.7684 0.76843093 3563 Q8N0W3 FUK L-fucose kinase yes yes 0 0 0 1 1 33.391 33.391 3 0.015884 28886 QUIQUE_C1277_190116_001 38.376 26.23 40191000 0 0 0 0 0 0 40191000 0 0 0 0 0 0 26965 3563 25345 246978;246979 315877;315878 315877 2 LHGVNINVEASK Unmodified 1279.6884 0.68844927 4055 Q9BWF3;E9PB51;D6R9K7;J3QRR5 RBM4 RNA-binding protein 4 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 34.735 34.735 3 0.0011109 28775 QUIQUE_C1368_190116_001 63.473 55.066 60140000 30922000 0 0 0 0 29218000 0 0 0 0 0 0 0 26966 4055 25346 246980;246981;246982;246983;246984;246985 315879;315880;315881;315882;315883;315884 315880 6 LHHELENVEEKR Unmodified 1531.7743 0.77430417 947 E9PJP2;Q5TF21 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 13.453 13.453 4 0.00010006 5841 QUIQUE_C1576_190116_001 113.61 92.052 148710000 15317000 1974200 0 0 27530000 0 36580000 0 0 0 52225000 15086000 0 26967 947 25347 246986;246987;246988;246989;246990;246991 315885;315886;315887;315888;315889;315890 315888 3 LHHVSSLAWLDEHTLVTTSHDASVK Unmodified 2782.4038 0.40384158 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 3 2 3 2 3 2 4 3 3 2 3 3 3 74.723 74.723 3;4;5 1.0196E-113 75528 QUIQUE_C1277_190116_001 188.72 174.99 11092000000 575060000 681190000 1118200000 659660000 861680000 550610000 858890000 842150000 1226800000 615770000 1061700000 858630000 1181800000 26968 1609 25348 246992;246993;246994;246995;246996;246997;246998;246999;247000;247001;247002;247003;247004;247005;247006;247007;247008;247009;247010;247011;247012;247013;247014;247015;247016;247017;247018;247019;247020;247021;247022;247023;247024;247025;247026;247027 315891;315892;315893;315894;315895;315896;315897;315898;315899;315900;315901;315902;315903;315904;315905;315906;315907;315908;315909;315910;315911;315912;315913;315914;315915;315916;315917;315918;315919;315920;315921;315922;315923;315924;315925;315926;315927;315928;315929;315930;315931;315932;315933;315934;315935;315936;315937;315938;315939;315940;315941;315942;315943;315944;315945;315946;315947;315948;315949;315950;315951;315952;315953;315954;315955;315956;315957;315958;315959;315960;315961;315962;315963;315964;315965 315899 73 LHIGMENK Unmodified 940.48004 0.4800364 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 20.742 20.742 2 0.013348 13540 QUIQUE_C1277_190116_001 87.435 42.041 71231000 0 71231000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26969 4607 25349 247028 315966 315966 1 LHIIEVGTPPTGNQPFPK Unmodified 1944.0469 0.046897198 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 85.47 85.47 2;3 1.1136E-104 88848 QUIQUE_C1218_190116_001 267.43 253.77 29433000000 2384700000 2798100000 2282400000 1960000000 2719800000 2043700000 2475700000 1911900000 1989700000 871280000 2876700000 2304300000 2814400000 26970 50 25350 247029;247030;247031;247032;247033;247034;247035;247036;247037;247038;247039;247040;247041;247042;247043;247044;247045;247046;247047;247048;247049;247050;247051;247052;247053;247054 315967;315968;315969;315970;315971;315972;315973;315974;315975;315976;315977;315978;315979;315980;315981;315982;315983;315984;315985;315986;315987;315988;315989;315990;315991;315992;315993;315994;315995;315996;315997;315998;315999;316000;316001;316002;316003;316004;316005;316006;316007;316008;316009;316010;316011;316012;316013;316014;316015;316016;316017 315970 51 LHIPWGDNSNQQHGDK Unmodified 1844.8554 0.85540803 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 41.909 41.909 2;3 0.00017245 38919 QUIQUE_C1218_190116_001 96.64 71.204 528510000 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316028;316029;316030;316031;316032;316033;316034;316035;316036;316037;316038 316034 11 LHISDFSFLMVLGK Oxidation (M) 1621.8538 0.85380004 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 1 0 1 1 1 1 142.53 142.53 3 0.00053626 148204 QUIQUE_C1576_190116_001 73.466 66.058 51553000 9075800 0 11771000 11333000 0 0 19373000 0 0 0 0 0 0 26974 1877 25354 247075;247076;247077;247078 316039;316040;316041;316042 316042 1101 3 LHISDFSFLMVLGK Unmodified 1605.8589 0.85888542 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 2 151.94 151.94 2;3 0.0003281 156558 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.324 73.694 28429000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28429000 0 26975 1877 25354 247079;247080 316043;316044 316043 2 LHISMLALEK Unmodified 1153.6529 0.65291539 145 A0A0A0MRE6;O94967;E9PR96;E9PKZ6 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 75.61 75.61 3 0.00053044 76504 QUIQUE_C1277_190116_001 77.192 62.731 38104000 0 15486000 0 0 0 11957000 0 0 0 0 0 10661000 0 26976 145 25355 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316067;316068;316069;316070;316071;316072;316073 316072 7 LHIVQVVCK Unmodified 1094.627 0.62703499 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 1 2 34.562 34.562 2;3 1.3166E-05 30018 QUIQUE_DMIX3_190116_001 173.88 153.36 2370300000 80294000 126900000 142580000 234540000 157150000 170200000 178410000 222550000 237160000 130590000 273880000 137400000 278640000 26979 1395 25358 247107;247108;247109;247110;247111;247112;247113;247114;247115;247116;247117;247118;247119;247120;247121;247122;247123;247124;247125 316074;316075;316076;316077;316078;316079;316080;316081;316082;316083;316084;316085;316086;316087;316088;316089;316090;316091;316092;316093;316094;316095;316096;316097;316098 316087 23 LHIVQVVCKK Unmodified 1222.722 0.72199801 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 20.606 20.606 3 0.0010348 14131 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.645 77.331 75387000 0 0 0 0 0 0 0 47669000 0 0 27719000 0 0 26980 1395 25359 247126;247127 316099;316100 316099 2 LHLDEDYPCSLVGNWNTWYGEQDQAVHLWR Unmodified 3700.6794 0.67936451 3985 Q9BPW8;H7C2U6 NIPSNAP1 Protein NipSnap homolog 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 150.82 150.82 3;4 5.7001E-54 153815 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.35 130.44 1919900000 0 45918000 118480000 0 0 0 138470000 211280000 333110000 0 602210000 249080000 221340000 26981 3985 25360 247128;247129;247130;247131;247132;247133;247134;247135;247136;247137;247138;247139 316101;316102;316103;316104;316105;316106;316107;316108;316109;316110;316111;316112;316113 316105 13 LHLDYIGPCK Unmodified 1214.6118 0.61177885 1964 P09486;F5GY03;E5RK62 SPARC SPARC yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 55.431 55.431 2;3 0.0052075 53970 QUIQUE_C1576_190116_001 112.84 97.2 14547000 0 0 0 0 0 14547000 0 0 0 0 0 0 0 26982 1964 25361 247140;247141;247142;247143;247144;247145;247146;247147 316114;316115;316116;316117;316118;316119;316120;316121 316118 8 LHLEGQQVR Unmodified 1078.5883 0.5883413 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.947 19.947 2;3 0.0079034 12954 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.574 27.271 109000000 0 0 0 0 0 0 0 20394000 31645000 23672000 33286000 0 0 26983 271 25362 247148;247149;247150;247151;247152;247153 316122;316123;316124;316125;316126;316127 316125 5 LHLETDSLALVALGALDTALYAAGSK Unmodified 2612.4061 0.40613299 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 172.46 172.46 3;4 2.5479E-99 176189 QUIQUE_DMIX7_190116_001 128.97 114.45 1482600000 0 45996000 81224000 10142000 62078000 0 174370000 41526000 80458000 0 489160000 352180000 145480000 26984 290;327;328 25363 247154;247155;247156;247157;247158;247159;247160;247161;247162;247163;247164 316128;316129;316130;316131;316132;316133;316134;316135;316136;316137;316138 316137 10 LHLFPDEYIPEDILK Unmodified 1840.9611 0.96110188 4072 Q9BYD1;E5RJI7 MRPL13 39S ribosomal protein L13, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 137.87 137.87 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316247;316248;316249 316248 3 LHLQSTDYGNFLANEASPLTVSVIDDR Unmodified 2974.4672 0.46722969 994 F5GYQ1;P61421;H3BQJ1;H3BQB4;H3BSG7 ATP6V0D1 V-type proton ATPase subunit d 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 140.92 140.92 2;3 7.8915E-284 146259 QUIQUE_C1368_190116_001 340.31 322.83 7428200000 764320000 868020000 742370000 506400000 657360000 555020000 682250000 218830000 381440000 267760000 856920000 513360000 414120000 26999 994 25378 247261;247262;247263;247264;247265;247266;247267;247268;247269;247270;247271;247272;247273;247274;247275;247276;247277;247278;247279 316250;316251;316252;316253;316254;316255;316256;316257;316258;316259;316260;316261;316262;316263;316264;316265;316266;316267;316268;316269;316270;316271;316272;316273;316274;316275 316256 26 LHLSGIDANPNALFPPVEFPAPR Unmodified 2471.2961 0.29612903 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 139.41 139.41 2;3 6.844E-87 146184 QUIQUE_DMIX5_190116_001 222.57 197.64 3208800000 233140000 0 19328000 336120000 269230000 220370000 303610000 308630000 316980000 125580000 435730000 290600000 349480000 27000 2524 25379 247280;247281;247282;247283;247284;247285;247286;247287;247288;247289;247290;247291;247292 316276;316277;316278;316279;316280;316281;316282;316283;316284;316285;316286;316287;316288;316289;316290;316291;316292;316293;316294;316295;316296;316297;316298;316299 316295 23 LHLSSPDNFR Unmodified 1184.5938 0.5938206 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.815 42.815 3 0.00041724 39029 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.287 61.417 242970000 36286000 30951000 0 42382000 0 35861000 0 42569000 0 14780000 0 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N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 64.97 64.97 4 1.4662E-05 65313 QUIQUE_C1277_190116_001 71.535 58.477 122510000 0 67417000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55092000 27008 1440 25387 247344;247345 316362;316363;316364 316363 3 LHNMIVDLDNVVK Unmodified 1508.8021 0.80209882 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 3 1 2 2 3 2 2 2 2 2 1 94.756 94.756 2;3 3.0331E-05 97261 QUIQUE_C1368_190116_001 144.28 109.59 3296100000 352580000 300150000 392270000 172930000 213520000 276740000 316450000 182550000 254940000 97195000 360520000 228460000 147750000 27009 693;3205 25388 247346;247347;247348;247349;247350;247351;247352;247353;247354;247355;247356;247357;247358;247359;247360;247361;247362;247363;247364;247365;247366;247367;247368;247369;247370;247371 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247612;247613;247614;247615;247616;247617;247618;247619;247620;247621;247622;247623;247624;247625;247626;247627;247628;247629;247630;247631;247632;247633;247634;247635;247636;247637;247638;247639;247640;247641 316684;316685;316686;316687;316688;316689;316690;316691;316692;316693;316694;316695;316696;316697;316698;316699;316700;316701;316702;316703;316704;316705;316706;316707;316708;316709;316710;316711;316712;316713;316714;316715;316716;316717;316718;316719;316720;316721;316722;316723;316724;316725 316697 42 LHSQEEDFR Unmodified 1159.5258 0.52580062 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WZF5;A0A087WW92;A0A087WV84 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.52 16.52 2;3 0.016029 9003 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.893 57.807 117260000 0 24537000 11756000 0 0 10858000 0 0 14337000 0 55776000 0 0 27041 3241 25418 247642;247643;247644;247645;247646;247647 316726;316727;316728;316729;316730;316731 316730 6 LHSVLKPQVQK Unmodified 1275.7663 0.76630566 723 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316805 12 LHTFESHKDEIFQVHWSPHNETILASSGTDR Unmodified 3617.7288 0.72875754 3183 Q16576;E9PC52;Q5JP02 RBBP7 Histone-binding protein RBBP7 yes no 0 0 1 1 1 81.84 81.84 4;5 0.001084 84204 QUIQUE_C1576_190116_001 31.78 15.379 103360000 0 0 0 0 0 0 69906000 0 0 0 33457000 0 0 27048 3183 25425 247723;247724 316808;316809 316808 2 LHTLEEEKEELAQYQK Unmodified 1986.9898 0.98983583 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 62.801 62.801 3 0.0030469 62963 QUIQUE_C1218_190116_001 56.872 41.717 172770000 53076000 51704000 0 0 0 0 0 0 0 0 67990000 0 0 27049 4532 25426 247725;247726;247727 316810;316811;316812 316810 3 LHTLGDNLLDPR Unmodified 1362.7256 0.72556306 2665 P55268;F5H520 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 70.868 70.868 2;3 0.00015181 72239 QUIQUE_C1218_190116_001 74.962 57.223 489870000 78994000 86117000 0 0 78261000 0 0 70234000 38371000 0 39761000 98133000 0 27050 2665 25427 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93.345 86.664 514620000 36100000 55882000 59444000 55906000 0 50232000 51341000 0 42494000 13466000 51298000 45457000 53000000 27059 1590 25436 247784;247785;247786;247787;247788;247789;247790;247791;247792;247793;247794 316902;316903;316904;316905;316906;316907;316908;316909;316910;316911;316912;316913;316914;316915 316905 14 LHVVGAPGGQSLSLSLDDLHNFPR Unmodified 2528.3136 0.31357 2591 P51687 SUOX Sulfite oxidase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 116.03 116.03 3;4 4.973E-05 120588 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.27 29.525 197830000 0 0 0 0 38525000 0 0 0 53347000 0 0 34329000 71631000 27060 2591 25437 247795;247796;247797;247798;247799;247800 316916;316917;316918;316919;316920;316921 316917 4 LHYAFQTEGK Unmodified 1192.5877 0.58767259 982;2594 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5;D6RE03;D6RA62;D6R910;D6RHW7;P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17;A0A2R8Y7S9;Q9UK32 RPS6KA2;RPS6KA3;RPS6KA6 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2;Ribosomal protein S6 kinase alpha-3;Ribosomal protein S6 kinase alpha-6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.947 29.947 2;3 0.00028986 24223 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.98 102.45 323530000 31682000 33206000 48164000 37954000 0 0 0 34489000 40156000 14743000 41842000 41290000 0 27061 982;2594 25438 247801;247802;247803;247804;247805;247806;247807;247808;247809 316922;316923;316924;316925;316926;316927;316928;316929;316930 316930 9 LHYGDLTDSTCLVK Unmodified 1620.7818 0.78175731 1583 O60547 GMDS GDP-mannose 4,6 dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 74.568 74.568 3 0.016936 74512 QUIQUE_C1277_190116_001 40.552 27.991 48615000 27344000 21272000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27062 1583 25439 247810;247811 316931;316932 316932 2 LHYGLPVVVK Unmodified 1123.6754 0.67536539 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0;A0A2R8Y815 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 3 4 2 3 2 3 2 1 4 2 2 3 2 62.955 62.955 2;3 0.00026612 63170 QUIQUE_C1277_190116_001 134.66 108.77 7645400000 253450000 325590000 868680000 386120000 740020000 286500000 810110000 181670000 676110000 161100000 1095200000 675940000 1184900000 27063 425 25440 247812;247813;247814;247815;247816;247817;247818;247819;247820;247821;247822;247823;247824;247825;247826;247827;247828;247829;247830;247831;247832;247833;247834;247835;247836;247837;247838;247839;247840;247841;247842;247843;247844 316933;316934;316935;316936;316937;316938;316939;316940;316941;316942;316943;316944;316945;316946;316947;316948;316949;316950;316951;316952;316953;316954;316955;316956;316957;316958;316959;316960;316961;316962;316963;316964;316965;316966;316967;316968;316969;316970;316971 316941 39 LHYGQHGGERPFK Unmodified 1524.7586 0.75859452 884 H0YFS7;E7EW59;Q9Y467 SALL2 Sal-like protein 2 yes no 0 0 1 2 14.247 14.247 3;4 0.0017226 6443 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.563 53.949 15252000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15252000 0 0 27064 884 25441 247845;247846 316972;316973 316973 2 LHYNEGLNIK Unmodified 1199.6299 0.62987176 848 E7EMN6;P41236;Q6NXS1 PPP1R2;PPP1R2P3 Protein phosphatase inhibitor 2;Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 38.143 38.143 3 0.053227 34418 QUIQUE_C1218_190116_001 34.953 21.997 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27065 848 25442 247847;247848 316974;316975 316974 2 LIAASSRPNQASSEGQFVVLSSSQSEESDLGEGGK Unmodified 3550.7023 0.7023276 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 1 1 90.903 90.903 3 1.3062E-46 91978 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.13 103.18 41408000 0 0 0 0 0 0 0 41408000 0 0 0 0 0 27066 4475 25443 247849 316976 316976 1 LIACGSLYQGICK Unmodified 1481.7371 0.73705572 4227 Q9HCM2 PLXNA4 Plexin-A4 yes yes 0 0 0 1 78.077 78.077 2 0.035221 79493 QUIQUE_C1368_190116_001 51.436 34.862 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27067 4227 25444 247850 316977 316977 1 LIADLQPNTEYSFVLMNR Unmodified 2123.0721 0.072125671 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9;H0Y380 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 139.22 139.22 2 0.026911 144894 QUIQUE_C1368_190116_001 66.619 53.988 18857000 0 0 18857000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27068 1998 25445 247851 316978 316978 1 LIADTSTIITEAR Unmodified 1402.7668 0.76675917 947 E9PJP2;Q5TF21;H3BRB8 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 0 1 1 1 84.215 84.215 2 0.0095966 80923 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.542 39.755 89917000 0 37166000 0 0 0 0 0 37458000 0 15293000 0 0 0 27069 947 25446 247852;247853;247854 316979;316980;316981 316981 2 LIADVAPSAIR Unmodified 1124.6554 0.65535823 2420 P39748;F5H1Y3 FEN1 Flap endonuclease 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.993 66.993 2 0.0072923 66652 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.224 28.829 310610000 0 34630000 44717000 21684000 0 16550000 21802000 29354000 29312000 13453000 48878000 26110000 24120000 27070 2420 25447 247855;247856;247857;247858;247859;247860;247861;247862;247863;247864;247865;247866 316982;316983;316984;316985;316986;316987;316988;316989;316990;316991;316992;316993 316992 12 LIAEEGVDSLNVK Unmodified 1385.7402 0.74021007 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.06 75.06 2 6.6256E-07 75085 QUIQUE_C1403_190116_001 130.41 89.383 545990000 132720000 64708000 80900000 53948000 0 82947000 56712000 0 38003000 0 0 36052000 0 27071 1713 25448 247867;247868;247869;247870;247871;247872;247873;247874;247875;247876;247877;247878 316994;316995;316996;316997;316998;316999;317000;317001;317002;317003;317004;317005;317006 316998 11 LIAEGNKEELR Unmodified 1270.6881 0.68811492 3857 Q96G03;E7ENQ8;E9PD70 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 21.248 21.248 2;3 0.0091059 14243 QUIQUE_C1403_190116_001 78.692 53.837 29706000 0 0 29706000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27072 3857 25449 247879;247880;247881;247882;247883;247884;247885 317007;317008;317009;317010;317011;317012;317013 317010 7 LIAEGNKEELRK Unmodified 1398.7831 0.78307794 3857 Q96G03;E7ENQ8;E9PD70 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes no 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 3 3 1 3 2 2 14.621 14.621 2;3;4 0.00037785 6683 QUIQUE_C1368_190116_001 130.01 61.937 2838500000 111080000 125800000 172540000 119450000 391220000 156720000 170650000 198150000 305060000 41566000 486970000 249250000 310070000 27073 3857 25450 247886;247887;247888;247889;247890;247891;247892;247893;247894;247895;247896;247897;247898;247899;247900;247901;247902;247903;247904;247905;247906;247907;247908;247909;247910 317014;317015;317016;317017;317018;317019;317020;317021;317022;317023;317024;317025;317026;317027;317028;317029;317030;317031;317032;317033;317034;317035;317036;317037;317038 317018 21 LIAEGTVTLQEFEEEIAK Unmodified 2019.0412 0.041202698 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 147.94 147.94 2 2.2244E-06 153848 QUIQUE_C1576_190116_001 127.79 99.085 134390000 0 0 0 46056000 0 0 24508000 0 0 47963000 15863000 0 0 27074 4487 25451 247911;247912;247913;247914;247915 317039;317040;317041;317042;317043 317040 4 LIAELWDSGIK Unmodified 1243.6812 0.68123863 413 A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RB22;B4DQ67 HARS2 Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 114.08 114.08 2 0.013359 119067 QUIQUE_C1218_190116_001 70.552 31.53 102350000 25111000 0 29624000 0 0 25423000 22193000 0 0 0 0 0 0 27075 413 25452 247916;247917;247918;247919 317044;317045;317046;317047 317044 4 LIAEQPPHLTPGIR Unmodified 1540.8726 0.87256165 709 C9JBI3;P78330 PSPH Phosphoserine phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.733 60.733 3 0.0003669 60769 QUIQUE_C1218_190116_001 77.078 56.651 1000300000 77094000 80223000 89071000 86175000 108490000 67937000 81107000 69656000 90503000 41774000 112490000 95762000 0 27076 709 25453 247920;247921;247922;247923;247924;247925;247926;247927;247928;247929;247930;247931 317048;317049;317050;317051;317052;317053;317054;317055;317056;317057;317058;317059 317048 9 LIAFTSEHSHFSLK Unmodified 1615.8358 0.83584179 2894 Q05329;A0A3B3IU09 GAD2 Glutamate decarboxylase 2 yes no 0 0 0 2 2 3 1 1 1 3 2 62.73 62.73 2;3;4 2.9894E-05 62004 QUIQUE_DMIX7_190116_001 110.86 73.745 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317077;317078;317079;317080;317081;317082;317083;317084;317085 317078 8 LIAINANDPEASK Unmodified 1354.7092 0.70924429 4150 Q9H2U2;D6R967;H0Y9D8 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.76 54.76 2 0.00011741 52900 QUIQUE_C1403_190116_001 117.67 90.419 2451100000 263190000 191550000 246110000 171470000 236560000 184610000 190790000 0 208870000 0 290400000 199320000 268180000 27080 4150 25457 247958;247959;247960;247961;247962;247963;247964;247965;247966;247967;247968 317086;317087;317088;317089;317090;317091;317092;317093;317094;317095;317096 317089 10 LIALLEVLSQK Unmodified 1225.7646 0.76457433 2178;3061;1628 Q14315;P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98;O75369 FLNC;FLNA;FLNB Filamin-C;Filamin-A;Filamin-B no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 143.19 143.19 2;3 3.9193E-37 148387 QUIQUE_C1368_190116_001 228.31 169.06 2958900000 170230000 166050000 226040000 273870000 276430000 207140000 264980000 177950000 330220000 167770000 263940000 239560000 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317133;317134;317135;317136;317137;317138;317139;317140;317141;317142;317143;317144;317145;317146;317147;317148;317149;317150;317151;317152;317153;317154;317155;317156;317157;317158;317159;317160;317161;317162;317163;317164;317165;317166;317167;317168;317169;317170;317171;317172;317173;317174;317175;317176;317177;317178;317179;317180;317181;317182;317183;317184;317185;317186;317187;317188;317189;317190;317191;317192;317193;317194;317195;317196;317197;317198;317199;317200;317201;317202;317203;317204;317205;317206;317207;317208;317209;317210;317211;317212;317213;317214;317215;317216;317217;317218;317219;317220;317221;317222;317223;317224;317225;317226;317227;317228;317229;317230;317231;317232;317233;317234;317235;317236;317237;317238;317239;317240;317241;317242 317176 102 LIANDDMAELLLGESK Unmodified 1730.8761 0.87605162 3486 Q86TV6 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes yes 0 0 0 2 1 1 140.34 140.34 2;3 0.00020257 145645 QUIQUE_C1218_190116_001 106.13 89.876 207130000 84286000 0 0 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248073;248074;248075;248076;248077;248078;248079;248080;248081;248082;248083;248084;248085;248086;248087;248088;248089;248090;248091;248092;248093;248094;248095 317255;317256;317257;317258;317259;317260;317261;317262;317263;317264;317265;317266;317267;317268;317269;317270;317271;317272;317273;317274;317275;317276;317277;317278;317279;317280;317281;317282;317283;317284;317285;317286;317287;317288;317289;317290;317291;317292;317293;317294;317295;317296 317266 38 LIAQACVSIFPDSGHFNVDNIR Unmodified 2472.222 0.22197781 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 123.62 123.62 3 1.8557E-08 127840 QUIQUE_C1277_190116_001 85.248 63.238 987800000 116130000 63529000 169850000 87910000 159660000 0 105170000 0 0 0 155520000 0 130020000 27088 2572 25465 248096;248097;248098;248099;248100;248101;248102;248103;248104;248105;248106;248107;248108 317297;317298;317299;317300;317301;317302;317303;317304;317305;317306;317307;317308;317309;317310;317311;317312;317313 317301 14 LIASMSSDSLR Oxidation (M) 1194.5914 0.59143734 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 1 0 1 32.621 32.621 2 0.049059 26483 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.908 53.669 37702000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37702000 0 0 0 27089 1785 25466 248109 317314 317314 0 LIASNSTMER Unmodified 1120.5547 0.55465791 1686 O94805 ACTL6B Actin-like protein 6B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.084 24.084 2 0.0029057 17584 QUIQUE_C1277_190116_001 87.308 29.748 166730000 0 33482000 0 37408000 0 31149000 0 0 22389000 0 42303000 0 0 27090 1686 25467 248110;248111;248112;248113;248114;248115 317315;317316;317317;317318;317319;317320 317315 6 LIASYCNVGDIEGASK Unmodified 1695.8138 0.81378572 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.598 80.598 2 1.0373E-24 81405 QUIQUE_C1368_190116_001 156.14 141.46 791550000 59864000 78644000 92300000 62646000 67585000 67073000 71973000 53524000 71810000 26183000 56770000 83180000 0 27091 2452 25468 248116;248117;248118;248119;248120;248121;248122;248123;248124;248125;248126;248127;248128 317321;317322;317323;317324;317325;317326;317327;317328;317329;317330;317331;317332;317333;317334;317335 317324 15 LIATFPDTLTYSAYR Unmodified 1730.8879 0.88793694 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.84 122.84 2 1.3236E-05 126544 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.64 82.831 1417500000 112770000 0 154690000 131720000 216570000 0 158580000 0 222580000 62756000 0 143230000 214630000 27092 2207 25469 248129;248130;248131;248132;248133;248134;248135;248136;248137 317336;317337;317338;317339;317340;317341;317342;317343;317344 317343 9 LIAVDISPVESTGVSHFATYVAAMR Unmodified 2633.3523 0.35232328 3651 Q8NFV4 ABHD11 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 146 146 3 3.2448E-17 150311 QUIQUE_C1277_190116_001 95.926 88.123 501040000 67512000 67079000 68970000 59054000 0 0 0 0 0 0 0 110820000 127600000 27093 3651 25470 248138;248139;248140;248141;248142;248143 317345;317346;317347;317348;317349;317350 317346 6 LIAVEIYR Unmodified 975.57532 0.57531699 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.541 75.541 2 0.015844 76327 QUIQUE_C1277_190116_001 84.097 47.077 96497000 0 29361000 35761000 31375000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27094 3037 25471 248144;248145;248146;248147 317351;317352;317353;317354 317351 4 LIAVIGDEDTVTGFLLGGIGELNK Unmodified 2443.321 0.32100637 3204 Q16864 ATP6V1F V-type proton ATPase subunit F yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 2 2 3 170.26 170.26 2;3 1.6925E-24 174585 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.01 121.06 627320000 118350000 59414000 42726000 0 27458000 0 22738000 72251000 86745000 18480000 87119000 0 92038000 27095 3204 25472 248148;248149;248150;248151;248152;248153;248154;248155;248156;248157;248158;248159;248160;248161;248162;248163;248164;248165;248166 317355;317356;317357;317358;317359;317360;317361;317362;317363;317364;317365;317366;317367;317368;317369;317370;317371;317372;317373;317374;317375 317366 21 LICCDILDVLDK Unmodified 1475.7364 0.73638702 2745 P62258;K7EIT4 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 3 2 1 1 2 1 1 2 140.4 140.4 2;3 5.3713E-10 144782 QUIQUE_C1277_190116_001 156.48 107.69 110760000000 8875200000 9912000000 10817000000 13755000000 8304100000 9194700000 8977500000 4777800000 7144000000 3915800000 7695900000 7434100000 9953500000 27096 2745 25473 248167;248168;248169;248170;248171;248172;248173;248174;248175;248176;248177;248178;248179;248180;248181;248182;248183;248184;248185;248186;248187;248188 317376;317377;317378;317379;317380;317381;317382;317383;317384;317385;317386;317387;317388;317389;317390;317391;317392;317393;317394;317395;317396;317397;317398;317399;317400;317401;317402;317403;317404;317405;317406;317407;317408;317409;317410;317411;317412;317413 317378 38 LICCDILDVLDKHLIPAANTGESK Unmodified 2694.3721 0.37207244 2745 P62258 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 3 2 3 3 3 140.65 140.65 2;3;4 1.5827E-41 143974 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.18 127.98 19880000000 48850000 205550000 175070000 0 569780000 0 405220000 4736400000 3064700000 0 2524900000 3866700000 4283300000 27097 2745 25474 248189;248190;248191;248192;248193;248194;248195;248196;248197;248198;248199;248200;248201;248202;248203;248204;248205;248206;248207 317414;317415;317416;317417;317418;317419;317420;317421;317422;317423;317424;317425;317426;317427;317428;317429;317430;317431;317432;317433;317434;317435;317436 317422 22 LICLVTGSPSIR Unmodified 1314.733 0.73295662 3393 Q6PI48;A0A3B3IT01;A0A3B3ISK7;A0A3B3IS54 DARS2 Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 86.571 86.571 2 0.012427 83385 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.1 59.234 105550000 45878000 0 0 37270000 0 0 0 0 0 22405000 0 0 0 27098 3393 25475 248208;248209;248210 317437;317438;317439 317439 3 LICQATGFSPR Unmodified 1248.6285 0.62849155 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 53.55 53.55 2 0.0073643 51736 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.157 44.256 55793000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33006000 22787000 27099 352 25476 248211;248212;248213;248214;248215 317440;317441;317442;317443;317444 317444 4 LICSRPDSGLVFNVLR Unmodified 1844.9931 0.99308749 3759 Q92854;E9PFD9 SEMA4D Semaphorin-4D yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 104.35 104.35 3 0.0069097 107701 QUIQUE_DMIX8_190116_001 53.828 36.427 142240000 0 0 29543000 18424000 0 0 31417000 0 0 0 27877000 0 34975000 27100 3759 25477 248216;248217;248218;248219;248220 317445;317446;317447;317448;317449 317449 1 LIDAETTAAAWPNVAAVSITGR Unmodified 2226.1644 0.16444615 3226 Q3LXA3;H0YCY6 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 137.36 137.36 2;3 9.4759E-11 140346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.21 84.466 214030000 0 0 0 0 0 0 35799000 64388000 29870000 0 40147000 43824000 0 27101 3226 25478 248221;248222;248223;248224;248225;248226 317450;317451;317452;317453;317454;317455 317451 4 LIDALIENFLQPSK Unmodified 1599.8872 0.88720866 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 158.71 158.71 2;3 1.0338E-17 162509 QUIQUE_C1277_190116_001 154.66 126.64 3835700000 203860000 220900000 666930000 314110000 377440000 152910000 391550000 137810000 278870000 98489000 338890000 390670000 263230000 27102 3390 25479 248227;248228;248229;248230;248231;248232;248233;248234;248235;248236;248237;248238;248239;248240;248241;248242;248243;248244;248245;248246;248247;248248;248249;248250 317456;317457;317458;317459;317460;317461;317462;317463;317464;317465;317466;317467;317468;317469;317470;317471;317472;317473;317474;317475;317476;317477;317478;317479;317480;317481;317482;317483;317484;317485;317486 317458 30 LIDAYAFR Unmodified 967.51272 0.51271674 1026 F6VCX5;Q16816 PHKG1 Phosphorylase b kinase gamma catalytic chain, skeletal muscle/heart isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 76.133 76.133 2 0.0048352 76578 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.67 28.076 139840000 0 0 0 44279000 0 0 0 54183000 0 0 0 41380000 0 27103 1026 25480 248251;248252;248253;248254 317487;317488;317489;317490 317489 4 LIDDMVAQAMK Unmodified 1233.6097 0.60972994 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.253 99.253 2 0.0014505 101864 QUIQUE_C1403_190116_001 84.615 64.285 1377100000 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1243.6846 0.68460945 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.97 125.97 2 1.711E-05 131883 QUIQUE_C1218_190116_001 141.2 85.665 18980000000 1500300000 1589600000 1914000000 1373900000 1053800000 1435500000 1150100000 1341300000 2277600000 427150000 1709400000 1872200000 1335200000 27106 2518 25482 248282;248283;248284;248285;248286;248287;248288;248289;248290;248291;248292;248293;248294 317526;317527;317528;317529;317530;317531;317532;317533;317534;317535;317536;317537;317538;317539;317540;317541;317542;317543;317544;317545;317546;317547;317548;317549;317550;317551;317552;317553;317554;317555 317527 30 LIDDYDSTK Unmodified 1068.4975 0.49752018 3717 Q8WXD2 SCG3 Secretogranin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 64.841 64.841 3 0.027685 63856 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.191 0 95800000 27888000 0 0 0 29529000 0 0 38383000 0 0 0 0 0 27107 3717 25483 248295;248296;248297 317556;317557;317558 317558 3 LIDDYGVEEEPAELPEGTSLTVDNK Unmodified 2732.2916 0.29161632 2845 Q00577 PURA Transcriptional activator protein Pur-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 122.42 122.42 2;3 1.5037E-142 127559 QUIQUE_C1218_190116_001 264.52 251.1 1045700000 146800000 102600000 0 87145000 209240000 364510000 69974000 0 0 0 0 34374000 31030000 27108 2845 25484 248298;248299;248300;248301;248302;248303;248304;248305;248306;248307 317559;317560;317561;317562;317563;317564;317565;317566;317567;317568;317569;317570 317559 12 LIDDYGVEEEPAELPEGTSLTVDNKR Unmodified 2888.3927 0.39272735 2845 Q00577 PURA Transcriptional activator protein Pur-alpha yes yes 0 0 1 2 3 2 2 2 2 3 3 3 2 4 3 3 107.47 107.47 2;3;4 2.4544E-177 109546 QUIQUE_DMIX3_190116_001 274.23 257.57 10031000000 381850000 789980000 684130000 520500000 667580000 436320000 779760000 1105000000 893320000 190640000 1523100000 1075100000 983830000 27109 2845 25485 248308;248309;248310;248311;248312;248313;248314;248315;248316;248317;248318;248319;248320;248321;248322;248323;248324;248325;248326;248327;248328;248329;248330;248331;248332;248333;248334;248335;248336;248337;248338;248339;248340;248341 317571;317572;317573;317574;317575;317576;317577;317578;317579;317580;317581;317582;317583;317584;317585;317586;317587;317588;317589;317590;317591;317592;317593;317594;317595;317596;317597;317598;317599;317600;317601;317602;317603;317604;317605;317606;317607;317608 317592 38 LIDELENSQK Unmodified 1187.6034 0.60338224 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YHT2 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 0 1 1 1 1 46.482 46.482 2 0.00584 43543 QUIQUE_C1277_190116_001 76.1 54.249 248480000 0 80103000 0 0 0 0 75097000 0 0 0 0 93276000 0 27110 356 25486 248342;248343;248344;248345 317609;317610;317611;317612;317613 317610 4 LIDELENSQKR Unmodified 1343.7045 0.70449327 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YHT2 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 1 1 33.524 33.524 2 0.012241 29147 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.614 38.773 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27111 356 25487 248346 317614 317614 1 LIDFGLAR Unmodified 903.5178 0.51780212 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 90.385 90.385 2 0.0010608 94734 QUIQUE_C1218_190116_001 146.21 0 2721700000 153550000 222150000 229280000 211880000 193580000 220960000 204300000 218810000 155830000 102270000 281290000 267850000 259920000 27112 3154 25488 248347;248348;248349;248350;248351;248352;248353;248354;248355;248356;248357;248358;248359;248360;248361;248362;248363;248364;248365;248366;248367;248368;248369;248370 317615;317616;317617;317618;317619;317620;317621;317622;317623;317624;317625;317626;317627;317628;317629;317630;317631;317632;317633;317634;317635;317636;317637;317638;317639;317640;317641;317642;317643;317644 317615 28 LIDFLQAK Unmodified 946.54877 0.54876789 1216 H7BYJ3;O14578 CIT Citron Rho-interacting kinase yes no 0 0 0 1 1 90.435 90.435 2 0.025037 92955 QUIQUE_C1218_190116_001 71.852 39.787 16955000 16955000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27113 1216 25489 248371;248372 317645;317646 317645 2 LIDIGNSCR Unmodified 1046.5179 0.51787847 1377 O00139;H0Y8H2 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 41.644 41.644 2 0.0095216 38497 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.738 24.166 770740000 0 0 143200000 114200000 0 0 140520000 0 0 47022000 92726000 131170000 101900000 27114 1377 25490 248373;248374;248375;248376;248377;248378;248379 317647;317648;317649;317650;317651;317652;317653 317652 5 LIDISIGSLR Unmodified 1085.6445 0.64445919 430 A0A2R8Y5H9;Q8IVT5 KSR1 Kinase suppressor of Ras 1 yes no 0 0 0 1 67.093 67.093 2 0.015357 67008 QUIQUE_C1218_190116_001 63.48 7.4689 33472000 33472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27115 430 25491 248380 317654 317654 1 LIDLHSPSEIVK Unmodified 1349.7555 0.7554662 2698 P60866;G3XAN0 RPS20 40S ribosomal protein S20 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 68.607 68.607 2;3 2.764E-05 68136 QUIQUE_C1403_190116_001 127.76 98.678 3390000000 246720000 274930000 306060000 320880000 215610000 261500000 239380000 244530000 331250000 110310000 280520000 283260000 275080000 27116 2698 25492 248381;248382;248383;248384;248385;248386;248387;248388;248389;248390;248391;248392;248393;248394;248395;248396;248397;248398;248399;248400;248401;248402;248403;248404;248405;248406;248407 317655;317656;317657;317658;317659;317660;317661;317662;317663;317664;317665;317666;317667;317668;317669;317670;317671;317672;317673;317674;317675;317676;317677;317678;317679;317680;317681;317682;317683;317684;317685;317686;317687;317688;317689;317690;317691;317692;317693;317694;317695;317696 317669 42 LIDLHTNVATAVLEHIK Unmodified 1886.0625 0.062547262 3708 Q8WVM8 SCFD1 Sec1 family domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 1 2 1 2 2 2 115.43 115.43 3;4 1.733E-05 120532 QUIQUE_C1438_190116_001 80.738 70.124 1562600000 125510000 132490000 128650000 110530000 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1 1 2 1 2 1 2 2 1 134.92 134.92 2;3 3.875E-27 140776 QUIQUE_C1576_190116_001 138.77 118.39 2506100000 100800000 160650000 173990000 122950000 150190000 147150000 229020000 170860000 262790000 51429000 429930000 272550000 233810000 27128 456 25504 248500;248501;248502;248503;248504;248505;248506;248507;248508;248509;248510;248511;248512;248513;248514;248515;248516;248517;248518 317805;317806;317807;317808;317809;317810;317811;317812;317813;317814;317815;317816;317817;317818;317819;317820;317821;317822;317823;317824;317825 317815 19 LIEADISKR Unmodified 1043.5975 0.597509 3887 Q96JB5;J3QRM1 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 0 1 1 23.933 23.933 2 0.020414 17564 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.423 11.864 40063000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40063000 0 0 27129 3887 25505 248519 317826 317826 1 LIEDFLAR Unmodified 975.53893 0.53893149 1536 O43617;A0A087WWM0;A6NKE1 TRAPPC3 Trafficking protein particle complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.712 94.712 2 0.018957 97234 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synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 90.927 90.927 3 0.0019491 92945 QUIQUE_C1277_190116_001 38.724 30.436 102560000 0 43364000 0 59192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27135 3071 25511 248546;248547;248548;248549 317857;317858;317859;317860 317857 4 LIEEVHAVVTVR Unmodified 1363.7823 0.78234966 1366 M0R0N4;M0QYZ2;P53680;X6R390;M0QZ21 AP2S1 AP-2 complex subunit sigma yes no 0 0 0 1 1 1 3 2 2 2 1 64.513 64.513 2;3 0.00029274 59958 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.089 57.19 95474000 0 0 0 0 0 0 0 25182000 0 70292000 0 0 0 27136 1366 25512 248550;248551;248552;248553;248554;248555;248556;248557;248558;248559;248560;248561;248562 317861;317862;317863;317864;317865;317866;317867;317868;317869;317870;317871;317872;317873 317869 13 LIEEVMIGEDK Unmodified 1274.6428 0.64280421 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.579 82.579 2 0.00015645 83557 QUIQUE_C1277_190116_001 127.76 86.778 1116000000 191560000 201140000 205430000 161240000 0 154180000 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O-acetyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.93 102.93 2 0.0018808 100314 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.139 54.178 1497800000 152380000 113340000 140750000 83408000 108460000 117070000 87141000 88346000 113270000 72586000 149930000 148710000 122360000 27140 2462 25516 248579;248580;248581;248582;248583;248584;248585;248586;248587;248588;248589;248590;248591 317902;317903;317904;317905;317906;317907;317908;317909;317910;317911;317912;317913;317914;317915;317916;317917;317918;317919;317920;317921;317922;317923;317924;317925;317926;317927;317928;317929 317920 28 LIEIASR Unmodified 800.4756 0.47560295 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 35.725 35.725 2 0.019681 31567 QUIQUE_C1277_190116_001 119.56 34.197 1184800000 324680000 328700000 286750000 0 113480000 0 0 0 65020000 0 66172000 0 0 27141 2008 25517 248592;248593;248594;248595;248596;248597 317930;317931;317932;317933;317934;317935 317931 6 LIEIENFK Unmodified 1004.5542 0.5542472 3079 Q14683;V9GYN9 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A yes no 0 0 0 1 78.261 78.261 2 0.02842 78352 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.787 15.62 24402000 0 0 0 0 0 0 0 24402000 0 0 0 0 0 27142 3079 25518 248598 317936 317936 1 LIELHSPDSR Unmodified 1165.6091 0.60913632 2995 Q13425;H0YCS0;H7BY41 SNTB2 Beta-2-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.256 33.256 2;3 0.0078632 28682 QUIQUE_C1218_190116_001 47.559 30.328 84139000 23114000 0 0 27671000 0 0 0 0 33355000 0 0 0 0 27143 2995 25519 248599;248600;248601;248602 317937;317938;317939;317940 317937 4 LIELQAGK Unmodified 870.51747 0.51746776 1329 K7ELL7;P14314;K7EPW7 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.562 54.562 2 0.022199 60316 QUIQUE_C1403_190116_001 74.423 0.026461 382810000 0 0 0 76307000 0 94194000 0 0 0 0 108890000 0 103420000 27144 1329 25520 248603;248604;248605;248606;248607 317941;317942;317943;317944;317945;317946 317942 6 LIELQAGKK Unmodified 998.61243 0.61243078 1329 K7ELL7;P14314;K7EPW7 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 1 1 19.939 19.939 2 0.0429 12833 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.721 8.8725 120430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 120430000 0 27145 1329 25521 248608 317947 317947 1 LIENVDPEK Unmodified 1055.5499 0.5498901 3973 Q99747;J3KTJ6 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 37.341 37.341 2 0.0031968 33416 QUIQUE_C1438_190116_001 91.853 77.857 1740600000 245770000 0 225990000 219410000 185510000 0 280230000 184260000 0 111330000 0 0 288090000 27146 3973 25522 248609;248610;248611;248612;248613;248614;248615;248616 317948;317949;317950;317951;317952;317953;317954;317955 317951 4 LIERDPYEHPER Unmodified 1552.7634 0.76340513 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 1 1 2 21.881 21.881 3;4 0.021948 14897 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.734 11.504 133640000 0 0 0 0 0 0 0 33882000 0 0 99757000 0 0 27147 4161 25523 248617;248618;248619 317956;317957;317958 317957 3 LIETELLQLTQLELK Unmodified 1783.0343 0.034266826 3406 Q6UWE0 LRSAM1 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 yes yes 0 0 0 1 1 157.96 157.96 2;3 8.3366E-05 163208 QUIQUE_C1218_190116_001 117.86 100.05 41489000 32963000 0 0 0 0 0 0 0 0 8526400 0 0 0 27148 3406 25524 248620;248621 317959;317960 317959 2 LIETYFSK Unmodified 999.5277 0.5276981 2689 P60201;B1B1G3;B1B1G4;B1B1G6;B1B1G2;B1B1G1 PLP1 Myelin proteolipid protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.943 66.943 2 0.0036146 67064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.17 80.882 50045000000 4299500000 2864400000 8978400000 2834700000 2647200000 1896100000 6574200000 2772700000 2037900000 1817800000 8019400000 2140400000 3162500000 27149 2689 25525 248622;248623;248624;248625;248626;248627;248628;248629;248630;248631;248632;248633;248634 317961;317962;317963;317964;317965;317966;317967;317968;317969;317970;317971;317972;317973;317974;317975;317976;317977;317978;317979;317980;317981;317982;317983;317984;317985;317986;317987;317988 317977 28 LIEVANLACSISNNEEGVK Unmodified 2059.0256 0.025569409 2369 P35221;G3XAM7;E5RFK9;E5RFM5;E5RJP7;E5RGD2;E5RFG3 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 3 2 1 1 1 2 114.45 114.45 2;3 6.531E-55 118278 QUIQUE_C1403_190116_001 172.1 151.64 949370000 34765000 82662000 93125000 64289000 88592000 85096000 28111000 144800000 111020000 0 57795000 43238000 115880000 27150 2369 25526 248635;248636;248637;248638;248639;248640;248641;248642;248643;248644;248645;248646;248647;248648;248649;248650;248651;248652;248653;248654;248655 317989;317990;317991;317992;317993;317994;317995;317996;317997;317998;317999;318000;318001;318002;318003;318004;318005;318006;318007;318008;318009;318010 317994 20 LIEVGPSGAQFLGK Unmodified 1414.782 0.78201531 2856 Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.574 96.574 2 1.0396E-05 99546 QUIQUE_C1277_190116_001 137.98 97.625 4476800000 385160000 433480000 412030000 306110000 329150000 244270000 474120000 258530000 293070000 157490000 360080000 459300000 363990000 27151 2856 25527 248656;248657;248658;248659;248660;248661;248662;248663;248664;248665;248666;248667;248668 318011;318012;318013;318014;318015;318016;318017;318018;318019;318020;318021;318022;318023;318024;318025;318026;318027;318028 318013 18 LIEVGPSGAQFLGPVIVEIPHFAALR Unmodified 2729.5269 0.52685724 1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;H0Y931 ANK2 no no 0 0 0 1 1 2 2 2 3 1 1 3 2 3 3 3 160.87 160.87 2;3;4 1.0337E-29 165757 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.39 122.91 13142000000 221470000 970270000 1220100000 906760000 824170000 737990000 936290000 607950000 1390300000 333940000 914370000 2477900000 1600400000 27152 902;1255;1134 25528 248669;248670;248671;248672;248673;248674;248675;248676;248677;248678;248679;248680;248681;248682;248683;248684;248685;248686;248687;248688;248689;248690;248691;248692;248693;248694;248695 318029;318030;318031;318032;318033;318034;318035;318036;318037;318038;318039;318040;318041;318042;318043;318044;318045;318046;318047;318048;318049;318050;318051;318052;318053;318054;318055;318056;318057;318058;318059;318060;318061;318062;318063;318064;318065;318066;318067 318052 35 LIEVNGQNVEGLR Unmodified 1439.7732 0.77324153 3147 Q15599;H3BUQ9;H3BN50;H3BQS0 SLC9A3R2 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.717 73.717 2 0.0003614 75278 QUIQUE_C1218_190116_001 119.22 63.854 609600000 41965000 40458000 35203000 47982000 47991000 37744000 46870000 53206000 82375000 0 52141000 61291000 62372000 27153 3147 25529 248696;248697;248698;248699;248700;248701;248702;248703;248704;248705;248706;248707 318068;318069;318070;318071;318072;318073;318074;318075;318076;318077;318078;318079 318068 12 LIEVTETICK Unmodified 1204.6373 0.6373249 4017 Q9BT09;A0A0C4DFY8 CNPY3 Protein canopy homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 65.22 65.22 2 0.0089009 63996 QUIQUE_C1403_190116_001 83.783 48.959 51630000 0 0 0 32810000 0 0 0 0 0 18820000 0 0 0 27154 4017 25530 248708;248709;248710 318080;318081;318082;318083 318081 4 LIEVTETICKR Unmodified 1360.7384 0.73843593 4017 Q9BT09;A0A0C4DFY8 CNPY3 Protein canopy homolog 3 yes no 0 0 1 1 48.783 48.783 3 0.026098 45944 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.334 21.396 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27155 4017 25531 248711 318084 318084 1 LIEYYQQLAQK Unmodified 1395.7398 0.73981614 4461 Q9UJW0;E5RGG1;H9KVE0;E5RK21 DCTN4 Dynactin subunit 4 yes no 0 0 0 1 80.285 80.285 2 0.035465 76361 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.42 26.334 62276000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62276000 0 0 0 27156 4461 25532 248712 318085 318085 1 LIFDNLK Unmodified 861.496 0.49600404 590;1371;1872 P05023;P20648;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733;P54707;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP4A;ATP1A3;ATP1A4;ATP12A;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Potassium-transporting ATPase alpha chain 1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Potassium-transporting ATPase alpha chain 2;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.954 79.954 2 0.019682 82534 QUIQUE_C1218_190116_001 119.57 63.962 1334800000 245580000 0 320530000 0 170430000 184130000 203110000 0 0 0 143820000 67184000 0 27157 1872;1371;590 25533 248713;248714;248715;248716;248717;248718;248719 318086;318087;318088;318089;318090;318091;318092;318093;318094 318086 9 LIFGDALLMEPLEK Unmodified 1587.8582 0.85821672 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.18 151.18 2 0.00019093 156412 QUIQUE_C1368_190116_001 110.86 73.665 1195300000 110300000 138570000 124960000 103450000 109760000 109320000 100260000 49226000 63058000 27856000 92887000 92599000 73072000 27158 4250 25534 248720;248721;248722;248723;248724;248725;248726;248727;248728;248729;248730;248731;248732 318095;318096;318097;318098;318099;318100;318101;318102;318103;318104;318105;318106;318107 318097 12 LIFIVDVWHPELTPQQR Unmodified 2090.1313 0.13129553 2944 Q12797 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes yes 0 0 0 1 141.07 141.07 3 0.0013915 148452 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.862 49.763 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27159 2944 25535 248733 318108 318108 1 LIFLNFVR Unmodified 1020.612 0.61203685 3320 Q5T712;Q8N2K0 ABHD12 Monoacylglycerol lipase ABHD12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.13 130.13 2 0.00080184 133291 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.06 51.464 215700000 17802000 23906000 25371000 29006000 0 21622000 15753000 19665000 23060000 8461600 0 14546000 16505000 27160 3320 25536 248734;248735;248736;248737;248738;248739;248740;248741;248742;248743;248744;248745 318109;318110;318111;318112;318113;318114;318115;318116;318117;318118;318119;318120;318121 318117 13 LIFPEFER Unmodified 1049.5546 0.55458155 2865 Q02108;J3KQW2;Q6PJR4 GUCY1A3 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 105.52 105.52 2 0.037751 107805 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.962 16.244 40241000 0 0 0 0 21353000 0 0 18888000 0 0 0 0 0 27161 2865 25537 248746;248747;248748 318122;318123;318124;318125 318124 4 LIFPYVELDLHSYDLGIENR Unmodified 2405.2267 0.22671206 1662 O75874;C9J4N6;C9JJE5;C9JLU6 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 156.11 156.11 2;3 6.7972E-10 163158 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.77 102.58 1315700000 62273000 0 0 0 0 0 124380000 134750000 268610000 0 253500000 271980000 200210000 27162 1662 25538 248749;248750;248751;248752;248753;248754;248755;248756 318126;318127;318128;318129;318130;318131;318132;318133;318134 318131 9 LIFQMPQNK Unmodified 1117.5954 0.59540051 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8;E9PDT6;E7EWC2;F5H7S7;F2Z2E2;Q13576;Q86VI3 IQGAP1;IQGAP2;IQGAP3 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1;Ras GTPase-activating-like protein IQGAP2;Ras GTPase-activating-like protein IQGAP3 yes no 0 0 0 1 77.008 77.008 2 0.04706 77445 QUIQUE_C1403_190116_001 64.757 44.132 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27163 2487 25539 248757 318135 318135 1 LIFQVLDAVK Unmodified 1144.6856 0.68559572 3039 Q14012;C9JES6 CAMK1 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.91 123.91 2 0.0016163 128311 QUIQUE_C1368_190116_001 95.502 74.981 1373900000 110160000 137860000 101020000 112720000 117550000 101980000 105240000 75187000 115590000 45593000 122550000 115130000 113350000 27164 3039 25540 248758;248759;248760;248761;248762;248763;248764;248765;248766;248767;248768;248769;248770;248771 318136;318137;318138;318139;318140;318141;318142;318143;318144;318145;318146;318147;318148;318149;318150 318140 13 LIFSTITSK Unmodified 1008.5855 0.58554733 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.291 72.291 2 0.0015611 74107 QUIQUE_C1218_190116_001 102.46 69.107 788680000 134700000 99342000 0 0 111620000 106870000 98962000 0 0 0 126240000 0 110940000 27165 2466 25541 248772;248773;248774;248775;248776;248777;248778;248779;248780;248781;248782 318151;318152;318153;318154;318155;318156;318157;318158;318159;318160;318161 318151 10 LIFTDGSR Unmodified 907.47633 0.47633123 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.521 49.521 2 0.0036007 47626 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.04 57.998 6985800000 473130000 463030000 647840000 537310000 454860000 486330000 433900000 524720000 581880000 354990000 727860000 573680000 726300000 27166 2400 25542 248783;248784;248785;248786;248787;248788;248789;248790;248791;248792;248793;248794;248795 318162;318163;318164;318165;318166;318167;318168;318169;318170;318171;318172;318173;318174;318175;318176;318177;318178;318179;318180;318181 318178 20 LIFYDLR Unmodified 938.52255 0.52255314 3103 Q15046;H3BVA8 KARS Lysine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 98.692 98.692 2 0.035447 102860 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.866 47.324 352910000 0 0 0 85492000 67967000 0 0 0 0 0 117230000 0 82219000 27167 3103 25543 248796;248797;248798;248799 318182;318183;318184;318185;318186 318185 5 LIGELAK Unmodified 742.45889 0.45889025 3960 Q99584 S100A13 Protein S100-A13 yes yes 0 0 0 1 32.975 32.975 2 0.039849 28492 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.377 5.8813 627460000 0 0 0 0 0 0 0 0 627460000 0 0 0 0 27168 3960 25544 248800 318187 318187 1 LIGEVFNIVSQQSTAR Unmodified 1760.9421 0.94209778 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 124.63 124.63 2 3.4086E-06 130000 QUIQUE_C1218_190116_001 121.4 97.018 124410000 28581000 0 0 0 35299000 0 35766000 0 0 24762000 0 0 0 27169 3684 25545 248801;248802;248803;248804;248805;248806;248807;248808 318188;318189;318190;318191;318192;318193;318194;318195 318188 8 LIGEVSSGSGETFSYPDFLR Unmodified 2160.0375 0.037514303 2652 Q5STX8;P55008 AIF1 Allograft inflammatory factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 139.56 139.56 2 2.8523E-101 143770 QUIQUE_C1403_190116_001 210.14 178.08 279580000 0 47004000 77337000 79660000 55826000 0 0 0 0 19751000 0 0 0 27170 2652 25546 248809;248810;248811;248812;248813 318196;318197;318198;318199;318200;318201 318199 6 LIGEYGLR Unmodified 919.51272 0.51271674 3 B5MCT8;C9JM19;A0A024R4M0;P46781;F2Z3C0;A8MXK4 RPS9 40S ribosomal protein S9 yes no 0 0 0 1 59.381 59.381 2 0.012432 58534 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.643 43.67 31708000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31708000 27171 3 25547 248814 318202 318202 1 LIGGESGIVSLVGEEYK Unmodified 1748.9196 0.919631 4313 Q9NWU1;C9J2G3;C9JQQ2;F8VNS3 OXSM 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 121.57 121.57 2 0.024975 126042 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.483 30.858 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27172 4313 25548 248815 318203 318203 1 LIGLSATLPNYEDVATFLR Unmodified 2092.1205 0.12045607 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 162.49 162.49 2 1.1345E-13 168784 QUIQUE_C1438_190116_001 120.14 98.09 138330000 19647000 21160000 0 7992600 32980000 0 0 21252000 0 0 35294000 0 0 27173 1650 25549 248816;248817;248818;248819;248820;248821 318204;318205;318206;318207;318208;318209;318210 318207 6 LIGLTTIFSATALGFLAHK Unmodified 1973.135 0.13498392 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 1 2 1 4 1 1 166.05 166.05 2;3 8.5501E-37 170756 QUIQUE_C1368_190116_001 155.92 145.07 8713900000 567880000 552990000 631930000 347860000 313830000 605510000 965240000 502550000 916570000 262700000 1616700000 1214500000 215640000 27174 2261 25550 248822;248823;248824;248825;248826;248827;248828;248829;248830;248831;248832;248833;248834;248835;248836;248837;248838;248839;248840;248841;248842 318211;318212;318213;318214;318215;318216;318217;318218;318219;318220;318221;318222;318223;318224;318225;318226;318227;318228;318229;318230;318231;318232;318233;318234;318235;318236;318237 318214 24 LIGLTTIFSATALGFLAHKR Unmodified 2129.2361 0.23609495 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 1 1 151.03 151.03 4 1.3082E-65 158626 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.67 135.79 76490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76490000 0 0 27175 2261 25551 248843 318238 318238 1 LIGLYNQK Unmodified 947.54402 0.54401687 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.787 47.787 2 0.0036451 45138 QUIQUE_C1403_190116_001 117.7 64.144 1909500000 196460000 190920000 137260000 150990000 146740000 141160000 193970000 0 137250000 0 197700000 190430000 226620000 27176 4226 25552 248844;248845;248846;248847;248848;248849;248850;248851;248852;248853;248854 318239;318240;318241;318242;318243;318244;318245;318246;318247;318248;318249 318242 2 LIGNLCYK Unmodified 979.51609 0.51608756 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2;B1AHE4 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.212 53.212 2 0.020376 50840 QUIQUE_C1403_190116_001 76.847 49.884 573510000 0 86327000 63270000 81390000 0 70813000 51273000 74499000 0 38844000 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319127 997 LIGSVDDLLPSLPSSSR Unmodified 1754.9414 0.94142907 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 2 1 135.39 135.39 2 1.1937E-10 139239 QUIQUE_C1403_190116_001 107.12 90.091 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27182 3060 25557 249927;249928;249929 319491;319492;319493 319491 3 LIGTAVPQR Unmodified 953.56581 0.56581494 4524 Q9UPY8;C9JB30 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.938 32.938 2 0.0017546 28688 QUIQUE_C1218_190116_001 100.45 44.44 3003600000 268620000 255890000 181100000 311640000 328920000 243980000 257170000 166710000 192400000 68286000 208760000 179150000 340990000 27183 4524 25558 249930;249931;249932;249933;249934;249935;249936;249937;249938;249939;249940;249941;249942 319494;319495;319496;319497;319498;319499;319500;319501;319502;319503;319504;319505;319506;319507 319495 14 LIGTNCIIYPVNSK Unmodified 1590.844 0.84396364 4094 Q9C0C9 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes yes 0 0 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319637;319638;319639;319640;319641;319642;319643;319644 319641 8 LIIGFISK Unmodified 889.56369 0.56368968 370 A0A1W2PNW1;P42226;G3V2X7;H0YJH6 STAT6 Signal transducer and activator of transcription 6 yes no 0 0 0 1 93.259 93.259 2 0.053534 94413 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.776 19.671 10897000 0 0 0 0 0 0 0 10897000 0 0 0 0 0 27197 370 25572 250058 319645 319645 1 LIILASGGPQALVNIMR Unmodified 1765.0284 0.028410363 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 146.89 146.89 2;3 2.869E-30 152047 QUIQUE_DMIX3_190116_001 188.61 171.59 1905800000 140330000 123260000 134730000 150880000 126790000 100270000 193990000 107540000 163260000 38228000 213240000 258730000 154580000 27198 425 25573 250059;250060;250061;250062;250063;250064;250065;250066;250067;250068;250069;250070;250071;250072;250073;250074;250075 319646;319647;319648;319649;319650;319651;319652;319653;319654;319655;319656;319657;319658;319659;319660;319661;319662;319663;319664;319665;319666;319667;319668;319669;319670;319671;319672;319673;319674;319675;319676 319662 30 LIILASGGPQALVNIMR Oxidation (M) 1781.0233 0.023324985 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 1 0 1 125.55 125.55 2 0.038403 130178 QUIQUE_DMIX3_190116_001 40.449 28.995 19013000 0 0 0 0 0 0 0 0 19013000 0 0 0 0 27199 425 25573 250076 319677 319677 1 LIILDEIHLLHDDRGPVLEALVAR Unmodified 2719.5385 0.53848456 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 1 1 146.3 146.3 4 4.6337E-07 151019 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.352 64.057 56389000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56389000 0 27200 1650 25574 250077 319678 319678 1 LIILEHYSQASEWAAK Unmodified 1857.9625 0.96249887 2484 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;D6RB13;D6R917;D6RFK5 GNPDA1 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 94.317 94.317 2;3 2.9464E-36 96389 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.46 141.05 1923600000 158830000 157650000 172410000 138640000 123170000 146850000 198440000 31455000 133080000 52158000 202580000 180510000 227870000 27201 2484 25575 250078;250079;250080;250081;250082;250083;250084;250085;250086;250087;250088;250089;250090;250091;250092;250093;250094;250095;250096;250097;250098;250099;250100;250101 319679;319680;319681;319682;319683;319684;319685;319686;319687;319688;319689;319690;319691;319692;319693;319694;319695;319696;319697;319698;319699;319700;319701;319702;319703;319704;319705;319706;319707;319708;319709;319710;319711;319712 319696 33 LIILENTIYLFSK Unmodified 1565.9069 0.90688147 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 154.23 154.23 2 0.0044815 159385 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.096 52.437 16615000 0 0 0 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406200000 366960000 287470000 295160000 392200000 267980000 314460000 0 241280000 211260000 336440000 320180000 267560000 27208 2079 25580 250119;250120;250121;250122;250123;250124;250125;250126;250127;250128;250129;250130 319732;319733;319734;319735;319736;319737;319738;319739;319740;319741;319742;319743;319744;319745;319746;319747;319748 319734 15 LIIQAGIK Unmodified 854.55894 0.55893865 2349 P32321;D6RBJ9 DCTD Deoxycytidylate deaminase yes no 0 0 0 1 51.254 51.254 2 0.050731 49366 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.441 3.21 25509000 0 0 0 0 0 0 0 0 25509000 0 0 0 0 27209 2349 25581 250131 319749 319749 1 LIITEETAK Unmodified 1016.5754 0.57537657 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.566 38.566 2 0.0012367 35247 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.57 38.536 1530700000 134710000 117420000 116230000 89245000 126440000 113620000 128410000 109730000 99587000 49115000 165820000 148600000 131790000 27210 4284 25582 250132;250133;250134;250135;250136;250137;250138;250139;250140;250141;250142;250143;250144 319750;319751;319752;319753;319754;319755;319756;319757;319758;319759;319760;319761;319762;319763;319764;319765;319766 319760 16 LIITQVR Unmodified 841.53854 0.53853756 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 43.005 43.005 2 0.042144 39913 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.381 9.4319 130220000 0 0 0 0 0 0 0 0 130220000 0 0 0 0 27211 2452 25583 250145 319767 319767 1 LIIVEGCQR Unmodified 1086.5856 0.5855641 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733;P54707;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A4;ATP12A;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Potassium-transporting ATPase alpha chain 2;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.611 44.611 2 0.0013239 41351 QUIQUE_C1403_190116_001 104.75 51.58 2531100000 299470000 240260000 342800000 225610000 315800000 199110000 213730000 238190000 201250000 0 254890000 0 0 27212 1872;1371;590 25584 250146;250147;250148;250149;250150;250151;250152;250153;250154;250155 319768;319769;319770;319771;319772;319773;319774;319775;319776;319777;319778;319779;319780;319781;319782;319783;319784 319775 16 LIIWDSYTTNK Unmodified 1352.6976 0.69761697 2767;2769;4207 P62873;F6UT28;B1AKQ8;F6X3N5;P62879;C9JXA5;E7EP32;C9JIS1;C9JZN1;Q9HAV0 GNB1;GNB2;GNB4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 no no 0 0 0 1 1 4 2 2 2 2 1 2 3 2 2 2 96.73 96.73 2;3 2.7246E-25 100802 QUIQUE_C1277_190116_001 186.25 178.03 93414000000 7007400000 7830000000 8479800000 6355600000 6423600000 6177700000 8352000000 5880900000 6081000000 3883600000 9618000000 7999000000 9325800000 27213 2767;2769;4207 25585 250156;250157;250158;250159;250160;250161;250162;250163;250164;250165;250166;250167;250168;250169;250170;250171;250172;250173;250174;250175;250176;250177;250178;250179;250180;250181 319785;319786;319787;319788;319789;319790;319791;319792;319793;319794;319795;319796;319797;319798;319799;319800;319801;319802;319803;319804;319805;319806;319807;319808;319809;319810;319811;319812;319813;319814;319815;319816;319817;319818;319819;319820;319821;319822;319823;319824;319825;319826;319827;319828;319829;319830;319831;319832;319833;319834;319835;319836;319837;319838;319839;319840;319841;319842;319843;319844;319845 319789 61 LIIWSPVR Unmodified 982.59639 0.59638679 30 A0A087WTS0;P18283;H0YJK8 GPX2 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 97.763 97.763 2 0.0036392 101754 QUIQUE_C1218_190116_001 117.17 81.289 184050000 26222000 0 0 0 18860000 0 15194000 17086000 29756000 0 0 26275000 50662000 27214 30 25586 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319862;319863;319864;319865;319866;319867;319868;319869;319870;319871;319872;319873;319874;319875;319876;319877;319878;319879;319880;319881;319882;319883;319884;319885;319886;319887;319888;319889;319890;319891;319892;319893;319894;319895;319896;319897;319898;319899;319900;319901 319886 39 LIKEPAPDSGLLGLFQGQNSLLH Unmodified 2446.322 0.32200943 3799 Q96AB3 ISOC2 Isochorismatase domain-containing protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 142.82 142.82 3 1.2211E-05 149857 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.11 63.711 689250000 0 0 0 0 0 0 0 179260000 152970000 0 221550000 0 135470000 27216 3799 25588 250220;250221;250222;250223 319902;319903;319904;319905 319904 0 LILAANR Unmodified 769.48102 0.48102268 701 C9J695;Q6ICL3;C9JDT9;A0A0A0MSI5;C9JKN2;B7Z4A5;B7Z6W2;F8WDT9;A8MWT1 TANGO2;C22orf25 Transport and Golgi organization protein 2 homolog yes no 0 0 0 1 27.152 27.152 2 0.046142 21381 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.906 0.53209 57432000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57432000 0 0 27217 701 25589 250224 319906;319907 319906 2 LILACIMGYFAGK Unmodified 1455.7618 0.76181391 4320 Q9NX40;D6RG39;D6RIT9;D6RDK6;D6RBN5;D6RDI5;D6RI08;D6RA54;D6RC55;D6RDK1;D6RIV2;D6R9T5 OCIAD1 OCIA domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 162.22 162.22 2 3.1674E-07 167395 QUIQUE_C1368_190116_001 130.75 103.01 572770000 21533000 33256000 16288000 16868000 24215000 0 41931000 45885000 88562000 5944200 98141000 138150000 41999000 27218 4320 25590 250225;250226;250227;250228;250229;250230;250231;250232;250233;250234;250235;250236;250237 319908;319909;319910;319911;319912;319913;319914;319915;319916;319917;319918;319919;319920;319921;319922;319923 319911 15 LILADALCYAHTFNPK Unmodified 1845.9447 0.94474031 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 126.95 126.95 2;3 1.5608E-29 131720 QUIQUE_C1368_190116_001 188.91 144.14 8240800000 399870000 646720000 833620000 1057900000 539990000 699230000 518800000 722800000 464980000 147830000 817230000 519920000 871930000 27219 2282 25591 250238;250239;250240;250241;250242;250243;250244;250245;250246;250247;250248;250249;250250;250251;250252;250253;250254;250255;250256;250257;250258;250259;250260;250261;250262 319924;319925;319926;319927;319928;319929;319930;319931;319932;319933;319934;319935;319936;319937;319938;319939;319940;319941;319942;319943;319944;319945;319946;319947;319948;319949;319950;319951;319952;319953;319954;319955;319956;319957;319958;319959;319960;319961;319962;319963;319964;319965;319966;319967;319968;319969;319970 319935 47 LILAGALR Unmodified 825.54362 0.54362294 718 C9JEX3;Q13614 MTMR2 Myotubularin-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 82.842 82.842 2 0.015681 83157 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.359 11.32 12862000 0 0 0 0 0 0 0 12862000 0 0 0 0 0 27220 718 25592 250263;250264;250265;250266;250267 319971;319972;319973;319974;319975 319975 5 LILAGNALQSDSK Unmodified 1328.73 0.72997974 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.588 64.588 2 0.00055556 64931 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319983;319984;319985;319986;319987;319988;319989;319990;319991;319992;319993;319994;319995 319987 13 LILDFLNSKK Unmodified 1189.7071 0.70705945 145 A0A0A0MRE6;O94967;E9PR96;E9PKZ6 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 1 1 1 94.875 94.875 3 0.0031979 96058 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.887 34.264 12460000 0 0 0 0 0 0 0 12460000 0 0 0 0 0 27224 145 25596 250288;250289 319996;319997 319996 2 LILDLSMK Unmodified 931.54124 0.54123967 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.392 99.392 2 0.021461 101360 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.109 49 457560000 0 34577000 38704000 0 0 49167000 37414000 63622000 48395000 17736000 70753000 50747000 46440000 27225 2613 25597 250290;250291;250292;250293;250294;250295;250296;250297;250298;250299 319998;319999;320000;320001;320002;320003;320004;320005;320006;320007;320008 320002 11 LILDSAR Unmodified 786.45995 0.45995289 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.289 36.289 2 0.0052204 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25608 250384;250385;250386;250387;250388;250389;250390;250391;250392;250393;250394;250395;250396 320126;320127;320128;320129;320130;320131;320132;320133;320134;320135;320136;320137;320138;320139;320140 320126 15 LILNYSPRDEEEEMMEVSLDATKR Unmodified 2867.3681 0.36810927 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 2 2 1 1 1 126.07 126.07 3;4 2.6242E-18 129203 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.689 86.948 406030000 0 0 0 0 0 0 0 181710000 0 0 60720000 82689000 80910000 27238 3753 25609 250397;250398;250399;250400;250401 320141;320142;320143;320144;320145;320146;320147;320148 320143 8 LILPELGPVFK Unmodified 1224.7482 0.74819598 312 F8VSC5;A0A0U1RQQ9;Q6P3W7;H0YIK6 SCYL2 SCY1-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.69 135.69 2 0.0004941 139844 QUIQUE_C1277_190116_001 101.64 49.789 216320000 18493000 17264000 0 18145000 19308000 24313000 21877000 14270000 0 11323000 26912000 20039000 24377000 27239 312 25610 250402;250403;250404;250405;250406;250407;250408;250409;250410;250411;250412 320149;320150;320151;320152;320153;320154;320155;320156;320157;320158;320159;320160;320161 320151 12 LILPHVDIQLK Unmodified 1287.7915 0.79145778 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 0 4 2 3 2 3 2 2 4 2 2 3 3 3 121.1 121.1 2;3 0.00024226 102870 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.616 51.873 15983000000 1996700000 1555800000 603220000 480430000 1266100000 1236000000 1006200000 1630400000 710580000 307230000 1806500000 2159100000 1224800000 27240 2518 25611 250413;250414;250415;250416;250417;250418;250419;250420;250421;250422;250423;250424;250425;250426;250427;250428;250429;250430;250431;250432;250433;250434;250435;250436;250437;250438;250439;250440;250441;250442;250443;250444;250445;250446;250447 320162;320163;320164;320165;320166;320167;320168;320169;320170;320171;320172;320173;320174;320175;320176;320177;320178;320179;320180;320181;320182;320183;320184;320185;320186;320187;320188;320189;320190;320191;320192;320193;320194;320195;320196;320197;320198;320199;320200;320201;320202;320203;320204;320205;320206;320207 320187 42 LILPVGPAGGNQMLEQYDK Oxidation (M) 2058.0456 0.045576569 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;A0A3F2YNX8 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 106.21 106.21 2;3 3.0201E-74 111009 QUIQUE_C1218_190116_001 194.12 173.74 1086600000 96220000 104210000 111170000 72647000 89868000 151820000 78011000 33269000 53100000 99200000 79165000 45012000 72949000 27241 150 25612 250448;250449;250450;250451;250452;250453;250454;250455;250456;250457;250458;250459;250460;250461;250462 320208;320209;320210;320211;320212;320213;320214;320215;320216;320217;320218;320219;320220;320221;320222;320223;320224;320225;320226;320227;320228;320229;320230 320209 85 21 LILPVGPAGGNQMLEQYDK Unmodified 2042.0507 0.050661947 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;A0A3F2YNX8 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 2 2 2 125.2 125.2 2;3 7.14E-100 129649 QUIQUE_C1277_190116_001 210.41 197.21 4664200000 549890000 555990000 559100000 445900000 436520000 424670000 527340000 49830000 156310000 168410000 341720000 204940000 243570000 27242 150 25612 250463;250464;250465;250466;250467;250468;250469;250470;250471;250472;250473;250474;250475;250476;250477;250478;250479;250480;250481;250482 320231;320232;320233;320234;320235;320236;320237;320238;320239;320240;320241;320242;320243;320244;320245;320246;320247;320248;320249;320250;320251;320252;320253;320254;320255;320256;320257;320258 320234 27 LILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIK Unmodified 2783.4528 0.4527656 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;A0A3F2YNX8 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.09 133.09 3 7.8571E-46 137474 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.87 120.97 4462100000 67144000 175980000 153810000 116400000 273480000 69826000 240790000 634380000 641300000 0 668090000 677600000 743270000 27243 150 25613 250483;250484;250485;250486;250487;250488;250489;250490;250491;250492;250493;250494 320259;320260;320261;320262;320263;320264;320265;320266;320267;320268;320269;320270;320271;320272;320273;320274;320275 320269 17 LILPVGPAGGNQMLEQYDKLQDGSIK Oxidation (M) 2799.4477 0.44768022 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;A0A3F2YNX8 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 114.02 114.02 3 2.3728E-19 117404 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.03 92.128 788880000 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27248 3662 25617 250532;250533;250534;250535;250536;250537;250538;250539;250540;250541;250542;250543;250544;250545;250546;250547;250548;250549;250550;250551;250552;250553;250554;250555;250556 320317;320318;320319;320320;320321;320322;320323;320324;320325;320326;320327;320328;320329;320330;320331;320332;320333;320334;320335;320336;320337;320338;320339;320340;320341;320342;320343;320344;320345;320346;320347 320329 28 LIMDSLHMAAR Unmodified 1256.6369 0.63694775 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.168 68.168 3 0.00062407 67489 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.01 53.381 284370000 41502000 0 36086000 21854000 30375000 17213000 24861000 14071000 19178000 0 23402000 25924000 29905000 27249 1705 25618 250557;250558;250559;250560;250561;250562;250563;250564;250565;250566;250567 320348;320349;320350;320351;320352;320353;320354;320355;320356;320357;320358;320359;320360 320360 12 LIMGIGHR Unmodified 895.50619 0.50619157 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 31.71 31.71 2 0.050046 26529 QUIQUE_C1218_190116_001 55.604 9.2525 68293000 68293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27250 2623 25619 250568 320361 320361 1 LIMQYLK Unmodified 907.52011 0.5201103 3217 Q2TAY7 SMU1 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 72.264 72.264 2 0.046357 72340 QUIQUE_C1277_190116_001 77.72 38.057 18322000 0 18322000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27251 3217 25620 250569 320362 320362 1 LIMWDPDR Unmodified 1044.5063 0.50625115 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;Q14168 MPP2 MAGUK p55 subfamily member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 88.602 88.602 2 0.020996 90483 QUIQUE_C1403_190116_001 75.854 38.834 291910000 0 65555000 56002000 50736000 39681000 54699000 0 0 25235000 0 0 0 0 27252 159 25621 250570;250571;250572;250573;250574;250575 320363;320364;320365;320366;320367;320368;320369 320366 7 LIMWDPDRYGTTVPYTSR Unmodified 2170.0517 0.05172458 159 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2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.13 168.13 2;3 4.1317E-36 172925 QUIQUE_C1368_190116_001 143.38 124.55 2011300000 104520000 230960000 191030000 74197000 105840000 147180000 266030000 129090000 92048000 0 128630000 351560000 190230000 27258 4190 25627 250597;250598;250599;250600;250601;250602;250603;250604;250605;250606;250607;250608;250609;250610;250611;250612;250613;250614;250615;250616;250617;250618;250619;250620 320392;320393;320394;320395;320396;320397;320398;320399;320400;320401;320402;320403;320404;320405;320406;320407;320408;320409;320410;320411;320412;320413;320414;320415;320416;320417 320396 26 LINGGVAGLVGVTCVFPIDLAK Unmodified 2212.229 0.22896066 4134 Q9H1K4 SLC25A18 Mitochondrial glutamate carrier 2 yes yes 0 0 0 1 160.62 160.62 3 5.2292E-05 162966 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.381 36.787 12021000 0 0 0 0 0 0 0 12021000 0 0 0 0 0 27259 4134 25628 250621 320418 320418 1 LINLVGESLR Unmodified 1112.6554 0.65535823 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;F6S6P2;X6REW1;A0A0G2JJM1 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.791 88.791 2 0.0068097 90499 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.15 49.194 883320000 0 99816000 89971000 90021000 89723000 77868000 80506000 0 78765000 27018000 93335000 77085000 79217000 27260 7 25629 250622;250623;250624;250625;250626;250627;250628;250629;250630;250631;250632 320419;320420;320421;320422;320423;320424;320425;320426;320427;320428;320429;320430 320430 8 LINQPLPDLK Unmodified 1149.6758 0.67575932 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.64 72.64 2 0.0060145 73887 QUIQUE_C1218_190116_001 118.5 78.227 3678100000 281100000 382730000 318990000 668970000 275790000 398710000 0 600810000 341230000 0 409780000 0 0 27261 2009 25630 250633;250634;250635;250636;250637;250638;250639;250640;250641 320431;320432;320433;320434;320435;320436;320437;320438;320439 320431 5 LINQVLELQHTLEDLSAR Unmodified 2091.1324 0.13241774 239 A0A0C4DGB0;Q9UIL1 SCOC Short coiled-coil protein yes no 0 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320442;320443;320444;320445;320446;320447;320448;320449;320450;320451;320452;320453;320454;320455;320456;320457;320458;320459;320460;320461;320462;320463;320464;320465;320466;320467;320468;320469;320470;320471;320472;320473;320474;320475;320476;320477;320478;320479;320480;320481;320482;320483;320484;320485;320486;320487;320488;320489;320490;320491;320492;320493;320494;320495;320496;320497;320498 320497 55 LINSLYPPGQEPIPK Unmodified 1664.9138 0.91375776 4444 Q9UI15;H7C5N2 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 0 0 2 4 2 2 2 2 1 2 3 1 2 2 3 90.174 90.174 2 2.7464E-13 92666 QUIQUE_C1218_190116_001 138.63 122.37 2862200000 290130000 269560000 220790000 191760000 209470000 214200000 206990000 201270000 218080000 68567000 254820000 262180000 254400000 27264 4444 25633 250680;250681;250682;250683;250684;250685;250686;250687;250688;250689;250690;250691;250692;250693;250694;250695;250696;250697;250698;250699;250700;250701;250702;250703;250704;250705;250706;250707 320499;320500;320501;320502;320503;320504;320505;320506;320507;320508;320509;320510;320511;320512;320513;320514;320515;320516;320517;320518;320519;320520;320521;320522;320523;320524;320525;320526;320527;320528;320529;320530;320531;320532;320533;320534;320535;320536;320537;320538;320539;320540;320541;320542;320543;320544;320545;320546;320547;320548;320549;320550;320551;320552;320553;320554;320555 320499 55 LINYHQEQAVNCLLGNVFYER Unmodified 2579.2591 0.25909159 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.36 133.36 3 8.069E-15 137435 QUIQUE_C1403_190116_001 120.75 109.84 750490000 86051000 74402000 41704000 58048000 0 42157000 77313000 91581000 84479000 22929000 0 78940000 92888000 27265 2377 25634 250708;250709;250710;250711;250712;250713;250714;250715;250716;250717;250718 320556;320557;320558;320559;320560;320561;320562;320563;320564;320565;320566;320567 320559 12 LIPDDVMTR Unmodified 1058.543 0.54303059 4450 Q9UIJ7 AK3 GTP:AMP phosphotransferase AK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.596 63.596 2 0.023183 63176 QUIQUE_C1277_190116_001 60.91 33.948 762200000 0 75468000 0 89598000 75412000 102490000 76665000 58908000 87561000 32350000 79016000 0 84735000 27266 4450 25635 250719;250720;250721;250722;250723;250724;250725;250726;250727;250728 320568;320569;320570;320571;320572;320573;320574;320575;320576;320577;320578;320579;320580;320581 320568 14 LIPDSIGKDIEK Unmodified 1326.7395 0.73948179 809 D6RG13;D6RAT0;P61247;D6RB09;D6R9B6;H0Y9Y4 RPS3A 40S ribosomal protein S3a yes no 0 0 1 1 59.135 59.135 3 0.0021201 57232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.414 41.1 45461000 0 0 0 0 0 0 0 45461000 0 0 0 0 0 27267 809 25636 250729 320582 320582 1 LIPDTLYSVNLVALYSDGEGNPSPAQGR Unmodified 2945.4771 0.4770661 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 155.88 155.88 3 0.061544 150904 QUIQUE_DMIX4_190116_001 17.65 14.309 11162000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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250754 320608 320608 1 LIPGVEYLVSIIAMK Oxidation (M) 1660.9474 0.94736607 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 169.27 169.27 2;3 1.3449E-05 170691 QUIQUE_C1563_190116_001 100.93 80.724 1080100000 10435000 23739000 46984000 35369000 66051000 144670000 37263000 88784000 309140000 28504000 96616000 93875000 98668000 27271 2233 25640 250755;250756;250757;250758;250759;250760;250761;250762;250763;250764;250765;250766;250767;250768;250769;250770 320609;320610;320611;320612;320613;320614;320615;320616;320617;320618;320619;320620;320621;320622;320623;320624 320614 1594 16 LIPGVEYLVSIIAMK Unmodified 1644.9525 0.95245145 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 171.31 171.31 2;3 5.5714E-06 175257 QUIQUE_DMIX8_190116_001 121.08 93.063 2353200000 18267000 30526000 16898000 15318000 55815000 0 142700000 167160000 783590000 28290000 457770000 422050000 214840000 27272 2233 25640 250771;250772;250773;250774;250775;250776;250777;250778;250779;250780;250781;250782;250783;250784;250785;250786;250787;250788 320625;320626;320627;320628;320629;320630;320631;320632;320633;320634;320635;320636;320637;320638;320639;320640;320641;320642;320643;320644;320645;320646 320644 21 LIPLITSNCTSK Unmodified 1345.7275 0.72753689 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 70.924 70.924 2 0.0034677 71104 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.006 51.059 251950000 0 0 0 64072000 74060000 0 71213000 42610000 0 0 0 0 0 27273 310;830 25641 250789;250790;250791;250792 320647;320648;320649;320650 320650 3 LIPLLLQLTSR Unmodified 1265.8071 0.80710784 101 A0A0G2JN29;A0A087X117;Q15155;A0A0G2JP90;A0A087WW46;J3KN36;P69849;Q5JPE7;H3BUC9;A0A087WTD5 NOMO1;NOMO3;NOMO2 Nodal modulator 1;Nodal modulator 3;Nodal modulator 2 yes no 0 0 0 1 1 144.22 144.22 2 0.019301 150994 QUIQUE_C1438_190116_001 64.297 34.043 44525000 0 0 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1515.7529 0.75290002 448 A0A2R8Y7R9;Q13136;H0YDW2 PPFIA1 Liprin-alpha-1 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 2 13.706 13.706 2;3 0.00035669 5461 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.89 79.003 155580000 0 6813200 0 6818500 0 0 0 11061000 39446000 0 32285000 0 59152000 27278 448 25646 250802;250803;250804;250805;250806;250807;250808;250809;250810 320662;320663;320664;320665;320666;320667;320668;320669;320670 320669 8 LIQEEKETTEQR Unmodified 1502.7577 0.75765105 1612 O75145 PPFIA3 Liprin-alpha-3 yes yes 0 0 1 1 1 15.558 15.558 3 0.00035422 7727 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.189 73.644 76348000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39619000 0 36729000 27279 1612 25647 250811;250812 320671;320672;320673 320673 3 LIQELAK Unmodified 813.496 0.49600404 1543 O43681;A0A087WXS7 ASNA1 ATPase ASNA1 yes no 0 0 0 1 32.008 32.008 2 0.060883 25744 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.093 10.406 90646000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90646000 0 0 0 27280 1543 25648 250813 320674 320674 1 LIQEQHPEEELIK Unmodified 1604.841 0.84098675 267;275;3025 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320775;320776;320777;320778;320779;320780;320781;320782;320783;320784;320785;320786;320787;320788;320789;320790;320791;320792;320793;320794;320795;320796;320797;320798;320799;320800;320801;320802;320803;320804;320805;320806;320807;320808;320809;320810;320811;320812;320813;320814;320815;320816;320817;320818;320819;320820;320821;320822;320823;320824;320825;320826;320827;320828;320829;320830;320831;320832;320833;320834;320835;320836;320837;320838;320839;320840;320841 320785 67 LIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRR Unmodified 3663.9407 0.94066457 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 134.22 134.22 5 0.030233 141187 QUIQUE_DMIX5_190116_001 19.636 16.037 37002000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37002000 0 0 27288 273;342 25655 250924 320842 320842 0 LIQIAAR Unmodified 783.49667 0.49667274 142 A0A0A0MRA5;B7Z4B8;Q9BUJ2;M0R3F1 HNRNPUL1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 34.813 34.813 2 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0.92670699 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 1 1 1 1 1 115.4 115.4 3 0.0053584 119437 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.695 31.907 172860000 0 0 0 0 0 0 0 42884000 41896000 0 53225000 0 34857000 27292 381 25659 250937;250938;250939;250940 320859;320860;320861;320862;320863 320861 3 LIQMAVALAHIR Unmodified 1334.7857 0.7856609 3369 Q6L8Q7 PDE12 2',5'-phosphodiesterase 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.049 94.049 3 0.00040945 97308 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.942 66.601 284730000 0 17044000 24035000 0 18580000 0 28419000 28735000 55489000 0 34996000 42823000 34607000 27293 3369 25660 250941;250942;250943;250944;250945;250946;250947;250948;250949 320864;320865;320866;320867;320868;320869;320870;320871;320872 320870 9 LIQNLDANHDGR Unmodified 1364.6797 0.6796755 3855 Q96FQ6 S100A16 Protein S100-A16 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 24.549 24.549 2;3 0.00097212 18171 QUIQUE_C1576_190116_001 93.096 54.133 490820000 74431000 114450000 152020000 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A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 48.202 48.202 2;3 9.2348E-66 45947 QUIQUE_C1438_190116_001 232.42 206.98 14151000000 922280000 1573700000 1580600000 1302600000 1445200000 1133700000 1450000000 386380000 731210000 518310000 1106500000 760680000 1239600000 27296 267;275;3025 25662 250981;250982;250983;250984;250985;250986;250987;250988;250989;250990;250991;250992;250993;250994;250995;250996;250997;250998;250999;251000;251001;251002;251003;251004;251005 320906;320907;320908;320909;320910;320911;320912;320913;320914;320915;320916;320917;320918;320919;320920;320921;320922;320923;320924;320925;320926;320927;320928;320929;320930;320931;320932;320933;320934;320935;320936;320937;320938;320939;320940;320941;320942 320923 37 LIQNNHYAMEDVATRR Oxidation (M) 1945.9428 0.94284283 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 1 1 1 1 1 23.114 23.114 3 7.4634E-05 17229 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.507 83.605 1060300000 0 26233000 0 0 0 0 0 307690000 283510000 0 271380000 171500000 0 27297 267;275;3025 25663 251006;251007;251008;251009;251010 320943;320944;320945;320946;320947 320944 170 5 LIQNNHYAMEDVATRR Unmodified 1929.9479 0.94792821 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 2 38.659 38.659 3;4 1.8797E-05 34387 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.909 84.348 3156900000 0 59185000 0 0 172790000 0 61888000 718960000 542760000 0 470880000 617090000 513310000 27298 267;275;3025 25663 251011;251012;251013;251014;251015;251016;251017;251018;251019;251020;251021;251022;251023;251024 320948;320949;320950;320951;320952;320953;320954;320955;320956;320957;320958;320959;320960;320961;320962;320963;320964;320965 320958 18 LIQNVFEIK Unmodified 1102.6386 0.63864553 174 A0A0A0MSI8;O00471;F8W9B8 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 92.782 92.782 2 0.0083072 95213 QUIQUE_C1368_190116_001 89.698 40.34 169510000 0 0 46501000 41318000 0 36453000 0 0 0 0 45236000 0 0 27299 174 25664 251025;251026;251027;251028 320966;320967;320968;320969 320966 3 LIQQFLTLRPDQQLHIFNTLR Unmodified 2593.4493 0.44927563 1742 O95674 CDS2 Phosphatidate cytidylyltransferase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.42 138.42 4 4.6104E-14 144721 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.04 110.39 797520000 0 41998000 71931000 70602000 53953000 35373000 78883000 88362000 95532000 0 138450000 51333000 71103000 27300 1742 25665 251029;251030;251031;251032;251033;251034;251035;251036;251037;251038;251039 320970;320971;320972;320973;320974;320975;320976;320977;320978;320979;320980;320981;320982 320979 13 LIQQPQNASMFVNR Unmodified 1644.8406 0.84060959 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 72.265 72.265 2;3 7.5826E-21 73197 QUIQUE_C1218_190116_001 158.79 126.47 1239500000 302490000 182780000 243970000 142450000 143050000 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3149.6696 0.66957509 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 131.91 131.91 3 5.7146E-19 134351 QUIQUE_C1563_190116_001 91.583 80.33 171860000 0 0 0 0 0 137590000 0 0 0 34262000 0 0 0 27304 1198 25667 251056;251057 321003;321004;321005;321006;321007 321003 5 LIQSHPESAEDLQEK Unmodified 1722.8424 0.84244331 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 30.271 30.271 2;3 1.7074E-112 24878 QUIQUE_C1576_190116_001 237.48 216.11 58029000000 3938200000 4413300000 5658700000 4245000000 5021200000 3984200000 5486700000 3974800000 5114400000 2022100000 4258900000 4300900000 5610800000 27305 267;275;3025 25668 251058;251059;251060;251061;251062;251063;251064;251065;251066;251067;251068;251069;251070;251071;251072;251073;251074;251075;251076;251077;251078;251079;251080;251081;251082;251083 321008;321009;321010;321011;321012;321013;321014;321015;321016;321017;321018;321019;321020;321021;321022;321023;321024;321025;321026;321027;321028;321029;321030;321031;321032;321033;321034;321035 321022 22 LIQSVMGAR Unmodified 973.53789 0.53788563 3402 Q6SZW1;J3KSG7;J3KRZ6 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 41.929 41.929 2 0.0041096 38718 QUIQUE_C1576_190116_001 89.752 42.685 54885000 0 0 0 0 0 0 25891000 0 0 0 0 28995000 0 27306 3402 25669 251084;251085;251086 321036;321037;321038;321039 321038 4 LIQYCQSK Unmodified 1038.5168 0.51681584 2087 P15121;E9PCX2 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 22.554 22.554 1;2 0.0036756 16071 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.69 85.556 10123000000 0 0 961150000 853250000 0 910660000 965340000 898330000 1309500000 468440000 1282700000 1086700000 1386500000 27307 2087 25670 251087;251088;251089;251090;251091;251092;251093;251094;251095;251096;251097;251098;251099;251100 321040;321041;321042;321043;321044;321045;321046;321047;321048;321049;321050;321051;321052;321053 321045 6 LISASLFLR Unmodified 1018.6175 0.61751616 135;499;4457 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;H0Y3A3;A0A3B3ITG3;Q5VWQ8;Q9UJF2;H0Y638 SYNGAP1;DAB2IP;RASAL2 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP;Disabled homolog 2-interacting protein;Ras GTPase-activating protein nGAP no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.32 107.32 2 0.0023457 110877 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.302 37.021 499230000 46622000 56999000 33798000 32388000 34439000 37319000 41907000 36322000 42119000 11187000 55974000 70156000 0 27308 135;499;4457 25671 251101;251102;251103;251104;251105;251106;251107;251108;251109;251110;251111;251112 321054;321055;321056;321057;321058;321059;321060;321061;321062;321063;321064;321065;321066;321067 321064 10 LISDIIR Unmodified 828.5069 0.50690308 3579 Q8N335;C9JM46;C9JFA7;C9K0P5 GPD1L Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)] 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251123;251124;251125;251126;251127;251128;251129 321078;321079;321080;321081;321082;321083;321084;321085 321084 8 LISEILSESVVPDVR Unmodified 1654.9142 0.91415169 423 A0A2R8Y765;J3QKS7;A0A2R8Y7U4;A0A2U3TZQ7;A0A2R8Y7I9;A0A2R8Y4T4;A0A2R8Y855;B4DGM3;Q969G3;K7EMQ8;A0A2R8YES3;J3QR61 SMARCE1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 yes no 0 0 0 1 132.88 132.88 2 0.025365 136598 QUIQUE_C1403_190116_001 45.764 33.551 18561000 0 0 0 18561000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27312 423 25675 251130 321086 321086 1 LISEQVSHHPPISAFHAEGLNNDFIFHGSIYPK Unmodified 3700.8427 0.84266509 4066 Q9BXW6 OSBPL1A Oxysterol-binding protein-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 106.88 106.88 5 6.6202E-10 111756 QUIQUE_C1438_190116_001 56.709 50.377 763060000 0 0 0 0 105310000 122630000 0 0 139560000 0 108540000 97094000 189930000 27313 4066 25676 251131;251132;251133;251134;251135;251136 321087;321088;321089;321090;321091;321092 321087 5 LISETTSVCKPEQVAK Unmodified 1788.9291 0.92914983 1348 K7ERC8;Q06136 KDSR 3-ketodihydrosphingosine reductase yes no 0 0 1 1 1 1 1 36.027 36.027 2;3 1.0905E-06 31203 QUIQUE_C1403_190116_001 119.74 94.27 107490000 0 0 0 21659000 0 23832000 0 0 44765000 17233000 0 0 0 27314 1348 25677 251137;251138;251139;251140 321093;321094;321095;321096 321093 4 LISEVIGER Unmodified 1014.571 0.5709599 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.729 58.729 2 0.0010111 57153 QUIQUE_C1368_190116_001 107.69 47.012 1307900000 0 0 127120000 155450000 62725000 85562000 173130000 116000000 108870000 74002000 136690000 110000000 158380000 27315 2184 25678 251141;251142;251143;251144;251145;251146;251147;251148;251149;251150;251151 321097;321098;321099;321100;321101;321102;321103;321104;321105;321106;321107;321108 321097 12 LISGDSSSEPTLLLSDPTLVDK Unmodified 2286.1842 0.18423812 3219 Q2UY09 COL28A1 Collagen alpha-1(XXVIII) chain yes yes 0 0 0 1 130.69 130.69 2 0.0044367 137119 QUIQUE_C1438_190116_001 65.704 45.323 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27316 3219 25679 251152 321109 321109 1 LISGEYIGALAMSEPNAGSDVVSMK Unmodified 2538.2346 0.23457591 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YKV0;H0YN10;A0A087WVD3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 136.22 136.22 2;3 5.4349E-18 141493 QUIQUE_C1368_190116_001 137.61 117.52 170200000 0 0 34723000 0 0 0 0 0 0 24574000 110900000 0 0 27317 192 25680 251153;251154;251155;251156;251157 321110;321111;321112;321113;321114;321115 321111 6 LISGVMTSK Unmodified 934.51575 0.5157532 3713 Q8WWI5 SLC44A1 Choline transporter-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 35.307 35.307 2 0.02664 29483 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.426 16.197 29613000 0 0 0 0 0 0 0 18087000 0 11527000 0 0 0 27318 3713 25681 251158;251159;251160 321116;321117;321118 321118 3 LISGWVSR Unmodified 916.51305 0.51305109 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 59.278 59.278 2 0.015035 55882 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.212 27.748 146600000 0 0 0 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321149 2566 2 LISLMSGELQR Unmodified 1245.6751 0.67510739 3524 Q86YS7 C2CD5 C2 domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 69.559 69.559 2;3 0.020303 91551 QUIQUE_DMIX8_190116_001 55.064 34.76 152310000 0 0 110420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41889000 27322 3524 25685 251179;251180 321150;321151 321151 2 LISLQSASVVYDLLTIALGR Unmodified 2131.2253 0.22525549 3486 Q86TV6;Q6PIF1;H0YJP9;H0YIZ4 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes no 0 0 0 1 177.38 177.38 3 0.0012088 180795 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.819 43.73 4867500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4867500 0 27323 3486 25686 251181 321152 321152 1 LISLTDENALSGNEELTVK Unmodified 2045.0528 0.052830017 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 114.77 114.77 2 2.3467E-16 111020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 152.74 122.93 135280000 29676000 0 0 53776000 0 23538000 0 0 0 28285000 0 0 0 27324 2079 25687 251182;251183;251184;251185;251186;251187;251188 321153;321154;321155;321156;321157;321158;321159 321159 6 LISPNLGVVFFNACEAASR Unmodified 2064.0462 0.046245271 3348 Q66K74 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 145.99 145.99 2;3 2.189E-11 150773 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.55 103.14 1109600000 81856000 91514000 94485000 29852000 105460000 80514000 93809000 78091000 81650000 17008000 124090000 123090000 108190000 27325 3348 25688 251189;251190;251191;251192;251193;251194;251195;251196;251197;251198;251199;251200;251201;251202;251203;251204;251205;251206;251207;251208;251209;251210;251211;251212 321160;321161;321162;321163;321164;321165;321166;321167;321168;321169;321170;321171;321172;321173;321174;321175;321176;321177;321178;321179;321180;321181;321182;321183;321184;321185;321186;321187;321188;321189;321190;321191 321179 32 LISQAYEVLSDPK Unmodified 1461.7715 0.7715102 3711 Q8WW22;C9JDE6;F5H170;F8WF76 DNAJA4 DnaJ homolog subfamily A member 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 90.465 90.465 2 0.0019607 92734 QUIQUE_C1277_190116_001 89.548 63.034 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1910;321911;321912;321913;321914;321915;321916;321917;321918 321573 622 LISSDGHEFIVK Unmodified 1343.7085 0.70851601 839 E5RHG8;Q15369;R4GMY8 TCEB1 Transcription elongation factor B polypeptide 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 56.155 56.155 2;3 0.00013214 52682 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.018 61.794 2986300000 265150000 271060000 363700000 186080000 0 253870000 348160000 140870000 253890000 91721000 134700000 260490000 416550000 27328 839 25691 251849;251850;251851;251852;251853;251854;251855;251856;251857;251858;251859;251860;251861;251862;251863;251864;251865;251866;251867;251868;251869;251870 321919;321920;321921;321922;321923;321924;321925;321926;321927;321928;321929;321930;321931;321932;321933;321934;321935;321936;321937;321938;321939;321940;321941;321942;321943 321937 21 LISSPTSFIDVGAR Unmodified 1461.7827 0.78274359 3507 Q86WG5;H0YD05 SBF2 Myotubularin-related protein 13 yes no 0 0 0 1 105.75 105.75 2 0.0079921 108585 QUIQUE_C1403_190116_001 71.555 44.882 25528000 0 0 0 25528000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27329 3507 25692 251871 321944 321944 0 LISSVDPQFLK Unmodified 1245.6969 0.69688869 4045 Q9BVG4;A6NDF3 PBDC1 Protein PBDC1 yes no 0 0 0 1 1 1 91.574 91.574 2 0.0027402 92663 QUIQUE_C1403_190116_001 76.465 36.463 62799000 23247000 0 0 39552000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27330 4045 25693 251872;251873;251874 321945;321946;321947 321946 3 LISTLIYK Unmodified 949.58482 0.58481905 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.361 70.361 2 0.0036323 70830 QUIQUE_C1576_190116_001 116.54 85.824 1107800000 0 0 0 91960000 125870000 91177000 140730000 116590000 106460000 63274000 140120000 123100000 108540000 27331 1470 25694 251875;251876;251877;251878;251879;251880;251881;251882;251883;251884 321948;321949;321950;321951;321952;321953;321954;321955;321956;321957;321958;321959;321960 321952 13 LISVCYFESENDWWVSK Unmodified 2160.9826 0.98264196 369;3752 A0A1W2PNV4;E9PF58;Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 0 0 0 1 1 150.51 150.51 2 0.00033458 155129 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.718 76.119 62543000 0 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321989 204 LISYAQLTGR Unmodified 1120.6241 0.6240581 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 77.499 77.499 2 0.064654 73783 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.04 46.655 37500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37500000 0 0 0 27336 1416 25699 252002 322194 322194 0 LISYSYMVR Unmodified 1130.5794 0.57941609 1912 P07099 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 76.939 76.939 2 0.0021582 76935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.253 71.33 147010000 0 0 0 0 0 0 0 147010000 0 0 0 0 0 27337 1912 25700 252003 322195;322196 322196 2 LITDLQDQNQK Unmodified 1314.6779 0.67794416 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 40.927 40.927 2 4.1374E-13 37882 QUIQUE_C1218_190116_001 195.17 154.14 1312900000 129900000 0 138250000 118370000 120100000 96925000 107860000 89564000 115560000 49689000 121940000 117770000 106990000 27338 2355 25701 252004;252005;252006;252007;252008;252009;252010;252011;252012;252013;252014;252015;252016 322197;322198;322199;322200;322201;322202;322203;322204;322205;322206;322207;322208;322209 322197 12 LITEDVQGK Unmodified 1001.5393 0.53932542 809 D6RG13;D6RAT0;P61247;D6RB09;D6RAS7;H0Y8L7;E9PFI5;D6RED7;D6RGE0 RPS3A 40S ribosomal protein S3a yes no 0 0 0 1 1 29.02 29.02 2 0.011065 23742 QUIQUE_C1576_190116_001 73.248 36.228 472640000 0 0 0 0 0 0 227800000 0 0 0 244850000 0 0 27339 809 25702 252017;252018 322210;322211 322210 2 LITEPAEIMA Unmodified 1086.5631 0.56309733 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.61 107.61 1;2 0.0014417 112035 QUIQUE_C1576_190116_001 97.602 85.555 254220000 36712000 0 29173000 35497000 0 25887000 34810000 0 0 0 31692000 28160000 32288000 27340 2422 25703 252019;252020;252021;252022;252023;252024;252025;252026;252027 322212;322213;322214;322215;322216;322217;322218;322219;322220;322221;322222 322217 8 LITIEINPDCAAITQR Unmodified 1826.956 0.95603328 2189 P21964;E7EMS6;E7EUU8;F8WBW9 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 3 2 2 1 113.77 113.77 2 1.9082E-06 118867 QUIQUE_C1576_190116_001 132.5 106.46 561970000 36637000 0 196020000 0 0 185030000 97777000 0 0 0 46508000 0 0 27341 2189 25704 252028;252029;252030;252031;252032;252033;252034;252035;252036 322223;322224;322225;322226;322227;322228;322229;322230;322231 322229 7 LITLEEEMTK Unmodified 1205.6213 0.62134049 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3;I3L398 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.654 77.654 2 0.00035401 78394 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.71 63.58 508210000 0 191190000 0 0 0 0 0 0 0 0 179790000 0 137240000 27342 1917 25705 252037;252038;252039;252040;252041;252042 322232;322233;322234;322235;322236;322237 322237 6 LITLEEEMTK Oxidation (M) 1221.6163 0.61625511 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3;I3L398 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 1 0 1 49.785 49.785 2 0.026767 44554 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.708 42.448 33211000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33211000 0 0 0 27343 1917 25705 252043 322238 322238 1 LITLEQGK Unmodified 900.52803 0.52803245 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 34.849 34.849 1;2 6.8684E-16 30098 QUIQUE_C1368_190116_001 225.08 84.101 19349000000 1205900000 1515500000 1690700000 1548700000 1539200000 1654900000 1387700000 1377900000 1559100000 582800000 1875800000 1566800000 1844300000 27344 2870 25706 252044;252045;252046;252047;252048;252049;252050;252051;252052;252053;252054;252055;252056;252057;252058;252059;252060;252061;252062;252063;252064 322239;322240;322241;322242;322243;322244;322245;322246;322247;322248;322249;322250;322251;322252;322253;322254;322255;322256;322257;322258;322259 322243 8 LITQTFSHHNQLAQK Unmodified 1764.9271 0.92711641 4543 Q9Y266;A0A0A0MSS4;A0A0A0MSU9 NUDC Nuclear migration protein nudC yes no 0 0 0 1 2 2 1 3 2 2 3 2 1 3 27.148 27.148 2;3;4 1.8226E-22 22385 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.14 125.65 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A0A087WUQ6;P07203;A0A2R8Y6B6 GPX1 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 80.045 80.045 2 1.8868E-07 80613 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.67 120.42 609830000 0 0 0 0 0 0 0 162060000 0 104650000 0 343130000 0 27350 41 25711 252104;252105;252106;252107 322301;322302;322303;322304;322305;322306 322303 6 LITWYNPLSAPELELDQAGENSVANWR Unmodified 3085.5145 0.51451424 2448 P42356 PI4KA Phosphatidylinositol 4-kinase alpha yes yes 0 0 0 1 1 165.53 165.53 3 4.2368E-15 167630 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.102 73.526 35090000 0 0 0 0 0 0 0 35090000 0 0 0 0 0 27351 2448 25712 252108;252109 322307;322308 322307 2 LIVAGLPR Unmodified 837.54362 0.54362294 3760 Q92859 NEO1 Neogenin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.492 62.492 2 0.030354 62342 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.035 18.861 80674000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49853000 30821000 0 27352 3760 25713 252110;252111;252112;252113;252114;252115;252116;252117;252118 322309;322310;322311;322312;322313;322314;322315;322316;322317 322316 9 LIVALMK Unmodified 786.50373 0.50373196 1954 P08758;D6RBL5;E9PHT9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 68.887 68.887 2 0.043299 69100 QUIQUE_C1403_190116_001 80.377 0 1363700000 0 0 281550000 353590000 0 340080000 0 0 0 166750000 0 0 221730000 27353 1954 25714 252119;252120;252121;252122;252123 322318;322319;322320;322321;322322 322319 5 LIVALMKPSR Oxidation (M) 1142.6845 0.68454987 1954 P08758;D6RBL5;E9PHT9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.867 37.867 3 0.019909 33017 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.426 45.733 986420000 0 64059000 0 66077000 68409000 0 0 156030000 184710000 56366000 194880000 0 195890000 27354 1954 25715 252124;252125;252126;252127;252128;252129;252130;252131 322323;322324;322325;322326;322327;322328;322329;322330;322331;322332 322330 9 LIVALMKPSR Unmodified 1126.6896 0.68963525 1954 P08758;D6RBL5;E9PHT9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 52.601 52.601 2;3 0.00037274 49843 QUIQUE_DMIX8_190116_001 135.83 89.405 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member 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 30.84 30.84 2 0.014225 25900 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.402 63.605 35121000 0 0 0 0 0 0 0 0 35121000 0 0 0 0 27389 3819 25748 252446;252447 322721;322722 322722 2 LKDHMLIPVSMSELEK Oxidation (M) 1884.9689 0.96890615 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 3 1 77.068 77.068 2;3;4 4.0257E-09 78345 QUIQUE_C1218_190116_001 116.51 91.169 563600000 42114000 0 35556000 0 0 0 0 29392000 106590000 229310000 76151000 44494000 0 27390 1684 25749 252448;252449;252450;252451;252452;252453;252454;252455;252456;252457;252458;252459;252460;252461;252462;252463 322723;322724;322725;322726;322727;322728;322729;322730;322731;322732;322733;322734;322735;322736;322737;322738 322724 921 14 LKDHMLIPVSMSELEK Unmodified 1868.974 0.97399153 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 3 3 3 1 2 3 87.484 87.484 2;3;4 4.1697E-65 88970 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252494;252495 322778;322779 322779 921 2 LKDHMLIPVSMSELEKVDGLLTCCSVLINK Unmodified 3441.7744 0.77437579 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 2 4 3 1 148.14 148.14 3;4;5 2.1488E-64 151750 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.07 143.47 1239700000 0 0 0 0 0 0 0 751390000 328710000 0 0 159640000 0 27393 1684 25750 252496;252497;252498;252499;252500;252501;252502;252503 322780;322781;322782;322783;322784;322785;322786;322787;322788;322789 322782 8 LKDHYLEFEK Unmodified 1320.6714 0.67140222 616 B4DKF8;E5RJ29;Q9NYI0;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 PH and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 1 1 3 2 2 1 1 1 1 1 2 2 34.454 34.454 2;3 0.00075252 30700 QUIQUE_C1218_190116_001 88.338 65.652 1470700000 119500000 223000000 130100000 168610000 97075000 95678000 131490000 0 96941000 33448000 203200000 171640000 0 27394 616 25751 252504;252505;252506;252507;252508;252509;252510;252511;252512;252513;252514;252515;252516;252517;252518;252519;252520 322790;322791;322792;322793;322794;322795;322796;322797;322798;322799;322800;322801;322802;322803;322804;322805;322806;322807 322790 15 LKDIGPEVVK Unmodified 1096.6492 0.64921022 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 1 30.066 30.066 3 0.063715 25024 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.034 8.6615 33832000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33832000 0 0 27395 455 25752 252521 322808 322808 1 LKDISTLEPLK Unmodified 1255.7388 0.73875351 3749 Q92688 ANP32B Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B yes yes 0 0 1 1 56.988 56.988 3 0.023223 55086 QUIQUE_C1403_190116_001 49.448 0 63047000 0 0 0 63047000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27396 3749 25753 252522 322809 322809 1 LKDIVSLVPR Unmodified 1138.7074 0.7073938 1737 O95573;F5GWH2 ACSL3 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.813 70.813 3 0.0032945 71038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.201 70.715 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Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 1 1 90.829 90.829 3 0.068595 93299 QUIQUE_DMIX8_190116_001 36.445 30.961 26747000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26747000 27399 462 25756 252551 322843 322843 1 LKDLIAWQIPFLAEGIR Unmodified 1982.1353 0.13531828 126 A0A096LNH6;Q14185 DOCK1 Dedicator of cytokinesis protein 1 yes no 0 0 1 1 153.96 153.96 3 0.0012115 159065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.765 52.666 15237000 0 0 0 0 0 0 0 0 15237000 0 0 0 0 27400 126 25757 252552 322844 322844 1 LKDLILLIK Unmodified 1067.7318 0.73181764 97 A0A087X0V5;P29728;F8W1C5 OAS2 2'-5'-oligoadenylate synthase 2 yes no 0 0 1 1 88.194 88.194 3 0.026116 91654 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.756 53.756 22678000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22678000 0 0 27401 97 25758 252553 322845 322845 1 LKDLNSQADSLMTSSAFDTSQVK Oxidation (M) 2501.1955 0.19554786 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 78.378 78.378 2;3 4.7664E-49 79153 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0.88720866 400 A0A286YEX2;Q5T7P8;V9GYC4;V9GYY7;V9GY33 SYT6 Synaptotagmin-6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 105.46 105.46 3 0.0087222 107008 QUIQUE_C1563_190116_001 51.591 36.205 187780000 40031000 41634000 32274000 40279000 0 33559000 0 0 0 0 0 0 0 27405 400 25761 252609;252610;252611;252612;252613 322921;322922;322923;322924;322925 322925 5 LKDSEAELQR Unmodified 1187.6146 0.61461563 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 16.706 16.706 2;3 3.4669E-11 9185 QUIQUE_DMIX3_190116_001 166.33 97.904 40335000000 2683500000 3443300000 2053900000 3489200000 2485100000 2054100000 3113700000 2662700000 3619800000 702640000 5950600000 3484300000 4592500000 27406 3171 25762 252614;252615;252616;252617;252618;252619;252620;252621;252622;252623;252624;252625;252626;252627;252628;252629;252630;252631;252632;252633;252634;252635;252636;252637;252638 322926;322927;322928;322929;322930;322931;322932;322933;322934;322935;322936;322937;322938;322939;322940;322941;322942;322943;322944;322945;322946;322947;322948;322949;322950 322942 20 LKDSEAELQRR Unmodified 1343.7157 0.71572665 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 2 1 1 12.557 12.557 3 0.0029817 5068 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.113 57.546 42276000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20081000 0 22195000 27407 3171 25763 252639;252640 322951;322952 322952 1 LKDTENAIENMVGPDWK Unmodified 1958.9408 0.94077715 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 99.139 99.139 2;3 3.6914E-22 101539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.51 37.212 1000200000 0 0 0 231020000 183470000 0 0 0 281630000 20204000 0 283840000 0 27408 831;1569 25764 252641;252642;252643;252644;252645 322953;322954;322955;322956;322957 322955 5 LKDVLLQVDDERR Unmodified 1597.8788 0.87876924 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 2 1 1 47.479 47.479 2;4 0.014542 45445 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.43 84.455 101240000 0 0 0 0 0 0 0 0 28458000 0 72779000 0 0 27409 2378 25765 252646;252647 322958;322959 322958 2 LKDVQEQLSR Unmodified 1214.6619 0.66190017 1610 O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 1 1 23.153 23.153 2 0.018294 16607 QUIQUE_C1576_190116_001 87.913 43.778 52012000 0 0 0 0 0 0 52012000 0 0 0 0 0 0 27410 1610 25766 252648 322960 322960 1 LKDYAFIHFDER Unmodified 1552.7674 0.76742787 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 72.831 72.831 3;4 0.0038148 73495 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.31 45.365 266630000 0 24325000 23738000 25547000 0 0 30701000 0 30734000 0 103840000 27744000 0 27411 1581 25767 252649;252650;252651;252652;252653;252654;252655;252656 322961;322962;322963;322964;322965;322966;322967;322968 322965 8 LKDYAFVHFEDR Unmodified 1538.7518 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252684;252685;252686;252687;252688;252689;252690;252691;252692;252693;252694;252695;252696;252697;252698;252699;252700;252701;252702;252703;252704;252705;252706;252707;252708;252709;252710 322998;322999;323000;323001;323002;323003;323004;323005;323006;323007;323008;323009;323010;323011;323012;323013;323014;323015;323016;323017;323018;323019;323020;323021;323022;323023;323024;323025;323026;323027 323006 26 LKECMDMLR Unmodified 1194.5559 0.55592023 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 41.991 41.991 2;3 0.0017596 38274 QUIQUE_C1403_190116_001 79.489 54.052 599270000 95727000 60402000 0 31741000 38747000 49998000 87202000 44913000 92226000 0 35941000 62373000 0 27417 1700 25773 252711;252712;252713;252714;252715;252716;252717;252718;252719;252720;252721;252722;252723 323028;323029;323030;323031;323032;323033;323034;323035;323036;323037;323038;323039;323040;323041;323042 323032 15 LKEEENTVGR Unmodified 1173.599 0.59896556 4166 Q9H479 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P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 2 2 2 1 1 1 59.624 59.624 2;3 1.2503E-27 59361 QUIQUE_C1218_190116_001 201.04 150.76 3694800000 403800000 151360000 151020000 165730000 0 298490000 0 788610000 876480000 49997000 269540000 0 539780000 27440 2483 25795 252860;252861;252862;252863;252864;252865;252866;252867;252868;252869;252870;252871;252872;252873 323201;323202;323203;323204;323205;323206;323207;323208;323209;323210;323211;323212;323213;323214 323202 10 LKETGYVVERPSTTK Unmodified 1706.9203 0.9202997 4332 Q9NYF8;A0A1W2PQ43;E9PK09;E9PQN2;E9PKI6;E9PK91 BCLAF1 Bcl-2-associated transcription factor 1 yes no 0 0 2 1 22.457 22.457 3 0.049971 15865 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.871 23.768 38474000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38474000 0 0 27441 4332 25796 252874 323215 323215 1 LKEVFSMAGVVVR Unmodified 1433.8065 0.80645592 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R019;M0R2T0;M0QZM1;M0R0N3;M0QYQ7 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 1 1 1 2 86.712 86.712 2;3 0.012789 89571 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.576 44.966 276140000 0 0 0 0 0 0 0 79216000 41816000 0 155110000 0 0 27442 2603 25797 252875;252876;252877;252878 323216;323217;323218;323219 323219 4 LKEVLEYNAIGGK Unmodified 1432.7926 0.79257999 2073 P14324;A0A087WVN4;A0A087X1D8 FDPS Farnesyl pyrophosphate synthase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 56.843 56.843 2;3 0.0040574 56080 QUIQUE_C1218_190116_001 58.116 53.117 928080000 164170000 186390000 0 187230000 152500000 101490000 79445000 0 0 56861000 0 0 0 27443 2073 25798 252879;252880;252881;252882;252883;252884;252885;252886;252887;252888;252889;252890;252891;252892;252893;252894 323220;323221;323222;323223;323224;323225;323226;323227;323228;323229;323230;323231;323232;323233;323234;323235;323236 323222 10 LKEYEAAVEQLK Unmodified 1419.7609 0.76094551 1112 H0Y2W2;Q5T9A4 ATAD3A;ATAD3B ATPase family AAA domain-containing protein 3B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.486 56.486 2 0.0039579 54853 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.09 72.396 319270000 0 39543000 47977000 0 0 0 0 32112000 58036000 14930000 76945000 49728000 0 27444 1112 25799 252895;252896;252897;252898;252899;252900;252901 323237;323238;323239;323240;323241;323242;323243;323244 323243 7 LKGAILTTMLATR Unmodified 1387.8221 0.82210598 4533;3010;896;803;1135 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;Q9UQM7;Q13554;H7BZC6 CAMK2D;CAMK2A;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 1 1 83.921 83.921 3 0.018035 84315 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.836 26.947 50469000 0 0 0 0 0 0 0 50469000 0 0 0 0 0 27445 803;896;1135;4533;3010 25800 252902 323245 323245 1 LKGDDLQAIK Unmodified 1099.6237 0.62372375 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V2D6;G3V5V7;A0A0G2JPF8;A0A0G2JNQ3;P0DMR1;O60812;B7ZW38;B2RXH8 HNRNPC;HNRNPCL4;HNRNPCL1;HNRNPCL3;HNRNPCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 4;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2 yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 1 26.745 26.745 2;3 0.015612 20522 QUIQUE_C1403_190116_001 134.68 57.002 4445200000 919000000 0 369110000 445600000 823300000 925900000 381330000 0 169310000 253070000 0 0 158620000 27446 598 25801 252903;252904;252905;252906;252907;252908;252909;252910;252911;252912;252913;252914;252915 323246;323247;323248;323249;323250;323251;323252;323253;323254;323255;323256;323257;323258 323249 1 LKGDDLQAIKK Unmodified 1227.7187 0.71868677 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V2D6;G3V5V7 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 0 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 2 18.314 18.314 2;3 0.00013481 10720 QUIQUE_C1277_190116_001 138.76 102.34 12570000000 418010000 780780000 429230000 587040000 1129400000 434270000 764500000 1582400000 1459600000 0 2123200000 1392900000 1468800000 27447 598 25802 252916;252917;252918;252919;252920;252921;252922;252923;252924;252925;252926;252927;252928;252929;252930;252931;252932;252933;252934 323259;323260;323261;323262;323263;323264;323265;323266;323267;323268;323269;323270;323271;323272;323273;323274;323275;323276;323277 323260 9 LKGDVDVSGPK Unmodified 1113.603 0.60298831 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 1 2 18.205 18.205 2;3 0.016957 10546 QUIQUE_C1576_190116_001 77.379 41.499 200480000 0 0 24932000 0 0 0 35615000 139940000 0 0 0 0 0 27448 2935 25803 252935;252936;252937;252938 323278;323279;323280;323281 323279 3 LKGEIDASVPELEGDLRGPQVDVK Unmodified 2563.3493 0.34934639 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 2 1 99.363 99.363 4 0.0076913 100968 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.835 26.882 40773000 0 0 0 0 0 0 0 40773000 0 0 0 0 0 27449 2935 25804 252939 323282 323282 1 LKGEMMDLQHGSLFLQTPK 2 Oxidation (M) 2204.097 0.096960213 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 2 1 1 2 1 1 1 1 62.692 62.692 3;4 1.3246E-05 62554 QUIQUE_C1218_190116_001 99.86 90.918 1138600000 133060000 351710000 165480000 178360000 0 0 0 0 154580000 155420000 0 0 0 27450 1915 25805 252940;252941;252942;252943;252944;252945;252946 323283;323284;323285;323286;323287;323288;323289 323283 1133;1134 7 LKGEMMDLQHGSLFLQTPK Oxidation (M) 2188.102 0.10204559 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 1 1 3 2 3 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 79.325 79.325 2;3;4 5.6629E-21 80317 QUIQUE_C1277_190116_001 119.31 93.187 4704300000 695830000 307430000 391980000 287510000 219680000 265820000 163210000 260340000 231460000 373580000 746620000 234880000 525930000 27451 1915 25805 252947;252948;252949;252950;252951;252952;252953;252954;252955;252956;252957;252958;252959;252960;252961;252962;252963;252964;252965;252966;252967;252968;252969 323290;323291;323292;323293;323294;323295;323296;323297;323298;323299;323300;323301;323302;323303;323304;323305;323306;323307;323308;323309;323310;323311;323312;323313;323314 323294 1133;1134 25 LKGEMMDLQHGSLFLQTPK Unmodified 2172.1071 0.10713097 1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;C9J7H8;F5H793 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase yes no 0 0 1 3 3 3 3 2 3 3 2 2 2 2 2 2 92.987 92.987 2;3;4 1.4096E-241 95930 QUIQUE_DMIX5_190116_001 292.44 273.15 15045000000 1955800000 1794300000 1992000000 1786000000 706560000 1434000000 1608100000 364890000 564440000 336060000 1210800000 566350000 725370000 27452 1915 25805 252970;252971;252972;252973;252974;252975;252976;252977;252978;252979;252980;252981;252982;252983;252984;252985;252986;252987;252988;252989;252990;252991;252992;252993;252994;252995;252996;252997;252998;252999;253000;253001 323315;323316;323317;323318;323319;323320;323321;323322;323323;323324;323325;323326;323327;323328;323329;323330;323331;323332;323333;323334;323335;323336;323337;323338;323339;323340;323341;323342;323343;323344;323345;323346;323347;323348;323349;323350;323351;323352;323353;323354 323348 39 LKGEMMDLQHGSLFLR 2 Oxidation (M) 1905.9441 0.94408839 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 2 1 1 1 1 56.707 56.707 4 0.0040913 52640 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.888 36.004 171190000 54243000 0 0 0 0 0 0 58651000 0 58301000 0 0 0 27453 1775 25806 253002;253003;253004 323355;323356;323357 323357 964;965 2 LKGEMMDLQHGSLFLR Unmodified 1873.9543 0.95425914 1775 P00338;F5GXY2;F5GYU2;F5GXH2;F5H5J4;F5H6W8 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 1 3 3 3 2 2 1 1 2 1 1 1 2 1 88.978 88.978 2;3;4 6.7558E-07 91011 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.38 90.533 2481800000 246220000 449850000 267070000 237210000 232680000 52641000 95589000 279860000 99693000 18639000 151970000 190900000 159490000 27454 1775 25806 253005;253006;253007;253008;253009;253010;253011;253012;253013;253014;253015;253016;253017;253018;253019;253020;253021;253022;253023;253024;253025;253026;253027 323358;323359;323360;323361;323362;323363;323364;323365;323366;323367;323368;323369;323370;323371;323372;323373;323374;323375;323376;323377;323378;323379;323380;323381;323382;323383;323384;323385;323386;323387;323388 323384 31 LKGLEAEVLR Unmodified 1126.671 0.67100829 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 1 1 49.078 49.078 3 0.061439 47560 QUIQUE_DMIX5_190116_001 33.89 8.269 20922000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20922000 0 0 27455 3459 25807 253028 323389 323389 1 LKGPQITGPSLEGDLGLK Unmodified 1822.02 0.020013746 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 95.16 95.16 2;3 0.00079636 97374 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.998 45.175 619380000 0 40134000 0 0 62978000 53962000 39179000 120560000 46253000 13881000 98008000 62439000 81989000 27456 2935 25808 253029;253030;253031;253032;253033;253034;253035;253036;253037;253038;253039 323390;323391;323392;323393;323394;323395;323396;323397;323398;323399;323400;323401 323396 10 LKGSGNLEAIHIIK Unmodified 1491.8773 0.87731267 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 45.498 45.498 3 0.0020011 42775 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.499 63.375 390290000 0 0 0 0 0 0 0 0 94130000 0 170840000 125320000 0 27457 2810 25809 253040;253041;253042 323402;323403;323404 323403 0 LKGTVGEPTYDAEFQHFLR Unmodified 2207.1011 0.10111761 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 91.612 91.612 4 4.819E-05 93494 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.449 54.967 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253120;253121;253122;253123;253124;253125;253126;253127;253128;253129;253130;253131;253132;253133 323498;323499;323500;323501;323502;323503;323504;323505;323506;323507;323508;323509;323510;323511;323512;323513;323514;323515;323516;323517;323518;323519;323520 323512 23 LKLSILYPATTGR Unmodified 1431.8449 0.84494991 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 1 2 1 82.231 82.231 2;3 0.015491 83072 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.592 31.687 105760000 0 0 0 0 0 0 0 74590000 0 0 31172000 0 0 27467 2298 25819 253134;253135;253136 323521;323522;323523;323524 323521 4 LKNDNTEAFYK Unmodified 1341.6565 0.65648044 2977 X6R9L0;Q13217 DNAJC3 DnaJ homolog subfamily C member 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 24.478 24.478 2 0.0084279 17711 QUIQUE_DMIX7_190116_001 87.149 59.325 48615000 0 24856000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23759000 0 27468 2977 25820 253137;253138;253139;253140 323525;323526;323527;323528 323528 4 LKNDSDLFGLGLEEAGPK Unmodified 1901.9735 0.97345748 3229 Q3YEC7;H0Y4Z8 RABL6 Rab-like protein 6 yes no 0 0 1 1 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subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 2 1 3 2 2 2 2 2 2 1 146.83 146.83 3;4 2.4879E-57 150295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.45 121.2 4323200000 0 87310000 321800000 0 0 0 250870000 496530000 557030000 116240000 773330000 1289000000 431030000 27474 2660 25826 253172;253173;253174;253175;253176;253177;253178;253179;253180;253181;253182;253183;253184;253185;253186;253187;253188 323565;323566;323567;323568;323569;323570;323571;323572;323573;323574;323575;323576;323577;323578;323579;323580;323581;323582;323583;323584 323573 20 LKPDPNTLCDEFK Unmodified 1575.7603 0.76029359 770 CON__P02769 yes yes 0 0 1 1 70.369 70.369 3 0.00015267 66332 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.33 97.281 50667000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50667000 0 0 0 + 27475 770 25827 253189 323585 323585 1 LKPEADTLPR Unmodified 1138.6346 0.63462279 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.898 23.898 3 0.0092219 17486 QUIQUE_C1563_190116_001 72.434 47.58 1606000000 0 167920000 219550000 242870000 0 196390000 0 266700000 327170000 0 0 0 185360000 27476 3093 25828 253190;253191;253192;253193;253194;253195;253196 323586;323587;323588;323589;323590;323591;323592 323589 4 LKPEDITQIQPQQLVLR Unmodified 2018.1524 0.1524249 1893 P05556;C9JPK5;E7ERX5;Q5T3E6;E9PLR6;E7EUI6;E7EQW5 ITGB1 Integrin beta-1;Integrin beta yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 111.81 111.81 2;3 7.931E-07 114918 QUIQUE_C1403_190116_001 81.526 77.174 913320000 54302000 78676000 83570000 94260000 81605000 0 90276000 73422000 98327000 41669000 90053000 55641000 71517000 27477 1893 25829 253197;253198;253199;253200;253201;253202;253203;253204;253205;253206;253207;253208;253209;253210;253211;253212 323593;323594;323595;323596;323597;323598;323599;323600;323601;323602;323603;323604;323605;323606;323607;323608;323609;323610;323611;323612;323613;323614;323615 323598 20 LKPEGLHQLLAGFEDK Unmodified 1793.9676 0.96758424 4070 Q9BY32 ITPA Inosine triphosphate pyrophosphatase yes yes 0 0 1 3 1 1 1 2 1 1 97.748 97.748 2;3;4 0.00024611 99552 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.671 54.292 229600000 47639000 21151000 0 25932000 0 0 37845000 28727000 51718000 16591000 0 0 0 27478 4070 25830 253213;253214;253215;253216;253217;253218;253219;253220;253221;253222 323616;323617;323618;323619;323620;323621;323622;323623;323624;323625 323622 10 LKPEIKDVIEQLNLVTTWLQLQIPR Unmodified 2986.7219 0.72192824 2901 Q06323;H0YLU2 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 2 1 171.89 171.89 4 0.039153 179296 QUIQUE_DMIX5_190116_001 25.803 23.49 35953000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35953000 0 0 27479 2901 25831 253223 323626 323626 1 LKPEYLEELPTMMQHFSQFLGK Unmodified 2665.3284 0.32841671 141;2883 A0A0A0MR85;A6NNT0;Q03013 GSTM4 Glutathione S-transferase Mu 4 no no 0 0 1 2 2 1 156.16 156.16 3;4 0.0002759 159069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.359 45.913 166110000 0 0 0 0 0 0 0 75759000 62816000 0 0 0 27530000 27480 141;2883 25832 253224;253225;253226;253227;253228 323627;323628;323629;323630;323631;323632 323628 5 LKPEYLQALPEMLK Unmodified 1671.927 0.92696498 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PGV1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 109.43 109.43 2;3 8.2903E-07 112104 QUIQUE_DMIX7_190116_001 127.37 108.63 6692900000 0 247980000 769680000 797050000 213880000 573100000 839720000 681180000 0 233500000 1129100000 487670000 720020000 27481 2277 25833 253229;253230;253231;253232;253233;253234;253235;253236;253237;253238;253239;253240;253241;253242;253243;253244;253245;253246;253247 323633;323634;323635;323636;323637;323638;323639;323640;323641;323642;323643;323644;323645;323646;323647;323648;323649;323650;323651;323652;323653;323654;323655;323656 323654 20 LKPEYLQALPEMLK Oxidation (M) 1687.9219 0.92187961 2277 P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PGV1 GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 1 1 1 85.799 85.799 2 0.059886 87970 QUIQUE_C1368_190116_001 62.924 41.293 31833000 0 0 31833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27482 2277 25833 253248 323657 323657 1 LKPGDLVGVNK Unmodified 1138.671 0.67100829 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PLG2 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 43.136 43.136 2;3 0.01395 39857 QUIQUE_C1368_190116_001 80.231 57.45 460610000 0 0 78638000 126920000 0 57783000 99809000 0 0 0 97458000 0 0 27483 4672 25834 253249;253250;253251;253252;253253;253254;253255;253256 323658;323659;323660;323661;323662;323663;323664;323665 323658 8 LKPGTMIEWGNNWAR Unmodified 1771.8828 0.88280876 3985 Q9BPW8;C9JDV8 NIPSNAP1 Protein NipSnap homolog 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 95.573 95.573 2;3 9.0493E-12 98003 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.32 115.38 5273600000 549620000 509980000 451260000 364060000 296770000 343830000 375350000 424310000 356380000 83327000 541850000 528580000 448320000 27484 3985 25835 253257;253258;253259;253260;253261;253262;253263;253264;253265;253266;253267;253268;253269;253270;253271;253272;253273;253274;253275;253276;253277;253278;253279;253280;253281 323666;323667;323668;323669;323670;323671;323672;323673;323674;323675;323676;323677;323678;323679;323680;323681;323682;323683;323684;323685;323686;323687;323688;323689;323690;323691;323692;323693;323694;323695;323696 323684 27 LKPGTMIEWGNNWAR Oxidation (M) 1787.8777 0.87772338 3985 Q9BPW8;C9JDV8 NIPSNAP1 Protein NipSnap homolog 1 yes no 0 1 1 1 1 1 77.334 77.334 3 0.0035703 78357 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.817 45.026 165590000 0 0 0 0 0 0 0 0 108000000 57592000 0 0 0 27485 3985 25835 253282;253283;253284 323697;323698;323699 323699 2829 3 LKPGYLEATVDWFR Unmodified 1693.8828 0.88279198 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 3 3 2 3 2 2 2 2 122.48 122.48 2;3 1.4456E-28 125714 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.3 124.5 8957800000 881870000 562180000 718950000 209820000 802840000 318570000 593140000 698770000 923780000 117580000 984730000 968300000 1177300000 27486 3120 25836 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Actin-related protein 3 yes no 0 1 2 1 1 1 1 1 25.241 25.241 4 9.9247E-05 17734 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.992 79.243 701760000 0 0 0 0 0 0 0 148080000 115170000 22671000 0 154770000 261070000 27488 2714 25838 253314;253315;253316;253317;253318 323766;323767;323768;323769;323770 323770 2142 3 LKPKPIDVQVITHHMQR Unmodified 2039.1462 0.14623409 2714 P61158;B4DXW1 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 2 2 1 40.873 40.873 4 0.00051586 37359 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.716 61.278 292630000 0 0 0 0 0 0 0 137040000 155590000 0 0 0 0 27489 2714 25838 253319;253320;253321 323771;323772;323773;323774 323772 3 LKPLGEQER Unmodified 1068.5928 0.59275797 2615 P52888;K7EP46 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 1 1 14.75 14.75 3 0.00050284 6849 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.01 54.596 23333000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23333000 0 0 0 27490 2615 25839 253322 323775 323775 1 LKPLPGETMEK Unmodified 1241.669 0.66895938 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 27.098 27.098 2 0.049401 21457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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323785;323786;323787;323788;323789;323790;323791;323792;323793;323794;323795;323796;323797;323798;323799 323791 14 LKPQLLQGVYAMGFNRPSK Unmodified 2146.1721 0.17211449 1021 F6QDS0 DDX19A no no 0 0 2 1 92.384 92.384 4 0.033909 93237 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.587 26.148 31994000 0 0 0 0 0 0 0 31994000 0 0 0 0 0 27494 1021 25843 253340 323800 323800 1 LKPQYLEELPGQLK Unmodified 1654.9294 0.92940782 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 83.836 83.836 2;3 9.7124E-36 86939 QUIQUE_C1218_190116_001 178.53 155.84 39416000000 2203300000 2646400000 3011700000 1943300000 1412500000 3468100000 2559100000 6180400000 4000000000 1624100000 3471600000 3225500000 3669900000 27495 2174 25844 253341;253342;253343;253344;253345;253346;253347;253348;253349;253350;253351;253352;253353;253354;253355;253356;253357;253358;253359;253360;253361;253362;253363;253364;253365 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N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.44 144.44 3 0.00036269 147818 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.834 55.917 475120000 35329000 48725000 33137000 26940000 46790000 34265000 43599000 41692000 32999000 0 44046000 41970000 45627000 27500 2808 25849 253388;253389;253390;253391;253392;253393;253394;253395;253396;253397;253398;253399 323860;323861;323862;323863;323864;323865;323866;323867;323868;323869;323870;323871;323872 323867 13 LKPYFLTDGTGTVTPANASGINDGAAAVVLMK Unmodified 3191.6537 0.65365025 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.48 133.48 3 1.0306E-40 137906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.57 104.78 2613200000 130320000 158070000 125070000 159850000 187630000 129260000 154720000 270660000 308840000 90886000 385180000 221350000 291380000 27501 4054 25850 253400;253401;253402;253403;253404;253405;253406;253407;253408;253409;253410;253411;253412 323873;323874;323875;323876;323877;323878;323879;323880;323881;323882;323883;323884;323885;323886;323887 323882 15 LKPYFLTDGTGTVTPANASGINDGAAAVVLMK Oxidation (M) 3207.6486 0.64856488 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 1 1 1 125.07 125.07 3 1.486E-19 121645 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.149 61.254 44069000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44069000 0 0 0 27502 4054 25850 253413 323888 323888 2844 1 LKPYGALVDK Unmodified 1102.6386 0.63864553 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 1 1 1 32.186 32.186 3 0.033068 27545 QUIQUE_C1218_190116_001 47.971 27.194 425860000 200640000 0 225220000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27503 96 25851 253414;253415 323889;323890 323889 2 LKQDILDEMRK Unmodified 1387.7493 0.74933497 3615 Q8N8S7;A0A0U1RRM6 ENAH Protein enabled homolog yes no 0 0 2 1 1 1 43.042 43.042 3 0.019764 39411 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.089 51.853 113190000 0 0 0 0 0 0 0 52728000 35880000 0 0 24583000 0 27504 3615 25852 253416;253417;253418 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0.8861628 2267 P27701;E9PJC7 CD82 CD82 antigen;Tetraspanin yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 96.571 96.571 2;3 0.00019645 99217 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.866 77.808 577370000 0 144850000 0 0 24883000 0 0 103840000 128390000 0 96320000 0 79089000 27507 2267 25855 253438;253439;253440;253441;253442;253443;253444;253445;253446 323917;323918;323919;323920;323921;323922;323923;323924;323925;323926;323927;323928;323929 323927 12 LKQEYFVVAATLQDIIR Unmodified 2006.1201 0.12006214 2016;2017;948 P11216;E9PK47;P06737;P11217 PYGB;PYGL;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 0 1 2 2 3 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 145.09 145.09 2;3 2.2178E-54 150097 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.68 151.67 12386000000 472690000 518450000 1203300000 921000000 622900000 460030000 970780000 1379400000 1879000000 275010000 1585800000 1095600000 1002300000 27508 2016;948;2017 25856 253447;253448;253449;253450;253451;253452;253453;253454;253455;253456;253457;253458;253459;253460;253461;253462;253463;253464;253465;253466;253467;253468;253469;253470;253471;253472;253473;253474;253475 323930;323931;323932;323933;323934;323935;323936;323937;323938;323939;323940;323941;323942;323943;323944;323945;323946;323947;323948;323949;323950;323951;323952;323953;323954;323955;323956;323957;323958;323959;323960;323961;323962;323963;323964;323965;323966;323967;323968;323969;323970;323971;323972;323973;323974;323975;323976;323977;323978;323979;323980;323981;323982;323983;323984;323985 323961 54 LKQIEEQTIK Unmodified 1228.7027 0.70270235 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3 RDX Radixin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 20.549 20.549 2;3 0.0015337 13386 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.883 57.767 763290000 0 0 0 0 0 0 0 131640000 133570000 0 213190000 167090000 117800000 27509 434 25857 253476;253477;253478;253479;253480;253481;253482;253483;253484;253485 323986;323987;323988;323989;323990;323991;323992;323993;323994;323995 323990 9 LKQNLEEQLDR Unmodified 1384.731 0.73104237 3724 Q8WZA0 LZIC Protein LZIC yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 32.919 32.919 2 0.0038966 28282 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.78 75.736 177060000 0 0 40888000 0 32431000 0 0 31284000 44894000 0 0 27557000 0 27510 3724 25858 253486;253487;253488;253489;253490 323996;323997;323998;323999;324000;324001;324002 324000 5 LKQQSELQSQVR Unmodified 1442.7841 0.78414057 3087 Q14847;C9J9W2 LASP1 LIM and SH3 domain protein 1 yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 19.07 19.07 2;3 2.7561E-05 11788 QUIQUE_DMIX7_190116_001 148.32 118.07 3562200000 0 0 0 66861000 53813000 0 0 973100000 634550000 0 697410000 470760000 665720000 27511 3087 25859 253491;253492;253493;253494;253495;253496;253497;253498;253499;253500;253501;253502 324003;324004;324005;324006;324007;324008;324009;324010;324011;324012;324013;324014 324012 12 LKQVEDEKNSFR Unmodified 1491.7682 0.76815616 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 2 1 18.168 18.168 3 0.0497 10798 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.343 34.5 79832000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79832000 0 0 27512 2378 25860 253503 324015 324015 0 LKSDGTIAAITEK Unmodified 1345.7453 0.74529545 2502 P48066 SLC6A11 Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 37.016 37.016 2 3.7192E-05 32676 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.54 87.249 76647000 0 0 0 0 0 0 0 17855000 22445000 0 36347000 0 0 27513 2502 25861 253504;253505;253506 324016;324017;324018;324019 324019 4 LKSDTAAAAVR Unmodified 1101.6142 0.6142217 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 1 1 12.336 12.336 3 0.06385 4485 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.185 5.1427 2240200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2240200 0 0 0 27514 2197 25862 253507 324020 324020 1 LKSEDGVEGDLGETQSR Unmodified 1818.8595 0.85954994 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 35.639 35.639 2;3 2.9656E-29 31033 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.24 128.95 1259400000 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LKTDNAGDQHGGGGGGGGGAGAAGGGGGGENYDDPHKTPASPVVHIR Unmodified 4278.9775 0.97754845 2082 P14866 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L yes yes 0 0 2 2 2 33.045 33.045 5;6 6.3604E-12 28915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.065 54.479 228750000 0 0 0 0 0 0 0 73764000 0 0 154980000 0 0 27517 2082 25865 253541;253542;253543;253544 324058;324059;324060;324061;324062;324063 324061 6 LKTEAEIALK Unmodified 1114.6598 0.6597749 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 30.127 30.127 2;3 0.007154 24925 QUIQUE_C1438_190116_001 55.806 34.936 953630000 0 0 127480000 0 114700000 0 0 245140000 254010000 0 0 212290000 0 27518 3117 25866 253545;253546;253547;253548;253549 324064;324065;324066;324067;324068 324065 2 LKVDELISSAIFHFK Unmodified 1745.9716 0.97160699 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 135.99 135.99 3;4 0.0010972 142052 QUIQUE_C1218_190116_001 68.481 58.95 359270000 14493000 27602000 30897000 44039000 20738000 0 0 34279000 46942000 0 91743000 48537000 0 27519 2986 25867 253550;253551;253552;253553;253554;253555;253556;253557;253558;253559 324069;324070;324071;324072;324073;324074;324075;324076;324077;324078 324069 10 LKVEGYSGTAGDSMAYHNGR Oxidation (M) 2127.9644 0.96436614 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 1 1 1 31.239 31.239 3 0.0087563 26348 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.916 35.751 28161000 0 0 0 0 0 0 0 0 28161000 0 0 0 0 27520 2233 25868 253560 324079 324079 1595 1 LKVGLQVVAVK Unmodified 1152.7594 0.75942937 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 57.779 57.779 3 0.0020124 55883 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.944 67.057 12489000 0 0 0 0 0 0 0 12489000 0 0 0 0 0 27521 2004 25869 253561 324080 324080 1 LKVTEGGEPYR Unmodified 1247.651 0.65100113 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 1 1 1 1 24.015 24.015 2 0.0091673 17339 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.377 62.058 104630000 0 0 0 0 0 0 0 23486000 0 0 34448000 46694000 0 27522 956;3084 25870 253562;253563;253564 324081;324082;324083 324082 3 LKYENEVALR Unmodified 1233.6717 0.67173657 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 38.765 38.765 2 0.0023151 34386 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.71 80.268 2457500000 204760000 0 170050000 0 0 0 0 231710000 0 343440000 374670000 547710000 585200000 + 27523 776 25871 253565;253566;253567;253568;253569;253570;253571 324084;324085;324086;324087;324088;324089;324090 324089 5 LKYPLEEFVK Unmodified 1264.7067 0.7067251 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 4 1 1 1 1 1 1 1 1 86.333 86.333 3 9.8045E-05 88503 QUIQUE_C1277_190116_001 107.83 103.78 1011800000 98660000 92508000 117050000 70659000 0 72958000 84779000 68535000 78336000 28859000 120980000 89958000 88554000 27524 1198 25872 253572;253573;253574;253575;253576;253577;253578;253579;253580;253581;253582;253583;253584;253585;253586;253587 324091;324092;324093;324094;324095;324096;324097;324098;324099;324100;324101;324102;324103;324104;324105;324106;324107;324108;324109;324110;324111;324112;324113;324114;324115;324116;324117;324118;324119;324120;324121;324122;324123;324124;324125;324126;324127;324128;324129;324130;324131;324132;324133;324134;324135;324136;324137;324138;324139;324140;324141 324098 51 LKYPLEEFVKENQQEEAR Unmodified 2249.1328 0.13281167 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 2 1 83.341 83.341 4 0.015796 83758 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.966 46.349 27477000 0 0 0 0 0 0 0 27477000 0 0 0 0 0 27525 1198 25873 253588 324142 324142 0 LLAAAPAGSPAPPPR Unmodified 1384.7827 0.78268401 496 A0A3B3ISX9 yes yes 0 0 0 1 1 104.02 104.02 3 0.031363 107421 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.275 0 54388000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29416000 0 24972000 27526 496 25874 253589;253590 324143;324144 324144 2 LLAAEQTVVR Unmodified 1098.6397 0.63970816 1738 O95613 PCNT Pericentrin yes yes 0 0 0 1 1 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Unmodified 2121.1794 0.17936793 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 110.56 110.56 2;3 1.7969E-34 114149 QUIQUE_C1368_190116_001 173.06 149.59 3333900000 114560000 207510000 287850000 295280000 313670000 175190000 246930000 329250000 338010000 88230000 50481000 322370000 564560000 27533 4600 25881 253619;253620;253621;253622;253623;253624;253625;253626;253627;253628;253629;253630;253631;253632;253633;253634;253635;253636;253637;253638;253639;253640 324176;324177;324178;324179;324180;324181;324182;324183;324184;324185;324186;324187;324188;324189;324190;324191;324192;324193;324194;324195;324196;324197;324198 324180 22 LLAALMDDEVGSGEDLLR Unmodified 1915.9561 0.95609286 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 141.83 141.83 2 0.0099721 146509 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.622 63.256 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27534 4606 25882 253641 324199 324199 1 LLADELISPK Unmodified 1097.6332 0.6332258 3782 Q93100;I3L0Z1 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 86.457 86.457 2 0.0039027 89550 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.749 49.909 344200000 0 0 49061000 39381000 42066000 0 0 50701000 53852000 0 56296000 52844000 0 27535 3782 25883 253642;253643;253644;253645;253646;253647;253648 324200;324201;324202;324203;324204;324205;324206 324205 6 LLADEYTFAFPPHHDTIKK Unmodified 2242.1423 0.14225415 4480 Q9UL12;A0A0A0MT55;Q5SYV1 SARDH Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 97.099 97.099 3 0.026016 99813 QUIQUE_DMIX8_190116_001 18.455 2.5122 5859100000 0 1268700000 0 0 0 0 0 0 0 0 2320700000 0 2269700000 27536 4480 25884 253649;253650;253651 324207;324208;324209 324209 3 LLADPTGAFGK Unmodified 1088.5866 0.58660996 2300 P30044 PRDX5 Peroxiredoxin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 1 1 2 1 1 76.227 76.227 1;2 0.00014897 75699 QUIQUE_C1563_190116_001 128.36 84.553 20379000000 1554200000 1463300000 1632200000 1268600000 1771100000 1447900000 1831000000 1028600000 1489300000 704380000 2426700000 1670600000 2090900000 27537 2300 25885 253652;253653;253654;253655;253656;253657;253658;253659;253660;253661;253662;253663;253664;253665;253666;253667;253668;253669;253670;253671;253672;253673;253674 324210;324211;324212;324213;324214;324215;324216;324217;324218;324219;324220;324221;324222;324223;324224;324225;324226;324227;324228;324229;324230;324231;324232;324233;324234;324235;324236;324237;324238;324239;324240;324241;324242;324243;324244;324245;324246;324247;324248;324249;324250;324251;324252 324229 34 LLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNR Unmodified 2976.5444 0.54441738 2300 P30044 PRDX5 Peroxiredoxin-5, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 170.98 170.98 3 1.0912E-30 172676 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.86 101.55 50437000 0 0 0 0 0 0 0 50437000 0 0 0 0 0 27538 2300 25886 253675 324253 324253 1 LLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRR Unmodified 3132.6455 0.64552841 2300 P30044 PRDX5 Peroxiredoxin-5, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 166.95 166.95 4 3.976E-37 168962 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.86 104.78 127900000 0 0 0 0 0 0 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.552 76.552 2 0.0099341 77251 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.98 23.928 746700000 85118000 59344000 70615000 57625000 56227000 68072000 71710000 63658000 70085000 0 87685000 0 56558000 27546 2452 25894 253691;253692;253693;253694;253695;253696;253697;253698;253699;253700;253701 324269;324270;324271;324272;324273;324274;324275;324276;324277;324278;324279 324277 11 LLAELPASVHALTGVDLSK Unmodified 1933.0884 0.088427662 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 125.75 125.75 3 0.006855 130399 QUIQUE_C1218_190116_001 39.905 30.621 91447000 91447000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27547 3057 25895 253702 324280;324281 324281 2 LLAELVR Unmodified 812.51199 0.51198846 3471;528 Q7Z6Z7;A5YM72 HUWE1;CARNS1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1;Carnosine synthase 1 no no 0 0 0 1 63.848 63.848 2 0.049176 62539 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.269 31.807 35893000 0 0 0 0 0 0 0 35893000 0 0 0 0 0 27548 3471;528 25896 253703 324282 324282 1 LLAEPAGGLVGER Unmodified 1280.7089 0.70885036 3013 Q13572;G3V4M9 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.245 71.245 2 0.00027086 71194 QUIQUE_C1403_190116_001 112.13 62.089 663370000 0 56987000 39120000 76909000 59069000 68818000 36875000 102050000 100460000 0 0 0 123080000 27549 3013 25897 253704;253705;253706;253707;253708;253709;253710;253711;253712;253713 324283;324284;324285;324286;324287;324288;324289;324290;324291;324292;324293;324294;324295;324296;324297 324287 14 LLAEPVPGIK Unmodified 1035.6328 0.63283187 2712 P61088;F8VSD4;F8VV71;Q5JXB2;F8VZ29 UBE2N;UBE2NL Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N;Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 N-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.396 67.396 2 0.0023073 68296 QUIQUE_C1218_190116_001 90.657 57.816 12264000000 1144400000 1098900000 1110700000 882450000 1068000000 714000000 890030000 861050000 932610000 384420000 1154400000 1031200000 991650000 27550 2712 25898 253714;253715;253716;253717;253718;253719;253720;253721;253722;253723;253724;253725;253726 324298;324299;324300;324301;324302;324303;324304;324305;324306;324307;324308;324309;324310;324311;324312;324313;324314;324315;324316 324298 19 LLAESVTEVEIFGK Unmodified 1533.829 0.82902508 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 124.73 124.73 2 0.0044345 127258 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.979 17.571 181230000 0 0 0 0 0 0 0 116730000 0 37973000 0 26535000 0 27551 3053 25899 253727;253728;253729;253730;253731 324317;324318;324319;324320;324321 324317 5 LLAETVAPAVR Unmodified 1138.671 0.67100829 4014 Q9BSJ8;F8VZB1 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes no 0 0 0 1 1 59.761 59.761 2 0.027552 57757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.255 35.015 91592000 0 0 0 0 0 0 0 61266000 0 30326000 0 0 0 27552 4014 25900 253732;253733 324322;324323 324322 2 LLAEVTLK Unmodified 885.55352 0.55351892 4547 Q9Y285;K7ER00;K7EPH2;K7ER16 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 0 0 0 1 61.326 61.326 2 0.021461 56914 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.109 25.751 26852000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26852000 0 0 0 27553 4547 25901 253734 324324 324324 1 LLAFLLPR Unmodified 941.60622 0.60622319 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 119.67 119.67 2 0.01603 123937 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.801 33.761 21501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21501000 27554 934 25902 253735;253736;253737 324325;324326;324327 324327 3 LLAGDHPIDLLLR Unmodified 1444.8402 0.84019889 3070 Q14515 SPARCL1 SPARC-like protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 3 1 1 1 1 2 1 1 108.98 108.98 2;3 0.00014091 111814 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.011 65.815 594450000 65693000 40174000 34945000 31146000 55740000 73644000 49953000 39540000 40365000 20118000 66203000 44447000 32477000 27555 3070 25903 253738;253739;253740;253741;253742;253743;253744;253745;253746;253747;253748;253749;253750;253751;253752;253753;253754 324328;324329;324330;324331;324332;324333;324334;324335;324336;324337;324338;324339;324340;324341;324342;324343;324344;324345;324346;324347 324347 20 LLAHVRPPVSK Unmodified 1215.7452 0.74517629 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 19.901 19.901 2;3 0.00050493 12759 QUIQUE_C1438_190116_001 96.113 74.718 4995000000 558280000 571950000 318580000 377690000 467170000 248600000 349070000 501490000 0 162440000 562800000 361690000 515230000 27556 452 25904 253755;253756;253757;253758;253759;253760;253761;253762;253763;253764;253765;253766;253767;253768 324348;324349;324350;324351;324352;324353;324354;324355;324356;324357;324358;324359;324360;324361 324352 5 LLAHVTLELQHYHQLLEK Unmodified 2184.2055 0.20552311 2677 P56192;H0YIP0 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 89.453 89.453 3;4;5 3.9278E-05 91433 QUIQUE_C1368_190116_001 73.928 66.004 357000000 59526000 0 46335000 40177000 80087000 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324380;324381;324382;324383;324384;324385;324386;324387;324388;324389;324390 324385 11 LLALDGHLYAVGGECLLSVER Unmodified 2284.1886 0.18855241 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 2 2 3 2 1 2 2 3 1 2 3 3 134.97 134.97 2;3 2.1822E-23 139370 QUIQUE_C1576_190116_001 153.24 114.45 2503900000 0 211200000 257260000 154770000 216070000 175060000 199310000 155680000 363530000 51979000 250910000 241440000 226710000 27560 1688 25908 253796;253797;253798;253799;253800;253801;253802;253803;253804;253805;253806;253807;253808;253809;253810;253811;253812;253813;253814;253815;253816;253817;253818;253819;253820;253821 324391;324392;324393;324394;324395;324396;324397;324398;324399;324400;324401;324402;324403;324404;324405;324406;324407;324408;324409;324410;324411;324412;324413;324414;324415;324416;324417;324418;324419;324420;324421;324422;324423;324424;324425 324406 35 LLALNPDAVELFK Unmodified 1441.8181 0.81806646 4015 Q9BSL1 UBAC1 Ubiquitin-associated domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 137.99 137.99 2 0.0014578 145046 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.297 29.065 191770000 0 0 57633000 0 0 0 0 0 0 0 58782000 0 75353000 27561 4015 25909 253822;253823;253824 324426;324427;324428 324427 3 LLALYNQGHIK Unmodified 1268.7241 0.7241065 3958 Q99536;K7ESA3 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.125 48.125 3 0.0083605 45243 QUIQUE_C1403_190116_001 43.168 34.164 218250000 29508000 35661000 29741000 31252000 29293000 26351000 36443000 0 0 0 0 0 0 27562 3958 25910 253825;253826;253827;253828;253829;253830;253831 324429;324430;324431;324432;324433;324434;324435 324432 7 LLALYNQGHIKPHIDSVWPFEK Unmodified 2604.3853 0.38527838 3958 Q99536;K7ESA3 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 1 1 2 2 2 3 1 3 3 3 1 3 2 3 107.96 107.96 3;4;5 6.0306E-55 111015 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.29 118.59 6788500000 42832000 319110000 329580000 98189000 339630000 108070000 424840000 1180900000 1143800000 50383000 948890000 722320000 1079900000 27563 3958 25911 253832;253833;253834;253835;253836;253837;253838;253839;253840;253841;253842;253843;253844;253845;253846;253847;253848;253849;253850;253851;253852;253853;253854;253855;253856;253857;253858;253859;253860 324436;324437;324438;324439;324440;324441;324442;324443;324444;324445;324446;324447;324448;324449;324450;324451;324452;324453;324454;324455;324456;324457;324458;324459;324460;324461;324462;324463;324464;324465;324466;324467;324468;324469;324470;324471;324472;324473;324474 324455 39 LLANMVYQYK Unmodified 1241.6478 0.64783001 2276 P28074;H0YJM8 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.774 83.774 2 0.0003219 84778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.34 111.56 2013200000 137650000 149700000 156850000 125220000 107130000 112650000 149330000 171830000 175640000 46591000 248310000 189360000 242950000 27564 2276 25912 253861;253862;253863;253864;253865;253866;253867;253868;253869;253870;253871;253872;253873 324475;324476;324477;324478;324479;324480;324481;324482;324483;324484;324485;324486;324487;324488;324489 324482 15 LLANMVYQYK Oxidation (M) 1257.6427 0.64274463 2276 P28074;H0YJM8 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes no 0 1 0 1 60.646 60.646 2 0.015495 59580 QUIQUE_C1277_190116_001 65.313 51.959 32888000 0 32888000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27565 2276 25912 253874 324490 324490 1 LLANQQVFHISCFR Unmodified 1731.8879 0.88789414 4427 Q9UHB6;F8VQE1;F8VS07 LIMA1 LIM domain and actin-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 89.802 89.802 3 0.016409 93239 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.898 39.08 96715000 0 0 0 0 0 0 0 0 54801000 0 41915000 0 0 27566 4427 25913 253875;253876 324491;324492 324492 1 LLANSIHGLNAARPDYIASK Unmodified 2123.1487 0.14873651 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 67.298 67.298 3;4 1.0389E-05 67086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.08 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acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.27 113.27 2 1.2144E-12 119101 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.34 143.45 3178800000 244560000 226750000 239640000 244970000 283530000 249830000 253250000 286530000 291490000 0 260840000 269190000 328180000 27570 3110 25917 253894;253895;253896;253897;253898;253899;253900;253901;253902;253903;253904;253905 324511;324512;324513;324514;324515;324516;324517;324518;324519;324520;324521;324522;324523;324524 324522 12 LLAQLAQECQEQR Unmodified 1585.7882 0.78823967 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 1 60.972 60.972 2 0.011164 61086 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.977 50.107 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27571 2863 25918 253906 324525 324525 1 LLAQTTLR Unmodified 914.55492 0.5549159 2258 P27105;F8VSL7 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 35.751 35.751 2 0.009742 31592 QUIQUE_C1438_190116_001 92.187 18.863 2637600000 0 0 0 0 480670000 0 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25922 253917;253918;253919;253920;253921 324536;324537;324538;324539;324540;324541 324537 6 LLASALQTHGFHPCWPR Unmodified 1989.9996 0.99956985 4626 Q9Y5L3 ENTPD2 Ectonucleoside triphosphate diphosphohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 2 3 2 2 2 1 2 2 85.414 85.414 3;4 4.3636E-13 86786 QUIQUE_C1403_190116_001 124.09 110.26 3365100000 65528000 274480000 109080000 285880000 71964000 227590000 469280000 314400000 576340000 83356000 113030000 347680000 426490000 27576 4626 25923 253922;253923;253924;253925;253926;253927;253928;253929;253930;253931;253932;253933;253934;253935;253936;253937;253938;253939;253940;253941;253942;253943;253944;253945 324542;324543;324544;324545;324546;324547;324548;324549;324550;324551;324552;324553;324554;324555;324556;324557;324558;324559;324560;324561;324562;324563;324564;324565;324566;324567;324568;324569;324570;324571;324572 324551 26 LLASANLEEVTMK Unmodified 1417.7487 0.74866627 2384 P35659;B4DFG0;H0Y993 DEK Protein DEK yes no 0 0 0 1 1 87.592 87.592 2 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60.286 2 2.1755E-11 60073 QUIQUE_C1438_190116_001 160.75 106.2 53140000000 2884100000 3626500000 4500600000 2124800000 3438100000 2932900000 5365000000 3886000000 5924000000 3190000000 5186400000 5557000000 4524400000 27580 912;826 25926 253955;253956;253957;253958;253959;253960;253961;253962;253963;253964;253965;253966;253967 324583;324584;324585;324586;324587;324588;324589;324590;324591;324592;324593;324594;324595;324596;324597;324598;324599;324600;324601;324602;324603;324604 324588 22 LLASEIYDILQSSNMADGDSFNEMNSR Unmodified 3019.3539 0.35391577 4310 Q9NVT9;E5RJ86 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 167.08 167.08 3 2.7351E-08 170188 QUIQUE_C1403_190116_001 60.104 57.689 68876000 0 30276000 0 17793000 0 0 0 20807000 0 0 0 0 0 27581 4310 25927 253968;253969;253970 324605;324606;324607 324606 1 LLASIAEDYRK Unmodified 1277.698 0.69795133 1057 F8W9S7;Q14C86 GAPVD1 GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 51.079 51.079 3 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Unmodified 845.50446 0.50446024 3071 Q14558;B4DP31;C9J168;C9JUN4;C9JKT9 PRPSAP1 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 57.964 57.964 2 0.01188 57227 QUIQUE_C1218_190116_001 89.369 17.654 46836000 25385000 21451000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27585 3071 25931 253987;253988 324624;324625 324624 2 LLASMMCK Unmodified 952.45442 0.45441528 1565 O60256;E7EPA1;C9JJS3;C9K0K7;C9JDU5;C9JDH0;E7EW35 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 49.216 49.216 2 0.048788 46714 QUIQUE_C1218_190116_001 55.902 38.609 18232000 18232000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27586 1565 25932 253989 324626 324626 1 LLASSDPLAQIAEDKPYAELWMGTHPR Oxidation (M) 3024.5015 0.50150671 2365 P34949;H3BPB8;H3BMZ9;H3BPP3;H3BP57;H3BUZ9;H3BT48;H3BPM5;H3BQX0;H3BU66;H3BT46;H3BPU7;H3BUG1 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 131.33 131.33 4 2.1962E-09 135205 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.423 58.774 412430000 42527000 0 85706000 0 0 0 0 0 85695000 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254031;254032;254033;254034;254035;254036;254037;254038;254039;254040;254041;254042;254043;254044;254045;254046;254047;254048;254049;254050;254051;254052 324674;324675;324676;324677;324678;324679;324680;324681;324682;324683;324684;324685;324686;324687;324688;324689;324690;324691;324692;324693;324694;324695;324696;324697;324698;324699;324700;324701;324702;324703;324704;324705 324692 31 LLAVNNTNLQDVR Unmodified 1468.7998 0.79979063 3279 Q5JUW8;Q92796 DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.471 71.471 2 7.153E-10 72357 QUIQUE_C1438_190116_001 143.61 113.05 1140800000 115890000 113370000 94677000 100360000 94695000 77122000 90051000 55248000 73060000 29890000 103070000 91033000 102350000 27595 3279 25940 254053;254054;254055;254056;254057;254058;254059;254060;254061;254062;254063;254064;254065 324706;324707;324708;324709;324710;324711;324712;324713;324714;324715;324716;324717;324718;324719 324710 14 LLAVNNVCLEEVTHEEAVTALK Unmodified 2451.2679 0.26792495 2954 Q12959;A0A0C4DFT3;E7EQD7;B4E2H8;H7C166 DLG1 Disks large homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.88 119.88 3 8.6421E-06 124971 QUIQUE_C1576_190116_001 65.784 52.053 511860000 86574000 73256000 67875000 55285000 58747000 53749000 59580000 0 0 0 0 0 56789000 27596 2954 25941 254066;254067;254068;254069;254070;254071;254072;254073 324720;324721;324722;324723;324724;324725;324726;324727;324728;324729;324730;324731;324732 324729 13 LLAVTGEQAQQAR Unmodified 1383.747 0.74702678 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 38.678 38.678 2 0.0014904 34722 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.97 66.03 22664000 0 0 0 0 0 22664000 0 0 0 0 0 0 0 27597 3278 25942 254074;254075;254076;254077;254078;254079;254080;254081 324733;324734;324735;324736;324737;324738;324739;324740 324739 8 LLAVYALPSWGR Unmodified 1344.7554 0.75540662 210 A0A0B4J293;H0YKX0;Q96EP0 RNF31 E3 ubiquitin-protein ligase RNF31 yes no 0 0 0 1 129.62 129.62 2 0.027016 136413 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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324840;324841;324842;324843;324844;324845;324846;324847;324848;324849 324849 10 LLCWADAGTK Unmodified 1133.5539 0.55392962 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 1 70.283 70.283 2 0.032792 66287 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.65 35.913 14414000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14414000 0 0 0 27606 3042 25951 254172 324850 324850 1 LLCYCPGGQAGGAQQGFLLRDPLDDPDTR Unmodified 3189.4972 0.49716639 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 127.8 127.8 3 2.1873E-13 134110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.287 68.192 81941000 0 0 0 0 0 0 0 24919000 0 0 57022000 0 0 27607 3269 25952 254173;254174 324851;324852 324852 2 LLDAEDVDVPSPDEK Unmodified 1640.7781 0.77811172 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 85.93 85.93 2 0.00017149 88843 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.911 57.608 191270000 0 0 0 0 0 0 0 65562000 0 0 67628000 58082000 0 27608 1187 25953 254175;254176;254177 324853;324854;324855 324854 3 LLDAQLATGGIVDPR Unmodified 1537.8464 0.84640648 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 3 2 1 1 1 2 101.96 101.96 2;3 1.4318E-12 105393 QUIQUE_C1368_190116_001 155.15 117.68 8187800000 606710000 624580000 606910000 207540000 524570000 296950000 673850000 963240000 922820000 481240000 1009700000 774830000 494850000 27609 3117 25954 254178;254179;254180;254181;254182;254183;254184;254185;254186;254187;254188;254189;254190;254191;254192;254193;254194;254195 324856;324857;324858;324859;324860;324861;324862;324863;324864;324865;324866;324867;324868;324869;324870;324871;324872;324873;324874;324875;324876;324877;324878;324879;324880;324881;324882;324883;324884;324885;324886;324887;324888;324889 324863 32 LLDAQLSTGGIVDPSK Unmodified 1612.8672 0.8672015 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 96.062 96.062 2 1.8738E-79 100162 QUIQUE_DMIX5_190116_001 206.69 180.57 2551100000 0 0 0 137850000 308320000 175220000 294720000 36061000 259180000 0 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324906;324907;324908;324909;324910;324911;324912;324913;324914;324915;324916;324917;324918;324919;324920;324921;324922;324923;324924;324925;324926;324927;324928;324929;324930;324931;324932;324933;324934;324935;324936;324937;324938;324939;324940;324941;324942;324943;324944;324945;324946;324947;324948;324949;324950;324951;324952;324953;324954;324955;324956 324944 51 LLDCLLESHR Unmodified 1254.6391 0.63905624 4652 Q9Y6D6;E5RIF2;E5RHL7;E5RHZ1 ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.401 71.401 3 0.0040659 71799 QUIQUE_C1277_190116_001 63.694 38.568 26745000 0 11124000 0 0 15622000 0 0 0 0 0 0 0 0 27612 4652 25957 254233;254234;254235;254236 324957;324958;324959;324960 324957 4 LLDDAMAADK Unmodified 1061.5063 0.50631073 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L1I0 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.417 49.417 2 0.0034764 47434 QUIQUE_C1438_190116_001 84.213 48.917 459240000 153920000 0 0 0 75470000 71707000 66275000 0 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324980;324981;324982;324983;324984;324985 324982 2883 6 LLDDGFGMDPFPDDLTASWPDWALPR Oxidation (M) 2962.3484 0.34836011 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 yes yes 0 1 0 1 1 172.06 172.06 3 5.1057E-06 176432 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.051 52.323 41237000 0 0 0 0 0 0 0 17045000 24192000 0 0 0 0 27616 4464 25960 254261;254262 324986;324987 324987 2974 2 LLDDGFGMDPFPDDLTASWPDWALPR Unmodified 2946.3534 0.35344549 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 yes yes 0 0 0 1 174.45 174.45 3 3.9679E-08 178568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.122 56.011 23949000 0 0 0 0 0 0 0 0 23949000 0 0 0 0 27617 4464 25960 254263 324988 324988 1 LLDDISNGYDDSEDGGHTLGDPSYSYETTEK Unmodified 3392.4328 0.43281384 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.49 106.49 3 1.6496E-75 108506 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.16 155.16 446060000 43509000 41513000 40081000 33259000 0 53489000 61696000 62929000 41055000 0 0 68529000 0 27618 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1.5767E-09 129893 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.38 92.933 189840000 0 0 35672000 0 0 0 23815000 63673000 34058000 0 0 0 32627000 27624 4302 25967 254332;254333;254334;254335;254336;254337;254338 325070;325071;325072;325073;325074;325075;325076 325074 7 LLDEDEIR Unmodified 1001.5029 0.50293991 1546 O43719;Q5H919;Q5H918 HTATSF1 HIV Tat-specific factor 1 yes no 0 0 0 1 51.032 51.032 2 0.0081619 49841 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.352 56.546 52231000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52231000 0 0 27625 1546 25968 254339 325077;325078 325078 2 LLDEEEATDNDLR Unmodified 1531.7002 0.70019575 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.549 64.549 2 2.2409E-17 63532 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.43 136.03 2007000000 234370000 184130000 163770000 228120000 154710000 139940000 133370000 190670000 153780000 103900000 146240000 174050000 0 27626 3700 25969 254340;254341;254342;254343;254344;254345;254346;254347;254348;254349;254350;254351 325079;325080;325081;325082;325083;325084;325085;325086;325087;325088;325089;325090;325091;325092 325087 13 LLDEEISR Unmodified 973.50803 0.50802529 3920 Q96PU8 QKI Protein quaking yes yes 0 0 0 1 1 46.413 46.413 2 0.0089766 43853 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.195 33.077 521960000 0 0 0 0 248690000 0 0 0 0 0 273270000 0 0 27627 3920 25970 254352;254353 325093;325094 325094 2 LLDELSDPESSK Unmodified 1331.6456 0.64564098 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 68.176 68.176 2 0.016069 67900 QUIQUE_C1277_190116_001 55.353 36.258 23405000 0 23405000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27628 3684 25971 254354 325095 325095 1 LLDELSPNTAPHK Unmodified 1433.7514 0.75144346 2203 P22830;K7ELX4;K7EPN2 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 2 1 48.687 48.687 2;3 0.0015876 46523 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.058 66.544 838640000 0 0 162780000 63181000 62603000 101260000 0 18010000 131640000 0 110240000 113520000 75420000 27629 2203 25972 254355;254356;254357;254358;254359;254360;254361;254362;254363;254364;254365;254366;254367 325096;325097;325098;325099;325100;325101;325102;325103;325104;325105;325106;325107;325108;325109 325107 9 LLDELTLEGVAR Unmodified 1327.7347 0.73473076 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0;F8WCF4;C9JR33;C9J3U7;F8WF57;F8WDM4 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 111.87 111.87 2 1.7597E-09 115279 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.22 97.248 3127400000 284120000 264560000 210870000 172160000 322330000 150870000 298070000 207360000 216060000 176670000 355770000 233070000 235460000 27630 3549 25973 254368;254369;254370;254371;254372;254373;254374;254375;254376;254377;254378;254379;254380;254381;254382;254383 325110;325111;325112;325113;325114;325115;325116;325117;325118;325119;325120;325121;325122;325123;325124;325125;325126;325127;325128;325129;325130;325131;325132;325133;325134;325135;325136;325137;325138;325139;325140;325141;325142;325143;325144 325131 34 LLDENKDSLINFK Unmodified 1547.8195 0.81952302 3347 Q66K14;G3V133 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 1 1 81.028 81.028 3 0.043261 81134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.406 31.528 47282000 0 0 0 0 0 0 0 47282000 0 0 0 0 0 27631 3347 25974 254384 325145 325145 1 LLDEQFAVLR Unmodified 1202.6659 0.66592292 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 106.69 106.69 2 2.5957E-08 106874 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.86 59.561 509310000 0 0 157780000 215100000 0 0 0 51704000 64061000 20670000 0 0 0 27632 1613 25975 254385;254386;254387;254388;254389;254390;254391;254392 325146;325147;325148;325149;325150;325151;325152;325153 325151 8 LLDEVFFSEK Unmodified 1225.6231 0.62305505 2246 P25789;H0YMZ1;H0YL69;H0YN18;H0YMA1;H0YLC2;H0YKT8;H0YMI6;H0YLS6 PSMA4 Proteasome subunit alpha type-4;Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.88 113.88 2 0.00022747 116819 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.18 90.003 3838800000 269170000 289910000 332940000 290100000 285970000 267590000 312950000 284480000 287480000 155880000 407700000 319700000 334950000 27633 2246 25976 254393;254394;254395;254396;254397;254398;254399;254400;254401;254402;254403;254404;254405 325154;325155;325156;325157;325158;325159;325160;325161;325162;325163;325164;325165;325166;325167;325168;325169;325170;325171 325165 18 LLDEWFTLDEVPK Unmodified 1603.8134 0.81337501 69 H7BXI1;A0A087WXU3;A0FGR8 ESYT2 Extended synaptotagmin-2 yes no 0 0 0 1 65.124 65.124 3 0.041314 64088 QUIQUE_DMIX7_190116_001 26.541 0 379320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 379320000 0 27634 69 25977 254406 325172 325172 1 LLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFK Oxidation (M) 2424.2359 0.23589654 1183 H3BNC9;P08708 RPS17 40S ribosomal protein S17 yes no 0 1 0 1 1 1 1 144.91 144.91 2 3.0078E-27 149187 QUIQUE_C1277_190116_001 134.88 122.68 96679000 20629000 19657000 0 0 0 0 0 0 0 0 56393000 0 0 27635 1183 25978 254407;254408;254409;254410 325173;325174;325175;325176;325177;325178 325175 679 6 LLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFK Unmodified 2408.241 0.24098191 1183 H3BNC9;P08708 RPS17 40S ribosomal protein S17 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 2 153.88 153.88 2;3 6.7152E-77 159290 QUIQUE_C1368_190116_001 227.42 194.23 1025900000 104830000 164440000 84283000 33257000 61125000 86483000 91101000 40102000 115930000 0 55028000 95093000 94231000 27636 1183 25978 254411;254412;254413;254414;254415;254416;254417;254418;254419;254420;254421;254422;254423;254424;254425;254426;254427;254428;254429;254430;254431 325179;325180;325181;325182;325183;325184;325185;325186;325187;325188;325189;325190;325191;325192;325193;325194;325195;325196;325197;325198;325199 325184 21 LLDFLCR Unmodified 935.48987 0.48987281 1615 O75170 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.99 104.99 2 0.019528 109416 QUIQUE_C1218_190116_001 129.96 75.436 154790000 22765000 21859000 18437000 0 0 0 19348000 0 23834000 5981900 17469000 0 25095000 27637 1615 25979 254432;254433;254434;254435;254436;254437;254438;254439;254440 325200;325201;325202;325203;325204;325205;325206;325207;325208 325200 9 LLDGALK Unmodified 728.44324 0.44324019 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 42.55 42.55 2 0.026322 39407 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.163 94.163 242110000 0 0 0 35354000 0 0 39033000 30980000 40821000 0 45448000 50473000 0 27638 310;830 25980 254441;254442;254443;254444;254445;254446 325209;325210;325211;325212;325213;325214 325212 6 LLDGDDGPLR Unmodified 1069.5404 0.54038805 1745 O95741 CPNE6 Copine-6 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 2 1 2 1 61.373 61.373 2 5.2314E-05 60611 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325235;325236;325237;325238;325239;325240;325241;325242;325243;325244;325245;325246;325247;325248;325249;325250;325251;325252 325237 18 LLDGFFIRPFYK Unmodified 1514.8286 0.82857157 361 K7ERN1;A0A1B0GVY1;Q96PU5;H0Y8X6 NEDD4L;NEDD4 E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like no no 0 0 1 1 1 1 1 1 132.24 132.24 3 0.00033665 137225 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.548 73.198 73433000 0 0 0 0 0 0 0 18650000 20253000 0 16191000 18339000 0 27641 361 25983 254478;254479;254480;254481;254482 325253;325254;325255;325256;325257 325254 5 LLDGSAEFDGK Unmodified 1150.5506 0.55061839 3879 Q96ID5 IGSF21 Immunoglobulin superfamily member 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.16 60.16 2 0.0041614 59696 QUIQUE_C1576_190116_001 87.149 69.909 59709000 16692000 17545000 25472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27642 3879 25984 254483;254484;254485;254486;254487 325258;325259;325260;325261;325262 325261 4 LLDIACWIHHK Unmodified 1404.7336 0.73362533 358 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325263;325264;325265;325266;325267;325268;325269;325270;325271;325272;325273;325274;325275;325276;325277;325278;325279;325280;325281;325282;325283;325284;325285;325286;325287;325288;325289;325290;325291;325292;325293;325294;325295;325296;325297;325298;325299;325300;325301;325302;325303;325304;325305;325306;325307;325308;325309;325310;325311;325312;325313;325314;325315;325316;325317;325318;325319;325320;325321;325322;325323;325324;325325;325326;325327 325279 62 LLDICAAMGLLEK Unmodified 1445.7622 0.76220784 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 152.83 152.83 2 0.001257 160102 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.979 54.465 1989600000 0 80123000 68302000 1332500000 69604000 0 48377000 58216000 105960000 0 35035000 130810000 60640000 27644 1741 25986 254526;254527;254528;254529;254530;254531;254532;254533;254534;254535;254536;254537;254538 325328;325329;325330;325331;325332;325333;325334;325335;325336;325337;325338;325339;325340 325338 13 LLDKSDTAYQWNLK Unmodified 1693.8675 0.86753585 2218 P23515 OMG Oligodendrocyte-myelin glycoprotein yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 77.064 77.064 2;3 3.2408E-13 77681 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.1 122.11 285550000 0 0 0 0 0 0 0 108730000 34119000 0 46114000 48238000 48341000 27645 2218 25987 254539;254540;254541;254542;254543;254544;254545 325341;325342;325343;325344;325345;325346;325347 325342 7 LLDKVELMLPEK Unmodified 1426.8105 0.81053824 1735 Q5R3B4;O95563 MPC2 Mitochondrial pyruvate carrier 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.418 94.418 3 0.0002751 96650 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.712 65.6 370200000 29741000 0 33821000 29212000 14726000 37540000 0 37004000 55527000 0 51393000 35917000 45324000 27646 1735 25988 254546;254547;254548;254549;254550;254551;254552;254553;254554;254555;254556 325348;325349;325350;325351;325352;325353;325354;325355;325356;325357;325358 325355 9 LLDLDALR Unmodified 927.53893 0.53893149 2322 P30622;A0A3B3ITA2 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 99.748 99.748 2 0.021461 101964 QUIQUE_C1403_190116_001 75.109 8.0772 21249000 0 0 0 21249000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27647 2322 25989 254557;254558;254559;254560 325359;325360;325361;325362 325359 4 LLDLELAPSASVVLLPAGR Unmodified 1933.1248 0.12481317 3736 Q92575 UBXN4 UBX domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.96 152.96 2 0.00017402 155450 QUIQUE_C1563_190116_001 105.65 98.039 354540000 28036000 33174000 0 20778000 26690000 44190000 61576000 22042000 0 0 30848000 51884000 35320000 27648 3736 25990 254561;254562;254563;254564;254565;254566;254567;254568;254569;254570 325363;325364;325365;325366;325367;325368;325369;325370;325371;325372 325367 8 LLDLENIQIPDAPPPIPK Unmodified 1982.1088 0.10882875 3732 Q92556 ELMO1 Engulfment and cell motility protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.33 146.33 2 0.00090635 151644 QUIQUE_C1368_190116_001 93.649 72.348 273710000 27990000 31591000 21544000 57308000 31319000 0 24912000 0 0 12281000 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 165.12 165.12 2 0.0089344 168660 QUIQUE_C1403_190116_001 73.881 57.628 79756000 0 11372000 0 22802000 0 18657000 0 0 0 5927100 0 20997000 0 27651 235 25993 254599;254600;254601;254602;254603 325406;325407;325408;325409;325410 325407 1 LLDLHQSWK Unmodified 1138.6135 0.61349341 2627 P53609 PGGT1B Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.602 60.602 3 0.0023977 59229 QUIQUE_C1403_190116_001 70.028 47.308 467260000 34240000 37230000 40336000 40991000 40459000 0 0 48083000 62059000 17370000 42176000 43773000 60545000 27652 2627 25994 254604;254605;254606;254607;254608;254609;254610;254611;254612;254613;254614 325411;325412;325413;325414;325415;325416;325417;325418;325419;325420;325421 325414 11 LLDLITWELEPDGALDR Unmodified 1968.0204 0.020407676 1024 F6SYF8;Q9UBP4 DKK3 Dickkopf-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 163.75 163.75 2 6.1346E-05 167351 QUIQUE_C1277_190116_001 113.83 99.592 395350000 29739000 60289000 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LLDLLHLQLICR Unmodified 1505.8752 0.87520418 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 137.59 137.59 3 0.046851 142043 QUIQUE_C1277_190116_001 43.544 34.494 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27656 1820 25998 254635 325446 325446 1 LLDLNPASRITAEEALLHPFFKDMSL Oxidation (M) 2956.5368 0.53682958 1398 O00311 CDC7 Cell division cycle 7-related protein kinase yes yes 0 1 2 1 107.34 107.34 3 0.0047519 111137 QUIQUE_C1218_190116_001 43.162 23.187 62216000 62216000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27657 1398 25999 254636 325447 325447 780 1 LLDLSSNQLIDENQLYLIAHLPR Unmodified 2677.4439 0.44391548 432 A0A2R8Y5Q8;Q15813;A0A2U3TZJ6;A0A2R8YHI9;A0A2R8YFL4;A0A2R8Y7E7;A0A2R8Y6Q1 TBCE Tubulin-specific chaperone E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.71 155.71 3 5.1368E-08 158478 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.847 71.048 571660000 64892000 0 43739000 39513000 54652000 44024000 39567000 35991000 54100000 0 92720000 102470000 0 27658 432 26000 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124.97 2 1.459E-07 128854 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.24 112.62 1772300000 523170000 269780000 0 166800000 527600000 141410000 0 0 0 143550000 0 0 0 27664 1821 26006 254668;254669;254670;254671;254672;254673;254674;254675;254676;254677;254678;254679 325483;325484;325485;325486;325487;325488;325489;325490;325491;325492;325493;325494;325495;325496;325497;325498;325499;325500 325500 17 LLDPEDISVDHPDEK Unmodified 1720.8156 0.81555986 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 73.364 73.364 2;3 5.1316E-79 74443 QUIQUE_C1218_190116_001 207.44 182.39 29286000000 2058000000 2936000000 2157200000 2472100000 2588100000 1426500000 2324400000 2047300000 2536600000 1044400000 2864800000 2299400000 2531800000 27665 2851 26007 254680;254681;254682;254683;254684;254685;254686;254687;254688;254689;254690;254691;254692;254693;254694;254695;254696;254697;254698;254699;254700;254701;254702;254703;254704;254705;254706 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325611;325612;325613;325614;325615;325616;325617;325618;325619;325620;325621;325622;325623;325624 325612 12 LLDPSSPLALALSAR Unmodified 1522.8719 0.87189295 182 E7EUA2;A6NHU9;A0A0A0MSQ6;Q9UPX8;H7C1X5 SHANK2 SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 139.38 139.38 2 0.0049973 141999 QUIQUE_C1563_190116_001 91.03 64.911 40379000 13243000 0 0 0 0 13157000 0 13978000 0 0 0 0 0 27672 182 26014 254761;254762;254763 325625;325626;325627 325626 1 LLDQCENQELEAPGGIATPPVYGQLLALYLLHNDMNNAR Unmodified 4350.1413 0.14129123 925 E9PGT6;Q99627 COPS8 COP9 signalosome complex subunit 8 yes no 0 0 0 2 1 167.57 167.57 3;4 1.3149E-32 169647 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.324 84.238 141310000 0 0 0 0 0 0 0 78018000 0 0 63288000 0 0 27673 925 26015 254764;254765;254766 325628;325629;325630 325629 3 LLDQIVEK Unmodified 956.55425 0.5542472 909 E9PEB5;Q96AE4;C9JSZ1 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 56.503 56.503 2 0.026517 55793 QUIQUE_C1218_190116_001 107.29 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325664;325665;325666;325667;325668;325669;325670;325671;325672;325673;325674;325675;325676;325677;325678;325679;325680;325681 325670 18 LLDSLPSDTR Unmodified 1115.5823 0.58225287 1879 P05155;H9KV48;E9PGN7 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.963 58.963 2 0.0022886 57281 QUIQUE_C1368_190116_001 90.761 55.404 765000000 79265000 62060000 100810000 93323000 0 37865000 50337000 64411000 0 52834000 130590000 0 93506000 27679 1879 26021 254809;254810;254811;254812;254813;254814;254815;254816;254817;254818 325682;325683;325684;325685;325686;325687;325688;325689;325690;325691 325684 8 LLDSNHSQSMISCVKQEGSSYNER Unmodified 2768.2494 0.24939112 238 A0A0C4DGU1;A0A0C4DGA9;Q6ZU67 BEND4 BEN domain-containing protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 118.3 118.3 3 0.00016911 124313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.012 1.7744 256390000 0 0 0 0 0 68304000 0 0 76237000 0 111850000 0 0 27680 238 26022 254819;254820;254821 325692;325693;325694 325694 3 LLDSSTVTHLFK Unmodified 1359.7398 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Dystonin no no 0 0 0 1 1 111.16 111.16 2 0.020467 116613 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.349 32.557 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27690 2882 26032 254889;254890 325789;325790 325789 2 LLDVNNQR Unmodified 970.51959 0.51959303 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 26.191 26.191 2 0.016146 19651 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.614 42.112 226580000 0 0 0 0 0 0 0 93918000 81843000 0 0 0 50821000 27691 1408 26033 254891;254892;254893 325791;325792;325793 325793 3 LLDVTCSSLSVTQEEAEELLQALHR Unmodified 2840.4226 0.42258769 4360 Q9P000;E9PJ95 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 160.92 160.92 3 5.0581E-57 166296 QUIQUE_C1368_190116_001 153.83 141.03 807900000 0 158220000 188860000 0 86371000 143840000 0 0 91717000 0 138890000 0 0 27692 4360 26034 254894;254895;254896;254897;254898;254899 325794;325795;325796;325797;325798;325799 325795 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Unmodified 2940.3625 0.36248985 2651 P54920;M0R0Y2;M0R213 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 89.721 89.721 3;4 1.3216E-176 91189 QUIQUE_DMIX1_190116_001 230.03 211.31 738840000 0 0 0 0 0 0 0 246980000 128070000 0 80219000 138290000 145290000 27705 2651 26047 255065;255066;255067;255068;255069;255070;255071;255072;255073 326020;326021;326022;326023;326024;326025;326026;326027;326028;326029 326022 10 LLEALDEMLTHDIAK Unmodified 1710.8862 0.88622238 4353 Q9NZN4 EHD2 EH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.48 138.48 3 3.3618E-13 142903 QUIQUE_C1277_190116_001 133.66 105.11 959880000 139760000 131140000 46907000 83557000 127540000 24478000 86843000 34824000 52594000 40120000 61453000 64866000 65798000 27706 4353 26048 255074;255075;255076;255077;255078;255079;255080;255081;255082;255083;255084;255085;255086 326030;326031;326032;326033;326034;326035;326036;326037;326038;326039;326040;326041;326042;326043;326044 326033 15 LLEAQACTGGIIDPSTGER Unmodified 1986.9681 0.96805453 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 1 84.751 84.751 2;3 1.1273E-132 87818 QUIQUE_C1438_190116_001 228.03 204.18 1677700000 154320000 160400000 204160000 82004000 134760000 97765000 186490000 84153000 108530000 150940000 121310000 113290000 79579000 27707 3117 26049 255087;255088;255089;255090;255091;255092;255093;255094;255095;255096;255097;255098;255099;255100;255101;255102 326045;326046;326047;326048;326049;326050;326051;326052;326053;326054;326055;326056;326057;326058;326059;326060;326061;326062;326063;326064;326065;326066;326067;326068;326069;326070;326071;326072;326073;326074;326075;326076;326077 326056 33 LLEAQACTGGIIDPSTGERFPVTDAVNK Unmodified 2958.4757 0.47568589 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 107.58 107.58 3;4 5.8867E-65 110310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.22 135.67 2214500000 0 72878000 102630000 43592000 133930000 0 125350000 437630000 323370000 20871000 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E7EW69;B5ME97;Q9P0V9;E7EX04 SEPT10 Septin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.41 121.41 2 0.00043919 127038 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.53 79.657 1204100000 100430000 0 115910000 86488000 109110000 68363000 122210000 96339000 113180000 48135000 145790000 75642000 122450000 27721 646 26063 255278;255279;255280;255281;255282;255283;255284;255285;255286;255287;255288;255289 326309;326310;326311;326312;326313;326314;326315;326316;326317;326318;326319;326320;326321;326322 326320 14 LLEEENQESLR Unmodified 1358.6678 0.66777341 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 45.065 45.065 2 0.00032535 42529 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.71 79.564 411870000 0 0 0 0 65035000 0 66682000 0 101850000 0 0 0 178300000 27722 2515 26064 255290;255291;255292;255293 326323;326324;326325;326326;326327 326326 4 LLEEFVNHIQELQIMDER Unmodified 2255.1256 0.1256178 174 A0A0A0MSI8;O00471;F8W9B8 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 145.18 145.18 3 1.2154E-06 149404 QUIQUE_C1277_190116_001 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255338;255339;255340;255341;255342;255343;255344;255345;255346;255347;255348;255349;255350;255351;255352;255353;255354;255355;255356;255357;255358;255359;255360;255361 326376;326377;326378;326379;326380;326381;326382;326383;326384;326385;326386;326387;326388;326389;326390;326391;326392;326393;326394;326395;326396;326397;326398;326399;326400 326393 24 LLEETGICVVPGSGFGQR Unmodified 1917.9618 0.96184694 2226;3680 P24298;Q8TD30 GPT;GPT2 Alanine aminotransferase 1;Alanine aminotransferase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 113.38 113.38 2;3 1.2644E-08 110657 QUIQUE_DMIX4_190116_001 142.38 119.27 1211900000 54336000 67699000 99104000 91526000 84539000 71796000 82810000 113800000 111300000 44508000 164270000 122440000 103770000 27730 2226;3680 26072 255362;255363;255364;255365;255366;255367;255368;255369;255370;255371;255372;255373;255374;255375;255376 326401;326402;326403;326404;326405;326406;326407;326408;326409;326410;326411;326412;326413;326414;326415 326410 13 LLEEYTQLAR Unmodified 1234.6558 0.65575216 3515 Q86X76 NIT1 Nitrilase homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.244 85.244 2 0.00091451 86510 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.15 76.908 1373700000 148370000 132650000 173840000 142710000 147770000 134360000 159110000 0 141480000 40656000 0 152700000 0 27731 3515 26073 255377;255378;255379;255380;255381;255382;255383;255384;255385;255386;255387;255388 326416;326417;326418;326419;326420;326421;326422;326423;326424;326425;326426;326427;326428 326427 10 LLEFELAQLTK Unmodified 1303.7388 0.73875351 2999 Q13464;A0A0U1RQV4 ROCK1 Rho-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 129.42 129.42 2 0.0054522 125834 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.893 49.65 17107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17107000 0 0 0 27732 2999 26074 255389 326429 326429 1 LLEFNQGK Unmodified 947.50763 0.50763136 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.522 45.522 2 0.0025487 41982 QUIQUE_C1563_190116_001 135.87 38.798 2077000000 185560000 189400000 238730000 201850000 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326452;326453;326454;326455;326456;326457;326458 326455 7 LLEGCLVGGR Unmodified 1072.5699 0.56991404 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;E9PMX3;E9PQP1;E9PPR0;E9PLC6;E9PJL9;E9PPD6 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.794 60.794 2 0.001716 59176 QUIQUE_C1368_190116_001 94.302 48.584 4838000000 441000000 454330000 452730000 315490000 288710000 372640000 385950000 278190000 392160000 177140000 415790000 426060000 437790000 27736 1069 26078 255413;255414;255415;255416;255417;255418;255419;255420;255421;255422;255423;255424;255425 326459;326460;326461;326462;326463;326464;326465;326466;326467;326468;326469;326470;326471;326472 326462 11 LLEGDGGPNTGGMGAYCPAPQVSNDLLLK Unmodified 2943.4106 0.41064279 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes no 0 0 0 1 1 131.01 131.01 3 0.021462 136196 QUIQUE_C1218_190116_001 14.48 8.1164 133600000 50977000 82628000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27737 2194 26079 255426;255427 326473;326474 326473 2 LLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSR Unmodified 2308.0567 0.056746196 763 CON__P02533;P02533;CON__Q61782 KRT14 Keratin, type I cytoskeletal 14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 60.638 60.638 3 4.3635E-68 56731 QUIQUE_DMIX4_190116_001 177.32 160.3 277170000 0 0 0 0 0 0 0 47870000 0 125580000 0 47050000 56667000 + 27738 763 26080 255428;255429;255430;255431 326475;326476;326477;326478 326476 4 LLEGEECR Unmodified 1004.4597 0.45969489 781;782;2033;778;764;792;787 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908;P12036;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__P13647;P13647;H0YI76;CON__Q32MB2;Q86Y46;H0YIC5;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2 KRT2;NEFH;KRT6C;KRT6A;KRT5;KRT73 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal;Neurofilament heavy polypeptide;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 5;Keratin, type II cytoskeletal 73 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.719 22.719 2 0.013433 16207 QUIQUE_C1218_190116_001 87.323 57.137 2128700000 306810000 188900000 0 0 0 163190000 294540000 154290000 200730000 374790000 0 0 445440000 + 27739 781;782;2033;764;778;787;792 26081 255432;255433;255434;255435;255436;255437;255438;255439 326479;326480;326481;326482;326483;326484;326485;326486 326479 8 LLEGEEER Unmodified 973.47164 0.47163978 1819;2886;3223;2171 Q03252;P02545;A0A0C4DGC5;Q3BDU5;P20700;E9PBF6 LMNB2;LMNA;LMNB1 Lamin-B2;Prelamin-A/C;Lamin-A/C;Lamin-B1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.098 22.098 2 0.012204 15503 QUIQUE_C1218_190116_001 88.942 65.923 4864100000 940150000 908980000 856740000 0 1021500000 0 0 0 749150000 387560000 0 0 0 27740 2886;1819;3223;2171 26082 255440;255441;255442;255443;255444;255445 326487;326488;326489;326490;326491;326492 326487 6 LLEGEEERLK Unmodified 1214.6507 0.65066678 2886;2171 Q03252;P20700 LMNB2;LMNB1 Lamin-B2;Lamin-B1 no no 0 0 1 1 35.817 35.817 3 0.026695 31223 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.162 22.763 32087000 0 0 0 0 0 0 0 32087000 0 0 0 0 0 27741 2886;2171 26083 255446 326493 326493 1 LLEGEENR Unmodified 958.47197 0.47197413 395;1336;389;1342 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;A0A1W2PPA3;A0A1W2PS58;A0A1W2PQU7;A0A1X7SBR3;K7EPT8;K7EMP8;P14136;K7EPI4 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 4 2 2 3 2 3 2 30.81 30.81 1;2 2.2842E-09 12420 QUIQUE_C1277_190116_001 177.71 103.27 958140000000 56119000000 68700000000 81671000000 85109000000 62980000000 84017000000 78963000000 60897000000 78634000000 54569000000 82717000000 71931000000 91829000000 27742 389;395;1336;1342 26084 255447;255448;255449;255450;255451;255452;255453;255454;255455;255456;255457;255458;255459;255460;255461;255462;255463;255464;255465;255466;255467;255468;255469;255470;255471;255472;255473;255474;255475;255476;255477 326494;326495;326496;326497;326498;326499;326500;326501;326502;326503;326504;326505;326506;326507;326508;326509;326510;326511;326512;326513;326514;326515;326516;326517;326518;326519;326520;326521;326522;326523;326524;326525;326526;326527;326528;326529;326530;326531;326532;326533;326534;326535;326536;326537;326538;326539;326540;326541;326542;326543;326544;326545;326546 326497 40 LLEGEENRITIPVQTFSNLQIR Unmodified 2569.3864 0.3864006 395;1336;389;1342 A0A1W2PR46;A0A1W2PRT3;A0A1W2PPA3;A0A1W2PS58;A0A1X7SBR3;K7EPT8;K7EMP8;P14136;K7EPI4 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 5 5 1 3 2 6 128.75 128.75 2;3;4 6.3952E-45 131967 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.82 134.27 55516000000 173230000 0 193060000 398260000 254320000 325930000 316320000 30069000000 11281000000 178030000 1073100000 4753300000 6501200000 27743 389;395;1336;1342 26085 255478;255479;255480;255481;255482;255483;255484;255485;255486;255487;255488;255489;255490;255491;255492;255493;255494;255495;255496;255497;255498;255499;255500;255501;255502;255503;255504;255505;255506;255507 326547;326548;326549;326550;326551;326552;326553;326554;326555;326556;326557;326558;326559;326560;326561;326562;326563;326564;326565;326566;326567;326568;326569;326570;326571;326572;326573;326574;326575;326576;326577;326578;326579;326580;326581;326582;326583;326584;326585;326586;326587;326588;326589;326590;326591;326592;326593;326594 326559 46 LLEGEESR Unmodified 931.46108 0.4610751 1952;2435;772 P08670;B0YJC4;B0YJC5;CON__P05787;P05787;CON__Q9H552;CON__Q9DCV7;CON__Q3KNV1;CON__P08729;P08729;P41219;H7C5W5 VIM;KRT8;KRT7;PRPH Vimentin;Keratin, type II cytoskeletal 8;Keratin, type II cytoskeletal 7;Peripherin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.949 19.949 2 0.00048867 12527 QUIQUE_C1368_190116_001 155.51 94.711 81707000000 4911000000 5568300000 7124700000 9600500000 7022500000 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LLEGMELIVSQVHPETK Unmodified 1922.0183 0.018299186 1812 Q5I0G2;P01236;A6XMH3 PRL Prolactin yes no 0 0 0 1 125.78 125.78 3 0.00026533 130090 QUIQUE_C1218_190116_001 67.449 44.646 131830000 131830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27746 1812 26088 255534 326624;326625 326625 2 LLEGMELIVSQVHPETK Oxidation (M) 1938.0132 0.013213808 1812 Q5I0G2;P01236;A6XMH3 PRL Prolactin yes no 0 1 0 1 86.335 86.335 3 0.036075 88230 QUIQUE_C1218_190116_001 40.515 30.318 33185000 33185000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27747 1812 26088 255535 326626 326626 0 LLEHKEIDGR Unmodified 1208.6513 0.65133548 124 A0A087X2I1;P62333;H0YJC0;H0YJS8;H0YJE9;H0YJT1;H0YJD2;H0YJY8 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 1 1 16.65 16.65 3 0.0015432 9161 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.763 55.909 13835000 0 0 0 0 0 0 0 13835000 0 0 0 0 0 27748 124 26089 255536 326627 326627 1 LLEIDPYLKPYAVDFQR Unmodified 2079.1041 0.10407773 2887 Q04446 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.21 132.21 3 3.2381E-08 138460 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.92 75.732 786510000 45909000 76612000 54382000 59192000 99082000 34482000 69441000 56752000 73863000 20999000 101830000 93964000 0 27749 2887 26090 255537;255538;255539;255540;255541;255542;255543;255544;255545;255546;255547;255548 326628;326629;326630;326631;326632;326633;326634;326635;326636;326637;326638;326639;326640 326638 12 LLEIVER Unmodified 870.51747 0.51746776 2943 Q12792 TWF1 Twinfilin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 60.655 60.655 2 0.04475 59689 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.116 14.34 519460000 0 0 0 0 98748000 0 0 0 108450000 0 108890000 99956000 103420000 27750 2943 26091 255549;255550;255551;255552;255553 326641;326642;326643;326644;326645 326644 5 LLEIVSYK Unmodified 963.56408 0.56408361 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.557 76.557 2 0.0036146 76041 QUIQUE_C1563_190116_001 112.17 39.938 547350000 57027000 49370000 56589000 40502000 59200000 37644000 0 44850000 0 21162000 65002000 52273000 63735000 27751 3778 26092 255554;255555;255556;255557;255558;255559;255560;255561;255562;255563;255564 326646;326647;326648;326649;326650;326651;326652;326653;326654;326655;326656;326657 326652 12 LLEKCAMTALSSK Unmodified 1450.7524 0.75237144 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 1 1 23.404 23.404 3 0.059681 17052 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.041 8.5203 37654000 0 0 0 0 0 0 0 37654000 0 0 0 0 0 27752 3977 26093 255565 326658 326658 1 LLELFPVNR Unmodified 1099.639 0.63897988 873 E7ETZ4;Q9Y6E2;B5MCE7;B5MCH7;Q75MG1;E9PFD4 BZW2 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.4 109.4 2 0.0013557 111424 QUIQUE_C1563_190116_001 104.45 61.324 137490000 15923000 15232000 12181000 15501000 16628000 12271000 0 12411000 0 0 0 15937000 21407000 27753 873 26094 255566;255567;255568;255569;255570;255571;255572;255573;255574;255575;255576;255577 326659;326660;326661;326662;326663;326664;326665;326666;326667;326668;326669;326670;326671 326665 13 LLELGITGPEGHVLSHPEEVEAEAVYR Unmodified 2943.4978 0.49780154 1430 O14531 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 3 2 2 2 1 3 2 1 114.75 114.75 3;4 4.1722E-37 119443 QUIQUE_C1218_190116_001 127.14 119.86 5202400000 330270000 579780000 507100000 143740000 304820000 482580000 447320000 410580000 437020000 0 612790000 649690000 296740000 27754 1430 26095 255578;255579;255580;255581;255582;255583;255584;255585;255586;255587;255588;255589;255590;255591;255592;255593;255594;255595;255596;255597;255598;255599;255600;255601;255602 326672;326673;326674;326675;326676;326677;326678;326679;326680;326681;326682;326683;326684;326685;326686;326687;326688;326689;326690;326691;326692;326693;326694;326695;326696;326697;326698;326699;326700;326701;326702;326703;326704;326705;326706;326707;326708;326709;326710;326711;326712;326713;326714;326715 326673 42 LLELGPKPEVAQQTR Unmodified 1677.9414 0.94136949 2630 P53621;A0A3B3IS84;A0A3B3IT15;A0A3B3ISC6;A0A3B3ITI7 COPA Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 1 1 1 1 1 55.745 55.745 3 0.00013436 53697 QUIQUE_C1403_190116_001 85.619 48.849 260120000 63416000 0 0 91103000 0 55168000 0 0 0 0 0 50434000 0 27755 2630 26096 255603;255604;255605;255606 326716;326717;326718;326719 326717 4 LLELIEGFMLSK Unmodified 1391.7734 0.77342445 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.18 162.18 2 7.9618E-06 164297 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.78 101.71 472040000 25527000 42083000 50584000 22124000 35724000 21447000 36058000 57221000 61965000 9135200 27276000 82901000 0 27756 1741 26097 255607;255608;255609;255610;255611;255612;255613;255614;255615;255616;255617;255618 326720;326721;326722;326723;326724;326725;326726;326727;326728;326729;326730;326731;326732 326727 12 LLELIGHAVAHLK Unmodified 1412.8504 0.85036964 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 87.491 87.491 3 0.00010304 90764 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.021 66.471 121720000 0 0 55455000 0 0 0 0 0 0 0 66268000 0 0 27757 119 26098 255619;255620;255621;255622;255623;255624 326733;326734;326735;326736;326737;326738 326737 6 LLELLPGK Unmodified 881.5586 0.5586043 3605 Q8N684;F5H669;F5H6M0;F5H047;J3QT54 CPSF7 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.207 83.207 2 0.0057105 85349 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.45 58.077 429200000 34211000 47554000 35604000 24511000 40395000 31155000 31155000 30157000 37357000 0 47603000 32234000 37266000 27758 3605 26099 255625;255626;255627;255628;255629;255630;255631;255632;255633;255634;255635;255636 326739;326740;326741;326742;326743;326744;326745;326746;326747;326748;326749;326750;326751;326752;326753;326754 326752 16 LLELLWNK Unmodified 1027.6066 0.60661712 3767 Q92905 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 119.02 119.02 2 0.0028106 123042 QUIQUE_C1368_190116_001 134.66 94.091 846210000 66303000 86120000 61678000 67567000 67719000 84433000 69173000 52041000 54824000 28632000 75484000 76185000 56049000 27759 3767 26100 255637;255638;255639;255640;255641;255642;255643;255644;255645;255646;255647;255648;255649;255650 326755;326756;326757;326758;326759;326760;326761;326762;326763;326764;326765;326766;326767;326768;326769;326770;326771;326772 326759 17 LLELQELVLR Unmodified 1224.7442 0.74417324 410 A0A2Q2TH77;Q08379;A0A087WYC0 GOLGA2 Golgin subfamily A member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.54 132.54 2 0.0017165 138410 QUIQUE_C1218_190116_001 105.78 66.636 183310000 19630000 17609000 18650000 0 0 15200000 22406000 14871000 18343000 0 19763000 18220000 18614000 27760 410 26101 255651;255652;255653;255654;255655;255656;255657;255658;255659;255660;255661;255662 326773;326774;326775;326776;326777;326778;326779;326780;326781;326782;326783;326784 326773 12 LLELQEVDSLLR Unmodified 1426.8031 0.80314468 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.26 140.26 2 0.00029134 146127 QUIQUE_C1218_190116_001 132.91 59.847 775270000 38428000 67521000 51134000 129240000 48434000 28015000 52355000 52300000 115310000 34176000 57647000 47214000 53507000 27761 2101 26102 255663;255664;255665;255666;255667;255668;255669;255670;255671;255672;255673;255674;255675 326785;326786;326787;326788;326789;326790;326791;326792;326793;326794;326795;326796;326797;326798 326785 13 LLELQSIGTNNFLR Unmodified 1616.8886 0.88860564 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 127.14 127.14 2;3 2.1854E-28 132151 QUIQUE_C1563_190116_001 168.22 89.286 1841900000 157280000 114550000 147680000 109230000 131100000 151500000 179640000 81048000 175680000 76038000 219610000 164280000 134310000 27762 1713 26103 255676;255677;255678;255679;255680;255681;255682;255683;255684;255685;255686;255687;255688;255689 326799;326800;326801;326802;326803;326804;326805;326806;326807;326808;326809;326810;326811;326812;326813;326814;326815;326816 326807 17 LLELQYFISR Unmodified 1280.7129 0.71287311 3765 Q92896;H3BM42 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 133.64 133.64 2 0.0039027 137937 QUIQUE_C1277_190116_001 82.749 41.762 130960000 24888000 25608000 0 0 30358000 0 21562000 0 0 0 0 28543000 0 27763 3765 26104 255690;255691;255692;255693;255694 326817;326818;326819;326820;326821 326818 3 LLELTGPK Unmodified 869.52222 0.52221879 1858 P04217;M0R009 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 52.941 52.941 2 0.032564 51133 QUIQUE_C1368_190116_001 65.252 33.948 60524000 0 0 60524000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27764 1858 26105 255695;255696 326822;326823 326822 2 LLEMILNKPGLK Unmodified 1367.821 0.82104335 2616 P52895;B4DK69;S4R3P0 AKR1C2 Aldo-keto reductase family 1 member C2 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 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chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 150.69 150.69 3;4 4.8138E-20 156332 QUIQUE_C1368_190116_001 93.397 81.083 3645900000 220870000 367500000 409500000 304640000 228630000 121360000 403920000 339260000 206550000 0 253780000 483470000 306420000 27769 50 26109 255742;255743;255744;255745;255746;255747;255748;255749;255750;255751;255752;255753;255754;255755;255756;255757 326874;326875;326876;326877;326878;326879;326880;326881;326882;326883;326884;326885;326886;326887;326888;326889;326890;326891;326892;326893 326880 15 LLEMNLMHAPQVADAILGNQMFTHYDR 2 Oxidation (M) 3159.494 0.49399527 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 2 2 2 1 130.96 130.96 3;4 2.7862E-12 135216 QUIQUE_C1277_190116_001 66.886 60.791 1861000000 0 204990000 163970000 168990000 0 134950000 0 155500000 309350000 0 0 612940000 110340000 27770 50 26109 255758;255759;255760;255761;255762;255763;255764;255765;255766;255767;255768 326894;326895;326896;326897;326898;326899;326900;326901;326902;326903;326904 326894 34;35;36 11 LLENEETQINGFCIIENFK Unmodified 2310.1202 0.12019808 2042 P12271 RLBP1 Retinaldehyde-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 82.159 82.159 3 0.026261 83844 QUIQUE_DMIX3_190116_001 22.874 18.425 151210000 0 0 0 0 0 0 0 0 151210000 0 0 0 0 27771 2042 26110 255769 326905 326905 1 LLEPGSLGGIPSPAK Unmodified 1434.8082 0.80823006 4618 Q9Y584 TIMM22 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim22 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 91.703 91.703 2 0.026224 89082 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.175 40.232 149400000 0 44143000 0 0 0 0 0 0 0 17474000 52459000 0 35329000 27772 4618 26111 255770;255771;255772;255773 326906;326907;326908;326909 326907 3 LLEPLDYETVIEELEK Unmodified 1931.9979 0.9979409 457 A0A2R8YD85;A0A2R8Y5U0;Q96BY6;F8WE73 DOCK10 Dedicator of cytokinesis protein 10 yes no 0 0 0 1 165.49 165.49 2 0.00091569 169367 QUIQUE_C1277_190116_001 83.769 70.09 18044000 0 18044000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27773 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326997;326998;326999;327000;327001 326997 2 LLEQLQEIGQEK Unmodified 1426.7668 0.76675917 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45;A0A087WXA6 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 93.205 93.205 2 0.007705 96315 QUIQUE_C1218_190116_001 82.417 65.186 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27784 3241 26123 255855;255856;255857;255858;255859 327002;327003;327004;327005;327006 327002 5 LLEQSIQSAQETEK Unmodified 1602.8101 0.81008055 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532 DMD Dystrophin yes no 0 0 0 1 18.994 18.994 4 0.062242 11383 QUIQUE_C1563_190116_001 18.829 4.7452 160640000 0 0 0 0 0 160640000 0 0 0 0 0 0 0 27785 8 26124 255860 327007 327007 1 LLEQWEKDDDIEEGDLPEHK Unmodified 2437.1285 0.12851416 3083 Q14696 MESDC2 LDLR chaperone MESD yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.383 85.383 3 1.1214E-05 87037 QUIQUE_C1368_190116_001 76.118 67.728 546210000 82498000 74501000 104230000 0 100200000 0 0 0 0 0 101850000 82923000 0 27786 3083 26125 255861;255862;255863;255864;255865;255866 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256086;256087;256088;256089;256090;256091;256092;256093;256094;256095;256096;256097;256098 327261;327262;327263;327264;327265;327266;327267;327268;327269;327270;327271;327272;327273;327274;327275;327276;327277;327278 327277 17 LLEVIILQCK Unmodified 1227.7261 0.72608033 1727 O95373;O15397 IPO7;IPO8 Importin-7;Importin-8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.08 110.08 2 0.00024951 113092 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.4 91.46 638490000 38686000 45050000 51912000 29541000 47586000 39941000 67800000 52570000 64627000 26120000 73425000 69057000 32179000 27810 1727 26149 256099;256100;256101;256102;256103;256104;256105;256106;256107;256108;256109;256110;256111 327279;327280;327281;327282;327283;327284;327285;327286;327287;327288;327289;327290;327291 327290 10 LLEVLSGEILPK Unmodified 1309.7857 0.7857037 1472 O15020;A4QPE4;E9PJZ2 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.79 125.79 2 0.00054174 131098 QUIQUE_C1218_190116_001 93.111 72.781 242640000 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Unmodified 1014.571 0.5709599 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 70.602 70.602 2 3.7578E-09 71570 QUIQUE_C1438_190116_001 170.66 91.549 20656000000 1574900000 1685100000 1439100000 1385000000 1732200000 1130200000 1448500000 1599000000 1889700000 613510000 2172200000 1786200000 2200600000 27813 2851 26152 256141;256142;256143;256144;256145;256146;256147;256148;256149;256150;256151;256152;256153;256154 327331;327332;327333;327334;327335;327336;327337;327338;327339;327340;327341;327342;327343;327344;327345;327346;327347 327335 17 LLEVNQQSLLGLTHGEAVQLLR Unmodified 2430.3595 0.35945756 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7;H0YCG0 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.74 139.74 3 1.0939E-45 136285 QUIQUE_DMIX4_190116_001 156.85 136.23 944860000 68839000 114200000 105260000 0 89054000 43790000 78071000 86041000 103410000 43856000 73757000 75332000 63257000 27814 289 26153 256155;256156;256157;256158;256159;256160;256161;256162;256163;256164;256165;256166 327348;327349;327350;327351;327352;327353;327354;327355;327356;327357;327358;327359;327360;327361;327362 327359 15 LLEVPEGR Unmodified 911.50763 0.50763136 116 F8WCZ6;A0A087X232;P09871 C1S Complement C1s subcomponent;Complement C1s subcomponent heavy chain;Complement C1s subcomponent light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 45.887 45.887 2 0.020244 43004 QUIQUE_C1438_190116_001 77.058 27.699 112280000 0 0 0 22525000 32979000 0 29463000 27314000 0 0 0 0 0 27815 116 26154 256167;256168;256169;256170;256171;256172 327363;327364;327365;327366;327367;327368 327364 6 LLEVPVMLTEQYPQGLGPTVPELGTEGLRPLAK Oxidation (M) 3560.9164 0.91640688 3799 Q96AB3;K7EKW4;K7ENV7 ISOC2 Isochorismatase domain-containing protein 2, mitochondrial yes no 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.03 148.03 3;4 5.1971E-21 152111 QUIQUE_C1277_190116_001 82.62 77.513 973610000 159370000 67251000 77926000 76679000 0 60112000 69844000 70805000 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327383;327384;327385;327386;327387;327388;327389;327390;327391;327392;327393;327394;327395;327396;327397;327398;327399;327400;327401;327402;327403;327404;327405;327406;327407;327408;327409;327410;327411 327405 26 LLEVQGSRPGK Unmodified 1182.6721 0.67207093 2739 P62136;E9PMD7 PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 1 20.447 20.447 2;3 0.0010239 13604 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.721 50.589 2180000000 76548000 247070000 213200000 255010000 85657000 175470000 186520000 176910000 241650000 37702000 134220000 239860000 110190000 27818 2739 26156 256212;256213;256214;256215;256216;256217;256218;256219;256220;256221;256222;256223;256224;256225;256226;256227;256228;256229;256230;256231;256232 327412;327413;327414;327415;327416;327417;327418;327419;327420;327421;327422;327423;327424;327425;327426;327427;327428;327429;327430;327431;327432;327433 327427 21 LLEVQSQVEELQK Unmodified 1541.8301 0.83008771 3500 Q86VS8 HOOK3 Protein Hook homolog 3 yes yes 0 0 0 1 84.795 84.795 2 0.010408 81132 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.499 44.773 15009000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15009000 0 0 0 27819 3500 26157 256233 327434 327434 1 LLEVSDDPQVLAVAAHDVGEYVR Unmodified 2494.2704 0.27036779 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 145.62 145.62 2;3 4.2086E-50 151477 QUIQUE_C1218_190116_001 171.09 140.65 9495800000 939880000 956960000 723500000 563330000 756250000 708540000 683590000 689120000 619040000 227650000 1089700000 839650000 698600000 27820 4443 26158 256234;256235;256236;256237;256238;256239;256240;256241;256242;256243;256244;256245;256246;256247;256248;256249;256250;256251;256252;256253;256254 327435;327436;327437;327438;327439;327440;327441;327442;327443;327444;327445;327446;327447;327448;327449;327450;327451;327452;327453;327454;327455;327456;327457;327458;327459;327460;327461;327462;327463 327437 26 LLEVVQPCLQAAK Unmodified 1467.8119 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LLGDASVSFTENCVVGIQANTER Unmodified 2479.2013 0.20130194 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 178.1 178.1 3 0.020497 180775 QUIQUE_C1368_190116_001 19.378 18.152 4116500 0 0 1426600 0 0 0 0 0 2689800 0 0 0 0 27848 1935 26186 256413;256414 327667;327668 327667 2 LLGDLGLR Unmodified 855.5178 0.51780212 2173 P20916;M0QZU4;M0R3B9 MAG Myelin-associated glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 82.501 82.501 2 0.022208 78974 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.415 7.4217 260490000 93035000 91459000 0 0 0 0 0 38582000 0 37419000 0 0 0 27849 2173 26187 256415;256416;256417;256418 327669;327670;327671;327672 327672 4 LLGDLLPEAVR Unmodified 1194.6972 0.69722304 4129 Q9H1B7 IRF2BPL Interferon regulatory factor 2-binding protein-like yes yes 0 0 0 1 1 118.34 118.34 2 0.016511 122929 QUIQUE_C1218_190116_001 56.632 34.782 28018000 13773000 0 0 0 0 0 0 14245000 0 0 0 0 0 27850 4129 26188 256419;256420 327673;327674 327673 2 LLGDVSCR Unmodified 918.4593 0.45930096 1599 O60883 GPR37L1 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328086 271 LLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQK Unmodified 3135.6692 0.66918116 2799 P68871 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes yes 0 0 1 1 2 142.47 142.47 4;5 0.00038517 146674 QUIQUE_DMIX7_190116_001 39.593 36.961 203500000 0 29118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 174380000 0 27878 2799 26216 256875;256876;256877 328335;328336;328337;328338 328338 4 LLGNVLVCVLAR Unmodified 1325.7853 0.78532654 1817 P02042 HBD Hemoglobin subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 4 1 1 136.03 136.03 2;3 1.3261E-09 142191 QUIQUE_C1218_190116_001 153.08 141.72 5768700000 370180000 716810000 461200000 122390000 562030000 229930000 326350000 144290000 411450000 72437000 808710000 871690000 671230000 27879 1817 26217 256878;256879;256880;256881;256882;256883;256884;256885;256886;256887;256888;256889;256890;256891;256892;256893;256894 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0.54811597 2044 P12277;H0YJG0 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 3 1 2 65.002 65.002 2 2.4839E-06 65078 QUIQUE_C1438_190116_001 173.93 118.54 165180000000 11801000000 11505000000 14733000000 10959000000 10826000000 13389000000 13606000000 13103000000 13016000000 5245400000 16363000000 14727000000 15905000000 27931 2044 26266 257402;257403;257404;257405;257406;257407;257408;257409;257410;257411;257412;257413;257414;257415;257416;257417;257418;257419 329044;329045;329046;329047;329048;329049;329050;329051;329052;329053;329054;329055;329056;329057;329058;329059;329060;329061;329062;329063;329064;329065;329066;329067;329068;329069;329070;329071;329072;329073;329074;329075;329076;329077;329078;329079;329080;329081;329082;329083;329084;329085;329086;329087;329088;329089;329090;329091;329092;329093;329094;329095;329096;329097;329098;329099;329100;329101;329102;329103;329104;329105;329106;329107 329064 64 LLIENGVSMHR Unmodified 1267.6707 0.67069072 518 H7BYP1;G5E9G1;A2A3F3;A2A3F4;E9PBI7;A2A3F7;Q9HCF6 TRPM3 Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3 yes no 0 0 0 1 129.64 129.64 2 0.013466 132439 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.379 29.27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27932 518 26267 257420 329108 329108 1 LLIEPTAGVGVAAVLSQHFQTVSPEVK Unmodified 2789.5327 0.53273048 4104 Q9GZT4;V9GYE8 SRR Serine racemase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.99 143.99 3 3.7886E-19 140140 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.813 84.537 1294600000 83398000 0 108330000 110220000 97299000 142360000 107360000 108420000 152370000 80412000 93715000 81183000 129510000 27933 4104 26268 257421;257422;257423;257424;257425;257426;257427;257428;257429;257430;257431;257432 329109;329110;329111;329112;329113;329114;329115;329116;329117;329118;329119;329120;329121;329122;329123;329124;329125;329126 329122 17 LLIGADGHNSGVR Unmodified 1307.6946 0.69459728 4574 Q9Y2Z9;A0A0D9SFJ1;G3V3A1 COQ6 Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 30.849 30.849 2;3 0.011754 25462 QUIQUE_C1368_190116_001 56.404 26.087 34900000 0 0 20090000 0 0 14810000 0 0 0 0 0 0 0 27934 4574 26269 257433;257434;257435;257436;257437 329127;329128;329129;329130;329131 329127 5 LLIGTLYHR Unmodified 1084.6393 0.63931423 300 A0A0J9YXF2;A0A0J9YYG4;Q15165;J3QT77 PON2 Serum paraoxonase/arylesterase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 3 2 1 2 62.587 62.587 2;3 0.00014771 60313 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.95 51.357 4416200000 221450000 459720000 241980000 277810000 223400000 266180000 484870000 322780000 488410000 81338000 450940000 359510000 537780000 27935 300 26270 257438;257439;257440;257441;257442;257443;257444;257445;257446;257447;257448;257449;257450;257451;257452;257453;257454;257455 329132;329133;329134;329135;329136;329137;329138;329139;329140;329141;329142;329143;329144;329145;329146;329147;329148;329149;329150;329151;329152 329145 21 LLIHQSLAGGIIGVK Unmodified 1517.9293 0.92934824 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 86.556 86.556 2;3 5.1718E-54 88232 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.27 179.31 20775000000 1680500000 2090000000 1819700000 1467400000 1745000000 1489700000 1461200000 1285900000 1689200000 587670000 2065000000 1707800000 1685600000 27936 2735;3319 26271 257456;257457;257458;257459;257460;257461;257462;257463;257464;257465;257466;257467;257468;257469;257470;257471;257472;257473;257474;257475;257476;257477;257478;257479;257480;257481 329153;329154;329155;329156;329157;329158;329159;329160;329161;329162;329163;329164;329165;329166;329167;329168;329169;329170;329171;329172;329173;329174;329175;329176;329177;329178;329179;329180;329181;329182;329183;329184;329185;329186;329187;329188;329189;329190;329191;329192;329193;329194;329195;329196;329197;329198;329199;329200;329201;329202;329203;329204;329205;329206;329207;329208;329209;329210;329211 329194 59 LLIIASIGQLK Unmodified 1167.7591 0.75909502 432 A0A2R8Y5Q8;Q15813;A0A2U3TZJ6;A0A2R8YHI9;A0A2R8YFL4;A0A2R8Y7E7;A0A2R8Y6Q1 TBCE Tubulin-specific chaperone E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 119.01 119.01 2 0.023138 116438 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.965 26.711 74912000 0 0 0 11251000 0 13275000 0 0 0 8312300 21362000 20712000 0 27937 432 26272 257482;257483;257484;257485;257486 329212;329213;329214;329215;329216 329214 5 LLIIGTTSR Unmodified 972.59678 0.59678072 1245 I3L0N3;P46459;I3L2G1;K7EQD6 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.177 62.177 2 0.001153 62879 QUIQUE_C1218_190116_001 106.36 69.262 7038900000 817580000 866250000 662090000 665920000 672390000 650810000 699570000 243040000 289120000 274730000 399620000 385600000 412170000 27938 1245 26273 257487;257488;257489;257490;257491;257492;257493;257494;257495;257496;257497;257498;257499 329217;329218;329219;329220;329221;329222;329223;329224;329225;329226;329227;329228;329229 329217 11 LLILADMADVMR Unmodified 1359.7254 0.7254284 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.62 145.62 2 0.00051557 150802 QUIQUE_C1368_190116_001 111.06 83.942 1864400000 122250000 136590000 162840000 128620000 103970000 116340000 161470000 172820000 169860000 0 215430000 197370000 176790000 27939 2250 26274 257500;257501;257502;257503;257504;257505;257506;257507;257508;257509;257510;257511 329230;329231;329232;329233;329234;329235;329236;329237;329238;329239;329240;329241;329242;329243;329244;329245;329246 329234 17 LLILADMADVMR Oxidation (M) 1375.7203 0.72034303 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 1 0 1 2 1 119.93 119.93 2 0.013648 123962 QUIQUE_C1403_190116_001 79.974 60.187 149120000 0 0 0 37051000 0 0 0 0 77405000 0 34668000 0 0 27940 2250 26274 257512;257513;257514;257515 329247;329248;329249;329250 329247 1610 3 LLILADMADVYK Unmodified 1363.7421 0.74212433 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RJ41 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.53 135.53 2 0.0023456 138366 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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26282 257562;257563;257564;257565;257566;257567;257568;257569;257570;257571;257572;257573;257574;257575;257576;257577;257578;257579;257580;257581;257582;257583;257584;257585 329301;329302;329303;329304;329305;329306;329307;329308;329309;329310;329311;329312;329313;329314;329315;329316;329317;329318;329319;329320;329321;329322;329323;329324;329325;329326;329327 329302 26 LLIPVAEGMNEIWLR Oxidation (M) 1768.9546 0.95457672 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 1 0 1 1 1 137.83 137.83 2 0.00013884 134367 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.266 72.24 255950000 0 0 0 0 0 0 0 0 98762000 49217000 0 107970000 0 27949 3800 26282 257586;257587;257588 329328;329329;329330;329331 329330 2740 4 LLIQAAIVR Unmodified 995.64915 0.64915064 3016 Q13616;A0A0C4DGX4 CUL1 Cullin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.376 78.376 2 0.0075421 79046 QUIQUE_C1403_190116_001 81.297 26.747 215300000 0 20370000 15166000 13366000 23059000 0 19375000 22629000 23694000 8623700 18808000 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257614;257615;257616;257617;257618;257619;257620;257621;257622;257623;257624;257625;257626;257627;257628 329358;329359;329360;329361;329362;329363;329364;329365;329366;329367;329368;329369;329370;329371;329372 329362 14 LLISLSQGNR Unmodified 1099.635 0.63495714 2574 P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 68.125 68.125 2 0.00020677 69122 QUIQUE_C1218_190116_001 124.23 72.443 274020000 83637000 65450000 31113000 66523000 27298000 0 0 0 0 0 0 0 0 27956 2574 26289 257629;257630;257631;257632;257633;257634;257635 329373;329374;329375;329376;329377;329378;329379 329373 6 LLITGTEQFNQKPK Unmodified 1615.8934 0.89335667 3730 Q92538 GBF1 Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 1 1 55.093 55.093 3 0.015555 52817 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.445 23.032 21986000 0 0 0 0 0 0 0 21986000 0 0 0 0 0 27957 3730 26290 257636 329380 329380 1 LLIVSNPVDILTYVAWK Unmodified 1943.1132 0.11318585 1775 P00338;F5GXY2 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 169.64 169.64 2;3 2.7307E-38 173888 QUIQUE_DMIX3_190116_001 197.56 0 21268000000 1345900000 1328600000 2436800000 919590000 1202500000 351980000 1081400000 2039400000 2196600000 287730000 3844800000 2823300000 1409400000 27958 1775 26291 257637;257638;257639;257640;257641;257642;257643;257644;257645;257646;257647;257648;257649;257650;257651;257652;257653;257654;257655;257656;257657;257658;257659;257660;257661 329381;329382;329383;329384;329385;329386;329387;329388;329389;329390;329391;329392;329393;329394;329395;329396;329397;329398;329399;329400;329401;329402;329403;329404;329405;329406;329407;329408;329409;329410;329411;329412;329413;329414 329402 34 LLIVSTTPYSEK Unmodified 1349.7442 0.74423282 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.815 76.815 2 6.5584E-06 77449 QUIQUE_C1277_190116_001 134.25 95.099 2701600000 243830000 224080000 244500000 194610000 233560000 217760000 260830000 163220000 198630000 134770000 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257678;257679;257680;257681;257682;257683;257684;257685;257686;257687;257688;257689;257690;257691;257692;257693;257694;257695 329433;329434;329435;329436;329437;329438;329439;329440;329441;329442;329443;329444;329445;329446;329447;329448;329449;329450;329451;329452 329434 19 LLIYDASNLETGVPSR Unmodified 1746.9152 0.91521432 411 A0A2Q2TTZ9;P01594;P01593 Ig kappa chain V-I region AU;Ig kappa chain V-I region AG yes no 0 0 0 1 110.56 110.56 2 0.00033123 116067 QUIQUE_C1438_190116_001 102.66 67.12 41677000 0 0 0 0 41677000 0 0 0 0 0 0 0 0 27962 411 26295 257696 329453 329453 1 LLIYETEAK Unmodified 1078.591 0.59102664 2543 P49756 RBM25 RNA-binding protein 25 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.835 56.835 2 0.0077604 56182 QUIQUE_C1218_190116_001 80.684 47.168 140800000 20470000 21434000 17876000 25645000 0 22038000 0 0 0 13165000 20176000 0 0 27963 2543 26296 257697;257698;257699;257700;257701;257702;257703 329454;329455;329456;329457;329458;329459;329460 329454 7 LLIYGASTR Unmodified 992.56548 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329475;329476;329477;329478;329479;329480;329481;329482;329483;329484;329485;329486;329487 329487 13 LLKEEDMTK Unmodified 1105.5689 0.56891099 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.486 20.486 3 0.0042661 13613 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.645 53.483 335340000 61145000 69634000 59479000 54001000 0 0 31872000 0 34951000 0 0 24257000 0 27966 2416 26299 257726;257727;257728;257729;257730;257731;257732 329488;329489;329490;329491;329492;329493;329494 329493 7 LLKPGGVLTYCNLTSWGELMK Unmodified 2379.2331 0.23305976 3064 Q14353;A0A1W2PR36;K7EM34 GAMT Guanidinoacetate N-methyltransferase yes no 0 0 1 1 138.84 138.84 3 0.041552 144035 QUIQUE_DMIX8_190116_001 29.058 21.612 178660000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 178660000 27967 3064 26300 257733 329495 329495 1 LLKPLNIPELLFATDR Unmodified 1852.0822 0.082220072 3695 Q8WU76 SCFD2 Sec1 family domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 144.41 144.41 3 0.00095311 149403 QUIQUE_C1277_190116_001 65.716 62.655 75670000 0 18503000 12489000 0 0 0 0 0 0 0 25564000 19114000 0 27968 3695 26301 257734;257735;257736;257737 329496;329497;329498;329499 329496 4 LLLAADPGGSPAQR Unmodified 1364.7412 0.74121312 3295 Q5SQI0 ATAT1 Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.457 59.457 2 0.0002053 58281 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.616 74.829 389520000 0 31962000 0 55959000 33678000 26068000 35097000 46310000 43468000 0 35362000 32031000 49587000 27969 3295 26302 257738;257739;257740;257741;257742;257743;257744;257745;257746;257747 329500;329501;329502;329503;329504;329505;329506;329507;329508;329509;329510 329509 11 LLLAALGR Unmodified 825.54362 0.54362294 378 C9J4M6;A0A1W2PPT5;C9J2Y9;P30876 POLR2B DNA-directed RNA polymerase;DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 81.573 81.573 2 0.0070768 82916 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.384 9.481 30152000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14914000 15238000 0 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162.96 162.96 3;4 5.163E-32 164803 QUIQUE_C1563_190116_001 86.081 81.879 1805100000 73179000 203840000 143120000 98375000 48793000 111770000 189030000 133310000 99996000 37059000 210380000 456210000 0 27975 1655 26306 257833;257834;257835;257836;257837;257838;257839;257840;257841;257842;257843;257844;257845;257846;257847;257848 329618;329619;329620;329621;329622;329623;329624;329625;329626;329627;329628;329629;329630;329631;329632;329633;329634;329635;329636;329637 329626 20 LLLAGAGR Unmodified 769.48102 0.48102268 4713 yes yes 0 0 0 1 1 1 27.457 27.457 2 0.033676 21489 QUIQUE_C1403_190116_001 64.547 11.026 101080000 0 0 0 51698000 0 0 49382000 0 0 0 0 0 0 + 27976 4713 26307 257849;257850;257851 329638;329639;329640 329639 3 LLLAGYDDFNCNIWDAMK Oxidation (M) 2173.9813 0.98126175 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 145.4 145.4 3 0.00073098 151185 QUIQUE_C1218_190116_001 57.52 40.835 634910000 118170000 107910000 0 102750000 0 137070000 84133000 0 84880000 0 0 0 0 27977 2769 26308 257852;257853;257854;257855;257856;257857;257858 329641;329642;329643;329644;329645;329646;329647 329641 2201 7 LLLAGYDDFNCNIWDAMK Unmodified 2157.9863 0.98634713 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 158.67 158.67 2;3 9.2541E-31 162882 QUIQUE_C1277_190116_001 185.59 171.03 11118000000 914150000 1012000000 1603300000 584880000 582760000 642700000 1000700000 648440000 867540000 117690000 1291600000 872850000 979390000 27978 2769 26308 257859;257860;257861;257862;257863;257864;257865;257866;257867;257868;257869;257870;257871;257872;257873;257874;257875;257876 329648;329649;329650;329651;329652;329653;329654;329655;329656;329657;329658;329659;329660;329661;329662;329663;329664;329665;329666;329667;329668 329650 21 LLLAGYDDFNCNIWDAMKGDR Oxidation (M) 2502.1308 0.13077954 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 1 1 1 1 1 1 131.03 131.03 3 6.1412E-07 137326 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.755 80.365 1239600000 0 0 0 0 0 0 0 327680000 279790000 0 301260000 330920000 0 27979 2769 26309 257877;257878;257879;257880 329669;329670;329671;329672;329673;329674 329673 2201 6 LLLAGYDDFNCNIWDAMKGDR Unmodified 2486.1359 0.13586491 2769 P62879;E7EP32 GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 0 1 1 1 1 148.48 148.48 3 1.1014E-05 153026 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.364 65.545 191870000 0 0 0 0 0 0 0 101620000 33397000 0 0 56853000 0 27980 2769 26309 257881;257882;257883 329675;329676;329677 329677 2 LLLAGYDDFNCNVWDALK Unmodified 2126.0143 0.014276441 2767;602 P62873;B3KVK2 GNB1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 158.53 158.53 2;3 6.7715E-18 163896 QUIQUE_C1368_190116_001 165.73 132.78 24037000000 368640000 5939800000 8520900000 0 3616700000 3036200000 440080000 0 0 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258094;258095;258096;258097;258098;258099;258100;258101;258102;258103;258104;258105;258106;258107;258108;258109 329957;329958;329959;329960;329961;329962;329963;329964;329965;329966;329967;329968;329969;329970;329971;329972;329973;329974;329975;329976;329977;329978;329979;329980;329981;329982;329983;329984;329985;329986;329987;329988 329974 32 LLLEFTDTSYEEKR Unmodified 1742.8727 0.87268081 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 6 3 2 4 2 2 90.342 90.342 2;3 1.3437E-71 91429 QUIQUE_DMIX1_190116_001 210.87 176.91 11233000000 246120000 527580000 506980000 327170000 809140000 592110000 537070000 2831000000 1809000000 369870000 754830000 968830000 953740000 28000 2174 26329 258110;258111;258112;258113;258114;258115;258116;258117;258118;258119;258120;258121;258122;258123;258124;258125;258126;258127;258128;258129;258130;258131;258132;258133;258134;258135 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330026;330027;330028;330029;330030;330031;330032;330033;330034;330035;330036;330037;330038;330039;330040;330041;330042;330043;330044;330045;330046;330047;330048;330049;330050;330051;330052;330053;330054;330055;330056 330029 31 LLLEGISSTHVNHLR Unmodified 1687.937 0.93695282 667;668 B7ZC38;Q9NR46;B7ZC39 SH3GLB2 Endophilin-B2 no no 0 0 0 3 3 3 3 3 2 3 3 3 2 3 3 3 60.773 60.773 2;3;4 3.8642E-18 59667 QUIQUE_DMIX7_190116_001 149.96 115.07 5028000000 446850000 445020000 437830000 398340000 448670000 309300000 462340000 356960000 364060000 71562000 356110000 435250000 495740000 28002 667;668 26331 258160;258161;258162;258163;258164;258165;258166;258167;258168;258169;258170;258171;258172;258173;258174;258175;258176;258177;258178;258179;258180;258181;258182;258183;258184;258185;258186;258187;258188;258189;258190;258191;258192;258193;258194;258195;258196 330057;330058;330059;330060;330061;330062;330063;330064;330065;330066;330067;330068;330069;330070;330071;330072;330073;330074;330075;330076;330077;330078;330079;330080;330081;330082;330083;330084;330085;330086;330087;330088;330089;330090;330091;330092;330093;330094;330095;330096;330097;330098 330095 42 LLLEGVENK Unmodified 1013.5757 0.57571092 2354 P33121;E7EPM6;B7Z3Z9;D6RER0 ACSL1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 yes no 0 0 0 1 1 57.281 57.281 2 0.018299 54971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.42 15.665 71832000 0 0 0 0 0 0 0 46908000 0 24924000 0 0 0 28003 2354 26332 258197;258198 330099;330100 330099 2 LLLEHLECLVSR Unmodified 1480.8072 0.8071842 1078;1612;448 O75145;R4GN36;R4GNF1;E9PPF6;G3V200;O75334;F8VWR9;A0A2R8Y7R9;Q13136;E9PJZ7 PPFIA3;PPFIA1;PPFIA2 Liprin-alpha-3;Liprin-alpha-2;Liprin-alpha-1 no no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 1 1 121.01 121.01 2;3 2.8453E-06 126414 QUIQUE_C1218_190116_001 113.65 92.091 412880000 31275000 85043000 0 55141000 0 59825000 0 16017000 17566000 6871900 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330135;330136;330137;330138;330139;330140;330141;330142;330143;330144;330145;330146;330147;330148;330149;330150;330151;330152;330153;330154;330155 330137 21 LLLEYTDSSYEEKK Unmodified 1716.8458 0.84579735 2277;1965;141;2883 A0A0A0MR85;P09488;E7EWW9;B9ZVX7;H3BQT3;Q03013;P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM4;GSTM1;GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4;Glutathione S-transferase Mu 2 no no 0 0 1 1 2 2 1 65.823 65.823 2;3 6.0205E-12 65578 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.34 128.65 1973500000 0 0 0 71799000 0 0 0 1071900000 664890000 0 0 0 164890000 28008 141;1965;2883;2277 26337 258246;258247;258248;258249;258250;258251 330156;330157;330158;330159;330160;330161 330157 5 LLLEYTDSSYVEKK Unmodified 1686.8716 0.87161817 481 A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1 GSTM5 Glutathione S-transferase Mu 5 yes no 0 0 1 1 72.598 72.598 3 0.018572 73453 QUIQUE_DMIX8_190116_001 38.028 21.089 22377000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22377000 28009 481 26338 258252 330162 330162 1 LLLFAIQR Unmodified 972.61204 0.61203685 3331 Q5VIR6;F6VX93;I3L184 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.57 107.57 2 0.00080184 112286 QUIQUE_C1218_190116_001 149.06 77.039 284680000 23125000 27002000 23167000 21831000 30161000 0 28973000 26050000 30183000 12932000 0 34727000 26525000 28010 3331 26339 258253;258254;258255;258256;258257;258258;258259;258260;258261;258262;258263 330163;330164;330165;330166;330167;330168;330169;330170;330171;330172;330173 330163 9 LLLFDYDKVELANMNR Unmodified 1953.003 0.002983473 4110 Q9GZZ9;E7EQ61;E7EWE1;C9J0F6;C9J5W5;C9JRV9 UBA5 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.14 128.14 3 1.9409E-07 132209 QUIQUE_C1403_190116_001 118.33 100.85 734400000 53197000 62451000 60207000 44730000 46518000 42134000 60203000 66915000 71887000 22418000 77960000 53357000 72422000 28011 4110 26340 258264;258265;258266;258267;258268;258269;258270;258271;258272;258273;258274;258275;258276 330174;330175;330176;330177;330178;330179;330180;330181;330182;330183;330184;330185;330186;330187;330188;330189;330190 330177 17 LLLFSDGNSQGATPAAIEK Unmodified 1931 6.5851002E-06 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.4 106.4 2 7.3479E-36 108664 QUIQUE_C1563_190116_001 187.57 150.59 3612400000 317010000 258200000 263540000 339430000 618050000 432010000 219310000 175730000 212260000 171760000 0 278620000 326510000 28012 96 26341 258277;258278;258279;258280;258281;258282;258283;258284;258285;258286;258287;258288 330191;330192;330193;330194;330195;330196;330197;330198;330199;330200;330201;330202;330203;330204;330205 330199 15 LLLFSPSVVHLGVPLSVGVQLQDVPR Unmodified 2768.5953 0.59527116 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 157.19 157.19 3 0.015685 162201 QUIQUE_DMIX3_190116_001 26.766 23.636 88656000 0 0 0 0 0 0 0 0 88656000 0 0 0 0 28013 290;327;328 26342 258289 330206 330206 1 LLLGAGAVAYGVR Unmodified 1258.7398 0.73975656 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7;F5H3X6;F5H0C5;F5H2D2 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 3 3 1 94.367 94.367 2;3 9.2015E-06 96392 QUIQUE_C1403_190116_001 122.13 77.053 4569000000 324960000 343020000 335200000 319540000 273520000 277840000 363100000 382050000 392630000 161280000 529990000 467090000 398760000 28014 1272 26343 258290;258291;258292;258293;258294;258295;258296;258297;258298;258299;258300;258301;258302;258303;258304;258305;258306;258307;258308;258309;258310;258311;258312;258313 330207;330208;330209;330210;330211;330212;330213;330214;330215;330216;330217;330218;330219;330220;330221;330222;330223;330224;330225;330226;330227;330228;330229;330230;330231;330232;330233;330234;330235;330236;330237;330238;330239;330240;330241;330242;330243 330215 35 LLLGDLAPVR Unmodified 1065.6546 0.65462995 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.04 103.04 2 0.004731 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258327;258328;258329 330258;330259;330260 330258 3 LLLHCEGR Unmodified 996.51748 0.51748454 3569 Q8N126;A0A0C4DG09 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes no 0 0 0 1 1 19.868 19.868 2 0.042713 12640 QUIQUE_C1277_190116_001 58.815 42.671 317730000 0 143070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 174650000 28018 3569 26347 258330;258331 330261;330262 330261 2 LLLIATGK Unmodified 827.54804 0.54803961 4258 Q9NQW6;H7C1K5 ANLN Actin-binding protein anillin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.381 61.381 2 0.009742 60425 QUIQUE_C1576_190116_001 92.187 17.996 398780000 39053000 50126000 0 0 29876000 15469000 47147000 25293000 29086000 20338000 56412000 41625000 44357000 28019 4258 26348 258332;258333;258334;258335;258336;258337;258338;258339;258340;258341;258342 330263;330264;330265;330266;330267;330268;330269;330270;330271;330272;330273;330274;330275 330267 13 LLLIDWPELK Unmodified 1238.7275 0.72746054 540 J3KTL8;A6NHR9 SMCHD1 Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1 yes no 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LLLLVNPFGGR Unmodified 1197.7234 0.72337821 1376 M0R344;Q9NRA0;M0R0E9;A0A075B7A1 SPHK2 Sphingosine kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.21 139.21 2 0.0005507 141917 QUIQUE_C1563_190116_001 100.45 85.3 161070000 11912000 17648000 10922000 9681200 19057000 7550600 13440000 0 13912000 6485900 17200000 21247000 12014000 28036 1376 26365 258518;258519;258520;258521;258522;258523;258524;258525;258526;258527;258528;258529 330500;330501;330502;330503;330504;330505;330506;330507;330508;330509;330510;330511;330512 330505 13 LLLLVQGK Unmodified 882.59024 0.59023878 1178 H3BM67;H3BUP2;H3BUN4;O60936 NOL3 Nucleolar protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.371 72.371 2 0.014048 72152 QUIQUE_C1403_190116_001 86.512 35.973 96894000 25237000 0 20341000 17432000 0 12913000 0 0 13936000 7036000 0 0 0 28037 1178 26366 258530;258531;258532;258533;258534;258535 330513;330514;330515;330516;330517;330518 330515 6 LLLNLAENPAMTR Unmodified 1454.7915 0.79153413 4424 Q9UH62 ARMCX3 Armadillo 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330618;330619;330620;330621;330622;330623;330624;330625;330626;330627;330628;330629;330630;330631;330632;330633;330634;330635;330636;330637;330638;330639;330640;330641;330642;330643;330644;330645;330646;330647;330648;330649;330650;330651;330652;330653;330654;330655;330656;330657;330658;330659;330660;330661 330660 42 LLLPLFR Unmodified 870.56911 0.5691094 4042 Q9BV86 NTMT1 N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1;N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.13 123.13 2 0.019338 127351 QUIQUE_C1368_190116_001 114.67 78.08 515960000 38319000 36262000 54544000 42189000 41494000 38204000 41585000 30171000 45926000 0 50203000 42886000 54174000 28048 4042 26377 258637;258638;258639;258640;258641;258642;258643;258644;258645;258646;258647;258648 330662;330663;330664;330665;330666;330667;330668;330669;330670;330671;330672;330673 330664 12 LLLPWLEAR Unmodified 1109.6597 0.65971533 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 137.39 137.39 2 1.843E-07 143663 QUIQUE_C1218_190116_001 163.77 151.57 20615000000 1848100000 1684900000 1449300000 1615000000 1987000000 1552600000 1737200000 1342200000 1418700000 628020000 1708900000 1845800000 1796800000 28049 50 26378 258649;258650;258651;258652;258653;258654;258655;258656;258657;258658;258659;258660;258661;258662;258663;258664;258665 330674;330675;330676;330677;330678;330679;330680;330681;330682;330683;330684;330685;330686;330687;330688;330689;330690;330691;330692;330693;330694;330695;330696;330697;330698;330699;330700;330701;330702;330703;330704;330705 330674 32 LLLQAGYDPELR Unmodified 1386.7507 0.75071518 1327 K7EL81;Q9BZL4 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 96.703 96.703 2 0.00053033 99459 QUIQUE_C1368_190116_001 99.815 58.367 111600000 0 28047000 30472000 0 0 27779000 25298000 0 0 0 0 0 0 28050 1327 26379 258666;258667;258668;258669;258670;258671 330706;330707;330708;330709;330710;330711 330708 6 LLLQAIQSFEK Unmodified 1288.7391 0.73908786 1457 O14920 IKBKB Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 120.44 120.44 2 0.0009083 124749 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.111 67.973 37281000 0 0 0 0 0 0 0 0 37281000 0 0 0 0 28051 1457 26380 258672;258673;258674;258675;258676;258677 330712;330713;330714;330715;330716;330717 330715 6 LLLQGLMDSVEAK Unmodified 1415.7694 0.76940171 1259 J3KN16;Q5VYK3 KIAA0368;ECM29 Proteasome-associated protein ECM29 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 134.27 134.27 2 0.00053907 138287 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.13 73.837 119790000 0 0 0 35890000 28889000 23383000 0 0 0 0 0 31629000 0 28052 1259 26381 258678;258679;258680;258681 330718;330719;330720;330721 330721 4 LLLQHAMEHGSFDGADQGLLNSFFR Oxidation (M) 2818.3497 0.34969751 382 A0A1W2PQ75;O15488 GYG2 Glycogenin-2 yes no 0 1 0 1 130.68 130.68 4 2.9037E-05 133450 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.426 47.151 34207000 0 0 0 0 0 0 0 34207000 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258861;258862;258863;258864;258865;258866;258867 330932;330933;330934;330935;330936;330937;330938;330939;330940 330940 7 LLNDEDPVVVTK Unmodified 1340.7187 0.71874635 2084 P14923;C9JTX4;C9J826;C9JK18;C9JKY1 JUP Junction plakoglobin yes no 0 0 0 1 1 1 65.249 65.249 2 0.0048404 64436 QUIQUE_C1403_190116_001 78.653 41.308 102400000 0 0 0 59505000 0 24603000 0 0 0 18290000 0 0 0 28083 2084 26410 258868;258869;258870 330941;330942;330943;330944 330942 4 LLNDEDQVVVNK Unmodified 1384.7198 0.71980898 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.728 52.728 2 2.1147E-06 51418 QUIQUE_C1218_190116_001 167.09 134.25 3435100000 382570000 433400000 310290000 422940000 377010000 343090000 0 340480000 370810000 121780000 0 332700000 0 28084 425 26411 258871;258872;258873;258874;258875;258876;258877;258878;258879;258880 330945;330946;330947;330948;330949;330950;330951;330952;330953;330954;330955 330946 10 LLNDISTALR Unmodified 1114.6346 0.63462279 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 85.777 85.777 2 0.01221 97625 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.812 7.2654 237930000 63183000 75647000 0 0 0 0 0 0 28273000 0 0 70830000 0 28085 135 26412 258881;258882;258883;258884 330956;330957;330958;330959 330958 3 LLNEIIADFDDLLSKPK Unmodified 1943.0615 0.061544209 2922 Q08462 ADCY2 Adenylate cyclase type 2 yes yes 0 0 1 1 1 165.34 165.34 3 0.00031733 172716 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.234 68.819 58755000 0 0 0 0 0 0 0 0 25821000 0 32935000 0 0 28086 2922 26413 258885;258886 330960;330961 330961 2 LLNENSYVPR Unmodified 1203.6248 0.62478638 1837 P02786;G3V0E5 TFRC Transferrin receptor protein 1;Transferrin receptor protein 1, serum form yes no 0 0 0 1 1 1 56.01 56.01 2 0.013387 54623 QUIQUE_C1368_190116_001 80.787 54.095 29642000 0 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330973;330974;330975;330976;330977;330978;330979;330980;330981;330982;330983;330984;330985;330986;330987;330988;330989;330990;330991;330992;330993;330994;330995;330996;330997;330998 330977 26 LLNIRPPPR Unmodified 1074.6662 0.66619769 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 38.551 38.551 3 0.009457 33219 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.981 13.263 51406000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51406000 0 0 0 28090 1620 26417 258912 330999;331000 330999 2 LLNIWQER Unmodified 1070.5873 0.58727866 4255 Q9NQG5 RPRD1B Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 89.017 89.017 2 0.027083 90530 QUIQUE_C1277_190116_001 69.998 23.628 38877000 0 28436000 0 0 0 0 0 0 0 10441000 0 0 0 28091 4255 26418 258913;258914;258915;258916;258917 331001;331002;331003;331004;331005;331006 331002 6 LLNLGLITESQAHTLEDEVAEVLQK Unmodified 2762.4702 0.47018981 3717 Q8WXD2 SCG3 Secretogranin-3 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 168.32 168.32 3;4 4.0786E-37 172884 QUIQUE_C1218_190116_001 137.45 125.25 328670000 122660000 0 0 49722000 0 0 0 0 45182000 0 0 111100000 0 28092 3717 26419 258918;258919;258920;258921;258922;258923 331007;331008;331009;331010;331011;331012 331007 6 LLNLLADLVER Unmodified 1267.75 0.7499869 2325 P30837 ALDH1B1 Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 150.6 150.6 2 0.00047555 154904 QUIQUE_C1277_190116_001 120.68 73.791 229460000 36197000 23856000 18026000 52733000 0 0 23305000 0 35442000 0 0 18737000 21162000 28093 2325 26420 258924;258925;258926;258927;258928;258929;258930;258931 331013;331014;331015;331016;331017;331018;331019;331020 331014 8 LLNLYIK Unmodified 875.54804 0.54803961 310;830;1060 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122;F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP2;CLASP1 CLIP-associating protein 2;CLIP-associating protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.463 79.463 2 0.034513 80002 QUIQUE_DMIX7_190116_001 87.582 9.8621 404620000 47977000 0 48578000 0 52847000 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1 1 146.65 146.65 3 0.0021638 149643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.911 34.872 50054000 0 0 0 0 0 0 0 50054000 0 0 0 0 0 28096 1387 26423 258954 331052 331052 1 LLNPLVR Unmodified 823.52797 0.52797287 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;H0Y7R3;H0Y493;H0Y7J9;E9PCD1 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 60.529 60.529 2 0.043299 59351 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.377 23.867 36608000 0 0 0 0 0 0 0 0 16297000 0 0 0 20310000 28097 1056 26424 258955;258956 331053;331054 331054 2 LLNPTTADLR Unmodified 1112.619 0.61897272 679 B8ZZW5;Q8NBF6;H7C0I1 AVL9 Late secretory pathway protein AVL9 homolog yes no 0 0 0 2 1 1 75.034 75.034 2 0.0017155 55649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.309 48.974 57378000 0 34776000 0 0 0 0 0 0 0 22601000 0 0 0 28098 679 26425 258957;258958;258959;258960 331055;331056;331057;331058 331058 4 LLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELR Unmodified 3036.3659 0.36586067 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 3 2 2 1 2 2 2 128.21 128.21 2;3 3.6558E-99 133555 QUIQUE_C1218_190116_001 228.76 209.68 2671500000 246610000 238940000 220750000 297270000 184040000 182620000 278760000 190320000 209190000 66937000 153830000 213180000 189070000 28099 2121 26426 258961;258962;258963;258964;258965;258966;258967;258968;258969;258970;258971;258972;258973;258974;258975;258976;258977;258978;258979;258980;258981;258982;258983;258984;258985 331059;331060;331061;331062;331063;331064;331065;331066;331067;331068;331069;331070;331071;331072;331073;331074;331075;331076;331077;331078;331079;331080;331081;331082;331083;331084;331085;331086;331087;331088;331089;331090;331091;331092;331093;331094;331095 331061 37 LLNQEEGEYYNVPIPEGDEEGNMELR Oxidation (M) 3052.3608 0.36077529 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 1 0 1 1 1 3 1 2 2 1 2 2 1 116.96 116.96 2;3 1.2591E-142 121281 QUIQUE_C1368_190116_001 205.78 195.99 1432300000 0 116330000 43855000 154490000 0 0 37107000 211500000 204670000 161730000 227360000 233290000 41971000 28100 2121 26426 258986;258987;258988;258989;258990;258991;258992;258993;258994;258995;258996;258997;258998;258999;259000;259001;259002 331096;331097;331098;331099;331100;331101;331102;331103;331104;331105;331106;331107;331108;331109;331110;331111;331112;331113;331114 331098 1451 19 LLNQEEGEYYNVPVADADNCSLLQK Unmodified 2881.344 0.34400301 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 1 120.74 120.74 3 0.053755 117402 QUIQUE_DMIX4_190116_001 20.056 13.257 27199000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27199000 0 0 0 28101 1877 26427 259003 331115 331115 1 LLNQLQYCEEAGIPLVAIIGEQELK Unmodified 2840.4994 0.49938144 2035 P12081;B4DDD8;B3KWE1;B4E1C5 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.39 164.39 3 1.6217E-10 169314 QUIQUE_C1368_190116_001 76.237 69.588 564250000 41042000 64357000 44268000 34604000 43377000 0 54271000 25069000 52321000 15580000 100910000 60616000 27836000 28102 2035 26428 259004;259005;259006;259007;259008;259009;259010;259011;259012;259013;259014;259015 331116;331117;331118;331119;331120;331121;331122;331123;331124;331125;331126;331127;331128;331129 331118 12 LLNSDLGELINK Unmodified 1327.7347 0.73473076 865 H0YBP1;E7ESA6;Q05397;E9PEI4;H0YB16;H0YBZ1;E5RHD8;E5RI03;B4DWJ1 PTK2 Focal adhesion kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 62.854 62.854 2;3 0.0033196 106214 QUIQUE_C1368_190116_001 72.434 41.841 176640000 53746000 0 32284000 0 0 0 90611000 0 0 0 0 0 0 28103 865 26429 259016;259017;259018;259019;259020;259021;259022;259023 331130;331131;331132;331133;331134;331135;331136;331137 331131 8 LLNTAGGYPYSFWIGR Unmodified 1813.9152 0.91515474 2807 P78357 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 139.01 139.01 2 8.3966E-30 143746 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.7 143.22 524370000 0 0 0 0 0 0 91298000 0 102650000 0 142840000 61337000 126250000 28104 2807 26430 259024;259025;259026;259027;259028 331138;331139;331140;331141;331142;331143;331144 331140 7 LLNTFLER Unmodified 1004.5655 0.56548059 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.728 79.728 2 0.0024947 81647 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.11 39.042 1705500000 41212000 72140000 157040000 105350000 78292000 108650000 135940000 184410000 190550000 84649000 217380000 174570000 155320000 28105 3053 26431 259029;259030;259031;259032;259033;259034;259035;259036;259037;259038;259039;259040;259041 331145;331146;331147;331148;331149;331150;331151;331152;331153;331154;331155;331156;331157;331158;331159;331160 331157 16 LLNTTQKCFLDVQESVTTQVER Unmodified 2608.3167 0.31666605 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin yes no 0 0 1 1 1 146.32 146.32 4 0.013961 151997 QUIQUE_C1368_190116_001 29.136 8.3216 71021000 0 40467000 30554000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28106 2882 26432 259042;259043 331161;331162 331162 2 LLNVCSEALSYFLTLTSESHR Unmodified 2439.2104 0.21041007 4652 Q9Y6D6;E5RIF2;E5RHL7;E5RHZ1 ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 166.15 166.15 3 1.5039E-06 170044 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.704 68.992 141420000 0 0 0 17638000 0 0 36281000 0 48802000 0 0 38698000 0 28107 4652 26433 259044;259045;259046;259047 331163;331164;331165;331166 331166 4 LLPAELPAKR Unmodified 1106.6812 0.68117905 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 37.051 37.051 3 0.0052579 33320 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.56 45.93 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28108 2813 26434 259048;259049 331167;331168 331167 2 LLPAITILGCR Unmodified 1225.7217 0.72166366 3880 Q96IJ6 GMPPA Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 118.94 118.94 2 0.00068435 123946 QUIQUE_C1576_190116_001 97.635 66.263 288330000 22392000 23695000 0 45693000 24388000 39858000 34020000 27776000 0 0 0 33224000 37284000 28109 3880 26435 259050;259051;259052;259053;259054;259055;259056;259057;259058;259059;259060;259061 331169;331170;331171;331172;331173;331174;331175;331176;331177;331178;331179;331180;331181;331182;331183 331179 12 LLPALASVPALPSDS Unmodified 1449.8079 0.80789571 2885 Q03154;A0A1B0GU86 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 144.45 144.45 2 0.0079873 149343 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.647 77.612 394980000 61766000 0 0 0 0 0 0 78977000 78666000 0 95610000 0 79963000 28110 2885 26436 259062;259063;259064;259065;259066 331184;331185;331186;331187;331188 331186 3 LLPALTVLDIHDNQLTSLPSAIR Unmodified 2499.4061 0.40607341 4194 Q9H9A6 LRRC40 Leucine-rich repeat-containing protein 40 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.38 148.38 3 2.966E-14 153108 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.08 101.36 1286800000 101560000 101150000 96590000 0 113170000 99062000 125780000 100310000 136800000 50757000 119860000 112100000 129650000 28111 4194 26437 259067;259068;259069;259070;259071;259072;259073;259074;259075;259076;259077;259078 331189;331190;331191;331192;331193;331194;331195;331196;331197;331198;331199;331200;331201 331197 12 LLPDDPYEK Unmodified 1088.539 0.53899107 2812 P78417;Q5TA02;Q5TA01 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.137 57.137 2 0.0021912 56415 QUIQUE_C1218_190116_001 95.909 69.307 5265100000 399200000 467620000 499730000 428150000 422340000 0 405700000 391940000 368170000 224670000 638860000 422040000 596720000 28112 2812 26438 259079;259080;259081;259082;259083;259084;259085;259086;259087;259088;259089;259090 331202;331203;331204;331205;331206;331207;331208;331209;331210;331211;331212;331213;331214;331215;331216;331217;331218 331202 17 LLPDHTYSVVSGGDPLCIPELTWEQLK Unmodified 3066.5372 0.53722351 3276 Q5JRX3 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 154.7 154.7 3 9.7169E-05 160565 QUIQUE_C1576_190116_001 45.957 37.778 203600000 0 0 0 64148000 0 0 65020000 0 0 0 0 0 74431000 28113 3276 26439 259091;259092;259093 331219;331220;331221 331220 3 LLPDTINSINLDR Unmodified 1482.8042 0.80420731 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 103.58 103.58 2 0.0033969 100777 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.298 57.825 387500000 64055000 0 0 62118000 0 0 0 0 80457000 20978000 83786000 76110000 0 28114 3037 26440 259094;259095;259096;259097;259098;259099 331222;331223;331224;331225;331226;331227 331225 4 LLPELLQPYTER Unmodified 1470.8082 0.80823006 2963 Q13057 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.92 118.92 2 0.00053092 122663 QUIQUE_DMIX3_190116_001 123.86 108.2 694750000 72491000 55926000 84739000 0 59313000 54816000 49097000 62807000 76956000 38520000 0 70069000 70017000 28115 2963 26441 259100;259101;259102;259103;259104;259105;259106;259107;259108;259109;259110;259111 331228;331229;331230;331231;331232;331233;331234;331235;331236;331237;331238;331239 331236 11 LLPETPSDPFAIWQITDR Unmodified 2098.0735 0.073505879 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715;H0Y5N9;H0Y991 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 157.27 157.27 2 3.808E-05 162678 QUIQUE_C1218_190116_001 113.76 96.546 247760000 36911000 0 19285000 39307000 36662000 23886000 45009000 0 0 15684000 0 0 31019000 28116 90 26442 259112;259113;259114;259115;259116;259117;259118;259119;259120;259121 331240;331241;331242;331243;331244;331245;331246;331247;331248;331249;331250 331241 10 LLPFLSNPYR Unmodified 1218.6761 0.67609367 3019 Q13625 TP53BP2 Apoptosis-stimulating of p53 protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 113.92 113.92 2 0.0039892 117530 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.452 55.49 152490000 0 0 0 0 31891000 38211000 37586000 0 0 0 0 0 44800000 28117 3019 26443 259122;259123;259124;259125 331251;331252;331253;331254;331255 331255 5 LLPFNPQLFQNNCGETEQDTEK Unmodified 2621.2068 0.20678125 1699 O94919 ENDOD1 Endonuclease domain-containing 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 125.97 125.97 3 0.00063368 130115 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331264;331265;331266;331267;331268;331269;331270;331271;331272;331273;331274;331275;331276;331277 331268 14 LLPGILALYK Unmodified 1099.7005 0.70051751 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.04 126.04 2 0.006881 129369 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.323 60.72 192650000 0 22509000 19785000 20566000 29753000 12687000 0 18664000 22157000 0 0 13927000 32602000 28121 934 26447 259145;259146;259147;259148;259149;259150;259151;259152;259153 331278;331279;331280;331281;331282;331283;331284;331285;331286;331287 331283 9 LLPGYYMNLNQNPR Oxidation (M) 1707.8403 0.84027524 1570;553 O60331;O14986;A6PW57;Q99755 PIP5K1C;PIP5K1B;PIP5K1A Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma;Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 beta;Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha no no 0 1 0 1 1 75.474 75.474 2 0.0013577 76572 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.098 63.8 75145000 0 0 0 0 0 0 0 29577000 0 0 45568000 0 0 28122 1570;553 26448 259154;259155 331288;331289 331289 368 1 LLPGYYMNLNQNPR Unmodified 1691.8454 0.84536062 1570;553 O60331;O14986;A6PW57;Q99755 PIP5K1C;PIP5K1B;PIP5K1A Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma;Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 beta;Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha no no 0 0 0 1 1 96.461 96.461 2 0.0028351 98238 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.013 75.026 90313000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18165000 0 72148000 0 28123 1570;553 26448 259156;259157 331290;331291 331291 2 LLPHMHNIVEYMLQR Unmodified 1892.9753 0.97532893 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 111.34 111.34 3 3.1091E-12 115131 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.21 78.655 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28124 3772 26449 259158;259159;259160;259161 331292;331293;331294;331295 331294 4 LLPIDGANDLFFQPPPLTPTSK Unmodified 2380.2678 0.26784859 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 156.22 156.22 2;3 6.2782E-08 161861 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.668 69.668 2 0.019915 69429 QUIQUE_C1403_190116_001 109.88 109.88 215700000 0 0 53569000 60923000 0 40736000 36897000 0 0 23576000 0 0 0 28133 2465 26458 259252;259253;259254;259255;259256;259257 331400;331401;331402;331403;331404;331405;331406 331401 7 LLPQGTVIFEDISIEHFEGTVTK Unmodified 2572.3425 0.3424701 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 145.61 145.61 3 1.5958E-11 151481 QUIQUE_C1218_190116_001 93.006 88.75 183090000 15323000 0 35884000 27468000 0 0 0 44509000 59908000 0 0 0 0 28134 1645 26459 259258;259259;259260;259261;259262;259263 331407;331408;331409;331410;331411;331412 331407 6 LLPQLTYLDGYDR Unmodified 1565.809 0.80895834 1170;3749 H0YN26;P39687;Q92688 ANP32A;ANP32B Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member A;Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 120.83 120.83 2;3 0.00015705 122050 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.23 80.289 1658100000 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331455;331456;331457;331458;331459;331460;331461;331462;331463;331464;331465;331466;331467;331468;331469;331470;331471;331472;331473;331474;331475;331476;331477;331478;331479;331480;331481;331482;331483;331484;331485;331486;331487;331488;331489;331490;331491;331492;331493;331494;331495;331496 331493 42 LLPVYLNCVLK Unmodified 1330.7683 0.7682795 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 121.23 121.23 2 0.012265 126866 QUIQUE_C1218_190116_001 60.59 26.384 494650000 88473000 88446000 0 0 103630000 70759000 0 0 0 21059000 0 0 122280000 28139 2636 26464 259315;259316;259317;259318;259319;259320 331497;331498;331499;331500;331501;331502;331503 331498 7 LLPYEQSSLLELIK Unmodified 1644.9338 0.9338245 118 A0A087X256;Q2M389;F8VYH7 KIAA1033 WASH complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 145.39 145.39 2 0.018529 150938 QUIQUE_C1368_190116_001 67.08 54.503 136350000 0 0 28662000 18972000 0 0 0 16464000 0 0 39920000 0 32327000 28140 118 26465 259321;259322;259323;259324;259325 331504;331505;331506;331507;331508 331504 3 LLPYLAAVYALDHFSK Unmodified 1819.9873 0.98725705 1494 O15254 ACOX3 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 152.34 152.34 3 0.00022791 157783 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.208 55.508 64916000 0 0 0 0 0 0 0 0 21730000 0 27049000 0 16138000 28141 1494 26466 259326;259327;259328 331509;331510;331511;331512 331509 4 LLQAAAGASAR Unmodified 1027.5774 0.57744226 3947 Q96T76;H7C1W5 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 1 22.6 22.6 2 0.0010972 16031 QUIQUE_C1218_190116_001 90.15 20.152 82904000 47562000 0 0 0 0 0 35342000 0 0 0 0 0 0 28142 3947 26467 259329;259330;259331 331513;331514;331515 331513 3 LLQAETASNSAR Unmodified 1259.647 0.64697839 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 22.74 22.74 2 8.9169E-05 15802 QUIQUE_DMIX7_190116_001 121.83 69.976 188780000 0 0 0 0 0 0 0 66537000 0 38888000 0 83356000 0 28143 3091 26468 259332;259333;259334 331516;331517;331518 331518 2 LLQAFLER Unmodified 988.57057 0.57056597 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.087 85.087 2 0.027967 86497 QUIQUE_C1368_190116_001 69.198 27.971 513080000 0 85018000 67523000 0 0 0 0 69167000 73079000 35498000 100150000 82641000 0 28144 2657 26469 259335;259336;259337;259338;259339;259340;259341 331519;331520;331521;331522;331523;331524;331525;331526 331521 8 LLQAGFSELK Unmodified 1104.6179 0.61791009 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;C9JBE1;F8WAN0;E7EPX3;B9ZVU2;E5RJ35 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 74.66 74.66 2 0.014578 75434 QUIQUE_C1576_190116_001 78.113 27.481 351570000 72851000 43910000 73976000 54238000 0 58254000 48340000 0 0 0 0 0 0 28145 1 26470 259342;259343;259344;259345;259346;259347;259348 331527;331528;331529;331530;331531;331532;331533 331532 6 LLQAGFSELKETEK Unmodified 1591.8457 0.84573777 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;C9JBE1;F8WAN0;E7EPX3;B9ZVU2;E5RJ35 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 1 1 1 64.019 64.019 3 0.00028827 62643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.837 52.248 61718000 0 0 0 0 0 0 0 61718000 0 0 0 0 0 28146 1 26471 259349;259350 331534;331535;331536 331535 3 LLQAMEPVHVAR Unmodified 1362.7442 0.74419001 3177 Q16401 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes yes 0 0 0 1 54.347 54.347 3 0.012183 52738 QUIQUE_C1218_190116_001 34.75 25.238 75702000 75702000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28147 3177 26472 259351 331537 331537 1 LLQAQLQAQK Unmodified 1139.6663 0.66625727 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.393 35.393 2 5.1427E-05 30521 QUIQUE_C1368_190116_001 143.12 99.874 922780000 104190000 0 75680000 120810000 71884000 165660000 113480000 0 0 79516000 65832000 46061000 79670000 28148 3803 26473 259352;259353;259354;259355;259356;259357;259358;259359;259360;259361;259362;259363 331538;331539;331540;331541;331542;331543;331544;331545;331546;331547;331548;331549;331550 331540 13 LLQASFK Unmodified 805.46979 0.46978929 3145;1349 K7ERD8;K7EL66;M0QX52;Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 no no 0 0 0 1 1 1 38.045 38.045 2 0.030069 33985 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.986 16.268 883040000 0 0 0 0 304360000 223530000 0 0 0 0 0 0 355150000 28149 1349;3145 26474 259364;259365;259366 331551;331552;331553 331553 3 LLQCDPSSAGQF Unmodified 1321.5973 0.597251 2726 P61601 NCALD Neurocalcin-delta yes yes 0 0 0 1 1 87.489 87.489 2 0.0034929 88896 QUIQUE_C1277_190116_001 99.257 77.02 146720000 63187000 83533000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28150 2726 26475 259367;259368 331554;331555 331555 0 LLQCYPPPDPAVR Unmodified 1524.7759 0.77588407 1701 O94973;A0A0G2JS82;E9PR62;A0A0G2JRF9;A0A0G2JQA4;A0A0G2JRS3;E9PNC4 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 69.669 69.669 2 0.0018699 69676 QUIQUE_C1277_190116_001 83.883 62.884 350460000 0 45449000 0 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331577 1 LLQDEFPGIPSPLDAAVECHR Unmodified 2363.158 0.15798057 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.36 133.36 3 7.3911E-07 139343 QUIQUE_C1218_190116_001 81.574 66.804 1362600000 153000000 121930000 46097000 90134000 267590000 157610000 110780000 0 62251000 41034000 96582000 71470000 144130000 28154 1839 26479 259390;259391;259392;259393;259394;259395;259396;259397;259398;259399;259400;259401 331578;331579;331580;331581;331582;331583;331584;331585;331586;331587;331588;331589;331590;331591;331592;331593 331579 15 LLQDFFNGK Unmodified 1080.5604 0.56039521 2010;2643;558;2117 A8K7Q2;P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PN89;P17066;P54652 HSPA8;HSPA6;HSPA2 Heat shock cognate 71 kDa protein;Heat shock 70 kDa protein 6;Heat shock-related 70 kDa protein 2 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 97.382 97.382 2 6.8041E-18 99650 QUIQUE_DMIX1_190116_001 186.94 116.68 22806000000 1509100000 1521400000 1395700000 1512900000 1521900000 1572500000 1767500000 1720600000 2121700000 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0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 100.68 100.68 2 2.6136E-07 98259 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.77 150.06 9860600000 479370000 697420000 659380000 673460000 692930000 674970000 821200000 832280000 821740000 514510000 1143200000 1017300000 832810000 28157 282 26482 259419;259420;259421;259422;259423;259424;259425;259426;259427;259428;259429;259430;259431;259432 331628;331629;331630;331631;331632;331633;331634;331635;331636;331637;331638;331639;331640;331641;331642;331643;331644;331645;331646;331647;331648;331649;331650;331651;331652;331653;331654;331655;331656;331657 331649 30 LLQDHPWLLSQNLVVKPDQLIK Unmodified 2596.4741 0.47409339 2623 P53396;K7ESG8 ACLY ATP-citrate synthase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 128.92 128.92 3;4 3.0299E-06 131505 QUIQUE_C1563_190116_001 72.145 64.699 1023700000 0 101980000 0 0 103240000 179660000 0 0 475330000 40337000 123130000 0 0 28158 2623 26483 259433;259434;259435;259436;259437;259438;259439 331658;331659;331660;331661;331662;331663;331664;331665 331660 7 LLQDLFPK Unmodified 972.56442 0.56441796 1402 O00408;E9PEF1 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 100.64 100.64 2 0.0064687 105242 QUIQUE_C1438_190116_001 101.64 38.801 107730000 0 42843000 0 0 25005000 0 24763000 0 0 0 15122000 0 0 28159 1402 26484 259440;259441;259442;259443;259444;259445;259446;259447;259448;259449;259450;259451;259452;259453;259454;259455;259456;259457;259458;259459 331666;331667;331668;331669;331670;331671;331672;331673;331674;331675;331676;331677;331678;331679;331680;331681;331682;331683;331684;331685;331686;331687 331674 22 LLQDLLSEEENQEK Unmodified 1686.8312 0.83120992 3538 Q8IWQ3 BRSK2 Serine/threonine-protein kinase BRSK2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 103.1 103.1 2 0.00026497 107156 QUIQUE_C1218_190116_001 97.911 77.123 90031000 32404000 33354000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24274000 0 28160 3538 26485 259460;259461;259462;259463 331688;331689;331690;331691 331688 4 LLQDSGAPDGTLNIIHGQHEAVNFICDHPDIK Unmodified 3523.7154 0.71541566 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 2 2 3 3 3 109.52 109.52 3;4;5 6.2603E-41 112010 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.63 106.12 39467000000 2972500000 4200200000 4284900000 2936900000 3172300000 3961800000 2043200000 2870900000 2476400000 500570000 3658100000 3453700000 2936100000 28161 2870 26486 259464;259465;259466;259467;259468;259469;259470;259471;259472;259473;259474;259475;259476;259477;259478;259479;259480;259481;259482;259483;259484;259485;259486;259487;259488;259489;259490;259491;259492;259493;259494;259495;259496;259497;259498;259499;259500 331692;331693;331694;331695;331696;331697;331698;331699;331700;331701;331702;331703;331704;331705;331706;331707;331708;331709;331710;331711;331712;331713;331714;331715;331716;331717;331718;331719;331720;331721;331722;331723;331724;331725;331726;331727;331728;331729;331730;331731;331732;331733;331734;331735;331736;331737;331738;331739;331740;331741;331742;331743;331744 331724 51 LLQDSLGGNAK Unmodified 1114.5982 0.59823728 1476 O15066;F8WAR6;F8WER6;O14782 KIF3B;KIF3C Kinesin-like protein KIF3B;Kinesin-like protein KIF3B, N-terminally processed;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 37.551 37.551 2 0.0049837 33972 QUIQUE_C1218_190116_001 70.056 20.638 169510000 18389000 25011000 0 27658000 23236000 0 0 0 0 0 0 34052000 41162000 28162 1476 26487 259501;259502;259503;259504;259505;259506 331745;331746;331747;331748;331749;331750 331745 5 LLQDSVDFSLADAINTEFK Unmodified 2125.0579 0.057915395 1952 P08670;B0YJC4;A0A1B0GTT5;A0A1B0GVG8 VIM Vimentin yes no 0 0 0 14 21 45 12 34 13 35 52 66 4 51 40 33 172.09 172.09 2;3 5.1661E-195 160564 QUIQUE_C1563_190116_001 255.45 239.51 18348000000 401160000 720590000 1785100000 1266400000 1032700000 1612200000 866530000 1489700000 3665300000 456070000 2256300000 1464100000 1332100000 28163 1952 26488 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subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 1 1 2 1 1 1 140.05 140.05 2;3 8.8237E-36 145146 QUIQUE_C1368_190116_001 168.61 142.49 927510000 68275000 78303000 103840000 121340000 26550000 48150000 85135000 59381000 87182000 33276000 70739000 102060000 43280000 28195 3046 26520 260079;260080;260081;260082;260083;260084;260085;260086;260087;260088;260089;260090;260091;260092;260093;260094;260095;260096;260097;260098;260099;260100 332453;332454;332455;332456;332457;332458;332459;332460;332461;332462;332463;332464;332465;332466;332467;332468;332469;332470;332471;332472;332473;332474;332475;332476;332477;332478 332459 24 LLQSATEAQR Unmodified 1115.5935 0.59348625 1575 O60477 BRINP1 BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.519 20.519 2 0.00048526 13586 QUIQUE_C1576_190116_001 110.87 63.805 385320000 38874000 47659000 45428000 44044000 24065000 39890000 44201000 0 35427000 0 40548000 0 25185000 28196 1575 26521 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260121;260122;260123;260124;260125;260126;260127;260128;260129;260130;260131 332499;332500;332501;332502;332503;332504;332505;332506;332507;332508;332509 332499 10 LLQSLGLK Unmodified 870.55385 0.55385327 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 64.154 64.154 2 0.01729 63397 QUIQUE_C1403_190116_001 81.784 0.48718 359600000 0 0 0 138690000 0 0 0 59712000 0 0 161190000 0 0 28199 3086 26524 260132;260133;260134 332510;332511;332512 332510 3 LLQSLLDTR Unmodified 1057.6132 0.61315906 2961 Q13045 FLII Protein flightless-1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 83.841 83.841 2 0.024423 85428 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.019 23.624 32297000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15182000 17115000 0 28200 2961 26525 260135;260136;260137 332513;332514;332515 332515 3 LLQSNPVLEAFGNAK Unmodified 1599.8621 0.86205654 1014 F5H6E2;O00159;I3L204;I3L501;I3L3Y6 MYO1C Unconventional myosin-Ic yes no 0 0 0 1 115.36 115.36 2 0.010588 118601 QUIQUE_C1403_190116_001 57.225 43.532 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28201 1014 26526 260138 332516 332516 1 LLQSQLQVK Unmodified 1055.6339 0.63389451 3876 Q96I25;Q5W011;Q5W010 RBM17 Splicing factor 45 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 41.734 41.734 2 0.019983 38870 QUIQUE_C1438_190116_001 63.21 18.763 146330000 19308000 0 0 34616000 24210000 0 0 0 29984000 0 0 0 38214000 28202 3876 26527 260139;260140;260141;260142;260143;260144 332517;332518;332519;332520;332521;332522 332520 6 LLQTAATAAQQGGQANHPTAAVVTEK Unmodified 2575.3354 0.33542766 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.805 51.805 3 2.8641E-129 49870 QUIQUE_C1277_190116_001 151.91 131.65 1210700000 121160000 127600000 67004000 100640000 144900000 87869000 111640000 0 84486000 0 149160000 117470000 98736000 28203 2427 26528 260145;260146;260147;260148;260149;260150;260151;260152;260153;260154;260155 332523;332524;332525;332526;332527;332528;332529;332530;332531;332532;332533;332534;332535;332536;332537;332538 332524 15 LLQTDDEEEAGLLELLK Unmodified 1927.999 0.99900353 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 152.05 152.05 2;3 1.1127E-44 158876 QUIQUE_C1438_190116_001 219.35 184.65 1411200000 124450000 184760000 106390000 0 141590000 0 0 0 254690000 70391000 135850000 249620000 143460000 28204 2657 26529 260156;260157;260158;260159;260160;260161;260162;260163;260164;260165 332539;332540;332541;332542;332543;332544;332545;332546;332547;332548;332549;332550 332544 12 LLQTIGK Unmodified 771.48544 0.48543935 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 27.394 27.394 2 0.019688 21979 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.61 28.349 181130000 0 0 0 0 0 45853000 0 49705000 0 31210000 0 54364000 0 28205 2439 26530 260166;260167;260168;260169 332551;332552;332553;332554 332552 4 LLQTLPQLR Unmodified 1080.6655 0.66552898 3312 Q5T4S7;A0A0A0MSW0;X6RE05 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 1 77.956 77.956 2 0.022261 80233 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.469 43.283 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28206 3312 26531 260170 332555 332555 1 LLQVASPFLEPHLVR Unmodified 1717.9879 0.98792576 1653 O75694;E9PF10 NUP155 Nuclear pore complex protein Nup155 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.06 110.06 3 0.00075418 115400 QUIQUE_C1218_190116_001 64.675 44.568 181620000 32796000 0 32215000 0 33022000 0 28711000 0 0 0 29947000 24926000 0 28207 1653 26532 260171;260172;260173;260174;260175;260176 332556;332557;332558;332559;332560;332561 332556 5 LLQVTPADSGEYVCR Unmodified 1706.8298 0.82977013 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 79.357 79.357 2 1.2838E-05 81399 QUIQUE_C1438_190116_001 98.156 75.515 159260000 0 0 0 0 55902000 0 0 40405000 0 0 0 62957000 0 28208 2834 26533 260177;260178;260179 332562;332563;332564 332562 3 LLQVVEEPQALAAFLR Unmodified 1796.0196 0.019619815 3989 Q9BQ67;M0QX71 GRWD1 Glutamate-rich WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 154.64 154.64 2;3 0.016081 159849 QUIQUE_C1218_190116_001 36.928 29.336 45121000 6332900 0 0 38788000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28209 3989 26534 260180;260181 332565;332566 332565 1 LLQYLYSLK Unmodified 1139.659 0.65904662 2526 P49356;B4DL54 FNTB;CHURC1-FNTB Protein farnesyltransferase subunit beta yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 105.61 105.61 2 0.014899 109640 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.897 23.548 86872000 0 0 0 0 0 0 0 0 28769000 0 26280000 0 31822000 28210 2526 26535 260182;260183;260184;260185;260186;260187;260188 332567;332568;332569;332570;332571;332572;332573 332571 7 LLQYSDALEHLLTTGQGVVLER Unmodified 2454.3118 0.31183867 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;C9J6X0;Q8N1B9 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 2 2 3 3 2 3 3 2 152.82 152.82 2;3;4 2.1556E-129 157588 QUIQUE_DMIX3_190116_001 239.18 211.52 12366000000 733900000 1229900000 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321 A0A0U1RRL8;Q8TB22;H0Y9M1 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.143 83.143 2 0.0076035 85934 QUIQUE_C1438_190116_001 72.928 51.628 108390000 0 0 33539000 0 28272000 16754000 29827000 0 0 0 0 0 0 28220 321 26545 260273;260274;260275;260276;260277 332682;332683;332684;332685;332686 332684 5 LLSEDPANYADAPTEGIR Unmodified 1930.9272 0.92723557 1450 O14841;A0A087WY99 OPLAH 5-oxoprolinase yes no 0 0 0 1 94.464 94.464 2 0.0048636 91043 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.809 46.276 29651000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29651000 0 0 0 28221 1450 26546 260278 332687 332687 1 LLSEDPANYADAPTEGIRR Unmodified 2087.0283 0.028346601 1450 O14841;A0A087WY99 OPLAH 5-oxoprolinase yes no 0 0 1 1 77.35 77.35 3 0.0029819 77311 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.621 30.127 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28222 1450 26547 260279 332688 332688 1 LLSEEVFDFSSGQITQVK Unmodified 2026.0259 0.025886985 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 136.72 136.72 2;3 0.00015608 139482 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phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 132.78 132.78 2 1.8833E-05 138322 QUIQUE_C1218_190116_001 129.85 107.77 5242200000 195320000 340200000 454270000 495360000 390980000 413780000 523550000 312800000 638020000 252710000 301020000 543970000 380160000 28228 2017 26552 260317;260318;260319;260320;260321;260322;260323;260324;260325;260326;260327;260328;260329;260330 332730;332731;332732;332733;332734;332735;332736;332737;332738;332739;332740;332741;332742;332743;332744;332745;332746;332747;332748;332749 332730 20 LLSFVDDEAFIRDVAK Unmodified 1836.9622 0.96216452 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 134.52 134.52 2;3 1.6999E-09 139397 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.97 119.85 868040000 0 0 0 0 0 0 0 256120000 239820000 0 79518000 176530000 116060000 28229 2017 26553 260331;260332;260333;260334;260335;260336 332750;332751;332752;332753;332754;332755;332756;332757;332758;332759;332760 332753 11 LLSGDTYEAVVTAVDPVADIATLR Unmodified 2488.3061 0.30608459 229 A0A0C4DG44;O43464 HTRA2 Serine protease HTRA2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.26 164.26 3 1.3887E-14 168025 QUIQUE_C1403_190116_001 103.84 95.45 546460000 0 64242000 73149000 43915000 65558000 0 0 47171000 76366000 24487000 100090000 0 51476000 28230 229 26554 260337;260338;260339;260340;260341;260342;260343;260344;260345 332761;332762;332763;332764;332765;332766;332767;332768;332769;332770 332764 10 LLSGEDVGQDEGATR Unmodified 1545.7271 0.7270792 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.116 46.116 2 1.3562E-06 43228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.54 88.526 312870000 41498000 60001000 0 31804000 55739000 27281000 0 26109000 0 0 70433000 0 0 28231 2021 26555 260346;260347;260348;260349;260350;260351;260352;260353;260354;260355 332771;332772;332773;332774;332775;332776;332777;332778;332779;332780 332777 10 LLSGGSVLDIIK Unmodified 1213.7282 0.72818882 1746 O95747;C9JIG9 OXSR1 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332843 147 LLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSK Unmodified 4257.3235 0.32353634 2801;1075 P69905;G3V1N2 HBA1;HBA2 Hemoglobin subunit alpha no no 0 0 1 1 1 170.4 170.4 5 5.5414E-11 178115 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.762 60.021 1343100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1286200000 56980000 0 28237 2801;1075 26561 260466;260467 332962;332963 332962 2 LLSIPLVSLDIPSGWDAETGSDSEDGLRPDVLVSLAAPK Unmodified 4032.0943 0.094307486 554 A6XGL0 YJEFN3 YjeF N-terminal domain-containing protein 3 yes yes 0 0 1 1 169.83 169.83 3 0.00010381 177216 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.751 41.476 37349000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37349000 0 0 28238 554 26562 260468 332964 332964 1 LLSLCLQK Unmodified 973.56304 0.56303775 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.858 71.858 2 0.0077002 68766 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.068 45.28 319670000 0 0 0 0 0 0 64255000 59276000 74917000 37920000 0 83304000 0 28239 4417 26563 260469;260470;260471;260472;260473 332965;332966;332967;332968;332969 332968 5 LLSLGAQANFFHPEK Unmodified 1670.878 0.87804096 245;1040 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;F8WAK2;F8VXI9;Q14161;R4GNG3;F8W822 GIT1;GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT1;ARF GTPase-activating protein GIT2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.256 97.256 3 3.1118E-09 99710 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.54 94.244 1120500000 70847000 91410000 77501000 69486000 111430000 59845000 92339000 111080000 76422000 25136000 125970000 103730000 105270000 28240 245;1040 26564 260474;260475;260476;260477;260478;260479;260480;260481;260482;260483;260484;260485;260486 332970;332971;332972;332973;332974;332975;332976;332977;332978;332979;332980;332981;332982;332983 332979 12 LLSLLEKDEFK Unmodified 1333.7493 0.74931819 2375 P35270 SPR Sepiapterin reductase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.395 84.395 3 0.000338 85649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.08 87.845 880600000 53964000 81429000 59441000 67146000 67866000 55424000 57002000 74709000 85031000 34157000 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333055 10 LLSPLVK Unmodified 768.51093 0.51092582 4203 Q9HAB8 PPCS Phosphopantothenate--cysteine ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 49.523 49.523 2 0.050616 47276 QUIQUE_C1403_190116_001 74.439 8.3009 110060000 0 0 0 32882000 0 0 0 0 0 0 0 32219000 44960000 28248 4203 26571 260553;260554;260555 333059;333060;333061 333059 3 LLSPTER Unmodified 814.45487 0.45486751 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180;E9PKK8;E9PPK9;E9PQF2 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 21.747 21.747 2 0.021502 14939 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.76 24.387 113710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 113710000 0 0 28249 4330 26572 260556 333062 333062 1 LLSPVVPQISAPQSNK Unmodified 1676.9461 0.94612052 3574 Q8N1F7;H3BVG0;H3BRD9;H3BVE2 NUP93 Nuclear pore complex protein Nup93 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.176 90.176 2 0.0002501 93588 QUIQUE_C1218_190116_001 87.641 75.064 336420000 37076000 31566000 28585000 0 32621000 27682000 39440000 26403000 26586000 0 28774000 27467000 30218000 28250 3574 26573 260557;260558;260559;260560;260561;260562;260563;260564;260565;260566;260567 333063;333064;333065;333066;333067;333068;333069;333070;333071;333072;333073 333063 11 LLSQEEQTSK Unmodified 1161.5877 0.58773217 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 16.87 16.87 2 0.0027923 9274 QUIQUE_C1368_190116_001 98.009 37.42 84085000 0 0 41708000 42377000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28251 135 26574 260568;260569;260570 333074;333075;333076 333074 3 LLSRPQDALEGVVLSPSLEAR Unmodified 2249.2379 0.23794545 1112 H0Y2W2 ATAD3A no no 0 0 1 1 1 1 1 1 117.66 117.66 3 6.7557E-05 120108 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.676 53.748 349980000 80450000 0 51598000 0 0 0 0 77857000 91022000 49050000 0 0 0 28252 1112 26575 260571;260572;260573;260574;260575 333077;333078;333079;333080;333081 333079 5 LLSSAFDEVYPALPSDVQTAIK Unmodified 2363.226 0.22604336 1403;1117 O00410;H0Y8C6;E7ETV3;E7EQT5;E7EV12;C9JMV5;E7EWK4;E7EX05;C9JZ53;H0Y3V4 IPO5 Importin-5 no no 0 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996.5314 0.53140327 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 53.864 53.864 2 0.031896 51946 QUIQUE_C1277_190116_001 65.676 39.074 112190000 0 35465000 32635000 0 25426000 0 0 0 0 18662000 0 0 0 28260 173 26583 260629;260630;260631;260632 333146;333147;333148;333149 333146 4 LLSVEGSTLR Unmodified 1073.6081 0.60807369 1014 F5H6E2;O00159 MYO1C Unconventional myosin-Ic yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.7 57.7 2 0.013076 56273 QUIQUE_C1403_190116_001 65.305 14.698 166910000 0 0 34633000 49409000 50821000 0 0 0 32043000 0 0 0 0 28261 1014 26584 260633;260634;260635;260636 333150;333151;333152;333153;333154 333152 5 LLSVEPDDHLTVAESLKR Unmodified 2021.0793 0.079319539 624 B4DWG0;O95199;B4E372 RCBTB2 RCC1 and BTB domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 77.835 77.835 4 0.027807 77495 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.512 3.4706 64134000 0 0 0 0 0 0 0 64134000 0 0 0 0 0 28262 624 26585 260637 333155 333155 1 LLSVNIR Unmodified 813.50724 0.50723743 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 53.83 53.83 2 0.021346 52297 QUIQUE_C1277_190116_001 105.27 0 322420000 0 118470000 0 0 110160000 0 93785000 0 0 0 0 0 0 28263 1929 26586 260638;260639;260640 333156;333157;333158 333156 3 LLSVVPVPEGYSVK Unmodified 1485.8443 0.84428121 4102 Q9GZN8 C20orf27 UPF0687 protein C20orf27 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.89 104.89 2 0.0019412 108217 QUIQUE_C1277_190116_001 73.499 62.335 1750500000 109520000 112100000 115180000 99844000 141550000 92599000 146170000 142030000 178040000 48227000 172860000 159130000 233200000 28264 4102 26587 260641;260642;260643;260644;260645;260646;260647;260648;260649;260650;260651;260652;260653 333159;333160;333161;333162;333163;333164;333165;333166;333167;333168;333169;333170;333171 333160 3 LLSWSDNWR Unmodified 1175.5724 0.57235688 3673 Q8TCD5;J3KSY6;J3KSX6 NT5C 5'(3')-deoxyribonucleotidase, cytosolic type yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 96.893 96.893 2 0.00042753 105551 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.27 66.108 2362100000 1153600000 97375000 127100000 93915000 47419000 89759000 52143000 109310000 121090000 44852000 149260000 134250000 142080000 28265 3673 26588 260654;260655;260656;260657;260658;260659;260660;260661;260662;260663;260664;260665;260666;260667;260668 333172;333173;333174;333175;333176;333177;333178;333179;333180;333181;333182;333183;333184;333185;333186;333187;333188;333189;333190;333191 333183 19 LLSYASYCIEHGDLELAAK Unmodified 2152.0511 0.051055878 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 105.95 105.95 2 5.1679E-11 107947 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.02 100.14 32501000 0 0 0 0 0 0 0 32501000 0 0 0 0 0 28266 693;3205 26589 260669;260670 333192;333193 333192 2 LLSYHVSAQNLVAIPVYVK Unmodified 2113.1936 0.19356144 2632 P53677;E5RJ52 AP3M2 AP-3 complex subunit mu-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 120.14 120.14 3 9.3038E-05 117441 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.697 68.599 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LLSYQTSLVSDGETWHVMGISSLLPSLEAWK Unmodified 3446.7432 0.74319354 404 A0A286YF22;O43175;A0A286YFA2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 167.64 167.64 3 3.6382E-09 172145 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.706 57.219 158150000 0 0 0 0 0 0 0 0 158150000 0 0 0 0 28270 404 26592 260683 333208 333208 1 LLTAHGQGYGK Unmodified 1143.6037 0.60365701 293 H7C1E5;A0A0G2JQW1;A0A0J9YXQ9;Q53QD4;Q8WVT3;H7C373 TRAPPC12;CGI-87 Trafficking protein particle complex subunit 12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.082 16.082 3 0.0032481 8822 QUIQUE_C1218_190116_001 56.043 28.74 119280000 25135000 22551000 16414000 0 0 0 0 0 0 0 25926000 29252000 0 28271 293 26593 260684;260685;260686;260687;260688;260689 333209;333210;333211;333212;333213;333214 333209 6 LLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPK Unmodified 3111.5045 0.50454318 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 1 169.87 169.87 3 5.1932E-09 173748 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.019 60.116 329330000 0 0 0 0 0 0 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333490;333491;333492;333493;333494;333495;333496;333497;333498;333499;333500;333501 333495 12 LLTSNIIVTTVQYLSSALHK Unmodified 2200.2467 0.24671922 3562 Q8IZD9 DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.93 168.93 3 7.2147E-14 170760 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.92 112.1 573830000 35118000 41120000 0 0 24145000 0 53991000 74391000 78880000 8148300 52125000 62882000 143030000 28302 3562 26624 260927;260928;260929;260930;260931;260932;260933;260934;260935;260936 333502;333503;333504;333505;333506;333507;333508;333509;333510;333511;333512;333513 333508 12 LLTSQDVSYDEAR Unmodified 1495.7155 0.71545188 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.211 59.211 2 0.0003282 58889 QUIQUE_C1438_190116_001 110.39 85.533 359080000 0 49711000 0 41106000 64019000 23682000 45014000 0 0 0 83269000 52277000 0 28303 2021 26625 260937;260938;260939;260940;260941;260942;260943 333514;333515;333516;333517;333518;333519;333520 333516 5 LLTSSAYR Unmodified 909.49198 0.4919813 1040 F8WAK2;F8VXI9;Q14161;R4GNG3 GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT2 yes no 0 0 0 1 28.306 28.306 2 0.039313 22326 QUIQUE_C1277_190116_001 60.972 26.785 16577000 0 16577000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28304 1040 26626 260944 333521 333521 1 LLTSYGFIQCSER Unmodified 1572.7606 0.76062794 1645 O75534;E9PLD4;E9PKN4 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 93.56 93.56 2 8.964E-08 95864 QUIQUE_C1277_190116_001 135.47 98.356 647620000 73538000 78863000 104820000 0 86744000 72817000 95485000 42164000 0 0 0 0 93187000 28305 1645 26627 260945;260946;260947;260948;260949;260950;260951;260952 333522;333523;333524;333525;333526;333527;333528;333529;333530 333524 9 LLTTIGK Unmodified 744.47454 0.47454032 922;170 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;A0A0A0MSA7;A0A0U1RQK7;O43432 EIF4G1;EIF4G3 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1;Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 31.409 31.409 2 0.039576 27116 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.614 10.575 182210000 0 0 0 0 0 0 0 45792000 0 21888000 41563000 35516000 37451000 28306 922;170 26628 260953;260954;260955;260956;260957 333531;333532;333533;333534;333535 333531 5 LLTVFAYGTYADYLAEAR Unmodified 2036.0255 0.025493054 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248;F5H4U8 COPS7A COP9 signalosome complex subunit 7a yes no 0 0 0 1 1 1 154.31 154.31 2 0.0048486 160543 QUIQUE_C1576_190116_001 58.32 45.34 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28307 4411 26629 260958;260959;260960 333536;333537;333538 333536 3 LLTVNPEHR Unmodified 1077.5931 0.59309232 3494 Q86UX6 STK32C Serine/threonine-protein kinase 32C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.463 23.463 3 0.0074644 16884 QUIQUE_C1438_190116_001 52.278 27.503 149140000 37421000 26450000 0 16900000 26043000 10959000 31366000 0 0 0 0 0 0 28308 3494 26630 260961;260962;260963;260964;260965;260966 333539;333540;333541;333542;333543;333544 333542 5 LLTVPFEK Unmodified 945.55352 0.55351892 1723 O95336;M0R1L2 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.686 79.686 2 0.0035988 82354 QUIQUE_C1218_190116_001 113.5 76.405 4575000000 367650000 331630000 375680000 352980000 0 332810000 294200000 456950000 419000000 211790000 498610000 396540000 537190000 28309 1723 26631 260967;260968;260969;260970;260971;260972;260973;260974;260975;260976;260977;260978;260979 333545;333546;333547;333548;333549;333550;333551;333552;333553;333554;333555;333556;333557;333558;333559 333545 15 LLTVTAK Unmodified 744.47454 0.47454032 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 24.307 24.307 2 0.019293 17459 QUIQUE_C1368_190116_001 114.02 44.591 66279000 41395000 0 24884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28310 914 26632 260980;260981 333560;333561 333561 2 LLTYNAAR Unmodified 920.50797 0.50796571 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.486 32.486 2 0.0036122 27646 QUIQUE_C1218_190116_001 114.72 51.573 606750000 91979000 78205000 0 0 0 0 0 91100000 144840000 45328000 0 0 155300000 28311 2470 26633 260982;260983;260984;260985;260986;260987 333562;333563;333564;333565;333566;333567 333562 5 LLVACCLADIFR Unmodified 1449.7472 0.74722648 4291 Q9NTI5;H0Y9L9;Q29RF7 PDS5B;PDS5A Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B;Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 118.49 118.49 2;3 0.00048748 155127 QUIQUE_C1438_190116_001 110.14 87.494 147110000 0 0 0 0 20315000 0 0 102130000 0 0 24660000 0 0 28312 4291 26634 260988;260989;260990 333568;333569;333570 333568 2 LLVAENR Unmodified 813.47085 0.47085192 4414 Q9UDT6;H7C4L6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.705 22.705 2 0.019482 15953 QUIQUE_C1576_190116_001 111.28 46.502 844180000 0 105800000 95212000 0 104850000 101580000 110350000 92303000 116500000 0 117580000 0 0 28313 4414 26635 260991;260992;260993;260994;260995;260996;260997;260998 333571;333572;333573;333574;333575;333576;333577;333578 333575 8 LLVAGEGHTR Unmodified 1051.5774 0.57744226 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 16.123 16.123 2;3 0.00080387 8269 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.94 64.633 947160000 57328000 0 61026000 64868000 11106000 32508000 80488000 159440000 223530000 59494000 0 153880000 43492000 28314 2226 26636 260999;261000;261001;261002;261003;261004;261005;261006;261007;261008;261009;261010;261011;261012;261013;261014;261015;261016 333579;333580;333581;333582;333583;333584;333585;333586;333587;333588;333589;333590;333591;333592;333593;333594;333595;333596;333597;333598 333596 19 LLVALGTLISDDSNAVQLAK Unmodified 2040.1467 0.14667082 4541 Q9Y263 PLAA Phospholipase A-2-activating protein yes yes 0 0 0 1 1 148.29 148.29 2 7.6391E-06 152375 QUIQUE_C1277_190116_001 83.243 65.504 42521000 18025000 24495000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28315 4541 26637 261017;261018 333599;333600 333600 2 LLVATSVAAR Unmodified 999.60768 0.60767975 234 A0A0C4DG89;Q7L014 DDX46 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 yes no 0 0 0 1 1 1 46.768 46.768 2 0.017705 44350 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.602 9.3336 65099000 0 0 0 0 0 0 0 23357000 0 0 24103000 0 17640000 28316 234 26638 261019;261020;261021 333601;333602;333603 333602 3 LLVDADNCLHR Unmodified 1324.6558 0.65576893 4342 Q9NZB2 FAM120A Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 49.413 49.413 2;3 0.013294 45099 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.433 33.567 115320000 24235000 22412000 0 0 0 0 29024000 0 0 10168000 29478000 0 0 28317 4342 26639 261022;261023;261024;261025;261026 333604;333605;333606;333607;333608 333607 5 LLVDAIHNQLTDMEK Unmodified 1738.8924 0.89237039 825 D6RGX2;Q9NUQ7;H0YA18 UFSP2 Ufm1-specific protease 2 yes no 0 0 0 1 110.46 110.46 3 0.037538 114461 QUIQUE_C1218_190116_001 33.301 21.687 24089000 24089000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28318 825 26640 261027 333609 333609 1 LLVDSLPPSTKPFQEAQSELNQAAADLNQSAGEVVHATR Unmodified 4131.0873 0.087265048 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 156.42 156.42 4 7.8464E-65 160310 QUIQUE_C1403_190116_001 118.31 100.28 1802300000 0 190310000 406490000 445500000 281730000 72300000 0 0 0 109700000 171520000 0 124700000 28319 4606 26641 261028;261029;261030;261031;261032;261033;261034;261035;261036;261037 333610;333611;333612;333613;333614;333615;333616;333617;333618;333619;333620;333621;333622 333613 13 LLVDVDESTLSPEEQKER Unmodified 2086.043 0.042993612 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 1 1 79.571 79.571 3 4.8565E-05 80879 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.551 77.296 66505000 0 0 0 0 0 0 0 0 66505000 0 0 0 0 28320 1644 26642 261038 333623 333623 1 LLVEEGCEDR Unmodified 1218.5551 0.55505184 3812 Q96BW5;A0A0A0MSI3 PTER Phosphotriesterase-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 37.821 37.821 2 0.0096635 33364 QUIQUE_C1277_190116_001 69.915 46.486 217030000 0 52466000 0 0 35729000 40865000 69373000 0 0 18595000 0 0 0 28321 3812 26643 261039;261040;261041;261042;261043;261044 333624;333625;333626;333627;333628;333629 333625 6 LLVEHQAISFMLAEMAMK Unmodified 2061.0461 0.046110616 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 151.19 151.19 3 0.00061223 155221 QUIQUE_C1277_190116_001 41.485 34.594 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28322 666 26644 261045;261046 333630;333631 333631 2 LLVELGFSK Unmodified 1004.5906 0.59063271 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6 RRM2B Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B yes no 0 0 0 1 1 100.17 100.17 2 0.019014 101580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.355 49.812 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28323 3449 26645 261047;261048 333632;333633 333633 2 LLVERMMALQTDIVDLQRSPMGR 2 Oxidation (M) 2703.387 0.387011 1457 O14920 IKBKB Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta yes yes 0 2 2 1 98.344 98.344 3 0.00015607 101825 QUIQUE_C1576_190116_001 56.529 41.945 65360000 0 0 0 0 0 0 65360000 0 0 0 0 0 0 28324 1457 26646 261049 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333646;333647;333648;333649;333650;333651;333652;333653;333654;333655;333656;333657;333658;333659;333660;333661;333662 333648 17 LLVGNDDVHIIAR Unmodified 1433.7991 0.79906235 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.197 73.197 3 3.0583E-08 73543 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.43 81.54 512180000 33770000 61039000 38333000 16924000 49879000 31428000 55076000 46845000 33502000 14165000 43345000 45013000 42864000 28327 3471 26649 261072;261073;261074;261075;261076;261077;261078;261079;261080;261081;261082;261083;261084 333663;333664;333665;333666;333667;333668;333669;333670;333671;333672;333673;333674;333675;333676;333677 333671 14 LLVGSEDYGR Unmodified 1107.556 0.55603811 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 52.393 52.393 2 7.2468E-05 50313 QUIQUE_C1368_190116_001 140.5 94.075 5433200000 1156300000 1133000000 1044800000 0 1123400000 0 0 0 0 0 0 0 975720000 28328 267;275;3025 26650 261085;261086;261087;261088;261089 333678;333679;333680;333681;333682;333683;333684;333685 333683 8 LLVGSEDYGRDLTGVQNLR Unmodified 2104.0913 0.091281208 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 99.797 99.797 3 0.00012485 101242 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.97 59.286 70088000 0 0 0 0 0 0 0 70088000 0 0 0 0 0 28329 267;275;3025 26651 261090 333686 333686 1 LLVGVDEK Unmodified 871.50148 0.50148335 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 41.481 41.481 2 0.030205 37428 QUIQUE_C1368_190116_001 67.169 17.58 446020000 142090000 0 127680000 0 0 0 0 0 0 0 176240000 0 0 28330 2623 26652 261091;261092;261093 333687;333688;333689 333688 2 LLVGVDEKLNPEDIKK Unmodified 1809.0248 0.024764773 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 2 1 69.298 69.298 4 0.00065511 68477 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.416 61.009 45985000 0 0 0 0 0 0 0 45985000 0 0 0 0 0 28331 2623 26653 261094 333690 333690 1 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333909;333910;333911;333912;333913;333914;333915;333916;333917;333918;333919;333920;333921;333922;333923;333924;333925;333926;333927;333928;333929;333930;333931;333932;333933;333934;333935 333930 27 LLVVDQETDEELR Unmodified 1557.7886 0.78861683 3147 Q15599;H3BMF5 SLC9A3R2 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 84.36 84.36 2 3.9821E-07 86326 QUIQUE_C1218_190116_001 123.79 96.694 68202000 40266000 0 0 0 0 0 0 0 0 27936000 0 0 0 28357 3147 26678 261293;261294;261295;261296 333936;333937;333938;333939 333936 3 LLVVDRETDEFFK Unmodified 1609.8352 0.83517309 1441 O14745;J3QRA3 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.672 97.672 3 0.0031788 101530 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.098 30.961 579940000 0 0 23150000 29402000 39738000 0 35277000 75122000 77698000 0 75819000 110170000 113570000 28358 1441 26679 261297;261298;261299;261300;261301;261302;261303;261304;261305 333940;333941;333942;333943;333944;333945;333946;333947;333948 333946 7 LLVVDRETDEFFKK Unmodified 1737.9301 0.93013611 1441 O14745;J3QRA3 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes no 0 0 2 1 2 1 1 79.019 79.019 2;4 0.0030021 80154 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.86 92.111 281800000 0 0 0 0 0 0 0 40089000 172510000 0 33327000 0 35872000 28359 1441 26680 261306;261307;261308;261309;261310 333949;333950;333951;333952;333953 333950 5 LLVVGITDPDPDIR Unmodified 1521.8403 0.84025847 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 1 112.73 112.73 2 0.00092691 116225 QUIQUE_C1277_190116_001 96.847 69.105 41826000 0 0 0 13416000 0 0 0 0 0 0 28409000 0 0 28360 2447 26681 261311;261312;261313 333954;333955;333956 333954 3 LLVVSSSPYLGDGR Unmodified 1461.7827 0.78274359 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 92.332 92.332 2 0.0038697 89446 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.397 61.933 58610000 0 0 0 0 0 0 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333971;333972;333973;333974;333975;333976;333977;333978;333979;333980;333981;333982;333983;333984;333985;333986;333987;333988;333989;333990;333991;333992;333993;333994;333995;333996;333997;333998;333999;334000;334001;334002;334003;334004;334005;334006;334007;334008;334009;334010;334011;334012;334013;334014;334015;334016;334017;334018;334019;334020;334021;334022;334023;334024;334025;334026;334027;334028;334029;334030;334031;334032;334033;334034;334035;334036;334037;334038;334039;334040;334041;334042;334043;334044;334045;334046;334047;334048;334049;334050;334051;334052;334053;334054;334055;334056;334057;334058;334059;334060;334061;334062;334063;334064;334065;334066;334067;334068;334069;334070;334071;334072;334073;334074;334075;334076;334077;334078;334079;334080;334081;334082;334083;334084;334085;334086;334087;334088;334089;334090;334091;334092;334093;334094;334095;334096;334097;334098;334099;334100;334101;334102;334103;334104;334105;334106;334107;334108;334109;334110;334111;334112;334113;334114;334115;334116;334117;334118;334119;334120;334121;334122;334123;334124;334125;334126;334127;334128;334129;334130;334131;334132;334133;334134;334135;334136;334137;334138;334139;334140;334141;334142;334143;334144;334145;334146;334147;334148;334149;334150;334151;334152;334153;334154;334155;334156 334050 175 LLVYEALEYAK Unmodified 1310.7122 0.71220441 3832 Q96DB5;E5RH53;H0YB83;H0YB03 RMDN1 Regulator of microtubule dynamics protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.64 117.64 2 0.0012751 120379 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.653 71.254 537900000 54139000 23568000 71685000 0 46543000 52518000 34754000 60700000 71539000 23039000 0 39278000 60141000 28364 3832 26685 261418;261419;261420;261421;261422;261423;261424;261425;261426;261427;261428;261429 334157;334158;334159;334160;334161;334162;334163;334164;334165;334166;334167;334168;334169;334170;334171;334172;334173 334166 17 LLWEQELYNNFVYNSPR Unmodified 2184.064 0.064003825 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 0 0 0 2 157.66 157.66 2;3 0.0001468 161180 QUIQUE_C1403_190116_001 111.39 90.435 83058000 0 0 0 83058000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28365 1401 26686 261430;261431 334174;334175 334174 1 LLWEQLQGLESSK Unmodified 1529.809 0.80895834 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.62 126.62 2 8.6281E-06 131236 QUIQUE_C1368_190116_001 122.69 104.88 371150000 46352000 35336000 44362000 33105000 0 41226000 36163000 24116000 0 10541000 41432000 32059000 26459000 28366 3241 26687 261432;261433;261434;261435;261436;261437;261438;261439;261440;261441;261442;261443 334176;334177;334178;334179;334180;334181;334182;334183;334184;334185;334186;334187;334188;334189 334179 14 LLWFVTESK Unmodified 1121.6121 0.61209643 315 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4 DIP2C Disco-interacting protein 2 homolog C yes no 0 0 0 1 1 116.22 116.22 2 0.020857 122178 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.582 43.806 29501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29501000 0 0 28367 315 26688 261444;261445 334190;334191 334191 2 LLWIDTK Unmodified 887.51165 0.5116541 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 90.279 90.279 2 0.044716 87045 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.146 14.342 24429000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24429000 0 0 0 28368 1713 26689 261446 334192 334192 1 LLWILQR Unmodified 940.58582 0.5858221 3447 Q7L985 LINGO2 Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 115.56 115.56 2 0.019666 118930 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.05 63.332 22578000 10177000 0 0 0 0 0 0 0 12401000 0 0 0 0 28369 3447 26690 261447;261448 334193;334194 334194 2 LLWTLESLVTGR Unmodified 1386.7871 0.78710068 3561 Q8IZ83 ALDH16A1 Aldehyde dehydrogenase family 16 member A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.64 154.64 2 4.2751E-06 161608 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.63 86.028 573120000 0 20364000 49433000 44944000 82396000 28098000 48325000 39331000 67689000 18953000 62605000 58096000 52882000 28370 3561 26691 261449;261450;261451;261452;261453;261454;261455;261456;261457;261458;261459;261460 334195;334196;334197;334198;334199;334200;334201;334202;334203;334204;334205;334206;334207;334208 334205 13 LLWTTSR Unmodified 875.4865 0.48650199 425;2084 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0;P14923 CTNNB1;JUP Catenin beta-1;Junction plakoglobin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.54 56.54 2 0.020155 55146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.11 51.644 1719100000 218920000 210400000 0 227390000 200270000 164930000 0 186520000 0 0 0 247020000 263610000 28371 425;2084 26692 261461;261462;261463;261464;261465;261466;261467;261468 334209;334210;334211;334212;334213;334214;334215;334216;334217;334218;334219;334220 334217 12 LLYAVNTHCHADHITGSGLLR Unmodified 2347.1855 0.18553272 1736 O95571;M0QXB5 ETHE1 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 3 1 3 2 1 61.615 61.615 3;4;5 5.3686E-36 60856 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.52 98.085 1096400000 67598000 78031000 92961000 147700000 97547000 133130000 92819000 0 192070000 0 0 158810000 35778000 28372 1736 26693 261469;261470;261471;261472;261473;261474;261475;261476;261477;261478;261479;261480;261481;261482;261483;261484 334221;334222;334223;334224;334225;334226;334227;334228;334229;334230;334231;334232;334233;334234;334235;334236;334237 334233 17 LLYCSNGGHFLR Unmodified 1435.7031 0.70305348 1884 P05230;C9JDC5;B5MCF4;C9JUP6 FGF1 Fibroblast growth factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 57.864 57.864 2;3 0.0001486 56090 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.229 87.505 146990000 16994000 30498000 0 20631000 0 0 0 56461000 0 22405000 0 0 0 28373 1884 26694 261485;261486;261487;261488;261489;261490 334238;334239;334240;334241;334242;334243 334241 6 LLYDLADQLHAAVGASR Unmodified 1811.953 0.95299681 2067 P13804;H0YK49;H0YNX6;H0YL12 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 119.27 119.27 2;3 5.758E-23 122969 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.4 102.91 6385300000 576490000 476640000 547190000 572200000 469410000 621070000 504790000 541530000 444010000 197430000 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10 LLYEALVDCK Unmodified 1222.6268 0.62676022 3439 Q7L2H7;J3KNJ2;H0YCQ8;E9PRY0 EIF3M Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M yes no 0 0 0 1 1 94.501 94.501 2 0.0062253 95445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.731 56.569 68384000 0 0 0 0 0 0 0 39233000 0 29152000 0 0 0 28376 3439 26697 261529;261530 334291;334292 334291 2 LLYEALVDCKK Unmodified 1350.7217 0.72172323 3439 Q7L2H7;J3KNJ2;H0YCQ8;E9PRY0 EIF3M Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M yes no 0 0 1 1 1 1 2 83.871 83.871 3 0.0093788 68792 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.847 33.634 58736000 0 0 0 0 0 0 11040000 0 0 0 17923000 29773000 0 28377 3439 26698 261531;261532;261533;261534;261535 334293;334294;334295;334296;334297 334294 5 LLYEANLPENFR Unmodified 1477.7565 0.75652884 3553 Q8IYB5;A0A087X1X9 SMAP1 Stromal membrane-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.24 103.24 2 0.00019815 107568 QUIQUE_C1218_190116_001 134.84 105.37 1242200000 176270000 0 152270000 129730000 0 103780000 129260000 112280000 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Q8TCU6;H0YDZ4 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes no 0 0 0 1 138.38 138.38 3 0.0025162 145623 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.928 23.408 22355000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22355000 0 0 28390 3676 26711 261626 334415 334415 1 LMAPYTPFLTELMYQNLK Unmodified 2172.0999 0.099920326 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 166.38 166.38 2;3 0.00042778 168365 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.813 54.319 45442000 0 21254000 0 8949500 0 0 0 15238000 0 0 0 0 0 28391 2441 26712 261627;261628;261629 334416;334417;334418;334419;334420 334420 5 LMASDMIESCVK Unmodified 1382.6244 0.62439373 4494;981 F1T0E5;H7C538;H7C4K9;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.824 84.824 2 0.0028175 85845 QUIQUE_C1403_190116_001 73.887 18.425 341330000 52546000 81506000 0 46441000 39486000 31801000 0 0 0 0 53494000 36058000 0 28392 981;4494 26713 261630;261631;261632;261633;261634;261635;261636 334421;334422;334423;334424;334425;334426;334427;334428 334424 8 LMATLSNTNPSFVR Unmodified 1549.7923 0.79226242 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.656 82.656 2 2.1663E-07 83550 QUIQUE_DMIX8_190116_001 135.86 109.74 127740000 0 0 0 0 45654000 0 42758000 0 0 0 0 39324000 0 28393 3459 26714 261637;261638;261639;261640;261641;261642;261643;261644;261645;261646 334429;334430;334431;334432;334433;334434;334435;334436;334437;334438 334438 10 LMAVPNLFMLETVDSVK Unmodified 1905.9944 0.99439262 1695 O94903;E5RFX7;E5RG77;H0YBG2 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 3 2 1 1 2 1 2 2 158.89 158.89 2;3 0.0001152 165487 QUIQUE_C1438_190116_001 96.82 82.577 1018100000 12414000 13629000 144160000 21301000 120050000 107270000 119230000 10533000 128240000 0 22815000 158550000 159880000 28394 1695 26715 261647;261648;261649;261650;261651;261652;261653;261654;261655;261656;261657;261658;261659;261660;261661;261662;261663;261664;261665 334439;334440;334441;334442;334443;334444;334445;334446;334447;334448;334449;334450;334451;334452;334453;334454;334455;334456;334457;334458;334459 334446 19 LMAVPNLFMLETVDSVK Oxidation (M) 1921.9893 0.98930724 1695 O94903;E5RFX7;E5RG77;H0YBG2 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes no 0 1 0 1 1 1 148.53 148.53 2 0.010904 156098 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.627 26.748 157460000 0 0 44659000 0 0 0 0 0 0 0 63976000 48828000 0 28395 1695 26715 261666;261667;261668 334460;334461;334462 334461 929 2 LMCGGVEIR Unmodified 1033.5049 0.50487094 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 47.407 47.407 2 0.026913 45045 QUIQUE_C1218_190116_001 58.23 18.567 120810000 59595000 0 0 0 0 0 61216000 0 0 0 0 0 0 28396 723 26716 261669;261670 334463;334464 334463 2 LMCPQEIVDYIADKK Unmodified 1821.9005 0.90049224 1434 O14561;H3BNK3 NDUFAB1 Acyl carrier protein, mitochondrial;Acyl carrier protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 127.48 127.48 3 0.0002496 131427 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.898 65.84 314920000 40782000 53354000 41471000 0 0 0 0 0 122690000 0 0 0 56621000 28397 1434 26717 261671;261672;261673;261674;261675;261676;261677 334465;334466;334467;334468;334469;334470;334471 334471 4 LMDAVMLQLTR Unmodified 1289.6836 0.68356359 4101 Q9GZN7;K7EPS3;K7EPN1;K7EJ96 ROGDI Protein rogdi homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 118.53 118.53 2 0.00090925 124489 QUIQUE_C1438_190116_001 93.096 73.334 37108000 0 0 19796000 0 17312000 0 0 0 0 0 0 0 0 28398 4101 26718 261678;261679;261680;261681;261682;261683;261684;261685 334472;334473;334474;334475;334476;334477;334478;334479;334480 334475 8 LMDEVAGIVAAR Oxidation (M) 1259.6544 0.65437195 1379 O00154;K7EKP8 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 70.907 70.907 2 0.00044084 70444 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.61 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143;4559;298 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;Q9Y2J2;A0A0J9YWE1;A0A0J9YWN0 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 1 0 1 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 3 149.59 149.59 2;3 1.4892E-12 152097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 133.05 119.85 1744000000 24491000 21158000 262800000 165700000 112690000 24324000 116170000 187360000 139950000 58183000 205290000 177980000 247950000 28401 143;4559;298 26720 261714;261715;261716;261717;261718;261719;261720;261721;261722;261723;261724;261725;261726;261727;261728;261729;261730;261731;261732;261733;261734;261735;261736 334516;334517;334518;334519;334520;334521;334522;334523;334524;334525;334526;334527;334528;334529;334530;334531;334532;334533;334534;334535;334536;334537;334538;334539;334540 334527 82 25 LMDGSEIFSLLESAR Unmodified 1666.8236 0.82362212 143;4559;298 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;Q9Y2J2;A0A0J9YWE1;A0A0J9YWN0 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 5 4 4 5 5 4 4 4 3 2 2 4 4 163.29 163.29 2;3 3.05E-94 164851 QUIQUE_C1563_190116_001 215.72 184.23 5309900000 516960000 387430000 502850000 439180000 420220000 307480000 544200000 409910000 315670000 16085000 465890000 499050000 484990000 28402 143;4559;298 26720 261737;261738;261739;261740;261741;261742;261743;261744;261745;261746;261747;261748;261749;261750;261751;261752;261753;261754;261755;261756;261757;261758;261759;261760;261761;261762;261763;261764;261765;261766;261767;261768;261769;261770;261771;261772;261773;261774;261775;261776;261777;261778;261779;261780;261781;261782;261783;261784;261785;261786 334541;334542;334543;334544;334545;334546;334547;334548;334549;334550;334551;334552;334553;334554;334555;334556;334557;334558;334559;334560;334561;334562;334563;334564;334565;334566;334567;334568;334569;334570;334571;334572;334573;334574;334575;334576;334577;334578;334579;334580;334581;334582;334583;334584;334585;334586;334587;334588;334589;334590;334591;334592;334593;334594 334567 49 LMDILYASEEHEGHTEEPEAEEQAHEQQPPQQEEY Unmodified 4149.7658 0.76579207 3145 Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.121 93.121 4 1.708E-21 94932 QUIQUE_C1277_190116_001 76.259 74.872 1336700000 111140000 114840000 0 105430000 123270000 100270000 105380000 132550000 100170000 44187000 140920000 99649000 158840000 28403 3145 26721 261787;261788;261789;261790;261791;261792;261793;261794;261795;261796;261797;261798 334595;334596;334597;334598;334599;334600;334601;334602;334603;334604;334605;334606;334607;334608;334609;334610;334611 334596 17 LMDLDVEQLGIPEQEYSCVVK Unmodified 2464.1866 0.18656308 2032 P12004 PCNA Proliferating cell nuclear antigen yes yes 0 0 0 1 145.88 145.88 2 2.5444E-07 150343 QUIQUE_C1277_190116_001 124.62 96.651 31525000 0 31525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28404 2032 26722 261799 334612 334612 1 LMDLLADSR Unmodified 1032.5274 0.52738052 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.164 84.164 2 0.0037409 86597 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.601 41.011 462390000 49833000 53525000 40518000 0 40533000 39028000 35090000 41040000 0 18545000 60998000 42506000 40772000 28405 1591 26723 261800;261801;261802;261803;261804;261805;261806;261807;261808;261809;261810 334613;334614;334615;334616;334617;334618;334619;334620;334621;334622;334623;334624;334625;334626 334622 13 LMDLLDR Unmodified 874.45824 0.45823833 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 81.51 81.51 2 0.019342 82373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 63.684 642250000 203080000 178500000 141190000 0 0 0 0 119470000 0 0 0 0 0 28406 2605 26724 261811;261812;261813;261814 334627;334628;334629;334630;334631 334630 5 LMDLLGEGLKR Unmodified 1243.6958 0.69584284 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.918 82.918 3 0.0011742 84427 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.385 45.056 275490000 19522000 23729000 21398000 0 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cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.09 139.09 2 0.0014591 141733 QUIQUE_C1563_190116_001 99.815 63.258 1808300000 212630000 187020000 178030000 178570000 128440000 137540000 159170000 70762000 62211000 50132000 155790000 129860000 158170000 28409 2422 26727 261842;261843;261844;261845;261846;261847;261848;261849;261850;261851;261852;261853;261854 334661;334662;334663;334664;334665;334666;334667;334668;334669;334670;334671;334672;334673 334666 12 LMDSMVAEFLK Oxidation (M) 1298.625 0.62504566 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385;F8WDB9;F8WEW0 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 117.3 117.3 2 0.0030206 121544 QUIQUE_C1368_190116_001 77.662 59.223 117810000 0 0 29186000 28761000 0 30084000 29781000 0 0 0 0 0 0 28410 2422 26727 261855;261856;261857;261858 334674;334675;334676;334677;334678 334675 1848 4 LMDSVALK Unmodified 875.47864 0.47863942 4315 Q9NWV4 C1orf123 UPF0587 protein C1orf123 yes yes 0 0 0 1 47.262 47.262 2 0.039178 45340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.369 32.267 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28411 4315 26728 261859 334679 334679 1 LMDVGLIAIR Unmodified 1099.6424 0.6423507 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.71 113.71 2 0.00094816 110903 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.27 83.394 5651500000 471250000 516150000 326800000 434420000 484870000 343720000 504870000 391610000 390760000 177270000 529440000 533630000 546710000 28412 2343 26729 261860;261861;261862;261863;261864;261865;261866;261867;261868;261869;261870;261871;261872 334680;334681;334682;334683;334684;334685;334686;334687;334688;334689;334690;334691;334692;334693;334694;334695;334696;334697;334698;334699;334700;334701;334702;334703 334698 24 LMDVGLIAIR Oxidation (M) 1115.6373 0.63726532 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 90.717 90.717 2 0.014129 94090 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334729;334730;334731 334730 3 LMELHGEGSSSGK Unmodified 1330.6187 0.61871473 809 D6RG13;D6RAT0;P61247;D6R9B6;H0Y9Y4 RPS3A 40S ribosomal protein S3a yes no 0 0 0 1 1 1 19.525 19.525 2;3 0.00092312 12407 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.112 74.248 152900000 0 0 0 0 0 0 0 0 69972000 0 0 0 82928000 28419 809 26734 261900;261901;261902 334732;334733;334734;334735 334733 4 LMELQEAVR Unmodified 1087.5696 0.56957969 77;1567 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6;O60271;A0A087X2D8 MAPK8IP3;SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3;C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.123 62.123 2 0.0074526 61413 QUIQUE_C1403_190116_001 81.548 46.054 403970000 0 0 0 80463000 0 90131000 77978000 70945000 0 0 0 0 84450000 28420 77;1567 26735 261903;261904;261905;261906;261907;261908;261909 334736;334737;334738;334739;334740;334741;334742 334738 6 LMEPHRPER Unmodified 1163.587 0.58696109 2535 P49593;A8MX49;B5MCT7 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 12.593 12.593 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334806 8 LMFNSPGFVEYVVDR Unmodified 1771.8603 0.86034198 3177 Q16401 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.17 143.17 2 8.4144E-29 146376 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.15 127.9 591350000 51139000 73735000 0 0 55780000 0 58381000 62729000 69331000 14628000 75955000 76182000 53494000 28428 3177 26742 261971;261972;261973;261974;261975;261976;261977;261978;261979;261980;261981;261982 334808;334809;334810;334811;334812;334813;334814;334815;334816;334817;334818;334819;334820;334821 334815 14 LMFTAFLPDSTGSFTR Unmodified 1789.8709 0.87090667 2155 P19838;D6RF93 NFKB1 Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit;Nuclear factor NF-kappa-B p50 subunit yes no 0 0 0 1 149.87 149.87 2 0.019555 154380 QUIQUE_C1277_190116_001 51.218 37.79 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28429 2155 26743 261983 334822 334822 1 LMGEDEKPAAK Unmodified 1187.5856 0.58562368 4438 Q9UHV9 PFDN2 Prefoldin subunit 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 15.706 15.706 2;3 0.00061781 8234 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protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.1 116.1 2 0.00044606 120036 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.93 88.124 336050000 20988000 25346000 34835000 32248000 19380000 0 29141000 37402000 37309000 0 41128000 26513000 31761000 28472 292;3442 26778 262279;262280;262281;262282;262283;262284;262285;262286;262287;262288;262289;262290 335214;335215;335216;335217;335218;335219;335220;335221;335222;335223;335224;335225;335226 335222 12 LMNIFLK Unmodified 877.50955 0.50954561 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.105 93.105 2 0.01933 94720 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.54 81.047 574400000 48635000 58998000 49359000 41704000 70844000 33439000 39792000 0 34799000 22264000 81791000 29070000 63705000 28473 1803 26779 262291;262292;262293;262294;262295;262296;262297;262298;262299;262300;262301;262302 335227;335228;335229;335230;335231;335232;335233;335234;335235;335236;335237;335238;335239;335240;335241;335242 335242 16 LMNLLQER Unmodified 1015.5485 0.54845032 3284 Q5M775 SPECC1 Cytospin-B yes yes 0 0 0 1 73.299 73.299 2 0.042713 72791 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.815 40.829 14313000 0 0 0 0 0 0 0 14313000 0 0 0 0 0 28474 3284 26780 262303 335243 335243 1 LMNQMNAR Unmodified 976.45826 0.4582551 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 20.282 20.282 2 0.048252 13372 QUIQUE_C1438_190116_001 75.311 52.001 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28475 3421 26781 262304 335244 335244 1 LMPDKESMYYPR Unmodified 1528.7054 0.70542124 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 54.837 54.837 2 0.0065401 53343 QUIQUE_C1368_190116_001 84.17 61.529 32438000 0 0 32438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28476 3662 26782 262305;262306;262307 335245;335246;335247 335245 3 LMPNLYPPETIADGVK Unmodified 1756.907 0.90695782 4104 Q9GZT4 SRR Serine racemase yes yes 0 0 0 1 1 113.95 113.95 2 0.030854 117448 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.809 25.598 113140000 0 0 0 0 0 0 0 0 86609000 26535000 0 0 0 28477 4104 26783 262308;262309 335248;335249 335248 2 LMQADLGGTEILAPLQNIYR Unmodified 2215.1671 0.16708869 1416 O00534;B4DHS6 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes no 0 0 0 1 2 1 2 151.72 151.72 2;3 2.4532E-56 157236 QUIQUE_C1218_190116_001 172.1 152.78 112430000 19071000 24027000 0 26735000 0 42597000 0 0 0 0 0 0 0 28478 1416 26784 262310;262311;262312;262313;262314;262315 335250;335251;335252;335253;335254;335255;335256 335250 7 LMQADLGGTEILAPLQNIYR Oxidation (M) 2231.162 0.16200331 1416 O00534;B4DHS6 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes no 0 1 0 1 1 144.6 144.6 2 0.0030185 140440 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.524 44.991 8223800 0 0 0 0 0 0 0 0 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262325;262326;262327;262328;262329;262330;262331;262332;262333 335266;335267;335268;335269;335270;335271;335272;335273;335274 335268 6 LMQITSLHSLNAFLLPIK Unmodified 2038.1649 0.16490384 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.1 145.1 3 0.0019625 149914 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.265 42.615 526510000 24288000 63486000 0 39507000 93982000 20712000 44229000 38108000 44374000 0 54305000 57299000 46217000 28483 2554 26788 262334;262335;262336;262337;262338;262339;262340;262341;262342;262343;262344 335275;335276;335277;335278;335279;335280;335281;335282;335283;335284;335285 335282 8 LMQLVDHR Unmodified 1010.5331 0.5331346 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 30.909 30.909 2 0.0078552 24951 QUIQUE_C1563_190116_001 96.492 66.919 192620000 44870000 75995000 0 0 0 71752000 0 0 0 0 0 0 0 28484 381 26789 262345;262346;262347;262348 335286;335287;335288;335289 335289 4 LMQQLQDLEECREELDTDEYEETKK Unmodified 3171.4224 0.42238927 3724 Q8WZA0 LZIC Protein LZIC yes yes 0 0 2 1 1 1 108.25 108.25 4 2.2889E-09 112340 QUIQUE_C1218_190116_001 74.222 66.322 200370000 74893000 0 0 57322000 0 68156000 0 0 0 0 0 0 0 28485 3724 26790 262349;262350;262351 335290;335291;335292 335290 3 LMSANASDLPLNIECFMNDLDVSSK Unmodified 2783.2816 0.28160245 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 168.98 168.98 3 0.037761 170850 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.971 16.019 35644000 0 0 0 0 0 0 0 35644000 0 0 0 0 0 28486 1748 26791 262352 335293 335293 1 LMSANASDLPLSIECFMNDVDVSGTMNR Unmodified 3086.3817 0.3817272 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 169.07 169.07 3 3.3798E-08 174267 QUIQUE_C1576_190116_001 56.854 51.253 101810000 21348000 0 0 0 24263000 0 56203000 0 0 0 0 0 0 28487 2363 26792 262353;262354;262355 335294;335295;335296 335296 2 LMSELVSNGVQIYQFPTDDDTIAK Unmodified 2683.3051 0.30509831 646 E7EW69;B5ME97;Q9P0V9;E7EX04;F5H1F2;C9JEQ7 SEPT10 Septin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 141.77 141.77 3 1.4152E-12 146521 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.352 90.399 349240000 47991000 0 0 0 0 41543000 0 50704000 60783000 24183000 60278000 0 63756000 28488 646 26793 262356;262357;262358;262359;262360;262361;262362 335297;335298;335299;335300;335301;335302;335303 335300 7 LMSNALSTVTR Unmodified 1191.6282 0.6281572 4348 Q9NZJ7;H0Y8C3 MTCH1 Mitochondrial carrier homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 57.849 57.849 2 0.0028683 57731 QUIQUE_C1218_190116_001 112.36 54.798 193880000 123080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70796000 28489 4348 26794 262363;262364 335304;335305 335304 1 LMSSGNEESLR Unmodified 1221.566 0.56595087 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.14 30.14 2 0.00043855 24641 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.7 75.964 510690000 49390000 39818000 67301000 65809000 51009000 0 59233000 22423000 36964000 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335320;335321;335322;335323;335324;335325;335326;335327;335328;335329 335320 2776 8 LMSSLPNFCGIFNHLER Unmodified 2033.9815 0.98153652 3920 Q96PU8;H0YFB7 QKI Protein quaking yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.08 138.08 3 3.597E-07 143116 QUIQUE_C1368_190116_001 103.13 93.074 1207900000 116720000 115280000 118710000 118870000 95403000 127080000 117580000 82414000 0 0 100650000 104510000 110690000 28493 3920 26796 262387;262388;262389;262390;262391;262392;262393;262394;262395;262396;262397 335330;335331;335332;335333;335334;335335;335336;335337;335338;335339;335340;335341;335342 335332 13 LMTDTINEPILLCR Oxidation (M) 1703.8586 0.85862742 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 100.8 100.8 2 1.3603E-07 104583 QUIQUE_C1218_190116_001 129.88 105.04 302890000 37393000 0 56319000 48090000 0 38001000 0 76818000 0 46270000 0 0 0 28494 1553 26797 262398;262399;262400;262401;262402;262403;262404 335343;335344;335345;335346;335347;335348;335349;335350 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Unmodified 940.51642 0.51642191 4695 yes no 0 0 0 1 24.619 24.619 2 0.033272 18463 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.803 7.3398 13222000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13222000 0 + 28497 4695 26799 262424 335372 335372 1 LMTPTLSFLAR Unmodified 1248.69 0.69002918 3224 Q3KQU3 MAP7D1 MAP7 domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 122.18 122.18 2 0.048528 124579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.001 11.913 13036000 0 0 0 0 0 0 0 13036000 0 0 0 0 0 28498 3224 26800 262425 335373 335373 1 LMTQAQLEEATR Unmodified 1389.6922 0.69221402 1101 G5E9W7;G5E9V5;P82650;H7C5F2;H7C5H3 MRPS22 28S ribosomal protein S22, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 60.778 60.778 2 0.0061184 60980 QUIQUE_C1218_190116_001 80.763 67.386 67296000 31040000 0 36256000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28499 1101 26801 262426;262427 335374;335375 335374 0 LMTSSTNNWVLIK Unmodified 1505.7912 0.79119978 1437 O14617;A0A2R8Y4J3;A0A087WYN6 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 100.67 100.67 2 0.025505 104409 QUIQUE_C1218_190116_001 62.466 46.587 49181000 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protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 46.27 46.27 2 0.02099 44100 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.42 8.9425 569480000 0 0 0 0 180740000 0 0 0 0 0 199360000 189380000 0 28507 2514 26807 262481;262482;262483 335432;335433;335434;335435 335433 4 LMVEPLQAILIR Unmodified 1394.8319 0.83194239 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.16 140.16 2 0.0013095 146950 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.802 91.582 288200000 0 0 32613000 0 37171000 27234000 30610000 29979000 21252000 15678000 34784000 23667000 35215000 28508 196 26808 262484;262485;262486;262487;262488;262489;262490;262491;262492;262493 335436;335437;335438;335439;335440;335441;335442;335443;335444;335445;335446 335444 11 LMVHNWEYLGK Oxidation (M) 1404.686 0.68600643 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 63.79 63.79 2;3 0.0004657 64063 QUIQUE_C1218_190116_001 82.954 68.869 339080000 48123000 63446000 45957000 46213000 0 33726000 0 0 0 46626000 54989000 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335618;335619 335618 2 LMWLFGCPLLLDDVAR Oxidation (M) 1933.9794 0.97941126 1477 O15067;J3QSG0;J3QSH6;J3KTL4;J3QL39 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 1 0 1 1 166.64 166.64 2 4.5769E-05 160790 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.353 85.586 36028000 0 29804000 0 0 0 0 0 0 0 6223700 0 0 0 28525 1477 26822 262641;262642 335620;335621 335621 820 2 LMWLFGCPLLLDDVAR Unmodified 1917.9845 0.98449664 1477 O15067;J3QSG0;J3QSH6;J3KTL4;J3QL39 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 169.8 169.8 2 2.3071E-05 174027 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.42 108.99 101380000 0 0 0 0 0 0 0 19684000 0 0 0 45792000 35904000 28526 1477 26822 262643;262644;262645;262646 335622;335623;335624;335625 335625 4 LMYFKDPLDAFAR Unmodified 1585.7963 0.79628516 1129 H0Y7Q1;O75689;A0A087WTN6;H7C324;A0A3B3ISA7 ADAP1 Arf-GAP with dual PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 127.11 127.11 3 0.0034428 131240 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.619 55.248 72943000 0 0 0 0 0 0 0 18413000 0 0 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262656;262657;262658;262659;262660;262661;262662;262663;262664;262665;262666;262667;262668 335635;335636;335637;335638;335639;335640;335641;335642;335643;335644;335645;335646;335647;335648;335649;335650 335643 15 LNAIYQNNLTK Unmodified 1290.6932 0.6932003 1779 P00390;A0A2R8YF59;H0YC68 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.194 52.194 2 9.6295E-05 50770 QUIQUE_C1438_190116_001 132.88 109.02 2025600000 228950000 164350000 184170000 141380000 129710000 128650000 149600000 232040000 0 0 295470000 186510000 184780000 28530 1779 26826 262669;262670;262671;262672;262673;262674;262675;262676;262677;262678;262679 335651;335652;335653;335654;335655;335656;335657;335658;335659;335660;335661;335662;335663;335664;335665;335666;335667;335668;335669 335657 19 LNATNIELATVQPGQNFHMFTK Unmodified 2473.2424 0.2423789 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 115.88 115.88 2;3 1.3678E-54 119828 QUIQUE_C1368_190116_001 215.48 204.37 2590500000 280000000 264190000 352010000 275630000 198220000 0 236620000 114160000 174120000 0 299390000 138610000 257570000 28531 2273 26827 262680;262681;262682;262683;262684;262685;262686;262687;262688;262689;262690;262691;262692 335670;335671;335672;335673;335674;335675;335676;335677;335678;335679;335680;335681;335682;335683;335684;335685;335686;335687 335676 18 LNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIK Unmodified 3442.7443 0.74425618 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 1 1 1 1 138.57 138.57 4 0.022513 144112 QUIQUE_C1368_190116_001 23.642 18.637 327360000 0 0 73822000 0 0 0 0 0 67567000 0 0 0 185970000 28532 2273 26828 262693;262694;262695 335688;335689;335690 335688 3 LNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKDI Unmodified 3670.8553 0.85526319 2273 P28066 PSMA5 Proteasome subunit alpha type-5 yes yes 0 0 2 1 160.37 160.37 4 4.4868E-06 162814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.087 39.706 83525000 0 0 0 0 0 0 0 83525000 0 0 0 0 0 28533 2273 26829 262696 335691 335691 1 LNCLVAPTLFLEFHGSQQALEEQLQR Unmodified 3040.544 0.54404023 3511 Q86WU2 LDHD Probable D-lactate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 151.15 151.15 3 1.0004E-07 156290 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.477 46.953 283900000 0 0 70883000 0 44028000 0 0 0 52189000 0 68142000 0 48658000 28534 3511 26830 262697;262698;262699;262700;262701 335692;335693;335694;335695;335696 335694 5 LNCQVIGASVDSHFCHLAWVNTPK Unmodified 2752.3214 0.32137427 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 0 4 5 6 3 4 3 5 5 5 2 6 6 6 107.39 107.39 2;3;4 8.0951E-161 109179 QUIQUE_C1403_190116_001 243.29 233.76 77753000000 5343300000 5732800000 7179300000 5786200000 5274300000 5442400000 7325800000 6376400000 7917300000 1779200000 6045200000 5724000000 7827100000 28535 2904 26831 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335840 112 1 LNDGNEYLFQAK Unmodified 1410.6779 0.67794416 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 73.579 73.579 2 8.7577E-14 72859 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.4 148.57 21867000000 2021500000 2202700000 1786400000 1593500000 2134300000 1304500000 1906700000 1007200000 1618000000 769770000 2024800000 1634800000 1862500000 28541 2851 26836 262794;262795;262796;262797;262798;262799;262800;262801;262802;262803;262804;262805;262806;262807;262808;262809;262810;262811 335841;335842;335843;335844;335845;335846;335847;335848;335849;335850;335851;335852;335853;335854;335855;335856;335857;335858;335859;335860;335861;335862;335863;335864;335865;335866;335867 335858 27 LNDGSQITYEK Unmodified 1266.6092 0.6091959 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.996 31.996 2 4.5155E-24 26800 QUIQUE_C1277_190116_001 207.83 159.55 1893100000 0 165570000 220640000 168310000 126860000 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262897;262898;262899 335977;335978;335979 335978 3 LNDQLEEQR Unmodified 1143.552 0.55201537 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 25.579 25.579 2 0.016045 19052 QUIQUE_C1277_190116_001 66.299 31.03 25768000 0 25768000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28554 228 26848 262900 335980 335980 1 LNDYIFSFDK Unmodified 1260.6027 0.60265396 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.91 114.91 2 0.00022961 118485 QUIQUE_DMIX7_190116_001 135.72 113.33 555210000 53146000 56579000 48905000 40270000 53504000 29112000 44356000 53702000 0 0 63221000 45957000 66465000 28555 2638 26849 262901;262902;262903;262904;262905;262906;262907;262908;262909;262910;262911 335981;335982;335983;335984;335985;335986;335987;335988;335989;335990;335991;335992;335993;335994;335995 335994 15 LNDYLQIETIQALEELAAK Unmodified 2174.1471 0.14706475 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUC3;A0A1B0GV98;A0A1B0GTC5;A0A1B0GU26;A0A1B0GTY1 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 167.83 167.83 2;3 8.1711E-58 169716 QUIQUE_DMIX1_190116_001 133.94 118.35 1219200000 142490000 121490000 53408000 46314000 150520000 30979000 64002000 112420000 69754000 29487000 211050000 154190000 33067000 28556 334 26850 262912;262913;262914;262915;262916;262917;262918;262919;262920;262921;262922;262923;262924;262925;262926;262927;262928;262929;262930;262931;262932;262933;262934;262935 335996;335997;335998;335999;336000;336001;336002;336003;336004;336005;336006;336007;336008;336009;336010;336011;336012;336013;336014;336015;336016;336017;336018;336019;336020;336021;336022 336009 27 LNEAAAGLNQAATELVQASR Unmodified 2026.0443 0.044331016 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 2 3 1 2 2 1 2 2 2 3 1 2 122.41 122.41 2;3 3.0318E-26 126759 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.91 151.7 1760600000 91021000 171030000 246010000 111030000 183550000 148860000 50119000 130330000 139600000 92219000 214620000 69245000 112960000 28557 4600 26851 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263001;263002;263003;263004;263005;263006 336100;336101;336102;336103;336104;336105 336101 6 LNECVDHTPK Unmodified 1211.5605 0.56047157 2812 P78417;Q5TA02;Q5TA01 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 14.576 14.576 2;3 7.4421E-14 7097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.83 149.04 7494400000 847580000 711650000 1083300000 783880000 1111900000 0 1010500000 379150000 231100000 50271000 302460000 168890000 813810000 28564 2812 26858 263007;263008;263009;263010;263011;263012;263013;263014;263015;263016;263017;263018;263019;263020;263021;263022;263023;263024;263025;263026 336106;336107;336108;336109;336110;336111;336112;336113;336114;336115;336116;336117;336118;336119;336120;336121;336122;336123;336124;336125;336126 336118 14 LNEDMACSVAGITSDANVLTNELR Unmodified 2592.216 0.21596573 2246 P25789;H0YMZ1;H0YL69;H0YN18;H0YMA1;H0YLC2;H0YKT8;H0YLS6 PSMA4 Proteasome subunit alpha type-4;Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 1 1 2 2 2 149.31 149.31 2;3 5.852E-51 154935 QUIQUE_C1218_190116_001 153.86 139.83 1865900000 180840000 188250000 315700000 148640000 156540000 237450000 143310000 20595000 64397000 0 173680000 132000000 104470000 28565 2246 26859 263027;263028;263029;263030;263031;263032;263033;263034;263035;263036;263037;263038;263039;263040;263041;263042;263043;263044;263045;263046;263047;263048;263049 336127;336128;336129;336130;336131;336132;336133;336134;336135;336136;336137;336138;336139;336140;336141;336142;336143;336144;336145;336146;336147;336148;336149;336150;336151;336152;336153;336154;336155 336129 27 LNEDMACSVAGITSDANVLTNELR Oxidation (M) 2608.2109 0.21088035 2246 P25789;H0YMZ1;H0YL69;H0YN18;H0YMA1;H0YLC2;H0YKT8;H0YLS6 PSMA4 Proteasome subunit alpha type-4;Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit beta type yes no 0 1 0 1 149.36 149.36 2 2.9201E-06 154040 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.738 68.762 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28566 2246 26859 263050 336156 336156 1602 1 LNEDTIQDVVQAADLLLLTDLK Unmodified 2439.3108 0.31083562 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 177.54 177.54 2;3 2.5398E-61 182203 QUIQUE_C1576_190116_001 210.1 186.16 292830000 0 15598000 10346000 0 0 0 19423000 20298000 33745000 0 150140000 0 43284000 28567 4143 26860 263051;263052;263053;263054;263055;263056;263057;263058 336157;336158;336159;336160;336161;336162;336163;336164 336159 7 LNEEIER Unmodified 901.45051 0.45051041 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.316 20.316 2 0.02099 13579 QUIQUE_C1218_190116_001 106.42 0 788290000 114890000 0 145330000 0 0 127460000 0 93821000 0 0 161200000 145580000 0 28568 4631 26861 263059;263060;263061;263062;263063;263064 336165;336166;336167;336168;336169;336170 336165 6 LNEFLELER Unmodified 1161.603 0.60298831 3284 Q5M775;J3KSG2 SPECC1 Cytospin-B yes no 0 0 0 1 1 1 1 92.581 92.581 2 0.0021183 94344 QUIQUE_C1277_190116_001 96.668 25.167 69344000 21372000 22711000 0 0 0 25261000 0 0 0 0 0 0 0 28569 3284 26862 263065;263066;263067;263068 336171;336172;336173;336174 336172 4 LNEGVVEFASYGDLK Unmodified 1639.8094 0.80935227 2981 Q13243 SRSF5 Serine/arginine-rich splicing factor 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 111.03 111.03 2 1.214E-05 113554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.24 96.986 88870000 0 0 0 0 0 22401000 0 34281000 32187000 0 0 0 0 28570 2981 26863 263069;263070;263071 336175;336176;336177;336178 336176 4 LNEHFLNTTDFLDTIK Unmodified 1919.9629 0.9628928 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 2 3 3 2 4 125.4 125.4 2;3 1.6036E-54 130771 QUIQUE_DMIX5_190116_001 226.19 213.05 22787000000 1946900000 2076400000 2446700000 1896800000 1582100000 1619600000 1311400000 1833000000 1593400000 682670000 2268200000 1867200000 1662800000 28571 2518 26864 263072;263073;263074;263075;263076;263077;263078;263079;263080;263081;263082;263083;263084;263085;263086;263087;263088;263089;263090;263091;263092;263093;263094;263095;263096;263097;263098;263099;263100;263101;263102;263103 336179;336180;336181;336182;336183;336184;336185;336186;336187;336188;336189;336190;336191;336192;336193;336194;336195;336196;336197;336198;336199;336200;336201;336202;336203;336204;336205;336206;336207;336208;336209;336210;336211;336212;336213;336214;336215;336216;336217;336218;336219;336220;336221;336222;336223;336224;336225;336226;336227;336228;336229;336230 336222 51 LNEIEGTLNK Unmodified 1129.5979 0.59790293 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41 41 2 7.8874E-05 38264 QUIQUE_C1218_190116_001 156.92 64.478 905450000 127110000 112000000 106370000 72256000 166620000 0 95351000 0 89595000 0 68847000 67300000 0 28572 2008 26865 263104;263105;263106;263107;263108;263109;263110;263111;263112;263113 336231;336232;336233;336234;336235;336236;336237;336238;336239;336240;336241 336232 10 LNEILQAR Unmodified 955.54508 0.5450795 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 40.5 40.5 2 0.05286 36956 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.692 25.676 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28573 645 26866 263114 336242 336242 1 LNEILYPPLKQEQVQVLIEK Unmodified 2393.357 0.35699795 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 1 1 1 1 1 118.38 118.38 3 6.9008E-06 121191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.144 58.923 276470000 0 51745000 0 0 0 0 43567000 102960000 78200000 0 0 0 0 28574 4250 26867 263115;263116;263117;263118 336243;336244;336245;336246 336245 4 LNEIVDAANAVISHIDQTALAVYIAMK Unmodified 2882.5212 0.52117952 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 177.26 177.26 3 1.1696E-05 184152 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.756 33.957 20204000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20204000 0 0 28575 2285 26868 263119 336247 336247 1 LNEIVDQIK Unmodified 1070.5972 0.59717465 836 E5RGS5;E5RGQ3;Q9H446;E5RJE3 RWDD1 RWD domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.942 57.942 2 0.0070911 57135 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.563 23.748 75219000 0 0 0 0 0 0 0 0 40138000 0 0 0 35081000 28576 836 26869 263120;263121;263122;263123;263124 336248;336249;336250;336251;336252 336250 5 LNELADQDFPLHPR Unmodified 1663.8318 0.83181904 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 79.995 79.995 2;3 2.1317E-17 81463 QUIQUE_C1277_190116_001 151.79 117.01 3457400000 266510000 267390000 307040000 227310000 219250000 248900000 271490000 252650000 310320000 158360000 311840000 300790000 315550000 28577 4091 26870 263125;263126;263127;263128;263129;263130;263131;263132;263133;263134;263135;263136;263137;263138;263139;263140;263141;263142;263143;263144;263145;263146;263147;263148;263149;263150 336253;336254;336255;336256;336257;336258;336259;336260;336261;336262;336263;336264;336265;336266;336267;336268;336269;336270;336271;336272;336273;336274;336275;336276;336277;336278;336279;336280;336281;336282;336283;336284;336285;336286;336287;336288;336289;336290;336291;336292;336293;336294;336295;336296;336297 336259 45 LNELLEAIK Unmodified 1041.607 0.60701105 144 A0A0A0MRE5;Q9ULH1;H0YBF7 ASAP1 Arf-GAP with SH3 domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.828 86.828 2 0.0021183 89902 QUIQUE_C1438_190116_001 96.668 53.422 174720000 21527000 17707000 18645000 19613000 17849000 0 18587000 0 0 0 22540000 16022000 22232000 28578 144 26871 263151;263152;263153;263154;263155;263156;263157;263158;263159;263160;263161 336298;336299;336300;336301;336302;336303;336304;336305;336306;336307;336308 336302 11 LNELLVK Unmodified 827.51165 0.5116541 2952 Q12931;I3L0K7;I3L253 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 44.837 44.837 2 0.022155 39334 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.77 19.396 34700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34700000 0 0 0 28579 2952 26872 263162 336309 336309 1 LNELMSQIR Unmodified 1102.5805 0.58047873 3456 Q7Z3B4 NUP54 Nucleoporin p54 yes yes 0 0 0 1 62.031 62.031 2 0.042726 61672 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.692 27.9 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28580 3456 26873 263163 336310 336310 1 LNENHSGELWK Unmodified 1325.6364 0.6364137 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.035 30.035 2 3.8969E-06 24833 QUIQUE_C1277_190116_001 147.62 106.2 483840000 45869000 40464000 59533000 0 50137000 53378000 41408000 0 0 0 68157000 56738000 68157000 28581 194 26874 263164;263165;263166;263167;263168;263169;263170;263171;263172 336311;336312;336313;336314;336315;336316;336317;336318;336319 336312 6 LNEQASEEILK Unmodified 1272.6561 0.65614609 221 A0A0C4DFV9;Q01105 SET Protein SET yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.018 51.018 2 3.6278E-06 48418 QUIQUE_C1563_190116_001 147.75 83.187 5126200000 633580000 540420000 313030000 412460000 634640000 475390000 409450000 165180000 344070000 150640000 391580000 296340000 359400000 28582 221 26875 263173;263174;263175;263176;263177;263178;263179;263180;263181;263182;263183;263184;263185 336320;336321;336322;336323;336324;336325;336326;336327;336328;336329;336330;336331;336332;336333 336325 13 LNEQASEEILKVEQK Unmodified 1756.9207 0.92069363 221 A0A0C4DFV9;Q01105 SET Protein SET yes no 0 0 1 1 64.063 64.063 3 0.029865 62838 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.372 39.817 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28583 221 26876 263186 336334 336334 1 LNEQHQLILSK Unmodified 1321.7354 0.73539946 3553 Q8IYB5 SMAP1 Stromal membrane-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 30.767 30.767 2;3 0.0025437 25202 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.77 85.767 223890000 0 0 0 98691000 0 0 0 64956000 0 0 60245000 0 0 28584 3553 26877 263187;263188;263189;263190;263191;263192;263193 336335;336336;336337;336338;336339;336340;336341 336341 7 LNEQQSVLQR Unmodified 1213.6415 0.64149908 3079 Q14683;G8JLG1;V9GY57 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 0 1 30.929 30.929 2 0.04919 26039 QUIQUE_C1368_190116_001 48.091 28.101 102710000 0 0 102710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28585 3079 26878 263194 336342 336342 1 LNEQYEHASIHLWDLLEGK Unmodified 2294.1331 0.13314602 3067 Q14444;G3V153 CAPRIN1 Caprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 129.51 129.51 4 4.3672E-05 133609 QUIQUE_C1277_190116_001 77.391 69.858 527370000 69466000 86600000 0 0 0 0 103950000 54041000 78761000 23393000 55336000 55831000 0 28586 3067 26879 263195;263196;263197;263198;263199;263200;263201;263202;263203 336343;336344;336345;336346;336347;336348;336349;336350;336351;336352 336344 8 LNETLSSFSDDNK Unmodified 1468.6682 0.66816734 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.068 62.068 2 1.3294E-07 61041 QUIQUE_C1277_190116_001 158.05 110.44 173010000 38445000 36313000 0 0 0 24443000 45779000 0 0 0 0 28025000 0 28587 3895 26880 263204;263205;263206;263207;263208;263209;263210;263211 336353;336354;336355;336356;336357;336358;336359;336360 336354 8 LNEVEQLLYYLQNR Unmodified 1793.9312 0.93119874 3758 Q92845 KIFAP3 Kinesin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 164.13 164.13 2;3 1.0017E-10 166260 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.06 121.88 267160000 27644000 32746000 18491000 14636000 39902000 9206900 23314000 15665000 0 8710000 28184000 18840000 29825000 28588 3758 26881 263212;263213;263214;263215;263216;263217;263218;263219;263220;263221;263222;263223;263224 336361;336362;336363;336364;336365;336366;336367;336368;336369;336370;336371;336372;336373;336374 336368 14 LNEVIVK Unmodified 813.496 0.49600404 4152 Q9H2X9 SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 0 1 28.249 28.249 2 0.057855 22499 QUIQUE_C1368_190116_001 70.67 24.006 64395000 0 0 64395000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28589 4152 26882 263225 336375 336375 1 LNEVSSDANR Unmodified 1103.5207 0.52071524 665 B7Z7F3;Q9H6Z4;K7ESQ0 RANBP3 Ran-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 14.851 14.851 2 0.0051243 6858 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.556 44.76 15697000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15697000 0 0 0 28590 665 26883 263226 336376 336376 1 LNFANPPFK Unmodified 1046.5549 0.5549159 2474 P45985;R4GN37 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 79.486 79.486 2 0.015519 76669 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.032 26.929 262490000 0 0 44465000 0 0 37555000 0 41250000 0 39195000 100020000 0 0 28591 2474 26884 263227;263228;263229;263230;263231;263232 336377;336378;336379;336380;336381;336382 336380 5 LNFAVASR Unmodified 876.48175 0.48175096 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.453 47.453 2 1.2432E-09 44124 QUIQUE_C1563_190116_001 181.81 94.224 6176300000 503130000 649340000 657840000 596440000 557580000 486050000 0 0 529190000 275440000 758630000 545810000 616820000 28592 2308 26885 263233;263234;263235;263236;263237;263238;263239;263240;263241;263242;263243 336383;336384;336385;336386;336387;336388;336389;336390;336391;336392;336393;336394 336388 11 LNFGDDIPSALR Unmodified 1316.6725 0.67246486 4509 Q9UNE7;H3BUD0;H3BS86 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.15 111.15 2 0.00043196 115015 QUIQUE_C1368_190116_001 111.73 85.292 908870000 104480000 108320000 63265000 67259000 94951000 93464000 0 73699000 98227000 36149000 92050000 77003000 0 28593 4509 26886 263244;263245;263246;263247;263248;263249;263250;263251;263252;263253;263254;263255;263256;263257 336395;336396;336397;336398;336399;336400;336401;336402;336403;336404;336405;336406;336407;336408;336409;336410 336399 15 LNFGLAR Unmodified 789.44972 0.44972255 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.203 60.203 2 0.019333 56904 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.6 71.55 620540000 56374000 58973000 64307000 0 0 51560000 0 71774000 74284000 37313000 86727000 56285000 62942000 28594 3226 26887 263258;263259;263260;263261;263262;263263;263264;263265;263266;263267 336411;336412;336413;336414;336415;336416;336417;336418;336419;336420 336417 10 LNFHPDQEDQFFSLVHEK Unmodified 2229.0491 0.049082043 3790 Q969Z0;H7C4R5 TBRG4 Protein TBRG4 yes no 0 0 0 1 108.28 108.28 4 0.019272 112021 QUIQUE_C1218_190116_001 25.41 17.606 32617000 32617000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28595 3790 26888 263268 336421 336421 1 LNFLESK Unmodified 849.45962 0.45961853 2853 Q01432;E9PKC5 AMPD3 AMP deaminase 3 yes no 0 0 0 1 53.464 53.464 2 0.044365 52430 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.451 27.995 14125000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14125000 0 0 28596 2853 26889 263269 336422 336422 1 LNFNGEGEPEELMVDNWR Unmodified 2147.9582 0.95821812 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 0 0 1 134.02 134.02 2 5.3778E-07 138389 QUIQUE_C1277_190116_001 126.63 106.17 53618000 0 53618000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28597 1796 26890 263270 336423 336423 1 LNFNGEGEPEELMVDNWR Oxidation (M) 2163.9531 0.95313275 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 1 0 1 118.88 118.88 2 0.0001226 115643 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.926 85.647 21903000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21903000 0 0 0 28598 1796 26890 263271 336424 336424 1021 1 LNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLK Unmodified 2782.3385 0.33846413 1796 P00918 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.05 127.05 3 9.1114E-15 131703 QUIQUE_DMIX8_190116_001 109.85 101.95 1961800000 108310000 143550000 113850000 122200000 157710000 116700000 105730000 179820000 210170000 39847000 307630000 191940000 164390000 28599 1796 26891 263272;263273;263274;263275;263276;263277;263278;263279;263280;263281;263282;263283;263284 336425;336426;336427;336428;336429;336430;336431;336432;336433;336434;336435;336436;336437;336438;336439;336440;336441;336442;336443;336444;336445;336446;336447 336447 21 LNFQAFAELCR Unmodified 1367.6656 0.66560534 3013 Q13572;G3V5A3;G3V588;G3V3C0 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.07 121.07 2 0.00029658 124883 QUIQUE_C1403_190116_001 119.62 96.93 54616000 0 0 0 21597000 0 0 0 0 33019000 0 0 0 0 28600 3013 26892 263285;263286;263287;263288 336448;336449;336450;336451;336452 336448 5 LNFSHGTHEYHAETIK Unmodified 1882.8962 0.89621022 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;H3BT25;P14618 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 4 4 3 3 3 3 3 4 3 3 4 4 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336453;336454;336455;336456;336457;336458;336459;336460;336461;336462;336463;336464;336465;336466;336467;336468;336469;336470;336471;336472;336473;336474;336475;336476;336477;336478;336479;336480;336481;336482;336483;336484;336485;336486;336487;336488;336489;336490;336491;336492;336493;336494;336495;336496;336497;336498;336499;336500;336501;336502;336503;336504;336505;336506;336507;336508;336509;336510;336511;336512;336513;336514;336515;336516;336517;336518;336519;336520;336521;336522;336523;336524;336525 336469 71 LNFSQVHIMDEHWR Unmodified 1810.8573 0.85732229 3472 Q7Z7A1 CNTRL Centriolin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 102.04 102.04 2 0.024346 107065 QUIQUE_C1438_190116_001 47.261 13.852 663710000 0 0 0 198400000 127280000 0 158470000 0 0 0 179570000 0 0 28602 3472 26894 263333;263334;263335;263336 336526;336527;336528;336529 336527 4 LNFSTPTSTNIVSVCR Unmodified 1794.8934 0.89343302 1477 O15067;J3QSG0;J3QSH6 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes no 0 0 0 1 96.32 96.32 2 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alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 91.017 91.017 2 0.0029423 93427 QUIQUE_C1277_190116_001 92.439 47.992 245910000 0 26916000 0 19578000 36160000 0 29745000 0 0 0 48179000 40895000 44441000 28606 1909 26898 263352;263353;263354;263355;263356;263357;263358;263359;263360;263361 336546;336547;336548;336549;336550;336551;336552;336553;336554;336555 336546 9 LNGGLGTSMGCK Unmodified 1193.5533 0.5532777 3202;735 C9JNZ1;C9JVG3;C9JWG0;C9JQU9;C9JUW1;Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.778 33.778 2 0.0010552 29053 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.428 70.98 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28607 735;3202 26899 263362;263363;263364;263365;263366;263367 336556;336557;336558;336559;336560;336561 336560 6 LNGGLGTSMGCK Oxidation (M) 1209.5482 0.54819232 3202;735 C9JNZ1;C9JVG3;C9JWG0;C9JQU9;C9JUW1;Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase no no 0 1 0 1 1 19.009 19.009 2 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LNHQAELLLK Unmodified 1177.6819 0.68190733 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 36.66 36.66 3 0.0045149 32823 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.727 30.89 27578000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27578000 0 0 28615 2882 26906 263424 336626 336626 1 LNHTYSQLLK Unmodified 1215.6612 0.66117189 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YCU9;A0A2R8YDS8;A0A2R8Y885;A0A2R8Y820;H7C2C6;A0A2R8Y7D4;A0A2R8Y5D7;H0Y7U8;H0Y470 CCDC88A Girdin yes no 0 0 0 1 1 2 1 35.18 35.18 2;3 0.02347 30822 QUIQUE_C1277_190116_001 34.773 11.547 105390000 0 26644000 59543000 19199000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28616 473 26907 263425;263426;263427;263428;263429 336627;336628;336629;336630;336631 336628 5 LNHVGDWGTQFGMLIAHLQDK Unmodified 2379.1794 0.17938471 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 141.73 141.73 4 0.0001563 145762 QUIQUE_C1277_190116_001 58.366 49.27 66716000 23658000 43057000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28617 2638 26908 263430;263431 336632;336633;336634 336634 3 LNHYVLYK Unmodified 1048.5706 0.57056597 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 29.157 29.157 3 0.026928 23475 QUIQUE_C1368_190116_001 40.268 13.014 81665000 0 31422000 27982000 0 22261000 0 0 0 0 0 0 0 0 28618 1516 26909 263432;263433;263434 336635;336636;336637 336636 3 LNIDQDALFFLK Unmodified 1435.7711 0.77111627 3814 Q96BY7 ATG2B Autophagy-related protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 148.55 148.55 2 0.0029628 153844 QUIQUE_C1218_190116_001 87.298 72.804 28317000 14029000 0 0 14288000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28619 3814 26910 263435;263436 336638;336639 336638 2 LNIDSIIQR Unmodified 1070.6084 0.60840804 1041 F8VYE8;P36873;F8VR82;A0A087WYY5 PPP1CC Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 92.805 92.805 2 0.00043092 89713 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.72 65.435 110200000 51442000 39315000 0 0 0 0 0 0 0 19447000 0 0 0 28620 1041 26911 263437;263438;263439 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Q01813;B1APP6;V9GY25 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 1 1 2 1 1 3 1 1 2 1 2 1 2 127.86 127.86 3 1.4367E-05 132654 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.369 46.359 942890000 106540000 106320000 64471000 52963000 107830000 48976000 52112000 74692000 42637000 0 98431000 83525000 104400000 28624 2861 26915 263493;263494;263495;263496;263497;263498;263499;263500;263501;263502;263503;263504;263505;263506;263507;263508;263509;263510 336703;336704;336705;336706;336707;336708;336709;336710;336711;336712;336713;336714;336715;336716;336717;336718;336719;336720;336721;336722;336723 336716 14 LNIISNLDCVNEVIGIR Unmodified 1941.0353 0.035346234 2309 P30153;B3KQV6;P30154;H0YDG7 PPP2R1A;PPP2R1B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 150.02 150.02 2;3 2.6922E-63 155164 QUIQUE_C1368_190116_001 192.86 128.42 10763000000 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no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 69.788 69.788 3 0.00029705 70071 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.302 69.449 50284000 0 0 0 0 23838000 0 0 0 0 0 0 26447000 0 28633 4271 26923 263589;263590;263591;263592;263593;263594;263595;263596;263597;263598;263599;263600;263601;263602 336817;336818;336819;336820;336821;336822;336823;336824;336825;336826;336827;336828;336829;336830 336828 14 LNIQPSEADYAVDIR Unmodified 1702.8526 0.85261407 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.446 98.446 2 8.1697E-06 101060 QUIQUE_C1368_190116_001 127.78 93.398 695260000 75278000 76624000 59170000 62924000 70259000 44965000 63836000 40245000 49279000 32357000 73886000 0 46434000 28634 4334 26924 263603;263604;263605;263606;263607;263608;263609;263610;263611;263612;263613;263614 336831;336832;336833;336834;336835;336836;336837;336838;336839;336840;336841;336842;336843;336844 336834 14 LNISEVDEQVR Unmodified 1300.6623 0.6622941 2853 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337078;337079;337080;337081;337082;337083;337084;337085;337086;337087;337088;337089;337090;337091;337092;337093 337091 16 LNLGTVGFYR Unmodified 1138.6135 0.61349341 959 E9PLK3;P55786;H0YCQ5 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.937 94.937 2 2.8923E-50 98825 QUIQUE_C1438_190116_001 221.7 202.92 8330900000 618640000 650570000 626810000 597060000 697420000 606550000 645870000 603150000 586560000 285400000 942160000 689380000 781260000 28657 959 26945 263802;263803;263804;263805;263806;263807;263808;263809;263810;263811;263812;263813;263814 337094;337095;337096;337097;337098;337099;337100;337101;337102;337103;337104;337105;337106;337107;337108;337109;337110;337111;337112;337113 337101 20 LNLIAELESR Unmodified 1156.6452 0.64518747 3144 Q15526 SURF1 Surfeit locus protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 118.24 118.24 2 0.010101 121378 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.276 36.435 210120000 30846000 43929000 25849000 0 26826000 0 0 29493000 30768000 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263855;263856;263857;263858;263859;263860;263861;263862;263863;263864;263865 337158;337159;337160;337161;337162;337163;337164;337165;337166;337167;337168;337169 337161 1664 11 LNLPINIIGLAPLCENMPSGK Unmodified 2263.2068 0.20684501 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 159.76 159.76 2;3 3.3286E-128 164033 QUIQUE_DMIX7_190116_001 218.28 188.22 4783300000 245320000 301020000 472010000 571550000 502670000 286490000 246160000 332140000 284550000 50549000 652270000 236290000 602330000 28663 2282 26950 263866;263867;263868;263869;263870;263871;263872;263873;263874;263875;263876;263877;263878;263879;263880;263881;263882;263883;263884;263885;263886;263887;263888;263889;263890 337170;337171;337172;337173;337174;337175;337176;337177;337178;337179;337180;337181;337182;337183;337184;337185;337186;337187;337188;337189;337190;337191;337192;337193;337194;337195;337196;337197;337198;337199;337200;337201;337202;337203;337204;337205;337206;337207 337204 38 LNLQSVTEQSSLDDFLATAELAGTEFVAEK Unmodified 3225.5929 0.59288372 4114 Q9H089;F8WFC6 LSG1 Large subunit GTPase 1 homolog yes no 0 0 0 1 172.86 172.86 3 0.032762 176786 QUIQUE_DMIX8_190116_001 20.734 14.893 11451000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11451000 28664 4114 26951 263891 337208 337208 1 LNLSQVR Unmodified 828.48175 0.48175096 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 35.651 35.651 2 0.064243 29987 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.344 20.423 41871000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41871000 0 0 0 28665 3726 26952 263892 337209 337209 1 LNLVEAFVEDAELR Unmodified 1616.841 0.84098675 443 A0A2R8YFH0;E9PHA6;A0A2R8Y6P0;A0A2R8YG02;P43246;A0A2R8Y7S8 MSH2 DNA mismatch repair protein Msh2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 163.55 163.55 2;3 9.6117E-07 168705 QUIQUE_C1368_190116_001 122.42 103.68 73321000 0 16675000 21291000 6593400 10975000 0 0 0 0 5630700 0 12156000 0 28666 443 26953 263893;263894;263895;263896;263897;263898;263899;263900;263901 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2 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 146.6 146.6 2;3 2.5688E-18 150682 QUIQUE_DMIX7_190116_001 150.68 127.45 4113400000 176180000 286010000 376140000 286700000 172250000 152130000 326980000 251230000 423290000 61390000 579930000 546690000 474520000 28718 2309 27004 264302;264303;264304;264305;264306;264307;264308;264309;264310;264311;264312;264313;264314;264315;264316;264317;264318;264319;264320;264321;264322;264323;264324;264325;264326;264327 337702;337703;337704;337705;337706;337707;337708;337709;337710;337711;337712;337713;337714;337715;337716;337717;337718;337719;337720;337721;337722;337723;337724;337725;337726;337727;337728;337729;337730;337731;337732;337733;337734;337735;337736;337737 337732 33 LNSLCMAWLVDHVYAIR Oxidation (M) 2076.0285 0.028486717 2309 P30153;B3KQV6;P30154 PPP2R1A;PPP2R1B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform yes no 0 1 0 2 1 1 2 1 124.56 124.56 3 5.9384E-11 128684 QUIQUE_C1368_190116_001 119.56 101.86 323360000 72590000 95216000 124680000 0 0 0 0 30879000 0 0 0 0 0 28719 2309 27004 264328;264329;264330;264331;264332;264333;264334 337738;337739;337740;337741;337742;337743;337744;337745 337741 1697 7 LNSLMSLVNK Unmodified 1117.6165 0.61652988 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.01 89.01 2 0.0015721 91983 QUIQUE_C1438_190116_001 96.034 55.966 905410000 87768000 82550000 92950000 78248000 75147000 24646000 88400000 70952000 74641000 31999000 0 98768000 99341000 28720 1389 27005 264335;264336;264337;264338;264339;264340;264341;264342;264343;264344;264345;264346;264347;264348 337746;337747;337748;337749;337750;337751;337752;337753;337754;337755;337756;337757;337758;337759 337751 13 LNSNDEDIHTANER Unmodified 1626.7234 0.72339081 1864 P04424;F8W943 ASL Argininosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 18.572 18.572 2;3 3.097E-37 11584 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.99 135.25 382600000 0 0 28433000 34131000 0 106880000 30599000 75615000 0 0 0 89175000 17765000 28721 1864 27006 264349;264350;264351;264352;264353;264354;264355;264356 337760;337761;337762;337763;337764;337765;337766;337767 337765 8 LNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTK Unmodified 2458.2989 0.29889072 2697 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3KTN0 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 2 1 2 143.93 143.93 2;3 3.8016E-50 149816 QUIQUE_C1218_190116_001 184.41 142.77 898320000 91185000 66052000 176040000 41943000 40414000 40743000 52440000 37722000 57177000 35672000 135710000 42556000 80669000 28722 2697 27007 264357;264358;264359;264360;264361;264362;264363;264364;264365;264366;264367;264368;264369;264370;264371;264372;264373;264374;264375 337768;337769;337770;337771;337772;337773;337774;337775;337776;337777;337778;337779;337780;337781;337782;337783;337784;337785;337786;337787 337769 19 LNSNTQVVLLSATMPSDVLEVTKK Unmodified 2586.3939 0.39385374 2697 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3KTN0 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 1 1 1 1 127.42 127.42 3 1.4231E-06 130586 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.871 57.166 167860000 0 0 0 0 0 0 0 50522000 0 0 77656000 39682000 0 28723 2697 27008 264376;264377;264378 337788;337789;337790 337788 3 LNSSGSSEDSFVEIR Unmodified 1625.7533 0.75329395 3825 Q96CV9;A0A087WY28 OPTN Optineurin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.023 69.023 2 1.307E-08 69596 QUIQUE_C1438_190116_001 122.55 79.804 408170000 45630000 44641000 0 44579000 30414000 39116000 48331000 42227000 49233000 27147000 0 36854000 0 28724 3825 27009 264379;264380;264381;264382;264383;264384;264385;264386;264387;264388;264389;264390 337791;337792;337793;337794;337795;337796;337797;337798;337799;337800;337801;337802 337794 12 LNSSSVSNLAAVGDLLHSSQASLTAALGLRPAPAGR Unmodified 3500.8699 0.86994247 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 1 1 155.4 155.4 4 0.00054707 158206 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.749 29.693 106930000 0 0 0 0 0 0 0 106930000 0 0 0 0 0 28725 135 27010 264391 337803 337803 1 LNSSTEANVIK Unmodified 1174.6194 0.61936665 3656 Q8NI08 NCOA7 Nuclear receptor coactivator 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 26.515 26.515 2 0.012468 20627 QUIQUE_C1368_190116_001 76.843 28.049 49788000 0 0 27484000 0 22304000 0 0 0 0 0 0 0 0 28726 3656 27011 264392;264393;264394;264395 337804;337805;337806;337807 337804 3 LNSSVQLAGLR Unmodified 1156.6564 0.65642086 4424 Q9UH62 ARMCX3 Armadillo repeat-containing X-linked protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 60.355 60.355 2 0.0046406 60007 QUIQUE_C1368_190116_001 70.908 38.096 241360000 0 0 116670000 0 0 0 0 0 0 0 124690000 0 0 28727 4424 27012 264396;264397 337808;337809 337808 1 LNSVQSSERPLFLVHPIEGSTTVFHSLASR Unmodified 3307.7313 0.73132372 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 3 3 2 3 109.31 109.31 3;4;5 4.0632E-63 112905 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.35 133.2 3048300000 144370000 307540000 254990000 123250000 285190000 0 191270000 356320000 527440000 0 365830000 492080000 0 28728 2524 27013 264398;264399;264400;264401;264402;264403;264404;264405;264406;264407;264408;264409;264410;264411;264412;264413;264414;264415;264416;264417;264418 337810;337811;337812;337813;337814;337815;337816;337817;337818;337819;337820;337821;337822;337823;337824;337825;337826;337827;337828;337829;337830;337831;337832;337833;337834;337835;337836 337830 23 LNSYIQGK Unmodified 921.49198 0.4919813 4638 Q9Y5Z4;Q5THN1;C9IZA0 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.845 22.845 2 0.018262 16345 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.229 17.571 2566100000 221840000 229730000 0 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Unmodified 1171.6019 0.60194245 3819 Q96CM8;E9PF16 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 62.324 62.324 2 0.0054621 60965 QUIQUE_C1403_190116_001 117.89 91.475 77222000 33148000 0 0 44075000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28737 3819 27022 264466;264467;264468;264469;264470 337887;337888;337889;337890;337891 337888 4 LNTQEIFDDWAR Unmodified 1506.7103 0.71030693 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.39 129.39 2 0.00052112 134998 QUIQUE_C1576_190116_001 107.4 86.623 1037200000 0 91442000 143770000 0 86999000 84159000 115970000 142590000 187000000 0 0 185300000 0 28738 3053 27023 264471;264472;264473;264474;264475;264476;264477;264478 337892;337893;337894;337895;337896;337897;337898;337899;337900 337896 7 LNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTK Unmodified 2471.3557 0.35567732 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 165.17 165.17 2;3 8.4861E-74 169525 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.91 160.18 365950000 79665000 0 0 0 0 0 0 75942000 82511000 0 85942000 41891000 0 28739 3055 27024 264479;264480;264481;264482;264483;264484;264485;264486;264487;264488 337901;337902;337903;337904;337905;337906;337907;337908;337909;337910;337911 337906 11 LNTSIQVVLLSATMPTDVLEVTK Oxidation (M) 2487.3506 0.35059194 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 1 156.4 156.4 3 0.00013076 161385 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.389 40.397 39161000 0 0 0 0 0 0 0 18652000 20509000 0 0 0 0 28740 3055 27024 264489;264490 337912;337913 337913 2515 2 LNVALQR Unmodified 812.48684 0.48683634 2865 Q02108;J3KQW2;Q6PJR4 GUCY1A3 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 33.682 33.682 2 0.044891 27655 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.994 35.533 8948800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8948800 0 0 0 28741 2865 27025 264491 337914 337914 1 LNVCVSK Unmodified 818.43202 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264524;264525;264526;264527;264528;264529;264530;264531;264532;264533;264534;264535;264536;264537;264538;264539;264540;264541;264542;264543;264544;264545;264546;264547;264548;264549 337958;337959;337960;337961;337962;337963;337964;337965;337966;337967;337968;337969;337970;337971;337972;337973;337974;337975;337976;337977;337978;337979;337980;337981;337982;337983;337984;337985;337986 337973 28 LNVEFALIHK Unmodified 1182.6761 0.67609367 2030 P11908 PRPS2 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.731 81.731 3 0.0013848 81919 QUIQUE_C1563_190116_001 68.893 61.063 316540000 0 30239000 26656000 31724000 24952000 32588000 19111000 19783000 46103000 0 31894000 29674000 23811000 28746 2030 27030 264550;264551;264552;264553;264554;264555;264556;264557;264558;264559;264560 337987;337988;337989;337990;337991;337992;337993;337994;337995;337996;337997;337998 337992 12 LNVGAPDVTLR Unmodified 1153.6455 0.64552182 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 2 73.603 73.603 2 0.0094161 73953 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.028 39.774 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28747 2935 27031 264561;264562;264563;264564 337999;338000;338001;338002 338002 4 LNVIDDDVEEIKK Unmodified 1528.7985 0.79845323 1664 O75886 STAM2 Signal transducing adapter molecule 2 yes yes 0 0 1 1 66.689 66.689 3 0.061402 62644 QUIQUE_DMIX4_190116_001 25.542 14.972 23328000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23328000 0 0 0 28748 1664 27032 264565 338003 338003 0 LNVIFTK Unmodified 833.50109 0.50108942 1060 F8WA11;Q7Z460 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.98 57.98 2 0.02071 57030 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.32 46.959 71150000 0 0 0 0 0 0 17485000 0 14406000 0 20799000 18460000 0 28749 1060 27033 264566;264567;264568;264569 338004;338005;338006;338007;338008 338007 5 LNVITVGPR Unmodified 967.58147 0.581465 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.036 56.036 2 0.014831 54428 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.993 33.185 690730000 0 0 0 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phosphodiesterase eta-2;Phosphoinositide phospholipase C no no 0 0 0 1 2 1 47.676 47.676 2 0.026664 45068 QUIQUE_C1403_190116_001 93.593 49.062 37462000 0 0 0 13321000 0 0 0 0 0 0 24141000 0 0 28752 1604 27036 264589;264590;264591;264592 338033;338034;338035;338036 338033 4 LNVTEQEK Unmodified 959.49238 0.49237523 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;A0A2R8Y6I8 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 17.109 17.109 2 0.0013841 9978 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.64 71.503 841180000 0 15666000 0 0 0 18017000 0 61236000 0 746260000 0 0 0 28753 1906 27037 264593;264594;264595;264596 338037;338038;338039;338040 338039 3 LNVTEQEKIDK Unmodified 1315.6983 0.69834526 1906 P06733;A0A2R8Y6G6;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 1 3 2 3 2 22.241 22.241 2;3 0.00010271 18018 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.88 98.571 3838800000 0 0 0 0 0 0 0 834580000 782180000 0 1263500000 0 958620000 28754 1906 27038 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338109;338110;338111;338112;338113;338114;338115;338116;338117 338109 9 LNVWDLSK Unmodified 973.52328 0.52328142 2933;3183 Q09028;H0YCT5;H0YF10;H0YDK2;H0YEU5;Q5JNZ6;Q16576;E9PC52;Q5JP02 RBBP4;RBBP7 Histone-binding protein RBBP4;Histone-binding protein RBBP7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 92.61 92.61 2 0.012696 95984 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.294 43.847 400710000 78138000 49415000 52919000 0 0 66801000 0 35831000 33888000 0 49681000 34040000 0 28758 2933;3183 27042 264668;264669;264670;264671;264672;264673;264674;264675 338118;338119;338120;338121;338122;338123;338124;338125 338124 7 LNWAFEMYDLDGDGR Unmodified 1800.7777 0.77773456 4498 Q9UM19 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.34 147.34 2 0.00050607 153524 QUIQUE_C1576_190116_001 92.925 79.525 479670000 38810000 41501000 31045000 17266000 41445000 23591000 46160000 37924000 46192000 0 66987000 54687000 34062000 28759 4498 27043 264676;264677;264678;264679;264680;264681;264682;264683;264684;264685;264686;264687;264688;264689 338126;338127;338128;338129;338130;338131;338132;338133;338134;338135;338136;338137;338138;338139;338140 338134 12 LNWAFNMYDLDGDGK Unmodified 1757.7719 0.7719209 2761 P62760;E7ER47 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.77 143.77 2 1.3396E-05 149189 QUIQUE_C1368_190116_001 97.121 88.721 1493300000 123080000 141650000 119340000 111010000 139160000 98216000 141070000 66526000 127800000 0 152160000 156010000 117310000 28760 2761 27044 264690;264691;264692;264693;264694;264695;264696;264697;264698;264699;264700;264701 338141;338142;338143;338144;338145;338146;338147;338148;338149;338150;338151;338152;338153;338154;338155 338144 15 LNWAFNMYDLDGDGK Oxidation (M) 1773.7668 0.76683553 2761 P62760;E7ER47 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 124.81 124.81 2 0.0021034 128537 QUIQUE_C1277_190116_001 67.656 58.224 51951000 0 34113000 0 0 0 0 0 0 0 17838000 0 0 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338163;338164;338165;338166;338167;338168;338169;338170;338171;338172;338173;338174;338175;338176;338177;338178;338179;338180;338181;338182;338183;338184 338175 21 LNWMNLR Unmodified 945.48546 0.48545613 1560 O43924;B8ZZK5 PDE6D Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.795 89.795 2 0.0093563 92440 QUIQUE_C1576_190116_001 150.82 77.78 387490000 62170000 0 54590000 0 0 0 53280000 56102000 76618000 0 0 0 84731000 28764 1560 27047 264722;264723;264724;264725;264726;264727 338185;338186;338187;338188;338189;338190;338191;338192 338188 7 LNWTGTSK Unmodified 905.46068 0.46068117 1730 O95433;H0YJU2;H0YJG7 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.953 30.953 2 0.01159 25571 QUIQUE_C1576_190116_001 89.752 39.12 579580000 80009000 0 64303000 66075000 74957000 73337000 80720000 39688000 0 0 62474000 38016000 0 28765 1730 27048 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338257;338258;338259;338260;338261;338262;338263;338264;338265;338266;338267;338268 338258 12 LPAAVSTLQEMAPGTTFNPVIGDSSVDPK Unmodified 2941.4743 0.47428891 3874 Q96HY7 DHTKD1 Probable 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component DHKTD1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 144.23 144.23 3 0.0026722 148712 QUIQUE_C1277_190116_001 37.054 34.374 31381000 0 31381000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28772 3874 27055 264795 338269 338269 0 LPACVVDCGTGYTK Unmodified 1539.7061 0.70614953 2714 P61158;F8WEW2;F8WE84 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.7 59.7 2 1.5738E-28 58436 QUIQUE_DMIX3_190116_001 194.17 181.05 5746600000 383780000 550830000 543070000 592050000 461670000 404240000 566610000 334860000 349180000 149930000 431290000 388260000 590820000 28773 2714 27056 264796;264797;264798;264799;264800;264801;264802;264803;264804;264805;264806;264807;264808 338270;338271;338272;338273;338274;338275;338276;338277;338278;338279;338280;338281;338282;338283;338284;338285;338286;338287;338288;338289;338290;338291;338292;338293;338294;338295 338287 26 LPADTCLLEFAR Unmodified 1404.7071 0.7071358 3646 Q8NF37;A0A0G2JQ62;A0A0G2JRI7 LPCAT1 Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 114.45 114.45 2 0.0054484 117260 QUIQUE_C1563_190116_001 69.979 52.115 49570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27528000 0 22042000 28774 3646 27057 264809;264810;264811;264812;264813 338296;338297;338298;338299;338300 338298 5 LPADVSPINYSLCLKPDLLDFTFEGK Unmodified 2951.499 0.49904709 959 E9PLK3;P55786;E9PP11;E9PJY4;E9PPD4;E9PJF9;E9PPZ2 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.56 160.56 3 3.6115E-84 167876 QUIQUE_DMIX5_190116_001 172.74 161.22 1482500000 66826000 0 0 24007000 80621000 0 149890000 162290000 210580000 0 280160000 400770000 107370000 28775 959 27058 264814;264815;264816;264817;264818;264819;264820;264821;264822 338301;338302;338303;338304;338305;338306;338307;338308;338309;338310;338311;338312;338313;338314 338312 14 LPAELGPQLLHK Unmodified 1314.766 0.76597131 4318 Q9NX08 COMMD8 COMM domain-containing protein 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 72.1 72.1 3 0.0021219 72162 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.864 48.324 300570000 51552000 0 0 41369000 0 0 36735000 29048000 0 10876000 49686000 29805000 51498000 28776 4318 27059 264823;264824;264825;264826;264827;264828;264829;264830 338315;338316;338317;338318;338319;338320;338321;338322;338323;338324;338325 338321 8 LPAELQELPGLSHQYWSAPSDK Unmodified 2465.2227 0.22268931 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 125.62 125.62 3 1.5454E-09 122404 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.11 91.307 342410000 160360000 0 0 0 0 122680000 0 0 0 59373000 0 0 0 28777 2266 27060 264831;264832;264833 338326;338327;338328;338329;338330 338330 4 LPAELQELPGLSHQYWSAPSDKEGYSGVGLLSR Unmodified 3583.7947 0.79471184 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;G3V3C7;A0A0C4DGK8;H7C4A8;G3V5M0;G3V359 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 136.27 136.27 3;4 3.3439E-86 139397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.88 144.17 1209200000 0 0 0 0 71238000 0 78626000 307000000 183300000 0 252800000 162090000 154100000 28778 2266 27061 264834;264835;264836;264837;264838;264839;264840;264841;264842 338331;338332;338333;338334;338335;338336;338337;338338;338339 338334 9 LPAGYEIVLYISMSDSDK Oxidation (M) 2015.9762 0.9761596 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 1 0 1 151.61 151.61 2 0.0077779 146987 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.463 40.517 9203500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9203500 0 0 0 28779 4560 27062 264843 338340 338340 3014 1 LPALANK Unmodified 725.44357 0.44357454 3508 Q86WI1 PKHD1L1 Fibrocystin-L yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.24 70.24 2 0.036129 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338359;338360;338361;338362;338363;338364;338365;338366;338367;338368;338369;338370;338371;338372;338373;338374;338375;338376 338372 17 LPANHPLLTGQR Unmodified 1315.7361 0.73606817 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 26.818 26.818 2;3 4.1402E-06 20712 QUIQUE_C1277_190116_001 146.11 124.66 23621000000 2582100000 2450200000 1789600000 1780200000 2072800000 1517000000 2339300000 1433500000 1269700000 789360000 2585600000 1814700000 1196900000 28782 2414 27065 264872;264873;264874;264875;264876;264877;264878;264879;264880;264881;264882;264883;264884;264885;264886;264887;264888;264889;264890;264891;264892;264893;264894;264895;264896;264897 338377;338378;338379;338380;338381;338382;338383;338384;338385;338386;338387;338388;338389;338390;338391;338392;338393;338394;338395;338396;338397;338398;338399;338400;338401;338402;338403;338404;338405;338406;338407;338408;338409 338380 26 LPANLLDQFEK Unmodified 1286.6871 0.68705229 4554 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338492;338493;338494;338495;338496;338497;338498;338499;338500;338501;338502;338503;338504;338505;338506;338507;338508;338509;338510;338511;338512;338513;338514;338515;338516 338511 25 LPAYLTIQMVR Oxidation (M) 1319.7271 0.72714296 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 1 0 1 93.654 93.654 2 0.017288 90473 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.433 30.42 21716000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21716000 0 0 0 28792 2642 27074 264970 338517;338518;338519 338517 3 LPCGGVGVDSDTIWNEVHSAGAAR Unmodified 2467.155 0.15502045 2680 P56524 HDAC4 Histone deacetylase 4 yes yes 0 0 0 1 114.12 114.12 3 0.026609 119754 QUIQUE_C1438_190116_001 25.408 20.649 47702000 0 0 0 0 47702000 0 0 0 0 0 0 0 0 28793 2680 27075 264971 338520 338520 1 LPCIFICENNR Unmodified 1434.6748 0.67478982 1943 P08559 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 94.461 94.461 2 0.00098317 95358 QUIQUE_C1563_190116_001 107.15 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dipeptidase yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 154.03 154.03 2;3 1.3719E-44 159988 QUIQUE_C1218_190116_001 183.99 172.12 7404300000 696160000 605630000 793560000 589700000 497420000 642750000 540670000 405190000 611720000 395430000 576210000 539710000 510120000 28803 3897 27085 265043;265044;265045;265046;265047;265048;265049;265050;265051;265052;265053;265054;265055;265056;265057;265058;265059;265060;265061;265062;265063;265064;265065;265066 338603;338604;338605;338606;338607;338608;338609;338610;338611;338612;338613;338614;338615;338616;338617;338618;338619;338620;338621;338622;338623;338624;338625;338626;338627;338628;338629;338630;338631;338632;338633;338634;338635;338636;338637;338638;338639;338640;338641;338642;338643;338644;338645;338646;338647 338604 45 LPDGSSFTNQFPSDAPLEEAR Unmodified 2277.055 0.054955282 3736 Q92575 UBXN4 UBX domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 118.48 118.48 2 7.0334E-19 123117 QUIQUE_C1218_190116_001 168.1 146.85 82944000 22924000 0 0 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Unmodified 1215.6863 0.68632401 4181 Q9H7B4;A8MXR1 SMYD3 Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 108.6 108.6 2 0.0011605 111875 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.98 75.09 216140000 0 24380000 31253000 0 0 23734000 27237000 0 20789000 0 32091000 28802000 27853000 28807 4181 27089 265086;265087;265088;265089;265090;265091;265092;265093 338680;338681;338682;338683;338684;338685;338686;338687;338688 338687 9 LPDLIADALHR Unmodified 1232.6877 0.68772099 1097 G5E9G7;Q9P2S2 NRXN2 Neurexin-2 yes no 0 0 0 3 1 1 1 104.73 104.73 3 0.014754 108417 QUIQUE_C1576_190116_001 48.004 34.603 3966400 3966400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28808 1097 27090 265094;265095;265096;265097;265098;265099 338689;338690;338691;338692;338693;338694 338694 6 LPDLIIFLHTLNNIFEPHVAVR Unmodified 2570.4373 0.43731396 4582 Q9Y399;Q5T8A0 MRPS2 28S ribosomal protein S2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 169.37 169.37 4 8.6458E-06 176752 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.25 61.355 57974000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57974000 0 0 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chain;Gamma-glutamyltransferase 7 light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 56.043 56.043 2 0.00053798 55489 QUIQUE_C1438_190116_001 101.38 61.029 175950000 0 0 37210000 52642000 36655000 0 0 0 0 0 49438000 0 0 28831 4453 27112 265238;265239;265240;265241;265242;265243 338881;338882;338883;338884;338885;338886;338887 338883 7 LPEDPLLSGLLDSPALK Unmodified 1776.9873 0.98731663 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 3 2 2 2 155.31 155.31 2;3 1.8653E-53 150658 QUIQUE_DMIX4_190116_001 224.42 202.22 4094800000 269910000 380520000 447640000 355260000 286890000 309730000 252560000 292880000 282160000 135010000 376130000 422110000 284040000 28832 2524 27113 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translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 24.93 24.93 1;2 0.013106 19181 QUIQUE_C1218_190116_001 87.754 35.071 2135400000 501340000 381740000 351820000 418120000 0 482390000 0 0 0 0 0 0 0 28841 2786 27122 265360;265361;265362;265363;265364;265365;265366 339042;339043;339044;339045;339046;339047;339048;339049 339042 6 LPEGDLGKEIEQK Unmodified 1454.7617 0.76167379 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 0 0 1 1 1 1 50.213 50.213 2;3 0.0035724 48692 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.22 55.265 125060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43163000 31361000 50535000 28842 2786 27123 265367;265368;265369 339050;339051;339052 339050 2 LPEGKPVQVATPIVASSEAVAEK Unmodified 2319.2686 0.26857687 340 A0A1B0GTL5;Q9BXF6 RAB11FIP5 Rab11 family-interacting protein 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265421;265422;265423;265424;265425;265426;265427;265428 339116;339117;339118;339119;339120;339121;339122;339123 339120 6 LPEQFEGKK Unmodified 1074.571 0.5709599 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 19.621 19.621 3 0.0022791 12629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.704 46.616 39157000 0 0 0 0 0 0 0 39157000 0 0 0 0 0 28857 2225 27137 265429 339124 339124 1 LPESENLQEFWDNLIGGVDMVTDDDRR Unmodified 3162.4564 0.45640701 2524 P49327;A0A0U1RQF0;A0A0U1RRG3 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 171.14 171.14 3 3.9834E-161 175014 QUIQUE_DMIX7_190116_001 212.38 204.73 323420000 0 0 0 0 0 0 0 0 87740000 0 121340000 100900000 13430000 28858 2524 27138 265430;265431;265432;265433 339125;339126;339127;339128 339127 4 LPESENLQEFWDNLIGGVDMVTDDDRR Oxidation (M) 3178.4513 0.45132163 2524 P49327;A0A0U1RQF0;A0A0U1RRG3 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 1 1 169.65 169.65 3 1.9348E-08 173659 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.237 50.175 23681000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23681000 0 28859 2524 27138 265434 339129 339129 1955 1 LPESVER Unmodified 828.43413 0.43413207 1673 O75955;A0A140T9R1;A0A140T9W4;A0A140T974 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 19.991 19.991 2 0.043201 12835 QUIQUE_C1368_190116_001 80.462 32.713 230780000 0 0 230780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28860 1673 27139 265435 339130 339130 1 LPETNLFETEETRK Unmodified 1705.8523 0.85227972 3103 Q15046 KARS Lysine--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 65.697 65.697 2;3 0.00033587 65656 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.84 64.951 1134000000 143050000 0 40996000 0 188400000 143710000 224110000 0 25161000 78006000 33607000 180860000 76074000 28861 3103 27140 265436;265437;265438;265439;265440;265441;265442;265443;265444;265445;265446;265447;265448 339131;339132;339133;339134;339135;339136;339137;339138;339139;339140;339141;339142;339143 339138 11 LPETVHTAVR Unmodified 1121.6193 0.61930707 4625 Q9Y5L0;C9J7E5;E9PFH4 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.748 20.748 3 0.0016475 13802 QUIQUE_C1438_190116_001 77.379 53.157 580920000 53971000 0 50026000 54355000 72314000 50996000 77558000 0 0 0 81119000 66778000 73801000 28862 4625 27141 265449;265450;265451;265452;265453;265454;265455;265456;265457 339144;339145;339146;339147;339148;339149;339150;339151;339152 339147 9 LPEVEVPQHL Unmodified 1159.6237 0.62372375 2877 Q02818 NUCB1 Nucleobindin-1 yes yes 0 0 0 1 90.387 90.387 2 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339248;339249;339250;339251;339252;339253;339254 339250 7 LPFSGFR Unmodified 822.43882 0.43882351 3818 Q96C86 DCPS m7GpppX diphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.613 71.613 2 0.022056 71774 QUIQUE_C1277_190116_001 102.98 64.778 147750000 25264000 33020000 0 0 28018000 22097000 0 39351000 0 0 0 0 0 28870 3818 27149 265513;265514;265515;265516;265517 339255;339256;339257;339258;339259;339260 339256 6 LPFTALGSGQDAALAVLEDR Unmodified 2043.0637 0.063669474 2425 P40306;J3QL48;J3QQN1 PSMB10 Proteasome subunit beta type-10 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 149.13 149.13 2;3 5.3905E-57 154389 QUIQUE_C1368_190116_001 176.23 155.85 1501400000 102680000 76744000 269070000 149880000 125080000 88920000 67213000 82796000 109360000 44648000 195610000 84258000 105130000 28871 2425 27150 265518;265519;265520;265521;265522;265523;265524;265525;265526;265527;265528;265529;265530;265531;265532;265533;265534;265535;265536;265537;265538;265539;265540;265541;265542;265543 339261;339262;339263;339264;339265;339266;339267;339268;339269;339270;339271;339272;339273;339274;339275;339276;339277;339278;339279;339280;339281;339282;339283;339284;339285;339286;339287;339288;339289;339290;339291;339292 339267 31 LPFTDGDAQQLQR Unmodified 1487.7369 0.73685603 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.045 74.045 2 1.6276E-64 74349 QUIQUE_C1277_190116_001 208.11 172.57 1347900000 112470000 121680000 121610000 99210000 109100000 107720000 119960000 98194000 87341000 39474000 148570000 105960000 76617000 28872 354 27151 265544;265545;265546;265547;265548;265549;265550;265551;265552;265553;265554;265555;265556 339293;339294;339295;339296;339297;339298;339299;339300;339301;339302;339303;339304;339305;339306;339307;339308;339309 339294 17 LPGAICSLTCGGADIGTAMAK Unmodified 2062.985 0.98496692 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;H0YHM6 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 114.06 114.06 2 2.5676E-64 118639 QUIQUE_C1218_190116_001 204.28 191.08 209550000 39343000 31766000 60696000 0 0 37158000 40592000 0 0 0 0 0 0 28873 336 27152 265557;265558;265559;265560;265561 339310;339311;339312;339313;339314 339310 3 LPGAWDPAAHQGGNGVLLEGELIDVSR Unmodified 2770.4038 0.40384157 203 A0A0A6YYH1;Q7Z6K5 C15orf38-AP3S2;ARPIN Arpin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 133.79 133.79 3 8.4423E-65 136899 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.91 138.98 226770000 0 0 0 0 43413000 0 0 57391000 50575000 27784000 47604000 0 0 28874 203 27153 265562;265563;265564;265565;265566;265567;265568;265569 339315;339316;339317;339318;339319;339320;339321;339322 339319 8 LPGDHSYVSQPLVVPADQQLEIER Unmodified 2689.3711 0.37114446 3334 Q5VUB5 FAM171A1 Protein FAM171A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.03 108.03 3 5.7641E-32 111327 QUIQUE_C1277_190116_001 98.21 78.672 503880000 28987000 43986000 0 58536000 41090000 35070000 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Unmodified 1238.6772 0.6771563 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.692 80.692 2 5.2172E-07 82067 QUIQUE_C1277_190116_001 171.56 125.14 10765000000 0 907140000 1151700000 863810000 844190000 771690000 818310000 765660000 1021700000 377800000 1192400000 917360000 1133200000 28879 1688 27158 265620;265621;265622;265623;265624;265625;265626;265627;265628;265629;265630;265631 339381;339382;339383;339384;339385;339386;339387;339388;339389;339390;339391;339392;339393;339394;339395;339396;339397;339398;339399 339382 19 LPGGVQNFPQFSALR Unmodified 1629.8627 0.86272524 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 118.1 118.1 2 0.0052853 121434 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.505 70.937 87070000 0 0 0 0 0 0 0 36953000 0 15135000 0 34982000 0 28880 3471 27159 265632;265633;265634 339400;339401;339402 339402 3 LPGHAGSINEVAFHPDEPIIISASSDKR Unmodified 2956.5043 0.5042839 3836 Q96DI7;Q9NSS8 SNRNP40;DKFZp434D199 U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 83.679 83.679 4;5 2.1542E-05 86064 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.586 45.082 423190000 0 0 0 0 54388000 0 0 45645000 123650000 0 81989000 46651000 70864000 28881 3836 27160 265635;265636;265637;265638;265639;265640;265641 339403;339404;339405;339406;339407;339408;339409;339410 339407 8 LPGIPIK Unmodified 736.48471 0.48471107 3675 Q8TCS8 PNPT1 Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 59.279 59.279 2 0.037804 58093 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.061 52.947 15094000 0 0 0 0 0 0 0 0 15094000 0 0 0 0 28882 3675 27161 265642 339411 339411 1 LPGISETAMIFAGVDVTKEPIPVLPTVHYNMGGIPTNYK Unmodified 4169.1581 0.15811049 2326 P31040;D6RFM5;A0A087X1I3 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 157.97 157.97 4 5.242E-11 163021 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.318 59.917 197140000 0 0 0 0 0 0 0 0 46055000 0 100320000 50762000 0 28883 2326 27162 265643;265644;265645 339412;339413;339414 339412 2 LPGLIDVHVHLR Unmodified 1367.8038 0.8037538 1029 F8VPD4;P27708;H7C3Z5 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.677 79.677 3 0.0058035 81541 QUIQUE_C1438_190116_001 44.616 33.407 129750000 13678000 0 19340000 0 14852000 0 0 19060000 24153000 0 24171000 14491000 0 28884 1029 27163 265646;265647;265648;265649;265650;265651;265652;265653;265654 339415;339416;339417;339418;339419;339420;339421;339422;339423;339424 339418 10 LPGLLGNFPGPFEEEMK Oxidation (M) 1889.9233 0.92333617 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GW48;A0A1B0GVJ1;A0A1B0GVE7;A0A1B0GU62;A0A1B0GU06;A0A1B0GV95;A0A1B0GUJ3;A0A1B0GVA3;A0A1B0GW66 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 1 0 1 1 1 1 145.03 145.03 2 1.2246E-06 147669 QUIQUE_C1563_190116_001 104.59 94.947 208380000 53464000 0 0 0 57118000 47990000 49809000 0 0 0 0 0 0 28885 341 27164 265655;265656;265657;265658 339425;339426;339427;339428 339427 240 3 LPGLLGNFPGPFEEEMK Unmodified 1873.9284 0.92842155 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUH5;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GW48;A0A1B0GVJ1;A0A1B0GVE7;A0A1B0GU62;A0A1B0GU06;A0A1B0GV95;A0A1B0GUJ3;A0A1B0GVA3;A0A1B0GW66 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 152.66 152.66 2 0.00042468 158184 QUIQUE_C1218_190116_001 102.62 87.081 487540000 154780000 131130000 0 0 62675000 0 0 0 0 0 0 138960000 0 28886 341 27164 265659;265660;265661;265662;265663 339429;339430;339431;339432;339433;339434 339429 5 LPGLLMTIIR Unmodified 1125.6944 0.69438627 2629 P53618;E9PP73;E9PP63;E9PKQ1 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.11 135.11 2 0.012136 141284 QUIQUE_C1218_190116_001 66.299 46.522 248870000 37254000 31423000 29711000 31572000 33419000 28731000 0 0 0 11209000 0 21789000 23762000 28887 2629 27165 265664;265665;265666;265667;265668;265669;265670;265671;265672 339435;339436;339437;339438;339439;339440;339441;339442;339443 339435 8 LPGLVFLYMEK Oxidation (M) 1324.7101 0.71009592 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 127.11 127.11 2 0.00055134 131825 QUIQUE_C1576_190116_001 106.18 86.188 227120000 29734000 37697000 0 52946000 0 20176000 61585000 0 0 24980000 0 0 0 28888 2598 27166 265673;265674;265675;265676;265677;265678 339444;339445;339446;339447;339448;339449;339450;339451;339452 339450 2046 8 LPGLVFLYMEK Unmodified 1308.7152 0.71518129 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 141.97 141.97 2 0.00046493 147006 QUIQUE_C1368_190116_001 106.18 80.619 1258700000 87430000 111400000 68844000 183150000 98009000 45332000 241450000 51497000 46042000 43086000 76134000 119200000 87079000 28889 2598 27166 265679;265680;265681;265682;265683;265684;265685;265686;265687;265688;265689;265690;265691;265692 339453;339454;339455;339456;339457;339458;339459;339460;339461;339462;339463;339464;339465;339466;339467;339468;339469;339470;339471;339472;339473;339474;339475;339476 339457 23 LPGPGQALPSAPGVVLGPEDLPVEVLQFHPTSDGILVSAAGTTVK Unmodified 4430.3737 0.37371723 204 A0A0A6YYL4;P57737;I3L167;I3L426 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 164.61 164.61 3;4 4.6726E-17 169151 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.144 66.979 445180000 35060000 62525000 34506000 110980000 32290000 27584000 0 28727000 45674000 21178000 0 46658000 0 28890 204 27167 265693;265694;265695;265696;265697;265698;265699;265700;265701;265702;265703 339477;339478;339479;339480;339481;339482;339483;339484;339485;339486;339487;339488;339489 339486 10 LPGPPDAPGAVFVLGGEGLR Unmodified 1918.0312 0.031247134 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 137.08 137.08 2;3 1.6141E-17 141491 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.52 124.57 4596600000 347950000 559870000 500930000 385720000 386140000 476890000 373900000 231200000 276230000 128690000 375340000 248610000 305180000 28891 3859 27168 265704;265705;265706;265707;265708;265709;265710;265711;265712;265713;265714;265715;265716;265717;265718;265719;265720;265721;265722;265723;265724;265725;265726;265727 339490;339491;339492;339493;339494;339495;339496;339497;339498;339499;339500;339501;339502;339503;339504;339505;339506;339507;339508;339509;339510;339511;339512;339513;339514;339515;339516;339517;339518;339519;339520;339521;339522;339523 339513 30 LPGPTLWASYSLEYGK Unmodified 1780.9036 0.903587 1928 P07741;H3BQB1;H3BQF1 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 135.05 135.05 2 2.7567E-05 140032 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.38 86.713 440810000 0 75128000 0 45802000 0 82280000 46558000 25068000 64938000 0 61208000 39830000 0 28892 1928 27169 265728;265729;265730;265731;265732;265733;265734;265735;265736;265737;265738 339524;339525;339526;339527;339528;339529;339530;339531;339532;339533;339534;339535 339533 12 LPGQEGAAAPGEAGAVCLK Unmodified 1794.8934 0.89343302 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.704 65.704 2 5.3261E-87 66347 QUIQUE_C1438_190116_001 204.82 156.25 432410000 0 98923000 82328000 86678000 76054000 0 88423000 0 0 0 0 0 0 28893 3452 27170 265739;265740;265741;265742;265743;265744 339536;339537;339538;339539;339540;339541 339539 5 LPGQPTIEGYLYTQEK Unmodified 1835.9305 0.93053004 1602 O60890 OPHN1 Oligophrenin-1 yes yes 0 0 0 1 104.99 104.99 2 0.0106 107663 QUIQUE_C1403_190116_001 61.11 46.853 33796000 0 0 0 33796000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28894 1602 27171 265745 339542 339542 1 LPGSVGTPLPGVQVR Unmodified 1475.846 0.84601255 3238 Q4G176;F5H5A1;F5H362;F5H755;H0YGC7 ACSF3 Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.576 85.576 2 8.1873E-08 87346 QUIQUE_C1277_190116_001 147.28 117.03 540960000 52527000 72612000 48081000 29625000 0 56047000 55534000 38194000 49175000 17552000 63648000 0 57963000 28895 3238 27172 265746;265747;265748;265749;265750;265751;265752;265753;265754;265755;265756 339543;339544;339545;339546;339547;339548;339549;339550;339551;339552;339553;339554 339544 11 LPHLPGLEDLGIQATPLELK Unmodified 2153.2096 0.20960543 3197 Q16795;F5H0J3 NDUFA9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.86 145.86 3 7.218E-13 151339 QUIQUE_C1368_190116_001 114.96 107.12 1972600000 133100000 136740000 173620000 190010000 120200000 152870000 183510000 68819000 183550000 94831000 223010000 152630000 159750000 28896 3197 27173 265757;265758;265759;265760;265761;265762;265763;265764;265765;265766;265767;265768;265769 339555;339556;339557;339558;339559;339560;339561;339562;339563;339564;339565;339566;339567;339568;339569;339570;339571;339572;339573;339574;339575;339576;339577;339578;339579;339580;339581;339582;339583;339584;339585 339563 31 LPHSVLLEIQK Unmodified 1275.7551 0.75507227 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 2 2 4 2 3 2 3 2 3 2 2 2 4 64.089 64.089 2;3 2.2083E-24 64047 QUIQUE_DMIX1_190116_001 217.64 149.62 33348000000 2396100000 2185600000 2400600000 2477100000 1965600000 2698900000 2229600000 3643900000 3849000000 1355600000 2778100000 2783400000 2584200000 28897 4639 27174 265770;265771;265772;265773;265774;265775;265776;265777;265778;265779;265780;265781;265782;265783;265784;265785;265786;265787;265788;265789;265790;265791;265792;265793;265794;265795;265796;265797;265798;265799;265800;265801;265802 339586;339587;339588;339589;339590;339591;339592;339593;339594;339595;339596;339597;339598;339599;339600;339601;339602;339603;339604;339605;339606;339607;339608;339609;339610;339611;339612;339613;339614;339615;339616;339617;339618;339619;339620;339621;339622;339623;339624;339625;339626;339627;339628;339629;339630;339631;339632;339633;339634;339635;339636;339637;339638;339639;339640;339641;339642;339643;339644;339645;339646;339647;339648;339649 339619 64 LPHSVLLEIQKELLDYK Unmodified 2037.151 0.15102792 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 1 2 132.22 132.22 3;4 5.7173E-17 134907 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.5 93.939 49204000 0 0 0 0 0 0 0 49204000 0 0 0 0 0 28898 4639 27175 265803;265804 339650;339651 339650 2 LPHVLLLQLGTTFFK Unmodified 1726.0182 0.018163252 1554 O43809;H3BND3;H3BV41 NUDT21 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 148.16 148.16 2;3 6.667E-06 154339 QUIQUE_C1218_190116_001 93.348 91.479 766160000 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Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 135.15 135.15 3 2.4751E-07 138158 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.637 84.759 474580000 0 0 0 0 0 0 0 133440000 125040000 0 67975000 63303000 84823000 28905 3977 27182 265867;265868;265869;265870;265871;265872 339739;339740;339741;339742;339743;339744;339745 339739 6 LPILELSHIWELSDFDK Unmodified 2054.0724 0.072443247 3829 Q96D71;E9PMG1;H0YDT0;H7C225;H7C1V2 REPS1 RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 159.35 159.35 3 0.00028087 161612 QUIQUE_C1563_190116_001 66.335 56.547 7995700 0 0 0 0 0 7995700 0 0 0 0 0 0 0 28906 3829 27183 265873 339746 339746 1 LPILSTK Unmodified 770.49019 0.49019038 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein yes yes 0 0 0 1 44.513 44.513 2 0.061225 41731 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.915 24.304 27282000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27282000 28907 1058 27184 265874 339747 339747 1 LPIPESQVITINPELPVEEAAEDYAK Unmodified 2864.4695 0.4695211 1723 O95336;M0R261;M0R1L2;M0R0U3 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 153.46 153.46 2;3 8.2862E-70 156069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 215.81 203.52 7422400000 529830000 545310000 609060000 764130000 636030000 360040000 510340000 588440000 585570000 244600000 789460000 532750000 726800000 28908 1723 27185 265875;265876;265877;265878;265879;265880;265881;265882;265883;265884;265885;265886;265887;265888;265889;265890;265891;265892;265893;265894;265895;265896;265897;265898;265899;265900 339748;339749;339750;339751;339752;339753;339754;339755;339756;339757;339758;339759;339760;339761;339762;339763;339764;339765;339766;339767;339768;339769;339770;339771;339772;339773;339774;339775;339776;339777;339778;339779;339780;339781;339782;339783;339784 339771 36 LPIPESQVITINPELPVEEAAEDYAKK Unmodified 2992.5645 0.56448412 1723 O95336;M0R261;M0R1L2;M0R0U3 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 141.71 141.71 3 2.6813E-12 146726 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.545 60.385 400240000 0 0 0 0 0 0 0 97973000 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339791;339792;339793;339794;339795;339796;339797;339798;339799;339800;339801;339802;339803;339804;339805;339806 339806 16 LPIVNEDDELVAIIAR Unmodified 1778.9778 0.97781458 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 145.98 145.98 2 1.5962E-18 148775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.02 128.39 396280000 53392000 48575000 70150000 0 53280000 51445000 62292000 32586000 0 24564000 0 0 0 28912 2040 27189 265921;265922;265923;265924;265925;265926;265927;265928 339807;339808;339809;339810;339811;339812;339813;339814 339813 7 LPKPDLCPPVLYTLMTR Unmodified 2013.0791 0.079125304 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 1 1 132.15 132.15 3 0.0050802 136295 QUIQUE_C1277_190116_001 38.915 29.166 38895000 0 38895000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28913 3060 27190 265929 339815 339815 1 LPKPPKPVSK Unmodified 1089.691 0.69101545 1141 H0YBZ2;P04233;H0YBZ8;E7ESL3 CD74 HLA class II histocompatibility antigen gamma chain yes no 0 0 2 1 1 14.636 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protein MYG1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.221 95.221 2 0.0026609 98772 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.35 44.091 1007000000 78523000 80912000 102930000 67907000 80224000 56942000 66392000 65428000 79156000 21053000 120610000 86283000 100640000 28938 4210 27213 266137;266138;266139;266140;266141;266142;266143;266144;266145;266146;266147;266148;266149 340073;340074;340075;340076;340077;340078;340079;340080;340081;340082;340083;340084;340085;340086;340087;340088;340089;340090 340087 17 LPLPEQGSPLEAQLDAFVSVLR Unmodified 2378.2846 0.28456129 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 170.55 170.55 3 9.501E-08 172377 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.144 73.055 15414000 0 0 0 0 0 0 0 15414000 0 0 0 0 0 28939 4488 27214 266150 340091 340091 1 LPLPPGAFSGLWK Unmodified 1381.7758 0.77580772 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 138.33 138.33 2 0.0082565 134571 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.56 31.75 14405000 0 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60310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.67 78.164 44409000000 3313300000 3536800000 4318900000 4009300000 3097300000 3624900000 3375300000 3270700000 3508300000 1115000000 4135400000 3552000000 3552100000 28943 469;2794 27218 266159;266160;266161;266162;266163;266164;266165;266166;266167;266168;266169;266170;266171;266172 340100;340101;340102;340103;340104;340105;340106;340107;340108;340109;340110;340111;340112;340113;340114;340115;340116;340117;340118;340119;340120;340121;340122;340123;340124;340125;340126;340127;340128;340129;340130;340131;340132;340133;340134;340135;340136 340121 36 LPLQLDDAVRPEAEGEEEGR Unmodified 2222.0815 0.081504383 2083 P14868;C9J7S3;C9JLC1 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 85.203 85.203 2;3 1.663E-55 86763 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.91 156.52 7820500000 544350000 509260000 638320000 605300000 658300000 579240000 566600000 636280000 637740000 286240000 785000000 625920000 747970000 28944 2083 27219 266173;266174;266175;266176;266177;266178;266179;266180;266181;266182;266183;266184;266185;266186;266187;266188;266189;266190;266191;266192;266193;266194;266195;266196;266197;266198 340137;340138;340139;340140;340141;340142;340143;340144;340145;340146;340147;340148;340149;340150;340151;340152;340153;340154;340155;340156;340157;340158;340159;340160;340161;340162 340154 26 LPLSPPLVEDSAFEPSR Unmodified 1852.9571 0.95707914 1768 O96007 MOCS2 Molybdopterin synthase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 122.53 122.53 2 0.0097894 125969 QUIQUE_C1403_190116_001 66.004 50.115 48814000 0 0 0 48814000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28945 1768 27220 266199 340163 340163 1 LPLTALAQNMQEASTQLEDSLLGK Unmodified 2570.3262 0.32616811 3353 Q68EM7;C9IZD3 ARHGAP17 Rho GTPase-activating protein 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 171.07 171.07 3 9.7479E-15 172675 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.659 81.083 185570000 21005000 0 70663000 0 0 0 24014000 27432000 0 0 0 42457000 0 28946 3353 27221 266200;266201;266202;266203;266204 340164;340165;340166;340167;340168 340167 3 LPLTPVFEGLAFK Unmodified 1430.8173 0.81733818 1071 G3V198;Q12769 NUP160 Nuclear pore complex protein Nup160 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 144.34 144.34 2 0.0028904 150471 QUIQUE_C1218_190116_001 87.298 57.044 131950000 17437000 0 0 20001000 0 0 0 17203000 24606000 0 30619000 22080000 0 28947 1071 27222 266205;266206;266207;266208;266209;266210 340169;340170;340171;340172;340173;340174 340169 3 LPLVTPHTQCR Unmodified 1320.6972 0.69723982 2742 P62191 PSMC1 26S protease regulatory subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 30.953 30.953 3 0.0011539 25713 QUIQUE_C1576_190116_001 61.435 52.247 93916000 0 0 0 28280000 0 34221000 31415000 0 0 0 0 0 0 28948 2742 27223 266211;266212;266213 340175;340176;340177;340178 340178 3 LPLVVEDFVK Unmodified 1157.6696 0.66961131 3622 Q8NB37;H0YE25;H0YF25;H0YER3 PDDC1 Parkinson disease 7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.71 121.71 2 0.00069809 127547 QUIQUE_C1218_190116_001 107.57 66.072 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protein AVL9 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 107.47 107.47 2 0.0017885 111602 QUIQUE_C1438_190116_001 93.561 60.668 117300000 28370000 0 0 0 27207000 0 0 27532000 0 0 34186000 0 0 28951 679 27226 266236;266237;266238;266239;266240;266241;266242 340218;340219;340220;340221;340222;340223;340224 340220 6 LPMGAVIK Unmodified 827.4939 0.49389555 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.478 50.478 2 0.022182 48210 QUIQUE_C1277_190116_001 74.439 26.337 566330000 110770000 114880000 109950000 0 0 90741000 0 61629000 49888000 28469000 0 0 0 28952 2179 27227 266243;266244;266245;266246;266247;266248;266249 340225;340226;340227;340228;340229;340230;340231;340232 340226 8 LPMGSIK Unmodified 744.4204 0.42039626 1197 H3BRL3;O14562 UBFD1 Ubiquitin domain-containing protein UBFD1 yes no 0 0 0 1 1 51.858 51.858 2 0.040019 49992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.229 34.987 54823000 0 0 0 0 0 0 0 29908000 0 0 24915000 0 0 28953 1197 27228 266250;266251 340233;340234 340233 2 LPMPNLK Unmodified 811.4626 0.46259542 2978 Q13228;A6PVX1;F2Z2W8;F8WCR4;C9JVL0 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 54.271 54.271 2 0.033704 52679 QUIQUE_C1403_190116_001 88.201 57.143 84879000 0 0 47668000 37212000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28954 2978 27229 266252;266253 340235;340236 340236 2 LPMSIIIVGVGNADFSDMR Unmodified 2034.0278 0.027818015 1745 O95741 CPNE6 Copine-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 3 3 3 3 1 3 157.29 157.29 2;3 6.7797E-06 158046 QUIQUE_C1563_190116_001 100.55 62.531 204360000 0 0 0 0 0 24688000 27457000 13704000 22108000 0 88224000 0 28181000 28955 1745 27230 266254;266255;266256;266257;266258;266259;266260;266261;266262;266263;266264;266265;266266;266267;266268;266269;266270;266271;266272;266273 340237;340238;340239;340240;340241;340242;340243;340244;340245;340246;340247;340248;340249;340250;340251;340252;340253;340254;340255;340256 340240 18 LPMSIIIVGVGNADFSDMR Oxidation (M) 2050.0227 0.022732637 1745 O95741 CPNE6 Copine-6 yes yes 0 1 0 2 1 140.9 140.9 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266312;266313;266314;266315;266316;266317;266318;266319;266320;266321;266322;266323;266324;266325;266326;266327;266328;266329;266330;266331;266332;266333;266334;266335;266336;266337;266338 340304;340305;340306;340307;340308;340309;340310;340311;340312;340313;340314;340315;340316;340317;340318;340319;340320;340321;340322;340323;340324;340325;340326;340327;340328;340329;340330;340331;340332;340333;340334;340335;340336;340337;340338;340339;340340;340341 340309 36 LPNGVFTPDFQEFVNK Unmodified 1850.9203 0.9202997 2395 P36507;G5E9C7;A0A1B0GUL7;M0R1B6 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 137.07 137.07 2 2.4134E-29 141839 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.21 141.88 718060000 0 0 0 0 0 0 0 122010000 135620000 0 171410000 137740000 151290000 28960 2395 27234 266339;266340;266341;266342;266343 340342;340343;340344;340345;340346;340347;340348 340344 7 LPNLLGR Unmodified 781.48102 0.48102268 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 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Unmodified 1958.9446 0.94461697 1358 M0QWZ7;Q9NP81;M0R2C6;B4DJM9 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 40.018 40.018 3 0.0018727 36434 QUIQUE_C1218_190116_001 51.684 44.393 419280000 117370000 63686000 0 0 0 0 0 66333000 0 41077000 130810000 0 0 28965 1358 27239 266392;266393;266394;266395;266396 340404;340405;340406;340407;340408 340404 3 LPNSVLGR Unmodified 854.4974 0.49740102 4353 Q9NZN4 EHD2 EH domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 38.777 38.777 2 0.011743 35241 QUIQUE_C1438_190116_001 89.55 16.511 201680000 0 41758000 0 34317000 58117000 0 0 0 37338000 0 0 30146000 0 28966 4353 27240 266397;266398;266399;266400;266401 340409;340410;340411;340412;340413;340414;340415 340413 7 LPNTCNFSIR Unmodified 1220.5972 0.59719142 132 A0A0A0MQU4;Q96I15;H7C3V9;H7C277;H7C1N7;H7C4A1 SCLY Selenocysteine lyase yes no 0 0 0 1 66.046 66.046 2 0.030337 65874 QUIQUE_C1218_190116_001 64.841 49.903 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28967 132 27241 266402 340416 340416 1 LPNTLKPDSYR Unmodified 1302.6932 0.6932003 2088 P15144;H0YKT6 ANPEP Aminopeptidase N yes no 0 0 1 2 1 1 1 130.37 130.37 2 0.014748 132545 QUIQUE_C1403_190116_001 79.474 51.265 270970000 0 0 0 72745000 44737000 0 0 0 0 0 0 73215000 80268000 28968 2088 27242 266403;266404;266405;266406;266407 340417;340418;340419;340420;340421 340417 5 LPPAQQDEIIDR Unmodified 1393.7201 0.72014333 4163 Q9H425;E5RI90 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes no 0 0 0 2 53.025 53.025 2 0.032852 50839 QUIQUE_C1403_190116_001 47.894 26.43 85609000 0 0 0 85609000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28969 4163 27243 266408;266409 340422;340423 340422 2 LPPCTIFQAFK Unmodified 1320.69 0.69002918 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.83 113.83 2 0.0014505 116238 QUIQUE_C1563_190116_001 84.615 58.807 692050000 0 107440000 107170000 85682000 67259000 80890000 77943000 0 0 0 62893000 46842000 55928000 28970 699 27244 266410;266411;266412;266413;266414;266415;266416;266417;266418 340424;340425;340426;340427;340428;340429;340430;340431;340432;340433;340434;340435;340436;340437;340438 340430 15 LPPEEASPYVVDHGESGPLR Unmodified 2148.0487 0.048747692 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 71.821 71.821 3 3.2383E-08 71882 QUIQUE_C1277_190116_001 90.972 77.14 284190000 46249000 45354000 45111000 0 52774000 44924000 49776000 0 0 0 0 0 0 28971 2636 27245 266419;266420;266421;266422;266423;266424 340439;340440;340441;340442;340443;340444 340440 4 LPPEVANFMQLVELDVSR Unmodified 2056.0663 0.066312011 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.09 170.09 2;3 5.5267E-14 174392 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.25 107.57 212070000 14158000 18082000 9633100 7957600 17657000 0 14970000 10316000 52247000 0 40609000 26444000 0 28972 289 27246 266425;266426;266427;266428;266429;266430;266431;266432;266433;266434 340445;340446;340447;340448;340449;340450;340451;340452;340453;340454;340455 340453 11 LPPGEYILVPSTFEPNK Unmodified 1899.9982 0.99821567 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 2 1 1 3 1 1 1 1 126.78 126.78 2;3 1.5058E-16 123489 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.79 98.904 290740000 58210000 0 30538000 64247000 33682000 45789000 30951000 0 0 27317000 0 0 0 28973 2127 27247 266435;266436;266437;266438;266439;266440;266441;266442;266443;266444;266445 340456;340457;340458;340459;340460;340461;340462;340463;340464;340465;340466;340467;340468;340469 340468 14 LPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIR Unmodified 2763.3578 0.35780258 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.6 135.6 3 1.2971E-08 132020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.312 66.55 712470000 113420000 138250000 0 124410000 0 132030000 0 0 0 80937000 123410000 0 0 28974 2127 27248 266446;266447;266448;266449;266450;266451 340470;340471;340472;340473;340474;340475;340476;340477;340478 340475 9 LPPGEYVVVPSTFEPNK Unmodified 1871.9669 0.96691554 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 4 2 2 109.18 109.18 2;3 0.00026673 110948 QUIQUE_C1563_190116_001 77.527 53.676 314930000 0 61291000 0 76035000 0 68735000 45224000 0 0 63643000 0 0 0 28975 1921 27249 266452;266453;266454;266455;266456;266457;266458;266459;266460;266461 340479;340480;340481;340482;340483;340484;340485;340486;340487;340488 340484 10 LPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLR Unmodified 2688.3799 0.37991824 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.51 128.51 3 7.5593E-09 133106 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.593 68.486 1264400000 0 124980000 130540000 140140000 123660000 74403000 120950000 87830000 154720000 64442000 124760000 118020000 0 28976 1921 27250 266462;266463;266464;266465;266466;266467;266468;266469;266470;266471;266472 340489;340490;340491;340492;340493;340494;340495;340496;340497;340498;340499;340500;340501;340502;340503;340504;340505;340506;340507;340508;340509;340510;340511 340503 23 LPPGVDPAAVTSALSPEGVLSIQAAPASAQAPPPAAAK Unmodified 3516.8828 0.88279857 1433 O14558 HSPB6 Heat shock protein beta-6 yes yes 0 0 0 1 2 1 148.53 148.53 3;4 0.0009476 154071 QUIQUE_C1368_190116_001 32.189 27.283 147600000 0 0 34413000 0 0 71191000 0 0 0 0 0 0 41999000 28977 1433 27251 266473;266474;266475;266476 340512;340513;340514;340515 340512 4 LPPILIIHLK Unmodified 1155.7744 0.77435115 1346 K7EQL6;Q8NFA0 USP32 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32 yes no 0 0 0 1 1 1 101.62 101.62 3 0.0053663 105199 QUIQUE_C1277_190116_001 95.358 95.358 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28978 1346 27252 266477;266478;266479 340516;340517;340518 340516 3 LPPLPLTLALGAFLNHR Unmodified 1842.088 0.087974152 1769 O96008 TOMM40 Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 165.72 165.72 3 2.2888E-53 169493 QUIQUE_C1403_190116_001 162.37 151.9 1910100000 198470000 141010000 103790000 133700000 161990000 118700000 254130000 80971000 206430000 31895000 144090000 141280000 193600000 28979 1769 27253 266480;266481;266482;266483;266484;266485;266486;266487;266488;266489;266490;266491;266492;266493;266494 340519;340520;340521;340522;340523;340524;340525;340526;340527;340528;340529;340530;340531;340532;340533;340534;340535;340536;340537;340538 340524 20 LPPLPSLTSQPHQVLASEPIPFSDLQQVSR Unmodified 3280.7456 0.7455768 3364 Q6IAA8 LAMTOR1 Ragulator complex protein LAMTOR1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 141.92 141.92 3;4 3.9711E-21 146535 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.847 70.7 230770000 0 0 0 25256000 0 29912000 0 22914000 0 0 112960000 39733000 0 28980 3364 27254 266495;266496;266497;266498;266499;266500 340539;340540;340541;340542;340543;340544 340544 4 LPPLPVTPGMEGAGVVIAVGEGVSDR Oxidation (M) 2532.3258 0.32577417 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 1 0 1 1 142.21 142.21 3 3.2757E-05 147933 QUIQUE_C1218_190116_001 47.225 39.603 86631000 44091000 42540000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28981 3958 27255 266501;266502 340545;340546 340545 2795 1 LPPLPVTPGMEGAGVVIAVGEGVSDR Unmodified 2516.3309 0.33085955 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 2 2 3 2 1 2 1 1 1 1 1 3 153.38 153.38 2;3 8.5876E-24 158329 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.88 98.863 1075700000 123980000 18455000 95117000 133540000 71152000 141080000 86576000 68952000 63159000 50709000 39976000 0 182980000 28982 3958 27255 266503;266504;266505;266506;266507;266508;266509;266510;266511;266512;266513;266514;266515;266516;266517;266518;266519;266520;266521;266522 340547;340548;340549;340550;340551;340552;340553;340554;340555;340556;340557;340558;340559;340560;340561;340562;340563;340564;340565;340566;340567;340568;340569;340570;340571;340572;340573;340574;340575 340574 26 LPPLPVTPGMEGAGVVIAVGEGVSDRK Unmodified 2644.4258 0.42582257 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 139.36 139.36 3 7.4173E-109 144161 QUIQUE_DMIX3_190116_001 183.39 164.01 1201500000 25490000 49636000 50273000 44327000 68383000 0 56627000 204080000 215900000 0 188920000 130140000 167740000 28983 3958 27256 266523;266524;266525;266526;266527;266528;266529;266530;266531;266532;266533;266534 340576;340577;340578;340579;340580;340581;340582;340583;340584;340585;340586;340587;340588;340589;340590 340586 14 LPPLPVTPGMEGAGVVIAVGEGVSDRK Oxidation (M) 2660.4207 0.42073719 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 1 1 1 1 127.47 127.47 3 9.1242E-27 130493 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.73 93.057 102870000 0 0 0 0 0 0 0 38737000 64134000 0 0 0 0 28984 3958 27256 266535;266536 340591;340592 340591 2795 2 LPPNVVAVPDVVQAAEDADILIFVVPHQFIGK Unmodified 3409.865 0.86496366 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 4 4 2 1 1 1 174.2 174.2 3;4 1.3682E-20 178160 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.157 80.453 1366700000 0 41898000 0 0 0 0 440460000 135670000 276220000 0 330860000 20998000 120590000 28985 2184 27257 266537;266538;266539;266540;266541;266542;266543;266544;266545;266546;266547;266548;266549;266550;266551 340593;340594;340595;340596;340597;340598;340599;340600;340601;340602;340603;340604;340605;340606;340607;340608;340609 340606 16 LPPNVVEESAR Unmodified 1209.6354 0.63535107 1802 P01023;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000024146 A2M Alpha-2-macroglobulin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 43.02 43.02 2 0.0060801 39465 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.334 40.219 337440000 0 64786000 0 39118000 67176000 0 0 0 0 0 73170000 27817000 65376000 28986 1802 27258 266552;266553;266554;266555;266556;266557 340610;340611;340612;340613;340614;340615;340616;340617 340617 7 LPPQQIEK Unmodified 951.53893 0.53893149 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 1 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340938;340939;340940;340941;340942;340943;340944;340945;340946;340947;340948;340949 340939 10 LPSEPGMTLLTIR Unmodified 1426.7854 0.78538612 3807 Q96BJ3 AIDA Axin interactor, dorsalization-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.69 115.69 2 3.3913E-10 118543 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.71 92.294 644480000 50729000 39089000 77985000 52748000 33328000 55019000 60739000 63773000 46864000 22122000 0 62706000 79376000 29017 3807 27288 266840;266841;266842;266843;266844;266845;266846;266847;266848;266849;266850;266851 340950;340951;340952;340953;340954;340955;340956;340957;340958;340959;340960;340961;340962 340958 7 LPSEVSALQHLK Unmodified 1320.7402 0.74015049 3672 X6RK58;Q8TCA0;A0A0A0MS58 LRRC20 Leucine-rich repeat-containing protein 20 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 66.095 66.095 3 0.001496 65931 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.252 54.132 316620000 25265000 46547000 13593000 22611000 21120000 0 21552000 20513000 25855000 0 33494000 38182000 47884000 29018 3672 27289 266852;266853;266854;266855;266856;266857;266858;266859;266860;266861;266862;266863;266864 340963;340964;340965;340966;340967;340968;340969;340970;340971;340972;340973;340974;340975;340976;340977 340974 13 LPSFELLHK Unmodified 1082.6124 0.61243078 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 3 2 2 2 2 2 1 76.065 76.065 2;3 0.00041885 77781 QUIQUE_C1218_190116_001 95.608 86.914 1708000000 198030000 157190000 115290000 144110000 150400000 80034000 156050000 153070000 120140000 65415000 170610000 113680000 83998000 29019 3179 27290 266865;266866;266867;266868;266869;266870;266871;266872;266873;266874;266875;266876;266877;266878;266879;266880;266881;266882;266883;266884;266885;266886;266887;266888;266889 340978;340979;340980;340981;340982;340983;340984;340985;340986;340987;340988;340989;340990;340991;340992;340993;340994;340995;340996;340997;340998;340999;341000;341001;341002;341003;341004;341005 340978 27 LPSGEDYNLK Unmodified 1134.5557 0.55570376 4572 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69587000 120900000 333000000 178010000 469030000 307270000 664630000 16955000 847810000 2106100000 119270000 29022 2195 27293 266897;266898;266899;266900;266901;266902;266903;266904;266905;266906;266907;266908;266909;266910;266911;266912;266913;266914 341013;341014;341015;341016;341017;341018;341019;341020;341021;341022;341023;341024;341025;341026;341027;341028;341029;341030 341025 18 LPSGLPVSLLTLYLDNNK Unmodified 1956.0932 0.093178689 2597 P51884;CON__Q05443 LUM Lumican yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 165.43 165.43 2;3 1.6493E-31 169091 QUIQUE_C1403_190116_001 157.52 149.79 218760000 36531000 19129000 0 48442000 93149000 0 0 0 0 0 0 0 21507000 29023 2597 27294 266915;266916;266917;266918;266919;266920 341031;341032;341033;341034;341035;341036;341037 341034 7 LPSGSDHVMLK Oxidation (M) 1198.6016 0.6016081 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.648 23.648 2 0.00061988 17071 QUIQUE_C1403_190116_001 111.61 59.752 2570800000 160290000 123460000 0 226440000 183820000 111080000 181760000 196460000 297220000 89091000 363720000 216430000 421040000 29024 1218;28;2057 27295 266921;266922;266923;266924;266925;266926;266927;266928;266929;266930;266931;266932 341038;341039;341040;341041;341042;341043;341044;341045;341046;341047;341048;341049;341050 341041 16 13 LPSGSDHVMLK Unmodified 1182.6067 0.60669348 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 30.363 30.363 2;3 1.2677E-12 25268 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.45 108.92 9365000000 276510000 282040000 1217300000 1365900000 910460000 252230000 1411800000 597130000 873070000 205310000 554500000 502650000 916090000 29025 1218;28;2057 27295 266933;266934;266935;266936;266937;266938;266939;266940;266941;266942;266943;266944;266945;266946;266947;266948;266949;266950;266951;266952;266953;266954;266955 341051;341052;341053;341054;341055;341056;341057;341058;341059;341060;341061;341062;341063;341064;341065;341066;341067;341068;341069;341070;341071;341072;341073;341074;341075;341076;341077;341078;341079;341080;341081 341069 29 LPSGSGAASPTGSAVDIR Unmodified 1641.8322 0.83221298 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.246 55.246 2 1.0105E-53 54241 QUIQUE_C1218_190116_001 182.02 149.41 1422400000 83824000 81533000 108160000 109720000 97146000 158050000 167500000 114960000 110660000 48290000 126760000 97353000 118470000 29026 2935 27296 266956;266957;266958;266959;266960;266961;266962;266963;266964;266965;266966;266967;266968 341082;341083;341084;341085;341086;341087;341088;341089;341090;341091;341092;341093;341094 341082 13 LPSGVFSLEFQDFVNK Unmodified 1825.9251 0.92505073 2875 Q02750;H3BRW9 MAP2K1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 1 2 1 2 150.45 150.45 2;3 8.9032E-257 156264 QUIQUE_C1218_190116_001 295.78 271.93 4410100000 370060000 411600000 351450000 234310000 272980000 261100000 299830000 386170000 370210000 71819000 608520000 441230000 330840000 29027 2875 27297 266969;266970;266971;266972;266973;266974;266975;266976;266977;266978;266979;266980;266981;266982;266983;266984;266985;266986;266987;266988;266989 341095;341096;341097;341098;341099;341100;341101;341102;341103;341104;341105;341106;341107;341108;341109;341110;341111;341112;341113;341114;341115;341116;341117;341118;341119;341120;341121;341122;341123;341124;341125;341126;341127;341128;341129;341130;341131;341132;341133;341134 341097 39 LPSHSDFLAELR Unmodified 1383.7147 0.71466402 2015 P11215 ITGAM Integrin alpha-M yes yes 0 0 0 1 83.446 83.446 3 0.022694 83949 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.594 32.062 17268000 0 0 0 0 0 0 0 17268000 0 0 0 0 0 29028 2015 27298 266990 341135 341135 1 LPSINDLDSIFGPVLSPK Unmodified 1911.0353 0.035329459 3996 Q9BQI5 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 167.07 167.07 2 0.00054572 171803 QUIQUE_C1218_190116_001 71.279 56.18 98021000 33848000 24302000 0 31601000 0 0 0 0 0 8270100 0 0 0 29029 3996 27299 266991;266992;266993;266994 341136;341137;341138;341139 341136 4 LPSPTSAPQQPASQAAPPTQGQGR Unmodified 2371.188 0.18803514 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 50.422 50.422 2;3 1.805E-143 48479 QUIQUE_C1277_190116_001 274.23 253.95 3618300000 379580000 262800000 276560000 378040000 283280000 177750000 267710000 258390000 215160000 121960000 368750000 287650000 340600000 29030 2125 27300 266995;266996;266997;266998;266999;267000;267001;267002;267003;267004;267005;267006;267007;267008;267009;267010;267011;267012;267013;267014;267015;267016;267017;267018;267019;267020;267021 341140;341141;341142;341143;341144;341145;341146;341147;341148;341149;341150;341151;341152;341153;341154;341155;341156;341157;341158;341159;341160;341161;341162;341163;341164;341165;341166;341167;341168;341169;341170;341171;341172;341173;341174;341175;341176;341177;341178;341179;341180;341181;341182;341183;341184;341185;341186;341187;341188;341189;341190 341147 51 LPSQTESVTSNR Unmodified 1317.6525 0.6524577 3212 Q2M2I8 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.846 24.846 2 7.1913E-07 19242 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.88 102.73 301260000 0 0 0 67593000 0 69854000 0 60933000 0 0 102880000 0 0 29031 3212 27301 267022;267023;267024;267025;267026;267027 341191;341192;341193;341194;341195;341196 341194 6 LPSRPPLPGSGGSQSGAK Unmodified 1691.8955 0.89548193 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.995 33.995 3 0.00021097 30255 QUIQUE_C1218_190116_001 78.794 59.4 479750000 48118000 93880000 0 68826000 0 41987000 0 0 71888000 0 71122000 0 83933000 29032 4617 27302 267028;267029;267030;267031;267032;267033;267034 341197;341198;341199;341200;341201;341202;341203;341204;341205 341198 7 LPSSPASPSPK Unmodified 1066.5659 0.56587452 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 22.742 22.742 2 0.056087 15949 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.882 19.939 62338000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26015000 36323000 29033 1230;4172;346 27303 267035;267036 341206;341207 341207 2 LPSSPVYEDAASFK Unmodified 1509.7351 0.73512469 3056 Q14247;H0YEV2;H0YCD9 CTTN Src substrate cortactin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.062 85.062 2 2.7559E-22 86904 QUIQUE_DMIX3_190116_001 178.81 162.68 1476200000 172630000 165840000 139770000 164880000 0 146750000 0 64422000 145740000 67081000 152180000 100980000 155950000 29034 3056 27304 267037;267038;267039;267040;267041;267042;267043;267044;267045;267046;267047 341208;341209;341210;341211;341212;341213;341214;341215;341216;341217;341218;341219;341220;341221;341222 341218 13 LPSTGEGTQFYLFENVDNAQQFK Unmodified 2632.2445 0.24454697 2319 P30519;A0A087WT44;I3L159;I3L1F5 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 137.92 137.92 2;3 3.6087E-19 141079 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.21 110.37 801360000 71012000 56674000 0 0 63482000 110050000 108740000 63198000 70832000 46614000 80042000 70288000 60436000 29035 2319 27305 267048;267049;267050;267051;267052;267053;267054;267055;267056;267057;267058;267059;267060;267061 341223;341224;341225;341226;341227;341228;341229;341230;341231;341232;341233;341234;341235;341236 341230 12 LPSVEGLHAIVVSDR Unmodified 1590.873 0.87295558 4426 Q9UHA4 LAMTOR3 Ragulator complex protein LAMTOR3 yes yes 0 0 0 1 92.595 92.595 3 0.00025037 95133 QUIQUE_C1218_190116_001 77.222 59.478 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29036 4426 27306 267062 341237 341237 1 LPSVPQIAK Unmodified 951.57532 0.57531699 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 60.599 60.599 2 0.053277 59915 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.833 24.91 17344000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17344000 0 0 29037 354 27307 267063 341238 341238 1 LPSVPVEWNEINAAWGQTVLLLHALANK Unmodified 3082.6604 0.66039061 3068 Q14457;K7ELY9;E7EV84;K7ERY0;K7EMA2 BECN1 Beclin-1 yes no 0 0 0 1 1 173.68 173.68 3 2.7392E-19 181031 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.389 88.804 47278000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27071000 20207000 0 29038 3068 27308 267064;267065 341239;341240 341239 2 LPTAVFEGPSFGYTEQSAR Unmodified 2055.9902 0.99017018 4608 Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 115.41 115.41 2;3 1.6025E-36 117989 QUIQUE_DMIX1_190116_001 200.19 178.13 1508200000 75079000 98294000 118420000 120430000 83130000 86826000 122380000 132280000 146510000 81225000 158840000 116670000 168100000 29039 4608 27309 267066;267067;267068;267069;267070;267071;267072;267073;267074;267075;267076;267077;267078;267079 341241;341242;341243;341244;341245;341246;341247;341248;341249;341250;341251;341252;341253;341254;341255;341256;341257;341258;341259;341260;341261 341253 20 LPTDASEDADQPAGDSAILLR Unmodified 2154.0441 0.044056244 1595 O60826 CCDC22 Coiled-coil domain-containing protein 22 yes yes 0 0 0 1 98.908 98.908 2 8.9075E-10 101493 QUIQUE_C1277_190116_001 138.91 70.628 43726000 0 43726000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29040 1595 27310 267080 341262 341262 1 LPTDLTACDNR Unmodified 1274.5925 0.59249998 3935 Q96RS6 NUDCD1 NudC domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 47.052 47.052 2 0.0023872 44710 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.655 43.36 189460000 0 0 49955000 34300000 37886000 0 0 0 0 0 34849000 32474000 0 29041 3935 27311 267081;267082;267083;267084;267085 341263;341264;341265;341266;341267 341267 5 LPTEEEWEFAAR Unmodified 1476.6885 0.68850885 1279 J3KQJ1;Q8NBJ7;C9JL30;A8MXB9;C9J660;F8WA42;H7C3B2 SUMF2 Sulfatase-modifying factor 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 98.406 98.406 2 4.0176E-07 100834 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175639 QUIQUE_C1218_190116_001 167.3 132.58 922750000 31333000 186680000 33194000 21915000 79377000 5201300 143040000 24484000 64330000 13211000 141590000 130710000 47690000 29046 4520 27316 267125;267126;267127;267128;267129;267130;267131;267132;267133;267134;267135;267136;267137 341314;341315;341316;341317;341318;341319;341320;341321;341322;341323;341324;341325;341326;341327;341328 341314 15 LPTPVLLPYKPQVIR Unmodified 1733.0604 0.060362418 3947 Q96T76;H0Y746;H0Y7V3 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 100.15 100.15 3 0.0034034 103891 QUIQUE_C1438_190116_001 59.225 45.479 226080000 34818000 0 0 0 40676000 0 0 0 48542000 18357000 0 0 83691000 29047 3947 27317 267138;267139;267140;267141;267142;267143 341329;341330;341331;341332;341333;341334 341331 6 LPTSSKPPGAVPSNALTNPAPSK Unmodified 2230.1957 0.19574628 3460 Q7Z434 MAVS Mitochondrial antiviral-signaling protein yes yes 0 0 1 1 54.937 54.937 3 0.018817 52498 QUIQUE_C1563_190116_001 21.348 9.2882 28571000 0 0 0 0 0 28571000 0 0 0 0 0 0 0 29048 3460 27318 267144 341335 341335 1 LPTTGMTITK Unmodified 1061.5791 0.57908174 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5;F6SJA5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 0 1 1 47.533 47.533 2 0.015863 44727 QUIQUE_C1403_190116_001 63.076 40.004 131210000 84827000 0 0 46384000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29049 465 27319 267145;267146 341336;341337 341337 1 LPTVPLSGMYNK Unmodified 1318.6955 0.69550848 1197 H3BRL3;O14562 UBFD1 Ubiquitin domain-containing protein UBFD1 yes no 0 0 0 1 83.072 83.072 3 0.01276 84676 QUIQUE_C1576_190116_001 33.057 14.79 15788000 0 0 0 0 0 0 15788000 0 0 0 0 0 0 29050 1197 27320 267147 341338 341338 1 LPVATIFTTHATLLGR Unmodified 1709.9828 0.98284038 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 114.23 114.23 2;3 1.6398E-19 118088 QUIQUE_C1368_190116_001 145.69 118.92 946350000 66835000 66476000 65244000 59192000 113440000 58718000 172210000 27653000 60867000 26695000 85542000 53169000 90319000 29051 2068 27321 267148;267149;267150;267151;267152;267153;267154;267155;267156;267157;267158;267159;267160;267161;267162;267163 341339;341340;341341;341342;341343;341344;341345;341346;341347;341348;341349;341350;341351;341352;341353;341354;341355 341341 16 LPVDFSNIPTYLLK Unmodified 1618.897 0.89704506 1051 F8W733;Q9NXR7 BRE BRCA1-A complex subunit BRE yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.87 149.87 2 7.8683E-05 155686 QUIQUE_C1218_190116_001 131.17 114.15 685060000 41628000 51626000 73038000 51772000 63385000 37259000 67815000 0 58838000 20380000 80415000 63151000 75752000 29052 1051 27322 267164;267165;267166;267167;267168;267169;267170;267171;267172;267173;267174;267175 341356;341357;341358;341359;341360;341361;341362;341363;341364;341365;341366;341367;341368;341369 341357 13 LPVDIAYK Unmodified 917.52222 0.52221879 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 50.56 50.56 2 0.018737 48475 QUIQUE_C1277_190116_001 79.469 0 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341394;341395;341396;341397;341398;341399;341400;341401;341402;341403;341404;341405;341406;341407;341408;341409;341410;341411;341412;341413;341414;341415;341416;341417;341418;341419;341420 341410 27 LPVGTTATLYFR Unmodified 1337.7343 0.73433683 4335 Q9NZ01;M0R2N5 TECR Very-long-chain enoyl-CoA reductase yes no 0 0 0 1 1 97.179 97.179 2 0.0034236 101432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.5 57.767 127270000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 81811000 45457000 0 29059 4335 27329 267211;267212 341421;341422 341421 1 LPVIDPESGNTLYILTHK Unmodified 2009.0833 0.083342284 1042 F8VYY9;P54619;F8VPF5;F8VVA3 PRKAG1 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.02 122.02 3 4.7675E-14 125925 QUIQUE_C1277_190116_001 126.88 117.37 838490000 65197000 80029000 70217000 71101000 58092000 52068000 75971000 58181000 55245000 21703000 78878000 71632000 80176000 29060 1042 27330 267213;267214;267215;267216;267217;267218;267219;267220;267221;267222;267223;267224;267225 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Unmodified 1055.5724 0.57235688 3181 Q16543;K7EQA9;K7EKQ2 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.04 23.04 2 0.006063 16515 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.55 56.231 2022100000 0 0 0 344070000 282470000 215590000 311130000 0 0 0 313420000 238480000 316940000 29101 3181 27369 267540;267541;267542;267543;267544;267545;267546 341848;341849;341850;341851;341852;341853;341854 341852 2 LQAEAQQLRK Unmodified 1183.6673 0.6673199 3181 Q16543;K7EQA9;K7EKQ2 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 15.337 15.337 3 0.0099632 7666 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.872 32.111 37546000 0 0 0 0 0 0 0 37546000 0 0 0 0 0 29102 3181 27370 267547 341855;341856 341855 2 LQAEEVAQQK Unmodified 1142.5932 0.5931519 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.966 20.966 2 1.7571E-14 14424 QUIQUE_C1218_190116_001 175.38 97.041 14156000000 1106700000 1009300000 0 391870000 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341897;341898;341899;341900;341901;341902;341903;341904;341905;341906;341907;341908;341909;341910 341909 14 LQAENLQLR Unmodified 1083.6037 0.60365701 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QLH1 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.433 49.433 2 0.0010839 47213 QUIQUE_C1576_190116_001 107.01 38.625 689770000 115160000 0 129270000 0 0 134350000 149550000 0 0 0 0 0 161440000 29108 245 27376 267597;267598;267599;267600;267601;267602;267603;267604;267605 341911;341912;341913;341914;341915;341916;341917;341918;341919;341920 341916 10 LQAENTALQK Unmodified 1114.5982 0.59823728 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 21.368 21.368 2 0.014372 14231 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.268 19.919 64672000 0 0 0 0 0 0 0 45124000 0 19548000 0 0 0 29109 3241 27377 267606;267607 341921;341922 341922 1 LQAESESAATR Unmodified 1161.5626 0.56258006 1022 F6RY50;Q96FS4 SIPA1 Signal-induced proliferation-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 14.906 14.906 2 0.0038393 6728 QUIQUE_C1563_190116_001 90.15 35.993 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29110 1022 27378 267608;267609;267610 341923;341924;341925 341924 3 LQAFDFLLLLR Unmodified 1347.7915 0.79145778 428 A0A2R8Y5F1;A0A2R8YGU4;X5D2U8;H3BMQ0;A0A2R8YDZ2;A0A2R8Y7X5;A0A2R8YDR3;A0A2R8Y7C8;A0A2R8YGD6;P49815;A0A2R8Y6C9 TSC2 Tuberin yes no 0 0 0 1 169.17 169.17 2 0.065128 176609 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.579 30.493 12662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12662000 0 0 29111 428 27379 267611 341926 341926 1 LQAFGFCEYKEPESTLR Unmodified 2073.983 0.98297631 2543 P49756;E9PQU5 RBM25 RNA-binding protein 25 yes no 0 0 1 1 1 91.581 91.581 3 0.021397 94987 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.111 16.189 90314000 0 0 0 40628000 0 0 0 0 0 0 49686000 0 0 29112 2543 27380 267612;267613 341927;341928 341928 2 LQAFSAAIESCNK Unmodified 1437.6922 0.69221402 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.544 65.544 2 0.00037681 63942 QUIQUE_C1563_190116_001 93.258 75.822 1027500000 86780000 166340000 0 126330000 0 119250000 0 133900000 130040000 40398000 0 0 224480000 29113 2876 27381 267614;267615;267616;267617;267618;267619;267620;267621 341929;341930;341931;341932;341933;341934;341935;341936 341932 4 LQAGEETASHYR Unmodified 1360.6371 0.63714198 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 18.999 18.999 2;3 3.871E-15 11931 QUIQUE_C1218_190116_001 185.08 144.36 28283000000 2653800000 754800000 2564000000 2319500000 2620500000 1977000000 2825700000 1892400000 2148100000 893350000 3153000000 2250700000 2229800000 29114 4393 27382 267622;267623;267624;267625;267626;267627;267628;267629;267630;267631;267632;267633;267634;267635;267636;267637;267638;267639;267640;267641;267642;267643;267644;267645;267646 341937;341938;341939;341940;341941;341942;341943;341944;341945;341946;341947;341948;341949;341950;341951;341952;341953;341954;341955;341956;341957;341958;341959;341960;341961 341938 17 LQAGEYVSLGK Unmodified 1163.6186 0.61863837 1737;1577 O95573;O60488 ACSL3;ACSL4 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3;Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 61.554 61.554 2 0.0014477 60089 QUIQUE_C1403_190116_001 84.658 36.81 1092900000 132820000 119840000 0 137510000 0 133780000 136740000 0 0 0 0 215540000 216690000 29115 1737;1577 27383 267647;267648;267649;267650;267651;267652;267653 341962;341963;341964;341965;341966;341967;341968 341964 5 LQAGTVFVNTYNK Unmodified 1453.7565 0.75652884 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 69.303 69.303 2 0.00038719 69306 QUIQUE_C1403_190116_001 129.16 117.52 2058700000 114280000 195620000 297410000 131130000 156950000 248160000 175690000 0 121880000 95525000 240010000 134940000 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Glutaminyl-peptide cyclotransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.18 118.18 3 6.9155E-10 123780 QUIQUE_C1218_190116_001 129.38 104.96 228970000 33180000 33027000 15947000 25255000 17269000 17087000 35845000 0 24622000 0 0 26739000 0 29118 641 27386 267688;267689;267690;267691;267692;267693;267694;267695;267696 342005;342006;342007;342008;342009;342010;342011;342012;342013 342005 9 LQAISWAR Unmodified 943.52395 0.52395013 4267 Q9NRF8;H0Y5S6 CTPS2 CTP synthase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 63.517 63.517 2 0.040438 62226 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.212 33.755 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29119 4267 27387 267697;267698;267699;267700 342014;342015;342016;342017 342017 4 LQALANEQAAAAHELEK Unmodified 1805.9272 0.92717599 3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 0 1 1 3 62.788 62.788 2;3 7.5585E-05 62819 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.09 79.747 193810000 0 0 0 0 0 0 95056000 0 0 0 98756000 0 0 29120 3490 27388 267701;267702;267703;267704;267705 342018;342019;342020;342021;342022;342023 342022 5 LQALDTGWNELHK Unmodified 1523.7732 0.77324153 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 77.069 77.069 2;3 2.8942E-23 78580 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.74 156.87 32771000000 2200900000 3078900000 2490900000 1978200000 3080000000 1546000000 2493100000 2680500000 2891600000 1076900000 3172600000 2957500000 3123700000 29121 2851 27389 267706;267707;267708;267709;267710;267711;267712;267713;267714;267715;267716;267717;267718;267719;267720;267721;267722;267723;267724;267725;267726;267727;267728;267729;267730;267731 342024;342025;342026;342027;342028;342029;342030;342031;342032;342033;342034;342035;342036;342037;342038;342039;342040;342041;342042;342043;342044;342045;342046;342047;342048;342049;342050;342051;342052;342053;342054;342055;342056;342057;342058;342059;342060;342061;342062;342063;342064;342065;342066;342067;342068;342069;342070;342071;342072;342073;342074;342075;342076;342077;342078;342079;342080 342071 57 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2161.9698 0.96984544 3787 Q969P0;C9J8Z4 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 2 49.334 49.334 2;3 6.2876E-17 46315 QUIQUE_C1563_190116_001 117.26 109.11 1877000000 163920000 202300000 239960000 186160000 208640000 150500000 331510000 55359000 0 36247000 0 113610000 188830000 29127 3787 27395 267763;267764;267765;267766;267767;267768;267769;267770;267771;267772;267773;267774;267775;267776;267777;267778 342114;342115;342116;342117;342118;342119;342120;342121;342122;342123;342124;342125;342126;342127;342128;342129;342130 342123 16 LQAQETVHEVALK Unmodified 1464.7936 0.79364262 2946 Q12840;J3KNA1 KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 40.377 40.377 2 0.0096214 35732 QUIQUE_C1403_190116_001 68.893 48.589 17837000 17837000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29128 2946 27396 267779;267780 342131;342132 342132 2 LQAQLDLIEK Unmodified 1169.6656 0.66558856 4166 Q9H479 FN3K Fructosamine-3-kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.307 77.307 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2383.1842 0.18419532 1388 O00231;J3QS13 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes no 0 0 1 1 2 2 2 102.16 102.16 3;4 0.00033205 104822 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.332 52.144 430740000 0 0 0 0 0 0 0 74120000 78941000 0 0 158660000 119010000 29137 1388 27405 267832;267833;267834;267835;267836;267837;267838 342190;342191;342192;342193;342194;342195;342196 342194 7 LQATVQELQK Unmodified 1156.6452 0.64518747 2327 P31146;H3BRY3 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.756 37.756 2 0.00022986 33253 QUIQUE_DMIX8_190116_001 135.71 50.968 1992700000 239380000 211530000 253380000 270960000 0 222630000 228720000 0 0 120030000 246930000 0 199100000 29138 2327 27406 267839;267840;267841;267842;267843;267844;267845;267846;267847 342197;342198;342199;342200;342201;342202;342203;342204;342205;342206 342206 10 LQAVEVVITHLAPGTK Unmodified 1674.9669 0.96685596 4569 Q9Y2V2 CARHSP1 Calcium-regulated heat stable protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 2 101.6 101.6 2;3 1.9885E-05 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342317;342318;342319;342320;342321;342322;342323;342324;342325;342326;342327;342328;342329;342330;342331;342332;342333;342334;342335;342336;342337;342338;342339;342340;342341;342342;342343;342344;342345;342346;342347;342348;342349;342350;342351;342352;342353;342354;342355;342356;342357;342358;342359;342360;342361;342362;342363;342364;342365 342323 48 LQCTYIEVEQVSK Unmodified 1595.7865 0.78650834 1297 J3QL71;Q96FV2;J3QRJ1;J3QR84;J3KT79 SCRN2 Secernin-2 yes no 0 0 0 1 72.444 72.444 2 0.00057965 68818 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.441 73.484 30837000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30837000 0 0 0 29148 1297 27416 267981 342366 342366 1 LQDAEIAR Unmodified 914.48214 0.48214489 1902 R4GN98;P06703 S100A6 Protein S100;Protein S100-A6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.912 21.912 2 0.00011333 15208 QUIQUE_DMIX7_190116_001 165.11 70.442 3394100000 186970000 0 422600000 0 217380000 149130000 315320000 0 792720000 168540000 695080000 446330000 0 29149 1902 27417 267982;267983;267984;267985;267986;267987;267988;267989;267990;267991 342367;342368;342369;342370;342371;342372;342373;342374;342375;342376 342375 10 LQDAFSAIGQNADLDLPQIAVVGGQSAGK Unmodified 2882.4774 0.47740045 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 150.51 150.51 2;3 1.3057E-108 153238 QUIQUE_C1563_190116_001 234.04 222.31 10533000000 1050800000 983460000 985280000 984040000 783220000 714600000 625380000 742870000 758600000 380260000 875420000 904170000 744780000 29150 269;2893 27418 267992;267993;267994;267995;267996;267997;267998;267999;268000;268001;268002;268003;268004;268005;268006;268007;268008;268009;268010;268011;268012;268013;268014;268015;268016;268017 342377;342378;342379;342380;342381;342382;342383;342384;342385;342386;342387;342388;342389;342390;342391;342392;342393;342394;342395;342396;342397;342398;342399;342400;342401;342402;342403;342404;342405;342406;342407;342408;342409;342410;342411;342412;342413;342414;342415;342416;342417;342418 342396 42 LQDAFSALGQSCLLELPQIAVVGGQSAGK Unmodified 2956.5328 0.53280684 4528;840 E5RHK8;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 163.58 163.58 3 1.1309E-20 167089 QUIQUE_C1403_190116_001 93.384 88.689 1247500000 108310000 132170000 131520000 74397000 133930000 133880000 167630000 120800000 104640000 33026000 0 0 107180000 29151 840;4528 27419 268018;268019;268020;268021;268022;268023;268024;268025;268026;268027;268028 342419;342420;342421;342422;342423;342424;342425;342426;342427;342428;342429;342430;342431;342432;342433;342434 342422 15 LQDAFSSIGQSCHLDLPQIAVVGGQSAGK Unmodified 2982.4869 0.48691928 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 131.1 131.1 3 5.3823E-29 135164 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.35 97.14 1233000000 80081000 112240000 100140000 110780000 91249000 111440000 87021000 83655000 91964000 30186000 108500000 82182000 143520000 29152 2569 27420 268029;268030;268031;268032;268033;268034;268035;268036;268037;268038;268039;268040;268041;268042 342435;342436;342437;342438;342439;342440;342441;342442;342443;342444;342445;342446;342447;342448;342449;342450;342451;342452;342453 342452 17 LQDAINILK Unmodified 1026.6073 0.6073454 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 75.501 75.501 2 0.013518 71391 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.825 34.529 124640000 94974000 0 0 0 0 0 0 0 0 29669000 0 0 0 29153 2452 27421 268043;268044 342454;342455 342455 2 LQDAYYIFQEMADK Unmodified 1733.7971 0.79707302 1359 M0QXB4;O14579 COPE Coatomer subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.44 137.44 2 0.00023584 143285 QUIQUE_C1218_190116_001 111.79 98.114 600530000 41316000 57948000 64469000 50701000 42930000 58360000 52433000 45000000 0 0 65264000 59710000 62403000 29154 1359 27422 268045;268046;268047;268048;268049;268050;268051;268052;268053;268054;268055;268056 342456;342457;342458;342459;342460;342461;342462;342463;342464;342465;342466;342467;342468;342469 342456 14 LQDDSVETVTSIEQAK Unmodified 1761.8632 0.86323833 2526 P49356 FNTB Protein farnesyltransferase subunit beta yes yes 0 0 0 1 78.386 78.386 2 1.7409E-05 74642 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.69 103.81 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29155 2526 27423 268057 342470 342470 1 LQDEELDPEFVQQVADFCSYIFSNSK Unmodified 3107.407 0.4069972 2350 P32455;Q9H0R5;F6X827 GBP1;GBP3 Interferon-induced guanylate-binding protein 1;Guanylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 172.59 172.59 3 1.0879E-07 174204 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.803 50.85 13200000 0 0 0 0 0 0 0 13200000 0 0 0 0 0 29156 2350 27424 268058 342471 342471 1 LQDEFENR Unmodified 1049.4778 0.47778779 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;H0YCH5;H0YD77;H0YEC5 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 31.407 31.407 2 0.0059506 25956 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.56 57.137 78134000 0 0 0 0 0 0 0 52770000 0 25365000 0 0 0 29157 798 27425 268059;268060 342472;342473 342472 2 LQDEGQEAEGEK Unmodified 1331.5841 0.58410336 1975 P09914;Q5T764 IFIT1;IFIT1B Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1;Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.221 15.221 2 1.0638E-45 7314 QUIQUE_C1403_190116_001 202.56 172.79 1449100000 91135000 79596000 402170000 93350000 67256000 47384000 119320000 47987000 77096000 30628000 291770000 48832000 52549000 29158 1975 27426 268061;268062;268063;268064;268065;268066;268067;268068;268069;268070;268071;268072;268073 342474;342475;342476;342477;342478;342479;342480;342481;342482;342483;342484;342485;342486;342487 342477 14 LQDEGQEAEGEKYIEEALANMSSQTYVFR Unmodified 3334.53 0.52996588 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 164.21 164.21 3 4.9439E-45 171302 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.66 127.2 310590000 0 0 33163000 0 0 0 0 50388000 0 0 227040000 0 0 29159 1975 27427 268074;268075;268076 342488;342489;342490;342491;342492;342493 342493 6 LQDEIQNMK Unmodified 1117.5438 0.54375887 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.157 36.157 2 5.1397E-34 31704 QUIQUE_C1403_190116_001 211.39 142.97 28019000000 3790700000 2462700000 3583900000 4877800000 0 3721700000 2320300000 607940000 1228000000 1601600000 1453400000 1002500000 1368700000 29160 1952 27428 268077;268078;268079;268080;268081;268082;268083;268084;268085;268086;268087;268088 342494;342495;342496;342497;342498;342499;342500;342501;342502;342503;342504;342505;342506;342507 342497 14 LQDEIQNMK Oxidation (M) 1133.5387 0.53867349 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 19.634 19.634 2 3.8221E-06 12654 QUIQUE_C1218_190116_001 192.58 146.63 1247600000 647260000 0 0 0 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yes no 0 1 1 5 8 7 8 7 8 7 8 7 7 6 6 6 34.885 34.885 2;3 9.8924E-115 26163 QUIQUE_C1368_190116_001 238.98 182.2 19190000000 550390000 1792800000 1996700000 2190500000 1887700000 1449000000 1189900000 1760500000 2217600000 789560000 1418400000 885920000 1061000000 29163 1952 27429 268121;268122;268123;268124;268125;268126;268127;268128;268129;268130;268131;268132;268133;268134;268135;268136;268137;268138;268139;268140;268141;268142;268143;268144;268145;268146;268147;268148;268149;268150;268151;268152;268153;268154;268155;268156;268157;268158;268159;268160;268161;268162;268163;268164;268165;268166;268167;268168;268169;268170;268171;268172;268173;268174;268175;268176;268177;268178;268179;268180;268181;268182;268183;268184;268185;268186;268187;268188;268189;268190;268191;268192;268193;268194;268195;268196;268197;268198;268199;268200;268201;268202;268203;268204;268205;268206;268207;268208;268209;268210 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342903 199 LQDETNLRLEAENNLAAYRQEADEATLAR Unmodified 3316.6284 0.6283748 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 3 2 2 1 1 116.12 116.12 3;4 2.5435E-126 120778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 193.14 159.04 4850800000 0 0 0 0 0 0 0 3340400000 475020000 0 404920000 312840000 317650000 29168 389;395;1336 27433 268442;268443;268444;268445;268446;268447;268448;268449;268450 343007;343008;343009;343010;343011;343012;343013;343014;343015;343016;343017;343018;343019;343020;343021;343022 343012 16 LQDEYDSVLYSIVDLHSITVPQDPAVLR Unmodified 3184.6292 0.62920964 4422 Q9UGM6 WARS2 Tryptophan--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 162.67 162.67 3 0.0034293 167473 QUIQUE_DMIX3_190116_001 30.206 19.876 25683000 0 0 0 0 0 0 0 0 25683000 0 0 0 0 29169 4422 27434 268451 343023 343023 1 LQDFASTVEALEEGK Unmodified 1635.7992 0.79918151 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 134.88 134.88 2;3 2.9342E-18 139791 QUIQUE_C1368_190116_001 142.91 119.53 462280000 0 97589000 48856000 56820000 65179000 36459000 38134000 0 33383000 42301000 0 43562000 0 29170 2385 27435 268452;268453;268454;268455;268456;268457;268458;268459;268460;268461;268462 343024;343025;343026;343027;343028;343029;343030;343031;343032;343033;343034;343035 343026 12 LQDFNVGDYIEAVLDR Unmodified 1865.9159 0.9159426 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 168.58 168.58 2;3 7.6445E-80 170430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 211.38 187.63 21261000000 1159800000 1682900000 2187700000 575530000 1569300000 749720000 1701400000 1315800000 576320000 461700000 4368500000 2206000000 2706100000 29171 2016 27436 268463;268464;268465;268466;268467;268468;268469;268470;268471;268472;268473;268474;268475;268476;268477;268478;268479;268480;268481;268482;268483;268484;268485;268486 343036;343037;343038;343039;343040;343041;343042;343043;343044;343045;343046;343047;343048;343049;343050;343051;343052;343053;343054;343055;343056;343057;343058;343059;343060;343061;343062;343063;343064;343065 343052 30 LQDGNHLLFQQVPMVEIDGMK Unmodified 2411.1977 0.19773689 1491 O15217 GSTA4 Glutathione S-transferase A4 yes yes 0 0 0 1 1 131.37 131.37 3 9.7812E-05 134437 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.847 57.178 77953000 0 0 0 0 0 0 0 22834000 0 0 0 55119000 0 29172 1491 27437 268487;268488 343066;343067 343066 2 LQDKQEHCSQLESHLK Unmodified 1978.9531 0.95307317 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 1 1 18.262 18.262 3 0.055069 10881 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.492 25.533 27972000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27972000 0 0 29173 3108 27438 268489 343068 343068 1 LQDLELK Unmodified 857.48583 0.48583328 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394;H7C0A4;C9JIZ1;C9J5E5 HDLBP Vigilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 43.727 43.727 2 0.03902 40458 QUIQUE_C1368_190116_001 84.097 0 118630000 0 0 28573000 0 0 23743000 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glutamate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 149.47 149.47 2;3 0.0020943 155155 QUIQUE_C1218_190116_001 78.763 62.626 78266000 29443000 17617000 0 15443000 15764000 0 0 0 0 0 0 0 0 29177 1202 27442 268504;268505;268506;268507 343086;343087;343088;343089 343086 4 LQDLYSIVR Unmodified 1105.6132 0.61315906 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.799 87.799 2 2.2774E-06 88590 QUIQUE_C1563_190116_001 152.63 81.718 827870000 96935000 72281000 46366000 69174000 142250000 41953000 0 0 71046000 50190000 92606000 85845000 59218000 29178 2419 27443 268508;268509;268510;268511;268512;268513;268514;268515;268516;268517;268518 343090;343091;343092;343093;343094;343095;343096;343097;343098;343099;343100;343101;343102;343103;343104 343097 15 LQDMLDGFIK Unmodified 1178.6005 0.60054547 2653 P55010;H0YLZ1;H0YN40;H0YMJ8;H0YM54 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.92 116.92 2 0.00023561 120556 QUIQUE_C1403_190116_001 117.89 52.638 496020000 47970000 48653000 51429000 73908000 39096000 57894000 46322000 21330000 38983000 0 0 31470000 38962000 29179 2653 27444 268519;268520;268521;268522;268523;268524;268525;268526;268527;268528;268529 343105;343106;343107;343108;343109;343110;343111;343112;343113;343114;343115 343108 7 LQDMLDGFIKK Unmodified 1306.6955 0.69550848 2653 P55010;H0YLZ1;H0YN40;H0YMJ8;H0YM54 EIF5 Eukaryotic translation initiation factor 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 88.784 88.784 3 0.0015942 91896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.385 57.126 101430000 0 0 0 0 0 0 0 25295000 18162000 0 31497000 0 26479000 29180 2653 27445 268530;268531;268532;268533;268534 343116;343117;343118;343119;343120;343121;343122 343120 7 LQDNVREDLYEAADKWVAAVGK Unmodified 2489.2551 0.25505207 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 2 2 1 138.09 138.09 3;4 3.7457E-10 143186 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.18 96.378 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1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.342 76.342 2 1.5996E-35 76909 QUIQUE_C1368_190116_001 172.13 137.75 563350000 46860000 44408000 43256000 41409000 36488000 39646000 58322000 0 52449000 25470000 54987000 53018000 67032000 29191 3557 27456 268611;268612;268613;268614;268615;268616;268617;268618;268619;268620;268621;268622;268623 343203;343204;343205;343206;343207;343208;343209;343210;343211;343212;343213;343214;343215;343216 343206 13 LQDVHAEAEGEK Unmodified 1324.6259 0.62590859 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 0 1 16.143 16.143 2 0.043758 8415 QUIQUE_C1218_190116_001 45.653 18.523 12063000 12063000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29192 2986 27457 268624 343217 343217 1 LQDVHAEAEGEKYIEEILDQISSQPYVLR Unmodified 3371.6885 0.68851544 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 1 1 1 166.2 166.2 4 3.7209E-12 170382 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.765 60.605 219970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 142310000 77658000 0 29193 2986 27458 268625;268626 343218;343219 343219 1 LQDVHVAEGK Unmodified 1094.572 0.57202253 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.409 16.409 2;3 0.0051856 8731 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.786 22.581 640720000 22661000 31922000 68808000 92385000 60591000 59740000 56215000 44008000 86400000 31016000 24648000 62328000 0 29194 3154 27459 268627;268628;268629;268630;268631;268632;268633;268634;268635;268636;268637;268638 343220;343221;343222;343223;343224;343225;343226;343227;343228;343229;343230;343231 343230 11 LQEACKDILLFK Unmodified 1476.801 0.80103619 2069;2331 P13861;H7C1L0;P31323 PRKAR2A;PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit no no 0 0 1 2 2 1 2 1 78.114 78.114 2;3 0.002951 78926 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.13 88.139 867320000 0 0 0 0 0 0 0 328120000 171750000 0 96563000 198660000 72229000 29195 2069;2331 27460 268639;268640;268641;268642;268643;268644;268645;268646 343232;343233;343234;343235;343236;343237;343238;343239;343240 343232 7 LQEAESNLRK Unmodified 1186.6306 0.63060004 1334 K7ES98;K7EM85;Q92619;F5H1R4 HMHA1 Minor histocompatibility protein HA-1;Minor histocompatibility antigen HA-1 yes no 0 0 1 1 31.511 31.511 2 0.033596 26048 QUIQUE_C1277_190116_001 57.59 0.86853 105620000 0 105620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29196 1334 27461 268647 343241 343241 1 LQEAGILSAEELQR Unmodified 1555.8206 0.82058566 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 88.233 88.233 2 1.6423E-14 88823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.71 115.1 4183300000 0 0 0 0 0 0 0 979900000 955040000 430610000 665520000 700240000 451960000 29197 3117 27462 268648;268649;268650;268651;268652;268653;268654 343242;343243;343244;343245;343246;343247;343248;343249;343250 343242 9 LQEALMHYK Unmodified 1131.5747 0.57466507 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 33.957 33.957 2 0.051266 29161 QUIQUE_C1277_190116_001 62.88 27.949 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29198 1497 27463 268655;268656 343251;343252 343251 2 LQEALNLFK Unmodified 1074.6073 0.6073454 2778 P63092;Q5JWF2 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.496 90.496 2 3.0984E-07 93303 QUIQUE_C1576_190116_001 160.75 110.71 4577100000 321570000 424090000 601670000 381270000 329880000 0 434780000 336100000 462590000 161710000 400930000 308400000 414090000 29199 2778 27464 268657;268658;268659;268660;268661;268662;268663;268664;268665;268666;268667;268668 343253;343254;343255;343256;343257;343258;343259;343260;343261;343262;343263;343264;343265;343266;343267;343268 343260 15 LQEANAQLAEQACPHDVEMTPVQR Unmodified 2734.2803 0.28029732 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 74.145 74.145 3 7.123E-75 73625 QUIQUE_C1563_190116_001 169.42 155.18 142630000 0 0 0 87208000 0 55424000 0 0 0 0 0 0 0 29200 57 27465 268669;268670;268671 343269;343270;343271 343270 3 LQEAQEELAGLQR Unmodified 1483.7631 0.76307078 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 68.692 68.692 2 0.0020217 68594 QUIQUE_C1218_190116_001 90.146 63.548 39186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39186000 0 0 0 29201 4414 27466 268672;268673 343272;343273 343272 2 LQEDGLSVWFQR Unmodified 1476.7361 0.73612775 3580 Q8N3E9;K7EQF2;F5GXC1 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 123.23 123.23 2 0.00051875 127673 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.75 73.726 285260000 0 0 0 0 0 0 53550000 0 66100000 0 61915000 57098000 46592000 29202 3580 27467 268674;268675;268676;268677;268678 343274;343275;343276;343277;343278;343279 343279 6 LQEDKEQMAQQLAEETQGFQR Oxidation (M) 2522.1707 0.1707301 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 76.1 76.1 3 8.3449E-10 77309 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.41 100.16 520590000 42378000 0 89852000 0 62941000 0 0 48445000 73072000 34096000 73444000 96364000 0 29203 3117 27468 268679;268680;268681;268682;268683;268684;268685;268686;268687;268688 343280;343281;343282;343283;343284;343285;343286;343287;343288;343289 343289 2567 10 LQEDKEQMAQQLAEETQGFQR Unmodified 2506.1758 0.17581547 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 95.674 95.674 2;3 3.1104E-113 99103 QUIQUE_C1218_190116_001 213.03 205.41 4602700000 330260000 401830000 473420000 169640000 273770000 151550000 359150000 442370000 441610000 247430000 656320000 405240000 250160000 29204 3117 27468 268689;268690;268691;268692;268693;268694;268695;268696;268697;268698;268699;268700;268701;268702;268703;268704;268705;268706;268707;268708;268709 343290;343291;343292;343293;343294;343295;343296;343297;343298;343299;343300;343301;343302;343303;343304;343305;343306;343307;343308;343309;343310;343311;343312 343290 23 LQEDPNYSPQR Unmodified 1345.6262 0.62624295 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;H0Y710;H0Y4L1 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 1 29.794 29.794 2 0.0008645 23759 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.97 58.532 68416000 28471000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39945000 29205 7 27469 268710;268711;268712 343313;343314;343315 343315 2 LQEDYDMESVLR Unmodified 1496.6817 0.68170891 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 96.749 96.749 2 0.00016166 99280 QUIQUE_C1277_190116_001 103.34 65.997 175980000 0 48748000 0 45574000 0 33481000 0 48179000 0 0 0 0 0 29206 2564 27470 268713;268714;268715;268716;268717;268718;268719;268720;268721 343316;343317;343318;343319;343320;343321;343322;343323;343324;343325 343317 10 LQEEEGTPFTAIR Unmodified 1489.7413 0.7412727 875 E7EUK8;O94921 CDK14 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Unmodified 1190.535 0.5349851 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 1 1 1 15.468 15.468 2 9.2584E-05 7420 QUIQUE_C1368_190116_001 133.23 104.13 292010000 0 0 85498000 129230000 0 0 0 27054000 0 0 50225000 0 0 29218 725 27480 268787;268788;268789;268790 343394;343395;343396;343397 343394 4 LQEGQTLEFLVASVPK Unmodified 1757.9564 0.95635086 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 141.72 141.72 2;3 0.0022368 146377 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.01 62.835 283160000 0 0 0 0 27088000 0 0 0 141010000 10681000 104380000 0 0 29219 2665 27481 268791;268792;268793;268794 343398;343399;343400;343401;343402 343399 4 LQEGYDHSYYFIATFITDHIR Unmodified 2588.2336 0.23358835 2003 P10768;X6RA14 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 3 4 2 3 3 2 152.14 152.14 2;3;4 9.5482E-114 157142 QUIQUE_DMIX3_190116_001 189.15 179.94 7716400000 0 158110000 191310000 107620000 87125000 83182000 461180000 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peptide VGF[554-577] yes yes 0 0 0 1 1 157.11 157.11 3 0.00018397 162692 QUIQUE_C1218_190116_001 73.279 58.19 78594000 47872000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30722000 0 0 29244 1493 27506 268966;268967 343612;343613 343612 2 LQEQHLSSPQGVQLDIASQSLDQEILLK Unmodified 3116.6354 0.63535765 4062 Q9BXK5;E9PDD6;F2Z2C3;A0A087WW80;A0A0A0MR90 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.97 130.97 3 4.6477E-54 135466 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.23 133.42 536280000 52124000 55918000 0 0 62772000 39960000 0 64638000 73494000 0 64614000 65394000 57363000 29245 4062 27507 268968;268969;268970;268971;268972;268973;268974;268975;268976 343614;343615;343616;343617;343618;343619;343620;343621;343622;343623;343624;343625;343626;343627;343628 343621 14 LQEQLMGAVVMEKPNIR Unmodified 1955.0332 0.033237744 4507 Q9UN37 VPS4A Vacuolar protein sorting-associated protein 4A no no 0 0 1 1 1 89.547 89.547 3 0.0070798 92189 QUIQUE_C1576_190116_001 42.708 26.585 104340000 0 0 0 0 48060000 0 56280000 0 0 0 0 0 0 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29249 38 27511 268988;268989 343640;343641 343641 2 LQESGEVPVHK Unmodified 1221.6354 0.63535107 1456 O14910;H0YIA8;H0YI92;J3KN23 LIN7A Protein lin-7 homolog A yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 2 1 18.94 18.94 2;3 0.00043855 11460 QUIQUE_C1563_190116_001 103.7 48.024 2632100000 371370000 638150000 126870000 0 0 132580000 140570000 436950000 117660000 38711000 522200000 107070000 0 29250 1456 27512 268990;268991;268992;268993;268994;268995;268996;268997;268998;268999;269000;269001;269002 343642;343643;343644;343645;343646;343647;343648;343649;343650;343651;343652;343653;343654 343646 12 LQESTQTVQSLHGSSR Unmodified 1756.8704 0.8703894 4631 Q9Y5S2 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes yes 0 0 0 1 24.264 24.264 3 0.0028876 17654 QUIQUE_C1403_190116_001 51.495 41.424 39901000 0 0 0 39901000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29251 4631 27513 269003 343655 343655 1 LQESVMEASR Unmodified 1148.5496 0.54957253 1561 O60216 RAD21 Double-strand-break repair protein rad21 homolog yes yes 0 0 0 1 32.22 32.22 2 0.027452 26856 QUIQUE_C1277_190116_001 66.27 23.187 34831000 0 34831000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29252 1561 27514 269004 343656 343656 1 LQETLSAADR Unmodified 1102.5619 0.56185177 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 30.699 30.699 2 0.0020911 25599 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.867 20.366 51708000 0 0 0 0 0 0 0 0 51708000 0 0 0 0 29253 2813 27515 269005;269006 343657;343658 343657 2 LQETSNWLLSQQQADGSFQDLSPVIHR Unmodified 3096.5265 0.52647591 327 A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 132.64 132.64 3 3.3121E-92 135643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.97 158.63 395350000 0 0 0 0 135660000 0 0 85836000 0 37848000 0 136010000 0 29254 327 27516 269007;269008;269009;269010;269011;269012 343659;343660;343661;343662;343663;343664;343665 343662 7 LQEVECEEQR Unmodified 1318.5823 0.58232922 3015 Q13596;H0YK42 SNX1 Sorting nexin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.968 21.968 2 0.00022747 15203 QUIQUE_C1576_190116_001 118.18 99.111 641470000 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phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 1 0 1 1 1 97.383 97.383 3 0.00093109 99919 QUIQUE_C1277_190116_001 48.656 40.266 252060000 0 93101000 0 0 75891000 0 0 0 0 0 0 0 83062000 29262 2758;2789 27523 269098;269099;269100 343768;343769;343770 343768 2184 3 LQEYGSIFTGAQDPGLQR Unmodified 1978.9749 0.97485447 681 Q9NQA3;C4AMC7;Q6VEQ5;A8K0Z3 WASH6P;WASH3P;WASH2P;WASH1 WAS protein family homolog 6;Putative WAS protein family homolog 3;WAS protein family homolog 2;WAS protein family homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 104.07 104.07 2 3.6195E-05 106318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.53 98.328 91905000 0 0 0 27450000 0 0 0 34519000 0 0 29936000 0 0 29263 681 27524 269101;269102;269103 343771;343772;343773 343772 3 LQEYNIPGVIQSVIGWK Unmodified 1943.0516 0.051648225 1742 O95674 CDS2 Phosphatidate cytidylyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 164.15 164.15 2;3 0.00045882 166264 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.87 82.209 74300000 0 0 0 0 0 0 0 20690000 0 0 39884000 13727000 0 29264 1742 27525 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343912;343913;343914;343915;343916;343917;343918;343919;343920;343921;343922;343923;343924;343925;343926;343927;343928;343929;343930;343931;343932;343933;343934;343935;343936;343937;343938;343939;343940;343941;343942;343943;343944;343945;343946;343947;343948;343949;343950;343951;343952;343953;343954;343955;343956;343957;343958;343959;343960;343961;343962;343963;343964;343965;343966;343967;343968 343943 52 LQGAHLTSILSHEEQMFVNR Oxidation (M) 2325.1536 0.15356389 912 E9PF17;P13611 VCAN Versican core protein yes no 0 1 0 1 1 3 1 2 1 2 109.37 109.37 3;4 6.5262E-07 114090 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.622 76.693 886770000 0 51494000 66766000 0 0 0 0 200910000 98384000 0 247980000 83502000 137740000 29276 912 27536 269271;269272;269273;269274;269275;269276;269277;269278;269279;269280;269281 343969;343970;343971;343972;343973;343974;343975;343976;343977;343978;343979;343980;343981 343972 562 11 LQGASWDTQNGPQER Unmodified 1685.7758 0.77576073 3104 Q15049 MLC1 Membrane protein MLC1 yes yes 0 0 0 1 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124620000 0 80438000 178120000 198970000 348040000 29279 3787 27539 269295;269296;269297;269298;269299;269300;269301;269302;269303;269304;269305 343996;343997;343998;343999;344000;344001;344002;344003;344004;344005;344006 344005 8 LQGEFQLR Unmodified 989.52943 0.52942943 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;A0A2R8Y542 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 53.346 53.346 2 0.00026334 51121 QUIQUE_C1368_190116_001 160.91 67.652 886400000 0 0 147360000 106770000 0 0 0 134610000 126950000 67792000 156210000 146700000 0 29280 3053 27540 269306;269307;269308;269309;269310;269311;269312 344007;344008;344009;344010;344011;344012;344013;344014;344015;344016 344008 10 LQGEHQGSLIIHPR Unmodified 1583.8532 0.85322319 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 25.437 25.437 3;4 0.00013292 20019 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.043 28.196 340850000 0 72634000 0 0 0 133240000 0 99568000 0 0 35403000 0 0 29281 3060 27541 269313;269314;269315;269316;269317;269318 344017;344018;344019;344020;344021;344022;344023 344021 7 LQGEIAHVK Unmodified 993.56073 0.56072956 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 15.614 15.614 2 0.016007 7590 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.351 30.471 257660000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 257660000 0 0 0 + 29282 781;782 27542 269319 344024 344024 1 LQGEVVAFDYQSK Unmodified 1482.7355 0.73545904 1328 K7ELG9;Q3MHD2 LSM12 Protein LSM12 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.874 78.874 2 0.00074117 78697 QUIQUE_C1563_190116_001 84.605 67.579 461530000 65280000 62092000 54523000 48235000 46557000 48728000 43038000 0 0 0 46420000 0 46661000 29283 1328 27543 269320;269321;269322;269323;269324;269325;269326;269327;269328 344025;344026;344027;344028;344029;344030;344031;344032;344033 344030 9 LQGGVLLAQIR Unmodified 1166.7135 0.71354181 932 E9PHY0;P11117;B7Z7D2;E9PQY3;E9PP23 ACP2 Lysosomal acid phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.759 86.759 2 0.0012574 88539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.639 46.21 294160000 32895000 35154000 28538000 0 36830000 26518000 0 0 30361000 11287000 33370000 34554000 24654000 29284 932 27544 269329;269330;269331;269332;269333;269334;269335;269336;269337;269338 344034;344035;344036;344037;344038;344039;344040;344041;344042;344043 344039 9 LQGHQDQIFSLAWSPDGQQLATVCK Unmodified 2826.3759 0.37591226 204 A0A0A6YYL4;P57737 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 0 1 125.13 125.13 3 0.0043824 130292 QUIQUE_C1576_190116_001 28.41 26.002 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29285 204 27545 269339 344044 344044 1 LQGHVVLAQCR Unmodified 1279.6819 0.68192411 132 A0A0A0MQU4;Q96I15;H7C3V9;H7C277;H7C4A1 SCLY Selenocysteine lyase yes no 0 0 0 1 1 22.303 22.303 3 0.028938 15496 QUIQUE_C1218_190116_001 27.163 19.252 67603000 31952000 0 0 0 0 0 0 35651000 0 0 0 0 0 29286 132 27546 269340;269341 344045;344046 344045 2 LQGILADLR Unmodified 997.59203 0.59202969 993 F5GYK2;Q9NRL3;R4GN16 STRN4 Striatin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 90.051 90.051 2 0.0083391 92767 QUIQUE_C1576_190116_001 79.059 20.633 144800000 22720000 0 0 0 29953000 0 25266000 0 0 0 25192000 17086000 24582000 29287 993 27547 269342;269343;269344;269345;269346;269347;269348 344047;344048;344049;344050;344051;344052;344053 344049 6 LQGINCGPDFTPSFANLGR Unmodified 2062.9895 0.98945867 922 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;C9J6B6;C9J2Z7;C9K073 EIF4G1 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1 yes no 0 0 0 1 1 125.32 125.32 2 0.0070677 131576 QUIQUE_C1438_190116_001 74.29 53.827 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29288 922 27548 269349;269350 344054;344055 344054 2 LQGLEADCVR Unmodified 1159.5656 0.56555694 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 44.159 44.159 2 0.0015737 40438 QUIQUE_C1563_190116_001 108.98 64.53 335610000 0 55278000 0 57962000 0 62394000 68419000 42745000 0 0 0 0 48817000 29289 3803 27549 269351;269352;269353;269354;269355;269356;269357;269358 344056;344057;344058;344059;344060;344061;344062;344063 344059 7 LQGQLEQGDDTAAER Unmodified 1629.7594 0.75944196 1157 H0YGW7;Q8NE71 ABCF1 ATP-binding cassette sub-family F member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 32.254 32.254 2 1.2702E-05 26810 QUIQUE_C1277_190116_001 98.407 75.49 86165000 0 33365000 0 40841000 0 0 0 0 0 11959000 0 0 0 29290 1157 27550 269359;269360;269361 344064;344065;344066 344064 3 LQGQLLSIEHEVEAYK Unmodified 1855.968 0.96797818 4528;840 E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 110.89 110.89 2;3 4.3767E-09 115396 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.45 83.181 2239200000 176770000 263250000 195740000 114980000 212490000 139900000 189180000 120550000 153280000 51544000 296320000 168910000 156300000 29291 840;4528 27551 269362;269363;269364;269365;269366;269367;269368;269369;269370;269371;269372;269373;269374;269375;269376;269377;269378 344067;344068;344069;344070;344071;344072;344073;344074;344075;344076;344077;344078;344079;344080;344081;344082;344083;344084;344085;344086 344084 20 LQGSCTSCPSSIITLK Unmodified 1750.8594 0.8593557 4501 Q9UMS0;C9J8Q1;F8W9P7;H7C537 NFU1 NFU1 iron-sulfur cluster scaffold homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 75.389 75.389 2 1.8489E-05 76259 QUIQUE_C1218_190116_001 86.803 69.861 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29292 4501 27552 269379 344087 344087 1 LQGSGVTVNALHPGVAR Unmodified 1674.9166 0.91655173 3626 Q8NBN7 RDH13 Retinol dehydrogenase 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 48.742 48.742 3 0.0098332 45759 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.112 41.007 167930000 0 22765000 0 0 35513000 0 0 0 0 0 47020000 23570000 39066000 29293 3626 27553 269380;269381;269382;269383;269384 344088;344089;344090;344091;344092 344092 5 LQGTHYSVQSDIWSMGLSLVELAVGR Unmodified 2845.4433 0.44326355 2395 P36507;G5E9C7 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 0 1 173.06 173.06 3 7.6328E-18 180321 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344106;344107;344108;344109;344110;344111;344112;344113;344114;344115;344116;344117;344118;344119;344120;344121;344122;344123;344124;344125;344126;344127;344128;344129;344130;344131;344132;344133;344134;344135;344136;344137;344138;344139;344140;344141;344142;344143;344144;344145;344146;344147;344148;344149;344150;344151;344152;344153;344154;344155;344156;344157;344158;344159;344160;344161;344162;344163;344164;344165;344166;344167;344168;344169;344170;344171;344172;344173;344174;344175;344176;344177;344178;344179;344180;344181;344182;344183;344184;344185;344186;344187;344188;344189;344190;344191;344192;344193;344194;344195;344196;344197;344198;344199;344200;344201;344202;344203;344204;344205;344206;344207;344208;344209;344210;344211;344212;344213;344214;344215;344216;344217;344218;344219;344220;344221;344222;344223;344224;344225;344226;344227;344228;344229;344230;344231;344232;344233;344234 344192 128 LQHIQAPLSWELVR Unmodified 1688.9362 0.93622454 1159 H0YI09;Q9H8H3 METTL7A 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344261;344262;344263;344264;344265;344266;344267;344268;344269;344270;344271;344272;344273;344274 344264 14 LQHLENELTHDIITK Unmodified 1802.9527 0.95266246 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 2 3 3 3 3 3 2 2 2 3 3 2 2 66.217 66.217 2;3;4 3.4587E-36 65281 QUIQUE_C1368_190116_001 199.41 167.09 16116000000 774770000 1607100000 1954300000 839380000 3690400000 1089100000 411580000 384540000 449660000 1075800000 1771700000 261720000 1805900000 29302 4;1799 27561 269474;269475;269476;269477;269478;269479;269480;269481;269482;269483;269484;269485;269486;269487;269488;269489;269490;269491;269492;269493;269494;269495;269496;269497;269498;269499;269500;269501;269502;269503;269504;269505;269506 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LQHPLGVTWDK Unmodified 1292.6877 0.68772099 3623 Q8NBF2 NHLRC2 NHL repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 1 50.115 50.115 2;3 0.00070344 47078 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.64 54.852 565660000 0 0 101010000 0 0 57039000 0 59665000 82690000 38904000 103600000 86935000 35825000 29304 3623 27563 269528;269529;269530;269531;269532;269533;269534;269535;269536;269537;269538;269539;269540;269541;269542 344340;344341;344342;344343;344344;344345;344346;344347;344348;344349;344350;344351;344352;344353;344354 344348 15 LQHQLMSTEDALR Unmodified 1540.7668 0.76677595 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 47.761 47.761 2 0.0033717 45275 QUIQUE_C1218_190116_001 98.353 72.695 42790000 23754000 0 0 0 0 19037000 0 0 0 0 0 0 0 29305 4414 27564 269543;269544;269545;269546 344355;344356;344357;344358 344355 3 LQHSTSILR Unmodified 1053.5931 0.59309232 60 A0A2R8Y7T6;A0A087WWK8;A0A3B3IRZ4;Q6DN90;A0A2R8Y695 IQSEC1 IQ motif and SEC7 domain-containing 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Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 60.609 60.609 2;3 1.1011E-248 59054 QUIQUE_C1368_190116_001 286.09 249.24 47723000000 3196300000 4244300000 3662000000 3127100000 4181600000 3406500000 3422100000 3048200000 3965200000 3581100000 3864800000 3718700000 4304600000 29311 267;275;3025 27570 269576;269577;269578;269579;269580;269581;269582;269583;269584;269585;269586;269587;269588;269589;269590;269591;269592;269593;269594;269595;269596;269597;269598;269599;269600;269601 344389;344390;344391;344392;344393;344394;344395;344396;344397;344398;344399;344400;344401;344402;344403;344404;344405;344406;344407;344408;344409;344410;344411;344412;344413;344414;344415;344416;344417;344418;344419;344420;344421;344422;344423;344424;344425;344426;344427;344428;344429;344430 344397 42 LQICTQHHTEAIGK Unmodified 1634.8199 0.81987415 4061 Q9BXB4 OSBPL11 Oxysterol-binding protein-related protein 11 yes yes 0 0 0 1 20.488 20.488 4 0.027281 13511 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27138 QUIQUE_C1277_190116_001 186.46 123.18 1698100000 193460000 129170000 215570000 143600000 89667000 126390000 163920000 89851000 82082000 36831000 119810000 141100000 166660000 29316 1568 27575 269637;269638;269639;269640;269641;269642;269643;269644;269645;269646;269647;269648;269649;269650;269651;269652;269653;269654;269655;269656;269657;269658;269659;269660 344474;344475;344476;344477;344478;344479;344480;344481;344482;344483;344484;344485;344486;344487;344488;344489;344490;344491;344492;344493;344494;344495;344496;344497;344498;344499;344500;344501;344502;344503 344479 30 LQIIPTLCHLLR Unmodified 1475.8646 0.8646395 1573 O60443 DFNA5 Non-syndromic hearing impairment protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.48 122.48 3 0.00015136 127553 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.767 94.767 677680000 172130000 94671000 61203000 0 0 0 76626000 49464000 66959000 15274000 52488000 0 88865000 29317 1573 27576 269661;269662;269663;269664;269665;269666;269667;269668;269669;269670 344504;344505;344506;344507;344508;344509;344510;344511;344512;344513;344514;344515 344512 10 LQILELR Unmodified 883.5491 0.54910224 3936 Q96RT1;B4DIP2 ERBB2IP Protein LAP2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 83.685 83.685 2 0.024222 84972 QUIQUE_C1368_190116_001 98.503 32.365 185630000 0 19323000 48537000 29770000 0 34049000 0 0 0 14094000 39859000 0 0 29318 3936 27577 269671;269672;269673;269674;269675;269676 344516;344517;344518;344519;344520;344521;344522 344518 7 LQILHIHTAR Unmodified 1200.7091 0.70912513 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 30.683 30.683 2;3 0.0014678 25021 QUIQUE_C1403_190116_001 69.979 45.636 9444300000 912730000 1038400000 733960000 908920000 510640000 715620000 1160800000 460290000 652610000 375280000 644620000 662420000 667980000 29319 1245 27578 269677;269678;269679;269680;269681;269682;269683;269684;269685;269686;269687;269688;269689;269690;269691;269692;269693;269694;269695;269696;269697;269698;269699;269700;269701 344523;344524;344525;344526;344527;344528;344529;344530;344531;344532;344533;344534;344535;344536;344537;344538;344539;344540;344541;344542;344543;344544;344545;344546;344547;344548;344549;344550;344551 344532 27 LQILNLGAK Unmodified 968.60187 0.6018661 1386 O00203 AP3B1 AP-3 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 79.444 79.444 2 0.034838 80142 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.098 21.279 46733000 0 0 0 0 0 21771000 0 24962000 0 0 0 0 0 29320 1386 27579 269702;269703 344552;344553 344553 1 LQILNSIFPGIGCPVPR Unmodified 1880.0342 0.034224022 4322 Q9NX47 MARCH5 E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5 yes yes 0 0 0 1 150.39 150.39 2 0.0075624 154220 QUIQUE_C1403_190116_001 63.727 41.529 9738000 0 0 0 9738000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29321 4322 27580 269704 344554 344554 1 LQILSLR Unmodified 841.53854 0.53853756 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.661 78.661 2 6.0041E-05 78465 QUIQUE_C1563_190116_001 174.64 57.079 1051000000 0 0 125210000 95509000 90251000 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0.55530983 947 E9PJP2;Q5TF21;H3BRB8 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.073 48.073 2 0.015814 44600 QUIQUE_C1563_190116_001 66.621 5.6601 185310000 39966000 0 0 34959000 0 27730000 0 0 0 19169000 34121000 29360000 0 29325 947 27584 269720;269721;269722;269723;269724;269725;269726 344570;344571;344572;344573;344574;344575;344576 344573 5 LQINQSIIFCNSSQR Unmodified 1806.9047 0.90466641 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 98.047 98.047 2 1.4261E-08 100379 QUIQUE_C1403_190116_001 146.07 129.13 229830000 0 106860000 0 39408000 0 40128000 0 0 0 0 0 43435000 0 29326 2249 27585 269727;269728;269729;269730;269731;269732 344577;344578;344579;344580;344581;344582 344579 5 LQIQCVVEDDK Unmodified 1345.6548 0.65476588 979;2291;2229 E9PRY8;H0YE72;H0YE58;P29692;E9PQZ1;E9PK01;P24534 EEF1D;EEF1B2 Elongation factor 1-delta;Elongation factor 1-beta no no 0 0 0 1 1 1 66.592 66.592 2 0.00017618 65803 QUIQUE_C1403_190116_001 147.2 111.9 343840000 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344617;344618;344619;344620;344621;344622;344623;344624;344625;344626;344627;344628;344629;344630 344622 12 LQKEEEIEFLYNENTVR Unmodified 2153.0641 0.064063405 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 1 92.711 92.711 3 6.2799E-05 96314 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.506 58.968 190720000 0 0 0 0 0 0 39330000 0 0 0 51987000 41186000 58221000 29332 2441 27591 269775;269776;269777;269778 344631;344632;344633;344634;344635 344633 5 LQLDSPEDAEFIVAK Unmodified 1673.8512 0.85121708 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.59 112.59 2 9.4901E-06 117482 QUIQUE_C1218_190116_001 120.57 82.877 756310000 85149000 80093000 66694000 70745000 54412000 67936000 0 0 80893000 0 108850000 76844000 64687000 29333 1516 27592 269779;269780;269781;269782;269783;269784;269785;269786;269787;269788;269789 344636;344637;344638;344639;344640;344641;344642;344643;344644;344645;344646 344636 10 LQLEACETR Unmodified 1118.539 0.53900784 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 34.896 34.896 2 0.00164 29969 QUIQUE_C1368_190116_001 101.64 65.763 471160000 0 0 471160000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29334 3117 27593 269790 344647 344647 1 LQLEATER Unmodified 958.50836 0.50835964 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.127 30.127 2 2.9313E-15 24660 QUIQUE_DMIX7_190116_001 194.27 59.61 5965400000 369510000 401390000 460110000 177120000 375230000 163940000 370340000 702790000 819570000 316350000 767510000 647000000 394550000 29335 3117 27594 269791;269792;269793;269794;269795;269796;269797;269798;269799;269800;269801;269802;269803 344648;344649;344650;344651;344652;344653;344654;344655;344656;344657;344658;344659;344660;344661 344659 10 LQLEETDHQK Unmodified 1239.6095 0.60953025 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 18.027 18.027 2;3 2.6091E-11 10356 QUIQUE_C1403_190116_001 159.28 110.71 10925000000 948180000 830510000 880080000 285870000 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344920 2662 2 LQLLTGEHRPEDEEELEK Unmodified 2164.0648 0.064791686 3005 Q13505;A0A0C4DFQ1 MTX1 Metaxin-1 yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 1 57.888 57.888 3;4 0.00019473 56265 QUIQUE_C1403_190116_001 80.316 63.437 519960000 0 84788000 0 91717000 61659000 230050000 0 0 25585000 26158000 0 0 0 29364 3005 27622 270028;270029;270030;270031;270032;270033;270034;270035 344922;344923;344924;344925;344926;344927;344928;344929 344923 7 LQLLTGEHRPEDEEELEKELYR Unmodified 2725.3559 0.35588833 3005 Q13505;A0A0C4DFQ1 MTX1 Metaxin-1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 2 1 92.075 92.075 4;5 6.0518E-06 93800 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.535 56.219 582320000 0 67145000 0 0 56643000 0 0 76554000 127860000 0 166920000 87199000 0 29365 3005 27623 270036;270037;270038;270039;270040;270041;270042;270043 344930;344931;344932;344933;344934;344935;344936;344937;344938 344932 9 LQLNGNLQLELAQVLAQERPK Unmodified 2374.3332 0.33324281 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 141.41 141.41 3 5.6624E-10 144798 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.45 99.364 175260000 0 0 0 0 0 0 0 49970000 48939000 0 36647000 0 39704000 29366 2524 27624 270044;270045;270046;270047 344939;344940;344941;344942 344939 4 LQLNIVEMK Unmodified 1086.6107 0.61071622 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 88.158 88.158 1;2 3.3509E-13 91200 QUIQUE_C1438_190116_001 184.38 96.349 5412500000 820390000 505940000 584920000 556530000 331560000 572670000 410060000 146300000 243250000 342320000 426070000 238670000 233830000 29367 1684 27625 270048;270049;270050;270051;270052;270053;270054;270055;270056;270057;270058;270059;270060;270061 344943;344944;344945;344946;344947;344948;344949;344950;344951;344952;344953;344954;344955;344956;344957;344958;344959;344960;344961;344962;344963;344964;344965;344966 344950 23 LQLNIVEMK Oxidation (M) 1102.6056 0.60563084 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 65.053 65.053 2 0.013199 64266 QUIQUE_C1403_190116_001 73.157 51.411 874780000 0 0 121890000 361470000 0 112900000 90259000 39366000 60835000 88057000 0 0 0 29368 1684 27625 270062;270063;270064;270065;270066;270067;270068;270069 344967;344968;344969;344970;344971;344972;344973;344974 344969 924 7 LQLNIVEMKDENATLDGGDVLFTGR Unmodified 2747.38 0.37999459 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 5 4 2 2 6 2 138.71 138.71 2;3 0 142833 QUIQUE_C1438_190116_001 294.22 276.68 28378000000 1117700000 1305700000 1861700000 1921800000 1536600000 1119300000 1931900000 4164900000 4078400000 772060000 2929500000 2760000000 2878900000 29369 1684 27626 270070;270071;270072;270073;270074;270075;270076;270077;270078;270079;270080;270081;270082;270083;270084;270085;270086;270087;270088;270089;270090;270091;270092;270093;270094;270095;270096;270097;270098;270099;270100;270101;270102 344975;344976;344977;344978;344979;344980;344981;344982;344983;344984;344985;344986;344987;344988;344989;344990;344991;344992;344993;344994;344995;344996;344997;344998;344999;345000;345001;345002;345003;345004;345005;345006;345007;345008;345009;345010;345011;345012;345013;345014;345015;345016;345017;345018;345019;345020;345021 344988 44 LQLNIVEMKDENATLDGGDVLFTGR Oxidation (M) 2763.3749 0.37490921 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 1 1 1 125.78 125.78 3 2.1609E-05 132128 QUIQUE_C1438_190116_001 68.445 61.796 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29370 1684 27626 270103;270104 345022;345023 345022 924 2 LQLPGAAQR Unmodified 952.54541 0.54541385 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.606 41.606 2 0.00044606 38873 QUIQUE_C1218_190116_001 117.93 55.217 2212400000 195500000 232940000 186200000 238560000 197710000 267890000 192200000 109920000 215650000 79774000 155400000 140610000 0 29371 1688 27627 270105;270106;270107;270108;270109;270110;270111;270112;270113;270114;270115;270116 345024;345025;345026;345027;345028;345029;345030;345031;345032;345033;345034;345035;345036 345024 12 LQLPNMK Unmodified 842.46841 0.46840908 3800 Q96AC1;H0YJ34;G3V281;G3V5R2 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 0 1 53.862 53.862 2 0.060613 52426 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.234 46.611 32699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32699000 0 0 29372 3800 27628 270117 345037 345037 1 LQLPVWEYK Unmodified 1174.6386 0.63864553 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 1 107.61 107.61 2 0.014831 111475 QUIQUE_C1368_190116_001 67.993 18.667 194120000 0 0 70616000 0 0 0 52728000 0 0 0 70773000 0 0 29373 1506 27629 270118;270119;270120 345038;345039;345040 345038 2 LQLPVWEYKDR Unmodified 1445.7667 0.76669959 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 86.224 86.224 3 8.6935E-05 87793 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.7 78.157 175200000 0 0 0 0 0 0 0 52577000 40736000 0 0 45136000 36755000 29374 1506 27630 270121;270122;270123;270124 345041;345042;345043;345044;345045 345041 5 LQLQAEER Unmodified 985.51926 0.51925868 37 A0A0A0MQV6;A0A087WUF6;P09038 FGF2 Fibroblast growth factor;Fibroblast growth factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 27.089 27.089 2 0.013835 21109 QUIQUE_C1438_190116_001 86.794 7.3253 235190000000 0 0 0 0 51637000000 0 0 0 0 0 59520000000 56948000000 67083000000 29375 37 27631 270125;270126;270127;270128 345046;345047;345048;345049 345046 4 LQLQLEEAAAQNQR Unmodified 1610.8376 0.8376327 3265 Q59EK9 RUNDC3A 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345065;345066;345067;345068;345069;345070;345071;345072;345073;345074;345075;345076;345077 345075 13 LQLTLYQYK Unmodified 1168.6492 0.64921022 4184 Q9H7Z7 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes yes 0 0 0 1 1 89.431 89.431 2 0.015582 91289 QUIQUE_C1576_190116_001 103.83 41.287 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29382 4184 27638 270156;270157 345078;345079 345078 2 LQLTTER Unmodified 859.47633 0.47633123 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 25.986 25.986 2 0.041681 20460 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.784 22.143 114380000 0 42183000 0 40699000 0 0 0 31495000 0 0 0 0 0 29383 3779 27639 270158;270159;270160 345080;345081;345082 345082 3 LQLVEAECK Unmodified 1088.5536 0.55359527 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 41.689 41.689 2 0.034243 38095 QUIQUE_C1403_190116_001 55.112 32.875 31411000 0 0 0 31411000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29384 4596 27640 270161 345083 345083 1 LQLVEAGLVECLLEIVQQK Unmodified 2181.2079 0.20789087 2605 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31884000 137260000 127930000 160700000 29402 4280 27656 270300;270301;270302;270303;270304;270305;270306;270307;270308;270309;270310;270311;270312;270313 345253;345254;345255;345256;345257;345258;345259;345260;345261;345262;345263;345264;345265;345266 345254 14 LQMEQQQQLQQR Oxidation (M) 1572.7678 0.76783858 4280 Q9NS69 TOMM22 Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 20.338 20.338 2 2.1343E-37 13003 QUIQUE_DMIX5_190116_001 191.45 153.97 380960000 0 0 26529000 32162000 26682000 24608000 0 30099000 28007000 27792000 77006000 30773000 77302000 29403 4280 27656 270314;270315;270316;270317;270318;270319;270320;270321;270322;270323;270324;270325;270326 345267;345268;345269;345270;345271;345272;345273;345274;345275;345276;345277;345278;345279 345275 2897 8 LQMLIIDNFIPR Unmodified 1471.8221 0.82210598 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.53 152.53 2 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345342;345343;345344;345345;345346;345347;345348;345349;345350;345351;345352;345353;345354;345355 345353 11 LQNEVESVTGMLNEAEGK Unmodified 1946.9255 0.92552101 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 2 1 122.04 122.04 2;3 2.633E-23 126004 QUIQUE_C1277_190116_001 143.64 127.5 235120000 0 164060000 0 0 71061000 0 0 0 0 0 0 0 0 29411 2385 27664 270393;270394;270395 345356;345357;345358;345359 345357 4 LQNFSYDQR Unmodified 1169.5465 0.54653606 4295 Q9NTZ6 RBM12 RNA-binding protein 12 yes yes 0 0 0 1 44.306 44.306 2 0.019526 41006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.139 78.584 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29412 4295 27665 270396 345360 345360 1 LQNIFLGLVNIIEEK Unmodified 1741.9978 0.99782174 871 E7ET15;O15042 U2SURP U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 169.58 169.58 2;3 1.3373E-12 175693 QUIQUE_C1438_190116_001 132.59 110.05 259810000 24071000 18756000 42284000 7704200 37618000 0 16169000 17780000 0 4790200 34825000 55810000 0 29413 871 27666 270397;270398;270399;270400;270401;270402;270403;270404;270405;270406;270407;270408;270409 345361;345362;345363;345364;345365;345366;345367;345368;345369;345370;345371;345372;345373 345365 13 LQNLDALTNLTVLSMQSNR Unmodified 2130.1103 0.11030209 3140 Q15435;H7C003;C9JD73;B5MBZ8;C9J177 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 3 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 143.73 143.73 2;3 1.1614E-73 149708 QUIQUE_C1218_190116_001 191.78 170.22 2012200000 289960000 0 0 78302000 122310000 69847000 286610000 185540000 199240000 0 267780000 251730000 260900000 29414 3140 27667 270410;270411;270412;270413;270414;270415;270416;270417;270418;270419;270420;270421;270422;270423;270424;270425;270426;270427 345374;345375;345376;345377;345378;345379;345380;345381;345382;345383;345384;345385;345386;345387;345388;345389;345390;345391;345392;345393;345394 345375 19 LQNLDALTNLTVLSMQSNR Oxidation (M) 2146.1052 0.10521671 3140 Q15435;H7C003;C9JD73;B5MBZ8;C9J177 PPP1R7 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7 yes no 0 1 0 1 3 133.11 133.11 2;3 2.5601E-13 129287 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.96 106.06 59546000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59546000 0 0 0 29415 3140 27667 270428;270429;270430;270431 345395;345396;345397;345398;345399 345398 2598 3 LQNLQLQPGNAK Unmodified 1322.7306 0.73064844 2196 P22307 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.836 43.836 2 0.00040066 40797 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.79 99.457 1880100000 149810000 141290000 210010000 78395000 184640000 129900000 133810000 75922000 131630000 39465000 237480000 179920000 187860000 29416 2196 27668 270432;270433;270434;270435;270436;270437;270438;270439;270440;270441;270442;270443;270444 345400;345401;345402;345403;345404;345405;345406;345407;345408;345409;345410;345411;345412 345410 8 LQNLQLQPGNAKL Unmodified 1435.8147 0.81471242 2196 P22307 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes yes 0 0 1 1 76.247 76.247 2 0.0010825 76002 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.62 83.351 34265000 0 0 0 0 0 0 0 34265000 0 0 0 0 0 29417 2196 27669 270445 345413 345413 1 LQNNNVYTIAK Unmodified 1276.6776 0.67755023 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.42 39.42 2 0.00037933 35626 QUIQUE_C1438_190116_001 117.01 75.138 9684700000 752080000 834780000 757890000 694330000 822540000 579310000 827470000 653320000 659580000 321400000 1006200000 870320000 905520000 29418 2777 27670 270446;270447;270448;270449;270450;270451;270452;270453;270454;270455;270456;270457;270458 345414;345415;345416;345417;345418;345419;345420;345421;345422;345423;345424;345425;345426;345427;345428 345420 15 LQNPAITGPAVPYSR Unmodified 1582.8467 0.84674083 361 K7ERN1;A0A1B0GVY1;Q96PU5 NEDD4L E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like yes no 0 0 0 1 1 75.031 75.031 2 0.00076189 75503 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.695 61.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29419 361 27671 270459;270460 345429;345430 345430 2 LQNPDLDSEALLALPLPQLVQK Unmodified 2414.3421 0.34207617 1415 O00519 FAAH Fatty-acid amide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.71 159.71 3 0.00023925 162173 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.089 45.356 144710000 0 18987000 18541000 15545000 0 0 0 20550000 27515000 6558200 0 0 37017000 29420 1415 27672 270461;270462;270463;270464;270465;270466;270467 345431;345432;345433;345434;345435;345436;345437;345438;345439 345434 9 LQNQLQGAIVIERPNVK Unmodified 1919.0952 0.095244374 1625 O75351 VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.365 71.365 3 0.00024174 71466 QUIQUE_C1277_190116_001 60.093 49.896 401740000 70578000 61550000 54340000 54762000 54466000 42369000 45688000 0 0 17989000 0 0 0 29421 1625 27673 270468;270469;270470;270471;270472;270473;270474;270475;270476 345440;345441;345442;345443;345444;345445;345446;345447;345448;345449 345441 10 LQNSTLMAEFSK Unmodified 1367.6755 0.67550132 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WZF5;A0A087WW92;A0A087WWF2 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 82.9 82.9 2 0.025499 84772 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345458;345459;345460;345461;345462;345463;345464;345465;345466;345467;345468;345469;345470;345471;345472;345473;345474;345475;345476;345477;345478;345479 345472 22 LQNVQIALDFLK Unmodified 1400.8028 0.80275075 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PLY5;E9PS75 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 135.45 135.45 2 0.0037628 142275 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.827 61.665 183210000 0 0 39895000 0 18474000 0 32844000 0 40228000 0 51765000 0 0 29425 1187 27677 270497;270498;270499;270500;270501;270502 345480;345481;345482;345483;345484;345485 345484 2 LQNVQIALDYLR Unmodified 1444.8038 0.80381338 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1;E9PKG0;E9PQ28 PLEC Plectin no no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 120.17 120.17 2;3 3.6435E-37 125646 QUIQUE_C1438_190116_001 186.78 149.31 8034500000 581630000 554700000 478820000 285240000 634980000 379010000 554200000 808960000 1092600000 361400000 989470000 877560000 435870000 29426 3117 27678 270503;270504;270505;270506;270507;270508;270509;270510;270511;270512;270513;270514;270515;270516;270517;270518;270519;270520;270521;270522;270523;270524;270525 345486;345487;345488;345489;345490;345491;345492;345493;345494;345495;345496;345497;345498;345499;345500;345501;345502;345503;345504;345505;345506;345507;345508;345509;345510;345511;345512;345513;345514 345497 29 LQNWAHEKDPQVK Unmodified 1591.8107 0.81068967 65;4141 A0A087WXL6;B7Z879;A0A0G2JS92;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 0 0 1 1 20.321 20.321 4 0.05269 13332 QUIQUE_C1368_190116_001 24.275 11.157 44319000 0 0 44319000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29427 65;4141 27679 270526 345515 345515 1 LQPFHSTELEDDAIYSVHVPAGLYR Unmodified 2856.4083 0.40825825 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QQI0 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 123.55 123.55 3;4 0.0022237 128364 QUIQUE_DMIX8_190116_001 35.32 32.222 73400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 73400000 29428 245 27680 270527;270528;270529 345516;345517;345518 345518 3 LQPFNSSEDSTNLVPLVVESSKPPEVDAPDK Unmodified 3337.6565 0.65654661 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 1 1 1 130.23 130.23 3 6.7359E-13 134300 QUIQUE_C1277_190116_001 66.294 56.236 62544000 0 32750000 0 0 0 0 0 29794000 0 0 0 0 0 29429 4668 27681 270530;270531 345519;345520 345519 2 LQPHEFQGGTFTISNLGMFGIK Unmodified 2421.2151 0.21510151 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 137.41 137.41 3 9.5437E-06 142199 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.454 57.832 1830600000 0 227620000 0 0 190180000 205860000 0 0 266820000 61801000 346630000 277420000 254300000 29430 1997 27682 270532;270533;270534;270535;270536;270537;270538;270539;270540;270541 345521;345522;345523;345524;345525;345526;345527;345528;345529;345530 345526 9 LQPPLSQYSVQALR Unmodified 1598.878 0.87804096 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 97.67 97.67 2 0.0010588 101440 QUIQUE_C1438_190116_001 78.908 43.494 230100000 64652000 0 46159000 0 33546000 35066000 50674000 0 0 0 0 0 0 29431 3753 27683 270542;270543;270544;270545;270546 345531;345532;345533;345534;345535 345533 3 LQPPLSQYSVQALRPGSR Unmodified 1996.0854 0.085407969 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 85.186 85.186 2;3 2.7085E-07 87404 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.428 70.148 6633600000 201980000 356800000 284180000 137870000 372270000 153530000 382970000 1041800000 841650000 222790000 913750000 998470000 725580000 29432 3753 27684 270547;270548;270549;270550;270551;270552;270553;270554;270555;270556;270557;270558;270559;270560;270561;270562;270563 345536;345537;345538;345539;345540;345541;345542;345543;345544;345545;345546;345547;345548;345549;345550;345551;345552;345553;345554;345555;345556;345557;345558;345559;345560;345561;345562;345563;345564;345565;345566;345567;345568 345562 33 LQPPSGTELPAFNPIVHPSAITQVLLLANPQK Unmodified 3389.8711 0.87111167 4465 Q9UJY5 GGA1 ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 158.85 158.85 3;4 7.4606E-07 163920 QUIQUE_C1368_190116_001 54.311 48.613 720120000 75475000 69775000 115920000 75206000 61157000 44512000 53004000 0 55742000 0 68514000 44295000 56512000 29433 4465 27685 270564;270565;270566;270567;270568;270569;270570;270571;270572;270573;270574;270575;270576 345569;345570;345571;345572;345573;345574;345575;345576;345577;345578;345579;345580;345581;345582;345583;345584;345585;345586 345573 17 LQPPSGTELSPFSPIQPPAAITQVMLLANPLK Unmodified 3354.8261 0.82613531 4339 Q9NZ52;J3KSS7;J3KTR5;J3QS87 GGA3 ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3 yes no 0 0 0 1 1 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no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 53.772 53.772 3;4 0.00067953 51868 QUIQUE_C1277_190116_001 65.225 59.063 349250000 88883000 30181000 64474000 46157000 0 0 0 0 0 15635000 0 47788000 56134000 29436 4643 27688 270596;270597;270598;270599;270600;270601;270602;270603;270604;270605 345607;345608;345609;345610;345611;345612;345613;345614;345615;345616;345617 345610 11 LQPVLQPLPSPGVGGK Unmodified 1585.9192 0.91917749 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.113 89.113 2 2.6058E-05 92092 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.56 114.67 2009400000 167340000 0 162270000 272900000 352720000 253560000 172760000 129530000 168930000 108240000 221170000 0 0 29437 2037 27689 270606;270607;270608;270609;270610;270611;270612;270613;270614;270615 345618;345619;345620;345621;345622;345623;345624;345625;345626;345627;345628 345628 7 LQPYNGVALRPWDGNSDDR Unmodified 2172.0348 0.034828962 3231 Q3ZCQ8;M0R0C3;M0R2F8;M0R003;M0R1Y4 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 1 1 1 1 86.7 86.7 3 0.0023866 89648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.288 44.758 204720000 0 0 0 0 0 0 56911000 0 68374000 0 79435000 0 0 29438 3231 27690 270616;270617;270618 345629;345630;345631 345631 3 LQQAKDEILEWESR Unmodified 1743.8792 0.87916317 3015 Q13596;H0YK42 SNX1 Sorting nexin-1 yes no 0 0 1 1 1 78.23 78.23 3 0.014317 80346 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.771 27.079 83465000 0 0 0 0 0 0 0 0 39318000 0 44147000 0 0 29439 3015 27691 270619;270620 345632;345633 345633 2 LQQAQLYPIAIFIKPK Unmodified 1870.108 0.10804089 3279 Q5JUW8;Q92796 DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.42 122.42 3 1.974E-07 125748 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.707 88.469 884720000 51325000 95364000 61756000 60551000 54139000 44899000 64504000 78886000 80321000 24884000 112430000 66803000 88853000 29440 3279 27692 270621;270622;270623;270624;270625;270626;270627;270628;270629;270630;270631;270632;270633 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15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.053 75.053 2 7.4359E-109 75208 QUIQUE_DMIX1_190116_001 228.61 201.18 655280000 62180000 80601000 88964000 0 58631000 71893000 0 0 95486000 24942000 55657000 43903000 73024000 29444 4394 27696 270682;270683;270684;270685;270686;270687;270688;270689;270690;270691;270692 345701;345702;345703;345704;345705;345706;345707;345708;345709;345710;345711;345712;345713 345708 13 LQQELDDATMDLEQQR Unmodified 1931.8895 0.88946986 3459 Q7Z406;A0A0C4DFM8;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 93.659 93.659 2 1.1738E-20 95457 QUIQUE_C1403_190116_001 149.41 129.03 20414000 0 0 0 20414000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29445 3459 27697 270693 345714 345714 1 LQQELDDLLVDLDHQR Unmodified 1948.9854 0.98541915 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 133.65 133.65 2;3 1.0175E-18 139523 QUIQUE_C1218_190116_001 169.79 158.94 4579400000 409170000 348680000 509420000 618260000 492530000 0 449150000 396770000 457130000 115870000 416260000 313290000 52922000 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Unmodified 1911.9538 0.95378467 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 134.91 134.91 2 3.7117E-95 139232 QUIQUE_C1277_190116_001 220.9 181.75 236290000 0 89242000 46131000 27881000 0 0 27870000 0 0 0 0 45165000 0 29448 2385 27700 270732;270733;270734;270735;270736 345762;345763;345764;345765;345766;345767 345762 6 LQQELEAANQSLAELR Unmodified 1811.9377 0.93774068 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 103.46 103.46 2 0.012205 106473 QUIQUE_C1277_190116_001 63.181 46.549 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29449 3241 27701 270737 345768 345768 1 LQQELEFLEVQEEYIKDEQK Unmodified 2537.2537 0.25371467 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.9 130.9 3 7.0326E-07 133666 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.429 81.557 2031600000 165950000 173750000 198330000 161810000 204880000 151410000 162640000 191130000 167600000 68390000 0 209140000 176600000 29450 2466 27702 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270774;270775;270776;270777;270778;270779;270780;270781;270782;270783;270784;270785 345807;345808;345809;345810;345811;345812;345813;345814;345815;345816;345817;345818 345817 292 11 LQQGYNAMGFSQGGQFLR Unmodified 2000.9527 0.95267924 406 A0A2C9F2P4;A0A286YFF7;P50897;Q5T0S4;A0A286YFE3;A0A286YFL8;E9PK48 PPT1 Palmitoyl-protein thioesterase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 106.46 106.46 2;3 6.1459E-122 109425 QUIQUE_DMIX8_190116_001 225.97 194.9 2919300000 152310000 260240000 229720000 198380000 207910000 143390000 197040000 167290000 235580000 54504000 332860000 440650000 299410000 29459 406 27710 270786;270787;270788;270789;270790;270791;270792;270793;270794;270795;270796;270797;270798;270799;270800;270801 345819;345820;345821;345822;345823;345824;345825;345826;345827;345828;345829;345830;345831;345832;345833;345834;345835;345836 345835 18 LQQHIQELEAHLEAEEGAR Unmodified 2200.0873 0.087258463 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 77.431 77.431 3 0.00031024 78438 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345952;345953;345954;345955;345956;345957;345958;345959;345960;345961;345962;345963;345964;345965;345966;345967;345968;345969;345970;345971;345972;345973;345974;345975;345976;345977;345978;345979;345980;345981;345982;345983;345984;345985;345986;345987;345988;345989;345990;345991;345992;345993;345994;345995;345996;345997;345998;345999;346000;346001;346002;346003;346004;346005 345961 54 LQQTQNQVDEVVDIMR Unmodified 1914.9469 0.94692516 3165 Q15836 VAMP3 Vesicle-associated membrane protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 109.17 109.17 2;3 4.9319E-116 113933 QUIQUE_C1218_190116_001 257.52 217.89 915230000 64037000 63303000 42638000 64916000 45231000 58572000 53444000 95814000 166240000 18167000 97011000 60848000 85013000 29480 3165 27729 270937;270938;270939;270940;270941;270942;270943;270944;270945;270946;270947;270948;270949;270950 346006;346007;346008;346009;346010;346011;346012;346013;346014;346015;346016;346017;346018;346019;346020 346006 14 LQQTQSLHSLR Unmodified 1309.7102 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LQSIGTENTEENR Unmodified 1489.7009 0.70086445 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.39 27.39 2 4.8594E-41 21329 QUIQUE_C1368_190116_001 188.28 165.63 13924000000 1695000000 1710700000 1313500000 1211000000 1092100000 1355200000 1287900000 570010000 611410000 922380000 785170000 683690000 686080000 29495 1851 27743 271066;271067;271068;271069;271070;271071;271072;271073;271074;271075;271076;271077;271078;271079 346146;346147;346148;346149;346150;346151;346152;346153;346154;346155;346156;346157;346158;346159;346160;346161;346162;346163;346164 346150 19 LQSIGTENTEENRR Unmodified 1645.802 0.80197548 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 19.734 19.734 2;3 1.6989E-28 12197 QUIQUE_C1277_190116_001 168.3 155.69 43499000000 12243000000 20250000000 0 0 0 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346182 5 LQSLLAK Unmodified 771.48544 0.48543935 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.892 32.892 2 0.00018824 27912 QUIQUE_DMIX7_190116_001 168.74 25.722 924700000 89907000 99165000 80124000 74990000 92174000 77538000 104600000 73663000 0 40171000 106550000 85830000 0 29499 4653 27747 271100;271101;271102;271103;271104;271105;271106;271107;271108;271109;271110 346187;346188;346189;346190;346191;346192;346193;346194;346195;346196;346197;346198 346198 7 LQSLNLTGNCLDSFPAELFRPGALPLLSELAAADNCLR Unmodified 4156.1085 0.10853454 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 1 1 1 171.56 171.56 3 4.8203E-54 175525 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.41 93.061 105410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42464000 62943000 0 29500 3576 27748 271111;271112 346199;346200 346200 2 LQSLPFALTHLNLK Unmodified 1593.9243 0.92426287 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.65 115.65 3 0.00064057 119687 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.681 68.741 290460000 0 21063000 0 0 26092000 0 18658000 40901000 36640000 0 45610000 41864000 59632000 29501 289 27749 271113;271114;271115;271116;271117;271118;271119;271120 346201;346202;346203;346204;346205;346206;346207;346208 346205 7 LQSNIQYITR Unmodified 1234.667 0.66698555 915 E9PFK9;Q9UJ41;Q3HKR1;A0A0A0MSJ3 RABGEF1 Rab5 GDP/GTP exchange factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 52.547 52.547 2 0.00020342 51009 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.28 105.08 272080000 0 0 0 0 39086000 0 54317000 0 0 0 62789000 72156000 43734000 29502 915 27750 271121;271122;271123;271124;271125 346209;346210;346211;346212;346213 346211 5 LQSPEFQSLFTEGLK Unmodified 1722.8829 0.88285156 3923 Q96Q11;C9JRS7;F8W8C3 TRNT1 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.94 132.94 2 6.0738E-06 137928 QUIQUE_C1368_190116_001 116.24 74.534 617240000 0 57565000 59136000 53032000 76503000 48964000 70707000 0 46863000 0 70019000 71202000 63249000 29503 3923 27751 271126;271127;271128;271129;271130;271131;271132;271133;271134;271135;271136 346214;346215;346216;346217;346218;346219;346220;346221;346222;346223;346224;346225 346215 12 LQSQDLGR Unmodified 915.47739 0.47739386 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 18.623 18.623 2 0.0039847 10915 QUIQUE_DMIX4_190116_001 110.81 38.787 143940000 0 0 0 0 0 0 0 98404000 0 45537000 0 0 0 29504 1472 27752 271137;271138 346226;346227 346227 1 LQSQLLSLEK Unmodified 1157.6656 0.66558856 2569;1337 P50570;K7EMQ3 DNM2 Dynamin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 66.372 66.372 2 1.7824E-05 65816 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.82 0 10834000000 1133400000 1082300000 822730000 788560000 912400000 787790000 1171800000 642020000 529240000 436120000 868130000 742430000 917460000 29505 2569;1337 27753 271139;271140;271141;271142;271143;271144;271145;271146;271147;271148;271149;271150;271151;271152 346228;346229;346230;346231;346232;346233;346234;346235;346236;346237;346238;346239;346240;346241;346242;346243;346244;346245 346237 17 LQSQLLSLEKEVEEYK Unmodified 1935.0201 0.020073325 2569;1337 P50570;K7EMQ3 DNM2 Dynamin-2 no no 0 0 1 1 2 1 2 1 118.78 118.78 2;3 8.7095E-18 124350 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.47 0 502890000 0 0 0 0 0 0 0 101270000 77975000 0 37977000 181820000 103830000 29506 2569;1337 27754 271153;271154;271155;271156;271157;271158;271159 346246;346247;346248;346249;346250;346251;346252;346253 346249 7 LQSQLQENEEFQK Unmodified 1619.7791 0.77911477 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.441 47.441 2 1.3651E-75 44893 QUIQUE_DMIX3_190116_001 215.83 175.98 273320000 0 0 39134000 0 0 0 34657000 0 32669000 21442000 65652000 51050000 28719000 29507 1187 27755 271160;271161;271162;271163;271164;271165;271166 346254;346255;346256;346257;346258;346259;346260 346256 7 LQSQMSGQQLVEQSHVVLSTLWEPHITQR Unmodified 3358.7092 0.70920807 2963 Q13057 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 135.83 135.83 4 5.015E-13 140647 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.213 65.257 654880000 0 0 120770000 0 77327000 0 97187000 0 121610000 0 0 128090000 109910000 29508 2963 27756 271167;271168;271169;271170;271171;271172 346261;346262;346263;346264;346265;346266;346267;346268;346269 346269 9 LQSQPTDTDGGR Unmodified 1273.5899 0.58985744 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.435 14.435 2 9.0021E-05 6732 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.73 95.561 150320000 0 0 31485000 26327000 31724000 0 0 0 0 11844000 16208000 10989000 21742000 29509 3277 27757 271173;271174;271175;271176;271177;271178;271179;271180 346270;346271;346272;346273;346274;346275;346276;346277 346275 7 LQSQVLQAMR Oxidation (M) 1188.6285 0.62849155 4029 Q9BU61 NDUFAF3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3 yes yes 0 1 0 1 1 29.179 29.179 2 0.026544 23773 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.859 41.319 61680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32783000 0 28897000 29510 4029 27758 271181;271182 346278;346279 346278 2 LQSQVLQAMR Unmodified 1172.6336 0.63357693 4029 Q9BU61 NDUFAF3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3 yes yes 0 0 0 1 1 54.928 54.928 2 0.0084486 53638 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.692 24.249 351520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 203580000 147940000 0 29511 4029 27758 271183;271184 346280;346281;346282 346281 3 LQSQYASSEATISQLR Unmodified 1780.8955 0.89554151 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.994 73.994 2 2.5468E-09 73924 QUIQUE_C1403_190116_001 146.79 114.94 552840000 47211000 44958000 0 69343000 41870000 135830000 39348000 35987000 32732000 21213000 46648000 37699000 0 29512 3108 27759 271185;271186;271187;271188;271189;271190;271191;271192;271193;271194;271195 346283;346284;346285;346286;346287;346288;346289;346290;346291;346292;346293 346285 11 LQSRPAAPPAPGPGQLTLR Unmodified 1926.0799 0.079928661 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 1 2 2 1 60.262 60.262 2;3 3.4479E-05 59590 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.896 67.334 865620000 0 0 0 0 0 0 0 407690000 267080000 0 0 190860000 0 29513 3958 27760 271196;271197;271198;271199;271200 346294;346295;346296;346297;346298;346299 346295 6 LQSSNIFTVAK Unmodified 1206.6608 0.66083754 2938 Q10567 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.611 65.611 2 3.5298E-05 66352 QUIQUE_C1218_190116_001 138.66 79.414 2146600000 174220000 173530000 158330000 168300000 208600000 123330000 163170000 153210000 125200000 70858000 230190000 179660000 217940000 29514 2938 27761 271201;271202;271203;271204;271205;271206;271207;271208;271209;271210;271211;271212;271213 346300;346301;346302;346303;346304;346305;346306;346307;346308;346309;346310;346311;346312;346313;346314;346315;346316;346317;346318 346300 19 LQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGR Unmodified 2145.9498 0.9497787 760;777 K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;K7EMJ2;K7EQH6;CON__P13646-1 KRT13 Keratin, type I cytoskeletal 13 no no 0 0 0 1 1 66.196 66.196 2 1.4774E-10 62162 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.47 111.57 22118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22118000 0 0 0 + 29515 760;777 27762 271214;271215 346319;346320 346320 2 LQSTFVFEEIGR Unmodified 1424.73 0.72997974 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 112.2 112.2 2 8.195E-05 116999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.47 68.118 2224800000 147630000 171870000 258860000 199280000 164570000 269170000 243500000 103840000 129170000 0 215100000 195250000 126610000 29516 455 27763 271216;271217;271218;271219;271220;271221;271222;271223;271224;271225;271226;271227;271228 346321;346322;346323;346324;346325;346326;346327;346328;346329;346330;346331;346332;346333;346334;346335;346336;346337;346338 346334 16 LQSTFVFEEIGRR Unmodified 1580.8311 0.83109076 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 1 1 89.476 89.476 3 3.6846E-08 91226 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.12 85.405 166950000 0 0 0 0 0 0 0 69280000 0 0 97673000 0 0 29517 455 27764 271229;271230 346339;346340 346339 2 LQSVLGK Unmodified 743.45414 0.45413923 3011 Q13561;F8W1I6 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 24.389 24.389 2 0.023138 18616 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.74 22.126 942080000 124310000 238500000 0 126710000 0 0 0 313270000 0 139300000 0 0 0 29518 3011 27765 271231;271232;271233;271234;271235 346341;346342;346343;346344;346345 346344 4 LQSVQALTEIQEFISFISK Unmodified 2180.1729 0.17288557 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 174.84 174.84 2;3 6.0761E-27 175831 QUIQUE_C1563_190116_001 157.91 114.14 124100000 0 0 19668000 0 0 0 0 16629000 0 0 33822000 53976000 0 29519 2813 27766 271236;271237;271238;271239;271240;271241;271242 346346;346347;346348;346349;346350;346351;346352 346348 6 LQSWLYSSR Unmodified 1138.5771 0.57710791 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;C9J6X0;Q8N1B9 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.638 70.638 2 1.9403E-06 71042 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.73 82.819 2678800000 228120000 210120000 230990000 169240000 165000000 159340000 218580000 192170000 198410000 97535000 344730000 242170000 222400000 29520 64 27767 271243;271244;271245;271246;271247;271248;271249;271250;271251;271252;271253;271254;271255 346353;346354;346355;346356;346357;346358;346359;346360;346361;346362;346363;346364;346365;346366;346367;346368;346369 346366 16 LQTAPVPMPDLK Unmodified 1308.7112 0.71115855 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.733 85.733 2 0.00050608 87072 QUIQUE_C1403_190116_001 125.75 104.3 3499500000 285990000 275190000 242410000 379940000 191430000 239280000 219720000 331540000 264600000 80301000 230210000 309590000 449300000 29521 291;1247 27768 271256;271257;271258;271259;271260;271261;271262;271263;271264;271265;271266;271267;271268 346370;346371;346372;346373;346374;346375;346376;346377;346378;346379;346380;346381;346382;346383;346384;346385;346386;346387;346388;346389;346390;346391;346392 346378 23 LQTAPVPMPDLK Oxidation (M) 1324.7061 0.70607317 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.484 62.484 2 0.0016715 62192 QUIQUE_C1438_190116_001 81.525 59.565 450660000 29508000 35855000 0 45468000 33563000 33844000 0 39938000 50360000 17425000 44956000 53344000 66404000 29522 291;1247 27768 271269;271270;271271;271272;271273;271274;271275;271276;271277;271278;271279;271280;271281;271282 346393;346394;346395;346396;346397;346398;346399;346400;346401;346402;346403;346404;346405;346406;346407;346408 346398 219 14 LQTASDESYK Unmodified 1140.5299 0.52988294 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 19.225 19.225 2 0.04206 12029 QUIQUE_C1218_190116_001 50.473 23.336 163040000 55170000 0 0 49139000 0 58735000 0 0 0 0 0 0 0 29523 267;275;3025 27769 271283;271284;271285 346409;346410;346411 346409 3 LQTASDESYKDPTNIQLSK Unmodified 2137.0539 0.053892649 267;275 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6 SPTAN1 no no 0 0 1 2 4 4 2 2 2 4 2 3 2 3 3 4 59.499 59.499 2;3 0 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LQTASDESYKDPTNIQSK Unmodified 2023.9698 0.96982867 3025 Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 37.892 37.892 3 3.8124E-05 33636 QUIQUE_C1403_190116_001 93.381 70.243 83021000 0 39068000 0 43953000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29525 3025 27771 271323;271324;271325 346483;346484;346485 346485 3 LQTDISELENR Unmodified 1316.6572 0.65720872 4249 Q9NQ48;H7C488 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.167 68.167 2 1.9667E-24 68793 QUIQUE_C1438_190116_001 183.43 117.36 1327200000 174800000 86041000 110850000 84212000 97347000 89784000 107550000 85001000 119360000 48047000 88998000 118280000 116950000 29526 4249 27772 271326;271327;271328;271329;271330;271331;271332;271333;271334;271335;271336;271337;271338 346486;346487;346488;346489;346490;346491;346492;346493;346494;346495;346496;346497;346498;346499;346500;346501 346491 16 LQTDQAEASKPTWGTQGDFSTTHALPAVK Unmodified 3084.5152 0.51524252 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 3 2 1 1 1 2 79.972 79.972 3;4 6.3365E-36 80658 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.82 99.799 1986100000 142950000 209070000 0 160300000 140420000 114600000 178030000 240760000 173450000 98954000 55759000 155640000 316180000 29527 981;4494 27773 271339;271340;271341;271342;271343;271344;271345;271346;271347;271348;271349;271350;271351;271352;271353;271354;271355 346502;346503;346504;346505;346506;346507;346508;346509;346510;346511;346512;346513;346514;346515;346516;346517;346518;346519;346520;346521;346522 346513 21 LQTFLETK Unmodified 978.5386 0.53859714 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 2 52.708 52.708 2 0.041028 51556 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.265 42.077 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29528 2882 27774 271356;271357 346523;346524 346524 2 LQTGFTENEVLQIFCDTCEAVAR Unmodified 2700.2524 0.25235124 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 166.34 166.34 2;3 1.7701E-160 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271489;271490;271491;271492;271493;271494;271495;271496;271497;271498;271499;271500;271501;271502;271503 346672;346673;346674;346675;346676;346677;346678;346679;346680;346681;346682;346683;346684;346685;346686;346687;346688;346689 346683 15 LQVEHPVTECITGLDLVQEMIR Unmodified 2579.3087 0.3087439 1881 P05165;A0A1B0GUX9 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.37 144.37 3 3.8333E-09 149598 QUIQUE_C1368_190116_001 93.583 85.591 1173000000 117550000 128290000 172590000 94064000 109470000 110900000 0 0 90716000 0 151590000 101630000 96183000 29548 1881 27794 271504;271505;271506;271507;271508;271509;271510;271511;271512;271513;271514 346690;346691;346692;346693;346694;346695;346696;346697;346698;346699;346700;346701 346692 12 LQVEHPVTEMITGTDLVEWQLR Unmodified 2593.321 0.32102315 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8;G5E9X5 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 139.96 139.96 3 4.9513E-09 144410 QUIQUE_C1277_190116_001 92.95 85.59 477330000 43141000 30969000 97821000 53125000 41014000 34007000 0 0 54327000 16796000 0 62400000 43725000 29549 3933 27795 271515;271516;271517;271518;271519;271520;271521;271522;271523;271524;271525 346702;346703;346704;346705;346706;346707;346708;346709;346710;346711;346712 346703 10 LQVEHTVTEEITDVDLVHAQIHVAEGR Unmodified 3037.5469 0.546877 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 2 1 108.37 108.37 4;5 3.591E-24 106095 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.219 93.252 1668800000 99803000 0 290910000 106970000 177980000 162050000 335090000 42743000 0 60984000 291250000 101030000 0 29550 2026 27796 271526;271527;271528;271529;271530;271531;271532;271533;271534;271535;271536;271537;271538;271539 346713;346714;346715;346716;346717;346718;346719;346720;346721;346722;346723;346724;346725;346726;346727;346728;346729 346725 16 LQVEPAVDTSGVQCYGPGIEGQGVFR Unmodified 2762.3334 0.33337875 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 123.65 123.65 3 1.327E-05 129579 QUIQUE_C1438_190116_001 52.97 50.211 281390000 0 62989000 72585000 57824000 60161000 0 0 0 0 27836000 0 0 0 29551 2178 27797 271540;271541;271542;271543;271544 346730;346731;346732;346733;346734 346733 5 LQVEQAPHSSPGAK Unmodified 1447.7419 0.7419414 3591 Q8N4P3;H0YNP9;H0YKT9 HDDC3 Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 18.437 18.437 2;3 0.00011636 10824 QUIQUE_C1438_190116_001 86.944 58.041 1003200000 90699000 0 109820000 0 108330000 83412000 76975000 92207000 117880000 0 128520000 98352000 96970000 29552 3591 27798 271545;271546;271547;271548;271549;271550;271551;271552;271553;271554;271555;271556;271557;271558;271559;271560;271561 346735;346736;346737;346738;346739;346740;346741;346742;346743;346744;346745;346746;346747;346748;346749;346750;346751 346739 15 LQVFDAR Unmodified 847.4552 0.45520186 699 C9J5P6;P29475;A0A0A0MTA6;P29474 NOS1;NOS3 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain;Nitric oxide synthase, endothelial yes no 0 0 0 1 45.195 45.195 2 0.060724 42733 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.176 26.176 78586000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 78586000 0 0 29553 699 27799 271562 346752 346752 1 LQVGCAQVVPVPEPPLHPVVPDLPSSVVFPDR Unmodified 3443.8275 0.8275323 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 148.39 148.39 3 1.4651E-09 151070 QUIQUE_C1563_190116_001 62.683 53.382 18134000 0 0 0 0 0 18134000 0 0 0 0 0 0 0 29554 3269 27800 271563 346753 346753 1 LQVGCAQVVPVPEPPLHPVVPDLPSSVVFPDREAAR Unmodified 3871.0455 0.045463995 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 138.22 138.22 4 0.033327 141006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 18.867 14.199 26431000 0 0 0 0 0 0 0 26431000 0 0 0 0 0 29555 3269 27801 271564 346754 346754 1 LQVGQELIDYFSDK Unmodified 1653.825 0.82500233 1060 F8WA11;Q7Z460 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 146.59 146.59 2 0.00031675 151900 QUIQUE_C1368_190116_001 105.17 79.785 158480000 43761000 40926000 44814000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28978000 29556 1060 27802 271565;271566;271567;271568;271569 346755;346756;346757;346758;346759 346757 5 LQVIIIGSR Unmodified 997.62842 0.6284152 502 A0A3B3ITT1;Q6IQ22 RAB12 Ras-related protein Rab-12 yes no 0 0 0 1 1 1 78.67 78.67 2 0.008597 80621 QUIQUE_C1218_190116_001 78.334 22.324 55516000 17559000 19021000 18935000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29557 502 27803 271570;271571;271572 346760;346761;346762;346763 346761 4 LQVINLAAK Unmodified 968.60187 0.6018661 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 62.899 62.899 2 0.0073307 62311 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.89 38.767 290070000 0 0 0 0 0 43320000 0 63732000 0 0 71079000 52205000 59733000 29558 2990 27804 271573;271574;271575;271576;271577;271578 346764;346765;346766;346767;346768;346769 346768 4 LQVIQFK Unmodified 874.52764 0.52763852 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 63.783 63.783 2 0.033008 62635 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.734 51.706 201270000 0 100200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 101070000 29559 2105 27805 271579;271580 346770;346771 346771 2 LQVLHPFDPEQR Unmodified 1477.7678 0.76776223 694 C9J494;Q9H000 MKRN2 Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 70.996 70.996 3 0.010082 71364 QUIQUE_C1368_190116_001 40.113 32.202 96579000 0 0 25565000 0 0 0 31728000 0 39286000 0 0 0 0 29560 694 27806 271581;271582;271583;271584 346772;346773;346774;346775;346776 346772 5 LQVLLLAR Unmodified 924.61204 0.61203685 1770 O96011;H7C3V6 PEX11B Peroxisomal membrane protein 11B yes no 0 0 0 1 1 89.919 89.919 2 0.039647 93530 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.76 23.731 16351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16351000 0 0 29561 1770 27807 271585;271586 346777;346778 346778 2 LQVLLTYR Unmodified 1004.6019 0.6018661 4169 Q9H4A4;A6NKB8;A0A087WU27;A0A087WUS4 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 1 1 1 1 78.747 78.747 2 0.0012292 79647 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.35 115.84 238420000 0 0 0 0 0 0 0 60454000 70112000 41752000 0 0 66101000 29562 4169 27808 271587;271588;271589;271590 346779;346780;346781;346782;346783 346779 3 LQVNQVVIHEDFIQSCFDR Unmodified 2346.1427 0.14266485 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 119.75 119.75 3 0.013492 122286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 28.748 22.391 41290000 0 0 0 0 0 0 0 41290000 0 0 0 0 0 29563 3777 27809 271591 346784 346784 1 LQVSQQEDITK Unmodified 1287.667 0.66704513 2286 P29218;H0YBL1;E5RG13;E5RIP7 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.071 35.071 2 0.00037181 30881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.83 113.35 4160100000 343630000 287220000 385660000 291630000 0 342890000 0 478280000 408150000 254710000 546490000 391180000 430220000 29564 2286 27810 271592;271593;271594;271595;271596;271597;271598;271599;271600;271601;271602 346785;346786;346787;346788;346789;346790;346791;346792;346793;346794;346795;346796;346797;346798;346799 346791 14 LQVTMPGIK Unmodified 985.56304 0.56303775 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 71.256 71.256 2 0.011056 70609 QUIQUE_C1563_190116_001 73.26 33.157 96874000 0 0 0 25501000 0 35761000 35612000 0 0 0 0 0 0 29565 2935 27811 271603;271604;271605;271606 346800;346801;346802;346803 346802 4 LQVTNVLSQPLTQATVK Unmodified 1839.0466 0.046562847 1869 P04844;Q5JYR7;Q5JYR4 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.62 105.62 2 0.00040542 110087 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.273 73.422 341280000 38117000 24672000 0 38433000 0 0 36741000 30783000 49817000 13564000 62542000 0 46614000 29566 1869 27812 271607;271608;271609;271610;271611;271612;271613;271614;271615 346804;346805;346806;346807;346808;346809;346810;346811;346812 346811 8 LQVTPEGR Unmodified 898.48723 0.48723027 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7;A0A0D9SFJ4 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.198 22.198 2 0.02931 15012 QUIQUE_C1277_190116_001 67.981 22.029 485470000 0 90797000 0 0 89424000 0 0 81618000 53975000 0 108760000 0 60893000 29567 4250 27813 271616;271617;271618;271619;271620;271621 346813;346814;346815;346816;346817;346818;346819 346813 7 LQVVDQPLPVR Unmodified 1262.7347 0.73467118 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.524 73.524 2 0.00022714 70295 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.13 107.47 2576300000 191630000 197950000 185320000 227610000 184480000 141760000 214760000 187660000 212470000 104370000 274650000 237010000 216670000 29568 2524 27814 271622;271623;271624;271625;271626;271627;271628;271629;271630;271631;271632;271633;271634 346820;346821;346822;346823;346824;346825;346826;346827;346828;346829;346830;346831;346832;346833;346834;346835;346836;346837;346838;346839;346840 346836 19 LQVVLEHMPVGPDAILR Unmodified 1886.0448 0.044788708 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47;H0Y710;H0Y4L1 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.61 117.61 2;3 0.00013751 121390 QUIQUE_C1277_190116_001 78.501 60.8 432190000 47804000 83875000 42854000 0 39628000 26061000 0 35912000 28312000 13582000 34973000 43570000 35622000 29569 7 27815 271635;271636;271637;271638;271639;271640;271641;271642;271643;271644;271645;271646 346841;346842;346843;346844;346845;346846;346847;346848;346849;346850;346851;346852 346842 12 LQWFCDR Unmodified 1023.4596 0.45963531 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.085 77.085 2 0.019704 78275 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.89 91.375 452130000 64284000 0 63561000 43691000 0 50543000 0 44657000 66462000 16432000 49728000 0 52775000 29570 2452 27816 271647;271648;271649;271650;271651;271652;271653;271654;271655 346853;346854;346855;346856;346857;346858;346859;346860;346861;346862 346860 10 LQWLLDESFKGDK Unmodified 1577.809 0.80895834 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 102.95 102.95 3 0.0024118 106007 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.043 57.841 140220000 0 0 33047000 21119000 22701000 0 0 23358000 39992000 0 0 0 0 29571 4336 27817 271656;271657;271658;271659;271660 346863;346864;346865;346866;346867;346868;346869 346869 7 LQYAGWGPK Unmodified 1018.5236 0.52361577 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 63.769 63.769 2 0.0089716 63795 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subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 93.97 93.97 2 0.011056 95681 QUIQUE_C1403_190116_001 73.26 34.468 246950000 0 74393000 0 68366000 61537000 0 0 42650000 0 0 0 0 0 29574 3141 27820 271682;271683;271684;271685 346902;346903;346904;346905;346906 346903 5 LQYIITNVLK Unmodified 1203.7227 0.72270951 3544 Q8IX04 UEVLD Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.82 101.82 2 0.0062253 105117 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.731 61.509 115710000 0 0 20772000 0 0 14263000 22308000 0 20711000 0 20340000 0 17312000 29575 3544 27821 271686;271687;271688;271689;271690;271691 346907;346908;346909;346910;346911;346912;346913 346911 7 LQYLAFMQPHLLGNEFTHLEFPR Unmodified 2800.4159 0.41592659 4493 Q9ULR3 PPM1H Protein phosphatase 1H yes yes 0 0 0 1 1 1 1 147.85 147.85 4 2.5965E-12 153073 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.19 93.468 257070000 0 0 0 0 0 0 0 0 79731000 0 55668000 82058000 39618000 29576 4493 27822 271692;271693;271694;271695 346914;346915;346916;346917 346914 3 LQYPELFDSLSPEAVR Unmodified 1862.9414 0.94142907 2042 P12271 RLBP1 Retinaldehyde-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 139.34 139.34 2 0.035418 145028 QUIQUE_C1576_190116_001 44.457 26.648 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29577 2042 27823 271696 346918 346918 1 LQYTEHQQLEGWR Unmodified 1686.8114 0.81141795 2945 Q12800;F8VWL0;F8VX55;Q9NZI6 TFCP2;TFCP2L1 Alpha-globin transcription factor CP2;Transcription factor CP2-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 57.403 57.403 2 0.002854 56276 QUIQUE_C1368_190116_001 76.143 46.609 38733000 0 0 0 0 0 38733000 0 0 0 0 0 0 0 29578 2945 27824 271697;271698 346919;346920 346919 2 LQYYVPR Unmodified 937.50215 0.50215205 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 49.577 49.577 2 0.070293 47948 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.547 25.729 69013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69013000 0 0 29579 3777 27825 271699 346921 346921 1 LRAEIDNVK Unmodified 1056.5928 0.59275797 778 CON__P13647;P13647;H0YI76 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 yes no 0 0 1 1 20.316 20.316 3 0.0047652 12961 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.243 40.025 16538000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16538000 0 0 0 + 29580 778 27826 271700 346922 346922 1 LRAEIDNVKK Unmodified 1184.6877 0.68772099 778 CON__P13647;P13647;H0YI76 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 yes no 0 0 2 1 1 13.505 13.505 3 0.0064172 6065 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.102 62.205 81703000 0 0 0 0 0 0 0 60202000 0 0 0 21500000 0 + 29581 778 27827 271701;271702 346923;346924 346923 1 LRAEIENLHR Unmodified 1249.6891 0.68911797 743 C9JTE0;Q16653;A0A0G2JHM8;Q5SSB8;A0A0G2JIQ0;A0A0G2JHB7;A0A140T9L1;A0A0G2JJE4;A0A0G2JI49;A0A0G2JIU9;A0A0G2JHA9;A0A0G2JKI0;A0A1W2PQ17;E9PG44 MOG Myelin-oligodendrocyte glycoprotein yes no 0 0 1 1 23.442 23.442 3 0.015222 17149 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.029 54.164 218180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 218180000 0 0 29582 743 27828 271703 346925 346925 0 LRAELDEVNK Unmodified 1185.6354 0.63535107 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 26.121 26.121 2;3 0.0011449 20107 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347022;347023;347024;347025;347026;347027;347028;347029;347030;347031;347032;347033;347034;347035;347036;347037 347024 11 LREAIAELER Unmodified 1198.667 0.66698555 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 1 1 42.168 42.168 3 0.026483 38853 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.299 21.073 169060000 0 0 0 0 0 0 0 74650000 42630000 0 51784000 0 0 29594 3117 27840 271806;271807;271808 347038;347039;347040;347041 347040 3 LREANQQQQFNR Unmodified 1530.7651 0.76513646 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 2 1 15.492 15.492 2;3 1.1599E-36 8223 QUIQUE_DMIX1_190116_001 191.52 133.66 707830000 0 0 0 0 0 0 0 333500000 99342000 0 201500000 0 73477000 29595 267;275;3025 27841 271809;271810;271811;271812;271813;271814 347042;347043;347044;347045;347046;347047 347043 6 LREDEGTWVQVSLLHFVPTR Unmodified 2381.2492 0.24917883 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 1 1 3 2 2 1 1 2 2 1 1 2 130.81 130.81 3;4 3.7247E-06 136187 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347069;347070;347071;347072;347073;347074;347075;347076;347077;347078;347079;347080;347081;347082;347083;347084;347085;347086 347070 17 LREEGPIIK Unmodified 1053.6182 0.61824444 1480 O15085 ARHGEF11 Rho guanine nucleotide exchange factor 11 yes yes 0 0 1 1 20.968 20.968 3 0.040793 14094 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.457 23.676 13722000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13722000 29598 1480 27844 271848 347087 347087 1 LREEHILMR Unmodified 1195.6496 0.64956134 1158 H0YI08;Q9Y6F6 MRVI1 Protein MRVI1 yes no 0 0 1 1 23.232 23.232 3 0.012357 16896 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.064 27.735 16392000 0 0 0 0 0 0 0 16392000 0 0 0 0 0 29599 1158 27845 271849 347088 347088 1 LREELKPIAFAR Unmodified 1441.8405 0.84053324 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 1 2 1 2 1 2 48.325 48.325 3;4 0.00027498 45956 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.274 65.265 666590000 0 23986000 32306000 0 38222000 0 36121000 139990000 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347108 0 LRELEDQAR Unmodified 1128.5887 0.58873523 3375 Q6NY19 KANK3 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 17.18 17.18 3 0.0048002 9732 QUIQUE_C1438_190116_001 70.908 42.182 40661000 0 9363100 0 0 13104000 0 0 0 0 0 0 0 18194000 29603 3375 27849 271868;271869;271870 347109;347110;347111 347110 2 LRENELTYYCCK Unmodified 1647.7385 0.73851229 471 E9PNW4;A0A2U3TZL5;E9PR17;P13987;H0YET2 CD59 CD59 glycoprotein yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 45.907 45.907 2;3 4.543E-19 42235 QUIQUE_C1368_190116_001 168.3 149.56 4942300000 113530000 179770000 597060000 547350000 417780000 147740000 642070000 417750000 159540000 156230000 536670000 166250000 860580000 29604 471 27850 271871;271872;271873;271874;271875;271876;271877;271878;271879;271880;271881;271882;271883;271884;271885;271886;271887;271888;271889;271890;271891 347112;347113;347114;347115;347116;347117;347118;347119;347120;347121;347122;347123;347124;347125;347126;347127;347128;347129;347130;347131;347132;347133;347134 347114 21 LRENELTYYCCKK Unmodified 1775.8335 0.8334753 471 E9PNW4;A0A2U3TZL5;E9PR17;P13987;H0YET2 CD59 CD59 glycoprotein yes no 0 0 2 1 31.66 31.66 3 0.031278 26424 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.042 55.766 34378000 0 0 0 0 0 0 0 34378000 0 0 0 0 0 29605 471 27851 271892 347135 347135 1 LRENVFQEHQTLK Unmodified 1640.8635 0.86345352 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 30.581 30.581 2;3 4.7147E-06 25387 QUIQUE_C1277_190116_001 101.75 76.106 1103300000 51323000 71377000 0 99789000 124060000 57061000 0 164540000 166580000 0 72154000 96780000 199610000 29606 3056 27852 271893;271894;271895;271896;271897;271898;271899;271900;271901;271902;271903 347136;347137;347138;347139;347140;347141;347142;347143;347144;347145;347146;347147 347137 12 LREQLGPVTQEFWDNLEK Unmodified 2201.1117 0.1116823 1821 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271920;271921;271922;271923;271924;271925;271926;271927;271928;271929;271930;271931;271932;271933;271934;271935;271936;271937 347168;347169;347170;347171;347172;347173;347174;347175;347176;347177;347178;347179;347180;347181;347182;347183;347184;347185;347186;347187 347175 17 LREQQLVGEK Unmodified 1198.667 0.66698555 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 19.895 19.895 2;3 0.0022603 12781 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.03 52.924 230080000 52134000 0 38130000 0 0 0 57127000 0 63348000 19336000 0 0 0 29609 3043 27855 271938;271939;271940;271941;271942 347188;347189;347190;347191;347192 347191 3 LRETLNISGPPLK Unmodified 1436.8351 0.83511351 2282 P28838;H0Y983 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 60.856 60.856 2;3 0.0016996 60108 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.927 63.601 726870000 0 26131000 0 0 0 0 0 227730000 0 0 268860000 85111000 119040000 29610 2282 27856 271943;271944;271945;271946;271947;271948;271949 347193;347194;347195;347196;347197;347198;347199 347197 6 LREVLHELYK Unmodified 1298.7347 0.73467118 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 1 1 1 41.111 41.111 2;3 0.028309 37243 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.354 34.724 104030000 0 0 0 0 0 0 0 104030000 0 0 0 0 0 29611 2176 27857 271950;271951 347200;347201 347200 2 LREVVETPLLHPER Unmodified 1686.9417 0.94170385 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 53.314 53.314 3;4 0.0012696 52216 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.771 47.013 613010000 0 0 0 0 0 0 37900000 73341000 108050000 0 154620000 105230000 133870000 29612 2389 27858 271952;271953;271954;271955;271956;271957;271958;271959;271960;271961 347202;347203;347204;347205;347206;347207;347208;347209;347210;347211;347212;347213;347214;347215;347216 347204 13 LREYEAALNSK Unmodified 1292.6725 0.67246486 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5;A0A0D9SFY5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 3 1 2 2 1 1 27.572 27.572 2;3 0.0026073 22496 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347648;347649;347650;347651;347652;347653;347654;347655 347650 6 LRNELQTDKPFIPLVEK Unmodified 2039.1415 0.14152586 4192 Q9H993 ARMT1 Protein-glutamate O-methyltransferase yes yes 0 0 2 2 1 1 1 2 1 2 2 1 2 78.313 78.313 3;4 0.00016327 79885 QUIQUE_C1576_190116_001 85.362 75.992 1137100000 0 0 124190000 47943000 67633000 78930000 127820000 93754000 147730000 0 163900000 87065000 198120000 29625 4192 27870 272175;272176;272177;272178;272179;272180;272181;272182;272183;272184;272185;272186;272187;272188;272189 347656;347657;347658;347659;347660;347661;347662;347663;347664;347665;347666;347667;347668;347669;347670 347661 15 LRPAGTAAGDGALALQEPGLWLGEVELAAEEAAQDGAEPGR Unmodified 4056.0189 0.018851132 1718 O95278;H0Y6I8;A0A1W2PQ84 EPM2A Laforin yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 3 1 168.16 168.16 3;4 3.7005E-142 172137 QUIQUE_DMIX7_190116_001 165.92 157.03 918000000 0 22682000 0 0 69318000 0 302310000 100400000 0 0 78063000 330700000 14528000 29626 1718 27871 272190;272191;272192;272193;272194;272195;272196;272197;272198;272199;272200 347671;347672;347673;347674;347675;347676;347677;347678;347679;347680;347681;347682 347681 12 LRPEAQPHPSAGPK Unmodified 1483.7896 0.7895603 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 2 10.507 10.507 3;4 8.8822E-05 2742 QUIQUE_C1368_190116_001 90.444 66.695 308330000 17894000 0 21969000 104070000 19207000 0 26779000 12937000 33751000 5890500 0 23537000 42293000 29627 1074 27872 272201;272202;272203;272204;272205;272206;272207;272208;272209;272210;272211;272212;272213;272214;272215;272216 347683;347684;347685;347686;347687;347688;347689;347690;347691;347692;347693;347694;347695;347696;347697;347698;347699 347685 16 LRPEAQPHPSAGPKPAESK Unmodified 1996.049 0.049022463 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 2 1 2 1 2 2 2 1 2 10.563 10.563 4;5 9.8143E-101 2655 QUIQUE_DMIX8_190116_001 185.61 165.25 402730000 0 0 0 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347752 13 LRPEVMQDLLESTDFTEHEIQEWYK Oxidation (M) 3151.4808 0.48083085 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1;E5RJJ6;E5RGZ0;E5RI95;A0A1B0GXG3;E5RHE8;E5RI78;E5RHC8;E5RIG4;E5RIA5;E5RK89;E5RFL9;E5RJT1;E5RIX3 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 1 1 1 143.81 143.81 3 5.2795E-07 148394 QUIQUE_C1277_190116_001 59.555 53.953 26485000 0 26485000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29632 2726 27877 272271 347762 347762 2161 1 LRPEVMQDLLESTDFTEHEIQEWYK Unmodified 3135.4859 0.48591622 2726 P61601;E5RGA9;E5RIZ1;E5RJJ6;E5RGZ0;E5RI95;A0A1B0GXG3;E5RHE8;E5RI78;E5RHC8;E5RIG4;E5RIA5;E5RK89;E5RFL9;E5RJT1;E5RIX3 NCALD Neurocalcin-delta yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 159.77 159.77 3;4 2.1203E-36 166854 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.95 128.04 480740000 0 30851000 0 0 0 0 201210000 0 80724000 0 167950000 0 0 29633 2726 27877 272272;272273;272274;272275;272276;272277;272278 347763;347764;347765;347766;347767;347768;347769;347770;347771 347770 8 LRPIPITASVEIQEPSSR Unmodified 1992.1004 0.10038933 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 83.321 83.321 2;3 1.9167E-18 84630 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.72 99.124 1253500000 68657000 151480000 0 109480000 152420000 0 129990000 97368000 177340000 49219000 122550000 86950000 108020000 29634 2207 27878 272279;272280;272281;272282;272283;272284;272285;272286;272287;272288;272289;272290;272291;272292;272293;272294;272295;272296 347772;347773;347774;347775;347776;347777;347778;347779;347780;347781;347782;347783;347784;347785;347786;347787;347788;347789 347782 18 LRPLFEACGEVVQIRPIFSNR Unmodified 2500.3373 0.33728233 3098 Q15020;F8VV04 SART3 Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3 yes no 0 0 2 1 1 1 115.07 115.07 4 0.0047731 120598 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.618 35.424 205420000 0 0 0 0 0 0 0 0 61626000 0 84407000 59386000 0 29635 3098 27879 272297;272298;272299 347790;347791;347792;347793 347792 4 LRPLSYPDTDVILMCFSIDSPDSLENIPEK Oxidation (M) 3479.684 0.68402368 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Keratin, type II cytoskeletal 1 no no 0 0 2 1 1 10.861 10.861 3 0.0043567 3171 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.596 41.867 225670000 0 0 0 0 0 0 0 71427000 0 154240000 0 0 0 + 29651 1859;792 27893 272419;272420 347928;347929 347929 2 LRSELDVVR Unmodified 1085.6193 0.61930707 3427;1008 Q6ZVM7;B7Z2U2;F5H3S6 TOM1L2 TOM1-like protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.431 32.431 3 0.009054 27408 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.087 63.316 432180000 0 35468000 41414000 0 37728000 22127000 0 44262000 50401000 9970800 66659000 54999000 69148000 29652 3427;1008 27894 272421;272422;272423;272424;272425;272426;272427;272428;272429;272430 347930;347931;347932;347933;347934;347935;347936;347937;347938;347939;347940 347938 10 LRSELEMVSGNVR Unmodified 1488.7719 0.77186132 1592 O60784;B0QY01 TOM1 Target of Myb protein 1 yes no 0 0 1 1 1 55.444 55.444 2 0.013346 53716 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.313 68.877 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29653 1592 27895 272431;272432 347941;347942 347942 2 LRTEGDGVYTLNDK Unmodified 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2;3 9.5942E-65 33840 QUIQUE_DMIX5_190116_001 225.13 125.6 809380000 0 102760000 0 0 154660000 0 93200000 45188000 62195000 27899000 189170000 0 134310000 29656 1793 27898 272440;272441;272442;272443;272444;272445;272446;272447 347950;347951;347952;347953;347954;347955;347956;347957;347958;347959 347958 7 LRVDPVNFK Unmodified 1086.6186 0.61857879 2801;1075;762 P69905;A0A2R8Y7C0;CON__P01966;G3V1N2 HBA1;HBA2 Hemoglobin subunit alpha no no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 46.771 46.771 2;3 3.3328E-08 44443 QUIQUE_C1277_190116_001 168.27 76.639 45786000000 1415700000 4172400000 2729400000 1224800000 5034200000 1640900000 1956100000 2129900000 3111800000 470390000 10154000000 6065300000 5681800000 + 29657 2801;762;1075 27899 272448;272449;272450;272451;272452;272453;272454;272455;272456;272457;272458;272459;272460;272461;272462;272463;272464;272465;272466;272467;272468;272469;272470;272471;272472 347960;347961;347962;347963;347964;347965;347966;347967;347968;347969;347970;347971;347972;347973;347974;347975;347976;347977;347978;347979;347980;347981;347982;347983;347984;347985;347986;347987;347988;347989;347990;347991;347992;347993;347994;347995;347996;347997;347998;347999;348000;348001;348002;348003;348004;348005;348006;348007;348008;348009 347965 50 LRYEVDTVLR Unmodified 1262.6983 0.69828568 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 60 60 2;3 0.00019199 59532 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.568 69.004 6082800000 0 244210000 0 171340000 579510000 109470000 674190000 617770000 721510000 67216000 575400000 1192200000 1130000000 29658 3862 27900 272473;272474;272475;272476;272477;272478;272479;272480;272481;272482;272483;272484;272485;272486;272487;272488;272489 348010;348011;348012;348013;348014;348015;348016;348017;348018;348019;348020;348021;348022;348023;348024;348025;348026;348027 348022 11 LSAAEDPLVQSLR Unmodified 1397.7514 0.75144346 2507 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Nuclear pore complex protein Nup133 yes yes 0 0 0 1 1 1 54.709 54.709 2 0.01758 53122 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.32 32.56 41429000 0 0 0 0 0 0 0 9946400 0 0 14503000 16980000 0 29662 3699 27904 272501;272502;272503 348039;348040;348041 348039 3 LSAALSSLQR Unmodified 1044.5928 0.59275797 4375 Q9P1Y5 CAMSAP3 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 51.989 51.989 2 0.016512 49763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.128 48.78 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29663 4375 27905 272504;272505 348042;348043 348043 2 LSAAVTEAFVR Unmodified 1162.6346 0.63462279 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.033 77.033 2 0.00018514 79170 QUIQUE_C1218_190116_001 125.48 52.22 882040000 76794000 71553000 62758000 78583000 60178000 54355000 59464000 94385000 73736000 32161000 84595000 88021000 45457000 29664 2254 27906 272506;272507;272508;272509;272510;272511;272512;272513;272514;272515;272516;272517;272518 348044;348045;348046;348047;348048;348049;348050;348051;348052;348053;348054;348055;348056;348057 348044 12 LSADMADHSNLIR Unmodified 1441.6984 0.69836203 1196 H3BRL0;Q9BXC9;J3QLW0 BBS2 Bardet-Biedl syndrome 2 protein yes no 0 0 0 1 53.764 53.764 3 0.03442 52076 QUIQUE_C1218_190116_001 35.45 23.506 20417000 20417000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29665 1196 27907 272519 348058 348058 1 LSADNMDPDFVER Unmodified 1507.6613 0.66130782 1715 O95219;F8W9T3 SNX4 Sorting nexin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.923 83.923 2 0.00036687 85178 QUIQUE_C1277_190116_001 110.66 84.723 196850000 30358000 29621000 35243000 28694000 0 23564000 0 22809000 0 0 0 26565000 0 29666 1715 27908 272520;272521;272522;272523;272524;272525;272526;272527 348059;348060;348061;348062;348063;348064;348065;348066 348060 8 LSAEAVFEK Unmodified 992.51786 0.51786169 3484 Q86TP1;A0A3B3ITN0 PRUNE Protein prune homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.322 59.322 2 0.0018811 57963 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.136 33.062 130790000 0 19061000 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348075;348076;348077;348078;348079;348080;348081;348082;348083;348084;348085;348086;348087;348088;348089;348090;348091;348092;348093;348094;348095;348096;348097;348098;348099;348100;348101;348102;348103;348104;348105;348106;348107 348081 33 LSAEERDQLLPNLR Unmodified 1652.8846 0.8845829 2724 P61457 PCBD1 Pterin-4-alpha-carbinolamine dehydratase yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 72.624 72.624 2;3 0.0018453 72989 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.653 67.048 656870000 0 0 0 0 0 0 0 114860000 104330000 0 135140000 172310000 130230000 29670 2724 27912 272561;272562;272563;272564;272565;272566;272567 348108;348109;348110;348111;348112;348113;348114;348115;348116 348114 9 LSAEILR Unmodified 800.4756 0.47560295 4376 Q9P1Z2 CALCOCO1 Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 45.743 45.743 2 0.023465 42666 QUIQUE_C1403_190116_001 100.07 25.349 95305000 0 0 19946000 19912000 0 19267000 21634000 0 0 0 0 14547000 0 29671 4376 27913 272568;272569;272570;272571;272572 348117;348118;348119;348120;348121 348118 5 LSAEKVEIATLTR Unmodified 1429.814 0.81404372 2246 P25789;H0YMZ1;H0YL69;H0YN18 PSMA4 Proteasome subunit alpha type-4;Proteasome subunit alpha type yes no 0 0 1 1 61.05 61.05 3 0.029494 59404 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.285 19.148 42693000 0 0 0 0 0 0 0 42693000 0 0 0 0 0 29672 2246 27914 272573 348122 348122 1 LSAELLLGQLNAEHAEADVR Unmodified 2148.1175 0.11749596 3155 Q15750 TAB1 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 117.81 117.81 3 0.022243 122499 QUIQUE_C1368_190116_001 22.936 13.839 35503000 0 0 35503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29673 3155 27915 272574 348123 348123 1 LSAEPAPDFSDYSEMAK Unmodified 1856.8138 0.8138453 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.55 100.55 2 0.00017475 103327 QUIQUE_C1277_190116_001 112.5 103.75 971140000 86485000 85293000 87858000 109640000 67368000 97515000 79422000 58508000 66982000 0 89384000 54640000 88041000 29674 4252 27916 272575;272576;272577;272578;272579;272580;272581;272582;272583;272584;272585;272586 348124;348125;348126;348127;348128;348129;348130;348131;348132;348133;348134;348135;348136;348137 348126 13 LSAETLQQVNR Unmodified 1257.6677 0.66771383 1000 F5H1S9;G8JLB3;Q9Y606 PUS1 tRNA pseudouridine synthase;tRNA pseudouridine synthase A, mitochondrial yes no 0 0 0 1 48.207 48.207 2 0.058679 45584 QUIQUE_C1218_190116_001 58.699 20.084 22516000 22516000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29675 1000 27917 272587 348138 348138 0 LSAETWDLLR Unmodified 1202.6295 0.62953741 177 A0A0A0MSK4;A0A0A0MRC4;Q86YR5 GPSM1 G-protein-signaling modulator 1 yes no 0 0 0 1 1 1 111.12 111.12 2 0.0018569 113221 QUIQUE_C1563_190116_001 93.178 51.526 20319000 0 0 0 0 0 20319000 0 0 0 0 0 0 0 29676 177 27918 272588;272589;272590 348139;348140;348141 348140 3 LSAGVPPLAIR Unmodified 1092.6655 0.66552898 4490 Q9ULL4 PLXNB3 Plexin-B3 yes yes 0 0 0 1 32.544 32.544 3 0.05992 27693 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.286 9.8226 593790000 0 0 0 0 0 0 0 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272640;272641;272642;272643;272644;272645;272646;272647;272648;272649;272650;272651;272652;272653;272654;272655;272656;272657;272658;272659;272660;272661;272662 348202;348203;348204;348205;348206;348207;348208;348209;348210;348211;348212;348213;348214;348215;348216;348217;348218;348219;348220;348221;348222;348223;348224;348225;348226;348227;348228;348229;348230;348231;348232;348233;348234 348230 31 LSAIYGGTYMLNKPVDDIIMENGK 2 Oxidation (M) 2673.303 0.30298982 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 2 1 1 112.51 112.51 3 7.1295E-08 109089 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.045 70.014 80223000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80223000 0 0 0 29684 2328 27923 272663 348235 348235 1715;1716 1 LSALALLSLLPSDNSVIQDK Unmodified 2096.1729 0.17288557 4445 Q9UI26;H0Y8M5 IPO11 Importin-11 yes no 0 0 0 1 1 1 166.96 166.96 2 0.00014059 160971 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.941 71.736 59641000 0 0 0 0 0 15070000 36676000 0 0 7894800 0 0 0 29685 4445 27924 272664;272665;272666 348236;348237;348238 348238 3 LSALGNVTTCNDYVALVHPDLDR Unmodified 2542.2486 0.24858649 2681 P56537 EIF6 Eukaryotic translation initiation factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.69 119.69 3 2.5677E-07 123678 QUIQUE_C1368_190116_001 74.584 66.397 595530000 77253000 89966000 76614000 74620000 87338000 96894000 67190000 0 0 25650000 0 0 0 29686 2681 27925 272667;272668;272669;272670;272671;272672;272673;272674 348239;348240;348241;348242;348243;348244;348245;348246;348247 348241 9 LSALLQETK Unmodified 1001.5757 0.57571092 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.359 43.359 2 0.0004383 40527 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.5 72.815 768970000 68842000 86152000 62061000 0 95518000 0 0 60048000 76590000 33018000 114980000 83704000 88061000 29687 1591 27926 272675;272676;272677;272678;272679;272680;272681;272682;272683;272684 348248;348249;348250;348251;348252;348253;348254;348255;348256;348257;348258;348259 348253 12 LSALPPEGGKPYLESFK Unmodified 1831.972 0.97200092 4252 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domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 112.28 112.28 3 0.00039622 114572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.574 68.66 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29693 1057 27932 272719 348294 348294 1 LSAQIQEHR Unmodified 1080.5676 0.56760585 38 F5GYK0;A0A0A0MS35;A0A087WUH1;Q7Z4K8;Q5VT61 TRIM46 Tripartite motif-containing protein 46 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 15.525 15.525 3 0.003399 7671 QUIQUE_C1403_190116_001 64.04 36.711 63478000 17445000 0 0 17830000 0 0 0 0 0 0 13231000 0 14972000 29694 38 27933 272720;272721;272722;272723;272724 348295;348296;348297;348298;348299 348297 3 LSASDMLQVR Unmodified 1118.5754 0.57539335 3659 Q8TAF3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes yes 0 0 0 1 82.064 82.064 2 0.022384 83894 QUIQUE_C1576_190116_001 57.859 25.018 40408000 0 0 0 0 0 0 40408000 0 0 0 0 0 0 29695 3659 27934 272725 348300 348300 1 LSASETSLHR Unmodified 1099.5622 0.56218613 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 19.144 19.144 2;3 0.00012566 11971 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1301.6939 0.69392858 13 A0A075B730;P58107 EPPK1 Epiplakin yes no 0 0 0 1 1 84.868 84.868 2 0.045618 85710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.309 5.0048 45212000 0 0 0 0 0 0 0 25146000 0 0 0 20066000 0 29698 13 27937 272751;272752 348328;348329 348328 2 LSAYYNLLHCLR Unmodified 1521.7762 0.77621842 1812 Q5I0G2;P01236;A6XMH3 PRL Prolactin yes no 0 0 0 2 1 1 99.148 99.148 2;3 2.7055E-06 102464 QUIQUE_C1218_190116_001 110.66 80.456 159940000 130830000 0 0 29107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29699 1812 27938 272753;272754;272755;272756 348330;348331;348332;348333;348334 348331 5 LSCAYSGFSSPR Unmodified 1330.5976 0.59758535 72 A0A087WY82;Q9Y624 F11R Junctional adhesion molecule A yes no 0 0 0 1 1 54.457 54.457 2 0.0029536 51989 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.64 60.969 16978000 0 0 0 0 0 0 16978000 0 0 0 0 0 0 29700 72 27939 272757;272758 348335;348336 348336 2 LSCFAQTVSPAEK Unmodified 1436.697 0.69696505 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.099 52.099 2 2.5627E-17 49874 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348360;348361;348362;348363;348364;348365;348366;348367;348368;348369;348370;348371;348372;348373;348374;348375;348376;348377;348378;348379;348380;348381;348382;348383;348384 348373 25 LSCVPVLIFANK Unmodified 1359.7584 0.75844309 2393 P36405 ARL3 ADP-ribosylation factor-like protein 3 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 117.11 117.11 2;3 0.00080102 122811 QUIQUE_C1218_190116_001 87.806 73.14 1008200000 253170000 0 208000000 0 0 248720000 224220000 0 0 74072000 0 0 0 29703 2393 27942 272783;272784;272785;272786;272787;272788;272789;272790;272791;272792 348385;348386;348387;348388;348389;348390;348391;348392;348393;348394;348395 348386 10 LSDAGITPLFLTR Unmodified 1402.782 0.78201531 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 121.62 121.62 2 3.0393E-17 127028 QUIQUE_C1218_190116_001 163.12 115.29 4638900000 249890000 253580000 276020000 372670000 558000000 596180000 310130000 341400000 311520000 164480000 399670000 309060000 496290000 29704 2037 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277320000 0 0 0 29706 267;275;3025 27945 272815 348434 348434 1 LSDDNTIGKEEIQQR Unmodified 1744.8592 0.85915601 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 2 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 36.117 36.117 2;3 7.16E-111 31442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 273.04 248.66 35532000000 2031800000 2568200000 2437800000 2347900000 3112600000 2251600000 3256100000 2560000000 3302000000 800380000 4039100000 2833300000 3991200000 29707 267;275;3025 27946 272816;272817;272818;272819;272820;272821;272822;272823;272824;272825;272826;272827;272828;272829;272830;272831;272832;272833;272834;272835;272836;272837;272838;272839;272840;272841;272842;272843;272844;272845;272846;272847;272848;272849;272850 348435;348436;348437;348438;348439;348440;348441;348442;348443;348444;348445;348446;348447;348448;348449;348450;348451;348452;348453;348454;348455;348456;348457;348458;348459;348460;348461;348462;348463;348464;348465;348466;348467;348468;348469;348470;348471;348472;348473;348474;348475;348476;348477;348478;348479 348463 42 LSDEDGTNMHLQLVR Unmodified 1726.8308 0.83083277 3468 Q7Z6G3 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 68.635 68.635 3 0.018594 69148 QUIQUE_C1218_190116_001 37.657 30.6 142160000 69134000 0 0 73027000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29708 3468 27947 272851;272852 348480;348481 348480 2 LSDETLIDIMTR Unmodified 1405.7123 0.71228076 2146 P19367;B1AR63;B1AR62 HK1 Hexokinase-1;Hexokinase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 135.35 135.35 2;3 1.3788E-45 139386 QUIQUE_C1277_190116_001 201.75 156.38 9039000000 862880000 868160000 797840000 703810000 547250000 599660000 788560000 697890000 604460000 264430000 831420000 881000000 591690000 29709 2146 27948 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29711 4555 27949 272878 348530 348530 1 LSDFNDITNMLLLK Unmodified 1635.8542 0.85419397 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 157.62 157.62 2 0.00063321 162868 QUIQUE_C1368_190116_001 98.353 73.499 275870000 0 0 79279000 21468000 22510000 34536000 18488000 25226000 0 0 40688000 33673000 0 29712 2813 27950 272879;272880;272881;272882;272883;272884;272885;272886 348531;348532;348533;348534;348535;348536;348537;348538 348531 7 LSDFNIIDTLGVGGFGR Unmodified 1779.9155 0.91554867 3035 Q13976;A0A0A0MSB3 PRKG1 cGMP-dependent protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 156.99 156.99 2;3 6.9124E-24 161424 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.5 133.74 157110000 62668000 0 9391400 78997000 0 0 0 0 0 6055900 0 0 0 29713 3035 27951 272887;272888;272889;272890;272891;272892;272893;272894;272895;272896;272897;272898 348539;348540;348541;348542;348543;348544;348545;348546;348547;348548;348549;348550;348551 348546 13 LSDGELLFECAGHK Unmodified 1574.7399 0.73989249 716 C9JG97;C9JEH3;Q13685;C9JTS3 AAMP Angio-associated migratory cell protein yes no 0 0 0 1 75.733 75.733 2 0.043391 76628 QUIQUE_C1218_190116_001 43.419 31.687 33234000 33234000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29714 716 27952 272899 348552 348552 1 LSDGFNGADLR Unmodified 1163.5571 0.55710075 124 A0A087X2I1;P62333;H0YJC0 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.253 60.253 2 0.00047426 58972 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.06 83.683 825340000 73582000 83012000 94729000 0 0 77890000 0 107040000 106870000 48146000 142050000 92028000 0 29715 124 27953 272900;272901;272902;272903;272904;272905;272906;272907;272908 348553;348554;348555;348556;348557;348558;348559;348560;348561 348557 7 LSDGVAVLK Unmodified 900.52803 0.52803245 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 45.208 45.208 2 0.00046275 39148 QUIQUE_DMIX4_190116_001 116.73 51.473 21448000000 1719900000 1467800000 1853200000 1404100000 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348591;348592;348593;348594;348595;348596;348597;348598;348599;348600;348601;348602;348603;348604;348605;348606;348607;348608;348609;348610;348611;348612;348613;348614;348615 348592 23 LSDGVSSELLGLNSEEK Unmodified 1775.8789 0.8788884 4726 yes yes 0 0 0 1 33.26 33.26 3 0.010681 28245 QUIQUE_C1277_190116_001 26.781 15.261 24481000 0 24481000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 29718 4726 27956 272955 348616 348616 1 LSDIGEGIR Unmodified 958.50836 0.50835964 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 41.39 41.39 2 0.0012367 37635 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.57 49.557 271120000 0 0 0 0 0 0 0 75242000 98300000 0 0 97577000 0 29719 2014 27957 272956;272957;272958;272959 348617;348618;348619;348620;348621;348622;348623 348623 7 LSDIPEGK Unmodified 857.44945 0.44944778 2498 P47985;P0C7P4 UQCRFS1;UQCRFS1P1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11;Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.504 22.504 2 0.0036855 15823 QUIQUE_C1403_190116_001 121.99 99.858 6223500000 969120000 846990000 803460000 642230000 659030000 655330000 827060000 0 0 0 0 0 820320000 29720 2498 27958 272960;272961;272962;272963;272964;272965;272966;272967;272968 348624;348625;348626;348627;348628;348629;348630;348631;348632;348633 348628 9 LSDLLAPISEQIK Unmodified 1425.8079 0.80789571 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 113.56 113.56 2;3 1.7519E-12 117557 QUIQUE_C1368_190116_001 159.09 133.15 14989000000 1281700000 1166100000 1676800000 1662200000 1441100000 1302300000 1344500000 1280700000 20720000 584940000 1774900000 1453300000 0 29721 2857;3307 27959 272969;272970;272971;272972;272973;272974;272975;272976;272977;272978;272979;272980;272981;272982;272983;272984;272985;272986;272987;272988;272989;272990 348634;348635;348636;348637;348638;348639;348640;348641;348642;348643;348644;348645;348646;348647;348648;348649;348650;348651;348652;348653;348654;348655;348656;348657 348640 17 LSDLLAPISEQIKEVITFR Unmodified 2171.2202 0.22017012 2857;3307 Q01518;Q5T0R1;Q5T0R4;Q5T0R3;Q5T0R2;Q5T0R7;Q5T0R6;Q5T0R5;Q5T0R9 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1;Adenylyl cyclase-associated protein no no 0 0 1 1 162.76 162.76 3 1.611E-05 165086 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.057 90.106 58081000 0 0 0 0 0 0 0 58081000 0 0 0 0 0 29722 2857;3307 27960 272991 348658;348659 348659 2 LSDLLDWK Unmodified 988.52295 0.52294707 2068 P13807;M0QYU1 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 103.82 103.82 2 0.0088412 106686 QUIQUE_C1277_190116_001 93.374 28.122 656390000 45897000 34728000 37241000 32431000 58299000 47934000 80184000 37067000 40660000 23610000 55343000 54585000 108410000 29723 2068 27961 272992;272993;272994;272995;272996;272997;272998;272999;273000;273001;273002;273003;273004;273005 348660;348661;348662;348663;348664;348665;348666;348667;348668;348669;348670;348671;348672;348673 348661 14 LSDLLEVDKDEALTESDEHFSTK Unmodified 2620.2392 0.23918682 2511 P48553;A0A096LPH7 TRAPPC10;LOC102724200 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes no 0 0 1 1 2 1 98.158 98.158 3;4 6.4647E-11 100585 QUIQUE_C1277_190116_001 73.459 58.875 168290000 49185000 84464000 0 0 34644000 0 0 0 0 0 0 0 0 29724 2511 27962 273006;273007;273008;273009 348674;348675;348676;348677;348678 348677 5 LSDLQEALDQALNYVR Unmodified 1846.9425 0.94249171 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 165.83 165.83 2;3 0.00012654 170263 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.448 70.813 88225000 0 0 0 0 0 0 57955000 9896300 20374000 0 0 0 0 29725 130 27963 273010;273011;273012 348679;348680;348681 348681 3 LSDLVNTAILIALNK Unmodified 1596.9451 0.94505789 3699 Q8WUM0 NUP133 Nuclear pore complex protein Nup133 yes yes 0 0 0 2 1 160.07 160.07 2;3 0.00093775 165119 QUIQUE_C1218_190116_001 44.132 39.729 16958000 14522000 0 0 0 0 0 0 0 0 2435200 0 0 0 29726 3699 27964 273013;273014;273015 348682;348683;348684 348682 1 LSDLVNTAILIALNKR Unmodified 1753.0462 0.046168917 3699 Q8WUM0 NUP133 Nuclear pore complex protein Nup133 yes yes 0 0 1 1 1 142.54 142.54 3 9.4926E-06 145893 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.694 81.412 39452000 0 0 0 0 0 0 0 27243000 0 0 0 0 12209000 29727 3699 27965 273016;273017 348685;348686 348685 2 LSDPANWLK Unmodified 1042.5447 0.54474515 2141 P19022 CDH2 Cadherin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 85.97 85.97 2 0.028878 88194 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.301 41.691 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29728 2141 27966 273018;273019;273020 348687;348688;348689 348688 3 LSDPGIPITVLSR Unmodified 1366.782 0.78201531 2215 P23458 JAK1 Tyrosine-protein kinase JAK1 yes yes 0 0 0 1 1 106.97 106.97 2 0.0025603 110098 QUIQUE_C1403_190116_001 77.379 55.915 20259000 0 20259000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29729 2215 27967 273021;273022 348690;348691 348691 2 LSDPSDLPR Unmodified 998.50327 0.50327426 174 A0A0A0MSI8;O00471;F8W9B8 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 0 0 0 1 1 39.387 39.387 2 0.02664 34946 QUIQUE_C1277_190116_001 58.426 30.901 106660000 0 88998000 0 0 0 0 0 0 0 17661000 0 0 0 29730 174 27968 273023;273024 348692;348693 348692 2 LSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMER Oxidation (M) 3421.6071 0.60711077 2796;737 C9JQ00;P68366;C9JJQ8;C9JEV8 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain no no 0 1 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 2 159.15 159.15 3 3.4761E-198 166259 QUIQUE_DMIX5_190116_001 223.42 213.45 3930000000 189460000 723810000 0 136450000 413510000 113280000 540210000 376900000 330450000 0 506650000 599310000 0 29731 737;2796 27969 273025;273026;273027;273028;273029;273030;273031;273032;273033;273034;273035;273036;273037;273038;273039 348694;348695;348696;348697;348698;348699;348700;348701;348702;348703;348704;348705;348706;348707;348708 348706 443 15 LSDQCTGLQGFLVFHSFGGGTGSGFTSLLMER Unmodified 3405.6122 0.61219615 2796;737 C9JQ00;P68366;C9JJQ8;C9JEV8 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain no no 0 0 0 1 1 1 2 4 3 2 163.31 163.31 3;4 6.343E-177 170222 QUIQUE_DMIX5_190116_001 215.15 195.95 2397200000 0 61966000 0 0 0 0 278480000 47513000 210770000 0 1138900000 396790000 262770000 29732 737;2796 27969 273040;273041;273042;273043;273044;273045;273046;273047;273048;273049;273050;273051;273052;273053 348709;348710;348711;348712;348713;348714;348715;348716;348717;348718;348719;348720;348721;348722;348723 348718 10 LSDQDLDQALSDEELNAFQK Unmodified 2278.0601 0.060100239 3547 Q8IXI1;H3BST5 RHOT2 Mitochondrial Rho GTPase 2 yes no 0 0 0 1 135.27 135.27 2 4.555E-47 142349 QUIQUE_DMIX5_190116_001 203.85 183.47 39700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39700000 0 0 29733 3547 27970 273054 348724 348724 1 LSDQFHDILIR Unmodified 1355.7197 0.7197494 1623 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Unmodified 1350.6779 0.67794416 4531 Q9UQB8;I3L4C2;B4DWA1;I3L3C6;I3L0Y9 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 60.33 60.33 2 1.7196E-12 58913 QUIQUE_C1368_190116_001 167.12 96.145 497290000 0 0 98258000 138360000 0 98436000 66568000 0 0 41535000 54139000 0 0 29739 4531 27975 273086;273087;273088;273089;273090;273091 348776;348777;348778;348779;348780;348781 348776 2 LSDSYSNTLPVRK Unmodified 1478.7729 0.77290718 4531 Q9UQB8;I3L4C2;B4DWA1;I3L3C6;I3L0Y9 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 39.278 39.278 3 0.01636 35320 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.681 10.148 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29740 4531 27976 273092 348782 348782 1 LSDVTLVPVSCSELEK Unmodified 1774.9023 0.90226638 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.38 101.38 2 1.8934E-08 104258 QUIQUE_DMIX8_190116_001 137.17 113.79 4222300000 384820000 353710000 333800000 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mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.91 59.91 2 0.00045175 60320 QUIQUE_C1218_190116_001 124.98 67.702 4174400000 426290000 278240000 365260000 274860000 304480000 323510000 339870000 263960000 326850000 148770000 408970000 345030000 368350000 29766 445 28002 273300;273301;273302;273303;273304;273305;273306;273307;273308;273309;273310;273311;273312 349028;349029;349030;349031;349032;349033;349034;349035;349036;349037;349038;349039;349040 349028 10 LSELDDR Unmodified 846.40831 0.40831125 1062;3165 J3QRU4;F8WCA0;L7N2F9;P63027;K7ENK9;K7EKX0;F5GZV7;P23763;Q15836 VAMP2;VAMP3;VAMP1 Vesicle-associated membrane protein 2;Vesicle-associated membrane protein 1;Vesicle-associated membrane protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.136 22.136 2 0.0042886 15434 QUIQUE_DMIX4_190116_001 162.07 70.483 5089900000 0 0 0 0 0 1151500000 0 744920000 848700000 470100000 888930000 0 985760000 29767 1062;3165 28003 273313;273314;273315;273316;273317;273318 349041;349042;349043;349044;349045;349046;349047 349044 7 LSELDDRADALQAGASQFETSAAK Unmodified 2493.1983 0.19832505 1062;3165 J3QRU4;F8WCA0;L7N2F9;P63027;K7ENK9;K7EKX0;Q15836 VAMP2;VAMP3 Vesicle-associated membrane protein 2;Vesicle-associated membrane protein 3 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 3 2 2 2 2 99.945 99.945 2;3 2.5102E-223 102610 QUIQUE_DMIX3_190116_001 274.81 242.18 4992600000 0 83675000 82693000 53515000 138370000 0 128440000 1165300000 804020000 0 648090000 569520000 1319000000 29768 1062;3165 28004 273319;273320;273321;273322;273323;273324;273325;273326;273327;273328;273329;273330;273331;273332;273333;273334 349048;349049;349050;349051;349052;349053;349054;349055;349056;349057;349058;349059;349060;349061;349062;349063;349064;349065;349066;349067;349068;349069 349063 20 LSELDQLLNTLWTR Unmodified 1700.9097 0.90973501 3244 Q504Y0 SLC39A12 Zinc transporter ZIP12 yes yes 0 0 0 1 1 168.59 168.59 2 1.6654E-28 172600 QUIQUE_DMIX7_190116_001 170.4 141.09 122080000 0 0 0 0 0 0 0 26635000 0 0 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2575.3507 0.35068379 4255;248 Q9NQG5;E9PIQ9;E9PQF3;K7EQR8;A0A0C4DGQ6;Q96P16 RPRD1B;RPRD1A Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B;Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 126.52 126.52 4 2.5926E-05 131114 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.123 50.59 449750000 0 0 58847000 71416000 0 0 0 56350000 86050000 0 92219000 84872000 0 29775 4255;248 28011 273362;273363;273364;273365;273366;273367 349101;349102;349103;349104;349105;349106 349104 4 LSEMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLTAAGMAR Oxidation (M) 3816.8703 0.87026133 2046 P12532;F8WCN3 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 1 1 1 2 3 2 2 2 2 1 2 1 3 2 2 140.35 140.35 3;4 4.0388E-86 144270 QUIQUE_C1368_190116_001 151.34 145.24 4230000000 213300000 446650000 402830000 315130000 231160000 246450000 311970000 220490000 319740000 141800000 404780000 418680000 557040000 29776 2046 28012 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349135;349136;349137;349138;349139;349140;349141;349142;349143;349144;349145;349146;349147;349148;349149;349150;349151;349152;349153;349154;349155;349156;349157;349158;349159;349160;349161;349162;349163;349164;349165;349166 349155 31 LSEMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLTAAGMAR 2 Oxidation (M) 3832.8652 0.86517595 2046 P12532;F8WCN3 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 2 1 1 1 135.5 135.5 4 6.7805E-21 132125 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.342 75.028 174040000 0 0 0 0 0 97006000 0 0 0 77038000 0 0 0 29778 2046 28012 273418;273419 349167;349168 349168 1358;1359 2 LSENNIQTIFAVTEEFQPVYK Unmodified 2469.2428 0.24275605 1893 P05556 ITGB1 Integrin beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 160.97 160.97 2;3 2.6716E-13 163328 QUIQUE_DMIX1_190116_001 153.7 142.6 921390000 20593000 38502000 53450000 27734000 162350000 44081000 39942000 42187000 165700000 7372500 54497000 192400000 72578000 29779 1893 28013 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Unmodified 1648.8196 0.8195826 1696 O94905;E5RHW4 ERLIN2 Erlin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 111.13 111.13 2 8.4257E-31 114988 QUIQUE_C1368_190116_001 168.02 142.63 2234300000 322900000 283330000 348320000 237570000 302110000 283780000 315310000 0 0 140980000 0 0 0 29797 1696 28030 273601;273602;273603;273604;273605;273606;273607;273608 349393;349394;349395;349396;349397;349398;349399;349400 349395 8 LSFGLEDEPLETATKEN Unmodified 1891.9051 0.90510315 1696 O94905 ERLIN2 Erlin-2 yes yes 0 0 1 1 112.97 112.97 2 0.0030743 119132 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.486 56.254 152340000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 152340000 0 0 29798 1696 28031 273609 349401 349401 1 LSFHTDYPALHHPPGVQLLHCIK Unmodified 2679.3744 0.37439612 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 87.763 87.763 5;6 0.0049818 86382 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.767 28.938 120340000 0 0 0 0 0 0 0 0 44231000 23610000 52499000 0 0 29799 1670 28032 273610;273611;273612 349402;349403;349404 349403 2 LSFICTEVDCK Unmodified 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158.82 2 0.00026197 164488 QUIQUE_C1218_190116_001 134.13 113.35 422000000 28380000 31739000 80469000 29032000 32579000 26712000 32253000 25163000 36469000 6989100 35214000 41824000 15176000 29804 2630 28037 273647;273648;273649;273650;273651;273652;273653;273654;273655;273656;273657;273658;273659 349443;349444;349445;349446;349447;349448;349449;349450;349451;349452;349453;349454;349455;349456;349457;349458;349459;349460;349461 349444 19 LSFMPFFLK Unmodified 1128.6042 0.60417428 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.89 150.89 2 0.0019615 155811 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.299 75.408 320940000 0 9088300 0 0 17292000 0 12893000 70802000 53536000 0 48403000 46920000 62005000 29805 2014 28038 273660;273661;273662;273663;273664;273665;273666;273667;273668;273669 349462;349463;349464;349465;349466;349467;349468;349469;349470;349471;349472;349473 349468 12 LSFNPTQLEEQCHI Unmodified 1714.7985 0.79847001 768 CON__P02754 yes yes 0 0 0 1 1 113.48 113.48 2 0.0011913 110021 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.662 68.708 25177000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25177000 0 0 0 + 29806 768 28039 273670;273671 349474;349475;349476 349475 3 LSFPMGR Unmodified 806.41089 0.4108942 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 64.733 64.733 2 0.03642 64252 QUIQUE_C1218_190116_001 86.121 86.121 24166000 24166000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29807 723 28040 273672 349477 349477 1 LSFQHDPETSVLVLR Unmodified 1739.9206 0.92063405 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 3 2 2 2 93.496 93.496 2;3 6.1312E-29 96396 QUIQUE_C1576_190116_001 162.31 144.04 3391200000 133260000 593260000 150200000 83500000 583130000 79686000 573070000 80922000 103570000 39839000 744470000 99981000 126350000 29808 956;3084 28041 273673;273674;273675;273676;273677;273678;273679;273680;273681;273682;273683;273684;273685;273686;273687;273688;273689;273690;273691;273692;273693;273694;273695;273696;273697 349478;349479;349480;349481;349482;349483;349484;349485;349486;349487;349488;349489;349490;349491;349492;349493;349494;349495;349496;349497;349498;349499;349500;349501;349502;349503;349504 349492 27 LSFSGLR Unmodified 778.43374 0.43373813 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.038 59.038 2 0.0083582 55830 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.61 36.051 6274800000 440840000 230900000 536640000 197380000 487780000 199510000 572300000 668240000 709840000 332350000 856190000 613920000 428930000 29809 3117 28042 273698;273699;273700;273701;273702;273703;273704;273705;273706;273707;273708;273709;273710 349505;349506;349507;349508;349509;349510;349511;349512;349513;349514;349515;349516;349517;349518;349519;349520;349521;349522;349523;349524;349525;349526 349521 21 LSFTSVGSITSGYSQSSQVFGR Unmodified 2294.1179 0.11788989 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 130.1 130.1 2 1.2468E-44 136515 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.95 166.86 485220000 23016000 83600000 49782000 0 44663000 0 24915000 37232000 0 0 61650000 87478000 72881000 29810 1916 28043 273711;273712;273713;273714;273715;273716;273717;273718;273719;273720;273721;273722;273723;273724;273725;273726 349527;349528;349529;349530;349531;349532;349533;349534;349535;349536;349537;349538;349539;349540;349541;349542 349538 14 LSFYYLIMAK Unmodified 1247.6624 0.66241744 1802 P01023;H0YFH1 A2M Alpha-2-macroglobulin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.49 139.49 2 0.0018121 144020 QUIQUE_C1277_190116_001 93.429 61.668 109930000 0 14811000 0 0 17106000 0 10782000 0 0 6025100 39638000 0 21572000 29811 1802 28044 273727;273728;273729;273730;273731;273732;273733 349543;349544;349545;349546;349547;349548;349549;349550 349543 8 LSGAGGAGGFR Unmodified 948.47773 0.47772821 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.584 23.584 2 3.9491E-37 16673 QUIQUE_C1563_190116_001 199.29 167.17 11757000000 1166900000 807810000 748360000 850110000 825020000 840730000 1141700000 977250000 710320000 457140000 1236800000 591620000 1403600000 29812 3176 28045 273734;273735;273736;273737;273738;273739;273740;273741;273742;273743;273744;273745;273746 349551;349552;349553;349554;349555;349556;349557;349558;349559;349560;349561;349562;349563;349564;349565;349566 349558 12 LSGDWNPLHIDPNFASLAGFDKPILHGLCTFGFSAR Unmodified 3969.9625 0.96246265 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 164.98 164.98 5 2.0974E-23 169552 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.22 70.603 351480000 0 0 0 0 0 0 52657000 0 78860000 0 219970000 0 0 29813 455 28046 273747;273748;273749 349567;349568;349569 349568 3 LSGFSFK Unmodified 784.41194 0.41194006 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.693 60.693 2 0.042242 57540 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.297 22.636 10381000000 1945100000 0 0 1012600000 1554100000 0 1165500000 749810000 1677000000 413190000 957540000 906470000 0 29814 2293 28047 273750;273751;273752;273753;273754;273755;273756;273757;273758 349570;349571;349572;349573;349574;349575;349576;349577;349578 349576 9 LSGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVAR Oxidation (M) 3315.5143 0.51425624 1936;845 E5RK69;P08133 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 167.7 167.7 3 9.9481E-20 171957 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.108 73.131 389390000 37350000 0 33402000 42693000 51491000 0 27053000 48420000 101620000 0 0 0 47362000 29815 845;1936 28048 273759;273760;273761;273762;273763;273764;273765;273766 349579;349580;349581;349582;349583;349584;349585;349586 349585 496 7 LSGGDDDAAGQFFPEAAQVAYQMWELSAVAR Unmodified 3299.5193 0.51934162 1936;845 E5RK69;P08133 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 3 2 2 1 175.37 175.37 2;3;4 2.0377E-87 182486 QUIQUE_DMIX5_190116_001 216.96 202.38 3106300000 19362000 26631000 16950000 0 84692000 20969000 223890000 125790000 523730000 0 1647700000 273480000 143150000 29816 845;1936 28048 273767;273768;273769;273770;273771;273772;273773;273774;273775;273776;273777;273778;273779;273780;273781;273782 349587;349588;349589;349590;349591;349592;349593;349594;349595;349596;349597;349598;349599;349600;349601;349602;349603 349600 17 LSGGGDWHIAYVLLYGPR Unmodified 1973.0159 0.015931421 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 3 2 1 142.8 142.8 2;3 8.3211E-24 147505 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.56 107.83 585850000 0 24328000 61211000 23190000 42124000 20436000 57226000 52535000 90090000 17763000 93456000 60291000 43200000 29817 2642 28049 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750.42759 0.42759012 2520 P49006 MARCKSL1 MARCKS-related protein yes yes 0 0 0 1 1 49.114 49.114 2 0.041681 46577 QUIQUE_C1368_190116_001 81.784 16.981 170780000 0 107940000 62839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29820 2520 28052 273810;273811 349633;349634 349634 2 LSGLTSTLPDTVLSHLFSQEELVNNTELVQSYR Unmodified 3689.8788 0.8788354 1191;4492 H3BQJ4;H3BPQ3;Q9ULP0 NDRG4 Protein NDRG4 no no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 165.68 165.68 3;4 7.5112E-149 171738 QUIQUE_C1438_190116_001 188.26 181.43 16110000000 1222200000 1636600000 2309100000 892090000 1428100000 1070900000 1400500000 1357800000 931660000 131370000 1880900000 1150600000 698570000 29821 1191;4492 28053 273812;273813;273814;273815;273816;273817;273818;273819;273820;273821;273822;273823;273824;273825;273826;273827;273828;273829;273830;273831;273832;273833;273834;273835;273836 349635;349636;349637;349638;349639;349640;349641;349642;349643;349644;349645;349646;349647;349648;349649;349650;349651;349652;349653;349654;349655;349656;349657;349658;349659;349660;349661;349662;349663;349664;349665 349645 31 LSGLTTNVVDIILAHHFGQEELQANLDLIQTYR Unmodified 3720.9475 0.94752409 4423 Q9UGV2;Q5TH30;F8WBF9 NDRG3 Protein NDRG3 yes no 0 0 0 1 165.67 165.67 4 7.5081E-10 169850 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.137 49.3 53106000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53106000 0 29822 4423 28054 273837 349666 349666 1 LSGLVFFPHLDR Unmodified 1399.7612 0.76122028 4552 Q9Y2C4 EXOG Nuclease EXOG, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 115.24 115.24 3 0.0001012 118811 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.64 82.287 268770000 33202000 42225000 27065000 23866000 0 19641000 0 22534000 35274000 11440000 20376000 0 33151000 29823 4552 28055 273838;273839;273840;273841;273842;273843;273844;273845;273846;273847;273848;273849 349667;349668;349669;349670;349671;349672;349673;349674;349675;349676;349677;349678 349675 11 LSGPLKEQYAQEHGLNFQR Unmodified 2214.1182 0.11816466 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 1 1 1 62.619 62.619 3;4 0.004514 61319 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.089 35.488 45703000 0 0 0 0 0 0 0 20317000 0 0 0 25386000 0 29824 3116 28056 273850;273851 349679;349680;349681 349680 3 LSGQDVER Unmodified 902.44576 0.44575938 2869;903;4487 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3;Q9ULD0 OGDH;OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial;2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 16.335 16.335 2 0.022334 8870 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.301 29.58 209650000 0 0 0 0 0 0 0 82753000 0 126900000 0 0 0 29825 903;2869;4487 28057 273852;273853 349682;349683;349684;349685 349682 4 LSGSHSQGVAYPVR Unmodified 1456.7423 0.74227576 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 22.201 22.201 3 0.00024993 15286 QUIQUE_C1368_190116_001 59.864 38.635 215410000 0 0 53028000 0 70523000 0 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A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 47.041 47.041 2;3 0.0013954 43051 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.666 59.486 2373600000 0 0 204370000 0 526610000 754400000 400910000 0 0 186690000 300640000 0 0 29839 96 28071 274017;274018;274019;274020;274021;274022;274023;274024;274025;274026 349877;349878;349879;349880;349881;349882;349883;349884;349885;349886 349885 6 LSIIGEVLSR Unmodified 1085.6445 0.64445919 3534 Q8IWA4;C9JXQ1 MFN1 Mitofusin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.13 113.13 2 0.0077984 117398 QUIQUE_C1368_190116_001 72.643 20.789 84607000 0 0 12138000 0 0 10544000 12748000 0 13920000 0 11503000 12564000 11190000 29840 3534 28072 274027;274028;274029;274030;274031;274032;274033;274034;274035;274036 349887;349888;349889;349890;349891;349892;349893;349894;349895;349896 349888 10 LSILENR Unmodified 843.48142 0.48141661 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 45.126 45.126 2 0.033929 42226 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.029 21.036 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cognate 71 kDa protein no no 0 0 1 1 1 1 1 1 17.186 17.186 2 0.027105 10074 QUIQUE_C1218_190116_001 110.22 8.8062 3199700000 124580000 0 0 0 0 0 0 0 522120000 0 1067900000 569540000 915540000 29855 558;2010 28087 274119;274120;274121;274122;274123 350000;350001;350002;350003;350004 350000 1 LSKEEIER Unmodified 1002.5346 0.53457439 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 0 1 1 14.54 14.54 2 0.062457 6734 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.439 30.44 179520000 0 0 0 0 0 0 0 179520000 0 0 0 0 0 29856 282;2362 28088 274124 350005 350005 1 LSKPCCYIFPGGR Unmodified 1553.7483 0.74828911 2483;921 E9PGC8;P78559;P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1A;MAP1B Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2;Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 no no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 2 63.561 63.561 2;3 0.0022055 63528 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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350081;350082;350083;350084;350085;350086;350087;350088;350089;350090;350091 350089 10 LSLDELGR Unmodified 901.4869 0.48689592 590 B1AKY9;P50993 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 70.272 70.272 2 0.0036296 74746 QUIQUE_C1218_190116_001 116.3 55.651 2332300000 156210000 132970000 307570000 231540000 196660000 117800000 152840000 217870000 204950000 62413000 238260000 134350000 178870000 29863 590 28095 274190;274191;274192;274193;274194;274195;274196;274197;274198;274199;274200;274201;274202;274203;274204;274205 350092;350093;350094;350095;350096;350097;350098;350099;350100;350101;350102;350103;350104;350105;350106;350107;350108;350109;350110;350111;350112;350113;350114;350115;350116;350117;350118;350119;350120;350121 350093 30 LSLDELHR Unmodified 981.52434 0.52434406 1872 P05023;Q5TC01;Q5TC02 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.824 49.824 2 0.013433 48595 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alpha-8 chain yes no 0 0 1 1 24.31 24.31 2 0.048153 18199 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.252 29.758 228050000 0 0 0 0 0 0 0 0 228050000 0 0 0 0 29869 688 28101 274241 350160 350160 1 LSLEDLFR Unmodified 991.53385 0.53384611 3603 Q8N608;C9J4M8;J3KQK8;J3KPP1 DPP10 Inactive dipeptidyl peptidase 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.79 142.79 2 0.0018048 148512 QUIQUE_C1218_190116_001 139.28 49.73 590450000 55454000 52311000 57706000 38014000 54233000 37113000 64654000 30318000 32902000 31890000 53775000 40269000 41808000 29870 3603 28102 274242;274243;274244;274245;274246;274247;274248;274249;274250;274251;274252;274253;274254 350161;350162;350163;350164;350165;350166;350167;350168;350169;350170;350171;350172;350173;350174 350161 14 LSLEEFFNSAVHLLSR Unmodified 1860.9734 0.9733979 1212 H7BXZ5;J3QSW6;O60229;C9IZQ6;H7C0I9 KALRN Kalirin yes no 0 0 0 1 170.35 170.35 3 0.00041803 173947 QUIQUE_C1277_190116_001 65.716 52.486 13432000 0 13432000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29871 1212 28103 274255 350175 350175 1 LSLEEFIR Unmodified 1005.5495 0.54949617 2407;2726;2826 P37235;P61601;P84074 HPCAL1;NCALD;HPCA Hippocalcin-like protein 1;Neurocalcin-delta;Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.67 117.67 2 3.2478E-10 123030 QUIQUE_C1438_190116_001 185.42 139.7 3429600000 356370000 396050000 317500000 269310000 287240000 265860000 360850000 122980000 214480000 102030000 250210000 229210000 257450000 29872 2407;2726;2826 28104 274256;274257;274258;274259;274260;274261;274262;274263;274264;274265;274266;274267;274268 350176;350177;350178;350179;350180;350181;350182;350183;350184;350185;350186;350187;350188;350189;350190;350191;350192;350193;350194;350195;350196;350197;350198;350199;350200;350201;350202;350203;350204;350205;350206;350207 350189 32 LSLEFGDPASSLFR Unmodified 1537.7777 0.77765821 3369 Q6L8Q7;F6T1Q0 PDE12 2',5'-phosphodiesterase 12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.23 143.23 2 1.0362E-06 149015 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274281;274282;274283;274284;274285;274286;274287;274288;274289;274290;274291;274292;274293;274294;274295;274296;274297;274298;274299;274300;274301;274302;274303;274304;274305;274306;274307;274308;274309;274310;274311 350220;350221;350222;350223;350224;350225;350226;350227;350228;350229;350230;350231;350232;350233;350234;350235;350236;350237;350238;350239;350240;350241;350242;350243;350244;350245;350246;350247;350248;350249;350250;350251;350252;350253;350254;350255;350256;350257;350258;350259;350260;350261;350262;350263;350264;350265;350266;350267;350268;350269;350270;350271;350272;350273;350274;350275;350276;350277;350278;350279;350280;350281 350224 62 LSLEIEQLELQR Unmodified 1469.809 0.80895834 1847 P04003 C4BPA C4b-binding protein alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 118.25 118.25 2 3.2373E-28 123473 QUIQUE_C1438_190116_001 183.72 97.86 172830000 44171000 0 0 0 96436000 0 0 0 0 32226000 0 0 0 29875 1847 28107 274312;274313;274314 350282;350283;350284;350285 350283 4 LSLELLK Unmodified 814.51641 0.51640513 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 87.219 87.219 2 0.026275 88903 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.262 17.415 9845200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9845200 0 29876 2447 28108 274315 350286 350286 1 LSLEQLSLDLYQGTGSLAQVPLDK Unmodified 2587.3745 0.37449851 3814 Q96BY7 ATG2B Autophagy-related protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 167.45 167.45 3 0.020355 170367 QUIQUE_C1403_190116_001 26.5 19.739 22610000 0 0 0 22610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29877 3814 28109 274316 350287 350287 1 LSLESEGAGEGAAASPELSALEEAFR Unmodified 2590.2399 0.23985552 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 0 2 3 3 3 2 2 2 2 2 3 1 2 2 153.68 153.68 2;3 4.8106E-240 159318 QUIQUE_C1368_190116_001 319.15 296.16 4682000000 551540000 724710000 561830000 396440000 397170000 516650000 379980000 185740000 193020000 189670000 106790000 248590000 229880000 29878 1687 28110 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350456;350457;350458;350459;350460;350461;350462;350463;350464;350465;350466;350467;350468;350469;350470 350459 15 LSLMPWFHGK Oxidation (M) 1230.6219 0.62194961 2439 P41240;H3BUM9;K7ENL8;K7ES68;K7EQY5;P42679 CSK;MATK Tyrosine-protein kinase CSK;Non-specific protein-tyrosine kinase;Megakaryocyte-associated tyrosine-protein kinase yes no 0 1 0 1 80.427 80.427 3 0.051267 80661 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.282 33.23 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29889 2439 28120 274465 350471 350471 1 LSLNIDPDAK Unmodified 1084.5764 0.57643921 2079 P14625;H0YIV0 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 72.211 72.211 2 0.0047561 68408 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.108 47.999 942770000 369940000 273790000 0 0 0 0 0 111240000 0 187800000 0 0 0 29890 2079 28121 274466;274467;274468;274469 350472;350473;350474;350475;350476 350476 5 LSLPDNDLTTLPASIANLINLR Unmodified 2363.306 0.30602501 3936 Q96RT1;B4DIP2 ERBB2IP Protein LAP2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 170.76 170.76 2;3 4.9648E-07 176882 QUIQUE_C1438_190116_001 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350493;350494;350495;350496;350497;350498;350499;350500;350501;350502 350494 10 LSLQDVAELIR Unmodified 1255.7136 0.71360139 4290 Q9NTG7;E9PM75 SIRT3 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.04 148.04 2 0.0062467 152309 QUIQUE_C1277_190116_001 66.92 35.286 830720000 91606000 118020000 95761000 47851000 87381000 116350000 0 68122000 43900000 0 73075000 88653000 0 29894 4290 28125 274496;274497;274498;274499;274500;274501;274502;274503;274504;274505 350503;350504;350505;350506;350507;350508;350509;350510;350511;350512;350513 350504 11 LSLQLALTELETLAEK Unmodified 1770.9979 0.99788132 3339 Q5VXI4;Q9HCE6;A0A384DVK7 ARHGEF10L Rho guanine nucleotide exchange factor 10-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 169.57 169.57 2 1.9532E-06 174000 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.71 104.49 91663000 23483000 5669400 20270000 0 22006000 0 0 0 20235000 0 0 0 0 29895 3339 28126 274506;274507;274508;274509;274510 350514;350515;350516;350517;350518 350518 5 LSLQNCCLTGAGCGVLSSTLR Unmodified 2266.0868 0.086806232 2055 P13489;E9PIM9;E9PMJ3;E9PLZ3;E9PIK5 RNH1 Ribonuclease inhibitor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.62 116.62 2 1.4396E-43 120658 QUIQUE_C1368_190116_001 190.87 171.27 1399200000 96464000 0 107520000 150870000 123210000 144430000 153020000 110390000 97015000 39122000 107710000 107470000 161930000 29896 2055 28127 274511;274512;274513;274514;274515;274516;274517;274518;274519;274520;274521;274522 350519;350520;350521;350522;350523;350524;350525;350526;350527;350528;350529;350530;350531;350532 350522 12 LSLSFALADGSHK Unmodified 1344.7038 0.70376498 3369 Q6L8Q7;F6T1Q0 PDE12 2',5'-phosphodiesterase 12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.217 83.217 3 0.0030142 84684 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.487 47.561 91584000 0 19786000 0 19437000 17916000 14677000 0 0 19769000 0 0 0 0 29897 3369 28128 274523;274524;274525;274526;274527 350533;350534;350535;350536;350537 350537 5 LSLSNAISTALPLTQLR Unmodified 1797.036 0.035998161 3053 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domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 142.7 142.7 3 0.00035684 139006 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.024 48.978 263110000 0 0 53973000 40118000 0 47418000 0 0 0 63049000 0 58548000 0 29904 3712 28135 274590;274591;274592;274593;274594 350614;350615;350616;350617;350618 350617 5 LSMINTMSK Unmodified 1023.5093 0.50928762 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 49.152 49.152 2 0.001817 46849 QUIQUE_C1218_190116_001 99.802 21.61 205340000 152440000 0 0 0 0 0 0 0 0 52897000 0 0 0 29905 3982 28136 274595;274596;274597 350619;350620;350621 350619 3 LSMKPEPLFR Unmodified 1216.6638 0.66381443 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 61.854 61.854 2;3 0.00074358 59443 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.048 81.023 4761900000 457180000 516270000 444560000 354100000 0 0 885510000 396220000 0 123170000 759010000 236690000 589160000 29906 2483 28137 274598;274599;274600;274601;274602;274603;274604;274605;274606;274607;274608;274609 350622;350623;350624;350625;350626;350627;350628;350629;350630;350631;350632;350633;350634 350630 9 LSMSQLNEK Oxidation (M) 1064.5172 0.51720977 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 1 0 1 1 1 18.106 18.106 2 0.0013367 10717 QUIQUE_DMIX7_190116_001 106.6 58.751 59361000 0 0 0 0 0 0 12356000 0 22293000 0 0 24711000 0 29907 2916 28138 274610;274611;274612 350635;350636;350637 350637 2395 3 LSMSQLNEK Unmodified 1048.5223 0.52229515 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 40.38 40.38 2 0.014961 37525 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.98 57.766 85516000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85516000 0 29908 2916 28138 274613;274614 350638;350639 350638 1 LSMYGVDLHHAK Unmodified 1369.6813 0.6812554 143;4559;560;4172;933;1529;3243 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;O43491;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A0A0MRA8;A0A1B0GTF8;A8K968;Q9Y2J2;Q4VXN0 EPB41L2;EPB41L1;EPB41L3 Band 4.1-like protein 2;Band 4.1-like protein 1;Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 42.606 42.606 2;3 0.00012754 39070 QUIQUE_C1368_190116_001 110.38 92.07 6505500000 688980000 808400000 539940000 779470000 205890000 879120000 0 598320000 416150000 160620000 712970000 0 715650000 29909 933;1529;4172;143;560;4559;3243 28139 274615;274616;274617;274618;274619;274620;274621;274622;274623;274624;274625;274626;274627;274628;274629;274630;274631;274632 350640;350641;350642;350643;350644;350645;350646;350647;350648;350649;350650;350651;350652;350653;350654;350655;350656;350657;350658;350659;350660;350661 350645 18 LSMYGVDLHHAK Oxidation (M) 1385.6762 0.67617003 143;4559;560;4172;933;1529;3243 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;O43491;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A0A0MRA8;A0A1B0GTF8;A8K968;Q9Y2J2;Q4VXN0 EPB41L2;EPB41L1;EPB41L3 Band 4.1-like protein 2;Band 4.1-like protein 1;Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 1 0 1 1 1 1 2 1 1 1 24.589 24.589 2;3 0.00061295 18541 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.692 75.912 426340000 0 32150000 0 37581000 0 0 0 0 116790000 70196000 47686000 121930000 0 29910 933;1529;4172;143;560;4559;3243 28139 274633;274634;274635;274636;274637;274638;274639;274640;274641 350662;350663;350664;350665;350666;350667;350668;350669;350670 350667 81;572 9 LSMYGVDLHK Unmodified 1161.5852 0.58522975 449 A0A3B3ITP0;A0A2R8Y7Y3;Q4VB86;A0A2R8YD30;A0A2U3TZH6;P11171;A0A2R8Y6D0;A0A2R8Y420;A0A2R8Y7N0;A0A2R8YFR9;A0A2R8Y6G5;A0A2R8Y570;A0A2R8Y5G2;A0A2R8Y5Z6;A0A3B3IU06;A0A1B0GWG0;A0A3B3IUD6;A0A2R8YCW8;A0A2R8Y4N6;A0A2R8Y6T6;A0A3B3ITC5 EPB41 Protein 4.1 yes no 0 0 0 1 1 62.611 62.611 3 0.024965 62140 QUIQUE_C1277_190116_001 43.168 30.211 14064000 0 0 0 0 0 14064000 0 0 0 0 0 0 0 29911 449 28140 274642;274643 350671;350672 350671 2 LSMYLMKADLMPFLYWNMMLR Unmodified 2666.2955 0.29554214 4660 Q9Y6N5;H3BNP9 SQRDL Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 78.358 78.358 5 0.056433 79829 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LSNHVFVFQGAGEAAMGIAHLLVMALEK Unmodified 2952.5354 0.53538979 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 2 171.44 171.44 3;4 1.0216E-12 178725 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.952 63.725 126590000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 126590000 0 0 29915 3198 28144 274663;274664 350695;350696;350697 350695 3 LSNIFVIGK Unmodified 989.59097 0.59096706 2757 P62701 RPS4X 40S ribosomal protein S4, X isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 87.961 87.961 2 0.00042841 90132 QUIQUE_C1277_190116_001 119.21 87.907 571910000 43958000 62834000 54674000 60524000 70443000 33247000 54714000 43010000 34944000 19443000 44598000 0 49519000 29916 2757 28145 274665;274666;274667;274668;274669;274670;274671;274672;274673;274674;274675;274676;274677;274678 350698;350699;350700;350701;350702;350703;350704;350705;350706;350707;350708;350709;350710;350711;350712 350700 13 LSNLALVKPEK Unmodified 1210.7285 0.72852317 1344 K7EQA1;O14737 PDCD5 Programmed cell death protein 5 yes no 0 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15 LSPDAFIQMALQLAYYR Unmodified 1999.0237 0.023718915 2462 P43155;H0Y4Z7 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes no 0 0 0 1 1 174.45 174.45 3 0.00016253 181574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.816 62.513 38364000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27022000 11342000 0 29933 2462 28159 274811;274812 350860;350861 350860 2 LSPDAIPGK Unmodified 896.49673 0.49673232 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.681 33.681 2 0.025868 28763 QUIQUE_C1277_190116_001 58.981 35.961 339400000 0 78867000 66921000 89316000 0 0 0 0 0 0 104300000 0 0 29934 2524 28160 274813;274814;274815;274816 350862;350863;350864;350865 350862 4 LSPDAVAQLAFQMAFLR Unmodified 1876.9869 0.98693948 2223 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351221;351222;351223;351224;351225;351226;351227;351228;351229;351230;351231;351232 351224 11 LSQETEALGR Unmodified 1102.5619 0.56185177 2877 Q02818 NUCB1 Nucleobindin-1 yes yes 0 0 0 1 1 27.56 27.56 2 0.025788 21944 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.908 13.039 89388000 0 0 41900000 0 0 0 0 0 0 0 47487000 0 0 29970 2877 28195 275081;275082 351233;351234 351234 2 LSQGSGSSITAAGMR Unmodified 1421.6933 0.69327665 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.153 37.153 2 0.0032558 33676 QUIQUE_C1576_190116_001 64.945 37.173 22067000 0 0 22067000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29971 135 28196 275083;275084;275085;275086 351235;351236;351237;351238 351238 4 LSQGVTLVVDR Unmodified 1185.6717 0.67173657 2224 P23919;H7BZ20 DTYMK Thymidylate kinase yes no 0 0 0 1 61.418 61.418 2 0.024089 60789 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.597 20.784 11934000 0 0 0 0 0 0 0 0 11934000 0 0 0 0 29972 2224 28197 275087 351239 351239 1 LSQIGVENTEENR Unmodified 1487.7216 0.72159989 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.648 37.648 2 1.7012E-12 32851 QUIQUE_DMIX4_190116_001 149.96 135.27 16631000000 1588900000 1729200000 1916700000 1527500000 1188200000 1764000000 1302200000 702850000 1007600000 859130000 1081900000 905030000 1058200000 29973 1978 28198 275088;275089;275090;275091;275092;275093;275094;275095;275096;275097;275098;275099;275100 351240;351241;351242;351243;351244;351245;351246;351247;351248;351249;351250;351251;351252;351253;351254;351255 351252 16 LSQIGVENTEENRR Unmodified 1643.8227 0.82271092 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 1 2 2 2 2 2 2 25.7 25.7 2;3 7.6098E-22 20243 QUIQUE_C1218_190116_001 149.23 107.69 76461000000 4127200000 6235400000 3681900000 6759200000 6123800000 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LSQMGVTTDGVPAQQLR Unmodified 1799.92 0.91998213 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A140T8W4 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 19.329 19.329 3;4 0.0002354 12594 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.594 47.497 863760000 0 0 0 0 0 0 44567000 181720000 105920000 0 307280000 101180000 123100000 29981 135 28206 275163;275164;275165;275166;275167;275168;275169 351345;351346;351347;351348;351349;351350;351351 351346 7 LSQNNFALGYK Unmodified 1253.6404 0.64043645 4545 Q9Y277 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.759 64.759 2 5.921E-09 64629 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.86 95.861 14293000000 1046400000 908650000 1270700000 1077700000 899440000 1128600000 1083300000 1104500000 1059600000 532730000 1419300000 1438200000 1324300000 29982 4545 28207 275170;275171;275172;275173;275174;275175;275176;275177;275178;275179;275180;275181;275182 351352;351353;351354;351355;351356;351357;351358;351359;351360;351361;351362;351363;351364;351365;351366;351367;351368;351369;351370;351371;351372;351373;351374;351375;351376;351377 351372 26 LSQNSLASQEEGSLGEAWAQVK Unmodified 2331.1343 0.13426824 1597 O60861 GAS7 Growth arrest-specific protein 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 117.15 117.15 2 4.8548E-11 120065 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.94 139.26 222650000 0 38418000 0 0 31638000 29669000 0 38919000 42481000 0 41525000 0 0 29983 1597 28208 275183;275184;275185;275186;275187;275188 351378;351379;351380;351381;351382;351383 351381 6 LSQPITVQVWNHR Unmodified 1576.8474 0.84740953 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 1 45.82 45.82 3 0.066015 43406 QUIQUE_DMIX7_190116_001 28.283 6.4801 196260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 196260000 0 29984 877 28209 275189 351384 351384 1 LSQSDEDVIR Unmodified 1160.5673 0.56733108 4182 Q9H7D7;H0Y917 WDR26 WD repeat-containing protein 26 yes no 0 0 0 1 1 1 36.962 36.962 2 0.023203 31249 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member 3 yes yes 0 0 0 1 44.022 44.022 3 1.81E-13 40631 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.624 83.419 43190000 0 0 0 0 0 0 0 43190000 0 0 0 0 0 29988 4523 28213 275202 351398 351398 1 LSQYQEPLHLPGVR Unmodified 1635.8733 0.87328993 1881 P05165 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.258 77.258 2;3 6.0222E-05 78079 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109 97.082 1050500000 94188000 75862000 92978000 89676000 71587000 75906000 79964000 75287000 78507000 48567000 85109000 85967000 96940000 29989 1881 28214 275203;275204;275205;275206;275207;275208;275209;275210;275211;275212;275213;275214;275215;275216 351399;351400;351401;351402;351403;351404;351405;351406;351407;351408;351409;351410;351411;351412;351413;351414;351415;351416;351417;351418;351419;351420;351421;351422;351423 351415 25 LSRPFQNQTHAK Unmodified 1425.7477 0.74769548 397;2473 D6RJF9;A0A286YFI3;A0A286YFC0;A8MWW6;A0A286YFJ6;A0A286YFJ4;A0A286YEN5;A0A286YF85;A0A286YFA6;A0A286YF62;A0A286YEW9;P53779;A0A286YFN2;A0A286YFB6;A0A286YFM6;A0A286YEQ0;A0A286YEQ7;A0A286YEX7;A0A1P0B7D2;A0A286YFD7;A0A286YES9;A0A286YF97;A0A286YEV3;A0A286YF35;A0A286YF19;A0A286YF83;A0A286YEY0;P45983;D6RCB1;D7R525;D6R9C1;D6RDG1;A0A286YFK3;D6RAU3;A0A286YF95;E5RJ57;A0A1W2PPW1;D6RAJ0;C9J762;A8MPV1;P45984;J3KNK1 MAPK10;MAPK8;MAPK9 Mitogen-activated protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 11.623 11.623 3;4 0.00035141 4476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.368 76.313 196520000 0 0 0 2112500 31285000 0 21229000 17894000 0 0 55587000 30927000 37481000 29990 397;2473 28215 275217;275218;275219;275220;275221;275222;275223;275224;275225 351424;351425;351426;351427;351428;351429;351430;351431;351432;351433 351428 9 LSRPNIFILNNR Unmodified 1455.831 0.83103118 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 78.472 78.472 3 0.0014968 79504 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351441;351442;351443;351444;351445;351446;351447;351448;351449;351450;351451;351452;351453;351454 351451 10 LSSAWPGTLR Unmodified 1086.5822 0.58219329 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.636 68.636 2 0.00028766 68939 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.05 79.655 2525500000 0 0 196970000 373490000 117810000 318990000 264200000 0 582420000 0 0 0 671610000 29994 4464 28219 275246;275247;275248;275249;275250;275251;275252;275253;275254 351455;351456;351457;351458;351459;351460;351461;351462;351463 351462 9 LSSCDMCELAR Unmodified 1340.5523 0.55229142 2854 Q01433;H0Y360 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.638 58.638 2 0.005931 58143 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.704 37.017 260810000 0 0 64564000 0 0 47527000 51242000 0 0 0 44703000 0 52777000 29995 2854 28220 275255;275256;275257;275258;275259 351464;351465;351466;351467;351468 351467 4 LSSCDSFTSTINELNHCLSLR Unmodified 2453.1315 0.13150782 1929 P07814;V9GYZ6;V9GZ76 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.43 135.43 3 1.3049E-14 138377 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.23 113.02 1015800000 53183000 100170000 102540000 77516000 102710000 76472000 95244000 70926000 68253000 13277000 96440000 70247000 88861000 29996 1929 28221 275260;275261;275262;275263;275264;275265;275266;275267;275268;275269;275270;275271;275272 351469;351470;351471;351472;351473;351474;351475;351476;351477;351478;351479;351480;351481;351482;351483;351484 351477 15 LSSDCEDQIR Unmodified 1221.5296 0.52956537 3765 Q92896 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 24.86 24.86 2 0.016178 18515 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.823 34.096 83946000 0 19615000 0 0 0 0 27981000 0 0 0 36350000 0 0 29997 3765 28222 275273;275274;275275;275276 351485;351486;351487;351488 351488 4 LSSDVLTLLIK Unmodified 1200.7329 0.73293985 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 136.35 136.35 2 0.015195 141246 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.859 32.936 821380000 156100000 0 0 111280000 0 0 0 0 180360000 58307000 176690000 0 138640000 29998 1324 28223 275277;275278;275279;275280;275281;275282 351489;351490;351491;351492;351493;351494 351494 4 LSSEFVFNNPNIK Unmodified 1507.7671 0.76709352 4032 Q9BUE6;Q5TBE2 ISCA1 Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 93.952 93.952 2 0.0058675 96465 QUIQUE_C1218_190116_001 65.157 48.44 36639000 36639000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29999 4032 28224 275283;275284 351495;351496 351495 2 LSSEMNTSTVNSAR Unmodified 1495.6937 0.69367058 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.61 31.61 2 4.5272E-116 26295 QUIQUE_C1403_190116_001 240.85 194.72 1069200000 145820000 105770000 117540000 108480000 0 83667000 87503000 65923000 74975000 41596000 106000000 63900000 68023000 30000 2171 28225 275285;275286;275287;275288;275289;275290;275291;275292;275293;275294;275295;275296 351497;351498;351499;351500;351501;351502;351503;351504;351505;351506;351507;351508;351509;351510;351511 351501 13 LSSEMNTSTVNSAR Oxidation (M) 1511.6886 0.68858521 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 18.205 18.205 2 0.019964 10677 QUIQUE_C1368_190116_001 69.451 54.185 55729000 0 0 15859000 0 0 0 9576200 0 0 12422000 17871000 0 0 30001 2171 28225 275297;275298;275299;275300 351512;351513;351514;351515 351512 3 LSSEQFHEAASK Unmodified 1332.631 0.63099397 1308 J3QTA6;Q9BRQ6;H0Y922 CHCHD6 MICOS complex subunit MIC25 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 2 20.948 20.948 2;3 7.2646E-38 14039 QUIQUE_C1438_190116_001 194.17 151.57 1630400000 78866000 122670000 174550000 112120000 204610000 79682000 171590000 150930000 160350000 25690000 81207000 67140000 201000000 30002 1308 28226 275301;275302;275303;275304;275305;275306;275307;275308;275309;275310;275311;275312;275313;275314;275315;275316;275317;275318;275319 351516;351517;351518;351519;351520;351521;351522;351523;351524;351525;351526;351527;351528;351529;351530;351531;351532;351533;351534 351521 17 LSSFATSVAEDQSVASLTAPQTEETGK Unmodified 2753.3243 0.32431343 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 112.27 112.27 2;3 3.0069E-09 115728 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.284 90.556 277610000 0 0 0 0 120720000 0 0 130990000 0 25900000 0 0 0 30003 921 28227 275320;275321;275322;275323;275324 351535;351536;351537;351538;351539;351540;351541 351541 7 LSSGGGSSSETVGR Unmodified 1279.6004 0.60042213 418 A0A2R8Y4D7;Q96PE2 ARHGEF17 Rho guanine nucleotide exchange factor 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.66 14.66 2 1.0338E-17 6858 QUIQUE_C1576_190116_001 154.66 89.619 410890000 44192000 0 45809000 0 62180000 54533000 48604000 0 36007000 0 51484000 30981000 37100000 30004 418 28228 275325;275326;275327;275328;275329;275330;275331;275332;275333 351542;351543;351544;351545;351546;351547;351548;351549;351550;351551 351547 8 LSSGNEENKKEEDNDEIK Unmodified 2076.9447 0.94473613 4430 Q9UHD1;E9PPQ5 CHORDC1 Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1 yes no 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 11.081 11.081 2;3;4 1.8193E-104 3209 QUIQUE_C1277_190116_001 183.36 143.27 456310000 0 10254000 48738000 43605000 95787000 22251000 44489000 0 62216000 0 63445000 18997000 46530000 30005 4430 28229 275334;275335;275336;275337;275338;275339;275340;275341;275342;275343;275344;275345;275346;275347;275348;275349 351552;351553;351554;351555;351556;351557;351558;351559;351560;351561;351562;351563;351564;351565;351566;351567;351568 351553 16 LSSIIDCTGTASYHGFLPVLVR Unmodified 2405.2413 0.24131626 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 134.22 134.22 3 0.00055106 139143 QUIQUE_C1368_190116_001 45.844 31.829 180480000 0 0 95791000 0 0 24244000 34626000 25823000 0 0 0 0 0 30006 3471 28230 275350;275351;275352;275353 351569;351570;351571;351572;351573 351570 5 LSSLEGLHTK Unmodified 1083.5924 0.59242362 4556 Q9Y2I1;C9J715 NISCH Nischarin yes no 0 0 0 1 25.667 25.667 3 0.053834 19291 QUIQUE_C1403_190116_001 25.892 12.934 33372000 0 0 0 33372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30007 4556 28231 275354 351574 351574 1 LSSLIILMPHHVEPLER Unmodified 1983.0976 0.09755256 2565 P50454;E9PKH2;E9PR70;E9PPV6 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 98.66 98.66 3;4 0.0026517 100981 QUIQUE_C1403_190116_001 47.916 27.548 104560000 0 16952000 0 19366000 22245000 24527000 21468000 0 0 0 0 0 0 30008 2565 28232 275355;275356;275357;275358;275359;275360 351575;351576;351577;351578;351579;351580 351576 5 LSSLNLTNQALNK Unmodified 1414.778 0.77799256 3524 Q86YS7;H0YFC4 C2CD5 C2 domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 68.156 68.156 2 0.0015883 67753 QUIQUE_C1277_190116_001 78.759 45.916 181310000 43049000 39690000 0 0 0 0 0 33642000 0 0 0 0 64924000 30009 3524 28233 275361;275362;275363;275364;275365 351581;351582;351583;351584;351585;351586 351582 6 LSSLPFQK Unmodified 918.51747 0.51746776 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.871 55.871 2 0.0051766 55014 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.42 29.569 3677100000 0 0 333130000 0 0 258240000 0 457180000 528570000 195580000 647660000 556590000 700110000 30010 2734 28234 275366;275367;275368;275369;275370;275371;275372;275373 351587;351588;351589;351590;351591;351592;351593;351594;351595 351589 9 LSSLQDVQAAPALAGVLWDHLSEK Unmodified 2547.3333 0.33330239 3494 Q86UX6 STK32C Serine/threonine-protein kinase 32C yes yes 0 0 0 1 152.54 152.54 3 0.045571 156860 QUIQUE_C1277_190116_001 22.096 8.9082 63547000 0 63547000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30011 3494 28235 275374 351596 351596 1 LSSLSDPVSER Unmodified 1188.5986 0.59863121 4058 Q9BX66;S4R303 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.955 45.955 2 0.0011193 42830 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.21 60.392 366370000 0 0 0 0 73441000 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LSTGPALVAAGLAPAEVVVATVASSGVVK Unmodified 2633.5004 0.50036772 34 E7ER32;A0A087X287;B0QY83;A0A087WU73;W0Z7M9;Q969V6 MKL1;mkl1 MKL/myocardin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 170.75 170.75 3 4.5645E-13 173403 QUIQUE_C1403_190116_001 71.297 63.851 15545000 0 0 0 15545000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30033 34 28256 275535 351818 351818 1 LSTGVFRPQLDEPIPLYEAK Unmodified 2272.2103 0.21033371 1755 O95825;A6NMA8 CRYZL1 Quinone oxidoreductase-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.12 116.12 3 0.00017356 113578 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.152 55.804 776140000 69177000 78725000 63166000 75009000 0 56549000 86626000 82745000 0 33294000 134920000 95926000 0 30034 1755 28257 275536;275537;275538;275539;275540;275541;275542;275543;275544;275545 351819;351820;351821;351822;351823;351824;351825;351826;351827;351828;351829;351830 351827 11 LSTHELTSLLEK Unmodified 1369.7453 0.74529545 1111;3416 H0Y2S9;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.807 86.807 3 0.0006565 84578 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.76 48.373 125150000 20740000 0 30802000 0 0 0 0 16498000 0 9466400 15761000 0 31883000 30035 1111;3416 28258 275546;275547;275548;275549;275550;275551 351831;351832;351833;351834;351835;351836;351837 351835 6 LSTIALALGVER Unmodified 1241.7343 0.73433683 2309 P30153;C9J9C1;P30154;E9PPI5;E9PNM7;E9PHZ6 PPP2R1A;PPP2R1B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A beta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 105.63 105.63 2 0.00038248 108871 QUIQUE_C1403_190116_001 113.47 84.386 3857000000 317390000 302700000 295490000 234650000 290400000 401820000 273330000 376160000 318380000 123370000 305120000 298710000 319460000 30036 2309 28259 275552;275553;275554;275555;275556;275557;275558;275559;275560;275561;275562;275563;275564;275565 351838;351839;351840;351841;351842;351843;351844;351845;351846;351847;351848;351849;351850;351851;351852;351853;351854;351855;351856;351857;351858;351859;351860;351861;351862;351863;351864;351865;351866;351867 351845 30 LSTLCPSAVLQR Unmodified 1343.7231 0.72312022 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.9 77.9 2 4.4549E-20 79184 QUIQUE_C1576_190116_001 171.56 113.98 2214400000 213370000 191790000 168770000 161820000 234720000 148090000 216700000 114860000 141800000 75587000 183790000 180830000 182280000 30037 3499 28260 275566;275567;275568;275569;275570;275571;275572;275573;275574;275575;275576;275577;275578 351868;351869;351870;351871;351872;351873;351874;351875;351876;351877;351878;351879;351880;351881;351882;351883;351884;351885;351886;351887;351888;351889;351890;351891 351878 24 LSTLILHGGGTVCR Unmodified 1482.7977 0.79768214 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 50.061 50.061 2;3 0.0026856 48400 QUIQUE_C1438_190116_001 56.599 44.044 142840000 0 43957000 0 0 36681000 27296000 0 0 0 0 34903000 0 0 30038 4331 28261 275579;275580;275581;275582;275583 351892;351893;351894;351895;351896;351897 351895 6 LSTLVETTLK Unmodified 1103.6438 0.64379049 1148 H0YDU8;P53041 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 1 65.134 65.134 2 0.040544 64719 QUIQUE_C1218_190116_001 71.349 49.218 188830000 188830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30039 1148 28262 275584 351898 351898 0 LSTMETGTGLIR Unmodified 1277.6649 0.66493664 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 65.402 65.402 2 0.016156 65322 QUIQUE_C1368_190116_001 66.595 38.197 28525000 0 0 28525000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30040 2285 28263 275585 351899 351899 1 LSTPFVIR Unmodified 931.5491 0.54910224 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 76.054 76.054 2 0.02931 77173 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.981 32.487 31272000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31272000 30041 2357 28264 275586 351900 351900 1 LSTSTTIENIEITIK Unmodified 1661.9087 0.90873196 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 112.77 112.77 2 2.4177E-05 116247 QUIQUE_C1403_190116_001 101.53 83.265 674990000 0 0 63589000 133280000 0 0 0 0 244430000 165690000 0 67987000 0 30042 4418 28265 275587;275588;275589;275590;275591;275592 351901;351902;351903;351904;351905;351906;351907 351902 5 LSTVASTDILATVLEEMPPFPER Unmodified 2515.288 0.28799169 1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 171.09 171.09 2;3 5.1934E-74 178297 QUIQUE_DMIX5_190116_001 224.33 199.61 2597300000 183270000 425090000 186880000 91803000 179870000 0 80140000 236970000 188780000 30315000 435610000 400660000 157870000 30043 1701 28266 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Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 80.362 80.362 1;2 0.00022747 81712 QUIQUE_C1277_190116_001 118.18 79.386 5927500000 429780000 438820000 475210000 394780000 518840000 344030000 464540000 449650000 459010000 281280000 611920000 437730000 621890000 30051 959 28273 275672;275673;275674;275675;275676;275677;275678;275679;275680;275681;275682;275683;275684;275685;275686 352005;352006;352007;352008;352009;352010;352011;352012;352013;352014;352015;352016;352017;352018;352019;352020;352021;352022;352023;352024;352025;352026;352027;352028;352029;352030 352006 24 LSVEIPCPPAVSEADLATDER Unmodified 2268.0944 0.094377255 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 3 2 2 2 2 1 1 125.48 125.48 2;3 9.3281E-44 130119 QUIQUE_C1368_190116_001 155.57 147.47 862090000 49885000 98987000 167950000 61966000 124510000 164750000 96257000 0 0 0 53866000 43930000 0 30052 2009 28274 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275726;275727;275728;275729;275730 352082;352083;352084;352085;352086 352082 5 LSVIGSIR Unmodified 843.5178 0.51780212 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 57.131 57.131 2 0.01606 56849 QUIQUE_C1218_190116_001 83.753 18.08 168330000 42711000 46410000 0 0 41523000 0 0 0 37684000 0 0 0 0 30057 2911 28279 275731;275732;275733;275734 352087;352088;352089;352090 352087 4 LSVISVEDPPQR Unmodified 1338.7143 0.71432967 2411 P38117 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.552 67.552 2 0.00060298 67041 QUIQUE_C1368_190116_001 107.83 78.358 4014500000 372660000 382300000 405570000 323520000 403850000 267550000 0 413950000 383270000 185620000 466390000 409830000 0 30058 2411 28280 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Unmodified 2167.1599 0.15987805 3777 Q93008 USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X yes yes 0 0 0 1 156.75 156.75 2 2.9399E-07 159355 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.98 100.34 14891000 0 0 0 0 0 0 0 14891000 0 0 0 0 0 30068 3777 28290 275810 352176 352176 1 LSVQGEVSTFTGK Unmodified 1351.6983 0.69834526 3048 Q14165;F5H1S8;H0YG07 MLEC Malectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 89.196 89.196 2 0.002926 92348 QUIQUE_C1218_190116_001 86.923 62.58 295770000 49263000 0 106580000 85682000 0 54244000 0 0 0 0 0 0 0 30069 3048 28291 275811;275812;275813;275814 352177;352178;352179;352180 352177 3 LSVSVTQLDPKEEELSLQDITMR Unmodified 2630.3473 0.34729748 3733 Q92558;Q5SZK5;Q5SZK4 WASF1 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 1 yes no 0 0 1 1 133.21 133.21 3 0.00092753 140100 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.215 40.402 50548000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50548000 0 0 30070 3733 28292 275815 352181 352181 0 LSVVHTNTYAK Unmodified 1231.6561 0.65608651 4367 Q9P0K1;F8WAD8;E7EPF1 ADAM22 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22 yes no 0 0 0 1 1 1 1 20.541 20.541 3 0.0021453 13725 QUIQUE_C1438_190116_001 67.385 44.468 128310000 0 0 0 0 0 0 0 0 30001000 0 51312000 0 46995000 30071 4367 28293 275816;275817;275818;275819 352182;352183;352184;352185 352182 4 LSVWAVSLQGK Unmodified 1186.671 0.67100829 3470 Q7Z6L1 TECPR1 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 99.24 99.24 2 0.028561 102656 QUIQUE_C1576_190116_001 77.049 49.825 17265000 0 0 0 17265000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30072 3470 28294 275820;275821 352186;352187 352187 1 LSVYAALQR Unmodified 1019.5764 0.57637963 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.147 70.147 2 2.1245E-09 70525 QUIQUE_C1576_190116_001 173.59 106.79 2227600000 171450000 168110000 110290000 57635000 145560000 67652000 130860000 360250000 200100000 231350000 273560000 208270000 102510000 30073 3117 28295 275822;275823;275824;275825;275826;275827;275828;275829;275830;275831;275832;275833;275834 352188;352189;352190;352191;352192;352193;352194;352195;352196;352197;352198;352199;352200;352201;352202;352203;352204;352205;352206;352207;352208;352209;352210;352211;352212;352213;352214;352215;352216;352217;352218;352219;352220;352221;352222;352223;352224 352204 36 LSVYQAMK Oxidation (M) 954.48445 0.48445308 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.385 25.385 2 0.0091313 20003 QUIQUE_C1218_190116_001 97.068 43.513 1386200000 64958000 92561000 107710000 42291000 0 56295000 106800000 126500000 212480000 121270000 179790000 132120000 143390000 30074 3117 28296 275835;275836;275837;275838;275839;275840;275841;275842;275843;275844;275845;275846 352225;352226;352227;352228;352229;352230;352231;352232;352233;352234;352235;352236;352237;352238;352239;352240 352226 2569 16 LSVYQAMK Unmodified 938.48954 0.48953845 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.629 46.629 2 0.0048393 44570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.66 77.817 3669400000 0 0 530940000 169280000 307040000 192860000 473910000 399760000 386120000 175360000 621890000 412240000 0 30075 3117 28296 275847;275848;275849;275850;275851;275852;275853;275854;275855;275856 352241;352242;352243;352244;352245;352246;352247;352248;352249;352250 352246 9 LSWEQLQPCLDR Unmodified 1543.7453 0.74531222 3563 Q8N0W3;J3KSP6 FUK L-fucose kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 114.14 114.14 2 0.0012161 117706 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.35 84.307 159760000 40839000 44860000 0 0 0 27474000 0 0 0 0 0 0 46588000 30076 3563 28297 275857;275858;275859;275860 352251;352252;352253;352254;352255 352255 5 LSWNLVNSFPHHTFFWEGLDGSR Unmodified 2745.3088 0.30881898 4292 Q9NTJ4 MAN2C1 Alpha-mannosidase 2C1 yes yes 0 0 0 1 146.92 146.92 4 0.052161 151579 QUIQUE_DMIX7_190116_001 11.943 5.4856 33842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33842000 0 30077 4292 28298 275861 352256 352256 1 LSWSQLGGSPAEPIPGRQGWVSSSLTLK Unmodified 2937.5349 0.53485575 66 A0A087WXM8;P50895 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 1 1 1 1 97.447 97.447 5 0.054647 99109 QUIQUE_C1563_190116_001 17.358 5.1619 116880000 0 0 0 0 0 28298000 0 0 0 0 0 23592000 64993000 30078 66 28299 275862;275863;275864 352257;352258;352259 352257 3 LSWTADEGVFDNFVLK Unmodified 1839.9043 0.90431529 2233 P24821;J3QSU6;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 2 1 154.74 154.74 2 1.3534E-18 149803 QUIQUE_DMIX4_190116_001 140.31 122.58 602980000 0 0 0 0 0 49666000 0 94898000 178670000 45110000 154370000 80259000 0 30079 2233 28300 275865;275866;275867;275868;275869;275870;275871;275872;275873;275874;275875;275876 352260;352261;352262;352263;352264;352265;352266;352267;352268;352269;352270;352271;352272;352273;352274 352270 15 LSYAGGRPPSYAGSPVHHAAER Unmodified 2279.1196 0.11956164 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WVV7;A0A087WU33 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 1 1 28.227 28.227 4 0.0017282 22392 QUIQUE_C1403_190116_001 25.581 20.251 76980000 0 0 0 76980000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30080 103 28301 275877 352275;352276 352276 2 LSYCGGGEALAVPFEPAR Unmodified 1892.9091 0.90908309 1152 H0YF29;Q6P1X6 C8orf82 UPF0598 protein C8orf82 yes no 0 0 0 1 112.46 112.46 2 0.023499 116440 QUIQUE_C1218_190116_001 58.817 47.911 51200000 51200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30081 1152 28302 275878 352277 352277 1 LSYFEHNLETWR Unmodified 1593.7576 0.75759147 2401 P36915;A2AB27 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 89.967 89.967 2;3 0.00031778 92678 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.617 69.901 1053300000 88208000 70994000 47237000 78908000 77395000 46780000 175600000 0 77505000 28770000 182340000 92545000 87008000 30082 2401 28303 275879;275880;275881;275882;275883;275884;275885;275886;275887;275888;275889;275890;275891;275892;275893 352278;352279;352280;352281;352282;352283;352284;352285;352286;352287;352288;352289;352290;352291;352292;352293;352294 352290 17 LSYLEEAVMHLDHSDPITR Unmodified 2225.0787 0.078667612 3379 Q6P2E9;I3L3M2;I3L0V0 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes no 0 0 0 2 125.08 125.08 3;4 1.1181E-05 129665 QUIQUE_C1218_190116_001 92.307 82.777 45428000 45428000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30083 3379 28304 275894;275895 352295;352296;352297 352295 3 LSYSTSQEFSSR Unmodified 1390.6365 0.63647328 3334 Q5VUB5 FAM171A1 Protein FAM171A1 yes yes 0 0 0 1 49.797 49.797 2 0.043758 48246 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.653 32.697 22656000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22656000 0 0 30084 3334 28305 275896 352298 352298 1 LSYTCEGGFR Unmodified 1188.5234 0.52335778 1949 P08603 CFH Complement factor H yes yes 0 0 0 1 1 55.083 55.083 2 0.02808 53433 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.27 47.488 32417000 0 32417000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30085 1949 28306 275897;275898 352299;352300 352300 2 LSYTQLLR Unmodified 992.56548 0.56548059 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 81.996 81.996 2 5.2577E-06 83340 QUIQUE_DMIX7_190116_001 170.06 101.14 9040000000 668670000 626730000 792040000 290090000 649170000 349840000 746710000 884860000 915300000 457210000 1183200000 881080000 595050000 30086 3117 28307 275899;275900;275901;275902;275903;275904;275905;275906;275907;275908;275909;275910;275911;275912 352301;352302;352303;352304;352305;352306;352307;352308;352309;352310;352311;352312;352313;352314;352315;352316 352315 16 LSYTVHSSIDSISMR Unmodified 1694.8298 0.82977013 971 E9PQ73;Q8TDW7 FAT3 Protocadherin Fat 3 yes no 0 0 0 1 1 1 50.411 50.411 2;3 0.037959 49136 QUIQUE_C1218_190116_001 33.204 23.007 780040000 364180000 0 0 296440000 0 0 119410000 0 0 0 0 0 0 30087 971 28308 275913;275914;275915 352317;352318;352319 352317 3 LSYYGLR Unmodified 870.45995 0.45995289 2879 Q02880;E9PCY5;H7BZ82 TOP2B DNA topoisomerase 2-beta;DNA topoisomerase 2 yes no 0 0 0 1 56.365 56.365 2 0.054619 55065 QUIQUE_C1368_190116_001 72.355 27.823 18750000 0 0 18750000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30088 2879 28309 275916 352320 352320 1 LTAALLESTANVK Unmodified 1329.7504 0.75038083 3523 Q86YM7;Q86YM6 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 76.44 76.44 2 0.00032315 77464 QUIQUE_C1368_190116_001 110.54 70.918 47438000 0 0 47438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30089 3523 28310 275917 352321 352321 1 LTAALVLR Unmodified 855.55419 0.55418762 2594 P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17;A0A2R8Y603 RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 62.403 62.403 2 0.04733 62436 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.035 22.325 15840000 0 0 0 0 15840000 0 0 0 0 0 0 0 0 30090 2594 28311 275918;275919 352322;352323 352323 2 LTAASVGVQGSGWGWLGFNK Unmodified 2034.0323 0.032309767 1855 P04179;F5H4R2;F5GYZ5;F5H3C5 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes no 0 0 0 6 6 7 6 7 5 9 9 12 3 16 8 5 150.53 150.53 2;3 2.1105E-221 146503 QUIQUE_DMIX1_190116_001 269.7 247.38 4095900000 219470000 277630000 326790000 215140000 318190000 229870000 464220000 337920000 473710000 104360000 523490000 295600000 309510000 30091 1855 28312 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352324;352325;352326;352327;352328;352329;352330;352331;352332;352333;352334;352335;352336;352337;352338;352339;352340;352341;352342;352343;352344;352345;352346;352347;352348;352349;352350;352351;352352;352353;352354;352355;352356;352357;352358;352359;352360;352361;352362;352363;352364;352365;352366;352367;352368;352369;352370;352371;352372;352373;352374;352375;352376;352377;352378;352379;352380;352381;352382;352383;352384;352385;352386;352387;352388;352389;352390;352391;352392;352393;352394;352395;352396;352397;352398;352399;352400;352401;352402;352403;352404;352405;352406;352407;352408;352409;352410;352411;352412;352413;352414;352415;352416;352417;352418;352419;352420;352421;352422;352423;352424;352425;352426;352427;352428;352429;352430;352431;352432;352433;352434;352435;352436;352437;352438;352439;352440;352441;352442;352443;352444;352445;352446;352447;352448;352449;352450;352451;352452;352453;352454;352455;352456;352457;352458;352459;352460 352388 131 LTAAVLLAK Unmodified 898.58515 0.5851534 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.697 64.697 2 0.00041479 64187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.74 59.594 2016100000 242980000 189830000 168550000 143610000 192630000 142720000 174650000 140720000 146610000 89214000 194070000 0 190480000 30092 3390 28313 276019;276020;276021;276022;276023;276024;276025;276026;276027;276028;276029;276030 352461;352462;352463;352464;352465;352466;352467;352468;352469;352470;352471;352472;352473;352474;352475 352468 15 LTACQVATAFNLSR Unmodified 1550.7875 0.78751139 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 112.43 112.43 2 0.00068918 115674 QUIQUE_C1368_190116_001 92.925 66.808 60167000 23089000 0 37077000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30093 1741 28314 276031;276032;276033;276034;276035;276036 352476;352477;352478;352479;352480;352481 352477 5 LTADDEAFLSANAGAILSQFEK Unmodified 2310.138 0.13795663 3724 Q8WZA0;K7ES95 LZIC Protein LZIC yes no 0 0 0 2 2 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276092;276093;276094;276095;276096;276097;276098;276099;276100;276101;276102;276103;276104;276105;276106;276107;276108 352549;352550;352551;352552;352553;352554;352555;352556;352557;352558;352559;352560;352561;352562;352563;352564;352565 352556 16 LTAEVENAK Unmodified 973.50803 0.50802529 100 A0A087X106;CON__O43790;CON__Q14533;O43790;Q14533;CON__Q6NT21;CON__P78385;P78385;A6NCN2 KRT81;KRT86;KRT83;KRT87P Keratin, type II cuticular Hb6;Keratin, type II cuticular Hb1;Keratin, type II cuticular Hb3;Putative keratin-87 protein yes no 0 0 0 1 18.463 18.463 2 0.0019297 11073 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.629 52.911 50797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50797000 0 + 30101 100 28322 276109 352566 352566 1 LTAFELVYEQIPATLITDSMVAAAMAHR Unmodified 3061.5617 0.56166412 4039 Q9BV20 MRI1 Methylthioribose-1-phosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 173.17 173.17 3 1.811E-12 177486 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.31 61.823 28219000 0 0 0 0 0 0 0 0 28219000 0 0 0 0 30102 4039 28323 276110 352567 352567 1 LTAFPSESVK Unmodified 1077.5706 0.57062555 2144 P19320;E9PDD2 VCAM1 Vascular cell adhesion protein 1 yes no 0 0 0 1 49.641 49.641 2 0.050343 47129 QUIQUE_C1368_190116_001 47.706 21.812 486470000 0 0 486470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30103 2144 28324 276111 352568 352568 1 LTAFVNTLNGK Unmodified 1176.6503 0.65027285 2655 Q5VWC4;P55036;A6PVX3 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 no no 0 0 0 1 66.042 66.042 2 0.062894 66797 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.297 27.557 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30104 2655 28325 276112 352569 352569 1 LTAIDILTTCAADIQR Unmodified 1773.9295 0.92948418 1650 O75643;B4E0P5 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 1 145.64 145.64 2;3 5.2721E-13 148586 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.13 91.865 347650000 36076000 27028000 0 21801000 21832000 18679000 23454000 54922000 34067000 7905300 21364000 53400000 27125000 30105 1650 28326 276113;276114;276115;276116;276117;276118;276119;276120;276121;276122;276123;276124;276125;276126;276127;276128;276129;276130 352570;352571;352572;352573;352574;352575;352576;352577;352578;352579;352580;352581;352582;352583;352584;352585;352586;352587;352588;352589 352581 20 LTALADLEDWEELEK Unmodified 1773.8673 0.86726108 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 147.62 147.62 2 1.105E-05 153847 QUIQUE_C1438_190116_001 95.417 80.216 83019000 51682000 0 0 0 0 0 0 31337000 0 0 0 0 0 30106 4140 28327 276131;276132;276133;276134;276135 352590;352591;352592;352593;352594 352593 3 LTALDYHNPAGFNCK Unmodified 1719.8039 0.80388973 4535 Q9Y224;G3V4C6;G3V4E7 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 0 2 1 1 1 67.367 67.367 2;3 1.0182E-09 66353 QUIQUE_C1403_190116_001 152.7 142.64 236570000 142210000 0 39833000 24956000 0 0 0 0 0 29577000 0 0 0 30107 4535 28328 276136;276137;276138;276139;276140 352595;352596;352597;352598;352599 352598 5 LTALDYHNPAGFNCKDETEFR Unmodified 2497.1332 0.13322238 4535 Q9Y224;G3V4C6;G3V4E7 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 1 1 1 1 80.319 80.319 3 1.0483E-07 81609 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.206 77.611 120190000 0 0 0 0 42990000 0 0 0 41876000 0 0 35327000 0 30108 4535 28329 276141;276142;276143 352600;352601;352602 352601 3 LTALEER Unmodified 830.44978 0.44978213 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 23.003 23.003 2 0.050661 15991 QUIQUE_C1277_190116_001 74.415 5.7149 97159000 0 97159000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30109 1472 28330 276144 352603 352603 1 LTALGRPQFLLQFSEVLAK Unmodified 2130.2201 0.22011054 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6;C9JIW4 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.36 144.36 3 3.9681E-11 149532 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.4 88.576 650070000 0 0 27754000 0 16193000 0 19878000 98768000 140510000 0 133030000 111530000 102400000 30110 62 28331 276145;276146;276147;276148;276149;276150;276151;276152 352604;352605;352606;352607;352608;352609;352610;352611;352612;352613 352609 10 LTAPPAAFLCHLDNLLRPLLK Unmodified 2372.3402 0.34024245 751 C9JWV4;G5E9Q8;Q9H9Q4 NHEJ1 Non-homologous end-joining factor 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 159.53 159.53 4 4.387E-10 164255 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.958 81.797 364040000 27602000 41929000 18204000 0 0 0 0 0 78469000 0 125920000 71916000 0 30111 751 28332 276153;276154;276155;276156;276157;276158 352614;352615;352616;352617;352618;352619;352620 352618 7 LTAQFVAR Unmodified 904.51305 0.51305109 3141 Q15459 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 38.265 38.265 2 0.010866 35135 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.706 45.733 347260000 0 0 44042000 0 49029000 0 0 58548000 56104000 0 68642000 70896000 0 30112 3141 28333 276159;276160;276161;276162;276163;276164 352621;352622;352623;352624;352625;352626 352623 6 LTAQVASLTSELTTLNATIQQQDQELAGLK Unmodified 3184.6827 0.68270178 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.37 167.37 3 8.1943E-197 171043 QUIQUE_C1277_190116_001 221.85 197.57 956900000 77870000 216990000 0 0 106740000 59187000 81584000 72821000 101710000 0 175200000 0 64791000 30113 3091 28334 276165;276166;276167;276168;276169;276170;276171;276172;276173 352627;352628;352629;352630;352631;352632;352633;352634;352635 352628 9 LTASAPGYLAITK Unmodified 1304.734 0.73400248 2113 P16870 CPE Carboxypeptidase E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 74.993 74.993 2 0.00045868 76269 QUIQUE_C1576_190116_001 91.313 53.021 2113000000 0 0 256390000 234160000 0 230320000 293900000 0 246470000 0 289330000 272920000 289510000 30114 2113 28335 276174;276175;276176;276177;276178;276179;276180;276181 352636;352637;352638;352639;352640;352641;352642;352643;352644;352645 352641 10 LTASEQAHPQEPAESAHEPR Unmodified 2184.0196 0.019572828 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 0 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 20.101 20.101 3;4 1.7942E-09 12674 QUIQUE_C1368_190116_001 91.725 66.77 3221100000 400350000 312530000 153770000 188230000 386930000 88549000 237790000 217650000 444860000 51418000 251420000 212690000 274950000 30115 2880 28336 276182;276183;276184;276185;276186;276187;276188;276189;276190;276191;276192;276193;276194;276195;276196;276197;276198;276199;276200;276201;276202;276203;276204;276205;276206;276207 352646;352647;352648;352649;352650;352651;352652;352653;352654;352655;352656;352657;352658;352659;352660;352661;352662;352663;352664;352665;352666;352667;352668;352669;352670;352671;352672;352673;352674 352651 28 LTAYAMTIPFVR Unmodified 1381.7428 0.74279303 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 127.27 127.27 2;3 0.00019439 131888 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.71 93.936 1386400000 0 39329000 43292000 36641000 51486000 21812000 55734000 236720000 225970000 11828000 247530000 202140000 213970000 30116 1153 28337 276208;276209;276210;276211;276212;276213;276214;276215;276216;276217;276218;276219;276220;276221 352675;352676;352677;352678;352679;352680;352681;352682;352683;352684;352685;352686;352687;352688;352689;352690;352691;352692;352693;352694;352695 352685 21 LTAYAMTIPFVR Oxidation (M) 1397.7377 0.73770765 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 102.02 102.02 2 0.0010817 99139 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.533 67.222 146980000 0 0 0 0 0 0 0 48702000 71482000 26800000 0 0 0 30117 1153 28337 276222;276223;276224 352696;352697;352698;352699 352699 672 4 LTAYTATPEAIYGTSHVAISPSHR Unmodified 2542.2816 0.28160117 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 77.893 77.893 4 2.1103E-06 79339 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.356 49.237 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353142 1 LTEDKADVQSIIGLQR Unmodified 1784.9632 0.96322715 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 82.579 82.579 2;3 1.9174E-06 83552 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.1 109.18 757940000 0 58084000 71140000 51373000 104740000 0 56454000 34503000 174550000 0 0 106660000 100450000 30162 2983 28376 276607;276608;276609;276610;276611;276612;276613;276614;276615;276616;276617 353143;353144;353145;353146;353147;353148;353149;353150;353151;353152;353153 353149 9 LTEDLEYHELLDR Unmodified 1644.7995 0.79951586 2192 P22059;H0YCV6 OSBP Oxysterol-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 3 1 1 88.033 88.033 2;3 2.4626E-10 89336 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.57 123.84 603460000 43437000 42961000 44431000 56312000 60328000 34785000 0 55581000 46625000 0 114320000 49318000 55353000 30163 2192 28377 276618;276619;276620;276621;276622;276623;276624;276625;276626;276627;276628;276629;276630;276631;276632;276633 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(M) 2371.0573 0.057280243 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 1 0 1 1 108.85 108.85 2 1.5267E-09 114159 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.95 82.377 94169000 0 0 0 0 0 0 0 0 42308000 0 51861000 0 0 30186 2079 28398 276783;276784 353349;353350 353350 1405 2 LTESVDVLMPNVGEIVGGSMR Unmodified 2202.1024 0.10243952 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 149.73 149.73 2;3 8.7056E-10 156870 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.77 124.74 437820000 24340000 33452000 35721000 0 0 18625000 0 46704000 47833000 0 126270000 51706000 53169000 30187 1553 28399 276785;276786;276787;276788;276789;276790;276791;276792;276793;276794 353351;353352;353353;353354;353355;353356;353357;353358;353359;353360;353361;353362 353359 11 LTESYCETWR Unmodified 1343.5816 0.58160094 2419 P39060;H7BXV5;H7C457 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.07 59.07 2 0.0017727 57486 QUIQUE_C1368_190116_001 93.649 71.563 553210000 39517000 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353440;353441;353442;353443;353444;353445;353446;353447;353448;353449;353450;353451;353452;353453;353454;353455;353456;353457;353458;353459;353460;353461;353462;353463;353464;353465 353453 26 LTFDTTFSPNTGK Unmodified 1427.6933 0.69325988 2469 P45880;A0A0A0MR02;Q5JSD2;Q5JSD1 VDAC2 Voltage-dependent anion-selective channel protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.126 86.126 2 1.3605E-52 89081 QUIQUE_C1218_190116_001 199.08 161.6 17868000000 1667800000 1584500000 1822100000 1558400000 1445200000 1676600000 1644800000 739010000 1154100000 720460000 1526400000 1054900000 1273300000 30197 2469 28409 276870;276871;276872;276873;276874;276875;276876;276877;276878;276879;276880;276881;276882;276883 353466;353467;353468;353469;353470;353471;353472;353473;353474;353475;353476;353477;353478;353479;353480;353481;353482;353483;353484;353485;353486;353487;353488;353489;353490;353491;353492;353493;353494;353495;353496;353497 353467 32 LTFDTTFSPNTGKK Unmodified 1555.7882 0.7882229 2469 P45880;A0A0A0MR02;Q5JSD2;Q5JSD1 VDAC2 Voltage-dependent anion-selective channel protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 62.671 62.671 2;3 0.0012721 61262 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.243 71.549 1502200000 0 0 0 0 0 0 0 294420000 157480000 0 474460000 279370000 296430000 30198 2469 28410 276884;276885;276886;276887;276888;276889 353498;353499;353500;353501;353502;353503;353504 353504 6 LTFDYHQK Unmodified 1050.5134 0.51344502 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 33.519 33.519 2;3 0.023103 28776 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.218 21.755 68751000 0 0 0 30831000 0 0 0 0 0 0 37920000 0 0 30199 3532 28411 276890;276891 353505;353506;353507 353506 3 LTFEVVHLAR Unmodified 1183.6713 0.67134264 3072 Q14571 ITPR2 Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 2 yes yes 0 0 0 1 1 76.009 76.009 3 0.019123 77919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.908 45.241 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30200 3072 28412 276892;276893 353508;353509 353509 2 LTFFNSTLNTSGLVPEGDALPIPGAHR Unmodified 2823.4555 0.45554279 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 146.68 146.68 3 0.0041076 152004 QUIQUE_C1368_190116_001 26.841 25.008 88851000 0 0 0 0 0 88851000 0 0 0 0 0 0 0 30201 1665 28413 276894;276895 353510;353511 353510 2 LTFFNSTLNTSGLVPEGDALPIPGAHRPGVVTK Unmodified 3404.8092 0.80923969 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 133.17 133.17 3 2.3999E-29 139461 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.942 87.036 502770000 0 0 0 0 81307000 0 88694000 0 118210000 0 133050000 81502000 0 30202 1665 28414 276896;276897;276898;276899;276900 353512;353513;353514;353515;353516 353515 5 LTFIPGFIGSLK Unmodified 1291.754 0.75400964 3936 Q96RT1;B4DIP2 ERBB2IP Protein LAP2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.78 140.78 2 0.0010478 145292 QUIQUE_C1277_190116_001 83.862 43.51 528050000 41247000 30844000 53337000 34164000 57558000 39863000 43598000 34333000 44551000 24738000 36663000 37729000 49426000 30203 3936 28415 276901;276902;276903;276904;276905;276906;276907;276908;276909;276910;276911;276912;276913 353517;353518;353519;353520;353521;353522;353523;353524;353525;353526;353527;353528;353529;353530;353531;353532 353519 16 LTFLDLR Unmodified 876.5069 0.50690308 4194 Q9H9A6 LRRC40 Leucine-rich repeat-containing protein 40 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.72 104.72 2 0.023138 109168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.74 49.17 305490000 0 30159000 33489000 0 29668000 0 36803000 22607000 32328000 0 36069000 35820000 48544000 30204 4194 28416 276914;276915;276916;276917;276918;276919;276920;276921;276922 353533;353534;353535;353536;353537;353538;353539;353540;353541 353539 9 LTFLNSFK Unmodified 968.53312 0.53311783 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;F5H1T6;Q9Y487 ATP6V0A1;ATP6V0A2 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a;V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 91.463 91.463 2 0.0017177 92995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.68 91.93 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0.19905752 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 1 2 1 1 118.66 118.66 4 0.0009406 122318 QUIQUE_DMIX8_190116_001 51.819 37.05 105610000 0 0 0 0 0 0 0 42920000 0 0 0 33754000 28939000 30208 4475 28420 276936;276937;276938;276939 353557;353558;353559;353560 353560 3 LTFRPHSTDSATHR Unmodified 1624.807 0.80700128 3704 Q8WVC0 LEO1 RNA polymerase-associated protein LEO1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 13.859 13.859 4 2.7528E-05 5914 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.52 80.889 66112000 0 0 0 0 10875000 0 0 0 26302000 0 18831000 10104000 0 30209 3704 28421 276940;276941;276942;276943 353561;353562;353563;353564 353563 4 LTFSCLGGSDNFK Unmodified 1444.6657 0.66566492 81 A0A087WYT3;Q15185 PTGES3 Prostaglandin E synthase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.247 92.247 2 4.2689E-10 95074 QUIQUE_C1576_190116_001 145.99 123.9 10822000000 804700000 810280000 506940000 799390000 857510000 933830000 1134000000 745680000 872620000 318840000 988230000 917510000 1132200000 30210 81 28422 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106.68 3 0.0017311 110952 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.722 42.072 537060000 0 110240000 0 99378000 0 0 0 90387000 0 0 122860000 114200000 0 30212 699 28424 276974;276975;276976;276977;276978 353600;353601;353602;353603;353604 353603 5 LTFVDFLTYDILDQNR Unmodified 1971.9942 0.99419293 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 3 2 2 2 3 2 172.67 172.67 2;3 0 178057 QUIQUE_C1576_190116_001 316.11 278.14 25294000000 765500000 784400000 679410000 404600000 1187500000 976590000 2717600000 2977000000 4257600000 476550000 4392200000 2924800000 2750400000 30213 2174 28425 276979;276980;276981;276982;276983;276984;276985;276986;276987;276988;276989;276990;276991;276992;276993;276994;276995;276996;276997;276998;276999;277000;277001;277002;277003;277004;277005;277006;277007 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353802 102 33 LTGMAFR Unmodified 794.41089 0.4108942 1863 P04406;E7EUT5;O14556 GAPDH;GAPDHS Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase;Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, testis-specific yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.638 42.638 2 0.0096243 39805 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.07 116.58 109250000000 9158800000 9481900000 9981200000 10117000000 6187400000 7934100000 8296300000 7985700000 7393900000 2959700000 12048000000 8979500000 8728600000 30227 1863 28438 277127;277128;277129;277130;277131;277132;277133;277134;277135;277136;277137;277138;277139 353814;353815;353816;353817;353818;353819;353820;353821;353822;353823;353824;353825;353826;353827;353828;353829;353830;353831;353832;353833;353834;353835;353836;353837;353838;353839;353840;353841;353842;353843;353844;353845;353846 353837 33 LTGMAFR Oxidation (M) 810.40581 0.40580882 1863 P04406;E7EUT5;O14556 GAPDH;GAPDHS Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase;Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, testis-specific yes no 0 1 0 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LTGSTPMQVVTCLTR Unmodified 1662.8433 0.84331171 4556 Q9Y2I1 NISCH Nischarin yes yes 0 0 0 1 1 155.5 155.5 3 0.032851 162358 QUIQUE_C1438_190116_001 27.335 0 35232000 0 0 0 0 18040000 0 0 0 0 0 17192000 0 0 30232 4556 28442 277181;277182 353911;353912 353911 2 LTGSTSSLNK Unmodified 1006.5295 0.52948901 4302 Q9NV70 EXOC1 Exocyst complex component 1 yes yes 0 0 0 1 14.881 14.881 2 0.049902 6906 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.853 25.722 7757900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7757900 0 0 0 30233 4302 28443 277183 353913 353913 1 LTGSTVGMR Unmodified 920.47495 0.47495102 2626 P53602;H3BP35 MVD Diphosphomevalonate decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 21.272 21.272 2 0.003868 14353 QUIQUE_C1368_190116_001 90.308 30.699 70537000 0 34177000 36360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30234 2626 28444 277184;277185 353914;353915;353916 353916 3 LTGSYNTMVGNNEGSMVLGLK Unmodified 2184.0555 0.055489329 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 0 1 112.06 112.06 2 3.8342E-05 115554 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WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 13.294 13.294 3;4 2.6797E-37 3278 QUIQUE_C1277_190116_001 161.04 91.178 1778500000 132720000 272250000 109810000 22192000 91179000 153920000 147660000 235620000 86396000 23856000 203100000 48016000 251820000 30238 145 28448 277200;277201;277202;277203;277204;277205;277206;277207;277208;277209;277210;277211;277212;277213;277214;277215;277216;277217;277218;277219;277220;277221;277222;277223;277224;277225 353931;353932;353933;353934;353935;353936;353937;353938;353939;353940;353941;353942;353943;353944;353945;353946;353947;353948;353949;353950;353951;353952;353953;353954;353955;353956;353957;353958;353959;353960 353934 30 LTHPNVVAAR Unmodified 1076.6091 0.60907674 1457 O14920;G3V105;E5RGW5;J3KNS5 IKBKB Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 18.588 18.588 3 0.0051825 11494 QUIQUE_C1218_190116_001 46.475 13.843 26543000 11837000 0 0 0 14706000 0 0 0 0 0 0 0 0 30239 1457 28449 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yes yes 0 0 1 1 1 151.6 151.6 3 5.6836E-12 158977 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.951 62.231 149130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64809000 0 84325000 30262 3128 28472 277373;277374 354129;354130 354129 2 LTLADIER Unmodified 929.5182 0.51819605 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.966 77.966 2 0.0018048 79963 QUIQUE_C1218_190116_001 139.28 44.611 1572500000 316650000 0 257410000 238950000 145000000 0 0 0 219980000 128160000 0 266300000 0 30263 1655 28473 277375;277376;277377;277378;277379;277380;277381 354131;354132;354133;354134;354135;354136;354137;354138 354131 7 LTLAELNQILYR Unmodified 1445.8242 0.82421447 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.81 140.81 2 5.8603E-06 145604 QUIQUE_DMIX8_190116_001 163.16 106.6 1213600000 105050000 101540000 0 87117000 178650000 64800000 97855000 127960000 151500000 56926000 0 106530000 135670000 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354935;354936;354937;354938;354939;354940;354941;354942;354943;354944;354945;354946;354947;354948 354941 828 14 LTNSQNFDEYMK Unmodified 1488.6555 0.65549416 1505 O15540 FABP7 Fatty acid-binding protein, brain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.17 67.17 2 5.1716E-05 66777 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.61 136.23 7757100000 592020000 666880000 713090000 362030000 442630000 545780000 475720000 851940000 566600000 332180000 882100000 521670000 804490000 30317 1505 28525 277987;277988;277989;277990;277991;277992;277993;277994;277995;277996;277997;277998;277999 354949;354950;354951;354952;354953;354954;354955;354956;354957;354958;354959;354960;354961;354962;354963;354964;354965;354966;354967;354968;354969 354968 21 LTNVAVVR Unmodified 870.5287 0.52870115 4583 Q9Y3A5;A0A087X020;F8WE72 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.849 27.849 2 0.00077104 22370 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.4 91.588 1156600000 79579000 88018000 81344000 111070000 65897000 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A0A087WY55;Q9NP79;Q5TGM0 VTA1 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 61.588 61.588 2 0.055944 59915 QUIQUE_C1563_190116_001 54.205 29.573 280770000 0 81124000 0 0 0 74581000 0 0 0 23905000 0 0 101160000 30321 70 28529 278020;278021;278022;278023 354990;354991;354992;354993 354991 4 LTPEFSQR Unmodified 976.49779 0.49779495 1555 O43813;E9PHS0;F8WDS9 LANCL1 LanC-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.823 32.823 2 0.0036031 27494 QUIQUE_C1403_190116_001 113.89 62.923 7182000000 776920000 845890000 0 554030000 676530000 533720000 743740000 554710000 625230000 281140000 844890000 745230000 0 30322 1555 28530 278024;278025;278026;278027;278028;278029;278030;278031;278032;278033;278034 354994;354995;354996;354997;354998;354999;355000;355001;355002;355003;355004 354996 7 LTPEYLELK Unmodified 1104.6067 0.6066767 1638 O75477 ERLIN1 Erlin-1 yes yes 0 0 0 1 77.901 77.901 2 0.041537 78519 QUIQUE_C1403_190116_001 53.089 27.515 15809000 0 0 0 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2;3 1.3144E-07 159898 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.39 97.728 2484200000 19599000 46296000 0 0 66644000 0 57314000 402880000 500460000 0 415490000 690810000 284680000 30326 199 28534 278050;278051;278052;278053;278054;278055;278056;278057;278058;278059;278060;278061 355020;355021;355022;355023;355024;355025;355026;355027;355028;355029;355030;355031;355032;355033;355034;355035;355036;355037 355031 16 LTPFMLGALVAMYEHK Oxidation (M) 1835.9314 0.93139843 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 144.29 144.29 3 8.9919E-05 148895 QUIQUE_C1403_190116_001 75.574 59.081 1445300000 0 59856000 41616000 34449000 77803000 0 0 256220000 216860000 0 274410000 297960000 186130000 30327 199 28534 278062;278063;278064;278065;278066;278067;278068;278069;278070;278071 355038;355039;355040;355041;355042;355043;355044;355045;355046;355047;355048;355049;355050;355051;355052;355053;355054;355055;355056 355043 120;121 17 LTPFMLGALVAMYEHK 2 Oxidation (M) 1851.9263 0.92631306 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 2 0 1 1 136.99 136.99 3 0.00094851 139745 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.159 40.653 19360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19360000 0 0 0 30328 199 28534 278072;278073 355057;355058 355057 120;121 2 LTPFTIQENLNLALNSASAIGCHVVNIGAEDLK Unmodified 3521.8188 0.8188181 2066 P13796;Q5TBN3 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 0 1 1 168.27 168.27 3;4 0.028397 174713 QUIQUE_C1438_190116_001 19.636 9.7534 86969000 0 0 0 0 22542000 0 0 0 0 0 64427000 0 0 30329 2066 28535 278074;278075 355059;355060 355059 2 LTPGCEAEAETEAICFFVQQFTDMEHNR Oxidation (M) 3345.4377 0.43766218 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 0 1 1 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SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 0 2 1 2 2 2 3 2 1 1 2 1 1 148.28 148.28 2;3 2.1415E-06 152229 QUIQUE_C1403_190116_001 137.16 102.44 879980000 95440000 20211000 89219000 117040000 84898000 126020000 116980000 35035000 52136000 47402000 40362000 0 55238000 30345 309;4058 28550 278188;278189;278190;278191;278192;278193;278194;278195;278196;278197;278198;278199;278200;278201;278202;278203;278204;278205;278206;278207 355190;355191;355192;355193;355194;355195;355196;355197;355198;355199;355200;355201;355202;355203;355204;355205;355206;355207;355208;355209;355210;355211;355212;355213;355214;355215;355216;355217;355218;355219 355198 29 LTPYEVDELRR Unmodified 1389.7252 0.72522871 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.657 56.657 2;3 0.00017507 55399 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.397 65.588 1398700000 84108000 235570000 0 0 214930000 0 0 55965000 191210000 79896000 290720000 0 246350000 30346 381 28551 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LTQLYEQAR Unmodified 1120.5877 0.58767259 3495 Q86UX7;F5H1C6 FERMT3 Fermitin family homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 36.879 36.879 2 0.0035397 33014 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.064 44.251 100790000 0 0 0 73054000 0 0 0 27737000 0 0 0 0 0 30357 3495 28562 278308;278309;278310 355327;355328;355329 355329 2 LTQNADCVVVLDNTALNR Unmodified 2015.0106 0.010588046 2209;4270 P23258;K7EIS0;Q9NRH3 TUBG1;TUBG2 Tubulin gamma-1 chain;Tubulin gamma chain;Tubulin gamma-2 chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 94.398 94.398 2 4.3116E-45 97716 QUIQUE_C1218_190116_001 170.52 129.47 132780000 35487000 36393000 0 30817000 0 30082000 0 0 0 0 0 0 0 30358 2209;4270 28563 278311;278312;278313;278314;278315 355330;355331;355332;355333;355334 355330 5 LTQNGDMLDLLK Unmodified 1359.7068 0.70680145 1124 H0Y599;Q8N1I0;F5GXW1;H0Y7H7 DOCK4 Dedicator of cytokinesis protein 4 yes no 0 0 0 1 72.493 72.493 2 0.052662 72896 QUIQUE_C1218_190116_001 44.203 9.4005 30848000 30848000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30359 1124 28564 278316 355335 355335 1 LTQNVDLLALLK Unmodified 1339.8075 0.80750177 3562 Q8IZD9 DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.9 138.9 2 0.0017775 143232 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.148 54.31 88727000 25052000 0 11956000 0 0 0 0 0 20265000 0 0 21988000 9465700 30360 3562 28565 278317;278318;278319;278320;278321;278322 355336;355337;355338;355339;355340;355341 355340 6 LTQTVAHLK Unmodified 1009.592 0.59202969 1880 P05161;A0A096LNZ9;A0A096LPJ4 ISG15 Ubiquitin-like protein ISG15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 16.462 16.462 2 0.0097087 8853 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.213 32.089 209630000 0 42429000 0 33285000 0 0 0 0 83527000 0 16814000 33572000 0 30361 1880 28566 278323;278324;278325;278326;278327 355342;355343;355344;355345;355346 355344 5 LTQYIDGQGR Unmodified 1149.5778 0.57783619 412;3010;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3;Q13554;H7C394 CAMK2G;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 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278340;278341;278342;278343;278344;278345;278346;278347;278348;278349;278350;278351;278352;278353;278354;278355;278356;278357;278358;278359;278360;278361;278362;278363 355362;355363;355364;355365;355366;355367;355368;355369;355370;355371;355372;355373;355374;355375;355376;355377;355378;355379;355380;355381;355382;355383;355384;355385;355386 355365 22 LTQYMDGSGMPK Unmodified 1326.5948 0.59480816 896;803 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.457 55.457 2 5.9392E-05 52964 QUIQUE_C1563_190116_001 125.23 116.04 1305300000 162210000 150670000 115870000 104290000 99801000 99744000 110170000 72014000 80588000 27587000 112840000 90712000 78755000 30364 803;896 28569 278364;278365;278366;278367;278368;278369;278370;278371;278372;278373;278374;278375;278376 355387;355388;355389;355390;355391;355392;355393;355394;355395;355396;355397;355398;355399;355400;355401;355402 355394 16 LTQYMDGSGMPK 2 Oxidation (M) 1358.5846 0.58463741 896;803 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 2 0 1 1 1 19.753 19.753 2 0.0059715 12374 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.276 62.082 68663000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34565000 0 34099000 0 30365 803;896 28569 278377;278378;278379 355403;355404;355405 355404 482;483 3 LTRDETNYGIPQR Unmodified 1561.7849 0.78486885 2787 P63244;D6RAC2;D6REE5;D6RHH4;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;D6RBD0;D6RFZ9;D6RAU2;E9PD14;D6RGK8;D6R909 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 36.644 36.644 3 0.024466 32317 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.664 19.518 160960000 0 0 0 0 0 0 0 56322000 0 0 68912000 35726000 0 30366 2787 28570 278380;278381;278382 355406;355407;355408 355408 3 LTRPGSSYFNLNPFEVLQIDPEVTDEEIK Unmodified 3349.6718 0.67180274 1671 O75937 DNAJC8 DnaJ homolog subfamily C member 8 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.87 159.87 3 1.8534E-31 164639 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.03 106.42 469970000 0 36983000 0 31743000 68331000 29580000 0 42743000 68444000 0 82946000 57250000 51952000 30367 1671 28571 278383;278384;278385;278386;278387;278388;278389;278390;278391 355409;355410;355411;355412;355413;355414;355415;355416;355417 355414 9 LTSALFNAASGWLGWK Unmodified 1720.8937 0.89369102 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 158.43 158.43 2 0.00046564 162119 QUIQUE_C1277_190116_001 80.318 63.741 60320000 33953000 26367000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30368 4148 28572 278392;278393 355418;355419 355419 2 LTSAVSSLPELLEK Unmodified 1485.829 0.82902508 3708 Q8WVM8 SCFD1 Sec1 family domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.61 113.61 2 0.0001943 117325 QUIQUE_C1368_190116_001 117.09 99.032 714430000 85902000 83218000 84056000 0 85004000 0 0 64962000 76038000 39483000 94709000 0 101060000 30369 3708 28573 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2B catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 122.93 122.93 2 0.00023728 126872 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.353 54.165 1045200000 174970000 0 146160000 0 0 0 137110000 93115000 74111000 69352000 0 183670000 166730000 30374 2107 28578 278464;278465;278466;278467;278468;278469;278470;278471 355543;355544;355545;355546;355547;355548;355549;355550;355551 355548 7 LTSELITHICK Unmodified 1313.7013 0.70132214 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 54.024 54.024 2;3 3.3105E-18 52582 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.59 113.35 1185400000 17881000 21241000 448730000 0 0 0 125470000 67819000 40020000 0 442800000 0 21392000 30375 2168 28579 278472;278473;278474;278475;278476;278477;278478;278479;278480;278481;278482 355552;355553;355554;355555;355556;355557;355558;355559;355560;355561;355562 355558 10 LTSENCEHFVNELR Unmodified 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355876 139 LTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSLR Unmodified 2634.3323 0.33231612 4033 Q9BUF5;K7ESM5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes no 0 0 0 1 1 153.14 153.14 3 0.0034311 157724 QUIQUE_C1277_190116_001 40.756 33.31 148830000 0 84217000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64611000 0 30403 4033 28606 278799;278800 356017;356018 356017 1 LTTSPAQNAQQLHER Unmodified 1692.8543 0.8543454 3732 Q92556;C9JIW2;C9IZR8 ELMO1 Engulfment and cell motility protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 25.939 25.939 3 0.00017477 19864 QUIQUE_C1438_190116_001 75.316 52.711 308010000 28334000 0 35301000 55511000 40746000 32745000 0 0 0 13527000 51527000 0 50315000 30404 3732 28607 278801;278802;278803;278804;278805;278806;278807;278808 356019;356020;356021;356022;356023;356024;356025;356026 356022 8 LTTVCPTSKPQTQGLAK Unmodified 1828.9717 0.97168334 2048 P12931 SRC Proto-oncogene tyrosine-protein kinase Src yes yes 0 0 1 1 31.626 31.626 3 0.038558 26227 QUIQUE_C1277_190116_001 36.469 26.622 50961000 0 50961000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30405 2048 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21.789 2;3;4;5 1.3626E-99 15325 QUIQUE_C1218_190116_001 218.16 195.96 3174200000 724390000 202750000 135660000 0 113690000 0 391750000 442400000 196650000 279550000 133060000 141730000 412540000 30408 3195 28611 278820;278821;278822;278823;278824;278825;278826;278827;278828;278829;278830;278831;278832;278833;278834;278835;278836;278837;278838;278839;278840;278841;278842;278843;278844;278845;278846 356041;356042;356043;356044;356045;356046;356047;356048;356049;356050;356051;356052;356053;356054;356055;356056;356057;356058;356059;356060;356061;356062;356063;356064;356065;356066;356067;356068;356069;356070 356044 29 LTTVPTQAFEYLSK Unmodified 1596.8399 0.83992412 4289 Q9NT99;M0R2G0 LRRC4B Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes no 0 0 0 1 114.65 114.65 2 0.014437 111242 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.198 33.156 39258000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39258000 0 0 0 30409 4289 28612 278847 356071 356071 1 LTVAAPPSGGPGFLSIERPDSRPPR Unmodified 2573.3714 0.37141923 327;328 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68.073 242070000 28157000 22861000 33289000 0 20685000 0 24183000 0 21688000 12875000 29675000 32419000 16239000 30414 3341 28617 278874;278875;278876;278877;278878;278879;278880;278881;278882;278883 356105;356106;356107;356108;356109;356110;356111;356112;356113;356114 356106 9 LTVDEAVR Unmodified 901.4869 0.48689592 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.437 35.437 2 0.00036995 30926 QUIQUE_C1368_190116_001 158.12 73.873 17343000000 0 0 2005300000 0 1927400000 0 2128900000 1947000000 2256600000 926420000 2225600000 2181300000 1744100000 30415 3117 28618 278884;278885;278886;278887;278888;278889;278890;278891;278892 356115;356116;356117;356118;356119;356120;356121;356122;356123;356124 356115 10 LTVDGLEK Unmodified 873.48075 0.48074791 4524 Q9UPY8 MAPRE3 Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.296 42.296 2 0.0073259 38444 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.458 45.107 5069000000 522910000 0 426140000 466140000 506640000 440390000 459230000 0 436780000 134340000 584120000 442330000 649960000 30416 4524 28619 278893;278894;278895;278896;278897;278898;278899;278900;278901;278902;278903 356125;356126;356127;356128;356129;356130;356131;356132;356133;356134;356135;356136 356136 7 LTVDGVETYMVVTR Unmodified 1581.8072 0.80724378 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.8 114.8 2 4.8012E-07 119650 QUIQUE_C1218_190116_001 126.66 91.244 469190000 39337000 52804000 54258000 52619000 0 54623000 0 49783000 36187000 23474000 43135000 62965000 0 30417 2806 28620 278904;278905;278906;278907;278908;278909;278910;278911;278912;278913;278914 356137;356138;356139;356140;356141;356142;356143;356144;356145;356146;356147;356148;356149;356150;356151;356152 356138 16 LTVEDLEK Unmodified 945.50188 0.50187728 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.418 61.418 2 0.0051926 57781 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0 0 0 30420 3150 28623 278933 356175 356175 1 LTVEDPVTVEYITR Unmodified 1633.8563 0.85630246 1448 O14818;H0Y586;Q8TAA3;A0A087WYS6 PSMA7;PSMA8 Proteasome subunit alpha type-7;Proteasome subunit alpha type-7-like yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 107.39 107.39 2;3 7.515E-29 110340 QUIQUE_C1277_190116_001 174.24 135.67 4598100000 379610000 398870000 505690000 321510000 319340000 328350000 331400000 351000000 403770000 147860000 459990000 321450000 329290000 30421 1448 28624 278934;278935;278936;278937;278938;278939;278940;278941;278942;278943;278944;278945;278946;278947;278948;278949;278950;278951 356176;356177;356178;356179;356180;356181;356182;356183;356184;356185;356186;356187;356188;356189;356190;356191;356192;356193;356194;356195;356196;356197 356179 21 LTVEEAVR Unmodified 915.50255 0.50254598 3117;1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;Q15149;H0YDN1 MACF1;PLEC Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5;Plectin no no 0 0 0 1 1 1 1 37.814 37.814 2 0.0081619 34527 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differentiation antigen CD14, urinary form;Monocyte differentiation antigen CD14, membrane-bound form yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 141.62 141.62 2;3 2.1581E-05 138009 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.89 95.229 831490000 0 29669000 138220000 276420000 143620000 0 29640000 57658000 23539000 64334000 68388000 0 0 30425 1945 28628 278962;278963;278964;278965;278966;278967;278968;278969;278970;278971;278972;278973;278974;278975 356209;356210;356211;356212;356213;356214;356215;356216;356217;356218;356219;356220;356221;356222 356221 9 LTVIAEQIQHLQEQAR Unmodified 1876.0167 0.016659702 4038 Q9BV19 C1orf50 Uncharacterized protein C1orf50 yes yes 0 0 0 1 95.151 95.151 3 0.00098026 98399 QUIQUE_C1576_190116_001 53.008 42.541 30427000 0 0 0 0 0 0 30427000 0 0 0 0 0 0 30426 4038 28629 278976 356223 356223 1 LTVIDTPGFGDHINNENCWQPIMK Unmodified 2798.3156 0.31562019 4432 Q9UHD8;K7EL40;K7EK18;K7ER52;K7EIE4;K7EQD7;K7ELJ9;K7EJZ2 SEPT9 Septin-9 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 123.42 123.42 2;3 3.1047E-51 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279713;279714;279715;279716;279717;279718;279719;279720;279721;279722;279723;279724;279725;279726;279727;279728;279729;279730;279731;279732;279733;279734;279735;279736;279737 357192;357193;357194;357195;357196;357197;357198;357199;357200;357201;357202;357203;357204;357205;357206;357207;357208;357209;357210;357211;357212;357213;357214;357215;357216;357217;357218;357219;357220 357192 27 LVDQNIFSFYLSR Unmodified 1600.8249 0.82494275 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;H7C469;C9JH19;F8WD96 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 3 2 2 4 2 2 146.48 146.48 2;3 6.8722E-53 153038 QUIQUE_DMIX5_190116_001 202.16 177.82 12431000000 705440000 1125800000 755820000 660470000 1088200000 769030000 996110000 933060000 1132000000 268340000 1620800000 1252400000 1123600000 30520 358 28720 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1049.5506 0.55055881 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 1 22.198 22.198 2;3 2.4901E-05 15650 QUIQUE_DMIX3_190116_001 130.75 105.97 23656000000 1492800000 1178700000 1607500000 1388200000 2267900000 925100000 1927800000 2779300000 2640000000 720980000 3082800000 1716600000 1927900000 30522 2851 28722 279776;279777;279778;279779;279780;279781;279782;279783;279784;279785;279786;279787;279788;279789;279790;279791;279792;279793;279794;279795;279796;279797;279798;279799 357270;357271;357272;357273;357274;357275;357276;357277;357278;357279;357280;357281;357282;357283;357284;357285;357286;357287;357288;357289;357290;357291;357292;357293;357294;357295;357296 357288 17 LVDTLPSIK Unmodified 984.58555 0.58554733 4553 Q9Y2D0 CA5B Carbonic anhydrase 5B, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 68.21 68.21 2 0.042086 67031 QUIQUE_C1563_190116_001 52.937 5.8549 72928000 0 34346000 0 0 0 38582000 0 0 0 0 0 0 0 30523 4553 28723 279800;279801 357297;357298 357298 2 LVDVEELNYWACK Unmodified 1637.7759 0.77594365 4476 Q9UKU0;E7ERD7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 yes no 0 0 0 1 1 125.25 125.25 2 0.0019438 130979 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.974 62.11 15292000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15292000 0 0 0 30524 4476 28724 279802;279803 357299;357300;357301 357301 3 LVDVICEK Unmodified 974.51067 0.51066783 2163;1743 O95716;P20336;S4R3Q3 RAB3D;RAB3A Ras-related protein Rab-3D;Ras-related protein Rab-3A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.993 44.993 2 0.0024947 41849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 136.11 63.074 8197300000 783230000 812870000 611170000 629690000 597940000 572160000 629050000 531930000 464950000 384160000 820600000 700100000 659480000 30525 1743;2163 28725 279804;279805;279806;279807;279808;279809;279810;279811;279812;279813;279814;279815;279816 357302;357303;357304;357305;357306;357307;357308;357309;357310;357311;357312;357313;357314;357315;357316;357317;357318;357319;357320;357321;357322;357323;357324 357318 22 LVDVPFQVEFPAPK Unmodified 1584.8552 0.85518025 20 A0A087X0V7;A0A087WYH9;A0A075B7G8;J3KPL8;O00213;V9GYR7 APBB1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 132.75 132.75 2 0.0067829 135654 QUIQUE_C1563_190116_001 64.64 38.981 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30526 20 28726 279817;279818;279819 357325;357326;357327 357325 3 LVDVVAVILK Unmodified 1067.6954 0.69543213 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 128.34 128.34 2 0.020211 132585 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.597 47.312 429650000 0 0 47920000 56918000 71303000 0 0 53872000 84007000 0 0 72023000 43605000 30527 1283 28727 279820;279821;279822;279823;279824;279825;279826 357328;357329;357330;357331;357332;357333;357334 357332 7 LVDWIILQCAEDIEHPPPGR Unmodified 2357.1838 0.18380139 4444 Q9UI15;C9JCX3 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 0 0 3 2 3 3 1 3 4 2 2 3 2 2 3 141.81 141.81 2;3;4 4.4844E-30 147242 QUIQUE_C1368_190116_001 141.86 128.13 7924500000 917840000 595690000 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yes 0 1 0 1 12.982 12.982 3 0.00042813 5142 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.769 68.352 7639000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7639000 0 30534 3925 28733 279895 357430 357430 2777 1 LVEAFGGATK Unmodified 991.53385 0.53384611 396 A0A1X7SBT7;O95502 NPTXR Neuronal pentraxin receptor yes no 0 0 0 1 1 1 40.042 40.042 2 0.031601 35562 QUIQUE_C1576_190116_001 64.04 18.322 43948000 43948000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30535 396 28734 279896;279897;279898 357431;357432;357433 357433 3 LVEAISR Unmodified 786.45995 0.45995289 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 25.168 25.168 2 0.044716 18167 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.146 20.9 81191000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 81191000 0 0 0 30536 3053 28735 279899 357434 357434 1 LVEALAAATEK Unmodified 1114.6234 0.6233894 4003 Q9BRJ7;K7EIN2;K7ENA3 NUDT16L1 Protein syndesmos yes no 0 0 0 1 1 56.161 56.161 2 0.0054708 51585 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.847 14.236 27258000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27258000 0 0 0 30537 4003 28736 279900;279901 357435;357436 357436 2 LVEALCAEHQINLIK Unmodified 1749.9447 0.94474031 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 85.305 85.305 2;3 7.033E-44 87536 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.15 151.29 5669400000 475430000 561710000 161670000 405900000 471140000 455330000 514490000 363240000 483410000 198330000 557680000 468700000 552370000 30538 2240 28737 279902;279903;279904;279905;279906;279907;279908;279909;279910;279911;279912;279913;279914;279915;279916;279917;279918;279919;279920;279921;279922;279923;279924;279925;279926 357437;357438;357439;357440;357441;357442;357443;357444;357445;357446;357447;357448;357449;357450;357451;357452;357453;357454;357455;357456;357457;357458;357459;357460;357461;357462;357463;357464;357465;357466;357467 357460 30 LVEALPYNTSLVEMK Unmodified 1705.8961 0.89605879 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 113.09 113.09 2 0.0025917 117159 QUIQUE_C1368_190116_001 67.385 49.521 507660000 0 0 0 0 0 107800000 0 94787000 129840000 0 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357476;357477;357478;357479;357480 357476 5 LVECLETVLNK Unmodified 1316.701 0.70098779 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.077 94.077 2 0.00043855 97297 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.7 70.86 2659700000 199380000 241200000 215790000 192570000 202610000 166700000 253810000 169090000 198430000 98054000 255420000 260080000 206590000 30543 1749 28742 279940;279941;279942;279943;279944;279945;279946;279947;279948;279949;279950;279951;279952 357481;357482;357483;357484;357485;357486;357487;357488;357489;357490;357491;357492;357493;357494;357495;357496 357494 15 LVECLLR Unmodified 901.50552 0.50552287 1750 O95786 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes yes 0 0 0 1 1 60.125 60.125 2 0.038719 59959 QUIQUE_C1438_190116_001 84.359 43.056 49407000 0 0 0 0 20536000 0 0 0 28870000 0 0 0 0 30544 1750 28743 279953;279954 357497;357498 357497 2 LVECQYELTDR Unmodified 1424.6606 0.66057954 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.257 58.257 2 2.439E-24 57180 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.65 121.49 1468000000 125540000 131200000 119540000 132900000 117280000 96080000 129170000 118780000 103330000 49027000 110940000 110840000 123370000 30545 245 28744 279955;279956;279957;279958;279959;279960;279961;279962;279963;279964;279965;279966;279967 357499;357500;357501;357502;357503;357504;357505;357506;357507;357508;357509;357510;357511 357509 13 LVEDHLAVQSLIR Unmodified 1491.8409 0.84092717 2869;903;4487 E9PCR7;E9PDF2;Q02218;A0A0D9SFS3;C9J4G7;Q9ULD0 OGDH;OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial;2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 82.638 82.638 2;3 3.9623E-76 83713 QUIQUE_C1368_190116_001 185.59 126.92 4645500000 498510000 390170000 539770000 320120000 341330000 387600000 444670000 215520000 366530000 135880000 387350000 305300000 312710000 30546 903;2869;4487 28745 279968;279969;279970;279971;279972;279973;279974;279975;279976;279977;279978;279979;279980;279981;279982;279983;279984;279985;279986;279987;279988;279989;279990;279991;279992 357512;357513;357514;357515;357516;357517;357518;357519;357520;357521;357522;357523;357524;357525;357526;357527;357528;357529;357530;357531;357532;357533;357534;357535;357536;357537;357538;357539;357540;357541 357518 30 LVEDMENK Unmodified 976.45355 0.45354688 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.311 22.311 2 0.012053 15537 QUIQUE_C1403_190116_001 89.142 69.296 1677600000 0 0 429330000 389030000 0 357790000 303680000 0 0 197750000 0 0 0 30547 585;2493 28746 279993;279994;279995;279996;279997 357542;357543;357544;357545;357546 357543 5 LVEDMENKIR Unmodified 1245.6387 0.63872189 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 1 1 40.305 40.305 3 0.02451 36234 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.194 39.269 115590000 0 0 0 0 0 0 0 115590000 0 0 0 0 0 30548 585;2493 28747 279998 357547 357547 1 LVEEALEK Unmodified 929.50696 0.50696266 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 32.876 32.876 2 0.042869 27943 QUIQUE_C1368_190116_001 58.716 23.824 64398000 0 0 64398000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30549 119 28748 279999 357548 357548 1 LVEEEANILGR Unmodified 1241.6616 0.66156582 947 E9PJP2;Q5TF21;J3QL92 SOGA3;MTCL1 Protein SOGA3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.298 71.298 2 0.00011076 72090 QUIQUE_C1576_190116_001 131.5 89.216 572400000 62792000 0 50843000 50619000 52606000 36785000 54048000 24606000 29665000 22478000 79254000 59701000 49005000 30550 947 28749 280000;280001;280002;280003;280004;280005;280006;280007;280008;280009;280010;280011;280012 357549;357550;357551;357552;357553;357554;357555;357556;357557;357558;357559;357560;357561;357562 357555 12 LVEEEVNIPNR Unmodified 1310.683 0.68302954 4351 Q9NZL9;E5RJR3 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.645 59.645 2 0.00027947 57871 QUIQUE_C1403_190116_001 120.15 81.007 167480000 47729000 37202000 0 27001000 0 17209000 20740000 0 0 17599000 0 0 0 30551 4351 28750 280013;280014;280015;280016;280017;280018;280019 357563;357564;357565;357566;357567;357568;357569;357570 357565 8 LVEEEVNIPNRR Unmodified 1466.7841 0.78414057 4351 Q9NZL9;E5RJR3 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 2 42.122 42.122 2;3 1.114E-05 38719 QUIQUE_C1403_190116_001 133.23 96.802 1207200000 143920000 59902000 0 164060000 130040000 46904000 52992000 63447000 195210000 0 0 157500000 193240000 30552 4351 28751 280020;280021;280022;280023;280024;280025;280026;280027;280028;280029;280030;280031;280032;280033;280034;280035;280036;280037 357571;357572;357573;357574;357575;357576;357577;357578;357579;357580;357581;357582;357583;357584;357585;357586;357587;357588 357576 16 LVEEGIVSPSDLDLVMSEGLGMR Unmodified 2445.2131 0.21311218 4564 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2225.1117 0.1116823 516 A1L0T0;M0R026;M0QZX5 ILVBL Acetolactate synthase-like protein yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 150.15 150.15 2;3 1.087E-05 155437 QUIQUE_C1368_190116_001 126.95 113.27 346810000 50666000 23106000 32638000 0 60628000 21644000 0 22673000 21111000 11596000 47689000 30576000 24484000 30556 516 28755 280085;280086;280087;280088;280089;280090;280091;280092;280093;280094;280095;280096;280097 357660;357661;357662;357663;357664;357665;357666;357667;357668;357669;357670;357671;357672;357673;357674;357675 357664 14 LVEGLSALVVDVK Unmodified 1340.7915 0.79151736 2157 P19971;C9JGI3 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 120.76 120.76 2 0.001257 125105 QUIQUE_C1368_190116_001 80.979 53.676 98605000 0 0 39001000 24960000 0 0 0 0 0 18422000 16223000 0 0 30557 2157 28756 280098;280099;280100;280101 357676;357677;357678;357679 357676 4 LVEHFCAEFK Unmodified 1278.6067 0.60669348 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 54.033 54.033 2;3 0.00027445 52636 QUIQUE_C1438_190116_001 116.52 88.746 1844500000 142490000 194570000 103590000 117640000 186450000 154930000 210800000 80256000 123060000 54687000 170550000 110700000 194810000 30558 180;3738 28757 280102;280103;280104;280105;280106;280107;280108;280109;280110;280111;280112;280113;280114;280115;280116;280117;280118;280119;280120;280121;280122;280123 357680;357681;357682;357683;357684;357685;357686;357687;357688;357689;357690;357691;357692;357693;357694;357695;357696;357697;357698;357699;357700;357701;357702;357703;357704;357705;357706 357688 26 LVEHVPGQPVR Unmodified 1229.6881 0.68805534 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.481 26.481 3 0.0054213 20344 QUIQUE_C1438_190116_001 59.426 41.99 414080000 0 36479000 0 48486000 69997000 50352000 0 51489000 42592000 20397000 47552000 46733000 0 30559 2225 28758 280124;280125;280126;280127;280128;280129;280130;280131;280132 357707;357708;357709;357710;357711;357712;357713;357714;357715 357709 4 LVEIAQVPK Unmodified 995.60153 0.60153174 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.169 54.169 2 0.0079223 52252 QUIQUE_C1368_190116_001 80.229 48.294 5373900000 406300000 408240000 400590000 473420000 360310000 414860000 341820000 559680000 458910000 281850000 471540000 381810000 414630000 30560 3202 28759 280133;280134;280135;280136;280137;280138;280139;280140;280141;280142;280143;280144;280145 357716;357717;357718;357719;357720;357721;357722;357723;357724;357725;357726;357727;357728;357729;357730 357720 11 LVEIEPGKR Unmodified 1039.6026 0.60259438 3830 Q96DA2 RAB39B Ras-related protein Rab-39B yes yes 0 0 1 1 20.981 20.981 2 0.025347 14021 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.252 26.46 25672000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25672000 30561 3830 28760 280146 357731 357731 1 LVEIIGSR Unmodified 885.52837 0.5283668 4294 Q9NTX5;H0Y5L2;H0YCS9 ECHDC1 Ethylmalonyl-CoA decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.799 50.799 2 0.0039304 49552 QUIQUE_C1218_190116_001 111.01 16.6 1374900000 88050000 82016000 108650000 99158000 100500000 101660000 112430000 111350000 141440000 62709000 137820000 110860000 118250000 30562 4294 28761 280147;280148;280149;280150;280151;280152;280153;280154;280155;280156;280157;280158;280159 357732;357733;357734;357735;357736;357737;357738;357739;357740;357741;357742;357743;357744;357745;357746 357732 15 LVEINGHNVESK Unmodified 1337.6939 0.69392858 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 26.209 26.209 3 0.0058861 20465 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.557 30.941 36053000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36053000 0 0 30563 271 28762 280160;280161 357747;357748 357747 2 LVEKGETDLIQK Unmodified 1371.7609 0.76094551 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 32.352 32.352 3 0.002147 27221 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.731 53.094 63226000 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Unmodified 1373.7013 0.70132214 1587;2604 P52294;C9JYI4;O60684;O15131;Q5TFJ7 KPNA1;KPNA6;KPNA5 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed;Importin subunit alpha-7;Importin subunit alpha-6 no no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 2 72.896 72.896 2;3 0.00053042 73532 QUIQUE_C1277_190116_001 100.88 66.626 1099100000 52201000 141260000 164070000 131100000 49176000 125730000 67069000 70862000 43535000 0 36030000 42976000 175140000 30567 2604;1587 28766 280178;280179;280180;280181;280182;280183;280184;280185;280186;280187;280188;280189;280190;280191;280192;280193;280194;280195;280196;280197 357766;357767;357768;357769;357770;357771;357772;357773;357774;357775;357776;357777;357778;357779;357780;357781;357782;357783;357784;357785;357786;357787;357788;357789 357770 21 LVELPYTVK Unmodified 1060.6168 0.61684746 4243 Q9NPF4 OSGEP Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 78.682 78.682 2 0.011794 75370 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.23 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280219;280220;280221;280222;280223;280224;280225;280226;280227;280228;280229;280230;280231 357813;357814;357815;357816;357817;357818;357819;357820;357821;357822;357823;357824;357825 357825 6 LVEPQSQALLHAQPIISIR Unmodified 2112.2055 0.20552311 20 A0A087X0V7;A0A087WYH9;A0A075B7G8;J3KPL8;O00213;V9GY97 APBB1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.16 102.16 3 2.4631E-05 106280 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.49 72.562 623880000 0 52799000 37159000 0 79282000 51793000 69199000 40840000 41473000 36954000 70102000 74671000 69608000 30574 20 28773 280232;280233;280234;280235;280236;280237;280238;280239;280240;280241;280242 357826;357827;357828;357829;357830;357831;357832;357833;357834;357835;357836 357834 9 LVEPVTDFLLDMPYHIR Unmodified 2057.0656 0.06558373 1970 P09619 PDGFRB Platelet-derived growth factor receptor beta yes yes 0 0 0 1 1 1 153.52 153.52 3 0.002237 156752 QUIQUE_C1403_190116_001 41.912 32.629 20125000 20125000 0 0 0 0 0 0 0 0 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358233;358234;358235;358236;358237;358238;358239;358240;358241;358242;358243;358244;358245;358246;358247;358248 358239 14 LVGIISSR Unmodified 843.5178 0.51780212 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 44.878 44.878 2 0.0037111 40689 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.82 20.189 234350000 70898000 50420000 0 0 0 0 0 46038000 0 37796000 0 0 29202000 30618 2040 28816 280599;280600;280601;280602;280603;280604;280605;280606;280607;280608;280609 358249;358250;358251;358252;358253;358254;358255;358256;358257;358258;358259 358259 11 LVGILDILDEENR Unmodified 1497.8039 0.80387296 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 150.03 150.03 2 0.0013142 156157 QUIQUE_C1576_190116_001 80.596 67.64 236720000 43152000 25857000 38905000 50752000 0 41347000 36705000 0 0 0 0 0 0 30619 153 28817 280610;280611;280612;280613;280614;280615;280616;280617 358260;358261;358262;358263;358264;358265;358266;358267;358268 358267 9 LVGILDILDEENRLPQPSDQHFTSAVHQK Unmodified 3298.6946 0.69460387 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 125.44 125.44 5 0.00031414 129333 QUIQUE_DMIX7_190116_001 37.637 31.796 236730000 0 0 44779000 57580000 29791000 0 0 0 0 0 0 36885000 67697000 30620 153 28818 280618;280619;280620;280621;280622 358269;358270;358271;358272;358273 358272 4 LVGLEAPSVR Unmodified 1039.6026 0.60259438 3626 Q8NBN7 RDH13 Retinol dehydrogenase 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 64.848 64.848 2 0.017222 64064 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.732 48.583 83425000 0 29423000 0 0 0 0 0 0 0 0 54002000 0 0 30621 3626 28819 280623;280624;280625;280626;280627;280628;280629;280630;280631 358274;358275;358276;358277;358278;358279;358280;358281;358282 358282 8 LVGLPVHLLFLR Unmodified 1375.8704 0.8703768 326 H7C5D3;H7C4U4;Q0P5T2;A0A140T9G8;Q5SQH8;H7C5B5 C6orf136 Uncharacterized protein C6orf136 yes no 0 0 0 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95.708 2 0.0039024 99221 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.75 44.617 208040000 28195000 24598000 23381000 0 24128000 0 0 22949000 29615000 0 21160000 0 34009000 30624 3498 28822 280651;280652;280653;280654;280655;280656;280657;280658 358305;358306;358307;358308;358309;358310;358311;358312 358311 7 LVGQGASAVLLDLPNSGGEAQAK Unmodified 2194.1594 0.15936077 3969 Q99714;Q5H928 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 110.27 110.27 2;3 6.3798E-53 114116 QUIQUE_DMIX3_190116_001 209.66 190.93 6924300000 504860000 506910000 600650000 448280000 474210000 499710000 530370000 474610000 586040000 311240000 695370000 644340000 647760000 30625 3969 28823 280659;280660;280661;280662;280663;280664;280665;280666;280667;280668;280669;280670;280671;280672;280673;280674;280675;280676;280677;280678;280679;280680;280681;280682;280683;280684;280685 358313;358314;358315;358316;358317;358318;358319;358320;358321;358322;358323;358324;358325;358326;358327;358328;358329;358330;358331;358332;358333;358334;358335;358336;358337;358338;358339;358340;358341;358342;358343;358344;358345;358346;358347;358348;358349;358350;358351;358352;358353;358354;358355;358356;358357;358358;358359 358344 47 LVGQQYLHDALGEFIK Unmodified 1829.9676 0.96758424 4457 Q9UJF2 RASAL2 Ras GTPase-activating protein nGAP yes yes 0 0 0 1 1 134.61 134.61 3 0.0055853 140274 QUIQUE_C1576_190116_001 35.329 20.174 32899000 0 0 0 0 16047000 0 16852000 0 0 0 0 0 0 30626 4457 28824 280686;280687 358360;358361 358361 2 LVGQSIIAYLQK Unmodified 1331.7813 0.78128702 2630 P53621;A0A3B3IT15;A0A3B3IU89 COPA Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 0 1 1 1 120.85 120.85 2 0.0027223 126249 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.162 47.047 134320000 0 0 0 0 0 0 0 49236000 0 0 85086000 0 0 30627 2630 28825 280688;280689;280690 358362;358363;358364 358364 3 LVGRPPLPVPAVGIGTVHLHQHEDILAK Unmodified 2962.6869 0.68688013 3874 Q96HY7 DHTKD1 Probable 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component DHKTD1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 86.916 86.916 5 0.00011692 89955 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.6 42.224 119240000 0 0 0 0 38668000 0 0 0 0 0 50108000 30465000 0 30628 3874 28826 280691;280692;280693 358365;358366;358367 358366 3 LVGSDQAPGR Unmodified 998.51451 0.51450765 3229 Q3YEC7;F2Z2T0;H0Y4Z8 RABL6 Rab-like protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.689 18.689 2 0.00028201 10932 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.25 99.323 786400000 83562000 111350000 0 73503000 85104000 96519000 75900000 71115000 69790000 25176000 0 0 94387000 30629 3229 28827 280694;280695;280696;280697;280698;280699;280700;280701;280702;280703 358368;358369;358370;358371;358372;358373;358374;358375;358376;358377 358377 9 LVGSDQETLR Unmodified 1116.5775 0.57750184 3368 Q6KCM7 SLC25A25 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-2 yes yes 0 0 0 1 1 30.032 30.032 2 0.034412 24832 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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358383;358384;358385;358386;358387;358388;358389;358390;358391;358392;358393;358394;358395;358396;358397;358398;358399;358400;358401;358402;358403;358404;358405;358406 358384 21 LVGVFHTEYGALNR Unmodified 1574.8205 0.82052608 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 74.38 74.38 2;3 1.1332E-18 74435 QUIQUE_C1403_190116_001 141.38 114.84 5384600000 683410000 529330000 393420000 289600000 641050000 264520000 355450000 317100000 465930000 167100000 418080000 502950000 356650000 30633 4419 28831 280732;280733;280734;280735;280736;280737;280738;280739;280740;280741;280742;280743;280744;280745;280746;280747;280748;280749;280750;280751;280752 358407;358408;358409;358410;358411;358412;358413;358414;358415;358416;358417;358418;358419;358420;358421;358422;358423;358424;358425;358426;358427;358428;358429;358430;358431;358432;358433;358434;358435;358436;358437 358413 31 LVGVLVHSGQASGGHYYSYIIQR Unmodified 2503.2972 0.29719166 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 87.653 87.653 3 0.00015322 84240 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.499 33.483 14998000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14998000 0 0 0 30634 1414;3777 28832 280753 358438 358438 1 LVGYLDR Unmodified 834.45995 0.45995289 1924 P07602;C9JIZ6;Q5BJH1 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.151 46.151 2 0.021367 43738 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.2 54.164 7845400000 0 883050000 916590000 0 840080000 741800000 815200000 341090000 643060000 0 908680000 794960000 960850000 30635 1924 28833 280754;280755;280756;280757;280758;280759;280760;280761;280762;280763 358439;358440;358441;358442;358443;358444;358445;358446;358447;358448;358449;358450 358448 12 LVHDKELAAEDEQVFLMK Unmodified 2114.0718 0.07179132 1515 O43237;J3KRI4;J3KSD2 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 3 78.697 78.697 2;3;4 3.3443E-46 80459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 215 200.31 682570000 0 44016000 49078000 0 0 0 57626000 152840000 76982000 0 79070000 70525000 152430000 30636 1515 28834 280764;280765;280766;280767;280768;280769;280770;280771;280772;280773;280774;280775 358451;358452;358453;358454;358455;358456;358457;358458;358459;358460;358461;358462;358463;358464;358465;358466 358460 14 LVHGYIVFYSAK Unmodified 1395.7551 0.75507227 4278 Q9NRY4 ARHGAP35 Rho GTPase-activating protein 35 yes yes 0 0 0 1 73.839 73.839 3 0.0069245 74230 QUIQUE_C1277_190116_001 42.788 36.311 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30637 4278 28835 280776 358467 358467 1 LVHLVESWDLR Unmodified 1365.7405 0.74048484 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 88.7 88.7 3 0.0020479 90461 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.5 25.583 48194000 0 0 0 0 0 0 0 21837000 26356000 0 0 0 0 30638 934 28836 280777;280778 358468;358469 358469 2 LVHLWSSDSHQPLWSR Unmodified 1946.9751 0.97512924 1757 O95834;K7EIK7;A0A0C4DGQ7;C9JRL6;K7ELI8 EML2 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 82.691 82.691 4 0.048658 84061 QUIQUE_C1403_190116_001 27.85 11.357 105940000 0 0 0 38067000 0 0 0 0 0 0 0 29955000 37916000 30639 1757 28837 280779;280780;280781 358470;358471;358472 358470 3 LVHPGVAEVVFVK Unmodified 1392.8129 0.8129215 1027 F6VRR5;Q9BY77 POLDIP3 Polymerase delta-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.093 72.093 3 1.506E-06 73679 QUIQUE_C1218_190116_001 100.93 93.387 291940000 29815000 40595000 28237000 19014000 24349000 27800000 0 25025000 26902000 0 34834000 22224000 13148000 30640 1027 28838 280782;280783;280784;280785;280786;280787;280788;280789;280790;280791;280792 358473;358474;358475;358476;358477;358478;358479;358480;358481;358482;358483;358484;358485 358473 13 LVHSYPYDWR Unmodified 1334.6408 0.6407708 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 3 1 1 1 2 57.156 57.156 2;3 0.0025113 55876 QUIQUE_C1277_190116_001 59.908 49.903 1025200000 113640000 106600000 123120000 31027000 25088000 119430000 122130000 99084000 45967000 0 45356000 32462000 161250000 30641 4285 28839 280793;280794;280795;280796;280797;280798;280799;280800;280801;280802;280803;280804;280805;280806;280807;280808;280809;280810;280811;280812 358486;358487;358488;358489;358490;358491;358492;358493;358494;358495;358496;358497;358498;358499;358500;358501;358502;358503;358504;358505;358506;358507 358489 22 LVHVEEPHTETVR Unmodified 1544.7947 0.79470526 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 23.423 23.423 2;3;4 7.6538E-05 16481 QUIQUE_C1368_190116_001 91.858 85.42 1422700000 156060000 106180000 193260000 108450000 227850000 0 0 0 113280000 52109000 194220000 112410000 158850000 30642 1802 28840 280813;280814;280815;280816;280817;280818;280819;280820;280821;280822;280823;280824 358508;358509;358510;358511;358512;358513;358514;358515;358516;358517;358518;358519;358520 358510 12 LVIAGHLLR Unmodified 990.63383 0.63383493 2105 P16219;E9PE82 ACADS Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.458 55.458 2 0.0073686 52832 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.784 28.23 298020000 26177000 36512000 33584000 0 23107000 0 42929000 30283000 0 11826000 46056000 0 47543000 30643 2105 28841 280825;280826;280827;280828;280829;280830;280831;280832;280833 358521;358522;358523;358524;358525;358526;358527;358528;358529 358527 7 LVICPDEGFYK Unmodified 1339.6482 0.64822394 2710 P61081;M0QYI6 UBE2M NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.646 89.646 2 0.00034234 90437 QUIQUE_C1563_190116_001 118.18 107.89 1434400000 0 0 232610000 0 0 202000000 221750000 0 205260000 80526000 254600000 237670000 0 30644 2710 28842 280834;280835;280836;280837;280838;280839;280840;280841 358530;358531;358532;358533;358534;358535;358536;358537;358538 358533 9 LVIDEPAK Unmodified 883.50148 0.50148335 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 0 1 1 1 34.349 34.349 2 0.042958 29109 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.469 36.345 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30645 2596 28843 280842;280843;280844 358539;358540;358541 358541 3 LVIEEAER Unmodified 957.51311 0.51311067 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 36.889 36.889 2 0.0065653 33583 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.28 18.613 2868800000 0 0 391980000 412610000 347830000 0 454780000 402180000 386980000 0 472480000 0 0 30646 2573 28844 280845;280846;280847;280848;280849;280850;280851 358542;358543;358544;358545;358546;358547;358548 358546 3 LVIEECPLTSEAQTNDAAK Unmodified 2088.0045 0.0044996155 3245 Q52LD8 RFTN2 Raftlin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 81.136 81.136 2 3.3874E-16 82428 QUIQUE_C1277_190116_001 148.91 126.71 325860000 0 37093000 42331000 41269000 44584000 28173000 54399000 0 0 0 43727000 0 34283000 30647 3245 28845 280852;280853;280854;280855;280856;280857;280858;280859 358549;358550;358551;358552;358553;358554;358555;358556 358549 7 LVIEEQSGPFIWIPSK Unmodified 1841.9927 0.99273636 655 B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;B5MCC5 DLG2 Disks large homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.33 140.33 2 1.5593E-06 136502 QUIQUE_DMIX4_190116_001 110.38 80.444 1048000000 89107000 132440000 0 71226000 86372000 70190000 0 102160000 90893000 34453000 140010000 122140000 109020000 30648 655 28846 280860;280861;280862;280863;280864;280865;280866;280867;280868;280869;280870 358557;358558;358559;358560;358561;358562;358563;358564;358565;358566;358567;358568 358564 12 LVIGGAGGELIISAVAQAIMSK Oxidation (M) 2113.1817 0.18167612 2391 P36269;H7C1X2 GGT5 Gamma-glutamyltransferase 5;Gamma-glutamyltransferase 5 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 5 light chain yes no 0 1 0 1 169.37 169.37 3 0.00059498 173712 QUIQUE_C1218_190116_001 45.423 41.674 12379000 12379000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30649 2391 28847 280871 358569 358569 1795 1 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281040;281041;281042;281043;281044;281045;281046;281047;281048;281049;281050;281051 358838;358839;358840;358841;358842;358843;358844;358845;358846;358847;358848;358849;358850;358851 358847 14 LVIQSYFVQTLK Unmodified 1437.8232 0.82315184 4616 Q9Y547;X6R7Y7 HSPB11 Intraflagellar transport protein 25 homolog no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 119.5 119.5 2 0.0087659 122874 QUIQUE_C1403_190116_001 76.228 57.448 323300000 44422000 36604000 0 50472000 0 39480000 0 55024000 50833000 0 0 46470000 0 30666 4616 28863 281052;281053;281054;281055;281056;281057;281058 358852;358853;358854;358855;358856;358857;358858 358854 6 LVITPLTDR Unmodified 1026.6073 0.6073454 1130 H0Y7V4;A0A075B6F3;Q96JB1 DNAH8 Dynein heavy chain 8, axonemal no no 0 0 0 1 1 65.827 65.827 2 0.028233 65103 QUIQUE_C1403_190116_001 57.281 3.5246 83445000 0 0 0 49090000 0 0 0 0 0 0 0 34355000 0 30667 1130 28864 281059;281060 358859;358860 358859 2 LVIVGDGACGK Unmodified 1087.5696 0.56957969 2725;1937 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281075;281076;281077;281078;281079;281080;281081;281082;281083;281084;281085 358877;358878;358879;358880;358881;358882;358883;358884;358885;358886;358887 358885 10 LVKPGNQNTQVTEAWNK Unmodified 1925.9959 0.99592426 4530 Q9UQ80;F8VR77;F8W0A3;H0YIN7 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 42.337 42.337 2;3 4.4631E-22 39188 QUIQUE_C1277_190116_001 173.72 146.75 3996200000 374110000 37057000 300040000 364450000 364730000 542300000 340980000 380660000 36289000 139800000 460160000 313500000 342090000 30670 4530 28867 281086;281087;281088;281089;281090;281091;281092;281093;281094;281095;281096;281097;281098;281099;281100;281101;281102;281103;281104;281105;281106;281107;281108 358888;358889;358890;358891;358892;358893;358894;358895;358896;358897;358898;358899;358900;358901;358902;358903;358904;358905;358906;358907;358908;358909;358910;358911;358912;358913 358890 25 LVKPTAIIGVAAIAGAFTEQILR Unmodified 2351.3941 0.39405216 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 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358941;358942;358943;358944 358942 4 LVLAEAQVGDER Unmodified 1298.683 0.68302954 66 A0A087WXM8;P50895;K7ENU8 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 59.701 59.701 2 0.023452 58461 QUIQUE_C1277_190116_001 66.19 52.837 38841000 0 38841000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30673 66 28870 281137 358945;358946 358945 2 LVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVR Oxidation (M) 2698.4993 0.49926229 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YLC3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 149.87 149.87 4 8.6427E-18 156115 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.94 85.999 244170000 0 82380000 0 0 0 21973000 47343000 0 39473000 0 52999000 0 0 30674 192 28871 281138;281139;281140;281141;281142;281143 358947;358948;358949;358950;358951;358952 358952 114 6 LVLAGGPLGLMQAVLDHTIPYLHVR Unmodified 2682.5043 0.50434766 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YLC3 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 3 1 3 170.11 170.11 3;4 7.385E-74 175462 QUIQUE_C1576_190116_001 157.15 146.31 1142900000 0 0 0 0 63508000 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360354;360355;360356;360357;360358;360359;360360;360361;360362;360363;360364 360355 2765 10 LVPPFKPQVTSETDTR Unmodified 1813.9574 0.95741349 4538 Q9Y243 AKT3 RAC-gamma serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.411 59.411 3 0.00032756 58254 QUIQUE_C1277_190116_001 63.145 52.487 249280000 40200000 35009000 32125000 32558000 29349000 22330000 39484000 0 0 18224000 0 0 0 30772 4538 28964 282133;282134;282135;282136;282137;282138;282139;282140 360365;360366;360367;360368;360369;360370;360371;360372 360366 8 LVPQQLAH Unmodified 904.51305 0.51305109 2000 P10606 COX5B Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.133 34.133 2 0.0082701 30593 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.95 66.421 13570000000 1952500000 1742600000 1112500000 768480000 1449500000 956560000 1146700000 627860000 622210000 248820000 1171100000 975540000 795130000 30773 2000 28965 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chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 62.481 62.481 2 5.3501E-10 61635 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.83 146.74 969890000 80480000 83078000 109040000 105940000 103870000 82809000 104960000 107260000 99036000 0 93423000 0 0 30789 3154 28980 282339;282340;282341;282342;282343;282344;282345;282346;282347;282348;282349;282350 360652;360653;360654;360655;360656;360657;360658;360659;360660;360661;360662;360663;360664 360663 11 LVQDAYLSR Unmodified 1063.5662 0.56620887 4452 Q9UIW2 PLXNA1 Plexin-A1 yes yes 0 0 0 1 46.288 46.288 2 0.057371 43467 QUIQUE_C1218_190116_001 60.91 12.407 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30790 4452 28981 282351 360665 360665 1 LVQDVANNTNEEAGDGTTTATVLAR Unmodified 2559.2413 0.2412525 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4;C9JL25 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 4 3 2 2 3 4 3 3 2 2 2 78.536 78.536 2;3 7.149E-177 79454 QUIQUE_C1368_190116_001 294.39 274.38 27283000000 2284900000 1895000000 2808300000 2071200000 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360804 360804 1 LVQLLVR Unmodified 839.55927 0.559273 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0;A0A2R8Y815 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.122 64.122 2 0.016314 64326 QUIQUE_C1438_190116_001 133.99 61.967 2921400000 354040000 347350000 329860000 0 281220000 298420000 0 348510000 332160000 0 0 308660000 321180000 30802 425 28993 282454;282455;282456;282457;282458;282459;282460;282461;282462 360805;360806;360807;360808;360809;360810;360811;360812;360813;360814 360808 7 LVQLQEK Unmodified 856.50182 0.5018177 190 A0A0A0MT60;Q5T1M5 FKBP15 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;FK506-binding protein 15 yes no 0 0 0 1 1 22.416 22.416 2 0.030434 15743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.706 42.591 34675000 0 0 0 0 0 0 0 19838000 0 14838000 0 0 0 30803 190 28994 282463;282464 360815;360816 360815 2 LVQNCLWTLR Unmodified 1301.6914 0.69142616 425;2084 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2703;1562 29002 282529;282530;282531;282532;282533;282534;282535;282536;282537;282538;282539;282540;282541 360894;360895;360896;360897;360898;360899;360900;360901;360902;360903;360904;360905;360906;360907 360907 14 LVQTPLTDR Unmodified 1041.5819 0.58185893 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 43.944 43.944 2 0.01368 41443 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.598 34.79 32602000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32602000 0 0 30813 3053 29003 282542;282543;282544;282545;282546;282547;282548;282549;282550 360908;360909;360910;360911;360912;360913;360914;360915;360916;360917 360915 10 LVQTTYECLMQAIDAVKPGVR Unmodified 2391.229 0.22903702 2624 P53582 METAP1 Methionine aminopeptidase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 141.8 141.8 3 1.0981E-06 147393 QUIQUE_C1368_190116_001 83.213 76.225 104140000 0 0 34491000 0 0 26057000 0 0 43595000 0 0 0 0 30814 2624 29004 282551;282552;282553 360918;360919;360920 360918 3 LVQWGPGLVALQEAEIPEHFGAVR Unmodified 2615.386 0.38600667 648 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282645;282646;282647;282648;282649;282650;282651;282652;282653;282654;282655;282656;282657;282658;282659;282660;282661;282662;282663;282664;282665;282666;282667;282668;282669;282670;282671;282672;282673;282674;282675;282676 361055;361056;361057;361058;361059;361060;361061;361062;361063;361064;361065;361066;361067;361068;361069;361070;361071;361072;361073;361074;361075;361076;361077;361078;361079;361080;361081;361082;361083;361084;361085;361086;361087;361088;361089;361090;361091;361092;361093;361094;361095;361096;361097;361098;361099;361100;361101;361102;361103;361104;361105;361106;361107;361108;361109 361057 47 LVSCVEPAGLR Unmodified 1199.6332 0.63324258 1615 O75170 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 53.189 53.189 2 0.005558 51157 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.149 58.372 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30821 1615 29009 282677;282678;282679;282680 361110;361111;361112;361113 361113 4 LVSDEMVVELIEK Unmodified 1502.7902 0.79019673 1047 F8W1A4;P54819;F8VZG5;G3V213 AK2 Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.1 136.1 2 0.0047191 141833 QUIQUE_C1218_190116_001 79.82 50.347 667320000 59837000 77456000 0 82892000 70436000 61587000 0 56123000 79030000 0 62932000 51680000 65344000 30822 1047 29010 282681;282682;282683;282684;282685;282686;282687;282688;282689;282690 361114;361115;361116;361117;361118;361119;361120;361121;361122;361123;361124 361114 9 LVSDGNINSDR Unmodified 1188.5735 0.57347909 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 3 1 2 2 3 25.487 25.487 2 4.1485E-24 19770 QUIQUE_DMIX3_190116_001 179.8 136.56 23592000000 1726900000 2057700000 1398800000 1723200000 2446000000 1521600000 2120500000 1306600000 1963700000 914240000 2610000000 1844500000 1957900000 30823 2851 29011 282691;282692;282693;282694;282695;282696;282697;282698;282699;282700;282701;282702;282703;282704;282705;282706;282707;282708;282709;282710;282711;282712 361125;361126;361127;361128;361129;361130;361131;361132;361133;361134;361135;361136;361137;361138;361139;361140;361141;361142;361143;361144;361145;361146;361147;361148;361149;361150;361151;361152;361153 361141 28 LVSDGNINSDRIQEK Unmodified 1686.8537 0.8536767 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 1 33.089 33.089 2 2.0699E-12 28530 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.99 130.03 64756000 0 0 0 0 0 0 0 49581000 15175000 0 0 0 0 30824 2851 29012 282713;282714 361154;361155 361154 2 LVSDGQALPEMEIHLQTNAEK Unmodified 2322.1526 0.15256084 2952 Q12931 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 95.855 95.855 3 1.3993E-20 98750 QUIQUE_C1218_190116_001 95.622 80.694 105820000 105820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30825 2952 29013 282715;282716;282717;282718;282719;282720 361156;361157;361158;361159;361160;361161 361156 6 LVSDINR Unmodified 815.45012 0.45011648 2021 P11277 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes yes 0 0 0 1 20.331 20.331 2 0.055397 13462 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.949 25.183 30220000 0 0 0 0 0 0 0 30220000 0 0 0 0 0 30826 2021 29014 282721 361162 361162 1 LVSDSLSEHEK Unmodified 1242.6092 0.6091959 3898 Q96KR1;H0Y8W1 ZFR Zinc finger RNA-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 20.935 20.935 2;3 0.0024031 14091 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.556 61.46 152960000 0 0 34332000 18257000 0 31147000 0 0 0 0 69229000 0 0 30827 3898 29015 282722;282723;282724;282725;282726;282727;282728;282729 361163;361164;361165;361166;361167;361168;361169;361170 361169 8 LVSEDPINDGEWHR Unmodified 1665.7747 0.7746981 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 65.306 65.306 2 0.052041 66036 QUIQUE_C1438_190116_001 41.704 27.014 17433000 0 0 0 0 17433000 0 0 0 0 0 0 0 0 30828 2834 29016 282730 361171 361171 1 LVSEFPYIEAEVK Unmodified 1522.7919 0.79191129 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.56 114.56 2 0.0018051 119790 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.305 40.78 2011000000 0 216440000 0 0 219380000 0 227290000 171200000 223710000 110060000 367150000 248310000 227480000 30829 2463 29017 282731;282732;282733;282734;282735;282736;282737;282738;282739 361172;361173;361174;361175;361176;361177;361178;361179;361180;361181;361182;361183;361184;361185;361186 361182 15 LVSELDDANLQVENVR Unmodified 1812.9218 0.92175626 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 94.771 94.771 2 2.5895E-09 97146 QUIQUE_C1368_190116_001 149.26 124.88 193170000 0 0 43518000 0 0 0 39706000 0 0 18335000 0 40295000 51312000 30830 2486 29018 282740;282741;282742;282743;282744;282745 361187;361188;361189;361190;361191;361192 361187 5 LVSELDDANLQVENVRDQALILMNAR Unmodified 2938.5182 0.51821941 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 1 1 151.73 151.73 3 0.059116 154541 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.47 20.736 15380000 0 0 0 0 0 0 0 15380000 0 0 0 0 0 30831 2486 29019 282746 361193 361193 0 LVSELWDAGIK Unmodified 1229.6656 0.66558856 2035 P12081;B4DDD8;B3KWE1;B4E1C5 HARS Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 103.47 103.47 2 0.0069586 101327 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.535 37.793 307440000 0 0 95668000 0 63126000 0 0 0 0 36931000 0 0 111710000 30832 2035 29020 282747;282748;282749;282750;282751 361194;361195;361196;361197;361198 361197 5 LVSESSDVLPK Unmodified 1172.6289 0.62886871 772 CON__P05787;P05787 KRT8 Keratin, type II cytoskeletal 8 yes no 0 0 0 1 48.914 48.914 2 0.018747 46493 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.48 36.586 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 30833 772 29021 282752 361199 361199 1 LVSETEWNLLQK Unmodified 1458.7718 0.77184455 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 100.9 100.9 2 0.029276 103849 QUIQUE_C1277_190116_001 63.32 43.033 75857000 0 42311000 0 0 0 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repeat-containing protein 20 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.58 112.58 2 0.017959 114917 QUIQUE_C1403_190116_001 80.165 64.667 37087000 23110000 0 0 0 0 0 0 0 0 13977000 0 0 0 30837 3672 29024 282769;282770;282771;282772;282773;282774;282775;282776;282777;282778 361223;361224;361225;361226;361227;361228;361229;361230;361231;361232 361226 10 LVSGMQHPGSAGGVYETTQHFIDIK Unmodified 2671.3064 0.30643572 2523 P49257 LMAN1 Protein ERGIC-53 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 91.747 91.747 4 0.012706 93357 QUIQUE_C1403_190116_001 27.143 19.431 200320000 48444000 0 0 49419000 50020000 0 52435000 0 0 0 0 0 0 30838 2523 29025 282779;282780;282781;282782 361233;361234;361235;361236 361234 4 LVSGWVKPIIIGR Unmodified 1436.8868 0.88675515 1662 O75874;C9J4N6 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 92.516 92.516 2;3 3.7809E-06 94627 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.01 103.22 2962000000 61856000 145100000 136190000 149490000 185230000 77353000 177200000 432410000 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94.45 2 0.00015636 96704 QUIQUE_C1277_190116_001 107.85 81.332 139810000 39655000 23711000 0 36719000 0 22437000 17290000 0 0 0 0 0 0 30842 1242;2047;2381 29029 282842;282843;282844;282845;282846;282847;282848;282849 361320;361321;361322;361323;361324;361325;361326;361327 361321 7 LVSIGYPQELLSFAYDSTFPTR Unmodified 2503.2635 0.26349149 2552 P49902;Q5JUV4;H0YHR8 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 168.9 168.9 2;3 1.0575E-10 173204 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.93 116.18 983400000 89209000 22377000 54191000 60699000 69367000 65789000 104280000 123820000 169980000 25825000 40556000 56735000 100570000 30843 2552 29030 282850;282851;282852;282853;282854;282855;282856;282857;282858;282859;282860;282861;282862;282863;282864;282865;282866;282867;282868;282869;282870;282871 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Unmodified 1891.9502 0.95021962 4605 Q9Y4E8;F8W0H4;H0YI31;F8VZG8 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 142.59 142.59 2 0.0031832 147474 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.318 64.779 131280000 0 0 0 0 0 20536000 0 0 43353000 10672000 56718000 0 0 30861 4605 29047 283063;283064;283065;283066;283067 361600;361601;361602;361603;361604 361601 4 LVSYSGVLFFLK Unmodified 1371.7802 0.78022439 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.69 149.69 2 0.0021929 155026 QUIQUE_C1368_190116_001 76.465 56.475 275360000 0 30320000 24585000 12123000 21170000 0 15211000 19968000 30164000 20526000 48053000 36285000 16955000 30862 1492 29048 283068;283069;283070;283071;283072;283073;283074;283075;283076;283077;283078 361605;361606;361607;361608;361609;361610;361611;361612;361613;361614;361615;361616 361607 11 LVTAIGDVVNHDPAVGDR Unmodified 1846.9537 0.95372509 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 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361702;361703;361704;361705;361706;361707;361708;361709;361710;361711;361712;361713;361714;361715;361716;361717;361718;361719 361702 18 LVTGGGEEVDVHSLGAR Unmodified 1694.8588 0.85876208 3356 Q6DKJ4;A0A0G2JQK5 NXN Nucleoredoxin yes no 0 0 0 1 1 1 57.086 57.086 3 0.00051854 56278 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.09 46.65 129320000 0 0 0 27609000 38919000 0 0 0 0 0 62795000 0 0 30871 3356 29056 283162;283163;283164 361720;361721;361722 361722 1 LVTLEEFLASTQR Unmodified 1505.809 0.80895834 2877 Q02818;H7BZI1 NUCB1 Nucleobindin-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 142.83 142.83 2;3 2.3148E-06 148673 QUIQUE_C1218_190116_001 128.81 80.873 681330000 71452000 72274000 83272000 48248000 69640000 56401000 66368000 0 31946000 7163800 85345000 42381000 46844000 30872 2877 29057 283165;283166;283167;283168;283169;283170;283171;283172;283173;283174;283175;283176;283177;283178;283179;283180;283181;283182;283183;283184;283185;283186;283187 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2 3 2 2 2 1 105.38 105.38 2;3 2.0633E-71 108297 QUIQUE_C1277_190116_001 206.11 180.17 5649200000 425760000 459920000 540800000 508660000 400910000 433980000 536600000 358690000 462240000 194030000 593090000 352420000 382090000 30879 2576 29064 283231;283232;283233;283234;283235;283236;283237;283238;283239;283240;283241;283242;283243;283244;283245;283246;283247;283248;283249;283250;283251;283252;283253;283254;283255;283256 361802;361803;361804;361805;361806;361807;361808;361809;361810;361811;361812;361813;361814;361815;361816;361817;361818;361819;361820;361821;361822;361823;361824;361825;361826;361827;361828;361829;361830 361804 27 LVTMQIWDTAGQER Oxidation (M) 1662.8036 0.80355538 2576 P51149;C9J592;C9J8S3;C9IZZ0 RAB7A Ras-related protein Rab-7a yes no 0 1 0 1 83.894 83.894 2 0.0027355 84368 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.289 57.413 31567000 0 0 0 0 0 0 0 31567000 0 0 0 0 0 30880 2576 29064 283257 361831 361831 2025 1 LVTPEDDELDELRPGQR Unmodified 1980.9752 0.9752484 2930 Q08AM6 VAC14 Protein VAC14 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.35 81.35 3 6.2033E-10 82361 QUIQUE_C1277_190116_001 112.8 82.665 693610000 111020000 148160000 99370000 0 135130000 76882000 0 98447000 0 24602000 0 0 0 30881 2930 29065 283258;283259;283260;283261;283262;283263;283264;283265 361832;361833;361834;361835;361836;361837;361838;361839;361840;361841 361834 8 LVTPGETPSWTGSGFVR Unmodified 1789.8999 0.89989861 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 103.75 103.75 2 5.8079E-05 108390 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.04 93.028 476170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 270080000 206090000 0 30882 2665 29066 283266;283267 361842;361843 361842 2 LVTPHGESEQIGVIPSK Unmodified 1789.9574 0.95741349 3279 Q5JUW8;Q92796 DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 57.843 57.843 2;3 7.9714E-05 55427 QUIQUE_C1277_190116_001 73.881 57.628 45116000 13308000 0 0 0 0 0 0 0 0 31808000 0 0 0 30883 3279 29067 283268;283269;283270 361844;361845;361846 361845 3 LVTQDTENELKK Unmodified 1416.746 0.74602373 2592;1320 K7EK35;P42229;K7EIF9;P51692 STAT5A;STAT5B Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A;Signal transducer and activator of transcription 5B no no 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 24.298 24.298 2;3 7.8169E-05 17854 QUIQUE_C1403_190116_001 144.77 114.96 346990000 40575000 81474000 0 34086000 91101000 0 28740000 0 32920000 0 38090000 0 0 30884 1320;2592 29068 283271;283272;283273;283274;283275;283276;283277;283278;283279;283280 361847;361848;361849;361850;361851;361852;361853;361854;361855;361856 361850 10 LVTSIGDVVNHDPVVGDR Unmodified 1890.9799 0.97993984 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 87.608 87.608 2;3 6.8731E-143 90261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 271.08 229.08 22598000000 1907300000 1780500000 2435300000 1772000000 1364100000 1730800000 2059900000 1090800000 2091800000 830960000 2053600000 1823300000 1658200000 30885 2016 29069 283281;283282;283283;283284;283285;283286;283287;283288;283289;283290;283291;283292;283293;283294;283295;283296;283297;283298;283299;283300;283301;283302;283303;283304;283305;283306;283307 361857;361858;361859;361860;361861;361862;361863;361864;361865;361866;361867;361868;361869;361870;361871;361872;361873;361874;361875;361876;361877;361878;361879;361880;361881;361882;361883;361884;361885;361886;361887;361888;361889;361890;361891;361892;361893;361894;361895;361896;361897 361888 40 LVTSLPSWALLTNHFK Unmodified 1826.0091 0.0090551289 884 H0YFS7;E7EW59;Q9Y467 SALL2 Sal-like protein 2 yes no 0 0 0 2 132.28 132.28 3 0.00053906 138744 QUIQUE_C1438_190116_001 51.147 34.267 21916000 0 0 0 0 21916000 0 0 0 0 0 0 0 0 30886 884 29070 283308;283309 361898;361899 361898 1 LVTSPCCIVTSTYGWTANMER Unmodified 2445.1127 0.11268663 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 3 3 3 4 2 3 1 2 3 3 133.26 133.26 2;3 3.0136E-86 140367 QUIQUE_C1218_190116_001 236.3 227.25 4919900000 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phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.66 101.66 2 0.00043338 105915 QUIQUE_C1218_190116_001 108.67 99.713 623320000 58571000 0 69471000 70263000 64455000 60464000 0 81267000 0 42436000 85314000 91074000 0 30890 1421 29073 283372;283373;283374;283375;283376;283377;283378;283379;283380 361978;361979;361980;361981;361982;361983;361984;361985;361986;361987 361978 8 LVTVYCEHGHK Unmodified 1341.65 0.64995528 3874 Q96HY7;C9JWN1 DHTKD1 Probable 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component DHKTD1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 14.444 14.444 3 0.0023139 6422 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.252 36.376 8258900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8258900 0 0 0 30891 3874 29074 283381 361988 361988 1 LVVADTR Unmodified 772.4443 0.44430282 2197 P22314;Q5JRR9;Q5JRS0 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.02 20.02 2 0.02472 12666 QUIQUE_C1403_190116_001 97.473 29.074 1106400000 0 155920000 0 89356000 0 169690000 0 533950000 0 0 0 157520000 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284030;284031;284032;284033;284034;284035;284036;284037;284038;284039;284040 362770;362771;362772;362773;362774;362775;362776;362777;362778;362779;362780;362781;362782;362783 362775 13 LWGDHGQEALESAHVCLINATATGTEILK Unmodified 3133.5502 0.55024782 3012 Q13564;J3KRK3;H3BSS8 NAE1 NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 138.5 138.5 3;4 3.002E-19 143191 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.982 79.478 218850000 0 42541000 0 0 0 0 0 0 38254000 0 0 96763000 41294000 30972 3012 29149 284041;284042;284043;284044;284045 362784;362785;362786;362787;362788;362789 362789 6 LWGDSGIQECFNR Unmodified 1580.7042 0.70417569 1963 P09471;H3BTM2;A0A1W2PP87 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 98.925 98.925 2 1.9728E-52 101649 QUIQUE_DMIX3_190116_001 196.27 184.41 42078000000 3188700000 3504600000 4423900000 3225900000 3262700000 3094200000 4672300000 2254600000 2782200000 1111100000 4022700000 2979100000 3555600000 30973 1963 29150 284046;284047;284048;284049;284050;284051;284052;284053;284054;284055;284056;284057;284058;284059;284060;284061;284062 362790;362791;362792;362793;362794;362795;362796;362797;362798;362799;362800;362801;362802;362803;362804;362805;362806;362807;362808;362809;362810;362811;362812;362813;362814;362815;362816;362817 362807 28 LWGEPVNLR Unmodified 1082.5873 0.58727866 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 82.188 82.188 2 0.025711 82572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.774 57.671 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30974 1414;3777 29151 284063 362818 362818 1 LWGLTEMFPER Unmodified 1377.6751 0.67510739 4280 Q9NS69 TOMM22 Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.61 140.61 2 4.094E-08 147170 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.34 121.27 1163800000 113990000 97497000 82016000 82288000 67327000 72653000 93322000 95470000 93838000 22813000 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LWIDQSGEIDIVNHK Unmodified 1765.8999 0.89989861 2192 P22059 OSBP Oxysterol-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 102.27 102.27 3 0.019859 104604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.366 8.5874 214470000 0 0 0 0 29115000 36944000 33645000 41569000 0 0 0 34727000 38471000 30981 2192 29158 284095;284096;284097;284098;284099;284100 362858;362859;362860;362861;362862;362863 362861 4 LWIEQYGTVEILNHR Unmodified 1869.9737 0.97373226 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;E7ET92 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 118.8 118.8 3 6.7446E-08 123104 QUIQUE_C1277_190116_001 111.83 94.342 299950000 0 32519000 34661000 0 49161000 0 33886000 23191000 32933000 0 38747000 0 54848000 30982 454 29159 284101;284102;284103;284104;284105;284106;284107;284108;284109;284110 362864;362865;362866;362867;362868;362869;362870;362871;362872;362873;362874 362864 9 LWIIEAR Unmodified 899.52289 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LWQYLLSR Unmodified 1077.5971 0.59711507 3501 Q86VU5 COMTD1 Catechol O-methyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.44 106.44 2 0.021068 109662 QUIQUE_C1277_190116_001 75.738 39.553 227960000 23499000 18357000 0 19218000 16237000 15436000 27717000 30042000 20056000 0 33594000 23802000 0 31000 3501 29177 284214;284215;284216;284217;284218;284219;284220;284221;284222;284223 362990;362991;362992;362993;362994;362995;362996;362997;362998;362999;363000 362991 11 LWSGYSLLYFEGQEK Unmodified 1818.8829 0.88285156 1946 P08572;A0A3B3IS47 COL4A2 Collagen alpha-2(IV) chain;Canstatin yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 140.86 140.86 2 1.4676E-05 144976 QUIQUE_C1277_190116_001 94.747 73.496 673680000 90155000 97895000 118000000 61341000 82659000 0 47217000 0 75682000 0 100730000 0 0 31001 1946 29178 284224;284225;284226;284227;284228;284229;284230;284231;284232;284233 363001;363002;363003;363004;363005;363006;363007;363008;363009;363010;363011;363012;363013 363004 10 LWSLGQQR Unmodified 986.52976 0.52976379 3659 Q8TAF3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes yes 0 0 0 1 58.681 58.681 2 0.048329 57492 QUIQUE_C1218_190116_001 56.011 7.507 57293000 57293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31002 3659 29179 284234 363014 363014 1 LWSNSHRPELVR Unmodified 1492.7899 0.78989465 2616 P52895;B4DK69;S4R3P0 AKR1C2 Aldo-keto reductase family 1 member C2 yes no 0 0 1 1 32.675 32.675 4 0.0084479 26648 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.209 24.114 31903000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31903000 0 0 0 31003 2616 29180 284235 363015;363016;363017 363017 3 LWSNSHRPELVRPALER Unmodified 2059.1075 0.1075404 2616 P52895;B4DK69;S4R3P0 AKR1C2 Aldo-keto reductase family 1 member C2 yes no 0 0 2 1 1 48.162 48.162 5 0.0078183 45702 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.338 27.183 36300000 0 0 0 18402000 0 0 0 17898000 0 0 0 0 0 31004 2616 29181 284236;284237 363018;363019 363019 2 LWSSLQTHCCSQNK Unmodified 1747.777 0.77702306 4748 X6R5C5;X6R8A1;P10619;Q5JZH0 CTSA Carboxypeptidase;Lysosomal protective protein;Lysosomal protective protein 32 kDa chain;Lysosomal protective protein 20 kDa chain yes no 0 0 0 1 32.444 32.444 3 0.013382 27301 QUIQUE_C1277_190116_001 42.958 24.593 22771000 0 22771000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31005 4748 29182 284238 363020 363020 1 LWSTFHRPELVR Unmodified 1539.831 0.83103118 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;S4R3D5 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1 member C3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.856 60.856 4 0.00025859 60305 QUIQUE_C1576_190116_001 87.001 67.397 298300000 39660000 38156000 0 42774000 34321000 36773000 47808000 0 35032000 0 23772000 0 0 31006 183 29183 284239;284240;284241;284242;284243;284244;284245;284246 363021;363022;363023;363024;363025;363026;363027;363028;363029;363030;363031;363032;363033 363031 13 LWSTFHRPELVRPALENSLK Unmodified 2392.3015 0.30154876 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;S4R3D5 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1 member C3 yes no 0 0 2 1 3 1 84.194 84.194 4;5 0.00028413 85092 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.134 48.512 309160000 0 0 0 0 0 0 0 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31010 3485 29187 284256;284257;284258;284259;284260;284261 363044;363045;363046;363047;363048;363049;363050 363048 7 LWTLVSEQTR Unmodified 1231.6561 0.65608651 943 E9PJD9;E9PLL6;P46776 RPL27A 60S ribosomal protein L27a yes no 0 0 0 1 1 1 1 82.696 82.696 2 0.0066136 84536 QUIQUE_C1576_190116_001 74.376 21.59 70403000 0 0 0 0 35953000 0 34451000 0 0 0 0 0 0 31011 943 29188 284262;284263;284264;284265 363051;363052;363053;363054 363054 4 LWTVPTNMPSK Oxidation (M) 1288.6486 0.64855829 2218 P23515 OMG Oligodendrocyte-myelin glycoprotein yes yes 0 1 0 1 1 1 60.106 60.106 2 0.017369 59734 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.37 18.368 366530000 0 0 107260000 0 0 0 0 0 0 0 145130000 114130000 0 31012 2218 29189 284266;284267;284268 363055;363056;363057 363056 3 LWVACYNGGR Unmodified 1194.5604 0.56041199 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 0 0 1 64.824 64.824 2 0.045217 64708 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.659 53.071 79542000 0 0 0 0 0 0 0 0 79542000 0 0 0 0 31013 3143 29190 284269 363058 363058 1 LWVDTCSEIFGGLDICAVEALHGK Unmodified 2689.288 0.28800846 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 0 3 1 1 2 8 8 165.86 165.86 3 8.4045E-07 167498 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.901 53.945 654830000 85662000 0 0 0 0 0 37870000 25128000 60409000 0 265640000 180120000 0 31014 2125 29191 284270;284271;284272;284273;284274;284275;284276;284277;284278;284279;284280;284281;284282;284283;284284;284285;284286;284287;284288;284289;284290;284291;284292 363059;363060;363061;363062;363063;363064;363065;363066;363067;363068;363069;363070;363071;363072;363073;363074;363075;363076;363077;363078;363079;363080;363081;363082 363067 23 LWVIFPGEEGLDYGGVAR Unmodified 1976.9996 0.99961265 3884 Q96J02;A0A1W2PNZ8 ITCH E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.97 152.97 2 2.7652E-07 160090 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.76 108.96 388200000 29313000 29391000 35793000 27794000 34890000 34378000 35757000 0 32198000 0 42144000 54504000 32036000 31015 3884 29192 284293;284294;284295;284296;284297;284298;284299;284300;284301;284302;284303 363083;363084;363085;363086;363087;363088;363089;363090;363091;363092;363093;363094 363092 12 LWWADQVSEK Unmodified 1260.6139 0.61388734 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 1 96.392 96.392 2 0.024741 100158 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.258 35.929 92141000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64778000 27363000 0 31016 2911 29193 284304;284305 363095;363096 363095 1 LWWLDLK Unmodified 972.54329 0.54328858 1839 P02790 HPX Hemopexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 141.2 141.2 2 0.026204 146558 QUIQUE_C1368_190116_001 94.407 71.388 272850000 0 0 17370000 25287000 88579000 47902000 24085000 0 32322000 0 37303000 0 0 31017 1839 29194 284306;284307;284308;284309;284310;284311;284312 363097;363098;363099;363100;363101;363102;363103 363097 7 LWYCDLQQESSGIAGILK Unmodified 2080.0299 0.029926505 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 149.39 149.39 2;3 1.8293E-53 154811 QUIQUE_C1368_190116_001 178.22 163.34 1601700000 156660000 152210000 171080000 114590000 161280000 83974000 113590000 102320000 128470000 24937000 159120000 138550000 94909000 31018 2503 29195 284313;284314;284315;284316;284317;284318;284319;284320;284321;284322;284323;284324;284325;284326;284327;284328;284329;284330;284331;284332;284333;284334;284335;284336 363104;363105;363106;363107;363108;363109;363110;363111;363112;363113;363114;363115;363116;363117;363118;363119;363120;363121;363122;363123;363124;363125;363126;363127;363128;363129;363130;363131;363132;363133 363110 30 LWYTLDR Unmodified 965.49707 0.49706667 1778 P00387 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes yes 0 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subunit delta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.948 60.948 2 0.0019463 60562 QUIQUE_C1576_190116_001 98.457 47.602 406420000 38488000 43018000 44825000 33659000 36317000 25864000 45025000 0 30920000 9370900 31538000 42109000 25282000 31024 437;1437 29201 284368;284369;284370;284371;284372;284373;284374;284375;284376;284377;284378;284379 363166;363167;363168;363169;363170;363171;363172;363173;363174;363175;363176;363177;363178;363179 363173 13 LYASLGANDEDIR Unmodified 1435.6943 0.69432251 1102 G5E9V7;G5E9V6;Q8IUR7;B7Z637;C9J2I1;H7C5B7 ARMC8 Armadillo repeat-containing protein 8 yes no 0 0 0 1 1 68.663 68.663 2 0.0041067 69498 QUIQUE_C1218_190116_001 70.942 51.671 15974000 0 15974000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31025 1102 29202 284380;284381 363180;363181 363180 2 LYCIYVAIGQK Unmodified 1326.7006 0.70059386 2243 P25705;K7EK77;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 98.821 98.821 2 0.00023205 98867 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.74 87.558 657960000 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363429 13 LYELDGLR Unmodified 977.5182 0.51819605 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;Q5LJB0;H0Y6Y4;H0Y4E0 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.518 76.518 2 0.012204 76315 QUIQUE_C1563_190116_001 88.942 41.875 528620000 0 0 68071000 40939000 45765000 38016000 55796000 49903000 57655000 0 67998000 54120000 50361000 31053 4622 29229 284583;284584;284585;284586;284587;284588;284589;284590;284591;284592 363438;363439;363440;363441;363442;363443;363444;363445;363446;363447;363448 363442 11 LYELIITR Unmodified 1019.6015 0.60153174 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.713 88.713 2 0.0074468 90254 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.009 33.251 1202200000 99522000 81900000 107950000 95998000 111370000 81873000 78433000 81092000 94228000 56486000 131750000 86924000 94695000 31054 1921 29230 284593;284594;284595;284596;284597;284598;284599;284600;284601;284602;284603;284604;284605 363449;363450;363451;363452;363453;363454;363455;363456;363457;363458;363459;363460;363461;363462;363463;363464 363463 15 LYENFISEFEHR Unmodified 1582.7416 0.74160705 4512 Q9UNM6;A0A087WUL9;J3KNQ3;E9PQG3;E9PPD2 PSMD13 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 113.56 113.56 2;3 0.00010886 116980 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.77 107.08 2458800000 195340000 291280000 231580000 185490000 157710000 136030000 192770000 162510000 180740000 64574000 269390000 170270000 221140000 31055 4512 29231 284606;284607;284608;284609;284610;284611;284612;284613;284614;284615;284616;284617;284618;284619;284620;284621 363465;363466;363467;363468;363469;363470;363471;363472;363473;363474;363475;363476;363477;363478;363479;363480;363481;363482;363483;363484;363485;363486 363486 22 LYEPDQLQELK Unmodified 1374.7031 0.70309628 4342 Q9NZB2;A0A0C4DG79 FAM120A Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.944 81.944 2 0.0016797 84384 QUIQUE_C1438_190116_001 103.19 53.478 483380000 61391000 50217000 59328000 48678000 47037000 66500000 62822000 0 43560000 0 0 43850000 0 31056 4342 29232 284622;284623;284624;284625;284626;284627;284628;284629;284630 363487;363488;363489;363490;363491;363492;363493;363494;363495;363496;363497;363498;363499 363492 13 LYEQILAENEK Unmodified 1348.6874 0.68744622 1467 O14974;H0YIS3;H0YIM2;A0A0U1RQZ1 PPP1R12A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 1 70.935 70.935 2 0.0014036 70309 QUIQUE_C1403_190116_001 103.88 54.782 163310000 60185000 103120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31057 1467 29233 284631;284632;284633 363500;363501;363502 363502 3 LYEQLSGK Unmodified 936.49165 0.49164694 2307 P30086 PEBP1 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.983 29.983 2 0.0024947 24577 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91.426 3 9.3472E-08 92976 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.24 84.336 179490000 0 0 0 0 0 0 0 63315000 42437000 0 42202000 31537000 0 31062 2911 29238 284667;284668;284669;284670;284671 363548;363549;363550;363551;363552;363553 363548 6 LYFTFQDDEK Unmodified 1304.5925 0.5924832 911 E9PER6;O15530;Q6A1A2;H3BQ10 PDPK1;PDPK2P 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1;Putative 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.898 93.898 2 0.0022337 90996 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.069 81.674 154920000 31733000 26787000 0 21373000 0 30740000 28110000 0 0 16182000 0 0 0 31063 911 29239 284672;284673;284674;284675;284676;284677;284678 363554;363555;363556;363557;363558;363559;363560 363560 7 LYFVMEYVNGGDLMYHIQQVGK Oxidation (M) 2619.2502 0.25016639 2121 P17252 PRKCA Protein kinase C alpha type yes yes 0 1 0 1 1 1 1 139.18 139.18 3 2.9388E-06 145891 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.872 70.41 174130000 0 0 0 37913000 0 29705000 0 0 44798000 0 61710000 0 0 31064 2121 29240 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104.72 2 0.0011343 108809 QUIQUE_C1576_190116_001 86.772 71.143 141230000 30426000 0 30695000 25348000 0 20799000 33958000 0 0 0 0 0 0 31070 1136 29246 284700;284701;284702;284703;284704 363585;363586;363587;363588;363589 363589 5 LYGIQAFCK Unmodified 1098.5532 0.55320134 4209 Q9HAV7 GRPEL1 GrpE protein homolog 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 82.786 82.786 2 0.0088322 83118 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.674 61.471 36215000 0 0 0 0 0 0 0 36215000 0 0 0 0 0 31071 4209 29247 284705 363590 363590 1 LYGIQGIPTLIMLDPQGEVITR Unmodified 2426.3243 0.32431761 3356 Q6DKJ4;A0A0C4DGI2 NXN Nucleoredoxin yes no 0 0 0 1 1 164.5 164.5 3 0.0011013 171871 QUIQUE_DMIX5_190116_001 23.195 19.214 30461000 0 0 0 0 13788000 0 0 0 0 0 16673000 0 0 31072 3356 29248 284706;284707 363591;363592 363592 1 LYGPSSVSFADDFVR Unmodified 1658.794 0.79403655 2565 P50454;E9PR70;E9PPV6;E9PJH8;E9PIG2;E9PRS3;E9PNX1;E9PK86;E9PMI5;E9PQ34 SERPINH1 Serpin H1 yes no 0 0 0 1 1 123.14 123.14 2 5.5025E-05 127645 QUIQUE_C1218_190116_001 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LYQEMFAWK Unmodified 1214.5794 0.57941609 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 107.77 107.77 2 0.0053947 112621 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.794 67.007 379470000 0 0 0 0 0 33522000 0 68457000 83949000 0 106220000 87331000 0 31143 3053 29318 285305;285306;285307;285308;285309 364370;364371;364372;364373;364374;364375 364374 2 LYQGGPGGGSGGGGSGASGGPTIEEVD Unmodified 2319.0251 0.025111716 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.897 83.897 2 3.1497E-44 85110 QUIQUE_DMIX3_190116_001 203.78 197.05 1837000000 152880000 155000000 142240000 142350000 164320000 102460000 151310000 0 238090000 114900000 252410000 221080000 0 31144 2643 29319 285310;285311;285312;285313;285314;285315;285316;285317;285318;285319;285320 364376;364377;364378;364379;364380;364381;364382;364383;364384;364385;364386 364383 11 LYQHAVEYFLHAIK Unmodified 1730.9144 0.91442646 4507 Q9UN37 VPS4A Vacuolar protein sorting-associated protein 4A no no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 1 1 1 1 109.82 109.82 3;4 1.9938E-14 112706 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.36 111.54 707620000 38823000 86440000 48846000 89290000 0 65722000 39222000 116950000 102380000 12169000 25886000 37059000 44833000 31145 4507 29320 285321;285322;285323;285324;285325;285326;285327;285328;285329;285330;285331;285332;285333;285334;285335;285336;285337 364387;364388;364389;364390;364391;364392;364393;364394;364395;364396;364397;364398;364399;364400;364401;364402;364403 364396 17 LYQLLTQYK Unmodified 1168.6492 0.64921022 3832 Q96DB5;E5RH53;H0YB83;E5RGC8 RMDN1 Regulator of microtubule dynamics protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 83.128 83.128 2 0.0029423 84094 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.439 36.429 100860000 0 0 0 0 59864000 0 0 40995000 0 0 0 0 0 31146 3832 29321 285338;285339;285340 364404;364405;364406 364405 3 LYQPEYQEVSTEEQR Unmodified 1897.8694 0.86938634 89 A0A087X054;Q9Y4L1 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.195 64.195 2 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365359;365360;365361;365362;365363;365364;365365;365366;365367;365368;365369;365370;365371;365372;365373;365374;365375;365376 365371 18 MADAIILAIAGGQELLAR Oxidation (M) 1841.0081 0.0080688509 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y8V7;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 1 0 1 1 2 2 1 1 2 1 1 160.11 160.11 2;3 1.3796E-09 164033 QUIQUE_C1403_190116_001 103.75 91.483 103570000 0 0 16137000 10782000 0 14193000 0 14275000 15424000 0 16199000 0 16562000 31219 821 29391 286039;286040;286041;286042;286043;286044;286045;286046;286047;286048;286049;286050 365377;365378;365379;365380;365381;365382;365383;365384;365385;365386;365387;365388 365380 485 12 MADALDNYVIR Unmodified 1279.6231 0.62307182 1881 P05165;A0A1B0GU58;H0Y5U0 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 90.695 90.695 2 0.0010651 93599 QUIQUE_C1576_190116_001 105.4 94.762 63726000 0 0 0 0 28174000 0 35552000 0 0 0 0 0 0 31220 1881 29392 286051;286052;286053 365389;365390;365391 365391 3 MADCGGLPQISQPAK Unmodified 1571.7436 0.74359766 3737 Q92597;E7ESM1 NDRG1 Protein NDRG1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 63.477 63.477 2 3.3179E-05 63512 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.803 76.596 407450000 75410000 0 0 73726000 55613000 0 108220000 0 0 0 0 0 94479000 31221 3737 29393 286054;286055;286056;286057;286058;286059;286060 365392;365393;365394;365395;365396;365397;365398 365397 7 MADCGGLPQVVQPGK Unmodified 1555.7487 0.74868304 4423 Q9UGV2;Q5TH30;F8WBF9 NDRG3 Protein NDRG3 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 68.226 68.226 2 7.6161E-13 67422 QUIQUE_C1368_190116_001 135.86 103.25 507260000 79332000 79926000 69118000 77079000 0 53229000 65337000 0 0 24589000 0 58654000 0 31222 4423 29394 286061;286062;286063;286064;286065;286066;286067;286068;286069;286070;286071 365399;365400;365401;365402;365403;365404;365405;365406;365407;365408;365409;365410;365411 365401 13 MADEAGSEADHEGTHSTK Unmodified 1871.7592 0.75918397 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 0 2 2 10.458 10.458 3;4 2.6788E-64 2772 QUIQUE_C1277_190116_001 159.81 153.23 42265000 0 21068000 0 0 0 21197000 0 0 0 0 0 0 0 31223 1823 29395 286072;286073;286074;286075 365412;365413;365414;365415 365412 4 MADEAVCVGPAPTSK Unmodified 1531.7011 0.70106415 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 46.28 46.28 2 0.010602 43831 QUIQUE_C1576_190116_001 53.388 38.122 70411000 0 0 0 35336000 0 0 35076000 0 0 0 0 0 0 31224 1881 29396 286076;286077 365416;365417 365417 2 MADGAPLAGVR Unmodified 1056.5386 0.53861391 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 43.411 43.411 2 0.0034015 40057 QUIQUE_C1277_190116_001 73.985 62.216 393490000 54894000 59461000 61353000 65828000 0 40242000 0 0 0 0 58301000 53410000 0 31225 3434 29397 286078;286079;286080;286081;286082;286083;286084 365418;365419;365420;365421;365422;365423;365424;365425;365426 365419 9 MADKDGDLIATK Unmodified 1276.6333 0.63330216 1557 O43852 CALU Calumenin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.659 23.659 2 0.0028557 18184 QUIQUE_C1218_190116_001 117.86 81.464 36359000 0 0 36359000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31226 1557 29398 286085;286086;286087;286088;286089;286090;286091 365427;365428;365429;365430;365431;365432;365433;365434 365427 8 MADLHAVPR Oxidation (M) 1024.5124 0.51239916 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.661 18.661 2 0.00059822 11706 QUIQUE_C1218_190116_001 113.71 86.744 1113500000 59158000 97885000 70229000 80914000 55371000 57582000 66977000 0 176110000 0 152580000 139890000 156770000 31227 3051 29399 286092;286093;286094;286095;286096;286097;286098;286099;286100;286101;286102 365435;365436;365437;365438;365439;365440;365441;365442;365443;365444;365445;365446;365447;365448 365436 2487 12 MADLHAVPR Unmodified 1008.5175 0.51748454 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 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E7EVJ5;Q96F07;A0A087WWZ1;A0A087WTQ3 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 107.37 107.37 3 1.4505E-07 110734 QUIQUE_C1368_190116_001 78.987 73.107 306210000 54535000 45624000 55169000 55653000 0 33795000 61431000 0 0 0 0 0 0 31230 882 29401 286125;286126;286127;286128;286129;286130;286131 365472;365473;365474;365475;365476;365477;365478;365479 365476 5 MADSGGLPQVTQPGK Oxidation (M) 1500.7242 0.72424243 4492 Q9ULP0 NDRG4 Protein NDRG4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 45.702 45.702 2 1.5137E-11 42980 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.86 100.42 836100000 48376000 0 79236000 0 261810000 57158000 0 0 31629000 0 235490000 0 122400000 31231 4492 29402 286132;286133;286134;286135;286136;286137;286138;286139;286140;286141;286142;286143 365480;365481;365482;365483;365484;365485;365486;365487;365488;365489;365490;365491 365484 2984 11 MADSGGLPQVTQPGK Unmodified 1484.7293 0.72932781 4492 Q9ULP0 NDRG4 Protein NDRG4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 54.652 54.652 2 6.4433E-24 53241 QUIQUE_C1277_190116_001 153.34 125.33 1478900000 0 234740000 217730000 0 0 0 175310000 166240000 127660000 0 218620000 175260000 163340000 31232 4492 29402 286144;286145;286146;286147;286148;286149;286150;286151 365492;365493;365494;365495;365496;365497;365498;365499;365500;365501;365502;365503;365504;365505 365493 14 MADSGGQPQLTQPGK Oxidation (M) 1529.7144 0.71440603 4506;169 A0A0A0MS87;G3V578;H0YJT9;G3V5L7;A0A0U1RR50;Q9UN36 NDRG2 Protein NDRG2 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.24 25.24 2 1.7086E-164 19257 QUIQUE_C1218_190116_001 253.42 228.03 2109900000 82822000 152070000 105110000 143650000 136430000 173490000 127110000 137620000 200130000 98508000 205420000 122500000 425020000 31233 169;4506 29403 286152;286153;286154;286155;286156;286157;286158;286159;286160;286161;286162;286163;286164 365506;365507;365508;365509;365510;365511;365512;365513;365514;365515;365516;365517;365518;365519;365520;365521;365522;365523;365524;365525;365526;365527;365528;365529;365530;365531;365532;365533;365534;365535 365507 103 30 MADSGGQPQLTQPGK Unmodified 1513.7195 0.7194914 4506;169 A0A0A0MS87;G3V578;H0YJT9;G3V5L7;A0A0U1RR50;Q9UN36 NDRG2 Protein NDRG2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.409 32.409 2 2.4873E-24 26970 QUIQUE_DMIX8_190116_001 156.69 149.66 7189900000 690090000 551710000 786660000 590060000 475330000 500230000 533810000 522170000 568790000 180890000 600860000 502120000 687200000 31234 169;4506 29403 286165;286166;286167;286168;286169;286170;286171;286172;286173;286174;286175;286176;286177 365536;365537;365538;365539;365540;365541;365542;365543;365544;365545;365546;365547;365548;365549;365550;365551;365552;365553;365554;365555;365556;365557;365558;365559;365560;365561;365562;365563;365564;365565;365566;365567;365568;365569;365570;365571;365572;365573;365574 365572 39 MAEAALEAVRSELR Oxidation (M) 1560.793 0.7929907 1982 P0C870 JMJD7 JmjC domain-containing protein 7 yes yes 0 1 1 1 94.011 94.011 1 0.0006429 97281 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.913 12.619 687280000 0 0 0 0 0 0 0 0 687280000 0 0 0 0 31235 1982 29404 286178 365575 365575 1256 0 MAEAPPSEAMTLPK Unmodified 1471.7051 0.70508689 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 1 68.875 68.875 2 0.00020803 70080 QUIQUE_C1218_190116_001 94.767 80.348 953910000 150540000 95223000 65526000 102040000 83971000 125450000 0 101970000 48679000 0 92205000 49618000 38697000 31236 2009 29405 286179;286180;286181;286182;286183;286184;286185;286186;286187;286188;286189;286190;286191;286192 365576;365577;365578;365579;365580;365581;365582;365583;365584;365585;365586;365587;365588;365589;365590;365591;365592;365593 365577 18 MAEAPPSEAMTLPK 2 Oxidation (M) 1503.6949 0.69491614 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 2 0 1 38.722 38.722 2 0.058853 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1864 P04424;F8W943;H7C0S8 ASL Argininosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 1 91.292 91.292 2 0.010392 94924 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.693 62.453 17127000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17127000 0 0 31240 1864 29408 286207;286208;286209 365610;365611;365612 365612 2 MAEELKPMDTDKESIAESK Unmodified 2151.0075 0.0075360829 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 2 1 46.839 46.839 3 0.013506 44100 QUIQUE_C1218_190116_001 58.123 43.869 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31241 1579 29409 286210 365613 365613 1 MAEFLDWSLCNLAR Oxidation (M) 1740.7964 0.79636152 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 1 0 1 1 145.32 145.32 2 0.017809 150280 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.977 61.024 39994000 0 0 0 0 0 15844000 0 0 0 0 0 0 24150000 31242 1283 29410 286211;286212 365614;365615 365615 1 MAEGEAEGSVK Unmodified 1106.4914 0.49138895 3825 Q96CV9;A0A087WY28 OPTN Optineurin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.112 16.112 2 0.0019934 8404 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.099 30.04 360860000 29670000 53330000 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365626;365627;365628;365629;365630;365631;365632;365633;365634;365635;365636;365637 365637 10 MAENLGFVGPLK Oxidation (M) 1290.6642 0.66420836 3878 Q96I99;E9PDQ8;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 83.019 83.019 2 0.019772 84021 QUIQUE_C1403_190116_001 55.084 16.791 107600000 0 0 0 28786000 0 24597000 0 0 54219000 0 0 0 0 31246 3878 29413 286234;286235;286236 365638;365639;365640 365638 3 MAEPDPSHPLETQAGK Oxidation (M) 1722.7883 0.78829925 3549 Q8IXJ6;F8WBT6 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 1 0 1 1 2 1 59.181 59.181 2 0.0052133 58422 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.348 30.211 346980000 61937000 0 0 0 0 0 0 71272000 140000000 0 73771000 0 0 31247 3549 29414 286237;286238;286239;286240;286241 365641;365642;365643;365644;365645 365644 2687 5 MAEQYKEQAEK Unmodified 1353.6235 0.62346575 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 12.837 12.837 3 0.039978 5063 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.677 21.42 11992000 0 0 0 0 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MAFPLLDMVDLER Unmodified 1548.768 0.7680215 4067 Q9BXW7 CECR5 Cat eye syndrome critical region protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 163.25 163.25 2 0.0070875 167547 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.32 41.234 32923000 0 12442000 0 0 0 0 0 0 8428900 0 0 12052000 0 31252 4067 29419 286247;286248;286249 365651;365652;365653 365653 2 MAGATPVFIPLR Unmodified 1271.706 0.70601359 3422 Q6YP21;A0A0A0MRN7 CCBL2 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 100.57 100.57 2 0.00038584 103126 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.83 103.11 364260000 0 0 0 0 0 0 0 72579000 76513000 24911000 0 75471000 114790000 31253 3422 29420 286250;286251;286252;286253;286254;286255 365654;365655;365656;365657;365658;365659;365660 365656 7 MAGNEYVGFSNATFQSER Oxidation (M) 2022.8742 0.87415414 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.143 86.143 2 1.4907E-89 88612 QUIQUE_DMIX5_190116_001 211.06 187.69 403610000 32482000 39594000 0 23860000 0 28918000 35612000 39639000 37541000 29004000 42402000 45235000 49319000 31254 1700 29421 286256;286257;286258;286259;286260;286261;286262;286263;286264;286265;286266 365661;365662;365663;365664;365665;365666;365667;365668;365669;365670;365671 365669 936 11 MAGNEYVGFSNATFQSER Unmodified 2006.8792 0.87923952 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.597 93.597 2 1.2761E-24 95608 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.86 118.7 1320200000 142320000 102760000 110590000 85431000 81402000 107190000 119160000 52504000 77890000 40965000 148470000 124910000 126590000 31255 1700 29421 286267;286268;286269;286270;286271;286272;286273;286274;286275;286276;286277;286278;286279 365672;365673;365674;365675;365676;365677;365678;365679;365680;365681;365682;365683;365684 365680 12 MAGTAFDFENMK Oxidation (M) 1376.5741 0.57407272 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 1 0 3 3 3 2 2 2 1 2 2 1 1 1 74.438 74.438 2 2.5181E-08 86960 QUIQUE_C1218_190116_001 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365710;365711;365712;365713;365714;365715;365716;365717;365718;365719;365720;365721;365722;365723;365724;365725;365726;365727;365728;365729;365730;365731 365714 22 MAGTAFDFENMK 2 Oxidation (M) 1392.569 0.56898734 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 2 0 1 1 1 1 1 1 60.176 60.176 2 0.0087071 55839 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.82 59.506 120900000 34694000 0 31026000 0 0 0 0 21975000 0 33202000 0 0 0 31258 2328 29422 286316;286317;286318;286319;286320;286321 365732;365733;365734;365735;365736;365737 365737 1717;1718 5 MAGTAFDFENMKR Oxidation (M) 1532.6752 0.67518375 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 1 1 2 2 1 1 4 4 3 6 4 5 57.158 57.158 2;3 0.00017545 52006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.663 69.923 1949800000 100030000 104300000 0 0 0 0 28406000 377670000 363110000 217030000 249020000 321250000 188950000 31259 2328 29423 286322;286323;286324;286325;286326;286327;286328;286329;286330;286331;286332;286333;286334;286335;286336;286337;286338;286339;286340;286341;286342;286343;286344;286345;286346;286347;286348;286349;286350;286351;286352;286353 365738;365739;365740;365741;365742;365743;365744;365745;365746;365747;365748;365749;365750;365751;365752;365753;365754;365755;365756;365757;365758;365759;365760;365761;365762;365763;365764;365765;365766;365767;365768;365769;365770;365771 365744 1717;1718 30 MAGTAFDFENMKR Unmodified 1516.6803 0.68026913 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 72.316 72.316 2;3 2.9172E-52 73130 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.27 157.25 8434800000 198540000 556740000 286250000 256360000 512890000 156580000 742630000 968580000 754290000 52621000 1495200000 1115800000 1338400000 31260 2328 29423 286354;286355;286356;286357;286358;286359;286360;286361;286362;286363;286364;286365;286366;286367;286368;286369;286370;286371;286372;286373;286374;286375;286376 365772;365773;365774;365775;365776;365777;365778;365779;365780;365781;365782;365783;365784;365785;365786;365787;365788;365789;365790;365791;365792;365793;365794;365795;365796;365797 365791 20 MAGTAFDFENMKR 2 Oxidation (M) 1548.6701 0.67009837 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 2 1 1 2 2 1 1 1 42.108 42.108 2;3 0.00028631 38130 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.342 79.768 376590000 0 0 0 0 0 0 0 112610000 136660000 29778000 56148000 41397000 0 31261 2328 29423 286377;286378;286379;286380;286381;286382;286383;286384 365798;365799;365800;365801;365802;365803;365804;365805;365806 365801 1717;1718 8 MAGVRPDNVAEVVAGAR Unmodified 1710.8835 0.88353704 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 75.355 75.355 2;3 6.8896E-06 76972 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subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.422 47.422 2 0.0068412 45026 QUIQUE_C1576_190116_001 83.265 56.663 1212600000 120110000 0 157280000 157280000 112200000 0 134480000 91560000 0 0 190560000 128690000 120480000 31264 1921 29425 286412;286413;286414;286415;286416;286417;286418;286419;286420 365839;365840;365841;365842;365843;365844;365845;365846;365847;365848;365849;365850 365843 8 MAILQIMK Unmodified 946.53438 0.53438016 2983 Q13263;M0R3C0 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.491 91.491 2 0.0020674 93806 QUIQUE_C1277_190116_001 138.07 116.15 1054100000 122720000 120960000 96545000 88974000 69116000 86446000 51625000 92937000 86609000 32235000 71582000 71541000 62856000 31265 2983 29426 286421;286422;286423;286424;286425;286426;286427;286428;286429;286430;286431;286432;286433 365851;365852;365853;365854;365855;365856;365857;365858;365859;365860;365861;365862;365863;365864;365865;365866 365854 16 MAIMVQSPMFDGK Unmodified 1453.6768 0.67676365 1974 P09874;Q5VX84;Q5VX85 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 105.29 105.29 2 0.0074778 108223 QUIQUE_C1277_190116_001 84.817 73.666 92621000 34375000 28165000 30080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31266 1974 29427 286434;286435;286436 365867;365868;365869;365870 365868 3 MAIPGIPYER Acetyl (Protein N-term) 1187.6009 0.60087982 124 A0A087X2I1 PSMC6 yes yes 1 0 0 1 96.999 96.999 2 0.050754 101455 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.808 27.605 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31267 124 29428 286437 365871 365871 1 MAKPEEVLVVENDQGEVVR Unmodified 2140.0834 0.083418639 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 76.286 76.286 3 3.2983E-07 76677 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.88 57.829 721080000 65476000 79876000 0 97585000 58223000 59838000 72851000 0 79603000 0 79536000 66272000 61825000 31268 1470 29429 286438;286439;286440;286441;286442;286443;286444;286445;286446;286447;286448 365872;365873;365874;365875;365876;365877;365878;365879;365880;365881;365882;365883;365884;365885 365885 12 MAKPEEVLVVENDQGEVVR Oxidation (M) 2156.0783 0.078333261 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 1 1 1 1 1 67.44 67.44 3 0.00015088 67467 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.676 64.521 157110000 0 0 0 0 0 0 0 58644000 0 35268000 63195000 0 0 31269 1470 29429 286449;286450;286451 365886;365887;365888 365888 813 3 MALDIEIAAYR Oxidation (M) 1280.6435 0.64347291 869;1916;3176;2033 P07196;P12036;E7ESP9;P07197;E7EMV2;Q16352 NEFL;NEFH;NEFM;INA Neurofilament light polypeptide;Neurofilament heavy polypeptide;Neurofilament medium polypeptide;Alpha-internexin no no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 96.553 96.553 2 6.8262E-08 100187 QUIQUE_C1576_190116_001 149.72 108.73 1420800000 122190000 127540000 109860000 84175000 119540000 111330000 164700000 77064000 49200000 80085000 173890000 106890000 94384000 31270 1916;2033;869;3176 29430 286452;286453;286454;286455;286456;286457;286458;286459;286460;286461;286462;286463;286464;286465;286466;286467 365889;365890;365891;365892;365893;365894;365895;365896;365897;365898;365899;365900;365901;365902;365903;365904;365905;365906;365907;365908;365909;365910;365911;365912;365913;365914;365915;365916;365917;365918 365904 518 29 MALDIEIAAYR Unmodified 1264.6486 0.64855829 869;1916;3176;2033 P07196;P12036;E7ESP9;P07197;E7EMV2;Q16352 NEFL;NEFH;NEFM;INA Neurofilament light polypeptide;Neurofilament heavy polypeptide;Neurofilament medium polypeptide;Alpha-internexin no no 0 0 0 4 4 4 4 3 1 6 5 4 1 6 3 4 116.42 116.42 2 0.00012979 121559 QUIQUE_C1218_190116_001 152.34 91.368 1638800000 228220000 134280000 81809000 101110000 69869000 0 241360000 116130000 116750000 26776000 227850000 99559000 195070000 31271 1916;2033;869;3176 29430 286468;286469;286470;286471;286472;286473;286474;286475;286476;286477;286478;286479;286480;286481;286482;286483;286484;286485;286486;286487;286488;286489;286490;286491;286492;286493;286494;286495;286496;286497;286498;286499;286500;286501;286502;286503;286504;286505;286506;286507;286508;286509;286510;286511;286512;286513;286514;286515;286516 365919;365920;365921;365922;365923;365924;365925;365926;365927;365928;365929;365930;365931;365932;365933;365934;365935;365936;365937;365938;365939;365940;365941;365942;365943;365944;365945;365946;365947;365948;365949;365950;365951;365952;365953;365954;365955;365956;365957;365958;365959;365960;365961;365962;365963;365964;365965;365966;365967;365968;365969;365970;365971 365920 39 MALDIEIAAYRK Unmodified 1392.7435 0.74352131 869;1916;3176;2033 P07196;P12036;E7ESP9;P07197;E7EMV2;Q16352 NEFL;NEFH;NEFM;INA Neurofilament light polypeptide;Neurofilament heavy polypeptide;Neurofilament medium polypeptide;Alpha-internexin no no 0 0 1 3 2 2 2 1 86.115 86.115 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365984;365985;365986;365987;365988;365989;365990;365991;365992;365993;365994;365995;365996;365997;365998;365999;366000;366001;366002;366003;366004;366005;366006;366007;366008;366009;366010;366011;366012;366013;366014;366015;366016;366017;366018;366019;366020;366021;366022;366023 365986 1201 40 MALDIEIATYR Unmodified 1294.6591 0.65912298 1952;2435 P08670;B0YJC4;B0YJC5;P41219;H7C5W5 VIM;PRPH Vimentin;Peripherin no no 0 0 0 3 2 4 1 4 3 4 2 4 1 15 6 3 112.8 112.8 2 5.2493E-47 116398 QUIQUE_C1218_190116_001 213.53 103.12 8409600000 659840000 197500000 589510000 358060000 823170000 865360000 943970000 778180000 1140800000 247300000 1069200000 481700000 255040000 31274 1952;2435 29432 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366399;366400;366401;366402;366403;366404;366405;366406;366407;366408 366407 10 MAQQMLDLEEQLEEEEAAR Unmodified 2262.0144 0.014412375 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 134.42 134.42 2 0.052267 139235 QUIQUE_C1218_190116_001 53.981 46.611 18998000 18998000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31304 2385 29458 286830 366409 366409 0 MAQWGNKPVC Unmodified 1189.5372 0.5372337 2174 P21266 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 40.31 40.31 2 0.031773 36999 QUIQUE_C1576_190116_001 79.469 63.135 2764500000 0 590350000 0 0 0 0 318030000 1280300000 0 0 575800000 0 0 31305 2174 29459 286831;286832;286833;286834 366410;366411;366412;366413 366411 2 MAQWGNKPVC Oxidation (M) 1205.5321 0.53214833 2174 P21266 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes yes 0 1 1 1 1 30.592 30.592 2 1.2543E-07 24466 QUIQUE_DMIX4_190116_001 158.36 131.1 853370000 0 0 0 0 0 0 0 696030000 0 157340000 0 0 0 31306 2174 29459 286835;286836 366414;366415 366415 1523 2 MAQYLEEER Unmodified 1167.523 0.52302343 3173 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synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 0 1 170.79 170.79 3 1.1196E-12 178122 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.678 68.556 61518000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61518000 0 0 31309 2524 29462 286850 366429 366429 1957 1 MASEELACKLER Oxidation (M) 1451.6748 0.6748494 4036 Q9BUP0 EFHD1 EF-hand domain-containing protein D1 yes yes 0 1 1 1 19.378 19.378 2 0.038067 12056 QUIQUE_C1368_190116_001 71.379 54.149 71868000 0 0 71868000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31310 4036 29463 286851 366430 366430 1 MASPEDVSEVLAHIGTCLR Unmodified 2084.0031 0.0030598275 3341 Q5VZK9;A0A0U1RR91 LRRC16A Leucine-rich repeat-containing protein 16A yes no 0 0 0 1 142.57 142.57 3 0.0019157 148336 QUIQUE_C1368_190116_001 57.482 42.327 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31311 3341 29464 286852 366431 366431 1 MASSEGSTESEHLEGMEPGQK Unmodified 2219.9311 0.93107668 1078 G3V200;O75334;H0YHK3;H0YH95 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 0 1 21.839 21.839 4 0.066631 15133 QUIQUE_DMIX5_190116_001 11.956 7.3393 51040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51040000 0 0 31312 1078 29465 286853 366432 366432 1 MASSNMHEAEEWYR Unmodified 1739.7032 0.70318941 1322 K7EKD1 GFAP yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 3 3 2 1 1 2 62.629 62.629 2;3 4.8688E-132 55011 QUIQUE_C1368_190116_001 246.26 228.82 1286800000 96984000 117300000 191030000 161420000 36121000 250040000 177490000 0 76492000 27692000 0 39490000 112760000 31313 1322 29466 286854;286855;286856;286857;286858;286859;286860;286861;286862;286863;286864;286865;286866;286867;286868;286869;286870;286871;286872;286873;286874 366433;366434;366435;366436;366437;366438;366439;366440;366441;366442;366443;366444;366445;366446;366447;366448;366449;366450;366451;366452;366453 366438 18 MASTFIGNSTAIQELFK Unmodified 1856.9342 0.93423521 4033 Q9BUF5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes yes 0 0 0 4 4 5 3 2 1 3 4 2 2 6 2 3 147.77 147.77 2;3 2.6922E-63 151183 QUIQUE_DMIX8_190116_001 192.86 1.7994 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0 0 0 37784000 0 0 0 0 0 0 0 0 31315 4033 29468 286916 366503 366503 1 MASTFIGNSTAIQELFKR Oxidation (M) 2029.0303 0.030260856 4033 Q9BUF5 TUBB6 Tubulin beta-6 chain yes yes 0 1 1 1 1 125.23 125.23 2 7.8991E-31 128202 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.86 10.563 356770000 0 0 0 0 0 0 0 276370000 0 0 0 80400000 0 31316 4033 29468 286917;286918 366504;366505 366504 2840 2 MASVGLSDIAMDTTVTHATSHGR Unmodified 2357.1104 0.11037845 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 79.659 79.659 4 5.3977E-08 80869 QUIQUE_C1277_190116_001 51.301 48.027 153910000 26528000 40068000 56023000 0 31289000 0 0 0 0 0 0 0 0 31317 2834 29469 286919;286920;286921;286922 366506;366507;366508;366509 366507 2 MATADEIVK Unmodified 976.48993 0.48993238 3226 Q3LXA3;H0YCY6 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 33.279 33.279 2 0.025868 28790 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.981 11.132 51343000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51343000 0 0 31318 3226 29470 286923 366510 366510 1 MATANFGK Oxidation (M) 854.39564 0.39563807 1377 O00139;D6R9M0 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 1 0 1 98.331 98.331 1 0.058632 95105 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.616 14.068 30620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30620000 0 0 0 31319 1377 29471 286924 366511 366511 1 MATDPENIIK Oxidation (M) 1146.5591 0.55907458 1941 P08247;H7C4W3 SYP Synaptophysin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.654 45.654 2 1.81E-17 41203 QUIQUE_DMIX4_190116_001 177.7 140.94 3080500000 156720000 197820000 286650000 210430000 155600000 167960000 189620000 230790000 282630000 104990000 419930000 288950000 388360000 31320 1941 29472 286925;286926;286927;286928;286929;286930;286931;286932;286933;286934;286935;286936;286937 366512;366513;366514;366515;366516;366517;366518;366519;366520;366521;366522;366523;366524;366525;366526;366527;366528;366529 366525 1182 18 MATDPENIIK Unmodified 1130.5642 0.56415996 1941 P08247;H7C4W3 SYP Synaptophysin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.542 59.542 2 0.00021847 57787 QUIQUE_C1563_190116_001 118.5 99.713 6340300000 463170000 523940000 750280000 530740000 478320000 375470000 542800000 378900000 403030000 135810000 689600000 430850000 637390000 31321 1941 29472 286938;286939;286940;286941;286942;286943;286944;286945;286946;286947;286948;286949;286950 366530;366531;366532;366533;366534;366535;366536;366537;366538;366539;366540;366541;366542;366543;366544;366545;366546;366547;366548;366549 366537 20 MATEGMILTNHDHQIR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1923.8931 0.89311545 998 F5H039;Q9NQX3;G3V582;G3V4R0;G3V355;G3V4D2 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 1 1 0 1 102.44 102.44 2 0.013157 104052 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.283 17.534 430860000 0 0 0 0 0 0 0 430860000 0 0 0 0 0 31322 998 29473 286951 366550 366550 599 1 MATHTLITGLEEYVR Unmodified 1732.8818 0.8818057 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 109.23 109.23 3 0.00098935 111957 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.29 52.503 237500000 45457000 48207000 0 29411000 26659000 0 0 28466000 0 0 30199000 29105000 0 31323 7 29474 286952;286953;286954;286955;286956;286957;286958 366551;366552;366553;366554;366555;366556;366557;366558 366558 4 MATHTLITGLEEYVR Oxidation (M) 1748.8767 0.87672033 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 1 0 1 1 100.54 100.54 3 0.0058512 103054 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.68 35.309 74590000 0 0 0 0 0 0 0 24763000 0 0 0 0 49827000 31324 7 29474 286959;286960 366559;366560 366560 7 1 MATLHCQESEGHPR Unmodified 1651.7195 0.71950818 4059 Q9BX67;H0YD98 JAM3 Junctional adhesion molecule C yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 12.282 12.282 3;4 1.6727E-18 5104 QUIQUE_C1368_190116_001 131.53 119.48 38934000 2942400 0 12961000 0 8906200 0 6264100 0 0 0 7860100 0 0 31325 4059 29475 286961;286962;286963;286964;286965;286966;286967;286968;286969 366561;366562;366563;366564;366565;366566;366567;366568;366569 366562 9 MATLYSR Unmodified 840.41637 0.41637351 2436 P41222;H0Y5A1;Q5SQ11 PTGDS Prostaglandin-H2 D-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.22 30.22 2 0.019725 24652 QUIQUE_C1576_190116_001 124.37 71.69 2134000000 0 0 399420000 320070000 0 235370000 366680000 331490000 0 101170000 379830000 0 0 31326 2436 29476 286970;286971;286972;286973;286974;286975;286976 366570;366571;366572;366573;366574;366575;366576;366577;366578 366574 9 MATNAAAQNAIK Unmodified 1202.6078 0.60775611 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 22.674 22.674 2 0.0012936 16202 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.06 99.698 233780000 128280000 0 0 0 0 0 0 105500000 0 0 0 0 0 31327 4600 29477 286977;286978 366579;366580 366580 1 MATQASTLYSNNITK Unmodified 1641.8032 0.80322103 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 57.354 57.354 2 4.0686E-30 56577 QUIQUE_C1218_190116_001 167.71 139.7 767800000 139570000 100120000 143830000 0 0 155880000 115850000 112550000 0 0 0 0 0 31328 2993 29478 286979;286980;286981;286982;286983;286984;286985 366581;366582;366583;366584;366585;366586;366587 366581 7 MATQASTLYSNNITK Oxidation (M) 1657.7981 0.79813565 2993 Q13423;E9PCX7 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 47.63 47.63 2 1.6985E-05 43408 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.401 76.158 152090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48053000 0 0 104040000 31329 2993 29478 286986;286987 366588;366589 366588 2443 1 MATRPPDRPEGPHTSR Unmodified 1803.8798 0.87984864 3769 Q92932;E7EM83 PTPRN2 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 2 1 1 14.15 14.15 5 0.0065136 6016 QUIQUE_C1368_190116_001 45.14 34.278 22006000 10319000 0 11687000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31330 3769 29479 286988;286989 366590;366591 366591 2 MAVLALLAK Unmodified 928.57796 0.57795953 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.83 105.83 2 0.0073686 110664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.784 60.013 49941000 0 0 0 0 0 0 0 0 15697000 0 18139000 16105000 0 31331 2813 29480 286990;286991;286992;286993;286994;286995;286996 366592;366593;366594;366595;366596;366597;366598 366596 7 MAVMAMVIK Unmodified 992.5221 0.52210091 3461 Q7Z4H3;V9GYS5;V9GZ04 HDDC2 HD domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 86.511 86.511 2 0.01901 87585 QUIQUE_C1563_190116_001 89.369 64.55 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31332 3461 29481 286997;286998;286999 366599;366600;366601 366600 3 MAVPTCLLQMK Unmodified 1290.6498 0.64982062 4360 Q9P000 COMMD9 COMM domain-containing protein 9 yes yes 0 0 0 1 105.11 105.11 2 0.040632 106942 QUIQUE_C1563_190116_001 47.187 32.52 23662000 0 0 0 0 0 23662000 0 0 0 0 0 0 0 31333 4360 29482 287000 366602 366602 1 MAVQDAVDALMQK Unmodified 1418.6898 0.68977118 2476 P46060 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 127.27 127.27 2 0.0019889 131062 QUIQUE_C1277_190116_001 94.692 82.456 113160000 27207000 28751000 0 30048000 0 27151000 0 0 0 0 0 0 0 31334 2476 29483 287001;287002;287003;287004 366603;366604;366605;366606 366604 4 MAVSWHHDENLVDR Unmodified 1707.7787 0.77873762 334 A0A1B0GTC3;A0A1B0GVH5;Q9C0B1;A0A1B0GUC3;A0A1B0GV98;A0A1B0GTC5;A0A1B0GU26;A0A1B0GTY1;A0A1B0GTI3 FTO Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO yes no 0 0 0 1 65.108 65.108 2 0.061055 60986 QUIQUE_DMIX4_190116_001 39.918 9.0601 18439000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18439000 0 0 0 31335 334 29484 287005 366607 366607 1 MAVTFIGNSTAIQELFK Oxidation (M) 1884.9655 0.96553533 1922 Q5JP53;P07437;Q5ST81 TUBB Tubulin beta chain yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 2 144.81 144.81 2;3 8.0397E-181 149086 QUIQUE_C1277_190116_001 252.88 200.96 24095000000 1157000000 1367900000 1519400000 1097300000 1723900000 973350000 1561800000 2228700000 2545200000 1743000000 2900600000 2400600000 2876400000 31336 1922 29485 287006;287007;287008;287009;287010;287011;287012;287013;287014;287015;287016;287017;287018;287019;287020;287021;287022;287023;287024;287025;287026;287027;287028;287029;287030;287031;287032;287033 366608;366609;366610;366611;366612;366613;366614;366615;366616;366617;366618;366619;366620;366621;366622;366623;366624;366625;366626;366627;366628;366629;366630;366631;366632;366633;366634;366635;366636;366637;366638;366639;366640;366641;366642;366643;366644 366612 1149 37 MAVTFIGNSTAIQELFK Unmodified 1868.9706 0.97062071 1922 Q5JP53;P07437;Q5ST81 TUBB Tubulin beta chain yes no 0 0 0 2 5 5 3 5 3 4 3 4 3 9 5 6 153.87 153.87 2;3 4.8571E-105 159798 QUIQUE_DMIX5_190116_001 223.31 190.71 52639000000 3696600000 3876600000 3384800000 3479400000 4111400000 2553400000 5581700000 3860900000 4845500000 1138900000 6200200000 4924800000 4985000000 31337 1922 29485 287034;287035;287036;287037;287038;287039;287040;287041;287042;287043;287044;287045;287046;287047;287048;287049;287050;287051;287052;287053;287054;287055;287056;287057;287058;287059;287060;287061;287062;287063;287064;287065;287066;287067;287068;287069;287070;287071;287072;287073;287074;287075;287076;287077;287078;287079;287080;287081;287082;287083;287084;287085;287086;287087;287088;287089;287090 366645;366646;366647;366648;366649;366650;366651;366652;366653;366654;366655;366656;366657;366658;366659;366660;366661;366662;366663;366664;366665;366666;366667;366668;366669;366670;366671;366672;366673;366674;366675;366676;366677;366678;366679;366680;366681;366682;366683;366684;366685;366686;366687;366688;366689;366690;366691;366692;366693;366694;366695;366696;366697;366698;366699;366700;366701;366702;366703;366704;366705;366706;366707;366708;366709;366710;366711;366712;366713;366714;366715;366716;366717;366718;366719;366720;366721;366722;366723;366724;366725;366726;366727;366728;366729;366730;366731;366732;366733;366734;366735;366736;366737;366738;366739;366740;366741;366742;366743;366744;366745;366746;366747;366748;366749;366750;366751;366752;366753;366754;366755;366756 366724 108 MAVTFIGNSTAIQELFKR Oxidation (M) 2041.0666 0.066646362 1922 Q5JP53;P07437;Q5ST81 TUBB Tubulin beta chain yes no 0 1 1 2 1 2 128.47 128.47 2;3 7.4671E-37 131563 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.29 157.61 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29487 287106;287107;287108;287109;287110;287111 366775;366776;366777;366778;366779;366780;366781;366782;366783 366775 9 MCASSCDFVK Oxidation (M) 1219.4672 0.46716481 1685 O94772 LY6H Lymphocyte antigen 6H yes yes 0 1 0 1 1 26.005 26.005 2 0.032972 19579 QUIQUE_C1277_190116_001 55.235 39.032 60696000 0 34214000 0 0 0 26482000 0 0 0 0 0 0 0 31341 1685 29488 287112;287113 366784;366785 366784 2 MCCELALCK Unmodified 1183.4858 0.48579176 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0;A0A1B0GW70 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 50.597 50.597 2 0.035453 48618 QUIQUE_C1576_190116_001 54.776 44.789 82333000 0 26107000 0 17531000 0 19143000 19552000 0 0 0 0 0 0 31342 135 29489 287114;287115;287116;287117 366786;366787;366788;366789 366789 4 MCDLVSDFDGFSER Unmodified 1676.6811 0.68105699 2320 P30520 ADSS Adenylosuccinate synthetase isozyme 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 128.14 128.14 2 0.0045907 133628 QUIQUE_C1218_190116_001 65.179 58.291 84950000 34664000 0 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31345 4533 29491 287129;287130;287131;287132;287133;287134;287135;287136;287137;287138;287139;287140;287141;287142;287143;287144;287145;287146;287147;287148;287149;287150;287151;287152 366802;366803;366804;366805;366806;366807;366808;366809;366810;366811;366812;366813;366814;366815;366816;366817;366818;366819;366820;366821;366822;366823;366824;366825;366826;366827 366802 2997;2998 25 MCDPGMTAFEPEALGNLVEGLDFHR Unmodified 2805.2561 0.2560564 4533 Q9UQM7 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.35 161.35 3;4 1.1135E-50 163707 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.79 140.51 8631700000 882090000 927790000 840560000 876840000 610130000 597190000 674590000 430700000 318480000 82833000 964560000 951300000 474580000 31346 4533 29491 287153;287154;287155;287156;287157;287158;287159;287160;287161;287162;287163;287164;287165;287166 366828;366829;366830;366831;366832;366833;366834;366835;366836;366837;366838;366839;366840;366841;366842;366843;366844;366845;366846;366847;366848;366849 366842 21 MCDVMAAYFGK Unmodified 1291.5399 0.53993582 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47;C9JTK4;C9JGT8;C9JJD3;C9JPV8 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.71 107.71 2 0.0026953 110826 QUIQUE_C1403_190116_001 98.033 83.367 1061500000 91730000 139850000 100930000 125210000 84453000 74812000 112290000 0 79825000 0 129570000 0 122820000 31347 71 29492 287167;287168;287169;287170;287171;287172;287173;287174;287175;287176 366850;366851;366852;366853;366854;366855;366856;366857;366858;366859 366853 0 MCEVVLGEFLK Unmodified 1323.6567 0.65668014 2930 Q08AM6 VAC14 Protein VAC14 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 123.65 123.65 2 0.00071972 129037 QUIQUE_C1218_190116_001 96.89 83.512 81651000 34324000 31138000 0 0 0 16190000 0 0 0 0 0 0 0 31348 2930 29493 287177;287178;287179 366860;366861;366862;366863 366860 4 MCFVDPVR Unmodified 1022.4678 0.46775715 3988 Q9BQ24 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 69.293 69.293 2 0.014995 68640 QUIQUE_C1368_190116_001 85.265 53.329 224390000 33725000 42258000 40135000 33369000 0 45415000 0 29493000 0 0 0 0 0 31349 3988 29494 287180;287181;287182;287183;287184;287185;287186 366864;366865;366866;366867;366868;366869;366870 366866 6 MCFVDPVR Oxidation (M) 1038.4627 0.46267178 3988 Q9BQ24 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes yes 0 1 0 1 48.717 48.717 2 0.058984 46033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.676 26.527 40181000 0 0 0 0 0 0 0 40181000 0 0 0 0 0 31350 3988 29494 287187 366871 366871 1 MCINTEWGAFGDDGSLEDIR Unmodified 2284.9729 0.97288191 2146 P19367;B1AR63 HK1 Hexokinase-1;Hexokinase yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 1 143.19 143.19 2;3 3.7099E-56 147288 QUIQUE_C1403_190116_001 207.72 188.51 818720000 134930000 136650000 119960000 55598000 66509000 103690000 96549000 0 0 7685800 36049000 30628000 30465000 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287424;287425;287426;287427;287428;287429;287430;287431;287432;287433;287434;287435;287436 367184;367185;367186;367187;367188;367189;367190;367191;367192;367193;367194;367195;367196 367185 13 MDDVINISGHR Unmodified 1255.5979 0.5979197 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 47.577 47.577 3 0.046761 44335 QUIQUE_C1403_190116_001 25.701 15.392 103760000 53580000 0 0 50184000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31387 4296 29522 287437;287438 367197;367198 367198 2 MDEDVLTTLK Acetyl (Protein N-term) 1205.585 0.58495498 4237 Q9NP72;A0A087X163;Q5W0J0 RAB18 Ras-related protein Rab-18 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 132.56 132.56 2 0.0013949 137125 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.806 77.576 171290000 19881000 36815000 26069000 0 0 30214000 0 25585000 32730000 0 0 0 0 31388 4237 29523 287439;287440;287441;287442;287443;287444 367199;367200;367201;367202;367203;367204;367205 367205 7 MDEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGK Acetyl (Protein N-term);2 Oxidation (M) 3116.4604 0.46035468 2328 P31150;G5E9U5 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes no 1 2 0 1 187.53 187.53 3 3.4892E-06 193244 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.705 51.7 19015000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19015000 0 0 31389 2328 29524 287445 367206 367206 1719;1720 1 MDEEYDVIVLGTGLTECILSGIMSVNGK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 3100.4654 0.46544006 2328 P31150;G5E9U5 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes no 1 1 0 1 191.38 191.38 3 3.6639E-31 196668 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.21 108.49 47603000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47603000 0 0 31390 2328 29524 287446 367207 367207 1719;1720 1 MDEFHPFIEALLPHVR Acetyl (Protein N-term) 1991.9928 0.99275314 347 A0A1B0GW37;A0A1B0GU97 yes no 1 0 0 1 1 1 162.64 162.64 3 0.00024808 167528 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.08 62.371 43683000 0 12541000 0 0 0 0 0 0 14155000 0 16987000 0 0 31391 347 29525 287447;287448;287449 367208;367209;367210 367209 3 MDELGAGIAQSR Unmodified 1246.5976 0.59758535 3900 Q96LD4;K7EJ63 TRIM47 Tripartite motif-containing protein 47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.636 54.636 2 0.02153 53260 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.262 45.933 27427000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27427000 31392 3900 29526 287450;287451;287452;287453 367211;367212;367213;367214 367214 3 MDELQDVQLTEIKPLLNDK Acetyl (Protein N-term) 2283.1668 0.16681392 4423 Q9UGV2;Q5TH30 NDRG3 Protein NDRG3 yes no 1 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 153.25 153.25 2;3 1.2075E-22 157289 QUIQUE_C1403_190116_001 166.6 148.18 314230000 23527000 27506000 29064000 73709000 31423000 25624000 0 39697000 36297000 0 0 27385000 0 31393 4423 29527 287454;287455;287456;287457;287458;287459;287460;287461;287462;287463;287464 367215;367216;367217;367218;367219;367220;367221;367222;367223;367224;367225;367226;367227 367218 12 MDELQLFR Unmodified 1050.5168 0.51681584 2658 P55072;C9IZA5;C9JUP7 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 100.28 100.28 2 1.9163E-09 103696 QUIQUE_C1576_190116_001 179.16 157.45 3700700000 326100000 398320000 319350000 341000000 300590000 286710000 377480000 257100000 213260000 77946000 279290000 218680000 304900000 31394 2658 29528 287465;287466;287467;287468;287469;287470;287471;287472;287473;287474;287475;287476;287477;287478 367228;367229;367230;367231;367232;367233;367234;367235;367236;367237;367238;367239;367240;367241;367242;367243;367244;367245;367246;367247;367248;367249;367250;367251;367252;367253 367242 26 MDELQLFR Oxidation (M) 1066.5117 0.51173046 2658 P55072;C9IZA5;C9JUP7 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.101 86.101 2 0.001383 87329 QUIQUE_C1403_190116_001 145.04 128.89 1461200000 0 0 0 96285000 94645000 0 0 215680000 213190000 140140000 256990000 194870000 249400000 31395 2658 29528 287479;287480;287481;287482;287483;287484;287485;287486 367254;367255;367256;367257;367258;367259;367260;367261;367262;367263 367254 2101 10 MDENEFVAVTSTNAAK Oxidation (M) 1741.7829 0.78287952 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 65.658 65.658 2 7.1686E-66 66729 QUIQUE_DMIX1_190116_001 197.38 183.15 1142600000 29479000 102510000 113250000 0 77059000 77215000 83345000 99077000 109270000 82666000 142610000 98662000 127450000 31396 1430 29529 287487;287488;287489;287490;287491;287492;287493;287494;287495;287496;287497;287498;287499;287500;287501;287502;287503;287504;287505;287506;287507;287508;287509;287510 367264;367265;367266;367267;367268;367269;367270;367271;367272;367273;367274;367275;367276;367277;367278;367279;367280;367281;367282;367283;367284;367285;367286;367287;367288 367277 801 24 MDENEFVAVTSTNAAK Unmodified 1725.788 0.7879649 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 3 1 1 2 2 2 79.188 79.188 2 8.8943E-19 82649 QUIQUE_C1277_190116_001 191.23 181.8 3940100000 451990000 431170000 396030000 379140000 269970000 319900000 368660000 286310000 103320000 51842000 346350000 247920000 287450000 31397 1430 29529 287511;287512;287513;287514;287515;287516;287517;287518;287519;287520;287521;287522;287523;287524;287525;287526;287527;287528;287529;287530;287531;287532;287533;287534;287535;287536 367289;367290;367291;367292;367293;367294;367295;367296;367297;367298;367299;367300;367301;367302;367303;367304;367305;367306;367307;367308;367309;367310;367311;367312;367313;367314;367315;367316;367317;367318;367319;367320;367321;367322 367295 32 MDENQFVAVTSTNAAK Oxidation (M) 1740.7989 0.79886394 365;3050;3051 Q14194;E9PD68;A0A1C7CYX9;Q16555;Q14195;H0YBT4 CRMP1;DPYSL2;DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 1;Dihydropyrimidinase-related protein 2;Dihydropyrimidinase-related protein 3 no no 0 1 0 1 2 3 2 2 2 1 1 2 3 3 1 2 59.453 59.453 2;3 5.0001E-44 58350 QUIQUE_C1368_190116_001 178.36 154.51 23491000000 1184600000 1760600000 1832300000 1486300000 1303700000 1002700000 1271800000 1785500000 2487500000 2091600000 2741400000 1891700000 2651500000 31398 3050;365;3051 29530 287537;287538;287539;287540;287541;287542;287543;287544;287545;287546;287547;287548;287549;287550;287551;287552;287553;287554;287555;287556;287557;287558;287559;287560;287561 367323;367324;367325;367326;367327;367328;367329;367330;367331;367332;367333;367334;367335;367336;367337;367338;367339;367340;367341;367342;367343;367344;367345;367346;367347;367348;367349;367350;367351;367352;367353;367354;367355;367356;367357;367358;367359 367327 255;2478 33 MDENQFVAVTSTNAAK Unmodified 1724.8039 0.80394931 365;3050;3051 Q14194;E9PD68;A0A1C7CYX9;Q16555;Q14195;H0YBT4 CRMP1;DPYSL2;DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 1;Dihydropyrimidinase-related protein 2;Dihydropyrimidinase-related protein 3 no no 0 0 0 6 6 6 6 5 4 4 3 6 3 5 7 5 76.012 76.012 2;3 3.486E-67 74284 QUIQUE_DMIX7_190116_001 204.85 190.94 114090000000 8623700000 10033000000 11466000000 9622800000 7641500000 7873900000 10420000000 6625500000 7652400000 3818700000 10915000000 8743100000 10653000000 31399 3050;365;3051 29530 287562;287563;287564;287565;287566;287567;287568;287569;287570;287571;287572;287573;287574;287575;287576;287577;287578;287579;287580;287581;287582;287583;287584;287585;287586;287587;287588;287589;287590;287591;287592;287593;287594;287595;287596;287597;287598;287599;287600;287601;287602;287603;287604;287605;287606;287607;287608;287609;287610;287611;287612;287613;287614;287615;287616;287617;287618;287619;287620;287621;287622;287623;287624;287625;287626;287627 367360;367361;367362;367363;367364;367365;367366;367367;367368;367369;367370;367371;367372;367373;367374;367375;367376;367377;367378;367379;367380;367381;367382;367383;367384;367385;367386;367387;367388;367389;367390;367391;367392;367393;367394;367395;367396;367397;367398;367399;367400;367401;367402;367403;367404;367405;367406;367407;367408;367409;367410;367411;367412;367413;367414;367415;367416;367417;367418;367419;367420;367421;367422;367423;367424;367425;367426;367427;367428;367429;367430;367431;367432;367433;367434;367435;367436;367437;367438;367439;367440;367441;367442;367443;367444;367445;367446;367447;367448;367449;367450;367451;367452;367453;367454;367455;367456;367457;367458;367459;367460;367461;367462;367463;367464 367448 104 MDEQALLGLNPNADSDFR Acetyl (Protein N-term) 2046.9317 0.93166902 1534 O43592;F8WDU6;F5GYW6 XPOT Exportin-T yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 157.63 157.63 2 3.6913E-05 164237 QUIQUE_C1438_190116_001 92.457 78.199 148160000 21848000 17879000 0 20552000 29276000 23145000 0 0 0 0 0 0 35458000 31400 1534 29531 287628;287629;287630;287631;287632;287633 367465;367466;367467;367468;367469;367470 367468 4 MDEQEDLAK Unmodified 1077.4648 0.46483985 305 A0A0J9YYF7;Q86T65 DAAM2 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.649 22.649 2 0.011265 15977 QUIQUE_C1368_190116_001 72.968 60.178 100990000 0 32129000 19785000 31762000 0 0 0 0 0 0 0 0 17311000 31401 305 29532 287634;287635;287636;287637;287638;287639 367471;367472;367473;367474;367475;367476 367472 6 MDERPIHAEPQYPVR Unmodified 1836.8941 0.89410173 2141 P19022 CDH2 Cadherin-2 yes yes 0 0 1 1 1 39.066 39.066 4 0.052349 35172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 28.956 20.407 52530000 0 0 0 0 0 0 0 25388000 27143000 0 0 0 0 31402 2141 29533 287640;287641 367477;367478 367478 1 MDETDASSAVK Unmodified 1152.4969 0.49686826 2968 Q13148;B1AKP7;G3V162;A0A087X260;A0A087WYY0;A0A087WX29;A0A0A0N0M3;K7EN94;K7EJM5 TARDBP;TDP43 TAR DNA-binding protein 43 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.155 24.155 2 0.00045939 17597 QUIQUE_C1277_190116_001 114.5 104.51 331000000 71649000 48780000 79191000 44582000 0 34974000 0 20929000 30892000 0 0 0 0 31403 2968 29534 287642;287643;287644;287645;287646;287647;287648 367479;367480;367481;367482;367483;367484;367485;367486 367480 8 MDFAFPGSTNSLHR Unmodified 1578.7249 0.72491113 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 85.301 85.301 3 0.0023866 87187 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.598 48.161 23283000 0 0 0 0 0 0 0 0 23283000 0 0 0 0 31404 2101 29535 287649 367487 367487 1 MDFILSHAVYCR Unmodified 1510.7061 0.70608995 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 93.561 93.561 3 0.0029796 97125 QUIQUE_C1218_190116_001 51.211 42.896 49730000 16679000 0 0 0 15270000 0 17781000 0 0 0 0 0 0 31405 4334 29536 287650;287651;287652 367488;367489;367490 367488 1 MDFLLGNPFSSPVGQR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1821.872 0.8719693 1592 O60784;B0QY01;Q6UW50;H7BYN7;F8WB30;F8WAW7;F8WE29;F8WBB0 TOM1 Target of Myb protein 1 yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 162.84 162.84 2 1.7761E-11 167668 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.7 114.83 218230000 17379000 20772000 17235000 0 0 16379000 0 26701000 17032000 9372200 25307000 25815000 42241000 31406 1592 29537 287653;287654;287655;287656;287657;287658;287659;287660;287661;287662;287663;287664;287665;287666 367491;367492;367493;367494;367495;367496;367497;367498;367499;367500;367501;367502;367503;367504;367505 367505 867 13 MDFLLGNPFSSPVGQR Acetyl (Protein N-term) 1805.8771 0.87705468 1592 O60784;B0QY01;Q6UW50;H7BYN7;F8WB30;F8WAW7;F8WE29;F8WBB0 TOM1 Target of Myb protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.08 174.08 2 3.0197E-25 181164 QUIQUE_DMIX5_190116_001 198.81 181 1719500000 118850000 109350000 122940000 107480000 159720000 187090000 171370000 140580000 109110000 0 177220000 158560000 157200000 31407 1592 29537 287667;287668;287669;287670;287671;287672;287673;287674;287675;287676;287677;287678 367506;367507;367508;367509;367510;367511;367512;367513;367514;367515;367516;367517;367518 367516 13 MDFQQLADVAEK Acetyl (Protein N-term) 1435.6653 0.66533057 3581 Q8N3F0 MTURN Maturin yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.69 150.69 2 1.0008E-07 155628 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.37 136.84 850240000 85863000 69285000 66545000 57408000 49871000 72406000 73062000 53993000 74133000 20809000 70720000 57519000 98621000 31408 3581 29538 287679;287680;287681;287682;287683;287684;287685;287686;287687;287688;287689;287690;287691 367519;367520;367521;367522;367523;367524;367525;367526;367527;367528;367529;367530;367531;367532;367533 367533 12 MDFQQLADVAEK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1451.6602 0.66024519 3581 Q8N3F0 MTURN Maturin yes yes 1 1 0 1 1 1 125.43 125.43 2 0.0019212 129412 QUIQUE_C1277_190116_001 66.56 56.188 81894000 0 22560000 0 0 0 18330000 0 0 0 0 0 0 41004000 31409 3581 29538 287692;287693;287694 367534;367535;367536 367534 2692 2 MDGGSGGLGSGDNAPTTEALFVALGAGVTALSHPLLYVK Oxidation (M) 3758.8825 0.88254057 4348 Q9NZJ7;H0Y8C3 MTCH1 Mitochondrial carrier homolog 1 yes no 0 1 0 1 1 172.31 172.31 3 5.9366E-65 175797 QUIQUE_C1277_190116_001 118.81 116.99 70045000 0 28807000 0 0 0 0 0 41239000 0 0 0 0 0 31410 4348 29539 287695;287696 367537;367538 367537 2912 2 MDGGSGGLGSGDNAPTTEALFVALGAGVTALSHPLLYVK Unmodified 3742.8876 0.88762595 4348 Q9NZJ7;H0Y8C3 MTCH1 Mitochondrial carrier homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 172.62 172.62 3 1.1289E-70 175897 QUIQUE_C1277_190116_001 122.48 120.77 311440000 0 45847000 0 0 0 0 52902000 11546000 79151000 0 122000000 0 0 31411 4348 29539 287697;287698;287699;287700;287701 367539;367540;367541;367542;367543 367539 5 MDGIVPDIAVGTK Acetyl (Protein N-term) 1356.6959 0.69590241 322 A0A0U1RRM4;P26599;K7EKJ7;A0A0D9SF20 PTBP1 Polypyrimidine tract-binding protein 1 yes no 1 0 0 1 1 144.32 144.32 2 0.025292 147187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.418 46.326 41856000 0 0 0 22739000 0 0 0 19117000 0 0 0 0 0 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367596 45 MDIAIHHPWIR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1445.7238 0.72378892 977 E9PR44;P02511;E9PJL7;E9PRA8;E9PS12;E9PRS4 CRYAB Alpha-crystallin B chain yes no 1 1 0 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 72.669 72.669 2;3 0.00069116 73112 QUIQUE_C1277_190116_001 81.525 69.889 9357600000 508110000 1194600000 919190000 216020000 168830000 176390000 1593400000 139410000 987890000 591410000 968430000 0 1893900000 31417 977 29544 287742;287743;287744;287745;287746;287747;287748;287749;287750;287751;287752;287753;287754;287755;287756;287757 367605;367606;367607;367608;367609;367610;367611;367612;367613;367614;367615;367616;367617;367618;367619;367620;367621 367606 592 14 MDIDAPDVDVHGPDWHLK Unmodified 2058.9469 0.94692516 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 2 97.451 97.451 3;4 4.6854E-05 98798 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.779 51.689 213510000 35474000 0 0 0 0 45987000 0 132050000 0 0 0 0 0 31418 2935 29545 287758;287759;287760;287761 367622;367623;367624;367625 367625 4 MDIDAPDVEVQGPDWHLK Unmodified 2063.9622 0.96224087 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 112.88 112.88 2;3 3.455E-07 115389 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.337 83.135 316920000 0 0 0 45273000 60352000 0 46368000 95203000 0 0 69725000 0 0 31419 2935 29546 287762;287763;287764;287765;287766;287767;287768 367626;367627;367628;367629;367630;367631;367632;367633 367630 7 MDIDVPDVEVQGPDWHLK Unmodified 2091.9935 0.993541 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.29 126.29 3 8.304E-07 129265 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.58 99.137 501310000 44440000 45004000 0 0 0 57987000 0 89229000 58524000 13312000 85467000 57390000 49956000 31420 2935 29547 287769;287770;287771;287772;287773;287774;287775;287776;287777 367634;367635;367636;367637;367638;367639;367640;367641;367642 367637 9 MDILAQVLQILLK Oxidation (M) 1512.8949 0.89493657 3016 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1145.5751 0.575059 2780 P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.383 38.383 2 2.6117E-70 34325 QUIQUE_DMIX3_190116_001 237.92 175.21 45058000000 4356700000 4470000000 3904100000 3450700000 3165900000 3114000000 3841500000 3129700000 3401000000 508230000 4010200000 3702200000 4004300000 31426 2780 29551 287812;287813;287814;287815;287816;287817;287818;287819;287820;287821;287822;287823;287824 367683;367684;367685;367686;367687;367688;367689;367690;367691;367692;367693;367694;367695;367696;367697;367698;367699;367700;367701;367702;367703;367704;367705;367706 367697 24 MDKNELVQK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1161.57 0.56997362 2780 P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.203 20.203 2 0.00052239 13453 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.33 89.719 27624000000 0 3988000000 3652900000 3209300000 3392200000 3055100000 0 0 0 0 5693600000 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143.99 143.99 3 0.017021 146975 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.14 34.801 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31429 1459 29553 287856 367742 367742 1 MDLAPSK Unmodified 760.37893 0.37892537 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 22.254 22.254 2 0.05362 15633 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.875 51.61 113390000 0 0 0 0 0 0 0 0 113390000 0 0 0 0 31430 880 29554 287857 367743 367743 1 MDLEKPNYIVPDYMPVVYDK Unmodified 2428.1695 0.16945645 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.25 129.25 3 0.018497 126029 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.091 32.822 317240000 0 0 76602000 51915000 0 46328000 42335000 36395000 42610000 21052000 0 0 0 31431 3053 29555 287858;287859;287860;287861;287862;287863;287864 367744;367745;367746;367747;367748;367749;367750 367750 7 MDLFGDLPEPER Acetyl (Protein N-term) 1459.6653 0.66533057 4117 Q9H0C8;F8SNU7;E9PC05;F8SNU6 ILKAP;ILKAP3;ILKAP2 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1561.7042 0.70423527 3246 Q52LJ0 FAM98B Protein FAM98B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.176 65.176 2 6.4183E-32 64297 QUIQUE_C1368_190116_001 184.88 159.22 1189800000 84279000 109780000 116980000 85628000 79635000 91597000 106900000 94512000 81112000 21422000 125330000 88563000 104020000 31437 3246 29561 287899;287900;287901;287902;287903;287904;287905;287906;287907;287908;287909;287910;287911 367785;367786;367787;367788;367789;367790;367791;367792;367793;367794;367795;367796;367797 367787 13 MDLQLHIYQLK Unmodified 1400.7486 0.74860669 4494;981 F1T0E5;H7C538;H7C4K9;A0A0C4DGY2;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 2 1 97.247 97.247 2;3 0.00037113 99796 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.2 59.064 874930000 109190000 100810000 67937000 38620000 78735000 33012000 99089000 36960000 44585000 14280000 90327000 104300000 57087000 31438 981;4494 29562 287912;287913;287914;287915;287916;287917;287918;287919;287920;287921;287922;287923;287924;287925;287926;287927;287928;287929;287930;287931 367798;367799;367800;367801;367802;367803;367804;367805;367806;367807;367808;367809;367810;367811;367812;367813;367814;367815;367816;367817;367818;367819;367820;367821 367814 23 MDLVQEDQR Unmodified 1132.5183 0.5182724 3441 Q7L523;Q5VZM0 RRAGA;RRAGB Ras-related GTP-binding protein A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 37.874 37.874 2 0.01967 33641 QUIQUE_C1563_190116_001 86.67 69.305 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31439 3441 29563 287932;287933;287934;287935;287936 367822;367823;367824;367825;367826 367825 5 MDLVTYFGK Oxidation (M) 1088.5212 0.52123251 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 86.058 86.058 2 0.0034891 88678 QUIQUE_C1576_190116_001 92.439 66.703 2147800000 184960000 188740000 255420000 157530000 141890000 128120000 212600000 99185000 199850000 91719000 177440000 131170000 179170000 31440 1969 29564 287937;287938;287939;287940;287941;287942;287943;287944;287945;287946;287947;287948;287949;287950;287951;287952;287953;287954;287955;287956;287957;287958;287959 367827;367828;367829;367830;367831;367832;367833;367834;367835;367836;367837;367838;367839;367840;367841;367842;367843;367844;367845;367846;367847;367848;367849;367850;367851;367852;367853;367854;367855;367856;367857;367858 367845 1239 32 MDLVTYFGK Unmodified 1072.5263 0.52631789 1969 P09543 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 108.38 108.38 1;2 0.0012367 111938 QUIQUE_C1277_190116_001 105.57 94.74 14036000000 1167000000 1298200000 1384800000 944570000 1073300000 993320000 1563500000 782720000 956140000 348450000 1917000000 605720000 1001200000 31441 1969 29564 287960;287961;287962;287963;287964;287965;287966;287967;287968;287969;287970;287971;287972;287973;287974;287975 367859;367860;367861;367862;367863;367864;367865;367866;367867;367868;367869;367870;367871;367872;367873;367874;367875;367876;367877;367878;367879;367880;367881;367882;367883;367884;367885;367886;367887;367888;367889;367890;367891;367892 367862 31 MDLYVLR Unmodified 908.47897 0.47897377 277 A0A0E3D6M1;A0A0D9SGI1;Q86UL8;A0A0D9SGF8;A0A0D9SEY4;A0A1B0GTC0;E7EWI0;A0A1B0GVS6;A0A0D9SFP3 MAGI2 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 89.639 89.639 2 0.026322 90670 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.163 61.192 90322000 16147000 24902000 0 0 0 0 0 16233000 0 5751500 27289000 0 0 31442 277 29565 287976;287977;287978;287979;287980 367893;367894;367895;367896;367897 367895 5 MDMEEIIQR Unmodified 1163.5315 0.53147962 819 D6REB4;Q9H074 PAIP1 Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 88.884 88.884 2 0.0217 89429 QUIQUE_C1403_190116_001 79.906 47.972 35616000 35616000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31443 819 29566 287981;287982;287983;287984 367898;367899;367900;367901 367900 3 MDMSLDDIIK Unmodified 1179.5515 0.55154636 893 E9PB61;Q86V81 ALYREF THO complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 120.74 120.74 2 0.032246 124204 QUIQUE_C1403_190116_001 53.751 32.303 30067000 0 0 0 30067000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31444 893 29567 287985;287986;287987 367902;367903;367904 367903 3 MDNLSDTLK Acetyl (Protein N-term) 1077.5012 0.50122535 2605;827 P52306;D6RHH8;D6RB97;D6RC12;D6RHZ7 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 1 0 0 1 1 1 103.76 103.76 2 0.015966 105391 QUIQUE_C1563_190116_001 63.816 53.182 18393000 0 0 0 0 0 0 18393000 0 0 0 0 0 0 31445 2605;827 29568 287988;287989;287990 367905;367906;367907 367906 3 MDNLSDTLKK Acetyl (Protein N-term) 1205.5962 0.59618837 2605;827 P52306;D6RHH8;D6RB97;D6RC12;D6RHZ7 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 1 0 1 1 72.866 72.866 2 0.043963 73885 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.688 69.823 172560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 172560000 31446 2605;827 29569 287991 367908 367908 1 MDNYADLSDTELTTLLR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2027.9358 0.93575135 2561 P50402;Q5HY57;F8WEQ1 EMD Emerin yes no 1 1 0 1 163.4 163.4 2 0.00016946 166569 QUIQUE_C1403_190116_001 78.401 75.615 8047500 0 0 0 8047500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31447 2561 29570 287992 367909 367909 2010 1 MDNYADLSDTELTTLLR Acetyl (Protein N-term) 2011.9408 0.94083673 2561 P50402;Q5HY57;F8WEQ1 EMD Emerin yes no 1 0 0 1 1 1 1 169.6 169.6 2 0.00015065 175048 QUIQUE_C1576_190116_001 103.21 88.012 64976000 0 0 0 0 0 16502000 28934000 15692000 0 3847600 0 0 0 31448 2561 29570 287993;287994;287995;287996 367910;367911;367912;367913 367911 4 MDPASSGEGRPVSGHTDTTASAK Oxidation (M) 2274.0183 0.018252199 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 2 1 13.988 13.988 3;4 4.7057E-06 5975 QUIQUE_C1368_190116_001 65.901 62.663 138930000 10675000 0 39018000 17632000 26667000 0 0 0 21366000 0 0 0 23574000 31449 3452 29571 287997;287998;287999;288000;288001;288002;288003 367914;367915;367916;367917;367918;367919;367920 367915 2663 7 MDPASSGEGRPVSGHTDTTASAK Unmodified 2258.0233 0.023337577 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 18.186 18.186 3;4 1.0437E-10 11027 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.663 76.251 648870000 132020000 138830000 93116000 51801000 25790000 36489000 23396000 106020000 0 0 22040000 0 19370000 31450 3452 29571 288004;288005;288006;288007;288008;288009;288010;288011;288012;288013;288014;288015;288016;288017 367921;367922;367923;367924;367925;367926;367927;367928;367929;367930;367931;367932;367933;367934 367932 14 MDPFLVLLHSVSSSLSSSELTELK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2676.3568 0.35679953 2972 Q13158 FADD FAS-associated death domain protein yes yes 1 1 0 1 1 1 175.27 175.27 3 2.0894E-12 176639 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.767 86.736 60215000 0 8912200 0 0 0 0 0 30944000 0 0 0 20360000 0 31451 2972 29572 288018;288019;288020 367935;367936;367937 367936 2432 3 MDPLSELQDDLTLDDTSEALNQLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2761.2852 0.28515073 2912 Q07960;E9PNR6 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 1 1 0 2 1 1 1 1 1 1 173.27 173.27 2;3 6.2294E-09 175859 QUIQUE_C1403_190116_001 80.67 77.255 195260000 23789000 27072000 0 20299000 31685000 23630000 0 0 0 0 0 47367000 21416000 31452 2912 29573 288021;288022;288023;288024;288025;288026;288027;288028 367938;367939;367940;367941;367942;367943;367944;367945;367946 367941 2387 8 MDPLSELQDDLTLDDTSEALNQLK Acetyl (Protein N-term) 2745.2902 0.29023611 2912 Q07960;E9PNR6 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 1 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 1 2 176.25 176.25 2;3 1.3098E-14 180615 QUIQUE_C1368_190116_001 103.27 99.738 494550000 33587000 6887100 25415000 0 32271000 0 10172000 97317000 54803000 0 100450000 97002000 36647000 31453 2912 29573 288029;288030;288031;288032;288033;288034;288035;288036;288037;288038;288039;288040;288041;288042;288043;288044;288045 367947;367948;367949;367950;367951;367952;367953;367954;367955;367956;367957;367958;367959;367960;367961;367962;367963 367951 17 MDPMCSGKPELLSPGQAER Unmodified 2101.9595 0.95948045 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 1 1 68.463 68.463 3 0.063624 67483 QUIQUE_C1563_190116_001 29.766 15.751 27262000 0 0 0 0 0 27262000 0 0 0 0 0 0 0 31454 3452 29574 288046 367964 367964 1 MDPNTIIEALR Acetyl (Protein N-term) 1313.6649 0.66493664 1727 O95373;E9PLJ0 IPO7 Importin-7 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.91 166.91 2 5.2208E-05 171269 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.01 116.75 459230000 40184000 34059000 32528000 44795000 42223000 34976000 40987000 30821000 31663000 14481000 42638000 32852000 37020000 31455 1727 29575 288047;288048;288049;288050;288051;288052;288053;288054;288055;288056;288057;288058;288059 367965;367966;367967;367968;367969;367970;367971;367972;367973;367974;367975;367976;367977 367973 13 MDPNTIIEALR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1329.6599 0.65985126 1727 O95373;E9PLJ0 IPO7 Importin-7 yes no 1 1 0 1 1 139.19 139.19 2 0.0013543 143832 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.067 52.926 28166000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28166000 0 31456 1727 29575 288060;288061 367978;367979 367979 944 2 MDPSGVK Acetyl (Protein N-term) 774.35819 0.35818993 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFF6;A0A1B0GTB7;A0A1B0GW19;A0A1B0GWE2;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 1 0 0 1 1 1 40.807 40.807 1 0.025302 37814 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.03 112.98 682910000 0 0 0 0 0 0 0 0 252190000 85631000 345090000 0 0 31457 267;275;3025 29576 288062;288063;288064 367980;367981;367982 367982 0 MDPVSQLASAGTFR Acetyl (Protein N-term) 1520.7293 0.72932781 1066 F8WE43;F8WF23 SYNPR yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.07 148.07 2 7.5777E-18 152192 QUIQUE_C1277_190116_001 152.67 143.24 926850000 68442000 71468000 68564000 71144000 61295000 61850000 84521000 66250000 65713000 20209000 120030000 71745000 95624000 31458 1066 29577 288065;288066;288067;288068;288069;288070;288071;288072;288073;288074;288075;288076;288077 367983;367984;367985;367986;367987;367988;367989;367990;367991;367992;367993;367994;367995;367996;367997;367998;367999 367985 17 MDPVSQLASAGTFR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1536.7242 0.72424243 1066 F8WE43;F8WF23 SYNPR yes no 1 1 0 1 1 1 1 130.31 130.31 2 7.6408E-05 137317 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.72 99.284 112530000 0 0 0 0 0 0 0 0 26853000 19871000 46595000 19210000 0 31459 1066 29577 288078;288079;288080;288081 368000;368001;368002;368003 368002 629 4 MDPVVLSYMDSLLR Acetyl (Protein N-term) 1679.8263 0.82626466 3901 Q96LD8;H3BTK5;H3BTJ8;H3BS71 SENP8 Sentrin-specific protease 8 yes no 1 0 0 1 1 1 1 179.5 179.5 2 0.016993 183217 QUIQUE_C1368_190116_001 73.848 55.038 124080000 34921000 0 37417000 11945000 0 0 0 0 0 0 0 39798000 0 31460 3901 29578 288082;288083;288084;288085 368004;368005;368006;368007 368005 3 MDPVVLSYMDSLLR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1695.8212 0.82117928 3901 Q96LD8;H3BTK5;H3BTJ8;H3BS71 SENP8 Sentrin-specific protease 8 yes no 1 1 0 1 1 1 1 172.86 172.86 2 8.6718E-05 177135 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.961 76.989 75803000 0 0 0 0 0 0 0 17138000 21223000 10267000 0 0 27176000 31461 3901 29578 288086;288087;288088;288089 368008;368009;368010;368011 368009 2772 4 MDQAIIFCR Unmodified 1152.542 0.54198473 3726 Q92499;F1T0B3;A0A087X2G1 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.547 77.547 2 6.8344E-05 78329 QUIQUE_C1277_190116_001 164.53 138.64 1006500000 101220000 130010000 102090000 86845000 79882000 84589000 110720000 64445000 54702000 18208000 92892000 0 80904000 31462 3726 29579 288090;288091;288092;288093;288094;288095;288096;288097;288098;288099;288100;288101 368012;368013;368014;368015;368016;368017;368018;368019;368020;368021;368022;368023;368024;368025;368026;368027;368028;368029;368030;368031;368032;368033;368034 368014 23 MDQDKDDQITLEEFK Unmodified 1853.8353 0.83530902 4498 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27.945 27.945 2 0.039738 22128 QUIQUE_C1218_190116_001 61.213 46.546 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31471 1917 29587 288142 368075 368075 1 MDSTEPAYSEK Oxidation (M) 1272.518 0.51799763 469 A0A2U3TZH3;Q05639;A0A2R8Y488 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.231 18.231 2 1.6989E-05 10834 QUIQUE_DMIX4_190116_001 142.55 131.06 839550000 52265000 82620000 56786000 54770000 50639000 51708000 62705000 61364000 55716000 45596000 129530000 70775000 65073000 31472 469 29588 288143;288144;288145;288146;288147;288148;288149;288150;288151;288152;288153;288154;288155 368076;368077;368078;368079;368080;368081;368082;368083;368084;368085;368086;368087;368088 368085 343 13 MDSTEPAYSEK Unmodified 1256.5231 0.52308301 469 A0A2U3TZH3;Q05639;A0A2R8Y488 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23 23 2 0.0031448 16546 QUIQUE_C1576_190116_001 111.06 96.388 1767000000 189220000 263770000 244860000 226850000 0 233070000 282760000 0 0 0 326440000 0 0 31473 469 29588 288156;288157;288158;288159;288160;288161;288162 368089;368090;368091;368092;368093;368094;368095 368094 5 MDSTEPPYSQK Oxidation (M) 1297.5496 0.54963211 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.103 20.103 2 1.4931E-05 13265 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.39 117.01 1408900000 90880000 0 147530000 103500000 110560000 113770000 102480000 80931000 107670000 100790000 191390000 132290000 127090000 31474 2794 29589 288163;288164;288165;288166;288167;288168;288169;288170;288171;288172;288173;288174 368096;368097;368098;368099;368100;368101;368102;368103;368104;368105;368106;368107 368103 2238 10 MDSTEPPYSQK Unmodified 1281.5547 0.55471749 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.292 26.292 2 0.000179 20818 QUIQUE_C1218_190116_001 125.97 115.14 2576600000 250290000 353560000 268680000 228080000 202880000 199280000 222750000 119810000 99795000 65376000 264480000 197520000 104140000 31475 2794 29589 288175;288176;288177;288178;288179;288180;288181;288182;288183;288184;288185;288186;288187;288188 368108;368109;368110;368111;368112;368113;368114;368115;368116;368117;368118;368119;368120;368121;368122;368123;368124;368125;368126;368127 368108 20 MDSTLTASEIR Acetyl (Protein N-term) 1264.5969 0.59691665 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.62 100.62 2 0.00023875 103513 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.79 93.631 242810000 61843000 0 0 0 0 0 0 52065000 0 0 62539000 0 66366000 31476 2533 29590 288189;288190;288191;288192;288193;288194;288195;288196;288197 368128;368129;368130;368131;368132;368133;368134;368135;368136 368136 8 MDSTLTASEIR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1280.5918 0.59183127 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 1 1 0 1 1 1 71.911 71.911 2 0.0041102 71839 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.353 42.375 58830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58830000 0 31477 2533 29590 288198;288199;288200 368137;368138;368139 368139 1977 3 MDSTNADALYVR Unmodified 1354.6187 0.61871473 3963 Q99615;K7EPP7;K7ESP1;K7EIH8 DNAJC7 DnaJ homolog subfamily C member 7 yes no 0 0 0 1 1 1 59.507 59.507 2 0.0029513 57525 QUIQUE_C1563_190116_001 73.499 43.756 52514000 0 30494000 0 0 0 22019000 0 0 0 0 0 0 0 31478 3963 29591 288201;288202;288203 368140;368141;368142 368141 3 MDTAEDPAWLQLLQK Acetyl (Protein N-term) 1799.8764 0.87638598 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 169.16 169.16 2 4.1228E-19 173770 QUIQUE_C1218_190116_001 147.62 135.46 69450000 28231000 0 17272000 0 23946000 0 0 0 0 0 0 0 0 31479 3452 29592 288204;288205;288206;288207 368143;368144;368145;368146 368143 3 MDTGVIEGGLNVTLTIR Unmodified 1787.9451 0.94513424 3131;1044 F8VZX2;F8W0G4;F8VXH9;F8VTZ0;H3BSP4;Q15366 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 17.779 17.779 5 0.025763 10428 QUIQUE_DMIX3_190116_001 21.233 9.954 235760000 0 0 23595000 28145000 0 0 38300000 0 31089000 0 45988000 25009000 43632000 31480 1044;3131 29593 288208;288209;288210;288211;288212;288213;288214 368147;368148;368149;368150;368151;368152;368153 368150 5 MDVCETHLHWHTVAK Unmodified 1862.8556 0.85560773 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067;H7C0V9 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 1 40.869 40.869 4 0.00058571 37229 QUIQUE_C1218_190116_001 49.595 40.431 51200000 51200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31481 147 29594 288215 368154 368154 1 MDVFLMIR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1081.53 0.53002306 3132 Q15370;A0A0B4J296 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 1 1 0 3 2 2 1 1 2 2 1 2 2 1 161.4 161.4 2 0.0035749 156583 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.906 73.124 187690000 26899000 17597000 0 0 19310000 6371300 8142300 16335000 26476000 2264800 29738000 24176000 10383000 31482 3132 29595 288216;288217;288218;288219;288220;288221;288222;288223;288224;288225;288226;288227;288228;288229;288230;288231;288232;288233;288234 368155;368156;368157;368158;368159;368160;368161;368162;368163;368164;368165;368166;368167;368168;368169;368170;368171;368172;368173 368171 2591;2592 19 MDVFLMIR Acetyl (Protein N-term) 1065.5351 0.53510844 3132 Q15370;A0A0B4J296 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 172.33 172.33 2 0.0024425 177589 QUIQUE_C1576_190116_001 107.32 77.51 296250000 24649000 13568000 0 0 31881000 0 13977000 0 81116000 0 77797000 0 53266000 31483 3132 29595 288235;288236;288237;288238;288239;288240;288241 368174;368175;368176;368177;368178;368179;368180;368181;368182 368178 9 MDVGELLSYQPNR Acetyl (Protein N-term) 1562.7399 0.73989249 35 A0A087WUB9;Q8WYA6 CTNNBL1 Beta-catenin-like protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 156.45 156.45 2 0.00021378 160318 QUIQUE_C1403_190116_001 107.24 91.705 24074000 0 0 0 12906000 0 0 0 0 0 0 0 0 11168000 31484 35 29596 288242;288243;288244;288245 368183;368184;368185;368186 368183 4 MDVGGLSDPYVK Unmodified 1279.6118 0.61183843 2182;3618;1406 P21579;J3KQA0;K7EJS7;O00445;Q8N9I0 SYT1;SYT5;SYT2 Synaptotagmin-1;Synaptotagmin-5;Synaptotagmin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.929 84.929 2 0.00052347 86506 QUIQUE_C1368_190116_001 104.22 83.892 5159100000 525010000 564840000 606870000 573150000 329320000 436030000 453190000 222070000 0 126060000 523050000 385160000 414370000 31485 2182;1406;3618 29597 288246;288247;288248;288249;288250;288251;288252;288253;288254;288255;288256;288257 368187;368188;368189;368190;368191;368192;368193;368194;368195;368196;368197;368198;368199;368200 368189 11 MDVGGLSDPYVK Oxidation (M) 1295.6068 0.60675306 2182;3618;1406 P21579;J3KQA0;K7EJS7;O00445;Q8N9I0 SYT1;SYT5;SYT2 Synaptotagmin-1;Synaptotagmin-5;Synaptotagmin-2 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.402 65.402 2 0.0055387 65447 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.525 51.749 446460000 0 0 0 61773000 54580000 55854000 0 0 68692000 40779000 94321000 70458000 0 31486 2182;1406;3618 29597 288258;288259;288260;288261;288262;288263;288264;288265 368201;368202;368203;368204;368205;368206;368207;368208 368206 786 8 MDVLAEANGTFALNLLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1876.9604 0.96044996 2371 P35237;A0A2R8YDD0;A0A2R8Y517;A0A2R8Y5S1;A0A2R8Y6N4 SERPINB6 Serpin B6 yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.54 169.54 2 1.8814E-13 171120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.85 114.94 184910000 11826000 15244000 26309000 9644300 21499000 0 16100000 35652000 48636000 0 0 0 0 31487 2371 29598 288266;288267;288268;288269;288270;288271;288272;288273;288274 368209;368210;368211;368212;368213;368214;368215;368216;368217;368218 368215 1773 10 MDVLAEANGTFALNLLK Acetyl (Protein N-term) 1860.9655 0.96553533 2371 P35237;A0A2R8YDD0;A0A2R8Y517;A0A2R8Y5S1;A0A2R8Y6N4 SERPINB6 Serpin B6 yes no 1 0 0 1 1 1 175.62 175.62 2 7.7798E-17 176820 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.22 145.97 28301000 0 0 0 0 0 0 0 28301000 0 0 0 0 0 31488 2371 29598 288275;288276;288277 368219;368220;368221 368219 3 MDVLVSECSAR Acetyl (Protein N-term) 1307.585 0.58497176 2638 P54136;E5RJM9;E5RH09;E5RI24 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 1 0 0 1 119.03 119.03 2 0.0046088 122460 QUIQUE_C1403_190116_001 65.5 48.724 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31489 2638 29599 288278 368222 368222 1 MDVNIAPLR Acetyl (Protein N-term) 1069.559 0.559015 1667 O75915;F8WF90;C9JQU6;F8WF33 ARL6IP5 PRA1 family protein 3 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.86 122.86 2 1.5345E-07 128097 QUIQUE_C1218_190116_001 160.75 127.91 324090000 34845000 40860000 0 42369000 34593000 33888000 39255000 32953000 30406000 0 34922000 0 0 31490 1667 29600 288279;288280;288281;288282;288283;288284;288285;288286;288287;288288;288289 368223;368224;368225;368226;368227;368228;368229;368230;368231;368232;368233;368234;368235;368236 368224 14 MDVNIAPLR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1085.5539 0.55392962 1667 O75915;F8WF90;C9JQU6;F8WF33 ARL6IP5 PRA1 family protein 3 yes no 1 1 0 1 90.105 90.105 2 0.044901 86566 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.77 59.792 13799000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13799000 0 0 0 31491 1667 29600 288290 368237 368237 0 MDVNVGDIDIEGPEGK Unmodified 1686.7771 0.77706586 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 109.7 109.7 2 0.00046121 115295 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.469 68.603 222510000 0 0 0 0 0 47934000 0 0 0 0 78925000 47287000 48367000 31492 2935 29601 288291;288292;288293;288294;288295 368238;368239;368240;368241;368242;368243 368241 6 MDWGTLHTFIGGVNK Unmodified 1674.8188 0.81881152 421 A0A2R8Y6N2;A0A2R8YCY0;A0A2R8Y5T6;A0A2R8Y4J9;O95452 GJB6 Gap junction beta-6 protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 119.58 119.58 3 0.00049566 125419 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288309;288310;288311;288312;288313;288314 368257;368258;368259;368260;368261;368262 368259 6 MDYEDDRLR Unmodified 1211.5241 0.52408606 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 1 1 33.655 33.655 2;3 0.0025644 28875 QUIQUE_DMIX7_190116_001 147.51 132.84 658090000 26927000 67164000 0 107340000 0 72378000 40585000 188320000 54171000 0 50816000 50392000 0 31496 307 29604 288315;288316;288317;288318;288319;288320;288321;288322;288323;288324;288325;288326 368263;368264;368265;368266;368267;368268;368269;368270;368271;368272;368273;368274;368275 368275 9 MEAEDYVMAVVDK Unmodified 1498.6684 0.66836704 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 1 2 124.36 124.36 2 0.0022458 130917 QUIQUE_C1438_190116_001 89.403 71.968 199590000 0 0 0 0 33919000 0 0 0 0 0 44055000 0 121610000 31497 2483 29605 288327;288328;288329;288330;288331 368276;368277;368278;368279;368280 368276 5 MEAENLEQLIDQK Oxidation (M) 1575.745 0.74503745 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 1 0 1 1 97.935 97.935 2 0.0025814 95559 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.962 60.843 51054000 0 0 38334000 0 0 0 0 0 0 12720000 0 0 0 31498 2008 29606 288332;288333 368281;368282 368282 1288 2 MEAENLEQLIDQK Unmodified 1559.7501 0.75012283 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 111.08 111.08 2 1.6053E-12 114590 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.46 129.67 641250000 0 0 0 119660000 184840000 95350000 136150000 0 105260000 0 0 0 0 31499 2008 29606 288334;288335;288336;288337;288338 368283;368284;368285;368286;368287 368287 3 MEAFVVYR Unmodified 1013.5004 0.50043749 3089 Q14914;F2Z3J9 PTGR1 Prostaglandin reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.548 72.548 2 0.0036656 73034 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.57 100.09 1445500000 134950000 100470000 129750000 103890000 69661000 84838000 118620000 104630000 113350000 71097000 189940000 109870000 114460000 31500 3089 29607 288339;288340;288341;288342;288343;288344;288345;288346;288347;288348;288349;288350;288351 368288;368289;368290;368291;368292;368293;368294;368295;368296;368297;368298;368299;368300;368301;368302;368303;368304 368302 16 MEAIPCVVGDEEVWTSDVQYQVSPFNHGHK Unmodified 3457.5707 0.57072526 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 134.29 134.29 3;4 5.1939E-36 140458 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.17 103.31 2192200000 170760000 157110000 481420000 142740000 173920000 0 280350000 88011000 125000000 44795000 159240000 159730000 209080000 31501 2295 29608 288352;288353;288354;288355;288356;288357;288358;288359;288360;288361;288362;288363;288364;288365 368305;368306;368307;368308;368309;368310;368311;368312;368313;368314;368315;368316;368317;368318;368319;368320;368321 368317 15 MEAIPCVVGDEEVWTSDVQYQVSPFNHGHK Oxidation (M) 3473.5656 0.56563988 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 127.97 127.97 4 0.00011087 132915 QUIQUE_C1368_190116_001 41.734 39.988 91312000 0 0 91312000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31502 2295 29608 288366 368322 368322 1676 1 MEAIWLYQFR Acetyl (Protein N-term) 1397.6802 0.68019277 3830 Q96DA2 RAB39B Ras-related protein Rab-39B yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.48 172.48 2 0.0005476 179673 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.64 84.131 155510000 9348900 12047000 17486000 7513800 8563200 9773300 17158000 0 17488000 2190100 25035000 14619000 14292000 31503 3830 29609 288367;288368;288369;288370;288371;288372;288373;288374;288375;288376;288377;288378 368323;368324;368325;368326;368327;368328;368329;368330;368331;368332;368333;368334 368332 12 MEAIWLYQFR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1413.6751 0.67510739 3830 Q96DA2 RAB39B Ras-related protein Rab-39B yes yes 1 1 0 1 160.58 160.58 2 0.00034366 162755 QUIQUE_C1563_190116_001 103.56 92.342 5883100 0 0 0 0 0 5883100 0 0 0 0 0 0 0 31504 3830 29609 288379 368335 368335 2747 1 MEALILEPSLYTVK Acetyl (Protein N-term) 1647.8793 0.87934609 1034 F8VVA7;P61923;F8VXB1;F8W156;F8W651;F8VYZ4;F8VUC5 COPZ1 Coatomer subunit zeta-1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.06 170.06 2 0.0001453 171656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.45 103.91 1561600000 129270000 81028000 93529000 108830000 163530000 101830000 143310000 106830000 140860000 32112000 190710000 128080000 141670000 31505 1034 29610 288380;288381;288382;288383;288384;288385;288386;288387;288388;288389;288390;288391;288392 368336;368337;368338;368339;368340;368341;368342;368343;368344;368345;368346;368347;368348 368343 12 MEALIPVINK Acetyl (Protein N-term) 1168.6526 0.65258104 1108;1404 G8JLD5;F8VUJ9;F8VYL3;F8VR28;O00429;F8VZ52;B4DPZ9;B4DDQ3;F8W1W3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154 154 2 0.00034285 156460 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.66 90.425 1869300000 184170000 206020000 137000000 181800000 142120000 144890000 130380000 114090000 95109000 51936000 163300000 159720000 158800000 31506 1108;1404 29611 288393;288394;288395;288396;288397;288398;288399;288400;288401;288402;288403;288404;288405 368349;368350;368351;368352;368353;368354;368355;368356;368357;368358;368359;368360;368361;368362;368363;368364;368365;368366;368367;368368;368369;368370 368364 22 MEALIPVINK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1184.6475 0.64749566 1108;1404 G8JLD5;F8VUJ9;F8VYL3;F8VR28;O00429;F8VZ52;B4DPZ9;B4DDQ3;F8W1W3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 1 1 0 1 1 117.13 117.13 2 0.0038854 119358 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.224 53.554 44403000 0 0 0 0 0 0 0 26710000 0 17693000 0 0 0 31507 1108;1404 29611 288406;288407 368371;368372 368371 644 2 MEASVILPILK Acetyl (Protein N-term) 1254.7257 0.72574598 3502 Q86VW0;F8WFB2;C9J4X8;C9JHW6 SESTD1 SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.88 165.88 2 0.00063325 172961 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.308 77.661 119590000 10570000 11705000 9587600 12008000 9152800 9987000 17522000 8013900 11356000 0 9789700 0 9901000 31508 3502 29612 288408;288409;288410;288411;288412;288413;288414;288415;288416;288417;288418;288419 368373;368374;368375;368376;368377;368378;368379;368380;368381;368382;368383;368384;368385;368386 368383 14 MEATGVLPFVR Acetyl (Protein N-term) 1260.6536 0.65364367 2961 Q13045;J3KS54;J3KS39 FLII Protein flightless-1 homolog yes no 1 0 0 1 1 150.73 150.73 2 0.00028799 153598 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.802 83.599 18440000 0 9569100 0 0 0 0 0 8871000 0 0 0 0 0 31509 2961 29613 288420;288421 368387;368388 368388 2 MEAVLNELVSVEDLLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1858.9598 0.95978125 4590 Q9Y3D6 FIS1 Mitochondrial fission 1 protein yes yes 1 1 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 177.68 177.68 2 6.0696E-80 178842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 207.47 185.44 1474700000 72057000 65938000 51103000 0 195200000 212140000 130850000 125740000 127060000 21303000 201190000 182170000 89910000 31510 4590 29614 288422;288423;288424;288425;288426;288427;288428;288429;288430;288431;288432;288433;288434;288435 368389;368390;368391;368392;368393;368394;368395;368396;368397;368398;368399;368400;368401;368402;368403 368398 3025 12 MEAVLNELVSVEDLLK Acetyl (Protein N-term) 1842.9649 0.96486663 4590 Q9Y3D6 FIS1 Mitochondrial fission 1 protein yes yes 1 0 0 2 1 1 1 1 187.19 187.19 2 2.0628E-95 189651 QUIQUE_DMIX3_190116_001 220.53 196.02 326720000 0 0 0 0 4597400 0 0 12916000 51891000 0 237420000 19898000 0 31511 4590 29614 288436;288437;288438;288439;288440;288441 368404;368405;368406;368407;368408;368409;368410 368408 7 MEAVLTEELDEEEQLLR Acetyl (Protein N-term) 2087.9933 0.99326623 256 A0A0C4DH76;Q8N6M0 OTUD6B OTU domain-containing protein 6B yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 174.95 174.95 2 5.0111E-89 179345 QUIQUE_C1368_190116_001 252.88 220.15 104910000 4926200 8850500 9332100 5348200 9894800 0 12719000 10229000 20652000 0 0 8604600 14353000 31512 256 29615 288442;288443;288444;288445;288446;288447;288448;288449;288450;288451 368411;368412;368413;368414;368415;368416;368417;368418;368419;368420;368421;368422 368414 12 MECCDVPAETLYDVLHDIEYR Unmodified 2627.1342 0.13420993 1002 F5H8G1;F5H1Z6;F5H8H3;Q9Y365;F5GWK5;F5H0V7;F5GY11;H0YGA9;H0YFF3;F5GY07 STARD10 PCTP-like protein yes no 0 0 0 1 1 160.99 160.99 3 0.00060722 164787 QUIQUE_C1277_190116_001 52.541 49.817 48185000 16345000 31839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31513 1002 29616 288452;288453 368423;368424 368424 2 MECPEIDCEEGWALLK Unmodified 1978.8475 0.84747039 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 149.69 149.69 2;3 1.6182E-05 136407 QUIQUE_C1218_190116_001 127.17 116.56 266260000 27583000 0 81779000 44175000 0 0 0 31801000 37151000 0 43775000 0 0 31514 1975 29617 288454;288455;288456;288457;288458;288459 368425;368426;368427;368428;368429;368430 368425 6 MEDDAPVIYGLEFQAR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1910.872 0.87202888 564 A8MUM1;Q53HC9;C9J0U9;D3YTH5;F8WDS8;F8WDX0;F8WB12 TSSC1 Protein TSSC1 yes no 1 1 0 1 150.88 150.88 2 0.012997 146277 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.401 35.937 4165800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4165800 0 0 0 31515 564 29618 288460 368431 368431 373 1 MEDEAVLDR Unmodified 1076.4808 0.48082426 4662 Q9Y6R1;A0A1W2PNW8 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes no 0 0 0 1 1 1 40.52 40.52 2 0.042884 37287 QUIQUE_C1576_190116_001 66.621 40.019 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31516 4662 29619 288461;288462;288463 368432;368433;368434 368433 3 MEDEDEQGWCK Unmodified 1425.5177 0.51768005 4510 Q9UNF0 PACSIN2 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.535 39.535 2 0.0004904 36099 QUIQUE_C1218_190116_001 108.57 106.82 117870000 22450000 26676000 0 22580000 0 22958000 0 23211000 0 0 0 0 0 31517 4510 29620 288464;288465;288466;288467;288468;288469;288470;288471;288472 368435;368436;368437;368438;368439;368440;368441;368442;368443 368435 9 MEDGEFWMSFR Unmodified 1433.5744 0.57440707 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.35 133.35 2 1.1571E-05 138305 QUIQUE_C1368_190116_001 143.89 135.36 479240000 38511000 35186000 44348000 33999000 38928000 25362000 58649000 28833000 40176000 8528400 58045000 36397000 32280000 31518 1921 29621 288473;288474;288475;288476;288477;288478;288479;288480;288481;288482;288483;288484;288485 368444;368445;368446;368447;368448;368449;368450;368451;368452;368453;368454;368455;368456;368457;368458 368447 15 MEDGEFWMSFR Oxidation (M) 1449.5693 0.56932169 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 1 0 1 117.32 117.32 2 0.03518 119823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.436 50.053 14454000 0 0 0 0 0 0 0 14454000 0 0 0 0 0 31519 1921 29621 288486 368459 368459 1 MEDHQHVPIDIQTSK Acetyl (Protein N-term) 1818.857 0.85704752 3887 Q96JB5;J3QQY1;J3KRK4;J3KS63;J3KRI2 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 1 0 0 1 62.347 62.347 2 0.000228 61376 QUIQUE_C1403_190116_001 95.401 81.495 17484000 0 0 0 17484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31520 3887 29622 288487 368460 368460 1 MEDLDALLSDLETTTSHMPR Acetyl (Protein N-term) 2316.0614 0.061362567 1519 O43294;I3L209 TGFB1I1 Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein yes no 1 0 0 1 175.6 175.6 2 7.4483E-13 182706 QUIQUE_DMIX5_190116_001 148.72 141.52 25734000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25734000 0 0 31521 1519 29623 288488 368461 368461 1 MEDLLDLDEELR Acetyl (Protein N-term) 1531.7076 0.70758931 3856 Q96FT9;G3V4X2 IFT43 Intraflagellar transport protein 43 homolog yes no 1 0 0 1 1 172.11 172.11 2 0.01123 176496 QUIQUE_C1218_190116_001 52.79 33.028 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31522 3856 29624 288489;288490 368462;368463 368462 2 MEDMNEYSNIEEFAEGSK Acetyl (Protein N-term) 2163.8613 0.86126578 33 A0A087WU03 HNRNPDL yes yes 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 154 154 2;3 5.8849E-14 156485 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.21 153.84 467020000 58040000 58876000 41962000 44073000 31481000 34917000 24955000 60323000 0 0 36841000 38232000 37324000 31523 33 29625 288491;288492;288493;288494;288495;288496;288497;288498;288499;288500;288501;288502;288503;288504 368464;368465;368466;368467;368468;368469;368470;368471;368472;368473;368474;368475;368476;368477 368472 14 MEDSMDMDMSPLRPQNYLFGCELK Acetyl (Protein N-term) 2948.2523 0.25229293 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 162.36 162.36 3 3.5983E-14 167605 QUIQUE_C1218_190116_001 107.74 107.08 144940000 23195000 0 0 21626000 0 14086000 0 25239000 0 0 36260000 24532000 0 31524 1907 29626 288505;288506;288507;288508;288509;288510 368478;368479;368480;368481;368482;368483;368484 368478 6 MEDSVGCLETAEEVKR Unmodified 1851.8343 0.83426316 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 59.006 59.006 3 0.00054354 57306 QUIQUE_C1403_190116_001 63.918 41.115 240560000 43895000 40033000 49093000 61907000 0 0 45630000 0 0 0 0 0 0 31525 2378 29627 288511;288512;288513;288514;288515 368485;368486;368487;368488;368489;368490 368489 5 MEDTEPFSAELLSAMMR Oxidation (M) 1972.858 0.85803507 1963 P09471;H3BTM2;A0A1W2PP87 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 1 0 4 5 5 4 5 5 5 5 6 5 5 4 4 146.75 146.75 2;3 1.2539E-44 150853 QUIQUE_DMIX4_190116_001 174.73 158.2 9371600000 590090000 1075600000 977910000 604040000 748630000 823110000 836410000 543460000 804070000 252630000 929030000 555460000 631270000 31526 1963 29628 288516;288517;288518;288519;288520;288521;288522;288523;288524;288525;288526;288527;288528;288529;288530;288531;288532;288533;288534;288535;288536;288537;288538;288539;288540;288541;288542;288543;288544;288545;288546;288547;288548;288549;288550;288551;288552;288553;288554;288555;288556;288557;288558;288559;288560;288561;288562;288563;288564;288565;288566;288567;288568;288569;288570;288571;288572;288573;288574;288575;288576;288577 368491;368492;368493;368494;368495;368496;368497;368498;368499;368500;368501;368502;368503;368504;368505;368506;368507;368508;368509;368510;368511;368512;368513;368514;368515;368516;368517;368518;368519;368520;368521;368522;368523;368524;368525;368526;368527;368528;368529;368530;368531;368532;368533;368534;368535;368536;368537;368538;368539;368540;368541;368542;368543;368544;368545;368546;368547;368548;368549;368550;368551;368552;368553;368554;368555;368556;368557;368558;368559;368560;368561;368562;368563;368564 368548 1228;1229;1230 71 MEDTEPFSAELLSAMMR 2 Oxidation (M) 1988.8529 0.8529497 1963 P09471;H3BTM2;A0A1W2PP87 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 2 0 1 2 3 2 1 3 2 1 2 2 2 132.03 132.03 2 2.0976E-12 144405 QUIQUE_C1563_190116_001 124.86 119.78 920490000 42795000 90207000 177550000 78827000 49372000 130340000 87838000 0 41120000 45906000 96740000 0 79790000 31527 1963 29628 288578;288579;288580;288581;288582;288583;288584;288585;288586;288587;288588;288589;288590;288591;288592;288593;288594;288595;288596;288597;288598 368565;368566;368567;368568;368569;368570;368571;368572;368573;368574;368575;368576;368577;368578;368579;368580;368581;368582;368583;368584;368585 368576 1228;1229;1230 19 MEDTEPFSAELLSAMMR Unmodified 1956.8631 0.86312045 1963 P09471;H3BTM2;A0A1W2PP87 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 159.08 159.08 2;3 1.2229E-121 161557 QUIQUE_DMIX1_190116_001 278.46 267.55 21038000000 1883700000 1820000000 2047200000 1743800000 1442700000 1097400000 1867900000 1160100000 1417500000 247200000 2858300000 1621900000 1830600000 31528 1963 29628 288599;288600;288601;288602;288603;288604;288605;288606;288607;288608;288609;288610;288611;288612;288613;288614;288615;288616;288617;288618;288619;288620;288621;288622;288623;288624 368586;368587;368588;368589;368590;368591;368592;368593;368594;368595;368596;368597;368598;368599;368600;368601;368602;368603;368604;368605;368606;368607;368608;368609;368610;368611;368612;368613;368614;368615;368616;368617;368618;368619;368620;368621;368622;368623;368624;368625;368626;368627;368628;368629;368630;368631;368632 368615 46 MEDYQAAEETAFVVDEVSNIVK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2544.1578 0.15776537 2783 P63172 DYNLT1 Dynein light chain Tctex-type 1 yes yes 1 1 0 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 176.06 176.06 2;3 1.4352E-54 179987 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.34 154.71 220310000 4737500 21749000 17614000 0 19707000 0 9911200 34230000 56082000 0 10950000 39416000 5916900 31529 2783 29629 288625;288626;288627;288628;288629;288630;288631;288632;288633;288634;288635;288636;288637;288638;288639;288640 368633;368634;368635;368636;368637;368638;368639;368640;368641;368642;368643;368644;368645;368646;368647;368648;368649;368650;368651;368652;368653;368654 368648 2230 22 MEDYQAAEETAFVVDEVSNIVK Acetyl (Protein N-term) 2528.1629 0.16285075 2783 P63172 DYNLT1 Dynein light chain Tctex-type 1 yes yes 1 0 0 1 1 2 2 1 1 178.95 178.95 2;3 1.5221E-09 182661 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.14 121.51 117540000 0 14224000 0 0 0 0 0 27798000 45605000 0 17949000 11967000 0 31530 2783 29629 288641;288642;288643;288644;288645;288646;288647;288648 368655;368656;368657;368658;368659;368660;368661;368662;368663;368664 368662 10 MEEADALIESLCR Unmodified 1535.696 0.69597877 3954 Q99460;A0A087WW66;H7C378 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.67 123.67 2 0.00018772 129580 QUIQUE_C1438_190116_001 137.89 117.02 388690000 57493000 48197000 51629000 46437000 45002000 0 0 0 0 0 0 71243000 68686000 31531 3954 29630 288649;288650;288651;288652;288653;288654;288655;288656 368665;368666;368667;368668;368669;368670;368671;368672 368669 7 MEEANIQPNR Unmodified 1200.5557 0.55572054 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.81 24.81 2 1.8775E-05 17819 QUIQUE_DMIX7_190116_001 147.19 106.83 669710000 83375000 61438000 0 72573000 0 84789000 110680000 55560000 0 15949000 114960000 70391000 0 31532 2452 29631 288657;288658;288659;288660;288661;288662;288663;288664;288665 368673;368674;368675;368676;368677;368678;368679;368680;368681;368682;368683;368684 368684 11 MEEDPDDVPHGHITSLAVK Unmodified 2088.9786 0.97861922 2438 P41227;F8W808;A8MWP7 NAA10 N-alpha-acetyltransferase 10 yes no 0 0 0 1 1 1 56.872 56.872 4 0.024507 55983 QUIQUE_DMIX3_190116_001 29.444 26.109 104610000 0 0 0 0 35095000 0 0 0 35472000 0 34042000 0 0 31533 2438 29632 288666;288667;288668 368685;368686;368687 368686 3 MEEEIAALVIDNGSGMCK Acetyl (Protein N-term) 2007.8951 0.89514886 2788;1333 K7EM38;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;I3L3R2;J3KT65 ACTG1 Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 1 0 0 1 171.95 171.95 2 0.00024324 174496 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yes yes 1 0 1 1 47.432 47.432 2 0.047166 44240 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.127 35.105 56326000 0 0 0 0 0 0 0 56326000 0 0 0 0 0 31539 3434 29637 288709 368737 368737 1 MEEIANFPVRPSDVWIVTYPK Unmodified 2490.2617 0.26171736 3998 Q9BR01;F8WE22 SULT4A1 Sulfotransferase 4A1 yes no 0 0 1 1 1 1 139.3 139.3 3 8.5474E-05 143803 QUIQUE_C1277_190116_001 66.874 59.162 288410000 0 153840000 64030000 0 0 0 0 0 0 0 70538000 0 0 31540 3998 29638 288710;288711;288712 368738;368739;368740;368741;368742 368739 4 MEEICGGDKPFLAPNDLQTK Unmodified 2262.0661 0.066054015 3720 Q8WXF7 ATL1 Atlastin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.677 85.677 3 1.8145E-06 88453 QUIQUE_C1218_190116_001 90.968 69.57 316480000 68204000 56966000 0 45004000 0 32056000 42080000 0 0 0 0 33745000 38424000 31541 3720 29639 288713;288714;288715;288716;288717;288718;288719 368743;368744;368745;368746;368747;368748;368749;368750 368743 8 MEEIGILVEK Acetyl (Protein N-term) 1201.6264 0.62642587 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.07 152.07 2 0.00010517 156354 QUIQUE_C1277_190116_001 118.71 95.975 392130000 40703000 29278000 37918000 40573000 33552000 40027000 32952000 0 32208000 16603000 47220000 41098000 0 31542 2466 29640 288720;288721;288722;288723;288724;288725;288726;288727;288728;288729;288730;288731 368751;368752;368753;368754;368755;368756;368757;368758;368759;368760;368761;368762;368763 368753 13 MEEIVEGCTGALHILAR Unmodified 1897.939 0.93900301 425;2084 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0;P14923 CTNNB1;JUP Catenin beta-1;Junction plakoglobin no no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 97.389 97.389 2;3 1.1934E-22 100508 QUIQUE_C1368_190116_001 145.29 112.35 888990000 0 315120000 69209000 0 0 0 0 0 0 0 255920000 0 248740000 31543 425;2084 29641 288732;288733;288734;288735;288736;288737;288738;288739 368764;368765;368766;368767;368768;368769;368770;368771;368772 368766 8 MEEKDYSEADGLSER Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1815.7469 0.74688795 3243 Q4VXN0;Q4VXN1;Q4VXN2 EPB41L1 yes no 1 1 1 1 57.514 57.514 2 1.0585E-08 55615 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.61 119.38 18267000 0 0 0 0 0 0 0 18267000 0 0 0 0 0 31544 3243 29642 288740 368773 368773 2639 1 MEEKDYSEADGLSER Acetyl (Protein N-term) 1799.752 0.75197332 3243 Q4VXN0;Q4VXN1;Q4VXN2 EPB41L1 yes no 1 0 1 1 74.725 74.725 2 0.00057219 74457 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.69 87.458 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31545 3243 29642 288741 368774 368774 1 MEELHNQEMQK Unmodified 1415.6173 0.61733452 2208 P23246;H0Y9K7 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes no 0 0 0 1 1 1 18.868 18.868 3 0.00039617 11644 QUIQUE_C1218_190116_001 85.963 71.402 191600000 86733000 0 104870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31546 2208 29643 288742;288743;288744 368775;368776;368777 368775 3 MEELHNQEVQK Unmodified 1383.6453 0.64526383 3122 Q15233;H7C367;C9JYS8 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 2 2 2 1 1 2 16.618 16.618 2;3 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P51674;D6R9T7 GPM6A Neuronal membrane glycoprotein M6-a yes no 1 1 0 1 32.01 32.01 2 0.012276 25852 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.302 38.453 9648600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9648600 0 0 0 31555 2590 29650 288786 368822 368822 2042 1 MEEQGLADASLLK Unmodified 1403.6966 0.6966307 4392 Q9UBB4;B1AHE3 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 83.791 83.791 2 0.0039788 84851 QUIQUE_C1277_190116_001 85.813 67.501 490510000 70992000 97703000 0 79437000 38609000 0 0 151710000 52059000 0 0 0 0 31556 4392 29651 288787;288788;288789;288790;288791;288792 368823;368824;368825;368826;368827;368828 368824 6 MEEQGLADASLLKK Unmodified 1531.7916 0.79159371 4392 Q9UBB4;B1AHE3 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 1 1 1 1 1 59.866 59.866 3 0.0071084 58782 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.823 37.054 184110000 0 0 0 0 0 0 0 47343000 47495000 0 40996000 48272000 0 31557 4392 29652 288793;288794;288795;288796 368829;368830;368831;368832 368830 2 MEESGYESVLCVKPDVHVYR Acetyl (Protein N-term) 2438.1246 0.12463153 4311 Q9NVZ3;F6SKB8;D6RAN6;D6RB24 NECAP2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 114.36 114.36 3 1.6221E-06 118030 QUIQUE_C1277_190116_001 83.849 80.84 246380000 0 43400000 0 47418000 42663000 44173000 30694000 0 0 0 0 0 38029000 31558 4311 29653 288797;288798;288799;288800;288801;288802 368833;368834;368835;368836;368837;368838 368833 5 MEETQNVQLNK Unmodified 1332.6344 0.63436479 4196 Q9H9H4 VPS37B Vacuolar protein sorting-associated protein 37B yes yes 0 0 0 1 1 28.65 28.65 2 0.023224 23012 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.568 42.346 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31559 4196 29654 288803;288804 368839;368840 368840 2 MEEVEAMLLPETLKR Unmodified 1787.9161 0.9161423 1800 P01011;G3V3A0;G3V595;A0A087WY93 SERPINA3 Alpha-1-antichymotrypsin;Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 108.57 108.57 3 3.7363E-05 113439 QUIQUE_C1576_190116_001 70.529 59.894 210450000 0 0 43477000 0 34859000 0 37384000 0 0 0 62792000 0 31940000 31560 1800 29655 288805;288806;288807;288808;288809;288810 368841;368842;368843;368844;368845;368846 368843 5 MEEVVIAGMSGK Acetyl (Protein N-term) 1291.6152 0.61520925 2524 P49327;A0A0U1RQF0;A0A0U1RRG3;A0A1B0GTR5 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.67 145.67 2 0.00026456 152284 QUIQUE_C1438_190116_001 103.34 92.818 597760000 45283000 55353000 54244000 56714000 37317000 43812000 43320000 52788000 37985000 15928000 50164000 53408000 51449000 31561 2524 29656 288811;288812;288813;288814;288815;288816;288817;288818;288819;288820;288821;288822;288823 368847;368848;368849;368850;368851;368852;368853;368854;368855;368856;368857;368858;368859;368860;368861 368853 14 MEEVYLPDNINEGQVQVR Unmodified 2132.0208 0.020818382 3614 Q8N8N7;G3V3Y1 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 2 1 1 106.95 106.95 2;3 5.726E-31 110195 QUIQUE_C1368_190116_001 154.36 141.22 1760900000 135130000 135970000 175100000 118330000 123090000 105110000 90371000 169570000 111280000 70992000 267740000 137830000 120390000 31562 3614 29657 288824;288825;288826;288827;288828;288829;288830;288831;288832;288833;288834;288835;288836;288837;288838;288839;288840;288841;288842 368862;368863;368864;368865;368866;368867;368868;368869;368870;368871;368872;368873;368874;368875;368876;368877;368878;368879;368880 368866 18 MEEVYLPDNINEGQVQVR Oxidation (M) 2148.0157 0.015733004 3614 Q8N8N7;G3V3Y1 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 1 0 1 1 98.92 98.92 2 2.5448E-07 102957 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.22 95.793 42174000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14302000 27873000 0 0 31563 3614 29657 288843;288844 368881;368882;368883 368883 2695 3 MEFAELIK Acetyl (Protein N-term) 1021.5154 0.51541885 3925 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368979;368980;368981;368982;368983;368984 368983 2643 6 MEFPFDVDALFPER Acetyl (Protein N-term) 1753.8022 0.8021584 3295 Q5SQI0 ATAT1 Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 178.34 178.34 2 0.00069363 181546 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.695 62.604 82391000 7458700 0 3085200 0 0 0 13531000 0 11620000 0 21821000 16264000 8610100 31575 3295 29665 288933;288934;288935;288936;288937;288938;288939;288940 368985;368986;368987;368988;368989;368990;368991;368992;368993;368994 368991 9 MEFQAVVMAVGGGSR Acetyl (Protein N-term) 1579.7487 0.74868304 4264 Q9NR50;A0A0D9SEN0 EIF2B3 Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 167.95 167.95 2 0.00098146 172706 QUIQUE_C1218_190116_001 81.494 70.175 49875000 10357000 11031000 0 0 0 8570200 12595000 0 0 7321300 0 0 0 31576 4264 29666 288941;288942;288943;288944;288945 368995;368996;368997;368998;368999 368995 3 MEGAKPTLQLVYQAVQALYHDPDPSGK Acetyl (Protein N-term) 2997.4906 0.49060767 4625 Q9Y5L0;C9J7E5 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369006;369007;369008;369009;369010;369011;369012;369013;369014;369015;369016;369017;369018 369013 13 MEGASFGAGR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1039.4393 0.4392938 1550 O43761;Q96L30 SYNGR3 Synaptogyrin-3 yes no 1 1 0 1 1 45.184 45.184 2 0.010257 42290 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.982 44.556 66990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37769000 29221000 0 31580 1550 29668 288963;288964 369019;369020 369020 845 2 MEGGAYGAGK Acetyl (Protein N-term) 981.42258 0.4225811 637 B5MCD7;O43759;A2A283;F8WCE4 SYNGR1 Synaptogyrin-1 yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.426 46.426 1;2 4.54E-10 43318 QUIQUE_C1403_190116_001 182.53 152.35 342120000 66803000 31964000 44266000 29833000 0 22918000 36081000 21097000 18604000 0 45960000 24596000 0 31581 637 29669 288965;288966;288967;288968;288969;288970;288971;288972;288973;288974;288975 369021;369022;369023;369024;369025;369026;369027;369028;369029;369030;369031 369025 2 MEGGTENDLR Unmodified 1120.4819 0.48188689 4063 Q9BXP5 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.273 20.273 2 0.0057685 12850 QUIQUE_C1563_190116_001 76.345 38.796 176240000 38903000 47538000 0 0 0 38782000 0 0 0 0 51015000 0 0 31582 4063 29670 288976;288977;288978;288979;288980;288981;288982 369032;369033;369034;369035;369036;369037;369038 369035 7 MEGMDDDPEDR Unmodified 1308.4598 0.45983082 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 37.77 37.77 2 0.0043994 33585 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.17 81.746 30593000 0 30593000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31583 345 29671 288983;288984;288985;288986;288987;288988 369039;369040;369041;369042;369043;369044 369044 6 MEGNAEESTLFCFAVR Oxidation (M) 1875.8131 0.81313379 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 121.19 121.19 2 1.4057E-09 123750 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.24 99.577 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31584 50 29672 288989;288990;288991;288992;288993 369045;369046;369047;369048;369049 369047 37 5 MEGNAEESTLFCFAVR Unmodified 1859.8182 0.81821917 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 132.73 132.73 2 0.027156 135064 QUIQUE_C1277_190116_001 54.683 50.947 30750000 0 13399000 0 0 0 0 0 17351000 0 0 0 0 0 31585 50 29672 288994;288995 369050;369051 369050 1 MEGPLSVFGDR Acetyl (Protein N-term) 1248.5809 0.58087266 2132 P17987;E7ERF2;F5GZ03;F5GZI8;F5GYL4 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.34 154.34 2 9.0035E-05 159344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.75 111.74 811970000 74355000 77016000 77522000 80605000 59267000 58338000 66836000 55565000 52380000 21357000 61413000 51080000 76241000 31586 2132 29673 288996;288997;288998;288999;289000;289001;289002;289003;289004;289005;289006;289007;289008 369052;369053;369054;369055;369056;369057;369058;369059;369060;369061;369062;369063;369064;369065;369066;369067;369068;369069;369070;369071;369072;369073;369074;369075;369076;369077;369078;369079 369071 28 MEGPLSVFGDR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1264.5758 0.57578728 2132 P17987;E7ERF2;F5GZ03;F5GZI8;F5GYL4 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.53 132.53 2 0.00017648 128895 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.67 79.58 184000000 0 8533700 17437000 19830000 0 20272000 15381000 27728000 25416000 26351000 0 23054000 0 31587 2132 29673 289009;289010;289011;289012;289013;289014;289015;289016;289017;289018 369080;369081;369082;369083;369084;369085;369086;369087;369088;369089;369090;369091;369092 369090 1469 11 MEHQLELGNLQAK Unmodified 1509.761 0.76096229 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 51.301 51.301 3 0.022973 49474 QUIQUE_DMIX8_190116_001 38.445 30.535 117810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52284000 0 65522000 31588 4414 29674 289019;289020 369093;369094 369094 2 MEIATKDPLNPIK Unmodified 1468.796 0.79595081 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 0 1 2 1 1 3 1 2 64.929 64.929 2;3 0.0010596 65370 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.763 65.084 804900000 0 0 0 0 78493000 0 0 112030000 89534000 0 99711000 126590000 298540000 31589 3120 29675 289021;289022;289023;289024;289025;289026;289027;289028;289029;289030 369095;369096;369097;369098;369099;369100;369101;369102;369103;369104;369105;369106;369107 369100 11 MEIATKDPLNPIK Oxidation (M) 1484.7909 0.79086543 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 1 1 1 47.801 47.801 2 0.050474 45346 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.385 49.949 50686000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50686000 31590 3120 29675 289031 369108;369109 369108 2 MEIATKDPLNPIKQDVK Unmodified 1939.0448 0.044848288 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 0 2 2 2 61.061 61.061 3;4 0.00068186 59756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.079 42.568 231630000 0 0 0 0 0 0 0 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258500000 257990000 31594 1245 29679 289041;289042;289043;289044;289045;289046;289047;289048;289049;289050;289051;289052;289053 369121;369122;369123;369124;369125;369126;369127;369128;369129;369130;369131;369132;369133;369134;369135;369136;369137;369138;369139;369140;369141;369142;369143;369144;369145;369146 369129 26 MEIGLPDEK Oxidation (M) 1046.4954 0.49541169 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 0 1 1 1 46.605 46.605 2 0.024733 42403 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.582 36.643 94095000 0 42435000 0 0 0 29683000 0 0 0 21976000 0 0 0 31595 1245 29679 289054;289055;289056 369147;369148;369149 369149 3 MEIPVPVQPSWLR Acetyl (Protein N-term) 1592.8385 0.83848433 1433 O14558;A0A1X7SC65;K7EP04 HSPB6 Heat shock protein beta-6 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.73 165.73 2 0.00019176 169523 QUIQUE_C1277_190116_001 117.52 91.477 616780000 0 53793000 72358000 0 32163000 81637000 43778000 63074000 98856000 10943000 47908000 51275000 60999000 31596 1433 29680 289057;289058;289059;289060;289061;289062;289063;289064;289065;289066;289067 369150;369151;369152;369153;369154;369155;369156;369157;369158;369159;369160;369161 369150 12 MEIVDHALHALTDEVIIPHSGWER Unmodified 2767.3752 0.37518398 759 C9JZR2;O60716 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.1 137.1 4 1.2605E-08 141409 QUIQUE_C1277_190116_001 76.417 69.768 793090000 0 104670000 0 74426000 99073000 72313000 94781000 94123000 117100000 0 0 0 136600000 31597 759 29681 289068;289069;289070;289071;289072;289073;289074;289075 369162;369163;369164;369165;369166;369167;369168;369169 369162 8 MEIVELEDHPFFVGVQYHPEFLSR Unmodified 2917.4109 0.41090079 476 A0A3B3IRI2;P17812;B4E1E0 CTPS1 CTP synthase 1;CTP synthase yes no 0 0 0 1 141.21 141.21 4 0.0049556 148499 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.04 25.536 52109000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52109000 0 0 31598 476 29682 289076 369170 369170 1 MEIYRPHK Unmodified 1072.5488 0.54878467 3754 Q92769;E5RFI6;E5RJ04;E5RGV4;E5RHE7;E5RH52;E5RG37;E5RFP9;H3BM24;Q5TEE2;Q13547;E5RK19 HDAC2;HDAC1 Histone deacetylase 2;Histone deacetylase 1 yes no 0 0 1 1 16.069 16.069 3 0.028503 7873 QUIQUE_C1277_190116_001 51.059 21.958 39197000 0 39197000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31599 3754 29683 289077 369171 369171 1 MELENIVANTVLLK Acetyl (Protein N-term) 1627.8855 0.8854941 2364 P34947;D6RHX8;F8W9W2;P43250 GRK5;GRK6 G protein-coupled receptor kinase 5;G protein-coupled receptor kinase 6 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 174.68 174.68 2 0.00012761 179711 QUIQUE_C1576_190116_001 110.66 10.108 116650000 0 14121000 16419000 0 0 0 15269000 0 13824000 0 26713000 12246000 18060000 31600 2364 29684 289078;289079;289080;289081;289082;289083;289084 369172;369173;369174;369175;369176;369177;369178 369174 7 MELERPGGNEITR Unmodified 1500.7355 0.73547582 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 1 1 2 2 1 39.373 39.373 2;3 0.0029154 35268 QUIQUE_C1368_190116_001 68.83 32.546 764940000 0 0 222100000 223670000 0 0 0 0 0 0 189940000 0 129220000 31601 1823 29685 289085;289086;289087;289088;289089;289090 369179;369180;369181;369182;369183;369184;369185 369179 6 MELERPGGNEITR Oxidation (M) 1516.7304 0.73039044 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 1 1 1 1 1 26.854 26.854 3 0.03955 20864 QUIQUE_C1576_190116_001 48.704 36.728 100720000 0 0 0 0 0 0 48502000 0 0 24845000 0 0 27373000 31602 1823 29685 289091;289092;289093 369186;369187;369188 369186 0 MELEVPDEAESAEAGAVPSEAAWAAESGAAAGLAQK Acetyl (Protein N-term) 3554.6359 0.63588752 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 1 0 0 1 1 166.78 166.78 3 3.7362E-05 168291 QUIQUE_C1563_190116_001 41.914 37.865 38738000 0 0 0 21218000 0 17520000 0 0 0 0 0 0 0 31603 1570 29686 289094;289095 369189;369190 369190 2 MELFLAGR Acetyl (Protein N-term) 977.50044 0.50043749 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3KRZ4 DCXR L-xylulose reductase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.98 158.98 2 0.001789 162848 QUIQUE_C1277_190116_001 114.72 86.149 1181400000 97492000 104220000 102680000 78477000 115540000 94989000 75222000 93601000 89647000 27155000 109790000 96370000 96217000 31604 3464 29687 289096;289097;289098;289099;289100;289101;289102;289103;289104;289105;289106;289107;289108 369191;369192;369193;369194;369195;369196;369197;369198;369199;369200;369201;369202;369203;369204 369192 14 MELFLAGR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 993.49535 0.49535211 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3KRZ4 DCXR L-xylulose reductase yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 116.29 116.29 2 0.0068077 120065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.116 57.851 53668000 0 8400600 0 0 0 10069000 0 0 13931000 9123500 0 0 12144000 31605 3464 29687 289109;289110;289111;289112;289113 369205;369206;369207;369208;369209 369207 2668 5 MELFSQLFIQAVR Unmodified 1580.8385 0.83848433 3326 Q5TDF0;Q9BSD7 NTPCR Cancer-related nucleoside-triphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 155.77 155.77 2 2.7306E-05 160049 QUIQUE_C1403_190116_001 111.65 86.266 92758000 0 0 0 0 13833000 15813000 0 0 36505000 0 26606000 0 0 31606 3326 29688 289114;289115;289116;289117;289118 369210;369211;369212;369213;369214 369210 4 MELGELLYNK Acetyl (Protein N-term) 1250.6217 0.62167484 4019 Q9BTE1;H3BUD2;H3BS05;H3BR94 DCTN5 Dynactin subunit 5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.73 157.73 2 1.3159E-11 163374 QUIQUE_C1218_190116_001 159.11 137.65 720920000 62814000 74198000 59960000 72976000 54767000 0 51884000 55903000 60130000 26404000 61204000 68898000 71787000 31607 4019 29689 289119;289120;289121;289122;289123;289124;289125;289126;289127;289128;289129;289130 369215;369216;369217;369218;369219;369220;369221;369222;369223;369224;369225;369226;369227;369228 369216 14 MELGELLYNK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1266.6166 0.61658946 4019 Q9BTE1;H3BUD2;H3BS05;H3BR94 DCTN5 Dynactin subunit 5 yes no 1 1 0 1 135.76 135.76 2 0.0012484 131950 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 69.062 18283000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18283000 0 0 0 31608 4019 29689 289131 369229;369230 369229 2838 2 MELIQDTSRPPLEYVK Acetyl (Protein N-term) 1959.9976 0.99756374 1201 H3BRY5;P50225;H3BQX5;A0A0A6YYL2;P0DMN0;P0DMM9;H3BNY7 SULT1A1;SULT1A4;SULT1A3 Sulfotransferase;Sulfotransferase 1A1;Sulfotransferase 1A4;Sulfotransferase 1A3 yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 139.15 139.15 2 5.3892E-07 145063 QUIQUE_C1218_190116_001 94.551 73.888 293120000 0 0 69895000 0 0 41918000 50885000 63129000 0 0 0 0 67293000 31609 1201 29690 289132;289133;289134;289135;289136;289137 369231;369232;369233;369234;369235;369236 369231 4 MELITILEK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1146.6206 0.62061221 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 1 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 156.63 156.63 2 0.00065249 161015 QUIQUE_C1277_190116_001 99.802 83.599 1328300000 90526000 92930000 109960000 103100000 98568000 107270000 85990000 92391000 109920000 83257000 112410000 114540000 127420000 31610 3090 29691 289138;289139;289140;289141;289142;289143;289144;289145;289146;289147;289148;289149;289150;289151;289152;289153;289154;289155;289156;289157;289158;289159;289160;289161;289162;289163 369237;369238;369239;369240;369241;369242;369243;369244;369245;369246;369247;369248;369249;369250;369251;369252;369253;369254;369255;369256;369257;369258;369259;369260;369261;369262;369263;369264;369265 369240 2541 29 MELITILEK Acetyl (Protein N-term) 1130.6257 0.62569758 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 1 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 172.4 172.4 1;2 8.6166E-06 177045 QUIQUE_C1368_190116_001 186.25 102.98 10289000000 949640000 648580000 1241900000 39568000 1122900000 524670000 804950000 934000000 846040000 194130000 944350000 1011700000 1026800000 31611 3090 29691 289164;289165;289166;289167;289168;289169;289170;289171;289172;289173;289174;289175;289176;289177;289178 369266;369267;369268;369269;369270;369271;369272;369273;369274;369275;369276;369277;369278;369279;369280;369281 369269 13 MELLAHLLGEK Unmodified 1252.6849 0.6849438 4562 Q9Y2Q3 GSTK1 Glutathione S-transferase kappa 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 108.24 108.24 2;3 0.00044225 112700 QUIQUE_C1438_190116_001 104.05 79.125 923030000 94606000 82037000 0 80743000 102580000 71446000 82749000 73169000 49237000 7396200 47474000 110620000 120980000 31612 4562 29692 289179;289180;289181;289182;289183;289184;289185;289186;289187;289188;289189;289190;289191;289192;289193;289194;289195;289196;289197;289198;289199;289200 369282;369283;369284;369285;369286;369287;369288;369289;369290;369291;369292;369293;369294;369295;369296;369297;369298;369299;369300;369301;369302;369303;369304;369305 369290 22 MELLHPLGR Unmodified 1064.5801 0.5800848 3917 Q96PE7;F5GZ54 MCEE Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 61.42 61.42 3 0.0088013 61524 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.074 45.956 80921000 0 0 25151000 0 0 0 0 0 0 0 28585000 0 27185000 31613 3917 29693 289201;289202;289203 369306;369307;369308;369309 369308 4 MELLSTPHSIEINNITCDSFR Acetyl (Protein N-term) 2518.1832 0.18320904 3734 Q92561 PHYHIP Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 2 2 153.01 153.01 2;3 8.9576E-11 160231 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.06 117.43 475510000 27545000 42282000 46713000 29997000 36964000 0 0 0 0 0 153180000 138830000 0 31614 3734 29694 289204;289205;289206;289207;289208;289209;289210;289211;289212 369310;369311;369312;369313;369314;369315;369316;369317;369318 369316 6 MELQEIQLK Unmodified 1130.6005 0.60054547 63;3271;1260;1908 J3KN67;P06753;Q5HYB6;A0A087WWU8 TPM3;DKFZp686J1372 Tropomyosin alpha-3 chain no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 77.54 77.54 2 0.00042571 81186 QUIQUE_C1218_190116_001 119.41 0 8146900000 1068800000 1164100000 1046700000 887900000 836580000 926640000 163290000 44450000 578480000 378150000 714600000 139780000 197460000 31615 1260;1908;3271;63 29695 289213;289214;289215;289216;289217;289218;289219;289220;289221;289222;289223;289224;289225;289226;289227;289228;289229;289230;289231;289232;289233;289234;289235 369319;369320;369321;369322;369323;369324;369325;369326;369327;369328;369329;369330;369331;369332;369333;369334;369335;369336;369337;369338;369339;369340;369341;369342;369343 369321 23 MELQEMQLK Unmodified 1148.557 0.55696609 557;3325 CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951 TPM2b;TPM2 Tropomyosin beta chain no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 69.093 69.093 2 0.00051069 68703 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.26 0 1599700000 213770000 230330000 255150000 0 161000000 199530000 192030000 0 118500000 70495000 134930000 23991000 0 + 31616 557;3325 29696 289236;289237;289238;289239;289240;289241;289242;289243;289244;289245;289246;289247;289248;289249;289250;289251;289252 369344;369345;369346;369347;369348;369349;369350;369351;369352;369353;369354;369355;369356;369357;369358;369359;369360;369361;369362;369363;369364 369363 21 MELSAEYLR Acetyl (Protein N-term) 1152.5485 0.5485099 4157 Q9H3K6 BOLA2 BolA-like protein 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 131.59 131.59 2 0.035676 138146 QUIQUE_C1438_190116_001 56.378 33.638 101610000 0 22305000 0 0 21051000 0 0 0 25870000 0 32384000 0 0 31617 4157 29697 289253;289254;289255;289256 369365;369366;369367;369368;369369 369366 5 MELSDANLQTLTEYLK Acetyl (Protein N-term) 1909.9343 0.93429479 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171.16 171.16 2 4.9858E-147 174549 QUIQUE_C1277_190116_001 246.26 223.93 573310000 83579000 131520000 70392000 45951000 65941000 16634000 100100000 0 43353000 15847000 0 0 0 31618 2657 29698 289257;289258;289259;289260;289261;289262;289263;289264;289265 369370;369371;369372;369373;369374;369375;369376;369377;369378 369371 8 MELSDANLQTLTEYLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1925.9292 0.92920941 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 1 1 0 1 1 1 1 1 165.26 165.26 2 6.1596E-08 166965 QUIQUE_C1563_190116_001 119.69 102.75 86977000 0 0 0 25344000 0 23267000 0 0 0 17326000 0 21041000 0 31619 2657 29698 289266;289267;289268;289269;289270 369379;369380;369381;369382;369383 369380 2093 5 MELSDANLQTLTEYLKK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2054.0242 0.024172425 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 1 1 1 1 1 145.74 145.74 2 6.4055E-06 150629 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.552 76.192 32254000 0 0 0 0 0 0 0 32254000 0 0 0 0 0 31620 2657 29699 289271;289272 369384;369385 369385 2093 2 MELSQLLNEIR Acetyl (Protein N-term) 1386.7177 0.71770049 796 CON__Q8N1A0;Q8N1A0;J3QQR9 KRT222 Keratin-like protein KRT222 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 172.03 172.03 2 0.00036958 176461 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 81.665 33224000 5767600 5848100 0 3586100 0 0 9184300 4048000 0 0 0 0 4789900 + 31621 796 29700 289273;289274;289275;289276;289277;289278 369386;369387;369388;369389;369390;369391 369386 6 MELVQVLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1016.5576 0.55761802 4442 Q9UI09;F8VRD8;F8VXI1 NDUFA12 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 yes no 1 1 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 119 119 2 0.004217 124652 QUIQUE_C1218_190116_001 89.55 65.578 404430000 56663000 67312000 34862000 0 0 21373000 0 33605000 36651000 20208000 46599000 48360000 38794000 31622 4442 29701 289279;289280;289281;289282;289283;289284;289285;289286;289287;289288;289289;289290;289291 369392;369393;369394;369395;369396;369397;369398;369399;369400;369401;369402;369403;369404;369405;369406;369407;369408;369409;369410;369411;369412 369394 2955 21 MELVQVLK Acetyl (Protein N-term) 1000.5627 0.5627034 4442 Q9UI09;F8VRD8;F8VXI1 NDUFA12 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 yes no 1 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 150.18 150.18 1;2 0.0017989 154865 QUIQUE_C1277_190116_001 116.54 92.57 2323700000 244270000 244180000 194710000 188190000 160180000 137110000 181250000 161400000 156460000 43869000 262150000 172190000 177750000 31623 4442 29701 289292;289293;289294;289295;289296;289297;289298;289299;289300;289301;289302;289303;289304;289305;289306;289307;289308;289309;289310;289311;289312;289313;289314;289315;289316;289317;289318 369413;369414;369415;369416;369417;369418;369419;369420;369421;369422;369423;369424;369425;369426;369427;369428;369429;369430;369431;369432;369433;369434;369435;369436;369437;369438;369439;369440;369441;369442;369443;369444;369445 369418 20 MELVQVLKR Acetyl (Protein N-term) 1156.6638 0.66381443 4442 Q9UI09;F8VRD8;F8VXI1 NDUFA12 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 yes no 1 0 1 1 1 123 123 2 0.0027279 126288 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.11 113.88 61573000 0 0 0 0 0 0 0 28326000 0 0 33248000 0 0 31624 4442 29702 289319;289320 369446;369447;369448 369447 3 MELVQVLKR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1172.6587 0.65872905 4442 Q9UI09;F8VRD8;F8VXI1 NDUFA12 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 yes no 1 1 1 1 93.896 93.896 2 0.059091 98027 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.599 28.596 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31625 4442 29702 289321 369449 369449 2955 1 MEMEMEQVFEMK Oxidation (M) 1576.6282 0.62815848 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 106.48 106.48 2 1.6498E-05 108467 QUIQUE_DMIX4_190116_001 130.41 75.431 761060000 59418000 69557000 77567000 63896000 0 79362000 0 77301000 74416000 48109000 54498000 52615000 104320000 31626 3171 29703 289322;289323;289324;289325;289326;289327;289328;289329;289330;289331;289332;289333;289334;289335;289336;289337;289338;289339;289340;289341 369450;369451;369452;369453;369454;369455;369456;369457;369458;369459;369460;369461;369462;369463;369464;369465;369466;369467;369468;369469;369470 369466 2605;2606 20 MEMEMEQVFEMK Unmodified 1560.6332 0.63324386 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 0 1 126.02 126.02 2 0.010115 128635 QUIQUE_C1563_190116_001 88.681 43.544 17535000 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Purine nucleoside phosphorylase yes no 1 1 1 1 143.49 143.49 3 1.6009E-15 146398 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.06 112.26 106180000 0 0 0 0 0 0 0 106180000 0 0 0 0 0 31630 1786 29705 289355 369484;369485 369485 997 2 MENGYTYEDYKNTAEWLLSHTK Acetyl (Protein N-term) 2734.2221 0.22209696 1786 P00491;G3V2H3 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 1 0 1 1 1 1 150.47 150.47 3 3.9017E-05 155030 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.383 63.697 261060000 0 0 0 0 0 0 0 119050000 71282000 0 0 70727000 0 31631 1786 29705 289356;289357;289358 369486;369487;369488 369488 3 MENQVLTPHVYWAQR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1928.9203 0.92031648 4363 Q9P035;H3BS72 HACD3 Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 yes no 1 1 0 1 103.32 103.32 2 0.00014269 105037 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.245 66.087 29558000 0 0 0 0 0 0 0 29558000 0 0 0 0 0 31632 4363 29706 289359 369489 369489 2921 1 MENQVLTPHVYWAQR Acetyl (Protein N-term) 1912.9254 0.92540185 4363 Q9P035;H3BS72 HACD3 Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 yes no 1 0 0 1 120.08 120.08 2 0.00045072 122677 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.268 51.162 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31633 4363 29706 289360 369490 369490 1 MEPGPDGPAASGPAAIR Acetyl (Protein N-term) 1634.7723 0.77225526 2150 P19623;K7EKM4 SRM Spermidine synthase yes no 1 0 0 1 91.077 91.077 2 0.0071252 93124 QUIQUE_C1277_190116_001 48.704 33.165 22128000 0 22128000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31634 2150 29707 289361 369491 369491 1 MEPGPDGPAASGPAAIR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1650.7672 0.76716988 2150 P19623;K7EKM4 SRM Spermidine synthase yes no 1 1 0 1 71.275 71.275 2 0.0022282 71582 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.252 46.124 35631000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35631000 0 31635 2150 29707 289362 369492 369492 1501 1 MEPLNNLQVAVK Oxidation (M) 1370.7228 0.72278587 2777;2938 P63010;A0A087X253;Q10567 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 66.088 66.088 2 0.00029012 63325 QUIQUE_DMIX4_190116_001 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369510;369511;369512;369513;369514;369515;369516;369517;369518;369519;369520;369521;369522;369523;369524;369525;369526;369527;369528;369529;369530;369531 369514 22 MEPLWTGFWPAPSLSLGVPLHR Unmodified 2490.2882 0.28820688 1193 H3BR29;H3BSM7;Q96GQ5 C16orf58 RUS1 family protein C16orf58 yes no 0 0 0 1 1 163.04 163.04 3 0.0010773 167777 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.164 40.282 78993000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45733000 0 33260000 31638 1193 29709 289391;289392 369532;369533 369533 2 MEQLSSANTR Acetyl (Protein N-term) 1177.5397 0.53973612 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 1 0 0 1 1 1 66.957 66.957 2 0.020082 66885 QUIQUE_C1368_190116_001 50.978 34.775 117580000 0 0 71939000 0 0 0 0 0 45637000 0 0 0 0 31639 2324 29710 289393;289394;289395 369534;369535;369536 369534 3 MEQVNELK Acetyl (Protein N-term) 1031.4957 0.49574604 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 1 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 80.656 80.656 1;2 4.2959E-06 83078 QUIQUE_C1438_190116_001 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Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.814 70.814 2 0.0050955 70405 QUIQUE_C1368_190116_001 90.657 66.502 193040000 26595000 32080000 26100000 0 0 0 26633000 25020000 0 0 25549000 31063000 0 31651 882 29719 289475;289476;289477;289478;289479;289480;289481;289482 369626;369627;369628;369629;369630;369631;369632;369633 369628 8 MESVFNQAIR Oxidation (M) 1209.5812 0.58120701 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 1 0 1 57.15 57.15 2 0.0055207 55891 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.165 50.09 24200000 0 0 0 0 0 0 0 0 24200000 0 0 0 0 31652 882 29719 289483 369634 369634 523 1 MESYDIIANQPVVIDNGSGVIK Acetyl (Protein N-term) 2403.1992 0.19917668 2442 P42025 ACTR1B Beta-centractin yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 156.28 156.28 2;3 3.8656E-147 161593 QUIQUE_C1368_190116_001 227.42 218.6 644680000 86912000 41821000 37905000 31536000 0 28247000 26667000 150200000 31648000 27216000 70980000 56668000 54874000 31653 2442 29720 289484;289485;289486;289487;289488;289489;289490;289491;289492;289493;289494;289495;289496;289497 369635;369636;369637;369638;369639;369640;369641;369642;369643;369644;369645;369646;369647;369648;369649 369638 15 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIK Acetyl (Protein N-term) 2389.1835 0.18352661 2716 P61163;R4GMT0;A0A1B0GVS3 ACTR1A Alpha-centractin yes no 1 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 151.62 151.62 2;3 4.1744E-100 157887 QUIQUE_C1438_190116_001 200.55 183.81 2069800000 87076000 219230000 89107000 219000000 222690000 212270000 78024000 256720000 238270000 16966000 67374000 144230000 218810000 31654 2716 29721 289498;289499;289500;289501;289502;289503;289504;289505;289506;289507;289508;289509;289510;289511;289512;289513;289514;289515;289516;289517;289518;289519 369650;369651;369652;369653;369654;369655;369656;369657;369658;369659;369660;369661;369662;369663;369664;369665;369666;369667;369668;369669;369670;369671;369672;369673;369674;369675;369676;369677;369678;369679;369680;369681;369682 369660 33 MESYDVIANQPVVIDNGSGVIK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2405.1784 0.17844124 2716 P61163;R4GMT0;A0A1B0GVS3 ACTR1A Alpha-centractin yes no 1 1 0 1 1 1 137.83 137.83 2;3 1.8336E-66 145033 QUIQUE_DMIX5_190116_001 174.83 166.65 103880000 0 0 24199000 0 0 0 0 0 0 47864000 31820000 0 0 31655 2716 29721 289520;289521;289522 369683;369684;369685 369685 2150 3 MESYHKPDQQK Acetyl (Protein N-term) 1431.6453 0.64526383 2288 P29401;E9PFF2;F8W888;F8WAX4 TKT Transketolase yes no 1 0 1 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 19.159 19.159 2;3 5.7576E-47 12035 QUIQUE_C1218_190116_001 236.92 209.62 7909000000 936990000 417310000 1173000000 1090900000 243770000 837990000 241560000 1112400000 407980000 399320000 464840000 283930000 299120000 31656 2288 29722 289523;289524;289525;289526;289527;289528;289529;289530;289531;289532;289533;289534;289535;289536;289537;289538;289539;289540;289541 369686;369687;369688;369689;369690;369691;369692;369693;369694;369695;369696;369697;369698;369699;369700;369701;369702;369703;369704;369705 369688 17 MESYHKPDQQK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1447.6402 0.64017845 2288 P29401;E9PFF2;F8W888;F8WAX4 TKT Transketolase yes no 1 1 1 1 1 2 1 2 10.591 10.591 2;3 0.0001233 2930 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.88 112.57 530920000 0 0 0 16598000 0 0 0 38008000 99887000 304470000 0 71964000 0 31657 2288 29722 289542;289543;289544;289545;289546;289547;289548 369706;369707;369708;369709;369710;369711;369712 369709 1671 6 METETSAPGEQPK Oxidation (M) 1419.6188 0.61877431 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 14.978 14.978 2 0.00045369 6912 QUIQUE_C1368_190116_001 94.692 86.111 65381000 13091000 0 16953000 0 14781000 0 10901000 9655400 0 0 0 0 0 31658 4662 29723 289549;289550;289551;289552;289553 369713;369714;369715;369716;369717 369714 3066 5 METETSAPGEQPK Unmodified 1403.6239 0.62385968 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 19.777 19.777 2 6.3995E-05 13192 QUIQUE_C1218_190116_001 147.3 128.03 138390000 0 0 0 0 0 0 0 47509000 0 0 50061000 0 40817000 31659 4662 29723 289554;289555;289556;289557;289558 369718;369719;369720;369721;369722 369718 5 METILEQQR Acetyl (Protein N-term) 1188.5809 0.58087266 2949 Q12874 SF3A3 Splicing factor 3A subunit 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.13 116.13 2 5.3506E-13 121726 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.21 147.92 388950000 39724000 49170000 34426000 39709000 30990000 32126000 0 32504000 0 17710000 44544000 29766000 38282000 31660 2949 29724 289559;289560;289561;289562;289563;289564;289565;289566;289567;289568;289569 369723;369724;369725;369726;369727;369728;369729;369730;369731;369732;369733;369734;369735 369732 13 METQLQSIFEEVVK Acetyl (Protein N-term) 1721.8546 0.8545879 3281 Q5JWT2;Q9ULK4 MED23 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23 yes no 1 0 0 1 174.35 174.35 2 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369743;369744;369745;369746;369747;369748;369749;369750;369751;369752;369753;369754;369755;369756 369754 2049 13 MEVKPPPGRPQPDSGR Acetyl (Protein N-term) 1788.8941 0.89410173 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 1 0 2 2 3 2 2 1 3 1 2 2 2 1 37.922 37.922 2;3 3.8415E-06 33126 QUIQUE_C1277_190116_001 95.428 88.02 4068200000 465280000 600690000 526540000 403030000 190860000 461600000 352480000 242610000 221070000 0 355250000 248810000 0 31664 2601 29727 289584;289585;289586;289587;289588;289589;289590;289591;289592;289593;289594;289595;289596;289597;289598;289599;289600;289601;289602;289603;289604 369757;369758;369759;369760;369761;369762;369763;369764;369765;369766;369767;369768;369769;369770;369771;369772;369773;369774;369775;369776;369777;369778;369779;369780;369781;369782;369783;369784;369785;369786;369787;369788;369789;369790;369791;369792;369793;369794;369795 369762 38 MEVLAAETTSQQER Acetyl (Protein N-term) 1633.7618 0.76175015 1656 O75781 PALM Paralemmin-1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 123.24 123.24 2 7.1855E-87 128281 QUIQUE_C1218_190116_001 217.14 181.59 4591200000 348630000 330470000 0 530340000 470880000 431840000 420260000 264150000 438000000 83185000 343150000 369590000 560730000 31665 1656 29728 289605;289606;289607;289608;289609;289610;289611;289612;289613;289614;289615;289616;289617 369796;369797;369798;369799;369800;369801;369802;369803;369804;369805;369806;369807;369808;369809;369810;369811;369812;369813;369814;369815;369816;369817 369797 22 MEVLAAETTSQQER Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1649.7567 0.75666477 1656 O75781 PALM Paralemmin-1 yes yes 1 1 0 1 1 1 81.72 81.72 2 0.00010967 84254 QUIQUE_C1438_190116_001 106.01 72.783 99023000 0 0 0 0 65524000 0 33499000 0 0 0 0 0 0 31666 1656 29728 289618;289619;289620 369818;369819;369820 369818 893 1 MEVMNLMEQPIK Acetyl (Protein N-term) 1503.7135 0.71354309 2084 P14923;C9JTX4;C9J826;C9JK18;C9JKY1;C9JPI2;K7ERP3 JUP Junction plakoglobin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 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Q99426;K7EK42 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes no 1 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 175.28 175.28 2;3 1.9991E-14 176590 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.08 101.36 330430000 3402000 0 0 0 23911000 0 4894600 48126000 97733000 0 64286000 66670000 21405000 31669 3951 29730 289647;289648;289649;289650;289651;289652;289653;289654;289655;289656;289657;289658;289659;289660 369849;369850;369851;369852;369853;369854;369855;369856;369857;369858;369859;369860;369861;369862;369863;369864;369865;369866 369856 18 MEVVEAAAAQLETLK Acetyl (Protein N-term) 1643.844 0.84402322 3869 Q96HR8 NAF1 H/ACA ribonucleoprotein complex non-core subunit NAF1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 177.19 177.19 2 7.0893E-06 180050 QUIQUE_C1277_190116_001 95.417 81.259 41687000 7957800 5361400 0 3932500 0 0 0 8529400 9184600 0 0 6721600 0 31670 3869 29731 289661;289662;289663;289664;289665;289666;289667;289668 369867;369868;369869;369870;369871;369872;369873;369874 369868 8 MEYAEVR Unmodified 896.4062 0.40620276 3750 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369934;369935;369936;369937 369936 1561 4 MFDVGGQR Oxidation (M) 924.41235 0.41235077 1870;2779;1953 P63096;A0A3B3ITM0;P11488;P19087;A8MTJ3;P08754;P04899 GNAI1;GNAT1;GNAT2;GNAT3;GNAI3;GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1;Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1;Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-2;Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-3;Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 no no 0 1 0 1 25.871 25.871 2 0.034323 19859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.312 34.21 69317000 0 0 0 0 0 0 0 69317000 0 0 0 0 0 31678 2779;1953;1870 29738 289727 369938 369938 1 MFDVTEGALGTVSPTHNFEPPHYDGIEALTIQGDNLFSGSR Unmodified 4419.0754 0.075379733 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YHT2;H0YI78 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 0 1 1 1 1 155.18 155.18 4 4.1627E-17 159628 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.397 73.163 270420000 0 34354000 0 0 42497000 0 89184000 0 0 0 0 104390000 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289743;289744;289745;289746;289747;289748;289749;289750;289751;289752;289753;289754;289755 369959;369960;369961;369962;369963;369964;369965;369966;369967;369968;369969;369970;369971;369972 369963 13 MFEFYER Unmodified 1020.4375 0.43750288 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 83.537 83.537 2 0.025617 84317 QUIQUE_C1403_190116_001 95.62 86.227 926980000 0 0 0 131480000 0 111970000 148410000 118450000 0 0 238350000 178320000 0 31682 1620 29742 289756;289757;289758;289759;289760;289761 369973;369974;369975;369976;369977;369978 369973 6 MFEGEMASLTAILK Unmodified 1539.7677 0.76768715 4200 Q9HA64;I3L2G3;I3L139;I3L3W5 FN3KRP Ketosamine-3-kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 151.01 151.01 2 6.0141E-05 155247 QUIQUE_C1277_190116_001 117.09 76.097 1085900000 105430000 154150000 128950000 108240000 0 100430000 146550000 0 0 23998000 318170000 0 0 31683 4200 29743 289762;289763;289764;289765;289766;289767;289768;289769 369979;369980;369981;369982;369983;369984;369985;369986 369980 8 MFEHDFR Oxidation (M) 996.41235 0.41235077 912 E9PF17;P13611 VCAN Versican core protein yes no 0 1 0 1 24.046 24.046 2 0.049428 18021 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.784 70.415 37095000 0 0 0 0 0 0 0 0 37095000 0 0 0 0 31684 912 29744 289770 369987 369987 1 MFEIVFEDPK Unmodified 1253.6002 0.60021112 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 118.13 118.13 2 0.03223 115100 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.756 26.502 120520000 0 0 0 0 0 0 39418000 17403000 23119000 17604000 0 0 22977000 31685 1929 29745 289771;289772;289773;289774;289775 369988;369989;369990;369991;369992;369993 369992 6 MFEIVFEDPKIPGEK Unmodified 1777.8961 0.89605879 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 1 1 121.95 121.95 3 0.0010079 125244 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.331 58.696 140470000 0 0 0 0 0 0 0 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289784;289785;289786;289787;289788;289789;289790;289791;289792;289793;289794;289795;289796;289797 370003;370004;370005;370006;370007;370008;370009;370010;370011;370012;370013;370014;370015;370016 370007 10 MFESFIESVPLLK Oxidation (M) 1554.8004 0.80036749 2069 P13861;H7C1L0;H7C4A9 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 1 0 2 145.13 145.13 2 0.015311 141219 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.806 36.491 33644000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33644000 0 0 0 31689 2069 29748 289798;289799 370017;370018 370017 2 MFFEDEKPALLSQIDAEFEK Unmodified 2386.1403 0.14026482 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.44 147.44 3 7.6785E-06 154125 QUIQUE_C1438_190116_001 80.238 73.468 390540000 33290000 42943000 52738000 24175000 49139000 0 55703000 0 37161000 0 53428000 41968000 0 31690 3037 29749 289800;289801;289802;289803;289804;289805;289806;289807;289808 370019;370020;370021;370022;370023;370024;370025;370026;370027 370023 8 MFFLIDK Unmodified 912.47791 0.47791114 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 108.78 108.78 2 0.038851 114355 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.244 62.007 480570000 0 36189000 191050000 0 0 0 0 0 0 0 253330000 0 0 31691 2168 29750 289809;289810;289811 370028;370029;370030;370031 370031 4 MFFTCGPNEAMVVSGFCR Acetyl (Protein N-term) 2150.9046 0.90460811 1673 O75955;A2AB12;A2AB10;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A2AB11 FLOT1 Flotillin-1 yes no 1 0 0 2 1 2 1 170.33 170.33 2;3 1.1661E-05 174914 QUIQUE_C1218_190116_001 121.28 115.9 37347000 12161000 6899700 13821000 0 0 0 0 4465200 0 0 0 0 0 31692 1673 29751 289812;289813;289814;289815;289816;289817 370032;370033;370034;370035;370036;370037 370032 6 MFGGPGTASR Unmodified 979.45455 0.45454993 1952 P08670;B0YJC4;A0A1B0GTT5;A0A1B0GVG8 VIM Vimentin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 27.235 27.235 2 9.8893E-18 21457 QUIQUE_C1576_190116_001 180.87 152.34 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0.47144555 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 84.341 84.341 2 0.034121 87784 QUIQUE_C1438_190116_001 64.265 40.408 98375000 0 0 0 0 29453000 0 0 0 0 0 33065000 0 35857000 31700 2657 29756 289897;289898;289899 370144;370145;370146;370147 370145 4 MFHGIPATPGIGAPGNKPELYEEVK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2709.3472 0.3472379 4467 Q9UK41;E9PQR7;E9PM90;E9PR04;E9PLM9 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.75 105.75 3 2.4849E-17 110307 QUIQUE_C1218_190116_001 97.509 85.076 673670000 35029000 40334000 57942000 50413000 0 62438000 66243000 45234000 68864000 31211000 70231000 62686000 83045000 31701 4467 29757 289900;289901;289902;289903;289904;289905;289906;289907;289908;289909;289910;289911 370148;370149;370150;370151;370152;370153;370154;370155;370156;370157;370158;370159;370160;370161 370148 2976 14 MFHGIPATPGIGAPGNKPELYEEVK Acetyl (Protein N-term) 2693.3523 0.35232328 4467 Q9UK41;E9PQR7;E9PM90;E9PR04;E9PLM9 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.34 118.34 3 9.4088E-23 121837 QUIQUE_C1277_190116_001 113.08 107.63 773420000 104210000 86519000 111500000 96001000 0 85219000 101760000 65354000 0 0 0 0 122850000 31702 4467 29757 289912;289913;289914;289915;289916;289917;289918;289919 370162;370163;370164;370165;370166;370167;370168;370169;370170 370164 9 MFIFYGNK Unmodified 1018.4946 0.49462383 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.725 86.725 2 0.014521 84298 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.89 65.191 1717100000 154000000 155570000 173340000 139460000 135590000 112660000 171250000 0 108470000 45573000 193510000 172410000 155250000 31703 1701 29758 289920;289921;289922;289923;289924;289925;289926;289927;289928;289929;289930;289931 370171;370172;370173;370174;370175;370176;370177;370178;370179;370180;370181;370182;370183 370179 11 MFIFYGNK Oxidation (M) 1034.4895 0.48953845 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 68.014 68.014 2 0.032921 67761 QUIQUE_C1368_190116_001 69.383 9.0251 187670000 0 31444000 30298000 0 21271000 0 26092000 0 0 14824000 36869000 0 26869000 31704 1701 29758 289932;289933;289934;289935;289936;289937;289938 370184;370185;370186;370187;370188;370189;370190 370185 7 MFIGGLSWDTSK Oxidation (M) 1356.6384 0.63838754 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 1 0 2 2 2 102.85 102.85 2 0.0057258 107053 QUIQUE_C1218_190116_001 68.069 54.477 140270000 72826000 0 36735000 0 0 30707000 0 0 0 0 0 0 0 31705 39 29759 289939;289940;289941;289942;289943;289944 370191;370192;370193;370194;370195;370196 370191 18 5 MFIGGLSWDTSK Unmodified 1340.6435 0.64347291 39 A0A087WUK2;O14979 HNRNPDL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.14 119.14 2 0.00017601 122978 QUIQUE_C1277_190116_001 119.22 100.25 2046000000 253180000 283130000 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370387;370388;370389;370390;370391;370392;370393;370394;370395;370396;370397;370398;370399;370400;370401;370402;370403;370404;370405;370406;370407;370408;370409;370410;370411;370412;370413;370414;370415;370416;370417;370418;370419;370420;370421;370422;370423;370424;370425;370426;370427;370428;370429;370430;370431;370432;370433;370434;370435;370436;370437;370438;370439;370440;370441;370442;370443;370444;370445;370446;370447;370448;370449;370450;370451;370452;370453;370454;370455;370456;370457;370458;370459;370460;370461;370462;370463;370464;370465;370466;370467;370468;370469;370470;370471;370472;370473;370474;370475;370476;370477;370478 370443 87 MFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVK Unmodified 2885.4211 0.42107154 2801;1075;762 P69905;A0A2R8Y7C0;CON__P01966;G3V1N2 HBA1;HBA2 Hemoglobin subunit alpha no no 0 0 1 1 122.33 122.33 5 0.028363 126427 QUIQUE_DMIX7_190116_001 23.79 20.793 46857000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46857000 0 + 31721 2801;762;1075 29771 290115 370479 370479 1 MFLVNSFLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1155.5998 0.59981719 247;1323 A0A0C4DGQ5;P04632;K7ELJ7;K7EM73;K7ES78;K7EMQ1;K7EKD8 CAPNS1 Calpain small subunit 1 no no 1 1 0 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 2 2 162.61 162.61 2 1.3398E-05 167358 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.52 116.8 1936900000 87404000 124610000 69493000 78948000 87232000 120730000 59769000 290040000 364510000 58336000 116080000 182240000 297550000 31722 247;1323 29772 290116;290117;290118;290119;290120;290121;290122;290123;290124;290125;290126;290127;290128;290129;290130;290131;290132;290133;290134;290135;290136;290137 370480;370481;370482;370483;370484;370485;370486;370487;370488;370489;370490;370491;370492;370493;370494;370495;370496;370497;370498;370499;370500;370501;370502;370503 370497 144 24 MFLVNSFLK Acetyl (Protein N-term) 1139.6049 0.60490256 247;1323 A0A0C4DGQ5;P04632;K7ELJ7;K7EM73;K7ES78;K7EMQ1;K7EKD8 CAPNS1 Calpain small subunit 1 no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 3 2 1 2 2 174.72 174.72 1;2 1.1791E-06 176333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 193.41 117.56 3679700000 206110000 0 161000000 267420000 437000000 96868000 144130000 890750000 135280000 0 786280000 495520000 59357000 31723 247;1323 29772 290138;290139;290140;290141;290142;290143;290144;290145;290146;290147;290148;290149;290150;290151;290152;290153 370504;370505;370506;370507;370508;370509;370510;370511;370512;370513;370514;370515;370516;370517;370518;370519 370512 11 MFLYADNEDR Unmodified 1272.5445 0.54448715 70 A0A087WY55;Q9NP79;Q5TGM0 VTA1 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.081 70.081 2 0.0029057 71062 QUIQUE_C1218_190116_001 87.308 56.234 1235000000 131260000 117550000 93990000 106330000 72754000 90404000 84537000 113120000 83624000 36693000 94741000 107820000 102150000 31724 70 29773 290154;290155;290156;290157;290158;290159;290160;290161;290162;290163;290164;290165;290166 370520;370521;370522;370523;370524;370525;370526;370527;370528;370529;370530;370531;370532;370533;370534;370535 370520 16 MFMSELSGNIIDICPVGALTSKPYAFTAR Unmodified 3188.5708 0.5708486 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 155.79 155.79 3 4.8905E-08 161830 QUIQUE_C1576_190116_001 58.08 51.985 112500000 0 0 0 0 0 0 51315000 0 0 0 0 61180000 0 31725 2280 29774 290167;290168 370536;370537;370538 370537 3 MFMSELSGNIIDICPVGALTSKPYAFTARPWETR Unmodified 3857.8943 0.89430801 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 154.6 154.6 3;4 1.2784E-129 161592 QUIQUE_DMIX5_190116_001 180.35 175.42 866310000 0 0 0 0 0 0 0 223640000 131500000 0 64146000 380790000 66239000 31726 2280 29775 290169;290170;290171;290172;290173;290174 370539;370540;370541;370542;370543;370544;370545 370542 7 MFMSELSGNIIDICPVGALTSKPYAFTARPWETR 2 Oxidation (M) 3889.8841 0.88413725 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 2 2 1 143.39 143.39 4 1.5188E-06 148530 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.944 40.956 41393000 0 0 0 0 0 0 0 0 41393000 0 0 0 0 31727 2280 29775 290175 370546 370546 1651;1652 1 MFPAFGFGAR Unmodified 1099.5273 0.52732094 3793 Q96A23 CPNE4 Copine-4 yes yes 0 0 0 1 1 111.12 111.12 2 0.027829 114548 QUIQUE_C1403_190116_001 66.429 60.126 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31728 3793 29776 290176;290177 370547;370548 370548 2 MFQIQFHTGFVPR Unmodified 1606.8079 0.8078529 1469 O14976 GAK Cyclin-G-associated kinase yes yes 0 0 0 1 103.28 103.28 3 0.0022412 106293 QUIQUE_DMIX7_190116_001 56.205 50.042 20882000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20882000 0 31729 1469 29777 290178 370549 370549 1 MFQQCLELPSQSR Unmodified 1622.7545 0.7544967 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.72 84.72 2 4.0435E-41 87665 QUIQUE_C1218_190116_001 189.57 149.95 643780000 63262000 69798000 68965000 74349000 53074000 39525000 72030000 48955000 29629000 0 71781000 0 52416000 31730 4551 29778 290179;290180;290181;290182;290183;290184;290185;290186;290187;290188;290189;290190 370550;370551;370552;370553;370554;370555;370556;370557;370558;370559;370560;370561;370562;370563;370564;370565 370550 15 MFQSTAGSGGVQEDALMAVSTLVEVLGGEFLK 2 Oxidation (M) 3302.605 0.60504508 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 2 0 1 182.36 182.36 3 1.3657E-20 188687 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.088 77.428 12080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12080000 0 0 31731 3090 29779 290191 370566 370566 2542;2543 1 MFSEADACELWIDEK Oxidation (M) 1858.7754 0.7753513 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.53 116.53 2 1.0413E-08 113355 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.28 115.85 289710000 43134000 38708000 35272000 37702000 39088000 27631000 40058000 0 0 28117000 0 0 0 31732 2851 29780 290192;290193;290194;290195;290196;290197;290198;290199 370567;370568;370569;370570;370571;370572;370573;370574;370575 370575 2310 7 MFSEADACELWIDEK Unmodified 1842.7804 0.78043668 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 1 3 1 1 127.75 127.75 2 2.2018E-13 133626 QUIQUE_C1218_190116_001 138.94 115.56 1511400000 191900000 181920000 142690000 192030000 119820000 173240000 177140000 0 28528000 83665000 90012000 72976000 57527000 31733 2851 29780 290200;290201;290202;290203;290204;290205;290206;290207;290208;290209;290210;290211;290212;290213;290214;290215;290216 370576;370577;370578;370579;370580;370581;370582;370583;370584;370585;370586;370587;370588;370589;370590;370591;370592;370593;370594;370595;370596;370597;370598;370599;370600;370601;370602;370603;370604;370605;370606 370579 29 MFSFNMFDHPIPR Acetyl (Protein N-term) 1679.7589 0.7588538 3764 Q92890;C9IZG3 UFD1L Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.85 156.85 2 0.00015162 161500 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.06 99.524 244760000 26608000 23942000 0 16368000 15741000 0 18298000 28179000 22612000 0 35513000 20590000 36904000 31734 3764 29781 290217;290218;290219;290220;290221;290222;290223;290224;290225;290226;290227 370607;370608;370609;370610;370611;370612;370613;370614;370615;370616;370617 370617 11 MFSVESLER Acetyl (Protein N-term) 1138.5329 0.53285983 3500 Q86VS8 HOOK3 Protein Hook homolog 3 yes yes 1 0 0 1 141.09 141.09 2 0.024712 146123 QUIQUE_C1218_190116_001 56.729 37.947 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31735 3500 29782 290228 370618 370618 1 MFSWLGTDDR Acetyl (Protein N-term) 1268.5496 0.54957253 4352 Q9NZN3 EHD3 EH domain-containing protein 3 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.83 167.83 2 8.5436E-05 171312 QUIQUE_C1277_190116_001 120.12 78.671 343370000 49158000 42513000 34994000 35255000 27459000 26366000 22574000 19673000 14052000 6880200 17971000 23166000 23315000 31736 4352 29783 290229;290230;290231;290232;290233;290234;290235;290236;290237;290238;290239;290240;290241 370619;370620;370621;370622;370623;370624;370625;370626;370627;370628;370629;370630;370631;370632 370620 12 MFSWLGTDDRR Acetyl (Protein N-term) 1424.6507 0.65068356 4352 Q9NZN3 EHD3 EH domain-containing protein 3 yes yes 1 0 1 1 1 1 140.84 140.84 2 8.8856E-12 145696 QUIQUE_DMIX7_190116_001 165.15 63.61 114970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69335000 45637000 0 31737 4352 29784 290242;290243;290244 370633;370634;370635;370636;370637 370637 5 MFSWVSK Acetyl (Protein N-term) 925.43677 0.4367746 4175 Q9H4M9;C9JIJ3;C9IZH1 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 1 0 0 1 1 145.83 145.83 2 0.051483 150985 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.205 39.268 26014000 0 0 0 0 0 0 0 0 10529000 0 15485000 0 0 31738 4175 29785 290245;290246 370638;370639 370638 2 MFTAGIDLMDMASDILQPK Unmodified 2095.9992 0.99922 2959 Q13011;M0R248;M0QZW4 ECH1 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial no no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 2 2 1 1 1 171.97 171.97 2;3 5.6761E-36 175794 QUIQUE_DMIX7_190116_001 194.12 149.82 1174900000 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290285;290286;290287;290288;290289;290290;290291;290292;290293 370681;370682;370683;370684;370685;370686;370687;370688;370689 370686 2745 7 MFVDLNPDSDK Unmodified 1279.5755 0.57545293 2294;2556 P50148;P29992;K7EL62 GNAQ;GNA11 Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 82.603 82.603 2 0.0077556 82327 QUIQUE_C1563_190116_001 72.643 63.73 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31744 2556;2294 29789 290294;290295;290296;290297;290298;290299;290300;290301 370690;370691;370692;370693;370694;370695;370696;370697 370695 8 MFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIR Unmodified 3201.4747 0.47469961 2294;2556 P50148;P29992;K7EL62 GNAQ;GNA11 Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11 no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 2 2 2 1 126.93 126.93 3;4 2.7713E-44 131597 QUIQUE_C1368_190116_001 136.4 112.73 2233200000 52102000 155020000 215150000 103480000 236840000 0 164080000 178570000 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initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.51 141.51 2 1.1917E-07 147222 QUIQUE_C1218_190116_001 133.89 120.54 5522300000 388400000 506400000 461030000 509960000 399490000 488060000 448460000 357490000 311770000 125870000 649560000 457210000 418600000 31751 2697;3055 29795 290360;290361;290362;290363;290364;290365;290366;290367;290368;290369;290370;290371;290372 370763;370764;370765;370766;370767;370768;370769;370770;370771;370772;370773;370774;370775;370776;370777;370778;370779;370780;370781;370782 370764 20 MFVLTVAAENQVPLAK Unmodified 1729.9437 0.94367768 2141 P19022 CDH2 Cadherin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.7 121.7 2 6.8846E-05 127352 QUIQUE_C1438_190116_001 98.353 86.14 768810000 67420000 90095000 85057000 0 0 0 68198000 77718000 96396000 23940000 98866000 77469000 83649000 31752 2141 29796 290373;290374;290375;290376;290377;290378;290379;290380;290381;290382;290383;290384 370783;370784;370785;370786;370787;370788;370789;370790;370791;370792;370793;370794 370787 12 MFVNNEHDLQVCK Unmodified 1632.7388 0.73884664 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 50.616 50.616 2 0.0033944 48717 QUIQUE_C1218_190116_001 71.555 54.613 47049000 24271000 22777000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31753 3212 29797 290385;290386 370795;370796 370795 2 MFVTPGAGR Unmodified 934.46947 0.46947171 1430 O14531 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.972 38.972 2 0.00045675 34959 QUIQUE_C1368_190116_001 117.16 81.116 1516000000 174310000 194500000 179130000 143620000 124900000 115990000 178480000 161270000 0 41646000 202170000 0 0 31754 1430 29798 290387;290388;290389;290390;290391;290392;290393;290394;290395;290396 370797;370798;370799;370800;370801;370802;370803;370804;370805;370806;370807;370808;370809;370810;370811 370801 15 MFYSFQDKR Unmodified 1220.5648 0.56482866 4555 Q9Y2H1;F5H277 STK38L Serine/threonine-protein kinase 38-like yes no 0 0 1 1 47.323 47.323 3 0.061412 45414 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.001 21.565 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31755 4555 29799 290397 370812 370812 1 MGADLLGSVQAK Unmodified 1188.6173 0.61725816 310;830;1060 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4I5;E3W994;J3KR49;O75122;F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP2;CLASP1 CLIP-associating protein 2;CLIP-associating protein 1 no no 0 0 0 1 74.728 74.728 2 0.017213 70941 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.485 53.07 42233000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42233000 0 0 0 31756 310;830;1060 29800 290398 370813 370813 0 MGAGLGHGMDR Unmodified 1100.4855 0.48553248 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R2T0;M0QZM1 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.492 20.492 3 0.017534 14056 QUIQUE_C1218_190116_001 44.299 34.712 625890000 87755000 113080000 92592000 84021000 0 62906000 0 0 36977000 0 85234000 0 63317000 31757 2603 29801 290399;290400;290401;290402;290403;290404;290405;290406 370814;370815;370816;370817;370818;370819;370820;370821 370814 8 MGAMAKPDCIITCDGK 2 Oxidation (M) 1798.7722 0.77219695 2855 Q01469;I6L8B7 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes no 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.697 29.697 2 1.0433E-11 23499 QUIQUE_DMIX8_190116_001 131.06 123.49 632530000 22928000 0 36843000 34421000 26047000 40569000 34673000 47027000 111660000 24502000 94302000 78444000 81115000 31758 2855 29802 290407;290408;290409;290410;290411;290412;290413;290414;290415;290416;290417;290418;290419 370822;370823;370824;370825;370826;370827;370828;370829;370830;370831;370832;370833;370834 370834 2323;2324 13 MGAMAKPDCIITCDGK Oxidation (M) 1782.7773 0.77728233 2855 Q01469;I6L8B7 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes no 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 3 1 1 3 2 38.242 38.242 2;3 1.4143E-12 39013 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.84 125.97 2556900000 152420000 184240000 267060000 184210000 0 182310000 197720000 294390000 506560000 83976000 69286000 359280000 75428000 31759 2855 29802 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370859;370860;370861;370862;370863;370864;370865;370866;370867;370868;370869;370870;370871;370872;370873;370874;370875;370876;370877;370878;370879;370880;370881;370882;370883;370884 370863 23 MGANNLER Unmodified 903.42325 0.4232498 2603 P52272;A0A087X0X3;M0QZM1;M0R2I7 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 18.9 18.9 2 0.018737 11409 QUIQUE_C1563_190116_001 79.469 43.073 384270000 0 0 0 0 0 226080000 0 0 0 51852000 106340000 0 0 31761 2603 29803 290468;290469;290470;290471 370885;370886;370887;370888 370885 4 MGAPESGLAEYLFDK Oxidation (M) 1642.7549 0.75487386 1841 P02794;G3V192;G3V1D1 FTH1 Ferritin heavy chain;Ferritin heavy chain, N-terminally processed;Ferritin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.39 122.39 2 1.3687E-05 119957 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.56 85.587 3174300000 376740000 326540000 441800000 300810000 213950000 317910000 271750000 104090000 353600000 211970000 0 0 255120000 31762 1841 29804 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heavy chain;Ferritin heavy chain, N-terminally processed;Ferritin yes no 0 0 1 1 1 128.25 128.25 3 0.011262 132329 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.83 27.668 255490000 0 0 0 0 0 0 0 105010000 150480000 0 0 0 0 31764 1841 29805 290497;290498 370929;370930 370930 2 MGATPTPFK Unmodified 948.47389 0.47388839 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 39.337 39.337 2 0.043253 36002 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.457 35.953 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31765 345 29806 290499;290500;290501 370931;370932;370933 370932 3 MGAVFMDAPVSGGVGAAR Unmodified 1691.8123 0.81234593 2338 P31937;H7BZL2 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.617 95.617 2 0.00027853 97898 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.121 79.312 1863300000 183290000 155370000 207840000 193400000 146990000 154750000 0 0 111050000 45371000 268020000 168740000 228510000 31766 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0.50228798 2785 Q8WVC2;P63220 RPS21 40S ribosomal protein S21 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.962 47.962 2 0.00584 45368 QUIQUE_C1368_190116_001 76.1 62.833 413300000 40170000 59488000 69026000 0 35702000 31300000 42333000 0 32212000 0 55998000 0 47073000 31776 2785 29815 290579;290580;290581;290582;290583;290584;290585;290586;290587 371014;371015;371016;371017;371018;371019;371020;371021;371022;371023 371016 9 MGESDDSILR Oxidation (M) 1137.4972 0.49720261 2785 Q8WVC2;P63220 RPS21 40S ribosomal protein S21 yes no 0 1 0 1 1 1 34.013 34.013 2 0.027002 29106 QUIQUE_C1277_190116_001 57.55 44.513 90597000 0 46940000 43657000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31777 2785 29815 290588;290589;290590 371024;371025;371026 371024 3 MGFAVLLVNYR Unmodified 1281.6904 0.69036353 727 C9JIF9;P13798 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 132.59 132.59 2 0.011846 128936 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.452 72.222 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31778 727 29816 290591 371027 371027 1 MGFNIGVR Unmodified 892.45891 0.45890703 1536 O43617;A6NKE1 TRAPPC3 Trafficking protein particle complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.763 69.763 2 0.0036026 70211 QUIQUE_C1576_190116_001 113.85 87.736 398340000 47424000 51209000 28057000 0 35570000 37949000 31116000 37872000 39122000 0 52894000 0 37130000 31779 1536 29817 290592;290593;290594;290595;290596;290597;290598;290599;290600;290601 371028;371029;371030;371031;371032;371033;371034;371035;371036;371037;371038;371039;371040 371033 12 MGFPEAASSFR Unmodified 1198.5441 0.54409322 2196 P22307;H0YF61;H0YD06 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 0 1 1 82.196 82.196 2 0.017358 83073 QUIQUE_C1403_190116_001 67.334 54.297 49385000 0 0 0 21859000 0 27526000 0 0 0 0 0 0 0 31780 2196 29818 290602;290603 371041;371042 371041 1 MGFPPGAAQALVLQVFK Unmodified 1772.9647 0.96474747 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 159.27 159.27 2 0.0081663 164193 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.358 65.826 104500000 0 0 0 0 24540000 0 0 0 15193000 0 20889000 0 43875000 31781 3532 29819 290604;290605;290606;290607 371043;371044;371045;371046 371046 4 MGFPPNIVESAAENMVK Unmodified 1832.8801 0.88009115 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;Q5T9Q8;A0A0U1RRI1 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 139.37 139.37 2 0.0008187 142729 QUIQUE_C1563_190116_001 84.718 62.845 296720000 0 0 0 82682000 0 88167000 125870000 0 0 0 0 0 0 31782 445 29820 290608;290609;290610;290611 371047;371048;371049;371050;371051 371050 4 MGFTEVTPVTGASLR Oxidation (M) 1580.7868 0.78684269 2664 P55265 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes yes 0 1 0 1 1 82.804 82.804 2 0.006062 83423 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.198 33.08 33583000 0 0 0 0 0 0 0 33583000 0 0 0 0 0 31783 2664 29821 290612;290613 371052;371053 371053 2111 2 MGFVVTMLK Unmodified 1024.5449 0.54494484 3479 Q7Z7L7 ZER1 Protein zer-1 homolog yes yes 0 0 0 1 103.01 103.01 2 0.053957 105997 QUIQUE_C1277_190116_001 61.679 41.397 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31784 3479 29822 290614 371054 371054 1 MGFWAPLVLSHSR Unmodified 1499.7707 0.77073911 3702 Q8WUX9;E5RJI3;E5RIU9 CHMP7 Charged multivesicular body protein 7 yes no 0 0 0 1 110.88 110.88 3 0.044983 116577 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.579 30.786 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31785 3702 29823 290615 371055 371055 1 MGGEAPELALDPVPQDASTK Unmodified 2024.9725 0.97247121 2909 Q07812 BAX Apoptosis regulator BAX yes yes 0 0 0 1 1 1 98.275 98.275 2 9.5215E-10 100486 QUIQUE_C1277_190116_001 111.66 98.234 60326000 30238000 30088000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31786 2909 29824 290616;290617;290618 371056;371057;371058 371057 2 MGGEEAEIR Unmodified 990.44404 0.44404482 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 22.972 22.972 2 0.0041331 16393 QUIQUE_C1218_190116_001 89.698 41.849 218640000 80198000 0 86809000 0 0 0 0 51632000 0 0 0 0 0 31787 2916 29825 290619;290620;290621 371059;371060;371061 371059 3 MGGEEKPIGAGEEK Unmodified 1430.6711 0.67114423 2253 P26639;D6R9F8;D6RCA5;D6RDJ6;D6RJ97;D6RHV7;D6RCS6 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 1 16.01 16.01 2;3 8.0963E-46 8139 QUIQUE_C1403_190116_001 190.85 146.65 748260000 88550000 82910000 0 90956000 20354000 70476000 103770000 55094000 0 0 113820000 71512000 50818000 31788 2253 29826 290622;290623;290624;290625;290626;290627;290628;290629;290630;290631;290632;290633;290634;290635;290636;290637;290638 371062;371063;371064;371065;371066;371067;371068;371069;371070;371071;371072;371073;371074;371075;371076;371077;371078 371067 15 MGGFHWMQR Unmodified 1148.5008 0.50078862 3784;3367 Q969E4;Q6IPX3 TCEAL3;TCEAL6 Transcription elongation factor A protein-like 3;Transcription elongation factor A protein-like 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.461 57.461 3 0.00034728 56597 QUIQUE_C1277_190116_001 106.04 99.739 416680000 50138000 79898000 28316000 0 38344000 33005000 28165000 19395000 29941000 0 33169000 29096000 47210000 31789 3784;3367 29827 290639;290640;290641;290642;290643;290644;290645;290646;290647;290648;290649 371079;371080;371081;371082;371083;371084;371085;371086;371087;371088;371089;371090;371091;371092 371081 14 MGGGGAMNMGDPYGSGGQK Unmodified 1770.7124 0.71237389 2208 P23246;H0Y9K7;H0Y9U2 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.484 55.484 2 1.2308E-22 53528 QUIQUE_C1368_190116_001 138.02 129.62 446680000 36153000 51943000 37328000 46500000 33586000 27444000 32303000 41398000 0 0 52815000 41003000 46202000 31790 2208 29828 290650;290651;290652;290653;290654;290655;290656;290657;290658;290659;290660 371093;371094;371095;371096;371097;371098;371099;371100;371101;371102;371103;371104 371095 12 MGGGSIEVSVPR Unmodified 1187.5969 0.59685707 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 60.699 60.699 2 0.027613 59484 QUIQUE_C1277_190116_001 54.198 39.557 109170000 0 109170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31791 3875 29829 290661 371105 371105 1 MGGSSGALYGLFLTAAAQPLK Unmodified 2052.0714 0.071397389 3226 Q3LXA3;H0YCY6;I3L252 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 154.8 154.8 2;3 3.4492E-26 160684 QUIQUE_C1218_190116_001 176.89 147.2 891750000 64229000 59591000 77097000 65948000 62570000 42823000 53278000 87564000 90555000 17417000 136040000 78105000 56536000 31792 3226 29830 290662;290663;290664;290665;290666;290667;290668;290669;290670;290671;290672;290673;290674;290675;290676;290677;290678;290679;290680;290681;290682;290683;290684;290685;290686 371106;371107;371108;371109;371110;371111;371112;371113;371114;371115;371116;371117;371118;371119;371120;371121;371122;371123;371124;371125;371126;371127;371128;371129;371130;371131;371132;371133 371108 27 MGHAGAIIAGGK Unmodified 1081.5702 0.57024839 2625 P53597 SUCLG1 Succinyl-CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.32 17.32 3 0.00026956 10257 QUIQUE_C1218_190116_001 85.355 85.355 2799800000 385230000 257220000 304060000 202420000 145980000 242870000 217410000 149630000 182770000 49406000 138770000 238270000 285800000 31793 2625 29831 290687;290688;290689;290690;290691;290692;290693;290694;290695;290696;290697;290698;290699 371134;371135;371136;371137;371138;371139;371140;371141;371142;371143;371144;371145;371146;371147;371148;371149 371135 13 MGHALEEIKK Unmodified 1154.6118 0.61177885 1642 O75525;E5RG12;H0YAQ1;H0YAQ3;E5RJZ9 KHDRBS3 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 3 yes no 0 0 1 1 1 14.919 14.919 3 0.012889 7263 QUIQUE_C1576_190116_001 36.514 15.814 52415000 0 0 0 0 0 0 24801000 0 0 0 0 0 27614000 31794 1642 29832 290700;290701 371150;371151 371150 1 MGHPQFWK Oxidation (M) 1045.4804 0.48037075 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;E5RJ62;E5RIU5;E5RIL4;A0A0C4DGD8;E5RJ87;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 1 0 1 1 25.661 25.661 2 0.043356 19687 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.717 46.162 71507000 0 0 0 0 0 0 0 0 43154000 0 0 28353000 0 31795 1140;3457 29833 290702;290703 371152;371153 371152 2 MGIGGLDK Unmodified 789.40547 0.40547447 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 39.947 39.947 2 0.030205 36458 QUIQUE_C1218_190116_001 67.169 37.793 644890000 268670000 0 0 185330000 0 190880000 0 0 0 0 0 0 0 31796 1245 29834 290704;290705;290706 371154;371155;371156;371157 371154 4 MGIGGLDKEFSDIFR Oxidation (M) 1699.824 0.82395647 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 3 1 1 2 2 2 126.87 126.87 2;3 2.9386E-09 123940 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.96 112.61 1947100000 74708000 109660000 102170000 128260000 49122000 67665000 79152000 104740000 120790000 67975000 304630000 260220000 477990000 31797 1245 29835 290707;290708;290709;290710;290711;290712;290713;290714;290715;290716;290717;290718;290719;290720;290721;290722;290723;290724;290725;290726 371158;371159;371160;371161;371162;371163;371164;371165;371166;371167;371168;371169;371170;371171;371172;371173;371174;371175;371176;371177;371178;371179;371180;371181;371182;371183;371184;371185;371186;371187;371188;371189 371178 724 32 MGIGGLDKEFSDIFR Unmodified 1683.829 0.82904185 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.01 137.01 3 4.8322E-14 143413 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.98 119.72 5017700000 368550000 560890000 525370000 369440000 0 290780000 532740000 267970000 340420000 74352000 646960000 491630000 548620000 31798 1245 29835 290727;290728;290729;290730;290731;290732;290733;290734;290735;290736;290737;290738 371190;371191;371192;371193;371194;371195;371196;371197;371198;371199;371200;371201;371202 371199 9 MGIGGLDKEFSDIFRR Unmodified 1839.9302 0.93015288 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 2 2 2 1 1 2 122.32 122.32 3;4 7.8887E-06 126620 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.641 75.38 408050000 0 0 0 0 0 0 0 146070000 68470000 0 38667000 77847000 76991000 31799 1245 29836 290739;290740;290741;290742;290743;290744;290745;290746 371203;371204;371205;371206;371207;371208;371209;371210;371211;371212 371208 10 MGIGGLDKEFSDIFRR Oxidation (M) 1855.9251 0.9250675 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 2 1 110.88 110.88 3 0.00089174 114331 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.73 78.095 28513000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28513000 0 31800 1245 29836 290747 371213 371213 724 1 MGINSILLR Unmodified 1015.5848 0.58483582 3249 Q53FP2 TMEM35 Transmembrane protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.914 95.914 2 0.00078076 98372 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.86 76.347 252170000 24288000 29933000 32082000 24093000 20210000 30530000 29544000 18070000 20846000 0 0 0 22576000 31801 3249 29837 290748;290749;290750;290751;290752;290753;290754;290755;290756;290757;290758 371214;371215;371216;371217;371218;371219;371220;371221;371222;371223;371224 371222 10 MGISTELFGAEECSISNSLK Oxidation (M) 2188.0028 0.002785056 4703 yes yes 0 1 0 1 1 166.58 166.58 2 0.013286 172527 QUIQUE_C1438_190116_001 44.616 29.228 127560000 0 0 0 0 71576000 0 0 0 0 55988000 0 0 0 + 31802 4703 29838 290759;290760 371225;371226 371225 3086 1 MGITEYNNQCR Unmodified 1384.5864 0.58636874 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24;Q5TCD1 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 38.165 38.165 2 0.0018711 34469 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.139 85.785 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31803 2441 29839 290761;290762 371227;371228 371228 2 MGIVGPEFK Unmodified 976.50519 0.50518852 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.549 68.549 2 0.0022276 68677 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.531 73.399 4767900000 440090000 477180000 671770000 220050000 0 0 505170000 325850000 471310000 242740000 697350000 428510000 287930000 31804 3117 29840 290763;290764;290765;290766;290767;290768;290769;290770;290771;290772;290773 371229;371230;371231;371232;371233;371234;371235;371236;371237;371238;371239;371240;371241 371239 11 MGIVGPEFK Oxidation (M) 992.5001 0.50010314 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 1 50.511 50.511 2 0.024792 48194 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.546 36.72 100550000 0 0 0 0 0 0 0 0 100550000 0 0 0 0 31805 3117 29840 290774 371242 371242 1 MGIVSDYEK Unmodified 1040.4848 0.48484701 4110 Q9GZZ9;E7EQ61;E7EWE1;C9J0F6;C9J5W5 UBA5 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 yes no 0 0 0 1 47.372 47.372 2 0.05836 44456 QUIQUE_C1277_190116_001 48.423 19.911 47466000 0 47466000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31806 4110 29841 290775 371243 371243 1 MGIYVGAK Unmodified 837.44186 0.44185998 2861;2129 Q01813;Q5VSR5;V9GYV7;P17858 PFKP;PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type;ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 38.497 38.497 2 0.018221 33407 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.294 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371255;371256;371257;371258;371259;371260;371261;371262;371263;371264 371256 9 MGLALTALNKFEEAVTSYQK Unmodified 2213.1402 0.14020524 3843 Q96EQ0;D6RFW1 SGTB Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 152.51 152.51 3 3.3034E-06 159451 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.727 71.637 210740000 0 0 0 0 0 0 0 0 38723000 0 64875000 64156000 42988000 31810 3843 29845 290793;290794;290795;290796 371265;371266;371267;371268 371266 4 MGLIQTADQLR Unmodified 1244.6547 0.6547063 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 0 1 1 1 1 69.692 69.692 2;3 0.016773 82479 QUIQUE_C1277_190116_001 56.432 41.758 272490000 0 85144000 0 94014000 0 0 0 42623000 50709000 0 0 0 0 31811 2133 29846 290797;290798;290799;290800 371269;371270;371271;371272 371269 4 MGLLAVLR Unmodified 871.53134 0.53134369 1728 O95394;D6RCQ8;D6RF77;D6RCD1;D6RC77 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 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371333;371334;371335;371336;371337;371338;371339;371340;371341;371342;371343;371344;371345;371346;371347;371348;371349;371350;371351;371352;371353;371354;371355;371356;371357;371358;371359;371360 371340 2755 26 MGLVSCGPPPELPLAQVFGR Unmodified 2124.086 0.086001596 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 2 3 2 2 3 2 2 2 2 5 4 2 4 153.3 153.3 2;3 6.953E-117 160009 QUIQUE_C1438_190116_001 259.85 240.11 5974800000 554430000 740290000 699860000 678200000 494890000 408200000 680830000 116400000 261500000 172840000 426580000 289620000 451140000 31818 3862 29850 290861;290862;290863;290864;290865;290866;290867;290868;290869;290870;290871;290872;290873;290874;290875;290876;290877;290878;290879;290880;290881;290882;290883;290884;290885;290886;290887;290888;290889;290890;290891;290892;290893;290894;290895 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290934;290935;290936;290937;290938;290939;290940;290941 371481;371482;371483;371484;371485;371486;371487;371488 371487 8 MGPGIDR Unmodified 744.35886 0.35885863 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R2T0;M0QZM1 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 21.063 21.063 2 0.030434 13993 QUIQUE_C1218_190116_001 90.706 48.989 148680000 148680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31828 2603 29858 290942 371489 371489 1 MGPGIGAILER Unmodified 1112.6012 0.60121417 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0;A0A0C4DGV1;H0YN19;H0YKS1 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 90.42 90.42 2 0.00045661 92699 QUIQUE_C1277_190116_001 105.4 82.656 1082600000 48657000 105420000 116240000 68053000 105650000 62839000 93346000 33984000 77085000 0 144600000 97705000 128990000 31829 140 29859 290943;290944;290945;290946;290947;290948;290949;290950;290951;290952;290953;290954;290955 371490;371491;371492;371493;371494;371495;371496;371497;371498;371499;371500;371501;371502;371503 371491 11 MGPGIGAILER Oxidation (M) 1128.5961 0.59612879 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0;A0A0C4DGV1;H0YN19;H0YKS1 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 1 0 1 78.84 78.84 2 0.015082 78708 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.167 43.391 35342000 0 0 0 0 0 0 0 35342000 0 0 0 0 0 31830 140 29859 290956 371504;371505 371504 2 MGPLGLDHMASSIER Oxidation (M) 1628.7651 0.76506139 2603 P52272;A0A087X0X3;M0QZM1 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 1 0 1 1 1 1 68.31 68.31 3 0.0013376 57577 QUIQUE_C1277_190116_001 59.728 50.692 220480000 67388000 84275000 0 0 0 0 0 41231000 0 27588000 0 0 0 31831 2603 29860 290957;290958;290959;290960 371506;371507;371508;371509 371507 2060;2061 4 MGPLGLDHMASSIER Unmodified 1612.7701 0.77014677 2603 P52272;A0A087X0X3;M0QZM1 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.299 87.299 3 0.00032 88853 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.98 63.803 2542600000 217810000 244650000 304610000 222090000 178090000 204000000 203620000 144440000 161450000 60740000 248200000 181480000 171450000 31832 2603 29860 290961;290962;290963;290964;290965;290966;290967;290968;290969;290970;290971;290972;290973 371510;371511;371512;371513;371514;371515;371516;371517;371518;371519;371520;371521;371522;371523;371524;371525 371518 15 MGPLINRPHLER Unmodified 1431.7769 0.77688712 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 36.384 36.384 2;3;4 0.0011289 31822 QUIQUE_C1576_190116_001 73.848 65.937 14258000000 1175800000 1166200000 1579600000 669970000 851180000 1203100000 692050000 1189400000 1455000000 316850000 1392800000 1086400000 1479800000 31833 2522 29861 290974;290975;290976;290977;290978;290979;290980;290981;290982;290983;290984;290985;290986;290987;290988;290989;290990;290991;290992;290993;290994;290995;290996;290997 371526;371527;371528;371529;371530;371531;371532;371533;371534;371535;371536;371537;371538;371539;371540;371541;371542;371543;371544;371545;371546;371547;371548;371549;371550 371537 14 MGPLINRPHLER Oxidation (M) 1447.7718 0.77180175 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 26.977 26.977 3;4 0.0056515 19079 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.563 50.361 1454600000 0 0 0 233470000 0 123200000 0 90717000 361350000 128560000 243280000 193220000 80767000 31834 2522 29861 290998;290999;291000;291001;291002;291003;291004;291005;291006;291007 371551;371552;371553;371554;371555;371556;371557;371558;371559;371560 371560 1948 6 MGPNIYELR Oxidation (M) 1107.5383 0.53827956 3985 Q9BPW8;H7C2U6;C9JDV8 NIPSNAP1 Protein NipSnap homolog 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.881 60.881 2 0.00051101 57688 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.72 104.99 1952800000 143670000 161130000 129950000 92071000 107600000 108960000 97587000 159550000 206050000 76694000 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protein 1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 13.571 13.571 2 0.00060746 5336 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.549 87.251 72168000 7867700 0 8652300 2477000 9868900 0 0 0 9276100 0 14454000 0 19572000 31837 3087 29863 291033;291034;291035;291036;291037;291038;291039;291040 371603;371604;371605;371606;371607;371608;371609;371610 371610 2525;2526 8 MGPSGGEGMEPER Unmodified 1332.5438 0.54383522 3087 Q14847;C9J9W2 LASP1 LIM and SH3 domain protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 31.631 31.631 2 0.0010792 26073 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.171 67.964 532860000 80153000 63309000 40626000 86660000 34184000 52176000 34988000 30000000 34345000 12638000 29020000 0 34764000 31838 3087 29863 291041;291042;291043;291044;291045;291046;291047;291048;291049;291050;291051;291052;291053;291054 371611;371612;371613;371614;371615;371616;371617;371618;371619;371620;371621;371622;371623;371624;371625 371625 14 MGPSGGEGMEPER Oxidation (M) 1348.5387 0.53874985 3087 Q14847;C9J9W2 LASP1 LIM and SH3 domain protein 1 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protein 1 yes no 0 0 1 1 21.289 21.289 3 0.0079987 14399 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.992 38.627 48718000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48718000 31842 3087 29864 291066 371637 371637 1 MGPTELLIEMEDWK Unmodified 1690.7946 0.79463018 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 158 158 2;3 0.00017614 164331 QUIQUE_C1438_190116_001 83.204 75.027 1169100000 95107000 143420000 110200000 204080000 134350000 0 157300000 0 31906000 21150000 190070000 30523000 50940000 31843 1824 29865 291067;291068;291069;291070;291071;291072;291073;291074;291075;291076;291077;291078;291079;291080;291081;291082;291083;291084 371638;371639;371640;371641;371642;371643;371644;371645;371646;371647;371648;371649;371650;371651;371652;371653;371654;371655;371656;371657;371658;371659;371660;371661 371652 21 MGPTELLIEMEDWK Oxidation (M) 1706.7895 0.7895448 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 1 0 1 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mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.428 59.428 2 0.00039995 58098 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.543 66.29 584780000 56646000 63984000 81674000 48832000 39635000 35450000 58930000 32057000 53363000 0 61092000 53121000 0 31853 3643 29871 291112;291113;291114;291115;291116;291117;291118;291119;291120;291121;291122 371692;371693;371694;371695;371696;371697;371698;371699;371700;371701;371702 371699 11 MGQPSDPTAVVDPQTR Oxidation (M) 1713.7992 0.79919829 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 2 49.9 49.9 2 7.5004E-05 45240 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.018 78.765 93577000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16722000 76854000 0 0 31854 3643 29871 291123;291124;291125 371703;371704;371705 371703 2704 2 MGSENLNEQLEEFLANIGTSVQNVR Unmodified 2791.3447 0.34467172 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 171.18 171.18 3 1.6864E-69 172600 QUIQUE_C1563_190116_001 160.25 153.06 730090000 15514000 131030000 0 0 61956000 11072000 110010000 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371722;371723;371724;371725;371726;371727;371728;371729;371730 371728 8 MGSISFDFR Unmodified 1058.4855 0.48551571 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89;G3V4R9;G3V247 NRXN3 Neurexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 97.934 97.934 2 0.0067828 100923 QUIQUE_C1368_190116_001 83.429 57.49 64598000 0 0 27517000 0 14976000 0 22105000 0 0 0 0 0 0 31858 319 29874 291151;291152;291153 371731;371732;371733;371734 371732 4 MGTPYLQK Unmodified 936.47389 0.47388839 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.247 34.247 2 0.0036717 29166 QUIQUE_C1368_190116_001 124.37 95.845 2478300000 261390000 250880000 214090000 237850000 212600000 198290000 230160000 146190000 105170000 53579000 206310000 199650000 162130000 31859 269;2893 29875 291154;291155;291156;291157;291158;291159;291160;291161;291162;291163;291164;291165;291166 371735;371736;371737;371738;371739;371740;371741;371742;371743;371744;371745;371746;371747;371748;371749;371750;371751;371752;371753;371754;371755 371739 21 MGTPYLQK Oxidation (M) 952.4688 0.46880301 2893;269 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 22.108 22.108 2 0.0089607 15394 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.602 72.603 561550000 0 0 71771000 0 0 0 74365000 0 0 0 144450000 123330000 147630000 31860 269;2893 29875 291167;291168;291169;291170;291171 371756;371757;371758;371759;371760;371761;371762;371763 371760 192 8 MGTTVATNALLER Unmodified 1375.7129 0.71294946 1450 O14841;A0A087WY99 OPLAH 5-oxoprolinase yes no 0 0 0 1 71.427 71.427 2 0.036152 72824 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.286 37.079 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31861 1450 29876 291172 371764 371764 1 MGVEAVIALLEATPDTPACVVSLNGNHAVR Unmodified 3103.5794 0.57943945 2861 Q01813;B1APP6 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 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371816;371817;371818;371819;371820;371821;371822;371823;371824;371825;371826 371826 444;445 11 MGVLDGVLMELQDCALPLLK Unmodified 2214.1462 0.14621859 740 C9JRL4 MDH1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 2 2 1 175.26 175.26 2;3 2.5271E-37 180259 QUIQUE_C1576_190116_001 192.18 176.04 1793400000 58254000 92603000 0 0 41326000 189340000 94459000 26482000 186190000 0 291620000 776690000 36432000 31869 740 29881 291229;291230;291231;291232;291233;291234;291235;291236;291237;291238;291239;291240;291241;291242;291243 371827;371828;371829;371830;371831;371832;371833;371834;371835;371836;371837;371838;371839;371840;371841;371842 371832 16 MGVLDGVLMELQDCALPLLK Oxidation (M) 2230.1411 0.14113321 740 C9JRL4 MDH1 yes yes 0 1 0 1 3 1 1 2 2 4 2 174.24 174.24 2;3 6.1569E-65 182097 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.02 156.37 1011300000 0 145330000 0 27686000 37916000 0 363140000 0 92091000 0 259910000 85276000 0 31870 740 29881 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yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 139.83 139.83 3;4 7.9041E-65 146228 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.81 126.65 17520000000 1497500000 1784000000 1405700000 1374700000 1116000000 876590000 1374700000 1370200000 1357500000 370620000 2291000000 1358400000 1342800000 31872 150 29882 291266;291267;291268;291269;291270;291271;291272;291273;291274;291275;291276;291277;291278;291279;291280;291281;291282;291283;291284;291285;291286;291287;291288;291289 371869;371870;371871;371872;371873;371874;371875;371876;371877;371878;371879;371880;371881;371882;371883;371884;371885;371886;371887;371888;371889;371890;371891;371892;371893;371894;371895;371896;371897;371898;371899;371900;371901;371902;371903;371904;371905 371900 37 MHAAFGGTFK Unmodified 1065.5066 0.5065855 2656 P55058 PLTP Phospholipid transfer protein yes yes 0 0 0 1 31.395 31.395 3 0.049225 26182 QUIQUE_C1403_190116_001 30.918 24.328 12898000 0 0 0 12898000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31873 2656 29883 291290 371906 371906 1 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371931;371932;371933;371934;371935;371936;371937;371938;371939;371940;371941;371942;371943;371944;371945;371946;371947 371942 1653 16 MHEDINEEWISDK Unmodified 1644.709 0.7089863 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 65.381 65.381 2;3 4.8522E-41 64653 QUIQUE_C1403_190116_001 188.29 156.86 2042700000 201460000 216670000 233120000 179090000 120250000 156550000 223160000 63043000 116800000 37333000 178420000 116590000 200200000 31881 2280 29889 291329;291330;291331;291332;291333;291334;291335;291336;291337;291338;291339;291340;291341;291342;291343;291344;291345;291346;291347;291348;291349;291350;291351;291352;291353;291354 371948;371949;371950;371951;371952;371953;371954;371955;371956;371957;371958;371959;371960;371961;371962;371963;371964;371965;371966;371967;371968;371969;371970;371971;371972;371973 371955 25 MHEDINEEWISDKTR Oxidation (M) 1917.8527 0.85269042 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone 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372299 2 MIAAVDTDSPR Unmodified 1174.5652 0.56522259 2909 Q07812;I6LPK7;K4JQN1 BAX Apoptosis regulator BAX yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.397 39.397 2 0.0012818 35528 QUIQUE_C1277_190116_001 87.258 46.229 261070000 0 63392000 51987000 50916000 0 0 46860000 0 47911000 0 0 0 0 31909 2909 29909 291613;291614;291615;291616;291617;291618;291619;291620 372300;372301;372302;372303;372304;372305;372306;372307;372308 372301 9 MIAGQVLDINLAAEPK Oxidation (M) 1697.9022 0.9022068 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V555;G3V575;G3V5X6;G3V3K6;G3V251;B4DSU6 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 106.39 106.39 2;3 1.9635E-13 109860 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.76 74.072 1718400000 146860000 0 121680000 101780000 131270000 122630000 121260000 157460000 243440000 102050000 147690000 156930000 165340000 31910 598 29910 291621;291622;291623;291624;291625;291626;291627;291628;291629;291630;291631;291632;291633;291634;291635 372309;372310;372311;372312;372313;372314;372315;372316;372317;372318;372319;372320;372321;372322;372323 372317 393 8 MIAGQVLDINLAAEPK Unmodified 1681.9073 0.90729217 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V555;G3V575;G3V5X6;G3V3K6;G3V251;B4DSU6 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 0 0 3 2 1 2 2 2 3 2 2 1 2 2 1 117.65 117.65 2;3 1.028E-13 120707 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.42 121.4 5143900000 446180000 519520000 368180000 390090000 478760000 532980000 347350000 463080000 354450000 142340000 398680000 402310000 299990000 31911 598 29910 291636;291637;291638;291639;291640;291641;291642;291643;291644;291645;291646;291647;291648;291649;291650;291651;291652;291653;291654;291655;291656;291657;291658;291659;291660 372324;372325;372326;372327;372328;372329;372330;372331;372332;372333;372334;372335;372336;372337;372338;372339;372340;372341;372342;372343;372344;372345;372346;372347;372348;372349;372350;372351;372352;372353;372354;372355;372356;372357;372358;372359;372360;372361;372362;372363;372364;372365;372366;372367;372368;372369 372354 45 MIAILTENYGGK Unmodified 1308.6748 0.67477304 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.286 88.286 2 0.0020056 85665 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.25 78.798 578830000 35448000 52842000 56497000 64830000 55583000 45737000 0 48906000 0 31018000 67894000 60396000 59679000 31912 2253 29911 291661;291662;291663;291664;291665;291666;291667;291668;291669;291670;291671;291672 372370;372371;372372;372373;372374;372375;372376;372377;372378;372379;372380;372381 372378 10 MIALFNK Acetyl (Protein N-term) 877.47316 0.47316011 3808 Q96BM9;A0A087X2J2 ARL8A ADP-ribosylation factor-like protein 8A yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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Oxidation (M) 1095.527 0.52704617 2881 Q02978;I3L1P8 SLC25A11 Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein yes no 0 1 1 1 13.607 13.607 3 0.061136 5646 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.461 34.161 17070000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17070000 0 0 0 31917 2881 29915 291717 372427 372427 0 MIDLIIPR Unmodified 969.56812 0.56812313 2650 P54886 ALDH18A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase;Glutamate 5-kinase;Gamma-glutamyl phosphate reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.18 101.18 2 0.018957 104583 QUIQUE_C1368_190116_001 79.116 49.274 22640000 0 0 9856100 0 0 0 0 0 12784000 0 0 0 0 31918 2650 29916 291718;291719;291720;291721;291722;291723;291724;291725 372428;372429;372430;372431;372432;372433;372434;372435 372430 8 MIDVDSLTDKECDWLNNYHLTCR Unmodified 2897.2782 0.27824841 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 131.19 131.19 3;4 6.6006E-14 136838 QUIQUE_C1576_190116_001 101.71 94.908 806550000 110680000 93313000 56585000 71431000 0 58842000 121190000 0 59016000 14046000 58305000 78712000 84432000 31919 4259 29917 291726;291727;291728;291729;291730;291731;291732;291733;291734;291735;291736;291737;291738;291739 372436;372437;372438;372439;372440;372441;372442;372443;372444;372445;372446;372447;372448;372449;372450;372451;372452;372453 372445 18 MIEAVQNHIGSLNWGYR Unmodified 1986.9734 0.97341468 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9;E9PKD3 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 99.211 99.211 2;3 1.1541E-44 101757 QUIQUE_DMIX3_190116_001 204.86 171.63 1203300000 168810000 180310000 47166000 203420000 35052000 0 61394000 189380000 74869000 64059000 80564000 35927000 62353000 31920 22 29918 291740;291741;291742;291743;291744;291745;291746;291747;291748;291749;291750;291751;291752;291753;291754;291755 372454;372455;372456;372457;372458;372459;372460;372461;372462;372463;372464;372465;372466;372467;372468;372469;372470 372465 15 MIEEAGAIISTR Oxidation (M) 1305.6599 0.65985126 1379 O00154;K7EKP8 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.551 58.551 2 0.00063221 56831 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.88 34.527 747370000 76217000 82655000 83312000 70251000 71309000 56085000 61516000 59066000 43592000 24157000 0 64076000 55133000 31921 1379 29919 291756;291757;291758;291759;291760;291761;291762;291763;291764;291765;291766;291767 372471;372472;372473;372474;372475;372476;372477;372478;372479;372480;372481;372482;372483;372484 372484 773 14 MIEEAGAIISTR Unmodified 1289.6649 0.66493664 1379 O00154;K7EKP8 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 73.355 73.355 2;3 7.9618E-06 73349 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.78 49.514 3658100000 333840000 397610000 313310000 320860000 240240000 267720000 328430000 245200000 214840000 127590000 277960000 268120000 322370000 31922 1379 29919 291768;291769;291770;291771;291772;291773;291774;291775;291776;291777;291778;291779;291780;291781;291782;291783;291784;291785 372485;372486;372487;372488;372489;372490;372491;372492;372493;372494;372495;372496;372497;372498;372499;372500;372501;372502;372503;372504;372505;372506;372507;372508;372509;372510;372511;372512 372512 28 MIETAQVDER Unmodified 1190.5601 0.56013721 4483 Q9UL25 RAB21 Ras-related protein Rab-21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 31.549 31.549 2 7.6648E-05 26926 QUIQUE_C1218_190116_001 140.14 111.92 1255400000 106600000 121510000 120970000 107040000 72464000 91431000 106800000 70559000 92928000 39492000 137300000 76648000 111670000 31923 4483 29920 291786;291787;291788;291789;291790;291791;291792;291793;291794;291795;291796;291797;291798;291799 372513;372514;372515;372516;372517;372518;372519;372520;372521;372522;372523;372524;372525;372526;372527 372513 14 MIEVDPEAPTEEEK Unmodified 1615.7287 0.72871869 2271 P27987 ITPKB Inositol-trisphosphate 3-kinase B yes yes 0 0 0 1 64.801 64.801 2 0.013297 63443 QUIQUE_C1563_190116_001 54.7 19.476 44131000 0 0 0 0 0 44131000 0 0 0 0 0 0 0 31924 2271 29921 291800 372528 372528 1 MIFDVESMKK Unmodified 1226.6039 0.60391628 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 67.554 67.554 3 0.013653 67465 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.875 28.516 72636000 0 0 0 0 0 0 0 22900000 28042000 0 21694000 0 0 31925 1974 29922 291801;291802;291803 372529;372530;372531 372529 3 MIFVGIK Unmodified 806.47243 0.47243183 722 C9JFR7;P99999 CYCS Cytochrome c yes no 0 0 0 1 1 73.843 73.843 2 0.046357 74336 QUIQUE_C1368_190116_001 77.72 39.349 1071400000 0 0 598060000 0 0 0 0 0 473390000 0 0 0 0 31926 722 29923 291804;291805 372532;372533 372532 2 MIGENSGLVSYMR Unmodified 1455.685 0.68502015 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 91.525 91.525 2 0.0043795 93587 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.017 65.644 244310000 0 0 0 0 0 0 0 0 60437000 0 0 77987000 105890000 31927 3445 29924 291806;291807;291808 372534;372535;372536 372534 2 MIGFSETAK Oxidation (M) 998.47428 0.47428232 1245 I3L0N3;P46459;I3L2G1 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 1 2 1 2 2 32.71 32.71 2 0.0014666 27375 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.57 80.645 1181300000 59662000 0 71765000 72294000 120810000 0 74573000 55452000 189350000 80998000 248860000 207550000 0 31928 1245 29925 291809;291810;291811;291812;291813;291814;291815;291816;291817;291818;291819;291820;291821;291822 372537;372538;372539;372540;372541;372542;372543;372544;372545;372546;372547;372548;372549;372550;372551;372552;372553 372552 725 17 MIGFSETAK Unmodified 982.47937 0.4793677 1245 I3L0N3;P46459;I3L2G1 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.689 46.689 2 0.0022073 44011 QUIQUE_C1277_190116_001 95.741 75.182 3848700000 0 582860000 471870000 534610000 347220000 388890000 439310000 0 235260000 129360000 388750000 330530000 0 31929 1245 29925 291823;291824;291825;291826;291827;291828;291829;291830;291831;291832 372554;372555;372556;372557;372558;372559;372560;372561;372562;372563 372554 9 MIGGLFIYNHK Oxidation (M) 1307.6696 0.66962808 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47;C9JTK4;C9JGT8;C9JJD3;C9JPV8 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 2 2 1 66.997 66.997 2;3 0.00059896 66009 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.41 79.562 366530000 24820000 33908000 0 21134000 0 0 0 47228000 78940000 46120000 82172000 32205000 0 31930 71 29926 291833;291834;291835;291836;291837;291838;291839;291840;291841;291842;291843 372564;372565;372566;372567;372568;372569;372570;372571;372572;372573;372574;372575 372574 56 10 MIGGLFIYNHK Unmodified 1291.6747 0.67471346 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47;C9JTK4;C9JGT8;C9JJD3;C9JPV8 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 79.706 79.706 2;3 0.00048409 80303 QUIQUE_C1368_190116_001 67.334 44.416 791200000 68228000 80142000 63384000 75927000 0 63733000 67891000 72545000 49487000 23532000 87166000 63739000 75429000 31931 71 29926 291844;291845;291846;291847;291848;291849;291850;291851;291852;291853;291854;291855;291856 372576;372577;372578;372579;372580;372581;372582;372583;372584;372585;372586;372587;372588;372589;372590;372591 372579 16 MIGGLFIYNHK Acetyl (Protein N-term) 1333.6853 0.68527815 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47;C9JTK4;C9JGT8;C9JJD3;C9JPV8 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 1 0 0 1 134.59 134.59 2 0.050913 140322 QUIQUE_C1368_190116_001 51.864 30.962 72671000 0 0 72671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31932 71 29926 291857 372592 372592 0 MIGGPILPSER Unmodified 1168.6274 0.62742892 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;H0YHM6;F8VVF2;A0A1B0GVU0 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.549 71.549 2 0.0002247 71603 QUIQUE_C1403_190116_001 122.33 82.328 8841800000 728980000 584030000 953100000 531050000 601060000 614890000 839350000 643790000 703920000 157650000 910360000 770930000 802720000 31933 336 29927 291858;291859;291860;291861;291862;291863;291864;291865;291866;291867;291868;291869;291870 372593;372594;372595;372596;372597;372598;372599;372600;372601;372602;372603;372604;372605;372606;372607 372596 15 MIGGPILPSER Oxidation (M) 1184.6223 0.62234354 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;H0YHM6;F8VVF2;A0A1B0GVU0 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.471 59.471 2 9.6873E-05 58770 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.26 90.452 1865400000 0 106450000 158800000 90278000 107470000 97208000 109990000 172080000 234530000 128660000 253380000 191890000 214710000 31934 336 29927 291871;291872;291873;291874;291875;291876;291877;291878;291879;291880;291881;291882 372608;372609;372610;372611;372612;372613;372614;372615;372616;372617;372618;372619;372620;372621;372622;372623;372624;372625;372626;372627;372628 372621 236 21 MIGVNSVQSASK Acetyl (Protein N-term) 1261.6336 0.63363651 616 B4DKF8;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 yes no 1 0 0 1 1 84.622 84.622 2 0.0038378 85691 QUIQUE_C1403_190116_001 82.029 58.04 49821000 0 0 0 49821000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31935 616 29928 291883;291884 372629;372630 372630 1 MIHILLYYK Unmodified 1192.6678 0.66783717 1660 O75832;B1AJY7;B1AJY5 PSMD10 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.976 86.976 3 0.0020026 85034 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.265 76.376 227340000 11133000 18589000 20383000 9564400 11608000 14802000 22996000 33165000 0 9070900 36587000 39443000 0 31936 1660 29929 291885;291886;291887;291888;291889;291890;291891;291892;291893;291894;291895;291896;291897 372631;372632;372633;372634;372635;372636;372637;372638;372639;372640;372641;372642;372643 372640 13 MIHPIPADSWR Unmodified 1321.6601 0.66012603 3602 Q8N5V2 NGEF Ephexin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.085 59.085 3 0.013512 58228 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.352 38.22 88452000 0 0 12646000 19201000 0 0 0 0 18071000 0 21737000 16795000 0 31937 3602 29930 291898;291899;291900;291901;291902;291903 372644;372645;372646;372647;372648;372649 372649 6 MIICLEEEVLPFIPSASEHMLK Unmodified 2585.2943 0.29433939 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 156.46 156.46 3 0.0057571 159194 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.015 20.071 19119000 0 0 0 0 0 0 0 19119000 0 0 0 0 0 31938 1534 29931 291904 372650 372650 1 MIIEEAK Unmodified 832.43644 0.43644025 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 27.72 27.72 2 0.039849 21822 QUIQUE_C1277_190116_001 83.377 36.713 163820000 0 163820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31939 2514 29932 291905 372651 372651 1 MIIEEAKR Unmodified 988.53755 0.53755128 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 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31942 2459 29934 291919;291920;291921;291922;291923;291924;291925 372667;372668;372669;372670;372671;372672;372673 372668 1886 7 MIINEELMASLDQPTQTVVMHR Unmodified 2555.2546 0.25459984 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 131.87 131.87 3 1.4294E-09 136007 QUIQUE_C1277_190116_001 99.407 86.349 334230000 58590000 50872000 68573000 0 44409000 0 0 47051000 0 0 64730000 0 0 31943 645 29935 291926;291927;291928;291929;291930;291931 372674;372675;372676;372677;372678;372679;372680;372681 372675 8 MIKPFFHSLSEK Unmodified 1462.7643 0.76425675 1999 P10599 TXN Thioredoxin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 51.737 51.737 3 0.0045649 49401 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.602 49.505 901290000 139030000 0 0 0 0 0 173370000 259880000 329020000 0 0 0 0 31944 1999 29936 291932;291933;291934;291935 372682;372683;372684;372685 372685 3 MIKPFFHSLSEK Oxidation (M) 1478.7592 0.75917137 1999 P10599 TXN Thioredoxin yes yes 0 1 1 1 2 1 1 1 4 4 1 4 3 2 42.396 42.396 2;3;4 2.8247E-05 40464 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.25 94.965 2691000000 53101000 110370000 65607000 0 97440000 58022000 0 659280000 510070000 52582000 279090000 454170000 351250000 31945 1999 29936 291936;291937;291938;291939;291940;291941;291942;291943;291944;291945;291946;291947;291948;291949;291950;291951;291952;291953;291954;291955;291956;291957;291958;291959 372686;372687;372688;372689;372690;372691;372692;372693;372694;372695;372696;372697;372698;372699;372700;372701;372702;372703;372704;372705;372706;372707;372708;372709;372710;372711 372696 1265 19 MILASNFFK Unmodified 1069.563 0.56303775 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 107.6 107.6 2 0.017149 110119 QUIQUE_C1563_190116_001 65.246 57.556 2017900000 0 181410000 387040000 0 0 302490000 216790000 214260000 158740000 0 306330000 0 250820000 31946 1665 29937 291960;291961;291962;291963;291964;291965;291966;291967 372712;372713;372714;372715;372716;372717;372718;372719 372714 5 MILEIAPTSDNDFGR Unmodified 1677.8032 0.80322103 1241 H9KV31;O15394 NCAM2 Neural cell adhesion molecule 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.06 110.06 2 9.5448E-19 113288 QUIQUE_C1277_190116_001 176.8 151.42 1021600000 101020000 85142000 117030000 96216000 79698000 80364000 137380000 69811000 64382000 0 82188000 0 108330000 31947 1241 29938 291968;291969;291970;291971;291972;291973;291974;291975;291976;291977;291978 372720;372721;372722;372723;372724;372725;372726;372727;372728;372729;372730;372731;372732 372722 13 MILELFSK Oxidation (M) 995.53615 0.5361543 2812 P78417;Q5TA02;Q5TA01 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 93.75 93.75 2 0.0088981 96909 QUIQUE_C1438_190116_001 97.798 22.487 374480000 23670000 29848000 31063000 0 29499000 20336000 24686000 59244000 20111000 27015000 69196000 0 39816000 31948 2812 29939 291979;291980;291981;291982;291983;291984;291985;291986;291987;291988;291989;291990;291991 372733;372734;372735;372736;372737;372738;372739;372740;372741;372742;372743;372744;372745 372736 2263 13 MILELFSK Unmodified 979.54124 0.54123967 2812 P78417;Q5TA02;Q5TA01 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.46 114.46 2 0.007181 118886 QUIQUE_C1576_190116_001 98.997 28.084 3903000000 317020000 323080000 319350000 354170000 286030000 163150000 290890000 288370000 286270000 160340000 445440000 326870000 342010000 31949 2812 29939 291992;291993;291994;291995;291996;291997;291998;291999;292000;292001;292002;292003;292004 372746;372747;372748;372749;372750;372751;372752;372753;372754;372755;372756;372757;372758;372759;372760;372761;372762;372763;372764;372765;372766;372767;372768;372769;372770;372771;372772 372760 27 MILIQDGSQNTNVDKPLR Unmodified 2041.0626 0.062623617 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R0I5;M0QYH3 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 3 1 1 2 1 2 69.313 69.313 2;3 6.192E-75 69062 QUIQUE_C1277_190116_001 237.13 207.32 2262800000 339630000 370940000 138990000 140650000 163820000 85493000 173960000 259500000 0 89685000 208420000 155350000 136400000 31950 3770 29940 292005;292006;292007;292008;292009;292010;292011;292012;292013;292014;292015;292016;292017;292018;292019;292020;292021;292022;292023;292024;292025;292026;292027 372773;372774;372775;372776;372777;372778;372779;372780;372781;372782;372783;372784;372785;372786;372787;372788;372789;372790;372791;372792;372793;372794;372795;372796;372797;372798;372799;372800 372776 27 MILIQDGSQNTNVDKPLR Oxidation (M) 2057.0575 0.057538239 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0R0I5;M0QYH3 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 1 1 1 55.891 55.891 3 0.00031686 55312 QUIQUE_C1438_190116_001 78.234 64.607 33698000 0 0 0 0 33698000 0 0 0 0 0 0 0 0 31951 3770 29940 292028 372801 372801 2727 1 MILLEVNNR Unmodified 1100.6012 0.60121417 1486 O15144;C9JTV5;G5E9J0;G5E9S7 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 74.759 74.759 2 0.010832 74672 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.046 52.026 294680000 0 0 0 0 0 0 0 147880000 0 0 146800000 0 0 31952 1486 29941 292029;292030;292031;292032 372802;372803;372804;372805;372806 372803 5 MILLTLTGQPR Unmodified 1241.7166 0.71657828 1846 P03915 MT-ND5 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 103.5 103.5 2 0.0049416 105288 QUIQUE_C1368_190116_001 92.062 73.66 36252000 36252000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31953 1846 29942 292033;292034;292035;292036;292037;292038 372807;372808;372809;372810;372811;372812 372809 5 MILSTISWMGGK Unmodified 1322.6727 0.67266455 4303 Q9NV96 TMEM30A Cell cycle control protein 50A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 121.78 121.78 2 0.0069536 126485 QUIQUE_C1277_190116_001 68.657 43.734 28109000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28109000 31954 4303 29943 292039;292040;292041;292042;292043;292044 372813;372814;372815;372816;372817;372818 372814 6 MIMATNRPDTLDPALLRPGR Unmodified 2237.1773 0.17727622 124 A0A087X2I1;P62333 PSMC6 26S protease regulatory subunit 10B yes no 0 0 2 2 1 1 1 1 1 83.958 83.958 3;4 0.0011642 85599 QUIQUE_C1277_190116_001 62.765 58.497 382560000 0 139190000 39134000 0 45101000 73576000 39007000 0 46550000 0 0 0 0 31955 124 29944 292045;292046;292047;292048;292049;292050;292051 372819;372820;372821;372822;372823;372824;372825 372820 7 MIMQDKLEK Oxidation (M) 1150.5726 0.57261616 2363;3738;1748;180 O95757;E9PDE8;P34932;A0A087WYC1;A0A0A0MSM0;Q92598 HSPA4L;HSPA4;HSPH1 Heat shock 70 kDa protein 4L;Heat shock 70 kDa protein 4;Heat shock protein 105 kDa no no 0 1 1 2 1 1 1 2 16.161 16.161 2;3 0.0080974 8806 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.148 59.007 139140000 0 0 0 0 0 0 0 42148000 0 0 23890000 34194000 38905000 31956 1748;2363;180;3738 29945 292052;292053;292054;292055;292056;292057;292058 372826;372827;372828;372829;372830;372831;372832 372826 109 6 MIMQDKLEK Unmodified 1134.5777 0.57770153 2363;3738;1748;180 O95757;E9PDE8;P34932;A0A087WYC1;A0A0A0MSM0;Q92598 HSPA4L;HSPA4;HSPH1 Heat shock 70 kDa protein 4L;Heat shock 70 kDa protein 4;Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 1 1 1 28.811 28.811 2 0.03715 23055 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.136 43.301 200910000 0 0 0 0 0 0 0 109890000 91020000 0 0 0 0 31957 1748;2363;180;3738 29945 292059;292060 372833;372834 372834 2 MININILSVCK Unmodified 1303.6992 0.69921365 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6;A0A1B0GV93;E9PI21 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 112.91 112.91 2 0.00074572 117065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.342 62.089 477620000 0 0 100590000 0 0 0 0 75976000 61076000 0 94870000 74385000 70722000 31958 3252 29946 292061;292062;292063;292064;292065;292066 372835;372836;372837;372838;372839;372840 372837 5 MINLSVPDTIDER Unmodified 1501.7446 0.74464352 2066;181 A0A0A0MSQ0;P13797;U3KQI3;P13796;Q5TBN3 PLS3;LCP1 Plastin-3;Plastin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 102.66 102.66 2 0.0031408 105326 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.31 67.419 361400000 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292112;292113;292114;292115;292116;292117;292118;292119;292120;292121;292122;292123 372933;372934;372935;372936;372937;372938;372939;372940;372941;372942;372943;372944 372935 10 MIQDGKGDVTITNDGATILK Unmodified 2089.0725 0.072519601 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 75.805 75.805 2;3 1.7076E-74 76119 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.87 158.99 574720000 0 41922000 0 36864000 57978000 0 69751000 36190000 97503000 0 86058000 73906000 74550000 31966 2573 29952 292124;292125;292126;292127;292128;292129;292130;292131;292132;292133;292134;292135;292136 372945;372946;372947;372948;372949;372950;372951;372952;372953;372954;372955;372956;372957 372950 11 MIQDGKGDVTITNDGATILK Oxidation (M) 2105.0674 0.067434223 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 1 1 1 68.744 68.744 3 0.0062679 69812 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.187 40.186 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31967 2573 29952 292137 372958 372958 2022 1 MIQVYFPK Unmodified 1024.5416 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372979;372980;372981;372982;372983;372984;372985;372986;372987;372988;372989;372990;372991;372992;372993;372994;372995;372996;372997;372998;372999;373000;373001;373002;373003;373004;373005;373006;373007;373008;373009;373010;373011;373012;373013;373014;373015;373016 372986 35 MISDAIPELK Oxidation (M) 1131.5846 0.58456105 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 74.99 74.99 2 0.015359 76928 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.404 51.756 515420000 0 0 0 0 0 0 0 0 145850000 0 197380000 0 172190000 31972 2431 29955 292177;292178;292179 373017;373018;373019;373020 373019 4 MISDLIAGGIQPLQNLSVLK Oxidation (M) 2125.1817 0.18167612 216;1545 A0A0C4DFM0;G3V5T0;G3V4T6;G3V267;H0YJN8;O43708 GSTZ1 Maleylacetoacetate isomerase no no 0 1 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1 2 156.3 156.3 2 1.5226E-23 159214 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.21 125.69 391560000 39124000 0 64180000 35263000 16366000 68255000 0 37926000 24509000 42635000 19778000 0 43522000 31973 216;1545 29956 292180;292181;292182;292183;292184;292185;292186;292187;292188;292189;292190;292191;292192;292193;292194;292195;292196;292197 373021;373022;373023;373024;373025;373026;373027;373028;373029;373030;373031;373032;373033;373034;373035;373036;373037;373038 373032 133 18 MISDLIAGGIQPLQNLSVLK Unmodified 2109.1868 0.1867615 216;1545 A0A0C4DFM0;G3V5T0;G3V4T6;G3V267;H0YJN8;O43708 GSTZ1 Maleylacetoacetate isomerase no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 2 1 1 1 2 2 1 160.03 160.03 2;3 9.6675E-09 162022 QUIQUE_C1563_190116_001 137.62 115.09 1873700000 148200000 59819000 267450000 133460000 105780000 166760000 144510000 83820000 116950000 119360000 232120000 147270000 148210000 31974 216;1545 29956 292198;292199;292200;292201;292202;292203;292204;292205;292206;292207;292208;292209;292210;292211;292212;292213;292214;292215;292216 373039;373040;373041;373042;373043;373044;373045;373046;373047;373048;373049;373050;373051;373052;373053;373054;373055;373056;373057;373058;373059;373060 373048 21 MISEGLDPDLLERPDAPVPDGESEK Unmodified 2708.2851 0.28509115 996 F5GZ97;Q9Y3C0;H0YGN0 CCDC53 WASH complex subunit CCDC53 yes no 0 0 1 1 111.55 111.55 3 0.0016376 115427 QUIQUE_C1218_190116_001 39.893 28.644 45971000 45971000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31975 996 29957 292217 373061 373061 1 MISEIDKEGTGK Unmodified 1306.6439 0.64386684 2433 P41208 CETN2 Centrin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.96 21.96 2 0.0019784 14966 QUIQUE_C1368_190116_001 115.7 57.103 186230000 30559000 35148000 44827000 22218000 0 21116000 32361000 0 0 0 0 0 0 31976 2433 29958 292218;292219;292220;292221;292222;292223;292224;292225 373062;373063;373064;373065;373066;373067;373068;373069 373064 8 MISGMYLGEIVR Oxidation (M) 1383.689 0.6890429 2146 P19367;E9PB90;P52789;P52790 HK1;HK2;HK3 Hexokinase-1;Hexokinase;Hexokinase-2;Hexokinase-3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.82 96.82 2 0.00093092 98837 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.134 47.782 1172700000 138420000 0 0 142410000 0 98164000 0 139960000 0 69903000 215660000 220350000 147820000 31977 2146 29959 292226;292227;292228;292229;292230;292231;292232;292233 373070;373071;373072;373073;373074;373075;373076;373077 373073 1493;1494 8 MISGMYLGEIVR Unmodified 1367.6941 0.69412828 2146 P19367;E9PB90;P52789;P52790 HK1;HK2;HK3 Hexokinase-1;Hexokinase;Hexokinase-2;Hexokinase-3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 112.36 112.36 2 0.00052508 115766 QUIQUE_C1277_190116_001 97.813 89.281 4999700000 695310000 781550000 891120000 957560000 507310000 0 0 0 0 107340000 546830000 0 512690000 31978 2146 29959 292234;292235;292236;292237;292238;292239;292240;292241;292242 373078;373079;373080;373081;373082;373083;373084;373085;373086;373087;373088 373079 9 MISGMYLGEIVR 2 Oxidation (M) 1399.684 0.68395752 2146 P19367;E9PB90;P52789;P52790 HK1;HK2;HK3 Hexokinase-1;Hexokinase;Hexokinase-2;Hexokinase-3 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.609 86.609 2 0.0025394 87856 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.513 35.914 438590000 0 34116000 0 26860000 0 36148000 0 47345000 0 39552000 94793000 86554000 73226000 31979 2146 29959 292243;292244;292245;292246;292247;292248;292249;292250 373089;373090;373091;373092;373093;373094;373095;373096;373097;373098;373099;373100 373098 1493;1494 12 MISLSYSR Unmodified 955.4797 0.47970205 1516 O43242 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 58.007 58.007 2 0.0064687 56746 QUIQUE_C1277_190116_001 101.64 82.861 134630000 26737000 32729000 0 22733000 0 0 0 0 19646000 0 32780000 0 0 31980 1516 29960 292251;292252;292253;292254;292255;292256;292257 373101;373102;373103;373104;373105;373106;373107 373102 7 MISVNIFR Unmodified 978.53207 0.53207197 3119 Q15173;E9PNY3;E9PQN5 PPP2R5B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform yes no 0 0 0 1 1 96.93 96.93 2 0.049953 99222 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.975 20.42 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31981 3119 29961 292258;292259 373108;373109 373109 2 MITEHTSNDPYCFVEFYEHR Unmodified 2574.0944 0.09439403 2852 Q01085;E7ETJ9;E7ETC0;A6NKZ9 TIAL1 Nucleolysin TIAR yes no 0 0 0 1 1 104.21 104.21 4 0.00096706 106871 QUIQUE_C1403_190116_001 36.805 33.001 34162000 0 16199000 0 17963000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31982 2852 29962 292260;292261 373110;373111;373112 373112 3 MITIDGK Unmodified 776.41023 0.4102255 2707 P61019;E9PKL7;H0YD31;A0A1D5RMT4 RAB2A Ras-related protein Rab-2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.683 34.683 2 0.035447 31033 QUIQUE_C1218_190116_001 86.866 61.308 680900000 124050000 0 0 0 0 0 224160000 0 0 0 194680000 138010000 0 31983 2707 29963 292262;292263;292264;292265 373113;373114;373115;373116 373113 4 MITLITEQLQK Acetyl (Protein N-term) 1358.7479 0.74793799 818 D6RE00;Q9NYF3 FAM53C Protein FAM53C yes no 1 0 0 1 1 169.51 169.51 2 0.0012603 172484 QUIQUE_C1403_190116_001 77.677 46.148 6298500 0 0 0 4333900 0 1964600 0 0 0 0 0 0 0 31984 818 29964 292266;292267 373117;373118 373117 2 MITSAAGIISLLDEDEPQLK Unmodified 2143.1082 0.10823641 3954 Q99460;C9J9M4;F8WCE3 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 159.14 159.14 2;3 0.00065249 164572 QUIQUE_C1218_190116_001 91.307 75.778 360780000 125140000 119300000 28303000 0 32245000 0 0 0 0 0 29462000 26332000 0 31985 3954 29965 292268;292269;292270;292271;292272;292273;292274;292275 373119;373120;373121;373122;373123;373124;373125;373126 373120 7 MITSAAGIISLLDEDEPQLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2201.1137 0.11371571 3954 Q99460;C9J9M4;F8WCE3 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.1 172.1 2 2.7278E-30 174794 QUIQUE_C1403_190116_001 145.71 115.65 182700000 12567000 14583000 15139000 30384000 17616000 47457000 39063000 0 0 5889800 0 0 0 31986 3954 29965 292276;292277;292278;292279;292280;292281;292282;292283;292284 373127;373128;373129;373130;373131;373132;373133;373134;373135 373130 2788 9 MITSAAGIISLLDEDEPQLK Acetyl (Protein N-term) 2185.1188 0.11880109 3954 Q99460;C9J9M4;F8WCE3 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 177.25 177.25 2 2.7042E-39 181099 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.33 177.03 256640000 18244000 22400000 19944000 0 24581000 22335000 19471000 19663000 25043000 0 43189000 26055000 15712000 31987 3954 29965 292285;292286;292287;292288;292289;292290;292291;292292;292293;292294;292295 373136;373137;373138;373139;373140;373141;373142;373143;373144;373145;373146;373147;373148;373149;373150 373147 15 MITSAAGIISLLDEDEPQLK Oxidation (M) 2159.1032 0.10315103 3954 Q99460;C9J9M4;F8WCE3 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 152.73 152.73 2 1.9274E-116 157828 QUIQUE_DMIX3_190116_001 214.65 196.06 169440000 0 0 0 0 0 0 0 0 30157000 0 37188000 61158000 40941000 31988 3954 29965 292296;292297;292298;292299;292300;292301 373151;373152;373153;373154;373155;373156;373157 373153 2788 7 MITVVYGPDLVNISHLNLVAFQEEVAK Oxidation (M) 3014.5787 0.5786944 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7;A0A0D9SFJ4 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 1 0 1 1 157.46 157.46 3 4.2252E-13 161205 QUIQUE_C1277_190116_001 73.805 60.398 132380000 31996000 100380000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31989 4250 29966 292302;292303 373158;373159 373159 2891 2 MITVVYGPDLVNISHLNLVAFQEEVAK Unmodified 2998.5838 0.58377978 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;A0A1B0GVC1;B1AK73;A0A0D9SFE7;A0A0D9SFJ4 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 160.3 160.3 3 7.9013E-65 167445 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.35 146.05 359680000 0 29581000 48346000 0 0 0 70861000 0 49983000 0 57494000 103420000 0 31990 4250 29966 292304;292305;292306;292307;292308;292309 373160;373161;373162;373163;373164;373165;373166 373165 7 MIVDPVEPHGEMK Unmodified 1480.7054 0.70542124 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 50.087 50.087 2;3 0.0021014 47210 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292374;292375;292376;292377;292378;292379;292380;292381;292382;292383;292384;292385 373235;373236;373237;373238;373239;373240;373241;373242;373243;373244;373245;373246 373245 9 MKEIAEAYLGGK Oxidation (M) 1324.6697 0.66968766 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 1 1 1 1 37.215 37.215 2 6.7199E-05 33323 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.3 76.706 65463000 0 0 0 0 0 0 0 0 65463000 0 0 0 0 32005 2643 29978 292386;292387 373247;373248 373247 2083 2 MKEIAEAYLGK Unmodified 1251.6533 0.65330932 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 2 1 2 2 1 48.618 48.618 2;3 0.0015032 46778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.492 46.969 9303500000 274800000 361040000 0 273170000 0 188860000 0 1348700000 1435900000 67174000 2583400000 1636000000 1134400000 32006 2010 29979 292388;292389;292390;292391;292392;292393;292394;292395;292396;292397;292398;292399;292400;292401;292402 373249;373250;373251;373252;373253;373254;373255;373256;373257;373258;373259;373260;373261;373262;373263;373264;373265 373256 15 MKEIAEAYLGK Oxidation (M) 1267.6482 0.64822394 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 35.592 35.592 2;3 0.004061 32024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.625 69.009 3000600000 0 0 220490000 143900000 128680000 174790000 210500000 418870000 473720000 71297000 632090000 228230000 298050000 32007 2010 29979 292403;292404;292405;292406;292407;292408;292409;292410;292411;292412;292413;292414;292415;292416;292417;292418;292419 373266;373267;373268;373269;373270;373271;373272;373273;373274;373275;373276;373277;373278;373279;373280;373281;373282;373283 373275 1310 12 MKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQR Unmodified 3259.6224 0.62235013 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 146.95 146.95 2;3;4 2.0413E-36 153902 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.85 153.32 3601800000 49876000 106840000 0 75373000 168020000 44208000 195060000 406110000 561990000 0 974630000 554060000 465590000 32008 282 29980 292420;292421;292422;292423;292424;292425;292426;292427;292428;292429;292430;292431;292432 373284;373285;373286;373287;373288;373289;373290;373291;373292;373293;373294;373295;373296;373297;373298;373299;373300;373301 373297 16 MKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQR Oxidation (M) 3275.6173 0.61726475 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 143.16 143.16 3 7.8562E-13 148020 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.126 62.888 604910000 0 0 0 0 79738000 0 74829000 0 135580000 54236000 0 143570000 116960000 32009 282 29980 292433;292434;292435;292436;292437;292438 373302;373303;373304;373305;373306;373307;373308;373309 373309 211 8 MKELSQDSTGR Unmodified 1250.5925 0.59249998 2613 P52788;H7C2R7 SMS Spermine synthase yes no 0 0 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292451;292452;292453;292454;292455;292456;292457;292458;292459;292460 373322;373323;373324;373325;373326;373327;373328;373329;373330;373331 373329 7 MKETAEAYLGK Oxidation (M) 1255.6118 0.61183843 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 1 1 1 1 22.65 22.65 2 0.013949 16165 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.189 54.318 95251000 0 0 0 0 0 0 0 0 56214000 0 0 39037000 0 32013 2007 29983 292461;292462 373332;373333 373332 2 MKETAEAYLGKK Unmodified 1367.7119 0.71188683 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 2 1 1 1 19.67 19.67 3 0.0092466 12961 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.8 58.101 228500000 0 0 0 0 0 0 0 68082000 0 0 0 79821000 80599000 32014 2007 29984 292463;292464;292465 373334;373335;373336 373334 3 MKETAENYLGHTAK Unmodified 1591.7664 0.7664416 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 21.13 21.13 2;3;4 2.1187E-17 14708 QUIQUE_C1218_190116_001 157.5 121.84 1939100000 70114000 71303000 145580000 0 58523000 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initiation factor 3 subunit I yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.735 21.735 3 0.0081106 14553 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.036 63.115 456200000 124170000 69874000 83869000 77499000 0 40649000 0 0 0 0 60142000 0 0 32023 2988 29991 292518;292519;292520;292521;292522;292523 373390;373391;373392;373393;373394;373395 373395 5 MKPILLQGHER Oxidation (M) 1336.7285 0.72853995 2988 Q13347;Q5TFK1 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes no 0 1 1 1 1 15.999 15.999 3 0.027813 8491 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.875 38.997 78398000 0 0 0 0 0 0 0 44132000 0 34266000 0 0 0 32024 2988 29991 292524;292525 373396;373397 373396 1 MKPLDGSALYTGSALDFVR Unmodified 2040.035 0.035011883 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 123.19 123.19 3 0.014169 129434 QUIQUE_C1438_190116_001 50.883 41.719 49451000 0 0 0 0 49451000 0 0 0 0 0 0 0 0 32025 2037 29992 292526 373398 373398 0 MKPLMGVIYVPLTDK Oxidation (M) 1719.9303 0.9303358 150 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373797;373798;373799;373800;373801;373802;373803;373804;373805;373806;373807;373808;373809;373810;373811;373812;373813;373814;373815;373816;373817;373818;373819;373820;373821;373822;373823;373824 373812 28 MLDAEDIVGTLRPDEK Oxidation (M) 1816.8877 0.88767894 1313 K7EJH8 ACTN4 yes yes 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 100.95 100.95 2;3 7.2285E-06 103991 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.69 97.316 659630000 65701000 0 60514000 0 0 0 0 87501000 119020000 59543000 101050000 87747000 78559000 32057 1313 30016 292878;292879;292880;292881;292882;292883;292884;292885;292886;292887;292888;292889 373825;373826;373827;373828;373829;373830;373831;373832;373833;373834;373835;373836 373829 746 7 MLDAEDIVNTARPDEK Unmodified 1815.8673 0.86727785 1544 O43707 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 86.252 86.252 2;3 1.2656E-43 89095 QUIQUE_C1218_190116_001 218.85 194 1255800000 31857000 269390000 30498000 32363000 289920000 0 196680000 101760000 0 0 167220000 136110000 0 32058 1544 30017 292890;292891;292892;292893;292894;292895;292896;292897;292898;292899;292900 373837;373838;373839;373840;373841;373842;373843;373844;373845;373846;373847 373837 10 MLDAQVQTDPVSIGPVGK Unmodified 1853.9557 0.95569893 1123 H0Y542;O75363;H7C1E7;G3XAF7 BCAS1 Breast carcinoma-amplified sequence 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.987 95.987 2 3.6361E-24 98288 QUIQUE_C1277_190116_001 148.68 121.97 319300000 55206000 69190000 33239000 0 38930000 0 41795000 0 0 11340000 40052000 29547000 0 32059 1123 30018 292901;292902;292903;292904;292905;292906;292907;292908 373848;373849;373850;373851;373852;373853;373854;373855 373849 8 MLDEMKDNLLLDMYLAPHVR Unmodified 2416.1953 0.19529405 721 C9JFE4;Q13098;A0A096LP07;A0A096LPJ3;A8K070 GPS1 COP9 signalosome complex subunit 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 139.33 139.33 3;4 3.0169E-09 144202 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.9 97.584 595230000 29398000 28819000 43276000 22178000 0 19882000 39094000 63863000 102650000 0 141500000 55750000 48819000 32060 721 30019 292909;292910;292911;292912;292913;292914;292915;292916;292917;292918;292919;292920;292921 373856;373857;373858;373859;373860;373861;373862;373863;373864;373865;373866;373867;373868;373869;373870;373871;373872;373873 373866 17 MLDFFTIFSK Unmodified 1247.626 0.62603194 1939 P08240 SRPR Signal recognition particle receptor subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 162.79 162.79 2 0.027126 166670 QUIQUE_DMIX7_190116_001 55.461 36.681 12450000 5114200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7335900 0 32061 1939 30020 292922;292923 373874;373875 373875 2 MLDLYSQISSVPIGYSHPALLK Unmodified 2431.2821 0.28211845 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 138.07 138.07 2;3 1.0583E-10 142261 QUIQUE_C1403_190116_001 134.9 121.48 14059000000 1056600000 1115600000 1399900000 735190000 740300000 748340000 1062200000 1086000000 1420000000 175680000 1713900000 1358600000 1446800000 32062 1198 30021 292924;292925;292926;292927;292928;292929;292930;292931;292932;292933;292934;292935;292936;292937;292938;292939;292940;292941;292942;292943;292944;292945;292946;292947;292948 373876;373877;373878;373879;373880;373881;373882;373883;373884;373885;373886;373887;373888;373889;373890;373891;373892;373893;373894;373895;373896;373897;373898;373899;373900;373901;373902;373903 373885 28 MLDLYSQISSVPIGYSHPALLK Oxidation (M) 2447.277 0.27703307 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 131.98 131.98 2;3 1.2598E-05 136526 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.909 79.18 1746800000 0 0 358020000 0 0 352750000 311800000 378440000 0 0 345770000 0 0 32063 1198 30021 292949;292950;292951;292952;292953;292954 373904;373905;373906;373907;373908;373909 373908 686 5 MLDMGFEPQIR Oxidation (M) 1351.6264 0.62644264 381;266;1504;1290 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ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.27 106.27 2 0.00044352 109987 QUIQUE_C1368_190116_001 104.17 75.768 2157100000 193200000 244640000 269490000 215310000 161630000 152150000 164460000 87596000 133000000 0 230740000 160690000 144140000 32065 266;1504;1290;381 30022 292960;292961;292962;292963;292964;292965;292966;292967;292968;292969;292970;292971 373915;373916;373917;373918;373919;373920;373921;373922;373923;373924;373925;373926;373927;373928 373918 14 MLDMGFEPQIR 2 Oxidation (M) 1367.6214 0.62135726 381;266;1504;1290 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A2R8YDH3;O15523;J3KTA4;P17844;J3KRZ1;J3QSF1;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX3X;DDX3Y;DDX5;DDX17 ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 2 0 1 1 70.78 70.78 2 0.0058992 70361 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.213 52.84 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32066 266;1504;1290;381 30022 292972;292973 373929;373930 373930 153;154 2 MLDNLGYR Oxidation (M) 996.46987 0.46986564 854;2382 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2;H0Y9H2;P35612 ADD1;ADD2 Alpha-adducin;Beta-adducin no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 40.666 40.666 1;2 0.0043491 37214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.08 94.367 1320800000 126710000 117570000 140980000 111950000 0 0 90182000 119410000 225060000 88114000 0 141230000 159640000 32067 854;2382 30023 292974;292975;292976;292977;292978;292979;292980;292981;292982;292983;292984 373931;373932;373933;373934;373935;373936;373937;373938;373939;373940;373941;373942 373938 501 12 MLDNLGYR Unmodified 980.47495 0.47495102 854;2382 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2;H0Y9H2;P35612 ADD1;ADD2 Alpha-adducin;Beta-adducin no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 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373989 12 MLEILEGK Unmodified 931.50485 0.50485417 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 78.612 78.612 2 0.030205 80746 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.169 30.468 40923000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40923000 0 0 32076 798 30030 293032 374001 374001 1 MLELVAQK Unmodified 930.52084 0.52083858 942 E9PJ81;E9PRQ7;Q04323 UBXN1 UBX domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 2 51.724 51.724 2 0.05041 50079 QUIQUE_C1277_190116_001 73.616 38.724 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32077 942 30031 293033;293034;293035 374002;374003;374004 374002 3 MLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFR Oxidation (M) 3012.4685 0.46849202 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 1 1 1 2 1 2 1 3 2 2 1 1 120.64 120.64 3;4 2.304E-36 124037 QUIQUE_DMIX7_190116_001 125.58 107.02 1760600000 145940000 0 85053000 0 50269000 120230000 90528000 230040000 421410000 0 356160000 108300000 152640000 32078 3051 30032 293036;293037;293038;293039;293040;293041;293042;293043;293044;293045;293046;293047;293048;293049;293050;293051 374005;374006;374007;374008;374009;374010;374011;374012;374013;374014;374015;374016;374017;374018;374019;374020;374021;374022;374023;374024;374025;374026;374027 374024 2488;2489 23 MLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFR Unmodified 2996.4736 0.4735774 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 3 2 2 2 2 1 3 2 3 126.75 126.75 2;3;4 3.0506E-93 130976 QUIQUE_DMIX3_190116_001 176.84 167.99 15848000000 557930000 1031300000 1062000000 984280000 1178000000 774920000 1442300000 1248600000 1619800000 165320000 2463200000 1752500000 1567800000 32079 3051 30032 293052;293053;293054;293055;293056;293057;293058;293059;293060;293061;293062;293063;293064;293065;293066;293067;293068;293069;293070;293071;293072;293073;293074;293075;293076;293077;293078 374028;374029;374030;374031;374032;374033;374034;374035;374036;374037;374038;374039;374040;374041;374042;374043;374044;374045;374046;374047;374048;374049;374050;374051;374052;374053;374054;374055;374056;374057;374058;374059;374060;374061;374062;374063;374064;374065;374066;374067;374068;374069 374053 42 MLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFR 2 Oxidation (M) 3028.4634 0.46340664 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 2 1 1 108.39 108.39 3 6.6969E-08 110395 QUIQUE_C1563_190116_001 63.122 57.027 30529000 0 0 0 0 0 30529000 0 0 0 0 0 0 0 32080 3051 30032 293079 374070 374070 2488;2489 1 MLENIFLPLFK Unmodified 1363.7574 0.75738046 2853 Q01432;E9PKC5 AMPD3 AMP deaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.18 161.18 2 0.0024377 165834 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.649 64.487 258220000 0 0 22544000 25632000 18727000 18902000 35237000 20651000 25123000 0 31508000 30172000 29728000 32081 2853 30033 293080;293081;293082;293083;293084;293085;293086;293087;293088;293089 374071;374072;374073;374074;374075;374076;374077;374078;374079;374080;374081 374077 11 MLENIFLPLFK Oxidation (M) 1379.7523 0.75229508 2853 Q01432;E9PKC5 AMPD3 AMP deaminase 3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 153.54 153.54 2 0.0015162 156441 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.308 62.385 98457000 0 0 0 12471000 0 0 9833300 14776000 18737000 11382000 15460000 15795000 0 32082 2853 30033 293090;293091;293092;293093;293094;293095;293096 374082;374083;374084;374085;374086;374087;374088;374089 374084 2322 8 MLEQLDMR Unmodified 1034.4889 0.48888653 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;A0A140T9X9;A0A140T996;F6UJC5;A0A140TA18;A0A140T973;A0A140T9K1;A0A140T9L4 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.301 66.301 2 0.0036666 65928 QUIQUE_C1368_190116_001 125.25 80.641 1859000000 257590000 253290000 222440000 192680000 181140000 174180000 0 79340000 89947000 27678000 145340000 112770000 122590000 32083 3027 30034 293097;293098;293099;293100;293101;293102;293103;293104;293105;293106;293107;293108 374090;374091;374092;374093;374094;374095;374096;374097;374098;374099;374100;374101;374102;374103 374092 14 MLEQLDMRR Unmodified 1190.59 0.58999756 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;A0A140T9X9;A0A140T996;F6UJC5;A0A140TA18;A0A140T973;A0A140T9K1;A0A140T9L4 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 1 1 48.169 48.169 3 0.0121 45252 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.224 32.712 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32084 3027 30035 293109 374104 374104 1 MLEVFHAIK Unmodified 1086.5896 0.58958685 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 65.789 65.789 2;3 0.0045428 64194 QUIQUE_C1563_190116_001 57.59 35.597 457220000 39775000 51673000 28145000 37888000 39829000 28889000 35612000 33040000 25055000 15751000 33661000 49902000 37999000 32085 2629 30036 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MLFWACSTNKPEGYR Unmodified 1858.8495 0.84945972 3822 Q96CS3 FAF2 FAS-associated factor 2 yes yes 0 0 1 1 82.152 82.152 3 0.029047 83116 QUIQUE_C1403_190116_001 34.191 27.463 20099000 0 0 0 20099000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32088 3822 30039 293135 374132 374132 1 MLFYSFFK Oxidation (M) 1097.5256 0.52558961 4578 Q9Y333 LSM2 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2 yes yes 0 1 0 1 123.39 123.39 2 0.024006 127456 QUIQUE_C1277_190116_001 77.058 47.909 9883900 0 9883900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32089 4578 30040 293136 374133 374133 1 MLFYSFFK Unmodified 1081.5307 0.53067499 4578 Q9Y333 LSM2 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2 yes yes 0 0 0 1 137.85 137.85 2 0.042452 133969 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.252 40.329 6339400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6339400 0 0 0 32090 4578 30040 293137 374134 374134 1 MLGAVEGPR Acetyl (Protein N-term) 970.4906 0.49060109 3039 Q14012;C9JES6;F8W6S9 CAMK1 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.239 97.239 2 0.0026634 99330 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NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 1 2 1 27.417 27.417 3 0.060174 21504 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.871 48.965 71077000 0 0 0 0 0 0 0 71077000 0 0 0 0 0 32113 959 30058 293276 374285 374285 1 MLHDYIGDKDFKK Unmodified 1608.797 0.79701344 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2;E9PJ74;E9PRQ5 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 2 1 31.195 31.195 2 0.011663 26284 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.63 90.943 31106000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31106000 32114 959 30058 293277 374286 374286 1 MLHVDPHQR Unmodified 1131.5607 0.56074634 982;2594 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5;P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17;A0A2R8Y603 RPS6KA2;RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2;Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.527 14.527 3 0.0027751 6989 QUIQUE_C1218_190116_001 66.621 53.665 312140000 30476000 51323000 11735000 33002000 0 63298000 0 44670000 38232000 0 0 39402000 0 32115 982;2594 30059 293278;293279;293280;293281;293282;293283;293284;293285 374287;374288;374289;374290;374291;374292;374293;374294 374287 8 MLIDAQAEAAEQLGK Unmodified 1586.7974 0.79740737 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 1 1 96.548 96.548 2 0.0034162 97941 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.69 67.337 28991000 0 0 0 0 0 0 0 28991000 0 0 0 0 0 32116 2605 30060 293286;293287 374295;374296 374296 2 MLIDAQAEAAEQLGK Oxidation (M) 1602.7923 0.792322 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 82.892 82.892 2 0.0004498 79634 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.69 47.465 152940000 0 0 0 37078000 0 34566000 50157000 0 0 31135000 0 0 0 32117 2605 30060 293288;293289;293290;293291 374297;374298;374299;374300 374300 2065 4 MLILPLIISSLITGLSGLDAK Oxidation (M) 2183.2851 0.28507856 2458;417 P43004;A0A2R8YFE3;A0A2U3TZS7;A0A2R8Y4W1;A0A2R8Y860;A0A2R8YD46;A0A2U3U0E3;A0A2R8YG01;A0A163QEF0;H0YEK4;A0A2R8Y6B8;A0A2R8Y6J5;A0A2R8Y862;A0A2R8Y740;A0A2R8Y5Y1;A0A2R8Y642;C9J9N5;A0A2R8YH93;A0A2R8Y4D1 SLC1A2 Excitatory amino acid transporter 2;Amino acid transporter no no 0 1 0 1 2 183.14 183.14 3 4.4E-10 185877 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.17 95.081 335170000 0 0 0 0 0 0 0 13836000 321330000 0 0 0 0 32118 2458;417 30061 293292;293293;293294 374301;374302;374303 374302 299 1 MLINQHTLLFGGDTNPVHPK Unmodified 2231.1521 0.15210733 3113 Q15120 PDK3 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 87.362 87.362 4 0.044104 83942 QUIQUE_DMIX4_190116_001 21.37 12.661 15664000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15664000 0 0 0 32119 3113 30062 293295 374304 374304 1 MLIPYIEHWPR Unmodified 1453.754 0.75402642 1617 O75208;H3BNT2;H3BPY0 COQ9 Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 111.31 111.31 3 0.0017063 114561 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.685 70.945 133060000 32672000 0 0 0 0 22124000 0 0 0 0 27782000 25960000 24522000 32120 1617 30063 293296;293297;293298;293299;293300;293301;293302;293303;293304;293305;293306 374305;374306;374307;374308;374309;374310;374311;374312;374313;374314;374315 374308 11 MLIPYIEHWPR Oxidation (M) 1469.7489 0.74894104 1617 O75208;H3BNT2;H3BPY0 COQ9 Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 99.036 99.036 3 0.011986 102581 QUIQUE_C1576_190116_001 46.73 25.429 49640000 0 0 0 0 0 19965000 15242000 0 14433000 0 0 0 0 32121 1617 30063 293307;293308;293309 374316;374317;374318 374317 874 1 MLIQILTELEHSGIGR Unmodified 1808.9819 0.9818541 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 150.89 150.89 3 7.7433E-05 158541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.148 77.226 37640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37640000 0 0 32122 2447 30064 293310;293311 374319;374320 374320 2 MLISILTER Unmodified 1074.6107 0.61071622 2045 P12429;D6RA82;D6RFG5;D6RCA8;D6RAZ8 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.94 106.94 2 0.00011524 111665 QUIQUE_C1438_190116_001 143.01 108.2 610040000 43002000 56176000 47316000 37539000 46105000 44456000 36829000 40020000 31598000 18706000 108950000 43809000 55528000 32123 2045 30065 293312;293313;293314;293315;293316;293317;293318;293319;293320;293321;293322;293323;293324 374321;374322;374323;374324;374325;374326;374327;374328;374329;374330;374331;374332;374333;374334;374335;374336 374327 16 MLISSIK Unmodified 790.46226 0.46226107 2286 P29218;H0YBL1;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RG13;E5RIP7;E5RGY4;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 0 1 1 45.692 45.692 2 0.035447 43227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.866 34.635 407930000 0 0 185630000 0 0 0 0 222300000 0 0 0 0 0 32124 2286 30066 293325;293326 374337;374338 374338 2 MLITILGTVKPNANR Unmodified 1639.9443 0.94434638 2131 P17931;G3V3R6 LGALS3 Galectin-3;Galectin yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 88.868 88.868 2;3 7.8816E-24 87226 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.26 134.64 3880300000 191300000 312760000 433020000 285660000 365930000 201090000 223830000 318940000 357830000 113650000 395740000 347120000 333450000 32125 2131 30067 293327;293328;293329;293330;293331;293332;293333;293334;293335;293336;293337;293338;293339;293340;293341;293342;293343;293344 374339;374340;374341;374342;374343;374344;374345;374346;374347;374348;374349;374350;374351;374352;374353;374354;374355;374356;374357;374358;374359;374360 374354 18 MLITILGTVKPNANR Oxidation (M) 1655.9393 0.939261 2131 P17931;G3V3R6 LGALS3 Galectin-3;Galectin yes no 0 1 1 1 2 1 1 75.504 75.504 3 0.0012331 73598 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.889 53.607 272690000 0 0 0 0 0 0 0 0 63197000 54345000 85638000 0 69514000 32126 2131 30067 293345;293346;293347;293348;293349 374361;374362;374363;374364;374365 374363 1466 4 MLLADQGQSWK Oxidation (M) 1291.6231 0.62307182 1957 P09211;A8MX94;A0A087X2E9 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.538 56.538 2 4.8548E-08 53192 QUIQUE_DMIX4_190116_001 152.34 127.42 2052000000 349780000 0 670430000 274330000 0 318140000 0 0 0 316950000 0 0 122380000 32127 1957 30068 293350;293351;293352;293353;293354;293355;293356;293357;293358;293359 374366;374367;374368;374369;374370;374371;374372;374373;374374;374375 374373 1215 10 MLLADQGQSWK Unmodified 1275.6282 0.6281572 1957 P09211;A8MX94;A0A087X2E9 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.503 71.503 2 1.7583E-12 68790 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.32 131.95 13778000000 1764200000 1193700000 1839900000 1680900000 839080000 1517100000 1146400000 322350000 587020000 610240000 1006200000 507220000 763420000 32128 1957 30068 293360;293361;293362;293363;293364;293365;293366;293367;293368;293369;293370;293371;293372 374376;374377;374378;374379;374380;374381;374382;374383;374384;374385;374386;374387;374388;374389;374390;374391;374392;374393;374394;374395 374390 20 MLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLK Oxidation (M) 3006.4645 0.4644525 1957 P09211;A8MX94;A0A087X2E9 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 2 2 2 2 138.88 138.88 2;3;4 8.9536E-264 143540 QUIQUE_DMIX3_190116_001 262.59 247.43 4260900000 119310000 214260000 240320000 179020000 184480000 168510000 204230000 511780000 620790000 141800000 477690000 475890000 722840000 32129 1957 30069 293373;293374;293375;293376;293377;293378;293379;293380;293381;293382;293383;293384;293385;293386;293387;293388;293389;293390;293391;293392;293393 374396;374397;374398;374399;374400;374401;374402;374403;374404;374405;374406;374407;374408;374409;374410;374411;374412;374413;374414;374415;374416;374417;374418;374419;374420;374421;374422;374423 374412 1215 28 MLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLK Unmodified 2990.4695 0.46953788 1957 P09211;A8MX94;A0A087X2E9 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 1 2 3 3 2 2 2 4 6 8 2 5 6 6 146.39 146.39 2;3;4 0 151171 QUIQUE_DMIX5_190116_001 363.8 342.86 15771000000 327900000 497510000 1003600000 599530000 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374424;374425;374426;374427;374428;374429;374430;374431;374432;374433;374434;374435;374436;374437;374438;374439;374440;374441;374442;374443;374444;374445;374446;374447;374448;374449;374450;374451;374452;374453;374454;374455;374456;374457;374458;374459;374460;374461;374462;374463;374464;374465;374466;374467;374468;374469;374470;374471;374472;374473;374474;374475;374476;374477;374478;374479;374480;374481;374482;374483;374484;374485;374486;374487;374488;374489;374490;374491;374492;374493;374494;374495;374496;374497;374498;374499;374500;374501;374502;374503;374504;374505;374506;374507;374508;374509;374510;374511;374512;374513;374514;374515;374516;374517 374494 92 MLLCEAVAAVMAK Unmodified 1405.7131 0.71314916 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 141.18 141.18 2 0.00073643 146884 QUIQUE_C1218_190116_001 103.7 81.059 395110000 38356000 46792000 0 38894000 0 45220000 46130000 38599000 36408000 18528000 50212000 0 35974000 32131 2638 30070 293445;293446;293447;293448;293449;293450;293451;293452;293453;293454;293455;293456;293457 374518;374519;374520;374521;374522;374523;374524;374525;374526;374527;374528;374529;374530 374518 11 MLLDIFDENLHPLSK Unmodified 1783.9179 0.91785686 3635 Q8ND76 CCNY Cyclin-Y yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.83 138.83 3 8.3199E-07 143279 QUIQUE_C1277_190116_001 91.712 80.667 578200000 70079000 83522000 61505000 56732000 0 51044000 45730000 29115000 33127000 10081000 54189000 35232000 47843000 32132 3635 30071 293458;293459;293460;293461;293462;293463;293464;293465;293466;293467;293468;293469 374531;374532;374533;374534;374535;374536;374537;374538;374539;374540;374541;374542;374543;374544;374545 374533 15 MLLDPMGGIVMTNDGNAILR Unmodified 2130.0636 0.063551594 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;Q5SZX9;Q5SZX6 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 150.28 150.28 2;3 3.4858E-87 156159 QUIQUE_C1218_190116_001 196.84 182.58 1706700000 186920000 154300000 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alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 144.68 144.68 2;3 0.00076329 151111 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.288 68.284 847450000 48818000 57425000 54021000 34322000 78593000 26128000 62820000 31533000 65352000 23179000 185530000 123970000 55759000 32135 3867 30074 293499;293500;293501;293502;293503;293504;293505;293506;293507;293508;293509;293510;293511;293512;293513;293514;293515;293516;293517 374577;374578;374579;374580;374581;374582;374583;374584;374585;374586;374587;374588;374589;374590;374591;374592;374593;374594;374595 374590 19 MLLLEILHEIK Oxidation (M) 1366.7894 0.78940887 3867 Q96HE7;G3V2H0 ERO1L ERO1-like protein alpha yes no 0 1 0 1 1 1 1 129.35 129.35 3 0.0015827 134905 QUIQUE_C1576_190116_001 68.132 54.728 31541000 0 0 0 0 0 0 19626000 0 11914000 0 0 0 0 32136 3867 30074 293518;293519;293520;293521 374596;374597;374598;374599 374598 2757 4 MLLNDFLNDQNR Unmodified 1491.714 0.7140121 2858 Q01581 HMGCS1 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 122.71 122.71 2 0.0061253 127563 QUIQUE_C1218_190116_001 80.688 70.684 98463000 31658000 0 0 49024000 0 0 0 0 0 17781000 0 0 0 32137 2858 30075 293522;293523;293524 374600;374601;374602 374600 3 MLLNDFLNDQNR Oxidation (M) 1507.7089 0.70892672 2858 Q01581 HMGCS1 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 1 104.87 104.87 2 0.0085755 107233 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.294 63.701 16926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16926000 0 0 0 32138 2858 30075 293525;293526 374603;374604 374604 2330 1 MLLNLSENPAVAK Unmodified 1398.7541 0.754086 3828 Q96D09 GPRASP2 G-protein coupled receptor-associated sorting protein 2 yes yes 0 0 0 1 90.64 90.64 2 0.051232 93064 QUIQUE_C1218_190116_001 43.308 20.568 15256000 15256000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32139 3828 30076 293527 374605 374605 1 MLLNQHSLLFGGK Unmodified 1456.7861 0.78605483 3111 Q15118;C9JKT3;C9IYB4 PDK1 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 87.47 87.47 3 0.0021018 89220 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374623;374624;374625;374626;374627;374628;374629;374630;374631;374632;374633;374634;374635;374636;374637;374638;374639;374640;374641;374642 374627 20 MLLSPDQK Oxidation (M) 946.47937 0.4793677 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 24.248 24.248 1;2 0.0042727 18682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.89 80.076 1003200000 0 0 93639000 0 75932000 49443000 80630000 101380000 202950000 68448000 122460000 106930000 101400000 32146 3093 30082 293556;293557;293558;293559;293560;293561;293562;293563;293564;293565;293566 374643;374644;374645;374646;374647;374648;374649;374650;374651;374652;374653 374647 2547 11 MLLVDELR Unmodified 987.5423 0.54230231 2134 P18085;C9JAK5;C9JPM4;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.885 96.885 2 0.00029504 99549 QUIQUE_C1277_190116_001 160.03 85.31 1481200000 149500000 128990000 169730000 143410000 77333000 155550000 140790000 41239000 103170000 49830000 143120000 73946000 104570000 32147 2134 30083 293567;293568;293569;293570;293571;293572;293573;293574;293575;293576;293577;293578;293579 374654;374655;374656;374657;374658;374659;374660;374661;374662;374663;374664;374665;374666;374667;374668;374669;374670;374671;374672 374656 19 MLLVDELR Oxidation (M) 1003.5372 0.53721693 2134 P18085;C9JAK5;C9JPM4;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 1 0 1 1 1 77.125 77.125 2 0.014292 78430 QUIQUE_C1438_190116_001 89.142 28.784 71114000 0 0 0 0 28892000 28128000 0 0 0 14094000 0 0 0 32148 2134 30083 293580;293581;293582 374673;374674;374675 374673 1475 3 MLLVDELRDAVLLLFANK Oxidation (M) 2088.1653 0.16529777 2134 P18085;C9JAK5;C9JPM4;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 1 1 1 1 174.84 174.84 3 0.00026554 181958 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.526 72.43 54639000 0 0 0 0 0 0 0 0 37083000 0 17556000 0 0 32149 2134 30084 293583;293584 374676;374677 374677 1475 2 MLLYTEVTR Oxidation (M) 1140.5849 0.5848954 2560;2328;3300 P31150;G5E9U5;P50395;V9GYF8;Q5SX90;V9GYJ7;Q5SX86 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53.706 166550000 0 0 31224000 28533000 21460000 16726000 20136000 18279000 15897000 0 0 14299000 0 32158 2194 30090 293638;293639;293640;293641;293642;293643;293644;293645 374763;374764;374765;374766;374767;374768;374769;374770 374768 8 MLNYQGLQR Unmodified 1121.5652 0.56516301 2649 P54803;A0A087WX10;G3V255 GALC Galactocerebrosidase yes no 0 0 0 1 53.055 53.055 2 0.0086479 50909 QUIQUE_C1277_190116_001 95.541 76.447 38505000 0 38505000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32159 2649 30091 293646 374771 374771 1 MLPELFQDDEK Unmodified 1363.633 0.63296781 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 98.657 98.657 2 0.026794 101432 QUIQUE_C1277_190116_001 52.549 40.502 59207000 0 59207000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32160 4607 30092 293647 374772 374772 1 MLPSFVR Oxidation (M) 864.45276 0.45275902 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.302 56.302 2 0.042583 54702 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.512 41.567 1160400000 0 104150000 0 0 75567000 0 91933000 136980000 119000000 95117000 187740000 203860000 146000000 32161 2146 30093 293648;293649;293650;293651;293652;293653;293654;293655;293656 374773;374774;374775;374776;374777;374778;374779;374780;374781;374782;374783;374784 374776 12 MLPSFVR Unmodified 848.45784 0.4578444 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 65.008 65.008 2 0.026322 64819 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.163 41.48 1701500000 0 0 433500000 438810000 244710000 348950000 0 0 235570000 0 0 0 0 32162 2146 30093 293657;293658;293659;293660;293661 374785;374786;374787;374788;374789;374790;374791 374791 7 MLPTFVR Oxidation (M) 878.46841 0.46840908 2146 P19367;B1AR63;B1AR62;E9PB90;P52789;Q2TB90;P52790 HK1;HK2;HKDC1;HK3 Hexokinase-1;Hexokinase;Hexokinase-2;Putative hexokinase HKDC1;Hexokinase-3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.331 56.331 2 0.024402 54750 QUIQUE_C1368_190116_001 107.74 53.219 817930000 94947000 91911000 96554000 102000000 79728000 74057000 0 0 0 85787000 192940000 0 0 32163 2146 30094 293662;293663;293664;293665;293666;293667;293668;293669 374792;374793;374794;374795;374796;374797;374798;374799 374794 8 MLPTFVR Unmodified 862.47349 0.47349446 2146 P19367;B1AR63;B1AR62;E9PB90;P52789;Q2TB90;P52790 HK1;HK2;HKDC1;HK3 Hexokinase-1;Hexokinase;Hexokinase-2;Putative hexokinase HKDC1;Hexokinase-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.628 65.628 2 0.019803 62925 QUIQUE_DMIX4_190116_001 122.15 65.644 4247000000 0 573970000 554520000 510820000 363420000 0 543700000 0 255580000 108310000 465590000 440280000 430780000 32164 2146 30094 293670;293671;293672;293673;293674;293675;293676;293677;293678;293679 374800;374801;374802;374803;374804;374805;374806;374807;374808;374809 374806 10 MLPTIIADNAGYDSADLVAQLR Unmodified 2346.1889 0.18894634 2810 P78371;F5GWF6 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 2 2 3 2 3 2 2 2 3 2 2 2 2 149.78 149.78 2;3 5.7039E-20 153905 QUIQUE_C1403_190116_001 148.72 128.34 3374200000 231310000 257510000 316270000 259230000 276100000 191450000 303670000 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293709;293710;293711;293712;293713;293714;293715;293716;293717;293718;293719;293720;293721;293722;293723 374854;374855;374856;374857;374858;374859;374860;374861;374862;374863;374864;374865;374866;374867;374868;374869 374859 2259 15 MLQEDELR Unmodified 1032.491 0.49099502 2828 P84085 ARF5 ADP-ribosylation factor 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.143 40.143 2 0.0018048 36777 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.28 80.299 736180000 0 90078000 109070000 93016000 33417000 84132000 74851000 0 34375000 33071000 91298000 38034000 54838000 32167 2828 30096 293724;293725;293726;293727;293728;293729;293730;293731;293732;293733;293734 374870;374871;374872;374873;374874;374875;374876;374877;374878;374879;374880 374878 10 MLQEDELRDAVLLVFANK Unmodified 2103.1034 0.1034258 2828 P84085 ARF5 ADP-ribosylation factor 5 yes yes 0 0 1 2 4 5 3 4 2 154.41 154.41 2;3;4 2.3306E-23 163534 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.44 132.37 973630000 0 0 0 0 0 0 73331000 194640000 248610000 0 129500000 161810000 165750000 32168 2828 30097 293735;293736;293737;293738;293739;293740;293741;293742;293743;293744;293745;293746;293747;293748;293749;293750;293751;293752;293753;293754 374881;374882;374883;374884;374885;374886;374887;374888;374889;374890;374891;374892;374893;374894;374895;374896;374897;374898;374899;374900;374901 374890 21 MLQEDELRDAVLLVFANK Oxidation (M) 2119.0983 0.098340421 2828 P84085 ARF5 ADP-ribosylation factor 5 yes yes 0 1 1 1 153.91 153.91 3 0.0019775 156629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.307 40.488 29423000 0 0 0 0 0 0 0 29423000 0 0 0 0 0 32169 2828 30097 293755 374902 374902 2266 1 MLQEMQR Unmodified 934.43646 0.43645703 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 23.39 23.39 2 0.017387 16913 QUIQUE_C1368_190116_001 132.94 41.357 48350000 0 0 48350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32170 2350 30098 293756 374903 374903 1 MLQHIDYR Unmodified 1074.528 0.52804923 1298 J3QLE5;P63162;P14678;J3KRY3;S4R3P3 SNRPN;SNRPB Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.447 28.447 3 0.031448 22216 QUIQUE_C1563_190116_001 40.002 25.795 445660000 0 121140000 0 89379000 0 51340000 0 0 70533000 16584000 96677000 0 0 32171 1298 30099 293757;293758;293759;293760;293761;293762 374904;374905;374906;374907;374908;374909 374906 4 MLQLVEESK Unmodified 1075.5583 0.5583463 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.629 54.629 2 0.00040302 52156 QUIQUE_DMIX8_190116_001 121.05 67.494 4315300000 436360000 492740000 521010000 591050000 372230000 455170000 500050000 0 153580000 70713000 258430000 153120000 310780000 32172 2699 30100 293763;293764;293765;293766;293767;293768;293769;293770;293771;293772;293773;293774;293775 374910;374911;374912;374913;374914;374915;374916;374917;374918;374919;374920;374921;374922;374923;374924;374925;374926;374927;374928 374927 19 MLQLVEESK Oxidation (M) 1091.5533 0.55326092 2699 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Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 2 0 1 2 1 2 1 2 1 1 178.43 178.43 3 2.7134E-12 182906 QUIQUE_C1368_190116_001 96.708 92.611 235330000 9423400 11062000 11727000 0 0 0 0 16477000 79190000 0 62778000 32014000 12664000 32175 2457 30101 293793;293794;293795;293796;293797;293798;293799;293800;293801;293802;293803 374947;374948;374949;374950;374951;374952;374953;374954;374955;374956;374957 374950 1883;1884;1885 11 MLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSK Oxidation (M) 2559.409 0.40897522 2457 P43003;A0A087X0U3 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 1 0 2 1 182.4 182.4 3 9.0331E-14 191283 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.41 101.48 85984000 0 0 0 0 0 0 0 0 85984000 0 0 0 0 32176 2457 30101 293804;293805;293806 374958;374959;374960 374960 1883;1884;1885 3 MLQMVQLFK Unmodified 1136.6086 0.60860773 3502 Q86VW0;H0Y774 SESTD1 SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 116.49 116.49 2 0.016522 120141 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32179 537 30103 293823;293824 374977;374978 374977 1 MLQYCLQGLFHPAR Unmodified 1732.8542 0.85415117 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 107.43 107.43 3 0.00023425 110114 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.466 61.946 97315000 0 29392000 0 0 0 0 19784000 21569000 0 0 0 26570000 0 32180 1644 30104 293825;293826;293827;293828 374979;374980;374981;374982 374981 3 MLSAGVTEAVLK Unmodified 1217.669 0.66895938 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.75 77.75 2 0.0015648 78505 QUIQUE_C1277_190116_001 93.058 61.123 2208200000 212740000 234030000 167220000 163430000 178630000 164310000 171820000 148500000 141740000 72903000 207190000 178170000 167480000 32181 2605 30105 293829;293830;293831;293832;293833;293834;293835;293836;293837;293838;293839;293840;293841 374983;374984;374985;374986;374987;374988;374989;374990;374991;374992;374993;374994;374995;374996 374984 9 MLSAVSQQVQCIQEALR Unmodified 1959.987 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protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 144.84 144.84 2 0.0093495 147836 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.296 74.457 417190000 20606000 33594000 19927000 0 0 0 0 69995000 0 15531000 140770000 116770000 0 32201 3499 30117 293965;293966;293967;293968;293969;293970;293971 375151;375152;375153;375154;375155;375156;375157 375154 7 MLTFNPHK Unmodified 986.50077 0.50077184 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.127 29.127 2 0.014579 24145 QUIQUE_C1218_190116_001 85.813 63.885 2696100000 437140000 520840000 548110000 436570000 0 0 380980000 0 0 0 0 372510000 0 32202 2281 30118 293972;293973;293974;293975;293976;293977 375158;375159;375160;375161;375162;375163;375164 375158 7 MLTFNPHK Oxidation (M) 1002.4957 0.49568646 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 1 0 1 21.532 21.532 2 0.019045 14256 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.753 56.436 42366000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42366000 0 0 0 32203 2281 30118 293978 375165 375165 1 MLTFNPHKR Unmodified 1142.6019 0.60188287 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 18.271 18.271 2;3 0.0011731 10867 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.948 76.734 2426200000 0 0 0 34857000 0 0 0 551860000 424440000 0 681600000 351320000 382100000 32204 2281 30119 293979;293980;293981;293982;293983;293984;293985;293986 375166;375167;375168;375169;375170;375171;375172;375173;375174;375175;375176 375169 11 MLTFNPNKR Unmodified 1119.5859 0.58589846 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;E9PQW4;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.502 30.502 3 0.00033032 24415 QUIQUE_DMIX8_190116_001 103.74 85.919 1048400000 0 51509000 73684000 66598000 48924000 40358000 83638000 124150000 113560000 34373000 156000000 130240000 125380000 32205 897;2263 30120 293987;293988;293989;293990;293991;293992;293993;293994;293995;293996;293997;293998 375177;375178;375179;375180;375181;375182;375183;375184;375185;375186;375187;375188;375189;375190 375190 13 MLTGPVYSQSTALTHK Unmodified 1732.8818 0.8818057 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 57.478 57.478 2;3 2.1732E-24 56264 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.05 142.18 4579300000 443500000 480300000 463710000 457390000 506140000 92216000 453420000 311770000 52385000 146980000 568630000 495660000 107240000 32206 3499 30121 293999;294000;294001;294002;294003;294004;294005;294006;294007;294008;294009;294010;294011;294012;294013;294014;294015;294016;294017;294018;294019;294020;294021 375191;375192;375193;375194;375195;375196;375197;375198;375199;375200;375201;375202;375203;375204;375205;375206;375207;375208;375209;375210;375211;375212;375213;375214 375205 18 MLTGPVYSQSTALTHK Oxidation (M) 1748.8767 0.87672033 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 1 0 1 1 47.596 47.596 2 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375310;375311;375312;375313;375314;375315;375316 375313 6 MLVIEQCK Oxidation (M) 1035.5093 0.50928762 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 1 0 1 29.387 29.387 2 0.022232 23043 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.451 50.113 17756000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17756000 0 0 0 32224 2514 30135 294113 375317 375317 1 MLVLDEADEMLNK Unmodified 1519.7262 0.72621627 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 128.33 128.33 2 0.016661 133522 QUIQUE_C1368_190116_001 71.221 52.441 108880000 0 0 108880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32225 2416 30136 294114 375318 375318 1 MLVLDEADEMLNK Oxidation (M) 1535.7211 0.72113089 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 107.41 107.41 2 0.023847 112857 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.73 41.41 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32226 2416 30136 294115 375319 375319 1 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294123;294124;294125;294126;294127;294128;294129;294130;294131;294132;294133;294134;294135;294136 375327;375328;375329;375330;375331;375332;375333;375334;375335;375336;375337;375338;375339;375340;375341;375342;375343;375344 375337 18 MLVNENFEEYLR Oxidation (M) 1571.729 0.72899346 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.59 112.59 2 9.1146E-38 116166 QUIQUE_DMIX3_190116_001 194.06 154.91 1311300000 84683000 82359000 117800000 58525000 69013000 113430000 65016000 92428000 148450000 43970000 168390000 128090000 139110000 32230 1961 30139 294137;294138;294139;294140;294141;294142;294143;294144;294145;294146;294147;294148;294149 375345;375346;375347;375348;375349;375350;375351;375352;375353;375354;375355;375356;375357;375358;375359 375355 1224 15 MLVNENFEEYLR Unmodified 1555.7341 0.73407884 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.82 122.82 2 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32237 2976 30144 294203;294204;294205;294206;294207;294208;294209;294210 375421;375422;375423;375424;375425;375426;375427;375428 375425 2435 7 MLVTFDEELRPLPVSVR Unmodified 2000.0765 0.076482767 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 123.83 123.83 2;3 8.3033E-17 129671 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.34 96.963 1271100000 121960000 141810000 125860000 106330000 0 66445000 144380000 79374000 73436000 0 136660000 166490000 108310000 32238 2976 30144 294211;294212;294213;294214;294215;294216;294217;294218;294219;294220;294221;294222;294223;294224;294225 375429;375430;375431;375432;375433;375434;375435;375436;375437;375438;375439;375440;375441;375442;375443;375444;375445;375446;375447;375448;375449 375444 20 MLVVGGIDR Unmodified 958.52699 0.52698659 3103 Q15046 KARS Lysine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.983 61.983 2 0.023629 61086 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.59 18.126 657380000 0 83314000 96029000 0 47181000 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P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 75.821 75.821 2 0.0019139 75381 QUIQUE_C1563_190116_001 95.531 78.3 395320000 0 0 0 80257000 69077000 115370000 72445000 0 0 58172000 0 0 0 32241 1954 30146 294256;294257;294258;294259;294260 375488;375489;375490;375491;375492 375490 1204 4 MLVVLLQANRDPDAGIDEAQVEQDAQALFQAGELK Oxidation (M) 3810.9098 0.90981795 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 1 1 1 1 2 1 2 2 161.92 161.92 3;4 1.3915E-99 164179 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.49 156.31 836570000 0 36625000 0 0 37582000 0 184310000 94717000 186210000 0 297140000 0 0 32242 1954 30147 294261;294262;294263;294264;294265;294266;294267;294268;294269 375493;375494;375495;375496;375497;375498;375499;375500;375501;375502 375498 1204 10 MLVVLLQANRDPDAGIDEAQVEQDAQALFQAGELK Unmodified 3794.9149 0.91490333 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 165.75 165.75 3;4 1.7845E-39 172032 QUIQUE_C1438_190116_001 100.86 93.856 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yes no 0 1 0 1 1 96.116 96.116 2 0.0058753 100435 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.704 57.181 26977000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26977000 0 0 32277 2001 30169 294589;294590 375914;375915 375914 1266;1267 2 MMLSTEGR Acetyl (Protein N-term) 965.43104 0.4310373 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 85.983 85.983 1;2 0.01267 87695 QUIQUE_C1368_190116_001 125.01 88.032 283830000 0 64951000 70539000 51569000 0 0 51012000 0 0 0 24815000 20946000 0 32278 2672 30170 294591;294592;294593;294594;294595;294596 375916;375917;375918;375919;375920;375921;375922 375917 4 MMNGGHYTYSENR 2 Oxidation (M) 1590.6191 0.61912543 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.912 13.912 3 0.0020427 5776 QUIQUE_C1563_190116_001 69.716 69.026 341690000 32058000 53216000 0 17459000 0 69687000 24649000 23471000 70057000 0 8587400 0 42507000 32279 3956 30171 294597;294598;294599;294600;294601;294602;294603;294604;294605 375923;375924;375925;375926;375927;375928;375929;375930;375931 375926 2789;2790 9 MMNGGHYTYSENR Unmodified 1558.6293 0.62929619 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 23.37 23.37 2;3 2.5938E-10 17195 QUIQUE_C1218_190116_001 147.37 140.51 1356300000 183060000 184930000 252380000 52375000 38677000 26452000 250250000 102910000 37874000 30419000 163030000 0 33974000 32280 3956 30171 294606;294607;294608;294609;294610;294611;294612;294613;294614;294615;294616;294617;294618;294619;294620;294621;294622;294623 375932;375933;375934;375935;375936;375937;375938;375939;375940;375941;375942;375943;375944;375945;375946;375947;375948;375949 375932 16 MMNGGHYTYSENR Oxidation (M) 1574.6242 0.62421081 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 2 1 2 2 18.054 18.054 3 0.00048703 9360 QUIQUE_C1368_190116_001 77.527 75.948 595990000 62579000 49945000 121990000 50349000 29956000 100200000 0 14059000 0 80947000 85963000 0 0 32281 3956 30171 294624;294625;294626;294627;294628;294629;294630;294631;294632;294633;294634;294635;294636 375950;375951;375952;375953;375954;375955;375956;375957;375958;375959;375960;375961;375962 375952 2789;2790 10 MMNGGHYTYSENRVEK 2 Oxidation (M) 1946.8251 0.82509546 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 2 1 1 1 2 2 1 14.661 14.661 3;4 2.663E-13 6919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.21 130.12 322610000 0 0 0 0 0 0 0 21073000 39083000 0 159840000 76629000 25981000 32282 3956 30172 294637;294638;294639;294640;294641;294642;294643 375963;375964;375965;375966;375967;375968;375969 375966 2789;2790 7 MMNGGHYTYSENRVEK Oxidation (M) 1930.8302 0.83018084 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 1 1 2 1 1 18.715 18.715 3 0.0036239 10658 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.261 53.056 240270000 0 0 0 0 0 0 0 99363000 61094000 0 79817000 0 0 32283 3956 30172 294644;294645;294646;294647 375970;375971;375972;375973 375970 2789;2790 4 MMNGGHYTYSENRVEK Unmodified 1914.8353 0.83526622 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 22.008 22.008 3 0.0001333 15597 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.358 79.019 291650000 0 0 0 0 0 0 0 0 64323000 0 92198000 76589000 58541000 32284 3956 30172 294648;294649;294650;294651 375974;375975;375976;375977 375974 4 MMNTIIFHTK Unmodified 1234.6202 0.62023505 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 56.804 56.804 2;3 0.0037913 55498 QUIQUE_C1277_190116_001 57.836 48.403 255770000 67831000 64031000 68363000 55549000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32285 4551 30173 294652;294653;294654;294655;294656 375978;375979;375980;375981;375982 375979 5 MMPTPVILLK Acetyl (Protein N-term) 1183.6709 0.67087364 3977 Q99832;F8WBP8 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes no 1 0 0 1 1 1 158.48 158.48 2 0.0057346 163981 QUIQUE_C1218_190116_001 80.438 65.663 345850000 129100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 88458000 0 128300000 32286 3977 30174 294657;294658;294659 375983;375984;375985 375983 3 MMQAQEAVSR Unmodified 1149.5271 0.52706295 2873 Q02410;A0A0G2JMD7;A0A0D9SFA9;Q99767 APBA1;APBA2 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family A member 1;Amyloid beta A4 precursor protein-binding family A member 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 24.844 24.844 2 0.0040375 18407 QUIQUE_C1563_190116_001 82.287 63.193 96950000 0 0 0 30939000 0 30608000 0 0 0 0 35403000 0 0 32287 2873 30175 294660;294661;294662;294663;294664 375986;375987;375988;375989;375990 375989 5 MMTGGFFHK Unmodified 1054.4728 0.47284253 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 2 44.937 44.937 2;3 0.0085634 41303 QUIQUE_C1368_190116_001 46.39 37.176 1343800000 329810000 0 140370000 0 95028000 202570000 104280000 88708000 82452000 0 102350000 198240000 0 32288 1198 30176 294665;294666;294667;294668;294669;294670;294671;294672;294673;294674;294675;294676 375991;375992;375993;375994;375995;375996;375997;375998;375999;376000;376001;376002 375993 11 MMVADVFSHR Unmodified 1191.5529 0.55288377 1096 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294759;294760;294761;294762;294763;294764;294765;294766;294767;294768;294769;294770;294771;294772 376094;376095;376096;376097;376098;376099;376100;376101;376102;376103;376104;376105;376106;376107;376108 376102 2949 15 MNEFLENFEK Unmodified 1299.5805 0.58053831 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.497 99.497 2 1.5471E-11 103788 QUIQUE_C1218_190116_001 162.88 147.26 1995600000 219350000 181790000 209380000 237680000 178330000 168080000 207270000 68344000 0 47849000 145820000 160770000 170940000 32311 4419 30194 294773;294774;294775;294776;294777;294778;294779;294780;294781;294782;294783;294784 376109;376110;376111;376112;376113;376114;376115;376116;376117;376118;376119;376120;376121;376122 376109 13 MNELNHCIVAR Unmodified 1355.6438 0.64382404 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 31.764 31.764 2 0.017568 26638 QUIQUE_C1218_190116_001 62.303 51.151 0 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376138;376139;376140;376141;376142;376143;376144;376145 376143 4 MNEVISLWK Oxidation (M) 1134.5743 0.57433072 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.787 88.787 2 0.0005224 86238 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.33 95.842 3016100000 227720000 309140000 255130000 0 252220000 196310000 189030000 230600000 320990000 148900000 293880000 289480000 302730000 32315 267;275;3025 30198 294807;294808;294809;294810;294811;294812;294813;294814;294815;294816;294817;294818 376146;376147;376148;376149;376150;376151;376152;376153;376154;376155;376156;376157;376158;376159;376160;376161 376155 174 16 MNEVISLWK Unmodified 1118.5794 0.57941609 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.58 100.58 2 0.00040551 102839 QUIQUE_C1403_190116_001 120.87 92.986 13625000000 986980000 1322400000 995190000 927860000 1079600000 833070000 1215600000 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finger ZZ-type and EF-hand domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 177.92 177.92 3 0.004354 184954 QUIQUE_DMIX5_190116_001 31.818 16.663 6925400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6925400 0 0 32321 1508 30203 294853 376217 376217 1 MNLAIALTAAR Unmodified 1143.6434 0.64341333 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.008 97.008 2 0.0056344 98198 QUIQUE_C1563_190116_001 79.974 30.556 369000000 0 0 82360000 0 0 117920000 86245000 0 0 0 82468000 0 0 32322 2463 30204 294854;294855;294856;294857 376218;376219;376220;376221;376222;376223;376224;376225 376220 8 MNLAIALTAAR Oxidation (M) 1159.6383 0.63832796 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 74.018 74.018 2 0.041562 70009 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.35 12.955 11063000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11063000 0 0 0 32323 2463 30204 294858 376226 376226 1 MNLASSFVNGFVNAAFGQDK Unmodified 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376400;376401;376402;376403;376404;376405;376406;376407;376408;376409;376410;376411;376412;376413;376414 376408 15 MNPIVVVHGGGAGPISK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1689.8872 0.88722543 3438 Q7L266;A0A087WUG3;E9PJK6 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.31 75.31 2 9.1066E-06 74763 QUIQUE_C1563_190116_001 103.76 89.992 697540000 95442000 63216000 0 97938000 97989000 98035000 72224000 63784000 0 0 0 0 108920000 32347 3438 30221 295029;295030;295031;295032;295033;295034;295035;295036;295037 376415;376416;376417;376418;376419;376420;376421;376422;376423 376419 2659 7 MNPIVVVHGGGAGPISK Acetyl (Protein N-term) 1673.8923 0.89231081 3438 Q7L266;A0A087WUG3;E9PJK6 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.781 97.781 2 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protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 137.84 137.84 2 0.048691 143439 QUIQUE_C1576_190116_001 56.548 40.17 33470000 0 0 0 0 0 0 33470000 0 0 0 0 0 0 32357 2952 30228 295114 376506 376506 1 MNTVFHIWK Oxidation (M) 1190.5906 0.59064948 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 1 0 1 63.056 63.056 3 0.031604 62719 QUIQUE_C1218_190116_001 40.724 28.108 68480000 68480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32358 4419 30229 295115 376507 376507 1 MNTVFHIWK Unmodified 1174.5957 0.59573486 4419 Q9UFN0 NIPSNAP3A Protein NipSnap homolog 3A yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 75.594 75.594 2;3 0.011313 77591 QUIQUE_C1218_190116_001 43.185 17.121 1521400000 129530000 114850000 222800000 60824000 126010000 94950000 244920000 54309000 134840000 18909000 94718000 117130000 107620000 32359 4419 30229 295116;295117;295118;295119;295120;295121;295122;295123;295124;295125;295126;295127;295128;295129;295130 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295240;295241;295242;295243;295244;295245;295246;295247;295248;295249;295250;295251;295252;295253;295254;295255;295256;295257;295258;295259;295260;295261;295262;295263 376652;376653;376654;376655;376656;376657;376658;376659;376660;376661;376662;376663;376664;376665;376666;376667;376668;376669;376670;376671;376672;376673;376674;376675;376676;376677;376678;376679;376680;376681;376682;376683;376684;376685;376686;376687;376688 376670 37 MPCQLHQVIVAR Unmodified 1450.7537 0.75370884 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 2 2 47.282 47.282 2;3 9.642E-29 43995 QUIQUE_C1368_190116_001 185.81 149.87 1914600000 258530000 259290000 214590000 177890000 154970000 197970000 239470000 52512000 69481000 42311000 108210000 0 139340000 32375 2127 30241 295264;295265;295266;295267;295268;295269;295270;295271;295272;295273;295274;295275;295276;295277;295278;295279;295280;295281;295282;295283 376689;376690;376691;376692;376693;376694;376695;376696;376697;376698;376699;376700;376701;376702;376703;376704;376705;376706;376707;376708;376709;376710;376711;376712;376713 376694 24 MPCQLHQVIVAR Oxidation (M) 1466.7486 0.74862346 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 1 0 1 32.598 32.598 2 0.015634 27975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.916 36.216 22621000 0 0 0 0 0 0 0 0 22621000 0 0 0 0 32376 2127 30241 295284 376714 376714 1 MPCTEDYLSLILNR Oxidation (M) 1739.8222 0.82224192 770 CON__P02769 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 142.46 142.46 2;3 2.8549E-05 138367 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.77 92.91 1445600000 95684000 96972000 19346000 56908000 160970000 106510000 180070000 81314000 157480000 273840000 0 134110000 82384000 + 32377 770 30242 295285;295286;295287;295288;295289;295290;295291;295292;295293;295294;295295;295296;295297 376715;376716;376717;376718;376719;376720;376721;376722;376723;376724;376725;376726;376727;376728;376729 376725 463 15 MPDAVNFWLGEAAAVTSLHK Unmodified 2156.0725 0.072460022 1982 P0C870;B5MC20;C9K0I3 JMJD7 JmjC domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 161.33 161.33 3 3.0559E-07 166483 QUIQUE_C1368_190116_001 95.5 82.868 130010000 0 12226000 24264000 19736000 15860000 14653000 19137000 0 0 0 0 0 24131000 32378 1982 30243 295298;295299;295300;295301;295302;295303;295304 376730;376731;376732;376733;376734;376735;376736 376731 7 MPDEDSKIDHYVLEYR Unmodified 2008.92 0.9200417 4024 Q9BTV5;M0R366 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 81.775 81.775 3 0.012735 83626 QUIQUE_C1576_190116_001 35.329 25.541 23302000 0 0 0 0 0 0 23302000 0 0 0 0 0 0 32379 4024 30244 295305 376737 376737 1 MPDSTLPGSR Unmodified 1059.5019 0.50189405 4384 Q9P2B2 PTGFRN Prostaglandin F2 receptor negative regulator yes yes 0 0 0 1 2 1 116.54 116.54 2 0.033996 119733 QUIQUE_C1403_190116_001 53.166 35.781 11716000 0 0 0 11716000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32380 4384 30245 295306;295307;295308;295309 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377217 277 151 MPPPLPTR Unmodified 907.49496 0.49495818 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;K7EJK1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 4 2 3 2 5 58.563 58.563 1;2 0.0036323 33329 QUIQUE_C1563_190116_001 116.54 78.34 168140000000 6240400000 9002400000 15392000000 16291000000 6879600000 16121000000 12700000000 11540000000 16390000000 4475900000 11080000000 10755000000 31267000000 32419 389;395;1336 30274 295643;295644;295645;295646;295647;295648;295649;295650;295651;295652;295653;295654;295655;295656;295657;295658;295659;295660;295661;295662;295663;295664;295665;295666;295667;295668 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377442 251 MPPPLPTRVDFSLAGALNAGFKETR Unmodified 2684.4108 0.41084121 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 1 3 1 133.63 133.63 4 0.0010721 130601 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.084 28.026 237030000 0 0 0 0 0 104340000 0 0 0 71762000 60920000 0 0 32420 389;395;1336 30275 295669;295670;295671;295672;295673 377602;377603;377604;377605;377606;377607 377605 3 MPPYDEQTQAFIDAAQEAR Unmodified 2179.9844 0.98443288 1329 K7ELL7;P14314;A0A0C4DGP4 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 126.37 126.37 3 0.041016 130640 QUIQUE_C1368_190116_001 24.548 16.361 74013000 0 0 27399000 0 0 19031000 27583000 0 0 0 0 0 0 32421 1329 30276 295674;295675;295676 377608;377609;377610 377608 1 MPPYTVVYFPVR Unmodified 1467.7584 0.75844309 1957 P09211;A8MX94;A0A2R8Y5E5 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 121.17 121.17 2 0.00051689 123611 QUIQUE_C1563_190116_001 94.692 80.018 182630000 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295691;295692;295693;295694;295695;295696;295697;295698;295699;295700;295701;295702;295703 377625;377626;377627;377628;377629;377630;377631;377632;377633;377634;377635;377636;377637;377638;377639;377640 377637 16 MPTFSTPGAK Unmodified 1035.5059 0.5059168 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 50.071 50.071 2 0.032885 47406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.227 37.288 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32425 2935 30280 295704 377641 377641 1 MPTGEIEIK Unmodified 1016.5212 0.52123251 3393 Q6PI48;A0A3B3IT01;A0A3B3ISK7;A0A3B3IS01;A0A3B3ITS3;A0A3B3IS54 DARS2 Aspartate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 50.967 50.967 2 0.059319 48876 QUIQUE_C1368_190116_001 48.157 25.633 58047000 0 0 27786000 0 30260000 0 0 0 0 0 0 0 0 32426 3393 30281 295705;295706 377642;377643 377642 2 MPTPVIK Unmodified 784.4517 0.45169638 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 33.939 33.939 2 0.039849 30399 QUIQUE_C1218_190116_001 83.377 42.691 549630000 259420000 0 0 0 129080000 0 0 0 0 0 0 0 161130000 32427 1935 30282 295707;295708;295709 377644;377645;377646 377644 3 MPTPVILLK Unmodified 1010.6198 0.61982435 3977 Q99832;F8WBP8 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes no 0 0 0 1 1 158.96 158.96 2 0.015421 162507 QUIQUE_C1403_190116_001 67.169 54.813 4542000 0 0 0 4542000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32428 3977 30283 295710;295711 377647;377648 377647 2 MPVCYQCLEEGK Unmodified 1512.6411 0.64110643 4090 Q9C026 TRIM9 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 2 1 21.922 21.922 2;3 0.0053933 15262 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.435 47.655 991220000 133980000 46203000 40804000 63034000 0 113920000 0 0 74588000 0 197760000 188320000 132600000 32429 4090 30284 295712;295713;295714;295715;295716;295717;295718;295719;295720;295721;295722;295723;295724 377649;377650;377651;377652;377653;377654;377655;377656;377657;377658;377659;377660;377661 377656 13 MPVIKPDIANWELSVK Unmodified 1838.9964 0.99644153 1881 P05165;A0A1B0GU58;Q5JTW6 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 117.36 117.36 3 0.0025155 121959 QUIQUE_C1218_190116_001 42.708 33.292 104820000 104820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32430 1881 30285 295725 377662;377663 377663 2 MPVWYIMDEFGSR Unmodified 1629.732 0.73197035 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 150.77 150.77 2 0.0079364 158091 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.143 62.79 71267000 0 16018000 0 0 0 0 0 25735000 0 0 29515000 0 0 32431 3049 30286 295726;295727;295728;295729 377664;377665;377666;377667 377667 4 MQAGKPILYSYFR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1630.8177 0.81774888 216;1545 A0A0C4DFM0;G3V5T0;A0A0A0MR33;G3V267;O43708 GSTZ1 Maleylacetoacetate isomerase no no 1 1 1 1 1 1 107.34 107.34 2 0.00035836 109945 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.86 93.11 137770000 0 0 0 0 0 0 0 52971000 84801000 0 0 0 0 32432 216;1545 30287 295730;295731;295732 377668;377669;377670 377668 134 3 MQAHELFR Acetyl (Protein N-term) 1072.5124 0.51239916 2354 P33121;E7EPM6;D6RER0;D6RG07 ACSL1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1 yes no 1 0 0 1 70.289 70.289 2 0.018668 69337 QUIQUE_C1563_190116_001 61.999 43.964 22518000 0 0 0 0 0 22518000 0 0 0 0 0 0 0 32433 2354 30288 295733 377671 377671 1 MQAHIQDLEEQLDEEEGAR Unmodified 2240.0015 0.0015395026 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 93.933 93.933 3 1.6606E-06 97575 QUIQUE_C1218_190116_001 100.97 76.925 350410000 59190000 71027000 0 0 60182000 55299000 0 0 46410000 0 58302000 0 0 32434 2379 30289 295734;295735;295736;295737;295738;295739 377672;377673;377674;377675;377676;377677 377672 6 MQAQLLELR Unmodified 1100.6012 0.60121417 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45;A0A087WZF5 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 77.24 77.24 2 0.0080132 78382 QUIQUE_C1368_190116_001 88.948 46.839 33639000 0 0 33639000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32435 3241 30290 295740 377678 377678 1 MQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV Oxidation (M) 2398.9875 0.98750289 640;3097 B5MCX3;H7C2Y0;H7C1T1;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 1 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 54.192 54.192 3 6.4904E-31 51163 QUIQUE_C1403_190116_001 134.21 131.54 623000000 24645000 54355000 0 94979000 0 47901000 0 88616000 0 24198000 44341000 93646000 150320000 32436 640;3097 30291 295741;295742;295743;295744;295745;295746;295747;295748;295749;295750;295751;295752;295753 377679;377680;377681;377682;377683;377684;377685;377686;377687;377688;377689;377690;377691;377692;377693 377682 408;409;410;411 14 MQAQMQMQMQGGDGDGGALGHHV Unmodified 2382.9926 0.99258827 640;3097 B5MCX3;H7C2Y0;H7C1T1;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 67.995 67.995 3 9.3164E-31 67767 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.13 130.89 852290000 0 53256000 52380000 94028000 0 60564000 46067000 113070000 89902000 32309000 80136000 83177000 147400000 32437 640;3097 30291 295754;295755;295756;295757;295758;295759;295760;295761;295762;295763;295764;295765 377694;377695;377696;377697;377698;377699;377700;377701;377702;377703;377704;377705;377706;377707;377708 377703 14 MQAVQEATR Unmodified 1032.5022 0.50222841 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.366 17.366 2 1.4286E-07 9708 QUIQUE_DMIX7_190116_001 164.77 129.97 3208400000 368790000 423710000 0 0 154260000 174330000 134450000 512630000 534150000 187300000 0 512340000 206440000 32438 3117 30292 295766;295767;295768;295769;295770;295771;295772;295773;295774;295775 377709;377710;377711;377712;377713;377714;377715;377716;377717;377718 377717 9 MQAYQDIK Unmodified 995.47462 0.47461667 664 B7Z613 GPM6B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 27.945 27.945 2 0.0065309 22533 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.41 56.72 290500000 64605000 80893000 89727000 0 0 0 0 55271000 0 0 0 0 0 32439 664 30293 295776;295777;295778;295779;295780 377719;377720;377721;377722;377723;377724;377725 377725 7 MQCVAAFAVSAVASQWER Unmodified 2009.9452 0.94515102 4066 Q9BXW6 OSBPL1A Oxysterol-binding protein-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 145.87 145.87 2;3 0.00065648 152820 QUIQUE_C1438_190116_001 62.94 52.564 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Unmodified 1437.6558 0.65582851 4352 Q9NZN3 EHD3 EH domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.281 54.281 2 0.00041964 52451 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.27 126.35 966560000 101150000 0 80911000 106410000 98606000 80257000 119170000 60812000 81114000 22672000 119430000 96028000 0 32443 4352 30297 295801;295802;295803;295804;295805;295806;295807;295808;295809;295810;295811;295812 377746;377747;377748;377749;377750;377751;377752;377753;377754;377755;377756;377757;377758;377759;377760 377754 15 MQDQLQAQDFSK Oxidation (M) 1453.6507 0.65074314 4352 Q9NZN3 EHD3 EH domain-containing protein 3 yes yes 0 1 0 1 1 43.633 43.633 2 0.00092474 40513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.24 81.55 54012000 0 0 0 0 0 0 0 20831000 0 0 0 33181000 0 32444 4352 30297 295813;295814 377761;377762 377761 2913 1 MQEAMTQEVSDVFSDTTTPIK Unmodified 2357.0767 0.076678281 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 1 131.68 131.68 2;3 4.7032E-53 135655 QUIQUE_C1277_190116_001 161.24 153.46 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295929;295930;295931;295932;295933;295934;295935;295936 377887;377888;377889;377890;377891;377892;377893;377894 377893 7 MQHNLEQQIQAR Oxidation (M) 1510.7311 0.73105914 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 23.267 23.267 2;3 6.2809E-07 17119 QUIQUE_C1218_190116_001 143.89 122.14 9319900000 295170000 955530000 820150000 0 0 707700000 515090000 1183300000 1994900000 206380000 742660000 468010000 1430900000 32462 267;275;3025 30311 295937;295938;295939;295940;295941;295942;295943;295944;295945;295946;295947;295948;295949;295950;295951;295952 377895;377896;377897;377898;377899;377900;377901;377902;377903;377904;377905;377906;377907;377908;377909;377910;377911;377912 377895 175 16 MQHNLEQQIQAR Unmodified 1494.7361 0.73614452 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 28.858 28.858 2;3 2.2653E-21 23947 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A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304;F5GZY3;Q13474;P46939;Q5T097 DMD;DRP2;UTRN Dystrophin;Dystrophin-related protein 2;Utrophin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.595 20.595 3 0.0052614 13780 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.654 49.039 675640000 0 0 93478000 0 0 112840000 72563000 48304000 103100000 0 78232000 86230000 80896000 32465 8;2486 30313 295983;295984;295985;295986;295987;295988;295989;295990 377945;377946;377947;377948;377949;377950;377951;377952 377949 8 MQIMTHLPGAISDMIYIR Unmodified 2089.0523 0.052258627 2872 Q02338;E9PCG9 BDH1 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 138.45 138.45 2 0.0010555 145202 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.348 70.469 31415000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31415000 0 32466 2872 30314 295991;295992 377953;377954 377953 2 MQINAEEVVVGDLVEVK Unmodified 1870.971 0.97101464 590 B1AKY9;P50993 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 137.53 137.53 2;3 0.00013686 140621 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.158 70.619 117920000 0 0 0 30033000 0 0 0 39463000 30338000 6494800 11587000 0 0 32467 590 30315 295993;295994;295995;295996;295997;295998 377955;377956;377957;377958;377959;377960 377956 4 MQLASFLEDPQYQDQHSLHTEIIK Unmodified 2870.3909 0.39089363 426 A0A2R8Y566;Q9P260 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 0 1 1 1 112.76 112.76 4 0.0099386 115376 QUIQUE_DMIX1_190116_001 28.023 18.814 229480000 0 102140000 0 0 62849000 0 0 64488000 0 0 0 0 0 32468 426 30316 295999;296000;296001 377961;377962;377963 377963 3 MQLKPMEINPEMLNK 2 Oxidation (M) 1846.8991 0.89911203 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974;D6RF53 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 2 1 1 1 3 2 1 2 4 4 2 3 4 4 62.803 62.803 2;3 7.5159E-17 61846 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.91 126.34 3149900000 190710000 236420000 100340000 94048000 0 108410000 0 387050000 315640000 121270000 451260000 455760000 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296033;296034;296035;296036;296037;296038;296039;296040;296041;296042;296043;296044 377998;377999;378000;378001;378002;378003;378004;378005;378006;378007;378008;378009;378010 378004 1247;1248;1249 13 MQLKPMEINPEMLNK Unmodified 1814.9093 0.90928278 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974;D6RF53 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 92.451 92.451 2;3 4.1286E-43 95041 QUIQUE_C1277_190116_001 202.61 183.98 18800000000 2183400000 2474600000 1791700000 1517300000 1451500000 1294300000 2052200000 890510000 1072200000 14930000 1168500000 1205500000 1683800000 32471 1976 30317 296045;296046;296047;296048;296049;296050;296051;296052;296053;296054;296055;296056;296057;296058;296059;296060;296061;296062;296063;296064;296065;296066;296067;296068 378011;378012;378013;378014;378015;378016;378017;378018;378019;378020;378021;378022;378023;378024;378025;378026;378027;378028;378029;378030;378031;378032;378033;378034;378035;378036;378037 378015 19 MQLKPMEINPEMLNK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1872.9148 0.91476209 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974;D6RF53 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.93 107.93 2 1.6473E-05 110933 QUIQUE_C1368_190116_001 98.105 76.05 307900000 43175000 48996000 56372000 0 0 0 0 28335000 0 0 60171000 33743000 37103000 32472 1976 30317 296069;296070;296071;296072;296073;296074;296075 378038;378039;378040;378041;378042;378043;378044;378045 378040 1247;1248;1249 8 MQLKPMEINPEMLNK Acetyl (Protein N-term) 1856.9198 0.91984747 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974;D6RF53 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 126.9 126.9 2 5.7107E-05 131020 QUIQUE_C1277_190116_001 122.34 98.001 1358100000 212970000 194860000 0 0 196200000 0 141330000 0 0 0 231970000 167300000 213440000 32473 1976 30317 296076;296077;296078;296079;296080;296081;296082 378046;378047;378048;378049;378050;378051;378052 378047 5 MQLKPMEINPEMLNK 3 Oxidation (M) 1862.894 0.89402665 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974;D6RF53 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 3 1 2 2 3 2 2 1 49.195 49.195 2;3 9.552E-06 47151 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.191 82.979 876080000 0 0 0 0 0 0 0 38837000 27086000 450960000 262170000 47657000 49376000 32474 1976 30317 296083;296084;296085;296086;296087;296088;296089;296090;296091;296092;296093;296094 378053;378054;378055;378056;378057;378058;378059;378060;378061;378062;378063;378064;378065;378066;378067;378068;378069;378070;378071 378066 1247;1248;1249 19 MQLLAASYDLHR Unmodified 1416.7184 0.71836919 2021 P11277;H0YJE6 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes no 0 0 0 1 1 1 1 77.553 77.553 2 0.0045435 78611 QUIQUE_C1218_190116_001 68.893 55.937 24341000 24341000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32475 2021 30318 296095;296096;296097;296098 378072;378073;378074;378075 378072 4 MQLLEIITTEK Unmodified 1317.7214 0.72138888 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 121.18 121.18 2 5.8188E-05 124824 QUIQUE_C1403_190116_001 136.49 124.2 4740200000 334710000 399950000 558470000 432010000 333330000 417480000 351280000 239440000 650940000 158530000 309050000 288840000 266220000 32476 1153 30319 296099;296100;296101;296102;296103;296104;296105;296106;296107;296108;296109;296110;296111;296112;296113 378076;378077;378078;378079;378080;378081;378082;378083;378084;378085;378086;378087;378088;378089;378090;378091;378092;378093;378094;378095;378096;378097;378098;378099;378100;378101;378102;378103;378104;378105 378084 30 MQLLEIITTEK Oxidation (M) 1333.7163 0.71630351 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 98.167 98.167 2 0.060777 100843 QUIQUE_C1277_190116_001 45.598 29.395 44637000 0 44637000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32477 1153 30319 296114 378106 378106 1 MQLMELAILNGTYR Unmodified 1651.8426 0.84258343 3920 Q96PU8;F5GXS8;F5GYM3;H0YG47;H0YGD6 QKI Protein quaking yes no 0 0 0 1 141.95 141.95 2 0.0067829 144759 QUIQUE_C1563_190116_001 64.64 30.754 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32478 3920 30320 296115 378107 378107 1 MQLQLQTELR Unmodified 1258.6704 0.67035637 3893 Q96JN2;H7C4R2 CCDC136 Coiled-coil domain-containing protein 136 yes no 0 0 0 1 17.597 17.597 3 0.058769 10054 QUIQUE_DMIX8_190116_001 26.673 13.553 39678000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39678000 32479 3893 30321 296116 378108 378108 1 MQMEIDQLR Unmodified 1162.5475 0.54746404 1612 O75145;R4GN36 PPFIA3 Liprin-alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 73.711 73.711 2 0.016007 74704 QUIQUE_C1218_190116_001 66.351 52.348 57671000 32635000 0 0 25035000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32480 1612 30322 296117;296118 378109;378110 378109 2 MQMLEDEDDLAYAETEKK Unmodified 2157.9446 0.94460148 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.342 84.342 3 8.3224E-05 85100 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.78 74.342 223650000 0 22506000 43831000 0 0 34272000 31880000 38574000 0 14763000 0 37828000 0 32481 3053 30323 296119;296120;296121;296122;296123;296124;296125 378111;378112;378113;378114;378115;378116;378117 378115 7 MQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAK Unmodified 2702.3012 0.30123246 4514 Q9UNS2;H7C3P9;C9JLV5 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 140.89 140.89 3 0.05629 143921 QUIQUE_DMIX1_190116_001 21.172 15.197 55900000 0 0 0 0 0 0 0 55900000 0 0 0 0 0 32482 4514 30324 296126 378118 378118 1 MQNDAGEFVDLYVPR Acetyl (Protein N-term) 1794.8247 0.82468476 2785 Q8WVC2;P63220;Q9BYK1;Q9BYK2 RPS21 40S ribosomal protein S21 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.66 157.66 2 2.1531E-29 161716 QUIQUE_C1277_190116_001 163.99 140.87 464960000 36360000 37464000 49013000 0 47302000 41884000 39556000 35672000 26752000 11381000 61094000 35985000 42500000 32483 2785 30325 296127;296128;296129;296130;296131;296132;296133;296134;296135;296136;296137;296138 378119;378120;378121;378122;378123;378124;378125;378126;378127;378128;378129;378130 378120 12 MQNDAGEFVDLYVPR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1810.8196 0.81959938 2785 Q8WVC2;P63220;Q9BYK1;Q9BYK2 RPS21 40S ribosomal protein S21 yes no 1 1 0 1 1 145.28 145.28 2 0.0067459 151491 QUIQUE_C1576_190116_001 47.429 34.076 49285000 0 26902000 0 0 0 0 22383000 0 0 0 0 0 0 32484 2785 30325 296139;296140 378131;378132 378132 2232 1 MQNDTAENETTEK Unmodified 1509.6253 0.62531625 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 0 1 13.805 13.805 2 0.022058 5831 QUIQUE_C1403_190116_001 56.359 50.514 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32485 926;889 30326 296141 378133 378133 1 MQNDTAENETTEKEEK Unmodified 1895.8055 0.80546546 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 12.362 12.362 3 3.0073E-66 3281 QUIQUE_C1563_190116_001 166.35 154.2 520500000 34007000 38040000 64101000 0 4577200 84532000 6841400 0 58254000 0 30365000 102230000 97550000 32486 926;889 30327 296142;296143;296144;296145;296146;296147;296148;296149;296150;296151 378134;378135;378136;378137;378138;378139;378140;378141;378142;378143;378144 378139 11 MQNDTAENETTEKEEK Oxidation (M) 1911.8004 0.80038008 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 1 1 1 1 1 1 10.339 10.339 3 6.0661E-66 2771 QUIQUE_C1277_190116_001 197.15 179.19 28609000 0 12663000 0 0 0 10177000 0 1652400 0 0 0 4116800 0 32487 926;889 30327 296152;296153;296154;296155 378145;378146;378147;378148 378145 524 4 MQNPQILAALQER Unmodified 1510.7926 0.79259677 1033 F8W118;F8VV59;F8VRJ2;B7Z9C2 NAP1L1 yes no 0 0 0 1 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378159;378160;378161;378162;378163;378164;378165;378166;378167;378168;378169;378170;378171 378165 10 MQPQSVLHSGYFHPLLR Unmodified 2009.0305 0.030535628 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.003 86.003 4 1.3784E-05 88422 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.993 80.87 849840000 0 56820000 68937000 86807000 0 60292000 83893000 112770000 101740000 0 66874000 82527000 129180000 32491 2061 30330 296177;296178;296179;296180;296181;296182;296183;296184;296185;296186 378172;378173;378174;378175;378176;378177;378178;378179;378180;378181;378182;378183;378184;378185;378186 378182 15 MQPQSVLHSGYFHPLLR Acetyl (Protein N-term) 2051.0411 0.041100314 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 1 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 117.44 117.44 2;3 0.00013829 120279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.463 68.13 2438600000 0 143390000 233980000 205600000 0 106560000 202150000 341580000 417940000 47824000 33599000 268690000 437230000 32492 2061 30330 296187;296188;296189;296190;296191;296192;296193;296194;296195;296196;296197;296198;296199 378187;378188;378189;378190;378191;378192;378193;378194;378195;378196;378197;378198;378199;378200 378194 14 MQPQSVLHSGYFHPLLR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2067.036 0.036014936 2061 P13716 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase yes yes 1 1 0 1 2 1 1 100.57 100.57 3 0.0017299 103164 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.862 46.881 464480000 0 0 0 0 0 0 0 94146000 107820000 0 127620000 0 134890000 32493 2061 30330 296200;296201;296202;296203;296204 378201;378202;378203;378204;378205;378206;378207 378206 1388 6 MQQHEQALADCR Oxidation (M) 1501.6402 0.64019522 4509 Q9UNE7 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes yes 0 1 0 1 1 12.317 12.317 3 0.0036142 5627 QUIQUE_C1218_190116_001 56.956 48.912 24760000 10605000 0 0 0 0 14155000 0 0 0 0 0 0 0 32494 4509 30331 296205;296206 378208;378209 378208 2986 2 MQQHEQALADCR Unmodified 1485.6453 0.6452806 4509 Q9UNE7 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 16.076 16.076 2;3 0.0011928 8929 QUIQUE_C1218_190116_001 100.04 86.684 441550000 72549000 67268000 79207000 55851000 0 45174000 0 0 32580000 0 0 44248000 44676000 32495 4509 30331 296207;296208;296209;296210;296211;296212;296213;296214;296215;296216 378210;378211;378212;378213;378214;378215;378216;378217;378218;378219;378220;378221 378210 11 MQQHEQALADCRR Unmodified 1641.7464 0.74639163 4509 Q9UNE7 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes yes 0 0 1 1 1 1 1 11.062 11.062 3 0.00011058 3290 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.772 74.627 35124000 0 0 0 0 0 0 3953300 0 0 0 13012000 5504700 12654000 32496 4509 30332 296217;296218;296219;296220 378222;378223;378224;378225;378226 378224 4 MQQLEQMLTALDQMR Unmodified 1834.874 0.87395991 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.01 154.01 2;3 4.7921E-08 161064 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.673 89.162 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378272;378273;378274;378275;378276;378277;378278;378279;378280;378281;378282;378283;378284;378285;378286;378287;378288;378289;378290;378291;378292;378293;378294;378295;378296;378297;378298;378299 378294 28 MQQVGGNSQTESSLPGR Unmodified 1774.8268 0.82681002 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.669 38.669 2 7.3365E-63 35243 QUIQUE_C1218_190116_001 187.44 175.87 50293000 19697000 0 30596000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32501 77 30336 296282;296283;296284;296285;296286 378300;378301;378302;378303;378304 378300 5 MQSACLLSDMESFK Unmodified 1645.715 0.71499965 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 120.12 120.12 2 0.0033247 123541 QUIQUE_C1403_190116_001 81.431 77.349 17911000 0 0 0 17911000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32502 3102 30337 296287 378305 378305 1 MQSFGMK Unmodified 827.36698 0.36698048 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YF78;A0A286YFE1 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 30.379 30.379 2 0.020425 24991 QUIQUE_DMIX8_190116_001 108.24 76.935 946970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 449060000 0 497910000 32503 404 30338 296288;296289 378306;378307 378307 2 MQSLVQWGLDSYDYLQNAPPGFFPR Oxidation (M) 2944.3854 0.38541432 1229 H7C1U8;Q9BUR5;A0A0J9YXS4 APOO Apolipoprotein O yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 168.02 168.02 2;3 6.2247E-159 172145 QUIQUE_DMIX7_190116_001 222.27 206.88 452850000 0 46804000 0 0 0 33749000 47672000 75248000 77168000 0 0 118950000 53256000 32504 1229 30339 296290;296291;296292;296293;296294;296295;296296;296297 378308;378309;378310;378311;378312;378313;378314;378315;378316;378317 378315 706 10 MQSVAAFAVSAVASQWER Unmodified 1936.9465 0.94653123 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;A0A2R8YG95;E7ET92;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0;A0A2R8YG53 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 150.97 150.97 3 0.00073852 155739 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.123 49.3 98128000 15562000 0 0 14014000 0 0 0 17811000 35064000 0 0 15676000 0 32505 454 30340 296298;296299;296300;296301;296302 378318;378319;378320;378321;378322 378321 5 MQTDKPFDQTTISLQMGTNK Unmodified 2283.0875 0.087517738 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 86.795 86.795 2;3 3.0161E-133 88537 QUIQUE_DMIX3_190116_001 247.9 222.45 1117500000 66839000 60006000 65982000 127380000 0 115640000 58900000 202030000 228720000 0 155500000 0 36485000 32506 3137;908 30341 296303;296304;296305;296306;296307;296308;296309;296310;296311;296312;296313;296314;296315 378323;378324;378325;378326;378327;378328;378329;378330;378331;378332;378333;378334;378335 378331 11 MQTFSPAGSK Unmodified 1052.4961 0.4960804 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 27.556 27.556 2 0.037111 20913 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.126 24.639 35989000 23725000 0 0 0 0 0 0 0 0 12264000 0 0 0 32507 1492 30342 296316;296317 378336;378337 378337 2 MQTNQTPPTYNK Unmodified 1421.6609 0.66091389 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;F5H1T6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.714 22.714 2 0.00046872 16018 QUIQUE_C1438_190116_001 130.98 115.84 855690000 63682000 70082000 94081000 73210000 75893000 51397000 107250000 0 0 23046000 121380000 71979000 103690000 32508 3780 30343 296318;296319;296320;296321;296322;296323;296324;296325;296326;296327;296328 378338;378339;378340;378341;378342;378343;378344;378345;378346;378347;378348;378349 378343 12 MQTNQTPPTYNK Oxidation (M) 1437.6558 0.65582851 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;F5H1T6 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 17.558 17.558 2 0.00019574 10477 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.53 93.907 262760000 0 0 0 13683000 0 0 0 37969000 40083000 22228000 53379000 27005000 68411000 32509 3780 30343 296329;296330;296331;296332;296333;296334;296335 378350;378351;378352;378353;378354;378355;378356;378357 378352 2731 7 MQTQQVNTLK Unmodified 1189.6125 0.61250714 1610 O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 22.481 22.481 2 0.018016 15709 QUIQUE_C1218_190116_001 76.17 40.29 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32510 1610 30344 296336 378358 378358 1 MQVDQEEPHVEEQQQQTPAENK Oxidation (M) 2637.1613 0.16128762 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 1 0 1 1 1 31.203 31.203 3 2.6478E-05 26022 QUIQUE_C1218_190116_001 58.883 54.988 120260000 50730000 0 0 0 40102000 0 0 0 0 29428000 0 0 0 32511 2363 30345 296337;296338;296339 378359;378360;378361 378359 1758 3 MQVDQEEPHVEEQQQQTPAENK Unmodified 2621.1664 0.166373 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 40.516 40.516 2;3 0 35702 QUIQUE_C1368_190116_001 341.69 323.98 1308400000 230970000 95666000 506430000 104410000 111470000 0 89462000 0 0 70281000 45198000 54555000 0 32512 2363 30345 296340;296341;296342;296343;296344;296345;296346;296347;296348;296349;296350;296351;296352;296353;296354 378362;378363;378364;378365;378366;378367;378368;378369;378370;378371;378372;378373;378374;378375;378376;378377 378367 16 MQVDQEEPHVEEQQQQTPAENKAESEEMETSQAGSK Unmodified 4085.7702 0.77022552 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 56.778 56.778 4 0 55767 QUIQUE_DMIX5_190116_001 244.48 240.08 572870000 0 0 0 0 0 0 0 75907000 0 0 77813000 84633000 334520000 32513 2363 30346 296355;296356;296357;296358 378378;378379;378380;378381 378379 4 MQVNAEEVVVGDLVEIK Unmodified 1870.971 0.97101464 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 3 1 2 2 1 138.71 138.71 2;3 0.00023002 141808 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.979 56.049 513360000 13388000 0 81508000 0 140980000 0 53449000 76234000 95888000 0 51907000 0 0 32514 1371 30347 296359;296360;296361;296362;296363;296364;296365;296366;296367;296368;296369 378382;378383;378384;378385;378386;378387;378388;378389;378390;378391;378392 378389 9 MQYAPNTQVEILPQGHESPIFK Unmodified 2526.2577 0.25769461 2421 P40121;H7C0X8 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 103.44 103.44 2;3 3.6569E-15 106035 QUIQUE_C1277_190116_001 84.166 75.294 1381700000 199780000 197870000 412210000 344360000 0 227460000 0 0 0 0 0 0 0 32515 2421 30348 296370;296371;296372;296373;296374;296375 378393;378394;378395;378396;378397;378398;378399;378400 378395 7 MQYAPNTQVEILPQGHESPIFK Oxidation (M) 2542.2526 0.25260923 2421 P40121;H7C0X8 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 96.49 96.49 3 2.5731E-05 97370 QUIQUE_C1563_190116_001 59.163 56.28 206190000 0 48899000 0 67343000 0 49532000 0 0 0 40416000 0 0 0 32516 2421 30348 296376;296377;296378;296379;296380 378401;378402;378403;378404;378405 378404 1841 4 MRAEDGENYDIKK Oxidation (M) 1583.725 0.72497071 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6;E5RIX8 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 13.534 13.534 3 0.010409 5047 QUIQUE_C1277_190116_001 73.927 69.864 301670000 18954000 3881000 27659000 0 34834000 0 34323000 0 41714000 0 119510000 20795000 0 32517 843 30349 296381;296382;296383;296384;296385;296386;296387;296388 378406;378407;378408;378409;378410;378411;378412;378413 378407 492 8 MRAEDGENYDIKK Unmodified 1567.7301 0.73005609 843 E5RIW3;E5RJD8;O75347;E5RHG6;E5RIX8 TBCA Tubulin-specific chaperone A yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 18.736 18.736 3 0.0018741 11363 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.483 65.64 501360000 0 0 0 0 38098000 0 0 85644000 86451000 0 107650000 82724000 100790000 32518 843 30349 296389;296390;296391;296392;296393;296394 378414;378415;378416;378417;378418;378419 378417 6 MRDVVLSIVNDLTIAESNCPR Oxidation (M) 2417.2043 0.20427883 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 1 1 1 141.2 141.2 3 0.0003817 144172 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.963 54.341 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chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.904 65.904 3 0.002291 66426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.884 68.53 3312300000 0 125310000 112510000 108500000 157230000 0 237700000 308630000 357700000 87161000 503390000 431730000 882380000 32526 50 30356 296436;296437;296438;296439;296440;296441;296442;296443;296444;296445;296446 378468;378469;378470;378471;378472;378473;378474;378475;378476;378477;378478;378479;378480 378473 38 11 MREHLELFWSR Unmodified 1502.7453 0.74525264 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 2 1 73.42 73.42 3 0.001142 74012 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.85 64.12 435680000 0 0 0 0 0 0 0 0 65627000 0 273430000 96623000 0 32527 50 30356 296447;296448;296449;296450 378481;378482;378483;378484;378485 378485 5 MREIVHLQAGQCGNQIGAK Unmodified 2109.0572 0.057161084 2797;1862;1364;1363 P04350;M0R2D3;M0QY85;M0R0X0;M0QX14;M0R2T4;P68371;M0QYM7;M0R042;M0QY37 TUBB4A;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta-4B chain no no 0 0 1 1 1 1 1 3 4 3 3 3 40.884 40.884 2;3;4 1.2847E-131 38189 QUIQUE_DMIX1_190116_001 246.96 0 8848300000 0 38050000 75724000 0 60661000 0 52871000 3769000000 1303800000 0 1318200000 920170000 1309800000 32528 1862;2797;1364;1363 30357 296451;296452;296453;296454;296455;296456;296457;296458;296459;296460;296461;296462;296463;296464;296465;296466;296467;296468;296469;296470 378486;378487;378488;378489;378490;378491;378492;378493;378494;378495;378496;378497;378498;378499;378500;378501;378502;378503;378504;378505;378506;378507;378508;378509;378510;378511;378512;378513;378514;378515;378516;378517 378497 30 MRETAFEEDVQLPR Unmodified 1719.825 0.82501911 4346 Q9NZH0 GPRC5B G-protein coupled receptor family C group 5 member B yes yes 0 0 1 2 76.685 76.685 3 0.00077149 76554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.789 61.997 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32529 4346 30358 296471;296472 378518;378519 378518 2 MRGEAEAFAIGAR Unmodified 1377.6823 0.68231804 1673 O75955;A0A140T9R1;A0A140T9W4 FLOT1 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296487;296488;296489 378534;378535;378536 378534 3 MSADDGIR Unmodified 863.38072 0.38071629 2995 Q13425 SNTB2 Beta-2-syntrophin no no 0 0 0 1 1 20.593 20.593 2 0.061928 13706 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.786 22.979 27413000 0 0 0 0 0 0 0 18120000 0 9292900 0 0 0 32537 2995 30364 296490;296491 378537;378538 378537 2 MSAEAALSHSYFR Unmodified 1468.6769 0.67689831 2905 Q07002 CDK18 Cyclin-dependent kinase 18 yes yes 0 0 0 1 1 70.125 70.125 3 0.0045358 70456 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.265 39.129 36598000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19916000 16682000 0 32538 2905 30365 296492;296493 378539;378540 378540 2 MSAEINEIIR Oxidation (M) 1190.5965 0.59652272 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 1 0 1 60.216 60.216 2 0.047025 55953 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.276 35.395 18045000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18045000 0 0 0 32539 2135 30366 296494 378541 378541 1 MSALQESR Unmodified 920.43857 0.43856552 4608;1367 M0QZ28;E9PEY4;E7EVB6;O60941;Q9Y4J8 DTNA;DTNB Dystrobrevin;Dystrobrevin beta;Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 18.494 18.494 2 0.015074 10944 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.161 55.823 38784000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38784000 0 0 0 32540 1367;4608 30367 296495 378542 378542 1 MSASDPNSSIFLTDTAK Unmodified 1783.8298 0.82982971 2213 P23381;H0YJP3 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.073 87.073 2 6.6674E-75 84278 QUIQUE_DMIX4_190116_001 198.74 177.11 2773400000 181880000 202740000 582520000 288440000 190510000 0 215130000 202410000 178730000 70700000 356530000 155060000 148730000 32541 2213 30368 296496;296497;296498;296499;296500;296501;296502;296503;296504;296505;296506;296507 378543;378544;378545;378546;378547;378548;378549;378550;378551;378552;378553;378554;378555;378556 378552 14 MSASDPNSSIFLTDTAK Oxidation (M) 1799.8247 0.82474434 2213 P23381;H0YJP3 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 76.016 76.016 2 9.0326E-63 76373 QUIQUE_C1368_190116_001 187.11 176.5 632930000 0 0 135700000 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3030;4044;2797 P68371;Q13885;Q9BVA1 TUBB4B;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 1 0 4 3 2 3 3 2 5 2 1 2 3 2 3 141.07 141.07 2 3.7538E-121 142415 QUIQUE_C1403_190116_001 227.31 24.869 60534000000 3936300000 5050400000 4212900000 3687500000 3817400000 3361000000 4799000000 4238800000 5266300000 3393500000 7047600000 5469500000 6253500000 32545 2797;3030;4044 30371 296524;296525;296526;296527;296528;296529;296530;296531;296532;296533;296534;296535;296536;296537;296538;296539;296540;296541;296542;296543;296544;296545;296546;296547;296548;296549;296550;296551;296552;296553;296554;296555;296556;296557;296558 378578;378579;378580;378581;378582;378583;378584;378585;378586;378587;378588;378589;378590;378591;378592;378593;378594;378595;378596;378597;378598;378599;378600;378601;378602;378603;378604;378605;378606;378607;378608;378609;378610;378611;378612;378613;378614;378615;378616;378617;378618;378619;378620;378621;378622;378623;378624 378589 2245 47 MSATFIGNSTAIQELFK Unmodified 1856.9342 0.93423521 3030;4044;2797 P68371;Q13885;Q9BVA1 TUBB4B;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 4 4 3 3 4 5 6 3 5 3 4 7 4 144.07 144.07 2;3 1.4054E-121 151146 QUIQUE_C1368_190116_001 230.59 19.804 221270000000 18094000000 20253000000 15969000000 16658000000 18740000000 14163000000 21095000000 16117000000 16099000000 5009100000 21322000000 18764000000 18982000000 32546 2797;3030;4044 30371 296559;296560;296561;296562;296563;296564;296565;296566;296567;296568;296569;296570;296571;296572;296573;296574;296575;296576;296577;296578;296579;296580;296581;296582;296583;296584;296585;296586;296587;296588;296589;296590;296591;296592;296593;296594;296595;296596;296597;296598;296599;296600;296601;296602;296603;296604;296605;296606;296607;296608;296609;296610;296611;296612;296613 378625;378626;378627;378628;378629;378630;378631;378632;378633;378634;378635;378636;378637;378638;378639;378640;378641;378642;378643;378644;378645;378646;378647;378648;378649;378650;378651;378652;378653;378654;378655;378656;378657;378658;378659;378660;378661;378662;378663;378664;378665;378666;378667;378668;378669;378670;378671;378672;378673;378674;378675;378676;378677;378678;378679;378680;378681;378682;378683;378684;378685;378686;378687;378688;378689;378690;378691;378692;378693;378694;378695;378696;378697;378698;378699;378700;378701;378702;378703;378704;378705;378706;378707;378708;378709;378710;378711;378712;378713;378714;378715;378716;378717;378718;378719;378720;378721;378722;378723;378724;378725;378726;378727;378728;378729 378646 105 MSATFIGNSTAIQELFKR Unmodified 2013.0353 0.035346234 3030;4044;2797 P68371;Q13885;Q9BVA1 TUBB4B;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 127.89 127.89 2;3 9.2729E-64 133099 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component DHKTD1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 116.93 116.93 3 0.00014224 120239 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.746 73.89 220900000 0 47620000 67338000 0 0 0 0 22982000 0 0 48614000 0 34346000 32549 3874 30373 296633;296634;296635;296636;296637 378758;378759;378760;378761;378762 378760 4 MSDEEILEK Oxidation (M) 1108.4958 0.49580562 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCM0 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 31.642 31.642 2 0.00052968 26581 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.89 83.082 364550000 0 46357000 0 0 36405000 0 33757000 0 0 51285000 66472000 62541000 67736000 32550 2970 30374 296638;296639;296640;296641;296642;296643;296644 378763;378764;378765;378766;378767;378768;378769;378770;378771 378768 2431 9 MSDGLFLQK Oxidation (M) 1053.5165 0.51648149 2558 P50213;H0YL72 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.086 54.086 2 0.00060305 52534 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.41 88.413 1047700000 108240000 104460000 129290000 73913000 90295000 89896000 0 73433000 0 81423000 0 133940000 162820000 32551 2558 30375 296645;296646;296647;296648;296649;296650;296651;296652;296653;296654 378772;378773;378774;378775;378776;378777;378778;378779;378780;378781;378782 378779 2001 11 MSDGLFLQK Unmodified 1037.5216 0.52156686 2558 P50213;H0YL72 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 68.918 68.918 2 0.0024551 68594 QUIQUE_C1277_190116_001 93.561 70.848 1531300000 512170000 484610000 534570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32552 2558 30375 296655;296656;296657 378783;378784;378785 378784 3 MSDSLDTDPSMLGSSK Oxidation (M) 1685.7124 0.71241669 2164 P20337 RAB3B Ras-related protein Rab-3B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.041 63.041 2 1.4959E-13 61839 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.02 117.72 327160000 26044000 34287000 33924000 31281000 0 32773000 0 29212000 51406000 9370100 49410000 29452000 0 32553 2164 30376 296658;296659;296660;296661;296662;296663;296664;296665;296666;296667;296668 378786;378787;378788;378789;378790;378791;378792;378793;378794;378795;378796 378791 1508;1509 11 MSDSLDTDPSMLGSSK Unmodified 1669.7175 0.71750207 2164 P20337 RAB3B Ras-related protein Rab-3B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.992 76.992 2 3.9223E-13 77066 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.8 143.52 917880000 78652000 100480000 99954000 84890000 0 86422000 80262000 76309000 76168000 31932000 122400000 80410000 0 32554 2164 30376 296669;296670;296671;296672;296673;296674;296675;296676;296677;296678;296679 378797;378798;378799;378800;378801;378802;378803;378804;378805;378806;378807;378808 378804 10 MSEDKPQDYK Unmodified 1239.5442 0.5441528 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0;A0A2R8YG06 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 14.23 14.23 2;3 6.9824E-05 5868 QUIQUE_C1563_190116_001 163.91 104.93 393630000 0 0 26704000 38400000 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296694;296695;296696;296697;296698;296699;296700;296701;296702;296703;296704;296705;296706 378824;378825;378826;378827;378828;378829;378830;378831;378832;378833;378834;378835;378836 378831 1507 9 MSESLETDPAITAAK Oxidation (M) 1578.7447 0.7447031 3839 Q96E17 RAB3C Ras-related protein Rab-3C yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 52.975 52.975 2 4.8891E-18 51352 QUIQUE_C1218_190116_001 140.24 105.02 105450000 57685000 47764000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32558 3839 30379 296707;296708;296709;296710;296711;296712 378837;378838;378839;378840;378841;378842 378837 2748 6 MSESLETDPAITAAK Unmodified 1562.7498 0.74978848 3839 Q96E17 RAB3C Ras-related protein Rab-3C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.097 63.097 2 4.7606E-06 63090 QUIQUE_C1218_190116_001 142.89 95.292 1104200000 119070000 104400000 120250000 107350000 0 93459000 148930000 57633000 0 0 138090000 94929000 120040000 32559 3839 30379 296713;296714;296715;296716;296717;296718;296719;296720;296721;296722 378843;378844;378845;378846;378847;378848;378849;378850;378851;378852;378853 378843 11 MSEYITTALR Unmodified 1183.5907 0.59070906 3265 Q59EK9 RUNDC3A RUN domain-containing protein 3A yes yes 0 0 0 1 73.369 73.369 2 0.030633 74032 QUIQUE_C1218_190116_001 64.654 32.512 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32560 3265 30380 296723 378854 378854 1 MSFLFSAFK Unmodified 1076.5365 0.53648865 3702 Q8WUX9;E5RJI3;E5RIU9;E5RFR8 CHMP7 Charged multivesicular body protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 130.33 130.33 2 0.0079449 135041 QUIQUE_C1368_190116_001 80.165 51.947 90761000 0 16081000 16271000 11816000 0 0 15247000 0 31346000 0 0 0 0 32561 3702 30381 296724;296725;296726;296727;296728 378855;378856;378857;378858;378859;378860 378857 6 MSFQNLLAK Unmodified 1050.5532 0.55320134 1437;437 A0A2R8Y611;K7ELX8;O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 93.202 93.202 2 0.0060558 96845 QUIQUE_C1218_190116_001 85.272 48.512 359020000 76761000 107610000 0 0 0 0 0 0 0 14998000 78277000 81379000 0 32562 437;1437 30382 296729;296730;296731;296732;296733 378861;378862;378863;378864;378865;378866 378861 5 MSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSR Oxidation (M) 2580.1544 0.1544281 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 53.828 53.828 3 2.3289E-46 49498 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.29 135.1 459280000 0 0 0 0 0 0 0 102770000 0 146760000 0 89505000 120250000 + 32563 1859 30383 296734;296735;296736;296737;296738;296739 378867;378868;378869;378870;378871;378872;378873;378874 378869 1073 8 MSGECAPNVSVSVSTSHTTISGGGSR Unmodified 2564.1595 0.15951348 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.187 59.187 3 2.8088E-58 57803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.01 123.55 425350000 0 0 0 0 0 0 0 62429000 59469000 131290000 63522000 108650000 0 + 32564 1859 30383 296740;296741;296742;296743;296744;296745 378875;378876;378877;378878;378879;378880;378881;378882 378875 7 MSGGWELELNGTEAK Oxidation (M) 1636.7403 0.74028642 2906 Q07021;I3L3Q7;I3L3B0 C1QBP Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 86.759 86.759 2 4.901E-66 87854 QUIQUE_DMIX1_190116_001 203.51 184.16 378800000 0 35675000 0 0 0 0 38323000 53121000 54223000 34749000 0 97243000 65464000 32565 2906 30384 296746;296747;296748;296749;296750;296751;296752;296753;296754 378883;378884;378885;378886;378887;378888;378889;378890;378891;378892 378886 2384 8 MSGGWELELNGTEAK Unmodified 1620.7454 0.7453718 2906 Q07021;I3L3Q7;I3L3B0 C1QBP Complement component 1 Q subcomponent-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 96.863 96.863 2 0.00026192 98777 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.23 64.995 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32566 2906 30384 296755;296756 378893;378894 378894 2 MSIFGHSMGGHGALICALK Oxidation (M) 2001.9587 0.95869259 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 76.475 76.475 3 4.4131E-06 76792 QUIQUE_C1368_190116_001 97.081 87.324 368170000 47229000 73539000 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296790;296791;296792;296793;296794;296795;296796;296797;296798;296799;296800;296801;296802 378932;378933;378934;378935;378936;378937;378938;378939;378940;378941;378942;378943;378944 378939 8 MSISEGTVSDK Oxidation (M) 1168.5282 0.52816838 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 20.451 20.451 2 0.00089551 13424 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.143 58.585 386180000 0 32037000 32421000 0 0 40855000 0 71588000 50972000 13248000 52924000 40524000 51609000 32572 2483 30387 296803;296804;296805;296806;296807;296808;296809;296810;296811;296812 378945;378946;378947;378948;378949;378950;378951;378952;378953;378954 378952 1917 9 MSLEDLHSLDSR Unmodified 1401.6558 0.65582851 4253 Q9NQC7;H3BS09 CYLD Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD yes no 0 0 0 1 1 1 1 80.476 80.476 3 0.031707 81835 QUIQUE_C1368_190116_001 47.915 35.647 17125000 0 0 0 0 17125000 0 0 0 0 0 0 0 0 32573 4253 30388 296813;296814;296815;296816 378955;378956;378957;378958 378956 4 MSLFYAEATPMLK Unmodified 1500.7357 0.73565874 4300;4121 Q9H0Q0;Q9NUQ9;A0A1W2PRQ0;A0A087X178 FAM49A;FAM49B Protein FAM49A;Protein FAM49B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.17 123.17 2 0.00091735 126418 QUIQUE_C1403_190116_001 130.94 115.37 320580000 120630000 0 0 120550000 0 79397000 0 0 0 0 0 0 0 32574 4121;4300 30389 296817;296818;296819;296820;296821;296822;296823;296824;296825 378959;378960;378961;378962;378963;378964;378965;378966;378967;378968 378960 8 MSLFYAEATPMLK Oxidation (M) 1516.7306 0.73057336 4300;4121 Q9H0Q0;Q9NUQ9;A0A1W2PRQ0;A0A087X178 FAM49A;FAM49B Protein FAM49A;Protein FAM49B no no 0 1 0 1 107.37 107.37 2 0.0056268 110756 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.776 55.16 102400000 0 0 0 0 0 0 0 0 102400000 0 0 0 0 32575 4121;4300 30389 296826 378969 378969 2864 1 MSLHNLATVFGPTLLR Unmodified 1768.9658 0.96581011 366;2020 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05;P11274 ABR;BCR Active breakpoint cluster region-related protein;Breakpoint cluster region protein no no 0 0 0 1 132.95 132.95 3 0.0033258 136710 QUIQUE_C1403_190116_001 50.053 42.272 11508000 0 0 0 11508000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32576 366;2020 30390 296827 378970 378970 1 MSLHNLATVFGPTLLRPSEK Unmodified 2210.1882 0.18815848 2020 P11274 BCR Breakpoint cluster region protein yes yes 0 0 1 1 1 116.06 116.06 4 0.023211 118625 QUIQUE_DMIX1_190116_001 17.231 13.253 42842000 0 0 0 16530000 0 0 0 26313000 0 0 0 0 0 32577 2020 30391 296828;296829 378971;378972 378972 1 MSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK Unmodified 2525.3312 0.3311939 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 1 1 121.52 121.52 4 3.6472E-05 127802 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.061 47.439 68161000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68161000 0 0 32578 366 30392 296830 378973 378973 1 MSLHNLATVFGPTLLRPSEVESK Oxidation (M) 2541.3261 0.32610853 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 1 1 1 105.68 105.68 4 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21.694 3 0.019668 15061 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.211 34.233 49055000 0 0 0 0 0 0 0 0 49055000 0 0 0 0 32588 2017 30399 296863;296864 379007;379008 379007 1 MSMKEVDEQMLAIQSK Oxidation (M) 1882.8839 0.88385589 3006 Q13509;A0A0B4J269 TUBB3 Tubulin beta-3 chain yes no 0 1 1 1 1 69.448 69.448 2;3 0.00023634 70299 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.992 80.505 60036000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60036000 0 0 32589 3006 30400 296865;296866 379009;379010 379009 2448;2451;2452 1 MSMKEVDEQMLAIQSK 2 Oxidation (M) 1898.8788 0.87877052 3006 Q13509;A0A0B4J269 TUBB3 Tubulin beta-3 chain yes no 0 2 1 1 53.567 53.567 2 4.7718E-06 51676 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.688 71.809 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32590 3006 30400 296867 379011 379011 2448;2451;2452 1 MSMKEVDEQMLNVQNK 3 Oxidation (M) 1970.8747 0.87474777 3030;4044;2797;1922 Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13885;Q9BVA1 TUBB;TUBB4B;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 3 1 1 2 2 1 24.536 24.536 2;3 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HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 1 1 1 1 1 142.47 142.47 3;4 0.0013414 147446 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.497 36.136 88330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41572000 46758000 32600 335;1521 30405 296936;296937;296938 379082;379083;379084;379085 379084 233;234 4 MSPLSIVTALVDK Unmodified 1372.7636 0.76358805 4575 Q9Y305;C9J7L8 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 157.91 157.91 2 0.00036881 163358 QUIQUE_C1218_190116_001 113.22 95.405 641690000 89935000 65950000 77984000 69677000 67172000 58334000 65365000 19548000 33095000 16700000 46522000 0 31410000 32601 4575 30406 296939;296940;296941;296942;296943;296944;296945;296946;296947;296948;296949;296950;296951 379086;379087;379088;379089;379090;379091;379092;379093;379094;379095;379096;379097;379098;379099;379100;379101;379102 379087 15 MSPLSIVTALVDKIDMCK Oxidation (M) 2036.0356 0.035605509 4575 Q9Y305;C9J7L8 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 1 1 1 168.39 168.39 3 0.01416 172109 QUIQUE_C1277_190116_001 45.257 36.438 28076000 0 28076000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32602 4575 30407 296952 379103 379103 1 MSPLSIVTALVDKIDMCK Unmodified 2020.0407 0.040690887 4575 Q9Y305;C9J7L8 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 168.43 168.43 3 5.9939E-11 175709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.53 101.28 298370000 0 0 0 0 0 0 0 0 36758000 0 127020000 0 134590000 32603 4575 30407 296953;296954;296955 379104;379105;379106;379107;379108 379106 5 MSPNETLFLESTNK Unmodified 1609.7658 0.76577289 4213 Q9HB90 RRAGC Ras-related GTP-binding protein C no no 0 0 0 1 1 1 1 87.248 87.248 2 0.0002368 90036 QUIQUE_C1218_190116_001 92.112 76.846 202470000 91626000 0 0 0 0 0 110840000 0 0 0 0 0 0 32604 4213 30408 296956;296957;296958;296959 379109;379110;379111;379112 379109 4 MSQDDFQSPPIVELR Unmodified 1760.8403 0.84033482 3280 Q5JVZ5;Q96JJ3;H0YCM7;Q5JW01 ELMO2 Engulfment and cell motility protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 106.73 106.73 2 0.00057297 110033 QUIQUE_C1277_190116_001 95.417 86.134 90399000 0 26232000 0 0 0 0 0 0 34467000 0 29701000 0 0 32605 3280 30409 296960;296961;296962 379113;379114;379115 379113 3 MSQIDISSGSGLNDGQWHEVR Unmodified 2315.0601 0.060057435 4429 Q9UHC6 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes yes 0 0 0 2 88.647 88.647 3 2.9772E-06 90955 QUIQUE_C1218_190116_001 59.339 45.298 56184000 56184000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32606 4429 30410 296963;296964 379116;379117 379116 1 MSQLPMPGGTAPSPLRPWAPQIK Unmodified 2459.2817 0.28174129 1471 O14994;A0A0A0MR68;A0A087WTG8 SYN3 Synapsin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 115.45 115.45 3 0.0049033 119716 QUIQUE_C1218_190116_001 44.632 33.643 104390000 49227000 0 0 39312000 0 0 0 0 0 15851000 0 0 0 32607 1471 30411 296965;296966;296967 379118;379119;379120;379121 379118 3 MSQSIIVSGESGAGK Unmodified 1449.7133 0.71334339 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 44.616 44.616 2 1.105E-05 41334 QUIQUE_C1403_190116_001 95.417 82.144 0 0 0 0 0 0 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76.759 69.878 139450000 27186000 24744000 50369000 17425000 19725000 0 0 0 0 0 0 0 0 32611 1536 30414 296980;296981;296982;296983;296984;296985 379134;379135;379136;379137;379138;379139 379137 6 MSSEVVDSNPYSR Unmodified 1469.6457 0.64565776 4110 Q9GZZ9;E7EQ61;E7EWE1 UBA5 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.777 48.777 2 0.00014793 46405 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.898 80.118 268460000 33066000 0 47182000 51200000 0 51432000 0 0 39931000 0 0 45654000 0 32612 4110 30415 296986;296987;296988;296989;296990;296991;296992;296993;296994 379140;379141;379142;379143;379144;379145;379146;379147;379148 379146 9 MSSEVVDSNPYSR Oxidation (M) 1485.6406 0.64057238 4110 Q9GZZ9;E7EQ61;E7EWE1 UBA5 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 yes no 0 1 0 1 37.311 37.311 2 4.7101E-05 33078 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.06 88.275 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32613 4110 30415 296995 379149 379149 2861 1 MSSFGDFVALSDVCDVPTAK Oxidation (M) 2160.9708 0.97075665 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.76 134.76 2 1.5328E-29 141181 QUIQUE_C1438_190116_001 143.05 135.51 533330000 34461000 43433000 53769000 32584000 30039000 34312000 28936000 0 52092000 36475000 70697000 56490000 60042000 32614 2339 30416 296996;296997;296998;296999;297000;297001;297002;297003;297004;297005;297006;297007;297008 379150;379151;379152;379153;379154;379155;379156;379157;379158;379159;379160;379161;379162 379155 1739 12 MSSFGDFVALSDVCDVPTAK Unmodified 2144.9758 0.97584202 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.92 140.92 2 9.2663E-30 145194 QUIQUE_C1403_190116_001 144.88 132.25 1285100000 144710000 127960000 173060000 133670000 135670000 125710000 140430000 88375000 0 0 109900000 105660000 0 32615 2339 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297022;297023;297024;297025;297026;297027;297028;297029;297030;297031;297032;297033;297034;297035;297036;297037;297038;297039;297040;297041;297042;297043 379178;379179;379180;379181;379182;379183;379184;379185;379186;379187;379188;379189;379190;379191;379192;379193;379194;379195;379196;379197;379198;379199;379200;379201;379202;379203;379204;379205;379206;379207;379208;379209;379210;379211;379212;379213;379214;379215 379178 2453 37 MSSTFIGNSTAIQELFK Unmodified 1872.9291 0.92914983 3006 Q13509;A0A0B4J269 TUBB3 Tubulin beta-3 chain yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 3 2 3 2 3 139.75 139.75 3 9.4151E-31 142497 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.63 0 6838300000 296610000 668440000 679750000 601250000 637360000 541930000 243160000 376370000 491510000 288860000 716490000 653360000 643230000 32618 3006 30418 297044;297045;297046;297047;297048;297049;297050;297051;297052;297053;297054;297055;297056;297057;297058;297059;297060;297061;297062;297063;297064;297065;297066;297067;297068;297069;297070 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P26583;D6R9A6;P09429;Q5T7C4;B2RPK0 HMGB2;HMGB1;HMGB1P1 High mobility group protein B2;High mobility group protein B1;Putative high mobility group protein B1-like 1 no no 0 0 0 1 1 1 97.676 97.676 2 0.0034454 102305 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.52 35.259 205210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 205210000 0 0 32623 2252;1960 30421 297094;297095;297096 379278;379279;379280 379279 2 MSTEEIIQR Unmodified 1105.5438 0.54375887 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50;E9PLG2 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 0 1 47.296 47.296 2 0.0202 42100 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.498 64.794 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32624 4672 30422 297097 379281 379281 1 MSTGTFVVSQPLNYR Unmodified 1698.8399 0.83994089 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 95.518 95.518 2 5.5714E-06 99403 QUIQUE_C1438_190116_001 135.99 120.84 749690000 0 0 113700000 0 67647000 46723000 82233000 0 86103000 31050000 133920000 81396000 106930000 32625 2522 30423 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protein kinase 10;Mitogen-activated protein kinase 8;Mitogen-activated protein kinase 9 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.22 152.22 2 0.0027638 159086 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.692 75.56 425280000 0 63715000 58277000 59132000 0 0 61644000 0 0 9968400 0 96223000 76317000 32638 397;2473 30431 297236;297237;297238;297239;297240;297241;297242;297243;297244 379458;379459;379460;379461;379462;379463;379464;379465;379466;379467 379465 9 MTAAQPSETTVGNMVR Unmodified 1691.7971 0.7970898 2545 P49770;H0YJJ8;G3V5E5 EIF2B2 Translation initiation factor eIF-2B subunit beta yes no 0 0 0 1 60.977 60.977 2 0.012681 59971 QUIQUE_C1277_190116_001 64.64 37.967 22146000 0 22146000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32639 2545 30432 297245 379468 379468 0 MTAFDADDPATDNALLR Unmodified 1835.836 0.83597772 2666 P55290 CDH13 Cadherin-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 109.41 109.41 2 2.1658E-12 112507 QUIQUE_C1277_190116_001 122.46 105.93 352570000 40728000 48806000 58188000 44710000 43652000 43059000 73422000 0 0 0 0 0 0 32640 2666 30433 297246;297247;297248;297249;297250;297251;297252 379469;379470;379471;379472;379473;379474;379475;379476;379477 379470 9 MTALAQDFAVGLGPR Unmodified 1545.7973 0.79734779 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 116.02 116.02 2 0.0032793 119330 QUIQUE_C1403_190116_001 100.72 86.303 18093000 0 0 0 18093000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32641 2562 30434 297253 379478 379478 0 MTANQVQIPR Oxidation (M) 1172.5972 0.59719142 4458 Q9UJQ1 LAMP5 Lysosome-associated membrane glycoprotein 5 yes yes 0 1 0 1 31.594 31.594 2 0.0031255 26793 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.819 71.433 37435000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37435000 0 0 32642 4458 30435 297254 379479 379479 2973 1 MTANSVLEPGNSEVSLVCEK Unmodified 2163.0188 0.018769471 1992 P10155;G5E9R9 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes no 0 0 0 1 1 98.004 98.004 2 4.3063E-09 100663 QUIQUE_C1277_190116_001 109.48 100.43 59837000 0 23522000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36315000 0 32643 1992 30436 297255;297256 379480;379481 379480 1 MTASAASELILSK Unmodified 1320.6959 0.69590241 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 86.203 86.203 2 0.039369 88577 QUIQUE_C1218_190116_001 58.674 40.81 59733000 59733000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32644 981;4494 30437 297257 379482 379482 0 MTASAASELILSK Oxidation (M) 1336.6908 0.69081704 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 1 0 1 1 66.588 66.588 2 0.010475 62132 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.691 8.5235 41727000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41727000 0 0 0 32645 981;4494 30437 297258;297259 379483;379484 379484 594 2 MTATGSGENSTVAEHLIAQHSAIK Unmodified 2452.2016 0.20163629 846 E7EM64;Q7L5N1;H7C3T0 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 3 2 1 1 1 64.937 64.937 3;4 1.6602E-11 64044 QUIQUE_C1368_190116_001 85.467 81.739 1056800000 0 79932000 125780000 124900000 101690000 212960000 192570000 0 120900000 14660000 83465000 0 0 32646 846 30438 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no 0 0 0 1 61.509 61.509 2 0.051621 60835 QUIQUE_C1218_190116_001 56.729 29.592 40553000 40553000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32660 4631 30445 297465 379778 379778 1 MTELADVFSGVKPLTR Unmodified 1762.9288 0.9287559 2942 Q12768;E7EQI7 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes no 0 0 1 1 113.11 113.11 3 0.027575 115315 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.559 43.445 26752000 0 0 0 0 0 0 0 26752000 0 0 0 0 0 32661 2942 30446 297466 379779 379779 0 MTELFQSLADLNNVR Unmodified 1749.872 0.8719693 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 0 0 1 1 1 140.18 140.18 2 0.00056852 144356 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.062 52.808 23360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23360000 0 0 0 32662 2486 30447 297467;297468;297469 379780;379781;379782 379780 3 MTELFQSLADLNNVR Oxidation (M) 1765.8669 0.86688392 2486 P46939;Q5T097 UTRN Utrophin yes no 0 1 0 1 130.04 130.04 2 0.0023636 126399 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.262 27.628 24023000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24023000 0 0 0 32663 2486 30447 297470 379783 379783 1919 1 MTELYDYPK Unmodified 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379822;379823;379824;379825;379826;379827;379828;379829;379830;379831;379832;379833;379834;379835;379836;379837;379838;379839;379840;379841;379842;379843;379844;379845;379846;379847;379848;379849;379850;379851 379841 25 MTGSNTEEIDSR Unmodified 1338.5722 0.57215846 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 21.719 21.719 2 2.3409E-06 14781 QUIQUE_C1218_190116_001 148.32 137.56 51434000 51434000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32675 3597 30457 297533 379852 379852 0 MTGSNTEEIDSR Oxidation (M) 1354.5671 0.56707309 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 16.746 16.746 2 1.136E-05 9097 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.09 107.66 80056000 0 0 0 0 0 0 0 24802000 23856000 9698800 0 21700000 0 32676 3597 30457 297534;297535;297536;297537;297538 379853;379854;379855;379856;379857 379855 2693 5 MTHNLLLNYGLYR Oxidation (M) 1622.8239 0.8238969 3754 Q92769;E5RFI6;E5RJ04;E5RGV4;E5RHE7;E5RH52;E5RG37;E5RFP9;H3BM24;Q5TEE2;Q13547;E5RK19 HDAC2;HDAC1 Histone deacetylase 2;Histone deacetylase 1 yes no 0 1 0 1 1 1 84.527 84.527 3 0.00011977 86568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.858 79.231 117070000 0 0 0 0 27022000 0 0 0 48182000 0 0 0 41864000 32677 3754 30458 297539;297540;297541 379858;379859;379860 379859 2723 3 MTHNLLLNYGLYR Unmodified 1606.829 0.82898227 3754 Q92769;E5RFI6;E5RJ04;E5RGV4;E5RHE7;E5RH52;E5RG37;E5RFP9;H3BM24;Q5TEE2;Q13547;E5RK19 HDAC2;HDAC1 Histone deacetylase 2;Histone deacetylase 1 yes no 0 0 0 1 90.374 90.374 3 0.031834 93834 QUIQUE_C1438_190116_001 48.532 43.846 38735000 0 0 0 0 38735000 0 0 0 0 0 0 0 0 32678 3754 30458 297542 379861 379861 0 MTIAALESK Unmodified 962.51067 0.51066783 3459 Q7Z406;A1L2Z2 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 55.576 55.576 2 0.009134 53679 QUIQUE_C1368_190116_001 76.827 51.904 267600000 0 28379000 57726000 0 35032000 36469000 0 39670000 41472000 0 0 28847000 0 32679 3459 30459 297543;297544;297545;297546;297547;297548;297549 379862;379863;379864;379865;379866;379867;379868 379863 7 MTIAGTTDTPTDVTHHPIPSEEDINFILNEVR Unmodified 3562.725 0.7249773 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 2 1 1 1 1 1 2 4 142.86 142.86 3;4 4.2319E-20 149685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.522 67.464 1650500000 233980000 281660000 187950000 148740000 84750000 0 0 58652000 127380000 145610000 381800000 0 0 32680 2463 30460 297550;297551;297552;297553;297554;297555;297556;297557;297558;297559;297560;297561;297562;297563;297564;297565 379869;379870;379871;379872;379873;379874;379875;379876;379877;379878;379879;379880;379881;379882;379883;379884;379885;379886;379887;379888 379887 19 MTIAGTTDTPTDVTHHPIPSEEDINFILNEVR Oxidation (M) 3578.7199 0.71989192 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 138.75 138.75 4 8.0832E-07 142928 QUIQUE_C1403_190116_001 53.895 46.52 97095000 0 55042000 0 42053000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32681 2463 30460 297566;297567 379889;379890 379890 1893 2 MTIIGVILSFR Unmodified 1248.7264 0.72641468 4551;2662 Q9Y2A7;P55160 NCKAP1;NCKAP1L Nck-associated protein 1;Nck-associated protein 1-like no no 0 0 0 1 1 168.35 168.35 2 0.00045939 175728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.5 101.71 40714000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15090000 25624000 0 32682 4551;2662 30461 297568;297569 379891;379892 379891 2 MTILPPLEK Unmodified 1040.594 0.59400353 2226 P24298 GPT Alanine aminotransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.508 83.508 2 0.0063921 84704 QUIQUE_C1403_190116_001 84.498 60.974 377330000 26229000 41860000 0 43592000 0 41822000 0 0 56616000 17102000 58860000 37720000 53525000 32683 2226 30462 297570;297571;297572;297573;297574;297575;297576;297577;297578 379893;379894;379895;379896;379897;379898;379899;379900;379901;379902;379903 379895 8 MTILQTYFR Unmodified 1171.606 0.6059652 1624 O75348 ATP6V1G1 V-type proton ATPase subunit G 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.81 109.81 2 0.00016809 114661 QUIQUE_DMIX5_190116_001 140.09 124.71 1099400000 92869000 82314000 95559000 69541000 66305000 84644000 88931000 78242000 103470000 0 118980000 95722000 122870000 32684 1624 30463 297579;297580;297581;297582;297583;297584;297585;297586;297587;297588;297589;297590 379904;379905;379906;379907;379908;379909;379910;379911;379912;379913;379914;379915;379916;379917;379918 379915 12 MTINPIYEHVGYTTLNR Unmodified 2021.004 0.0040461055 2095 P15882 CHN1 N-chimaerin yes yes 0 0 0 1 1 1 92.027 92.027 3 0.00071868 93792 QUIQUE_C1277_190116_001 49.993 33.114 66491000 0 31676000 0 24621000 0 0 0 0 0 10194000 0 0 0 32685 2095 30464 297591;297592;297593 379919;379920;379921 379919 3 MTISQQEFGR Unmodified 1195.5656 0.56555694 2655 Q5VWC4;P55036;H0Y3Y9 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 3 53.788 53.788 2 0.0018052 51542 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.467 50.598 241220000 44872000 0 0 0 0 0 0 37844000 0 27379000 0 61310000 69816000 32686 2655 30465 297594;297595;297596;297597;297598;297599;297600;297601;297602;297603;297604;297605 379922;379923;379924;379925;379926;379927;379928;379929;379930;379931;379932;379933 379926 9 MTLADDVTLDDLIMAK Unmodified 1763.8685 0.86852341 2742 P62191 PSMC1 26S protease regulatory subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 150.56 150.56 2 3.5724E-05 155242 QUIQUE_C1277_190116_001 102.62 94.134 38660000 0 0 38660000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32687 2742 30466 297606;297607 379934;379935 379934 2 MTLDDFR Unmodified 896.4062 0.40620276 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.964 72.964 2 0.0092298 73239 QUIQUE_C1277_190116_001 151.17 119.06 1197300000 43118000 53361000 0 59316000 146330000 46481000 45533000 120230000 83691000 116130000 179970000 144360000 158810000 + 32688 780 30467 297608;297609;297610;297611;297612;297613;297614;297615;297616;297617;297618;297619 379936;379937;379938;379939;379940;379941;379942;379943;379944;379945;379946;379947;379948;379949;379950;379951;379952;379953 379937 18 MTLDDFR Oxidation (M) 912.40112 0.40111738 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 1 0 1 44.486 44.486 2 0.049661 39134 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.613 55.504 142460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 142460000 0 0 0 + 32689 780 30467 297620 379954 379954 1 MTLDTLSIYETPSMGLLDK Unmodified 2127.0479 0.047944335 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 0 1 1 1 151.03 151.03 2 0.00012372 156416 QUIQUE_C1218_190116_001 83.243 61.587 188700000 64881000 0 71577000 0 0 0 52239000 0 0 0 0 0 0 32690 2674 30468 297621;297622;297623 379955;379956;379957;379958 379955 4 MTLDTLSIYETPSMGLLDKK Unmodified 2255.1429 0.14290735 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 1 1 1 133.28 133.28 3 0.00065239 140091 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.637 41.009 88398000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43720000 44677000 0 32691 2674 30469 297624;297625 379959;379960 379959 2 MTLGMIWTIILR Oxidation (M) 1462.804 0.80401308 1544;2047;1242;2381 H9KV75;G3V2W4;G3V2X9;G3V2E8;O43707;P12814;G3V2N5;G3V5M4;P35609 ACTN1;ACTN4;ACTN2 Alpha-actinin-4;Alpha-actinin-1;Alpha-actinin-2 no no 0 1 0 2 166.87 166.87 2 0.0043812 174132 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.349 56.675 15584000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15584000 0 0 32692 1242;1544;2047;2381 30470 297626;297627 379961;379962 379961 715 2 MTLSNPSELDELMSEEAYEK Unmodified 2315.0185 0.0184947 385 A0A1W2PQV2;H3BUH9;P23434 GCSH Glycine cleavage system H protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 134.61 134.61 2;3 1.2884E-75 140112 QUIQUE_C1218_190116_001 193.47 182.2 2754900000 322210000 248980000 351030000 127240000 174570000 194250000 179030000 147800000 182280000 42951000 362480000 212160000 209950000 32693 385 30471 297628;297629;297630;297631;297632;297633;297634;297635;297636;297637;297638;297639;297640;297641;297642;297643 379963;379964;379965;379966;379967;379968;379969;379970;379971;379972;379973;379974;379975;379976;379977;379978;379979 379963 17 MTLSNPSELDELMSEEAYEK Oxidation (M) 2331.0134 0.013409322 385 A0A1W2PQV2;H3BUH9;P23434 GCSH Glycine cleavage system H protein, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 1 1 110.17 110.17 2 1.0653E-31 128966 QUIQUE_C1368_190116_001 128.71 108.6 138370000 50167000 45562000 0 0 0 42638000 0 0 0 0 0 0 0 32694 385 30471 297644;297645;297646;297647;297648 379980;379981;379982;379983;379984 379983 271;272 3 MTLVASEDYGDTLAAIQGLLK Oxidation (M) 2224.1297 0.12970013 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 1 162.28 162.28 2;3 4.4191E-76 166242 QUIQUE_C1277_190116_001 184.21 149.82 4383000000 387810000 778240000 530360000 145920000 491810000 122010000 0 632330000 257560000 241030000 264420000 192310000 339170000 32695 267;275;3025 30472 297649;297650;297651;297652;297653;297654;297655;297656;297657;297658;297659;297660;297661;297662;297663;297664;297665 379985;379986;379987;379988;379989;379990;379991;379992;379993;379994;379995;379996;379997;379998;379999;380000;380001;380002;380003;380004;380005;380006 379989 176 22 MTLVASEDYGDTLAAIQGLLK Unmodified 2208.1348 0.13478551 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 166.72 166.72 2;3 4.4194E-53 170693 QUIQUE_C1277_190116_001 198.46 178.03 11917000000 294110000 1584200000 160710000 0 0 0 551930000 0 3193600000 0 3739200000 879850000 1513700000 32696 267;275;3025 30472 297666;297667;297668;297669;297670;297671;297672;297673;297674;297675;297676;297677 380007;380008;380009;380010;380011;380012;380013;380014;380015;380016;380017;380018;380019 380009 11 MTNGFSGADLTEICQR Unmodified 1798.7978 0.79781808 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.285 94.285 2 0.00013233 91768 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.77 104.76 943200000 91046000 92963000 102510000 109080000 91915000 75923000 110040000 0 52220000 24549000 98794000 94158000 0 32697 2658 30473 297678;297679;297680;297681;297682;297683;297684;297685;297686;297687;297688 380020;380021;380022;380023;380024;380025;380026;380027;380028;380029;380030;380031;380032;380033 380030 13 MTNGFSGADLTEICQR Oxidation (M) 1814.7927 0.7927327 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.063 87.063 2 1.7051E-29 89749 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.99 145.25 853330000 0 34721000 0 39138000 41147000 0 32278000 137740000 145530000 50878000 131960000 124960000 114980000 32698 2658 30473 297689;297690;297691;297692;297693;297694;297695;297696;297697;297698 380034;380035;380036;380037;380038;380039;380040;380041;380042;380043 380041 2102 10 MTNPAIQNDFSYYR Unmodified 1718.7723 0.77225526 4300 Q9NUQ9;A0A1W2PRQ0;A0A087X178 FAM49B Protein FAM49B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 90.47 90.47 2 6.2996E-09 93976 QUIQUE_C1218_190116_001 136.38 122.47 575200000 0 82915000 0 76373000 57050000 0 74765000 0 53236000 0 154570000 0 76291000 32699 4300 30474 297699;297700;297701;297702;297703;297704;297705;297706;297707;297708 380044;380045;380046;380047;380048;380049;380050;380051;380052;380053 380044 7 MTNPAIQNDFSYYR Oxidation (M) 1734.7672 0.76716988 4300 Q9NUQ9;A0A1W2PRQ0;A0A087X178 FAM49B Protein FAM49B yes no 0 1 0 1 1 82.118 82.118 2 2.2338E-17 82354 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.26 126.87 85177000 0 0 0 0 0 0 0 56120000 0 29057000 0 0 0 32700 4300 30474 297709;297710 380054;380055 380054 2906 2 MTNTNLAVVFGPNLLWAK Oxidation (M) 2004.0503 0.050268017 2912 Q07960 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.74 150.74 2 2.4084E-38 155076 QUIQUE_C1277_190116_001 162.49 140.93 209310000 21504000 23078000 33369000 30014000 0 11083000 0 0 29372000 7676200 24379000 0 28833000 32701 2912 30475 297711;297712;297713;297714;297715;297716;297717;297718;297719;297720;297721 380056;380057;380058;380059;380060;380061;380062;380063;380064;380065;380066 380057 2388 10 MTNTNLAVVFGPNLLWAK Unmodified 1988.0554 0.055353395 2912 Q07960 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 2 154.18 154.18 2;3 7.4525E-14 156952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.04 148.37 814520000 0 0 63586000 0 84003000 30345000 60872000 121370000 123120000 0 121040000 78792000 131380000 32702 2912 30475 297722;297723;297724;297725;297726;297727;297728;297729;297730;297731;297732;297733;297734 380067;380068;380069;380070;380071;380072;380073;380074;380075;380076;380077;380078;380079;380080 380072 13 MTNYDVEHTIK Oxidation (M) 1365.6235 0.62346575 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 28.639 28.639 2;3 1.0411E-05 22993 QUIQUE_C1576_190116_001 145.25 95.435 897500000 65269000 0 272610000 0 57933000 59477000 71585000 0 57353000 178010000 63940000 30099000 41218000 32703 845;1936 30476 297735;297736;297737;297738;297739;297740;297741;297742;297743;297744;297745;297746 380081;380082;380083;380084;380085;380086;380087;380088;380089;380090;380091;380092 380086 497 11 MTNYDVEHTIK Unmodified 1349.6286 0.62855113 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 36.409 36.409 2;3 8.3422E-06 31995 QUIQUE_C1438_190116_001 145.46 136.07 8719100000 960730000 793110000 1186800000 899240000 848650000 850180000 837270000 150450000 370840000 262100000 601790000 463590000 494330000 32704 845;1936 30476 297747;297748;297749;297750;297751;297752;297753;297754;297755;297756;297757;297758;297759;297760;297761;297762;297763;297764;297765;297766;297767;297768;297769 380093;380094;380095;380096;380097;380098;380099;380100;380101;380102;380103;380104;380105;380106;380107;380108;380109;380110;380111;380112;380113;380114;380115 380102 14 MTNYDVEHTIKK Unmodified 1477.7235 0.72351415 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 24 24 2;3;4 7.7861E-06 17291 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.94 104.9 2293300000 262410000 102130000 349350000 0 74159000 31860000 71708000 0 159520000 0 439250000 255400000 547530000 32705 845;1936 30477 297770;297771;297772;297773;297774;297775;297776;297777;297778;297779;297780;297781;297782;297783;297784 380116;380117;380118;380119;380120;380121;380122;380123;380124;380125;380126;380127;380128;380129;380130 380128 14 MTNYDVEHTIKK Oxidation (M) 1493.7184 0.71842877 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 1 1 2 2 2 19.582 19.582 2;3;4 0.0016773 12954 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.71 73.503 536210000 0 0 0 0 0 0 0 56811000 0 0 345810000 0 133590000 32706 845;1936 30477 297785;297786;297787;297788;297789;297790 380131;380132;380133;380134;380135;380136 380132 497 6 MTPSYEIR Oxidation (M) 1011.4695 0.46953129 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 1 0 1 31.473 31.473 2 0.040463 25274 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.265 28.079 14062000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14062000 0 0 0 32707 2916 30478 297791 380137 380137 1 MTQEPFREELAYDR Acetyl (Protein N-term) 1825.8305 0.83049842 3104 Q15049;A6PVC3 MLC1 Membrane protein MLC1 yes no 1 0 1 1 107.97 107.97 2 0.0055345 109994 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.176 46.832 21548000 0 0 0 0 0 0 0 21548000 0 0 0 0 0 32708 3104 30479 297792 380138 380138 1 MTQLVLPGMVER Oxidation (M) 1388.7156 0.715592 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6;A0A1B0GV93;E9PI21 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 1 0 1 90.069 90.069 2 0.010012 93762 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.466 46.501 47783000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47783000 0 0 32709 3252 30480 297793 380139 380139 2641 1 MTRTDPPDLLVSTVYQDIKVATPGPASK Unmodified 2999.5638 0.56377261 683 C9J069 C9orf172 Uncharacterized protein C9orf172 yes yes 0 0 2 1 1 74.26 74.26 2 0.01687 75050 QUIQUE_C1576_190116_001 40.857 24.973 611350000 0 0 0 0 271430000 0 339920000 0 0 0 0 0 0 32710 683 30481 297794;297795 380140;380141 380141 0 MTSGVTGDWK Oxidation (M) 1096.4859 0.48590964 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 30.298 30.298 2 0.0018349 24794 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.331 70.159 299470000 38911000 28095000 0 0 0 0 0 40448000 78994000 37191000 0 0 75831000 32711 2280 30482 297796;297797;297798;297799;297800;297801 380142;380143;380144;380145;380146;380147;380148;380149 380146 1654 8 MTSGVTGDWK Unmodified 1080.491 0.49099502 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.795 40.795 2 0.0017155 36244 QUIQUE_C1368_190116_001 94.309 66.682 1073800000 148890000 119330000 121190000 96596000 66258000 93487000 102980000 65490000 68682000 0 103940000 86938000 0 32712 2280 30482 297802;297803;297804;297805;297806;297807;297808;297809;297810;297811;297812 380150;380151;380152;380153;380154;380155;380156;380157;380158;380159;380160;380161 380152 11 MTSSPRAPPGEQGRGGAEMIR Unmodified 2184.0528 0.052803987 4748 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297817;297818;297819;297820;297821;297822;297823;297824;297825;297826;297827 380167;380168;380169;380170;380171;380172;380173;380174;380175;380176;380177 380174 11 MTVCLETEK Unmodified 1109.5097 0.50968155 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.989 41.989 2 0.0022972 37611 QUIQUE_C1368_190116_001 94.806 70.786 568470000 62921000 77221000 64521000 68087000 55762000 0 66510000 24621000 31580000 21618000 56525000 39099000 0 32716 2620 30486 297828;297829;297830;297831;297832;297833;297834;297835;297836;297837;297838;297839 380178;380179;380180;380181;380182;380183;380184;380185;380186;380187;380188;380189;380190 380181 13 MTVCLETEKK Unmodified 1237.6046 0.60464457 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 24.026 24.026 2;3 0.0068649 17963 QUIQUE_C1218_190116_001 55.806 46.119 226430000 30045000 0 0 0 34499000 24824000 39138000 0 26754000 0 38333000 0 32839000 32717 2620 30487 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380244;380245;380246 380244 431 3 MTVVQAYIGGIHYR Unmodified 1606.829 0.82898227 2222 P23634 ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.625 95.625 3 0.00076985 98352 QUIQUE_C1368_190116_001 71.219 59.605 260880000 0 0 41166000 20816000 0 0 0 36717000 39778000 0 52223000 23631000 46551000 32722 2222 30491 297889;297890;297891;297892;297893;297894;297895 380247;380248;380249;380250;380251;380252;380253 380247 7 MTVVQAYINEK Unmodified 1294.6591 0.65912298 2158 P20020;E7ERY9 ATP2B1 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1;Calcium-transporting ATPase yes no 0 0 0 1 73.804 73.804 2 0.022331 74502 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.167 42.936 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32723 2158 30492 297896 380254 380254 1 MTVVWDK Unmodified 877.43677 0.4367746 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 53.66 53.66 2 0.025655 52249 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.541 56.705 5213200000 0 0 858930000 774200000 667980000 0 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380306;380307;380308;380309;380310;380311;380312;380313;380314;380315;380316;380317;380318 380318 1233 13 MVCDVVSR Unmodified 964.44702 0.44702171 1963 P09471;A0A1W2PP87 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.628 28.628 2 0.0036666 22913 QUIQUE_C1438_190116_001 125.25 60.449 19926000000 2064400000 2434500000 2919700000 2136300000 1500900000 1895900000 2321500000 0 1194000000 359390000 0 1404700000 1694700000 32732 1963 30500 297945;297946;297947;297948;297949;297950;297951;297952;297953;297954;297955 380319;380320;380321;380322;380323;380324;380325;380326;380327;380328;380329;380330 380324 11 MVCSSTCYR Unmodified 1162.4569 0.45693447 1358 M0QWZ7;Q9NP81;M0R2C6;M0R259 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 20.105 20.105 2 0.019175 13401 QUIQUE_C1218_190116_001 98.458 96.48 109620000 44067000 0 41502000 0 24054000 0 0 0 0 0 0 0 0 32733 1358 30501 297956;297957;297958;297959 380331;380332;380333;380334 380331 3 MVDFAGVK Unmodified 865.43677 0.4367746 2189 P21964;E7EMS6;E7EUU8;H7BZ45;F8WBW9 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 53.418 53.418 2 0.048788 51769 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.902 39.354 52657000 0 0 0 0 0 0 0 0 52657000 0 0 0 0 32734 2189 30502 297960 380335 380335 1 MVDPEKPQLGMIDR Unmodified 1627.8062 0.80619792 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 1 1 1 68.704 68.704 3 0.022323 68169 QUIQUE_C1277_190116_001 46.926 41.266 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32735 1974 30503 297961;297962 380336;380337 380337 2 MVDVGGQR Unmodified 860.41744 0.41743614 3063;2294;2556;2142;1758 P50148;P29992;K7EL62;P19086;O95837;Q14344 GNAQ;GNA11;GNAZ;GNA14;GNA13 Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11;Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-14;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 no no 0 0 0 1 19.255 19.255 2 0.039647 11888 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198740000 70807000 0 161420000 0 32740 3117 30506 297993;297994;297995;297996;297997;297998;297999;298000 380378;380379;380380;380381;380382;380383;380384;380385;380386;380387 380382 2571 9 MVEILFHYADR Unmodified 1392.686 0.68600643 728 C9JJN9;Q8N3P4;H7C1G7;H7C322 VPS8 Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 95.007 95.007 3 0.015867 97431 QUIQUE_C1277_190116_001 45.879 37.747 35640000 0 17796000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17844000 0 32741 728 30507 298001;298002;298003 380388;380389;380390 380388 3 MVEINFLCVHK Unmodified 1388.6945 0.69446263 2311;1584 P30419;Q5VUC6;O60551 NMT1;NMT2 Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1;Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase;Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 91.812 91.812 3 0.012024 93306 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.743 51.462 119160000 0 27151000 0 30554000 0 26401000 35051000 0 0 0 0 0 0 32742 2311;1584 30508 298004;298005;298006;298007;298008;298009 380391;380392;380393;380394;380395;380396 380396 6 MVFINNIALAQIK Unmodified 1473.8378 0.83775605 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 125.43 125.43 2;3 8.9224E-05 129163 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.61 92.604 638610000 77315000 60045000 69475000 0 57977000 63555000 76575000 51619000 44899000 0 54132000 83016000 0 32743 2452 30509 298010;298011;298012;298013;298014;298015;298016;298017;298018;298019;298020;298021;298022 380397;380398;380399;380400;380401;380402;380403;380404;380405;380406;380407;380408;380409;380410 380410 13 MVFINNIALAQIK Oxidation (M) 1489.8327 0.83267067 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 1 1 1 1 110.1 110.1 2 0.0016216 107824 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.239 70.584 86457000 0 0 0 0 0 0 0 0 26206000 11942000 25485000 22824000 0 32744 2452 30509 298023;298024;298025;298026;298027;298028 380411;380412;380413;380414;380415;380416 380414 1871 6 MVFQENSR Unmodified 1009.4651 0.46511462 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 1 1 27.354 27.354 2 0.025599 21594 QUIQUE_C1438_190116_001 71.342 51.346 207980000 0 82349000 0 0 61060000 0 0 0 0 0 0 64570000 0 32745 2898 30510 298029;298030;298031 380417;380418;380419 380418 3 MVGDVTGAQAYASTAK Unmodified 1568.7505 0.75045718 974 H7BYV1;E9PS44;E9PQN9;P13164;Q01629;Q01628 IFITM2;IFITM3;IFITM1 Interferon-induced transmembrane protein 1;Interferon-induced transmembrane protein 2;Interferon-induced transmembrane protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 58.562 58.562 2 4.6829E-13 57359 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.14 114.28 143280000 0 20277000 84702000 0 0 0 0 38303000 0 0 0 0 0 32746 974 30511 298032;298033;298034;298035 380420;380421;380422;380423 380422 4 MVGDVTGAQAYASTAK Oxidation (M) 1584.7454 0.7453718 974 H7BYV1;E9PS44;E9PQN9;P13164;Q01629;Q01628 IFITM2;IFITM3;IFITM1 Interferon-induced transmembrane protein 1;Interferon-induced transmembrane protein 2;Interferon-induced transmembrane protein 3 yes no 0 1 0 1 1 1 48.694 48.694 2 1.7904E-05 47105 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.53 81.771 83221000 0 0 0 0 0 0 0 0 20146000 0 35908000 0 27168000 32747 974 30511 298036;298037;298038 380424;380425;380426 380425 590 3 MVGFIIGR Unmodified 891.50004 0.50004356 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.395 84.395 2 0.0097391 85630 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.191 71.636 260320000 0 0 26948000 0 34659000 23019000 36528000 22188000 26872000 0 31811000 22992000 35301000 32748 3875 30512 298039;298040;298041;298042;298043;298044;298045;298046;298047 380427;380428;380429;380430;380431;380432;380433;380434;380435 380435 9 MVGGIAQIIAAQEEMLR Unmodified 1828.9539 0.95392479 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.21 154.21 3 4.6862E-17 158200 QUIQUE_C1403_190116_001 101.53 82.204 250210000 27414000 18366000 25246000 38596000 34953000 0 15679000 20766000 35359000 11318000 22510000 0 0 32749 4600 30513 298048;298049;298050;298051;298052;298053;298054;298055;298056;298057 380436;380437;380438;380439;380440;380441;380442;380443;380444;380445;380446;380447 380441 12 MVGGIAQIIAAQEEMLR Oxidation (M) 1844.9488 0.94883941 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 1 0 1 148.06 148.06 3 0.0038764 152471 QUIQUE_C1277_190116_001 46.249 27.416 12735000 0 12735000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32750 4600 30513 298058 380448 380448 3033 1 MVGGIAQIIAAQEEMLRK Unmodified 1957.0489 0.048887808 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 136.11 136.11 3 8.9785E-05 139500 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.221 60.915 159250000 0 0 0 0 0 0 0 91111000 32310000 0 0 0 35830000 32751 4600 30514 298059;298060;298061 380449;380450;380451;380452;380453 380450 5 MVGGVLVER Unmodified 958.52699 0.52698659 4438 Q9UHV9 PFDN2 Prefoldin subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.377 50.377 2 0.013659 48109 QUIQUE_C1277_190116_001 69.628 37.322 475570000 0 79517000 93810000 75281000 67727000 68553000 75706000 0 0 14974000 0 0 0 32752 4438 30515 298062;298063;298064;298065;298066;298067;298068 380454;380455;380456;380457;380458;380459;380460 380454 6 MVGLTTTHTLR Unmodified 1228.6598 0.65979168 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 37.203 37.203 2;3 0.032619 32610 QUIQUE_C1277_190116_001 37.18 27.227 553840000 198270000 59484000 0 237230000 0 0 0 0 0 0 0 58860000 0 32753 3445 30516 298069;298070;298071;298072;298073 380461;380462;380463;380464;380465 380462 5 MVGTVIMMK Unmodified 1008.517 0.51701553 2761 P62760 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 65.238 65.238 2 0.017708 63866 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.187 71.632 336900000 0 0 0 112570000 0 0 127030000 0 0 0 0 97300000 0 32754 2761 30517 298074;298075;298076;298077;298078 380466;380467;380468;380469;380470;380471 380471 6 MVGTVIMMR Unmodified 1036.5232 0.52316354 4498 Q9UM19;B4DGW9 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.307 70.307 2 0.00018506 70609 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.68 120.95 822500000 93813000 106580000 75377000 86857000 59702000 75766000 87397000 49216000 68063000 0 66369000 0 53352000 32755 4498 30518 298079;298080;298081;298082;298083;298084;298085;298086;298087;298088;298089 380472;380473;380474;380475;380476;380477;380478;380479;380480;380481;380482;380483;380484 380479 13 MVGVPAALDMMLTGR Unmodified 1560.7826 0.78262571 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 3 1 3 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 152.7 152.7 2;3 1.2657E-06 158089 QUIQUE_C1368_190116_001 84.759 71.882 1735400000 170750000 145700000 276120000 162610000 83004000 167100000 119170000 58474000 143970000 33125000 152710000 102750000 119950000 32756 1153 30519 298090;298091;298092;298093;298094;298095;298096;298097;298098;298099;298100;298101;298102;298103;298104;298105;298106;298107;298108;298109;298110;298111;298112;298113;298114;298115 380485;380486;380487;380488;380489;380490;380491;380492;380493;380494;380495;380496;380497;380498;380499;380500;380501;380502;380503;380504;380505;380506;380507;380508;380509;380510;380511;380512;380513;380514;380515;380516;380517;380518;380519;380520;380521;380522 380494 38 MVGVPAALDMMLTGR Oxidation (M) 1576.7775 0.77754033 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 142.34 142.34 2 0.0016493 147547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.089 54.824 411810000 0 0 0 0 0 0 0 70582000 109770000 32782000 104910000 0 93768000 32757 1153 30519 298116;298117;298118;298119;298120 380523;380524;380525;380526;380527;380528;380529;380530 380525 674 8 MVHETSYSAQFK Unmodified 1426.6551 0.65510023 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.285 30.285 2;3 1.183E-09 24337 QUIQUE_C1368_190116_001 153.7 116.51 564260000 204540000 33165000 56213000 61887000 32210000 40671000 0 42046000 46401000 0 0 47127000 0 32758 3889 30520 298121;298122;298123;298124;298125;298126;298127;298128;298129;298130;298131 380531;380532;380533;380534;380535;380536;380537;380538;380539;380540;380541;380542;380543;380544 380534 13 MVHETSYSAQFK Oxidation (M) 1442.65 0.65001485 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 1 0 1 23.487 23.487 2 0.0075077 17027 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.379 57.075 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32759 3889 30520 298132 380545 380545 2761 1 MVHNGIEYGDMQLICEAYHLMK Oxidation (M) 2667.1954 0.1953704 2602 P52209;K7EM49;K7EPF6;K7ELN9 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 1 0 1 1 135.83 135.83 3 3.0995E-05 138330 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.188 50.39 90328000 34225000 0 0 0 0 0 0 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MVIIDHGLQTLTHEVIVPHSGWER Unmodified 2766.4276 0.4275539 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 115.13 115.13 4 5.6218E-09 119410 QUIQUE_C1368_190116_001 80.83 73.637 288570000 0 29756000 49901000 24119000 0 0 43274000 0 56616000 0 45811000 39094000 0 32763 730 30523 298153;298154;298155;298156;298157;298158;298159 380567;380568;380569;380570;380571;380572;380573;380574 380568 7 MVILLCNLKPAK Unmodified 1398.8091 0.80909845 2950 Q12904 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 78.86 78.86 2;3 0.0050977 76204 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.408 55.497 81994000 0 28343000 0 0 0 0 0 24604000 0 9214100 0 19832000 0 32764 2950 30524 298160;298161;298162;298163 380575;380576;380577;380578 380577 3 MVINHLEK Unmodified 982.52699 0.52698659 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 1 20.254 20.254 2 0.022385 13400 QUIQUE_C1438_190116_001 74.255 10.949 183850000 0 0 0 0 183850000 0 0 0 0 0 0 0 0 32765 2572 30525 298164 380579 380579 1 MVIPGGIDVHTHFQMPYK Oxidation (M) 2085.0176 0.01758768 3051 Q14195;D6RF19 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes no 0 1 0 2 2 3 2 1 1 1 2 3 3 1 1 3 87.584 87.584 2;3;4 6.1328E-05 92555 QUIQUE_C1277_190116_001 84.14 74.352 4205700000 186210000 169390000 545300000 288490000 79675000 120840000 91809000 245010000 990820000 413380000 39541000 103500000 931720000 32766 3051 30526 298165;298166;298167;298168;298169;298170;298171;298172;298173;298174;298175;298176;298177;298178;298179;298180;298181;298182;298183;298184;298185;298186;298187;298188;298189 380580;380581;380582;380583;380584;380585;380586;380587;380588;380589;380590;380591;380592;380593;380594;380595;380596;380597;380598;380599;380600;380601;380602;380603;380604;380605 380582 2490;2491 20 MVIPGGIDVHTHFQMPYK Unmodified 2069.0227 0.022673058 3051 Q14195;D6RF19 DPYSL3 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49.063 2;3 0.00012141 47292 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.93 104.03 23388000000 1353400000 1752500000 2112700000 1501000000 1637900000 1276800000 1569400000 1718100000 2091900000 1754100000 2149300000 1962800000 2507800000 32769 365 30527 298231;298232;298233;298234;298235;298236;298237;298238;298239;298240;298241;298242;298243;298244;298245;298246;298247;298248;298249;298250;298251;298252;298253;298254;298255;298256 380678;380679;380680;380681;380682;380683;380684;380685;380686;380687;380688;380689;380690;380691;380692;380693;380694;380695;380696;380697;380698;380699;380700;380701;380702;380703;380704;380705;380706;380707;380708;380709;380710 380695 262 33 MVIPGGIDVHTR Unmodified 1293.6863 0.68634078 365 A0A1C7CYX9;Q16555;E5RFU4 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 66.19 66.19 2;3 0.00015277 66016 QUIQUE_C1277_190116_001 96.604 87.416 111910000000 8380000000 9008000000 11991000000 8650100000 7441900000 10849000000 9327600000 6660100000 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protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 83.155 83.155 2 0.023678 84767 QUIQUE_C1277_190116_001 53.756 26.502 67885000 0 24860000 0 0 0 0 0 0 0 0 43025000 0 0 32785 3432 30537 298465;298466;298467;298468 380996;380997;380998;380999 380996 3 MVLSNMEK Unmodified 950.45652 0.45652377 2286 P29218;H0YBL1;E5RG13;E5RIP7 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 36.103 36.103 2 0.015035 32272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.212 45.109 208890000 0 0 0 0 87162000 0 0 121730000 0 0 0 0 0 32786 2286 30538 298469;298470;298471 381000;381001;381002 381002 3 MVLVDLPGVINTVTSGMAPDTK Unmodified 2257.1698 0.1697908 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 164.19 164.19 2;3 1.0583E-10 165829 QUIQUE_C1563_190116_001 124.09 115.71 742320000 96410000 69349000 88467000 91643000 0 33901000 47930000 96927000 36610000 12517000 0 32743000 135830000 32787 831;1569 30539 298472;298473;298474;298475;298476;298477;298478;298479;298480;298481;298482;298483;298484;298485 381003;381004;381005;381006;381007;381008;381009;381010;381011;381012;381013;381014;381015;381016;381017 381010 11 MVLVDLPGVINTVTSGMAPDTK Oxidation (M) 2273.1647 0.16470543 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 1 0 1 1 1 152.16 152.16 2 8.4063E-05 157057 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.816 25.195 44434000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18991000 0 25442000 0 32788 831;1569 30539 298486;298487;298488 381018;381019;381020;381021 381018 487 4 MVLVGDVK Unmodified 859.48372 0.48372479 591;2030 B1ALA9;P60891;A0A2R8Y7H4;B7ZB02;P11908 PRPS1;PRPS2 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1;Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.528 50.528 2 0.013433 48575 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381033;381034;381035;381036;381037;381038 381033 6 MVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIK Unmodified 2635.2008 0.20083294 1726 O95372;Q5QPQ0;Q5QPN9;Q5QPQ1;Q5QPQ3;Q5QPQ2 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 0 0 1 170.17 170.17 3 0.00080901 172883 QUIQUE_C1403_190116_001 25.823 22.256 6978500 0 0 0 6978500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32792 1726 30543 298504 381039 381039 1 MVMPSWFDLMGLSPDAPEDEAGIKK Unmodified 2763.2958 0.29579595 1726 O95372;Q5QPQ0;Q5QPN9;Q5QPQ1;Q5QPQ3;Q5QPQ2 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 159.62 159.62 3 0.00036379 165430 QUIQUE_C1576_190116_001 32.04 25.934 316270000 30303000 0 44172000 42908000 0 22825000 38889000 0 0 0 0 65792000 71385000 32793 1726 30544 298505;298506;298507;298508;298509;298510;298511 381040;381041;381042;381043;381044;381045;381046 381044 7 MVMTLTFGDVVAVR 2 Oxidation (M) 1569.7895 0.78948522 1505 O15540 FABP7 Fatty acid-binding protein, brain yes yes 0 2 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.71 108.71 2 1.2324E-17 112155 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381063;381064;381065;381066;381067;381068;381069;381070;381071;381072;381073;381074;381075 381066 11 MVMTVFACLMGK Unmodified 1386.6532 0.65319144 2066;3076 P13796;Q14651 LCP1;PLS1 Plastin-2;Plastin-1 no no 0 0 0 1 141.84 141.84 2 0.0030434 144750 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.233 63.578 18022000 0 0 0 0 0 0 0 18022000 0 0 0 0 0 32797 2066;3076 30546 298540 381076 381076 1 MVMYLNMLR Unmodified 1169.5759 0.5759274 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 114.1 114.1 2 0.012404 118134 QUIQUE_C1277_190116_001 84.244 67.468 61921000 0 19732000 0 0 0 0 0 0 17922000 0 24268000 0 0 32798 3899 30547 298541;298542;298543;298544;298545;298546;298547 381077;381078;381079;381080;381081;381082;381083 381078 7 MVNFLLK Unmodified 863.4939 0.49389555 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.762 84.762 2 0.024661 82645 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.596 71.77 1386800000 226780000 246890000 203740000 0 0 0 193600000 0 0 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381125;381126;381127;381128;381129;381130;381131;381132;381133;381134;381135;381136;381137;381138;381139;381140;381141;381142;381143;381144;381145;381146;381147;381148;381149;381150;381151;381152;381153;381154;381155;381156;381157;381158;381159;381160;381161;381162;381163;381164;381165;381166;381167;381168;381169;381170;381171;381172 381139 47 MVNHFIAEFKR Unmodified 1390.718 0.71797526 2010;558 A8K7Q2;P11142;E9PKE3;E9PN89 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 47.033 47.033 2;3 0.00045444 43664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.062 68.349 1046500000 0 0 0 0 27451000 0 0 260970000 209230000 0 137660000 238020000 173160000 32803 558;2010 30550 298607;298608;298609;298610;298611;298612;298613;298614;298615 381173;381174;381175;381176;381177;381178;381179;381180;381181;381182;381183 381180 11 MVNSNLASVEELK Oxidation (M) 1448.7181 0.71809442 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 67.498 67.498 2 0.00046639 67826 QUIQUE_C1218_190116_001 92.866 71.894 133620000 40751000 35831000 0 0 0 24388000 0 0 0 32647000 0 0 0 32804 1943 30551 298616;298617;298618;298619 381184;381185;381186;381187 381184 1184 4 MVNSNLASVEELK Unmodified 1432.7232 0.7231798 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 75.171 75.171 2 6.8477E-06 75436 QUIQUE_C1277_190116_001 151.79 132 658870000 184860000 123540000 0 0 93057000 126240000 79438000 0 0 51734000 0 0 0 32805 1943 30551 298620;298621;298622;298623;298624;298625;298626;298627 381188;381189;381190;381191;381192;381193;381194;381195 381189 8 MVNSNLASVEELKEIDVEVR Unmodified 2273.1573 0.15731186 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 2 2 1 113.32 113.32 2;3 5.9161E-64 118286 QUIQUE_C1218_190116_001 204.43 168.69 3502900000 338810000 299310000 496850000 247520000 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0.57909852 2603 P52272;A0A087X0X3;M0QZM1;M0R2I7 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 1 57.061 57.061 2 0.027871 56115 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.108 30.321 214410000 0 0 0 0 0 68868000 0 0 33823000 0 72538000 39177000 0 32811 2603 30555 298666;298667;298668;298669 381239;381240;381241;381242 381240 4 MVPDFYVDSIADLLPALQG Unmodified 2063.0285 0.028529522 531 A6NDG6;H3BV17 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 178.7 178.7 2;3 0.004914 184097 QUIQUE_C1438_190116_001 52.247 33.036 19656000 0 0 0 0 11400000 0 0 0 0 0 8255800 0 0 32812 531 30556 298670;298671 381243;381244 381243 2 MVPLCQVEVLYFAK Acetyl (Protein N-term) 1737.8834 0.88338561 1772 O96033 MOCS2 Molybdopterin synthase sulfur carrier subunit yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 171.64 171.64 2 9.963E-05 175060 QUIQUE_C1277_190116_001 93.258 68.403 97872000 0 13283000 13090000 0 11766000 12818000 0 9545000 18487000 0 0 0 18884000 32813 1772 30557 298672;298673;298674;298675;298676;298677;298678 381245;381246;381247;381248;381249;381250;381251;381252;381253 381245 9 MVPVSVQQSLAAYNQR Unmodified 1789.9145 0.91450282 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 93.134 93.134 2;3 2.6299E-06 95105 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.24 88.773 1844400000 186850000 166960000 187170000 176960000 157410000 118250000 151120000 0 62062000 27351000 157310000 201960000 250980000 32814 3700 30558 298679;298680;298681;298682;298683;298684;298685;298686;298687;298688;298689;298690;298691;298692;298693;298694;298695;298696;298697;298698;298699;298700;298701;298702 381254;381255;381256;381257;381258;381259;381260;381261;381262;381263;381264;381265;381266;381267;381268;381269;381270;381271;381272;381273;381274;381275;381276;381277;381278;381279 381271 26 MVPVSVQQSLAAYNQR Oxidation (M) 1805.9094 0.90941744 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 1 0 1 84.13 84.13 2 0.03115 85952 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.034 36.402 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32815 3700 30558 298703 381280 381280 1 MVQEAEKYK Unmodified 1124.5536 0.55359527 2010;282;558 A8K7Q2;E9PS65;E9PM13;P11142;E9PKE3;E9PNE6;A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA8;HSPA1B;HSPA1A Heat shock cognate 71 kDa protein;Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A no no 0 0 1 1 1 14.557 14.557 3 0.014162 7207 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.598 82.84 210440000 0 0 0 0 0 0 0 142890000 0 0 0 0 67546000 32816 558;2010;282 30559 298704;298705 381281;381282 381281 0 MVQFEENGR Unmodified 1108.4971 0.49714303 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 35.186 35.186 2 0.0026507 29941 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.01 78.311 180670000 0 54510000 44651000 0 0 0 46925000 0 0 34583000 0 0 0 32817 2527;3303 30560 298706;298707;298708;298709 381283;381284;381285;381286;381287 381287 5 MVQFEENGRK Unmodified 1236.5921 0.59210605 2527;3303 P49368;B4DUR8;E9PRC8;E9PQ35;Q5SZX6;Q5SZW8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.627 19.627 3 0.0017766 12323 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.173 65.773 537380000 0 43260000 55748000 65466000 0 0 60616000 105300000 62661000 0 144320000 0 0 32818 2527;3303 30561 298710;298711;298712;298713;298714;298715;298716 381288;381289;381290;381291;381292;381293;381294 381294 6 MVQQCCTYVEEITDLPIK Unmodified 2226.0371 0.037062072 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 128.77 128.77 2 8.1249E-10 132938 QUIQUE_DMIX7_190116_001 128.31 120.94 103970000 0 0 60719000 0 0 43251000 0 0 0 0 0 0 0 32819 1389 30562 298717;298718;298719 381295;381296;381297 381297 3 MVQSVVYCHGGR Unmodified 1391.6438 0.64382404 703 C9J8C7 ACSL6 yes yes 0 0 0 1 23.345 23.345 3 0.066679 16784 QUIQUE_DMIX7_190116_001 28.764 17.859 38970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38970000 0 32820 703 30563 298720 381298 381298 1 MVQSYHPHSSDVR Unmodified 1541.7045 0.70451004 145 A0A0A0MRE6;O94967 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 2 1 1 1 1 13.822 13.822 3;4 0.0012258 6314 QUIQUE_C1218_190116_001 61.11 54.674 544410000 75184000 72315000 80789000 35704000 0 45229000 87349000 42790000 0 0 31632000 17378000 56041000 32821 145 30564 298721;298722;298723;298724;298725;298726;298727;298728;298729;298730;298731;298732;298733;298734 381299;381300;381301;381302;381303;381304;381305;381306;381307;381308;381309;381310;381311;381312;381313;381314 381299 15 MVQSYHPHSSDVR Oxidation (M) 1557.6994 0.69942466 145 A0A0A0MRE6;O94967 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 1 0 1 10.439 10.439 4 0.0026272 2725 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.116 41.522 22495000 0 0 0 0 0 0 0 22495000 0 0 0 0 0 32822 145 30564 298735 381315 381315 84 1 MVRPNQDGTLIASCSNDQTVR Unmodified 2361.1165 0.11652646 2460 P43034;I3L3N5 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.054 51.054 2;3 7.9278E-44 49586 QUIQUE_C1218_190116_001 146.13 138.23 4146000000 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2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 1 0 1 17.442 17.442 2 0.034757 9586 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.981 44.961 70973000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70973000 0 0 0 32825 1969 30566 298760 381343 381343 1 MVSAVLQFGNIALK Unmodified 1489.8327 0.83267067 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 129.24 129.24 2 0.00011777 133315 QUIQUE_C1403_190116_001 121.5 101.74 143250000 0 0 0 17377000 22940000 0 20521000 34111000 25033000 0 23271000 0 0 32826 3459 30567 298761;298762;298763;298764;298765;298766 381344;381345;381346;381347;381348;381349;381350;381351 381344 8 MVSDINNAWGCLEQVEK Unmodified 1991.9081 0.90809681 2047;1242 H9KV75;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 123.69 123.69 2 1.2607E-37 128709 QUIQUE_C1218_190116_001 200.21 167.26 556210000 94891000 115670000 0 0 0 95222000 174980000 0 0 0 75449000 0 0 32827 1242;2047 30568 298767;298768;298769;298770;298771 381352;381353;381354;381355;381356;381357 381352 6 MVSDINNAWGCLEQVEK Oxidation (M) 2007.903 0.90301143 2047;1242 H9KV75;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 1 0 1 115.11 115.11 2 7.7913E-23 119542 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.18 137.65 72680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72680000 32828 1242;2047 30568 298772 381358 381358 716 1 MVSDINNGWQHLEQAEK Unmodified 1997.9265 0.92652407 1544 O43707 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 81.022 81.022 2;3 7.617E-63 81840 QUIQUE_C1368_190116_001 187.11 168.01 380470000 180990000 49156000 28689000 0 0 18883000 30745000 0 0 34994000 37011000 0 0 32829 1544 30569 298773;298774;298775;298776;298777;298778;298779;298780 381359;381360;381361;381362;381363;381364;381365;381366 381362 7 MVSGFIPLKPTVK Unmodified 1415.821 0.82104335 1802 P01023;P20742;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000024146 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 0 1 1 1 1 72.156 72.156 2;3 0.017654 72301 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.499 54.257 307600000 0 0 0 0 0 0 0 0 94619000 0 164970000 0 48015000 32830 1802 30570 298781;298782;298783 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Unmodified 1995.9502 0.95016132 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 1 1 1 120.67 120.67 3 0.0018886 123878 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.376 43.603 65240000 0 0 0 0 0 0 0 31563000 0 0 33677000 0 0 32846 2613 30581 298951;298952 381574;381575 381574 1 MVTMVSVLEDLIGK Unmodified 1533.8146 0.81463734 3887 Q96JB5;J3QRM1 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 170.73 170.73 2 3.2641E-22 175934 QUIQUE_C1576_190116_001 162.38 145.35 521240000 83275000 70665000 36508000 31470000 0 0 60950000 64953000 104110000 0 0 0 69309000 32847 3887 30582 298953;298954;298955;298956;298957;298958;298959;298960 381576;381577;381578;381579;381580;381581;381582;381583;381584 381581 9 MVTMVSVLEDLIGK Oxidation (M) 1549.8096 0.80955196 3887 Q96JB5;J3QRM1 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 1 0 1 1 1 167.82 167.82 2 0.00010609 171451 QUIQUE_C1277_190116_001 114.86 96.998 54694000 0 47375000 0 0 0 0 0 0 0 7318600 0 0 0 32848 3887 30582 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synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 99.62 99.62 2 0.020675 102249 QUIQUE_C1277_190116_001 64.374 47.834 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32862 2524 30591 299119;299120;299121;299122;299123;299124 381784;381785;381786;381787;381788;381789 381785 6 MVVPVAALFTPLK Unmodified 1384.8152 0.81522969 1007 F5H365;Q15436;G3V4V1;G3V1W4;G3V3G5;G3V2R6;G3V5X8;G3V4Q2 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.96 145.96 2 0.0013332 152596 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.456 88.875 1187000000 106360000 116520000 104220000 108940000 109000000 88037000 82787000 61054000 74609000 28635000 100720000 88792000 117360000 32863 1007 30592 299125;299126;299127;299128;299129;299130;299131;299132;299133;299134;299135;299136;299137 381790;381791;381792;381793;381794;381795;381796;381797;381798;381799;381800;381801;381802 381800 12 MVVSDFHVFVR Unmodified 1334.6805 0.68052712 217 A0A0C4DFN3;Q99685;A0A3B3ITT3;E7EWX8;H7C599;H7C5K5;C9J8Q3 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.315 92.315 2;3 0.00025765 93828 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.763 77.795 1193700000 144230000 69605000 0 73841000 114090000 78625000 113090000 89090000 126580000 24259000 127520000 99681000 133090000 32864 217 30593 299138;299139;299140;299141;299142;299143;299144;299145;299146;299147;299148;299149;299150;299151 381803;381804;381805;381806;381807;381808;381809;381810;381811;381812;381813;381814;381815;381816;381817;381818;381819;381820 381815 18 MVVSDFHVFVR Oxidation (M) 1350.6754 0.67544174 217 A0A0C4DFN3;Q99685;A0A3B3ITT3;E7EWX8;H7C599;H7C5K5;C9J8Q3 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 1 0 1 1 1 75.479 75.479 3 0.0068501 75538 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.434 45.232 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32865 217 30593 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Unmodified 1196.5648 0.56482866 3042 Q14112;A0A087WZP6;H0YJV3 NID2 Nidogen-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.032 86.032 2 0.0094304 88443 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.256 55.105 320910000 62819000 0 0 0 87492000 28743000 0 0 0 23564000 69726000 48564000 0 32869 3042 30597 299166;299167;299168;299169;299170;299171 381835;381836;381837;381838;381839;381840;381841 381839 6 MWAAVFGGGVK Unmodified 1121.5692 0.56918576 3684 Q8TDJ6;H0YLM8 DMXL2 DmX-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.682 97.682 2 0.015087 101971 QUIQUE_C1438_190116_001 57.96 23.152 60772000 0 0 17375000 0 19911000 0 23486000 0 0 0 0 0 0 32870 3684 30598 299172;299173;299174;299175 381842;381843;381844;381845 381843 3 MWDLSSNQAIQIAQHDAPVK Unmodified 2251.1056 0.10555106 2811 P78406;E9PQ57;E9PPG9;B0QZ36 RAE1 mRNA export factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.79 111.79 3 3.7891E-09 116915 QUIQUE_C1218_190116_001 78.794 70.315 510450000 64959000 76458000 59873000 50195000 0 54066000 0 55970000 48723000 0 47288000 52915000 0 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299227;299228;299229;299230;299231;299232;299233;299234;299235;299236;299237;299238;299239;299240 381906;381907;381908;381909;381910;381911;381912;381913;381914;381915;381916;381917;381918;381919;381920;381921;381922;381923;381924;381925;381926;381927;381928;381929;381930;381931;381932;381933 381923 28 MWEVQTGYCVK Unmodified 1399.6264 0.62644264 2460 P43034;I3L3N5 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 80.461 80.461 2 0.0014364 82410 QUIQUE_C1277_190116_001 103.55 85.682 206370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86655000 0 119710000 32878 2460 30604 299241;299242;299243;299244;299245;299246;299247;299248;299249;299250 381934;381935;381936;381937;381938;381939;381940;381941;381942;381943 381934 9 MWEVQTGYCVK Oxidation (M) 1415.6214 0.62135726 2460 P43034;I3L3N5 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 1 0 1 69.945 69.945 2 0.037514 70390 QUIQUE_C1368_190116_001 64.711 51.12 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32879 2460 30604 299251 381944 381944 1 MWFQWSEQR Unmodified 1296.571 0.57097667 1495 Q5T8U5;O15260;B7Z1G8 SURF4 Surfeit locus protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 110.18 110.18 2 0.00048879 115286 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.96 115.73 118230000 0 0 22994000 21417000 0 0 28619000 0 0 0 29129000 0 16073000 32880 1495 30605 299252;299253;299254;299255;299256;299257;299258 381945;381946;381947;381948;381949;381950;381951 381950 7 MWSIENIAFGSGGGLLQK Unmodified 1906.9611 0.96111866 2465 P43490 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 152.79 152.79 2;3 9.8281E-11 158048 QUIQUE_C1368_190116_001 135.58 115.92 1213000000 87824000 63106000 160090000 161700000 91464000 114880000 73806000 0 152300000 22148000 173700000 85522000 26465000 32881 2465 30606 299259;299260;299261;299262;299263;299264;299265;299266;299267;299268;299269;299270;299271;299272;299273;299274;299275;299276;299277 381952;381953;381954;381955;381956;381957;381958;381959;381960;381961;381962;381963;381964;381965;381966;381967;381968;381969;381970;381971;381972;381973 381955 20 MWVFEETVNGR Unmodified 1366.634 0.63397086 3579 Q8N335;C9JM46;C9JFA7;C9K0P5 GPD1L Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)] yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.42 104.42 2 0.00044768 107694 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.62 83.351 299920000 19082000 30400000 21971000 30034000 0 0 26356000 0 31523000 0 58155000 39299000 43097000 32882 3579 30607 299278;299279;299280;299281;299282;299283;299284;299285;299286 381974;381975;381976;381977;381978;381979;381980;381981;381982;381983 381979 9 MWVQLLIPR Unmodified 1154.6634 0.66342049 2722 P61289;B3KQ25;K7ESG5;K7EMD0;K7EPX6;K7EKR3 PSME3 Proteasome activator complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.66 135.66 2 0.00041907 142247 QUIQUE_C1438_190116_001 119.89 100.91 121300000 0 14883000 15156000 14223000 12602000 0 0 0 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382037;382038;382039;382040;382041;382042;382043 382037 7 MYEVVYQIGTETR Oxidation (M) 1603.7552 0.75520821 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 1 0 1 84.387 84.387 2 0.0071134 80943 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.658 63.788 12330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12330000 0 0 0 32893 4435 30615 299339 382044 382044 2952 0 MYGAHLASISTPEEQDFINNR Oxidation (M) 2408.1067 0.10667328 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 1 0 2 3 2 2 2 1 2 3 3 5 3 4 4 95.903 95.903 2;3 1.2999E-112 97286 QUIQUE_DMIX1_190116_001 210.91 192.45 3612000000 108900000 203110000 244940000 155240000 227220000 63766000 214640000 329770000 482550000 148440000 447450000 534890000 451130000 32894 3862 30616 299340;299341;299342;299343;299344;299345;299346;299347;299348;299349;299350;299351;299352;299353;299354;299355;299356;299357;299358;299359;299360;299361;299362;299363;299364;299365;299366;299367;299368;299369;299370;299371;299372;299373;299374;299375 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histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain no no 0 0 0 1 42 42 2 0.020515 39160 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.982 7.3789 37285000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37285000 0 0 32896 2318;325 30617 299427 382151 382151 1 MYGCDVGPDGR Unmodified 1225.4856 0.48559206 2312;2313;2315;2317 P30453;P30457;A0A140T8W8;A0A1W2PR61;A0A1W2PPF8;A0A140T8Y4;A0A0G2JPD3;P30450;P18462;P30456;P30479;P30481;A0A140T9Y5;A0A140T997;A0A140TA14;A0A140TA11 HLA-A;HLA-B HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 38.597 38.597 2 0.011224 34386 QUIQUE_C1368_190116_001 61.56 6.0984 274930000 54970000 0 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299455;299456;299457;299458;299459;299460;299461;299462;299463;299464;299465;299466;299467;299468;299469;299470 382182;382183;382184;382185;382186;382187;382188;382189;382190;382191;382192;382193;382194;382195;382196;382197;382198;382199;382200;382201 382185 2123 18 MYGVLPWNAFPGK Unmodified 1478.738 0.738042 2689 P60201 PLP1 Myelin proteolipid protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.69 133.69 2;3 4.9641E-06 138701 QUIQUE_C1368_190116_001 126.24 111.27 31815000000 1915600000 1289900000 5694200000 1712700000 1352000000 1208000000 4959100000 1518500000 1202900000 792110000 6439400000 1460500000 2270200000 32904 2689 30623 299471;299472;299473;299474;299475;299476;299477;299478;299479;299480;299481;299482;299483;299484 382202;382203;382204;382205;382206;382207;382208;382209;382210;382211;382212;382213;382214;382215;382216;382217;382218;382219;382220;382221;382222;382223;382224;382225;382226;382227;382228 382207 27 MYHDDDLADLVFPSSATADTSIFAGQNDPLK Unmodified 3353.5398 0.53980229 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 156.68 156.68 3 1.0571E-15 159457 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.516 65.883 361150000 0 0 0 0 48327000 0 0 34912000 55134000 0 79586000 65227000 77966000 32905 880 30624 299485;299486;299487;299488;299489;299490 382229;382230;382231;382232;382233;382234;382235 382230 6 MYIEAGNHR Unmodified 1089.5026 0.50256276 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 2 1 1 2 17.447 17.447 2;3 0.0039205 10285 QUIQUE_C1218_190116_001 59.35 46.313 425630000 58576000 28328000 77641000 0 0 23859000 0 83777000 74870000 8018200 18163000 52399000 0 32906 1975 30625 299491;299492;299493;299494;299495;299496;299497;299498;299499;299500;299501;299502;299503;299504 382236;382237;382238;382239;382240;382241;382242;382243;382244;382245;382246;382247;382248;382249 382236 11 MYLETDPSGR Unmodified 1167.523 0.52302343 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 47.151 47.151 2 0.00014691 43890 QUIQUE_C1368_190116_001 122.13 92.562 303440000 0 21184000 60220000 58255000 0 0 23962000 43317000 0 37724000 39589000 19191000 0 32907 4664 30626 299505;299506;299507;299508;299509;299510;299511;299512 382250;382251;382252;382253;382254;382255;382256;382257;382258;382259 382252 6 MYLFYGNK Unmodified 1034.4895 0.48953845 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.317 77.317 2 0.0036845 78234 QUIQUE_C1368_190116_001 122.15 24.558 929030000 0 169600000 176500000 0 109350000 0 172110000 0 0 0 169490000 131990000 0 32908 1749 30627 299513;299514;299515;299516;299517;299518 382260;382261;382262;382263;382264;382265 382261 3 MYLGYEYVTAIR Unmodified 1477.7275 0.72753689 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.36 115.36 2 0.00034572 119182 QUIQUE_C1403_190116_001 114.5 65.078 1944900000 124860000 164870000 206180000 191960000 438100000 181040000 132040000 0 0 45642000 141500000 196050000 122700000 32909 1838 30628 299519;299520;299521;299522;299523;299524;299525;299526;299527;299528;299529 382266;382267;382268;382269;382270;382271;382272;382273;382274;382275;382276;382277;382278;382279;382280;382281;382282;382283;382284 382272 19 MYLGYEYVTAIR Oxidation (M) 1493.7225 0.72245152 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 103.04 103.04 2 0.00063465 107835 QUIQUE_C1438_190116_001 101.66 82.919 473650000 0 0 0 0 204260000 0 0 0 0 45145000 114820000 109430000 0 32910 1838 30628 299530;299531;299532;299533 382285;382286;382287;382288;382289 382285 1055 4 MYLTPSEK Unmodified 967.46847 0.46846866 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;A0A087WWZ1;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.525 32.525 2 0.0057328 27697 QUIQUE_C1277_190116_001 104.37 83.381 777420000 69626000 81839000 82880000 70224000 58286000 49938000 69542000 62063000 60773000 19498000 73898000 0 78854000 32911 292;882;3442 30629 299534;299535;299536;299537;299538;299539;299540;299541;299542;299543;299544;299545 382290;382291;382292;382293;382294;382295;382296;382297;382298;382299;382300;382301 382291 12 MYPIDFEK Unmodified 1041.4841 0.48411873 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 81.344 81.344 2 0.04381 82538 QUIQUE_C1277_190116_001 58.119 49.347 53115000 0 53115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32912 2197 30630 299546 382302 382302 1 MYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLR Unmodified 3089.3899 0.38990735 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 147.75 147.75 4 0.0006819 154692 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.122 33.027 244600000 0 0 0 0 0 0 68018000 0 27665000 0 60085000 33259000 55571000 32913 2197 30631 299547;299548;299549;299550;299551;299552;299553 382303;382304;382305;382306;382307;382308;382309;382310 382307 8 MYPIDFEKDDDSNFHMDFIVAASNLR Oxidation (M) 3105.3848 0.38482197 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 1 1 1 141.66 141.66 3 3.1989E-06 149076 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.091 65.035 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32914 2197 30631 299554 382311 382311 1552 1 MYPTDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQK Unmodified 3204.5359 0.53590288 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 172.57 172.57 3 0.00030531 175691 QUIQUE_C1277_190116_001 40.819 35.841 66999000 22686000 16012000 0 0 0 0 28302000 0 0 0 0 0 0 32915 2377 30632 299555;299556;299557 382312;382313;382314 382313 2 MYPTDDSAPLPAGTLDQPLFEVIQEAMQK Oxidation (M) 3220.5308 0.53081751 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 1 0 1 171.66 171.66 3 1.4539E-08 173129 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.218 54.123 29594000 0 0 0 0 0 0 0 29594000 0 0 0 0 0 32916 2377 30632 299558 382315 382315 1775 1 MYQTQVSDAGLYR Unmodified 1530.7137 0.71367774 4384 Q9P2B2 PTGFRN Prostaglandin F2 receptor negative regulator yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.689 65.689 2 9.7454E-06 64982 QUIQUE_C1368_190116_001 121.61 104.1 113280000 0 0 24155000 0 35901000 0 0 21137000 0 0 0 32085000 0 32917 4384 30633 299559;299560;299561;299562;299563;299564;299565 382316;382317;382318;382319;382320;382321;382322 382318 7 MYSIEPADR Unmodified 1080.491 0.49099502 514 A0AVT1;H0Y9U5 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 45.379 45.379 2 0.0019399 42104 QUIQUE_C1277_190116_001 98.523 69.362 213400000 0 54682000 0 66681000 0 48832000 0 43207000 0 0 0 0 0 32918 514 30634 299566;299567;299568;299569;299570 382323;382324;382325;382326;382327 382324 5 MYSTDDGVQFHAFGR Unmodified 1729.7519 0.75185416 3099 Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes yes 0 0 0 1 1 79.835 79.835 3 0.016105 81762 QUIQUE_C1576_190116_001 48.823 43.043 71808000 0 0 0 0 0 0 33599000 0 0 0 0 0 38208000 32919 3099 30635 299571;299572 382328;382329 382328 1 MYSYPAR Unmodified 886.40072 0.40072345 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V2D6;G3V555;G3V5V7;G3V575 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 28.829 28.829 2 0.03642 24090 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.121 63.499 593250000 0 0 0 0 141030000 0 0 150130000 133180000 0 168910000 0 0 32920 598 30636 299573;299574;299575;299576 382330;382331;382332;382333 382331 4 MYSYPAR Oxidation (M) 902.39564 0.39563807 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V2D6;G3V555;G3V5V7;G3V575 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 1 0 1 22.468 22.468 2 0.058258 15739 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.311 58.384 70998000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70998000 0 0 32921 598 30636 299577 382334 382334 1 MYSYVTEELPQLINANFPVDPQR Oxidation (M) 2739.3214 0.32141708 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 155.29 155.29 2;3 3.6078E-161 159770 QUIQUE_DMIX7_190116_001 232.8 214.88 2654800000 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299602;299603;299604;299605;299606;299607;299608;299609;299610;299611;299612;299613;299614;299615;299616;299617;299618;299619;299620;299621;299622;299623;299624;299625;299626;299627;299628 382366;382367;382368;382369;382370;382371;382372;382373;382374;382375;382376;382377;382378;382379;382380;382381;382382;382383;382384;382385;382386;382387;382388;382389;382390;382391;382392;382393;382394;382395;382396;382397;382398;382399;382400;382401;382402;382403;382404;382405;382406;382407;382408;382409;382410;382411;382412;382413;382414 382369 49 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWR Acetyl (Protein N-term) 2768.3381 0.3380702 2421 P40121;E7ENU9;B8ZZL6 CAPG Macrophage-capping protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 149.19 149.19 2;3 2.6208E-23 156195 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.38 136.94 2166100000 20829000 28203000 48093000 37815000 224330000 16609000 139520000 255080000 298870000 51902000 453210000 257400000 334200000 32924 2421 30638 299629;299630;299631;299632;299633;299634;299635;299636;299637;299638;299639;299640;299641;299642;299643;299644;299645;299646;299647 382415;382416;382417;382418;382419;382420;382421;382422;382423;382424;382425;382426;382427;382428;382429;382430;382431;382432;382433;382434;382435;382436;382437;382438;382439 382434 23 MYTAIPQSGSPFPGSVQDPGLHVWR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2784.333 0.33298482 2421 P40121;E7ENU9;B8ZZL6 CAPG Macrophage-capping protein yes no 1 1 0 1 139.11 139.11 3 0.00049543 135239 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.641 41.992 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32925 2421 30638 299648 382440 382440 1842 1 MYTEDEAR Unmodified 1013.4124 0.41241035 2078 P14621;U3KQL2;U3KPX1;E9PF46;F8WA34 ACYP2 Acylphosphatase-2;Acylphosphatase yes no 0 0 0 1 18.687 18.687 2 0.071118 11268 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.607 40.62 334170000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 334170000 0 0 32926 2078 30639 299649 382441 382441 1 MYTLLSGLYK Acetyl (Protein N-term) 1229.6366 0.63659662 3024 Q13795 ARFRP1 ADP-ribosylation factor-related protein 1 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.45 169.45 2 0.0005476 173835 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.64 84.258 54609000 0 8968100 0 0 10502000 8247000 6428800 7644700 4810000 0 0 0 8008800 32927 3024 30640 299650;299651;299652;299653;299654;299655;299656;299657;299658 382442;382443;382444;382445;382446;382447;382448;382449;382450 382447 9 MYVAVWTPYGVLR Unmodified 1553.8065 0.80645592 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 0 1 1 140.83 140.83 2 0.011822 137227 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.294 48.179 41296000 0 0 0 0 0 0 0 41296000 0 0 0 0 0 32928 1785 30641 299659;299660 382451;382452 382452 2 MYVFGGWVPLVMDDVK Unmodified 1854.9048 0.90484933 533 A6NEM2;P51610 HCFC1 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 0 0 0 1 165.75 165.75 2 0.0015127 170922 QUIQUE_C1368_190116_001 89.189 64.334 33554000 0 0 33554000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32929 533 30642 299661 382453 382453 1 MYVGECQGPGVR Unmodified 1351.6013 0.60129052 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 41.221 41.221 2 0.0014457 37481 QUIQUE_C1277_190116_001 89.247 70.153 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32930 3102 30643 299662 382454 382454 1 MYYSAVDPTK Unmodified 1173.5376 0.53761086 1784 P00450 CP Ceruloplasmin no no 0 0 0 1 51.481 51.481 2 0.00091605 50429 QUIQUE_C1438_190116_001 104.2 76.943 56444000 0 0 0 0 56444000 0 0 0 0 0 0 0 0 + 32931 1784 30644 299663 382455 382455 1 MYYSAVDPTKDIFTGLIGPMK Unmodified 2346.164 0.16397715 1784 P00450 CP Ceruloplasmin no no 0 0 1 1 144.2 144.2 3 0.0027115 151755 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.016 43.065 43353000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43353000 0 0 + 32932 1784 30645 299664 382456 382456 1 NAAAFQETLETLIK Unmodified 1547.8195 0.81952302 2804 P78333 GPC5 Glypican-5;Secreted glypican-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 138.8 138.8 2 0.0022373 142897 QUIQUE_C1277_190116_001 75.695 64.943 95381000 30484000 0 0 0 0 0 34257000 0 0 0 0 30640000 0 32933 2804 30646 299665;299666;299667;299668;299669 382457;382458;382459;382460;382461 382458 5 NAADSYFSLLQGFINSLDESTQESK Unmodified 2763.2875 0.28753399 3336 Q5VW32;F5GXQ0;Q5VW33 BROX BRO1 domain-containing protein BROX yes no 0 0 0 1 176.61 176.61 2 3.9924E-19 180598 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.97 131.18 9182900 0 0 0 0 0 0 0 0 9182900 0 0 0 0 32934 3336 30647 299670 382462 382462 1 NAAENMLEILGFK Unmodified 1448.7334 0.73335055 104 A0A087X1A5;Q5JW30;O95793 STAU1 Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.39 159.39 2 0.00047041 163363 QUIQUE_C1277_190116_001 114.83 96.522 167250000 15488000 20028000 13965000 18641000 16661000 20543000 13085000 0 0 5891700 0 24571000 18377000 32935 104 30648 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88434000 93318000 32939 3254 30652 299709;299710;299711;299712;299713;299714;299715;299716;299717;299718;299719;299720;299721;299722;299723;299724;299725;299726;299727 382508;382509;382510;382511;382512;382513;382514;382515;382516;382517;382518;382519;382520;382521;382522;382523;382524;382525;382526 382523 19 NAAQELATLLLSLPAPASVQQQSK Unmodified 2477.349 0.34895246 3312 Q5T4S7;A0A0A0MSW0;X6RE05 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.1 169.1 3 3.591E-15 170882 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.1 106.29 485660000 39083000 47608000 110060000 12541000 41949000 19577000 0 49486000 47582000 11467000 72985000 33330000 0 32940 3312 30653 299728;299729;299730;299731;299732;299733;299734;299735;299736;299737;299738 382527;382528;382529;382530;382531;382532;382533;382534;382535;382536;382537;382538 382533 11 NAAQFLLSTNDK Unmodified 1320.6674 0.66737948 2781 P63151 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes yes 0 0 0 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382555;382556;382557;382558;382559;382560;382561;382562;382563;382564;382565;382566;382567;382568;382569;382570;382571;382572;382573;382574;382575;382576;382577 382574 20 NAATEDLWESLENASGK Unmodified 1833.8381 0.83808621 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.04 132.04 2 1.6532E-12 137617 QUIQUE_C1218_190116_001 164.92 152.3 1211900000 146940000 136680000 124070000 151560000 103780000 141630000 133370000 28438000 46190000 67323000 0 67369000 64580000 32943 959 30656 299772;299773;299774;299775;299776;299777;299778;299779;299780;299781;299782;299783 382578;382579;382580;382581;382582;382583;382584;382585;382586;382587;382588;382589 382578 11 NAATEDLWESLENASGKPIAAVMNTWTK Oxidation (M) 3062.4655 0.46551513 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 1 1 1 1 152.11 152.11 3 7.5906E-09 154403 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.165 59.135 106890000 38599000 0 0 0 0 0 0 68287000 0 0 0 0 0 32944 959 30657 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dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.24 124.24 2 6.2744E-06 129961 QUIQUE_C1218_190116_001 136.96 121.07 2240800000 219930000 262100000 241500000 193270000 150510000 235570000 210460000 123370000 188020000 80973000 162580000 0 172490000 32949 1069 30661 299821;299822;299823;299824;299825;299826;299827;299828;299829;299830;299831;299832 382629;382630;382631;382632;382633;382634;382635;382636;382637;382638;382639;382640;382641;382642 382629 12 NACIECSVNQNSIR Unmodified 1663.7406 0.74063755 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.799 45.799 2 4.0099E-07 42077 QUIQUE_DMIX8_190116_001 153.95 125.93 600940000 41093000 55226000 46713000 46660000 45648000 44168000 57779000 36668000 40721000 14589000 56678000 54850000 60141000 32950 4392 30662 299833;299834;299835;299836;299837;299838;299839;299840;299841;299842;299843;299844;299845 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NAGNCLSPAVIVGLLK Unmodified 1624.8971 0.89706184 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 140.69 140.69 2;3 3.4309E-80 146992 QUIQUE_C1438_190116_001 213.16 204.93 11783000000 819860000 921690000 1101200000 764230000 1023100000 1123700000 856330000 862640000 1075800000 430620000 775060000 860530000 1168200000 32987 404 30699 300128;300129;300130;300131;300132;300133;300134;300135;300136;300137;300138;300139;300140;300141;300142;300143;300144;300145;300146;300147;300148;300149;300150;300151;300152 382982;382983;382984;382985;382986;382987;382988;382989;382990;382991;382992;382993;382994;382995;382996;382997;382998;382999;383000;383001;383002;383003;383004;383005;383006;383007;383008;383009;383010;383011;383012;383013;383014;383015;383016;383017;383018;383019;383020;383021;383022;383023;383024;383025;383026;383027;383028;383029;383030;383031;383032;383033;383034;383035 383002 54 NAGNEQDLGIQYK Unmodified 1448.6896 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383139;383140;383141;383142;383143;383144;383145;383146;383147;383148;383149;383150;383151;383152;383153;383154;383155;383156;383157;383158;383159;383160;383161;383162;383163;383164 383155 23 NAIDKLFVLFGAEILK Unmodified 1790.0342 0.034207247 2409 P37837;F2Z393 TALDO1 Transaldolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 167.98 167.98 2;3 1.1054E-28 170098 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.27 148.45 428170000 0 0 0 0 0 0 0 121170000 71997000 0 103890000 98731000 32386000 32996 2409 30708 300248;300249;300250;300251;300252;300253;300254;300255;300256 383165;383166;383167;383168;383169;383170;383171;383172;383173 383166 9 NAIHTFVQSGSHLAAR Unmodified 1707.8805 0.88050057 1849 P04040 CAT Catalase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 46.822 46.822 3;4 2.9516E-45 44221 QUIQUE_C1277_190116_001 168.05 153.78 1331700000 264180000 131140000 111560000 77504000 64689000 139800000 139480000 80632000 110940000 46191000 36143000 0 129420000 32997 1849 30709 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383225;383226;383227;383228;383229;383230;383231;383232;383233;383234;383235;383236;383237;383238;383239;383240;383241;383242;383243;383244;383245;383246 383228 22 NALDLLLPK Unmodified 995.60153 0.60153174 338 A0A1B0GWJ0;A0A1B0GTJ7;P30566;A0A1B0GTG9;A0A1B0GWF8;A0A096LNY4 ADSL Adenylosuccinate lyase yes no 0 0 0 1 1 1 116.84 116.84 2 0.035683 119268 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.712 37.936 48325000 0 0 0 17482000 11637000 0 0 19206000 0 0 0 0 0 33005 338 30717 300316;300317;300318 383247;383248;383249 383249 3 NALDPMSVLLAR Unmodified 1298.7017 0.70165649 2455 P42785 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.4 134.4 2 6.2279E-06 140814 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.59 86.769 568670000 39780000 57245000 47680000 0 49672000 49966000 46188000 30458000 62457000 27522000 56572000 45826000 55299000 33006 2455 30718 300319;300320;300321;300322;300323;300324;300325;300326;300327;300328;300329;300330;300331 383250;383251;383252;383253;383254;383255;383256;383257;383258;383259;383260;383261;383262;383263;383264 383261 14 NALENIR Unmodified 828.44537 0.44536545 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A2R8Y4K2;A0A2R8Y7B4;A0A2R8Y5S5 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.141 28.141 2 0.019305 22689 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.19 27.348 3655300000 0 421480000 337690000 339960000 0 387760000 373100000 247440000 350990000 207580000 347340000 310630000 331300000 33007 4564 30719 300332;300333;300334;300335;300336;300337;300338;300339;300340;300341;300342 383265;383266;383267;383268;383269;383270;383271;383272;383273;383274;383275;383276 383272 12 NALENIRK Unmodified 956.54033 0.54032847 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A2R8Y4K2;A0A2R8Y7B4;A0A2R8Y5S5 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 0 0 1 1 17.249 17.249 2 0.014405 9823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.187 13.041 132060000 0 0 0 0 0 0 0 132060000 0 0 0 0 0 33008 4564 30720 300343 383277 383277 1 NALESYAFNMK Unmodified 1286.5965 0.59652272 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.601 90.601 2 2.3637E-08 93372 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.07 137.08 9712100000 502560000 708640000 722300000 482590000 784760000 384820000 832430000 708620000 644870000 343540000 1726400000 1020800000 849720000 33009 282;2362 30721 300344;300345;300346;300347;300348;300349;300350;300351;300352;300353;300354;300355;300356 383278;383279;383280;383281;383282;383283;383284;383285;383286;383287;383288;383289;383290;383291;383292;383293;383294;383295;383296;383297;383298;383299;383300;383301;383302;383303;383304;383305;383306;383307;383308 383303 31 NALESYAFNMK Oxidation (M) 1302.5914 0.59143734 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 69.493 69.493 2 4.5152E-05 69747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.4 120.08 1959300000 104970000 150200000 173580000 129330000 143750000 121530000 134070000 104650000 167200000 146770000 268120000 150470000 164650000 33010 282;2362 30721 300357;300358;300359;300360;300361;300362;300363;300364;300365;300366;300367;300368;300369;300370 383309;383310;383311;383312;383313;383314;383315;383316;383317;383318;383319;383320;383321;383322;383323;383324;383325;383326;383327;383328;383329;383330;383331;383332 383323 212 23 NALESYTYNIK Unmodified 1314.6456 0.6455814 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.999 72.999 2 0.00045729 73580 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.86 87.916 10625000000 689040000 875010000 1037400000 826980000 0 775350000 977180000 0 1458700000 0 1358900000 1133000000 1493500000 33011 2643 30722 300371;300372;300373;300374;300375;300376;300377;300378;300379;300380;300381;300382;300383 383333;383334;383335;383336;383337;383338;383339;383340;383341;383342;383343;383344;383345;383346;383347 383345 12 NALFCLESAWK Unmodified 1337.6438 0.64380726 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 122.98 122.98 2 0.0025472 129278 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.662 63.727 515240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 299980000 0 215260000 33012 1802 30723 300384;300385;300386 383348;383349;383350;383351 383350 4 NALGAIHHTISVR Unmodified 1387.7684 0.76843093 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3;C9JH43 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 34.21 34.21 2;3 9.8565E-120 29865 QUIQUE_DMIX3_190116_001 247.31 195.97 6297400000 502720000 565020000 222840000 574480000 641040000 419220000 435720000 401610000 588740000 116590000 637060000 625320000 567020000 33013 756 30724 300387;300388;300389;300390;300391;300392;300393;300394;300395;300396;300397;300398;300399;300400;300401;300402;300403;300404;300405;300406;300407;300408;300409;300410;300411 383352;383353;383354;383355;383356;383357;383358;383359;383360;383361;383362;383363;383364;383365;383366;383367;383368;383369;383370;383371;383372;383373;383374;383375;383376;383377;383378;383379;383380;383381;383382 383373 29 NALGPGLSPELGPLPALR Unmodified 1770.9992 0.99921872 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 130.44 130.44 2;3 2.5797E-32 135194 QUIQUE_C1368_190116_001 152.4 131.61 2484900000 226020000 169310000 294420000 200040000 167760000 198960000 0 171660000 217480000 129090000 247280000 220150000 242720000 33014 3576 30725 300412;300413;300414;300415;300416;300417;300418;300419;300420;300421;300422;300423;300424;300425;300426;300427 383383;383384;383385;383386;383387;383388;383389;383390;383391;383392;383393;383394;383395;383396;383397;383398 383385 11 NALKQETEVELYNEFPEPIK Unmodified 2390.2006 0.20055689 2576 P51149;C9J8S3;C9J4V0;C9J4S4 RAB7A Ras-related protein Rab-7a yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 108.22 108.22 3 0.0047167 113255 QUIQUE_C1438_190116_001 50.358 46.158 411340000 0 66657000 66345000 65934000 47358000 0 0 89143000 75904000 0 0 0 0 33015 2576 30726 300428;300429;300430;300431;300432;300433 383399;383400;383401;383402;383403;383404;383405 383402 7 NALLQLTDSQIADVAR Unmodified 1726.9214 0.92136233 1650 O75643;B4E0P5 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 122.4 122.4 2 6.2832E-66 126206 QUIQUE_C1277_190116_001 197.07 173.47 277220000 56219000 53163000 0 0 37164000 0 0 26696000 0 17575000 47684000 38715000 0 33016 1650 30727 300434;300435;300436;300437;300438;300439;300440 383406;383407;383408;383409;383410;383411;383412 383407 6 NALLSLAK Unmodified 828.5069 0.50690308 1853 P04083;Q5T3N1 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.286 56.286 2 0.0065653 54855 QUIQUE_C1277_190116_001 101.28 27.668 4306600000 192670000 278850000 371680000 417030000 251130000 338390000 488050000 252380000 440010000 175030000 363080000 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Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.305 47.305 2 0.0041123 44898 QUIQUE_C1277_190116_001 110.34 57.654 268940000 29449000 33432000 41991000 0 30304000 0 41384000 0 0 0 42927000 49457000 0 33019 3896 30730 300476;300477;300478;300479;300480;300481;300482 383450;383451;383452;383453;383454;383455;383456;383457 383451 8 NALQELQQIIITPIK Unmodified 1721.0087 0.0087207779 87 A0A087WZT0;M0QZ22;Q5PRF9 SAMD4B Protein Smaug homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 156.81 156.81 2 8.4111E-06 160587 QUIQUE_C1403_190116_001 105.17 84.393 140590000 16124000 0 0 19951000 21438000 17351000 28341000 16970000 20419000 0 0 0 0 33020 87 30731 300483;300484;300485;300486;300487;300488;300489 383458;383459;383460;383461;383462;383463;383464 383459 7 NALQQENHIIDGVK Unmodified 1577.8162 0.81616898 40 A0A087WUN7;H0YJ40;G3V4X6;G3V2S9;Q9GZT3;H0YJW7 SLIRP SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 2 1 1 2 50.665 50.665 2;3 1.8936E-10 48310 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1177.5761 0.57612163 2655 Q5VWC4;P55036;H0Y3Y9;H0Y561 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.566 36.566 2 8.8567E-05 31636 QUIQUE_DMIX8_190116_001 121.9 91.732 347460000 0 43091000 0 58904000 0 0 0 60430000 0 0 68539000 35409000 81087000 33025 2655 30736 300542;300543;300544;300545;300546;300547;300548;300549 383523;383524;383525;383526;383527;383528;383529;383530;383531 383531 8 NAMGSLASQATK Oxidation (M) 1193.571 0.57103625 2655 Q5VWC4;P55036;H0Y3Y9;H0Y561 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 yes no 0 1 0 1 1 16.58 16.58 2 0.0033843 8758 QUIQUE_C1563_190116_001 73.781 52.809 31621000 0 0 0 17662000 0 13959000 0 0 0 0 0 0 0 33026 2655 30736 300550;300551 383532;383533 383533 2091 2 NAMITVLENTIK Unmodified 1345.7275 0.72753689 3257 Q53HC0 CCDC92 Coiled-coil domain-containing protein 92 yes yes 0 0 0 1 1 123.37 123.37 2 0.028095 127222 QUIQUE_C1277_190116_001 55.718 37.659 41344000 0 0 0 41344000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33027 3257 30737 300552;300553 383534;383535 383534 2 NAMSLPQLNEK Unmodified 1243.6231 0.62307182 4160 Q9H3Q1;J3KRZ9 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 66.505 66.505 2 0.0023077 66121 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.148 35.851 341300000 0 0 0 0 0 0 0 0 142140000 0 102480000 0 96690000 33028 4160 30738 300554;300555;300556 383536;383537;383538;383539;383540 383540 5 NANEMFR Unmodified 880.38614 0.38613602 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 24.851 24.851 2 0.045326 18563 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.616 25.932 41048000 0 0 0 0 0 0 0 41048000 0 0 0 0 0 33029 3053 30739 300557 383541 383541 1 NANLYFLDVVQQANTIFHLFDK Unmodified 2609.3278 0.32782309 174 A0A0A0MSI8;O00471;F8W9B8 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 0 0 0 1 173.56 173.56 3 0.0017613 177208 QUIQUE_DMIX7_190116_001 39.68 32.569 47777000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47777000 0 33030 174 30740 300558 383542 383542 1 NANSLGGGFHCWTCDVR Unmodified 1949.8261 0.82609851 2563 P50440 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 74.402 74.402 2;3 9.0667E-19 75273 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.86 118.88 361600000 58622000 83908000 55519000 0 94108000 0 0 0 0 0 0 0 69443000 33031 2563 30741 300559;300560;300561;300562;300563;300564;300565 383543;383544;383545;383546;383547;383548;383549 383548 7 NAPAIIFIDELDAIAPK Unmodified 1809.9877 0.98765098 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 167.38 167.38 2;3 1.7232E-22 171377 QUIQUE_C1368_190116_001 186.51 176.18 16273000000 1124400000 1150800000 1124600000 1166100000 1748100000 1019100000 1348900000 1069300000 1212200000 475520000 1420800000 1477800000 1935100000 33032 2658 30742 300566;300567;300568;300569;300570;300571;300572;300573;300574;300575;300576;300577;300578;300579;300580;300581;300582;300583;300584;300585;300586;300587;300588;300589;300590;300591;300592;300593;300594 383550;383551;383552;383553;383554;383555;383556;383557;383558;383559;383560;383561;383562;383563;383564;383565;383566;383567;383568;383569;383570;383571;383572;383573;383574;383575;383576;383577;383578;383579;383580;383581;383582;383583;383584;383585;383586;383587;383588;383589;383590;383591;383592;383593;383594;383595;383596;383597;383598;383599;383600;383601;383602;383603;383604;383605;383606 383564 57 NAPCILFIDEIDAVGR Unmodified 1801.9033 0.90326943 4612 Q9Y4W6 AFG3L2 AFG3-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 150.04 150.04 2 0.0043191 152792 QUIQUE_C1563_190116_001 57.566 43.63 55758000 0 0 29531000 0 0 26227000 0 0 0 0 0 0 0 33033 4612 30743 300595;300596;300597 383607;383608;383609;383610 383609 4 NAPTPQEFR Unmodified 1058.5145 0.51450765 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.161 30.161 2 0.0010534 24699 QUIQUE_C1277_190116_001 107.29 75.991 11450000000 826910000 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383680 15 NAQMAQSPILLLGGAASTLLQNR Oxidation (M) 2382.2689 0.268928 516 A1L0T0;M0R026;E9PJS0;M0R1B5;E9PL44 ILVBL Acetolactate synthase-like protein yes no 0 1 0 1 158.55 158.55 3 7.5247E-05 153459 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.162 44.073 21948000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21948000 0 0 0 33040 516 30749 300667 383694 383694 358 1 NASCYFDIEWR Unmodified 1459.619 0.61904908 3187 Q16658;C9JFC0;A0A0A0MSB2;C9JPH9 FSCN1 Fascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.99 117.99 2 0.00020519 121541 QUIQUE_C1277_190116_001 123.88 109.22 2057000000 170950000 243020000 159400000 123480000 159670000 126980000 189830000 148480000 167640000 37741000 183140000 183180000 163540000 33041 3187 30750 300668;300669;300670;300671;300672;300673;300674;300675;300676;300677;300678;300679;300680 383695;383696;383697;383698;383699;383700;383701;383702;383703;383704;383705;383706;383707;383708;383709;383710;383711;383712;383713;383714;383715;383716;383717;383718 383697 24 NASEMIDKLTLTFNR Unmodified 1751.8876 0.88761936 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Unmodified 1600.7845 0.7845345 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 74.574 74.574 2;3 1.6101E-35 74687 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.09 142.35 12717000000 3352200000 2759700000 0 1183200000 1223200000 0 0 153960000 1340300000 1347500000 0 1248000000 109580000 33067 3975 30772 300892;300893;300894;300895;300896;300897;300898;300899;300900;300901;300902;300903;300904;300905;300906;300907 383963;383964;383965;383966;383967;383968;383969;383970;383971;383972;383973;383974;383975;383976;383977;383978;383979;383980;383981;383982;383983 383975 21 NAVTQFVSSMSASADVLALAK Oxidation (M) 2125.0725 0.072519601 2498 P47985;P0C7P4 UQCRFS1;UQCRFS1P1 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial;Cytochrome b-c1 complex subunit 11;Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1 yes no 0 1 0 1 1 2 2 1 1 2 1 2 2 2 2 2 137.66 137.66 2;3 2.5603E-112 144261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 207.31 184.74 1670600000 45545000 56480000 175660000 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receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 72.766 72.766 3;4 1.1578E-05 73887 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.457 84.126 257040000 0 0 0 0 0 0 0 101120000 66118000 0 51233000 0 38572000 33070 2911 30774 300968;300969;300970;300971 384080;384081;384082;384083 384080 4 NAVWALSNLCR Unmodified 1302.6503 0.65028963 1587;2604 P52294;C9JYI4;O60684;O15131;Q5TFJ7 KPNA1;KPNA6;KPNA5 Importin subunit alpha-5;Importin subunit alpha-5, N-terminally processed;Importin subunit alpha-7;Importin subunit alpha-6 no no 0 0 0 1 1 1 99.982 99.982 2 0.026717 104168 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.579 20.644 312120000 0 0 0 0 0 0 130150000 0 83153000 0 98818000 0 0 33071 2604;1587 30775 300972;300973;300974 384084;384085;384086 384086 3 NAWADNANACAK Unmodified 1304.5568 0.55678317 4293 Q9NTJ5;E9PGZ4;C9JV50 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 0 0 0 1 1 1 26.894 26.894 2 0.011661 20820 QUIQUE_C1563_190116_001 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2/3 complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 72.981 72.981 1;2 4.3078E-05 74776 QUIQUE_C1218_190116_001 147.19 102.49 3036200000 228310000 268600000 296490000 249580000 234970000 209980000 280900000 210110000 219730000 108690000 251390000 243250000 234150000 33082 1486 30786 301036;301037;301038;301039;301040;301041;301042;301043;301044;301045;301046;301047;301048;301049;301050 384160;384161;384162;384163;384164;384165;384166;384167;384168;384169;384170;384171;384172;384173;384174;384175;384176;384177 384160 15 NCFHITAVR Unmodified 1116.5498 0.5498473 3468 Q7Z6G3 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 31.941 31.941 3 0.013462 26824 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.161 32.925 185990000 0 0 0 55436000 0 43457000 0 0 37005000 0 0 50089000 0 33083 3468 30787 301051;301052;301053;301054 384178;384179;384180;384181;384182 384181 5 NCFLNLAIPIVVFTETTEVR Unmodified 2335.2246 0.22460357 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 171.69 171.69 2;3 5.4779E-13 178980 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.54 131.16 133130000 0 0 0 0 0 0 0 11951000 19545000 0 67103000 24729000 9804500 33084 514 30788 301055;301056;301057;301058;301059;301060 384183;384184;384185;384186;384187;384188 384186 6 NCFLNLAIPIVVFTETTEVRK Unmodified 2463.3196 0.31956658 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 163.87 163.87 3 0.00015368 166321 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.788 74.336 52811000 0 0 0 0 0 0 0 22702000 18429000 0 0 11680000 0 33085 514 30789 301061;301062;301063 384189;384190;384191 384189 1 NCGEMSEIEAK Unmodified 1266.522 0.52203715 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 32.796 32.796 2 0.0028943 28231 QUIQUE_C1218_190116_001 75.509 65.547 58262000 15111000 0 22530000 0 0 0 20621000 0 0 0 0 0 0 33086 4606 30790 301064;301065;301066 384192;384193;384194;384195 384193 4 NCGGIPALVR Unmodified 1055.5546 0.55459833 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 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1306.634 0.63397086 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.539 78.539 2 2.5614E-18 80286 QUIQUE_C1438_190116_001 170.3 156 927100000 92834000 125420000 86093000 80440000 81347000 103910000 86081000 43225000 59972000 39357000 66729000 0 61694000 33114 3208 30816 301272;301273;301274;301275;301276;301277;301278;301279;301280;301281;301282;301283;301284 384438;384439;384440;384441;384442;384443;384444;384445;384446;384447;384448;384449;384450;384451;384452;384453;384454 384443 15 NCVVELNFGQKEEPFFPPPEEFVFIHAVPVEER Unmodified 3928.9134 0.91344677 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 1 1 153.85 153.85 4 1.1268E-05 161329 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.317 35.251 101920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 101920000 0 0 33115 3208 30817 301285 384455 384455 1 NCWHLDAAMR Unmodified 1272.5492 0.54919537 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 0 1 54.585 54.585 3 0.030332 52436 QUIQUE_C1403_190116_001 33.088 22.183 20947000 0 0 0 20947000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33116 2439 30818 301286 384456 384456 1 NCWHLDAAMRPSFLQLR Unmodified 2114.0302 0.030218052 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 1 1 1 110.44 110.44 4 0.031549 115781 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.858 24.039 80887000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49455000 31432000 0 33117 2439 30819 301287;301288 384457;384458 384457 2 NCWQNYLDFHR Unmodified 1551.6677 0.6677306 2081 P14854 COX6B1 Cytochrome c oxidase subunit 6B1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 1 2 2 95.775 95.775 2;3 5.0755E-06 99395 QUIQUE_C1438_190116_001 141.08 136.62 6196100000 644980000 753240000 696330000 287880000 463260000 434060000 718100000 320980000 376390000 95934000 170300000 532060000 702570000 33118 2081 30820 301289;301290;301291;301292;301293;301294;301295;301296;301297;301298;301299;301300;301301;301302;301303;301304;301305;301306;301307;301308;301309;301310;301311;301312;301313;301314;301315 384459;384460;384461;384462;384463;384464;384465;384466;384467;384468;384469;384470;384471;384472;384473;384474;384475;384476;384477;384478;384479;384480;384481;384482;384483;384484;384485;384486;384487;384488;384489;384490;384491;384492;384493;384494;384495;384496;384497;384498;384499;384500;384501;384502;384503;384504;384505;384506;384507;384508 384478 49 NDALEMVEETTWQGLK Unmodified 1862.872 0.87202888 2539 P49748;K7EQP4;K7EJW8;J3KS89;J3QKU9 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 145.11 145.11 2;3 2.0991E-07 140853 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.25 102.88 50193000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50193000 0 0 0 33119 2539 30821 301316;301317;301318 384509;384510;384511;384512 384510 4 NDANCIHMVDNGIVEK Unmodified 1827.8244 0.82436718 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 57.42 57.42 2;3 3.7402E-55 55648 QUIQUE_C1368_190116_001 195.2 170.91 1746900000 136500000 169000000 148620000 142900000 154680000 0 175670000 108810000 129790000 28613000 164530000 139620000 248180000 33120 2605 30822 301319;301320;301321;301322;301323;301324;301325;301326;301327;301328;301329;301330;301331;301332;301333;301334;301335;301336;301337;301338;301339;301340;301341 384513;384514;384515;384516;384517;384518;384519;384520;384521;384522;384523;384524;384525;384526;384527;384528;384529;384530;384531;384532;384533;384534;384535;384536;384537 384518 24 NDANPETHAFVTSPEIVTALAIAGTLK Unmodified 2779.4392 0.43922403 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 3 3 3 2 4 3 156.65 156.65 2;3;4 0 162306 QUIQUE_C1218_190116_001 293.72 275.81 21265000000 1890300000 1836100000 2011500000 1188200000 1649900000 1217700000 1372700000 1480000000 2307800000 583090000 1838200000 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35 NDDDSSEAMNDILAQVATNTETSK Unmodified 2568.1133 0.11333438 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 144.52 144.52 3 0.00053022 148333 QUIQUE_C1403_190116_001 43.241 40.143 39200000 0 0 0 39200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33124 1548 30826 301419 384647;384648 384647 2 NDDGWYEGVCNR Unmodified 1483.5786 0.57864083 157 B6VEX4;A0A0A0MRT6;Q8IZP0 ABI1 Abl interactor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 67.21 67.21 2 0.00061806 66797 QUIQUE_C1368_190116_001 91.549 84.696 121440000 0 22538000 23532000 0 0 20299000 0 19769000 0 12426000 0 0 22880000 33125 157 30827 301420;301421;301422;301423;301424;301425 384649;384650;384651;384652;384653;384654;384655 384650 7 NDEAEYICIAENK Unmodified 1567.6824 0.6824372 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.004 79.004 2 2.2431E-06 80713 QUIQUE_C1218_190116_001 128.88 123.57 1543100000 175510000 158160000 192050000 211620000 146940000 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PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 167.69 167.69 2;3 5.3195E-07 172602 QUIQUE_C1368_190116_001 136.99 121.79 223430000 10906000 24569000 27186000 8213900 25955000 27279000 13359000 0 22953000 3780900 22247000 0 36987000 33134 4150 30836 301496;301497;301498;301499;301500;301501;301502;301503;301504;301505;301506;301507;301508;301509 384734;384735;384736;384737;384738;384739;384740;384741;384742;384743;384744;384745;384746;384747;384748 384737 15 NDFIGQSTIPLNSLK Unmodified 1645.8675 0.86753585 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.57 110.57 2 5.9405E-29 114058 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.49 141.62 4003600000 320920000 0 471060000 365250000 306250000 406020000 307080000 258290000 445330000 292550000 343740000 0 487070000 33135 2578 30837 301510;301511;301512;301513;301514;301515;301516;301517;301518;301519;301520;301521 384749;384750;384751;384752;384753;384754;384755;384756;384757;384758;384759;384760;384761;384762;384763 384757 15 NDFMGAMSFGVSELLK Unmodified 1744.8164 0.81642826 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 162.94 162.94 2 0.0004908 166648 QUIQUE_C1277_190116_001 79.466 67.253 156340000 28916000 22336000 13980000 12784000 0 12172000 23023000 0 0 0 0 25381000 17750000 33136 1877 30838 301522;301523;301524;301525;301526;301527;301528;301529 384764;384765;384766;384767;384768;384769;384770;384771;384772 384765 9 NDFMGSLSFGISELQK Unmodified 1771.8451 0.84508585 1894 P05771;I3L1Z0 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 0 1 148.67 148.67 2 0.0089949 153696 QUIQUE_C1218_190116_001 91.202 60.092 23000000 23000000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33137 1894 30839 301530 384773 384773 0 NDFMGSLSFGVSELMK Unmodified 1760.8113 0.81134288 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 159.09 159.09 2 8.0419E-07 164310 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NDFTEEEEAQVR Unmodified 1465.6321 0.63211618 2784 P63208;E5RJR5 SKP1 S-phase kinase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 54.03 54.03 2 1.7804E-09 51774 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.98 160.02 10623000000 836110000 814250000 705100000 912880000 968930000 688230000 915490000 635210000 938270000 524470000 868180000 674760000 1141400000 33142 2784 30843 301577;301578;301579;301580;301581;301582;301583;301584;301585;301586;301587;301588;301589;301590;301591;301592;301593 384830;384831;384832;384833;384834;384835;384836;384837;384838;384839;384840;384841;384842;384843;384844;384845;384846;384847;384848;384849;384850;384851;384852;384853;384854;384855;384856;384857;384858 384845 29 NDFTEEEEAQVRK Unmodified 1593.7271 0.7270792 2784 P63208;E5RJR5 SKP1 S-phase kinase-associated protein 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 37.752 37.752 2;3 2.318E-31 34338 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.57 165.14 1182600000 0 0 0 0 0 0 0 346090000 216820000 0 228670000 168230000 222780000 33143 2784 30844 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385419;385420;385421;385422;385423;385424;385425;385426;385427;385428;385429;385430 385425 12 NDSQLVIEAYK Unmodified 1278.6456 0.6455814 671 B7ZL14;Q96RU3;H0Y7W6 FNBP1 Formin-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.08 67.08 2 0.00043302 63975 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.18 82.844 247310000 30874000 38224000 39873000 25885000 0 0 0 0 40195000 23395000 0 0 48861000 33194 671 30894 302051;302052;302053;302054;302055;302056;302057 385431;385432;385433;385434;385435;385436;385437;385438 385437 8 NDSVIVDTFHGLFK Unmodified 1590.8042 0.80420731 1096;2965 G5E9A6;P51784;Q13107;H7C189 USP11;USP4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 128.72 128.72 2;3 0.00035293 134501 QUIQUE_C1438_190116_001 77.527 64.694 353220000 52819000 40163000 0 38153000 39448000 38167000 35502000 16325000 0 18350000 0 37797000 36497000 33195 1096;2965 30895 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385514 8 NDVLDSLGISPDLLPEDFVR Unmodified 2213.1216 0.12157828 4395 Q9UBE0;M0QZS6 SAE1 SUMO-activating enzyme subunit 1;SUMO-activating enzyme subunit 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 1 168.66 168.66 2;3 2.7376E-75 172652 QUIQUE_DMIX7_190116_001 229.54 206.66 3293200000 196790000 385750000 139090000 205870000 267910000 426880000 233240000 341680000 263940000 68131000 196900000 367460000 199580000 33202 4395 30902 302118;302119;302120;302121;302122;302123;302124;302125;302126;302127;302128;302129;302130;302131;302132;302133;302134 385517;385518;385519;385520;385521;385522;385523;385524;385525;385526;385527;385528;385529;385530;385531;385532;385533;385534;385535 385533 16 NDVLPLSNSVPEDVGK Unmodified 1681.8523 0.85227972 3843 Q96EQ0;D6RFW1 SGTB Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 92.373 92.373 2 5.5442E-07 95539 QUIQUE_C1218_190116_001 115.34 96.67 336690000 60602000 61527000 43873000 0 67163000 0 0 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NDYCCFAAFPR Unmodified 1419.57 0.56999039 92 A0A087X0M8;O00533 CHL1 Neural cell adhesion molecule L1-like protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.437 92.437 2 0.00097519 94659 QUIQUE_C1277_190116_001 92.062 90.254 101710000 0 29685000 0 0 25760000 0 27848000 0 0 0 0 18421000 0 33210 92 30910 302150;302151;302152;302153;302154;302155;302156;302157;302158 385551;385552;385553;385554;385555;385556;385557;385558;385559 385551 9 NDYLLNLAATNAAISK Unmodified 1690.889 0.88899957 1520 O43295;A0A087WZH4 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 117.78 117.78 2 6.1054E-07 122781 QUIQUE_C1218_190116_001 114.7 95.748 182930000 31564000 25732000 0 31070000 0 25509000 35691000 0 0 0 0 33360000 0 33211 1520 30911 302159;302160;302161;302162;302163;302164 385560;385561;385562;385563;385564;385565 385560 6 NDYSYWLSTPEPMPMSMAPITGENIRPFISR 2 Oxidation (M) 3631.6786 0.67856115 494 A0A3B3ISV3;P02462 COL4A1 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten yes no 0 2 1 1 141.73 141.73 3 2.2304E-25 149129 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.822 87.652 49944000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49944000 0 0 33212 494 30912 302165 385566 385566 355;356 1 NDYVAAER Unmodified 936.43011 0.43010932 3973 Q99747 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 19.129 19.129 2 0.003641 12063 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.65 96.867 356880000 28875000 0 0 0 0 0 0 140190000 71703000 116120000 0 0 0 33213 3973 30913 302166;302167;302168;302169 385567;385568;385569;385570 385568 3 NEAGIVSCTAR Unmodified 1176.5557 0.55572054 3716 Q8WX93;H0YA05 PALLD Palladin no no 0 0 0 1 1 25.503 25.503 2 0.016602 19398 QUIQUE_C1277_190116_001 71.379 24.954 376650000 0 212450000 0 0 164200000 0 0 0 0 0 0 0 0 33214 3716 30914 302170;302171 385571;385572 385571 1 NEAIQAAHDAVAQEGQCR Unmodified 1966.8915 0.89153554 1976 P09936;D6R956;D6R974 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 3 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385701;385702;385703;385704;385705;385706;385707;385708;385709;385710;385711;385712;385713;385714;385715;385716;385717;385718;385719;385720;385721;385722;385723;385724;385725;385726;385727;385728;385729 385718 29 NECVVVIR Unmodified 987.51715 0.51715019 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.311 38.311 2 0.0057754 34091 QUIQUE_C1277_190116_001 104.21 61.085 750150000 0 126390000 137140000 95367000 102910000 108220000 0 83403000 96733000 0 0 0 0 33226 1883 30925 302283;302284;302285;302286;302287;302288;302289 385730;385731;385732;385733;385734;385735;385736;385737;385738 385730 9 NEDDLELAR Unmodified 1073.4989 0.49891717 305 A0A0J9YYF7;Q86T65 DAAM2 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 43.352 43.352 2 0.0047102 40438 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.37 47.341 119400000 0 26383000 0 42687000 0 0 0 0 50333000 0 0 0 0 33227 305 30926 302290;302291;302292;302293;302294 385739;385740;385741;385742;385743 385741 5 NEDEEEEEEEKDEAEDLLGR Unmodified 2405.983 0.98303171 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 1 1 1 95.02 95.02 3 0.0039266 98642 QUIQUE_C1438_190116_001 48.824 40.636 96512000 0 0 0 0 45614000 0 0 50898000 0 0 0 0 0 33228 4620 30927 302295;302296 385744;385745 385744 2 NEDELELR Unmodified 1016.4775 0.47745344 1693 O94875;A0A3B3ITL8 SORBS2 Sorbin and SH3 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.19 42.19 2 0.0089766 38175 QUIQUE_C1403_190116_001 93.195 29.889 246810000 29324000 62138000 0 34999000 40238000 0 0 30647000 0 15292000 0 34168000 0 33229 1693 30928 302297;302298;302299;302300;302301;302302;302303 385746;385747;385748;385749;385750;385751;385752;385753 385749 8 NEDIPNVAVYPHNGMIDLK Unmodified 2138.0466 0.046639202 2645 P54709 ATP1B3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.09 103.09 3 1.952E-11 106233 QUIQUE_C1403_190116_001 89.557 82.804 278180000 0 0 0 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S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 157.95 157.95 3 5.5883E-15 163345 QUIQUE_C1368_190116_001 64.176 42.427 63572000 0 0 21175000 0 24460000 17937000 0 0 0 0 0 0 0 33238 2329 30937 302389;302390;302391 385873;385874;385875 385873 2 NEEEVFAWNNEVK Unmodified 1606.7264 0.72635092 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.262 93.262 2 3.2609E-31 95361 QUIQUE_C1277_190116_001 177.44 154.8 985460000 100190000 83870000 146760000 66749000 90170000 101440000 116930000 39429000 62656000 56836000 0 62731000 57696000 33239 336 30938 302392;302393;302394;302395;302396;302397;302398;302399;302400;302401;302402;302403 385876;385877;385878;385879;385880;385881;385882;385883;385884;385885;385886;385887;385888;385889 385877 14 NEEGAPQEGILEDMPVDPDNEAYEMPSEEGYQDYEPEA Unmodified 4285.7264 0.7263546 2410 P37840 SNCA Alpha-synuclein yes yes 0 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385897;385898;385899;385900;385901;385902;385903;385904;385905;385906;385907;385908;385909;385910 385898 14 NEEKPVQMMFK Oxidation (M) 1395.6527 0.65265739 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12;A0A2R8Y6A7 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 1 1 1 1 30.53 30.53 2 0.039749 25638 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.879 44.481 57515000 0 0 0 0 0 0 0 28886000 28629000 0 0 0 0 33243 2371 30942 302421;302422 385911;385912 385912 2 NEELAQTWK Unmodified 1117.5404 0.54038805 3660 Q8TAT6;I3L283;I3L281 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog no no 0 0 0 1 42.66 42.66 2 0.0338 40090 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.235 34.82 22050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22050000 0 0 33244 3660 30943 302423 385913 385913 1 NEELEQLYQDQEVPKPK Unmodified 2086.0219 0.021864239 4309 Q9NVS9;J3QQZ9;J3QQV6;A0A286YFL3 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 79.212 79.212 2;3 2.5072E-62 79897 QUIQUE_C1403_190116_001 191.53 172.9 1348800000 172350000 133550000 144810000 139220000 106040000 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385974;385975;385976;385977;385978;385979;385980;385981;385982;385983;385984;385985;385986;385987;385988 385982 14 NEFIPTNFEILPLEK Unmodified 1802.9455 0.94545182 490 A0A3B3ISG5;P14735 IDE Insulin-degrading enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.2 149.2 2 4.0718E-06 153602 QUIQUE_C1403_190116_001 110.38 85.526 348910000 0 0 41452000 38381000 42904000 22659000 39877000 0 31467000 7074800 47204000 44377000 33518000 33252 490 30951 302494;302495;302496;302497;302498;302499;302500;302501;302502;302503 385989;385990;385991;385992;385993;385994;385995;385996;385997;385998 385990 9 NEFLGELQK Unmodified 1076.5502 0.55022446 820;594 D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;H0Y961;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.64 66.64 2 0.00050349 67342 QUIQUE_C1218_190116_001 128.12 23.684 3052400000 232030000 280900000 307690000 237330000 242220000 231900000 206940000 201440000 233840000 134460000 268020000 226840000 248750000 33253 820;594 30952 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Junction plakoglobin yes yes 0 0 0 1 106.78 106.78 2 0.035787 103738 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.172 43.482 24381000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24381000 0 0 0 33260 2084 30959 302562 386068 386068 1 NEGVATYAAAVLFR Unmodified 1480.7674 0.76742787 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8YG06 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 130.18 130.18 2;3 4.6084E-59 134197 QUIQUE_C1277_190116_001 175.74 146.94 2901400000 52458000 49586000 335520000 348230000 293210000 340000000 347720000 402300000 55061000 155630000 426410000 45016000 50236000 33261 425 30960 302563;302564;302565;302566;302567;302568;302569;302570;302571;302572;302573;302574;302575;302576;302577;302578;302579;302580;302581;302582;302583 386069;386070;386071;386072;386073;386074;386075;386076;386077;386078;386079;386080;386081;386082;386083;386084;386085;386086;386087;386088;386089;386090;386091;386092;386093;386094;386095;386096 386070 28 NEGVSSVLLGASNADQLMENIGAIQVLPK Unmodified 2966.5383 0.53828615 2985 Q13303 KCNAB2 Voltage-gated potassium channel subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 166.8 166.8 3 2.9256E-20 171765 QUIQUE_C1368_190116_001 92.924 80.958 1155300000 68127000 158780000 239080000 206340000 0 190660000 151050000 0 0 38254000 0 0 102980000 33262 2985 30961 302584;302585;302586;302587;302588;302589;302590;302591 386097;386098;386099;386100;386101;386102;386103;386104;386105 386099 9 NEHNSILQSLLETLK Unmodified 1737.9261 0.92611336 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;G3V2P7 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 1 142.15 142.15 2;3 3.6503E-29 148674 QUIQUE_C1438_190116_001 164.65 134.88 2078700000 238620000 224380000 83549000 105950000 361660000 267900000 224990000 27375000 142220000 152920000 141530000 107670000 0 33263 1050 30962 302592;302593;302594;302595;302596;302597;302598;302599;302600;302601;302602;302603;302604;302605;302606;302607;302608;302609;302610 386106;386107;386108;386109;386110;386111;386112;386113;386114;386115;386116;386117;386118;386119;386120;386121;386122;386123;386124;386125;386126;386127 386113 16 NEHTYVHSSATIPLDDPTLLFANAGMNQFK Unmodified 3330.5979 0.59792629 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 1 1 1 133.62 133.62 3;4 2.3358E-36 139057 QUIQUE_C1218_190116_001 109.08 103.82 217970000 71072000 39307000 0 49804000 0 57791000 0 0 0 0 0 0 0 33264 2533 30963 302611;302612;302613;302614;302615 386128;386129;386130;386131;386132;386133 386128 6 NEHVDYVDVGGAYVGPTQNR Unmodified 2189.0138 0.013759169 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 71.926 71.926 2;3 1.5966E-116 72048 QUIQUE_C1277_190116_001 214.82 205.25 3564800000 295740000 349900000 300090000 277630000 289740000 269990000 316790000 239140000 223280000 136180000 342400000 297010000 226910000 33265 2179 30964 302616;302617;302618;302619;302620;302621;302622;302623;302624;302625;302626;302627;302628;302629;302630;302631;302632;302633;302634;302635;302636;302637;302638;302639;302640 386134;386135;386136;386137;386138;386139;386140;386141;386142;386143;386144;386145;386146;386147;386148;386149;386150;386151;386152;386153;386154;386155;386156;386157;386158 386137 25 NEIDNYEEDYQK Unmodified 1558.6423 0.64234652 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 59.656 59.656 2 2.7445E-06 55898 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.97 151.62 4945500000 657470000 551620000 510870000 485210000 540120000 317210000 451800000 144130000 235360000 312100000 272380000 192870000 274370000 33266 2851 30965 302641;302642;302643;302644;302645;302646;302647;302648;302649;302650;302651;302652;302653;302654 386159;386160;386161;386162;386163;386164;386165;386166;386167;386168;386169;386170;386171;386172;386173;386174;386175;386176;386177;386178 386174 20 NEIGILK Unmodified 785.4647 0.46470391 3632;872 E7ETR1;B4DSW8;Q8NCB2;C9J9E2 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 42.044 42.044 2 0.062051 38175 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.485 8.1907 78988000 0 0 0 0 0 0 0 78988000 0 0 0 0 0 33267 872;3632 30966 302655 386179 386179 1 NEIIILANTTNTELK Unmodified 1685.92 0.91996535 2943 Q12792;F8VS81 TWF1 Twinfilin-1 yes no 0 0 0 1 1 101.3 101.3 2 0.0024956 103411 QUIQUE_C1403_190116_001 85.258 71.353 61542000 0 0 0 33607000 0 0 0 0 0 27935000 0 0 0 33268 2943 30967 302656;302657 386180;386181 386180 0 NEILDEVISLSQVTPK Unmodified 1783.9567 0.95674479 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 2 2 2 2 3 1 1 1 1 2 2 155.75 155.75 2;3 2.3718E-07 162400 QUIQUE_C1438_190116_001 87.388 77.288 905300000 68157000 116290000 120030000 60718000 55594000 168640000 53277000 21931000 38537000 0 35582000 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386203;386204;386205;386206;386207;386208;386209;386210;386211;386212;386213;386214;386215;386216;386217;386218;386219;386220;386221;386222;386223;386224;386225;386226;386227;386228;386229;386230 386206 28 NEIPFLCHSSTDYAK Unmodified 1780.809 0.80903469 4668 Q9Y6X4;D6RB01;D6R953;D6RC41 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 0 1 75.717 75.717 2 0.0014147 76296 QUIQUE_C1277_190116_001 80.69 40.772 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33271 4668 30970 302704 386231 386231 1 NEIQDLQTK Unmodified 1087.551 0.55095274 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 32.975 32.975 2 0.0073017 27826 QUIQUE_C1368_190116_001 81.972 24.794 135010000 0 0 108640000 0 0 0 0 0 0 26371000 0 0 0 33272 2350 30971 302705;302706 386232;386233;386234 386233 3 NEIVTETSPFAPAFLQPDDK Unmodified 2218.0794 0.079379118 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 134.53 134.53 2 0.021589 138329 QUIQUE_C1403_190116_001 72.523 60.238 0 0 0 0 0 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386427 1 NENLQAWFR Unmodified 1176.5676 0.56760585 2942 Q12768;E7EQI7 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes no 0 0 0 1 1 1 1 93.58 93.58 2 0.00098961 97846 QUIQUE_C1438_190116_001 107.9 91.355 282900000 0 0 0 80270000 53542000 68411000 80680000 0 0 0 0 0 0 33294 2942 30993 302859;302860;302861;302862 386428;386429;386430;386431 386429 4 NENQEVIGVAELVNK Unmodified 1654.8526 0.85261407 1402 O00408;E9PEF1 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 97.964 97.964 2 1.2703E-05 101726 QUIQUE_C1218_190116_001 98.406 82.152 513750000 110890000 0 84621000 81479000 78162000 65495000 0 0 0 33357000 59744000 0 0 33295 1402 30994 302863;302864;302865;302866;302867;302868;302869 386432;386433;386434;386435;386436;386437;386438;386439 386432 8 NENQLIIFADDTYPR Unmodified 1807.8741 0.87407779 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 123.32 123.32 2 3.194E-06 126139 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.08 116.71 127910000 0 0 0 0 0 62141000 0 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386485;386486;386487;386488;386489;386490;386491;386492;386493;386494;386495;386496;386497;386498;386499;386500;386501;386502;386503;386504;386505;386506;386507;386508;386509;386510;386511;386512;386513;386514;386515;386516;386517;386518;386519;386520;386521;386522;386523 386487 37 NEPTTPSWLADIPPWVPK Unmodified 2047.0415 0.041477469 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 3 1 1 1 1 1 1 2 157.16 157.16 2 6.8101E-18 161404 QUIQUE_C1277_190116_001 155.98 135.02 850060000 0 69145000 0 139170000 81041000 98652000 0 99530000 64079000 0 103610000 73315000 121510000 33303 921 31002 302938;302939;302940;302941;302942;302943;302944;302945;302946;302947;302948;302949;302950 386524;386525;386526;386527;386528;386529;386530;386531;386532;386533;386534;386535;386536;386537;386538;386539;386540;386541;386542;386543;386544;386545;386546 386526 20 NEPVDRPPVLLIANSQNILATYLSGAQVSTITPTSTR Unmodified 3936.0956 0.09564489 2911 Q07954;Q6PJ72;Q7Z7K9 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes no 0 0 1 1 2 163.27 163.27 3 2.1701E-63 167857 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.61 109.94 105940000 0 0 0 0 0 0 0 52104000 53835000 0 0 0 0 33304 2911 31003 302951;302952;302953 386547;386548;386549 386548 2 NEQDAYAINSYTR Unmodified 1543.6903 0.69029976 2232 P24752 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.359 58.359 2 4.2986E-65 56331 QUIQUE_C1563_190116_001 212.89 197.32 6431500000 460240000 488240000 595770000 460050000 417690000 363990000 616450000 544880000 594260000 205120000 574940000 525880000 584030000 33305 2232 31004 302954;302955;302956;302957;302958;302959;302960;302961;302962;302963;302964;302965;302966 386550;386551;386552;386553;386554;386555;386556;386557;386558;386559;386560;386561;386562;386563;386564;386565;386566;386567;386568;386569 386560 20 NESCSENYTTDFIYQLYSEEGK Unmodified 2676.1174 0.11735712 2861 Q01813;B1APP8 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 1 148.64 148.64 2;3 2.7285E-100 154932 QUIQUE_C1576_190116_001 252.91 242.42 1242500000 72722000 162090000 93042000 235520000 69982000 54634000 84586000 38435000 32144000 41471000 139410000 163930000 54569000 33306 2861 31005 302967;302968;302969;302970;302971;302972;302973;302974;302975;302976;302977;302978;302979;302980;302981;302982;302983;302984;302985 386570;386571;386572;386573;386574;386575;386576;386577;386578;386579;386580;386581;386582;386583;386584;386585;386586;386587;386588;386589;386590 386579 20 NESLTATDGLR Unmodified 1175.5782 0.57823012 1121 H0Y507;Q5TCZ1 SH3PXD2A SH3 and PX domain-containing protein 2A yes no 0 0 0 1 49.419 49.419 2 0.0051682 44149 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mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.008 85.008 2 8.2907E-53 87590 QUIQUE_C1438_190116_001 209.39 186.16 4425300000 403020000 422550000 436130000 348750000 381530000 364680000 472420000 198760000 267190000 109870000 307680000 315370000 397380000 33312 1971 31010 303014;303015;303016;303017;303018;303019;303020;303021;303022;303023;303024;303025;303026 386620;386621;386622;386623;386624;386625;386626;386627;386628;386629;386630;386631;386632;386633;386634;386635;386636;386637;386638;386639;386640;386641 386629 22 NEVDMQVLHLLGPK Unmodified 1591.8392 0.83921261 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RRI9;A0A0U1RQE9;A0A0U1RQL2;A0A0U1RR66;A0A0U1RRJ7;A0A0U1RQJ6 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.11 110.11 3 1.2551E-05 113690 QUIQUE_C1368_190116_001 98.942 78.515 538940000 56907000 56199000 63068000 48554000 41231000 28496000 66105000 28700000 32103000 14349000 42599000 30367000 30265000 33313 2496 31011 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Unmodified 1819.9832 0.98323431 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 1 3 2 2 1 1 85.927 85.927 2;3;4 2.0702E-17 88471 QUIQUE_C1218_190116_001 169.04 131.07 884190000 320210000 0 0 153470000 0 0 0 213210000 0 64605000 0 0 132690000 33316 756 31014 303050;303051;303052;303053;303054;303055;303056;303057;303058 386667;386668;386669;386670;386671;386672;386673;386674;386675;386676;386677;386678;386679 386671 12 NEVLCVLTQK Unmodified 1202.6329 0.63290823 1573 O60443;C9JSR4 DFNA5 Non-syndromic hearing impairment protein 5 yes no 0 0 0 1 72.662 72.662 2 0.015603 73516 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.283 36.59 61781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61781000 33317 1573 31015 303059 386680 386680 1 NEVLMVNIGSLSTGGR Unmodified 1645.8458 0.84575455 2432 P41091;Q2VIR3 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.16 115.16 2 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Unmodified 1380.6674 0.66737948 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.874 77.874 2 0.0004295 78411 QUIQUE_DMIX8_190116_001 135.55 124.06 956940000 112100000 0 66149000 90850000 142920000 0 0 0 89751000 50787000 153160000 99921000 151290000 33324 2377 31022 303087;303088;303089;303090;303091;303092;303093;303094;303095;303096 386710;386711;386712;386713;386714;386715;386716;386717;386718;386719 386719 10 NFAFLEFR Unmodified 1042.5236 0.52361577 1338 K7ENG2;P26368 U2AF2 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.24 124.24 2 1.3239E-09 129991 QUIQUE_C1218_190116_001 181.49 157.96 780390000 66425000 77071000 78535000 68635000 59778000 89143000 70159000 31482000 55053000 47370000 42654000 55338000 38748000 33325 1338 31023 303097;303098;303099;303100;303101;303102;303103;303104;303105;303106;303107;303108;303109 386720;386721;386722;386723;386724;386725;386726;386727;386728;386729;386730;386731;386732;386733;386734;386735 386720 16 NFAIGYYLK Unmodified 1087.5702 0.57023162 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.29 100.29 2 0.00164 103043 QUIQUE_C1277_190116_001 101.64 83.319 2264100000 239940000 150750000 160680000 125670000 146820000 189660000 222210000 126010000 150360000 66828000 190010000 253510000 241650000 33326 1700 31024 303110;303111;303112;303113;303114;303115;303116;303117;303118;303119;303120;303121;303122 386736;386737;386738;386739;386740;386741;386742;386743;386744;386745;386746;386747;386748;386749;386750;386751;386752 386738 16 NFAIGYYLKEK Unmodified 1344.7078 0.70778773 1700 O94925 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 121.73 121.73 2 0.036072 126857 QUIQUE_C1576_190116_001 68.735 57.905 475520000 0 0 0 268870000 0 0 206650000 0 0 0 0 0 0 33327 1700 31025 303123;303124 386753;386754 386754 2 NFALLGVGTSK Unmodified 1105.6132 0.61315906 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 87.066 87.066 2 0.0023331 90033 QUIQUE_C1438_190116_001 104.42 84.787 458470000 51954000 54767000 0 0 56872000 50062000 61596000 53188000 52961000 0 0 0 77070000 33328 514 31026 303125;303126;303127;303128;303129;303130;303131;303132 386755;386756;386757;386758;386759;386760;386761;386762 386757 4 NFANDATFEIK Unmodified 1268.6037 0.60371659 1943 P08559;Q5JPU0;Q5JPT9;Q5JPU1;Q5JPU2 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 81.316 81.316 2 0.014647 82194 QUIQUE_C1277_190116_001 58.37 46.323 88010000 35432000 52578000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33329 1943 31027 303133;303134 386763;386764 386764 1 NFAQIIEADEVLLFER Unmodified 1905.9836 0.98362824 3441 Q7L523 RRAGA Ras-related GTP-binding protein A yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 169.49 169.49 2;3 7.6045E-19 176644 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O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 2 1 166.08 166.08 2;3 0.00070489 167921 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.038 61.135 538710000 110360000 16259000 0 16084000 21898000 11523000 154700000 12481000 0 0 177990000 17422000 0 33333 1748 31030 303190;303191;303192;303193;303194;303195;303196;303197;303198;303199;303200;303201;303202 386847;386848;386849;386850;386851;386852;386853;386854;386855;386856;386857;386858;386859 386856 12 NFDEILR Unmodified 905.46068 0.46068117 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.802 69.802 2 0.016846 69275 QUIQUE_C1368_190116_001 133.47 96.913 33220000000 1858200000 1826900000 2465800000 2597200000 2416200000 2147100000 1970700000 2629000000 3998300000 1472500000 3709200000 2662100000 3466600000 33334 2298 31031 303203;303204;303205;303206;303207;303208;303209;303210;303211;303212;303213;303214;303215 386860;386861;386862;386863;386864;386865;386866;386867;386868;386869;386870;386871;386872;386873;386874;386875;386876;386877;386878;386879;386880;386881;386882;386883;386884;386885;386886;386887;386888;386889;386890;386891;386892;386893;386894;386895 386866 36 NFDFEDVFVK Unmodified 1258.587 0.58700389 3197 Q16795;A0A3B3ISG8 NDUFA9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.81 133.81 2 0.00014691 138321 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.13 103.91 1340600000 78906000 110040000 109020000 99024000 76599000 80481000 85324000 79155000 158300000 58840000 200790000 95197000 108870000 33335 3197 31032 303216;303217;303218;303219;303220;303221;303222;303223;303224;303225;303226;303227;303228 386896;386897;386898;386899;386900;386901;386902;386903;386904;386905;386906;386907;386908;386909;386910 386905 15 NFDLRPGVIVR Unmodified 1284.7303 0.73025451 2329 P31153;Q00266 MAT2A;MAT1A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2;S-adenosylmethionine synthase isoform type-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 72.662 72.662 2;3 0.0036073 72799 QUIQUE_C1277_190116_001 69.01 56.847 2134600000 227810000 241490000 0 169290000 221900000 134530000 276000000 234070000 312040000 86423000 0 0 231080000 33336 2329 31033 303229;303230;303231;303232;303233;303234;303235;303236;303237;303238;303239;303240 386911;386912;386913;386914;386915;386916;386917;386918;386919;386920;386921;386922;386923 386913 11 NFDQEGLVEHCK Unmodified 1474.6511 0.65107749 127 A0A096LNV3;A0A096LP02;Q9Y508 RNF114 E3 ubiquitin-protein ligase RNF114 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.161 38.161 3 0.0020135 34935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.967 52.059 167440000 0 20784000 35261000 0 29107000 28980000 0 28175000 25131000 0 0 0 0 33337 127 31034 303241;303242;303243;303244;303245;303246;303247 386924;386925;386926;386927;386928;386929;386930;386931 386930 8 NFDSLESLISAIQGDIEEAKK Unmodified 2306.1642 0.16417138 3785 Q969G6 RFK Riboflavin kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 168.83 168.83 3 5.8881E-09 174186 QUIQUE_C1576_190116_001 101.94 82.903 610580000 0 0 0 0 62186000 0 65975000 0 349480000 0 0 0 132950000 33338 3785 31035 303248;303249;303250;303251 386932;386933;386934;386935 386933 3 NFDVGHVPIR Unmodified 1152.604 0.60399136 2570 P50579;F8VRR3;F8VQZ7 METAP2 Methionine aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 52.85 52.85 2;3 0.010101 50328 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.276 38.357 662300000 0 108350000 79642000 87513000 0 0 74760000 0 0 41407000 146830000 0 123800000 33339 2570 31036 303252;303253;303254;303255;303256;303257;303258;303259;303260 386936;386937;386938;386939;386940;386941;386942;386943;386944;386945;386946;386947 386947 11 NFDVIDNLIISHELK Unmodified 1768.9359 0.93594977 1576 O60486 PLXNC1 Plexin-C1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 137.93 137.93 3 0.0044341 142507 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.077 43.497 92455000 18374000 0 0 17898000 21694000 0 17622000 0 0 0 0 0 16867000 33340 1576 31037 303261;303262;303263;303264;303265 386948;386949;386950;386951;386952 386952 5 NFEATLGWLQEHACSR Unmodified 1917.8792 0.87917994 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 119.52 119.52 3 0.0028539 116474 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.606 43.43 54133000 0 0 0 40046000 0 0 0 0 0 14087000 0 0 0 33341 4389 31038 303266;303267 386953;386954 386954 2 NFEDVAFDEK Unmodified 1212.5299 0.52988294 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 76.74 76.74 2 0.006758 76583 QUIQUE_C1563_190116_001 74.165 57.069 743730000 181670000 144550000 117620000 0 121030000 117210000 0 0 61658000 0 0 0 0 33342 1917 31039 303268;303269;303270;303271;303272;303273 386955;386956;386957;386958;386959;386960;386961 386960 4 NFEDVAFDEKK Unmodified 1340.6248 0.62484596 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 54.104 54.104 2;3 0.0010843 49404 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.26 85.391 113490000 33915000 0 0 0 0 0 0 40597000 0 38982000 0 0 0 33343 1917 31040 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147.54 147.54 3 4.8534E-09 150634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.006 85.202 261520000 0 0 0 30588000 0 24663000 50413000 32431000 51936000 12812000 58676000 0 0 33347 1869 31044 303319;303320;303321;303322;303323;303324;303325;303326;303327 387016;387017;387018;387019;387020;387021;387022;387023;387024;387025;387026;387027;387028;387029 387022 14 NFEWVAER Unmodified 1049.493 0.49304393 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 72.826 72.826 2 0.0036343 72445 QUIQUE_C1563_190116_001 116.73 68.877 2406900000 221230000 180520000 180180000 166240000 180490000 154330000 202250000 238230000 199950000 0 268170000 177430000 237840000 33348 2195 31045 303328;303329;303330;303331;303332;303333;303334;303335;303336;303337;303338;303339;303340 387030;387031;387032;387033;387034;387035;387036;387037;387038;387039;387040;387041;387042;387043;387044;387045;387046;387047;387048 387038 19 NFFEPTLLCNVTQDMLCTHEETFGPLAPVIK Oxidation (M) 3636.7303 0.73026237 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 156.69 156.69 3 3.635E-27 161887 QUIQUE_C1368_190116_001 93.596 88.437 509910000 83904000 0 116000000 67656000 73090000 65165000 64864000 0 0 0 0 0 39235000 33349 2588 31046 303341;303342;303343;303344;303345;303346;303347 387049;387050;387051;387052;387053;387054;387055 387050 2035 7 NFFEPTLLCNVTQDMLCTHEETFGPLAPVIK Unmodified 3620.7353 0.73534775 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 167.33 167.33 3;4 2.5761E-89 171854 QUIQUE_DMIX3_190116_001 167.87 163.01 6406400000 734170000 1504600000 1035200000 567460000 511610000 164310000 0 0 401850000 28556000 587810000 390820000 480020000 33350 2588 31046 303348;303349;303350;303351;303352;303353;303354;303355;303356;303357;303358;303359 387056;387057;387058;387059;387060;387061;387062;387063;387064;387065;387066;387067 387063 12 NFFLTNR Unmodified 910.4661 0.4661009 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 64.999 64.999 2 0.019342 65108 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.73 46.951 1253300000 0 0 0 252560000 244770000 202310000 0 0 264440000 0 0 0 289210000 33351 2127 31047 303360;303361;303362;303363;303364 387068;387069;387070;387071;387072 387071 4 NFFPIAGLEFSELPVTSPLGIAVIK Unmodified 2658.4673 0.46727668 3684 Q8TDJ6;H0YLM8 DMXL2 DmX-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 171.56 171.56 2;3 2.005E-09 178828 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.67 97.168 251760000 9083000 0 0 0 20514000 0 0 0 13399000 0 175560000 22748000 10454000 33352 3684 31048 303365;303366;303367;303368;303369;303370;303371 387073;387074;387075;387076;387077;387078;387079 387077 6 NFFTDVYDLYIK Unmodified 1536.75 0.75004648 1018 F5H785;P0DI82;P0DI81 TRAPPC2;TRAPPC2B Trafficking protein particle complex subunit 2B;Trafficking protein particle complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 166.58 166.58 2 0.00042986 171008 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.91 93.161 457000000 20650000 47619000 26125000 18509000 46178000 0 55625000 36541000 47536000 0 65583000 55147000 37487000 33353 1018 31049 303372;303373;303374;303375;303376;303377;303378;303379;303380;303381;303382;303383 387080;387081;387082;387083;387084;387085;387086;387087;387088;387089;387090;387091;387092;387093 387090 14 NFGDQPDIR Unmodified 1060.4938 0.49377221 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 1 41.473 41.473 2 0.028741 38113 QUIQUE_C1368_190116_001 67.169 49.134 37394000 0 0 37394000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33354 3135 31050 303384 387094 387094 1 NFGEDMDDERLK Unmodified 1467.63 0.63000769 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;Q9H361;H0YBN4 PABPC1;PABPC3 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 3 yes no 0 0 1 1 49.342 49.342 3 0.001679 47668 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.76 70.212 32748000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32748000 0 0 33355 2031 31051 303385 387095 387095 1 NFGEEVDDESLKELFSQFGK Unmodified 2317.075 0.075022022 596 B1ANR0;Q13310;H0Y5F5;H0YCC8 PABPC4 Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 152.81 152.81 3 4.576E-05 155564 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.21 65.121 270310000 24686000 34639000 37414000 31856000 42694000 0 0 35702000 63323000 0 0 0 0 33356 596 31052 303386;303387;303388;303389;303390;303391;303392 387096;387097;387098;387099;387100;387101;387102 387101 6 NFGLYNER Unmodified 1011.4774 0.47739386 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 3 1 2 1 2 1 1 1 50.923 50.923 1;2 0.009556 49156 QUIQUE_C1277_190116_001 163.72 74.171 482050000 99693000 82406000 65856000 0 76491000 0 0 0 0 0 157600000 0 0 33357 2120 31053 303393;303394;303395;303396;303397;303398;303399;303400;303401;303402;303403;303404;303405;303406;303407;303408 387103;387104;387105;387106;387107;387108;387109;387110;387111;387112;387113;387114;387115;387116;387117;387118 387106 11 NFGSYVTHETK Unmodified 1281.599 0.59896556 2782;3852 P63167;Q96FJ2 DYNLL1;DYNLL2 Dynein light chain 1, cytoplasmic;Dynein light chain 2, cytoplasmic no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 28.839 28.839 2;3 5.3564E-08 24195 QUIQUE_DMIX4_190116_001 150.35 139.64 7966400000 869720000 907720000 769740000 211310000 574100000 566710000 788970000 299460000 552480000 108040000 1111500000 614810000 591810000 33358 2782;3852 31054 303409;303410;303411;303412;303413;303414;303415;303416;303417;303418;303419;303420;303421;303422;303423;303424;303425;303426;303427;303428;303429;303430;303431;303432 387119;387120;387121;387122;387123;387124;387125;387126;387127;387128;387129;387130;387131;387132;387133;387134;387135;387136;387137;387138;387139;387140;387141;387142;387143;387144;387145;387146;387147;387148;387149;387150 387140 31 NFHEVMLALTVLETCVK Unmodified 2003.022 0.022004356 1592 O60784;V9GYF4;B0QY02;Q6UW50;V9GZ68;H7BYN7 TOM1 Target of Myb protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 155.97 155.97 3 0.00018938 162855 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.764 44.707 159980000 0 21075000 20193000 0 0 0 0 15991000 0 9347900 48497000 44875000 0 33359 1592 31055 303433;303434;303435;303436;303437;303438 387151;387152;387153;387154;387155;387156 387155 6 NFIAQGPYENR Unmodified 1307.6258 0.62584901 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.28 54.28 2 2.7642E-12 52163 QUIQUE_C1403_190116_001 160.59 147 11199000000 1055600000 1025000000 930850000 779750000 1020300000 685980000 1010700000 710230000 630320000 374130000 1173600000 854860000 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NFILDQCNVYNSGQR Unmodified 1826.837 0.83698078 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 89.139 89.139 2 2.3436E-129 92449 QUIQUE_C1218_190116_001 234.63 209.2 1959900000 140130000 169180000 196860000 163700000 132340000 139600000 148770000 129270000 125390000 50534000 235890000 166520000 161730000 33363 3208 31059 303456;303457;303458;303459;303460;303461;303462;303463;303464;303465;303466;303467;303468;303469 387186;387187;387188;387189;387190;387191;387192;387193;387194;387195;387196;387197;387198;387199;387200 387186 14 NFILDQTNVSAAAQR Unmodified 1646.8376 0.8376327 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7;A0A1W2PQD4 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 86.321 86.321 2;3 3.284E-44 87870 QUIQUE_DMIX3_190116_001 184.55 157.88 8682700000 660020000 801300000 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0.59857163 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.06 93.06 2 0.0009759 96351 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.051 76.67 1006200000 126640000 90937000 0 74813000 0 103040000 0 64999000 116940000 66423000 190480000 0 171960000 33391 1839 31085 303697;303698;303699;303700;303701;303702;303703;303704;303705;303706;303707 387493;387494;387495;387496;387497;387498;387499;387500;387501;387502;387503;387504;387505;387506;387507 387504 15 NFPTITALEWSPSHNLK Unmodified 1953.9949 0.99486163 4085 Q9BZH6 WDR11 WD repeat-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 114.68 114.68 3 0.054972 119426 QUIQUE_C1368_190116_001 27.149 21.48 20451000 0 0 20451000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33392 4085 31086 303708 387508 387508 1 NFQDFDCQEHDIETTHGVVHVTIR Unmodified 2896.3199 0.31985395 4423 Q9UGV2;Q5TH30 NDRG3 Protein NDRG3 yes no 0 0 0 1 1 2 1 84.013 84.013 4;5 1.26E-08 84581 QUIQUE_C1563_190116_001 76.421 73.08 440570000 0 112580000 0 0 79395000 200780000 0 0 0 0 47819000 0 0 33393 4423 31087 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A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 18.235 18.235 2;3 0.011874 10790 QUIQUE_C1438_190116_001 111.95 93.165 4158300000 0 322270000 694060000 265090000 248120000 594540000 849300000 102270000 132990000 63073000 259860000 451360000 175340000 33397 269;2893 31091 303720;303721;303722;303723;303724;303725;303726;303727;303728;303729;303730;303731;303732;303733;303734;303735 387520;387521;387522;387523;387524;387525;387526;387527;387528;387529;387530;387531;387532;387533;387534;387535;387536 387524 16 NFRPGTENTPMIAGLGK Unmodified 1801.9145 0.91450282 132 A0A0A0MQU4;Q96I15;H7C3V9;H7C277;H7C1N7 SCLY Selenocysteine lyase yes no 0 0 1 1 70.693 70.693 3 0.01965 70756 QUIQUE_C1277_190116_001 30.536 21.006 20910000 0 20910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33398 132 31092 303736 387537 387537 1 NFSAHLLDLLAR Unmodified 1368.7514 0.75138388 4013 Q9BSJ2;B3KTU7 TUBGCP2 Gamma-tubulin complex component 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 122.8 122.8 3 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of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.43 140.43 3 1.6089E-74 145456 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.69 136.82 677750000 0 0 43147000 39640000 0 58536000 79271000 84284000 92065000 0 102740000 80775000 97294000 33401 1997 31095 303750;303751;303752;303753;303754;303755;303756;303757;303758 387551;387552;387553;387554;387555;387556;387557;387558;387559 387556 7 NFSDNQLQEGK Unmodified 1278.584 0.58404378 2408 P37802;X6RJP6 TAGLN2 Transgelin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.643 32.643 2 5.3676E-24 27634 QUIQUE_C1277_190116_001 177.78 163.11 7940600000 561390000 702190000 749050000 701330000 599140000 548730000 660690000 461470000 441930000 251800000 873170000 553840000 835830000 33402 2408 31096 303759;303760;303761;303762;303763;303764;303765;303766;303767;303768;303769;303770;303771 387560;387561;387562;387563;387564;387565;387566;387567;387568;387569;387570;387571;387572;387573;387574;387575 387561 16 NFSGAELEGLVR Unmodified 1290.6568 0.65681479 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.89 100.89 2 9.0038E-08 105280 QUIQUE_C1218_190116_001 148.56 118.39 10981000000 893010000 1094800000 941820000 794010000 869820000 654990000 1063800000 516070000 606310000 397170000 1105600000 1040300000 1003500000 33403 1245 31097 303772;303773;303774;303775;303776;303777;303778;303779;303780;303781;303782;303783;303784 387576;387577;387578;387579;387580;387581;387582;387583;387584;387585;387586;387587;387588;387589;387590;387591 387576 16 NFSGPVPDLPEGITVAYTIPK Unmodified 2214.1572 0.15723551 4110 Q9GZZ9;E7EQ61 UBA5 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 143.16 143.16 2 0.00053989 149709 QUIQUE_C1438_190116_001 59.68 47.119 219720000 27199000 0 0 0 40971000 0 0 36849000 0 11697000 40173000 0 62831000 33404 4110 31098 303785;303786;303787;303788;303789;303790;303791 387592;387593;387594;387595;387596;387597;387598;387599 387594 7 NFSGTASTSLLGPPPGLLTPPVATELSQNAR Unmodified 3092.6142 0.61422828 3571 Q8N163;E5RFJ3;E5RGU7;E5RHH8 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 150.01 150.01 3 0.0068155 152574 QUIQUE_C1563_190116_001 27.165 21.07 27346000 0 0 0 0 0 27346000 0 0 0 0 0 0 0 33405 3571 31099 303792 387600 387600 1 NFSNYSSWHYR Unmodified 1459.6269 0.62691165 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 2 60.417 60.417 2;3 0.0009083 59111 QUIQUE_C1368_190116_001 93.111 75.637 336170000 0 40545000 64373000 29115000 0 0 0 34036000 35898000 16263000 39678000 36980000 39284000 33406 3750 31100 303793;303794;303795;303796;303797;303798;303799;303800;303801;303802;303803;303804;303805 387601;387602;387603;387604;387605;387606;387607;387608;387609;387610;387611;387612;387613 387603 13 NFSVNLYK Unmodified 983.50763 0.50763136 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 66.837 66.837 2 0.0051766 66425 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2081.1157 0.11570504 4598 Q9Y3Z3 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.481 89.481 3 0.00027416 87011 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.148 60.758 395940000 0 58759000 98057000 74134000 0 0 63060000 43554000 0 58375000 0 0 0 33410 4598 31104 303824;303825;303826;303827;303828;303829 387633;387634;387635;387636;387637;387638;387639 387639 5 NFTNLFGQPLVCLLSPTAYPK Unmodified 2379.2297 0.22968895 3620 Q8N9R8;Q3SXZ0;H7C4U2;H7C5A3 SCAI;C9orf126 Protein SCAI yes no 0 0 0 1 2 1 1 166.9 166.9 2;3 9.5738E-20 170676 QUIQUE_DMIX7_190116_001 168.5 155.08 268080000 0 37094000 0 0 0 0 134580000 0 0 0 0 96411000 0 33411 3620 31105 303830;303831;303832;303833;303834 387640;387641;387642;387643;387644 387644 5 NFTQGLVEDAPDGSDASQLLHQAEVAQQEFLEVK Unmodified 3712.7857 0.7856633 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 164.66 164.66 3 6.5327E-75 168665 QUIQUE_DMIX7_190116_001 142.37 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1260.7264 0.72641468 2647 P54727;Q5W0S5;Q5W0S4 RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.221 58.221 2 0.0081914 57541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.79 102.88 1546900000 0 0 199690000 212920000 0 130300000 199710000 0 196050000 0 230790000 198130000 179290000 33420 2647 31113 303884;303885;303886;303887;303888;303889;303890;303891 387700;387701;387702;387703;387704;387705;387706;387707 387705 3 NFWDPSPQLDTQQEIK Unmodified 1944.9218 0.92175626 1137 H0YAA3;Q9HAD4;D6RJA5;H0Y9Z3;D6R9M1 WDR41 WD repeat-containing protein 41 yes no 0 0 0 1 111.42 111.42 2 0.019945 113697 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.991 34.669 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33421 1137 31114 303892 387708 387708 1 NFWELLMNVK Unmodified 1292.6587 0.65872905 4260 Q9NQX7;E7EUS6;B8ZZM6 ITM2C Integral membrane protein 2C;CT-BRI3 yes no 0 0 0 1 1 158.02 158.02 2 0.0043261 164064 QUIQUE_C1576_190116_001 81.296 64.056 26755000 0 0 0 0 0 0 13327000 0 0 0 13428000 0 0 33422 4260 31115 303893;303894 387709;387710 387709 2 NFWVSGLSSTTR Unmodified 1353.6677 0.66771383 3138 Q15424 SAFB Scaffold attachment factor B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.208 93.208 2 3.3208E-07 97207 QUIQUE_C1438_190116_001 145.99 107.68 462650000 0 0 60107000 54124000 64578000 0 0 0 65881000 0 88281000 55517000 74158000 33423 3138 31116 303895;303896;303897;303898;303899;303900;303901 387711;387712;387713;387714;387715;387716;387717;387718 387714 8 NFYDSPEK Unmodified 998.43453 0.434526 886 E7EWP0;H0Y886;O43674 NDUFB5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.433 33.433 2 0.0043783 29053 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.36 92.064 438720000 74300000 85160000 53928000 0 0 0 0 0 70266000 0 90333000 0 64733000 33424 886 31117 303902;303903;303904;303905;303906;303907 387719;387720;387721;387722;387723;387724 387722 6 NFYFLEMNTR Unmodified 1333.6125 0.61250714 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 118.03 118.03 2 0.017593 115190 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.691 41.066 76909000 0 0 0 0 0 0 28954000 27122000 0 20834000 0 0 0 33425 1881 31118 303908;303909;303910 387725;387726;387727 387727 3 NFYGGNGIVGAQVPLGAGIALACK Unmodified 2346.2154 0.21543586 1943 P08559;Q5JPT9 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 136.71 136.71 2;3 2.5957E-74 139805 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.89 148.5 1985300000 142070000 90618000 81200000 74872000 111860000 131420000 198100000 103340000 296350000 17306000 248650000 254230000 235240000 33426 1943 31119 303911;303912;303913;303914;303915;303916;303917;303918;303919;303920;303921;303922;303923;303924;303925;303926;303927;303928;303929;303930;303931 387728;387729;387730;387731;387732;387733;387734;387735;387736;387737;387738;387739;387740;387741;387742;387743;387744;387745;387746;387747;387748;387749;387750;387751;387752;387753;387754 387744 24 NFYQEHPDLAR Unmodified 1388.6473 0.64731274 1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3KRX8;J3KTQ4;J3QR02;X6RLV5 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 42.443 42.443 2;3 0.001372 39246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.298 57.044 819390000 73717000 165000000 53884000 0 64988000 63739000 80365000 47946000 149480000 0 0 120270000 0 33427 1290 31120 303932;303933;303934;303935;303936;303937;303938;303939;303940;303941;303942;303943 387755;387756;387757;387758;387759;387760;387761;387762;387763;387764;387765;387766 387763 8 NFYVEHPEVAR Unmodified 1359.6571 0.65714914 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 43.593 43.593 2 0.013208 38219 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.435 53.398 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33428 381 31121 303944 387767 387767 1 NGADSEALHVLAFLQELNEK Unmodified 2197.1015 0.10151154 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 160.11 160.11 3 3.5342E-07 162940 QUIQUE_C1368_190116_001 94.313 85.371 151380000 0 0 34587000 29017000 0 0 0 21160000 0 0 66618000 0 0 33429 119 31122 303945;303946;303947;303948 387768;387769;387770;387771 387768 4 NGAFVNAATLGAQETPLHLVALYSSK Unmodified 2671.397 0.39696528 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 139.36 139.36 3 1.375E-17 142904 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.019 93.407 440420000 0 0 74485000 0 49870000 0 0 97606000 100540000 17180000 0 0 100740000 33430 4390 31123 303949;303950;303951;303952;303953;303954 387772;387773;387774;387775;387776;387777;387778 387775 6 NGAPIIMSFPHFYQADER Unmodified 2091.9836 0.98364501 394 A0A1W2PS43;Q14108;A0A1W2PPX5;A0A1W2PQR6;A0A1W2PQB7;A0A1W2PRS1;A0A1W2PRF6;A0A1W2PPU6 SCARB2 Lysosome membrane protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 117.86 117.86 3 0.00035461 121696 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.918 55.209 89311000 0 21903000 0 0 0 0 0 22204000 45204000 0 0 0 0 33431 394 31124 303955;303956;303957 387779;387780;387781 387781 3 NGAVIMAVR Unmodified 929.51167 0.51167088 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 38 38 2 0.0017799 33994 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.19 57.188 124020000 0 0 0 0 47927000 0 0 0 0 0 0 0 76090000 33432 4006 31125 303958;303959;303960;303961;303962 387782;387783;387784;387785;387786;387787 387786 6 NGDENYMEFLEVLTEHLDR Unmodified 2323.0427 0.042676036 4152 Q9H2X9 SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 165.32 165.32 3 8.5365E-08 172518 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.727 83.412 164250000 0 25572000 0 0 0 0 26966000 0 29625000 0 42930000 0 39156000 33433 4152 31126 303963;303964;303965;303966;303967 387788;387789;387790;387791;387792;387793;387794 387793 6 NGDGFVSLEEFLGDYR Unmodified 1816.8268 0.82679325 3058 Q14257;A8MXP8 RCN2 Reticulocalbin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.36 160.36 2 4.3637E-06 166843 QUIQUE_C1438_190116_001 128.54 119.11 422880000 51803000 50914000 34593000 23429000 45839000 39813000 40699000 0 31347000 11080000 40906000 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387836;387837;387838;387839;387840;387841;387842 387837 6 NGEAVPEDEQISAK Unmodified 1485.6947 0.69471644 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.156 35.156 2 0.00022089 31032 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.477 58.784 346610000 42341000 27696000 28886000 35210000 0 0 0 32192000 31001000 18031000 37569000 48203000 45482000 33439 1568 31132 304013;304014;304015;304016;304017;304018;304019;304020;304021;304022 387843;387844;387845;387846;387847;387848;387849;387850;387851;387852 387847 9 NGELENIKPK Unmodified 1140.6139 0.61388734 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 20.698 20.698 2;3 0.00082419 14170 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.18 131.11 4758900000 291590000 359670000 290950000 570680000 573390000 267950000 502000000 230210000 315540000 0 561370000 488380000 307150000 33440 2798 31133 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387913;387914;387915;387916;387917;387918;387919;387920;387921;387922;387923;387924;387925;387926 387923 13 NGEYLCTLDYQR Unmodified 1530.6773 0.67729224 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.336 77.336 2 0.00017846 78058 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.16 104.18 442600000 0 45325000 0 31523000 36590000 29274000 42140000 43930000 38494000 0 52926000 62802000 59595000 33447 151 31139 304093;304094;304095;304096;304097;304098;304099;304100;304101;304102;304103 387927;387928;387929;387930;387931;387932;387933;387934;387935;387936;387937;387938 387934 12 NGFDQCDYGWLSDASVR Unmodified 1988.8323 0.83228933 912;826 E9PF17;P13611;Q86W61;D6RGZ6 VCAN Versican core protein no no 0 0 0 2 3 1 1 2 2 2 3 2 1 1 2 2 124.3 124.3 2;3 5.711E-181 128683 QUIQUE_DMIX3_190116_001 254.18 242.54 6999700000 425410000 433330000 619520000 322520000 614570000 422980000 863030000 733130000 450350000 16265000 576190000 1062200000 460190000 33448 912;826 31140 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388019;388020;388021;388022;388023;388024;388025;388026;388027;388028;388029;388030 388026 1686 11 NGGLGHMNIALLSDLTK Unmodified 1752.9193 0.91925384 2302 P30048 PRDX3 Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 119.35 119.35 2;3 4.555E-05 123737 QUIQUE_C1218_190116_001 91.14 72.776 229080000 229080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33454 2302 31145 304178;304179 388031;388032 388031 2 NGGQILIADLR Unmodified 1168.6564 0.65642086 2669 P55735;A8MXL6;E7ERC8 SEC13 Protein SEC13 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.138 83.138 2 0.00039512 84861 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.52 93.089 369090000 0 0 0 40972000 0 48609000 60015000 60614000 62308000 0 96576000 0 0 33455 2669 31146 304180;304181;304182;304183;304184;304185;304186;304187;304188 388033;388034;388035;388036;388037;388038;388039;388040;388041;388042 388039 10 NGGSPALNNNPR Unmodified 1209.585 0.58504683 1427 O14495 PPAP2B Lipid phosphate phosphohydrolase 3 yes yes 0 0 0 1 1 15.269 15.269 2 0.0022928 7564 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388051;388052;388053;388054;388055;388056;388057 388052 7 NGIHDLDNISFPK Unmodified 1468.731 0.73104237 2538 P49721;A0A087WVV1 PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 1 83.628 83.628 2;3 0.0001063 85818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.628 59.174 1116600000 85831000 125250000 129860000 93409000 0 61398000 70067000 98699000 78374000 60962000 122290000 106750000 83712000 33459 2538 31150 304203;304204;304205;304206;304207;304208;304209;304210;304211;304212;304213;304214;304215;304216;304217;304218;304219;304220 388058;388059;388060;388061;388062;388063;388064;388065;388066;388067;388068;388069;388070;388071;388072;388073;388074;388075;388076;388077;388078;388079;388080;388081 388076 24 NGIPFTVYDNVR Unmodified 1393.699 0.69901396 3542 Q8IWW8;E5RFL4;B4DV11;B4DFI7 ADHFE1 Hydroxyacid-oxoacid transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 95.894 95.894 2 0.023778 98934 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.927 30.127 87644000 0 0 0 0 0 0 0 0 21013000 0 33465000 0 33166000 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388109;388110;388111;388112;388113;388114;388115;388116;388117;388118;388119;388120;388121 388112 12 NGLGLELGPQPQGVLR Unmodified 1646.9104 0.91040372 3866 Q96HD9;E9PRA7 ACY3 N-acyl-aromatic-L-amino acid amidohydrolase (carboxylate-forming) yes no 0 0 0 1 105.94 105.94 2 0.0095598 109790 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.385 51.131 37776000 0 0 0 0 0 0 0 0 37776000 0 0 0 0 33465 3866 31156 304259 388122 388122 0 NGLSPLHMAAQGDHVECVK Unmodified 2061.9724 0.9724284 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 53.088 53.088 3 0.00023264 51095 QUIQUE_C1218_190116_001 64.265 58.451 90274000 37115000 0 0 0 0 0 0 53159000 0 0 0 0 0 33466 1255;2856 31157 304260;304261 388123;388124 388123 2 NGLSPLHMAAQGDHVECVK Oxidation (M) 2077.9673 0.96734302 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 1 0 1 2 36.207 36.207 3 9.897E-05 32936 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.538 59.259 116170000 0 0 0 0 0 0 0 28327000 87842000 0 0 0 0 33467 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NGNELSDFQTNVDPVGESVSYSIHSTAK Unmodified 2994.3843 0.38428792 2803 P78324 SIRPA Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 yes yes 0 0 0 1 2 119.33 119.33 3 1.5569E-31 116353 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.75 113.13 116060000 0 0 0 0 0 0 0 49154000 0 0 66901000 0 0 33470 2803 31160 304281;304282;304283 388150;388151;388152 388151 3 NGNLPEFGDAISTASK Unmodified 1619.7791 0.77911477 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 88.444 88.444 2 0.00056132 89717 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.078 63.725 217160000 0 0 0 75548000 0 0 67602000 74010000 0 0 0 0 0 33471 4600 31161 304284;304285;304286;304287 388153;388154;388155;388156;388157;388158 388155 6 NGNYCVLQMDQSYKPDENEVR Unmodified 2558.1166 0.11658604 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.922 80.922 3 5.7088E-19 82285 QUIQUE_C1277_190116_001 123.43 111.24 307860000 0 49844000 48832000 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388177;388178;388179;388180 388178 4 NGPFKPNYYR Unmodified 1254.6146 0.61455605 1558;3868;1131 H0Y8B3;O43865;Q96HN2 AHCYL2;AHCYL1 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 2;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 1 1 27.916 27.916 3 0.004617 22302 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.297 52.431 773410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 773410000 0 0 33475 1131;1558;3868 31165 304308 388181 388181 1 NGPVEGAFSVYSDFLLYK Unmodified 2004.9833 0.98329389 1930 P07858 CTSB Cathepsin B;Cathepsin B light chain;Cathepsin B heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.92 158.92 2 2.0556E-31 164098 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.2 143.61 1427700000 97403000 115970000 96189000 67105000 115870000 69086000 112810000 147120000 150630000 24838000 177500000 137570000 115590000 33476 1930 31166 304309;304310;304311;304312;304313;304314;304315;304316;304317;304318;304319;304320;304321 388182;388183;388184;388185;388186;388187;388188;388189;388190;388191;388192;388193;388194;388195;388196;388197;388198;388199;388200;388201;388202;388203 388196 21 NGPVSSGTGAPGSLGR Unmodified 1412.7008 0.70080487 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 32.808 32.808 2 0.024191 28501 QUIQUE_C1438_190116_001 58.674 40.615 136780000 0 0 0 0 38246000 0 0 0 0 0 45988000 0 52548000 33477 3452 31167 304322;304323;304324 388204;388205;388206 388204 3 NGQALLALDK Unmodified 1041.5819 0.58185893 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 56.762 56.762 2 0.012386 54775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.933 50.351 37384000 0 0 0 0 0 0 0 37384000 0 0 0 0 0 33478 151 31168 304325 388207 388207 1 NGQDLGVAFK Unmodified 1047.5349 0.53490874 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 51.34 51.34 2 0.0095867 49563 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388250 11 NGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDR Oxidation (M) 4126.0569 0.056876122 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 1 2 2 1 161.79 161.79 3;4 1.8932E-54 165748 QUIQUE_C1277_190116_001 107.21 96.05 896700000 42960000 196260000 92191000 39095000 0 0 97861000 105140000 109300000 0 145930000 67956000 0 33487 2175 31177 304373;304374;304375;304376;304377;304378;304379;304380;304381;304382;304383;304384 388260;388261;388262;388263;388264;388265;388266;388267;388268;388269;388270;388271;388272;388273;388274 388262 1527 14 NGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDR Unmodified 4110.062 0.0619615 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 166.24 166.24 3;4 1.5635E-88 171273 QUIQUE_C1368_190116_001 148.14 139.74 5243400000 273140000 336540000 111160000 139060000 321140000 257060000 357820000 492660000 684930000 31270000 752640000 748580000 737370000 33488 2175 31177 304385;304386;304387;304388;304389;304390;304391;304392;304393;304394;304395;304396;304397;304398;304399;304400;304401;304402;304403;304404;304405;304406;304407;304408;304409;304410 388275;388276;388277;388278;388279;388280;388281;388282;388283;388284;388285;388286;388287;388288;388289;388290;388291;388292;388293;388294;388295;388296;388297;388298;388299;388300;388301;388302;388303 388280 29 NGSLICTASK Unmodified 1049.5175 0.51754412 4495 Q9ULV4;B4E3S0;F8VV53 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 22.496 22.496 2 0.0382 15352 QUIQUE_C1403_190116_001 51.762 31.207 122740000 49090000 41551000 0 32103000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33489 4495 31178 304411;304412;304413 388304;388305;388306 388306 3 NGTIELMEPLDEEISGIVEVVGR Unmodified 2498.2574 0.25741984 2373 P35244;B5MC59 RPA3 Replication protein A 14 kDa subunit yes no 0 0 0 1 171.4 171.4 2 0.0038818 175752 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.846 47.739 61186000 0 0 0 0 0 0 0 0 61186000 0 0 0 0 33490 2373 31179 304414 388307 388307 1 NGTLPWLRPDSK Unmodified 1382.7306 0.73064844 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 1 1 64.682 64.682 3 0.025811 63819 QUIQUE_C1403_190116_001 46.481 38.856 70719000 0 0 0 70719000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33491 2329 31180 304415 388308 388308 1 NGTSIIQGALTQLIQLYHR Unmodified 2125.1644 0.16438657 3573 Q8N1B4;A0A0G2JIG2 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes no 0 0 0 1 2 1 1 163.16 163.16 3 0.0013684 165715 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.612 46.176 114990000 0 0 0 0 0 0 0 12525000 30323000 0 17736000 0 54403000 33492 3573 31181 304416;304417;304418;304419;304420 388309;388310;388311;388312;388313 388309 3 NGTYEFLYTVQK Unmodified 1461.714 0.71399532 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 93.257 93.257 2 0.003732 95678 QUIQUE_DMIX7_190116_001 87.895 77.663 222150000 0 0 0 0 0 0 0 0 106710000 0 0 115440000 0 33493 4091 31182 304421;304422 388314;388315 388315 2 NGVDLLMK Unmodified 888.47389 0.47388839 3986;1503 Q9BPX5;O15511;B1ALC0 ARPC5L;ARPC5 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein;Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 no no 0 0 0 1 63.891 63.891 2 0.062222 59562 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.716 34.051 32447000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32447000 0 0 0 33494 3986;1503 31183 304423 388316 388316 1 NGVLEEAIIATILK Unmodified 1482.8657 0.86574494 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 160.8 160.8 2;3 6.3473E-05 164788 QUIQUE_C1277_190116_001 123.8 99.457 904910000 61681000 81322000 80411000 57601000 56921000 0 98176000 71791000 83039000 0 86887000 181450000 45631000 33495 4417 31184 304424;304425;304426;304427;304428;304429;304430;304431;304432;304433;304434;304435;304436;304437 388317;388318;388319;388320;388321;388322;388323;388324;388325;388326;388327;388328;388329;388330;388331;388332 388318 16 NGVNALQLDPALNR Unmodified 1493.795 0.79503961 3659 Q8TAF3;F8W7Y5;F8W6P2;F8W9K4;F8W7Q3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes no 0 0 0 1 1 88.138 88.138 2 0.00098024 91499 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.561 79.354 30948000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30948000 0 0 33496 3659 31185 304438;304439 388333;388334 388334 2 NGWSYDIEER Unmodified 1267.5469 0.54692999 1513 O43181 NDUFS4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.219 74.219 2 0.0034764 75165 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.213 66.393 524980000 0 67082000 0 55453000 0 0 53650000 60478000 88844000 16050000 69832000 70224000 43371000 33497 1513 31186 304440;304441;304442;304443;304444;304445;304446;304447;304448 388335;388336;388337;388338;388339;388340;388341;388342;388343;388344 388341 10 NGYELSPTAAANFTR Unmodified 1610.7689 0.76888444 2538 P49721 PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.723 86.723 2 4.2076E-06 87763 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.29 121.55 1224700000 0 116870000 0 113410000 115160000 114680000 0 173610000 172270000 58963000 0 153720000 206040000 33498 2538 31187 304449;304450;304451;304452;304453;304454;304455;304456;304457 388345;388346;388347;388348;388349;388350;388351;388352;388353;388354;388355 388350 9 NGYGFVEFDDLR Unmodified 1430.6466 0.64664404 259 A0A0D9SEM4;Q08170 SRSF4 Serine/arginine-rich splicing factor 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 120.9 120.9 2 0.0005697 123397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.538 75.299 140900000 34297000 0 0 0 0 0 0 34870000 0 22491000 49242000 0 0 33499 259 31188 304458;304459;304460;304461 388356;388357;388358;388359 388357 3 NGYPDLIVGAFGVDR Unmodified 1591.7995 0.79945628 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 136.39 136.39 2 0.015992 140167 QUIQUE_C1403_190116_001 62.042 53.945 22687000 0 0 0 22687000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33500 1909 31189 304462 388360 388360 1 NGYTPLHIAAK Unmodified 1183.635 0.63495714 2856;1255;2953 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651;Q12955 ANK2;ANK3 Ankyrin-2;Ankyrin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.96 33.96 2 0.00081932 29618 QUIQUE_C1277_190116_001 120.33 110.63 479100000 0 63198000 0 0 0 0 77331000 0 81022000 0 89146000 103040000 65360000 33501 1255;2856;2953 31190 304463;304464;304465;304466;304467;304468;304469;304470;304471;304472 388361;388362;388363;388364;388365;388366;388367;388368;388369;388370 388362 10 NHDEESLECLCR Unmodified 1560.6297 0.62969012 922;170 E9PGM1;E7EX73;E7EUU4;Q04637;C9JF13;A0A0A0MSA7;A0A0U1RQK7;O43432 EIF4G1;EIF4G3 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 1;Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 3 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 41.875 41.875 2;3 1.0478E-09 38518 QUIQUE_C1403_190116_001 180.07 173.21 242740000 0 34104000 19474000 44375000 65309000 0 33637000 0 45846000 0 0 0 0 33502 922;170 31191 304473;304474;304475;304476;304477;304478;304479 388371;388372;388373;388374;388375;388376;388377;388378 388374 8 NHEAQIQDMR Unmodified 1240.5619 0.56186855 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 17.931 17.931 2;3 3.1972E-39 11118 QUIQUE_C1218_190116_001 208.11 192.74 367350000 63452000 28692000 65265000 53165000 89861000 44512000 22407000 0 0 0 0 0 0 33503 2379 31192 304480;304481;304482;304483;304484;304485;304486;304487;304488;304489;304490;304491 388379;388380;388381;388382;388383;388384;388385;388386;388387;388388;388389;388390;388391;388392;388393 388380 15 NHEEEMKDLR Unmodified 1299.5877 0.58774895 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 14.327 14.327 2;3 8.7975E-17 6697 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.09 157.85 1950700000 79726000 63848000 0 10165000 0 127370000 0 135190000 270520000 89619000 314560000 423170000 436520000 + 33504 776 31193 304492;304493;304494;304495;304496;304497;304498;304499;304500;304501;304502;304503;304504;304505;304506 388394;388395;388396;388397;388398;388399;388400;388401;388402;388403;388404;388405;388406;388407;388408;388409 388401 14 NHEEEMNALR Unmodified 1241.5459 0.54588413 763 CON__P02533;P02533;CON__Q6IFX2;K7EPJ9;K7ESE1 KRT14;KRT17 Keratin, type I cytoskeletal 14 no no 0 0 0 1 1 20.39 20.39 2 0.0012219 13151 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.25 87.619 41349000 0 0 0 0 0 0 0 24263000 0 17086000 0 0 0 + 33505 763 31194 304507;304508 388410;388411 388411 2 NHEHSYQLEQR Unmodified 1439.6542 0.65418903 4387 Q9P2G1 ANKIB1 Ankyrin repeat and IBR domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 10.761 10.761 3 0.0083779 3254 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.841 40.936 6507600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6507600 0 0 0 33506 4387 31195 304509 388412 388412 1 NHGLSDEHVFEVICPSIPGYGFSEASSK Unmodified 3062.408 0.40800025 1912 P07099 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 121.45 121.45 4 0.0049706 126562 QUIQUE_C1218_190116_001 28.181 22.34 388620000 68984000 0 0 0 77136000 79451000 111120000 0 0 0 0 0 51928000 33507 1912 31196 304510;304511;304512;304513;304514 388413;388414;388415;388416;388417 388413 4 NHGLVSVGESVEEAFYYIHNLVVACEIQVR Unmodified 3430.698 0.69797469 854 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304584;304585;304586;304587;304588;304589;304590;304591;304592;304593;304594;304595;304596;304597;304598;304599;304600;304601;304602;304603;304604;304605;304606;304607;304608;304609;304610 388504;388505;388506;388507;388508;388509;388510;388511;388512;388513;388514;388515;388516;388517;388518;388519;388520;388521;388522;388523;388524;388525;388526;388527;388528;388529;388530;388531;388532;388533;388534;388535;388536;388537;388538;388539;388540;388541;388542;388543;388544;388545;388546;388547;388548;388549;388550;388551;388552;388553;388554;388555;388556 388532 52 NHIIKDQLASK Unmodified 1265.7092 0.70918471 3146 Q15582;H0Y8L3;S4R3C6;H0Y9D7 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 1 1 1 1 14.184 14.184 3 0.0002637 6670 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.35 93.662 43718000 0 0 0 0 0 0 0 0 19195000 0 0 15546000 8978200 33513 3146 31201 304611;304612;304613 388557;388558;388559 388557 3 NHLDYRPVALLFHK Unmodified 1721.9366 0.93655889 2692 P60484 PTEN Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 73.037 73.037 4 7.5092E-05 73614 QUIQUE_C1277_190116_001 96.756 82.891 432940000 30139000 43579000 30326000 44457000 26330000 0 48050000 48288000 47156000 0 52586000 0 62027000 33514 2692 31202 304614;304615;304616;304617;304618;304619;304620;304621;304622;304623;304624 388560;388561;388562;388563;388564;388565;388566;388567;388568;388569;388570;388571 388561 10 NHLEALPPEIGGCVALSVLSLR Unmodified 2344.2573 0.25730068 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 0 1 145.44 145.44 3 0.0038515 148408 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.504 16.517 23933000 0 0 0 0 0 0 0 23933000 0 0 0 0 0 33515 289 31203 304625 388572 388572 1 NHLLETTPK Unmodified 1051.5662 0.56620887 3446 Q7L7X3 TAOK1 Serine/threonine-protein kinase TAO1 yes yes 0 0 0 1 17.116 17.116 2 0.0073732 9730 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.178 79.175 23145000 0 0 0 0 0 0 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122.97 3 9.1708E-14 126032 QUIQUE_C1277_190116_001 123.19 108.03 710440000 143170000 99747000 16215000 104460000 44844000 0 124820000 0 0 36892000 0 31680000 108610000 33521 2186 31209 304661;304662;304663;304664;304665;304666;304667;304668;304669;304670;304671;304672;304673;304674;304675;304676;304677 388614;388615;388616;388617;388618;388619;388620;388621;388622;388623;388624;388625;388626;388627;388628;388629;388630;388631;388632;388633;388634 388618 17 NHNSLLSLPQEPYSFSEPAQQAMR Unmodified 2743.3024 0.30241297 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.01 114.01 3 1.6386E-08 117156 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.539 63.798 733750000 90939000 90620000 91757000 94773000 62209000 82473000 0 0 59167000 0 0 80977000 80834000 33522 1993 31210 304678;304679;304680;304681;304682;304683;304684;304685;304686 388635;388636;388637;388638;388639;388640;388641;388642;388643;388644;388645;388646;388647 388645 13 NHPGLLLMDTTFR Unmodified 1513.7711 0.77113304 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 92.88 92.88 2;3 0.00014068 95463 QUIQUE_C1277_190116_001 90.793 71.236 2203500000 171160000 182130000 166240000 151470000 208160000 108920000 146460000 78374000 241330000 53756000 306420000 162540000 226500000 33523 2026 31211 304687;304688;304689;304690;304691;304692;304693;304694;304695;304696;304697;304698;304699;304700;304701;304702;304703;304704;304705;304706;304707 388648;388649;388650;388651;388652;388653;388654;388655;388656;388657;388658;388659;388660;388661;388662;388663;388664;388665;388666;388667;388668;388669;388670;388671;388672;388673;388674 388652 27 NHPQMIAVLVDK Unmodified 1363.7282 0.7282056 2934 Q09161 NCBP1 Nuclear cap-binding protein subunit 1 yes yes 0 0 0 2 1 59.699 59.699 2;3 0.012963 58053 QUIQUE_C1277_190116_001 57.174 34.434 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dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 131.12 131.12 2 0.0059416 129097 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.7 39.498 40396000 30990000 0 0 0 0 0 0 0 0 9405600 0 0 0 33540 86 31226 304845;304846 388849;388850 388850 61;62 2 NIANPTAMLLSASNMLR Unmodified 1815.9335 0.9335237 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5;A0A0D9SG66 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 150.76 150.76 2;3 3.4786E-23 155612 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.34 94.936 2722700000 224540000 195690000 192770000 191670000 130490000 134780000 177420000 237980000 255180000 29743000 299430000 297340000 355720000 33541 86 31226 304847;304848;304849;304850;304851;304852;304853;304854;304855;304856;304857;304858;304859;304860;304861;304862;304863;304864;304865;304866;304867;304868;304869;304870;304871;304872 388851;388852;388853;388854;388855;388856;388857;388858;388859;388860;388861;388862;388863;388864;388865;388866;388867;388868;388869;388870;388871;388872;388873;388874;388875;388876;388877;388878;388879 388869 28 NIANPTATLLASCMMLDHLK Oxidation (M) 2229.0956 0.095580004 2582 P51553;G5E9Q7;E7EQB8;H0Y5Q7 IDH3G Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit gamma, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 132.04 132.04 3 0.0062494 134790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.656 39.837 28256000 0 0 0 0 0 0 0 28256000 0 0 0 0 0 33542 2582 31227 304873 388880 388880 2032;2033 0 NIASVGFHEDGR Unmodified 1300.616 0.61601261 137 A0A0A0MR05;Q9BVC4;H3BM50;H3BPU5;H3BPT1;H3BN58;H3BSZ4;H3BR25 MLST8 Target of rapamycin complex subunit LST8 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 37.568 37.568 2;3 0.00029274 34044 QUIQUE_C1218_190116_001 72.089 60.223 271380000 32995000 53342000 21632000 21637000 0 34220000 0 19333000 18809000 19717000 0 24549000 25149000 33543 137 31228 304874;304875;304876;304877;304878;304879;304880;304881;304882;304883;304884 388881;388882;388883;388884;388885;388886;388887;388888;388889;388890;388891;388892;388893 388881 13 NIATSLHEICSK Unmodified 1371.6816 0.68164933 20 A0A087X0V7;A0A087WYH9;A0A075B7G8;J3KPL8;O00213;V9GYR7;V9GY97 APBB1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 47.57 47.57 2 0.00089848 45614 QUIQUE_C1438_190116_001 85.813 61.037 47121000 0 0 0 0 27492000 0 0 0 0 0 0 19629000 0 33544 20 31229 304885;304886;304887 388894;388895;388896 388895 3 NIATYEEQLVALFGTNMDIVEPTA Oxidation (M) 2654.2785 0.27854921 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 1 0 1 172.98 172.98 3 5.2962E-05 177061 QUIQUE_C1218_190116_001 50.202 42.628 16194000 16194000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33545 2331 31230 304888 388897 388897 1726 1 NIATYYGAFIK Unmodified 1259.655 0.65502388 4473;3590;263 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389130 389130 1 NIEEVYVGGK Unmodified 1106.5608 0.56078914 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;H0YDZ7;Q5SZC3 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.588 47.588 2 0.0058027 44631 QUIQUE_C1368_190116_001 89.355 30.437 5140000000 433870000 499990000 476470000 455770000 386450000 365310000 500580000 346600000 326160000 0 459880000 337480000 551400000 33571 4567 31256 305085;305086;305087;305088;305089;305090;305091;305092;305093;305094;305095;305096 389131;389132;389133;389134;389135;389136;389137;389138;389139;389140;389141;389142;389143 389133 11 NIELICQENEGENDPVLQR Unmodified 2269.0645 0.06447411 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 1 2 1 1 96.614 96.614 2;3 2.0144E-63 99074 QUIQUE_DMIX3_190116_001 217.16 198.1 1430200000 0 81272000 58158000 212210000 162050000 134130000 67876000 96584000 194940000 30420000 153170000 93720000 145680000 33572 3150 31257 305097;305098;305099;305100;305101;305102;305103;305104;305105;305106;305107;305108;305109;305110;305111;305112;305113 389144;389145;389146;389147;389148;389149;389150;389151;389152;389153;389154;389155;389156;389157;389158;389159;389160;389161;389162 389156 18 NIEPTEYIDDLFK Unmodified 1595.7719 0.77190413 439 A0A2R8Y661;A0A2R8YGD3;Q9Y4G8;D6RE77;B7Z7Y1;E9PCH4;Q8TEU7 RAPGEF2;RAPGEF6 Rap guanine nucleotide exchange factor 2;Rap guanine nucleotide exchange factor 6 yes no 0 0 0 1 1 1 147.85 147.85 2 0.0036326 155113 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.494 51.882 210870000 0 0 95009000 0 0 0 0 44307000 0 0 71553000 0 0 33573 439 31258 305114;305115;305116 389163;389164;389165;389166 389166 4 NIEPTHAPFIEK Unmodified 1394.7194 0.71941505 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;H0Y314 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 48.837 48.837 2 0.001426 47189 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.659 52.33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33574 1187 31259 305117 389167 389167 1 NIEVMNSFELLSHTVEEK Unmodified 2118.0303 0.030320436 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 132.47 132.47 2;3 1.2073E-23 137225 QUIQUE_C1368_190116_001 185.95 149.62 713390000 118840000 0 48087000 98147000 86709000 115780000 115500000 33295000 97024000 0 0 0 0 33575 846 31260 305118;305119;305120;305121;305122;305123;305124;305125;305126 389168;389169;389170;389171;389172;389173;389174;389175;389176 389169 8 NIEVPFKPAR Unmodified 1169.6557 0.65569258 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 48.381 48.381 3 0.013782 46801 QUIQUE_C1218_190116_001 50.353 39.698 743800000 76688000 0 115500000 103540000 125060000 107900000 0 0 0 51344000 163770000 0 0 33576 2180 31261 305127;305128;305129;305130;305131;305132;305133 389177;389178;389179;389180;389181;389182;389183 389177 2 NIEYAASVLEAVYIDETRR Unmodified 2211.1172 0.11716161 2648 P54750 PDE1A Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A yes yes 0 0 1 1 150.2 150.2 3 0.0071526 156008 QUIQUE_C1576_190116_001 47.568 24.468 21991000 0 0 0 0 0 0 21991000 0 0 0 0 0 0 33577 2648 31262 305134 389184 389184 0 NIEYPVDLEISK Unmodified 1418.7293 0.72931103 3082 Q14694;H3BQP1 USP10 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 yes no 0 0 0 1 101.36 101.36 2 0.011246 106094 QUIQUE_C1438_190116_001 61.815 35.301 34143000 0 0 0 0 34143000 0 0 0 0 0 0 0 0 33578 3082 31263 305135 389185 389185 1 NIFESFVDYVAVEQLDGDNK Unmodified 2301.0801 0.0801074 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 169.25 169.25 3 2.0053E-06 173879 QUIQUE_C1218_190116_001 55.972 47.582 59824000 17490000 12204000 12172000 8473600 0 9484300 0 0 0 0 0 0 0 33579 3778 31264 305136;305137;305138;305139;305140 389186;389187;389188;389189;389190 389186 5 NIFESFVDYVAVEQLDGDNKYDAGEHGLQEAEK Unmodified 3728.7118 0.71182965 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 154.71 154.71 4 0.0037396 159534 QUIQUE_DMIX3_190116_001 27.825 19.627 143530000 0 0 0 0 0 0 0 74186000 69346000 0 0 0 0 33580 3778 31265 305141;305142 389191;389192 389192 2 NIFGEESNEFTNDWGEK Unmodified 2014.8545 0.85446456 2531 P49441;E7ET59;E7EUX4;E7ENF2;C9J173;B8ZZF6 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.09 124.09 2 3.2405E-07 121209 QUIQUE_DMIX4_190116_001 139.86 116.25 722540000 59107000 75064000 71534000 0 66038000 0 91900000 0 96170000 23082000 91555000 79876000 68209000 33581 2531 31266 305143;305144;305145;305146;305147;305148;305149;305150;305151;305152 389193;389194;389195;389196;389197;389198;389199;389200;389201;389202;389203 389200 10 NIFIECTGTDFTK Unmodified 1544.7181 0.71809442 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.959 97.959 2 0.00049035 101583 QUIQUE_C1218_190116_001 105.46 79.801 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Unmodified 1187.6332 0.63324258 2599 P51911;B7Z7E1;K7EQ72;K7ER02 CNN1 Calponin-1;Calponin yes no 0 0 0 1 69.067 69.067 2 0.014647 68888 QUIQUE_C1277_190116_001 58.37 27.573 92614000 0 92614000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33608 2599 31293 305297 389358 389358 1 NIIGSSPVADFSAIK Unmodified 1517.809 0.80895834 2449 P42566;B1AUU8 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 0 0 0 1 1 111 111 2 0.0025244 113552 QUIQUE_C1563_190116_001 79.741 54.082 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33609 2449 31294 305298;305299 389359;389360 389359 2 NIIGVIPYFPYSK Unmodified 1509.8232 0.82315184 3071 Q14558;B4DP31;C9J168;C9JNQ3;C9JUN4;C9JKT9 PRPSAP1 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.94 137.94 2 0.00048204 141228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.39 75.735 833130000 43702000 77946000 42240000 0 59065000 48869000 71413000 94150000 112730000 26103000 84821000 82237000 89859000 33610 3071 31295 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389613;389614;389615;389616;389617;389618;389619;389620;389621;389622;389623;389624;389625;389626;389627;389628;389629;389630;389631;389632;389633;389634;389635;389636 389625 24 NIIVFYGSQTGTAEEFANR Unmodified 2116.0225 0.022532941 2109 P16435;H0Y4R2;C9JU80 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 0 1 115.69 115.69 2 2.4687E-05 119408 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.55 85.35 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33626 2109 31311 305499 389637 389637 1 NIIVGFAR Unmodified 888.51814 0.51813647 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 66.583 66.583 2 0.039163 66662 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.673 4.3671 54066000 0 0 0 0 54066000 0 0 0 0 0 0 0 0 33627 739 31312 305500;305501;305502;305503 389638;389639;389640;389641 389641 4 NILAAASPYIR Unmodified 1187.6663 0.66625727 4143 Q9H2C0;A0A3B3ITY2;A0A0S2Z5G5 GAN Gigaxonin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 92.416 92.416 2 0.0014915 93522 QUIQUE_C1563_190116_001 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2 2 71.86 71.86 2;3 6.696E-05 72112 QUIQUE_C1277_190116_001 96.591 59.745 1028000000 64508000 68076000 105490000 76250000 94521000 0 94811000 74711000 116350000 27825000 116180000 87409000 101900000 33633 2615 31318 305538;305539;305540;305541;305542;305543;305544;305545;305546;305547;305548;305549;305550;305551;305552;305553;305554;305555;305556;305557;305558;305559;305560 389681;389682;389683;389684;389685;389686;389687;389688;389689;389690;389691;389692;389693;389694;389695;389696;389697;389698;389699;389700;389701;389702;389703;389704;389705;389706;389707 389683 26 NILDSKPTANK Unmodified 1199.651 0.65100113 4495 Q9ULV4;B4E3S0;H0YHL7 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 1 1 1 1 1 20.442 20.442 2;3 0.016099 13152 QUIQUE_C1277_190116_001 88.136 55.816 86342000 0 0 0 86342000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33634 4495 31319 305561;305562;305563;305564 389708;389709;389710;389711 389708 4 NILDSKPTANKK Unmodified 1327.746 0.74596415 4495 Q9ULV4;B4E3S0;H0YHL7 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 2 1 13.045 13.045 3 0.0029178 5136 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.085 39.606 56637000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56637000 0 33635 4495 31320 305565 389712 389712 1 NILENTPENHPDHSHLK Unmodified 1993.9606 0.96060139 3161 Q15811 ITSN1 Intersectin-1 yes yes 0 0 0 1 22.013 22.013 3 0.0029128 14936 QUIQUE_C1403_190116_001 48.711 9.8877 44833000 0 0 0 44833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 33636 3161 31321 305566 389713 389713 1 NILEQINALTGTLFTSK Unmodified 1862.0149 0.014928368 3454 Q7Z2Z2;A0A3B3ITU1 EFTUD1 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 169.24 169.24 2;3 3.0987E-24 173603 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.21 115.68 211630000 16663000 0 0 25550000 0 0 0 52432000 80546000 0 36434000 0 0 33637 3454 31322 305567;305568;305569;305570;305571;305572;305573 389714;389715;389716;389717;389718;389719;389720 389719 6 NILETLLQMK Unmodified 1201.674 0.67404476 2819 P82673 MRPS35 28S ribosomal protein S35, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.28 151.28 2 0.000957 153851 QUIQUE_C1563_190116_001 103.56 80.823 252120000 20139000 24160000 28415000 16141000 20449000 20269000 18140000 15346000 20475000 7393000 19797000 16660000 24734000 33638 2819 31323 305574;305575;305576;305577;305578;305579;305580;305581;305582;305583;305584;305585;305586 389721;389722;389723;389724;389725;389726;389727;389728;389729;389730;389731;389732;389733;389734;389735 389727 15 NILFVITKPDVYK Unmodified 1548.8916 0.89156576 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3;F8W0W4;F8W1N5;F8VNW4;F8VZ58;Q9BZK3 NACA;NACAP1 Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form;Putative nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 100.52 100.52 2;3 0.00037078 98401 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.013 74.929 2643800000 70592000 214830000 208590000 236030000 237970000 84356000 207090000 257420000 246180000 96443000 285710000 232360000 266240000 33639 892 31324 305587;305588;305589;305590;305591;305592;305593;305594;305595;305596;305597;305598;305599;305600;305601;305602;305603;305604;305605;305606;305607;305608;305609;305610 389736;389737;389738;389739;389740;389741;389742;389743;389744;389745;389746;389747;389748;389749;389750;389751;389752;389753;389754;389755;389756;389757;389758;389759;389760;389761;389762 389755 22 NILGAQVSEAVPLPEHGVSVVFVNLGNTK Unmodified 2987.608 0.60802069 3917 Q96PE7 MCEE Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 141.01 141.01 3 0.001398 144146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.054 31.423 102810000 0 0 0 0 0 0 0 32738000 70070000 0 0 0 0 33640 3917 31325 305611;305612 389763;389764 389763 2 NILGGTVFR Unmodified 975.55016 0.55016488 2518;1662 O75874;C9J4N6;P48735 IDH1;IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic;Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 78.815 78.815 1;2 2.844E-05 79647 QUIQUE_DMIX7_190116_001 171.53 84.666 13283000000 1579100000 1449600000 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34416000 82750000 85572000 91400000 38477000 91690000 0 92283000 82739000 63103000 33643 3818 31328 305634;305635;305636;305637;305638;305639;305640;305641;305642;305643;305644;305645;305646;305647;305648;305649;305650;305651;305652;305653;305654 389789;389790;389791;389792;389793;389794;389795;389796;389797;389798;389799;389800;389801;389802;389803;389804;389805;389806;389807;389808;389809;389810;389811;389812;389813;389814;389815;389816;389817;389818;389819 389808 31 NILHSFVQLR Unmodified 1225.6931 0.69314072 174 A0A0A0MSI8;O00471;F8W9B8 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 0 0 0 1 1 77.293 77.293 3 0.0025113 77788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.518 40.86 49437000 29007000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20429000 0 0 33644 174 31329 305655;305656 389820;389821 389821 1 NILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSLK Unmodified 3358.7759 0.77593346 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 12 184.28 184.28 3 1.8872E-05 187492 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Hexokinase-1 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 68.665 68.665 2;3 0.0049003 68953 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.64 20.096 708180000 0 0 0 0 0 0 0 49297000 166900000 0 230690000 237800000 23496000 33647 2146 31332 305683;305684;305685;305686;305687;305688;305689;305690 389859;389860;389861;389862;389863;389864;389865;389866 389860 7 NILIMAGDEASTIAEIIEECGGLEK Unmodified 2675.3034 0.30338375 1413 O00505;H0Y4S9 KPNA3 Importin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 173.51 173.51 3 2.1211E-07 177195 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.278 44.349 137420000 0 0 0 0 0 0 0 0 15623000 0 76900000 44895000 0 33648 1413 31333 305691;305692;305693 389867;389868;389869;389870 389870 4 NILLHQLQSAR Unmodified 1291.7361 0.73606817 97 A0A087X0V5;P29728;F8W1C5 OAS2 2'-5'-oligoadenylate synthase 2 yes no 0 0 0 1 50.22 50.22 2 0.0046129 48801 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.977 43.235 28378000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28378000 0 0 33649 97 31334 305694 389871 389871 1 NILLTNEQLESAR Unmodified 1499.7944 0.79437091 4195 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2898 31337 305704;305705;305706;305707;305708;305709;305710;305711;305712;305713;305714;305715;305716 389883;389884;389885;389886;389887;389888;389889;389890;389891;389892;389893;389894;389895;389896;389897 389890 13 NILQLHDLTTGALLK Unmodified 1648.9512 0.9512059 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 2 2 113.93 113.93 2;3 6.3132E-44 119026 QUIQUE_DMIX5_190116_001 211.38 161.18 2951200000 392260000 337000000 213330000 212620000 296920000 120940000 134620000 120110000 244780000 74034000 337360000 196310000 270910000 33653 2503 31338 305717;305718;305719;305720;305721;305722;305723;305724;305725;305726;305727;305728;305729;305730;305731;305732;305733;305734;305735;305736;305737;305738 389898;389899;389900;389901;389902;389903;389904;389905;389906;389907;389908;389909;389910;389911;389912;389913;389914;389915;389916;389917;389918;389919 389914 14 NILQTALCSIVVDVLFDFK Unmodified 2194.1708 0.17077708 834 E5RG91 VPS37A yes yes 0 0 0 1 1 1 84.008 84.008 4 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.532 62.532 2 0.001018 61540 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.79 42.536 9245700000 382430000 670000000 1529800000 815350000 594400000 879100000 979670000 0 0 459320000 1094200000 463400000 1378100000 33657 719 31342 305754;305755;305756;305757;305758;305759;305760;305761;305762;305763;305764;305765;305766 389940;389941;389942;389943;389944;389945;389946;389947;389948;389949;389950;389951;389952 389948 8 NILTSNNIDVKK Unmodified 1357.7565 0.75652884 719 C9JF17;P05090 APOD Apolipoprotein D yes no 0 0 1 1 40.555 40.555 3 0.00020798 36767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.021 74.057 171440000 0 0 0 0 0 0 0 171440000 0 0 0 0 0 33658 719 31343 305767 389953 389953 1 NILVASPECVK Unmodified 1228.6486 0.64855829 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 1 57.423 57.423 2 0.048184 55915 QUIQUE_C1277_190116_001 59.542 28.313 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33659 3060 31344 305768 389954 389954 1 NILVFGEDGSGK Unmodified 1234.6194 0.61936665 1515 O43237;H3BUM4 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 80.212 80.212 2 0.011246 81217 QUIQUE_C1403_190116_001 69.01 50.699 2546900000 0 0 494320000 496720000 0 0 531960000 0 456700000 0 567240000 0 0 33660 1515 31345 305769;305770;305771;305772;305773 389955;389956;389957;389958;389959;389960 389956 6 NILVSSAGSR Unmodified 1002.5458 0.54580778 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 29.641 29.641 2 0.03223 24352 QUIQUE_C1218_190116_001 53.756 28.197 423510000 159760000 0 0 0 0 0 0 0 0 82658000 0 181100000 0 33661 2037 31346 305774;305775;305776 389961;389962;389963;389964 389961 4 NIMEAMLQLFR Unmodified 1364.6945 0.69446263 3730 Q92538 GBF1 Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 169.92 169.92 2 2.3215E-12 174398 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.79 129.85 103250000 0 10391000 7088500 0 0 0 9132400 6044700 27671000 0 21085000 13028000 8809800 33662 3730 31347 305777;305778;305779;305780;305781;305782;305783;305784 389965;389966;389967;389968;389969;389970;389971;389972 389969 7 NINADEAAAMGAVYQAAALSK Unmodified 2078.0103 0.010253695 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 140.11 140.11 3 9.8456E-05 145182 QUIQUE_C1368_190116_001 43.956 39.152 203680000 72706000 0 33174000 54273000 0 43524000 0 0 0 0 0 0 0 33663 89 31348 305785;305786;305787;305788 389973;389974;389975;389976 389974 3 NINCSIEESFQR Unmodified 1495.6725 0.67254121 2388 P35914 HMGCL Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 72.968 72.968 2 0.012441 69691 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.785 35.045 94012000 0 0 0 0 0 0 79871000 0 0 14140000 0 0 0 33664 2388 31349 305789;305790 389977;389978 389978 2 NINDAWVCTNDMFR Oxidation (M) 1770.7454 0.74538858 2734 P61970 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 2 97.364 97.364 2 1.0007E-13 100282 QUIQUE_DMIX7_190116_001 140.31 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A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6;C9JBE1;F8WAN0;C9J1E2 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.73 166.73 3 8.8367E-93 171781 QUIQUE_C1368_190116_001 174.49 157.13 1184700000 95385000 170190000 230070000 128880000 59183000 110780000 118880000 0 97185000 43390000 0 0 130770000 33667 1 31351 305819;305820;305821;305822;305823;305824;305825;305826;305827;305828 390008;390009;390010;390011;390012;390013;390014;390015;390016;390017 390010 8 NINENFGPNTEMHLVPILATAIQEELEK Oxidation (M) 3179.5809 0.58087924 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6;C9JBE1;F8WAN0;C9J1E2 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 1 0 1 1 160.08 160.08 3 8.206E-06 165226 QUIQUE_C1368_190116_001 52.391 41.184 58478000 0 0 37246000 21232000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33668 1 31351 305829;305830 390018;390019 390018 1 2 NINIGDISIK Unmodified 1085.6081 0.60807369 3735 Q92572 AP3S1 AP-3 complex subunit sigma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 93.784 93.784 2 0.037493 96022 QUIQUE_C1277_190116_001 61.78 15.651 73401000 0 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0.0009083 78580 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.111 64.892 1160700000 0 94220000 79880000 85330000 121090000 69365000 98201000 93648000 124540000 0 117890000 152630000 123940000 33672 3596 31355 305840;305841;305842;305843;305844;305845;305846;305847;305848;305849;305850 390029;390030;390031;390032;390033;390034;390035;390036;390037;390038;390039 390036 10 NINPSTANSPK Unmodified 1141.5728 0.57275081 2485 P46937;H0YCI3 YAP1 Transcriptional coactivator YAP1 yes no 0 0 0 1 15.035 15.035 2 0.012471 7064 QUIQUE_C1563_190116_001 60.398 36.426 9576500 0 0 0 0 0 9576500 0 0 0 0 0 0 0 33673 2485 31356 305851 390040 390040 1 NIPEDNADMAR Oxidation (M) 1260.5405 0.54046441 2339 P31939;C9JLK0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 1 0 1 20.53 20.53 2 0.035151 13076 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.445 30.925 17305000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17305000 0 0 0 33674 2339 31357 305852 390041 390041 1 NIPGITLLNVSK Unmodified 1267.75 0.7499869 2399 P36578;H3BM89 RPL4 60S ribosomal protein L4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 108.69 108.69 2 0.012528 113717 QUIQUE_C1438_190116_001 76.143 56.872 96633000 0 27704000 42755000 0 0 0 26175000 0 0 0 0 0 0 33675 2399 31358 305853;305854;305855;305856 390042;390043;390044;390045 390044 4 NIPHEAFVYQK Unmodified 1344.6826 0.68263561 4304 Q9NVE7;H0YA26 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 43.24 43.24 2;3 0.00045885 40283 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.51 88.129 292410000 0 0 0 0 0 0 0 25769000 123720000 0 60822000 34912000 47186000 33676 4304 31359 305857;305858;305859;305860;305861;305862 390046;390047;390048;390049;390050;390051;390052 390049 7 NIPIHSCPK Unmodified 1064.5437 0.54369929 3825 Q96CV9 OPTN Optineurin yes yes 0 0 0 1 14.372 14.372 3 0.029702 6669 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.395 22.257 12675000 0 0 0 0 0 0 0 12675000 0 0 0 0 0 33677 3825 31360 305863 390053 390053 1 NIPIPTLR Unmodified 922.56 0.56000128 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.339 78.339 2 0.0057754 79226 QUIQUE_C1368_190116_001 104.21 51.526 3396500000 210270000 278850000 277050000 206820000 254390000 252030000 297160000 301670000 263560000 110860000 338210000 281410000 324230000 33678 4356 31361 305864;305865;305866;305867;305868;305869;305870;305871;305872;305873;305874;305875;305876 390054;390055;390056;390057;390058;390059;390060;390061;390062;390063;390064;390065;390066 390056 13 NIPLLFLQNITGFMVGR Unmodified 1932.0655 0.06552415 4223 Q9HCC0;D6RD67 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 172.98 172.98 2;3 3.6443E-104 176564 QUIQUE_DMIX7_190116_001 219.42 201.28 855730000 12519000 31113000 58076000 15322000 40738000 26905000 70210000 47311000 167140000 0 152000000 148590000 85790000 33679 4223 31362 305877;305878;305879;305880;305881;305882;305883;305884;305885;305886;305887;305888;305889;305890;305891;305892;305893;305894;305895;305896;305897 390067;390068;390069;390070;390071;390072;390073;390074;390075;390076;390077;390078;390079;390080;390081;390082;390083;390084;390085;390086;390087;390088;390089 390086 22 NIPLLFLQNITGFMVGR Oxidation (M) 1948.0604 0.060438772 4223 Q9HCC0;D6RD67 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.87 167.87 2 4.0398E-18 172704 QUIQUE_C1218_190116_001 126.83 72.963 501650000 52174000 54472000 61514000 53106000 72689000 0 0 61933000 0 9263700 0 80091000 56409000 33680 4223 31362 305898;305899;305900;305901;305902;305903;305904;305905;305906 390090;390091;390092;390093;390094;390095;390096;390097;390098 390090 2885 7 NIPMLFVR Unmodified 988.55281 0.55280741 2750 P62310 LSM3 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3 yes yes 0 0 0 1 1 1 103.2 103.2 2 0.035882 108121 QUIQUE_C1438_190116_001 63.148 31.193 107310000 0 0 0 0 32129000 0 0 0 0 0 44802000 30383000 0 33681 2750 31363 305907;305908;305909 390099;390100;390101 390099 3 NIPMSVNDIVKPGMR Unmodified 1669.8644 0.8643815 4416 Q9UDY4 DNAJB4 DnaJ homolog subfamily B member 4 yes yes 0 0 1 1 86.893 86.893 3 0.033223 87673 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.278 27.651 19905000 0 0 0 0 0 0 0 19905000 0 0 0 0 0 33682 4416 31364 305910 390102 390102 1 NIPPYFVALVPQEEELDDQK Unmodified 2343.1634 0.1634431 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 146.29 146.29 2;3 9.665E-30 153036 QUIQUE_C1438_190116_001 144.68 119.23 2101100000 208800000 203110000 275790000 196730000 168790000 212100000 190580000 97641000 127060000 96023000 83577000 110300000 130630000 33683 2050 31365 305911;305912;305913;305914;305915;305916;305917;305918;305919;305920;305921;305922;305923;305924;305925;305926;305927;305928;305929;305930;305931;305932;305933;305934;305935 390103;390104;390105;390106;390107;390108;390109;390110;390111;390112;390113;390114;390115;390116;390117;390118;390119;390120;390121;390122;390123;390124;390125;390126;390127;390128;390129;390130;390131;390132;390133;390134;390135;390136;390137;390138;390139;390140;390141;390142 390119 40 NIPQGAPVK Unmodified 922.52362 0.52361577 2993 Q13423;E9PCX7;H0Y8P5 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 20.784 20.784 2 0.054689 14081 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.442 23.218 88219000 0 0 0 0 0 0 0 0 88219000 0 0 0 0 33684 2993 31366 305936 390143 390143 1 NIPQMSFDDTEREPDQTFSLNR Unmodified 2639.1922 0.19219382 4103 Q9GZP4;X6RHB9 PITHD1 PITH domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.07 109.07 3 1.0129E-14 113794 QUIQUE_C1438_190116_001 95.206 93.46 1613200000 120010000 134540000 124070000 116960000 123080000 80565000 120220000 126280000 136520000 46311000 172980000 130620000 181050000 33685 4103 31367 305937;305938;305939;305940;305941;305942;305943;305944;305945;305946;305947;305948;305949 390144;390145;390146;390147;390148;390149;390150;390151;390152;390153;390154;390155;390156;390157;390158;390159;390160;390161;390162;390163 390150 20 NIPQMSFDDTEREPDQTFSLNR Oxidation (M) 2655.1871 0.18710844 4103 Q9GZP4;X6RHB9 PITHD1 PITH domain-containing protein 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.372 89.372 3 3.8133E-07 92162 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.303 72.729 308550000 0 0 0 0 0 38959000 0 0 43523000 33922000 64913000 51978000 75254000 33686 4103 31367 305950;305951;305952;305953;305954;305955 390164;390165;390166;390167;390168;390169 390167 2860 5 NIPTVNENLENYYLEVNQLEK Unmodified 2535.2493 0.24929799 2597 P51884 LUM Lumican yes yes 0 0 0 1 1 142.25 142.25 2 1.5159E-07 149083 QUIQUE_C1438_190116_001 119.31 100.58 40611000 0 0 0 0 40611000 0 0 0 0 0 0 0 0 33687 2597 31368 305956;305957 390170;390171 390171 2 NIPVYECER Unmodified 1178.539 0.53900784 1646 O75569;G5E9Q4;F8WEG8;C9JMM3 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.568 40.568 2 0.017149 36199 QUIQUE_C1368_190116_001 65.246 28.087 212680000 0 0 64648000 0 56327000 0 0 45203000 0 0 0 46503000 0 33688 1646 31369 305958;305959;305960;305961;305962;305963 390172;390173;390174;390175;390176;390177 390172 6 NIQDTSDLDAIAK Unmodified 1402.694 0.69398816 4342 Q9NZB2;A0A0C4DH52 FAM120A Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 69.761 69.761 2 0.00015143 70594 QUIQUE_C1218_190116_001 123.79 81.194 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33689 4342 31370 305964;305965;305966 390178;390179;390180 390178 3 NIQFEAFHVFK Unmodified 1378.7034 0.70337105 4579 Q9Y376;A0A087X0K1 CAB39 Calcium-binding protein 39 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 98.976 98.976 2;3 0.00040997 103328 QUIQUE_C1218_190116_001 116.05 89.608 1553200000 142490000 154760000 98831000 130690000 106410000 95159000 156090000 138150000 64437000 28708000 163240000 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protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.72 105.72 2 1.5824E-07 108935 QUIQUE_C1277_190116_001 134.2 84.828 2842600000 256660000 0 408460000 259510000 0 250240000 0 228800000 292680000 137170000 413440000 328210000 267440000 33729 2050 31409 306317;306318;306319;306320;306321;306322;306323;306324;306325;306326;306327 390597;390598;390599;390600;390601;390602;390603;390604;390605;390606;390607;390608;390609;390610;390611 390599 15 NIYYLCAPNR Unmodified 1282.6128 0.61284149 2952 Q12931;I3L0K7 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.142 68.142 2 0.001077 66936 QUIQUE_C1563_190116_001 101.99 81.659 1216800000 103890000 87491000 99538000 92862000 89552000 89195000 114390000 72256000 106910000 36611000 97577000 91883000 134610000 33730 2952 31410 306328;306329;306330;306331;306332;306333;306334;306335;306336;306337;306338;306339;306340 390612;390613;390614;390615;390616;390617;390618;390619;390620;390621;390622;390623;390624;390625 390617 14 NKDDLTLSR Unmodified 1060.5513 0.55128709 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 19.456 19.456 2;3 0.00030263 12068 QUIQUE_C1403_190116_001 102.07 64.511 2670700000 216080000 204330000 154170000 240410000 345460000 336920000 71953000 773400000 0 50603000 0 152600000 124820000 33731 2009 31411 306341;306342;306343;306344;306345;306346;306347;306348;306349;306350;306351;306352;306353 390626;390627;390628;390629;390630;390631;390632;390633;390634;390635;390636;390637;390638;390639 390630 14 NKDDQITLDEFK Unmodified 1464.7096 0.70963822 2761 P62760 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 64.18 64.18 2 1.5547E-64 64303 QUIQUE_C1218_190116_001 214.64 193.64 1403700000 313590000 314090000 0 203520000 0 249020000 323460000 0 0 0 0 0 0 33732 2761 31412 306354;306355;306356;306357;306358 390640;390641;390642;390643;390644 390640 5 NKDDQITLDEFKEAAK Unmodified 1863.9214 0.92142191 2761 P62760 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes yes 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306372;306373;306374;306375;306376;306377;306378;306379;306380;306381;306382;306383;306384;306385;306386;306387;306388;306389;306390;306391;306392 390658;390659;390660;390661;390662;390663;390664;390665;390666;390667;390668;390669;390670;390671;390672;390673;390674;390675;390676;390677;390678;390679;390680;390681;390682;390683;390684 390666 25 NKDTDISIKPEGVR Unmodified 1570.8315 0.83148469 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 2 1 25.695 25.695 3 0.024601 19863 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.899 32.155 35623000 0 0 0 0 0 0 0 0 35623000 0 0 0 0 33739 3199 31419 306393 390685 390685 1 NKDTVFEEQIK Unmodified 1349.6827 0.68269519 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 35.914 35.914 2 0.064041 31378 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.894 16.504 50723000 0 0 0 0 0 0 0 50723000 0 0 0 0 0 33740 4607 31420 306394 390686 390686 1 NKDVLQAETSQQLCCQK Unmodified 2048.9619 0.96192329 148 A0A0A0MRI2;Q9UNH7 SNX6 Sorting nexin-6;Sorting nexin-6, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 40.765 40.765 2;3 0.00057269 38774 QUIQUE_C1403_190116_001 51.535 43.887 34926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34926000 33741 148 31421 306395;306396 390687;390688 390687 2 NKEDQYDHLDAADMTK Oxidation (M) 1908.816 0.81597056 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.226 24.226 3 7.9711E-05 17697 QUIQUE_C1277_190116_001 93.381 77.018 573070000 69672000 47337000 0 48184000 64034000 0 48742000 42478000 67999000 34106000 68893000 0 81628000 33742 2363 31422 306397;306398;306399;306400;306401;306402;306403;306404;306405;306406 390689;390690;390691;390692;390693;390694;390695;390696;390697;390698;390699 390690 1761 11 NKEDQYDHLDAADMTK Unmodified 1892.8211 0.82105594 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 40.272 40.272 2;3 8.6807E-283 35856 QUIQUE_C1368_190116_001 302.35 276.91 671840000 60998000 0 436610000 59336000 45119000 0 0 0 0 0 69776000 0 0 33743 2363 31422 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Unmodified 1275.6571 0.65714914 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;F8WBI9;E7ENC1;H7C5C9;C9JVW9;C9JVY9;C9JAW3 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 35.397 35.397 2 0.050694 30823 QUIQUE_C1218_190116_001 70.056 40.895 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33747 739 31426 306421 390714 390714 1 NKGPSPVSSEGIK Unmodified 1298.683 0.68302954 4152 Q9H2X9 SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 16.327 16.327 2;3 0.021487 8427 QUIQUE_C1277_190116_001 46.704 23.028 142810000 0 41286000 0 0 17885000 0 0 0 19103000 0 40539000 23997000 0 33748 4152 31427 306422;306423;306424;306425;306426;306427 390715;390716;390717;390718;390719;390720 390715 6 NKHEAMITDLEER Oxidation (M) 1600.7515 0.75151981 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 1 1 1 22.57 22.57 2 0.042845 16035 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.451 52.425 18224000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18224000 0 0 33749 2378 31428 306428 390721 390721 1 NKIEELQQR Unmodified 1156.62 0.62003536 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 18.119 18.119 2;3 0.0099038 10883 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.859 27.604 134440000 0 0 0 0 0 0 0 14344000 0 0 85888000 15568000 18641000 33750 3241 31429 306429;306430;306431;306432;306433 390722;390723;390724;390725;390726 390725 4 NKLEGLEDALQK Unmodified 1356.7249 0.72489436 764 CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259 KRT6C;KRT6A Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A no no 0 0 1 1 1 62.066 62.066 2 0.00048807 62379 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.2 77.191 16880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16880000 0 0 + 33751 764 31430 306434;306435 390727;390728 390727 2 NKLNDLEDALQQAK Unmodified 1598.8264 0.82639932 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 90.022 90.022 2;3 3.9501E-46 92409 QUIQUE_DMIX8_190116_001 193.49 166.01 1007900000 0 0 0 0 0 0 0 134380000 0 0 455270000 272890000 145320000 + 33752 1859 31431 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yes yes 0 0 1 1 1 1 62.598 62.598 2 1.358E-16 61982 QUIQUE_C1277_190116_001 150.49 124.37 121000000 0 69915000 51090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33757 1895 31436 306473;306474;306475 390774;390775;390776 390774 3 NKQEVMISDLEER Unmodified 1589.7719 0.7719209 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 55.492 55.492 2;3 0.00051917 54850 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.57 93.425 306750000 0 53784000 61087000 0 0 0 0 0 49197000 0 91578000 51105000 0 33758 2379 31437 306476;306477;306478;306479;306480;306481;306482 390777;390778;390779;390780;390781;390782;390783 390779 6 NKYEDEINK Unmodified 1151.5459 0.54586736 1859;778;764;792;772;793 P04264;CON__P04264;CON__H-INV:HIT000016045;CON__P05787;P05787;CON__H-INV:HIT000292931;F8VUG2;F8W1U3;CON__Q9H552;F8VP67;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__Q8VED5;CON__P13647;P13647;F8W0C6;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2;CON__Q6IFZ6 KRT1;KRT8;KRT6C;KRT6A;KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 1;Keratin, type II cytoskeletal 8;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 5 no no 0 0 1 1 18.337 18.337 2 0.063528 10539 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.516 47.78 38183000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38183000 0 0 0 + 33759 1859;772;764;778;792;793 31438 306483 390784 390784 1 NKYEDEINKR Unmodified 1307.647 0.64697839 1859;778;764;792;772;793 P04264;CON__P04264;CON__H-INV:HIT000016045;CON__P05787;P05787;F8VUG2;F8W1U3;F8VP67;CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__Q8VED5;CON__P13647;P13647;F8W0C6;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2;CON__Q6IFZ6 KRT1;KRT8;KRT6C;KRT6A;KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 1;Keratin, type II cytoskeletal 8;Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 5 no no 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 17.173 17.173 2;3 7.6547E-17 9788 QUIQUE_DMIX7_190116_001 185.14 156.05 7776200000 0 283150000 344950000 355190000 0 429330000 0 834930000 809040000 1071400000 910680000 1123700000 1613800000 + 33760 1859;772;764;778;792;793 31439 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1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 40.208 40.208 2 0.003115 36270 QUIQUE_C1403_190116_001 86.136 71.929 470700000 0 0 80097000 83013000 0 0 66021000 31236000 47632000 49389000 70650000 42664000 0 33789 2031 31467 306723;306724;306725;306726;306727;306728;306729;306730 391056;391057;391058;391059;391060;391061;391062;391063;391064;391065;391066 391057 11 NLDDGIDDERLR Unmodified 1429.6797 0.67973508 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;Q9H361;H0YAP2 PABPC1;PABPC3 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 53.034 53.034 3 0.00034652 51428 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.362 57.508 186040000 0 0 0 0 0 0 0 40654000 0 0 61545000 51958000 31883000 33790 2031 31468 306731;306732;306733;306734 391067;391068;391069;391070;391071 391068 5 NLDDLTLLK Unmodified 1043.5863 0.58627561 3242 Q4VC31;C9JQ41;H7C525 CCDC58 Coiled-coil domain-containing protein 58 yes no 0 0 0 1 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391344;391345;391346;391347;391348;391349;391350;391351;391352;391353;391354;391355;391356;391357;391358;391359;391360;391361;391362;391363;391364;391365;391366;391367;391368;391369;391370;391371;391372;391373 391345 30 NLDQMKKQISDVER Oxidation (M) 1718.8621 0.8621329 279 H9KV28;A0A2R8Y5N1;A0A140T8Z0;A0A0G2JH68;O60610 DIAPH1 Protein diaphanous homolog 1 yes no 0 1 2 1 1 74.068 74.068 3 0.036732 74317 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.951 38.356 940700000 0 0 0 0 0 0 0 425520000 515170000 0 0 0 0 33814 279 31490 306944;306945 391374;391375 391374 2 NLDQSGTNVAK Unmodified 1145.5677 0.56766543 3993 Q9BQE5;J3KQL8 APOL2 Apolipoprotein L2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.012 17.012 2 8.9753E-05 9261 QUIQUE_C1403_190116_001 146.69 107.37 910550000 0 70677000 195250000 125260000 0 88919000 88839000 0 0 0 149870000 80293000 111450000 33815 3993 31491 306946;306947;306948;306949;306950;306951;306952;306953 391376;391377;391378;391379;391380;391381;391382;391383 391378 2 NLDRPHEPEK Unmodified 1233.6102 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391473;391474;391475;391476;391477;391478;391479;391480;391481;391482;391483;391484;391485;391486;391487;391488;391489;391490;391491;391492;391493;391494;391495;391496;391497;391498;391499;391500;391501;391502;391503;391504;391505;391506;391507;391508;391509;391510;391511;391512;391513;391514;391515 391506 42 NLEAIVQEIKPTALIGVAAIGGAFSEQILK Unmodified 3092.7485 0.74853692 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 3 2 2 1 170.91 170.91 3;4 7.9873E-119 178135 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.38 135.02 3029200000 41065000 135390000 537690000 44532000 103260000 59568000 315670000 78470000 366140000 0 596320000 531520000 219600000 33824 2504 31499 307035;307036;307037;307038;307039;307040;307041;307042;307043;307044;307045;307046;307047;307048;307049;307050;307051;307052 391516;391517;391518;391519;391520;391521;391522;391523;391524;391525;391526;391527;391528;391529;391530;391531;391532;391533 391529 17 NLEALALDLMEPEQAVDLTLPK Oxidation (M) 2438.2614 0.26144258 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391537;391538;391539;391540;391541;391542;391543;391544;391545;391546;391547;391548;391549;391550;391551;391552;391553;391554;391555;391556;391557;391558;391559;391560;391561;391562;391563;391564;391565;391566 391565 30 NLEAQHKELEEK Unmodified 1466.7365 0.73652168 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 1 1 1 1 2 13.01 13.01 2;3;4 8.4285E-126 5917 QUIQUE_DMIX1_190116_001 252.21 186.68 240710000 0 0 0 0 0 0 0 114980000 0 0 6201700 65713000 53819000 33827 3171 31501 307082;307083;307084;307085;307086 391567;391568;391569;391570;391571 391567 5 NLEAQHKELEEKR Unmodified 1622.8376 0.8376327 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 2 1 10.707 10.707 4 0.0010203 3084 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.042 48.638 13583000 0 0 0 0 0 0 0 13583000 0 0 0 0 0 33828 3171 31502 307087 391572 391572 1 NLEAVETLGSTSTICSDK Unmodified 1923.9095 0.9095366 590;1371;1872 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34 NLEGYVGFANLPNQVYRK Unmodified 2081.0694 0.069423554 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;A0A0U1RRD1 SEPT7 Septin-7 yes no 0 0 1 1 106.56 106.56 3 0.013026 108733 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.146 17.438 31687000 0 0 0 0 0 0 0 31687000 0 0 0 0 0 33834 3171 31508 307150 391648 391648 1 NLELQLK Unmodified 856.50182 0.5018177 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7;A0A3B3ITA2;A0A3B3IS27 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 1 54.299 54.299 2 0.053305 53586 QUIQUE_C1438_190116_001 73.039 4.1239 63008000 0 0 0 0 26330000 0 0 0 0 0 36678000 0 0 33835 2322 31509 307151;307152 391649;391650 391649 2 NLELSQIQEIVDCMYPVEYGK Unmodified 2527.1975 0.19746212 3035 Q13976 PRKG1 cGMP-dependent protein kinase 1 no no 0 0 0 1 166.6 166.6 3 0.0010813 170342 QUIQUE_C1277_190116_001 47.75 39.466 18493000 0 18493000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33836 3035 31510 307153 391651 391651 1 NLENDVNSLKDQLEDLK Unmodified 1985.9906 0.99056411 1610 O75116;E9PF63 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 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mitochondrial;Adenylate kinase 2, mitochondrial, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.029 38.029 2 0.019703 33445 QUIQUE_C1277_190116_001 77.923 22.246 597070000 56496000 76874000 0 93751000 73746000 77204000 79678000 45469000 0 29008000 0 64848000 0 33849 1047 31523 307190;307191;307192;307193;307194;307195;307196;307197;307198 391694;391695;391696;391697;391698;391699;391700;391701;391702;391703;391704 391695 11 NLEVLNFFNNQIEELPTQISSLQK Unmodified 2817.4549 0.45487409 3136 Q15404 RSU1 Ras suppressor protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 168.37 168.37 2;3 1.0874E-100 172827 QUIQUE_DMIX3_190116_001 245.96 228.68 4616400000 0 0 836270000 272970000 298510000 0 273520000 369720000 449540000 0 993810000 546130000 575890000 33850 3136 31524 307199;307200;307201;307202;307203;307204;307205;307206;307207;307208;307209;307210;307211;307212;307213;307214 391705;391706;391707;391708;391709;391710;391711;391712;391713;391714;391715;391716;391717;391718;391719;391720;391721 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yes 0 0 0 1 137.43 137.43 3 0.0084191 142374 QUIQUE_C1218_190116_001 46.318 31.886 22797000 22797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33853 4316 31527 307232 391739 391739 1 NLFAFFDMAYQGFASGDGDK Oxidation (M) 2215.9521 0.95207011 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 1 1 1 2 2 1 168.45 168.45 2;3 2.7736E-57 174464 QUIQUE_C1438_190116_001 176.89 169.99 376100000 65242000 80528000 41228000 29834000 83825000 0 68224000 0 0 7217800 0 0 0 33854 1788 31528 307233;307234;307235;307236;307237;307238;307239;307240;307241;307242 391740;391741;391742;391743;391744;391745;391746;391747;391748;391749;391750 391746 1005 10 NLFAFFDMAYQGFASGDGDKDAWAVR Oxidation (M) 2914.3021 0.30207862 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 167.13 167.13 3 1.8815E-127 174229 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.96 187.46 1050800000 0 38761000 0 0 39693000 0 223040000 95736000 122730000 0 196340000 199420000 135120000 33855 1788 31529 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acid transporter A yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.05 144.05 2 0.00043576 150985 QUIQUE_C1438_190116_001 94.297 75.924 1069600000 76740000 84073000 82288000 80658000 62656000 58370000 61236000 81163000 143730000 27060000 136870000 88716000 86026000 33868 2459 31541 307326;307327;307328;307329;307330;307331;307332;307333;307334;307335;307336;307337;307338;307339 391866;391867;391868;391869;391870;391871;391872;391873;391874;391875;391876;391877;391878;391879;391880;391881;391882;391883;391884;391885;391886;391887;391888;391889;391890;391891;391892;391893;391894;391895 391878 29 NLFQLAR Unmodified 860.48684 0.48683634 1625 O75351 VPS4B Vacuolar protein sorting-associated protein 4B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 72.772 72.772 2 0.019576 73054 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.06 69.208 204730000 40353000 39191000 46984000 0 0 37252000 0 40947000 0 0 0 0 0 33869 1625 31542 307340;307341;307342;307343;307344 391896;391897;391898;391899;391900;391901 391901 6 NLFQQYDR Unmodified 1082.5145 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391907;391908;391909;391910;391911;391912;391913;391914;391915;391916;391917;391918;391919;391920;391921;391922;391923;391924;391925;391926;391927;391928;391929;391930;391931;391932;391933;391934;391935;391936;391937;391938;391939;391940 391930 33 NLFYLPHGLSIDK Unmodified 1515.8086 0.80856441 2140 P19021;H7BYD9 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.05 109.05 3 0.006623 112123 QUIQUE_C1403_190116_001 43.548 31.839 149220000 31999000 19538000 25679000 22874000 19803000 29327000 0 0 0 0 0 0 0 33872 2140 31545 307375;307376;307377;307378;307379;307380 391941;391942;391943;391944;391945;391946;391947 391945 7 NLFYLPHGLSIDKDGNYWVTDVALHQVFK Unmodified 3388.7244 0.72444743 2140 P19021;H7BYD9 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes no 0 0 1 1 150.29 150.29 5 0.06288 154954 QUIQUE_DMIX7_190116_001 15.888 11.199 23597000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23597000 0 33873 2140 31546 307381 391948 391948 1 NLGELIDR Unmodified 928.49779 0.49779495 3331 Q5VIR6;F6VX93;E7EVT8 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 63.26 63.26 2 0.033381 61694 QUIQUE_C1563_190116_001 64.734 35.318 45511000 0 0 0 0 0 21681000 23830000 0 0 0 0 0 0 33874 3331 31547 307382;307383;307384;307385 391949;391950;391951;391952 391951 4 NLGESEIR Unmodified 916.46141 0.46140945 3095 Q15008;C9J0E9;C9J7B7 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.187 24.187 2 0.0036361 17469 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.88 63.362 1524700000 162460000 140640000 133820000 138190000 129830000 117050000 126510000 91796000 0 55302000 164220000 140430000 124470000 33875 3095 31548 307386;307387;307388;307389;307390;307391;307392;307393;307394;307395;307396;307397 391953;391954;391955;391956;391957;391958;391959;391960;391961;391962;391963;391964;391965;391966 391966 14 NLGIPIITVLGDSK Unmodified 1438.8395 0.83953018 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.89 139.89 2 0.0041206 145897 QUIQUE_C1576_190116_001 82.171 64.658 290540000 44650000 52277000 45259000 45246000 0 0 42644000 46293000 0 14172000 0 0 0 33876 3037 31549 307398;307399;307400;307401;307402;307403;307404 391967;391968;391969;391970;391971;391972;391973 391971 6 NLGIPLGQDAEEK Unmodified 1382.7042 0.70415892 3372 Q6NUK1;A0A3B3IU96;J3KN42 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.062 73.062 2 0.0061514 73926 QUIQUE_C1576_190116_001 64.73 44.953 139530000 0 0 0 35764000 0 28602000 28884000 0 0 8719700 37562000 0 0 33877 3372 31550 307405;307406;307407;307408;307409;307410 391974;391975;391976;391977;391978;391979;391980 391977 7 NLGLEELGIELDPR Unmodified 1566.8253 0.82533668 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 140.71 140.71 2;3 5.9193E-14 146864 QUIQUE_C1218_190116_001 176.18 142.22 7640000000 713330000 557110000 851440000 474910000 629040000 646000000 516420000 497210000 610180000 230230000 747010000 617230000 549920000 33878 1971 31551 307411;307412;307413;307414;307415;307416;307417;307418;307419;307420;307421;307422;307423;307424;307425;307426;307427;307428;307429 391981;391982;391983;391984;391985;391986;391987;391988;391989;391990;391991;391992;391993;391994;391995;391996;391997;391998;391999;392000;392001;392002;392003;392004;392005;392006;392007;392008;392009;392010;392011;392012;392013;392014;392015 391982 35 NLGLFIVK Unmodified 902.55894 0.55893865 3923 Q96Q11 TRNT1 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 96.68 96.68 2 0.026074 98474 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.912 42.384 116130000 27548000 0 19968000 0 0 0 0 20461000 22122000 0 0 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392666;392667;392668;392669;392670;392671;392672;392673;392674;392675;392676;392677;392678;392679;392680 392676 13 NLISPELGVVFFNVPEK Unmodified 1901.0299 0.02985015 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 154.47 154.47 2;3 9.9513E-06 160485 QUIQUE_C1218_190116_001 99.34 90.631 6838200000 370330000 535670000 605040000 297740000 580530000 506230000 633870000 463590000 483500000 207690000 938340000 755410000 460280000 33926 921 31595 307951;307952;307953;307954;307955;307956;307957;307958;307959;307960;307961;307962;307963;307964;307965;307966;307967;307968;307969;307970;307971;307972;307973;307974;307975 392681;392682;392683;392684;392685;392686;392687;392688;392689;392690;392691;392692;392693;392694;392695;392696;392697;392698;392699;392700;392701;392702;392703;392704;392705;392706;392707;392708;392709;392710;392711;392712;392713;392714;392715;392716;392717;392718;392719;392720;392721;392722 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(M) 2130.1143 0.11432484 2139 P18669 PGAM1 Phosphoglycerate mutase 1 yes yes 0 1 2 6 5 4 5 4 5 3 4 4 3 5 4 5 63.12 63.12 2;3;4 9.3987E-21 62971 QUIQUE_C1277_190116_001 142.38 103.12 21241000000 1736800000 1746700000 1606600000 1801400000 1327300000 1255500000 783530000 1261700000 1989200000 1213000000 2332500000 1937400000 2249300000 33930 2139 31599 308035;308036;308037;308038;308039;308040;308041;308042;308043;308044;308045;308046;308047;308048;308049;308050;308051;308052;308053;308054;308055;308056;308057;308058;308059;308060;308061;308062;308063;308064;308065;308066;308067;308068;308069;308070;308071;308072;308073;308074;308075;308076;308077;308078;308079;308080;308081;308082;308083;308084;308085;308086;308087;308088;308089;308090;308091 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24088000 0 0 33933 871 31601 308122 392901 392901 1 NLLDAVDQAK Unmodified 1085.5717 0.57168818 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 45.242 45.242 2 0.0098599 29236 QUIQUE_C1403_190116_001 69.628 37.018 124990000 28292000 0 44285000 36627000 0 0 0 0 0 15788000 0 0 0 33934 3060 31602 308123;308124;308125;308126;308127;308128;308129;308130;308131;308132 392902;392903;392904;392905;392906;392907;392908;392909;392910;392911 392906 9 NLLDEELQR Unmodified 1128.5775 0.57750184 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 78.845 78.845 2 2.7106E-07 79938 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.68 91.683 2158000000 0 0 0 0 0 0 0 618150000 690750000 0 849070000 0 0 33935 3117 31603 308133;308134;308135 392912;392913;392914 392913 3 NLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMK Unmodified 2717.3193 0.31930859 2915 Q08209;E9PPC8;E9PK68 PPP3CA Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 156.78 156.78 3 0.0069617 161371 QUIQUE_DMIX7_190116_001 30.592 23.717 47909000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47909000 0 33936 2915 31604 308136 392915 392915 1 NLLDSMVLITDK Unmodified 1360.7272 0.72720254 2366 P35052;H7C410;H7C024;H7BZL4 GPC1 Glypican-1;Secreted glypican-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 139.62 139.62 2 0.0010001 135702 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.17 49.638 247070000 52322000 0 49444000 41492000 0 42075000 51719000 0 0 10021000 0 0 0 33937 2366 31605 308137;308138;308139;308140;308141;308142 392916;392917;392918;392919;392920;392921;392922;392923 392923 8 NLLDVIDQAR Unmodified 1155.6248 0.62478638 865 H0YBP1;E7ESA6;Q05397;E9PEI4;H0YB16;H0YBZ1;E5RHD8;E5RI03;B4DWJ1 PTK2 Focal adhesion kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 117.75 117.75 2 0.015447 114359 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.643 29.335 54483000 20991000 22428000 0 0 0 0 0 0 0 11064000 0 0 0 33938 865 31606 308143;308144;308145;308146;308147;308148;308149;308150;308151;308152 392924;392925;392926;392927;392928;392929;392930;392931;392932;392933 392931 10 NLLEIHGSLFK Unmodified 1269.7081 0.70812208 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 89.847 89.847 2 0.055141 93318 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.022 26.76 48489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48489000 0 0 33939 4323 31607 308153 392934 392934 1 NLLEISGPETVPLPNVPSIALPSKPAK Unmodified 2780.5688 0.56878164 4164 Q9H444 CHMP4B Charged multivesicular body protein 4b yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.41 140.41 3 4.7058E-06 146643 QUIQUE_C1438_190116_001 55.67 48.477 567590000 80875000 85130000 72172000 94890000 89524000 77587000 47193000 0 0 20217000 0 0 0 33940 4164 31608 308154;308155;308156;308157;308158;308159;308160;308161 392935;392936;392937;392938;392939;392940;392941;392942;392943 392940 8 NLLELLINIK Unmodified 1181.7384 0.73835958 509 A0A3B3IUC0;Q9Y287 ITM2B Integral membrane protein 2B;BRI2, membrane form;BRI2 intracellular domain;BRI2C, soluble form;Bri23 peptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 160.65 160.65 2 0.00019619 164786 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Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;A0A2R8YF01;A0A1B0GXI6 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 1 1 129.31 129.31 3 1.6371E-14 133355 QUIQUE_C1277_190116_001 86.791 80.761 228560000 0 88616000 0 0 70173000 0 69768000 0 0 0 0 0 0 33943 4276 31611 308182;308183;308184 392975;392976;392977 392975 3 NLLFLQR Unmodified 902.53379 0.53378653 3257;1006 Q53HC0;F5H7P8;F5H285;F5H2Z7 CCDC92 Coiled-coil domain-containing protein 92 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.154 87.154 2 0.019819 89832 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.68 49.663 186300000 19514000 18596000 16848000 13344000 15321000 16982000 19731000 0 0 0 23529000 20838000 21599000 33944 3257;1006 31612 308185;308186;308187;308188;308189;308190;308191;308192;308193;308194 392978;392979;392980;392981;392982;392983;392984;392985;392986;392987 392985 10 NLLGLYPR Unmodified 944.54435 0.54435122 3019 Q13625;A0A3B3ISJ2;Q96KQ4 TP53BP2;PPP1R13B Apoptosis-stimulating of p53 protein 2;Apoptosis-stimulating of p53 protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.464 84.464 2 0.0036808 87115 QUIQUE_DMIX5_190116_001 122.79 105.5 150090000 0 22670000 0 24547000 0 27191000 0 0 0 0 23876000 26860000 24941000 33945 3019 31613 308195;308196;308197;308198;308199;308200;308201;308202 392988;392989;392990;392991;392992;392993;392994;392995;392996;392997;392998;392999 392996 12 NLLHAEFLR Unmodified 1111.6138 0.61382777 3888 Q96JC1 VPS39 Vam6/Vps39-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 67.012 67.012 3 0.0032388 66742 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.216 42.912 71786000 0 18249000 0 0 0 0 0 16845000 20580000 0 0 16111000 0 33946 3888 31614 308203;308204;308205;308206;308207;308208;308209;308210 393000;393001;393002;393003;393004;393005;393006;393007;393008 393004 9 NLLHHILSGK Unmodified 1130.656 0.65602693 550;2475 A6NMN0;P46020;A6NIT2;P46019 PHKA1;PHKA2 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform;Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, liver isoform no no 0 0 0 1 1 1 44.512 44.512 3 0.0094345 41618 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.433 35.146 54811000 0 0 31169000 0 0 0 0 0 0 0 0 23642000 0 33947 550;2475 31615 308211;308212;308213 393009;393010;393011 393011 3 NLLHVTDTGVGMTR Unmodified 1512.7719 0.77186132 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 63.707 63.707 2;3 1.2341E-07 63079 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.95 85.896 3817900000 431530000 433160000 360200000 438320000 148650000 365530000 242410000 114650000 222620000 80383000 454450000 225190000 300840000 33948 2079 31616 308214;308215;308216;308217;308218;308219;308220;308221;308222;308223;308224;308225;308226;308227;308228;308229;308230;308231;308232;308233;308234;308235;308236;308237 393012;393013;393014;393015;393016;393017;393018;393019;393020;393021;393022;393023;393024;393025;393026;393027;393028;393029;393030;393031;393032;393033;393034;393035;393036;393037;393038;393039 393029 27 NLLHVTDTGVGMTR Oxidation (M) 1528.7668 0.76677595 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 1 0 1 1 1 1 48.112 48.112 2;3 0.0010307 45841 QUIQUE_C1277_190116_001 80.69 55.304 208660000 0 59522000 0 0 59754000 0 0 0 89379000 0 0 0 0 33949 2079 31616 308238;308239;308240;308241 393040;393041;393042;393043 393040 1406 4 NLLHVTDTGVGMTREELVK Oxidation (M) 2127.0994 0.099403054 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 1 1 1 66.53 66.53 3 0.00041207 65538 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.82 55.193 28079000 0 0 0 0 0 0 0 28079000 0 0 0 0 0 33950 2079 31617 308242 393044 393044 1406 1 NLLIFENLIDLK Unmodified 1443.8337 0.83371653 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 161.65 161.65 2 0.011842 164155 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.069 50.633 43109000 0 8583300 0 0 0 0 0 10181000 24346000 0 0 0 0 33951 2813 31618 308243;308244;308245 393045;393046;393047 393046 3 NLLILYDAIGTLADSVGHHLNQPEYIQK Unmodified 3134.64 0.6400491 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 3 1 164.41 164.41 3;4 5.9205E-37 168342 QUIQUE_C1277_190116_001 121.86 110.65 2697600000 148170000 360380000 170550000 249710000 85594000 80435000 191780000 98013000 289840000 0 306300000 542190000 174580000 33952 1446 31619 308246;308247;308248;308249;308250;308251;308252;308253;308254;308255;308256;308257;308258;308259;308260;308261;308262 393048;393049;393050;393051;393052;393053;393054;393055;393056;393057;393058;393059;393060;393061;393062;393063;393064;393065;393066 393051 16 NLLIWIK Unmodified 898.56402 0.56402403 4021 Q9BTM9 URM1 Ubiquitin-related modifier 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 114.82 114.82 2 0.044362 119089 QUIQUE_C1368_190116_001 79.454 44.376 107190000 0 19059000 25716000 0 0 0 0 0 29184000 0 33232000 0 0 33953 4021 31620 308263;308264;308265;308266 393067;393068;393069;393070 393068 4 NLLLAEVINIIK Unmodified 1351.8439 0.84388728 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 3 2 2 3 2 2 2 166.21 166.21 2;3 1.052E-37 170331 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308296;308297;308298;308299;308300;308301;308302;308303;308304;308305 393110;393111;393112;393113;393114;393115;393116;393117;393118;393119;393120;393121;393122;393123 393119 14 NLLLLANSTEEQQK Unmodified 1599.8468 0.84680041 1610 O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.159 82.159 2 3.309E-11 83403 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.31 90.667 337610000 0 34285000 29061000 31655000 30955000 19918000 0 36600000 42381000 0 43270000 33531000 35956000 33956 1610 31623 308306;308307;308308;308309;308310;308311;308312;308313;308314;308315 393124;393125;393126;393127;393128;393129;393130;393131;393132;393133 393129 9 NLLLLGK Unmodified 769.50617 0.5061748 3832 Q96DB5;H0YC67;H0YC27;H0YBD9 RMDN1 Regulator of microtubule dynamics protein 1 yes no 0 0 0 1 1 72.139 72.139 2 0.064836 74072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.035 0 241310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53650000 0 187660000 33957 3832 31624 308316;308317 393134;393135 393134 2 NLLLSGAQLEASR Unmodified 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and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 169.41 169.41 3 5.963E-07 173446 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.33 84.463 62477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62477000 0 33963 144 31630 308347 393165 393165 1 NLLQVDLTK Unmodified 1042.6023 0.60226003 167;2126 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;P17612 PRKACB;PRKACA cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta;cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.773 81.773 2 0.0016498 83575 QUIQUE_C1576_190116_001 101.54 44.261 2948800000 240940000 301070000 255420000 227340000 237580000 178830000 245690000 186550000 262580000 110480000 279470000 205350000 217480000 33964 167;2126 31631 308348;308349;308350;308351;308352;308353;308354;308355;308356;308357;308358;308359;308360 393166;393167;393168;393169;393170;393171;393172;393173;393174;393175;393176;393177;393178 393172 11 NLLQVDLTKR Unmodified 1198.7034 0.70337105 167;2126 A0A0A0MS54;P22694;A0A087WVC4;P17612 PRKACB;PRKACA cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta;cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha no no 0 0 1 1 1 1 1 62.39 62.39 3 0.0024618 61761 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.363 27.968 218000000 0 0 0 0 0 0 0 60833000 68630000 0 49673000 38868000 0 33965 167;2126 31632 308361;308362;308363;308364 393179;393180;393181;393182 393181 4 NLLSCENSDR Unmodified 1206.5299 0.52989972 3950 Q99259;F8WD43;U3KQR2;C9J6C9;C9JT43;C9JLZ7 GAD1 Glutamate decarboxylase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 30.96 30.96 2 0.0020562 25302 QUIQUE_C1563_190116_001 92.062 74.198 107010000 0 30545000 0 38594000 0 37875000 0 0 0 0 0 0 0 33966 3950 31633 308365;308366;308367;308368;308369 393183;393184;393185;393186;393187 393186 5 NLLSFLR Unmodified 861.50724 0.50723743 1867 P04839;Q5H9D4;Q9Y5S8 CYBB;NOX1 Cytochrome b-245 heavy chain;NADPH oxidase 1 yes no 0 0 0 1 113.64 113.64 2 0.047361 117960 QUIQUE_C1368_190116_001 76.847 0 18848000 0 0 18848000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33967 1867 31634 308370 393188 393188 1 NLLSSWDEVIHIADQLR Unmodified 2008.0378 0.037789075 432 A0A2R8Y5Q8;Q15813;A0A2R8YHI9;A0A2R8YFL4;A0A2R8Y7E7;A0A2R8Y6Q1;A0A2R8Y4V6;A0A2R8Y784;A0A2R8YER9;A0A2R8Y809;A0A2R8Y897;A0A2R8Y6L2;A0A2R8Y4E7 TBCE Tubulin-specific chaperone E yes no 0 0 0 1 1 1 1 165.88 165.88 3 5.4244E-20 170158 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.23 79.95 115720000 0 37115000 0 0 0 0 0 15164000 43503000 0 0 0 19940000 33968 432 31635 308371;308372;308373;308374 393189;393190;393191;393192 393192 3 NLLSVAYK Unmodified 906.51747 0.51746776 2745;2780;2891;2341;2262;2736;2342 P27348;E9PG15;P31946;Q4VY20;Q4VY19;A0A0J9YWE8;A0A0J9YWZ2;P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1;P62258;B4DJF2;I3L3T1;K7EIT4;Q04917;A2IDB2;P61981;P31947 YWHAQ;YWHAB;YWHAZ;YWHAE;YWHAH;YWHAG;SFN 14-3-3 protein theta;14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein zeta/delta;14-3-3 protein epsilon;14-3-3 protein eta;14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed;14-3-3 protein sigma no no 0 0 0 2 3 2 1 3 2 3 1 2 2 1 2 3 63.6 63.6 1;2 0.0048629 62867 QUIQUE_C1277_190116_001 190.51 62.668 139110000000 12408000000 14545000000 8554300000 8189900000 10876000000 9078000000 12869000000 13472000000 8950700000 6932600000 9527900000 8502300000 15204000000 33969 2262;2341;2780;2745;2891;2736;2342 31636 308375;308376;308377;308378;308379;308380;308381;308382;308383;308384;308385;308386;308387;308388;308389;308390;308391;308392;308393;308394;308395;308396;308397;308398;308399;308400;308401 393193;393194;393195;393196;393197;393198;393199;393200;393201;393202;393203;393204;393205;393206;393207;393208;393209;393210;393211;393212;393213;393214;393215;393216;393217;393218;393219;393220;393221;393222;393223;393224;393225;393226;393227;393228;393229;393230;393231;393232;393233;393234;393235;393236;393237;393238;393239;393240;393241;393242;393243 393200 47 NLLSVAYKNVIGAR Unmodified 1516.8726 0.87256165 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1;K7EIT4 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 1 1 102.67 102.67 3 0.022254 106440 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33972 1534 31639 308409;308410 393253;393254 393253 2 NLLVAFR Unmodified 831.49667 0.49667274 3947 Q96T76;Q5T454;B0QZ77 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 78.895 78.895 2 0.019355 79728 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.69 24.106 101020000 0 14122000 0 0 24672000 18649000 0 22460000 21120000 0 0 0 0 33973 3947 31640 308411;308412;308413;308414;308415 393255;393256;393257;393258;393259 393258 5 NLLVNTLYTVR Unmodified 1304.7452 0.74523587 3747 Q92673;E9PKB0;E9PS32;E9PP43;E9PPB3 SORL1 Sortilin-related receptor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 106.41 106.41 2 0.0004904 109706 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.57 81.877 235420000 0 0 0 0 0 22467000 11089000 28739000 45533000 9627900 45153000 32706000 40100000 33974 3747 31641 308416;308417;308418;308419;308420;308421;308422;308423 393260;393261;393262;393263;393264;393265;393266;393267;393268;393269 393263 10 NLLVSVQSR Unmodified 1014.5822 0.58219329 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 50.559 50.559 2 0.025868 46649 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.981 13.263 84969000 0 0 0 0 0 0 0 0 20150000 8408100 26622000 29789000 0 33975 1187 31642 308424;308425;308426;308427 393270;393271;393272;393273 393271 4 NLLYEYAR Unmodified 1040.5291 0.52909508 1358 M0QWZ7;Q9NP81;B4DJM9;M0R2H5;M0R1C0 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 70.069 70.069 2 0.050863 70384 QUIQUE_C1218_190116_001 73.26 43.884 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33976 1358 31643 308428 393274 393274 1 NLLYVADSYNHK Unmodified 1435.7096 0.70957864 3623 Q8NBF2 NHLRC2 NHL repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 60.054 60.054 2;3 1.2596E-05 56661 QUIQUE_DMIX4_190116_001 150.08 122.33 249050000 0 0 0 54465000 39631000 0 28314000 56565000 39867000 30208000 0 0 0 33977 3623 31644 308429;308430;308431;308432;308433;308434 393275;393276;393277;393278;393279;393280 393280 4 NLMALAR Unmodified 787.43744 0.4374433 3958 Q99536;K7ESA3 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 49.616 49.616 2 0.019191 46392 QUIQUE_C1368_190116_001 112.56 17.89 803480000 150990000 161460000 157330000 198090000 0 135620000 0 0 0 0 0 0 0 33978 3958 31645 308435;308436;308437;308438;308439 393281;393282;393283;393284;393285 393283 5 NLMESLAQGAEEPK Unmodified 1515.7239 0.72390808 3967 Q99683 MAP3K5 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 95.279 95.279 2 0.0083343 98529 QUIQUE_C1576_190116_001 58.172 31.074 125180000 0 0 0 31134000 16958000 17212000 27991000 0 0 0 0 0 31889000 33979 3967 31646 308440;308441;308442;308443;308444 393286;393287;393288;393289;393290 393289 2 NLMFLVLR Unmodified 1004.5841 0.58410754 1553 O43776;K7EPK2;K7EQ35;K7EMQ6 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.02 129.02 2 0.0013185 135149 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.37 127.32 1206500000 109110000 111810000 100760000 74165000 88564000 0 93846000 88864000 113910000 0 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394734;394735;394736 394734 2666 1 NMDPLNDNVATLLHQSSDR Unmodified 2139.0015 0.0014799231 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 108.7 108.7 3 1.088E-16 113497 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.89 89.656 690370000 68149000 68584000 71124000 84786000 59943000 68162000 62450000 60081000 42798000 28700000 75591000 0 0 34124 2379 31780 309552;309553;309554;309555;309556;309557;309558;309559;309560;309561;309562;309563;309564 394737;394738;394739;394740;394741;394742;394743;394744;394745;394746;394747;394748;394749;394750 394749 13 NMDPLNDNVATLLHQSSDR Oxidation (M) 2154.9964 0.99639455 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 1 0 1 97.177 97.177 3 0.0061612 94046 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.384 30.634 33230000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33230000 0 0 0 34125 2379 31780 309565 394751 394751 1784 1 NMDPLNDNVTSLLNASSDK Unmodified 2046.9528 0.9527984 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 127.51 127.51 2 0.019996 131520 QUIQUE_C1277_190116_001 41.542 32.008 85271000 0 85271000 0 0 0 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394757;394758;394759;394760;394761;394762;394763;394764;394765;394766;394767;394768;394769;394770;394771;394772;394773;394774;394775;394776;394777;394778;394779;394780;394781;394782;394783;394784 394762 27 NMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGR Oxidation (M) 2204.893 0.89299211 2200 P22626 HNRNPA2B1 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes yes 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 48.295 48.295 2;3 7.8027E-196 46395 QUIQUE_DMIX5_190116_001 239.18 233.87 1225000000 73022000 99088000 97314000 103920000 84025000 87733000 51404000 105770000 94429000 70196000 125590000 106390000 126130000 34129 2200 31784 309595;309596;309597;309598;309599;309600;309601;309602;309603;309604;309605;309606;309607;309608;309609 394785;394786;394787;394788;394789;394790;394791;394792;394793;394794;394795;394796;394797;394798;394799;394800;394801;394802;394803 394801 1556 19 NMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGR Unmodified 2188.8981 0.89807748 2200 P22626 HNRNPA2B1 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 1 60.118 60.118 2;3 2.5608E-176 59382 QUIQUE_DMIX1_190116_001 297.7 292.55 4055600000 306820000 330080000 291150000 324730000 289300000 276410000 206980000 489380000 370640000 124030000 423140000 270990000 351990000 34130 2200 31784 309610;309611;309612;309613;309614;309615;309616;309617;309618;309619;309620;309621;309622;309623;309624;309625;309626;309627;309628 394804;394805;394806;394807;394808;394809;394810;394811;394812;394813;394814;394815;394816;394817;394818;394819;394820;394821;394822;394823;394824;394825;394826;394827;394828;394829 394817 25 NMGLYGER Unmodified 938.428 0.42800083 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.133 35.133 2 0.0036146 31680 QUIQUE_C1218_190116_001 126.67 107.94 3390200000 381980000 368460000 0 275260000 251710000 229130000 320330000 246860000 256520000 87515000 346350000 330750000 295290000 34131 1788 31785 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341 31787 309642;309643 394853;394854 394853 2 NMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTR Unmodified 2811.3718 0.37175486 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 143.42 143.42 2;3 6.9352E-27 149224 QUIQUE_C1218_190116_001 106.63 100.47 1210600000 102670000 130510000 137040000 106680000 100710000 96416000 89759000 68634000 67896000 0 89589000 112580000 108070000 34134 2529 31788 309644;309645;309646;309647;309648;309649;309650;309651;309652;309653;309654;309655;309656;309657;309658 394855;394856;394857;394858;394859;394860;394861;394862;394863;394864;394865;394866;394867;394868;394869;394870;394871 394855 15 NMITGTAPLDGCILVVAANDGPMPQTR Oxidation (M) 2827.3667 0.36666949 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 134.27 134.27 3 0.00034194 138060 QUIQUE_C1403_190116_001 51.621 40.098 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34135 2529 31788 309659 394872 394872 1970 1 NMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISK Oxidation (M) 2924.426 0.4259585 2794;469 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beta-8 chain-like protein LOC260334;Tubulin beta-6 chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.684 27.684 2 0.0010141 22478 QUIQUE_C1218_190116_001 107.66 103.31 52189000000 5178000000 6045900000 4037300000 3665000000 3881600000 3646900000 5715800000 3102400000 2771500000 1232700000 3703100000 4017800000 5191300000 34141 1862;1922;2797;3006;3030;3230;4033;4044 31791 309938;309939;309940;309941;309942;309943;309944;309945;309946;309947;309948;309949;309950 395212;395213;395214;395215;395216;395217;395218;395219;395220;395221;395222;395223;395224;395225;395226;395227;395228;395229;395230;395231;395232;395233;395234 395212 23 NMNKEDEGEITK Unmodified 1406.6348 0.63475872 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 14.203 14.203 2;3 2.2471E-36 5876 QUIQUE_C1563_190116_001 187.31 160.01 1282200000 0 0 77600000 49857000 0 193720000 8697200 126010000 433810000 37575000 56196000 185990000 112710000 34142 2233 31792 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(M) 1315.5173 0.51728612 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.572 54.572 2 0.0037798 50358 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.731 78.671 738250000 63706000 0 45676000 0 94817000 37368000 0 83756000 69578000 132550000 0 124480000 86310000 + 34147 1859 31796 310006;310007;310008;310009;310010;310011;310012;310013;310014 395291;395292;395293;395294;395295;395296;395297;395298;395299 395297 1071;1072 8 NMQDMVEDYR Unmodified 1299.5224 0.5223715 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 0 1 1 1 76.569 76.569 2 0.0062573 78114 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.71 70.633 466330000 0 0 0 0 0 0 0 0 111770000 107900000 246670000 0 0 + 34148 1859 31796 310015;310016;310017 395300;395301;395302 395302 0 NMQNAEEWFK Oxidation (M) 1311.5554 0.55538619 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 1 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 63.631 63.631 2 0.00018713 61995 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.52 115.93 1346500000 109840000 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1650.8148 0.81478877 2169 P20618 PSMB1 Proteasome subunit beta type-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 66.722 66.722 2;3 3.6305E-58 66767 QUIQUE_C1218_190116_001 198.97 110.79 469760000 82964000 110720000 0 0 0 0 0 261450000 0 14623000 0 0 0 34151 2169 31798 310048;310049;310050;310051;310052 395338;395339;395340;395341;395342 395338 5 NMSPDLR Unmodified 831.39089 0.39088704 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 1 1 23.814 23.814 2 0.055034 17213 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.138 41.953 483180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 203260000 279920000 34152 4418 31799 310053;310054 395343;395344 395344 1 NMSVIAHVDHGK Unmodified 1306.6452 0.64520425 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 19.117 19.117 2;3 9.0777E-14 11622 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.09 100.86 6703700000 468340000 748070000 751770000 818450000 553760000 659660000 102950000 489600000 596380000 162700000 164030000 554980000 633020000 34153 2058 31800 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395407;395408;395409;395410;395411;395412;395413;395414;395415;395416;395417;395418;395419;395420;395421;395422;395423;395424;395425;395426;395427;395428;395429;395430;395431;395432;395433 395420 384 26 NMVPQQALVIR Unmodified 1267.7071 0.70707622 590;1371;1872 P05023;Q5TC01;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2;Q13733;E9PRA5;B1AKY9;P50993 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A4;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.584 75.584 2 0.00037863 75781 QUIQUE_C1403_190116_001 117.04 103.27 4141300000 296080000 277760000 670320000 405560000 263700000 255550000 482470000 294640000 0 62461000 477540000 229390000 425870000 34159 1872;1371;590 31804 310136;310137;310138;310139;310140;310141;310142;310143;310144;310145;310146;310147 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A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 121.97 121.97 2;3 0.0034256 127517 QUIQUE_C1576_190116_001 55.688 49.118 369920000 0 0 0 56719000 34762000 38530000 48798000 46491000 0 0 56981000 0 87640000 34168 153 31813 310221;310222;310223;310224;310225;310226;310227;310228 395529;395530;395531;395532;395533;395534;395535;395536 395532 1 NNDFYVTGESYAGK Unmodified 1563.6842 0.68415175 4155 Q9H3G5;C9JLV0;C9J6L4;C9JI22 CPVL Probable serine carboxypeptidase CPVL yes no 0 0 0 1 1 1 1 69.48 69.48 2 4.1897E-05 69713 QUIQUE_C1403_190116_001 103.91 93.386 29402000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29402000 34169 4155 31814 310229;310230;310231;310232 395537;395538;395539;395540 395539 4 NNDLCYWVPELVR Unmodified 1676.7981 0.79807608 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 139.86 139.86 2 0.0017266 142864 QUIQUE_C1563_190116_001 93.821 71.623 56107000 0 34608000 0 0 21499000 0 0 0 0 0 0 0 0 34170 2441 31815 310233;310234;310235 395541;395542;395543 395543 3 NNEDISIIPPLFTVSVDHR Unmodified 2165.1117 0.1116823 2584 P51571;A6NLM8 SSR4 Translocon-associated protein subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 140.56 140.56 3 6.2923E-05 146528 QUIQUE_C1218_190116_001 74.519 68.809 938330000 81749000 147190000 130950000 0 0 96739000 153230000 68491000 91583000 31434000 75902000 0 61064000 34171 2584 31816 310236;310237;310238;310239;310240;310241;310242;310243;310244;310245;310246 395544;395545;395546;395547;395548;395549;395550;395551;395552;395553;395554;395555;395556 395544 11 NNEESPTATVAEQGEDITSK Unmodified 2118.9553 0.95530082 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 64.22 64.22 2 6.5072E-66 63614 QUIQUE_C1403_190116_001 220.21 211.01 166480000 0 31251000 36376000 48071000 0 50780000 0 0 0 0 0 0 0 34172 2998 31817 310247;310248;310249;310250 395557;395558;395559;395560 395559 4 NNEESPTATVAEQGEDITSKK Unmodified 2247.0503 0.050263834 2998 Q13451 FKBP5 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP5, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 53.356 53.356 3 0.0011842 50990 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.123 35.171 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34173 2998 31818 310251 395561 395561 1 NNEGTYYSPNYNPQSR Unmodified 1902.8133 0.81326845 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 51.877 51.877 2 1.1014E-05 49954 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.02 121.05 132460000 0 0 0 0 77947000 0 0 0 0 22575000 31942000 0 0 34174 1784 31819 310252;310253;310254 395562;395563;395564 395564 3 NNEVWLIQK Unmodified 1142.6084 0.60840804 4638 Q9Y5Z4 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.819 73.819 2 0.0020914 73431 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.82 78.265 1510700000 150710000 0 142800000 136580000 0 113910000 149330000 145760000 134400000 46354000 177910000 139050000 173850000 34175 4638 31820 310255;310256;310257;310258;310259;310260;310261;310262;310263;310264;310265 395565;395566;395567;395568;395569;395570;395571;395572;395573;395574;395575;395576;395577;395578 395578 14 NNFAVGYR Unmodified 939.45626 0.45626449 2469 P45880;A0A0A0MR02;Q5JSD2;Q5JSD1 VDAC2 Voltage-dependent anion-selective channel protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.688 37.688 2 1.4041E-14 33194 QUIQUE_C1563_190116_001 187.72 107.16 13739000000 1050000000 978920000 1125200000 1024800000 841630000 975590000 1254200000 942290000 1136100000 339850000 1572100000 1174100000 1324700000 34176 2469 31821 310266;310267;310268;310269;310270;310271;310272;310273;310274;310275;310276;310277;310278 395579;395580;395581;395582;395583;395584;395585;395586;395587;395588;395589;395590;395591;395592;395593 395584 15 NNFEGEVTKENLLDFIK Unmodified 2009.0106 0.010571271 1917 P07237;H7BZ94;I3L312;I3L398;I3L4M2;I3NI03 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 126.6 126.6 3 1.4588E-06 130723 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.429 79.719 504680000 0 14187000 0 0 0 0 33853000 88231000 112330000 0 141880000 0 114190000 34177 1917 31822 310279;310280;310281;310282;310283;310284 395594;395595;395596;395597;395598;395599 395597 6 NNFLIQMFHYIK Unmodified 1566.8017 0.80170489 2468 P45381 ASPA Aspartoacylase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 1 137.96 137.96 2;3 0.00014258 141497 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.15 94.216 378050000 13367000 15008000 73391000 0 16349000 0 0 65840000 45380000 0 85478000 45604000 17637000 34178 2468 31823 310285;310286;310287;310288;310289;310290;310291;310292;310293;310294;310295;310296;310297;310298 395600;395601;395602;395603;395604;395605;395606;395607;395608;395609;395610;395611;395612;395613 395606 14 NNGAGYFLEHLAFK Unmodified 1579.7783 0.77832691 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 113.08 113.08 2;3 0.0016556 116392 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.185 50.205 423310000 180460000 0 0 0 0 0 0 0 0 103290000 139560000 0 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alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 40.461 40.461 2 0.0040378 36686 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.61 86.457 112280000 0 0 0 0 37517000 0 0 0 0 0 40076000 0 34689000 34203 2140 31847 310496;310497;310498;310499;310500;310501;310502 395874;395875;395876;395877;395878;395879;395880 395880 7 NNNIDAAIENIENMLTSENK Unmodified 2246.0485 0.048489695 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 167.66 167.66 2;3 3.7099E-56 169545 QUIQUE_DMIX1_190116_001 207.72 186.42 543320000 98291000 106270000 0 0 16649000 29067000 69884000 70361000 73349000 0 0 29959000 49485000 34204 2452 31848 310503;310504;310505;310506;310507;310508;310509;310510;310511;310512;310513;310514 395881;395882;395883;395884;395885;395886;395887;395888;395889;395890;395891;395892;395893 395887 12 NNNQQLAQLQK Unmodified 1297.6739 0.67386184 4551 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396017;396018;396019;396020;396021;396022;396023;396024;396025;396026;396027;396028;396029;396030;396031;396032;396033;396034;396035;396036;396037;396038;396039;396040;396041 396019 23 NNSGLSFEELYR Unmodified 1427.6681 0.66810776 3017 Q13618;H7C1L6;A0A087X1R9 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.085 97.085 2 0.0040695 100817 QUIQUE_C1218_190116_001 72.2 58.431 60229000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60229000 0 34224 3017 31868 310648;310649;310650;310651;310652;310653 396042;396043;396044;396045;396046;396047 396042 6 NNSNDIVNAIMELTM Oxidation (M) 1693.7651 0.76512097 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3 NACA Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.55 172.55 2 1.7553E-18 174024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.17 128.73 230870000 19371000 21164000 17162000 17919000 25022000 0 0 25477000 21912000 0 19686000 21126000 42031000 34225 892 31869 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27 NPCQDPYILTPENR Unmodified 1715.7937 0.79371898 314 A0A0U1RQV3;Q12805 EFEMP1 EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1 yes no 0 0 0 1 69.911 69.911 2 2.2916E-10 70241 QUIQUE_C1368_190116_001 134.08 119.66 26787000 0 0 26787000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34249 314 31891 310829 396246 396246 1 NPDDITNEEYGEFYK Unmodified 1832.7741 0.77408897 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 99.651 99.651 2 1.7202E-146 95594 QUIQUE_C1277_190116_001 281.99 281.99 32717000000 2224700000 2772900000 2089200000 2407800000 2492000000 2879700000 3058100000 2169200000 1951900000 1328800000 3757700000 2766700000 2818100000 34250 1931 31892 310830;310831;310832;310833;310834;310835;310836;310837;310838;310839;310840;310841;310842;310843;310844;310845 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396358;396359;396360;396361;396362;396363;396364;396365;396366;396367;396368;396369;396370 396358 13 NPEFTSGLAIASYR Unmodified 1524.7573 0.75725712 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 1 98.892 98.892 2 2.256E-07 103040 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.37 73.84 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34259 119 31901 310918;310919;310920 396371;396372;396373 396373 3 NPEHFVVCNR Unmodified 1270.5877 0.58768937 3217 Q2TAY7 SMU1 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.793 23.793 2 3.0517E-05 16759 QUIQUE_C1277_190116_001 145.72 126.45 107150000 28820000 23308000 0 0 0 0 0 25307000 0 0 0 29713000 0 34260 3217 31902 310921;310922;310923;310924;310925;310926;310927;310928;310929;310930 396374;396375;396376;396377;396378;396379;396380;396381;396382;396383 396375 10 NPEILAIAPVLLDALTDPSR Unmodified 2117.1732 0.17321992 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 2 1 1 1 172.44 172.44 2;3 1.4847E-29 176661 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.1 111.27 351110000 0 10735000 140910000 0 38899000 0 28692000 16698000 42466000 3637800 0 35190000 33881000 34261 3740 31903 310931;310932;310933;310934;310935;310936;310937;310938;310939;310940;310941;310942 396384;396385;396386;396387;396388;396389;396390;396391;396392;396393;396394;396395;396396 396392 12 NPEISHLLNNPDIMR Unmodified 1761.8832 0.88320269 4433 Q9UHD9 UBQLN2 Ubiquilin-2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 1 1 91.717 91.717 2;3 5.586E-24 92940 QUIQUE_C1403_190116_001 154.07 130.46 347370000 96931000 51282000 0 104730000 0 0 0 94420000 0 0 0 0 0 34262 4433 31904 310943;310944;310945;310946;310947;310948;310949;310950;310951;310952;310953;310954;310955;310956;310957 396397;396398;396399;396400;396401;396402;396403;396404;396405;396406;396407;396408;396409;396410;396411;396412;396413 396405 17 NPEISHMLNNPDIMR Unmodified 1779.8396 0.83962331 4503 Q9UMX0 UBQLN1 Ubiquilin-1 yes yes 0 0 0 1 82.185 82.185 2 0.0016734 83499 QUIQUE_C1277_190116_001 82.202 56.816 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34263 4503 31905 310958 396414 396414 1 NPELEFQDK Unmodified 1118.5244 0.52440364 3782 Q93100;I3L1N3 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes no 0 0 0 1 47.221 47.221 2 0.027639 41961 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.708 34.666 23763000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23763000 0 0 0 34264 3782 31906 310959 396415 396415 1 NPELQNLLLDDFFK Unmodified 1704.8723 0.87228688 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 161.99 161.99 2;3 6.5303E-132 166333 QUIQUE_DMIX8_190116_001 284.15 235.87 6457000000 700460000 504670000 737320000 572600000 521740000 556480000 641230000 362660000 327310000 284810000 558940000 243150000 445640000 34265 2602 31907 310960;310961;310962;310963;310964;310965;310966;310967;310968;310969;310970;310971;310972;310973;310974;310975;310976;310977;310978;310979;310980;310981 396416;396417;396418;396419;396420;396421;396422;396423;396424;396425;396426;396427;396428;396429;396430;396431;396432;396433;396434;396435;396436;396437;396438;396439;396440;396441;396442 396442 26 NPELRGSSGGALDPNTR Unmodified 1739.8551 0.85507368 3236 Q4G0P3 HYDIN Hydrocephalus-inducing protein homolog yes yes 0 0 1 1 10.63 10.63 4 0.045126 3072 QUIQUE_C1576_190116_001 20.939 10.774 10436000 0 0 0 0 0 0 10436000 0 0 0 0 0 0 34266 3236 31908 310982 396443 396443 1 NPELVPQNYISDSLAQSVVQHLR Unmodified 2606.3453 0.34526406 523 A3KMH1 VWA8 von Willebrand factor A domain-containing protein 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 141.93 141.93 3 0.00098512 149196 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.672 34.416 83669000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39711000 43958000 0 34267 523 31909 310983;310984;310985 396444;396445;396446 396445 2 NPEPELLVR Unmodified 1065.5819 0.58185894 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.752 58.752 2 0.00014103 57680 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396469 15 NPEQVDLYQFMAK Unmodified 1581.7497 0.7497289 2677 P56192 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 113.96 113.96 2 0.0013566 119343 QUIQUE_C1438_190116_001 101.38 77.229 193250000 0 0 53269000 39378000 58025000 0 0 0 0 0 0 0 42575000 34270 2677 31912 311012;311013;311014;311015;311016;311017 396480;396481;396482;396483;396484;396485 396483 5 NPESGYIEVEHCHGECVADTQLCGAR Unmodified 2987.2596 0.25963823 4191 Q9H977 WDR54 WD repeat-containing protein 54 yes yes 0 0 0 1 2 65.486 65.486 3;4 5.5091E-99 65376 QUIQUE_C1576_190116_001 179.38 152.23 197190000 0 0 0 44683000 0 0 152510000 0 0 0 0 0 0 34271 4191 31913 311018;311019;311020 396486;396487;396488 396488 3 NPETGLDLPQLVYHVENEGAAGVDR Unmodified 2692.3093 0.30927249 2531 P49441 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.01 136.01 3 1.6019E-98 138948 QUIQUE_C1563_190116_001 153.94 134.89 1342900000 0 0 110890000 137260000 108400000 101600000 123020000 132200000 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311033;311034;311035;311036;311037;311038;311039;311040;311041;311042;311043;311044;311045;311046;311047;311048 396506;396507;396508;396509;396510;396511;396512;396513;396514;396515;396516;396517;396518;396519;396520;396521;396522;396523;396524;396525 396516 20 NPFGLVPVLENSQGQLIYESAITCEYLDEAYPGK Unmodified 3813.8448 0.84475808 2812 P78417;Q5TA02;Q5TA01 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 0 1 1 169.71 169.71 3 1.2384E-05 173348 QUIQUE_C1277_190116_001 44.564 40.077 65328000 0 36502000 0 0 28826000 0 0 0 0 0 0 0 0 34275 2812 31917 311049;311050 396526;396527 396526 2 NPFGLVPVLENSQGQLIYESAITCEYLDEAYPGKK Unmodified 3941.9397 0.9397211 2812 P78417;Q5TA02;Q5TA01 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 165.45 165.45 3 7.8319E-66 169333 QUIQUE_C1277_190116_001 135.32 127.45 205780000 0 74809000 0 25786000 43029000 0 0 25408000 0 0 0 0 36745000 34276 2812 31918 311051;311052;311053;311054;311055;311056 396528;396529;396530;396531;396532;396533 396528 6 NPFGNAGLLLGEAGK Unmodified 1456.7674 0.76742787 2539 P49748;G3V1M7 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 113.61 113.61 2 2.0401E-35 116441 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.68 145.9 2234300000 147940000 120630000 190580000 133570000 141390000 146020000 147560000 219060000 223880000 118330000 218610000 190970000 235710000 34277 2539 31919 311057;311058;311059;311060;311061;311062;311063;311064;311065;311066;311067;311068;311069;311070 396534;396535;396536;396537;396538;396539;396540;396541;396542;396543;396544;396545;396546;396547;396548;396549;396550;396551;396552;396553;396554;396555;396556;396557;396558;396559;396560;396561 396550 27 NPFTLGDSSNPGQTER Unmodified 1718.786 0.78599106 1226 H7C0E5;O75312 ZPR1 Zinc finger protein ZPR1 yes no 0 0 0 1 1 1 63.219 63.219 2 0.00012113 62697 QUIQUE_C1368_190116_001 92.039 81.807 78028000 0 0 26938000 29047000 0 0 0 0 0 0 0 0 22044000 34278 1226 31920 311071;311072;311073 396562;396563;396564 396562 2 NPFYSLEMPIR Unmodified 1365.6751 0.67510739 4550 Q9Y296;E9PQE8;E9PKS9;E9PN70 TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 118.42 118.42 2 0.012526 121649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.081 42.562 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34279 4550 31921 311074;311075;311076 396565;396566;396567 396565 3 NPGFEIIHGLLDR Unmodified 1479.7834 0.78341229 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 2 2 2 5 2 2 119.98 119.98 2;3 3.7533E-41 124193 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.81 164.43 4003200000 292290000 381490000 403500000 92105000 141040000 543900000 411920000 198640000 237500000 75475000 537930000 338430000 348970000 34280 4284 31922 311077;311078;311079;311080;311081;311082;311083;311084;311085;311086;311087;311088;311089;311090;311091;311092;311093;311094;311095;311096;311097;311098;311099;311100;311101;311102;311103 396568;396569;396570;396571;396572;396573;396574;396575;396576;396577;396578;396579;396580;396581;396582;396583;396584;396585;396586;396587;396588;396589;396590;396591;396592;396593;396594;396595;396596;396597;396598;396599;396600;396601;396602;396603;396604;396605;396606;396607;396608 396590 38 NPGFYVEANPMPTFK Unmodified 1710.8076 0.80757813 2143 P19174 PLCG1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase gamma-1 yes yes 0 0 0 1 111.55 111.55 2 0.0019925 115921 QUIQUE_C1368_190116_001 66.267 52.458 33926000 0 0 33926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34281 2143 31923 311104 396609 396609 1 NPGGWVEK Unmodified 885.43447 0.43446642 1371 M0R116;P13637 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 23.859 23.859 2 0.062222 17428 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.716 20.781 192880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 119480000 73400000 0 34282 1371 31924 311105;311106 396610;396611 396611 2 NPGGWWEGELQAR Unmodified 1498.6953 0.69532556 3161 Q15811;F8W7U0;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000001528 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.66 101.66 2 0.0017146 106099 QUIQUE_C1438_190116_001 91.855 67.511 285430000 38751000 37820000 38853000 34453000 28786000 36520000 39363000 0 0 0 30889000 0 0 + 34283 3161 31925 311107;311108;311109;311110;311111;311112;311113;311114 396612;396613;396614;396615;396616;396617;396618;396619 396616 7 NPGNQAAYEHFETMK Unmodified 1735.7624 0.76241885 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 49.423 49.423 2;3 1.3319E-18 47409 QUIQUE_C1438_190116_001 146.5 132.69 1807400000 126230000 191060000 264050000 30390000 195080000 136670000 197330000 127590000 114340000 0 140870000 98128000 185620000 34284 2135 31926 311115;311116;311117;311118;311119;311120;311121;311122;311123;311124;311125;311126;311127;311128;311129;311130;311131;311132;311133;311134;311135 396620;396621;396622;396623;396624;396625;396626;396627;396628;396629;396630;396631;396632;396633;396634;396635;396636;396637;396638;396639;396640;396641;396642 396629 18 NPGNQAAYEHFETMK Oxidation (M) 1751.7573 0.75733347 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 1 0 1 34.045 34.045 3 0.0033117 29744 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.334 47.443 45800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45800000 0 0 34285 2135 31926 311136 396643 396643 1481 1 NPGSSGTGGTATWKPGSSGPGSTGSWNSGSSGTGSTGNQNPGSPR Unmodified 4119.8139 0.81389675 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 1 2 2 2 60.133 60.133 3;4 3.1912E-263 58762 QUIQUE_C1277_190116_001 223.86 220.18 319510000 0 116720000 0 0 0 0 94448000 0 0 108340000 0 0 0 34286 1823 31927 311137;311138;311139;311140;311141;311142 396644;396645;396646;396647;396648;396649 396645 6 NPGSVAENNLCSQYEEK Unmodified 1937.8425 0.84251967 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9;H9KVD0;H9KVC4 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 55.589 55.589 2 2.6762E-247 54331 QUIQUE_DMIX1_190116_001 341.27 317.6 384220000 0 0 134070000 0 35734000 0 56718000 32748000 0 0 124950000 0 0 34287 2168 31928 311143;311144;311145;311146;311147 396650;396651;396652;396653;396654;396655 396653 6 NPGYPQSEGLLGECMIR Unmodified 1919.887 0.88696744 3981 Q99961;M0R0I3;M0QYE0 SH3GL1 Endophilin-A2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.74 103.74 2 1.4792E-22 106824 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.36 120.92 747590000 64154000 83848000 95862000 70545000 49983000 56079000 64934000 46594000 45380000 14661000 61089000 50585000 43878000 34288 3981 31929 311148;311149;311150;311151;311152;311153;311154;311155;311156;311157;311158;311159;311160 396656;396657;396658;396659;396660;396661;396662;396663;396664;396665;396666;396667;396668;396669 396664 14 NPHNDRFVLSK Unmodified 1325.684 0.6840326 2288 P29401;E9PFF2;F8W888 TKT Transketolase yes no 0 0 1 1 17.524 17.524 3 0.032938 10316 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.879 26.238 266730000 0 0 0 0 0 0 0 266730000 0 0 0 0 0 34289 2288 31930 311161 396670 396670 1 NPHPSSAFLNLIGFVSR Unmodified 1854.9741 0.97406661 2620 P53004;C9J1E1 BLVRA Biliverdin reductase A yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 136.45 136.45 2;3 1.4206E-12 139516 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.392 92.501 4608200000 393730000 300360000 425070000 341510000 283550000 299620000 356930000 302740000 454750000 142940000 511800000 387220000 408000000 34290 2620 31931 311162;311163;311164;311165;311166;311167;311168;311169;311170;311171;311172;311173;311174;311175;311176;311177;311178;311179;311180;311181;311182;311183;311184;311185 396671;396672;396673;396674;396675;396676;396677;396678;396679;396680;396681;396682;396683;396684;396685;396686;396687;396688;396689;396690;396691;396692;396693;396694;396695;396696 396685 25 NPHVALYALEVMESVVK Unmodified 1897.9972 0.99716981 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 0 1 151.78 151.78 3 0.03071 157463 QUIQUE_C1576_190116_001 40.493 34.288 24214000 0 0 0 0 0 0 24214000 0 0 0 0 0 0 34291 1464 31932 311186 396697 396697 0 NPIHAIGLLIR Unmodified 1215.7452 0.74517629 1071 G3V198;Q12769;E9PR16 NUP160 Nuclear pore complex protein Nup160 yes no 0 0 0 1 85.109 85.109 3 0.012812 88118 QUIQUE_C1438_190116_001 46.706 24.232 16422000 0 0 0 0 16422000 0 0 0 0 0 0 0 0 34292 1071 31933 311187 396698 396698 1 NPILWNVADVVIKFPEEEAPSTVLSQNLFTPK Unmodified 3594.8974 0.897386 1869 P04844;H0Y5M1;Q5JYR3 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 1 1 168.21 168.21 3 1.9709E-06 175633 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.968 39.739 98870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 98870000 0 0 34293 1869 31934 311188 396699 396699 1 NPITGFGK Unmodified 832.4443 0.44430282 3283 Q5JXI8 FHL1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 37.987 37.987 1;2 0.012845 33922 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.8 115.57 5155500000 686500000 715850000 0 481370000 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H4;70 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4;35 kDa inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H4 yes no 0 0 0 1 71.143 71.143 3 0.012098 72569 QUIQUE_C1438_190116_001 48.623 42.022 120300000 0 0 0 0 120300000 0 0 0 0 0 0 0 0 34299 669 31940 311233 396748 396748 0 NPMALYILK Unmodified 1061.5943 0.59433788 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 0 1 96.889 96.889 2 0.021021 99383 QUIQUE_C1277_190116_001 62.464 35.327 51754000 0 51754000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34300 3093 31941 311234 396749 396749 1 NPMVETLGTVLQLK Unmodified 1541.8487 0.84871466 2898 Q06124;A0A1W2PPU4;H0YF12 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 1 2 138.21 138.21 2;3 2.3171E-22 143468 QUIQUE_C1368_190116_001 164.04 140.19 839760000 79895000 87973000 74124000 85342000 80039000 76462000 79422000 68884000 86647000 17979000 103000000 0 0 34301 2898 31942 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NPNTSEPQHLLVMK Oxidation (M) 1622.8086 0.80864076 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 1 0 1 34.593 34.593 2 0.044441 30318 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.718 40.452 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34306 1872 31945 311328 396871 396871 1 NPPAFTELQLPR Unmodified 1381.7354 0.73539946 3369 Q6L8Q7;F6T1Q0 PDE12 2',5'-phosphodiesterase 12 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 102.79 102.79 2 0.0040822 107212 QUIQUE_C1218_190116_001 87.298 73.091 268150000 35897000 30450000 51568000 0 58981000 0 0 29321000 0 0 0 61930000 0 34307 3369 31946 311329;311330;311331;311332;311333;311334;311335 396872;396873;396874;396875;396876;396877;396878 396872 4 NPPEQLPIVLQVLLSQVHR Unmodified 2179.2477 0.24772227 3568 Q8N122 RPTOR Regulatory-associated protein of mTOR yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.24 165.24 3 1.2297E-22 169065 QUIQUE_C1277_190116_001 132.79 110.36 612150000 44188000 66086000 48504000 60459000 99958000 23851000 78493000 30415000 52118000 10556000 37678000 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396893;396894;396895;396896;396897;396898;396899;396900;396901;396902;396903;396904;396905;396906;396907;396908;396909;396910;396911;396912;396913;396914;396915;396916;396917;396918;396919;396920;396921;396922;396923;396924;396925 396908 32 NPPGFAFVEFEDPRDAADAVR Unmodified 2319.092 0.09200949 2831 P84103;A0A087X2D0 SRSF3 Serine/arginine-rich splicing factor 3 yes no 0 0 1 2 2 2 1 129.09 129.09 2;3 1.4138E-97 135423 QUIQUE_DMIX5_190116_001 197.19 163.5 1170800000 0 0 0 0 0 0 0 282050000 0 0 366950000 296490000 225280000 34310 2831 31949 311369;311370;311371;311372;311373;311374;311375 396926;396927;396928;396929;396930;396931;396932;396933 396930 8 NPPGFAFVEFEDPRDAEDAVR Unmodified 2377.0975 0.097488798 208 A0A0B4J1Z1;C9JAB2;Q16629 SRSF7 Serine/arginine-rich splicing factor 7 yes no 0 0 1 1 1 1 128.3 128.3 3 0.0058181 132613 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.592 41.405 592330000 0 0 0 0 0 0 0 182670000 192910000 0 216750000 0 0 34311 208 31950 311376;311377;311378 396934;396935;396936 396935 1 NPPIDDLIK Unmodified 1023.5601 0.56006086 1420;1413 O00629;O00505 KPNA4;KPNA3 Importin subunit alpha-3;Importin subunit alpha-4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 73.614 73.614 2 0.0080372 73081 QUIQUE_C1563_190116_001 79.906 47.971 346470000 50733000 55560000 0 61768000 44673000 51448000 53193000 0 0 29099000 0 0 0 34312 1420;1413 31951 311379;311380;311381;311382;311383;311384;311385;311386 396937;396938;396939;396940;396941;396942;396943;396944;396945;396946;396947;396948 396945 11 NPPPNADPNMK Unmodified 1193.5499 0.54990688 909 E9PEB5;Q96AE4 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 16.903 16.903 2 0.0054711 9128 QUIQUE_C1368_190116_001 68.846 52.07 116810000 0 29004000 27997000 26092000 14122000 19590000 0 0 0 0 0 0 0 34313 909 31952 311387;311388;311389;311390;311391 396949;396950;396951;396952;396953 396950 5 NPPPNSDPNLR Unmodified 1219.5945 0.59454889 3875 Q96I24 FUBP3 Far upstream element-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 19.586 19.586 2 0.040632 12272 QUIQUE_C1218_190116_001 47.187 27.046 31351000 31351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34314 3875 31953 311392 396954 396954 1 NPQAHIEGNMK Unmodified 1237.5874 0.58735502 1583 O60547 GMDS GDP-mannose 4,6 dehydratase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 14.654 14.654 2;3 0.00066444 6449 QUIQUE_C1277_190116_001 98.055 80.815 163540000 35611000 11406000 0 0 0 16625000 26916000 0 15917000 0 0 16991000 40068000 34315 1583 31954 311393;311394;311395;311396;311397;311398;311399;311400;311401;311402;311403 396955;396956;396957;396958;396959;396960;396961;396962;396963;396964;396965 396957 10 NPQAVLDVLEFYNSK Unmodified 1735.8781 0.87810054 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCM0 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 144.08 144.08 2 6.8463E-12 140325 QUIQUE_DMIX4_190116_001 127.17 111.8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34316 2970 31955 311404;311405;311406 396966;396967;396968 396968 3 NPQAVLDVLK Unmodified 1095.6288 0.62880913 2974;120 A0A087X294;O75914;B1AKS5;Q13177 PAK3;PAK2 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3;Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 no no 0 0 0 1 1 84.23 84.23 2 0.0038166 86547 QUIQUE_C1438_190116_001 96.143 79.367 47157000 0 0 0 0 20681000 0 0 0 0 26475000 0 0 0 34317 120;2974 31956 311407;311408 396969;396970 396969 2 NPQDEQERIEER Unmodified 1541.707 0.70701246 902;1134 E9PCH6;H0YAG3;H0Y931 ANK2 no no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 20.737 20.737 2;3 0.00029199 14298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.77 79.985 2024700000 22222000 189210000 0 0 146110000 0 192640000 234210000 406530000 23011000 257990000 316090000 236720000 34318 902;1134 31957 311409;311410;311411;311412;311413;311414;311415;311416;311417;311418;311419;311420 396971;396972;396973;396974;396975;396976;396977;396978;396979;396980;396981;396982 396976 7 NPQELYDVYCFAR Unmodified 1673.7508 0.75079153 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.01 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397512;397513;397514;397515;397516;397517 397513 6 NQAPPGLYTK Unmodified 1087.5662 0.56620887 1797 P00966 ASS1 Argininosuccinate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 28.84 28.84 2 0.0067527 23499 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.173 56.109 555590000 0 0 0 0 0 0 209550000 187330000 0 0 0 158710000 0 34365 1797 32002 311830;311831;311832;311833 397518;397519;397520;397521;397522 397520 5 NQCTQVVQER Unmodified 1260.5881 0.5880833 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 18.21 18.21 2 0.017913 10645 QUIQUE_C1576_190116_001 70.1 38.166 27957000 0 0 0 0 0 0 27957000 0 0 0 0 0 0 34366 2096 32003 311834 397523 397523 1 NQDAAQQFLGR Unmodified 1246.6054 0.60544792 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 56.923 56.923 2 3.7676E-24 55709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 180.44 151.28 327880000 0 0 0 0 0 0 0 78032000 0 0 140690000 109150000 0 34367 1472 32004 311835;311836;311837;311838 397524;397525;397526;397527 397526 3 NQDATVYVGGLDEK Unmodified 1507.7155 0.71545188 3139 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397561;397562;397563;397564;397565;397566;397567;397568;397569;397570 397568 6 NQDNLQGWNK Unmodified 1215.5632 0.56324876 2306 P30085;Q5T0D2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.574 35.574 2 1.0275E-10 31044 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.26 125.11 4527300000 352170000 388430000 400480000 333300000 278180000 356560000 366080000 304970000 353380000 124460000 455090000 349980000 464180000 34373 2306 32010 311877;311878;311879;311880;311881;311882;311883;311884;311885;311886;311887;311888;311889 397571;397572;397573;397574;397575;397576;397577;397578;397579;397580;397581;397582;397583;397584;397585;397586 397582 14 NQDPILPVLVK Unmodified 1234.7285 0.72852317 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.756 95.756 2 0.027492 98312 QUIQUE_C1403_190116_001 52.278 43.746 497260000 0 53990000 0 78673000 58335000 0 58180000 85652000 0 14947000 0 66062000 81425000 34374 3889 32011 311890;311891;311892;311893;311894;311895;311896;311897 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398093;398094;398095;398096;398097;398098;398099;398100;398101;398102;398103;398104;398105 398100 13 NQSPEPSSGPR Unmodified 1154.5316 0.53161428 3085 Q14699;G3XAJ6;C9JHG2 RFTN1 Raftlin yes no 0 0 0 1 11.037 11.037 2 0.054204 3440 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.161 39.502 2230400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2230400 0 0 0 34431 3085 32065 312345 398106 398106 1 NQSPVLEPVGR Unmodified 1194.6357 0.63568542 2594 P51812;B4DG22;B1AXG1;B7ZB17;A0A2R8Y603 RPS6KA3 Ribosomal protein S6 kinase alpha-3 yes no 0 0 0 1 40.057 40.057 2 0.032618 36512 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.292 34.09 22534000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22534000 0 34432 2594 32066 312346 398107 398107 1 NQSQGYNQWQQGQFWGQK Unmodified 2210.9882 0.98821312 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 95.699 95.699 2 1.0046E-63 98808 QUIQUE_C1218_190116_001 244.95 224.85 55120000 31768000 23352000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34433 2849 32067 312347;312348 398108;398109 398108 2 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67.038 2 1.0133E-65 66691 QUIQUE_C1277_190116_001 201.6 176.76 2624600000 135990000 201650000 224690000 161840000 0 0 137310000 221510000 387690000 256310000 319250000 282900000 295460000 34443 2643 32077 312453;312454;312455;312456;312457;312458;312459;312460;312461;312462;312463 398243;398244;398245;398246;398247;398248;398249;398250;398251;398252;398253;398254;398255;398256;398257;398258;398259;398260;398261;398262 398245 2085 20 NQVAMNPTNTIFDAK Unmodified 1662.8036 0.80355538 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 84.805 84.805 2 1.0649E-13 85975 QUIQUE_DMIX8_190116_001 158.04 141.66 3490800000 0 0 0 984520000 0 0 0 0 0 0 1005300000 664630000 836330000 34444 2643 32077 312464;312465;312466;312467 398263;398264;398265;398266;398267 398267 5 NQVAMNPTNTIFDAKR Unmodified 1818.9047 0.90466641 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 66.642 66.642 2;3 2.9431E-30 66228 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.3 132.94 350350000 0 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398277;398278;398279;398280;398281;398282;398283;398284;398285;398286;398287;398288;398289;398290;398291;398292;398293;398294;398295 398281 1311 19 NQVAMNPTNTVFDAK Unmodified 1648.7879 0.78790532 2010 P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.201 73.201 2 5.7352E-24 73321 QUIQUE_C1277_190116_001 188.91 185.26 33357000000 2874500000 3464500000 2902000000 3356500000 2245800000 2427700000 3047800000 1347100000 2076400000 996030000 3203200000 2407700000 3007800000 34448 2010 32079 312490;312491;312492;312493;312494;312495;312496;312497;312498;312499;312500;312501;312502 398296;398297;398298;398299;398300;398301;398302;398303;398304;398305;398306;398307;398308;398309;398310;398311;398312;398313;398314;398315;398316;398317;398318;398319;398320 398298 25 NQVAMNPTNTVFDAKR Oxidation (M) 1820.8839 0.88393097 2010 P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25 HSPA8 Heat shock 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Unmodified 3037.4889 0.48889311 2201 P22676;H3BN14;A6NER6 CALB2 Calretinin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 167.73 167.73 3 7.311E-57 172159 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.47 138.37 1000800000 0 0 0 0 0 0 31386000 102790000 264970000 0 305560000 150470000 145620000 34500 2201 32127 312895;312896;312897;312898;312899;312900 398843;398844;398845;398846;398847;398848;398849 398845 7 NSDGKIEMAELAQILPTEENFLLCFR Oxidation (M) 3053.4838 0.48380773 2201 P22676;H3BN14;A6NER6 CALB2 Calretinin yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 160.45 160.45 3 1.5208E-17 165177 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.7 94.037 409140000 0 0 0 0 0 0 0 57751000 101820000 0 76239000 123600000 49734000 34501 2201 32127 312901;312902;312903;312904;312905 398850;398851;398852;398853;398854 398851 1559 3 NSDPALGLDDDPDAPAAQLAR Unmodified 2120.9974 0.9974404 4434 Q9UHG2 PCSK1N ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN yes yes 0 0 0 1 1 99.403 99.403 2 3.2993E-19 102069 QUIQUE_C1277_190116_001 161.82 149.19 45329000 0 45329000 0 0 0 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mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.576 79.576 2 0.00052273 76852 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.61 87.485 3368200000 361100000 356080000 320430000 245430000 221600000 279560000 315790000 159660000 265950000 107750000 276810000 229300000 228740000 34505 856 32131 312922;312923;312924;312925;312926;312927;312928;312929;312930;312931;312932;312933;312934 398875;398876;398877;398878;398879;398880;398881;398882;398883;398884;398885;398886;398887;398888;398889;398890 398886 15 NSDSILEAIQKK Unmodified 1344.7249 0.72489436 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 59.571 59.571 2 0.01063 58913 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.536 51.904 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34506 856 32132 312935;312936 398891;398892 398892 2 NSEPAGLETPEAK Unmodified 1341.6412 0.64122431 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 32.9 32.9 2 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complex subunit beta yes no 0 2 0 1 154.08 154.08 3 6.9794E-07 161732 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.264 48.863 71133000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71133000 0 0 34515 2777 32139 313021 398986 398986 2220;2221 1 NSFYVALER Unmodified 1097.5506 0.55055881 2490 P47224 RABIF Guanine nucleotide exchange factor MSS4 yes yes 0 0 0 1 75.147 75.147 2 0.029582 75630 QUIQUE_C1277_190116_001 63.816 40.462 35143000 0 35143000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34516 2490 32140 313022 398987 398987 1 NSGELEATSAFLASGQR Unmodified 1736.8329 0.83294126 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 92.246 92.246 2 9.987E-17 95299 QUIQUE_C1218_190116_001 161.76 140 108110000 34972000 0 25864000 0 0 33068000 0 0 0 14203000 0 0 0 34517 4331 32141 313023;313024;313025;313026;313027 398988;398989;398990;398991;398992 398988 5 NSGIIILR Unmodified 884.54435 0.54435122 3853 Q96FN4;H3BUC8 CPNE2 Copine-2 yes no 0 0 0 1 57.604 57.604 2 0.050353 57026 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.531 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398998;398999;399000;399001;399002;399003;399004;399005;399006;399007;399008;399009;399010;399011;399012;399013;399014;399015;399016;399017;399018 399000 1220;1221 20 NSGMPPGAAAIAVLPVTLDTPMNR Unmodified 2392.2243 0.22428599 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 0 0 2 2 2 3 2 2 3 2 4 2 2 3 2 144.8 144.8 2;3 6.2669E-63 149407 QUIQUE_C1277_190116_001 204.78 191.94 3775200000 407850000 426460000 362070000 249670000 268130000 289030000 443860000 194610000 263480000 64028000 322620000 202810000 280550000 34521 1959 32144 313052;313053;313054;313055;313056;313057;313058;313059;313060;313061;313062;313063;313064;313065;313066;313067;313068;313069;313070;313071;313072;313073;313074;313075;313076;313077;313078;313079;313080;313081;313082 399019;399020;399021;399022;399023;399024;399025;399026;399027;399028;399029;399030;399031;399032;399033;399034;399035;399036;399037;399038;399039;399040;399041;399042;399043;399044;399045;399046;399047;399048;399049;399050;399051;399052;399053;399054;399055;399056;399057;399058;399059;399060;399061;399062;399063;399064;399065;399066;399067;399068;399069;399070;399071 399025 51 NSGMPPGAAAIAVLPVTLDTPMNR 2 Oxidation (M) 2424.2141 0.21411524 1959 P09417 QDPR Dihydropteridine reductase yes yes 0 2 0 1 2 124.96 124.96 2;3 8.5235E-09 130548 QUIQUE_C1218_190116_001 90.654 77.251 126350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 126350000 0 0 0 34522 1959 32144 313083;313084;313085 399072;399073;399074;399075;399076 399072 1220;1221 5 NSGQNLEEDMGQSEQK Unmodified 1792.7534 0.75337031 4209 Q9HAV7 GRPEL1 GrpE protein homolog 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 39.58 39.58 2 8.8237E-36 35700 QUIQUE_C1277_190116_001 168.61 156.74 14664000 0 14664000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34523 4209 32145 313086 399077 399077 1 NSHLINVLMWELEK Unmodified 1724.892 0.89197646 600 B3KS98;O15372;A0A087WZK9;E5RJT0 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 132.61 132.61 3 0.00028181 137240 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.81 66.392 84114000 0 0 28589000 0 0 0 0 0 0 0 33125000 22400000 0 34524 600 32146 313087;313088;313089;313090 399078;399079;399080;399081 399080 4 NSIEDIHAFAIR Unmodified 1384.7099 0.709913 4279 Q9NRY5;E7ESJ7 FAM114A2 Protein FAM114A2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 81.598 81.598 2;3 0.011991 83969 QUIQUE_C1438_190116_001 60.342 49.591 168610000 0 22848000 0 0 77664000 0 0 21780000 0 0 25721000 20600000 0 34525 4279 32147 313091;313092;313093;313094;313095;313096 399082;399083;399084;399085;399086;399087 399084 6 NSILAQVLDQSAR Unmodified 1413.7576 0.75759147 1344 K7EQA1;O14737;K7ESJ4 PDCD5 Programmed cell death protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.68 114.68 2 9.0643E-06 119816 QUIQUE_C1438_190116_001 109.24 80.509 374080000 0 0 0 0 0 67235000 58491000 54613000 60593000 37440000 51161000 0 44551000 34526 1344 32148 313097;313098;313099;313100;313101;313102;313103;313104;313105;313106;313107 399088;399089;399090;399091;399092;399093;399094;399095;399096;399097;399098;399099;399100 399090 12 NSIPNPVADIYNQSDKPPPLNILTPYR Unmodified 3035.5716 0.57163518 4523 Q9UPY6 WASF3 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3 yes yes 0 0 1 2 1 1 142.45 142.45 3 1.9595E-14 145053 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.71 69.346 187330000 0 0 0 95344000 0 58185000 0 33797000 0 0 0 0 0 34527 4523 32149 313108;313109;313110;313111 399101;399102;399103;399104 399104 4 NSITLAWGK Unmodified 988.53418 0.53418046 200 A0A0A0MTS7;A0A0A0MRA3;Q8WZ42 TTN Titin yes no 0 0 0 1 74.039 74.039 2 0.061122 73791 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.657 16.368 176310000 0 0 0 0 0 0 0 176310000 0 0 0 0 0 34528 200 32150 313112 399105 399105 1 NSITVPYK Unmodified 920.49673 0.49673232 2845 Q00577 PURA Transcriptional activator protein Pur-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 37.367 37.367 2 0.016401 33218 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Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 1 2 3 3 3 3 2 3 3 3 1 4 2 2 80.89 80.89 3;4;5 2.7987E-108 81764 QUIQUE_C1403_190116_001 178.33 169.25 12135000000 398120000 2159300000 993910000 905030000 722630000 251790000 1180800000 935540000 1149700000 109830000 1318600000 1055500000 954580000 34532 412;3299;3010 32154 313128;313129;313130;313131;313132;313133;313134;313135;313136;313137;313138;313139;313140;313141;313142;313143;313144;313145;313146;313147;313148;313149;313150;313151;313152;313153;313154;313155;313156;313157;313158;313159;313160;313161 399121;399122;399123;399124;399125;399126;399127;399128;399129;399130;399131;399132;399133;399134;399135;399136;399137;399138;399139;399140;399141;399142;399143;399144;399145;399146;399147;399148;399149;399150;399151;399152;399153;399154;399155;399156;399157;399158;399159;399160;399161;399162;399163;399164;399165;399166;399167;399168;399169;399170 399135 49 NSKPVHTTILNPHIHLMGDESACIAYIR Unmodified 3186.6067 0.60665726 4533 Q9UQM7 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes yes 0 0 1 1 3 1 1 1 2 2 1 1 2 1 82.757 82.757 3;4;5 7.4583E-27 84351 QUIQUE_C1277_190116_001 107.76 100.09 1817000000 48717000 405310000 127960000 65292000 78195000 0 198510000 144420000 86087000 0 210610000 270190000 181670000 34533 4533 32155 313162;313163;313164;313165;313166;313167;313168;313169;313170;313171;313172;313173;313174;313175;313176;313177 399171;399172;399173;399174;399175;399176;399177;399178;399179;399180;399181;399182;399183;399184;399185;399186;399187;399188 399174 17 NSLDCEIVSAK Unmodified 1234.5864 0.58635197 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.549 49.549 2 4.7952E-05 46536 QUIQUE_C1368_190116_001 137.46 76.549 7490000000 513680000 644140000 782540000 731660000 633790000 604510000 649060000 339370000 430270000 230270000 695060000 532770000 702920000 34534 2857 32156 313178;313179;313180;313181;313182;313183;313184;313185;313186;313187;313188;313189;313190 399189;399190;399191;399192;399193;399194;399195;399196;399197;399198;399199;399200;399201;399202 399191 14 NSLEILLGSIGR Unmodified 1270.7245 0.72450043 4398 Q9UBI1;H0Y4E5;R4GNF2 COMMD3 COMM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.13 139.13 2 9.6059E-06 143888 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155 107.43 437780000 28624000 35080000 50053000 24612000 36278000 30881000 42072000 0 42007000 15300000 45833000 39525000 47519000 34535 4398 32157 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2 2 2 47.839 47.839 2;3 7.3867E-95 45101 QUIQUE_C1218_190116_001 246.96 232.8 8106000000 699250000 634730000 754480000 791510000 765780000 721420000 541570000 471560000 678660000 292970000 673430000 505280000 575390000 34565 1819;3223 32185 313375;313376;313377;313378;313379;313380;313381;313382;313383;313384;313385;313386;313387;313388;313389;313390;313391;313392;313393;313394;313395;313396;313397;313398;313399;313400;313401 399421;399422;399423;399424;399425;399426;399427;399428;399429;399430;399431;399432;399433;399434;399435;399436;399437;399438;399439;399440;399441;399442;399443;399444;399445;399446;399447;399448;399449;399450;399451;399452;399453;399454 399422 34 NSNPALNDNLEK Unmodified 1327.6368 0.63680763 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.969 31.969 2 0.00010477 27184 QUIQUE_C1218_190116_001 150.15 134.49 3853500000 269190000 211040000 412500000 402690000 297850000 229470000 327400000 285480000 286120000 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399594 157 NSSYVHGGVDASGKPQEAVYGQNDIHHK Unmodified 2993.4016 0.40160974 4508 Q9UN86;D6RAC7;D6RB17;D6RGJ4;D6RBM9;D6REX8;D6RBR0;D6RE13;D6RBW8 G3BP2 Ras GTPase-activating protein-binding protein 2 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 30.245 30.245 3;4;5 4.7634E-27 24025 QUIQUE_DMIX8_190116_001 110.08 103.28 867470000 115090000 130970000 197610000 121930000 0 0 0 0 108270000 56070000 77272000 60267000 0 34583 4508 32203 313566;313567;313568;313569;313570;313571;313572;313573;313574;313575 399744;399745;399746;399747;399748;399749;399750;399751;399752;399753;399754 399754 11 NSTFSEIFK Unmodified 1071.5237 0.52367535 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.13 82.13 2 0.001817 82275 QUIQUE_C1563_190116_001 99.802 66.006 7347600000 946690000 739410000 813700000 675570000 608280000 780990000 618400000 220870000 373120000 503320000 415650000 308100000 343500000 34584 2288 32204 313576;313577;313578;313579;313580;313581;313582;313583;313584;313585;313586;313587;313588 399755;399756;399757;399758;399759;399760;399761;399762;399763;399764;399765;399766;399767;399768;399769;399770 399761 14 NSTFSEIFKK Unmodified 1199.6186 0.61863837 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 54.081 54.081 2;3 0.00043944 51810 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.71 101.05 11212000000 265410000 520880000 595800000 456100000 1111200000 370600000 869520000 1388400000 1586900000 301690000 1470100000 1441200000 834290000 34585 2288 32205 313589;313590;313591;313592;313593;313594;313595;313596;313597;313598;313599;313600;313601;313602;313603;313604;313605;313606;313607;313608 399771;399772;399773;399774;399775;399776;399777;399778;399779;399780;399781;399782;399783;399784;399785;399786;399787;399788;399789;399790;399791;399792;399793;399794 399785 22 NSTGGTSVGWDSPPASPLQR Unmodified 2012.9552 0.95518166 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 84.041 84.041 2;3 7.1369E-267 85578 QUIQUE_C1277_190116_001 281.65 263.52 1422200000 77051000 91016000 108180000 82756000 95830000 103640000 116600000 111410000 155320000 41227000 166550000 127580000 144990000 34586 2994 32206 313609;313610;313611;313612;313613;313614;313615;313616;313617;313618;313619;313620;313621;313622 399795;399796;399797;399798;399799;399800;399801;399802;399803;399804;399805;399806;399807;399808;399809;399810;399811;399812;399813;399814;399815;399816;399817 399798 23 NSTIVFPLPIDMLQGIIGAK Oxidation (M) 2142.1759 0.17586246 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 1 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 165.15 165.15 2;3 2.1226E-09 168757 QUIQUE_C1277_190116_001 111.12 98.733 442510000 17027000 56484000 0 32242000 50068000 0 54233000 35345000 26543000 43701000 33763000 30472000 62632000 34587 2258 32207 313623;313624;313625;313626;313627;313628;313629;313630;313631;313632;313633;313634;313635;313636 399818;399819;399820;399821;399822;399823;399824;399825;399826;399827;399828;399829;399830;399831 399819 1619 10 NSTIVFPLPIDMLQGIIGAK Unmodified 2126.1809 0.18094784 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 1 3 2 2 2 2 1 2 172.82 172.82 2;3 6.8246E-65 177414 QUIQUE_C1368_190116_001 185.87 164.62 4053500000 165930000 246790000 706940000 157470000 318060000 26032000 490900000 353730000 525780000 139350000 351510000 160440000 410590000 34588 2258 32207 313637;313638;313639;313640;313641;313642;313643;313644;313645;313646;313647;313648;313649;313650;313651;313652;313653;313654;313655;313656;313657;313658;313659;313660;313661;313662 399832;399833;399834;399835;399836;399837;399838;399839;399840;399841;399842;399843;399844;399845;399846;399847;399848;399849;399850;399851;399852;399853;399854;399855;399856;399857;399858;399859;399860;399861 399840 27 NSTLPKAIVSSR Unmodified 1271.7197 0.7197494 3428 Q709C8 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.98 100.98 2 0.0030444 105520 QUIQUE_C1218_190116_001 108.98 57.632 5751200000 745790000 723370000 996890000 623660000 704160000 621820000 884930000 0 66220000 141350000 136000000 0 106990000 34589 3428 32208 313663;313664;313665;313666;313667;313668;313669;313670;313671;313672;313673 399862;399863;399864;399865;399866;399867;399868;399869;399870;399871;399872;399873 399862 12 NSTTDQVYQAIAAK Unmodified 1508.7471 0.74708636 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7;A0A2R8Y3S6 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.05 78.05 2 3.1347E-10 79022 QUIQUE_C1368_190116_001 131.83 106.99 1120400000 91141000 100010000 121610000 0 0 96391000 95988000 90424000 108200000 66526000 148740000 101660000 99691000 34590 3899 32209 313674;313675;313676;313677;313678;313679;313680;313681;313682;313683;313684 399874;399875;399876;399877;399878;399879;399880;399881;399882;399883;399884;399885;399886 399876 13 NSVDELNNNVEAVSQTSSSSFQYMYLLK Unmodified 3166.4765 0.47647375 1824 P02675 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.58 152.58 3 2.9333E-144 155309 QUIQUE_DMIX1_190116_001 201.58 189.79 1072200000 45889000 80977000 76118000 138310000 157910000 0 104200000 82545000 83713000 45928000 68637000 50266000 137660000 34591 1824 32210 313685;313686;313687;313688;313689;313690;313691;313692;313693;313694;313695;313696 399887;399888;399889;399890;399891;399892;399893;399894;399895;399896;399897;399898;399899;399900;399901;399902;399903;399904 399897 18 NSVEVALNK Unmodified 972.52401 0.52400971 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 27.685 27.685 2 0.024231 22132 QUIQUE_C1438_190116_001 94.114 57.929 429250000 0 0 0 0 110830000 97874000 0 0 0 0 123680000 96856000 0 34592 2641 32211 313697;313698;313699;313700 399905;399906;399907;399908 399905 1 NSVFQQGMK Unmodified 1037.4964 0.49641475 590;1371;1872 P05023;Q5TC05;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.605 31.605 2 0.00039627 26229 QUIQUE_C1403_190116_001 121.62 95.235 697610000 0 0 269110000 180080000 0 124150000 0 124270000 0 0 0 0 0 34593 1872;1371;590 32212 313701;313702;313703;313704;313705;313706;313707;313708;313709;313710;313711 399909;399910;399911;399912;399913;399914;399915;399916;399917;399918;399919;399920 399911 12 NSVFQQGMK Oxidation (M) 1053.4913 0.49132937 590;1371;1872 P05023;Q5TC05;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 1 0 1 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NTAELQPESGK Unmodified 1172.5673 0.56733108 1499 O15355 PPM1G Protein phosphatase 1G yes yes 0 0 0 1 17.496 17.496 2 0.011224 9685 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.56 38.779 10794000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10794000 0 0 0 34615 1499 32233 313788 400002 400002 1 NTAEWLLSHTK Unmodified 1298.6619 0.66190017 1786 P00491;G3V5M2;G3V2H3 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 3 1 1 1 69.445 69.445 2;3 2.1064E-08 69441 QUIQUE_DMIX5_190116_001 185.33 160.55 1187800000 201680000 0 126680000 168780000 0 127200000 122570000 0 94809000 81574000 94809000 67342000 102380000 34616 1786 32234 313789;313790;313791;313792;313793;313794;313795;313796;313797;313798;313799;313800;313801 400003;400004;400005;400006;400007;400008;400009;400010;400011;400012;400013;400014;400015;400016 400014 12 NTALETLHQNSITQVSIYEVDK Unmodified 2502.2602 0.26019703 3752 Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 102.81 102.81 2;3 2.416E-260 107000 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NTCQLYIQTDHLFFK Unmodified 1926.9298 0.92981853 1439 O14672 ADAM10 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.01 111.01 3 0.00054579 109010 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.527 46.331 334790000 23813000 42065000 55559000 50497000 40089000 0 48411000 0 24806000 16637000 32910000 0 0 34624 1439 32242 313858;313859;313860;313861;313862;313863;313864;313865;313866 400078;400079;400080;400081;400082;400083;400084;400085;400086;400087;400088 400087 11 NTDEMVELR Oxidation (M) 1121.5023 0.50228798 2735;3319 P61978;S4R457;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.2 27.2 2 0.00050803 21335 QUIQUE_DMIX7_190116_001 119.21 95.782 1221700000 99753000 140840000 122260000 101230000 100340000 100850000 61544000 103750000 0 69069000 125280000 83505000 113320000 34625 2735;3319 32243 313867;313868;313869;313870;313871;313872;313873;313874;313875;313876;313877;313878 400089;400090;400091;400092;400093;400094;400095;400096;400097;400098;400099;400100 400099 2168 11 NTDEMVELR Unmodified 1105.5074 0.50737336 2735;3319 P61978;S4R457;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.604 47.604 2 0.0015993 45265 QUIQUE_C1218_190116_001 102.07 84.555 1523100000 533670000 596330000 0 0 0 0 0 0 0 0 393100000 0 0 34626 2735;3319 32243 313879;313880;313881;313882;313883 400101;400102;400103;400104;400105 400101 3 NTDEPMGITLK Unmodified 1217.5962 0.59618837 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.034 64.034 2 0.0059128 63372 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.817 67.305 298760000 0 54327000 0 0 0 0 32448000 48034000 43275000 0 81322000 39352000 0 34627 472;1460 32244 313884;313885;313886;313887;313888;313889 400106;400107;400108;400109;400110;400111;400112 400112 5 NTDQASMPDNTAAQK Oxidation (M) 1606.6893 0.68931349 2378;2385 P35579;P35749 MYH9;MYH11 Myosin-9;Myosin-11 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 10.538 10.538 2 2.6681E-79 2938 QUIQUE_DMIX1_190116_001 211.46 186.67 234340000 6255900 0 0 15086000 0 0 0 68484000 22039000 79892000 0 42581000 0 34628 2378;2385 32245 313890;313891;313892;313893;313894;313895 400113;400114;400115;400116;400117;400118 400115 1782 6 NTDQASMPDNTAAQK Unmodified 1590.6944 0.69439886 2378;2385 P35579;P35749 MYH9;MYH11 Myosin-9;Myosin-11 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.973 20.973 2 4.9499E-231 13728 QUIQUE_C1368_190116_001 287.57 261.94 1055000000 70960000 157850000 91843000 134510000 106450000 95188000 107760000 56605000 69147000 22560000 0 73013000 69123000 34629 2378;2385 32245 313896;313897;313898;313899;313900;313901;313902;313903;313904;313905;313906;313907 400119;400120;400121;400122;400123;400124;400125;400126;400127;400128;400129;400130 400121 11 NTDQASMPENTVAQK Unmodified 1632.7413 0.74134906 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.874 29.874 2 1.2648E-05 24089 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P02689;S4R371;P05413;S4R3A2 PMP2;FABP3 Myelin P2 protein;Fatty acid-binding protein, heart no no 0 0 0 1 1 30.586 30.586 2 0.028867 25673 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.906 22.991 902010000 0 611830000 0 0 0 0 0 290180000 0 0 0 0 0 34636 1825;1889 32252 313932;313933 400156;400157 400157 2 NTEKDSNAENMNSQPEK Unmodified 1934.8276 0.82759788 3324 Q5TC84;A0A3B3IRI0 OGFRL1 Opioid growth factor receptor-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 10.541 10.541 3 0.00031606 3047 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.022 45.654 15382000 0 0 0 0 0 0 0 0 15382000 0 0 0 0 34637 3324 32253 313934;313935 400158;400159 400159 2 NTETEESLVK Unmodified 1148.5561 0.55609769 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2;B1ANG9;B1ANH3 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 25.793 25.793 2 0.003379 19051 QUIQUE_C1368_190116_001 96.331 29.902 667070000 90754000 98979000 83893000 99284000 0 102280000 90780000 0 0 39203000 61891000 0 0 34638 3194 32254 313936;313937;313938;313939;313940;313941;313942;313943 400160;400161;400162;400163;400164;400165;400166;400167;400168;400169 400162 9 NTETEESLVKR Unmodified 1304.6572 0.65720872 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2;B1ANG9;B1ANH3 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 19.992 19.992 2;3 1.9871E-05 13289 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.98 111.91 336230000 0 31602000 0 0 0 0 0 104650000 0 0 107010000 92974000 0 34639 3194 32255 313944;313945;313946;313947;313948;313949 400170;400171;400172;400173;400174;400175 400172 6 NTFAEVTGLSPGVTYYFK Unmodified 1992.9833 0.98329389 1833 P02751 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.41 138.41 2 1.1384E-23 142550 QUIQUE_C1403_190116_001 146.96 125.66 237260000 0 0 0 33048000 56393000 28754000 0 0 59708000 14217000 0 45138000 0 34640 1833 32256 313950;313951;313952;313953;313954;313955 400176;400177;400178;400179;400180;400181 400176 6 NTFDHPYPTTK Unmodified 1319.6146 0.61461563 2732 P61962 DCAF7 DDB1- and CUL4-associated factor 7 yes yes 0 0 0 1 27.859 27.859 2 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subcomplex subunit 12 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 129.51 129.51 2;3 3.5284E-30 135674 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.47 140.79 440890000 51875000 63136000 61298000 77111000 0 0 0 0 43989000 0 92322000 51157000 0 34644 4442 32260 313967;313968;313969;313970;313971;313972;313973;313974;313975;313976;313977 400194;400195;400196;400197;400198;400199;400200;400201;400202;400203;400204 400203 11 NTGESASQLLDAETAER Unmodified 1790.8282 0.82824981 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 74.882 74.882 2 8.7414E-07 71602 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.96 104.58 253880000 48853000 60287000 0 0 0 0 0 68023000 0 31815000 44906000 0 0 34645 271 32261 313978;313979;313980;313981;313982;313983;313984 400205;400206;400207;400208;400209;400210;400211;400212 400211 8 NTGIICTIGPASR Unmodified 1358.6976 0.69763375 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;H3BT25;H3BU13;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 61.903 61.903 2 2.2059E-41 62351 QUIQUE_C1218_190116_001 192.5 163.33 71519000000 6551400000 6000500000 6728500000 6503200000 5651500000 5138900000 6050600000 4848800000 4734700000 2183700000 5639800000 5459300000 6028000000 34646 1203;2077 32262 313985;313986;313987;313988;313989;313990;313991;313992;313993;313994;313995;313996;313997;313998 400213;400214;400215;400216;400217;400218;400219;400220;400221;400222;400223;400224;400225;400226;400227;400228;400229;400230;400231;400232;400233;400234;400235;400236;400237;400238;400239;400240;400241;400242;400243 400214 31 NTGLITVQGPVDR Unmodified 1368.7361 0.73612775 2914 Q08174 PCDH1 Protocadherin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 66.353 66.353 2 0.0011756 66501 QUIQUE_C1218_190116_001 81.525 59.93 91627000 38320000 29881000 0 23426000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34647 2914 32263 313999;314000;314001 400244;400245;400246 400244 3 NTGLITVQGPVDREDLSTLR Unmodified 2183.1546 0.15460975 2914 Q08174 PCDH1 Protocadherin-1 yes yes 0 0 1 1 1 94.758 94.758 3 0.00026975 97067 QUIQUE_C1277_190116_001 62.362 53.571 62872000 0 62872000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34648 2914 32264 314002;314003 400247;400248 400247 2 NTGLSHELCR Unmodified 1185.5561 0.55605489 4355 Q9NZQ3;C9JSC3;H7C2K2 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 1 19.706 19.706 2;3 0.061071 13010 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.539 27.236 21936000 0 0 21936000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34649 4355 32265 314004;314005 400249;400250 400250 2 NTGQTCVCSNQFLVQR Unmodified 1910.8727 0.87271436 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.111 64.111 2 0 64343 QUIQUE_C1218_190116_001 311.49 280.61 2938500000 214810000 312370000 326530000 272070000 261700000 312620000 329650000 120650000 132390000 37822000 214170000 191290000 212390000 34650 2588 32266 314006;314007;314008;314009;314010;314011;314012;314013;314014;314015;314016;314017;314018 400251;400252;400253;400254;400255;400256;400257;400258;400259;400260;400261;400262;400263;400264 400251 14 NTGTEAPDYLATVDVDPK Unmodified 1904.9004 0.90035212 2978 Q13228;H0Y532;F2Z2W8;F8WCR4;C9JVL0 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 95.821 95.821 2;3 1.8635E-31 98574 QUIQUE_C1277_190116_001 157.35 144.72 7255100000 426210000 441640000 623840000 551190000 558430000 523720000 487480000 615330000 725880000 312950000 697940000 519360000 771090000 34651 2978 32267 314019;314020;314021;314022;314023;314024;314025;314026;314027;314028;314029;314030;314031;314032;314033 400265;400266;400267;400268;400269;400270;400271;400272;400273;400274;400275;400276;400277;400278;400279;400280;400281;400282;400283;400284;400285;400286;400287;400288;400289;400290;400291;400292 400268 28 NTHATTHNAYDLEVIDIFK Unmodified 2201.0753 0.075296793 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 105.19 105.19 3;4 0.002771 108333 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Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.203 53.203 2 2.1226E-58 51889 QUIQUE_C1218_190116_001 201.6 135.17 1842200000 192050000 183970000 164430000 129100000 209740000 104780000 110220000 163800000 70638000 104390000 164200000 112550000 132340000 34655 2008 32271 314051;314052;314053;314054;314055;314056;314057;314058;314059;314060;314061;314062;314063 400310;400311;400312;400313;400314;400315;400316;400317;400318;400319;400320;400321;400322;400323;400324 400310 15 NTIICAPTGCGK Unmodified 1290.606 0.60604155 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 0 1 37.126 37.126 2 0.025864 33045 QUIQUE_C1368_190116_001 56.725 28.712 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34656 1750 32272 314064 400325 400325 1 NTILFLR Unmodified 875.52289 0.52288749 861 E7ER68;Q658Y4 FAM91A1 Protein FAM91A1 yes no 0 0 0 1 1 82.752 82.752 2 0.038851 84121 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.244 45.025 23135000 0 0 0 0 10794000 0 0 0 0 0 0 12341000 0 34657 861 32273 314065;314066 400326;400327 400327 2 NTIMFDDIGR Unmodified 1180.5547 0.55465791 3709 Q8WVY7 UBLCP1 Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 85.904 85.904 2 0.017645 87473 QUIQUE_C1277_190116_001 61.65 29.33 71847000 24039000 21903000 25905000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34658 3709 32274 314067;314068;314069;314070 400328;400329;400330;400331 400329 4 NTIQWLENELNR Unmodified 1528.7634 0.76340513 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 135.55 135.55 2;3 0.00015093 138672 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.87 92.951 1040100000 71843000 76107000 93902000 68464000 0 0 114090000 102830000 142590000 0 145170000 94293000 130790000 34659 2355 32275 314071;314072;314073;314074;314075;314076;314077;314078;314079;314080;314081;314082;314083 400332;400333;400334;400335;400336;400337;400338;400339;400340;400341;400342;400343;400344;400345;400346 400341 14 NTISLLVAGLK Unmodified 1127.6914 0.69140938 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.57 114.57 2 0.0003267 119779 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.67 51.176 1080400000 0 84029000 147810000 74224000 75540000 89816000 112990000 76152000 109010000 74104000 140420000 0 96275000 34660 3053 32276 314084;314085;314086;314087;314088;314089;314090;314091;314092;314093;314094;314095 400347;400348;400349;400350;400351;400352;400353;400354;400355;400356;400357;400358;400359;400360;400361 400360 15 NTISLLVAGLKK Unmodified 1255.7864 0.7863724 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 87.087 87.087 2;3 0.00037846 88869 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.456 55.537 531440000 0 0 0 0 0 0 0 120020000 128850000 0 122560000 124970000 35028000 34661 3053 32277 314096;314097;314098;314099;314100;314101;314102;314103;314104 400362;400363;400364;400365;400366;400367;400368;400369;400370;400371;400372;400373;400374 400364 13 NTIVTSYNR Unmodified 1066.5407 0.5407224 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.87 26.87 2 8.3473E-07 20943 QUIQUE_DMIX7_190116_001 157.34 122.53 11462000000 845670000 857100000 947570000 770060000 843660000 695940000 853760000 774850000 928420000 518620000 1647800000 755050000 1023400000 34662 3975 32278 314105;314106;314107;314108;314109;314110;314111;314112;314113;314114;314115;314116;314117 400375;400376;400377;400378;400379;400380;400381;400382;400383;400384;400385;400386;400387;400388;400389;400390;400391;400392;400393;400394;400395;400396 400393 21 NTIYAALQDFAQVTLR Unmodified 1822.9577 0.95774784 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 162.31 162.31 2 5.3136E-13 166292 QUIQUE_C1277_190116_001 131.06 110.22 132660000 0 27427000 0 16694000 0 20792000 0 17748000 0 7996600 0 0 42004000 34663 882 32279 314118;314119;314120;314121;314122;314123;314124 400397;400398;400399;400400;400401;400402;400403;400404 400397 6 NTIYAALQDFAQVTLREPLR Unmodified 2318.2383 0.2382798 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 1 1 157.91 157.91 3 0.002156 160430 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.69 55.3 22743000 0 0 0 0 0 0 0 22743000 0 0 0 0 0 34664 882 32280 314125 400405 400405 0 NTLDLIAPSPADAQHWVLGLHK Unmodified 2395.2648 0.2648289 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 129.91 129.91 3;4 5.6154E-28 134432 QUIQUE_C1277_190116_001 135.49 114.75 3115100000 166450000 170250000 453940000 195640000 172630000 206440000 198280000 268330000 344470000 94793000 323260000 152010000 368650000 34665 2578 32281 314126;314127;314128;314129;314130;314131;314132;314133;314134;314135;314136;314137;314138;314139;314140 400406;400407;400408;400409;400410;400411;400412;400413;400414;400415;400416;400417;400418;400419;400420;400421;400422;400423;400424;400425;400426;400427;400428;400429;400430;400431;400432;400433;400434;400435;400436;400437;400438;400439;400440 400413 35 NTLEWCLPVIDAK Unmodified 1557.7861 0.78611441 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 130.55 130.55 2 0.00074528 137013 QUIQUE_C1438_190116_001 84.507 53.397 128850000 0 0 0 0 64036000 0 0 0 0 0 64817000 0 0 34666 2506 32282 314141;314142;314143;314144 400441;400442;400443;400444;400445 400442 5 NTLFNLSNFLDK Unmodified 1424.73 0.72997974 907;3002 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5;E5RFU0;E5RHK9;Q13492;E9PI56;E9PKP6;E9PLJ8 SNAP91;PICALM Clathrin coat assembly protein AP180;Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 143.02 143.02 2 9.3729E-28 148497 QUIQUE_C1368_190116_001 178.08 150.06 10863000000 1093400000 983570000 743250000 902270000 881810000 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400479;400480;400481;400482;400483;400484;400485;400486;400487;400488;400489;400490;400491;400492;400493;400494;400495 400491 15 NTLLIAGLQAR Unmodified 1168.6928 0.69280637 252 A0A0C4DGS1;P39656 DDOST Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.455 84.455 2 0.0014915 85598 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.213 53.958 577100000 39999000 57818000 44400000 39048000 58835000 37247000 53281000 38173000 50700000 20692000 57018000 36959000 42933000 34669 252 32285 314173;314174;314175;314176;314177;314178;314179;314180;314181;314182;314183;314184;314185 400496;400497;400498;400499;400500;400501;400502;400503;400504;400505;400506;400507;400508;400509 400504 14 NTLNPVWQTFSIPVR Unmodified 1770.9417 0.94170385 4225 Q9HCH3;A0A0J9YWA1 CPNE5 Copine-5 yes no 0 0 0 1 1 137.75 137.75 2 0.013069 142397 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.676 36.422 127120000 0 0 0 0 0 0 71505000 0 0 0 0 0 55613000 34670 4225 32286 314186;314187 400510;400511 400511 2 NTLNPYYNESFSFEVPFEQIQK Unmodified 2693.2649 0.26494806 2182 P21579;J3KQA0 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 151.9 151.9 2;3 8.4612E-210 156206 QUIQUE_C1277_190116_001 257.16 245.55 5275700000 139020000 376980000 490010000 362580000 461410000 320340000 552270000 317260000 408270000 193340000 719140000 656250000 278790000 34671 2182 32287 314188;314189;314190;314191;314192;314193;314194;314195;314196;314197;314198;314199;314200;314201;314202;314203;314204;314205;314206;314207;314208;314209;314210;314211;314212 400512;400513;400514;400515;400516;400517;400518;400519;400520;400521;400522;400523;400524;400525;400526;400527;400528;400529;400530;400531;400532;400533;400534;400535;400536;400537;400538;400539;400540;400541;400542;400543;400544 400515 32 NTLTQTTENLR Unmodified 1289.6575 0.65754307 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 43.412 43.412 2 0.0041018 40084 QUIQUE_C1403_190116_001 87.895 36.702 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34672 2096 32288 314213 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400554;400555;400556;400557;400558;400559;400560;400561;400562;400563;400564;400565;400566;400567;400568;400569;400570;400571;400572;400573;400574;400575;400576;400577;400578;400579;400580 400569 27 NTMSLLAANNLLAGLR Oxidation (M) 1686.9087 0.90868916 4405 Q9UBQ7 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.1 130.1 2 6.219E-36 134313 QUIQUE_C1277_190116_001 172.17 157.75 794040000 0 97007000 0 0 0 105920000 65859000 75115000 124340000 66127000 155190000 0 104490000 34678 4405 32292 314248;314249;314250;314251;314252;314253;314254;314255 400581;400582;400583;400584;400585;400586;400587;400588;400589 400581 2934 8 NTMTDSTILLEDVQK Unmodified 1706.8397 0.83966612 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;E7ERV5;O95317;Q9UES5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 107.51 107.51 2 0.0055528 110227 QUIQUE_C1277_190116_001 73.927 55.791 64669000 36526000 28143000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34679 4607 32293 314256;314257 400590;400591 400591 2 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NVADDYIHTAACLHSLALEEPTVIK Unmodified 2779.3851 0.38507997 4636 Q9Y5X3;Q5QPE5;Q5QPE4;A0A087WUY5 SNX5 Sorting nexin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 134.13 134.13 4 4.1728E-11 138272 QUIQUE_C1277_190116_001 81.922 70.715 260240000 0 44357000 0 68481000 0 86331000 40862000 0 0 20205000 0 0 0 34715 4636 32327 314531;314532;314533;314534;314535 400945;400946;400947;400948;400949 400945 5 NVADLEEQNKR Unmodified 1314.6528 0.65279205 947 E9PJP2;Q5TF21;H3BRB8 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 19.142 19.142 2;3 1.1049E-12 12176 QUIQUE_C1218_190116_001 166.07 118.88 654690000 76678000 95084000 85663000 39219000 67220000 65400000 98949000 0 27729000 11914000 86827000 0 0 34716 947 32328 314536;314537;314538;314539;314540;314541;314542;314543;314544;314545;314546;314547;314548;314549;314550;314551;314552 400950;400951;400952;400953;400954;400955;400956;400957;400958;400959;400960;400961;400962;400963;400964;400965;400966 400950 12 NVADYYPEYK Unmodified 1260.5663 0.56626845 994 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2;3 4.5457E-23 84433 QUIQUE_DMIX5_190116_001 167.3 145.29 1153100000 0 137130000 0 0 111930000 0 0 201090000 197020000 53744000 137950000 117790000 196430000 34719 3152 32331 314568;314569;314570;314571;314572;314573;314574;314575;314576;314577;314578;314579 400988;400989;400990;400991;400992;400993;400994;400995;400996;400997;400998;400999;401000;401001 400998 13 NVAQVAEDTVLQNR Unmodified 1555.7954 0.79543354 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 91.14 91.14 2 5.6031E-23 94227 QUIQUE_DMIX5_190116_001 167.11 150.48 1092900000 88689000 86226000 94667000 95026000 85269000 76584000 88180000 80155000 89015000 32499000 85536000 90796000 100230000 34720 4606 32332 314580;314581;314582;314583;314584;314585;314586;314587;314588;314589;314590;314591;314592;314593 401002;401003;401004;401005;401006;401007;401008;401009;401010;401011;401012;401013;401014;401015;401016 401013 14 NVAQYNANHPDFPMQIEQLER Unmodified 2513.1758 0.17575589 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 104.09 104.09 2;3 9.4925E-07 107391 QUIQUE_C1368_190116_001 80.236 69.552 929450000 0 0 155270000 100370000 57294000 87259000 93058000 88950000 0 0 176850000 80119000 90282000 34721 3053 32333 314594;314595;314596;314597;314598;314599;314600;314601;314602;314603 401017;401018;401019;401020;401021;401022;401023;401024;401025;401026;401027 401017 7 NVASGEMNSVLEILYPR Unmodified 1890.9509 0.9509479 218 A0A0C4DFP6;Q9NQ79;Q5T4F6 CRTAC1 Cartilage acidic protein 1 yes no 0 0 0 1 1 152.2 152.2 2;3 0.00095678 157841 QUIQUE_C1218_190116_001 66.393 49.773 61305000 32287000 29018000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34722 218 32334 314604;314605 401028;401029 401028 2 NVASGGGGVGDGVQEPTTGNWR Unmodified 2113.9777 0.97770801 1404 O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.087 68.087 2 0 68789 QUIQUE_C1218_190116_001 296.23 262.55 962640000 70305000 83969000 63030000 102140000 67691000 60011000 94299000 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Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 123.1 123.1 2;3 8.3081E-64 128332 QUIQUE_C1218_190116_001 220.21 199.15 5307600000 428820000 477040000 362960000 418790000 354500000 409740000 476630000 328280000 442210000 187760000 551500000 374620000 494720000 34733 1010;1033 32345 314679;314680;314681;314682;314683;314684;314685;314686;314687;314688;314689;314690;314691;314692;314693;314694;314695;314696;314697;314698;314699;314700;314701;314702;314703;314704 401106;401107;401108;401109;401110;401111;401112;401113;401114;401115;401116;401117;401118;401119;401120;401121;401122;401123;401124;401125;401126;401127;401128;401129;401130;401131;401132;401133;401134;401135;401136;401137 401106 31 NVDLLTPLATQLTYEGLIDEIYGIQNSYVK Unmodified 3382.7548 0.75480409 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;F5H2X5 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 1 175.41 175.41 3 3.2647E-06 182463 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.968 48.481 52082000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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314718;314719;314720;314721;314722;314723;314724;314725;314726;314727;314728;314729;314730;314731;314732;314733 401155;401156;401157;401158;401159;401160;401161;401162;401163;401164;401165;401166;401167;401168;401169;401170;401171 401169 2802 17 NVDMLSELVQEYDEPILK Unmodified 2134.0504 0.050387176 3972 Q99733;C9JZI7;A8MXH2;H0YCI4 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 163.97 163.97 2;3 9.9621E-65 170187 QUIQUE_C1438_190116_001 235.25 219.88 4147200000 303120000 339840000 308820000 210540000 446010000 240520000 290600000 376960000 297640000 21975000 462880000 491910000 356430000 34737 3972 32348 314734;314735;314736;314737;314738;314739;314740;314741;314742;314743;314744;314745;314746;314747;314748;314749;314750;314751;314752;314753;314754;314755;314756;314757;314758 401172;401173;401174;401175;401176;401177;401178;401179;401180;401181;401182;401183;401184;401185;401186;401187;401188;401189;401190;401191;401192;401193;401194;401195;401196;401197;401198;401199;401200;401201;401202;401203;401204;401205;401206 401185 33 NVDPFHIYFCNLK Unmodified 1665.7973 0.79734779 3435 Q7L0Y3;C9JVB6 TRMT10C Mitochondrial ribonuclease P protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 118.99 118.99 3 0.0018847 123456 QUIQUE_C1368_190116_001 62.924 51.133 136390000 20490000 0 28855000 18158000 0 21964000 0 0 0 0 22472000 24453000 0 34738 3435 32349 314759;314760;314761;314762;314763;314764 401207;401208;401209;401210;401211;401212;401213 401209 7 NVDVEFFK Unmodified 996.49165 0.49164694 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 86.135 86.135 1;2 0.0042411 89376 QUIQUE_C1218_190116_001 109.86 93.568 7003000000 649690000 520490000 632710000 538620000 567350000 552580000 645890000 233090000 480200000 265760000 721720000 578530000 616380000 34739 2483 32350 314765;314766;314767;314768;314769;314770;314771;314772;314773;314774;314775;314776;314777;314778;314779;314780;314781;314782;314783 401214;401215;401216;401217;401218;401219;401220;401221;401222;401223;401224;401225;401226;401227;401228;401229;401230;401231;401232;401233;401234;401235;401236;401237;401238;401239;401240 401215 21 NVDVEFFKR Unmodified 1152.5928 0.59275797 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 64.626 64.626 2;3 0.0089972 62312 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.04 44.279 89984000 0 0 0 0 0 0 0 89984000 0 0 0 0 0 34740 2483 32351 314784;314785;314786;314787 401241;401242;401243;401244;401245 401243 5 NVEAMNFADIER Oxidation (M) 1423.6402 0.64017845 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 1 1 66.735 66.735 2 0.029906 66723 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314804;314805;314806;314807 401265;401266;401267;401268 401265 4 NVEDIELWLYEVEGHLASDDYGK Unmodified 2693.2497 0.24969192 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 169.09 169.09 2;3 0 173416 QUIQUE_DMIX3_190116_001 300.89 265.54 6425000000 55181000 212580000 420960000 0 276420000 0 1462100000 168180000 727950000 9925200 1623000000 904420000 564300000 34744 267;275;3025 32354 314808;314809;314810;314811;314812;314813;314814;314815;314816;314817;314818;314819;314820;314821;314822;314823;314824 401269;401270;401271;401272;401273;401274;401275;401276;401277;401278;401279;401280;401281;401282;401283;401284;401285;401286 401280 18 NVEDIELWLYEVEGHLASDDYGKDLTNVQNLQK Unmodified 3846.8588 0.85882824 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 167.27 167.27 4 2.9716E-86 174559 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.42 138.36 3667900000 0 0 0 0 0 0 0 108530000 669700000 0 1528700000 1089400000 271530000 34745 267;275;3025 32355 314825;314826;314827;314828;314829 401287;401288;401289;401290;401291;401292;401293 401291 7 NVEDLSGGELQR Unmodified 1315.6368 0.63680763 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.101 54.101 2 0.00045518 52865 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.47 78.94 276370000 0 0 0 0 0 0 0 43153000 73746000 0 91567000 67904000 0 34746 2718 32356 314830;314831;314832;314833;314834;314835 401294;401295;401296;401297;401298;401299 401297 3 NVEELVIVLK Unmodified 1154.6911 0.69107503 2629 P53618;E9PP73 COPB1 Coatomer subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 109.72 109.72 2 0.015177 113246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.464 50.31 71999000 0 0 0 0 25036000 0 0 21674000 25290000 0 0 0 0 34747 2629 32357 314836;314837;314838;314839;314840 401300;401301;401302;401303;401304 401302 5 NVEGQDMLYQSLK Oxidation (M) 1539.7239 0.72390808 2777;2938 P63010;A0A087X253;Q10567 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 1 0 1 2 1 1 1 2 2 2 2 1 2 65.724 65.724 2 0.00011945 62957 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.28 73.961 1186400000 59033000 140920000 85287000 60349000 0 68775000 0 150180000 155870000 111390000 92396000 82243000 179960000 34748 2777;2938 32358 314841;314842;314843;314844;314845;314846;314847;314848;314849;314850;314851;314852;314853;314854;314855;314856;314857 401305;401306;401307;401308;401309;401310;401311;401312;401313;401314;401315;401316;401317;401318;401319;401320;401321;401322 401317 2222 18 NVEGQDMLYQSLK Unmodified 1523.729 0.72899346 2777;2938 P63010;A0A087X253;Q10567 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.797 85.797 2 0.00011026 87690 QUIQUE_C1368_190116_001 141.88 110.46 4727900000 493260000 508330000 439460000 413990000 372670000 359120000 382800000 359040000 322620000 161550000 504130000 410900000 0 34749 2777;2938 32358 314858;314859;314860;314861;314862;314863;314864;314865;314866;314867;314868;314869 401323;401324;401325;401326;401327;401328;401329;401330;401331;401332;401333;401334;401335;401336;401337;401338;401339 401325 17 NVEHIIDSLR Unmodified 1194.6357 0.63568542 3235 Q4G0N4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 70.909 70.909 2;3 0.0016836 71385 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.692 79.541 857130000 62795000 51275000 88220000 68154000 60932000 64930000 70228000 37486000 59187000 37066000 162180000 41281000 53399000 34750 3235 32359 314870;314871;314872;314873;314874;314875;314876;314877;314878;314879;314880;314881;314882;314883 401340;401341;401342;401343;401344;401345;401346;401347;401348;401349;401350;401351;401352;401353;401354 401352 14 NVEHIIDSLRNEGIEVR Unmodified 1992.0389 0.038851707 3235 Q4G0N4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 1 2 102.75 102.75 3;4 0.00029975 105140 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.235 53.929 351620000 0 0 0 0 0 0 0 128320000 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401379;401380;401381;401382;401383;401384;401385;401386;401387;401388;401389;401390;401391;401392;401393;401394;401395;401396;401397;401398;401399;401400;401401;401402;401403;401404;401405;401406;401407;401408;401409;401410;401411;401412;401413;401414;401415;401416;401417;401418;401419;401420;401421;401422;401423;401424;401425;401426;401427;401428;401429;401430;401431;401432;401433;401434;401435;401436;401437;401438;401439;401440;401441;401442;401443;401444;401445;401446;401447;401448;401449;401450;401451;401452;401453;401454;401455 401429 76 NVFDGIFR Unmodified 966.49232 0.49231565 470 H0Y7S3;A0A2U3U055;A0A2U3TZI3;Q01814;A0A2R8Y4R4;A0A2R8Y535 ATP2B2 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2 yes no 0 0 0 1 1 111.53 111.53 2 0.040858 116541 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.262 46.195 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34756 470 32365 314946;314947 401456;401457 401457 2 NVFFSPMSMSCALAMVYMGAK Unmodified 2341.0437 0.04374413 2371 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401935;401936;401937;401938;401939;401940;401941;401942;401943;401944;401945;401946;401947;401948;401949;401950;401951;401952;401953 401935 19 NVLELSNVVR Unmodified 1141.6455 0.64552182 1998 P10586 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 83.956 83.956 2 0.015687 81110 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.216 22.187 257230000 0 78561000 0 0 0 0 0 63283000 0 39701000 0 75685000 0 34798 1998 32405 315344;315345;315346;315347 401954;401955;401956;401957 401956 4 NVLFAHLDDNER Unmodified 1441.695 0.69499121 2330 P31321;C9JSK5;C9IZL8;C9JR00 PRKAR1B cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 64.607 64.607 2 0.0037247 64120 QUIQUE_C1277_190116_001 64.439 49.772 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34799 2330 32406 315348;315349 401958;401959 401958 2 NVLFSHLDDNER Unmodified 1457.6899 0.68990583 2002 P10644;K7EPB2;K7EIE5;K7EID3;K7EJ40;K7EK41 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 59.886 59.886 2;3 5.7352E-07 58142 QUIQUE_DMIX8_190116_001 169.65 140.18 6639900000 556060000 584180000 588720000 522980000 591860000 431770000 586490000 396610000 616810000 296980000 523990000 278160000 665300000 34800 2002 32407 315350;315351;315352;315353;315354;315355;315356;315357;315358;315359;315360;315361;315362;315363;315364;315365;315366;315367;315368;315369;315370;315371;315372;315373;315374 401960;401961;401962;401963;401964;401965;401966;401967;401968;401969;401970;401971;401972;401973;401974;401975;401976;401977;401978;401979;401980;401981;401982;401983;401984;401985 401985 25 NVLGHMQQGGAPSPFDR Unmodified 1809.8581 0.85805057 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 66.294 66.294 2;3 0 65750 QUIQUE_C1368_190116_001 308.74 250.04 3246300000 279280000 316760000 337410000 374900000 245900000 345990000 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6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 2 2 61.884 61.884 2;3 5.6972E-104 60877 QUIQUE_DMIX7_190116_001 216.88 191.87 2692400000 302960000 349710000 287310000 0 265380000 164160000 181000000 192730000 178440000 89711000 194880000 226700000 259390000 34803 452 32409 315406;315407;315408;315409;315410;315411;315412;315413;315414;315415;315416;315417;315418;315419;315420;315421;315422;315423;315424 402020;402021;402022;402023;402024;402025;402026;402027;402028;402029;402030;402031;402032;402033;402034;402035;402036;402037;402038;402039 402036 19 NVLGHMQQGGSPTPFDR Oxidation (M) 1855.8635 0.86352988 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 43.652 43.652 2;3 8.6809E-30 39938 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.82 132.88 655960000 0 0 0 0 0 0 0 0 99328000 245770000 0 235290000 75577000 34804 452 32409 315425;315426;315427;315428;315429;315430 402040;402041;402042;402043;402044;402045 402040 330 6 NVLIQESETFR Unmodified 1334.683 0.68302954 1078 G3V200;O75334;H0YHK3;F8VYK7;F8W1Y8 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 78.23 78.23 2 0.00045729 80097 QUIQUE_C1218_190116_001 111.61 98.028 169220000 45210000 43342000 46107000 0 0 0 0 0 0 0 0 34558000 0 34805 1078 32410 315431;315432;315433;315434;315435;315436 402046;402047;402048;402049;402050;402051 402046 6 NVLIQESETFRK Unmodified 1462.778 0.77799256 1078 G3V200;O75334;H0YHK3;F8VYK7;F8W1Y8 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 1 1 55.231 55.231 3 0.057807 53989 QUIQUE_C1576_190116_001 29.303 18.658 25895000 0 0 0 0 0 0 25895000 0 0 0 0 0 0 34806 1078 32411 315437 402052 402052 1 NVLISVLQAIR Unmodified 1224.7554 0.75540662 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.2 144.2 2 0.0024673 150308 QUIQUE_C1576_190116_001 105.52 85.734 1738300000 124650000 143680000 125810000 92708000 231060000 87621000 143960000 115980000 151090000 59206000 150520000 152510000 159490000 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402069;402070;402071;402072;402073;402074;402075;402076;402077;402078;402079;402080;402081;402082;402083;402084;402085;402086;402087;402088;402089;402090;402091;402092 402092 24 NVLIVEDVVGTGR Unmodified 1369.7565 0.75652884 4268 Q9NRG1 PRTFDC1 Phosphoribosyltransferase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 100.66 100.66 2 0.00018786 97986 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.83 80.301 262430000 25233000 29828000 46820000 37273000 0 0 41000000 39283000 0 0 0 42996000 0 34810 4268 32415 315465;315466;315467;315468;315469;315470;315471;315472;315473;315474;315475 402093;402094;402095;402096;402097;402098;402099;402100;402101;402102;402103 402101 10 NVLLDPQLVPGGGASEMAVAHALTEK Unmodified 2616.3581 0.35813694 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 2 136.63 136.63 2;3 2.5785E-12 141352 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.796 79.473 6206700000 499960000 500130000 602220000 572340000 464890000 411850000 731720000 541950000 0 158080000 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Protein TSSC1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 94.291 94.291 3;4 4.0822E-08 96203 QUIQUE_C1403_190116_001 102.07 92.884 1061200000 157190000 0 131870000 129010000 0 99301000 121110000 0 98115000 42696000 111870000 124730000 45268000 34814 564 32418 315496;315497;315498;315499;315500;315501;315502;315503;315504;315505;315506;315507;315508 402126;402127;402128;402129;402130;402131;402132;402133;402134;402135;402136;402137;402138;402139 402130 14 NVLLLGEDGAGK Unmodified 1184.6401 0.6401021 4653 Q9Y6G9 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 70.167 70.167 2 0.0065771 70048 QUIQUE_C1277_190116_001 77.379 59.393 624800000 92357000 74634000 80169000 67467000 52520000 58541000 70868000 77900000 0 0 0 0 50347000 34815 4653 32419 315509;315510;315511;315512;315513;315514;315515;315516;315517;315518;315519 402140;402141;402142;402143;402144;402145;402146;402147;402148;402149;402150;402151 402141 11 NVLNSQNLQPPIIPLFPVIK Unmodified 2243.3042 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402218;402219;402220;402221;402222;402223;402224;402225;402226;402227;402228;402229;402230;402231;402232;402233;402234;402235;402236;402237;402238;402239;402240;402241;402242;402243;402244;402245;402246;402247 402223 2769 30 NVMLLPVGSADDGAHSQNEK Unmodified 2080.9848 0.98476723 3897 Q96KP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 65.985 65.985 2;3 3.5945E-87 65572 QUIQUE_C1576_190116_001 196.58 172.83 17383000000 1081800000 1182700000 1462300000 1374000000 1210300000 1239700000 1711800000 1277500000 1511700000 538810000 1752600000 1319300000 1720200000 34829 3897 32431 315603;315604;315605;315606;315607;315608;315609;315610;315611;315612;315613;315614;315615;315616;315617;315618;315619;315620;315621;315622;315623;315624;315625;315626;315627;315628 402248;402249;402250;402251;402252;402253;402254;402255;402256;402257;402258;402259;402260;402261;402262;402263;402264;402265;402266;402267;402268;402269;402270;402271;402272;402273;402274;402275;402276;402277;402278 402264 31 NVMSAFGLTDDQVSGPPSAPAEDR Unmodified 2460.1227 0.12271727 3751 Q92734 TFG Protein TFG yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 3 2 2 121.38 121.38 2;3 2.0871E-74 125274 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.55 198.52 1212400000 84837000 102960000 131900000 115430000 118120000 51232000 60810000 90405000 50686000 51370000 116050000 104560000 134030000 34830 3751 32432 315629;315630;315631;315632;315633;315634;315635;315636;315637;315638;315639;315640;315641;315642;315643;315644;315645;315646;315647;315648;315649;315650;315651;315652;315653 402279;402280;402281;402282;402283;402284;402285;402286;402287;402288;402289;402290;402291;402292;402293;402294;402295;402296;402297;402298;402299;402300;402301;402302;402303;402304;402305;402306 402295 27 NVMVVVSR Unmodified 902.50077 0.50077184 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402385;402386;402387;402388;402389;402390;402391;402392;402393;402394;402395;402396;402397;402398;402399;402400;402401;402402;402403;402404;402405;402406 402390 20 NVNVQNFHISWK Unmodified 1484.7524 0.75244651 1544 O43707 ACTN4 Alpha-actinin-4 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 85.964 85.964 2;3 7.4889E-13 89170 QUIQUE_C1218_190116_001 158.79 119.77 5178000000 467520000 540100000 394780000 432700000 407100000 375280000 159590000 361680000 415580000 147970000 525540000 506650000 443540000 34839 1544 32441 315738;315739;315740;315741;315742;315743;315744;315745;315746;315747;315748;315749;315750;315751;315752;315753;315754;315755;315756;315757;315758;315759;315760;315761 402407;402408;402409;402410;402411;402412;402413;402414;402415;402416;402417;402418;402419;402420;402421;402422;402423;402424;402425;402426;402427;402428;402429;402430;402431;402432;402433;402434;402435;402436;402437 402409 30 NVPCGTSGGVMIYFDR Unmodified 1771.8022 0.80217518 1696 O94905;E5RHW4 ERLIN2 Erlin-2 yes no 0 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1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.753 63.753 2 5.7605E-07 62658 QUIQUE_DMIX8_190116_001 143.4 115 2085300000 199890000 145870000 148430000 228360000 168080000 0 154940000 70585000 128800000 418290000 121100000 143020000 157920000 + 34849 781;782 32450 315903;315904;315905;315906;315907;315908;315909;315910;315911;315912;315913;315914 402620;402621;402622;402623;402624;402625;402626;402627;402628;402629;402630;402631;402632;402633;402634;402635;402636;402637 402636 18 NVQDAIADAEQRGEHALK Unmodified 1963.9712 0.97116607 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 1 1 1 89.849 89.849 3 0.0017636 91051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.595 42.637 97059000 0 0 0 0 0 0 0 34286000 0 0 0 62773000 0 + 34850 781;782 32451 315915;315916 402638;402639 402638 2 NVQFVFDAVTDVIIK Unmodified 1706.9243 0.92432245 1870;2779;1953 P63096;P08754;P04899 GNAI1;GNAI3;GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1;Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha;Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 no no 0 0 0 7 3 7 6 1 11 12 27 36 6 1 168.72 168.72 2;3 2.0544E-24 174529 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.48 115.21 1965500000 119200000 32875000 91664000 0 65293000 6964600 245930000 137280000 432640000 0 716180000 103740000 13740000 34851 2779;1953;1870 32452 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402640;402641;402642;402643;402644;402645;402646;402647;402648;402649;402650;402651;402652;402653;402654;402655;402656;402657;402658;402659;402660;402661;402662;402663;402664;402665;402666;402667;402668;402669;402670;402671;402672;402673;402674;402675;402676;402677;402678;402679;402680;402681;402682;402683;402684;402685;402686;402687;402688;402689;402690;402691;402692;402693;402694;402695;402696;402697;402698;402699;402700;402701;402702;402703;402704;402705;402706;402707;402708;402709;402710;402711;402712;402713;402714;402715;402716;402717;402718;402719;402720;402721;402722;402723;402724;402725;402726;402727;402728;402729;402730;402731;402732;402733;402734;402735;402736;402737;402738;402739;402740;402741;402742;402743;402744;402745;402746;402747;402748;402749;402750;402751;402752;402753;402754;402755;402756;402757;402758;402759;402760;402761;402762;402763;402764;402765;402766;402767;402768 402723 118 NVQGIIEILK Unmodified 1125.6758 0.67575932 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.93 106.93 2 0.005136 110172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.516 34.069 1011200000 87726000 63760000 90736000 78317000 79631000 79107000 76361000 57453000 109370000 0 122610000 89950000 76190000 34852 2452 32453 316034;316035;316036;316037;316038;316039;316040;316041;316042;316043;316044;316045 402769;402770;402771;402772;402773;402774;402775;402776;402777;402778;402779;402780;402781 402777 13 NVQGILEVSK Unmodified 1085.6081 0.60807369 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.248 56.248 2 0.0084549 54411 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.331 71.408 1423000000 131530000 127040000 118760000 108200000 134410000 126370000 114830000 130110000 114480000 84057000 0 110660000 122520000 34853 3533 32454 316046;316047;316048;316049;316050;316051;316052;316053;316054;316055;316056;316057 402782;402783;402784;402785;402786;402787;402788;402789;402790;402791;402792;402793 402792 6 NVQICSIFDIATELNR Unmodified 1891.9462 0.94619688 2014 P11182 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 157.46 157.46 2 0.0010161 162395 QUIQUE_C1218_190116_001 93.623 81.263 24731000 24731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34854 2014 32455 316058;316059 402794;402795;402796 402794 3 NVQLQENEIR Unmodified 1241.6364 0.6364137 1041 F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;A0A087WYY5 PPP1CC Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 39.567 39.567 2 0.0023173 34668 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.601 62.383 294650000 0 0 0 142670000 0 114280000 0 0 0 37694000 0 0 0 34855 1041 32456 316060;316061;316062 402797;402798;402799 402799 3 NVQLTENEIR Unmodified 1214.6255 0.62551466 2739 P62136;E9PMD7;F5H1L6;F5H037 PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 44.62 44.62 2 0.029731 41350 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.224 54.514 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34856 2739 32457 316063 402800 402800 1 NVQVFLISGGFR Unmodified 1335.7299 0.72992016 709 C9JBI3;P78330 PSPH Phosphoserine phosphatase yes no 0 0 0 1 119.28 119.28 2 0.00051689 121733 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.692 72.947 54407000 0 0 0 0 0 0 0 54407000 0 0 0 0 0 34857 709 32458 316064 402801;402802 402802 2 NVQVYNPTPNSLDVR Unmodified 1714.8638 0.86384745 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 76.764 76.764 2 0.01058 77918 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.262 43.384 38564000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38564000 34858 90 32459 316065 402803;402804 402804 2 NVRPDYLK Unmodified 1003.5451 0.5450795 1855 P04179 SOD2 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 19.852 19.852 2 0.023529 12195 QUIQUE_C1277_190116_001 113.41 64.908 6333000000 0 1293000000 1805800000 0 0 0 1443900000 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402814;402815;402816 402814 3 NVSGQIHLITLANNELK Unmodified 1863.0214 0.021410729 3672 X6RK58;Q8TCA0 LRRC20 Leucine-rich repeat-containing protein 20 yes no 0 0 0 1 1 92.115 92.115 3 0.038878 96406 QUIQUE_C1438_190116_001 31.818 25.382 23940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23940000 34863 3672 32464 316078;316079 402817;402818 402817 2 NVSIGIVGK Unmodified 885.52837 0.5283668 2244 P25786;F5GX11 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1 yes no 0 0 0 1 48.584 48.584 2 0.026099 43394 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.815 31.853 74976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74976000 0 0 0 34864 2244 32465 316080 402819 402819 1 NVSLGNVLAVAYATQR Unmodified 1674.9053 0.90531834 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 2 131.54 131.54 2;3 2.7381E-07 135644 QUIQUE_C1403_190116_001 142.38 129.18 720000000 58970000 40173000 51725000 61133000 61129000 40181000 0 62426000 66829000 45163000 74123000 72665000 85488000 34865 4330 32466 316081;316082;316083;316084;316085;316086;316087;316088;316089;316090;316091;316092;316093;316094;316095;316096;316097;316098 402820;402821;402822;402823;402824;402825;402826;402827;402828;402829;402830;402831;402832;402833;402834;402835;402836;402837;402838;402839 402825 20 NVSNDPDVIK Unmodified 1099.551 0.55095274 1076 G3V1P3;Q969J3 LOH12CR1 Loss of heterozygosity 12 chromosomal region 1 protein yes no 0 0 0 1 1 26.804 26.804 2 0.023795 20443 QUIQUE_C1277_190116_001 56.729 36.17 54167000 0 32122000 0 0 0 0 0 22045000 0 0 0 0 0 34866 1076 32467 316099;316100 402840;402841 402840 2 NVSNLKPVPLIGPK Unmodified 1474.8871 0.88714908 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.557 59.557 2 0.0017421 58480 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.69 116.03 685870000 53640000 64484000 82959000 73284000 0 38754000 0 67494000 76112000 0 95884000 58908000 74356000 34867 3629 32468 316101;316102;316103;316104;316105;316106;316107;316108;316109;316110 402842;402843;402844;402845;402846;402847;402848;402849;402850;402851 402848 10 NVSQHLEDLER Unmodified 1338.6528 0.65279205 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 40.371 40.371 2 0.017219 36807 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.633 30.698 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34868 2486 32469 316111 402852 402852 1 NVSSILGFDSNQLPANAPIEDRR Unmodified 2512.267 0.26701374 4365 Q9P0J1;E5RIV4;E5RIE5;E5RI96 PDP1 [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 111.75 111.75 3 3.8195E-08 115775 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.975 63.886 101070000 0 0 0 0 0 0 0 0 58042000 0 0 0 43032000 34869 4365 32470 316112;316113 402853;402854 402853 2 NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMR 2 Oxidation (M) 2903.3753 0.37531992 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 2 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 134.74 134.74 2;3 2.1638E-91 131187 QUIQUE_DMIX4_190116_001 168.32 159.82 1069000000 99216000 85692000 60924000 0 74717000 0 0 0 91592000 352040000 106760000 36852000 161240000 + 34870 776 32471 316114;316115;316116;316117;316118;316119;316120;316121;316122;316123 402855;402856;402857;402858;402859;402860;402861;402862;402863;402864 402860 467;468 10 NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMR Oxidation (M) 2887.3804 0.3804053 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 153.24 153.24 2;3 1.1435E-43 155977 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.4 125.49 1058400000 112290000 89547000 85163000 84489000 88794000 92335000 76605000 115210000 0 313930000 0 0 0 + 34871 776 32471 316124;316125;316126;316127;316128;316129;316130;316131;316132;316133 402865;402866;402867;402868;402869;402870;402871;402872;402873;402874;402875;402876;402877;402878 402876 467;468 14 NVSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMR Unmodified 2871.3855 0.38549067 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 160.33 160.33 2;3 1.0924E-177 167752 QUIQUE_DMIX5_190116_001 288.21 270.72 1025000000 0 35756000 0 0 41342000 0 30546000 86236000 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316178;316179;316180;316181;316182;316183;316184;316185;316186;316187;316188;316189;316190;316191 402928;402929;402930;402931;402932;402933;402934;402935;402936;402937;402938;402939;402940;402941;402942;402943;402944;402945;402946;402947;402948;402949;402950;402951;402952 402942 25 NVTESPSFSAGDNPPVLFSSDFR Unmodified 2469.1448 0.14483292 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 0 2 2 1 133.11 133.11 2;3 3.6806E-31 139630 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.35 153.48 235750000 0 0 0 0 0 0 96002000 0 0 0 103540000 0 36214000 34876 2173 32475 316192;316193;316194;316195;316196 402953;402954;402955;402956;402957;402958 402957 5 NVTHIDQALQEAHR Unmodified 1630.8176 0.81756596 1037 F8VVX6;Q5HYK3;B4DP72 COQ5 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.296 35.296 3 2.8391E-07 31636 QUIQUE_C1218_190116_001 106.3 84.068 325400000 41642000 51939000 0 32333000 0 0 40084000 28371000 37811000 13160000 43850000 0 36207000 34877 1037 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403048;403049;403050;403051;403052;403053;403054;403055;403056;403057;403058;403059;403060;403061;403062;403063 403049 16 NVVLPTETEVAPAKDVTLLK Unmodified 2136.2042 0.2041857 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 100.1 100.1 2;3 5.8569E-06 103209 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.36 73.54 890740000 0 0 0 0 0 0 0 290210000 179890000 0 145160000 119940000 155540000 34889 880 32488 316284;316285;316286;316287;316288;316289;316290 403064;403065;403066;403067;403068;403069;403070;403071;403072 403068 9 NVVLQTLEGHLR Unmodified 1377.7728 0.7728476 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 1 3 89.417 89.417 2;3 0.00015723 90427 QUIQUE_C1563_190116_001 102.4 89.264 1103400000 156090000 144570000 203440000 0 0 99923000 135390000 0 51077000 0 140840000 43308000 128800000 34890 3057 32489 316291;316292;316293;316294;316295;316296;316297;316298;316299;316300;316301;316302;316303;316304;316305 403073;403074;403075;403076;403077;403078;403079;403080;403081;403082;403083;403084;403085;403086;403087;403088;403089 403078 15 NVVLSGGSTMFR Unmodified 1266.6391 0.63905624 4374 Q9P1U1 ACTR3B Actin-related protein 3B yes yes 0 0 0 1 1 75.329 75.329 2 0.017932 76034 QUIQUE_C1277_190116_001 65.5 45.714 127940000 0 77490000 0 50445000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34891 4374 32490 316306;316307 403090;403091 403090 2 NVVMFVAQVLVGK Unmodified 1402.8006 0.80064226 3453 Q7Z2W4;C9J6P4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 158.16 158.16 2 0.0020776 160926 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.111 73.349 76787000 0 0 0 0 0 0 19471000 16491000 0 0 20108000 20716000 0 34892 3453 32491 316308;316309;316310;316311;316312;316313;316314 403092;403093;403094;403095;403096;403097;403098 403094 7 NVVTIFSAPNYCYR Unmodified 1702.8137 0.81372614 2758;2789 P62714;H0YC23;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 3 109.54 109.54 2;3 2.9518E-22 113018 QUIQUE_C1368_190116_001 196.48 172.14 4928200000 224870000 394380000 354390000 318490000 392910000 301080000 413180000 419650000 421580000 121950000 482810000 492470000 590390000 34893 2758;2789 32492 316315;316316;316317;316318;316319;316320;316321;316322;316323;316324;316325;316326;316327;316328;316329;316330 403099;403100;403101;403102;403103;403104;403105;403106;403107;403108;403109;403110;403111;403112;403113;403114;403115;403116;403117;403118 403104 20 NVVVVDGVR Unmodified 955.54508 0.5450795 2660 P55084;F5GZQ3;B5MD38;C9JEY0;C9JE81;C9K0M0 HADHB Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial;3-ketoacyl-CoA thiolase yes no 0 0 0 1 1 38.473 38.473 2 0.011592 34912 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.36 71.548 706810000 0 0 0 0 318670000 0 0 388140000 0 0 0 0 0 34894 2660 32493 316331;316332 403119;403120 403120 0 NVWVHLDGPGVTR Unmodified 1448.7524 0.75244651 1785 P00488 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[ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 22.764 22.764 2;3 4.7952E-05 16555 QUIQUE_C1218_190116_001 137.46 97.458 1352900000 302780000 0 178480000 301950000 0 0 140680000 0 84649000 0 155940000 99939000 88498000 34900 1711 32498 316364;316365;316366;316367;316368;316369;316370;316371;316372;316373 403153;403154;403155;403156;403157;403158;403159;403160;403161;403162 403154 9 NWCEEQYSGGCYTTYFPPGILTQYGR Unmodified 3146.3539 0.35385619 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 1 1 149.17 149.17 3 2.9114E-05 154479 QUIQUE_C1368_190116_001 48.759 47.605 97644000 0 0 40078000 35061000 0 22506000 0 0 0 0 0 0 0 34901 2261 32499 316374;316375;316376 403163;403164;403165 403163 3 NWDPAQLSR Unmodified 1085.5254 0.52540669 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;B7Z7G7 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 1 1 1 64.89 64.89 2 0.019974 65381 QUIQUE_C1438_190116_001 62.546 46.344 162110000 0 38240000 0 0 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yes 0 0 1 1 105.22 105.22 3 0.015985 108568 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.672 34.458 81514000 0 0 0 0 0 0 0 0 81514000 0 0 0 0 34926 1384 32523 316572 403418 403418 1 NWTIHTWIR Unmodified 1225.6356 0.63562584 1104 G5EA06;Q92552;D6RH20;D6RJC7 MRPS27 28S ribosomal protein S27, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 83.811 83.811 3 0.0005986 86540 QUIQUE_C1218_190116_001 97.431 81.801 87449000 11476000 11057000 13469000 0 13860000 0 0 16657000 0 5303900 15626000 0 0 34927 1104 32524 316573;316574;316575;316576;316577;316578;316579 403419;403420;403421;403422;403423;403424;403425;403426 403419 8 NWVQTLRPVSAK Unmodified 1397.7779 0.77793298 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 57.397 57.397 3 0.0039925 54945 QUIQUE_C1563_190116_001 54.7 40.442 189890000 32686000 40635000 0 39508000 37345000 39719000 0 0 0 0 0 0 0 34928 2285 32525 316580;316581;316582;316583;316584 403427;403428;403429;403430;403431 403431 4 NWYVQPSCATSGDGLYEGLTWLTSNYK Unmodified 3109.4128 0.41275128 2753 P62330 ARF6 ADP-ribosylation factor 6 yes yes 0 0 0 1 1 165.61 165.61 3 0.00087677 170129 QUIQUE_DMIX8_190116_001 37.283 35.145 57737000 0 0 33630000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24107000 34929 2753 32526 316585;316586 403432;403433 403433 2 NYAAALETFTEGQK Unmodified 1541.7362 0.73618733 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.61 100.61 2 2.2628E-52 104958 QUIQUE_C1218_190116_001 213.81 189.59 1110400000 93144000 94750000 88427000 81419000 108280000 102420000 101540000 55463000 72828000 50118000 71962000 95484000 94596000 34930 4572 32527 316587;316588;316589;316590;316591;316592;316593;316594;316595;316596;316597;316598;316599 403434;403435;403436;403437;403438;403439;403440;403441;403442;403443;403444;403445;403446;403447;403448;403449;403450 403434 12 NYAELTVMK Unmodified 1067.5321 0.53213155 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 61.918 61.918 2 0.011932 60565 QUIQUE_C1403_190116_001 72.038 49.147 83560000 0 31883000 0 24078000 0 0 0 27600000 0 0 0 0 0 34931 310;830 32528 316600;316601;316602 403451;403452;403453 403452 3 NYAEYQVCLAAVGLVGDLCR Unmodified 2270.0824 0.082372781 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 155.96 155.96 3 0.0043231 161548 QUIQUE_C1218_190116_001 42.529 24.234 50867000 15934000 0 0 0 0 0 0 0 0 9916000 0 25017000 0 34932 3090 32529 316603;316604;316605 403454;403455;403456 403454 1 NYAPVAMLQSAMTR Unmodified 1551.7538 0.75376842 3426 Q6ZTR5 CXorf22 Uncharacterized protein CXorf22 yes yes 0 0 0 1 54.97 54.97 2 0.015621 53449 QUIQUE_C1368_190116_001 52.579 30.049 57465000 0 0 57465000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34933 3426 32530 316606 403457 403457 1 NYCGLPGEYWLGNDK Unmodified 1784.7828 0.78281994 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.24 115.24 2 3.8836E-18 118964 QUIQUE_C1368_190116_001 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Somatotropin;Growth hormone variant;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1 yes no 0 0 0 1 1 1 107.37 107.37 2 1.8443E-13 111936 QUIQUE_C1218_190116_001 185.42 162.68 1682300000 1580900000 0 0 0 0 0 101350000 0 0 0 0 0 0 34952 493 32549 316709;316710;316711 403588;403589;403590;403591;403592 403589 5 NYGPEVWEDIKK Unmodified 1476.7249 0.72489436 2867 Q02153;E9PCN2 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 74.701 74.701 3 0.0017779 70776 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.754 39.067 15780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15780000 0 0 0 34953 2867 32550 316712 403593;403594 403593 2 NYGSYSTQASAAAATAELLK Unmodified 2015.98 0.97999942 1449 O14828 SCAMP3 Secretory carrier-associated membrane protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 109.52 109.52 2 1.482E-05 112044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.1 92.966 65676000 0 0 0 0 0 0 0 25240000 40436000 0 0 0 0 34954 1449 32551 316713;316714 403595;403596 403595 1 NYHIFYR Unmodified 1011.4926 0.49265 153 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ribonucleoprotein U-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.197 83.197 2 8.2054E-54 83415 QUIQUE_C1563_190116_001 190.15 144.99 620520000 31637000 44027000 57062000 55089000 49710000 50192000 51926000 65146000 0 20469000 70138000 65831000 59297000 34958 142 32554 316721;316722;316723;316724;316725;316726;316727;316728;316729;316730;316731;316732 403603;403604;403605;403606;403607;403608;403609;403610;403611;403612;403613;403614 403608 12 NYILSASASALWNDEVDKAEQELR Unmodified 2721.3246 0.3245882 667 B7ZC38;Q9NR46 SH3GLB2 Endophilin-B2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.31 150.31 3 9.2527E-88 153287 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.03 172.18 805320000 92700000 87720000 0 0 72767000 64583000 0 121710000 82844000 0 140780000 63971000 78246000 34959 667 32555 316733;316734;316735;316736;316737;316738;316739;316740;316741 403615;403616;403617;403618;403619;403620;403621;403622;403623;403624 403619 9 NYILSTQDR Unmodified 1108.5513 0.55128709 2627 P53609 PGGT1B Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 40.572 40.572 2 0.030278 37330 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.208 41.066 20323000 0 0 0 0 20323000 0 0 0 0 0 0 0 0 34960 2627 32556 316742;316743;316744;316745 403625;403626;403627;403628 403626 4 NYIMDFQVGK Unmodified 1213.5801 0.58014438 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.908 96.908 2 0.0018596 99387 QUIQUE_C1368_190116_001 93.162 79.166 1269200000 99765000 127660000 174360000 0 73724000 102310000 79708000 51322000 127640000 56945000 124520000 138880000 112320000 34961 1961 32557 316746;316747;316748;316749;316750;316751;316752;316753;316754;316755;316756;316757 403629;403630;403631;403632;403633;403634;403635;403636;403637;403638;403639;403640 403631 12 NYIMDFQVGKEFEEDLTGIDDR Unmodified 2633.1955 0.19554786 1961 P09455;A0A0A0MQT0;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 152.57 152.57 3 0.068838 160069 QUIQUE_DMIX5_190116_001 26.064 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107.57 88.303 815140000 101200000 97738000 75750000 59436000 58642000 60374000 69630000 40259000 67463000 12603000 58205000 60015000 53825000 34965 618 32560 316765;316766;316767;316768;316769;316770;316771;316772;316773;316774;316775;316776;316777 403649;403650;403651;403652;403653;403654;403655;403656;403657;403658;403659;403660;403661;403662 403653 14 NYIQSLTQMPK Unmodified 1321.67 0.67002202 627 B4E0K5;Q16539 MAPK14 Mitogen-activated protein kinase 14 yes no 0 0 0 1 89.824 89.824 2 0.051419 92527 QUIQUE_C1368_190116_001 51.528 32.257 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34966 627 32561 316778 403663 403663 1 NYISQYSEIAIQMMMHMQPK Unmodified 2442.1204 0.12041455 1924 P07602 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes yes 0 0 0 1 162.37 162.37 3 0.0075034 169901 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.477 44.883 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34967 1924 32562 316779 403664 403664 1 NYITMDELR Unmodified 1153.5438 0.54375887 2047;1242 H9KV75;H0YJW3;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 78.811 78.811 2 0.01218 75680 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.692 46.873 73408000 0 0 58103000 0 0 0 0 0 0 15305000 0 0 0 34968 1242;2047 32563 316780;316781;316782;316783;316784;316785 403665;403666;403667;403668;403669;403670 403669 6 NYITMDELRR Unmodified 1309.6449 0.6448699 2047;1242 H9KV75;H0YJW3;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 1 1 1 1 1 59.612 59.612 3 0.01279 58709 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.715 33.35 136700000 0 0 0 0 0 0 0 18709000 0 0 44735000 29565000 43690000 34969 1242;2047 32564 316786;316787;316788;316789 403671;403672;403673;403674 403673 4 NYIVEDGDIIFFK Unmodified 1571.7872 0.78716026 1276 J3KQ32;Q9NTK5 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.61 130.61 2 9.5161E-06 127315 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.83 105.69 2301700000 259640000 243710000 0 0 227080000 0 221390000 278850000 229340000 124190000 262620000 254930000 200000000 34970 1276 32565 316790;316791;316792;316793;316794;316795;316796;316797;316798;316799;316800 403675;403676;403677;403678;403679;403680;403681;403682;403683;403684;403685;403686;403687 403684 12 NYKPVVQTTGNAR Unmodified 1446.7579 0.75792582 195 A0A0R4J2G3;A0A0A0MTJ9;Q6PIU2 NCEH1 Neutral cholesterol ester hydrolase 1 yes no 0 0 1 1 1 17.359 17.359 2 0.019999 9548 QUIQUE_C1277_190116_001 77.379 65.513 26537000 0 14114000 0 12423000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34971 195 32566 316801;316802 403688;403689 403688 2 NYLAEGWALPITHTR Unmodified 1740.8948 0.89475365 2511 P48553 TRAPPC10 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 104.79 104.79 3 0.00042372 109502 QUIQUE_C1218_190116_001 69.729 59.095 195660000 30532000 33852000 0 27826000 22342000 22918000 29154000 0 0 0 0 0 29040000 34972 2511 32567 316803;316804;316805;316806;316807;316808;316809 403690;403691;403692;403693;403694;403695;403696;403697 403690 8 NYLAWYQQK Unmodified 1212.5928 0.59275797 1899 P06312 IGKV4-1 Ig kappa chain V-IV region yes yes 0 0 0 1 79.876 79.876 2 0.029232 81517 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protein kinase 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 60.091 60.091 2;3 0.00046765 58659 QUIQUE_C1403_190116_001 116.37 89.234 13745000000 1048600000 1074500000 1092300000 970010000 1069000000 916690000 1013400000 1051200000 1160600000 656520000 1426000000 1036400000 1229600000 34978 2281 32573 316844;316845;316846;316847;316848;316849;316850;316851;316852;316853;316854;316855;316856;316857;316858;316859;316860;316861;316862;316863;316864;316865;316866;316867;316868;316869 403738;403739;403740;403741;403742;403743;403744;403745;403746;403747;403748;403749;403750;403751;403752;403753;403754;403755;403756;403757;403758;403759;403760;403761;403762;403763;403764;403765;403766;403767;403768;403769;403770;403771;403772;403773;403774;403775;403776;403777;403778;403779;403780;403781;403782;403783;403784;403785;403786;403787;403788;403789;403790 403752 53 NYLNYGEEGAPGK Unmodified 1410.6416 0.64155866 1874 P05060 CHGB Secretogranin-1;PE-11;GAWK peptide;CCB peptide yes yes 0 0 0 1 1 54.79 54.79 2 0.0025603 53943 QUIQUE_C1218_190116_001 77.379 62.228 21210000 0 0 0 0 0 0 21210000 0 0 0 0 0 0 34979 1874 32574 316870;316871 403791;403792 403791 2 NYLPAINGIVFLVDCADHER Unmodified 2315.1369 0.13685119 4648 Q9Y6B6;Q9H029;D6R9R5;D6RD69;D6RDB2 SAR1B;DKFZp434B2017 GTP-binding protein SAR1b yes no 0 0 0 1 1 2 159.02 159.02 3 0.00038871 162510 QUIQUE_C1403_190116_001 42.711 34.062 39823000 0 0 0 39823000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34980 4648 32575 316872;316873;316874;316875 403793;403794;403795;403796;403797 403794 5 NYLPAINGIVFLVDCADHSR Unmodified 2273.1263 0.12628651 4262 Q9NR31;Q5SQT8 SAR1A GTP-binding protein SAR1a yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 158.53 158.53 3 4.93E-07 162914 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.21 64.391 677310000 71400000 0 0 112280000 43966000 69691000 68942000 57151000 78112000 0 120220000 0 55552000 34981 4262 32576 316876;316877;316878;316879;316880;316881;316882;316883;316884;316885;316886 403798;403799;403800;403801;403802;403803;403804;403805;403806;403807;403808;403809;403810;403811;403812 403812 15 NYLPNFIQSVLSSIDLR Unmodified 1978.0524 0.052376507 3115 Q15124;Q5JTY7 PGM5 Phosphoglucomutase-like protein 5 yes no 0 0 0 1 1 173.28 173.28 2 0.0028136 180553 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.283 62.072 15093000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15093000 0 0 34982 3115 32577 316887;316888 403813;403814 403814 2 NYLQSLPSK Unmodified 1048.5553 0.55530983 2263;897 E9PBK7;H0YEX6;E9PRH7;P27361;E9PQW4;E9PJF0;B3KR49 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.227 51.227 2 0.00044667 50042 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.89 90.365 3479400000 220120000 0 363420000 281640000 378910000 236920000 377190000 239260000 365420000 0 641260000 375240000 0 34983 897;2263 32578 316889;316890;316891;316892;316893;316894;316895;316896;316897;316898 403815;403816;403817;403818;403819;403820;403821;403822;403823;403824;403825;403826;403827 403824 11 NYLSCDVEVR Unmodified 1253.571 0.57103625 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 59.305 59.305 2 0.016206 57820 QUIQUE_C1368_190116_001 83.647 55.765 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34984 2463 32579 316899;316900;316901;316902;316903 403828;403829;403830;403831;403832 403829 5 NYLSCDVEVRR Unmodified 1409.6721 0.67214728 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 43.072 43.072 3 0.052912 39515 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.299 38.995 19752000 0 0 0 0 0 0 0 19752000 0 0 0 0 0 34985 2463 32580 316904 403833 403833 0 NYLSIFR Unmodified 911.4865 0.48650199 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.91 93.91 2 0.009894 98078 QUIQUE_C1218_190116_001 144.9 72.283 2036100000 173680000 160570000 189900000 151370000 183630000 119640000 164080000 151480000 165900000 76768000 175950000 167080000 156020000 34986 1921 32581 316905;316906;316907;316908;316909;316910;316911;316912;316913;316914;316915;316916;316917 403834;403835;403836;403837;403838;403839;403840;403841;403842;403843;403844;403845;403846;403847;403848;403849;403850;403851;403852;403853;403854 403834 21 NYLSQPR Unmodified 876.44537 0.44536545 2175 P21281;H0YC04;E5RGH6;H0YAT8 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.764 22.764 2 0.013339 15845 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.89 113.87 13238000000 1193700000 1309000000 1180800000 0 1099700000 968160000 1402000000 826970000 880970000 495790000 1293600000 1203000000 1383900000 34987 2175 32582 316918;316919;316920;316921;316922;316923;316924;316925;316926;316927;316928;316929 403855;403856;403857;403858;403859;403860;403861;403862;403863;403864;403865;403866;403867;403868 403866 14 NYLTNLLK Unmodified 977.55458 0.55458155 3016 Q13616;A0A0C4DGX4 CUL1 Cullin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.52 100.52 2 0.03696 103652 QUIQUE_C1277_190116_001 62.464 41.765 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403875;403876;403877;403878;403879;403880;403881;403882;403883;403884;403885 403881 11 NYMSNPSYNYEIVNR Oxidation (M) 1878.8207 0.82066201 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 68.892 68.892 2 9.7304E-54 68684 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.15 180.66 373490000 0 0 46366000 0 0 0 0 83204000 86609000 29854000 58928000 68528000 0 34991 3053 32585 316947;316948;316949;316950;316951;316952 403886;403887;403888;403889;403890;403891 403887 2502 6 NYNECIR Unmodified 967.41816 0.41816443 4185 Q9H832;D6RB11 UBE2Z Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Z yes no 0 0 0 1 19.702 19.702 2 0.028135 12527 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.467 68.28 63044000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63044000 34992 4185 32586 316953 403892 403892 1 NYNFGGEFVEAMIR Unmodified 1645.7559 0.75587691 2934 Q09161 NCBP1 Nuclear cap-binding protein subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 141.41 141.41 2 1.5697E-07 146207 QUIQUE_C1277_190116_001 114.86 101.91 26018000 0 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403923;403924;403925;403926;403927;403928;403929;403930;403931;403932;403933;403934;403935;403936;403937;403938;403939;403940 403935 17 NYPESYPQLPR Unmodified 1362.6568 0.65681479 3620 Q8N9R8 SCAI Protein SCAI yes yes 0 0 0 1 1 1 69.864 69.864 2 0.029342 67560 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.598 40.927 218600000 0 0 182820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35782000 34998 3620 32592 316992;316993;316994 403941;403942;403943 403942 2 NYPNTFWMNPQYLIK Oxidation (M) 1943.924 0.92400487 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.58 127.58 2 8.6175E-07 131714 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.9 107.32 1269800000 44846000 71150000 49198000 73721000 69680000 58721000 58923000 113040000 162920000 81748000 181390000 121510000 182990000 34999 2127 32593 316995;316996;316997;316998;316999;317000;317001;317002;317003;317004;317005;317006;317007 403944;403945;403946;403947;403948;403949;403950;403951;403952;403953;403954;403955;403956;403957;403958;403959 403953 1461 15 NYPNTFWMNPQYLIK Unmodified 1927.9291 0.92909025 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.75 142.75 2 1.015E-05 149023 QUIQUE_C1218_190116_001 103.08 88.184 2580700000 170600000 186150000 160300000 216090000 211490000 157590000 218370000 178230000 269140000 0 291820000 205930000 314950000 35000 2127 32593 317008;317009;317010;317011;317012;317013;317014;317015;317016;317017;317018;317019 403960;403961;403962;403963;403964;403965;403966;403967;403968;403969;403970;403971 403960 12 NYQFDFLRPQHSLFNYFTK Unmodified 2464.1964 0.19641498 3141 Q15459 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes yes 0 0 1 1 136.6 136.6 4 0.035611 141569 QUIQUE_DMIX3_190116_001 19.347 11.813 44420000 0 0 0 0 0 0 0 0 44420000 0 0 0 0 35001 3141 32594 317020 403972 403972 1 NYQFFIGENMNPDGMVALLDYR 2 Oxidation (M) 2638.1832 0.18320904 214 Q5W0H4;A0A0B4J2C3;P13693;J3KPG2;H0YCX0;E9PJF7 TPT1 Translationally-controlled tumor protein yes no 0 2 0 1 1 145.17 145.17 3 0.00012411 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144.1 3 0.0012198 151634 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.819 37.832 39112000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39112000 0 0 35010 3574 32603 317095 404065 404065 0 NYTNSPEESSK Unmodified 1254.5364 0.53642488 500 A0A3B3ITH3;Q9P2X3;J3QQU0 IMPACT Protein IMPACT yes no 0 0 0 1 13.825 13.825 2 0.014305 5890 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.294 63.068 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35011 500 32604 317096 404066 404066 1 NYTSVYDK Unmodified 988.45018 0.45017606 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;Q5SZC5 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.877 25.877 2 0.0036418 19074 QUIQUE_DMIX8_190116_001 117.4 103.73 3119400000 417880000 430110000 385220000 440840000 0 0 465740000 0 189720000 0 283070000 187330000 319530000 35012 4567 32605 317097;317098;317099;317100;317101;317102;317103;317104;317105 404067;404068;404069;404070;404071;404072;404073;404074;404075;404076 404076 7 NYTSVYDKNNLLTNK Unmodified 1785.8897 0.88972785 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6;Q5SZC5 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 58.112 58.112 3 2.8521E-06 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nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.753 52.753 2 0.0036871 49560 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.52 105.37 7297400000 792010000 950840000 669150000 412910000 670930000 453130000 619790000 795170000 337230000 351660000 358220000 619950000 266410000 35018 2200 32611 317133;317134;317135;317136;317137;317138;317139;317140;317141;317142;317143;317144;317145 404108;404109;404110;404111;404112;404113;404114;404115;404116;404117;404118;404119;404120;404121;404122;404123;404124;404125;404126;404127;404128;404129;404130;404131;404132;404133;404134 404129 27 NYYGYQGYR Unmodified 1182.5094 0.50942227 3208 Q1KMD3 HNRNPUL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.64 47.64 2 0.0070525 44861 QUIQUE_C1403_190116_001 82.671 66.527 858150000 0 95364000 56075000 65114000 61514000 70872000 80947000 90293000 75164000 18441000 87035000 67677000 89657000 35019 3208 32612 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VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 67.903 67.903 2;3 5.313E-13 68123 QUIQUE_C1277_190116_001 137.17 126 7844300000 614890000 714440000 706230000 729810000 801180000 470400000 693670000 349850000 702800000 278360000 661440000 502780000 618490000 35026 3958 32619 317197;317198;317199;317200;317201;317202;317203;317204;317205;317206;317207;317208;317209;317210 404203;404204;404205;404206;404207;404208;404209;404210;404211;404212;404213;404214;404215;404216;404217;404218 404205 15 PAAQPSFHQAQK Unmodified 1308.6575 0.65748349 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 0 1 1 1 2 12.86 12.86 3 9.15E-05 5443 QUIQUE_C1403_190116_001 90.005 71.498 45674000 28383000 0 0 2506700 0 14784000 0 0 0 0 0 0 0 35027 1753 32620 317211;317212;317213;317214;317215 404219;404220;404221;404222;404223;404224;404225 404221 6 PAASITSKPATLTTTSATSK Unmodified 1933.0368 0.036786022 1304 J3QRS9;X6R4W8;O43670;J3KS31 ZNF207 BUB3-interacting and GLEBS 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404266 0 PADEIAVDRDVPWGVDSLITLAFQDQR Unmodified 3025.5145 0.51451424 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 1 1 1 167.03 167.03 3 3.5995E-20 169028 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.596 86.221 499510000 0 0 0 0 0 0 0 247660000 0 0 0 0 251850000 35033 3187 32626 317254;317255 404267;404268 404267 2 PADLDLIQSTPFKPLALK Unmodified 1966.1139 0.11391413 4109;162 A0A0A0MS29;Q9GZY8;C9JHF5 MFF Mitochondrial fission factor no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.19 127.19 3 0.00018004 132674 QUIQUE_C1218_190116_001 81.692 77.649 482970000 56929000 47587000 53230000 54574000 64305000 77676000 44106000 0 33439000 16532000 0 0 34589000 35034 162;4109 32627 317256;317257;317258;317259;317260;317261;317262;317263;317264;317265 404269;404270;404271;404272;404273;404274;404275;404276;404277;404278;404279;404280 404269 12 PADVILDPDTANAILLVSEDQR Unmodified 2364.2173 0.21726958 1409 O00478;C9JZT5 BTN3A3 Butyrophilin subfamily 3 member A3 yes no 0 0 0 1 150.52 150.52 2 6.1133E-07 145930 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.527 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404354;404355;404356;404357;404358;404359;404360;404361;404362;404363;404364 404354 11 PAFSAIR Unmodified 760.42317 0.42317345 1828 X6RLJ0;P02745 C1QA Complement C1q subcomponent subunit A yes no 0 0 0 1 1 33.057 33.057 2 0.019551 29134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.7 45.704 222980000 0 0 149440000 0 0 0 0 73542000 0 0 0 0 0 35048 1828 32641 317336;317337 404365;404366 404366 2 PAFSNALEPDFK Unmodified 1334.6507 0.65066678 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 91.074 91.074 2 0.00052501 88417 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.76 120.9 177320000 64608000 53927000 0 0 58787000 0 0 0 0 0 0 0 0 35049 3043 32642 317338;317339;317340;317341;317342 404367;404368;404369;404370;404371 404371 3 PAGAAQLTVNSEK Unmodified 1284.6674 0.66737948 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 27.173 27.173 2 0.00047182 20603 QUIQUE_C1563_190116_001 120.77 105.16 266680000 66282000 69945000 0 0 0 54446000 0 0 0 35723000 0 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404384;404385;404386;404387;404388;404389;404390;404391;404392;404393;404394;404395;404396;404397;404398;404399;404400;404401;404402 404387 19 PAGPQLFLPDPDPQR Unmodified 1646.8417 0.84165545 4034 Q9BUH6 C9orf142 Protein PAXX yes yes 0 0 0 1 1 1 1 107.03 107.03 2 7.4299E-06 111798 QUIQUE_C1438_190116_001 106.35 84.15 138250000 18999000 37242000 0 0 50171000 0 0 0 0 0 0 0 31833000 35053 4034 32646 317368;317369;317370;317371 404403;404404;404405;404406 404405 2 PAHVGEMVLVSCPELFR Unmodified 1939.9648 0.96482383 918 E9PFU5;P41586 ADCYAP1R1 Pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide type I receptor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 110.43 110.43 3 8.0049E-05 114455 QUIQUE_C1576_190116_001 86.548 71.393 207520000 37688000 0 0 54176000 0 25909000 49616000 0 40129000 0 0 0 0 35054 918 32647 317372;317373;317374;317375;317376;317377;317378;317379 404407;404408;404409;404410;404411;404412;404413;404414 404413 8 PAHVVVGDVLQAADVDK Unmodified 1731.9155 0.91554867 2299 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404676;404677;404678;404679;404680;404681;404682;404683;404684;404685;404686;404687;404688;404689;404690;404691;404692;404693;404694;404695;404696;404697;404698;404699 404676 23 PALPFILR Unmodified 925.57492 0.57492306 3312 Q5T4S7;X6R960 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 1 107.49 107.49 2 0.040382 109823 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.294 52.362 17407000 0 0 0 0 0 0 0 17407000 0 0 0 0 0 35071 3312 32664 317577 404700;404701 404701 2 PALPYLDVDMMDICK Unmodified 1779.8246 0.8245501 4514 Q9UNS2;H7C3P9;C9JLV5 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 146.73 146.73 2 9.1655E-05 151275 QUIQUE_C1277_190116_001 96.103 78.629 18889000 0 18889000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35072 4514 32665 317578;317579;317580 404702;404703;404704 404703 3 PALQPELPTQEDPTPEILSESVGEK Unmodified 2703.3491 0.34907162 3469 Q7Z6L0;A0A0G2JLL6;A0A1B0GTP1;A0A1B0GTE9 PRRT2 Proline-rich transmembrane protein 2 yes no 0 0 0 1 2 129.14 129.14 2;3 1.0302E-17 132797 QUIQUE_C1403_190116_001 102.36 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14 PANFLDLGGGVK Unmodified 1186.6346 0.63462279 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 94.713 94.713 2 0.0012161 97486 QUIQUE_C1218_190116_001 105.52 59.571 113150000 71976000 0 0 0 0 0 0 0 0 41178000 0 0 0 35081 3878 32673 317632;317633 404758;404759;404760 404759 2 PANKQEDEVMR Unmodified 1315.619 0.61904908 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 0 1 1 12.796 12.796 3 0.00081806 5079 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.843 65.079 7317700 0 0 0 0 0 0 0 7317700 0 0 0 0 0 35082 1487 32674 317634 404761 404761 1 PANPPGLLALLDEECWFPK Unmodified 2166.082 0.081962076 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 168.96 168.96 2;3 0.025545 171876 QUIQUE_C1403_190116_001 51.211 45.932 75224000 0 0 0 31107000 17337000 0 26780000 0 0 0 0 0 0 35083 3459 32675 317635;317636;317637 404762;404763;404764 404762 2 PANPPGVLALLDEECWFPK Unmodified 2152.0663 0.066312011 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 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PAPMVFWK Oxidation (M) 990.49971 0.49970921 2434 U3KQG5;P41217;F8W7G1 CD200 OX-2 membrane glycoprotein yes no 0 1 0 1 1 69.591 69.591 2 0.013814 66799 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.673 71.638 81307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20882000 60425000 0 0 35093 2434 32684 317672;317673 404814;404815;404816 404814 1857 3 PAPPQRPPPPSGAR Unmodified 1423.7684 0.76843093 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;H7BZC2 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 17.177 17.177 3 0.025713 10258 QUIQUE_C1218_190116_001 58.071 42.431 192760000 72826000 0 47368000 0 0 38701000 33862000 0 0 0 0 0 0 35094 723 32685 317674;317675;317676;317677 404817;404818;404819;404820 404817 0 PAPSPSPVPGTVPGASER Unmodified 1701.8686 0.86859848 1318 K7ENB6;K7EK24;Q9NS82 SLC7A10 Asc-type amino acid transporter 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 54.861 54.861 2 3.6321E-05 53592 QUIQUE_C1218_190116_001 96.464 71.611 81360000 13840000 0 0 22150000 0 0 0 20918000 0 0 0 24451000 0 35095 1318 32686 317678;317679;317680;317681;317682 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Unmodified 1073.5757 0.57571092 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 54.916 54.916 2 0.0031468 53424 QUIQUE_C1218_190116_001 98.033 70.151 238620000 136110000 0 0 0 0 0 0 102510000 0 0 0 0 0 35098 2990 32689 317695;317696 404838;404839 404838 2 PAPYFER Unmodified 878.42865 0.42865276 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3KT37;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 35.768 35.768 2 0.036465 31951 QUIQUE_C1218_190116_001 86.086 69.16 422190000 121080000 0 86137000 0 55879000 119540000 0 0 0 39555000 0 0 0 35099 143;560;4559 32690 317697;317698;317699;317700;317701 404840;404841;404842;404843;404844 404840 5 PAQALTFAK Unmodified 945.52837 0.5283668 177 A0A0A0MSK4;A0A0A0MRC4;Q86YR5;A0A087WVF5 GPSM1 G-protein-signaling modulator 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 37.753 37.753 2 0.0061041 34005 QUIQUE_C1218_190116_001 85.161 47.553 166780000 31562000 32197000 0 0 0 0 0 22102000 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35107 1693 32698 317751 404895 404895 1 PASPALSEGSSSEATTPVISSVAER Unmodified 2429.1922 0.19217704 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 2 85.101 85.101 2;3 6.3038E-196 87605 QUIQUE_C1218_190116_001 292.28 273.55 811210000 138570000 91936000 0 37894000 104660000 27403000 0 96074000 63079000 17424000 74994000 38610000 120560000 35108 921 32699 317752;317753;317754;317755;317756;317757;317758;317759;317760;317761;317762;317763;317764;317765;317766;317767;317768 404896;404897;404898;404899;404900;404901;404902;404903;404904;404905;404906;404907;404908;404909;404910;404911;404912;404913 404896 16 PASPATETVPAFSER Unmodified 1558.7627 0.76273643 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 64.45 64.45 2 8.4144E-29 64625 QUIQUE_C1218_190116_001 160.15 125.43 321910000 61733000 50000000 68557000 0 0 63496000 0 0 0 35966000 42157000 0 0 35109 3432 32700 317769;317770;317771;317772;317773;317774;317775 404914;404915;404916;404917;404918;404919;404920 404914 7 PASPVAGSPK Unmodified 909.49198 0.4919813 2963 Q13057;K7EN91 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 0 1 13.863 13.863 2 0.061443 5925 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.436 5.1111 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35110 2963 32701 317776 404921 404921 1 PASTPVIFAGGQVR Unmodified 1398.7619 0.76194857 916 E9PFP8 PCBP3 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.185 71.185 2 8.2447E-07 71833 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.63 86.434 731480000 61334000 85383000 112610000 66602000 44872000 56904000 54350000 53930000 54091000 16277000 62668000 62456000 0 35111 916 32702 317777;317778;317779;317780;317781;317782;317783;317784;317785;317786;317787;317788;317789 404922;404923;404924;404925;404926;404927;404928;404929;404930;404931;404932;404933;404934;404935;404936;404937;404938;404939;404940 404938 19 PASVSENHDAGPDGDK Unmodified 1594.6859 0.68594267 4172;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 10.547 10.547 3 0.0013958 2995 QUIQUE_C1403_190116_001 56.407 43.78 15200000 0 0 0 15200000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35112 1230;4172 32703 317790 404941 404941 1 PASVSENHDAGPDGDKR Unmodified 1750.7871 0.7870537 4172;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 1 1 10.487 10.487 4 0.00018882 2847 QUIQUE_C1563_190116_001 57.499 50.771 3887500 0 0 0 0 0 3887500 0 0 0 0 0 0 0 35113 1230;4172 32704 317791 404942 404942 1 PASVSENHDAGPDGDKRDEDGESGGQR Unmodified 2781.1822 0.18223407 4172;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 13.097 13.097 4;5 1.7137E-44 4964 QUIQUE_DMIX8_190116_001 137.16 129.64 264880000 7289100 0 17757000 0 24293000 0 0 33156000 32550000 0 25316000 50515000 74001000 35114 1230;4172 32705 317792;317793;317794;317795;317796;317797;317798;317799;317800;317801;317802;317803;317804;317805;317806 404943;404944;404945;404946;404947;404948;404949;404950;404951;404952;404953;404954;404955;404956;404957;404958 404958 16 PATEAELLTCHSAEYVGHLR Unmodified 2253.0848 0.084815622 4402 Q9UBN7;A0A2R8YDE6 HDAC6 Histone deacetylase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.664 80.664 4 2.8574E-07 83005 QUIQUE_C1438_190116_001 67.655 63.129 706420000 115120000 106970000 99640000 69806000 62917000 72802000 0 0 0 0 57616000 49089000 72467000 35115 4402 32706 317807;317808;317809;317810;317811;317812;317813;317814;317815 404959;404960;404961;404962;404963;404964;404965;404966;404967 404963 8 PATFTDTTHYPLLLVVDGTPGSQSVAEK Unmodified 2943.4866 0.48656815 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 133.47 133.47 3 5.3038E-16 138249 QUIQUE_C1218_190116_001 83.465 76.666 41675000 41675000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35116 914 32707 317816 404968 404968 1 PATGERK Unmodified 757.40825 0.40825167 551 A6NNK5;Q12888;C9JXV0 TP53BP1 Tumor suppressor p53-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 27.937 27.937 2 0.057254 21967 QUIQUE_C1576_190116_001 84.359 0 113120000 0 0 0 0 0 0 57411000 0 0 0 0 55709000 0 35117 551 32708 317817;317818 404969;404970 404969 2 PATGYPLPPQIFNESQYR Unmodified 2077.0269 0.026890038 1627 O75368 SH3BGRL SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 120.54 120.54 3 0.011444 124164 QUIQUE_C1368_190116_001 37.292 29.719 68667000 0 23813000 36455000 0 0 0 0 0 0 8399100 0 0 0 35118 1627 32709 317819;317820;317821;317822 404971;404972;404973;404974 404973 2 PATLTTTSATSK Unmodified 1177.619 0.6190323 1304 J3QRS9;X6R4W8;O43670;J3KS31 ZNF207 BUB3-interacting and GLEBS motif-containing protein ZNF207 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 18.192 18.192 2 9.0038E-08 10439 QUIQUE_C1403_190116_001 148.56 128.25 388160000 68764000 50783000 0 86694000 0 49848000 0 0 0 21952000 35559000 0 74564000 35119 1304 32710 317823;317824;317825;317826;317827;317828;317829 404975;404976;404977;404978;404979;404980;404981 404977 7 PATLTVTNFFK Unmodified 1237.6707 0.67067394 3908 Q96N67;A0A0U1RQT6;A0A1B0GUE9;Q96HP0 DOCK7;DOCK6 Dedicator of cytokinesis protein 7;Dedicator of cytokinesis protein 6 yes no 0 0 0 1 110.41 110.41 2 0.03115 113439 QUIQUE_C1403_190116_001 70.908 59.414 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35120 3908 32711 317830 404982 404982 1 PATPLVPCR Unmodified 1009.5379 0.53788563 3996 Q9BQI5 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.445 36.445 2 0.0017799 31575 QUIQUE_C1563_190116_001 100.19 57.188 253820000 46692000 46389000 33697000 56574000 0 32065000 38402000 0 0 0 0 0 0 35121 3996 32712 317831;317832;317833;317834;317835;317836 404983;404984;404985;404986;404987;404988 404987 6 PAVEAYGEFLCMFEENYPETLK Unmodified 2636.1815 0.1814777 1680 O76054;B3KRD8;C9JZI9;H7C4C6 SEC14L2 SEC14-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 167.41 167.41 3 0.00084613 170566 QUIQUE_C1403_190116_001 44.341 36.538 60331000 0 0 22043000 21369000 0 16919000 0 0 0 0 0 0 0 35122 1680 32713 317837;317838;317839 404989;404990;404991 404990 3 PAVLAAPSGLER Unmodified 1179.6612 0.66117189 4129 Q9H1B7 IRF2BPL Interferon regulatory factor 2-binding protein-like yes yes 0 0 0 1 61.346 61.346 2 0.019877 60220 QUIQUE_C1403_190116_001 59.426 37.34 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35123 4129 32714 317840 404992 404992 1 PAVLGFEGSANK Unmodified 1188.6139 0.61388734 4243 Q9NPF4;G3V445 OSGEP Probable tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase yes no 0 0 0 1 55.789 55.789 2 0.0058509 51083 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.5 43.414 14118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14118000 0 0 0 35124 4243 32715 317841 404993 404993 1 PAVLQVECHPYLAQNELIAHCQAR Unmodified 2816.385 0.38503716 2076 P14550 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 3 2 1 83.354 83.354 3;4 4.9103E-128 85015 QUIQUE_C1277_190116_001 209.75 200.42 3617400000 52790000 495700000 581190000 668720000 447790000 544370000 579550000 0 0 0 0 0 247350000 35125 2076 32716 317842;317843;317844;317845;317846;317847;317848;317849;317850;317851;317852;317853;317854;317855;317856 404994;404995;404996;404997;404998;404999;405000;405001;405002;405003;405004;405005;405006;405007;405008 404996 14 PAVTTLVVK Unmodified 926.58007 0.58006802 533 A6NEM2;P51610 HCFC1 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 0 0 0 1 46.276 46.276 2 0.027067 43445 QUIQUE_C1218_190116_001 58.119 31.896 17657000 17657000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35126 533 32717 317857 405009 405009 1 PAVVTVGDFPEEDYGLDEI Unmodified 2063.9575 0.95753265 3951 Q99426 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.37 160.37 2 4.5508E-06 162519 QUIQUE_C1563_190116_001 137.89 132.62 400580000 51226000 43180000 0 44465000 48393000 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405025;405026;405027;405028;405029;405030;405031;405032;405033;405034;405035;405036;405037;405038;405039;405040 405034 2411 16 PAWLWGAEMGANEHGVCIANEAINTR Unmodified 2866.3279 0.32791621 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 0 2 3 4 2 4 6 1 1 1 2 134.41 134.41 3 7.4916E-70 137795 QUIQUE_C1218_190116_001 159.98 153.89 1325700000 96932000 106880000 204460000 77229000 0 145740000 434150000 0 0 0 102150000 31303000 126880000 35130 2941 32720 317882;317883;317884;317885;317886;317887;317888;317889;317890;317891;317892;317893;317894;317895;317896;317897;317898;317899;317900;317901;317902;317903;317904;317905;317906;317907 405041;405042;405043;405044;405045;405046;405047;405048;405049;405050;405051;405052;405053;405054;405055;405056;405057;405058;405059;405060;405061;405062;405063;405064;405065;405066;405067;405068;405069 405041 22 PAYHSSLMDPDTK Unmodified 1460.6606 0.66057954 1487 O15145;C9JZD1 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 33.282 33.282 2;3 4.473E-17 27941 QUIQUE_DMIX8_190116_001 160.77 144.76 2032000000 107770000 185440000 156650000 172450000 170840000 194670000 209840000 162270000 145670000 67235000 251220000 162820000 45128000 35131 1487 32721 317908;317909;317910;317911;317912;317913;317914;317915;317916;317917;317918;317919;317920;317921;317922;317923;317924;317925;317926;317927;317928 405070;405071;405072;405073;405074;405075;405076;405077;405078;405079;405080;405081;405082;405083;405084;405085;405086;405087;405088;405089;405090;405091 405091 14 PAYQGSNPISDIWAIHALR Unmodified 2108.0803 0.080322592 3542 Q8IWW8 ADHFE1 Hydroxyacid-oxoacid transhydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 127.79 127.79 3 0.00018995 125260 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.105 60.884 156840000 0 0 68631000 0 0 0 69308000 0 0 18905000 0 0 0 35132 3542 32722 317929;317930;317931 405092;405093;405094 405094 1 PCCYIFPGGR Unmodified 1225.5372 0.5372337 2483;921 E9PGC8;P78559;P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1A;MAP1B Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2;Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.508 66.508 2 0.0016861 66403 QUIQUE_C1277_190116_001 94.662 83.833 561440000 0 117980000 125400000 0 110580000 127600000 0 17717000 32624000 29548000 0 0 0 35133 921;2483 32723 317932;317933;317934;317935;317936;317937;317938 405095;405096;405097;405098;405099;405100;405101 405095 6 PCKPLLTLGLDYTGISWK Unmodified 2061.0969 0.096883858 4259 Q9NQW7;Q5T6H7;Q5T6H2 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 135.07 135.07 3 0.00012493 140862 QUIQUE_C1576_190116_001 86.479 77.383 89315000 0 36734000 21921000 0 0 0 30659000 0 0 0 0 0 0 35134 4259 32724 317939;317940;317941 405102;405103;405104 405104 3 PCNHVLSLSFPIR Unmodified 1538.8028 0.80276752 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 3 2 1 1 1 2 1 89.723 89.723 2;3 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32753 318136;318137;318138;318139;318140;318141;318142;318143;318144;318145;318146;318147;318148 405343;405344;405345;405346;405347;405348;405349;405350;405351;405352;405353;405354;405355;405356;405357 405346 14 PENLLCMGPELVK Unmodified 1498.7524 0.75237144 4525 Q9UPZ9 ICK Serine/threonine-protein kinase ICK no no 0 0 0 1 1 65.423 65.423 3 0.026838 63742 QUIQUE_C1403_190116_001 27.862 5.1412 86114000 0 0 0 17849000 0 0 0 0 0 68265000 0 0 0 35164 4525 32754 318149;318150 405358;405359 405358 2 PEPATGYTLEFR Unmodified 1379.6721 0.67213051 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 1 82.906 82.906 2 0.00048665 80217 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.24 67.242 57293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27595000 29698000 0 0 35165 3187 32755 318151;318152 405360;405361;405362 405360 3 PEVLPDEVPEALR Unmodified 1462.7668 0.76675917 200 A0A0A0MTS7;H7C0U7 TTN yes no 0 0 0 1 52.185 52.185 4 0.057716 49647 QUIQUE_DMIX1_190116_001 20.427 4.2894 223630000 0 0 0 0 0 0 0 223630000 0 0 0 0 0 35166 200 32756 318153 405363 405363 1 PEYAYGSAGSPPK Unmodified 1322.6143 0.61428128 2876 Q02790;F5H1U3 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 131.07 131.07 2 0.035257 134907 QUIQUE_C1403_190116_001 46.158 0.7902 25024000 0 0 0 25024000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35167 2876 32757 318154 405364 405364 1 PEYMLPVHFYGR Unmodified 1507.7282 0.7282056 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 97.927 97.927 3 0.0057585 101856 QUIQUE_C1438_190116_001 43.501 32.857 124990000 29761000 0 32492000 24706000 16294000 21742000 0 0 0 0 0 0 0 35168 2016 32758 318155;318156;318157;318158;318159 405365;405366;405367;405368;405369 405368 5 PFAGGGYR Unmodified 823.39769 0.39768698 4516 Q9UNZ2;F2Z2K0 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes no 0 0 0 1 1 21.727 21.727 2 0.019034 14645 QUIQUE_C1368_190116_001 78.994 55.117 127330000 0 0 68560000 0 0 0 58766000 0 0 0 0 0 0 35169 4516 32759 318160;318161 405370;405371 405370 2 PFENGQYLDIYGITR Unmodified 1784.8733 0.87334951 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 123.91 123.91 2 3.9766E-09 129155 QUIQUE_C1218_190116_001 130.1 107.18 51620000 0 0 0 51620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35170 3455 32760 318162;318163;318164;318165 405372;405373;405374;405375 405372 4 PFETLLSQNQGGK Unmodified 1417.7201 0.72014333 1957 P09211;A0A087X243 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes no 0 0 0 1 2 1 71.583 71.583 2 8.1715E-05 69349 QUIQUE_C1563_190116_001 103.08 59.571 25438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25438000 0 0 0 35171 1957 32761 318166;318167;318168;318169 405376;405377;405378;405379 405377 4 PFEVPFLK Unmodified 975.54295 0.54295423 536 A6NFX8;Q9UKK9 NUDT5 ADP-sugar pyrophosphatase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 115.71 115.71 2 0.0014623 121080 QUIQUE_C1218_190116_001 141.78 79.068 315570000 31206000 30196000 29831000 44922000 27931000 33690000 29300000 0 17155000 29149000 9869400 15546000 16771000 35172 536 32762 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405423;405424;405425;405426;405427;405428;405429;405430;405431;405432;405433;405434;405435;405436;405437;405438;405439;405440;405441;405442 405437 18 PFFPGLVK Unmodified 903.52182 0.52182486 3222;1572 O60361;Q32Q12;J3KPD9;P22392;F6XY72 NME2P1;NME1-NME2;NME2 Putative nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B no no 0 0 0 1 1 1 1 90.545 90.545 2 0.029575 91419 QUIQUE_C1563_190116_001 67.741 41.262 10717000 0 0 0 0 0 10717000 0 0 0 0 0 0 0 35177 1572;3222 32766 318222;318223;318224;318225 405443;405444;405445;405446 405444 4 PFGCVTLGDK Unmodified 1092.5274 0.52738052 3632;872 E7ETR1;B4DSW8;F8WDJ4;Q8NCB2;C9J9E2;C9JSB2 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.205 59.205 2 0.0045032 57721 QUIQUE_C1277_190116_001 80.688 53.434 314690000 88397000 71850000 0 0 40967000 39356000 51928000 0 0 22192000 0 0 0 35178 872;3632 32767 318226;318227;318228;318229;318230;318231 405447;405448;405449;405450;405451;405452 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Unmodified 985.59605 0.59605244 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.23 103.23 2 3.7668E-05 106603 QUIQUE_C1368_190116_001 144.83 97.766 1479500000 250520000 150970000 180160000 152360000 106830000 177430000 132080000 34826000 38986000 81456000 53620000 52213000 68049000 35186 1790 32775 318280;318281;318282;318283;318284;318285;318286;318287;318288;318289;318290;318291;318292;318293 405518;405519;405520;405521;405522;405523;405524;405525;405526;405527;405528;405529;405530;405531;405532;405533;405534;405535;405536;405537;405538;405539;405540;405541;405542;405543 405526 23 PFLDHLIWEAEDTR Unmodified 1740.8471 0.84713476 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 132.25 132.25 2;3 0.00034402 135984 QUIQUE_C1403_190116_001 119.76 90.806 636720000 130920000 32336000 118520000 88044000 127080000 0 88154000 0 0 31060000 0 20608000 0 35187 2665 32776 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22.897 22.897 3 0.01188 16354 QUIQUE_C1438_190116_001 40.242 24.301 253380000 0 46790000 65897000 0 38310000 53196000 49187000 0 0 0 0 0 0 35204 911 32793 318404;318405;318406;318407;318408 405676;405677;405678;405679;405680;405681 405678 5 PGAHINAVGASR Unmodified 1148.6051 0.60505399 3088 Q14894;I3L325 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 14.16 14.16 2;3 0.00065337 6674 QUIQUE_C1218_190116_001 90.827 72.051 819460000 156410000 108710000 8760800 88843000 0 214840000 78789000 0 68458000 44438000 11250000 0 38957000 35205 3088 32794 318409;318410;318411;318412;318413;318414;318415;318416;318417;318418;318419;318420;318421;318422;318423;318424 405682;405683;405684;405685;405686;405687;405688;405689;405690;405691;405692;405693;405694;405695;405696;405697;405698;405699 405684 18 PGAHINAVGASRPDWR Unmodified 1702.8652 0.86518486 3088 Q14894;I3L325 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 34.612 34.612 3;4 0.00065653 30994 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yes 0 0 0 1 35.605 35.605 2 0.0036582 30895 QUIQUE_C1563_190116_001 62.338 46.373 20206000 0 0 0 0 0 20206000 0 0 0 0 0 0 0 35208 4331 32797 318439 405715 405715 1 PGALPLLSELAAADNCLR Unmodified 1879.9826 0.98258238 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 154.69 154.69 2;3 2.4842E-17 160246 QUIQUE_C1218_190116_001 161.1 132.34 371280000 89440000 55728000 109010000 41775000 0 0 61224000 0 0 14108000 0 0 0 35209 3576 32798 318440;318441;318442;318443;318444;318445;318446;318447;318448;318449;318450 405716;405717;405718;405719;405720;405721;405722;405723;405724;405725;405726;405727 405718 11 PGAQLYQFR Unmodified 1078.556 0.55597854 4376 Q9P1Z2;F8VQE3;F8VWP8;F8VPN1;F8VUB3;F8VZI3;F8W0X2;F8VRQ9;F8VXS2 CALCOCO1 Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 58.817 58.817 2 0.0019501 57737 QUIQUE_C1403_190116_001 98.418 79.324 164580000 0 0 33204000 30819000 0 22282000 32955000 0 0 0 25581000 0 19735000 35210 4376 32799 318451;318452;318453;318454;318455;318456 405728;405729;405730;405731;405732;405733;405734 405729 7 PGASLPPLDLQALEK Unmodified 1547.8559 0.85590853 2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 121.03 121.03 2;3 7.5054E-06 124695 QUIQUE_C1277_190116_001 106.26 85.47 1062300000 139080000 78738000 123530000 107940000 83607000 128900000 79229000 0 64101000 47839000 69037000 56961000 83292000 35211 2026 32800 318457;318458;318459;318460;318461;318462;318463;318464;318465;318466;318467;318468;318469;318470;318471 405735;405736;405737;405738;405739;405740;405741;405742;405743;405744;405745;405746;405747;405748;405749;405750;405751;405752;405753;405754;405755;405756;405757 405737 23 PGASPAPDEDAEAAGAEQGGDSTEATAKPK Unmodified 2824.2635 0.26350409 3324 Q5TC84 OGFRL1 Opioid growth factor receptor-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 38.651 38.651 3 2.1426E-63 34838 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.25 138.63 116090000 0 0 0 0 0 0 0 0 64736000 0 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318556;318557;318558;318559;318560;318561;318562;318563;318564;318565;318566;318567;318568 405855;405856;405857;405858;405859;405860;405861;405862;405863;405864;405865;405866;405867;405868;405869;405870;405871 405857 15 PGFSIADK Unmodified 833.42832 0.42831841 2771 P62913;Q5VVC8 RPL11 60S ribosomal protein L11 yes no 0 0 0 1 38.157 38.157 2 0.063598 34699 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.464 38.315 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35232 2771 32820 318569 405872 405872 1 PGFWDPIGR Unmodified 1043.5189 0.51886475 654 B7Z2R7;Q5T8D3;X6RDD7;Q5T8E0;K7EM05;Q8NC06 ACBD5;ACBD4 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5;Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.41 107.41 2 0.0023457 110394 QUIQUE_C1368_190116_001 94.302 60.506 146660000 21605000 21757000 29874000 18576000 0 15770000 29668000 0 0 9414000 0 0 0 35233 654 32821 318570;318571;318572;318573;318574;318575;318576;318577;318578;318579;318580;318581 405873;405874;405875;405876;405877;405878;405879;405880;405881;405882;405883;405884;405885 405875 12 PGGAAAEGAGPGAAR Unmodified 1208.5898 0.58979786 530 A6NCS6 C2orf72 Uncharacterized protein C2orf72 yes yes 0 0 0 1 1 14.287 14.287 2 3.9803E-05 6323 QUIQUE_C1403_190116_001 92.611 76.73 17847000 0 0 6026300 11820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35234 530 32822 318582;318583 405886;405887 405887 1 PGGAAPLGYDFWYQPR Unmodified 1793.8526 0.85255449 2978 Q13228;A6PVX1;H0Y532 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 129.76 129.76 2;3 2.3377E-35 133810 QUIQUE_C1403_190116_001 214.26 196.12 2244200000 160160000 110820000 309250000 160330000 122620000 393340000 233980000 51873000 163240000 167850000 125780000 52316000 192640000 35235 2978 32823 318584;318585;318586;318587;318588;318589;318590;318591;318592;318593;318594;318595;318596;318597;318598;318599;318600 405888;405889;405890;405891;405892;405893;405894;405895;405896;405897;405898;405899;405900;405901;405902;405903;405904;405905;405906;405907;405908;405909;405910 405894 22 PGGDGEGDTNHIER Unmodified 1452.6229 0.62294848 128 G5E9D8;A0A096LP62;C9J2H1;Q86UX2 ITIH5 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5 yes no 0 0 0 1 1 13.388 13.388 3 0.0049267 5656 QUIQUE_C1218_190116_001 41.838 36.139 23836000 6791000 0 0 0 17045000 0 0 0 0 0 0 0 0 35236 128 32824 318601;318602 405911;405912 405911 2 PGGDHDCVLVLLLMPR Unmodified 1790.9171 0.91714535 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 141.77 141.77 3 0.00019862 146811 QUIQUE_C1218_190116_001 55.186 43.811 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35237 890;3052 32825 318603 405913 405913 1 PGGDTIFGK Unmodified 890.44978 0.44978213 2546 P49773;D6REP8;D6RE99;D6RD60;D6RC06 HINT1 Histidine triad nucleotide-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.51 39.51 2 0.0019462 34778 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.458 57.231 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factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 16.689 16.689 4;5 0.0067023 8631 QUIQUE_C1368_190116_001 38.261 30.749 321470000 88242000 44636000 30740000 48042000 28821000 80988000 0 0 0 0 0 0 0 35241 2208 32829 318622;318623;318624;318625;318626;318627;318628 405932;405933;405934;405935;405936;405937;405938 405934 7 PGGGPVSVELVGPR Unmodified 1319.7197 0.7197494 3787 Q969P0 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.672 71.672 2 0.002297 68805 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.632 61.677 533020000 0 0 145360000 129690000 84485000 0 127270000 0 0 46224000 0 0 0 35242 3787 32830 318629;318630;318631;318632;318633 405939;405940;405941;405942;405943 405943 3 PGGIIHVYGDDSSDR Unmodified 1586.7325 0.73249893 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 2 2 1 49.236 49.236 2;3 0.0014118 46293 QUIQUE_C1277_190116_001 89.548 73.657 200060000 54261000 86462000 0 41836000 0 0 0 0 0 17504000 0 0 0 35243 77 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318641;318642;318643;318644;318645;318646;318647;318648;318649;318650;318651;318652;318653;318654;318655;318656;318657;318658;318659;318660;318661;318662;318663;318664;318665;318666;318667;318668;318669;318670;318671;318672;318673;318674;318675 405951;405952;405953;405954;405955;405956;405957;405958;405959;405960;405961;405962;405963;405964;405965;405966;405967;405968;405969;405970;405971;405972;405973;405974;405975;405976;405977;405978;405979;405980;405981;405982;405983;405984;405985;405986;405987;405988;405989;405990;405991;405992;405993;405994;405995;405996;405997;405998;405999;406000;406001;406002;406003;406004;406005;406006;406007;406008;406009;406010;406011;406012;406013;406014;406015;406016;406017;406018;406019;406020;406021;406022;406023;406024;406025;406026;406027;406028;406029;406030;406031;406032 405990 81 PGGPALWGDAFER Unmodified 1371.6571 0.65714914 4009 Q9BS92 NIPSNAP3B Protein NipSnap homolog 3B yes yes 0 0 0 1 1 1 106.13 106.13 2 0.00073893 103597 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175.9 3 1.4619E-06 178953 QUIQUE_C1277_190116_001 54.683 52.63 55103000 0 8175800 0 0 0 0 22248000 0 0 0 0 9162600 15517000 35249 2685 32837 318688;318689;318690;318691 406045;406046;406047;406048 406045 4 PGGVHQDLPLGLMDDIYQFSK Unmodified 2329.1413 0.14126787 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 148.27 148.27 3 1.6814E-06 143887 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.247 47.753 337650000 72403000 65214000 60152000 64010000 0 48513000 0 0 0 27352000 0 0 0 35250 1620 32838 318692;318693;318694;318695;318696;318697;318698 406049;406050;406051;406052;406053;406054;406055;406056 406055 8 PGGVVHSFSHNVGPGDK Unmodified 1689.8223 0.82231699 1365 M0QYN0;Q969H8 MYDGF Myeloid-derived growth factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.996 22.996 3 6.9509E-05 16213 QUIQUE_C1403_190116_001 88.203 76.763 252180000 59673000 44761000 58411000 50484000 0 38851000 0 0 0 0 0 0 0 35251 1365 32839 318699;318700;318701;318702;318703 406057;406058;406059;406060;406061 406060 5 PGGWNTGGSR Unmodified 987.45224 0.45224175 517 A2A2V1;P04156;X6RKS3 PRNP Major prion protein yes no 0 0 0 1 1 1 19.651 19.651 2 0.025788 12790 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.908 30.61 130190000 0 42155000 0 0 0 0 0 88038000 0 0 0 0 0 35252 517 32840 318704;318705;318706 406062;406063;406064 406063 3 PGHDPPPLPQPDPR Unmodified 1518.7579 0.75792582 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 37.66 37.66 3 0.023597 33640 QUIQUE_C1218_190116_001 36.292 23.932 44624000 44624000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35253 921 32841 318707 406065 406065 0 PGHTTVSAGGVLNDQHWHYVR Unmodified 2330.1305 0.13046068 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 55.118 55.118 3;4;5 8.6536E-08 53698 QUIQUE_C1277_190116_001 92.474 79.811 1733700000 100500000 274290000 172150000 153520000 146120000 0 193050000 128110000 53146000 22622000 238830000 71059000 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1300.7364 0.73640252 1361 M0QXN1 EMP3 yes yes 0 0 1 1 1 1 35.985 35.985 3 0.0068599 31917 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.836 3.3651 193310000 0 0 0 0 0 60052000 0 0 0 0 68896000 64359000 0 35260 1361 32848 318771;318772;318773 406158;406159;406160 406160 1 PGLGGSSGLAGAWLK Unmodified 1369.7354 0.73539946 2110 P16455 MGMT Methylated-DNA--protein-cysteine methyltransferase yes yes 0 0 0 1 103.71 103.71 2 3.9718E-09 107573 QUIQUE_C1368_190116_001 108.35 88.358 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35261 2110 32849 318774 406161 406161 1 PGLIYNIGIDVK Unmodified 1300.7391 0.73908786 3329 Q5THJ4;H3BLS7 VPS13D Vacuolar protein sorting-associated protein 13D yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.071 37.071 3 0.0035981 32460 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.879 16.335 233660000 0 59801000 0 0 0 0 0 72790000 82276000 18788000 0 0 0 35262 3329 32850 318775;318776;318777;318778 406162;406163;406164;406165 406165 3 PGLLFLPDLPSAPFVPR Unmodified 1835.0345 0.034541598 3330 Q5U4P2 ASPHD1 Aspartate beta-hydroxylase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 166.49 166.49 2 1.0688E-06 169677 QUIQUE_C1403_190116_001 104.32 90.911 39604000 12508000 0 13225000 13870000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35263 3330 32851 318779;318780;318781 406166;406167;406168 406168 2 PGLPGEASAAAVALGGTGETPAR Unmodified 2049.0491 0.049082043 426 A0A2R8Y566;Q9P260;A0A075B785 KIAA1468 LisH domain and HEAT repeat-containing protein KIAA1468 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 101.28 101.28 2;3 1.1745E-12 102721 QUIQUE_C1563_190116_001 105.39 93.031 105270000 39477000 34011000 31778000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35264 426 32852 318782;318783;318784;318785;318786;318787 406169;406170;406171;406172;406173;406174 406173 5 PGLPGVPPFLLHR Unmodified 1398.8136 0.81359021 1762 O95865 DDAH2 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.37 111.37 3 0.0001103 116156 QUIQUE_C1218_190116_001 93.258 80.631 180880000 27089000 24890000 0 0 26933000 26832000 33472000 0 0 17911000 0 0 23753000 35265 1762 32853 318788;318789;318790;318791;318792;318793;318794;318795;318796 406175;406176;406177;406178;406179;406180;406181;406182;406183 406175 9 PGLPTTFATLDIDGVR Unmodified 1671.8832 0.88318591 998 F5H039;Q9NQX3;H0YJR5 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 133.14 133.14 2 0.010785 138633 QUIQUE_C1576_190116_001 63.727 50.048 19451000 0 0 0 0 0 0 19451000 0 0 0 0 0 0 35266 998 32854 318797 406184 406184 1 PGLRPAPNSVDVDDFINTR Unmodified 2082.0494 0.049416394 1206 H3BUU9;P55287 CDH11 Cadherin-11 yes no 0 0 1 1 96.257 96.257 3 0.001241 99091 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.989 53.892 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35267 1206 32855 318798 406185 406185 1 PGLSLVK Unmodified 712.44833 0.44832557 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.597 36.597 2 0.02099 32217 QUIQUE_C1403_190116_001 106.42 16.512 1142600000 211010000 0 120080000 210700000 229620000 264740000 0 0 0 0 0 0 106440000 35268 96 32856 318799;318800;318801;318802;318803;318804 406186;406187;406188;406189;406190;406191 406188 6 PGLSPYR Unmodified 788.41809 0.41808807 3084 Q14697 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB yes yes 0 0 0 1 25.611 25.611 2 0.064836 19204 QUIQUE_C1563_190116_001 67.035 43.063 29369000 0 0 0 0 0 29369000 0 0 0 0 0 0 0 35269 3084 32857 318805 406192 406192 1 PGLVDSNPAPPESQEK Unmodified 1663.8053 0.80532952 704 C9J8T6;Q14061 COX17 Cytochrome c oxidase copper chaperone yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 44.151 44.151 2 7.464E-14 41363 QUIQUE_C1218_190116_001 170.18 138.75 206230000 56356000 66658000 41020000 0 0 0 0 42193000 0 0 0 0 0 35270 704 32858 318806;318807;318808;318809;318810;318811;318812 406193;406194;406195;406196;406197;406198;406199;406200 406194 8 PGLVPIEK Unmodified 851.51165 0.5116541 4678 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.339 59.339 2 0.033314 57667 QUIQUE_C1277_190116_001 64.776 0 1826600000 367010000 382260000 0 268780000 382440000 273530000 0 0 0 152540000 0 0 0 + 35271 4678 32859 318813;318814;318815;318816;318817;318818 406201;406202;406203;406204;406205;406206;406207 406202 7 PGLVVVHAEDGTTSK Unmodified 1508.7835 0.78347187 2303 P30049;A0A087WTL3 ATP5D ATP synthase subunit delta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 33.048 33.048 2;3 1.1877E-65 28119 QUIQUE_C1218_190116_001 218.15 195.95 2376600000 543070000 470890000 402760000 54365000 46103000 463260000 311170000 41491000 26172000 17307000 0 0 0 35272 2303 32860 318819;318820;318821;318822;318823;318824;318825;318826;318827;318828;318829;318830;318831;318832 406208;406209;406210;406211;406212;406213;406214;406215;406216;406217;406218;406219;406220;406221;406222;406223;406224 406210 17 PGLWLYTHPLIK Unmodified 1436.818 0.81800688 650 B7WPJ3;Q8WTX7;F2Z3I9;H7C2U7;F2Z2C1;F8WD52 GATSL3 GATS-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 102.14 102.14 3 0.0015653 104449 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.632 38.685 31401000 0 0 0 0 0 0 0 16671000 14730000 0 0 0 0 35273 650 32861 318833;318834 406225;406226;406227 406226 3 PGMLDFTGK Oxidation (M) 980.46372 0.46371763 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 1 0 1 1 1 45.385 45.385 2 0.010728 42206 QUIQUE_C1277_190116_001 77.072 60.778 88922000 38946000 22197000 0 0 27779000 0 0 0 0 0 0 0 0 35274 1914 32862 318835;318836;318837 406228;406229;406230 406229 1131 3 PGMLDFTGK Unmodified 964.4688 0.46880301 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.986 77.986 2 0.0013972 78905 QUIQUE_C1277_190116_001 104.06 82.097 352770000 66317000 71212000 70961000 26138000 0 56339000 44566000 0 0 0 0 17238000 0 35275 1914 32862 318838;318839;318840;318841;318842;318843;318844 406231;406232;406233;406234;406235;406236;406237;406238 406233 8 PGMLEMLLPGQPEAVAR Unmodified 1807.9325 0.93246107 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7;A0A2R8Y6Q7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 139.04 139.04 2 9.6031E-10 143042 QUIQUE_C1403_190116_001 112.51 98.844 313730000 0 0 0 71155000 41788000 79213000 74829000 23216000 0 23524000 0 0 0 35276 2513 32863 318845;318846;318847;318848;318849;318850 406239;406240;406241;406242;406243;406244 406239 5 PGMVVTFAPVNITTEVK Unmodified 1801.9648 0.96480705 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 0 1 126.68 126.68 2 0.021513 130797 QUIQUE_C1277_190116_001 50.207 35.517 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35277 469 32864 318851 406245 406245 1 PGMVVTFAPVNITTEVK Oxidation (M) 1817.9597 0.95972167 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 1 0 1 110.13 110.13 2 0.0037782 106829 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.802 44.139 22033000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22033000 0 0 0 35278 469 32864 318852 406246 406246 345 1 PGMVVTFAPVNVTTEVK Unmodified 1787.9492 0.94915699 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3 yes no 0 0 0 1 121 121 2 0.01467 124287 QUIQUE_C1403_190116_001 46.069 0 68479000 0 0 0 68479000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35279 2794 32865 318853 406247 406247 1 PGNAGLTDDEK Unmodified 1115.5095 0.50948185 4440 Q9UHY7;D6RA00 ENOPH1 Enolase-phosphatase E1 yes no 0 0 0 1 15.966 15.966 2 0.00051049 8101 QUIQUE_DMIX4_190116_001 110.46 83.203 55323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55323000 0 0 0 35280 4440 32866 318854 406248 406248 1 PGNWILER Unmodified 983.51886 0.51886475 2225;2239 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80;P25391 LAMA2;LAMA1 Laminin subunit alpha-2;Laminin subunit alpha-1 no no 0 0 0 1 68.612 68.612 2 0.0064801 69889 QUIQUE_C1438_190116_001 101.6 62.795 70648000 0 0 0 0 70648000 0 0 0 0 0 0 0 0 35281 2225;2239 32867 318855 406249 406249 1 PGNYVEPTIVTGLGHDASIAHTETFAPILYVFK Unmodified 3556.8242 0.82422106 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.05 152.05 4 8.0676E-58 156219 QUIQUE_C1403_190116_001 129.01 121.64 1602100000 136900000 83718000 196140000 135390000 137280000 206000000 285070000 43581000 0 95193000 102360000 109420000 71024000 35282 336 32868 318856;318857;318858;318859;318860;318861;318862;318863;318864;318865;318866;318867 406250;406251;406252;406253;406254;406255;406256;406257;406258;406259;406260;406261;406262;406263 406254 14 PGPALWPLPLSVK Unmodified 1373.8071 0.80710784 1925 P07686 HEXB Beta-hexosaminidase subunit beta;Beta-hexosaminidase subunit beta chain B;Beta-hexosaminidase subunit beta chain A yes yes 0 0 0 1 1 1 135.31 135.31 2 0.0043458 140817 QUIQUE_C1368_190116_001 68.893 48.023 29640000 0 0 15468000 0 14172000 0 0 0 0 0 0 0 0 35283 1925 32869 318868;318869;318870 406264;406265;406266;406267 406266 4 PGPAPHDQELGFFLETGLQR Unmodified 2208.0964 0.096366586 3486 Q86TV6;G3V3H1 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes no 0 0 0 1 1 1 1 119.81 119.81 3 0.00013523 123492 QUIQUE_C1277_190116_001 64.203 55.915 234950000 83482000 53554000 0 0 45015000 0 52900000 0 0 0 0 0 0 35284 3486 32870 318871;318872;318873;318874 406268;406269;406270;406271;406272 406269 5 PGPFLLSGSR Unmodified 1029.5607 0.56072956 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 69.607 69.607 2 0.0062419 69345 QUIQUE_C1277_190116_001 74.92 42.985 201980000 0 201980000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35285 2460 32871 318875;318876 406273;406274 406273 2 PGPGAGPGPAAGAALPDQSFLWNVFQR Unmodified 2677.3401 0.34011911 1623 O75340;E7EPW6;A0A087WZ38;D6RA21;Q86W51 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.09 158.09 2;3 1.2706E-64 163768 QUIQUE_C1218_190116_001 189.2 159.14 1279100000 143770000 119380000 159800000 138730000 116840000 169450000 0 55983000 95737000 48550000 92319000 68764000 69800000 35286 1623 32872 318877;318878;318879;318880;318881;318882;318883;318884;318885;318886;318887;318888;318889;318890 406275;406276;406277;406278;406279;406280;406281;406282;406283;406284;406285;406286;406287;406288;406289;406290;406291 406276 17 PGPGLLDNAIDSGSSAAQLPQK Unmodified 2135.0859 0.08586148 797 D3DPN2;O75056 SDC3 Syndecan;Syndecan-3 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 104.35 104.35 2;3 5.325E-46 107340 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.77 174.21 731540000 35145000 37508000 0 114580000 16185000 50943000 0 173820000 182760000 25361000 32653000 16746000 45838000 35287 797 32873 318891;318892;318893;318894;318895;318896;318897;318898;318899;318900;318901;318902;318903;318904 406292;406293;406294;406295;406296;406297;406298;406299;406300;406301;406302;406303;406304;406305;406306 406302 15 PGPGVWDPNWDR Unmodified 1394.6367 0.63674805 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 94.072 94.072 2 0.0012715 97714 QUIQUE_C1218_190116_001 82.417 65.746 309600000 68664000 0 41424000 38159000 0 41540000 40687000 0 0 0 46470000 0 32656000 35288 3871 32874 318905;318906;318907;318908;318909;318910;318911;318912 406307;406308;406309;406310;406311;406312;406313;406314;406315;406316 406307 10 PGPGVWDPNWDRR Unmodified 1550.7379 0.73785908 3871 Q96HS1 PGAM5 Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 71.918 71.918 3 0.014348 72752 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.204 19.046 82534000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82534000 35289 3871 32875 318913 406317 406317 1 PGPIGPAGAR Unmodified 891.49265 0.49265 27 A0A087WTA8;P08123 COL1A2 Collagen alpha-2(I) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.812 20.812 2 0.0061286 13698 QUIQUE_C1576_190116_001 75.109 42.18 443560000 73771000 70413000 123830000 63720000 0 42546000 69279000 0 0 0 0 0 0 35290 27 32876 318914;318915;318916;318917;318918;318919 406318;406319;406320;406321;406322;406323 406323 5 PGPQPTAETTR Unmodified 1153.5728 0.57275081 2528;1150 P49407;E9PM35;H0YET9 ARRB1 Beta-arrestin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 15.501 15.501 2 0.00043198 7397 QUIQUE_C1368_190116_001 111.46 80.843 313080000 108970000 0 147140000 0 0 0 0 0 0 56972000 0 0 0 35291 2528;1150 32877 318920;318921;318922;318923;318924 406324;406325;406326;406327;406328;406329 406326 5 PGPTAESASGPSEDPSVNFLK Unmodified 2085.9855 0.98547873 3004 Q13501;E7EMC7;E9PFW8 SQSTM1 Sequestosome-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.173 87.173 2 2.8679E-128 88885 QUIQUE_DMIX3_190116_001 284.68 246.05 601580000 30318000 36841000 36956000 40908000 40674000 36391000 76470000 31917000 37615000 23958000 68448000 38750000 102340000 35292 3004 32878 318925;318926;318927;318928;318929;318930;318931;318932;318933;318934;318935;318936;318937 406330;406331;406332;406333;406334;406335;406336;406337;406338;406339;406340;406341;406342;406343 406339 14 PGPTPSGTNVGSSGR Unmodified 1369.6586 0.65860571 2691 P60468 SEC61B Protein transport protein Sec61 subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.595 19.595 2 5.5714E-06 12187 QUIQUE_C1576_190116_001 102.4 57.264 425490000 44583000 0 0 0 0 0 59324000 59988000 54334000 23903000 75011000 50168000 58178000 35293 2691 32879 318938;318939;318940;318941;318942;318943;318944;318945;318946;318947;318948 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1816.9036 0.903587 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 148.18 148.18 2 1.2524E-12 152832 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.07 112.23 405490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 158790000 126540000 120160000 35318 2217 32903 319109;319110;319111;319112;319113;319114 406529;406530;406531;406532;406533;406534 406533 6 PGVFDLINK Unmodified 1001.5546 0.55458155 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63;F8W6J1 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 103.4 103.4 2 4.9654E-13 105679 QUIQUE_DMIX1_190116_001 183.26 129.7 1689700000 218920000 128540000 227900000 124070000 143490000 152060000 176860000 123480000 0 62007000 145110000 0 187270000 35319 236 32904 319115;319116;319117;319118;319119;319120;319121;319122;319123;319124;319125;319126;319127;319128 406535;406536;406537;406538;406539;406540;406541;406542;406543;406544;406545;406546;406547;406548;406549;406550;406551 406543 15 PGVGLDAINDANLLEACIYR Unmodified 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PGVVHVIDVDRGEEK Unmodified 1647.858 0.8580338 2661 P55087 AQP4 Aquaporin-4 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 35.917 35.917 3;4 3.3971E-06 31288 QUIQUE_C1277_190116_001 81.526 63.726 394440000 56561000 102160000 0 122330000 37206000 0 0 0 30819000 21939000 0 0 23436000 35323 2661 32908 319141;319142;319143;319144;319145;319146;319147;319148;319149 406565;406566;406567;406568;406569;406570;406571;406572;406573 406566 8 PGVYYGQCSEICGANHSFMPIVLELIPLK Unmodified 3291.613 0.61304777 1781 P00403 MT-CO2 Cytochrome c oxidase subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 163.36 163.36 3 1.1066E-37 168345 QUIQUE_C1368_190116_001 126.46 121.25 206210000 32929000 32395000 38820000 0 0 30310000 35478000 0 0 0 36283000 0 0 35324 1781 32909 319150;319151;319152;319153;319154;319155 406574;406575;406576;406577;406578;406579 406576 6 PGYAAIQALLSSR Unmodified 1345.7354 0.73539946 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.64 123.64 2 2.9862E-23 129241 QUIQUE_C1218_190116_001 168.46 143.69 960330000 64085000 57510000 95638000 104530000 85548000 100400000 85609000 62936000 93161000 39173000 77133000 94609000 0 35325 2198 32910 319156;319157;319158;319159;319160;319161;319162;319163;319164;319165;319166;319167 406580;406581;406582;406583;406584;406585;406586;406587;406588;406589;406590;406591;406592;406593;406594;406595;406596;406597;406598 406581 19 PGYHYICLR Unmodified 1177.5702 0.57024839 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2;Q8IV92 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 42.835 42.835 3 0.034541 40255 QUIQUE_C1438_190116_001 40.352 29.187 119810000 0 0 0 0 60760000 0 0 0 0 0 59047000 0 0 35326 4250 32911 319168;319169;319170 406599;406600;406601 406599 3 PGYQGDGFR Unmodified 995.44609 0.44609374 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 29.265 29.265 2 0.0051961 24206 QUIQUE_C1438_190116_001 87.251 68.56 148810000 0 0 69342000 0 49850000 0 0 0 29622000 0 0 0 0 35327 2075 32912 319171;319172;319173;319174 406602;406603;406604;406605;406606;406607 406604 5 PHAFKPGDLVFAK Unmodified 1425.7769 0.77687035 3463 Q7Z4V5;M0R0J3 HDGFRP2 Hepatoma-derived growth factor-related protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.759 56.759 3 0.0025048 54573 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.754 48.276 244980000 21414000 0 0 0 41914000 0 25845000 0 0 0 47762000 42985000 65066000 35328 3463 32913 319175;319176;319177;319178;319179;319180 406608;406609;406610;406611;406612;406613 406613 6 PHDIFEANDLFENGNMTQVQTTLVALAGLAK Unmodified 3356.6711 0.67109123 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 169.73 169.73 3 5.7223E-75 174370 QUIQUE_C1368_190116_001 115.76 113.81 288880000 19861000 29259000 113450000 17395000 43293000 0 23835000 0 41783000 0 0 0 0 35329 3137;908 32914 319181;319182;319183;319184;319185;319186;319187 406614;406615;406616;406617;406618;406619;406620 406616 7 PHIDSVWPFEK Unmodified 1353.6717 0.67173657 3958 Q99536;K7ESA3 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 90.219 90.219 2;3 0.00034605 92670 QUIQUE_C1277_190116_001 70.808 62.738 152660000 0 23039000 18172000 14373000 17469000 20052000 49095000 0 0 0 10457000 0 0 35330 3958 32915 319188;319189;319190;319191;319192;319193;319194;319195;319196;319197;319198 406621;406622;406623;406624;406625;406626;406627;406628;406629;406630;406631;406632;406633 406623 13 PHIYGYAVK Unmodified 1046.5549 0.5549159 1159 H0YI09;Q9H8H3 METTL7A Methyltransferase-like protein 7A yes no 0 0 0 1 1 32.206 32.206 2 0.00049784 27497 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.19 86.932 70049000 0 41938000 0 0 0 0 0 28111000 0 0 0 0 0 35331 1159 32916 319199;319200 406634;406635 406635 2 PHPCVLLK Unmodified 962.53716 0.53715735 1745;1167 O95741;H0YLV2;H0YLM2;H0YNP2;H0YNX4;H0YNM7;H0YKJ0;H0YM67;H0YNV2;H0YNV6;H0YKP1 CPNE6 Copine-6 no no 0 0 0 1 21.02 21.02 2 0.017542 14150 QUIQUE_C1368_190116_001 81.381 54.585 100060000 0 0 100060000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35332 1745;1167 32917 319201 406636 406636 1 PHPLVTSTDIVLTITK Unmodified 1733.9927 0.99273636 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.05 101.05 3 1.3401E-13 103818 QUIQUE_C1368_190116_001 103.79 96.383 246870000 50861000 56062000 39140000 0 38457000 62348000 0 0 0 0 0 0 0 35333 2180 32918 319202;319203;319204;319205;319206;319207 406637;406638;406639;406640;406641;406642 406639 5 PHPWFFGK Unmodified 1014.5076 0.50757178 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.269 67.269 2 0.014372 67056 QUIQUE_C1218_190116_001 86.086 47.848 256970000 110700000 118200000 0 0 0 0 0 0 0 28066000 0 0 0 35334 2774 32919 319208;319209;319210;319211 406643;406644;406645;406646 406643 4 PHSEAGTAFIQTQQLHAAMADTFLEHMCR Unmodified 3297.5118 0.51177059 2077;1203 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H3BTN5;H3BQ34;H3BUW1;H3BTJ2;H3BT25;H3BU13;H3BN34;H3BQZ3;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 1 0 1 102.93 102.93 4 7.5211E-05 105369 QUIQUE_C1403_190116_001 44.301 40.837 87575000 0 0 0 87575000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35336 1203;2077 32920 319240 406694 406694 696;697 0 PHSVSLNDTETR Unmodified 1354.6477 0.64770667 4369 Q9P0L0 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 2 1 1 1 19.093 19.093 2;3 4.884E-05 11633 QUIQUE_C1403_190116_001 107.06 85.826 2017100000 330460000 0 267670000 412970000 122030000 333480000 202770000 0 0 0 253860000 93840000 0 35337 4369 32921 319241;319242;319243;319244;319245;319246;319247;319248;319249;319250;319251;319252;319253 406695;406696;406697;406698;406699;406700;406701;406702;406703;406704;406705;406706;406707 406699 8 PHSVSLNDTETRK Unmodified 1482.7427 0.74266969 4369 Q9P0L0 VAPA Vesicle-associated membrane protein-associated protein A yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 3 1 2 2 12.125 12.125 3;4 2.5362E-08 3958 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.51 98.827 206130000 2858200 0 3882800 0 26458000 0 16565000 11628000 24165000 0 17644000 88101000 14832000 35338 4369 32922 319254;319255;319256;319257;319258;319259;319260;319261;319262;319263;319264;319265;319266;319267;319268;319269 406708;406709;406710;406711;406712;406713;406714;406715;406716;406717;406718;406719;406720;406721;406722;406723;406724 406720 15 PHSYPALSAEQK Unmodified 1326.6568 0.65681479 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 2 4 2 3 3 3 21.45 21.45 2;3 2.65E-216 14079 QUIQUE_C1277_190116_001 291.87 263.65 22744000000 2214700000 2199100000 1825600000 1818400000 1866100000 1655400000 1743600000 1328200000 1541900000 1134800000 2228000000 1359800000 1828700000 35339 1978 32923 319270;319271;319272;319273;319274;319275;319276;319277;319278;319279;319280;319281;319282;319283;319284;319285;319286;319287;319288;319289;319290;319291;319292;319293;319294;319295;319296;319297;319298;319299;319300;319301;319302;319303;319304;319305;319306;319307 406725;406726;406727;406728;406729;406730;406731;406732;406733;406734;406735;406736;406737;406738;406739;406740;406741;406742;406743;406744;406745;406746;406747;406748;406749;406750;406751;406752;406753;406754;406755;406756;406757;406758;406759;406760;406761;406762;406763;406764;406765;406766;406767;406768;406769;406770;406771;406772;406773;406774;406775;406776;406777;406778;406779;406780;406781;406782;406783;406784;406785;406786 406732 61 PHSYPALSAEQKK Unmodified 1454.7518 0.75177781 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 3 3 3 3 3 14.845 14.845 2;3;4 3.3509E-41 7393 QUIQUE_DMIX3_190116_001 227.81 204.49 7527000000 0 70108000 44435000 26524000 148090000 0 67014000 1541500000 1347600000 0 1852900000 1309200000 1119600000 35340 1978 32924 319308;319309;319310;319311;319312;319313;319314;319315;319316;319317;319318;319319;319320;319321;319322;319323;319324;319325;319326;319327;319328;319329;319330 406787;406788;406789;406790;406791;406792;406793;406794;406795;406796;406797;406798;406799;406800;406801;406802;406803;406804;406805;406806;406807;406808;406809;406810;406811;406812;406813;406814;406815;406816;406817;406818;406819;406820;406821;406822;406823;406824;406825;406826;406827;406828;406829;406830;406831 406807 43 PHVATLSLHSLFELR Unmodified 1718.9468 0.94678922 4662 Q9Y6R1 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 104.3 104.3 3;4 3.6866E-06 107542 QUIQUE_C1368_190116_001 86.944 79.536 109300000 0 21046000 25274000 0 0 0 62979000 0 0 0 0 0 0 35341 4662 32925 319331;319332;319333;319334;319335 406832;406833;406834;406835;406836 406833 5 PHVAYFVPMSK Unmodified 1274.6482 0.64816436 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.21 55.21 3 0.0026218 53716 QUIQUE_C1368_190116_001 46.64 35.642 24543000 0 0 24543000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35342 2641 32926 319336;319337;319338;319339 406837;406838;406839;406840 406838 4 PHVNVGTIGHVDHGK Unmodified 1565.8063 0.806273 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 36.88 36.88 3;4 1.3303E-29 32985 QUIQUE_C1403_190116_001 163.8 142.03 1629800000 213900000 190910000 173670000 240420000 455430000 163560000 191920000 0 0 0 0 0 0 35343 2529 32927 319340;319341;319342;319343;319344;319345;319346;319347 406841;406842;406843;406844;406845;406846;406847;406848;406849 406845 8 PIAAVMNTWTK Unmodified 1230.6431 0.64307898 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.12 80.12 2 0.00045939 77829 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.5 77.021 625810000 0 0 117000000 121470000 80411000 105780000 93640000 0 0 40898000 0 0 66612000 35344 959 32928 319348;319349;319350;319351;319352;319353;319354 406850;406851;406852;406853;406854;406855;406856;406857;406858 406857 9 PIALMALK Unmodified 855.5252 0.52519568 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 76.928 76.928 2 0.028082 78265 QUIQUE_C1218_190116_001 69.093 69.093 39694000 19210000 20484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35345 2357 32929 319355;319356;319357;319358;319359;319360 406859;406860;406861;406862;406863;406864 406859 6 PIAQLLELWK Unmodified 1209.7121 0.71214483 982 F2Z2J1;D6RE03 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.64 143.64 2 0.00035792 150223 QUIQUE_C1438_190116_001 132.01 86.675 604650000 47435000 61160000 0 55148000 65447000 52083000 70511000 0 55546000 0 74723000 64613000 57981000 35346 982 32930 319361;319362;319363;319364;319365;319366;319367;319368;319369;319370;319371 406865;406866;406867;406868;406869;406870;406871;406872;406873;406874;406875;406876 406870 12 PIDVQVITHHMQR Oxidation (M) 1588.8144 0.81439484 2714 P61158;B4DXW1 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 1 0 1 1 1 32.604 32.604 4 0.0040933 26823 QUIQUE_C1368_190116_001 54.524 42.239 255170000 52481000 0 125370000 77321000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35347 2714 32931 319372;319373;319374 406877;406878;406879 406878 2142 3 PIDVQVITHHMQR Unmodified 1572.8195 0.81948022 2714 P61158;B4DXW1 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 53.975 53.975 3;4 0.00084923 52021 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.548 65.449 4213500000 440220000 532660000 613890000 573640000 386310000 486230000 549340000 65719000 112700000 55619000 105950000 182180000 109090000 35348 2714 32931 319375;319376;319377;319378;319379;319380;319381;319382;319383;319384;319385;319386;319387;319388;319389;319390;319391;319392;319393;319394;319395 406880;406881;406882;406883;406884;406885;406886;406887;406888;406889;406890;406891;406892;406893;406894;406895;406896;406897;406898;406899;406900;406901;406902;406903;406904;406905;406906;406907;406908 406900 21 PIEASIR Unmodified 784.4443 0.44430282 1936 P08133 ANXA6 Annexin A6 yes yes 0 0 0 1 23.127 23.127 2 0.065318 16076 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.473 37.114 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35349 1936 32932 319396 406909 406909 1 PIEEQGPLDVIIHK Unmodified 1586.8668 0.86680757 3013 Q13572;G3V5A3;G3V588 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 88.852 88.852 3 0.0026175 89420 QUIQUE_C1563_190116_001 57.034 42.951 214070000 0 32111000 79864000 40588000 0 42143000 0 0 0 19361000 0 0 0 35350 3013 32933 319397;319398;319399;319400;319401 406910;406911;406912;406913;406914 406913 2 PIFLNTIDPSHPMAK Unmodified 1679.8705 0.87051274 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 91.346 91.346 3 2.2123E-05 92198 QUIQUE_C1563_190116_001 77.372 65.758 362340000 108580000 47185000 42236000 70211000 0 58836000 35294000 0 0 0 0 0 0 35351 2533 32934 319402;319403;319404;319405;319406;319407;319408 406915;406916;406917;406918;406919;406920;406921 406920 5 PIGLCCIAPVLAAK Unmodified 1481.8098 0.80982674 215 P0DPI2;A0A0B4J2D5;A0A096LPI6;A0A096LNH5;H7C1F6;H7C2G3 C21orf33 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.82 116.82 2 8.0378E-29 114036 QUIQUE_DMIX4_190116_001 174.02 128.89 1110200000 191680000 161060000 132870000 112570000 88683000 187390000 105330000 0 34389000 46834000 0 0 49382000 35352 215 32935 319409;319410;319411;319412;319413;319414;319415;319416;319417;319418;319419;319420;319421 406922;406923;406924;406925;406926;406927;406928;406929;406930;406931;406932;406933;406934;406935 406932 14 PIHTTILNPHVHVIGEDAACIAYIR Unmodified 2809.4698 0.46975307 412;3010;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3;Q13554;H7C394 CAMK2G;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 93.755 93.755 3;4;5 4.6053E-05 96260 QUIQUE_C1277_190116_001 47.745 41.381 401390000 0 62234000 38593000 83588000 216970000 0 0 0 0 0 0 0 0 35353 412;3299;3010 32936 319422;319423;319424;319425 406936;406937;406938;406939 406936 4 PIIDLYEEMGK Unmodified 1306.6479 0.64788959 2306 P30085 CMPK1 UMP-CMP kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 115.29 115.29 2 0.00049143 119371 QUIQUE_C1218_190116_001 108.67 78.858 23243000 23243000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35354 2306 32937 319426;319427;319428 406940;406941;406942 406940 3 PIIFALSNPTSK Unmodified 1286.7234 0.72343779 3198;2504 P48163;Q16798;E9PMB9 ME1;ME3 NADP-dependent malic enzyme;NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.318 96.318 2 0.00024386 94210 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.68 92.284 830220000 150990000 105160000 103160000 106670000 87575000 0 93844000 0 0 51345000 0 66678000 64792000 35355 2504;3198 32938 319429;319430;319431;319432;319433;319434;319435;319436;319437;319438 406943;406944;406945;406946;406947;406948;406949;406950;406951;406952 406950 6 PIIFDCR Unmodified 919.45857 0.45857268 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0;D6RBK0 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 1 1 58.74 58.74 2 0.035447 58339 QUIQUE_C1218_190116_001 86.866 57.528 165780000 86019000 0 0 0 0 79766000 0 0 0 0 0 0 0 35356 2370 32939 319439;319440 406953;406954 406953 2 PIIHFGSDYEDR Unmodified 1447.6732 0.67319314 517 A2A2V1;P04156;X6RKS3 PRNP Major prion protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 2 1 2 62.08 62.08 2;3 1.9199E-10 61341 QUIQUE_C1277_190116_001 155.97 150.25 6772000000 581070000 721450000 772740000 578030000 569010000 487290000 580100000 259540000 361620000 219370000 639740000 346010000 656050000 35357 517 32940 319441;319442;319443;319444;319445;319446;319447;319448;319449;319450;319451;319452;319453;319454;319455;319456;319457;319458;319459;319460 406955;406956;406957;406958;406959;406960;406961;406962;406963;406964;406965;406966;406967;406968;406969;406970;406971;406972;406973;406974;406975;406976;406977;406978;406979;406980;406981;406982;406983;406984;406985;406986;406987;406988 406958 32 PIIILGPTK Unmodified 950.61645 0.61645353 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352;A0A3B3ISR0;B7Z3U2;A0A3B3IU19 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.771 69.771 2 0.00040007 68856 QUIQUE_DMIX8_190116_001 121.85 117.83 1174600000 143250000 128750000 96177000 76682000 98090000 0 97266000 79283000 82230000 48968000 127980000 110920000 85015000 35358 487 32941 319461;319462;319463;319464;319465;319466;319467;319468;319469;319470;319471;319472;319473 406989;406990;406991;406992;406993;406994;406995;406996;406997;406998;406999;407000;407001;407002;407003;407004;407005;407006;407007 407006 19 PIILLDSLSGMR Unmodified 1313.7377 0.73770765 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 1 132.27 132.27 2 0.04619 137739 QUIQUE_C1218_190116_001 54.608 7.7166 35145000 18336000 0 16809000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35359 3891 32942 319474;319475 407008;407009 407008 2 PIKPMQFLGDEETVR Unmodified 1758.8975 0.89745577 2139 P18669 PGAM1 Phosphoglycerate mutase 1 yes yes 0 0 1 1 85.471 85.471 3 0.020351 87287 QUIQUE_C1218_190116_001 31.614 23.899 48936000 48936000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35360 2139 32943 319476 407010;407011 407010 2 PIKPSPPYFGLLLASVGR Unmodified 1911.0982 0.098204487 476 A0A3B3IRI2;P17812;B4E1E0 CTPS1 CTP synthase 1;CTP synthase yes no 0 0 1 1 1 1 137.5 137.5 3 0.020207 141494 QUIQUE_C1277_190116_001 28.813 24.104 51399000 0 37471000 0 0 0 0 0 0 0 13928000 0 0 0 35361 476 32944 319477;319478;319479 407012;407013;407014 407013 3 PILDPVDFLGLQDK Unmodified 1568.845 0.84500949 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.05 155.05 2 7.4353E-05 157894 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.01 89.892 742150000 76151000 45834000 44753000 59834000 59975000 0 0 43646000 97831000 42070000 95194000 85438000 91427000 35362 2198 32945 319480;319481;319482;319483;319484;319485;319486;319487;319488;319489;319490 407015;407016;407017;407018;407019;407020;407021;407022;407023;407024;407025 407020 11 PILYSNWLSK Unmodified 1219.6601 0.66010926 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.28 106.28 2 0.0003183 109928 QUIQUE_C1277_190116_001 114.97 80.882 835530000 0 55921000 159340000 0 71979000 0 131580000 85816000 112900000 0 0 93690000 124310000 35363 3053 32946 319491;319492;319493;319494;319495;319496;319497;319498;319499;319500 407026;407027;407028;407029;407030;407031;407032;407033;407034;407035;407036;407037 407027 12 PILYSYFR Unmodified 1057.5597 0.55966693 216;1545 A0A0C4DFM0;G3V5T0;G3V4T6;A0A0A0MR33;G3V267;O43708 GSTZ1 Maleylacetoacetate isomerase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.063 95.063 2 0.016736 97171 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.671 36.953 300390000 0 41259000 78320000 0 0 68450000 0 0 0 22528000 27573000 17010000 45255000 35364 216;1545 32947 319501;319502;319503;319504;319505;319506;319507 407038;407039;407040;407041;407042;407043;407044 407043 6 PINLEPIFQGYIDSLK Unmodified 1845.9877 0.98765098 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 2 1 2 1 2 164.54 164.54 2;3 2.4298E-13 158746 QUIQUE_DMIX4_190116_001 136.01 111.16 175900000 62404000 8562100 0 25003000 10402000 0 0 0 0 69533000 0 0 0 + 35365 781;782 32948 319508;319509;319510;319511;319512;319513;319514;319515 407045;407046;407047;407048;407049;407050;407051;407052;407053 407053 7 PINLEPIFQGYIDSLKR Unmodified 2002.0888 0.088762013 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 1 1 1 1 1 152.03 152.03 3 9.6251E-06 156011 QUIQUE_C1403_190116_001 88.133 78.375 112140000 25141000 0 0 0 0 0 0 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0 35368 3061 32951 319537;319538 407086;407087 407087 2 PIPYIYGSR Unmodified 1064.5655 0.56548059 2024 P11413 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 71.913 71.913 2 0.0087437 73337 QUIQUE_C1438_190116_001 77.923 48.546 81716000 0 0 0 21943000 35355000 0 0 0 0 0 0 0 24418000 35369 2024 32952 319539;319540;319541;319542 407088;407089;407090;407091;407092 407090 5 PIRPGQHPAASPTHPSAIR Unmodified 1989.0657 0.06567558 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 15.549 15.549 4;5 0.00065598 7340 QUIQUE_C1563_190116_001 48.376 44.46 445800000 0 26932000 0 46426000 59053000 23400000 157230000 0 112250000 0 0 0 20498000 35370 2355 32953 319543;319544;319545;319546;319547;319548;319549;319550 407093;407094;407095;407096;407097;407098;407099;407100;407101 407097 9 PISPGLSYASHTVGFTPPTSLTR Unmodified 2385.2329 0.23286007 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 105.7 105.7 3 9.7894E-05 109040 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DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 16.118 16.118 2 0.011043 8201 QUIQUE_C1403_190116_001 67.897 31.712 22506000 0 0 0 22506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35377 2265 32960 319572 407124 407124 1 PIWLQIAESAYR Unmodified 1445.7667 0.76669959 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 138.66 138.66 2;3 9.0049E-07 143444 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.16 109.6 1764000000 181700000 144430000 109820000 96819000 84644000 92268000 164250000 101030000 173970000 61216000 266200000 190540000 97148000 35378 1655 32961 319573;319574;319575;319576;319577;319578;319579;319580;319581;319582;319583;319584;319585;319586 407125;407126;407127;407128;407129;407130;407131;407132;407133;407134;407135;407136;407137;407138;407139;407140;407141;407142 407142 18 PIYGGWLLLAPDGTDFDNPVHR Unmodified 2452.2175 0.21754435 3416 Q6WCQ1;J3KSK7 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.65 149.65 3 2.3261E-07 154409 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.215 67.222 448990000 32536000 42265000 44950000 48551000 26332000 39707000 45014000 0 44609000 0 73211000 51816000 0 35379 3416 32962 319587;319588;319589;319590;319591;319592;319593;319594;319595;319596 407143;407144;407145;407146;407147;407148;407149;407150;407151;407152;407153 407150 11 PIYVDCFGNLVPLTK Unmodified 1734.9015 0.90147851 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 135.4 135.4 2 0.0041552 140429 QUIQUE_C1218_190116_001 80.17 65.48 42188000 42188000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35380 902;1255;2856;1134 32963 319597;319598 407154;407155 407154 2 PKPAVPMKPMSINSNLLGYIGIDTIIEQMR 2 Oxidation (M) 3357.7499 0.7498756 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 2 2 1 1 145.84 145.84 4 3.4586E-08 151107 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.688 49.699 132980000 0 0 0 0 0 0 0 0 76509000 0 0 56471000 0 35381 419;584 32964 319599;319600 407156;407157 407156 300;301 2 PKPAVPMKPMSINSNLLGYIGIDTIIEQMR Unmodified 3325.76 0.76004636 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 0 2 1 1 1 155.26 155.26 4 5.8342E-25 162574 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.773 84.398 230390000 0 0 0 0 0 0 0 0 51031000 0 82178000 97183000 0 35382 419;584 32964 319601;319602;319603 407158;407159;407160 407159 3 PKPNQNLSEASGK Unmodified 1368.6997 0.69974224 3585 Q8N3V7 SYNPO Synaptopodin yes yes 0 0 1 1 10.319 10.319 3 0.014957 2750 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.897 37.889 7872200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7872200 0 0 0 35383 3585 32965 319604 407161 407161 1 PKPPSATSIPAILK Unmodified 1418.8497 0.84970094 4502 Q9UMS4;F5GY56 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes no 0 0 1 1 66.231 66.231 3 0.04329 66318 QUIQUE_C1218_190116_001 39.163 25.354 65875000 65875000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35384 4502 32966 319605 407162 407162 1 PKPQLAQKPSQDVPPPATAAAGGPPHPQLNK Unmodified 3136.6782 0.67816594 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 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32968 319635;319636;319637;319638 407200;407201;407202;407203 407200 4 PLAGGEPVSLGSLR Unmodified 1351.746 0.74596415 41 A0A087WUQ6;P07203;A0A2R8Y6B6 GPX1 Glutathione peroxidase;Glutathione peroxidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.7 82.7 2 0.00011064 85552 QUIQUE_C1218_190116_001 129.82 90.797 4830200000 333910000 372830000 477640000 410320000 378180000 349270000 426840000 228930000 341280000 185230000 536950000 391920000 396850000 35387 41 32969 319639;319640;319641;319642;319643;319644;319645;319646;319647;319648;319649;319650;319651 407204;407205;407206;407207;407208;407209;407210;407211;407212;407213;407214;407215;407216;407217;407218;407219;407220 407204 17 PLAHHIPVEK Unmodified 1139.6451 0.64512789 559 A8K878;P55145 MANF Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor yes no 0 0 0 1 14.626 14.626 3 0.0069358 6772 QUIQUE_C1218_190116_001 53.124 38.663 7569500 7569500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35388 559 32970 319652 407221 407221 1 PLAQLADPWQK Unmodified 1265.6768 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407356;407357;407358;407359;407360;407361 407361 5 PLFPGSTVEDELHLIFR Unmodified 1969.0309 0.030912783 1017 F5H6Z0;Q00537 CDK17 Cyclin-dependent kinase 17 yes no 0 0 0 1 156.59 156.59 3 0.0013706 162399 QUIQUE_C1368_190116_001 55.097 44.153 21477000 0 0 21477000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35408 1017 32990 319778 407362 407362 1 PLFPHVLCHNCAVEFNFGQK Unmodified 2413.146 0.14597609 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 2 1 2 3 2 103.03 103.03 2;3;4 8.8134E-38 106137 QUIQUE_C1403_190116_001 149.57 142.29 6663000000 221550000 545810000 490980000 380840000 588200000 337460000 811220000 272940000 418900000 45971000 672960000 1325800000 550390000 35409 2849 32991 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407416;407417;407418;407419;407420;407421;407422;407423 407423 6 PLHELIMQLLEETPEEK Oxidation (M) 2064.0449 0.044907867 2798 P68402;J3KNE3 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes no 0 1 0 1 137.11 137.11 3 0.0062973 132378 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.454 34.271 37642000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37642000 0 0 0 35414 2798 32995 319828 407424 407424 2246 1 PLHISTFINELDSGFR Unmodified 1844.9421 0.94209778 924 E9PGT1;Q15631 TSN Translin yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 140.02 140.02 2;3 4.0393E-25 144154 QUIQUE_DMIX7_190116_001 117.08 105.31 3715000000 204060000 381500000 220000000 415780000 279220000 203170000 248110000 186730000 369310000 92076000 576200000 385910000 152940000 35415 924 32996 319829;319830;319831;319832;319833;319834;319835;319836;319837;319838;319839;319840;319841;319842;319843;319844;319845;319846;319847;319848;319849;319850 407425;407426;407427;407428;407429;407430;407431;407432;407433;407434;407435;407436;407437;407438;407439;407440;407441;407442;407443;407444;407445;407446;407447;407448;407449;407450;407451 407449 25 PLHYAAWQGR Unmodified 1197.6043 0.60432571 3718 Q8WXD9;J3QRN1;Q8WXE0 CASKIN1;CASKIN2 Caskin-1;Caskin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.983 36.983 3 0.00010371 32242 QUIQUE_C1368_190116_001 95.502 88.362 184890000 42633000 43061000 38070000 29063000 0 32063000 0 0 0 0 0 0 0 35416 3718 32997 319851;319852;319853;319854;319855 407452;407453;407454;407455;407456 407454 5 PLIDQVVQTALSETQDPEEVSVTVK Unmodified 2724.4069 0.40692085 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 2 160.51 160.51 2;3 4.1646E-09 168031 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.07 102.68 33972000 0 0 0 0 0 0 0 33972000 0 0 0 0 0 35417 50 32998 319856;319857;319858 407457;407458;407459 407459 3 PLIEVGELLDLTR Unmodified 1466.8344 0.83444481 4093 Q9C0C2 TNKS1BP1 182 kDa tankyrase-1-binding protein yes yes 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Unmodified 1004.6019 0.6018661 3769 Q92932;E7EM83;A0A0A0MSD7 PTPRN2 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 36.769 36.769 2 0.010986 32914 QUIQUE_C1277_190116_001 67.981 43.349 70439000 0 28387000 0 0 18165000 0 0 0 0 0 0 0 23887000 35422 3769 33003 319865;319866;319867 407466;407467;407468 407466 3 PLLDSVAQQQGAWLPHVADFR Unmodified 2347.2073 0.20731402 944 E9PJE4;Q9GZQ3;H0YEQ6 COMMD5 COMM domain-containing protein 5 yes no 0 0 0 1 138.7 138.7 3 0.0025373 143829 QUIQUE_C1218_190116_001 43.116 34.928 32617000 32617000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35423 944 33004 319868 407469 407469 1 PLLGGPFSLTTHTGER Unmodified 1681.8788 0.87876924 1296 J3QL56;O75880 SCO1 Protein SCO1 homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 86.695 86.695 3 0.013634 87227 QUIQUE_C1563_190116_001 38.661 27.29 27429000 0 0 0 0 0 27429000 0 0 0 0 0 0 0 35424 1296 33005 319869 407470 407470 1 PLLGHDAVIQALAQK Unmodified 1572.8988 0.8987764 2928 Q08AD1 CAMSAP2 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 87.566 87.566 3 0.05258 88040 QUIQUE_C1563_190116_001 23.481 18.425 59255000 0 0 0 0 0 59255000 0 0 0 0 0 0 0 35425 2928 33006 319870 407471 407471 0 PLLGLILLNEK Unmodified 1221.7697 0.76965971 4447 Q9UIA9;E7ESC6;Q9H2T7 XPO7;RANBP17 Exportin-7;Ran-binding protein 17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.8 139.8 2 3.7658E-08 144218 QUIQUE_C1277_190116_001 152.86 132.87 923140000 67344000 126060000 72298000 63741000 73517000 53901000 80277000 47786000 73656000 40867000 80628000 87427000 55639000 35426 4447 33007 319871;319872;319873;319874;319875;319876;319877;319878;319879;319880;319881;319882;319883 407472;407473;407474;407475;407476;407477;407478;407479;407480;407481;407482;407483;407484;407485;407486 407474 12 PLLLLGQLHHLHR Unmodified 1545.9256 0.92560027 3639 Q8NDH3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes yes 0 0 0 1 1 65.946 65.946 4 0.00047552 63938 QUIQUE_C1277_190116_001 76.655 69.453 49053000 0 41755000 0 0 0 0 0 0 0 7298700 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407526 9 PLLQFTLIMMAFYTGLSR Unmodified 2101.1104 0.11042543 1427 O14495;A0A286YES4;A0A286YEZ7 PPAP2B Lipid phosphate phosphohydrolase 3 yes no 0 0 0 1 135.19 135.19 3 0.0086904 140061 QUIQUE_C1218_190116_001 27.85 15.85 23146000 23146000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35436 1427 33015 319927 407533 407533 1 PLLQVTSPVLQR Unmodified 1349.8031 0.8030851 3201 Q16849;C9JR27 PTPRN Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.422 91.422 2 6.9619E-05 94810 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.63 107.55 427890000 0 46740000 57040000 48402000 43814000 22195000 58014000 17440000 43047000 0 44259000 0 46935000 35437 3201 33016 319928;319929;319930;319931;319932;319933;319934;319935;319936;319937 407534;407535;407536;407537;407538;407539;407540;407541;407542;407543;407544 407543 9 PLLSFISPSIPITFLR Unmodified 1800.0549 0.054942689 1420;1413 O00629;O00505 KPNA4;KPNA3 Importin subunit alpha-3;Importin subunit alpha-4 no no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 167.28 167.28 2;3 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Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 78.99 78.99 3 8.2164E-05 79614 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.367 71.636 630650000 81786000 95023000 0 82457000 0 57766000 74045000 0 96789000 48325000 0 94464000 0 35443 882 33021 319972;319973;319974;319975;319976;319977;319978;319979 407580;407581;407582;407583;407584;407585;407586;407587;407588 407585 9 PLNPNFCFLQCTSAYPLQPEDVNLR Unmodified 2992.4211 0.4211479 4263 Q9NR45;Q5TBR1 NANS Sialic acid synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 150.48 150.48 3 2.3255E-31 156144 QUIQUE_C1218_190116_001 130.83 124.93 203340000 43177000 40267000 46764000 29414000 0 0 43723000 0 0 0 0 0 0 35444 4263 33022 319980;319981;319982;319983;319984 407589;407590;407591;407592;407593 407589 5 PLNVTVIR Unmodified 910.56 0.56000128 1390 O00233 PSMD9 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9 yes yes 0 0 0 1 1 54.091 54.091 2 0.026319 52163 QUIQUE_C1218_190116_001 70.69 33.596 51898000 35557000 0 0 0 0 0 0 0 0 16341000 0 0 0 35445 1390 33023 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PLTPLQEEMASLLQQIEIER Unmodified 2337.225 0.2249975 4151 Q9H2W6;A0A087WT90 MRPL46 39S ribosomal protein L46, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 171.09 171.09 3 4.35E-05 175334 QUIQUE_C1218_190116_001 53.201 30.101 91932000 91932000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35464 4151 33041 320104;320105 407752;407753 407752 2 PLTPTYAQAPK Unmodified 1185.6394 0.63937381 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.854 39.854 2 0.00015198 35757 QUIQUE_C1403_190116_001 128.12 93.313 519100000 70125000 72921000 0 116070000 52989000 71953000 0 0 39527000 27906000 0 0 67608000 35465 151 33042 320106;320107;320108;320109;320110;320111;320112;320113 407754;407755;407756;407757;407758;407759;407760;407761 407756 7 PLTQEEIAQR Unmodified 1183.6197 0.619701 3454 Q7Z2Z2 EFTUD1 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.045 32.045 2 0.00028008 26830 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.26 108.7 342630000 43992000 32152000 0 30468000 27334000 25964000 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3755;58 A0A087WW91;Q92777 SYN2 Synapsin-2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 30.783 30.783 3 4.1732E-11 24956 QUIQUE_C1368_190116_001 114.03 96.951 376790000 88560000 0 75192000 67110000 0 0 100280000 0 0 0 0 0 45651000 35469 58;3755 33046 320135;320136;320137;320138;320139 407785;407786;407787;407788;407789 407786 5 PLVALLDGR Unmodified 952.57057 0.57056597 2989;2682 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1;E7EUB3;Q5SQP8;P56545 CTBP1;CTBP2 C-terminal-binding protein 1;C-terminal-binding protein 2 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 88.069 88.069 2 0.00046166 89728 QUIQUE_C1438_190116_001 125.58 87.976 3491900000 372520000 330740000 300970000 265620000 274690000 266550000 253330000 153290000 223420000 107720000 384920000 273600000 284490000 35470 2989;2682 33047 320140;320141;320142;320143;320144;320145;320146;320147;320148;320149;320150;320151;320152;320153;320154 407790;407791;407792;407793;407794;407795;407796;407797;407798;407799;407800;407801;407802;407803;407804;407805;407806;407807;407808;407809;407810;407811;407812;407813;407814;407815;407816;407817 407800 28 PLVDILILPGYVQACR Unmodified 1826.0124 0.012425947 1641 O75508;B4DFI2 CLDN11 Claudin-11;Claudin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 154.09 154.09 2;3 3.6502E-06 159236 QUIQUE_C1368_190116_001 124.92 101.32 2223700000 148600000 176360000 628060000 119450000 102080000 116990000 285950000 26414000 114640000 185200000 104600000 118880000 96518000 35471 1641 33048 320155;320156;320157;320158;320159;320160;320161;320162;320163;320164;320165;320166;320167;320168;320169;320170;320171;320172;320173;320174;320175;320176;320177;320178;320179 407818;407819;407820;407821;407822;407823;407824;407825;407826;407827;407828;407829;407830;407831;407832;407833;407834;407835;407836;407837;407838;407839;407840;407841;407842;407843;407844;407845 407823 27 PLVDLSYDSALEVLR Unmodified 1688.8985 0.89850163 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 2 148.65 148.65 2 8.3763E-09 154049 QUIQUE_C1218_190116_001 125.54 101.16 56566000 33274000 0 0 0 0 23292000 0 0 0 0 0 0 0 35472 699 33049 320180;320181;320182 407846;407847;407848;407849 407846 4 PLVEEPQNLIK Unmodified 1278.7184 0.71835242 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 78.991 78.991 2 0.017041 81374 QUIQUE_C1438_190116_001 74.772 66.547 35375000 0 0 0 0 35375000 0 0 0 0 0 0 0 0 + 35473 769 33050 320183 407850 407850 1 PLVEKDPTMK Unmodified 1156.6162 0.61619553 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 1 1 21.054 21.054 3 0.038864 13988 QUIQUE_C1218_190116_001 41.338 23.279 16663000 16663000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35474 77 33051 320184 407851 407851 1 PLVETIFER Unmodified 1102.6023 0.60226003 1377 O00139 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.38 95.38 2 0.00048805 98658 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.89 92.763 1872300000 162640000 168300000 161530000 148590000 120570000 149360000 168220000 111730000 113700000 53425000 199410000 160390000 154460000 35475 1377 33052 320185;320186;320187;320188;320189;320190;320191;320192;320193;320194;320195;320196;320197 407852;407853;407854;407855;407856;407857;407858;407859;407860;407861;407862;407863;407864;407865;407866;407867;407868 407865 17 PLVLLIPLR Unmodified 1032.7059 0.70593724 4610 Q9Y4P1;C9JIK8;H7C2A6 ATG4B Cysteine protease ATG4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 131.34 131.34 2 0.00095324 127884 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.24 49.033 20355000 0 0 0 0 0 14101000 0 0 0 6254400 0 0 0 35476 4610 33053 320198;320199;320200;320201 407869;407870;407871;407872 407872 4 PLVVFVLGGPGAGK Unmodified 1309.7758 0.77580772 2306 P30085;Q5T0D2;E9PJD2 CMPK1 UMP-CMP kinase yes no 0 0 0 1 117.16 117.16 2 0.027938 119403 QUIQUE_C1563_190116_001 60.518 44.637 9244600 0 0 0 0 0 9244600 0 0 0 0 0 0 0 35477 2306 33054 320202 407873 407873 1 PLYEGLGSGGEK Unmodified 1205.5928 0.59281755 4337 Q9NZ32;G3V2Q5;G3V5Y4;F6S9Y6;G3V524;G3V4K6 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.064 48.064 2 0.00049826 45672 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.29 54.295 764690000 0 80592000 73009000 0 69135000 45008000 0 81647000 107180000 0 107800000 105420000 94897000 35478 4337 33055 320203;320204;320205;320206;320207;320208;320209;320210;320211 407874;407875;407876;407877;407878;407879;407880;407881;407882;407883 407880 9 PLYGAFR Unmodified 822.43882 0.43882351 1483 O15126;A0A087WXB0 SCAMP1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 yes no 0 0 0 1 1 51.442 51.442 2 0.037804 49252 QUIQUE_C1403_190116_001 85.061 48.595 196240000 0 83076000 0 113160000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35479 1483 33056 320212;320213 407884;407885 407885 2 PLYIPSNR Unmodified 958.52362 0.52361577 1329 K7ELL7;P14314;K7EPW7;K7EKX1;K7EJ70 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 45.505 45.505 2 0.035359 42951 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320274;320275;320276;320277;320278;320279;320280;320281;320282;320283;320284;320285;320286;320287;320288;320289;320290;320291;320292;320293;320294;320295 407983;407984;407985;407986;407987;407988;407989;407990;407991;407992;407993;407994;407995;407996;407997;407998;407999;408000;408001;408002;408003;408004;408005;408006;408007;408008;408009;408010;408011;408012;408013;408014;408015;408016;408017;408018;408019;408020;408021;408022 407989 40 PMFQISEYQALK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1511.733 0.7330162 4734 yes yes 1 1 0 1 1 80.377 80.377 2 0.009196 81835 QUIQUE_C1277_190116_001 51.113 9.3893 82480000 0 31891000 50589000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 35491 4734 33065 320296;320297 408023;408024 408023 3096 2 PMGDLLDQIFIHR Unmodified 1553.8024 0.80243317 1127 H0Y704;O15231 ZNF185 Zinc finger protein 185 yes no 0 0 0 2 139.85 139.85 3 0.0060407 144233 QUIQUE_C1277_190116_001 46.88 40.402 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35492 1127 33066 320298;320299 408025;408026 408025 2 PMIHELLTEGR Unmodified 1294.6704 0.67035637 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 60.567 60.567 2;3 1.8169E-12 58991 QUIQUE_C1368_190116_001 163.16 139.2 3078500000 353810000 329850000 337390000 306190000 315930000 209240000 330500000 23959000 169900000 12557000 251690000 197220000 240270000 35493 3090 33067 320300;320301;320302;320303;320304;320305;320306;320307;320308;320309;320310;320311;320312;320313;320314;320315;320316;320317;320318;320319;320320;320321;320322;320323 408027;408028;408029;408030;408031;408032;408033;408034;408035;408036;408037;408038;408039;408040;408041;408042;408043;408044;408045;408046;408047;408048;408049;408050;408051;408052;408053 408033 25 PMIHELLTEGR Oxidation (M) 1310.6653 0.66527099 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 1 0 1 1 1 3 1 47.367 47.367 2;3 0.0018999 43398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.062 62.856 186670000 71073000 0 0 0 0 31126000 0 0 0 84472000 0 0 0 35494 3090 33067 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Glutathione S-transferase Mu 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 111.19 111.19 2 1.8255E-24 114537 QUIQUE_DMIX8_190116_001 186.13 132.16 4534200000 419890000 479220000 413060000 484670000 485560000 349780000 0 393700000 536860000 106700000 864800000 0 0 35510 2277 33078 320402;320403;320404;320405;320406;320407;320408;320409;320410;320411;320412;320413;320414 408147;408148;408149;408150;408151;408152;408153;408154;408155;408156;408157;408158;408159;408160;408161;408162;408163 408163 17 PMVYLVNLSEK Unmodified 1291.6846 0.68460945 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JCJ9 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.909 98.909 2 0.00047426 100112 QUIQUE_C1563_190116_001 102.06 68.799 943130000 135170000 147240000 105650000 114560000 95021000 91701000 122770000 0 42057000 37304000 0 0 51662000 35511 1276 33079 320415;320416;320417;320418;320419;320420;320421;320422;320423;320424 408164;408165;408166;408167;408168;408169;408170;408171;408172;408173 408169 7 PMVYLVNLSEK Oxidation (M) 1307.6795 0.67952407 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JCJ9 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 1 0 1 83.857 83.857 2 0.00052005 80373 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.7 83.938 27783000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27783000 0 0 0 35512 1276 33079 320425 408174;408175;408176 408176 737 3 PMVYLVNLSEKDYIR Unmodified 1838.9601 0.96005603 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JCJ9 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 107.97 107.97 3 1.441E-18 111856 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.47 132.43 325040000 0 0 0 0 0 0 0 66198000 54117000 0 86665000 61633000 56427000 35513 1276 33080 320426;320427;320428;320429;320430 408177;408178;408179;408180;408181;408182;408183 408179 7 PMYSNPPLNGAR Unmodified 1315.6343 0.63430521 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 46.361 46.361 2 5.2012E-05 43219 QUIQUE_C1277_190116_001 126.07 91.535 544140000 115270000 71909000 85966000 70613000 63822000 0 73096000 0 0 17501000 0 0 45967000 35514 1788 33081 320431;320432;320433;320434;320435;320436;320437;320438;320439;320440;320441;320442;320443;320444;320445 408184;408185;408186;408187;408188;408189;408190;408191;408192;408193;408194;408195;408196;408197;408198;408199;408200;408201;408202;408203 408186 20 PMYSNPPLNGAR Oxidation (M) 1331.6292 0.62921983 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 35.162 35.162 2 0.0036632 30356 QUIQUE_C1218_190116_001 89.047 38.898 14277000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14277000 0 0 0 35515 1788 33081 320446;320447;320448 408204;408205;408206 408204 1003 3 PNAQELPSMYQR Unmodified 1432.6769 0.67689831 1272 J3KPX7;Q99623;F5GY37;F5GWA7;F5H3X6 PHB2 Prohibitin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 58.927 58.927 2 0.00053207 55458 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.48 77.835 292030000 54981000 0 69140000 42330000 0 54586000 55878000 0 0 15119000 0 0 0 35516 1272 33082 320449;320450;320451;320452;320453;320454;320455 408207;408208;408209;408210;408211;408212;408213 408213 6 PNFAGTWK Unmodified 919.4552 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408258;408259;408260;408261;408262;408263;408264;408265;408266;408267;408268;408269 408260 11 PNNPDWGTFEEVSGNVSPGTR Unmodified 2259.0192 0.019238477 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 109.69 109.69 2;3 2.2541E-64 112819 QUIQUE_C1277_190116_001 209.13 183.61 123340000 0 36051000 0 31686000 0 0 32708000 0 0 22894000 0 0 0 35525 1823 33091 320506;320507;320508;320509;320510 408270;408271;408272;408273;408274 408271 5 PNPDILDHER Unmodified 1204.5836 0.58364985 4529 Q9UQ35;I3L0N7;I3L4D8 SRRM2 Serine/arginine repetitive matrix protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 130.79 130.79 2 0.016384 133813 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.659 23.354 184570000 17910000 0 0 22701000 20138000 0 0 24354000 36884000 0 43409000 19171000 0 35526 4529 33092 320511;320512;320513;320514;320515;320516;320517 408275;408276;408277;408278;408279;408280;408281 408278 7 PNSEPASLLELFNSIATQGELVR Unmodified 2484.286 0.28601785 2213 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protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 154.46 154.46 2 1.653E-07 159235 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.43 113.12 87137000 16211000 0 0 0 0 0 0 11323000 18540000 0 21530000 19533000 0 35528 3470 33094 320544;320545;320546;320547;320548;320549;320550 408312;408313;408314;408315;408316;408317;408318;408319;408320 408315 8 PNTLTLVHVR Unmodified 1148.6666 0.66659162 1653 O75694;E9PF10 NUP155 Nuclear pore complex protein Nup155 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.63 41.63 3 0.0040659 37790 QUIQUE_C1563_190116_001 53.567 40.032 321360000 0 35441000 37035000 25463000 47883000 40643000 30367000 0 30520000 0 0 37255000 36757000 35529 1653 33095 320551;320552;320553;320554;320555;320556;320557;320558;320559;320560 408321;408322;408323;408324;408325;408326;408327;408328;408329;408330;408331 408326 11 PPRTPPPPSR Unmodified 1100.6091 0.60907674 430 A0A2R8Y5H9;Q8IVT5;A0A0A0MQW1;A8MY87;A0A2R8Y4X0 KSR1 Kinase suppressor of Ras 1 yes no 0 0 1 1 10.531 10.531 3 0.04481 2813 QUIQUE_C1218_190116_001 38.402 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Q15370;B8ZZU8;I3L0M9 TCEB2 Transcription elongation factor B polypeptide 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 73.582 73.582 2 0.00012586 75147 QUIQUE_C1218_190116_001 132.01 91.965 2778700000 470770000 381160000 421600000 0 340460000 386130000 394590000 0 0 113550000 270470000 0 0 35532 3132 33098 320588;320589;320590;320591;320592;320593;320594;320595 408372;408373;408374;408375;408376;408377;408378;408379 408372 2 PQAPPSQPLPQTQAK Unmodified 1586.8417 0.84165545 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 31.605 31.605 2 2.4492E-06 26871 QUIQUE_C1218_190116_001 112.43 87.638 161720000 59678000 0 25433000 39941000 0 36672000 0 0 0 0 0 0 0 35533 3212 33099 320596;320597;320598;320599 408380;408381;408382;408383 408380 4 PQDGVAVLVR Unmodified 1052.5978 0.59784335 1014 F5H6E2;O00159 MYO1C Unconventional myosin-Ic yes no 0 0 0 1 50.709 50.709 2 0.031605 48267 QUIQUE_C1403_190116_001 53.965 21.355 14740000 0 0 0 14740000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35534 1014 33100 320600 408384 408384 1 PQEAAVAPEKPPASDETK Unmodified 1863.9214 0.92142191 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 22.547 22.547 2;3 1.2851E-09 15901 QUIQUE_C1218_190116_001 139.6 119.4 716340000 235690000 75482000 48991000 117770000 68426000 98513000 0 0 0 71472000 0 0 0 35535 2293 33101 320601;320602;320603;320604;320605;320606;320607;320608 408385;408386;408387;408388;408389;408390;408391;408392;408393;408394;408395 408387 11 PQEEPKDNSSSATDPSFK Unmodified 1962.8807 0.88067931 359 A0A1B0GVP4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 2 3 10.468 10.468 3;4;5 0.0013618 2660 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.088 11.176 485310000 0 0 0 24634000 50138000 0 14997000 0 54467000 0 124810000 98644000 117620000 35536 359 33102 320609;320610;320611;320612;320613;320614;320615;320616;320617;320618;320619 408396;408397;408398;408399;408400;408401;408402;408403;408404;408405;408406 408405 11 PQFLLQFSEVLAK Unmodified 1518.8446 0.84461556 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6;C9JIW4 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 146.36 146.36 2 0.0046178 150923 QUIQUE_C1277_190116_001 68.132 53.16 60087000 0 60087000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35537 62 33103 320620 408407 408407 1 PQPEPQQEPVLITMATVVLTVLTHTPAPR Unmodified 3162.7111 0.71110555 185 A0A0G2JKZ1;A0A0A0MSV9;O15533;C9JA35 TAPBP Tapasin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 177.89 177.89 3 2.2087E-19 182057 QUIQUE_C1368_190116_001 88.014 82.234 123180000 0 0 69596000 18251000 0 0 0 8225400 9299800 0 17810000 0 0 35538 185 33104 320621;320622;320623;320624;320625;320626 408408;408409;408410;408411;408412;408413 408409 6 PQPPPPPPGAHSPGATPGPGTATAER Unmodified 2441.2088 0.20877058 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 0 6 3 2 1 2 3 2 2 2 1 39.988 39.988 3 4.5067E-37 33778 QUIQUE_C1368_190116_001 133.15 129.34 2048900000 469060000 227040000 455370000 133530000 184330000 313350000 171620000 0 0 33697000 60855000 0 0 35539 2125 33105 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320826;320827;320828;320829;320830;320831;320832;320833;320834;320835;320836;320837;320838;320839;320840;320841;320842;320843;320844;320845;320846;320847 408679;408680;408681;408682;408683;408684;408685;408686;408687;408688;408689;408690;408691;408692;408693;408694;408695;408696;408697;408698;408699;408700 408682 22 PSDEEMLFIYGHYK Unmodified 1727.7865 0.78650834 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 84.443 84.443 2 0.00096318 87122 QUIQUE_C1438_190116_001 82.008 65.755 42860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42860000 0 35564 1914 33130 320848;320849;320850 408701;408702;408703 408701 3 PSDEHHPEVK Unmodified 1173.5415 0.54145068 4111 Q9H008 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 10.511 10.511 3 0.064752 2931 QUIQUE_DMIX7_190116_001 29.551 16.974 7878200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7878200 0 35565 4111 33131 320851 408704 408704 1 PSDEHKTDLNPDNLQGGDDLDPNYVLSSR Unmodified 3210.4701 0.47014282 2044 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408722;408723;408724;408725;408726;408727;408728;408729;408730;408731 408723 10 PSDLRPGDVSSK Unmodified 1256.6361 0.63607935 889 E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 17.677 17.677 2;3 4.5075E-13 9740 QUIQUE_DMIX8_190116_001 160.91 104.48 743750000 0 0 0 45819000 57817000 122760000 28425000 113870000 158680000 79110000 97225000 0 40052000 35568 889 33134 320878;320879;320880;320881;320882;320883;320884;320885;320886;320887;320888;320889 408732;408733;408734;408735;408736;408737;408738;408739;408740;408741;408742;408743 408743 6 PSDLRPGDVSSKR Unmodified 1412.7372 0.73719038 889 E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon yes no 0 0 2 1 14.427 14.427 4 0.028388 6742 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.643 39.375 13839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13839000 0 0 35569 889 33135 320890 408744 408744 0 PSDQVFCYNPATDSWSAVR Unmodified 2198.9691 0.96911716 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 114.59 114.59 2 1.0382E-55 117854 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0.82249573 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 69.742 69.742 2 5.2917E-235 69355 QUIQUE_C1403_190116_001 314.74 295.08 125880000 0 0 0 58536000 29210000 38131000 0 0 0 0 0 0 0 35575 4668 33140 320924;320925;320926;320927;320928 408780;408781;408782;408783;408784 408781 4 PSETGIIGIIDPECR Unmodified 1655.8189 0.8188711 3179 Q16531;F5GY55;F5H2L3;F5GWI0;F5GZY8 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 120.53 120.53 2 1.5638E-06 125739 QUIQUE_C1576_190116_001 101.89 71.064 133400000 0 0 33337000 40560000 37564000 21939000 0 0 0 0 0 0 0 35576 3179 33141 320929;320930;320931;320932;320933;320934;320935 408785;408786;408787;408788;408789;408790;408791;408792 408791 8 PSETPQAEVGPTGCPHR Unmodified 1818.8319 0.8318954 1988 P0DN79;P35520;C9JMA6 CBS Cystathionine beta-synthase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 25.459 25.459 3 9.1003E-06 19035 QUIQUE_C1403_190116_001 99.663 88.618 372870000 0 42689000 0 47264000 0 43460000 38956000 36808000 0 23841000 0 0 139850000 35577 1988 33142 320936;320937;320938;320939;320940;320941;320942;320943;320944 408793;408794;408795;408796;408797;408798;408799;408800;408801 408794 9 PSFLQLR Unmodified 859.49159 0.49158736 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 0 1 1 1 71.03 71.03 2 0.020578 71701 QUIQUE_C1576_190116_001 107.74 51.718 132440000 0 0 0 0 39984000 0 64658000 0 0 0 0 27801000 0 35578 2439 33143 320945;320946;320947 408802;408803;408804 408803 3 PSGVQMDQPCCR Oxidation (M) 1449.5799 0.57990315 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.562 16.562 2 5.4643E-28 8500 QUIQUE_C1277_190116_001 182.46 162.7 924640000 89117000 126700000 73366000 101180000 59907000 59430000 79057000 28958000 53876000 50217000 59572000 53340000 89917000 35579 3982 33144 320948;320949;320950;320951;320952;320953;320954;320955;320956;320957;320958;320959;320960 408805;408806;408807;408808;408809;408810;408811;408812;408813;408814;408815;408816;408817 408806 2819 13 PSGVQMDQPCCR Unmodified 1433.585 0.58498853 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.321 28.321 2 2.537E-37 23304 QUIQUE_C1218_190116_001 189.58 181.36 2315400000 273760000 338480000 236340000 236760000 147010000 224200000 263380000 71341000 92137000 62941000 83083000 106110000 179820000 35580 3982 33144 320961;320962;320963;320964;320965;320966;320967;320968;320969;320970;320971;320972;320973 408818;408819;408820;408821;408822;408823;408824;408825;408826;408827;408828;408829;408830;408831;408832;408833;408834;408835;408836 408819 19 PSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADK Unmodified 3463.599 0.5990485 2933 Q09028;H0YCT5;H0YF10;H0YDK2;H0YEU5 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes no 0 0 0 1 132.63 132.63 4 0.00016889 136926 QUIQUE_C1277_190116_001 36.978 31.819 59121000 0 59121000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35581 2933 33145 320974 408837;408838 408837 2 PSILPSK Unmodified 740.44324 0.44324019 880 E7EVA0;P27816;B5MEG9 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 0 1 1 27.927 27.927 2 0.028875 21815 QUIQUE_C1403_190116_001 91.9 28.613 296560000 0 0 0 181710000 0 114850000 0 0 0 0 0 0 0 35582 880 33146 320975;320976 408839;408840 408839 2 PSILTYQYAEDLIR Unmodified 1680.8723 0.87228688 4067 Q9BXW7 CECR5 Cat eye syndrome critical region protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 135.16 135.16 2 2.039E-10 141620 QUIQUE_DMIX5_190116_001 134.75 117.81 366410000 62626000 61105000 56414000 51489000 0 0 0 0 0 21138000 31799000 30348000 51487000 35583 4067 33147 320977;320978;320979;320980;320981;320982;320983;320984 408841;408842;408843;408844;408845;408846;408847;408848 408846 8 PSINYYQVADFK Unmodified 1443.7034 0.70343063 85 D6REQ6;D6RHI9;A0A087WZM2;O00584 RNASET2 Ribonuclease T2 yes no 0 0 0 1 96.067 96.067 2 0.0033271 99273 QUIQUE_C1368_190116_001 75.819 62.466 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35584 85 33148 320985 408849 408849 1 PSIQALIHGLNR Unmodified 1317.7517 0.75171823 1411 O00487 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes yes 0 0 0 1 90.386 90.386 3 0.0058035 91324 QUIQUE_C1563_190116_001 44.616 36.216 8663000 0 0 0 0 0 8663000 0 0 0 0 0 0 0 35585 1411 33149 320986 408850 408850 1 PSLDFPASAFGFSSLQPAPPQLPSPAEPR Unmodified 3007.508 0.5079723 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 154.94 154.94 3;4 1.9771E-27 161977 QUIQUE_C1277_190116_001 76.294 65.872 787260000 81726000 71826000 57821000 62164000 94953000 54256000 0 71001000 0 23604000 81204000 47424000 141280000 35586 921 33150 320987;320988;320989;320990;320991;320992;320993;320994;320995;320996;320997;320998 408851;408852;408853;408854;408855;408856;408857;408858;408859;408860;408861;408862;408863;408864;408865;408866;408867;408868 408853 15 PSLITGIMK Unmodified 958.55214 0.55213871 4562 Q9Y2Q3;E9PFN5;C9JNT3 GSTK1 Glutathione S-transferase kappa 1 yes no 0 0 0 1 1 78.028 78.028 2 0.009778 79758 QUIQUE_C1218_190116_001 75.043 60.268 52661000 27363000 25298000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35587 4562 33151 320999;321000 408869;408870 408869 2 PSLSWLR Unmodified 857.47594 0.4759373 2912 Q07960;E9PNR6 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 78.517 78.517 2 0.050616 79309 QUIQUE_C1277_190116_001 74.439 47.574 22830000 0 22830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35588 2912 33152 321001 408871 408871 1 PSPAISVSVSAPAFYAPQK Unmodified 1916.0044 0.0043636815 1114 H0Y2Y8;Q15942;C9IZ41 ZYX Zyxin yes no 0 0 0 1 1 1 106.96 106.96 2 1.5513E-05 112164 QUIQUE_C1438_190116_001 121.28 120.57 92573000 0 0 25638000 0 32810000 0 0 0 34125000 0 0 0 0 35589 1114 33153 321002;321003;321004 408872;408873;408874 408873 3 PSPAISVSVSAPAFYAPQKK Unmodified 2044.0993 0.099326699 1114 H0Y2Y8;Q15942;C9IZ41 ZYX Zyxin yes no 0 0 1 1 1 87.698 87.698 3 0.00031337 89029 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.512 45.202 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35590 1114 33154 321005;321006 408875;408876 408875 2 PSPEFFK Unmodified 850.4225 0.42250475 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.17 48.17 2 0.032179 45499 QUIQUE_C1277_190116_001 89.369 66.44 3253400000 464610000 457390000 674010000 459990000 378500000 476780000 0 0 342090000 0 0 0 0 35591 4111 33155 321007;321008;321009;321010;321011;321012;321013 408877;408878;408879;408880;408881;408882;408883 408878 7 PSPIQEESIPIALSGR Unmodified 1692.9046 0.90464964 2249 P26196;Q8IV96 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes no 0 0 0 1 103.75 103.75 2 0.042525 107220 QUIQUE_C1218_190116_001 39.73 32.36 50181000 50181000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35592 2249 33156 321014 408884 408884 1 PSPLEAPNER Unmodified 1108.5513 0.55128709 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A yes no 0 0 0 1 29.746 29.746 2 0.06041 24369 QUIQUE_C1368_190116_001 54.722 30.203 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35593 497 33157 321015 408885 408885 1 PSPQQPGSTKPPSQQPGSAK Unmodified 2003.0072 0.007217228 4665 Q9Y6V0 PCLO Protein piccolo yes yes 0 0 1 1 1 1 15.407 15.407 3 0.027375 7768 QUIQUE_C1438_190116_001 22.24 11.864 84641000 0 0 32945000 0 32506000 0 0 0 19190000 0 0 0 0 35594 4665 33158 321016;321017;321018 408886;408887;408888 408887 3 PSPWRPLVLLIPLR Unmodified 1656.0239 0.023917332 4610 Q9Y4P1;C9JIK8;H7C2A6 ATG4B Cysteine protease ATG4B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 141.91 141.91 3 0.0023974 144703 QUIQUE_C1563_190116_001 68.034 65.173 126290000 16474000 0 25198000 0 21444000 24617000 38554000 0 0 0 0 0 0 35595 4610 33159 321019;321020;321021;321022;321023 408889;408890;408891;408892;408893 408892 4 PSPYMFECITENFSIDPAR Unmodified 2273.0133 0.013290163 3859 Q96GD0;Q6ZT62 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 153.3 153.3 2 7.3599E-64 157403 QUIQUE_C1277_190116_001 184.21 163.78 41682000 0 24897000 0 0 0 0 16785000 0 0 0 0 0 0 35596 3859 33160 321024;321025 408894;408895 408894 2 PSQGMTAADDFFQGTR Oxidation (M) 1743.7522 0.75224809 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 76.743 76.743 2 2.4892E-07 73384 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.25 101.19 315330000 67891000 67441000 51845000 0 41674000 0 0 0 0 86479000 0 0 0 35597 3050 33161 321026;321027;321028;321029;321030;321031;321032;321033 408896;408897;408898;408899;408900;408901;408902;408903;408904;408905;408906 408905 2480 11 PSQGMTAADDFFQGTR Unmodified 1727.7573 0.75733347 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 94.598 94.598 2 4.7547E-66 97167 QUIQUE_C1277_190116_001 236.92 227.26 1864100000 363880000 266450000 286890000 233330000 143650000 263880000 200020000 0 0 106040000 0 0 0 35598 3050 33161 321034;321035;321036;321037;321038;321039;321040;321041 408907;408908;408909;408910;408911;408912;408913;408914 408908 6 PSQLQSQFR Unmodified 1089.5567 0.55670682 3142 Q15477 SKIV2L Helicase SKI2W yes yes 0 0 0 1 30.388 30.388 2 0.032046 25505 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.157 36.939 38145000 0 0 0 0 0 0 0 0 38145000 0 0 0 0 35599 3142 33162 321042 408915 408915 1 PSQMEHAMETMMFTFHK Unmodified 2081.8831 0.88314439 2700 P60903 S100A10 Protein S100-A10 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 2 114.93 114.93 3;4 4.1755E-05 118432 QUIQUE_C1403_190116_001 72.819 70.939 901610000 21566000 79370000 67269000 72363000 30686000 51524000 122710000 77997000 94506000 0 63775000 50412000 169440000 35600 2700 33163 321043;321044;321045;321046;321047;321048;321049;321050;321051;321052;321053;321054;321055;321056;321057;321058;321059;321060;321061 408916;408917;408918;408919;408920;408921;408922;408923;408924;408925;408926;408927;408928;408929;408930;408931;408932;408933;408934;408935;408936;408937;408938;408939;408940;408941;408942;408943 408923 27 PSQMEHAMETMMFTFHK Oxidation (M) 2097.8781 0.87805901 2700 P60903 S100A10 Protein S100-A10 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 85.556 85.556 3;4 0.0006508 87044 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.764 57.27 218800000 0 45812000 0 0 0 0 32942000 0 60783000 0 31528000 0 47733000 35601 2700 33163 321062;321063;321064;321065;321066 408944;408945;408946;408947;408948;408949 408948 2135 6 PSQVLEGEAVGIK Unmodified 1325.7191 0.7190807 1266;3022 J3KNV4;Q13683 ITGA7 Integrin alpha-7;Integrin alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.617 59.617 2 0.00032652 58703 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.05 108.83 778100000 63324000 55171000 104140000 71699000 52025000 56174000 62968000 24933000 61555000 46821000 80712000 39827000 58753000 35602 1266;3022 33164 321067;321068;321069;321070;321071;321072;321073;321074;321075;321076;321077;321078;321079 408950;408951;408952;408953;408954;408955;408956;408957;408958;408959;408960;408961;408962;408963 408961 14 PSQVLQPLWAASHTPDFFGSALR Unmodified 2524.2863 0.28629262 1951 P08648 ITGA5 Integrin alpha-5;Integrin alpha-5 heavy chain;Integrin alpha-5 light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 144.71 144.71 3 0.00015664 148791 QUIQUE_C1403_190116_001 47.281 43.21 75284000 13886000 18243000 0 18827000 24328000 0 0 0 0 0 0 0 0 35603 1951 33165 321080;321081;321082;321083 408964;408965;408966;408967 408966 4 PSQVVAETR Unmodified 985.51926 0.51925868 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 14.527 14.527 2 0.0036085 6546 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.906 42.344 12033000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12033000 0 0 0 35604 2058 33166 321084 408968 408968 1 PSRPPPPTPR Unmodified 1100.6091 0.60907674 3884 Q96J02 ITCH E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog yes yes 0 0 1 1 10.326 10.326 3 0.024041 2849 QUIQUE_C1403_190116_001 43.897 2.1924 5636000 0 0 0 5636000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35605 3884 33167 321085 408969 408969 1 PSSAYPSTTIVNPTIVLLQHNR Unmodified 2407.286 0.28595827 4058 Q9BX66;S4R303 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 112.05 112.05 3 2.3233E-11 114981 QUIQUE_C1403_190116_001 105.52 97.806 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29384000 0 0 0 81227000 0 35609 2009 33171 321092;321093;321094;321095;321096;321097;321098;321099;321100;321101 408976;408977;408978;408979;408980;408981;408982;408983;408984;408985;408986;408987;408988;408989;408990 408982 15 PSSINYMVAPVTGNDVGIR Unmodified 1988.999 0.99896073 1417;1105 G5EA09;O00560 SDCBP Syntenin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 107.34 107.34 2 2.9868E-16 110025 QUIQUE_C1403_190116_001 157.86 143.45 129940000 0 0 0 73801000 0 0 0 56139000 0 0 0 0 0 35610 1105;1417 33172 321102;321103;321104;321105;321106 408991;408992;408993;408994;408995;408996 408992 6 PSSINYMVAPVTGNDVGIR Oxidation (M) 2004.9939 0.99387535 1417;1105 G5EA09;O00560 SDCBP Syntenin-1 no no 0 1 0 1 90.752 90.752 2 0.062075 87454 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.242 33.563 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35611 1105;1417 33172 321107 408997 408997 1 PSSMYSTGGK Unmodified 1013.4488 0.44879585 1631 O75382;A0A1W2PPI7 TRIM3 Tripartite motif-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 98.075 98.075 1 0.062053 102423 QUIQUE_C1438_190116_001 78.77 31.027 20592000 0 0 0 0 20592000 0 0 0 0 0 0 0 0 35612 1631 33173 321108 408998 408998 0 PSSPGGLPEEDSVLFNK Unmodified 1771.8628 0.8628444 231 A0A0C4DG54;Q5R372;A0A0U1RQY6 RABGAP1L Rab GTPase-activating protein 1-like yes no 0 0 0 1 96.455 96.455 2 0.041965 98963 QUIQUE_C1277_190116_001 37.744 24.607 28281000 0 28281000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35613 231 33174 321109 408999 408999 1 PSSPSPSVVSEK Unmodified 1199.6034 0.60338224 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 23.029 23.029 2 0.00046333 16927 QUIQUE_C1218_190116_001 123.96 76.382 141100000 64042000 0 0 40411000 0 36644000 0 0 0 0 0 0 0 35614 981;4494 33175 321110;321111;321112 409000;409001;409002 409000 3 PSSSGGYWVGMSTIR Unmodified 1583.7402 0.74022685 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 0 1 1 92.072 92.072 2 0.0067328 95092 QUIQUE_C1218_190116_001 56.205 28.463 45005000 28635000 0 0 0 0 0 16370000 0 0 0 0 0 0 35615 4234 33176 321113;321114 409003;409004 409003 1 PSSSPVIFAGGQDR Unmodified 1416.6997 0.69974224 3131 Q15366;H3BSS4 PCBP2 Poly(rC)-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 54.928 54.928 2 1.2609E-28 51615 QUIQUE_DMIX4_190116_001 201.6 176.22 3147300000 253480000 307130000 276350000 314630000 281580000 301470000 262570000 193020000 220300000 102850000 180620000 205720000 247600000 35616 3131 33177 321115;321116;321117;321118;321119;321120;321121;321122;321123;321124;321125;321126;321127;321128 409005;409006;409007;409008;409009;409010;409011;409012;409013;409014;409015;409016;409017;409018;409019;409020;409021;409022;409023 409017 19 PSSSVMNMHEIYTVLNPGEVLPTAFEASEK Unmodified 3276.5683 0.56826565 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 152.27 152.27 3 3.5062E-26 157516 QUIQUE_C1368_190116_001 98.839 92.808 436560000 94002000 86571000 0 55036000 74974000 0 85923000 0 0 40052000 0 0 0 35617 4100 33178 321129;321130;321131;321132;321133;321134;321135 409024;409025;409026;409027;409028;409029;409030;409031 409026 6 PSTEHSWFPGYAWTVAQCK Unmodified 2251.0157 0.015673424 375 A0A1W2PPJ5;Q96SW2 CRBN Protein cereblon yes no 0 0 0 1 1 1 112.15 112.15 3 0.00013628 116153 QUIQUE_C1368_190116_001 67.645 59.894 108170000 0 0 30386000 0 42924000 0 34865000 0 0 0 0 0 0 35618 375 33179 321136;321137;321138 409032;409033;409034 409032 3 PSVDYVCQLK Unmodified 1207.5907 0.59070906 1555 O43813 LANCL1 LanC-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 60.216 60.216 2 0.00069041 59095 QUIQUE_C1277_190116_001 107.69 78.997 205570000 0 205570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35619 1555 33180 321139 409035 409035 1 PSVHALDLEWR Unmodified 1321.6779 0.67788459 4490 Q9ULL4;H7C0P4 PLXNB3 Plexin-B3 yes no 0 0 0 1 1 1 14.93 14.93 3 0.021427 6877 QUIQUE_C1277_190116_001 31.989 18.22 429610000 0 135490000 0 0 0 125600000 0 0 0 0 168530000 0 0 35620 4490 33181 321140;321141;321142 409036;409037;409038 409036 3 PSVVFLK Unmodified 788.47963 0.47962569 2547 P49789;E9PBZ0 FHIT Bis(5'-adenosyl)-triphosphatase yes no 0 0 0 1 56.105 56.105 2 0.030434 54922 QUIQUE_C1368_190116_001 90.706 54.048 32269000 0 0 32269000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35621 2547 33182 321143 409039 409039 1 PSVYIPEFIAANQSAR Unmodified 1761.905 0.90498399 4245 Q9NPH2 ISYNA1 Inositol-3-phosphate synthase 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 3 1 2 1 1 2 2 1 116.3 116.3 2;3 6.3921E-10 121568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.77 99.861 1485000000 84472000 94466000 114830000 122040000 159620000 168130000 111040000 27569000 92176000 46702000 139680000 166360000 157870000 35622 4245 33183 321144;321145;321146;321147;321148;321149;321150;321151;321152;321153;321154;321155;321156;321157;321158;321159;321160;321161;321162;321163;321164 409040;409041;409042;409043;409044;409045;409046;409047;409048;409049;409050;409051;409052;409053;409054;409055;409056;409057;409058;409059;409060;409061;409062 409059 17 PSWITTMYGGK Unmodified 1239.5958 0.59579444 2455 P42785 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 94.393 94.393 2 0.0021889 95687 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.565 78.078 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35623 2455 33184 321165;321166;321167 409063;409064;409065 409065 3 PSYQEEAVTK Unmodified 1150.5506 0.55061839 467 A0A2R8YGD1;O14773;A0A2R8Y7U1;A0A2R8YD45 TPP1 Tripeptidyl-peptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.421 22.421 2 3.2868E-30 15882 QUIQUE_C1438_190116_001 198.25 198.25 8104700000 759840000 753150000 755460000 558980000 669740000 688120000 655390000 310400000 484750000 380650000 794200000 486520000 807500000 35624 467 33185 321168;321169;321170;321171;321172;321173;321174;321175;321176;321177;321178;321179;321180 409066;409067;409068;409069;409070;409071;409072;409073;409074;409075;409076;409077;409078;409079;409080 409071 15 PSYVLSGAAMNVAYTDGDLER Unmodified 2228.0419 0.041947754 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 122.32 122.32 3 0.037719 128340 QUIQUE_C1438_190116_001 16.93 11.721 25206000 0 0 0 0 25206000 0 0 0 0 0 0 0 0 35625 1029 33186 321181 409081 409081 1 PTAAELEEVLQVNSLIQTQK Unmodified 2210.1794 0.17942751 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 147.06 147.06 3 1.6383E-06 152653 QUIQUE_C1218_190116_001 85.496 76.852 150920000 41737000 0 0 28471000 42453000 0 38258000 0 0 0 0 0 0 35626 4014 33187 321182;321183;321184;321185 409082;409083;409084;409085 409082 4 PTAIIGVAAIAGAFTEQILR Unmodified 2011.1466 0.14661124 3198 Q16798;E9PMB9 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 0 1 170.87 170.87 3 0.0041249 172225 QUIQUE_C1563_190116_001 51.819 42.565 16717000 0 0 0 0 0 16717000 0 0 0 0 0 0 0 35627 3198 33188 321186 409086 409086 0 PTASVIPSGVEWIK Unmodified 1482.8082 0.80823006 4660 Q9Y6N5;H3BNX3;H3BMS6;A0A1B0GXB4;H3BV36 SQRDL Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 111.22 111.22 2 0.00022755 116134 QUIQUE_C1218_190116_001 92.409 44.126 272830000 22107000 37651000 45446000 53461000 47950000 37876000 28344000 0 0 0 0 0 0 35628 4660 33189 321187;321188;321189;321190;321191;321192;321193;321194 409087;409088;409089;409090;409091;409092;409093;409094;409095;409096 409087 9 PTFIGTEPSLGVK Unmodified 1344.7289 0.7289171 2644 P54687;A0A087WYF2 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.694 84.694 2 0.00038085 84965 QUIQUE_C1563_190116_001 94.616 64.362 761240000 142590000 151000000 98718000 113860000 0 140560000 0 0 0 0 114520000 0 0 35629 2644 33190 321195;321196;321197;321198;321199;321200 409097;409098;409099;409100;409101;409102;409103;409104 409102 8 PTFNVQVK Unmodified 931.51272 0.51271674 3781 Q93052;A0A087WZF1;C9JUT4;C9JXK9 LPP Lipoma-preferred partner yes no 0 0 0 1 1 1 1 42.179 42.179 2 0.0036582 38336 QUIQUE_C1403_190116_001 118.89 85.456 164530000 33425000 0 0 51821000 0 59425000 19858000 0 0 0 0 0 0 35630 3781 33191 321201;321202;321203;321204 409105;409106;409107;409108 409106 3 PTFPGVIR Unmodified 885.50724 0.50723743 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 61.735 61.735 2 0.043369 60660 QUIQUE_C1403_190116_001 79.146 56.216 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35631 4334 33192 321205 409109 409109 1 PTFSQLYTFLAASFK Unmodified 1719.8872 0.88720866 3620 Q8N9R8;Q3SXZ0 SCAI;C9orf126 Protein SCAI yes no 0 0 0 1 1 169.91 169.91 2 5.531E-07 174707 QUIQUE_C1368_190116_001 142.91 127.02 95220000 0 0 29685000 0 0 0 65534000 0 0 0 0 0 0 35632 3620 33193 321206;321207 409110;409111 409110 2 PTGGVGAVALLIGPNAPLIFER Unmodified 2161.2259 0.2259242 2858 Q01581 HMGCS1 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 161.41 161.41 2;3 1.6082E-17 165196 QUIQUE_C1403_190116_001 121.79 109.81 785680000 43447000 33477000 32664000 86943000 64857000 68092000 64506000 75503000 62444000 35948000 41975000 138120000 37701000 35633 2858 33194 321208;321209;321210;321211;321212;321213;321214;321215;321216;321217;321218;321219;321220;321221;321222;321223;321224;321225;321226;321227;321228 409112;409113;409114;409115;409116;409117;409118;409119;409120;409121;409122;409123;409124;409125;409126;409127;409128;409129;409130;409131;409132;409133;409134;409135 409117 23 PTGVAVHPSGDIIIADYDNK Unmodified 2081.0429 0.042934032 4091 Q9C040 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 80.583 80.583 2;3 2.1951E-56 81735 QUIQUE_C1368_190116_001 183 162.41 1809600000 265760000 197200000 264620000 180590000 0 0 234770000 0 86935000 140700000 152810000 107260000 178930000 35634 4091 33195 321229;321230;321231;321232;321233;321234;321235;321236;321237;321238;321239;321240 409136;409137;409138;409139;409140;409141;409142;409143;409144;409145;409146;409147 409138 8 PTICHYFMR Unmodified 1223.558 0.55796915 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 56.086 56.086 3 0.010617 55030 QUIQUE_C1218_190116_001 47.198 37.71 61573000 36238000 0 0 0 0 25335000 0 0 0 0 0 0 0 35635 3549 33196 321241;321242 409148;409149 409148 2 PTIDSIIEHLR Unmodified 1292.7089 0.70885036 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 108.65 108.65 3 0.00013104 113248 QUIQUE_C1438_190116_001 92.611 73.368 158320000 42449000 0 35992000 0 24936000 0 41531000 0 0 13411000 0 0 0 35636 335;1521 33197 321243;321244;321245;321246;321247;321248 409150;409151;409152;409153;409154;409155;409156 409152 7 PTLDTLHEQASALPQEHAESPDVR Unmodified 2640.278 0.27797236 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 69.957 69.957 4 1.7799E-24 70962 QUIQUE_C1218_190116_001 127.35 116.92 524220000 140110000 84457000 97235000 71756000 0 130670000 0 0 0 0 0 0 0 35637 2851 33198 321249;321250;321251;321252;321253;321254 409157;409158;409159;409160;409161;409162 409157 4 PTLNELGISTPEELGLDKV Unmodified 2024.0678 0.067751799 2170 P20674;H3BRM5;H3BV69 COX5A Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial yes no 0 0 1 1 142.53 142.53 2 5.7954E-11 147440 QUIQUE_C1218_190116_001 159.12 143.75 42214000 42214000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35638 2170 33199 321255 409163 409163 1 PTMADELYNQDYPIHSVEDR Unmodified 2392.0641 0.064139759 2563 P50440;H0YMX4 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.31 102.31 3 1.0841E-87 104903 QUIQUE_C1277_190116_001 196.31 187.32 985180000 105310000 94369000 114210000 151480000 95817000 113080000 96575000 35569000 53298000 36223000 0 0 89247000 35639 2563 33200 321256;321257;321258;321259;321260;321261;321262;321263;321264;321265;321266 409164;409165;409166;409167;409168;409169;409170;409171;409172;409173;409174;409175;409176;409177;409178 409167 15 PTMADELYNQDYPIHSVEDR Oxidation (M) 2408.0591 0.059054382 2563 P50440;H0YMX4 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 2 83.773 83.773 3 2.5318E-07 80679 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.391 93.668 49443000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49443000 0 0 0 35640 2563 33200 321267;321268 409179;409180 409180 2012 2 PTNSIVFTK Unmodified 1005.5495 0.54949617 199;790 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 0 0 1 1 38.68 38.68 2 0.02239 34947 QUIQUE_C1218_190116_001 61.48 37.957 57609000 35065000 22544000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 35641 199;790 33201 321269;321270 409181;409182 409181 2 PTNWIEGTQAVLR Unmodified 1483.7783 0.77832691 3121 Q15223 PVRL1 Nectin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 100.7 100.7 2 0.00094882 103365 QUIQUE_C1403_190116_001 83.045 58.663 174990000 0 0 61184000 57174000 0 56635000 0 0 0 0 0 0 0 35642 3121 33202 321271;321272;321273;321274 409183;409184;409185;409186 409184 2 PTPAPTATPTAPSPLQATAGPSYPR Unmodified 2446.2492 0.24923841 1399 O00330 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 85.533 85.533 3 1.9692E-19 87060 QUIQUE_C1368_190116_001 103.67 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409419;409420;409421;409422;409423;409424;409425;409426;409427;409428;409429;409430;409431;409432;409433;409434;409435;409436;409437;409438;409439;409440;409441;409442;409443;409444;409445;409446;409447 409434 28 PVCSFDPEGLIFAAGVNSEMVK Unmodified 2366.1287 0.12865427 3413 Q6UXN9;C9JBU3 WDR82 WD repeat-containing protein 82 yes no 0 0 0 1 156.59 156.59 3 0.00073143 161463 QUIQUE_C1218_190116_001 34.217 26.32 17430000 17430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35666 3413 33226 321472 409448 409448 1 PVDFTGYWK Unmodified 1111.5338 0.53384611 1961 P09455;A0A0A0MTB9;H0YAK8 RBP1 Retinol-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.645 99.645 2 0.00023201 101746 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.54 96.892 3374100000 184380000 188380000 253670000 163980000 133160000 167990000 174360000 248880000 381350000 106600000 468280000 429510000 473590000 35667 1961 33227 321473;321474;321475;321476;321477;321478;321479;321480;321481;321482;321483;321484;321485 409449;409450;409451;409452;409453;409454;409455;409456;409457;409458;409459;409460;409461;409462;409463;409464 409458 16 PVDIVFLLDGSER Unmodified 1458.7718 0.77184455 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 144.44 144.44 2 0.0018389 151230 QUIQUE_C1438_190116_001 90.685 71.37 124240000 34817000 0 8132200 0 27642000 53652000 0 0 0 0 0 0 0 35668 2036 33228 321486;321487;321488;321489 409465;409466;409467;409468;409469 409468 4 PVDMLLR Unmodified 842.46841 0.46840908 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 128.04 128.04 2 0.068351 134520 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.331 11.809 26050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26050000 0 0 35669 2456 33229 321490 409470 409470 1 PVEAAVVAAAVPSSGSGVGGGGTAGPGTGGLPR Unmodified 2759.4202 0.42021992 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 102.06 102.06 3 3.9332E-75 106341 QUIQUE_C1218_190116_001 146.78 129.28 784430000 88802000 67850000 80703000 100620000 0 98450000 86022000 0 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A0A087X0V7;A0A087WYH9;A0A075B7G8;J3KPL8;O00213;V9GYR7 APBB1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 157.64 157.64 3 2.9201E-09 161656 QUIQUE_C1277_190116_001 105.79 86.392 149970000 22231000 16263000 25657000 24294000 0 25331000 21539000 0 0 14652000 0 0 0 35677 20 33237 321546;321547;321548;321549;321550;321551;321552 409535;409536;409537;409538;409539;409540;409541 409536 7 PVIAAVHGGCIGGGVDLVTACDIR Unmodified 2406.2148 0.21478394 2959 Q13011;M0R248 ECH1 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 103.9 103.9 3 0.00081802 105613 QUIQUE_C1563_190116_001 40.723 27.402 37945000 0 0 0 0 0 37945000 0 0 0 0 0 0 0 35678 2959 33238 321553 409542 409542 1 PVIACSVTIK Unmodified 1086.6107 0.61071622 2670 P55769 NHP2L1 NHP2-like protein 1;NHP2-like protein 1, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.56 114.56 2 0.0029689 118269 QUIQUE_C1368_190116_001 86.953 19.921 782690000 89029000 0 94323000 64291000 109220000 63939000 75762000 78464000 88012000 0 0 0 119650000 35679 2670 33239 321554;321555;321556;321557;321558;321559;321560;321561;321562 409543;409544;409545;409546;409547;409548;409549;409550;409551;409552;409553 409544 11 PVICATQMLESMIK Unmodified 1619.8085 0.80850611 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.66 141.66 2 1.042E-36 147967 QUIQUE_C1218_190116_001 180.97 158.05 4181900000 561170000 558800000 481960000 726970000 342110000 510670000 355190000 146160000 0 126940000 128700000 0 243200000 35680 1203;2077 33240 321563;321564;321565;321566;321567;321568;321569;321570;321571;321572;321573;321574;321575 409554;409555;409556;409557;409558;409559;409560;409561;409562;409563;409564;409565;409566;409567;409568;409569;409570;409571;409572;409573;409574;409575;409576;409577;409578 409556 25 PVICATQMLESMIK Oxidation (M) 1635.8034 0.80342073 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 1 0 3 1 1 104.1 104.1 2 0.00176 109132 QUIQUE_C1277_190116_001 89.403 63.465 54110000 0 0 33171000 0 0 0 0 0 0 20939000 0 0 0 35681 1203;2077 33240 321576;321577;321578;321579;321580 409579;409580;409581;409582;409583 409581 689;690 5 PVIDNPNYK Unmodified 1058.5397 0.53965977 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 0 1 29.972 29.972 2 0.039144 24423 QUIQUE_C1403_190116_001 53.753 29.797 267770000 0 0 0 267770000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35682 2269 33241 321581 409584 409584 1 PVIFEDVGR Unmodified 1030.5447 0.54474515 2940 Q10713;Q5SXN9 PMPCA Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 71.153 71.153 2 0.0023457 71262 QUIQUE_C1277_190116_001 94.302 60.214 240300000 74493000 38661000 52818000 32688000 0 41644000 0 0 0 0 0 0 0 35683 2940 33242 321582;321583;321584;321585;321586 409585;409586;409587;409588;409589;409590 409586 6 PVIGSQYPLEK Unmodified 1229.6656 0.66558856 2917 Q08257 CRYZ Quinone oxidoreductase yes yes 0 0 0 1 1 1 60.617 60.617 2 0.00021101 60111 QUIQUE_C1218_190116_001 123.42 94.502 70776000 42897000 27878000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35684 2917 33243 321587;321588;321589 409591;409592;409593 409591 3 PVIHPLSSPSNR Unmodified 1302.7044 0.70443369 541 A6NHX0 GATSL2 GATS-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 24.315 24.315 3 0.0091123 18293 QUIQUE_C1218_190116_001 48.659 32.522 221180000 52641000 43073000 83442000 0 0 0 42020000 0 0 0 0 0 0 35685 541 33244 321590;321591;321592;321593 409594;409595;409596;409597;409598 409594 5 PVIILGPMK Oxidation (M) 982.58852 0.58852422 2954;655;3279 Q12959;A0A0C4DFT3;B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;B5MCC5;H7C325;F8W750;Q5JUW8;Q92796 DLG1;DLG2;DLG3 Disks large homolog 1;Disks large homolog 2;Disks large homolog 3 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 57.175 57.175 2 0.012503 55027 QUIQUE_C1368_190116_001 73.975 42.02 142240000 32488000 0 27547000 0 0 26902000 0 25401000 0 0 0 29898000 0 35686 2954;655;3279 33245 321594;321595;321596;321597;321598 409599;409600;409601;409602;409603 409600 417 5 PVIILGPMK Unmodified 966.59361 0.5936096 2954;655;3279 Q12959;A0A0C4DFT3;B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;B5MCC5;H7C325;F8W750;Q5JUW8;Q92796 DLG1;DLG2;DLG3 Disks large homolog 1;Disks large homolog 2;Disks large homolog 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.836 79.836 2 0.012163 81512 QUIQUE_C1277_190116_001 71.715 71.715 630040000 82562000 86541000 59982000 57826000 49117000 55668000 63017000 19565000 25959000 15128000 39767000 33001000 41911000 35687 2954;655;3279 33245 321599;321600;321601;321602;321603;321604;321605;321606;321607;321608;321609;321610;321611 409604;409605;409606;409607;409608;409609;409610;409611;409612;409613;409614;409615;409616;409617 409606 12 PVILDPVDPTNNVSGDK Unmodified 1778.905 0.90504357 97 A0A087X0V5;P29728;F8W1C5 OAS2 2'-5'-oligoadenylate synthase 2 yes no 0 0 0 1 88.524 88.524 2 0.00014235 91898 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.59 89.903 80103000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80103000 0 0 35688 97 33246 321612 409618 409618 1 PVIMPPEVAIGALGSIK Unmodified 1690.9692 0.96916415 2014 P11182 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 142.26 142.26 2;3 0.00015373 144958 QUIQUE_C1563_190116_001 75.911 64.535 361920000 35379000 23265000 71697000 29148000 27347000 34940000 40884000 0 21280000 0 33108000 21461000 23415000 35689 2014 33247 321613;321614;321615;321616;321617;321618;321619;321620;321621;321622;321623;321624 409619;409620;409621;409622;409623;409624;409625;409626;409627;409628;409629;409630;409631;409632 409626 11 PVIPPVSTPGQPNAVGTFTEIPASNIR Unmodified 2758.4654 0.4653792 1399 O00330 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 127.94 127.94 3 2.4311E-06 130525 QUIQUE_C1563_190116_001 55.526 48.494 78046000 0 27900000 0 0 0 29811000 0 0 0 20334000 0 0 0 35690 1399 33248 321625;321626;321627 409633;409634;409635 409634 1 PVISASPTIR Unmodified 1039.6026 0.60259438 3606 Q8N6C5 IGSF1 Immunoglobulin superfamily member 1 yes yes 0 0 0 1 1 43.612 43.612 2 0.006881 40918 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.985 42.696 130710000 0 0 0 0 58272000 0 0 0 72441000 0 0 0 0 35691 3606 33249 321628;321629 409636;409637 409637 2 PVIVEPLEQLDDEDGLPEK Unmodified 2134.0681 0.06814573 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 128.12 128.12 2;3 2.9018E-48 132995 QUIQUE_C1368_190116_001 193.16 173.58 5263900000 519220000 611680000 635390000 466970000 457130000 483960000 433170000 332360000 224130000 96698000 542570000 252290000 208290000 35692 2208 33250 321630;321631;321632;321633;321634;321635;321636;321637;321638;321639;321640;321641;321642;321643;321644;321645;321646;321647;321648;321649;321650;321651;321652 409638;409639;409640;409641;409642;409643;409644;409645;409646;409647;409648;409649;409650;409651;409652;409653;409654;409655;409656;409657;409658;409659;409660;409661;409662;409663;409664;409665;409666;409667;409668;409669;409670 409646 33 PVIVEPMEQFDDEDGLPEK Unmodified 2186.0089 0.0089162914 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 0 3 2 2 2 4 2 1 120.94 120.94 2;3 3.1778E-13 125895 QUIQUE_C1218_190116_001 115.06 98.715 590950000 145440000 116560000 88122000 107110000 45567000 88149000 0 0 0 0 0 0 0 35693 3719 33251 321653;321654;321655;321656;321657;321658;321659;321660;321661;321662;321663;321664;321665;321666;321667;321668 409671;409672;409673;409674;409675;409676;409677;409678;409679;409680;409681;409682;409683;409684;409685;409686 409673 14 PVIYIDQTR Unmodified 1103.5975 0.597509 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 53.561 53.561 2 0.00048535 51289 QUIQUE_C1403_190116_001 127.02 97.86 7105000000 726890000 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4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 47.812 47.812 2 0.010177 44801 QUIQUE_C1368_190116_001 74.486 30.091 112360000 0 35438000 40501000 36417000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35725 2522 33283 321874;321875;321876 409935;409936;409937 409936 3 PVTLLASLFK Unmodified 1087.6641 0.664132 3923 Q96Q11 TRNT1 CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.72 134.72 2 0.0034764 140486 QUIQUE_C1218_190116_001 84.213 72.444 421290000 48334000 47922000 45740000 53081000 50719000 45871000 0 39146000 32615000 22131000 35727000 0 0 35726 3923 33284 321877;321878;321879;321880;321881;321882;321883;321884;321885;321886 409938;409939;409940;409941;409942;409943;409944;409945;409946;409947 409938 10 PVTQTDVYR Unmodified 1077.5455 0.54547343 1610 O75116;E9PF63;Q14DU5 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 24.782 24.782 2 0.0077604 18635 QUIQUE_C1218_190116_001 80.684 34.732 158680000 45506000 36111000 27689000 0 0 49374000 0 0 0 0 0 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0.00014999 146513 QUIQUE_DMIX4_190116_001 44.301 37.868 7069400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7069400 0 0 0 35730 2004 33287 321900 409961 409961 1276 1 PVTVEPMDQLDDEEGLPEK Oxidation (M) 2155.9831 0.98309547 3122 Q15233;H7C367 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 1 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 82.481 82.481 2 5.044E-28 85019 QUIQUE_C1218_190116_001 141.54 133.22 335720000 45570000 58686000 54669000 24490000 0 28534000 0 0 23931000 29405000 46634000 23796000 0 35731 3122 33288 321901;321902;321903;321904;321905;321906;321907;321908;321909;321910;321911;321912;321913 409962;409963;409964;409965;409966;409967;409968;409969;409970;409971;409972;409973;409974 409963 2584 13 PVTVEPMDQLDDEEGLPEK Unmodified 2139.9882 0.98818085 3122 Q15233;H7C367 NONO Non-POU domain-containing octamer-binding protein yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 102.19 102.19 2;3 2.904E-45 106509 QUIQUE_DMIX5_190116_001 176.75 162.72 1581100000 266470000 153700000 143090000 185360000 86934000 190140000 93077000 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40203000 0 0 35734 2518 33290 321934;321935;321936;321937;321938;321939;321940;321941;321942;321943 409999;410000;410001;410002;410003;410004;410005;410006;410007;410008;410009;410010 410002 1943;1944 12 PVVEMDGDEMTR Unmodified 1377.5905 0.59045107 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.19 59.19 2 0.00014489 55290 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.09 106.51 1835200000 220860000 238660000 234080000 203370000 105280000 191830000 143300000 96884000 110430000 69917000 0 125050000 95524000 35735 2518 33290 321944;321945;321946;321947;321948;321949;321950;321951;321952;321953;321954;321955;321956 410011;410012;410013;410014;410015;410016;410017;410018;410019;410020;410021;410022;410023;410024 410021 10 PVVEMDGDEMTR 2 Oxidation (M) 1409.5803 0.58028031 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 2 0 1 1 1 20.47 20.47 2 0.0024161 12961 QUIQUE_C1368_190116_001 85.958 75.093 47052000 0 0 0 0 0 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A0A1B0GWF9;A0A1B0GUK4;A0A1B0GVB2;A0A1B0GTS4;A0A1B0GU53;E7EN11;A0A1B0GTF6;A0A1B0GTA9;A0A1B0GTN8;H0Y476;A0A1C7CYX2;A0A1B0GTX2;O00305;A0A1B0GXG0;A0A1B0GTP5;A0A1B0GUI8;A0A1B0GUU8;E7DBM8;A0A1B0GUW8;A0A1B0GVT6;A0A1B0GTH0;A0A1B0GW63;A0A1B0GV16;A0A1B0GU05;A0A1B0GUM9;A0A1B0GTP6;F8VU10;A0A1B0GU42;A0A2R8Y7A6;P54284;F8VUW8 CACNB4;CACNB3 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4;Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 68.804 68.804 2 0.013076 68615 QUIQUE_C1277_190116_001 65.305 53.937 168550000 35980000 36438000 35619000 0 22913000 0 26036000 0 0 0 0 11561000 0 35738 332;2639 33292 321973;321974;321975;321976;321977;321978 410041;410042;410043;410044;410045;410046 410042 6 PVVSFIAGLTAPPGR Unmodified 1480.8402 0.84019889 2625 P53597 SUCLG1 Succinyl-CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.87 122.87 2;3 1.2383E-52 128635 QUIQUE_C1218_190116_001 193.73 169.39 835120000 219980000 73070000 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410068;410069;410070;410071;410072;410073;410074;410075;410076;410077;410078;410079;410080;410081;410082;410083;410084;410085;410086;410087;410088;410089;410090;410091;410092;410093;410094;410095;410096;410097;410098;410099;410100;410101;410102;410103;410104;410105 410074 38 PVWDFLSK Unmodified 990.51747 0.51746776 3619 Q8N9I9;A0A0C4DGI8;F8VUZ4;F8VV96 DTX3 Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3 yes no 0 0 0 1 119.15 119.15 2 0.035455 123383 QUIQUE_C1218_190116_001 63.419 38.525 70028000 70028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35741 3619 33295 322018 410106 410106 1 PVWLGFLGPIIK Unmodified 1338.8064 0.80637956 1784 P00450;E9PFZ2;D6RE86 CP Ceruloplasmin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 158.26 158.26 2 0.00053312 164596 QUIQUE_C1438_190116_001 124.98 114.15 56653000 0 8532000 0 9255300 25481000 9586400 0 0 0 3799100 0 0 0 + 35742 1784 33296 322019;322020;322021;322022;322023 410107;410108;410109;410110;410111;410112 410110 6 PVYPGQTLQTEMWK Unmodified 1676.8232 0.82322819 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 101.22 101.22 2 8.0454E-07 104259 QUIQUE_C1368_190116_001 123.8 91.792 345810000 101120000 67328000 109630000 0 0 67735000 0 0 0 0 0 0 0 35743 455 33297 322024;322025;322026;322027;322028 410113;410114;410115;410116;410117;410118 410116 6 PWALTFSYGR Unmodified 1196.5978 0.59784335 1851;1978 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BR68;P09972;A8MVZ9 ALDOA;ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase;Fructose-bisphosphate aldolase C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 114.79 114.79 2 2.813E-14 117804 QUIQUE_C1368_190116_001 174.16 156.77 7779000000 412950000 484050000 444190000 272990000 415320000 407230000 667730000 621260000 969630000 254200000 1039000000 1071900000 718580000 35744 1851;1978 33298 322029;322030;322031;322032;322033;322034;322035;322036;322037;322038;322039;322040;322041;322042 410119;410120;410121;410122;410123;410124;410125;410126;410127;410128;410129;410130;410131;410132;410133;410134;410135;410136;410137;410138;410139;410140;410141;410142;410143;410144;410145;410146;410147;410148;410149;410150;410151;410152;410153;410154;410155;410156;410157;410158;410159;410160;410161;410162;410163;410164;410165;410166 410126 48 PWIGLAEALGTLMR Unmodified 1526.8279 0.82791964 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFL2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 167.27 167.27 2;3 7.3463E-07 172196 QUIQUE_C1368_190116_001 156.58 117.28 1103200000 75620000 102790000 172740000 77372000 113810000 89078000 109760000 32645000 68749000 37973000 56716000 0 165940000 35745 404 33299 322043;322044;322045;322046;322047;322048;322049;322050;322051;322052;322053;322054;322055;322056 410167;410168;410169;410170;410171;410172;410173;410174;410175;410176;410177;410178;410179;410180;410181;410182 410169 16 PWIGLAEALGTLMR Oxidation (M) 1542.8228 0.82283426 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFL2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 150.48 150.48 2;3 0.0023019 154520 QUIQUE_C1403_190116_001 73.499 57.362 84784000 23032000 18839000 28737000 14176000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35746 404 33299 322057;322058;322059;322060;322061;322062 410183;410184;410185;410186;410187;410188 410187 288 3 PWKPGDKEPCAHPNSR Unmodified 1874.8846 0.88459967 3200 Q16822;H0YML5;H0YM31;H0YMY3 PCK2 Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial yes no 0 0 2 1 14.432 14.432 4 0.020473 6584 QUIQUE_C1368_190116_001 28.627 17.366 18712000 0 0 18712000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35747 3200 33300 322063 410189 410189 1 PWLGLDHFNK Unmodified 1225.6244 0.62439245 3778 Q93009 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.466 78.466 3 0.0016696 80908 QUIQUE_C1218_190116_001 85.764 76.965 488500000 72726000 66167000 56145000 56289000 48810000 44236000 55108000 0 0 0 49516000 39507000 0 35748 3778 33301 322064;322065;322066;322067;322068;322069;322070;322071;322072 410190;410191;410192;410193;410194;410195;410196;410197;410198 410190 0 PWSQHYHQGYY Unmodified 1464.6211 0.62109799 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQD4;A0A087WVI9 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 40.377 40.377 2 0.00077265 36672 QUIQUE_C1218_190116_001 95.775 84.945 20505000 20505000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35749 2849 33302 322073 410199 410199 1 PWTVMESLQK Unmodified 1217.6114 0.6114445 1515 O43237;B4E2E0;H3BUM4 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 89.455 89.455 2 0.032458 92872 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.083 70.435 230130000 0 158750000 0 0 0 0 0 0 0 0 71375000 0 0 35750 1515 33303 322074;322075 410200;410201 410201 0 PWVFSQLIK Unmodified 1116.6332 0.63316622 1471 O14994 SYN3 Synapsin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 125.2 125.2 2 0.011794 130152 QUIQUE_C1368_190116_001 72.23 48.075 130390000 0 0 40396000 0 25217000 0 0 0 0 0 26750000 22609000 15420000 35751 1471 33304 322076;322077;322078;322079;322080 410202;410203;410204;410205;410206 410202 5 PWVSDFSHPHYLAGR Unmodified 1767.8481 0.84813781 3897 Q96KP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes yes 0 0 0 3 3 2 3 3 2 2 1 1 2 1 1 75.382 75.382 2;3;4 1.1126E-37 77214 QUIQUE_C1218_190116_001 174.77 164.46 2766300000 344400000 386040000 392840000 390490000 274710000 295300000 275180000 50210000 115000000 185300000 0 0 56823000 35752 3897 33305 322081;322082;322083;322084;322085;322086;322087;322088;322089;322090;322091;322092;322093;322094;322095;322096;322097;322098;322099;322100;322101;322102;322103;322104 410207;410208;410209;410210;410211;410212;410213;410214;410215;410216;410217;410218;410219;410220;410221;410222;410223;410224;410225;410226;410227;410228;410229;410230;410231;410232;410233;410234;410235;410236;410237;410238 410209 31 PYAFTARPWETR Unmodified 1493.7415 0.74154747 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.971 72.971 3 0.00033981 73044 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.187 58.251 1112900000 81567000 84482000 112190000 85251000 72737000 86565000 145270000 26442000 92314000 42483000 127010000 72671000 83896000 35753 2280 33306 322105;322106;322107;322108;322109;322110;322111;322112;322113;322114;322115;322116;322117 410239;410240;410241;410242;410243;410244;410245;410246;410247;410248;410249;410250;410251;410252;410253;410254;410255 410250 17 PYANQPTVR Unmodified 1044.5352 0.53524309 2147 P19387;H3BRR2 POLR2C DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 yes no 0 0 0 1 19.568 19.568 2 0.023155 12455 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.77 49.621 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35754 2147 33307 322118 410256 410256 1 PYEGSILEADCDILIPAASEK Unmodified 2290.1039 0.10387931 1777 P00367 GLUD1 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 134.46 134.46 2 1.3232E-75 138680 QUIQUE_C1277_190116_001 177.84 152.2 78862000 0 37049000 0 0 0 41813000 0 0 0 0 0 0 0 35755 1777 33308 322119;322120 410257;410258 410257 2 PYFLEAYRPIR Unmodified 1423.7612 0.76122028 2658 P55072;C9IZA5;C9JUP7 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.151 86.151 3 0.001248 83969 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.865 67.607 217450000 31735000 36944000 33434000 37685000 26003000 0 35041000 0 0 16605000 0 0 0 35756 2658 33309 322121;322122;322123;322124;322125;322126;322127 410259;410260;410261;410262;410263;410264;410265;410266;410267 410267 9 PYLFQSDPSGAYFAWK Unmodified 1875.8832 0.88318591 5 A0A024RA52;P25787;C9JCK5 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 141.33 141.33 2 2.9373E-25 137559 QUIQUE_DMIX4_190116_001 158.04 141.79 382160000 0 0 0 144960000 125170000 0 0 0 0 51176000 0 60860000 0 35757 5 33310 322128;322129;322130;322131;322132 410268;410269;410270;410271;410272;410273 410271 6 PYLQDYFTNANR Unmodified 1500.6997 0.69974224 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 96.726 96.726 2 0.0073375 101197 QUIQUE_C1438_190116_001 76.143 49.028 85256000 0 0 0 0 85256000 0 0 0 0 0 0 0 0 35758 3405 33311 322133 410274 410274 1 PYQYPALTPEQK Unmodified 1433.7191 0.7190807 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.183 62.183 2 1.2114E-54 60710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 208.63 173.27 35027000000 2914300000 3372200000 2780800000 2631200000 2781300000 2083400000 3156200000 1903200000 2403100000 1098100000 3706300000 2767100000 3429500000 35759 1851 33312 322134;322135;322136;322137;322138;322139;322140;322141;322142;322143;322144;322145;322146 410275;410276;410277;410278;410279;410280;410281;410282;410283;410284;410285;410286;410287;410288;410289;410290;410291;410292;410293;410294;410295;410296;410297;410298;410299;410300;410301;410302;410303;410304;410305;410306;410307;410308;410309;410310;410311;410312;410313;410314;410315;410316;410317;410318;410319;410320;410321;410322;410323;410324;410325;410326;410327;410328;410329;410330;410331;410332;410333;410334;410335;410336;410337;410338;410339;410340;410341;410342;410343 410312 69 PYQYPALTPEQKK Unmodified 1561.814 0.81404372 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 41.722 41.722 2;3 1.1743E-88 39642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 229.82 197.5 2271200000 0 0 0 0 0 0 0 1063800000 354470000 0 245060000 291840000 316040000 35760 1851 33313 322147;322148;322149;322150;322151;322152;322153;322154;322155;322156 410344;410345;410346;410347;410348;410349;410350;410351;410352;410353;410354;410355;410356;410357;410358;410359;410360;410361 410350 18 PYSELNYETSHYPASPDSWV Unmodified 2341.0175 0.017507143 855 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8 CTNND2 Catenin delta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 122.96 122.96 2 3.9278E-75 127082 QUIQUE_DMIX3_190116_001 188.29 180.74 178670000 33897000 30562000 0 36546000 0 0 0 0 36773000 0 0 0 40894000 35761 855 33314 322157;322158;322159;322160;322161 410362;410363;410364;410365;410366 410365 5 PYSLLVYIPSR Unmodified 1306.7285 0.72852317 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes no 0 0 0 1 123.82 123.82 2 0.00045818 128371 QUIQUE_C1218_190116_001 119.68 102.24 9901800 9901800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35762 2887 33315 322162 410367 410367 1 PYTEFPFGQHSSGEAAQDAVR Unmodified 2293.04 0.039973919 3388 Q6PCB0;J3QLP3;J3QRR0 VWA1 von Willebrand factor A domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 78.858 78.858 3 0.0038337 76222 QUIQUE_DMIX4_190116_001 33.153 25.349 142580000 0 36005000 28836000 0 58371000 0 0 0 0 19370000 0 0 0 35763 3388 33316 322163;322164;322165;322166 410368;410369;410370;410371;410372 410372 5 PYTFHSHGITYYK Unmodified 1612.7674 0.76742787 1784 P00450;E9PFZ2;D6RE86 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 40.522 40.522 2;3;4 0.0019577 36576 QUIQUE_C1438_190116_001 76.282 57.61 454410000 56156000 36039000 70695000 0 140790000 41249000 0 0 40344000 69130000 0 0 0 35764 1784 33317 322167;322168;322169;322170;322171;322172;322173;322174;322175;322176 410373;410374;410375;410376;410377;410378;410379;410380;410381;410382;410383 410377 11 PYTPISSDDDK Unmodified 1236.551 0.55101232 1778 P00387;B1AHF3 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes no 0 0 0 1 31.795 31.795 2 0.0081878 26470 QUIQUE_C1218_190116_001 64.39 34.135 39728000 39728000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35765 1778 33318 322177 410384 410384 1 PYTPISSDDDKGFVDLVIK Unmodified 2108.0678 0.067751799 1778 P00387;B1AHF3 CYB5R3 NADH-cytochrome b5 reductase 3;NADH-cytochrome b5 reductase 3 membrane-bound form;NADH-cytochrome b5 reductase 3 soluble form yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.9 119.9 3 4.6231E-05 124539 QUIQUE_C1368_190116_001 89.049 74.091 898810000 0 117360000 207300000 141520000 77034000 0 0 0 79619000 108850000 85148000 0 81985000 35766 1778 33319 322178;322179;322180;322181;322182;322183;322184;322185 410385;410386;410387;410388;410389;410390;410391;410392;410393 410387 8 PYTPVTSDEDQGYVDLVIK Unmodified 2138.0419 0.041930979 4437 Q9UHQ9;H7C0R7 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 121.81 121.81 2 2.2367E-45 126067 QUIQUE_C1368_190116_001 161.63 112 80188000 42100000 0 38088000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35767 4437 33320 322186;322187;322188;322189 410394;410395;410396;410397;410398 410396 5 PYVEEGLHPQIIIR Unmodified 1662.9093 0.90934108 3977 Q99832;F8WAM2 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes no 0 0 0 1 1 82.389 82.389 3 0.00090277 83767 QUIQUE_C1218_190116_001 69.716 57.948 57460000 38001000 0 0 0 0 0 0 0 0 19459000 0 0 0 35768 3977 33321 322190;322191 410399;410400 410399 2 PYVENIWALLLK Unmodified 1457.8282 0.82823722 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 163.94 163.94 2 0.00044658 167594 QUIQUE_C1277_190116_001 110.53 92.199 126150000 31586000 20924000 31349000 19649000 22645000 0 0 0 0 0 0 0 0 35769 3499 33322 322192;322193;322194;322195;322196 410401;410402;410403;410404;410405 410402 5 PYVTKEELYQNLTR Unmodified 1752.9046 0.90464964 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.148 77.148 3 1.9984E-05 77989 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.35 87.112 267840000 0 0 0 0 0 0 31286000 37519000 86590000 0 0 51593000 60857000 35770 267;275;3025 33323 322197;322198;322199;322200;322201;322202 410406;410407;410408;410409;410410;410411 410408 6 QAAAAAAAAAATAAWTGTTFTK Unmodified 2022.0171 0.017053633 3898 Q96KR1 ZFR Zinc finger RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 127.64 127.64 3 0.062913 130407 QUIQUE_DMIX1_190116_001 21.022 15.268 19196000 0 0 0 0 0 0 0 19196000 0 0 0 0 0 35771 3898 33324 322203 410412 410412 1 QAAAAATQTIAASQNAAVSNK Unmodified 1986.013 0.013030887 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 48.376 48.376 2;3 4.0232E-76 45911 QUIQUE_C1403_190116_001 184.01 167.47 257040000 0 27812000 67502000 22619000 29904000 22869000 60996000 0 0 0 0 0 25338000 35772 4606 33325 322204;322205;322206;322207;322208;322209;322210;322211 410413;410414;410415;410416;410417;410418;410419;410420 410415 8 QAAAAGIFLNNVK Unmodified 1315.7248 0.72483478 4251 Q9NQ88 TIGAR Fructose-2,6-bisphosphatase TIGAR yes yes 0 0 0 1 1 78.885 78.885 2 0.014247 79666 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.081 46.514 69292000 0 0 0 42051000 0 0 0 27241000 0 0 0 0 0 35773 4251 33326 322212;322213 410421;410422 410422 1 QAAAHTDHLRDVLR Unmodified 1601.8386 0.83863576 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 1 1 21.417 21.417 3 0.015922 14679 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.445 17.37 25886000 0 0 0 0 0 0 0 25886000 0 0 0 0 0 35774 693;3205 33327 322214 410423 410423 1 QAAASATQTIAAAQHAASTPK Unmodified 1994.0181 0.018116265 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 2 2 1 52.816 52.816 2;3 6.1236E-26 51493 QUIQUE_C1438_190116_001 160.48 152.18 2545000000 0 290090000 319700000 325500000 268140000 152350000 221360000 188900000 218370000 118370000 131400000 171930000 138920000 35775 4600 33328 322215;322216;322217;322218;322219;322220;322221;322222;322223;322224;322225;322226;322227;322228;322229;322230;322231 410424;410425;410426;410427;410428;410429;410430;410431;410432;410433;410434;410435;410436;410437;410438;410439;410440;410441;410442;410443;410444;410445 410430 21 QAAAYGLGVMAQYGGDNYRPFCTEALPLLVR Unmodified 3400.6697 0.66965144 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 1 1 151.33 151.33 3 0.0054316 158942 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.264 33.748 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35776 1403 33329 322232 410446 410446 1 QAACIWLLSLVR Unmodified 1428.7911 0.7911402 1259 J3KN16;Q5VYK3 KIAA0368;ECM29 Proteasome-associated protein ECM29 homolog yes no 0 0 0 1 153.36 153.36 2 0.015556 156125 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.006 56.855 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35777 1259 33330 322233 410447 410447 1 QAADLTQELPSVLLLHQLAK Unmodified 2187.2263 0.22631813 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.95 140.95 3 2.3342E-30 146786 QUIQUE_C1218_190116_001 110.37 104.22 1028900000 91014000 89924000 90783000 77730000 63683000 108610000 101840000 55597000 126600000 56664000 107400000 0 59012000 35778 3419 33331 322234;322235;322236;322237;322238;322239;322240;322241;322242;322243;322244;322245 410448;410449;410450;410451;410452;410453;410454;410455;410456;410457;410458;410459;410460 410448 12 QAADMILLDDNFASIVTGVEEGR Oxidation (M) 2479.1901 0.19006855 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A4;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 1 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 162.16 162.16 2;3 1.412E-100 165935 QUIQUE_C1277_190116_001 193.69 166.04 995500000 84327000 105960000 121990000 43277000 109710000 0 120090000 100800000 92484000 0 127980000 33746000 55134000 35779 1872;1371;590 33332 322246;322247;322248;322249;322250;322251;322252;322253;322254;322255;322256;322257;322258;322259;322260;322261;322262;322263;322264 410461;410462;410463;410464;410465;410466;410467;410468;410469;410470;410471;410472;410473;410474;410475;410476;410477;410478;410479;410480;410481 410464 385 21 QAADMILLDDNFASIVTGVEEGR Unmodified 2463.1952 0.19515393 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A4;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 2 2 3 2 3 2 3 3 2 1 4 3 4 170.59 170.59 2;3 3.9616E-224 174394 QUIQUE_C1438_190116_001 260.18 239.75 4850000000 328920000 450630000 392780000 370250000 486280000 569040000 478850000 415220000 297810000 41607000 265090000 377440000 376070000 35780 1872;1371;590 33332 322265;322266;322267;322268;322269;322270;322271;322272;322273;322274;322275;322276;322277;322278;322279;322280;322281;322282;322283;322284;322285;322286;322287;322288;322289;322290;322291;322292;322293;322294;322295;322296;322297;322298 410482;410483;410484;410485;410486;410487;410488;410489;410490;410491;410492;410493;410494;410495;410496;410497;410498;410499;410500;410501;410502;410503;410504;410505;410506;410507;410508;410509;410510;410511;410512;410513;410514;410515;410516;410517;410518;410519;410520;410521;410522 410492 38 QAAELFLDTVSTFTSYELMDYK Oxidation (M) 2587.204 0.20398728 3095 Q15008;H7C531 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 1 0 1 171.07 171.07 3 0.00010047 175277 QUIQUE_C1218_190116_001 60.939 49.044 16404000 16404000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35781 3095 33333 322299 410523 410523 2548 0 QAALEEEQAR Unmodified 1143.552 0.55201537 3002 Q13492;H0YCY1;H0YEF7;H0YEH1 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 18.267 18.267 2 0.00035507 10932 QUIQUE_C1403_190116_001 129.42 114.04 448690000 0 0 97059000 141880000 0 0 0 0 0 0 104350000 0 105400000 35782 3002 33334 322300;322301;322302;322303 410524;410525;410526;410527 410525 3 QAALQVAEGFISR Unmodified 1388.7412 0.74121312 2421 P40121;H7C0X8 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 2 2 3 2 2 3 3 2 2 1 110.86 110.86 2;3 6.776E-07 112406 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.17 89.822 6165500000 0 400260000 631180000 177210000 0 688000000 715670000 52826000 1078000000 412810000 1102900000 855740000 50892000 35783 2421 33335 322304;322305;322306;322307;322308;322309;322310;322311;322312;322313;322314;322315;322316;322317;322318;322319;322320;322321;322322;322323;322324;322325;322326 410528;410529;410530;410531;410532;410533;410534;410535;410536;410537;410538;410539;410540;410541;410542;410543;410544;410545;410546;410547;410548;410549;410550;410551;410552 410541 21 QAAPCVLFFDELDSIAK Unmodified 1922.9448 0.94479989 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 163.63 163.63 2;3 2.5678E-22 158296 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.6 155.07 8628000000 445530000 658530000 769020000 572460000 997960000 384830000 972420000 711180000 674020000 141590000 841070000 723050000 736300000 35784 2658 33336 322327;322328;322329;322330;322331;322332;322333;322334;322335;322336;322337;322338;322339;322340;322341;322342;322343;322344;322345;322346;322347;322348;322349;322350 410553;410554;410555;410556;410557;410558;410559;410560;410561;410562;410563;410564;410565;410566;410567;410568;410569;410570;410571;410572;410573;410574;410575;410576;410577 410570 23 QAAPGPQQSQSPSSR Unmodified 1524.7281 0.72808225 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 14.219 14.219 2 8.5034E-05 6757 QUIQUE_C1218_190116_001 90.653 80.13 32956000 7378700 0 0 0 0 0 0 6586900 0 0 7538300 0 11452000 35785 4517 33337 322351;322352;322353;322354 410578;410579;410580;410581 410578 4 QAAQPFDESDMAQLTQNATELLEESSELR Unmodified 3250.4936 0.49358038 4708 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 109.48 109.48 3 0.00057234 112806 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.928 27.595 572100000 81069000 78682000 95026000 0 68759000 0 0 0 89060000 50384000 109120000 0 0 + 35786 4708 33338 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0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.396 62.396 2 0.0012413 60616 QUIQUE_C1368_190116_001 105.52 70.167 76054000 25886000 0 0 26740000 0 0 0 23428000 0 0 0 0 0 35789 4428 33341 322376;322377;322378;322379;322380;322381;322382;322383;322384;322385 410605;410606;410607;410608;410609;410610;410611;410612;410613;410614 410607 10 QACTLLGISESHQMGIFR Unmodified 2046.9979 0.99791487 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 107.53 107.53 3 0.0025877 110829 QUIQUE_C1277_190116_001 57.525 41.707 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35790 4607 33342 322386 410615 410615 1 QADETLDFEEQILEAAK Unmodified 1948.9266 0.92656687 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.36 143.36 2 1.5356E-16 147722 QUIQUE_C1403_190116_001 164.68 151.48 707300000 60526000 73554000 75274000 67645000 81716000 58790000 84600000 0 0 31341000 0 83043000 90813000 35791 4606 33343 322387;322388;322389;322390;322391;322392;322393;322394;322395;322396 410616;410617;410618;410619;410620;410621;410622;410623;410624;410625;410626;410627 410621 12 QADFEAHNILR Unmodified 1312.6524 0.65239812 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 48.188 48.188 3 0.0039796 45920 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.043 36.944 272560000 0 0 0 40482000 0 0 63985000 0 0 0 59062000 48331000 60702000 35792 2554 33344 322397;322398;322399;322400;322401 410628;410629;410630;410631;410632;410633 410630 5 QADFVQTPITGIFGGHIR Unmodified 1956.0217 0.02174508 3082 Q14694;H3BNA1 USP10 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 118.33 118.33 3 4.5923E-08 122362 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.04 105.29 272950000 0 37463000 0 29677000 25269000 34261000 0 46673000 31504000 0 0 34115000 33989000 35793 3082 33345 322402;322403;322404;322405;322406;322407;322408;322409 410634;410635;410636;410637;410638;410639;410640;410641 410639 8 QADGAASAPTEEEEEVVKDR Unmodified 2129.9713 0.97128523 734;357 A0A1B0GV68;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 1 1 1 50.571 50.571 3 0.00035104 48081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.851 44.123 107150000 0 0 0 49962000 0 0 0 57188000 0 0 0 0 0 35794 357;734 33346 322410;322411 410642;410643 410643 2 QADLEKEELAEELASSLSGR Unmodified 2174.0703 0.070270995 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 1 1 122.37 122.37 3 0.039273 126351 QUIQUE_C1277_190116_001 45.784 31.743 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35795 2385 33347 322412 410644 410644 1 QADLYISEGLHPR Unmodified 1497.7576 0.75759147 2424;3729 P40227;Q92526 CCT6A;CCT6B T-complex protein 1 subunit zeta;T-complex protein 1 subunit zeta-2 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 2 2 1 1 1 60.248 60.248 2;3 1.617E-23 56722 QUIQUE_DMIX4_190116_001 172.56 135.5 4935900000 435790000 515090000 425410000 374280000 0 354540000 374480000 396320000 489700000 329490000 471820000 368760000 400270000 35796 2424;3729 33348 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410704;410705;410706;410707;410708;410709;410710;410711;410712;410713;410714;410715;410716;410717;410718;410719;410720;410721;410722;410723;410724;410725;410726;410727;410728;410729;410730;410731;410732;410733;410734;410735;410736;410737;410738;410739;410740;410741;410742;410743;410744;410745;410746;410747;410748;410749;410750;410751;410752;410753;410754;410755;410756;410757;410758;410759;410760;410761;410762;410763;410764 410711 61 QADYVPSDQDLLR Unmodified 1518.7314 0.7314363 2778 P63092;Q5JWF2;S4R3E3 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.39 84.39 2 1.5353E-23 85719 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.8 143.04 3547000000 0 0 457160000 363010000 323980000 327410000 376260000 298330000 365190000 0 406170000 317430000 312020000 35802 2778 33354 322502;322503;322504;322505;322506;322507;322508;322509;322510;322511 410765;410766;410767;410768;410769;410770;410771;410772;410773;410774;410775;410776;410777;410778;410779;410780 410775 16 QAEAFLNNQEYVLAHTEMPTTLEGAEAAIK Oxidation (M) 3304.5922 0.59217221 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.24 125.24 3 9.262E-75 130832 QUIQUE_C1438_190116_001 153.06 147.4 3977000000 199490000 248950000 248010000 214160000 358340000 201650000 178660000 461520000 412460000 261010000 430210000 385970000 376530000 35803 2851 33355 322512;322513;322514;322515;322516;322517;322518;322519;322520;322521;322522;322523;322524 410781;410782;410783;410784;410785;410786;410787;410788;410789;410790;410791;410792;410793;410794;410795 410785 2316 14 QAEAFLNNQEYVLAHTEMPTTLEGAEAAIK Unmodified 3288.5973 0.59725759 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.04 140.04 3 3.2194E-196 145348 QUIQUE_C1368_190116_001 215.81 205.39 7354500000 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322541;322542;322543 410820;410821;410822 410820 2 QAEEEDLQR Unmodified 1116.5047 0.50473083 4133 Q9H1K0 RBSN Rabenosyn-5 yes yes 0 0 0 1 18.068 18.068 2 0.020522 10545 QUIQUE_C1368_190116_001 70.919 20.312 20591000 0 0 20591000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35807 4133 33358 322544 410823 410823 1 QAEEKFIEFEDALEQEK Unmodified 2081.9793 0.97933072 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 1 1 13.681 13.681 3 0.024352 5771 QUIQUE_C1218_190116_001 26.781 0 6359000 6359000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35808 77 33359 322545 410824 410824 1 QAEELIQQEHADQAEIR Unmodified 2006.9657 0.96574634 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 54.275 54.275 2;3 1.5895E-75 52526 QUIQUE_DMIX3_190116_001 203.74 179.49 2868900000 159420000 123280000 617470000 136260000 173800000 77812000 148180000 198480000 173580000 41619000 722350000 105440000 191200000 35809 1452 33360 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QAFEEIILQYNK Unmodified 1494.7718 0.77184455 881 E7EVC7;Q676U5;C9JAY7;C9JK97;C9J1B2 ATG16L1 Autophagy-related protein 16-1 yes no 0 0 0 1 116.18 116.18 2 0.033845 119475 QUIQUE_C1403_190116_001 53.124 19.899 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35826 881 33376 322695 411008 411008 1 QAFEQIK Unmodified 862.45487 0.45486751 3079 Q14683;G8JLG1;V9GY57 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 0 1 1 1 26.671 26.671 2 0.049128 20146 QUIQUE_C1576_190116_001 75.311 0 1624100000 0 0 0 0 0 0 701020000 0 0 355740000 0 567300000 0 35827 3079 33377 322696;322697;322698 411009;411010;411011 411009 3 QAFLQVFVQPHIIQLK Unmodified 1908.0985 0.098538838 1241 H9KV31;O15394 NCAM2 Neural cell adhesion molecule 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 130.24 130.24 3 0.011023 136451 QUIQUE_C1438_190116_001 41.014 32.673 128850000 0 20392000 0 0 25235000 0 30154000 0 18022000 0 0 0 35048000 35828 1241 33378 322699;322700;322701;322702;322703 411012;411013;411014;411015;411016 411013 5 QAFNATAVVR Unmodified 1075.5774 0.57744226 3039;3526 Q14012;H7C071;Q8IU85;A0A087WUR6 CAMK1;CAMK1D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D no no 0 0 0 1 1 1 1 1 45.315 45.315 2 0.0052095 41952 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.264 56.178 400010000 0 0 0 117250000 0 86985000 88258000 0 0 43458000 0 64055000 0 35829 3039;3526 33379 322704;322705;322706;322707;322708 411017;411018;411019;411020;411021;411022;411023 411023 6 QAFPNTNR Unmodified 946.46208 0.46207815 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 19.259 19.259 2 0.0081139 11878 QUIQUE_C1403_190116_001 95.531 88.795 1348500000 343430000 0 0 345170000 313740000 0 0 0 0 0 0 0 346190000 35830 2255 33380 322709;322710;322711;322712 411024;411025;411026;411027;411028 411025 5 QAFQGDSIPVFDLLILGVGPDGHTCSLFPDHPLLQER Unmodified 4088.0466 0.046586207 1723 O95336;M0R261 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 0 1 2 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322755;322756;322757;322758;322759;322760;322761;322762;322763;322764;322765;322766;322767;322768 411082;411083;411084;411085;411086;411087;411088;411089;411090;411091;411092;411093;411094;411095;411096 411092 1673 13 QAFTPSSTMMEVFLQEK Unmodified 1972.9274 0.92743527 3047 Q14157;F8W726 UBAP2L Ubiquitin-associated protein 2-like yes no 0 0 0 1 1 143.65 143.65 2 8.1875E-05 146786 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.023 72.15 49434000 0 0 0 0 0 0 0 25608000 0 0 0 0 23826000 35835 3047 33384 322769;322770 411097;411098 411097 2 QAGAEALSQAVAR Unmodified 1270.663 0.6629628 3740 Q92616 GCN1L1 Translational activator GCN1 yes yes 0 0 0 1 1 46.638 46.638 2 0.018515 43590 QUIQUE_C1403_190116_001 58.274 37.945 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35836 3740 33385 322771;322772 411099;411100 411099 2 QAGEVTFADAHRPK Unmodified 1525.7637 0.76373948 2981 Q13243 SRSF5 Serine/arginine-rich splicing factor 5 yes yes 0 0 1 1 22.301 22.301 3 0.00877 15799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.09 49.741 78603000 0 0 0 0 0 0 0 78603000 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0.053380838 2286 P29218;H0YBL1;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RG13;E5RGY4;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 135.78 135.78 3 4.48E-11 139351 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.47 89.431 300600000 0 0 0 0 0 0 0 162680000 79095000 0 0 0 58823000 35840 2286 33389 322788;322789;322790 411116;411117;411118 411116 3 QAGIDSLLR Unmodified 971.53999 0.53999412 4550 Q9Y296;E9PQE8;E9PKS9;E9PN70 TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 71.019 71.019 2 0.027429 71335 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.859 7.7321 43027000 0 0 0 0 0 0 0 0 43027000 0 0 0 0 35841 4550 33390 322791 411119 411119 1 QAGLGNHLSGSER Unmodified 1324.6484 0.64837537 3146 Q15582;H0Y8L3;S4R3C6;H0Y9D7;H0YAB8 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 16.675 16.675 2;3 0.0030455 8652 QUIQUE_C1403_190116_001 72.531 44.323 166860000 18095000 33515000 0 24174000 0 34803000 0 0 0 16712000 0 39566000 0 35842 3146 33391 322792;322793;322794;322795;322796;322797;322798 411120;411121;411122;411123;411124;411125;411126 411122 7 QAGLQVWR Unmodified 956.5192 0.5191991 4664 Q9Y6U3;C9JGB6;F8WBX5 SCIN Adseverin yes no 0 0 0 1 1 1 1 53.932 53.932 2 0.015425 51741 QUIQUE_C1368_190116_001 84.699 53.409 196880000 33437000 0 69279000 0 0 0 0 0 37365000 0 56797000 0 0 35843 4664 33392 322799;322800;322801;322802 411127;411128;411129;411130 411128 4 QAGPASVPLR Unmodified 994.55598 0.55597854 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.293 31.293 2 0.0044743 26528 QUIQUE_C1218_190116_001 80.787 53.533 4617600000 916270000 891310000 0 1002800000 0 0 903620000 0 0 457950000 0 445620000 0 35844 2308 33393 322803;322804;322805;322806;322807;322808;322809;322810 411131;411132;411133;411134;411135;411136;411137;411138 411131 7 QAGPASVPLRTEEEFKK Unmodified 1885.9898 0.98977625 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 2 1 43.635 43.635 3 0.012863 39788 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Unmodified 2133.9646 0.96456583 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.465 72.465 3 1.8773E-07 72640 QUIQUE_C1403_190116_001 103.13 94.085 907110000 101090000 123320000 82781000 80530000 67042000 75696000 95463000 51613000 48562000 0 65314000 47751000 67946000 35848 2240 33397 322824;322825;322826;322827;322828;322829;322830;322831;322832;322833;322834;322835 411156;411157;411158;411159;411160;411161;411162;411163;411164;411165;411166;411167;411168 411159 12 QAHLTNQYMQR Unmodified 1388.6619 0.66191694 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;H0YB86 PABPC1 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 2 1 21.969 21.969 2;3 5.3496E-08 15407 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.36 135.7 226720000 50476000 0 0 51900000 0 0 0 86670000 0 37671000 0 0 0 35849 2031 33398 322836;322837;322838;322839;322840;322841;322842;322843;322844;322845;322846;322847;322848;322849 411169;411170;411171;411172;411173;411174;411175;411176;411177;411178;411179;411180;411181;411182;411183 411179 15 QAHLTNQYMQR Oxidation (M) 1404.6568 0.65683157 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YAR2;H0YB86 PABPC1 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein yes no 0 1 0 1 1 1 14.282 14.282 3 0.0029674 5972 QUIQUE_C1277_190116_001 61.958 53.362 47290000 0 19533000 0 15154000 0 0 0 0 0 12603000 0 0 0 35850 2031 33398 322850;322851;322852 411184;411185;411186 411184 1341 3 QAIELSPDNQYVK Unmodified 1503.7569 0.75692277 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.004 69.004 2 5.985E-18 70163 QUIQUE_C1218_190116_001 167.12 121.76 622310000 75651000 76106000 151440000 0 0 0 0 0 35766000 0 199940000 33546000 49861000 35851 1452 33399 322853;322854;322855;322856;322857;322858;322859;322860;322861;322862 411187;411188;411189;411190;411191;411192;411193;411194;411195;411196;411197 411188 10 QAIGLMGYR Unmodified 1007.5222 0.52223557 1210 H7C2Z6;H7BXD5;P28676 GCA Grancalcin yes no 0 0 0 1 1 66.221 66.221 2 0.04599 65428 QUIQUE_C1277_190116_001 65.235 17.486 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35852 1210 33400 322863;322864 411198;411199 411198 2 QAIGWNINIPALLQEK Unmodified 1806.9992 0.99921872 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 153.21 153.21 2 0.011026 148547 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.888 62.699 81498000 0 0 0 0 0 0 35992000 0 31233000 14273000 0 0 0 35853 498 33401 322865;322866;322867 411200;411201;411202 411202 3 QAILGEHPSSFR Unmodified 1340.6837 0.68369824 649 B7WPG3;C9IYN3;D6W592;Q8WVV9 HNRNPLL;HNRPLL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like yes no 0 0 0 1 39.929 39.929 3 0.054991 36117 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.718 2.8003 40699000 0 0 0 0 0 0 0 40699000 0 0 0 0 0 35854 649 33402 322868 411203 411203 1 QAILHPDTNEK Unmodified 1264.6412 0.64116473 3679 Q8TD22;B8ZZJ6;H7C1S9 SFXN5 Sideroflexin-5 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 2 17.258 17.258 2;3 2.7873E-12 9539 QUIQUE_DMIX5_190116_001 185.08 150.83 1071800000 42004000 111960000 152330000 150320000 0 33343000 27265000 28283000 147480000 0 193900000 33290000 151580000 35855 3679 33403 322869;322870;322871;322872;322873;322874;322875;322876;322877;322878;322879;322880;322881;322882;322883;322884;322885 411204;411205;411206;411207;411208;411209;411210;411211;411212;411213;411214;411215;411216;411217;411218;411219;411220;411221;411222 411218 16 QAIPLDENEGIYVQDVK Unmodified 1929.9684 0.96837211 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.54 98.54 2 8.4806E-14 100795 QUIQUE_C1403_190116_001 155.42 132.88 1241200000 75849000 105870000 151780000 119930000 113840000 0 101900000 78462000 78158000 72888000 149730000 86570000 106260000 35856 3086 33404 322886;322887;322888;322889;322890;322891;322892;322893;322894;322895;322896;322897 411223;411224;411225;411226;411227;411228;411229;411230;411231;411232;411233;411234 411226 12 QAITQVVVSR Unmodified 1099.635 0.63495714 4195 Q9H9B4 SFXN1 Sideroflexin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.844 41.844 2 9.6824E-10 38501 QUIQUE_C1277_190116_001 177.7 100.42 7864300000 579750000 648260000 663910000 654730000 527210000 810240000 698200000 526520000 570150000 235420000 733060000 601410000 615440000 35857 4195 33405 322898;322899;322900;322901;322902;322903;322904;322905;322906;322907;322908;322909;322910 411235;411236;411237;411238;411239;411240;411241;411242;411243;411244;411245;411246;411247;411248 411236 11 QAIVGDINIACPGMLDLK Unmodified 1926.9907 0.99070423 3608 Q8N6N7 ACBD7 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.7 135.7 2 8.9123E-76 140156 QUIQUE_C1277_190116_001 238.47 198.85 459080000 43444000 49836000 43244000 0 28499000 22626000 0 0 80108000 0 68941000 59971000 62410000 35858 3608 33406 322911;322912;322913;322914;322915;322916;322917;322918;322919 411249;411250;411251;411252;411253;411254;411255;411256;411257;411258 411251 10 QAIVGDINIACPGMLDLK Oxidation (M) 1942.9856 0.98561885 3608 Q8N6N7 ACBD7 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 7 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 122.33 122.33 2 2.8254E-13 125501 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.03 107.22 119740000 0 0 0 0 0 0 0 15768000 21977000 0 27315000 21412000 33270000 35859 3608 33406 322920;322921;322922;322923;322924 411259;411260;411261;411262;411263 411259 2694 5 QALDSEEEEEDVAAK Unmodified 1661.7268 0.72680443 3630 Q8NC44;H7C3D5 FAM134A Protein FAM134A yes no 0 0 0 1 44.344 44.344 2 4.8986E-05 41285 QUIQUE_C1218_190116_001 103.75 89.332 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35860 3630 33407 322925 411264 411264 1 QALEALPQLSSGADKK Unmodified 1654.889 0.88899957 3896 Q96KP1 EXOC2 Exocyst complex component 2 yes yes 0 0 1 1 58.447 58.447 3 0.044664 57054 QUIQUE_C1277_190116_001 29.216 21.039 16859000 0 16859000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35861 3896 33408 322926 411265 411265 1 QALEDLEK Unmodified 944.48148 0.48147619 1050;4116 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;Q9H0B6;A8MZ87;A8MX29;E9PQ02 KLC1;KLC2 Kinesin light chain 1;Kinesin light chain 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 36.452 36.452 2 0.027275 32623 QUIQUE_C1218_190116_001 69.825 0.90971 646500000 191290000 184850000 0 153690000 0 0 0 116670000 0 0 0 0 0 35862 1050;4116 33409 322927;322928;322929;322930 411266;411267;411268;411269 411266 4 QALEGLGDLK Unmodified 1042.5659 0.56587452 2035;413 A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RB22;B4DQ67;D6RJE6;P12081;B4DDD8;B3KWE1;E7ETE2;B4E1C5 HARS2;HARS Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial;Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.878 65.878 2 0.0046364 64636 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.231 33.805 748130000 68234000 0 0 103210000 77067000 80416000 104210000 70363000 71030000 0 0 72309000 101300000 35863 413;2035 33410 322931;322932;322933;322934;322935;322936;322937;322938;322939;322940;322941 411270;411271;411272;411273;411274;411275;411276;411277;411278;411279;411280;411281 411281 12 QALESILASER Unmodified 1215.6459 0.64591575 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 78.769 78.769 2 0.0065408 79472 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.19 29.808 203930000 0 49418000 0 0 0 0 46892000 0 0 12826000 0 37593000 57199000 35864 4148 33411 322942;322943;322944;322945;322946 411282;411283;411284;411285;411286 411285 4 QALETVNDYNPLMK Unmodified 1634.7974 0.79740737 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 96.503 96.503 2 5.4508E-07 100078 QUIQUE_C1576_190116_001 159.09 136.55 396120000 39109000 0 0 72967000 0 0 77102000 0 0 0 0 97364000 109580000 35865 3053 33412 322947;322948;322949;322950;322951 411287;411288;411289;411290;411291;411292 411289 5 QALETVNDYNPLMK Oxidation (M) 1650.7923 0.792322 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 84.209 84.209 2 0.00026254 87216 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.37 94.409 386990000 0 0 66325000 0 0 0 0 0 88868000 0 85130000 72370000 74301000 35866 3053 33412 322952;322953;322954;322955;322956 411293;411294;411295;411296;411297;411298;411299;411300 411296 2503 8 QALHSLELHYQAFLR Unmodified 1824.9635 0.96350192 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 3 2 2 3 1 3 2 3 1 3 3 2 89.611 89.611 2;3;4 1.6348E-09 91700 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.32 118.23 6171900000 39636000 607320000 446680000 178700000 512540000 114910000 487560000 811090000 768590000 139960000 938900000 783960000 342040000 35867 3117 33413 322957;322958;322959;322960;322961;322962;322963;322964;322965;322966;322967;322968;322969;322970;322971;322972;322973;322974;322975;322976;322977;322978;322979;322980;322981;322982;322983;322984;322985 411301;411302;411303;411304;411305;411306;411307;411308;411309;411310;411311;411312;411313;411314;411315;411316;411317;411318;411319;411320;411321;411322;411323;411324;411325;411326;411327;411328;411329;411330;411331;411332;411333;411334;411335;411336;411337;411338;411339;411340;411341;411342;411343;411344;411345;411346 411327 44 QALIAPGDAER Unmodified 1139.5935 0.59348625 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 37.758 37.758 2 0.0052982 34140 QUIQUE_C1218_190116_001 69.276 48.405 532730000 79050000 92096000 85262000 0 0 0 103620000 0 0 0 85831000 86870000 0 35868 4606 33414 322986;322987;322988;322989;322990;322991 411347;411348;411349;411350;411351;411352 411347 4 QALIDMNTLFTLLK Unmodified 1619.8957 0.89566485 56 B4DGL8;A0A087WW65;O75027;A0A2R8Y473 ABCB7 ATP-binding cassette sub-family B member 7, mitochondrial yes no 0 0 0 1 169.14 169.14 2 0.0070961 174289 QUIQUE_C1576_190116_001 60.49 45.346 42288000 0 0 0 0 0 0 42288000 0 0 0 0 0 0 35869 56 33415 322992 411353 411353 1 QALLELLGACQEAPRPHLGEFEADPR Unmodified 2916.4552 0.45522522 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 123.85 123.85 4 4.1709E-08 129502 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.122 52.219 542020000 47773000 0 66912000 0 0 0 0 67336000 111140000 0 151890000 0 96964000 35870 3269 33416 322993;322994;322995;322996;322997;322998 411354;411355;411356;411357;411358;411359;411360;411361 411358 8 QALLEQQR Unmodified 984.53524 0.53524309 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000001528;C9JQZ7 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.225 22.225 2 0.0036388 16074 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.04 69.279 393340000 0 55348000 59141000 69501000 0 42900000 51033000 48061000 0 0 67359000 0 0 + 35871 3161 33417 322999;323000;323001;323002;323003;323004;323005 411362;411363;411364;411365;411366;411367;411368;411369;411370 411367 9 QALNEIETR Unmodified 1072.5513 0.55128709 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 0 1 1 1 31.252 31.252 2 0.0058804 26160 QUIQUE_C1368_190116_001 85.676 35.549 2491300000 0 0 1106500000 0 749400000 0 0 0 0 0 0 0 635340000 35872 2721 33418 323006;323007;323008 411371;411372;411373 411371 2 QALNLPDVFGLVVLPLELK Unmodified 2077.2187 0.21871355 4594 Q9Y3I1 FBXO7 F-box only protein 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 173.89 173.89 2 3.6666E-05 181178 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.468 87.92 40166000 0 0 0 0 8675400 0 0 13276000 0 0 18215000 0 0 35873 4594 33419 323009;323010;323011 411374;411375;411376 411376 3 QALNTDYLDSDYQR Unmodified 1700.7642 0.76419299 1699 O94919 ENDOD1 Endonuclease domain-containing 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 78.418 78.418 2 1.4844E-17 79033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.85 140.69 742050000 0 0 0 159140000 159310000 0 168140000 177260000 0 78192000 0 0 0 35874 1699 33420 323012;323013;323014;323015;323016 411377;411378;411379;411380;411381;411382 411380 5 QALPHSYYWSAPAPYLGNK Unmodified 2162.0585 0.058524517 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 95.784 95.784 3 0.00014048 99134 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.425 41.876 206150000 14246000 0 0 0 29956000 0 0 53834000 0 0 59222000 48890000 0 35875 2225 33421 323017;323018;323019;323020;323021 411383;411384;411385;411386;411387;411388 411386 6 QALPQLETPPNPSALLALLAR Unmodified 2212.258 0.25795261 4375 Q9P1Y5 CAMSAP3 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 167.09 167.09 3 0.0024056 171914 QUIQUE_C1218_190116_001 43.497 38.518 41595000 15541000 0 12976000 0 0 7294900 0 0 0 5783200 0 0 0 35876 4375 33422 323022;323023;323024;323025 411389;411390;411391;411392 411389 4 QALPQVR Unmodified 810.47119 0.47118627 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;A6PVH9;E7ENH5;Q5JX45;H0Y524 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 0 1 1 1 24.366 24.366 2 0.051092 17882 QUIQUE_C1368_190116_001 74.191 27.424 151180000 0 0 46220000 41161000 0 0 0 0 0 0 0 0 63800000 35877 579 33423 323026;323027;323028 411393;411394;411395 411393 3 QALQDLLSEYMGNAGR Unmodified 1764.8465 0.84648283 2369 P35221;G3XAM7 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 150.77 150.77 2;3 1.7105E-54 153570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 240.8 215.94 559690000 50194000 59621000 71735000 70976000 0 12703000 37528000 62644000 62986000 12608000 0 36374000 82322000 35878 2369 33424 323029;323030;323031;323032;323033;323034;323035;323036;323037;323038;323039;323040;323041;323042;323043;323044;323045;323046 411396;411397;411398;411399;411400;411401;411402;411403;411404;411405;411406;411407;411408;411409;411410;411411;411412;411413;411414;411415;411416 411408 20 QALQDLLSEYMNNTGR Unmodified 1851.8785 0.87851124 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 148.6 148.6 2;3 2.1444E-10 153852 QUIQUE_C1368_190116_001 171.62 128.45 1179500000 140280000 48421000 155310000 47481000 110590000 169090000 0 0 135680000 47571000 37047000 161070000 126950000 35879 2250 33425 323047;323048;323049;323050;323051;323052;323053;323054;323055;323056;323057;323058;323059;323060;323061;323062;323063;323064;323065 411417;411418;411419;411420;411421;411422;411423;411424;411425;411426;411427;411428;411429;411430;411431;411432;411433;411434;411435;411436;411437;411438;411439;411440;411441 411423 23 QALQDLLSEYMNNTGR Oxidation (M) 1867.8734 0.87342586 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 1 0 1 126.49 126.49 2 0.0039712 123078 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.301 49.396 14107000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14107000 0 0 0 35880 2250 33425 323066 411442 411442 1612 1 QALQDLLSEYMNNTGRK Unmodified 1979.9735 0.97347426 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 1 1 129.56 129.56 3 0.00011885 132365 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.241 44.212 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35881 2250 33426 323067 411443 411443 1 QALQDTLALYK Unmodified 1262.6871 0.68705229 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 2 1 2 2 1 88.056 88.056 1;2 2.2172E-47 91135 QUIQUE_DMIX5_190116_001 242.35 125.31 12643000000 854410000 1248000000 804850000 807980000 1401800000 553690000 864750000 1017800000 1212900000 488150000 1329800000 1032500000 1026800000 35882 2851 33427 323068;323069;323070;323071;323072;323073;323074;323075;323076;323077;323078;323079;323080;323081;323082;323083;323084;323085;323086 411444;411445;411446;411447;411448;411449;411450;411451;411452;411453;411454;411455;411456;411457;411458;411459;411460;411461;411462;411463;411464;411465;411466;411467;411468;411469;411470;411471;411472;411473;411474;411475;411476;411477;411478;411479;411480;411481 411477 32 QALQEIVILPSLRPELFTGLR Unmodified 2392.3842 0.38421575 420 A0A2R8Y5N9;A0A2R8YFW8;A0A2R8YCL5;A0A2R8Y4I8;A0A2U3TZR0;Q9UBP0;A0A2R8Y7K2;A0A2R8YEA0 SPAST Spastin yes no 0 0 1 1 152.29 152.29 3 0.052491 156989 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.947 27.771 25246000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25246000 0 35883 420 33428 323087 411482 411482 1 QALQGEREGLEETLR Unmodified 1727.8802 0.8802258 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 1 2 53.836 53.836 2;3 0.002739 51472 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.261 39.422 207930000 0 0 0 0 0 0 0 207930000 0 0 0 0 0 35884 1916 33429 323088;323089 411483;411484 411484 2 QALQLQGDDANSLHLLALLLSAQK Unmodified 2559.4021 0.40205066 3486 Q86TV6;Q6PIF1;A0A0C4DGK5 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.13 159.13 3 2.4904E-09 165034 QUIQUE_C1576_190116_001 83.039 76.007 544650000 77069000 48102000 0 69737000 42069000 0 32880000 44220000 35255000 25253000 72236000 46576000 51251000 35885 3486 33430 323090;323091;323092;323093;323094;323095;323096;323097;323098;323099;323100 411485;411486;411487;411488;411489;411490;411491;411492;411493;411494;411495;411496 411489 12 QALSEIETR Unmodified 1045.5404 0.54038805 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 0 1 1 1 34.198 34.198 2 0.0070619 30268 QUIQUE_C1218_190116_001 82.645 47.821 805000000 235780000 238540000 330680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35886 3185 33431 323101;323102;323103 411497;411498;411499 411497 3 QALSGFGYR Unmodified 997.49813 0.49812931 1623 O75340;A0A024QZ42 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 54.281 54.281 2 0.018608 50987 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.308 67.817 199770000 141070000 0 0 0 0 0 0 0 0 58693000 0 0 0 35887 1623 33432 323104;323105;323106;323107;323108;323109 411500;411501;411502;411503;411504;411505 411504 5 QALTEFNTAIQEIVVTHWHR Unmodified 2392.2288 0.22877774 3255 Q53H82 LACTB2 Beta-lactamase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.72 138.72 4 2.1212E-06 144882 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.586 75.012 433270000 0 37021000 53951000 36547000 30106000 21019000 39280000 50252000 51148000 10684000 54617000 48648000 0 35888 3255 33433 323110;323111;323112;323113;323114;323115;323116;323117;323118;323119;323120 411506;411507;411508;411509;411510;411511;411512;411513;411514;411515;411516;411517;411518;411519;411520 411518 15 QALVAIFTHLR Unmodified 1267.7401 0.74009091 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 1 99.197 99.197 2;3 0.00056234 101676 QUIQUE_C1368_190116_001 76.682 68.169 2097200000 56531000 185020000 206360000 135220000 119720000 92888000 217150000 220330000 236910000 91773000 206380000 220830000 108070000 35889 3053 33434 323121;323122;323123;323124;323125;323126;323127;323128;323129;323130;323131;323132;323133;323134;323135;323136;323137;323138;323139;323140;323141;323142 411521;411522;411523;411524;411525;411526;411527;411528;411529;411530;411531;411532;411533;411534;411535;411536;411537;411538;411539;411540;411541;411542;411543 411524 21 QALVEFEDVLGACNAVNYAADNQIYIAGHPAFVNYSTSQK Unmodified 4387.0856 0.085550489 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4;M0R1W6;B4DVF8;M0QYL7 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L yes no 0 0 0 1 157 157 4 0.00059289 162783 QUIQUE_C1576_190116_001 35.699 33.08 32743000 0 0 0 0 0 0 32743000 0 0 0 0 0 0 35890 2082 33435 323143 411544 411544 1 QALVEFENIDSAK Unmodified 1462.7304 0.73037367 649 B7WPG3;C9IYN3;D6W592;Q8WVV9;H7BXH8;C9JJZ7 HNRNPLL;HNRPLL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.382 87.382 2 0.00052 90224 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.34 91.158 336520000 46939000 44321000 61721000 35363000 0 40428000 0 31086000 33637000 0 0 43023000 0 35891 649 33436 323144;323145;323146;323147;323148;323149;323150;323151;323152 411545;411546;411547;411548;411549;411550;411551;411552;411553 411552 8 QALVGQPASLTVTTK Unmodified 1512.8512 0.8511575 1631 O75382;A0A1W2PPI7 TRIM3 Tripartite motif-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.314 65.314 2 2.1018E-05 65248 QUIQUE_C1576_190116_001 105.65 72.808 513000000 48812000 57475000 0 54038000 0 47839000 76461000 44167000 47726000 0 58772000 0 77707000 35892 1631 33437 323153;323154;323155;323156;323157;323158;323159;323160;323161 411554;411555;411556;411557;411558;411559;411560;411561;411562;411563 411559 10 QALVLLTVSGVLAGAGLGAALR Unmodified 2049.231 0.23100957 2459 P43007 SLC1A4 Neutral amino acid transporter A yes yes 0 0 0 1 1 1 169.41 169.41 3 0.00027455 171198 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.814 42.709 44814000 0 0 0 0 0 0 0 6355200 13785000 0 24674000 0 0 35893 2459 33438 323162;323163;323164 411564;411565;411566 411564 3 QAMFHYFQVPDR Unmodified 1537.7136 0.71361816 4455 Q9UJ70;H7C3G9;C9JEV6;H7C286;E9PPU6;H0YC94 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 87.816 87.816 2;3 0.002452 89142 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.944 50.09 176550000 0 100550000 0 0 0 0 0 0 60987000 15012000 0 0 0 35894 4455 33439 323165;323166;323167;323168;323169;323170;323171;323172 411567;411568;411569;411570;411571;411572;411573;411574 411572 7 QAMFHYFQVPDR Oxidation (M) 1553.7085 0.70853279 4455 Q9UJ70;H7C3G9;C9JEV6;H7C286;E9PPU6;H0YC94 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 1 0 1 1 2 70.781 70.781 3 0.016861 71263 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.789 30.162 118490000 0 0 0 0 0 19325000 0 0 37074000 0 62086000 0 0 35895 4455 33439 323173;323174;323175;323176 411575;411576;411577;411578 411576 4 QANCPLYVTK Unmodified 1192.591 0.59104341 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.752 32.752 2 0.0052687 26874 QUIQUE_C1368_190116_001 78.06 53.138 2589400000 273510000 347690000 359470000 250060000 0 240520000 318220000 0 222670000 88921000 298310000 189970000 0 35896 1430 33440 323177;323178;323179;323180;323181;323182;323183;323184;323185;323186 411579;411580;411581;411582;411583;411584;411585;411586;411587;411588;411589;411590 411581 9 QANTGLFNLR Unmodified 1132.5989 0.59890598 2615 P52888;K7EP46;K7EL02;K7EIK4;K7EMU4;K7EL32 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 70.374 70.374 2 0.049356 69941 QUIQUE_C1563_190116_001 48.036 19.862 177080000 0 0 0 0 0 177080000 0 0 0 0 0 0 0 35897 2615 33441 323187 411591 411591 1 QANWLSVSNIIQLGGTIIGSAR Unmodified 2297.2492 0.24917883 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 2 2 2 1 1 2 170.71 170.71 2;3 7.716E-55 172273 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.32 153.83 1223400000 66758000 40342000 0 22541000 82813000 30331000 141330000 223360000 222160000 17843000 78190000 168450000 129290000 35898 2129 33442 323188;323189;323190;323191;323192;323193;323194;323195;323196;323197;323198;323199;323200;323201;323202;323203;323204;323205;323206 411592;411593;411594;411595;411596;411597;411598;411599;411600;411601;411602;411603;411604;411605;411606;411607;411608;411609;411610;411611 411601 20 QAPELSLSSQDLELVTK Unmodified 1856.9731 0.97312313 1393 O00273 DFFA DNA fragmentation factor subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 119.27 119.27 2 0.00043095 122643 QUIQUE_C1277_190116_001 83.692 70.291 119830000 35005000 41912000 0 0 42915000 0 0 0 0 0 0 0 0 35899 1393 33443 323207;323208;323209 411612;411613;411614;411615 411614 3 QAPQTIHLPSGEILDVFDAAER Unmodified 2406.2179 0.21793829 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 137.4 137.4 3 2.6961E-15 140295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.534 69.791 3015300000 201050000 269540000 211320000 232720000 227930000 235750000 203300000 201260000 242910000 112450000 319390000 267020000 290670000 35900 2180 33444 323210;323211;323212;323213;323214;323215;323216;323217;323218;323219;323220;323221;323222 411616;411617;411618;411619;411620;411621;411622;411623;411624;411625;411626;411627;411628;411629;411630;411631;411632;411633;411634 411625 19 QAPSIATIGSTCDLNLK Unmodified 1787.9087 0.90874874 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.143 96.143 2 3.4587E-06 98877 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.73 88.1 440600000 0 0 39514000 45688000 33080000 50502000 83921000 26233000 38793000 0 32650000 29776000 60438000 35901 3061 33445 323223;323224;323225;323226;323227;323228;323229;323230;323231;323232 411635;411636;411637;411638;411639;411640;411641;411642;411643;411644 411641 9 QAPSLHNLFAVCR Unmodified 1511.7667 0.76671637 1607 O75061;S4R305 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes no 0 0 0 1 1 1 80.647 80.647 3 0.00015494 81402 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.289 71.929 150340000 0 0 0 0 0 0 0 47090000 0 0 46510000 56739000 0 35902 1607 33446 323233;323234;323235 411645;411646;411647 411647 3 QAQDQWLDEQLSIAR Unmodified 1799.8802 0.8802258 4001 Q9BRF8 CPPED1 Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 114.09 114.09 2 3.8572E-06 119738 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.64 95.761 238870000 0 0 0 0 0 0 0 0 101840000 37744000 99290000 0 0 35903 4001 33447 323236;323237;323238;323239 411648;411649;411650;411651 411651 4 QAQEYEALLNIK Unmodified 1418.7405 0.74054442 771 CON__P05784 no no 0 0 0 1 1 1 98.834 98.834 2 0.00083316 100985 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.149 62.63 83604000 0 0 0 0 0 0 0 33992000 0 0 0 0 49612000 + 35904 771 33448 323240;323241;323242 411652;411653;411654 411652 3 QAQFYENIVK Unmodified 1238.6295 0.62953741 126 A0A096LNH6;Q14185 DOCK1 Dedicator of cytokinesis protein 1 yes no 0 0 0 1 68.244 68.244 2 0.011952 68472 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.568 45.569 35031000 0 0 0 0 0 0 0 0 35031000 0 0 0 0 35905 126 33449 323243 411655 411655 1 QAQIEVVPSASALIIK Unmodified 1665.9665 0.96652161 2304 P30050 RPL12 60S ribosomal protein L12 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 112.6 112.6 2;3 2.2991E-10 117782 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.99 145.08 2429200000 135750000 199600000 300490000 197640000 154060000 203680000 194500000 195490000 170350000 91849000 230550000 171840000 183440000 35906 2304 33450 323244;323245;323246;323247;323248;323249;323250;323251;323252;323253;323254;323255;323256;323257;323258 411656;411657;411658;411659;411660;411661;411662;411663;411664;411665;411666;411667;411668;411669;411670;411671;411672;411673 411670 12 QAQILASEAEK Unmodified 1186.6194 0.61936665 4466 Q9UJZ1;A0A087WYB4;F2Z2I8 STOML2 Stomatin-like protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 27.584 27.584 2 0.0021431 21096 QUIQUE_C1368_190116_001 102.55 79.812 344160000 53207000 0 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Q8N0X4;Q5JVC0;Q5JVB9 CLYBL Citrate lyase subunit beta-like protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 51.864 51.864 2 0.01007 49429 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.829 36.092 33669000 0 0 0 0 0 0 0 33669000 0 0 0 0 0 35910 3564 33454 323277 411695 411695 1 QAQQERDELADEIANSSGK Unmodified 2087.972 0.97195393 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 57.128 57.128 2;3 3.9831E-194 55257 QUIQUE_C1368_190116_001 306.69 283.01 622840000 0 0 46529000 39752000 38343000 0 38681000 188470000 37843000 86000000 47472000 33985000 65765000 35911 2378 33455 323278;323279;323280;323281;323282;323283;323284;323285;323286;323287;323288;323289 411696;411697;411698;411699;411700;411701;411702;411703;411704;411705;411706;411707 411697 12 QAQSPAGVSSEVEVLK Unmodified 1627.8417 0.84171503 448 A0A2R8Y7R9;Q13136;E9PJZ7 PPFIA1 Liprin-alpha-1 yes no 0 0 0 1 69.357 69.357 2 0.06053 68658 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.717 19.373 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35912 448 33456 323290 411708 411708 1 QAQSPSGVSSEVEVLK Unmodified 1643.8366 0.83662965 1078 G3V200;O75334;H0YHK3 PPFIA2 Liprin-alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.294 64.294 2 3.9282E-06 64800 QUIQUE_C1218_190116_001 135.02 103.26 496670000 42686000 41128000 61577000 48082000 0 36513000 49595000 38568000 31029000 14740000 51009000 41355000 40385000 35913 1078 33457 323291;323292;323293;323294;323295;323296;323297;323298;323299;323300;323301;323302 411709;411710;411711;411712;411713;411714;411715;411716;411717;411718;411719;411720 411709 12 QAQVATGGGPGAPPGSQPDYSAAWAEYYR Unmodified 2951.3474 0.34744891 3770 Q92945;M0R0C6;M0R3J3;M0R251;M0R263 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 114.28 114.28 3 7.3143E-13 116716 QUIQUE_C1563_190116_001 69.016 56.214 79362000 0 0 0 0 46091000 33271000 0 0 0 0 0 0 0 35914 3770 33458 323303;323304;323305 411721;411722;411723 411722 3 QAQVPLAAVIKPLAR Unmodified 1573.9668 0.96679638 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 1 1 1 1 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202.45 6632200000 349430000 533090000 578870000 535060000 375650000 530670000 467710000 446470000 543940000 214620000 709290000 674180000 673250000 35917 4172 33461 323325;323326;323327;323328;323329;323330;323331;323332;323333;323334;323335;323336;323337;323338;323339;323340;323341;323342;323343;323344;323345 411747;411748;411749;411750;411751;411752;411753;411754;411755;411756;411757;411758;411759;411760;411761;411762;411763;411764;411765;411766;411767;411768;411769 411752 22 QASEGPLK Unmodified 828.43413 0.43413207 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 11.403 11.403 2 0.02931 3396 QUIQUE_C1277_190116_001 67.981 33.157 27449000 0 11122000 0 0 0 8362100 0 0 0 0 7965300 0 0 35918 1863 33462 323346;323347;323348 411770;411771;411772 411770 3 QASEQNWANYSAEQNR Unmodified 1894.8194 0.81941646 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.694 53.694 2 9.2624E-95 52457 QUIQUE_C1218_190116_001 248.32 223.47 1306400000 53839000 0 30101000 137950000 64400000 103340000 49004000 201580000 296260000 32316000 0 75425000 262230000 35919 2123 33463 323349;323350;323351;323352;323353;323354;323355;323356;323357;323358;323359;323360 411773;411774;411775;411776;411777;411778;411779;411780;411781;411782;411783;411784;411785 411773 13 QASFHPDVSDEVR Unmodified 1485.6848 0.68482046 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 42.24 42.24 2;3 0.0083901 39502 QUIQUE_C1218_190116_001 47.666 41.718 506070000 97238000 83106000 0 79258000 0 0 0 59912000 0 0 70081000 58316000 58157000 35920 4606 33464 323361;323362;323363;323364;323365;323366;323367;323368 411786;411787;411788;411789;411790;411791;411792;411793 411786 6 QASHAQLGDAYDQEIR Unmodified 1800.8391 0.83908927 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 42.58 42.58 2;3 3.1208E-256 38390 QUIQUE_C1368_190116_001 289.38 237.13 8555600000 964540000 993580000 496310000 587310000 820530000 202010000 982030000 613940000 496170000 404960000 847480000 500200000 646510000 35921 869 33465 323369;323370;323371;323372;323373;323374;323375;323376;323377;323378;323379;323380;323381;323382;323383;323384;323385;323386;323387;323388;323389;323390;323391;323392;323393;323394 411794;411795;411796;411797;411798;411799;411800;411801;411802;411803;411804;411805;411806;411807;411808;411809;411810;411811;411812;411813;411814;411815;411816;411817;411818;411819;411820;411821;411822;411823;411824;411825;411826;411827;411828;411829;411830;411831;411832;411833 411804 40 QASIQHIQNAIDTEK Unmodified 1694.8588 0.85876208 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 47.08 47.08 2;3 0 44055 QUIQUE_C1368_190116_001 309.35 279.43 12845000000 0 1653400000 1331600000 955580000 251220000 1074400000 930350000 1128000000 1440500000 488740000 1305800000 1505500000 779960000 35922 2230 33466 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411944;411945;411946;411947;411948;411949;411950;411951;411952;411953;411954;411955;411956 411950 13 QASVADYEETVKK Unmodified 1466.7253 0.72528829 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A0J9YWF7;H0YHM6;F8WDY6 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 33.863 33.863 2;3 0.00046007 28838 QUIQUE_C1277_190116_001 105.46 90.767 10499000000 422680000 656850000 806560000 679650000 795280000 174440000 1087500000 876650000 1422400000 343860000 903340000 1118700000 1211400000 35930 336 33474 323496;323497;323498;323499;323500;323501;323502;323503;323504;323505;323506;323507;323508;323509;323510;323511;323512;323513;323514;323515;323516;323517;323518;323519 411957;411958;411959;411960;411961;411962;411963;411964;411965;411966;411967;411968;411969;411970;411971;411972;411973;411974;411975;411976;411977;411978;411979;411980;411981;411982;411983;411984;411985;411986;411987;411988;411989 411960 29 QATAHCPNSYVNNNDIYQVTPVYR Unmodified 2823.3035 0.3034756 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.102 81.102 3 6.661E-32 82265 QUIQUE_C1277_190116_001 137.72 131.21 1042000000 85124000 197510000 127720000 67295000 179970000 85497000 71658000 0 0 24201000 91580000 0 111430000 35931 4100 33475 323520;323521;323522;323523;323524;323525;323526;323527;323528;323529 411990;411991;411992;411993;411994;411995;411996;411997;411998;411999 411991 10 QATELALLQR Unmodified 1141.6455 0.64552182 3773 V9GYM8;Q92974;Q5VY93;V9GYF0 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 71.123 71.123 2 0.024741 71399 QUIQUE_C1277_190116_001 56.258 39.482 109660000 0 37920000 0 44868000 0 0 26873000 0 0 0 0 0 0 35932 3773 33476 323530;323531;323532;323533 412000;412001;412002;412003 412000 4 QATGIEDGELR Unmodified 1187.5782 0.57823012 1310 K4DI93;Q13620 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 37.269 37.269 2 0.0049661 33003 QUIQUE_C1218_190116_001 70.1 50.623 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323632;323633;323634;323635;323636;323637;323638;323639;323640;323641;323642;323643;323644;323645;323646;323647;323648;323649;323650;323651;323652;323653;323654;323655;323656;323657 412120;412121;412122;412123;412124;412125;412126;412127;412128;412129;412130;412131;412132;412133;412134;412135;412136;412137;412138;412139;412140;412141;412142;412143;412144;412145;412146;412147;412148;412149;412150;412151 412125 32 QATVVLNCVGPYR Unmodified 1475.7555 0.75548298 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.382 71.382 2 0.00043538 71559 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.867 63.14 739780000 0 0 0 90369000 70896000 84555000 107180000 109080000 0 32910000 0 97398000 147390000 35943 3629 33486 323658;323659;323660;323661;323662;323663;323664;323665 412152;412153;412154;412155;412156;412157;412158;412159;412160;412161 412157 7 QATYGYYLGNPAEFHDSSDHHTFK Unmodified 2784.2205 0.22045748 3128 Q15293 RCN1 Reticulocalbin-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 72.838 72.838 4;5 1.6668E-12 72148 QUIQUE_C1563_190116_001 70.091 63.796 602020000 75346000 83786000 134000000 101230000 89395000 71834000 0 0 0 0 0 0 46429000 35944 3128 33487 323666;323667;323668;323669;323670;323671;323672;323673;323674;323675 412162;412163;412164;412165;412166;412167;412168;412169;412170;412171 412170 10 QAVAWLVAMHK Unmodified 1252.675 0.67504781 3988 Q9BQ24 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.798 75.798 3 0.0010443 77592 QUIQUE_C1218_190116_001 55.718 40.516 328840000 30696000 0 44047000 0 0 0 0 62500000 60988000 16482000 49146000 64983000 0 35945 3988 33488 323676;323677;323678;323679;323680;323681;323682 412172;412173;412174;412175;412176;412177;412178 412172 7 QAVDFLSNEGHIYSTVDDDHFK Unmodified 2536.1506 0.15064658 2097 P15927;Q5TEJ0 RPA2 Replication protein A 32 kDa subunit yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 100.41 100.41 3;4 5.7809E-06 103174 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.061 44.615 1396800000 75106000 189320000 183460000 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39.973 1 0.035727 36993 QUIQUE_C1218_190116_001 132.76 28.31 122590000 25289000 27644000 0 0 0 22249000 26528000 0 0 0 0 20882000 0 35950 3973 33493 323719;323720;323721;323722;323723 412229;412230;412231;412232;412233 412229 0 QAVEMKNDKSEEEQSSSSVK Unmodified 2239.0274 0.027419902 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;P07910;G3V2D6;G3V5V7 HNRNPC Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 yes no 0 0 2 1 14.786 14.786 3 0.00020893 7158 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.783 68.114 22195000 0 0 0 0 0 0 0 22195000 0 0 0 0 0 35951 598 33494 323724 412234 412234 1 QAVEQQIQSHR Unmodified 1322.6691 0.66911081 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 17.503 17.503 2;3 7.0237E-13 10567 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.19 126.19 1840000000 211440000 111280000 159330000 87726000 156010000 134720000 156770000 136510000 124380000 63142000 154330000 120300000 224040000 35952 2355 33495 323725;323726;323727;323728;323729;323730;323731;323732;323733;323734;323735;323736;323737;323738;323739;323740;323741;323742;323743;323744;323745;323746;323747;323748;323749;323750 412235;412236;412237;412238;412239;412240;412241;412242;412243;412244;412245;412246;412247;412248;412249;412250;412251;412252;412253;412254;412255;412256;412257;412258;412259;412260 412250 15 QAVIGNLDEEQYK Unmodified 1505.7362 0.73618733 1566 O60268;H3BMU3;H3BNA7 KIAA0513 Uncharacterized protein KIAA0513 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.938 64.938 2 2.9319E-05 64399 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.11 118.09 1742900000 148760000 159520000 131080000 165210000 159310000 182430000 135110000 0 135480000 64979000 147560000 145930000 167560000 35953 1566 33496 323751;323752;323753;323754;323755;323756;323757;323758;323759;323760;323761;323762;323763 412261;412262;412263;412264;412265;412266;412267;412268;412269;412270;412271;412272;412273;412274;412275;412276 412271 14 QAVLGAGLPISTPCTTINK Unmodified 1940.0401 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QUIQUE_C1277_190116_001 128.31 101.53 1111400000 108660000 67185000 112000000 70574000 120340000 66505000 58306000 88567000 95019000 47786000 115250000 71336000 89830000 35965 1728 33506 323870;323871;323872;323873;323874;323875;323876;323877;323878;323879;323880;323881;323882;323883;323884;323885;323886;323887;323888;323889 412434;412435;412436;412437;412438;412439;412440;412441;412442;412443;412444;412445;412446;412447;412448;412449;412450;412451;412452;412453;412454;412455;412456;412457;412458;412459;412460 412438 25 QAWFIENEEQEYVQTVK Unmodified 2140.0113 0.011299553 1853 P04083;Q5T3N1;Q5T3N0 ANXA1 Annexin A1;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.59 123.59 2;3 2.956E-104 127631 QUIQUE_DMIX3_190116_001 266.74 246.89 1276700000 0 79831000 78986000 120110000 80236000 94013000 94648000 109080000 216040000 39544000 88271000 75920000 200010000 35966 1853 33507 323890;323891;323892;323893;323894;323895;323896;323897;323898;323899;323900;323901 412461;412462;412463;412464;412465;412466;412467;412468;412469;412470;412471;412472;412473;412474 412470 13 QAYTGNNSSQIQAAMK Unmodified 1710.7995 0.79953264 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.708 45.708 2 3.4963E-19 43614 QUIQUE_C1218_190116_001 170.04 157.46 717820000 62861000 66298000 71894000 51177000 28494000 60546000 68415000 42759000 51528000 0 85845000 66398000 61604000 35967 1689 33508 323902;323903;323904;323905;323906;323907;323908;323909;323910;323911;323912;323913 412475;412476;412477;412478;412479;412480;412481;412482;412483;412484;412485;412486 412475 12 QAYTQFGGK Unmodified 998.48214 0.48214489 2246 P25789;H0YMZ1;H0YL69;H0YN18;H0YMA1;H0YLC2;H0YKT8;H0YMI6;H0YKS0;H0YMV3 PSMA4 Proteasome subunit alpha type-4;Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.539 26.539 2 0.0015611 20386 QUIQUE_C1277_190116_001 102.46 68.612 2517300000 233420000 291460000 323300000 264760000 281510000 0 257450000 249940000 0 90985000 0 255160000 269270000 35968 2246 33509 323914;323915;323916;323917;323918;323919;323920;323921;323922;323923 412487;412488;412489;412490;412491;412492;412493;412494;412495;412496;412497;412498 412488 12 QAYVDKLEELMK Unmodified 1465.7487 0.74866627 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 2 103.75 103.75 2;3 0.00034652 108688 QUIQUE_C1218_190116_001 82.362 68.773 878050000 56879000 126650000 58791000 75336000 71670000 0 0 124810000 57639000 0 83644000 78428000 144200000 35969 180;3738 33510 323924;323925;323926;323927;323928;323929;323930;323931;323932;323933;323934;323935;323936 412499;412500;412501;412502;412503;412504;412505;412506;412507;412508;412509;412510;412511;412512;412513 412499 15 QCAECALVSLK Unmodified 1277.6108 0.61079258 3988 Q9BQ24 ZFYVE21 Zinc finger FYVE domain-containing protein 21 yes yes 0 0 0 1 60.684 60.684 2 0.0636 60190 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.77 19.615 88888000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 88888000 35970 3988 33511 323937 412514 412514 1 QCALVALEDVK Unmodified 1244.6435 0.64347291 1594 O60825;F6RAZ1 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes no 0 0 0 1 1 81.703 81.703 2 0.0024406 82552 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.549 65.165 186790000 0 0 0 0 0 0 0 93592000 93203000 0 0 0 0 35971 1594 33512 323938;323939 412515;412516 412515 2 QCANLQNAIADAEQR Unmodified 1700.79 0.79003058 778;792 CON__P13647;P13647;H0YI76;CON__Q5XQN5 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 80.563 80.563 2;3 9.2976E-13 82627 QUIQUE_DMIX5_190116_001 161.94 149.37 202450000 0 0 0 33802000 42012000 0 0 0 0 26456000 42917000 0 57260000 + 35972 778;792 33513 323940;323941;323942;323943;323944;323945 412517;412518;412519;412520;412521;412522 412521 6 QCASTVQQQEDR Unmodified 1448.6314 0.63140468 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 12.541 12.541 2 8.4595E-10 5074 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.15 118.46 50734000 0 13404000 6273600 0 10978000 0 0 0 0 0 0 20078000 0 35973 228 33514 323946;323947;323948;323949;323950 412523;412524;412525;412526;412527 412527 5 QCCVLFDFVSDPLSDLK Unmodified 2041.9489 0.94889899 917;1163 E9PFR3;Q14738;H0Y8C4;H0YJ75;Q13362;Q96B13;G3V2U3 PPP2R5D;PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform no no 0 0 0 1 1 162.12 162.12 2 3.8177E-07 169532 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.44 97.082 56885000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56885000 0 0 35974 917;1163 33515 323951;323952 412528;412529 412529 2 QCDLAGVETCK Unmodified 1279.5537 0.55367163 4448 Q9UIC8;I3L4A2;I3L2E3;I3L537 LCMT1 Leucine carboxyl methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 34.003 34.003 2 0.0098689 28999 QUIQUE_C1277_190116_001 62.823 40.083 34982000 0 34982000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35975 4448 33516 323953 412530 412530 1 QCEGITSPEGSK Unmodified 1291.5714 0.57143018 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 20.02 20.02 2 0.0068071 13329 QUIQUE_C1218_190116_001 68.786 52.22 218530000 0 83394000 0 68531000 0 66608000 0 0 0 0 0 0 0 35976 4617 33517 323954;323955;323956;323957 412531;412532;412533;412534 412531 4 QCFYEDIAQGTK Unmodified 1458.6449 0.64492948 201 A0A0A6YYA0;Q9Y3B3;G3V2Y2 TMED7-TICAM2;TMED7 Transmembrane emp24 domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 72.071 72.071 2 0.0012956 73462 QUIQUE_C1438_190116_001 82.261 78.101 254010000 0 0 66332000 0 88456000 0 99223000 0 0 0 0 0 0 35977 201 33518 323958;323959;323960;323961;323962 412535;412536;412537;412538;412539 412537 4 QCGNIFCAECSAK Unmodified 1543.6218 0.62176797 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 48.453 48.453 2 0.009679 46807 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.418 51.772 49273000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20997000 0 28276000 35978 3108 33519 323963;323964;323965 412540;412541;412542 412541 3 QCGQVAAAAAAQPPASHGPER Unmodified 2072.981 0.98101925 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 0 1 27.903 27.903 3 0.0095201 21987 QUIQUE_C1403_190116_001 44.341 37.493 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35979 1753 33520 323966 412543 412543 1 QCHECIEHIR Unmodified 1380.6027 0.60268751 4155 Q9H3G5;H7C0X5;C9JLV0;H7C218 CPVL Probable serine carboxypeptidase CPVL yes no 0 0 0 1 13.333 13.333 3 0.04567 5443 QUIQUE_C1218_190116_001 35.71 29.012 5067500 5067500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35980 4155 33521 323967 412544 412544 1 QCIGTMTIEIDFLQK Oxidation (M) 1811.8798 0.87975679 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.56 123.56 2 8.6175E-07 127394 QUIQUE_C1403_190116_001 118.9 101.43 606450000 56824000 74378000 0 53825000 78719000 87070000 87722000 0 0 27614000 53209000 40259000 46828000 35981 1245 33522 323968;323969;323970;323971;323972;323973;323974;323975;323976;323977 412545;412546;412547;412548;412549;412550;412551;412552;412553;412554;412555;412556 412547 726 12 QCIVAHPVNPPYYIPLVELVPHPETAPTTVDR Unmodified 3621.8654 0.86537436 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A087WW38 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 3 135.85 135.85 3;4 1.1217E-64 140931 QUIQUE_C1368_190116_001 138.34 131.76 8610500000 502140000 665850000 450710000 827860000 598030000 500940000 591810000 746180000 903440000 364670000 719410000 746090000 993410000 35982 4564 33523 323978;323979;323980;323981;323982;323983;323984;323985;323986;323987;323988;323989;323990;323991;323992;323993;323994;323995;323996;323997;323998;323999;324000;324001;324002 412557;412558;412559;412560;412561;412562;412563;412564;412565;412566;412567;412568;412569;412570;412571;412572;412573;412574;412575;412576;412577;412578;412579;412580;412581;412582;412583;412584;412585;412586;412587;412588;412589;412590;412591;412592;412593;412594;412595;412596;412597;412598;412599;412600;412601 412566 44 QCPLALDAILGLLSLSVK Unmodified 1910.0911 0.091070199 4463 Q9UJX3 ANAPC7 Anaphase-promoting complex subunit 7 yes yes 0 0 0 1 1 175.39 175.39 2;3 0.0021641 182514 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.709 52.253 15886000 0 0 0 0 0 0 0 0 8513400 0 7372100 0 0 35983 4463 33524 324003;324004 412602;412603 412603 2 QCQETEITTK Unmodified 1236.5656 0.56561652 375 A0A1W2PPJ5;Q96SW2;J3QT87 CRBN Protein cereblon yes no 0 0 0 1 1 1 1 17.075 17.075 2 0.0039027 9233 QUIQUE_C1563_190116_001 82.749 57.496 56553000 0 0 0 0 0 35108000 0 0 0 0 0 21445000 0 35984 375 33525 324005;324006;324007;324008 412604;412605;412606;412607 412604 4 QCQPSDTVCASVR Unmodified 1506.6555 0.65551094 1685 O94772 LY6H Lymphocyte antigen 6H yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.641 31.641 2 9.8636E-07 26814 QUIQUE_C1277_190116_001 156.48 116.48 1360900000 144850000 207130000 171360000 163390000 111830000 141470000 192850000 28819000 0 17564000 58121000 41886000 81592000 35985 1685 33526 324009;324010;324011;324012;324013;324014;324015;324016;324017;324018;324019;324020 412608;412609;412610;412611;412612;412613;412614;412615;412616;412617;412618;412619;412620;412621;412622;412623;412624 412611 17 QCSSGLQAVASIAGGIR Unmodified 1673.8519 0.85190256 1956 P09110;H7C131 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 106.34 106.34 2;3 0.00049187 110102 QUIQUE_C1368_190116_001 97.86 83.602 219560000 0 17426000 75859000 0 43595000 0 0 0 39788000 0 42893000 0 0 35986 1956 33527 324021;324022;324023;324024;324025;324026 412625;412626;412627;412628;412629;412630 412627 6 QCVDHYNEVK Unmodified 1290.5663 0.56628523 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 14.644 14.644 2;3 1.1171E-11 7073 QUIQUE_C1218_190116_001 150.27 125.37 734980000 172850000 269940000 13756000 25504000 0 66576000 0 24864000 143620000 5519900 0 0 12348000 35987 64 33528 324027;324028;324029;324030;324031;324032;324033;324034;324035;324036;324037 412631;412632;412633;412634;412635;412636;412637;412638;412639;412640;412641;412642;412643;412644 412633 14 QCVENADLPEGEK Unmodified 1487.6562 0.65622244 3954 Q99460;A0A087WW66;C9J9M4;H7BZR6 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.827 34.827 2 0.00012903 29465 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.25 98.147 706330000 71460000 83031000 59655000 81640000 78474000 63097000 78014000 20382000 29846000 26016000 38741000 32950000 43019000 35988 3954 33529 324038;324039;324040;324041;324042;324043;324044;324045;324046;324047;324048;324049;324050 412645;412646;412647;412648;412649;412650;412651;412652;412653;412654;412655;412656;412657;412658;412659 412655 15 QCVENADLPEGEKKPIDQR Unmodified 2225.0746 0.074644866 3954 Q99460;A0A087WW66;C9J9M4;H7BZR6 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 2 31.061 31.061 3;4 0.00012419 25590 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.809 64.555 298350000 0 30123000 0 0 51110000 0 0 21458000 0 0 118150000 77514000 0 35989 3954 33530 324051;324052;324053;324054;324055;324056;324057 412660;412661;412662;412663;412664;412665;412666 412665 6 QCVINVPSLCGMDHTEK Unmodified 1986.8962 0.89615191 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.985 84.985 3 2.1099E-13 87984 QUIQUE_C1218_190116_001 110.84 107.18 665750000 114270000 107730000 89767000 126470000 62981000 80689000 83841000 0 0 0 0 0 0 35990 2121 33531 324058;324059;324060;324061;324062;324063;324064 412667;412668;412669;412670;412671;412672;412673;412674;412675 412668 9 QCVINVPSLCGMDHTEKR Unmodified 2142.9973 0.99726294 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 1 1 70.561 70.561 3 3.8968E-05 70593 QUIQUE_C1277_190116_001 85.636 69.87 58118000 0 58118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35991 2121 33532 324065 412676 412676 1 QDACQGDSGGVFAVR Unmodified 1565.6893 0.68925391 492 A0A3B3ITU4;F5H2D0;A0A3B3ISR2;B4DPQ0;P00736 C1R Complement C1r subcomponent;Complement C1r subcomponent heavy chain;Complement C1r subcomponent light chain yes no 0 0 0 1 56.355 56.355 2 0.00046036 55807 QUIQUE_C1438_190116_001 99.5 74.484 27735000 0 0 0 0 27735000 0 0 0 0 0 0 0 0 35992 492 33533 324066 412677 412677 1 QDALVSLR Unmodified 900.50288 0.50288033 3433 Q7L099;H0Y8I0 RUFY3 Protein RUFY3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 48.943 48.943 2 0.022334 47552 QUIQUE_C1218_190116_001 74.301 40.198 973620000 214030000 0 0 0 0 0 179830000 0 140200000 61295000 0 164940000 213320000 35993 3433 33534 324067;324068;324069;324070;324071;324072 412678;412679;412680;412681;412682;412683 412678 4 QDAQDLYEAGEK Unmodified 1365.6048 0.6048388 1968 P09525;Q6P452 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.062 43.062 2 0.00033238 40152 QUIQUE_C1438_190116_001 140.78 118.93 894880000 0 85400000 103260000 131070000 90928000 94381000 66199000 0 83666000 53128000 80515000 52813000 53515000 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324255;324256;324257;324258;324259;324260;324261;324262;324263;324264 412876;412877;412878;412879;412880;412881;412882;412883;412884;412885 412879 2943 10 QDFNMMEQR 2 Oxidation (M) 1229.4805 0.48050669 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 2 0 1 17.294 17.294 2 0.027544 9517 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.635 91.322 34780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34780000 0 0 0 36014 4418 33552 324265 412886 412886 2943 0 QDFPLVK Unmodified 845.4647 0.46470391 2397 P36543;C9J8H1 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 54.245 54.245 2 0.025655 52060 QUIQUE_C1368_190116_001 95.541 39.938 947000000 148790000 152350000 135090000 123580000 121050000 0 0 91889000 121030000 53212000 0 0 0 36015 2397 33553 324266;324267;324268;324269;324270;324271;324272;324273 412887;412888;412889;412890;412891;412892;412893;412894;412895 412889 9 QDFVDLQGQLR Unmodified 1317.6677 0.66771383 2462 P43155 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes yes 0 0 0 1 89.352 89.352 2 0.0076116 92956 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acid-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 52.832 52.832 2 8.3198E-19 50997 QUIQUE_C1277_190116_001 194.9 151.77 2521900000 264970000 265350000 123430000 203770000 237350000 149430000 199690000 241620000 188610000 115410000 207740000 151290000 173220000 36018 2292 33556 324300;324301;324302;324303;324304;324305;324306;324307;324308;324309;324310;324311;324312;324313 412927;412928;412929;412930;412931;412932;412933;412934;412935;412936;412937;412938;412939;412940;412941;412942;412943;412944;412945;412946 412929 16 QDGDYSPDNSAQPGDR Unmodified 1720.6925 0.69248461 3874 Q96HY7;C9JWN1;H7C1J3 DHTKD1 Probable 2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component DHKTD1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 26.471 26.471 2 3.5578E-13 20437 QUIQUE_C1368_190116_001 134.08 116.21 17787000 0 0 17787000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36019 3874 33557 324314 412947 412947 1 QDGNEAVGGFFSQIGQLYMVHHLWAYR Unmodified 3122.4821 0.48210867 1622 O75323 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 156.66 156.66 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Unmodified 2181.0637 0.063686249 3607 Q8N6D5;K7EQM1 ANKRD29 Ankyrin repeat domain-containing protein 29 yes no 0 0 0 1 105.59 105.59 3 0.071075 110833 QUIQUE_DMIX5_190116_001 21.569 12.92 44988000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44988000 0 0 36023 3607 33560 324328 412962 412962 1 QDGTPLSWWVGR Unmodified 1400.6837 0.68369824 25 F5H107;A0A087WTA1;A0A0A0MR20;E9PDN6;Q9C0A0 CNTNAP4 Contactin-associated protein-like 4 yes no 0 0 0 1 129.82 129.82 2 0.012963 136298 QUIQUE_C1438_190116_001 57.174 37.903 25196000 0 0 0 0 25196000 0 0 0 0 0 0 0 0 36024 25 33561 324329 412963 412963 1 QDGVLAVTCAQEGVIR Unmodified 1714.8672 0.86721827 1238 H7C5A7;O14734 ACOT8 Acyl-coenzyme A thioesterase 8 yes no 0 0 0 1 86.693 86.693 2 0.021671 89087 QUIQUE_C1368_190116_001 66.989 50.735 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36025 1238 33562 324330 412964 412964 1 QDGVLQDWVIDDCIGNWWRPNFEPPQYPYIPAHITKPK Unmodified 4592.2376 0.23757488 1554 O43809;H3BND3 NUDT21 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 yes no 0 0 2 1 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324371;324372;324373;324374;324375;324376;324377;324378;324379;324380;324381;324382;324383;324384 413011;413012;413013;413014;413015;413016;413017;413018;413019;413020;413021;413022;413023;413024;413025;413026;413027;413028;413029;413030;413031;413032;413033;413034 413028 24 QDILTQESR Unmodified 1088.5462 0.54620171 125 A0A088AWL3;O75376 NCOR1 Nuclear receptor corepressor 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 1 1 2 1 28.667 28.667 2 0.0033433 22133 QUIQUE_C1403_190116_001 91.516 28.037 50688000000 4714200000 6432000000 7139600000 6777800000 5065000000 7497500000 6128200000 391060000 762220000 3211800000 0 2568200000 0 36034 125 33571 324385;324386;324387;324388;324389;324390;324391;324392;324393;324394;324395;324396;324397;324398;324399 413035;413036;413037;413038;413039;413040;413041;413042;413043;413044;413045;413046;413047;413048;413049;413050;413051;413052 413042 18 QDIMPTTTTK Oxidation (M) 1150.554 0.5539892 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 1 0 1 17.012 17.012 2 0.059121 9036 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1 2 1 2 2 2 132.88 132.88 2;3 2.6959E-66 139230 QUIQUE_C1438_190116_001 176.04 148.7 5834100000 352880000 403690000 510240000 395100000 568240000 459550000 558290000 414130000 584610000 163210000 452230000 410770000 561130000 36045 2393 33581 324459;324460;324461;324462;324463;324464;324465;324466;324467;324468;324469;324470;324471;324472;324473;324474;324475;324476;324477;324478;324479 413124;413125;413126;413127;413128;413129;413130;413131;413132;413133;413134;413135;413136;413137;413138;413139;413140;413141;413142;413143;413144;413145;413146;413147;413148;413149;413150;413151;413152 413133 29 QDLLVASLFR Unmodified 1160.6554 0.65535823 3568 Q8N122 RPTOR Regulatory-associated protein of mTOR yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.9 131.9 2 0.00024591 137143 QUIQUE_C1368_190116_001 117.53 76.497 214950000 0 26280000 15998000 22996000 26895000 0 16957000 0 49594000 0 20875000 17031000 18320000 36046 3568 33582 324480;324481;324482;324483;324484;324485;324486;324487;324488;324489 413153;413154;413155;413156;413157;413158;413159;413160;413161;413162 413154 9 QDLMNIAGTTLSSK Unmodified 1477.7446 0.74464352 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.821 96.821 2 6.2446E-24 99073 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.81 135.85 1079200000 254350000 0 0 0 167580000 0 0 0 0 71189000 291860000 162310000 131920000 36047 2810 33583 324490;324491;324492;324493;324494;324495;324496;324497;324498;324499;324500 413163;413164;413165;413166;413167;413168;413169;413170;413171;413172;413173;413174 413169 12 QDLMNIAGTTLSSK Oxidation (M) 1493.7396 0.73955814 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 1 0 1 2 69.281 69.281 2 0.0014209 65261 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.597 62.025 43238000 0 0 0 0 0 0 0 17489000 0 25749000 0 0 0 36048 2810 33583 324501;324502;324503 413175;413176;413177 413176 2260 3 QDLPALEEKPR Unmodified 1294.6881 0.68811492 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 37.238 37.238 2;3 0.0026282 32904 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.751 56.126 2123200000 228610000 242170000 58222000 61790000 204890000 161380000 283090000 58398000 0 74989000 281940000 253060000 214690000 36049 2363 33584 324504;324505;324506;324507;324508;324509;324510;324511;324512;324513;324514;324515;324516;324517;324518;324519;324520;324521 413178;413179;413180;413181;413182;413183;413184;413185;413186;413187;413188;413189;413190;413191;413192;413193;413194;413195;413196;413197;413198;413199;413200 413193 18 QDLPGALSSNAIR Unmodified 1340.7048 0.70482762 2392 P36404 ARL2 ADP-ribosylation factor-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.106 72.106 2 0.00038085 71487 QUIQUE_C1563_190116_001 94.616 58.672 891900000 76287000 61849000 85568000 64947000 66465000 56138000 74374000 64946000 80272000 0 95491000 79670000 85894000 36050 2392 33585 324522;324523;324524;324525;324526;324527;324528;324529;324530;324531;324532;324533 413201;413202;413203;413204;413205;413206;413207;413208;413209;413210;413211;413212;413213 413207 12 QDLPILVAK Unmodified 995.60153 0.60153174 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.872 74.872 2 0.0023755 76575 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.992 63.488 916080000 0 0 0 0 0 0 297290000 0 202010000 0 206530000 210250000 0 36051 1436 33586 324534;324535;324536;324537 413214;413215;413216;413217 413216 4 QDLPNAMAISEMTDK Unmodified 1662.7593 0.75930731 2134 P18085;C9JAK5;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.34 101.34 2 1.162E-06 105750 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.27 101.38 524660000 47686000 60573000 71564000 0 0 0 65160000 0 52793000 0 97663000 54707000 74519000 36052 2134 33587 324538;324539;324540;324541;324542;324543;324544;324545;324546 413218;413219;413220;413221;413222;413223;413224;413225;413226;413227;413228 413225 9 QDLPNAMAISEMTDKLGLQSLR Unmodified 2430.2247 0.22467992 2134 P18085;C9JAK5;U3KQF2 ARF4 ADP-ribosylation factor 4 yes no 0 0 1 1 143.98 143.98 3 4.231E-08 146955 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.248 72.018 25400000 0 0 0 0 0 0 0 25400000 0 0 0 0 0 36053 2134 33588 324547 413229 413229 1 QDLPNAMNAAEITDK Oxidation (M) 1645.7618 0.76175015 2827 P84077;P61204;H0YGG7 ARF1;ARF3 ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3 yes no 0 1 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 61.418 61.418 2 8.9615E-24 61187 QUIQUE_C1277_190116_001 152.4 73.842 4379500000 273880000 407910000 175940000 349230000 269830000 297160000 296380000 281510000 417230000 264250000 539400000 362600000 444220000 36054 2827 33589 324548;324549;324550;324551;324552;324553;324554;324555;324556;324557;324558;324559;324560;324561;324562;324563;324564;324565;324566;324567;324568;324569;324570;324571;324572 413230;413231;413232;413233;413234;413235;413236;413237;413238;413239;413240;413241;413242;413243;413244;413245;413246;413247;413248;413249;413250;413251;413252;413253;413254;413255;413256;413257;413258;413259;413260;413261;413262;413263;413264;413265;413266 413234 2265 37 QDLPNAMNAAEITDK Unmodified 1629.7668 0.76683553 2827 P84077;P61204;H0YGG7 ARF1;ARF3 ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.44 81.44 2 1.7344E-07 82612 QUIQUE_C1368_190116_001 124.38 98.334 7713600000 0 1525300000 0 0 930960000 1010000000 1020400000 884070000 1041500000 0 0 0 1301400000 36055 2827 33589 324573;324574;324575;324576;324577;324578;324579;324580;324581;324582 413267;413268;413269;413270;413271;413272;413273;413274;413275;413276;413277;413278;413279;413280;413281 413270 15 QDLPNAMNAAEITDKLGLHSLR Oxidation (M) 2422.2275 0.22745711 2827 P84077;P61204;H0YGG7 ARF1;ARF3 ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3 yes no 0 1 1 2 2 106.13 106.13 4 4.3878E-10 108935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.21 92.364 240450000 0 0 0 0 0 0 0 164890000 75560000 0 0 0 0 36056 2827 33590 324583;324584;324585;324586 413282;413283;413284;413285;413286;413287 413285 2265 6 QDLPNAMNAAEITDKLGLHSLR Unmodified 2406.2325 0.23254249 2827 P84077;P61204;H0YGG7 ARF1;ARF3 ADP-ribosylation factor 1;ADP-ribosylation factor 3 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 117.43 117.43 3;4 1.0367E-11 120953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.41 94.52 1092600000 0 0 0 0 0 0 0 470820000 185520000 0 105040000 177190000 153990000 36057 2827 33590 324587;324588;324589;324590;324591;324592;324593;324594;324595;324596 413288;413289;413290;413291;413292;413293;413294;413295;413296;413297;413298;413299;413300;413301;413302 413293 15 QDLPPLDEKPR Unmodified 1306.6881 0.68811492 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.611 37.611 3 0.0018982 33987 QUIQUE_C1277_190116_001 75.819 50.119 425940000 0 62371000 0 0 40244000 41425000 62733000 50159000 37085000 0 68794000 0 63126000 36058 1748 33591 324597;324598;324599;324600;324601;324602;324603;324604 413303;413304;413305;413306;413307;413308;413309;413310;413311;413312 413303 9 QDLPSLDEKPR Unmodified 1296.6674 0.66737948 3738 Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa yes yes 0 0 1 1 40.364 40.364 3 0.019799 36196 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.991 25.246 92582000 0 0 0 0 0 0 0 92582000 0 0 0 0 0 36059 3738 33592 324605 413313 413313 1 QDLSAIAR Unmodified 872.47158 0.4715802 4411 Q9UBW8;F5H7C6;F5GYF7;F5H248 COPS7A COP9 signalosome complex subunit 7a yes no 0 0 0 1 1 1 34.778 34.778 2 0.0192 30198 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.728 27.873 97475000 0 0 0 0 0 0 0 0 53841000 0 0 43634000 0 36060 4411 33593 324606;324607;324608 413314;413315;413316;413317 413317 4 QDLSLRPLIWAAVR Unmodified 1636.9413 0.94130991 3563 Q8N0W3;J3KSP6 FUK L-fucose kinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.11 123.11 3 0.00056042 129249 QUIQUE_C1438_190116_001 80.967 64.282 462160000 0 0 31201000 0 51656000 37110000 51262000 53198000 47171000 0 72328000 57454000 60779000 36061 3563 33594 324609;324610;324611;324612;324613;324614;324615;324616;324617 413318;413319;413320;413321;413322;413323;413324;413325;413326 413319 8 QDLTTALGLVK Unmodified 1157.6656 0.66558856 3773 V9GYM8;Q92974 ARHGEF2 Rho guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 103.08 103.08 2 0.0011449 105389 QUIQUE_C1277_190116_001 103.7 80.272 109900000 31549000 31627000 0 31542000 0 0 0 0 0 15179000 0 0 0 36062 3773 33595 324618;324619;324620;324621 413327;413328;413329;413330;413331 413328 5 QDLTTLDVTK Unmodified 1132.5976 0.59756858 2432 P41091;Q2VIR3;H7BZU1 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 60.288 60.288 2 0.0067712 58319 QUIQUE_C1563_190116_001 99.815 76.386 237890000 0 0 0 0 0 78403000 0 75622000 0 0 0 83860000 0 36063 2432 33596 324622;324623;324624 413332;413333;413334 413332 0 QDLVISLLPYVLHPLVAK Unmodified 2017.1976 0.19758418 4413 Q9UDR5;F8WAH1 AASS Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase, mitochondrial;Lysine ketoglutarate reductase;Saccharopine dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 163.79 163.79 3 5.2622E-05 170646 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.873 86.268 798030000 63359000 38943000 134990000 40289000 50447000 35967000 96047000 49954000 72220000 16958000 53280000 0 145580000 36064 4413 33597 324625;324626;324627;324628;324629;324630;324631;324632;324633;324634;324635;324636;324637 413335;413336;413337;413338;413339;413340;413341;413342;413343;413344;413345;413346;413347 413345 9 QDLVKDDIK Unmodified 1072.5764 0.57643921 1399 O00330 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 23.4 23.4 3 0.053214 17064 QUIQUE_C1438_190116_001 38.303 17.304 54675000 0 0 0 0 20691000 0 0 0 0 0 33984000 0 0 36065 1399 33598 324638;324639 413348;413349 413348 2 QDMPNAMPVSELTDK Unmodified 1674.7593 0.75930731 2828 P84085;C9J1Z8 ARF5 ADP-ribosylation factor 5 yes no 0 0 0 1 1 88.302 88.302 2 0.00018381 90858 QUIQUE_C1576_190116_001 90.926 74.919 30552000 0 0 0 0 0 0 30552000 0 0 0 0 0 0 36066 2828 33599 324640;324641 413350;413351 413350 2 QDMPNAMPVSELTDK 2 Oxidation (M) 1706.7491 0.74913655 2828 P84085;C9J1Z8 ARF5 ADP-ribosylation factor 5 yes no 0 2 0 1 52.468 52.468 2 0.00078062 47663 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.819 66.164 9969100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9969100 0 0 0 36067 2828 33599 324642 413352 413352 2267;2268 1 QDMPPPGGYGPIDYK Oxidation (M) 1649.7396 0.73955814 4364;852 Q9P0J0;B4DEZ3;K7EJE1;K7EP87;E7ENQ6 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 no no 0 1 0 1 1 66.143 66.143 2 0.027042 66647 QUIQUE_C1218_190116_001 46.34 24.254 33885000 17308000 0 16577000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36068 4364;852 33600 324643;324644 413353;413354 413353 2 QDMPSEDVVSLQVSLINLAMK Unmodified 2316.1705 0.17051909 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 1 1 167.92 167.92 2;3 5.7432E-08 172516 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.75 114.35 33083000 0 0 0 0 0 0 0 0 33083000 0 0 0 0 36069 3926 33601 324645;324646 413355;413356;413357 413357 3 QDMSISLAALELLSGLAK Unmodified 1859.0074 0.0074001489 3513 Q86X10;A2A2F0;A0A0J9YW54 RALGAPB Ral GTPase-activating protein subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 172.1 172.1 2 7.7357E-05 175950 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.84 111.65 116700000 14453000 15291000 0 27342000 12059000 0 0 11993000 0 0 0 24449000 11113000 36070 3513 33602 324647;324648;324649;324650;324651;324652;324653 413358;413359;413360;413361;413362;413363;413364 413364 7 QDPASYAPDAK Unmodified 1161.5302 0.53021729 3104 Q15049;A6PVC3 MLC1 Membrane protein MLC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 30.266 30.266 2 0.0021747 24274 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.974 52.844 66468000 0 0 0 0 0 0 0 0 40114000 26354000 0 0 0 36071 3104 33603 324654;324655;324656;324657 413365;413366;413367;413368 413368 4 QDPASYAPDAKPSDLQLSK Unmodified 2029.9956 0.99564949 3104 Q15049;A6PVC3 MLC1 Membrane protein MLC1 yes no 0 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413493;413494;413495;413496;413497;413498;413499;413500;413501;413502;413503;413504;413505;413506;413507;413508;413509;413510;413511;413512;413513;413514 413497 22 QDSVITDEMNYSLILK Unmodified 1867.9237 0.9237301 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 0 1 136.21 136.21 2 0.0045356 138973 QUIQUE_C1563_190116_001 56.956 35.197 26713000 0 0 0 0 0 26713000 0 0 0 0 0 0 0 36087 438;2509 33617 324773 413515 413515 1 QDTEEDEEEDEKDK Unmodified 1737.6701 0.67007741 4543 Q9Y266;A0A0A0MSS4;A0A0A0MSU9 NUDC Nuclear migration protein nudC yes no 0 0 1 1 10.702 10.702 3 0.022768 3104 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.29 53.532 9880900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9880900 0 0 0 36088 4543 33618 324774 413516 413516 1 QDTVSNFSK Unmodified 1024.4825 0.48253882 2462 P43155 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 21.369 21.369 2 0.0056504 15015 QUIQUE_C1218_190116_001 86.205 66.208 683730000 115130000 0 79539000 68025000 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33621 324789;324790;324791;324792;324793;324794;324795;324796;324797;324798;324799;324800;324801 413534;413535;413536;413537;413538;413539;413540;413541;413542;413543;413544;413545;413546;413547;413548 413537 15 QDVHLLMTNCIK Unmodified 1470.7323 0.7323047 1548 O43747;H3BNR4;H3BR36;H3BUN9;H3BN71;B4DGE1;H3BRM7 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 63.955 63.955 2;3 0.0011191 64228 QUIQUE_C1218_190116_001 60.628 34.087 182180000 38977000 46206000 0 0 57993000 0 0 0 0 0 0 39000000 0 36092 1548 33622 324802;324803;324804;324805;324806;324807 413549;413550;413551;413552;413553;413554 413549 6 QDVIITALDNVEAR Unmodified 1555.8206 0.82058566 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 124.4 124.4 2;3 1.1917E-07 127072 QUIQUE_C1563_190116_001 129.84 87.502 665040000 53751000 61791000 59009000 70855000 44937000 69867000 70994000 0 38180000 42055000 43528000 56046000 54029000 36093 514 33623 324808;324809;324810;324811;324812;324813;324814;324815;324816;324817;324818;324819;324820;324821;324822;324823;324824 413555;413556;413557;413558;413559;413560;413561;413562;413563;413564;413565;413566;413567;413568;413569;413570;413571;413572;413573;413574;413575 413565 21 QDVLHWLNEEK Unmodified 1409.6939 0.69392858 1615 O75170 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 93.61 93.61 3 0.0097434 91019 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.94 29.532 24032000 0 0 0 0 17346000 0 0 0 0 6686700 0 0 0 36094 1615 33624 324825;324826 413576;413577 413577 2 QDVVNAVR Unmodified 899.48248 0.48247924 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.585 22.585 2 0.0036229 16043 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.69 71.285 913940000 0 85224000 79220000 0 204650000 125930000 0 81866000 0 0 107150000 95748000 134160000 36095 2037 33625 324827;324828;324829;324830;324831;324832;324833;324834 413578;413579;413580;413581;413582;413583;413584;413585 413583 7 QDVVNWLNEEK Unmodified 1372.6623 0.6622941 4518 Q9UPN7 PPP6R1 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1 yes yes 0 0 0 1 95.805 95.805 2 0.023646 97093 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.536 43.855 30106000 0 0 0 0 0 0 0 30106000 0 0 0 0 0 36096 4518 33626 324835 413586 413586 1 QDVYDLLK Unmodified 992.51786 0.51786169 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.494 91.494 2 0.0080119 93313 QUIQUE_C1277_190116_001 95.909 57.776 947440000 77852000 99303000 0 72863000 79805000 59035000 90573000 87454000 81112000 31419000 96913000 81544000 89564000 36097 3954 33627 324836;324837;324838;324839;324840;324841;324842;324843;324844;324845;324846;324847 413587;413588;413589;413590;413591;413592;413593;413594;413595;413596;413597;413598;413599 413588 13 QDVYGPQPQVR Unmodified 1285.6415 0.64149908 759 C9JZR2;O60716;E9PRE2 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.407 36.407 2 0.000436 32403 QUIQUE_C1438_190116_001 145.16 110.97 177790000 0 0 0 0 87659000 0 0 0 90135000 0 0 0 0 36098 759 33628 324848;324849;324850;324851;324852;324853 413600;413601;413602;413603;413604;413605 413601 6 QDWEHAANDVSFATIR Unmodified 1858.8598 0.85982471 2444 P42224;J3KPM9;E7EPD2;D2KFR9;E7ENM1;E9PH66 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 98.156 98.156 2;3 1.6897E-24 100906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.47 131.75 2161200000 155190000 92340000 343440000 127640000 161750000 0 150160000 159180000 186010000 0 422430000 172370000 190660000 36099 2444 33629 324854;324855;324856;324857;324858;324859;324860;324861;324862;324863;324864;324865;324866;324867;324868;324869;324870;324871;324872;324873;324874 413606;413607;413608;413609;413610;413611;413612;413613;413614;413615;413616;413617;413618;413619;413620;413621;413622;413623;413624;413625;413626;413627 413621 21 QEADEATLAR Unmodified 1102.5255 0.52546627 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EJU1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 0 4 3 5 4 4 5 5 4 5 5 3 4 5 39.498 39.498 1;2 9.4145E-64 14284 QUIQUE_C1403_190116_001 255.07 199.54 1003800000000 63385000000 74105000000 84196000000 83390000000 72048000000 80588000000 84152000000 67912000000 84536000000 60284000000 83947000000 76952000000 88281000000 36100 389;395;1336 33630 324875;324876;324877;324878;324879;324880;324881;324882;324883;324884;324885;324886;324887;324888;324889;324890;324891;324892;324893;324894;324895;324896;324897;324898;324899;324900;324901;324902;324903;324904;324905;324906;324907;324908;324909;324910;324911;324912;324913;324914;324915;324916;324917;324918;324919;324920;324921;324922;324923;324924;324925;324926;324927;324928;324929;324930 413628;413629;413630;413631;413632;413633;413634;413635;413636;413637;413638;413639;413640;413641;413642;413643;413644;413645;413646;413647;413648;413649;413650;413651;413652;413653;413654;413655;413656;413657;413658;413659;413660;413661;413662;413663;413664;413665;413666;413667;413668;413669;413670;413671;413672;413673;413674;413675;413676;413677;413678;413679;413680;413681;413682;413683;413684;413685;413686;413687;413688;413689;413690;413691;413692;413693;413694;413695;413696;413697;413698;413699;413700;413701;413702;413703;413704;413705;413706;413707;413708;413709;413710;413711;413712;413713;413714;413715;413716;413717;413718;413719;413720;413721;413722;413723;413724;413725;413726;413727;413728 413659 86 QEAEQLKNQIR Unmodified 1355.7157 0.71572665 2767 P62873;F6UT28;B1AKQ8;F6X3N5 GNB1 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 yes no 0 0 1 2 1 1 20.953 20.953 2;3 1.585E-11 14310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.72 145.72 433560000 0 0 0 0 0 0 0 350660000 0 0 0 49214000 33685000 36101 2767 33631 324931;324932;324933;324934 413729;413730;413731;413732 413729 3 QEAFLLNEDLGDSLDSVEALLK Unmodified 2418.2166 0.21660088 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 3 2 1 171.02 171.02 2;3 0 176678 QUIQUE_C1438_190116_001 295.37 272.01 15640000000 174610000 613670000 0 71334000 1851600000 260700000 1241100000 3599500000 2876000000 101950000 2767400000 1174400000 907830000 36102 267;275;3025 33632 324935;324936;324937;324938;324939;324940;324941;324942;324943;324944;324945;324946;324947;324948;324949;324950;324951;324952;324953;324954;324955;324956 413733;413734;413735;413736;413737;413738;413739;413740;413741;413742;413743;413744;413745;413746;413747;413748;413749;413750;413751;413752;413753;413754 413738 21 QEAFLLNEDLGDSLDSVEALLKK Unmodified 2546.3116 0.3115639 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 163.47 163.47 3 0.00097403 165806 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.913 38.882 57514000 0 0 0 0 0 0 0 57514000 0 0 0 0 0 36103 267;275;3025 33633 324957 413755 413755 1 QEAGISEGQGTAGEEEEK Unmodified 1847.8021 0.80209464 1533 O43583;F8VVL1 DENR Density-regulated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 25.718 25.718 2 5.7022E-76 19538 QUIQUE_C1277_190116_001 201.76 164.43 315700000 0 56729000 38210000 74225000 38214000 56784000 51538000 0 0 0 0 0 0 36104 1533 33634 324958;324959;324960;324961;324962;324963 413756;413757;413758;413759;413760;413761 413756 3 QEAGISEGQGTAGEEEEKKK Unmodified 2103.992 0.99202067 1533 O43583;F8VVL1 DENR Density-regulated protein yes no 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 14.472 14.472 3;4 7.4174E-18 6787 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.71 104.74 831510000 0 19977000 41297000 20383000 49884000 0 0 144000000 169780000 0 94471000 132480000 159250000 36105 1533 33635 324964;324965;324966;324967;324968;324969;324970;324971;324972;324973;324974;324975;324976 413762;413763;413764;413765;413766;413767;413768;413769;413770;413771;413772;413773;413774;413775 413770 14 QEAIDEVKR Unmodified 1086.5669 0.56693715 3125 Q15276;A0A087WZZ3 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 16.543 16.543 3 0.010295 8535 QUIQUE_C1277_190116_001 53.756 37.554 88489000 0 62133000 0 0 0 0 0 0 0 0 26357000 0 0 36106 3125 33636 324977;324978;324979 413776;413777;413778 413776 3 QEAIDVLLLGNTLNSDLADK Unmodified 2141.1216 0.12157828 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 153.63 153.63 2;3 1.0705E-06 156295 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.86 125.37 460380000 0 0 0 0 153690000 0 160370000 46043000 0 0 100280000 0 0 36107 723 33637 324980;324981;324982;324983;324984;324985 413779;413780;413781;413782;413783;413784 413783 4 QEAIDWLLGLAVR Unmodified 1482.8195 0.81946344 4535 Q9Y224;G3V4C6;H0YJB9 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 165.4 165.4 2;3 9.4591E-18 169815 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413810;413811;413812;413813;413814;413815;413816;413817;413818;413819;413820;413821;413822;413823;413824;413825;413826;413827 413821 18 QEALGAR Unmodified 743.3926 0.3926016 2873 Q02410 APBA1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family A member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 40.437 40.437 2 0.022664 21545 QUIQUE_C1368_190116_001 101.72 10.582 428580000 0 0 229010000 0 0 0 11143000 0 188420000 0 0 0 0 36110 2873 33640 325022;325023;325024 413828;413829;413830 413828 3 QEALKNDLVEALKR Unmodified 1625.9101 0.91006937 585 B1AK87;B1AK88 CAPZB yes no 0 0 2 1 1 61.763 61.763 4 0.02135 61208 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.813 24.489 99910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54000000 0 45910000 36111 585 33641 325025;325026 413831;413832 413832 2 QEALLAAISEK Unmodified 1171.6449 0.64485312 1479;1107 X6RM00;G8JLD3;X6RLX0;Q8IUD2;K7EPD6;A0A0U1RQN0;O15083;H7C4G9 ERC1;ERC2 ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1;ERC protein 2 no no 0 0 0 1 81.219 81.219 2 0.048947 81479 QUIQUE_C1563_190116_001 45.939 25.706 55544000 0 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325151;325152;325153;325154;325155;325156;325157;325158;325159;325160;325161;325162;325163 413974;413975;413976;413977;413978;413979;413980;413981;413982;413983;413984;413985;413986 413975 13 QEERESSQQAQR Unmodified 1474.676 0.67604668 3337 Q5VWV2;Q8TEW0 PARD3 Partitioning defective 3 homolog yes no 0 0 1 1 15.354 15.354 3 0.053923 7603 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.303 2.6445 22827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22827000 0 0 36136 3337 33665 325164 413987 413987 1 QEESITVQTMMNTLR Oxidation (M) 1795.8444 0.84443392 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 1 3 1 1 1 89.67 89.67 2 9.9916E-31 93900 QUIQUE_C1218_190116_001 168.02 138.27 617610000 42903000 133040000 56896000 0 0 33959000 42643000 0 56188000 107420000 60719000 44591000 39253000 36137 2941 33666 325165;325166;325167;325168;325169;325170;325171;325172;325173;325174;325175;325176;325177 413988;413989;413990;413991;413992;413993;413994;413995;413996;413997;413998;413999;414000;414001;414002;414003 413988 2412;2413 16 QEESITVQTMMNTLR Unmodified 1779.8495 0.8495193 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 2 2 2 2 1 1 123.09 123.09 2;3 3.1911E-79 127348 QUIQUE_C1277_190116_001 210.15 174.5 6821900000 543880000 598460000 844260000 860490000 629910000 169950000 130930000 651720000 781010000 220560000 783590000 472480000 134650000 36138 2941 33666 325178;325179;325180;325181;325182;325183;325184;325185;325186;325187;325188;325189;325190;325191;325192;325193;325194;325195;325196;325197;325198 414004;414005;414006;414007;414008;414009;414010;414011;414012;414013;414014;414015;414016;414017;414018;414019;414020;414021;414022;414023;414024;414025;414026;414027;414028;414029;414030;414031 414008 28 QEESITVQTMMNTLR 2 Oxidation (M) 1811.8393 0.83934854 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 2 0 1 1 51.786 51.786 2 1.8163E-08 49189 QUIQUE_C1368_190116_001 122.33 93.368 45298000 0 0 21599000 0 0 0 0 0 0 23699000 0 0 0 36139 2941 33666 325199;325200 414032;414033 414032 2412;2413 2 QEESLMPSQVVK Unmodified 1373.6861 0.68606601 4175 Q9H4M9;A0A024R571;C9J2Z4 EHD1 EH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 60.643 60.643 2 0.0040264 59964 QUIQUE_C1403_190116_001 70.389 55.723 176360000 0 62950000 0 54023000 0 0 0 0 31933000 0 0 0 27450000 36140 4175 33667 325201;325202;325203;325204 414034;414035;414036;414037;414038 414036 4 QEESQRPIQMVK Unmodified 1471.7453 0.74531222 4352 Q9NZN3 EHD3 EH domain-containing protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.124 22.124 2 1.3456E-08 15685 QUIQUE_C1218_190116_001 141.27 87.491 112010000 39894000 34217000 0 0 0 0 37898000 0 0 0 0 0 0 36141 4352 33668 325205;325206;325207;325208;325209;325210;325211 414039;414040;414041;414042;414043;414044;414045 414039 7 QEEVCVIDALLADIR Unmodified 1742.8873 0.88728501 3210 Q27J81;A0A0A0MQU1 INF2 Inverted formin-2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 164.22 164.22 2;3 2.8081E-06 169199 QUIQUE_C1218_190116_001 87.148 70.483 51429000 8835900 0 0 20636000 0 8903200 13054000 0 0 0 0 0 0 36142 3210 33669 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414052;414053;414054;414055;414056;414057;414058;414059;414060;414061;414062;414063;414064;414065;414066;414067;414068;414069;414070;414071;414072;414073;414074;414075;414076;414077;414078;414079;414080;414081;414082;414083;414084;414085;414086;414087;414088;414089;414090;414091;414092;414093;414094;414095;414096;414097;414098;414099;414100;414101;414102;414103;414104;414105;414106;414107;414108;414109;414110;414111;414112;414113;414114;414115;414116;414117;414118;414119;414120 414056 68 QEFEFWYPVDLR Unmodified 1627.7671 0.76709352 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 150.24 150.24 2 0.0024095 156039 QUIQUE_C1218_190116_001 97.813 72.975 62889000 0 0 28274000 19997000 0 14618000 0 0 0 0 0 0 0 36144 4389 33671 325258;325259;325260;325261;325262 414121;414122;414123;414124;414125;414126 414121 6 QEFEKQDELKR Unmodified 1448.726 0.72595699 3499;1614 O75155;Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND2;CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2;Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 no no 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 1 17.063 17.063 2;3;4 0.0036078 9310 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.5 56.987 1157500000 0 62194000 16407000 0 43489000 0 0 119940000 245370000 0 345590000 226210000 98307000 36145 1614;3499 33672 325263;325264;325265;325266;325267;325268;325269;325270;325271;325272;325273;325274;325275 414127;414128;414129;414130;414131;414132;414133;414134;414135;414136;414137;414138;414139 414137 11 QEFEVMEDHAGTYGLGDR Unmodified 2052.8847 0.88471883 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L2Z2 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 2 86.417 86.417 2;3 1.4464E-64 88747 QUIQUE_C1576_190116_001 186.68 166.29 3022600000 62318000 526140000 438210000 701400000 401200000 494200000 399170000 0 0 0 0 0 0 36146 291 33673 325276;325277;325278;325279;325280;325281;325282;325283;325284;325285;325286 414140;414141;414142;414143;414144;414145;414146;414147;414148;414149;414150;414151;414152;414153;414154 414153 15 QEFEVMEDHAGTYGLGDRK Unmodified 2180.9797 0.97968185 291 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L2Z2 MAPT Microtubule-associated protein tau yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 68.837 68.837 3;4 6.3278E-06 69391 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.511 72.059 893210000 0 0 53172000 53610000 64290000 0 0 363240000 69065000 0 91514000 0 198320000 36147 291 33674 325287;325288;325289;325290;325291;325292;325293;325294;325295 414155;414156;414157;414158;414159;414160;414161;414162;414163 414161 8 QEFFVALR Unmodified 1008.5393 0.53926584 2449 P42566;B1AUU8 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 0 0 0 1 1 90.723 90.723 2 0.0062929 92602 QUIQUE_C1368_190116_001 102.3 68.5 41244000 16791000 0 24453000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36148 2449 33675 325296;325297 414164;414165 414165 2 QEFLDKPEDVLLK Unmodified 1572.8399 0.83992412 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 90.313 90.313 3 0.012225 92513 QUIQUE_C1277_190116_001 40.278 32.822 93001000 0 26111000 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325303;325304;325305;325306;325307;325308;325309;325310;325311;325312 414172;414173;414174;414175;414176;414177;414178;414179;414180;414181;414182 414177 11 QEGIATSDNFMQAFLNVLDQCPK Unmodified 2625.2203 0.22032283 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;E9PKF8;H0YE22 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 170.96 170.96 2;3 2.6154E-143 175777 QUIQUE_C1368_190116_001 171.06 164.42 891620000 48675000 107130000 117290000 21702000 69445000 60630000 70894000 73151000 64193000 10452000 119610000 87661000 40785000 36153 798 33680 325313;325314;325315;325316;325317;325318;325319;325320;325321;325322;325323;325324;325325;325326;325327;325328;325329;325330 414183;414184;414185;414186;414187;414188;414189;414190;414191;414192;414193;414194;414195;414196;414197;414198;414199;414200;414201 414187 18 QEGIIFIGPPPSAIR Unmodified 1593.8879 0.88787736 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;G5E9X5 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.76 116.76 2 2.3625E-09 119675 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.36 129.33 870800000 82014000 75717000 81423000 62187000 63343000 73879000 69861000 48851000 66139000 24729000 66284000 63536000 92836000 36154 3933 33681 325331;325332;325333;325334;325335;325336;325337;325338;325339;325340;325341;325342;325343 414202;414203;414204;414205;414206;414207;414208;414209;414210;414211;414212;414213;414214;414215 414210 14 QEGLDGGLPEEVLFGNLDLLPPPGK Unmodified 2603.3483 0.34828376 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119;A0A087X2B6 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 168.37 168.37 2;3 1.0983E-17 169917 QUIQUE_C1563_190116_001 100.62 94.553 1363500000 92851000 167310000 151250000 98767000 120710000 49217000 75801000 72703000 0 26699000 278710000 122460000 106990000 36155 3571 33682 325344;325345;325346;325347;325348;325349;325350;325351;325352;325353;325354;325355;325356;325357;325358 414216;414217;414218;414219;414220;414221;414222;414223;414224;414225;414226;414227;414228;414229;414230 414223 14 QEGLESVLK Unmodified 1001.5393 0.53932542 2084 P14923 JUP Junction plakoglobin yes yes 0 0 0 1 57.855 57.855 2 0.024285 56790 QUIQUE_C1403_190116_001 60.118 21.312 52950000 0 0 0 52950000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36156 2084 33683 325359 414231 414231 1 QEGLTFFGTELAPVR Unmodified 1663.857 0.85697116 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 132.48 132.48 2;3 1.2207E-43 129155 QUIQUE_DMIX4_190116_001 178.71 120.01 2291900000 138060000 131390000 140070000 216630000 132820000 228960000 210650000 157130000 163800000 98702000 227500000 179810000 266380000 36157 3803 33684 325360;325361;325362;325363;325364;325365;325366;325367;325368;325369;325370;325371;325372;325373;325374 414232;414233;414234;414235;414236;414237;414238;414239;414240;414241;414242;414243;414244;414245;414246;414247;414248;414249 414245 17 QEHCSQLESHLK Unmodified 1494.6885 0.68852563 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 16.003 16.003 3 0.00061545 8588 QUIQUE_C1218_190116_001 54.823 45.035 83226000 32784000 0 50442000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36158 3108 33685 325375;325376;325377 414250;414251;414252 414250 3 QEIEAETDR Unmodified 1089.4938 0.49383179 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.274 18.274 2 0.00061838 11034 QUIQUE_C1218_190116_001 111.39 71.746 633000000 75228000 72770000 77088000 86567000 64075000 73584000 71235000 0 30610000 37115000 44724000 0 0 36159 2569 33686 325378;325379;325380;325381;325382;325383;325384;325385;325386;325387 414253;414254;414255;414256;414257;414258;414259;414260;414261;414262;414263;414264;414265 414253 13 QEIECQNQEYSLLLSIK Unmodified 2094.0303 0.030320436 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 125.29 125.29 2 8.6286E-90 122529 QUIQUE_DMIX4_190116_001 259.48 229.28 267340000 0 0 0 0 0 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325401;325402;325403;325404;325405;325406;325407;325408;325409;325410 414282;414283;414284;414285;414286;414287;414288;414289;414290;414291 414291 7 QEILAALEK Unmodified 1013.5757 0.57571092 1924 P07602;C9JIZ6;Q5BJH1 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.823 71.823 2 0.0057996 72792 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.862 44.98 5722400000 672290000 728840000 628910000 399760000 609780000 499290000 0 185260000 0 232170000 565330000 499850000 700910000 36163 1924 33690 325411;325412;325413;325414;325415;325416;325417;325418;325419;325420;325421 414292;414293;414294;414295;414296;414297;414298;414299;414300;414301;414302;414303 414301 7 QEILENKDVVVQHVHFDGLGR Unmodified 2431.2608 0.26080615 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 80.624 80.624 4;5 2.3231E-19 81695 QUIQUE_C1368_190116_001 124.31 98.07 1175300000 0 144170000 106160000 107580000 0 61401000 118740000 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325440;325441;325442;325443;325444;325445 414322;414323;414324;414325;414326;414327 414324 5 QEIQHLFR Unmodified 1069.5669 0.56687757 1869 P04844;H0Y5M1 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 38.313 38.313 3 0.023414 35048 QUIQUE_C1218_190116_001 43.246 19.092 55326000 23782000 0 31544000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36167 1869 33694 325446;325447 414328;414329 414328 2 QEISAAFK Unmodified 892.46543 0.46543219 1954 P08758;E9PHT9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.038 34.038 2 0.0064687 29576 QUIQUE_C1438_190116_001 101.64 66.538 24388000000 1235900000 1900400000 1820300000 2139800000 2135900000 1892400000 2257000000 2167200000 2009300000 1203500000 2107100000 1239500000 2279400000 36168 1954 33695 325448;325449;325450;325451;325452;325453;325454;325455;325456;325457;325458;325459;325460 414330;414331;414332;414333;414334;414335;414336;414337;414338;414339;414340;414341;414342;414343;414344 414335 15 QEISSLKDELQTALR Unmodified 1729.921 0.92102798 1111;3416 H0Y2S9;H0Y7E2;H7C3G6;J3QRL2;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 1 1 1 2 1 83.641 83.641 3;4 3.5479E-09 102884 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.63 77.691 87964000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51668000 36296000 36169 1111;3416 33696 325461;325462;325463;325464;325465 414345;414346;414347;414348;414349 414346 4 QEITDKDHTVSR Unmodified 1427.7005 0.70047052 2999 Q13464;A0A0U1RQV4 ROCK1 Rho-associated protein kinase 1 yes no 0 0 1 1 1 10.622 10.622 4 0.00026425 2987 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.288 66.876 8855300 2760700 0 0 0 0 0 0 0 0 6094600 0 0 0 36170 2999 33697 325466;325467 414350;414351 414351 2 QEIVSLFNAFGR Unmodified 1379.7197 0.7197494 3867 Q96HE7 ERO1L ERO1-like protein alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.74 135.74 2 8.1744E-07 139813 QUIQUE_C1403_190116_001 140.83 82.875 749260000 72645000 67492000 57790000 50635000 54488000 52771000 67216000 0 62952000 29600000 100110000 79133000 54422000 36171 3867 33698 325468;325469;325470;325471;325472;325473;325474;325475;325476;325477;325478;325479;325480 414352;414353;414354;414355;414356;414357;414358;414359;414360;414361;414362;414363;414364;414365;414366;414367 414357 16 QEKLEQLAR Unmodified 1113.6142 0.6142217 2851;2021 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277 SPTBN1;SPTB Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic no no 0 0 1 1 1 20.628 20.628 3 0.021496 13507 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.603 25.517 330210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 177680000 152530000 0 36172 2851;2021 33699 325481;325482 414368;414369 414368 2 QEKPAEKPAETPVATSPTATDSTSGDSSR Unmodified 2944.3898 0.38976723 2647 P54727;H0Y579 RAD23B UV excision repair protein RAD23 homolog B yes no 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 23.869 23.869 3;4 1.5748E-143 16467 QUIQUE_C1368_190116_001 200.74 191.89 2804300000 467080000 219150000 471770000 201110000 125950000 226140000 152310000 138460000 59836000 69090000 195670000 328560000 149200000 36173 2647 33700 325483;325484;325485;325486;325487;325488;325489;325490;325491;325492;325493;325494;325495;325496;325497;325498;325499;325500;325501;325502;325503;325504;325505;325506 414370;414371;414372;414373;414374;414375;414376;414377;414378;414379;414380;414381;414382;414383;414384;414385;414386;414387;414388;414389;414390;414391;414392;414393;414394;414395;414396;414397;414398;414399;414400;414401;414402 414377 32 QELAVFCSPEPPAK Unmodified 1571.7654 0.76537896 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.42 79.42 2 0.0014018 81350 QUIQUE_C1438_190116_001 75.683 58.284 350660000 0 0 81502000 78180000 80230000 0 0 0 0 0 74871000 35878000 0 36174 4600 33701 325507;325508;325509;325510;325511;325512;325513 414403;414404;414405;414406;414407;414408;414409;414410 414406 8 QELEAEYLAIFK Unmodified 1452.75 0.75004648 148 A0A0A0MRI2;Q9UNH7;G3V5X9;Q86XE0 SNX6;SNX32 Sorting nexin-6;Sorting nexin-6, N-terminally processed;Sorting nexin-32 yes no 0 0 0 1 1 136.18 136.18 2 0.0032232 132570 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.642 54.918 36577000 0 0 0 0 0 0 36577000 0 0 0 0 0 0 36175 148 33702 325514;325515 414411;414412 414412 2 QELEDLTADIK Unmodified 1273.6402 0.64016167 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 87.741 87.741 2 0.00079039 89610 QUIQUE_C1277_190116_001 109.42 60.625 278710000 75809000 57297000 37805000 52084000 0 55719000 0 0 0 0 0 0 0 36176 2721 33703 325516;325517;325518;325519;325520 414413;414414;414415;414416;414417 414414 4 QELEDLTADIKK Unmodified 1401.7351 0.73512469 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 65.847 65.847 2;3 0.00013697 65483 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.089 52.972 689450000 68489000 105490000 0 124680000 85058000 70851000 91952000 29970000 34947000 0 43809000 34209000 0 36177 2721 33704 325521;325522;325523;325524;325525;325526;325527;325528;325529;325530;325531 414418;414419;414420;414421;414422;414423;414424;414425;414426;414427;414428;414429;414430 414428 13 QELELSVK Unmodified 944.51786 0.51786169 3202;735 C9JNZ1;C9JVG3;C9JWG0;C9JQU9;C9JUW1;C9JTZ5;F2Z3H1;C9J3M0;F2Z3P4;F8WC70;Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7;C9J6Q0 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 46.959 46.959 2 0.037693 42450 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.999 17.552 304960000 0 120350000 0 0 0 0 0 93293000 0 91310000 0 0 0 36178 735;3202 33705 325532;325533;325534 414431;414432;414433 414433 3 QELELSVKK Unmodified 1072.6128 0.61282471 3202;735 C9JNZ1;C9JVG3;C9JWG0;C9JQU9;C9JUW1;C9JTZ5;F2Z3H1;C9J3M0;F2Z3P4;F8WC70;Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7;C9J6Q0 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase no no 0 0 1 1 25.674 25.674 3 0.036867 19721 QUIQUE_DMIX1_190116_001 31.494 10.794 77955000 0 0 0 0 0 0 0 77955000 0 0 0 0 0 36179 735;3202 33706 325535 414434;414435 414435 2 QELEQHSVDTASTSDAVTFITYVQSLK Unmodified 2996.4615 0.46147561 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 146.37 146.37 3 2.6194E-05 153502 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.12 44.187 317370000 0 0 80656000 0 0 0 0 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414461;414462;414463;414464;414465;414466;414467 414467 6 QELLELFKELHTGR Unmodified 1711.9257 0.92571943 4114 Q9H089;H7C2X7 LSG1 Large subunit GTPase 1 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 163.27 163.27 3 0.00089691 164918 QUIQUE_C1563_190116_001 58.32 47.058 25582000 0 0 0 12979000 0 12603000 0 0 0 0 0 0 0 36186 4114 33713 325565;325566;325567 414468;414469;414470 414470 3 QELLGWLAEK Unmodified 1185.6394 0.63937381 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 116.79 116.79 2 0.0025891 114272 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.08 67.552 210930000 0 30997000 37918000 34358000 0 26225000 0 0 71561000 9866000 0 0 0 36187 3037 33714 325568;325569;325570;325571;325572;325573 414471;414472;414473;414474;414475;414476;414477;414478 414478 8 QELQELNDR Unmodified 1143.552 0.55201537 2435 P41219;F8W835 PRPH Peripherin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.852 31.852 2 0.00021419 26758 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.98 53.764 646330000 0 0 160320000 0 0 63575000 0 79080000 101360000 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P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 41.406 41.406 2 0.039728 37754 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.709 25.413 145930000 0 0 0 0 0 0 0 145930000 0 0 0 0 0 36190 2524 33717 325592 414499 414499 1 QELSHALYQHDAACR Unmodified 1797.8217 0.82166506 4502 Q9UMS4;F5GY56;F5H2I0 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 26.419 26.419 2;3;4 1.4679E-185 19980 QUIQUE_C1403_190116_001 221.59 196 1391300000 169460000 214070000 105060000 106620000 98016000 75685000 113000000 143970000 74957000 15770000 95826000 80424000 98401000 36191 4502 33718 325593;325594;325595;325596;325597;325598;325599;325600;325601;325602;325603;325604;325605;325606;325607;325608;325609 414500;414501;414502;414503;414504;414505;414506;414507;414508;414509;414510;414511;414512;414513;414514;414515;414516;414517;414518 414506 19 QELTSQAER Unmodified 1060.5149 0.51490158 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 15.391 15.391 2 0.00044897 7453 QUIQUE_DMIX4_190116_001 117.72 44.848 12596000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12596000 0 0 0 36192 3091 33719 325610 414519 414519 1 QELTVFQSK Unmodified 1078.5659 0.56587452 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 52.474 52.474 2 0.053215 47379 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.85 23.436 19588000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19588000 0 0 0 36193 4606 33720 325611 414520 414520 1 QELVDAFVEHR Unmodified 1341.6677 0.66771383 1251 I3L2B0;K7EIG1;O75153 CLUH Clustered mitochondria protein homolog yes no 0 0 0 1 74.017 74.017 3 0.062957 70546 QUIQUE_DMIX4_190116_001 23.468 14.464 31580000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31580000 0 0 0 36194 1251 33721 325612 414521 414521 1 QELWQGLEELR Unmodified 1399.7096 0.70957864 3119 Q15173 PPP2R5B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit beta isoform yes yes 0 0 0 1 123.19 123.19 2 0.037572 127762 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.584 31.925 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36195 3119 33722 325613 414522 414522 1 QEMAVCPEQLSEFLDSLR Unmodified 2150.9976 0.9976401 3468 Q7Z6G3;H3BPH6 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes no 0 0 0 2 1 163.96 163.96 2;3 1.0392E-10 166968 QUIQUE_C1403_190116_001 134.04 112.35 50085000 23376000 0 0 26709000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36196 3468 33723 325614;325615;325616 414523;414524;414525 414525 2 QEMFPHDPAEALCR Unmodified 1699.7447 0.7446603 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 1 1 78.434 78.434 3 0.016957 79544 QUIQUE_C1368_190116_001 42.568 37.451 147560000 0 66747000 43950000 0 0 36865000 0 0 0 0 0 0 0 36197 3722 33724 325617;325618;325619 414526;414527;414528 414527 1 QEMGGIVTELIR Unmodified 1344.7071 0.7071358 2267 P27701;E9PJC7 CD82 CD82 antigen;Tetraspanin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.45 113.45 2 0.00044836 117389 QUIQUE_C1368_190116_001 110.39 71.611 559360000 0 76847000 99965000 62851000 49420000 72932000 71573000 0 0 0 48871000 32600000 44300000 36198 2267 33725 325620;325621;325622;325623;325624;325625;325626;325627;325628 414529;414530;414531;414532;414533;414534;414535;414536;414537;414538 414530 10 QEMLQTEGSQCAK Oxidation (M) 1524.6548 0.65484224 4443 Q9UI12;G3V126;E5RG49;E5RHH0 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.753 17.753 2 9.5792E-24 9869 QUIQUE_C1277_190116_001 174.98 146.28 220900000 25190000 24768000 19152000 18897000 24977000 15833000 19737000 0 0 12250000 23911000 14382000 21802000 36199 4443 33726 325629;325630;325631;325632;325633;325634;325635;325636;325637;325638;325639 414539;414540;414541;414542;414543;414544;414545;414546;414547;414548;414549 414540 2960 11 QEMLQTEGSQCAK Unmodified 1508.6599 0.65992761 4443 Q9UI12;G3V126;E5RG49;E5RHH0 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.361 25.361 2 1.2925E-31 18212 QUIQUE_DMIX8_190116_001 183.03 164.36 1041800000 88409000 155340000 91677000 100550000 80005000 91864000 114690000 29934000 37325000 23857000 81260000 43384000 103540000 36200 4443 33726 325640;325641;325642;325643;325644;325645;325646;325647;325648;325649;325650;325651;325652 414550;414551;414552;414553;414554;414555;414556;414557;414558;414559;414560;414561;414562;414563 414563 13 QEMQEVQSSR Unmodified 1220.5455 0.54554978 2200 P22626 HNRNPA2B1 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.506 16.506 2 0.00024608 8613 QUIQUE_C1438_190116_001 135.71 102.16 19089000000 1223300000 1865300000 1706400000 2141900000 1245800000 1320000000 1375300000 1478000000 1488300000 267050000 2056400000 1312500000 1609000000 36201 2200 33727 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STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 37.073 37.073 2 0.053305 33245 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.039 16.529 192010000 0 0 0 0 0 0 90271000 0 0 0 101740000 0 0 36225 2444 33749 325905;325906 414880;414881 414881 2 QEQLQLINNQLR Unmodified 1495.8107 0.81068967 4520 Q9UPQ0;D6RD46;E7EPK0;E9PDJ9;H0Y8P3;G5EA03 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 78.383 78.383 2 0.00051465 78141 QUIQUE_C1563_190116_001 120.31 108.84 21633000 0 0 0 0 0 21633000 0 0 0 0 0 0 0 36226 4520 33750 325907 414882 414882 1 QEQSYFVR Unmodified 1055.5036 0.50360861 1586 O60664 PLIN3 Perilipin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 37.085 37.085 2 0.02605 32620 QUIQUE_C1403_190116_001 107.59 40.912 804890000 0 0 123900000 160840000 0 0 0 233380000 0 0 286760000 0 0 36227 1586 33751 325908;325909;325910;325911 414883;414884;414885;414886 414884 1 QEQVQVLIEK Unmodified 1212.6714 0.67140222 4250 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124.31 2 0.00041511 128149 QUIQUE_C1277_190116_001 96.113 80.574 856970000 119730000 100100000 134510000 128330000 108940000 131010000 134360000 0 0 0 0 0 0 36230 4419 33754 325924;325925;325926;325927;325928;325929;325930 414900;414901;414902;414903;414904;414905;414906;414907;414908;414909 414903 9 QESIMDAGPVVVHCSAGIGR Unmodified 2081.9986 0.99864315 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 84.006 84.006 3 0.00020071 86705 QUIQUE_C1576_190116_001 47.75 38.335 289370000 0 0 0 0 91453000 0 73222000 0 43081000 0 81615000 0 0 36231 2898 33755 325931;325932;325933;325934 414910;414911;414912;414913 414911 4 QESLQAILNR Unmodified 1170.6357 0.63568542 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 78.048 78.048 2 0.0025065 78247 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.542 67.947 57360000 0 0 0 0 0 0 0 26264000 0 0 0 31095000 0 36232 1187 33756 325935;325936;325937;325938 414914;414915;414916;414917;414918;414919 414917 6 QESMPFAVVGSDK Unmodified 1393.6548 0.65476588 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 80.374 80.374 2 0.0015222 80952 QUIQUE_C1403_190116_001 79.201 65.083 330560000 98233000 0 87318000 72039000 0 72970000 0 0 0 0 0 0 0 36233 419 33757 325939;325940;325941;325942 414920;414921;414922;414923;414924;414925 414922 6 QESVDQSEEAAR Unmodified 1347.5903 0.59025137 754 C9JY79;Q9H254 SPTBN4 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 17.324 17.324 2 0.00050852 9553 QUIQUE_C1368_190116_001 119.22 94.086 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36234 754 33758 325943;325944;325945;325946 414926;414927;414928;414929 414927 4 QETDYVLNNGFNPR Unmodified 1665.7747 0.7746981 3580 Q8N3E9 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 81.145 81.145 2 4.7456E-07 83871 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.71 100 143240000 0 0 34014000 0 0 0 30210000 0 0 0 44109000 0 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414940;414941;414942;414943;414944;414945;414946;414947;414948;414949;414950;414951;414952 414945 11 QETEVELYNEFPEPIKLDK Unmodified 2320.1475 0.14745868 2576 P51149;C9J8S3;C9J4V0;C9J4S4 RAB7A Ras-related protein Rab-7a yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.92 119.92 3 0.00019602 123552 QUIQUE_C1403_190116_001 72.359 64.913 549960000 74671000 88817000 119350000 82777000 0 0 0 54159000 56176000 0 74014000 0 0 36238 2576 33762 325969;325970;325971;325972;325973;325974;325975 414953;414954;414955;414956;414957;414958;414959;414960 414956 8 QETFDAGLQAFQQEGIANITALK Unmodified 2492.2547 0.25471772 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 3 5 3 3 4 3 2 2 3 2 2 2 3 154.88 154.88 2;3 1.419E-126 159252 QUIQUE_C1218_190116_001 276.63 260.83 15464000000 1235100000 1954200000 1520900000 1177300000 1578600000 1403700000 1247700000 650250000 1116900000 788650000 983500000 864480000 943170000 36239 267;275;3025 33763 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Neural cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 35.396 35.396 2;3 2.3702E-11 34929 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.72 106.18 668350000 0 0 0 111510000 0 56675000 95978000 56206000 78911000 11947000 89244000 67085000 100800000 36242 2057 33766 326044;326045;326046;326047;326048;326049;326050;326051;326052;326053;326054 415052;415053;415054;415055;415056;415057;415058;415059;415060;415061;415062 415060 10 QETPDQVGSQR Unmodified 1243.5793 0.57929275 2868 Q02156 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes yes 0 0 0 1 17.218 17.218 2 0.023961 9469 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.426 42.65 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36243 2868 33767 326055 415063 415063 1 QETVDCLK Unmodified 991.46445 0.46444592 4533;896;803;1135 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;Q9UQM7 CAMK2D;CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.46 22.46 2 0.0079363 16239 QUIQUE_C1218_190116_001 96.19 40.686 5027500000 847800000 804860000 429190000 515140000 496430000 432530000 528210000 187670000 196280000 0 288040000 301380000 0 36244 803;896;1135;4533 33768 326056;326057;326058;326059;326060;326061;326062;326063;326064;326065;326066 415064;415065;415066;415067;415068;415069;415070;415071;415072;415073;415074 415064 11 QETVDCLKK Unmodified 1119.5594 0.55940893 4533;896;803;1135 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;Q9UQM7 CAMK2D;CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha no no 0 0 1 1 1 14.57 14.57 3 0.0086772 6454 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.461 29.019 114160000 0 0 0 0 0 0 0 17039000 0 97124000 0 0 0 36245 803;896;1135;4533 33769 326067;326068 415075;415076 415076 2 QETVECLK Unmodified 1005.4801 0.48009598 3010 Q13554;H7BXS4;H7BZC6 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.157 22.157 2 0.0047749 15514 QUIQUE_C1438_190116_001 107.9 49.728 2360200000 659800000 603340000 0 518330000 386230000 0 0 0 0 0 0 0 192550000 36246 3010 33770 326069;326070;326071;326072;326073 415077;415078;415079;415080;415081;415082 415080 5 QETVECLKK Unmodified 1133.5751 0.575059 3010 Q13554;H7BXS4;H7BZC6 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 0 0 1 1 14.155 14.155 3 0.02377 6130 QUIQUE_DMIX4_190116_001 35.908 9.1188 30488000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30488000 0 0 0 36247 3010 33771 326074 415083 415083 1 QETVECLR Unmodified 1033.4862 0.48624399 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.536 25.536 2 0.00077091 19406 QUIQUE_DMIX4_190116_001 149.4 68.938 3204200000 300570000 367830000 297310000 348510000 0 274780000 379700000 209980000 294150000 137510000 0 287530000 306310000 36248 412;3299 33772 326075;326076;326077;326078;326079;326080;326081;326082;326083;326084;326085 415084;415085;415086;415087;415088;415089;415090;415091;415092;415093;415094;415095 415093 8 QEVINELFYTER Unmodified 1539.7569 0.75692277 4354 Q9NZN5;E9PMR6 ARHGEF12 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 yes no 0 0 0 1 1 108.03 108.03 2 0.0045725 110895 QUIQUE_C1403_190116_001 79.693 53.755 23140000 0 0 0 23140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36249 4354 33773 326086;326087 415096;415097 415096 2 QEVLQETFIR Unmodified 1261.6667 0.6666512 3684 Q8TDJ6;H0YLM8 DMXL2 DmX-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 80.168 80.168 2 0.011602 82410 QUIQUE_C1218_190116_001 79.986 24.455 93065000 54274000 0 0 0 38791000 0 0 0 0 0 0 0 0 36250 3684 33774 326088;326089;326090;326091 415098;415099;415100;415101 415098 4 QEVPIIIVFR Unmodified 1212.723 0.72304386 378 C9J4M6;A0A1W2PPT5;C9J2Y9;P30876 POLR2B DNA-directed RNA polymerase;DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 yes no 0 0 0 1 1 1 124.37 124.37 2 0.016823 130064 QUIQUE_C1218_190116_001 78.516 59.736 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36251 378 33775 326092;326093;326094 415102;415103;415104 415102 3 QEVPSWLENMAYEHHYK Unmodified 2159.9735 0.97347426 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A0J9YVQ7;A0A087WVZ1;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.944 95.944 4 0.00027917 98071 QUIQUE_DMIX8_190116_001 46.543 36.885 280920000 22282000 32881000 46329000 32032000 28531000 0 41638000 0 0 0 0 40543000 36682000 36252 266;1504 33776 326095;326096;326097;326098;326099;326100;326101;326102 415105;415106;415107;415108;415109;415110;415111;415112 415112 8 QEVQDLQASLK Unmodified 1257.6565 0.65648044 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 54.852 54.852 2 0.0078214 51967 QUIQUE_C1563_190116_001 72.478 32.477 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36253 3108 33777 326103;326104 415113;415114 415113 2 QEVQDLQASLKEEK Unmodified 1643.8366 0.83662965 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 47.346 47.346 3 0.003252 44682 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.939 57.185 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36254 3108 33778 326105;326106;326107;326108 415115;415116;415117;415118 415117 4 QEVQNLIK Unmodified 970.54475 0.54474515 3051 Q14195 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.297 37.297 2 0.00095814 32696 QUIQUE_C1368_190116_001 147.34 48.835 20559000000 1472900000 1370700000 1831900000 1791500000 1164700000 1154300000 1930300000 1183400000 2011500000 1058200000 1694400000 1590000000 2305600000 36255 3051 33779 326109;326110;326111;326112;326113;326114;326115;326116;326117;326118;326119;326120;326121 415119;415120;415121;415122;415123;415124;415125;415126;415127;415128;415129;415130;415131;415132;415133;415134;415135;415136;415137;415138;415139;415140;415141 415124 19 QEYALAMIQCK Unmodified 1353.6421 0.64209271 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.024 83.024 2 1.711E-05 85690 QUIQUE_C1438_190116_001 141.2 113.89 1296400000 130860000 186070000 116340000 0 116210000 112540000 138270000 58923000 72876000 28232000 120140000 109190000 106750000 36256 4443 33780 326122;326123;326124;326125;326126;326127;326128;326129;326130;326131;326132;326133;326134 415142;415143;415144;415145;415146;415147;415148;415149;415150;415151;415152;415153;415154;415155 415146 14 QEYALAMIQCK Oxidation (M) 1369.637 0.63700733 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 1 0 1 1 1 1 58.988 58.988 2 0.0035283 58003 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.043 63.879 39755000 0 0 0 0 19387000 0 0 0 0 0 0 20368000 0 36257 4443 33780 326135;326136;326137;326138 415156;415157;415158;415159 415159 2961 4 QEYDEAGPSIVHR Unmodified 1499.7005 0.70047052 2792;2759;548 A6NL76;P62736;P68032;P68133 ACTA1;ACTA2;ACTC1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 38.499 38.499 2;3 1.4473E-17 35529 QUIQUE_C1218_190116_001 177.44 161.55 5678200000 658000000 1196400000 475220000 520040000 884790000 137090000 533410000 199300000 269410000 179310000 56860000 435040000 133350000 36258 548;2759;2792 33781 326139;326140;326141;326142;326143;326144;326145;326146;326147;326148;326149;326150;326151;326152;326153;326154;326155;326156;326157;326158;326159;326160;326161;326162;326163;326164 415160;415161;415162;415163;415164;415165;415166;415167;415168;415169;415170;415171;415172;415173;415174;415175;415176;415177;415178;415179;415180;415181;415182;415183;415184;415185;415186;415187;415188;415189;415190;415191;415192;415193;415194;415195;415196 415161 37 QEYDESGPSIVHR Unmodified 1515.6954 0.69538514 2788;2696;526;3401;1984 P60709;A0A2R8YFE2;P63261;A5A3E0;P0CG39;Q6S8J3 ACTB;ACTG1;POTEF;POTEJ;POTEE Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;POTE ankyrin domain family member F;POTE ankyrin domain family member J;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 0 4 5 4 5 2 4 6 3 4 4 4 3 3 35.587 35.587 1;2;3 2.2248E-158 30626 QUIQUE_C1576_190116_001 211.96 197.93 310700000000 26657000000 26484000000 24681000000 28443000000 23906000000 23708000000 22507000000 20265000000 21794000000 12477000000 30990000000 23373000000 25411000000 36259 2696;2788;526;1984;3401 33782 326165;326166;326167;326168;326169;326170;326171;326172;326173;326174;326175;326176;326177;326178;326179;326180;326181;326182;326183;326184;326185;326186;326187;326188;326189;326190;326191;326192;326193;326194;326195;326196;326197;326198;326199;326200;326201;326202;326203;326204;326205;326206;326207;326208;326209;326210;326211;326212;326213;326214;326215 415197;415198;415199;415200;415201;415202;415203;415204;415205;415206;415207;415208;415209;415210;415211;415212;415213;415214;415215;415216;415217;415218;415219;415220;415221;415222;415223;415224;415225;415226;415227;415228;415229;415230;415231;415232;415233;415234;415235;415236;415237;415238;415239;415240;415241;415242;415243;415244;415245;415246;415247;415248;415249;415250;415251;415252;415253;415254;415255;415256;415257;415258;415259;415260;415261;415262;415263;415264;415265;415266;415267;415268;415269;415270;415271;415272;415273;415274;415275;415276;415277;415278;415279;415280;415281;415282;415283;415284;415285;415286;415287;415288;415289;415290;415291;415292;415293;415294;415295;415296;415297;415298;415299;415300;415301;415302;415303;415304;415305;415306;415307;415308;415309;415310;415311;415312;415313;415314;415315;415316;415317;415318;415319;415320;415321;415322;415323;415324;415325;415326;415327;415328;415329;415330;415331 415264 130 QEYDESGPSIVHRK Unmodified 1643.7903 0.79034816 2788;2696;526;3401;1984 P60709;A0A2R8YFE2;P63261;A5A3E0;P0CG39;Q6S8J3 ACTB;ACTG1;POTEF;POTEJ;POTEE Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;POTE ankyrin domain family member F;POTE ankyrin domain family member J;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 1 3 3 1 3 3 21.025 21.025 2;3;4 6.7726E-58 14118 QUIQUE_DMIX7_190116_001 197.31 165.31 1327900000 0 0 0 0 0 0 0 506180000 208660000 0 72305000 314580000 226140000 36260 2696;2788;526;1984;3401 33783 326216;326217;326218;326219;326220;326221;326222;326223;326224;326225;326226;326227;326228 415332;415333;415334;415335;415336;415337;415338;415339;415340;415341;415342;415343;415344;415345 415341 14 QEYEQLIAK Unmodified 1120.5764 0.57643921 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.943 50.943 2 4.3078E-05 48514 QUIQUE_DMIX7_190116_001 147.19 106.92 2353700000 151480000 164740000 0 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415356;415357;415358;415359;415360;415361;415362;415363;415364;415365;415366;415367;415368;415369;415370;415371;415372;415373;415374;415375;415376;415377 415357 20 QEYLDTLYR Unmodified 1199.5823 0.58225287 2690 P60228;E5RGA2;H0YBR5 EIF3E Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 78.898 78.898 2 0.0010925 79755 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.93 91.775 298680000 62422000 55434000 0 52736000 0 0 0 36366000 38883000 0 52839000 0 0 36263 2690 33786 326256;326257;326258;326259;326260;326261 415378;415379;415380;415381;415382;415383;415384 415383 7 QEYLEVQR Unmodified 1063.5298 0.52982336 1464 O14964;I3L1E3 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 0 1 1 1 38.823 38.823 2 0.0036033 34973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.91 78.411 145230000 0 0 0 55446000 0 0 37165000 0 0 0 52624000 0 0 36264 1464 33787 326262;326263;326264 415385;415386;415387 415387 3 QEYVLTQQGFIYQGSAK Unmodified 1958.9738 0.97379183 2190 P21980;A2A299 TGM2 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415394;415395;415396;415397;415398;415399;415400;415401;415402;415403;415404;415405;415406 415401 13 QFAALVASK Unmodified 933.52837 0.5283668 3954 Q99460;A0A087WW66;C9J9M4 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 44.88 44.88 2 0.012807 41689 QUIQUE_C1368_190116_001 70.816 40.204 458890000 0 0 79470000 0 66308000 0 0 63758000 60197000 34313000 76375000 0 78465000 36268 3954 33791 326281;326282;326283;326284;326285;326286;326287;326288 415407;415408;415409;415410;415411;415412;415413;415414;415415;415416;415417;415418;415419 415407 13 QFAEENGLLFLEASAK Unmodified 1765.8887 0.88866522 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 0 0 2 3 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 133.34 133.34 2 3.0635E-10 137206 QUIQUE_C1277_190116_001 161.48 134 618120000 49607000 63388000 56950000 45937000 0 63569000 46266000 59326000 63048000 0 64046000 57745000 48241000 36269 2713 33792 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0 0 0 1 55.243 55.243 2 0.053497 54072 QUIQUE_C1368_190116_001 86.833 61.006 220130000 0 0 220130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36271 2058 33794 326323 415462 415462 0 QFAGPHFAAVNSNNEIIITDFHNHSVK Unmodified 3006.4737 0.47365247 4091 Q9C040;A0A0J9YY97 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 3 90.546 90.546 3;4;5 7.0386E-24 93684 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.679 91.06 662730000 0 0 0 0 0 98906000 0 106220000 85884000 0 371710000 0 0 36272 4091 33795 326324;326325;326326;326327;326328;326329 415463;415464;415465;415466;415467;415468;415469 415468 6 QFAPEYEK Unmodified 1010.4709 0.4709115 2059 P13667;C9JMN9 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes no 0 0 0 1 32.751 32.751 2 0.037522 26553 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.107 46.445 42587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42587000 0 0 0 36273 2059 33796 326330 415470 415470 1 QFAPIHAEAPEFMEMSVEQEILVTGIK 2 Oxidation (M) 3075.4933 0.49330979 1900 P06576;H0YH81;F8W079 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 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415519;415520;415521;415522;415523;415524;415525;415526;415527;415528;415529;415530;415531;415532;415533;415534;415535;415536;415537;415538;415539;415540;415541;415542;415543;415544;415545;415546;415547;415548;415549;415550;415551;415552;415553;415554;415555;415556;415557;415558;415559;415560;415561;415562;415563;415564;415565;415566;415567;415568;415569;415570;415571;415572;415573;415574;415575;415576;415577;415578;415579;415580;415581;415582;415583;415584;415585;415586;415587;415588;415589;415590;415591;415592;415593;415594;415595;415596;415597;415598;415599;415600;415601;415602;415603;415604;415605;415606;415607;415608;415609;415610 415529 87 QFAQALR Unmodified 832.45554 0.45553621 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 27.701 27.701 2 0.0099252 21259 QUIQUE_C1277_190116_001 142.63 77.367 258240000 0 103240000 0 0 0 0 0 108070000 0 46939000 0 0 0 36277 1594 33798 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415663;415664;415665;415666;415667;415668;415669;415670 415663 7 QFDSPMPSPFQGGSFTLPLDVMK Unmodified 2525.1971 0.19706819 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 1 163.14 163.14 2;3 1.6447E-13 166953 QUIQUE_C1277_190116_001 120.66 105.28 931280000 70387000 99516000 24991000 149430000 104470000 80569000 0 33707000 117250000 0 138650000 41775000 70537000 36282 2009 33803 326467;326468;326469;326470;326471;326472;326473;326474;326475;326476;326477;326478;326479;326480;326481;326482;326483 415671;415672;415673;415674;415675;415676;415677;415678;415679;415680;415681;415682;415683;415684;415685;415686;415687;415688;415689;415690;415691;415692 415672 20 QFDSPMPSPFQGGSFTLPLDVMK Oxidation (M) 2541.192 0.19198281 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 1 0 1 2 1 1 154.28 154.28 2;3 6.4244E-06 156777 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.08 66.532 96534000 0 33681000 0 45273000 0 0 0 17580000 0 0 0 0 0 36283 2009 33803 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Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 42.075 42.075 2;3 6.4333E-132 37472 QUIQUE_DMIX8_190116_001 250.7 235.16 4399100000 0 40870000 0 26003000 299100000 0 51717000 1055700000 766100000 0 806900000 656180000 696520000 36285 3171 33805 326517;326518;326519;326520;326521;326522;326523;326524;326525;326526;326527;326528;326529;326530;326531 415731;415732;415733;415734;415735;415736;415737;415738;415739;415740;415741;415742;415743;415744;415745;415746 415746 13 QFEDELHPDLK Unmodified 1369.6514 0.65139506 4587 Q9Y3C6 PPIL1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.78 59.78 2;3 5.1931E-08 58824 QUIQUE_C1277_190116_001 150.61 120.35 1218200000 268780000 90561000 0 197000000 65707000 80598000 75734000 181250000 0 0 115240000 76634000 66736000 36286 4587 33806 326532;326533;326534;326535;326536;326537;326538;326539;326540;326541;326542 415747;415748;415749;415750;415751;415752;415753;415754;415755;415756;415757;415758 415750 10 QFEDLNR Unmodified 920.43519 0.4351947 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 29.411 29.411 2 0.069659 24134 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.803 43.032 114890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 114890000 0 0 36287 2142 33807 326543 415759 415759 1 QFEEIWER Unmodified 1135.5298 0.52982336 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 85.035 85.035 2 0.03941 87174 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.91 45.529 60912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17091000 43821000 0 0 36288 153 33808 326544;326545 415760;415761 415761 2 QFEGLADKLSFGLEDEPLETATK Unmodified 2537.2537 0.25371467 1696 O94905;E5RHW4 ERLIN2 Erlin-2 yes no 0 0 1 1 134.61 134.61 3 5.7308E-06 137401 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.634 54.174 79718000 0 0 0 0 0 0 0 79718000 0 0 0 0 0 36289 1696 33809 326546 415762 415762 1 QFEGSTSFVR Unmodified 1156.5513 0.55128709 3653 Q8NFX7 STXBP6 Syntaxin-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 50.235 50.235 2 0.0017819 47883 QUIQUE_C1277_190116_001 93.598 73.459 694940000 0 245720000 0 0 0 0 0 167380000 0 69589000 212250000 0 0 36290 3653 33810 326547;326548;326549;326550 415763;415764;415765;415766 415763 3 QFEHLDPQNQHTFEAR Unmodified 1995.9187 0.91873657 2877 Q02818;C9JKZ2 NUCB1 Nucleobindin-1 yes no 0 0 0 1 1 45.603 45.603 4 0.020521 42279 QUIQUE_C1438_190116_001 23.527 17.304 107550000 42899000 0 0 0 64655000 0 0 0 0 0 0 0 0 36291 2877 33811 326551;326552 415767;415768 415768 2 QFELSEQTK Unmodified 1108.5401 0.5400537 833 H0YBX2;G5EA19;U3KQS5;E5RG17;Q6P1N9;E5RG62;E5RK70;E5RGF2;A0A0D9SGD3 TATDN1 Putative deoxyribonuclease TATDN1 yes no 0 0 0 1 36.714 36.714 2 0.014378 32852 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.625 46.239 30328000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30328000 36292 833 33812 326553 415769 415769 1 QFFEIQSK Unmodified 1025.5182 0.51819605 3825 Q96CV9 OPTN Optineurin yes yes 0 0 0 1 63.998 63.998 2 0.042869 63187 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111560000 92318000 36296 1242;2047 33816 326558;326559;326560;326561;326562;326563;326564;326565;326566;326567;326568;326569 415774;415775;415776;415777;415778;415779;415780;415781;415782;415783;415784;415785;415786;415787 415782 13 QFGIVTIGEEK Unmodified 1219.6449 0.64485312 2590 P51674;D6R9D2 GPM6A Neuronal membrane glycoprotein M6-a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.138 82.138 2 4.141E-05 83527 QUIQUE_C1277_190116_001 138.08 117.13 22828000000 1713100000 2103300000 2452900000 1749700000 1788300000 1542600000 2397600000 1206300000 1607500000 1075500000 1810600000 1637700000 1742700000 36297 2590 33817 326570;326571;326572;326573;326574;326575;326576;326577;326578;326579;326580;326581;326582 415788;415789;415790;415791;415792;415793;415794;415795;415796;415797;415798;415799;415800;415801;415802;415803;415804 415789 17 QFGIVTIGEEKK Unmodified 1347.7398 0.73981614 2590 P51674;D6R9D2 GPM6A Neuronal membrane glycoprotein M6-a yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 56.87 56.87 2;3 3.2464E-12 55185 QUIQUE_DMIX7_190116_001 166.69 136.37 4403800000 272810000 381130000 547380000 340260000 0 185520000 156420000 358110000 418910000 135270000 618340000 547360000 442260000 36298 2590 33818 326583;326584;326585;326586;326587;326588;326589;326590;326591;326592;326593;326594;326595;326596;326597;326598;326599;326600;326601;326602;326603;326604;326605 415805;415806;415807;415808;415809;415810;415811;415812;415813;415814;415815;415816;415817;415818;415819;415820;415821;415822;415823;415824;415825;415826;415827 415825 11 QFGLTTSIPFR Unmodified 1265.6768 0.67682195 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.06 110.06 2 0.0010057 115067 QUIQUE_C1438_190116_001 91.584 75.922 271590000 31690000 24848000 30818000 24122000 41423000 25947000 0 0 27425000 0 28045000 37270000 0 36299 2225 33819 326606;326607;326608;326609;326610;326611;326612;326613;326614 415828;415829;415830;415831;415832;415833;415834;415835;415836 415832 8 QFGPLVR Unmodified 815.46537 0.46537261 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 0 1 1 47.135 47.135 2 0.05653 44475 QUIQUE_C1403_190116_001 71.359 47.387 399360000 0 0 0 166050000 0 0 0 0 0 0 233310000 0 0 36300 2176 33820 326615;326616 415837;415838 415837 2 QFGPTFALDTVHVDPVIR Unmodified 2011.0527 0.052710858 3491 Q86UT6;C9JLK8;C9JQE9;C9J0R6 NLRX1 NLR family member X1 yes no 0 0 0 1 125.22 125.22 3 0.06438 127770 QUIQUE_C1563_190116_001 38.227 33.61 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36301 3491 33821 326617 415839 415839 1 QFGVAPFTIAR Unmodified 1205.6557 0.65569258 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 100.65 100.65 2 0.00047426 103268 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.06 67.254 159240000 0 0 0 0 0 0 0 82950000 0 0 0 0 76285000 36302 2037 33822 326618;326619 415840;415841 415841 2 QFHIIVCGLDSIIAR Unmodified 1740.9345 0.93450998 3664 Q8TBC4;F8W8D4 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 126.88 126.88 3 9.9345E-19 130305 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.42 97.363 212690000 17165000 32126000 0 16012000 0 0 25451000 26352000 20984000 0 0 27998000 46599000 36303 3664 33823 326620;326621;326622;326623;326624;326625;326626;326627;326628;326629 415842;415843;415844;415845;415846;415847;415848;415849;415850;415851 415846 7 QFHLTDDDLLR Unmodified 1371.6783 0.67827852 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes no 0 0 0 1 1 83.355 83.355 3 0.032619 85450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.544 19.191 33591000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14882000 18708000 0 0 36304 2887 33824 326630;326631 415852;415853 415853 2 QFIAAQGSSR Unmodified 1063.5411 0.54105675 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 21.632 21.632 2 0.0027576 14956 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.136 57.063 165370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 165370000 0 0 36305 1929 33825 326632 415854 415854 1 QFIDSNPNQPLVILEMESGASAK Unmodified 2487.2315 0.23153944 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 143.22 143.22 2;3 6.8617E-161 148995 QUIQUE_C1218_190116_001 232.28 208.44 2296700000 172220000 179300000 188650000 182070000 203920000 155380000 160460000 187450000 207740000 71810000 185180000 183140000 219390000 36306 2533 33826 326633;326634;326635;326636;326637;326638;326639;326640;326641;326642;326643;326644;326645;326646;326647;326648;326649;326650;326651;326652;326653;326654;326655;326656;326657;326658 415855;415856;415857;415858;415859;415860;415861;415862;415863;415864;415865;415866;415867;415868;415869;415870;415871;415872;415873;415874;415875;415876;415877;415878;415879;415880;415881;415882;415883;415884;415885;415886;415887;415888;415889;415890;415891;415892 415856 37 QFILVMNALDNR Unmodified 1432.7497 0.74966932 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 123.49 123.49 2 0.016069 128291 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.353 31.502 65914000 0 0 0 0 0 0 0 0 65914000 0 0 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1 1 1 1 1 1 1 151.02 151.02 2 1.7982E-07 153866 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.76 119.48 711180000 45260000 0 58897000 45209000 56882000 0 88018000 69574000 106150000 16742000 88088000 54415000 81939000 36310 2427 33830 326672;326673;326674;326675;326676;326677;326678;326679;326680;326681;326682;326683 415909;415910;415911;415912;415913;415914;415915;415916;415917;415918;415919;415920;415921 415915 13 QFLDFGR Unmodified 881.43955 0.43955179 3113 Q15120 PDK3 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 84.433 84.433 2 0.022911 85863 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.21 56.681 65042000 20040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21945000 0 23057000 36311 3113 33831 326684;326685;326686 415922;415923;415924 415924 3 QFLDYFK Unmodified 959.47527 0.4752686 2197 P22314;Q5JRR6 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.83 106.83 2 0.024917 108951 QUIQUE_C1563_190116_001 97.068 62.815 4553800000 425560000 369650000 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O60749 SNX2 Sorting nexin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 3 1 1 70.526 70.526 2 0.0031639 71378 QUIQUE_C1438_190116_001 85.862 45.51 1052600000 92820000 0 93479000 98325000 111410000 85843000 98489000 87782000 94548000 28252000 0 109930000 151740000 36314 1590 33834 326710;326711;326712;326713;326714;326715;326716;326717;326718;326719;326720;326721;326722 415950;415951;415952;415953;415954;415955;415956;415957;415958;415959;415960;415961;415962 415953 12 QFLEVWEK Unmodified 1077.5495 0.54949617 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.34 92.34 2 0.0039847 95785 QUIQUE_C1438_190116_001 110.81 77.257 1141100000 90946000 82227000 72781000 87852000 86553000 76637000 100930000 0 120950000 56647000 154310000 102390000 108840000 36315 727 33835 326723;326724;326725;326726;326727;326728;326729;326730;326731;326732;326733;326734 415963;415964;415965;415966;415967;415968;415969;415970;415971;415972;415973;415974;415975;415976 415968 14 QFLFRPWDVTK Unmodified 1435.7612 0.76122028 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 1 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 103.67 103.67 2;3 5.8281E-99 108178 QUIQUE_C1218_190116_001 244.24 191.45 11540000000 854790000 1065400000 779430000 836640000 1058300000 722740000 1025800000 898330000 882820000 298810000 1092900000 888980000 1134900000 36316 2197 33836 326735;326736;326737;326738;326739;326740;326741;326742;326743;326744;326745;326746;326747;326748;326749;326750;326751;326752;326753;326754;326755;326756;326757;326758;326759;326760;326761 415977;415978;415979;415980;415981;415982;415983;415984;415985;415986;415987;415988;415989;415990;415991;415992;415993;415994;415995;415996;415997;415998;415999;416000;416001;416002;416003;416004;416005;416006;416007;416008;416009;416010;416011;416012;416013;416014;416015;416016;416017;416018;416019 415980 43 QFLICSICLER Unmodified 1437.7108 0.71084097 4091 Q9C040;A0A0J9YX34;A0A0J9YW70;C9JVI3;A0A0J9YXY2 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 117.13 117.13 2 0.001687 122577 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83 62.13 161440000 0 0 0 0 0 52674000 41470000 0 30287000 0 37010000 0 0 36317 4091 33837 326762;326763;326764;326765 416020;416021;416022;416023;416024 416024 5 QFLLFLTGSDR Unmodified 1295.6874 0.68738664 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 134.06 134.06 2 0.0011548 130139 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.247 77.4 12161000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12161000 0 0 0 36318 3270 33838 326766 416025 416025 1 QFLMSDKPLHLEASLDK Unmodified 1971.0135 0.013548159 2528;1150 P49407;E9PM35;H0YET9 ARRB1 Beta-arrestin-1 no no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 87.242 87.242 3;4 0.0002457 88793 QUIQUE_C1277_190116_001 83.253 61.412 921940000 202920000 197140000 0 93317000 55249000 101080000 66752000 62958000 56295000 49322000 0 0 36915000 36319 2528;1150 33839 326767;326768;326769;326770;326771;326772;326773;326774;326775;326776;326777;326778;326779;326780;326781 416026;416027;416028;416029;416030;416031;416032;416033;416034;416035;416036;416037;416038;416039;416040;416041;416042 416030 17 QFLPFLQR Unmodified 1047.5866 0.58655038 3432 Q7KZF4;H7C597 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.1 111.1 2 0.0019639 114532 QUIQUE_C1403_190116_001 161.47 105.35 938050000 54784000 73699000 69437000 66195000 74222000 25087000 80571000 74164000 92418000 30034000 116550000 83960000 96934000 36320 3432 33840 326782;326783;326784;326785;326786;326787;326788;326789;326790;326791;326792;326793;326794 416043;416044;416045;416046;416047;416048;416049;416050;416051;416052;416053;416054;416055 416046 12 QFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSK Unmodified 2712.3283 0.3282766 1917 P07237;H7BZ94;I3L312;I3L398;I3L3U6 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 2 1 162.5 162.5 2;3 2.2592E-83 166215 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416083;416084;416085;416086;416087;416088;416089;416090;416091;416092;416093;416094;416095;416096;416097;416098;416099 416094 16 QFLSETEK Unmodified 980.48148 0.48147619 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.237 28.237 1;2 0.0033724 21861 QUIQUE_C1563_190116_001 132.08 93.951 52837000000 5098600000 5398100000 3417500000 4330700000 4215000000 3219300000 4432200000 3749800000 3773900000 1696500000 4471200000 4273800000 4760800000 36323 1976 33843 326830;326831;326832;326833;326834;326835;326836;326837;326838;326839;326840;326841;326842;326843 416100;416101;416102;416103;416104;416105;416106;416107;416108;416109;416110;416111;416112;416113;416114;416115;416116;416117;416118;416119;416120;416121;416122 416109 22 QFLSETEKMSPEDR Oxidation (M) 1711.7723 0.77231483 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 1 1 1 33.257 33.257 2 0.03106 28564 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.845 59.331 20050000 0 0 0 0 0 0 0 20050000 0 0 0 0 0 36324 1976 33844 326844 416123 416123 0 QFLSQFEMQSR Unmodified 1399.6554 0.65543458 1068 F8WJN3;Q16630 CPSF6 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 92.443 92.443 2 0.0024031 94814 QUIQUE_C1368_190116_001 78.556 48.302 141810000 0 0 56602000 36029000 0 0 0 0 0 0 0 49179000 0 36325 1068 33845 326845;326846;326847;326848 416124;416125;416126;416127 416124 4 QFLTQLMQK Unmodified 1135.606 0.6059652 3141 Q15459 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 87.675 87.675 2 0.0075799 90014 QUIQUE_C1576_190116_001 81.191 48.581 52726000 0 0 0 0 0 25066000 27660000 0 0 0 0 0 0 36326 3141 33846 326849;326850;326851;326852;326853 416128;416129;416130;416131;416132 416130 5 QFLWSFR Unmodified 982.50249 0.5024864 270 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channel subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 116.73 116.73 3 5.7286E-06 120312 QUIQUE_C1403_190116_001 95.767 87.166 182890000 0 47870000 0 57994000 0 38199000 0 0 0 0 38824000 0 0 36329 2985 33849 326869;326870;326871;326872 416152;416153;416154;416155 416153 4 QFNYTHICAGASAFGK Unmodified 1770.8148 0.81478877 2067 P13804;H0YLU7;H0YNX6;H0YL12;H0YKF0 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 74.001 74.001 2;3 2.2387E-13 74493 QUIQUE_C1368_190116_001 155.08 136.34 2038100000 0 151980000 176270000 144100000 290760000 90560000 182550000 192770000 90724000 86947000 309280000 202620000 119560000 36330 2067 33850 326873;326874;326875;326876;326877;326878;326879;326880;326881;326882;326883;326884;326885;326886;326887;326888;326889;326890;326891;326892;326893 416156;416157;416158;416159;416160;416161;416162;416163;416164;416165;416166;416167;416168;416169;416170;416171;416172;416173;416174;416175;416176;416177;416178;416179;416180 416159 25 QFPILLDFK Unmodified 1119.6328 0.63283187 1892 P05546 SERPIND1 Heparin cofactor 2 yes yes 0 0 0 1 1 136.01 136.01 2 0.025868 138829 QUIQUE_C1563_190116_001 58.981 37.053 31570000 0 18263000 0 0 0 13308000 0 0 0 0 0 0 0 36331 1892 33851 326894;326895 416181;416182 416182 2 QFQDAGHFDAENIK Unmodified 1618.7376 0.73758431 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 54.216 54.216 2;3 1.7204E-71 52420 QUIQUE_DMIX3_190116_001 237.67 201.25 13076000000 955940000 1070900000 1487900000 1264000000 1133200000 912540000 1288800000 573370000 892680000 468750000 1034500000 766730000 1226900000 36332 267;275;3025 33852 326896;326897;326898;326899;326900;326901;326902;326903;326904;326905;326906;326907;326908;326909;326910;326911;326912;326913;326914;326915;326916;326917;326918;326919 416183;416184;416185;416186;416187;416188;416189;416190;416191;416192;416193;416194;416195;416196;416197;416198;416199;416200;416201;416202;416203;416204;416205;416206;416207 416200 22 QFQDAGHFDAENIKK Unmodified 1746.8325 0.83254733 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 3 3 2 3 3 2 3 3 3 3 2 2 1 37.795 37.795 2;3;4 5.6702E-95 34316 QUIQUE_C1218_190116_001 237.53 194.23 20598000000 1807000000 2467900000 927640000 1970200000 1690800000 734540000 2272700000 2294700000 2363400000 469400000 1465800000 1016500000 1117000000 36333 267;275;3025 33853 326920;326921;326922;326923;326924;326925;326926;326927;326928;326929;326930;326931;326932;326933;326934;326935;326936;326937;326938;326939;326940;326941;326942;326943;326944;326945;326946;326947;326948;326949;326950;326951;326952 416208;416209;416210;416211;416212;416213;416214;416215;416216;416217;416218;416219;416220;416221;416222;416223;416224;416225;416226;416227;416228;416229;416230;416231;416232;416233;416234;416235;416236;416237;416238;416239;416240;416241;416242;416243;416244;416245 416210 31 QFQFTDWPEQGVPK Unmodified 1705.81 0.81002097 987;1998;2987 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9;H0Y380;Q3KPI9;F5GWR7;P23468;Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRF;PTPRD;PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F;Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.54 115.54 2 0.00030091 119442 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.05 74.907 1033200000 82777000 96167000 117580000 86261000 50156000 79989000 102060000 0 122670000 29783000 85415000 84520000 95839000 36334 1998;987;2987 33854 326953;326954;326955;326956;326957;326958;326959;326960;326961;326962;326963;326964;326965 416246;416247;416248;416249;416250;416251;416252;416253;416254;416255;416256;416257;416258;416259;416260 416260 15 QFRDPEYGEWFGYLSR Unmodified 2048.9381 0.93807503 547 A6NKZ2;P51606 RENBP N-acylglucosamine 2-epimerase yes no 0 0 1 1 1 1 1 126.95 126.95 3 2.643E-06 133030 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.361 71.971 114870000 0 0 0 0 0 0 0 35790000 24433000 0 34545000 20104000 0 36335 547 33855 326966;326967;326968;326969 416261;416262;416263;416264 416263 4 QFRPAVYAGEVER Unmodified 1520.7736 0.77357588 1760 O95848 NUDT14 Uridine diphosphate glucose pyrophosphatase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.157 50.157 3 0.0010159 48058 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.162 48.758 326120000 0 0 0 33542000 39173000 19085000 0 31691000 38096000 0 46935000 47426000 70173000 36336 1760 33856 326970;326971;326972;326973;326974;326975;326976;326977 416265;416266;416267;416268;416269;416270;416271;416272 416270 7 QFRPPMGGYCIEFPAGLIDDGETPEAAALR Unmodified 3277.5536 0.55361863 536 A6NFX8;Q9UKK9;A6NJU6;A6NCQ0;H0YEY4 NUDT5 ADP-sugar pyrophosphatase yes no 0 0 1 2 1 1 1 146.54 146.54 3 1.2221E-07 150923 QUIQUE_C1403_190116_001 56.435 45.532 234500000 0 68734000 55523000 72367000 0 0 0 0 0 0 0 0 37877000 36337 536 33857 326978;326979;326980;326981;326982 416273;416274;416275;416276;416277 416276 3 QFSANDKVYTVEK Unmodified 1527.7569 0.75692277 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 36.224 36.224 2;3 0.0018788 32504 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.63 81.066 574060000 0 0 0 0 0 0 0 274650000 153010000 0 30888000 30853000 84660000 36338 2400 33858 326983;326984;326985;326986;326987;326988;326989 416278;416279;416280;416281;416282;416283;416284 416279 7 QFSFPLSSEPFQGSYK Unmodified 1847.873 0.87301516 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 126.39 126.39 2 0.00043614 132716 QUIQUE_C1438_190116_001 86.467 72.022 1535300000 0 0 0 0 408760000 0 0 0 0 159870000 510720000 0 455910000 36339 1802 33859 326990;326991;326992;326993 416285;416286;416287;416288;416289 416285 5 QFSGDVVLTAR Unmodified 1191.6248 0.62478638 1659 O75828 CBR3 Carbonyl reductase [NADPH] 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 65.758 65.758 2 0.016843 61939 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.404 39.733 96525000 0 23701000 0 23870000 0 0 0 32738000 0 16217000 0 0 0 36340 1659 33860 326994;326995;326996;326997;326998 416290;416291;416292;416293;416294;416295 416295 6 QFSHTNAALEEVSR Unmodified 1587.7641 0.76413341 1712 O95197 RTN3 Reticulon-3 yes yes 0 0 0 2 39.564 39.564 2;3 0.0028386 35652 QUIQUE_C1403_190116_001 75.479 50.093 81652000 0 0 0 81652000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36341 1712 33861 326999;327000 416296;416297 416296 2 QFSMFLGK Unmodified 956.47897 0.47897377 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 87.374 87.374 1;2 0.0097801 90398 QUIQUE_DMIX5_190116_001 186.3 131.77 5222500000 0 0 0 461090000 854740000 0 0 1070100000 669660000 0 756350000 749250000 661270000 36342 2174 33862 327001;327002;327003;327004;327005;327006;327007;327008 416298;416299;416300;416301;416302;416303;416304;416305;416306;416307 416304 9 QFSSADEAALKEPIIK Unmodified 1745.92 0.91996535 4223 Q9HCC0;D6RD67 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 1 1 1 2 1 70.188 70.188 2;3 2.1667E-08 69940 QUIQUE_C1368_190116_001 147.33 126.33 1647900000 143450000 158120000 151980000 106300000 190070000 118610000 159440000 158460000 148980000 44433000 39001000 185560000 43460000 36343 4223 33863 327009;327010;327011;327012;327013;327014;327015;327016;327017;327018;327019;327020;327021;327022;327023;327024;327025;327026;327027;327028 416308;416309;416310;416311;416312;416313;416314;416315;416316;416317;416318;416319;416320;416321;416322;416323;416324;416325;416326;416327;416328;416329;416330;416331;416332 416313 25 QFSSSYLSR Unmodified 1073.5142 0.5141733 780 CON__P35527;P35527 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 46.708 46.708 2 0.03011 44744 QUIQUE_C1438_190116_001 56.258 33.216 47069000 0 0 0 0 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416335;416336;416337;416338;416339;416340;416341;416342;416343;416344;416345;416346;416347;416348;416349;416350;416351;416352;416353;416354;416355;416356;416357;416358;416359;416360;416361 416354 26 QFTPCQLLADHANSPNK Unmodified 1939.921 0.92104476 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.984 72.984 3 0.00052828 72973 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.803 53.757 314340000 0 0 0 0 64013000 74678000 80417000 0 0 0 50637000 0 44597000 36347 1153 33867 327056;327057;327058;327059;327060;327061 416362;416363;416364;416365;416366;416367 416367 5 QFTPCQLLADHANSPNKK Unmodified 2068.016 0.016007775 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 1 56.976 56.976 3;4 3.3465E-06 54638 QUIQUE_C1563_190116_001 100.77 77.547 3068000000 233710000 358590000 400020000 387540000 216530000 306630000 117540000 247920000 123560000 112240000 95401000 310770000 157580000 36348 1153 33868 327062;327063;327064;327065;327066;327067;327068;327069;327070;327071;327072;327073;327074;327075;327076;327077;327078;327079;327080 416368;416369;416370;416371;416372;416373;416374;416375;416376;416377;416378;416379;416380;416381;416382;416383;416384;416385;416386;416387;416388;416389;416390;416391;416392 416378 24 QFTQSPETEASADSFPDTK Unmodified 2084.9175 0.91745875 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.405 70.405 2 1.3822E-63 70531 QUIQUE_DMIX3_190116_001 182.02 143.61 391270000 0 37545000 47953000 0 38042000 41771000 0 48846000 78096000 0 0 32283000 66733000 36349 16;1475 33869 327081;327082;327083;327084;327085;327086;327087;327088 416393;416394;416395;416396;416397;416398;416399;416400;416401;416402 416399 10 QFTSSTSYNR Unmodified 1189.5364 0.53636531 1823 P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.46 22.46 2 1.255E-07 15907 QUIQUE_DMIX3_190116_001 154.28 122.32 721550000 39229000 0 0 68961000 51251000 0 80612000 84987000 44847000 0 100860000 32242000 218560000 36350 1823 33870 327089;327090;327091;327092;327093;327094;327095;327096;327097;327098;327099 416403;416404;416405;416406;416407;416408;416409;416410;416411;416412;416413;416414 416411 10 QFVFDLHSGK Unmodified 1176.5928 0.59275797 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 63.222 63.222 3 0.0026404 61663 QUIQUE_DMIX8_190116_001 55.649 43.216 97417000 0 0 0 26510000 0 0 17755000 0 0 21875000 0 0 31278000 36351 4007 33871 327100;327101;327102;327103 416415;416416;416417;416418 416418 3 QFVHLAVHAENFR Unmodified 1566.8055 0.80554471 1184 H3BNU1;Q9ULP9;H3BV07;A0A2R8Y518 TBC1D24 TBC1 domain family member 24 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 54.338 54.338 3;4 9.0664E-05 52924 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416438;416439;416440;416441;416442;416443;416444;416445;416446;416447;416448;416449;416450;416451;416452;416453;416454;416455;416456;416457;416458;416459;416460;416461;416462;416463;416464 416444 27 QFVPIKVEQIEAGTPGR Unmodified 1868.0156 0.01559707 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 83.81 83.81 2;3 0.00028544 86462 QUIQUE_C1438_190116_001 62.475 57.265 1049000000 0 52159000 0 48019000 75470000 21004000 66172000 230730000 147460000 0 41865000 189170000 176960000 36354 22 33874 327133;327134;327135;327136;327137;327138;327139;327140;327141;327142;327143;327144;327145 416465;416466;416467;416468;416469;416470;416471;416472;416473;416474;416475;416476;416477;416478 416467 11 QFVQWDELLCQLEAATQVKPAEE Unmodified 2731.3163 0.3163317 1669 O75935;X6RCK5;X6RLR1 DCTN3 Dynactin subunit 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 171.01 171.01 2;3 1.2582E-111 178299 QUIQUE_DMIX5_190116_001 262.42 226.53 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416619;416620;416621;416622;416623;416624;416625;416626;416627;416628;416629;416630;416631;416632;416633;416634;416635;416636 416628 16 QGAACNVWYLNSVEMESLTGHQAIQK Unmodified 2933.38 0.38001136 3350 Q68CZ2 TNS3 Tensin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 124.12 124.12 3 1.7732E-11 128155 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.302 75.503 216550000 67439000 0 0 0 0 0 0 0 0 27829000 71054000 0 50228000 36366 3350 33885 327275;327276;327277;327278 416637;416638;416639;416640 416640 4 QGAAIGIPYFTAYR Unmodified 1526.7882 0.78816332 2917 Q08257;A6NP24;C9JH92 CRYZ Quinone oxidoreductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 120.92 120.92 2 5.2064E-18 125080 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.71 117.44 1824600000 129480000 125690000 185460000 113840000 150150000 133980000 96018000 199240000 221960000 48239000 188420000 0 232080000 36367 2917 33886 327279;327280;327281;327282;327283;327284;327285;327286;327287;327288;327289;327290;327291 416641;416642;416643;416644;416645;416646;416647;416648;416649;416650;416651;416652;416653;416654;416655;416656;416657;416658;416659;416660;416661;416662;416663;416664;416665;416666;416667;416668;416669 416662 29 QGADTLAFMSLLEEK Unmodified 1651.8127 0.81272309 3005 Q13505 MTX1 Metaxin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 148.21 148.21 2 1.1832E-05 152415 QUIQUE_C1277_190116_001 100.02 85.342 435930000 63301000 62979000 0 53299000 0 35177000 0 55992000 69281000 14948000 80952000 0 0 36368 3005 33887 327292;327293;327294;327295;327296;327297;327298;327299 416670;416671;416672;416673;416674;416675;416676;416677 416671 7 QGADTLAYIALLEEK Unmodified 1633.8563 0.85630246 3272 Q5HYI7 MTX3 Metaxin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 138.65 138.65 2 0.0012198 142659 QUIQUE_C1403_190116_001 71.176 54.262 83400000 33229000 0 0 28038000 0 0 0 0 0 0 0 0 22133000 36369 3272 33888 327300;327301;327302;327303 416678;416679;416680;416681 416680 4 QGAFITLVAR Unmodified 1074.6186 0.61857879 1348 K7ERC8;Q06136;K7EQS7 KDSR 3-ketodihydrosphingosine reductase yes no 0 0 0 1 1 83.723 83.723 2 0.035756 84827 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.579 36.435 99592000 0 0 0 0 0 0 0 40152000 59439000 0 0 0 0 36370 1348 33889 327304;327305 416682;416683 416682 2 QGAFLVNAAR Unmodified 1045.5669 0.56687757 2682 Q5SQP8;P56545 CTBP2 C-terminal-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.178 47.178 2 0.019615 45147 QUIQUE_C1218_190116_001 60.074 29.889 191440000 47193000 42399000 0 28131000 35239000 0 0 0 0 0 0 0 38479000 36371 2682 33890 327306;327307;327308;327309;327310 416684;416685;416686;416687;416688 416684 5 QGAFLVNTAR Unmodified 1075.5774 0.57744226 2989 Q13363;H0Y8W7;H0Y9M9 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.579 45.579 2 0.0077174 42447 QUIQUE_C1403_190116_001 125.83 89.383 688130000 0 175590000 0 164140000 0 0 191030000 0 157370000 0 0 0 0 36372 2989 33891 327311;327312;327313;327314 416689;416690;416691;416692 416690 0 QGAIVAVTGDGVNDSPALK Unmodified 1810.9425 0.94249171 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 78.236 78.236 2;3 2.691E-219 79723 QUIQUE_C1218_190116_001 266.97 242.12 5352500000 370340000 357670000 768070000 443580000 405230000 292280000 453900000 360100000 419390000 211710000 507170000 302320000 460780000 36373 1872;1371;590 33892 327315;327316;327317;327318;327319;327320;327321;327322;327323;327324;327325;327326;327327;327328;327329;327330 416693;416694;416695;416696;416697;416698;416699;416700;416701;416702;416703;416704;416705;416706;416707;416708;416709;416710;416711;416712;416713 416694 21 QGAIVAVTGDGVNDSPALKK Unmodified 1939.0375 0.037454724 590;1371;1872 P05023;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 1 2 2 1 1 1 2 2 2 2 1 2 57.489 57.489 2;3 1.45E-46 56500 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.27 152.94 2257400000 0 95426000 192600000 110280000 21785000 82087000 199720000 335550000 358710000 0 434760000 33930000 392590000 36374 1872;1371;590 33893 327331;327332;327333;327334;327335;327336;327337;327338;327339;327340;327341;327342;327343;327344;327345;327346;327347;327348 416714;416715;416716;416717;416718;416719;416720;416721;416722;416723;416724;416725;416726;416727;416728;416729;416730;416731;416732 416729 17 QGANINEIR Unmodified 1013.5254 0.52540669 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.066 25.066 2 0.00045721 19235 QUIQUE_C1218_190116_001 125.31 85.247 3501200000 268150000 0 261300000 398170000 381970000 0 321750000 500160000 431350000 156470000 507230000 274650000 0 36375 3130 33894 327349;327350;327351;327352;327353;327354;327355;327356;327357;327358 416733;416734;416735;416736;416737;416738;416739;416740;416741;416742;416743 416734 11 QGAPAPPPAAR Unmodified 1031.5512 0.55122751 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 17.233 17.233 2 0.00043709 9437 QUIQUE_C1438_190116_001 103.56 84.585 956800000 91868000 82338000 109060000 90705000 69158000 102990000 82436000 100790000 57551000 0 85624000 0 84268000 36376 3452 33895 327359;327360;327361;327362;327363;327364;327365;327366;327367;327368;327369;327370 416744;416745;416746;416747;416748;416749;416750;416751;416752;416753;416754;416755;416756 416748 11 QGAPGQHSGFEYSR Unmodified 1519.6804 0.68040378 2352 P32929 CTH Cystathionine gamma-lyase yes yes 0 0 0 1 1 1 22.5 22.5 3 0.038632 15665 QUIQUE_C1563_190116_001 33.796 20.678 134750000 0 0 0 0 0 40363000 0 0 0 0 49488000 0 44901000 36377 2352 33896 327371;327372;327373 416757;416758;416759 416757 3 QGAPTSFLPPEASQLKPDR Unmodified 2038.0484 0.048353761 142 A0A0A0MRA5;B7Z4B8;Q9BUJ2;M0QYZ0;M0QYI8;M0R203;M0QZV6;M0R0K8 HNRNPUL1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.218 86.218 3 0.004106 88226 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.358 45.101 406650000 0 0 64836000 0 51403000 59544000 0 59046000 59604000 0 0 51322000 60899000 36378 142 33897 327374;327375;327376;327377;327378;327379;327380 416760;416761;416762;416763;416764;416765;416766;416767 416764 6 QGCDCECLGGGR Unmodified 1367.5017 0.50165283 4277 Q9NRX4 PHPT1 14 kDa phosphohistidine phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.215 20.215 2 3.4037E-45 12791 QUIQUE_C1368_190116_001 196.52 192.95 4982200000 284660000 433430000 549530000 365670000 302450000 425670000 496990000 385350000 409150000 110740000 389000000 296100000 533490000 36379 4277 33898 327381;327382;327383;327384;327385;327386;327387;327388;327389;327390;327391;327392;327393 416768;416769;416770;416771;416772;416773;416774;416775;416776;416777;416778;416779;416780 416770 13 QGDITEDETIR Unmodified 1275.5943 0.59427411 3498 Q86VN1;A0A3B3ISW7 VPS36 Vacuolar protein-sorting-associated protein 36 yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.857 37.857 2 0.001547 34090 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.869 59.839 62362000 0 23333000 0 0 0 0 0 0 0 0 39029000 0 0 36380 3498 33899 327394;327395;327396;327397 416781;416782;416783;416784 416784 4 QGDKEAELGLPFSPLCDR Unmodified 2030.9731 0.97313991 614 B4DK72;Q01064 PDE1B Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B yes no 0 0 1 1 105.99 105.99 3 0.0099351 109218 QUIQUE_DMIX7_190116_001 33.666 24.009 36775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36775000 0 36381 614 33900 327398 416785 416785 1 QGDLPVASFTPEER Unmodified 1544.7471 0.74708636 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.247 84.247 2 5.859E-11 85688 QUIQUE_C1277_190116_001 138.63 112.69 291440000 0 53484000 68501000 0 0 48825000 0 47282000 0 21268000 52078000 0 0 36382 3445 33901 327399;327400;327401;327402;327403;327404;327405;327406;327407 416786;416787;416788;416789;416790;416791;416792;416793;416794 416787 7 QGDNCDSIIR Unmodified 1176.5193 0.51933503 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 26.811 26.811 2 0.01326 20457 QUIQUE_C1368_190116_001 65.157 26.195 104220000 23374000 0 41618000 39229000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36383 4389 33902 327408;327409;327410 416795;416796;416797 416796 3 QGDTAILR Unmodified 872.47158 0.4715802 1175 H3BLU2;Q13449;C9J5G3 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 1 1 1 22.954 22.954 2 0.056145 15966 QUIQUE_C1563_190116_001 54.157 21.687 907570000 0 0 0 0 0 349650000 0 289530000 0 0 0 0 268400000 36384 1175 33903 327411;327412;327413 416798;416799;416800 416798 3 QGDTGDWIGTFLGHK Unmodified 1630.774 0.77396981 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.58 121.58 2;3 5.0395E-05 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52.555 41.945 190550000 33636000 46213000 0 0 28260000 0 0 0 0 15001000 67438000 0 0 36388 2387 33907 327424;327425;327426;327427;327428;327429;327430;327431;327432;327433;327434;327435 416812;416813;416814;416815;416816;416817;416818;416819;416820;416821;416822;416823 416814 11 QGEIFLLPAR Unmodified 1142.6448 0.64479354 2488 P46952;C9IY88 HAAO 3-hydroxyanthranilate 3,4-dioxygenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 97.478 97.478 2 0.0054673 99378 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.948 54.561 613130000 145120000 0 0 59181000 66930000 0 0 65197000 72201000 35116000 0 74859000 94526000 36389 2488 33908 327436;327437;327438;327439;327440;327441;327442;327443 416824;416825;416826;416827;416828;416829;416830;416831 416827 8 QGELENYVSDGYK Unmodified 1500.6733 0.67325272 4531 Q9UQB8;I3L4C2;I3L2M4;B4DWA1;I3L1C8;I3L327;I3L125;I3L4A3 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.981 73.981 2 0.0003913 74112 QUIQUE_DMIX7_190116_001 108.47 95.378 689190000 82844000 82952000 82794000 0 53693000 39109000 48581000 96433000 48262000 42417000 55425000 56685000 0 36390 4531 33909 327444;327445;327446;327447;327448;327449;327450;327451;327452;327453;327454 416832;416833;416834;416835;416836;416837;416838;416839;416840;416841;416842;416843;416844;416845 416845 14 QGEYGLASICNGGGGASAMLIQK Unmodified 2281.0831 0.083101063 2232 P24752 ACAT1 Acetyl-CoA acetyltransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 111.6 111.6 2 5.6608E-115 114324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 204.23 180.16 195640000 0 0 0 0 0 0 39687000 0 44946000 0 59897000 51108000 0 36391 2232 33910 327455;327456;327457;327458;327459;327460;327461;327462 416846;416847;416848;416849;416850;416851;416852;416853;416854 416849 8 QGEYICTLDYQR Unmodified 1544.6929 0.6929423 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 73.764 73.764 2 3.4582E-14 74586 QUIQUE_C1576_190116_001 164.66 121.92 816070000 54968000 0 79106000 90796000 67908000 70186000 80043000 83996000 64229000 24606000 70915000 59903000 69417000 36392 3362 33911 327463;327464;327465;327466;327467;327468;327469;327470;327471;327472;327473;327474;327475;327476 416855;416856;416857;416858;416859;416860;416861;416862;416863;416864;416865;416866;416867;416868;416869;416870;416871;416872;416873;416874;416875 416865 19 QGFDFLCMPVFHPR Unmodified 1749.812 0.811952 1440 O14744;G3V580;G3V2L6;C9JSX3 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 137.64 137.64 2;3 1.0086E-07 143480 QUIQUE_C1218_190116_001 127.85 116.75 924070000 72520000 85221000 79277000 66643000 74963000 59468000 87834000 54432000 80048000 22497000 84531000 71283000 85356000 36393 1440 33912 327477;327478;327479;327480;327481;327482;327483;327484;327485;327486;327487;327488;327489;327490 416876;416877;416878;416879;416880;416881;416882;416883;416884;416885;416886;416887;416888;416889;416890;416891 416876 16 QGFDFLCMPVFHPR Oxidation (M) 1765.8069 0.80686662 1440 O14744;G3V580;G3V2L6;C9JSX3 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 115.43 115.43 3 0.0093445 117856 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.28 34.812 15356000 0 0 0 0 0 0 0 15356000 0 0 0 0 0 36394 1440 33912 327491 416892 416892 803 1 QGFGELLQAVPLADSFR Unmodified 1846.9577 0.95774784 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 158.66 158.66 2;3 3.1043E-141 161091 QUIQUE_C1277_190116_001 242.07 191.28 5201400000 364230000 597000000 597680000 317030000 330650000 270650000 342810000 423110000 500700000 128310000 452080000 460300000 416890000 36395 2266 33913 327492;327493;327494;327495;327496;327497;327498;327499;327500;327501;327502;327503;327504;327505;327506;327507;327508;327509;327510;327511;327512;327513;327514;327515;327516;327517;327518;327519 416893;416894;416895;416896;416897;416898;416899;416900;416901;416902;416903;416904;416905;416906;416907;416908;416909;416910;416911;416912;416913;416914;416915;416916;416917;416918;416919;416920;416921;416922 416897 26 QGFGNLPICMAK Unmodified 1334.6475 0.64751243 2027;1005 F5H2F4;V9GYY3;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 94.952 94.952 2 0.00050259 99121 QUIQUE_C1218_190116_001 105.94 83.222 649760000 82348000 0 107420000 74373000 100300000 0 109340000 0 43717000 0 0 38936000 93322000 36396 1005;2027 33914 327520;327521;327522;327523;327524;327525;327526;327527 416923;416924;416925;416926;416927;416928;416929;416930 416923 7 QGFGNVATNTDGK Unmodified 1307.6106 0.61059288 1824 P02675;D6REL8 FGB Fibrinogen beta chain;Fibrinopeptide B;Fibrinogen beta chain yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 2 2 2 1 1 31.119 31.119 2 0.00014843 26352 QUIQUE_C1403_190116_001 116.55 98.727 5471300000 288200000 482050000 0 841550000 659160000 136520000 677110000 220310000 293650000 303070000 708080000 200880000 660770000 36397 1824 33915 327528;327529;327530;327531;327532;327533;327534;327535;327536;327537;327538;327539;327540;327541;327542;327543;327544;327545;327546 416931;416932;416933;416934;416935;416936;416937;416938;416939;416940;416941;416942;416943;416944;416945;416946;416947;416948;416949;416950 416937 20 QGFNVVVESGAGEASK Unmodified 1577.7686 0.76855009 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.672 64.672 2 0.00042796 64220 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.337 80.528 474400000 50763000 34180000 39383000 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non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.483 64.483 2 0.0034076 64893 QUIQUE_C1438_190116_001 84.498 71.509 17600000000 1029600000 1259000000 1445200000 1224200000 1681200000 1158200000 1517700000 1123800000 1409700000 578740000 2132000000 1329300000 1711000000 36400 267;275;3025 33918 327572;327573;327574;327575;327576;327577;327578;327579;327580;327581;327582;327583;327584 416977;416978;416979;416980;416981;416982;416983;416984;416985;416986;416987;416988;416989;416990;416991;416992;416993;416994;416995;416996;416997;416998 416984 22 QGFWEEFETLQQQECK Unmodified 2085.9102 0.9102053 2898 Q06124 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 141.64 141.64 2;3 2.6902E-256 148404 QUIQUE_DMIX5_190116_001 290.61 276.94 1323700000 93488000 136890000 80238000 97482000 110300000 109060000 112570000 81259000 111490000 37481000 119380000 104330000 129690000 36401 2898 33919 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33925 327679;327680;327681;327682;327683;327684;327685;327686;327687;327688;327689;327690;327691;327692 417132;417133;417134;417135;417136;417137;417138;417139;417140;417141;417142;417143;417144;417145;417146;417147;417148;417149;417150;417151;417152;417153;417154;417155;417156;417157;417158;417159;417160;417161;417162;417163 417133 32 QGGLGPMNIPLVSDPKR Oxidation (M) 1793.9458 0.94580295 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 1 1 4 3 3 2 4 70.406 70.406 2;3 1.8777E-09 70592 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.07 90.19 2586200000 0 0 0 0 0 0 0 670630000 458410000 0 475380000 375530000 606280000 36409 2904 33926 327693;327694;327695;327696;327697;327698;327699;327700;327701;327702;327703;327704;327705;327706;327707;327708 417164;417165;417166;417167;417168;417169;417170;417171;417172;417173;417174;417175;417176;417177;417178;417179;417180;417181;417182 417165 2382 17 QGGLGPMNIPLVSDPKR Unmodified 1777.9509 0.95088832 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 90.962 90.962 2;3 2.1289E-07 92690 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.8 81.187 1467300000 0 0 0 0 0 0 0 830070000 399630000 0 0 0 237590000 36410 2904 33926 327709;327710;327711;327712;327713;327714;327715 417183;417184;417185;417186;417187;417188;417189;417190 417183 7 QGGLLVNFHPSILTCLLPQLTSPR Unmodified 2660.4472 0.44722671 3499 Q86VP6;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.45 160.45 3 1.2943E-14 166282 QUIQUE_C1576_190116_001 104.41 97.138 3953800000 238240000 347060000 188020000 0 226860000 74996000 785780000 402080000 393820000 47883000 371850000 565990000 311250000 36411 3499 33927 327716;327717;327718;327719;327720;327721;327722;327723;327724;327725;327726;327727 417191;417192;417193;417194;417195;417196;417197;417198;417199;417200;417201;417202;417203;417204;417205;417206;417207;417208 417198 17 QGHDQMSSGFQHER Unmodified 1642.6907 0.69065089 4539 Q9Y250 LZTS1 Leucine zipper putative tumor suppressor 1 yes yes 0 0 0 1 1 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57681000 0 0 0 45488000 0 115580000 36415 2777 33931 327735;327736;327737;327738;327739;327740;327741;327742;327743;327744;327745;327746;327747;327748;327749;327750;327751;327752 417216;417217;417218;417219;417220;417221;417222;417223;417224;417225;417226;417227;417228;417229;417230;417231;417232;417233;417234 417231 18 QGHNSVFLIK Unmodified 1141.6244 0.62439245 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 35.757 35.757 2;3 0.0061833 30855 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.276 54.609 257170000 0 89463000 0 0 0 29401000 0 0 29721000 85321000 0 23267000 0 36416 1839 33932 327753;327754;327755;327756;327757;327758 417235;417236;417237;417238;417239;417240 417238 4 QGHSDSHYSSHSSSNTLSSNASSAHSDEK Unmodified 3030.2572 0.25718993 1511 O43166;F5GYF8 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 10.368 10.368 5 0.010172 2733 QUIQUE_C1563_190116_001 25.499 22.751 2798700 0 0 0 0 0 2798700 0 0 0 0 0 0 0 36417 1511 33933 327759 417241 417241 1 QGIEMHLFR Unmodified 1129.5702 0.57024839 2995 Q13425 SNTB2 Beta-2-syntrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 67.187 67.187 3 0.010617 64385 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.198 28.452 198570000 24098000 28774000 0 0 29362000 17847000 0 26030000 25118000 17164000 30181000 0 0 36418 2995 33934 327760;327761;327762;327763;327764;327765;327766;327767 417242;417243;417244;417245;417246;417247;417248;417249 417248 8 QGIETHLFR Unmodified 1099.5774 0.57744226 3029 Q13884 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 44.799 44.799 2;3 0.0057396 41676 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.549 38.984 270670000 60543000 75280000 0 0 0 0 0 68266000 22352000 44231000 0 0 0 36419 3029 33935 327768;327769;327770;327771;327772;327773;327774 417250;417251;417252;417253;417254;417255;417256;417257 417255 7 QGIETPEDQNDLRK Unmodified 1641.7958 0.79582747 3148 Q15637 SF1 Splicing factor 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 29.971 29.971 2;3 0.00041004 24614 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.69 94.028 708910000 59427000 55374000 0 63393000 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417558 2 QGLYELSASNFELHVAQGDHFIK Unmodified 2602.2816 0.28160117 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 117.76 117.76 4 5.1075E-11 123194 QUIQUE_C1576_190116_001 88.09 84.191 325960000 0 0 56860000 0 36453000 0 53542000 0 61088000 0 0 62154000 55862000 36443 3627 33959 327991;327992;327993;327994;327995;327996 417559;417560;417561;417562;417563;417564;417565 417562 6 QGNLSLPLNR Unmodified 1110.6146 0.61455605 3235 Q4G0N4;B7Z8V7;A0A0C4DGV3 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.336 59.336 2 0.027226 57721 QUIQUE_C1563_190116_001 76.827 46.572 701300000 0 0 146660000 0 113270000 95816000 118350000 0 0 0 0 105860000 121340000 36444 3235 33960 327997;327998;327999;328000;328001;328002 417566;417567;417568;417569;417570;417571 417568 4 QGNMTAALQAALK Unmodified 1315.6918 0.69182009 1503 O15511;B1ALC0 ARPC5 Actin-related protein 2/3 complex subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 87.745 87.745 2 0.00038719 89537 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Microtubule-associated protein RP/EB family member 3 yes no 0 0 0 1 79.745 79.745 2 2.2553E-38 76276 QUIQUE_DMIX4_190116_001 161.87 144.7 63879000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63879000 0 0 0 36452 4524 33967 328083 417690;417691 417691 2 QGQEHIGSSCSFAEQALR Unmodified 2003.9119 0.91193663 1631 O75382;A0A1W2PPI7;E9PMK8 TRIM3 Tripartite motif-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 55.973 55.973 3 0.064872 54708 QUIQUE_DMIX8_190116_001 24.3 20.638 57215000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57215000 36453 1631 33968 328084 417692 417692 0 QGQETAVAPSLVAPALNKPK Unmodified 2018.116 0.1160394 3150 Q15691 MAPRE1 Microtubule-associated protein RP/EB family member 1 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 65.697 65.697 2;3 9.5791E-17 66048 QUIQUE_C1438_190116_001 171.95 168.38 6672100000 379090000 438950000 27668000 680820000 554630000 525470000 43966000 747080000 778450000 168780000 504990000 483370000 1338900000 36454 3150 33969 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Unmodified 1179.5706 0.57064232 4715 yes no 0 0 0 1 46.969 46.969 3 0.047336 45091 QUIQUE_C1438_190116_001 33.039 15.22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 36470 4715 33983 328300 417971 417971 1 QGTFHSQQALEYGTK Unmodified 1693.806 0.80599822 2625 P53597 SUCLG1 Succinyl-CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 1 1 33.09 33.09 2;3 0 26866 QUIQUE_C1368_190116_001 339.3 310.6 5085900000 387290000 476800000 824770000 101720000 113110000 392320000 366670000 372350000 469530000 215460000 480830000 398640000 486390000 36471 2625 33984 328301;328302;328303;328304;328305;328306;328307;328308;328309;328310;328311;328312;328313;328314;328315;328316;328317;328318;328319;328320 417972;417973;417974;417975;417976;417977;417978;417979;417980;417981;417982;417983;417984;417985;417986;417987;417988;417989;417990;417991;417992 417977 20 QGTFPHGIDILTTADYFAVGNR Unmodified 2392.1812 0.18115885 1283 J3KR97;Q9BTW9;I3L0V3 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 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translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 47.363 47.363 2 0.011612 45328 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.485 53.754 50565000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50565000 0 0 36477 645 33990 328345 418018 418018 1 QGVDADINGLR Unmodified 1156.5836 0.58364985 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.53 55.53 2 5.8969E-37 54522 QUIQUE_DMIX5_190116_001 196.32 154.67 2403500000 0 0 40794000 0 296580000 0 89224000 386180000 271810000 374930000 340200000 315590000 288200000 + 36478 780 33991 328346;328347;328348;328349;328350;328351;328352;328353;328354;328355;328356 418019;418020;418021;418022;418023;418024;418025;418026;418027;418028;418029;418030;418031;418032 418028 14 QGVDDIEKFEDEGAGFEESSETGDYEEK Unmodified 3138.2949 0.29492337 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 118.02 118.02 3 8.7091E-31 120335 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.62 113.6 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Ankyrin-2 no no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 1 1 2 1 117.81 117.81 3;4 7.3021E-15 120811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.08 99.832 3624000000 395920000 414190000 383220000 250580000 198240000 298430000 380710000 181190000 239720000 0 202970000 434140000 244690000 36483 1255;2856 33996 328388;328389;328390;328391;328392;328393;328394;328395;328396;328397;328398;328399;328400;328401;328402;328403;328404;328405 418068;418069;418070;418071;418072;418073;418074;418075;418076;418077;418078;418079;418080;418081;418082;418083;418084;418085;418086;418087;418088 418081 16 QGYPDHMVFSEFR Unmodified 1611.714 0.7140121 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 86.188 86.188 3 0.019517 87389 QUIQUE_C1403_190116_001 40.552 28.576 53441000 0 0 0 26138000 0 0 27303000 0 0 0 0 0 0 36484 271 33997 328406;328407 418089;418090 418089 2 QGYVLSSIEGR Unmodified 1207.6197 0.619701 1307 J3QT28;O43684 BUB3 Mitotic checkpoint protein BUB3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 68.427 68.427 2 0.0039881 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Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 1 2 1 2 10.318 10.318 4;5 1.7103E-45 2612 QUIQUE_DMIX7_190116_001 155.24 122.26 111680000 15423000 4615000 0 4038600 6339800 4478400 10878000 23253000 14870000 0 0 27786000 0 36504 2208 34016 328620;328621;328622;328623;328624;328625;328626;328627;328628;328629;328630;328631;328632;328633 418369;418370;418371;418372;418373;418374;418375;418376;418377;418378;418379;418380;418381;418382;418383 418383 15 QHIQVFIDR Unmodified 1154.6196 0.61964142 4299 Q9NUQ8 ABCF3 ATP-binding cassette sub-family F member 3 yes yes 0 0 0 1 1 41.613 41.613 3 0.016295 38738 QUIQUE_C1218_190116_001 57.032 41.824 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36505 4299 34017 328634;328635 418384;418385 418384 2 QHITLALEK Unmodified 1051.6026 0.60259438 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 2 2 1 2 2 31.657 31.657 2;3 0.00046764 26670 QUIQUE_C1277_190116_001 116.37 47.196 2962400000 156450000 225480000 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418866;418867;418868;418869;418870;418871;418872;418873;418874;418875;418876;418877;418878;418879;418880;418881 418867 13 QICPEVENAQPGALK Unmodified 1652.8192 0.81920545 3819 Q96CM8;E9PF16 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 59.037 59.037 2 0.00016104 58783 QUIQUE_C1438_190116_001 87.363 69.051 304670000 39825000 0 0 54640000 32106000 18703000 39573000 0 45754000 0 36876000 0 37191000 36547 3819 34058 329017;329018;329019;329020;329021;329022;329023;329024 418882;418883;418884;418885;418886;418887;418888;418889 418884 8 QICSQLSER Unmodified 1119.5343 0.53425682 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.568 24.568 2 0.0039433 17912 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.135 58.18 170850000 32527000 0 0 32269000 35433000 0 0 0 0 0 36465000 34157000 0 36548 4596 34059 329025;329026;329027;329028;329029 418890;418891;418892;418893;418894 418894 4 QICVVMLESPPK Oxidation (M) 1415.7153 0.71525765 916 E9PFP8;P57721 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QIEALQGELK Unmodified 1127.6186 0.61863837 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 1 56.123 56.123 2 0.011515 53554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.23 23.474 56678000 0 0 0 0 0 0 0 35526000 0 21152000 0 0 0 36560 3108 34070 329123;329124 419003;419004 419003 2 QIEELKGQEVSPK Unmodified 1483.7882 0.7882229 1976 P09936;D6RE83;D6R956;D6R974 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 2 2 2 2 1 2 26.984 26.984 2;3 6.8911E-12 20651 QUIQUE_C1277_190116_001 164.9 91.015 42290000000 1047700000 6126100000 1027300000 1265800000 0 2762100000 5106800000 5922900000 4837300000 0 6315600000 1872300000 6006200000 36561 1976 34071 329125;329126;329127;329128;329129;329130;329131;329132;329133;329134;329135;329136;329137;329138;329139;329140;329141;329142 419005;419006;419007;419008;419009;419010;419011;419012;419013;419014;419015;419016;419017;419018;419019;419020;419021;419022;419023 419006 16 QIEEQTIK Unmodified 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419026;419027;419028;419029;419030;419031;419032;419033;419034;419035;419036;419037;419038;419039;419040;419041;419042;419043;419044;419045;419046;419047;419048;419049;419050;419051;419052;419053;419054;419055;419056;419057;419058;419059;419060;419061;419062;419063;419064;419065;419066;419067;419068;419069;419070;419071;419072;419073 419029 44 QIEGHTICALGDGAAWPVQGLIR Unmodified 2461.2536 0.25361228 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 126.71 126.71 2;3 7.1774E-11 132858 QUIQUE_C1218_190116_001 86.748 79.061 2430500000 239510000 236980000 254840000 0 165740000 0 208520000 137120000 167530000 60562000 293330000 276130000 390270000 36564 1069 34074 329181;329182;329183;329184;329185;329186;329187;329188;329189;329190;329191;329192 419074;419075;419076;419077;419078;419079;419080;419081;419082;419083;419084;419085;419086;419087;419088;419089;419090;419091 419076 16 QIEINTISASFGGLASR Unmodified 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Q5JRI1;O75494;Q8WXF0 SRSF10;SRSF12 Serine/arginine-rich splicing factor 10;Serine/arginine-rich splicing factor 12 yes no 0 0 1 1 46.064 46.064 3 0.038182 42912 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.159 33.988 34366000 0 0 0 0 0 0 0 34366000 0 0 0 0 0 36567 1640 34077 329210 419113 419113 0 QIELACDSQEDVDSWK Unmodified 1921.8364 0.83637165 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 91.99 91.99 2 4.0955E-07 94418 QUIQUE_C1368_190116_001 122.45 102.79 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36568 2569 34078 329211;329212;329213 419114;419115;419116 419114 3 QIESTETSCHGCR Unmodified 1563.6406 0.64058916 127 A0A096LNV3;A0A096LP02;Q9Y508 RNF114 E3 ubiquitin-protein ligase RNF114 yes no 0 0 0 1 1 10.476 10.476 3 7.2206E-06 2745 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.04 118.37 12182000 0 4653700 0 0 0 0 0 0 0 7528100 0 0 0 36569 127 34079 329214;329215 419117;419118 419118 2 QIETGPFLEAVSHLPPFFDCLGSPVFTPIK Unmodified 3342.6999 0.69987217 4344 Q9NZD2;F5H0U5;F5GZ49 GLTP Glycolipid transfer protein yes no 0 0 0 1 169.95 169.95 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4 QIGNVAALPGIVHR Unmodified 1443.831 0.83103118 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 72.528 72.528 2;3 0.0011766 73132 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.619 53.519 2089400000 289230000 332710000 0 0 45554000 0 0 281110000 248090000 0 358400000 258320000 276020000 36587 4593 34097 329328;329329;329330;329331;329332;329333;329334;329335 419260;419261;419262;419263;419264;419265;419266;419267;419268 419266 8 QIGTLLAELR Unmodified 1112.6554 0.65535823 3471 Q7Z6Z7;H0Y659;A0A087X146 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.37 104.37 2 0.0049519 107242 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.148 39.05 163860000 0 21429000 30128000 19095000 0 0 0 27795000 23508000 0 0 18967000 22938000 36588 3471 34098 329336;329337;329338;329339;329340;329341;329342;329343;329344 419269;419270;419271;419272;419273;419274;419275;419276;419277;419278;419279 419278 11 QIGVEHVVVYVNK Unmodified 1482.8195 0.81946344 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 58.605 58.605 2;3 2.8947E-41 57248 QUIQUE_DMIX5_190116_001 191.4 166.52 7605800000 777740000 748200000 620540000 612170000 672980000 329450000 739080000 546550000 819040000 246480000 767200000 236700000 489630000 36589 2529 34099 329345;329346;329347;329348;329349;329350;329351;329352;329353;329354;329355;329356;329357;329358;329359;329360;329361;329362;329363;329364;329365;329366;329367;329368;329369 419280;419281;419282;419283;419284;419285;419286;419287;419288;419289;419290;419291;419292;419293;419294;419295;419296;419297;419298;419299;419300;419301;419302;419303;419304;419305;419306;419307;419308 419305 29 QIGWLTEQLPSGGTAPTLALLTEK Unmodified 2523.3585 0.35845451 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 156.4 156.4 2;3 3.0418E-51 161961 QUIQUE_C1218_190116_001 203.99 193.33 8405600000 589830000 632130000 1117400000 551900000 743080000 554560000 1061200000 389070000 679080000 244030000 576330000 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419334;419335;419336;419337;419338;419339;419340;419341;419342;419343;419344;419345;419346;419347;419348;419349;419350;419351;419352;419353 419351 17 QIHVIDMDTIDVSNLNR Unmodified 1981.9891 0.98912432 3664 Q8TBC4;F8W8D4;F8WF86 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 106.11 106.11 2;3 9.4171E-19 109197 QUIQUE_C1277_190116_001 131.69 110.06 824520000 97512000 109980000 0 91462000 68557000 93457000 84752000 26808000 107400000 0 47953000 96643000 0 36592 3664 34102 329414;329415;329416;329417;329418;329419;329420;329421;329422;329423;329424 419354;419355;419356;419357;419358;419359;419360;419361;419362;419363;419364;419365;419366;419367;419368 419356 13 QIIDAINK Unmodified 913.52328 0.52328142 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 40.14 40.14 2 0.015425 36823 QUIQUE_C1218_190116_001 84.699 7.8656 256130000 102290000 0 0 153840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36593 2037 34103 329425;329426 419369;419370 419369 2 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phosphodiesterase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 104.04 104.04 2 1.5806E-07 107080 QUIQUE_C1277_190116_001 131.82 94.475 540830000 0 61475000 75622000 77136000 72991000 59610000 81261000 63129000 49606000 0 0 0 0 36605 614 34115 329512;329513;329514;329515;329516;329517;329518;329519 419473;419474;419475;419476;419477;419478;419479;419480 419473 8 QILEALR Unmodified 841.50215 0.50215205 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;A0A2R8YGH2;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 51.789 51.789 2 0.064243 49794 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.344 3.781 52449000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52449000 0 36606 472;1460 34116 329520 419481 419481 1 QILELEER Unmodified 1028.5502 0.55022446 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.889 56.889 2 0.0065653 55004 QUIQUE_C1368_190116_001 101.28 29.942 5369000000 841510000 718180000 590280000 357790000 513170000 491540000 757760000 0 0 405170000 693560000 0 0 36607 3176 34117 329521;329522;329523;329524;329525;329526;329527;329528;329529 419482;419483;419484;419485;419486;419487;419488;419489;419490 419484 8 QILGVIDKK Unmodified 1012.6281 0.62808085 3067 Q14444;E9PLA9 CAPRIN1 Caprin-1 yes no 0 0 1 1 32.185 32.185 2 0.038251 27044 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.981 30.763 25335000 0 0 0 0 0 0 0 25335000 0 0 0 0 0 36608 3067 34118 329530 419491 419491 1 QILLGPNTGLSGGMPGALPSLPGK Unmodified 2274.2406 0.24058798 4280 Q9NS69 TOMM22 Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog yes yes 0 0 0 2 1 136.93 136.93 2;3 4.1051E-12 142092 QUIQUE_C1218_190116_001 130.29 103.16 100050000 80306000 19749000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36609 4280 34119 329531;329532;329533 419492;419493;419494;419495 419494 4 QILLGPNTGLSGGMPGALPSLPGKI Unmodified 2387.3247 0.32465196 4280 Q9NS69 TOMM22 Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog yes yes 0 0 1 1 1 146.48 146.48 2 2.347E-08 149598 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.08 75.955 77895000 0 0 0 0 0 0 0 28400000 0 0 0 0 49495000 36610 4280 34120 329534;329535 419496;419497 419496 2 QILLPFR Unmodified 885.54362 0.54362294 2869;903;4487 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3;Q9ULD0 OGDH;OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial;2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.571 91.571 2 0.019493 94046 QUIQUE_C1277_190116_001 116.87 31.811 2463900000 263450000 183620000 233890000 184240000 182140000 211990000 200350000 162110000 232750000 81017000 168850000 188380000 171130000 36611 903;2869;4487 34121 329536;329537;329538;329539;329540;329541;329542;329543;329544;329545;329546;329547;329548 419498;419499;419500;419501;419502;419503;419504;419505;419506;419507;419508;419509;419510;419511;419512;419513;419514;419515;419516;419517;419518;419519;419520;419521;419522 419502 25 QILLYSATFPLSVQK Unmodified 1706.9607 0.96070795 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 132.86 132.86 2 1.874E-18 135836 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419542;419543;419544;419545 419543 3 QILSADLR Unmodified 914.51853 0.5185304 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 49.826 49.826 2 0.0076933 48144 QUIQUE_C1218_190116_001 97.093 22.903 963740000 349850000 389110000 0 0 0 0 0 0 0 224780000 0 0 0 36615 959 34125 329569;329570;329571 419546;419547;419548 419546 2 QILVGDIGDTVEDPYTSFVK Unmodified 2195.0998 0.099780209 4546 Q9Y281 CFL2 Cofilin-2 yes yes 0 0 0 3 2 3 3 2 3 3 2 2 2 2 2 2 147.71 147.71 2;3 3.3179E-101 146535 QUIQUE_C1368_190116_001 209.41 191.27 6721800000 520380000 542670000 567780000 497660000 600890000 355790000 588910000 552660000 667170000 163160000 597550000 461980000 605210000 36616 4546 34126 329572;329573;329574;329575;329576;329577;329578;329579;329580;329581;329582;329583;329584;329585;329586;329587;329588;329589;329590;329591;329592;329593;329594;329595;329596;329597;329598;329599;329600;329601;329602 419549;419550;419551;419552;419553;419554;419555;419556;419557;419558;419559;419560;419561;419562;419563;419564;419565;419566;419567;419568;419569;419570;419571;419572;419573;419574;419575;419576;419577;419578;419579;419580;419581 419554 32 QIMGGFK Unmodified 779.4 0.39999517 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 1 1 34.907 34.907 2 0.026458 30809 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.883 69.697 482310000 0 0 0 0 0 0 295180000 187130000 0 0 0 0 0 36617 4069 34127 329603;329604 419582;419583 419583 2 QINDIQLSR Unmodified 1085.5829 0.58292157 2988 Q13347 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes yes 0 0 0 1 1 44.01 44.01 2 0.015705 41272 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.367 23.399 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36618 2988 34128 329605;329606 419584;419585 419585 2 QINDYVEK Unmodified 1007.4924 0.49237523 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;G3V2B9;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.369 28.369 2 0.013805 22659 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.833 47.17 6767600000 552800000 791030000 761040000 0 1154600000 0 572610000 571180000 0 427890000 1084000000 0 852450000 36619 4;1799 34129 329607;329608;329609;329610;329611;329612;329613;329614;329615 419586;419587;419588;419589;419590;419591;419592;419593;419594 419593 5 QINHIFYR Unmodified 1089.572 0.57196295 917 E9PFR3;Q14738;H0Y8C4 PPP2R5D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.417 33.417 3 0.012323 28489 QUIQUE_C1403_190116_001 53.166 36.39 132170000 0 46166000 0 30328000 0 28117000 0 0 0 0 0 27558000 0 36620 917 34130 329616;329617;329618;329619 419595;419596;419597;419598;419599 419597 5 QINNIFLR Unmodified 1016.5767 0.57671398 3180;3118 Q16537;Q15172 PPP2R5E;PPP2R5A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 74.913 74.913 2 0.025188 76650 QUIQUE_C1438_190116_001 71.715 39.754 34212000 0 0 0 0 34212000 0 0 0 0 0 0 0 0 36621 3180;3118 34131 329620 419600 419600 1 QINQEYLISQVEGHQVSLK Unmodified 2212.1488 0.14879609 4586 Q9Y3C4 TPRKB EKC/KEOPS complex subunit TPRKB yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 107.23 107.23 3 0.0012937 109713 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.094 36.614 255440000 39663000 0 51084000 0 0 36811000 0 59020000 0 0 68859000 0 0 36622 4586 34132 329621;329622;329623;329624;329625 419601;419602;419603;419604;419605 419604 5 QINQLAQR Unmodified 969.53558 0.53557744 2814 P78560 CRADD Death domain-containing protein CRADD yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.509 19.509 2 0.0067112 12344 QUIQUE_C1368_190116_001 100.74 33.707 24719000 0 0 24719000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36623 2814 34133 329626;329627;329628;329629;329630;329631 419606;419607;419608;419609;419610;419611 419608 6 QINSFQVFVEEVLK Unmodified 1678.893 0.89302232 3237 Q4G0X4 KCTD21 BTB/POZ domain-containing protein KCTD21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 164.12 164.12 2 0.0015515 169289 QUIQUE_C1368_190116_001 93.345 76.124 160230000 0 0 28661000 0 20504000 0 28136000 0 17236000 0 37622000 0 28068000 36624 3237 34134 329632;329633;329634;329635;329636;329637 419612;419613;419614;419615;419616;419617 419612 5 QINVGNALEYVSR Unmodified 1461.7576 0.75759147 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.16 103.16 2 6.6293E-11 105726 QUIQUE_DMIX7_190116_001 177.57 137.57 2285200000 154490000 152910000 140740000 201550000 281180000 250980000 129520000 168170000 152750000 81696000 165410000 160380000 245430000 36625 2037 34135 329638;329639;329640;329641;329642;329643;329644;329645;329646;329647;329648;329649;329650 419618;419619;419620;419621;419622;419623;419624;419625;419626;419627;419628;419629;419630;419631 419630 14 QIPQATASMK Unmodified 1073.5539 0.55392962 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YF78;A0A286YFE1 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.409 25.409 2 0.0020246 19289 QUIQUE_C1563_190116_001 112.41 67.964 6890700000 402980000 547050000 648610000 551470000 479740000 568640000 587390000 485320000 623230000 0 700820000 471090000 824340000 36626 404 34136 329651;329652;329653;329654;329655;329656;329657;329658;329659;329660;329661;329662 419632;419633;419634;419635;419636;419637;419638;419639;419640;419641;419642;419643;419644 419638 13 QIPQATASMK Oxidation (M) 1089.5488 0.54884425 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YF78;A0A286YFE1 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 1 0 1 15.444 15.444 2 0.027941 7345 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.916 35.616 151920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 151920000 0 0 0 36627 404 34136 329663 419645 419645 1 QIPVLQTNNGPSLTGLTTIAAHLVK Unmodified 2585.4541 0.45408623 1523 O43324;D6RBD7;C9J1V9;H0YAL7 EEF1E1;EEF1E1-BLOC1S5 Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.45 147.45 3 2.2525E-07 153441 QUIQUE_C1218_190116_001 56.72 53.678 980200000 47389000 0 91582000 38740000 57251000 100760000 73921000 180410000 82606000 19653000 92851000 90158000 104880000 36628 1523 34137 329664;329665;329666;329667;329668;329669;329670;329671;329672;329673;329674;329675 419646;419647;419648;419649;419650;419651;419652;419653;419654;419655;419656;419657 419646 12 QIQAAYSILSEVQQAVSQGSSDSQILDLSNR Unmodified 3334.6641 0.6640916 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.94 168.94 3 3.121E-137 173854 QUIQUE_C1368_190116_001 190.79 180.64 804620000 48162000 76980000 65711000 75097000 37504000 141690000 63271000 0 219730000 0 76473000 0 0 36629 1974 34138 329676;329677;329678;329679;329680;329681;329682;329683;329684 419658;419659;419660;419661;419662;419663;419664;419665;419666 419660 9 QIQEDWELAER Unmodified 1415.6681 0.66810776 915 E9PFK9;Q9UJ41;Q3HKR1;A0A1W2PPY0;V9GYI8;E9PHB8 RABGEF1;KCTD7 Rab5 GDP/GTP exchange factor yes no 0 0 0 1 1 78.583 78.583 2 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419675;419676;419677;419678;419679;419680;419681;419682;419683;419684;419685;419686;419687;419688 419676 10 QIQELVEAIVLPMNHK Oxidation (M) 1877.0081 0.0080688509 4672 R4GNH3;P17980;E9PM69;E9PMD8;E9PN50 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 120.98 120.98 3 0.00012644 118064 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.507 68.777 166010000 0 29941000 0 0 0 28030000 0 35833000 0 25322000 0 0 46889000 36633 4672 34141 329706;329707;329708;329709;329710;329711 419689;419690;419691;419692;419693;419694 419692 3069 3 QIQESVTFASQVYR Unmodified 1654.8315 0.83148469 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 85.96 85.96 2 0.055495 82534 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.706 33.75 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36634 902;1255;2856;1134 34142 329712 419695 419695 1 QIQFADDMQEFTK Oxidation (M) 1615.7188 0.7188227 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 74.558 74.558 2 0.00049225 73376 QUIQUE_C1563_190116_001 96.113 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Sarcolemmal membrane-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.494 66.494 2 0.00090499 65853 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.162 67.223 164270000 17499000 22016000 0 0 20848000 0 0 20276000 35669000 11277000 0 18242000 18440000 36643 1222 34150 329756;329757;329758;329759;329760;329761;329762;329763;329764 419746;419747;419748;419749;419750;419751;419752;419753;419754 419753 9 QIQVNDEDVR Unmodified 1214.5891 0.58912916 4485 Q9ULC3 RAB23 Ras-related protein Rab-23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.897 31.897 2 0.00091451 26313 QUIQUE_C1368_190116_001 120.15 26.781 871160000 0 89419000 109780000 85874000 71657000 63684000 112790000 51689000 80762000 37456000 0 70574000 97479000 36644 4485 34151 329765;329766;329767;329768;329769;329770;329771;329772;329773;329774;329775 419755;419756;419757;419758;419759;419760;419761;419762;419763;419764;419765;419766;419767;419768;419769 419757 15 QIQVSWLR Unmodified 1028.5767 0.57671398 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 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protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 72.923 72.923 3 0.0014227 73758 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.393 50.452 69057000 0 0 0 0 0 0 0 37648000 0 0 31409000 0 0 36666 3461 34172 329943;329944 419963;419964 419964 2 QITQNTDYR Unmodified 1137.5415 0.54145068 3765 Q92896 GLG1 Golgi apparatus protein 1 yes yes 0 0 0 1 19.893 19.893 2 0.04949 12490 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.673 44.897 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36667 3765 34173 329945 419965 419965 1 QITQSALLAEAR Unmodified 1299.7147 0.71466402 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.634 65.634 2 0.00051602 65019 QUIQUE_C1368_190116_001 94.363 59.007 203490000 0 23143000 71694000 13944000 0 32088000 0 29253000 0 0 0 33370000 0 36668 2813 34174 329946;329947;329948;329949;329950;329951 419966;419967;419968;419969;419970;419971;419972 419968 6 QITQVYGFYDECLR Unmodified 1790.8298 0.82977013 2758;2789;2693 P62714;E5RHC1;E7ESG8;E5RFI3;E5RHP4;P67775;P60510;H3BTA2;H3BV22 PPP2CB;PPP2CA;PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit no no 0 0 0 2 2 1 1 1 3 2 1 1 1 1 2 1 108.76 108.76 2;3 1.4509E-86 112407 QUIQUE_C1277_190116_001 217.14 156.62 4717800000 447100000 449760000 434800000 420390000 396660000 426450000 425990000 216510000 292650000 186680000 334200000 351630000 335000000 36669 2758;2789;2693 34175 329952;329953;329954;329955;329956;329957;329958;329959;329960;329961;329962;329963;329964;329965;329966;329967;329968;329969;329970 419973;419974;419975;419976;419977;419978;419979;419980;419981;419982;419983;419984;419985;419986;419987;419988;419989;419990;419991;419992;419993;419994;419995;419996;419997;419998;419999;420000;420001;420002;420003;420004 419977 31 QITQVYGFYDECLRK Unmodified 1918.9247 0.92473315 2758;2789;2693 P62714;E5RHC1;E7ESG8;E5RFI3;E5RHP4;P67775;P60510;H3BTA2;H3BV22 PPP2CB;PPP2CA;PPP4C Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit no no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 86.181 86.181 2;3 3.8951E-10 87583 QUIQUE_DMIX8_190116_001 151.26 133.59 2125700000 0 93003000 80326000 46375000 98149000 27933000 102710000 342260000 304640000 20130000 238290000 352130000 419790000 36670 2758;2789;2693 34176 329971;329972;329973;329974;329975;329976;329977;329978;329979;329980;329981;329982;329983;329984 420005;420006;420007;420008;420009;420010;420011;420012;420013;420014;420015;420016;420017;420018 420018 11 QITQVYGFYDECQTK Unmodified 1878.8458 0.84581413 1421 O00743;Q5T1S7 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.806 86.806 2 1.2801E-43 88132 QUIQUE_C1403_190116_001 178.32 166.79 705970000 52853000 68018000 73394000 63763000 54465000 52572000 71875000 0 50307000 21418000 73602000 62730000 60973000 36671 1421 34177 329985;329986;329987;329988;329989;329990;329991;329992;329993;329994;329995;329996 420019;420020;420021;420022;420023;420024;420025;420026;420027;420028;420029;420030;420031 420023 11 QITSYGETCPGLEQYAIK Unmodified 2056.9776 0.97755658 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 96.226 96.226 2;3 1.7595E-45 98618 QUIQUE_C1368_190116_001 224.43 178.27 2640500000 277720000 241710000 312240000 220600000 215410000 291980000 254360000 89024000 160080000 86510000 156860000 129490000 204480000 36672 2572 34178 329997;329998;329999;330000;330001;330002;330003;330004;330005;330006;330007;330008;330009;330010;330011;330012 420032;420033;420034;420035;420036;420037;420038;420039;420040;420041;420042;420043;420044;420045;420046;420047;420048 420035 17 QITSYGETCPGLEQYAIKK Unmodified 2185.0725 0.072519601 2572 P50990 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 75.835 75.835 3 0.00012455 76520 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.43 57.869 668560000 0 0 0 0 42242000 0 0 96542000 103670000 0 140950000 155870000 129290000 36673 2572 34179 330013;330014;330015;330016;330017;330018;330019 420049;420050;420051;420052;420053;420054;420055;420056;420057 420052 8 QITTELAEHR Unmodified 1196.6149 0.61494998 616 B4DKF8;E5RJ29;Q9NYI0;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 PH and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 24.398 24.398 2;3 0.00011692 17896 QUIQUE_C1563_190116_001 138.98 78.539 1621200000 246370000 233310000 361700000 214410000 82536000 168740000 0 39065000 46740000 36770000 62991000 92265000 36344000 36674 616 34180 330020;330021;330022;330023;330024;330025;330026;330027;330028;330029;330030;330031;330032;330033;330034;330035;330036;330037;330038 420058;420059;420060;420061;420062;420063;420064;420065;420066;420067;420068;420069;420070;420071;420072;420073;420074;420075;420076;420077;420078;420079 420072 21 QITVNDLPVGR Unmodified 1210.667 0.66698555 2904;2346 Q06830;A0A0A0MSI0;A0A0A0MRQ5;P32119 PRDX1;PRDX2 Peroxiredoxin-1;Peroxiredoxin-2 no no 0 0 0 2 3 1 3 3 2 2 3 2 3 3 3 3 80.716 80.716 2;3 1.5521E-08 72429 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.35 117.38 153040000000 10998000000 10964000000 12642000000 11369000000 11744000000 9805500000 11881000000 13190000000 13158000000 5564300000 15049000000 12422000000 14257000000 36675 2904;2346 34181 330039;330040;330041;330042;330043;330044;330045;330046;330047;330048;330049;330050;330051;330052;330053;330054;330055;330056;330057;330058;330059;330060;330061;330062;330063;330064;330065;330066;330067;330068;330069;330070;330071 420080;420081;420082;420083;420084;420085;420086;420087;420088;420089;420090;420091;420092;420093;420094;420095;420096;420097;420098;420099;420100;420101;420102;420103;420104;420105;420106;420107;420108;420109;420110;420111;420112;420113;420114;420115;420116;420117;420118;420119;420120;420121;420122;420123;420124;420125;420126 420107 44 QIVDAQAVCTR Unmodified 1259.6292 0.62921983 2290 P29590;H3BT57 PML Protein PML yes no 0 0 0 1 1 1 38.489 38.489 2 0.0284 34976 QUIQUE_C1438_190116_001 51.927 33.615 58769000 0 0 0 0 58769000 0 0 0 0 0 0 0 0 36676 2290 34182 330072;330073;330074 420127;420128;420129 420127 3 QIVEILTAYASAVGIGTTQVQPE Unmodified 2387.2584 0.25840612 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 1 2 172.43 172.43 2;3 0.00050691 175834 QUIQUE_C1277_190116_001 66.533 59.804 446130000 0 64619000 65675000 78063000 32469000 0 0 60068000 44079000 10350000 0 36678000 54131000 36677 693;3205 34183 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420146;420147;420148;420149;420150;420151;420152;420153;420154;420155;420156;420157;420158;420159;420160;420161;420162;420163;420164;420165;420166;420167;420168;420169;420170;420171;420172;420173;420174;420175;420176;420177 420167 27 QIVQSISDLNEIFR Unmodified 1660.8784 0.87843489 1205 H3BU86;O14662;F8W9Z6 STX16-NPEPL1;STX16 Syntaxin-16 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 136.15 136.15 2 1.6968E-10 140611 QUIQUE_C1277_190116_001 135.66 96.04 227300000 0 28300000 0 44890000 37529000 40570000 0 0 28166000 0 0 24739000 23103000 36679 1205 34185 330116;330117;330118;330119;330120;330121;330122 420178;420179;420180;420181;420182;420183;420184 420178 7 QIVSAVQYCHQK Unmodified 1459.7242 0.72418285 900 E9PC69;Q7KZI7;E7ETY4;F5H4F6;H0YNV4 MARK2;MARK3 Serine/threonine-protein kinase MARK2 no no 0 0 0 2 24.018 24.018 2;3 0.052545 17721 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.989 19.193 76719000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 76719000 0 36680 900 34186 330123;330124 420185;420186 420185 2 QIVSEMLR Unmodified 974.5219 0.52190122 1749 O95782 AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 55.609 55.609 2 0.0036557 54200 QUIQUE_C1277_190116_001 127.12 92.293 610960000 0 144140000 0 125330000 0 88119000 0 104770000 0 0 148600000 0 0 36681 1749 34187 330125;330126;330127;330128;330129 420187;420188;420189;420190;420191;420192 420187 6 QIVTQYQTIILTYQENLTDLHQYR Unmodified 2980.5294 0.52943602 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.83 146.83 3 1.9843E-40 151660 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.64 131.43 425830000 50248000 44912000 0 33043000 0 44668000 46821000 41632000 46313000 0 57324000 60865000 0 36682 3916 34188 330130;330131;330132;330133;330134;330135;330136;330137;330138 420193;420194;420195;420196;420197;420198;420199;420200;420201 420199 9 QIVWNGPVGVFEWEAFAR Unmodified 2104.053 0.053045209 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 3 1 2 3 2 164.12 164.12 2;3 3.2599E-141 166024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 276.71 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330182;330183;330184;330185;330186;330187;330188;330189;330190;330191;330192;330193 420272;420273;420274;420275;420276;420277;420278;420279;420280;420281;420282;420283 420279 6 QIWQQYFAAK Unmodified 1281.6506 0.6506072 1253 I3L448;A8MRA7;Q5TC12;H0YEW4 ATPAF1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.724 97.724 2 0.0029905 99981 QUIQUE_C1403_190116_001 86.833 66.546 254240000 56871000 0 60480000 47975000 44986000 43931000 0 0 0 0 0 0 0 36687 1253 34193 330194;330195;330196;330197;330198 420284;420285;420286;420287;420288;420289 420287 6 QIWTLEQPPDEAGSAAVCLR Unmodified 2240.0896 0.089566649 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 120 120 2;3 6.2677E-117 122521 QUIQUE_C1563_190116_001 274.09 239.71 1864900000 0 216140000 159930000 145030000 220390000 120320000 177790000 116410000 190120000 35802000 223190000 137950000 121830000 36688 3187 34194 330199;330200;330201;330202;330203;330204;330205;330206;330207;330208;330209;330210;330211;330212;330213 420290;420291;420292;420293;420294;420295;420296;420297;420298;420299;420300;420301;420302;420303;420304;420305;420306;420307 420295 17 QIWTVNEALIQK Unmodified 1441.7929 0.79291434 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 1 100.35 100.35 2 0.021286 103647 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.847 42.061 65333000 0 0 34911000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30422000 36689 3270 34195 330214;330215 420308;420309 420309 2 QIYHTELEK Unmodified 1159.5873 0.58733824 93 H0YKH1;A0A087X0P4;H0YLF5;A0A0A0MTI0;P40424;H0YLD4;H0YLT4;H0YLB0;H0YLM3;U3KQA2;F8WA05;H0Y5D0;Q5JS98;P40426 PBX1;PBX3 Pre-B-cell leukemia transcription factor 1;Pre-B-cell leukemia transcription factor 3 yes no 0 0 0 1 1 20.446 20.446 3 0.016692 13145 QUIQUE_C1277_190116_001 42.336 27.003 113130000 0 59306000 0 0 0 53821000 0 0 0 0 0 0 0 36690 93 34196 330216;330217 420310;420311 420310 1 QIYLSENPEETAAR Unmodified 1619.7791 0.77911477 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.629 61.629 2 4.3021E-88 61043 QUIQUE_DMIX1_190116_001 223.71 179.39 863410000 75050000 69899000 61374000 64063000 75533000 65708000 71399000 85084000 63939000 31200000 56905000 70753000 72500000 36691 4475 34197 330218;330219;330220;330221;330222;330223;330224;330225;330226;330227;330228;330229;330230 420312;420313;420314;420315;420316;420317;420318;420319;420320;420321;420322;420323;420324;420325;420326 420319 15 QIYLTDNPEAVAIK Unmodified 1573.8352 0.83517309 3645 Q8NEU8 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 90.864 90.864 2 0.00033817 92544 QUIQUE_C1403_190116_001 101.95 76.568 158890000 0 0 0 20848000 70971000 0 67072000 0 0 0 0 0 0 36692 3645 34198 330231;330232;330233;330234 420327;420328;420329;420330 420328 4 QIYPPINVLPSLSR Unmodified 1595.9035 0.90352742 2175;731 P21281;C9JL73;P15313 ATP6V1B2;ATP6V1B1 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform;V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform no no 0 0 0 2 3 2 3 2 2 2 2 1 2 1 1 2 127.56 127.56 2;3 4.4518E-05 131424 QUIQUE_C1368_190116_001 118.28 88.504 7893600000 675230000 744650000 652120000 611020000 614230000 572120000 651130000 519740000 485760000 274400000 783700000 606020000 703520000 36693 2175;731 34199 330235;330236;330237;330238;330239;330240;330241;330242;330243;330244;330245;330246;330247;330248;330249;330250;330251;330252;330253;330254;330255;330256;330257;330258;330259 420331;420332;420333;420334;420335;420336;420337;420338;420339;420340;420341;420342;420343;420344;420345;420346;420347;420348;420349;420350;420351;420352;420353;420354;420355;420356;420357;420358;420359;420360;420361;420362;420363;420364;420365;420366;420367;420368;420369;420370;420371;420372;420373;420374;420375;420376;420377;420378;420379;420380;420381;420382;420383;420384 420340 52 QKADEAYLIGR Unmodified 1262.6619 0.66190017 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 35.364 35.364 3 0.0048512 31138 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.194 29.988 82297000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82297000 36694 2026 34200 330260 420385 420385 1 QKDGHGEAIMFK Unmodified 1359.6605 0.66051996 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 1 1 19.244 19.244 2 0.0034389 11856 QUIQUE_C1403_190116_001 94.692 60.896 33760000 0 0 0 33760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36695 4560 34201 330261 420386 420386 1 QKDVDKEFYLFPTVFDENESLLLEDNIR Unmodified 3415.6824 0.68236743 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 2 1 155.44 155.44 4 0.025963 162370 QUIQUE_C1438_190116_001 26.273 20.954 35369000 0 0 0 0 35369000 0 0 0 0 0 0 0 0 36696 1784 34202 330262 420387 420387 1 QKDYETATLSEIK Unmodified 1524.7672 0.7671531 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 1 1 49.953 49.953 2 0.02942 47676 QUIQUE_DMIX7_190116_001 83.081 56.567 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36697 1242;2047 34203 330263 420388 420388 1 QKEEESQQQAVLEQER Unmodified 1957.9341 0.93411186 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Protein-arginine deiminase type-6 yes yes 0 0 1 1 141.92 141.92 3 0.0010539 144635 QUIQUE_C1563_190116_001 52.265 22.284 54079000 0 0 0 0 0 54079000 0 0 0 0 0 0 0 36701 3403 34207 330274 420399 420399 1 QKEPFVFASVR Unmodified 1306.7034 0.70337105 4393 Q9UBB6 NCDN Neurochondrin yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 2 59.099 59.099 2;3 0.0010473 58267 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.39 99.08 3942200000 151980000 362140000 0 234170000 570190000 42120000 0 344980000 431790000 0 759030000 483520000 562270000 36702 4393 34208 330275;330276;330277;330278;330279;330280;330281;330282;330283;330284;330285;330286;330287 420400;420401;420402;420403;420404;420405;420406;420407;420408;420409;420410;420411;420412 420407 7 QKEQLEAEAQALR Unmodified 1512.7896 0.78961988 3803 Q96AQ6 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes yes 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 41.603 41.603 2;3 3.4195E-07 36946 QUIQUE_DMIX8_190116_001 137.46 108.5 815180000 40394000 0 0 157770000 0 204540000 0 33801000 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420445;420446;420447;420448;420449;420450;420451;420452;420453;420454;420455;420456;420457;420458;420459;420460;420461;420462;420463 420451 5 QKFETPGIMQFTNEEK Unmodified 1925.9193 0.91931342 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 1 1 83.966 83.966 3 0.032404 84444 QUIQUE_C1563_190116_001 38.14 35.743 65780000 0 0 0 0 0 65780000 0 0 0 0 0 0 0 36708 903;2869 34214 330335 420464 420464 1 QKGADFLVTEVENGGSLGSK Unmodified 2035.0222 0.02219859 2077;1203 H3BTN5;H3BQ34;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 0 1 1 1 94.254 94.254 2 8.4268E-56 96751 QUIQUE_DMIX7_190116_001 174.62 150.55 191780000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 131100000 60676000 0 36709 1203;2077 34215 330336;330337 420465;420466;420467 420466 3 QKGDTPASATAGDTLSVPAPAVQPEESLK Unmodified 2864.4403 0.44034624 693 C9J406;H7C463 IMMT no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.099 85.099 3 1.1865E-27 86345 QUIQUE_C1277_190116_001 110.07 106.45 754730000 131540000 150590000 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Cell division control protein 42 homolog yes yes 0 0 1 1 11.294 11.294 3 0.029725 3554 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.592 34.726 38311000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38311000 0 0 0 36719 2701 34225 330463 420637 420637 1 QKQEEESLGQVTDQVEVNAQNSVPDEEAK Unmodified 3227.5066 0.5065879 889;926 E9PGZ1;C9J813;C9JEK3;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 1 1 94.411 94.411 3 2.5245E-27 91118 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.58 95.23 19542000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19542000 0 0 0 36720 926;889 34226 330464 420638 420638 1 QKSDAEEDGGTVSQEEEDR Unmodified 2107.8778 0.87777878 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 1 1 1 19.544 19.544 2 1.5232E-171 12281 QUIQUE_C1403_190116_001 288.12 271.18 78223000 0 0 31891000 46332000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36721 2269 34227 330465;330466 420639;420640 420640 2 QKVDSLLENLEK Unmodified 1414.7668 0.76675917 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V2D6;G3V5V7;A0A0G2JPF8;A0A0G2JNQ3;P0DMR1;O60812;B7ZW38;B2RXH8 HNRNPC;HNRNPCL4;HNRNPCL1;HNRNPCL3;HNRNPCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 4;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 2 1 75.067 75.067 2;3 6.1127E-27 75737 QUIQUE_C1277_190116_001 207.34 144.52 7397000000 723310000 720280000 413670000 485760000 443500000 309610000 606420000 1150200000 643790000 201570000 648040000 701990000 348860000 36722 598 34228 330467;330468;330469;330470;330471;330472;330473;330474;330475;330476;330477;330478;330479;330480;330481;330482;330483;330484;330485;330486;330487;330488 420641;420642;420643;420644;420645;420646;420647;420648;420649;420650;420651;420652;420653;420654;420655;420656;420657;420658;420659;420660;420661;420662;420663;420664;420665;420666;420667;420668;420669;420670;420671 420645 30 QKVEALSPGDR Unmodified 1198.6306 0.63060004 3276 Q5JRX3;A0A0A0MRX9;H0Y4F7 PITRM1 Presequence protease, mitochondrial yes no 0 0 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0.64189301 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.296 40.296 2 1.7966E-05 36842 QUIQUE_C1277_190116_001 158.87 123.44 5723500000 381740000 382950000 621310000 182680000 390060000 184070000 304930000 665980000 661070000 322640000 806310000 484030000 335690000 36736 3117 34242 330563;330564;330565;330566;330567;330568;330569;330570;330571;330572;330573;330574;330575 420764;420765;420766;420767;420768;420769;420770;420771;420772;420773;420774;420775;420776;420777;420778;420779;420780;420781;420782 420766 19 QLAEFVPLDYSVPIEIPTIK Unmodified 2271.2402 0.24023686 4239 Q9NP92 MRPS30 28S ribosomal protein S30, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 162.7 162.7 2 3.4873E-06 167958 QUIQUE_C1218_190116_001 89.507 72.844 77327000 14835000 12295000 0 11951000 15576000 0 0 0 18977000 3692500 0 0 0 36737 4239 34243 330576;330577;330578;330579;330580;330581 420783;420784;420785;420786;420787;420788 420783 6 QLAEILLR Unmodified 954.58622 0.58621603 3486 Q86TV6;Q6PIF1;G3V3H1 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420833 9 QLALFLAR Unmodified 930.56509 0.56508666 284 A0A0G2JJD3;O95870 ABHD16A Abhydrolase domain-containing protein 16A yes no 0 0 0 1 1 1 1 91.521 91.521 2 0.014925 93504 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.357 63.81 84743000 0 0 0 0 14711000 0 21022000 0 0 0 27407000 0 21604000 36746 284 34250 330633;330634;330635;330636 420841;420842;420843;420844 420844 4 QLALWNPK Unmodified 968.54435 0.54435122 4495 Q9ULV4;B4E3S0 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.501 70.501 2 0.0056247 71013 QUIQUE_C1438_190116_001 104.76 57.415 1469300000 113370000 129300000 166770000 115830000 130660000 98397000 139970000 0 102170000 58380000 165320000 122040000 127070000 36747 4495 34251 330637;330638;330639;330640;330641;330642;330643;330644;330645;330646;330647;330648 420845;420846;420847;420848;420849;420850;420851;420852;420853;420854;420855;420856;420857;420858 420849 13 QLANITMGLPLSPAADSAR Unmodified 1925.004 0.0040461055 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes 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420863;420864;420865;420866;420867;420868;420869;420870;420871;420872;420873;420874 420871 11 QLANYNFDFR Unmodified 1286.6044 0.60438529 284 A0A0G2JJD3;O95870;A0A0G2JI89 ABHD16A Abhydrolase domain-containing protein 16A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 93.092 93.092 2 0.019793 95409 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.931 46.025 145400000 0 0 25494000 12905000 0 0 0 26556000 24369000 0 31263000 24811000 0 36751 284 34255 330663;330664;330665;330666;330667;330668 420875;420876;420877;420878;420879;420880 420878 6 QLAPIWDK Unmodified 969.52837 0.5283668 1917 P07237;H7BZ94;H0Y3Z3 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.747 67.747 2 0.025436 68564 QUIQUE_C1438_190116_001 71.491 46.672 611560000 0 171020000 0 159530000 169800000 0 0 0 111210000 0 0 0 0 36752 1917 34256 330669;330670;330671;330672 420881;420882;420883;420884 420883 4 QLAQDTGLTILQVNNWFINAR Unmodified 2414.2706 0.27064256 1442 O14770;U3KQI2;F5GYS8;H0YNY8;U3KPR8;O00470;U3KQJ9;H0YMV2;H3BLU4;H0YNA8;A6NDR6;Q99687 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83.56 83.56 2;3 4.3199E-07 84541 QUIQUE_C1277_190116_001 117.93 100.99 1200400000 269500000 285730000 0 44056000 43297000 31829000 228970000 196260000 34274000 66459000 0 0 0 36775 723 34278 330863;330864;330865;330866;330867;330868;330869;330870;330871;330872;330873;330874;330875 421117;421118;421119;421120;421121;421122;421123;421124;421125;421126;421127;421128;421129 421120 8 QLEDCLILQTLLHSK Unmodified 1809.9659 0.96586969 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 135.01 135.01 3 0.00034067 138161 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.531 55.393 191390000 0 0 0 47238000 0 0 48608000 33683000 0 0 61857000 0 0 36776 4148 34279 330876;330877;330878;330879 421130;421131;421132;421133 421132 3 QLEDELQDLAAK Unmodified 1371.6882 0.6881745 4631 Q9Y5S2;H0YLY0 CDC42BPB Serine/threonine-protein kinase MRCK beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.518 97.518 2 0.00021849 100186 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.04 94.191 187810000 48330000 57462000 0 0 0 0 0 0 28491000 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421221;421222;421223;421224;421225 421225 4 QLEEEIAR Unmodified 986.50327 0.50327426 3534 Q8IWA4;H7C5H5 MFN1 Mitofusin-1 yes no 0 0 0 1 33.32 33.32 2 0.0092599 28923 QUIQUE_C1576_190116_001 92.822 1.781 785770000 0 0 0 0 0 0 785770000 0 0 0 0 0 0 36787 3534 34290 330962 421226 421226 1 QLEEEKNSLQEQQEEEEEARK Unmodified 2602.1994 0.19944727 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 2 2 1 35.854 35.854 3;4 4.7748E-05 31842 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.256 62.457 121200000 0 0 0 0 0 0 0 77714000 0 0 43490000 0 0 36788 2379 34291 330963;330964;330965 421227;421228;421229 421227 3 QLEEELR Unmodified 915.46616 0.46616048 557 CON__Q3SX28;A7XZE4 TPM2b yes no 0 0 0 1 1 28.891 28.891 2 0.023465 23732 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.07 0 100300000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55578000 0 44723000 + 36789 557 34292 330966;330967 421230;421231 421230 2 QLEEEQQALQK Unmodified 1342.6729 0.67285879 557;3325 CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951 TPM2b;TPM2 Tropomyosin beta chain no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.244 31.244 2 1.253E-38 25780 QUIQUE_C1277_190116_001 205.12 135.92 1023800000 202050000 354280000 176360000 0 0 0 0 0 92658000 33524000 73555000 91407000 0 + 36790 557;3325 34293 330968;330969;330970;330971;330972;330973;330974;330975 421232;421233;421234;421235;421236;421237;421238;421239 421233 8 QLEEILEMK Unmodified 1131.5846 0.58456105 1479 O15083;H7C4G9 ERC2 ERC protein 2 yes no 0 0 0 1 90.069 90.069 2 0.04349 92100 QUIQUE_C1277_190116_001 66.351 42.33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36791 1479 34294 330976 421240 421240 1 QLEEQLR Unmodified 914.48214 0.48214489 1019 F5H7S3;B7Z596;H0YL42;H0YK20 TPM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.028 24.028 2 0.023465 17825 QUIQUE_C1438_190116_001 100.07 17.804 817270000 0 0 194590000 120040000 165110000 0 115150000 0 166760000 55638000 0 0 0 36792 1019 34295 330977;330978;330979;330980;330981;330982 421241;421242;421243;421244;421245;421246 421243 6 QLEESQDSLSEELAK Unmodified 1704.8054 0.8053891 1568 O60282;A0A0G2JMZ6 KIF5C Kinesin heavy chain isoform 5C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.188 71.188 2 3.0438E-146 71278 QUIQUE_C1277_190116_001 246.26 199.8 753270000 0 48283000 59482000 65198000 61415000 40348000 72030000 59096000 60253000 31287000 92400000 76176000 87300000 36793 1568 34296 330983;330984;330985;330986;330987;330988;330989;330990;330991;330992;330993;330994 421247;421248;421249;421250;421251;421252;421253;421254;421255;421256;421257;421258 421247 12 QLEESVDALSEELVQLR Unmodified 1957.0004 0.0004005156 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 149.76 149.76 2;3 1.2607E-37 154277 QUIQUE_DMIX7_190116_001 200.21 150.71 1110000000 86596000 81111000 87380000 87924000 96779000 98527000 89188000 122760000 92450000 39929000 86146000 89558000 51665000 36794 2355 34297 330995;330996;330997;330998;330999;331000;331001;331002;331003;331004;331005;331006;331007;331008;331009;331010;331011;331012;331013;331014;331015;331016;331017;331018;331019 421259;421260;421261;421262;421263;421264;421265;421266;421267;421268;421269;421270;421271;421272;421273;421274;421275;421276;421277;421278;421279;421280;421281;421282;421283;421284;421285;421286;421287;421288 421287 30 QLEHNAYHPIEWAINAATLSQFYINK Unmodified 3070.5301 0.53010472 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GTE6;A0A0D9SFK7;A0A1B0GUH6;A0A1B0GV79;A0A1B0GW21;A0A1B0GTX3 KIAA1279;KIF1BP KIF1-binding protein yes no 0 0 0 1 145.74 145.74 4 0.041911 150870 QUIQUE_DMIX3_190116_001 20.482 14.641 38863000 0 0 0 0 0 0 0 0 38863000 0 0 0 0 36795 348 34298 331020 421289 421289 1 QLEIHSPDAK Unmodified 1136.5826 0.58258722 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 1 1 21.916 21.916 2 0.0091438 14850 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.128 58.181 94863000 24991000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41145000 28726000 0 36796 3029 34299 331021;331022;331023;331024 421290;421291;421292;421293 421292 4 QLEILQQQLLHEQALLLEYK Unmodified 2449.3581 0.35806058 4473 Q9UKE5 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.05 147.05 3 1.9774E-07 151983 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.175 90.729 680540000 0 56109000 53408000 62674000 62236000 59451000 91147000 49887000 88485000 0 0 88854000 68289000 36797 4473 34300 331025;331026;331027;331028;331029;331030;331031;331032;331033;331034 421294;421295;421296;421297;421298;421299;421300;421301;421302;421303 421301 9 QLEITGR Unmodified 815.45012 0.45011648 2721;3185;2351 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54;P61266;P32856 STX1A;STX1B;STX2 Syntaxin-1A;Syntaxin-1B;Syntaxin-2 no no 0 0 0 1 1 24.844 24.844 2 0.019567 18436 QUIQUE_C1368_190116_001 117.93 17.868 1337200000 0 0 883620000 0 0 0 0 0 0 0 0 453610000 0 36798 3185;2721;2351 34301 331035;331036 421304;421305;421306 421304 3 QLELACETQEEVDSWK Unmodified 1963.8833 0.88332185 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 114.91 114.91 2;3 1.4726E-79 112247 QUIQUE_DMIX4_190116_001 256.47 235.68 3067000000 287710000 340320000 358420000 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0.78961988 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 79.437 79.437 3 0.013704 79579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.14 42.864 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36801 4607 34304 331068 421348 421348 1 QLELENLQASYEDLKAQSQEEIRR Unmodified 2889.4468 0.4468286 1738 O95613 PCNT Pericentrin yes yes 0 0 2 1 1 1 1 19.521 19.521 3 0.0010809 12273 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.392 32.808 665680000 0 0 0 0 0 0 0 108570000 0 0 223980000 128820000 204320000 36802 1738 34305 331069;331070;331071;331072 421349;421350;421351;421352 421350 4 QLELENLTTQETR Unmodified 1573.7948 0.79476484 2133 P18031;B4DSN5 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type yes no 0 0 0 1 1 1 81.197 81.197 2 0.0014009 82725 QUIQUE_C1368_190116_001 80.014 36.38 78749000 0 0 42873000 0 35876000 0 0 0 0 0 0 0 0 36803 2133 34306 331073;331074;331075 421353;421354;421355;421356 421354 4 QLEMILNKPGLK Unmodified 1382.7956 0.79555688 183;2889 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;Q04828;H0Y804;A6NHU4 AKR1C3;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C3;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 1 2 1 1 2 2 1 1 1 2 2 2 2 63.767 63.767 2;3 0.00033146 64504 QUIQUE_C1218_190116_001 84.507 53.618 2078900000 186660000 125850000 107590000 246230000 153590000 131700000 145770000 138700000 315480000 0 126550000 167370000 233390000 36804 183;2889 34307 331076;331077;331078;331079;331080;331081;331082;331083;331084;331085;331086;331087;331088;331089;331090;331091;331092;331093;331094 421357;421358;421359;421360;421361;421362;421363;421364;421365;421366;421367;421368;421369;421370;421371;421372;421373;421374;421375;421376;421377 421358 15 QLEMILNKPGLK Oxidation (M) 1398.7905 0.7904715 183;2889 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;Q04828;H0Y804;A6NHU4 AKR1C3;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C3;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 1 1 1 51.772 51.772 3 0.017845 47020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.49 46.48 50163000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50163000 0 0 0 36805 183;2889 34307 331095 421378 421378 0 QLEMSAEAER Oxidation (M) 1178.5238 0.52375171 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.795 16.795 2 0.0011244 9472 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.7 79.932 1888400000 85198000 139800000 145510000 0 101260000 0 113560000 332800000 415130000 74898000 0 246480000 233720000 36806 3117 34308 331096;331097;331098;331099;331100;331101;331102;331103;331104;331105 421379;421380;421381;421382;421383;421384;421385;421386;421387;421388 421386 2573 8 QLEMSAEAER Unmodified 1162.5288 0.52883709 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 31.16 31.16 2 0.00019619 25353 QUIQUE_DMIX8_190116_001 123.86 44.744 1673800000 0 139560000 162780000 62875000 101390000 50277000 120500000 216050000 191140000 96871000 220460000 166640000 145210000 36807 3117 34308 331106;331107;331108;331109;331110;331111;331112;331113;331114;331115;331116;331117;331118;331119 421389;421390;421391;421392;421393;421394;421395;421396;421397;421398;421399;421400;421401;421402;421403;421404;421405;421406;421407 421407 19 QLENELQMEEYLK Unmodified 1665.792 0.79198764 4608;1367 M0QZ28;M0R0C4;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 1 106.91 106.91 2 3.2797E-32 109736 QUIQUE_C1403_190116_001 185.77 155.21 263580000 0 0 0 102330000 0 0 0 0 0 40757000 0 0 120490000 36808 1367;4608 34309 331120;331121;331122 421408;421409;421410;421411 421408 4 QLENLEQQK Unmodified 1128.5775 0.57750184 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 23.849 23.849 2 0.0047342 17223 QUIQUE_C1277_190116_001 129.77 77.37 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36809 4443 34310 331123;331124;331125;331126 421412;421413;421414;421415 421412 4 QLENLEQQKYDDEDISEDIK Unmodified 2451.1289 0.12890809 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 83.303 83.303 2;3 2.0539E-64 85957 QUIQUE_C1218_190116_001 187.16 165.91 3390000000 156910000 297590000 223840000 234000000 267990000 145530000 285400000 259820000 264530000 67172000 448110000 395460000 343610000 36810 4443 34311 331127;331128;331129;331130;331131;331132;331133;331134;331135;331136;331137;331138;331139;331140;331141;331142;331143;331144;331145;331146;331147 421416;421417;421418;421419;421420;421421;421422;421423;421424;421425;421426;421427;421428;421429;421430;421431;421432;421433;421434;421435;421436;421437;421438;421439;421440;421441;421442 421419 26 QLENSLNEFGEK Unmodified 1406.6678 0.66777341 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 64.898 64.898 2 1.5995E-06 65055 QUIQUE_C1218_190116_001 139.43 63.695 355430000 84139000 46394000 0 79069000 44500000 66838000 0 0 0 34489000 0 0 0 36811 2253 34312 331148;331149;331150;331151;331152;331153 421443;421444;421445;421446;421447;421448;421449 421443 7 QLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGPK Unmodified 2928.3566 0.35661661 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 130.28 130.28 3 5.6105E-18 135052 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.77 95.866 327270000 0 0 0 0 0 0 0 112800000 73601000 0 74275000 66600000 0 36812 2253 34313 331154;331155;331156;331157 421450;421451;421452;421453 421451 3 QLENVLDDLDPESAMLPAGFR Oxidation (M) 2345.1209 0.12092636 4356 Q9NZR1 TMOD2 Tropomodulin-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 151.49 151.49 2;3 2.1882E-64 157105 QUIQUE_C1218_190116_001 171.21 150.83 689950000 53469000 80956000 57919000 71212000 60471000 0 64820000 0 105490000 68736000 0 80263000 46607000 36813 4356 34314 331158;331159;331160;331161;331162;331163;331164;331165;331166;331167;331168;331169 421454;421455;421456;421457;421458;421459;421460;421461;421462;421463;421464;421465;421466 421454 2916 13 QLENVLDDLDPESAMLPAGFR Unmodified 2329.126 0.12601173 4356 Q9NZR1 TMOD2 Tropomodulin-2 yes yes 0 0 0 3 3 2 1 2 3 3 3 2 3 2 3 165.41 165.41 2;3 2.1876E-64 167236 QUIQUE_C1576_190116_001 218.16 195.58 3792800000 234910000 392120000 113340000 246460000 307520000 0 320080000 328470000 519030000 112020000 563630000 544820000 110390000 36814 4356 34314 331170;331171;331172;331173;331174;331175;331176;331177;331178;331179;331180;331181;331182;331183;331184;331185;331186;331187;331188;331189;331190;331191;331192;331193;331194;331195;331196;331197;331198;331199 421467;421468;421469;421470;421471;421472;421473;421474;421475;421476;421477;421478;421479;421480;421481;421482;421483;421484;421485;421486;421487;421488;421489;421490;421491;421492;421493;421494;421495;421496;421497;421498;421499;421500;421501;421502;421503;421504;421505;421506;421507 421481 38 QLEQQEEILR Unmodified 1284.6674 0.66737948 3838 Q96DZ1 ERLEC1 Endoplasmic reticulum lectin 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.119 50.119 2 0.00030116 48518 QUIQUE_C1218_190116_001 134.66 86.375 174870000 43437000 0 0 0 43506000 0 40027000 0 0 10814000 0 37085000 0 36815 3838 34315 331200;331201;331202;331203;331204;331205;331206 421508;421509;421510;421511;421512;421513;421514 421508 7 QLEQSEKDLVK Unmodified 1315.6983 0.69834526 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 23.174 23.174 2;3 8.0351E-12 16682 QUIQUE_DMIX3_190116_001 163.43 106.39 313860000 0 0 0 0 0 0 0 60707000 0 0 209610000 43545000 0 36816 3433 34316 331207;331208;331209;331210;331211;331212 421515;421516;421517;421518;421519;421520;421521 421516 6 QLEQTLQQFNIK Unmodified 1488.7936 0.79364262 106 A0A087X1E4;P53365 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 96.098 96.098 2 0.00072798 98397 QUIQUE_C1368_190116_001 107.79 82.129 221130000 34267000 35340000 48914000 32775000 52386000 0 0 0 0 17449000 0 0 0 36817 106 34317 331213;331214;331215;331216;331217;331218 421522;421523;421524;421525;421526;421527;421528 421525 7 QLEQVIAK Unmodified 927.53893 0.53893149 1823 P02671;A0A087WUA0 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.49 28.49 2 0.0067774 23591 QUIQUE_C1218_190116_001 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0 0 1 1 1 15.603 15.603 2 0.034121 8068 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.265 32.975 138220000 0 0 0 0 0 0 0 66674000 0 22983000 0 48560000 0 36820 8;2486 34320 331241;331242;331243 421551;421552;421553 421551 3 QLETLGQEK Unmodified 1044.5451 0.54513908 772 CON__P05787;P05787;CON__H-INV:HIT000292931;F8VUG2;F8W1U3;CON__Q9H552;F8VP67 KRT8 Keratin, type II cytoskeletal 8 yes no 0 0 0 1 24.171 24.171 2 0.028558 17937 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.047 27.671 41450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41450000 0 + 36821 772 34321 331244 421554 421554 1 QLETVLDDLDPENALLPAGFR Unmodified 2325.1852 0.18524117 4333 Q9NYL9 TMOD3 Tropomodulin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 165.27 165.27 2 9.7226E-10 168503 QUIQUE_C1403_190116_001 143.98 129.29 76334000 0 0 0 43581000 0 21019000 0 0 0 11735000 0 0 0 36822 4333 34322 331245;331246;331247 421555;421556;421557 421555 3 QLEVEPEEPEAENK Unmodified 1639.7577 0.75771063 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.446 47.446 2 1.0652E-36 44782 QUIQUE_DMIX1_190116_001 220.1 193.42 758970000 88400000 51602000 70952000 52223000 44690000 52046000 58905000 43227000 59687000 24388000 89793000 56052000 67003000 36823 1324 34323 331248;331249;331250;331251;331252;331253;331254;331255;331256;331257;331258;331259;331260 421558;421559;421560;421561;421562;421563;421564;421565;421566;421567;421568;421569;421570 421565 12 QLEVYTSGGDPESVAGEYGR Unmodified 2112.96 0.95999226 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 1 1 91.053 91.053 2 1.6052E-48 92443 QUIQUE_DMIX1_190116_001 200.44 186.48 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36824 574 34324 331261;331262 421571;421572 421571 2 QLEYQQLEDDKLSQK Unmodified 1863.9214 0.92142191 143;4559 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;J3QS55;J3KS70;J3QKY2;J3KRD1;J3QKK4;J3QR33;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 62.5 62.5 2;3 4.9711E-130 61639 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331287;331288;331289;331290;331291;331292;331293;331294;331295;331296;331297;331298;331299;331300;331301;331302;331303;331304;331305;331306;331307;331308;331309;331310;331311;331312;331313;331314 421599;421600;421601;421602;421603;421604;421605;421606;421607;421608;421609;421610;421611;421612;421613;421614;421615;421616;421617;421618;421619;421620;421621;421622;421623;421624;421625;421626;421627;421628;421629;421630;421631;421632;421633;421634;421635;421636;421637 421624 38 QLFAQAEK Unmodified 933.49198 0.4919813 4249 Q9NQ48;H7C488;C9J0R9 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 27.961 27.961 2 0.015675 22800 QUIQUE_C1218_190116_001 84.368 52.413 505580000 74176000 0 78169000 0 0 53791000 0 60541000 0 27039000 71277000 74423000 66164000 36827 4249 34327 331315;331316;331317;331318;331319;331320;331321;331322 421638;421639;421640;421641;421642;421643;421644;421645 421638 8 QLFCWLDK Unmodified 1108.5376 0.53755128 2842 Q00169;F5GWE5 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 110.55 110.55 2 0.0086325 114220 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.54 0 974940000 0 0 0 0 0 0 218660000 0 148050000 0 197650000 195260000 215320000 36828 2842 34328 331323;331324;331325;331326;331327 421646;421647;421648;421649;421650;421651 421651 6 QLFDQVVK Unmodified 975.53893 0.53893149 859;2248;434 P26038;V9GZ54;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E9PNV3;E9PQ82;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 64.731 64.731 1;2 2.8872E-14 64929 QUIQUE_DMIX5_190116_001 217.02 139.73 13099000000 1015600000 1000800000 204970000 1230200000 1039000000 1110000000 1005600000 0 1475000000 945050000 1521900000 1198600000 1352000000 36829 2248;434;859 34329 331328;331329;331330;331331;331332;331333;331334;331335;331336;331337;331338;331339;331340;331341;331342;331343;331344 421652;421653;421654;421655;421656;421657;421658;421659;421660;421661;421662;421663;421664;421665;421666;421667;421668;421669;421670;421671;421672;421673 421670 16 QLFEIDSVDTEGKGDIQQAR Unmodified 2248.0972 0.097154447 4481 Q9UL15;G3V274 BAG5 BAG family molecular chaperone regulator 5 yes no 0 0 1 1 87.807 87.807 3 0.025895 88636 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.257 32.074 41135000 0 0 0 0 0 0 0 41135000 0 0 0 0 0 36830 4481 34330 331345 421674 421674 0 QLFHGTPVTIENFLNWK Unmodified 2043.0578 0.057796236 836 E5RGS5;E5RGQ3;Q9H446 RWDD1 RWD domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 141.59 141.59 3 0.0031883 146753 QUIQUE_DMIX3_190116_001 29.422 26.071 129020000 0 0 38256000 0 0 0 0 0 54467000 0 0 36296000 0 36831 836 34331 331346;331347;331348 421675;421676;421677 421676 2 QLFHPEQLITGK Unmodified 1409.7667 0.76669959 2795;3430;3992;2796;1990;688;1031;737 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421699 145 QLFHPEQLITGKEDAANNYAR Unmodified 2414.1979 0.19787154 2795;3430;3992;2796;1990;688;1031;737 C9JQ00;C9K0S6;F8VQQ4;F8VRZ4;F8VWV9;F8VX09;P0DPH8;P0DPH7;P68363;F8VVB9;F8VS66;P68366;C9JJQ8;C9JEV8;C9JDL2;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2;C9J2C0;Q9NY65 TUBA4A;TUBA8;TUBA1A;TUBA1B;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 0 1 2 4 3 3 3 2 3 3 3 2 5 3 4 87.14 87.14 2;3;4 5.0264E-286 82742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 283.83 275.84 135990000000 309540000 2961700000 1781500000 1249600000 7978700000 673260000 5172600000 25847000000 25137000000 207140000 19576000000 20642000000 24452000000 36833 737;1031;1990;2795;2796;3430;3992;688 34333 331412;331413;331414;331415;331416;331417;331418;331419;331420;331421;331422;331423;331424;331425;331426;331427;331428;331429;331430;331431;331432;331433;331434;331435;331436;331437;331438;331439;331440;331441;331442;331443;331444;331445;331446;331447;331448;331449;331450;331451 421827;421828;421829;421830;421831;421832;421833;421834;421835;421836;421837;421838;421839;421840;421841;421842;421843;421844;421845;421846;421847;421848;421849;421850;421851;421852;421853;421854;421855;421856;421857;421858;421859;421860;421861;421862;421863;421864;421865;421866;421867;421868;421869;421870;421871;421872;421873;421874;421875;421876;421877;421878;421879;421880;421881;421882;421883;421884;421885;421886;421887;421888;421889;421890;421891;421892;421893;421894;421895;421896;421897;421898;421899;421900;421901;421902;421903;421904;421905;421906;421907;421908;421909;421910;421911;421912;421913;421914;421915;421916;421917;421918;421919 421873 91 QLFLEAVER Unmodified 1103.5975 0.597509 701 C9J695;Q6ICL3 TANGO2 Transport and Golgi organization protein 2 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 85.949 85.949 2 0.040678 88210 QUIQUE_C1368_190116_001 53.327 27.59 87958000 0 0 33957000 0 32397000 0 21604000 0 0 0 0 0 0 36834 701 34334 331452;331453;331454 421920;421921;421922;421923 421921 4 QLFLGGVDR Unmodified 1003.5451 0.5450795 2038 P12235;V9GYG0 SLC25A4 ADP/ATP translocase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.084 69.084 2 0.00041537 69469 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.15 55.378 4756900000 469130000 386720000 331540000 266490000 283050000 267100000 332320000 515700000 369820000 228670000 512530000 439080000 354730000 36835 2038 34335 331455;331456;331457;331458;331459;331460;331461;331462;331463;331464;331465;331466;331467 421924;421925;421926;421927;421928;421929;421930;421931;421932;421933;421934;421935;421936;421937;421938;421939;421940;421941;421942 421934 19 QLFLQTYAR Unmodified 1138.6135 0.61349341 2630 P53621;A0A3B3IS84;A0A3B3ISC6;A0A3B3ITI7 COPA Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.499 76.499 2 0.00048535 77485 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.02 95.179 262010000 0 0 26161000 0 37472000 0 32409000 32461000 42714000 0 40648000 25079000 25065000 36836 2630 34336 331468;331469;331470;331471;331472;331473;331474;331475;331476;331477 421943;421944;421945;421946;421947;421948;421949;421950;421951;421952;421953;421954;421955 421948 13 QLFSSLFSGILK Unmodified 1338.7547 0.75473792 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.79 152.79 2 0.00054247 158205 QUIQUE_C1368_190116_001 93.096 75.231 337940000 0 21516000 49629000 0 26586000 31883000 28244000 27808000 43970000 11013000 43771000 37721000 15796000 36837 2813 34337 331478;331479;331480;331481;331482;331483;331484;331485;331486;331487;331488;331489 421956;421957;421958;421959;421960;421961;421962;421963;421964;421965;421966;421967;421968 421957 12 QLFVLAGAAEEGFMTAELAGVIK Oxidation (M) 2380.2348 0.2348339 2779 P63096 GNAI1 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 yes yes 0 1 0 2 1 1 166.79 166.79 2;3 1.2723E-07 171779 QUIQUE_C1368_190116_001 80.387 66.423 116200000 0 0 57390000 33317000 0 25489000 0 0 0 0 0 0 0 36838 2779 34338 331490;331491;331492;331493 421969;421970;421971;421972 421970 2224 4 QLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIK Unmodified 2358.2505 0.25048397 1953 P08754 GNAI3 Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 152.38 152.38 2 4.9401E-18 155332 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.84 83.706 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36839 1953 34339 331494;331495 421973;421974 421973 2 QLGDAVTQIATTWER Unmodified 1687.8529 0.85294842 4712 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.469 86.469 2 0.0010585 88958 QUIQUE_C1218_190116_001 72.2 43.624 229750000 30645000 39725000 0 0 0 0 0 65890000 57718000 35767000 0 0 0 + 36840 4712 34340 331496;331497;331498;331499;331500;331501 421975;421976;421977;421978;421979;421980 421975 6 QLGDNEAITQEIVGCAHLENYALK Unmodified 2685.3068 0.30682965 70 A0A087WY55;Q9NP79;Q5TGM0 VTA1 Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 130.52 130.52 3 1.824E-32 134882 QUIQUE_C1277_190116_001 139.51 121.41 1254100000 0 230620000 0 193700000 234570000 199620000 0 0 0 74646000 170440000 150530000 0 36841 70 34341 331502;331503;331504;331505;331506;331507;331508;331509;331510;331511 421981;421982;421983;421984;421985;421986;421987;421988;421989;421990;421991;421992;421993 421983 12 QLGELLTDGVR Unmodified 1199.651 0.65100113 3525 Q8IU81 IRF2BP1 Interferon regulatory factor 2-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 83.923 83.923 2 0.06145 86024 QUIQUE_C1368_190116_001 50.452 23.779 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36842 3525 34342 331512 421994 421994 1 QLGENFSGIYCSLLPLGCWSADSQR Unmodified 2857.3163 0.31634848 727 C9JIF9;P13798;H7C1U0 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 163.39 163.39 2;3 1.8355E-19 167300 QUIQUE_C1277_190116_001 76.237 72.705 529690000 0 53381000 39242000 32119000 51598000 31762000 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331528;331529;331530;331531;331532;331533;331534;331535;331536;331537;331538;331539;331540;331541 422010;422011;422012;422013;422014;422015;422016;422017;422018;422019;422020;422021;422022;422023 422019 14 QLGGGYYVFPGASHNR Unmodified 1721.8274 0.82740237 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90;A0A2R8YF51;A0A2R8Y5D2;A0A2R8Y6J9 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 1 68.355 68.355 3 0.015519 67782 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.167 7.4663 179850000 0 101850000 0 0 0 0 0 78009000 0 0 0 0 0 36846 4598 34346 331542;331543 422024;422025 422025 2 QLGGSVELVDIGK Unmodified 1313.7191 0.7190807 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3KSV5;A0A087WYZ1;J3QRA8;J3QR27;J3QLU1;J3QKQ0;J3QRD0;J3QQN6;J3QL02;A0A087WVS2;J3KRD5 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 90.291 90.291 1;2 0.0012219 92359 QUIQUE_C1576_190116_001 102.53 64.982 24768000 24768000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36847 3897 34347 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0.13539463 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 1 0 1 115.54 115.54 2 2.2411E-09 121573 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.942 93.848 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36856 1591 34354 331586 422069 422069 866 1 QLGQDLLNSYIENEGK Unmodified 1819.8952 0.89520716 1748 O95757;E9PDE8 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 123.93 123.93 2 8.4457E-36 127279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.98 157.64 915250000 133890000 87158000 74989000 0 94229000 0 62150000 84001000 96211000 0 68417000 112340000 101860000 36857 1748 34355 331587;331588;331589;331590;331591;331592;331593;331594;331595;331596;331597 422070;422071;422072;422073;422074;422075;422076;422077;422078;422079;422080;422081;422082 422078 12 QLGTAYVSATTGAVATALGLK Unmodified 1992.0892 0.089155943 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5;S4R3N9 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 151.01 151.01 2;3 4.9879E-35 155973 QUIQUE_DMIX3_190116_001 188.59 175.18 1199400000 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422438;422439;422440;422441;422442;422443;422444;422445;422446;422447;422448;422449;422450;422451;422452;422453;422454;422455;422456;422457;422458;422459;422460;422461;422462;422463;422464;422465;422466;422467;422468;422469;422470;422471;422472;422473;422474 422467 36 QLLDQVEQIQK Unmodified 1340.73 0.72997974 3475 Q7Z7H5 TMED4 Transmembrane emp24 domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.766 79.766 2 1.3323E-05 82126 QUIQUE_C1438_190116_001 143.04 37.936 463240000 0 0 78039000 75941000 71441000 0 63190000 0 65748000 0 0 58328000 50551000 36895 3475 34391 331913;331914;331915;331916;331917;331918;331919 422475;422476;422477;422478;422479;422480;422481 422477 6 QLLEEELAR Unmodified 1099.5873 0.58733824 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.958 65.958 2 0.00051151 65279 QUIQUE_C1368_190116_001 128.61 79.852 6002000000 389380000 456750000 479090000 157750000 404140000 0 399600000 757510000 784290000 262750000 858010000 640620000 412150000 36896 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Q9NZN5;E9PMR6 ARHGEF12 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.22 97.22 2 0.00041183 99496 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.597 35.634 66693000 0 0 0 0 0 0 0 25648000 20686000 0 0 20359000 0 36934 4354 34429 332291;332292;332293;332294;332295 422941;422942;422943;422944;422945 422945 5 QLLWLELLR Unmodified 1182.7125 0.71247918 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.29 157.29 2 0.006361 162682 QUIQUE_C1368_190116_001 134.15 116.91 997460000 71382000 99721000 182630000 49738000 54035000 36393000 76661000 73376000 107060000 0 89969000 80845000 75655000 36935 62 34430 332296;332297;332298;332299;332300;332301;332302;332303;332304;332305;332306;332307 422946;422947;422948;422949;422950;422951;422952;422953;422954;422955;422956;422957;422958 422948 12 QLLYSFK Unmodified 897.496 0.49600404 156 A0A0C4DG97;A0A0A0MRS5;F8W946;Q9BXM9;Q8N450 FSD1L FSD1-like protein yes no 0 0 0 1 69.342 69.342 2 0.05362 70375 QUIQUE_C1438_190116_001 72.875 36.046 29292000 0 0 0 0 29292000 0 0 0 0 0 0 0 0 36936 156 34431 332308 422959 422959 1 QLMADLVVSK Unmodified 1102.6056 0.60563084 1471 O14994;A0A0A0MR68;A0A087WTG8 SYN3 Synapsin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.139 76.139 2 0.0027576 76556 QUIQUE_C1403_190116_001 88.136 66.389 329240000 45107000 45183000 35197000 27908000 28389000 0 39520000 23721000 26132000 0 0 29227000 28856000 36937 1471 34432 332309;332310;332311;332312;332313;332314;332315;332316;332317;332318 422960;422961;422962;422963;422964;422965;422966;422967;422968;422969;422970;422971 422964 12 QLMEAKQQELK Oxidation (M) 1360.7021 0.70205043 3931 Q96RL7 VPS13A Vacuolar protein sorting-associated protein 13A yes yes 0 1 1 1 1 81.494 81.494 3 0.03164 82494 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.353 22.176 160330000 0 0 0 0 0 88127000 0 0 0 0 0 72199000 0 36938 3931 34433 332319;332320 422972;422973 422973 2 QLMETPANEMTPTR Oxidation (M) 1633.744 0.74399159 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 43.504 43.504 2 8.0643E-14 40214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.1 124.66 133810000 0 0 0 0 0 0 0 50167000 35236000 13848000 34557000 0 0 36939 2282 34434 332321;332322;332323;332324;332325;332326;332327 422974;422975;422976;422977;422978;422979;422980 422977 1666 7 QLMETPANEMTPTR Unmodified 1617.7491 0.74907697 2282 P28838;H0Y9Q1 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.518 63.518 2 1.0838E-13 62714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.72 119.52 1276900000 0 0 192690000 210450000 70790000 147180000 0 152680000 120850000 60428000 155460000 0 166340000 36940 2282 34434 332328;332329;332330;332331;332332;332333;332334;332335;332336;332337;332338 422981;422982;422983;422984;422985;422986;422987;422988;422989;422990;422991 422986 8 QLMSELETLPR Unmodified 1315.6806 0.6805867 1595 O60826 CCDC22 Coiled-coil domain-containing protein 22 yes yes 0 0 0 1 1 1 98.585 98.585 2 0.0066117 100321 QUIQUE_C1368_190116_001 75.509 56.253 26816000 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Unmodified 999.50976 0.50975662 2758 P62714;E5RJX4 PPP2CB Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform yes no 0 0 0 1 14.652 14.652 2 0.039728 6691 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.709 22.29 7070500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7070500 0 0 0 36944 2758 34438 332355 423010 423010 1 QLNESIIVALFQGQFK Unmodified 1833.9989 0.99888437 2428 P40818 USP8 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8 yes yes 0 0 0 1 163.68 163.68 3 0.00017868 166010 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.68 49.087 7899300 0 0 0 0 0 0 0 7899300 0 0 0 0 0 36945 2428 34439 332356 423011 423011 1 QLNHFWEIVVQDGITLITK Unmodified 2253.2158 0.21575344 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 169.46 169.46 2;3 3.941E-55 176681 QUIQUE_DMIX5_190116_001 222.88 204.97 848580000 13457000 0 29999000 0 0 0 30157000 23009000 71256000 0 228320000 431590000 20796000 36946 2051 34440 332357;332358;332359;332360;332361;332362;332363;332364;332365;332366 423012;423013;423014;423015;423016;423017;423018;423019;423020;423021 423018 10 QLNHPNVIK Unmodified 1061.5982 0.5981777 3686 Q8TDX7 NEK7 Serine/threonine-protein kinase Nek7 yes yes 0 0 0 1 1 16.821 16.821 3 0.027762 8523 QUIQUE_C1277_190116_001 39.919 18.947 71851000 0 39474000 0 0 0 0 0 32377000 0 0 0 0 0 36947 3686 34441 332367;332368 423022;423023 423022 2 QLNIIQNAEAVHFFCNYEESR Unmodified 2581.202 0.20197064 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7;H3BPW8;H3BMJ9 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 1 2 2 2 132.09 132.09 2;3 4.7294E-233 137005 QUIQUE_C1368_190116_001 266.42 247.09 9900900000 912790000 644230000 885010000 639200000 784520000 714580000 870070000 667960000 743290000 190850000 863050000 909570000 1075800000 36948 1198 34442 332369;332370;332371;332372;332373;332374;332375;332376;332377;332378;332379;332380;332381;332382;332383;332384;332385;332386;332387;332388;332389;332390;332391;332392;332393;332394 423024;423025;423026;423027;423028;423029;423030;423031;423032;423033;423034;423035;423036;423037;423038;423039;423040;423041;423042;423043;423044;423045;423046;423047;423048;423049;423050;423051;423052;423053;423054;423055;423056;423057;423058;423059;423060;423061;423062;423063;423064 423034 41 QLNNLALLCQNQGK Unmodified 1612.8355 0.83552421 1050;4286 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;Q9NSK0;H7C4M1;K7EL76;Q6P597 KLC1;KLC4;KLC3 Kinesin light chain 1;Kinesin light chain 4;Kinesin light chain 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.049 77.049 2 2.2012E-87 77546 QUIQUE_DMIX1_190116_001 222.88 180.69 1324600000 103410000 152130000 95021000 101320000 110580000 110510000 146410000 98484000 125550000 69818000 110550000 100800000 0 36949 1050;4286 34443 332395;332396;332397;332398;332399;332400;332401;332402;332403;332404;332405;332406 423065;423066;423067;423068;423069;423070;423071;423072;423073;423074;423075;423076;423077;423078 423073 14 QLNPINLTER Unmodified 1196.6513 0.65133548 1405 O00442 RTCA RNA 3'-terminal phosphate cyclase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 67.885 67.885 2 0.0052095 68310 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.264 38.966 256770000 0 0 63590000 58755000 0 0 0 0 28201000 0 64985000 0 41242000 36950 1405 34444 332407;332408;332409;332410;332411 423079;423080;423081;423082;423083 423081 5 QLNSALPQDIESLTGGLAGSK Unmodified 2098.0906 0.090612506 1078 G3V200;O75334;F8VU88 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 137.86 137.86 2 4.9552E-05 142867 QUIQUE_C1368_190116_001 86.497 33.245 62867000 30510000 0 32357000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36951 1078 34445 332412;332413;332414;332415;332416 423084;423085;423086;423087;423088 423085 5 QLNSTVSSLHSR Unmodified 1327.6844 0.68442653 1145 H0YD93;Q8WXA3 RUFY2 RUN and FYVE domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 20.211 20.211 2;3 0.0092567 13175 QUIQUE_C1368_190116_001 47.915 35.338 59082000 0 0 42672000 0 0 0 0 0 0 0 16411000 0 0 36952 1145 34446 332417;332418 423089;423090 423089 2 QLPDKWQHDLFDSGFGGGAGVETGGK Unmodified 2702.2725 0.27249305 893 E9PB61;Q86V81 ALYREF THO complex subunit 4 yes no 0 0 1 1 1 106.97 106.97 3;4 0.038148 109357 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.888 9.959 75360000 0 0 0 0 0 0 0 34557000 0 0 0 40803000 0 36953 893 34447 332419;332420 423091;423092 423091 2 QLPELIR Unmodified 867.5178 0.51780212 2157 P19971;C9JGI3 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 1 62.056 62.056 2 0.060325 61187 QUIQUE_C1368_190116_001 69.383 28.081 118330000 0 0 118330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36954 2157 34448 332421 423093 423093 1 QLPFLLYQVTR Unmodified 1376.7816 0.78162138 3440 Q7L3T8 PARS2 Probable proline--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 132.82 132.82 2 0.009375 136187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.283 52.912 56706000 0 0 0 0 0 0 0 18723000 19257000 0 0 0 18726000 36955 3440 34449 332422;332423;332424 423094;423095;423096 423094 3 QLPFRGDDGIFDDNFIEER Unmodified 2282.0604 0.060375011 1578 O60493 SNX3 Sorting nexin-3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 129.56 129.56 3 0.0044894 133535 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light chain 3B;Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2;Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.84 41.84 2 0.0206 39353 QUIQUE_C1218_190116_001 107.67 50.571 4017800000 386030000 394930000 362530000 328620000 350320000 341040000 348010000 288380000 295300000 137590000 437800000 347260000 0 36961 529;4168 34455 332455;332456;332457;332458;332459;332460;332461;332462;332463;332464;332465;332466 423144;423145;423146;423147;423148;423149;423150;423151;423152;423153;423154;423155;423156;423157;423158;423159;423160;423161;423162 423144 19 QLQAAAAHWQQHQQHR Unmodified 1936.9517 0.95170846 2540 P49750;F8VU51 YLPM1 YLP motif-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 15.578 15.578 3;4 0.00016634 7635 QUIQUE_C1576_190116_001 65.956 45.118 155730000 0 37400000 0 0 0 0 20841000 26559000 0 0 35516000 0 35418000 36962 2540 34456 332467;332468;332469;332470;332471;332472;332473 423163;423164;423165;423166;423167;423168;423169 423166 7 QLQAETEPIVK Unmodified 1254.682 0.68196691 2690 P60228;H0YBR5;E5RIT4 EIF3E Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E yes no 0 0 0 1 1 1 1 40.821 40.821 2 0.00011901 35884 QUIQUE_DMIX4_190116_001 130.75 76.993 161300000 0 0 0 54059000 0 33357000 0 0 0 34713000 0 39175000 0 36963 2690 34457 332474;332475;332476;332477 423170;423171;423172;423173;423174 423172 3 QLQALSSELAQAR Unmodified 1413.7576 0.75759147 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y4H6 RDX Radixin yes no 0 0 0 1 1 73.991 73.991 2 4.3417E-39 71943 QUIQUE_DMIX4_190116_001 187.99 145.39 311050000 0 0 0 0 311050000 0 0 0 0 0 0 0 0 36964 434 34458 332478;332479 423175;423176 423176 2 QLQAQDEEGGGHVPERPK Unmodified 1973.9555 0.95551601 847 E7EMG9;P33241;C9JU59;C9JDV1 LSP1 Lymphocyte-specific protein 1 yes no 0 0 1 1 20.422 20.422 3 0.00035617 13307 QUIQUE_C1403_190116_001 62.765 30.031 22956000 0 0 0 22956000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36965 847 34459 332480 423177 423177 1 QLQDELEMLVER Unmodified 1501.7446 0.74464352 2976 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Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 55.488 55.488 3 0.01548 54349 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.682 20.317 220940000 0 0 0 0 0 0 0 0 109450000 0 111490000 0 0 36972 1187 34466 332506;332507 423204;423205 423204 2 QLQEERPELSESELTR Unmodified 1942.9596 0.95959833 954 E9PKP7;P17480;E9PLT2 UBTF Nucleolar transcription factor 1 yes no 0 0 1 1 60.07 60.07 3 0.025866 55602 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.083 25.968 12293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12293000 0 0 0 36973 954 34467 332508 423206 423206 1 QLQEETPPGGPLTEALPPAR Unmodified 2100.0851 0.085133198 4658 Q9Y6M9;E9PH64 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 95.772 95.772 2;3 2.9022E-64 99317 QUIQUE_DMIX5_190116_001 218.6 175.79 512860000 49751000 116920000 57274000 0 35864000 38012000 79424000 0 0 42645000 0 48462000 44510000 36974 4658 34468 332509;332510;332511;332512;332513;332514;332515;332516;332517;332518;332519;332520;332521;332522;332523 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423239 7 QLQELEDKQNADISAMQDTINK Unmodified 2531.2173 0.21734594 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 86.659 86.659 2;3 2.177E-53 88289 QUIQUE_C1277_190116_001 160.81 156.49 1557700000 73404000 242880000 127290000 136470000 93415000 85009000 222600000 76512000 0 90577000 177740000 93946000 137910000 36977 1916 34471 332538;332539;332540;332541;332542;332543;332544;332545;332546;332547;332548;332549;332550;332551 423244;423245;423246;423247;423248;423249;423250;423251;423252;423253;423254;423255;423256;423257;423258;423259;423260;423261 423247 16 QLQELEDKQNADISAMQDTINKLENELR Unmodified 3285.6147 0.61469857 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 149.87 149.87 3;4 7.7934E-66 154122 QUIQUE_C1403_190116_001 158.18 142.04 5317300000 34395000 242430000 110600000 146870000 336590000 0 0 906370000 723910000 36349000 1252200000 696170000 831350000 36978 1916 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423605 698 QLQSLTCDLESLRG Unmodified 1618.7985 0.79847001 1322 K7EKD1 GFAP yes yes 0 0 1 3 3 3 3 8 5 5 5 7 4 3 4 11 126.96 126.96 2;3 2.5034E-37 117111 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.77 148.43 81717000000 3507700000 3719300000 6266500000 5578200000 8434600000 7614900000 7476600000 5667400000 5731900000 3327300000 6077500000 8175000000 10140000000 37002 1322 34496 333265;333266;333267;333268;333269;333270;333271;333272;333273;333274;333275;333276;333277;333278;333279;333280;333281;333282;333283;333284;333285;333286;333287;333288;333289;333290;333291;333292;333293;333294;333295;333296;333297;333298;333299;333300;333301;333302;333303;333304;333305;333306;333307;333308;333309;333310;333311;333312;333313;333314;333315;333316;333317;333318;333319;333320;333321;333322;333323;333324;333325;333326;333327;333328 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424257;424258;424259;424260;424261;424262;424263;424264 424259 8 QLQSPLPLPTTLPLLSASIASTK Unmodified 2375.3676 0.36756264 3684 Q8TDJ6;H0YLM8 DMXL2 DmX-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 160.87 160.87 3 7.229E-08 166281 QUIQUE_C1218_190116_001 75.184 72.087 153000000 20263000 24773000 26259000 15173000 23985000 0 0 21107000 0 7327600 0 14109000 0 37004 3684 34498 333336;333337;333338;333339;333340;333341;333342;333343 424265;424266;424267;424268;424269;424270;424271;424272;424273 424265 9 QLQTFFHK Unmodified 1047.5502 0.55016488 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 39.626 39.626 2;3 0.042707 35262 QUIQUE_C1403_190116_001 58.819 34.962 375770000 0 0 0 120530000 0 94172000 0 161070000 0 0 0 0 0 37005 98;3487 34499 333344;333345;333346 424274;424275;424276;424277 424274 4 QLQTLAPK Unmodified 897.52837 0.5283668 3530 Q8IV08;M0R2W7;E2QRG1;M0R1F7 PLD3 Phospholipase D3 yes no 0 0 0 1 1 23.667 23.667 2 0.018737 16878 QUIQUE_C1277_190116_001 79.469 33.517 99163000 0 40603000 0 58560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37006 3530 34500 333347;333348 424278;424279 424278 2 QLQVDLQILR Unmodified 1224.719 0.71902112 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 107.81 107.81 2 0.013504 111418 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.267 37.591 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37007 1187 34501 333349;333350 424280;424281 424281 2 QLQVLAGIYPIAQIQEPYTAVGYLASR Unmodified 2961.5964 0.59639337 2401 P36915;A0A140T8Y2 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 164.14 164.14 2;3 1.0676E-77 166177 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.01 157.4 1103900000 66897000 82442000 41938000 62465000 99374000 46874000 93771000 81874000 114760000 33907000 177720000 90434000 111490000 37008 2401 34502 333351;333352;333353;333354;333355;333356;333357;333358;333359;333360;333361;333362;333363;333364 424282;424283;424284;424285;424286;424287;424288;424289;424290;424291;424292;424293;424294;424295;424296;424297;424298;424299 424290 18 QLQVVPLFGDMQIELAR Oxidation (M) 1972.0452 0.045182639 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 139.51 139.51 2;3 1.8522E-07 145316 QUIQUE_C1218_190116_001 111.12 88.59 487680000 33762000 35638000 36704000 34778000 0 20690000 47619000 53105000 48830000 20188000 51481000 48048000 56837000 37009 292;882;3442 34503 333365;333366;333367;333368;333369;333370;333371;333372;333373;333374;333375;333376;333377 424300;424301;424302;424303;424304;424305;424306;424307;424308;424309;424310;424311;424312 424300 223 13 QLQVVPLFGDMQIELAR Unmodified 1956.0503 0.050268017 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.74 156.74 2 1.6966E-37 159362 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.69 137.31 992360000 61421000 82255000 58211000 65614000 91720000 37938000 89878000 93250000 99001000 15941000 129400000 110360000 57364000 37010 292;882;3442 34503 333378;333379;333380;333381;333382;333383;333384;333385;333386;333387;333388;333389;333390 424313;424314;424315;424316;424317;424318;424319;424320;424321;424322;424323;424324;424325;424326 424321 13 QLQYCPSVESPYSK Unmodified 1684.7767 0.77667193 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.921 68.921 2 1.2114E-17 68474 QUIQUE_C1403_190116_001 153.95 133.17 521720000 49241000 55036000 0 77619000 58857000 63185000 36859000 68938000 49996000 0 0 61989000 0 37011 855;928 34504 333391;333392;333393;333394;333395;333396;333397;333398;333399 424327;424328;424329;424330;424331;424332;424333;424334;424335 424329 9 QLQYDPTPLTWSK Unmodified 1575.7933 0.79330827 2686 P58397 ADAMTS12 A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 12 yes yes 0 0 0 3 2 1 2 2 1 5 3 3 5 6 2 7 159.9 159.9 2 0.00062027 114497 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.476 53.27 145300000000 4655500000 5292500000 5924500000 5449800000 4756100000 5902800000 4968500000 25034000000 19694000000 15169000000 16073000000 16334000000 16047000000 37012 2686 34505 333400;333401;333402;333403;333404;333405;333406;333407;333408;333409;333410;333411;333412;333413;333414;333415;333416;333417;333418;333419;333420;333421;333422;333423;333424;333425;333426;333427;333428;333429;333430;333431;333432;333433;333434;333435;333436;333437;333438;333439;333440;333441 424336;424337;424338;424339;424340;424341;424342;424343;424344;424345;424346;424347;424348;424349;424350;424351;424352;424353;424354;424355;424356;424357;424358;424359;424360;424361;424362;424363;424364;424365;424366;424367;424368;424369;424370;424371;424372;424373;424374;424375;424376;424377;424378;424379;424380;424381;424382;424383;424384;424385;424386;424387;424388;424389;424390;424391;424392;424393;424394;424395;424396;424397;424398;424399;424400;424401;424402;424403;424404;424405;424406;424407;424408;424409;424410;424411;424412;424413;424414;424415;424416;424417;424418 424410 81 QLRDESQLR Unmodified 1143.5996 0.59963426 1145 H0YD93;Q8WXA3 RUFY2 RUN and FYVE domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.013 19.013 2;3 0.0026771 11906 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.26 38.351 359120000 0 41112000 60675000 0 0 19745000 0 0 97418000 0 0 63004000 77167000 37013 1145 34506 333442;333443;333444;333445;333446;333447 424419;424420;424421;424422;424423;424424 424422 6 QLSAFGEYVAEILPK Unmodified 1663.8821 0.88212328 1639 O75489;E9PS48;G3V194;E9PKL8 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 152.88 152.88 2 4.4283E-05 148590 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.641 65.107 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37014 1639 34507 333448;333449 424425;424426 424425 2 QLSAQGQMTQLCELINK Unmodified 1960.971 0.97103142 4514 Q9UNS2;C9JLV5;J3QKR0;J3KTQ1 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 120.75 120.75 2;3 8.1879E-75 124598 QUIQUE_C1277_190116_001 197.25 182.05 199960000 28838000 54076000 30670000 40707000 45665000 0 0 0 0 0 0 0 0 37015 4514 34508 333450;333451;333452;333453;333454;333455;333456;333457 424427;424428;424429;424430;424431;424432;424433;424434;424435;424436 424429 10 QLSDAISIIGR Unmodified 1171.6561 0.65608651 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.474 96.474 2 0.0023878 98781 QUIQUE_C1277_190116_001 103.26 50.773 750850000 74283000 102080000 0 108250000 128960000 78862000 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QLTAELAEHR Unmodified 1166.6044 0.60438529 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 26.986 26.986 3 0.016765 21375 QUIQUE_DMIX3_190116_001 38.783 23.632 37768000 0 0 0 0 0 0 0 0 37768000 0 0 0 0 37033 3997 34525 333604 424633 424633 1 QLTAHLQDVNR Unmodified 1293.6789 0.67894722 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 2 1 2 28.219 28.219 2;3 1.6602E-12 23178 QUIQUE_DMIX1_190116_001 187.1 149.95 2775300000 103740000 334800000 373270000 125040000 107460000 96439000 109530000 287780000 355840000 25281000 405310000 124030000 326770000 37034 890;3052 34526 333605;333606;333607;333608;333609;333610;333611;333612;333613;333614;333615;333616;333617;333618;333619;333620;333621;333622;333623 424634;424635;424636;424637;424638;424639;424640;424641;424642;424643;424644;424645;424646;424647;424648;424649;424650;424651;424652;424653;424654;424655;424656;424657 424646 24 QLTCTEEMAQR Unmodified 1365.6017 0.60168445 3147 Q15599;H3BMF5 SLC9A3R2 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.405 30.405 2 0.00034234 24722 QUIQUE_C1403_190116_001 118.18 103.88 247850000 35727000 51710000 0 51490000 0 42608000 39152000 0 0 0 0 27163000 0 37035 3147 34527 333624;333625;333626;333627;333628;333629;333630 424658;424659;424660;424661;424662;424663;424664;424665 424661 8 QLTEADLR Unmodified 944.49271 0.49270958 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;Q14168 MPP2 MAGUK p55 subfamily member 2 yes no 0 0 0 1 1 35.158 35.158 2 0.037751 30609 QUIQUE_C1218_190116_001 61.962 25.567 137980000 90593000 0 0 0 0 0 0 0 0 47385000 0 0 0 37036 159 34528 333631;333632 424666;424667 424666 2 QLTEIYGGLSAGEFQLIR Unmodified 1994.0473 0.047291129 3705 Q8WVF1;C9JF58 OSCP1 Protein OSCP1 no no 0 0 0 1 141.54 141.54 2 0.00084744 146661 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.219 59.54 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37037 3705 34529 333633 424668 424668 1 QLTEMLPSILNQLGADSLTSLR Unmodified 2399.273 0.27301032 2162 P20290;H0Y9Y1;D6RDG3 BTF3 Transcription factor BTF3 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 1 1 168.85 168.85 2;3 3.7579E-36 170437 QUIQUE_C1563_190116_001 176.23 150.25 700600000 28729000 9926000 52503000 150700000 34506000 51752000 44524000 75413000 144060000 18701000 38924000 0 50862000 37038 2162 34530 333634;333635;333636;333637;333638;333639;333640;333641;333642;333643;333644;333645;333646;333647;333648;333649;333650 424669;424670;424671;424672;424673;424674;424675;424676;424677;424678;424679;424680;424681;424682;424683;424684;424685 424676 17 QLTFEEIAK Unmodified 1077.5706 0.57062555 4512 Q9UNM6;A0A087WUL9;E9PL38 PSMD13 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 71.998 71.998 2 0.0017893 72517 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.09 63.521 292280000 0 0 66835000 76630000 0 0 0 0 60486000 0 0 0 88329000 37039 4512 34531 333651;333652;333653;333654;333655 424686;424687;424688;424689;424690 424690 5 QLTLEQLHAVEISAVHSR Unmodified 2030.0909 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333668;333669;333670;333671;333672;333673;333674;333675;333676;333677;333678;333679;333680;333681;333682;333683;333684;333685;333686;333687;333688;333689;333690 424709;424710;424711;424712;424713;424714;424715;424716;424717;424718;424719;424720;424721;424722;424723;424724;424725;424726;424727;424728;424729;424730;424731;424732;424733 424721 22 QLTLSCPLCVNPVCR Unmodified 1815.8794 0.87937964 2203 P22830 FECH Ferrochelatase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 102.35 102.35 2 6.5311E-13 105474 QUIQUE_DMIX8_190116_001 136.48 113.9 166160000 0 0 0 0 0 0 0 31960000 39252000 0 36252000 0 58693000 37042 2203 34534 333691;333692;333693;333694;333695;333696 424734;424735;424736;424737;424738;424739 424739 5 QLTPEQLSTLLTLLQLLPK Unmodified 2148.277 0.27695671 3201 Q16849 PTPRN Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 174.68 174.68 2;3 6.9663E-08 181717 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.88 99.903 147750000 0 9919300 0 0 0 0 20756000 5838400 16097000 0 50585000 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Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 36.407 36.407 2 0.058687 32640 QUIQUE_C1438_190116_001 53.554 22.886 36163000 0 0 0 0 36163000 0 0 0 0 0 0 0 0 37046 2993 34538 333721 424766 424766 1 QLTVLSDQQK Unmodified 1158.6245 0.62445203 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.512 36.512 2 0.00034043 31976 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.19 85.269 419640000 49633000 37865000 41160000 41313000 58992000 0 49347000 51182000 0 23381000 66771000 0 0 37047 1534 34539 333722;333723;333724;333725;333726;333727;333728;333729;333730 424767;424768;424769;424770;424771;424772;424773;424774;424775 424775 7 QLTVQMMQNPQILAALQER Unmodified 2211.1504 0.15039277 1010 F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;F8W020;F8W0J6;F8VXI6;F8VUX1;F8VVB5 NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 138.7 138.7 2;3 1.2489E-172 143319 QUIQUE_DMIX3_190116_001 306.05 268.9 1141600000 63804000 91974000 38091000 89344000 54561000 87543000 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333808;333809;333810;333811;333812;333813;333814;333815;333816;333817;333818;333819;333820 424857;424858;424859;424860;424861;424862;424863;424864;424865;424866;424867;424868;424869;424870;424871;424872;424873;424874 424860 18 QLVHALAMHYAAGALFR Oxidation (M) 1883.9829 0.98285715 3474 Q7Z7G8 VPS13B Vacuolar protein sorting-associated protein 13B yes yes 0 1 0 1 1 104.06 104.06 2 0.010262 107566 QUIQUE_C1218_190116_001 50.284 27.809 1213100000 552310000 660840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37061 3474 34553 333821;333822 424875;424876 424875 2670 2 QLVHELDEAEYR Unmodified 1500.7209 0.72087161 2901 Q06323;H0YKK6 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 52.828 52.828 2;3 4.7245E-55 50365 QUIQUE_C1368_190116_001 212.28 186.89 3777000000 297570000 332110000 505640000 426060000 312450000 257020000 233430000 326710000 352240000 184000000 307850000 139410000 102500000 37062 2901 34554 333823;333824;333825;333826;333827;333828;333829;333830;333831;333832;333833;333834;333835;333836;333837;333838;333839;333840;333841;333842;333843;333844;333845;333846 424877;424878;424879;424880;424881;424882;424883;424884;424885;424886;424887;424888;424889;424890;424891;424892;424893;424894;424895;424896;424897;424898;424899;424900;424901;424902;424903;424904;424905;424906;424907;424908 424883 32 QLVMNHMHHEDQQVR Oxidation (M) 1916.8734 0.87338306 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 1 0 1 1 1 3 2 1 2 2 2 1 2 1 10.5 10.5 3;4 9.5169E-19 2843 QUIQUE_C1368_190116_001 141.46 134.06 503730000 36905000 8598500 17853000 67258000 43777000 0 9298400 58677000 82957000 19399000 19022000 113830000 26157000 37063 4443 34555 333847;333848;333849;333850;333851;333852;333853;333854;333855;333856;333857;333858;333859;333860;333861;333862;333863;333864;333865 424909;424910;424911;424912;424913;424914;424915;424916;424917;424918;424919;424920;424921;424922;424923;424924;424925;424926;424927;424928;424929 424911 2962;2963 20 QLVMNHMHHEDQQVR Unmodified 1900.8785 0.87846844 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 16.225 16.225 3;4 5.9279E-07 8414 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.72 101.91 1964300000 205000000 339800000 107540000 232520000 45012000 68150000 150420000 123390000 120360000 0 293360000 156910000 121830000 37064 4443 34555 333866;333867;333868;333869;333870;333871;333872;333873;333874;333875;333876;333877;333878;333879;333880;333881;333882;333883;333884;333885;333886;333887;333888 424930;424931;424932;424933;424934;424935;424936;424937;424938;424939;424940;424941;424942;424943;424944;424945;424946;424947;424948;424949;424950;424951;424952;424953;424954;424955;424956;424957;424958;424959 424951 30 QLVSEGNIHADK Unmodified 1309.6626 0.66262845 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 22.167 22.167 2;3 0.0013569 15389 QUIQUE_C1403_190116_001 81.865 43.089 211770000 0 0 0 64940000 0 0 53953000 0 0 0 29046000 63827000 0 37065 1472 34556 333889;333890;333891;333892 424960;424961;424962;424963;424964 424960 5 QLVSNLEK Unmodified 929.5182 0.51819605 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 28.108 28.108 2 0.0063722 21651 QUIQUE_C1277_190116_001 102 14.718 141630000 54935000 86698000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37066 2385 34557 333893;333894;333895 424965;424966;424967 424966 3 QLVTSEPEMIGAEVISEFLINGEESK Unmodified 2848.4052 0.40520629 1286 J3KSL8;J3QQJ5;Q9Y2L5 TRAPPC8 Trafficking protein particle complex subunit 8 yes no 0 0 0 1 172.97 172.97 3 0.0046503 174201 QUIQUE_C1563_190116_001 31.173 25.555 11026000 0 0 0 0 0 11026000 0 0 0 0 0 0 0 37067 1286 34558 333896 424968 424968 1 QLWAAVQAQDVATVLLLLAHAR Unmodified 2386.3485 0.34849895 1036 J3KNM6;F8VVT9;Q99490 AGAP2 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 170.87 170.87 3 2.9021E-15 178267 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.036 86.397 120650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46324000 74330000 0 37068 1036 34559 333897;333898 424969;424970 424969 2 QLWGLLIEETEK Unmodified 1457.7766 0.77659558 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 136.27 136.27 2;3 0.00016565 142114 QUIQUE_C1218_190116_001 152.54 112.19 2161000000 347910000 375400000 282910000 257310000 0 289040000 0 92270000 202640000 151520000 162000000 0 0 37069 2851 34560 333899;333900;333901;333902;333903;333904;333905;333906;333907;333908 424971;424972;424973;424974;424975;424976;424977;424978;424979;424980;424981 424973 6 QLWGLLIEETEKR Unmodified 1613.8777 0.8777066 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 118.29 118.29 2;3 4.6547E-31 121984 QUIQUE_C1277_190116_001 177.76 133.45 21886000000 1116000000 1829600000 1571600000 1260700000 1466100000 846150000 1772100000 2181200000 2413300000 629950000 2628200000 2376800000 1794000000 37070 2851 34561 333909;333910;333911;333912;333913;333914;333915;333916;333917;333918;333919;333920;333921;333922;333923;333924;333925;333926;333927;333928;333929;333930;333931;333932;333933;333934 424982;424983;424984;424985;424986;424987;424988;424989;424990;424991;424992;424993;424994;424995;424996;424997;424998;424999;425000;425001;425002;425003;425004;425005;425006;425007;425008;425009;425010;425011;425012;425013;425014;425015;425016;425017;425018;425019;425020;425021;425022;425023;425024;425025;425026;425027;425028;425029;425030;425031;425032;425033;425034;425035 424988 53 QLWMVLQR Unmodified 1072.5852 0.58517017 1585 O60645;D6RB59;H0Y995 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 0 1 100.19 100.19 2 0.026074 103694 QUIQUE_C1576_190116_001 70.912 39.623 18558000 0 0 0 0 0 0 18558000 0 0 0 0 0 0 37071 1585 34562 333935 425036 425036 1 QLYCYEVVPQQPALSPVTQCVLESVLR Unmodified 3175.6046 0.60459157 204 A0A0A6YYL4;P57737;I3L167;E7EP81;I3L212;I3L0X8 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 164.58 164.58 3 3.0481E-12 168592 QUIQUE_C1277_190116_001 66.36 47.957 61548000 0 32386000 0 0 29162000 0 0 0 0 0 0 0 0 37072 204 34563 333936;333937;333938 425037;425038;425039 425037 3 QLYETTDTTTR Unmodified 1327.6256 0.62557424 4447 Q9UIA9;E7ESC6;H0YBE1 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.888 28.888 2 0.00050204 22627 QUIQUE_C1277_190116_001 109.66 75.411 336780000 65334000 55430000 0 0 0 0 0 49596000 65414000 30838000 0 70164000 0 37073 4447 34564 333939;333940;333941;333942;333943;333944 425040;425041;425042;425043;425044;425045 425041 4 QLYHLGVVEAYSGLTK Unmodified 1776.941 0.94103514 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 96.173 96.173 2;3 3.9419E-38 98840 QUIQUE_C1277_190116_001 177.36 160.98 2011800000 138920000 207790000 145110000 144460000 187100000 145920000 137040000 166980000 213230000 46983000 142930000 205190000 130110000 37074 2916 34565 333945;333946;333947;333948;333949;333950;333951;333952;333953;333954;333955;333956;333957;333958;333959;333960;333961;333962;333963;333964;333965;333966;333967;333968;333969 425046;425047;425048;425049;425050;425051;425052;425053;425054;425055;425056;425057;425058;425059;425060;425061;425062;425063;425064;425065;425066;425067;425068;425069;425070;425071 425049 25 QLYLPMLFK Unmodified 1151.6413 0.64128807 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.39 136.39 2 0.0086631 140545 QUIQUE_C1403_190116_001 91.9 80.389 334460000 34456000 32594000 38292000 31120000 35302000 0 38929000 30583000 31006000 0 31143000 0 31032000 37075 1470 34566 333970;333971;333972;333973;333974;333975;333976;333977;333978;333979 425072;425073;425074;425075;425076;425077;425078;425079;425080;425081;425082 425075 11 QLYNIYAK Unmodified 1011.5389 0.53893149 3192 Q16740;M0R208 CLPP ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial;ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit yes no 0 0 0 1 51.407 51.407 2 0.060338 49307 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.163 39.239 55195000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55195000 0 37076 3192 34567 333980 425083 425083 1 QLYNVEATSYALLALLQLK Unmodified 2150.1987 0.19870639 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 171.95 171.95 2;3 4.4805E-64 175703 QUIQUE_DMIX7_190116_001 181.51 163.06 925190000 25732000 31224000 28875000 28640000 65601000 0 173150000 24847000 181040000 8424300 192970000 106670000 58018000 37077 1803 34568 333981;333982;333983;333984;333985;333986;333987;333988;333989;333990;333991;333992;333993;333994;333995;333996;333997;333998;333999;334000 425084;425085;425086;425087;425088;425089;425090;425091;425092;425093;425094;425095;425096;425097;425098;425099;425100;425101;425102;425103 425101 19 QLYQILTDFDIR Unmodified 1523.7984 0.79839365 2152 P19784;H3BNI9 CSNK2A2 Casein kinase II subunit alpha' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.52 146.52 2 1.2423E-08 150894 QUIQUE_C1277_190116_001 173.32 144.6 391420000 34294000 41313000 0 47400000 43497000 26895000 0 34268000 39842000 0 65677000 58229000 0 37078 2152 34569 334001;334002;334003;334004;334005;334006;334007;334008;334009 425104;425105;425106;425107;425108;425109;425110;425111;425112;425113;425114;425115 425105 11 QLYQTLTDYDIR Unmodified 1527.7569 0.75692277 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;Q8NEV1;A0A2R8Y4D6;A0A2R8Y4H0;V9GYA2;A0A2R8YDY7 CSNK2A1;CSNK2A3 Casein kinase II subunit alpha;Casein kinase II subunit alpha 3 yes no 0 0 0 1 1 1 100.95 100.95 2 4.2512E-15 102775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.67 146.9 416110000 144980000 138940000 0 0 0 0 0 132190000 0 0 0 0 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QLYVLGHEAMK Oxidation (M) 1303.6595 0.65945733 2197 P22314;Q5JRR9;Q5JRS0;Q5JRS1;Q5JRS3;Q5JRS2 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 35.294 35.294 2 0.010935 30696 QUIQUE_C1277_190116_001 63.426 18.345 139450000 0 19461000 24342000 0 0 26013000 0 0 29551000 10785000 0 0 29297000 37082 2197 34573 334031;334032;334033;334034;334035;334036 425140;425141;425142;425143;425144;425145 425140 1553 6 QLYVLGHEAMK Unmodified 1287.6645 0.66454271 2197 P22314;Q5JRR9;Q5JRS0;Q5JRS1;Q5JRS3;Q5JRS2 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.574 51.574 2;3 0.0084759 48339 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.16 15.595 922120000 0 0 0 226120000 177630000 277410000 0 0 0 49419000 88825000 0 102710000 37083 2197 34573 334037;334038;334039;334040;334041;334042 425146;425147;425148;425149;425150;425151 425149 6 QMAAVLLR Unmodified 900.52151 0.52150728 1403;1117 O00410;H0Y8C6;E7ETV3;E7EQT5;E7EV12;C9JMV5;C9JZD8;E7EWK4;E7EX05;C9JQT6;E7ESA1;E7ESZ1;E7ETV8;H0Y3V4 IPO5 Importin-5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 54.715 54.715 2 0.006157 52160 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.8 41.24 1019200000 124900000 117680000 0 126520000 0 92953000 0 106640000 117450000 0 162710000 0 170400000 37084 1403;1117 34574 334043;334044;334045;334046;334047;334048;334049;334050 425152;425153;425154;425155;425156;425157;425158;425159;425160 425160 9 QMAEIAVNAVLTVADMER Unmodified 1959.9758 0.97578244 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 3 1 1 161.36 161.36 2;3 8.7978E-08 166189 QUIQUE_C1218_190116_001 105.9 89.498 135370000 15918000 0 8238800 16613000 16755000 16320000 6914600 26797000 0 8768100 19050000 0 0 37085 2514 34575 334051;334052;334053;334054;334055;334056;334057;334058;334059;334060;334061;334062 425161;425162;425163;425164;425165;425166;425167;425168;425169;425170;425171;425172;425173 425161 13 QMAFDFAR Unmodified 984.44874 0.44873627 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 77.419 77.419 2 0.014747 79283 QUIQUE_C1438_190116_001 130 98.698 1632200000 242200000 257460000 180220000 221110000 146620000 140220000 0 207750000 0 0 236590000 0 0 37086 907 34576 334063;334064;334065;334066;334067;334068;334069;334070 425174;425175;425176;425177;425178;425179;425180;425181 425178 0 QMAFMLGR Unmodified 952.46228 0.46227785 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 77.053 77.053 2 0.0076983 77987 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.075 71.181 101570000 0 0 0 0 0 0 0 38275000 0 0 0 30945000 32348000 37087 2976 34577 334071;334072;334073 425182;425183;425184 425182 3 QMCICADFEK Unmodified 1300.525 0.52501404 2083 P14868 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 69.938 69.938 2 0.017645 69974 QUIQUE_C1403_190116_001 61.65 52.787 76509000 0 0 40598000 35910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37088 2083 34578 334074;334075 425185;425186 425186 2 QMDLLQEFYETTLEALK Oxidation (M) 2087.0133 0.013273388 2717 P61201;B4DIH5;H0YKU5;H0YM03 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 172.1 172.1 2 3.8607E-53 175763 QUIQUE_DMIX7_190116_001 184.31 165.21 216370000 11878000 24439000 0 8510200 0 0 78201000 0 19893000 0 0 39761000 33692000 37089 2717 34579 334076;334077;334078;334079;334080;334081;334082;334083 425187;425188;425189;425190;425191;425192;425193;425194;425195 425194 2151 9 QMDPGDFINSSETR Unmodified 1595.6886 0.68858521 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4I5;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 85.804 85.804 2 0.0041998 88601 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.023 48.203 91815000 0 27976000 0 0 0 0 0 0 0 0 40280000 23559000 0 37090 310;830 34580 334084;334085;334086 425196;425197;425198 425197 2 QMEKDETVSDCSPHIANIGR Unmodified 2286.0369 0.036879151 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 45.556 45.556 3;4 4.2812E-23 42783 QUIQUE_C1277_190116_001 104.84 100.29 2928000000 198990000 177260000 346810000 165450000 429200000 169700000 228240000 134070000 137000000 0 330130000 306620000 304580000 37091 585;2493 34581 334087;334088;334089;334090;334091;334092;334093;334094;334095;334096;334097;334098;334099;334100;334101;334102;334103;334104;334105;334106;334107 425199;425200;425201;425202;425203;425204;425205;425206;425207;425208;425209;425210;425211;425212;425213;425214;425215;425216;425217;425218;425219;425220;425221;425222 425202 24 QMEKDETVSDCSPHIANIGR Oxidation (M) 2302.0318 0.031793774 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.689 39.689 3;4 5.1675E-05 35989 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.783 61.302 403490000 0 46041000 56740000 64850000 34119000 0 49783000 32047000 39964000 20732000 0 0 59213000 37092 585;2493 34581 334108;334109;334110;334111;334112;334113;334114;334115;334116 425223;425224;425225;425226;425227;425228;425229;425230;425231;425232;425233 425231 378 11 QMEQISQFLK Oxidation (M) 1266.6278 0.62782285 4444 Q9UI15;C9J5W6;H7C5N2 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.492 72.492 2 0.00021314 72845 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.86 61.268 874390000 99976000 122670000 76179000 68491000 87901000 66340000 0 69716000 55119000 31907000 105800000 90296000 0 37093 4444 34582 334117;334118;334119;334120;334121;334122;334123;334124;334125;334126;334127 425234;425235;425236;425237;425238;425239;425240;425241;425242;425243;425244;425245;425246;425247 425241 2965 14 QMEQISQFLK Unmodified 1250.6329 0.63290823 4444 Q9UI15;C9J5W6;H7C5N2 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.253 93.253 2 0.0023102 90768 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.64 48.353 3210600000 390600000 366680000 0 252590000 0 244380000 317480000 287910000 272860000 92307000 355200000 277580000 353030000 37094 4444 34582 334128;334129;334130;334131;334132;334133;334134;334135;334136;334137;334138 425248;425249;425250;425251;425252;425253;425254;425255;425256;425257;425258 425255 5 QMEQISQFLQAAER Unmodified 1677.8145 0.81445442 2408 P37802;X6RJP6 TAGLN2 Transgelin-2 yes no 0 0 0 2 3 3 1 2 2 2 3 1 1 2 2 2 132.74 132.74 2;3 1.8352E-35 129012 QUIQUE_DMIX7_190116_001 226.33 198.47 2165900000 66274000 313170000 374330000 12587000 265510000 210740000 57469000 231020000 0 100210000 65681000 234820000 234070000 37095 2408 34583 334139;334140;334141;334142;334143;334144;334145;334146;334147;334148;334149;334150;334151;334152;334153;334154;334155;334156;334157;334158;334159;334160;334161;334162;334163;334164 425259;425260;425261;425262;425263;425264;425265;425266;425267;425268;425269;425270;425271;425272;425273;425274;425275;425276;425277;425278;425279;425280;425281;425282;425283;425284;425285;425286;425287;425288;425289;425290;425291;425292;425293;425294;425295;425296 425293 35 QMEQISQFLQAAER Oxidation (M) 1693.8094 0.80936904 2408 P37802;X6RJP6 TAGLN2 Transgelin-2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 105.04 105.04 2;3 6.2081E-23 108396 QUIQUE_C1368_190116_001 167.18 139.85 1041900000 0 114590000 101500000 95110000 74839000 57346000 77107000 63129000 81712000 52149000 146830000 68544000 109100000 37096 2408 34583 334165;334166;334167;334168;334169;334170;334171;334172;334173;334174;334175;334176;334177 425297;425298;425299;425300;425301;425302;425303;425304;425305;425306;425307;425308;425309;425310;425311 425298 1815 14 QMFAQMYQK Unmodified 1173.5311 0.53108569 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 1 58.424 58.424 2 0.020318 58159 QUIQUE_C1576_190116_001 78.178 69.315 223500000 0 0 0 0 0 0 108870000 0 0 0 0 0 114630000 37097 2161 34584 334178;334179 425312;425313 425312 2 QMFEGEVASLEALR Unmodified 1578.7712 0.77119262 4166 Q9H479 FN3K Fructosamine-3-kinase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 125.74 125.74 2;3 4.6506E-05 128594 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.08 126.46 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2938 34587 334199;334200;334201 425336;425337;425338 425337 3 QMGFPLIYVEAEQVEDDR Oxidation (M) 2153.9939 0.99393493 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 1 0 2 1 1 2 2 2 1 2 138.19 138.19 2;3 1.3128E-30 144678 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.22 115.21 363960000 33238000 57317000 53678000 0 0 0 0 33875000 36277000 52675000 50404000 0 46499000 37101 959 34588 334202;334203;334204;334205;334206;334207;334208;334209;334210;334211;334212;334213;334214 425339;425340;425341;425342;425343;425344;425345;425346;425347;425348;425349;425350;425351;425352;425353;425354;425355 425352 586 16 QMGFPLIYVEAEQVEDDR Unmodified 2137.999 0.99902031 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 3 2 3 2 3 2 3 1 4 2 2 3 3 150.56 150.56 2;3 2.5242E-45 154255 QUIQUE_C1277_190116_001 207.8 187.22 1337700000 84551000 126170000 143790000 124040000 136600000 96937000 166460000 39773000 97693000 31644000 138450000 68133000 83419000 37102 959 34588 334215;334216;334217;334218;334219;334220;334221;334222;334223;334224;334225;334226;334227;334228;334229;334230;334231;334232;334233;334234;334235;334236;334237;334238;334239;334240;334241;334242;334243;334244;334245;334246;334247 425356;425357;425358;425359;425360;425361;425362;425363;425364;425365;425366;425367;425368;425369;425370;425371;425372;425373;425374;425375;425376;425377;425378;425379;425380;425381;425382;425383;425384;425385;425386;425387;425388;425389;425390;425391;425392;425393;425394;425395;425396;425397;425398;425399;425400;425401;425402 425361 44 QMGFPLIYVEAEQVEDDRLLR Unmodified 2520.2683 0.2682593 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 1 1 1 150.67 150.67 3 0.016702 158062 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.973 33.211 240490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 139150000 101340000 0 37103 959 34589 334248;334249 425403;425404;425405 425403 3 QMGYQCFVSFFDLR Oxidation (M) 1812.7964 0.79636152 2988 Q13347 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes yes 0 1 0 1 151.55 151.55 2 0.0098187 155316 QUIQUE_C1403_190116_001 58.274 46.111 7795700 0 0 0 7795700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37104 2988 34590 334250 425406 425406 2440 1 QMIGEFLGNR Unmodified 1163.5757 0.5757277 60;388 A0A2R8Y7T6;A0A087WWK8;A0A3B3IRZ4;Q6DN90;A0A3B3IU98;A0A0C4DGT3;A0A2R8Y695;A0A1W2PRJ5;A0A1W2PR28;Q5JU85 IQSEC1;IQSEC2 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 1;IQ motif and SEC7 domain-containing protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 83.867 83.867 2 0.003115 86215 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.136 57.962 130920000 28631000 39304000 34938000 0 0 0 0 0 0 0 28051000 0 0 37105 60;388 34591 334251;334252;334253;334254 425407;425408;425409;425410;425411 425410 5 QMIGYNLATK Unmodified 1137.5852 0.58522975 3878 Q96I99;E9PDQ8;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 59.632 59.632 2 0.019822 58491 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.908 35.089 165380000 0 0 80105000 0 0 0 0 85274000 0 0 0 0 0 37106 3878 34592 334255;334256 425412;425413 425413 2 QMLFDLESAYNAFNR Unmodified 1817.8407 0.84066917 4467 Q9UK41 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 153.76 153.76 2;3 6.7928E-13 158141 QUIQUE_C1277_190116_001 168.3 151.36 622240000 37763000 55406000 60459000 30492000 38266000 30340000 0 59233000 52974000 0 104860000 80229000 72214000 37107 4467 34593 334257;334258;334259;334260;334261;334262;334263;334264;334265;334266;334267;334268;334269;334270;334271;334272 425414;425415;425416;425417;425418;425419;425420;425421;425422;425423;425424;425425;425426;425427;425428;425429;425430;425431 425415 18 QMLLELTR Unmodified 1002.5532 0.55320134 4062 Q9BXK5;A0A087WX97 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 79.822 79.822 2 0.043327 80797 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.426 17.238 67638000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33914000 33724000 37108 4062 34594 334273;334274 425432;425433 425433 2 QMLPLNTNIR Unmodified 1198.6492 0.64922699 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 73.445 73.445 2 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K7ERN1;A0A1B0GVY1;Q96PU5 NEDD4L E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like yes no 0 1 0 1 172.07 172.07 2 0.027474 175519 QUIQUE_C1277_190116_001 40.025 27.257 11577000 0 11577000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37113 361 34598 334279 425438 425438 1 QMNLQQQPK Unmodified 1113.5601 0.56007764 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 0 0 1 19.933 19.933 2 0.030704 13032 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.875 53.388 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37114 2970;120 34599 334280 425439 425439 1 QMNPFIEDILNR Unmodified 1488.7395 0.73949856 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 138.38 138.38 2 0.0006885 141564 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.108 79.876 247840000 0 0 48438000 33729000 57198000 31392000 0 77086000 0 0 0 0 0 37115 1534 34600 334281;334282;334283;334284;334285 425440;425441;425442;425443;425444;425445 425445 6 QMPDVNVSWDGEGPK Unmodified 1657.7406 0.74062078 1399 O00330;H0YD97 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 93.893 93.893 2 0.05622 96555 QUIQUE_C1218_190116_001 58.674 42.784 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37116 1399 34601 334286 425446 425446 1 QMQLENVSVALEFLDR Oxidation (M) 1906.9459 0.94586252 2178;1628 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98;O75369 FLNA;FLNB Filamin-A;Filamin-B no no 0 1 0 1 1 1 144.71 144.71 2 5.6576E-05 152065 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.121 82.863 124690000 0 0 0 0 0 26614000 0 50390000 0 0 47684000 0 0 37117 2178;1628 34602 334287;334288;334289 425447;425448;425449 425449 880 3 QMQNTGESEASGNK Unmodified 1479.626 0.62598495 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 10.562 10.562 2 0.0003126 2986 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.01 70.526 25746000 0 0 0 0 0 0 0 16525000 0 9220500 0 0 0 37118 1452 34603 334290;334291 425450;425451 425451 2 QMQNTGESEASGNKEMIEALK Unmodified 2294.0519 0.051860514 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 1 1 1 57.585 57.585 3 0.00041845 56173 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.339 55.761 115050000 0 0 0 0 0 0 0 44994000 0 0 70054000 0 0 37119 1452 34604 334292;334293 425452;425453 425453 2 QMQSSFTSSEQELER Unmodified 1785.7839 0.78394215 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;G3V5P0 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 63.926 63.926 2 1.3415E-08 63216 QUIQUE_C1277_190116_001 153.34 140.76 32843000 0 32843000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37120 3490 34605 334294;334295 425454;425455 425454 2 QMQVLHPAAR Unmodified 1149.6077 0.60769653 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.119 20.119 3 0.025795 12600 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.395 31.693 1678800000 338070000 0 0 343450000 0 269330000 0 260430000 0 67636000 399850000 0 0 37121 2573 34606 334296;334297;334298;334299;334300;334301 425456;425457;425458;425459;425460;425461;425462 425462 5 QMSLLLR Unmodified 859.49496 0.49495818 2243 P25705 ATP5A1 ATP synthase 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1302.6602 0.66018561 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.121 53.121 2 9.4974E-05 52275 QUIQUE_C1218_190116_001 106.62 85.717 323490000 0 0 0 78819000 58753000 53775000 52937000 40446000 0 0 0 38759000 0 37125 3086 34609 334315;334316;334317;334318;334319;334320;334321;334322;334323 425476;425477;425478;425479;425480;425481;425482;425483;425484 425476 9 QMVEHGGFYR Oxidation (M) 1238.5502 0.55024123 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 19.185 19.185 3 0.027722 11801 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.715 34.055 17811000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17811000 0 0 0 37126 3053 34610 334324 425485 425485 1 QMVETELK Oxidation (M) 992.48485 0.48484701 2745 P62258;K7EIT4 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 20.249 20.249 2 0.020943 13009 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.191 39.888 1901800000 371390000 0 0 0 0 0 312540000 424520000 514930000 278450000 0 0 0 37127 2745 34611 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Unmodified 2161.0613 0.061286213 1562 O60234;M0R0C1;M0QYJ8;M0QXC2 GMFG Glia maturation factor gamma yes no 0 0 0 1 138.56 138.56 2 0.00033638 144177 QUIQUE_C1368_190116_001 77.527 64.649 33372000 0 0 33372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37130 1562 34613 334346 425508 425508 1 QNADISAMQDTINK Unmodified 1547.725 0.72497071 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.106 62.106 2 1.4817E-29 62495 QUIQUE_C1218_190116_001 176.78 162.09 1699400000 403900000 286940000 221460000 199750000 131570000 209070000 0 0 0 134750000 59020000 0 52950000 37131 1916 34614 334347;334348;334349;334350;334351;334352;334353;334354;334355 425509;425510;425511;425512;425513;425514;425515;425516;425517;425518 425510 10 QNADISAMQDTINKLENELR Unmodified 2302.1223 0.12232334 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 2 1 2 1 1 150.03 150.03 2;3 2.3954E-133 156819 QUIQUE_DMIX5_190116_001 228.73 208.35 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425615;425616;425617;425618;425619;425620;425621;425622;425623;425624 425616 9 QNEHCLTNFDLAEYR Unmodified 1908.8425 0.84246009 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.158 83.158 2;3 4.9135E-07 85564 QUIQUE_C1438_190116_001 89.911 76.398 802340000 57045000 96970000 82907000 87487000 60724000 48260000 88498000 42582000 45724000 29653000 55873000 57200000 49413000 37141 4607 34624 334442;334443;334444;334445;334446;334447;334448;334449;334450;334451;334452;334453;334454;334455 425625;425626;425627;425628;425629;425630;425631;425632;425633;425634;425635;425636;425637;425638;425639;425640;425641 425633 17 QNFIDPLQNLHDK Unmodified 1580.7947 0.79470526 3982 Q99962 SH3GL2 Endophilin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 84.757 84.757 2;3 0.00037505 81832 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.363 74.756 1455700000 488450000 0 0 313150000 195630000 279000000 0 0 0 179470000 0 0 0 37142 3982 34625 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425648;425649;425650;425651;425652;425653;425654;425655;425656;425657;425658;425659;425660;425661;425662;425663;425664;425665;425666;425667;425668;425669;425670;425671;425672;425673;425674;425675;425676;425677;425678;425679;425680;425681;425682;425683;425684;425685;425686;425687;425688;425689;425690;425691;425692;425693;425694;425695;425696;425697;425698;425699;425700 425683 51 QNFTEPTAIQAQGWPVALSGLDMVGVAQTGSGK Unmodified 3357.6663 0.66634021 1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3QRN5;J3QLG9;J3QR62 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 159.36 159.36 3 4.6153E-29 163063 QUIQUE_C1403_190116_001 86.079 80.419 196590000 32649000 0 67302000 40368000 0 0 0 0 0 0 0 56270000 0 37144 1290 34627 334492;334493;334494;334495 425701;425702;425703;425704;425705 425703 4 QNGQTDFFR Unmodified 1111.5047 0.50467125 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 46.362 46.362 2 0.0068412 42516 QUIQUE_C1563_190116_001 83.265 55.74 629940000 107350000 116840000 0 71560000 77508000 73689000 127190000 0 0 55797000 0 0 0 37145 3753 34628 334496;334497;334498;334499;334500;334501;334502 425706;425707;425708;425709;425710;425711;425712 425710 7 QNGQTDFFRK Unmodified 1239.5996 0.59963426 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 25.839 25.839 3 0.0072086 19830 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.425 19.572 58898000 0 0 0 0 0 0 0 58898000 0 0 0 0 0 37146 3753 34629 334503 425713;425714 425714 2 QNGWLPISAMNK Unmodified 1357.6813 0.6812554 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 96.666 96.666 2 0.0044113 99137 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.276 56.464 61687000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45607000 16079000 37147 856 34630 334504;334505;334506 425715;425716;425717 425716 3 QNGYLEFDALSR Unmodified 1411.6732 0.67319314 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 101.74 101.74 2 0.012353 104979 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.888 34.459 25141000 0 0 0 0 0 0 0 0 25141000 0 0 0 0 37148 1692 34631 334507 425718 425718 1 QNHEEIMDAK Unmodified 1213.5397 0.53973612 4609 Q9Y4K3 TRAF6 TNF receptor-associated factor 6 yes yes 0 0 0 1 24.024 24.024 2 0.0274 17372 QUIQUE_C1277_190116_001 55.37 23.61 108260000 0 108260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37149 4609 34632 334508 425719 425719 1 QNHLFEQYR Unmodified 1233.5891 0.58906958 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 1 2 1 33.158 33.158 2;3 0.012975 27611 QUIQUE_C1368_190116_001 70.816 54.809 248700000 47118000 0 52500000 0 0 0 0 0 0 0 110280000 38797000 0 37150 617 34633 334509;334510;334511;334512;334513;334514 425720;425721;425722;425723;425724;425725 425722 4 QNISPDKIPWSALK Unmodified 1595.8671 0.86714192 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 87.143 87.143 2;3 0.0001332 89216 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.64 88.63 281270000 0 0 0 0 0 0 0 97812000 77431000 0 0 0 106030000 37151 3053 34634 334515;334516;334517 425726;425727;425728;425729 425728 3 QNIYCSLFLPR Unmodified 1409.7126 0.71255553 3810 Q96BQ5 CCDC127 Coiled-coil domain-containing protein 127 yes yes 0 0 0 1 1 115.26 115.26 2 0.0061825 121269 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.614 54.776 29528000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29528000 0 0 37152 3810 34635 334518;334519 425730;425731 425730 2 QNLDALLNQLK Unmodified 1268.7089 0.70885036 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.73 116.73 2 0.00015563 120515 QUIQUE_C1368_190116_001 153.24 122.99 1281200000 21932000 47597000 124430000 83359000 49391000 82019000 79192000 139520000 178240000 62425000 155080000 149370000 108620000 37153 3053 34636 334520;334521;334522;334523;334524;334525;334526;334527;334528;334529;334530;334531;334532 425732;425733;425734;425735;425736;425737;425738;425739;425740;425741;425742;425743;425744;425745;425746;425747;425748 425734 17 QNLDELGIGTYHNIAFIHPDTPIIK Unmodified 2818.4654 0.4653792 923 E9PGP6;Q9UGJ0 PRKAG2 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-2 yes no 0 0 0 1 127.73 127.73 4 0.048554 131188 QUIQUE_C1403_190116_001 19.492 12.617 50677000 0 0 0 50677000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37154 923 34637 334533 425749 425749 1 QNLEGDHSDAPMETETSFK Unmodified 2134.9113 0.91132751 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 54.516 54.516 2;3 8.8996E-10 52544 QUIQUE_C1403_190116_001 96.464 88.74 748720000 81820000 87007000 96794000 81846000 41794000 80583000 71244000 0 37553000 16630000 56747000 45548000 51152000 37155 1748 34638 334534;334535;334536;334537;334538;334539;334540;334541;334542;334543;334544;334545;334546 425750;425751;425752;425753;425754;425755;425756;425757;425758;425759;425760;425761;425762 425754 13 QNLEPLFEQYINNLR Unmodified 1889.9636 0.9635615 778;764 CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259;CON__P13647;P13647;F8W0C6 KRT6C;KRT6A;KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A;Keratin, type II cytoskeletal 5 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 2 4 1 2 153.12 153.12 2;3 5.5041E-12 148217 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.79 106.11 326720000 17037000 0 0 59451000 0 19156000 0 23013000 19669000 24804000 76459000 0 87133000 + 37156 764;778 34639 334547;334548;334549;334550;334551;334552;334553;334554;334555;334556;334557;334558;334559;334560;334561;334562;334563;334564;334565 425763;425764;425765;425766;425767;425768;425769;425770;425771;425772;425773;425774;425775;425776;425777;425778;425779;425780;425781;425782;425783;425784 425776 21 QNLFLGSLTSR Unmodified 1234.667 0.66698555 3231 Q3ZCQ8;M0R0C3;M0R2F8 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 0 1 1 95.463 95.463 2 0.032459 99051 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.161 30.907 155570000 0 0 0 63517000 0 0 0 0 0 0 92049000 0 0 37157 3231 34640 334566;334567 425785;425786 425786 2 QNLFQEAEEFLYR Unmodified 1685.8049 0.80493559 114 A0A087X1Z3;Q9UL46 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 164.72 164.72 2;3 4.3775E-24 168214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.92 161.01 2957300000 230660000 170210000 417320000 230330000 385170000 120910000 278190000 205250000 260990000 43789000 392340000 17910000 204260000 37158 114 34641 334568;334569;334570;334571;334572;334573;334574;334575;334576;334577;334578;334579;334580;334581;334582;334583;334584;334585;334586;334587;334588;334589;334590;334591;334592;334593;334594 425787;425788;425789;425790;425791;425792;425793;425794;425795;425796;425797;425798;425799;425800;425801;425802;425803;425804;425805;425806;425807;425808;425809;425810;425811;425812;425813;425814;425815;425816;425817;425818 425810 31 QNLFTTWSHHLQQANIQFR Unmodified 2368.1825 0.18249625 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 2 1 113.57 113.57 3;4 1.4471E-22 117463 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.48 119.83 1454700000 0 40758000 176080000 63303000 45288000 0 56147000 219880000 334730000 0 363520000 155000000 0 37159 3053 34642 334595;334596;334597;334598;334599;334600;334601;334602;334603;334604;334605;334606;334607 425819;425820;425821;425822;425823;425824;425825;425826;425827;425828;425829;425830;425831;425832;425833;425834;425835;425836 425831 18 QNLLDDLVTR Unmodified 1185.6354 0.63535107 4511 Q9UNK0;I3L305 STX8 Syntaxin-8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 108.94 108.94 2 0.010523 111997 QUIQUE_C1403_190116_001 68.657 42.273 49184000 0 14327000 0 34857000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37160 4511 34643 334608;334609;334610;334611 425837;425838;425839;425840 425838 4 QNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDTDPHFQDALMQLAK Oxidation (M) 4151.023 0.022950232 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 166.73 166.73 3;4 1.5166E-88 171688 QUIQUE_C1368_190116_001 140.88 136.77 549420000 60492000 147960000 58411000 65593000 0 44957000 0 31554000 93427000 0 0 0 47031000 37161 4600 34644 334612;334613;334614;334615;334616;334617;334618;334619;334620 425841;425842;425843;425844;425845;425846;425847;425848;425849 425844 3034 9 QNLLQAAGNVGQASGELLQQIGESDTDPHFQDALMQLAK Unmodified 4135.028 0.02803561 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 2 168.05 168.05 3;4 1.3683E-88 172118 QUIQUE_DMIX7_190116_001 141.23 133.29 1242000000 0 83204000 0 25234000 94789000 0 0 0 0 0 479790000 388460000 170560000 37162 4600 34644 334621;334622;334623;334624;334625;334626;334627;334628;334629 425850;425851;425852;425853;425854;425855;425856;425857;425858;425859;425860 425857 11 QNLLSQSHAYQQFLR Unmodified 1831.9329 0.93293007 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 88.502 88.502 2;3 2.0568E-230 90535 QUIQUE_DMIX1_190116_001 282.94 255.46 19847000000 1682800000 1733900000 1328700000 982670000 2087300000 982650000 1338800000 1824500000 1725600000 714720000 1830300000 1845500000 1769300000 37163 2851 34645 334630;334631;334632;334633;334634;334635;334636;334637;334638;334639;334640;334641;334642;334643;334644;334645;334646;334647;334648;334649;334650;334651;334652;334653;334654;334655;334656;334657 425861;425862;425863;425864;425865;425866;425867;425868;425869;425870;425871;425872;425873;425874;425875;425876;425877;425878;425879;425880;425881;425882;425883;425884;425885;425886;425887;425888;425889;425890;425891;425892;425893;425894;425895;425896;425897;425898;425899;425900;425901;425902;425903;425904;425905;425906;425907;425908;425909;425910;425911;425912;425913;425914;425915;425916;425917;425918;425919;425920;425921;425922;425923;425924 425901 64 QNLPLSSGK Unmodified 942.51345 0.51344502 2238 P25325;B1AH49 MPST 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase;Sulfurtransferase yes no 0 0 0 1 24.026 24.026 2 0.05468 17534 QUIQUE_C1576_190116_001 49.444 21.708 29587000 0 0 0 0 0 0 29587000 0 0 0 0 0 0 37164 2238 34646 334658 425925 425925 1 QNLQLCVQVASK Unmodified 1386.7289 0.72893388 2631 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yes 0 0 2 1 1 1 154.81 154.81 5 2.0166E-09 159520 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.678 69.333 167180000 0 67765000 0 0 0 0 0 48649000 0 0 0 0 50767000 37174 1624 34656 334736;334737;334738 426018;426019;426020 426020 3 QNRFEIVYNLLSLR Unmodified 1763.9683 0.96825295 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 140.48 140.48 3 4.5339E-14 147192 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.1 129.73 202940000 0 0 0 0 0 0 0 48691000 40298000 0 50167000 63788000 0 37175 1639 34657 334739;334740;334741;334742;334743 426021;426022;426023;426024;426025 426023 5 QNSTTTGVSVIMNTALDK Unmodified 1878.9357 0.93569177 3596 Q8N568 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes yes 0 0 0 1 104.8 104.8 2 0.0026836 106637 QUIQUE_C1563_190116_001 77.42 54.542 35700000 0 0 0 0 0 35700000 0 0 0 0 0 0 0 37176 3596 34658 334744 426026 426026 1 QNVAVNELCGR Unmodified 1258.6088 0.60881874 1114 H0Y2Y8;Q15942;C9JJK5 ZYX Zyxin yes no 0 0 0 1 1 1 1 41.674 41.674 2 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727 34671 334825;334826;334827;334828;334829;334830;334831;334832;334833;334834;334835;334836;334837;334838;334839;334840;334841;334842;334843;334844 426122;426123;426124;426125;426126;426127;426128;426129;426130;426131;426132;426133;426134;426135;426136;426137;426138;426139;426140;426141;426142;426143 426124 22 QPAPFSDEIEVDFSKPYVR Unmodified 2223.0848 0.084798847 717 C9JEJ2;P49585;C9J050;C9JVS0;C9JPY0;F8WAZ5;C9J2E1 PCYT1A Choline-phosphate cytidylyltransferase A yes no 0 0 1 1 1 1 117.01 117.01 3 0.0036731 120035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.348 43.355 86509000 0 0 0 0 0 0 0 45098000 0 0 0 0 41411000 37192 717 34672 334845;334846;334847 426144;426145;426146 426144 2 QPAPKPEPSFSEYASVQVPR Unmodified 2213.1117 0.1116823 2803 P78324 SIRPA Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.692 79.692 3 1.0438E-05 80816 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.023 68.836 1896700000 150960000 165770000 134310000 247410000 134290000 123420000 0 189210000 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76.641 2 0.030946 78295 QUIQUE_C1218_190116_001 48.741 39.402 43249000 21978000 0 0 0 21271000 0 0 0 0 0 0 0 0 37219 3884 34697 335100;335101 426466;426467 426466 2 QPLWNHLLNYYK Unmodified 1587.8198 0.8197978 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.34 106.34 3 0.0099672 109091 QUIQUE_C1277_190116_001 47.361 31.421 171170000 18451000 29180000 24753000 0 0 20802000 25006000 31704000 0 21278000 0 0 0 37220 3766 34698 335102;335103;335104;335105;335106;335107;335108 426468;426469;426470;426471;426472;426473;426474;426475 426469 8 QPLYEFEDCLGGGKPK Unmodified 1836.8716 0.87163495 1725 O95352 ATG7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 81.591 81.591 3 0.00023437 82609 QUIQUE_C1368_190116_001 84.195 68.56 227660000 48388000 49842000 58020000 29994000 0 41420000 0 0 0 0 0 0 0 37221 1725 34699 335109;335110;335111;335112;335113 426476;426477;426478;426479;426480 426478 5 QPMILEK Unmodified 857.46807 0.46807473 2529 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90.758 90.758 2;3 2.0979E-32 94304 QUIQUE_C1218_190116_001 140.03 121.2 666790000 64702000 134040000 0 80891000 59541000 0 0 155090000 115840000 0 56687000 0 0 37229 3123 34707 335159;335160;335161;335162;335163;335164;335165;335166;335167;335168;335169;335170;335171;335172;335173 426537;426538;426539;426540;426541;426542;426543;426544;426545;426546;426547;426548;426549;426550;426551;426552 426538 16 QPPTAAGRPVDASPR Unmodified 1518.7903 0.79028858 4653 Q9Y6G9;E9PHI6 DYNC1LI1 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.661 18.661 3 0.00077424 11011 QUIQUE_C1277_190116_001 55.885 45.532 676330000 47359000 74663000 64629000 0 89259000 0 83800000 60426000 76586000 0 96915000 82697000 0 37230 4653 34708 335174;335175;335176;335177;335178;335179;335180;335181;335182;335183;335184;335185 426553;426554;426555;426556;426557;426558;426559;426560;426561;426562;426563;426564;426565;426566;426567 426554 13 QPPWCDPLGPFVVGGEDLDPFGPR Unmodified 2651.2479 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synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.442 43.442 2 0.00037933 39909 QUIQUE_C1368_190116_001 117.01 84.173 1021200000 77620000 59164000 87498000 91422000 109530000 89004000 100730000 83884000 76013000 0 96698000 64616000 85042000 37238 1005;2027 34716 335237;335238;335239;335240;335241;335242;335243;335244;335245;335246;335247;335248 426625;426626;426627;426628;426629;426630;426631;426632;426633;426634;426635;426636;426637;426638 426627 13 QPSSAFAAFVK Unmodified 1151.5975 0.597509 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.744 79.744 2 0.0028048 80606 QUIQUE_C1368_190116_001 76.064 53.933 863800000 69621000 85723000 67845000 0 141030000 44931000 54135000 43584000 61808000 53085000 112480000 43513000 86055000 37239 1803 34717 335249;335250;335251;335252;335253;335254;335255;335256;335257;335258;335259;335260 426639;426640;426641;426642;426643;426644;426645;426646;426647;426648;426649;426650;426651 426641 10 QPSSPGPTPR Unmodified 1022.5145 0.51450765 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 12.617 12.617 2 0.0045713 5442 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.455 64.489 123330000 14896000 65411000 11772000 0 0 18038000 0 0 0 13208000 0 0 0 37240 2994 34718 335261;335262;335263;335264;335265;335266;335267 426652;426653;426654;426655;426656;426657;426658;426659 426659 7 QPSSYFVQFPQAMQR Unmodified 1812.8617 0.86173896 660 B7Z4W5;Q16773 CCBL1 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 108.88 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426698 2 QPVFGANYIK Unmodified 1135.6026 0.60259438 537 K7EIJ0;K7ENL2;A6NG10;K7EMC9;Q969T9;K7EIN1;K7ESN4 WBP2 WW domain-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.556 67.556 2 0.0033065 66793 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.064 62.572 1584400000 153720000 227450000 216590000 198100000 258260000 0 239790000 0 0 0 0 0 290520000 37246 537 34724 335305;335306;335307;335308;335309;335310;335311 426699;426700;426701;426702;426703;426704;426705;426706 426705 7 QPVLSQTEAR Unmodified 1127.5935 0.59348625 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.451 22.451 2 4.6496E-05 15753 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.73 111.12 4280300000 0 388750000 393940000 381310000 379020000 327730000 374690000 350880000 381020000 0 455390000 401070000 446520000 37247 2274 34725 335312;335313;335314;335315;335316;335317;335318;335319;335320;335321;335322 426707;426708;426709;426710;426711;426712;426713;426714;426715;426716;426717;426718 426716 10 QPVVASVSLLIFK Unmodified 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.274 28.274 2 0.00067018 22121 QUIQUE_C1368_190116_001 100.72 74.208 143230000 29686000 0 30880000 45825000 0 36837000 0 0 0 0 0 0 0 37263 2380 34740 335403;335404;335405;335406;335407;335408 426816;426817;426818;426819;426820;426821 426818 6 QQALTVSTDPEHRFELALQLGELK Unmodified 2722.429 0.42899369 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 1 1 126.94 126.94 4 0.034335 131559 QUIQUE_DMIX3_190116_001 24.351 17.476 46705000 0 0 0 0 0 0 0 0 46705000 0 0 0 0 37264 2380 34741 335409 426822 426822 1 QQANTIFWSPQGQFVVLAGLR Unmodified 2359.2437 0.24369953 2674 P55884 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes yes 0 0 0 1 1 2 157.56 157.56 2;3 0.00079917 164973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.9 86.54 147410000 0 0 0 0 0 0 0 26546000 41949000 0 78910000 0 0 37265 2674 34742 335410;335411;335412;335413 426823;426824;426825;426826 426826 2 QQASEADAAAATFR Unmodified 1435.6692 0.66917039 1932 P07902;G3V3U5;G3V223;F2Z2X9;G3V4G9 GALT Galactose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.975 46.975 2 0.00026497 44114 QUIQUE_C1277_190116_001 97.911 78.655 401460000 65046000 49991000 43115000 0 0 31333000 0 55989000 0 17310000 49702000 44254000 44722000 37266 1932 34743 335414;335415;335416;335417;335418;335419;335420;335421;335422;335423;335424;335425 426827;426828;426829;426830;426831;426832;426833;426834;426835;426836;426837;426838 426828 12 QQASFPGDR Unmodified 1004.4676 0.46755746 1691 O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin yes no 0 0 0 1 1 21.948 21.948 2 0.052818 15683 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.96 20.584 78185000 0 0 0 0 0 0 0 34890000 43295000 0 0 0 0 37267 1691 34744 335426;335427 426839;426840 426839 2 QQDAQEFFLHLINMVER Unmodified 2117.0364 0.036408866 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 166.15 166.15 2;3 2.2116E-05 169813 QUIQUE_C1277_190116_001 81.317 72.823 1897800000 169810000 279030000 0 116990000 166690000 95652000 245860000 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335463;335464;335465;335466;335467;335468;335469;335470;335471;335472;335473;335474;335475;335476;335477;335478;335479;335480;335481;335482;335483;335484;335485;335486;335487 426877;426878;426879;426880;426881;426882;426883;426884;426885;426886;426887;426888;426889;426890;426891;426892;426893;426894;426895;426896;426897;426898;426899;426900;426901;426902;426903;426904;426905;426906;426907;426908 426896 32 QQEAALELEELKK Unmodified 1527.8144 0.81443765 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 57.682 57.682 2;3 2.27E-06 56299 QUIQUE_C1277_190116_001 99.941 87.146 737320000 0 183330000 98005000 150990000 199420000 0 0 0 33370000 72221000 0 0 0 37273 926;889 34749 335488;335489;335490;335491;335492;335493;335494;335495 426909;426910;426911;426912;426913;426914;426915;426916 426910 6 QQEALEEQAALEPK Unmodified 1582.7839 0.7838658 3887 Q96JB5;J3QRM1 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.055 56.055 2 0.00088575 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335523;335524;335525;335526;335527;335528;335529;335530;335531;335532;335533 426950;426951;426952;426953;426954;426955;426956;426957;426958;426959;426960;426961 426957 11 QQEQADSLER Unmodified 1202.5527 0.55274365 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 17.657 17.657 2 0.00030382 10076 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.57 85.291 93511000 0 46150000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47362000 0 37279 3091 34755 335534;335535 426962;426963;426964 426964 3 QQEQQVPILEK Unmodified 1338.7143 0.71432967 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 49.032 49.032 2 0.0045396 46822 QUIQUE_C1277_190116_001 90.696 72.787 63630000 0 19064000 20342000 0 0 0 0 0 0 0 24225000 0 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335658;335659;335660;335661;335662;335663;335664;335665;335666;335667;335668;335669;335670;335671;335672;335673;335674;335675;335676;335677;335678;335679;335680;335681;335682;335683;335684 427098;427099;427100;427101;427102;427103;427104;427105;427106;427107;427108;427109;427110;427111;427112;427113;427114;427115;427116;427117;427118;427119;427120;427121;427122;427123;427124;427125;427126;427127;427128;427129;427130;427131;427132;427133;427134;427135;427136;427137;427138;427139;427140 427111 43 QQIPVFR Unmodified 886.50249 0.5024864 4256 Q9NQR4 NIT2 Omega-amidase NIT2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.555 51.555 2 0.020883 49338 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.76 74.291 890060000 142520000 0 124160000 0 118490000 0 0 89464000 0 56919000 113570000 95741000 149190000 37300 4256 34774 335685;335686;335687;335688;335689;335690;335691;335692 427141;427142;427143;427144;427145;427146;427147;427148;427149;427150 427147 10 QQIQSIQQSIER Unmodified 1456.7634 0.76340513 2670 P55769 NHP2L1 NHP2-like protein 1;NHP2-like protein 1, N-terminally processed no no 0 0 0 1 55.595 55.595 2 0.00036618 50780 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.93 84.159 39052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39052000 0 0 0 37301 2670 34775 335693 427151;427152 427151 2 QQISLATQMVR Unmodified 1273.6813 0.6812554 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.718 64.718 2 4.6401E-08 63164 QUIQUE_C1563_190116_001 151.48 122.32 827770000 109860000 0 119930000 0 0 118270000 117000000 141320000 69882000 0 79439000 0 72074000 37302 2514 34776 335694;335695;335696;335697;335698;335699;335700;335701 427153;427154;427155;427156;427157;427158;427159;427160;427161;427162 427155 10 QQISLATQMVR Oxidation (M) 1289.6762 0.67617003 2514 P48643;E7ENZ3;B7ZAR1;E9PCA1 CCT5 T-complex protein 1 subunit epsilon yes no 0 1 0 1 42.941 42.941 2 0.0020683 39360 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.645 58.615 33863000 0 0 0 0 0 0 0 33863000 0 0 0 0 0 37303 2514 34776 335702 427163 427163 1940 1 QQLAAYQEEAER Unmodified 1434.6739 0.67392142 3523 Q86YM7;Q86YM6 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.998 39.998 2 0.00089137 35980 QUIQUE_C1277_190116_001 85.958 66.196 236970000 0 51100000 0 0 54336000 31281000 0 37941000 0 0 62311000 0 0 37304 3523 34777 335703;335704;335705;335706;335707;335708 427164;427165;427166;427167;427168;427169 427164 5 QQLDELSWATALAEGER Unmodified 1915.9276 0.92756992 16;1475 A0A075B7B1;C9JIE4;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.37 142.37 2;3 1.0007E-16 147076 QUIQUE_DMIX7_190116_001 163.27 143.43 329050000 0 14184000 23963000 17449000 0 19023000 19561000 22997000 26972000 0 19649000 138260000 26998000 37305 16;1475 34778 335709;335710;335711;335712;335713;335714;335715;335716;335717;335718;335719 427170;427171;427172;427173;427174;427175;427176;427177;427178;427179;427180 427179 9 QQLDEQILLLQHSK Unmodified 1691.9206 0.92063405 705;592 C9JA33;B1ALY0;C9JZH4 PALM2;PALM2-AKAP2 no no 0 0 0 1 82.722 82.722 3 0.040794 83154 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and activator of transcription yes no 0 0 0 1 148.96 148.96 2 0.0069856 151840 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.466 58.905 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37316 2427 34788 335784 427249 427249 1 QQLQLSLQNTR Unmodified 1327.7208 0.72081203 1602 O60890 OPHN1 Oligophrenin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 57.671 57.671 2 0.034661 55269 QUIQUE_C1218_190116_001 58.676 29.949 68909000 33859000 11334000 0 0 0 0 0 0 0 23715000 0 0 0 37317 1602 34789 335785;335786;335787 427250;427251;427252 427250 2 QQLQQAEEALVAK Unmodified 1454.7729 0.77290718 44 A0A087X0G7;A0A087WUW6;A0A087X1B1;Q9Y6K9 IKBKG NF-kappa-B essential modulator yes no 0 0 0 1 1 1 66.518 66.518 2 0.011149 66530 QUIQUE_C1368_190116_001 57.204 39.34 69710000 0 0 31628000 0 0 12357000 0 0 0 0 0 0 25725000 37318 44 34790 335788;335789;335790 427253;427254;427255 427253 2 QQLQQVPGLLHR Unmodified 1415.7997 0.79973106 3049 Q14166 TTLL12 Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 56.269 56.269 3 0.027836 54420 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.013 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QQMQDFFLAHKDEEWFR Unmodified 2254.0266 0.026572462 4063 Q9BXP5 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 113.96 113.96 4 0.00018105 117907 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.12 70.881 132610000 0 0 0 19519000 0 0 27931000 0 29857000 0 31746000 23562000 0 37333 4063 34803 335898;335899;335900;335901;335902 427383;427384;427385;427386;427387;427388 427386 5 QQNAQGGFSSTQDTVVALHALSK Unmodified 2386.1877 0.18770079 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 87.791 87.791 2;3 6.5499E-06 85208 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.871 63.948 88343000 0 0 0 0 16322000 0 0 0 0 72021000 0 0 0 37334 1802 34804 335903;335904 427389;427390 427390 1 QQNDELTTLADEAQSLKDEIDVLR Unmodified 2743.3512 0.35119688 3500 Q86VS8 HOOK3 Protein Hook homolog 3 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 161.74 161.74 3 2.0685E-24 165748 QUIQUE_DMIX7_190116_001 129.34 116.41 642690000 46431000 49903000 0 83197000 54032000 50095000 54278000 43571000 68190000 0 88890000 62621000 41482000 37335 3500 34805 335905;335906;335907;335908;335909;335910;335911;335912;335913;335914;335915;335916;335917 427391;427392;427393;427394;427395;427396;427397;427398;427399;427400;427401;427402;427403;427404;427405;427406 427405 14 QQNFNTGIK Unmodified 1048.5302 0.53015772 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.12 24.12 1;2 4.6703E-18 17525 QUIQUE_C1576_190116_001 226.46 125.17 19312000000 2127600000 1835600000 3289100000 1921500000 2004100000 1624900000 74276000 698770000 1478100000 960590000 1732600000 1565000000 0 37336 267;275;3025 34806 335918;335919;335920;335921;335922;335923;335924;335925;335926;335927;335928;335929 427407;427408;427409;427410;427411;427412;427413;427414;427415;427416;427417;427418;427419 427414 12 QQNPGHTLEAGWFLLR Unmodified 1865.9537 0.95366552 547 A6NKZ2;P51606;H7C2G7 RENBP N-acylglucosamine 2-epimerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 113.07 113.07 2;3 0.0002833 117145 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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335939;335940;335941;335942;335943;335944;335945;335946;335947;335948;335949;335950;335951;335952;335953;335954;335955;335956;335957;335958;335959;335960;335961 427431;427432;427433;427434;427435;427436;427437;427438;427439;427440;427441;427442;427443;427444;427445;427446;427447;427448;427449;427450;427451;427452;427453;427454;427455;427456 427450 26 QQPDTELEIQQK Unmodified 1455.7205 0.72053726 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 42.372 42.372 2 0.00091112 38488 QUIQUE_C1368_190116_001 102.52 54.921 102670000 0 0 24687000 0 0 0 0 25615000 29825000 0 0 22542000 0 37340 4285 34810 335962;335963;335964;335965;335966 427457;427458;427459;427460;427461 427457 5 QQPGPSEHIER Unmodified 1276.616 0.61601261 2568 P50552;K7EQD0 VASP Vasodilator-stimulated phosphoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 14.578 14.578 3 0.0027442 6348 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.172 47.984 225020000 0 0 0 57091000 0 0 0 40208000 0 0 66749000 0 60973000 37341 2568 34811 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QQQQTGNHPITVHCSAGAGR Unmodified 2146.0086 0.0086309865 2216 P23469 PTPRE Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 13.726 13.726 4 4.4867E-05 5899 QUIQUE_C1576_190116_001 69.122 55.081 159340000 11007000 0 26458000 6648400 10970000 0 37694000 0 14950000 0 25273000 0 26344000 37366 2216 34836 336154;336155;336156;336157;336158;336159;336160;336161 427688;427689;427690;427691;427692;427693;427694;427695;427696 427693 9 QQQVEAVELEAK Unmodified 1370.7042 0.70415892 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;G3V5P0 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 46.06 46.06 2 3.4762E-05 43177 QUIQUE_C1368_190116_001 128.03 70.445 290440000 0 0 65448000 60679000 0 0 49314000 0 0 0 60060000 0 54938000 37367 3490 34837 336162;336163;336164;336165;336166;336167;336168 427697;427698;427699;427700;427701;427702;427703 427697 7 QQRPLEFR Unmodified 1072.5778 0.57777661 3156 Q15773 MLF2 Myeloid leukemia factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.631 21.631 3 0.0045786 14962 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336176;336177;336178;336179;336180;336181;336182;336183;336184;336185;336186;336187;336188 427712;427713;427714;427715;427716;427717;427718;427719;427720;427721;427722;427723;427724;427725;427726;427727 427722 15 QQSDLDKYIILMTLQDRNEK Unmodified 2450.2475 0.24752385 3198 Q16798;E9PMB9;Q6TCH8;E9PNN2 ME3 NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial;Malic enzyme yes no 0 0 2 1 117.59 117.59 4 0.0030343 121935 QUIQUE_DMIX8_190116_001 41.257 26.797 45506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45506000 37371 3198 34841 336189 427728 427728 1 QQSELQSQVR Unmodified 1201.6051 0.60511357 3087 Q14847;C9J9W2 LASP1 LIM and SH3 domain protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 19.64 19.64 2 0.0015607 11940 QUIQUE_C1563_190116_001 113.66 77.714 1565200000 0 0 0 749750000 0 576040000 0 0 0 239420000 0 0 0 37372 3087 34842 336190;336191;336192 427729;427730;427731 427730 2 QQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVK Unmodified 2605.169 0.16895596 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 1 1 71.901 71.901 3;4 7.1085E-08 72279 QUIQUE_C1277_190116_001 63.272 49.4 1051400000 0 104990000 0 146350000 46026000 0 70781000 181460000 174560000 0 52056000 92692000 182480000 37373 3130 34843 336193;336194;336195;336196;336197;336198;336199;336200;336201;336202;336203;336204;336205 427732;427733;427734;427735;427736;427737;427738;427739;427740;427741;427742;427743;427744;427745 427733 14 QQSHFAMMHGGTGFAGIDSSSPEVK Oxidation (M) 2621.1639 0.16387058 3130 Q15365 PCBP1 Poly(rC)-binding protein 1 yes yes 0 1 0 2 61.107 61.107 3;4 4.4886E-07 56720 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.416 52.612 145360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 145360000 0 0 0 37374 3130 34843 336206;336207 427746;427747 427747 2589;2590 2 QQSIAGSADSKPIDVSR Unmodified 1757.8908 0.89079049 2950 Q12904 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 1 34.543 34.543 2;3 0.00033905 29693 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.713 66.964 395470000 0 0 0 0 0 0 0 60593000 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336223;336224;336225;336226;336227;336228;336229;336230;336231;336232;336233 427765;427766;427767;427768;427769;427770;427771;427772;427773;427774;427775;427776;427777 427767 11 QQSLETAMSFVAR Oxidation (M) 1482.7137 0.71367774 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 1 0 1 1 1 66.821 66.821 2 0.023478 62786 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.247 36.023 96942000 0 0 0 48428000 0 0 28614000 0 0 19899000 0 0 0 37378 2037 34846 336234;336235;336236 427778;427779;427780 427780 3 QQSPGLGRPIWLQIAESAYR Unmodified 2269.1967 0.19674933 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 135.31 135.31 3 0.0012338 138949 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.029 55.961 442710000 0 0 0 0 0 0 0 136580000 0 0 144170000 83963000 78000000 37379 1655 34847 336237;336238;336239;336240;336241 427781;427782;427783;427784;427785 427781 3 QQTESLLQLLTPAYITK Unmodified 1946.0724 0.072443247 3901 Q96LD8 SENP8 Sentrin-specific protease 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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427969 473 QQVHVELDVAKPDLTAALKEIR Unmodified 2472.37 0.37002225 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EKH9;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 1 2 3 2 2 2 2 2 1 2 104.42 104.42 3;4;5 5.8884E-15 109043 QUIQUE_C1438_190116_001 112.54 95.677 1326900000 49939000 79169000 168530000 0 113090000 0 104450000 84941000 172720000 0 391130000 68743000 94151000 37394 389;395;1336 34862 336688;336689;336690;336691;336692;336693;336694;336695;336696;336697;336698;336699;336700;336701;336702;336703;336704;336705;336706 428429;428430;428431;428432;428433;428434;428435;428436;428437;428438;428439;428440;428441;428442;428443;428444;428445;428446;428447;428448;428449 428436 18 QQVPSGESAILDR Unmodified 1398.7103 0.71030693 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 56.552 56.552 2 0.010408 54910 QUIQUE_C1403_190116_001 64.64 11.429 713890000 0 112420000 131310000 94617000 110910000 83224000 0 0 0 43221000 0 138190000 0 37395 1974 34863 336707;336708;336709;336710;336711;336712;336713;336714 428450;428451;428452;428453;428454;428455;428456;428457 428452 7 QQVQELLDELDEQK Unmodified 1713.8421 0.84210896 2449 P42566;B1AUU8 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 0 0 0 1 119.63 119.63 3 0.041417 122086 QUIQUE_C1563_190116_001 20.432 16.26 15610000 0 0 0 0 0 15610000 0 0 0 0 0 0 0 37396 2449 34864 336715 428458 428458 1 QQVQVVGLQER Unmodified 1282.6993 0.69934831 1377 O00139;H0Y8H2 KIF2A Kinesin-like protein KIF2A yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.118 46.118 2;3 0.0004441 43205 QUIQUE_C1403_190116_001 104.22 76.918 1038600000 109940000 83787000 178860000 90298000 66300000 74173000 82684000 50441000 57305000 59567000 58718000 70437000 56057000 37397 1377 34865 336716;336717;336718;336719;336720;336721;336722;336723;336724;336725;336726;336727;336728;336729 428459;428460;428461;428462;428463;428464;428465;428466;428467;428468;428469;428470;428471;428472;428473;428474;428475;428476 428464 18 QQVTILATPLPEESMK Unmodified 1783.939 0.93898623 2947 Q12846;C9JFM5;A0A087WWW0 STX4 Syntaxin-4 yes no 0 0 0 1 1 102.58 102.58 2 0.0085653 105298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.548 52.803 38201000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38201000 0 0 37398 2947 34866 336730;336731 428477;428478 428477 2 QQWALVEFEKPVTCPR Unmodified 1986.9986 0.9985668 2685 P57772;C9J8T0 EEFSEC Selenocysteine-specific elongation factor yes no 0 0 1 1 98.515 98.515 3 0.013058 101544 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.454 32.861 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37399 2685 34867 336732 428479 428479 1 QQWDAAIYFMEEALQAR Unmodified 2068.9677 0.9676606 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 169.66 169.66 2;3 1.2557E-104 171331 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.14 166.82 970310000 59521000 66655000 97572000 23195000 22293000 22925000 71621000 68222000 90217000 11176000 240350000 107320000 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aldehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 1 60.71 60.71 3 0.00071016 60024 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.916 31.553 41034000 0 0 0 0 0 0 0 0 41034000 0 0 0 0 37413 2587 34880 336866 428621 428621 1 QRHDGAFLIR Unmodified 1211.6523 0.65233854 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 21.889 21.889 3 0.00013366 14532 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.06 105.4 1015400000 0 0 57270000 0 94539000 0 0 276040000 168370000 0 207620000 110770000 100750000 37414 2774 34881 336867;336868;336869;336870;336871;336872;336873 428622;428623;428624;428625;428626;428627;428628;428629 428629 8 QRIDEFEAL Unmodified 1119.556 0.55603812 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 83.761 83.761 2 0.010951 84949 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.28 77.098 1562900000 0 0 0 0 0 0 0 357490000 483180000 101140000 0 268940000 352200000 37415 859 34882 336874;336875;336876;336877;336878 428630;428631;428632;428633;428634 428631 3 QRIDEFESM Unmodified 1153.5074 0.50737336 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 67.981 67.981 2 0.018462 67629 QUIQUE_C1403_190116_001 131.27 45.996 531450000 0 0 0 118390000 0 0 0 0 176970000 53506000 182580000 0 0 37416 2248 34883 336879;336880;336881;336882 428635;428636;428637;428638 428635 1 QRIDEFESM Oxidation (M) 1169.5023 0.50228799 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 1 1 1 1 43.03 43.03 2 0.01726 39662 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.33 91.546 85917000 0 0 0 0 0 0 0 47649000 0 0 0 38268000 0 37417 2248 34883 336883;336884 428639;428640 428639 2 QRIDEFESMMHL Unmodified 1534.6908 0.69083381 611 B4DIZ1;Q8TAM6 ERMN Ermin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 113.82 113.82 3 0.0021652 118689 QUIQUE_C1218_190116_001 72.652 67.279 78660000 9592300 17937000 11924000 0 0 0 22251000 16956000 0 0 0 0 0 37418 611 34884 336885;336886;336887;336888;336889 428641;428642;428643;428644;428645;428646 428641 6 QRLEALGTGWEELGR Unmodified 1713.8798 0.87983187 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 91.997 91.997 3 5.3475E-06 94057 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.508 71.668 236720000 0 0 0 0 0 0 0 49271000 37649000 0 57309000 41234000 51260000 37419 1472 34885 336890;336891;336892;336893;336894 428647;428648;428649;428650;428651;428652 428652 6 QRLEMNLGLQK Unmodified 1328.7235 0.72345457 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 51.869 51.869 2;3 2.004E-17 50507 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.9 67.918 866090000 0 0 0 0 53818000 0 0 189580000 165670000 0 146390000 166340000 144290000 37420 2851 34886 336895;336896;336897;336898;336899;336900;336901;336902;336903;336904;336905 428653;428654;428655;428656;428657;428658;428659;428660;428661;428662;428663;428664;428665;428666;428667;428668 428655 16 QRLEMNLGLQK Oxidation (M) 1344.7184 0.71836919 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 2 1 30.318 30.318 2;3 0.0017315 25357 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.445 50.967 147360000 0 0 0 0 0 0 0 96327000 51034000 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hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 1 1 19.601 19.601 3 0.03426 12317 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.372 35.434 52196000 0 0 0 0 0 0 0 52196000 0 0 0 0 0 37424 3850 34889 336922 428691 428691 1 QRNEVVVELRK Unmodified 1368.7837 0.78374664 1420 O00629 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes yes 0 0 2 1 19.313 19.313 3 0.043369 12279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.258 39.87 28722000 0 0 0 0 0 0 0 28722000 0 0 0 0 0 37425 1420 34890 336923 428692 428692 1 QRPGQQVATCVR Unmodified 1398.715 0.71501515 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 14.842 14.842 2;3 0.0011778 6189 QUIQUE_C1563_190116_001 79.23 65.83 1008600000 0 0 132100000 198610000 0 203490000 142350000 0 155950000 33393000 0 142720000 0 37426 1645 34891 336924;336925;336926;336927;336928;336929;336930;336931;336932 428693;428694;428695;428696;428697;428698;428699;428700;428701 428696 8 QRPPQTPLR Unmodified 1091.62 0.61997578 4342 Q9NZB2 FAM120A Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 14.475 14.475 3 0.001754 6237 QUIQUE_C1277_190116_001 89.886 71.279 142770000 21128000 19069000 0 26954000 19675000 31639000 24301000 0 0 0 0 0 0 37427 4342 34892 336933;336934;336935;336936;336937;336938 428702;428703;428704;428705;428706;428707;428708 428704 7 QRPQATAEQIR Unmodified 1296.6898 0.68984626 3047 Q14157;F8W726;Q5VU77;Q5VU81;Q5VU80;Q5VU79;Q5VU78 UBAP2L Ubiquitin-associated protein 2-like yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 13.868 13.868 2;3 9.0846E-05 6337 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.985 74.537 519820000 68078000 37320000 72416000 39868000 35894000 23702000 74143000 20884000 53805000 0 55278000 20938000 17489000 37428 3047 34893 336939;336940;336941;336942;336943;336944;336945;336946;336947;336948;336949;336950;336951;336952;336953;336954;336955 428709;428710;428711;428712;428713;428714;428715;428716;428717;428718;428719;428720;428721;428722;428723;428724;428725 428721 13 QRVDVEDLGVDFLTIVGHK Unmodified 2139.1324 0.13241774 132 A0A0A0MQU4;Q96I15;H7C3V9;H7C277;H7C1S7 SCLY Selenocysteine lyase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.56 143.56 4 2.4099E-05 146669 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.87 59.84 156520000 26758000 0 0 13778000 16569000 14508000 14637000 19742000 21846000 0 15503000 0 13185000 37429 132 34894 336956;336957;336958;336959;336960;336961;336962;336963;336964 428726;428727;428728;428729;428730;428731;428732;428733;428734;428735;428736;428737 428733 11 QRVEAAVGEDLFQEAHEVILK Unmodified 2380.2387 0.23867373 2323 P30711;A0A0G2JRQ5 GSTT1 Glutathione S-transferase theta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 118.95 118.95 4 4.8333E-08 122552 QUIQUE_C1403_190116_001 95.206 88.557 342670000 0 0 0 73061000 58045000 0 0 81444000 0 0 0 60569000 69548000 37430 2323 34895 336965;336966;336967;336968;336969 428738;428739;428740;428741;428742;428743;428744 428738 7 QRWDEAFR Unmodified 1106.5257 0.52574104 2266 P27695;G3V3M6;G3V5Q1;H7C4A8 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 46.984 46.984 3 0.037337 44131 QUIQUE_C1277_190116_001 47.574 30.736 64157000 0 26914000 0 0 0 10071000 0 0 0 0 0 27171000 0 37431 2266 34896 336970;336971;336972 428745;428746;428747 428745 3 QRYEILTPNSIPK Unmodified 1557.8515 0.85149185 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 2 1 65.807 65.807 2;3 0.011848 64542 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.509 34.515 110430000 0 0 0 0 0 0 0 110430000 0 0 0 0 0 37432 2378 34897 336973;336974;336975 428748;428749;428750 428750 2 QSAALCLLR Unmodified 1030.5593 0.55934935 1749;1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1;E9PR62;A0A0G2JRF9;A0A0G2JQA4;A0A0G2JRS3;E9PNC4;A0A0G2JQT9;H0YEG0;A0A0G2JS17;H0YDE9;O95782 AP2A2;AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-2;AP-2 complex subunit alpha-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.431 63.431 2 2.6248E-06 62910 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.5 95.892 2748600000 0 0 343590000 0 267910000 261370000 384920000 302010000 287150000 0 265240000 320630000 315770000 37433 1701;1749 34898 336976;336977;336978;336979;336980;336981;336982;336983;336984 428751;428752;428753;428754;428755;428756;428757;428758;428759;428760;428761 428757 11 QSALEYFVYTIR Unmodified 1488.7613 0.76127986 3324 Q5TC84;A0A3B3IRI0 OGFRL1 Opioid growth factor receptor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 139.41 139.41 2 0.010885 144353 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.488 51.743 79827000 0 0 0 0 0 0 0 0 79827000 0 0 0 0 37434 3324 34899 336985 428762 428762 1 QSALISWQPPR Unmodified 1281.683 0.68296996 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 2 1 3 1 3 86.412 86.412 2 5.3564E-08 89110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.35 128.26 2544400000 141300000 162940000 158670000 0 165170000 92624000 210180000 366410000 326210000 63587000 375840000 259980000 221470000 37435 3753 34900 336986;336987;336988;336989;336990;336991;336992;336993;336994;336995;336996;336997;336998;336999;337000;337001;337002;337003;337004;337005 428763;428764;428765;428766;428767;428768;428769;428770;428771;428772;428773;428774;428775;428776;428777;428778;428779;428780;428781;428782;428783;428784;428785;428786;428787;428788;428789;428790 428782 28 QSAQLTALAAQQQAAGK Unmodified 1683.8904 0.89039656 3796 Q96A49 SYAP1 Synapse-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 53.404 53.404 2 0.0060929 50738 QUIQUE_C1563_190116_001 53.388 31.515 42679000 0 0 0 0 0 42679000 0 0 0 0 0 0 0 37436 3796 34901 337006 428791 428791 1 QSCNILISTMNK Unmodified 1407.685 0.68502015 3052;890 E7EX90;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 67.09 67.09 2 8.2778E-28 66778 QUIQUE_C1403_190116_001 179.08 140.78 391610000 0 0 0 95843000 0 78271000 114340000 0 103150000 0 0 0 0 37437 890;3052 34902 337007;337008;337009;337010 428792;428793;428794;428795 428792 4 QSDDEVYAPGLDIESSLK Unmodified 1964.9215 0.92148149 3141 Q15459 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 116.75 116.75 2 0.00025659 120227 QUIQUE_C1403_190116_001 82.515 67.829 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428802;428803;428804;428805;428806;428807;428808;428809;428810;428811;428812;428813 428803 7 QSEDLGSQFTEIFIK Unmodified 1740.857 0.85703074 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 140.3 140.3 2 4.7126E-09 145724 QUIQUE_C1218_190116_001 149.26 132.23 407350000 67408000 81408000 0 0 0 57957000 80777000 73513000 0 46286000 0 0 0 37441 1591 34905 337028;337029;337030;337031;337032;337033 428814;428815;428816;428817;428818;428819;428820 428814 7 QSEDSTFYLGER Unmodified 1430.6314 0.6313879 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 66.63 66.63 2 5.4913E-05 66842 QUIQUE_C1438_190116_001 125.74 103.1 253600000 0 36153000 0 41348000 107280000 0 0 38666000 0 30151000 0 0 0 37442 1784 34906 337034;337035;337036;337037;337038;337039 428821;428822;428823;428824;428825;428826 428824 4 QSELESIQEVLGDYR Unmodified 1764.853 0.853008 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4;E9PLY5 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 141.97 141.97 2;3 2.2782E-35 147553 QUIQUE_C1368_190116_001 169.89 145.6 226420000 0 0 42633000 0 0 25701000 0 0 0 0 64043000 58597000 35443000 37443 1187 34907 337040;337041;337042;337043;337044;337045 428827;428828;428829;428830;428831;428832;428833 428828 6 QSELSAEESPEK Unmodified 1332.6045 0.60450445 1059 F8W9X7;Q567U6 CCDC93 Coiled-coil domain-containing protein 93 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.992 22.992 2 9.9289E-05 17005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.36 79.17 96357000 0 0 0 21243000 0 24986000 0 22675000 0 0 27453000 0 0 37444 1059 34908 337046;337047;337048;337049;337050 428834;428835;428836;428837;428838 428837 4 QSEPLEITLLAPER Unmodified 1594.8566 0.85663681 2233 P24821;J3QSU6;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.89 115.89 2 0.00032355 121816 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.82 91.583 648790000 0 0 32227000 0 27036000 54805000 0 75874000 189740000 43534000 86903000 70324000 68348000 37445 2233 34909 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F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 82.598 82.598 2 0.00028389 79057 QUIQUE_DMIX4_190116_001 109 90.729 28080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28080000 0 0 0 37452 2609 34915 337109;337110 428908;428909;428910 428910 3 QSGESIDIITR Unmodified 1217.6252 0.62518031 3179 Q16531;F5GY55;F5H2L3;F5GWI0;F5GZY8;F5GYG8 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.224 58.224 2 0.0008428 56524 QUIQUE_C1368_190116_001 94.297 65.135 499610000 0 135790000 121570000 0 0 82947000 0 110390000 0 48912000 0 0 0 37453 3179 34916 337111;337112;337113;337114;337115 428911;428912;428913;428914;428915;428916 428912 6 QSGGTTALPLYFVGLYCDK Unmodified 2089.019 0.019027468 4198 Q9H9J2 MRPL44 39S ribosomal protein L44, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 149.32 149.32 2 0.011993 153812 QUIQUE_C1277_190116_001 55.656 37.583 24488000 0 24488000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37454 4198 34917 337116 428917 428917 1 QSGGYVATIGTK Unmodified 1180.6088 0.60880197 3143 Q15493 RGN 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429106;429107;429108;429109;429110;429111;429112;429113;429114;429115;429116;429117;429118;429119;429120;429121;429122;429123;429124;429125;429126;429127 429107 22 QSLEELGPIYK Unmodified 1275.6711 0.67106787 1703 O95057;K7EN06 DIRAS1 GTP-binding protein Di-Ras1 yes no 0 0 0 1 80.239 80.239 2 0.012651 81944 QUIQUE_C1576_190116_001 66.962 26.08 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37472 1703 34934 337274 429128 429128 1 QSLETICLLLAYK Unmodified 1550.8378 0.83781563 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;C9J9S3;C9JP48;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;A0A087WYY5;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.97 139.97 2 0.00049328 145007 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.23 100.01 2582300000 222910000 208700000 192630000 0 200690000 154930000 208380000 300030000 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337290;337291;337292;337293;337294;337295;337296;337297;337298;337299;337300;337301;337302;337303;337304;337305;337306;337307;337308;337309;337310;337311;337312;337313;337314;337315;337316;337317;337318;337319;337320;337321;337322;337323;337324;337325;337326;337327;337328;337329;337330;337331 429147;429148;429149;429150;429151;429152;429153;429154;429155;429156;429157;429158;429159;429160;429161;429162;429163;429164;429165;429166;429167;429168;429169;429170;429171;429172;429173;429174;429175;429176;429177;429178;429179;429180;429181;429182;429183;429184;429185;429186;429187;429188;429189;429190;429191;429192;429193;429194;429195;429196;429197;429198;429199;429200;429201;429202;429203;429204;429205;429206;429207;429208;429209;429210;429211;429212;429213;429214;429215;429216;429217;429218;429219;429220;429221;429222 429166 76 QSLGHPPPEPGPDR Unmodified 1482.7215 0.72154031 2069 P13861;C9J830 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 22.295 22.295 2;3 0.00028339 15851 QUIQUE_C1218_190116_001 90.614 71.834 314420000 26932000 20852000 0 36606000 0 33733000 0 159190000 0 0 0 0 37112000 37476 2069 34938 337332;337333;337334;337335;337336;337337;337338;337339 429223;429224;429225;429226;429227;429228;429229;429230 429223 8 QSLLDMAQTWGEFR Unmodified 1680.793 0.7929907 601 M0QZP4;B3KSI3;M0QZ10;M0QXF9;O15382 BCAT2 Branched-chain-amino-acid aminotransferase;Branched-chain-amino-acid aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 153.33 153.33 2 0.0029461 157039 QUIQUE_C1403_190116_001 89.403 73.864 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37477 601 34939 337340 429231 429231 1 QSLLSVAPK Unmodified 941.55458 0.55458155 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 49.541 49.541 1;2 0.015897 47634 QUIQUE_C1218_190116_001 66.504 31.255 2286200000 706460000 560580000 0 0 0 0 0 514850000 0 0 0 504300000 0 37478 1198 34940 337341;337342;337343;337344;337345 429232;429233;429234;429235;429236 429232 4 QSLTMDPVVK Unmodified 1116.5849 0.5848954 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 53.282 53.282 2 0.0039027 51084 QUIQUE_C1403_190116_001 82.749 30.347 427330000 0 0 0 98407000 0 108090000 136130000 0 0 0 0 84710000 0 37479 2363 34941 337346;337347;337348;337349 429237;429238;429239;429240;429241 429237 5 QSLTMDPVVK Oxidation (M) 1132.5798 0.57981002 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 1 0 1 1 31.972 31.972 2 0.020732 27490 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.78 44.54 188110000 0 0 0 0 0 0 0 0 87554000 0 100550000 0 0 37480 2363 34941 337350;337351 429242;429243 429242 2 QSMAFSILNTPK Unmodified 1335.6857 0.68567208 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 96.227 96.227 2 0.043665 97632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.286 32.68 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37481 3091 34942 337352 429244 429244 1 QSNASQTLCDIVR Unmodified 1490.7147 0.71474038 1615 O75170 PPP6R2 Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 69.376 69.376 2 0.0050387 69318 QUIQUE_C1277_190116_001 88.803 73.426 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37482 1615 34943 337353 429245 429245 1 QSNASSDVEVEEK Unmodified 1420.6318 0.63178183 1637 O75475 PSIP1 PC4 and SFRS1-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.43 19.43 2 1.1022E-17 11818 QUIQUE_C1277_190116_001 166.29 141.45 739810000 112170000 108940000 70084000 75870000 62039000 74719000 89902000 0 37815000 31312000 0 39317000 37649000 37483 1637 34944 337354;337355;337356;337357;337358;337359;337360;337361;337362;337363;337364 429246;429247;429248;429249;429250;429251;429252;429253;429254;429255;429256 429247 11 QSNNEANLREEVLK Unmodified 1642.8275 0.82746195 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 38.48 38.48 2;3 0.00079996 34966 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.128 43.917 494600000 0 0 0 0 0 0 57060000 0 90961000 0 90083000 83933000 172560000 37484 3700 34945 337365;337366;337367;337368;337369;337370 429257;429258;429259;429260;429261;429262 429258 5 QSNSYDMFMR Unmodified 1277.5169 0.51689219 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.726 75.726 2 0.0053804 76199 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.677 72.518 411620000 0 0 71595000 76505000 0 57673000 64170000 0 53508000 25467000 0 62700000 0 37485 2083 34946 337371;337372;337373;337374;337375;337376;337377 429263;429264;429265;429266;429267;429268;429269;429270 429268 8 QSPDHPTVGAGVLHITENGPTEVDYSPSDMQDSSLSHK Unmodified 4031.8443 0.84431716 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 93.536 93.536 5 0.0041244 95270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.19 13.509 119030000 0 0 0 0 0 0 0 63644000 0 0 55389000 0 0 37486 2483 34947 337378;337379 429271;429272 429271 2 QSPEHNLTHPELSVAVEMLSSVALINR Unmodified 2970.5233 0.52330478 2487 P46940;A0A0J9YXZ5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 149 149 4 0.00037127 154909 QUIQUE_C1368_190116_001 40.428 37.851 29261000 0 0 29261000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37487 2487 34948 337380 429273 429273 1 QSPINIDEDLTQVNVNLK Unmodified 2039.0535 0.053498719 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 124.28 124.28 2;3 1.1193E-63 127141 QUIQUE_DMIX1_190116_001 187.74 171.65 2531500000 199210000 110540000 157060000 75330000 147020000 182270000 489500000 173450000 454300000 311520000 0 231280000 0 37488 2217 34949 337381;337382;337383;337384;337385;337386;337387;337388;337389;337390;337391;337392;337393;337394;337395 429274;429275;429276;429277;429278;429279;429280;429281;429282;429283;429284;429285;429286;429287;429288;429289;429290;429291 429284 16 QSPINIDEDLTQVNVNLKK Unmodified 2167.1485 0.14846174 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 102.78 102.78 2;3 8.7814E-17 105144 QUIQUE_DMIX7_190116_001 169.58 146.11 2358000000 0 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0 0 0 37491 246 34952 337412 429308 429308 1 QSPVAMETASTGVAGVSSAMDHTFSTTSK Unmodified 2884.3219 0.32188736 3199 Q16799 RTN1 Reticulon-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.98 110.98 3 9.2353E-55 113630 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.28 140.21 439700000 91687000 123480000 0 0 0 0 0 55431000 45690000 0 0 51063000 72347000 37492 3199 34953 337413;337414;337415;337416;337417;337418 429309;429310;429311;429312;429313;429314 429311 6 QSPVDIDTHTAK Unmodified 1310.6466 0.64664404 1796 P00918;E5RID5;E5RK37 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 23.096 23.096 2;3 5.6996E-20 16132 QUIQUE_C1368_190116_001 169.93 138.86 24014000000 885700000 1379700000 2159600000 1851300000 2394300000 1544800000 1995900000 1480900000 2375600000 960320000 3059000000 1912500000 2014600000 37493 1796 34954 337419;337420;337421;337422;337423;337424;337425;337426;337427;337428;337429;337430;337431;337432;337433;337434;337435;337436;337437;337438;337439;337440;337441;337442 429315;429316;429317;429318;429319;429320;429321;429322;429323;429324;429325;429326;429327;429328;429329;429330;429331;429332;429333;429334;429335;429336;429337;429338;429339;429340;429341;429342 429319 24 QSQANAPVYQQNVLHTGK Unmodified 1981.997 0.99698689 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;H0Y7R3;H0Y493 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 39.707 39.707 3 0.0077928 35834 QUIQUE_C1403_190116_001 26.78 17.199 36016000 0 0 0 36016000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37494 1056 34955 337443 429343 429343 1 QSQGTTPDTTPAR Unmodified 1358.6426 0.64262129 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 14.371 14.371 2 0.00010454 6568 QUIQUE_C1576_190116_001 113.44 68.284 246920000 0 46503000 0 0 42018000 44145000 80594000 0 0 8527000 0 25134000 0 37495 1255;2856 34956 337444;337445;337446;337447;337448;337449 429344;429345;429346;429347;429348;429349;429350;429351 429348 7 QSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASK Unmodified 2624.1726 0.17256381 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;C9JJD0;C9JKG6;E9PCY0;Q14203 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429360;429361;429362;429363;429364 429361 5 QSQQTLYHSHPPHPADR Unmodified 1997.9456 0.94562002 364 A0A1B0GWK2;Q674X7 KAZN Kazrin yes no 0 0 0 1 1 1 13.994 13.994 4 0.00041543 5703 QUIQUE_C1563_190116_001 63.321 53.264 38456000 0 0 0 10023000 9198900 19235000 0 0 0 0 0 0 0 37499 364 34960 337462;337463;337464 429365;429366;429367 429367 3 QSRPVAGGPGAPPAARPPASPSPQR Unmodified 2405.2676 0.26762287 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 2 1 1 1 4 1 1 3 2 1 27.611 27.611 3;4 2.9819E-19 21793 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.905 63.259 1813900000 57492000 0 110720000 0 117280000 0 0 292290000 124260000 32800000 473460000 334190000 271440000 37500 2125 34961 337465;337466;337467;337468;337469;337470;337471;337472;337473;337474;337475;337476;337477;337478;337479 429368;429369;429370;429371;429372;429373;429374;429375;429376;429377;429378;429379;429380;429381;429382;429383;429384;429385;429386;429387;429388;429389 429378 21 QSSAPASPAASAAGLAGQAAK Unmodified 1810.9173 0.91733959 3299 Q5SWX3 CAMK2G yes 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430098;430099;430100;430101 430100 4 QTLEEELFGNNEESPAFK Unmodified 2080.9589 0.95892963 354 A0A1B0GV05;Q684P5 RAP1GAP2 Rap1 GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 134.03 134.03 2 5.9049E-25 140441 QUIQUE_DMIX5_190116_001 192.65 143.2 44632000 0 44632000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37584 354 35043 338036;338037;338038;338039 430102;430103;430104;430105 430105 4 QTLENERGELANEVK Unmodified 1728.8642 0.86424139 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 45.081 45.081 2;3 1.1356E-163 42069 QUIQUE_C1438_190116_001 251.84 169.09 1073400000 0 0 90250000 35658000 290440000 0 0 34422000 69308000 0 242380000 259500000 51482000 37585 2378 35044 338040;338041;338042;338043;338044;338045;338046;338047;338048;338049;338050;338051;338052;338053 430106;430107;430108;430109;430110;430111;430112;430113;430114;430115;430116;430117;430118;430119;430120 430110 12 QTLFASQVMR Unmodified 1179.607 0.60702783 2552 P49902 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes yes 0 0 0 1 68.033 68.033 2 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338058;338059;338060;338061;338062;338063;338064;338065;338066;338067;338068 430125;430126;430127;430128;430129;430130;430131;430132;430133;430134;430135 430131 11 QTLLHYISNVVK Unmodified 1413.798 0.79799972 3921 Q96PY5;C9IZY8 FMNL2 Formin-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.112 95.112 3 0.00344 97666 QUIQUE_C1368_190116_001 47.189 35.954 201300000 28587000 32691000 19731000 26107000 17060000 0 26754000 0 0 0 30954000 19414000 0 37590 3921 35049 338069;338070;338071;338072;338073;338074;338075;338076 430136;430137;430138;430139;430140;430141;430142;430143;430144;430145 430138 10 QTLLIFFQDLHIR Unmodified 1642.9195 0.91951184 3705 Q8WVF1;C9JF58 OSCP1 Protein OSCP1 no no 0 0 0 1 1 1 145.75 145.75 3 0.00012336 150127 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.202 83.421 68856000 0 0 0 0 0 0 14547000 0 25168000 0 0 29141000 0 37591 3705 35050 338077;338078;338079 430146;430147;430148 430148 3 QTLMWSATWPK Unmodified 1347.6645 0.66454271 381;1290 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Unmodified 1496.7947 0.79470526 2389 P35998;A0A1W2PQS1;C9JLS9 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.455 51.455 2 7.0893E-65 49091 QUIQUE_C1403_190116_001 211.78 162.43 1275300000 179100000 163850000 178910000 183230000 168620000 170010000 0 0 0 67309000 0 0 164230000 37595 2389 35054 338124;338125;338126;338127;338128;338129;338130;338131 430203;430204;430205;430206;430207;430208;430209;430210;430211;430212;430213 430207 10 QTLSIYQALK Unmodified 1163.655 0.65502388 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.001 81.001 2 0.0033506 78932 QUIQUE_DMIX4_190116_001 104.06 88.395 5248400000 527700000 521150000 585020000 191620000 422840000 243550000 559870000 357100000 484550000 304690000 439110000 349040000 262210000 37596 3117 35055 338132;338133;338134;338135;338136;338137;338138;338139;338140;338141;338142;338143;338144 430214;430215;430216;430217;430218;430219;430220;430221;430222;430223;430224;430225;430226;430227;430228;430229;430230;430231;430232;430233;430234;430235;430236;430237;430238 430232 25 QTLSIYQALKK Unmodified 1291.75 0.7499869 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 56.972 56.972 3 0.0010592 55972 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.434 61.509 1377800000 0 0 0 0 0 0 0 466040000 275100000 0 367270000 269350000 0 37597 3117 35056 338145;338146;338147;338148 430239;430240;430241;430242 430240 4 QTLSTPGTIILGTIPVPK Unmodified 1835.0768 0.076800343 3326 Q5TDF0;Q9BSD7 NTPCR Cancer-related nucleoside-triphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.63 135.63 2;3 0.00348 140132 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.297 76.753 241310000 37708000 0 0 14353000 0 0 0 32346000 45338000 22094000 53846000 35625000 0 37598 3326 35057 338149;338150;338151;338152;338153;338154;338155 430243;430244;430245;430246;430247;430248;430249 430246 4 QTLWPLSIHDPTR Unmodified 1562.8205 0.82052608 3304 Q5T0D9 TPRG1L Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein yes yes 0 0 0 1 1 96.838 96.838 3 0.0050699 98964 QUIQUE_C1277_190116_001 46.3 35.356 37264000 0 37264000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37599 3304 35058 338156;338157 430250;430251 430250 2 QTMEELKDLLK Unmodified 1346.7116 0.71155248 1464 O14964;I3L1P5;I3L165;I3L2H4 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 1 1 1 1 90.051 90.051 2;3 0.030891 91426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.934 39.385 25461000 0 0 0 25461000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37600 1464 35059 338158;338159;338160 430252;430253;430254 430253 3 QTMFYTEVTDAQR Unmodified 1588.7192 0.71915705 1760 O95848 NUDT14 Uridine diphosphate glucose pyrophosphatase yes yes 0 0 0 1 81.49 81.49 2 0.010573 83316 QUIQUE_C1576_190116_001 70.488 55.223 22963000 0 0 0 0 0 0 22963000 0 0 0 0 0 0 37601 1760 35060 338161 430255 430255 1 QTMQVDEHARPQTTLEQLQK Oxidation (M) 2396.1754 0.17542154 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 2 41.514 41.514 3;4 1.1812E-06 38584 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.281 88.471 460430000 0 38074000 0 0 0 64948000 0 28063000 59249000 0 51723000 0 218370000 37602 2453 35061 338162;338163;338164;338165;338166;338167;338168 430256;430257;430258;430259;430260;430261;430262;430263 430261 1879 7 QTMQVDEHARPQTTLEQLQK Unmodified 2380.1805 0.18050692 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 54.915 54.915 2;3;4 2.5371E-06 53204 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.092 89.337 921210000 0 258880000 199690000 0 0 0 0 387180000 0 75457000 0 0 0 37603 2453 35061 338169;338170;338171;338172;338173;338174 430264;430265;430266;430267;430268;430269 430267 5 QTMSHDSQAVASSLQSCFSHLMK Unmodified 2579.1567 0.15667671 2365 P34949;H3BPB8;F5GX71;H3BMZ9;H3BPP3;H3BP57;H3BUZ9;H3BT48 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 110.01 110.01 3;4 2.6566E-07 113262 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.561 71.347 780620000 109150000 65548000 49970000 113820000 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430328;430329;430330;430331;430332;430333;430334;430335;430336;430337;430338;430339;430340;430341;430342;430343;430344;430345;430346;430347;430348 430332 21 QTNPSAMEVEEDDPVPEIR Oxidation (M) 2170.9688 0.96884239 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 0 1 2 1 1 84.66 84.66 2 2.4736E-22 87615 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.51 122.85 190730000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19806000 99409000 26712000 44802000 37608 2658 35065 338235;338236;338237;338238;338239 430349;430350;430351;430352;430353;430354 430352 2103 6 QTNPSAMEVEEDDPVPEIRR Unmodified 2311.075 0.075038797 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 78.327 78.327 3 2.9541E-18 78739 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.21 84.266 79289000 0 0 0 0 0 0 0 79289000 0 0 0 0 0 37609 2658 35066 338240 430355;430356;430357 430357 3 QTPAGPETEEEPYR Unmodified 1602.7162 0.71618016 3005 Q13505;A0A0C4DFQ1 MTX1 Metaxin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.372 38.372 2 0.00017867 34776 QUIQUE_C1218_190116_001 110.08 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2 4 2 2 138.88 138.88 2;3 5.8139E-143 145857 QUIQUE_DMIX5_190116_001 280.54 262.74 5985100000 303400000 399110000 413750000 275470000 395990000 397630000 438280000 571720000 629650000 317240000 737710000 511850000 593250000 37612 282;2362 35069 338260;338261;338262;338263;338264;338265;338266;338267;338268;338269;338270;338271;338272;338273;338274;338275;338276;338277;338278;338279;338280;338281;338282;338283;338284;338285;338286;338287;338288 430379;430380;430381;430382;430383;430384;430385;430386;430387;430388;430389;430390;430391;430392;430393;430394;430395;430396;430397;430398;430399;430400;430401;430402;430403;430404;430405;430406;430407;430408;430409;430410;430411;430412;430413;430414;430415;430416;430417;430418;430419;430420;430421;430422 430414 42 QTQPTVNWVVPVADK Unmodified 1680.8835 0.88352026 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.163 95.163 2 0.018958 97769 QUIQUE_C1277_190116_001 76.522 72.759 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338502;338503;338504;338505;338506;338507;338508;338509;338510;338511;338512;338513;338514;338515;338516;338517;338518;338519;338520;338521;338522;338523;338524;338525;338526;338527;338528;338529;338530;338531 430732;430733;430734;430735;430736;430737;430738;430739;430740;430741;430742;430743;430744;430745;430746;430747;430748;430749;430750;430751;430752;430753;430754;430755;430756;430757;430758;430759;430760;430761;430762;430763;430764;430765;430766;430767;430768;430769;430770;430771;430772;430773;430774;430775;430776;430777;430778;430779;430780;430781;430782;430783 430733 51 QTTVSNSQQAYQEAFEISKK Unmodified 2286.1128 0.11280451 2341 P31946 YWHAB 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 72.144 72.144 2;3 4.3288E-56 72580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.08 157.94 5477000000 0 67120000 54232000 39804000 180680000 0 161220000 1208900000 1146000000 0 865150000 1013000000 740880000 37631 2341 35087 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431306;431307;431308;431309;431310;431311;431312;431313;431314;431315;431316;431317;431318;431319;431320;431321;431322;431323;431324 431311 19 QVEHPLLSGLLYPGLQALDEEYLK Unmodified 2724.4374 0.43743311 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.54 158.54 3 1.8461E-51 162727 QUIQUE_C1277_190116_001 104.97 95.241 2535900000 148750000 385350000 501920000 152560000 138250000 149160000 77293000 123240000 154740000 0 377850000 199020000 127740000 37683 2641 35137 338984;338985;338986;338987;338988;338989;338990;338991;338992;338993;338994;338995 431325;431326;431327;431328;431329;431330;431331;431332;431333;431334;431335;431336;431337;431338;431339;431340 431327 16 QVEILNR Unmodified 870.49232 0.49231565 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 32.306 32.306 2 0.026322 26980 QUIQUE_C1563_190116_001 94.163 6.1344 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431348;431349;431350;431351;431352;431353;431354;431355;431356;431357;431358;431359;431360;431361;431362;431363;431364;431365;431366;431367;431368;431369;431370;431371;431372;431373;431374;431375;431376;431377;431378;431379;431380;431381;431382;431383;431384;431385;431386;431387;431388;431389;431390;431391;431392;431393;431394;431395;431396;431397;431398;431399 431356 50 QVELELQQIEQK Unmodified 1483.7882 0.7882229 3573 Q8N1B4 VPS52 Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 82.35 82.35 2 0.00080913 83801 QUIQUE_C1277_190116_001 112.3 78.374 111560000 0 37194000 0 0 0 0 0 31360000 0 0 43006000 0 0 37686 3573 35140 339033;339034;339035 431400;431401;431402 431400 3 QVENAGAIGPSR Unmodified 1197.6102 0.61019895 4432 Q9UHD8;K7ENL0;K7EJV0;K7EPY1 SEPT9 Septin-9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.88 22.88 2 0.00051896 16236 QUIQUE_DMIX4_190116_001 95.483 62.873 629470000 0 64062000 0 0 115640000 74519000 0 92304000 0 55398000 81959000 0 145590000 37687 4432 35141 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QVEVINFGDCLVR Unmodified 1547.7766 0.77661235 2476 P46060;H0Y4Q3 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 112.78 112.78 2 0.0033969 115599 QUIQUE_C1563_190116_001 87.298 50.874 86181000 0 0 0 0 0 56375000 0 0 0 0 0 0 29806000 37694 2476 35147 339088;339089 431474;431475 431474 2 QVEVTVHKGDECQLVGPAQPSHWK Unmodified 2728.3391 0.33913283 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 1 1 52.913 52.913 3;4 3.3262E-11 51697 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.793 67.537 410560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 374790000 0 35774000 37695 3117 35148 339090;339091;339092;339093 431476;431477;431478;431479 431477 4 QVEYLVNEK Unmodified 1120.5764 0.57643921 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.225 40.225 2 9.9408E-13 36338 QUIQUE_C1277_190116_001 210.01 117.82 10246000000 928480000 981310000 922610000 773650000 793770000 658210000 795020000 677820000 606110000 339810000 1066200000 841710000 861630000 37696 2120 35149 339094;339095;339096;339097;339098;339099;339100;339101;339102;339103;339104;339105;339106 431480;431481;431482;431483;431484;431485;431486;431487;431488;431489;431490;431491;431492;431493;431494 431481 13 QVFAENKDEIALVLFGTDGTDNPLSGGDQYQNITVHR Unmodified 4060.9767 0.97665197 2051 P13010;C9JZ81 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 145.43 145.43 4 3.0145E-54 148314 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.08 93.676 211700000 0 58161000 0 0 0 0 0 83675000 0 0 0 0 69866000 37697 2051 35150 339107;339108;339109 431495;431496;431497 431496 3 QVFFELNGQLR Unmodified 1349.7092 0.70918471 2026 P11498;E9PS68 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 106.17 106.17 2 0.0046052 108024 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.594 60.856 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37698 2026 35151 339110;339111 431498;431499 431498 2 QVFGEATK Unmodified 878.44978 0.44978213 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GV23;A0A1B0GU92;A0A1B0GU03;C9JH19;F8WD96;F8W787 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 1 20.375 20.375 2 0.039916 12917 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.589 16.182 555040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 555040000 0 0 0 37699 358 35152 339112 431500 431500 1 QVFGQTTIHQHIPFNWDSEFVQLHFGK Unmodified 3239.5941 0.59410196 4459 Q9UJS0 SLC25A13 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 yes yes 0 0 0 1 1 2 128.83 128.83 4;5 0.011139 134225 QUIQUE_C1368_190116_001 26.127 20.968 221200000 0 0 27470000 0 0 0 0 0 0 0 48812000 144920000 0 37700 4459 35153 339113;339114;339115;339116 431501;431502;431503;431504;431505 431501 5 QVFLATWK Unmodified 991.5491 0.54910224 2777 P63010;A0A087X253 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 81.032 81.032 2 0.0045575 82480 QUIQUE_C1403_190116_001 108.7 73.496 861360000 0 0 0 412140000 0 0 0 0 0 0 0 0 449220000 37701 2777 35154 339117;339118;339119;339120;339121;339122;339123;339124 431506;431507;431508;431509;431510;431511;431512;431513 431506 8 QVFSSYTGK Unmodified 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37704 174 35157 339136 431526 431526 0 QVGLMVQER Unmodified 1058.5543 0.55426398 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.774 41.774 2 0.001828 37553 QUIQUE_C1368_190116_001 114.5 51.35 11427000000 862240000 1014300000 1355100000 0 972320000 1050200000 1201000000 0 1300000000 337230000 1145700000 1188600000 1000400000 37705 336 35158 339137;339138;339139;339140;339141;339142;339143;339144;339145;339146;339147 431527;431528;431529;431530;431531;431532;431533;431534;431535;431536;431537 431529 10 QVGLMVQER Oxidation (M) 1074.5492 0.5491786 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 30.077 30.077 2 0.034954 24703 QUIQUE_C1368_190116_001 56.434 27.516 484320000 0 0 290720000 0 0 0 0 0 0 0 193600000 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339198;339199;339200;339201;339202;339203;339204;339205;339206;339207;339208;339209;339210 431600;431601;431602;431603;431604;431605;431606;431607;431608;431609;431610;431611;431612;431613;431614;431615 431605 16 QVGVGYVDSIQR Unmodified 1319.6834 0.68336389 443 A0A2R8YFH0;E9PHA6;A0A2R8Y6P0;A0A2R8YG02;P43246;A0A2R8Y7S8;C9J809 MSH2 DNA mismatch repair protein Msh2 yes no 0 0 0 1 1 42.923 42.923 2 0.06249 38884 QUIQUE_C1563_190116_001 48.794 27.494 50597000 0 0 0 0 0 0 50597000 0 0 0 0 0 0 37710 443 35162 339211;339212 431616;431617 431616 2 QVGYENAGTVEFLVDR Unmodified 1795.8741 0.87407779 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 111.58 111.58 2 0.00039641 115785 QUIQUE_C1368_190116_001 109.15 92.613 94536000 0 0 62790000 0 0 31746000 0 0 0 0 0 0 0 37711 2026 35163 339213;339214;339215;339216;339217 431618;431619;431620;431621;431622 431619 5 QVHDEEVAELLATLQASSQAAAEVDVTVAKPDLTSALR Unmodified 3975.0437 0.043668899 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 1 2 1 1 3 2 6 1 173.55 173.55 3;4 1.3172E-55 172668 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.1 118.28 1192200000 28980000 0 0 0 29091000 0 210550000 246670000 270550000 0 400040000 6295500 0 37712 3176 35164 339218;339219;339220;339221;339222;339223;339224;339225;339226;339227;339228;339229;339230;339231;339232;339233 431623;431624;431625;431626;431627;431628;431629;431630;431631;431632;431633;431634;431635;431636;431637;431638 431637 15 QVHLLLDMLAAIAGPENSSK Unmodified 2106.1143 0.11432484 3814 Q96BY7 ATG2B Autophagy-related protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 157.5 157.5 3 0.021157 165133 QUIQUE_DMIX5_190116_001 30.21 24.247 38770000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38770000 0 0 37713 3814 35165 339234 431639 431639 1 QVICVYTDDFTDR Unmodified 1630.7297 0.72972174 4156 Q9H3H3 C11orf68 UPF0696 protein C11orf68 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 94.559 94.559 2 0.00036659 97976 QUIQUE_C1218_190116_001 126.67 102.33 194860000 42070000 45129000 39134000 30637000 0 37885000 0 0 0 0 0 0 0 37714 4156 35166 339235;339236;339237;339238;339239 431640;431641;431642;431643;431644 431640 4 QVIEQLSSGFFSPK Unmodified 1565.809 0.80895834 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 117.14 117.14 2;3 1.303E-86 119847 QUIQUE_DMIX1_190116_001 217.83 161.26 4730000000 146110000 265420000 399220000 384910000 297830000 254330000 409350000 462190000 636020000 185310000 275720000 539520000 474050000 37715 2017 35167 339240;339241;339242;339243;339244;339245;339246;339247;339248;339249;339250;339251;339252;339253;339254 431645;431646;431647;431648;431649;431650;431651;431652;431653;431654;431655;431656;431657;431658;431659;431660;431661;431662;431663;431664;431665;431666;431667;431668;431669;431670;431671;431672;431673;431674;431675;431676 431661 31 QVIEYAR Unmodified 877.46577 0.46576654 2512 R4GMR5;P48556 PSMD8 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 1 1 25.518 25.518 2 0.03351 19290 QUIQUE_C1368_190116_001 88.35 41.548 205580000 0 0 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yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 84.605 84.605 3 1.2617E-07 85740 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.968 74.037 264610000 0 63979000 0 43882000 0 36110000 0 45140000 75493000 0 0 0 0 37718 3564 35170 339270;339271;339272;339273;339274 431712;431713;431714;431715;431716;431717 431716 6 QVIINLINQK Unmodified 1181.7132 0.71320746 4293 Q9NTJ5;E9PGZ4;F8WDN7 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.426 81.426 2 0.00016425 82152 QUIQUE_C1403_190116_001 122.74 30.272 396250000 32980000 0 43393000 50594000 24134000 27155000 41704000 34134000 27824000 12955000 51018000 24221000 26140000 37719 4293 35171 339275;339276;339277;339278;339279;339280;339281;339282;339283;339284;339285;339286;339287 431718;431719;431720;431721;431722;431723;431724;431725;431726;431727;431728;431729;431730;431731;431732 431721 15 QVIIQGFR Unmodified 959.55525 0.55525025 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 60.298 60.298 2 0.018443 56402 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QVIQQNPALLPALLQQLGQENPQLLQQISR Unmodified 3377.8783 0.87832231 2646 P54725;K7EQ16 RAD23A UV excision repair protein RAD23 homolog A yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 168.1 168.1 3;4 1.3476E-87 169914 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.2 159.08 4713500000 268170000 455040000 223990000 268580000 738620000 850890000 481500000 331300000 219060000 98039000 109450000 484610000 184220000 37726 2646 35178 339308;339309;339310;339311;339312;339313;339314;339315;339316;339317;339318;339319;339320;339321;339322;339323;339324;339325 431755;431756;431757;431758;431759;431760;431761;431762;431763;431764;431765;431766;431767;431768;431769;431770;431771;431772 431765 17 QVIQTPLADSLPVSR Unmodified 1622.8992 0.89917033 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 97.366 97.366 2 0.002588 101216 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.78 30.643 50767000 21363000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29404000 0 0 37727 1716 35179 339326;339327 431773;431774 431774 2 QVITLLNELKR Unmodified 1325.8031 0.8030851 1956 P09110;C9JDE9;H7C131;H0Y4D4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.007 84.007 3 0.0038134 86276 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.511 32.1 230210000 0 16498000 20265000 0 16275000 14949000 17606000 21869000 31380000 0 34996000 23015000 33358000 37728 1956 35180 339328;339329;339330;339331;339332;339333;339334;339335;339336;339337 431775;431776;431777;431778;431779;431780;431781;431782;431783;431784 431782 10 QVKPYVEEGLHPQIIIR Unmodified 2018.1313 0.13129553 3977 Q99832;F8WAM2 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes no 0 0 1 2 1 3 1 1 1 2 1 2 1 2 2 2 72.114 72.114 2;3;4 2.8192E-07 72538 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.69 74.712 6021600000 511670000 380940000 591630000 297340000 361130000 259680000 731680000 278080000 595630000 112700000 685580000 507840000 707650000 37729 3977 35181 339338;339339;339340;339341;339342;339343;339344;339345;339346;339347;339348;339349;339350;339351;339352;339353;339354;339355;339356;339357;339358 431785;431786;431787;431788;431789;431790;431791;431792;431793;431794;431795;431796;431797;431798;431799;431800;431801;431802;431803;431804;431805;431806;431807;431808;431809;431810;431811;431812;431813 431808 24 QVLALQSQLADTK Unmodified 1413.7827 0.78274359 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.993 71.993 2 1.8467E-05 71921 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.06 100.06 613620000 163580000 0 139470000 0 0 0 121890000 0 98974000 0 0 0 89711000 37730 2379 35182 339359;339360;339361;339362;339363 431814;431815;431816;431817;431818 431818 3 QVLALQSQLADTKK Unmodified 1541.8777 0.8777066 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 1 1 51.336 51.336 3 0.0014577 48752 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.37 31.815 41703000 0 0 0 0 0 0 0 41703000 0 0 0 0 0 37731 2379 35183 339364 431819 431819 1 QVLDAVYYLHR Unmodified 1375.7248 0.72483478 3526 Q8IU85;A0A087WUR6 CAMK1D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 2 84.869 84.869 2;3 9.7252E-05 86902 QUIQUE_C1576_190116_001 115.42 99.041 1320100000 85312000 111410000 87851000 102440000 90104000 80014000 112660000 94628000 103580000 56945000 148750000 96119000 150310000 37732 3526 35184 339365;339366;339367;339368;339369;339370;339371;339372;339373;339374;339375;339376;339377;339378;339379;339380;339381;339382 431820;431821;431822;431823;431824;431825;431826;431827;431828;431829;431830;431831;431832;431833;431834;431835;431836;431837;431838;431839;431840;431841 431829 20 QVLDLLAQLVQLR Unmodified 1507.9086 0.9086128 2456 P42858 HTT Huntingtin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 169.33 169.33 2;3 1.1189E-24 174651 QUIQUE_C1576_190116_001 177.06 152.27 195820000 9554300 23671000 0 0 27702000 4518100 19845000 21451000 17476000 7904100 0 63699000 0 37733 2456 35185 339383;339384;339385;339386;339387;339388;339389;339390;339391;339392;339393;339394 431842;431843;431844;431845;431846;431847;431848;431849;431850;431851;431852;431853 431847 12 QVLDNLTMEK Oxidation (M) 1205.5962 0.59618837 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.186 51.186 2 0.00021057 47250 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.21 99.053 1255900000 93764000 0 0 102670000 220880000 73834000 0 261550000 153010000 254040000 96160000 0 0 + 37734 780 35186 339395;339396;339397;339398;339399;339400;339401;339402 431854;431855;431856;431857;431858;431859;431860;431861 431860 471 5 QVLDNLTMEK Unmodified 1189.6013 0.60127375 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.726 64.726 2 0.0034059 63948 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.044 64.247 368630000 0 0 0 0 0 0 0 58422000 0 85788000 91614000 69724000 63077000 + 37735 780 35186 339403;339404;339405;339406;339407 431862;431863;431864;431865;431866;431867;431868 431862 5 QVLEAVAYLHSLK Unmodified 1469.8242 0.82421447 3632 Q8NCB2;C9J9E2;B4DM24;C9JSB2 CAMKV CaM kinase-like vesicle-associated protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 96.581 96.581 2;3 0.00050921 94130 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431879;431880;431881;431882;431883;431884;431885;431886;431887;431888 431884 4 QVLFSADDR Unmodified 1049.5142 0.5141733 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.206 49.206 2 4.3104E-18 46647 QUIQUE_C1368_190116_001 190.26 58.17 37514000000 2714700000 3004000000 3178900000 2715100000 2715100000 2657200000 2524400000 3417000000 3034500000 1631700000 3641000000 2958300000 3321700000 37739 1978 35190 339427;339428;339429;339430;339431;339432;339433;339434;339435;339436;339437;339438;339439 431889;431890;431891;431892;431893;431894;431895;431896;431897;431898;431899;431900;431901;431902;431903;431904;431905;431906;431907;431908;431909;431910;431911;431912;431913;431914;431915;431916;431917;431918;431919 431895 31 QVLFSADDRVK Unmodified 1276.6776 0.67755023 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;J3QKK1;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 1 2 2 41.767 41.767 2;3 0.0011079 38589 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.524 53.356 2027000000 0 0 0 0 0 0 0 1058800000 284020000 0 241100000 443110000 0 37740 1978 35191 339440;339441;339442;339443;339444;339445;339446 431920;431921;431922;431923;431924;431925;431926;431927;431928;431929 431923 10 QVLGQMVIDEELLGDGHSYSPR Oxidation (M) 2458.1798 0.17983822 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 111.87 111.87 3 0.00055669 115287 QUIQUE_C1277_190116_001 60.278 49.134 65895000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24622000 0 41273000 0 37741 2274 35192 339447;339448;339449;339450 431930;431931;431932;431933 431931 1642 3 QVLGQMVIDEELLGDGHSYSPR Unmodified 2442.1849 0.1849236 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.82 123.82 3 2.7265E-05 129033 QUIQUE_C1576_190116_001 59.212 52.652 2028900000 283300000 240590000 258880000 0 209820000 0 201100000 268660000 0 0 291130000 275390000 0 37742 2274 35192 339451;339452;339453;339454;339455;339456;339457;339458 431934;431935;431936;431937;431938;431939;431940;431941 431938 6 QVLIRPCSK Unmodified 1099.6172 0.61719858 1182;1252 H3BN98;I3L246;H3BV27;H3BT37;I3L303;I3L3P7;P62244 RPS15A 40S ribosomal protein S15a no no 0 0 1 1 1 1 17.633 17.633 2;3 0.030947 10050 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.698 32.959 107350000 0 0 0 0 0 0 0 58443000 37738000 0 0 11165000 0 37743 1182;1252 35193 339459;339460;339461 431942;431943;431944 431943 3 QVLLAQAEAEK Unmodified 1198.6558 0.65575216 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.213 45.213 2 0.00046493 42858 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.18 66.111 1326700000 109020000 113320000 150970000 150050000 172440000 0 143900000 109270000 0 81371000 0 141530000 154880000 37744 3057 35194 339462;339463;339464;339465;339466;339467;339468;339469;339470;339471 431945;431946;431947;431948;431949;431950;431951;431952;431953;431954 431951 10 QVLLGDQIPK Unmodified 1109.6445 0.64445919 2275 P28072 PSMB6 Proteasome subunit beta type-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 65.328 65.328 2 0.0042529 65068 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.547 63.728 1968900000 200390000 198240000 140800000 142500000 150690000 119000000 165520000 162040000 151500000 56171000 167560000 159870000 154610000 37745 2275 35195 339472;339473;339474;339475;339476;339477;339478;339479;339480;339481;339482;339483;339484;339485 431955;431956;431957;431958;431959;431960;431961;431962;431963;431964;431965;431966;431967;431968;431969;431970;431971;431972;431973;431974 431970 19 QVLLSAAEAAEVILR Unmodified 1581.909 0.90900673 2810 P78371 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes yes 0 0 0 8 10 8 7 8 6 7 9 7 3 4 5 5 147.6 147.6 2;3 3.4521E-07 149778 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.2 104.07 1855200000 204070000 162970000 166840000 101320000 180890000 119610000 148980000 220600000 187020000 68776000 52127000 127580000 114360000 37746 2810 35196 339486;339487;339488;339489;339490;339491;339492;339493;339494;339495;339496;339497;339498;339499;339500;339501;339502;339503;339504;339505;339506;339507;339508;339509;339510;339511;339512;339513;339514;339515;339516;339517;339518;339519;339520;339521;339522;339523;339524;339525;339526;339527;339528;339529;339530;339531;339532;339533;339534;339535;339536;339537;339538;339539;339540;339541;339542;339543;339544;339545;339546;339547;339548;339549;339550;339551;339552;339553;339554;339555;339556;339557;339558;339559;339560;339561;339562;339563;339564;339565;339566;339567;339568;339569;339570;339571;339572 431975;431976;431977;431978;431979;431980;431981;431982;431983;431984;431985;431986;431987;431988;431989;431990;431991;431992;431993;431994;431995;431996;431997;431998;431999;432000;432001;432002;432003;432004;432005;432006;432007;432008;432009;432010;432011;432012;432013;432014;432015;432016;432017;432018;432019;432020;432021;432022;432023;432024;432025;432026;432027;432028;432029;432030;432031;432032;432033;432034;432035;432036;432037;432038;432039;432040;432041;432042;432043;432044;432045;432046;432047;432048;432049;432050;432051;432052;432053;432054;432055;432056;432057;432058;432059;432060;432061;432062;432063;432064;432065 432031 82 QVLLSEPEEAAALYR Unmodified 1687.8781 0.87810054 727 C9JIF9;P13798;H7C393;F8WEH5 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 105.52 105.52 2;3 3.0147E-09 109907 QUIQUE_C1218_190116_001 162.26 115.65 2352800000 189140000 184350000 200320000 197910000 166140000 136400000 150940000 205090000 197460000 0 267560000 194020000 263460000 37747 727 35197 339573;339574;339575;339576;339577;339578;339579;339580;339581;339582;339583;339584;339585 432066;432067;432068;432069;432070;432071;432072;432073;432074;432075;432076;432077;432078;432079;432080;432081 432066 16 QVLLYEPQVNSPK Unmodified 1513.814 0.81404372 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 84.974 84.974 2 0.0025616 73025 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.885 37.942 180820000 0 36666000 0 0 0 31229000 0 58146000 0 54775000 0 0 0 37748 3779 35198 339586;339587;339588;339589;339590 432082;432083;432084;432085;432086 432085 5 QVLNQDLTFQHIK Unmodified 1582.8467 0.84674083 3338 Q5VWZ2 LYPLAL1 Lysophospholipase-like protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 66.03 66.03 2;3 4.4823E-17 66088 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.75 90.202 2762800000 187710000 179870000 228430000 174540000 249410000 231000000 220810000 167410000 251120000 60534000 258700000 219380000 333890000 37749 3338 35199 339591;339592;339593;339594;339595;339596;339597;339598;339599;339600;339601;339602;339603;339604;339605;339606;339607;339608;339609;339610;339611;339612;339613;339614;339615 432087;432088;432089;432090;432091;432092;432093;432094;432095;432096;432097;432098;432099;432100;432101;432102;432103;432104;432105;432106;432107;432108;432109;432110;432111;432112;432113 432109 26 QVLPDPEVLEAVGDR Unmodified 1635.8468 0.84680041 3803 Q96AQ6;Q5T173 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 117.16 117.16 2 8.6644E-06 121244 QUIQUE_C1368_190116_001 104.87 57.606 894070000 83953000 83087000 105800000 126100000 90299000 132250000 136290000 0 0 0 136290000 0 0 37750 3803 35200 339616;339617;339618;339619;339620;339621;339622;339623 432114;432115;432116;432117;432118;432119;432120;432121;432122;432123;432124;432125;432126;432127;432128 432119 15 QVLPDPEVLEAVGDRQDGLR Unmodified 2205.139 0.13895968 3803 Q96AQ6;Q5T173 PBXIP1 Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1 yes no 0 0 1 1 1 112.33 112.33 3 0.0013904 118127 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.167 39.156 55179000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55179000 0 0 37751 3803 35201 339624;339625 432129;432130 432130 2 QVLSDLAIQIYQQLVR Unmodified 1886.0625 0.062547262 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 170.35 170.35 2;3 4.0798E-207 171734 QUIQUE_C1563_190116_001 272.1 249.9 2823100000 129500000 316330000 45818000 127240000 210700000 267340000 228260000 273640000 205000000 22070000 435300000 429960000 131920000 37752 4607 35202 339626;339627;339628;339629;339630;339631;339632;339633;339634;339635;339636;339637;339638;339639;339640;339641;339642;339643;339644;339645;339646;339647;339648;339649;339650 432131;432132;432133;432134;432135;432136;432137;432138;432139;432140;432141;432142;432143;432144;432145;432146;432147;432148;432149;432150;432151;432152;432153;432154;432155 432141 25 QVLSLNLNGCNSLMKK Oxidation (M) 1833.9441 0.94408839 3621 Q8NB14 USP38 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 yes yes 0 1 1 1 1 86.713 86.713 2 0.0077944 88491 QUIQUE_C1277_190116_001 59.198 18.702 158030000 0 71521000 0 0 86509000 0 0 0 0 0 0 0 0 37753 3621 35203 339651;339652 432156;432157 432156 2698 2 QVLVAPGNAGTACSEK Unmodified 1600.7879 0.78790532 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.984 37.984 2 4.7189E-09 34619 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.38 102.49 1154800000 87723000 99164000 113440000 91292000 126950000 101410000 93067000 79134000 65340000 0 123240000 81950000 92076000 37754 2194 35204 339653;339654;339655;339656;339657;339658;339659;339660;339661;339662;339663;339664 432158;432159;432160;432161;432162;432163;432164;432165;432166;432167;432168;432169;432170;432171;432172 432167 15 QVLVGHLTHDR Unmodified 1273.6891 0.68911797 1124 H0Y599;Q8N1I0;F5GXW1 DOCK4 Dedicator of cytokinesis protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 19.138 19.138 3 0.0042429 12365 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.511 43.139 194130000 28828000 0 0 0 32526000 0 70169000 30331000 32273000 0 0 0 0 37755 1124 35205 339665;339666;339667;339668;339669 432173;432174;432175;432176;432177 432176 5 QVMCLQDFFGDDDIFIACGPEK Unmodified 2604.1335 0.13348165 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 165.3 165.3 2;3 5.1059E-66 172444 QUIQUE_DMIX5_190116_001 174.83 170.36 509830000 14548000 33185000 0 41190000 0 35773000 82696000 58607000 74613000 3220700 35022000 35733000 95244000 37756 1478;3342 35206 339670;339671;339672;339673;339674;339675;339676;339677;339678;339679;339680;339681;339682;339683;339684;339685;339686;339687 432178;432179;432180;432181;432182;432183;432184;432185;432186;432187;432188;432189;432190;432191;432192;432193;432194;432195;432196;432197;432198;432199;432200;432201 432195 24 QVMMFSATLSK Unmodified 1241.6148 0.61481532 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;A0A140T9X9;A0A140T996;F6UJC5;A0A140TA18;A0A140T973;A0A140T9K1;H0YCC6 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B yes no 0 0 0 1 1 1 85.919 85.919 2 0.0041987 86649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.006 55.803 61652000 0 0 0 0 0 0 0 61652000 0 0 0 0 0 37757 3027 35207 339688;339689;339690 432202;432203;432204 432203 3 QVMQDELDRKEEQVLR Unmodified 2015.0106 0.010588046 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 2 1 59.539 59.539 4 2.6433E-05 57690 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.391 66.291 63251000 0 0 0 0 0 0 0 63251000 0 0 0 0 0 37758 4607 35208 339691 432205 432205 1 QVMVVPVGPTCDEYAQK Unmodified 1919.9121 0.91211956 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.364 84.364 2 4.9385E-13 85528 QUIQUE_C1368_190116_001 111.12 89.893 317520000 51277000 55507000 0 56782000 41846000 36174000 52379000 23553000 0 0 0 0 0 37759 2253 35209 339692;339693;339694;339695;339696;339697;339698;339699;339700;339701 432206;432207;432208;432209;432210;432211;432212;432213;432214;432215 432208 10 QVMVVPVGPTCDEYAQK Oxidation (M) 1935.907 0.90703418 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 70.989 70.989 2 0.0023601 70998 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.408 48.989 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37760 2253 35209 339702 432216 432216 1613 1 QVMYQQSSGR Unmodified 1182.5452 0.54515585 4499 Q9UM22 EPDR1 Mammalian ependymin-related protein 1 yes yes 0 0 0 1 17.866 17.866 2 0.011147 10411 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.71 83.78 58519000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58519000 37761 4499 35210 339703 432217 432217 0 QVNELVR Unmodified 856.47667 0.47666558 3110 Q15102;M0R389;M0R1K3 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.558 21.558 2 0.020194 15147 QUIQUE_C1218_190116_001 108.98 5.6986 1015000000 118760000 182500000 48711000 0 0 123560000 0 198190000 127610000 0 0 215680000 0 37762 3110 35211 339704;339705;339706;339707;339708;339709;339710 432218;432219;432220;432221;432222;432223;432224;432225 432218 8 QVNITVQK Unmodified 928.53418 0.53418046 4363 Q9P035;H3BS72;H3BPZ1 HACD3 Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.536 22.536 2 0.018262 15798 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.229 22.062 738510000 0 93011000 123760000 121320000 0 114560000 0 77407000 87674000 43080000 0 77693000 0 37763 4363 35212 339711;339712;339713;339714;339715;339716;339717;339718 432226;432227;432228;432229;432230;432231;432232;432233 432232 6 QVPNESFFNFFNPLK Unmodified 1826.8992 0.89917033 3972 Q99733;H0YCI4 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.72 159.72 2 1.0341E-23 161360 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.04 130.44 2686000000 218400000 281850000 181620000 147460000 232000000 206560000 189110000 187340000 233370000 64977000 250770000 256810000 235700000 37764 3972 35213 339719;339720;339721;339722;339723;339724;339725;339726;339727;339728;339729;339730;339731;339732 432234;432235;432236;432237;432238;432239;432240;432241;432242;432243;432244;432245;432246;432247;432248;432249;432250;432251;432252;432253;432254;432255;432256;432257;432258;432259;432260;432261;432262;432263;432264;432265;432266 432253 33 QVPVGPDGLPLLDGGPPLGPFADGALDR Unmodified 2739.4232 0.42318003 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 163.29 163.29 3 1.8299E-05 167050 QUIQUE_C1277_190116_001 47.919 34.047 149710000 24589000 33891000 0 0 0 21977000 0 36216000 0 0 0 0 33034000 37765 730 35214 339733;339734;339735;339736;339737;339738 432267;432268;432269;432270;432271;432272 432268 6 QVQADFITLGLSEEK Unmodified 1676.8621 0.86211612 414 A0A2R8Y620;A0A2R8Y7U2;A0A2R8Y600;A0A2R8Y455;Q86VX2;V9GY66 COMMD7 COMM domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 118.44 118.44 2 0.0025877 122975 QUIQUE_C1218_190116_001 64.65 41.753 61664000 31004000 0 0 0 0 0 0 30660000 0 0 0 0 0 37766 414 35215 339739;339740 432273;432274 432273 2 QVQEAIAGISNAAQATSPTDEAK Unmodified 2299.1292 0.12918286 2250 P26232 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 1 85.049 85.049 2;3 3.8514E-143 86449 QUIQUE_C1368_190116_001 290.95 258.88 1391800000 75019000 83017000 90684000 89807000 59662000 70337000 87223000 243890000 214400000 98631000 87397000 90979000 100780000 37767 2250 35216 339741;339742;339743;339744;339745;339746;339747;339748;339749;339750;339751;339752;339753;339754;339755;339756 432275;432276;432277;432278;432279;432280;432281;432282;432283;432284;432285;432286;432287;432288;432289;432290;432291;432292 432277 18 QVQEFLK Unmodified 890.48617 0.48616764 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 37.325 37.325 2 0.022911 32281 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.21 43.759 209100000 60586000 0 53654000 0 62771000 0 0 0 0 32085000 0 0 0 37768 2059 35217 339757;339758;339759;339760 432293;432294;432295;432296 432296 4 QVQEFLKDGDDVIIIGVFK Unmodified 2162.1623 0.16232089 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 1 1 137.26 137.26 3 0.0042937 144420 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.237 28.636 41563000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41563000 0 0 37769 2059 35218 339761 432297 432297 1 QVQELELK Unmodified 985.54441 0.5444108 1606 O75052;E9PIP8;H7C2G1 NOS1AP Carboxyl-terminal PDZ ligand of neuronal nitric oxide synthase protein yes no 0 0 0 1 38.572 38.572 2 0.041195 34442 QUIQUE_C1277_190116_001 82.716 19.836 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37770 1606 35219 339762 432298 432298 1 QVQFSEEHWVHESGRPVQR Unmodified 2334.1254 0.1253753 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 44.37 44.37 4;5 7.0475E-08 42015 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.5 95.313 83737000 0 0 0 0 35064000 0 0 48673000 0 0 0 0 0 37771 2834 35220 339763;339764 432299;432300 432300 2 QVQGSEISSIDEFCR Unmodified 1753.7941 0.79411291 4467 Q9UK41;E9PQR7 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.421 85.421 2 9.9946E-24 86754 QUIQUE_C1403_190116_001 174.42 139.7 475230000 0 62622000 78449000 58004000 0 66201000 0 0 66213000 20984000 0 62270000 60484000 37772 4467 35221 339765;339766;339767;339768;339769;339770;339771;339772;339773 432301;432302;432303;432304;432305;432306;432307;432308;432309 432304 9 QVQHEESTEGEADHSGYAGELGFR Unmodified 2632.1426 0.14260109 3764 Q92890;C9JNP9 UFD1L Ubiquitin fusion degradation protein 1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.559 54.559 4 0.0010967 53333 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.058 44.176 207380000 0 0 0 48502000 0 0 0 0 50550000 0 63133000 0 45193000 37773 3764 35222 339774;339775;339776;339777 432310;432311;432312;432313 432311 3 QVQHILASASPSGR Unmodified 1449.7688 0.76882486 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H0Y9T9 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 1 1 25.059 25.059 2 0.0018585 18798 QUIQUE_C1403_190116_001 77.124 52.286 95707000 0 0 0 0 31012000 31389000 33306000 0 0 0 0 0 0 37774 821 35223 339778;339779;339780;339781 432314;432315;432316;432317 432314 4 QVQIDGLVVLK Unmodified 1210.7285 0.72852317 600 B3KS98;O15372;E5RFW7;E5RFH0 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 112.45 112.45 2 0.0024746 117555 QUIQUE_C1438_190116_001 78.113 52.008 111160000 0 0 56180000 0 39566000 0 0 0 0 15414000 0 0 0 37775 600 35224 339782;339783;339784;339785 432318;432319;432320;432321 432319 4 QVQPEGPYR Unmodified 1072.5302 0.53015772 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.768 22.768 2 0.00040467 16058 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.13 59.414 749890000 0 0 0 44188000 0 0 0 106510000 156070000 82948000 0 180080000 180100000 37776 2524 35225 339786;339787;339788;339789;339790;339791 432322;432323;432324;432325;432326;432327 432326 6 QVQSLMVHQR Unmodified 1224.6397 0.63972494 423 A0A2R8Y765;J3QKS7;A0A2R8Y7U4;A0A2U3TZQ7;A0A2R8Y7I9;A0A2R8Y4T4;A0A2R8Y855;B4DGM3;Q969G3;K7EMQ8;H7C048;J3QR61 SMARCE1 SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 yes no 0 0 0 1 1 20.448 20.448 3 0.054087 13347 QUIQUE_C1368_190116_001 33.866 17.977 95052000 0 61380000 33672000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37777 423 35226 339792;339793 432328;432329 432329 2 QVQSLTCEVDALK Unmodified 1489.7446 0.74464352 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 0 3 2 2 2 3 3 2 1 1 1 2 1 2 80.615 80.615 2;3 3.4456E-06 82167 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339819;339820;339821;339822;339823;339824;339825;339826;339827;339828;339829;339830;339831;339832;339833;339834 432360;432361;432362;432363;432364;432365;432366;432367;432368;432369;432370;432371;432372;432373;432374;432375;432376;432377;432378;432379;432380;432381 432376 19 QVQTSGGLWTECIAQLSPEQQAAIQELLNSA Unmodified 3369.6511 0.65108407 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 173.73 173.73 3 1.0558E-30 177425 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.287 90.528 205900000 0 0 0 0 0 0 0 0 43446000 0 57374000 105080000 0 37780 1403 35229 339835;339836;339837 432382;432383;432384 432384 2 QVQVALETAQR Unmodified 1241.6728 0.67279921 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 39.594 39.594 2 9.9093E-06 36372 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.86 127.29 2248300000 318730000 0 0 0 0 87080000 0 688690000 0 323860000 829910000 0 0 37781 3117 35230 339838;339839;339840;339841;339842 432385;432386;432387;432388;432389;432390;432391;432392;432393 432389 9 QVQVSFSSR Unmodified 1036.5302 0.53015772 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 36.21 36.21 2 0.0013568 31783 QUIQUE_C1368_190116_001 104.44 43.638 94393000 0 41878000 30968000 21547000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37782 3684 35231 339843;339844;339845;339846 432394;432395;432396;432397 432395 4 QVQWECINPK Unmodified 1300.6234 0.62340617 3793 Q96A23 CPNE4 Copine-4 yes yes 0 0 0 1 61.202 61.202 2 0.021675 60116 QUIQUE_C1277_190116_001 58.426 30.69 61085000 0 61085000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37783 3793 35232 339847 432398 432398 1 QVRPMLLVDDR Oxidation (M) 1356.7184 0.71836919 4123 Q9H0R4;K7ER15;K7EQD2;K7EMY7;A0A1B0GXB1;K7EJQ8 HDHD2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2 yes no 0 1 1 1 42.436 42.436 3 0.018813 38796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.452 39.315 71723000 0 0 0 0 0 0 0 71723000 0 0 0 0 0 37784 4123 35233 339848 432399 432399 1 QVSAAASVVSQALHDLLQHVR Unmodified 2228.2026 0.20256299 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 153.45 153.45 3;4 1.8913E-146 157860 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0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.93 107.93 2 8.9776E-18 111521 QUIQUE_C1368_190116_001 181.41 107.15 721730000 63981000 0 91053000 80024000 0 53059000 64603000 62880000 72853000 0 88973000 79666000 64635000 37787 1290 35236 339873;339874;339875;339876;339877;339878;339879;339880;339881;339882 432427;432428;432429;432430;432431;432432;432433;432434;432435;432436;432437;432438 432428 12 QVSIEEGER Unmodified 1045.504 0.50400254 2167;3258 P20340;Q53S08 RAB6A;RAB6C Ras-related protein Rab-6A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.13 22.13 2 3.0662E-06 14927 QUIQUE_C1277_190116_001 150.05 113.08 853730000 0 213710000 0 0 247510000 0 0 213060000 0 0 0 0 179450000 37788 2167;3258 35237 339883;339884;339885;339886;339887 432439;432440;432441;432442;432443 432440 4 QVSIEEGERK Unmodified 1173.599 0.59896556 2167;3258 P20340;Q53S08 RAB6A;RAB6C Ras-related protein Rab-6A no no 0 0 1 1 14.015 14.015 3 0.064149 6076 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.727 22.103 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37789 2167;3258 35238 339888 432444 432444 1 QVSLEAWLQR Unmodified 1228.6564 0.65642086 2592;1320 K7EK35;P42229;K7EIF9;P51692 STAT5A;STAT5B Signal transducer and activator of transcription;Signal transducer and activator of transcription 5A;Signal transducer and activator of transcription 5B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 111.08 111.08 2 0.017191 115534 QUIQUE_C1576_190116_001 84.476 51.635 22846000 0 0 0 0 0 0 22846000 0 0 0 0 0 0 37790 1320;2592 35239 339889;339890;339891;339892;339893 432445;432446;432447;432448;432449 432447 4 QVSTAMAEEIR Unmodified 1233.6023 0.60233638 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 49.529 49.529 2 0.0071493 46069 QUIQUE_C1403_190116_001 74.162 35.014 73531000 31735000 31466000 0 0 0 0 0 0 0 10330000 0 0 0 37791 1705 35240 339894;339895;339896;339897 432450;432451;432452;432453 432452 2 QVSTAMAEEIRR Unmodified 1389.7034 0.70344741 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 1 1 37.294 37.294 3 0.02116 33060 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.352 30.578 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37792 1705 35241 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1135.6462 0.64619053 4072 Q9BYD1;E5RJI7 MRPL13 39S ribosomal protein L13, mitochondrial yes no 0 0 0 1 32.316 32.316 3 0.021394 27433 QUIQUE_C1218_190116_001 41.08 25.929 20862000 20862000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37796 4072 35245 339911 432467 432467 1 QVTCLQDFFGDDDVFIACGPEK Unmodified 2560.125 0.12502546 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 154.71 154.71 2;3 4.9302E-11 158717 QUIQUE_C1277_190116_001 142.91 131.22 195790000 17554000 52111000 0 47619000 16249000 39193000 23067000 0 0 0 0 0 0 37797 3596 35246 339912;339913;339914;339915;339916;339917;339918;339919;339920 432468;432469;432470;432471;432472;432473;432474;432475;432476 432470 9 QVTESVSDSITVLP Unmodified 1473.7563 0.75625407 1601 O60888 CUTA Protein CutA yes yes 0 0 0 1 121.39 121.39 2 0.021496 123917 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.998 36.762 25047000 0 0 0 0 0 0 0 25047000 0 0 0 0 0 37798 1601 35247 339921 432477 432477 1 QVTGQPQNASFVK Unmodified 1402.7205 0.72047768 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4350 35294 340328;340329 432977;432978 432977 2 QWLQEIDR Unmodified 1086.5458 0.54580778 4124;2763 Q9H0U4;E9PLD0;P62820;E7END7 RAB1B;RAB1A Ras-related protein Rab-1B;Ras-related protein Rab-1A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.954 73.954 2 0.0024856 74484 QUIQUE_C1277_190116_001 136.16 50.943 7007100000 567800000 640620000 654560000 615730000 471980000 582540000 672260000 455590000 533700000 197410000 586860000 429760000 598280000 37847 4124;2763 35295 340330;340331;340332;340333;340334;340335;340336;340337;340338;340339;340340;340341;340342 432979;432980;432981;432982;432983;432984;432985;432986;432987;432988;432989;432990;432991;432992;432993;432994;432995;432996;432997;432998;432999 432981 20 QWLQEVK Unmodified 929.49707 0.49706667 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.394 49.394 2 0.019305 47087 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.19 51.471 6684200000 537500000 611360000 608080000 444450000 0 458220000 516990000 603410000 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340363;340364;340365 433025;433026;433027 433027 3 QWNNCAFLESSAK Unmodified 1553.6933 0.69327665 2719 P61224;E7ESV4;F5H7Y6;A6NIZ1;F5H823;B7ZB78;F5GZG1 RAP1B Ras-related protein Rap-1b;Ras-related protein Rap-1b-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.432 77.432 2 2.5002E-07 74720 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.25 122.02 2696000000 187730000 237220000 207200000 229340000 266290000 213720000 247050000 187340000 215340000 127410000 166650000 187870000 222850000 37851 2719 35299 340366;340367;340368;340369;340370;340371;340372;340373;340374;340375;340376;340377;340378 433028;433029;433030;433031;433032;433033;433034;433035;433036;433037;433038;433039;433040;433041;433042;433043 433040 14 QWQCDQEPCLVDPDMIK Unmodified 2160.9278 0.92784597 4100 Q9GZM7;F6SDV2 TINAGL1 Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 112.68 112.68 2 0.00023783 116110 QUIQUE_C1277_190116_001 118.76 84.997 208090000 0 69945000 57510000 0 42604000 38032000 0 0 0 0 0 0 0 37852 4100 35300 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[ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 140.25 140.25 2 0.030424 145271 QUIQUE_C1218_190116_001 48.823 44.021 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37854 1620 35301 340408 433083 433083 1 QWQSYFGR Unmodified 1070.4934 0.49337828 3620 Q8N9R8;Q3SXZ0 SCAI;C9orf126 Protein SCAI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.609 75.609 2 0.0064558 76263 QUIQUE_C1277_190116_001 101.69 87.534 190180000 24101000 25892000 29397000 0 22992000 0 0 30028000 32010000 0 0 25758000 0 37855 3620 35302 340409;340410;340411;340412;340413;340414;340415 433084;433085;433086;433087;433088;433089;433090 433085 7 QWSHISESAK Unmodified 1171.5622 0.56218613 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 18.029 18.029 3 0.016925 10756 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.958 33.953 358440000 0 0 63292000 0 0 0 71613000 70939000 77063000 0 0 75530000 0 37856 472;1460 35303 340416;340417;340418;340419;340420 433091;433092;433093;433094;433095 433094 5 QWTEILHFTEHSGLTTGVAFGHHAK Unmodified 2803.383 0.38304655 4502 Q9UMS4;H0YGZ5 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes no 0 0 0 1 97.009 97.009 4 0.04272 99915 QUIQUE_DMIX3_190116_001 15.68 13.207 32791000 0 0 0 0 0 0 0 0 32791000 0 0 0 0 37857 4502 35304 340421 433096 433096 1 QWTFNYILR Unmodified 1239.64 0.64004252 3229 Q3YEC7;F2Z2T0;H0Y4Z8;G3V154;H0Y7H6 RABL6 Rab-like protein 6 yes no 0 0 0 1 1 123.7 123.7 2 0.010402 126245 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.251 71.991 34925000 0 0 0 0 0 0 0 34925000 0 0 0 0 0 37858 3229 35305 340422;340423 433097;433098 433097 2 QWVIQEFK Unmodified 1076.5655 0.56548059 2525 P49354;E9PQP6;B3KVN2;H0YCW1 FNTA Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.955 89.955 2 0.0035988 91916 QUIQUE_C1277_190116_001 113.5 81.362 932000000 59116000 70340000 0 89570000 78226000 86628000 0 81282000 108490000 23690000 107250000 106710000 120690000 37859 2525 35306 340424;340425;340426;340427;340428;340429;340430;340431;340432;340433;340434 433099;433100;433101;433102;433103;433104;433105;433106;433107;433108;433109 433100 11 QWVPVLQDFSNK Unmodified 1459.746 0.74596415 991 F5GXC5;Q8TB96 ITFG1 T-cell immunomodulatory protein yes no 0 0 0 1 1 1 117.8 117.8 2 0.024882 122777 QUIQUE_C1218_190116_001 51.436 36.228 75105000 36311000 0 0 0 0 0 0 0 38794000 0 0 0 0 37860 991 35307 340435;340436;340437 433110;433111;433112;433113 433111 4 QYADICLFNTAQYK Unmodified 1733.8083 0.80830641 2528;1150 P49407;E9PM35;H0YET9 ARRB1 Beta-arrestin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 109.3 109.3 2 2.0624E-115 112281 QUIQUE_C1403_190116_001 234.9 215.66 2205600000 143260000 219460000 193610000 184690000 189650000 0 164660000 190330000 205750000 83489000 216190000 213810000 200650000 37861 2528;1150 35308 340438;340439;340440;340441;340442;340443;340444;340445;340446;340447;340448;340449;340450 433114;433115;433116;433117;433118;433119;433120;433121;433122;433123;433124;433125;433126;433127;433128;433129;433130;433131 433119 18 QYADKLEFMHILTR Unmodified 1763.9029 0.9028755 2450 P42574 CASP3 Caspase-3;Caspase-3 subunit p17;Caspase-3 subunit p12 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 97.897 97.897 4 0.00043095 100719 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.675 54.336 111870000 0 0 0 0 0 0 0 26470000 0 0 27944000 24956000 32505000 37862 2450 35309 340451;340452;340453;340454 433132;433133;433134;433135 433132 4 QYAGFSTVEESNK Unmodified 1458.6627 0.66268803 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 49.559 49.559 2 0.0049386 46599 QUIQUE_C1368_190116_001 84.507 68.542 446900000 62204000 62278000 129760000 0 0 79038000 0 0 0 0 113610000 0 0 37863 2191 35310 340455;340456;340457;340458;340459 433136;433137;433138;433139;433140 433138 5 QYAHWMAACR Unmodified 1292.5543 0.55428075 3800 Q96AC1;H0YJ34;A0A0U1RRM8 FERMT2 Fermitin family homolog 2 yes no 0 0 0 1 35.385 35.385 3 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433230;433231;433232;433233;433234;433235;433236 433231 7 QYDISDPQRPR Unmodified 1373.6688 0.66877646 2978 Q13228;H0Y532 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 28.555 28.555 2;3 1.2563E-11 22931 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.88 137.74 7005900000 348100000 383110000 0 578460000 577690000 589840000 488220000 503820000 705300000 405340000 939970000 414920000 1071100000 37873 2978 35320 340536;340537;340538;340539;340540;340541;340542;340543;340544;340545;340546;340547;340548;340549;340550;340551;340552 433237;433238;433239;433240;433241;433242;433243;433244;433245;433246;433247;433248;433249;433250;433251;433252;433253 433250 15 QYDQEIENLEK Unmodified 1407.6518 0.65178899 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 67.67 67.67 2 0.0027784 67536 QUIQUE_C1403_190116_001 76.228 55.661 75468000 0 0 35382000 40087000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37874 4145 35321 340553;340554;340555 433254;433255;433256 433255 3 QYDSFTFTASK Unmodified 1293.5877 0.58773217 201 A0A0A6YYA0;Q9Y3B3 TMED7-TICAM2;TMED7 Transmembrane emp24 domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 72.274 72.274 2 0.010614 72516 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.893 49.622 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37875 201 35322 340556;340557;340558 433257;433258;433259 433259 3 QYDVSYDTGDK Unmodified 1289.5412 0.54117591 3950 Q99259 GAD1 Glutamate decarboxylase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.963 38.963 2 0.00082403 35428 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.692 80.89 397780000 59208000 58503000 53503000 44409000 40030000 51035000 0 25923000 31873000 0 0 33297000 0 37876 3950 35323 340559;340560;340561;340562;340563;340564;340565;340566;340567 433260;433261;433262;433263;433264;433265;433266;433267;433268;433269 433267 10 QYECSLEQALR Unmodified 1395.6453 0.64526383 3687 Q8TE77;E9PIT5 SSH3 Protein phosphatase Slingshot homolog 3 yes no 0 0 0 1 73.104 73.104 2 0.004064 74757 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.258 71.055 25861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25861000 0 0 37877 3687 35324 340568 433270 433270 1 QYEHNIINYK Unmodified 1320.6463 0.64625011 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 1 32.115 32.115 2 0.0098831 27066 QUIQUE_C1403_190116_001 133.98 78.742 44833000 0 0 0 44833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37878 2381 35325 340569 433271 433271 0 QYEMGECTR Unmodified 1172.459 0.45904296 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.216 23.216 2 0.0050983 16650 QUIQUE_C1576_190116_001 87.476 82.036 263970000 0 36688000 22730000 36805000 22965000 0 43067000 15849000 0 0 26490000 27583000 31797000 37879 1987 35326 340570;340571;340572;340573;340574;340575;340576;340577;340578 433272;433273;433274;433275;433276;433277;433278;433279;433280 433276 8 QYEQQTYQVIPEVIK Unmodified 1864.9571 0.95707914 574 B0QY89;Q9Y262;C9JHP4;C9K0Q7;H7C3A0 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 1 1 99.999 99.999 2 0.00029936 104231 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.28 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433288;433289;433290;433291;433292;433293;433294;433295;433296;433297;433298;433299;433300 433292 13 QYFHQLEK Unmodified 1091.54 0.53999412 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 23.617 23.617 2;3 0.03696 17516 QUIQUE_C1438_190116_001 62.464 44.479 228170000 0 0 77629000 0 63044000 0 0 0 0 0 0 0 87493000 37883 2452 35330 340596;340597;340598 433301;433302;433303 433302 3 QYFPNDEDQVGAAK Unmodified 1580.7107 0.71070086 2060 P13674 P4HA1 Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 56.37 56.37 2;3 0.022667 74693 QUIQUE_C1576_190116_001 48.284 30.016 3240300000 0 772180000 724280000 0 0 0 55798000 34053000 0 0 783450000 50215000 820360000 37884 2060 35331 340599;340600;340601;340602;340603;340604;340605;340606;340607 433304;433305;433306;433307;433308;433309;433310;433311;433312 433307 9 QYFVQWCADR Unmodified 1371.603 0.60300508 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YFV6;A0A2R8YF18 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 2 88.223 88.223 2 0.0089616 88769 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.645 55.341 105670000 0 0 0 0 0 0 0 58924000 0 46751000 0 0 0 37885 4598 35332 340608;340609;340610 433313;433314;433315 433313 2 QYGIIPWNAFPGK Unmodified 1489.7718 0.77178497 664;3001 B7Z613;B7Z248;Q13491 GPM6B Neuronal membrane glycoprotein M6-b no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.8 130.8 2 0.00044543 127707 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.64 79.915 24736000000 1318900000 1876600000 2241000000 1709100000 1690300000 1249900000 2677500000 2182200000 2143100000 915380000 2189800000 2303100000 2238600000 37886 664;3001 35333 340611;340612;340613;340614;340615;340616;340617;340618;340619;340620;340621;340622;340623 433316;433317;433318;433319;433320;433321;433322;433323;433324;433325;433326;433327;433328;433329;433330;433331;433332;433333;433334;433335;433336;433337;433338;433339;433340;433341;433342;433343;433344;433345;433346;433347;433348 433339 33 QYGITGENVR Unmodified 1135.5622 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O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 81.985 81.985 2 1.0774E-10 84198 QUIQUE_C1218_190116_001 117.92 98.309 82070000 24878000 23358000 0 33835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37889 2223 35336 340640;340641;340642;340643 433367;433368;433369;433370 433367 3 QYIEFVADR Unmodified 1139.5611 0.56112349 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6;C9JXC1;A0A286YFD6;P31350 RRM2B;RRM2 Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B;Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.956 73.956 2 0.008597 70857 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.334 49.173 159810000 0 0 0 0 0 0 0 36845000 44434000 15404000 0 0 63127000 37890 3449 35337 340644;340645;340646;340647 433371;433372;433373;433374 433373 3 QYIISEELISEGK Unmodified 1507.777 0.77698951 536 A6NFX8;Q9UKK9;A6NJU6;A6NCQ0;C9JYY9 NUDT5 ADP-sugar pyrophosphatase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 100.09 100.09 2 0.00040451 101668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.86 90.57 574820000 116560000 116430000 0 0 0 105990000 0 133690000 0 102160000 0 0 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433388;433389;433390;433391;433392;433393;433394;433395;433396;433397;433398;433399;433400;433401;433402;433403;433404;433405;433406;433407;433408;433409;433410 433398 23 QYKPVVYSNTIQSLAAIVR Unmodified 2149.1895 0.18953869 1963 P09471;A0A1W2PRJ7;A0A1W2PS82 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 120.7 120.7 2;3 2.3114E-37 118588 QUIQUE_DMIX4_190116_001 158.45 153.74 32461000000 1442400000 1789600000 2535200000 1668900000 2068700000 1383600000 3047600000 2809200000 3424700000 1084100000 3854300000 3260900000 4091500000 37894 1963 35341 340674;340675;340676;340677;340678;340679;340680;340681;340682;340683;340684;340685;340686;340687;340688;340689;340690;340691;340692;340693;340694;340695;340696;340697;340698;340699 433411;433412;433413;433414;433415;433416;433417;433418;433419;433420;433421;433422;433423;433424;433425;433426;433427;433428;433429;433430;433431;433432;433433;433434;433435;433436;433437;433438;433439;433440;433441;433442;433443;433444;433445;433446;433447;433448;433449;433450;433451;433452;433453;433454;433455;433456;433457;433458;433459;433460;433461;433462;433463;433464;433465;433466 433453 56 QYLAQWLEK Unmodified 1177.6132 0.61315906 2444 P42224;J3KPM9;E7EPD2;D2KFR9;E7ENM1;E9PH66 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 95.564 95.564 2 0.008597 97405 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.334 47.031 225580000 0 0 0 0 0 0 0 113630000 0 0 0 111950000 0 37895 2444 35342 340700;340701 433467;433468 433468 2 QYLEELQSVQR Unmodified 1391.7045 0.70449327 1111;3416 H0Y2S9;H0Y7E2;H7C3G6;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 1 1 1 74.488 74.488 2 5.3564E-08 74705 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3741 35348 340728;340729 433502;433503 433503 2 QYLSGELEVELTPQGTLAER Unmodified 2232.1274 0.12739194 2673 P55809 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 4 1 2 1 128.35 128.35 2 6.2608E-39 130181 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.84 136.44 224590000 0 0 26922000 0 34159000 0 27132000 80137000 0 14485000 0 41753000 0 37902 2673 35349 340730;340731;340732;340733;340734;340735;340736;340737;340738;340739;340740;340741;340742 433504;433505;433506;433507;433508;433509;433510;433511;433512;433513;433514;433515;433516;433517 433513 14 QYLVFHDGDSVVFAGPAGNSVETR Unmodified 2564.2296 0.2295656 727 C9JIF9;P13798;H7C393 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.63 108.63 3 3.1208E-63 111800 QUIQUE_C1277_190116_001 116.45 108.74 1275500000 88276000 87278000 78298000 107100000 108700000 79951000 96070000 127990000 88577000 60830000 107780000 129360000 115290000 37903 727 35350 340743;340744;340745;340746;340747;340748;340749;340750;340751;340752;340753;340754;340755 433518;433519;433520;433521;433522;433523;433524;433525;433526;433527;433528;433529;433530;433531;433532;433533;433534;433535;433536;433537;433538 433519 21 QYMEEENYDK Unmodified 1347.5289 0.52889667 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 33.684 33.684 2 0.0042594 29323 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.525 72.831 122440000 0 0 35730000 53245000 0 0 0 0 0 0 33470000 0 0 37904 1689 35351 340756;340757;340758;340759 433539;433540;433541;433542 433542 4 QYMEGFNDELEAFK Unmodified 1719.745 0.74503745 3181 Q16543;K7EQA9;K7EKQ2;K7EL68 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 124.03 124.03 2 0.000449 120999 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.288 79.048 151950000 52253000 48129000 26608000 0 0 0 0 0 0 24955000 0 0 0 37905 3181 35352 340760;340761;340762;340763;340764 433543;433544;433545;433546;433547;433548 433548 6 QYMEGFNDELEAFK Oxidation (M) 1735.74 0.73995207 3181 Q16543;K7EQA9;K7EKQ2;K7EL68 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 106.29 106.29 2 0.01812 103128 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.727 54.294 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37906 3181 35352 340765 433549 433549 1 QYMEGFNDELEAFKER Unmodified 2004.8887 0.88874158 3181 Q16543;K7EQA9;K7EKQ2;K7EL68 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 108.59 108.59 3 2.3488E-06 112060 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.31 100.21 604360000 0 50416000 37678000 42335000 35891000 0 97949000 86167000 59652000 0 76556000 61904000 55814000 37907 3181 35353 340766;340767;340768;340769;340770;340771;340772;340773;340774;340775;340776 433550;433551;433552;433553;433554;433555;433556;433557;433558;433559;433560;433561;433562;433563 433558 11 QYMEGFNDELEAFKER Oxidation (M) 2020.8837 0.8836562 3181 Q16543;K7EQA9;K7EKQ2;K7EL68 CDC37 Hsp90 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finger FYVE domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 119.57 119.57 2 0.039643 121942 QUIQUE_C1563_190116_001 42.556 27.68 17268000 0 0 0 0 0 17268000 0 0 0 0 0 0 0 37935 1089 35380 340960 433821 433821 1 QYYALEVSYFK Unmodified 1409.6867 0.68671794 3767 Q92905 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 no no 0 0 0 1 1 1 1 109.97 109.97 2 0.037068 113473 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.593 50.231 386550000 0 70317000 89479000 0 0 0 0 0 0 0 120500000 106250000 0 37936 3767 35381 340961;340962;340963;340964 433822;433823;433824;433825 433825 2 QYYIGDIHPSDLKPESGSK Unmodified 2133.0378 0.037848654 1263 J3KNF8;H3BUX2;O43169 CYB5B Cytochrome b5 type B yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 67.474 67.474 2;3;4 7.8699E-99 68338 QUIQUE_C1218_190116_001 207.52 189.43 1908500000 165440000 291270000 152970000 273440000 73433000 110020000 124410000 151160000 231630000 0 135390000 91575000 107720000 37937 1263 35382 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433868;433869;433870;433871;433872;433873;433874;433875;433876 433869 9 RADAGFVYSEAVASHYMR Unmodified 2028.9476 0.94759386 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;A0A2R8YGH2;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 1 1 84.661 84.661 3 0.0054862 86538 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.226 41.179 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37947 472;1460 35392 341013 433877 433877 1 RADDDRFPR Unmodified 1146.553 0.55301842 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 2 1 13.613 13.613 3 0.058067 5859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.943 74.788 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37948 3046 35393 341014 433878 433878 1 RADLNQGIGEPQSPSR Unmodified 1723.8602 0.86015906 3815 Q96C19 EFHD2 EF-hand domain-containing protein D2 yes yes 0 0 1 1 1 1 31.161 31.161 2;3 0.011892 26642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.252 28.87 119340000 0 0 0 69753000 0 0 0 18180000 0 0 0 0 31411000 37949 3815 35394 341015;341016;341017 433879;433880;433881 433880 3 RADQLADESLESTR Unmodified 1589.7645 0.76452734 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 3 2 36.895 36.895 2;3;4 2.0037E-46 33580 QUIQUE_C1277_190116_001 190.37 163.48 4307000000 464900000 541170000 511450000 683700000 177910000 599930000 565650000 56258000 54019000 93170000 83444000 233330000 242060000 37950 2699 35395 341018;341019;341020;341021;341022;341023;341024;341025;341026;341027;341028;341029;341030;341031;341032;341033;341034;341035;341036;341037;341038;341039;341040 433882;433883;433884;433885;433886;433887;433888;433889;433890;433891;433892;433893;433894;433895;433896;433897;433898;433899;433900;433901;433902;433903;433904;433905 433884 23 RADQLADESLESTRR Unmodified 1745.8656 0.86563837 2699 P60880;A0A0A0MSS0 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes no 0 0 2 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 28.435 28.435 2;3 2.4381E-78 23600 QUIQUE_C1218_190116_001 171.26 142.31 4757900000 196640000 437240000 424640000 455880000 446460000 0 570450000 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37953 2296 35398 341062;341063;341064;341065;341066;341067 433930;433931;433932;433933;433934;433935 433933 6 RAEDGSVIDYELIDQDAR Unmodified 2063.976 0.97597668 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;H0YNP5;H0YN28;H0YL33;H0YNA0 ANXA2 Annexin A2;Annexin yes no 0 0 1 3 5 3 6 5 4 5 5 4 4 6 5 7 93.253 93.253 2;3 1.3702E-104 93887 QUIQUE_C1368_190116_001 216.68 185.79 12669000000 554650000 773360000 835710000 1861100000 1166000000 651580000 1323300000 638750000 1133500000 551070000 1096600000 662490000 1420700000 37954 1920 35399 341068;341069;341070;341071;341072;341073;341074;341075;341076;341077;341078;341079;341080;341081;341082;341083;341084;341085;341086;341087;341088;341089;341090;341091;341092;341093;341094;341095;341096;341097;341098;341099;341100;341101;341102;341103;341104;341105;341106;341107;341108;341109;341110;341111;341112;341113;341114;341115;341116;341117;341118;341119;341120;341121;341122;341123;341124;341125;341126;341127;341128;341129 433936;433937;433938;433939;433940;433941;433942;433943;433944;433945;433946;433947;433948;433949;433950;433951;433952;433953;433954;433955;433956;433957;433958;433959;433960;433961;433962;433963;433964;433965;433966;433967;433968;433969;433970;433971;433972;433973;433974;433975;433976;433977;433978;433979;433980;433981;433982;433983;433984;433985;433986;433987;433988;433989;433990;433991;433992;433993;433994;433995;433996;433997;433998;433999;434000;434001;434002;434003;434004;434005;434006;434007;434008;434009;434010;434011;434012 433946 75 RAEEFLTASQEAL Unmodified 1463.7256 0.72562264 917 E9PFR3;Q14738;H0Y8C4 PPP2R5D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 86.969 86.969 2 0.00084219 88354 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.681 48.764 89593000 0 0 0 0 0 0 0 35051000 0 9202200 0 25230000 20109000 37955 917 35400 341130;341131;341132;341133 434013;434014;434015;434016;434017 434016 5 RAEFTVETR Unmodified 1107.5673 0.5672715 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.866 20.866 2 0.0065296 13997 QUIQUE_C1438_190116_001 89.047 34.89 583730000 0 0 0 93062000 113910000 55207000 84711000 0 87730000 0 0 77361000 71745000 37956 2178 35401 341134;341135;341136;341137;341138;341139;341140 434018;434019;434020;434021;434022;434023;434024 434019 7 RAEFVWHK Unmodified 1071.5614 0.56139826 1715 O95219;F8W9T3 SNX4 Sorting nexin-4 yes no 0 0 1 1 21.284 21.284 3 0.036013 14650 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.152 14.632 10995000 0 0 0 0 0 0 0 10995000 0 0 0 0 0 37957 1715 35402 341141 434025 434025 1 RAEGDIKPYSSSDR Unmodified 1579.759 0.75904803 3295 Q5SQI0 ATAT1 Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.137 14.137 3 0.00095356 6610 QUIQUE_C1218_190116_001 80.534 67.397 335110000 46338000 34831000 35101000 29171000 0 71148000 43177000 0 29392000 0 20491000 0 25463000 37958 3295 35403 341142;341143;341144;341145;341146;341147;341148;341149;341150 434026;434027;434028;434029;434030;434031;434032;434033;434034 434026 8 RAEGLGHEQTPLPAAQAQVQATGPEAGR Unmodified 2839.4325 0.43251594 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 2 2 2 1 2 1 2 3 2 52.77 52.77 3;4 1.6611E-92 50587 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.31 160.01 1934700000 171880000 169950000 170130000 317190000 148910000 178940000 65564000 77949000 186720000 14197000 67824000 165310000 200120000 37959 3889 35404 341151;341152;341153;341154;341155;341156;341157;341158;341159;341160;341161;341162;341163;341164;341165;341166;341167;341168;341169;341170;341171;341172;341173;341174;341175;341176 434035;434036;434037;434038;434039;434040;434041;434042;434043;434044;434045;434046;434047;434048;434049;434050;434051;434052;434053;434054;434055;434056;434057;434058;434059;434060;434061;434062;434063;434064;434065;434066 434055 30 RAEISNAIDQYVTGTIGEDEDLIK Unmodified 2649.3134 0.31335481 2339 P31939;H7C1S2 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.76 141.76 3 2.9181E-15 147077 QUIQUE_C1368_190116_001 110.31 103.35 1289100000 96580000 87184000 147290000 133590000 77957000 90086000 101110000 0 151990000 48068000 132120000 102260000 120820000 37960 2339 35405 341177;341178;341179;341180;341181;341182;341183;341184;341185;341186;341187;341188 434067;434068;434069;434070;434071;434072;434073;434074;434075;434076;434077;434078;434079;434080;434081 434069 14 RAEPATPVVK Unmodified 1066.6135 0.61349341 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 1 2 1 1 12.886 12.886 2 0.033099 3395 QUIQUE_C1277_190116_001 57.859 27.673 46785000 0 4756800 0 0 0 0 0 32608000 9420500 0 0 0 0 37961 4517 35406 341189;341190;341191;341192 434082;434083;434084;434085 434082 4 RAEQLLQDAR Unmodified 1198.6418 0.64183343 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 23.134 23.134 2;3 0.0084794 16383 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chain no no 0 0 1 4 3 5 2 3 95.759 95.759 3;4 1.511E-08 97670 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.19 96.116 2675800000 0 0 0 0 0 0 0 713120000 269780000 0 922430000 261380000 509120000 37964 1990;2795;2796;3430;3992;688 35409 341210;341211;341212;341213;341214;341215;341216;341217;341218;341219;341220;341221;341222;341223;341224;341225;341226 434103;434104;434105;434106;434107;434108;434109;434110;434111;434112;434113;434114;434115;434116;434117;434118;434119;434120;434121;434122;434123;434124;434125;434126;434127;434128 434106 24 RAFVHWYVGEGMEEGEFSEAR Oxidation (M) 2501.107 0.10700763 2795;3430;3992;2796;1990;688 P0DPH8;P0DPH7;P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;C9J2C0;Q9NY65 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C;TUBA8 Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 1 1 2 1 81.267 81.267 3;4 1.0652E-06 82677 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.303 77.421 223960000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 154750000 69201000 0 37965 1990;2795;2796;3430;3992;688 35409 341227;341228;341229 434129;434130;434131;434132;434133 434133 421;2243 4 RAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK Oxidation (M) 3388.5129 0.51287603 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 1 2 1 115.92 115.92 4 2.1427E-15 118443 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.211 70.984 110660000 0 0 0 0 0 0 0 110660000 0 0 0 0 0 37966 2795;2796;3430;3992 35410 341230 434134 434134 2243;2244 1 RAFVHWYVGEGMEEGEFSEAREDMAALEK Unmodified 3372.518 0.51796141 2795;3430;3992;2796 P68363;P68366;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3 TUBA1B;TUBA4A;TUBA1A;TUBA1C Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 2 1 1 125.13 125.13 4 1.5067E-15 128940 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.875 77.658 162130000 0 0 0 0 0 0 0 67040000 0 0 0 95088000 0 37967 2795;2796;3430;3992 35410 341231;341232 434135;434136;434137 434136 2 RAGDLLEDSPK Unmodified 1199.6146 0.61461563 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 1 1 28.111 28.111 2 0.031855 22469 QUIQUE_C1438_190116_001 54.584 22.06 33622000 0 0 0 0 33622000 0 0 0 0 0 0 0 0 37968 2596 35411 341233 434138 434138 1 RAIADMLR Unmodified 944.52257 0.52256992 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 1 1 37.563 37.563 2 0.065154 34031 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.96 18.938 38959000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38959000 0 0 37969 4600 35412 341234 434139 434139 1 RAIGNIELGIR Unmodified 1210.7146 0.71460444 2483 P46821;D6RA32;D6RGJ3;D6RCL2 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.02 58.02 3 0.0014897 56817 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.211 37.595 220210000 0 11748000 0 0 14532000 0 19290000 24623000 30775000 0 54272000 38054000 26922000 37970 2483 35413 341235;341236;341237;341238;341239;341240;341241;341242 434140;434141;434142;434143;434144;434145;434146;434147 434145 7 RAIYQATYR Unmodified 1140.604 0.60399136 2276 P28074 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes yes 0 0 1 1 21.68 21.68 2 0.042892 15006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.456 40.72 64745000 0 0 0 0 0 0 0 64745000 0 0 0 0 0 37971 2276 35414 341243 434148 434148 1 RALAAQLPVLPR Unmodified 1303.8088 0.80883918 3860 Q96GK7;C9JGM0 FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A yes no 0 0 1 1 1 65.993 65.993 3 0.026673 67088 QUIQUE_DMIX7_190116_001 30.068 23.031 13969000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13969000 37972 3860 35415 341244;341245 434149;434150 434149 2 RALANSLACQGK Unmodified 1287.6718 0.67175335 1851 P04075;J3KPS3;H3BR68 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 17.286 17.286 2;3 7.5087E-06 9448 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.8 61.419 2602800000 107230000 140450000 132250000 103650000 129950000 0 176560000 265030000 238190000 16429000 472720000 355170000 465200000 37973 1851 35416 341246;341247;341248;341249;341250;341251;341252;341253;341254;341255;341256;341257;341258;341259;341260;341261;341262;341263;341264;341265;341266;341267;341268 434151;434152;434153;434154;434155;434156;434157;434158;434159;434160;434161;434162;434163;434164;434165;434166;434167;434168;434169;434170;434171;434172;434173;434174;434175;434176 434171 22 RALELEQER Unmodified 1142.6044 0.60438529 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.229 20.229 3 0.0031004 13181 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.243 56.628 631750000 43350000 0 79881000 0 69183000 0 60116000 55336000 78006000 0 81825000 67900000 96153000 37974 2248 35417 341269;341270;341271;341272;341273;341274;341275;341276;341277 434177;434178;434179;434180;434181;434182;434183;434184;434185 434184 9 RALIVLAHSER Unmodified 1263.7412 0.74115354 620 B4DLR8;P15559;H3BRK3 NQO1 NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1 yes no 0 0 1 1 21.791 21.791 3 0.00062648 15243 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.692 65.6 82136000 0 0 0 0 0 0 0 0 82136000 0 0 0 0 37975 620 35418 341278 434186 434186 1 RALTHIDHSLSR Unmodified 1404.7586 0.75859452 2677 P56192;F5H2V6 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 14.866 14.866 4 0.00042651 7149 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.345 50.833 28430000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28430000 0 0 37976 2677 35419 341279 434187 434187 1 RAPAVPPARPGSR Unmodified 1330.7582 0.75820059 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 2 2 1 1 1 11.501 11.501 3 6.2294E-07 2659 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.39 107.8 314890000 0 0 0 0 0 0 0 103300000 39552000 0 7850700 164190000 0 37977 269;2893 35420 341280;341281;341282;341283;341284 434188;434189;434190;434191;434192 434190 5 RAPFDLFENK Unmodified 1235.6299 0.62987176 1938 P08238;Q58FF7 HSP90AB1;HSP90AB3P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3 yes no 0 0 1 2 1 1 4 4 2 1 1 1 79.788 79.788 2;3 0.00088896 79028 QUIQUE_C1563_190116_001 84.658 65.415 540850000 0 0 0 21839000 426450000 23351000 34767000 0 0 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434218;434219;434220;434221;434222;434223;434224;434225;434226;434227;434228;434229;434230;434231;434232;434233;434234;434235;434236;434237;434238;434239;434240;434241;434242;434243;434244;434245;434246;434247;434248;434249;434250;434251;434252;434253;434254;434255;434256;434257;434258;434259;434260;434261;434262;434263;434264;434265;434266;434267;434268;434269;434270;434271;434272;434273;434274;434275;434276;434277;434278;434279;434280;434281;434282;434283;434284;434285;434286;434287;434288;434289;434290;434291;434292;434293;434294;434295;434296;434297;434298;434299;434300;434301;434302;434303;434304;434305;434306;434307;434308;434309;434310;434311;434312;434313;434314;434315;434316;434317;434318;434319;434320;434321;434322;434323;434324;434325;434326;434327;434328;434329;434330;434331;434332;434333;434334;434335;434336;434337;434338;434339;434340;434341;434342;434343;434344;434345;434346;434347;434348 434288 131 RAPFDLFENRK Unmodified 1391.731 0.73098279 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 2 1 1 1 1 56.155 56.155 3 0.020742 56275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.165 60.409 159680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 159680000 37981 1931 35424 341339;341340;341341;341342 434349;434350;434351;434352 434350 4 RAPQITTPVK Unmodified 1109.6557 0.65569258 3199 Q16799;Q2NKQ5 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 19.392 19.392 2;3 0.0050363 11847 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.044 63.791 1226300000 183160000 178740000 0 297820000 20952000 185770000 0 0 0 0 145000000 0 214840000 37982 3199 35425 341343;341344;341345;341346;341347;341348;341349;341350;341351;341352 434353;434354;434355;434356;434357;434358;434359;434360;434361;434362 434361 9 RAPQMDWSK Unmodified 1117.5339 0.53386288 1441 O14745 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes yes 0 0 1 1 1 1 23.738 23.738 2 0.0036067 18273 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.598 44.008 233250000 0 0 0 79088000 0 0 0 41789000 0 0 0 0 112370000 37983 1441 35426 341353;341354;341355 434363;434364;434365 434364 3 RAPVIWDNIHANDYDQK Unmodified 2053.997 0.99698689 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 63.765 63.765 3 1.9507E-05 64141 QUIQUE_C1218_190116_001 94.882 80.866 220170000 71234000 0 40554000 48979000 0 59401000 0 0 0 0 0 0 0 37984 1579 35427 341356;341357;341358;341359;341360 434366;434367;434368;434369;434370 434366 5 RAQEILSQLPIK Unmodified 1394.8245 0.82454882 2386 P35754 GLRX Glutaredoxin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 70.652 70.652 2 0.03516 71395 QUIQUE_C1576_190116_001 51.927 26.541 55631000 0 0 0 0 28271000 0 27360000 0 0 0 0 0 0 37985 2386 35428 341361;341362;341363 434371;434372;434373 434372 3 RAQLADSFHLQQFFR Unmodified 1862.954 0.95399987 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 3 2 2 3 101.27 101.27 2;3;4 1.3383E-24 103689 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.71 119.74 2105300000 0 0 0 0 0 0 65488000 470270000 244930000 0 646730000 244800000 433120000 37986 267;275;3025 35429 341364;341365;341366;341367;341368;341369;341370;341371;341372;341373;341374;341375;341376 434374;434375;434376;434377;434378;434379;434380;434381;434382;434383;434384;434385;434386;434387;434388;434389 434388 14 RARPELALR Unmodified 1080.6516 0.65161026 3859 Q96GD0 PDXP Pyridoxal phosphate phosphatase yes yes 0 0 2 1 1 16.296 16.296 3 0.0046258 9074 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.16 48.078 333570000 0 0 0 0 0 0 0 163100000 0 0 0 170460000 0 37987 3859 35430 341377;341378 434390;434391 434390 2 RASALIDRPAPYFER Unmodified 1760.9322 0.93220179 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3KT37;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 53.379 53.379 3 4.9798E-05 50881 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.418 62.754 607230000 0 0 0 0 0 0 44548000 238360000 0 0 135610000 0 188710000 37988 143;560;4559 35431 341379;341380;341381;341382;341383;341384 434392;434393;434394;434395;434396;434397;434398 434398 6 RASHTAPQVLFSHR Unmodified 1605.8488 0.84880651 1486 O15144;H7C3F9 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 1 18.291 18.291 3;4 0.00069962 10182 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.136 53.936 501870000 0 0 0 0 0 0 22243000 68510000 61682000 0 182760000 95396000 71278000 37989 1486 35432 341385;341386;341387;341388;341389;341390;341391;341392 434399;434400;434401;434402;434403;434404;434405;434406;434407;434408 434408 10 RATDVMIAGK Unmodified 1060.5699 0.56991404 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.196 19.196 2 0.0057709 11766 QUIQUE_C1563_190116_001 82.749 35.682 267340000 0 47472000 0 35191000 31408000 33473000 35467000 0 0 0 44400000 0 39934000 37990 2219 35433 341393;341394;341395;341396;341397;341398;341399 434409;434410;434411;434412;434413;434414;434415 434412 7 RATWLHQALR Unmodified 1250.6996 0.69962308 2989 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 24.154 24.154 3 0.057081 17908 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37994 1439 35437 341407 434424 434424 1 RAWEDAEKDCR Unmodified 1434.631 0.63101075 1436 O14594;K7EKF8 NCAN Neurocan core protein yes no 0 0 2 1 1 1 16.529 16.529 3 0.037758 8796 QUIQUE_DMIX8_190116_001 67.997 52.076 89377000 0 0 0 0 0 0 26380000 0 0 0 62996000 0 0 37995 1436 35438 341408;341409;341410 434425;434426;434427 434427 3 RCEAFGWHAIIVDGHSVEELCK Unmodified 2612.2264 0.22641126 2288 P29401;A0A0B4J1R6;E9PFF2 TKT Transketolase yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 3 3 2 2 2 2 92.37 92.37 3;4;5 2.5328E-56 94309 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.88 153.26 4910200000 26925000 400020000 174940000 406120000 304900000 65325000 609660000 454600000 737900000 106390000 529920000 496880000 596620000 37996 2288 35439 341411;341412;341413;341414;341415;341416;341417;341418;341419;341420;341421;341422;341423;341424;341425;341426;341427;341428;341429;341430;341431;341432;341433;341434;341435;341436 434428;434429;434430;434431;434432;434433;434434;434435;434436;434437;434438;434439;434440;434441;434442;434443;434444;434445;434446;434447;434448;434449;434450;434451;434452;434453;434454;434455;434456;434457;434458;434459;434460 434444 30 RCELCDDGYFGDPLGR Unmodified 1928.8145 0.81453078 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 1 1 92.737 92.737 3 0.0033573 93833 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.824 35.497 15450000 0 0 0 0 0 0 0 15450000 0 0 0 0 0 37997 2008 35440 341437 434461 434461 1 RCEPIAMTVPR Unmodified 1328.6693 0.66931051 2327 P31146;H3BRY3 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 2 40.025 40.025 2;3 0.00023921 36604 QUIQUE_C1277_190116_001 79.492 61.683 1002800000 38408000 123640000 0 129240000 81153000 0 138580000 0 37767000 0 201700000 68460000 183890000 37998 2327 35441 341438;341439;341440;341441;341442;341443;341444;341445;341446;341447;341448;341449;341450;341451;341452;341453 434462;434463;434464;434465;434466;434467;434468;434469;434470;434471;434472;434473;434474;434475;434476;434477;434478;434479 434464 18 RCEPIAMTVPR Oxidation (M) 1344.6642 0.66422513 2327 P31146;H3BRY3 CORO1A Coronin-1A;Coronin yes no 0 1 1 1 22.568 22.568 3 0.026482 15395 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.383 26.483 18983000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18983000 0 0 0 37999 2327 35441 341454 434480 434480 1 RCFPAIHAYK Unmodified 1261.639 0.63899666 3535 Q8IWA5;K7EPV6;K7ESF5 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 24.526 24.526 3 0.010498 17385 QUIQUE_DMIX7_190116_001 39.873 30.227 172720000 0 0 0 0 0 0 0 39237000 0 0 0 88040000 45443000 38000 3535 35442 341455;341456;341457;341458 434481;434482;434483;434484 434483 4 RCILDLAHQWGEFK Unmodified 1771.8828 0.88280876 2644 P54687 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes yes 0 0 1 1 102.76 102.76 3 0.026081 104528 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.382 26.04 20515000 0 0 0 0 0 0 0 20515000 0 0 0 0 0 38001 2644 35443 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341465;341466;341467;341468;341469;341470;341471;341472;341473;341474;341475;341476;341477 434491;434492;434493;434494;434495;434496;434497;434498;434499;434500;434501;434502;434503;434504 434491 14 RDDGSWEVIEGYR Unmodified 1580.7219 0.72193424 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 83.806 83.806 2;3 2.5311E-41 85027 QUIQUE_C1403_190116_001 193.28 170.81 5858300000 512580000 331270000 683240000 208040000 435520000 331180000 478940000 455580000 510160000 79636000 805440000 484350000 542390000 38005 1777 35447 341478;341479;341480;341481;341482;341483;341484;341485;341486;341487;341488;341489;341490;341491;341492;341493;341494;341495;341496;341497;341498;341499;341500;341501 434505;434506;434507;434508;434509;434510;434511;434512;434513;434514;434515;434516;434517;434518;434519;434520;434521;434522;434523;434524;434525;434526;434527;434528;434529;434530;434531 434511 26 RDDGTGQLLLPLSDAR Unmodified 1725.901 0.90096124 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 90.67 90.67 2;3 2.0133E-09 92072 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.99 93.566 2711400000 269580000 238080000 287090000 0 328250000 0 224720000 306480000 0 152050000 331250000 386930000 187000000 38006 3117 35448 341502;341503;341504;341505;341506;341507;341508;341509;341510;341511;341512;341513;341514;341515;341516;341517;341518;341519;341520;341521 434532;434533;434534;434535;434536;434537;434538;434539;434540;434541;434542;434543;434544;434545;434546;434547;434548;434549;434550;434551;434552;434553;434554;434555;434556;434557;434558 434547 24 RDDSNESDVVESLDEIYHTGTFAQIHEMQDLGDK Unmodified 3892.7334 0.73336973 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7EQF8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 142.82 142.82 4 1.2896E-65 148435 QUIQUE_C1218_190116_001 135.15 128.97 163110000 46528000 0 50719000 34430000 0 0 31437000 0 0 0 0 0 0 38007 1324 35449 341522;341523;341524;341525 434559;434560;434561;434562;434563 434559 5 RDEDAENLGNFVMFPANGNIDLMYFPYYGK Oxidation (M) 3515.5802 0.58022732 2074 P14415;I3L1V9 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes no 0 1 1 1 2 1 1 161.8 161.8 3 3.297E-36 169368 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.88 100.6 258080000 0 0 0 0 0 0 0 53800000 103580000 0 51356000 49343000 0 38008 2074 35450 341526;341527;341528;341529;341530 434564;434565;434566;434567;434568 434567 1397;1398 5 RDEDAENLGNFVMFPANGNIDLMYFPYYGK Unmodified 3499.5853 0.58531269 2074 P14415;I3L1V9 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 166.46 166.46 3 5.3396E-41 173621 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.33 114.67 1002200000 0 0 0 0 0 0 0 184200000 208630000 0 292580000 191890000 124860000 38009 2074 35450 341531;341532;341533;341534;341535;341536 434569;434570;434571;434572;434573;434574;434575 434572 7 RDELTLEGIK Unmodified 1172.6401 0.6401021 2416 P38919;I3L3H2 EIF4A3 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.229 51.229 2 1.4441E-11 48439 QUIQUE_C1368_190116_001 161.67 99.99 877200000 136040000 160410000 144770000 0 0 118470000 0 112600000 104670000 0 0 100240000 0 38010 2416 35451 341537;341538;341539;341540;341541;341542;341543;341544 434576;434577;434578;434579;434580;434581;434582;434583 434578 8 RDETALQEEEELQLALALSQSEAEEK Unmodified 2958.4306 0.43056942 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 140.99 140.99 3 7.4924E-24 144977 QUIQUE_C1403_190116_001 113.13 95.917 156560000 43321000 44537000 0 43290000 0 0 0 0 0 25414000 0 0 0 38011 1464 35452 341545;341546;341547;341548;341549 434584;434585;434586;434587;434588 434586 5 RDETALQEEEELQLALALSQSEAEEKER Unmodified 3243.5743 0.57427354 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 2 1 1 128.9 128.9 4 3.7373E-08 132075 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.172 57.828 104800000 0 0 0 0 0 0 0 47657000 57142000 0 0 0 0 38012 1464 35453 341550;341551 434589;434590;434591 434590 3 RDEWQECPCSSSR Unmodified 1695.673 0.67295192 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 24.638 24.638 2;3 9.6403E-53 18020 QUIQUE_C1218_190116_001 202.32 193.36 601930000 72817000 154740000 75695000 119800000 0 50109000 112450000 0 0 16322000 0 0 0 38013 1688 35454 341552;341553;341554;341555;341556;341557;341558;341559;341560 434592;434593;434594;434595;434596;434597;434598;434599;434600 434592 9 RDFLQLFAPR Unmodified 1261.6931 0.69314072 1519 O43294 TGFB1I1 Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein yes yes 0 0 1 1 108.49 108.49 3 0.0011153 111822 QUIQUE_C1277_190116_001 72.006 54.57 9590400 0 9590400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38014 1519 35455 341561 434601 434601 1 RDFTPAELR Unmodified 1103.5724 0.57235688 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 35.924 35.924 2 0.017008 32361 QUIQUE_C1576_190116_001 72.638 37.282 339160000 0 0 0 0 0 0 94128000 0 0 0 100240000 0 144800000 38015 1391 35456 341562;341563;341564 434602;434603;434604 434602 3 RDFVDHIDLVDPVDGVVLVDPEYLK Unmodified 2866.4753 0.47527518 2528 P49407;E9PM35 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 150.31 150.31 3;4 2.5617E-17 156089 QUIQUE_C1218_190116_001 93.966 87.168 534360000 27897000 29513000 31333000 36398000 89846000 0 86304000 41190000 52448000 13369000 45328000 34834000 45899000 38016 2528 35457 341565;341566;341567;341568;341569;341570;341571;341572;341573;341574;341575;341576;341577;341578 434605;434606;434607;434608;434609;434610;434611;434612;434613;434614;434615;434616;434617;434618;434619;434620;434621;434622;434623 434605 18 RDHFEEAMR Unmodified 1189.5298 0.52984014 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 15.379 15.379 2;3 0.00011034 7566 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434638;434639;434640;434641;434642;434643;434644;434645;434646;434647;434648;434649;434650;434651;434652 434650 14 RDIEDPEIVVQATVL Unmodified 1695.9043 0.90431529 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 1 1 126.38 126.38 2 0.012051 132821 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.574 51.639 67445000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67445000 0 0 38019 1423 35460 341608 434653 434653 1 RDLATDLSLIEVK Unmodified 1471.8246 0.8246084 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 100.96 100.96 3 0.00015364 104552 QUIQUE_C1218_190116_001 71.279 56.926 48068000 20441000 0 0 0 0 27628000 0 0 0 0 0 0 0 38020 2009 35461 341609;341610;341611;341612 434654;434655;434656;434657 434654 3 RDNEVDGQDYHFVVSR Unmodified 1934.8871 0.88710209 3279 Q5JUW8;Q92796 DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 1 1 51.741 51.741 3 0.0025324 50671 QUIQUE_C1438_190116_001 45.342 35.243 51605000 0 0 0 0 51605000 0 0 0 0 0 0 0 0 38021 3279 35462 341613 434658 434658 1 RDPHLACVAYER Unmodified 1485.7147 0.7146808 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434750;434751;434752;434753;434754;434755;434756 434756 7 RDYLLLVMEGTDDGR Unmodified 1751.8512 0.85123386 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 1 1 1 116.9 116.9 3 0.0011451 119281 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.716 48.435 20624000 0 0 0 0 0 0 0 20624000 0 0 0 0 0 38028 4234 35469 341680;341681 434757;434758 434758 1 REDAEHNLVLFR Unmodified 1497.7688 0.76882486 2435 P41219;F8W835 PRPH Peripherin yes no 0 0 1 1 52.645 52.645 3 0.042167 47904 QUIQUE_DMIX4_190116_001 33.273 25.386 17086000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17086000 0 0 0 38029 2435 35470 341682 434759 434759 1 REDCLPYAATVLR Unmodified 1562.7875 0.78751139 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 1 1 1 73.61 73.61 3 0.022698 74569 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.555 30.925 48298000 0 0 0 0 0 0 0 0 18702000 0 29596000 0 0 38030 1283 35471 341683;341684 434760;434761 434760 1 REDCSPADKPYIDEAR Unmodified 1920.8636 0.86358946 3835 Q96DG6 CMBL Carboxymethylenebutenolidase homolog yes yes 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434795;434796;434797;434798;434799;434800;434801;434802;434803;434804;434805;434806;434807;434808;434809;434810;434811;434812;434813;434814;434815;434816;434817;434818 434798 16 REDLVVAPAGITLK Unmodified 1480.8613 0.86132826 2040 P12268;H0Y4R1;E7ETK5 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 2 79.086 79.086 2;3 0.001855 80259 QUIQUE_C1277_190116_001 73.881 45.154 526850000 38616000 27588000 32336000 29127000 67727000 28497000 34939000 53417000 61542000 0 43389000 25411000 84259000 38035 2040 35476 341731;341732;341733;341734;341735;341736;341737;341738;341739;341740;341741;341742;341743;341744;341745 434819;434820;434821;434822;434823;434824;434825;434826;434827;434828;434829;434830;434831;434832;434833 434820 11 REDMAPHIYAVAQTAYR Unmodified 1990.9683 0.9683293 271 A0A0D9SFK2;Q92614;H0YEV9 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 94.568 94.568 2 0.0052371 95902 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.555 37.773 53990000 0 0 0 0 0 0 0 53990000 0 0 0 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QUIQUE_C1277_190116_001 74.047 72.048 501870000 120900000 76955000 0 0 52740000 0 57057000 0 0 0 76931000 57362000 59923000 38039 2751 35480 341751;341752;341753;341754;341755;341756;341757;341758;341759;341760;341761 434839;434840;434841;434842;434843;434844;434845;434846;434847;434848;434849;434850 434842 11 REEEEVLDQGDFYSLLSK Unmodified 2156.0273 0.027343548 2140 P19021;H7BYD9 PAM Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase;Peptidylglycine alpha-hydroxylating monooxygenase;Peptidyl-alpha-hydroxyglycine alpha-amidating lyase yes no 0 0 1 1 1 1 1 123.9 123.9 3 0.005202 120711 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.358 22.262 125470000 35828000 0 31129000 0 0 0 41468000 0 0 17041000 0 0 0 38040 2140 35481 341762;341763;341764;341765 434851;434852;434853;434854 434854 2 REEETLDTIK Unmodified 1232.6248 0.62484596 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 1 1 22.453 22.453 2 0.038962 15560 QUIQUE_C1563_190116_001 59.931 12.273 15101000 0 0 0 0 0 15101000 0 0 0 0 0 0 0 38041 1021 35482 341766 434855 434855 1 REEFVQWVELLPDTQTPSWLGLPNNAER Unmodified 3323.6575 0.65749008 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 162.77 162.77 3 3.0855E-13 167199 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.616 63.989 129700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 129700000 0 38042 3053 35483 341767;341768;341769 434856;434857;434858 434857 3 REEFWLGLDNLNK Unmodified 1632.826 0.82600539 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 1 1 1 109.67 109.67 2 0.0041426 107927 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.522 45.972 110240000 0 0 0 0 0 0 0 0 110240000 0 0 0 0 38043 2233 35484 341770;341771 434859;434860 434860 2 REELFIVSK Unmodified 1119.6288 0.62880913 2087 P15121;E9PCX2;E9PEF9 AKR1B1 Aldose reductase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.125 46.125 2 1.8975E-05 42403 QUIQUE_DMIX8_190116_001 163.16 55.586 11210000000 0 0 1501000000 1279100000 1025700000 0 1215500000 1139200000 1399800000 552950000 1464800000 0 1631800000 38044 2087 35485 341772;341773;341774;341775;341776;341777;341778;341779;341780 434861;434862;434863;434864;434865;434866;434867;434868;434869 434869 4 REELITNWEQIR Unmodified 1585.8213 0.82125436 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 82.965 82.965 2;3 1.0184E-15 84202 QUIQUE_DMIX7_190116_001 167.71 143.64 29531000000 2212100000 2750400000 2768000000 2315400000 2571400000 2099700000 2740600000 1184100000 2580100000 841380000 3135100000 2616300000 1715900000 38045 267;275;3025 35486 341781;341782;341783;341784;341785;341786;341787;341788;341789;341790;341791;341792;341793;341794;341795;341796;341797;341798;341799;341800;341801;341802;341803;341804 434870;434871;434872;434873;434874;434875;434876;434877;434878;434879;434880;434881;434882;434883;434884;434885;434886;434887;434888;434889;434890;434891;434892;434893;434894;434895;434896;434897;434898 434896 28 REELLDHLEK Unmodified 1280.6725 0.67246486 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 1 1 34.825 34.825 3 0.036384 30169 QUIQUE_C1403_190116_001 36.847 21.971 54250000 0 0 0 54250000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38046 2279 35487 341805 434899 434899 1 REESFTFIPR Unmodified 1280.6513 0.65133548 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.107 62.107 3 0.00024152 61466 QUIQUE_C1368_190116_001 93.058 75.69 108530000 0 0 21924000 14222000 0 0 0 0 0 0 32828000 16964000 22596000 38047 2357 35488 341806;341807;341808;341809;341810;341811 434900;434901;434902;434903;434904;434905 434900 6 REFPTVPLVK Unmodified 1184.6917 0.69174374 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 1 1 60.403 60.403 2 0.039722 59039 QUIQUE_C1403_190116_001 55.549 15.548 31736000 0 0 0 31736000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38048 3202 35489 341812 434906 434906 1 REGGDGEEQDVGDAGR Unmodified 1645.6928 0.69281896 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 14.744 14.744 2;3 1.0339E-09 6996 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.54 96.275 135780000 0 0 12022000 9279600 0 0 61413000 0 12950000 19769000 20349000 0 0 38049 3576 35490 341813;341814;341815;341816;341817;341818 434907;434908;434909;434910;434911;434912 434912 6 REGWCFGAK Unmodified 1109.5076 0.50764813 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 32.761 32.761 2 0.036114 27703 QUIQUE_C1277_190116_001 60.019 36.496 37321000 0 37321000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38050 62 35491 341819 434913 434913 1 REHASIDAQSGAGVPNPSTSASPK Unmodified 2363.1466 0.14656426 3549 Q8IXJ6 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes yes 0 0 1 1 30.326 30.326 3 0.0009852 24774 QUIQUE_C1277_190116_001 37.369 29.377 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38051 3549 35492 341820 434914 434914 1 REIEIAEQDMSALISLR Unmodified 1973.0252 0.025175478 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 1 1 131.97 131.97 3 0.0089715 138498 QUIQUE_C1438_190116_001 39.905 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273;342 35503 341857;341858;341859;341860;341861;341862;341863;341864;341865;341866;341867;341868;341869;341870;341871 434955;434956;434957;434958;434959;434960;434961;434962;434963;434964;434965;434966;434967;434968;434969;434970;434971;434972;434973;434974;434975;434976;434977;434978;434979;434980;434981;434982;434983;434984;434985;434986;434987;434988;434989;434990;434991;434992 434975 38 REPVGNDVATILSR Unmodified 1525.8213 0.82125436 4523 Q9UPY6 WASF3 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.954 66.954 3 0.0033936 66163 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.237 47.715 258240000 0 0 0 46162000 36214000 36175000 0 0 46247000 0 31911000 0 61527000 38063 4523 35504 341872;341873;341874;341875;341876;341877 434993;434994;434995;434996;434997;434998 434998 5 REPVSLEEWTK Unmodified 1372.6987 0.69867961 3669;706 C9JA93;Q8TC07 TBC1D15 TBC1 domain family member 15 no no 0 0 1 1 1 1 1 59.861 59.861 2 0.0042662 59536 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.566 41.644 114120000 0 0 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50.463 3 9.046E-79 47967 QUIQUE_C1368_190116_001 130.25 117.94 293500000 0 35826000 40703000 39618000 40467000 21364000 38152000 0 35175000 0 0 0 42190000 38066 3212 35507 341903;341904;341905;341906;341907;341908;341909;341910 435029;435030;435031;435032;435033;435034;435035;435036 435030 8 REYYFAITMER Unmodified 1477.7024 0.70238478 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;Q5T9Q5;A0A2R8Y5P6;A0A2R8Y6E6;A0A0U1RQF8 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 2 1 81.974 81.974 3 0.0086572 83592 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.659 38.097 149480000 0 0 0 0 0 0 0 32636000 0 0 72708000 44134000 0 38067 445 35508 341911;341912;341913;341914 435037;435038;435039;435040 435039 4 RFDAERPVDCSVIVVNK Unmodified 2003.0258 0.02584418 4224 Q9HCD5;Q5JY17 NCOA5 Nuclear receptor coactivator 5 yes no 0 0 2 1 1 1 59.571 59.571 3 0.013474 58239 QUIQUE_C1563_190116_001 56.959 42.365 101950000 0 0 33313000 0 0 30866000 0 0 0 0 37769000 0 0 38068 4224 35509 341915;341916;341917 435041;435042;435043 435042 3 RFDAMPFTLR Oxidation (M) 1268.6336 0.63357693 4530 Q9UQ80 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes yes 0 1 1 1 1 1 1 65.894 65.894 3 0.0081179 65616 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.359 38.992 80442000 0 0 0 0 0 0 0 22853000 21319000 0 19891000 16380000 0 38069 4530 35510 341918;341919;341920;341921 435044;435045;435046;435047 435046 2994 4 RFDAMPFTLR Unmodified 1252.6387 0.63866231 4530 Q9UQ80 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes yes 0 0 1 1 88.662 88.662 3 0.0073824 89563 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.765 39.899 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38070 4530 35510 341922 435048 435048 1 RFDDAVVQSDMK Oxidation (M) 1425.6558 0.65582851 2010 P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 27.943 27.943 2;3 0.0010472 22570 QUIQUE_C1218_190116_001 105.94 77.862 2890800000 195060000 277270000 0 251850000 226170000 235750000 229290000 0 324570000 242040000 0 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435062;435063;435064;435065;435066;435067;435068;435069;435070;435071;435072;435073;435074;435075;435076;435077;435078;435079;435080;435081;435082;435083;435084;435085;435086;435087;435088;435089;435090;435091;435092;435093;435094;435095;435096;435097;435098;435099;435100 435063 39 RFDEAALSIQK Unmodified 1276.6776 0.67755023 3973 Q99747 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 49.421 49.421 2;3 0.002726 47293 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.029 20.435 1546800000 233090000 106490000 127700000 99570000 106780000 97096000 128360000 190550000 212400000 40672000 0 95849000 108220000 38073 3973 35512 341961;341962;341963;341964;341965;341966;341967;341968;341969;341970;341971;341972;341973;341974;341975 435101;435102;435103;435104;435105;435106;435107;435108;435109;435110;435111;435112;435113;435114;435115;435116;435117 435111 16 RFDEILEASDGIMVAR Oxidation (M) 1836.904 0.90399771 2077;1203 H3BTN5;P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase;Pyruvate kinase PKM no no 0 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435303 242 RFDGVQDPR Unmodified 1088.5363 0.53630573 1391 O00264 PGRMC1 Membrane-associated progesterone receptor component 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 21.795 21.795 2;3 0.0012478 14434 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.267 61.311 2829300000 144510000 0 66444000 0 98948000 0 618540000 60561000 494050000 851470000 338500000 84070000 72213000 38076 1391 35514 342148;342149;342150;342151;342152;342153;342154;342155;342156;342157;342158;342159;342160;342161;342162 435414;435415;435416;435417;435418;435419;435420;435421;435422;435423;435424;435425;435426;435427;435428 435424 12 RFDLFDFCYHLLK Unmodified 1772.8708 0.87084709 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 132.96 132.96 3 0.0001041 137189 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.264 83.651 271230000 0 0 0 0 0 0 0 28777000 43005000 0 75376000 76713000 47360000 38077 882 35515 342163;342164;342165;342166;342167 435429;435430;435431;435432;435433 435432 3 RFDSELSQAHEEAQR Unmodified 1801.8343 0.83433824 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 1 1 32.166 32.166 3 2.5421E-06 27972 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.67 85.304 530410000 205930000 0 265350000 0 0 0 0 59126000 0 0 0 0 0 38078 271 35516 342168;342169;342170 435434;435435;435436 435436 3 RFDTEEEFK Unmodified 1199.5459 0.54586736 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 33.178 33.178 2 0.065743 28470 QUIQUE_C1576_190116_001 52.278 17.471 21121000 0 0 0 0 0 0 21121000 0 0 0 0 0 0 38079 2638 35517 342171 435437 435437 1 RFDVLAPHLTK Unmodified 1295.735 0.73500553 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 1 49.993 49.993 3 0.019708 45663 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.095 27.838 58681000 0 41601000 0 0 0 0 0 0 0 17080000 0 0 0 38080 271 35518 342172;342173 435438;435439 435439 2 RFDVSGYPTLK Unmodified 1281.6717 0.67173657 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 1 1 62.412 62.412 2 0.017112 62530 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10.257 3 0.010039 2687 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.179 49.29 5257700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5257700 0 0 0 38084 3555 35522 342187 435455 435455 1 RFEELGVK Unmodified 976.53418 0.53418046 2888 Q04760 GLO1 Lactoylglutathione lyase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.839 26.839 2 0.0053442 19910 QUIQUE_DMIX8_190116_001 114.89 58.884 30344000000 2104300000 2871800000 2533100000 2567700000 2614200000 2476000000 2564900000 1463600000 2389400000 345910000 3079000000 2697200000 2636900000 38085 2888 35523 342188;342189;342190;342191;342192;342193;342194;342195;342196;342197;342198;342199;342200 435456;435457;435458;435459;435460;435461;435462;435463;435464;435465;435466;435467;435468 435468 8 RFEETGQELAELLEEEK Unmodified 2048.9902 0.99022976 2393 P36405 ARL3 ADP-ribosylation factor-like protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.58 121.58 2;3 6.8206E-30 125091 QUIQUE_C1403_190116_001 178.07 94.301 741470000 59801000 0 0 52961000 111880000 47230000 148720000 77456000 0 51431000 0 75049000 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5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 0 1 1 117.16 117.16 2 0.035032 119660 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.751 39.085 33257000 0 0 0 0 0 0 0 33257000 0 0 0 0 0 38098 2806 35535 342250 435524 435524 1 RFPAFGFGAR Unmodified 1124.5879 0.58794737 1745 O95741 CPNE6 Copine-6 yes yes 0 0 1 2 2 1 2 3 2 4 3 3 70.829 70.829 2;3 0.00052383 69088 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.7 78.89 809730000 0 84102000 0 0 86418000 59865000 0 20421000 131930000 57952000 97188000 142400000 129460000 38099 1745 35536 342251;342252;342253;342254;342255;342256;342257;342258;342259;342260;342261;342262;342263;342264;342265;342266;342267;342268;342269;342270;342271;342272 435525;435526;435527;435528;435529;435530;435531;435532;435533;435534;435535;435536;435537;435538;435539;435540;435541;435542;435543;435544;435545;435546;435547;435548;435549;435550;435551;435552 435549 27 RFPEEPHVPLEQR Unmodified 1632.8372 0.83723877 3673 Q8TCD5;J3KRC4;J3KSX6 NT5C 5'(3')-deoxyribonucleotidase, cytosolic type yes no 0 0 1 1 2 2 1 2 1 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435713;435714;435715;435716;435717;435718;435719;435720;435721;435722 435717 10 RGDLAALLSGVR Unmodified 1226.7095 0.70951906 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 89.806 89.806 3 0.00039154 90462 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.989 33.028 45527000 25951000 0 0 0 0 0 0 19577000 0 0 0 0 0 38126 1913 35560 342416;342417;342418;342419;342420;342421;342422;342423 435723;435724;435725;435726;435727;435728;435729;435730 435726 8 RGDLPFVVPR Unmodified 1154.656 0.65602693 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 3 3 2 2 1 3 2 2 1 2 2 2 64.573 64.573 2;3 0.00031576 64794 QUIQUE_C1438_190116_001 118.67 82.113 1513000000 66642000 154340000 120110000 68674000 171260000 0 165720000 228820000 30226000 26845000 206170000 117170000 157050000 38127 2378 35561 342424;342425;342426;342427;342428;342429;342430;342431;342432;342433;342434;342435;342436;342437;342438;342439;342440;342441;342442;342443;342444;342445;342446;342447;342448;342449 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mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.993 77.993 3 0.0002397 78669 QUIQUE_C1277_190116_001 85.554 55.811 214880000 32411000 34020000 47049000 0 30602000 28867000 26550000 0 0 15378000 0 0 0 38129 2463 35563 342467;342468;342469;342470;342471;342472;342473;342474;342475 435782;435783;435784;435785;435786;435787;435788;435789;435790;435791;435792;435793;435794 435785 13 RGDVLAAWSGIRPLVTDPK Unmodified 2050.1324 0.13235816 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 1 100.81 100.81 3 0.0018361 105385 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.893 52.42 579450000 0 0 0 0 0 0 184670000 0 0 0 394770000 0 0 38130 2463 35564 342476;342477 435795;435796 435796 1 RGEAHLAVNDFELAR Unmodified 1696.8645 0.86451616 2876 Q02790 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed yes yes 0 0 1 2 2 3 3 3 2 3 3 2 2 2 3 2 58.511 58.511 2;3;4 1.2429E-08 57772 QUIQUE_C1438_190116_001 125.61 91.726 3523700000 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105 kDa no no 0 0 1 1 1 1 1 124.83 124.83 3 0.0026291 121803 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.228 29.955 256060000 0 0 0 0 97299000 0 0 110560000 0 48193000 0 0 0 38167 180;3738 35601 342708;342709;342710;342711 436072;436073;436074;436075 436074 3 RGPGESADPGPFVEDGTGR Unmodified 1899.8711 0.87111768 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 1 1 1 46.618 46.618 3 0.00070413 43918 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.205 27.829 76607000 0 0 0 43585000 0 0 0 33021000 0 0 0 0 0 38168 3718 35602 342712;342713 436076;436077 436077 2 RGPGGVWAAEAISDAR Unmodified 1611.8118 0.8117523 1985 P0DJI8 SAA1 Serum amyloid A-1 protein;Amyloid protein A;Serum amyloid protein A(2-104);Serum amyloid protein A(3-104);Serum amyloid protein A(2-103);Serum amyloid protein A(2-102);Serum amyloid protein A(4-101) yes yes 0 0 1 1 2 69.679 69.679 3 3.4814E-05 69292 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.657 77.94 130850000 0 80544000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50302000 38169 1985 35603 342714;342715;342716 436078;436079;436080 436079 3 RGPGLYYVDSEGNR Unmodified 1581.7536 0.75356872 2276 P28074 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 3 43.677 43.677 2;3 9.4949E-05 41329 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.71 77.723 641520000 43959000 74473000 0 46256000 56652000 0 49966000 36875000 41839000 0 114220000 88311000 88973000 38170 2276 35604 342717;342718;342719;342720;342721;342722;342723;342724;342725;342726;342727;342728;342729;342730;342731;342732;342733;342734;342735;342736;342737;342738 436081;436082;436083;436084;436085;436086;436087;436088;436089;436090;436091;436092;436093;436094;436095;436096;436097;436098;436099;436100;436101;436102;436103;436104;436105 436094 23 RGPLGPNWK Unmodified 1023.5614 0.56139826 2519 P48739;A0A0A0MSW4;B3KYB6 PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform yes no 0 0 1 1 23.797 23.797 2 0.0065303 17315 QUIQUE_C1368_190116_001 89.046 46.572 26092000 0 0 26092000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38171 2519 35605 342739 436106 436106 1 RGPLQVAFTIK Unmodified 1228.7292 0.72919187 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B4DXZ6;P51114;E7EU85;E9PFF5 FXR1 Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 yes no 0 0 1 1 52.035 52.035 3 0.00091528 50160 QUIQUE_C1368_190116_001 50.986 35.48 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38174 625 35608 342757 436125 436125 1 RGPPSDGHEALEK Unmodified 1391.6793 0.67934115 4144 Q9H2D6;H0Y5J9 TRIOBP TRIO and F-actin-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 10.444 10.444 3 1.339E-10 2789 QUIQUE_C1403_190116_001 122.33 62.17 31945000 7312900 0 0 15555000 9076800 0 0 0 0 0 0 0 0 38175 4144 35609 342758;342759;342760 436126;436127;436128 436127 3 RGPQLVCTGSDDGTVK Unmodified 1688.8152 0.8151827 3836 Q96DI7 SNRNP40 U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein yes yes 0 0 1 1 1 1 28.316 28.316 3 0.032552 23180 QUIQUE_C1218_190116_001 26.89 9.4878 34303000 0 0 0 0 0 0 34303000 0 0 0 0 0 0 38176 3836 35610 342761;342762;342763 436129;436130;436131 436129 3 RGPSASSVAVMTSSTSDHHLDAAAAR Unmodified 2581.2303 0.23031066 4355 Q9NZQ3;C9JSC3;C9JMQ4 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 1 1 1 1 1 42.912 42.912 4 2.3051E-11 39669 QUIQUE_C1403_190116_001 80.02 73.794 302000000 0 0 0 38290000 0 148810000 71335000 43560000 0 0 0 0 0 38177 4355 35611 342764;342765;342766;342767 436132;436133;436134;436135 436132 2 RGQHWLLDGFPR Unmodified 1480.7688 0.76876528 2259 P27144;D3DQ64 AK4 Adenylate kinase 4, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 77.897 77.897 3 0.00071358 73958 QUIQUE_C1403_190116_001 66.498 57.215 26161000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26161000 0 0 0 38178 2259 35612 342768;342769;342770 436136;436137;436138;436139 436136 4 RGQILWFR Unmodified 1074.6087 0.60868281 2158;2222;470 H0Y7S3;A0A2U3U055;A0A2U3TZI3;Q01814;A0A2R8Y4R4;Q16720;H0YDG5;H7BZS8;H7BY13;P20020;E7ERY9;A0A0U1RQU3;H0YHH6;P23634 ATP2B2;ATP2B3;ATP2B4;ATP2B1 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1;Calcium-transporting ATPase;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 no no 0 0 1 1 1 1 68.451 68.451 2 1.6E-14 69320 QUIQUE_DMIX5_190116_001 189.62 133.07 143210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63632000 21694000 57884000 38179 470;2158;2222 35613 342771;342772;342773 436140;436141;436142;436143 436141 4 RGQPFWLTLHFEGR Unmodified 1742.9005 0.90050773 2190 P21980;A2A299;A2A2A0 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes no 0 0 1 1 1 100.51 100.51 3 0.00072801 104639 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.885 47.615 46643000 0 0 0 0 0 0 0 0 46643000 0 0 0 0 38180 2190 35614 342774;342775 436144;436145 436145 2 RGQTCVVHYTGMLEDGK Unmodified 1949.9088 0.90876551 2773 P62942;Q5W0X3;A0A087WZM5 FKBP1A Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 1 1 1 1 1 43.929 43.929 3 2.9357E-10 42012 QUIQUE_C1218_190116_001 91.637 76.215 62387000 0 0 0 0 0 0 62387000 0 0 0 0 0 0 38181 2773 35615 342776;342777;342778;342779 436146;436147;436148;436149 436146 4 RGQTCVVHYTGMLEDGKK Unmodified 2078.0037 0.0037285295 2773 P62942;Q5W0X3;A0A087WZM5 FKBP1A Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 31.722 31.722 3;4 1.0835E-22 26971 QUIQUE_C1218_190116_001 129.46 120.98 3108600000 672950000 453050000 257440000 211020000 38151000 165770000 0 224680000 221780000 49992000 376070000 0 437660000 38182 2773 35616 342780;342781;342782;342783;342784;342785;342786;342787;342788;342789;342790;342791;342792;342793;342794 436150;436151;436152;436153;436154;436155;436156;436157;436158;436159;436160;436161;436162;436163;436164;436165 436151 14 RGQTCVVHYTGMLEDGKK Oxidation (M) 2093.9986 0.99864315 2773 P62942;Q5W0X3;A0A087WZM5 FKBP1A Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 21.01 21.01 4 0.00012954 14061 QUIQUE_C1368_190116_001 80.975 66.361 579770000 0 0 81157000 58098000 100690000 0 68742000 38817000 73781000 0 0 59481000 99010000 38183 2773 35616 342795;342796;342797;342798;342799;342800;342801;342802 436166;436167;436168;436169;436170;436171;436172;436173;436174;436175;436176 436167 2208 11 RGQVLILLVEQALR Unmodified 1606.9883 0.98826011 520 H0Y5G7;A2RRP1 NBAS Neuroblastoma-amplified sequence yes no 0 0 1 1 142.76 142.76 3 0.0032927 150200 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.568 36.131 11048000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11048000 0 0 38184 520 35617 342803 436177 436177 1 RGSIGENQIKDEK Unmodified 1472.7583 0.75831975 926 E9PGZ1;C9J813 CALD1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 10.735 10.735 3 0.0015146 2908 QUIQUE_C1368_190116_001 77.776 46.886 235190000 14370000 0 7024500 41163000 0 0 13216000 0 94368000 12694000 0 52357000 0 38185 926 35618 342804;342805;342806;342807;342808;342809;342810 436178;436179;436180;436181;436182;436183;436184 436179 6 RGTEHSGSTVPSILNR Unmodified 1709.8809 0.8808945 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 26.905 26.905 3 0.00014133 20918 QUIQUE_C1368_190116_001 58.712 49.43 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Unmodified 2120.0247 0.024658206 2044 P12277;H0YJG0 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 1 4 4 3 3 2 3 3 6 3 3 5 4 4 88.593 88.593 2;3 1.1278E-113 83095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 256.45 225.26 78147000000 4134900000 6678300000 6581000000 5069900000 5111100000 5475200000 5879800000 8270100000 8071200000 2666900000 5408200000 6492800000 8307000000 38188 2044 35621 342843;342844;342845;342846;342847;342848;342849;342850;342851;342852;342853;342854;342855;342856;342857;342858;342859;342860;342861;342862;342863;342864;342865;342866;342867;342868;342869;342870;342871;342872;342873;342874;342875;342876;342877;342878;342879;342880;342881;342882;342883;342884;342885;342886;342887;342888;342889 436221;436222;436223;436224;436225;436226;436227;436228;436229;436230;436231;436232;436233;436234;436235;436236;436237;436238;436239;436240;436241;436242;436243;436244;436245;436246;436247;436248;436249;436250;436251;436252;436253;436254;436255;436256;436257;436258;436259;436260;436261;436262;436263;436264;436265;436266;436267;436268;436269;436270;436271;436272;436273;436274;436275;436276;436277;436278;436279;436280;436281;436282;436283;436284;436285;436286;436287;436288;436289;436290;436291;436292;436293;436294;436295;436296;436297;436298;436299;436300;436301;436302;436303;436304;436305;436306;436307;436308;436309 436268 83 RGTHTTVSQVQPPPSK Unmodified 1718.9064 0.90638097 4355 Q9NZQ3;C9JSC3;C9JMQ4;C9JC20 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 10.722 10.722 3;4 1.0934E-06 3299 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.67 95.805 156540000 5313300 0 0 27669000 14962000 0 0 29756000 15904000 0 16776000 0 46158000 38189 4355 35622 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436355;436356;436357;436358;436359;436360;436361 436358 1277 6 RGVMLAVDAVIAELKK Unmodified 1712.0019 0.001861261 2004 P10809;E7ESH4;E7EXB4 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 123.3 123.3 3;4 6.1041E-12 127709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.47 111.58 1332800000 47576000 101170000 146850000 82401000 0 0 204110000 54181000 142610000 5890900 172750000 184520000 190710000 38194 2004 35626 342940;342941;342942;342943;342944;342945;342946;342947;342948;342949;342950;342951;342952 436362;436363;436364;436365;436366;436367;436368;436369;436370;436371;436372;436373;436374;436375;436376;436377;436378;436379 436373 15 RGVSCQFGPDVTK Unmodified 1449.7034 0.70344741 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 1 2 1 1 1 32 32 2;3 0.0078045 26969 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.451 18.359 126460000 0 38051000 0 0 0 0 32460000 0 0 0 30428000 25517000 0 38195 1148 35627 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RGWDENVYYTVPLVR Unmodified 1865.9424 0.94243213 3985 Q9BPW8 NIPSNAP1 Protein NipSnap homolog 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 105.33 105.33 2;3 0.00023279 108275 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.5 82.558 740870000 0 22692000 41338000 0 39871000 0 27986000 141450000 86324000 0 176870000 118100000 86237000 38199 3985 35631 342964;342965;342966;342967;342968;342969;342970;342971;342972;342973;342974;342975 436391;436392;436393;436394;436395;436396;436397;436398;436399;436400;436401;436402;436403;436404 436402 13 RGWVLGPNNYYSFASQQQKPEDTTIPSTELAK Unmodified 3624.7849 0.78487544 2512 R4GMR5;P48556 PSMD8 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8 yes no 0 0 2 1 110.05 110.05 4 0.034312 114155 QUIQUE_DMIX8_190116_001 22.969 21.111 100390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100390000 38200 2512 35632 342976 436405 436405 1 RHAPIEQLAR Unmodified 1189.668 0.6679886 2544 P49757;G3V3Z8 NUMB Protein numb homolog yes no 0 0 1 1 1 1 15.082 15.082 3 0.00093491 7464 QUIQUE_DMIX3_190116_001 72.2 53.455 46260000 0 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436651;436652;436653 436653 3 RIDALNTEELR Unmodified 1328.7048 0.70482762 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 46.364 46.364 2 0.00092328 43202 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.898 47.371 291500000 0 0 0 45847000 0 0 0 0 0 0 84838000 73040000 87777000 38217 3597 35648 343151;343152;343153;343154 436654;436655;436656;436657;436658 436658 4 RIDITLSSVK Unmodified 1130.6659 0.66592292 2920 Q08380;K7EP36 LGALS3BP Galectin-3-binding protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.982 50.982 2 0.0040244 48881 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.38 46.317 496130000 69170000 0 43512000 0 75182000 33091000 0 45947000 0 0 96694000 59552000 72980000 38218 2920 35649 343155;343156;343157;343158;343159;343160;343161;343162 436659;436660;436661;436662;436663;436664;436665;436666 436664 4 RIDSLMDEISFLK Unmodified 1565.8123 0.81232916 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 133.5 133.5 2;3 0.0001041 139871 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.264 81.235 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101.36 95.059 482740000 0 0 0 0 0 0 25578000 116100000 65145000 0 116250000 80247000 79419000 38221 1916 35651 343189;343190;343191;343192;343193;343194 436694;436695;436696;436697;436698;436699;436700;436701 436695 8 RIDSVYLDPLVFR Unmodified 1591.8722 0.8722273 1573 O60443;C9JSR4;H7C147;H7BZJ0 DFNA5 Non-syndromic hearing impairment protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 118.17 118.17 3 0.00018555 122528 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.457 61.615 101830000 0 0 0 0 0 0 0 32362000 27360000 0 18549000 0 23559000 38222 1573 35652 343195;343196;343197;343198;343199 436702;436703;436704;436705;436706;436707 436704 4 RIEDNLPAGEE Unmodified 1241.5888 0.58879481 1536 O43617;A0A087WWM0;A0A087WYS5 TRAPPC3 Trafficking protein particle complex subunit 3 yes no 0 0 1 1 1 1 42.734 42.734 2 0.0091222 40100 QUIQUE_C1576_190116_001 67.113 33.39 105240000 0 0 0 0 0 0 47540000 0 0 0 57703000 0 0 38223 1536 35653 343200;343201;343202 436708;436709;436710 436709 3 RIEELEAELR Unmodified 1256.6725 0.67246486 4282 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343227;343228;343229;343230;343231;343232;343233;343234;343235;343236;343237;343238;343239;343240;343241;343242;343243;343244;343245;343246;343247;343248;343249;343250 436738;436739;436740;436741;436742;436743;436744;436745;436746;436747;436748;436749;436750;436751;436752;436753;436754;436755;436756;436757;436758;436759;436760;436761;436762;436763;436764;436765;436766 436757 29 RIEGSGDQVDTLELSGGAK Unmodified 1930.9596 0.95959833 4528;840 E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.329 54.329 3 1.9085E-05 52472 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.118 65.891 344970000 30681000 43043000 25212000 27382000 42243000 16816000 36367000 28749000 0 0 53801000 40673000 0 38229 840;4528 35659 343251;343252;343253;343254;343255;343256;343257;343258;343259;343260 436767;436768;436769;436770;436771;436772;436773;436774;436775;436776 436776 9 RIEHPTAGNTEAWEDTHAK Unmodified 2162.0141 0.01409352 1119 H0Y465;P21359;J3KSB5 NF1 Neurofibromin;Neurofibromin truncated yes no 0 0 1 1 22.624 22.624 4 0.06036 16116 QUIQUE_DMIX7_190116_001 13.754 11.51 21865000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21865000 0 38230 1119 35660 343261 436777 436777 1 RIEPADAHVLQK Unmodified 1375.7572 0.75719754 696 C9J5D1;E7EQ69;Q9GZZ1;A0A087WWJ2;B0AZT5 NAA50 N-alpha-acetyltransferase 50 yes no 0 0 1 1 21.329 21.329 3 0.049425 14629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.718 19.581 33636000 0 0 0 0 0 0 0 33636000 0 0 0 0 0 38231 696 35661 343262 436778 436778 1 RIEQHYFEDR Unmodified 1391.6582 0.65821178 1634 O75431;C9JNK6 MTX2 Metaxin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 22.739 22.739 2;3 7.7362E-05 15953 QUIQUE_C1403_190116_001 106.16 76.414 2271900000 224440000 195650000 245310000 223110000 167600000 0 253030000 132900000 208540000 0 342890000 0 278440000 38232 1634 35662 343263;343264;343265;343266;343267;343268;343269;343270;343271;343272;343273;343274;343275 436779;436780;436781;436782;436783;436784;436785;436786;436787;436788;436789;436790;436791;436792 436782 12 RIESLIDRDYMER Unmodified 1694.841 0.84100352 1310;3018 K4DI93;Q13620;Q13619;A0A0A0MR50 CUL4B;CUL4A Cullin-4B;Cullin-4A no no 0 0 2 1 62.921 62.921 3 0.0027635 61518 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.08 53.678 35859000 0 0 0 0 0 0 0 35859000 0 0 0 0 0 38233 1310;3018 35663 343276 436793 436793 1 RIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFK Unmodified 3517.7042 0.7041655 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 132.23 132.23 3;4 1.2375E-40 136974 QUIQUE_C1368_190116_001 118.68 111.11 1117700000 63594000 81456000 95093000 76818000 118350000 199130000 361590000 43474000 56083000 22163000 0 0 0 38234 2281 35664 343277;343278;343279;343280;343281;343282;343283;343284;343285;343286;343287 436794;436795;436796;436797;436798;436799;436800;436801;436802;436803;436804;436805 436797 11 RIEYIEAR Unmodified 1048.5665 0.56654322 3701 Q8WUW1 BRK1 Protein BRICK1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 23.685 23.685 2 0.009565 17058 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.64 53.082 212090000 0 0 0 0 0 0 39835000 0 60876000 0 52731000 0 58652000 38235 3701 35665 343288;343289;343290;343291 436806;436807;436808;436809 436809 4 RIFDAVGFTFPNR Unmodified 1538.7994 0.7993967 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 105.82 105.82 2;3 0.00019607 108855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.589 62.711 580190000 0 0 0 0 50560000 0 0 66969000 96912000 0 164480000 123420000 77839000 38236 4393;697 35666 343292;343293;343294;343295;343296;343297;343298;343299;343300;343301;343302;343303;343304;343305;343306;343307;343308 436810;436811;436812;436813;436814;436815;436816;436817;436818;436819;436820;436821;436822;436823;436824;436825;436826;436827;436828;436829;436830 436816 21 RIGQPTLLLYVDAGPETMTQR Unmodified 2358.2366 0.23656524 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 115.4 115.4 3 1.1682E-10 118588 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.75 97.798 616820000 0 0 0 0 0 0 0 121530000 144990000 0 134170000 111270000 104860000 38237 1791 35667 343309;343310;343311;343312;343313 436831;436832;436833;436834;436835;436836;436837;436838 436832 8 RIGQPTLLLYVDAGPETMTQR Oxidation (M) 2374.2315 0.23147986 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 1 1 1 1 101.73 101.73 3 0.00068907 104682 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.541 48.286 227410000 0 0 0 0 0 0 0 0 105390000 0 0 0 122020000 38238 1791 35667 343314;343315 436839;436840 436840 1016 2 RIGRFGYGYGPYQPVPEQPLYPQPYQPQYQQYTF Unmodified 4124.985 0.98497223 1842 P02808 STATH Statherin yes yes 0 0 2 2 137.68 137.68 3;4 1.4788E-13 144828 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.809 56.002 137720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 137720000 0 0 38239 1842 35668 343316;343317 436841;436842 436841 2 RIILEAEK Unmodified 970.58113 0.58113065 3133 Q15382;C9J931 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 0 1 1 19.879 19.879 2 0.026017 12398 QUIQUE_C1277_190116_001 81.296 12.509 44645000 0 44645000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38240 3133 35669 343318 436843 436843 1 RIILLAEGR Unmodified 1039.6502 0.65021327 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 40.48 40.48 2 0.0026458 37309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.09 81.766 444950000 0 0 45271000 56147000 90513000 0 82870000 0 0 0 106130000 64021000 0 38241 2219 35670 343319;343320;343321;343322;343323;343324 436844;436845;436846;436847;436848;436849;436850 436849 5 RIILLVK Unmodified 853.61131 0.61130857 2602 P52209;K7EM49;K7EPF6;K7EMN2 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 1 1 37.966 37.966 2 0.038922 34169 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.163 1.4707 318650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 318650000 0 38242 2602 35671 343325 436851 436851 1 RILDEIEEHNIK Unmodified 1507.7995 0.79945628 640;3097 B5MCX3;C9J2Q4;H7C2Y0;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 1 1 54.702 54.702 2;3 0.002462 52121 QUIQUE_DMIX8_190116_001 94.767 72.126 1536000000 26403000 35388000 30365000 30910000 179890000 171720000 190480000 0 297580000 55064000 282300000 183930000 51988000 38243 640;3097 35672 343326;343327;343328;343329;343330;343331;343332;343333;343334;343335;343336;343337;343338;343339;343340;343341;343342 436852;436853;436854;436855;436856;436857;436858;436859;436860;436861;436862;436863;436864;436865;436866;436867;436868 436868 15 RILGLLDAYLK Unmodified 1273.7758 0.77580772 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 1 1 1 2 1 115.25 115.25 2;3 0.0027136 120367 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.408 45.382 191260000 0 0 0 0 0 0 0 38448000 47981000 0 92980000 11845000 0 38244 2255 35673 343343;343344;343345;343346;343347 436869;436870;436871;436872;436873 436871 3 RILISLATGHR Unmodified 1235.7462 0.74623892 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 1 1 34.087 34.087 3 0.035388 29345 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.845 20.306 46139000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46139000 0 38245 845;1936 35674 343348;343349 436874;436875 436875 2 RILVATNLFGR Unmodified 1258.751 0.75098995 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;A0A140T9X3;H0Y400 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B no no 0 0 1 1 1 76.46 76.46 3 0.00011395 77473 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.525 61.494 65666000 0 0 0 0 0 0 0 17251000 0 0 48415000 0 0 38246 3027 35675 343350;343351 436876;436877;436878 436878 2 RIPEEILGK Unmodified 1053.6182 0.61824444 2395 P36507;G5E9C7 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 40.395 40.395 2 0.011843 37632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.986 49.731 348520000 57372000 58663000 0 54564000 0 0 0 49023000 0 0 58461000 0 70431000 38247 2395 35676 343352;343353;343354;343355;343356;343357;343358 436879;436880;436881;436882;436883;436884;436885;436886 436883 8 RIPEPELWLAVGPR Unmodified 1631.9148 0.91476081 3563 Q8N0W3;J3KSP6;J3KTP6 FUK L-fucose kinase yes no 0 0 1 1 1 110.57 110.57 3 0.0019909 115569 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.607 49.858 80716000 0 0 0 0 0 0 44163000 0 0 0 36553000 0 0 38248 3563 35677 343359;343360 436887;436888 436888 2 RIPIHNEDITYDELVLMMQR Unmodified 2485.2457 0.24574971 3751 Q92734;C9JJP5;C9JUE0;C9JTY3 TFG Protein TFG yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 122.37 122.37 4 8.2396E-07 126735 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.486 78.886 167690000 0 0 0 0 0 0 0 30567000 23974000 0 41834000 35392000 35919000 38249 3751 35678 343361;343362;343363;343364;343365 436889;436890;436891;436892;436893;436894 436894 4 RIPLAEWESR Unmodified 1255.6673 0.6673199 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 2 2 3 3 2 2 2 2 1 2 2 2 58.804 58.804 2;3 4.5119E-05 56238 QUIQUE_C1563_190116_001 104.22 90.412 7425700000 791370000 575100000 739200000 470390000 844350000 540150000 690240000 486990000 674980000 74330000 716190000 633020000 189360000 38250 2337 35679 343366;343367;343368;343369;343370;343371;343372;343373;343374;343375;343376;343377;343378;343379;343380;343381;343382;343383;343384;343385;343386;343387;343388;343389;343390;343391;343392 436895;436896;436897;436898;436899;436900;436901;436902;436903;436904;436905;436906;436907;436908;436909;436910;436911;436912;436913;436914;436915;436916;436917;436918;436919;436920;436921;436922;436923;436924;436925;436926;436927;436928;436929;436930;436931;436932;436933;436934;436935 436910 40 RIPLTICFPEYK Unmodified 1535.817 0.8170206 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 99.24 99.24 2;3 0.0013572 103211 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.034 45.039 98413000 0 0 0 0 0 0 27754000 0 0 0 41127000 29532000 0 38251 2142 35680 343393;343394;343395;343396;343397;343398 436936;436937;436938;436939;436940;436941;436942 436939 7 RIPQSTLSEFYPR Unmodified 1592.8311 0.83109076 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 0 1 3 2 4 1 2 3 1 4 4 1 76.58 76.58 2;3 0.00053608 78125 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.469 62.011 932790000 110450000 99290000 171330000 0 0 0 129740000 37843000 40740000 0 243340000 100060000 0 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chain;Tropomyosin beta chain no no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 59.915 59.915 2;3 2.4988E-09 58879 QUIQUE_DMIX3_190116_001 167.6 122.46 7625100000 486660000 900450000 820150000 615620000 383070000 512840000 642040000 473100000 870880000 274460000 219240000 557270000 869320000 + 38256 1260;1908;3424;435;2791;3271;557;3325;1019;1164;63 35685 343442;343443;343444;343445;343446;343447;343448;343449;343450;343451;343452;343453;343454;343455;343456;343457;343458;343459;343460;343461;343462;343463;343464;343465 436991;436992;436993;436994;436995;436996;436997;436998;436999;437000;437001;437002;437003;437004;437005;437006;437007;437008;437009;437010;437011;437012;437013;437014 437007 19 RIQLVEEELDRAQER Unmodified 1882.9861 0.98608786 63;3271;435;2791;1260;1019;1908;3424;1164;557;3325 J3KN67;K7EP68;P06753;Q6ZN40;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;A0A2R8YGX3;A0A2R8YEU4;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;Q5HYB6;CON__Q3SX28;A7XZE4;Q5TCU3;Q5TCU8;P07951;F5H7S3;B7Z596;H0YKJ4;H0YK48;A0A087WWU8;D6R904 TPM3;TPM4;TPM1;DKFZp686J1372;TPM2b;TPM2 Tropomyosin alpha-3 chain;Tropomyosin alpha-4 chain;Tropomyosin beta chain no no 0 0 2 1 63.629 63.629 3 0.0093042 62370 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.289 40.423 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 38257 1260;1908;3424;435;2791;3271;557;3325;1019;1164;63 35686 343466 437015 437015 1 RISAVSVAER Unmodified 1086.6146 0.61455605 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 19.397 19.397 3 0.0036353 11889 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.198 26.894 153680000 0 22680000 0 0 34567000 0 31759000 0 0 0 0 39415000 25263000 38258 2916 35687 343467;343468;343469;343470;343471 437016;437017;437018;437019;437020 437020 5 RISEQFTAMFR Unmodified 1384.6922 0.69215444 3030;4044;2797;1862;1922;3006 P04350;Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;Q13885;Q9BVA1 TUBB4A;TUBB;TUBB4B;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 2 3 1 3 2 2 80.341 80.341 2;3 1.528E-06 81783 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.36 103.92 6347500000 73788000 100700000 230270000 56974000 278750000 29413000 121220000 1327100000 766020000 15427000 1419600000 1001400000 926790000 38259 1862;1922;2797;3006;3030;4044 35688 343472;343473;343474;343475;343476;343477;343478;343479;343480;343481;343482;343483;343484;343485;343486;343487;343488;343489;343490;343491;343492;343493 437021;437022;437023;437024;437025;437026;437027;437028;437029;437030;437031;437032;437033;437034;437035;437036;437037;437038;437039;437040;437041;437042;437043;437044;437045;437046;437047;437048 437031 25 RISEQFTAMFR Oxidation (M) 1400.6871 0.68706906 3030;4044;2797;1862;1922;3006 P04350;Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371;Q13509;A0A0B4J269;Q13885;Q9BVA1 TUBB4A;TUBB;TUBB4B;TUBB3;TUBB2A;TUBB2B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 55.96 55.96 2;3 0.00023477 54999 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1 RIVAPPGGR Unmodified 921.55083 0.55083358 3051 Q14195;H0YBT4 DPYSL3 Dihydropyrimidinase-related protein 3 yes no 0 0 1 1 13.405 13.405 2 1.0576E-12 5394 QUIQUE_DMIX4_190116_001 181.74 80.987 41063000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41063000 0 0 0 38263 3051 35691 343509 437071 437071 1 RIVAVTGAEAQK Unmodified 1241.7092 0.70918471 2533 P49588;H3BPK7 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 2 2 2 2 16.943 16.943 2;3 0.00029369 9229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 124.42 65.989 1815700000 0 101400000 241440000 0 73543000 64928000 101850000 171530000 107890000 46272000 355570000 205910000 345370000 38264 2533 35692 343510;343511;343512;343513;343514;343515;343516;343517;343518;343519;343520;343521;343522;343523;343524;343525;343526 437072;437073;437074;437075;437076;437077;437078;437079;437080;437081;437082;437083;437084;437085;437086;437087;437088 437086 9 RIVITGDADIDHDQALAQAIK Unmodified 2262.1968 0.19680891 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 1 1 1 1 83.482 83.482 3 1.4892E-07 84630 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.725 81.967 136270000 0 0 0 29200000 27212000 0 24994000 30367000 0 0 0 0 24501000 38265 143;560;4559 35693 343527;343528;343529;343530;343531 437089;437090;437091;437092;437093;437094 437094 5 RIVSQLLTLMDGLK Unmodified 1585.9225 0.92254831 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 1 2 1 2 135.96 135.96 2;3 3.9317E-06 140550 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.53 92.229 1140100000 20210000 72780000 68254000 51843000 21183000 0 44449000 253860000 66746000 0 317930000 102600000 120260000 38266 2658 35694 343532;343533;343534;343535;343536;343537;343538;343539;343540;343541;343542;343543;343544;343545;343546;343547;343548 437095;437096;437097;437098;437099;437100;437101;437102;437103;437104;437105;437106;437107;437108;437109;437110;437111;437112;437113;437114 437108 16 RKDPEGTPYINHPIGVAR Unmodified 2019.065 0.065006878 3591 Q8N4P3;H0YNP9 HDDC3 Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1 yes no 0 0 2 1 1 30.863 30.863 4 0.0037613 25283 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.405 23.446 123600000 0 0 0 0 0 0 0 63174000 60423000 0 0 0 0 38267 3591 35695 343549;343550 437115;437116 437116 2 RKDPELWGSVLLESNPYR Unmodified 2158.1171 0.11710203 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 2 2 3 2 3 2 2 2 3 2 2 2 2 3 105.89 105.89 2;3;4 1.0812E-22 109175 QUIQUE_C1403_190116_001 143.39 130.68 8208900000 329750000 637180000 501300000 459970000 536930000 243160000 684230000 941900000 752070000 127420000 1100100000 911790000 983090000 38268 50 35696 343551;343552;343553;343554;343555;343556;343557;343558;343559;343560;343561;343562;343563;343564;343565;343566;343567;343568;343569;343570;343571;343572;343573;343574;343575;343576;343577;343578;343579;343580 437117;437118;437119;437120;437121;437122;437123;437124;437125;437126;437127;437128;437129;437130;437131;437132;437133;437134;437135;437136;437137;437138;437139;437140;437141;437142;437143;437144;437145;437146;437147;437148;437149;437150;437151;437152;437153;437154;437155;437156;437157;437158;437159;437160;437161;437162;437163;437164;437165;437166;437167;437168;437169;437170;437171;437172 437131 56 RKEDEVEEWQHR Unmodified 1639.7703 0.77028142 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 2 2 3 3 17.703 17.703 2;3;4 6.7315E-77 10586 QUIQUE_C1218_190116_001 229.29 209.94 15613000000 867090000 1009800000 798080000 1151000000 1726500000 761340000 911930000 1539700000 1768500000 449730000 1425700000 1038200000 2165100000 38269 859 35697 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B1, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 24.262 24.262 2;3;4 0.0015379 18491 QUIQUE_C1438_190116_001 92.939 66.504 523710000 0 0 0 0 53417000 0 0 0 60491000 0 33105000 294390000 82307000 38271 2230 35699 343619;343620;343621;343622;343623;343624 437213;437214;437215;437216;437217;437218 437213 6 RKEQEHMINWVEK Oxidation (M) 1741.857 0.85698794 2230 P24539;Q5QNZ2 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes no 0 1 2 1 15.908 15.908 4 0.029707 8286 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.941 31.405 50702000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50702000 0 38272 2230 35699 343625 437219 437219 1 RKEVTDEIVK Unmodified 1215.6823 0.68230126 2213 P23381 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes yes 0 0 2 1 14.091 14.091 3 0.015093 6326 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.76 49.323 73996000 0 0 0 0 0 0 0 73996000 0 0 0 0 0 38273 2213 35700 343626 437220 437220 1 RKGDEVDGVDEVAK Unmodified 1515.7529 0.75290002 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 2 1 1 18.844 18.844 3 0.014201 11249 QUIQUE_C1368_190116_001 55.354 40.004 140070000 58251000 0 81819000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38274 1974 35701 343627;343628 437221;437222 437222 2 RKLDLFANVVHVK Unmodified 1537.9093 0.9092815 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 1 1 55.649 55.649 4 0.00023412 55345 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.894 63.018 241010000 0 0 0 0 0 0 0 41090000 0 0 89734000 63482000 46703000 38275 86 35702 343629;343630;343631;343632 437223;437224;437225;437226;437227 437224 5 RKLEGDSTDLSDQIAELQAQIAELK Unmodified 2770.4349 0.43486693 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 2 1 143.78 143.78 4 0.0039045 148387 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.658 39.234 74700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74700000 0 38276 2378 35703 343633 437228 437228 0 RKPADLQNLAPGTHPPFITFNSEVK Unmodified 2776.466 0.4660479 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 2 1 1 1 88.119 88.119 4 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RKPDTIEVQQMK Oxidation (M) 1487.7766 0.77661235 859;2248;434 P26038;A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y7M3;E7EQR4;P15311 MSN;RDX;EZR Moesin;Radixin;Ezrin no no 0 1 2 1 1 10.5 10.5 3 0.0061756 2785 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.871 68.188 406150000 0 0 0 0 0 0 0 51736000 0 354420000 0 0 0 38279 2248;434;859 35705 343662;343663 437261;437262 437261 312 2 RKPEDVLDDDDAGSAPLK Unmodified 1939.9487 0.9486993 2383 P35613;A0A087WUV8 BSG Basigin yes no 0 0 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 48.047 48.047 2;3 6.4378E-18 45203 QUIQUE_C1368_190116_001 148.7 116.1 853420000 0 0 141250000 42449000 107290000 106670000 214020000 0 143970000 0 0 97764000 0 38280 2383 35706 343664;343665;343666;343667;343668;343669;343670;343671;343672;343673;343674;343675;343676 437263;437264;437265;437266;437267;437268;437269;437270;437271;437272;437273;437274;437275 437264 8 RKPQIICYPETGHYIEPPYFPLCR Unmodified 3033.4993 0.49933864 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 2 2 102.68 102.68 4;5 1.2046E-06 104520 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.381 40.744 134260000 0 0 0 0 0 0 0 134260000 0 0 0 0 0 38281 98;3487 35707 343677;343678 437276;437277 437276 1 RKPVEGYDISFLITNFHTEQMYK Oxidation (M) 2831.3953 0.39525072 1063 F8WCF6;P59998;R4GN08 ARPC4-TTLL3;ARPC4 Actin-related protein 2/3 complex subunit 4 yes no 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 109.13 109.13 3;4 3.913E-06 112273 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.705 65.662 989360000 0 53149000 64043000 0 0 0 0 115350000 201760000 0 169760000 253460000 131840000 38282 1063 35708 343679;343680;343681;343682;343683;343684;343685;343686;343687 437278;437279;437280;437281;437282;437283;437284;437285;437286 437280 626 9 RKPVLPALTINPTIAEGPSPTSEGASEANLVDLQK Unmodified 3612.9363 0.9362907 2395 P36507 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 116.07 116.07 3;4 1.1199E-28 121293 QUIQUE_C1218_190116_001 88.683 84.869 1012200000 35508000 0 0 121310000 0 0 0 196200000 160540000 47144000 159620000 0 291870000 38283 2395 35709 343688;343689;343690;343691;343692;343693;343694;343695;343696 437287;437288;437289;437290;437291;437292;437293;437294;437295;437296;437297;437298 437287 12 RKQEELQQLEQQR Unmodified 1711.8965 0.89654457 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 22.896 22.896 2;3 8.9642E-30 16201 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.54 139.95 1732500000 0 0 66385000 170370000 0 0 0 611780000 142610000 96785000 170460000 131450000 342690000 38284 3117 35710 343697;343698;343699;343700;343701;343702;343703;343704;343705;343706 437299;437300;437301;437302;437303;437304;437305;437306;437307;437308 437304 7 RKVDWLTEK Unmodified 1173.6506 0.6506072 2697;3055;2416 P38919;I3L3H2;P60842;J3KT12;J3QS69;J3KSZ0;J3QL43;J3KTN0;J3QL52;Q14240;E7EQG2 EIF4A3;EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-III;Eukaryotic initiation factor 4A-III, N-terminally processed;Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 2 1 21.958 21.958 3 0.018563 15321 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.282 41.895 143100000 0 0 0 0 0 0 0 0 143100000 0 0 0 0 38285 2416;2697;3055 35711 343707 437309 437309 1 RKWEAVHAAEQR Unmodified 1479.7695 0.76949356 280 A0A0G2JI36;A0A1W2PSE7;A0A0G2JIF2;A0A0G2JL56;P30455;P30443;A0A1W2PQD0 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-36 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-1 alpha chain yes no 0 0 2 1 2 12.707 12.707 3;4 0.015077 5111 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.189 39.819 33080000 0 0 0 0 0 0 0 0 13004000 0 0 20076000 0 38286 280 35712 343708;343709;343710 437310;437311;437312 437310 3 RLAEDDKDGVMAHK Unmodified 1583.7726 0.77258961 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 2 1 11.231 11.231 4 0.019396 3510 QUIQUE_DMIX5_190116_001 30.894 26.346 7647300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7647300 0 0 38287 1414;3777 35713 343711 437313 437313 1 RLAEDEAFQR Unmodified 1233.6102 0.61019895 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 2 1 1 2 1 25.335 25.335 2;3 0.0010543 19381 QUIQUE_DMIX5_190116_001 125.7 80.617 968710000 0 65837000 124140000 0 0 0 67430000 0 169170000 0 443710000 98424000 0 38288 3117 35714 343712;343713;343714;343715;343716;343717;343718;343719 437314;437315;437316;437317;437318;437319;437320;437321;437322 437321 7 RLAGGDWFTSR Unmodified 1264.6313 0.63126874 2309 P30153;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 60.11 60.11 3 0.0029158 59226 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.955 31.326 232390000 0 0 0 0 0 0 0 51187000 29091000 0 55990000 46728000 49392000 38289 2309 35715 343720;343721;343722;343723;343724 437323;437324;437325;437326;437327;437328 437325 6 RLAGQFLEELR Unmodified 1330.7357 0.73573382 743 C9JTE0;Q16653;A0A0G2JHM8;A0A0G2JHB7;A0A1W2PQ17 MOG Myelin-oligodendrocyte glycoprotein yes no 0 0 1 1 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2 3 4 4 2 3 2 4 2 3 88.639 88.639 2;3;4 2.8051E-54 91459 QUIQUE_C1576_190116_001 167.82 149.72 6581800000 850450000 278760000 779210000 710840000 185450000 585500000 728940000 87294000 541750000 268630000 153350000 579780000 831830000 38317 267;275;3025 35743 343899;343900;343901;343902;343903;343904;343905;343906;343907;343908;343909;343910;343911;343912;343913;343914;343915;343916;343917;343918;343919;343920;343921;343922;343923;343924;343925;343926;343927;343928;343929;343930;343931;343932;343933;343934;343935;343936;343937;343938 437516;437517;437518;437519;437520;437521;437522;437523;437524;437525;437526;437527;437528;437529;437530;437531;437532;437533;437534;437535;437536;437537;437538;437539;437540;437541;437542;437543;437544;437545;437546;437547;437548;437549;437550;437551;437552;437553;437554;437555;437556;437557;437558;437559;437560;437561;437562;437563;437564;437565;437566;437567;437568;437569;437570;437571;437572;437573;437574;437575;437576;437577;437578 437554 62 RLEAELAAHEPAIQGVLDTGKK Unmodified 2345.2703 0.27030821 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 2 3 2 3 2 3 2 3 3 2 1 2 2 5 75.972 75.972 3;4 1.7471E-35 76517 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.93 136.43 10293000000 633240000 845710000 734790000 474620000 940870000 550530000 808610000 965480000 982600000 271140000 905430000 898060000 1281700000 38318 267;275;3025 35744 343939;343940;343941;343942;343943;343944;343945;343946;343947;343948;343949;343950;343951;343952;343953;343954;343955;343956;343957;343958;343959;343960;343961;343962;343963;343964;343965;343966;343967;343968;343969;343970;343971 437579;437580;437581;437582;437583;437584;437585;437586;437587;437588;437589;437590;437591;437592;437593;437594;437595;437596;437597;437598;437599;437600;437601;437602;437603;437604;437605;437606;437607;437608;437609;437610;437611;437612;437613;437614;437615;437616;437617;437618;437619;437620;437621;437622;437623;437624;437625;437626;437627;437628;437629;437630;437631;437632;437633;437634;437635;437636;437637;437638;437639;437640;437641;437642;437643;437644;437645;437646;437647;437648;437649 437626 65 RLEAFLTQK Unmodified 1104.6291 0.62914348 2395;2875 Q02750;P36507;A0A1B0GUL7 MAP2K1;MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1;Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 40.582 40.582 2 0.0086601 36931 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.731 33.876 1412100000 0 0 241600000 0 324540000 0 0 315110000 0 73982000 0 0 456860000 38319 2875;2395 35745 343972;343973;343974;343975;343976 437650;437651;437652;437653;437654 437653 5 RLEAGDHPVELLAR Unmodified 1574.8529 0.85288884 1964 P09486;F5GY03 SPARC SPARC yes no 0 0 1 1 44.905 44.905 3 0.0057662 42123 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.112 37.165 118940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 118940000 38320 1964 35746 343977 437655 437655 1 RLEASDGGLDSAELAAELGMEHQAVVGAVK Unmodified 3022.503 0.50296327 4547 Q9Y285;K7ER00;K7EPH2;K7ER16;K7EK06 FARSA Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 3 2 2 1 2 2 2 118.34 118.34 3;4 1.5939E-137 123844 QUIQUE_C1218_190116_001 194.26 169.05 1408200000 48619000 178120000 140780000 106470000 93138000 108070000 60563000 142760000 63474000 0 194420000 148930000 122880000 38321 4547 35747 343978;343979;343980;343981;343982;343983;343984;343985;343986;343987;343988;343989;343990;343991;343992;343993;343994;343995;343996;343997;343998;343999;344000 437656;437657;437658;437659;437660;437661;437662;437663;437664;437665;437666;437667;437668;437669;437670;437671;437672;437673;437674;437675;437676;437677;437678;437679;437680;437681 437656 25 RLEAYLAR Unmodified 990.56106 0.56106391 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 1 1 1 1 29.364 29.364 2 0.058466 23783 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.828 13.761 534930000 0 0 0 0 0 0 182220000 0 0 0 132380000 0 220330000 38322 2515 35748 344001;344002;344003 437682;437683;437684;437685 437683 4 RLEDLSESIVNDFAYMK Unmodified 2028.9826 0.98264196 2542 P49755 TMED10 Transmembrane emp24 domain-containing protein 10 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 2 142.22 142.22 2;3 8.8259E-05 147075 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.61 89.013 330740000 0 30839000 0 0 0 0 50373000 21023000 116550000 0 0 111960000 0 38323 2542 35749 344004;344005;344006;344007;344008;344009;344010 437686;437687;437688;437689;437690;437691;437692;437693 437689 6 RLEEAALR Unmodified 956.54033 0.54032847 3794 Q96A33;A0A087WYW6 CCDC47 Coiled-coil domain-containing protein 47 yes no 0 0 1 1 1 17.871 17.871 2 0.055492 10135 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.104 14.661 43640000 0 0 0 0 0 0 0 24157000 0 19483000 0 0 0 38324 3794 35750 344011;344012 437694;437695 437695 2 RLEEAPLVTK Unmodified 1154.6659 0.66592292 4082 Q9BZE9;J3KRY8;J3QR12 ASPSCR1 Tether containing UBX domain for GLUT4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 25.861 25.861 2 0.017945 19679 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.299 29.904 105400000 0 16103000 0 14446000 0 0 0 16289000 17131000 0 17323000 0 24107000 38325 4082 35751 344013;344014;344015;344016;344017;344018 437696;437697;437698;437699;437700;437701 437700 6 RLEEASLLHQFQADADDIDAWMLDILK Oxidation (M) 3171.5547 0.55466449 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 162.74 162.74 3;4 2.8041E-44 165090 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.57 125.73 942790000 0 40377000 46423000 18245000 0 0 94667000 82794000 441530000 0 0 142420000 76337000 38326 2851 35752 344019;344020;344021;344022;344023;344024;344025;344026;344027;344028 437702;437703;437704;437705;437706;437707;437708;437709;437710;437711;437712 437707 2308 9 RLEEESAQLK Unmodified 1201.6303 0.63026569 4596 Q9Y3P9 RABGAP1 Rab GTPase-activating protein 1 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437755;437756;437757;437758;437759;437760 437758 5 RLEEPSLR Unmodified 998.55089 0.55089316 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.254 23.254 2 0.001117 17184 QUIQUE_C1218_190116_001 149.65 22.089 1648200000 146700000 0 163160000 123310000 159240000 105250000 171250000 105570000 135090000 57808000 163980000 152060000 164790000 38332 1108;1404 35758 344068;344069;344070;344071;344072;344073;344074;344075;344076;344077;344078;344079 437761;437762;437763;437764;437765;437766;437767;437768;437769;437770;437771;437772;437773;437774 437762 13 RLEESDVLQEAR Unmodified 1443.7318 0.73177065 1535 O43615;M0QXU7;M0R301;M0R124 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 1 1 1 1 44.363 44.363 2 0.00027718 41475 QUIQUE_DMIX8_190116_001 118.9 61.558 40863000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40863000 38333 1535 35759 344080;344081;344082 437775;437776;437777 437777 3 RLEFLYDK Unmodified 1082.576 0.57604528 821 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RLEMYGIR Unmodified 1036.5488 0.54878467 734;357 A0A1B0GV68;M0R262;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.448 40.448 2 0.0053287 36308 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.94 76.954 823430000 0 62351000 88595000 89849000 70248000 76494000 140270000 34757000 0 0 106740000 73303000 80822000 38339 357;734 35765 344119;344120;344121;344122;344123;344124;344125;344126;344127;344128;344129 437815;437816;437817;437818;437819;437820;437821;437822;437823;437824;437825;437826;437827;437828 437828 14 RLENNHAQLLR Unmodified 1362.748 0.74802984 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.936 15.936 3 0.00024307 7943 QUIQUE_C1403_190116_001 92.866 77.327 793880000 47733000 68099000 34704000 88419000 0 43003000 72750000 62608000 78811000 32086000 99912000 85951000 79808000 38340 1751 35766 344130;344131;344132;344133;344134;344135;344136;344137;344138;344139;344140;344141 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2513.2591 0.25907482 2257 P26992;Q5T8H6 CNTFR Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 137.62 137.62 3 9.7209E-05 140799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.303 55.027 106200000 0 0 0 0 0 0 0 52276000 53920000 0 0 0 0 38346 2257 35772 344200;344201 437907;437908 437907 2 RLFAQLAGDDMEVSATELMNILNK Unmodified 2678.3408 0.34077231 247 A0A0C4DGQ5;P04632;K7ELJ7;A0A075B7C0;U3KQE2;K7EM73;K7EIV0 CAPNS1 Calpain small subunit 1 yes no 0 0 1 1 165.04 165.04 3 1.1244E-11 172351 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.79 81.169 114110000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 114110000 0 0 38347 247 35773 344202 437909;437910 437909 2 RLFEQNVQR Unmodified 1188.6364 0.63635412 2710 P61081;M0QX69 UBE2M NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 yes no 0 0 1 1 22.239 22.239 2 0.048804 15570 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.425 32.404 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38348 2710 35774 344203 437911 437911 1 RLFFWMQEPK Unmodified 1380.7013 0.70126256 3172 Q16186 ADRM1 Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 yes yes 0 0 1 1 1 1 103.74 103.74 3 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437915;437916;437917;437918;437919;437920;437921;437922;437923;437924;437925;437926;437927;437928;437929;437930;437931;437932;437933;437934;437935;437936;437937;437938;437939;437940;437941;437942;437943;437944;437945;437946;437947;437948;437949;437950;437951;437952;437953;437954 437948 38 RLFTNFHR Unmodified 1089.5832 0.58319634 2842 Q00169;F5GWE5;I3L4H1 PITPNA Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 22.728 22.728 3 0.003945 15992 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.738 0 1136000000 0 0 0 0 0 0 0 180210000 171650000 0 303340000 261560000 219270000 38351 2842 35777 344236;344237;344238;344239;344240 437955;437956;437957;437958;437959 437958 4 RLGANSGLHIIIFDEIDAICK Unmodified 2354.2417 0.24165062 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 131.54 131.54 4 0.0040707 135820 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.72 24.918 25096000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25096000 0 38352 1245 35778 344241 437960 437960 1 RLGAPQQPGPGPPPSR Unmodified 1610.8641 0.86412223 3827 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yes 0 0 1 1 1 21.491 21.491 3 0.054922 14725 QUIQUE_C1438_190116_001 44.863 22.871 22123000 0 22123000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38356 1472 35782 344249;344250 437969;437970 437970 2 RLGLDEFNFIK Unmodified 1350.7296 0.7295858 2868 Q02156;E9PBI2 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes no 0 0 1 1 1 1 107.7 107.7 3 0.0013371 110169 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.784 43.201 21449000 10570000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10879000 0 38357 2868 35783 344251;344252;344253 437971;437972;437973;437974 437973 4 RLGLSTLGELK Unmodified 1185.7081 0.70812208 80 A0A087WYR3;O43399;A0A087WZ51 TPD52L2 Tumor protein D54 yes no 0 0 1 1 65.766 65.766 3 0.032953 65629 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.447 23.491 11489000 0 0 0 0 0 0 0 0 11489000 0 0 0 0 38358 80 35784 344254 437975 437975 1 RLGMFNIQHCK Oxidation (M) 1418.6911 0.69110858 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 1 1 1 1 22.217 22.217 3 0.011543 15184 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.466 37.774 79144000 0 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 1362.7871 0.78710068 2856;1255;902;2953 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651;Q12955 ANK2;ANK3 Ankyrin-2;Ankyrin-3 no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 81.66 81.66 2;3 0.00061709 83425 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.479 15.909 628810000 0 0 46439000 0 35342000 0 49745000 186460000 90430000 21031000 66191000 64533000 68640000 38363 902;1255;2856;2953 35788 344264;344265;344266;344267;344268;344269;344270;344271;344272;344273 437986;437987;437988;437989;437990;437991;437992;437993;437994;437995;437996 437994 7 RLHPDPFLR Unmodified 1149.6407 0.64071122 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 28.975 28.975 3 0.046578 23725 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.269 11.915 26602000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26602000 0 0 38364 3684 35789 344274 437997 437997 1 RLHVSNIPFR Unmodified 1237.7044 0.70437411 122 A0A0G2JSB3;I3L1D4;B0QYY7;S4R469;F8VR27;F8VZY7;B0QYV1;B0QYY4;A0A087X2B1;A0A0G2JRA5;J3KNW3;B7Z1U7;F8VZG9;A0A286YEU2;O43251;Q9NWB1;B0QYY6;A0A3B3ITL7;J3QQZ2;J3QRF4;F8VRS4;A6NFN3 RBFOX1;RBFOX2;RBFOX3 RNA binding protein fox-1 homolog;RNA binding protein fox-1 homolog 2;RNA binding protein fox-1 homolog 1;RNA binding protein fox-1 homolog 3 yes no 0 0 1 1 1 34.72 34.72 3 0.0048914 31114 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.334 34.758 71715000 0 0 0 0 0 0 0 30922000 0 0 40793000 0 0 38365 122 35790 344275;344276 437998;437999 437998 2 RLIELYK Unmodified 933.56475 0.56475231 2409 P37837;F2Z393 TALDO1 Transaldolase yes no 0 0 1 1 36.84 36.84 2 0.058946 32790 QUIQUE_C1368_190116_001 83.364 2.0669 303790000 0 0 303790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38366 2409 35791 344277 438000 438000 1 RLIFSTITSK Unmodified 1164.6867 0.68665836 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory subunit 6B yes yes 0 0 1 1 52.111 52.111 2 0.022442 49534 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.04 38.481 39203000 0 0 0 0 0 0 0 39203000 0 0 0 0 0 38367 2466 35792 344278 438001 438001 1 RLKPFGVQR Unmodified 1099.6614 0.66144666 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 2 1 1 1 1 16.123 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1132.6968 0.69682911 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 1 1 56.52 56.52 2 0.059567 55921 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.066 19.837 20947000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20947000 0 0 38371 1645 35796 344297 438021 438021 1 RLLLQLEATK Unmodified 1183.7289 0.72885752 3011 Q13561;F8W1I6;H0YI98;F8VW18 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 55.043 55.043 2 0.021861 54190 QUIQUE_C1438_190116_001 88.37 61.58 357690000 0 0 0 0 110020000 0 0 0 114900000 0 0 132770000 0 38372 3011 35797 344298;344299;344300 438022;438023;438024 438022 0 RLNDFASTVR Unmodified 1177.6204 0.62036971 2170 P20674;H3BNX8;H3BRM5;H3BV69 COX5A Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 2 2 2 2 32.121 32.121 2;3 0.0050009 28292 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.03 59.818 2812900000 60905000 333990000 66849000 0 280550000 0 308810000 81040000 375790000 0 550970000 359890000 394100000 38373 2170 35798 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Unmodified 1095.64 0.64004252 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 1 1 45.488 45.488 2 0.061444 40198 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.102 29.936 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38381 289 35806 344355 438080 438080 1 RLPEAIEEVK Unmodified 1182.6608 0.66083754 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 40.078 40.078 2;3 0.00029256 36780 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.22 76.625 3177000000 218930000 210100000 364340000 212800000 214550000 198120000 259650000 208800000 294560000 132110000 324170000 223040000 315850000 38382 4405 35807 344356;344357;344358;344359;344360;344361;344362;344363;344364;344365;344366;344367;344368;344369;344370 438081;438082;438083;438084;438085;438086;438087;438088;438089;438090;438091;438092;438093;438094;438095;438096;438097;438098;438099;438100;438101;438102;438103;438104;438105 438093 24 RLPENLYNDR Unmodified 1288.6524 0.65239812 2085 P14927;B7Z2R2;E5RHG9 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438226;438227;438228;438229;438230;438231 438226 5 RLQCPFEQELLR Unmodified 1587.8191 0.81914587 1766 O95990;C9JAU5 FAM107A Protein FAM107A yes no 0 0 1 1 37.567 37.567 3 0.046937 33402 QUIQUE_C1218_190116_001 32.062 11.109 32190000 32190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38395 1766 35820 344458 438232 438232 1 RLQDFLR Unmodified 946.53485 0.53484916 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.835 49.835 2 0.026277 48124 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.57 38.305 671540000 71496000 95282000 67273000 44632000 81551000 39884000 73388000 63756000 53026000 0 0 0 81248000 38396 1472 35821 344459;344460;344461;344462;344463;344464;344465;344466;344467;344468 438233;438234;438235;438236;438237;438238;438239;438240;438241;438242;438243 438241 11 RLQEDKEQMAQQLAEETQGFQR Unmodified 2662.2769 0.2769265 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 2 1 2 2 1 1 84.046 84.046 3;4 4.0772E-45 85193 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.02 119.37 1071000000 0 0 73371000 0 0 0 0 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ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 19.602 19.602 2;3 4.8999E-22 12315 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.1 144.13 169960000000 16308000000 0 20575000000 21289000000 17524000000 13221000000 19008000000 6632100000 9319100000 4804500000 15410000000 13083000000 12789000000 38405 1851 35829 344517;344518;344519;344520;344521;344522;344523;344524;344525;344526;344527;344528;344529;344530;344531;344532;344533;344534;344535;344536;344537;344538 438296;438297;438298;438299;438300;438301;438302;438303;438304;438305;438306;438307;438308;438309;438310;438311;438312;438313;438314;438315;438316;438317 438309 22 RLQSIGTENTEENRR Unmodified 1801.9031 0.90308651 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 2 2 3 2 2 3 3 2 3 2 1 1 3 2 14.863 14.863 2;3;4 8.0734E-28 7107 QUIQUE_DMIX3_190116_001 139.6 115.07 63129000000 2839500000 7223400000 452320000 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Unmodified 1603.8431 0.84305243 3591 Q8N4P3;H0YNP9;H0YKT9 HDDC3 Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1 yes no 0 0 1 1 14.007 14.007 3 0.0016959 6174 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.883 33.5 13810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13810000 0 38408 3591 35832 344575 438355 438355 1 RLSEDYGVLK Unmodified 1178.6295 0.62953741 2346 P32119;A6NIW5 PRDX2 Peroxiredoxin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 38.23 38.23 2;3 4.5119E-05 33636 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.22 76.017 3828200000 109260000 0 142290000 112410000 169410000 103710000 1955600000 175980000 160550000 280350000 239770000 184380000 194440000 38409 2346 35833 344576;344577;344578;344579;344580;344581;344582;344583;344584;344585;344586;344587;344588;344589 438356;438357;438358;438359;438360;438361;438362;438363;438364;438365;438366;438367;438368;438369;438370;438371;438372;438373 438373 13 RLSLESEGAGEGAAASPELSALEEAFR Unmodified 2746.341 0.34096655 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.42 138.42 3 4.334E-15 143909 QUIQUE_C1576_190116_001 79.512 73.008 945340000 134750000 202700000 199690000 127560000 0 99838000 180800000 0 0 0 0 0 0 38410 1687 35834 344590;344591;344592;344593;344594;344595 438374;438375;438376;438377;438378;438379 438379 6 RLSLESEGAGEGAAASPELSALEEAFRR Unmodified 2902.4421 0.44207757 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 126.22 126.22 4 2.3491E-15 130725 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.089 75.726 356180000 0 0 0 0 0 0 0 116860000 61219000 0 56676000 53599000 67830000 38411 1687 35835 344596;344597;344598;344599;344600 438380;438381;438382;438383;438384;438385;438386 438381 6 RLSNVSSSGSINLLESPQLATLAEDVTAALAK Unmodified 3254.7358 0.73579998 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 168.06 168.06 3;4 4.8252E-197 172150 QUIQUE_DMIX7_190116_001 216.8 206.83 1451900000 0 90812000 0 71717000 0 0 0 409510000 144490000 0 89439000 385140000 260840000 38412 2009 35836 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19.793 19.793 2;3;4 5.7912E-18 12806 QUIQUE_DMIX3_190116_001 138.91 114.71 26221000000 1458300000 2454800000 2540900000 2458300000 193920000 1713600000 1640200000 4201500000 3215500000 547160000 302230000 269110000 5225000000 38414 1978 35838 344626;344627;344628;344629;344630;344631;344632;344633;344634;344635;344636;344637;344638;344639;344640;344641;344642;344643;344644;344645;344646;344647;344648;344649;344650;344651;344652 438412;438413;438414;438415;438416;438417;438418;438419;438420;438421;438422;438423;438424;438425;438426;438427;438428;438429;438430;438431;438432;438433;438434;438435;438436;438437;438438;438439 438433 23 RLSVEIWDWDR Unmodified 1473.7365 0.7364621 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.96 112.96 3 0.010437 116838 QUIQUE_C1368_190116_001 40.066 28.804 295890000 0 23570000 22294000 0 9778000 12296000 37764000 31705000 29478000 13087000 52378000 37684000 25856000 38415 2121 35839 344653;344654;344655;344656;344657;344658;344659;344660;344661;344662;344663 438440;438441;438442;438443;438444;438445;438446;438447;438448;438449;438450 438441 11 RLSVEVWDWDR Unmodified 1459.7208 0.72081203 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.51 102.51 3 0.0011046 105203 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.924 54.619 104050000 0 13263000 14017000 0 0 0 13758000 0 12812000 0 11705000 24321000 14179000 38416 1877 35840 344664;344665;344666;344667;344668;344669;344670 438451;438452;438453;438454;438455;438456;438457 438456 7 RLTAEDLFEAR Unmodified 1319.6834 0.68336389 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 75.318 75.318 3 3.1076E-07 76323 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.42 122.49 680110000 41805000 0 56237000 0 67024000 0 59811000 119300000 91648000 34211000 81271000 67692000 61108000 38417 3117 35841 344671;344672;344673;344674;344675;344676;344677;344678;344679;344680;344681;344682;344683;344684;344685 438458;438459;438460;438461;438462;438463;438464;438465;438466;438467;438468;438469;438470;438471;438472;438473;438474;438475;438476;438477;438478;438479;438480;438481 438474 23 RLTDADAMK Unmodified 1019.507 0.50697943 2243 P25705;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 1 1 15.61 15.61 2 0.015166 7636 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.376 20.219 158810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 158810000 0 0 0 38418 2243 35842 344686 438482 438482 1 RLTELETAVR Unmodified 1186.667 0.66698555 3011 Q13561;F8W1I6;H0YI98;F8VW18;F8VRV7 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.899 34.899 2;3 0.0098298 31267 QUIQUE_C1218_190116_001 53.237 20.149 162420000 0 0 0 66813000 21515000 17625000 0 34572000 0 0 21892000 0 0 38419 3011 35843 344687;344688;344689;344690;344691;344692;344693 438483;438484;438485;438486;438487;438488;438489 438483 5 RLTGFHETSNINDFSAGVANR Unmodified 2305.12 0.11995557 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 1 3 3 3 2 3 2 3 4 4 2 4 3 3 66.056 66.056 2;3;4 2.0565E-113 64227 QUIQUE_DMIX8_190116_001 257.35 235.03 28326000000 611380000 1063600000 1404200000 1190500000 779440000 591390000 2068400000 3121500000 2761700000 175500000 5792600000 1915000000 6851400000 38420 2086 35844 344694;344695;344696;344697;344698;344699;344700;344701;344702;344703;344704;344705;344706;344707;344708;344709;344710;344711;344712;344713;344714;344715;344716;344717;344718;344719;344720;344721;344722;344723;344724;344725;344726;344727;344728;344729;344730;344731;344732 438490;438491;438492;438493;438494;438495;438496;438497;438498;438499;438500;438501;438502;438503;438504;438505;438506;438507;438508;438509;438510;438511;438512;438513;438514;438515;438516;438517;438518;438519;438520;438521;438522;438523;438524;438525;438526;438527;438528;438529;438530;438531;438532;438533;438534;438535;438536;438537;438538;438539;438540;438541;438542;438543;438544 438544 52 RLTLEHIQK Unmodified 1136.6666 0.66659162 3538 Q8IWQ3 BRSK2 Serine/threonine-protein kinase 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alpha-1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 1 1 1 19.042 19.042 2 0.04872 11920 QUIQUE_C1218_190116_001 53.517 34.538 44946000 16420000 0 0 0 0 0 0 0 28526000 0 0 0 0 38479 1872;1371;590 35900 345137;345138 439019;439020 439019 2 RNVIFQPVAELK Unmodified 1412.814 0.81398414 2861 Q01813;B1APP8;H0Y757 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 1 1 69.305 69.305 2 0.0073506 69476 QUIQUE_C1218_190116_001 62.005 26.061 24523000 24523000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38480 2861 35901 345139 439021 439021 1 RPAEDMEEEQAFK Oxidation (M) 1594.6933 0.69333623 2735;3319 P61978;S4R457;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 1 1 1 1 1 22.652 22.652 2;3 0.0010386 15855 QUIQUE_C1218_190116_001 99.752 60.13 126840000 47348000 24884000 0 0 0 0 0 0 0 54613000 0 0 0 38481 2735;3319 35902 345140;345141;345142 439022;439023;439024 439022 2169 3 RPAEDMEEEQAFK Unmodified 1578.6984 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GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 1 1 1 15.755 15.755 2 0.046 7967 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.351 45.051 111840000 0 0 0 0 0 0 0 0 45051000 0 0 66792000 0 38488 245 35907 345246;345247 439170;439171 439171 2 RPANQFVPR Unmodified 1083.5938 0.59376103 2790 P67870;Q5SRQ6 CSNK2B Casein kinase II subunit beta yes no 0 0 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 18.13 18.13 2;3 0.00015553 10528 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.143 78.477 3639300000 370570000 399590000 135290000 293720000 371230000 305950000 177920000 323460000 316290000 37968000 455300000 256980000 195050000 38489 2790 35908 345248;345249;345250;345251;345252;345253;345254;345255;345256;345257;345258;345259;345260;345261;345262;345263;345264;345265;345266;345267;345268;345269;345270 439172;439173;439174;439175;439176;439177;439178;439179;439180;439181;439182;439183;439184;439185;439186;439187;439188;439189;439190;439191;439192;439193;439194;439195;439196;439197 439192 24 RPAPQPASGANIPK Unmodified 1402.7681 0.76809658 1690 O94830 DDHD2 Phospholipase DDHD2 yes yes 0 0 1 1 2 18.923 18.923 2;3 0.0080167 11613 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.624 27.681 122930000 0 0 0 0 0 0 0 0 32345000 0 90588000 0 0 38490 1690 35909 345271;345272;345273 439198;439199;439200 439199 3 RPAQPHRPSPASSLQR Unmodified 1783.9554 0.95539685 1121 H0Y507;Q5TCZ1 SH3PXD2A SH3 and PX domain-containing protein 2A yes no 0 0 2 1 13.376 13.376 4 0.0045375 5605 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.522 43.726 3789800 0 0 0 0 0 0 0 3789800 0 0 0 0 0 38491 1121 35910 345274 439201 439201 1 RPASTAGLPTAGLPTATGLPSGAPPGVATIR Unmodified 2854.5665 0.56649023 67 A0A087WXN9;Q765P7 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.38 107.38 3 3.9247E-14 110407 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.771 66.819 532490000 0 0 0 53133000 33711000 38619000 0 99613000 85051000 19041000 52344000 50616000 100360000 38492 67 35911 345275;345276;345277;345278;345279;345280;345281;345282;345283 439202;439203;439204;439205;439206;439207;439208;439209;439210;439211;439212;439213;439214 439206 13 RPASVSSSAAVEHEQR Unmodified 1709.8445 0.844509 3465 Q7Z5L9 IRF2BP2 Interferon regulatory factor 2-binding protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.729 10.729 3 1.4822E-07 3127 QUIQUE_C1403_190116_001 102.36 90.568 165220000 5331800 0 12718000 14897000 22163000 0 7774500 14862000 27304000 4849700 15537000 14870000 24910000 38493 3465 35912 345284;345285;345286;345287;345288;345289;345290;345291;345292;345293;345294 439215;439216;439217;439218;439219;439220;439221;439222;439223;439224;439225 439217 11 RPAVYIDEEALAR Unmodified 1501.7889 0.7888916 1718 O95278 EPM2A Laforin yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 60.417 60.417 2;3 0.00037404 60650 QUIQUE_C1218_190116_001 79.875 68.401 749670000 48997000 0 52897000 59549000 43427000 36734000 114570000 0 98823000 31879000 80435000 39966000 142400000 38494 1718 35913 345295;345296;345297;345298;345299;345300;345301;345302;345303;345304;345305;345306;345307;345308;345309;345310;345311 439226;439227;439228;439229;439230;439231;439232;439233;439234;439235;439236;439237;439238;439239;439240;439241;439242 439226 15 RPCFSALEVDETYVPK Unmodified 1909.9244 0.9243988 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;A0A087WWT3;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 3 90.436 90.436 2;3 5.152E-44 92343 QUIQUE_DMIX1_190116_001 208.28 184.6 44291000000 3949500000 3797800000 2001600000 4672100000 7922500000 3235300000 3333200000 854250000 2690500000 511800000 3605500000 3423100000 4293700000 + 38495 769 35914 345312;345313;345314;345315;345316;345317;345318;345319;345320;345321;345322;345323;345324;345325;345326;345327;345328;345329;345330;345331;345332;345333;345334;345335;345336;345337;345338;345339 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439751;439752;439753;439754;439755;439756;439757;439758;439759;439760;439761;439762;439763;439764;439765;439766 439754 15 RPGEEGTVMSLAGK Unmodified 1430.7188 0.71876312 1769 O96008;K7EKG4 TOMM40 Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 42.878 42.878 2;3 6.1661E-05 39383 QUIQUE_C1403_190116_001 81.448 70.97 474830000 55094000 49422000 46646000 58256000 27287000 44549000 0 86345000 0 0 0 60802000 46428000 38525 1769 35943 345631;345632;345633;345634;345635;345636;345637;345638;345639;345640;345641;345642;345643;345644 439767;439768;439769;439770;439771;439772;439773;439774;439775;439776;439777;439778;439779;439780;439781;439782;439783;439784 439772 16 RPGGPSNVLR Unmodified 1051.5887 0.58867565 3331 Q5VIR6;I3L184 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.938 14.938 3 0.00078446 7621 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.882 56.564 153430000 27171000 28769000 16738000 0 0 32797000 0 19678000 0 8869400 0 0 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Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 1 28.628 28.628 2;3 2.7327E-08 23458 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.52 97.282 3755600000 296760000 132090000 105760000 125700000 99586000 230240000 137920000 373840000 527230000 264870000 749460000 475460000 236730000 38538 50 35955 345731;345732;345733;345734;345735;345736;345737;345738;345739;345740;345741;345742;345743;345744;345745;345746;345747;345748;345749;345750 439889;439890;439891;439892;439893;439894;439895;439896;439897;439898;439899;439900;439901;439902;439903;439904;439905;439906;439907;439908;439909;439910;439911;439912;439913;439914;439915;439916;439917;439918;439919;439920 439908 40 32 RPISADSAIMNPASK Unmodified 1556.7981 0.79807608 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;J3KSQ2;J3QL20 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 39.304 39.304 2;3 5.8879E-44 36033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 184.1 141.76 7932000000 817510000 853650000 707600000 704830000 625240000 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439978;439979;439980;439981;439982;439983;439984;439985;439986;439987;439988;439989;439990;439991;439992;439993;439994;439995;439996;439997 439991 19 RPLEQQQPHHIPTSAPVYQQPQQQPVAQSYGGYK Unmodified 3884.9347 0.93466799 3087 Q14847;C9J9W2;J3KSN1 LASP1 LIM and SH3 domain protein 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 59.201 59.201 4;5 1.508E-75 57445 QUIQUE_C1368_190116_001 146.83 139.22 1441300000 0 209960000 235360000 351440000 195300000 90134000 0 47744000 45216000 104280000 0 0 161830000 38543 3087 35959 345811;345812;345813;345814;345815;345816;345817;345818;345819;345820;345821;345822;345823;345824;345825 439998;439999;440000;440001;440002;440003;440004;440005;440006;440007;440008;440009;440010;440011;440012;440013;440014 440002 15 RPLFLAPDFDR Unmodified 1345.7143 0.71427009 4363 Q9P035;H3BS72;H3BPZ1 HACD3 Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 86.897 86.897 2;3 0.0035552 88479 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.207 39.836 876920000 91931000 94668000 0 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440345;440346;440347;440348;440349;440350;440351;440352;440353;440354 440354 10 RPNQALLENIALYLTHMLK Unmodified 2237.2354 0.23544303 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 158.04 158.04 3 8.3296E-06 165334 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.993 85.038 168500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86472000 82023000 0 38563 617 35978 346084;346085 440355;440356 440355 2 RPPASDGLDLSQAAAR Unmodified 1623.8329 0.83288168 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 1 3 4 5 4 4 4 3 5 8 4 5 3 5 46.656 46.656 2;3 3.8775E-44 42379 QUIQUE_DMIX5_190116_001 190.37 146.16 4313400000 384440000 362980000 347600000 345640000 259820000 308440000 353830000 469520000 510190000 181610000 321700000 124970000 342700000 38564 3176 35979 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P09429;Q5T7C4 HMGB1 High mobility group protein B1 yes no 0 0 2 1 2 2 2 2 1 1 93.766 93.766 3;4 0.00021592 96217 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.163 91.059 3898500000 53954000 0 0 0 0 0 0 615990000 877610000 115700000 881630000 771020000 582620000 38570 1960 35985 346176;346177;346178;346179;346180;346181;346182;346183;346184;346185;346186 440510;440511;440512;440513;440514;440515;440516;440517;440518;440519;440520 440517 8 RPPSPIKFDLNEPLHLSFLQNAAK Unmodified 2731.481 0.48096968 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 2 1 116.46 116.46 4 0.00011795 122561 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.961 42.457 83278000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 83278000 0 0 38571 514 35986 346187 440521 440521 1 RPPTPGPDTSVSGPR Unmodified 1519.7743 0.77430417 4177 Q9H6K5 PRR36 Proline-rich protein 36 yes yes 0 0 1 1 23.743 23.743 3 0.02998 17136 QUIQUE_C1218_190116_001 34.262 19.576 20933000 20933000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38572 4177 35987 346188 440522 440522 1 RPQIDPAVEGFIR Unmodified 1496.81 0.80996139 48 X6RCC3;A0A087WV97;Q8WU79 SMAP2 Stromal membrane-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 1 77.954 77.954 3 0.030171 78298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 28.089 15.924 77745000 0 0 0 43215000 0 0 0 34530000 0 0 0 0 0 38573 48 35988 346189;346190 440523;440524 440524 2 RPQLYYETSIHAIK Unmodified 1717.9152 0.91515474 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 1 1 3 1 1 1 1 2 1 51.796 51.796 2;3;4 0.00052614 48916 QUIQUE_C1403_190116_001 73.305 67.401 2047300000 354550000 533980000 291060000 248820000 0 0 0 147260000 187080000 98379000 186200000 0 0 38574 3722 35989 346191;346192;346193;346194;346195;346196;346197;346198;346199;346200;346201 440525;440526;440527;440528;440529;440530;440531;440532;440533;440534;440535 440530 10 RPQSADAYMTR Unmodified 1294.6088 0.60881874 145 A0A0A0MRE6;O94967 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 19.37 19.37 2;3 0.0015996 11974 QUIQUE_C1368_190116_001 56.205 36.195 281750000 50525000 41699000 55613000 27541000 0 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1102.5771 0.57710791 3083 Q14696 MESDC2 LDLR chaperone MESD yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.435 24.435 2 0.00051428 18049 QUIQUE_C1277_190116_001 113.93 53.016 637040000 85922000 69128000 129300000 52808000 0 38974000 60709000 41834000 0 17250000 85076000 0 56040000 38580 3083 35995 346287;346288;346289;346290;346291;346292;346293;346294;346295;346296 440648;440649;440650;440651;440652;440653;440654;440655;440656;440657;440658;440659 440649 12 RPSATLIAWELLR Unmodified 1524.8776 0.87764703 4134 Q9H1K4 SLC25A18 Mitochondrial glutamate carrier 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.25 117.25 3 0.00014959 120287 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.457 75.336 364670000 15486000 26556000 31765000 17554000 0 28002000 34752000 38051000 33953000 8192200 51120000 49342000 29896000 38581 4134 35996 346297;346298;346299;346300;346301;346302;346303;346304;346305;346306;346307;346308 440660;440661;440662;440663;440664;440665;440666;440667;440668;440669;440670;440671;440672;440673;440674 440668 15 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TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.823 86.823 3 7.2171E-12 90087 QUIQUE_C1218_190116_001 83.435 76.56 400800000 37463000 33488000 46869000 0 36702000 36336000 37511000 40512000 0 0 45249000 43089000 43580000 38586 2041 36001 346347;346348;346349;346350;346351;346352;346353;346354;346355;346356 440731;440732;440733;440734;440735;440736;440737;440738;440739;440740 440731 10 RPTAAELLK Unmodified 997.59203 0.59202969 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 1 1 25.405 25.405 2 0.04726 18963 QUIQUE_C1277_190116_001 72.23 9.7657 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38587 4417 36002 346357 440741 440741 1 RPTEICADPQFIIGGATR Unmodified 2001.0102 0.010194116 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 86.633 86.633 2;3 2.5817E-06 89674 QUIQUE_C1438_190116_001 77.871 68.587 3945700000 241290000 292170000 459920000 334610000 313030000 339400000 419220000 175190000 300600000 152690000 302430000 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440768;440769;440770;440771;440772;440773;440774;440775;440776;440777;440778;440779;440780;440781;440782;440783;440784;440785;440786;440787;440788;440789;440790;440791;440792;440793;440794 440774 26 RPTLSAPLAR Unmodified 1080.6404 0.64037687 4528 Q9UQ16;H0YBC6 DNM3 Dynamin-3 yes no 0 0 1 1 1 29.724 29.724 2 0.0016549 24238 QUIQUE_C1277_190116_001 102.55 35.082 213100000 0 99481000 0 0 0 0 113620000 0 0 0 0 0 0 38590 4528 36005 346398;346399 440795;440796 440795 1 RPTPNDDTLDEGVGLVHSNIATEHIPSPAK Unmodified 3179.5847 0.58471907 2858 Q01581 HMGCS1 Hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.223 89.223 4 1.6843E-05 90592 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.415 39.766 523180000 80927000 102810000 0 101250000 0 0 0 95621000 0 0 0 68291000 74281000 38591 2858 36006 346400;346401;346402;346403;346404;346405 440797;440798;440799;440800;440801;440802 440800 6 RPTPQDSPIFLPVDDTSFR Unmodified 2187.096 0.096032235 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 109.85 109.85 2;3 1.2549E-06 113780 QUIQUE_C1576_190116_001 84.249 69.056 1585600000 32941000 49390000 0 257500000 0 0 299010000 246970000 513010000 121470000 0 65267000 0 38592 2524 36007 346406;346407;346408;346409;346410;346411;346412;346413;346414;346415;346416;346417;346418;346419 440803;440804;440805;440806;440807;440808;440809;440810;440811;440812;440813;440814;440815;440816;440817;440818 440810 16 RPTTQQFIDTIIK Unmodified 1559.8671 0.86714192 1575 O60477 BRINP1 BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 1 yes yes 0 0 1 1 90.33 90.33 3 0.023888 91891 QUIQUE_C1403_190116_001 27.845 14.968 22576000 0 0 0 22576000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38593 1575 36008 346420 440819 440819 1 RPTVEQGLGQLSNLLNSK Unmodified 1953.0643 0.064338176 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.08 115.08 3 3.3941E-05 118931 QUIQUE_C1368_190116_001 89.566 80.966 680620000 56746000 50936000 45290000 49491000 46868000 0 70851000 71322000 69780000 28585000 62670000 54154000 73931000 38594 1510 36009 346421;346422;346423;346424;346425;346426;346427;346428;346429;346430;346431;346432 440820;440821;440822;440823;440824;440825;440826;440827;440828;440829;440830;440831;440832;440833;440834;440835;440836 440822 17 RPVFDDKEDVNFDHFQILR Unmodified 2389.1815 0.1814932 3494 Q86UX6 STK32C Serine/threonine-protein kinase 32C yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 97.344 97.344 4 4.6787E-05 99752 QUIQUE_C1277_190116_001 86.8 78.305 348620000 94542000 80746000 65400000 53806000 0 0 0 54124000 0 0 0 0 0 38595 3494 36010 346433;346434;346435;346436;346437 440837;440838;440839;440840;440841 440838 5 RPVGASFSFGGK Unmodified 1208.6302 0.63020611 821 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24.768 2;3 0.0041414 18170 QUIQUE_C1438_190116_001 87.895 36.829 7997700000 682580000 560740000 832180000 0 626790000 252100000 599340000 1066000000 1223800000 380040000 0 960860000 813220000 38623 3117 36036 346627;346628;346629;346630;346631;346632;346633;346634;346635;346636;346637;346638;346639;346640;346641 441060;441061;441062;441063;441064;441065;441066;441067;441068;441069;441070;441071;441072;441073;441074 441065 13 RQEPAQPPISDAR Unmodified 1463.7481 0.74808942 4523 Q9UPY6 WASF3 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3 yes yes 0 0 1 1 1 19.981 19.981 3 0.0086358 13097 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.532 32.656 57758000 0 0 0 0 0 0 0 0 57758000 0 0 0 0 38624 4523 36037 346642;346643 441075;441076 441076 2 RQEQIQAMPLADSQAVR Unmodified 1939.9898 0.98979302 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 55.196 55.196 2;3 6.341E-05 53617 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.645 60.917 2685500000 179720000 236030000 264930000 74296000 192090000 72391000 184650000 281080000 314110000 101640000 378170000 242190000 164200000 38625 3117 36038 346644;346645;346646;346647;346648;346649;346650;346651;346652;346653;346654;346655;346656;346657;346658;346659;346660;346661;346662;346663;346664;346665;346666 441077;441078;441079;441080;441081;441082;441083;441084;441085;441086;441087;441088;441089;441090;441091;441092;441093;441094;441095;441096;441097;441098;441099;441100;441101 441090 24 RQEQIQAMPLADSQAVR Oxidation (M) 1955.9847 0.98470765 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 1 1 1 1 2 1 39.586 39.586 3 7.5659E-05 35551 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.551 78.27 516930000 0 44980000 0 0 0 0 0 124300000 118430000 112680000 0 116540000 0 38626 3117 36038 346667;346668;346669;346670;346671;346672 441102;441103;441104;441105;441106;441107 441104 2572 5 RQFEDEKANWEAQQR Unmodified 1933.9031 0.90308651 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2;Q5JXL7 SEPT7;DKFZp586I031 Septin-7 yes no 0 0 2 1 30.303 30.303 3 0.0059519 25126 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.331 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441372 9 RRPPQPIQQPQR Unmodified 1499.8433 0.8433272 1439 O14672 ADAM10 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 10 yes yes 0 0 2 1 2 1 10.796 10.796 3 8.029E-06 3146 QUIQUE_DMIX8_190116_001 126.19 99.224 59055000 0 0 0 0 0 0 0 0 21817000 0 19884000 0 17355000 38655 1439 36067 346884;346885;346886;346887 441376;441377;441378;441379;441380 441380 3 RRPQLYYETSIHAIK Unmodified 1874.0163 0.016265772 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 2 1 1 1 39.579 39.579 4 0.00078444 36912 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.261 61.176 238650000 0 0 33617000 0 0 0 0 93191000 111840000 0 0 0 0 38656 3722 36068 346888;346889;346890 441381;441382;441383;441384 441383 4 RRQEQIQAMPLADSQAVR Unmodified 2096.0909 0.090904053 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 2 1 1 1 41.184 41.184 3;4 5.7827E-10 37690 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.5 67.353 184520000 0 0 0 0 0 0 0 78158000 53876000 0 52490000 0 0 38657 3117 36069 346891;346892;346893 441385;441386;441387 441386 3 RSDGEDGSLDQDNR Unmodified 1562.6557 0.65570517 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 1 1 2 1 13.469 13.469 2;3 7.7277E-05 5475 QUIQUE_C1403_190116_001 80.632 47.319 8844000 0 0 0 3841100 0 0 0 0 0 0 0 5002900 0 38658 3362 36070 346894;346895;346896;346897 441388;441389;441390;441391 441389 4 RSDPAAFESR Unmodified 1134.5418 0.54178503 1253 I3L448;A8MRA7;Q5TC12;H0YDD6 ATPAF1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 yes no 0 0 1 1 17.501 17.501 3 0.054917 10149 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.098 17.764 11694000 0 0 0 0 0 0 0 11694000 0 0 0 0 0 38659 1253 36071 346898 441392 441392 1 RSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINR Unmodified 3507.6253 0.62526325 4526 Q9UQ03 CORO2B Coronin-2B yes yes 0 0 1 1 145.22 145.22 3 0.041608 150449 QUIQUE_DMIX3_190116_001 26.06 23.857 37265000 0 0 0 0 0 0 0 0 37265000 0 0 0 0 38660 4526 36072 346899 441393 441393 0 RSDSYQEDIYPMTPGTEPALTPDEWLGGINRDPVLMSLK Unmodified 4391.109 0.10898805 4526 Q9UQ03 CORO2B Coronin-2B yes yes 0 0 2 1 1 1 154.63 154.63 4 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subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 34.615 34.615 2;3 1.5549E-06 30625 QUIQUE_C1218_190116_001 140.01 96.564 2930700000 196730000 227400000 172800000 233110000 271510000 139150000 242620000 235050000 287460000 89777000 274960000 259000000 301160000 38664 2002 36076 346910;346911;346912;346913;346914;346915;346916;346917;346918;346919;346920;346921;346922;346923;346924;346925;346926;346927;346928;346929;346930;346931;346932;346933;346934;346935 441404;441405;441406;441407;441408;441409;441410;441411;441412;441413;441414;441415;441416;441417;441418;441419;441420;441421;441422;441423;441424;441425;441426;441427;441428;441429;441430;441431;441432;441433;441434 441406 30 RSENKNEGQDATMYCK Unmodified 1929.8309 0.83090912 4641 Q9Y639;Q9UFM8;H3BU51 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 0 2 1 1 1 1 10.711 10.711 3 0.00062588 3063 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.754 73.733 37475000 0 0 0 0 0 0 12556000 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1870.9247 0.92473315 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 1 1 1 92.595 92.595 3 0.0024666 94925 QUIQUE_DMIX8_190116_001 54.281 48.907 48641000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24135000 24506000 38668 2483 36080 346954;346955 441455;441456 441456 2 RSIEEACLTLQHLNR Unmodified 1838.9421 0.94211455 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 56.18 56.18 3 0.0074773 55158 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.796 25.882 78995000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 78995000 38669 921 36081 346956 441457 441457 1 RSIQFVDWCPTGFK Unmodified 1739.8454 0.84536062 2795;2796 P68363;P68366 TUBA1B;TUBA4A Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-4A chain no no 0 0 1 1 1 1 3 1 2 2 2 102.71 102.71 2;3 2.61E-07 105030 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.24 86.533 2780100000 0 27646000 0 0 60135000 0 66993000 439180000 236260000 0 719830000 574130000 655970000 38670 2795;2796 36082 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1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 1 1 76.564 76.564 3 0.00012259 78634 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.057 61.536 40545000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40545000 0 0 38673 2031;596 36085 346973 441483;441484 441483 2 RSNIWLAAVTK Unmodified 1257.7194 0.71935547 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47;C9JTK4;C9JGT8;C9JJD3;C9JPV8 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 1 2 1 62.195 62.195 2;3 0.0017788 61315 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.023 39.147 80195000 0 0 0 0 0 0 0 56661000 0 0 0 23534000 0 38674 71 36086 346974;346975;346976 441485;441486;441487 441485 3 RSPEAPQPVIAMEEPAVPAPLPK Unmodified 2423.2883 0.28826646 2072 P14317;E7EVW7 HCLS1 Hematopoietic lineage cell-specific protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 97.095 97.095 3 1.1004E-06 101117 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.033 61.349 239580000 0 0 59560000 83010000 0 39249000 0 0 0 0 57763000 0 0 38675 2072 36087 346977;346978;346979;346980 441488;441489;441490;441491 441491 4 RSPLTYGVGVLNR Unmodified 1430.7994 0.7993967 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441654;441655;441656;441657;441658;441659;441660;441661;441662;441663;441664;441665;441666;441667;441668;441669;441670;441671;441672;441673;441674;441675;441676;441677;441678;441679;441680;441681;441682;441683;441684;441685;441686;441687;441688;441689;441690;441691;441692;441693;441694;441695;441696;441697;441698;441699;441700;441701;441702;441703;441704;441705;441706;441707;441708;441709;441710;441711;441712;441713;441714;441715;441716;441717;441718;441719;441720;441721;441722;441723;441724;441725;441726;441727;441728;441729;441730;441731;441732;441733;441734;441735 441690 79 RSYVSSGEMMVGGLAPGR 2 Oxidation (M) 1884.8822 0.88221641 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;K7EJK1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 2 1 1 2 2 1 2 2 2 49.392 49.392 2;3 6.3816E-05 46887 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.653 74.596 4223400000 0 0 0 0 0 138310000 0 781140000 1098900000 160870000 567670000 514850000 961630000 38687 389;395;1336 36096 347153;347154;347155;347156;347157;347158;347159;347160;347161;347162;347163;347164 441736;441737;441738;441739;441740;441741;441742;441743;441744;441745;441746;441747;441748;441749;441750;441751;441752;441753;441754;441755;441756;441757;441758;441759 441753 278;279 24 RSYVSSGEMMVGGLAPGRR Oxidation (M) 2024.9884 0.98841282 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;K7EJK1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 1 2 3 1 1 1 59.104 59.104 3;4 0.00048251 60999 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.894 74.106 1847700000 0 0 0 0 0 0 0 1420600000 173070000 0 111470000 0 142500000 38688 389;395;1336 36097 347165;347166;347167;347168;347169;347170 441760;441761;441762;441763;441764;441765 441762 278;279 6 RSYVSSGEMMVGGLAPGRR Unmodified 2008.9935 0.99349819 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;K7EJK1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 2 3 3 3 2 3 63.919 63.919 3;4 3.1922E-36 65337 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.71 134.25 8063200000 0 0 0 0 0 0 0 3057500000 1151700000 0 806270000 1275200000 1772600000 38689 389;395;1336 36097 347171;347172;347173;347174;347175;347176;347177;347178;347179;347180;347181;347182;347183;347184 441766;441767;441768;441769;441770;441771;441772;441773;441774;441775;441776;441777;441778;441779;441780;441781;441782;441783;441784;441785;441786;441787;441788 441772 22 RTAQEVETYR Unmodified 1251.6208 0.62076364 1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3KRX8;J3KTQ4;J3QR02 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 2 15.69 15.69 2;3 0.00051428 7930 QUIQUE_C1438_190116_001 113.93 67.501 355490000 29938000 17564000 67119000 59984000 31979000 0 0 0 0 0 39696000 65157000 44056000 38690 1290 36098 347185;347186;347187;347188;347189;347190;347191;347192;347193;347194;347195;347196;347197;347198;347199 441789;441790;441791;441792;441793;441794;441795;441796;441797;441798;441799;441800;441801;441802;441803 441795 14 RTDDIPVWDQEFLK Unmodified 1760.8733 0.87334951 2784 P63208;E5RJR5;E7ERH2;F8W8N3;E5RGM3 SKP1 S-phase kinase-associated protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 110.41 110.41 2;3 4.878E-43 114789 QUIQUE_DMIX5_190116_001 190.1 143.75 6305700000 392060000 476370000 423030000 402700000 594220000 382070000 504810000 568320000 645340000 185240000 534270000 457040000 740220000 38691 2784 36099 347200;347201;347202;347203;347204;347205;347206;347207;347208;347209;347210;347211;347212;347213;347214;347215;347216 441804;441805;441806;441807;441808;441809;441810;441811;441812;441813;441814;441815;441816;441817;441818;441819;441820;441821;441822;441823;441824;441825;441826;441827;441828;441829;441830;441831;441832;441833;441834 441827 31 RTDIFGVEETAIGK Unmodified 1534.7991 0.79912193 3141 Q15459 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 1 83.295 83.295 2;3 0.00098598 84416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.673 45.808 474440000 67577000 70458000 51562000 71857000 32392000 21509000 24684000 20766000 63656000 9693000 0 16269000 24018000 38692 3141 36100 347217;347218;347219;347220;347221;347222;347223;347224;347225;347226;347227;347228;347229;347230;347231;347232;347233;347234 441835;441836;441837;441838;441839;441840;441841;441842;441843;441844;441845;441846;441847;441848;441849;441850;441851;441852;441853;441854 441847 19 RTEEGPTLSYGR Unmodified 1364.6684 0.66844211 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;D6R991 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 1 1 27.074 27.074 2;3 0.00048771 21200 QUIQUE_C1576_190116_001 65.563 49.642 928680000 51274000 80135000 64248000 0 122310000 0 143920000 117050000 120320000 0 89960000 57072000 82398000 38693 307 36101 347235;347236;347237;347238;347239;347240;347241;347242;347243;347244;347245;347246;347247;347248;347249 441855;441856;441857;441858;441859;441860;441861;441862;441863;441864;441865;441866;441867;441868;441869;441870 441861 16 RTEGVGPGVPGEVEMVK Unmodified 1739.8876 0.88761936 2263 P27361;E9PQW4;E9PJF0 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase yes no 0 0 1 1 2 1 1 59.026 59.026 2;3 0.0007396 57140 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.797 71.011 335030000 62477000 0 0 0 0 0 0 182070000 80653000 9834900 0 0 0 38694 2263 36102 347250;347251;347252;347253;347254 441871;441872;441873;441874;441875;441876 441874 5 RTEITIVKPQESAHR Unmodified 1763.9642 0.9642302 4432 Q9UHD8;K7EJ51;K7ENL0;K7ER34 SEPT9 Septin-9 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.866 18.866 4 5.7124E-06 11302 QUIQUE_C1403_190116_001 101.42 90.828 1548500000 114370000 189190000 144550000 220350000 166260000 179320000 114810000 0 0 0 0 195030000 224600000 38695 4432 36103 347255;347256;347257;347258;347259;347260;347261;347262;347263 441877;441878;441879;441880;441881;441882;441883;441884;441885;441886 441881 10 RTETDFSNLFAR Unmodified 1455.7106 0.71064128 3950 Q99259;F8WD43;U3KQR2;C9J6C9;C9JT43 GAD1 Glutamate decarboxylase 1 yes no 0 0 1 1 1 81.349 81.349 3 0.0095306 82338 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.88 39.269 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13 RTGAIVDVPVGEELLGR Unmodified 1779.9843 0.98429694 2243;1351 K7ERX7;K7EQH4;P25705;K7EK77;K7EJP1 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 100.44 100.44 2;3 0.00025659 104739 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.907 45.003 1332900000 0 122290000 129080000 0 137940000 0 68007000 173650000 0 0 295730000 220340000 185820000 38699 1351;2243 36107 347280;347281;347282;347283;347284;347285;347286;347287;347288 441904;441905;441906;441907;441908;441909;441910;441911;441912;441913 441911 9 RTGYESGEYEMLGEGLGVK Unmodified 2073.9677 0.96772018 3011 Q13561;F8W1I6;F8VW18;F8VX93;F8VRV7;H0YHL1 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 91.683 91.683 3 0.033277 93629 QUIQUE_C1277_190116_001 18.772 8.3955 106980000 0 41555000 0 22621000 0 0 0 42806000 0 0 0 0 0 38700 3011 36108 347289;347290;347291 441914;441915;441916;441917 441915 4 RTHLPEVFLSK Unmodified 1325.7456 0.74557022 822 D6RF35;P02774 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 1 1 43.222 43.222 3 0.036804 40259 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441988 1 RTQEVLQAVAEK Unmodified 1370.7518 0.75177781 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 28.794 28.794 2;3 0.0007924 22576 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.93 66.418 412790000 0 0 0 0 38668000 28044000 0 39226000 90506000 0 45260000 40180000 130910000 38711 2880 36119 347352;347353;347354;347355;347356;347357;347358;347359;347360 441989;441990;441991;441992;441993;441994;441995;441996;441997 441996 9 RTVPPAVTGITFLSGGQSEEEASINLNAINK Unmodified 3212.6677 0.66772041 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BR68 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 129.46 129.46 3 5.7758E-55 132683 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.9 133.19 243320000 0 0 0 0 40022000 0 0 48144000 51688000 0 0 45589000 57881000 38712 1851 36120 347361;347362;347363;347364;347365;347366 441998;441999;442000;442001;442002;442003;442004;442005 442001 8 RVAAMSVAQR Unmodified 1087.592 0.59204647 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 1 1 15.969 15.969 3 0.01279 8454 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.715 16.493 8105100 0 0 0 0 0 0 0 8105100 0 0 0 0 0 38713 1506 36121 347367 442006 442006 1 RVAEELALEQAK Unmodified 1355.7409 0.74087877 741 C9JRZ6;Q9NX63;F8WAR4;A0A286YEX5 CHCHD3 MICOS complex subunit MIC19 yes no 0 0 1 1 1 36.919 36.919 3 0.01947 32474 QUIQUE_C1368_190116_001 31.215 16.339 66374000 0 33255000 33119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38714 741 36122 347368;347369 442007;442008 442008 2 RVAQDWLK Unmodified 1014.5611 0.56106391 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 1 1 1 1 1 31.483 31.483 2 0.04334 26563 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.981 17.015 768510000 0 162250000 0 0 0 0 171300000 0 207380000 0 0 0 227580000 38715 693;3205 36123 347370;347371;347372;347373 442009;442010;442011;442012 442011 4 RVATPVDWK Unmodified 1070.5873 0.58727866 2298 P30041 PRDX6 Peroxiredoxin-6 yes yes 0 0 1 1 1 31.312 31.312 2 0.041113 25956 QUIQUE_C1576_190116_001 57.59 38.075 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2/3 complex subunit 5-like protein yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 142.44 142.44 3;4 1.7492E-112 146811 QUIQUE_C1277_190116_001 161.29 155.63 2309600000 158310000 191840000 234980000 134600000 222320000 112500000 132920000 242220000 224680000 83821000 197380000 250200000 123870000 38719 3986 36127 347391;347392;347393;347394;347395;347396;347397;347398;347399;347400;347401;347402;347403;347404;347405;347406 442031;442032;442033;442034;442035;442036;442037;442038;442039;442040;442041;442042;442043;442044;442045;442046;442047;442048;442049;442050;442051 442033 21 RVDIIPGFEFDR Unmodified 1462.7569 0.75686319 4169 Q9H4A4;A6NKB8 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.53 108.53 3 0.00027566 113558 QUIQUE_C1438_190116_001 69.03 52.68 459470000 28012000 31228000 42490000 40968000 34833000 32633000 36516000 33404000 40458000 30821000 40358000 30377000 37368000 38720 4169 36128 347407;347408;347409;347410;347411;347412;347413;347414;347415;347416;347417;347418;347419 442052;442053;442054;442055;442056;442057;442058;442059;442060;442061;442062;442063;442064;442065;442066;442067 442057 16 RVDPVYIHLAER Unmodified 1466.7994 0.7993967 2964 Q13085;Q59FY4 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.611 47.611 3 0.0021981 45799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.487 44.134 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38721 2964 36129 347420;347421;347422;347423;347424;347425 442068;442069;442070;442071;442072;442073 442070 6 RVDQNWYEGK Unmodified 1293.6102 0.61019895 1693 O94875;A0A3B3ITL8 SORBS2 Sorbin and SH3 domain-containing protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 34.049 34.049 2 0.013216 29483 QUIQUE_C1438_190116_001 70.977 39.219 1003800000 0 300950000 0 0 201310000 0 248390000 0 0 0 0 0 253150000 38722 1693 36130 347426;347427;347428;347429 442074;442075;442076;442077 442075 4 RVEAAQETVADYQQTIK Unmodified 1948.9854 0.98541915 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 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36137 347487;347488 442137;442138 442138 2 RVELEAALQQAK Unmodified 1354.7569 0.75686319 779 CON__P19013;P19013 KRT4 Keratin, type II cytoskeletal 4 yes no 0 0 1 1 49.492 49.492 3 0.032566 44259 QUIQUE_DMIX4_190116_001 26.359 13.174 13976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13976000 0 0 0 + 38730 779 36138 347489 442139 442139 1 RVEPGSPAEAAALR Unmodified 1422.7579 0.75792582 3147 Q15599 SLC9A3R2 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 yes yes 0 0 1 1 1 1 31.785 31.785 2 0.023223 27068 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.49 39.619 83919000 0 19906000 37774000 0 0 0 0 0 0 0 26239000 0 0 38731 3147 36139 347490;347491;347492 442140;442141;442142 442142 3 RVEPVCSGLQAQILHCYR Unmodified 2185.0885 0.088461212 1308 J3QTA6;Q9BRQ6 CHCHD6 MICOS complex subunit MIC25 yes no 0 0 1 1 1 1 1 71.117 71.117 3 0.0071988 71806 QUIQUE_C1277_190116_001 50.493 41.784 349150000 72507000 70504000 0 0 0 0 0 0 0 0 65193000 0 140950000 38732 1308 36140 347493;347494;347495;347496 442143;442144;442145;442146 442144 2 RVEVNGEHATVR Unmodified 1365.7113 0.71130998 432 A0A2R8Y5Q8;Q15813;A0A2U3TZJ6;A0A2R8YHI9;A0A2R8YFL4;A0A2R8Y7E7;A0A2R8Y4V6;A0A2R8Y784;A0A2R8YER9;A0A2R8Y809;A0A2R8Y5H6;A0A2R8Y787;A0A2R8Y6G3;A0A2R8Y4P2;A0A2R8YFM3;A0A2R8Y897;A0A2R8YF12;A0A2R8Y6L2;A0A2R8Y3S1;A0A2R8YH53;A0A2R8Y597 TBCE Tubulin-specific chaperone E yes no 0 0 1 1 1 10.796 10.796 3 0.012442 3184 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.013 27.754 17531000 0 0 0 0 0 0 0 10973000 0 6558500 0 0 0 38733 432 36141 347497;347498 442147;442148 442148 2 RVEYVPLVEEALK Unmodified 1543.861 0.86099391 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 98.142 98.142 2 0.028552 101751 QUIQUE_C1218_190116_001 42.083 9.8654 51977000 24972000 0 0 27005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38734 205 36142 347499;347500 442149;442150 442149 1 RVFIMDNCEELIPEYLNFIR Unmodified 2570.2662 0.26615081 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 1 1 1 1 156.42 156.42 3 0.0034598 161072 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.476 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36144 347512 442162 442162 1407;1408 1 RVFQPSPLASQFELPGDFFNLTAEEIKR Unmodified 3235.6666 0.6665982 4088 Q9BZV1;K7EP32;K7ELN1 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 2 1 150.87 150.87 4 0.0010104 153773 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.659 34.219 39039000 0 0 0 0 0 0 0 39039000 0 0 0 0 0 38739 4088 36145 347513 442163 442163 0 RVGEQDSAPTQEKPTSPGK Unmodified 2010.997 0.99704647 4058 Q9BX66;S4R303 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 yes no 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 13.664 13.664 3;4 7.3737E-23 6010 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.44 102.35 846860000 29459000 0 21131000 57130000 50417000 52741000 21720000 153690000 174120000 0 42820000 68470000 175170000 38740 4058 36146 347514;347515;347516;347517;347518;347519;347520;347521;347522;347523;347524;347525;347526;347527;347528;347529;347530;347531 442164;442165;442166;442167;442168;442169;442170;442171;442172;442173;442174;442175;442176;442177;442178;442179;442180;442181;442182;442183;442184 442175 21 RVGFQYEGTYK Unmodified 1346.6619 0.66190017 2024 P11413 G6PD Glucose-6-phosphate 1-dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 36.979 36.979 2 0.01175 34162 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.434 40.674 24410000 0 0 24410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38741 2024 36147 347532;347533 442185;442186 442186 1 RVGFYVNTFK Unmodified 1229.6557 0.65569258 2530 P49418 AMPH Amphiphysin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 54.304 54.304 2;3 0.0091051 52919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.043 34.976 178350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 86185000 92164000 0 38742 2530 36148 347534;347535;347536;347537 442187;442188;442189;442190;442191 442189 4 RVGGVQSLGGTGALR Unmodified 1426.8005 0.80045934 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 35.449 35.449 3 0.0014699 30860 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.592 29.847 742440000 0 0 0 0 0 0 32427000 135580000 103500000 0 177880000 144350000 148700000 38743 2120 36149 347538;347539;347540;347541;347542;347543 442192;442193;442194;442195;442196;442197 442196 6 RVGIVAWHPTAR Unmodified 1361.768 0.768037 4495 Q9ULV4;B4E3S0;F8W1H8;F8VUX3;F8VSA4;F8VRE9;F8VTT6;F8VVB7;F8VV53 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 1 1 1 1 32.895 32.895 3 0.022723 27795 QUIQUE_DMIX8_190116_001 27.676 15.81 142550000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68225000 32937000 41391000 38744 4495 36150 347544;347545;347546 442198;442199;442200 442200 3 RVHLTEDQWGK Unmodified 1367.6946 0.69459728 4090 Q9C026 TRIM9 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9 yes yes 0 0 1 1 23.608 23.608 3 0.031681 16859 QUIQUE_C1277_190116_001 45.257 36.124 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38745 4090 36151 347547 442201 442201 1 RVHPQVTVYPAK Unmodified 1393.783 0.78301836 2815 P79483;A0A182DWH4 HLA-DRB3 HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 3 chain yes no 0 0 1 1 1 18.006 18.006 3 0.0087505 10462 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.712 34.834 37099000 0 0 14819000 0 0 0 0 0 0 0 22280000 0 0 38746 2815 36152 347548;347549 442202;442203 442203 1 RVHPVSTMIK Unmodified 1166.6594 0.65939775 1775 P00338 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.919 14.919 3 0.00063082 7645 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.342 63.662 2246800000 0 368270000 51662000 274190000 27756000 240500000 0 274970000 249660000 120010000 0 499070000 140740000 38747 1775 36153 347550;347551;347552;347553;347554;347555;347556;347557;347558;347559 442204;442205;442206;442207;442208;442209;442210;442211;442212;442213 442211 9 RVHVTQEDFEMAVAK Unmodified 1758.8723 0.87230365 2743 P62195 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 51.433 51.433 3 3.67E-09 49803 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.99 104.7 247310000 0 0 0 0 0 0 39021000 0 0 0 77966000 49475000 80844000 38748 2743 36154 347560;347561;347562;347563;347564;347565 442214;442215;442216;442217;442218;442219;442220 442218 7 RVIEQLGGK Unmodified 998.58728 0.58727866 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.306 17.306 2 0.014269 9455 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.378 32.132 183850000 19338000 40684000 0 17766000 0 21400000 0 0 29412000 18555000 0 36697000 0 38749 4443 36155 347566;347567;347568;347569;347570;347571;347572 442221;442222;442223;442224;442225;442226;442227 442227 7 RVIISAPSADAPMFVMGVNHEK 2 Oxidation (M) 2400.193 0.19298586 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 68.457 68.457 3;4 2.398E-12 65868 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.57 102.75 1600200000 52946000 109000000 120710000 76119000 0 0 0 167510000 436640000 65204000 156020000 222560000 193540000 38750 1863 36156 347573;347574;347575;347576;347577;347578;347579;347580;347581;347582;347583 442228;442229;442230;442231;442232;442233;442234;442235;442236;442237;442238;442239;442240;442241 442237 1083;1084 13 RVIISAPSADAPMFVMGVNHEK Oxidation (M) 2384.1981 0.19807124 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 78.265 78.265 3;4 4.6919E-15 78889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.17 110.73 3763600000 183990000 395530000 447680000 336380000 290290000 242500000 0 534700000 474860000 309410000 0 0 548270000 38751 1863 36156 347584;347585;347586;347587;347588;347589;347590;347591;347592;347593;347594 442242;442243;442244;442245;442246;442247;442248;442249;442250;442251;442252 442248 1083;1084 11 RVIISAPSADAPMFVMGVNHEK Unmodified 2368.2032 0.20315662 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 3 3 91.328 91.328 2;3;4 2.3665E-113 93236 QUIQUE_DMIX3_190116_001 237.3 217.46 45204000000 2816600000 3901600000 4199100000 4031900000 2102400000 2325400000 3310000000 5312000000 4570600000 750210000 4344300000 3295700000 4244200000 38752 1863 36156 347595;347596;347597;347598;347599;347600;347601;347602;347603;347604;347605;347606;347607;347608;347609;347610;347611;347612;347613;347614;347615;347616;347617;347618;347619;347620;347621;347622;347623;347624;347625;347626;347627;347628;347629;347630;347631;347632 442253;442254;442255;442256;442257;442258;442259;442260;442261;442262;442263;442264;442265;442266;442267;442268;442269;442270;442271;442272;442273;442274;442275;442276;442277;442278;442279;442280;442281;442282;442283;442284;442285;442286;442287;442288;442289;442290;442291;442292;442293;442294;442295;442296;442297;442298;442299;442300;442301;442302;442303;442304;442305;442306;442307;442308;442309;442310;442311;442312;442313;442314;442315;442316;442317;442318;442319;442320;442321;442322;442323;442324;442325;442326;442327 442303 73 RVIISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLK Oxidation (M) 3104.5423 0.54232567 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 2 1 84.81 84.81 4 3.0262E-12 85412 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.828 62.706 79601000 0 0 0 0 0 0 0 79601000 0 0 0 0 0 38753 1863 36157 347633 442328 442328 1083;1084 1 RVIISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLK Unmodified 3088.5474 0.54741104 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 2 3 1 1 94.893 94.893 3;4;5 1.0207E-52 96564 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.9 133.86 742660000 0 0 0 0 0 0 0 612390000 0 0 66142000 64131000 0 38754 1863 36157 347634;347635;347636;347637;347638 442329;442330;442331;442332;442333 442330 5 RVLDELTLTK Unmodified 1186.6921 0.69213767 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 1 1 59.562 59.562 2 0.015592 54875 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.626 17.821 43028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43028000 0 0 0 + 38755 776 36158 347639 442334 442334 1 RVLGLVLLR Unmodified 1037.7073 0.70733422 1298 J3QLE5;P63162;P14678 SNRPN;SNRPB Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' yes no 0 0 1 1 75.659 75.659 2 0.029548 77410 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.21 21.318 71266000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71266000 0 0 38756 1298 36159 347640 442335 442335 1 RVLIAAHGNSLR Unmodified 1305.763 0.76295162 2139;2090 P15259;P18669 PGAM2;PGAM1 Phosphoglycerate mutase 2;Phosphoglycerate mutase 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 17.884 17.884 3 9.4289E-05 9816 QUIQUE_DMIX8_190116_001 131.02 114.82 3190900000 0 0 48007000 0 126520000 0 0 764140000 564440000 0 956160000 0 731620000 38757 2090;2139 36160 347641;347642;347643;347644;347645;347646 442336;442337;442338;442339;442340;442341 442341 0 RVLQALEGLK Unmodified 1125.687 0.68699271 2417 P39019;A0A075B6E2 RPS19 40S ribosomal protein S19 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.881 51.881 2 3.3418E-07 50481 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.66 73.838 936450000 72790000 88622000 62230000 92987000 97276000 70359000 58846000 84682000 145140000 0 126530000 0 36986000 38758 2417 36161 347647;347648;347649;347650;347651;347652;347653;347654;347655;347656;347657 442342;442343;442344;442345;442346;442347;442348;442349;442350;442351;442352;442353 442350 11 RVLQQFADNDVSR Unmodified 1546.7852 0.7852032 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 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442358;442359;442360;442361;442362;442363;442364;442365;442366;442367;442368;442369;442370;442371;442372;442373;442374;442375;442376;442377;442378 442372 16 RVNDNKTAAEEALR Unmodified 1585.8172 0.81723161 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 2 1 115.27 115.27 3 0.027906 119484 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.481 26.385 45926000 0 0 0 0 0 0 0 0 45926000 0 0 0 0 38762 2008 36165 347681 442379 442379 1 RVNQAIWLLCTGAR Unmodified 1656.8882 0.88822849 1370 M0R0F0;M0R0R2;P46782;M0QZN2 RPS5 40S ribosomal protein S5;40S ribosomal protein S5, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 87.565 87.565 3 0.0092134 88481 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.568 37.687 14073000 0 0 0 0 0 0 0 14073000 0 0 0 0 0 38763 1370 36166 347682 442380 442380 1 RVPFSLLR Unmodified 986.60253 0.6025348 1866 P04792;F8WE04 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 60.424 60.424 2 1.7605E-14 60214 QUIQUE_DMIX1_190116_001 188.98 72.093 1412400000 0 0 0 0 0 0 0 394500000 292760000 0 164930000 234330000 325890000 38764 1866 36167 347683;347684;347685;347686;347687 442381;442382;442383;442384;442385;442386;442387 442381 7 RVPIPVDR Unmodified 950.56615 0.56614929 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 23.382 23.382 2 0.016513 16824 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.308 50.646 897690000 0 235400000 324160000 0 0 221650000 0 0 0 116480000 0 0 0 38765 2463 36168 347688;347689;347690;347691 442388;442389;442390;442391 442391 4 RVPPPALSR Unmodified 991.5927 0.59269839 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 1 1 15.487 15.487 2 0.041113 7819 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.59 37.803 23858000 0 0 0 0 0 0 0 23858000 0 0 0 0 0 38766 3046 36169 347692 442392 442392 1 RVQLAEDLKK Unmodified 1198.7034 0.70337105 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;H7C141;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 16.875 16.875 3 0.010139 9818 QUIQUE_C1218_190116_001 89.171 68.964 617350000 113010000 124510000 0 0 0 44761000 0 49387000 61783000 0 61669000 65936000 96295000 38767 831;1569 36170 347693;347694;347695;347696;347697;347698;347699;347700 442393;442394;442395;442396;442397;442398;442399;442400 442393 5 RVSDIQWFR Unmodified 1205.6305 0.63054046 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 1 1 1 65.521 65.521 2 0.04056 66726 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.859 30.116 185420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 90329000 0 95088000 38768 3116 36171 347701;347702 442401;442402 442401 2 RVSMELGGLAPFIVFDSANVDQAVAGAMASK Oxidation (M) 3166.5791 0.5791051 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 1 1 155.84 155.84 3 4.428E-16 158528 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.833 62.546 27719000 0 0 0 0 0 0 0 27719000 0 0 0 0 0 38769 2588 36172 347703 442403 442403 2037;2038 0 RVSMELGGLAPFIVFDSANVDQAVAGAMASK Unmodified 3150.5842 0.58419048 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 164.53 164.53 3 0.017339 171743 QUIQUE_DMIX5_190116_001 9.2725 0 114810000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 114810000 0 0 38770 2588 36172 347704 442404 442404 1 RVTDIIMQK Unmodified 1102.6169 0.61686423 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YHT2;H0YIM6 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 1 1 1 36.606 36.606 2 0.042883 32154 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.729 20.334 71945000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37961000 33983000 38771 356 36173 347705;347706 442405;442406 442406 2 RVTFLCGDAGPLAVGAVIYHK Unmodified 2243.1885 0.18849283 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 1 1 108.95 108.95 4 0.0050546 111275 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.436 27.633 26521000 0 0 0 0 0 0 0 26521000 0 0 0 0 0 38772 4281 36174 347707 442407 442407 1 RVTLELGGK Unmodified 971.57638 0.57637963 1875;1776;2325;1169;1113 H0Y2X5;P47895;H0YMG7;O94788;P00352;P05091;P30837 ALDH1A3;ALDH1A2;ALDH1A1;ALDH2;ALDH1B1 Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3;Retinal dehydrogenase 2;Retinal dehydrogenase 1;Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial;Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.472 24.472 2 0.030345 17524 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.823 19.577 919350000 146370000 0 130480000 0 0 0 0 189010000 0 66150000 208570000 178770000 0 38773 1113;1169;1776;1875;2325 36175 347708;347709;347710;347711;347712;347713 442408;442409;442410;442411;442412;442413 442413 3 RVVHASGDASYSAGDSGDAAAQPAFTGIK Unmodified 2805.3318 0.33179884 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;A0A0J9YW31;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 54.166 54.166 3;4 2.6244E-161 51875 QUIQUE_C1368_190116_001 206.93 198.31 1518900000 53624000 144860000 135360000 39270000 40639000 108140000 132300000 213060000 151530000 17450000 154460000 130800000 197380000 38774 143;560;4559 36176 347714;347715;347716;347717;347718;347719;347720;347721;347722;347723;347724;347725;347726;347727;347728;347729;347730;347731;347732;347733;347734;347735 442414;442415;442416;442417;442418;442419;442420;442421;442422;442423;442424;442425;442426;442427;442428;442429;442430;442431;442432;442433;442434;442435;442436;442437 442419 23 RVVHFAEPGAGTK Unmodified 1367.731 0.73098279 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 1 17.139 17.139 3 0.0077836 9230 QUIQUE_C1403_190116_001 47.189 37.656 26451000 0 0 17489000 8962400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38775 271 36177 347736;347737 442438;442439 442439 2 RVVIVDPETGKEMSVYEAYR Unmodified 2340.1784 0.17838166 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 85.031 85.031 3 1.7475E-24 87280 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.98 134.89 436540000 0 0 0 0 42640000 0 76476000 95515000 0 0 126780000 95127000 0 38776 3117 36178 347738;347739;347740;347741;347742;347743 442440;442441;442442;442443;442444;442445;442446 442444 6 RVVLASASPR Unmodified 1054.6247 0.6247268 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 1 1 16.013 16.013 3 0.0075144 8514 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.352 23.612 10635000 0 0 0 0 0 0 0 0 10635000 0 0 0 0 38777 1741 36179 347744 442447 442447 1 RVVSEIPVLK Unmodified 1138.7074 0.7073938 4588 Q9Y3C8 UFC1 Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 yes yes 0 0 1 1 1 46.961 46.961 2 0.034411 45482 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.691 28.429 68357000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29073000 0 39285000 38778 4588 36180 347745;347746 442448;442449 442448 2 RVVVITQNIDELHR Unmodified 1690.9479 0.94785186 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 51.243 51.243 3 0.00032018 50154 QUIQUE_C1576_190116_001 77.42 63.741 129520000 0 0 0 0 23049000 0 22566000 0 0 0 45529000 0 38378000 38779 4323 36181 347747;347748;347749;347750 442450;442451;442452;442453 442451 3 RVYATILNAGTNTDGFK Unmodified 1839.9479 0.94791144 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.374 72.374 2 1.548E-16 73253 QUIQUE_C1277_190116_001 160.47 127.98 205220000 0 48626000 0 41755000 23426000 0 0 0 0 0 62598000 0 28812000 38780 2524 36182 347751;347752;347753;347754;347755;347756;347757;347758 442454;442455;442456;442457;442458;442459;442460;442461 442454 8 RVYGDIIHTPAK Unmodified 1368.7514 0.75138388 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 1 28.385 28.385 2;3 0.00017233 22687 QUIQUE_C1277_190116_001 90.793 73.658 3297200000 181440000 366740000 0 341980000 346520000 238710000 411060000 352600000 0 49038000 288150000 441800000 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1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 41.625 41.625 2 5.6468E-12 38998 QUIQUE_C1438_190116_001 167.18 100.91 409970000 0 97668000 54176000 0 84039000 0 88058000 0 0 0 0 0 86029000 38784 1472 36186 347783;347784;347785;347786;347787;347788 442490;442491;442492;442493;442494;442495 442492 5 RWEGGDPGVSNQK Unmodified 1428.6746 0.67459012 1521;335 A0A1B0GTF3;K7ENF6;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 18.748 18.748 2;3 2.2012E-07 11553 QUIQUE_C1218_190116_001 149.49 105.17 2436600000 160420000 279780000 255470000 196050000 226300000 180040000 375560000 143100000 168990000 69366000 142650000 108170000 130660000 38785 335;1521 36187 347789;347790;347791;347792;347793;347794;347795;347796;347797;347798;347799;347800;347801;347802;347803;347804;347805;347806;347807;347808;347809;347810;347811 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yes 0 0 1 1 1 1 75.752 75.752 3 0.00022114 77934 QUIQUE_C1438_190116_001 53.188 47.066 143780000 0 0 0 0 60607000 0 0 0 0 0 83169000 0 0 38796 2139 36198 347896;347897;347898 442625;442626;442627;442628 442626 4 RYADLTEDQLPSCESLKDTIAR Unmodified 2580.249 0.24898042 2139 P18669 PGAM1 Phosphoglycerate mutase 1 yes yes 0 0 2 2 2 2 2 1 91.062 91.062 3;4 1.7263E-05 92709 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.326 80.214 474270000 0 0 0 0 0 0 0 74037000 65076000 0 134600000 66682000 133880000 38797 2139 36199 347899;347900;347901;347902;347903;347904;347905;347906;347907 442629;442630;442631;442632;442633;442634;442635;442636;442637 442630 7 RYAGLKPGELPTCESLK Unmodified 1917.9982 0.99823245 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 0 2 1 1 1 54.095 54.095 3 0.026148 52310 QUIQUE_C1403_190116_001 52.731 37.961 174470000 0 0 80254000 44540000 0 0 49672000 0 0 0 0 0 0 38798 2090 36200 347908;347909;347910 442638;442639;442640 442639 2 RYASGSSASLGGPESAVA Unmodified 1665.7958 0.79582747 3117 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347929;347930;347931;347932;347933;347934;347935;347936;347937;347938;347939;347940;347941;347942;347943;347944;347945 442659;442660;442661;442662;442663;442664;442665;442666;442667;442668;442669;442670;442671;442672;442673;442674;442675;442676 442664 17 RYFDGSGGNNHAVEHYR Unmodified 1977.883 0.88301977 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 1 1 1 20.54 20.54 4 0.018567 13830 QUIQUE_DMIX7_190116_001 32.858 26.376 82203000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34451000 47752000 0 38805 2472 36207 347946;347947 442677;442678 442678 2 RYGHGVSEEDKGFGPIFEEQPINTIYPEESLEGK Unmodified 3850.8326 0.83261349 2948 Q12860;F8VUI9;F8VUI8;F8VQW3;F8VX96 CNTN1 Contactin-1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 2 114.29 114.29 4;5 9.0309E-46 118073 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.96 98.015 1106500000 42779000 81041000 70914000 138580000 72409000 69303000 134070000 78262000 78019000 0 64982000 120910000 155260000 38806 2948 36208 347948;347949;347950;347951;347952;347953;347954;347955;347956;347957;347958;347959;347960;347961;347962;347963 442679;442680;442681;442682;442683;442684;442685;442686;442687;442688;442689;442690;442691;442692;442693;442694;442695;442696;442697 442692 16 RYIETDPANR Unmodified 1233.6102 0.61019895 166;788 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;CON__Q3SX14 GSN Gelsolin no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 18.954 18.954 2;3 0.0006309 11572 QUIQUE_C1403_190116_001 90.149 66.773 951570000 0 0 0 80530000 0 72500000 108480000 0 154100000 0 428940000 0 107010000 + 38807 166;788 36209 347964;347965;347966;347967;347968;347969;347970 442698;442699;442700;442701;442702;442703;442704 442698 2 RYLQQLAEKPLETR Unmodified 1743.9632 0.96316757 2854 Q01433;H0Y360 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 2 1 49.296 49.296 3 0.0018395 46548 QUIQUE_C1277_190116_001 69.729 57.706 34182000 0 34182000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38808 2854 36210 347971 442705 442705 1 RYNEDLELEDAIHTAILTLK Unmodified 2356.2274 0.22744034 5 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348143;348144 442897;442898 442897 2 SAAPGSLGYQWLSDGSGVFEIAEASGVR Unmodified 2810.3511 0.3511373 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239;I3L2D5 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 162.62 162.62 3 3.357E-08 157173 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.914 50.116 202820000 0 0 0 0 0 27426000 0 43596000 75806000 14596000 0 0 41400000 38836 2952 36237 348145;348146;348147;348148;348149 442899;442900;442901;442902;442903;442904 442903 5 SAAPHPGDIGDFINEGLK Unmodified 1836.9006 0.90062689 2141 P19022 CDH2 Cadherin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.15 100.15 3 7.3022E-39 103300 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.45 116.49 1896200000 153020000 0 232840000 186720000 171100000 153310000 156890000 164750000 251810000 0 196460000 0 229320000 38837 2141 36238 348150;348151;348152;348153;348154;348155;348156;348157;348158;348159 442905;442906;442907;442908;442909;442910;442911;442912;442913;442914;442915 442912 11 SAAQAAAQTNSNAAGK Unmodified 1459.7015 0.70153315 3631 Q8NC51 SERBP1 Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 10.588 10.588 2 2.1585E-79 2976 QUIQUE_DMIX1_190116_001 205.49 183.74 132470000 0 0 0 0 0 0 0 76505000 13911000 42051000 0 0 0 38838 3631 36239 348160;348161;348162 442916;442917;442918 442916 3 SAAQLSLSSR Unmodified 1018.5407 0.5407224 4184 Q9H7Z7 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.127 31.127 2 0.00036089 25884 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.63 87.973 961910000 136840000 0 118400000 118580000 0 99405000 123620000 0 103360000 35551000 112700000 113440000 0 38839 4184 36240 348163;348164;348165;348166;348167;348168;348169;348170;348171;348172;348173 442919;442920;442921;442922;442923;442924;442925;442926;442927;442928;442929;442930 442926 12 SAASYALGSISVGNLPEYLPFVLQEITSQPK Unmodified 3278.7075 0.70745996 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 3 2 1 175.52 175.52 2;3;4 1.2686E-53 181192 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442942;442943;442944;442945;442946;442947;442948;442949;442950;442951;442952;442953;442954;442955;442956;442957;442958;442959;442960;442961;442962;442963;442964;442965;442966;442967;442968;442969;442970;442971;442972;442973;442974;442975;442976;442977;442978;442979;442980;442981;442982;442983 442944 40 SAATSGAGSTTSGVVSGSLGSR Unmodified 1895.9185 0.9184618 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 46.913 46.913 2 3.5043E-08 44963 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.8 89.92 31299000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31299000 0 0 38842 3471 36243 348214;348215 442984;442985 442984 2 SAATWDER Unmodified 934.41446 0.41445926 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.679 22.679 2 0.016365 16081 QUIQUE_C1576_190116_001 83.265 47.385 6820900000 838130000 1027100000 0 0 664830000 628560000 473220000 837580000 1015800000 373680000 0 961990000 0 38843 2851 36244 348216;348217;348218;348219;348220;348221;348222;348223;348224 442986;442987;442988;442989;442990;442991;442992;442993;442994 442990 4 SACDTVDTWLDDTAK Unmodified 1696.725 0.72503029 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.24 110.24 2 1.4862E-05 112261 QUIQUE_C1563_190116_001 94.402 88.796 370110000 0 27673000 57488000 40774000 0 35137000 42321000 19574000 21965000 17716000 59262000 0 48201000 38844 3053 36245 348225;348226;348227;348228;348229;348230;348231;348232;348233;348234 442995;442996;442997;442998;442999;443000;443001;443002;443003;443004;443005 442998 10 SACKEDIPSEK Unmodified 1262.5813 0.58126659 3114 Q15121;B1AKZ5 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes no 0 0 1 2 3 2 1 2 2 2 1 12.548 12.548 2;3 5.5066E-05 5380 QUIQUE_DMIX4_190116_001 134.18 96.569 985310000 9634800 208090000 0 0 0 49865000 0 402230000 107340000 34394000 0 173760000 0 38845 3114 36246 348235;348236;348237;348238;348239;348240;348241;348242;348243;348244;348245;348246;348247;348248;348249 443006;443007;443008;443009;443010;443011;443012;443013;443014;443015;443016;443017;443018;443019;443020;443021;443022;443023;443024 443021 17 SADAAAGAPLPR Acetyl (Protein N-term) 1137.5778 0.57783619 1441 O14745;J3QRP6 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 63.424 63.424 2 3.392E-10 63546 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.84 138.33 1907600000 0 0 186800000 0 267460000 190540000 197900000 191480000 0 0 249820000 320860000 302790000 38846 1441 36247 348250;348251;348252;348253;348254;348255;348256;348257;348258;348259 443025;443026;443027;443028;443029;443030;443031;443032;443033;443034;443035;443036;443037 443033 12 SADCSVEEEPWK Unmodified 1435.5926 0.59255956 2458 P43004;A0A2R8YFE3;A0A2U3TZS7;A0A2R8Y4W1;A0A2R8Y860;A0A2R8YD46;A0A2R8Y4N0;A0A2R8YHI4 SLC1A2 Excitatory amino acid transporter 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 56.375 56.375 2 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 45.613 45.613 2 0.0028943 41054 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.509 52.728 1324400000 113350000 140860000 197190000 0 0 0 0 141060000 279900000 58569000 211900000 181560000 0 38849 57 36250 348281;348282;348283;348284;348285;348286;348287;348288 443060;443061;443062;443063;443064;443065;443066;443067;443068 443065 6 SADEPMTTFVVCNECGNR Unmodified 2085.8554 0.85540931 379 A0A1W2PRL9;A0A1W2PPZ5;P23193;B7Z4S1 TCEA1 Transcription elongation factor A protein 1 yes no 0 0 0 1 87.369 87.369 2 0.00023718 88226 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.729 63.266 20093000 0 0 0 0 0 0 0 20093000 0 0 0 0 0 38850 379 36251 348289 443069 443069 1 SADESGQALLAAGHYASDEVR Unmodified 2145.9927 0.99268938 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 3 2 3 2 2 88.533 88.533 2;3 0 90615 QUIQUE_C1368_190116_001 358.04 338.3 43973000000 3272200000 4084700000 3255500000 3130200000 4693100000 2233900000 3762600000 3137700000 2884700000 1329300000 3855900000 3588500000 4744300000 38851 267;275;3025 36252 348290;348291;348292;348293;348294;348295;348296;348297;348298;348299;348300;348301;348302;348303;348304;348305;348306;348307;348308;348309;348310;348311;348312;348313;348314;348315;348316;348317;348318 443070;443071;443072;443073;443074;443075;443076;443077;443078;443079;443080;443081;443082;443083;443084;443085;443086;443087;443088;443089;443090;443091;443092;443093;443094;443095;443096;443097;443098;443099;443100;443101;443102;443103;443104;443105;443106;443107;443108;443109;443110;443111;443112;443113;443114;443115;443116;443117;443118;443119;443120;443121;443122;443123;443124;443125;443126;443127;443128;443129;443130;443131 443082 61 SADESGQALLAAGHYASDEVREK Unmodified 2403.1302 0.13024549 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 2 1 81.513 81.513 3;4 1.3176E-17 82379 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.55 108.44 462600000 0 0 0 0 0 0 0 248120000 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443148;443149;443150;443151;443152;443153;443154;443155;443156;443157;443158;443159;443160;443161;443162 443149 13 SADGLTASCLCPATCR Unmodified 1738.7437 0.74367402 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 64.414 64.414 2 0.00026482 63727 QUIQUE_C1277_190116_001 116.03 84.739 24767000 0 24767000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38855 1408 36256 348341 443163 443163 1 SADGSAPAGEGEGVTLQR Unmodified 1700.7966 0.79655575 2859 Q01650 SLC7A5 Large neutral amino acids transporter small subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 42.41 42.41 2 1.6956E-10 39619 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.8 94.934 144750000 0 0 0 55216000 0 0 0 0 48492000 0 41044000 0 0 38856 2859 36257 348342;348343;348344 443164;443165;443166 443166 3 SADGVIVSGVK Unmodified 1030.5659 0.56587452 148 A0A0A0MRI2;Q9UNH7;G3V5X9 SNX6 Sorting nexin-6;Sorting nexin-6, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 36.736 36.736 2 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QUIQUE_C1277_190116_001 122.33 106.44 1671100000 109310000 13211000 23739000 84104000 206350000 0 183650000 154310000 213710000 0 251590000 223010000 208070000 38860 1688 36261 348351;348352;348353;348354;348355;348356;348357;348358;348359;348360;348361;348362;348363;348364;348365;348366;348367;348368;348369 443174;443175;443176;443177;443178;443179;443180;443181;443182;443183;443184;443185;443186;443187;443188;443189;443190;443191;443192 443176 18 SADMVALDGFIYR Oxidation (M) 1472.697 0.69696505 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 110.83 110.83 2 0.0010557 116040 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.438 53.106 440890000 0 55210000 67646000 45129000 0 0 29368000 56235000 0 0 123950000 0 63354000 38861 1688 36261 348370;348371;348372;348373;348374;348375;348376;348377 443193;443194;443195;443196;443197;443198;443199;443200;443201;443202;443203 443201 928 11 SADPPPAIWVATTK Unmodified 1452.7613 0.76127986 3659 Q8TAF3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 82.466 82.466 2 0.0057063 84468 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.091 49.398 145410000 0 29938000 0 26072000 0 26931000 0 25401000 0 0 37067000 0 0 38862 3659 36262 348378;348379;348380;348381;348382 443204;443205;443206;443207;443208 443208 4 SADTLWDIQK Unmodified 1175.5823 0.58225287 1915 P07195 LDHB L-lactate dehydrogenase B chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 80.908 80.908 2 1.0128E-07 82011 QUIQUE_C1368_190116_001 174.02 146.69 66221000000 5256900000 4796400000 6127700000 5346800000 5259800000 4531400000 5036400000 5162800000 5039600000 2481800000 6131400000 5099000000 5950900000 38863 1915 36263 348383;348384;348385;348386;348387;348388;348389;348390;348391;348392;348393;348394;348395;348396 443209;443210;443211;443212;443213;443214;443215;443216;443217;443218;443219;443220;443221;443222;443223;443224;443225;443226;443227;443228;443229;443230;443231;443232;443233;443234;443235;443236 443214 27 SADTLWGIQK Unmodified 1117.5768 0.57677356 1775 P00338 LDHA L-lactate dehydrogenase A chain yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.908 71.908 2 1.1911E-17 72336 QUIQUE_C1277_190116_001 179.68 139.41 14596000000 1314700000 1320300000 1452800000 1333100000 1003500000 929430000 1128600000 1132500000 867620000 509540000 1342500000 959320000 1301700000 38864 1775 36264 348397;348398;348399;348400;348401;348402;348403;348404;348405;348406;348407;348408;348409;348410 443237;443238;443239;443240;443241;443242;443243;443244;443245;443246;443247;443248;443249;443250;443251;443252;443253;443254;443255;443256;443257;443258;443259;443260;443261;443262 443240 26 SADVEPVSASAAHILGEVCR Unmodified 2067.0055 0.0055026685 3075 Q14644 RASA3 Ras GTPase-activating protein 3 yes yes 0 0 0 1 102.37 102.37 3 0.011338 105169 QUIQUE_C1403_190116_001 35.389 24.35 41313000 0 0 0 41313000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38865 3075 36265 348411 443263 443263 1 SADVESVVSGTLR Unmodified 1318.6729 0.67285879 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.989 84.989 2;3 0.00051973 81964 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.69 75.911 4593700000 339700000 310340000 621950000 407570000 305540000 377310000 285690000 373430000 239560000 257370000 475400000 283320000 316470000 38866 2295 36266 348412;348413;348414;348415;348416;348417;348418;348419;348420;348421;348422;348423;348424;348425 443264;443265;443266;443267;443268;443269;443270;443271;443272;443273;443274;443275;443276;443277;443278;443279;443280 443277 17 SADVSPTTEGVK Unmodified 1189.5826 0.5826468 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 21.112 21.112 2 0.00051896 14753 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.483 52.648 413070000 0 135820000 74236000 0 0 88980000 0 114030000 0 0 0 0 0 38867 4091 36267 348426;348427;348428;348429 443281;443282;443283;443284 443284 3 SADYVNLALK Unmodified 1092.5815 0.58152458 319;261 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0A0MR89;H0YJL2;A0A0U1RQP8;A0A0D9SFF4;A0A0R4J2G7;A0A0D9SEP4;A0A1D5RMU6;E7ERL8;Q9ULB1;A0A0U1RRK7;F5GYC7;F8WB18 NRXN3;NRXN1 Neurexin-3;Neurexin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.063 73.063 2 0.0066735 74718 QUIQUE_C1218_190116_001 100.02 78.057 793110000 110930000 0 88067000 0 113270000 54507000 119930000 0 70023000 0 99827000 68793000 67761000 38868 319;261 36268 348430;348431;348432;348433;348434;348435;348436;348437;348438 443285;443286;443287;443288;443289;443290;443291;443292;443293 443285 5 SAEAELQSKR Unmodified 1117.5728 0.57275081 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 1 12.493 12.493 3 0.031782 5258 QUIQUE_DMIX1_190116_001 31.843 19.267 3933500 0 0 0 0 0 0 0 3933500 0 0 0 0 0 38869 3117 36269 348439 443294 443294 1 SAECIDEAAER Unmodified 1249.5245 0.52447999 3558 Q8IYS1 PM20D2 Peptidase M20 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 25.565 25.565 2 0.065863 19581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.321 50.068 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38870 3558 36270 348440 443295 443295 1 SAEDLDLLNASFQDESK Unmodified 1880.864 0.86396661 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.6 118.6 2 5.8375E-273 122316 QUIQUE_C1277_190116_001 294.69 267.26 1070900000 0 127740000 75732000 98795000 101140000 88002000 100810000 93025000 83252000 46728000 147010000 108710000 0 38871 723 36271 348441;348442;348443;348444;348445;348446;348447;348448;348449;348450;348451;348452 443296;443297;443298;443299;443300;443301;443302;443303;443304;443305;443306;443307 443297 12 SAEDYNSSNALNVK Unmodified 1510.69 0.68996541 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCM0 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.919 43.919 2 2.1369E-46 40600 QUIQUE_C1277_190116_001 215.87 196.22 970720000 129620000 128270000 101180000 107380000 134670000 89945000 0 112920000 0 79518000 0 87227000 0 38872 2970 36272 348453;348454;348455;348456;348457;348458;348459;348460;348461;348462 443308;443309;443310;443311;443312;443313;443314;443315;443316;443317;443318;443319 443310 11 SAEEAASVLATSISPEQCIK Unmodified 2090.0201 0.02014968 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 109.38 109.38 2 9.5661E-76 113805 QUIQUE_C1576_190116_001 194.12 162.9 118710000 31404000 0 36865000 0 0 0 28956000 0 0 0 0 0 21487000 38873 310;830 36273 348463;348464;348465;348466;348467 443320;443321;443322;443323;443324 443323 4 SAEEEAADLPTKPTK Unmodified 1585.7835 0.78353145 3710 Q8WW12 PCNP PEST proteolytic signal-containing nuclear protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.774 30.774 2 2.7833E-11 25421 QUIQUE_C1438_190116_001 126.12 99.229 136600000 24807000 25078000 0 35809000 0 0 0 20608000 23407000 6891700 0 0 0 38874 3710 36274 348468;348469;348470;348471;348472;348473;348474;348475 443325;443326;443327;443328;443329;443330;443331;443332 443328 8 SAEEGELAESK Unmodified 1148.5197 0.51971219 4093 Q9C0C2 TNKS1BP1 182 kDa tankyrase-1-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 18.635 18.635 2 0.0010999 10789 QUIQUE_C1403_190116_001 90.108 64.971 74380000 58068000 0 0 16312000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38875 4093 36275 348476;348477;348478 443333;443334;443335 443334 3 SAEETFQLSR Unmodified 1166.5568 0.5567664 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.786 49.786 2 0.00014851 47971 QUIQUE_C1576_190116_001 138.06 109.14 326440000 0 0 59292000 0 44961000 41007000 62483000 49768000 0 0 0 0 68926000 38876 1384 36276 348479;348480;348481;348482;348483;348484;348485;348486;348487;348488;348489 443336;443337;443338;443339;443340;443341;443342;443343;443344;443345;443346 443340 10 SAEHTLVDMVQLLFTR Unmodified 1858.9611 0.96111866 3730 Q92538 GBF1 Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 165.67 165.67 3 7.4328E-07 170958 QUIQUE_C1576_190116_001 85.734 79.297 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443435;443436;443437;443438;443439;443440;443441 443441 6 SAFLLQNLLVGHPEHK Unmodified 1801.9839 0.98390301 4350 Q9NZL4 HSPBP1 Hsp70-binding protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 2 1 1 1 1 2 97.306 97.306 3;4 0.00010601 99913 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.823 76.312 670090000 0 0 80056000 30684000 97096000 30524000 91775000 90174000 28347000 19008000 67818000 36809000 97801000 38889 4350 36289 348578;348579;348580;348581;348582;348583;348584;348585;348586;348587;348588;348589;348590;348591;348592;348593 443442;443443;443444;443445;443446;443447;443448;443449;443450;443451;443452;443453;443454;443455;443456;443457;443458;443459;443460 443450 18 SAFLQAFLGR Unmodified 1108.6029 0.60292873 3547 Q8IXI1 RHOT2 Mitochondrial Rho GTPase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.75 125.75 2 0.0051243 129158 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.114 70.686 172430000 0 17937000 18820000 0 21539000 0 0 13882000 26232000 6384000 28579000 24742000 14312000 38890 3547 36290 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Transferrin receptor protein 1;Transferrin receptor protein 1, serum form yes no 0 0 0 1 134.19 134.19 2 0.0045345 139290 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.412 56.749 30602000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30602000 38893 1837 36293 348619 443487 443487 1 SAFSSAETTELSGK Unmodified 1413.6624 0.66235368 3902 Q96LJ7 DHRS1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 53.94 53.94 2 0.0028942 52095 QUIQUE_C1368_190116_001 70.345 58.057 92268000 0 19965000 36398000 0 0 0 0 0 0 0 35906000 0 0 38894 3902 36294 348620;348621;348622 443488;443489;443490 443489 3 SAFTLDGWFK Unmodified 1170.571 0.5709599 3238 Q4G176;A0A3B3ISK9;F5H5A1;F5H362;F5H755 ACSF3 Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 136.33 136.33 2 0.0013142 138780 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.136 53.8 42462000 18977000 0 0 0 0 0 0 17102000 0 6383200 0 0 0 38895 3238 36295 348623;348624;348625;348626 443491;443492;443493;443494;443495 443493 5 SAFTPATATGSSPSPVLGQGEK Unmodified 2089.0328 0.032763277 3161 Q15811;F8W7U0;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000001528 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.78 72.78 2 9.58E-66 73412 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.57 152.14 173170000 0 0 0 28735000 22712000 25180000 24239000 0 27405000 0 0 0 44905000 + 38896 3161 36296 348627;348628;348629;348630;348631;348632 443496;443497;443498;443499;443500;443501 443500 6 SAFTTVLTVSHK Unmodified 1289.698 0.69795133 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 57.247 57.247 3 0.001496 56537 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.252 60.86 118300000 0 0 0 0 0 0 0 0 27164000 0 0 47221000 43912000 38897 3684 36297 348633;348634;348635 443502;443503;443504;443505 443502 4 SAFVVER Unmodified 806.42865 0.42865276 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 29.113 29.113 2 0.059144 23594 QUIQUE_C1576_190116_001 69.998 43.036 117610000 0 0 0 0 0 0 68814000 0 48798000 0 0 0 0 38898 2427 36298 348636;348637 443506;443507 443506 2 SAGACTAAAFLK Unmodified 1166.5754 0.57539335 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.501 59.501 2 0.00034572 57900 QUIQUE_C1563_190116_001 114.5 98.834 4734800000 262180000 0 590400000 517670000 408250000 316440000 336360000 431610000 381740000 112210000 604600000 339020000 434290000 38899 2282 36299 348638;348639;348640;348641;348642;348643;348644;348645;348646;348647;348648;348649 443508;443509;443510;443511;443512;443513;443514;443515;443516;443517;443518;443519;443520;443521 443514 12 SAGDALHEGGGGAEDALGPR Unmodified 1835.8398 0.83981755 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 2 1 48.577 48.577 2;3 0.00044882 45970 QUIQUE_C1403_190116_001 62.966 52.499 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38900 4340 36300 348650;348651;348652 443522;443523;443524 443522 3 SAGDLGIAVCNVPAASVEETADSTLCHILNLYR Unmodified 3515.7025 0.70246772 2989 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 168.96 168.96 3;4 5.2447E-236 173636 QUIQUE_C1218_190116_001 227.41 217.08 1329400000 138130000 209160000 0 56693000 139150000 0 234420000 37613000 79409000 0 273040000 92020000 69739000 38901 2989 36301 348653;348654;348655;348656;348657;348658;348659;348660;348661;348662;348663;348664;348665 443525;443526;443527;443528;443529;443530;443531;443532;443533;443534;443535;443536;443537 443525 13 SAGDVDTLAFDGR Unmodified 1322.6103 0.61025853 1408 O00468;A0A087X208;H0Y5U1 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 74.41 74.41 2 0.032054 73909 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.73 20.345 49776000 0 0 0 0 0 0 0 33242000 0 16533000 0 0 0 38902 1408 36302 348666;348667 443538;443539 443538 1 SAGFHPSGSVLAVGTVTGR Unmodified 1798.9326 0.93259572 1757 O95834;K7EIK7;K7EII6;K7ELB2 EML2 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 70.906 70.906 3 5.1611E-05 71118 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Unmodified 1086.557 0.55704117 4573 Q9Y2Z4;H0YHS6 YARS2 Tyrosine--tRNA ligase, mitochondrial;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 48.159 48.159 2 0.012028 45085 QUIQUE_C1403_190116_001 66.457 35.153 73422000 16159000 19532000 0 17139000 0 0 0 0 0 0 0 20593000 0 38908 4573 36308 348704;348705;348706;348707 443577;443578;443579;443580 443579 3 SAGPQSQLLASVIAEK Unmodified 1597.8675 0.86753585 2382 P35612;A0A1C7CYY0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 3 2 1 2 2 1 104.53 104.53 2;3 2.6257E-06 109226 QUIQUE_C1218_190116_001 135.81 119.56 2965900000 265880000 218470000 199460000 258820000 267070000 203280000 231900000 290640000 184720000 48275000 266360000 184090000 346900000 38909 2382 36309 348708;348709;348710;348711;348712;348713;348714;348715;348716;348717;348718;348719;348720;348721;348722;348723;348724;348725;348726;348727;348728;348729;348730;348731 443581;443582;443583;443584;443585;443586;443587;443588;443589;443590;443591;443592;443593;443594;443595;443596;443597;443598;443599;443600;443601;443602;443603;443604;443605;443606;443607;443608;443609;443610;443611;443612;443613;443614;443615 443583 34 SAGQENLETLK Unmodified 1188.5986 0.59863121 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.328 33.328 2 0.00020243 28482 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.72 94.657 390890000 32046000 38813000 0 0 0 33160000 30858000 0 84758000 21755000 0 53056000 96447000 38910 2515 36310 348732;348733;348734;348735;348736;348737;348738;348739 443616;443617;443618;443619;443620;443621;443622;443623;443624 443620 7 SAGQGEVLVYVEDPAGHQEEAK Unmodified 2312.0921 0.092069069 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.261 76.261 3 2.2685E-07 76601 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.524 54.164 668530000 54124000 63668000 0 0 76843000 0 62349000 84623000 89383000 75623000 92428000 69488000 0 38911 2178 36311 348740;348741;348742;348743;348744;348745;348746;348747;348748;348749 443625;443626;443627;443628;443629;443630;443631;443632;443633;443634;443635;443636;443637;443638;443639 443635 14 SAGSALYASR Unmodified 981.48796 0.48795855 3880 Q96IJ6;A0A087WUI8;F8WD54;C9JAH0 GMPPA Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.999 22.999 2 0.0040375 17206 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.287 53.138 265350000 0 36323000 0 0 26821000 0 0 34250000 45252000 0 59672000 30340000 32689000 38912 3880 36312 348750;348751;348752;348753;348754;348755;348756;348757 443640;443641;443642;443643;443644;443645;443646;443647;443648 443642 9 SAGVQCFGPTAEAAQLESSK Unmodified 2036.9473 0.94731909 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 85.886 85.886 2 0.00046425 88720 QUIQUE_C1438_190116_001 99.511 78.848 279030000 0 37694000 53810000 39295000 53251000 38206000 56770000 0 0 0 0 0 0 38913 2194 36313 348758;348759;348760;348761;348762;348763 443649;443650;443651;443652;443653;443654 443652 5 SAGVQCFGPTAEAAQLESSKR Unmodified 2193.0484 0.048430116 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.461 70.461 3 2.0002E-16 70712 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.131 88.307 590780000 35140000 62914000 69764000 0 0 0 44041000 78004000 0 0 123170000 78000000 99749000 38914 2194 36314 348764;348765;348766;348767;348768;348769;348770;348771;348772 443655;443656;443657;443658;443659;443660;443661;443662;443663;443664;443665;443666 443661 12 SAGWNIPIGLLYCDLPEPR Unmodified 2170.0881 0.088110086 1838 P02787;C9JVG0 TF Serotransferrin yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 1 2 2 3 161.42 161.42 2;3 1.3846E-07 168170 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1312.7139 0.71393574 2929 Q08AE8;K7EMJ7;J3KNG6 SPIRE1 Protein spire homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 105.62 105.62 3 0.004191 108871 QUIQUE_C1277_190116_001 58.676 40.868 8332900 0 8332900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38917 2929 36317 348801;348802;348803 443704;443705;443706 443704 3 SAHFSTLAIK Unmodified 1073.5869 0.58694431 1497 O15294;C9JZL3 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 33.299 33.299 3 0.029459 29426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.228 33.794 99971000 0 0 0 0 0 0 0 42074000 0 0 0 0 57897000 38918 1497 36318 348804;348805 443707;443708 443707 1 SAHLQWMVVR Acetyl (Protein N-term) 1267.6496 0.64956134 1166 H0YLP6;H0YMF4;H0YKD8;P46779 RPL28 60S ribosomal protein L28 yes no 1 0 0 1 98.842 98.842 2 0.0061872 101560 QUIQUE_C1277_190116_001 74.127 24.709 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38919 1166 36319 348806 443709 443709 1 SAIFHFESAVEK Unmodified 1363.6772 0.67721588 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 65.967 65.967 2 0.00053614 65097 QUIQUE_C1368_190116_001 103.18 68.975 209930000 0 0 119870000 0 0 0 0 43663000 46393000 0 0 0 0 38920 1975 36320 348807;348808;348809 443710;443711;443712 443710 3 SAIGEGMTR Unmodified 920.43857 0.43856552 2175;731 P21281;C9JZ02;C9JL73;P15313 ATP6V1B2;ATP6V1B1 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform;V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.259 22.259 2 0.0010237 15714 QUIQUE_C1218_190116_001 107.57 78.425 4602900000 609600000 623830000 457750000 425650000 358330000 364570000 428330000 379880000 0 143940000 470410000 340560000 0 38921 2175;731 36321 348810;348811;348812;348813;348814;348815;348816;348817;348818;348819;348820 443713;443714;443715;443716;443717;443718;443719;443720;443721;443722;443723 443713 6 SAILVPSEK Unmodified 942.5386 0.53859714 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.511 35.511 2 0.013209 32031 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translation initiation factor 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 138.08 138.08 2 5.6013E-161 143448 QUIQUE_C1218_190116_001 244.56 205.38 801520000 206570000 0 0 90883000 195160000 154450000 154450000 0 0 0 0 0 0 38924 1332 36324 348843;348844;348845;348846;348847;348848;348849;348850 443749;443750;443751;443752;443753;443754;443755;443756;443757 443749 9 SAIRDNNPVVVLENELMYGVPFEFPPEAQSK Unmodified 3488.7286 0.72860611 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 168.51 168.51 3 0.045113 170443 QUIQUE_DMIX1_190116_001 28.673 12.403 50605000 0 0 0 0 0 0 0 50605000 0 0 0 0 0 38925 2013 36325 348851 443758 443758 0 SAITIFPQR Unmodified 1031.5764 0.57637963 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 69.423 69.423 2 0.011056 69886 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.26 28.179 18168000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18168000 38926 699 36326 348852;348853;348854;348855;348856;348857;348858 443759;443760;443761;443762;443763;443764;443765 443765 7 SAITPGGLR Unmodified 870.49232 0.49231565 2360 P34897;H0YIZ0 SHMT2 Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial;Serine hydroxymethyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 29.642 29.642 2 0.011056 23793 QUIQUE_C1403_190116_001 73.26 36.865 240280000 0 0 0 42863000 0 0 0 51617000 0 23994000 0 48787000 73023000 38927 2360 36327 348859;348860;348861;348862;348863 443766;443767;443768;443769;443770 443766 5 SAIVHLINYQDDAELATR Unmodified 2028.0276 0.027618319 2084 P14923;C9JTX4;C9J826;C9JK18;C9JKY1 JUP Junction plakoglobin yes no 0 0 0 1 1 1 94.224 94.224 3 0.0016305 95551 QUIQUE_C1403_190116_001 52.814 47.484 120670000 0 0 0 62067000 0 0 0 35520000 0 23084000 0 0 0 38928 2084 36328 348864;348865;348866 443771;443772;443773;443774 443771 4 SAIYGFGDQSNLR Unmodified 1426.6841 0.68409218 3629 Q8NBX0 SCCPDH Saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.873 77.873 2 0.0010746 74809 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isoform yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 159.08 159.08 2;3 9.4998E-25 161447 QUIQUE_DMIX1_190116_001 156.36 150.26 14273000000 1473300000 1043500000 1311400000 1664400000 1008600000 1174500000 936580000 881230000 923370000 297340000 1608600000 963530000 986740000 38938 2309 36337 348937;348938;348939;348940;348941;348942;348943;348944;348945;348946;348947;348948;348949;348950;348951;348952;348953;348954;348955;348956;348957;348958;348959;348960;348961;348962;348963;348964 443856;443857;443858;443859;443860;443861;443862;443863;443864;443865;443866;443867;443868;443869;443870;443871;443872;443873;443874;443875;443876;443877;443878;443879;443880;443881;443882;443883;443884;443885;443886;443887;443888;443889;443890;443891;443892;443893;443894;443895;443896;443897;443898;443899;443900;443901 443879 45 SALDQYR Unmodified 851.41373 0.41373097 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 29.375 29.375 2 0.038851 24145 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.244 52.13 633010000 0 0 0 0 0 0 0 0 633010000 0 0 0 0 38939 3117 36338 348965 443902 443902 1 SALEWYAHK Acetyl (Protein N-term) 1145.5506 0.55055881 3351 Q68D91 MBLAC2 Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 89.024 89.024 2 0.053313 85887 QUIQUE_DMIX4_190116_001 41.631 24.246 134780000 55923000 54413000 0 0 0 0 0 0 0 24445000 0 0 0 38940 3351 36339 348966;348967;348968 443903;443904;443905 443905 2 SALFAQLNQGEAITK Unmodified 1589.8413 0.8413211 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.689 92.689 2 1.8884E-36 95103 QUIQUE_C1277_190116_001 176.78 145.28 3120300000 287910000 286300000 302090000 287820000 273270000 251330000 312190000 150380000 110140000 113420000 241040000 232040000 272390000 38941 2422 36340 348969;348970;348971;348972;348973;348974;348975;348976;348977;348978;348979;348980;348981 443906;443907;443908;443909;443910;443911;443912;443913;443914;443915;443916;443917;443918;443919;443920;443921 443909 15 SALFLLEHQADINVR Unmodified 1724.921 0.9209684 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 103.44 103.44 2;3 6.1116E-10 107685 QUIQUE_C1218_190116_001 109.83 97.689 241970000 23828000 38053000 0 32261000 27266000 0 0 31465000 30585000 9825700 0 33812000 14876000 38942 4390 36341 348982;348983;348984;348985;348986;348987;348988;348989;348990;348991;348992 443922;443923;443924;443925;443926;443927;443928;443929;443930;443931;443932 443922 8 SALIAALCDKDVETLEAPEGRPDSGVPSLR Unmodified 3165.5976 0.59759194 3725 Q8WZA9;M0QZP8 IRGQ Immunity-related GTPase family Q protein yes no 0 0 2 1 1 115.93 115.93 4 1.7692E-05 119793 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.76 37.236 94091000 0 0 0 0 38873000 0 0 0 0 0 0 55218000 0 38943 3725 36342 348993;348994 443933;443934;443935 443935 3 SALILCYGHVAAR Unmodified 1429.75 0.75000367 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 60.51 60.51 2 0.0061093 59789 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.657 25.914 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38944 934 36343 348995 443936 443936 1 SALLALGLK Unmodified 884.5695 0.56950333 2949 Q12874 SF3A3 Splicing factor 3A subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.714 86.714 2 0.013967 89348 QUIQUE_C1438_190116_001 69.198 27.896 469290000 40209000 43573000 37915000 38275000 48055000 36483000 41719000 0 39936000 19914000 47124000 42725000 33362000 38945 2949 36344 348996;348997;348998;348999;349000;349001;349002;349003;349004;349005;349006;349007 443937;443938;443939;443940;443941;443942;443943;443944;443945;443946;443947;443948 443941 10 SALLSVQYSSTSSDRPVVK Unmodified 2023.0586 0.058584096 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 64.292 64.292 2;3 1.2847E-131 64673 QUIQUE_C1218_190116_001 257.91 236.95 13619000000 915000000 890530000 945070000 911770000 777600000 856100000 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yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 154.39 154.39 3 1.7898E-22 159625 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.43 89.627 1484200000 49809000 82018000 246260000 109850000 61839000 193960000 134670000 94290000 184490000 42630000 0 284410000 0 38948 4111 36347 349035;349036;349037;349038;349039;349040;349041;349042;349043;349044;349045;349046;349047;349048;349049;349050 443983;443984;443985;443986;443987;443988;443989;443990;443991;443992;443993;443994;443995;443996;443997;443998 443995 2863 12 SALQAIGVEAHQAVMIGDDIVGDVGGAQR Unmodified 2876.4451 0.44505446 4111 Q9H008 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 3 1 2 4 2 3 2 3 1 158.45 158.45 3;4 1.7503E-24 162281 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.802 69.781 5807300000 121880000 113330000 284580000 614920000 111160000 0 436340000 867140000 851060000 208860000 974720000 1100200000 123180000 38949 4111 36347 349051;349052;349053;349054;349055;349056;349057;349058;349059;349060;349061;349062;349063;349064;349065;349066;349067;349068;349069;349070;349071;349072;349073;349074 443999;444000;444001;444002;444003;444004;444005;444006;444007;444008;444009;444010;444011;444012;444013;444014;444015;444016;444017;444018;444019;444020;444021;444022;444023;444024;444025;444026;444027;444028;444029;444030;444031;444032;444033 444030 29 SALSGHLETVILGLLK Unmodified 1649.9716 0.97160699 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;A6NMY6;H0YKS4;H0YNP5;H0YMM1;H0YKZ7;H0YLV6;H0YMT9;H0YKX9;H0YKL9;H0YMW4 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 2 2 2 7 4 3 8 3 7 5 3 2 6 156.96 156.96 2;3 4.0637E-95 155408 QUIQUE_C1403_190116_001 245.92 199.22 47978000000 1316800000 815490000 5243000000 6617200000 2162500000 1730500000 7506300000 1323400000 8548100000 2521100000 4197000000 1902900000 4093600000 38950 1920 36348 349075;349076;349077;349078;349079;349080;349081;349082;349083;349084;349085;349086;349087;349088;349089;349090;349091;349092;349093;349094;349095;349096;349097;349098;349099;349100;349101;349102;349103;349104;349105;349106;349107;349108;349109;349110;349111;349112;349113;349114;349115;349116;349117;349118;349119;349120;349121;349122;349123;349124;349125;349126;349127;349128 444034;444035;444036;444037;444038;444039;444040;444041;444042;444043;444044;444045;444046;444047;444048;444049;444050;444051;444052;444053;444054;444055;444056;444057;444058;444059;444060;444061;444062;444063;444064;444065;444066;444067;444068;444069;444070;444071;444072;444073;444074;444075;444076;444077;444078;444079;444080;444081;444082;444083;444084;444085;444086;444087;444088;444089;444090;444091;444092;444093;444094;444095;444096;444097;444098;444099;444100;444101;444102 444048 64 SALSIVR Unmodified 744.44939 0.4493882 2580 P51452;K7ELG5 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 34.749 34.749 2 0.019682 30911 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.89 62.89 662880000 115770000 0 89381000 0 0 0 0 85212000 103990000 45355000 0 103260000 119910000 38951 2580 36349 349129;349130;349131;349132;349133;349134;349135 444103;444104;444105;444106;444107;444108;444109;444110;444111;444112 444106 10 SALTIQFFQK Unmodified 1181.6445 0.64445919 1447 O14807 MRAS Ras-related protein M-Ras yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 102.85 102.85 2 0.0009006 107224 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.44 88.775 252910000 0 0 0 0 0 0 58296000 36494000 35791000 22316000 37951000 27615000 34449000 38952 1447 36350 349136;349137;349138;349139;349140;349141;349142 444113;444114;444115;444116;444117;444118;444119 444117 6 SALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYR Unmodified 2966.4298 0.42978155 1808;1807;1809 P01116;P01112;P01111 KRAS;HRAS;NRAS GTPase KRas;GTPase KRas, N-terminally processed;GTPase HRas;GTPase HRas, N-terminally processed;GTPase NRas no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.9 141.9 3 1.0034E-128 145986 QUIQUE_C1403_190116_001 198.05 186.84 2632100000 186130000 202120000 284010000 233560000 163500000 194980000 349950000 122490000 205460000 92900000 262440000 142180000 192400000 38953 1809;1808;1807 36351 349143;349144;349145;349146;349147;349148;349149;349150;349151;349152;349153;349154;349155 444120;444121;444122;444123;444124;444125;444126;444127;444128;444129;444130;444131;444132;444133 444124 14 SALTIQLIQNHFVDEYDPTIEDSYRK Unmodified 3094.5247 0.52474457 1808;1807;1809 P01116;P01112;P01111 KRAS;HRAS;NRAS GTPase KRas;GTPase KRas, N-terminally processed;GTPase HRas;GTPase HRas, N-terminally processed;GTPase NRas no no 0 0 1 1 1 1 1 1 128.96 128.96 3;4 1.9117E-11 134982 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.888 71.277 480940000 0 86845000 77618000 0 0 0 0 167780000 62037000 0 86666000 0 0 38954 1809;1808;1807 36352 349156;349157;349158;349159;349160 444134;444135;444136;444137;444138;444139 444139 6 SALTPPTDMPTPTTDKITQAAMETIYLCK Acetyl (Protein N-term) 3236.5655 0.56548845 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 1 0 1 1 159.52 159.52 3 4.7108E-12 161989 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.972 56.825 39429000 0 0 0 0 0 0 0 39429000 0 0 0 0 0 38955 3433 36353 349161 444140 444140 1 SALTVQFVQGIFVEK Unmodified 1664.9138 0.91375776 2719;2765 P61224;E7ESV4;F5H7Y6;F5GX62;A6NIZ1;F5H6R7;F5H004;F5H077;F5GWU8;F5H491;F5H0B7;F5H500;F5GYB5;F5H4H0;F5GYH7;F8WBC0;P62834;A0A075B6Q0 RAP1B;RAP1A Ras-related protein Rap-1b;Ras-related protein Rap-1b-like protein;Ras-related protein Rap-1A no no 0 0 0 3 4 5 5 3 2 1 5 3 1 3 4 3 142.46 142.46 2;3 2.8184E-18 145695 QUIQUE_C1403_190116_001 143.17 110.22 1077100000 51354000 85423000 126630000 126390000 82171000 62876000 39113000 110370000 104440000 27206000 61362000 115680000 84079000 38956 2719;2765 36354 349162;349163;349164;349165;349166;349167;349168;349169;349170;349171;349172;349173;349174;349175;349176;349177;349178;349179;349180;349181;349182;349183;349184;349185;349186;349187;349188;349189;349190;349191;349192;349193;349194;349195;349196;349197;349198;349199;349200;349201;349202;349203 444141;444142;444143;444144;444145;444146;444147;444148;444149;444150;444151;444152;444153;444154;444155;444156;444157;444158;444159;444160;444161;444162;444163;444164;444165;444166;444167;444168;444169;444170;444171;444172;444173;444174;444175;444176;444177;444178;444179;444180;444181;444182;444183;444184;444185;444186;444187;444188;444189;444190;444191;444192;444193;444194;444195;444196;444197;444198 444158 50 SALVQIYELEEHKIETWR Unmodified 2243.1586 0.15863249 1042 F8VYY9;P54619;H0YIC9;F8VPF5;F8VVA3;F8VZX1;F8VSL2 PRKAG1 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1 yes no 0 0 1 1 1 123.31 123.31 4 5.7596E-05 128786 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.479 78.089 53529000 0 0 0 0 0 15416000 0 0 0 0 38113000 0 0 38957 1042 36355 349204;349205 444199;444200 444200 1 SALWDSGLDYLHGTGHGVGSFLNVHEGPCGISYK Unmodified 3629.6998 0.6997656 4259 Q9NQW7;Q5T6H7 XPNPEP1 Xaa-Pro aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 133.26 133.26 4;5 1.6552E-10 138506 QUIQUE_C1368_190116_001 62.383 57.669 640710000 43536000 50844000 54547000 0 68241000 0 123330000 0 90156000 0 100300000 0 109760000 38958 4259 36356 349206;349207;349208;349209;349210;349211;349212;349213 444201;444202;444203;444204;444205;444206;444207;444208 444203 8 SALYYVDLIGGK Unmodified 1297.6918 0.69180331 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.42 119.42 2 0.0005192 124822 QUIQUE_C1576_190116_001 95.573 79.424 2059800000 160060000 180390000 181280000 201360000 157640000 138600000 181120000 153950000 181010000 83246000 61784000 169210000 210140000 38959 727 36357 349214;349215;349216;349217;349218;349219;349220;349221;349222;349223;349224;349225;349226 444209;444210;444211;444212;444213;444214;444215;444216;444217;444218;444219;444220;444221;444222;444223;444224;444225;444226;444227;444228;444229;444230;444231;444232;444233;444234;444235 444224 27 SAMGELYER Unmodified 1054.4753 0.47534495 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.779 46.779 2 0.020019 44049 QUIQUE_C1277_190116_001 74.301 32.409 377490000 62593000 49715000 0 0 44145000 0 79770000 0 0 0 83711000 0 57561000 38960 2033 36358 349227;349228;349229;349230;349231;349232 444236;444237;444238;444239;444240;444241;444242 444237 7 SAMGMFVDAFSK Unmodified 1289.5784 0.57842982 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 130.34 130.34 2 0.023616 134984 QUIQUE_C1218_190116_001 51.998 38.419 18235000 18235000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38961 3555 36359 349233 444243 444243 1 SAMSVQSSLVMHPIYAYGSEEQR Unmodified 2569.1941 0.19410807 3771 Q92947;K7EKT3;K7EKH1 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.6 101.6 3 1.3548E-23 103826 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.41 90.823 820270000 78274000 73476000 102770000 65135000 59112000 0 97703000 114350000 0 0 70793000 74789000 83869000 38962 3771 36360 349234;349235;349236;349237;349238;349239;349240;349241;349242;349243 444244;444245;444246;444247;444248;444249;444250;444251;444252;444253;444254;444255;444256 444251 13 SANFLDHLYVGIPR Unmodified 1600.8362 0.83617614 991 F5GXC5;Q8TB96;H3BUJ1 ITFG1 T-cell immunomodulatory protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 118.01 118.01 3 5.5879E-05 121617 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.967 64.617 182880000 33884000 32855000 38765000 0 0 36431000 0 11859000 17688000 11403000 0 0 0 38963 991 36361 349244;349245;349246;349247;349248;349249;349250 444257;444258;444259;444260;444261;444262;444263 444262 4 SANGFPYREDEEGAFGEHGSQGTYSNTK Unmodified 3034.2965 0.29653555 2009 P11137;E7EV03;A8MZ31 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 62.422 62.422 4 0.02842 60986 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.642 20.951 53006000 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444266;444267;444268;444269;444270;444271;444272;444273;444274;444275;444276;444277;444278;444279;444280;444281;444282;444283;444284;444285;444286;444287;444288;444289;444290;444291;444292;444293;444294;444295;444296;444297;444298;444299;444300;444301;444302;444303;444304;444305;444306;444307;444308;444309;444310;444311;444312;444313;444314;444315;444316;444317;444318;444319;444320;444321;444322;444323 444269 58 SANPQDHPVIQPNYLSTETDIEDFR Unmodified 2885.3468 0.34678021 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.29 113.29 3 9.8025E-18 117183 QUIQUE_C1368_190116_001 100.88 94.515 925690000 44167000 58008000 70048000 0 61467000 35662000 55399000 93667000 119280000 0 139140000 131430000 117420000 38967 3643 36365 349282;349283;349284;349285;349286;349287;349288;349289;349290;349291;349292 444324;444325;444326;444327;444328;444329;444330;444331;444332;444333;444334 444326 11 SANSELGGIWSVGQR Unmodified 1559.7692 0.76921879 925 E9PGT6;Q99627 COPS8 COP9 signalosome complex subunit 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.525 96.525 2 1.1049E-08 93984 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.84 106.81 1573400000 163620000 165200000 147550000 122370000 151720000 127170000 136460000 141420000 0 57704000 0 153950000 206280000 38968 925 36366 349293;349294;349295;349296;349297;349298;349299;349300;349301;349302;349303 444335;444336;444337;444338;444339;444340;444341;444342;444343;444344;444345;444346 444344 12 SANSWLAEKK Unmodified 1132.5877 0.58767259 1566 O60268;H3BMU3 KIAA0513 Uncharacterized protein KIAA0513 yes no 0 0 1 1 22.152 22.152 2 0.0036155 15547 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.886 57.276 29677000 0 0 0 0 0 0 0 29677000 0 0 0 0 0 38969 1566 36367 349304 444347 444347 1 SANVNEFPVLK Unmodified 1216.6452 0.64518747 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 70.681 70.681 2 0.00045661 70547 QUIQUE_C1403_190116_001 105.4 84.696 370520000 0 0 0 101130000 0 0 0 61262000 0 0 118620000 89502000 0 38970 2657 36368 349305;349306;349307;349308;349309 444348;444349;444350;444351;444352;444353 444349 5 SANYCHTSQGDPIGLILLGEVALGNMYELK Unmodified 3262.6002 0.60023448 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 169.82 169.82 3 7.1227E-36 175164 QUIQUE_C1576_190116_001 103.95 87.332 172660000 22345000 0 0 0 0 0 64739000 47153000 0 0 0 38420000 0 38971 1974 36369 349310;349311;349312;349313 444354;444355;444356;444357 444355 4 SAPAGSSHPAASAR Acetyl (Protein N-term) 1307.6218 0.62182627 1734 O95487 SEC24B Protein transport protein Sec24B yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.544 14.544 2 5.4741E-05 6746 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.342 59.071 252150000 23417000 14131000 0 27831000 30371000 0 18070000 26856000 32119000 0 29311000 14783000 35259000 38972 1734 36370 349314;349315;349316;349317;349318;349319;349320;349321;349322;349323;349324 444358;444359;444360;444361;444362;444363;444364;444365;444366;444367;444368 444365 10 SAPCGSLAFSGDR Unmodified 1323.5877 0.58774895 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.977 47.977 2 0.0057997 46121 QUIQUE_C1438_190116_001 69.01 55.743 147970000 0 0 0 0 0 0 0 50558000 0 0 0 0 97407000 38973 921 36371 349325;349326;349327;349328;349329 444369;444370;444371;444372;444373 444370 5 SAPDISFTIDANK Unmodified 1377.6776 0.67760981 4608;1367;1350 K7ERH7;M0QZ28;M0R021;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 87.726 87.726 2 0.0020186 90032 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.659 42.315 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38974 1350;1367;4608 36372 349330 444374 444374 1 SAPEVTAPGAPAYR Unmodified 1385.6939 0.69392858 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;O95317;Q9UES5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 48.976 48.976 2 0.014798 47784 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.08 27.141 262890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 125150000 0 137730000 38975 4607 36373 349331;349332 444375;444376 444375 2 SAPFIECHGR Unmodified 1172.5397 0.53967654 494 A0A3B3ISV3;P02462;P29400 COL4A1;COL4A5 Collagen alpha-1(IV) chain;Arresten;Collagen alpha-5(IV) chain yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 22.732 22.732 2;3 0.0013628 16229 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.19 0 2564200000 143300000 547820000 223000000 0 197750000 76975000 136770000 229930000 177540000 0 243530000 272420000 315160000 38976 494 36374 349333;349334;349335;349336;349337;349338;349339;349340;349341;349342;349343;349344;349345;349346;349347 444377;444378;444379;444380;444381;444382;444383;444384;444385;444386;444387;444388;444389;444390;444391 444386 9 SAPLIADQAVLQLLPK Unmodified 1675.9873 0.98725705 195 A0A0R4J2G3;A0A0A0MTJ9;Q6PIU2 NCEH1 Neutral cholesterol ester hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 146.52 146.52 2 0.0029265 153385 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.338 82.152 176890000 0 29473000 0 0 0 0 0 0 32347000 10862000 40562000 28258000 35390000 38977 195 36375 349348;349349;349350;349351;349352;349353 444392;444393;444394;444395;444396;444397 444395 3 SAPLPNDSQAR Unmodified 1154.568 0.56799978 2505 P48426 PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha yes yes 0 0 0 1 19.339 19.339 2 0.015274 12632 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.785 39.113 1719700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1719700000 0 0 38978 2505 36376 349354 444398 444398 1 SAPSATPIFAPGENCSPAWGAAPAAYDAADTHLR Acetyl (Protein N-term) 3481.5997 0.5997172 3064 Q14353;A0A1W2PR36 GAMT Guanidinoacetate N-methyltransferase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.74 139.74 3 1.2358E-38 144845 QUIQUE_C1368_190116_001 95.435 89.834 357720000 0 60417000 45318000 70817000 45594000 48296000 39771000 0 0 0 0 0 47506000 38979 3064 36377 349355;349356;349357;349358;349359;349360;349361 444399;444400;444401;444402;444403;444404;444405 444400 7 SAPYEFPEESPIEQLEER Unmodified 2148.9851 0.98514438 2854 Q01433;H0Y360;H0YCL9;E9PIJ1;E9PJF6 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 128.91 128.91 2;3 3.8123E-05 134348 QUIQUE_C1218_190116_001 96.135 82.171 642080000 60452000 68372000 0 54331000 51953000 53553000 53381000 60589000 66644000 29436000 79748000 0 63622000 38980 2854 36378 349362;349363;349364;349365;349366;349367;349368;349369;349370;349371;349372;349373;349374;349375;349376 444406;444407;444408;444409;444410;444411;444412;444413;444414;444415;444416;444417;444418;444419;444420 444406 11 SAPYEFPEESPIEQLEERR Unmodified 2305.0863 0.08625541 2854 Q01433;H0Y360;H0YCL9;E9PIJ1;E9PJF6 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 1 1 113.61 113.61 3 0.0019038 116154 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.672 30.05 64474000 0 0 0 0 0 0 0 64474000 0 0 0 0 0 38981 2854 36379 349377 444421 444421 1 SAQASVSCALEALEPFWEVLVR Unmodified 2461.2311 0.23114551 4402 Q9UBN7;A0A2R8YDE6;A0A2R8YCS4 HDAC6 Histone deacetylase 6 yes no 0 0 0 1 1 1 174.42 174.42 3 1.9167E-05 181648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.064 57.411 50145000 0 0 0 0 0 0 0 0 6793000 0 22139000 21213000 0 38982 4402 36380 349378;349379;349380 444422;444423;444424 444423 3 SAQEEITEYRR Unmodified 1380.6634 0.66335673 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 28.632 28.632 2;3 0.00010187 23166 QUIQUE_C1576_190116_001 116.77 86.83 1632700000 43144000 114300000 55417000 35790000 76707000 35893000 257510000 0 188250000 31761000 338550000 181100000 274260000 38983 2033 36381 349381;349382;349383;349384;349385;349386;349387;349388;349389;349390;349391;349392;349393;349394;349395;349396;349397;349398 444425;444426;444427;444428;444429;444430;444431;444432;444433;444434;444435;444436;444437;444438;444439;444440;444441;444442;444443;444444;444445;444446;444447;444448 444436 23 SAQFLYPAAQLQHLWR Unmodified 1928.0057 0.0057010855 4292 Q9NTJ4 MAN2C1 Alpha-mannosidase 2C1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 127.84 127.84 2;3 4.2213E-06 131634 QUIQUE_C1403_190116_001 101.62 90.808 603090000 40737000 41144000 35553000 34565000 50685000 49807000 47724000 63255000 75114000 19593000 0 73701000 71208000 38984 4292 36382 349399;349400;349401;349402;349403;349404;349405;349406;349407;349408;349409;349410;349411 444449;444450;444451;444452;444453;444454;444455;444456;444457;444458;444459;444460;444461;444462;444463;444464 444453 13 SAQHYTETALDEIK Unmodified 1604.7682 0.76821573 2808 P78362;C9J2M4;C9JWF7 SRPK2 SRSF protein kinase 2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes no 0 0 0 1 1 1 57.554 57.554 2 0.00018969 56949 QUIQUE_C1218_190116_001 108.17 63.745 87436000 20263000 0 0 37422000 0 0 0 0 0 0 0 29750000 0 38985 2808 36383 349412;349413;349414 444465;444466;444467;444468 444465 4 SASACSTPTHTPQDSLTGVGGDVQEAFAQSSR Unmodified 3248.464 0.46401158 4608;1367 M0QZ28;M0R0C4;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 0 1 1 102.86 102.86 3 2.2029E-47 105364 QUIQUE_C1403_190116_001 128.49 120.21 112860000 0 0 0 53552000 0 59308000 0 0 0 0 0 0 0 38986 1367;4608 36384 349415;349416 444469;444470 444469 2 SASAEAANEIHYIPSVLIGGHGR Unmodified 2348.1873 0.18730686 1429 O14525;B1AJS1 ASTN1 Astrotactin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 94.581 94.581 3 0.00011002 97339 QUIQUE_C1277_190116_001 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Unmodified 1133.5751 0.575059 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 47.318 47.318 2 0.0049661 44476 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.1 45.324 376980000 0 88314000 0 0 0 0 0 0 0 0 149400000 0 139260000 38995 1802 36393 349463;349464;349465;349466 444523;444524;444525;444526 444526 4 SASQMFELIHK Unmodified 1289.6438 0.64380726 305 A0A0J9YYF7;Q86T65 DAAM2 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2 yes no 0 0 0 1 72.587 72.587 3 0.056071 73272 QUIQUE_DMIX3_190116_001 22.142 12.63 31808000 0 0 0 0 0 0 0 0 31808000 0 0 0 0 38996 305 36394 349467 444527 444527 1 SASQSSLDKLDQELKEQQK Unmodified 2161.0863 0.08625541 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 2 1 61.712 61.712 3 0.00051483 60237 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.449 67.836 23529000 0 0 0 0 0 0 0 23529000 0 0 0 0 0 38997 1567 36395 349468 444528 444528 1 SASQYFLEAYNTISEQAVK Unmodified 2148.0375 0.037514303 1424 O14490;Q6IS01 DLGAP1 Disks large-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 147.37 147.37 2 2.8452E-22 153450 QUIQUE_C1218_190116_001 174.95 162.68 209810000 25464000 0 39626000 0 38416000 0 28165000 0 0 0 0 40446000 37688000 38998 1424 36396 349469;349470;349471;349472;349473;349474;349475 444529;444530;444531;444532;444533;444534;444535;444536;444537 444529 9 SASSDTSEELNSQDSPPK Unmodified 1877.8127 0.81265932 1441 O14745;J3QRP6 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes no 0 0 0 1 1 31.914 31.914 2 4.4749E-07 26785 QUIQUE_C1403_190116_001 136.24 118.43 38384000 0 0 0 22190000 0 16194000 0 0 0 0 0 0 0 38999 1441 36397 349476;349477 444538;444539 444538 2 SASSGAEGDVSSER Unmodified 1337.5695 0.56951593 3688 Q8TEA8 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.473 15.473 2 1.7429E-07 7877 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.22 102.51 303410000 60914000 0 53224000 60002000 58598000 39333000 0 0 0 0 0 0 31339000 39000 3688 36398 349478;349479;349480;349481;349482;349483;349484;349485;349486 444540;444541;444542;444543;444544;444545;444546;444547;444548 444546 7 SASSGAEGDVSSEREP Unmodified 1563.6649 0.66487288 3688 Q8TEA8 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.033 24.033 2 2.1479E-23 17709 QUIQUE_C1218_190116_001 184.31 168.42 1052200000 107970000 93142000 169170000 83133000 0 50131000 92063000 81157000 83940000 34726000 129570000 127230000 0 39001 3688 36399 349487;349488;349489;349490;349491;349492;349493;349494;349495;349496;349497 444549;444550;444551;444552;444553;444554;444555;444556;444557;444558;444559 444549 11 SASVQGFFLNHYLSK Unmodified 1696.8573 0.85730551 3592 Q8N4Q0 ZADH2 Zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 104 104 3 0.015562 105928 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.517 34.991 39065000 0 0 0 0 0 0 0 39065000 0 0 0 0 0 39002 3592 36400 349498 444560 444560 1 SASYKPVFVTEITDDLHFYVQDVETGTQLEK Unmodified 3558.7406 0.74061059 3432 Q7KZF4;H7C597 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 158.03 158.03 3;4 6.9103E-31 162762 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.189 92.529 958460000 0 144570000 0 0 0 0 85303000 87747000 98700000 0 277040000 86196000 178910000 39003 3432 36401 349499;349500;349501;349502;349503;349504;349505;349506;349507 444561;444562;444563;444564;444565;444566;444567;444568;444569 444569 8 SATAATAPPAAPAGEGGPPAPPPNLTSNR Acetyl (Protein N-term) 2679.3253 0.3252569 1062 J3QRU4;F8WCA0;L7N2F9;P63027 VAMP2 Vesicle-associated membrane protein 2 yes no 1 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 2 3 2 93.945 93.945 2;3 5.8638E-57 95994 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.98 143.35 5818000000 493900000 484250000 526520000 702570000 463340000 509660000 416650000 369870000 340800000 206860000 451870000 307500000 544160000 39004 1062 36402 349508;349509;349510;349511;349512;349513;349514;349515;349516;349517;349518;349519;349520;349521;349522;349523;349524;349525;349526;349527;349528;349529;349530;349531;349532;349533;349534 444570;444571;444572;444573;444574;444575;444576;444577;444578;444579;444580;444581;444582;444583;444584;444585;444586;444587;444588;444589;444590;444591;444592;444593;444594;444595;444596;444597;444598;444599;444600;444601;444602;444603;444604;444605;444606;444607;444608;444609;444610;444611;444612;444613;444614;444615;444616;444617;444618 444604 49 SATAATAPPAAPAGEGGPPAPPPNLTSNRR Acetyl (Protein N-term) 2835.4264 0.42636793 1062 J3QRU4;F8WCA0;L7N2F9;P63027 VAMP2 Vesicle-associated membrane protein 2 yes no 1 0 1 2 1 1 77.115 77.115 2;3 6.0202E-63 76929 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.05 133.46 348460000 0 0 0 0 0 0 0 161850000 73968000 0 0 112640000 0 39005 1062 36403 349535;349536;349537;349538 444619;444620;444621;444622;444623 444619 5 SATADQEFSKEDMAK Unmodified 1656.7301 0.73011567 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 29.154 29.154 2;3 2.3668E-05 23790 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.92 88.237 131940000 0 0 0 57714000 0 0 0 0 0 0 41401000 0 32825000 39006 4304 36404 349539;349540;349541 444624;444625;444626 444625 3 SATASPQQPQAQQR Unmodified 1496.7332 0.73316763 309 A0A0U1RQI5 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 13.139 13.139 2 1.2671E-100 3302 QUIQUE_C1277_190116_001 251.8 198.05 996420000 34570000 106160000 36491000 27465000 60807000 51896000 73090000 167250000 78235000 22559000 112440000 28436000 197020000 39007 309 36405 349542;349543;349544;349545;349546;349547;349548;349549;349550;349551;349552;349553;349554;349555;349556 444627;444628;444629;444630;444631;444632;444633;444634;444635;444636;444637;444638;444639;444640;444641;444642;444643;444644;444645;444646;444647 444628 21 SATAVPAGLGATEQTQEGLTGK Unmodified 2086.0542 0.054227 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.595 74.595 2 1.0506E-05 74708 QUIQUE_C1403_190116_001 102.65 82.064 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39008 4517 36406 349557;349558;349559;349560 444648;444649;444650;444651 444650 4 SATEPGPPGYSVSPAVPGR Unmodified 1824.9006 0.90062689 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 69.904 69.904 2;3 6.0018E-36 71147 QUIQUE_C1218_190116_001 195.71 180.17 5379400000 244700000 305030000 200700000 416530000 343600000 344400000 276080000 547210000 741180000 262930000 571840000 479620000 645540000 39009 3093 36407 349561;349562;349563;349564;349565;349566;349567;349568;349569;349570;349571;349572;349573;349574;349575;349576;349577;349578;349579 444652;444653;444654;444655;444656;444657;444658;444659;444660;444661;444662;444663;444664;444665;444666;444667;444668;444669;444670;444671;444672;444673;444674;444675;444676 444653 25 SATLASIDAELQK Unmodified 1345.7089 0.70890994 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.711 85.711 2 0.0029374 83177 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.47 91.632 551150000 86538000 0 0 68881000 85193000 83771000 0 0 96898000 44443000 0 85424000 0 39010 2355 36408 349580;349581;349582;349583;349584;349585;349586;349587 444677;444678;444679;444680;444681;444682;444683;444684 444682 6 SATLLQLITK Unmodified 1086.6649 0.66486028 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 111.54 111.54 1;2 0.0040375 115233 QUIQUE_C1368_190116_001 82.287 64.729 1801000000 271310000 201780000 134650000 168180000 193740000 169070000 179890000 0 95448000 0 164620000 91630000 130670000 39011 1108;1404 36409 349588;349589;349590;349591;349592;349593;349594;349595;349596;349597;349598;349599 444685;444686;444687;444688;444689;444690;444691;444692;444693;444694;444695;444696;444697;444698;444699;444700 444688 13 SATLMVYEDVVQIVSGFQGAR Unmodified 2269.1413 0.14126787 3334 Q5VUB5 FAM171A1 Protein FAM171A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 172.04 172.04 3 8.1691E-27 176231 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.092 94.335 65430000 0 10444000 0 0 0 0 20517000 0 34468000 0 0 0 0 39012 3334 36410 349600;349601;349602 444701;444702;444703 444703 3 SATLPLPAR Unmodified 924.53927 0.53926584 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.327 47.327 2 0.0020096 44092 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.798 64.283 567210000 46829000 43683000 0 68405000 54242000 52145000 39233000 47110000 67694000 15715000 33592000 32325000 66233000 39013 309;4058 36411 349603;349604;349605;349606;349607;349608;349609;349610;349611;349612;349613;349614 444704;444705;444706;444707;444708;444709;444710;444711;444712;444713;444714;444715;444716;444717;444718;444719;444720 444720 16 SATSSSVSNVVITK Unmodified 1378.7304 0.73037367 2449 P42566;B1AUU8 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 38.417 38.417 2 0.000449 34733 QUIQUE_C1403_190116_001 85.288 67.852 138990000 0 0 30563000 25405000 0 42556000 0 0 0 0 0 0 40470000 39014 2449 36412 349615;349616;349617;349618;349619;349620;349621;349622;349623 444721;444722;444723;444724;444725;444726;444727;444728;444729 444722 9 SATSWFLVSSSGAR Acetyl (Protein N-term) 1496.726 0.72595699 1280 J3KQR7;Q9Y4F5 CEP170B Centrosomal protein of 170 kDa protein B yes no 1 0 0 1 145.33 145.33 2 0.0013124 150506 QUIQUE_C1218_190116_001 71.153 62.408 39096000 39096000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39015 1280 36413 349624 444730 444730 1 SATYVNTEGR Unmodified 1096.5149 0.51490158 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 18.925 18.925 2 1.341E-07 11381 QUIQUE_C1563_190116_001 166.52 135.9 3309500000 0 0 620770000 0 357840000 493620000 537170000 0 526960000 241600000 0 0 531580000 39016 2280 36414 349625;349626;349627;349628;349629;349630;349631 444731;444732;444733;444734;444735;444736;444737;444738;444739;444740;444741 444735 11 SAVADKHELLSLASSNHLGK Unmodified 2076.0964 0.096366586 600 B3KS98;O15372;A0A087WZK9;E5RJT0 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 1 1 58.114 58.114 4 0.029977 56599 QUIQUE_C1403_190116_001 27.924 13.452 113920000 0 0 0 113920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39017 600 36415 349632 444742 444742 1 SAVAWEER Unmodified 946.45084 0.45084476 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 33.398 33.398 2 0.034212 28671 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.207 12.751 44905000 0 0 0 0 0 0 0 44905000 0 0 0 0 0 39018 1472 36416 349633 444743 444743 1 SAVDQAGGAQIVIDHLR Unmodified 1748.9169 0.91694566 2605 P52306;D6RHH8 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 88.986 88.986 2;3 2.6922E-63 90663 QUIQUE_DMIX7_190116_001 192.86 166.82 3353200000 225600000 360070000 309250000 225240000 241090000 269110000 302260000 154890000 273000000 97187000 358650000 271890000 265030000 39019 2605 36417 349634;349635;349636;349637;349638;349639;349640;349641;349642;349643;349644;349645;349646;349647;349648;349649;349650;349651;349652;349653;349654;349655;349656;349657;349658 444744;444745;444746;444747;444748;444749;444750;444751;444752;444753;444754;444755;444756;444757;444758;444759;444760;444761;444762;444763;444764;444765;444766;444767;444768;444769;444770;444771;444772;444773;444774;444775;444776;444777;444778;444779 444776 36 SAVEDEGLK Unmodified 946.46074 0.46074075 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.349 20.349 2 0.00072286 13505 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.41 42.025 14957000000 0 0 1760400000 2057100000 1740400000 2196800000 1296500000 1033100000 1827300000 0 0 1521700000 1523300000 39020 282 36418 349659;349660;349661;349662;349663;349664;349665;349666;349667;349668 444780;444781;444782;444783;444784;444785;444786;444787;444788;444789;444790;444791;444792;444793 444790 14 SAVEEMEAEEAAAK Unmodified 1463.645 0.64498906 1024 F6SYF8;Q9UBP4;E9PKK9;E9PHY3;E9PKW6 DKK3 Dickkopf-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 66.162 66.162 2 0.00073832 65405 QUIQUE_C1277_190116_001 81.92 64.1 74258000 0 27661000 0 0 0 31820000 0 0 0 14776000 0 0 0 39021 1024 36419 349669;349670;349671;349672 444794;444795;444796;444797 444794 4 SAVENCQDSWR Unmodified 1350.5623 0.56226248 2602 P52209 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.557 32.557 2 4.0498E-38 27791 QUIQUE_C1218_190116_001 190.88 187.63 5237400000 553420000 367150000 649120000 465140000 429080000 302500000 451780000 455320000 427140000 148960000 0 403120000 584670000 39022 2602 36420 349673;349674;349675;349676;349677;349678;349679;349680;349681;349682;349683;349684 444798;444799;444800;444801;444802;444803;444804;444805;444806;444807;444808;444809 444798 12 SAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGK Oxidation (M) 2766.2993 0.29930143 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 1 0 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 2 118.22 118.22 2;3 5.5188E-46 121765 QUIQUE_C1277_190116_001 148.03 142.2 3127000000 366970000 403810000 410870000 306100000 319240000 383200000 31774000 0 0 203040000 53792000 291230000 356980000 39023 3050 36421 349685;349686;349687;349688;349689;349690;349691;349692;349693;349694;349695;349696;349697;349698;349699;349700;349701;349702 444810;444811;444812;444813;444814;444815;444816;444817;444818;444819;444820;444821;444822;444823;444824;444825;444826;444827;444828;444829;444830;444831;444832 444815 2481 23 SAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGK Unmodified 2750.3044 0.30438681 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 3 1 3 1 1 1 1 1 137.28 137.28 2;3;4 7.5569E-196 142572 QUIQUE_C1368_190116_001 297.36 276.92 6704000000 38623000 1702600000 1294700000 1223200000 112620000 1230000000 0 490800000 63718000 304450000 131080000 112110000 0 39024 3050 36421 349703;349704;349705;349706;349707;349708;349709;349710;349711;349712;349713;349714;349715;349716;349717;349718;349719 444833;444834;444835;444836;444837;444838;444839;444840;444841;444842;444843;444844;444845;444846;444847;444848;444849;444850;444851;444852 444838 19 SAVGELSEDSSNVVHLIK Unmodified 1882.9636 0.96362108 799 D3DSM0 ITGB2 Integrin beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.11 102.11 3 9.0303E-06 105161 QUIQUE_C1277_190116_001 86.367 48.812 400750000 43406000 57880000 65711000 67725000 0 0 42550000 0 29354000 0 49517000 0 44602000 39025 799 36422 349720;349721;349722;349723;349724;349725;349726;349727 444853;444854;444855;444856;444857;444858;444859;444860 444854 7 SAVGFDYQGK Unmodified 1070.5033 0.50327426 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.741 44.741 2 0.0058504 41493 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.064 56.97 633180000 69480000 48022000 0 67148000 63164000 0 0 75379000 78710000 36268000 61702000 52610000 80694000 39026 3056 36423 349728;349729;349730;349731;349732;349733;349734;349735;349736;349737;349738 444861;444862;444863;444864;444865;444866;444867;444868;444869;444870;444871;444872;444873 444872 12 SAVGFEYQGK Unmodified 1084.5189 0.51892433 3056 Q14247 CTTN Src substrate cortactin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.957 40.957 2 0.0011605 38001 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.98 81.347 1173400000 115970000 110850000 53373000 117430000 114110000 88695000 51401000 144410000 0 82849000 91610000 101540000 101170000 39027 3056 36424 349739;349740;349741;349742;349743;349744;349745;349746;349747;349748;349749;349750 444874;444875;444876;444877;444878;444879;444880;444881;444882;444883;444884;444885;444886;444887 444883 11 SAVGHEYVAEVEK Unmodified 1416.6885 0.68850885 2072 P14317;E7EVW7 HCLS1 Hematopoietic lineage cell-specific protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 32.375 32.375 2;3 8.3592E-06 27227 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.68 95.634 252420000 0 0 0 136300000 0 64387000 33397000 0 0 18328000 0 0 0 39028 2072 36425 349751;349752;349753;349754 444888;444889;444890;444891;444892 444892 3 SAVLHEGEGNIR Unmodified 1280.6473 0.64731274 2541 P49754;C9JU58;C9J3F8;H7BXH3 VPS41 Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog yes no 0 0 0 1 19.851 19.851 3 0.011042 12644 QUIQUE_C1576_190116_001 46.069 31.508 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39029 2541 36426 349755 444893 444893 1 SAVLISSKPGCFIAGADINMLAACK Unmodified 2593.3066 0.30663541 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 123.93 123.93 3 7.6237E-17 129030 QUIQUE_C1368_190116_001 95.71 87.756 187200000 0 0 49747000 0 46815000 0 0 0 0 0 90635000 0 0 39030 1153 36427 349756;349757;349758;349759;349760 444894;444895;444896;444897;444898;444899 444895 6 SAVLSEPVLFLK Unmodified 1301.7595 0.75948895 3383 Q6P587 FAHD1 Acylpyruvase FAHD1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 118.21 118.21 2 0.019188 120023 QUIQUE_C1563_190116_001 64.297 50.091 61651000 0 0 0 0 0 42161000 0 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39033 245 36430 349776;349777;349778;349779;349780;349781;349782;349783;349784 444918;444919;444920;444921;444922;444923;444924;444925;444926;444927 444920 8 SAVQGPPER Unmodified 939.47739 0.47739386 401;287;403 A0A0G2JMB2;A0A286YEY1;P01876;A0A286YEY5;P01877 IGHA1;IGHA2 Ig alpha-1 chain C region;Ig alpha-2 chain C region no no 0 0 0 1 14.393 14.393 2 0.008597 6102 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.334 29.831 129260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 129260000 0 0 0 39034 287;401;403 36431 349785 444928 444928 1 SAVSQPQAAPSPLEK Acetyl (Protein N-term) 1550.794 0.79403655 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 69.391 69.391 2 0.00026065 70089 QUIQUE_C1438_190116_001 77.062 58.795 308510000 0 59776000 0 0 59850000 36512000 0 50375000 0 33914000 0 68088000 0 39035 3362 36432 349786;349787;349788;349789;349790;349791 444929;444930;444931;444932;444933;444934;444935;444936 444930 7 SAVTALWGK Unmodified 931.51272 0.51271674 2799 P68871;A0A2R8Y7R2;F8W6P5;A0A0J9YWK4 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes no 0 0 0 3 3 4 1 3 3 2 3 2 1 2 2 2 70.845 70.845 1;2 0.00017912 70823 QUIQUE_C1368_190116_001 164.53 98.46 212930000000 17457000000 21901000000 19349000000 6926200000 20777000000 14769000000 12343000000 8434000000 11051000000 3569100000 31356000000 22443000000 22554000000 39036 2799 36433 349792;349793;349794;349795;349796;349797;349798;349799;349800;349801;349802;349803;349804;349805;349806;349807;349808;349809;349810;349811;349812;349813;349814;349815;349816;349817;349818;349819;349820;349821;349822 444937;444938;444939;444940;444941;444942;444943;444944;444945;444946;444947;444948;444949;444950;444951;444952;444953;444954;444955;444956;444957;444958;444959;444960;444961;444962;444963;444964;444965;444966;444967;444968;444969;444970;444971;444972;444973;444974;444975;444976;444977;444978;444979;444980;444981;444982;444983;444984;444985;444986;444987;444988;444989;444990;444991;444992;444993;444994;444995;444996;444997;444998;444999 444955 51 SAVTSLLDGLNQAFEEVSSQSGGAK Unmodified 2494.2187 0.21872615 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.33 170.33 3 2.0932E-23 177543 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.47 105.52 580730000 0 82748000 23494000 22864000 50142000 0 46057000 0 69179000 0 96488000 144560000 45196000 39037 228 36434 349823;349824;349825;349826;349827;349828;349829;349830;349831 445000;445001;445002;445003;445004;445005;445006;445007;445008;445009 445007 9 SAVTTVVNPK Unmodified 1014.571 0.5709599 1893 P05556 ITGB1 Integrin beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.186 24.186 2 0.0046555 18724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.165 49.479 492370000 109210000 72669000 0 0 55244000 0 0 84578000 104930000 0 0 0 65745000 39038 1893 36435 349832;349833;349834;349835;349836;349837;349838 445010;445011;445012;445013;445014;445015;445016;445017;445018;445019 445016 9 SAVVEMLIMR Unmodified 1147.6093 0.60933601 194 A0A0A0MTH3;Q13418;A0A087WWY6 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 1 108.38 108.38 2 0.053505 113913 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.149 62.268 89255000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89255000 0 0 39039 194 36436 349839 445020 445020 0 SAWYMGPVSR Unmodified 1152.5386 0.53861391 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 0 1 1 80.803 80.803 2 0.025474 83198 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.013 39.811 135050000 0 0 0 0 53988000 0 0 0 0 0 81064000 0 0 39040 2480 36437 349840;349841 445021;445022 445022 2 SAYALCTFALSTGDPSQPVR Unmodified 2140.0259 0.02590376 4070 Q9BY32 ITPA Inosine triphosphate pyrophosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.74 115.74 2 6.9999E-09 119726 QUIQUE_C1368_190116_001 131.66 117.7 288550000 0 0 50364000 26629000 0 0 28307000 44938000 51681000 0 0 50011000 36621000 39041 4070 36438 349842;349843;349844;349845;349846;349847;349848;349849;349850 445023;445024;445025;445026;445027;445028;445029;445030;445031 445024 8 SAYDSTMETMNYAQIR Unmodified 1879.808 0.80804841 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 97.812 97.812 2 0.00056895 100271 QUIQUE_C1277_190116_001 89.301 78.088 262360000 52312000 60945000 63604000 0 0 0 0 0 0 14347000 71151000 0 0 39042 2623 36439 349851;349852;349853;349854;349855 445032;445033;445034;445035;445036 445033 5 SAYEFSETESMLK Unmodified 1520.6705 0.67047553 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.04 91.04 2 1.4723E-12 94312 QUIQUE_C1218_190116_001 151.15 133.78 965090000 96144000 90481000 85728000 106190000 84539000 101740000 105980000 71528000 78117000 0 70074000 74571000 0 39043 1977 36440 349856;349857;349858;349859;349860;349861;349862;349863;349864;349865;349866 445037;445038;445039;445040;445041;445042;445043;445044;445045;445046;445047;445048;445049 445037 10 SAYEFSETESMLK Oxidation (M) 1536.6654 0.66539015 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 68.161 68.161 2 0.0015297 67898 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.758 71.071 223790000 0 0 0 37819000 0 0 0 0 43596000 27355000 38895000 37215000 38906000 39044 1977 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Putative nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.192 53.192 2 0.0073686 51095 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.784 71.026 2470100000 339500000 329100000 251190000 317170000 220780000 338670000 280990000 95535000 64602000 0 114710000 117840000 0 39052 1572;3222 36447 349958;349959;349960;349961;349962;349963;349964;349965;349966;349967;349968 445161;445162;445163;445164;445165;445166;445167;445168;445169;445170;445171 445170 5 SCALEHVTR Unmodified 1071.5131 0.51312744 3681 Q8TD55;C9J4A7 PLEKHO2 Pleckstrin homology domain-containing family O member 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 16.315 16.315 2;3 0.017949 8003 QUIQUE_C1563_190116_001 41.399 22.669 83289000 0 0 0 0 0 10544000 0 53860000 18885000 0 0 0 0 39053 3681 36448 349969;349970;349971;349972;349973 445172;445173;445174;445175;445176 445173 4 SCAVAEYGVYVK Unmodified 1344.6384 0.63838754 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08;P00739;A0A0A0MRD9 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CON__P67983;Q8N339;P80297;P04732;P02795;P13640 MT1M;MT1X;MT1E;MT2A;MT1G Metallothionein-1M;Metallothionein-1X;Metallothionein-1E;Metallothionein-2;Metallothionein-1G yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.979 15.979 2 1.9119E-05 7996 QUIQUE_C1403_190116_001 145.72 144.24 2522500000 138600000 203440000 503800000 260150000 247770000 198210000 324370000 121930000 77544000 21244000 128820000 101540000 195080000 + 39059 784 36454 350093;350094;350095;350096;350097;350098;350099;350100;350101;350102;350103;350104;350105 445335;445336;445337;445338;445339;445340;445341;445342;445343;445344;445345;445346;445347;445348;445349;445350 445339 16 SCCSCCPVGCSK Unmodified 1460.4975 0.49749543 1865 P04733 MT1F Metallothionein-1F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.686 14.686 2 0.00050915 6261 QUIQUE_C1563_190116_001 105.4 104.61 170810000 5740800 14033000 36674000 15733000 19853000 24775000 31765000 8362400 0 0 0 0 13877000 39060 1865 36455 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350128;350129;350130;350131;350132;350133 445374;445375;445376;445377;445378;445379 445376 5 SCDYLFFR Unmodified 1106.4855 0.48551571 3909 Q96NL8 C8orf37 Protein C8orf37 yes yes 0 0 0 1 101.96 101.96 2 0.033344 105215 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.757 49.982 12751000 0 0 0 0 0 0 0 0 12751000 0 0 0 0 39063 3909 36458 350134 445380 445380 1 SCENLAPFNTALK Unmodified 1463.7079 0.70786408 2971 Q13155;A8MU58 AIMP2 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 81.626 81.626 2 0.0054231 83428 QUIQUE_C1218_190116_001 65.879 30.655 198670000 93177000 105490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39064 2971 36459 350135;350136;350137 445381;445382;445383 445381 3 SCESNSPFPVHPGTAECCTK Unmodified 2263.9296 0.92963689 822 D6RF35;P02774;D6RBJ7;D6RF20 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 1 1 45.38 45.38 3 0.00058598 43014 QUIQUE_C1277_190116_001 55.453 51.102 76955000 0 30729000 0 0 46226000 0 0 0 0 0 0 0 0 39065 822 36460 350138;350139 445384;445385 445384 2 SCESSMVLGYWDIR Acetyl (Protein N-term) 1743.7596 0.75964166 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.29 159.29 2 6.7565E-37 162067 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.19 169.51 2138100000 170140000 168310000 204040000 157080000 250270000 296300000 191080000 206710000 90748000 63946000 65681000 138390000 135370000 39066 2174 36461 350140;350141;350142;350143;350144;350145;350146;350147;350148;350149;350150;350151;350152 445386;445387;445388;445389;445390;445391;445392;445393;445394;445395;445396;445397;445398;445399;445400;445401;445402;445403;445404;445405;445406;445407;445408 445398 23 SCESSMVLGYWDIR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1759.7546 0.75455628 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 147.4 147.4 2 4.0029E-15 150247 QUIQUE_C1563_190116_001 148.28 134.12 203910000 25663000 25402000 24552000 21317000 0 63890000 19896000 23186000 0 0 0 0 0 39067 2174 36461 350153;350154;350155;350156;350157;350158;350159 445409;445410;445411;445412;445413;445414;445415;445416 445414 1524 5 SCEVIIGSTHVLTPK Unmodified 1639.8603 0.86034198 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 62.586 62.586 2;3 5.4815E-05 61991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.961 67.107 284690000 20311000 29848000 0 31392000 71533000 0 0 0 0 12505000 24645000 94451000 0 39068 1384 36462 350160;350161;350162;350163;350164;350165;350166;350167;350168;350169 445417;445418;445419;445420;445421;445422;445423;445424;445425;445426;445427 445425 10 SCFGHPLAPQALEDVK Unmodified 1767.8614 0.86140461 3547 Q8IXI1;I3L2C6 RHOT2 Mitochondrial Rho GTPase 2 yes no 0 0 0 1 71.857 71.857 3 0.037296 72591 QUIQUE_C1576_190116_001 18.536 6.9227 24497000 0 0 0 0 0 0 24497000 0 0 0 0 0 0 39069 3547 36463 350170 445428 445428 1 SCFLCMVCK Oxidation (M) 1219.4858 0.48579176 2177 P21291;E9PS42 CSRP1 Cysteine and glycine-rich protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.196 57.196 2 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445446 22 SCFPSLFQAEQTHR Unmodified 1706.7835 0.78348864 2559 P50336 PPOX Protoporphyrinogen oxidase yes yes 0 0 0 1 1 79.325 79.325 3 0.020334 80543 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.801 35.142 99988000 0 0 0 0 0 0 0 41387000 0 0 0 0 58601000 39072 2559 36465 350196;350197 445468;445469 445468 0 SCFQPLFQFEDMQEIIQNFVR Oxidation (M) 2691.2461 0.24614365 4506;169 A0A0A0MS87;H7C0X0;A0A0U1RR50;H0YJ56;Q9UN36;G3V2I9;G3V5S0;G3V383;G3V5P9;G3V2S0;G3V552;G3V3P6;G3V4T9;G3V2T2;G3V3P1;G3V3D5;G3V358;G3V3L1 NDRG2 Protein NDRG2 no no 0 1 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 166.16 166.16 2;3 1.3171E-53 168130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.48 153.06 1397300000 70359000 58441000 189040000 31160000 69465000 36983000 86057000 44614000 62729000 0 77917000 404330000 266200000 39073 169;4506 36466 350198;350199;350200;350201;350202;350203;350204;350205;350206;350207;350208;350209;350210;350211;350212;350213 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0.0002862 148702 QUIQUE_C1277_190116_001 73.208 66.48 110350000 0 22610000 0 0 23144000 0 28747000 0 0 0 0 15051000 20800000 39075 3792 36467 350229;350230;350231;350232;350233;350234 445506;445507;445508;445509;445510;445511 445506 5 SCGLHQLLR Unmodified 1082.5655 0.56549736 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 29.666 29.666 2 0.024423 24535 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.019 44.357 52501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52501000 0 0 39076 290;327;328 36468 350235;350236 445512;445513 445513 2 SCGQVVEEWK Unmodified 1220.5496 0.54957253 2074 P14415 ATP1B2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.048 46.048 2 4.6745E-05 44273 QUIQUE_C1218_190116_001 143.7 129.5 2088100000 311500000 226890000 231020000 253400000 123330000 193770000 216510000 64881000 0 98592000 152230000 105290000 110690000 39077 2074 36469 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yes no 0 0 0 1 1 74.958 74.958 2 0.027126 76216 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.461 35.627 315430000 0 0 0 0 0 0 177200000 0 138220000 0 0 0 0 39079 2452 36471 350262;350263 445557;445558 445558 2 SCGSSTPDEFPTDIPGTK Unmodified 1894.8255 0.82547262 2432 P41091;H7BZU1 EIF2S3 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.57 81.57 2 2.6191E-13 82667 QUIQUE_C1277_190116_001 124.45 118.22 488600000 44024000 52314000 67228000 69401000 57428000 40410000 67432000 0 0 0 48539000 41823000 0 39080 2432 36472 350264;350265;350266;350267;350268;350269;350270;350271;350272 445559;445560;445561;445562;445563;445564;445565;445566;445567 445560 9 SCIENILR Unmodified 1003.5121 0.51206481 4245 Q9NPH2;J3QS51 ISYNA1 Inositol-3-phosphate synthase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 64.196 64.196 2 0.018344 63242 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.098 37.263 142440000 0 0 60058000 0 0 0 0 46638000 0 35742000 0 0 0 39081 4245 36473 350273;350274;350275 445568;445569;445570 445569 3 SCILRPGGSEDASAMLR Unmodified 1818.8717 0.87165172 2615 P52888;K7EP46;K7EL02 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.277 67.277 3 0.00022793 68025 QUIQUE_C1218_190116_001 66.779 55.735 212180000 52559000 0 0 42868000 0 0 28891000 0 0 0 41685000 46172000 0 39082 2615 36474 350276;350277;350278;350279;350280;350281 445571;445572;445573;445574;445575;445576 445571 3 SCLLHQFIEK Unmodified 1273.6489 0.64889264 2165 P20338 RAB4A Ras-related protein Rab-4A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.569 59.569 2;3 0.0051856 58047 QUIQUE_C1368_190116_001 54.27 39.815 163370000 32032000 27530000 37242000 0 0 19005000 0 0 17566000 0 29993000 0 0 39083 2165 36475 350282;350283;350284;350285;350286;350287 445577;445578;445579;445580;445581;445582 445579 6 SCLLHQFIENK Unmodified 1387.6918 0.69182009 2706 P61018;M0R0X1 RAB4B Ras-related protein Rab-4B no no 0 0 0 1 1 61.811 61.811 3 0.0044658 60864 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.802 50.768 64289000 0 0 0 0 0 0 35097000 0 0 0 0 0 29192000 39084 2706 36476 350288;350289 445583;445584 445584 2 SCLLHQFTEK Unmodified 1261.6125 0.61250714 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 42.919 42.919 2;3 4.1752E-18 40124 QUIQUE_C1438_190116_001 167.67 117.63 1705200000 129810000 0 174190000 159170000 197180000 154840000 163110000 0 101740000 0 365790000 0 259400000 39085 2713 36477 350290;350291;350292;350293;350294;350295;350296;350297;350298;350299;350300;350301 445585;445586;445587;445588;445589;445590;445591;445592;445593;445594;445595;445596;445597;445598;445599 445589 15 SCLLLQFTDK Unmodified 1223.622 0.62200919 2707;3697 P61019;E9PKL7;H0YD31;E9PE37;H0YDL5;Q8WUD1;A0A3B3ITL1 RAB2A;RAB2B Ras-related protein Rab-2A;Ras-related protein Rab-2B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.41 102.41 2 0.0044828 105080 QUIQUE_C1277_190116_001 100.76 76.736 601270000 86018000 66102000 85118000 76551000 67597000 84906000 82445000 0 25637000 26897000 0 0 0 39086 2707;3697 36478 350302;350303;350304;350305;350306;350307;350308;350309;350310 445600;445601;445602;445603;445604;445605;445606;445607;445608;445609;445610;445611 445601 11 SCLLLQFTDKR Unmodified 1379.7231 0.72312022 2707;3697 P61019;E9PKL7;H0YD31;E9PE37;H0YDL5;Q8WUD1;A0A3B3ITL1 RAB2A;RAB2B Ras-related protein Rab-2A;Ras-related protein Rab-2B no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 79.37 79.37 2;3 0.00035309 80748 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.313 77.913 1233900000 34814000 95139000 75925000 88783000 89041000 56280000 171440000 82148000 86582000 29968000 221580000 102230000 99984000 39087 2707;3697 36479 350311;350312;350313;350314;350315;350316;350317;350318;350319;350320;350321;350322;350323;350324;350325 445612;445613;445614;445615;445616;445617;445618;445619;445620;445621;445622;445623;445624;445625;445626;445627;445628;445629;445630;445631;445632;445633;445634;445635 445626 23 SCLLPQLHPQPDSGPQGR Unmodified 1985.9741 0.97414296 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.13 64.13 3 0.00017535 63459 QUIQUE_C1576_190116_001 70.091 43.943 86748000 39539000 0 0 0 0 0 47209000 0 0 0 0 0 0 39088 3750 36480 350326;350327;350328;350329;350330 445636;445637;445638;445639;445640 445639 5 SCMLTGTPESVQSAK Unmodified 1594.7331 0.73309256 909 E9PEB5;Q96AE4;C9JSZ1 FUBP1 Far upstream element-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.733 49.733 2 3.4781E-29 47247 QUIQUE_C1277_190116_001 164.81 149.8 490290000 57723000 78755000 66100000 44813000 50066000 57019000 55574000 0 0 13613000 39290000 27339000 0 39089 909 36481 350331;350332;350333;350334;350335;350336;350337;350338;350339;350340 445641;445642;445643;445644;445645;445646;445647;445648;445649;445650;445651 445642 10 SCNCLLLK Unmodified 1006.494 0.49397191 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.52 40.52 2 0.0035988 37694 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.5 90.718 50817000000 2783300000 3723500000 3986900000 4209700000 5652600000 3328300000 5822600000 2671000000 2524500000 1627500000 4769100000 4101900000 5616000000 39090 1906 36482 350341;350342;350343;350344;350345;350346;350347;350348;350349;350350;350351;350352;350353 445652;445653;445654;445655;445656;445657;445658;445659;445660;445661;445662;445663;445664;445665;445666;445667;445668;445669;445670;445671;445672;445673;445674;445675;445676;445677;445678;445679;445680;445681;445682;445683;445684;445685 445671 34 SCPIIVHCSDGAGR Unmodified 1527.6922 0.6922308 3201;3769 Q92932;E7EM83;A0A3B3IU41;H7C0U9;Q16849 PTPRN2;PTPRN Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2;Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N no no 0 0 0 1 1 1 1 24.298 24.298 2 0.0019551 17761 QUIQUE_C1277_190116_001 85.813 70.183 68878000 39499000 0 0 0 0 0 29379000 0 0 0 0 0 0 39091 3769;3201 36483 350354;350355;350356;350357 445686;445687;445688;445689 445687 4 SCPVVQSSQHLFLDLPK Unmodified 1953.9982 0.99823245 2677 P56192 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 99.027 99.027 3 0.013078 103664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 27.512 14.763 43917000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43917000 0 0 39092 2677 36484 350358;350359 445690;445691 445691 2 SCQFVAVR Unmodified 965.47529 0.47528537 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.892 32.892 2 0.016736 28307 QUIQUE_C1438_190116_001 82.671 54.159 1017200000 0 110720000 95829000 94634000 103160000 76382000 93386000 91218000 0 0 123080000 106140000 122700000 39093 1929 36485 350360;350361;350362;350363;350364;350365;350366;350367;350368;350369 445692;445693;445694;445695;445696;445697;445698;445699;445700;445701 445695 10 SCQTALVEILDVIVR Unmodified 1714.9288 0.9287559 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 168.25 168.25 2;3 1.973E-24 172726 QUIQUE_DMIX3_190116_001 153.09 143.03 1439600000 44807000 211620000 451130000 151720000 127570000 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Q9Y277;E5RJN6;E5RHZ6;E5RHE1 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 yes no 0 0 0 1 1 42.325 42.325 3 5.0937E-09 38191 QUIQUE_C1563_190116_001 93.269 82.454 94999000 0 0 0 37035000 0 57964000 0 0 0 0 0 0 0 39096 4545 36488 350403;350404 445736;445737 445737 2 SCSGVEFSTSGSSNTDTGK Unmodified 1906.7851 0.78506437 2469 P45880;A0A0A0MR02;Q5JSD2;Q5JSD1;A2A3S1 VDAC2 Voltage-dependent anion-selective channel protein 2 yes no 0 0 0 1 3 3 1 2 1 1 1 1 1 3 1 1 36.765 36.765 2 1.0357E-132 32265 QUIQUE_C1403_190116_001 287.04 286.14 2192200000 162000000 244490000 291870000 217870000 204100000 227260000 179080000 61747000 62066000 64489000 222170000 108720000 146300000 39097 2469 36489 350405;350406;350407;350408;350409;350410;350411;350412;350413;350414;350415;350416;350417;350418;350419;350420;350421;350422;350423;350424 445738;445739;445740;445741;445742;445743;445744;445745;445746;445747;445748;445749;445750;445751;445752;445753;445754;445755;445756;445757;445758;445759;445760;445761;445762;445763;445764;445765;445766;445767;445768;445769;445770;445771;445772;445773;445774 445750 37 SCSGVMEFSTSGHAYTDTGK Unmodified 2120.8779 0.87791889 832 E5RFP6 VDAC3 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 2 1 1 1 1 1 2 59.589 59.589 2;3 1.8514E-196 58573 QUIQUE_C1277_190116_001 255.72 246.67 1453700000 120840000 184530000 156830000 149650000 67915000 109500000 146710000 68126000 60710000 56385000 89996000 73082000 169460000 39098 832 36490 350425;350426;350427;350428;350429;350430;350431;350432;350433;350434;350435;350436;350437;350438;350439;350440;350441;350442 445775;445776;445777;445778;445779;445780;445781;445782;445783;445784;445785;445786;445787;445788;445789;445790;445791;445792;445793;445794;445795;445796 445779 22 SCSGVMEFSTSGHAYTDTGK Oxidation (M) 2136.8728 0.87283352 832 E5RFP6 VDAC3 yes yes 0 1 0 1 45.927 45.927 3 6.3279E-05 40656 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.251 51.829 21024000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21024000 0 0 0 39099 832 36490 350443 445797;445798 445797 489 2 SCSLLSLATIK Unmodified 1191.6533 0.65330932 3406 Q6UWE0 LRSAM1 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 103.23 103.23 2 0.01432 107734 QUIQUE_C1438_190116_001 68.893 59.51 73932000 0 0 0 0 24281000 20809000 28842000 0 0 0 0 0 0 39100 3406 36491 350444;350445;350446 445799;445800;445801 445799 3 SCSLVLEHQPDNIK Unmodified 1638.8036 0.80355538 3062 Q14318;U3KQ64;A0A0A0MTJ1;U3KQI1 FKBP8 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP8 yes no 0 0 0 1 45.269 45.269 2 1.6831E-10 41974 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.16 123.63 25574000 0 0 0 0 0 0 0 25574000 0 0 0 0 0 39101 3062 36492 350447 445802 445802 0 SCSNFTAQALNHGTETEVLLVK Unmodified 2418.1849 0.1849236 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 95.273 95.273 2;3 1.5762E-45 97749 QUIQUE_C1277_190116_001 164.65 144.18 1050400000 254450000 305600000 290550000 39989000 34767000 22088000 45663000 0 0 0 0 28751000 28569000 39102 4091 36493 350448;350449;350450;350451;350452;350453;350454;350455;350456;350457;350458;350459 445803;445804;445805;445806;445807;445808;445809;445810;445811;445812;445813;445814;445815 445807 13 SCSPELQQK Unmodified 1075.4968 0.49680868 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 0 1 14.455 14.455 2 0.059758 6400 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.036 20.549 17932000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17932000 0 0 0 39103 2102 36494 350460 445816 445816 1 SCSSPVFSR Unmodified 1025.46 0.46002924 1745;1167 O95741;H0YLV2;H0YLM2;H0YNP2;H0YNX4;H0YNM7;H0YKJ0;H0YM67;H0YKP1 CPNE6 Copine-6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.496 26.496 2 0.00045846 20659 QUIQUE_C1576_190116_001 117.04 99.796 9088500000 898070000 1178000000 901980000 0 937010000 885190000 958250000 479510000 551290000 246110000 658030000 674610000 720480000 39104 1745;1167 36495 350461;350462;350463;350464;350465;350466;350467;350468;350469;350470;350471;350472 445817;445818;445819;445820;445821;445822;445823;445824;445825;445826;445827;445828;445829 445823 12 SCSSSCAVHDLIFWR Unmodified 1823.8083 0.80832319 659 B7Z4M1 RTN3 Reticulon yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 104.55 104.55 2;3 1.1159E-35 107141 QUIQUE_C1403_190116_001 173.72 159.79 6684400000 615170000 912140000 618940000 637090000 617170000 476380000 820050000 206240000 323470000 140150000 510940000 354240000 452380000 39105 659 36496 350473;350474;350475;350476;350477;350478;350479;350480;350481;350482;350483;350484;350485;350486;350487;350488;350489;350490;350491;350492;350493;350494;350495;350496;350497;350498 445830;445831;445832;445833;445834;445835;445836;445837;445838;445839;445840;445841;445842;445843;445844;445845;445846;445847;445848;445849;445850;445851;445852;445853;445854;445855;445856;445857;445858;445859;445860;445861;445862;445863;445864;445865;445866 445841 35 SCTTESCDFVR Unmodified 1360.5387 0.53874985 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 1 33.493 33.493 2 0.0041003 28374 QUIQUE_C1368_190116_001 87.913 67.288 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39106 2562 36497 350499;350500 445867;445868 445867 2 SCVCHGSTTLCQR Unmodified 1564.6545 0.65446508 1575 O60477 BRINP1 BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 1 yes yes 0 0 0 1 14.678 14.678 3 0.0010578 6907 QUIQUE_C1368_190116_001 65.043 63.234 12421000 0 0 12421000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39107 1575 36498 350501 445869 445869 1 SCVEEPEPEPEAAEGDGDKK Unmodified 2171.9165 0.91647247 2596 P51858 HDGF Hepatoma-derived growth factor yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 30.83 30.83 2;3 4.3397E-06 25829 QUIQUE_C1438_190116_001 59.857 50.81 396170000 101790000 0 79401000 56343000 69853000 0 70987000 0 0 17796000 0 0 0 39108 2596 36499 350502;350503;350504;350505;350506;350507;350508 445870;445871;445872;445873;445874;445875;445876 445874 7 SCVLFNCAALASQIAAEQNLDNDEGLK Unmodified 2950.3801 0.38007094 3700 Q8WUM4;A0A3B3IT07 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.94 146.94 3 3.934E-31 151005 QUIQUE_C1403_190116_001 117.36 109.92 599230000 64552000 63072000 78389000 66610000 92460000 65697000 75667000 0 0 24504000 0 68279000 0 39109 3700 36500 350509;350510;350511;350512;350513;350514;350515;350516;350517 445877;445878;445879;445880;445881;445882;445883;445884;445885;445886;445887;445888 445883 12 SCVQCQAWGTGEK Unmodified 1509.634 0.63404721 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 35.396 35.396 2 1.2026E-06 31204 QUIQUE_C1576_190116_001 129.89 112.66 132680000 0 0 23498000 22206000 0 0 28032000 21470000 24276000 0 13202000 0 0 39110 2101 36501 350518;350519;350520;350521;350522;350523;350524;350525 445889;445890;445891;445892;445893;445894;445895;445896 445893 7 SCYDLSCHAR Unmodified 1267.5074 0.50739014 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 21.326 21.326 2;3 0.00039069 14937 QUIQUE_C1218_190116_001 112.41 107.45 674470000 33966000 141110000 89614000 114370000 0 0 118330000 47797000 26597000 0 38845000 63845000 0 39111 2440 36502 350526;350527;350528;350529;350530;350531;350532;350533;350534;350535;350536;350537;350538;350539;350540;350541;350542 445897;445898;445899;445900;445901;445902;445903;445904;445905;445906;445907;445908;445909;445910;445911;445912;445913;445914 445897 17 SCYEDGWLIK Unmodified 1269.57 0.56997362 385 A0A1W2PQV2;H3BUH9;P23434 GCSH Glycine cleavage system H protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.631 89.631 2 0.0060476 92655 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.698 78.477 1539800000 187060000 186440000 190820000 93684000 157510000 132600000 117400000 80116000 82866000 0 177860000 0 133440000 39112 385 36503 350543;350544;350545;350546;350547;350548;350549;350550;350551;350552;350553 445915;445916;445917;445918;445919;445920;445921;445922;445923;445924;445925;445926 445925 10 SCYLSSLDLLLEHR Unmodified 1704.8505 0.85050558 3990 Q9BQ69 MACROD1 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 128.13 128.13 2;3 2.5175E-11 131059 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.61 127.15 1541700000 177080000 188430000 105470000 81985000 137360000 100840000 148290000 60050000 159930000 36273000 110110000 100210000 135730000 39113 3990 36504 350554;350555;350556;350557;350558;350559;350560;350561;350562;350563;350564;350565;350566;350567;350568;350569;350570;350571;350572 445927;445928;445929;445930;445931;445932;445933;445934;445935;445936;445937;445938;445939;445940;445941;445942;445943;445944;445945;445946;445947 445939 20 SDAAKPLLGHDAVIQALAQK Unmodified 2045.1269 0.12693843 2928 Q08AD1 CAMSAP2 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 78.444 78.444 3 0.0022796 80582 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.295 44.491 105030000 0 0 0 0 55951000 0 0 0 0 0 49082000 0 0 39114 2928 36505 350573;350574 445948;445949 445949 2 SDAAVDTSSEITTK Acetyl (Protein N-term) 1465.6784 0.67839767 677 B8ZZQ6;P06454 PTMA Prothymosin alpha;Prothymosin alpha, N-terminally processed;Thymosin alpha-1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 65.799 65.799 2 7.2545E-08 66257 QUIQUE_C1218_190116_001 132.32 114.43 76990000 0 0 0 0 76990000 0 0 0 0 0 0 0 0 39115 677 36506 350575;350576;350577;350578 445950;445951;445952;445953 445950 4 SDAEEDGGTVSQEEEDR Unmodified 1851.7242 0.72423825 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.675 28.675 2 0 23439 QUIQUE_C1218_190116_001 323.45 311.24 534630000 55264000 51132000 64940000 110220000 39759000 69718000 78438000 0 0 27723000 0 0 37443000 39116 2269 36507 350579;350580;350581;350582;350583;350584;350585;350586;350587 445954;445955;445956;445957;445958;445959;445960;445961;445962 445954 9 SDAEEDGGTVSQEEEDRKPK Unmodified 2204.9669 0.96692814 2269 P27824 CANX Calnexin yes yes 0 0 2 2 2 2 3 1 2 2 2 2 1 2 19.439 19.439 2;3;4 6.9351E-37 12596 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.19 145 1970800000 44554000 142240000 231000000 370020000 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Unmodified 1865.8982 0.89818405 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 120.65 120.65 2;3 2.1305E-79 126017 QUIQUE_C1218_190116_001 234.72 203.99 5050800000 495210000 497870000 622680000 378640000 428660000 397420000 408560000 240910000 373000000 80690000 490810000 259350000 377040000 39119 2082 36510 350623;350624;350625;350626;350627;350628;350629;350630;350631;350632;350633;350634;350635;350636;350637;350638;350639;350640;350641;350642;350643;350644;350645;350646;350647;350648 446001;446002;446003;446004;446005;446006;446007;446008;446009;446010;446011;446012;446013;446014;446015;446016;446017;446018;446019;446020;446021;446022;446023;446024;446025;446026;446027;446028;446029;446030;446031;446032;446033;446034;446035;446036;446037;446038;446039;446040;446041 446004 41 SDALETLGFLNHYQMK Oxidation (M) 1881.8931 0.89309867 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 1 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446065;446066;446067;446068;446069;446070 446066 6 SDCESQECVTK Unmodified 1341.5177 0.51768005 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 13.399 13.399 2 0.0008422 5382 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.309 78.106 4747100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4747100 0 0 0 39126 4281 36516 350677 446071 446071 1 SDDELLDDFFHDQSTATSQAGTLSSIPTALTR Unmodified 3438.6063 0.60630195 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 158.9 158.9 3 5.1789E-37 164407 QUIQUE_C1218_190116_001 109.09 103.98 407830000 48916000 69641000 0 0 55304000 43815000 0 0 0 0 96991000 93164000 0 39127 3471 36517 350678;350679;350680;350681;350682;350683 446072;446073;446074;446075;446076;446077;446078;446079 446073 8 SDDEVDDPAVELK Unmodified 1430.6413 0.64128389 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.088 64.088 2 0.00048761 60046 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.283 90.1 1331000000 101860000 86454000 87147000 0 207130000 177240000 95810000 63212000 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4475 36520 350708 446106 446106 1 SDDKVTLEER Unmodified 1190.5779 0.57789577 1803 P01024;M0QXZ3 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.055 19.055 3 0.0013736 12192 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.659 50.596 759000000 55200000 94402000 98023000 79975000 0 79898000 63566000 36065000 65975000 0 124760000 61138000 0 39131 1803 36521 350709;350710;350711;350712;350713;350714;350715;350716;350717;350718 446107;446108;446109;446110;446111;446112;446113;446114;446115;446116 446113 10 SDDSVIQLLNPNR Unmodified 1469.7474 0.74742071 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8;F5H125;H0YG94 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.57 113.57 2 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protein-like yes yes 1 0 0 1 115.92 115.92 2 0.00013957 120100 QUIQUE_C1218_190116_001 70.806 59.487 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39138 3637 36528 350766 446179 446179 1 SDEGQLSPATR Unmodified 1159.5469 0.54692999 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 21.715 21.715 2 0.00096343 14825 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.53 83.932 17678000000 1441800000 0 1573500000 0 2497500000 0 2221300000 2223700000 3287600000 0 2004600000 2428300000 0 39139 3117 36529 350767;350768;350769;350770;350771;350772;350773;350774 446180;446181;446182;446183;446184;446185;446186;446187;446188 446186 6 SDEISFADFK Unmodified 1157.5241 0.52406928 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 96.517 96.517 2 0.029448 100513 QUIQUE_C1438_190116_001 65.404 45.768 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39140 3102 36530 350775;350776;350777 446189;446190;446191 446189 3 SDEREVAEAATGEDASSPPPK Acetyl (Protein N-term) 2183.9818 0.98184992 3958 Q99536;K7ERT7 VAT1 Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog yes no 1 0 1 1 65.402 65.402 2 0.0011769 64320 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.545 61.493 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39141 3958 36531 350778 446192 446192 1 SDEVDEQVACQEVK Unmodified 1634.7094 0.70938023 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 0 1 1 45.63 45.63 2 2.2059E-10 43581 QUIQUE_C1438_190116_001 134.3 108.65 28454000 0 0 0 0 28454000 0 0 0 0 0 0 0 0 39142 2880 36532 350779;350780 446193;446194 446194 2 SDEWFAK Unmodified 881.39193 0.3919329 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4;I3L1I0 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.482 51.482 2 0.039849 47190 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.377 61.606 360210000 0 0 0 0 0 124380000 0 37539000 77866000 56301000 0 64126000 0 39143 4220 36533 350781;350782;350783;350784;350785 446195;446196;446197;446198;446199 446198 5 SDFDSNPFADPDLNNPFKDPSVTQVTR Acetyl (Protein N-term) 3064.405 0.40502337 1483 O15126 SCAMP1 Secretory carrier-associated membrane protein 1 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 151.71 151.71 3 4.1495E-36 154097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.28 117.41 209060000 0 0 0 73201000 0 50965000 0 84891000 0 0 0 0 0 39144 1483 36534 350786;350787;350788;350789 446200;446201;446202;446203 446203 3 SDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIER Unmodified 2999.3277 0.32770102 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 162.09 162.09 3 1.8236E-14 164117 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.006 80.473 290560000 41766000 38080000 0 0 39855000 0 64402000 57091000 49366000 0 0 0 0 39145 2175 36535 350790;350791;350792;350793;350794;350795 446204;446205;446206;446207;446208;446209;446210 446209 7 SDFFELLSNHHLDSQSR Unmodified 2030.9446 0.94461697 1445 O14776;G3V220 TCERG1 Transcription elongation regulator 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 103.02 103.02 4 0.00010144 106480 QUIQUE_C1277_190116_001 71.697 62.282 109160000 0 25132000 0 29705000 0 0 15019000 0 0 0 24805000 0 14499000 39146 1445 36536 350796;350797;350798;350799;350800 446211;446212;446213;446214;446215 446211 5 SDFQCVVGFGGIHSTPSTVLSDQAK Unmodified 2636.2541 0.25406579 3253 Q53GT1 KLHL22 Kelch-like protein 22 yes yes 0 0 0 1 109.67 109.67 3 0.014878 113028 QUIQUE_C1277_190116_001 27.143 19.431 46134000 0 46134000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39147 3253 36537 350801 446216 446216 1 SDFQVNLNNASR Unmodified 1363.648 0.64804102 759 C9JZR2;O60716;H0YC95 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.704 59.704 2 0.00037478 58677 QUIQUE_C1277_190116_001 113.69 92.816 436410000 44750000 48746000 57502000 52912000 47751000 33004000 0 0 50381000 0 62858000 38509000 0 39148 759 36538 350802;350803;350804;350805;350806;350807;350808;350809;350810 446217;446218;446219;446220;446221;446222;446223;446224;446225 446218 9 SDFSVWTILK Unmodified 1194.6285 0.62847478 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YG95;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0;A0A2R8YG53;A0A2R8Y429;A0A2R8Y703 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 140.48 140.48 2 0.003115 146267 QUIQUE_C1218_190116_001 86.136 65.576 154520000 26451000 0 0 0 0 27296000 0 33522000 35119000 0 32132000 0 0 39149 454 36539 350811;350812;350813;350814;350815 446226;446227;446228;446229;446230;446231 446227 6 SDFSVWTILKK Unmodified 1322.7234 0.72343779 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YG95;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0;A0A2R8YG53;A0A2R8Y429;A0A2R8Y703 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2 yes no 0 0 1 1 1 111.67 111.67 3 0.0020818 114674 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.744 54.02 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39150 454 36540 350816;350817 446232;446233 446232 2 SDFTIDLK Unmodified 937.47566 0.47566253 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 77.027 77.027 2 0.023496 77182 QUIQUE_C1403_190116_001 73.248 43.889 69051000 0 19249000 0 17821000 0 0 0 0 21867000 10113000 0 0 0 39151 3419 36541 350818;350819;350820;350821 446234;446235;446236;446237;446238;446239 446236 6 SDFYDIVLVATPLNR Unmodified 1721.8988 0.89883598 4435 Q9UHG3 PCYOX1 Prenylcysteine oxidase 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 152.55 152.55 2;3 1.3308E-12 155191 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.62 112.86 1990900000 165210000 185680000 149330000 129410000 176810000 138220000 167720000 127600000 170680000 65689000 207190000 178500000 128840000 39152 4435 36542 350822;350823;350824;350825;350826;350827;350828;350829;350830;350831;350832;350833;350834;350835;350836;350837;350838 446240;446241;446242;446243;446244;446245;446246;446247;446248;446249;446250;446251;446252;446253;446254;446255;446256;446257;446258;446259 446252 19 SDGALLLGASSLSGR Unmodified 1402.7416 0.74160705 3991 Q9BQA1 WDR77 Methylosome protein 50 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 94.615 94.615 2 7.3101E-06 96212 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.49 77.765 946080000 111960000 113800000 99881000 82600000 101220000 92190000 0 101620000 82424000 47700000 0 112700000 0 39153 3991 36543 350839;350840;350841;350842;350843;350844;350845;350846;350847;350848;350849 446260;446261;446262;446263;446264;446265;446266;446267;446268;446269;446270;446271;446272 446268 13 SDGAPASDSKPGSSEAAPSSK Unmodified 1931.8708 0.87084291 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 1 4 4 4 3 4 4 4 2 2 3 2 2 13.517 13.517 2;3 6.9095E-164 3317 QUIQUE_C1563_190116_001 233.84 213.64 7848400000 782610000 1243000000 456930000 239280000 1434700000 1386300000 1114400000 0 91652000 78241000 507760000 90963000 422610000 39154 2817 36544 350850;350851;350852;350853;350854;350855;350856;350857;350858;350859;350860;350861;350862;350863;350864;350865;350866;350867;350868;350869;350870;350871;350872;350873;350874;350875;350876;350877;350878;350879;350880;350881;350882;350883;350884;350885;350886;350887 446273;446274;446275;446276;446277;446278;446279;446280;446281;446282;446283;446284;446285;446286;446287;446288;446289;446290;446291;446292;446293;446294;446295;446296;446297;446298;446299;446300;446301;446302;446303;446304;446305;446306;446307;446308;446309;446310;446311 446294 39 SDGDLIVPAR Unmodified 1041.5455 0.54547343 501 A0A3B3ITP4;Q495G5;Q8IVH4 MMAA Methylmalonic aciduria type A protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 48.047 48.047 2 0.0052305 46195 QUIQUE_C1218_190116_001 78.192 50.309 38703000 14027000 0 24676000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39155 501 36545 350888;350889;350890 446312;446313;446314 446312 3 SDGDPVQPAVLQVHQTS Unmodified 1776.8642 0.86424139 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 70.875 70.875 2 8.092E-07 70632 QUIQUE_C1403_190116_001 106.26 88.784 220150000 54188000 0 0 50588000 55072000 27427000 0 0 0 0 0 0 32871000 39156 1751 36546 350891;350892;350893;350894;350895 446315;446316;446317;446318;446319 446316 5 SDGFSIETCK Unmodified 1142.4914 0.49138895 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.391 46.391 2 0.00022747 43689 QUIQUE_C1438_190116_001 118.18 107.3 1999700000 160960000 93656000 209940000 237700000 210050000 97647000 230070000 56359000 219690000 50670000 114670000 206780000 111470000 39157 2127 36547 350896;350897;350898;350899;350900;350901;350902;350903;350904;350905;350906;350907;350908 446320;446321;446322;446323;446324;446325;446326;446327;446328;446329;446330;446331;446332 446324 11 SDGGAVLALGLLGPVTR Unmodified 1594.9043 0.90425571 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 141.52 141.52 2;3 0.00033146 145785 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.31 105.07 1992900000 170830000 198900000 164820000 163060000 193290000 149070000 178420000 95516000 114630000 56629000 179210000 190860000 137710000 39158 4500 36548 350909;350910;350911;350912;350913;350914;350915;350916;350917;350918;350919;350920;350921;350922;350923 446333;446334;446335;446336;446337;446338;446339;446340;446341;446342;446343;446344;446345;446346;446347;446348 446347 15 SDGGYTYDTSDLAAIK Unmodified 1675.7577 0.75771063 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 90.907 90.907 2 0.00012495 93979 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.79 103.11 257810000 79677000 0 0 25667000 0 0 0 46935000 0 58008000 47526000 0 0 39159 2638 36549 350924;350925;350926;350927;350928;350929;350930 446349;446350;446351;446352;446353;446354;446355;446356 446355 7 SDGIYIINLK Unmodified 1134.6285 0.62847478 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.04 99.04 2 0.0021538 101552 QUIQUE_C1277_190116_001 91.516 69.988 2075700000 199220000 194450000 271240000 196150000 226040000 184740000 160720000 103310000 179970000 76322000 283570000 0 0 39160 225 36550 350931;350932;350933;350934;350935;350936;350937;350938;350939;350940;350941 446357;446358;446359;446360;446361;446362;446363;446364;446365;446366;446367;446368;446369;446370;446371;446372;446373 446359 17 SDGIYIINLKR Unmodified 1290.7296 0.7295858 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 0 0 1 1 74.074 74.074 3 0.0087524 73859 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.625 31.527 16771000 0 0 0 0 0 0 0 16771000 0 0 0 0 0 39161 225 36551 350942 446374;446375 446375 2 SDGLDNEEKPPAPPLR Acetyl (Protein N-term) 1775.869 0.86899241 120 A0A087X294;O75914;B1AKS5 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 yes no 1 0 1 1 3 1 1 1 1 71.349 71.349 2 5.8492E-09 71366 QUIQUE_DMIX8_190116_001 144.47 117.89 128050000 0 0 0 27844000 0 23387000 0 0 0 19738000 0 0 57084000 39162 120 36552 350943;350944;350945;350946;350947;350948;350949;350950 446376;446377;446378;446379;446380;446381;446382;446383 446383 8 SDHEELSGSSTNLADHNPSSWR Unmodified 2425.0531 0.053057801 1442 O14770;H0YMX5;U3KQI2;H0YKE5;H0YKN2;U3KQ95 MEIS2 Homeobox protein Meis2 yes no 0 0 0 1 55.863 55.863 3 0.050175 54707 QUIQUE_C1576_190116_001 21.606 13.419 36684000 0 0 0 0 0 0 36684000 0 0 0 0 0 0 39163 1442 36553 350951 446384 446384 1 SDHWPLSDVR Unmodified 1210.5731 0.57308516 1527 O43427;H0YCE7 FIBP Acidic fibroblast growth factor intracellular-binding protein yes no 0 0 0 1 56.262 56.262 3 0.020658 54713 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.3 37.707 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39164 1527 36554 350952 446385 446385 1 SDIATLLK Unmodified 859.50148 0.50148335 4605 Q9Y4E8;F8W0H4;H0YI31 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes no 0 0 0 1 1 1 68.478 68.478 2 0.03696 68388 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.464 29.854 98553000 0 0 0 0 0 0 0 28906000 41720000 0 0 0 27928000 39165 4605 36555 350953;350954;350955 446386;446387;446388 446387 3 SDIAVPIPK Unmodified 938.54368 0.54368251 2917 Q08257;A6NP24;C9JH92 CRYZ Quinone oxidoreductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 62.012 62.012 2 0.013967 58026 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.198 50.467 631420000 0 0 17610000 161070000 149910000 155630000 91393000 0 0 55805000 0 0 0 39166 2917 36556 350956;350957;350958;350959;350960;350961 446389;446390;446391;446392;446393;446394;446395 446395 7 SDIDEIVLVGGSTR Unmodified 1459.7518 0.75183739 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.05 102.05 2 6.8265E-14 104910 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.07 99.878 1603400000 100360000 129460000 114990000 122170000 152430000 135640000 132090000 101600000 119210000 116480000 134530000 109760000 134650000 39167 2007 36557 350962;350963;350964;350965;350966;350967;350968;350969;350970;350971;350972;350973;350974 446396;446397;446398;446399;446400;446401;446402;446403;446404;446405;446406;446407;446408;446409;446410;446411;446412;446413;446414;446415;446416;446417;446418;446419 446412 24 SDIENADESSSSILKPLISPAAER Unmodified 2528.2606 0.26059096 4662 Q9Y6R1;A0A1W2PNW8;A0A1W2PRU6 SLC4A4 Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.85 105.85 3 4.4747E-18 108938 QUIQUE_C1277_190116_001 87.659 80.547 714770000 103420000 62490000 81483000 85675000 72902000 117340000 67436000 0 46131000 31964000 0 0 45926000 39168 4662 36558 350975;350976;350977;350978;350979;350980;350981;350982;350983;350984 446420;446421;446422;446423;446424;446425;446426;446427;446428;446429;446430 446421 10 SDIGAHQPGMSLSSSK Unmodified 1600.7515 0.75151981 3739 Q92599 SEPT8 Septin-8 yes yes 0 0 0 1 2 32.004 32.004 2;3 0.00051333 27603 QUIQUE_C1218_190116_001 47.222 30.153 169110000 53398000 0 115720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39169 3739 36559 350985;350986;350987 446431;446432;446433 446431 3 SDIGEVILVGGMTR Unmodified 1445.7548 0.75481428 2415 P38646;H0YBG6 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 115.83 115.83 2;3 7.3977E-08 119658 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.97 135.67 2850800000 302600000 258680000 310570000 215080000 214130000 278030000 288150000 110710000 186100000 82878000 230110000 170710000 203060000 39170 2415 36560 350988;350989;350990;350991;350992;350993;350994;350995;350996;350997;350998;350999;351000;351001;351002;351003;351004;351005;351006;351007 446434;446435;446436;446437;446438;446439;446440;446441;446442;446443;446444;446445;446446;446447;446448;446449;446450;446451;446452;446453;446454;446455;446456;446457;446458;446459;446460;446461;446462 446452 29 SDIGEVILVGGMTR Oxidation (M) 1461.7497 0.7497289 2415 P38646;H0YBG6 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 95.497 95.497 2 0.00022677 96910 QUIQUE_C1563_190116_001 93.839 66.411 417680000 0 34860000 118560000 0 0 125620000 0 0 0 138630000 0 0 0 39171 2415 36560 351008;351009;351010;351011;351012 446463;446464;446465;446466;446467;446468 446465 1838 6 SDISPLTPR Unmodified 984.52401 0.52400971 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.633 41.633 2 0.00047712 37034 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.52 110.37 2666500000 172890000 127780000 156610000 159130000 167650000 238960000 106610000 295700000 307670000 62407000 290540000 226740000 353800000 39172 2483 36561 351013;351014;351015;351016;351017;351018;351019;351020;351021;351022;351023;351024;351025 446469;446470;446471;446472;446473;446474;446475;446476;446477;446478;446479;446480;446481;446482;446483;446484;446485 446481 16 SDIYVCMISFAHNVAAQGK Unmodified 2109.9976 0.99758052 2560 P50395 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 138.02 138.02 2;3 8.2297E-36 143165 QUIQUE_C1368_190116_001 178.67 169.14 2937400000 213910000 264090000 360130000 267560000 240230000 38237000 276180000 38538000 303280000 0 326590000 299640000 309050000 39173 2560 36562 351026;351027;351028;351029;351030;351031;351032;351033;351034;351035;351036;351037;351038;351039;351040;351041;351042;351043;351044;351045;351046;351047;351048 446486;446487;446488;446489;446490;446491;446492;446493;446494;446495;446496;446497;446498;446499;446500;446501;446502;446503;446504;446505;446506;446507;446508 446491 22 SDIYVCMISYAHNVAAQGK Unmodified 2125.9925 0.99249514 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 124.14 124.14 2;3 3.0496E-36 126706 QUIQUE_C1563_190116_001 174.39 55.008 9927400000 631120000 737870000 1056200000 812090000 985700000 844780000 711780000 529430000 807960000 416930000 848770000 752940000 791850000 39174 2328 36563 351049;351050;351051;351052;351053;351054;351055;351056;351057;351058;351059;351060;351061;351062;351063;351064;351065;351066;351067;351068;351069;351070;351071;351072;351073 446509;446510;446511;446512;446513;446514;446515;446516;446517;446518;446519;446520;446521;446522;446523;446524;446525;446526;446527;446528;446529;446530;446531;446532;446533;446534;446535;446536;446537;446538;446539;446540;446541;446542;446543;446544;446545;446546;446547;446548;446549;446550;446551;446552;446553 446527 45 SDIYVCMISYAHNVAAQGK Oxidation (M) 2141.9874 0.98740976 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 1 0 2 2 1 1 2 1 1 2 2 1 73.858 73.858 3 1.5646E-06 75236 QUIQUE_C1277_190116_001 90.654 82.295 613550000 37743000 69159000 51279000 58441000 115610000 0 42070000 0 39300000 62747000 0 77480000 59724000 39175 2328 36563 351074;351075;351076;351077;351078;351079;351080;351081;351082;351083;351084;351085;351086;351087;351088 446554;446555;446556;446557;446558;446559;446560;446561;446562;446563;446564;446565;446566;446567;446568;446569 446557 1714 13 SDKDLETQVIQLNEQVHSLK Unmodified 2323.202 0.20195387 3145 Q15555 MAPRE2 Microtubule-associated protein RP/EB family member 2 yes yes 0 0 1 2 2 3 2 4 2 2 2 3 2 2 2 3 101.7 101.7 2;3;4 1.3885E-135 104775 QUIQUE_C1368_190116_001 223.76 209.73 8367300000 769610000 682170000 817550000 576790000 759420000 637450000 656500000 783320000 638880000 240130000 484300000 440130000 881090000 39176 3145 36564 351089;351090;351091;351092;351093;351094;351095;351096;351097;351098;351099;351100;351101;351102;351103;351104;351105;351106;351107;351108;351109;351110;351111;351112;351113;351114;351115;351116;351117;351118;351119 446570;446571;446572;446573;446574;446575;446576;446577;446578;446579;446580;446581;446582;446583;446584;446585;446586;446587;446588;446589;446590;446591;446592;446593;446594;446595;446596;446597;446598;446599;446600;446601;446602;446603;446604;446605;446606;446607;446608;446609;446610;446611;446612;446613;446614;446615;446616 446579 46 SDKLPYK Acetyl (Protein N-term) 891.47018 0.47018322 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 33.05 33.05 2 0.050218 28594 QUIQUE_C1218_190116_001 98.997 20.381 661460000 66248000 96091000 0 0 88980000 0 0 0 111510000 0 158110000 0 140520000 39177 2219 36565 351120;351121;351122;351123;351124;351125 446617;446618;446619;446620;446621;446622 446617 6 SDKWIDIHNPATNEVIGR Unmodified 2064.0389 0.038851707 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 1 2 3 3 3 2 3 3 3 4 3 3 3 81.204 81.204 2;3;4 9.8707E-161 83519 QUIQUE_DMIX5_190116_001 245.69 219.97 7866800000 190870000 487380000 474870000 378380000 329270000 291550000 402240000 1027600000 1106200000 0 1046800000 1065600000 1066000000 39178 2870 36566 351126;351127;351128;351129;351130;351131;351132;351133;351134;351135;351136;351137;351138;351139;351140;351141;351142;351143;351144;351145;351146;351147;351148;351149;351150;351151;351152;351153;351154;351155;351156;351157;351158;351159;351160 446623;446624;446625;446626;446627;446628;446629;446630;446631;446632;446633;446634;446635;446636;446637;446638;446639;446640;446641;446642;446643;446644;446645;446646;446647;446648;446649;446650;446651;446652;446653;446654;446655;446656;446657;446658;446659;446660;446661;446662;446663;446664;446665;446666;446667;446668;446669;446670;446671;446672;446673;446674;446675;446676;446677;446678;446679;446680;446681;446682;446683;446684;446685;446686;446687 446675 65 SDLAVEAGAPYAER Unmodified 1447.6943 0.69432251 3787 Q969P0;C9J8Z4 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.209 64.209 2 6.4421E-05 63651 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.77 89.024 3667200000 410810000 385980000 421690000 339550000 343900000 0 457630000 0 288100000 226030000 0 337020000 456540000 39179 3787 36567 351161;351162;351163;351164;351165;351166;351167;351168;351169;351170 446688;446689;446690;446691;446692;446693;446694;446695;446696;446697;446698 446697 11 SDLAVPSELALLK Unmodified 1354.7708 0.77078192 2920 Q08380 LGALS3BP Galectin-3-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 123.13 123.13 2 0.03858 128139 QUIQUE_C1576_190116_001 45.565 19.181 698200000 117920000 0 89658000 0 130300000 0 133860000 0 0 46142000 180320000 0 0 39180 2920 36568 351171;351172;351173;351174;351175;351176 446699;446700;446701;446702;446703;446704 446702 4 SDLDSLK Unmodified 776.3916 0.39159855 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8;E9PQR1 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 27.784 27.784 2 0.0238 22136 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.375 30.89 165340000 0 0 0 0 0 0 0 0 41813000 0 38328000 36996000 48204000 39181 3226 36569 351177;351178;351179;351180 446705;446706;446707;446708 446707 4 SDLDTLLSMEMK Unmodified 1381.6469 0.64690331 3280 Q5JVZ5;Q96JJ3;Q5JW01 ELMO2 Engulfment and cell motility protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 136.24 136.24 2 0.0020976 139810 QUIQUE_C1277_190116_001 99.283 81.847 22615000 22615000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39182 3280 36570 351181;351182;351183 446709;446710;446711 446710 2 SDLEHFMLVR Unmodified 1245.6176 0.61759251 962 E9PMJ2;J3KP39;Q9BPY3;G3V179;E9PIM5 FAM118B Protein FAM118B yes no 0 0 0 1 1 88.037 88.037 3 0.03001 91433 QUIQUE_C1438_190116_001 40.496 16.82 9512500 0 0 0 0 9512500 0 0 0 0 0 0 0 0 39183 962 36571 351184;351185 446712;446713 446713 2 SDLEMQYETLQEELMALK 2 Oxidation (M) 2202.0072 0.0072017319 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 2 0 2 1 1 1 1 1 3 1 1 156.27 156.27 2 7.316E-39 151661 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.6 153.01 413760000 61332000 26966000 29119000 0 41646000 0 0 34781000 31406000 121590000 0 23327000 43592000 + 39184 780 36572 351186;351187;351188;351189;351190;351191;351192;351193;351194;351195;351196;351197 446714;446715;446716;446717;446718;446719;446720;446721;446722;446723;446724;446725 446722 472;473 10 SDLEMQYETLQEELMALK Oxidation (M) 2186.0123 0.01228711 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 1 0 1 3 158.02 158.02 2 1.2419E-13 163562 QUIQUE_C1438_190116_001 128.31 102.19 73934000 0 0 0 0 28943000 0 0 0 0 44991000 0 0 0 + 39185 780 36572 351198;351199;351200;351201 446726;446727;446728;446729 446726 472;473 4 SDLEMQYETLQEELMALK Unmodified 2170.0174 0.017372488 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 161.73 161.73 2 6.6668E-11 156366 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.65 91.508 26917000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26917000 0 + 39186 780 36572 351202;351203;351204 446730;446731;446732;446733 446730 4 SDLEMQYETLQEELMALKK 2 Oxidation (M) 2330.1022 0.10216475 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 2 1 1 1 1 138.58 138.58 3 0.00051786 141847 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.49 54.221 380710000 0 0 0 0 0 0 0 207140000 111640000 61931000 0 0 0 + 39187 780 36573 351205;351206;351207 446734;446735;446736 446734 472;473 2 SDLEMQYETLQEELMALKK Oxidation (M) 2314.1073 0.10725013 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 1 1 1 139.16 139.16 3 0.00031184 142071 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.436 59.33 39905000 0 0 0 0 0 0 0 39905000 0 0 0 0 0 + 39188 780 36573 351208 446737 446737 472;473 1 SDLEQLDHEVK Unmodified 1311.6307 0.63065962 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 43.609 43.609 2 0.032124 38217 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.602 29.822 12155000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12155000 0 0 0 39189 1187 36574 351209 446738 446738 1 SDLFQEDLYPPTAGPDPALTAEEWLGGR Unmodified 3044.4403 0.44034624 2327 P31146 CORO1A Coronin-1A yes yes 0 0 0 1 1 1 167.59 167.59 3 3.9597E-19 171165 QUIQUE_C1277_190116_001 90.37 85.241 80825000 0 37487000 0 28569000 0 0 0 0 0 14770000 0 0 0 39190 2327 36575 351210;351211;351212 446739;446740;446741;446742;446743;446744 446740 6 SDLHPTLPAGR Unmodified 1162.6095 0.60947067 4303 Q9NV96 TMEM30A Cell cycle control protein 50A yes yes 0 0 0 1 1 30.873 30.873 3 0.026817 25865 QUIQUE_C1218_190116_001 30.729 15.912 49828000 26062000 0 0 23765000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39191 4303 36576 351213;351214 446745;446746 446745 2 SDLKAEALASAIASTK Unmodified 1574.8516 0.85155143 4310 Q9NVT9 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 85.174 85.174 3 0.026902 85747 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.333 12.646 24217000 0 0 0 0 0 0 0 24217000 0 0 0 0 0 39192 4310 36577 351215 446747 446747 1 SDLLAAIR Unmodified 857.49707 0.49706667 4523 Q9UPY6 WASF3 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.793 75.793 2 0.0036559 74793 QUIQUE_C1563_190116_001 118.69 57.888 312320000 32147000 26549000 0 0 0 40536000 0 54278000 58265000 20693000 44107000 35743000 0 39193 4523 36578 351216;351217;351218;351219;351220;351221;351222;351223;351224 446748;446749;446750;446751;446752;446753;446754;446755;446756;446757;446758 446752 10 SDLLLEGFNNYR Unmodified 1439.7045 0.70449327 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 116.17 116.17 2 0.00052569 120936 QUIQUE_C1576_190116_001 98.044 71.602 311210000 0 0 0 0 0 0 101340000 0 0 54686000 155180000 0 0 39194 2379 36579 351225;351226;351227 446759;446760;446761;446762 446760 3 SDMGVGVFTPTIEAR Unmodified 1578.7712 0.77119262 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 106.2 106.2 2 0.00038167 109163 QUIQUE_C1277_190116_001 102.4 76.462 287760000 43751000 38398000 59076000 33805000 0 35864000 0 43676000 33192000 0 0 0 0 39195 1998 36580 351228;351229;351230;351231;351232;351233;351234 446763;446764;446765;446766;446767;446768;446769;446770 446765 8 SDMLLSR Unmodified 820.41129 0.41128813 1622 O75323;H7C333;C9K068;C9J7B1 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes no 0 0 0 1 39.011 39.011 2 0.029232 35140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.626 24.592 133570000 0 0 0 0 0 0 0 133570000 0 0 0 0 0 39196 1622 36581 351235 446771 446771 1 SDMNTVLNYIFSHAQVTK Unmodified 2067.0095 0.0095254139 2964 Q13085 ACACA Acetyl-CoA carboxylase 1;Biotin carboxylase yes yes 0 0 0 1 153.4 153.4 3 0.00054114 157836 QUIQUE_C1277_190116_001 61.102 57.498 26593000 0 26593000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39197 2964 36582 351236 446772 446772 1 SDNGELEDKPPAPPVR Acetyl (Protein N-term) 1761.8533 0.85334235 2974 Q13177 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.883 59.883 2 2.8038E-79 58742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 208.95 181.62 483640000 29473000 48112000 0 58605000 36360000 0 41109000 41868000 56665000 21021000 57853000 43829000 48748000 39198 2974 36583 351237;351238;351239;351240;351241;351242;351243;351244;351245;351246;351247 446773;446774;446775;446776;446777;446778;446779;446780;446781;446782;446783 446779 11 SDNILLGMDGSVK Unmodified 1347.6704 0.67041595 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCG5;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.311 93.311 2 0.00043911 90253 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.163 74.245 673330000 131570000 0 0 105580000 0 107130000 0 0 81507000 53335000 106100000 88109000 0 39199 2970;120 36584 351248;351249;351250;351251;351252;351253;351254;351255;351256;351257 446784;446785;446786;446787;446788;446789;446790;446791;446792;446793;446794;446795 446792 11 SDNVLLGMEGSVK Unmodified 1347.6704 0.67041595 2974 Q13177;H7C1X3 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes no 0 0 0 1 86.2 86.2 2 0.023137 88529 QUIQUE_C1368_190116_001 55.776 26.979 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39200 2974 36585 351258 446796 446796 1 SDPAAFESR Unmodified 978.44067 0.44067401 1253 I3L448;A8MRA7;Q5TC12;H0YEW4;H0YDD6 ATPAF1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 no no 0 0 0 1 1 25.036 25.036 2 0.061319 18701 QUIQUE_C1563_190116_001 47.603 32.827 98289000 0 0 0 0 0 42503000 0 0 0 0 55786000 0 0 39201 1253 36586 351259;351260 446797;446798 446797 2 SDPDHLAELVK Unmodified 1222.6194 0.61936665 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 1 3 1 2 53.416 53.416 2;3 0.00045795 51104 QUIQUE_C1403_190116_001 105.52 80.385 446950000 83136000 79143000 48788000 88167000 0 43012000 87129000 0 0 17579000 0 0 0 39202 153 36587 351261;351262;351263;351264;351265;351266;351267;351268;351269;351270;351271;351272;351273;351274;351275;351276;351277;351278 446799;446800;446801;446802;446803;446804;446805;446806;446807;446808;446809;446810;446811;446812;446813;446814;446815;446816;446817 446806 18 SDPEMGWVPEPPTMTLGASR Acetyl (Protein N-term) 2198.9976 0.9976401 1745;1167 O95741;H0YLV2;H0YLM2;H0YNP2;H0YNX4;H0YNM7;H0YKJ0;H0YM67;H0YNV2;H0YNV6;H0YKP1 CPNE6 Copine-6 no no 1 0 0 2 1 3 2 3 2 2 1 1 1 2 1 157.53 157.53 2;3 1.526E-18 162261 QUIQUE_DMIX3_190116_001 163.27 154.76 1000700000 132720000 22993000 125240000 0 76572000 135460000 84026000 91376000 59921000 22832000 79218000 97339000 73020000 39203 1745;1167 36588 351279;351280;351281;351282;351283;351284;351285;351286;351287;351288;351289;351290;351291;351292;351293;351294;351295;351296;351297;351298;351299 446818;446819;446820;446821;446822;446823;446824;446825;446826;446827;446828;446829;446830;446831;446832;446833;446834;446835;446836;446837;446838;446839;446840;446841;446842;446843;446844;446845;446846 446840 24 SDPEMGWVPEPPTMTLGASR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2214.9926 0.99255472 1745;1167 O95741;H0YLV2;H0YLM2;H0YNP2;H0YNX4;H0YNM7;H0YKJ0;H0YM67;H0YNV2;H0YNV6;H0YKP1 CPNE6 Copine-6 no no 1 1 0 1 147.3 147.3 2 0.0020057 142981 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.333 44.442 12513000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12513000 0 0 0 39204 1745;1167 36588 351300 446847;446848 446847 677 2 SDPFLEFFR Unmodified 1156.5553 0.55530983 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;A6PVH9;E7ENH5;Q5JX45;Q5JX56;Q5JX58;Q5JX59;Q5JX60;Q5JX44;Q5JX61;Q5JX52 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.65 142.65 2 0.00068586 149253 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.02 117.43 928590000 43841000 63303000 74103000 74861000 87987000 55446000 71606000 38990000 80102000 49824000 105750000 77865000 104910000 39205 579 36589 351301;351302;351303;351304;351305;351306;351307;351308;351309;351310;351311;351312;351313 446849;446850;446851;446852;446853;446854;446855;446856;446857;446858;446859;446860;446861;446862 446860 10 SDPFLEIFR Unmodified 1122.571 0.5709599 3793 Q96A23 CPNE4 Copine-4 yes yes 0 0 0 1 134.19 134.19 2 0.059758 140736 QUIQUE_C1438_190116_001 48.036 31.742 27130000 0 0 0 0 27130000 0 0 0 0 0 0 0 0 39206 3793 36590 351314 446863 446863 1 SDPFLVFYR Unmodified 1142.576 0.57604528 4225;853 E7ENV7;Q86YQ8;Q8IYJ1;Q9HCH3;A0A0J9YWA1;A0A0J9YWU8;A0A087WX62 CPNE8;CPNE9;CPNE5 Copine-8;Copine-9;Copine-5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 123.4 123.4 2 0.0089716 120589 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.282 59.297 139040000 23633000 0 0 24444000 23782000 0 26639000 0 0 12687000 0 0 27857000 39207 853;4225 36591 351315;351316;351317;351318;351319;351320;351321 446864;446865;446866;446867;446868;446869;446870 446868 7 SDPFMEIYK Unmodified 1128.5161 0.51614714 1745 O95741;H0YLV2;H0YLM2 CPNE6 Copine-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 92.542 92.542 1;2 0.018465 93545 QUIQUE_C1563_190116_001 117.04 81.156 4241300000 469100000 507490000 352750000 342910000 0 418130000 371300000 318300000 330400000 129770000 317170000 314400000 369600000 39208 1745 36592 351322;351323;351324;351325;351326;351327;351328;351329;351330;351331;351332;351333;351334 446871;446872;446873;446874;446875;446876;446877;446878;446879;446880;446881;446882;446883;446884;446885 446876 14 SDPFMEIYK Oxidation (M) 1144.5111 0.51106176 1745 O95741;H0YLV2;H0YLM2 CPNE6 Copine-6 yes no 0 1 0 1 1 1 1 79.385 79.385 2 0.051852 79927 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.482 41.79 267550000 0 0 0 0 0 0 0 61763000 76012000 54829000 0 74948000 0 39209 1745 36592 351335;351336;351337;351338 446886;446887;446888;446889 446886 4 SDPGLLTNTMDVFVK Unmodified 1635.8178 0.81780846 2813 P78527;H0YG84 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes no 0 0 0 1 1 135.48 135.48 2 5.4815E-05 140803 QUIQUE_C1368_190116_001 91.961 74.296 67277000 0 0 44078000 0 0 0 0 23200000 0 0 0 0 0 39210 2813 36593 351339;351340 446890;446891 446890 2 SDPIMLLK Unmodified 915.50994 0.50993955 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 79.023 79.023 2 0.042451 79842 QUIQUE_C1403_190116_001 58.981 35.009 195660000 0 0 0 122400000 0 0 0 0 0 0 73266000 0 0 39211 1943 36594 351341;351342 446892;446893 446892 2 SDPIMLLK Oxidation (M) 931.50485 0.50485417 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 68.493 68.493 2 0.04229 65196 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.287 46.36 121790000 0 0 0 0 0 65907000 0 0 0 55886000 0 0 0 39212 1943 36594 351343;351344 446894;446895 446895 2 SDPIQEIR Unmodified 956.49271 0.49270958 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 39.786 39.786 2 0.019173 36464 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.77 46.835 103220000 0 0 0 0 0 0 0 38666000 0 0 64553000 0 0 39213 4007 36595 351345;351346 446896;446897 446896 2 SDPLCVLFLNTSGQQWYEVER Unmodified 2540.2006 0.20057366 1611 O75131;A0A087WYQ3;E5RHZ0;A0A087WXR6;A0A087WUS8;E5RFT7 CPNE3 Copine-3 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 161.29 161.29 2;3 1.2056E-64 166458 QUIQUE_C1368_190116_001 173.36 147.23 428870000 26011000 0 76223000 0 0 32556000 60808000 74364000 94249000 0 0 0 64656000 39214 1611 36596 351347;351348;351349;351350;351351;351352;351353;351354;351355;351356;351357;351358;351359 446898;446899;446900;446901;446902;446903;446904;446905;446906;446907;446908;446909;446910 446901 13 SDPLCVLLQDVGGGSWAELGR Unmodified 2228.0896 0.089566649 579 F2Z2V0;B0QZ18;Q99829;A6PVH9;E7ENH5;Q5JX45;Q5JX56;Q5JX58;Q5JX59;Q5JX60;Q5JX44;Q5JX54;Q5JX55;Q5JX61;Q5JX52;Q5JX57;E7EV27;Q5JX53 CPNE1 Copine-1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 170.48 170.48 2;3 3.0101E-06 177652 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.962 76.581 248670000 0 0 0 0 30668000 0 36463000 28894000 38660000 0 63245000 0 50740000 39215 579 36597 351360;351361;351362;351363;351364;351365;351366;351367 446911;446912;446913;446914;446915;446916;446917;446918 446917 7 SDPLLIGIPTSENPFK Unmodified 1726.9142 0.91415169 4399 Q9UBI6 GNG12 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 139.14 139.14 2 4.4301E-09 142581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.34 107.65 1288500000 0 0 0 0 0 0 0 196210000 264100000 59936000 219120000 199630000 349490000 39216 4399 36598 351368;351369;351370;351371;351372;351373 446919;446920;446921;446922;446923;446924 446919 6 SDPLQQWELVPIEVFEAR Unmodified 2155.095 0.094969603 1716 O95248 SBF1 Myotubularin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 170.35 170.35 2;3 1.1384E-23 177610 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.96 133.55 149890000 0 11993000 25530000 0 13662000 0 15132000 0 13342000 0 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273440000 207510000 286240000 27200000 42008000 16099000 40093000 40295000 57287000 39221 2761 36603 351415;351416;351417;351418;351419;351420;351421;351422;351423;351424;351425;351426;351427;351428;351429;351430;351431;351432;351433 446973;446974;446975;446976;446977;446978;446979;446980;446981;446982;446983;446984;446985;446986;446987;446988;446989;446990;446991;446992;446993;446994;446995;446996;446997;446998;446999;447000;447001;447002;447003;447004;447005 446975 33 SDPSIVLLLQCDMQK Unmodified 1745.8692 0.86919211 4498 Q9UM19;B4DGW9 HPCAL4 Hippocalcin-like protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 138.08 138.08 3 0.00056712 142682 QUIQUE_C1277_190116_001 53.121 46.393 61279000 0 29505000 0 0 12100000 19674000 0 0 0 0 0 0 0 39222 4498 36604 351434;351435;351436;351437;351438 447006;447007;447008;447009;447010;447011 447007 4 SDPTSYAGYIEDLKK Unmodified 1685.8148 0.81483158 2645 P54709;C9JA36;C9JXZ1 ATP1B3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.51 92.51 3 0.00012543 94462 QUIQUE_C1368_190116_001 78.285 65.137 784590000 63790000 41825000 75919000 117470000 55096000 56694000 108640000 64536000 0 41395000 101640000 57595000 0 39223 2645 36605 351439;351440;351441;351442;351443;351444;351445;351446;351447;351448;351449 447012;447013;447014;447015;447016;447017;447018;447019;447020;447021;447022;447023 447014 10 SDPVVSYR Unmodified 921.4556 0.45559579 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.285 28.285 2 0.018262 22467 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.229 63.265 1644200000 223650000 269440000 276770000 0 267350000 0 0 276660000 0 0 330370000 0 0 39224 2058 36606 351450;351451;351452;351453;351454;351455 447024;447025;447026;447027;447028;447029 447029 6 SDPYHATSGALSPAK Unmodified 1500.7209 0.72087161 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 31.858 31.858 2;3 3.1216E-94 27059 QUIQUE_DMIX5_190116_001 215.53 196.21 6902800000 416240000 612710000 916340000 285510000 195980000 543320000 295540000 681540000 952860000 231120000 730850000 376230000 664520000 39225 2123 36607 351456;351457;351458;351459;351460;351461;351462;351463;351464;351465;351466;351467;351468;351469;351470;351471;351472;351473;351474;351475;351476;351477;351478;351479 447030;447031;447032;447033;447034;447035;447036;447037;447038;447039;447040;447041;447042;447043;447044;447045;447046;447047;447048;447049;447050;447051;447052;447053;447054;447055;447056;447057;447058;447059;447060;447061;447062;447063;447064;447065;447066;447067;447068;447069;447070;447071;447072 447063 43 SDPYLEFHK Unmodified 1134.5346 0.53457439 1611 O75131;A0A087WYQ3 CPNE3 Copine-3 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 1 1 2 1 1 2 2 2 43.62 43.62 2;3 0.0027872 41132 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.654 53.441 1506900000 78265000 41974000 150960000 53639000 171160000 48560000 37726000 135270000 65343000 29888000 270510000 193270000 230310000 39226 1611 36608 351480;351481;351482;351483;351484;351485;351486;351487;351488;351489;351490;351491;351492;351493;351494;351495;351496;351497;351498;351499 447073;447074;447075;447076;447077;447078;447079;447080;447081;447082;447083;447084;447085;447086;447087;447088;447089;447090;447091;447092;447093;447094;447095;447096;447097;447098;447099 447086 22 SDQDYILK Unmodified 980.48148 0.48147619 4530 Q9UQ80;F8VR77;F8W0A3;H0YIN7;F8VZ69 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 43.791 43.791 2 0.0084445 41260 QUIQUE_C1218_190116_001 94.302 46.387 891880000 124110000 118090000 125490000 99855000 0 0 107660000 101150000 0 59653000 155860000 0 0 39227 4530 36609 351500;351501;351502;351503;351504;351505;351506;351507 447100;447101;447102;447103;447104;447105;447106;447107;447108;447109 447100 9 SDQEAKPSTEDLGDKK Acetyl (Protein N-term) 1788.8378 0.83775186 676 B8ZZJ0;B9A032;B8ZZN6;P63165 SUMO1 Small ubiquitin-related modifier 1 yes no 1 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.474 22.474 3 6.0822E-07 15925 QUIQUE_C1218_190116_001 95.767 79.101 453860000 56161000 0 63482000 52408000 55853000 0 51628000 42534000 37770000 0 43115000 50911000 0 39228 676 36610 351508;351509;351510;351511;351512;351513;351514;351515;351516 447110;447111;447112;447113;447114;447115;447116;447117;447118 447110 9 SDQKQEQLLLK Unmodified 1328.73 0.72997974 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 1 1 28.267 28.267 2 0.0028491 22649 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.171 51.418 91835000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91835000 0 0 39229 2444 36611 351517 447119 447119 1 SDQKQEQLLLKK Unmodified 1456.8249 0.82494275 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 2 1 18.248 18.248 3 0.002575 10772 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.318 67.182 93056000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 93056000 0 0 39230 2444 36612 351518 447120 447120 1 SDQNLQTALELTR Unmodified 1487.758 0.7579854 1727 O95373 IPO7 Importin-7 yes yes 0 0 0 1 90.552 90.552 2 0.00044163 87416 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.9 98.035 32309000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32309000 0 0 0 39231 1727 36613 351519 447121 447121 1 SDQQLDCALDLMR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1621.7076 0.70760609 2493 P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta yes no 1 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 118.16 118.16 2 2.6872E-06 122009 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.8 78.664 463510000 27972000 46815000 61370000 0 38579000 51438000 32225000 30271000 0 34970000 67293000 42152000 30429000 39232 2493 36614 351520;351521;351522;351523;351524;351525;351526;351527;351528;351529;351530;351531 447122;447123;447124;447125;447126;447127;447128;447129;447130;447131;447132;447133 447132 1922 12 SDQQLDCALDLMR Acetyl (Protein N-term) 1605.7127 0.71269147 2493 P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.09 150.09 2 3.6935E-14 155228 QUIQUE_DMIX3_190116_001 158.41 143.14 2571300000 206300000 229680000 239820000 214730000 199730000 235750000 191080000 203740000 152210000 0 258800000 187440000 252050000 39233 2493 36614 351532;351533;351534;351535;351536;351537;351538;351539;351540;351541;351542;351543 447134;447135;447136;447137;447138;447139;447140;447141;447142;447143;447144;447145;447146;447147 447143 14 SDQVNGVLVLSLLDK Unmodified 1598.8879 0.88793694 3376 Q6NZI2 PTRF Polymerase I and transcript release factor yes yes 0 0 0 1 144.73 144.73 2 0.030943 140421 QUIQUE_DMIX4_190116_001 44.511 20.906 19747000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19747000 0 0 0 39234 3376 36615 351544 447148 447148 1 SDSAFFWEER Unmodified 1272.5411 0.54111633 1610;2999 Q13464;A0A0U1RQV4;O75116;D6REE7;C9JFJ0 ROCK1;ROCK2 Rho-associated protein kinase 1;Rho-associated protein kinase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 105.17 105.17 2 0.0025054 108095 QUIQUE_C1403_190116_001 100.02 72.275 231320000 0 0 43093000 36893000 31246000 0 0 0 0 14774000 38601000 30679000 36036000 39235 2999;1610 36616 351545;351546;351547;351548;351549;351550;351551 447149;447150;447151;447152;447153;447154;447155 447150 6 SDSDTEGLLFSR Unmodified 1325.6099 0.60992418 4172;346 Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.376 84.376 2 7.0521E-05 86034 QUIQUE_C1277_190116_001 123.96 97.514 652120000 200020000 103710000 0 161910000 0 118590000 0 0 0 27857000 40029000 0 0 39236 4172;346 36617 351552;351553;351554;351555;351556;351557 447156;447157;447158;447159;447160;447161 447157 6 SDSELNSEVAAR Unmodified 1276.5895 0.58952309 3260 Q53TN4 CYBRD1 Cytochrome b reductase 1 yes yes 0 0 0 1 1 30.834 30.834 2 7.8699E-06 25010 QUIQUE_DMIX4_190116_001 132.88 110.14 99546000 0 0 0 73635000 0 0 0 0 0 25911000 0 0 0 39237 3260 36618 351558;351559 447162;447163 447163 2 SDSEVAGYIR Unmodified 1095.5197 0.51965261 4155 Q9H3G5;H7C0X5;H7C218 CPVL Probable serine carboxypeptidase CPVL yes no 0 0 0 1 1 1 46.364 46.364 2 0.0061575 41671 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1 1 1 1 1 1 1 47.847 47.847 2 2.6784E-122 45129 QUIQUE_C1218_190116_001 230.06 221.25 573350000 50964000 68165000 94607000 59597000 45385000 32076000 81202000 0 24849000 0 33697000 27474000 55336000 39240 3569 36621 351586;351587;351588;351589;351590;351591;351592;351593;351594;351595;351596 447191;447192;447193;447194;447195;447196;447197;447198;447199;447200;447201 447191 11 SDSGTYGCTATSNMGSYK Oxidation (M) 1901.7408 0.74075671 3569 Q8N126 CADM3 Cell adhesion molecule 3 yes yes 0 1 0 1 28.043 28.043 2 6.5343E-45 22340 QUIQUE_C1368_190116_001 168.61 164.46 18115000 0 0 18115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39241 3569 36621 351597 447202 447202 2690 1 SDSHPSDALTR Unmodified 1184.5422 0.54217896 2539 P49748;K7EQP4;K7EJW8;J3QKU9 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 14.45 14.45 3 0.0022112 6542 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.245 72.113 67728000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67728000 0 0 0 39242 2539 36622 351598 447203 447203 0 SDSLVVCEVDPELTEK Acetyl (Protein N-term) 1860.8663 0.8662748 1562 O60234;M0QYJ8;M0QX47;M0QXC2;M0QXZ6;M0R2P2 GMFG Glia maturation factor gamma yes no 1 0 0 1 135.22 135.22 2 0.00033581 139061 QUIQUE_C1403_190116_001 74.392 59.42 29197000 0 0 0 29197000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39243 1562 36623 351599 447204 447204 1 SDSNASFLR Unmodified 995.46722 0.46722311 2856;1255 I6L894;D6RHE1;D6R9U4;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.851 33.851 2 3.109E-06 29080 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.91 85.157 1002600000 75342000 88108000 101910000 97082000 114730000 99423000 100120000 0 76057000 0 95590000 64457000 89790000 39244 1255;2856 36624 351600;351601;351602;351603;351604;351605;351606;351607;351608;351609;351610 447205;447206;447207;447208;447209;447210;447211;447212;447213;447214;447215;447216;447217 447215 11 SDSWSLANLSSTK Unmodified 1394.6678 0.66777341 4390 Q9P2R3 ANKFY1 Rabankyrin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.04 92.04 2 0.0022781 95459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.363 73.67 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351622;351623;351624;351625;351626;351627;351628;351629;351630;351631;351632;351633;351634;351635;351636;351637;351638;351639;351640;351641;351642;351643 447230;447231;447232;447233;447234;447235;447236;447237;447238;447239;447240;447241;447242;447243;447244;447245;447246;447247;447248;447249;447250;447251;447252;447253;447254;447255;447256;447257;447258;447259 447238 28 SDTAVADTR Acetyl (Protein N-term) 976.44615 0.44615331 95 A0A087X0R6;Q9UMY4 SNX12 Sorting nexin-12 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.872 29.872 2 0.0084528 23714 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.305 47.92 194100000 33896000 38169000 0 0 0 0 0 0 38152000 14813000 0 31265000 37806000 39248 95 36628 351644;351645;351646;351647;351648;351649;351650 447260;447261;447262;447263;447264;447265;447266 447263 7 SDTAVADTRR Acetyl (Protein N-term) 1132.5473 0.54726434 95 A0A087X0R6;Q9UMY4 SNX12 Sorting nexin-12 yes no 1 0 1 1 20.454 20.454 2 0.0022553 13647 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.71 63.181 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39249 95 36629 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C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 1 0 1 1 1 49.956 49.956 2 0.0017242 45095 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.659 56.281 48422000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16315000 0 32107000 0 39252 3318 36631 351670;351671;351672 447289;447290;447291 447290 2645 2 SDTEHSTNEVGTLCHK Unmodified 1813.7901 0.79009016 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.108 17.108 3 1.0363E-09 9198 QUIQUE_C1277_190116_001 97.073 91.969 508890000 81388000 60987000 50639000 60834000 71087000 65260000 41321000 0 0 0 0 0 77370000 39253 3597 36632 351673;351674;351675;351676;351677;351678;351679;351680 447292;447293;447294;447295;447296;447297;447298;447299 447293 7 SDTFINLR Unmodified 964.49779 0.49779495 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.676 66.676 2 0.004032 66676 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.63 70.683 2095900000 308150000 0 0 0 0 0 314580000 0 305180000 205390000 352300000 269120000 341170000 39254 2127 36633 351681;351682;351683;351684;351685;351686;351687 447300;447301;447302;447303;447304;447305;447306;447307;447308;447309 447304 10 SDTIANYELVYK Unmodified 1414.698 0.6980109 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 87.655 87.655 2 0.052724 89791 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.347 36.259 53542000 0 0 0 0 0 0 0 0 53542000 0 0 0 0 39255 987 36634 351688 447310 447310 1 SDTITFK Unmodified 810.41233 0.41233399 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 31.681 31.681 2 0.060724 25475 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.176 32.71 30690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30690000 0 0 0 39256 2223 36635 351689 447311 447311 1 SDTLQITDLGVSGAR Unmodified 1531.7842 0.78420015 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 93.556 93.556 2 1.9255E-35 95519 QUIQUE_DMIX3_190116_001 171.05 100.95 8177500000 843030000 938710000 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1 94.84 94.84 2 0.00048513 97092 QUIQUE_C1277_190116_001 90.685 63.57 514460000 45931000 62664000 53682000 51851000 71274000 0 65224000 34595000 0 0 0 48350000 80892000 39259 2045 36638 351716;351717;351718;351719;351720;351721;351722;351723;351724;351725 447343;447344;447345;447346;447347;447348;447349;447350;447351;447352;447353 447344 11 SDVASVNWSAPSQAFPR Unmodified 1817.8697 0.86966111 1283 J3KR97;Q9BTW9;A0A0J9YWI5;A0A0J9YVR1;I3L120;A0A0J9YXU4 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.67 102.67 2 4.7245E-07 104461 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.31 130.95 587810000 0 64234000 98777000 45604000 89431000 59814000 85356000 59136000 59657000 25803000 0 0 0 39260 1283 36639 351726;351727;351728;351729;351730;351731;351732;351733;351734 447354;447355;447356;447357;447358;447359;447360;447361;447362;447363 447360 10 SDVAVPLTLHGYSDLDSEEPGTGGAASR Unmodified 2800.3151 0.31514573 4197 Q9H9H5;C9JPF8;H7BZQ6 MAP6D1 MAP6 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 102.15 102.15 3 4.5762E-24 106106 QUIQUE_C1218_190116_001 96.019 82.147 334880000 42285000 75823000 0 51912000 0 0 68729000 0 0 27870000 68264000 0 0 39261 4197 36640 351735;351736;351737;351738;351739;351740 447364;447365;447366;447367;447368;447369;447370 447364 7 SDVCTPGGTTIYGLHALEQGGLR Unmodified 2401.1696 0.16960788 3256 Q53H96;A0A0A0MQS1;B5MD87 PYCRL Pyrroline-5-carboxylate reductase 3;Pyrroline-5-carboxylate reductase yes no 0 0 0 1 1 1 109.54 109.54 3 4.2488E-08 112085 QUIQUE_C1403_190116_001 78.976 71.7 246400000 60902000 0 0 96587000 0 88912000 0 0 0 0 0 0 0 39262 3256 36641 351741;351742;351743 447371;447372;447373;447374;447375 447373 5 SDVDLYQVR Unmodified 1093.5404 0.54038805 1390 O00233;J3KN29;F5H5V4;F5GX23;F5H169;F5H7X1 PSMD9 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 55.246 55.246 2 0.0031968 53887 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.853 67.699 89625000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89625000 39263 1390 36642 351744;351745 447376;447377 447377 2 SDVEAIFSK Unmodified 994.49713 0.49712625 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V555;G3V575;G3V5X6;G3V3K6;G3V251;A0A0G2JPF8;A0A0G2JNQ3;P0DMR1;O60812;B7ZW38;B2RXH8;B4DSU6;G3V4M8;G3V2H6 HNRNPC;HNRNPCL4;HNRNPCL1;HNRNPCL3;HNRNPCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 4;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.779 66.779 2 0.0058829 66517 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.67 52.028 2853800000 288780000 285450000 199650000 224500000 271620000 252240000 216570000 0 213280000 125250000 320160000 234100000 222160000 39264 598 36643 351746;351747;351748;351749;351750;351751;351752;351753;351754;351755;351756;351757 447378;447379;447380;447381;447382;447383;447384;447385;447386;447387;447388;447389;447390;447391 447385 12 SDVEIPATVTAFSFEDDTVPLSPLK Unmodified 2677.3374 0.3374443 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 159.58 159.58 2;3 1.4217E-29 161803 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.51 150.95 6240400000 362710000 532020000 504090000 432580000 511790000 515560000 478380000 345690000 738830000 198960000 542500000 385250000 692000000 39265 4418 36644 351758;351759;351760;351761;351762;351763;351764;351765;351766;351767;351768;351769;351770;351771;351772;351773;351774;351775;351776;351777;351778;351779;351780;351781;351782;351783 447392;447393;447394;447395;447396;447397;447398;447399;447400;447401;447402;447403;447404;447405;447406;447407;447408;447409;447410;447411;447412;447413;447414;447415;447416;447417;447418 447407 27 SDVFTNSEK Unmodified 1025.4666 0.46655441 174 A0A0A0MSI8;O00471 EXOC5 Exocyst complex component 5 yes no 0 0 0 1 22.524 22.524 2 0.019339 15419 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.673 46.897 18403000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18403000 0 0 0 39266 174 36645 351784 447419 447419 1 SDVHTEAVQAALAK Unmodified 1438.7416 0.74160705 315;3080 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4;Q14689 DIP2C;DIP2A Disco-interacting protein 2 homolog C;Disco-interacting protein 2 homolog A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.608 42.608 2;3 0.0049116 39569 QUIQUE_DMIX1_190116_001 32.61 21.685 96635000 20290000 0 0 15401000 38228000 0 0 22715000 0 0 0 0 0 39267 315;3080 36646 351785;351786;351787;351788;351789 447420;447421;447422;447423;447424 447423 4 SDVLELTDDNFESR Unmodified 1638.7373 0.73730954 1221 H7BZJ3 PDIA3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 103.85 103.85 2;3 4.8996E-47 106712 QUIQUE_C1277_190116_001 193.96 183.21 7393000000 634240000 663890000 763870000 648140000 638550000 619020000 636880000 0 516490000 247310000 812310000 568630000 643630000 39268 1221 36647 351790;351791;351792;351793;351794;351795;351796;351797;351798;351799;351800;351801;351802 447425;447426;447427;447428;447429;447430;447431;447432;447433;447434;447435;447436;447437;447438;447439;447440;447441;447442 447426 17 SDVLETVVLINPSDEAVSTEVR Unmodified 2371.2118 0.21184985 2483 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Q96J02;A0A1W2PR79 ITCH E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog yes no 0 0 0 2 1 1 1 163.13 163.13 2;3 0.00090643 167737 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.457 70.767 137140000 0 0 0 0 0 0 0 25571000 29495000 0 0 45086000 36990000 39270 3884 36649 351829;351830;351831;351832;351833 447497;447498;447499;447500;447501 447499 4 SDVLQPGAEVTTDDR Unmodified 1601.7533 0.75329395 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.942 56.942 2 2.5201E-13 54686 QUIQUE_C1563_190116_001 138.75 111.64 946230000 72868000 91744000 98247000 83332000 0 65827000 96085000 53545000 75290000 32424000 98667000 73345000 104850000 39271 2636 36650 351834;351835;351836;351837;351838;351839;351840;351841;351842;351843;351844;351845 447502;447503;447504;447505;447506;447507;447508;447509;447510;447511;447512;447513;447514 447506 13 SDVLVEYQGEGR Unmodified 1350.6416 0.64155866 1023 H0YFA9;H7C3P4;F6S8M0;P15586 GNS N-acetylglucosamine-6-sulfatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.685 57.685 2 0.0012715 55844 QUIQUE_C1368_190116_001 82.417 66.787 135000000 31761000 21222000 40595000 0 0 0 0 0 21182000 0 0 20236000 0 39272 1023 36651 351846;351847;351848;351849;351850 447515;447516;447517;447518;447519 447517 5 SDVLVVVVSMLSTAPQPIR Unmodified 2010.1183 0.11834758 4465 Q9UJY5 GGA1 ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 2 2 1 2 1 1 170.58 170.58 2;3 5.1135E-54 172309 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.39 159.71 235460000 22175000 27807000 8257300 0 21229000 0 19122000 34821000 40125000 6410400 24950000 14645000 15913000 39273 4465 36652 351851;351852;351853;351854;351855;351856;351857;351858;351859;351860;351861;351862;351863;351864;351865 447520;447521;447522;447523;447524;447525;447526;447527;447528;447529;447530;447531;447532;447533;447534 447527 15 SDVMYTDWK Unmodified 1143.4907 0.49066067 2151 P19652 ORM2 Alpha-1-acid glycoprotein 2 yes yes 0 0 0 1 69.725 69.725 2 0.018299 69743 QUIQUE_C1368_190116_001 64.42 48.981 57812000 0 0 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351874;351875;351876;351877;351878;351879;351880;351881;351882;351883;351884;351885;351886;351887;351888;351889;351890;351891;351892;351893 447543;447544;447545;447546;447547;447548;447549;447550;447551;447552;447553;447554;447555;447556;447557;447558;447559;447560;447561;447562;447563;447564;447565 447543 20 SDVVYTDWK Unmodified 1111.5186 0.51858998 1835 P02763 ORM1 Alpha-1-acid glycoprotein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 63.487 63.487 2 0.0037167 62379 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.657 81.443 1426600000 290630000 0 140770000 101810000 373830000 111640000 119730000 0 0 0 167500000 0 120730000 39277 1835 36656 351894;351895;351896;351897;351898;351899;351900;351901 447566;447567;447568;447569;447570;447571;447572;447573;447574;447575 447574 8 SDVVYTDWKK Unmodified 1239.6136 0.61355299 1835 P02763 ORM1 Alpha-1-acid glycoprotein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 39.839 39.839 2;3 0.0020788 36815 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.033 82.371 1573700000 0 112510000 0 0 403410000 0 0 435880000 80358000 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1.8328E-16 182785 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.6 152.35 143900000 0 0 0 0 0 0 9686300 0 27409000 0 79889000 26912000 0 39281 2474 36660 351916;351917;351918;351919;351920;351921;351922 447592;447593;447594;447595;447596;447597;447598 447595 7 SDVYCEVCEFLVK Unmodified 1646.732 0.73202992 1924 P07602;C9JIZ6;A0A0J9YXB8 PSAP Prosaposin;Saposin-A;Saposin-B-Val;Saposin-B;Saposin-C;Saposin-D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 137.21 137.21 2 0.0014489 141481 QUIQUE_C1277_190116_001 79.693 68.48 126610000 23243000 25210000 0 0 0 0 0 19634000 31163000 0 0 0 27360000 39282 1924 36661 351923;351924;351925;351926;351927;351928 447599;447600;447601;447602;447603;447604 447600 6 SDYAQLLEDMQNAFR Oxidation (M) 1815.8098 0.80976297 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 2 3 2 3 2 3 2 2 2 2 2 3 2 117.88 117.88 2;3 3.0567E-54 122041 QUIQUE_C1218_190116_001 194.17 178.96 1783900000 138560000 200320000 177300000 91469000 130010000 130410000 111750000 97353000 135540000 125370000 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351959;351960;351961;351962;351963;351964;351965;351966;351967;351968;351969;351970;351971;351972;351973;351974;351975;351976;351977;351978;351979;351980;351981;351982;351983;351984 447642;447643;447644;447645;447646;447647;447648;447649;447650;447651;447652;447653;447654;447655;447656;447657;447658;447659;447660;447661;447662;447663;447664;447665;447666;447667;447668;447669;447670;447671;447672;447673;447674;447675;447676;447677;447678;447679;447680;447681;447682;447683;447684;447685 447646 44 SDYDMVDYLNELR Unmodified 1631.7137 0.71373732 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.37 143.37 2 5.615E-06 150509 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.37 110.02 1604600000 0 0 193530000 159400000 168700000 165750000 173800000 0 148640000 72280000 216080000 144470000 161910000 39285 3090 36663 351985;351986;351987;351988;351989;351990;351991;351992;351993;351994 447686;447687;447688;447689;447690;447691;447692;447693;447694;447695;447696;447697;447698 447695 11 SDYISDEALESLPGFK Unmodified 1769.836 0.83596095 3409 Q6UWR7 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 135.94 135.94 2;3 1.6372E-07 140123 QUIQUE_C1403_190116_001 85.006 78.569 230870000 19816000 25255000 16510000 33940000 19057000 0 28158000 9923200 15278000 13517000 24165000 0 25246000 39286 3409 36664 351995;351996;351997;351998;351999;352000;352001;352002;352003;352004;352005;352006;352007 447699;447700;447701;447702;447703;447704;447705;447706;447707;447708;447709;447710;447711;447712;447713;447714 447705 15 SDYLNTFEFMDK Unmodified 1508.6493 0.64934615 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.63 127.63 2 0.00020546 133048 QUIQUE_C1218_190116_001 118.4 110.57 1731400000 113860000 153150000 158600000 160150000 103950000 110630000 120270000 146690000 140080000 56638000 181950000 122400000 163060000 39287 1662 36665 352008;352009;352010;352011;352012;352013;352014;352015;352016;352017;352018;352019;352020 447715;447716;447717;447718;447719;447720;447721;447722;447723;447724;447725;447726;447727;447728;447729;447730 447716 14 SDYLNTFEFMDK Oxidation (M) 1524.6443 0.64426077 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 1 1 106.38 106.38 2 0.012071 103520 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.434 43.408 68213000 0 0 0 0 0 0 0 23810000 23004000 21399000 0 0 0 39288 1662 36665 352021;352022;352023 447731;447732;447733 447733 895 3 SDYLNTFEFMDKLGENLK Unmodified 2163.0194 0.019421398 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 147.95 147.95 3 0.00028846 150795 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.809 70.912 42853000 0 0 0 0 0 0 0 42853000 0 0 0 0 0 39289 1662 36666 352024 447734;447735;447736 447735 3 SDYMFQR Unmodified 945.40145 0.40145173 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8YF34 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 46.922 46.922 2 0.057767 41563 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.716 44.492 26834000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26834000 0 0 0 39290 2513 36667 352025 447737 447737 1 SEAASVSTTNPSQGEDFK Unmodified 1853.8279 0.82791546 265 A0A0D9SF30 NCAM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.675 43.675 2 4.9007E-45 40625 QUIQUE_DMIX7_190116_001 169.58 142.05 1313600000 179900000 0 204660000 0 0 121710000 152840000 74606000 172220000 54033000 0 88830000 264820000 39291 265 36668 352026;352027;352028;352029;352030;352031;352032;352033;352034 447738;447739;447740;447741;447742;447743;447744;447745;447746 447745 9 SEAASVSTTNPSQGEDFKMDEGNFK Unmodified 2675.1657 0.1657043 265 A0A0D9SF30 NCAM1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 72.611 72.611 3 2.5329E-98 72865 QUIQUE_DMIX1_190116_001 180.36 172.4 436110000 0 0 0 0 0 0 0 94568000 88771000 0 60694000 70419000 121660000 39292 265 36669 352035;352036;352037;352038;352039 447747;447748;447749;447750;447751 447747 5 SEADGLR Acetyl (Protein N-term) 788.36645 0.36644643 4234 Q9HDC9 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes yes 1 0 0 1 31.927 31.927 1 0.033949 26607 QUIQUE_C1277_190116_001 164 41.455 86625000 0 86625000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39293 4234 36670 352040 447752 447752 0 SEAEEAITSFNGHKPPGSSEPITVK Unmodified 2611.2766 0.27657538 3152 Q15717 ELAVL1 ELAV-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 72.662 72.662 3 0.01198 68874 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.36 24 54883000 0 0 0 0 0 0 0 40335000 0 14549000 0 0 0 39294 3152 36671 352041;352042 447753;447754 447754 1 SEAGLAGAPAR Unmodified 998.51451 0.51450765 3735 Q92572 AP3S1 AP-3 complex subunit sigma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 20.717 20.717 2 0.0018032 13973 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.279 56.385 122830000 0 0 0 61354000 0 0 0 36985000 0 24490000 0 0 0 39295 3735 36672 352043;352044;352045 447755;447756;447757 447756 3 SEAHLTELLEEICDR Unmodified 1813.8516 0.85162779 1045 F8W031;F8VXJ7;F8W1K5 CNPY2 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 122.25 122.25 2;3 2.4253E-07 127794 QUIQUE_C1218_190116_001 118.52 94.641 1015800000 63853000 140530000 94363000 79694000 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352064;352065;352066;352067;352068;352069;352070;352071;352072;352073;352074 447778;447779;447780;447781;447782;447783;447784;447785;447786;447787;447788;447789 447782 12 SEALPTDLPAPSAPDLTEPK Unmodified 2048.0314 0.031366293 1329 K7ELL7;P14314 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.03 107.03 2 5.439E-30 110439 QUIQUE_C1277_190116_001 191.06 160.5 944570000 117320000 111370000 84376000 0 88245000 103290000 78881000 73780000 62573000 44781000 58817000 71049000 50073000 39299 1329 36676 352075;352076;352077;352078;352079;352080;352081;352082;352083;352084;352085;352086 447790;447791;447792;447793;447794;447795;447796;447797;447798;447799;447800;447801;447802 447791 13 SEANDQGPPGEDGVTR Unmodified 1627.7074 0.70740639 4131 Q9H1E5 TMX4 Thioredoxin-related transmembrane protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 25.449 25.449 2 6.7351E-08 19026 QUIQUE_C1403_190116_001 120.87 103.01 43532000 0 0 0 22631000 0 20902000 0 0 0 0 0 0 0 39300 4131 36677 352087;352088 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protein 6A yes no 0 0 0 1 96.391 96.391 3 0.028383 98303 QUIQUE_C1403_190116_001 17.425 8.0094 35771000 0 0 0 35771000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39303 1771 36680 352105 447824 447824 1 SECAIVYNDR Unmodified 1225.5397 0.53973612 614 B4DK72;Q01064 PDE1B Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B yes no 0 0 0 1 33.617 33.617 2 0.058241 29320 QUIQUE_C1438_190116_001 46.334 34.108 23038000 0 0 0 0 23038000 0 0 0 0 0 0 0 0 39304 614 36681 352106 447825 447825 1 SECLNNIGDSSPLIR Unmodified 1673.8043 0.80428367 3772 Q92973;E7EW37 TNPO1 Transportin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.091 83.091 2 1.8269E-09 85338 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.24 90.635 853360000 55034000 0 82300000 0 106910000 95662000 133380000 0 0 26503000 134950000 98824000 119810000 39305 3772 36682 352107;352108;352109;352110;352111;352112;352113;352114;352115 447826;447827;447828;447829;447830;447831;447832;447833;447834 447832 6 SEDCFILDHGK Unmodified 1319.5816 0.58160094 166;788 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1.2063E-27 29384 QUIQUE_DMIX3_190116_001 169.65 157.15 1885300000 0 0 0 0 0 0 0 493720000 372460000 0 429260000 156690000 433140000 + 39307 166;788 36684 352142;352143;352144;352145;352146;352147;352148;352149;352150;352151;352152;352153;352154;352155 447880;447881;447882;447883;447884;447885;447886;447887;447888;447889;447890;447891;447892;447893;447894;447895 447885 15 SEDEVGSLIEYEFR Unmodified 1671.7628 0.76279601 2207 P23229;H7BZ97 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.08 134.08 2 1.3774E-10 138594 QUIQUE_C1277_190116_001 158.31 123.61 288180000 0 47279000 42351000 37717000 50463000 0 0 0 31362000 0 40250000 38758000 0 39308 2207 36685 352156;352157;352158;352159;352160;352161;352162;352163 447896;447897;447898;447899;447900;447901;447902;447903 447896 4 SEDFGVNEDLADSDAR Unmodified 1738.7282 0.72820141 1853 P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.272 81.272 2 1.287E-54 82330 QUIQUE_C1403_190116_001 193.23 166.71 3406900000 153470000 249850000 377440000 420130000 194130000 352930000 390320000 167360000 299290000 152420000 201890000 108020000 339680000 39309 1853 36686 352164;352165;352166;352167;352168;352169;352170;352171;352172;352173;352174;352175;352176 447904;447905;447906;447907;447908;447909;447910;447911;447912;447913;447914;447915;447916;447917;447918;447919;447920;447921;447922;447923;447924;447925;447926 447911 23 SEDFSLPAYMDR Oxidation (M) 1445.6133 0.613295 2052 P13073;H3BN72;H3BNV9;Q86WV2;H3BNI5 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.13 85.13 2 0.0006164 86930 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.52 92.675 1455200000 190450000 0 143920000 88216000 0 140570000 0 118340000 150500000 101790000 223730000 158000000 139690000 39310 2052 36687 352177;352178;352179;352180;352181;352182;352183;352184;352185;352186 447927;447928;447929;447930;447931;447932;447933;447934;447935;447936;447937;447938;447939 447934 1373 13 SEDFSLPAYMDR Unmodified 1429.6184 0.61838038 2052 P13073;H3BN72;H3BNV9;Q86WV2;H3BNI5 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.85 104.85 2 1.0329E-09 107666 QUIQUE_C1403_190116_001 154.35 127.83 3486900000 502150000 268940000 342840000 293890000 96607000 338800000 307770000 145460000 273690000 96647000 376140000 232660000 211280000 39311 2052 36687 352187;352188;352189;352190;352191;352192;352193;352194;352195;352196;352197;352198;352199 447940;447941;447942;447943;447944;447945;447946;447947;447948;447949;447950;447951;447952;447953;447954;447955;447956;447957;447958;447959;447960;447961;447962;447963;447964;447965;447966;447967;447968 447947 29 SEDFSLPAYMDRR Unmodified 1585.7195 0.7194914 2052 P13073;H3BN72;H3BNV9;Q86WV2;H3BNI5 COX4I1 Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 84.391 84.391 2;3 9.9255E-07 86008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.17 79.993 564270000 0 0 0 0 0 0 0 190690000 132280000 0 105170000 74656000 61470000 39312 2052 36688 352200;352201;352202;352203;352204;352205;352206;352207 447969;447970;447971;447972;447973;447974;447975;447976;447977;447978;447979;447980;447981 447971 13 SEDGVEGDLGETQSR Unmodified 1577.6805 0.68052294 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.576 42.576 2 8.9545E-13 39725 QUIQUE_C1218_190116_001 135.1 118.47 421480000 74626000 59951000 56572000 0 49025000 60692000 80025000 0 0 0 40589000 0 0 39313 2935 36689 352208;352209;352210;352211;352212;352213;352214;352215;352216 447982;447983;447984;447985;447986;447987;447988;447989;447990;447991;447992 447982 10 SEDLDNSIDKTEAGIK Unmodified 1733.8319 0.8319382 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 55.18 55.18 2;3 0.00039444 53579 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.022 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1 1 1 1 93.219 93.219 2;3 2.6916E-129 95055 QUIQUE_C1277_190116_001 233.46 209.12 3732900000 351090000 377050000 293860000 315770000 411900000 336660000 433820000 293970000 393850000 150940000 0 373950000 0 39317 3926 36693 352230;352231;352232;352233;352234;352235;352236;352237;352238;352239;352240;352241;352242;352243;352244 448008;448009;448010;448011;448012;448013;448014;448015;448016;448017;448018;448019;448020;448021;448022;448023;448024;448025;448026;448027 448011 20 SEDSIAGSGVEHSTPDTEPGKEESWVSIK Unmodified 3057.4051 0.40508295 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 77.063 77.063 3;4 5.32E-54 77489 QUIQUE_DMIX8_190116_001 141.37 135.58 1528000000 179960000 221960000 0 173420000 222770000 153010000 209120000 0 96744000 0 0 82157000 188810000 39318 2880 36694 352245;352246;352247;352248;352249;352250;352251;352252;352253;352254;352255;352256;352257;352258;352259;352260 448028;448029;448030;448031;448032;448033;448034;448035;448036;448037;448038;448039;448040;448041;448042;448043;448044;448045;448046;448047 448046 20 SEDSSALPWSINR Acetyl (Protein N-term) 1502.7001 0.70013617 1746 O95747;C9JIG9;F8WBK9 OXSR1 Serine/threonine-protein kinase OSR1 yes no 1 0 0 1 1 1 126.93 126.93 2 0.0038325 129186 QUIQUE_C1563_190116_001 79.201 66.586 26889000 0 0 0 26889000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39319 1746 36695 352261;352262;352263 448048;448049;448050 448050 3 SEDTAVQHGLEGLSISK Unmodified 1769.8796 0.8795571 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 73.277 73.277 2;3 1.2828E-45 73449 QUIQUE_DMIX1_190116_001 193.06 142.95 1282800000 117140000 34044000 323290000 137350000 113360000 0 40079000 96507000 91870000 45719000 283460000 0 0 39320 1452 36696 352264;352265;352266;352267;352268;352269;352270;352271;352272;352273;352274;352275;352276;352277;352278;352279;352280;352281;352282;352283;352284 448051;448052;448053;448054;448055;448056;448057;448058;448059;448060;448061;448062;448063;448064;448065;448066;448067;448068;448069;448070;448071;448072;448073;448074 448067 24 SEEAHAEDSVMDHHFR Unmodified 1895.7857 0.78567349 3631 Q8NC51 SERBP1 Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein yes yes 0 0 0 1 32.041 32.041 4 0.00014045 26967 QUIQUE_C1218_190116_001 73.834 68.054 103420000 103420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39321 3631 36697 352285 448075 448075 1 SEEEMAAEAAALR Unmodified 1376.6242 0.62419403 2547 P49789 FHIT Bis(5'-adenosyl)-triphosphatase yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.206 75.206 2 0.00067447 76018 QUIQUE_C1277_190116_001 86.189 50.245 509190000 0 38930000 47212000 40702000 62376000 31564000 61568000 39940000 61204000 0 67789000 57910000 0 39322 2547 36698 352286;352287;352288;352289;352290;352291;352292;352293;352294;352295;352296;352297 448076;448077;448078;448079;448080;448081;448082;448083;448084;448085;448086;448087;448088;448089;448090;448091;448092 448078 17 SEEETSPLVTHQNPAGPVASAPELESK Unmodified 2803.3512 0.35119688 2459 P43007 SLC1A4 Neutral amino acid transporter A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.837 74.837 3 4.3345E-24 75280 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.102 87.361 235980000 0 0 0 80723000 62767000 0 0 0 0 0 0 0 92487000 39323 2459 36699 352298;352299;352300;352301 448093;448094;448095;448096;448097 448097 3 SEEIKDTILQTVDLVSQETGEK Unmodified 2461.2435 0.24354391 4145 Q9H2G2 SLK STE20-like serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.67 148.67 3 3.3613E-36 152803 QUIQUE_C1403_190116_001 142.04 134.51 456940000 37239000 33044000 0 80293000 48589000 57690000 35921000 0 58176000 16111000 0 36027000 53852000 39324 4145 36700 352302;352303;352304;352305;352306;352307;352308;352309;352310;352311;352312;352313 448098;448099;448100;448101;448102;448103;448104;448105;448106;448107;448108;448109 448101 12 SEEIKMSEAK Unmodified 1150.554 0.5539892 200 A0A0A0MTS7;A0A0A0MRA3;Q8WZ42 TTN Titin yes no 0 0 1 1 67.449 67.449 2 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Unmodified 2525.2074 0.20743318 3114 Q15121 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 126.81 126.81 3;4 4.9297E-37 131315 QUIQUE_C1277_190116_001 137.09 133.42 3402300000 0 252500000 102530000 87809000 176820000 92596000 253750000 431480000 574300000 21923000 409690000 390260000 608680000 39327 3114 36703 352342;352343;352344;352345;352346;352347;352348;352349;352350;352351;352352;352353;352354;352355;352356;352357;352358;352359;352360 448147;448148;448149;448150;448151;448152;448153;448154;448155;448156;448157;448158;448159;448160;448161;448162;448163;448164;448165;448166;448167;448168;448169;448170;448171;448172;448173 448148 26 SEEITTGSAWFSFLESHNKLDKDNLSYIEHIFEISR Unmodified 4242.0546 0.054567936 3114 Q15121 PEA15 Astrocytic phosphoprotein PEA-15 yes yes 0 0 2 1 3 2 159.03 159.03 4;5 5.2603E-42 164010 QUIQUE_DMIX7_190116_001 95.56 90.246 736880000 0 0 0 0 0 0 0 0 57336000 0 433050000 246490000 0 39328 3114 36704 352361;352362;352363;352364;352365;352366 448174;448175;448176;448177;448178;448179 448179 5 SEELNLPEGK Unmodified 1114.5506 0.55061839 271 A0A0D9SFK2;Q92614;H0YEV9 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 2 45.187 45.187 2 0.032703 42512 QUIQUE_C1576_190116_001 74.464 31.866 51225000 0 0 0 0 0 0 51225000 0 0 0 0 0 0 39329 271 36705 352367;352368;352369 448180;448181;448182 448180 2 SEEMQTVQQEQLLQETQALQQSFLSEK Oxidation (M) 3195.5242 0.52415222 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.4 151.4 3 4.5787E-31 156028 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.35 104.83 1361200000 67595000 94052000 82273000 52433000 75097000 57680000 67503000 177610000 185940000 0 214830000 153350000 132870000 39330 3117 36706 352370;352371;352372;352373;352374;352375;352376;352377;352378;352379;352380;352381 448183;448184;448185;448186;448187;448188;448189;448190;448191;448192;448193;448194 448191 2574 12 SEEMQTVQQEQLLQETQALQQSFLSEK Unmodified 3179.5292 0.5292376 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 155.38 155.38 2;3 0 157950 QUIQUE_DMIX1_190116_001 272.31 262.21 2965900000 220640000 207100000 243240000 135650000 199210000 97831000 177810000 306390000 439040000 110620000 336730000 311700000 179970000 39331 3117 36706 352382;352383;352384;352385;352386;352387;352388;352389;352390;352391;352392;352393;352394;352395;352396;352397 448195;448196;448197;448198;448199;448200;448201;448202;448203;448204;448205;448206;448207;448208;448209;448210;448211 448204 17 SEEMQTVQQEQLLQETQALQQSFLSEKDSLLQR Oxidation (M) 3907.9109 0.91094017 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 1 1 2 1 1 154.64 154.64 3;4 1.6145E-130 157682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 181.56 172.67 372940000 0 0 0 0 0 0 0 256140000 56539000 0 60261000 0 0 39332 3117 36707 352398;352399;352400;352401 448212;448213;448214;448215;448216 448214 2574 5 SEEMQTVQQEQLLQETQALQQSFLSEKDSLLQR Unmodified 3891.916 0.91602554 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 2 1 2 2 1 157.18 157.18 3;4 1.2205E-130 164582 QUIQUE_DMIX5_190116_001 184.44 179.82 752350000 0 0 0 0 0 0 0 289430000 94290000 0 178790000 157550000 32285000 39333 3117 36707 352402;352403;352404;352405;352406;352407;352408;352409 448217;448218;448219;448220;448221;448222;448223;448224;448225;448226;448227;448228 448224 12 SEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGK Oxidation (M) 3178.4509 0.45085263 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EPG4;K7EM24;K7ELZ6;K7EQW2 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 171.68 171.68 3 1.4031E-44 178960 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.28 126.19 341450000 0 21163000 33376000 0 22556000 0 34888000 34405000 24431000 0 58003000 76566000 36058000 39334 3780 36708 352410;352411;352412;352413;352414;352415;352416;352417;352418 448229;448230;448231;448232;448233;448234;448235;448236;448237 448235 2732 9 SEEMTLAQLFLQSEAAYCCVSELGELGK Unmodified 3162.4559 0.455938 3780 Q93050;B7Z641;B7Z2A9;K7EPG4;K7EM24;K7ELZ6;K7EQW2 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 173.04 173.04 3 6.2197E-65 180261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.18 145.56 329050000 0 0 4193700 0 17142000 0 38896000 26434000 48756000 0 126370000 39613000 27647000 39335 3780 36708 352419;352420;352421;352422;352423;352424;352425;352426 448238;448239;448240;448241;448242;448243;448244;448245;448246 448244 9 SEENEEPMETDQNAK Unmodified 1749.6999 0.69993775 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.79 22.79 2 1.2938E-43 16276 QUIQUE_C1218_190116_001 218.75 199.09 216370000 46483000 40054000 0 39468000 0 42816000 47547000 0 0 0 0 0 0 39336 2363 36709 352427;352428;352429;352430;352431 448247;448248;448249;448250;448251 448247 4 SEENEEPMETDQNAK Oxidation (M) 1765.6949 0.69485237 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 1 0 1 1 15.365 15.365 2 4.9187E-44 7536 QUIQUE_C1368_190116_001 183.99 178.14 27065000 0 14314000 12751000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39337 2363 36709 352432;352433 448252;448253 448253 1762 2 SEENEEPMETDQNAKEEEK Oxidation (M) 2280.9176 0.91759468 2363 P34932;A0A087WYC1 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.245 16.245 3 1.0397E-07 8492 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.96 108.75 264310000 14694000 29499000 26868000 28744000 0 0 0 32789000 0 0 53991000 22874000 54854000 39338 2363 36710 352434;352435;352436;352437;352438;352439;352440;352441 448254;448255;448256;448257;448258;448259;448260;448261 448259 1762 8 SEEQLKEEGIEYK Unmodified 1580.757 0.75698235 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 1 1 1 1 2 2 37.822 37.822 2;3 6.648E-89 33430 QUIQUE_C1277_190116_001 274.8 222.31 8940300000 1001300000 373090000 1167000000 820870000 573760000 316430000 1050900000 252560000 350540000 177120000 517330000 1030800000 1308600000 39339 1971 36711 352442;352443;352444;352445;352446;352447;352448;352449;352450;352451;352452;352453;352454;352455;352456;352457;352458;352459;352460;352461 448262;448263;448264;448265;448266;448267;448268;448269;448270;448271;448272;448273;448274;448275;448276;448277;448278;448279;448280;448281;448282;448283;448284;448285;448286;448287;448288 448266 25 SEETKENEGFTVTAEGK Unmodified 1854.8483 0.84831655 1803 P01024;M0QYC8 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 1 1 2 31.334 31.334 2;3 7.1642E-52 26248 QUIQUE_C1277_190116_001 178.67 146.34 115480000 0 25427000 0 0 90057000 0 0 0 0 0 0 0 0 39340 1803 36712 352462;352463;352464 448289;448290;448291 448289 3 SEETLDEGPPK Unmodified 1200.551 0.55101232 2846 Q00688 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.899 26.899 2 6.6384E-05 21155 QUIQUE_C1403_190116_001 135.71 103.36 1198500000 0 134020000 127580000 121280000 99171000 79815000 122620000 0 105570000 0 152180000 119740000 136530000 39341 2846 36713 352465;352466;352467;352468;352469;352470;352471;352472;352473;352474 448292;448293;448294;448295;448296;448297;448298;448299;448300;448301;448302 448294 8 SEEVATKEELVADAK Unmodified 1617.8097 0.8097462 869 E7ESP9;P07197 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.142 38.142 2 4.505E-65 34709 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.32 167.63 669600000 68411000 81752000 44222000 54035000 0 37319000 98735000 60008000 42007000 0 86232000 0 96885000 39342 869 36714 352475;352476;352477;352478;352479;352480;352481;352482;352483;352484;352485 448303;448304;448305;448306;448307;448308;448309;448310;448311;448312;448313 448310 11 SEEWADNHLPLTDAELAR Unmodified 2065.9705 0.97049737 1586 O60664;K7ERZ3 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 98.504 98.504 2;3 1.8807E-23 100711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 188.19 166.94 2752900000 137930000 240300000 115270000 207030000 148680000 134180000 132150000 302620000 288260000 104680000 318830000 258300000 364670000 39343 1586 36715 352486;352487;352488;352489;352490;352491;352492;352493;352494;352495;352496;352497;352498;352499;352500;352501;352502;352503;352504;352505;352506;352507;352508 448314;448315;448316;448317;448318;448319;448320;448321;448322;448323;448324;448325;448326;448327;448328;448329;448330;448331;448332;448333;448334;448335;448336;448337;448338;448339;448340;448341;448342;448343;448344;448345;448346;448347 448330 33 SEFEQNLSEK Unmodified 1209.5513 0.55134667 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.901 34.901 2 3.0517E-05 30079 QUIQUE_C1368_190116_001 145.72 115.56 3582400000 400050000 382590000 329190000 388940000 317070000 302400000 325010000 150830000 274200000 204570000 369040000 0 138490000 39344 693;3205 36716 352509;352510;352511;352512;352513;352514;352515;352516;352517;352518;352519;352520;352521 448348;448349;448350;448351;448352;448353;448354;448355;448356;448357;448358;448359;448360;448361;448362;448363;448364;448365 448352 15 SEFLQESNLIMAK Unmodified 1508.7545 0.75447993 3486 Q86TV6 TTC7B Tetratricopeptide repeat protein 7B yes yes 0 0 0 1 1 1 103.03 103.03 2 0.0028337 104782 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.895 73.989 152720000 45299000 70333000 0 0 0 0 0 37091000 0 0 0 0 0 39345 3486 36717 352522;352523;352524 448366;448367;448368 448368 2 SEFRDESQYFR Unmodified 1462.6477 0.64770667 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 1 1 1 55.445 55.445 3 0.0070568 53984 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.166 54.442 85787000 0 0 0 0 0 0 0 37158000 0 0 48629000 0 0 39346 3676 36718 352525;352526 448369;448370 448369 1 SEFVILR Unmodified 862.49125 0.49125301 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.997 70.997 2 0.0098368 71714 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.06 98.94 936480000 0 107060000 102090000 87986000 102330000 73263000 0 57142000 78064000 42379000 102670000 66149000 117350000 39347 2641 36719 352527;352528;352529;352530;352531;352532;352533;352534;352535;352536;352537 448371;448372;448373;448374;448375;448376;448377;448378;448379;448380;448381;448382;448383 448381 13 SEFVILRDEK Unmodified 1234.6558 0.65575216 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 1 2 1 50.837 50.837 2;3 0.0032278 48180 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.15 76.73 87586000 0 0 0 0 0 0 0 51209000 36378000 0 0 0 0 39348 2641 36720 352538;352539;352540 448384;448385;448386 448386 3 SEFVVPDLELPSWLTTGNYR Unmodified 2322.1532 0.15321276 2130 P17900 GM2A Ganglioside GM2 activator;Ganglioside GM2 activator isoform short yes yes 0 0 0 1 166.75 166.75 2 0.0089472 171324 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.594 54.066 934450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 934450000 39349 2130 36721 352541 448387 448387 0 SEFYANEACK Unmodified 1217.5023 0.50228798 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.992 30.992 2 0.0096195 25153 QUIQUE_C1368_190116_001 78.934 74.151 1089900000 124880000 53959000 178570000 115170000 108110000 146330000 110160000 68837000 0 92357000 48510000 0 42968000 39350 98;3487 36722 352542;352543;352544;352545;352546;352547;352548;352549;352550;352551;352552 448388;448389;448390;448391;448392;448393;448394;448395;448396;448397;448398 448390 10 SEFYANEACKR Unmodified 1373.6034 0.60339901 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 1 1 1 2 1 1 2 2 1 21.127 21.127 2;3 0.00030591 14971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.75 86.557 611990000 0 0 26154000 35090000 130080000 0 36724000 220950000 90384000 0 72607000 0 0 39351 98;3487 36723 352553;352554;352555;352556;352557;352558;352559;352560;352561;352562;352563 448399;448400;448401;448402;448403;448404;448405;448406;448407;448408;448409;448410 448406 10 SEFYHDEFKR Unmodified 1356.6099 0.6098646 4143 Q9H2C0 GAN Gigaxonin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 29.483 29.483 3 0.01336 24180 QUIQUE_C1576_190116_001 47.559 38.738 413510000 0 0 54222000 53230000 48043000 0 53828000 0 73161000 0 0 78080000 52943000 39352 4143 36724 352564;352565;352566;352567;352568;352569;352570 448411;448412;448413;448414;448415;448416;448417 448414 4 SEGALELADVSNELPGLK Unmodified 1840.9418 0.941823 2931 Q08J23 NSUN2 tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 132.38 132.38 2 0.00037517 137460 QUIQUE_C1368_190116_001 75.102 57.408 52713000 0 0 32881000 19832000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39353 2931 36725 352571;352572 448418;448419 448418 2 SEGDSVGESVHGK Acetyl (Protein N-term) 1328.5844 0.58443771 138 Q5T093;Q5T092;A0A0A0MR06;Q5T091;O15258 RER1 Protein RER1 yes no 1 0 0 1 22.48 22.48 2 0.00075388 15692 QUIQUE_C1218_190116_001 79.201 67.354 22155000 22155000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39354 138 36726 352573 448420 448420 1 SEGEGEAASADDGSLNTSGAGPK Unmodified 2105.8985 0.89851422 1281 J3KQS6;Q9NWV8;M0QXG9;M0R3F4;M0R2A4;M0R2K3;M0R193;M0R0I0;M0R2I2 BABAM1 BRISC and BRCA1-A complex member 1 yes no 0 0 0 1 1 38.313 38.313 2 8.0137E-14 34964 QUIQUE_C1438_190116_001 147.12 131.92 21339000 0 0 0 0 21339000 0 0 0 0 0 0 0 0 39355 1281 36727 352574;352575 448421;448422 448421 2 SEGETIMSSSMGK Unmodified 1342.5745 0.57446665 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 0 1 45.507 45.507 2 0.041954 43277 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.354 32.918 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39356 2506 36728 352576 448423 448423 1 SEGFDTYR Unmodified 973.41412 0.4141249 2032 P12004 PCNA Proliferating cell nuclear antigen yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.168 34.168 2 0.0073259 29236 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.458 70.351 312190000 0 43491000 30166000 38790000 36137000 0 30276000 0 34082000 0 33169000 27292000 38791000 39357 2032 36729 352577;352578;352579;352580;352581;352582;352583;352584;352585 448424;448425;448426;448427;448428;448429;448430;448431;448432 448432 9 SEGGFIWACK Unmodified 1153.5226 0.5226295 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.426 78.426 2 0.0080502 79266 QUIQUE_C1368_190116_001 91.064 74.294 1965900000 144950000 162160000 181440000 178450000 161820000 108690000 174800000 149340000 131320000 74538000 171400000 145330000 181680000 39358 1662 36730 352586;352587;352588;352589;352590;352591;352592;352593;352594;352595;352596;352597;352598 448433;448434;448435;448436;448437;448438;448439;448440;448441;448442;448443;448444;448445;448446;448447 448436 15 SEGHLCLPVR Unmodified 1166.5866 0.58662674 3235 Q4G0N4;B7Z8V7;A0A0C4DGV3;D6RHI4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.031 36.031 3 0.00083021 32407 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.399 53.728 1185300000 0 99242000 126070000 150860000 121940000 146930000 127990000 74690000 0 41936000 93590000 78537000 123470000 39359 3235 36731 352599;352600;352601;352602;352603;352604;352605;352606;352607;352608;352609 448448;448449;448450;448451;448452;448453;448454;448455;448456;448457;448458;448459 448455 10 SEGQATVIQQLEQTIEDLR Unmodified 2157.0913 0.091340788 4340 Q9NZ56;B0QZA8 FMN2 Formin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 168.68 168.68 2;3 1.6361E-107 173122 QUIQUE_DMIX3_190116_001 214.65 182.59 304120000 0 52528000 18586000 113160000 0 0 0 0 0 9945300 109900000 0 0 39360 4340 36732 352610;352611;352612;352613;352614;352615;352616 448460;448461;448462;448463;448464;448465;448466 448464 7 SEGSHHITSTPGVPK Unmodified 1532.7583 0.75831975 1511 O43166 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 14.906 14.906 3 0.013652 7017 QUIQUE_C1576_190116_001 40.983 28.106 72254000 0 0 18727000 31366000 0 0 22160000 0 0 0 0 0 0 39361 1511 36733 352617;352618;352619 448467;448468;448469 448469 3 SEGTYCCGPVPVR Unmodified 1480.6439 0.64388362 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 44.411 44.411 2 1.725E-06 41371 QUIQUE_C1438_190116_001 129.38 99.128 226690000 62027000 54679000 0 45776000 64211000 0 0 0 0 0 0 0 0 39362 2190 36734 352620;352621;352622;352623 448470;448471;448472;448473 448473 4 SEGVVAVLLTK Unmodified 1114.6598 0.6597749 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 91.618 91.618 2 0.058529 94308 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.743 48.033 149290000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 149290000 39363 2524 36735 352624 448474 448474 0 SEGYFGMYR Unmodified 1108.4648 0.46478027 4190 Q9H936;E9PJH7;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;K4DIB6;K4DIB3;A0A0D9SFA8;K4DIB0;K4DIA2;A0A0D9SG84;E9PI74;E9PQ36;E9PJY0;A0A0A6YYN8 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.567 72.567 2 0.00046056 73256 QUIQUE_C1576_190116_001 116.88 97.097 1144600000 150400000 128980000 131730000 77316000 72874000 72055000 114450000 0 0 19085000 144960000 113450000 119290000 39364 4190 36736 352625;352626;352627;352628;352629;352630;352631;352632;352633;352634;352635 448475;448476;448477;448478;448479;448480;448481;448482;448483;448484;448485 448481 8 SEHIVSEYIDTFFEDLK Unmodified 2070.9786 0.97860244 1674 O75962;E7EWP2;E7EPJ7;A0A1W2PRD7;A0A087X139 TRIO Triple functional domain protein yes no 0 0 0 1 1 159.23 159.23 3 0.00093262 165023 QUIQUE_C1576_190116_001 42.913 33.383 25141000 0 0 0 0 10778000 0 14363000 0 0 0 0 0 0 39365 1674 36737 352636;352637 448486;448487 448487 2 SEHPGLSIGDTAK Unmodified 1310.6466 0.64664404 2252 P26583;D6R9A6 HMGB2 High mobility group protein B2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 26.729 26.729 2;3 0.00057914 20171 QUIQUE_C1563_190116_001 62.042 41.185 275900000 97403000 0 0 0 60926000 33793000 0 0 34556000 19854000 29373000 0 0 39366 2252 36738 352638;352639;352640;352641;352642;352643;352644;352645;352646 448488;448489;448490;448491;448492;448493;448494;448495;448496;448497;448498;448499 448493 11 SEHQAVLQSLSQTIECLQQGGHEEGLVHEK Unmodified 3370.6212 0.62118093 4286 Q9NSK0;C9J8T5;C9JXT5;C9JQU1;C9K0D5 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 0 0 0 1 115.55 115.55 4 0.025939 120261 QUIQUE_C1368_190116_001 21.347 15.746 40865000 0 0 40865000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39367 4286 36739 352647 448500 448500 1 SEIANAPDGAGSLPCTELPHDLSLK Unmodified 2591.2537 0.25373144 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.87 107.87 3 4.4017E-20 112483 QUIQUE_C1218_190116_001 110.36 106.71 1732200000 223810000 203670000 222460000 247650000 182210000 208320000 0 81416000 0 0 105210000 102380000 155080000 39368 4252 36740 352648;352649;352650;352651;352652;352653;352654;352655;352656;352657 448501;448502;448503;448504;448505;448506;448507;448508;448509;448510;448511;448512;448513 448502 13 SEIAQLSQEK Unmodified 1131.5772 0.57716749 232 A0A0G2JR20;A0A0C4DG71;A0A0G2JQM2;A0A0G2JR50;Q86SQ7 SDCCAG8 Serologically defined colon cancer antigen 8 yes no 0 0 0 1 1 42.942 42.942 2 0.0073766 40604 QUIQUE_C1438_190116_001 73.26 1.7589 1284700000 0 0 0 0 561900000 0 0 0 0 0 0 0 722790000 39369 232 36741 352658;352659 448514;448515 448514 1 SEIDLFNIR Unmodified 1105.5768 0.57677356 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 111.47 111.47 1;2 1.0078E-25 114827 QUIQUE_DMIX8_190116_001 230.59 153.53 20619000000 1496300000 1638000000 1798000000 1747700000 1119300000 1784000000 2153200000 1045800000 1626900000 1358800000 2077100000 1001700000 1772500000 39370 1954 36742 352660;352661;352662;352663;352664;352665;352666;352667;352668;352669;352670;352671;352672;352673;352674;352675;352676;352677;352678;352679;352680;352681 448516;448517;448518;448519;448520;448521;448522;448523;448524;448525;448526;448527;448528;448529;448530;448531;448532;448533;448534;448535;448536;448537;448538;448539;448540;448541;448542;448543 448543 18 SEIDLFNIRK Unmodified 1233.6717 0.67173657 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 78.117 78.117 2;3 5.1674E-05 79351 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.7 88.498 3649400000 0 26726000 0 0 44864000 0 48560000 1548100000 559180000 0 570650000 329930000 521360000 39371 1954 36743 352682;352683;352684;352685;352686;352687;352688;352689;352690;352691 448544;448545;448546;448547;448548;448549;448550;448551;448552;448553;448554;448555;448556;448557;448558;448559 448550 16 SEIDLLDIR Unmodified 1072.5764 0.57643921 2045 P12429;D6RA82 ANXA3 Annexin A3;Annexin yes no 0 0 0 1 108.25 108.25 2 0.001817 112622 QUIQUE_C1368_190116_001 99.802 51.046 56804000 0 0 56804000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39372 2045 36744 352692 448560;448561;448562 448561 3 SEIDLLNIR Unmodified 1071.5924 0.59242362 1936;845 E5RK69;H0YC77;P08133;E7EMC6;E5RFF0 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 101.58 101.58 2 4.0678E-44 104738 QUIQUE_C1368_190116_001 218.79 151.8 15821000000 1669000000 0 1763000000 1514900000 1514200000 1720600000 1575700000 0 1385000000 918350000 1523400000 1140900000 1096300000 39373 845;1936 36745 352693;352694;352695;352696;352697;352698;352699;352700;352701;352702;352703;352704;352705;352706;352707 448563;448564;448565;448566;448567;448568;448569;448570;448571;448572;448573;448574;448575;448576;448577;448578;448579;448580 448568 18 SEIDLLNIRR Unmodified 1227.6935 0.69353465 1936;845 E5RK69;H0YC77;P08133;E7EMC6;E5RFF0 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 74.151 74.151 3 1.7027E-05 74658 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.56 76.822 657850000 0 0 0 0 22166000 0 0 275730000 0 0 103270000 150490000 106200000 39374 845;1936 36746 352708;352709;352710;352711;352712 448581;448582;448583;448584;448585 448582 5 SEIDLVQIK Unmodified 1043.5863 0.58627561 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.258 76.258 2 0.0068412 76468 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.265 22.675 1398200000 220770000 181520000 0 220350000 0 183710000 0 207930000 252040000 131910000 0 0 0 39375 2161 36747 352713;352714;352715;352716;352717;352718;352719;352720;352721 448586;448587;448588;448589;448590;448591;448592;448593;448594;448595 448592 10 SEIDMNDIK Unmodified 1063.4856 0.48557529 1853 P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 51.035 51.035 2 0.01113 48209 QUIQUE_DMIX8_190116_001 73.157 54.426 485250000 0 0 0 0 0 0 0 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1383.5976 0.59764493 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 40.347 40.347 2 0.0038494 36862 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.18 71.507 28797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28797000 0 39380 1187 36752 352734;352735;352736 448608;448609;448610 448609 3 SEIHLFLQR Unmodified 1141.6244 0.62439245 3142 Q15477 SKIV2L Helicase SKI2W yes yes 0 0 0 1 1 1 63.654 63.654 3 0.021779 64541 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.597 34.038 11861000 0 0 11861000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39381 3142 36753 352737;352738;352739 448611;448612;448613 448612 3 SEIIPMFSNLASDEQDSVR Unmodified 2136.9997 0.99974859 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.21 135.21 2 1.3367E-17 139710 QUIQUE_C1277_190116_001 167.03 143.35 3372000000 209730000 303640000 271020000 260590000 259170000 223500000 279290000 323200000 275030000 60350000 316480000 275210000 314810000 39382 2309 36754 352740;352741;352742;352743;352744;352745;352746;352747;352748;352749;352750;352751;352752 448614;448615;448616;448617;448618;448619;448620;448621;448622;448623;448624;448625;448626;448627;448628;448629;448630;448631;448632;448633;448634;448635;448636;448637 448616 24 SEIIPMFSNLASDEQDSVR Oxidation (M) 2152.9947 0.99466321 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 1 0 2 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 2 117.11 117.11 2 1.4119E-07 123197 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.58 72.902 798070000 0 73784000 53586000 65483000 50162000 85103000 43620000 48174000 104480000 46135000 52840000 66664000 108050000 39383 2309 36754 352753;352754;352755;352756;352757;352758;352759;352760;352761;352762;352763;352764;352765;352766;352767;352768;352769;352770 448638;448639;448640;448641;448642;448643;448644;448645;448646;448647;448648;448649;448650;448651;448652;448653;448654;448655;448656;448657;448658 448655 1700 19 SEIPSPQSQLLEDAEANLVGR Unmodified 2252.1285 0.12845458 4489 Q9ULJ8 PPP1R9A Neurabin-1 yes yes 0 0 0 1 145.75 145.75 3 0.017864 148667 QUIQUE_DMIX1_190116_001 16.734 14.136 20879000 0 0 0 0 0 0 0 20879000 0 0 0 0 0 39384 4489 36755 352771 448659 448659 1 SEISENTDASGK Unmodified 1236.547 0.54698957 4427 Q9UHB6;F8VQE1;F8VRN8 LIMA1 LIM domain and actin-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 15.124 15.124 2 0.00051585 7111 QUIQUE_C1277_190116_001 94.297 73.967 56379000 0 18475000 0 0 0 16057000 0 0 21846000 0 0 0 0 39385 4427 36756 352772;352773;352774 448660;448661;448662 448660 2 SEISGDLAR Unmodified 946.47197 0.47197413 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.884 28.884 2 9.1646E-05 23006 QUIQUE_DMIX4_190116_001 144.38 44.456 11332000000 999590000 937060000 1175000000 991460000 826000000 879390000 1136300000 336320000 804070000 554160000 1037800000 792560000 862020000 39386 845;1936 36757 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448918;448919;448920;448921;448922;448923;448924;448925;448926;448927;448928;448929;448930;448931;448932;448933;448934;448935;448936;448937;448938;448939;448940;448941;448942;448943;448944;448945;448946;448947;448948;448949;448950 448946 33 SELELTLGKLEQVR Unmodified 1613.8988 0.89883598 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 105.69 105.69 3 1.1324E-10 107676 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.78 80.703 30531000 0 0 0 0 0 0 0 30531000 0 0 0 0 0 39406 3117 36777 352974 448951 448951 1 SELEMVSGNVR Unmodified 1219.5867 0.58668632 1592 O60784;B0QY01 TOM1 Target of Myb protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.4 56.4 2 0.00043473 55274 QUIQUE_C1576_190116_001 120.12 54.867 808390000 97447000 75751000 88922000 73200000 64899000 67690000 65789000 33199000 39634000 28325000 56978000 39132000 77420000 39407 1592 36778 352975;352976;352977;352978;352979;352980;352981;352982;352983;352984;352985;352986;352987 448952;448953;448954;448955;448956;448957;448958;448959;448960;448961;448962;448963;448964;448965 448959 9 SELEQLR Acetyl (Protein N-term) 915.46616 0.46616048 2769;4207 P62879;C9JXA5;C9JIS1;C9JZN1;Q9HAV0;C9JD14 GNB2;GNB4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 no no 1 0 0 2 2 2 1 2 2 1 3 2 2 2 79.455 79.455 1;2 6.9543E-05 80771 QUIQUE_DMIX3_190116_001 170.94 29.391 10266000000 1882300000 0 1237500000 0 1138500000 600910000 1332100000 604350000 388880000 0 1118000000 895520000 1067700000 39408 2769;4207 36779 352988;352989;352990;352991;352992;352993;352994;352995;352996;352997;352998;352999;353000;353001;353002;353003;353004;353005;353006;353007;353008 448966;448967;448968;448969;448970;448971;448972;448973;448974;448975;448976;448977;448978;448979;448980;448981;448982;448983;448984;448985;448986;448987 448978 13 SELEQLRQEAEQLR Acetyl (Protein N-term) 1769.8908 0.89079049 2769;4207 P62879;C9JXA5;C9JIS1;C9JZN1;Q9HAV0;C9JD14 GNB2;GNB4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 no no 1 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 130.59 130.59 2;3 1.8375E-86 133672 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.87 155.33 22435000000 359570000 801720000 25529000 472350000 1482800000 327660000 1057100000 4297500000 3398200000 0 3354100000 3334600000 3523600000 39409 2769;4207 36780 353009;353010;353011;353012;353013;353014;353015;353016;353017;353018;353019;353020;353021;353022;353023;353024;353025;353026;353027;353028;353029 448988;448989;448990;448991;448992;448993;448994;448995;448996;448997;448998;448999;449000;449001;449002;449003;449004;449005;449006;449007;449008;449009;449010;449011;449012;449013;449014;449015;449016;449017 449000 29 SELFGETAR Unmodified 1008.4876 0.4876242 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 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353084;353085;353086 449092;449093;449094;449095 449094 3 SELKELLTR Unmodified 1087.6237 0.62372375 2251 P26447 S100A4 Protein S100-A4 yes yes 0 0 1 1 51.161 51.161 3 0.032803 48742 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.978 16.591 12802000 0 0 0 0 0 0 0 12802000 0 0 0 0 0 39417 2251 36787 353087 449096 449096 1 SELLPAGWNNNKDLYVLR Unmodified 2101.0956 0.095638305 3288 Q5QPM7;Q92530;Q5QPM9 PSMF1 Proteasome inhibitor PI31 subunit yes no 0 0 1 1 114.49 114.49 3 1.0815E-10 116954 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.06 107.59 65156000 0 0 0 0 0 0 0 65156000 0 0 0 0 0 39418 3288 36788 353088 449097 449097 1 SELLQQALCNAK Unmodified 1373.6973 0.6972994 2882 Q03001 DST Dystonin no no 0 0 0 1 75.378 75.378 2 0.003788 76475 QUIQUE_C1368_190116_001 73.573 54.793 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39419 2882 36789 353089 449098 449098 1 SELLSQLQQHEEESR Unmodified 1811.865 0.86496967 3745 Q92665 MRPS31 28S ribosomal protein S31, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 63.365 63.365 3 0.0011048 63046 QUIQUE_C1368_190116_001 47.548 29.183 34216000 0 0 34216000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39420 3745 36790 353090 449099 449099 1 SELPLVIQTFLNLEEK Unmodified 1872.0244 0.024430422 3964 Q99624;A0A087WWS5 SLC38A3 Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 170.07 170.07 2;3 3.3673E-30 174405 QUIQUE_DMIX3_190116_001 130.06 116.43 320230000 0 64784000 0 12131000 0 0 22094000 32276000 114770000 12710000 31374000 0 30100000 39421 3964 36791 353091;353092;353093;353094;353095;353096;353097;353098;353099;353100;353101;353102 449100;449101;449102;449103;449104;449105;449106;449107;449108;449109;449110;449111 449106 11 SELSGNFEK Unmodified 1009.4716 0.47163978 2574 P50995;E5RIN3;P27216 ANXA11;ANXA13 Annexin A11;Annexin A13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.882 29.882 2 0.00049353 24227 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.5 53.71 2106000000 120100000 148160000 141280000 219660000 143150000 103250000 195190000 126400000 217720000 93816000 195490000 164180000 237640000 39422 2574 36792 353103;353104;353105;353106;353107;353108;353109;353110;353111;353112;353113;353114;353115 449112;449113;449114;449115;449116;449117;449118;449119;449120;449121;449122;449123;449124;449125 449123 11 SELTDSASVLDNFK Unmodified 1524.7308 0.7307676 1556 O43815 STRN Striatin yes yes 0 0 0 1 1 1 112.11 112.11 2 0.0053521 114124 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.821 59.582 67755000 0 0 0 0 0 0 0 52110000 0 15646000 0 0 0 39423 1556 36793 353116;353117;353118 449126;449127;449128 449126 3 SELTGKFEK Unmodified 1037.5393 0.53932542 1954 P08758;D6RBL5;E9PHT9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 1 1 19.828 19.828 2 0.031656 12952 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.57 46.607 166230000 0 0 0 0 0 0 0 0 166230000 0 0 0 0 39424 1954 36794 353119 449129 449129 0 SELTQQLNALFQDK Unmodified 1633.8312 0.83115034 1903 P06727 APOA4 Apolipoprotein A-IV yes yes 0 0 0 1 136.51 136.51 2 0.000222 143273 QUIQUE_C1438_190116_001 108.35 80.366 44207000 0 0 0 0 44207000 0 0 0 0 0 0 0 0 39425 1903 36795 353120 449130 449130 1 SELVAMLEEEELRK Unmodified 1674.8498 0.84983687 2426 P40616;B4DZG7;F8VYN9 ARL1 ADP-ribosylation factor-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 102.69 102.69 2;3 8.1385E-05 107667 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.71 67.333 117880000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71967000 0 45916000 39426 2426 36796 353121;353122;353123 449131;449132;449133 449131 3 SELVANNVTLPAGEQR Unmodified 1696.8744 0.87441214 1095 G5E972;P42167;P42166 TMPO Lamina-associated polypeptide 2, isoforms beta/gamma;Thymopoietin;Thymopentin;Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha;Thymopoietin;Thymopentin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 69.539 69.539 2 4.607E-10 69158 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.33 104.93 323530000 74399000 83369000 0 0 0 0 0 55911000 0 32108000 77744000 0 0 39427 1095 36797 353124;353125;353126;353127;353128;353129;353130;353131 449134;449135;449136;449137;449138;449139;449140;449141 449139 8 SELVPEPR Acetyl (Protein N-term) 967.49746 0.4974606 584 B1AHR2 SEPT3 yes yes 1 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.991 77.991 1;2 0.0057399 79768 QUIQUE_C1576_190116_001 89.752 57.625 604380000 0 45928000 52418000 99800000 40836000 50949000 49649000 26575000 54931000 21066000 47452000 55746000 59026000 39428 584 36798 353132;353133;353134;353135;353136;353137;353138;353139;353140;353141;353142;353143;353144 449142;449143;449144;449145;449146;449147;449148;449149;449150;449151;449152;449153;449154;449155;449156;449157;449158;449159;449160;449161 449150 19 SEMEEALTAITEELAVSMK Oxidation (M) 2096.9857 0.98573801 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 1 0 2 2 1 1 166.17 166.17 2;3 0.00014038 171570 QUIQUE_C1576_190116_001 83.856 76.246 135340000 60902000 46265000 0 0 0 0 28175000 0 0 0 0 0 0 39429 869 36799 353145;353146;353147;353148;353149;353150 449162;449163;449164;449165;449166;449167 449167 519 3 SEMEEALTAITEELAVSMK Unmodified 2080.9908 0.99082339 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 1 1 2 1 1 172.26 172.26 2;3 9.8352E-86 176677 QUIQUE_C1218_190116_001 196.33 179.17 857100000 233220000 125930000 68700000 29676000 86477000 27850000 180530000 18015000 14751000 23705000 16852000 0 31389000 39430 869 36799 353151;353152;353153;353154;353155;353156;353157;353158;353159;353160;353161;353162;353163;353164;353165;353166;353167;353168 449168;449169;449170;449171;449172;449173;449174;449175;449176;449177;449178;449179;449180;449181;449182;449183;449184;449185;449186 449169 18 SEMEEALTAITEELAVSMKEEK Unmodified 2467.171 0.1709726 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 166.5 166.5 3 2.5104E-11 170681 QUIQUE_DMIX8_190116_001 109.08 100.79 305280000 23211000 42716000 0 0 39933000 0 59220000 28905000 0 0 0 0 111300000 39431 869 36800 353169;353170;353171;353172;353173;353174 449187;449188;449189;449190;449191;449192 449192 6 SEMEMAHLYSLCDAAHAQTEVAK Unmodified 2591.1454 0.14544332 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 2 1 3 2 1 88.249 88.249 3;4 4.547E-26 91555 QUIQUE_C1218_190116_001 122.65 115.89 401100000 0 58172000 0 71153000 0 149070000 122710000 0 0 0 0 0 0 39432 1689 36801 353175;353176;353177;353178;353179;353180;353181;353182;353183;353184 449193;449194;449195;449196;449197;449198;449199;449200;449201;449202;449203 449193 11 SEMEVQDAELK Unmodified 1277.5809 0.58093224 4530 Q9UQ80 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.634 47.634 2 0.00023219 45202 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.73 86.438 1036100000 123460000 147970000 0 137470000 107800000 117560000 0 59480000 82799000 28840000 120390000 0 110310000 39433 4530 36802 353185;353186;353187;353188;353189;353190;353191;353192;353193;353194;353195;353196 449204;449205;449206;449207;449208;449209;449210;449211;449212;449213;449214;449215 449210 12 SEMEVQDAELK Oxidation (M) 1293.5758 0.57584686 4530 Q9UQ80 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.83 28.83 2 0.0027366 23413 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1 0 1 105.36 105.36 2 0.037816 109392 QUIQUE_C1576_190116_001 61.56 48.983 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39436 2407 36803 353220 449240 449240 1 SEMTPEELQK Unmodified 1190.5489 0.54890383 2751 P62316;K7ERG4 SNRPD2 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 35.355 35.355 2 0.010058 31554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.338 48.713 293900000 0 75501000 0 0 0 0 0 45846000 57500000 0 64179000 50879000 0 39437 2751 36804 353221;353222;353223;353224;353225 449241;449242;449243;449244;449245 449242 2 SENAVVDGPFLVEK Unmodified 1502.7617 0.76167379 3623 Q8NBF2 NHLRC2 NHL repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 89.769 89.769 2 0.0090087 92709 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.91 37.595 179110000 0 0 0 0 0 0 0 0 84712000 26953000 67444000 0 0 39438 3623 36805 353226;353227;353228 449246;449247;449248;449249 449248 3 SENEEFVEVGR Unmodified 1293.5837 0.58370943 2002 P10644;K7EM13 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 52.795 52.795 2 0.00050645 51489 QUIQUE_C1218_190116_001 127.76 87.72 1943800000 166970000 154090000 145250000 174060000 199440000 133990000 181620000 126510000 183590000 58703000 121420000 168030000 130110000 39439 2002 36806 353229;353230;353231;353232;353233;353234;353235;353236;353237;353238;353239;353240;353241;353242 449250;449251;449252;449253;449254;449255;449256;449257;449258;449259;449260;449261;449262;449263 449250 12 SENENQEQIEESK Unmodified 1562.6696 0.6696239 3892 Q96JJ7 TMX3 Protein disulfide-isomerase TMX3 yes yes 0 0 0 1 1 1 18.426 18.426 2 1.4915E-75 10996 QUIQUE_C1218_190116_001 215.08 190.3 45569000 19593000 0 0 0 0 17410000 0 0 0 8565700 0 0 0 39440 3892 36807 353243;353244;353245 449264;449265;449266 449264 3 SENEPIENEAAK Unmodified 1329.6048 0.6048388 3878 Q96I99;E9PDQ8 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.529 20.529 2 0.00048258 13546 QUIQUE_C1438_190116_001 107.58 88.307 900290000 133900000 0 139410000 122360000 99681000 124820000 89255000 0 58355000 41014000 44702000 0 46794000 39441 3878 36808 353246;353247;353248;353249;353250;353251;353252;353253;353254;353255;353256 449267;449268;449269;449270;449271;449272;449273;449274;449275;449276;449277;449278 449270 12 SENGLEFTSSGSANTETTK Unmodified 1958.8705 0.87050855 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 0 0 0 3 3 2 1 1 2 1 2 2 1 2 3 1 52.585 52.585 2 8.8889E-242 48435 QUIQUE_C1403_190116_001 275.23 235.21 2154000000 256750000 196020000 161270000 223880000 131530000 248340000 167270000 116770000 108310000 155370000 143480000 120590000 124460000 39442 726;2185 36809 353257;353258;353259;353260;353261;353262;353263;353264;353265;353266;353267;353268;353269;353270;353271;353272;353273;353274;353275;353276;353277;353278;353279;353280 449279;449280;449281;449282;449283;449284;449285;449286;449287;449288;449289;449290;449291;449292;449293;449294;449295;449296;449297;449298;449299;449300;449301;449302;449303;449304;449305;449306;449307;449308;449309;449310;449311;449312;449313;449314;449315;449316;449317;449318;449319;449320;449321;449322;449323;449324;449325;449326;449327;449328 449295 50 SENISPEEEYK Unmodified 1323.583 0.58304073 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.506 34.506 2 0.0017009 30656 QUIQUE_C1218_190116_001 82.914 60.272 233990000 27300000 41064000 0 35443000 0 0 29680000 0 26968000 0 40860000 32678000 0 39443 4551 36810 353281;353282;353283;353284;353285;353286;353287;353288 449329;449330;449331;449332;449333;449334;449335;449336 449329 7 SENKDIENLR Unmodified 1216.6048 0.60477922 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3 KTN1 Kinectin yes no 0 0 1 1 20.353 20.353 3 0.030126 12927 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.334 37.23 11957000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11957000 0 0 0 39444 3490 36811 353289 449337 449337 1 SENKNEGQDATMYCK Oxidation (M) 1789.7247 0.72471272 4641 Q9Y639;Q9UFM8;H3BU51 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 13.409 13.409 3 9.3383E-06 5576 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.77 99.009 322090000 26000000 16596000 43385000 2679200 32623000 0 34195000 0 32185000 0 73038000 0 61387000 39445 4641 36812 353290;353291;353292;353293;353294;353295;353296;353297;353298;353299;353300 449338;449339;449340;449341;449342;449343;449344;449345;449346;449347;449348 449347 3059 9 SENKNEGQDATMYCK Unmodified 1773.7298 0.72979809 4641 Q9Y639;Q9UFM8;H3BU51 NPTN;DKFZp566H1924 Neuroplastin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 16.554 16.554 2;3 1.7873E-78 8752 QUIQUE_C1368_190116_001 210.79 185.94 1815600000 144580000 247550000 136570000 223210000 127650000 108810000 166850000 73980000 89191000 20432000 207870000 96742000 172220000 39446 4641 36812 353301;353302;353303;353304;353305;353306;353307;353308;353309;353310;353311;353312;353313;353314;353315;353316;353317;353318;353319;353320;353321;353322;353323;353324;353325 449349;449350;449351;449352;449353;449354;449355;449356;449357;449358;449359;449360;449361;449362;449363;449364;449365;449366;449367;449368;449369;449370;449371;449372;449373 449354 25 SENLGQGDKPDYFSSVATVVYLR Unmodified 2544.2496 0.24963234 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 125.38 125.38 3 0.0002572 129760 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.18 28.138 112620000 0 0 0 0 0 0 0 0 112620000 0 0 0 0 39447 2265 36813 353326;353327 449374;449375 449374 2 SENNLQEDLFDQILAGK Unmodified 1932.9429 0.94288564 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70;A0A0U1RRD0 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 151.02 151.02 2;3 2.898E-44 153677 QUIQUE_C1563_190116_001 215.34 181.93 3114900000 218480000 287770000 243050000 217530000 243570000 212100000 292390000 156830000 320430000 82018000 274400000 267470000 298870000 39448 3596 36814 353328;353329;353330;353331;353332;353333;353334;353335;353336;353337;353338;353339;353340;353341;353342;353343;353344;353345;353346;353347;353348;353349;353350;353351;353352;353353;353354 449376;449377;449378;449379;449380;449381;449382;449383;449384;449385;449386;449387;449388;449389;449390;449391;449392;449393;449394;449395;449396;449397;449398;449399;449400;449401;449402;449403;449404;449405;449406;449407;449408;449409;449410;449411;449412;449413;449414 449391 39 SENPGEISLR Unmodified 1100.5462 0.54620171 3930 Q96RF0 SNX18 Sorting nexin-18 yes yes 0 0 0 1 1 40.909 40.909 2 0.0077984 37043 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.643 38.39 126970000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54103000 72868000 39449 3930 36815 353355;353356 449415;449416 449416 2 SENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIK Oxidation (M) 3195.7312 0.73123187 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 1 0 2 1 175.16 175.16 3 4.8694E-32 182523 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.6 96.569 38653000 0 0 0 0 0 0 0 0 13913000 0 24739000 0 0 39450 282 36816 353357;353358;353359 449417;449418;449419 449419 213 3 SENVQDLLLLDVAPLSLGLETAGGVMTALIK Unmodified 3179.7363 0.73631725 282 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37 HSPA1B;HSPA1A Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A yes no 0 0 0 1 1 182.18 182.18 3 9.251E-47 185295 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.64 121.74 118300000 0 0 0 0 0 0 0 0 52588000 0 65717000 0 0 39451 282 36816 353360;353361 449420;449421 449420 2 SENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIK Oxidation (M) 3251.7574 0.75744662 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 172 172 3 9.4257E-41 176240 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.99 108.36 206060000 0 0 0 0 0 0 0 13737000 99739000 0 46386000 46200000 0 39452 2643 36817 353362;353363;353364;353365 449422;449423;449424;449425;449426 449423 2086 5 SENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTPLIK Unmodified 3235.7625 0.762532 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 175.75 175.75 3 1.0408E-87 182704 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.05 153.84 349520000 0 0 0 0 0 0 0 10426000 92427000 0 181790000 64882000 0 39453 2643 36817 353366;353367;353368;353369 449427;449428;449429;449430;449431 449430 5 SENVQDLLLLDVTPLSLGIETAGGVMTVLIK Oxidation (M) 3253.7731 0.77309669 2010;558 A8K7Q2;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 1 0 1 176.83 176.83 3 6.6672E-05 183768 QUIQUE_DMIX5_190116_001 42.319 36.999 16562000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16562000 0 0 39454 558;2010 36818 353370 449432 449432 371 1 SEPDKADPFSFEGPEIVDCDGCTIDWK Unmodified 3113.327 0.32703232 3972 Q99733;C9JZI7;E9PP22;H0YCI4 NAP1L4 Nucleosome assembly protein 1-like 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.55 137.55 3 1.9611E-14 141631 QUIQUE_C1277_190116_001 75.703 73.339 372090000 50266000 61002000 0 0 63703000 69353000 80265000 0 0 0 0 47496000 0 39455 3972 36819 353371;353372;353373;353374;353375;353376 449433;449434;449435;449436;449437;449438;449439 449434 6 SEPHSLSSEALMR Unmodified 1442.6824 0.68237762 4261 Q9NR28;H7BZK7;A0A2U3TZH2 DIABLO Diablo homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.027 39.027 2;3 0.0012861 35107 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.295 58.413 149280000 0 45767000 0 0 33363000 0 0 0 0 0 36260000 33891000 0 39456 4261 36820 353377;353378;353379;353380;353381;353382;353383;353384;353385 449440;449441;449442;449443;449444;449445;449446;449447;449448 449446 8 SEPIPESNDGPVK Unmodified 1367.6569 0.65687437 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.935 35.935 2 0.00028193 31832 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.13 91.826 7784100000 724130000 702110000 734360000 744820000 0 675400000 707510000 469710000 609390000 272590000 823770000 576450000 743840000 39457 2308 36821 353386;353387;353388;353389;353390;353391;353392;353393;353394;353395;353396;353397 449449;449450;449451;449452;449453;449454;449455;449456;449457;449458;449459;449460;449461 449460 13 SEPLDAAIIEEELDELRR Unmodified 2097.059 0.058978027 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325;H0Y326;Q5JV20;F8WAI0 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 143.92 143.92 3 0.0012796 148775 QUIQUE_C1277_190116_001 53.779 40.742 119120000 0 51791000 45982000 0 21349000 0 0 0 0 0 0 0 0 39458 228 36822 353398;353399;353400;353401;353402 449462;449463;449464;449465;449466 449462 5 SEPPVSEQLDVAGR Unmodified 1482.7314 0.7314363 3415 Q6VY07;B4DF77 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 59.969 59.969 2 0.0077405 59332 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.799 44.935 51729000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51729000 0 39459 3415 36823 353403;353404;353405 449467;449468;449469 449468 3 SEPQDFQEADSWGDTK Unmodified 1838.7595 0.75950154 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 78.2 78.2 2 3.9189E-05 79366 QUIQUE_C1218_190116_001 105.65 92.225 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39460 921 36824 353406 449470 449470 1 SEPQDFQEADSWGDTKR Unmodified 1994.8606 0.86061257 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 62.022 62.022 3 0.010697 60441 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.754 44.314 61806000 0 0 0 0 0 0 0 61806000 0 0 0 0 0 39461 921 36825 353407 449471 449471 0 SEPTQALELTEDDIKEDGIVPLR Unmodified 2567.2966 0.29664212 1526 O43396;K7ER96 TXNL1 Thioredoxin-like protein 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 3 1 1 2 131.03 131.03 3 1.3218E-17 134339 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.54 104.08 2493000000 153840000 240870000 268440000 224040000 222920000 208380000 120600000 233720000 0 165070000 143880000 179380000 331860000 39462 1526 36826 353408;353409;353410;353411;353412;353413;353414;353415;353416;353417;353418;353419;353420;353421;353422;353423;353424;353425;353426;353427;353428;353429 449472;449473;449474;449475;449476;449477;449478;449479;449480;449481;449482;449483;449484;449485;449486;449487;449488;449489;449490;449491;449492;449493;449494;449495;449496;449497;449498;449499;449500;449501 449489 29 SEPVKEESSELEQPFAQDTSSVGPDR Unmodified 2847.3046 0.30464062 3138;3045 Q15424;Q14151 SAFB;SAFB2 Scaffold attachment factor B1;Scaffold attachment factor B2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.857 81.857 3 3.4009E-37 82995 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.86 125.42 809750000 78489000 71196000 73921000 95052000 89247000 56752000 47471000 74698000 68609000 36830000 0 49536000 67948000 39463 3138;3045 36827 353430;353431;353432;353433;353434;353435;353436;353437;353438;353439;353440;353441 449502;449503;449504;449505;449506;449507;449508;449509;449510;449511;449512;449513;449514;449515 449512 14 SEQAVAQLEEEKK Unmodified 1487.7468 0.74675201 4286 Q9NSK0;C9J8T5;C9JZE5 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 0 0 1 1 1 25.859 25.859 3 0.033278 19971 QUIQUE_C1403_190116_001 34.851 17.829 93481000 0 0 0 40641000 0 0 0 0 0 0 52840000 0 0 39464 4286 36828 353442;353443 449516;449517 449516 2 SEQDQAENEGEDSAVLMER Unmodified 2135.8913 0.89132035 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 1 70.662 70.662 2 1.0192E-22 71033 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.63 101.68 24008000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24008000 0 0 39465 645 36829 353444;353445 449518;449519 449519 2 SEQEDEVLLVSSSR Unmodified 1576.758 0.75804498 6;4349 A0A024RBG1;Q9NZJ9 NUDT4 Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 74.733 74.733 2 0.00025209 76093 QUIQUE_C1218_190116_001 91.62 46.598 283130000 87405000 99162000 0 96562000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39466 6;4349 36830 353446;353447;353448;353449 449520;449521;449522;449523;449524 449520 5 SEQEFQEQLESAR Unmodified 1579.7114 0.71142914 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;F5GYT8;G5E9X5 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.999 66.999 2 1.2293E-52 67436 QUIQUE_C1438_190116_001 199.68 173.63 737650000 0 55722000 63486000 64271000 70679000 55493000 68579000 47782000 70221000 30503000 65310000 68529000 77078000 39467 3933 36831 353450;353451;353452;353453;353454;353455;353456;353457;353458;353459;353460;353461 449525;449526;449527;449528;449529;449530;449531;449532;449533;449534;449535;449536;449537;449538 449528 13 SEQFINLR Unmodified 1005.5243 0.52434406 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.039 61.039 2 0.0039304 60012 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.01 75.758 2750100000 234500000 215500000 231230000 232200000 248490000 174370000 218120000 191430000 241210000 82866000 249130000 219960000 211080000 39468 1921 36832 353462;353463;353464;353465;353466;353467;353468;353469;353470;353471;353472;353473;353474 449539;449540;449541;449542;449543;449544;449545;449546;449547;449548;449549;449550;449551;449552;449553 449546 15 SEQGTLTSSESHPEAAPK Unmodified 1854.8595 0.85954994 4554 Q9Y2H0 DLGAP4 Disks large-associated protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 20.513 20.513 3 0.0015098 13425 QUIQUE_C1403_190116_001 42.716 39.112 84015000 0 0 0 54242000 0 0 0 0 0 0 29773000 0 0 39469 4554 36833 353475;353476 449554;449555 449554 2 SEQSICQAR Acetyl (Protein N-term) 1119.4979 0.49787131 3615;4441 Q8N8S7;A0A0U1RRM6;A0A075B6E5;Q9UI08 ENAH;EVL Protein enabled homolog;Ena/VASP-like protein no no 1 0 0 1 35.096 35.096 2 0.038471 30824 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.335 28.239 52932000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52932000 39470 3615;4441 36834 353477 449556 449556 1 SEQSVAQLEEEKK Unmodified 1503.7417 0.74166663 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;G3V2P7 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 22.581 22.581 2;3 0.00025425 15593 QUIQUE_C1368_190116_001 125.23 97.017 999610000 0 0 211360000 234660000 0 59936000 92275000 0 267780000 133600000 0 0 0 39471 1050 36835 353478;353479;353480;353481;353482;353483;353484;353485;353486 449557;449558;449559;449560;449561;449562;449563;449564;449565 449558 8 SESEDLQQVIASVLR Unmodified 1672.8632 0.86317875 2235 P25054;E9PFT7;A0A2Q2SV78;H3BNH8;R4GMU6 APC Adenomatous polyposis coli protein yes no 0 0 0 1 158.27 158.27 2 0.0059002 163891 QUIQUE_C1368_190116_001 85.274 66.529 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39472 2235 36836 353487 449566 449566 1 SESEEEVLLVSSSR Unmodified 1549.7471 0.74714594 1765 O95989 NUDT3 Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 77.325 77.325 2 3.8234E-07 78475 QUIQUE_C1368_190116_001 127.52 102.13 1208300000 106170000 111800000 121740000 102000000 0 142660000 150180000 0 94320000 97323000 139750000 0 142370000 39473 1765 36837 353488;353489;353490;353491;353492;353493;353494;353495;353496;353497;353498;353499 449567;449568;449569;449570;449571;449572;449573;449574;449575;449576;449577;449578;449579 449569 12 SESELIDELSEDFDR Unmodified 1782.7796 0.77956828 240 E7ES10;E9PCH5;E7EVY3;B7Z574;A0A0C4DGB5;P20810;H0Y7F0;H0Y9H6;E9PDE4;E7EQ12;A0A0A0MR45;E7EQA0;H0YD33;D6RC54 CAST Calpastatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 146.67 146.67 2 3.2513E-05 152513 QUIQUE_C1218_190116_001 100.55 86.648 258650000 47010000 0 36536000 89513000 56278000 29317000 0 0 0 0 0 0 0 39474 240 36838 353500;353501;353502;353503;353504 449580;449581;449582;449583;449584;449585 449580 5 SESEVEEAAAIIAQRPDNPR Unmodified 2181.0662 0.06618867 3186 Q16643;D6R9W4;D6R9Q9 DBN1 Drebrin yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 2 2 1 2 97.862 97.862 2;3;4 3.5206E-37 101691 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.38 142.82 2832000000 0 654800000 0 0 86289000 32419000 68477000 301870000 287590000 149830000 468250000 286700000 495830000 39475 3186 36839 353505;353506;353507;353508;353509;353510;353511;353512;353513;353514;353515;353516;353517;353518;353519;353520;353521 449586;449587;449588;449589;449590;449591;449592;449593;449594;449595;449596;449597;449598;449599;449600;449601;449602;449603;449604 449601 19 SESIAFIEESKK Unmodified 1366.698 0.6980109 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 1 1 1 44.978 44.978 2 0.037795 41292 QUIQUE_C1277_190116_001 64.73 36.521 77211000 35719000 41492000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39476 699 36840 353522;353523 449605;449606 449606 2 SESIRPDEFSLEIFER Unmodified 1952.948 0.94797101 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 1 1 128.94 128.94 3 0.0037387 131737 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.349 20.42 11642000 0 0 0 0 0 0 0 11642000 0 0 0 0 0 39477 2863 36841 353524 449607 449607 1 SESIWVQALK Unmodified 1159.6237 0.62372375 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 90.55 90.55 2 0.045218 92504 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.418 27.332 36520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36520000 0 39478 264 36842 353525 449608 449608 1 SESLVVCDVAEDLVEK Acetyl (Protein N-term) 1832.8714 0.87136018 2703 P60983;G3V4P8;G3V3X4 GMFB Glia maturation factor beta yes no 1 0 0 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ribonucleoprotein A1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 17.572 17.572 2;3 0.00021714 9872 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.66 94.03 3040200000 340650000 193930000 251640000 156650000 211820000 134220000 191120000 203800000 199190000 0 564820000 297520000 294830000 39481 1049 36845 353545;353546;353547;353548;353549;353550;353551;353552;353553;353554;353555;353556;353557;353558 449633;449634;449635;449636;449637;449638;449639;449640;449641;449642;449643;449644;449645;449646 449642 8 SESPKEPEQLRK Unmodified 1426.7416 0.74160705 1049 F8W6I7;P09651;F8VTQ5;F8W646 HNRNPA1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed yes no 0 0 2 1 2 1 2 2 1 10.824 10.824 3;4 4.1128E-06 3002 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.76 94.131 645500000 0 0 0 0 34408000 0 0 196970000 30547000 0 104900000 184240000 94433000 39482 1049 36846 353559;353560;353561;353562;353563;353564;353565;353566;353567 449647;449648;449649;449650;449651;449652;449653;449654;449655;449656;449657;449658 449654 11 SESQGTAPAFK Unmodified 1121.5353 0.53530267 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.532 20.532 2 0.0023322 13917 QUIQUE_C1218_190116_001 104.2 56.352 1181200000 121570000 0 0 132050000 150250000 122640000 153070000 0 0 54843000 157950000 142960000 145910000 39483 3154 36847 353568;353569;353570;353571;353572;353573;353574;353575;353576 449659;449660;449661;449662;449663;449664;449665;449666;449667 449659 7 SESTSGATQFMPDPK Unmodified 1581.6981 0.69808726 75 A0A087WYF7;Q6UXV4;A0A087WUX8 APOOL MICOS complex subunit MIC27 yes no 0 0 0 1 60.511 60.511 2 0.01312 59661 QUIQUE_C1218_190116_001 55.452 36.78 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39484 75 36848 353577 449668 449668 1 SESVPPVTDWAWYK Unmodified 1663.7882 0.7882229 2383;4671 R4GMX5;R4GN83;P35613;A0A087WUV8;A0A087X2B5;I3L192 BSG Basigin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.44 123.44 2 0.0012057 126607 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.015 54.311 2276000000 0 0 246880000 0 0 0 362400000 220340000 331840000 122830000 336930000 290650000 364080000 39485 4671;2383 36849 353578;353579;353580;353581;353582;353583;353584;353585;353586 449669;449670;449671;449672;449673;449674;449675;449676;449677 449672 9 SETDKETSLVK Unmodified 1235.6245 0.62451161 3298 Q5SW79;H0Y2V6 CEP170 Centrosomal protein of 170 kDa yes no 0 0 1 1 1 2 1 17.154 17.154 2 0.0051674 10048 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.82 70.437 76211000 15839000 0 0 0 0 18933000 0 0 0 0 0 0 41439000 39486 3298 36850 353587;353588;353589;353590;353591 449678;449679;449680;449681;449682 449680 5 SETDLLDIR Unmodified 1060.5401 0.5400537 2574 P50995;H0Y6E1 ANXA11 Annexin A11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.685 82.685 2 0.00037878 84207 QUIQUE_DMIX3_190116_001 135 93.346 2117800000 157600000 185870000 145600000 215110000 151560000 133700000 205400000 146510000 240920000 119350000 0 187270000 228880000 39487 2574 36851 353592;353593;353594;353595;353596;353597;353598;353599;353600;353601;353602;353603 449683;449684;449685;449686;449687;449688;449689;449690;449691;449692;449693;449694;449695 449692 13 SETDTSLIR Unmodified 1020.5088 0.50875357 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.216 32.216 2 0.00042753 26792 QUIQUE_C1403_190116_001 119.27 52.242 2052600000 238850000 235300000 249960000 240410000 224940000 241740000 272140000 0 0 129510000 0 219770000 0 39488 2424 36852 353604;353605;353606;353607;353608;353609;353610;353611;353612;353613 449696;449697;449698;449699;449700;449701;449702;449703;449704;449705 449699 10 SETEDSILHQLFIVR Unmodified 1785.9261 0.92611336 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 2 3 2 1 1 1 1 1 1 2 130.84 130.84 2;3 1.9339E-29 133889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 141.32 119.1 1668700000 153740000 132730000 58901000 138450000 203310000 174590000 54746000 134930000 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449727;449728;449729;449730;449731;449732;449733;449734;449735;449736;449737;449738;449739;449740;449741;449742;449743;449744;449745;449746;449747;449748;449749;449750 449742 24 SETITEEELVGLMNK Oxidation (M) 1707.8237 0.8236817 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.612 93.612 2 8.362E-19 91411 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.91 133.75 2154100000 143570000 180520000 227680000 151760000 149590000 188780000 157040000 0 0 146670000 237500000 242280000 328670000 39491 2102 36855 353655;353656;353657;353658;353659;353660;353661;353662;353663;353664;353665 449751;449752;449753;449754;449755;449756;449757;449758;449759;449760;449761;449762;449763;449764;449765;449766;449767;449768 449763 1437 17 SETITEEELVGLMNK Unmodified 1691.8288 0.82876708 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 1 125.66 125.66 2;3 3.8123E-44 129831 QUIQUE_C1277_190116_001 224.58 192.57 14799000000 896780000 1054500000 1487500000 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gamma, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.026 31.026 2 0.00045661 26510 QUIQUE_C1218_190116_001 105.4 76.451 9487700000 858330000 705570000 1001400000 751640000 436670000 838820000 891630000 619040000 741840000 371530000 750850000 824600000 695780000 39494 2396 36857 353693;353694;353695;353696;353697;353698;353699;353700;353701;353702;353703;353704;353705 449813;449814;449815;449816;449817;449818;449819;449820;449821;449822;449823;449824;449825;449826;449827;449828;449829;449830;449831;449832;449833;449834;449835;449836;449837;449838;449839 449813 27 SEVEEVDFAGWLCK Unmodified 1667.7501 0.75012283 2395 P36507;G5E9C7;M0R1B6 MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.2 135.2 2 1.6808E-17 137948 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152.07 127.22 485630000 41644000 58844000 44420000 41729000 43500000 48756000 48637000 39004000 34812000 20340000 36075000 27868000 0 39495 2395 36858 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Unmodified 1231.6296 0.62959699 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 0 1 76.099 76.099 2 0.0024203 72269 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.24 56.717 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39497 2886 36860 353746 449887 449887 1 SEVELAAALSDKR Unmodified 1387.7307 0.73070802 2886 Q03252 LMNB2 Lamin-B2 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 57.69 57.69 2;3 2.0749E-07 55358 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.76 75.849 4313300000 233290000 389030000 359860000 305270000 377100000 380900000 336700000 354670000 363410000 143850000 382310000 372280000 314590000 39498 2886 36861 353747;353748;353749;353750;353751;353752;353753;353754;353755;353756;353757;353758;353759;353760;353761;353762;353763;353764;353765;353766;353767;353768;353769;353770;353771;353772 449888;449889;449890;449891;449892;449893;449894;449895;449896;449897;449898;449899;449900;449901;449902;449903;449904;449905;449906;449907;449908;449909;449910;449911;449912;449913;449914;449915;449916;449917;449918;449919;449920;449921;449922;449923;449924;449925;449926 449925 38 SEVELVQLVIDGVNYLIDCER Unmodified 2462.2363 0.23629047 2046 P12532 CKMT1A Creatine kinase U-type, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 182.35 182.35 3 2.2454E-19 185099 QUIQUE_DMIX7_190116_001 124.2 116.05 47695000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35638000 12057000 0 39499 2046 36862 353773;353774 449927;449928 449928 2 SEVLLVSEDGK Unmodified 1174.6081 0.60813326 4455 Q9UJ70;H7C3G9;H7C1L7 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 53.696 53.696 2 0.0001331 52892 QUIQUE_C1218_190116_001 129.63 99.458 746700000 136160000 139440000 155140000 0 128410000 0 0 0 0 0 0 0 187540000 39500 4455 36863 353775;353776;353777;353778;353779;353780;353781;353782;353783;353784 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SEVSSDEDIQFR Unmodified 1410.6263 0.62630252 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 3 1 57.908 57.908 2 0.00052585 55236 QUIQUE_C1403_190116_001 117.7 72.561 520970000 0 24664000 0 265570000 29570000 16880000 0 0 0 184280000 0 0 0 39504 1153 36867 353793;353794;353795;353796;353797;353798;353799;353800;353801;353802 449948;449949;449950;449951;449952;449953;449954;449955;449956;449957;449958;449959 449949 10 SEVTFLAPVTRPDK Unmodified 1558.8355 0.83550744 3860 Q96GK7;C9JGM0 FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 67.004 67.004 2;3 0.0013952 66744 QUIQUE_C1277_190116_001 92.866 76.195 530660000 65229000 54004000 42272000 40206000 47270000 28569000 40015000 0 44555000 26645000 49456000 47109000 45334000 39505 3860 36868 353803;353804;353805;353806;353807;353808;353809;353810;353811;353812;353813;353814;353815;353816 449960;449961;449962;449963;449964;449965;449966;449967;449968;449969;449970;449971;449972;449973;449974 449961 13 SEWGSLLEELVAEGK Unmodified 1645.8199 0.81991695 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 159.83 159.83 2;3 2.4798E-35 164406 QUIQUE_DMIX3_190116_001 169.23 141.02 5239100000 348600000 358170000 563890000 309900000 582990000 226350000 460470000 229220000 374840000 198480000 739460000 385120000 461590000 39506 2129 36869 353817;353818;353819;353820;353821;353822;353823;353824;353825;353826;353827;353828;353829;353830;353831;353832;353833;353834;353835;353836;353837;353838;353839;353840;353841 449975;449976;449977;449978;449979;449980;449981;449982;449983;449984;449985;449986;449987;449988;449989;449990;449991;449992;449993;449994;449995;449996;449997;449998;449999;450000 449992 26 SEWSDLLSDLQK Unmodified 1419.6882 0.6881745 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 148.18 148.18 2;3 1.528E-28 154073 QUIQUE_C1218_190116_001 185.29 152.97 9672100000 873130000 907630000 830780000 600880000 711410000 736520000 699490000 611360000 743180000 318630000 1247400000 766960000 624700000 39507 452 36870 353842;353843;353844;353845;353846;353847;353848;353849;353850;353851;353852;353853;353854;353855;353856;353857;353858;353859;353860;353861;353862;353863;353864;353865;353866 450001;450002;450003;450004;450005;450006;450007;450008;450009;450010;450011;450012;450013;450014;450015;450016;450017;450018;450019;450020;450021;450022;450023;450024;450025;450026;450027;450028;450029;450030;450031;450032;450033;450034;450035;450036;450037;450038;450039;450040;450041;450042;450043;450044 450002 44 SEYDSLLPDVYEWPESASSPPVITE Unmodified 2809.2858 0.28580266 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PR68 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 170.44 170.44 2;3 7.2261E-05 173826 QUIQUE_C1277_190116_001 74.769 61.35 203480000 35864000 34774000 14064000 43774000 12304000 0 0 42416000 0 0 0 20281000 0 39508 374 36871 353867;353868;353869;353870;353871;353872;353873;353874;353875;353876 450045;450046;450047;450048;450049;450050;450051;450052;450053;450054;450055 450048 11 SEYPSIK Unmodified 822.41233 0.41233399 850 J3KMY5;G3V3E8;E7EMS2;G3V3D1;P61916;H0YIZ1 NPC2 Epididymal secretory protein E1 yes no 0 0 0 1 1 26.823 26.823 2 0.060724 20561 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.176 22.512 51414000 0 0 0 0 0 0 0 24537000 26876000 0 0 0 0 39509 850 36872 353877;353878 450056;450057 450057 2 SEYQPSDAPFER Unmodified 1424.6208 0.62082322 3889 Q96JE9 MAP6 Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.024 57.024 2 0.00075232 55030 QUIQUE_C1403_190116_001 101.66 85.526 3584500000 329330000 280610000 315580000 337300000 260980000 267950000 281940000 345110000 244540000 0 271220000 235430000 414500000 39510 3889 36873 353879;353880;353881;353882;353883;353884;353885;353886;353887;353888;353889;353890 450058;450059;450060;450061;450062;450063;450064;450065;450066;450067;450068;450069 450061 11 SFADINLYR Unmodified 1097.5506 0.55055881 1807 P01111 NRAS GTPase NRas yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.592 89.592 2 0.0066567 90958 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.492 65.263 557470000 76208000 55458000 0 0 56303000 0 59121000 52475000 53437000 18954000 83560000 47264000 54692000 39511 1807 36874 353891;353892;353893;353894;353895;353896;353897;353898;353899;353900 450070;450071;450072;450073;450074;450075;450076;450077;450078;450079;450080 450074 10 SFAFVGPSR Unmodified 966.49232 0.49231565 3197 Q16795;A0A3B3ISG8;H3BRM9 NDUFA9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 63.631 63.631 2 0.0091346 62238 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.825 58.042 90209000 0 0 0 0 0 0 0 57152000 0 33058000 0 0 0 39512 3197 36875 353901;353902 450081;450082;450083;450084 450082 4 SFAGNLNTYK Unmodified 1113.5455 0.54547343 2861 Q01813;B1APP6 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.962 47.962 2 0.00025009 45217 QUIQUE_C1403_190116_001 144.09 105.3 4127800000 0 413750000 0 542690000 349140000 349230000 492500000 278600000 356550000 0 437770000 457260000 450280000 39513 2861 36876 353903;353904;353905;353906;353907;353908;353909;353910;353911;353912;353913;353914 450085;450086;450087;450088;450089;450090;450091;450092;450093;450094;450095;450096;450097 450087 12 SFAGNLNTYKR Unmodified 1269.6466 0.64658446 2861 Q01813;B1APP6 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 0 1 1 1 2 1 32.814 32.814 2;3 0.0022055 27547 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.213 50.416 188010000 0 0 0 0 0 0 0 43738000 0 0 85972000 58298000 0 39514 2861 36877 353915;353916;353917;353918;353919 450098;450099;450100;450101;450102 450100 5 SFAMLSTCSR Oxidation (M) 1174.5111 0.51107853 343 A0A1B0GTQ5;A0A1B0GW59 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 15.39 15.39 2 0.0054987 7219 QUIQUE_C1277_190116_001 80.229 38.8 585340000 0 96235000 126380000 0 173010000 0 0 0 128510000 61200000 0 0 0 39515 343 36878 353920;353921;353922;353923;353924 450103;450104;450105;450106;450107;450108 450104 241 6 SFANTLVDVCAYAGSGNVLK Unmodified 2085.0201 0.0200901 2976 Q13200;H7C1H2 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 133.06 133.06 2;3 8.937E-25 138659 QUIQUE_C1218_190116_001 139.77 118.91 1027800000 115200000 64155000 88573000 64728000 94443000 54353000 106100000 65324000 122030000 13321000 52265000 86289000 101010000 39516 2976 36879 353925;353926;353927;353928;353929;353930;353931;353932;353933;353934;353935;353936;353937;353938;353939;353940 450109;450110;450111;450112;450113;450114;450115;450116;450117;450118;450119;450120;450121;450122;450123;450124;450125 450109 16 SFAPILPHLAEEVFQHIPYIK Unmodified 2448.3206 0.32055286 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 160.85 160.85 3;4 4.7576E-07 166473 QUIQUE_C1368_190116_001 83.251 76.691 523070000 0 0 120840000 0 44457000 0 0 37789000 104130000 0 69247000 71931000 74681000 39517 4285 36880 353941;353942;353943;353944;353945;353946;353947;353948;353949 450126;450127;450128;450129;450130;450131;450132;450133;450134;450135 450127 9 SFASLFSD Unmodified 872.3916 0.39159855 2125;3755;1471 P17600;A0A1W2PSE9;Q92777;O14994;A0A0A0MR68 SYN1;SYN2;SYN3 Synapsin-1;Synapsin-2;Synapsin-3 no no 0 0 0 1 133.82 133.82 1 0.049698 137635 QUIQUE_C1403_190116_001 110.9 104.14 176990000 0 0 0 176990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39518 2125;3755;1471 36881 353950 450136 450136 0 SFATFLSHVLDLVSHPR Unmodified 1925.0159 0.015931421 4385 Q9P2D3 HEATR5B HEAT repeat-containing protein 5B yes yes 0 0 0 1 163.75 163.75 3 0.0033495 168035 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.783 61.203 9498400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9498400 0 39519 4385 36882 353951 450137 450137 0 SFAVGMFK Unmodified 885.44186 0.44185998 2539 P49748;K7EQP4;K7EJW8 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 78.254 78.254 2 0.024721 80608 QUIQUE_C1218_190116_001 72.138 54.577 594840000 85732000 70324000 0 0 48684000 0 85527000 0 91934000 0 123270000 89370000 0 39520 2539 36883 353952;353953;353954;353955;353956;353957;353958 450138;450139;450140;450141;450142;450143;450144 450138 7 SFCSMAGPNLIAIGSSESAQK Unmodified 2154.0085 0.0085391359 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 113.51 113.51 2;3 5.7629E-233 117604 QUIQUE_C1368_190116_001 341.07 319.84 17689000000 1096300000 1218900000 1663200000 1440500000 1103400000 1137000000 1203300000 1475600000 1744000000 370250000 1886900000 1455700000 1894100000 39521 1684 36884 353959;353960;353961;353962;353963;353964;353965;353966;353967;353968;353969;353970;353971;353972;353973;353974;353975;353976;353977;353978;353979;353980;353981;353982;353983;353984 450145;450146;450147;450148;450149;450150;450151;450152;450153;450154;450155;450156;450157;450158;450159;450160;450161;450162;450163;450164;450165;450166;450167;450168;450169;450170;450171;450172;450173;450174;450175;450176;450177;450178;450179;450180;450181;450182;450183;450184;450185;450186;450187;450188;450189;450190 450152 46 SFCSMAGPNLIAIGSSESAQK Oxidation (M) 2170.0035 0.003453758 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 1 0 2 2 2 1 2 2 2 3 2 2 2 2 98.121 98.121 2;3 6.1285E-259 95890 QUIQUE_DMIX4_190116_001 272.72 255.78 3539300000 0 223050000 297660000 233080000 116170000 192950000 187640000 346840000 562780000 173300000 379690000 382540000 443560000 39522 1684 36884 353985;353986;353987;353988;353989;353990;353991;353992;353993;353994;353995;353996;353997;353998;353999;354000;354001;354002;354003;354004;354005;354006;354007;354008 450191;450192;450193;450194;450195;450196;450197;450198;450199;450200;450201;450202;450203;450204;450205;450206;450207;450208;450209;450210;450211;450212;450213;450214;450215;450216;450217 450209 925 26 SFDALLADLTR Unmodified 1220.6401 0.6401021 363 H3BLV5;A0A1B0GWD1;A8K340;O43602;E7EU50;A0A1B0GUE1 DCX Neuronal migration protein doublecortin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.03 143.03 2 0.0018699 149522 QUIQUE_C1438_190116_001 81.865 59.717 593600000 42380000 43076000 44093000 48285000 51775000 74032000 29357000 46977000 49077000 14936000 50487000 54397000 44725000 39523 363 36885 354009;354010;354011;354012;354013;354014;354015;354016;354017;354018;354019;354020;354021 450218;450219;450220;450221;450222;450223;450224;450225;450226;450227;450228;450229;450230;450231 450222 12 SFDALLIELTR Unmodified 1276.7027 0.70270235 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.76 150.76 2 3.6927E-08 156218 QUIQUE_C1368_190116_001 152.97 95.625 1102800000 84036000 82896000 112900000 77599000 59976000 85874000 79808000 126460000 149540000 30900000 131990000 0 80839000 39524 3596 36886 354022;354023;354024;354025;354026;354027;354028;354029;354030;354031;354032;354033 450232;450233;450234;450235;450236;450237;450238;450239;450240;450241;450242;450243;450244;450245;450246 450234 15 SFDDEESVDGNRPSSAASAFK Unmodified 2214.9665 0.9665342 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;D6RBU8;C9J668;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 63.234 63.234 3 0.0017657 62548 QUIQUE_C1403_190116_001 50.851 46.823 200570000 0 0 0 64615000 71594000 0 0 0 0 0 0 31304000 33056000 39525 310;830 36887 354034;354035;354036;354037 450247;450248;450249;450250 450247 3 SFDDPIVQTER Unmodified 1305.6201 0.62009493 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.192 66.192 2 0.00010212 66120 QUIQUE_C1576_190116_001 140.16 119.83 1923400000 131080000 160730000 155030000 136460000 157190000 140350000 151760000 173820000 131840000 65523000 174330000 178180000 167130000 39526 1748 36888 354038;354039;354040;354041;354042;354043;354044;354045;354046;354047;354048;354049;354050 450251;450252;450253;450254;450255;450256;450257;450258;450259;450260;450261;450262;450263 450257 13 SFDGFSSAQK Unmodified 1072.4825 0.48253882 4638 Q9Y5Z4 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.912 39.912 2 0.0007351 35820 QUIQUE_C1277_190116_001 107 65.813 1887800000 160370000 189290000 0 144100000 227400000 138680000 157760000 129600000 131520000 51130000 216610000 126750000 214570000 39527 4638 36889 354051;354052;354053;354054;354055;354056;354057;354058;354059;354060;354061;354062 450264;450265;450266;450267;450268;450269;450270;450271;450272;450273;450274;450275 450265 6 SFDIGVNK Unmodified 878.44978 0.44978213 3409 Q6UWR7;D6R9P1 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.884 46.884 2 0.022694 43681 QUIQUE_C1277_190116_001 73.975 39.27 242530000 0 71978000 0 85712000 61059000 0 0 0 0 23778000 0 0 0 39528 3409 36890 354063;354064;354065;354066;354067;354068 450276;450277;450278;450279;450280;450281;450282 450276 7 SFDIPPPPMDEK Oxidation (M) 1387.633 0.63296781 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 1 0 1 69.666 69.666 2 0.0087275 65934 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.734 40.59 49240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49240000 0 0 0 39529 2090 36891 354069 450283 450283 1433 1 SFDIPPPPMDEKHPYYNSISK Oxidation (M) 2477.1573 0.15731186 2090 P15259 PGAM2 Phosphoglycerate mutase 2 yes yes 0 1 1 1 1 74.223 74.223 3;4 0.00034403 74798 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.055 49.111 163370000 0 0 0 0 0 0 0 55613000 107760000 0 0 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1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 145.23 145.23 2;3 4.6807E-100 149424 QUIQUE_C1277_190116_001 230.16 217.8 854800000 90570000 141640000 65221000 97420000 78826000 101090000 96548000 0 0 0 37186000 77488000 68812000 39534 1779 36895 354078;354079;354080;354081;354082;354083;354084;354085;354086;354087;354088;354089;354090;354091;354092;354093;354094;354095;354096;354097;354098 450292;450293;450294;450295;450296;450297;450298;450299;450300;450301;450302;450303;450304;450305;450306;450307;450308;450309;450310;450311;450312;450313;450314;450315 450296 22 SFDSNAFTLLLR Unmodified 1382.7194 0.71941505 4398 Q9UBI1;R4GMW6;H0Y4W0;H0Y6Z9;R4GMX3;R4GN54;R4GN06;Q5T8Z1 COMMD3;COMMD3-BMI1 COMM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.65 142.65 2 2.6976E-37 147328 QUIQUE_C1277_190116_001 189.18 143.58 615750000 69373000 53467000 47144000 51139000 50189000 41454000 51188000 0 0 42896000 70479000 54504000 83919000 39535 4398 36896 354099;354100;354101;354102;354103;354104;354105;354106;354107;354108;354109 450316;450317;450318;450319;450320;450321;450322;450323;450324;450325;450326;450327 450317 12 SFDVNKPGCEVDDLK Unmodified 1721.7931 0.79305028 2432 P41091;Q2VIR3 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 60.836 60.836 2;3 9.0824E-05 60717 QUIQUE_C1218_190116_001 117.93 92.459 440410000 87580000 46532000 51019000 96167000 54373000 77122000 27619000 0 0 0 0 0 0 39536 2432 36897 354110;354111;354112;354113;354114;354115;354116;354117;354118;354119 450328;450329;450330;450331;450332;450333;450334;450335;450336;450337 450329 10 SFDVNKPGCEVDDLKGGVAGGSILK Unmodified 2561.2796 0.27955226 2432 P41091;Q2VIR3 EIF2S3;EIF2S3L Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3;Putative eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3-like protein yes no 0 0 2 1 1 90.194 90.194 4 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388900000 540890000 413980000 273060000 545270000 433660000 715430000 259140000 413830000 545430000 591630000 39539 1478;3342 36900 354137;354138;354139;354140;354141;354142;354143;354144;354145;354146;354147;354148;354149;354150;354151 450356;450357;450358;450359;450360;450361;450362;450363;450364;450365;450366;450367;450368;450369;450370;450371;450372;450373;450374;450375;450376;450377;450378;450379;450380;450381;450382;450383;450384;450385 450359 30 SFEAPATINSASLHPEK Unmodified 1797.8897 0.88972785 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 62.548 62.548 2;3 4.4112E-17 62396 QUIQUE_C1576_190116_001 138.02 123.86 1664900000 56653000 307000000 264360000 225150000 305480000 253190000 66916000 0 32569000 0 53586000 51307000 48636000 39540 4592 36901 354152;354153;354154;354155;354156;354157;354158;354159;354160;354161;354162;354163;354164;354165;354166;354167;354168 450386;450387;450388;450389;450390;450391;450392;450393;450394;450395;450396;450397;450398;450399;450400;450401;450402 450397 16 SFEAPATINSASLHPEKEFLVAGGEDFK Unmodified 2990.4662 0.46616706 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 113.25 113.25 3;4 8.8712E-24 117215 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.063 90.414 820060000 0 0 0 0 68705000 0 42803000 165800000 144550000 0 64288000 107670000 226230000 39541 4592 36902 354169;354170;354171;354172;354173;354174;354175;354176;354177;354178 450403;450404;450405;450406;450407;450408;450409;450410;450411;450412;450413;450414 450410 12 SFEDIHHYR Unmodified 1202.5469 0.54687041 1809 P01116 KRAS GTPase KRas;GTPase KRas, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 21.95 21.95 2;3 0.001036 14974 QUIQUE_C1438_190116_001 81.594 64.569 2853600000 206680000 301100000 354380000 309780000 191600000 232860000 280280000 170990000 174290000 78388000 196400000 153970000 202910000 39542 1809 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F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 46.759 46.759 2 0.022694 45194 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.975 26.981 137650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 65017000 0 72638000 39544 1029 36905 354216;354217 450457;450458 450457 2 SFEEKVENLK Unmodified 1221.6241 0.62411768 2667 P55327;H0YC42;E5RK35 TPD52 Tumor protein D52 yes no 0 0 1 1 1 1 41.385 41.385 2 0.0011621 37033 QUIQUE_DMIX8_190116_001 132.39 90.282 324170000 0 0 0 0 0 0 0 90793000 0 0 79770000 0 153610000 39545 2667 36906 354218;354219;354220 450459;450460;450461 450461 3 SFEGLFYFLGSIVNFSQDPDVHFK Unmodified 2792.3486 0.34861811 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 174.86 174.86 3 0.030107 181936 QUIQUE_DMIX5_190116_001 24.797 15.211 31732000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31732000 0 0 39546 50 36907 354221 450462 450462 1 SFEGNVFMYYGLSNFYQNHR Unmodified 2472.0957 0.095714659 4303 Q9NV96 TMEM30A Cell cycle control protein 50A yes yes 0 0 0 1 1 1 143.34 143.34 3 0.00060316 146818 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.239 70.586 100650000 0 0 0 0 0 0 0 22872000 0 0 43067000 34709000 0 39547 4303 36908 354222;354223;354224 450463;450464;450465 450463 2 SFEMLILGR Unmodified 1064.5689 0.56885141 2011 P11166;A6NL68;A0A0D9SG74;A0A0D9SFK9 SLC2A1 Solute carrier family 2, facilitated glucose transporter member 1 yes no 0 0 0 2 1 121.83 121.83 2 0.0291 125736 QUIQUE_C1403_190116_001 74.127 47.165 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39548 2011 36909 354225;354226;354227 450466;450467;450468 450467 3 SFEMSSFVETK Unmodified 1290.5802 0.58020396 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 90.723 90.723 2 0.0023872 88063 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.655 58.03 162630000 25167000 44126000 49068000 28787000 0 0 0 0 0 15478000 0 0 0 39549 4250 36910 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protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 107.41 107.41 2 6.8692E-05 111651 QUIQUE_C1576_190116_001 89.624 83.72 69574000 0 29294000 0 0 0 0 40280000 0 0 0 0 0 0 39567 4108 36927 354351;354352 450623;450624 450624 2 SFGGGTGSGFTSLLMER Oxidation (M) 1718.7934 0.79338463 539 A6NHL2 TUBAL3 Tubulin alpha chain-like 3 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 112.55 112.55 2 4.8822E-10 116577 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.7 91.765 3449600000 515470000 345210000 345460000 338280000 235560000 377070000 316260000 0 80901000 463820000 212470000 125890000 93232000 39568 539 36928 354353;354354;354355;354356;354357;354358;354359;354360;354361;354362;354363;354364;354365;354366 450625;450626;450627;450628;450629;450630;450631;450632;450633;450634;450635;450636;450637;450638;450639;450640;450641;450642;450643;450644;450645;450646;450647;450648;450649;450650;450651 450638 364 26 SFGGGTGSGFTSLLMER Unmodified 1702.7985 0.79847001 539 A6NHL2 TUBAL3 Tubulin alpha chain-like 3 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.65 123.65 2 7.8285E-17 127541 QUIQUE_C1277_190116_001 170.18 154.61 34233000000 4089200000 3949200000 4884400000 4691000000 2807900000 3743700000 4296100000 376400000 0 1630000000 1534300000 972800000 1258100000 39569 539 36928 354367;354368;354369;354370;354371;354372;354373;354374;354375;354376;354377;354378;354379 450652;450653;450654;450655;450656;450657;450658;450659;450660;450661;450662;450663;450664;450665;450666;450667 450655 16 SFGQTPSQLLIEPHPPR Unmodified 1902.9952 0.99519598 910 E9PEM5;P50851;H0YAC6;A0A3B3IS13;A0A3B3ISK3 LRBA Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein yes no 0 0 0 1 1 83.148 83.148 3 0.00163 84946 QUIQUE_DMIX8_190116_001 40.52 23.64 36699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36699000 39570 910 36929 354380;354381 450668;450669;450670 450670 3 SFGSAQEFAWAHDSSEYAIR Unmodified 2258.0029 0.0028601316 2380 P35606;H0Y938 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.37 106.37 3 3.5793E-06 108577 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.676 70.967 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2687.3492 0.34915215 2114 P16930 FAH Fumarylacetoacetase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 170.21 170.21 2;3 2.7588E-08 177359 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.22 103 973620000 0 52093000 73668000 79216000 55575000 42106000 0 243230000 49301000 0 256780000 121660000 0 39573 2114 36932 354409;354410;354411;354412;354413;354414;354415;354416;354417;354418;354419 450706;450707;450708;450709;450710;450711;450712;450713;450714;450715;450716 450714 11 SFGWETLDSFMQHDVQELCR Unmodified 2484.0838 0.083829344 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.27 156.27 3 9.5135E-38 160932 QUIQUE_DMIX3_190116_001 150.29 141.02 271630000 22704000 32198000 25978000 22753000 0 0 31522000 23179000 29136000 0 34688000 24689000 24784000 39574 3778 36933 354420;354421;354422;354423;354424;354425;354426;354427;354428;354429 450717;450718;450719;450720;450721;450722;450723;450724;450725;450726;450727 450724 11 SFHFQSFR Unmodified 1054.4985 0.49846366 2103 P16157;H0YBS0;A0A2R8Y4B0 ANK1 Ankyrin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.291 50.291 3 0.0010564 47528 QUIQUE_C1368_190116_001 110.03 48.063 225750000 34061000 26958000 27953000 23927000 22205000 17326000 0 11751000 0 0 36512000 25058000 0 39575 2103 36934 354430;354431;354432;354433;354434;354435;354436;354437;354438;354439 450728;450729;450730;450731;450732;450733;450734;450735;450736;450737 450730 10 SFHIGCYK Unmodified 1010.4644 0.46438634 3149 Q15654 TRIP6 Thyroid receptor-interacting protein 6 yes yes 0 0 0 1 30.767 30.767 2 0.039603 25898 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.788 45.349 20281000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20281000 0 0 39576 3149 36935 354440 450738 450738 1 SFHILAIATK Unmodified 1099.639 0.63897988 1331 K7ELV2;Q96EE3 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.821 65.821 3 0.00010363 65604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.813 83.14 80583000 18455000 17115000 0 0 0 9983500 0 21844000 0 0 0 13186000 0 39577 1331 36936 354441;354442;354443;354444;354445;354446;354447;354448;354449;354450 450739;450740;450741;450742;450743;450744;450745;450746;450747;450748 450745 10 SFHNELLTQLEQK Unmodified 1585.81 0.81002097 4531 Q9UQB8;I3L4C2;I3L2M4;I3L1C8;I3L327;I3L125;I3L526;I3L0M4;I3L3J7;I3L113;I3L2J6 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.958 81.958 3 0.00014537 85025 QUIQUE_C1218_190116_001 90.412 76.169 1772200000 252500000 280060000 268050000 248870000 279240000 220910000 222580000 0 0 0 0 0 0 39578 4531 36937 354451;354452;354453;354454;354455;354456;354457 450749;450750;450751;450752;450753;450754;450755 450749 6 SFIFMSEDALTNPQK Unmodified 1726.8236 0.82362212 898 E9PBM2;Q8WUF8 FAM172A Protein FAM172A yes no 0 0 0 1 122.66 122.66 2 0.039963 127138 QUIQUE_C1218_190116_001 48.513 35.393 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39579 898 36938 354458 450756 450756 1 SFIIVHPSWFIR Unmodified 1500.8242 0.82415489 3703 Q8WUY3;Q5JUB9;Q5JUB8;E9PDC2;A0A088AWP5;H7BZH9 PRUNE2 Protein prune homolog 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 121.95 121.95 2;3 0.00015155 125869 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.018 88.856 418930000 22930000 30778000 27178000 18445000 25690000 30922000 36676000 31165000 59376000 6753900 60279000 40664000 28069000 39580 3703 36939 354459;354460;354461;354462;354463;354464;354465;354466;354467;354468;354469;354470;354471;354472;354473;354474;354475 450757;450758;450759;450760;450761;450762;450763;450764;450765;450766;450767;450768;450769;450770;450771;450772;450773;450774;450775;450776 450768 20 SFIKDYPVVSIEDPFDQDDWGAWQK Unmodified 2984.3869 0.38685411 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 1 2 1 4 2 155.16 155.16 2;3;4 6.3095E-90 162505 QUIQUE_DMIX5_190116_001 214.54 203.68 4395000000 0 0 0 0 0 0 0 2013500000 480710000 0 1220600000 680120000 0 39581 1906 36940 354476;354477;354478;354479;354480;354481;354482;354483;354484 450777;450778;450779;450780;450781;450782;450783;450784;450785;450786 450784 8 SFILEEHMDK Unmodified 1247.5856 0.58562368 3373 Q6NVY1;B9A058;F8W8A6;H7C1A5 HIBCH 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 1 54.838 54.838 2;3 0.002821 53277 QUIQUE_C1368_190116_001 61.353 43.917 620500000 88023000 88512000 93904000 52878000 36279000 26612000 35886000 0 60419000 15449000 75492000 22799000 24249000 39582 3373 36941 354485;354486;354487;354488;354489;354490;354491;354492;354493;354494;354495;354496;354497;354498;354499;354500;354501;354502 450787;450788;450789;450790;450791;450792;450793;450794;450795;450796;450797;450798;450799;450800;450801;450802;450803;450804;450805;450806;450807;450808;450809 450795 22 SFIPVAEDSDFPIHNLPYGVFSTR Acetyl (Protein N-term) 2749.3388 0.3387817 2114 P16930;H0YLC7 FAH Fumarylacetoacetase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 167.12 167.12 2;3 3.5429E-19 171735 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.79 99.812 1962700000 90133000 152250000 171630000 223010000 38468000 0 103590000 322980000 268630000 77868000 169320000 155950000 188900000 39583 2114 36942 354503;354504;354505;354506;354507;354508;354509;354510;354511;354512;354513;354514;354515;354516 450810;450811;450812;450813;450814;450815;450816;450817;450818;450819;450820;450821;450822;450823;450824;450825;450826 450819 15 SFIPVER Unmodified 846.45995 0.45995289 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 0 1 50.763 50.763 2 0.033008 45762 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.734 0 85697000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85697000 0 0 0 39584 98;3487 36943 354517 450827 450827 1 SFITTDVNPYYDSFVR Unmodified 1922.905 0.90504357 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 133.38 133.38 2 4.2337E-44 138586 QUIQUE_C1368_190116_001 178.32 154.47 389060000 0 0 62748000 0 49266000 0 0 0 49734000 27822000 75379000 68489000 55619000 39585 4389 36944 354518;354519;354520;354521;354522;354523;354524 450828;450829;450830;450831;450832;450833;450834;450835 450828 8 SFITWLR Unmodified 921.50724 0.50723743 1734 O95487 SEC24B Protein transport protein Sec24B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 110.43 110.43 2 0.02784 115502 QUIQUE_C1218_190116_001 92.692 62.024 145220000 20483000 0 0 0 0 0 18655000 21122000 16911000 0 27549000 22665000 17835000 39586 1734 36945 354525;354526;354527;354528;354529;354530;354531 450836;450837;450838;450839;450840;450841;450842;450843 450836 8 SFKPDFGAESIYGGFLLGVR Unmodified 2159.1051 0.10514036 2380 P35606;H0Y938 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 1 1 1 1 146.59 146.59 3 0.00066875 148915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.878 34.9 1034600000 362460000 0 0 0 0 0 0 320180000 352020000 0 0 0 0 39587 2380 36946 354532;354533;354534 450844;450845;450846 450845 3 SFKPDFILVR Unmodified 1220.6917 0.69174374 1471 O14994 SYN3 Synapsin-3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.285 86.285 3 0.0035909 88097 QUIQUE_C1403_190116_001 69.01 53.121 772050000 0 0 125510000 91768000 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0.70818166 4605 Q9Y4E8 USP15 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15 yes yes 0 0 0 1 1 144.51 144.51 2 0.00050211 149712 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.98 75.411 51318000 0 0 0 0 0 0 0 0 28436000 0 0 22882000 0 39590 4605 36949 354559;354560 450879;450880 450879 2 SFLAMVVDIVQELK Oxidation (M) 1606.864 0.86403038 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 1 0 3 2 1 2 2 3 2 3 3 3 1 1 1 171.08 171.08 2;3 6.8363E-15 175415 QUIQUE_C1218_190116_001 146.79 135.47 3761800000 302300000 617190000 285160000 95093000 282400000 842290000 868030000 104810000 166470000 113980000 16833000 55248000 11956000 39591 1423 36950 354561;354562;354563;354564;354565;354566;354567;354568;354569;354570;354571;354572;354573;354574;354575;354576;354577;354578;354579;354580;354581;354582;354583;354584;354585;354586;354587 450881;450882;450883;450884;450885;450886;450887;450888;450889;450890;450891;450892;450893;450894;450895;450896;450897;450898;450899;450900;450901;450902;450903;450904;450905;450906;450907 450881 794 25 SFLAMVVDIVQELK Unmodified 1590.8691 0.86911575 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 176.55 176.55 2;3 4.7976E-17 180833 QUIQUE_C1368_190116_001 155.08 135.81 671190000 46377000 16604000 6539100 0 22381000 8050900 0 25779000 217100000 4480000 212430000 51295000 60150000 39592 1423 36950 354588;354589;354590;354591;354592;354593;354594;354595;354596;354597;354598;354599;354600;354601;354602;354603;354604;354605 450908;450909;450910;450911;450912;450913;450914;450915;450916;450917;450918;450919;450920;450921;450922;450923;450924;450925 450912 16 SFLDDPIWR Unmodified 1147.5662 0.56620887 3442 Q7L576;H0YL50 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.61 126.61 2 0.0074526 132613 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.548 55.811 596870000 0 0 62486000 60013000 48473000 0 0 72494000 86325000 36333000 77513000 76659000 76570000 39593 3442 36951 354606;354607;354608;354609;354610;354611;354612;354613;354614 450926;450927;450928;450929;450930;450931;450932;450933;450934;450935 450932 10 SFLDSGYR Unmodified 943.43995 0.43994572 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.879 59.879 2 0.00068617 58508 QUIQUE_C1368_190116_001 151.17 110.25 1485400000 128040000 157460000 158220000 149500000 190630000 121580000 159280000 0 157810000 0 0 113300000 149590000 39594 2135 36952 354615;354616;354617;354618;354619;354620;354621;354622;354623;354624;354625;354626 450936;450937;450938;450939;450940;450941;450942;450943;450944;450945;450946;450947 450938 10 SFLEDIR Unmodified 878.44978 0.44978213 2602 P52209;K7ELN9 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 76.835 76.835 2 0.060325 72902 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.383 22.617 44983000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44983000 0 0 0 39595 2602 36953 354627 450948 450948 1 SFLEDIRK Unmodified 1006.5447 0.54474515 2602 P52209;K7ELN9 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 51.174 51.174 2 0.016444 47410 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.37 25.118 3615400000 599630000 492820000 0 568480000 493780000 0 493060000 848470000 0 119130000 0 0 0 39596 2602 36954 354628;354629;354630;354631;354632;354633;354634 450949;450950;450951;450952;450953;450954;450955 450955 5 SFLEEVLASGLHSR Unmodified 1543.7995 0.79945628 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 3 2 2 1 2 131.02 131.02 2;3 1.9227E-07 135046 QUIQUE_C1403_190116_001 111.52 74.18 1088700000 117710000 90556000 77455000 81825000 74286000 90134000 76791000 112920000 64683000 33052000 103330000 82471000 83504000 39597 4276 36955 354635;354636;354637;354638;354639;354640;354641;354642;354643;354644;354645;354646;354647;354648;354649;354650;354651;354652;354653;354654;354655;354656;354657 450956;450957;450958;450959;450960;450961;450962;450963;450964;450965;450966;450967;450968;450969;450970;450971;450972;450973;450974;450975;450976;450977;450978;450979;450980;450981;450982 450963 25 SFLEFAEDVIQVPR Unmodified 1648.8461 0.84607213 561 R9WNI0;A8MQB8;G3V0J0;Q06787;Q8IXW7;A0A087WXI3;A0A087WWR6 FMR1 Fragile X mental retardation protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 160.17 160.17 3 6.8338E-05 164175 QUIQUE_C1277_190116_001 72.681 58.598 48156000 8485300 10384000 0 0 11249000 5384600 0 0 0 0 0 12653000 0 39598 561 36956 354658;354659;354660;354661;354662;354663;354664 450983;450984;450985;450986;450987;450988;450989 450984 5 SFLESIDDALAEK Unmodified 1436.7035 0.70349021 3155 Q15750 TAB1 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.4 138.4 2 0.00038431 141388 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.767 71.869 292030000 46916000 49386000 47025000 0 0 0 0 34169000 0 17765000 44586000 0 52181000 39599 3155 36957 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1 1 1 1 1 1 1 135.83 135.83 2 0.012978 138863 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.407 52.905 27082000 0 0 0 0 0 7305500 0 8895700 0 0 0 0 10880000 39602 3448 36960 354682;354683;354684;354685;354686;354687;354688 451011;451012;451013;451014;451015;451016;451017 451014 7 SFLFQLLK Unmodified 994.58515 0.5851534 2844 Q00535 CDK5 Cyclin-dependent-like kinase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.79 132.79 2 0.016146 135925 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.614 8.3036 1418200000 123510000 152410000 105590000 119830000 118860000 109750000 113080000 87287000 93743000 0 146770000 127790000 119570000 39603 2844 36961 354689;354690;354691;354692;354693;354694;354695;354696;354697;354698;354699;354700 451018;451019;451020;451021;451022;451023;451024;451025;451026;451027;451028;451029;451030;451031;451032;451033 451028 16 SFLINFIHTLENQR Unmodified 1730.9104 0.91040372 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 149.66 149.66 3 4.9669E-11 156103 QUIQUE_C1576_190116_001 134.21 106.56 198950000 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451044;451045;451046;451047;451048;451049;451050;451051;451052;451053;451054;451055;451056;451057;451058;451059;451060;451061;451062;451063;451064;451065;451066;451067;451068;451069;451070;451071;451072;451073;451074;451075;451076;451077;451078;451079;451080;451081;451082;451083;451084;451085;451086;451087;451088;451089;451090;451091;451092;451093;451094;451095;451096;451097;451098;451099;451100;451101;451102;451103;451104;451105;451106;451107;451108;451109 451096 65 SFLLDLLNATGK Unmodified 1290.7184 0.71835242 266 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A2R8YDH3;A0A0J9YVQ7 DDX3X ATP-dependent RNA helicase DDX3X yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.43 154.43 2 4.3129E-17 157446 QUIQUE_DMIX1_190116_001 212.21 145.95 2874500000 219400000 379320000 194590000 217810000 246170000 161380000 287040000 109100000 270250000 102750000 196440000 164700000 325570000 39606 266 36964 354740;354741;354742;354743;354744;354745;354746;354747;354748;354749;354750;354751;354752;354753 451110;451111;451112;451113;451114;451115;451116;451117;451118;451119;451120;451121;451122;451123;451124;451125;451126;451127 451119 17 SFLPLIR Unmodified 844.51707 0.51707383 2872 Q02338;E9PCG9;C9K0G7;H7C2W1;C9JM78;C9JQ90;A0A0G2JRX6 BDH1 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.595 98.595 2 0.017528 101710 QUIQUE_C1277_190116_001 132.8 58.207 1176100000 106300000 99290000 89189000 77428000 94258000 92439000 97476000 66546000 107370000 38097000 0 177620000 130090000 39607 2872 36965 354754;354755;354756;354757;354758;354759;354760;354761;354762;354763;354764;354765 451128;451129;451130;451131;451132;451133;451134;451135;451136;451137;451138;451139;451140;451141;451142;451143;451144;451145;451146;451147;451148;451149;451150 451130 23 SFLSQGQVLK Unmodified 1105.6132 0.61315906 2499 P48047;H7C068 ATP5O ATP synthase subunit O, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.776 64.776 2 1.0259E-07 64312 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.1 102.42 6076200000 677990000 526730000 553780000 381830000 394810000 381210000 471840000 584890000 370960000 203370000 608080000 447180000 473520000 39608 2499 36966 354766;354767;354768;354769;354770;354771;354772;354773;354774;354775;354776;354777;354778 451151;451152;451153;451154;451155;451156;451157;451158;451159;451160;451161;451162;451163;451164;451165;451166;451167;451168;451169;451170;451171;451172 451162 21 SFLVTVIHTLEK Unmodified 1385.7919 0.79185171 1576 O60486;B4DHQ7;F8W1K6 PLXNC1 Plexin-C1 yes no 0 0 0 1 1 1 122.25 122.25 2;3 0.005995 126943 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.252 44.523 12244000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12244000 0 0 39609 1576 36967 354779;354780;354781 451173;451174;451175 451175 3 SFLYEIVSNK Unmodified 1198.6234 0.6233894 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 99.943 99.943 2 0.0098298 102770 QUIQUE_C1368_190116_001 82.645 56.54 281650000 0 36076000 87086000 45916000 0 83229000 29339000 0 0 0 0 0 0 39610 4598 36968 354782;354783;354784;354785;354786 451176;451177;451178;451179;451180;451181;451182;451183;451184;451185 451179 10 SFLYEIVSNKR Unmodified 1354.7245 0.72450043 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 1 1 2 2 76.433 76.433 2;3 0.0015417 77538 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.57 49.339 438010000 0 26717000 88490000 0 0 39725000 0 68088000 43468000 24087000 60881000 50858000 35697000 39611 4598 36969 354787;354788;354789;354790;354791;354792;354793;354794;354795;354796;354797;354798;354799;354800;354801 451186;451187;451188;451189;451190;451191;451192;451193;451194;451195;451196;451197;451198;451199;451200;451201;451202 451197 15 SFMALSQDIQK Unmodified 1266.6278 0.62782285 3067 Q14444;E9PLA9;G3V153 CAPRIN1 Caprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 80.586 80.586 2 0.00049395 81379 QUIQUE_C1403_190116_001 131.5 104.39 642870000 76785000 95832000 80918000 79424000 89013000 0 76845000 0 55405000 22776000 0 0 65873000 39612 3067 36970 354802;354803;354804;354805;354806;354807;354808;354809;354810;354811 451203;451204;451205;451206;451207;451208;451209;451210;451211;451212;451213 451207 11 SFMESGGTVLSTNWSDVGKR Unmodified 2157.0161 0.016067355 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 1 1 105.59 105.59 3 9.6634E-07 107513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.975 76.997 33920000 0 0 0 0 0 0 0 33920000 0 0 0 0 0 39613 4572 36971 354812 451214 451214 0 SFMHVNTNANFYK Unmodified 1571.7191 0.71909747 2580 P51452;K7ES89 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 64.344 64.344 2;3 0.00011916 63490 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.565 73.841 454570000 62659000 99791000 55805000 45228000 0 0 0 116840000 54315000 19931000 0 0 0 39614 2580 36972 354813;354814;354815;354816;354817;354818;354819;354820;354821;354822;354823 451215;451216;451217;451218;451219;451220;451221;451222;451223;451224;451225;451226;451227 451223 11 SFMNNWEVYK Oxidation (M) 1332.5809 0.58087266 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 77.4 77.4 2 0.0017265 77753 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.431 77.248 581150000 35977000 41591000 0 0 0 41630000 0 50686000 87884000 83180000 87015000 73061000 80130000 39615 452 36973 354824;354825;354826;354827;354828;354829;354830;354831;354832;354833 451228;451229;451230;451231;451232;451233;451234;451235;451236;451237;451238 451235 333 11 SFMNNWEVYK Unmodified 1316.586 0.58595803 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.34 101.34 2 0.0011057 104338 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.64 70.271 2208200000 0 229520000 243940000 187610000 171390000 199860000 238850000 188220000 174680000 0 347140000 0 226960000 39616 452 36973 354834;354835;354836;354837;354838;354839;354840;354841;354842;354843 451239;451240;451241;451242;451243;451244;451245;451246;451247;451248 451248 9 SFMQVLCEK Unmodified 1140.5308 0.53075134 3286 Q5QJ74;E9PNS0;E9PJJ0;B3KNB6;G3V147 TBCEL Tubulin-specific chaperone cofactor E-like protein yes no 0 0 0 1 84 84 2 0.029001 84533 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.729 37.947 12550000 0 0 0 0 0 0 0 12550000 0 0 0 0 0 39617 3286 36974 354844 451249 451249 1 SFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPHQCNVFVYSSSK Unmodified 4351.0929 0.092944052 3349 Q66LE6 PPP2R2D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B delta isoform yes yes 0 0 1 1 156.08 156.08 5 8.7034E-05 160684 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.863 40.087 58512000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58512000 0 39618 3349 36975 354845 451250 451250 1 SFNIVDIKPANMEELTEVITAAEFHPNSCNTFVYSSSK Unmodified 4289.0297 0.029675094 2781 P63151 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 161.92 161.92 4 5.1306E-64 167320 QUIQUE_C1368_190116_001 115.4 107.08 643380000 0 196620000 152170000 0 59746000 0 0 0 0 0 0 108680000 126170000 39619 2781 36976 354846;354847;354848;354849;354850 451251;451252;451253;451254;451255;451256 451252 6 SFNLIIAK Unmodified 904.5382 0.53820321 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.229 78.229 2 0.0065537 79229 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.33 63.769 574270000 51702000 35420000 0 53329000 46079000 40928000 54730000 38655000 52416000 26203000 65923000 60456000 48431000 39620 2223 36977 354851;354852;354853;354854;354855;354856;354857;354858;354859;354860;354861;354862 451257;451258;451259;451260;451261;451262;451263;451264;451265;451266;451267;451268;451269;451270;451271;451272;451273 451266 17 SFNLSALEK Unmodified 1007.5288 0.52876073 727 C9JIF9;P13798;H7C393;H7C1U0;C9JLK2 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.584 79.584 2 0.004515 80237 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.819 26.104 1234800000 0 91128000 102840000 91114000 102230000 98992000 112810000 114100000 97957000 71066000 133090000 93008000 126470000 39621 727 36978 354863;354864;354865;354866;354867;354868;354869;354870;354871;354872;354873;354874 451274;451275;451276;451277;451278;451279;451280;451281;451282;451283;451284;451285;451286;451287;451288 451285 15 SFPAAIEHTIQWAR Unmodified 1625.8314 0.83142511 514 A0AVT1;H0Y8S8 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 104.12 104.12 2;3 3.2442E-10 107258 QUIQUE_C1368_190116_001 134.13 106.8 475130000 44235000 31400000 44890000 42518000 50684000 27555000 61093000 0 0 0 172760000 0 0 39622 514 36979 354875;354876;354877;354878;354879;354880;354881;354882;354883;354884;354885;354886;354887 451289;451290;451291;451292;451293;451294;451295;451296;451297;451298;451299;451300;451301 451291 13 SFPDTVYK Unmodified 955.4651 0.46509784 3984 Q9BPU6 DPYSL5 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451332;451333;451334;451335;451336;451337;451338;451339;451340;451341;451342;451343;451344;451345;451346;451347;451348;451349;451350;451351;451352;451353;451354;451355;451356 451336 25 SFPNLAFIR Unmodified 1063.5815 0.581465 2598 P51888 PRELP Prolargin yes yes 0 0 0 2 3 2 2 3 2 1 2 1 1 2 2 3 112.68 112.68 2 0.0029423 116112 QUIQUE_C1403_190116_001 105.12 77.01 287740000 0 0 26947000 77591000 0 0 90143000 0 0 29787000 0 31304000 31967000 39628 2598 36985 354929;354930;354931;354932;354933;354934;354935;354936;354937;354938;354939;354940;354941;354942;354943;354944;354945;354946;354947;354948;354949;354950;354951;354952;354953;354954 451357;451358;451359;451360;451361;451362;451363;451364;451365;451366;451367;451368;451369;451370;451371;451372;451373;451374;451375;451376;451377;451378;451379;451380;451381;451382;451383;451384;451385;451386;451387 451365 30 SFPPDAILFYIPQIVQALR Unmodified 2187.2092 0.2092115 2448 P42356 PI4KA Phosphatidylinositol 4-kinase alpha yes yes 0 0 0 1 1 175.95 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2 SFSEFGK Unmodified 800.37047 0.37046918 1525 O43390;B4DT28 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 1 1 34.523 34.523 2 0.035447 29896 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.866 61.308 335680000 0 0 0 0 0 0 97716000 0 82978000 46481000 108500000 0 0 39642 1525 36999 355049;355050;355051;355052 451530;451531;451532;451533 451531 4 SFSERFPEDGPELEEILTQLATADAR Unmodified 2920.409 0.40904611 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 163.54 163.54 3 2.8018E-09 168202 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.02 73.725 217390000 0 0 0 0 0 0 0 51926000 40251000 0 75453000 0 49763000 39643 4330 37000 355053;355054;355055;355056 451534;451535;451536;451537 451537 2 SFSFDYSYWSHTSPEDINYASQK Unmodified 2758.1823 0.18234064 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;F8W8V9;H7C0K6;A0A3B3ITW4 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 129.19 129.19 3 0.00036573 133087 QUIQUE_DMIX7_190116_001 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451640;451641;451642;451643;451644;451645;451646;451647;451648;451649;451650;451651;451652;451653;451654;451655;451656;451657;451658;451659;451660;451661;451662;451663;451664;451665;451666;451667;451668;451669;451670;451671;451672;451673;451674;451675;451676;451677;451678;451679;451680;451681;451682;451683;451684;451685;451686;451687;451688;451689 451644 43 SFVQGLGVASDVVR Unmodified 1432.7674 0.76742787 2366 P35052;H7C410;H7C024 GPC1 Glypican-1;Secreted glypican-1 yes no 0 0 0 1 101.33 101.33 2 0.065677 98127 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.172 42.912 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39666 2366 37023 355172 451690 451690 1 SFVQWLGCR Unmodified 1151.5546 0.55459833 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 104.4 104.4 2 0.0060589 107777 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.265 63.965 384140000 57631000 0 30731000 0 0 44995000 54764000 0 41367000 0 67165000 39598000 47889000 39667 1579 37024 355173;355174;355175;355176;355177;355178;355179;355180 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451724;451725;451726;451727;451728;451729;451730;451731;451732;451733;451734;451735;451736 451725 11 SFYPEEVSSMVLTK Oxidation (M) 1631.7753 0.77527495 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 1 0 2 2 3 3 1 3 2 2 4 4 2 4 2 97.758 97.758 2;3 8.3198E-05 95949 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.992 68.132 5077400000 150010000 214440000 435950000 393850000 163320000 197080000 279250000 221060000 642740000 303730000 637450000 840280000 598290000 39672 2010 37029 355207;355208;355209;355210;355211;355212;355213;355214;355215;355216;355217;355218;355219;355220;355221;355222;355223;355224;355225;355226;355227;355228;355229;355230;355231;355232;355233;355234;355235;355236;355237;355238;355239;355240 451737;451738;451739;451740;451741;451742;451743;451744;451745;451746;451747;451748;451749;451750;451751;451752;451753;451754;451755;451756;451757;451758;451759;451760;451761;451762;451763;451764;451765;451766;451767;451768;451769;451770;451771;451772;451773;451774;451775;451776;451777 451765 1312 40 SFYPEEVSSMVLTK Unmodified 1615.7804 0.78036033 2010 P11142;E9PKE3;E9PN89;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25;E9PI65 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 118.96 118.96 2;3 8.0359E-05 123387 QUIQUE_C1368_190116_001 98.439 87.177 25743000000 2140700000 2299600000 2013900000 2162700000 1961400000 1733300000 2178900000 1392000000 1898600000 946180000 2689100000 2056000000 2270300000 39673 2010 37029 355241;355242;355243;355244;355245;355246;355247;355248;355249;355250;355251;355252;355253;355254;355255;355256;355257;355258;355259;355260;355261;355262;355263;355264;355265;355266 451778;451779;451780;451781;451782;451783;451784;451785;451786;451787;451788;451789;451790;451791;451792;451793;451794;451795;451796;451797;451798;451799;451800;451801;451802;451803;451804;451805;451806;451807;451808;451809;451810;451811;451812;451813;451814 451786 37 SFYQFQHYR Unmodified 1274.5833 0.58325592 2446 P42285 SKIV2L2 Superkiller viralicidic activity 2-like 2 yes yes 0 0 0 1 1 50.289 50.289 3 0.0085634 48748 QUIQUE_C1576_190116_001 46.39 26.086 36293000 0 0 18832000 0 0 0 17462000 0 0 0 0 0 0 39674 2446 37030 355267;355268 451815;451816 451816 2 SGAAYIGGICSLLK Unmodified 1408.7384 0.73843593 4367 Q9P0K1;F8WAD8 ADAM22 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22 yes no 0 0 0 1 1 1 1 116.01 116.01 2 0.014483 119710 QUIQUE_C1403_190116_001 57.802 42.172 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39675 4367 37031 355269;355270;355271;355272 451817;451818;451819;451820 451818 4 SGAEAQTPEDSPNR Unmodified 1457.6383 0.63826419 1530 O43493 TGOLN2 Trans-Golgi network integral membrane protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.456 15.456 2 0.00011865 7741 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.64 106.86 40618000 0 20565000 0 0 0 0 0 0 0 0 20053000 0 0 39676 1530 37032 355273;355274;355275;355276 451821;451822;451823;451824 451823 4 SGAFGHLFR Unmodified 990.50355 0.50354903 3006 Q13509;A0A0B4J269;G3V2A3;G3V5W4;G3V2R8;G3V3R4;G3V2N6;G3V542 TUBB3 Tubulin beta-3 chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 49.601 49.601 2 0.0023457 48353 QUIQUE_C1218_190116_001 94.302 57.907 698550000 214120000 110010000 113200000 105120000 0 109370000 0 0 0 46737000 0 0 0 39677 3006 37033 355277;355278;355279;355280;355281;355282 451825;451826;451827;451828;451829;451830 451825 6 SGAFGHLFRPDNFIFGQSGAGNNWAK Unmodified 2794.3364 0.33643071 3006 Q13509;A0A0B4J269;G3V2A3;G3V542 TUBB3 Tubulin beta-3 chain yes no 0 0 1 3 3 3 3 3 3 6 3 3 3 3 3 4 126.32 126.32 2;3;4 0 130000 QUIQUE_DMIX1_190116_001 348.39 317.85 105120000000 4306200000 8611200000 6652800000 6025800000 5979900000 4845500000 8050200000 8525000000 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451831;451832;451833;451834;451835;451836;451837;451838;451839;451840;451841;451842;451843;451844;451845;451846;451847;451848;451849;451850;451851;451852;451853;451854;451855;451856;451857;451858;451859;451860;451861;451862;451863;451864;451865;451866;451867;451868;451869;451870;451871;451872;451873;451874;451875;451876;451877;451878;451879;451880;451881;451882;451883;451884;451885;451886;451887;451888;451889;451890;451891;451892;451893;451894;451895;451896;451897;451898;451899;451900;451901;451902;451903;451904;451905;451906;451907;451908;451909;451910;451911;451912;451913;451914;451915;451916;451917;451918;451919;451920;451921;451922;451923;451924;451925;451926;451927;451928;451929;451930;451931;451932;451933;451934;451935;451936;451937;451938;451939;451940;451941;451942;451943;451944;451945;451946;451947;451948;451949;451950;451951;451952;451953 451899 120 SGAGTEDSACIPWAYYSTVDQVK Unmodified 2504.1166 0.11656926 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 0 2 127.73 127.73 2;3 6.1516E-23 133891 QUIQUE_C1438_190116_001 123.76 116.17 112710000 0 0 0 0 112710000 0 0 0 0 0 0 0 0 39679 1784 37035 355326;355327 451954;451955 451954 2 SGAGTELSVR Unmodified 975.49852 0.49852324 2803 P78324;Q5TFQ8;H3BRP9;H3BV43;H3BML4;H9KV29;O00241;H3BUA5;H3BTT9 SIRPA;SIRPB1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1;Signal-regulatory protein beta-1 isoform 3;Signal-regulatory protein beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.003 23.003 2 0.0002663 16159 QUIQUE_C1403_190116_001 134.66 71.778 2796500000 0 575320000 731870000 518760000 0 368240000 0 0 381140000 221150000 0 0 0 39680 2803 37036 355328;355329;355330;355331;355332;355333;355334 451956;451957;451958;451959;451960;451961;451962;451963 451959 7 SGAGVPAVILR Unmodified 1038.6186 0.61857879 3731 Q92542;H0Y6T7;H0Y3Z4;Q5T205 NCSTN Nicastrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 63.714 63.714 2 0.0058532 62864 QUIQUE_C1403_190116_001 67.897 56.257 297590000 0 0 48745000 54477000 0 0 0 56410000 66255000 0 0 71705000 0 39681 3731 37037 355335;355336;355337;355338;355339 451964;451965;451966;451967;451968 451965 4 SGALDVLQMK Acetyl (Protein N-term) 1102.5692 0.56924534 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.44 128.44 2 7.4931E-05 131108 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.87 93.738 887750000 145470000 124860000 136380000 128470000 0 116790000 82255000 25716000 35791000 54505000 0 37511000 0 39682 225 37038 355340;355341;355342;355343;355344;355345;355346;355347;355348;355349;355350 451969;451970;451971;451972;451973;451974;451975;451976;451977;451978;451979;451980;451981 451977 13 SGALDVLQMK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1118.5642 0.56415996 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 1 1 0 1 1 1 104 104 2 0.0057442 106811 QUIQUE_C1403_190116_001 62.969 36.527 73997000 0 0 0 26408000 0 25513000 22076000 0 0 0 0 0 0 39683 225 37038 355351;355352;355353 451982;451983;451984 451982 139 3 SGALDVLQMKEEDVLK Acetyl (Protein N-term) 1815.9288 0.92881548 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 133.56 133.56 2;3 5.1525E-36 139436 QUIQUE_C1576_190116_001 207.66 154.97 3712700000 91250000 212970000 218550000 187390000 297380000 168770000 267330000 408100000 473600000 46000000 500460000 450270000 390620000 39684 225 37039 355354;355355;355356;355357;355358;355359;355360;355361;355362;355363;355364;355365;355366;355367;355368 451985;451986;451987;451988;451989;451990;451991;451992;451993;451994;451995;451996;451997;451998;451999;452000;452001;452002;452003 451994 19 SGALDVLQMKEEDVLK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1831.9237 0.9237301 225 C9J9K3;A0A0C4DG17;P08865;F8WD59 RPSA 40S ribosomal protein SA yes no 1 1 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 128.29 128.29 2 2.1963E-07 132986 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.69 82.751 710070000 0 91452000 57647000 0 101030000 67326000 48165000 50979000 48553000 26984000 95107000 49313000 73516000 39685 225 37039 355369;355370;355371;355372;355373;355374;355375;355376;355377;355378;355379;355380;355381;355382;355383;355384 452004;452005;452006;452007;452008;452009;452010;452011;452012;452013;452014;452015;452016;452017;452018;452019;452020 452014 139 15 SGALLACGIVNSGVR Unmodified 1472.7769 0.7769467 2976 Q13200 PSMD2 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.74 81.74 2 7.2669E-07 82605 QUIQUE_C1403_190116_001 118.9 101.47 1112500000 91028000 103330000 86966000 85039000 99660000 89401000 96676000 95769000 86652000 54366000 113820000 0 109760000 39686 2976 37040 355385;355386;355387;355388;355389;355390;355391;355392;355393;355394;355395;355396 452021;452022;452023;452024;452025;452026;452027;452028;452029;452030;452031;452032;452033;452034;452035;452036;452037;452038;452039 452028 19 SGAPSVLPH Unmodified 863.45012 0.45011648 4533 Q9UQM7 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 35.304 35.304 2 0.005702 31469 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.086 70.454 2496300000 0 0 306890000 352480000 375340000 0 392710000 0 0 0 385480000 367300000 316140000 39687 4533 37041 355397;355398;355399;355400;355401;355402;355403;355404;355405;355406;355407;355408;355409;355410 452040;452041;452042;452043;452044;452045;452046;452047;452048;452049;452050;452051;452052;452053;452054;452055;452056;452057;452058;452059;452060;452061 452056 22 SGAQASSTPLSPTR Unmodified 1358.679 0.6790068 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.653 23.653 2 3.4639E-10 18248 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.95 114.11 5813000000 471070000 478930000 553870000 626300000 624980000 429320000 387360000 377800000 396470000 250120000 490120000 274550000 452140000 39688 1819;3223 37042 355411;355412;355413;355414;355415;355416;355417;355418;355419;355420;355421;355422;355423 452062;452063;452064;452065;452066;452067;452068;452069;452070;452071;452072;452073;452074;452075;452076 452070 15 SGAQATWTELPWPHEK Unmodified 1836.8795 0.87949752 1839 P02790 HPX Hemopexin yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 3 1 2 96.973 96.973 2;3 0.00029203 99949 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.395 38.351 710040000 72518000 47429000 0 0 178800000 38813000 0 0 36165000 41106000 106470000 35957000 152790000 39689 1839 37043 355424;355425;355426;355427;355428;355429;355430;355431;355432;355433;355434;355435;355436 452077;452078;452079;452080;452081;452082;452083;452084;452085;452086;452087;452088;452089;452090 452085 12 SGASVVAIR Unmodified 858.49232 0.49231565 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;B0QZK4;Q5SWC8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 26.391 26.391 2 0.035708 20388 QUIQUE_C1576_190116_001 69.825 36.012 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39690 3297 37044 355437 452091 452091 1 SGAVEETFR Unmodified 994.47197 0.47197413 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.661 28.661 2 0.00086067 23419 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.11 66.044 2474300000 0 213800000 265150000 237410000 181410000 229480000 203570000 222890000 258810000 93886000 296210000 271710000 0 39691 3421 37045 355438;355439;355440;355441;355442;355443;355444;355445;355446;355447;355448 452092;452093;452094;452095;452096;452097;452098;452099;452100;452101;452102 452098 10 SGAWDESGVFIYTTSNHIK Unmodified 2110.996 0.99598384 2630 P53621;A0A3B3IS84;A0A3B3IT15;A0A3B3ISC6;A0A3B3IU89;A0A3B3ITV3 COPA Coatomer subunit alpha;Xenin;Proxenin yes no 0 0 0 1 1 104.63 104.63 3 0.0018832 109923 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.237 31.784 219060000 0 0 0 0 0 0 0 0 96657000 0 122410000 0 0 39692 2630 37046 355449;355450 452103;452104;452105 452104 3 SGAWHFSFNVK Unmodified 1278.6146 0.61455605 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A1B0GTF8;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 82.284 82.284 2;3 0.00037907 84337 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.02 92.247 2788200000 137820000 216830000 168100000 221400000 175560000 193780000 301790000 263140000 227730000 123340000 294570000 232040000 232130000 39693 143;560;4559 37047 355451;355452;355453;355454;355455;355456;355457;355458;355459;355460;355461;355462;355463;355464;355465;355466;355467;355468;355469;355470 452106;452107;452108;452109;452110;452111;452112;452113;452114;452115;452116;452117;452118;452119;452120;452121;452122;452123;452124;452125;452126;452127;452128;452129;452130;452131 452127 24 SGAYITCAPFNPAATESIATNIFPLLGDPTSENK Unmodified 3566.7239 0.72391466 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 169.19 169.19 3 5.8848E-10 174027 QUIQUE_C1368_190116_001 58.137 53.182 174120000 0 0 38259000 65008000 0 70856000 0 0 0 0 0 0 0 39694 4252 37048 355471;355472;355473 452132;452133;452134 452132 3 SGAYITCAPFNPAATESIATNIFPLLGDPTSENKTDEK Unmodified 4039.9361 0.93609228 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 163.25 163.25 3;4 1.0882E-15 167640 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.755 65.521 308310000 19852000 0 0 64689000 38404000 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82.543 67.171 74633000 0 0 0 0 0 0 0 55507000 0 19126000 0 0 0 39697 1628 37051 355493;355494 452173;452174 452173 2 SGDAAIVDMVPGK Unmodified 1258.6227 0.62273747 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9;A0A087WV01 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3;Elongation factor 1-alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 76.44 76.44 2 0.00041643 78204 QUIQUE_C1438_190116_001 96.171 75.868 967000000 199030000 0 180370000 197560000 86994000 161230000 105010000 0 0 0 0 36809000 0 39698 2794 37052 355495;355496;355497;355498;355499;355500;355501 452175;452176;452177;452178;452179;452180;452181;452182 452179 8 SGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGR Oxidation (M) 3010.3875 0.38746451 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3 yes no 0 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 3 2 124.79 124.79 3 1.8539E-44 131455 QUIQUE_C1403_190116_001 137.24 131.34 2114300000 145330000 232610000 88015000 375960000 39059000 64453000 0 346340000 241800000 19220000 286560000 0 274990000 39699 2794 37053 355502;355503;355504;355505;355506;355507;355508;355509;355510;355511;355512;355513;355514;355515;355516;355517;355518;355519;355520 452183;452184;452185;452186;452187;452188;452189;452190;452191;452192;452193;452194;452195;452196;452197;452198;452199;452200;452201;452202;452203;452204;452205;452206 452192 2240;2241 17 SGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGR Unmodified 2994.3925 0.39254989 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3 yes no 0 0 1 1 4 4 2 1 2 2 1 2 1 2 1 1 136.47 136.47 2;3;4 3.691E-144 141921 QUIQUE_C1218_190116_001 203.25 196.95 6960200000 422690000 583740000 697500000 902290000 475110000 568070000 533420000 759590000 416450000 69332000 521040000 402890000 608100000 39700 2794 37053 355521;355522;355523;355524;355525;355526;355527;355528;355529;355530;355531;355532;355533;355534;355535;355536;355537;355538;355539;355540;355541;355542;355543;355544 452207;452208;452209;452210;452211;452212;452213;452214;452215;452216;452217;452218;452219;452220;452221;452222;452223;452224;452225;452226;452227;452228;452229;452230;452231;452232;452233;452234;452235;452236;452237;452238;452239;452240;452241;452242;452243;452244;452245;452246;452247 452207 39 SGDAAIVDMVPGKPMCVESFSDYPPLGR 2 Oxidation (M) 3026.3824 0.38237913 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3 yes no 0 2 1 2 112.85 112.85 3 3.6658E-05 109191 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.209 47.326 68456000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68456000 0 0 0 39701 2794 37053 355545;355546 452248;452249;452250 452248 2240;2241 3 SGDAAIVEMVPGKPMCVESFSQYPPLGR 2 Oxidation (M) 3053.4297 0.42966367 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 2 1 1 106.09 106.09 3 0.0023661 109297 QUIQUE_C1277_190116_001 40.756 34.392 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39702 469 37054 355547 452251 452251 346;347 1 SGDAAIVEMVPGKPMCVESFSQYPPLGR Oxidation (M) 3037.4347 0.43474905 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 121.86 121.86 3 9.2321E-24 119612 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.766 91.758 360120000 0 0 0 0 0 0 0 66632000 44505000 33240000 82638000 76761000 56348000 39703 469 37054 355548;355549;355550;355551;355552;355553 452252;452253;452254;452255;452256;452257;452258 452255 346;347 6 SGDAAIVEMVPGKPMCVESFSQYPPLGR Unmodified 3021.4398 0.43983443 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 1 1 1 132.24 132.24 3 1.8327E-65 135224 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.68 146.57 545330000 0 0 0 0 0 0 0 198090000 0 0 347240000 0 0 39704 469 37054 355554;355555 452259;452260;452261;452262 452259 4 SGDAPLTVNELGTAYVSATTGAVATALGLNALTK Unmodified 3246.6984 0.69835184 4195 Q9H9B4;D6RFI0;S4R2X2 SFXN1 Sideroflexin-1 yes no 0 0 0 2 3 4 2 2 1 2 3 3 1 3 1 3 173.76 173.76 2;3;4 1.6166E-115 176868 QUIQUE_C1277_190116_001 177.1 174.94 7833700000 843080000 815020000 238610000 200780000 559240000 247000000 541300000 584110000 629450000 50723000 712410000 1269300000 1142700000 39705 4195 37055 355556;355557;355558;355559;355560;355561;355562;355563;355564;355565;355566;355567;355568;355569;355570;355571;355572;355573;355574;355575;355576;355577;355578;355579;355580;355581;355582;355583;355584;355585 452263;452264;452265;452266;452267;452268;452269;452270;452271;452272;452273;452274;452275;452276;452277;452278;452279;452280;452281;452282;452283;452284;452285;452286;452287;452288;452289;452290;452291;452292;452293;452294;452295 452265 33 SGDDVRNPSVVVK Unmodified 1370.7154 0.7153923 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 24.567 24.567 2 0.013007 18421 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.499 29.182 20106000 0 0 0 0 0 0 0 20106000 0 0 0 0 0 39706 2037 37056 355586 452296 452296 1 SGDETPGSEVPGDK Unmodified 1373.5947 0.59466805 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 23.602 23.602 2 0.0012486 16829 QUIQUE_C1368_190116_001 77.124 65.634 178710000 0 0 108020000 0 0 0 0 0 0 0 70695000 0 0 39707 3208 37057 355587;355588;355589;355590;355591 452297;452298;452299;452300;452301 452298 5 SGDGEGTPVEHVR Unmodified 1338.6164 0.61640654 3442 Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 2 1 1 1 15.771 15.771 2;3 9.5275E-06 8620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.89 106.82 751140000 53851000 34673000 69127000 28310000 52114000 37253000 103330000 61341000 56664000 34068000 80282000 83824000 56299000 39708 3442 37058 355592;355593;355594;355595;355596;355597;355598;355599;355600;355601;355602;355603;355604;355605;355606;355607;355608 452302;452303;452304;452305;452306;452307;452308;452309;452310;452311;452312;452313;452314;452315;452316;452317;452318;452319 452312 15 SGDGVVTVDDLR Unmodified 1231.6044 0.60444487 3033;1353 K7ES72;Q13938 CAPS Calcyphosin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.285 63.285 2 0.00082587 62714 QUIQUE_C1368_190116_001 87.298 69.479 9036700000 0 668470000 886040000 715940000 676780000 903470000 1428200000 0 1724000000 0 782890000 0 1251000000 39709 1353;3033 37059 355609;355610;355611;355612;355613;355614;355615;355616;355617 452320;452321;452322;452323;452324;452325;452326;452327;452328 452321 6 SGDLFNCGSLTIR Unmodified 1438.6875 0.68746299 2188 P21953 BCKDHB 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 99.107 99.107 2 0.010283 101667 QUIQUE_C1277_190116_001 79.889 54.504 92090000 0 92090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39710 2188 37060 355618 452329 452329 1 SGDLYVLAADK Unmodified 1150.587 0.58700389 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 69.965 69.965 2 0.012624 69276 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.255 30.879 55520000 0 0 0 0 0 0 0 55520000 0 0 0 0 0 39711 4285 37061 355619 452330 452330 1 SGDSEVYQLGDVSQK Unmodified 1610.7424 0.74239491 2890 Q04837;A0A0G2JLD8;E7EUY5;C9K0U8 SSBP1 Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.254 65.254 2 6.1735E-95 64496 QUIQUE_DMIX1_190116_001 222.25 196.82 4984600000 390070000 415830000 480570000 278630000 356200000 315020000 441040000 302660000 419550000 149800000 489160000 396760000 549310000 39712 2890 37062 355620;355621;355622;355623;355624;355625;355626;355627;355628;355629;355630;355631;355632 452331;452332;452333;452334;452335;452336;452337;452338;452339;452340;452341;452342;452343;452344;452345;452346 452339 16 SGDTPITVR Unmodified 944.49271 0.49270958 163 A0A0A0MS41;Q9BWM7;A0A1P0AYU5;S4R3N9 SFXN3 Sideroflexin;Sideroflexin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.089 25.089 2 0.00040564 18654 QUIQUE_C1563_190116_001 122.19 48.06 1358800000 115780000 0 176730000 152720000 0 100810000 159380000 145450000 122520000 52979000 146790000 0 185640000 39713 163 37063 355633;355634;355635;355636;355637;355638;355639;355640;355641;355642 452347;452348;452349;452350;452351;452352;452353;452354;452355;452356;452357 452351 7 SGDWMIDYVSNR Unmodified 1441.6296 0.62961376 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 111.16 111.16 2 0.00052804 116444 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.943 77.092 133730000 0 0 0 0 31322000 0 0 0 0 0 41205000 24133000 37070000 39714 2377 37064 355643;355644;355645;355646 452358;452359;452360;452361;452362 452360 4 SGDWVCPNPSCGNMNFAR Unmodified 2067.8349 0.83494864 19 A0A075B7D9;Q92804;A0A075B7F4 TAF15 TATA-binding protein-associated factor 2N yes no 0 0 0 1 1 1 94.268 94.268 2 2.2104E-17 96257 QUIQUE_C1403_190116_001 133.32 120.76 76281000 0 28990000 0 26878000 20413000 0 0 0 0 0 0 0 0 39715 19 37065 355647;355648;355649 452363;452364;452365 452364 2 SGEAIIANANYHDTSPYR Unmodified 1977.9181 0.91806787 849 E7EMR3;E7ES20;E7ENK1;E7ESV6;E7EUP0;E7EX52;E7EN28;E9PBG4;E7EW95;E7EVD6;E7ETE3;E7EUW2;Q9HAR2 ADGRL3;LPHN3 Latrophilin-3 yes no 0 0 0 1 1 58.462 58.462 3 0.03592 58098 QUIQUE_C1218_190116_001 29.202 22.162 140480000 71529000 0 68953000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39716 849 37066 355650;355651 452366;452367 452366 2 SGEDEQQEQTIAEDLVVTK Acetyl (Protein N-term) 2160.007 0.007002036 4530 Q9UQ80;F8VR77 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 2 130.82 130.82 2;3 7.4942E-17 133592 QUIQUE_DMIX1_190116_001 152 138.27 78159000 0 0 0 42153000 0 0 0 0 0 0 36007000 0 0 39717 4530 37067 355652;355653;355654;355655;355656;355657;355658 452368;452369;452370;452371;452372;452373;452374 452372 6 SGEEDFESLASQFSDCSSAK Unmodified 2179.8852 0.88517234 3008 Q13526;K7EMU7;K7EN45 PIN1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 127.95 127.95 2;3 0 132613 QUIQUE_C1368_190116_001 289.72 285.09 2002800000 223320000 246070000 202520000 149650000 121300000 123730000 172420000 138510000 129060000 51121000 172630000 135050000 137470000 39718 3008 37068 355659;355660;355661;355662;355663;355664;355665;355666;355667;355668;355669;355670;355671;355672;355673;355674;355675;355676;355677 452375;452376;452377;452378;452379;452380;452381;452382;452383;452384;452385;452386;452387;452388;452389;452390;452391;452392;452393;452394;452395;452396;452397;452398;452399;452400;452401;452402;452403;452404 452381 29 SGEEGMPDLAHVMR Unmodified 1527.681 0.68099741 1652 O75688;C9JIR6;A0A3B3IS24;B8ZZF0 PPM1B Protein phosphatase 1B yes no 0 0 0 1 77.44 77.44 3 0.038221 77179 QUIQUE_C1563_190116_001 23.362 16.16 10046000 0 0 0 0 0 10046000 0 0 0 0 0 0 0 39719 1652 37069 355678 452405 452405 1 SGEENPASKPTPVQDVQGDGR Acetyl (Protein N-term) 2209.0247 0.024717786 3110 Q15102;M0R389;M0QZT2;M0QXS6;M0R323 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 1 0 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 3 48.923 48.923 2;3 1.8495E-232 46770 QUIQUE_C1218_190116_001 324.03 311.86 4345300000 257420000 394290000 258240000 204080000 387390000 320340000 342360000 363020000 421160000 133780000 451400000 372920000 438920000 39720 3110 37070 355679;355680;355681;355682;355683;355684;355685;355686;355687;355688;355689;355690;355691;355692;355693;355694;355695;355696;355697;355698;355699;355700;355701;355702;355703 452406;452407;452408;452409;452410;452411;452412;452413;452414;452415;452416;452417;452418;452419;452420;452421;452422;452423;452424;452425;452426;452427;452428;452429;452430;452431;452432;452433;452434;452435;452436;452437;452438;452439;452440;452441;452442 452407 36 SGEESYNLDSVAK Unmodified 1397.6311 0.63105355 3866 Q96HD9;E9PRA7 ACY3 N-acyl-aromatic-L-amino acid amidohydrolase (carboxylate-forming) yes no 0 0 0 1 1 1 1 53.633 53.633 2 0.005278 51564 QUIQUE_C1218_190116_001 92.409 83.946 67543000 49387000 0 0 0 0 0 0 0 0 18156000 0 0 0 39721 3866 37071 355704;355705;355706;355707 452443;452444;452445;452446 452443 4 SGEFHAEPTVIEK Unmodified 1442.7042 0.70415892 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 37.115 37.115 2;3 0.00043231 33164 QUIQUE_C1576_190116_001 103.08 63.461 763930000 0 0 49168000 57008000 48380000 45294000 52798000 64969000 267040000 16189000 47093000 41757000 74234000 39722 16;1475 37072 355708;355709;355710;355711;355712;355713;355714;355715;355716;355717;355718;355719;355720 452447;452448;452449;452450;452451;452452;452453;452454;452455;452456;452457;452458;452459;452460 452453 13 SGEGEVSGLMR Unmodified 1120.5183 0.5182724 2983 Q13263;M0R0K9 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes no 0 0 0 1 47.093 47.093 2 0.014157 44189 QUIQUE_C1277_190116_001 65.535 50.76 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39723 2983 37073 355721 452461 452461 1 SGEGFIDFIGQVHK Unmodified 1532.7623 0.7623425 987;2987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468;Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRD;PTPRS Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.38 106.38 3 3.7236E-05 109687 QUIQUE_C1277_190116_001 98.942 93.863 666050000 73875000 84397000 65088000 0 54926000 36134000 71441000 40471000 72977000 24748000 83087000 0 58910000 39724 987;2987 37074 355722;355723;355724;355725;355726;355727;355728;355729;355730;355731;355732 452462;452463;452464;452465;452466;452467;452468;452469;452470;452471;452472;452473;452474;452475;452476;452477;452478 452463 17 SGEHDFGAAFDGDGDR Unmodified 1651.6499 0.64989151 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 53.897 53.897 2;3 2.5338E-44 51615 QUIQUE_C1368_190116_001 220.37 214.53 6269100000 545350000 521430000 790940000 600550000 485210000 503110000 575520000 226210000 435770000 249470000 417510000 339380000 578680000 39725 2400 37075 355733;355734;355735;355736;355737;355738;355739;355740;355741;355742;355743;355744;355745;355746;355747;355748;355749;355750;355751;355752;355753;355754;355755;355756;355757;355758 452479;452480;452481;452482;452483;452484;452485;452486;452487;452488;452489;452490;452491;452492;452493;452494;452495;452496;452497;452498;452499;452500;452501;452502;452503;452504;452505;452506;452507 452484 27 SGEHDFGAAFDGDGDRNMILGK Unmodified 2308.0179 0.017858269 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 1 1 1 1 87.654 87.654 3;4 2.0817E-07 88857 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.704 68.615 253280000 0 0 0 0 0 0 0 93347000 90487000 0 0 69447000 0 39726 2400 37076 355759;355760;355761 452508;452509;452510;452511 452509 3 SGEHDFGAAFDGDGDRNMILGK Oxidation (M) 2324.0128 0.012772891 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 74.846 74.846 3 3.5794E-08 75706 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.668 77.712 497840000 0 0 0 0 0 0 0 0 123490000 0 124450000 95493000 154410000 39727 2400 37076 355762;355763;355764;355765 452512;452513;452514;452515;452516;452517 452513 1810 6 SGEILYR Unmodified 836.43922 0.43921744 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes no 0 0 0 1 1 29.321 29.321 2 0.057389 23569 QUIQUE_C1277_190116_001 70.912 47.117 57506000 0 32662000 0 24844000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39728 2887 37077 355766;355767 452518;452519 452518 2 SGELAQEYDKR Unmodified 1294.6153 0.61534391 3079 Q14683;G8JLG1;H0Y7K8 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 20.59 20.59 2 0.0044482 13950 QUIQUE_DMIX3_190116_001 70.908 52.236 63358000 0 0 20387000 0 0 0 0 0 18105000 0 24867000 0 0 39729 3079 37078 355768;355769;355770;355771;355772 452520;452521;452522;452523;452524 452523 5 SGELGAVIEGLLR Unmodified 1312.7351 0.73506511 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 2 1 150.13 150.13 2;3 0.00021557 156595 QUIQUE_C1438_190116_001 84.718 59.244 2768600000 164190000 409870000 163500000 93571000 454420000 133960000 483150000 51965000 138710000 0 236950000 291440000 146820000 39730 4500 37079 355773;355774;355775;355776;355777;355778;355779;355780;355781;355782;355783;355784;355785;355786;355787;355788;355789;355790;355791 452525;452526;452527;452528;452529;452530;452531;452532;452533;452534;452535;452536;452537;452538;452539;452540;452541;452542;452543;452544;452545;452546;452547;452548;452549;452550;452551 452538 27 SGELPPNINIKEPR Acetyl (Protein N-term) 1604.8522 0.85222014 4195 Q9H9B4;D6RFI0;S4R2X2;D6RDG7;D6RAE9 SFXN1 Sideroflexin-1 yes no 1 0 1 2 83.788 83.788 2 0.0029326 84476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.695 59.442 81748000 0 0 0 0 0 0 0 81748000 0 0 0 0 0 39731 4195 37080 355792;355793 452552;452553 452553 2 SGELQGGPDDNLIEGGGTK Unmodified 1842.8595 0.85954994 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 67.693 67.693 2 1.487E-05 67119 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.51 118.57 100890000 0 0 0 0 0 0 0 34392000 0 0 0 27612000 38886000 39732 3797 37081 355794;355795;355796;355797;355798 452554;452555;452556;452557;452558 452556 4 SGENAANIASELAR Unmodified 1401.6848 0.68482046 1698 O94910;K7ESH3 LPHN1;ADGRL1 Latrophilin-1 yes no 0 0 0 1 73.291 73.291 2 0.038883 73950 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.155 38.455 30556000 0 0 0 0 0 0 0 0 30556000 0 0 0 0 39733 1698 37082 355799 452559 452559 1 SGENFDKFFTR Unmodified 1346.6255 0.62551466 1877 P05129 PRKCG Protein kinase C gamma type yes yes 0 0 1 1 1 74.771 74.771 3 0.0097751 75630 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.423 32.307 119730000 0 0 0 0 0 0 0 65264000 0 0 54466000 0 0 39734 1877 37083 355800;355801 452560;452561 452561 2 SGEQVPLLLK Unmodified 1082.6336 0.63356015 4140 Q9H269 VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes yes 0 0 0 1 1 74.59 74.59 2 0.054434 76102 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.378 37.4 16192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16192000 39735 4140 37084 355802;355803 452562;452563 452562 2 SGERPVTAGEEDEQVPDSIDAR Unmodified 2356.0779 0.077875568 4589 Q9Y3D0;H3BNV7 FAM96B Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18 yes no 0 0 1 1 1 1 1 55.432 55.432 3 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N-term) 2056.1357 0.13571221 755 C9JYN0 SYPL1 yes yes 1 0 1 1 1 1 158.51 158.51 2 0.0005384 163057 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105 83.37 87804000 0 0 0 0 0 0 0 0 33192000 0 29983000 24630000 0 39753 755 37100 356215;356216;356217 453065;453066;453067 453067 3 SGFSLDNGELR Unmodified 1193.5677 0.56766543 4516 Q9UNZ2;F2Z2K0 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.806 72.806 2 0.00075517 72855 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.143 83.106 1062000000 0 108730000 105620000 0 112170000 90020000 100470000 106250000 108310000 0 119350000 108070000 103040000 39754 4516 37101 356218;356219;356220;356221;356222;356223;356224;356225;356226;356227 453068;453069;453070;453071;453072;453073;453074;453075;453076;453077 453077 9 SGFSTEER Acetyl (Protein N-term) 953.40904 0.40903953 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 1 0 0 1 1 40.861 40.861 1 0.0091423 36868 QUIQUE_C1277_190116_001 149.4 111.76 467950000 0 201320000 0 0 0 0 266640000 0 0 0 0 0 0 39755 3120 37102 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453080;453081;453082;453083;453084;453085;453086;453087;453088;453089;453090;453091;453092;453093;453094;453095;453096;453097;453098;453099;453100;453101;453102;453103;453104;453105;453106;453107;453108;453109;453110;453111;453112;453113;453114;453115;453116 453089 33 SGGASHSELIHNLRK Unmodified 1604.8383 0.83830141 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;F8WDT3;F8WAV5;F8WAX2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 1 2 2 2 2 14.861 14.861 3;4 4.2185E-36 7208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.56 132.31 2172500000 0 0 0 0 0 0 0 454720000 0 0 666150000 512600000 539030000 39757 150 37104 356262;356263;356264;356265;356266;356267;356268;356269 453117;453118;453119;453120;453121;453122;453123;453124 453119 5 SGGDLTLHYR Unmodified 1117.5516 0.55162144 3659 Q8TAF3 WDR48 WD repeat-containing protein 48 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.555 32.555 3 0.012691 27954 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.664 22.421 402410000 0 52825000 0 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70.976 2 0.00020527 71494 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.24 105.49 446830000 0 0 0 0 87164000 0 0 76359000 73678000 0 70180000 87537000 51912000 + 39761 1859 37108 356284;356285;356286;356287;356288;356289 453139;453140;453141;453142;453143;453144;453145 453142 7 SGGGGDIHQGFQSLLTEVNK Unmodified 2043.0021 0.0021318501 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12;A0A2R8Y6A7 SERPINB6 Serpin B6 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 1 2 100.48 100.48 2;3 1.7757E-87 104501 QUIQUE_C1218_190116_001 212.7 190.66 7003000000 413330000 442760000 560350000 574170000 568150000 465540000 519220000 611010000 818910000 305620000 744530000 136890000 842490000 39762 2371 37109 356290;356291;356292;356293;356294;356295;356296;356297;356298;356299;356300;356301;356302;356303;356304;356305;356306;356307;356308;356309;356310;356311;356312;356313;356314;356315 453146;453147;453148;453149;453150;453151;453152;453153;453154;453155;453156;453157;453158;453159;453160;453161;453162;453163;453164;453165;453166;453167;453168;453169;453170;453171;453172;453173;453174;453175 453148 26 SGGGGGGGGCGGGGGVSSLR Unmodified 1548.6699 0.66991545 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.109 20.109 2 4.2298E-56 13105 QUIQUE_DMIX4_190116_001 206.06 192.71 1109200000 59793000 53898000 58362000 100290000 86816000 54359000 44837000 42475000 92587000 113110000 117210000 143270000 142210000 + 39763 776 37110 356316;356317;356318;356319;356320;356321;356322;356323;356324;356325;356326;356327;356328 453176;453177;453178;453179;453180;453181;453182;453183;453184;453185;453186;453187;453188;453189 453186 14 SGGGGGGGLGSGGSIR Unmodified 1231.5905 0.59052614 780 CON__P35527;P35527 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.964 19.964 2 7.1993E-36 12391 QUIQUE_DMIX8_190116_001 170.23 146.07 5026200000 312790000 0 168080000 314770000 974560000 274150000 228850000 0 491620000 637980000 546940000 537740000 538720000 + 39764 780 37111 356329;356330;356331;356332;356333;356334;356335;356336;356337;356338;356339 453190;453191;453192;453193;453194;453195;453196;453197;453198;453199;453200;453201 453201 12 SGGGGLMEEMNAMLAR Unmodified 1622.7215 0.72148201 2568 P50552;K7EM16 VASP Vasodilator-stimulated phosphoprotein yes no 0 0 0 1 136.59 136.59 2 0.0037178 140375 QUIQUE_C1403_190116_001 73.848 56.412 17520000 0 0 0 17520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39765 2568 37112 356340 453202 453202 1 SGGGPSGGGPGGSGR Acetyl (Protein N-term) 1184.517 0.51702685 2550 P49840 GSK3A Glycogen synthase kinase-3 alpha yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 16.459 16.459 2 0.0013295 8958 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.441 40.287 84188000 0 14812000 0 0 14362000 0 0 15728000 19918000 0 0 19370000 0 39766 2550 37113 356341;356342;356343;356344;356345 453203;453204;453205;453206;453207;453208 453208 6 SGGGYIVVDPILR Unmodified 1344.7402 0.74015049 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.16 103.16 2 0.0033969 107436 QUIQUE_C1438_190116_001 87.298 75.808 576580000 71064000 79082000 0 56951000 93529000 0 63162000 0 0 32329000 104670000 75790000 0 39767 2377 37114 356346;356347;356348;356349;356350;356351;356352;356353 453209;453210;453211;453212;453213;453214;453215;453216;453217 453213 8 SGGIETIANEYSDR Unmodified 1510.69 0.68996541 1748 O95757;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.116 76.116 2 6.3473E-05 76604 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.17 110.05 1475100000 107490000 115560000 102290000 91878000 129710000 89503000 120860000 90659000 96612000 64794000 134000000 153390000 178410000 39768 1748 37115 356354;356355;356356;356357;356358;356359;356360;356361;356362;356363;356364;356365;356366 453218;453219;453220;453221;453222;453223;453224;453225;453226;453227;453228;453229;453230 453226 13 SGGIPALVK Unmodified 840.5069 0.50690308 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 47.264 47.264 2 0.035453 45173 QUIQUE_C1218_190116_001 54.776 40.112 97068000 97068000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39769 425 37116 356367 453231 453231 1 SGGIVISPFR Unmodified 1031.5764 0.57637963 3173 Q16204 CCDC6 Coiled-coil domain-containing protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.642 80.642 2 0.0035536 82394 QUIQUE_C1576_190116_001 83.948 60.519 713900000 63743000 62790000 56661000 51439000 55956000 64902000 66047000 0 53886000 30042000 67753000 64089000 76594000 39770 3173 37117 356368;356369;356370;356371;356372;356373;356374;356375;356376;356377;356378;356379 453232;453233;453234;453235;453236;453237;453238;453239;453240;453241;453242;453243;453244 453238 11 SGGLGGSHALLLLR Unmodified 1349.7779 0.77793298 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 74.392 74.392 2;3 0.00011421 73670 QUIQUE_C1563_190116_001 87.18 72.493 914740000 112020000 98636000 93431000 0 0 128340000 0 132850000 147320000 63994000 0 0 138150000 39771 2452 37118 356380;356381;356382;356383;356384;356385;356386;356387;356388;356389 453245;453246;453247;453248;453249;453250;453251;453252;453253;453254;453255;453256;453257 453251 11 SGGLILYTWPANDRPSTR Unmodified 2003.0225 0.022473362 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0C4DGK4;Q9HDB5 NRXN3 Neurexin-3;Neurexin-3-beta;Neurexin-3-beta, soluble form;Neurexin-3-beta, C-terminal fragment yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.836 94.836 3 1.3247E-10 96895 QUIQUE_DMIX7_190116_001 92.211 77.792 660260000 69482000 80358000 71142000 61530000 0 34083000 74740000 0 40142000 35768000 70390000 70477000 52153000 39772 319 37119 356390;356391;356392;356393;356394;356395;356396;356397;356398;356399;356400 453258;453259;453260;453261;453262;453263;453264;453265;453266;453267;453268;453269;453270 453269 12 SGGMERPFVLAR Unmodified 1318.6816 0.68158975 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 50.796 50.796 3 0.00031745 47909 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.604 84.028 510850000 0 0 95271000 0 125490000 0 107150000 51702000 61180000 0 0 0 70051000 39773 956;3084 37120 356401;356402;356403;356404;356405;356406 453271;453272;453273;453274;453275;453276 453276 5 SGGMERPFVLAR Oxidation (M) 1334.6765 0.67650438 3084;956 E9PKU7;Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB no no 0 1 1 1 1 1 35.802 35.802 3 0.0014999 31594 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.69 66.973 444650000 0 0 0 0 0 0 0 135070000 156100000 0 0 0 153480000 39774 956;3084 37120 356407;356408;356409 453277;453278;453279 453278 581 2 SGGMSNELNNIISR Oxidation (M) 1506.7097 0.709655 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase 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92067 QUIQUE_C1368_190116_001 38.376 24.972 36720000 0 0 19285000 0 0 17435000 0 0 0 0 0 0 0 39789 2953 37133 356509;356510;356511;356512 453412;453413;453414;453415 453412 4 SGHFEQAIK Unmodified 1015.5087 0.50869399 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 15.042 15.042 2 0.00031389 7104 QUIQUE_DMIX4_190116_001 136.57 95.118 89062000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89062000 0 0 0 39790 2851 37134 356513 453416 453416 1 SGHFEQAIKEGEDMIAEEHFGSEK Unmodified 2704.2075 0.20750953 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 2 3 2 2 3 112.34 112.34 3;4;5 1.1482E-18 117223 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.33 115.67 1792300000 0 0 0 0 74369000 0 0 367580000 366190000 0 310950000 335950000 337310000 39791 2851 37135 356514;356515;356516;356517;356518;356519;356520;356521;356522;356523;356524;356525;356526 453417;453418;453419;453420;453421;453422;453423;453424;453425;453426;453427;453428;453429;453430;453431;453432;453433;453434;453435 453428 16 SGHFEQAIKEGEDMIAEEHFGSEK Oxidation (M) 2720.2024 0.20242415 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 1 2 92.506 92.506 4 5.6807E-06 92814 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.335 53.607 137140000 0 0 0 0 0 0 0 137140000 0 0 0 0 0 39792 2851 37135 356527;356528 453436;453437 453436 2290 2 SGHLTSVHSPEEHSFINSFGHENTWIGLNDR Unmodified 3503.6243 0.62429247 1436 O14594;K7EKF8 NCAN Neurocan core protein yes no 0 0 0 2 1 1 3 1 2 1 1 1 2 2 91.077 91.077 4;5 3.2338E-234 92868 QUIQUE_DMIX1_190116_001 234.48 224.65 1806200000 191120000 95563000 84906000 296090000 47297000 0 230020000 94202000 116770000 53401000 439770000 0 157030000 39793 1436 37136 356529;356530;356531;356532;356533;356534;356535;356536;356537;356538;356539;356540;356541;356542;356543;356544;356545 453438;453439;453440;453441;453442;453443;453444;453445;453446;453447;453448;453449;453450;453451;453452;453453;453454;453455;453456;453457;453458;453459;453460 453451 21 SGIALSR Acetyl (Protein N-term) 744.413 0.41300269 577 H3BQQ9;B0QYN7;P63279;H3BRD1 UBE2I SUMO-conjugating enzyme UBC9 yes no 1 0 0 1 1 1 1 53.442 53.442 2 0.04189 52519 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.782 16.687 129960000 0 0 27172000 0 0 31629000 0 0 0 0 39557000 0 31598000 39794 577 37137 356546;356547;356548;356549 453461;453462;453463;453464 453463 4 SGIDHNSIPK Unmodified 1066.5407 0.5407224 2958 Q13009 TIAM1 T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 1 yes yes 0 0 0 1 16.747 16.747 3 0.063195 9210 QUIQUE_DMIX5_190116_001 27.989 15.401 11329000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11329000 0 0 39795 2958 37138 356550 453465 453465 1 SGIIFAGHDK Unmodified 1043.54 0.53999412 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1;C9J5G3 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.743 25.743 2 0.004314 18998 QUIQUE_C1368_190116_001 81.338 58.266 2004100000 373480000 471970000 729260000 0 0 0 0 136990000 0 0 0 292350000 0 39796 1175 37139 356551;356552;356553;356554;356555 453466;453467;453468;453469;453470 453468 4 SGIIFAGHDKWSLDPR Unmodified 1797.9162 0.91621738 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1;C9J5G3 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 1 1 85.205 85.205 3 0.052612 85730 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.757 15.65 79396000 0 0 0 0 0 0 0 79396000 0 0 0 0 0 39797 1175 37140 356556 453471 453471 1 SGIILQAESR Unmodified 1072.5877 0.58767259 3645 Q8NEU8 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 43.106 43.106 2 0.016416 39153 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.1 39.543 130360000 0 0 0 0 0 0 52334000 0 0 24922000 0 0 53107000 39798 3645 37141 356557;356558;356559 453472;453473;453474 453474 3 SGILAAESIFNQLTSENLQSK Unmodified 2249.1539 0.15394104 3169 Q16134 ETFDH Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 2 2 3 1 1 1 1 2 1 1 2 156.23 156.23 2;3 6.4947E-19 151424 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.99 140.06 1085300000 75678000 51592000 129780000 106500000 127250000 58069000 60639000 49768000 78132000 43183000 99716000 67675000 137310000 39799 3169 37142 356560;356561;356562;356563;356564;356565;356566;356567;356568;356569;356570;356571;356572;356573;356574;356575;356576;356577;356578;356579 453475;453476;453477;453478;453479;453480;453481;453482;453483;453484;453485;453486;453487;453488;453489;453490;453491;453492;453493;453494;453495;453496;453497;453498 453494 23 SGILPILVHCLER Unmodified 1505.8388 0.83881868 1420 O00629 KPNA4 Importin subunit alpha-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 3 1 3 1 3 120.13 120.13 2;3 0.00011047 122926 QUIQUE_C1563_190116_001 76.588 55.031 1175700000 108110000 76852000 102960000 86433000 94510000 153830000 95404000 42246000 117440000 30840000 151010000 63592000 52475000 39800 1420 37143 356580;356581;356582;356583;356584;356585;356586;356587;356588;356589;356590;356591;356592;356593;356594;356595;356596;356597;356598;356599 453499;453500;453501;453502;453503;453504;453505;453506;453507;453508;453509;453510;453511;453512;453513;453514;453515;453516;453517;453518;453519;453520;453521;453522;453523;453524;453525;453526;453527;453528;453529 453511 29 SGINCPIQK Unmodified 1015.5121 0.51206481 850 J3KMY5;G3V3E8;E7EMS2;G3V3D1;P61916;G3V2V8;H0YIZ1 NPC2 Epididymal secretory protein E1 yes no 0 0 0 1 21.205 21.205 2 0.0051961 14160 QUIQUE_C1403_190116_001 87.251 48.833 61622000 0 0 0 61622000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39801 850 37144 356600 453530 453530 1 SGINPFDSQEAK Unmodified 1291.6044 0.60444487 2717 P61201;B4DIH5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 59.595 59.595 2 0.021642 58626 QUIQUE_C1218_190116_001 58.63 38.3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39802 2717 37145 356601 453531 453531 1 SGINPFDSQEAKPYK Unmodified 1679.8155 0.81550028 2717 P61201;B4DIH5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 58.07 58.07 2;3 9.9446E-06 56576 QUIQUE_C1368_190116_001 115.92 93.581 2033600000 140140000 222970000 194860000 216750000 210000000 165450000 234840000 36576000 174560000 0 179370000 150180000 107880000 39803 2717 37146 356602;356603;356604;356605;356606;356607;356608;356609;356610;356611;356612;356613;356614;356615;356616;356617;356618;356619;356620;356621 453532;453533;453534;453535;453536;453537;453538;453539;453540;453541;453542;453543;453544;453545;453546;453547;453548;453549;453550;453551;453552;453553 453537 22 SGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEK Unmodified 4530.1537 0.15368963 2717 P61201;B4DIH5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 154.46 154.46 4 4.707E-10 161611 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.528 53.68 386210000 0 0 0 0 0 0 0 167880000 89425000 0 99244000 29662000 0 39804 2717 37147 356622;356623;356624;356625 453554;453555;453556;453557 453556 4 SGIPIVTSPYQIHFTK Unmodified 1786.9618 0.96177059 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 102.22 102.22 2;3 0.00010327 99949 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.14 64.816 1451900000 92857000 90475000 109640000 83884000 230290000 60860000 89228000 40952000 66262000 71225000 199920000 67124000 249190000 39805 1803 37148 356626;356627;356628;356629;356630;356631;356632;356633;356634;356635;356636;356637;356638;356639;356640 453558;453559;453560;453561;453562;453563;453564;453565;453566;453567;453568;453569;453570;453571;453572;453573;453574 453569 10 SGKPGPFLLSGSR Unmodified 1301.7092 0.70918471 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 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24780000 45582000 44069000 48073000 39822 4394 37164 356783;356784;356785;356786;356787;356788;356789;356790;356791;356792;356793;356794;356795 453758;453759;453760;453761;453762;453763;453764;453765;453766;453767;453768;453769;453770;453771;453772;453773;453774;453775;453776;453777;453778;453779;453780;453781 453771 24 SGLSSPIYIDLR Unmodified 1319.7085 0.70851601 2012 P11172;E9PFD2;F2Z3P2;F2Z303;F8WDG4 UMPS Uridine 5'-monophosphate synthase;Orotate phosphoribosyltransferase;Orotidine 5'-phosphate decarboxylase yes no 0 0 0 1 108.88 108.88 2 0.034184 113006 QUIQUE_C1218_190116_001 47.302 24.231 77735000 77735000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39823 2012 37165 356796 453782 453782 1 SGLSTGWTQLSK Unmodified 1263.6459 0.64591575 1858 P04217;M0R009 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 72.86 72.86 2 0.0034003 74372 QUIQUE_C1438_190116_001 72.2 37.668 151930000 0 0 55514000 0 96414000 0 0 0 0 0 0 0 0 39824 1858 37166 356797;356798 453783;453784 453784 1 SGLTEVYQWYLDLR Unmodified 1741.8675 0.86753585 3877 Q96I59 NARS2 Probable asparagine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 162.14 162.14 2 0.010292 166539 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.434 48.22 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39825 3877 37167 356799 453785 453785 1 SGLTGLVIGGLYPVFLAIPVNGGLAAR Unmodified 2624.5054 0.50539352 4113 Q9H061 TMEM126A Transmembrane protein 126A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.25 172.25 3 1.1733E-31 176548 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.32 117.14 393650000 16668000 11883000 17351000 0 11731000 1464900 42168000 81582000 53272000 0 65461000 50485000 41582000 39826 4113 37168 356800;356801;356802;356803;356804;356805;356806;356807;356808;356809;356810 453786;453787;453788;453789;453790;453791;453792;453793;453794;453795;453796;453797;453798 453795 13 SGLTSLHLAAQEDK Unmodified 1468.7522 0.75217174 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 48.266 48.266 2;3 9.7E-38 45473 QUIQUE_C1277_190116_001 186.17 143.42 1052600000 187140000 154750000 76701000 172990000 102580000 154390000 135980000 0 0 68088000 0 0 0 39827 1255;2856 37169 356811;356812;356813;356814;356815;356816;356817;356818;356819;356820;356821;356822;356823;356824;356825 453799;453800;453801;453802;453803;453804;453805;453806;453807;453808;453809;453810;453811;453812;453813;453814;453815;453816 453804 17 SGLTSLHLAAQEDKVNVADILTK Unmodified 2422.3068 0.30675329 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 1 3 3 1 1 1 2 107.15 107.15 2;3;4 9.4571E-182 111785 QUIQUE_C1438_190116_001 257.15 205.93 4838100000 266590000 353900000 511990000 234980000 420400000 189410000 25803000 859620000 975460000 88068000 46839000 367280000 497780000 39828 1255;2856 37170 356826;356827;356828;356829;356830;356831;356832;356833;356834;356835;356836;356837;356838;356839;356840;356841;356842;356843;356844;356845;356846 453817;453818;453819;453820;453821;453822;453823;453824;453825;453826;453827;453828;453829;453830;453831;453832;453833;453834;453835;453836;453837;453838;453839 453826 20 SGLVLGQR Acetyl (Protein N-term) 870.49232 0.49231565 4286 Q9NSK0;C9J8T5;C9JXT5;C9JQU1;C9K0D5 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 1 0 0 1 77.991 77.991 2 0.030844 78014 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.981 17.479 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39829 4286 37171 356847 453840 453840 1 SGLVLTSILTLR Unmodified 1271.7813 0.78128702 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.98 139.98 2 9.7201E-06 145418 QUIQUE_C1368_190116_001 130.94 117.9 559100000 46741000 50324000 72995000 27558000 39010000 45314000 62137000 45492000 28146000 31154000 57386000 20882000 31958000 39830 2173 37172 356848;356849;356850;356851;356852;356853;356854;356855;356856;356857;356858;356859;356860 453841;453842;453843;453844;453845;453846;453847;453848;453849;453850;453851;453852;453853;453854;453855;453856;453857;453858;453859;453860;453861;453862;453863;453864;453865;453866 453848 26 SGMFWLR Unmodified 895.43744 0.4374433 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.417 98.417 2 0.012708 101377 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.5 91.154 4434400000 417450000 319730000 436160000 273610000 244700000 312660000 369820000 277850000 352100000 92817000 480290000 362140000 495100000 39831 2337 37173 356861;356862;356863;356864;356865;356866;356867;356868;356869;356870;356871;356872;356873 453867;453868;453869;453870;453871;453872;453873;453874;453875;453876;453877;453878;453879;453880;453881;453882;453883;453884;453885;453886;453887;453888;453889;453890;453891;453892;453893;453894;453895;453896;453897;453898;453899 453890 33 SGMFWLR Oxidation (M) 911.43236 0.43235793 2337 P31930 UQCRC1 Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 71.581 71.581 2 0.046318 70863 QUIQUE_C1277_190116_001 84.064 44.302 124250000 0 75055000 0 0 0 0 0 0 0 49195000 0 0 0 39832 2337 37173 356874;356875 453900;453901;453902 453900 3 SGMVQTEAQYR Unmodified 1268.5819 0.58193529 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.131 31.131 2 0.00011143 25763 QUIQUE_DMIX4_190116_001 131.44 103.22 1548300000 140210000 183580000 159870000 143810000 103060000 98662000 146550000 85813000 0 61470000 158090000 118710000 148510000 39833 2898 37174 356876;356877;356878;356879;356880;356881;356882;356883;356884;356885;356886;356887 453903;453904;453905;453906;453907;453908;453909;453910;453911;453912;453913;453914;453915;453916;453917 453914 15 SGMVQTEAQYR Oxidation (M) 1284.5768 0.57684991 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.44 19.44 2 0.00040596 12215 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453944;453945;453946;453947;453948;453949;453950;453951;453952;453953;453954;453955;453956;453957;453958;453959 453945 16 SGNIINMSSVASSVK Oxidation (M) 1508.7505 0.75045718 4037 Q9BUT1 BDH2 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 49.228 49.228 2 0.0010388 46118 QUIQUE_C1563_190116_001 73.36 51.79 345250000 0 29322000 0 46442000 0 40075000 0 0 0 24355000 65436000 51520000 88095000 39839 4037 37178 356925;356926;356927;356928;356929;356930;356931;356932 453960;453961;453962;453963;453964;453965;453966;453967 453962 2841 8 SGNIVAGIANESK Unmodified 1258.6517 0.65172941 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 50.069 50.069 2 0.0016416 44984 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.898 67.52 36442000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36442000 0 0 0 39840 2554 37179 356933 453968 453968 1 SGNTFRPEVHLLPPPSEELALNELVTLTCLAR Unmodified 3572.8661 0.86610265 401;287;403 A0A0G2JMB2;A0A286YEY1;P01876;A0A286YEY5;P01877 IGHA1;IGHA2 Ig alpha-1 chain C region;Ig alpha-2 chain C region no no 0 0 1 1 1 4 1 2 1 2 3 3 2 2 2 2 161.08 161.08 3;4 1.6504E-75 168419 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.99 147.41 6467900000 57278000 233970000 650630000 646690000 793980000 144090000 392910000 380770000 300430000 177710000 1480700000 665620000 543050000 39841 287;401;403 37180 356934;356935;356936;356937;356938;356939;356940;356941;356942;356943;356944;356945;356946;356947;356948;356949;356950;356951;356952;356953;356954;356955;356956;356957;356958;356959 453969;453970;453971;453972;453973;453974;453975;453976;453977;453978;453979;453980;453981;453982;453983;453984;453985;453986;453987;453988;453989;453990;453991;453992;453993;453994;453995;453996;453997;453998;453999;454000;454001;454002;454003;454004;454005;454006 454000 37 SGNYPSSLSNETDR Unmodified 1525.6645 0.66447894 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.079 37.079 2 0.00020884 33277 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.011 73.249 2416800000 214390000 228480000 149570000 163440000 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chain;Tubulin beta-4B chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 1 2 3 2 3 2 4 2 3 2 5 3 4 2 140.8 140.8 2;3;4 0 147231 QUIQUE_C1218_190116_001 464.09 453.27 335400000000 21372000000 25394000000 24320000000 19677000000 24969000000 19154000000 30306000000 31610000000 27884000000 8566300000 32224000000 33343000000 36580000000 39849 1862;1922;2797;3030;4044 37188 357013;357014;357015;357016;357017;357018;357019;357020;357021;357022;357023;357024;357025;357026;357027;357028;357029;357030;357031;357032;357033;357034;357035;357036;357037;357038;357039;357040;357041;357042;357043;357044;357045;357046;357047;357048;357049 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SGPVPGFQEDTLQLAFIDLR Unmodified 2202.1321 0.13208339 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 160.02 160.02 2 0.027979 167595 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.791 31.431 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39863 318 37201 357163 454317 454317 1 SGQASPSRPESPRPPFDL Unmodified 1923.9439 0.94388869 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 2 1 70.631 70.631 3 0.0025447 70977 QUIQUE_C1218_190116_001 74.793 58.486 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39864 269;2893 37202 357164 454318 454318 1 SGQCVQAFETHESDINSVR Unmodified 2162.9651 0.96509442 1444 O14775;H0YLU1 GNB5 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 60.424 60.424 2;3 1.674E-05 59240 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.316 82.324 1848100000 179930000 262910000 205490000 165160000 130500000 186150000 162360000 82254000 89108000 151280000 117450000 115540000 0 39865 1444 37203 357165;357166;357167;357168;357169;357170;357171;357172;357173;357174;357175;357176;357177;357178 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1714.811 0.8110408 658 F5GZ08;B7Z4G8;P51693;K7EQJ4;K7ELK0 APLP1 Amyloid-like protein 1;C30 yes no 0 0 0 2 1 1 13.587 13.587 3;4 3.2556E-06 5383 QUIQUE_C1368_190116_001 81.904 74.123 88458000 33244000 0 15156000 0 40057000 0 0 0 0 0 0 0 0 39878 658 37216 357287;357288;357289;357290 454469;454470;454471;454472 454471 4 SGSDEVQVGQQR Unmodified 1288.6008 0.60075648 1803 P01024;M0QXZ3 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.005 19.005 2 7.1074E-23 11659 QUIQUE_DMIX4_190116_001 183.72 168.46 2058100000 136720000 188470000 173600000 162960000 269910000 141380000 140220000 69316000 114630000 117530000 226670000 108820000 207880000 39879 1803 37217 357291;357292;357293;357294;357295;357296;357297;357298;357299;357300;357301;357302;357303 454473;454474;454475;454476;454477;454478;454479;454480;454481;454482;454483;454484;454485 454482 10 SGSGISVISSTSVDQR Unmodified 1578.7849 0.78492843 3161 Q15811;F8W7U0;A8CTZ0;C9JQZ7;D6PAW0 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 60.11 60.11 2 0.00060443 58861 QUIQUE_C1403_190116_001 75.618 56.347 16420000 0 0 0 16420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 39880 3161 37218 357304 454486 454486 1 SGSGTMNLGGSLTR Oxidation (M) 1352.6354 0.63542742 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 31.677 31.677 2 0.0022545 26517 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.632 42.328 1054300000 194070000 0 0 165170000 0 124750000 112400000 0 0 0 273500000 184430000 0 39881 585;2493 37219 357305;357306;357307;357308;357309;357310 454487;454488;454489;454490;454491;454492;454493 454492 379 7 SGSGTMNLGGSLTR Unmodified 1336.6405 0.6405128 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 51.584 51.584 2 5.5637E-59 49093 QUIQUE_C1403_190116_001 204.34 168.82 3543900000 0 316740000 496910000 382450000 337000000 323310000 379330000 148070000 312080000 96121000 0 355100000 396820000 39882 585;2493 37219 357311;357312;357313;357314;357315;357316;357317;357318;357319;357320;357321;357322;357323;357324 454494;454495;454496;454497;454498;454499;454500;454501;454502;454503;454504;454505;454506;454507;454508 454497 15 SGSGVNPYCGLIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQK Unmodified 4014.8946 0.89456182 1587 O60684 KPNA6 Importin subunit alpha-7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 146.82 146.82 4 1.5532E-29 151015 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.809 76.399 545350000 0 0 0 0 78996000 0 172190000 55100000 0 0 0 103170000 135880000 39883 1587 37220 357325;357326;357327;357328;357329 454509;454510;454511;454512;454513;454514 454513 5 SGSHGYDMSTFIR Unmodified 1456.6405 0.6405128 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 66.525 66.525 2;3 6.3767E-24 67648 QUIQUE_C1218_190116_001 175.49 167.93 4103500000 519960000 207240000 474210000 282560000 357040000 309830000 389030000 146250000 291000000 0 460250000 380010000 286150000 39884 907 37221 357330;357331;357332;357333;357334;357335;357336;357337;357338;357339;357340;357341;357342;357343;357344;357345;357346;357347;357348;357349;357350 454515;454516;454517;454518;454519;454520;454521;454522;454523;454524;454525;454526;454527;454528;454529;454530;454531;454532;454533;454534;454535;454536;454537;454538;454539;454540;454541;454542;454543 454517 24 SGSHGYDMSTFIR Oxidation (M) 1472.6354 0.63542742 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9;E5RFC6;E5RK51;E5RIJ5 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 1 0 1 2 1 2 2 3 1 2 36.601 36.601 2;3 0.0014906 32770 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.979 70.608 338200000 0 56041000 0 0 0 0 0 29836000 54254000 0 134630000 0 63440000 39885 907 37221 357351;357352;357353;357354;357355;357356;357357;357358;357359;357360;357361;357362;357363;357364 454544;454545;454546;454547;454548;454549;454550;454551;454552;454553;454554;454555;454556;454557 454553 554 13 SGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVR Oxidation (M) 2183.0576 0.057555014 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 51.369 51.369 2;3 1.3497E-112 49459 QUIQUE_DMIX3_190116_001 200.16 186.48 1579300000 84314000 116090000 109030000 84599000 106170000 85324000 83103000 161860000 216230000 104810000 258890000 168840000 0 39886 452 37222 357365;357366;357367;357368;357369;357370;357371;357372;357373;357374;357375;357376;357377;357378;357379 454558;454559;454560;454561;454562;454563;454564;454565;454566;454567;454568;454569;454570;454571;454572;454573 454568 334 16 SGSHTVAVMNVGAPAAGMNAAVR Unmodified 2167.0626 0.062640392 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 68.47 68.47 2;3 2.1234E-142 68441 QUIQUE_DMIX3_190116_001 258.81 232.27 5400600000 495720000 562000000 539180000 448710000 323940000 328010000 392200000 399230000 445850000 125840000 531260000 416750000 391930000 39887 452 37222 357380;357381;357382;357383;357384;357385;357386;357387;357388;357389;357390;357391;357392;357393;357394;357395;357396;357397;357398;357399;357400;357401;357402;357403;357404 454574;454575;454576;454577;454578;454579;454580;454581;454582;454583;454584;454585;454586;454587;454588;454589;454590;454591;454592;454593;454594;454595;454596;454597;454598;454599;454600;454601;454602 454593 29 SGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSR Unmodified 3445.7188 0.71876971 4410 Q9UBV8 PEF1 Peflin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 171.66 171.66 3 1.8129E-41 175585 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.93 115.88 741700000 0 0 34888000 0 0 0 0 65607000 129560000 0 278720000 179100000 53820000 39888 4410 37223 357405;357406;357407;357408;357409;357410 454603;454604;454605;454606;454607;454608;454609 454608 7 SGSISYTELQQALSQMGYNLSPQFTQLLVSR Oxidation (M) 3461.7137 0.71368433 4410 Q9UBV8 PEF1 Peflin yes yes 0 1 0 1 1 1 166.56 166.56 3 1.1933E-19 169776 QUIQUE_C1403_190116_001 76.859 61.218 120550000 0 0 0 25861000 0 43979000 0 0 0 0 0 0 50713000 39889 4410 37223 357411;357412;357413 454610;454611;454612;454613 454611 2938 4 SGSLAVDNADPILK Unmodified 1398.7355 0.73545904 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 74.553 74.553 2 0.0013873 75719 QUIQUE_C1218_190116_001 75.819 66.956 284540000 67694000 40858000 0 0 70167000 0 0 48222000 0 20696000 0 36907000 0 39890 2377 37224 357414;357415;357416;357417;357418;357419 454614;454615;454616;454617;454618;454619;454620 454614 7 SGSLENVPNVGVNK Unmodified 1412.726 0.72595699 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.289 55.289 2 8.2592E-37 53597 QUIQUE_DMIX7_190116_001 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357438 454643 454643 1 SGSLSLTQFADMISLK Unmodified 1696.8706 0.87057232 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 153.96 153.96 2 0.03124 157762 QUIQUE_C1403_190116_001 59.116 42.863 26996000 0 0 0 26996000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39894 2096 37228 357439 454644 454644 1 SGSMATAEASGSDGK Acetyl (Protein N-term) 1396.5776 0.57763777 1263 J3KNF8 CYB5B yes yes 1 0 0 1 1 1 38.72 38.72 2 0.0025251 34806 QUIQUE_C1218_190116_001 59.227 47.634 21033000 21033000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39895 1263 37229 357440;357441;357442 454645;454646;454647 454645 3 SGSMDPSGAHPSVR Oxidation (M) 1399.615 0.61502633 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 2 2 2 1 1 1 11.446 11.446 2;3 0.00010807 3815 QUIQUE_C1403_190116_001 87.083 83.86 181790000 5017000 0 23057000 17706000 0 0 0 20620000 42858000 0 30759000 13970000 27800000 39896 2908 37230 357443;357444;357445;357446;357447;357448;357449;357450;357451;357452;357453 454648;454649;454650;454651;454652;454653;454654;454655;454656;454657;454658;454659;454660;454661 454652 2386 13 SGSMDPSGAHPSVR Unmodified 1383.6201 0.62011171 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 19.175 19.175 2;3 0.0030262 11863 QUIQUE_DMIX5_190116_001 60.196 52.472 1114500000 0 221300000 211470000 0 113520000 0 0 123650000 29274000 0 254150000 0 161130000 39897 2908 37230 357454;357455;357456;357457;357458;357459;357460;357461;357462;357463;357464 454662;454663;454664;454665;454666;454667;454668;454669;454670;454671;454672 454670 7 SGSMSAYEMR Unmodified 1117.4532 0.4532293 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 34.772 34.772 2 0.036655 30521 QUIQUE_C1576_190116_001 52.278 43.064 213120000 0 0 0 60347000 54994000 0 45080000 0 0 0 0 0 52695000 39898 1921 37231 357465;357466;357467;357468 454673;454674;454675;454676 454675 3 SGSMSAYEMR Oxidation (M) 1133.4481 0.44814392 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 1 0 1 20.983 20.983 2 0.024333 13592 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.35 51.41 17443000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17443000 0 0 0 39899 1921 37231 357469 454677 454677 1 SGSTAVGVLISPQHTYFINCGDSR Unmodified 2565.2282 0.2281854 2387 P35813;E9PKB5;E9PJN3 PPM1A Protein phosphatase 1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.26 103.26 3 4.5822E-88 106176 QUIQUE_C1277_190116_001 143.19 135.57 598030000 101410000 99558000 97046000 0 98637000 61784000 0 56898000 0 0 0 0 82705000 39900 2387 37232 357470;357471;357472;357473;357474;357475;357476 454678;454679;454680;454681;454682;454683;454684;454685;454686;454687;454688 454681 10 SGSTAVGVMISPK Unmodified 1232.6435 0.64347291 1652 O75688;C9JIR6;A0A3B3IS24;B8ZZF0 PPM1B Protein phosphatase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.183 51.183 2 0.011792 49019 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.672 56.08 160260000 40337000 28773000 33527000 0 0 0 0 0 0 0 33665000 23964000 0 39901 1652 37233 357477;357478;357479;357480;357481 454689;454690;454691;454692;454693;454694 454694 4 SGSWAAIYQDIR Unmodified 1365.6677 0.66771383 2133 P18031 PTPN1 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1 yes yes 0 0 0 1 1 107.93 107.93 2 0.021333 110780 QUIQUE_C1403_190116_001 53.013 29.693 24446000 0 0 0 24446000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39902 2133 37234 357482;357483 454695;454696 454695 2 SGSYSYLEER Unmodified 1189.5251 0.52513192 1467 O14974;H0YIS3;H0YIM2;A0A0U1RQZ1 PPP1R12A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 45.941 45.941 2 0.028317 42280 QUIQUE_C1403_190116_001 55.064 39.625 55724000 0 0 0 26797000 0 0 0 28927000 0 0 0 0 0 39903 1467 37235 357484;357485 454697;454698 454697 2 SGTALHEAALCGK Unmodified 1313.6398 0.63978452 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 21.526 21.526 2 4.827E-14 14013 QUIQUE_C1277_190116_001 158.94 127.18 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39904 3718 37236 357486;357487 454699;454700 454700 2 SGTASVVCLLNNFYPR Unmodified 1796.888 0.88795372 1815 P01834 IGKC Ig kappa chain C 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357535;357536;357537;357538;357539;357540;357541;357542;357543;357544;357545;357546;357547;357548;357549;357550;357551 454808;454809;454810;454811;454812;454813;454814;454815;454816;454817;454818;454819;454820;454821;454822;454823;454824;454825 454825 16 SGTGIAAMSVMRPEQIMK Oxidation (M) 1921.9424 0.94237383 2264 P27449 ATP6V0C V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit yes yes 0 1 1 1 2 1 3 3 1 1 71.315 71.315 2;3 3.4323E-22 72591 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.1 126.35 519960000 0 75902000 70303000 0 0 0 0 37540000 181000000 0 106730000 18586000 29898000 39909 2264 37240 357552;357553;357554;357555;357556;357557;357558;357559;357560;357561;357562;357563 454826;454827;454828;454829;454830;454831;454832;454833;454834;454835;454836;454837 454834 1635;1636 11 SGTGIAAMSVMRPEQIMK 2 Oxidation (M) 1937.9373 0.93728845 2264 P27449 ATP6V0C V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit yes yes 0 2 1 1 54.652 54.652 3 0.0097347 52381 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.76 37.506 46614000 0 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 1793.9887 0.98871362 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 153.3 153.3 2 0.00013157 157593 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.43 66.71 469750000 34164000 60997000 0 49267000 36235000 32343000 0 31917000 44005000 23244000 26409000 53384000 77783000 39914 3402 37243 357609;357610;357611;357612;357613;357614;357615;357616;357617;357618;357619;357620 454891;454892;454893;454894;454895;454896;454897;454898;454899;454900;454901;454902 454901 10 SGTLVIDFR Unmodified 1006.5447 0.54474515 1691;1214 H7BY57;D6RBU5;D6RHX4;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.551 84.551 2 9.6027E-05 86461 QUIQUE_C1368_190116_001 144.12 88.591 1188700000 133600000 154830000 81701000 82680000 83002000 75269000 116570000 75561000 77101000 54832000 92141000 87377000 74032000 39915 1214;1691 37244 357621;357622;357623;357624;357625;357626;357627;357628;357629;357630;357631;357632;357633 454903;454904;454905;454906;454907;454908;454909;454910;454911;454912;454913;454914;454915;454916;454917;454918;454919;454920;454921;454922;454923;454924;454925;454926 454907 24 SGTMNSYEMR Oxidation (M) 1190.4696 0.46960765 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.343 19.343 2 0.0081599 11877 QUIQUE_C1576_190116_001 73.985 61.026 822170000 38859000 76130000 59198000 62266000 37228000 51972000 44638000 61847000 98541000 52187000 74332000 77302000 87665000 39916 2127 37245 357634;357635;357636;357637;357638;357639;357640;357641;357642;357643;357644;357645;357646 454927;454928;454929;454930;454931;454932;454933;454934;454935;454936;454937;454938;454939 454933 1462 13 SGTMNSYEMR Unmodified 1174.4747 0.47469303 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.744 29.744 2 0.0056827 24075 QUIQUE_C1277_190116_001 102.07 92.479 944930000 89374000 97058000 93896000 109000000 77757000 0 120330000 0 0 32624000 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357658;357659;357660;357661;357662;357663;357664;357665;357666;357667;357668;357669;357670;357671;357672;357673;357674;357675;357676;357677;357678;357679;357680;357681;357682 454951;454952;454953;454954;454955;454956;454957;454958;454959;454960;454961;454962;454963;454964;454965;454966;454967;454968;454969;454970;454971;454972;454973;454974;454975;454976;454977;454978;454979;454980;454981;454982;454983;454984;454985;454986;454987;454988;454989 454952 39 SGTTSQPEAAPTQAK Unmodified 1472.7107 0.71070086 4488 Q9ULE6 PALD1 Paladin yes yes 0 0 0 1 1 14.784 14.784 2 0.01576 6767 QUIQUE_C1368_190116_001 49.632 30.959 22219000 8850000 0 13369000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39920 4488 37248 357683;357684 454990;454991 454991 2 SGTTWVSQILDMIYQGGDLEK Unmodified 2340.1308 0.13076276 1201 H3BRY5;P50225;P50226;E9PKW4;E9PKR8;A0A0A6YYL2;P0DMN0;P0DMM9;E9PM76;H3BNY7 SULT1A1;SULT1A2;SULT1A4;SULT1A3 Sulfotransferase;Sulfotransferase 1A1;Sulfotransferase 1A2;Sulfotransferase 1A4;Sulfotransferase 1A3 yes no 0 0 0 2 1 174.51 174.51 2;3 1.6498E-19 178607 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.776 85.115 48602000 0 0 0 0 0 0 0 0 31226000 0 17376000 0 0 39921 1201 37249 357685;357686;357687 454992;454993;454994;454995 454992 3 SGTVDPQELQK Unmodified 1200.5986 0.59863121 685 C9J0K6;P30626 SRI Sorcin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.514 29.514 2 7.3874E-13 23901 QUIQUE_DMIX3_190116_001 166.09 132 17471000000 1183300000 1041900000 1498100000 1173100000 1211300000 1374700000 1468200000 1366600000 1670400000 534630000 1541700000 1562800000 1844100000 39922 685 37250 357688;357689;357690;357691;357692;357693;357694;357695;357696;357697;357698;357699;357700 454996;454997;454998;454999;455000;455001;455002;455003;455004;455005;455006;455007;455008;455009;455010;455011 455006 16 SGVAGHLILSDEDVTSEVQGLWR Unmodified 2467.2343 0.23431663 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 138.73 138.73 3 0.02219 143911 QUIQUE_DMIX8_190116_001 38.359 30.367 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39923 1510 37251 357701 455012 455012 1 SGVAYIAAPSGSAADK Unmodified 1463.7256 0.72562264 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.843 47.843 2 6.7738E-07 44713 QUIQUE_C1403_190116_001 113.95 91.041 1369000000 121700000 158300000 194380000 174030000 200930000 0 0 88649000 139810000 117530000 173690000 0 0 39924 2339 37252 357702;357703;357704;357705;357706;357707;357708;357709;357710 455013;455014;455015;455016;455017;455018;455019;455020;455021 455016 9 SGVAYIAAPSGSAADKVVIEACDELGIILAHTNLR Unmodified 3580.8559 0.85593189 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 166.28 166.28 3;4 1.1597E-65 170879 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.03 128.6 1864600000 0 0 0 0 0 0 0 284490000 221890000 0 693570000 513130000 151500000 39925 2339 37253 357711;357712;357713;357714;357715;357716 455022;455023;455024;455025;455026;455027 455023 6 SGVDADSSYFK Unmodified 1174.5142 0.51423288 4581 Q9Y394 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes yes 0 0 0 1 51.142 51.142 2 0.026831 48809 QUIQUE_C1403_190116_001 68.893 51.653 56122000 0 0 0 56122000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39926 4581 37254 357717 455028 455028 0 SGVEKDLDEVLQTHSVFVNVSK Unmodified 2429.2438 0.24381868 4583 Q9Y3A5;F8WE72 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 0 0 1 1 114.61 114.61 3 4.1291E-05 120442 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.437 49.249 60717000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60717000 0 0 39927 4583 37255 357718 455029 455029 1 SGVGNIFIK Unmodified 933.52837 0.5283668 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E5RGH3;E5RJB9;E5RH24;Q4VXU2;Q96DU9 PABPC1;PABPC1L;PABPC5 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 1-like;Polyadenylate-binding protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.891 65.891 2 0.00076343 66071 QUIQUE_C1218_190116_001 110.03 39.336 381410000 106280000 0 0 0 0 0 0 105730000 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3490 Q86UP2 KTN1 Kinectin yes yes 0 0 1 1 1 26.899 26.899 3 0.026961 21156 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.671 15.299 77845000 0 0 0 0 0 0 0 0 36133000 0 0 41713000 0 39932 3490 37260 357727;357728 455039;455040;455041 455041 3 SGVISDTELQQALSNGTWTPFNPVTVR Unmodified 2916.4618 0.46175038 1623 O75340;E7EPW6;H0Y9X3 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 2 1 158.94 158.94 2;3 2.9586E-77 164427 QUIQUE_C1218_190116_001 209.73 188.19 2667100000 217860000 245030000 211160000 163400000 193340000 134170000 127730000 226020000 257910000 58703000 345620000 282450000 203740000 39933 1623 37261 357729;357730;357731;357732;357733;357734;357735;357736;357737;357738;357739;357740;357741;357742;357743;357744;357745;357746;357747;357748 455042;455043;455044;455045;455046;455047;455048;455049;455050;455051;455052;455053;455054;455055;455056;455057;455058;455059;455060;455061;455062 455042 21 SGVLQALLGR Unmodified 1012.6029 0.60292873 3548 Q8IXI2;H7BXZ6;K7EIQ7 RHOT1 Mitochondrial Rho GTPase 1;Mitochondrial Rho GTPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.73 112.73 2 0.00042928 115651 QUIQUE_DMIX7_190116_001 111.74 65.857 342260000 39228000 38863000 0 29208000 35083000 29508000 47889000 27380000 36092000 15150000 0 43860000 0 39934 3548 37262 357749;357750;357751;357752;357753;357754;357755;357756;357757;357758 455063;455064;455065;455066;455067;455068;455069;455070;455071;455072;455073;455074;455075;455076;455077 455077 15 SGVLSVSSGAAAHR Unmodified 1297.6739 0.67386184 130 A0A0A0MTC7;A0A0A0MQS9;Q16363;H0Y351;H0YAQ5;E5RFQ2 LAMA4 Laminin subunit alpha-4 yes no 0 0 0 1 1 1 23.487 23.487 3 0.0003669 16778 QUIQUE_C1368_190116_001 77.078 64.5 81431000 0 0 33909000 0 47521000 0 0 0 0 0 0 0 0 39935 130 37263 357759;357760;357761 455078;455079;455080 455078 3 SGVSDHWALDDHHALHLTR Unmodified 2166.0355 0.035497664 4223 Q9HCC0;D6RD67;D6RDF7;D6R9R1 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 56.116 56.116 4;5 2.9769E-05 54515 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.776 77.06 816800000 71497000 58936000 170190000 89388000 0 59002000 97336000 125960000 0 76044000 0 68439000 0 39936 4223 37264 357762;357763;357764;357765;357766;357767;357768;357769;357770;357771;357772;357773 455081;455082;455083;455084;455085;455086;455087;455088;455089;455090;455091;455092;455093 455088 12 SGVSGIVGMEVDGLPFHNTHAEMIQK Unmodified 2752.3313 0.33127026 3457 Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 1 110.13 110.13 3;4 3.7273E-57 112649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.77 142.66 1318400000 394310000 0 283070000 0 0 63042000 177530000 261590000 0 51410000 87469000 0 0 39937 3457 37265 357774;357775;357776;357777;357778;357779;357780;357781;357782;357783;357784;357785 455094;455095;455096;455097;455098;455099;455100;455101;455102;455103;455104;455105 455102 10 SGVSITIDDPVR Unmodified 1257.6565 0.65648044 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3;G3V3B0 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 0 1 78.098 78.098 2 0.031695 80394 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.094 33.192 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39938 4745 37266 357786 455106 455106 1 SGVYQHVTGEMMGGHAIR Unmodified 1928.8985 0.89853518 1930 P07858;R4GMQ5 CTSB Cathepsin B;Cathepsin B light chain;Cathepsin B heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 1 2 1 1 55.001 55.001 3;4 7.0503E-05 53503 QUIQUE_C1576_190116_001 73.11 62.166 2734900000 153530000 170020000 210540000 159150000 324250000 0 288710000 436380000 0 60393000 523430000 175670000 232830000 39939 1930 37267 357787;357788;357789;357790;357791;357792;357793;357794;357795;357796;357797;357798;357799;357800;357801 455107;455108;455109;455110;455111;455112;455113;455114;455115;455116;455117;455118;455119;455120;455121 455113 14 SGVYQHVTGEMMGGHAIR Oxidation (M) 1944.8934 0.8934498 1930 P07858;R4GMQ5 CTSB Cathepsin B;Cathepsin B light chain;Cathepsin B heavy chain yes no 0 1 0 2 38.097 38.097 3 0.0001296 29537 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.932 68.174 98145000 0 0 0 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37270 357811 455131 455131 1 SGYHQSASEHGLVVIAPDTSPR Unmodified 2307.1244 0.12437225 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 49.995 49.995 2;3;4 6.8717E-88 47716 QUIQUE_C1277_190116_001 228.39 198.71 14573000000 1019300000 1115600000 1172000000 1440900000 734530000 980670000 1124100000 1035800000 1432800000 673450000 1326700000 943250000 1574200000 39944 2003 37271 357812;357813;357814;357815;357816;357817;357818;357819;357820;357821;357822;357823;357824;357825;357826;357827;357828;357829;357830;357831;357832;357833;357834;357835;357836;357837;357838;357839;357840;357841;357842;357843;357844;357845;357846;357847;357848;357849;357850;357851 455132;455133;455134;455135;455136;455137;455138;455139;455140;455141;455142;455143;455144;455145;455146;455147;455148;455149;455150;455151;455152;455153;455154;455155;455156;455157;455158;455159;455160;455161;455162;455163;455164;455165;455166;455167;455168;455169;455170;455171;455172;455173;455174;455175;455176;455177;455178;455179;455180;455181;455182;455183;455184;455185;455186;455187;455188;455189;455190;455191;455192;455193;455194;455195;455196;455197;455198;455199;455200;455201;455202;455203;455204;455205 455142 74 SGYHYVCLR Unmodified 1153.5339 0.53386288 2863 Q01970 PLCB3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 1 32.184 32.184 3 0.032937 27223 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.511 20.845 14261000 0 0 0 0 0 0 0 14261000 0 0 0 0 0 39945 2863 37272 357852 455206 455206 1 SGYIDEHELDALLK Unmodified 1601.7937 0.7937022 2201 P22676;H3BMN5 CALB2 Calretinin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.98 115.98 3 2.665E-05 120029 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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357866;357867;357868;357869;357870;357871;357872;357873;357874;357875;357876;357877;357878;357879;357880;357881;357882;357883;357884;357885;357886;357887 455240;455241;455242;455243;455244;455245;455246;455247;455248;455249;455250;455251;455252;455253;455254;455255;455256;455257;455258;455259;455260;455261;455262;455263;455264;455265;455266;455267;455268;455269;455270;455271;455272 455260 33 SGYIEANELK Unmodified 1122.5557 0.55570376 2201 P22676;H3BN14;A6NER6;H3BMN5 CALB2 Calretinin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.134 45.134 2 0.00072522 42017 QUIQUE_C1277_190116_001 107.15 67.152 19054000000 1652500000 1553100000 1435200000 1272300000 2101500000 1187900000 1358100000 1596300000 1638600000 663160000 1499300000 1487900000 1608500000 39948 2201 37275 357888;357889;357890;357891;357892;357893;357894;357895;357896;357897;357898;357899;357900 455273;455274;455275;455276;455277;455278;455279;455280;455281;455282;455283;455284;455285;455286;455287;455288;455289;455290;455291;455292;455293 455274 19 SGYIPSGHSLGTPEPAPR Unmodified 1821.901 0.90096124 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 52.251 52.251 3 0.060636 50505 QUIQUE_DMIX3_190116_001 25.198 14.917 32476000 0 0 0 0 0 0 0 0 32476000 0 0 0 0 39949 422 37276 357901 455294 455294 1 SGYITIGYR Unmodified 1028.5291 0.52909508 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.827 64.827 2 0.00040007 64333 QUIQUE_C1277_190116_001 121.85 52.674 797960000 100580000 78746000 107580000 127670000 93505000 0 0 0 76624000 61323000 0 79443000 72482000 39950 3827 37277 357902;357903;357904;357905;357906;357907;357908;357909;357910;357911 455295;455296;455297;455298;455299;455300;455301;455302;455303;455304;455305 455296 11 SGYLLPDTK Unmodified 992.51786 0.51786169 2079 P14625;H0YIV0 HSP90B1 Endoplasmin yes 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455318 4 SGYQDMPEYENFR Unmodified 1634.6671 0.66712148 1007 F5H365;Q15436 SEC23A Protein transport protein Sec23A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.783 84.783 2 0.00061933 85857 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.79 95.362 247280000 27569000 25550000 37185000 24327000 22618000 28383000 0 18720000 23116000 12626000 27185000 0 0 39954 1007 37281 357926;357927;357928;357929;357930;357931;357932;357933;357934;357935 455321;455322;455323;455324;455325;455326;455327;455328;455329;455330 455327 10 SGYSSPGSPGTPGSR Unmodified 1392.627 0.62697123 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.059 23.059 2 2.4864E-35 16385 QUIQUE_C1218_190116_001 169.21 158.05 6731500000 564670000 650340000 511360000 478470000 630330000 358020000 594870000 380430000 589360000 173220000 661890000 448830000 689730000 39955 291;1247 37282 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358041;358042;358043;358044;358045;358046;358047;358048;358049;358050;358051;358052;358053;358054;358055;358056;358057;358058;358059;358060;358061;358062;358063;358064;358065;358066 455464;455465;455466;455467;455468;455469;455470;455471;455472;455473;455474;455475;455476;455477;455478;455479;455480;455481;455482;455483;455484;455485;455486;455487;455488;455489;455490;455491;455492;455493;455494;455495;455496;455497;455498;455499;455500;455501;455502;455503;455504;455505;455506;455507;455508;455509;455510;455511;455512;455513;455514;455515;455516;455517;455518;455519;455520;455521 455468 57 SHDQVWVLSWGTLEK Unmodified 1783.8893 0.88933392 3589 Q8N475 FSTL5 Follistatin-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 122.17 122.17 3 0.014956 126685 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.982 28.392 14737000 0 0 0 0 0 0 0 0 14737000 0 0 0 0 39969 3589 37295 358067 455522 455522 1 SHDTTSNTLAQLLAK Unmodified 1598.8264 0.82639932 937 E9PIE3;Q969G5 PRKCDBP Protein kinase C delta-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 79.512 79.512 2;3 3.3926E-05 81376 QUIQUE_C1438_190116_001 65.773 53.413 101460000 0 19583000 0 35642000 46234000 0 0 0 0 0 0 0 0 39970 937 37296 358068;358069;358070 455523;455524;455525 455525 2 SHEGETAYIR Unmodified 1161.5415 0.54145068 1294 J3KTL2;Q07955;J3KSR8 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 16.335 16.335 2;3 4.9394E-05 8423 QUIQUE_C1438_190116_001 143.37 113.3 5466200000 337070000 592470000 363700000 522880000 449290000 449380000 428780000 453850000 618020000 147060000 322880000 527940000 252840000 39971 1294 37297 358071;358072;358073;358074;358075;358076;358077;358078;358079;358080;358081;358082;358083;358084;358085;358086;358087;358088;358089;358090;358091;358092;358093;358094;358095 455526;455527;455528;455529;455530;455531;455532;455533;455534;455535;455536;455537;455538;455539;455540;455541;455542;455543;455544;455545;455546;455547;455548;455549;455550;455551 455535 26 SHEGETSYIR Unmodified 1177.5364 0.53636531 2980 Q13242 SRSF9 Serine/arginine-rich splicing factor 9 yes yes 0 0 0 1 1 15.43 15.43 3 0.027897 7745 QUIQUE_DMIX4_190116_001 33.875 21.712 80051000 0 58994000 0 0 0 0 0 0 0 21057000 0 0 0 39972 2980 37298 358096;358097 455552;455553 455553 1 SHENEAEALRGEIQSLKEENNR Unmodified 2552.2215 0.22152011 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5;O95317;Q9UES5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 2 1 1 70.71 70.71 4 0.0015906 70139 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.052 37.254 150460000 0 0 0 0 0 0 0 80918000 0 0 0 0 69539000 39973 4607 37299 358098;358099 455554;455555 455555 2 SHFEQWGTLTDCVVMR Oxidation (M) 1980.8822 0.88221641 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8W646 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 91.879 91.879 2;3 1.3914E-18 95025 QUIQUE_C1218_190116_001 141.54 119 647840000 33457000 183240000 52751000 25142000 39597000 38824000 32706000 15185000 22538000 109120000 37917000 20696000 36672000 39974 1049 37300 358100;358101;358102;358103;358104;358105;358106;358107;358108;358109;358110;358111;358112;358113;358114 455556;455557;455558;455559;455560;455561;455562;455563;455564;455565;455566;455567;455568;455569;455570 455556 621 12 SHFEQWGTLTDCVVMR Unmodified 1964.8873 0.88730179 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8W646 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.02 103.02 3 9.4737E-13 107435 QUIQUE_C1438_190116_001 100.41 90.452 574790000 0 0 0 0 0 0 0 105320000 119790000 41187000 0 193990000 114510000 39975 1049 37300 358115;358116;358117;358118;358119;358120;358121 455571;455572;455573;455574;455575;455576;455577;455578 455571 7 SHFEQWGTLTDCVVMRDPNTK Unmodified 2520.1526 0.15257761 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8W646 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 92.306 92.306 3 1.052E-09 94384 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.31 90.382 262130000 0 0 0 0 0 0 0 81353000 66481000 0 51442000 62853000 0 39976 1049 37301 358122;358123;358124;358125;358126 455579;455580;455581;455582;455583 455581 4 SHFEQWGTLTDCVVMRDPNTKR Unmodified 2676.2537 0.25368864 1049 F8W6I7;P09651;F8VZ49;Q32P51;F8W646 HNRNPA1;HNRNPA1L2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1-like 2 yes no 0 0 2 1 1 80.222 80.222 4 4.7772E-09 81125 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.131 92.399 164760000 0 0 0 0 0 0 0 118340000 0 0 0 0 46419000 39977 1049 37302 358127;358128 455584;455585;455586 455585 3 SHFQHVFVIVR Unmodified 1367.7462 0.74623892 1511 O43166;F5GYF8;H0YJY2 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.659 47.659 3 0.0012752 44163 QUIQUE_C1368_190116_001 58.274 7.3236 148740000 0 40923000 30896000 0 0 0 0 25170000 0 0 0 51747000 0 39978 1511 37303 358129;358130;358131;358132;358133 455587;455588;455589;455590;455591 455588 4 SHFVLIAGEPLREPVIQHGPFVMNTNEEISQAILDFR Unmodified 4203.1575 0.15753364 1419 O00625 PIR Pirin yes yes 0 0 1 1 148.13 148.13 5 3.981E-07 155733 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.777 45.098 52261000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52261000 0 0 39979 1419 37304 358134 455592 455592 1 SHGFAAEFK Unmodified 992.47158 0.4715802 2664 P55265;A0A3B3IRQ9;H0YCK3;A0A3B3ISX1 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 24.43 24.43 2 0.017275 18053 QUIQUE_C1368_190116_001 65.156 37.049 46741000 0 0 46741000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39980 2664 37305 358135 455593 455593 1 SHGKDEECVLEAENKK Unmodified 1871.8683 0.86834049 744 C9JTE9;Q9UHQ4;C9IYK6;H7C5E2;B7Z2L0;H0Y7N8 BCAP29 B-cell receptor-associated protein 29 yes no 0 0 2 1 1 1 2 14.986 14.986 3;4 0.0053452 7015 QUIQUE_C1368_190116_001 38.093 33.275 151860000 29280000 0 42975000 18470000 0 0 61130000 0 0 0 0 0 0 39981 744 37306 358136;358137;358138;358139;358140 455594;455595;455596;455597;455598 455595 4 SHGNTLLSAAAAALCAGEPGPEGLLIVNTLPWK Unmodified 3327.7285 0.72854653 4292 Q9NTJ4 MAN2C1 Alpha-mannosidase 2C1 yes yes 0 0 0 1 167.56 167.56 3 6.5142E-07 161569 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.583 45.318 17028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17028000 0 0 0 39982 4292 37307 358141 455599 455599 1 SHHGEHERPEFIAYPHLR Unmodified 2211.0722 0.072217521 2034 P12074 COX6A1 Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.85 32.85 5 9.2124E-05 26933 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.215 48.027 1642000000 0 129040000 0 37289000 0 0 210390000 131060000 205880000 29467000 400120000 233460000 265290000 39983 2034 37308 358142;358143;358144;358145;358146;358147;358148;358149;358150 455600;455601;455602;455603;455604;455605;455606;455607;455608;455609;455610;455611 455608 12 SHHHGVTCDSACDSLSHHSDR Unmodified 2400.9672 0.96723646 1424 O14490;Q6IS01 DLGAP1 Disks large-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 10.496 10.496 5 0.016168 2729 QUIQUE_C1563_190116_001 30.659 30.538 1448800 0 0 0 0 0 1448800 0 0 0 0 0 0 0 39984 1424 37309 358151 455612 455612 0 SHHWGYGK Acetyl (Protein N-term) 1012.4515 0.45151346 1796 P00918;E5RID5;E5RK37 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 18.053 18.053 2 0.0018021 10370 QUIQUE_DMIX4_190116_001 130.04 104.15 218430000 0 0 0 0 0 9817300 0 100970000 0 107650000 0 0 0 39985 1796 37310 358152;358153;358154;358155 455613;455614;455615;455616 455616 4 SHIGLVYSQQINEVLDQLANLNGR Unmodified 2680.3933 0.39327689 3721 Q8WXG6;A0A0A0MRB5;F8W8U2 MADD MAP kinase-activating death domain protein yes no 0 0 0 1 160.34 160.34 3 9.3215E-06 164721 QUIQUE_DMIX7_190116_001 57.802 45.606 39481000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39481000 0 39986 3721 37311 358156 455617 455617 0 SHIMPAEFSSCPLNSDEEVNK Unmodified 2390.0519 0.051860514 4127 Q9H0W9;A0A087WT99;E9PQS1;E9PJU8;E9PPB5;A0A1W2PRB8 C11orf54 Ester hydrolase C11orf54 yes no 0 0 0 1 1 1 78.284 78.284 2;3 5.1222E-06 79265 QUIQUE_C1368_190116_001 106.3 101.59 107730000 49584000 0 18105000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40037000 39987 4127 37312 358157;358158;358159 455618;455619;455620 455619 2 SHIQIPPGLTELLQGYTVEVLR Acetyl (Protein N-term) 2504.3639 0.36387424 2069 P13861;C9J830 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 1 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 170.88 170.88 2;3 4.7426E-37 173537 QUIQUE_C1403_190116_001 114.84 101.52 2433100000 19628000 235240000 177210000 80952000 289500000 0 217530000 224090000 71656000 0 342910000 504410000 270000000 39988 2069 37313 358160;358161;358162;358163;358164;358165;358166;358167;358168;358169;358170;358171;358172;358173;358174;358175;358176;358177 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RNA-binding protein Luc7-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 42.388 42.388 3 0.00015214 37939 QUIQUE_C1563_190116_001 79.805 67.889 159360000 30199000 49230000 0 33780000 0 46151000 0 0 0 0 0 0 0 39991 4580 37316 358187;358188;358189;358190 455650;455651;455652;455653 455653 4 SHLQEYLNK Unmodified 1130.572 0.57202253 2448 P42356 PI4KA Phosphatidylinositol 4-kinase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 24.661 24.661 2 0.0022699 18974 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.09 68.634 77931000 0 0 0 0 0 0 0 0 30249000 0 0 0 47682000 39992 2448 37317 358191;358192;358193 455654;455655;455656 455655 2 SHLVNEVPVLASPDLLSEVSEMK Unmodified 2492.2832 0.28324066 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 140.76 140.76 3 2.1433E-06 146067 QUIQUE_C1218_190116_001 56.371 48.474 62564000 45374000 0 0 0 0 0 0 0 0 17191000 0 0 0 39993 1255;2856 37318 358194;358195 455657;455658 455657 2 SHLVNEVPVLASPDLLSEVSEMKQDLIK Unmodified 3089.6319 0.63185218 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 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SHWLGPNYTK Unmodified 1201.588 0.58800695 2854 Q01433;H0Y360;H0YF16 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 33.563 33.563 2;3 0.0014115 28243 QUIQUE_C1218_190116_001 97.965 72.975 117280000 58782000 0 0 0 0 0 0 58496000 0 0 0 0 0 40025 2854 37350 358558;358559;358560;358561 456080;456081;456082;456083 456080 3 SHYAAEEISEK Unmodified 1262.5779 0.57789577 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 18.539 18.539 3 0.00051056 10999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.56 53.44 331860000 66092000 0 76715000 67599000 0 0 0 0 0 0 79832000 0 41621000 40026 1472 37351 358562;358563;358564;358565;358566 456084;456085;456086;456087;456088 456087 5 SHYFEGVLK Unmodified 1078.5447 0.54474515 1042 F8VYY9;P54619;H0YIC9;F8VZX1;H0YHF8 PRKAG1 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 44.753 44.753 2 0.0020774 41627 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.093 65.715 419100000 0 70959000 0 0 106180000 66999000 0 36469000 42310000 0 96182000 0 0 40027 1042 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Unmodified 2279.1083 0.10832826 1331 K7ELV2;Q96EE3;K7EP88;K7ENI5 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 1 1 73.388 73.388 5 0.058634 74006 QUIQUE_DMIX3_190116_001 10.981 2.3803 25958000 0 0 0 0 0 0 0 0 25958000 0 0 0 0 40030 1331 37355 358590 456113 456113 1 SIACWTLSR Unmodified 1092.5386 0.53861391 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 1 74.424 74.424 2 0.057023 74759 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.794 6.6852 47503000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47503000 0 40031 1446 37356 358591 456114 456114 1 SIAELVPK Unmodified 855.50657 0.50656873 994 F5GYQ1;P61421;R4GN72;H3BQJ1 ATP6V0D1 V-type proton ATPase subunit d 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 58.133 58.133 1;2 0.035879 56080 QUIQUE_C1563_190116_001 133.81 76.001 650570000 0 239320000 52411000 0 55360000 41959000 57378000 152160000 0 13277000 0 0 38699000 40032 994 37357 358592;358593;358594;358595;358596;358597;358598;358599 456115;456116;456117;456118;456119;456120;456121;456122 456118 2 SIAFHSAVSLDPIK Unmodified 1483.8035 0.80347903 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 81.616 81.616 2;3 0.00031083 81894 QUIQUE_C1563_190116_001 89.731 60.644 852780000 0 202880000 0 117140000 256470000 147170000 0 0 0 0 0 129130000 0 40033 4592 37358 358600;358601;358602;358603;358604;358605 456123;456124;456125;456126;456127;456128;456129 456128 7 SIAFPSIGSGR Unmodified 1090.5771 0.57710791 1626 O75367;B4DJC3 H2AFY Core histone macro-H2A.1;Histone H2A yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 78.482 78.482 2 0.0017273 80475 QUIQUE_C1438_190116_001 82.749 42.748 390960000 0 53403000 0 0 37894000 58498000 59565000 48531000 41931000 0 44598000 0 46536000 40034 1626 37359 358606;358607;358608;358609;358610;358611;358612;358613;358614;358615;358616;358617 456130;456131;456132;456133;456134;456135;456136;456137;456138;456139;456140;456141;456142;456143 456133 13 SIAIGSQPVLTVGTTHISK Unmodified 1908.068 0.068026571 3838 Q96DZ1 ERLEC1 Endoplasmic reticulum lectin 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 78.056 78.056 3 0.00060539 78711 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.936 46.739 313730000 42221000 33796000 63036000 0 33872000 0 0 0 45340000 0 50842000 0 44627000 40035 3838 37360 358618;358619;358620;358621;358622;358623;358624 456144;456145;456146;456147;456148;456149;456150 456150 7 SIAPITDFEYSQEFFDHVK Unmodified 2272.0688 0.068814432 2413 P38405;K7EPE2;K7EQ80 GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.73 138.73 3 0.00042086 142746 QUIQUE_C1403_190116_001 60.564 52.276 597280000 108800000 0 114410000 115230000 136200000 0 0 49803000 72831000 0 0 0 0 40036 2413 37361 358625;358626;358627;358628;358629;358630 456151;456152;456153;456154;456155;456156 456153 5 SIAPITDFEYSQEFFDHVKK Unmodified 2400.1638 0.16377745 2413 P38405;K7EPE2;K7EQ80 GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 122 122 4 0.0039173 126510 QUIQUE_DMIX8_190116_001 35.036 21.164 54142000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19772000 34370000 40037 2413 37362 358631;358632 456157;456158 456158 2 SIAQYWLGCPAPGHL Unmodified 1668.8082 0.80824683 1848 P04004 VTN Vitronectin;Vitronectin V65 subunit;Vitronectin V10 subunit;Somatomedin-B yes yes 0 0 0 1 1 127.18 127.18 2 0.0003976 131539 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.239 41.605 102600000 0 0 0 0 49991000 0 0 0 52612000 0 0 0 0 40038 1848 37363 358633;358634 456159;456160 456160 2 SIASHVRPDR Unmodified 1136.6051 0.60505399 175 A0A0A0MSJ0;Q86XP3 DDX42 ATP-dependent RNA helicase DDX42 yes no 0 0 1 1 10.352 10.352 3 0.012788 2762 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.518 7.1914 5279000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5279000 0 0 0 40039 175 37364 358635 456161 456161 1 SIATLAITTLLK Unmodified 1243.7751 0.77513901 4645;4396 Q9Y678;Q9UBF2 COPG1;COPG2 Coatomer subunit gamma-1;Coatomer subunit gamma-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.35 143.35 2 0.00089137 149051 QUIQUE_C1576_190116_001 85.958 81.346 1447300000 103260000 114550000 123020000 99623000 130640000 110840000 125690000 128840000 98222000 35037000 133870000 138800000 104900000 40040 4645;4396 37365 358636;358637;358638;358639;358640;358641;358642;358643;358644;358645;358646;358647;358648 456162;456163;456164;456165;456166;456167;456168;456169;456170;456171;456172;456173;456174;456175;456176;456177 456169 13 SIATLMTDEVFHDVAYK Unmodified 1938.9397 0.93971451 687 E7EW28;C9J240;Q6U841;F8WDX9 SLC4A10 Anion exchange protein;Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger yes no 0 0 0 1 135.35 135.35 3 0.011002 140900 QUIQUE_C1368_190116_001 41.86 32.455 22262000 0 0 22262000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40041 687 37366 358649 456178 456178 1 SIATTLIDDTSSEVLDELYR Unmodified 2240.106 0.1059878 816 E5RIJ3;D6RCM8;O95379 TNFAIP8 Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 168.86 168.86 2;3 8.235E-47 176042 QUIQUE_DMIX5_190116_001 161.76 148.78 163410000 0 0 0 25613000 0 0 30480000 0 40545000 0 66768000 0 0 40042 816 37367 358650;358651;358652;358653;358654;358655 456179;456180;456181;456182;456183;456184 456183 6 SICEVLDLER Unmodified 1232.6071 0.60708741 2384 P35659;B4DFG0;D6RDA2;H0Y8X0 DEK Protein DEK yes no 0 0 0 1 97.014 97.014 2 0.0056233 98345 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.95 50.578 18283000 0 0 0 0 0 0 0 18283000 0 0 0 0 0 40043 2384 37368 358656 456185;456186 456185 2 SICTTVLELLDK Unmodified 1390.7378 0.73776723 2262 P27348;E9PG15 YWHAQ 14-3-3 protein theta yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 148.57 148.57 1;2;3 8.2821E-29 152954 QUIQUE_C1277_190116_001 223.78 139.57 41768000000 5003900000 3377800000 3545600000 4628900000 3352700000 4264000000 3853000000 1461100000 2354500000 1390500000 3531000000 2591200000 2413800000 40044 2262 37369 358657;358658;358659;358660;358661;358662;358663;358664;358665;358666;358667;358668;358669;358670;358671;358672;358673 456187;456188;456189;456190;456191;456192;456193;456194;456195;456196;456197;456198;456199;456200;456201;456202;456203 456189 17 SICTTVLELLDKYLIANATNPESK Unmodified 2692.3993 0.39933305 2262 P27348;E9PG15 YWHAQ 14-3-3 protein theta yes no 0 0 1 1 2 1 2 3 3 2 2 170.07 170.07 2;3;4 0 177270 QUIQUE_DMIX5_190116_001 361.93 332.2 10396000000 0 9917000 0 0 605760000 0 37783000 702280000 2193100000 0 4841700000 1882800000 123060000 40045 2262 37370 358674;358675;358676;358677;358678;358679;358680;358681;358682;358683;358684;358685;358686;358687;358688;358689 456204;456205;456206;456207;456208;456209;456210;456211;456212;456213;456214;456215;456216;456217;456218;456219 456215 15 SIDAGPVDAWTLAFSPDSQYLATGTHVGK Unmodified 3003.4614 0.46141603 1171 H0YN81;Q9GZS3;H0YMF9 WDR61 WD repeat-containing protein 61;WD repeat-containing protein 61, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 1 1 1 147.1 147.1 3 8.3929E-15 150349 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.982 75.078 471780000 0 0 0 0 0 0 0 99106000 100950000 0 157890000 113830000 0 40046 1171 37371 358690;358691;358692;358693;358694 456220;456221;456222;456223;456224 456220 3 SIDAIPDNQK Unmodified 1099.551 0.55095274 2493 P47756 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.518 30.518 2 0.00028766 24925 QUIQUE_C1277_190116_001 116.05 42.802 1719100000 98799000 110260000 113370000 147100000 137500000 147130000 148610000 119320000 178770000 71658000 154620000 150480000 141480000 40047 2493 37372 358695;358696;358697;358698;358699;358700;358701;358702;358703;358704;358705;358706;358707 456225;456226;456227;456228;456229;456230;456231;456232;456233;456234;456235;456236;456237 456226 12 SIDDLEDELYAQK Unmodified 1537.7148 0.71478318 1164 H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.31 110.31 2 4.9505E-32 113436 QUIQUE_C1277_190116_001 185.29 156.34 1386300000 67240000 105420000 124770000 98621000 117950000 89739000 103170000 92473000 183410000 47272000 103470000 135800000 116920000 40048 1164 37373 358708;358709;358710;358711;358712;358713;358714;358715;358716;358717;358718;358719;358720 456238;456239;456240;456241;456242;456243;456244;456245;456246;456247;456248;456249;456250;456251;456252;456253 456240 15 SIDDLEDQLYQQLEQNR Unmodified 2105.9865 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124530000 40057 1748 37381 358789;358790;358791;358792;358793;358794;358795;358796;358797;358798;358799;358800;358801 456327;456328;456329;456330;456331;456332;456333;456334;456335;456336;456337;456338;456339;456340;456341;456342;456343 456333 14 SIDLVSSVDGTPSLPVSLSWVR Unmodified 2313.2216 0.22162668 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 158.54 158.54 2 4.1317E-36 160949 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.38 122.42 166740000 0 0 35035000 0 38214000 0 27224000 23942000 0 0 0 42325000 0 40058 3684 37382 358802;358803;358804;358805;358806 456344;456345;456346;456347;456348 456347 5 SIDMSWDSVTMK Unmodified 1398.6159 0.61593753 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;E9PN18;E9PMU7;E9PL19;H0YCP8 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 107.95 107.95 2 0.0015274 110061 QUIQUE_C1563_190116_001 80.763 61.448 302950000 28509000 30419000 35433000 25827000 0 27944000 26368000 0 34412000 0 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Unmodified 1931.9418 0.94176342 3620 Q8N9R8 SCAI Protein SCAI yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 172.13 172.13 2;3 3.0121E-29 179333 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.5 131.63 241660000 10288000 14301000 6551500 0 12915000 11263000 24212000 9199100 10132000 0 83289000 46561000 12943000 40061 3620 37385 358845;358846;358847;358848;358849;358850;358851;358852;358853;358854;358855;358856;358857 456391;456392;456393;456394;456395;456396;456397;456398;456399;456400;456401;456402;456403 456399 13 SIDQDYER Unmodified 1024.4462 0.44615331 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 23.714 23.714 2 0.013714 16915 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.953 76.539 244290000 0 0 0 49453000 0 0 0 54616000 84831000 0 0 0 55388000 40062 345 37386 358858;358859;358860;358861 456404;456405;456406;456407;456408 456408 5 SIDQFANLVLHQTVER Unmodified 1868.9745 0.97446054 1482 O15116 LSM1 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.71 131.71 3 4.6351E-06 136911 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.464 55.764 23813000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23813000 0 0 0 40063 1482 37387 358862;358863;358864;358865;358866;358867;358868;358869;358870 456409;456410;456411;456412;456413;456414;456415;456416;456417 456415 9 SIDRPFIDPQR Unmodified 1342.6993 0.69934831 4378 Q9P253 VPS18 Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog yes yes 0 0 1 1 49.737 49.737 3 0.032387 47396 QUIQUE_C1218_190116_001 43.897 13.961 22689000 22689000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40064 4378 37388 358871 456418 456418 1 SIDSNPYDTDK Unmodified 1253.5412 0.54117591 1245 I3L0N3;P46459;I3L0L3 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.05 32.05 2 0.00044438 27825 QUIQUE_C1438_190116_001 114.97 104.98 7194800000 822220000 921280000 653770000 665050000 562070000 621620000 777310000 197340000 297410000 330230000 498990000 401080000 446400000 40065 1245 37389 358872;358873;358874;358875;358876;358877;358878;358879;358880;358881;358882;358883;358884 456419;456420;456421;456422;456423;456424;456425;456426;456427;456428;456429;456430;456431;456432;456433;456434;456435;456436;456437;456438;456439;456440;456441;456442 456428 23 SIDTGMGLER Unmodified 1077.5125 0.51245874 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.094 51.094 2 0.0015474 49077 QUIQUE_C1576_190116_001 96.331 37.35 1440700000 184830000 145620000 178630000 147940000 0 159290000 156460000 76415000 90589000 35682000 0 121420000 143790000 40066 2533 37390 358885;358886;358887;358888;358889;358890;358891;358892;358893;358894;358895 456443;456444;456445;456446;456447;456448;456449;456450;456451;456452;456453;456454;456455 456449 12 SIDTGMGLER Oxidation (M) 1093.5074 0.50737336 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 28.989 28.989 2 0.0061533 23311 QUIQUE_C1277_190116_001 78.334 35.088 352710000 0 43100000 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456464;456465;456466;456467;456468;456469;456470 456465 7 SIEDFAHSSFQMALSK Unmodified 1796.8403 0.84033482 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 118.53 118.53 2;3 2.519E-54 122356 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.57 165.72 2836700000 181170000 229960000 226680000 252900000 229180000 207640000 225750000 310160000 228430000 69852000 302850000 218470000 153660000 40071 1662 37394 358911;358912;358913;358914;358915;358916;358917;358918;358919;358920;358921;358922;358923;358924;358925;358926;358927;358928;358929;358930;358931;358932;358933;358934;358935 456471;456472;456473;456474;456475;456476;456477;456478;456479;456480;456481;456482;456483;456484;456485;456486;456487;456488;456489;456490;456491;456492;456493;456494;456495;456496;456497 456489 27 SIEDFAHSSFQMALSK Oxidation (M) 1812.8352 0.83524944 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 103.89 103.89 2 0.0019193 108991 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.179 53.448 22253000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22253000 0 0 40072 1662 37394 358936 456498 456498 896 1 SIEEACFTLQYLNK Unmodified 1714.8236 0.82362212 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 1 3 3 1 1 1 1 4 2 3 116.05 116.05 2 1.9725E-22 119764 QUIQUE_C1277_190116_001 164.64 121.9 1372600000 0 199910000 151120000 84843000 144030000 138960000 206970000 0 0 0 258020000 188780000 0 40073 2483 37395 358937;358938;358939;358940;358941;358942;358943;358944;358945;358946;358947;358948;358949;358950;358951;358952;358953;358954;358955;358956 456499;456500;456501;456502;456503;456504;456505;456506;456507;456508;456509;456510;456511;456512;456513;456514;456515;456516;456517;456518;456519;456520;456521;456522;456523;456524 456501 25 SIEEACLTLQHLNR Unmodified 1682.841 0.84100352 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 1 74.129 74.129 2;3 1.4413E-150 74687 QUIQUE_DMIX1_190116_001 257.72 223.85 5476100000 342540000 500210000 659270000 356820000 500290000 387500000 630120000 94172000 335570000 141120000 480740000 706700000 341020000 40074 921 37396 358957;358958;358959;358960;358961;358962;358963;358964;358965;358966;358967;358968;358969;358970;358971;358972;358973;358974;358975;358976;358977;358978;358979 456525;456526;456527;456528;456529;456530;456531;456532;456533;456534;456535;456536;456537;456538;456539;456540;456541;456542;456543;456544;456545;456546;456547;456548;456549;456550;456551;456552;456553;456554;456555;456556;456557;456558;456559 456544 33 SIEEQLGTEIKPIPSNIDK Unmodified 2110.1158 0.11576462 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 2 1 1 93.438 93.438 2;3 1.6933E-85 95462 QUIQUE_DMIX7_190116_001 229.39 208.14 1825900000 207420000 242410000 235580000 33965000 178050000 228290000 203940000 31179000 43348000 74425000 261660000 42123000 43533000 40075 2249 37397 358980;358981;358982;358983;358984;358985;358986;358987;358988;358989;358990;358991;358992;358993;358994;358995;358996;358997;358998;358999 456560;456561;456562;456563;456564;456565;456566;456567;456568;456569;456570;456571;456572;456573;456574;456575;456576;456577;456578;456579;456580 456579 19 SIEEVLR Unmodified 844.46543 0.46543219 462 A0A2R8YF87;Q96AX1;H3BMM5;A0A2R8Y5U3 VPS33A Vacuolar protein sorting-associated protein 33A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 46.977 46.977 2 0.02472 44308 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.473 8.8298 162330000 0 0 0 0 18779000 0 29804000 23109000 26284000 12918000 0 28983000 22454000 40076 462 37398 359000;359001;359002;359003;359004;359005;359006 456581;456582;456583;456584;456585;456586;456587 456584 7 SIEIPRPVDGVEVPGCGK Unmodified 1907.9775 0.977497 1338 K7ENG2;P26368 U2AF2 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 86.83 86.83 2;3 1.298E-23 88346 QUIQUE_C1277_190116_001 119.4 85.125 573620000 78688000 114730000 30929000 93231000 0 118810000 86307000 0 0 50924000 0 0 0 40077 1338 37399 359007;359008;359009;359010;359011;359012;359013;359014;359015;359016;359017 456588;456589;456590;456591;456592;456593;456594;456595;456596;456597;456598;456599 456589 11 SIELEHFEER Unmodified 1287.6095 0.60953025 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 52.775 52.775 2 0.0002825 49953 QUIQUE_C1563_190116_001 114.84 67.95 106630000 0 0 0 67721000 0 38910000 0 0 0 0 0 0 0 40078 3596 37400 359018;359019;359020;359021 456600;456601;456602;456603 456602 4 SIELESVR Unmodified 931.49746 0.4974606 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.112 43.112 2 0.0036129 40474 QUIQUE_C1218_190116_001 114.78 20.376 6992800000 778190000 806380000 481510000 499980000 698790000 411140000 1201800000 408710000 0 323410000 717250000 0 665710000 40079 869 37401 359022;359023;359024;359025;359026;359027;359028;359029;359030;359031;359032 456604;456605;456606;456607;456608;456609;456610;456611;456612;456613;456614;456615;456616;456617;456618;456619 456604 16 SIEPGSDYYELSDTR Unmodified 1730.7635 0.76352429 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.649 82.649 2 3.3139E-24 83907 QUIQUE_C1403_190116_001 155.99 148.86 7127400000 600620000 589800000 707820000 618930000 641650000 740450000 385150000 626020000 444920000 135720000 607580000 404560000 624140000 40080 2009 37402 359033;359034;359035;359036;359037;359038;359039;359040;359041;359042;359043;359044;359045 456620;456621;456622;456623;456624;456625;456626;456627;456628;456629;456630;456631;456632;456633;456634 456623 15 SIEPYLK Unmodified 848.46437 0.46436956 2187 P21912;A0A087WWT1 SDHB Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 41.931 41.931 2 0.049128 38878 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.311 30.7 511980000 0 0 0 0 0 0 0 179170000 0 0 332810000 0 0 40081 2187 37403 359046;359047 456635;456636 456635 2 SIEQSIEQEEGLNR Unmodified 1630.7798 0.77984305 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 83.05 83.05 2;3 1.5389E-71 84860 QUIQUE_C1368_190116_001 250.72 226.38 3555200000 0 423090000 520760000 527810000 0 323710000 551320000 165930000 258990000 92612000 356070000 37723000 297200000 40082 3185 37404 359048;359049;359050;359051;359052;359053;359054;359055;359056;359057;359058;359059;359060;359061;359062 456637;456638;456639;456640;456641;456642;456643;456644;456645;456646;456647;456648;456649;456650;456651;456652;456653;456654;456655;456656 456639 20 SIESTLDDLFR Unmodified 1294.6405 0.64049603 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 148.35 148.35 2 0.037506 143959 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.608 25.521 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40083 1408 37405 359063 456657 456657 1 SIETTDMTSLVK Oxidation (M) 1339.6541 0.65409718 359 A0A1B0GVP4 yes yes 0 1 0 1 1 143.61 143.61 3 0.0074202 149236 QUIQUE_C1218_190116_001 57.836 25.23 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40084 359 37406 359064;359065 456658;456659 456658 253 2 SIEYSPQLEDAGSR Unmodified 1550.7213 0.72126554 2834 P98160;A0A3B3IT11 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 1 1 62.553 62.553 2 0.00062848 61917 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.653 66.904 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40085 2834 37407 359066;359067;359068 456660;456661;456662 456661 3 SIFCPLMSFR Unmodified 1256.6046 0.60458499 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 no no 0 0 0 1 129.21 129.21 2 0.023562 133380 QUIQUE_C1277_190116_001 56.916 27.767 31296000 0 31296000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40086 4137 37408 359069 456663 456663 1 SIFDFSALK Unmodified 1026.5386 0.53859714 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 125.11 125.11 1;2 0.0002938 129532 QUIQUE_C1368_190116_001 160.88 71.737 7071100000 428530000 427840000 664930000 467930000 472340000 440450000 449880000 537320000 560790000 261750000 818890000 694510000 845890000 40087 2400 37409 359070;359071;359072;359073;359074;359075;359076;359077;359078;359079;359080;359081;359082;359083;359084;359085;359086;359087 456664;456665;456666;456667;456668;456669;456670;456671;456672;456673;456674;456675;456676;456677;456678;456679;456680;456681;456682;456683;456684;456685;456686;456687;456688;456689;456690;456691;456692 456670 24 SIFDFSALKELLSGPNR Unmodified 1892.9996 0.99961265 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 1 1 163.85 163.85 3 0.0020606 166027 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.159 43.389 10366000 0 0 0 0 0 0 0 10366000 0 0 0 0 0 40088 2400 37410 359088 456693 456693 1 SIFGEDALANVSIEKPIHQGPDAAVTGHIR Unmodified 3141.6207 0.62071064 2629 P53618 COPB1 Coatomer subunit beta yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 100.23 100.23 4;5 3.7654E-40 103253 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.03 105.96 768280000 0 0 0 57623000 76043000 0 0 78946000 185830000 0 151820000 218020000 0 40089 2629 37411 359089;359090;359091;359092;359093;359094;359095;359096 456694;456695;456696;456697;456698;456699;456700;456701;456702 456698 9 SIFKPFIFVDDVK Unmodified 1553.8494 0.84936659 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 122.12 122.12 2;3 9.7423E-05 126410 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.79 101.9 26022000000 773600000 1542900000 1564400000 1275300000 1823400000 1098700000 1644900000 4032900000 3429100000 338690000 3070900000 1613200000 3814100000 40090 2941 37412 359097;359098;359099;359100;359101;359102;359103;359104;359105;359106;359107;359108;359109;359110;359111;359112;359113;359114;359115;359116;359117;359118;359119;359120 456703;456704;456705;456706;456707;456708;456709;456710;456711;456712;456713;456714;456715;456716;456717;456718;456719;456720;456721;456722;456723;456724;456725;456726;456727;456728;456729;456730;456731;456732;456733;456734;456735;456736;456737;456738;456739;456740;456741;456742;456743;456744;456745;456746;456747;456748;456749;456750 456738 41 SIFLFLDR Unmodified 1009.5597 0.55966693 1310;3018 K4DI93;Q13620;A6NE76;Q13619;A0A0A0MR50;A0A087WWN2 CUL4B;CUL4A Cullin-4B;Cullin-4A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.87 133.87 2 0.015148 140299 QUIQUE_C1438_190116_001 85.064 46.826 230420000 0 33516000 29472000 25817000 30515000 0 0 0 34667000 0 34413000 42021000 0 40091 1310;3018 37413 359121;359122;359123;359124;359125;359126;359127;359128;359129 456751;456752;456753;456754;456755;456756;456757;456758;456759 456755 9 SIFPIHPSFR Unmodified 1199.6451 0.64512789 523 A3KMH1 VWA8 von Willebrand factor A domain-containing protein 8 yes yes 0 0 0 1 79.058 79.058 3 0.013577 81468 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SIFTPTNQIR Acetyl (Protein N-term) 1217.6404 0.64043645 4583 Q9Y3A5;A0A087X020;F8WE72 SBDS Ribosome maturation protein SBDS yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.1 108.1 2 0.00013327 111330 QUIQUE_DMIX7_190116_001 126.41 56.458 583310000 46492000 48161000 42160000 61247000 31883000 35252000 44851000 51754000 51534000 0 64088000 51400000 54486000 40095 4583 37417 359149;359150;359151;359152;359153;359154;359155;359156;359157;359158;359159;359160 456780;456781;456782;456783;456784;456785;456786;456787;456788;456789;456790;456791;456792;456793 456792 14 SIFTVCLDATMPR Unmodified 1509.732 0.73197035 2462 P43155 CRAT Carnitine O-acetyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 125.75 125.75 2 0.00042745 130345 QUIQUE_C1218_190116_001 127.42 91.913 42791000 42791000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40096 2462 37418 359161;359162 456794;456795 456794 2 SIFVTCGDWDLK Unmodified 1439.6755 0.67550132 1120 H0Y4B0;O43414;A0A3B3ISV9;F6QUN3;F6UGJ8 ERI3 ERI1 exoribonuclease 3 yes no 0 0 0 1 1 1 116.39 116.39 2 0.0033196 119035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.434 36.49 252150000 0 0 0 0 0 0 0 100620000 0 22822000 128710000 0 0 40097 1120 37419 359163;359164;359165 456796;456797;456798 456796 2 SIFYVPDMKPSMFDVSR Unmodified 2017.9642 0.96415513 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.79 132.79 3 0.00032828 139208 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.468 66.524 358440000 47496000 0 42865000 42577000 31148000 0 48329000 0 20964000 0 40576000 32973000 51510000 40098 2952 37420 359166;359167;359168;359169;359170;359171;359172;359173;359174 456799;456800;456801;456802;456803;456804;456805;456806;456807 456805 6 SIGALEVACGIVMTLVPGRPK Unmodified 2167.1857 0.18571564 3249 Q53FP2 TMEM35 Transmembrane protein 35 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 157.88 157.88 3 0.00016854 163244 QUIQUE_C1368_190116_001 49.768 40.605 86841000 0 16320000 21538000 0 0 8544700 0 0 0 0 40439000 0 0 40099 3249 37421 359175;359176;359177;359178 456808;456809;456810;456811 456809 4 SIGATLTDVDDLIFK Unmodified 1606.8454 0.84540342 3428 Q709C8;A0A3B3IU50 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes no 0 0 0 1 153 153 2 0.044098 155709 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.448 30.072 15519000 0 0 0 0 0 0 0 15519000 0 0 0 0 0 40100 3428 37422 359179 456812 456812 1 SIGDLGAR Unmodified 787.41882 0.41881635 4039 Q9BV20 MRI1 Methylthioribose-1-phosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 28.004 28.004 2 0.015753 22187 QUIQUE_C1368_190116_001 84.244 7.3971 155240000 0 0 43473000 0 0 0 0 0 37255000 0 28569000 45946000 0 40101 4039 37423 359180;359181;359182;359183 456813;456814;456815;456816;456817 456814 5 SIGESVPEPR Unmodified 1069.5404 0.54038805 4628 Q9Y5P6 GMPPB Mannose-1-phosphate guanyltransferase beta yes yes 0 0 0 1 35.644 35.644 2 0.0548 31079 QUIQUE_C1368_190116_001 66.299 32.046 76196000 0 0 76196000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40102 4628 37424 359184 456818 456818 0 SIGEYDVLR Unmodified 1050.5346 0.53457439 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 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Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase, mitochondrial;Lysine ketoglutarate reductase;Saccharopine dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 135.57 135.57 2 0.0011167 140178 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.295 50.395 283520000 46654000 0 70845000 0 35291000 0 0 57371000 42086000 0 0 31269000 0 40106 4413 37428 359198;359199;359200;359201;359202;359203 456833;456834;456835;456836;456837;456838 456837 6 SIGPNFQLGLK Unmodified 1172.6554 0.65535823 908 E9PDU6 CNN3 Calponin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 93.982 93.982 2 0.0011739 91610 QUIQUE_DMIX4_190116_001 88.948 64.025 178270000 0 32408000 37526000 33811000 26319000 31466000 0 0 0 16738000 0 0 0 40107 908 37429 359204;359205;359206;359207;359208;359209 456839;456840;456841;456842;456843;456844;456845;456846 456846 8 SIGQWYGPNTVAQVLK Unmodified 1759.9257 0.92571943 4610 Q9Y4P1;C9JQ72;C9J3C0;C9JVD5 ATG4B Cysteine protease ATG4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 123.14 123.14 2 0.0030176 128618 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.235 48.468 404030000 35514000 48298000 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1220.6653 0.66525421 3605 Q8N684;F5H669;F5H6M0;F5H047;J3QT54;C9J286;C9J323;C9JM38 CPSF7 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 102.66 102.66 2 0.0025583 106471 QUIQUE_C1576_190116_001 90.108 52.917 202340000 43511000 0 33431000 0 32847000 0 31759000 29932000 30862000 0 0 0 0 40114 3605 37435 359241;359242;359243;359244;359245;359246;359247;359248 456878;456879;456880;456881;456882;456883;456884;456885;456886 456882 9 SIHILPSSIK Unmodified 1093.6495 0.64954457 4527 Q9UQ13 SHOC2 Leucine-rich repeat protein SHOC-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 49.532 49.532 3 0.001951 46913 QUIQUE_C1277_190116_001 60.064 32.051 36804000 16122000 11919000 0 0 0 8763300 0 0 0 0 0 0 0 40115 4527 37436 359249;359250;359251 456887;456888;456889 456888 3 SIHNLGTILTTNAVASETVATGEGLR Unmodified 2624.377 0.37695812 4091 Q9C040;A0A0J9YX34 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 118.33 118.33 3 3.4389E-05 121408 QUIQUE_C1277_190116_001 47.357 33.465 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359259;359260;359261;359262;359263;359264;359265;359266;359267;359268;359269;359270;359271;359272;359273;359274 456897;456898;456899;456900;456901;456902;456903;456904;456905;456906;456907;456908;456909;456910;456911;456912;456913 456910 16 SIIFANYIAR Unmodified 1166.6448 0.64479354 3441 Q7L523;Q5VZM0 RRAGA;RRAGB Ras-related GTP-binding protein A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.21 103.21 2 0.0018711 105784 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.31 84.371 594210000 37955000 47648000 30719000 35278000 55265000 40391000 52401000 50846000 58075000 17188000 84464000 83981000 0 40119 3441 37440 359275;359276;359277;359278;359279;359280;359281;359282;359283;359284;359285;359286 456914;456915;456916;456917;456918;456919;456920;456921;456922;456923;456924;456925;456926 456922 13 SIIGMGTGAGAYILTR Unmodified 1579.8392 0.83921261 3737 Q92597;E5RIR1;E5RGM5;E5RIV1;E5RIM2;E5RG99 NDRG1 Protein NDRG1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 119.37 119.37 2;3 8.1026E-07 123055 QUIQUE_C1403_190116_001 112.44 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947790000 77219000 89174000 77433000 85760000 49058000 73282000 72309000 64473000 93100000 37296000 91480000 95393000 41809000 40124 3280 37444 359327;359328;359329;359330;359331;359332;359333;359334;359335;359336;359337;359338;359339;359340;359341;359342;359343;359344;359345;359346;359347;359348;359349;359350 456974;456975;456976;456977;456978;456979;456980;456981;456982;456983;456984;456985;456986;456987;456988;456989;456990;456991;456992;456993;456994;456995;456996;456997;456998;456999 456978 24 SIILTHVIR Unmodified 1050.655 0.6549643 3732 Q92556;H7C0S6;H7C3P3;H7C0N5 ELMO1 Engulfment and cell motility protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 49.292 49.292 3 0.016033 46052 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.282 40.999 50486000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12245000 21658000 0 16583000 40125 3732 37445 359351;359352;359353 457000;457001;457002 457000 3 SIINFFVECFR Unmodified 1430.7017 0.70165649 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.43 159.43 2 0.00060935 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359365;359366;359367;359368;359369;359370;359371;359372;359373;359374;359375;359376;359377 457019;457020;457021;457022;457023;457024;457025;457026;457027;457028;457029;457030;457031;457032;457033;457034;457035 457020 17 SIISMFDRENK Unmodified 1338.6602 0.66018561 1623 O75340 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 76.419 76.419 3 0.00096496 77355 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.687 70.723 192430000 0 0 0 0 0 0 0 66687000 59224000 0 29341000 37173000 0 40129 1623 37449 359378;359379;359380;359381;359382 457036;457037;457038;457039;457040;457041;457042;457043 457036 7 SIITYVATYYHYFSK Unmodified 1854.9192 0.91923707 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 148.06 148.06 3 0.00036147 152623 QUIQUE_C1277_190116_001 71.08 61.422 274990000 0 35213000 0 22796000 0 0 0 45118000 0 12756000 79276000 54926000 24902000 40130 1472 37450 359383;359384;359385;359386;359387;359388;359389;359390 457044;457045;457046;457047;457048;457049;457050;457051;457052 457044 9 SIITYVSSLYDAMPR Unmodified 1714.86 0.86000763 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 159.22 159.22 2;3 1.6554E-44 164203 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.54 140.1 2702000000 142400000 196040000 197440000 115720000 245610000 79923000 185300000 295380000 284640000 46961000 399380000 378250000 134960000 40131 3117 37451 359391;359392;359393;359394;359395;359396;359397;359398;359399;359400;359401;359402;359403;359404;359405;359406;359407;359408;359409;359410;359411;359412;359413;359414;359415;359416;359417;359418 457053;457054;457055;457056;457057;457058;457059;457060;457061;457062;457063;457064;457065;457066;457067;457068;457069;457070;457071;457072;457073;457074;457075;457076;457077;457078;457079;457080;457081;457082;457083;457084;457085;457086;457087;457088;457089;457090;457091;457092;457093;457094;457095;457096;457097;457098;457099;457100;457101;457102;457103;457104;457105;457106;457107 457089 55 SIITYVSSLYDAMPR Oxidation (M) 1730.8549 0.85492225 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 2 1 1 2 1 1 3 2 3 1 2 1 140.31 140.31 2;3 4.8112E-18 143878 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.39 116.01 1550600000 0 51363000 18914000 16267000 86455000 39355000 66347000 425740000 262210000 123860000 162860000 192170000 105030000 40132 3117 37451 359419;359420;359421;359422;359423;359424;359425;359426;359427;359428;359429;359430;359431;359432;359433;359434;359435;359436;359437;359438 457108;457109;457110;457111;457112;457113;457114;457115;457116;457117;457118;457119;457120;457121;457122;457123;457124;457125;457126;457127;457128;457129;457130 457120 2575 21 SIITYVVTYYHYFSK Unmodified 1882.9505 0.9505372 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 154.81 154.81 2;3 7.4992E-09 150797 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.1 102.25 4004000000 0 140890000 162480000 93868000 74986000 130490000 187800000 323550000 407060000 187420000 995800000 1022300000 277420000 40133 2851 37452 359439;359440;359441;359442;359443;359444;359445;359446;359447;359448;359449;359450;359451;359452;359453;359454 457131;457132;457133;457134;457135;457136;457137;457138;457139;457140;457141;457142;457143;457144;457145;457146;457147;457148;457149;457150;457151;457152;457153;457154;457155;457156;457157;457158;457159;457160 457152 30 SIKDTICNQDER Unmodified 1477.6831 0.6831059 4495 Q9ULV4;B4E3S0;H0YHL7 CORO1C Coronin-1C;Coronin yes no 0 0 1 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1397.7919 0.79185171 4061 Q9BXB4 OSBPL11 Oxysterol-binding protein-related protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.73 139.73 2 0.0085171 144214 QUIQUE_C1277_190116_001 77.744 39.177 259930000 0 20664000 23456000 23353000 19880000 28613000 0 19143000 23347000 12071000 43775000 21486000 24147000 40150 4061 37469 359575;359576;359577;359578;359579;359580;359581;359582;359583;359584;359585 457307;457308;457309;457310;457311;457312;457313;457314;457315;457316;457317;457318;457319 457308 13 SILYDER Unmodified 894.4447 0.44469675 5 A0A024RA52;P25787 PSMA2 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.458 36.458 2 0.039576 32049 QUIQUE_C1368_190116_001 83.614 20.9 1097700000 0 164140000 183680000 0 119720000 0 0 0 0 0 212430000 202530000 215200000 40151 5 37470 359586;359587;359588;359589;359590;359591 457320;457321;457322;457323;457324;457325 457321 6 SIMAAAGVPVVEGYHGEDQSDQCLK Unmodified 2660.2211 0.22105111 3933 Q96RQ3;E9PHF7;E9PG35;G5E9X5 MCCC1 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 91.5 91.5 3 2.7747E-22 93563 QUIQUE_C1277_190116_001 115.66 108.62 134460000 0 38727000 0 47983000 0 47747000 0 0 0 0 0 0 0 40152 3933 37471 359592;359593;359594 457326;457327;457328;457329 457326 2 SIMSYNGGAVMAMK Acetyl (Protein N-term) 1500.6775 0.67749193 2537 P49720;A0A087WXQ8;A0A087WY10 PSMB3 Proteasome subunit beta type-3 yes no 1 0 0 1 128.97 128.97 2 0.0051134 131624 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.806 41.133 23372000 0 0 0 0 0 0 0 23372000 0 0 0 0 0 40153 2537 37472 359595 457330 457330 1 SIMTEQLETIPK Oxidation (M) 1404.717 0.71703179 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 64.804 64.804 2 0.0006164 63675 QUIQUE_C1403_190116_001 104.52 47.96 442030000 111710000 86115000 0 127910000 0 0 0 0 54154000 62143000 0 0 0 40154 2009 37473 359596;359597;359598;359599;359600 457331;457332;457333;457334;457335;457336 457334 1304 5 SIMTEQLETIPK Unmodified 1388.7221 0.72211717 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 87.63 87.63 2 0.00028336 90463 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.23 48.67 3363000000 446290000 389530000 411290000 422740000 344500000 437430000 0 155960000 129770000 99083000 223360000 148980000 154090000 40155 2009 37473 359601;359602;359603;359604;359605;359606;359607;359608;359609;359610;359611;359612;359613 457337;457338;457339;457340;457341;457342;457343;457344;457345;457346;457347;457348;457349;457350;457351;457352 457349 15 SIMTEQLETIPKEEK Unmodified 1774.9023 0.90226638 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 70.956 70.956 2;3 4.8802E-06 71727 QUIQUE_C1438_190116_001 103.2 79.599 418600000 0 0 0 0 0 0 0 212200000 0 0 206400000 0 0 40156 2009 37474 359614;359615;359616 457353;457354;457355 457353 2 SIMTYVAQFLK Unmodified 1299.6897 0.68969482 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;F5GXQ8;F5GYQ7;F5H4Q0;A0A087WYJ5 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 158.47 158.47 2 0.014318 166080 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.735 44.391 12944000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12944000 0 0 40157 228 37475 359617 457356 457356 1 SINGELYAPLQHVSAVLPGGAADR Unmodified 2434.2605 0.2604718 3899 Q96L92;A0A2R8Y871 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 122.29 122.29 3 1.1392E-08 125251 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.091 56.631 221750000 0 0 0 52090000 0 51564000 0 66017000 0 0 52078000 0 0 40158 3899 37476 359618;359619;359620;359621 457357;457358;457359;457360 457359 4 SINGILFPGGSVDLR Unmodified 1543.8358 0.83584179 3757 Q92820 GGH Gamma-glutamyl hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 126.7 126.7 2 0.039316 130821 QUIQUE_C1277_190116_001 42.629 27.039 172760000 0 34133000 0 0 52789000 0 0 0 0 0 0 43717000 42119000 40159 3757 37477 359622;359623;359624;359625 457361;457362;457363;457364 457361 4 SINHQIESPSER Unmodified 1395.6743 0.67425577 4520 Q9UPQ0;D6RD46;E7EPK0;E9PDJ9;H0Y8P3;G5EA03 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 17.933 17.933 2;3 0.001018 10431 QUIQUE_C1438_190116_001 71.976 64.065 117400000 24749000 0 0 22129000 29070000 0 0 0 0 0 27468000 0 13985000 40160 4520 37478 359626;359627;359628;359629;359630 457365;457366;457367;457368;457369 457367 5 SINLPRPDNETLWDKLDHYYR Unmodified 2644.3034 0.30339925 3782 Q93100;I3L3F2;H3BV13;H3BQ89 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes no 0 0 2 1 112.84 112.84 4 0.00011096 116342 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.679 51.491 21046000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21046000 0 40161 3782 37479 359631 457370 457370 1 SINNDTTYCIK Unmodified 1327.6078 0.60781569 3255 Q53H82 LACTB2 Beta-lactamase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 38.999 38.999 2 0.0092213 35350 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.426 40.686 45907000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45907000 40162 3255 37480 359632 457371 457371 1 SINNPDMR Unmodified 945.43381 0.43381449 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 18.792 18.792 2 0.05185 11666 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.485 23.981 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40163 2623 37481 359633 457372 457372 1 SINPDEAVAYGAAVQAAILIGDK Unmodified 2285.1903 0.19032655 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 5 8 9 4 8 3 8 3 11 2 6 7 9 162.5 162.5 2;3 1.9908E-17 167086 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.69 133.52 3988800000 245660000 309430000 405230000 231050000 323790000 163290000 332140000 141420000 405790000 239820000 415710000 423320000 352150000 40164 2643 37482 359634;359635;359636;359637;359638;359639;359640;359641;359642;359643;359644;359645;359646;359647;359648;359649;359650;359651;359652;359653;359654;359655;359656;359657;359658;359659;359660;359661;359662;359663;359664;359665;359666;359667;359668;359669;359670;359671;359672;359673;359674;359675;359676;359677;359678;359679;359680;359681;359682;359683;359684;359685;359686;359687;359688;359689;359690;359691;359692;359693;359694;359695;359696;359697;359698;359699;359700;359701;359702;359703;359704;359705;359706;359707;359708;359709;359710;359711;359712;359713;359714;359715;359716 457373;457374;457375;457376;457377;457378;457379;457380;457381;457382;457383;457384;457385;457386;457387;457388;457389;457390;457391;457392;457393;457394;457395;457396;457397;457398;457399;457400;457401;457402;457403;457404;457405;457406;457407;457408;457409;457410;457411;457412;457413;457414;457415;457416;457417;457418;457419;457420;457421;457422;457423;457424;457425;457426;457427;457428;457429;457430;457431;457432;457433;457434;457435;457436;457437;457438;457439;457440;457441;457442;457443;457444;457445;457446;457447;457448;457449;457450;457451;457452;457453;457454;457455;457456;457457;457458;457459;457460;457461;457462;457463;457464;457465;457466;457467;457468;457469;457470;457471;457472;457473;457474;457475;457476;457477;457478;457479;457480;457481;457482;457483 457444 101 SINPDEAVAYGAAVQAAILMGDK Oxidation (M) 2319.1417 0.1416618 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 1 0 1 1 2 1 2 1 1 3 1 2 2 2 1 154.74 154.74 2;3 4.854E-100 157388 QUIQUE_C1563_190116_001 188.04 182.76 2010300000 74868000 83894000 153680000 107690000 290420000 101550000 92923000 112510000 116690000 284560000 285440000 209230000 96790000 40165 282;2362 37483 359717;359718;359719;359720;359721;359722;359723;359724;359725;359726;359727;359728;359729;359730;359731;359732;359733;359734;359735;359736 457484;457485;457486;457487;457488;457489;457490;457491;457492;457493;457494;457495;457496;457497;457498;457499;457500;457501;457502;457503;457504;457505;457506;457507;457508;457509 457494 214 25 SINPDEAVAYGAAVQAAILMGDK Unmodified 2303.1467 0.14674718 282;2362 A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;V9GZ37;Q53FA3;P34931 HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like no no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 3 2 2 2 3 4 2 161.43 161.43 2;3 2.9049E-39 166866 QUIQUE_C1218_190116_001 176.81 150.18 7385700000 491330000 579340000 722270000 848180000 637050000 705020000 624470000 334110000 444310000 472410000 618580000 442160000 466480000 40166 282;2362 37483 359737;359738;359739;359740;359741;359742;359743;359744;359745;359746;359747;359748;359749;359750;359751;359752;359753;359754;359755;359756;359757;359758;359759;359760;359761;359762;359763;359764;359765;359766;359767 457510;457511;457512;457513;457514;457515;457516;457517;457518;457519;457520;457521;457522;457523;457524;457525;457526;457527;457528;457529;457530;457531;457532;457533;457534;457535;457536;457537;457538;457539;457540;457541;457542;457543;457544;457545;457546;457547;457548;457549;457550;457551;457552;457553;457554;457555;457556;457557;457558;457559;457560;457561;457562;457563;457564;457565;457566;457567;457568;457569;457570;457571;457572;457573;457574;457575;457576 457512 65 SINPDEAVAYGAAVQAAILSGDK Unmodified 2259.1383 0.13829098 2010;558 A8K7Q2;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 0 4 2 2 2 2 4 3 2 4 3 3 4 2 156.06 156.06 2;3 3.316E-274 160912 QUIQUE_C1368_190116_001 343.26 327.32 38784000000 3560700000 3253200000 3130100000 6956500000 3848900000 2600200000 3519600000 1242100000 2015200000 1858600000 2341000000 2086700000 2371400000 40167 558;2010 37484 359768;359769;359770;359771;359772;359773;359774;359775;359776;359777;359778;359779;359780;359781;359782;359783;359784;359785;359786;359787;359788;359789;359790;359791;359792;359793;359794;359795;359796;359797;359798;359799;359800;359801;359802;359803;359804 457577;457578;457579;457580;457581;457582;457583;457584;457585;457586;457587;457588;457589;457590;457591;457592;457593;457594;457595;457596;457597;457598;457599;457600;457601;457602;457603;457604;457605;457606;457607;457608;457609;457610;457611;457612;457613;457614;457615;457616;457617;457618;457619;457620;457621;457622;457623;457624;457625;457626;457627;457628;457629;457630;457631;457632;457633;457634;457635;457636;457637;457638;457639;457640;457641;457642;457643;457644;457645;457646;457647;457648;457649;457650;457651;457652;457653;457654;457655;457656;457657;457658;457659;457660;457661;457662;457663;457664;457665;457666;457667;457668;457669;457670;457671;457672;457673;457674;457675;457676;457677;457678;457679;457680;457681;457682;457683;457684 457599 105 SINPDEAVAYGAAVQAAVLMGDK Oxidation (M) 2305.126 0.12601173 2117 P17066 HSPA6 Heat shock 70 kDa protein 6 yes yes 0 1 0 1 161.8 161.8 2 0.0080493 164173 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.491 42.232 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40168 2117 37485 359805 457685 457685 1446 1 SINPLGGFVHYGEVTNDFVMLK Unmodified 2436.2148 0.21476716 2418 P39023;G5E9G0 RPL3 60S ribosomal protein L3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 145.23 145.23 3 9.8811E-08 150813 QUIQUE_C1368_190116_001 80.98 67.792 162040000 0 0 55836000 50555000 26384000 0 0 0 0 0 29270000 0 0 40169 2418 37486 359806;359807;359808;359809 457686;457687;457688;457689 457686 4 SINQGLDR Unmodified 901.46174 0.4617438 2321 P30533;A0A3B3IRQ7 LRPAP1 Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein yes no 0 0 0 1 19.043 19.043 2 0.062222 11444 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.716 4.8675 29883000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29883000 0 0 0 40170 2321 37487 359810 457690 457690 1 SINQPVAFVR Unmodified 1129.6244 0.62439245 40 A0A087WUN7;H0YJ40;G3V4X6;G3V2S9;Q9GZT3;H0YJI1 SLIRP SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 60.03 60.03 2 0.0034076 59482 QUIQUE_C1438_190116_001 84.498 54.313 951860000 142010000 177290000 0 0 119170000 112930000 130480000 0 124350000 0 145620000 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457722;457723;457724;457725;457726;457727;457728;457729;457730;457731;457732;457733;457734;457735;457736;457737;457738;457739;457740;457741;457742;457743;457744;457745;457746;457747;457748;457749;457750;457751;457752;457753;457754;457755;457756;457757;457758;457759;457760;457761;457762;457763;457764;457765;457766;457767;457768;457769;457770 457749 1205 47 SIPAYLAETLYYAMK Unmodified 1732.8746 0.87459506 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 3 2 4 4 2 4 2 3 2 2 2 5 4 160.99 160.99 2;3 2.6097E-29 165273 QUIQUE_DMIX8_190116_001 165.63 148.72 21364000000 593090000 1237100000 1965000000 1856300000 1295400000 1735900000 1333800000 1470700000 1189500000 632240000 1856500000 3459800000 2738800000 40175 1954 37491 359868;359869;359870;359871;359872;359873;359874;359875;359876;359877;359878;359879;359880;359881;359882;359883;359884;359885;359886;359887;359888;359889;359890;359891;359892;359893;359894;359895;359896;359897;359898;359899;359900;359901;359902;359903;359904;359905;359906 457771;457772;457773;457774;457775;457776;457777;457778;457779;457780;457781;457782;457783;457784;457785;457786;457787;457788;457789;457790;457791;457792;457793;457794;457795;457796;457797;457798;457799;457800;457801;457802;457803;457804;457805;457806;457807;457808;457809;457810;457811;457812;457813;457814;457815;457816;457817;457818;457819;457820;457821;457822;457823;457824;457825;457826;457827;457828;457829;457830;457831;457832;457833;457834;457835;457836;457837;457838;457839;457840;457841;457842;457843;457844;457845;457846 457843 73 SIPDGSEKGDFIALDLGGSSFR Unmodified 2267.107 0.10699085 2146 P19367;B1AR63;B1AR62 HK1 Hexokinase-1;Hexokinase yes no 0 0 1 2 1 2 1 121.59 121.59 2;3 6.8824E-09 124426 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yes 0 0 0 1 1 1 47.507 47.507 1;2 0.021411 44961 QUIQUE_C1403_190116_001 75.189 33.887 1069700000 0 0 471870000 528710000 69119000 0 0 0 0 0 0 0 0 40179 2197 37495 359917;359918;359919 457862;457863;457864 457863 2 SIPLDEGEDEAQR Unmodified 1457.6634 0.66341631 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.21 48.21 2 0.00045506 45813 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.77 95.896 809810000 0 45821000 119260000 0 0 83212000 76710000 80813000 96247000 49557000 96379000 88737000 73077000 40180 3053 37496 359920;359921;359922;359923;359924;359925;359926;359927;359928;359929 457865;457866;457867;457868;457869;457870;457871;457872;457873;457874;457875;457876 457875 12 SIPLDEGEDEAQRR Unmodified 1613.7645 0.76452734 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 38.412 38.412 3 0.01225 33070 QUIQUE_DMIX4_190116_001 35.657 23.756 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40181 3053 37497 359930;359931 457877;457878 457878 2 SIPMTVDFIR Unmodified 1177.6165 0.61652988 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.02 108.02 2 0.00026909 111635 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.41 96.245 1656000000 166040000 178260000 0 144040000 118200000 113130000 127620000 121400000 112030000 45621000 194940000 148530000 186190000 40182 1787 37498 359932;359933;359934;359935;359936;359937;359938;359939;359940;359941;359942;359943;359944;359945 457879;457880;457881;457882;457883;457884;457885;457886;457887;457888;457889;457890;457891;457892;457893;457894;457895;457896;457897;457898;457899;457900;457901;457902 457895 24 SIPMTVDFIR Oxidation (M) 1193.6114 0.6114445 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 87.687 87.687 2 0.013095 89908 QUIQUE_C1576_190116_001 67.897 30.17 179010000 0 0 33089000 0 0 0 30677000 0 0 17167000 34493000 0 63579000 40183 1787 37498 359946;359947;359948;359949;359950;359951;359952 457903;457904;457905;457906;457907;457908;457909 457904 998 7 SIPTDNQIK Unmodified 1014.5346 0.53457439 620 B4DLR8;P15559;H3BNV2 NQO1 NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1 yes no 0 0 0 1 1 1 24.112 24.112 2 0.0091527 17671 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.774 33.774 281340000 0 0 0 0 0 0 0 77162000 152980000 51196000 0 0 0 40184 620 37499 359953;359954;359955 457910;457911;457912;457913;457914;457915 457913 6 SIQADGLVWGSSK Unmodified 1346.683 0.68302954 2229 P24534 EEF1B2 Elongation factor 1-beta yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 82.715 82.715 2 0.00036609 84993 QUIQUE_C1218_190116_001 109.24 70.214 2625800000 283050000 336370000 282490000 282030000 46953000 227550000 217170000 178470000 60864000 76517000 265140000 39110000 330080000 40185 2229 37500 359956;359957;359958;359959;359960;359961;359962;359963;359964;359965;359966;359967;359968;359969;359970;359971 457916;457917;457918;457919;457920;457921;457922;457923;457924;457925;457926;457927;457928;457929;457930;457931;457932;457933;457934;457935 457916 18 SIQCLTVHK Unmodified 1084.5699 0.56991404 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 1 1 1 1 1 2 20.47 20.47 2;3 0.01509 13173 QUIQUE_C1563_190116_001 68.525 53.846 11346000000 742020000 1381200000 996340000 1373700000 1319800000 1385700000 1236700000 497080000 329420000 127060000 398380000 311440000 1247100000 40186 1609 37501 359972;359973;359974;359975;359976;359977;359978;359979;359980;359981;359982;359983;359984;359985;359986;359987;359988;359989;359990 457936;457937;457938;457939;457940;457941;457942;457943;457944;457945;457946;457947;457948;457949;457950;457951;457952;457953;457954 457944 2 SIQEELQQLR Unmodified 1242.6568 0.65681479 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 87.291 87.291 2 3.1022E-30 88954 QUIQUE_C1368_190116_001 198.65 99.203 5988900000 444900000 450200000 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134795 QUIQUE_C1576_190116_001 327.3 305.55 213720000000 17067000000 18589000000 16765000000 15804000000 18142000000 15379000000 23064000000 12026000000 12684000000 7013800000 19357000000 18241000000 19591000000 40191 2795;2796 37506 360075;360076;360077;360078;360079;360080;360081;360082;360083;360084;360085;360086;360087;360088;360089;360090;360091;360092;360093;360094;360095;360096;360097;360098;360099;360100;360101;360102;360103;360104;360105;360106;360107;360108;360109;360110;360111;360112;360113;360114 458082;458083;458084;458085;458086;458087;458088;458089;458090;458091;458092;458093;458094;458095;458096;458097;458098;458099;458100;458101;458102;458103;458104;458105;458106;458107;458108;458109;458110;458111;458112;458113;458114;458115;458116;458117;458118;458119;458120;458121;458122;458123;458124;458125;458126;458127;458128;458129;458130;458131;458132;458133;458134;458135;458136;458137;458138;458139;458140;458141;458142;458143;458144 458119 55 SIQGDGEGDGDLK Unmodified 1289.5735 0.57353867 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 3 1 4 2 3 2 5 2 2 1 4 3 4 24.741 24.741 2 8.144E-05 18736 QUIQUE_C1218_190116_001 118.28 106.05 6427900000 725560000 588540000 706080000 343000000 563190000 307530000 502120000 486450000 400720000 37848000 475250000 779980000 511670000 40192 4128 37507 360115;360116;360117;360118;360119;360120;360121;360122;360123;360124;360125;360126;360127;360128;360129;360130;360131;360132;360133;360134;360135;360136;360137;360138;360139;360140;360141;360142;360143;360144;360145;360146;360147;360148;360149;360150 458145;458146;458147;458148;458149;458150;458151;458152;458153;458154;458155;458156;458157;458158;458159;458160;458161;458162;458163;458164;458165;458166;458167;458168;458169;458170;458171;458172;458173;458174;458175;458176;458177;458178;458179;458180;458181 458147 35 SIQGSSTSSSASSTLSHGEVK Unmodified 2035.9658 0.96580592 4380 Q9P265 DIP2B Disco-interacting protein 2 homolog B yes yes 0 0 0 1 1 28.82 28.82 3 0.003425 23378 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.84 18.772 26394000 0 0 0 0 0 0 0 26394000 0 0 0 0 0 40193 4380 37508 360151;360152 458182;458183 458182 2 SIQLDGLVWGASK Unmodified 1372.7351 0.73506511 979;2291 E9PRY8;A0A087X1X7;H0YE72;H0YE58;E9PQC9;P29692;E9PQZ1;E9PK01 EEF1D Elongation factor 1-delta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 119.82 119.82 2 0.00041052 123824 QUIQUE_C1403_190116_001 109.24 78.162 2067000000 175020000 195970000 154410000 177290000 166780000 153380000 141020000 158930000 178140000 69335000 155750000 155600000 185360000 40194 979;2291 37509 360153;360154;360155;360156;360157;360158;360159;360160;360161;360162;360163;360164;360165;360166;360167 458184;458185;458186;458187;458188;458189;458190;458191;458192;458193;458194;458195;458196;458197;458198;458199;458200;458201;458202 458189 18 SIQPEQVQR Unmodified 1083.5673 0.5672715 3399 Q6PML9 SLC30A9 Zinc transporter 9 yes yes 0 0 0 1 20.611 20.611 2 0.05537 13387 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.665 18.295 9773000 0 0 0 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15.933 2 0.038176 8071 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.349 51.587 12365000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12365000 0 0 0 40198 3754 37512 360171 458206 458206 1 SIRPGLSPYR Unmodified 1144.6353 0.63529149 3084 Q14697 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB yes yes 0 0 1 1 29.212 29.212 2 0.010674 23608 QUIQUE_C1576_190116_001 95.311 41.154 177630000 0 0 0 0 0 0 177630000 0 0 0 0 0 0 40199 3084 37513 360172 458207 458207 1 SISDKQQWDAAIYFMEEALQAR Unmodified 2599.2377 0.23768745 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 1 166.64 166.64 3 0.0012854 168784 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.855 52.535 18179000 0 0 0 0 0 0 0 0 18179000 0 0 0 0 40200 831;1569 37514 360173;360174 458208;458209 458208 1 SISFIPPDGEFELMR Unmodified 1736.8444 0.84435757 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 0 2 3 1 1 2 2 2 1 3 1 1 143.11 143.11 2 3.2219E-05 148560 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316940000 0 311960000 309380000 368070000 371840000 + 40203 1859 37517 360195;360196;360197;360198;360199 458236;458237;458238;458239;458240 458237 5 SISLYQR Unmodified 865.46577 0.46576654 1316 K7EK00;Q96ND0;K7ERQ2 FAM210A Protein FAM210A yes no 0 0 0 1 36.043 36.043 2 0.062217 32290 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.398 19.638 38971000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38971000 0 0 40204 1316 37518 360200 458241 458241 1 SISLYYTGEK Unmodified 1159.5761 0.57610486 2145 P19338;H7BY16 NCL Nucleolin yes no 0 0 0 1 62.841 62.841 2 0.060766 61267 QUIQUE_C1563_190116_001 46.001 18.698 221920000 0 0 0 0 0 221920000 0 0 0 0 0 0 0 40205 2145 37519 360201 458242 458242 1 SISMTTFTEPEVVFLQSR Unmodified 2071.0296 0.029592154 227 A0A0C4DG34;O95081 AGFG2 Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 148.1 148.1 2;3 0.00032863 151029 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.468 77.906 222820000 0 0 37093000 53432000 0 0 0 58823000 0 0 73473000 0 0 40206 227 37520 360202;360203;360204;360205;360206 458243;458244;458245;458246;458247;458248 458247 6 SISNPPGSNLR Unmodified 1140.5887 0.58873523 988 F5GWT4;Q9H4A3 WNK1 Serine/threonine-protein kinase WNK1 yes no 0 0 0 1 35.173 35.173 2 0.013991 30388 QUIQUE_C1403_190116_001 58.981 17.952 41847000 0 0 0 41847000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40207 988 37521 360207 458249 458249 1 SISPFPELEQFLQDTIK Unmodified 1991.0252 0.025158703 3647 Q8NFF5;Q5T196 FLAD1 FAD synthase;Molybdenum cofactor biosynthesis protein-like region;FAD synthase region yes no 0 0 0 1 1 170.54 170.54 2;3 0.00065699 173399 QUIQUE_C1403_190116_001 72.681 60.623 34219000 0 10892000 0 23326000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40208 3647 37522 360208;360209 458250;458251 458251 2 SISPFPELEQFLQDTIKR Unmodified 2147.1263 0.12626973 3647 Q8NFF5;Q5T196 FLAD1 FAD synthase;Molybdenum cofactor biosynthesis protein-like region;FAD synthase region yes no 0 0 1 1 1 1 1 162.54 162.54 3 9.3721E-06 165073 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.021 63.712 97432000 0 0 0 0 0 0 0 17203000 20925000 0 38083000 0 21221000 40209 3647 37523 360210;360211;360212;360213 458252;458253;458254;458255 458252 3 SISQLESLNR Unmodified 1145.6041 0.60405094 2999 Q13464;A0A0U1RQV4 ROCK1 Rho-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 56.149 56.149 2 0.044381 55136 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.825 30.803 42249000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42249000 40210 2999 37524 360214 458256 458256 0 SISSDEVNFLVYR Acetyl (Protein N-term) 1569.7675 0.76748745 4086 Q9BZK7;A0A0D9SF63;A0A1B0GUU2;F8W9D8;C9IYU9;C9JCW4;C9JTW8;C9JY82;C9JEC9;C9J3H2;C9J903;A0A0D9SEW5;A0A0D9SFS8;C9J7E1 TBL1XR1 F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 150.51 150.51 2 3.1664E-06 154700 QUIQUE_C1277_190116_001 145.89 118.77 98946000 25038000 21193000 0 21774000 17001000 13940000 0 0 0 0 0 0 0 40211 4086 37525 360215;360216;360217;360218;360219;360220 458257;458258;458259;458260;458261;458262;458263 458258 7 SISSSRSENVLSR Unmodified 1420.727 0.72701962 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 50.312 50.312 3 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458297;458298;458299;458300;458301;458302;458303;458304;458305;458306;458307;458308;458309;458310;458311;458312;458313;458314;458315;458316;458317;458318;458319;458320;458321 458309 23 SITIIGGGFLGSELACALGR Unmodified 1991.051 0.050996298 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 162.7 162.7 2;3 1.0905E-17 167720 QUIQUE_C1368_190116_001 151.74 106.89 385010000 26403000 59712000 41112000 30371000 24901000 8401900 38851000 13776000 48403000 15682000 53740000 0 23656000 40217 1756 37531 360263;360264;360265;360266;360267;360268;360269;360270;360271;360272;360273;360274;360275;360276;360277;360278;360279;360280 458322;458323;458324;458325;458326;458327;458328;458329;458330;458331;458332;458333;458334;458335;458336;458337;458338;458339;458340 458326 15 SITLPPDEIFR Unmodified 1286.6871 0.68705229 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;A0A0G2JQS7;D6RJF3;H0YA02 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 107.18 107.18 2 0.012341 111804 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.518 23.327 45850000 0 0 34075000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11775000 40218 4304 37532 360281;360282 458341;458342 458342 2 SITNTTVCTK Unmodified 1123.5543 0.55432356 3148 Q15637 SF1 Splicing factor 1 yes yes 0 0 0 1 19.652 19.652 2 0.060607 12181 QUIQUE_DMIX4_190116_001 46.022 10.142 38319000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38319000 0 0 0 40219 3148 37533 360283 458343 458343 1 SITTDDWK Unmodified 964.45018 0.45017606 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 39.752 39.752 2 0.045132 35795 QUIQUE_C1368_190116_001 57.281 3.7266 129870000 0 0 64925000 0 0 0 64945000 0 0 0 0 0 0 40220 1977 37534 360284;360285 458344;458345 458344 2 SITTDDWKDFLYSYFK Unmodified 2027.9517 0.95165941 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 159.44 159.44 2;3 2.667E-08 162134 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.39 100.65 570740000 0 0 23155000 0 51188000 0 0 79490000 137500000 0 51350000 107600000 120460000 40221 1977 37535 360286;360287;360288;360289;360290;360291;360292;360293;360294;360295;360296 458346;458347;458348;458349;458350;458351;458352;458353;458354;458355;458356;458357;458358 458351 11 SITVICDFYSLIR Unmodified 1585.8174 0.81741453 3227 Q3SXM5;H3BQI7;H3BT52;H3BNH5 HSDL1 Inactive hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 155.09 155.09 2 0.00037354 161470 QUIQUE_C1576_190116_001 94.297 50.784 242650000 0 0 0 0 0 24038000 55368000 0 58512000 12614000 0 54244000 37869000 40222 3227 37536 360297;360298;360299;360300;360301;360302 458359;458360;458361;458362;458363;458364 458360 6 SITVSALPFLR Unmodified 1202.7023 0.70230842 1429 O14525;B1AJS1 ASTN1 Astrotactin-1 yes no 0 0 0 1 1 124.27 124.27 2 0.0013828 128827 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.676 46.713 21162000 0 0 0 0 0 0 0 0 21162000 0 0 0 0 40223 1429 37537 360303;360304 458365;458366 458366 2 SITVSPIPFFNK Unmodified 1348.7391 0.73908786 1607 O75061;S4R305 DNAJC6 Putative tyrosine-protein phosphatase auxilin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.76 124.76 2 6.8489E-10 128965 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.84 110.71 385570000 0 65499000 0 50495000 39041000 46467000 0 52936000 44191000 0 0 52950000 33996000 40224 1607 37538 360305;360306;360307;360308;360309;360310;360311;360312;360313;360314 458367;458368;458369;458370;458371;458372;458373;458374;458375;458376;458377 458374 7 SITVTQDEGIRPSTTMEGLAK Unmodified 2233.126 0.12601173 1956 P09110;C9JDE9;H7C131;H0Y4D4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 1 1 1 78.225 78.225 2 8.2729E-16 78968 QUIQUE_C1368_190116_001 125.28 113.11 16243000 0 16243000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40225 1956 37539 360315;360316 458378;458379 458379 2 SITVTQDEGIRPSTTMEGLAK Oxidation (M) 2249.1209 0.12092636 1956 P09110;C9JDE9;H7C131;H0Y4D4 ACAA1 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 1 1 1 59.417 59.417 3 0.00027941 54910 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.578 34.928 17492000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17492000 0 0 0 40226 1956 37539 360317 458380 458380 1213 1 SIVDAYVLLNLGDSVTTDHISPAGNIAR Unmodified 2910.5087 0.50870058 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 151.9 151.9 3 2.0626E-45 159037 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.95 114.83 515170000 0 0 0 0 71592000 0 0 71703000 95758000 24365000 56973000 75195000 119590000 40227 2180 37540 360318;360319;360320;360321;360322;360323;360324;360325;360326;360327;360328 458381;458382;458383;458384;458385;458386;458387;458388;458389;458390;458391;458392;458393;458394;458395;458396 458389 15 SIVDKEGVPR Unmodified 1098.6033 0.60332266 645 Q99613;B5ME19;H3BPE4;H3BPE3;H3BTY8 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 1 1 1 21.875 21.875 3 0.0035802 14954 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.056 46.924 101850000 0 0 0 0 41672000 0 0 0 0 0 0 0 60178000 40228 645 37541 360329;360330 458397;458398 458398 2 SIVDNWPENHVK Unmodified 1436.7048 0.70482762 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PQT3;A0A1W2PQY8;A0A1W2PQ37;A0A1W2PQF8;A0A1W2PR68 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 53.967 53.967 2;3 5.2876E-05 52656 QUIQUE_C1576_190116_001 125.97 95.715 861460000 0 0 54441000 0 0 233390000 64020000 49619000 0 23176000 305180000 48335000 83300000 40229 374 37542 360331;360332;360333;360334;360335;360336;360337;360338;360339;360340;360341 458399;458400;458401;458402;458403;458404;458405;458406;458407;458408;458409 458403 11 SIVDYKPNLDLLEQQHQLIQEALIFDNK Unmodified 3323.7402 0.74015708 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 1 1 2 2 2 2 3 2 1 2 2 2 2 1 153.35 153.35 3;4 1.2906E-64 156116 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.95 135.01 11459000000 184530000 1745300000 917990000 957800000 1234700000 619190000 1186400000 187020000 741910000 127520000 1106800000 1101700000 1348200000 40230 1228;1544 37543 360342;360343;360344;360345;360346;360347;360348;360349;360350;360351;360352;360353;360354;360355;360356;360357;360358;360359;360360;360361;360362;360363;360364;360365 458410;458411;458412;458413;458414;458415;458416;458417;458418;458419;458420;458421;458422;458423;458424;458425;458426;458427;458428;458429;458430;458431;458432;458433;458434;458435;458436;458437;458438;458439 458427 25 SIVEEIEDLVAR Unmodified 1371.7246 0.72456001 1869 P04844;Q5JYR7;Q5JYR4;F2Z3K5 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 153.9 153.9 2;3 4.2751E-06 156450 QUIQUE_DMIX4_190116_001 136.63 101.12 853590000 40003000 40103000 79373000 38700000 137730000 51470000 96782000 0 117450000 68860000 89823000 49671000 43629000 40231 1869 37544 360366;360367;360368;360369;360370;360371;360372;360373;360374;360375;360376;360377;360378;360379;360380 458440;458441;458442;458443;458444;458445;458446;458447;458448;458449;458450;458451;458452;458453;458454;458455;458456;458457;458458 458453 19 SIVEGIIEEEEEDEEGSESISK Unmodified 2436.0915 0.091519526 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 131.51 131.51 2;3 1.1005E-65 136341 QUIQUE_C1368_190116_001 208.92 195.78 377900000 70562000 45774000 63027000 74953000 40200000 66430000 0 0 0 16949000 0 0 0 40232 4617 37545 360381;360382;360383;360384;360385;360386;360387;360388;360389;360390;360391;360392 458459;458460;458461;458462;458463;458464;458465;458466;458467;458468;458469;458470;458471 458463 12 SIVEGIIEEEEEDEEGSESISKR Unmodified 2592.1926 0.19263055 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 114.36 114.36 3 2.0891E-06 118520 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.133 61.235 65180000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 65180000 40233 4617 37546 360393;360394;360395;360396 458472;458473;458474;458475 458475 4 SIVETILIYK Unmodified 1177.6958 0.69582606 3967 Q99683 MAP3K5 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 115.65 115.65 2 0.01082 120454 QUIQUE_C1576_190116_001 68.224 56.079 116380000 0 14284000 12635000 12293000 17104000 12125000 16269000 15875000 0 0 0 15800000 0 40234 3967 37547 360397;360398;360399;360400;360401;360402;360403;360404 458476;458477;458478;458479;458480;458481;458482;458483 458481 8 SIVGMTMYNQATQEIAKPSELLTSVR Unmodified 2866.4569 0.4568647 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.94 138.94 3 2.7244E-46 144398 QUIQUE_C1368_190116_001 146.5 134.76 780160000 0 0 98002000 0 62056000 0 77054000 90639000 80705000 0 105360000 109190000 157160000 40235 4551 37548 360405;360406;360407;360408;360409;360410;360411;360412 458484;458485;458486;458487;458488;458489;458490;458491 458484 8 SIVHAVQAGIFVER Unmodified 1524.8413 0.84126152 614;2648;168 B4DK72;Q01064;A0A0A0MS69;Q14123;P54750 PDE1B;PDE1C;PDE1A Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B;Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C;Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 78.561 78.561 2;3 7.2046E-05 79897 QUIQUE_C1576_190116_001 91.812 79.185 280890000 36493000 30602000 0 30535000 0 0 52171000 0 38180000 0 45883000 0 47031000 40236 614;168;2648 37549 360413;360414;360415;360416;360417;360418;360419 458492;458493;458494;458495;458496;458497;458498;458499;458500 458497 8 SIVPISR Unmodified 770.46504 0.46503826 1654 O75695 RP2 Protein XRP2 yes yes 0 0 0 1 1 1 36.216 36.216 2 0.042242 32248 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.297 48.826 168640000 0 0 0 0 0 0 61089000 0 56351000 0 0 51199000 0 40237 1654 37550 360420;360421;360422 458501;458502;458503 458502 3 SIVPQGGSHSLR Unmodified 1236.6575 0.65748349 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 1 1 2 1 22.667 22.667 2;3 0.00028028 15943 QUIQUE_C1438_190116_001 84.605 63.606 1689500000 37343000 132380000 212430000 31987000 234760000 78134000 74892000 150830000 191040000 60858000 157480000 214420000 112930000 40238 2834 37551 360423;360424;360425;360426;360427;360428;360429;360430;360431;360432;360433;360434;360435;360436;360437;360438;360439;360440 458504;458505;458506;458507;458508;458509;458510;458511;458512;458513;458514;458515;458516;458517;458518;458519;458520;458521;458522;458523;458524 458510 20 SIVPTMHYQDSLPR Unmodified 1642.8137 0.81372614 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75;A0A1B0GTM0;A0A1B0GUD9;A0A1B0GTL9;A0A1B0GUB8 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 76.633 76.633 3 0.057182 77360 QUIQUE_C1277_190116_001 27.263 19.086 26337000 0 26337000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40239 2223 37552 360441 458525 458525 1 SIVPTMHYQDSLPR Oxidation (M) 1658.8086 0.80864076 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75;A0A1B0GTM0;A0A1B0GUD9;A0A1B0GTL9;A0A1B0GUB8 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 58.727 58.727 3 0.01889 54319 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.173 43.197 15469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15469000 0 0 0 40240 2223 37552 360442 458526 458526 0 SIVQGCHNSAELIAEISTACTYK Unmodified 2551.2047 0.20467276 3029 Q13884 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.5 108.5 3 3.9217E-12 113299 QUIQUE_C1218_190116_001 99.366 95.947 556130000 57457000 59429000 0 0 67829000 0 91490000 0 93452000 26935000 47080000 63023000 49430000 40241 3029 37553 360443;360444;360445;360446;360447;360448;360449;360450;360451;360452 458527;458528;458529;458530;458531;458532;458533;458534;458535;458536;458537;458538;458539 458527 13 SIVSELAGLLSAMEYVQK Unmodified 1937.018 0.017964835 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 175.2 175.2 2;3 1.1841E-23 180055 QUIQUE_C1576_190116_001 181.98 162.32 538730000 3064900 0 0 0 0 0 139080000 20789000 79040000 0 235480000 61281000 0 40242 2427 37554 360453;360454;360455;360456;360457;360458;360459;360460;360461;360462;360463 458540;458541;458542;458543;458544;458545;458546;458547;458548;458549;458550 458543 11 SIVSELAGLLSAMEYVQK Oxidation (M) 1953.0129 0.012879457 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 1 0 1 1 167.56 167.56 2 9.7881E-31 170614 QUIQUE_C1403_190116_001 152.4 122.85 97649000 0 61043000 0 36606000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40243 2427 37554 360464;360465 458551;458552 458552 1853 2 SIVSTLESFK Unmodified 1109.5968 0.5968403 4051 Q9BW62;Q5T558;A2A3H2 KATNAL1 Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 112.14 112.14 2 0.029155 115459 QUIQUE_C1277_190116_001 66.299 43.807 30167000 0 30167000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40244 4051 37555 360466;360467;360468;360469;360470 458553;458554;458555;458556;458557 458554 5 SIVSVGDPK Unmodified 900.49165 0.49164694 2970;120 Q13153;B3KNX7;E9PM17;A0A087X294;O75914 PAK1;PAK3 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 no no 0 0 0 1 31.309 31.309 2 0.012317 26076 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.501 29.999 77997000 0 0 0 0 0 0 0 77997000 0 0 0 0 0 40245 2970;120 37556 360471 458558 458558 1 SIVTDLVSQMDPHGR Unmodified 1653.8145 0.81445442 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 121.92 121.92 2;3 5.819E-05 119288 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.357 50.917 1013800000 168260000 101870000 128320000 101310000 78011000 121490000 93018000 37511000 57186000 24953000 34383000 0 67433000 40246 831;1569 37557 360472;360473;360474;360475;360476;360477;360478;360479;360480;360481;360482;360483;360484;360485;360486;360487 458559;458560;458561;458562;458563;458564;458565;458566;458567;458568;458569;458570;458571;458572;458573;458574;458575;458576;458577;458578;458579;458580;458581;458582;458583 458578 25 SIVTLDGGK Unmodified 888.49165 0.49164694 1889 S4R371;P05413 FABP3 Fatty acid-binding protein, heart yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 36.846 36.846 2 0.0071305 32567 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.452 23.637 1830100000 0 598780000 0 325330000 0 280890000 0 0 289030000 0 0 336070000 0 40247 1889 37558 360488;360489;360490;360491;360492 458584;458585;458586;458587;458588;458589;458590 458589 7 SIVTLQR Unmodified 815.4865 0.48650199 1825 P02689 PMP2 Myelin P2 protein yes yes 0 0 0 1 33.277 33.277 2 0.036465 28720 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.086 5.7091 75119000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 75119000 0 0 40248 1825 37559 360493 458591 458591 1 SIVVDLFHGQLR Unmodified 1382.767 0.76703394 1346 K7EQL6;Q8NFA0 USP32 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.75 105.75 3 0.0017511 110033 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.7 39.498 43414000 12041000 12887000 0 7025900 0 0 0 0 0 0 11460000 0 0 40249 1346 37560 360494;360495;360496;360497;360498;360499 458592;458593;458594;458595;458596;458597 458596 6 SIVVSPILIPENQR Unmodified 1563.8984 0.89844205 2666 P55290 CDH13 Cadherin-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.57 104.57 2 0.0020853 108900 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.403 75.246 1334600000 125090000 124360000 168650000 106850000 159840000 70550000 191370000 51559000 0 29348000 109030000 76213000 121720000 40250 2666 37561 360500;360501;360502;360503;360504;360505;360506;360507;360508;360509;360510;360511 458598;458599;458600;458601;458602;458603;458604;458605;458606;458607;458608;458609 458607 12 SIWAFGPDATGPNILVDDTLPSEVDK Unmodified 2756.3545 0.35449135 3099 Q15029;K7EP67;K7EJ74 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes no 0 0 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458626;458627;458628;458629;458630;458631;458632;458633;458634;458635;458636;458637;458638;458639 458637 14 SIYGEKFEDENFILK Unmodified 1830.904 0.90398093 2772 P62937;F8WE65;C9J5S7 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 3 2 2 4 2 3 3 2 101.02 101.02 2;3 1.3614E-78 103180 QUIQUE_C1403_190116_001 197.36 183.96 67117000000 1309400000 3203400000 3203200000 1415200000 5800400000 1686200000 3927700000 8110800000 6901700000 622180000 11278000000 9222200000 10437000000 40253 2772 37564 360538;360539;360540;360541;360542;360543;360544;360545;360546;360547;360548;360549;360550;360551;360552;360553;360554;360555;360556;360557;360558;360559;360560;360561;360562;360563;360564;360565;360566;360567;360568 458640;458641;458642;458643;458644;458645;458646;458647;458648;458649;458650;458651;458652;458653;458654;458655;458656;458657;458658;458659;458660;458661;458662;458663;458664;458665;458666;458667;458668;458669;458670;458671;458672;458673;458674;458675;458676;458677;458678;458679;458680;458681;458682;458683;458684;458685;458686;458687;458688;458689;458690;458691;458692;458693;458694;458695;458696 458654 55 SIYGERFPDENFK Unmodified 1600.7522 0.75217174 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 1 2 2 71.207 71.207 2;3 0.00066572 71013 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.28 99.677 251590000 0 0 0 0 0 0 0 171150000 80444000 0 0 0 0 40254 2210 37565 360569;360570;360571;360572 458697;458698;458699;458700 458698 4 SIYKPGQTVK Unmodified 1119.6288 0.62880913 1802 P01023;F8W7L3 A2M Alpha-2-macroglobulin yes no 0 0 1 1 1 2 15.693 15.693 2;3 0.014238 8091 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.699 18.347 206820000 0 0 0 0 0 0 0 0 41040000 0 0 165780000 0 40255 1802 37566 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protein yes no 0 0 2 1 1 1 1 25.826 25.826 2;3 0.0058895 19069 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.547 75.284 160390000 0 0 0 0 0 0 0 128940000 0 0 31455000 0 0 40262 1890 37573 360637;360638;360639;360640 458769;458770;458771;458772 458771 4 SKCEELSGLHGQLQEAR Unmodified 1940.9374 0.9374231 51 F8W7S5;A0A087WVV2;Q9P2E9 RRBP1 Ribosome-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 36.617 36.617 3 0.021975 32281 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.85 31.433 24908000 0 0 0 0 0 0 0 24908000 0 0 0 0 0 40263 51 37574 360641 458773 458773 1 SKDDQVTVIGAGVTLHEALAAAELLK Unmodified 2648.4385 0.43849575 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 1 6 3 9 6 4 4 4 3 6 4 4 2 4 149.59 149.59 2;3;4 3.2838E-240 144577 QUIQUE_DMIX4_190116_001 253.49 237.59 25294000000 2925100000 1700400000 2839400000 2502400000 1664200000 1884800000 1910700000 1100700000 2364200000 1307000000 1655900000 1801000000 1637700000 40264 2288 37575 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Unmodified 1299.6095 0.60953025 4515;2581 Q9UNW9;I3L2B5;F8VWX1;F8W659;J3KQU3;P51513 NOVA2;NOVA1 RNA-binding protein Nova-2;RNA-binding protein Nova-1 no no 0 0 1 1 22.087 22.087 2 0.014015 15251 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.472 61.528 71358000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 71358000 40268 4515;2581 37579 360724 458908 458908 1 SKDIVLVAYSALGSHR Unmodified 1714.9366 0.93661847 2889;2616 P52895;B4DK69;Q04828;H0Y804 AKR1C2;AKR1C1 Aldo-keto reductase family 1 member C2;Aldo-keto reductase family 1 member C1 no no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 83.74 83.74 3;4 0.0015527 84553 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.798 35.532 286320000 0 60842000 0 0 0 0 24248000 0 12415000 43725000 0 11289000 133800000 40269 2616;2889 37580 360725;360726;360727;360728;360729;360730;360731;360732;360733 458909;458910;458911;458912;458913;458914;458915;458916;458917;458918;458919 458916 9 SKDIVLVAYSALGSQR Unmodified 1705.9363 0.93628412 183 A0A0A0MSS8;P42330;S4R3Z2;A0A3B3IRI8 AKR1C3 Aldo-keto reductase family 1 member C3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 98.557 98.557 2;3 0.00050122 101412 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.768 78.002 829090000 0 52315000 0 55526000 55892000 30055000 0 113190000 325000000 0 91827000 105300000 0 40270 183 37581 360734;360735;360736;360737;360738;360739;360740;360741;360742 458920;458921;458922;458923;458924;458925;458926;458927;458928 458926 5 SKDKLDQVSSEIK Unmodified 1475.7831 0.78313752 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 0 2 1 1 24.218 24.218 2 0.0001654 17963 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.6 110.09 39715000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39715000 40271 3252 37582 360743;360744 458929;458930 458930 2 SKDLAEVGEGGGHSQAR Unmodified 1696.8129 0.81287452 4093 Q9C0C2 TNKS1BP1 182 kDa tankyrase-1-binding protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 13.638 13.638 3 9.8269E-05 5622 QUIQUE_C1438_190116_001 73.11 49.176 56984000 7729100 0 7234700 0 11357000 0 0 23557000 7106500 0 0 0 0 40272 4093 37583 360745;360746;360747;360748;360749 458931;458932;458933;458934;458935 458933 4 SKDPSGLLISVIR Unmodified 1383.8086 0.80856441 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 1 1 93.791 93.791 3 0.013403 94873 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.101 32.361 18995000 0 0 0 0 0 0 0 18995000 0 0 0 0 0 40273 3797 37584 360750 458936 458936 1 SKDQFEFALTAVAEEVNAILK Unmodified 2322.2107 0.21072764 3201 Q16849 PTPRN Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 172.02 172.02 3 1.2866E-13 175493 QUIQUE_C1277_190116_001 115.74 104.6 209540000 11246000 24883000 0 0 0 0 0 0 86566000 0 53037000 33810000 0 40274 3201 37585 360751;360752;360753;360754;360755 458937;458938;458939;458940;458941 458938 5 SKDSATAQAWFSAIHSNVNDLLTR Unmodified 2631.3041 0.30412753 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 1 3 1 1 1 1 136.92 136.92 3;4 1.6094E-40 141873 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.34 130.45 437350000 0 0 0 0 0 0 0 119570000 87735000 0 77780000 82523000 69740000 40275 3029 37586 360756;360757;360758;360759;360760;360761;360762 458942;458943;458944;458945;458946;458947;458948;458949;458950 458946 9 SKDTYLLYEGR Unmodified 1343.6721 0.67213051 4011 Q9BSH4 TACO1 Translational activator of cytochrome c oxidase 1 yes yes 0 0 1 1 47.459 47.459 2 0.017757 44583 QUIQUE_C1277_190116_001 76.619 55.024 21647000 0 21647000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40276 4011 37587 360763 458951 458951 1 SKDVINFTAEK Unmodified 1250.6507 0.65066678 1768 O96007 MOCS2 Molybdopterin synthase catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 34.506 34.506 2 0.003964 29909 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.283 61.196 200490000 0 0 31980000 34841000 23756000 0 0 18198000 0 0 45320000 0 46399000 40277 1768 37588 360764;360765;360766;360767;360768;360769;360770 458952;458953;458954;458955;458956;458957;458958;458959 458956 8 SKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETAR Oxidation (M) 3008.3896 0.389573 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 1 1 1 1 1 160.82 160.82 3 3.6259E-12 165585 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.974 62.388 126020000 0 0 0 0 0 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459283;459284;459285;459286;459287 459284 5 SKENISLLEK Unmodified 1159.6449 0.64485312 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.154 29.154 2 0.014302 23305 QUIQUE_C1403_190116_001 103.91 55.115 400610000 34349000 41074000 0 37444000 49675000 0 40885000 28043000 50291000 0 64564000 54282000 0 40295 3108 37603 361008;361009;361010;361011;361012;361013;361014;361015;361016 459288;459289;459290;459291;459292;459293;459294;459295;459296 459290 6 SKEPDGDRVVYTGTYDTEGVTPTK Unmodified 2614.2399 0.23985552 3849 Q96F85;B8ZZB8 CNRIP1 CB1 cannabinoid receptor-interacting protein 1 yes no 0 0 2 2 1 1 1 1 53.368 53.368 3;4 2.6607E-17 51307 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.74 99.007 341230000 0 0 0 0 0 0 0 254760000 0 0 0 0 86474000 40296 3849 37604 361017;361018;361019;361020;361021;361022 459297;459298;459299;459300;459301;459302;459303 459298 7 SKEQAELEAAR Unmodified 1230.6204 0.62042929 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 1 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 16.33 16.33 2;3 3.4521E-29 8397 QUIQUE_C1368_190116_001 192.38 148.03 9772900000 479880000 744060000 633950000 136340000 744150000 105440000 242850000 1200600000 1468700000 84609000 2153300000 1053300000 725630000 40297 3117 37605 361023;361024;361025;361026;361027;361028;361029;361030;361031;361032;361033;361034;361035;361036;361037;361038;361039;361040;361041;361042;361043;361044 459304;459305;459306;459307;459308;459309;459310;459311;459312;459313;459314;459315;459316;459317;459318;459319;459320;459321;459322;459323;459324;459325 459308 14 SKESVPEFPLSPPK Unmodified 1540.8137 0.81370936 2115 P16949;A2A2D0 STMN1 Stathmin yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 68.632 68.632 2;3 0.00048497 69001 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.03 90.809 427240000 0 111770000 57981000 0 0 0 0 35619000 35772000 0 62468000 66872000 56759000 40298 2115 37606 361045;361046;361047;361048;361049;361050;361051;361052;361053;361054 459326;459327;459328;459329;459330;459331;459332;459333;459334;459335;459336;459337 459333 12 SKFADLTDAAAR Unmodified 1264.6412 0.64116473 395;1336;389;1322 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EKH9;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136;K7EKD1 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 43.263 43.263 2;3 0.0019537 40059 QUIQUE_C1403_190116_001 133.07 83.651 3906500000 66133000 0 232580000 112520000 123170000 112090000 115190000 622540000 288490000 0 1557500000 403790000 272580000 40299 389;395;1336;1322 37607 361055;361056;361057;361058;361059;361060;361061;361062;361063;361064;361065;361066 459338;459339;459340;459341;459342;459343;459344;459345;459346;459347;459348;459349;459350 459341 11 SKFDNLYGCR Unmodified 1258.5765 0.57645598 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 36.56 36.56 2;3 0.0021345 32069 QUIQUE_C1403_190116_001 72.434 63.384 2384600000 135970000 138390000 166830000 74170000 0 0 207650000 284170000 282760000 0 380030000 293440000 421180000 40300 2219 37608 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1500.7249 0.72489436 2778 P63092;Q5JWF2;A0A0A0MR13 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 105.66 105.66 2;3 9.2853E-06 108342 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.26 89.046 1555200000 48934000 60923000 187980000 118940000 122740000 134820000 67632000 151040000 189210000 22072000 80514000 135660000 234750000 40303 2778 37611 361088;361089;361090;361091;361092;361093;361094;361095;361096;361097;361098;361099;361100;361101;361102;361103;361104;361105;361106;361107;361108;361109 459373;459374;459375;459376;459377;459378;459379;459380;459381;459382;459383;459384;459385;459386;459387;459388;459389;459390;459391;459392;459393;459394;459395;459396;459397;459398;459399;459400;459401;459402;459403;459404;459405 459391 32 SKINVNEIFYDLVR Unmodified 1708.9148 0.91482039 2719;2765 P61224;A6NIZ1;F5H823;B7ZB78;F5GZG1;P62834 RAP1B;RAP1A Ras-related protein Rap-1b;Ras-related protein Rap-1b-like protein;Ras-related protein Rap-1A no no 0 0 1 1 1 1 1 1 134 134 3 8.4144E-11 138853 QUIQUE_DMIX3_190116_001 136.83 109.69 255270000 0 0 0 0 0 0 0 76340000 48868000 0 57534000 44903000 27625000 40304 2719;2765 37612 361110;361111;361112;361113;361114 459406;459407;459408;459409;459410 459407 4 SKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAK Unmodified 2402.2329 0.23291965 2369 P35221;G3XAM7 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 2 1 106.66 106.66 3 0.00028493 108767 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.361 51.379 23632000 0 0 0 0 0 0 0 23632000 0 0 0 0 0 40305 2369 37613 361115 459411 459411 1 SKLDSLASDHQK Unmodified 1327.6732 0.67319314 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 14.654 14.654 2;3 4.5836E-19 7135 QUIQUE_C1218_190116_001 168.22 137.15 1039900000 10233000 15477000 104610000 15511000 30380000 29216000 173110000 134810000 219330000 0 172890000 134320000 0 40306 4414 37614 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Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.27 146.27 3 0.0019586 152392 QUIQUE_C1576_190116_001 58.712 53.81 489670000 56045000 0 56547000 0 49336000 81245000 56653000 0 52732000 18879000 64529000 0 53702000 40324 4250 37630 361295;361296;361297;361298;361299;361300;361301;361302;361303 459646;459647;459648;459649;459650;459651;459652;459653;459654 459650 9 SKQEALKNDLVEALK Unmodified 1684.9359 0.93594977 585 B1AK87;B1AK88 CAPZB yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 61.216 61.216 2;3 0.00012559 60546 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.79 97.401 301100000 0 0 0 0 30779000 0 24286000 73256000 69599000 0 19375000 83803000 0 40325 585 37631 361304;361305;361306;361307;361308;361309 459655;459656;459657;459658;459659;459660 459659 6 SKSDPIMLLK Unmodified 1130.6369 0.63693097 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 50.583 50.583 2;3 0.0086994 47307 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.943 56.344 265530000 75968000 0 0 0 0 0 0 75344000 0 0 35665000 0 78551000 40326 1943 37632 361310;361311;361312;361313 459661;459662;459663;459664;459665;459666;459667 459667 7 SKSDPIMLLK Oxidation (M) 1146.6318 0.63184559 1943 P08559;Q5JPU3 PDHA1 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial yes no 0 1 1 1 40.827 40.827 3 0.029287 37706 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.486 31.167 46556000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46556000 0 0 40327 1943 37632 361314 459668 459668 1 SKSEEAHAEDSVMDHHFR Unmodified 2110.9127 0.91266492 3631 Q8NC51 SERBP1 Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein yes yes 0 0 1 1 1 26.282 26.282 4 0.0004922 19577 QUIQUE_C1277_190116_001 62.203 58.096 70691000 18011000 52680000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40328 3631 37633 361315;361316 459669;459670 459670 2 SKSEMSYIDGEK Unmodified 1372.618 0.61804602 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 1 1 28.82 28.82 2 0.012441 23381 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.342 48.087 25845000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25845000 40329 309;4058 37634 361317 459671;459672 459671 2 SKTHAVLVALK Unmodified 1165.7183 0.71829284 2244 P25786;F5GX11;B4DEV8 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1;Proteasome subunit alpha type yes no 0 0 1 1 1 18.216 18.216 3 0.030562 11267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 35.774 26.875 62717000 0 0 0 0 0 0 0 24890000 0 0 37827000 0 0 40330 2244 37635 361318;361319 459673;459674 459673 2 SKVDEAVAVLQAHQAK Unmodified 1692.9159 0.91588303 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;Q9H361;H0YAS6;H0YB75;H0YAS7;H0YC10 PABPC1;PABPC3 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 57.295 57.295 3 0.00021616 56449 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.948 47.219 788250000 0 0 0 0 143160000 111620000 0 150580000 0 65180000 0 0 317710000 40331 2031 37636 361320;361321;361322;361323;361324 459675;459676;459677;459678;459679 459677 4 SKYPQHALALR Unmodified 1282.7146 0.71460444 103 A0A087X165;Q9C0H9;A0A087WU33 SRCIN1 SRC kinase signaling inhibitor 1 yes no 0 0 1 1 20.182 20.182 3 0.028089 13229 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.955 30.422 24539000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24539000 0 0 40332 103 37637 361325 459680 459680 1 SKYTTPSGEVR Unmodified 1223.6146 0.61461563 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2;E9PP11 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 14.852 14.852 2;3 0.00068274 7014 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.313 66.475 689460000 0 0 0 0 49834000 0 0 209620000 176020000 0 140770000 113210000 0 40333 959 37638 361326;361327;361328;361329;361330;361331;361332 459681;459682;459683;459684;459685;459686;459687 459686 5 SLAAEWGK Unmodified 860.43922 0.43921744 3190 Q16698 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 41.983 41.983 2 0.007181 39290 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.997 55.873 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SLAELGDCNEDLEQVEK Unmodified 1947.8732 0.87315109 4222 Q9HCB6 SPON1 Spondin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 92.104 92.104 2 3.5879E-10 93093 QUIQUE_C1563_190116_001 139.46 131.05 128320000 0 0 0 0 0 41158000 31810000 0 26749000 0 0 28604000 0 40351 4222 37654 361520;361521;361522;361523;361524 459922;459923;459924;459925;459926 459923 4 SLAESIDDALNCR Unmodified 1462.6722 0.67220686 60 A0A2R8Y7T6;A0A087WWK8;A0A3B3IRZ4;Q6DN90;A0A3B3IU98;A0A0C4DGT3;A0A2R8Y695 IQSEC1 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 113.03 113.03 2 0.045366 117479 QUIQUE_C1576_190116_001 70.942 45.003 27964000 0 0 0 0 0 0 27964000 0 0 0 0 0 0 40352 60 37655 361525 459927 459927 0 SLAGSSGPGASSGTSGDHGELVVR Unmodified 2184.0407 0.040702201 979;2291 E9PRY8;A0A087X1X7;H0YCK7;E9PIZ1;P29692;E9PK01;E9PPR1;E9PL12;E9PQ49;E9PI39;E9PMW7 EEF1D Elongation factor 1-delta no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 42.921 42.921 2;3 0 39640 QUIQUE_DMIX3_190116_001 309.94 279.39 3385300000 328960000 329460000 177970000 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460068;460069;460070;460071;460072;460073 460069 5 SLAQAEAEKQKEEAER Unmodified 1815.8963 0.8962698 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 2 2 2 2 1 19.983 19.983 2;3 4.3906E-282 13333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 301.57 265.25 1201200000 0 0 0 0 0 0 0 507290000 294020000 0 218040000 181850000 0 40367 3117 37667 361646;361647;361648;361649;361650;361651;361652 460074;460075;460076;460077;460078;460079;460080 460075 7 SLAQEALR Unmodified 886.48723 0.48723027 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 31.803 31.803 2 0.04974 27310 QUIQUE_C1277_190116_001 55.676 1.0647 4064200000 0 1801700000 0 2262500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40368 4551 37668 361653;361654 460081;460082 460081 2 SLAQPATTTAR Unmodified 1115.5935 0.59348625 67 A0A087WXN9;Q765P7 MTSS1L MTSS1-like protein yes no 0 0 0 1 1 19.467 19.467 2 0.030682 12369 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.108 22.3 32504000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32504000 0 0 0 40369 67 37669 361655;361656 460083;460084 460083 2 SLASDITDEQK Unmodified 1205.5776 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Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 61.22 61.22 2 0.0084554 59600 QUIQUE_C1563_190116_001 94.262 31.545 162440000 0 0 0 0 43963000 34566000 0 36155000 0 0 47757000 0 0 40372 3351 37672 361677;361678;361679;361680 460107;460108;460109;460110 460108 4 SLATTRPTVNADDLLK Unmodified 1713.9261 0.92611336 4507 Q9UN37 VPS4A Vacuolar protein sorting-associated protein 4A yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 72.446 72.446 2;3 5.1266E-19 73039 QUIQUE_DMIX1_190116_001 148.96 90.282 1027200000 0 0 119050000 159750000 143940000 0 0 163600000 0 0 203340000 132940000 104560000 40373 4507 37673 361681;361682;361683;361684;361685;361686;361687;361688;361689;361690;361691;361692;361693 460111;460112;460113;460114;460115;460116;460117;460118;460119;460120;460121;460122;460123;460124 460118 13 SLATWENENK Unmodified 1190.5568 0.5567664 2292 P29762 CRABP1 Cellular retinoic acid-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 42.027 42.027 2 0.00017332 37266 QUIQUE_DMIX4_190116_001 135.79 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37682 361731;361732 460167;460168 460168 2 SLCNLEESITSAGR Unmodified 1535.725 0.72497071 3246 Q52LJ0 FAM98B Protein FAM98B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.964 94.964 2 4.8979E-22 98728 QUIQUE_C1218_190116_001 194.17 149 1164500000 114060000 135100000 128380000 104890000 92571000 106860000 118490000 53832000 0 45971000 121600000 74564000 68183000 40383 3246 37683 361733;361734;361735;361736;361737;361738;361739;361740;361741;361742;361743;361744;361745 460169;460170;460171;460172;460173;460174;460175;460176;460177;460178;460179;460180;460181;460182;460183;460184;460185 460171 16 SLCSITDPANEK Unmodified 1333.6184 0.61838038 2605 P52306;D6RHH8 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.86 46.86 2 1.1612E-07 44193 QUIQUE_DMIX3_190116_001 179.51 157.27 911530000 104170000 109190000 81847000 78225000 79727000 77775000 105030000 88728000 88472000 0 0 98376000 0 40384 2605 37684 361746;361747;361748;361749;361750;361751;361752;361753;361754;361755 460186;460187;460188;460189;460190;460191;460192;460193;460194;460195;460196;460197 460196 12 SLCSQATSVNER Unmodified 1350.6198 0.61977736 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E7ENC1;C9JVY9 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 41.271 41.271 3 0.02604 38262 QUIQUE_C1576_190116_001 30.331 6.9554 192860000 0 0 47610000 70320000 0 0 74928000 0 0 0 0 0 0 40385 739 37685 361756;361757;361758 460198;460199;460200 460200 3 SLDADEFR Unmodified 951.42977 0.42977497 3033;1353 K7ES72;Q13938 CAPS Calcyphosin no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 47.632 47.632 1;2 0.0011854 45450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 144.83 80.03 10393000000 662920000 509830000 835110000 501140000 443560000 656240000 1238400000 797270000 1419600000 376450000 1014100000 628530000 1310200000 40386 1353;3033 37686 361759;361760;361761;361762;361763;361764;361765;361766;361767;361768;361769;361770;361771;361772;361773;361774 460201;460202;460203;460204;460205;460206;460207;460208;460209;460210;460211;460212;460213;460214;460215;460216;460217;460218 460215 15 SLDADEFRQGLAK Unmodified 1448.726 0.72595699 3033;1353 K7ES72;Q13938 CAPS Calcyphosin no no 0 0 1 1 61.673 61.673 3 0.046472 60265 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.025 26.061 28688000 0 0 0 0 0 0 0 28688000 0 0 0 0 0 40387 1353;3033 37687 361775 460219 460219 1 SLDADHAPLQQFFVVMEHCLK Unmodified 2484.193 0.19298586 3946 Q96T51;J3KPP6 RUFY1 RUN and FYVE domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 149.65 149.65 4 0.0005419 153915 QUIQUE_C1403_190116_001 35.834 28.558 131460000 0 0 0 26054000 0 0 48003000 0 25133000 0 0 0 32271000 40388 3946 37688 361776;361777;361778;361779 460220;460221;460222;460223;460224 460221 5 SLDALGWEER Unmodified 1174.5619 0.56185177 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26;H0Y9E4 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 88.599 88.599 2 0.00033479 90848 QUIQUE_C1218_190116_001 114.39 90.265 74980000 57901000 0 0 0 0 0 0 0 0 17079000 0 0 0 40389 4304 37689 361780;361781;361782 460225;460226;460227 460225 3 SLDDEVNAFK Unmodified 1136.535 0.53496832 594 B1AMS2;Q14141 SEPT6 Septin-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.486 78.486 2 6.5339E-05 80622 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.39 101.29 1865800000 238760000 217430000 195830000 155640000 151710000 127900000 147220000 0 143990000 0 152290000 170710000 164350000 40390 594 37690 361783;361784;361785;361786;361787;361788;361789;361790;361791;361792;361793 460228;460229;460230;460231;460232;460233;460234;460235;460236;460237;460238;460239;460240 460237 12 SLDDFQAWLGR Unmodified 1306.6306 0.63060004 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 137.24 137.24 2 2.475E-12 142448 QUIQUE_C1218_190116_001 161.37 112.58 354730000 94055000 0 0 70429000 0 74375000 0 85164000 0 30708000 0 0 0 40391 1472 37691 361794;361795;361796;361797;361798;361799;361800 460241;460242;460243;460244;460245;460246;460247 460241 7 SLDDIDLSALR Unmodified 1216.6299 0.62993134 3590 Q8N4C8;I3L4T2 MINK1 Misshapen-like kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 92.258 92.258 2;3 0.0057521 115609 QUIQUE_C1368_190116_001 77.662 33.313 5321800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5321800 0 0 0 40392 3590 37692 361801;361802 460248;460249 460248 1 SLDDSCSQLTSFLYSFCQQSR Unmodified 2528.0948 0.094787961 2068 P13807;M0QYU1 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes no 0 0 0 1 1 162.03 162.03 2 7.55E-19 165759 QUIQUE_C1277_190116_001 152.89 148.78 57278000 0 26553000 0 0 0 0 30725000 0 0 0 0 0 0 40393 2068 37693 361803;361804 460250;460251 460250 2 SLDDVIK Unmodified 788.42798 0.42798405 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 44.934 44.934 2 0.045326 42374 QUIQUE_C1438_190116_001 78.616 6.6662 765320000 0 0 218200000 265820000 281300000 0 0 0 0 0 0 0 0 40394 1776 37694 361805;361806;361807 460252;460253;460254 460254 3 SLDDVIKR Unmodified 944.5291 0.52909508 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.332 33.332 2 0.0053766 28628 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.88 36.422 2281300000 0 0 0 204090000 267320000 141900000 0 284380000 374940000 0 362800000 364510000 281340000 40395 1776 37695 361808;361809;361810;361811;361812;361813;361814;361815 460255;460256;460257;460258;460259;460260;460261;460262;460263 460261 8 SLDEIDLSALR Unmodified 1230.6456 0.6455814 4473 Q9UKE5;C9JVV1 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 111.61 111.61 2 0.0014018 114562 QUIQUE_C1277_190116_001 85.377 53.848 54734000 27392000 27342000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40396 4473 37696 361816;361817;361818 460264;460265;460266;460267 460265 4 SLDEISQPAQELK Unmodified 1456.7409 0.74093835 2037 P12111;E7ENL6;C9JNG9 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 68.958 68.958 2 9.6962E-06 68798 QUIQUE_C1277_190116_001 157.14 132.09 201480000 0 67094000 0 0 0 134380000 0 0 0 0 0 0 0 40397 2037 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58.306 1;2 0.0036011 57114 QUIQUE_C1368_190116_001 113.71 52.947 3439700000 320430000 252500000 424430000 265580000 55392000 256160000 65303000 322930000 343850000 135960000 380440000 305500000 311220000 40419 2453 37718 362001;362002;362003;362004;362005;362006;362007;362008;362009;362010;362011;362012;362013;362014;362015;362016;362017;362018 460486;460487;460488;460489;460490;460491;460492;460493;460494;460495;460496;460497;460498;460499;460500;460501;460502;460503;460504;460505;460506;460507;460508 460490 17 SLDLDSIIAEVK Unmodified 1301.7078 0.70784731 1859;792 P04264;CON__P04264;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 2 3 2 2 2 141.6 141.6 1;2;3 4.337E-28 148099 QUIQUE_DMIX7_190116_001 182.71 146.5 14777000000 802180000 645350000 687180000 746970000 1324400000 823930000 805580000 1231000000 1078900000 2141600000 1339300000 1713900000 1437100000 + 40420 1859;792 37719 362019;362020;362021;362022;362023;362024;362025;362026;362027;362028;362029;362030;362031;362032;362033;362034;362035;362036;362037;362038;362039;362040 460509;460510;460511;460512;460513;460514;460515;460516;460517;460518;460519;460520;460521;460522;460523;460524;460525;460526;460527;460528;460529;460530;460531;460532;460533;460534;460535;460536;460537;460538;460539;460540;460541;460542;460543;460544;460545;460546 460542 37 SLDLDSIIAEVKAQYEDIAQK Unmodified 2348.2111 0.21112157 1859 P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes yes 0 0 1 1 168.21 168.21 3 1.4311E-187 175620 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.63 189.86 250190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 250190000 0 0 + 40421 1859 37720 362041 460547 460547 1 SLDLDSIIDAVR Unmodified 1315.6983 0.69834526 793 CON__Q6IFZ6;CON__Q7Z794;Q7Z794 KRT77 Keratin, type II cytoskeletal 1b yes no 0 0 0 1 1 1 148.92 148.92 2 0.00091976 144665 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.377 52.153 30976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6813300 14147000 10016000 0 + 40422 793 37721 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108.6 3 3.9884E-24 112198 QUIQUE_DMIX3_190116_001 130.12 113.99 168690000 0 0 0 0 0 0 0 87847000 80841000 0 0 0 0 40443 3960 37741 362181;362182 460713;460714 460714 1 SLDWENPTER Unmodified 1245.5626 0.56258006 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 69.364 69.364 2 0.01047 69781 QUIQUE_C1218_190116_001 68.735 49.955 111310000 47707000 0 0 0 34864000 0 0 0 0 28739000 0 0 0 40444 2377 37742 362183;362184;362185;362186 460715;460716;460717;460718 460715 4 SLDWNAEYEVYVVAENQQGK Unmodified 2341.0863 0.08625541 2057;28;1218;265 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A0D9SF30;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 2 147.28 147.28 2;3 0.0010063 152989 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.146 63.742 23086000 0 0 0 0 0 0 0 0 23086000 0 0 0 0 40445 1218;265;28;2057 37743 362187;362188 460719;460720 460720 2 SLEADLMQLQEDLAAAER Oxidation (M) 2017.9626 0.9626348 2385 P35749 MYH11 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1776.8391 0.83908927 1936;845 E5RK69;P08133;E7EMC6 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 1 2 61.451 61.451 3;4 0.0029203 59992 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.305 33.419 291650000 0 0 0 0 0 0 0 291650000 0 0 0 0 0 40455 845;1936 37752 362271;362272 460825;460826 460826 2 SLEDDIR Unmodified 846.40831 0.40831125 1968 P09525;Q6P452;B4E1S2 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 40.514 40.514 2 0.061225 36513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.915 16.232 74883000 0 0 0 0 0 0 0 74883000 0 0 0 0 0 40456 1968 37753 362273 460827 460827 1 SLEDENKEAFR Unmodified 1336.6259 0.62590859 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 1 1 1 28.676 28.676 3 0.0044119 22879 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.958 80.807 153220000 0 0 0 0 0 0 0 0 73251000 0 0 0 79968000 40457 2515 37754 362274;362275 460828;460829 460829 1 SLEDLIFESLPENASHK Unmodified 1927.9527 0.95272204 1717 O95260;B4DK25;B4E107;F5GXE4;H0Y5C2 ATE1 Arginyl-tRNA--protein transferase 1 yes no 0 0 0 1 1 141.49 141.49 3 0.01058 146271 QUIQUE_C1277_190116_001 39.256 34.047 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40460 2597 37757 362291;362292;362293;362294;362295;362296;362297;362298;362299 460847;460848;460849;460850;460851;460852;460853;460854;460855;460856 460851 9 SLEDPFFVVR Acetyl (Protein N-term) 1249.6343 0.63428844 4747 X6R2W0;F6RTM7;K7EK75;Q5U8S2;O60499 STX10 Syntaxin-10 yes no 1 0 0 1 1 1 158.92 158.92 2 0.012291 165545 QUIQUE_C1438_190116_001 60.973 29.601 5290500 0 0 0 0 0 5290500 0 0 0 0 0 0 0 40461 4747 37758 362300;362301;362302 460857;460858;460859 460858 3 SLEDQVEMLR Unmodified 1218.5914 0.59143734 1329 K7ELL7;P14314 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 0 1 92.767 92.767 2 0.0044813 95135 QUIQUE_C1218_190116_001 96.668 54.689 140710000 140710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40462 1329 37759 362303 460860;460861 460861 2 SLEDQVEMLR Oxidation (M) 1234.5864 0.58635197 1329 K7ELL7;P14314 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 1 0 1 1 83.016 83.016 2 0.028724 86130 QUIQUE_C1438_190116_001 56.432 29.917 56616000 0 0 0 0 26823000 0 0 0 0 0 29793000 0 0 40463 1329 37759 362304;362305 460862;460863 460862 1 SLEEAQEWLK Unmodified 1231.6085 0.60846762 4294 Q9NTX5 ECHDC1 Ethylmalonyl-CoA decarboxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.536 89.536 2 0.0001715 92751 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.15 85.902 620110000 0 0 97051000 0 75164000 0 0 116550000 106150000 0 122880000 102330000 0 40464 4294 37760 362306;362307;362308;362309;362310;362311 460864;460865;460866;460867;460868;460869 460868 2 SLEEDLETLK Unmodified 1175.5921 0.59214885 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 95.46 95.46 2 0.003115 97935 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.136 60.399 220350000 0 0 0 0 0 0 21716000 0 55144000 0 0 39785000 103700000 40465 2515 37761 362312;362313;362314;362315;362316 460870;460871;460872;460873;460874;460875 460874 6 SLEEEGQELPQSADVQR Unmodified 1913.8967 0.89666373 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.331 67.331 2 1.047E-52 67011 QUIQUE_C1277_190116_001 179.02 142.5 420970000 30974000 25462000 0 18473000 33360000 0 0 52428000 63752000 15389000 58417000 43757000 78962000 40466 2515 37762 362317;362318;362319;362320;362321;362322;362323;362324;362325;362326;362327 460876;460877;460878;460879;460880;460881;460882;460883;460884;460885;460886;460887 460877 12 SLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVK Unmodified 2733.3684 0.36836727 627 B4E0K5;Q16539;E7EX54;B5TY33 MAPK14 Mitogen-activated protein kinase 14 yes no 0 0 0 1 1 1 166.24 166.24 3 1.3762E-12 170868 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.509 79.261 156730000 0 33668000 0 0 0 0 0 52895000 70171000 0 0 0 0 40467 627 37763 362328;362329;362330 460888;460889;460890 460890 3 SLEEIYLFSLPIK Unmodified 1550.8596 0.85959692 972 E9PQD7;P15880;H0YEN5;E9PPT0;E9PMM9;H3BNG3;H0YE27 RPS2 40S ribosomal protein S2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.19 155.19 2 3.6446E-10 160979 QUIQUE_C1218_190116_001 168.79 132.27 1459900000 132950000 150590000 114220000 0 119670000 128700000 154760000 84714000 158850000 45547000 125680000 117770000 126460000 40468 972 37764 362331;362332;362333;362334;362335;362336;362337;362338;362339;362340;362341;362342;362343 460891;460892;460893;460894;460895;460896;460897;460898;460899;460900;460901;460902;460903;460904;460905 460892 15 SLEELLLDANQLR Unmodified 1512.8148 0.814772 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;Q5T0G3 SCRIB;LRRC1 Protein scribble homolog no no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 145.47 145.47 2;3 2.8772E-07 152239 QUIQUE_C1438_190116_001 143.96 114.22 552670000 53146000 12795000 63803000 46875000 91973000 7908600 0 42518000 61630000 26371000 86075000 11644000 47933000 40469 289 37765 362344;362345;362346;362347;362348;362349;362350;362351;362352;362353;362354;362355;362356;362357;362358;362359;362360;362361;362362;362363 460906;460907;460908;460909;460910;460911;460912;460913;460914;460915;460916;460917;460918;460919;460920;460921;460922;460923;460924;460925 460914 16 SLEELNLSHNNLMSLPHDLFTPLHR Unmodified 2926.476 0.47596066 4289 Q9NT99 LRRC4B Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 133.13 133.13 4 1.12E-19 137387 QUIQUE_C1277_190116_001 106.55 92.652 492670000 44334000 63808000 50986000 59722000 76328000 52173000 0 0 64222000 0 81101000 0 0 40470 4289 37766 362364;362365;362366;362367;362368;362369;362370;362371 460926;460927;460928;460929;460930;460931;460932;460933;460934;460935;460936;460937 460927 12 SLEELPVDIILASVG Unmodified 1553.8552 0.85523983 4645 Q9Y678;H0Y8X7 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 177.61 177.61 2 4.6567E-08 182930 QUIQUE_C1438_190116_001 111.61 94.171 401070000 36245000 0 31584000 33227000 58277000 22706000 45975000 48777000 0 20294000 0 103980000 0 40471 4645 37767 362372;362373;362374;362375;362376;362377;362378;362379;362380 460938;460939;460940;460941;460942;460943;460944;460945;460946 460941 2 SLEENLATAK Unmodified 1074.5557 0.55570376 4249 Q9NQ48;H7C488 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.078 38.078 2 0.017483 34025 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.78 14.698 279000000 0 0 0 0 67733000 0 0 63220000 0 0 61390000 0 86659000 40472 4249 37768 362381;362382;362383;362384;362385 460947;460948;460949;460950;460951 460951 5 SLEEQDQETLR Unmodified 1346.6314 0.6313879 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.936 33.936 2 0.00044077 29853 QUIQUE_C1438_190116_001 121.73 78.864 361740000 0 0 0 0 51800000 0 0 0 92419000 0 55064000 62216000 100240000 40473 2515 37769 362386;362387;362388;362389;362390;362391 460952;460953;460954;460955;460956;460957;460958 460952 7 SLEFSER Unmodified 866.4134 0.41339662 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 33.9 33.9 2 0.030342 29628 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.777 55.528 373000000 0 0 143530000 0 0 0 0 153820000 0 75655000 0 0 0 40474 2331 37770 362392;362393;362394 460959;460960;460961 460960 3 SLEGDLEDLKDQIAQLEASLAAAK Unmodified 2527.3017 0.30172749 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 1 1 3 1 171.59 171.59 2;3;4 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1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 173.6 173.6 2;3 3.2772E-37 174605 QUIQUE_C1563_190116_001 150.21 102.66 439110000 6950000 0 0 0 0 408920000 0 0 9641800 0 13590000 0 0 40478 1913 37774 362412;362413;362414;362415;362416;362417;362418 460979;460980;460981;460982;460983;460984;460985 460981 7 SLEICHPQER Unmodified 1267.5979 0.5979197 4575 Q9Y305;H7C5Q2 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 1 2 2 22.301 22.301 2;3 0.00020027 15246 QUIQUE_C1277_190116_001 136.57 97.262 873120000 64818000 116030000 145600000 37940000 0 115980000 0 57623000 44281000 0 132760000 0 158090000 40479 4575 37775 362419;362420;362421;362422;362423;362424;362425;362426;362427;362428;362429;362430;362431;362432;362433;362434 460986;460987;460988;460989;460990;460991;460992;460993;460994;460995;460996;460997;460998;460999;461000;461001;461002 460988 17 SLEIEEK Unmodified 846.43346 0.43346336 2781;3349;2839;4568 Q66LE6;H0YB06;P63151;E5RIY1;A0A1W2PQI2;Q9Y2T4;Q00005 PPP2R2D;PPP2R2A;PPP2R2C;PPP2R2B Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B gamma isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform no no 0 0 0 1 23.76 23.76 2 0.051507 17265 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.975 5.49 194290000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 194290000 0 0 0 40480 3349;2781;4568;2839 37776 362435 461003 461003 1 SLEIISTAASHSNSAIR Unmodified 1755.9115 0.91152593 656 F8W1R0;B7Z493;E9PJX4;F8VWL3;Q96M96 FGD4 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 25.524 25.524 3 0.060186 19614 QUIQUE_DMIX5_190116_001 26.365 11.679 40009000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40009000 0 0 40481 656 37777 362436 461004 461004 1 SLEKENQEPLK Unmodified 1313.6827 0.68269519 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 1 1 15.968 15.968 2 0.026264 8450 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.387 18.956 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40482 2515 37778 362437 461005 461005 1 SLELNGAVEPSEGAPR Unmodified 1624.8057 0.80566387 993 F5GYK2;Q9NRL3;R4GN16;M0R2A7;M0QYS2;M0R0P4 STRN4 Striatin-4 yes no 0 0 0 1 65.93 65.93 2 0.001368 64900 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.267 51.123 14588000 0 0 0 0 0 0 0 14588000 0 0 0 0 0 40483 993 37779 362438 461006 461006 1 SLELNPNNSTAMLR Unmodified 1558.7773 0.77734063 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 82.795 82.795 2 1.9537E-14 84185 QUIQUE_C1277_190116_001 147.37 105.02 133690000 0 63852000 0 0 0 0 69839000 0 0 0 0 0 0 40484 4572 37780 362439;362440;362441;362442;362443 461007;461008;461009;461010;461011 461007 5 SLELNPNNSTAMLR Oxidation (M) 1574.7723 0.77225526 4572 Q9Y2Z0 SUGT1 Suppressor of G2 allele of SKP1 homolog yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 63.818 63.818 2 0.0038202 63478 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.261 42.372 263210000 0 0 0 0 0 0 36494000 0 55208000 0 51846000 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24.875 0 1131100000 25092000 0 15662000 52544000 43136000 372810000 0 0 455980000 62486000 82100000 21271000 0 40487 1094 37782 362473;362474;362475;362476;362477;362478;362479;362480;362481;362482;362483;362484;362485;362486;362487;362488 461044;461045;461046;461047;461048;461049;461050;461051;461052;461053;461054;461055;461056;461057;461058;461059 461051 16 SLENAIEWSVK Unmodified 1274.6507 0.65066678 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.196 98.196 2 0.00015645 100769 QUIQUE_C1277_190116_001 127.76 70.175 1253700000 106860000 97253000 102650000 101670000 88204000 90972000 109940000 103130000 74221000 57644000 119460000 101310000 100360000 40488 4617 37783 362489;362490;362491;362492;362493;362494;362495;362496;362497;362498;362499;362500;362501;362502 461060;461061;461062;461063;461064;461065;461066;461067;461068;461069;461070;461071;461072;461073;461074;461075;461076;461077;461078;461079;461080 461061 21 SLENVLEINK Unmodified 1157.6292 0.62920306 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 0 1 1 1 83.742 83.742 2 0.0053846 85346 QUIQUE_C1277_190116_001 105.36 67.636 120090000 0 48981000 0 0 0 33205000 37907000 0 0 0 0 0 0 40489 487 37784 362503;362504;362505 461081;461082;461083 461081 2 SLENVLEINKR Unmodified 1313.7303 0.73031409 487 B7Z647;A0A3B3IS17;A0A3B3ISQ5;B9EGL1;P78352 DLG4 Disks large homolog 4 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 61.916 61.916 2;3 0.00032381 61817 QUIQUE_C1438_190116_001 88.056 61.939 1954500000 162500000 165160000 133050000 174510000 105780000 128980000 205360000 169370000 156130000 74714000 60034000 215700000 203230000 40490 487 37785 362506;362507;362508;362509;362510;362511;362512;362513;362514;362515;362516;362517;362518;362519;362520;362521;362522;362523;362524;362525;362526;362527 461084;461085;461086;461087;461088;461089;461090;461091;461092;461093;461094;461095;461096;461097;461098;461099;461100;461101;461102;461103;461104;461105;461106;461107;461108;461109 461092 24 SLEPGTPR Unmodified 855.44503 0.4450311 2583 P51570;K7ERJ9;K7ERN9 GALK1 Galactokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.156 19.156 2 0.0081619 11587 QUIQUE_C1277_190116_001 95.352 34.564 1093500000 72470000 90376000 113090000 0 101200000 107890000 102910000 0 126880000 0 147310000 95090000 136230000 40491 2583 37786 362528;362529;362530;362531;362532;362533;362534;362535;362536;362537 461110;461111;461112;461113;461114;461115;461116;461117;461118;461119 461111 10 SLEPLPSSGPDFGGLGEEAEFVEVEPEAK Unmodified 3015.4237 0.42369312 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 148.09 148.09 3 8.923E-28 155120 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.237 68.268 125870000 0 0 0 0 0 0 63958000 0 0 0 61914000 0 0 40492 4615 37787 362538;362539;362540 461120;461121;461122 461122 3 SLEPSGILLK Unmodified 1055.6227 0.62266112 3315 Q5T5U3;E7ESW5;F8W9U9;A0A1B0GV73;A0A087WW76 ARHGAP21 Rho GTPase-activating protein 21 yes no 0 0 0 1 77.186 77.186 2 0.021467 78461 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.23 43.332 25444000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25444000 40493 3315 37788 362541 461123 461123 1 SLEQASLSPLGDR Unmodified 1371.6994 0.69940789 409 A0A2Q2T6B6;G9CGD6;Q8WWN9 CNKSR3;IPCEF1 Interactor protein for cytohesin exchange factors 1 yes no 0 0 0 1 1 72.701 72.701 2 0.0013122 73001 QUIQUE_C1403_190116_001 88.187 48.564 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40494 409 37789 362542;362543 461124;461125 461125 2 SLEQYDQVLDGAHGASLTDLANLSEGVSLAER Unmodified 3357.6325 0.63245712 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2;M0R3I1 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 151.93 151.93 3 1.4768E-25 154712 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.516 69.236 163890000 0 0 0 0 43835000 0 0 59258000 0 12441000 0 0 48362000 40495 4394 37790 362544;362545;362546;362547 461126;461127;461128;461129 461127 4 SLESALK Unmodified 746.41742 0.41741937 1485 O15143 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B yes yes 0 0 0 1 27.233 27.233 2 0.064916 21442 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.993 6.6349 29084000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29084000 0 40496 1485 37791 362548 461130 461130 1 SLESLDTSLFAK Unmodified 1309.6765 0.67654718 2949 Q12874 SF3A3 Splicing factor 3A subunit 3 yes yes 0 0 0 1 109.97 109.97 2 0.029586 112177 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.046 36.067 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40497 2949 37792 362549 461131 461131 1 SLESLHSFVAAATK Unmodified 1459.7671 0.76709352 3117 Q15149;H0YDN1;E9PMV1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 86.012 86.012 2;3 1.0246E-170 87730 QUIQUE_DMIX3_190116_001 267.02 242.18 12340000000 970600000 1206200000 1026100000 600250000 1089500000 513180000 851410000 1052700000 1284200000 603130000 1436500000 1139300000 567120000 40498 3117 37793 362550;362551;362552;362553;362554;362555;362556;362557;362558;362559;362560;362561;362562;362563;362564;362565;362566;362567;362568;362569;362570;362571;362572;362573;362574;362575 461132;461133;461134;461135;461136;461137;461138;461139;461140;461141;461142;461143;461144;461145;461146;461147;461148;461149;461150;461151;461152;461153;461154;461155;461156;461157;461158;461159;461160;461161;461162;461163;461164;461165;461166;461167;461168;461169;461170;461171;461172;461173;461174;461175;461176;461177;461178;461179;461180;461181;461182;461183 461169 52 SLETCMYDHK Oxidation (M) 1298.5271 0.52712253 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 1 0 1 16.897 16.897 2 0.011183 9335 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.256 61.042 16699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16699000 0 0 40499 3053 37794 362576 461184 461184 2505 1 SLETDSSLILDVPLGVISR Unmodified 2013.0994 0.099386279 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 160.27 160.27 2 4.0785E-28 165022 QUIQUE_DMIX3_190116_001 178.67 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Unmodified 1669.8576 0.85763986 2509 P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;A0A0C4DGB2 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit yes no 0 0 1 1 64.669 64.669 4 0.025859 63503 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.013 30.606 41216000 0 0 0 0 0 0 0 41216000 0 0 0 0 0 40514 2509 37809 362689 461319 461319 1 SLFGSIGDIESCK Unmodified 1411.6653 0.66533057 3073 Q14576;K7EPB5 ELAVL3 ELAV-like protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.25 109.25 2 3.7464E-08 113768 QUIQUE_C1576_190116_001 138.25 110.51 900840000 0 115490000 80217000 64236000 62218000 76985000 103310000 71559000 0 0 126140000 106780000 93914000 40515 3073 37810 362690;362691;362692;362693;362694;362695;362696;362697;362698;362699 461320;461321;461322;461323;461324;461325;461326;461327;461328;461329;461330;461331;461332 461328 11 SLFGSIGEIESCK Unmodified 1425.681 0.68098063 160 A0A0A0MRX1;Q12926;B1AM48 ELAVL2 ELAV-like protein;ELAV-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 108.13 108.13 2 0.00040407 112935 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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SLGASSYYSLLTAPR Unmodified 1584.8148 0.814772 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.56 114.56 2;3 2.5201E-13 117779 QUIQUE_C1277_190116_001 138.75 99.607 585800000 172620000 197050000 0 10897000 0 0 0 163940000 0 41287000 0 0 0 40534 2807 37829 362861;362862;362863;362864;362865;362866;362867;362868;362869;362870 461518;461519;461520;461521;461522;461523;461524;461525;461526;461527;461528;461529 461519 12 SLGAWNLENLR Unmodified 1271.6622 0.66223452 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 0 1 2 1 107.01 107.01 2;3 0.00029244 104597 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.75 74.61 194600000 0 0 0 0 0 0 50280000 0 0 47839000 0 0 96486000 40535 2515 37830 362871;362872;362873;362874 461530;461531;461532;461533;461534 461531 4 SLGCDRPINYK Unmodified 1321.6449 0.6448699 3592 Q8N4Q0;J3KTQ8 ZADH2 Zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 26.224 26.224 2 0.011055 20347 QUIQUE_C1277_190116_001 94.804 53.356 0 0 0 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yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.038 37.038 2 0.0013602 32898 QUIQUE_C1403_190116_001 98.582 82.109 520780000 0 44515000 90733000 100690000 51358000 0 0 40385000 19498000 37975000 66564000 25348000 43712000 40548 1828 37843 362927;362928;362929;362930;362931;362932;362933;362934;362935;362936 461594;461595;461596;461597;461598;461599;461600;461601;461602;461603 461596 9 SLGGQAVQIR Unmodified 1027.5774 0.57744226 4664 Q9Y6U3 SCIN Adseverin yes yes 0 0 0 1 1 1 36.867 36.867 2 0.0274 32914 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.37 37.334 398430000 0 0 0 0 0 0 0 147170000 0 144980000 0 0 106280000 40549 4664 37844 362937;362938;362939 461604;461605;461606 461604 2 SLGLQLPDGQR Unmodified 1182.6357 0.63568542 1477 O15067 PFAS Phosphoribosylformylglycinamidine synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 77.075 77.075 2 0.015101 77444 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.939 60.953 42308000 42308000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40550 1477 37845 362940;362941;362942;362943;362944 461607;461608;461609;461610;461611 461610 5 SLGLQMPVVVQSMYIFK Unmodified 1939.0311 0.031112479 3296 Q5SRE7;X6RJK6;G5E9M0;H7C2Q0 PHYHD1 Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 159.75 159.75 2 0.00020175 164240 QUIQUE_C1277_190116_001 118.87 108.68 46576000 0 23511000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23065000 40551 3296 37846 362945;362946 461612;461613 461612 2 SLGLSLSGGDQEDAGR Unmodified 1560.738 0.73797824 4455 Q9UJ70;H7C3G9;C9JEV6;H7C1L7;H0YEB7;H0YE82 NAGK N-acetyl-D-glucosamine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 71.85 71.85 2 4.4738E-13 71933 QUIQUE_C1277_190116_001 132.5 112.2 804740000 83940000 90217000 71959000 0 77787000 68385000 0 61886000 119210000 33908000 69180000 65803000 62464000 40552 4455 37847 362947;362948;362949;362950;362951;362952;362953;362954;362955;362956;362957;362958 461614;461615;461616;461617;461618;461619;461620;461621;461622;461623;461624;461625 461615 11 SLGMAVEDTVAAK Oxidation (M) 1306.6439 0.64386684 3088 Q14894;I3L3Y1 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 1 0 2 2 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37851 362998;362999 461669;461670 461669 2 SLGPQLYGVFPEGR Unmodified 1518.7831 0.78307794 4540 Q9Y259 CHKB Choline/ethanolamine kinase yes yes 0 0 0 1 110.9 110.9 2 0.00019845 116219 QUIQUE_C1438_190116_001 93.345 76.32 58898000 0 0 0 0 58898000 0 0 0 0 0 0 0 0 40558 4540 37852 363000 461671 461671 1 SLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMAR 2 Oxidation (M) 4100.8289 0.82892638 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;G3V361;G3V226 CALM2;CALM1 yes no 0 2 0 1 170.9 170.9 4 9.0486E-07 178292 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.118 47.562 40166000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40166000 0 0 40559 1128 37853 363001 461672 461672 653;654 1 SLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMAR Oxidation (M) 4084.834 0.83401175 1128 P0DP25;P0DP24;P0DP23;H0Y7A7;E7ETZ0;E7EMB3;Q96HY3;G3V361;G3V226 CALM2;CALM1 yes no 0 1 0 1 174 174 3 1.2096E-42 181171 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.75 93.094 101260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 101260000 0 0 40560 1128 37853 363002 461673 461673 653;654 1 SLGSADELFK Unmodified 1065.5342 0.53424004 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461679;461680;461681;461682;461683;461684;461685;461686 461679 8 SLGTADVHFER Unmodified 1230.5993 0.59929991 893 E9PB61;Q86V81 ALYREF THO complex subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.932 42.932 2;3 0.0019061 38780 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.262 40.877 285990000 0 0 88749000 0 0 47709000 0 63925000 0 24404000 0 0 61204000 40564 893 37857 363016;363017;363018;363019;363020 461687;461688;461689;461690;461691;461692;461693 461690 5 SLGTAGPPSAVK Unmodified 1083.5924 0.59242362 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 27.808 27.808 2 0.01166 21605 QUIQUE_C1403_190116_001 58.699 22.819 188600000 0 0 0 101340000 0 87259000 0 0 0 0 0 0 0 40565 3452 37858 363021;363022;363023;363024;363025 461694;461695;461696;461697;461698;461699 461696 6 SLGTDLMNEMR Unmodified 1265.5744 0.57440707 1893 P05556 ITGB1 Integrin beta-1 yes yes 0 0 0 1 1 105.1 105.1 2 0.012471 107090 QUIQUE_C1403_190116_001 60.398 32.224 76670000 31835000 0 0 44835000 0 0 0 0 0 0 0 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4-dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 40.478 40.478 2 0.00073327 37071 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.31 0 261430000 0 0 0 0 0 0 0 0 261430000 0 0 0 0 40573 2595 37865 363075 461759;461760 461760 2 SLGYAYVNFQQPADAER Unmodified 1927.9064 0.90644055 2031;596 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;H0YBN4;E5RGH3;E5RJB9;E5RH24;E5RHG7;B1ANR0;Q13310;B1ANR1 PABPC1;PABPC4 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 4 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.745 98.745 2;3 4.2012E-86 102914 QUIQUE_C1438_190116_001 220.37 202.1 1800000000 159020000 167210000 161510000 0 151580000 102350000 137240000 141310000 161170000 92404000 221630000 176610000 128000000 40574 2031;596 37866 363076;363077;363078;363079;363080;363081;363082;363083;363084;363085;363086;363087;363088 461761;461762;461763;461764;461765;461766;461767;461768;461769;461770;461771;461772;461773;461774 461765 12 SLGYDLPMVEEGEPDPEFEAILDTVDPNR Oxidation (M) 3262.4864 0.48636973 267;275;3025 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SLHDALCVLAQTVK Unmodified 1553.8236 0.82356254 2810 P78371;F5GWF6;F8VQ14 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 3 2 2 1 1 2 115.06 115.06 2;3 1.1005E-22 117775 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.79 118.96 5656700000 574520000 578400000 646800000 705820000 243200000 429250000 244240000 727630000 435090000 153480000 179990000 175630000 562630000 40580 2810 37870 363217;363218;363219;363220;363221;363222;363223;363224;363225;363226;363227;363228;363229;363230;363231;363232;363233;363234;363235;363236;363237;363238;363239 461941;461942;461943;461944;461945;461946;461947;461948;461949;461950;461951;461952;461953;461954;461955;461956;461957;461958;461959;461960;461961;461962;461963;461964;461965;461966;461967;461968;461969;461970;461971;461972;461973;461974;461975;461976;461977;461978;461979;461980;461981;461982;461983 461965 35 SLHDALCVVK Unmodified 1140.5961 0.59612879 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 3 43.127 43.127 2;3 0.0011693 39621 QUIQUE_C1563_190116_001 115.71 91.759 2137600000 140980000 143790000 198900000 220580000 147880000 208930000 298390000 101780000 162930000 133620000 88304000 107470000 184100000 40581 2132 37871 363240;363241;363242;363243;363244;363245;363246;363247;363248;363249;363250;363251;363252;363253;363254;363255;363256;363257;363258;363259;363260 461984;461985;461986;461987;461988;461989;461990;461991;461992;461993;461994;461995;461996;461997;461998;461999;462000;462001;462002;462003;462004;462005;462006;462007;462008;462009;462010;462011 461996 25 SLHDPDGLVATYISEVHEHDGHLYLGSFR Unmodified 3263.5636 0.56358969 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 3 1 2 1 1 2 1 129.37 129.37 4;5 5.4501E-28 133863 QUIQUE_C1368_190116_001 108.63 103.25 2621500000 62089000 205130000 225080000 254140000 122580000 144170000 577900000 50879000 228340000 34063000 205580000 335680000 175920000 40582 4234 37872 363261;363262;363263;363264;363265;363266;363267;363268;363269;363270;363271;363272;363273;363274;363275;363276;363277;363278;363279;363280;363281;363282 462012;462013;462014;462015;462016;462017;462018;462019;462020;462021;462022;462023;462024;462025;462026;462027;462028;462029;462030;462031;462032;462033;462034;462035 462015 20 SLHQAIEGDTSGDFLK Unmodified 1716.8319 0.83187862 1936;845 E5RK69;H0YC77;P08133;E7EMC6;E5RFF0 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 68.463 68.463 2;3 7.2625E-36 68396 QUIQUE_C1403_190116_001 206.49 171.96 20009000000 1597100000 1418900000 2077400000 1558600000 1354900000 1241300000 1520900000 1180600000 1959700000 775070000 1837700000 1850400000 1636800000 40583 845;1936 37873 363283;363284;363285;363286;363287;363288;363289;363290;363291;363292;363293;363294;363295;363296;363297;363298;363299;363300;363301;363302;363303;363304;363305;363306;363307;363308 462036;462037;462038;462039;462040;462041;462042;462043;462044;462045;462046;462047;462048;462049;462050;462051;462052;462053;462054;462055;462056;462057;462058;462059;462060;462061;462062;462063;462064;462065;462066;462067;462068;462069;462070;462071;462072;462073;462074;462075;462076;462077;462078;462079 462048 43 SLHQFLLEPITCHAWNR Acetyl (Protein N-term) 2163.0684 0.068377697 369;3752 A0A1W2PNV4;E9PF58;F8WFD3;Q92747 ARPC1A Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 1 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 3 130.23 130.23 2;3 1.8979E-53 135927 QUIQUE_C1218_190116_001 183.89 169.26 7398000000 502240000 676600000 591070000 485030000 528690000 517370000 679550000 568270000 616450000 149210000 711980000 565610000 805950000 40584 369;3752 37874 363309;363310;363311;363312;363313;363314;363315;363316;363317;363318;363319;363320;363321;363322;363323;363324;363325;363326;363327;363328;363329;363330;363331;363332 462080;462081;462082;462083;462084;462085;462086;462087;462088;462089;462090;462091;462092;462093;462094;462095;462096;462097;462098;462099;462100;462101;462102;462103;462104;462105;462106;462107;462108;462109;462110;462111 462081 29 SLHQVEISHCDAK Unmodified 1522.7198 0.71982575 4556 Q9Y2I1;C9J715 NISCH Nischarin yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 15.335 15.335 3;4 0.00033975 7659 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.219 53.16 359460000 18439000 53623000 69185000 42016000 0 24186000 44733000 0 0 11030000 55458000 0 40789000 40585 4556 37875 363333;363334;363335;363336;363337;363338;363339;363340;363341;363342;363343;363344;363345 462112;462113;462114;462115;462116;462117;462118;462119;462120;462121;462122;462123;462124 462122 12 SLHSVVQTLESDKVK Unmodified 1668.9046 0.90464964 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7;A0A3B3ITA2;A0A3B3IS27 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 1 1 57.875 57.875 4 0.0022761 56842 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.529 26.457 19500000 0 0 0 0 0 0 0 0 19500000 0 0 0 0 40586 2322 37876 363346 462125 462125 1 SLHTEEAPALDAAR Unmodified 1479.7318 0.73177065 60 A0A2R8Y7T6;A0A087WWK8;A0A3B3IRZ4;Q6DN90;A0A3B3IU98;A0A0C4DGT3;A0A2R8Y695 IQSEC1 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 35.831 35.831 2;3 1.251E-06 31314 QUIQUE_C1576_190116_001 118.4 90.661 62122000 0 0 22345000 0 0 0 25092000 0 0 14685000 0 0 0 40587 60 37877 363347;363348;363349;363350;363351;363352 462126;462127;462128;462129;462130;462131 462130 5 SLHTLFGDELCK Unmodified 1418.6864 0.68640036 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 3 1 1 78.243 78.243 2;3 7.82E-14 79332 QUIQUE_C1218_190116_001 160.33 137.75 304270000 48603000 0 0 0 53756000 0 0 0 0 201910000 0 0 0 + 40588 770 37878 363353;363354;363355;363356;363357;363358;363359;363360;363361;363362;363363 462132;462133;462134;462135;462136;462137;462138;462139;462140;462141;462142 462132 10 SLHTLFGDK Unmodified 1016.5291 0.52909508 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;A0A087WWT3;H7C013 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 40.26 40.26 2 4.9563E-05 36346 QUIQUE_C1277_190116_001 146.81 95.023 26763000000 2255800000 2523600000 1393500000 2883600000 4393700000 2119000000 1964100000 296630000 1544900000 402790000 2212500000 1931300000 2841400000 + 40589 769 37879 363364;363365;363366;363367;363368;363369;363370;363371;363372;363373;363374;363375;363376;363377 462143;462144;462145;462146;462147;462148;462149;462150;462151;462152;462153;462154;462155;462156;462157;462158;462159;462160;462161;462162;462163;462164;462165;462166;462167;462168;462169;462170;462171 462146 29 SLHTLFGDKLCTVATLR Unmodified 1931.0299 0.029866925 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;A0A087WWT3;H7C013 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 1 2 3 3 4 3 93.134 93.134 2;3;4 7.1958E-22 96418 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.28 137.6 3727400000 0 0 0 0 64060000 0 0 481420000 668560000 0 564690000 928560000 1020200000 + 40590 769 37880 363378;363379;363380;363381;363382;363383;363384;363385;363386;363387;363388;363389;363390;363391;363392;363393 462172;462173;462174;462175;462176;462177;462178;462179;462180;462181;462182;462183;462184;462185;462186;462187;462188;462189 462181 18 SLIANLAAANCYK Unmodified 1407.718 0.71803484 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 91.806 91.806 2 0.0023698 95337 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.45 95.614 603690000 0 0 0 0 97422000 0 88368000 0 112040000 0 108850000 81451000 115560000 40591 2663 37881 363394;363395;363396;363397;363398;363399 462190;462191;462192;462193;462194;462195 462193 3 SLIANLAAANCYKK Unmodified 1535.813 0.81299786 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 1 1 69.144 69.144 3 0.016158 68405 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.799 25.921 9457100 0 0 0 0 0 0 0 9457100 0 0 0 0 0 40592 2663 37882 363400 462196 462196 0 SLIATVEK Unmodified 859.50148 0.50148335 1310 K4DI93;Q13620 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 37.444 37.444 2 0.066666 33338 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462203;462204;462205;462206;462207 462203 488 5 SLIDMYSEVLDVLSDYDASYNTQDHLPR Unmodified 3258.5027 0.5026885 1569;831 E5KLJ9;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 174.71 174.71 3 7.2707E-144 181744 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.23 153.44 210980000 0 0 0 0 0 0 0 0 21217000 0 123770000 65993000 0 40596 831;1569 37885 363412;363413;363414 462208;462209;462210 462209 3 SLIEEGGDWDR Unmodified 1275.5731 0.57314474 3095 Q15008;C9J0E9;H7C531 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 77.135 77.135 2 0.0062508 78048 QUIQUE_C1368_190116_001 85.377 47.074 138560000 0 34997000 36825000 0 0 37872000 28870000 0 0 0 0 0 0 40597 3095 37886 363415;363416;363417;363418;363419 462211;462212;462213;462214;462215 462212 4 SLIEEGGDWDRR Unmodified 1431.6743 0.67425577 3095 Q15008;C9J0E9;H7C531 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 59.337 59.337 3 0.010949 58651 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.75 19.719 301480000 0 0 0 0 0 0 49242000 46770000 50742000 0 80379000 0 74345000 40598 3095 37887 363420;363421;363422;363423;363424 462216;462217;462218;462219;462220 462217 4 SLIFPNFEPLHK Unmodified 1440.7765 0.776536 734 C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.88 108.88 2;3 2.0891E-05 112163 QUIQUE_C1368_190116_001 102.4 88.391 957000000 202190000 78098000 106150000 65783000 52683000 42285000 87936000 42330000 56898000 30944000 92718000 73981000 25009000 40599 734 37888 363425;363426;363427;363428;363429;363430;363431;363432;363433;363434;363435;363436;363437;363438 462221;462222;462223;462224;462225;462226;462227;462228;462229;462230;462231;462232;462233;462234;462235;462236;462237 462225 16 SLIHLSLANNNLQTLPK Unmodified 1875.0578 0.057796236 272 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462267;462268;462269;462270;462271;462272;462273;462274;462275;462276;462277;462278;462279;462280;462281;462282;462283;462284;462285;462286;462287;462288;462289;462290;462291;462292;462293;462294 462269 28 SLILLDLSYNHLR Unmodified 1555.8722 0.8722273 482 A0A3B3IRN5;Q06828 FMOD Fibromodulin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.54 119.54 3 0.00018376 117075 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.548 60.108 566730000 35087000 46405000 27063000 87029000 42082000 0 135940000 0 31454000 24509000 40182000 46862000 50116000 40604 482 37893 363485;363486;363487;363488;363489;363490;363491;363492;363493;363494;363495 462295;462296;462297;462298;462299;462300;462301;462302;462303;462304;462305;462306;462307 462304 12 SLIPLYQNFYEER Unmodified 1670.8304 0.83042206 350 A0A1B0GUI1;Q6GYQ0;H0YJ04;H0YJB5 RALGAPA1 Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 128.5 128.5 2 0.0026317 134116 QUIQUE_C1218_190116_001 86.344 74.181 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40605 350 37894 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cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 112.72 112.72 2 0.00053512 117750 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.04 54.185 116720000 0 0 20752000 0 0 0 0 26932000 23776000 0 45262000 0 0 40609 1187 37898 363543;363544;363545;363546;363547 462368;462369;462370;462371;462372 462371 5 SLITTHHLMVYGNER Unmodified 1769.8883 0.88828807 3002 Q13492;E9PI56;E9PKP6;E9PLJ8 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes no 0 0 0 1 51.456 51.456 3 0.0078241 49188 QUIQUE_C1403_190116_001 40.237 21.825 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40610 3002 37899 363548 462373 462373 1 SLIVAGLGDGSIR Unmodified 1256.7089 0.70885036 3568 Q8N122 RPTOR Regulatory-associated protein of mTOR yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 92.961 92.961 2 0.0051427 90186 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.663 39.548 122720000 27503000 0 0 22629000 0 0 0 19715000 21768000 12352000 0 0 18757000 40611 3568 37900 363549;363550;363551;363552;363553;363554 462374;462375;462376;462377;462378;462379 462378 6 SLIVGLK Unmodified 728.47963 0.47962569 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 54.89 54.89 2 0.044362 53236 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.454 12.419 290800000 0 0 0 0 146840000 0 0 0 0 0 93829000 50132000 0 40612 2190 37901 363555;363556;363557 462380;462381;462382;462383 462382 4 SLKDMEESIR Unmodified 1206.5914 0.59143734 1329 K7ELL7;P14314;A0A0C4DGP4 PRKCSH Glucosidase 2 subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.431 49.431 3 4.0985E-05 47110 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.17 88.9 402600000 16026000 21502000 25867000 18149000 26739000 0 31797000 35854000 46473000 0 60592000 62745000 56856000 40613 1329 37902 363558;363559;363560;363561;363562;363563;363564;363565;363566;363567;363568 462384;462385;462386;462387;462388;462389;462390;462391;462392;462393;462394;462395 462392 11 SLKEESVEAVK Unmodified 1217.6503 0.65033243 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 20.305 20.305 2 0.0033089 13892 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.39 53.791 313870000 0 0 0 0 0 0 0 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40625 1102 37914 363656;363657 462517;462518 462518 1 SLLDFLPR Unmodified 959.54402 0.54401687 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 3 1 2 1 138.95 138.95 2 0.0036656 143861 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.57 58.778 212600000 23627000 0 23013000 24136000 26581000 22872000 25287000 0 22379000 17870000 26835000 0 0 40626 2636 37915 363658;363659;363660;363661;363662;363663;363664;363665;363666;363667;363668;363669;363670;363671;363672;363673;363674 462519;462520;462521;462522;462523;462524;462525;462526;462527;462528;462529;462530;462531;462532;462533;462534;462535;462536;462537;462538;462539;462540;462541;462542;462543;462544;462545 462537 27 SLLEGEGSSGGGGR Unmodified 1261.5899 0.58985744 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.162 28.162 2 7.1737E-05 22292 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.7 87.795 3499900000 191610000 208720000 132670000 204420000 215830000 205050000 143030000 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150.53 150.53 3 2.2382E-12 157482 QUIQUE_C1438_190116_001 100.94 93.99 1631100000 159080000 126650000 148680000 166460000 147200000 135170000 102170000 0 0 0 253340000 207010000 185380000 40648 2966 37937 363823;363824;363825;363826;363827;363828;363829;363830;363831;363832 462719;462720;462721;462722;462723;462724;462725;462726;462727;462728;462729;462730;462731;462732;462733;462734;462735;462736;462737;462738;462739 462729 21 SLLLVDQLIDL Unmodified 1240.7279 0.72785447 3212 Q2M2I8 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 174.02 174.02 2 0.00084253 177101 QUIQUE_C1277_190116_001 94.302 77.532 195440000 17062000 11451000 0 13856000 27631000 12008000 0 58527000 28373000 0 26536000 0 0 40649 3212 37938 363833;363834;363835;363836;363837;363838;363839;363840 462740;462741;462742;462743;462744;462745;462746;462747;462748 462741 9 SLLPGCQSVISR Unmodified 1315.6918 0.69182009 1736 O95571;M0QXB5 ETHE1 Persulfide dioxygenase ETHE1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 72.105 72.105 2 0.00091112 71799 QUIQUE_C1403_190116_001 102.52 51.178 398770000 0 0 109420000 105380000 65887000 0 0 83001000 0 35074000 0 0 0 40650 1736 37939 363841;363842;363843;363844;363845 462749;462750;462751;462752;462753;462754;462755 462750 7 SLLQALNEVK Unmodified 1113.6394 0.63937381 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;A0A2R8Y542 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.04 94.04 2 0.00050663 95758 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.3 31.144 1863900000 52015000 0 198750000 0 99873000 139660000 0 255950000 255260000 92462000 319430000 219250000 231280000 40651 3053 37940 363846;363847;363848;363849;363850;363851;363852;363853;363854;363855 462756;462757;462758;462759;462760;462761;462762;462763;462764;462765;462766;462767;462768;462769;462770 462769 13 SLLQAVANLPYK Unmodified 1315.75 0.7499869 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715;H0Y4P7 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 1 118.22 118.22 2 0.0049058 122640 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.948 61.862 208270000 0 0 0 0 186050000 0 0 0 0 0 0 0 22216000 40652 90 37941 363856;363857 462771;462772 462772 0 SLLQFLR Unmodified 875.52289 0.52288749 3461 Q7Z4H3;V9GYS5;V9GZ04 HDDC2 HD domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 107.29 107.29 2 0.020883 112209 QUIQUE_C1218_190116_001 106.76 27.307 300710000 33415000 27096000 0 33907000 29620000 0 31369000 0 47839000 0 54791000 42677000 0 40653 3461 37942 363858;363859;363860;363861;363862;363863;363864;363865 462773;462774;462775;462776;462777;462778;462779;462780 462773 8 SLLQGTILQYVK Unmodified 1361.7919 0.79185171 882;3442 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 128.78 128.78 2 0.0034388 125496 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.22 66.328 171710000 0 0 0 0 0 0 0 106960000 0 64752000 0 0 0 40654 882;3442 37943 363866;363867 462781;462782 462782 0 SLLQMVPLDEGASERPLQVPK Unmodified 2306.2304 0.23041723 2862 Q01968 OCRL Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1 yes yes 0 0 1 1 1 119.67 119.67 3 0.00028534 122237 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.362 53.762 56149000 0 0 0 26518000 0 0 0 29631000 0 0 0 0 0 40655 2862 37944 363868;363869 462783;462784 462784 2 SLLQSALDFLAGPGSLGGASGR Acetyl (Protein N-term) 2115.096 0.096032235 1469 O14976;D6RAW3;D6RF16;D6RAQ7;D6RE78;A0A087X1U9 GAK Cyclin-G-associated kinase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 182.74 182.74 2 2.6157E-100 185385 QUIQUE_DMIX7_190116_001 202.33 176.61 210520000 0 8291300 0 0 23965000 0 24522000 25333000 22986000 0 58622000 32926000 13871000 40656 1469 37945 363870;363871;363872;363873;363874;363875;363876;363877 462785;462786;462787;462788;462789;462790;462791;462792;462793;462794;462795;462796 462793 12 SLLQWVTSR Unmodified 1088.5978 0.59784335 2526 P49356;B4DL54 FNTB;CHURC1-FNTB Protein farnesyltransferase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 113.75 113.75 2 0.00044667 117994 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.89 49.468 222250000 0 0 19811000 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462812;462813;462814;462815;462816;462817;462818;462819;462820;462821 462818 9 SLLSGLLIK Unmodified 942.61137 0.61136815 4538 Q9Y243 AKT3 RAC-gamma serine/threonine-protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 116.23 116.23 2 0.010434 119658 QUIQUE_C1403_190116_001 74.127 14.922 147190000 24138000 22078000 15968000 22479000 0 20235000 25301000 0 0 0 0 0 16987000 40660 4538 37949 363901;363902;363903;363904;363905;363906;363907;363908 462822;462823;462824;462825;462826;462827;462828;462829 462825 8 SLLSGLLK Unmodified 829.5273 0.52730417 2335 P31749;A0A087WY56;G3V3X1;G3V2I6 AKT1 RAC-alpha serine/threonine-protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.73 100.73 2 0.022694 104627 QUIQUE_C1576_190116_001 73.975 2.5968 63405000 0 0 0 0 25899000 0 16059000 0 0 0 21447000 0 0 40661 2335 37950 363909;363910;363911;363912 462830;462831;462832;462833 462832 4 SLLSILQR Unmodified 928.57057 0.57056597 3471 Q7Z6Z7;H0Y659 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.99 103.99 2 0.0010608 106352 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.21 54.3 183290000 16614000 6174300 16752000 0 15443000 17460000 15471000 28710000 18148000 7741000 0 17126000 23646000 40662 3471 37951 363913;363914;363915;363916;363917;363918;363919;363920;363921;363922;363923 462834;462835;462836;462837;462838;462839;462840;462841;462842;462843;462844;462845 462840 12 SLLSIPNTDYIQLLSEIAK Unmodified 2117.162 0.16198654 1646 O75569 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.61 168.61 2 3.989E-22 170419 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.38 151.7 1842600000 119800000 191800000 129560000 95799000 102080000 0 103180000 203420000 173810000 37534000 326610000 163270000 195700000 40663 1646 37952 363924;363925;363926;363927;363928;363929;363930;363931;363932;363933;363934;363935 462846;462847;462848;462849;462850;462851;462852;462853;462854;462855;462856;462857 462852 11 SLLSNLDEVKK Unmodified 1244.6976 0.69761697 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 1 2 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 61.098 61.098 2;3 0.00025866 60147 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.937 74.57 2365000000 195500000 124850000 210980000 196600000 259260000 124680000 212240000 177950000 146860000 42495000 307000000 173420000 193190000 40664 3700 37953 363936;363937;363938;363939;363940;363941;363942;363943;363944;363945;363946;363947;363948;363949;363950;363951;363952;363953;363954 462858;462859;462860;462861;462862;462863;462864;462865;462866;462867;462868;462869;462870;462871;462872;462873;462874;462875;462876;462877;462878;462879;462880 462874 22 SLLSNVEGDNAVPMQHNNRPTQPLK Oxidation (M) 2774.377 0.3769749 1795 P00915;E5RFE7;E5RG81 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 1 1 2 2 3 1 2 2 1 1 2 1 4 2 3 61.259 61.259 3;4 5.303E-69 61051 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.69 149.06 3306800000 180200000 171290000 290880000 28818000 324440000 224860000 64434000 87686000 209240000 101020000 887390000 343520000 393070000 40665 1795 37954 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463088;463089;463090;463091;463092;463093;463094 463092 7 SLLWTETFMNK Unmodified 1368.6748 0.67477304 1909 P06756;H7BZG1 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 123.66 123.66 2 0.0065099 128185 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.148 59.362 27146000 0 0 0 0 0 0 0 0 27146000 0 0 0 0 40680 1909 37967 364131;364132;364133;364134 463095;463096;463097;463098 463097 4 SLMASEEEYSTK Unmodified 1373.6021 0.60206161 557 CON__Q3SX28;A7XZE4 TPM2b yes no 0 0 0 1 1 1 46.581 46.581 2 0.0018371 44180 QUIQUE_C1218_190116_001 96.171 78.307 284000000 71263000 134830000 0 77904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 40681 557 37968 364135;364136;364137 463099;463100;463101 463099 2 SLMDHTIPEV Unmodified 1140.5485 0.5485099 1417;1105 G5EA09;O00560;B4DHN5;E9PBU7 SDCBP Syntenin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 94.047 94.047 2 0.011039 96434 QUIQUE_C1277_190116_001 67.903 50.806 343530000 47129000 54274000 50789000 37897000 0 50852000 0 52057000 50535000 0 0 0 0 40682 1105;1417 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1637.8526 0.85255449 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 no no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 108.22 108.22 2;3 2.5543E-36 110991 QUIQUE_DMIX1_190116_001 184.55 143.96 395080000 0 0 0 0 0 0 40023000 211190000 30473000 0 54916000 58473000 0 + 40695 1859 37981 364218;364219;364220;364221;364222;364223;364224 463198;463199;463200;463201;463202;463203;463204 463200 4 SLNPALDGLTCGLTSHDKR Unmodified 2054.0215 0.021487084 145 A0A0A0MRE6;O94967 WDR47 WD repeat-containing protein 47 yes no 0 0 1 1 1 1 78.138 78.138 4 0.017907 79251 QUIQUE_C1368_190116_001 21.37 9.7275 106260000 0 0 42846000 0 44356000 0 19060000 0 0 0 0 0 0 40696 145 37982 364225;364226;364227 463205;463206;463207 463205 2 SLNQSLAEWK Unmodified 1174.5982 0.59823728 2645 P54709;H7C547;F8WBY4 ATP1B3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3 yes no 0 0 0 1 69.461 69.461 2 0.00066114 69080 QUIQUE_C1403_190116_001 108.15 46.148 47720000 0 0 0 47720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40697 2645 37983 364228 463208 463208 1 SLNTDVLFGLLR Unmodified 1346.7558 0.75580056 3741 Q92620 DHX38 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16 yes yes 0 0 0 1 151.11 151.11 2 0.031977 155805 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.297 44.982 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40698 3741 37984 364229 463209 463209 1 SLNVQLGR Unmodified 885.50321 0.50321468 3967 Q99683 MAP3K5 Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 40.478 40.478 2 0.04733 37232 QUIQUE_C1438_190116_001 76.035 42.296 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40699 3967 37985 364230;364231;364232 463210;463211;463212 463210 3 SLNYWCNLLGMK Unmodified 1497.7108 0.71084097 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.12 140.12 2 5.2048E-06 144401 QUIQUE_C1277_190116_001 156.94 120.24 2434500000 147910000 233210000 202930000 166030000 144320000 147320000 154950000 237190000 204810000 82171000 213360000 210280000 290020000 40700 4220 37986 364233;364234;364235;364236;364237;364238;364239;364240;364241;364242;364243;364244;364245 463213;463214;463215;463216;463217;463218;463219;463220;463221;463222;463223;463224;463225;463226;463227;463228;463229;463230 463216 18 SLPADILYEDQQCLVFR Unmodified 2066.0143 0.014276441 4060 Q9BX68 HINT2 Histidine triad nucleotide-binding protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 2 3 2 1 1 3 143.84 143.84 2;3 2.3847E-20 147756 QUIQUE_C1277_190116_001 174.21 151.63 150210000 67488000 0 0 0 0 12431000 0 0 0 0 70288000 0 0 40701 4060 37987 364246;364247;364248;364249;364250;364251;364252;364253;364254;364255;364256;364257;364258;364259;364260 463231;463232;463233;463234;463235;463236;463237;463238;463239;463240;463241;463242;463243;463244;463245;463246;463247 463237 15 SLPAPWLSMAPVSWITPGLK Unmodified 2150.1598 0.15981847 1858 P04217;M0R009 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 168.37 168.37 2 3.3176E-07 174530 QUIQUE_C1438_190116_001 128.96 107.05 206940000 0 0 0 12400000 65130000 0 0 0 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364275;364276;364277;364278;364279;364280;364281;364282;364283;364284;364285;364286 463262;463263;463264;463265;463266;463267;463268;463269;463270;463271;463272;463273;463274;463275;463276;463277;463278;463279;463280;463281;463282;463283;463284;463285 463274 24 SLPDPNLITFLFLLEHLK Unmodified 2109.1874 0.18741343 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQ41;B7Z683;I3NI05 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 171.51 171.51 3 0.0015504 175236 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.188 44.365 299310000 0 0 0 0 0 0 143470000 0 30543000 0 82800000 42490000 0 40705 366 37991 364287;364288;364289;364290;364291 463286;463287;463288;463289;463290 463290 3 SLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYK Unmodified 2889.3235 0.32346727 1402 O00408;E9PEF1;H7C009;F5GXX2 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 174.62 174.62 3 0.00024696 178243 QUIQUE_DMIX7_190116_001 45.011 42.233 15422000 0 0 0 0 0 0 0 4651600 0 0 0 10770000 0 40706 1402 37992 364292;364293 463291;463292 463292 2 SLPEEVVR Unmodified 927.50255 0.50254598 1186 H3BP71;O75150 RNF40 E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 133.72 133.72 1 0.051043 138093 QUIQUE_C1277_190116_001 111.28 14.207 1282700000 0 139870000 164640000 136010000 174060000 0 194310000 0 0 0 185680000 133070000 155060000 40707 1186 37993 364294;364295;364296;364297;364298;364299;364300;364301 463293;463294;463295;463296;463297;463298;463299;463300 463293 0 SLPEGAPCLPQWSVYIR Unmodified 1971.9877 0.98766776 928 E9PHB5 CTNND2 yes yes 0 0 0 1 1 138.66 138.66 2 0.027839 144086 QUIQUE_C1368_190116_001 55.314 35.475 26446000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26446000 0 40708 928 37994 364302;364303 463301;463302 463301 2 SLPEIDGLSK Unmodified 1057.5655 0.56554017 4494;981 F1T0E5;C9IYE1;A0A087X1P3;Q86UW7;F8W8P5;Q9ULU8 CADPS;CADPS2 Calcium-dependent secretion activator 2;Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 72.513 72.513 2 0.028562 72990 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.982 24.797 266960000 0 0 0 0 0 0 0 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0.60438529 4436 Q9UHL4;R4GNE8;R4GN05 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 44.96 44.96 2 0.0014915 41283 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.213 58.654 369090000 0 0 0 0 103710000 60234000 0 84261000 42230000 0 0 0 78658000 40712 4436 37998 364325;364326;364327;364328;364329 463324;463325;463326;463327;463328 463328 5 SLPGQNEDLVLTGYQVDK Unmodified 1974.9898 0.98983583 1805 P01040 CSTA Cystatin-A;Cystatin-A, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 104.5 104.5 2 6.4441E-05 101285 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.72 90.677 15186000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15186000 0 0 0 40713 1805 37999 364330;364331 463329;463330 463330 2 SLPGSAPPLTEK Unmodified 1195.6449 0.64485312 1158 H0YI08;Q9Y6F6;E9PJ61 MRVI1 Protein MRVI1 yes no 0 0 0 1 45.334 45.334 2 0.039132 42430 QUIQUE_C1368_190116_001 46.406 24.811 20393000 0 0 20393000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40714 1158 38000 364332 463331 463331 1 SLPGYMTR Unmodified 923.45349 0.4534873 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 40.42 40.42 2 0.046015 37056 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.721 28.614 110420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 110420000 40715 86 38001 364333 463332 463332 1 SLPHITDVSWR Unmodified 1309.6779 0.67788459 4398 Q9UBI1;H0Y4W0;H0Y4E5;R4GNF2 COMMD3 COMM domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 77.511 77.511 3 0.028541 79532 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.447 27.258 24535000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24535000 0 0 40716 4398 38002 364334 463333 463333 1 SLPISLVFLVPVR Unmodified 1438.8912 0.89117182 2015 P11215 ITGAM Integrin alpha-M yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 160.01 160.01 2 0.0003872 165436 QUIQUE_C1368_190116_001 112.75 108.14 385110000 0 31440000 34756000 33244000 42332000 16476000 40706000 27931000 30411000 13334000 41607000 40334000 32540000 40717 2015 38003 364335;364336;364337;364338;364339;364340;364341;364342;364343;364344;364345;364346 463334;463335;463336;463337;463338;463339;463340;463341;463342;463343;463344;463345;463346;463347 463336 14 SLPLLENQIK Unmodified 1153.6707 0.67067394 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 81.65 81.65 2 0.00988 82843 QUIQUE_C1368_190116_001 69.598 45.643 500620000 0 0 160270000 0 0 0 0 76829000 48947000 0 214580000 0 0 40718 2168 38004 364347;364348;364349;364350 463348;463349;463350;463351;463352 463348 5 SLPQSDPVLK Unmodified 1082.5972 0.59717465 4220 Q9HC38;F6TLX2;I3L3Q4 GLOD4 Glyoxalase domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 41.542 41.542 2 0.004731 38475 QUIQUE_C1403_190116_001 79.906 39.905 2671300000 219870000 219790000 249980000 201470000 199410000 190300000 193410000 196100000 221690000 80401000 240770000 200740000 257350000 40719 4220 38005 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Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3 yes no 0 0 0 1 1 102.32 102.32 2 0.000305 103786 QUIQUE_C1563_190116_001 103.76 90.361 29665000 0 0 0 0 0 29665000 0 0 0 0 0 0 0 40721 2112 38007 364378;364379 463393;463394 463394 2 SLPVPQLVPETEDEK Unmodified 1679.8618 0.86178177 1379 O00154 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.772 97.772 2 0.00016941 101471 QUIQUE_C1218_190116_001 87.001 72.582 2474900000 381690000 592920000 283190000 248810000 185740000 269470000 0 72576000 0 105120000 182960000 0 152410000 40722 1379 38008 364380;364381;364382;364383;364384;364385;364386;364387;364388;364389;364390;364391 463395;463396;463397;463398;463399;463400;463401;463402;463403;463404;463405;463406;463407;463408 463395 11 SLPVPQLVPETEDEKK Unmodified 1807.9567 0.95674479 1379 O00154 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 76.609 76.609 2;3 0.0010866 77572 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.059 33.012 840580000 71618000 105700000 77183000 61453000 62066000 0 73753000 86585000 68130000 36416000 63137000 63635000 70900000 40723 1379 38009 364392;364393;364394;364395;364396;364397;364398;364399;364400;364401;364402;364403;364404;364405;364406 463409;463410;463411;463412;463413;463414;463415;463416;463417;463418;463419;463420;463421;463422;463423;463424;463425;463426;463427;463428;463429;463430 463422 21 SLPVPQLVPETEDEKKR Unmodified 1964.0579 0.057855815 1379 O00154 ACOT7 Cytosolic acyl coenzyme A thioester hydrolase yes yes 0 0 2 2 1 1 1 2 1 1 3 2 2 61.741 61.741 3;4 0.00022012 61640 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.508 70.978 1196300000 0 106270000 56511000 49513000 51376000 0 111240000 78564000 91442000 0 288000000 203140000 160280000 40724 1379 38010 364407;364408;364409;364410;364411;364412;364413;364414;364415;364416;364417;364418;364419;364420;364421;364422 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61 SLQDTAELLSLENHPAK Unmodified 1864.9531 0.95305639 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 90.271 90.271 2 5.0456E-13 94050 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.98 80.157 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40734 1187 38018 364593 463635 463635 1 SLQEEHVAVAQLR Unmodified 1478.7841 0.78414057 3117 Q15149 PLEC Plectin yes yes 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 45.512 45.512 2;3 9.033E-13 42278 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.68 131.16 12203000000 972500000 794660000 1039900000 411210000 960890000 383810000 830730000 1082400000 1494200000 457870000 1791800000 1096700000 886380000 40735 3117 38019 364594;364595;364596;364597;364598;364599;364600;364601;364602;364603;364604;364605;364606;364607;364608;364609;364610;364611;364612;364613;364614;364615;364616;364617;364618;364619;364620 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96.15 2 0.0044838 98901 QUIQUE_C1368_190116_001 80.755 52.537 148500000 0 0 37047000 29847000 32946000 25397000 0 0 0 0 0 23260000 0 40738 466 38022 364628;364629;364630;364631;364632 463674;463675;463676;463677;463678;463679 463674 6 SLQEHLPDVVVYNAGTDILEGDR Unmodified 2539.2554 0.255446 639 B5MCS3;B5MCU6;B5MCQ6;E7ETT9;Q96DB2 HDAC11 Histone deacetylase 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 130.18 130.18 3 1.1768E-08 136439 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.885 79.606 99701000 0 0 0 18184000 0 0 49088000 0 0 0 32430000 0 0 40739 639 38023 364633;364634;364635;364636 463680;463681;463682;463683 463683 4 SLQELFLAHILSPWGAEVK Unmodified 2137.1572 0.15717593 1974 P09874 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.71 161.71 3 5.7555E-09 166836 QUIQUE_C1368_190116_001 108.18 75.792 650650000 46293000 61515000 64373000 36245000 0 17952000 37975000 60815000 56023000 7446200 85803000 130210000 45993000 40740 1974 38024 364637;364638;364639;364640;364641;364642;364643;364644;364645;364646;364647;364648 463684;463685;463686;463687;463688;463689;463690;463691;463692;463693;463694;463695;463696;463697;463698 463687 14 SLQEQADAAEER Unmodified 1345.611 0.61098681 1019;1164 F5H7S3;B7Z596;H0YN06;H0YKJ4;H0YK48 TPM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.898 30.898 2 3.5974E-10 25504 QUIQUE_DMIX4_190116_001 157.24 133.82 5728500000 396540000 516660000 560950000 400950000 412170000 403300000 499140000 274500000 541410000 214480000 539440000 458560000 510400000 40741 1019;1164 38025 364649;364650;364651;364652;364653;364654;364655;364656;364657;364658;364659;364660;364661 463699;463700;463701;463702;463703;463704;463705;463706;463707;463708;463709;463710;463711 463708 13 SLQESLQK Unmodified 931.49746 0.4974606 2999 Q13464;A0A0U1RQV4 ROCK1 Rho-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 22.748 22.748 2 0.015844 15652 QUIQUE_DMIX5_190116_001 84.097 33.2 160390000 0 0 0 0 0 0 65012000 51552000 0 0 43828000 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A0A1B0GWF9;A0A1B0GUK4;A0A1B0GVB2;A0A1B0GTS4;A0A1B0GU53;E7EN11;A0A1B0GTF6;A0A1B0GTA9;A0A1B0GTN8;H0Y476;A0A1C7CYX2;A0A1B0GTX2;O00305;A0A1B0GXG0;A0A1B0GTP5;A0A1B0GVU5;A0A1B0GVF0;A0A1B0GTX8;A0A1B0GTK1;A0A1B0GU07 CACNB4 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4 yes no 0 0 0 1 1 127.54 127.54 3 0.0016094 133164 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.923 28.429 66674000 33690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32985000 0 0 40745 332 38029 364673;364674 463725;463726 463726 2 SLQMYLER Unmodified 1038.5168 0.51681584 2443 P42126;Q96DC0 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 69.244 69.244 2 0.0036009 69856 QUIQUE_C1438_190116_001 113.7 63.657 847470000 191720000 152940000 0 0 159110000 153550000 190150000 0 0 0 0 0 0 40746 2443 38030 364675;364676;364677;364678;364679 463727;463728;463729;463730;463731;463732 463729 6 SLQPLAPR Unmodified 880.51305 0.51305109 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 32.604 32.604 2 0.040044 26719 QUIQUE_C1277_190116_001 86.512 34.94 107040000 0 0 0 0 0 0 0 61563000 0 45472000 0 0 0 40747 3086 38031 364680;364681;364682 463733;463734;463735 463733 3 SLQQLAEER Unmodified 1072.5513 0.55128709 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.79 45.79 2 3.2981E-07 42357 QUIQUE_C1403_190116_001 160.26 63.773 14258000000 1213000000 1297500000 0 1492500000 1062100000 0 1176500000 1694900000 1452200000 686630000 1206800000 1235000000 1741000000 40748 267;275;3025 38032 364683;364684;364685;364686;364687;364688;364689;364690;364691;364692;364693 463736;463737;463738;463739;463740;463741;463742;463743;463744;463745;463746;463747;463748;463749;463750;463751;463752;463753;463754;463755;463756;463757 463741 22 SLQQQLSDVCYR Unmodified 1495.7089 0.70892672 3502 Q86VW0;H7BZR8 SESTD1 SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 76.763 76.763 2 0.00052804 77990 QUIQUE_C1576_190116_001 98.943 76.95 30665000 0 0 0 0 0 0 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domain-containing protein 3, mitochondrial yes no 0 0 0 2 88.201 88.201 2;3 6.0508E-06 90577 QUIQUE_C1368_190116_001 92.039 69.565 34856000 0 0 34856000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40752 3833 38036 364710;364711 463775;463776 463776 2 SLQSLLGPSSK Unmodified 1115.6186 0.61863837 204 A0A0A6YYL4;P57737;I3L167;E7EP81 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.364 67.364 2 0.0030568 67667 QUIQUE_C1218_190116_001 74.841 34.738 111330000 30424000 36960000 0 0 0 0 0 30842000 0 13102000 0 0 0 40753 204 38037 364712;364713;364714;364715 463777;463778;463779;463780;463781 463777 4 SLQSVAEER Unmodified 1017.5091 0.50908792 460 A0A2R8YEM3;E7EQV9;P61313;E7EX53;A0A2R8Y738 RPL15 Ribosomal protein L15;60S ribosomal protein L15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 28.148 28.148 2 0.009134 22389 QUIQUE_C1403_190116_001 76.827 29.76 178450000 0 26120000 48115000 42777000 0 23606000 37828000 0 0 0 0 0 0 40754 460 38038 364716;364717;364718;364719;364720 463782;463783;463784;463785;463786;463787 463784 6 SLQSVGLKPIIPQGSYFLITDISDFK Unmodified 2865.5528 0.55279722 660 B7Z4W5;Q16773 CCBL1 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.95 157.95 3 2.4074E-09 163896 QUIQUE_C1576_190116_001 73.341 70.407 530700000 49377000 47569000 94569000 54532000 89705000 0 110060000 0 0 16230000 0 38732000 29931000 40755 660 38039 364721;364722;364723;364724;364725;364726;364727;364728;364729 463788;463789;463790;463791;463792;463793;463794;463795;463796;463797;463798 463794 11 SLQSVGLKPIIPQGSYFLITDISDFKR Unmodified 3021.6539 0.65390825 660 B7Z4W5;Q16773 CCBL1 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 1 yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 145.56 145.56 3;4 4.171E-24 150703 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.86 94.289 732710000 0 0 0 0 0 0 0 131030000 86871000 0 183680000 201760000 129380000 40756 660 38040 364730;364731;364732;364733;364734;364735 463799;463800;463801;463802;463803;463804;463805;463806 463800 7 SLQTDSSNTDTALATLEEALSEK Unmodified 2423.1551 0.15512284 1479 O15083;H7C4G9 ERC2 ERC protein 2 yes no 0 0 0 1 155.18 155.18 2 0.00053512 160039 QUIQUE_C1218_190116_001 68.481 52.936 30515000 30515000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40757 1479 38041 364736 463807 463807 1 SLQTDSSNTDTALATLEEALSEKER Unmodified 2708.2988 0.29882696 1479 O15083;H7C4G9 ERC2 ERC protein 2 yes no 0 0 1 1 1 137.38 137.38 3 0.0012145 142254 QUIQUE_DMIX7_190116_001 41.908 35.332 147490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89759000 57727000 0 40758 1479 38042 364737;364738 463808;463809 463809 2 SLQTICSWFK Unmodified 1268.6223 0.62234354 825 D6RGX2;Q9NUQ7;H0YA18;H0Y9B0 UFSP2 Ufm1-specific protease 2 yes no 0 0 0 1 116.3 116.3 2 0.040442 118769 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.908 22.485 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40759 825 38043 364739 463810 463810 1 SLQWMAGGTFTGEALQYTR Unmodified 2116.0048 0.004774387 96 A0A087X0S5;P12109 COL6A1 Collagen alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 135.95 135.95 2 1.044E-16 138676 QUIQUE_C1563_190116_001 155.98 128.3 60553000 0 0 0 0 0 35779000 0 24774000 0 0 0 0 0 40760 96 38044 364740;364741 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85.156 85.156 2;3 8.1069E-05 88103 QUIQUE_C1218_190116_001 94.461 82.078 380560000 37730000 46753000 32562000 27918000 42066000 34478000 47461000 27628000 0 20601000 0 30776000 32585000 40763 2903 38047 364747;364748;364749;364750;364751;364752;364753;364754;364755;364756;364757;364758;364759;364760 463818;463819;463820;463821;463822;463823;463824;463825;463826;463827;463828;463829;463830;463831;463832 463818 14 SLSAIYLEK Unmodified 1022.5648 0.56481189 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.75 64.75 2 0.0016605 64056 QUIQUE_C1277_190116_001 101.43 68.588 4641300000 349800000 296810000 363350000 138590000 298450000 181170000 322610000 565610000 486690000 295350000 583040000 454240000 305600000 40764 3117 38048 364761;364762;364763;364764;364765;364766;364767;364768;364769;364770;364771;364772;364773 463833;463834;463835;463836;463837;463838;463839;463840;463841;463842;463843;463844;463845;463846;463847;463848;463849;463850;463851;463852;463853;463854 463834 22 SLSALGNVISALAEGSTYVPYR Unmodified 2267.1798 0.17976186 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 167.01 167.01 2;3 1.7887E-166 170739 QUIQUE_C1277_190116_001 293.59 257.85 3833800000 256940000 241860000 655060000 265070000 195140000 194690000 336690000 257640000 255570000 47147000 366740000 264320000 496950000 40765 2355 38049 364774;364775;364776;364777;364778;364779;364780;364781;364782;364783;364784;364785;364786;364787;364788;364789;364790;364791;364792;364793;364794;364795;364796;364797;364798 463855;463856;463857;463858;463859;463860;463861;463862;463863;463864;463865;463866;463867;463868;463869;463870;463871;463872;463873;463874;463875;463876;463877;463878;463879;463880;463881;463882;463883;463884 463860 30 SLSALGNVISALAEGTK Unmodified 1629.8938 0.8937506 1568;2946 O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840;J3KNA1 KIF5C;KIF5A Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein no no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 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1907.8658 0.86583806 2636 P53992 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes yes 0 0 0 1 93.643 93.643 3 0.056952 96667 QUIQUE_C1576_190116_001 24.053 14.14 23285000 0 0 0 0 0 0 23285000 0 0 0 0 0 0 40776 2636 38060 364866 463959 463959 0 SLSGLILK Unmodified 829.5273 0.52730417 3772;1446 O14787;A0A075B780;K7ESC1;K7ENW1;Q92973;E7EW37 TNPO2;TNPO1 Transportin-2;Transportin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 71.045 71.045 1;2 0.0077095 71930 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.033 15.713 503430000 0 0 0 23705000 104590000 0 0 112880000 130290000 0 0 0 131970000 40777 1446;3772 38061 364867;364868;364869;364870;364871 463960;463961;463962;463963;463964;463965;463966 463963 6 SLSGLLPAQTSLEYALLDAVTQQEK Unmodified 2674.4065 0.40652692 3623 Q8NBF2 NHLRC2 NHL repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 3 1 2 168.56 168.56 2;3 1.3235E-28 172213 QUIQUE_C1277_190116_001 132.59 114.89 370110000 0 200610000 92177000 0 0 0 0 0 0 77318000 0 0 0 40778 3623 38062 364872;364873;364874;364875;364876;364877 463967;463968;463969;463970;463971;463972 463968 6 SLSGSTNTVASEGVTK Unmodified 1536.7631 0.76313036 713 C9JPK3;C9K0E4;C9JCY1;C9JQS3;E9PFI2;Q9Y2K9 STXBP5L Syntaxin-binding protein 5-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.58 32.58 2 8.8123E-08 28059 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.22 83.562 108150000 22562000 0 0 0 22570000 0 0 0 19117000 0 20825000 0 23075000 40779 713 38063 364878;364879;364880;364881;364882;364883 463973;463974;463975;463976;463977;463978 463976 5 SLSLCNMFLDEMAK Unmodified 1657.7514 0.75138516 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.35 145.35 2 9.5102E-07 150684 QUIQUE_C1368_190116_001 122.51 106.62 669820000 56554000 93602000 67793000 82273000 52056000 47429000 73165000 0 55263000 15702000 66550000 0 59429000 40780 4551 38064 364884;364885;364886;364887;364888;364889;364890;364891;364892;364893;364894 463979;463980;463981;463982;463983;463984;463985;463986;463987;463988;463989;463990;463991 463981 11 SLSLCNMFLDEMAK Oxidation (M) 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Unmodified 813.496 0.49600404 4172;346;1230 H7C2K6;Q9H4G0;A0A0C4DH22;A0A1B0GTW6 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 41.606 41.606 2 0.045132 39134 QUIQUE_C1438_190116_001 57.281 10.479 346570000 0 0 0 0 152160000 0 0 0 0 0 0 0 194410000 40787 1230;4172;346 38070 364956;364957 464073;464074 464073 2 SLSPIKDIISLK Unmodified 1312.7966 0.79660274 25 F5H107;A0A087WTA1;A0A0A0MR20;E9PDN6;Q9C0A0 CNTNAP4 Contactin-associated protein-like 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 92.566 92.566 3 0.00099326 96490 QUIQUE_C1438_190116_001 66.989 47.384 57228000 0 0 0 0 11421000 0 0 0 11622000 0 18772000 15413000 0 40788 25 38071 364958;364959;364960;364961;364962 464075;464076;464077;464078;464079 464076 5 SLSQSFENLLDEPAYGLIQK Unmodified 2251.1372 0.13722835 706 C9JA93 TBC1D15 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 155.24 155.24 2;3 3.3996E-06 160831 QUIQUE_C1368_190116_001 92.063 63.299 215250000 0 0 17099000 0 31009000 19169000 0 28763000 15563000 0 0 84043000 19601000 40789 706 38072 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.815 91.815 2 0.00052969 94868 QUIQUE_C1218_190116_001 99.568 80.253 82494000 24321000 28859000 0 0 0 29314000 0 0 0 0 0 0 0 40804 1568 38087 365103;365104;365105;365106;365107;365108;365109 464237;464238;464239;464240;464241;464242;464243;464244 464237 8 SLTEHGVAATDGR Unmodified 1312.6371 0.63714198 1001 H0YGQ3;F5H1U9;O75970;A0A075B6R8;B7ZB24 MPDZ Multiple PDZ domain protein yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 18.724 18.724 2;3 0.00012903 11113 QUIQUE_C1277_190116_001 117.25 98.272 323390000 49669000 53297000 36375000 47980000 32606000 54850000 30050000 0 0 0 18564000 0 0 40805 1001 38088 365110;365111;365112;365113;365114;365115;365116;365117;365118;365119;365120;365121 464245;464246;464247;464248;464249;464250;464251;464252;464253;464254;464255;464256 464248 12 SLTEYLQNVEQK Unmodified 1450.7304 0.73037367 2355 P33176 KIF5B Kinesin-1 heavy chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.796 91.796 2 2.8182E-37 93333 QUIQUE_DMIX1_190116_001 188.87 155.49 1443200000 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464285;464286;464287;464288;464289;464290;464291;464292;464293;464294;464295;464296;464297;464298 464293 13 SLTGVVNAQALTSAFSPHTKPWIGLAEALGTLMR Oxidation (M) 3552.8763 0.8762734 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFL2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 1 1 1 1 2 1 160.63 160.63 3;4 3.7516E-44 165240 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.65 106.82 1479800000 0 0 0 0 0 0 127250000 923150000 343010000 0 86346000 0 0 40811 404 38094 365159;365160;365161;365162;365163 464299;464300;464301;464302;464303 464302 288 5 SLTGVVNAQALTSAFSPHTKPWIGLAEALGTLMR Unmodified 3536.8814 0.88135878 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFL2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 2 2 3 1 167.46 167.46 3;4 1.0624E-235 174611 QUIQUE_DMIX5_190116_001 225.05 214.66 4370900000 0 0 0 0 0 0 0 48797000 1148800000 0 1470200000 1624000000 79153000 40812 404 38094 365164;365165;365166;365167;365168;365169;365170;365171;365172 464304;464305;464306;464307;464308;464309;464310;464311;464312;464313 464308 10 SLTLDTWEPELLK Unmodified 1543.8134 0.81337501 108 A0A087X1H5;Q15057;A0A0U1RQT1;H7C3K3 ACAP2 Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 137.81 137.81 2 0.0076546 141686 QUIQUE_C1403_190116_001 62.466 35.351 32878000 0 0 0 32878000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40813 108 38095 365173 464314 464314 1 SLTLFGQLLTK Unmodified 1219.7176 0.71762413 4452 Q9UIW2 PLXNA1 Plexin-A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 130.53 130.53 2 0.013359 133926 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.1 49.771 47161000 0 0 0 0 0 0 0 11842000 16153000 0 19167000 0 0 40814 4452 38096 365174;365175;365176 464315;464316;464317;464318 464316 4 SLTLLQAVLPQIK Unmodified 1422.881 0.88100107 862 F5H6L3;E7ERK8;Q17R89 ARHGAP44 Rho GTPase-activating protein 44 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.14 147.14 2 6.4944E-13 151329 QUIQUE_C1403_190116_001 155.42 149.64 365790000 42215000 28600000 43242000 26802000 28974000 27677000 37112000 16931000 20363000 10180000 29761000 22197000 31734000 40815 862 38097 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464455;464456;464457;464458;464459;464460;464461;464462;464463;464464;464465;464466;464467;464468;464469;464470;464471;464472;464473;464474 464471 20 SLVASLAEPDFVVTDFAK Unmodified 1907.988 0.98804492 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 1 148.34 148.34 2;3 3.5662E-45 153680 QUIQUE_C1368_190116_001 217.88 194.28 19703000000 1543400000 1443500000 1475200000 1533300000 1915000000 1547600000 1632600000 1480900000 1615200000 624260000 1872000000 1600700000 1418900000 40828 2197 38110 365294;365295;365296;365297;365298;365299;365300;365301;365302;365303;365304;365305;365306;365307;365308;365309;365310;365311;365312;365313;365314;365315 464475;464476;464477;464478;464479;464480;464481;464482;464483;464484;464485;464486;464487;464488;464489;464490;464491;464492;464493;464494;464495;464496;464497;464498;464499;464500;464501;464502;464503;464504;464505;464506;464507;464508;464509;464510;464511;464512;464513;464514;464515;464516 464484 41 SLVDLTAVDVPTR Unmodified 1384.7562 0.75619449 1639 O75489;E9PS48 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 108.22 108.22 2 2.5878E-23 111182 QUIQUE_DMIX7_190116_001 169.65 140.93 6256300000 641970000 560760000 539000000 362340000 430530000 420750000 473590000 394930000 441350000 207240000 747980000 553580000 482260000 40829 1639 38111 365316;365317;365318;365319;365320;365321;365322;365323;365324;365325;365326;365327;365328;365329;365330 464517;464518;464519;464520;464521;464522;464523;464524;464525;464526;464527;464528;464529;464530;464531;464532;464533;464534;464535;464536;464537;464538;464539;464540;464541;464542;464543;464544;464545;464546;464547;464548;464549;464550;464551 464546 35 SLVDTVYALKDEVQELR Unmodified 1977.0419 0.0418714 465 B1ALK7;A0A2R8YG42 ARHGEF7 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 147.46 147.46 3 8.4444E-14 150567 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.39 110.03 755120000 49879000 73474000 91745000 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41.262 41.262 2 0.00080132 37452 QUIQUE_DMIX7_190116_001 129.72 99.536 575130000 74987000 59819000 90092000 0 80446000 41076000 63348000 65792000 0 43247000 0 56320000 0 40832 148 38114 365355;365356;365357;365358;365359;365360;365361;365362;365363;365364;365365;365366;365367;365368 464580;464581;464582;464583;464584;464585;464586;464587;464588;464589;464590;464591;464592;464593;464594;464595;464596 464595 17 SLVEAISLWNEGVLAADKK Acetyl (Protein N-term) 2084.1154 0.11537069 2156 P19878 NCF2 Neutrophil cytosol factor 2 yes yes 1 0 1 1 1 170.79 170.79 3 0.00045168 175535 QUIQUE_C1368_190116_001 67.274 57.352 23854000 0 0 7393000 16461000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40833 2156 38115 365369;365370 464597;464598 464597 2 SLVEASSSGVSVLSLCEK Unmodified 1850.9295 0.92954376 4530 Q9UQ80;F8VR77;F8W0A3;H0YIN7 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 0 1 106.44 106.44 2 0.044556 110540 QUIQUE_C1368_190116_001 61.415 42.316 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40834 4530 38116 365371 464599 464599 1 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464614;464615;464616;464617;464618;464619;464620;464621;464622;464623;464624;464625;464626;464627 464623 13 SLVESVSSSPNK Unmodified 1232.6248 0.62484596 4150 Q9H2U2 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 32.685 32.685 2 0.0074211 27505 QUIQUE_C1218_190116_001 80.24 59.91 777760000 298340000 0 0 0 0 153040000 163380000 0 162990000 0 0 0 0 40837 4150 38119 365396;365397;365398;365399 464628;464629;464630;464631 464628 4 SLVGATYVER Unmodified 1093.5768 0.57677356 3557 Q8IYQ7 THNSL1 Threonine synthase-like 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 51.609 51.609 2 0.010033 47212 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.375 26.129 113260000 34483000 0 0 0 0 28524000 0 27545000 0 22702000 0 0 0 40838 3557 38120 365400;365401;365402;365403 464632;464633;464634;464635 464635 3 SLVHAGVPASYLLIPAASYVLPEVSK Unmodified 2680.484 0.48398938 26 A0A087WTA5;E7ERK9;Q9UI10 EIF2B4 Translation initiation factor eIF-2B subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 150.6 150.6 3 1.4258E-05 153586 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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464804;464805;464806;464807;464808;464809;464810;464811 464807 8 SLWGLVSK Acetyl (Protein N-term) 930.51747 0.51746776 370 A0A1W2PNW1;P42226;Q5FBW6;G3V2L2;G3V2M3;G3V3E9;G3V2H4;G3V5I8;G3V568;G3V370;G3V5K5 STAT6 Signal transducer and activator of transcription 6 yes no 1 0 0 1 1 1 146.28 146.28 2 0.037168 151980 QUIQUE_C1218_190116_001 55.531 31.027 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40858 370 38140 365541;365542;365543 464812;464813;464814 464812 3 SLWNDPGIQECYDR Unmodified 1751.7573 0.75733347 2556 P50148;B1AM21 GNAQ Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.552 98.552 2 2.0427E-71 101488 QUIQUE_C1277_190116_001 229.29 211.48 1887600000 0 191460000 171500000 159340000 155830000 147060000 242740000 126710000 194290000 0 191520000 148180000 159010000 40859 2556 38141 365544;365545;365546;365547;365548;365549;365550;365551;365552;365553;365554 464815;464816;464817;464818;464819;464820;464821;464822;464823;464824;464825;464826;464827 464815 13 SLWTDIPVNFPK Unmodified 1415.7449 0.74490152 2649 P54803 GALC Galactocerebrosidase yes yes 0 0 0 1 137.96 137.96 2 0.012223 143029 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.14 50.351 28699000 0 0 0 0 0 0 0 0 28699000 0 0 0 0 40860 2649 38142 365555 464828 464828 1 SLYALFSQFGHVVDIVALK Unmodified 2106.1514 0.15136227 1948 P08579 SNRPB2 U2 small nuclear ribonucleoprotein B'' yes yes 0 0 0 1 1 1 167.3 167.3 3 3.3876E-06 171372 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.759 65.135 182490000 0 20295000 0 0 0 0 0 0 0 0 72497000 89699000 0 40861 1948 38143 365556;365557;365558 464829;464830;464831 464831 2 SLYASSPGGVYATR Unmodified 1427.7045 0.70449327 1952 P08670;B0YJC4;A0A1B0GTT5;A0A1B0GVG8 VIM Vimentin yes no 0 0 0 1 2 1 3 1 2 1 2 2 2 1 1 1 57.137 57.137 1;2;3 5.7045E-10 55354 QUIQUE_C1403_190116_001 130.01 108.63 109830000000 3816000000 6910000000 7020500000 12842000000 8519500000 9931100000 6121800000 10155000000 11957000000 3678300000 7705900000 7379200000 13792000000 40862 1952 38144 365559;365560;365561;365562;365563;365564;365565;365566;365567;365568;365569;365570;365571;365572;365573;365574;365575;365576;365577;365578 464832;464833;464834;464835;464836;464837;464838;464839;464840;464841;464842;464843;464844;464845;464846;464847;464848;464849;464850;464851;464852;464853;464854;464855;464856;464857;464858;464859;464860;464861;464862;464863;464864;464865;464866;464867;464868;464869 464843 35 SLYAYIQK Unmodified 984.52803 0.52803245 2987 Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 60.736 60.736 2 0.036561 60721 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.717 35.928 73311000 0 0 19119000 0 0 0 0 0 0 0 22951000 0 31242000 40863 2987 38145 365579;365580;365581 464870;464871;464872 464871 3 SLYDEVAAQGEVVR Unmodified 1534.7627 0.76273643 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 97.077 97.077 2 1.1337E-07 99594 QUIQUE_C1368_190116_001 129.89 107.9 384200000 0 59817000 61732000 0 0 0 50432000 70424000 51915000 29843000 0 60038000 0 40864 1929 38146 365582;365583;365584;365585;365586;365587;365588 464873;464874;464875;464876;464877;464878;464879;464880;464881 464875 9 SLYHDISGDTSGDYR Unmodified 1684.7329 0.73289286 2574 P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 1 2 56.04 56.04 2;3 7.4766E-24 53897 QUIQUE_C1403_190116_001 152.47 136.33 993320000 100390000 130270000 56277000 187820000 42877000 90839000 141180000 0 46778000 76268000 42358000 0 78269000 40865 2574 38147 365589;365590;365591;365592;365593;365594;365595;365596;365597;365598;365599;365600;365601;365602;365603;365604;365605;365606;365607 464882;464883;464884;464885;464886;464887;464888;464889;464890;464891;464892;464893;464894;464895;464896;464897;464898;464899;464900;464901;464902;464903 464888 21 SLYHDISGDTSGDYRK Unmodified 1812.8279 0.82785588 2574 P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 1 39.624 39.624 2;3 8.8008E-07 36041 QUIQUE_C1277_190116_001 127.17 108.43 1727300000 0 202030000 118370000 0 0 0 221360000 235100000 315730000 0 305990000 45579000 283160000 40866 2574 38148 365608;365609;365610;365611;365612;365613;365614;365615;365616;365617;365618;365619 464904;464905;464906;464907;464908;464909;464910;464911;464912;464913;464914;464915 464905 11 SLYNVNGLK Unmodified 1006.5447 0.54474515 2944 Q12797 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes yes 0 0 0 1 53.692 53.692 2 0.02653 51358 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.134 23.835 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40867 2944 38149 365620 464916 464916 1 SLYPDAEDPQLGLDGPGEPDVR Unmodified 2339.0917 0.091734718 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 116.07 116.07 2 0.00018007 119397 QUIQUE_C1403_190116_001 63.134 50.989 15390000 0 0 0 15390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40868 3997 38150 365621 464917 464917 0 SLYPLTFIQVK Unmodified 1307.7489 0.74892426 2106 P16278;E7EQ29 GLB1 Beta-galactosidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 128.65 128.65 2 0.003942 134413 QUIQUE_C1438_190116_001 72.643 56.186 153160000 18618000 22761000 0 0 27032000 20896000 18209000 0 0 12076000 33566000 0 0 40869 2106 38151 365622;365623;365624;365625;365626;365627;365628 464918;464919;464920;464921;464922;464923;464924;464925;464926 464921 9 SLYPSLEDLK Acetyl (Protein N-term) 1205.618 0.61796967 1417 O00560;B4DHN5;E9PBU7 SDCBP Syntenin-1 yes no 1 0 0 1 137.43 137.43 2 0.011525 133476 QUIQUE_DMIX4_190116_001 61.691 43.152 11954000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11954000 0 0 0 40870 1417 38152 365629 464927 464927 1 SLYPSSEIQLNNK Unmodified 1491.7569 0.75692277 1664 O75886 STAM2 Signal transducing adapter molecule 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 71.76 71.76 2 0.00016949 72054 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.78 81.061 180240000 0 0 0 0 0 0 0 32718000 44964000 0 36175000 24775000 41604000 40871 1664 38153 365630;365631;365632;365633;365634 464928;464929;464930;464931;464932;464933 464928 6 SLYQSAGVAPESFEYIEAHGTGTK Unmodified 2541.2023 0.2023478 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.9 103.9 2;3 1.8208E-14 106959 QUIQUE_C1277_190116_001 109.04 99.759 3237300000 215860000 262870000 255820000 301470000 222930000 179810000 265680000 306210000 278000000 131700000 368210000 194260000 254520000 40872 2524 38154 365635;365636;365637;365638;365639;365640;365641;365642;365643;365644;365645;365646;365647;365648 464934;464935;464936;464937;464938;464939;464940;464941;464942;464943;464944;464945;464946;464947;464948;464949;464950;464951;464952;464953 464935 18 SLYSDHELR Unmodified 1118.5356 0.53563702 4151 Q9H2W6;A0A087WT90 MRPL46 39S ribosomal protein L46, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.645 29.645 3 0.00041593 24214 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.867 55.442 359960000 33182000 25880000 24485000 25014000 28886000 22797000 31215000 23126000 28582000 10172000 33119000 29512000 43994000 40873 4151 38155 365649;365650;365651;365652;365653;365654;365655;365656;365657;365658;365659;365660;365661 464954;464955;464956;464957;464958;464959;464960;464961;464962;464963;464964;464965;464966;464967 464963 14 SLYSFIK Unmodified 856.46945 0.46945494 1968 P09525;Q6P452 ANXA4 Annexin A4;Annexin yes no 0 0 0 1 78.506 78.506 2 0.055848 80122 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.715 12.106 114070000 0 0 0 0 0 0 0 0 114070000 0 0 0 0 40874 1968 38156 365662 464968 464968 1 SLYSMIK Unmodified 840.44153 0.44152563 1936;845 E5RK69;P08133 ANXA6 Annexin;Annexin A6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 61.699 61.699 2 0.035909 60764 QUIQUE_DMIX8_190116_001 86.512 41.901 2570900000 0 0 468610000 0 0 353000000 345440000 262130000 386940000 0 393540000 0 361220000 40875 845;1936 38157 365663;365664;365665;365666;365667;365668;365669 464969;464970;464971;464972;464973;464974;464975;464976;464977 464977 9 SLYVAEYHSEPVEDEKP Unmodified 1990.916 0.91600218 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 62.507 62.507 2;3 1.092E-53 61852 QUIQUE_C1277_190116_001 186.16 169.63 2156500000 172720000 227110000 144220000 261420000 208360000 0 65664000 189120000 192480000 0 300290000 301560000 93579000 40876 2249 38158 365670;365671;365672;365673;365674;365675;365676;365677;365678;365679;365680;365681;365682;365683;365684;365685;365686 464978;464979;464980;464981;464982;464983;464984;464985;464986;464987;464988;464989;464990;464991;464992;464993;464994;464995;464996;464997;464998;464999 464981 22 SLYYYIQQDTK Unmodified 1420.6874 0.68744622 1920 P07355;A6NMY6 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.7 83.7 2 7.4721E-13 84503 QUIQUE_DMIX1_190116_001 166.07 148.25 11455000000 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2.0838E-07 102850 QUIQUE_C1277_190116_001 110.98 84.191 1653300000 152180000 140850000 158930000 126100000 114850000 103250000 0 129350000 153350000 66961000 201740000 167890000 137810000 40879 2202 38161 365706;365707;365708;365709;365710;365711;365712;365713;365714;365715;365716;365717;365718;365719 465032;465033;465034;465035;465036;465037;465038;465039;465040;465041;465042;465043;465044;465045;465046;465047;465048;465049;465050;465051;465052;465053 465034 1567 20 SMAASGNLGHTPFVDEL Unmodified 1744.809 0.80903469 2202 P22695 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.64 110.64 2 1.4437E-44 108606 QUIQUE_DMIX4_190116_001 173.76 146.78 5692600000 567730000 433400000 570210000 411270000 366400000 438720000 464570000 390320000 378660000 121100000 619680000 463370000 467140000 40880 2202 38161 365720;365721;365722;365723;365724;365725;365726;365727;365728;365729;365730;365731;365732 465054;465055;465056;465057;465058;465059;465060;465061;465062;465063;465064;465065;465066;465067;465068;465069;465070;465071;465072;465073;465074;465075;465076;465077 465070 24 SMAEDTINAAVK Oxidation (M) 1264.5969 0.59691665 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 39.092 39.092 2 0.037916 35690 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.284 30.464 141450000 0 0 45563000 0 0 0 0 0 48922000 0 46965000 0 0 40881 2463 38162 365733;365734;365735 465078;465079;465080 465079 3 SMAGNIIPAIATTNAVIAGLIVLEGLK Oxidation (M) 2665.5088 0.50882392 4408 Q9UBT2;K7ESK7 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 1 1 2 177.61 177.61 2;3 1.1906E-23 180967 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.35 98.386 400040000 0 0 24204000 0 55275000 0 36991000 95933000 91704000 0 0 39899000 56031000 40882 4408 38163 365736;365737;365738;365739;365740;365741;365742;365743;365744;365745 465081;465082;465083;465084;465085;465086;465087;465088;465089;465090 465090 2937 8 SMAGNIIPAIATTNAVIAGLIVLEGLK Unmodified 2649.5139 0.5139093 4408 Q9UBT2;K7ESK7 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 179.52 179.52 2;3 2.4035E-12 186034 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.207 65.924 160150000 0 0 0 0 0 0 18562000 20581000 30401000 0 90608000 0 0 40883 4408 38163 365746;365747;365748;365749;365750 465091;465092;465093;465094;465095;465096 465095 6 SMALADPENR Unmodified 1102.5077 0.50770771 3029 Q13884;A0A3B3ITC2 SNTB1 Beta-1-syntrophin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.352 37.352 2 0.0060502 33416 QUIQUE_C1218_190116_001 75.378 42.538 80409000 45255000 35154000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40884 3029 38164 365751;365752;365753;365754;365755;365756;365757;365758;365759;365760;365761 465097;465098;465099;465100;465101;465102;465103;465104;465105;465106;465107 465097 11 SMASGGGVPTDEEQATGLER Unmodified 1990.8902 0.89019814 2000 P10606 COX5B Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 64.743 64.743 2 5.4867E-09 64426 QUIQUE_C1218_190116_001 141 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Unmodified 1774.6952 0.69518673 4514 Q9UNS2;H7C3P9 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.243 23.243 2 1.213E-21 16563 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.97 140.18 254170000 34432000 35831000 0 26465000 31351000 0 0 28428000 0 0 35760000 33636000 28269000 40900 4514 38178 365865;365866;365867;365868;365869;365870;365871;365872 465217;465218;465219;465220;465221;465222;465223;465224 465222 8 SMIAAAGYQHIR Unmodified 1316.6659 0.66593969 137 A0A0A0MR05;Q9BVC4;H3BM50;H3BPU5;H3BPT1;H3BN58 MLST8 Target of rapamycin complex subunit LST8 yes no 0 0 0 1 1 39.984 39.984 2 0.00072907 36136 QUIQUE_C1368_190116_001 117.89 80.414 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40901 137 38179 365873;365874 465225;465226 465225 2 SMIDDTYQCLTAVAGTPR Unmodified 1997.9187 0.9186615 4393;697 Q9UBB6;C9J5H8 NCDN Neurochondrin no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 134.69 134.69 2;3 6.2926E-122 139532 QUIQUE_C1368_190116_001 225.79 209.66 3561300000 500350000 425400000 373620000 319220000 321410000 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Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.94 149.94 2 2.9536E-09 152641 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129 107.63 3013600000 152950000 212330000 291640000 218630000 194880000 181810000 223470000 284450000 315370000 74273000 326780000 249610000 287370000 40907 4006 38184 365917;365918;365919;365920;365921;365922;365923;365924;365925;365926;365927;365928;365929 465278;465279;465280;465281;465282;465283;465284;465285;465286;465287;465288;465289;465290;465291 465286 13 SMLDQLGVPLYAVVK Oxidation (M) 1647.8906 0.89057948 4006 Q9BRX8 FAM213A Redox-regulatory protein FAM213A yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 129.33 129.33 2 0.0015382 126257 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.685 60.731 207310000 0 0 53451000 0 0 54918000 0 0 30465000 19148000 49328000 0 0 40908 4006 38184 365930;365931;365932;365933;365934;365935 465292;465293;465294;465295;465296;465297 465296 2837 4 SMLEEVISNWDR Unmodified 1477.6871 0.68712864 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;F5GXQ8;F5H422;F5GYQ7;F5H4Q0 SYNE1 Nesprin-1 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SMLEVNYPMENGIVR Unmodified 1750.8382 0.83822633 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 112.48 112.48 2 1.255E-14 114140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.65 117.17 93178000 69595000 0 0 0 0 0 0 0 0 23583000 0 0 0 40912 2715 38187 365953;365954;365955;365956;365957;365958;365959;365960 465316;465317;465318;465319;465320;465321;465322;465323 465319 7 SMLEVNYPMENGIVR 2 Oxidation (M) 1782.8281 0.82805557 2715 P61160;F5H6T1 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 2 0 1 80.584 80.584 2 0.024868 81465 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.344 46.653 44963000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44963000 0 40913 2715 38187 365961 465324 465324 2148;2149 0 SMLLLAPK Unmodified 871.52011 0.5201103 949 E9PS17;E9PK59;Q96KG9;E9PPN3;A0A0A0MQX4;H0YCI6 SCYL1 N-terminal kinase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 68.131 68.131 2 0.042451 68544 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.981 41.214 62616000 0 0 0 0 0 0 0 11929000 13222000 0 19754000 0 17712000 40914 949 38188 365962;365963;365964;365965 465325;465326;465327;465328;465329 465325 5 SMLQATAEANNLAAAASAK Unmodified 1831.9098 0.90981137 3355 Q6DD88;F5H6I7 ATL3 Atlastin-3 yes no 0 0 0 1 1 94.334 94.334 2 0.00044328 97172 QUIQUE_C1218_190116_001 68.257 55.056 45547000 24516000 0 0 0 0 0 0 21031000 0 0 0 0 0 40915 3355 38189 365966;365967 465330;465331 465330 2 SMLQATAEANNLAAVATAK Unmodified 1873.9568 0.95676156 3720 Q8WXF7 ATL1 Atlastin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.56 103.56 2 1.9801E-45 107955 QUIQUE_C1218_190116_001 162.37 134.94 325410000 42053000 39938000 55342000 42023000 0 32899000 43512000 0 0 0 36736000 0 32903000 40916 3720 38190 365968;365969;365970;365971;365972;365973;365974;365975 465332;465333;465334;465335;465336;465337;465338;465339 465332 7 SMMACLLSSLK Unmodified 1239.6025 0.60253608 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 131.43 131.43 2 0.0018699 136548 QUIQUE_C1218_190116_001 81.865 59.717 60551000 29254000 31297000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40917 1579 38191 365976;365977;365978;365979;365980 465340;465341;465342;465343;465344;465345 465341 6 SMMGGGLAEIPGLSINFAK Unmodified 1891.9536 0.95359044 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 148.19 148.19 2 0.001783 152377 QUIQUE_C1403_190116_001 75.088 58.95 252420000 0 0 0 69219000 0 77587000 0 0 0 0 105610000 0 0 40918 455 38192 365981;365982;365983 465346;465347;465348 465346 3 SMMGGGLAEIPGLSINFAK Oxidation (M) 1907.9485 0.94850506 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 1 0 1 139.09 139.09 2 0.031015 146397 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.211 43.107 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40919 455 38192 365984 465349 465349 1 SMMQSLSQNPDLAAQMMLNNPLFAGNPQLQEQMR Unmodified 3832.7827 0.78272542 4503 Q9UMX0 UBQLN1 Ubiquilin-1 yes yes 0 0 0 1 166.83 166.83 3 8.2482E-07 171196 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.479 42.991 32740000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32740000 40920 4503 38193 365985 465350 465350 1 SMNINLWSEITELLYK Oxidation (M) 1968.9867 0.98666471 2452 P42704 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 170.62 170.62 2 0.0034534 177897 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.532 48.105 127710000 0 0 0 0 0 0 0 0 55401000 0 72311000 0 0 40921 2452 38194 365986;365987 465351;465352 465352 1872 1 SMPDAMPLPGVGEELK Acetyl (Protein N-term) 1711.8161 0.81609391 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 145.32 145.32 2 0.00027507 150749 QUIQUE_C1218_190116_001 77.279 64.298 603550000 65305000 58270000 0 118640000 0 0 39929000 206220000 0 33415000 0 81779000 0 40922 1558 38195 365988;365989;365990;365991;365992;365993;365994 465353;465354;465355;465356;465357;465358;465359;465360 465353 8 SMPDAMPLPGVGEELK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1727.811 0.81100853 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 1 1 0 1 1 128.42 128.42 2 3.4165E-05 132931 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.925 74.18 84979000 0 0 0 0 0 0 0 39032000 45947000 0 0 0 0 40923 1558 38195 365995;365996 465361;465362 465362 853 2 SMPTSGALDR Oxidation (M) 1049.4812 0.48115861 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 1 0 1 1 17.225 17.225 2 0.028724 9699 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.432 37.992 223300000 68439000 0 0 0 0 0 0 0 154860000 0 0 0 0 40924 2400 38196 365997;365998 465363;465364 465364 2 SMPTSGALDR Unmodified 1033.4862 0.48624399 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 29.709 29.709 2 0.01389 23766 QUIQUE_C1368_190116_001 64.654 39.759 753150000 0 0 364600000 0 177170000 0 0 211380000 0 0 0 0 0 40925 2400 38196 365999;366000;366001 465365;465366;465367 465365 3 SMQGGLVGNDETVALTAFVTIALHHGLAVFQDEGAEPLK Oxidation (M) 4051.0361 0.036081101 290;327;328 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(M) 3898.883 0.88295128 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 155.08 155.08 4 3.2404E-23 159627 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.415 70.318 690080000 90488000 60990000 0 0 0 50320000 0 144450000 129180000 0 0 112050000 102600000 40929 903;2869 38200 366011;366012;366013;366014;366015;366016;366017 465378;465379;465380;465381;465382;465383;465384 465382 548 7 SMSHQAAIASQR Unmodified 1285.6197 0.61971778 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 0 1 12.086 12.086 3 0.0023622 4445 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.613 71.885 8678100 0 0 0 0 0 0 0 8678100 0 0 0 0 0 40930 3234 38201 366018 465385 465385 0 SMSINLPMSCLDSIALGFNFGR Oxidation (M) 2445.1491 0.14907214 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 0 2 166.66 166.66 2;3 7.2143E-06 168668 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.498 79.114 25527000 0 0 0 0 0 0 0 25527000 0 0 0 0 0 40931 2009 38202 366019;366020 465386;465387 465387 1305 2 SMSLVLDEFYSSLR Unmodified 1645.8022 0.8021584 4230 Q9HCN4 GPN1 GPN-loop GTPase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 155.01 155.01 2 4.1314E-05 159195 QUIQUE_C1277_190116_001 143.97 101.23 126790000 13271000 15592000 26064000 0 21316000 0 24480000 0 26070000 0 0 0 0 40932 4230 38203 366021;366022;366023;366024;366025;366026;366027;366028 465388;465389;465390;465391;465392;465393;465394;465395 465389 8 SMSQIYCIENAHGQLVR Unmodified 2004.951 0.95096468 564 A8MUM1;Q53HC9;C9JVR6 TSSC1 Protein TSSC1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 77.788 77.788 3 0.00028634 78625 QUIQUE_C1368_190116_001 65.943 56.66 290500000 61972000 0 46281000 0 0 54193000 56207000 0 0 0 0 36324000 35525000 40933 564 38204 366029;366030;366031;366032;366033;366034;366035 465396;465397;465398;465399;465400;465401;465402;465403 465397 8 SMSTEGLMK Unmodified 982.44635 0.44635301 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.484 36.484 2 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465430;465431 465431 1355 1 SMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMAR 2 Oxidation (M) 3618.7698 0.769819 2044 P12277;G3V4N7 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 2 1 2 3 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 2 137.67 137.67 3;4 8.9231E-158 141046 QUIQUE_DMIX1_190116_001 204.58 200.42 19858000000 1254500000 1565800000 1962800000 1080900000 1474700000 1961400000 944460000 1498900000 1583900000 1603800000 1750900000 1588300000 1587200000 40940 2044 38209 366064;366065;366066;366067;366068;366069;366070;366071;366072;366073;366074;366075;366076;366077;366078;366079;366080;366081;366082;366083;366084;366085;366086;366087;366088;366089;366090;366091;366092 465432;465433;465434;465435;465436;465437;465438;465439;465440;465441;465442;465443;465444;465445;465446;465447;465448;465449;465450;465451;465452;465453;465454;465455;465456;465457;465458;465459;465460;465461;465462;465463;465464;465465;465466;465467;465468;465469;465470;465471;465472;465473;465474;465475 465456 1354;1355 44 SMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMAR Oxidation (M) 3602.7749 0.77490438 2044 P12277;G3V4N7 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 1 1 5 4 6 4 5 4 4 4 4 4 5 4 5 143.39 143.39 3;4 0 152703 QUIQUE_C1218_190116_001 270.39 265.76 113370000000 6552400000 7793700000 13334000000 8797400000 7047700000 11877000000 6493300000 9440200000 8628500000 2917200000 11073000000 9664200000 9756100000 40941 2044 38209 366093;366094;366095;366096;366097;366098;366099;366100;366101;366102;366103;366104;366105;366106;366107;366108;366109;366110;366111;366112;366113;366114;366115;366116;366117;366118;366119;366120;366121;366122;366123;366124;366125;366126;366127;366128;366129;366130;366131;366132;366133;366134;366135;366136;366137;366138;366139;366140;366141;366142;366143;366144;366145;366146;366147;366148;366149;366150 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465573;465574;465575;465576;465577;465578;465579;465580;465581;465582;465583;465584;465585;465586;465587;465588;465589;465590;465591;465592;465593;465594;465595;465596;465597;465598;465599;465600;465601;465602;465603;465604;465605;465606;465607;465608;465609;465610;465611;465612;465613;465614;465615;465616;465617;465618;465619;465620;465621;465622;465623;465624;465625;465626;465627;465628;465629;465630;465631;465632;465633;465634;465635;465636;465637;465638;465639;465640;465641;465642;465643;465644;465645;465646;465647;465648;465649;465650;465651;465652;465653;465654;465655;465656;465657;465658;465659;465660;465661;465662;465663;465664;465665;465666;465667;465668;465669;465670;465671;465672;465673;465674;465675;465676;465677;465678;465679;465680;465681;465682;465683;465684;465685;465686;465687;465688;465689;465690 465577 115 SMTEAEQQQLIDDHFLFDKPVSPLLLASGMARDWPDAR Unmodified 4327.1042 0.10417744 2044 P12277;G3V4N7 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 2 1 160.82 160.82 4 0.026847 164979 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SMVDELFAEIVR Oxidation (M) 1423.7017 0.70171607 4595 Q9Y3L5;A0A087X2C3 RAP2C Ras-related protein Rap-2c yes no 0 1 0 1 1 1 1 141.88 141.88 2 0.00081646 146003 QUIQUE_C1277_190116_001 90.108 52.917 25464000 10020000 15444000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40951 4595 38216 366294;366295;366296;366297 465790;465791;465792;465793 465791 3031 4 SMVDELFAEIVR Unmodified 1407.7068 0.70680145 4595 Q9Y3L5;A0A087X2C3 RAP2C Ras-related protein Rap-2c yes no 0 0 0 1 1 1 1 165.24 165.24 2 0.001424 159215 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.297 74.51 50001000 45199000 0 0 0 0 0 0 0 0 4801700 0 0 0 40952 4595 38216 366298;366299;366300;366301 465794;465795;465796;465797 465797 4 SMVEEGTGLR Unmodified 1077.5125 0.51245874 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.115 36.115 2 2.1789E-05 32383 QUIQUE_DMIX1_190116_001 146.81 87.829 4781700000 387230000 397920000 0 209870000 326970000 218680000 407640000 569500000 537780000 187850000 668190000 463220000 406820000 40953 3117 38217 366302;366303;366304;366305;366306;366307;366308;366309;366310;366311;366312;366313 465798;465799;465800;465801;465802;465803;465804;465805;465806;465807;465808;465809 465804 10 SMVEEGTGLR Oxidation (M) 1093.5074 0.50737336 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.838 20.838 2 0.00024011 14048 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.08 107.3 1550500000 0 210390000 0 0 82538000 0 94242000 180820000 330590000 96712000 250410000 170200000 134640000 40954 3117 38217 366314;366315;366316;366317;366318;366319;366320;366321;366322 465810;465811;465812;465813;465814;465815;465816;465817;465818 465813 2576 9 SMVNLMDR Unmodified 964.44702 0.44702171 1921 P07384 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 60.19 60.19 2 0.022525 56149 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.127 39.32 123510000 0 0 0 74319000 0 0 0 31547000 0 17643000 0 0 0 40955 1921 38218 366323;366324;366325 465819;465820;465821 465821 3 SMVNTKPEKTEEDSEEVR Unmodified 2106.9739 0.97392777 3181 Q16543 CDC37 Hsp90 co-chaperone Cdc37;Hsp90 co-chaperone Cdc37, N-terminally processed yes yes 0 0 2 2 20.279 20.279 3;4 0.0014825 13320 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.432 35.339 58516000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58516000 0 0 40956 3181 38219 366326;366327 465822;465823 465822 2 SMVQFIGR Oxidation (M) 952.48004 0.4800364 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 1 0 1 39.969 39.969 2 0.043356 36894 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.717 39.788 30368000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30368000 0 0 40957 4650 38220 366328 465824 465824 1 SMVQFIGR Unmodified 936.48512 0.48512178 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 65.359 65.359 2 0.0067305 65382 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.67 71.097 497500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 204680000 135100000 157720000 40958 4650 38220 366329;366330;366331 465825;465826;465827 465826 3 SMYEEEINETR Unmodified 1399.5926 0.59255956 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 0 1 1 1 52.699 52.699 2 0.0027697 50613 QUIQUE_C1218_190116_001 76.282 57.011 56406000 37838000 0 0 0 0 0 0 0 0 18568000 0 0 0 40959 2171 38221 366332;366333;366334 465828;465829;465830 465828 3 SMYEEEINETRR Unmodified 1555.6937 0.69367058 2171 P20700;E9PBF6;A0A0D9SFE5 LMNB1 Lamin-B1 yes no 0 0 1 1 1 1 39.714 39.714 3 0.0011123 37139 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.164 35.533 48860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21478000 27381000 0 40960 2171 38222 366335;366336;366337 465831;465832;465833 465831 3 SNAAAYLQHLCYR Unmodified 1565.7409 0.74089555 759 C9JZR2;O60716;E9PKY0 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 71.462 71.462 2 9.4452E-06 72789 QUIQUE_C1438_190116_001 121.9 101.61 82711000 0 0 0 0 82711000 0 0 0 0 0 0 0 0 40961 759 38223 366338;366339 465834;465835 465834 2 SNADYQYQLLR Unmodified 1369.6626 0.66262845 1139 H0YAV9;Q9UIV1;E5RGH2 CNOT7 CCR4-NOT transcription complex subunit 7 yes no 0 0 0 1 72.039 72.039 2 0.018283 73565 QUIQUE_C1438_190116_001 61.65 46.506 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40962 1139 38224 366340 465836 465836 1 SNAHYNLQNAFNLAEQHLGLTK Unmodified 2482.2353 0.23531968 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 4 3 2 2 2 3 3 3 2 3 3 3 121.74 121.74 2;3;4 3.6053E-166 125813 QUIQUE_C1277_190116_001 270.55 253.15 26649000000 2003800000 2398700000 2030900000 1779500000 2157700000 1198800000 1860800000 2765100000 2912300000 827480000 2514800000 1981900000 2217400000 40963 2851 38225 366341;366342;366343;366344;366345;366346;366347;366348;366349;366350;366351;366352;366353;366354;366355;366356;366357;366358;366359;366360;366361;366362;366363;366364;366365;366366;366367;366368;366369;366370;366371;366372;366373;366374;366375 465837;465838;465839;465840;465841;465842;465843;465844;465845;465846;465847;465848;465849;465850;465851;465852;465853;465854;465855;465856;465857;465858;465859;465860;465861;465862;465863;465864;465865;465866;465867;465868;465869;465870;465871;465872;465873;465874;465875;465876;465877;465878;465879;465880;465881;465882;465883;465884;465885;465886;465887;465888;465889;465890;465891;465892;465893;465894;465895;465896;465897;465898;465899;465900;465901;465902 465842 66 SNALDIIFQTDLTGQK Unmodified 1762.9101 0.91012895 116 F8WCZ6;A0A087X232;P09871;F5H7T4;H0Y5D1 C1S Complement C1s subcomponent;Complement C1s subcomponent heavy chain;Complement C1s subcomponent light chain yes no 0 0 0 1 1 144.25 144.25 2 0.00049298 151641 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.73 86.867 80989000 0 0 0 0 36032000 0 0 0 0 0 44958000 0 0 40964 116 38226 366376;366377 465903;465904 465904 2 SNAPQIVAEMLSYLETADYSIR Unmodified 2470.205 0.20499034 1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 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78.655 64.886 324100000 75416000 36329000 53228000 31279000 28171000 0 0 41817000 0 20212000 0 37653000 0 40967 32 38229 366396;366397;366398;366399;366400;366401;366402;366403;366404 465927;465928;465929;465930;465931;465932;465933;465934;465935 465929 9 SNDIDLEGFDSVVSSTEK Unmodified 1940.8851 0.88509599 3806 Q96B97;Q5JPT2 SH3KBP1 SH3 domain-containing kinase-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 122.78 122.78 2 1.9732E-17 127105 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.06 121.08 129730000 0 19262000 0 24814000 0 0 0 0 24084000 0 0 29968000 31598000 40968 3806 38230 366405;366406;366407;366408;366409;366410;366411 465936;465937;465938;465939;465940;465941;465942 465940 7 SNDLFPVHHLDNNEFCPGDFVVDK Unmodified 2814.2708 0.27077849 4094 Q9C0C9;K7ES11 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 0 1 81.04 81.04 4 0.056251 82295 QUIQUE_DMIX3_190116_001 18.719 12.286 207760000 0 0 0 0 0 0 0 0 207760000 0 0 0 0 40969 4094 38231 366412 465943 465943 1 SNDPQMVAENFVPPLLDAVLIDYQR Oxidation (M) 2859.4113 0.41129472 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.38 172.38 3 1.9863E-11 176727 QUIQUE_C1218_190116_001 83.312 77.542 385500000 21043000 31572000 0 7485600 28942000 0 26270000 61013000 45510000 0 41113000 74856000 47699000 40970 1470 38232 366413;366414;366415;366416;366417;366418;366419;366420;366421;366422 465944;465945;465946;465947;465948;465949;465950;465951;465952;465953;465954 465944 814 11 SNDPQMVAENFVPPLLDAVLIDYQR Unmodified 2843.4164 0.4163801 1470 O14980 XPO1 Exportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 3 1 2 1 1 1 1 1 1 173.49 173.49 3 2.0093E-20 176907 QUIQUE_C1277_190116_001 111.4 106.05 461930000 23294000 37925000 40998000 10141000 22900000 0 78550000 36145000 34446000 0 65092000 45324000 67109000 40971 1470 38232 366423;366424;366425;366426;366427;366428;366429;366430;366431;366432;366433;366434;366435;366436 465955;465956;465957;465958;465959;465960;465961;465962;465963;465964;465965;465966;465967;465968;465969;465970;465971 465957 16 SNDPVAIAFADMLK Unmodified 1490.7439 0.74391524 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 149.51 149.51 2;3 2.9052E-10 155231 QUIQUE_C1218_190116_001 142.91 112.52 4739000000 345290000 429590000 459690000 421430000 338390000 321840000 353590000 360030000 358500000 100930000 462680000 353180000 433880000 40972 4356 38233 366437;366438;366439;366440;366441;366442;366443;366444;366445;366446;366447;366448;366449;366450;366451;366452;366453;366454;366455;366456;366457;366458;366459;366460;366461;366462 465972;465973;465974;465975;465976;465977;465978;465979;465980;465981;465982;465983;465984;465985;465986;465987;465988;465989;465990;465991;465992;465993;465994;465995;465996;465997;465998;465999;466000;466001;466002;466003;466004;466005;466006;466007;466008;466009;466010;466011;466012;466013;466014;466015;466016 465972 45 SNDPVAIAFADMLK Oxidation (M) 1506.7388 0.73882986 4356 Q9NZR1;G5EA42 TMOD2 Tropomodulin-2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 116.25 116.25 2 0.0010586 121990 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.469 66.234 262550000 0 0 69839000 0 52613000 0 0 0 63656000 0 76438000 0 0 40973 4356 38233 366463;366464;366465;366466 466017;466018;466019;466020;466021 466021 2918 5 SNDPVATAFAEMLK Unmodified 1492.7232 0.7231798 4333 Q9NYL9;H0YKU1;H0YNJ8 TMOD3 Tropomodulin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 143.68 143.68 2 9.1327E-05 146991 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 91.116 170910000 0 0 0 0 23415000 0 0 29276000 33703000 0 45148000 0 39372000 40974 4333 38234 366467;366468;366469;366470;366471 466022;466023;466024;466025;466026 466023 5 SNDPVAYALAEMLK Unmodified 1520.7545 0.75447993 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 3 1 1 1 1 1 2 154.32 154.32 2;3 7.163E-05 160016 QUIQUE_C1218_190116_001 76.391 71.686 413630000 46091000 62986000 49427000 55053000 43456000 48171000 0 37856000 8779500 15332000 0 38169000 8307900 40975 2279 38235 366472;366473;366474;366475;366476;366477;366478;366479;366480;366481;366482;366483;366484;366485;366486;366487;366488;366489;366490;366491 466027;466028;466029;466030;466031;466032;466033;466034;466035;466036;466037;466038;466039;466040;466041;466042;466043;466044;466045;466046;466047;466048;466049 466028 23 SNDSGIQQSSDDGR Unmodified 1464.6077 0.60769235 108 A0A087X1H5;Q15057;H7C3K3 ACAP2 Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 14.697 14.697 2 8.504E-14 6863 QUIQUE_C1218_190116_001 140.24 126.04 9320200 9320200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40976 108 38236 366492 466050 466050 1 SNDYIGGCQLGISAK Unmodified 1581.7457 0.74570615 4558 Q9Y2J0;F8VP47 RPH3A Rabphilin-3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.253 74.253 2 1.3017E-05 74497 QUIQUE_DMIX7_190116_001 128.57 113.89 555970000 80156000 90210000 63481000 72662000 55282000 43559000 0 44137000 50268000 0 0 56214000 0 40977 4558 38237 366493;366494;366495;366496;366497;366498;366499;366500;366501;366502 466051;466052;466053;466054;466055;466056;466057;466058;466059;466060;466061 466060 10 SNEDQSMGNWQIK Oxidation (M) 1551.6624 0.66237045 1819 P02545;A0A0C4DGC5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.833 42.833 2 3.0944E-32 38360 QUIQUE_DMIX4_190116_001 185.96 159.92 732730000 40746000 65879000 57731000 64431000 74337000 0 44912000 60426000 70700000 54712000 78048000 46699000 74105000 40978 1819 38238 366503;366504;366505;366506;366507;366508;366509;366510;366511;366512;366513;366514 466062;466063;466064;466065;466066;466067;466068;466069;466070;466071;466072;466073;466074;466075;466076 466072 1039 15 SNEDQSMGNWQIK Unmodified 1535.6675 0.66745583 1819 P02545;A0A0C4DGC5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.93 66.93 2 3.1501E-07 67856 QUIQUE_C1218_190116_001 160.33 148.12 1565100000 191850000 217970000 217490000 230300000 0 169080000 154220000 105070000 115520000 42207000 0 0 121410000 40979 1819 38238 366515;366516;366517;366518;366519;366520;366521;366522;366523;366524 466077;466078;466079;466080;466081;466082;466083;466084;466085;466086;466087;466088 466077 10 SNEEGSEEKGPEVR Unmodified 1545.6907 0.6906937 2342 P31947 SFN 14-3-3 protein sigma yes yes 0 0 1 1 13.018 13.018 3 8.4964E-05 5281 QUIQUE_C1368_190116_001 102.73 78.452 7748500 0 0 7748500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40980 2342 38239 366525 466089 466089 1 SNEILTAIIQGMR Oxidation (M) 1460.7657 0.76571331 3090 Q14974;J3KTM9;J3QRG4 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.21 114.21 2 0.00046553 119358 QUIQUE_C1438_190116_001 108.43 59.013 299870000 33530000 32865000 0 29250000 32128000 0 34687000 17878000 32127000 19134000 35447000 0 32828000 40981 3090 38240 366526;366527;366528;366529;366530;366531;366532;366533;366534;366535;366536 466090;466091;466092;466093;466094;466095;466096;466097;466098;466099;466100;466101 466093 2544 12 SNEILTAIIQGMR Unmodified 1444.7708 0.77079869 3090 Q14974;J3KTM9;J3QRG4 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 1 145.96 145.96 2;3 2.9458E-07 150716 QUIQUE_DMIX8_190116_001 153.12 123.65 3251000000 303960000 321700000 326100000 274070000 27096000 254950000 316040000 191520000 229540000 108410000 348770000 255620000 293230000 40982 3090 38240 366537;366538;366539;366540;366541;366542;366543;366544;366545;366546;366547;366548;366549;366550;366551;366552;366553;366554;366555;366556;366557;366558;366559;366560;366561 466102;466103;466104;466105;466106;466107;466108;466109;466110;466111;466112;466113;466114;466115;466116;466117;466118;466119;466120;466121;466122;466123;466124;466125;466126;466127;466128;466129;466130;466131;466132 466132 29 SNEKEQLQGLNDR Unmodified 1529.7434 0.74339797 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 1 22.983 22.983 2;3 1.1336E-156 16298 QUIQUE_DMIX3_190116_001 261.22 243.99 7499700000 424940000 656880000 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type-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.137 81.137 2 0.0039024 81027 QUIQUE_C1563_190116_001 82.75 58.596 4137200000 351310000 370540000 401970000 349780000 366080000 286200000 362300000 334500000 378190000 74365000 494230000 367780000 0 40992 2245 38250 366680;366681;366682;366683;366684;366685;366686;366687;366688;366689;366690;366691 466264;466265;466266;466267;466268;466269;466270;466271;466272;466273;466274;466275 466269 7 SNFKPSLLAQK Unmodified 1231.6925 0.69247202 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 1 1 35.658 35.658 2 0.035258 31704 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.786 42.671 179080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 179080000 0 0 40993 71 38251 366692 466276 466276 0 SNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLK Unmodified 2553.221 0.22097475 2730 P61769 B2M Beta-2-microglobulin;Beta-2-microglobulin form pI 5.3 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 148.66 148.66 2;3 1.7065E-27 153304 QUIQUE_DMIX3_190116_001 169.64 150.81 4635000000 275480000 33734000 630260000 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466305;466306;466307;466308;466309;466310;466311;466312;466313;466314;466315;466316;466317;466318;466319;466320;466321;466322;466323;466324;466325;466326;466327;466328;466329;466330;466331 466308 26 SNFSILQLHEFK Unmodified 1461.7616 0.76161421 3890 Q96JG6;H0Y7Q2 CCDC132 Coiled-coil domain-containing protein 132 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.158 95.158 3 0.0065326 93329 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.576 45.206 340660000 36019000 44699000 21866000 30039000 40868000 29039000 0 31491000 26506000 15245000 0 33229000 31664000 40996 3890 38254 366734;366735;366736;366737;366738;366739;366740;366741;366742;366743;366744 466332;466333;466334;466335;466336;466337;466338;466339;466340;466341;466342;466343;466344 466342 13 SNFSLAILNVGAPAAGMNAAVR Oxidation (M) 2159.1157 0.11572182 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.42 129.42 2 1.933E-44 135432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.34 94.936 512640000 34483000 37113000 45515000 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SNGLGPVMSGNTAYPVISCPPLTPDWGVQDVWSSLR Unmodified 3856.8553 0.85527996 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 172.28 172.28 3 0.025431 178777 QUIQUE_DMIX3_190116_001 20.062 18.4 103790000 0 0 0 0 0 0 0 0 12380000 0 80022000 0 11386000 41000 2195 38257 366764;366765;366766 466368;466369;466370;466371 466368 3 SNGWILPTVYQGMYNATTR Unmodified 2171.047 0.046973553 1528 O43488 AKR7A2 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 142.99 142.99 2;3 9.7859E-12 148885 QUIQUE_C1218_190116_001 132.08 103.11 1378500000 85667000 83303000 79121000 101970000 106630000 23962000 69806000 98230000 174140000 37913000 226960000 158540000 132210000 41001 1528 38258 366767;366768;366769;366770;366771;366772;366773;366774;366775;366776;366777;366778;366779;366780;366781;366782;366783;366784;366785;366786;366787;366788;366789 466372;466373;466374;466375;466376;466377;466378;466379;466380;466381;466382;466383;466384;466385;466386;466387;466388;466389;466390;466391;466392;466393;466394;466395;466396 466374 19 SNGWILPTVYQGMYNATTR Oxidation (M) 2187.0419 0.041888175 1528 O43488 AKR7A2 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 121.85 121.85 2 1.212E-07 125572 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.1 89.094 107340000 0 0 0 0 0 0 0 40104000 45179000 22055000 0 0 0 41002 1528 38258 366790;366791;366792 466397;466398;466399 466398 837 3 SNGYEEAYSVFK Unmodified 1392.6198 0.61976058 2460 P43034;I3L495 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.77 86.77 2 0.00020557 88348 QUIQUE_C1368_190116_001 110.39 78.627 1478300000 149990000 152690000 0 159650000 0 0 0 115940000 158620000 81903000 236530000 259530000 163450000 41003 2460 38259 366793;366794;366795;366796;366797;366798;366799;366800;366801;366802;366803;366804 466400;466401;466402;466403;466404;466405;466406;466407;466408;466409;466410;466411 466402 11 SNGYEEAYSVFKK Unmodified 1520.7147 0.7147236 2460 P43034;I3L495 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 1 2 66.21 66.21 2;3 0.0034388 65267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.156 81.214 261560000 0 0 0 0 0 0 0 261560000 0 0 0 0 0 41004 2460 38260 366805;366806 466412;466413 466413 1 SNHEEEVADLLAQIQASHITVER Unmodified 2588.2831 0.28305774 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 3 3 2 3 3 2 3 2 2 2 3 2 2 128.08 128.08 2;3;4 1.0109E-201 132433 QUIQUE_DMIX3_190116_001 250.62 227.41 35834000000 10416000000 3024900000 1911400000 1768800000 1459700000 1458400000 4799700000 1921100000 1447600000 1144800000 2499600000 2247500000 1734200000 41005 869 38261 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repeat-containing protein 40 yes yes 0 0 0 1 74.966 74.966 2 0.049353 70989 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.879 30.217 23077000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23077000 0 0 0 41014 4194 38270 366894 466523 466523 1 SNIVTVGDVEEINK Unmodified 1515.7781 0.77805214 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 79.883 79.883 2 0.00097963 80110 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.105 81.967 36513000 0 0 0 0 0 0 0 36513000 0 0 0 0 0 41015 2486 38271 366895 466524 466524 1 SNIWLAAVTK Unmodified 1101.6182 0.61824444 71 A0A087WY71;E9PFW3;Q96CW1;C9JJ47;C9JTK4;C9JGT8;C9JJD3;C9JPV8 AP2M1 AP-2 complex subunit mu yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.581 92.581 2 0.0049484 96509 QUIQUE_C1218_190116_001 79.16 57.712 1498300000 164530000 152100000 133310000 119780000 126920000 94551000 150020000 127370000 0 53659000 138120000 128260000 109650000 41016 71 38272 366896;366897;366898;366899;366900;366901;366902;366903;366904;366905;366906;366907 466525;466526;466527;466528;466529;466530;466531;466532;466533;466534;466535;466536;466537 466525 11 SNIWVAGDAACFYDIK Unmodified 1828.8454 0.8454202 1756 O95831;E9PMA0 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 130.91 130.91 2 0.0064728 133451 QUIQUE_C1563_190116_001 70.889 60.279 118050000 0 0 0 0 0 45538000 0 0 0 72512000 0 0 0 41017 1756 38273 366908;366909 466538;466539 466538 2 SNKDGGNQEVEIAR Unmodified 1515.7277 0.7277479 2069 P13861;H7C330 PRKAR2A cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit yes no 0 0 1 2 1 1 2 2 16.752 16.752 2;3 1.9341E-06 9073 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.28 100.95 197260000 0 0 0 0 0 0 0 50329000 11959000 0 19629000 47061000 68286000 41018 2069 38274 366910;366911;366912;366913;366914;366915;366916;366917 466540;466541;466542;466543;466544;466545;466546;466547;466548 466544 8 SNKPIHTIILNPHVHLVGDDAACIAYIR Unmodified 3136.6604 0.66040739 896;803 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 1 1 2 3 2 1 2 1 2 3 2 2 2 89.793 89.793 3;4;5 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1815.885 0.88503641 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 119.13 119.13 2 1.2334E-18 116210 QUIQUE_DMIX4_190116_001 170.79 134.5 429580000 57275000 0 72850000 0 107450000 0 0 0 0 48193000 101310000 42500000 0 41022 1803 38278 366977;366978;366979;366980;366981;366982 466621;466622;466623;466624;466625;466626;466627 466625 7 SNLELLR Unmodified 843.48142 0.48141661 493 A0A3B3ISS9;P01241;P01242;A0A087WUG6;H0YM39;P0DML3;P0DML2;A6NFB4 GH1;GH2;CSH1;CSH2 Somatotropin;Growth hormone variant;Chorionic somatomammotropin hormone 2;Chorionic somatomammotropin hormone 1 yes no 0 0 0 1 51.337 51.337 2 0.019757 49568 QUIQUE_C1218_190116_001 120.65 19.903 2417800000 2417800000 0 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3.8571E-23 75938 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.15 129.68 649620000 71688000 63710000 0 0 80874000 64338000 0 118440000 79437000 44093000 63889000 63157000 0 41031 1021 38287 367028;367029;367030;367031;367032;367033;367034;367035;367036;367037;367038;367039 466676;466677;466678;466679;466680;466681;466682;466683;466684;466685;466686;466687 466685 11 SNLVGMGVIPLEYLPGENADALGLTGQER Unmodified 3012.5226 0.52263608 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 163.2 163.2 2;3 2.4509E-127 166941 QUIQUE_C1403_190116_001 194.92 178.79 1832700000 127810000 182820000 168620000 202880000 148580000 114030000 107470000 123620000 189030000 48305000 0 208620000 210960000 41032 2180 38288 367040;367041;367042;367043;367044;367045;367046;367047;367048;367049;367050;367051;367052;367053;367054;367055;367056;367057;367058;367059 466688;466689;466690;466691;466692;466693;466694;466695;466696;466697;466698;466699;466700;466701;466702;466703;466704;466705;466706;466707 466695 20 SNLVISDPIPGAK Unmodified 1309.7242 0.72416608 4531 Q9UQB8;I3L4C2;I3L2M4;B4DWA1;I3L0Y9 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 81.911 81.911 2 0.013697 79016 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.401 38.943 104920000 0 0 0 44998000 0 43102000 0 0 0 16815000 0 0 0 41033 4531 38289 367060;367061;367062 466708;466709;466710 466710 1 SNLVISDPIPGAKPLPVPPELAPFVGR Unmodified 2779.5636 0.56363668 4531 Q9UQB8;I3L4C2;I3L2M4;B4DWA1;I3L0Y9 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.27 151.27 3 1.1134E-15 156652 QUIQUE_C1368_190116_001 83.881 78.513 635600000 34566000 27909000 36898000 72368000 0 48351000 40012000 109880000 50756000 13543000 53765000 77429000 70124000 41034 4531 38290 367063;367064;367065;367066;367067;367068;367069;367070;367071;367072;367073;367074 466711;466712;466713;466714;466715;466716;466717;466718;466719;466720;466721;466722;466723;466724 466713 13 SNMGHPEPASGLAALAK Unmodified 1649.8195 0.8195398 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 55.054 55.054 2;3 0.013546 54202 QUIQUE_C1576_190116_001 51.875 35.621 113070000 0 0 0 0 0 59058000 0 0 0 0 0 0 54009000 41035 2524 38291 367075;367076;367077 466725;466726;466727 466726 3 SNMGHPEPASGLAALAK Oxidation (M) 1665.8145 0.81445442 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 1 0 1 44.933 44.933 2 0.064556 42596 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.298 32.131 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41036 2524 38291 367078 466728 466728 1 SNMIQTIFTTIGLLYPFPK Oxidation (M) 2199.165 0.16496342 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 1 0 1 2 1 1 2 2 172.03 172.03 2;3 3.0184E-11 175732 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.51 105.74 599460000 0 0 0 0 0 0 14653000 62760000 184670000 0 114550000 222830000 0 41037 2233 38292 367079;367080;367081;367082;367083;367084;367085;367086;367087 466729;466730;466731;466732;466733;466734;466735;466736;466737 466737 1596 8 SNMIQTIFTTIGLLYPFPK Unmodified 2183.17 0.1700488 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 2 1 179.57 179.57 2;3 0.00054758 186176 QUIQUE_DMIX5_190116_001 58.073 48.789 74737000 0 0 0 0 0 0 0 0 13093000 0 48410000 13234000 0 41038 2233 38292 367088;367089;367090;367091 466738;466739;466740;466741;466742 466739 5 SNNMGIVGGFTQMIR Unmodified 1623.7861 0.78613118 3368 Q6KCM7 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 73.336 73.336 2 0.00047554 73417 QUIQUE_C1403_190116_001 90.913 77.485 342750000 54627000 0 55462000 78309000 0 0 60441000 0 0 0 93907000 0 0 41043 3048 38297 367111;367112;367113;367114;367115;367116;367117;367118 466763;466764;466765;466766;466767;466768;466769;466770 466766 7 SNPENNVGLITLANDCEVLTTLTPDTGR Unmodified 3013.4662 0.46624341 2655 Q5VWC4;P55036;A6PVX3 PSMD4 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.27 151.27 3 4.5082E-24 155537 QUIQUE_C1277_190116_001 96.123 83.927 692170000 0 65440000 79742000 79197000 81990000 59414000 44956000 61639000 0 21481000 50671000 65897000 81739000 41044 2655 38298 367119;367120;367121;367122;367123;367124;367125;367126;367127;367128;367129 466771;466772;466773;466774;466775;466776;466777;466778;466779;466780;466781;466782;466783;466784 466771 14 SNPEPSVAFELPSR Unmodified 1528.7522 0.75217174 2173 P20916 MAG Myelin-associated glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 90.438 90.438 2 2.9944E-05 92363 QUIQUE_C1277_190116_001 119.39 99.624 648770000 0 72074000 177770000 51798000 76852000 95339000 124010000 0 0 50930000 0 0 0 41045 2173 38299 367130;367131;367132;367133;367134;367135;367136;367137;367138;367139;367140 466785;466786;466787;466788;466789;466790;466791;466792;466793;466794;466795;466796;466797;466798 466787 14 SNPFAHLAEPLDPVQPGK Acetyl (Protein N-term) 1957.9898 0.98977625 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 1 0 0 1 130.06 130.06 2 1.0302E-06 135401 QUIQUE_C1368_190116_001 93.909 65.103 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41046 2180 38300 367141 466799 466799 1 SNPFAHLAEPLDPVQPGKK Acetyl (Protein N-term) 2086.0847 0.084739267 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 107.21 107.21 2;3 7.3092E-23 111729 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.66 99.412 1689900000 91788000 146490000 0 130670000 136450000 72354000 0 174890000 194780000 0 292530000 188200000 261770000 41047 2180 38301 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38309 367180 466841 466841 1 SNRLEELVLENAGLR Unmodified 1711.9217 0.92169668 3341 Q5VZK9 LRRC16A Leucine-rich repeat-containing protein 16A yes yes 0 0 1 1 117.6 117.6 3 0.054179 120039 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.469 25.614 14206000 0 0 0 0 0 0 0 14206000 0 0 0 0 0 41056 3341 38310 367181 466842 466842 1 SNSLAFIK Unmodified 878.48617 0.48616764 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 53.945 53.945 2 0.020606 51635 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.478 20.452 198280000 0 64693000 0 0 0 0 0 95616000 0 37976000 0 0 0 41057 3053 38311 367182;367183;367184 466843;466844;466845 466844 3 SNSQENVEASHPSQDGK Unmodified 1812.7874 0.78744763 2873 Q02410;A0A0G2JMD7;A0A0D9SFA9 APBA1 Amyloid beta A4 precursor protein-binding family A member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 10.414 10.414 3 2.2594E-10 2929 QUIQUE_C1218_190116_001 114.29 104.89 81652000 32668000 0 0 23625000 13806000 0 0 0 0 11553000 0 0 0 41058 2873 38312 367185;367186;367187;367188 466846;466847;466848;466849 466846 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Elongation factor 2 yes yes 0 0 1 1 1 2 3 2 5 5 1 3 2 146.44 146.44 4 5.2517E-88 151332 QUIQUE_C1368_190116_001 142.05 134.49 1464500000 67050000 25363000 111980000 122940000 0 0 187220000 264700000 293740000 0 74174000 200920000 116410000 41064 2058 38317 367216;367217;367218;367219;367220;367221;367222;367223;367224;367225;367226;367227;367228;367229;367230;367231;367232;367233;367234;367235;367236;367237;367238;367239;367240 466882;466883;466884;466885;466886;466887;466888;466889;466890;466891;466892;466893;466894;466895;466896;466897;466898;466899;466900;466901;466902;466903;466904;466905;466906;466907;466908 466885 21 SNTHEFVNLVK Unmodified 1286.6619 0.66190017 1635 O75436;S4R3Q6 VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 42.403 42.403 2;3 0.0010576 38661 QUIQUE_C1438_190116_001 107.11 39.216 303100000 80424000 127120000 28901000 33110000 0 0 0 0 0 33548000 0 0 0 41065 1635 38318 367241;367242;367243;367244;367245;367246;367247 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467008 20 SNVDFVK Unmodified 807.41267 0.41266834 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 27.46 27.46 2 0.042242 20862 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.297 39.795 55912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 55912000 0 0 0 41072 335;1521 38324 367339 467024 467024 1 SNVDMDFEVENAVLGK Unmodified 1765.8193 0.81926503 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 0 1 125.02 125.02 2 1.2227E-07 121633 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.58 95.01 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41073 1785 38325 367340 467025 467025 1 SNVSDAVAQSTR Unmodified 1233.5949 0.59494282 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 1 24.965 24.965 2 9.6572E-28 22629 QUIQUE_C1403_190116_001 206.97 183.65 72777000000 6468300000 6429200000 6978600000 5551000000 5519900000 5115200000 5863400000 4302400000 5270900000 2745100000 7217600000 5676300000 5639300000 41074 2688 38326 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367375;367376;367377;367378;367379;367380;367381;367382;367383;367384;367385;367386;367387;367388;367389;367390;367391;367392;367393;367394;367395;367396;367397;367398;367399;367400 467072;467073;467074;467075;467076;467077;467078;467079;467080;467081;467082;467083;467084;467085;467086;467087;467088;467089;467090;467091;467092;467093;467094;467095;467096;467097;467098;467099;467100;467101;467102;467103;467104;467105;467106;467107;467108;467109;467110;467111 467098 40 SNYQLGELVK Unmodified 1149.603 0.60298831 4447 Q9UIA9;E7ESC6 XPO7 Exportin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 68.754 68.754 2 0.010033 69089 QUIQUE_C1218_190116_001 69.375 32.615 122510000 52173000 0 0 0 0 0 0 0 0 21532000 0 48802000 0 41079 4447 38331 367401;367402;367403;367404 467112;467113;467114;467115 467112 4 SNYSVSLVGPAPWGFR Acetyl (Protein N-term) 1777.8788 0.87876924 3865 Q96HC4;D6RAA1;A0A0D9SFW3;D6RGG6 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 159.29 159.29 2 2.4547E-10 163577 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138.93 138.93 3 0.0023469 144154 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.866 48.56 22329000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22329000 41082 2952 38334 367428 467140 467140 1 SPADKFPEK Unmodified 1017.5131 0.51311067 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 16.105 16.105 2 0.009167 8223 QUIQUE_C1403_190116_001 104.01 63.235 227230000 0 0 0 31289000 0 29453000 46672000 27265000 35612000 0 25430000 31508000 0 41083 2033 38335 367429;367430;367431;367432;367433;367434;367435 467141;467142;467143;467144;467145;467146;467147;467148;467149;467150;467151 467142 11 SPAEAATALASPK Unmodified 1212.635 0.63501672 265 A0A0D9SF30 NCAM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.597 43.597 2 5.1525E-17 41099 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.44 143.86 2155100000 141040000 104950000 149420000 208800000 231760000 107490000 163340000 154490000 235270000 36322000 181290000 136250000 304710000 41084 265 38336 367436;367437;367438;367439;367440;367441;367442;367443;367444;367445;367446;367447;367448 467152;467153;467154;467155;467156;467157;467158;467159;467160;467161;467162;467163;467164;467165;467166;467167 467162 14 SPAGLQVLNDYLADK Unmodified 1602.8253 0.82533668 2229 P24534;C9JZW3;F2Z2G2;F8WF65 EEF1B2 Elongation factor 1-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.8 125.8 2 2.0171E-94 123082 QUIQUE_DMIX4_190116_001 218.5 185.27 6803800000 706190000 620670000 664090000 589120000 611220000 476240000 476670000 340690000 384010000 236030000 626600000 529720000 542570000 41085 2229 38337 367449;367450;367451;367452;367453;367454;367455;367456;367457;367458;367459;367460;367461 467168;467169;467170;467171;467172;467173;467174;467175;467176;467177;467178;467179;467180;467181;467182;467183;467184;467185;467186;467187;467188;467189;467190;467191;467192;467193;467194;467195;467196;467197 467189 30 SPAGSIVHELNPNFQPPK Unmodified 1930.9901 0.9901106 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 3 2 2 2 3 1 3 2 3 3 1 2 2 86.506 86.506 2;3 4.4973E-202 89827 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0.61243078 1636 O75439 PMPCB Mitochondrial-processing peptidase subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 53.323 53.323 2 0.00073024 51459 QUIQUE_C1218_190116_001 96.668 66.414 54764000 54764000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41088 1636 38340 367492;367493 467237;467238 467237 2 SPAITATLEGK Unmodified 1086.5921 0.59208927 3664 Q8TBC4;F8W8D4 UBA3 NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 49.357 49.357 2 0.0046762 44309 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.706 44.149 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41089 3664 38341 367494 467239 467239 1 SPAKPVQTITPHGK Unmodified 1459.8147 0.81471242 3313 Q5T5C0;Q3B794 STXBP5 Syntaxin-binding protein 5 yes no 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 10.906 10.906 3;4 6.3812E-05 2875 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.078 63.115 186450000 2275400 0 31950000 4959300 14234000 0 23400000 8818100 32665000 0 29505000 14672000 23973000 41090 3313 38342 367495;367496;367497;367498;367499;367500;367501;367502;367503;367504;367505;367506;367507;367508;367509;367510 467240;467241;467242;467243;467244;467245;467246;467247;467248;467249;467250;467251;467252;467253;467254;467255;467256;467257;467258 467254 18 SPALAFSLAATAQAAPR Unmodified 1641.8839 0.88385462 3920 Q96PU8;H0YG47;H0YGD6 QKI Protein quaking yes no 0 0 0 1 133.91 133.91 3 0.058328 136646 QUIQUE_C1563_190116_001 23.36 4.5275 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41091 3920 38343 367511 467259 467259 1 SPALQILLTNTK Unmodified 1297.7606 0.76055158 1020 F5H8H2;Q03426;A0A1B0GWC2 MVK Mevalonate kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.163 97.163 2 9.07E-05 99421 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.07 137.27 263380000 29241000 39263000 0 22323000 36650000 0 33624000 28687000 32549000 12738000 0 28309000 0 41092 1020 38344 367512;367513;367514;367515;367516;367517;367518;367519;367520;367521;367522 467260;467261;467262;467263;467264;467265;467266;467267;467268;467269;467270;467271 467267 12 SPANYNTCTTCR Unmodified 1443.5871 0.58709702 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 18.953 18.953 2 3.1268E-46 11404 QUIQUE_C1277_190116_001 204.5 182.41 211600000 0 37869000 0 39706000 27436000 0 0 30015000 0 0 36946000 0 39629000 41093 4517 38345 367523;367524;367525;367526;367527;367528;367529 467272;467273;467274;467275;467276;467277;467278 467273 7 SPAPGSPDEEGGAEAPAAGIR Unmodified 1934.897 0.89699808 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.94 49.94 2 1.3946E-53 47522 QUIQUE_DMIX3_190116_001 206.06 191.03 454130000 25786000 35129000 44374000 28463000 27218000 40936000 0 34056000 71916000 15919000 43311000 48878000 38147000 41094 16;1475 38346 367530;367531;367532;367533;367534;367535;367536;367537;367538;367539;367540;367541 467279;467280;467281;467282;467283;467284;467285;467286;467287;467288;467289;467290 467286 12 SPAPPLLHVAALGQK Unmodified 1497.8667 0.86674799 3571 Q8N163;E5RFJ3;H0YC69;E5RGU7;H0YC58 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 72.898 72.898 2;3 0.00016771 73023 QUIQUE_C1277_190116_001 75.911 69.03 791910000 122330000 73720000 73311000 73136000 56664000 52058000 43240000 67541000 68072000 20616000 75298000 65932000 0 41095 3571 38347 367542;367543;367544;367545;367546;367547;367548;367549;367550;367551;367552;367553;367554;367555 467291;467292;467293;467294;467295;467296;467297;467298;467299;467300;467301;467302;467303;467304;467305 467293 12 SPAPSSDFADAITELEDAFSR Unmodified 2225.0124 0.012421765 60 A0A2R8Y7T6;A0A087WWK8;A0A3B3IRZ4;Q6DN90;A0A3B3IU98;A0A0C4DGT3;A0A2R8Y695 IQSEC1 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 171.77 171.77 2;3 1.8046E-112 175650 QUIQUE_DMIX7_190116_001 208.51 189.41 956720000 51058000 86948000 69720000 40527000 71279000 75318000 104590000 50198000 60501000 17753000 123510000 142270000 63059000 41096 60 38348 367556;367557;367558;367559;367560;367561;367562;367563;367564;367565;367566;367567;367568;367569;367570;367571;367572;367573;367574;367575;367576;367577;367578;367579;367580;367581;367582 467306;467307;467308;467309;467310;467311;467312;467313;467314;467315;467316;467317;467318;467319;467320;467321;467322;467323;467324;467325;467326;467327;467328;467329;467330;467331;467332;467333;467334;467335;467336;467337;467338;467339;467340 467335 35 SPAQILISLESEERGELER Unmodified 2155.1121 0.11207623 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304 DMD Dystrophin yes no 0 0 1 1 130.49 130.49 3 0.0038765 134972 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.883 35.629 56025000 0 0 0 0 0 0 0 0 56025000 0 0 0 0 41097 8 38349 367583 467341 467341 1 SPAQILLR Unmodified 896.54435 0.54435122 2076 P14550 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.984 53.984 2 6.8859E-11 51532 QUIQUE_C1563_190116_001 186.43 0 5037100000 378760000 409500000 371550000 397720000 389060000 392230000 355840000 331080000 448860000 148580000 530350000 379890000 503660000 41098 2076 38350 367584;367585;367586;367587;367588;367589;367590;367591;367592;367593;367594;367595;367596 467342;467343;467344;467345;467346;467347;467348;467349;467350;467351;467352;467353;467354;467355;467356;467357;467358;467359;467360;467361;467362;467363;467364;467365;467366;467367;467368;467369 467355 28 SPAQYQVVLSER Unmodified 1375.7096 0.70957864 3418 Q6XQN6 NAPRT Nicotinate phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 64.294 64.294 2 0.00081607 64619 QUIQUE_C1438_190116_001 101.93 76.543 167040000 0 0 0 0 167040000 0 0 0 0 0 0 0 0 41099 3418 38351 367597 467370 467370 1 SPASDTYIVFGEAK Unmodified 1483.7195 0.71947463 892 F8VZJ2;H0YHX9;Q13765;E9PAV3;F8W0W4;F8W1N5;F8VNW4 NACA Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha;Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 87.772 87.772 2;3 2.6554E-22 85191 QUIQUE_DMIX4_190116_001 163.45 129.48 703160000 17680000 0 0 10469000 0 0 0 0 175410000 111950000 182110000 0 205540000 41100 892 38352 367598;367599;367600;367601;367602;367603;367604 467371;467372;467373;467374;467375;467376;467377;467378;467379;467380 467375 10 SPAYTLVWTR Unmodified 1192.6241 0.6240581 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 91.823 91.823 2 5.2124E-05 88881 QUIQUE_DMIX4_190116_001 143.03 89.066 214590000 0 87045000 0 0 0 0 0 83537000 0 44010000 0 0 0 41101 2834 38353 367605;367606;367607;367608;367609 467381;467382;467383;467384;467385;467386 467385 6 SPCGLTEQYLHK Unmodified 1431.6816 0.68164933 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 49.964 49.964 2;3 0.00031286 47937 QUIQUE_C1277_190116_001 122.77 91.968 538070000 59896000 53775000 0 0 59888000 124760000 51037000 0 0 0 112210000 0 76502000 41102 921 38354 367610;367611;367612;367613;367614;367615;367616;367617;367618 467387;467388;467389;467390;467391;467392;467393;467394;467395 467388 6 SPCIVLADADLDNAVEFAHHGVFYHQGQCCIAASR Unmodified 3927.7879 0.78794545 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 2 3 2 1 2 126.42 126.42 4;5 1.664E-46 130097 QUIQUE_C1403_190116_001 104.98 99.82 1244000000 0 110840000 212700000 336990000 199740000 121930000 261840000 0 0 0 0 0 0 41103 1776 38355 367619;367620;367621;367622;367623;367624;367625;367626;367627;367628;367629 467396;467397;467398;467399;467400;467401;467402;467403;467404;467405;467406;467407;467408;467409;467410 467400 14 SPCPEAAAPPPGPR Unmodified 1402.6663 0.66633362 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.942 29.942 2 0.0014536 25309 QUIQUE_C1438_190116_001 75.197 61.504 295730000 0 0 51805000 0 48144000 54313000 60154000 0 38077000 0 0 0 43240000 41104 3452 38356 367630;367631;367632;367633;367634;367635 467411;467412;467413;467414;467415;467416 467412 6 SPCQTDVLR Unmodified 1074.5128 0.51279309 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 25.913 25.913 2 0.020743 19875 QUIQUE_C1576_190116_001 82.279 42.176 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41105 1452 38357 367636;367637;367638 467417;467418;467419 467418 3 SPCYGYQWVSEEHEEAHHTAYLVFSPSK Unmodified 3337.4775 0.4774768 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 98.555 98.555 4 1.0977E-08 102017 QUIQUE_C1277_190116_001 62.377 60.211 234590000 0 62464000 52331000 0 0 0 0 0 0 0 63205000 0 56591000 41106 1802 38358 367639;367640;367641;367642 467420;467421;467422;467423;467424 467420 5 SPDCTHDNPLETR Unmodified 1540.6576 0.65761943 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.528 27.528 2 0.00038821 21446 QUIQUE_C1368_190116_001 108.56 90.252 125940000 0 0 56195000 0 0 0 43047000 0 0 0 0 0 26696000 41107 1371 38359 367643;367644;367645;367646;367647;367648;367649;367650;367651 467425;467426;467427;467428;467429;467430;467431;467432;467433;467434 467427 10 SPDEAYAIAK Unmodified 1063.5186 0.51858998 445 A0A2R8YDQ9;A0A2R8Y6Y7;Q9P2R7;A0A2R8Y5P6;A0A2R8Y6E6;A0A0U1RQF8;A0A0U1RQU7;A0A2R8Y5P4 SUCLA2 Succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.493 34.493 2 5.3875E-12 29505 QUIQUE_C1563_190116_001 166.3 116.17 4409300000 440680000 340140000 313980000 0 439230000 325690000 443870000 298010000 396920000 0 511980000 406950000 491860000 41108 445 38360 367652;367653;367654;367655;367656;367657;367658;367659;367660;367661;367662;367663 467435;467436;467437;467438;467439;467440;467441;467442;467443;467444;467445;467446;467447 467440 12 SPDEEDYDYESYEK Unmodified 1767.6635 0.66353547 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.681 66.681 2 1.4009E-22 66473 QUIQUE_DMIX8_190116_001 184.55 181.43 1051400000 71124000 70618000 103460000 69457000 83334000 119890000 91376000 79535000 79699000 21227000 100600000 82708000 78336000 41109 2483 38361 367664;367665;367666;367667;367668;367669;367670;367671;367672;367673;367674;367675;367676 467448;467449;467450;467451;467452;467453;467454;467455;467456;467457;467458;467459;467460;467461;467462 467462 15 SPDFTNENPLETR Unmodified 1518.6951 0.69505079 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.126 79.126 2 1.5405E-31 79898 QUIQUE_C1368_190116_001 218.15 132.47 1460200000 129520000 149690000 235650000 173880000 167600000 124320000 0 77312000 114760000 44006000 0 90323000 153130000 41110 1872 38362 367677;367678;367679;367680;367681;367682;367683;367684;367685;367686;367687 467463;467464;467465;467466;467467;467468;467469;467470;467471;467472;467473;467474;467475;467476;467477;467478;467479;467480;467481;467482;467483 467468 21 SPDLLMYQGPPDTAEIIK Unmodified 1986.9972 0.99722939 2820 P82909 MRPS36 28S ribosomal protein S36, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 128.22 128.22 2 0.014884 132547 QUIQUE_C1218_190116_001 45.115 37.702 51960000 51960000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41111 2820 38363 367688 467484 467484 1 SPDMLAHFR Unmodified 1072.5124 0.51239916 1548 O43747;H3BNR4 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 53.433 53.433 3 0.00019296 50996 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.431 76.653 178350000 65889000 66559000 0 0 0 0 0 33235000 0 12672000 0 0 0 41112 1548 38364 367689;367690;367691;367692;367693;367694 467485;467486;467487;467488;467489;467490 467489 6 SPDMLAHFR Oxidation (M) 1088.5073 0.50731378 1548 O43747;H3BNR4 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 1 0 1 32.923 32.923 3 0.023867 28088 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.203 30.434 14268000 0 0 0 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QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.182 89.228 108400000 65301000 0 0 0 0 0 0 0 0 43101000 0 0 0 41115 2758;2789 38366 367707;367708 467504;467505 467505 2185 2 SPDTNYLFMGDYVDR Unmodified 1791.7774 0.77740021 2758;2789 P62714;E5RHC1;E7ESG8;E5RFI3;E5RHP4;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 124.31 124.31 2 6.6458E-44 130568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.48 188.94 3229400000 378220000 346890000 357590000 329060000 243730000 328730000 255290000 240340000 209030000 123260000 157590000 259660000 0 41116 2758;2789 38366 367709;367710;367711;367712;367713;367714;367715;367716;367717;367718;367719;367720;367721;367722;367723 467506;467507;467508;467509;467510;467511;467512;467513;467514;467515;467516;467517;467518;467519;467520;467521;467522;467523;467524;467525;467526;467527;467528;467529;467530 467526 25 SPDTSLLLPDLLPMTDPFGSTSDAVIEK Unmodified 2958.4784 0.47837123 3212 Q2M2I8 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 170.22 170.22 3 3.7759E-15 171557 QUIQUE_C1563_190116_001 77.907 72.641 185830000 49442000 0 0 41250000 25146000 44271000 0 25719000 0 0 0 0 0 41117 3212 38367 367724;367725;367726;367727;367728 467531;467532;467533;467534;467535;467536 467534 4 SPDVGLYGVIPECGETYHSDLAEAK Unmodified 2706.2483 0.24831171 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 108.75 108.75 3 8.4889E-15 112853 QUIQUE_C1368_190116_001 92.147 88.05 45055000 0 0 45055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41118 2487 38368 367729 467537 467537 1 SPDVISSASTALSQDIPEIASEALSR Unmodified 2643.3239 0.3239195 3379 Q6P2E9 EDC4 Enhancer of mRNA-decapping protein 4 yes yes 0 0 0 1 166.37 166.37 3 0.0082462 168251 QUIQUE_C1563_190116_001 15.297 7.5847 22131000 0 0 0 0 0 22131000 0 0 0 0 0 0 0 41119 3379 38369 367730 467538 467538 1 SPEACCELTLQPLR Unmodified 1672.7913 0.79127614 1897 P06132;A0A1B0GVZ4;A0A1B0GVN9;H0Y5R6 UROD Uroporphyrinogen decarboxylase yes no 0 0 0 1 1 1 85.017 85.017 2 2.9125E-05 86422 QUIQUE_C1403_190116_001 119.45 94.012 128120000 0 38196000 40535000 49390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41120 1897 38370 367731;367732;367733 467539;467540;467541;467542 467542 4 SPEDPQVLDNFLQVLIK Unmodified 1954.0411 0.041143118 3113 Q15120 PDK3 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 168.73 168.73 2;3 6.3367E-23 162608 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.26 130.73 206940000 0 0 0 20919000 0 122280000 0 0 35773000 27971000 0 0 0 41121 3113 38371 367734;367735;367736;367737 467543;467544;467545;467546 467546 4 SPEEGAETPVYLALLPPDAEGPHGQFVSEK Unmodified 3163.535 0.53497491 2102 P16152 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes yes 0 0 0 3 3 3 3 3 3 2 2 3 3 2 2 3 130.52 130.52 2;3;4 1.9891E-136 134987 QUIQUE_DMIX8_190116_001 262.25 245.76 29917000000 1678300000 2378800000 2046500000 2540600000 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367788;367789;367790;367791;367792 467622;467623;467624;467625;467626 467624 5 SPEEWPNLAYWFIQHK Unmodified 2043.9843 0.98429694 2853 Q01432;E9PKC5 AMPD3 AMP deaminase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 150.5 150.5 3 0.00012964 153192 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.69 57.48 154450000 12060000 13996000 0 17638000 0 0 25499000 24641000 31065000 0 0 29553000 0 41126 2853 38376 367793;367794;367795;367796;367797;367798;367799 467627;467628;467629;467630;467631;467632;467633 467631 7 SPEFTHENPLETR Unmodified 1555.7267 0.72668527 590 B1AKY9;P50993 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 1 2 1 3 1 2 2 2 51.197 51.197 2;3 2.7388E-14 49932 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.87 132.97 2114000000 197860000 102650000 177920000 165450000 134240000 89017000 143400000 169520000 186010000 43111000 348970000 124860000 231030000 41127 590 38377 367800;367801;367802;367803;367804;367805;367806;367807;367808;367809;367810;367811;367812;367813;367814;367815;367816;367817;367818;367819;367820;367821;367822 467634;467635;467636;467637;467638;467639;467640;467641;467642;467643;467644;467645;467646;467647;467648;467649;467650;467651;467652;467653;467654;467655;467656;467657;467658;467659;467660;467661;467662;467663;467664;467665;467666;467667 467652 33 SPEKIEEVLSPEGSPSK Unmodified 1811.9153 0.9152739 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 58.182 58.182 2;3 7.9936E-37 57494 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.2 127.81 1666200000 0 78023000 0 0 70928000 0 0 302690000 400630000 0 126530000 286800000 400630000 41128 4418 38378 367823;367824;367825;367826;367827;367828;367829;367830;367831;367832;367833 467668;467669;467670;467671;467672;467673;467674;467675;467676;467677;467678;467679;467680;467681;467682;467683 467674 12 SPELAAQPSTYLAVAEELADVSGK Unmodified 2445.2275 0.22749992 3626 Q8NBN7 RDH13 Retinol dehydrogenase 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 162.22 162.22 2;3 2.8285E-26 166946 QUIQUE_DMIX3_190116_001 169.64 156.54 247700000 17586000 22025000 25990000 19355000 17955000 0 0 16749000 53815000 0 0 0 74221000 41129 3626 38379 367834;367835;367836;367837;367838;367839;367840;367841;367842;367843;367844 467684;467685;467686;467687;467688;467689;467690;467691;467692;467693;467694 467691 9 SPELVQAMFPK Unmodified 1245.6427 0.64274463 4392 Q9UBB4;A0A1W2PQD2 ATXN10 Ataxin-10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.194 98.194 2 0.0013421 99624 QUIQUE_C1563_190116_001 98.249 84.556 217170000 0 34074000 68668000 46941000 21679000 45808000 0 0 0 0 0 0 0 41130 4392 38380 367845;367846;367847;367848;367849 467695;467696;467697;467698;467699;467700 467700 2 SPEPEATLTFPFLDK Unmodified 1690.8454 0.84540342 4520 Q9UPQ0;E7EPK0;E9PDJ9;H0Y8P3;G5EA03 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 138.62 138.62 2 0.011746 142066 QUIQUE_C1403_190116_001 52.555 36.301 49453000 16158000 0 0 33295000 0 0 0 0 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Synapsin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.59 54.59 3 2.8285E-128 52341 QUIQUE_C1368_190116_001 153.82 146.71 312280000 40910000 41292000 42076000 50715000 26586000 36754000 40161000 0 0 0 33788000 0 0 41157 1471 38406 367993;367994;367995;367996;367997;367998;367999;368000 467864;467865;467866;467867;467868;467869;467870;467871 467866 7 SPGQLQRPTGVAVHPSGDIIIADYDNK Unmodified 2847.4515 0.45152005 4091 Q9C040 TRIM2 Tripartite motif-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 81.003 81.003 3;4 6.9459E-37 81886 QUIQUE_DMIX7_190116_001 128.55 110.46 3291700000 99748000 281520000 225290000 193460000 198340000 100720000 254380000 225540000 399680000 55621000 399770000 443680000 413930000 41158 4091 38407 368001;368002;368003;368004;368005;368006;368007;368008;368009;368010;368011;368012;368013;368014;368015;368016;368017;368018;368019;368020;368021;368022;368023 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P51398;V9GZ03;V9GYJ9;V9GYL9;V9GZ61;V9GYC9;V9GYA7;V9GYW1 DAP3 28S ribosomal protein S29, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 96.528 96.528 3 0.0028648 98911 QUIQUE_C1368_190116_001 53.981 42.926 39378000 0 0 31929000 0 0 0 0 0 0 7449000 0 0 0 41167 2579 38416 368086;368087 467990;467991 467990 1 SPIATIR Unmodified 756.44939 0.4493882 498 A0A3B3IT47;Q9Y2I8 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 27.277 27.277 2 0.021491 17097 QUIQUE_DMIX5_190116_001 104.8 53.944 153460000 0 0 0 59121000 0 0 0 0 0 0 94339000 0 0 41168 498 38417 368088;368089 467992;467993 467993 2 SPIFFNYLYSPLEIEALKPNVNVSSLK Unmodified 3081.6427 0.64267486 3507 Q86WG5 SBF2 Myotubularin-related protein 13 yes yes 0 0 1 1 160.21 160.21 3 4.9016E-12 164660 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.934 58.876 56365000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56365000 0 41169 3507 38418 368090 467994 467994 1 SPIFLQFIDCVWQMSK Unmodified 1997.9743 0.97432588 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 0 0 1 173.82 173.82 2 1.3566E-05 177554 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.101 72.561 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41170 3003 38419 368091 467995 467995 1 SPIIFIGTGEHIDDFEPFK Unmodified 2161.0732 0.073171528 1085 G3V4F7;P61011 SRP54 Signal recognition particle 54 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.65 139.65 3 0.0016975 136093 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.392 41.898 559440000 46788000 55139000 0 52384000 29049000 42286000 38577000 51509000 57136000 23674000 60167000 57199000 45537000 41171 1085 38420 368092;368093;368094;368095;368096;368097;368098;368099;368100;368101;368102;368103 467996;467997;467998;467999;468000;468001;468002;468003;468004;468005;468006;468007;468008 468005 10 SPILLGSLAHQIYR Unmodified 1566.8882 0.88821171 2338 P31937 HIBADH 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 99.54 99.54 2;3 2.1293E-14 102128 QUIQUE_C1277_190116_001 141.58 118.11 4457500000 193660000 227130000 337040000 332460000 442610000 308700000 408310000 203840000 365450000 125670000 501020000 486180000 525480000 41172 2338 38421 368104;368105;368106;368107;368108;368109;368110;368111;368112;368113;368114;368115;368116;368117;368118;368119;368120;368121;368122;368123;368124;368125;368126;368127;368128;368129 468009;468010;468011;468012;468013;468014;468015;468016;468017;468018;468019;468020;468021;468022;468023;468024;468025;468026;468027;468028;468029;468030;468031;468032;468033;468034;468035;468036 468011 27 SPILVATAVAAR Unmodified 1167.6976 0.69755739 266;1504 A0A2R8Y5G6;A0A0D9SFB3;A0A2R8YF78;A0A2R8YCW1;A0A0D9SG12;A0A2R8YFR4;A0A2U3TZJ9;A0A2R8YFS5;A0A2R8Y4A4;A0A2R8Y645;A0A0D9SF53;O00571;A0A2R8YDT5;A0A2R8Y7T2;F6S8Q4;A0A0J9YVQ7;A0A087WVZ1;O15523 DDX3X;DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.059 70.059 2 0.00073346 70384 QUIQUE_C1576_190116_001 110.53 70.466 1735000000 129940000 119840000 143370000 151150000 123340000 112230000 163410000 122010000 135390000 71127000 186230000 138790000 138210000 41173 266;1504 38422 368130;368131;368132;368133;368134;368135;368136;368137;368138;368139;368140;368141;368142;368143 468037;468038;468039;468040;468041;468042;468043;468044;468045;468046;468047;468048;468049;468050;468051;468052 468045 14 SPISTDECSIQELEQK Unmodified 1862.8568 0.85677275 4539 Q9Y250 LZTS1 Leucine zipper putative tumor suppressor 1 yes yes 0 0 0 1 85.377 85.377 2 5.6834E-18 86645 QUIQUE_C1403_190116_001 151.98 138.01 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41174 4539 38423 368144 468053 468053 1 SPITGNDLSPPVSFNLMFK Unmodified 2063.0398 0.03976291 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 146.99 146.99 2;3 6.0645E-219 151503 QUIQUE_C1403_190116_001 262.64 234.95 516470000 0 86662000 84535000 65142000 0 0 0 76171000 99179000 0 0 0 104780000 41175 2440 38424 368145;368146;368147;368148;368149;368150;368151;368152 468054;468055;468056;468057;468058;468059;468060;468061;468062;468063 468057 10 SPKPVKPVEDEDEAGLQK Unmodified 1965.0055 0.0054858935 2914 Q08174 PCDH1 Protocadherin-1 yes yes 0 0 2 1 22.517 22.517 3 0.0023311 16115 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.253 52.939 40953000 0 0 0 0 0 0 0 40953000 0 0 0 0 0 41176 2914 38425 368153 468064 468064 1 SPLAGDFISMQCR Unmodified 1480.6803 0.68026913 1686 O94805 ACTL6B Actin-like protein 6B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 96.069 96.069 2 3.6446E-10 98306 QUIQUE_C1277_190116_001 168.79 154.98 165570000 36556000 38200000 0 51149000 0 0 0 0 0 0 0 39664000 0 41177 1686 38426 368154;368155;368156;368157 468065;468066;468067;468068;468069;468070 468067 6 SPLAQMEEER Oxidation (M) 1204.5394 0.53940177 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2 SEPT7 Septin-7 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.541 19.541 2 0.0020244 11928 QUIQUE_DMIX8_190116_001 94.409 73.784 1191100000 158420000 228830000 243830000 0 0 207090000 0 62763000 0 0 120490000 72528000 97184000 41178 3171 38427 368158;368159;368160;368161;368162;368163;368164;368165;368166 468071;468072;468073;468074;468075;468076;468077;468078;468079 468079 2607 9 SPLAQMEEER Unmodified 1188.5445 0.54448715 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2 SEPT7 Septin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.19 48.19 2 6.0668E-12 45402 QUIQUE_C1368_190116_001 166.07 142.99 2130800000 263740000 210390000 269890000 210190000 136600000 263130000 234930000 74443000 104070000 99602000 157610000 106160000 0 41179 3171 38427 368167;368168;368169;368170;368171;368172;368173;368174;368175;368176;368177;368178 468080;468081;468082;468083;468084;468085;468086;468087;468088;468089;468090;468091;468092;468093;468094;468095;468096;468097 468085 18 SPLAQMEEERR Oxidation (M) 1360.6405 0.6405128 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2 SEPT7 Septin-7 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.668 14.668 2;3 0.00063934 6806 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.525 68.121 3913000000 295090000 0 471700000 227840000 461670000 470120000 71944000 336650000 546110000 194780000 837070000 0 0 41180 3171 38428 368179;368180;368181;368182;368183;368184;368185;368186;368187;368188 468098;468099;468100;468101;468102;468103;468104;468105;468106;468107 468105 2607 9 SPLAQMEEERR Unmodified 1344.6456 0.64559818 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4;A0A0U1RRM2 SEPT7 Septin-7 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 33.075 33.075 2;3 5.7112E-70 28304 QUIQUE_C1218_190116_001 224.58 208.37 14603000000 628090000 1144200000 1704700000 1135900000 884600000 853200000 1148800000 1140800000 1260300000 371450000 1590800000 1222600000 1517300000 41181 3171 38428 368189;368190;368191;368192;368193;368194;368195;368196;368197;368198;368199;368200;368201;368202;368203;368204;368205;368206;368207;368208;368209;368210;368211;368212;368213;368214 468108;468109;468110;468111;468112;468113;468114;468115;468116;468117;468118;468119;468120;468121;468122;468123;468124;468125;468126;468127;468128;468129;468130;468131;468132;468133;468134;468135;468136;468137;468138;468139;468140;468141;468142;468143;468144;468145;468146;468147 468109 40 SPLDGAMVVAASSVQGFSTVWQGLECAAK Unmodified 2965.4314 0.43137823 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1504.7596 0.7595653 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.37 117.37 2 0.0012786 121674 QUIQUE_C1368_190116_001 80.834 73.185 3569100000 194090000 226370000 426790000 240580000 247080000 377500000 278950000 274330000 238010000 95033000 375220000 281070000 314070000 41188 1665 38434 368238;368239;368240;368241;368242;368243;368244;368245;368246;368247;368248;368249;368250 468173;468174;468175;468176;468177;468178;468179;468180;468181;468182;468183;468184;468185;468186;468187;468188;468189 468175 16 SPLIIFSDCDMNNAVK Oxidation (M) 1838.8543 0.85427033 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.06 100.06 2 3.3877E-06 102990 QUIQUE_C1277_190116_001 107.03 90.494 1435500000 81257000 150650000 184230000 134690000 145400000 0 0 165220000 187620000 0 0 201170000 185270000 41189 2522 38435 368251;368252;368253;368254;368255;368256;368257;368258;368259 468190;468191;468192;468193;468194;468195;468196;468197;468198;468199;468200 468192 1949 9 SPLIIFSDCDMNNAVK Unmodified 1822.8594 0.8593557 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.02 117.02 2 6.9195E-66 120697 QUIQUE_DMIX3_190116_001 196.24 181.68 7312700000 436340000 631330000 734110000 612460000 536390000 567970000 621660000 551890000 433610000 204260000 679010000 586190000 717510000 41190 2522 38435 368260;368261;368262;368263;368264;368265;368266;368267;368268;368269;368270;368271;368272 468201;468202;468203;468204;468205;468206;468207;468208;468209;468210;468211;468212;468213;468214;468215;468216;468217;468218;468219 468214 19 SPLMSEFQSQISSNPELAAIFESIQK Oxidation (M) 2896.4164 0.41643968 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.55 166.55 3 6.1183E-70 168257 QUIQUE_C1563_190116_001 161.04 154.24 1812400000 113680000 119320000 233170000 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4 yes no 0 0 0 1 32.066 32.066 2 0.06245 25922 QUIQUE_DMIX4_190116_001 54.157 1.4411 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41196 1124 38440 368310 468260 468260 1 SPLTAASPGELPTEGAGPDVVEDISHLLADVAR Unmodified 3283.6572 0.65721531 1334 K7ES98;K7EM85;Q92619;K7EQA4 HMHA1 Minor histocompatibility protein HA-1;Minor histocompatibility antigen HA-1 yes no 0 0 0 1 169.45 169.45 3 8.6407E-46 176772 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.43 98.054 45904000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45904000 0 0 41197 1334 38441 368311 468261 468261 1 SPLTICFPEYTGPNTYEDAAAYIQAQFESK Unmodified 3410.5653 0.56528876 1963 P09471;A0A1W2PP38;A0A1W2PQ24;H3BNR5 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 0 2 1 1 3 1 4 2 2 1 3 2 1 168.45 168.45 2;3 7.4955E-278 175515 QUIQUE_DMIX5_190116_001 328.07 312.65 5584600000 91893000 264960000 229270000 0 358360000 212830000 742710000 496130000 1090200000 16769000 1323200000 711120000 47205000 41198 1963 38442 368312;368313;368314;368315;368316;368317;368318;368319;368320;368321;368322;368323;368324;368325;368326;368327;368328;368329;368330;368331;368332;368333;368334 468262;468263;468264;468265;468266;468267;468268;468269;468270;468271;468272;468273;468274;468275;468276;468277;468278;468279;468280;468281;468282;468283;468284 468280 21 SPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNK Unmodified 3744.66 0.65999378 2779 P63096 GNAI1 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.34 169.34 3 5.2664E-103 176664 QUIQUE_DMIX5_190116_001 171.31 166.5 767950000 0 0 42653000 0 67670000 32500000 74702000 30989000 58582000 0 167520000 191870000 101460000 41199 2779 38443 368335;368336;368337;368338;368339;368340;368341;368342;368343 468285;468286;468287;468288;468289;468290;468291;468292;468293;468294 468292 10 SPLTICYPEYAGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNKR Unmodified 3900.7611 0.76110481 2779 P63096 GNAI1 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 yes yes 0 0 1 1 165.95 165.95 3 8.4899E-58 171295 QUIQUE_C1576_190116_001 129.01 119.08 48299000 0 0 0 0 0 0 48299000 0 0 0 0 0 0 41200 2779 38444 368344 468295 468295 1 SPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNR Unmodified 3802.6767 0.67670648 1953 P08754 GNAI3 Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 169.14 169.14 3 4.9759E-64 173616 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.46 130.83 171490000 0 0 0 0 31273000 0 0 50293000 47359000 0 0 0 42566000 41201 1953 38445 368345;368346;368347;368348 468296;468297;468298;468299 468298 4 SPLTQEQLIPNLAMK Unmodified 1681.9073 0.90729217 4509 Q9UNE7;H3BTA3 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.52 115.52 2 2.5777E-54 119206 QUIQUE_DMIX8_190116_001 194.17 179.93 658580000 62296000 56900000 0 55062000 52823000 52855000 72783000 64247000 0 0 94948000 63188000 83482000 41202 4509 38446 368349;368350;368351;368352;368353;368354;368355;368356;368357;368358 468300;468301;468302;468303;468304;468305;468306;468307;468308;468309;468310 468310 11 SPLTYGVGVLNR Unmodified 1274.6983 0.69828568 1521;335;3282 A0A1B0GTF3;O43301;Q5JX83;Q96MM6 HSPA12A;HSPA12B Heat shock 70 kDa protein 12A;Heat shock 70 kDa protein 12B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.002 88.002 2 1.2883E-54 91505 QUIQUE_C1218_190116_001 208.25 172.8 3061200000 324730000 339060000 266030000 218670000 288350000 208300000 294340000 176050000 176840000 120830000 205940000 229140000 212880000 41203 335;1521;3282 38447 368359;368360;368361;368362;368363;368364;368365;368366;368367;368368;368369;368370;368371 468311;468312;468313;468314;468315;468316;468317;468318;468319;468320;468321;468322;468323;468324;468325;468326;468327;468328;468329;468330;468331;468332;468333;468334;468335;468336;468337;468338;468339;468340 468311 30 SPLVAAMQHFLPVLK Unmodified 1649.9327 0.93271906 1727 O95373;E9PLB2 IPO7 Importin-7 yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 141.41 141.41 2;3 2.8423E-25 146352 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SPLVMDVLNIQGVQR Unmodified 1667.9029 0.9028755 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 3 2 2 1 3 2 2 132.17 132.17 2;3 2.6097E-29 136637 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.63 144.24 770370000 0 0 20133000 57909000 0 44054000 57307000 109940000 134370000 11501000 156550000 95614000 83006000 41206 3053 38450 368404;368405;368406;368407;368408;368409;368410;368411;368412;368413;368414;368415;368416;368417;368418;368419;368420;368421;368422;368423;368424 468384;468385;468386;468387;468388;468389;468390;468391;468392;468393;468394;468395;468396;468397;468398;468399;468400;468401;468402;468403;468404;468405;468406;468407;468408 468395 23 SPLVMDVLNIQGVQR Oxidation (M) 1683.8978 0.89779012 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 1 0 2 1 2 2 1 2 110.43 110.43 2 8.4555E-09 113592 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.34 112.43 347870000 0 0 0 0 0 0 0 63889000 44489000 31383000 86368000 47961000 73786000 41207 3053 38450 368425;368426;368427;368428;368429;368430;368431;368432;368433;368434 468409;468410;468411;468412;468413;468414;468415;468416;468417;468418 468411 2506 9 SPNCQGLMHLQGK Unmodified 1468.6915 0.69150251 3413 Q6UXN9;C9JBU3;C9J355 WDR82 WD repeat-containing protein 82 yes no 0 0 0 1 34.772 34.772 3 0.019229 29774 QUIQUE_C1563_190116_001 29.809 17.249 22706000 0 0 0 0 0 22706000 0 0 0 0 0 0 0 41208 3413 38451 368435 468419 468419 1 SPNDFALWK Unmodified 1076.5291 0.52909508 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 90.289 90.289 2 0.018213 93946 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.305 60.886 46016000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46016000 0 0 41209 617 38452 368436 468420 468420 0 SPNEEYVEVGR Unmodified 1277.5888 0.58879481 2330 P31321;H7BYW5 PRKAR1B cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 41.109 41.109 2 0.011559 37282 QUIQUE_C1277_190116_001 79.659 59.139 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41210 2330 38453 368437;368438;368439;368440 468421;468422;468423;468424 468421 4 SPNELVDDLFK Unmodified 1275.6347 0.63468237 4516 Q9UNZ2;F2Z2K0 NSFL1C NSFL1 cofactor p47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.83 123.83 2 6.4831E-05 126761 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.86 110.3 655840000 0 126680000 0 111590000 104320000 92048000 114630000 106570000 0 0 0 0 0 41211 4516 38454 368441;368442;368443;368444;368445;368446;368447;368448 468425;468426;468427;468428;468429;468430;468431;468432;468433;468434;468435 468434 11 SPNLDLVETEIK Unmodified 1356.7137 0.71366097 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 93.485 93.485 2 0.00059056 95551 QUIQUE_C1277_190116_001 92.112 66.538 149220000 54461000 49339000 0 0 0 0 0 0 0 0 45415000 0 0 41212 4148 38455 368449;368450;368451;368452;368453 468436;468437;468438;468439;468440 468437 5 SPNLDLVETEIKELILDIK Unmodified 2181.2144 0.21441604 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 170.51 170.51 3 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468446;468447;468448;468449;468450;468451;468452;468453;468454;468455;468456;468457;468458;468459;468460;468461;468462;468463;468464;468465 468450 20 SPPFFENLTLDLQPPK Unmodified 1841.9564 0.95635086 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 2 3 2 2 3 3 3 2 3 3 2 4 2 147.8 147.8 2;3 2.1156E-24 143827 QUIQUE_DMIX4_190116_001 153.38 107.5 1217300000 56484000 76335000 30771000 28967000 104920000 65401000 177450000 86596000 98154000 46424000 127810000 182830000 135190000 41216 2180 38459 368474;368475;368476;368477;368478;368479;368480;368481;368482;368483;368484;368485;368486;368487;368488;368489;368490;368491;368492;368493;368494;368495;368496;368497;368498;368499;368500;368501;368502;368503;368504;368505;368506;368507 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cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 36.694 36.694 2 0.0051386 33052 QUIQUE_C1438_190116_001 69.672 40.945 111720000 0 0 0 0 58801000 0 0 0 0 0 52916000 0 0 41229 66 38472 368615;368616 468662;468663;468664 468663 3 SPPYTAFLGNLPYDVTEESIKEFFR Unmodified 2919.4331 0.43307602 888 E7EX17;P23588;F8VP89;F8VSC7;F8VX11;F8W0K0;F8VRU1;F8VYE9 EIF4B Eukaryotic translation initiation factor 4B yes no 0 0 1 1 1 1 1 169.32 169.32 3 2.3041E-36 176565 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.41 127.25 532970000 0 0 0 0 26240000 0 0 0 67063000 0 168190000 271470000 0 41230 888 38473 368617;368618;368619;368620 468665;468666;468667;468668 468667 3 SPQAQEAPVNIDEGLTGCTIQLLPAQDK Unmodified 2992.4812 0.4811652 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 133.51 133.51 3 0.0034029 140083 QUIQUE_C1438_190116_001 30.273 24.37 30548000 0 0 0 0 30548000 0 0 0 0 0 0 0 0 41231 921 38474 368621 468669 468669 1 SPQESLSDLGAIESLR Unmodified 1700.8581 0.85809337 3890 Q96JG6;C9JA29;F8WDT1;F2Z3F0;A0A3B3IRQ5 CCDC132 Coiled-coil domain-containing protein 132 yes no 0 0 0 1 1 118.43 118.43 2 6.2688E-07 120724 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.97 117.76 36748000 0 0 0 0 0 0 0 36748000 0 0 0 0 0 41232 3890 38475 368622;368623 468670;468671 468670 2 SPQETYDVYCYVDHLDGDVFHLTVPSK Unmodified 3183.4495 0.44953072 912;826 E9PF17;P13611;Q86W61;D6RGZ6 VCAN Versican core protein no no 0 0 0 3 3 5 2 2 2 4 2 3 3 3 4 3 144.79 144.79 3;4 3.109E-144 151282 QUIQUE_DMIX3_190116_001 202.98 195.97 50151000000 3960000000 982270000 6152400000 4900000000 955950000 4402400000 7577100000 1016000000 5530600000 1655100000 1477600000 6223700000 5317800000 41233 912;826 38476 368624;368625;368626;368627;368628;368629;368630;368631;368632;368633;368634;368635;368636;368637;368638;368639;368640;368641;368642;368643;368644;368645;368646;368647;368648;368649;368650;368651;368652;368653;368654;368655;368656;368657;368658;368659;368660;368661;368662 468672;468673;468674;468675;468676;468677;468678;468679;468680;468681;468682;468683;468684;468685;468686;468687;468688;468689;468690;468691;468692;468693;468694;468695;468696;468697;468698;468699;468700;468701;468702;468703;468704;468705;468706;468707;468708;468709;468710;468711;468712;468713;468714;468715;468716;468717;468718;468719;468720;468721;468722;468723;468724;468725 468710 54 SPQGLELALPSR Unmodified 1266.6932 0.6932003 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 85.389 85.389 2 0.0036153 86547 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.49 89.722 212340000 52319000 15312000 31645000 24076000 0 26518000 34645000 0 0 0 0 0 27828000 41234 1255;2856 38477 368663;368664;368665;368666;368667;368668;368669;368670 468726;468727;468728;468729;468730;468731;468732;468733 468733 0 SPQGLGAFTPVVR Unmodified 1327.7248 0.72483478 2987 Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.647 85.647 2 0.00037312 88098 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.345 66.831 676190000 82355000 47678000 0 62648000 79066000 0 75140000 31512000 72875000 0 62402000 60590000 101920000 41235 2987 38478 368671;368672;368673;368674;368675;368676;368677;368678;368679;368680;368681 468734;468735;468736;468737;468738;468739;468740;468741;468742;468743;468744;468745;468746 468743 11 SPQGLGASTAEISAR Unmodified 1443.7318 0.73177065 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.052 49.052 2 6.6271E-36 45898 QUIQUE_C1368_190116_001 175.21 143.34 830950000 60290000 83120000 72553000 55572000 73872000 73207000 60067000 59084000 60065000 36627000 79321000 51541000 65628000 41236 987 38479 368682;368683;368684;368685;368686;368687;368688;368689;368690;368691;368692;368693;368694 468747;468748;468749;468750;468751;468752;468753;468754;468755;468756;468757;468758;468759;468760 468750 14 SPQHFHRPGNEPSSGR Unmodified 1788.8404 0.84042667 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 1 1 10.377 10.377 4 0.0047468 2765 QUIQUE_C1563_190116_001 40.493 30.963 2601600 0 0 0 0 0 2601600 0 0 0 0 0 0 0 41237 151 38480 368695 468761 468761 1 SPQMVSAIVR Unmodified 1086.5856 0.5855641 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.271 53.271 2 1.8659E-05 50717 QUIQUE_C1563_190116_001 147.2 55.881 1821000000 189930000 187340000 219210000 222550000 181370000 148820000 0 112150000 0 67413000 189700000 154010000 148490000 41238 425 38481 368696;368697;368698;368699;368700;368701;368702;368703;368704;368705;368706;368707 468762;468763;468764;468765;468766;468767;468768;468769;468770;468771;468772;468773;468774 468768 10 SPQMVSAIVR Oxidation (M) 1102.5805 0.58047873 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 1 0 1 1 1 31.086 31.086 2 0.0035324 26401 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.898 26.824 281900000 0 0 0 0 0 0 0 0 144680000 0 137210000 0 0 41239 425 38481 368708;368709;368710 468775;468776;468777 468775 307 3 SPQPQLLSNK Unmodified 1110.6033 0.60332266 3100 Q15031;E9PHM2;A0A2R8Y581 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 29.83 29.83 2 0.068193 24809 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.022 27.926 45947000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45947000 41240 3100 38482 368711 468778 468778 1 SPQQVLPSPDGR Unmodified 1279.6521 0.65206377 2198 P22570;A0A0A0MTN9;A0A0C4DFN8;A0A0A0MSZ4;A0A0A0MT64;A0A0A0MTR6;A0A0C4DGN7;J3QQX3 FDXR NADPH:adrenodoxin oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 43.151 43.151 2 0.021765 40719 QUIQUE_C1438_190116_001 70.675 51.419 128960000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 128960000 41241 2198 38483 368712;368713 468779;468780 468779 2 SPQTPELVSALTFR Unmodified 1544.8199 0.81985737 1054 F8W881;Q9NX05 FAM120C Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 117.64 117.64 2 0.0010593 122698 QUIQUE_C1218_190116_001 78.903 63.012 70562000 17019000 0 0 0 0 0 29060000 0 0 0 0 24483000 0 41242 1054 38484 368714;368715;368716;368717 468781;468782;468783;468784;468785 468781 5 SPQVLYSPVSPLSPHR Unmodified 1762.9366 0.93661847 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 76.109 76.109 3 0.036421 75922 QUIQUE_DMIX1_190116_001 19.934 12.703 24172000 0 0 0 0 0 0 0 24172000 0 0 0 0 0 41243 4517 38485 368718 468786 468786 1 SPQYCQVIHR Unmodified 1286.619 0.6189895 2978 Q13228;A6PVX1;F2Z2W8;F8WCR4;C9JVL0 SELENBP1 Selenium-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 29.104 29.104 2;3 0.0017479 23464 QUIQUE_C1403_190116_001 135.43 119.89 8302700000 173390000 584350000 871940000 847010000 186420000 772860000 579400000 663270000 822660000 337670000 832010000 560850000 1070900000 41244 2978 38486 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158.64 1722800000 180980000 195920000 157720000 154930000 133620000 178790000 162630000 174220000 148720000 50122000 22663000 143290000 19168000 41246 890;3052 38488 368743;368744;368745;368746;368747;368748;368749;368750;368751;368752;368753;368754;368755;368756;368757;368758;368759;368760;368761;368762;368763;368764 468813;468814;468815;468816;468817;468818;468819;468820;468821;468822;468823;468824;468825;468826;468827;468828;468829;468830;468831;468832;468833;468834;468835;468836;468837;468838;468839;468840;468841;468842;468843;468844;468845 468823 29 SPSAQLMEQVAQLK Oxidation (M) 1544.7868 0.78684269 3052;890 E7EX90;E7EWF7;Q14203 DCTN1 Dynactin subunit 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.382 75.382 2 3.5639E-10 76160 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.17 104.31 192100000 0 0 27473000 23759000 0 30171000 0 32489000 36697000 0 41516000 0 0 41247 890;3052 38488 368765;368766;368767;368768;368769;368770;368771;368772;368773;368774 468846;468847;468848;468849;468850;468851;468852;468853;468854;468855;468856 468851 530 10 SPSDCCHNQCAAGCTGPR Unmodified 2033.756 0.75604639 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8;A0A1W2PRR9 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 14.269 14.269 3 0.00305 6336 QUIQUE_C1576_190116_001 67.646 67.16 8097800 0 0 0 0 0 0 8097800 0 0 0 0 0 0 41248 1789 38489 368775 468857 468857 1 SPSDSGYSYETIGK Unmodified 1489.6573 0.6572683 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 54.314 54.314 2 3.0612E-14 51949 QUIQUE_C1368_190116_001 146.16 125.39 1990100000 525600000 0 816220000 0 0 495610000 0 0 0 152640000 0 0 0 41249 2483 38490 368776;368777;368778;368779;368780;368781 468858;468859;468860;468861;468862;468863;468864 468859 7 SPSDSSTASTPVAEQIER Unmodified 1860.8701 0.87011462 3186 Q16643;D6R9Q9 DBN1 Drebrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.619 50.619 2 1.9858E-45 46134 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0.0001776 87833 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.152 57.964 184580000 0 79013000 0 0 0 30576000 0 0 40809000 0 0 34180000 0 41253 504 38494 368795;368796;368797;368798;368799 468878;468879;468880;468881;468882 468881 4 SPSGAGEGASCSDGPR Unmodified 1490.6056 0.60558386 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.025 14.025 2 8.9034E-95 5750 QUIQUE_C1563_190116_001 216.68 209.74 517930000 69684000 81391000 87905000 29518000 45640000 97227000 64136000 0 0 0 9564100 10689000 22180000 41254 3452 38495 368800;368801;368802;368803;368804;368805;368806;368807;368808;368809 468883;468884;468885;468886;468887;468888;468889;468890;468891;468892 468888 10 SPSGGAAGPLLTPSQSLDGSR Unmodified 1953.9756 0.97558275 3827 Q96CX2 KCTD12 BTB/POZ domain-containing protein KCTD12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 78.164 78.164 2 1.0668E-145 78771 QUIQUE_DMIX3_190116_001 258.36 243.91 1772000000 115790000 138890000 191840000 199710000 158500000 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468918;468919;468920 468919 3 SPSKPLPEVTDEYKNDVK Unmodified 2045.0317 0.031700644 1890 P05455;E7ERC4;E9PGX9;E9PFL9 SSB Lupus La protein yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 2 3 1 1 1 1 43.842 43.842 3;4 1.1619E-37 40844 QUIQUE_C1438_190116_001 159.95 142.66 929310000 0 57361000 100770000 0 92760000 0 92867000 68889000 160300000 29631000 128870000 92165000 105700000 41258 1890 38499 368832;368833;368834;368835;368836;368837;368838;368839;368840;368841;368842;368843;368844;368845 468921;468922;468923;468924;468925;468926;468927;468928;468929;468930;468931;468932;468933;468934;468935;468936;468937 468925 16 SPSLPPTFAGTLTELEDSFTEQVQSLAK Unmodified 2992.4917 0.49171311 4519 Q9UPP2;A0A0G2JLG2 IQSEC3 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 174.8 174.8 3 6.2522E-27 179402 QUIQUE_C1368_190116_001 103.63 95.663 66148000 0 0 6827900 0 16288000 0 0 0 0 0 0 31223000 11809000 41259 4519 38500 368846;368847;368848;368849 468938;468939;468940;468941 468938 4 SPSLSPSPPSPLEK Unmodified 1421.7402 0.74021007 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 61.455 61.455 2 9.8363E-18 60467 QUIQUE_DMIX3_190116_001 189.57 154.06 1395700000 120250000 75640000 78559000 84475000 94500000 112650000 83160000 157290000 161530000 24458000 134500000 97283000 171400000 41260 2483 38501 368850;368851;368852;368853;368854;368855;368856;368857;368858;368859;368860;368861;368862;368863 468942;468943;468944;468945;468946;468947;468948;468949;468950;468951;468952;468953;468954;468955;468956;468957;468958;468959;468960;468961;468962;468963;468964;468965;468966;468967;468968;468969;468970 468958 29 SPSPFHAVAECR Unmodified 1356.6245 0.62446881 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;C9JBE1;F8WAN0;E7EPX3;B9ZVU2;E5RJ35 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 31.88 31.88 2;3 0.00043048 26728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.86 87.7 767800000 101520000 66748000 107020000 34151000 55358000 66745000 47632000 71597000 31563000 0 149430000 36031000 0 41261 1 38502 368864;368865;368866;368867;368868;368869;368870;368871;368872;368873;368874;368875;368876;368877;368878 468971;468972;468973;468974;468975;468976;468977;468978;468979;468980;468981;468982;468983;468984;468985 468983 14 SPSPPDGSPAATPEIR Unmodified 1577.7686 0.76855009 1412 O00499 BIN1 Myc box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 48.873 48.873 2 4.1494E-05 46045 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.856 72.553 101840000 33548000 0 0 0 0 0 0 0 0 20931000 47363000 0 0 41262 1412 38503 368879;368880;368881;368882 468986;468987;468988;468989;468990;468991 468987 6 SPSPSPTSPGSLR Unmodified 1268.6361 0.63607935 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.448 29.448 2 7.5846E-14 23660 QUIQUE_C1403_190116_001 168.74 133.44 1427700000 216030000 146750000 75808000 95063000 102840000 110730000 114340000 0 177780000 53002000 114810000 119680000 100880000 41263 1478;3342 38504 368883;368884;368885;368886;368887;368888;368889;368890;368891;368892;368893;368894 468992;468993;468994;468995;468996;468997;468998;468999;469000;469001;469002;469003;469004;469005;469006;469007;469008;469009;469010;469011;469012;469013 468999 22 SPSPSPTSPGSLRK Unmodified 1396.731 0.73104237 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 1 1 1 1 18.346 18.346 3 0.0017653 10997 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.034 40.897 177950000 0 0 0 0 0 0 0 0 79052000 0 68314000 0 30588000 41264 1478;3342 38505 368895;368896;368897 469014;469015;469016 469015 3 SPSPSSTAHSYGHSPTTANYGSQTEDLPQAPSGLAAAGR Unmodified 3854.7732 0.77320113 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 71.789 71.789 4 9.3179E-05 71863 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.686 41.869 40273000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40273000 0 41265 4517 38506 368898 469017;469018 469017 2 SPSSMVPSILINK Unmodified 1371.7432 0.74318696 2391 P36269;H7C1X2 GGT5 Gamma-glutamyltransferase 5;Gamma-glutamyltransferase 5 heavy chain;Gamma-glutamyltransferase 5 light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.865 97.865 2 0.00040068 101489 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.483 81.964 108520000 38549000 33576000 0 0 0 0 0 0 0 0 36398000 0 0 41266 2391 38507 368899;368900;368901;368902 469019;469020;469021;469022 469021 4 SPSSSQPLPQVPAPAQSQTQFHVQPQPQPK Unmodified 3220.6265 0.6265243 1114 H0Y2Y8;Q15942;H7C3D3 ZYX Zyxin yes no 0 0 0 1 79.054 79.054 3 1.1573E-06 79677 QUIQUE_C1403_190116_001 55.587 50.73 50083000 0 0 0 50083000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41267 1114 38508 368903 469023 469023 1 SPSSSTGSIASSR Unmodified 1222.579 0.5789584 4367 Q9P0K1;H7C3I4;H7C0Q9 ADAM22 Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 22 yes no 0 0 0 1 14.893 14.893 2 0.00051973 7166 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.69 79.412 35094000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35094000 41268 4367 38509 368904 469024 469024 1 SPSSVTGNALWK Unmodified 1245.6354 0.63535107 4331 Q9NYB0 TERF2IP Telomeric repeat-binding factor 2-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 58.495 58.495 2 0.0001958 57389 QUIQUE_C1563_190116_001 101.66 70.361 63342000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63342000 41269 4331 38510 368905;368906;368907 469025;469026;469027 469026 3 SPSTAILCNTCGNVCK Unmodified 1780.7906 0.79062421 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 56.037 56.037 2 4.222E-09 54006 QUIQUE_C1368_190116_001 158.01 143.78 294220000 0 61190000 49996000 102310000 0 80721000 0 0 0 0 0 0 0 41270 3362 38511 368908;368909;368910;368911;368912 469028;469029;469030;469031;469032 469029 5 SPSTESQLMSK Unmodified 1193.5598 0.55980286 2382 P35612;A0A1C7CYY0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 25.132 25.132 2 0.0045705 19559 QUIQUE_C1277_190116_001 82.029 61.888 113120000 0 0 113120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41271 2382 38512 368913;368914;368915;368916;368917;368918 469033;469034;469035;469036;469037;469038 469033 5 SPSTESQLMSK Oxidation (M) 1209.5547 0.55471749 2382 P35612;A0A1C7CYY0 ADD2 Beta-adducin yes no 0 1 0 1 1 1 15.767 15.767 2 0.0006516 7789 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.48 76.322 50771000 0 0 0 0 0 0 0 33387000 0 17384000 0 0 0 41272 2382 38512 368919;368920;368921 469039;469040;469041 469041 1790 3 SPSTGLYDNLEK Unmodified 1322.6354 0.63541065 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0;F8WCF4;C9JR33;C9J3U7 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.554 55.554 2 8.6584E-38 53933 QUIQUE_C1277_190116_001 226.29 150.99 3549100000 329880000 400780000 291650000 215100000 326090000 0 471600000 301820000 284420000 152940000 492820000 281950000 0 41273 3549 38513 368922;368923;368924;368925;368926;368927;368928;368929;368930;368931;368932 469042;469043;469044;469045;469046;469047;469048;469049;469050;469051;469052;469053;469054;469055 469044 14 SPSTLLPK Unmodified 841.49092 0.49091866 880;1058 E7EVA0;P27816;B5MEG9;F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 32.583 32.583 2 0.012125 28732 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.046 25.759 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62323000 147570000 148370000 0 103010000 84798000 138730000 41276 3865 38516 368949;368950;368951;368952;368953;368954;368955;368956;368957;368958;368959 469074;469075;469076;469077;469078;469079;469080;469081;469082;469083;469084 469075 8 SPTDWALFTYEGNSNDIR Unmodified 2084.9439 0.94394827 4460;605 B4DDD6;F8WC20;F8WBB2;F8WFE1;Q9UJU6;F8WBG8 DBNL Drebrin-like protein no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 132.62 132.62 2;3 2.2692E-76 138999 QUIQUE_DMIX5_190116_001 252.08 231.12 1500300000 97868000 111530000 100370000 113110000 112770000 127850000 96256000 137990000 128950000 60436000 110400000 127840000 174960000 41277 605;4460 38517 368960;368961;368962;368963;368964;368965;368966;368967;368968;368969;368970;368971;368972;368973;368974 469085;469086;469087;469088;469089;469090;469091;469092;469093;469094;469095;469096;469097;469098;469099 469096 14 SPTESVNTPVGK Unmodified 1214.6143 0.61428128 3721 Q8WXG6;A0A0A0MRB5 MADD MAP kinase-activating death domain protein yes no 0 0 0 1 1 23.533 23.533 2 0.013347 16687 QUIQUE_C1277_190116_001 56.725 22.768 29293000 0 29293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41278 3721 38518 368975;368976 469100;469101 469101 2 SPTLVIAYLMMR Unmodified 1393.7462 0.74616385 2580 P51452;K7ELG5 DUSP3 Dual specificity protein phosphatase 3 yes no 0 0 0 1 2 1 1 150.24 150.24 2 8.0092E-05 153466 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.79 119.83 103880000 0 0 0 0 0 0 0 28775000 32474000 0 31223000 0 11404000 41279 2580 38519 368977;368978;368979;368980;368981 469102;469103;469104;469105;469106 469102 2 SPTLYGISHDDLK Unmodified 1444.7198 0.71980898 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 1 59.926 59.926 2 0.016661 59298 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.808 43.036 79708000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40611000 39096000 41280 1650 38520 368982;368983 469107;469108 469107 2 SPTPLNDDQWHR Unmodified 1464.6746 0.67459012 4429 Q9UHC6 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 42.616 42.616 2;3 0.00056803 39310 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0.18128219 4199 Q9H9S4;Q5TAW7;B7ZBJ5 CAB39L Calcium-binding protein 39-like yes no 0 0 0 1 128.71 128.71 3 0.026962 133236 QUIQUE_DMIX3_190116_001 30.152 25.499 34603000 0 0 0 0 0 0 0 0 34603000 0 0 0 0 41284 4199 38524 369000 469126 469126 1 SPVDIVTGGISPVR Unmodified 1395.7722 0.7721789 910 E9PEM5;P50851;H0YAC6;H0Y9N9 LRBA Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein yes no 0 0 0 1 100.17 100.17 2 0.016153 102821 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.121 45.027 22499000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22499000 0 41285 910 38525 369001 469127 469127 1 SPVEFVEYNK Unmodified 1210.587 0.58700389 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.556 64.556 2 0.00015108 64361 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.28 102.5 886580000 97146000 102260000 71900000 91247000 90489000 0 86472000 82058000 59096000 0 97722000 108190000 0 41286 4250 38526 369002;369003;369004;369005;369006;369007;369008;369009;369010;369011 469128;469129;469130;469131;469132;469133;469134;469135;469136;469137;469138;469139;469140 469137 13 SPVESTTEPPAVR Unmodified 1368.6885 0.68850885 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.68 33.68 2 5.3852E-41 29103 QUIQUE_DMIX3_190116_001 203.94 165.86 324140000 0 0 44678000 50490000 48831000 0 51926000 0 47698000 26334000 54181000 0 0 41287 2636 38527 369012;369013;369014;369015;369016;369017;369018;369019 469141;469142;469143;469144;469145;469146;469147;469148;469149 469145 9 SPVEVAQDVLAAVGK Unmodified 1481.809 0.80895834 249 J3KRS1;A0A0C4DGQ8;Q6IAN0 DHRS7B Dehydrogenase/reductase SDR family member 7B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 142.57 142.57 2 1.1641E-05 148049 QUIQUE_C1218_190116_001 100.38 76.525 90224000 27808000 0 0 13772000 0 26042000 22602000 0 0 0 0 0 0 41288 249 38528 369020;369021;369022;369023;369024;369025 469150;469151;469152;469153;469154;469155 469150 6 SPVFSFSPEPGAGDEAR Unmodified 1748.8006 0.8005785 3683 Q8TDC3;J3KNK0 BRSK1 Serine/threonine-protein kinase BRSK1 yes no 0 0 0 1 1 1 93.32 93.32 2 1.9758E-06 94758 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.731 74.099 77738000 32031000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45708000 41289 3683 38529 369026;369027;369028 469156;469157;469158 469157 3 SPVGVQPILNEHTFCAGMSK Oxidation (M) 2187.0453 0.045258993 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 77.489 77.489 2;3 9.8522E-10 78978 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.74 83.879 978050000 0 0 0 0 26625000 0 19471000 137580000 164180000 32784000 568060000 0 29347000 41290 1793 38530 369029;369030;369031;369032;369033;369034;369035;369036 469159;469160;469161;469162;469163;469164;469165;469166;469167 469166 1017 9 SPVISIDPPSSTVQQGQDASFK Unmodified 2287.1332 0.1332056 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 2 1 95.427 95.427 2;3 7.6271E-66 98083 QUIQUE_C1368_190116_001 224.16 210.13 132610000 0 0 41202000 0 73368000 0 0 18037000 0 0 0 0 0 41291 2834 38531 369037;369038;369039;369040 469168;469169;469170;469171;469172 469168 5 SPVKEEEKPQEVK Unmodified 1525.7988 0.79878758 2033 P12036 NEFH Neurofilament heavy polypeptide yes yes 0 0 2 2 10.512 10.512 3;4 0.0046434 2879 QUIQUE_C1277_190116_001 70.412 60.754 22912000 0 22912000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41292 2033 38532 369041;369042 469173;469174 469174 2 SPVPFLGR Unmodified 871.49159 0.49158736 4480 Q9UL12;A0A0A0MT55;Q5SYV2 SARDH Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 73.415 73.415 2 0.0109 72971 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.661 64.552 12067000 0 0 0 0 0 0 0 12067000 0 0 0 0 0 41293 4480 38533 369043;369044;369045 469175;469176;469177 469176 3 SPVTFLSDLR Unmodified 1133.6081 0.60807369 527 A5YKK6 CNOT1 CCR4-NOT transcription complex subunit 1 yes yes 0 0 0 1 107.57 107.57 2 0.029837 110868 QUIQUE_C1277_190116_001 65.157 39.583 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41294 527 38534 369046 469178 469178 1 SPVTLTAYIVTSLLGYR Unmodified 1853.0299 0.02985015 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 174.33 174.33 2;3 6.6103E-63 178061 QUIQUE_DMIX7_190116_001 188.29 173.41 181830000 0 24976000 0 0 0 0 0 8554500 106390000 0 0 25604000 16301000 41295 3420 38535 369047;369048;369049;369050;369051;369052;369053 469179;469180;469181;469182;469183;469184;469185 469184 7 SPVTTLLECMHK Unmodified 1414.6949 0.69485656 2664 P55265;A0A3B3IRQ9;H0YCK3;A0A3B3ISX1;A0A3B3ITG9 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 89.923 89.923 3 2.6683E-05 92298 QUIQUE_C1368_190116_001 100.38 68.898 211850000 24900000 24811000 55558000 28985000 20034000 18320000 0 0 16978000 0 22263000 0 0 41296 2664 38536 369054;369055;369056;369057;369058;369059;369060;369061;369062;369063 469186;469187;469188;469189;469190;469191;469192;469193;469194;469195;469196 469189 11 SPVVSGDTSPR Unmodified 1100.5462 0.54620171 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.639 18.639 2 3.647E-08 11624 QUIQUE_C1218_190116_001 153.05 98.888 4502700000 513340000 521410000 227230000 289750000 361520000 299860000 228890000 273990000 450550000 144790000 461130000 310300000 419930000 41297 291;1247 38537 369064;369065;369066;369067;369068;369069;369070;369071;369072;369073;369074;369075;369076 469197;469198;469199;469200;469201;469202;469203;469204;469205;469206;469207;469208;469209 469197 8 SPVWPTFPFHR Unmodified 1369.6931 0.69314072 1235 H7C4E7;Q9Y534 CSDC2 Cold shock domain-containing protein C2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.98 105.98 3 0.00098384 110089 QUIQUE_C1218_190116_001 81.017 71.755 22456000 13305000 0 0 9150900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41298 1235 38538 369077;369078;369079;369080;369081;369082 469210;469211;469212;469213;469214;469215 469210 4 SPVYLDLAYLPSGSSAHLVDEEFFQR Unmodified 2939.4341 0.43413865 3348 Q66K74 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 152.81 152.81 3 1.7974E-57 157139 QUIQUE_DMIX7_190116_001 154.69 136.59 1007500000 57899000 68620000 0 57913000 73052000 77943000 68403000 71892000 147300000 27590000 138650000 160370000 57896000 41299 3348 38539 369083;369084;369085;369086;369087;369088;369089;369090;369091;369092;369093;369094;369095 469216;469217;469218;469219;469220;469221;469222;469223;469224;469225;469226;469227;469228;469229;469230;469231;469232;469233;469234 469232 19 SPVYLTVLK Unmodified 1018.6063 0.60628277 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.435 80.435 2 0.003694 82262 QUIQUE_C1576_190116_001 90.709 41.953 7277400000 600690000 617810000 578440000 550740000 591890000 513820000 512990000 605190000 537840000 290010000 640900000 564910000 672230000 41300 959 38540 369096;369097;369098;369099;369100;369101;369102;369103;369104;369105;369106;369107;369108 469235;469236;469237;469238;469239;469240;469241;469242;469243;469244;469245;469246;469247;469248;469249;469250 469242 16 SPWASDFK Unmodified 936.43413 0.43413207 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 55.937 55.937 2 0.027492 53712 QUIQUE_C1563_190116_001 69.628 53.996 71550000 0 0 0 0 0 71550000 0 0 0 0 0 0 0 41301 921 38541 369109 469251 469251 1 SPWASDFKDFQESSPQK Unmodified 1982.901 0.90102082 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 1 2 1 85.932 85.932 2;3 5.0345E-140 86650 QUIQUE_DMIX1_190116_001 241.41 227.73 345380000 0 0 0 0 62998000 0 0 256970000 0 25411000 0 0 0 41302 921 38542 369110;369111;369112;369113;369114 469252;469253;469254;469255;469256 469255 5 SPWGCVGHGALYHSQSPEAFFAHCPGIK Unmodified 3096.4123 0.41231455 2188 P21953 BCKDHB 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 96.916 96.916 4;5 2.1873E-16 99691 QUIQUE_C1277_190116_001 83.934 72.411 449370000 0 67009000 0 88620000 0 0 105710000 0 54809000 0 58537000 74683000 0 41303 2188 38543 369115;369116;369117;369118;369119;369120;369121 469257;469258;469259;469260;469261;469262;469263;469264;469265;469266;469267 469258 11 SPWSNKYDPPLEDGAMPSAR Unmodified 2217.0161 0.016067355 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 85.03 85.03 2;3 4.5089E-64 87253 QUIQUE_DMIX5_190116_001 180.48 165.32 2283300000 93827000 133100000 135550000 137050000 129550000 90470000 132390000 366720000 253540000 0 322960000 216890000 271220000 41304 585;2493 38544 369122;369123;369124;369125;369126;369127;369128;369129;369130;369131;369132;369133;369134;369135;369136;369137 469268;469269;469270;469271;469272;469273;469274;469275;469276;469277;469278;469279;469280;469281;469282;469283;469284;469285 469282 16 SPWSNKYDPPLEDGAMPSAR Oxidation (M) 2233.011 0.010981977 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 1 1 1 71.774 71.774 2 7.2133E-46 71172 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.72 139.84 26423000 0 0 0 0 0 0 0 26423000 0 0 0 0 0 41305 585;2493 38544 369138 469286 469286 380 1 SPYLYPLYGLGELPQGFAR Unmodified 2140.0993 0.099326699 2560;2328 P31150;P50395;Q5SX87;Q5SX91 GDI1;GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor alpha;Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 0 0 2 3 3 3 2 2 2 2 4 2 2 3 2 155.52 155.52 2;3 9.4259E-86 159995 QUIQUE_DMIX3_190116_001 254.89 238.75 85798000000 5406600000 6183800000 6378600000 6458800000 7832500000 4543400000 6483800000 7745000000 8366100000 2337300000 8445800000 8209500000 7406500000 41306 2328;2560 38545 369139;369140;369141;369142;369143;369144;369145;369146;369147;369148;369149;369150;369151;369152;369153;369154;369155;369156;369157;369158;369159;369160;369161;369162;369163;369164;369165;369166;369167;369168;369169;369170 469287;469288;469289;469290;469291;469292;469293;469294;469295;469296;469297;469298;469299;469300;469301;469302;469303;469304;469305;469306;469307;469308;469309;469310;469311;469312;469313;469314;469315;469316;469317;469318;469319;469320;469321;469322;469323;469324;469325;469326;469327;469328;469329;469330;469331;469332;469333;469334;469335;469336;469337;469338;469339;469340;469341;469342;469343;469344;469345;469346;469347;469348;469349;469350;469351;469352;469353;469354 469330 67 SPYQLVLQHSR Unmodified 1326.7044 0.70443369 3146 Q15582 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 52.039 52.039 3 0.0014815 47591 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.864 62.806 74220000 0 0 0 0 0 0 0 44832000 0 29388000 0 0 0 41307 3146 38546 369171;369172;369173;369174 469355;469356;469357;469358 469356 4 SPYTVTVGQACNPSACR Unmodified 1866.8353 0.83526622 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.122 57.122 2 4.7423E-104 56261 QUIQUE_C1438_190116_001 218.06 176.36 418410000 24053000 47523000 55185000 38042000 59130000 54825000 53165000 0 0 16484000 38435000 31567000 0 41308 2178 38547 369175;369176;369177;369178;369179;369180;369181;369182;369183;369184 469359;469360;469361;469362;469363;469364;469365;469366;469367;469368 469363 10 SQACGGNLGSIEELR Unmodified 1589.7468 0.74676879 622 B4DR80;Q9Y6E0;H0Y630;Q5JV98;Q5JV99 STK24 Serine/threonine-protein kinase 24;Serine/threonine-protein kinase 24 36 kDa subunit;Serine/threonine-protein kinase 24 12 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.049 72.049 2 0.00013357 72350 QUIQUE_C1277_190116_001 88.552 69.237 639930000 0 73901000 0 68599000 80514000 0 72638000 44848000 64192000 22259000 75142000 53645000 84190000 41309 622 38548 369185;369186;369187;369188;369189;369190;369191;369192;369193;369194 469369;469370;469371;469372;469373;469374;469375;469376;469377;469378;469379 469369 10 SQAEDVRVEGSFPVTMLPGDGVGPELMHAVK Unmodified 3251.5955 0.59548345 86 A0A087WZN1;O43837;A0A087X2E5 IDH3B Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit, mitochondrial;Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 1 1 130 130 4 0.00073426 132955 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.829 29.049 61787000 0 0 0 0 0 0 0 61787000 0 0 0 0 0 41310 86 38549 369195 469380 469380 1 SQAEFEK Acetyl (Protein N-term) 879.39741 0.39741221 1914 P07108 DBI Acyl-CoA-binding protein yes yes 1 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 36.143 36.143 1;2 0.0097209 31974 QUIQUE_DMIX7_190116_001 127.12 66.319 8341500000 889460000 1112600000 1048900000 0 1169900000 0 741950000 0 0 0 1098300000 892660000 1387700000 41311 1914 38550 369196;369197;369198;369199;369200;369201;369202;369203;369204;369205;369206;369207 469381;469382;469383;469384;469385;469386;469387;469388;469389;469390;469391;469392 469389 4 SQAEPLSGNKEPLADTSSNQQK Unmodified 2328.1193 0.11934645 2540 P49750;H0YIQ2 YLPM1 YLP motif-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 32.944 32.944 3 1.3231E-05 28006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.061 44.055 21499000 0 0 0 0 0 0 0 21499000 0 0 0 0 0 41312 2540 38551 369208 469393 469393 1 SQAFIEMETR Unmodified 1210.5652 0.56522259 307 A0A0R4J2E8;P43243;A8MXP9;D6REM6;H0Y8T4;B3KM87 MATR3 Matrin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 61.191 61.191 2 0.026747 59880 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.192 47.525 369840000 148520000 114680000 0 0 0 0 0 106640000 0 0 0 0 0 41313 307 38552 369209;369210;369211 469394;469395;469396 469396 2 SQAGVSSGAPPGR Unmodified 1169.5789 0.57889882 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 14.257 14.257 2 0.00013442 6769 QUIQUE_C1368_190116_001 99.752 63.357 13046000 0 0 0 0 0 13046000 0 0 0 0 0 0 0 41314 3091 38553 369212;369213;369214 469397;469398;469399 469397 3 SQALEFPDQPDIAEDLKDLITR Unmodified 2513.2649 0.26494806 3934 Q96RR4;F5GZ00 CAMKK2 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 159.64 159.64 3 2.2393E-08 163417 QUIQUE_C1403_190116_001 90.193 82.572 599050000 41616000 50606000 49069000 41217000 114650000 0 53130000 46560000 66913000 0 0 67885000 67406000 41315 3934 38554 369215;369216;369217;369218;369219;369220;369221;369222;369223;369224;369225 469400;469401;469402;469403;469404;469405;469406;469407;469408;469409;469410;469411;469412 469404 12 SQALLER Unmodified 815.45012 0.45011648 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 21.877 21.877 2 0.019674 14784 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.81 21.366 254420000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 254420000 0 0 0 41316 3176 38555 369226 469413 469413 1 SQAPGISLPGVLVGNK Unmodified 1535.8671 0.86714192 4053 Q9BW83;F5GZ09;H0Y6C7 IFT27 Intraflagellar transport protein 27 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.39 107.39 2 0.0048843 110328 QUIQUE_C1403_190116_001 56.295 47.107 498260000 52940000 59122000 66262000 40670000 0 61895000 0 56648000 74358000 18180000 68181000 0 0 41317 4053 38556 369227;369228;369229;369230;369231;369232;369233;369234;369235 469414;469415;469416;469417;469418;469419;469420;469421;469422 469417 4 SQAPGQPGASQWGSR Unmodified 1512.707 0.70695288 1319 K7EQ55;K7EK33;Q96EP5;K7EQ02 DAZAP1 DAZ-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 33.177 33.177 2 6.3089E-05 28294 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.672 49.729 63512000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63512000 0 0 41318 1319 38557 369236;369237 469423;469424 469424 1 SQAPLESSLDSLGDVFLDSGR Unmodified 2192.0597 0.059706308 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 2 158.54 158.54 2;3 9.4425E-05 160904 QUIQUE_C1563_190116_001 90.754 72.837 121580000 0 0 90165000 0 0 31420000 0 0 0 0 0 0 0 41319 3091 38558 369238;369239;369240 469425;469426;469427 469426 3 SQAPVLDAIR Unmodified 1068.5928 0.59275797 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 61.308 61.308 2 0.0066136 60009 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.376 52.848 471970000 0 85259000 0 0 233190000 0 0 85487000 0 68038000 0 0 0 41320 2037 38559 369241;369242;369243;369244;369245;369246 469428;469429;469430;469431;469432;469433;469434 469431 7 SQAYADYIGFILTLNEGVK Unmodified 2101.0732 0.073171528 3123 Q15257;F6WIT2;Q5T949;Q5T948;A6PVN9;A6PVN8;A6PVN7 PPP2R4 Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator yes no 0 0 0 1 2 1 166.31 166.31 2;3 7.027E-05 168123 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.86 111.02 116860000 29526000 0 0 0 0 0 0 36633000 50705000 0 0 0 0 41321 3123 38560 369247;369248;369249;369250 469435;469436;469437;469438 469436 4 SQDAEVGDGTTSVTLLAAEFLK Unmodified 2251.122 0.12197221 3977 Q99832;F8WAM2 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 159.85 159.85 2;3 2.4873E-54 163802 QUIQUE_C1403_190116_001 200.94 190.3 4018100000 220190000 256330000 292540000 206210000 341340000 183750000 603120000 242310000 258790000 138250000 310070000 684710000 280500000 41322 3977 38561 369251;369252;369253;369254;369255;369256;369257;369258;369259;369260;369261;369262;369263;369264;369265 469439;469440;469441;469442;469443;469444;469445;469446;469447;469448;469449;469450;469451;469452;469453;469454;469455;469456;469457;469458;469459;469460;469461;469462;469463;469464;469465 469444 27 SQDATSSSAAQPEVIVVPLYLVNTDR Unmodified 2759.3978 0.39775314 4058 Q9BX66;S4R406 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 147.96 147.96 3 0.015307 143587 QUIQUE_DMIX4_190116_001 21.293 14.644 14990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14990000 0 0 0 41323 4058 38562 369266 469466 469466 1 SQDGASQFQEVIR Acetyl (Protein N-term) 1505.711 0.71103521 735 C9JNZ1;C9JVG3;C9JWG0;C9JUW1;C9JTZ5;F2Z3H1;C9J3M0;F2Z3P4;F8WC70 UGP2 yes no 1 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 99.306 99.306 2 1.0939E-23 101438 QUIQUE_DMIX7_190116_001 199.7 172.08 1320700000 125660000 102530000 88955000 109310000 113160000 81189000 88480000 122980000 86820000 59951000 115240000 109520000 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469571;469572;469573;469574;469575;469576;469577;469578;469579;469580;469581;469582;469583;469584;469585;469586;469587;469588;469589;469590;469591;469592 469592 20 SQEMVHLVNK Unmodified 1183.6019 0.60194245 1143 H0YD13;P16070;H0Y2P0;H0YE40 CD44 CD44 antigen yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 2 24.616 24.616 2;3 0.00036089 17606 QUIQUE_DMIX8_190116_001 129.63 90.372 3939200000 500260000 207380000 360350000 301890000 185720000 171370000 145640000 226010000 719810000 69678000 573770000 0 477270000 41335 1143 38573 369378;369379;369380;369381;369382;369383;369384;369385;369386;369387;369388;369389;369390;369391;369392;369393;369394 469593;469594;469595;469596;469597;469598;469599;469600;469601;469602;469603;469604;469605;469606;469607;469608;469609;469610;469611;469612 469612 18 SQEMVHLVNK Oxidation (M) 1199.5969 0.59685707 1143 H0YD13;P16070;H0Y2P0;H0YE40 CD44 CD44 antigen yes no 0 1 0 1 1 15.59 15.59 2;3 0.013109 7988 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.881 40.627 101710000 0 0 0 0 0 0 0 0 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K7EL81;Q9BZL4;K7ER83 PPP1R12C Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12C yes no 0 0 0 1 1 22.122 22.122 2 0.0023672 15168 QUIQUE_C1403_190116_001 72.089 34.745 30136000 0 0 0 30136000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41340 1327 38577 369437;369438 469679;469680 469680 2 SQETECTYFSTPLLLGK Unmodified 1972.9452 0.94519382 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 3 2 2 1 1 2 2 1 2 3 2 124.39 124.39 2;3 1.669E-104 127065 QUIQUE_C1563_190116_001 272.5 255.72 23393000000 2742800000 2578300000 2607800000 1945600000 2033200000 1726500000 1875700000 1184800000 1192200000 688550000 1825100000 1689300000 1303600000 41341 2431 38578 369439;369440;369441;369442;369443;369444;369445;369446;369447;369448;369449;369450;369451;369452;369453;369454;369455;369456;369457;369458;369459;369460;369461 469681;469682;469683;469684;469685;469686;469687;469688;469689;469690;469691;469692;469693;469694;469695;469696;469697;469698;469699;469700;469701;469702;469703;469704;469705;469706;469707;469708;469709;469710;469711;469712 469695 32 SQETGDLDVGGLQETDK Unmodified 1790.817 0.81701642 583;2206 B1AHL2;B1AHM7;B1AHM9;H7C1M6;P23142 FBLN1 Fibulin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.213 67.213 2 1.7901E-30 67785 QUIQUE_C1218_190116_001 156.6 116.01 198690000 28412000 26810000 34389000 31722000 34285000 0 21934000 0 0 21139000 0 0 0 41342 583;2206 38579 369462;369463;369464;369465;369466;369467;369468 469713;469714;469715;469716;469717;469718;469719 469713 6 SQEVAYTDIK Unmodified 1152.5663 0.56626845 2550 P49840;A8MT37;M0QYV0 GSK3A Glycogen synthase kinase-3 alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.02 38.02 2 0.0092714 33984 QUIQUE_C1277_190116_001 79.974 62.734 573860000 76095000 95499000 0 0 0 78660000 80219000 0 61960000 0 108480000 72947000 0 41343 2550 38580 369469;369470;369471;369472;369473;369474;369475 469720;469721;469722;469723;469724;469725;469726;469727;469728 469722 9 SQEYLLDEGPAPGTPPR Unmodified 1825.8846 0.88464248 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 80.275 80.275 2 4.5872E-10 80195 QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.85 118.56 35590000 0 0 0 0 0 0 0 35590000 0 0 0 0 0 41344 3718 38581 369476 469729 469729 1 SQFEELCAELLQK Unmodified 1593.7709 0.77085827 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 123.6 123.6 2;3 4.4785E-10 129033 QUIQUE_C1218_190116_001 180.66 147.25 2541300000 191330000 253790000 126810000 206070000 216510000 213190000 323650000 153490000 146760000 104720000 187450000 230180000 187370000 41345 180;3738 38582 369477;369478;369479;369480;369481;369482;369483;369484;369485;369486;369487;369488;369489;369490;369491;369492;369493;369494;369495;369496;369497;369498;369499;369500;369501 469730;469731;469732;469733;469734;469735;469736;469737;469738;469739;469740;469741;469742;469743;469744;469745;469746;469747;469748;469749;469750;469751;469752;469753;469754 469731 24 SQFSDKPVQDR Unmodified 1305.6313 0.63132832 4057 Q9BWS9;E9PI70;E9PIP0;E9PRL3;E9PPH0;E9PPA0;E9PKF1 CHID1 Chitinase domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 17.065 17.065 2 0.027238 9776 QUIQUE_C1218_190116_001 69.979 43.465 44831000 22889000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21942000 0 0 41346 4057 38583 369502;369503 469755;469756 469755 2 SQFTITPGSEQIR Unmodified 1462.7416 0.74160705 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.112 68.112 2 5.1631E-05 68336 QUIQUE_C1277_190116_001 120.06 104.17 24326000000 2456900000 2234900000 2149000000 1562400000 1622100000 1338300000 1627800000 1609100000 2275100000 860880000 2482300000 2064900000 2042500000 41347 3975 38584 369504;369505;369506;369507;369508;369509;369510;369511;369512;369513;369514;369515;369516 469757;469758;469759;469760;469761;469762;469763;469764;469765;469766;469767;469768;469769;469770;469771;469772;469773;469774;469775;469776;469777;469778;469779;469780;469781;469782;469783;469784;469785;469786;469787;469788;469789 469761 33 SQGAALDKYAK Unmodified 1150.5982 0.59823728 2430;720;740 C9JF79;P40925;C9JRL4 MDH1 Malate dehydrogenase;Malate dehydrogenase, cytoplasmic no no 0 0 1 1 1 18.295 18.295 2;3 0.037517 10596 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.523 21.714 192210000 0 0 0 0 0 0 0 101930000 0 0 90273000 0 0 41348 720;2430;740 38585 369517;369518 469790;469791 469791 2 SQGCSEQVLTVLK Unmodified 1447.7341 0.73407884 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 68.611 68.611 2 0.00048648 68884 QUIQUE_C1368_190116_001 90.653 69.654 60821000 0 0 60821000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41349 2813 38586 369519 469792 469792 1 SQGDSNPAAIPHAAEDIQGDDR Acetyl (Protein N-term) 2305.0207 0.02069504 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 1 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 77.304 77.304 2;3 8.4248E-235 78364 QUIQUE_C1368_190116_001 268.26 246.7 3170700000 350120000 402110000 388010000 362310000 323030000 346300000 250980000 87625000 107630000 52744000 238300000 96307000 165230000 41350 2798 38587 369520;369521;369522;369523;369524;369525;369526;369527;369528;369529;369530;369531;369532;369533;369534;369535;369536;369537;369538;369539;369540;369541;369542 469793;469794;469795;469796;469797;469798;469799;469800;469801;469802;469803;469804;469805;469806;469807;469808;469809;469810;469811;469812;469813;469814;469815;469816;469817;469818;469819;469820;469821;469822;469823;469824;469825;469826 469803 34 SQGDSNPAAIPHAAEDIQGDDRWMSQHNR Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 3260.429 0.42896348 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 1 1 1 1 1 74.072 74.072 3 1.2657E-24 74566 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.982 90.754 66791000 0 0 0 0 0 0 0 28725000 0 0 0 0 38067000 41351 2798 38588 369543;369544 469827;469828 469827 2248 2 SQGDSNPAAIPHAAEDIQGDDRWMSQHNR Acetyl (Protein N-term) 3244.434 0.43404886 2798 P68402 PAFAH1B2 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit beta yes yes 1 0 1 3 1 1 1 86.403 86.403 3;4 7.5003E-78 87620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.46 154.73 625140000 0 0 0 0 0 0 0 452870000 64238000 0 53037000 0 54998000 41352 2798 38588 369545;369546;369547;369548;369549;369550 469829;469830;469831;469832;469833;469834;469835 469829 7 SQGGEPTYNVAVGR Unmodified 1433.6899 0.68990583 1099;2367 G5E9Q6;C9J0J7;C9JQ45;P35080;C9J712 PFN2 Profilin;Profilin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.086 43.086 2 2.1947E-46 40793 QUIQUE_C1218_190116_001 186.87 177.91 16692000000 1022900000 1188800000 1137700000 769760000 1243600000 935930000 1455200000 1454200000 1740300000 585430000 1645900000 1549000000 1962800000 41353 1099;2367 38589 369551;369552;369553;369554;369555;369556;369557;369558;369559;369560;369561;369562;369563 469836;469837;469838;469839;469840;469841;469842;469843;469844;469845;469846;469847;469848;469849;469850;469851;469852;469853;469854;469855;469856;469857;469858;469859 469837 24 SQGGGDGVSPTPPEGLAPGVEAGK Unmodified 2163.0444 0.044390595 366 A0A1C7CYZ0;Q12979;A0A0G2JQB5;I3L4Y1;I3L259;I3L2L3 ABR Active breakpoint cluster region-related protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.028 72.028 2 1.2228E-23 72977 QUIQUE_C1218_190116_001 176.42 162.76 585660000 44600000 46643000 60259000 49947000 50435000 35187000 52935000 38598000 40012000 20781000 55960000 44757000 45540000 41354 366 38590 369564;369565;369566;369567;369568;369569;369570;369571;369572;369573;369574;369575;369576 469860;469861;469862;469863;469864;469865;469866;469867;469868;469869;469870;469871;469872 469860 13 SQGGVQPIPSQGGK Unmodified 1338.6892 0.68917755 4342 Q9NZB2 FAM120A Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 22.201 22.201 2 0.0028399 14969 QUIQUE_C1277_190116_001 70.524 51.546 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flagella-associated protein 57 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.926 62.926 2 0.0015614 62230 QUIQUE_C1277_190116_001 78.939 58.239 14234000000 675560000 550120000 669820000 592080000 466850000 472670000 506300000 2486400000 2293600000 849070000 1685800000 1406700000 1578800000 41358 52 38594 369592;369593;369594;369595;369596;369597;369598;369599;369600;369601;369602;369603;369604 469890;469891;469892;469893;469894;469895;469896;469897;469898;469899;469900;469901;469902;469903;469904;469905;469906;469907;469908;469909;469910;469911 469893 22 SQGPALTASQSVHEQPTK Unmodified 1864.9279 0.92790427 4473 Q9UKE5 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 25.941 25.941 3 0.0069499 20325 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.615 38.011 104240000 0 0 0 64736000 0 0 0 39505000 0 0 0 0 0 41359 4473 38595 369605;369606 469912;469913 469913 2 SQGQDVTSSVYFMK Unmodified 1575.7239 0.72390808 2091 P15374;A0A087WTB8;Q5TBK7 UCHL3 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.018 81.018 2 0.0002166 83009 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.56 93.591 608670000 46236000 57793000 57819000 49842000 54167000 0 67967000 55452000 0 23347000 73190000 60143000 62716000 41360 2091 38596 369607;369608;369609;369610;369611;369612;369613;369614;369615;369616;369617 469914;469915;469916;469917;469918;469919;469920;469921;469922;469923;469924;469925 469923 11 SQHERDPWYSWDQPGLR Unmodified 2155.9824 0.98239946 1710 O95169;E9PQ68;K9J7I2 NDUFB8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial yes no 0 0 1 2 3 1 2 2 80.067 80.067 3;4 0.00062681 80667 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.962 58.771 537860000 0 0 0 0 0 0 0 134020000 145280000 0 65060000 132540000 60956000 41361 1710 38597 369618;369619;369620;369621;369622;369623;369624;369625;369626;369627 469926;469927;469928;469929;469930;469931;469932;469933;469934;469935;469936;469937 469936 10 SQHLDSDGLAQIFMQYGDHLYSK Unmodified 2652.2279 0.22785104 65;4141 A0A087WXL6;B7Z879;A0A087X2J4;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 0 0 0 1 1 137.81 137.81 4 0.035986 143192 QUIQUE_DMIX8_190116_001 23.488 15.955 61735000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37087000 0 24648000 41362 65;4141 38598 369628;369629 469938;469939 469939 2 SQHPYVLTEDTLK Unmodified 1529.7726 0.77257283 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 49.515 49.515 2;3 6.455E-05 48118 QUIQUE_C1218_190116_001 132.14 105.47 1513500000 0 81184000 0 129810000 220350000 170380000 103910000 108200000 0 42463000 139170000 217700000 300360000 41363 2037 38599 369630;369631;369632;369633;369634;369635;369636;369637;369638;369639;369640;369641 469940;469941;469942;469943;469944;469945;469946;469947;469948;469949;469950;469951;469952;469953 469940 12 SQHSSSSSHWHQEGVDVK Unmodified 2020.8987 0.89872941 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 11.935 11.935 3;4;5 9.1944E-05 4043 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2354 38602 369661 469975 469975 1 SQIEFALCR Unmodified 1122.5492 0.5491786 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 74.293 74.293 2 0.039064 76093 QUIQUE_C1438_190116_001 53.775 36.535 25010000 0 0 0 0 25010000 0 0 0 0 0 0 0 0 41367 4336 38603 369662 469976 469976 1 SQIFSTASDNQPTVTIK Unmodified 1835.9265 0.92650729 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.272 78.272 2 1.7905E-88 79474 QUIQUE_DMIX3_190116_001 256.13 225.06 6281800000 431960000 477420000 491830000 547300000 556660000 496170000 570640000 339560000 445330000 293520000 710450000 459920000 461060000 41368 2007 38604 369663;369664;369665;369666;369667;369668;369669;369670;369671;369672;369673;369674;369675 469977;469978;469979;469980;469981;469982;469983;469984;469985;469986;469987;469988;469989;469990;469991;469992;469993;469994;469995;469996;469997 469991 21 SQIGNTESELK Unmodified 1204.5935 0.59354583 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 28.416 28.416 2 0.0019058 22625 QUIQUE_C1277_190116_001 105.35 55.305 218270000 0 59125000 105820000 0 0 0 0 0 53321000 0 0 0 0 41369 3662 38605 369676;369677;369678 469998;469999;470000 469998 3 SQIGNTESELKK Unmodified 1332.6885 0.68850885 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 2 19.464 19.464 2;3 0.0012013 12069 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.821 43.746 2895600000 169920000 0 626950000 0 106590000 221720000 412310000 0 203550000 85742000 523810000 128190000 416780000 41370 3662 38606 369679;369680;369681;369682;369683;369684;369685;369686;369687;369688;369689;369690;369691 470001;470002;470003;470004;470005;470006;470007;470008;470009;470010;470011;470012;470013 470009 8 SQIHDIVLVGGSTR Unmodified 1480.7998 0.79979063 2010;558 A8K7Q2;P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PN89 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 0 2 2 4 3 4 2 5 3 5 3 5 4 4 53.723 53.723 2;3 6.0601E-11 52664 QUIQUE_C1277_190116_001 158.2 124.98 31204000000 2656700000 2922900000 2369900000 2694100000 2469600000 2217900000 3014000000 1772400000 2272300000 2143000000 2222900000 2171600000 2276500000 41371 558;2010 38607 369692;369693;369694;369695;369696;369697;369698;369699;369700;369701;369702;369703;369704;369705;369706;369707;369708;369709;369710;369711;369712;369713;369714;369715;369716;369717;369718;369719;369720;369721;369722;369723;369724;369725;369726;369727;369728;369729;369730;369731;369732;369733;369734;369735;369736;369737 470014;470015;470016;470017;470018;470019;470020;470021;470022;470023;470024;470025;470026;470027;470028;470029;470030;470031;470032;470033;470034;470035;470036;470037;470038;470039;470040;470041;470042;470043;470044;470045;470046;470047;470048;470049;470050;470051;470052;470053;470054;470055;470056;470057;470058;470059;470060;470061;470062;470063;470064;470065;470066;470067;470068;470069;470070;470071;470072;470073;470074;470075;470076;470077;470078;470079;470080;470081;470082;470083;470084;470085;470086;470087;470088;470089;470090;470091;470092;470093;470094;470095;470096;470097;470098;470099;470100;470101;470102;470103;470104;470105;470106;470107;470108;470109;470110;470111;470112;470113;470114;470115;470116 470021 103 SQILDYLFKPNFGASLHILK Unmodified 2303.2678 0.26778901 2649 P54803;A0A087WX10;G3V5E8;G3V4M2 GALC Galactocerebrosidase yes no 0 0 1 1 1 1 1 143.96 143.96 4 9.4995E-05 148994 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.454 62.445 151320000 0 0 0 0 0 0 0 31288000 36190000 0 0 42625000 41215000 41372 2649 38608 369738;369739;369740;369741 470117;470118;470119;470120;470121 470119 5 SQISTESFLHLR Unmodified 1416.7361 0.73612775 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.314 79.314 3 0.0003375 80289 QUIQUE_C1368_190116_001 83.182 72.236 384800000 43934000 48311000 45383000 48260000 41065000 42575000 54456000 0 0 0 0 0 60820000 41373 1450 38609 369742;369743;369744;369745;369746;369747;369748;369749;369750 470122;470123;470124;470125;470126;470127;470128;470129;470130;470131;470132 470125 11 SQLDIIIHSLK Unmodified 1265.7343 0.73433683 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 3 2 1 2 2 1 101.19 101.19 2;3 0.0001392 105374 QUIQUE_C1438_190116_001 144.27 123.18 3082000000 341940000 403860000 424710000 276030000 368780000 151080000 316370000 103400000 139910000 90832000 198390000 142630000 124100000 41374 2051 38610 369751;369752;369753;369754;369755;369756;369757;369758;369759;369760;369761;369762;369763;369764;369765;369766;369767;369768;369769;369770;369771;369772;369773;369774 470133;470134;470135;470136;470137;470138;470139;470140;470141;470142;470143;470144;470145;470146;470147;470148;470149;470150;470151;470152;470153;470154;470155;470156;470157;470158;470159;470160;470161;470162;470163;470164;470165;470166;470167 470148 32 SQLDIIIHSLKK Unmodified 1393.8293 0.82929985 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 81.566 81.566 2;3 0.0028784 83743 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.563 47.874 1007000000 0 58190000 0 0 79885000 25336000 64884000 167160000 184830000 0 152670000 151290000 122810000 41375 2051 38611 369775;369776;369777;369778;369779;369780;369781;369782;369783;369784;369785 470168;470169;470170;470171;470172;470173;470174;470175;470176;470177;470178 470176 10 SQLDLFDDVGTFASGPPK Unmodified 1892.9156 0.91560825 268 A0A0D9SF70;G5E9L0;Q8N6H7;E9PQP3;H0YDN9 ARFGAP2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 3 3 1 2 1 2 1 141.81 141.81 2;3 3.307E-46 148099 QUIQUE_C1576_190116_001 176.89 138.9 497980000 29379000 19761000 26880000 24319000 85835000 35294000 30466000 20651000 65377000 29015000 65523000 19791000 45684000 41376 268 38612 369786;369787;369788;369789;369790;369791;369792;369793;369794;369795;369796;369797;369798;369799;369800;369801;369802;369803;369804;369805;369806 470179;470180;470181;470182;470183;470184;470185;470186;470187;470188;470189;470190;470191;470192;470193;470194;470195;470196;470197;470198;470199;470200;470201 470189 20 SQLEESISQLR Unmodified 1288.6623 0.6622941 1229 H7C1U8;Q9BUR5;G3V1B6 APOO Apolipoprotein O yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.322 74.322 2 5.3564E-08 71759 QUIQUE_DMIX4_190116_001 150.35 93.919 3503500000 375520000 395710000 285160000 314290000 0 265450000 271820000 306820000 307240000 98590000 325070000 280850000 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470222;470223;470224;470225;470226;470227;470228;470229;470230;470231;470232;470233;470234;470235;470236;470237;470238 470227 520 17 SQLESHSDQNMHQAEEWFK Unmodified 2330.0022 0.0022082046 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 3 1 1 2 1 2 69.262 69.262 2;3;4 1.1598E-63 69683 QUIQUE_C1576_190116_001 192.55 166.42 2314400000 327530000 145040000 86024000 305620000 131530000 86513000 548010000 0 0 62174000 311510000 91564000 218900000 41380 869 38615 369839;369840;369841;369842;369843;369844;369845;369846;369847;369848;369849;369850;369851;369852;369853;369854;369855;369856;369857 470239;470240;470241;470242;470243;470244;470245;470246;470247;470248;470249;470250;470251;470252;470253;470254;470255;470256;470257;470258 470249 18 SQLETSLK Unmodified 904.48656 0.48656157 1528 O43488;H3BLU7;H7C5H7 AKR7A2 Aflatoxin B1 aldehyde reductase member 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.28 23.28 2 0.019173 16641 QUIQUE_C1576_190116_001 78.77 34.375 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2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 22.775 22.775 2;3 7.1202E-07 15392 QUIQUE_DMIX8_190116_001 141.95 120.49 45989000000 3138400000 3736500000 3801400000 4216900000 4403800000 1514800000 4312700000 3695300000 5070400000 1496400000 2318500000 2031400000 6252900000 41386 267;275;3025 38620 369894;369895;369896;369897;369898;369899;369900;369901;369902;369903;369904;369905;369906;369907;369908;369909;369910;369911;369912;369913;369914;369915;369916 470295;470296;470297;470298;470299;470300;470301;470302;470303;470304;470305;470306;470307;470308;470309;470310;470311;470312;470313;470314;470315;470316;470317 470316 19 SQLLILDR Unmodified 956.56548 0.56548059 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.705 74.705 2 0.001498 76410 QUIQUE_C1218_190116_001 141.39 36.349 14376000000 1534500000 1544300000 1234100000 1121000000 1268000000 869340000 1231200000 823530000 746430000 922460000 944870000 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470361;470362;470363;470364;470365;470366;470367;470368;470369;470370;470371;470372;470373;470374;470375;470376;470377;470378;470379;470380;470381;470382;470383 470363 23 SQLSQALNGLSDR Unmodified 1387.7056 0.7055559 4090 Q9C026 TRIM9 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9 yes yes 0 0 0 1 1 86.424 86.424 2 0.0005414 88127 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.91 80.481 60528000 0 0 0 0 21555000 0 0 0 0 0 0 38973000 0 41392 4090 38626 369961;369962 470384;470385 470385 2 SQMESMLISGYALNCVVGSQGMPK Unmodified 2586.195 0.19503605 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 145.29 145.29 3 5.5823E-05 150419 QUIQUE_C1368_190116_001 50.271 43.547 310040000 53481000 0 39046000 74381000 0 44262000 60978000 0 0 0 0 0 37896000 41393 2132 38627 369963;369964;369965;369966;369967;369968 470386;470387;470388;470389;470390;470391 470387 5 SQNIVTDSSSLSAEAIR Unmodified 1776.8854 0.88537076 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 3 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0.60953025 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 1 1 15.693 15.693 2 0.013044 7832 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.538 67.701 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41395 2812 38629 370010 470449 470449 1 SQNKEDYAGLKEEFR Unmodified 1812.8642 0.86424139 2812 P78417;Q5TA02 GSTO1 Glutathione S-transferase omega-1 yes no 0 0 2 2 39.395 39.395 2;3 5.6911E-05 35669 QUIQUE_C1368_190116_001 79.347 69.778 567760000 0 0 567760000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41396 2812 38630 370011;370012 470450;470451 470450 2 SQNQQYLVR Unmodified 1134.5782 0.57817054 1476 O15066;F8WAR6;F8WER6;O14782 KIF3B;KIF3C Kinesin-like protein KIF3B;Kinesin-like protein KIF3B, N-terminally processed;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.267 25.267 2 0.01557 18944 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.215 56.396 130120000 0 0 0 34374000 0 0 0 0 0 0 56221000 39526000 0 41397 1476 38631 370013;370014;370015;370016;370017 470452;470453;470454;470455;470456 470455 5 SQNVMAAASIANIVK Unmodified 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370036;370037;370038;370039;370040;370041;370042;370043;370044;370045;370046;370047;370048;370049;370050;370051;370052;370053;370054;370055;370056;370057;370058;370059;370060 470477;470478;470479;470480;470481;470482;470483;470484;470485;470486;470487;470488;470489;470490;470491;470492;470493;470494;470495;470496;470497;470498;470499;470500;470501;470502;470503;470504;470505;470506;470507;470508;470509;470510;470511;470512;470513;470514;470515;470516;470517;470518;470519;470520;470521;470522;470523;470524;470525;470526 470508 50 SQPDMAIMAVNTFVK Unmodified 1650.8109 0.81094895 2938 Q10567;C9J1E7 AP1B1 AP-1 complex subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 128.52 128.52 2 0.0014322 135259 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.963 55.423 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41403 2938 38636 370061 470527 470527 1 SQPELIEAHTCER Unmodified 1568.7253 0.72530506 1283 J3KR97;Q9BTW9;A0A0J9YWI5;A0A0J9YVR1 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 29.576 29.576 3 0.022766 24231 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.184 29.771 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470532;470533;470534;470535;470536;470537;470538;470539;470540;470541;470542;470543;470544;470545;470546;470547;470548;470549;470550;470551;470552;470553;470554;470555;470556 470550 24 SQPLTSPESR Unmodified 1100.5462 0.54620171 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 1 1 19.47 19.47 2 0.015863 11804 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.076 27.631 155540000 0 0 0 0 0 0 0 58031000 0 26035000 0 0 71474000 41407 2486 38640 370085;370086;370087 470557;470558;470559 470559 3 SQPPVAHAGQVYGEQPPK Unmodified 1888.9432 0.94316041 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 31.409 31.409 2;3 4.0817E-05 26742 QUIQUE_C1218_190116_001 70.942 55.315 836250000 100040000 88634000 72638000 94560000 69003000 63195000 70695000 49122000 48420000 24256000 58059000 41871000 55757000 41408 3718 38641 370088;370089;370090;370091;370092;370093;370094;370095;370096;370097;370098;370099;370100;370101;370102 470560;470561;470562;470563;470564;470565;470566;470567;470568;470569;470570;470571;470572;470573;470574;470575;470576 470560 17 SQPSPQAGLAGPGPAGYSTAR Unmodified 1968.9654 0.96535241 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;H7BZC2 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.218 58.218 2 7.0496E-20 56860 QUIQUE_C1277_190116_001 130.27 108.97 332520000 29658000 45412000 36517000 44540000 38540000 19958000 34044000 17314000 0 0 0 32324000 34215000 41409 723 38642 370103;370104;370105;370106;370107;370108;370109;370110;370111;370112 470577;470578;470579;470580;470581;470582;470583;470584;470585;470586 470578 10 SQPSQPSDHHETPPAAPDR Unmodified 2052.9249 0.92494416 92 A0A087X0M8;O00533 CHL1 Neural cell adhesion molecule L1-like protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 16.481 16.481 3;4 2.0277E-05 8332 QUIQUE_C1277_190116_001 89.049 79.766 292270000 34671000 89888000 46022000 60297000 0 0 50839000 0 0 10555000 0 0 0 41410 92 38643 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Unmodified 1427.6892 0.68923713 3327 Q5TFE4 NT5DC1 5'-nucleotidase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 15.587 15.587 2;3 3.9747E-05 7586 QUIQUE_C1403_190116_001 134.75 90.546 418440000 25319000 25300000 0 150460000 34190000 0 0 20676000 0 13392000 35001000 35130000 78971000 41420 3327 38653 370184;370185;370186;370187;370188;370189;370190;370191;370192;370193 470659;470660;470661;470662;470663;470664;470665;470666;470667;470668 470661 7 SQSAAVTPSSTTSSTR Unmodified 1566.7485 0.74854293 3172 Q16186;A0A087WX59 ADRM1 Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.854 16.854 2 5.5373E-95 9749 QUIQUE_C1218_190116_001 219.42 184.72 858360000 74879000 68805000 54569000 100480000 56745000 43478000 40151000 80209000 77103000 11345000 78777000 59676000 112150000 41421 3172 38654 370194;370195;370196;370197;370198;370199;370200;370201;370202;370203;370204;370205;370206 470669;470670;470671;470672;470673;470674;470675;470676;470677;470678;470679;470680;470681;470682;470683;470684;470685;470686;470687;470688 470670 20 SQSADAPGPTER Unmodified 1214.5527 0.55274365 4283 Q9NSC5;M0R2U7;M0R1B8 HOMER3 Homer protein homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 14.141 14.141 2 0.0013316 6405 QUIQUE_C1218_190116_001 82.029 63.49 40486000 13336000 14915000 0 0 0 0 12235000 0 0 0 0 0 0 41422 4283 38655 370207;370208;370209 470689;470690;470691 470689 3 SQSDLDFPGAADIPTR Unmodified 1688.8006 0.8005785 1058 F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 100.87 100.87 2 2.9621E-44 103503 QUIQUE_C1403_190116_001 180.84 168.97 723020000 0 71421000 0 84200000 81816000 83330000 54659000 0 95525000 0 90517000 85606000 75944000 41423 1058 38656 370210;370211;370212;370213;370214;370215;370216;370217;370218 470692;470693;470694;470695;470696;470697;470698;470699;470700;470701;470702;470703;470704;470705 470693 14 SQSEEQEEPAKTDQAVSK Unmodified 1989.9127 0.91270772 230 A0A0C4DG51;Q9NP80 PNPLA8 Calcium-independent phospholipase A2-gamma yes no 0 0 1 1 1 1 1 15.074 15.074 3 9.8586E-05 7278 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.574 80.485 112290000 16875000 0 17088000 0 0 0 0 0 31687000 0 46638000 0 0 41424 230 38657 370219;370220;370221;370222 470706;470707;470708;470709 470709 4 SQSLQDQPTR Unmodified 1158.5629 0.56291441 3590 Q8N4C8 MINK1 Misshapen-like kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 15.722 15.722 2 0.019579 7737 QUIQUE_C1438_190116_001 60.102 27.26 638470000 0 0 0 0 308870000 0 0 167810000 0 0 0 0 161780000 41425 3590 38658 370223;370224;370225 470710;470711;470712 470710 3 SQSLTNAFNLPEPAPPRPSLSQDEVK Unmodified 2821.4246 0.4246366 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 107.66 107.66 2;3 7.7258E-70 111139 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.43 154.44 3092500000 262620000 378420000 447650000 473010000 0 277200000 0 340500000 258850000 109010000 313100000 232180000 0 41426 2125 38659 370226;370227;370228;370229;370230;370231;370232;370233;370234;370235;370236;370237;370238 470713;470714;470715;470716;470717;470718;470719;470720;470721;470722;470723;470724;470725;470726;470727;470728;470729;470730;470731;470732;470733 470732 21 SQSLTNAFNLPEPAPPRPSLSQDEVKAETIR Unmodified 3391.7372 0.73719696 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 2 1 106.77 106.77 4 0.00019734 108579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.188 35.373 104610000 0 0 0 0 0 0 0 104610000 0 0 0 0 0 41427 2125 38660 370239 470734;470735 470734 2 SQSLTNAFSFSESSFFR Unmodified 1940.8905 0.89045614 3755 Q92777 SYN2 Synapsin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 142.68 142.68 2 7.5025E-13 147396 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.21 139.64 447460000 47077000 24061000 27115000 62315000 38112000 0 0 43435000 50033000 0 42365000 42977000 69965000 41428 3755 38661 370240;370241;370242;370243;370244;370245;370246;370247;370248;370249;370250 470736;470737;470738;470739;470740;470741;470742;470743;470744;470745;470746;470747 470743 11 SQSLTNSLSTSDTSQR Unmodified 1710.802 0.80203506 1471 O14994;A0A0A0MR68 SYN3 Synapsin-3 yes no 0 0 0 1 41.198 41.198 2 0.01226 37514 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.537 56.27 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41429 1471 38662 370251 470748 470748 1 SQSRSNSPLPVPPSK Unmodified 1579.8318 0.83181904 2982 Q13247 SRSF6 Serine/arginine-rich splicing factor 6 yes yes 0 0 1 1 83.022 83.022 3 0.062273 84739 QUIQUE_C1576_190116_001 23.362 2.3955 48347000 0 0 0 0 0 0 48347000 0 0 0 0 0 0 41430 2982 38663 370252 470749 470749 1 SQSSNDTFPTAMHIAAAIEVHEVLLPGLQK Oxidation (M) 3219.6234 0.62341276 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 136.46 136.46 4 4.4828E-06 140310 QUIQUE_C1403_190116_001 52.685 47.084 205080000 81375000 0 0 71408000 52299000 0 0 0 0 0 0 0 0 41431 1935 38664 370253;370254;370255 470750;470751;470752 470751 1171 3 SQSSNDTFPTAMHIAAAIEVHEVLLPGLQK Unmodified 3203.6285 0.62849814 1935 P07954 FH Fumarate hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 145.44 145.44 3;4 0.00045657 150714 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.698 30.732 492480000 0 47395000 0 0 105210000 0 0 0 49207000 0 144420000 0 146250000 41432 1935 38664 370256;370257;370258;370259;370260 470753;470754;470755;470756;470757 470755 5 SQSVDINAPGFNPLAGAGK Unmodified 1841.9272 0.92717599 3597 Q8N573 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 102.61 102.61 2 2.3092E-23 104762 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.78 118.48 1195700000 0 0 0 141420000 118200000 0 101340000 106520000 94514000 36814000 276140000 152600000 168120000 41433 3597 38665 370261;370262;370263;370264;370265;370266;370267;370268;370269;370270 470758;470759;470760;470761;470762;470763;470764;470765;470766;470767 470761 10 SQSVRPGADVTFICTAK Unmodified 1835.92 0.91998213 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 1 1 1 1 1 57.217 57.217 2 0.00015154 56673 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.54 68.044 145720000 0 0 0 0 42175000 0 0 0 0 0 31580000 45223000 26738000 41434 2834 38666 370271;370272;370273;370274 470768;470769;470770;470771 470769 4 SQTAMSETYDFLFK Acetyl (Protein N-term) 1708.7654 0.76543854 2165 P20338 RAB4A Ras-related protein Rab-4A yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.63 167.63 2 1.7854E-07 171206 QUIQUE_C1277_190116_001 151.1 134.18 274170000 30882000 36239000 32032000 25863000 22087000 0 28807000 0 53409000 6655200 0 0 38196000 41435 2165 38667 370275;370276;370277;370278;370279;370280;370281;370282;370283 470772;470773;470774;470775;470776;470777;470778;470779;470780 470773 7 SQTDQLVLIFAGK Unmodified 1418.7769 0.77692993 4433 Q9UHD9 UBQLN2 Ubiquilin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 127.02 127.02 2 0.0025987 132612 QUIQUE_C1218_190116_001 73.781 62.569 621100000 86723000 99462000 0 0 103800000 0 92642000 0 81542000 0 0 68972000 87955000 41436 4433 38668 370284;370285;370286;370287;370288;370289;370290 470781;470782;470783;470784;470785;470786;470787 470781 6 SQTGVGELTTQNTR Unmodified 1490.7325 0.73249893 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 33.308 33.308 2 0.00047167 28639 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.19 72.706 174320000 0 0 0 0 0 78517000 0 0 0 0 50373000 45433000 0 41437 3797 38669 370291;370292;370293;370294 470788;470789;470790;470791 470790 4 SQTIYEIIDNSQGFYVCPVEPQNR Unmodified 2856.3389 0.33885806 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 145.46 145.46 2;3 4.5647E-143 149520 QUIQUE_C1277_190116_001 269.02 251.32 13065000000 784540000 1041900000 1141900000 1188800000 1015800000 1262200000 992670000 798300000 1054300000 459820000 1044100000 1039900000 1240700000 41438 4639 38670 370295;370296;370297;370298;370299;370300;370301;370302;370303;370304;370305;370306;370307;370308;370309;370310;370311;370312;370313;370314;370315;370316;370317;370318;370319;370320;370321 470792;470793;470794;470795;470796;470797;470798;470799;470800;470801;470802;470803;470804;470805;470806;470807;470808;470809;470810;470811;470812;470813;470814;470815;470816;470817;470818;470819;470820;470821;470822;470823;470824;470825;470826;470827;470828;470829;470830;470831;470832;470833;470834;470835 470798 44 SQTLSQMTIVLCK Unmodified 1507.7738 0.77383516 4279 Q9NRY5;E7ESJ7 FAM114A2 Protein FAM114A2 yes no 0 0 0 1 1 93.84 93.84 2 0.0014787 95557 QUIQUE_C1403_190116_001 103.91 80.059 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41439 4279 38671 370322;370323 470836;470837 470836 2 SQTSQDLFSYQALYSYIPQNDDELELR Unmodified 3222.4993 0.49931768 4058;309 A0A0U1RQI5;A0A3B3IT56;A0A3B3IRR9;A0A3B3IRW8;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 162.43 162.43 3 1.1693E-06 167108 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.021 51.146 134380000 0 0 0 0 0 0 0 34389000 0 0 53235000 0 46752000 41440 309;4058 38672 370324;370325;370326 470838;470839;470840;470841 470841 3 SQTSSIPQKPQTNK Unmodified 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470843;470844;470845;470846;470847;470848;470849;470850;470851;470852;470853;470854;470855;470856;470857;470858;470859;470860;470861;470862;470863;470864;470865;470866;470867;470868;470869 470865 26 SQTTYYAQCYR Unmodified 1439.614 0.6139637 667;668 B7ZC38;Q9NR46;B7ZC39 SH3GLB2 Endophilin-B2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.997 38.997 2 2.9979E-18 34539 QUIQUE_C1368_190116_001 169.09 152.06 1004700000 50611000 76734000 90748000 58883000 73595000 50777000 85848000 74299000 63699000 45437000 110850000 83423000 139770000 41443 667;668 38675 370353;370354;370355;370356;370357;370358;370359;370360;370361;370362;370363;370364;370365 470870;470871;470872;470873;470874;470875;470876;470877;470878;470879;470880;470881;470882;470883;470884;470885;470886;470887;470888;470889;470890 470874 21 SQTVSAIATTAMGSPK Unmodified 1548.7818 0.78175731 2233 P24821;J3QSU6;F5H7V9;H0YGZ3 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 66.041 66.041 2 2.4893E-09 66120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.09 101.23 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471139 142 SQVFSTAADGQTQVEIK Unmodified 1807.8952 0.89520716 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 2 2 2 2 2 71.157 71.157 2 4.8303E-63 67751 QUIQUE_DMIX4_190116_001 190.37 170.81 889210000 118570000 114870000 75061000 109240000 50199000 85784000 0 50730000 102420000 90777000 0 53924000 37639000 41454 2415 38685 370630;370631;370632;370633;370634;370635;370636;370637;370638;370639;370640;370641;370642;370643;370644;370645;370646;370647;370648;370649 471276;471277;471278;471279;471280;471281;471282;471283;471284;471285;471286;471287;471288;471289;471290;471291;471292;471293;471294;471295;471296;471297;471298;471299;471300;471301;471302 471295 25 SQVMDEATALQLR Unmodified 1460.7293 0.72932781 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 87.927 87.927 2;3 2.1373E-10 89726 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.74 100.56 2745400000 173150000 181920000 166640000 167650000 149390000 175350000 210080000 430090000 286910000 109860000 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SQVNALEGELEEQR Unmodified 1600.7693 0.76927837 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 81.706 81.706 2 0.00020248 83753 QUIQUE_C1218_190116_001 112.43 87.575 102940000 33660000 37701000 0 0 0 31580000 0 0 0 0 0 0 0 41458 1613 38688 370675;370676;370677;370678 471337;471338;471339;471340 471337 4 SQVTHYSNLLCDLLR Unmodified 1817.9094 0.90941744 416 A0A2R8Y5E4;A0A2R8YFK2;A0A2R8Y6M6;A0A2R8Y4C2;A0A2R8YFS8;A0A2R8Y8C4;A0A2R8Y5C9;A0A2R8Y596;P56945 BCAR1 Breast cancer anti-estrogen resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 121.5 121.5 3 0.0020039 125566 QUIQUE_DMIX8_190116_001 44.005 29.751 81291000 0 0 0 0 0 26832000 24499000 0 0 0 0 0 29959000 41459 416 38689 370679;370680;370681 471341;471342;471343 471343 3 SQVTNYLGIEWMR Oxidation (M) 1611.7715 0.77152697 2563 P50440 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 113.97 113.97 2 0.0043941 111157 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.685 55.095 89280000 0 37432000 0 0 0 33885000 0 0 0 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471352;471353;471354;471355;471356;471357;471358;471359;471360;471361;471362;471363;471364;471365;471366;471367;471368;471369;471370;471371;471372;471373;471374;471375;471376 471355 25 SQVVIPILQWAIASTTLDHR Unmodified 2247.2376 0.23755152 4625 Q9Y5L0;C9J7E5;E9PFH4 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.32 166.32 3 2.8014E-07 169976 QUIQUE_C1277_190116_001 96.131 82.901 582480000 45600000 51842000 0 31010000 46696000 45846000 37359000 42360000 52511000 7898100 43241000 94059000 84061000 41463 4625 38692 370702;370703;370704;370705;370706;370707;370708;370709;370710;370711;370712;370713 471377;471378;471379;471380;471381;471382;471383;471384;471385;471386;471387;471388 471378 12 SQWLDVK Unmodified 874.45487 0.45486751 2174 P21266;A0A0A0MTN3 GSTM3 Glutathione S-transferase Mu 3 yes no 0 0 0 1 53.438 53.438 2 0.035439 51747 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.872 50.285 1323000000 0 0 0 0 0 0 0 0 1323000000 0 0 0 0 41464 2174 38693 370714 471389 471389 1 SQWLNEK Unmodified 903.44503 0.4450311 2277;1965;141;2883;481 A0A0A0MR85;A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1;P09488;E7EWW9;B9ZVX7;H3BRM6;H3BQT3;Q03013;P28161;E9PHN6;F6XZQ7;E9PHN7;E9PLF1 GSTM4;GSTM5;GSTM1;GSTM2 Glutathione S-transferase Mu 5;Glutathione S-transferase Mu 1;Glutathione S-transferase Mu 4;Glutathione S-transferase Mu 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.726 28.726 2 0.021626 24298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.37 51.729 8971000000 1280600000 0 621080000 1522600000 0 925110000 865060000 2272500000 0 0 839240000 644760000 0 41465 141;481;1965;2883;2277 38694 370715;370716;370717;370718;370719;370720;370721;370722 471390;471391;471392;471393;471394;471395;471396;471397;471398 471395 7 SQWMLEQLR Unmodified 1189.5914 0.59137776 3653 Q8NFX7 STXBP6 Syntaxin-binding protein 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 94.708 94.708 2 0.0098665 96859 QUIQUE_C1368_190116_001 74.92 55.826 198790000 0 0 74618000 0 0 0 0 45595000 0 19437000 0 59136000 0 41466 3653 38695 370723;370724;370725;370726 471399;471400;471401;471402 471399 4 SQWSPALTISK Unmodified 1216.6452 0.64518747 131 A0A0A0MQU3;P62837;D6RFM0;D6RAH7;H9KV45;A0A087WY85;P61077;D6RAW0 UBE2D2;UBE2D3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.059 75.059 2 0.0023203 74620 QUIQUE_C1563_190116_001 79.07 56.49 3353500000 0 268890000 338950000 361450000 343230000 321310000 454760000 0 448150000 0 0 366020000 450760000 41467 131 38696 370727;370728;370729;370730;370731;370732;370733;370734;370735 471403;471404;471405;471406;471407;471408;471409;471410;471411;471412 471408 6 SQWSPALTVSK Unmodified 1202.6295 0.62953741 54 A0A087WW00;P51668;C9J9H9;Q9Y2X8 UBE2D1;UBE2D4 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4 yes no 0 0 0 1 62.338 62.338 2 0.03042 61978 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.204 29.191 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41468 54 38697 370736 471413 471413 1 SQWYELQQLDSK Acetyl (Protein N-term) 1565.7362 0.73618733 2444 P42224;E7EPD2;D2KFR9;E7ENM1;E9PH66 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.44 135.44 2 2.5211E-05 141100 QUIQUE_C1218_190116_001 126.19 109.17 787650000 65757000 65340000 133440000 0 77547000 0 87330000 0 76619000 0 186460000 0 95147000 41469 2444 38698 370737;370738;370739;370740;370741;370742;370743;370744;370745 471414;471415;471416;471417;471418;471419;471420;471421;471422;471423;471424 471414 8 SQYEQLAEQNR Unmodified 1364.6321 0.6320566 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.813 35.813 2 1.0817E-18 31124 QUIQUE_DMIX4_190116_001 204.07 195.16 3545700000 436680000 217890000 151610000 329710000 238580000 305930000 211490000 137490000 174180000 724460000 258410000 359270000 0 + 41470 776 38699 370746;370747;370748;370749;370750;370751;370752;370753;370754;370755;370756;370757;370758 471425;471426;471427;471428;471429;471430;471431;471432;471433;471434;471435;471436;471437;471438;471439 471437 14 SQYEQLAEQNRK Unmodified 1492.727 0.72701962 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 1 22.09 22.09 2;3 3.3856E-05 15545 QUIQUE_C1218_190116_001 129.39 77.11 7240200000 510950000 208850000 305970000 397070000 331020000 262160000 442500000 0 0 934020000 1409300000 1404000000 1034400000 + 41471 776 38700 370759;370760;370761;370762;370763;370764;370765;370766;370767;370768;370769;370770;370771;370772;370773;370774;370775;370776;370777;370778;370779;370780 471440;471441;471442;471443;471444;471445;471446;471447;471448;471449;471450;471451;471452;471453;471454;471455;471456;471457;471458;471459;471460;471461;471462 471440 19 SQYLQLGPSR Unmodified 1147.5986 0.59857163 3404 Q6UUV9;M0QX46 CRTC1 CREB-regulated transcription coactivator 1 yes no 0 0 0 1 56.657 56.657 2 0.029647 54641 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.278 39.656 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41472 3404 38701 370781 471463 471463 1 SQYNFIADVVEK Unmodified 1411.6983 0.69834526 229 A0A0C4DG44;O43464 HTRA2 Serine protease HTRA2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 106.41 106.41 2 0.0066625 110748 QUIQUE_C1438_190116_001 64.55 53.386 263710000 57070000 73505000 0 0 56772000 0 76367000 0 0 0 0 0 0 41473 229 38702 370782;370783;370784;370785 471464;471465;471466;471467;471468 471467 5 SRADLTAEMISAPLGDFR Unmodified 1948.9677 0.9676606 4160 Q9H3Q1;J3KRZ9;J3QQS6;J3QR93 CDC42EP4 Cdc42 effector protein 4 yes no 0 0 1 1 1 1 119.09 119.09 3 0.00039137 122107 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.267 46.787 148630000 0 0 0 0 0 0 0 77025000 34139000 0 0 0 37462000 41474 4160 38703 370786;370787;370788 471469;471470;471471 471469 3 SRAELVGQLQR Unmodified 1255.6997 0.69968266 4111 Q9H008;Q5T1Z0 LHPP Phospholysine phosphohistidine inorganic pyrophosphate phosphatase yes no 0 0 1 1 1 29.376 29.376 3 0.0078641 24492 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.799 41.427 213780000 0 0 0 0 0 0 0 115790000 97994000 0 0 0 0 41475 4111 38704 370789;370790 471472;471473 471472 1 SRAEVDLER Unmodified 1073.5465 0.54653606 2405 P36959 GMPR 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Unmodified 2847.4841 0.48406573 2856;1255;902;1134 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;H0Y931 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 1 2 124.1 124.1 3;4 5.6415E-46 128008 QUIQUE_C1277_190116_001 149.04 142.24 4616500000 165910000 284910000 485370000 216970000 357060000 196500000 489450000 441000000 708090000 44134000 268400000 312730000 646000000 41479 902;1255;2856;1134 38708 370800;370801;370802;370803;370804;370805;370806;370807;370808;370809;370810;370811;370812;370813;370814;370815;370816;370817;370818;370819;370820;370821;370822;370823;370824;370825 471483;471484;471485;471486;471487;471488;471489;471490;471491;471492;471493;471494;471495;471496;471497;471498;471499;471500;471501;471502;471503;471504;471505;471506;471507;471508;471509;471510;471511;471512;471513;471514;471515;471516;471517;471518;471519;471520;471521 471489 39 SREDLSAQPVQTK Unmodified 1457.7474 0.74742071 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 147.93 147.93 2;3 7.8573E-22 153072 QUIQUE_DMIX3_190116_001 136.17 110.04 751240000 0 0 0 0 23640000 0 0 206040000 184630000 0 138850000 182310000 15775000 41482 2740;1041;2739 38711 370841;370842;370843;370844;370845;370846;370847;370848;370849;370850 471537;471538;471539;471540;471541;471542;471543;471544;471545;471546;471547;471548 471542 11 SREYQLNDSAAYYLNDLDR Unmodified 2305.0611 0.061103292 2779 P63096;A0A3B3ITM0 GNAI1 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 107.47 107.47 3 6.221E-05 110602 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.539 78.352 394350000 0 0 0 0 0 0 0 94392000 73306000 0 86524000 56604000 83529000 41483 2779 38712 370851;370852;370853;370854;370855 471549;471550;471551;471552;471553;471554 471552 6 SREYQLNDSAAYYLNDLER Unmodified 2319.0768 0.076753356 1870 P04899 GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 yes yes 0 0 1 1 109.35 109.35 3 0.027796 113389 QUIQUE_DMIX8_190116_001 49.973 41.886 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41484 1870 38713 370856 471555 471555 1 SREYQLNDSAK Unmodified 1309.6262 0.62624295 1963 P09471;H3BTM2;A0A1W2PP87 GNAO1 Guanine nucleotide-binding protein G(o) subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 15.654 15.654 2;3 5.9324E-12 8197 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.63 127.54 1649700000 0 0 0 19743000 0 0 0 1176400000 223530000 0 0 230060000 0 41485 1963 38714 370857;370858;370859;370860;370861;370862 471556;471557;471558;471559;471560;471561 471559 6 SREYQLNDSASYYLNDLDR Unmodified 2321.056 0.056017914 1953 P08754 GNAI3 Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha yes yes 0 0 1 1 1 102.43 102.43 3 7.2813E-05 105283 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.88 60.926 131090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 67725000 63363000 41486 1953 38715 370863;370864 471562;471563;471564 471562 3 SRFDRPPAR Unmodified 1100.5839 0.58392462 208 A0A0B4J1Z1;C9JAB2;Q16629;F8WEA1 SRSF7 Serine/arginine-rich splicing factor 7 yes no 0 0 2 1 10.589 10.589 3 0.056662 2968 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.626 52.096 22349000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22349000 0 0 0 41487 208 38716 370865 471565 471565 1 SRGEGPEAEFQSLTPSQIK Unmodified 2060.0174 0.017447563 4163 Q9H425 C1orf198 Uncharacterized protein C1orf198 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 81.412 81.412 3 0.0051973 82410 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.276 51.746 237000000 0 0 0 0 0 54408000 0 45505000 58704000 0 0 0 78384000 41488 4163 38717 370866;370867;370868;370869 471566;471567;471568;471569 471569 1 SRLEVSDDLENVCNWVVDTCLHK Unmodified 2787.2956 0.29561303 1652 O75688;C9JIR6;A0A3B3IS24 PPM1B Protein phosphatase 1B yes no 0 0 1 1 138.58 138.58 4 0.017418 144236 QUIQUE_C1576_190116_001 27.672 20.857 38423000 0 0 0 0 0 0 38423000 0 0 0 0 0 0 41489 1652 38718 370870 471570 471570 1 SRLEVTDDLEK Unmodified 1303.662 0.66195975 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 38.093 38.093 2 0.029884 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471600;471601;471602;471603;471604 471603 5 SRPVINIQK Unmodified 1053.6295 0.62947783 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 19.498 19.498 2;3 0.015652 12248 QUIQUE_C1368_190116_001 60.717 47.125 435510000 0 0 60990000 47161000 134420000 58213000 0 0 0 0 134730000 0 0 41496 2207 38725 370903;370904;370905;370906;370907;370908 471605;471606;471607;471608;471609;471610 471605 5 SRQELEQHSVDTASTSDAVTFITYVQSLK Unmodified 3239.5946 0.59461505 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 134.2 134.2 3;4 1.907E-27 140012 QUIQUE_C1576_190116_001 108.73 102.82 896280000 0 0 64085000 0 33991000 0 171590000 90944000 177420000 0 0 98019000 260220000 41497 3053 38726 370909;370910;370911;370912;370913;370914;370915;370916 471611;471612;471613;471614;471615;471616;471617;471618 471614 8 SRQELEQHSVDTASTSDAVTFITYVQSLKR Unmodified 3395.6957 0.69572608 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 2 1 121.54 121.54 4 0.00021498 124223 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.734 36.415 45369000 0 0 0 0 0 0 0 45369000 0 0 0 0 0 41498 3053 38727 370917 471619 471619 1 SRSPGSPVGEGTGSPPK Unmodified 1595.7903 0.79034816 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2;H0Y9H2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 1 1 1 1 16.618 16.618 3 0.0014614 8715 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.65 35.067 150390000 0 0 0 0 0 0 0 32902000 0 0 81894000 0 35599000 41499 854 38728 370918;370919;370920 471620;471621;471622 471621 3 SRYDSIDSYLSK Unmodified 1432.6834 0.68342347 2509;438 A0A2R8Y648;P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit no no 0 0 1 2 2 1 1 1 2 1 2 2 1 2 2 67.194 67.194 2;3 0.0031345 67893 QUIQUE_C1218_190116_001 107.85 29.331 626350000 27667000 56787000 20415000 25634000 33963000 36284000 27712000 82014000 86631000 14272000 115880000 99090000 0 41500 438;2509 38729 370921;370922;370923;370924;370925;370926;370927;370928;370929;370930;370931;370932;370933;370934;370935;370936;370937;370938;370939 471623;471624;471625;471626;471627;471628;471629;471630;471631;471632;471633;471634;471635;471636;471637;471638;471639;471640;471641;471642;471643 471623 21 SRYETYIHLLAMK Unmodified 1623.8443 0.84429799 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 85.127 85.127 4 0.053308 86477 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.708 22.658 17431000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17431000 0 41501 3997 38730 370940 471644 471644 1 SSAAGPDPSEAPEER Acetyl (Protein N-term) 1540.6641 0.66414459 554 A6XGL0;A0A087WUA6 YJEFN3 YjeF N-terminal domain-containing protein 3 yes no 1 0 0 1 45.278 45.278 2 3.0756E-05 42099 QUIQUE_C1277_190116_001 82.362 58.018 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41502 554 38731 370941 471645 471645 1 SSAEVIAQAR Unmodified 1030.5407 0.5407224 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.383 22.383 2 1.2146E-49 15492 QUIQUE_C1277_190116_001 214.64 145.44 98419000000 9065300000 7893600000 7459400000 6856700000 8094800000 6467600000 8397100000 6159900000 6207200000 6747100000 9441000000 6794000000 8835400000 41503 365 38732 370942;370943;370944;370945;370946;370947;370948;370949;370950;370951;370952;370953;370954 471646;471647;471648;471649;471650;471651;471652;471653;471654;471655;471656;471657;471658;471659;471660;471661;471662;471663;471664;471665;471666;471667;471668;471669;471670;471671;471672;471673;471674;471675;471676 471650 31 SSAHWWLAAR Unmodified 1183.5887 0.58867565 4355 Q9NZQ3;C9JSC3;F8WCR8 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.473 59.473 3 0.0025356 57921 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.067 35.695 63959000 20928000 0 0 0 0 0 15289000 16144000 0 11597000 0 0 0 41504 4355 38733 370955;370956;370957;370958;370959 471677;471678;471679;471680;471681 471680 4 SSAIGIENIQEVQEK Unmodified 1643.8366 0.83662965 985 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41512 1187 38741 371003 471728 471728 1 SSAPTTPPSVDKVDGFSR Acetyl (Protein N-term) 1888.9167 0.91667089 3180 Q16537 PPP2R5E Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform yes yes 1 0 1 1 1 1 1 79.723 79.723 2 2.2596E-29 81959 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.26 124.04 179470000 0 0 0 0 0 0 0 49489000 0 0 49237000 38042000 42702000 41513 3180 38742 371004;371005;371006;371007 471729;471730;471731;471732 471730 3 SSAQDPQAVLGALGR Unmodified 1468.7634 0.76340513 2254 P26640;A0A140T936;A0A140T954;A2ABF4;A0A0G2JJT9;A0A140T904 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 91.853 91.853 2 0.0018165 93644 QUIQUE_C1368_190116_001 67.385 49.521 583320000 106420000 0 108040000 96670000 0 0 100770000 78897000 92525000 0 0 0 0 41514 2254 38743 371008;371009;371010;371011;371012;371013 471733;471734;471735;471736;471737;471738;471739 471735 6 SSAQSSAPPAPGAR Unmodified 1282.6266 0.6265773 4197 Q9H9H5;C9JPF8;H7BZQ6 MAP6D1 MAP6 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 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2.3361E-31 31256 QUIQUE_C1438_190116_001 180.07 121.09 23478000000 2305300000 2329800000 2152000000 2076600000 1712600000 1596800000 2165300000 1297000000 1275300000 978320000 1882300000 1692000000 2014700000 41517 273;342 38746 371030;371031;371032;371033;371034;371035;371036;371037;371038;371039;371040;371041;371042;371043;371044;371045;371046;371047;371048;371049;371050;371051;371052;371053;371054;371055;371056;371057;371058;371059;371060 471758;471759;471760;471761;471762;471763;471764;471765;471766;471767;471768;471769;471770;471771;471772;471773;471774;471775;471776;471777;471778;471779;471780;471781;471782;471783;471784;471785;471786;471787;471788;471789;471790;471791;471792;471793;471794;471795;471796;471797;471798 471772 40 SSASVVFTTYTQK Unmodified 1417.7089 0.70890994 3444 Q7L5D6 GET4 Golgi to ER traffic protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 66.437 66.437 2 7.7625E-05 65998 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.34 82.19 171350000 31864000 41677000 0 0 34353000 0 0 35476000 0 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471811;471812;471813;471814;471815;471816;471817;471818;471819;471820;471821;471822 471818 12 SSAVPPGLPVYLDLCYIPNHSNSK Unmodified 2627.3054 0.30537308 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 2 3 1 2 2 2 1 3 1 2 130.02 130.02 2;3 9.6189E-15 127362 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.43 99.323 3743100000 233170000 415580000 321520000 213950000 279360000 407480000 486470000 0 0 152080000 401990000 394360000 437120000 41521 2483 38750 371084;371085;371086;371087;371088;371089;371090;371091;371092;371093;371094;371095;371096;371097;371098;371099;371100;371101;371102;371103 471823;471824;471825;471826;471827;471828;471829;471830;471831;471832;471833;471834;471835;471836;471837;471838;471839;471840;471841;471842;471843;471844;471845;471846;471847;471848;471849;471850;471851;471852;471853;471854;471855;471856;471857;471858;471859;471860;471861;471862;471863;471864;471865;471866;471867;471868;471869 471854 47 SSAYESLMEIVK Unmodified 1355.6643 0.66426794 3090 Q14974;J3KTM9;J3QKQ5 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.17 124.17 2 0.00044935 130190 QUIQUE_C1438_190116_001 125.75 104.15 3015900000 235470000 229410000 294520000 254000000 236590000 269350000 215410000 213730000 271490000 113460000 226740000 239300000 216450000 41522 3090 38751 371104;371105;371106;371107;371108;371109;371110;371111;371112;371113;371114;371115;371116 471870;471871;471872;471873;471874;471875;471876;471877;471878;471879;471880;471881;471882;471883;471884 471875 15 SSAYQELLQAK Unmodified 1236.635 0.63501672 2549 P49802;Q5T3H5 RGS7 Regulator of G-protein signaling 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.579 71.579 2 0.00074623 71788 QUIQUE_C1277_190116_001 96.331 80.128 652400000 78007000 83136000 57259000 64671000 51489000 49012000 66116000 64657000 0 0 79202000 58848000 0 41523 2549 38752 371117;371118;371119;371120;371121;371122;371123;371124;371125;371126 471885;471886;471887;471888;471889;471890;471891;471892;471893;471894 471886 7 SSCSLIAFNSDRPGVLGIVPLQGQGEDK Unmodified 2943.476 0.47602024 204 A0A0A6YYL4;P57737;I3L167;I3L426;I3L359;I3L2Y6;I3L1M1;I3NI06;I3L1G9 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 1 1 1 130.97 130.97 3 0.00022265 133611 QUIQUE_C1563_190116_001 45.462 39.099 79528000 0 0 0 0 0 29070000 0 50457000 0 0 0 0 0 41524 204 38753 371127;371128 471895;471896 471895 2 SSDASQGVITTPPPPSMPHK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 2090.9943 0.99426928 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 1 1 0 1 1 1 1 1 1 2 3 1 1 1 2 58.737 58.737 2;3 1.4163E-56 57382 QUIQUE_DMIX1_190116_001 168.89 156.62 815670000 23983000 59143000 0 40449000 39727000 25678000 38688000 124900000 195120000 34105000 74760000 54593000 104520000 41525 4418 38754 371129;371130;371131;371132;371133;371134;371135;371136;371137;371138;371139;371140;371141;371142;371143;371144 471897;471898;471899;471900;471901;471902;471903;471904;471905;471906;471907;471908;471909;471910;471911;471912;471913;471914;471915;471916;471917 471904 2944 21 SSDASQGVITTPPPPSMPHK Acetyl (Protein N-term) 2074.9994 0.99935466 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 78.544 78.544 2;3 1.3252E-220 79417 QUIQUE_C1277_190116_001 261.27 237.53 1191700000 59485000 104680000 99224000 123030000 77377000 102710000 89986000 78161000 86887000 76769000 119680000 66939000 106800000 41526 4418 38754 371145;371146;371147;371148;371149;371150;371151;371152;371153;371154;371155;371156;371157;371158;371159 471918;471919;471920;471921;471922;471923;471924;471925;471926;471927;471928;471929;471930;471931;471932;471933;471934;471935;471936;471937;471938;471939;471940;471941;471942;471943;471944;471945;471946 471921 29 SSDCPYIVQFYGALFR Unmodified 1921.9033 0.90326943 2474 P45985 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 162.76 162.76 2 9.6868E-05 167377 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.866 70.668 218350000 21770000 33149000 25921000 0 0 0 0 0 28892000 0 51353000 57262000 0 41527 2474 38755 371160;371161;371162;371163;371164;371165 471947;471948;471949;471950;471951;471952;471953 471950 7 SSDRVDGPASNLK Unmodified 1344.6634 0.66335673 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 2 2 1 2 18.482 18.482 2;3 0.00097486 11030 QUIQUE_C1438_190116_001 79.614 71.309 929950000 0 46476000 0 98970000 166590000 73514000 54125000 71218000 108780000 0 127330000 36027000 146920000 41528 2037 38756 371166;371167;371168;371169;371170;371171;371172;371173;371174;371175;371176;371177;371178;371179;371180 471954;471955;471956;471957;471958;471959;471960;471961;471962;471963;471964;471965;471966;471967;471968 471957 7 SSDTAGPSSVQQPHGHPTSSR Unmodified 2118.9679 0.96787161 439 A0A2R8Y661;A0A2R8YGD3;Q9Y4G8 RAPGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 13.103 13.103 4 5.0841E-08 5085 QUIQUE_C1368_190116_001 93.5 77.734 7258800 2983500 0 4275300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41529 439 38757 371181;371182 471969;471970 471970 2 SSEDPNEDIVER Unmodified 1388.6056 0.60556708 817 D6RHJ6;D6RD17;P01591;C9JA05 JCHAIN;IGJ Immunoglobulin J chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 35.524 35.524 2 1.8833E-05 31548 QUIQUE_C1438_190116_001 129.85 108.39 155620000 0 0 26436000 18784000 79956000 0 0 0 0 0 30444000 0 0 41530 817 38758 371183;371184;371185;371186 471971;471972;471973;471974;471975 471974 5 SSEEIESAFR Unmodified 1153.5251 0.52513192 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFH4;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 54.126 54.126 2 1.3157E-17 52806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 178.94 139.98 22233000000 1604500000 2144800000 1896200000 1760100000 1505700000 1677000000 1955000000 1754100000 1719500000 887460000 1815400000 1689000000 1824400000 41531 267;275;3025 38759 371187;371188;371189;371190;371191;371192;371193;371194;371195;371196;371197;371198;371199;371200 471976;471977;471978;471979;471980;471981;471982;471983;471984;471985;471986;471987;471988;471989;471990;471991;471992;471993;471994;471995;471996;471997;471998;471999 471994 24 SSEELLSALQK Unmodified 1203.6347 0.63468237 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 80.23 80.23 2 0.062105 76454 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.084 37.098 27611000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27611000 0 0 0 41532 153 38760 371201 472000 472000 1 SSEHINEGETAMLVCK Unmodified 1803.8131 0.81313379 2383;4671 R4GMX5;R4GN83;P35613;A0A087WUV8;A0A087X2B5;I3L192 BSG Basigin no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 49.288 49.288 2;3 2.8773E-45 46315 QUIQUE_C1368_190116_001 186.13 168.07 1644100000 189310000 218040000 196710000 205970000 169590000 124950000 212140000 39036000 32389000 0 132760000 123220000 0 41533 4671;2383 38761 371202;371203;371204;371205;371206;371207;371208;371209;371210;371211;371212;371213;371214;371215;371216;371217;371218;371219;371220;371221;371222 472001;472002;472003;472004;472005;472006;472007;472008;472009;472010;472011;472012;472013;472014;472015;472016;472017;472018;472019;472020;472021;472022;472023;472024 472007 20 SSEIEQAVQSLDR Unmodified 1460.7107 0.71070086 3986 Q9BPX5 ARPC5L Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.539 98.539 2 3.2141E-31 101435 QUIQUE_C1368_190116_001 177.57 154.83 3159100000 259780000 288630000 281760000 231430000 243350000 255210000 296570000 195210000 200260000 108670000 216180000 280570000 301510000 41534 3986 38762 371223;371224;371225;371226;371227;371228;371229;371230;371231;371232;371233;371234;371235 472025;472026;472027;472028;472029;472030;472031;472032;472033;472034;472035;472036;472037;472038;472039;472040;472041;472042 472027 16 SSELEQYLQR Unmodified 1251.6095 0.60953025 4425 Q9UH65;E7EMB1 SWAP70 Switch-associated protein 70 yes no 0 0 0 1 1 1 2 77.24 77.24 2 0.0074338 79014 QUIQUE_C1218_190116_001 102.46 83.194 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41535 4425 38763 371236;371237;371238;371239;371240 472043;472044;472045;472046;472047 472043 5 SSEMEPLLLAWSYFR Acetyl (Protein N-term) 1869.8971 0.89712142 244 A0A0C4DGH8;A0A0C4DGY3;A0A0C4DGX9;Q8TAM2;G3V2W6;G3V2Z9;G3V324;Q86U25 TTC8 Tetratricopeptide repeat protein 8 yes no 1 0 0 1 1 179.61 179.61 2 0.0058359 180421 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.721 54.577 4206100 0 0 0 0 0 0 0 1925900 0 0 0 0 2280200 41536 244 38764 371241;371242 472048;472049 472048 2 SSEMGIENVILGMPHR Unmodified 1768.86 0.86002441 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 111.07 111.07 2;3 2.8962E-06 114139 QUIQUE_C1368_190116_001 71.031 58.83 107550000 66911000 40641000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41537 4487 38765 371243;371244;371245;371246 472050;472051;472052;472053;472054 472053 5 SSEMNILIPQDGDYR Oxidation (M) 1752.7989 0.79886394 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 1 0 1 1 1 81.152 81.152 2 1.7758E-05 82275 QUIQUE_C1277_190116_001 94.191 81.615 78500000 26877000 24837000 26787000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41538 2422 38766 371247;371248;371249 472055;472056;472057 472056 1849 3 SSEMNILIPQDGDYR Unmodified 1736.8039 0.80394931 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 106.69 106.69 2 0.011088 110468 QUIQUE_C1218_190116_001 53.034 42.109 26929000 26929000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41539 2422 38766 371250 472058 472058 1 SSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFK Oxidation (M) 2826.3058 0.30582659 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 146.62 146.62 2;3 2.1269E-49 149437 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.6 121.9 529560000 83569000 0 107480000 111420000 86146000 91907000 0 0 0 49040000 0 0 0 41540 2857 38767 371251;371252;371253;371254;371255;371256;371257;371258;371259;371260 472059;472060;472061;472062;472063;472064;472065;472066;472067;472068;472069 472066 2329 10 SSEMNVLIPTEGGDFNEFPVPEQFK Unmodified 2810.3109 0.31091197 2857 Q01518 CAP1 Adenylyl cyclase-associated protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 154.42 154.42 2;3 5.2355E-14 159675 QUIQUE_C1368_190116_001 122.08 101.64 6462000000 491500000 479240000 590460000 641770000 476780000 302730000 341910000 510270000 576920000 177760000 790890000 527730000 554070000 41541 2857 38767 371261;371262;371263;371264;371265;371266;371267;371268;371269;371270;371271;371272;371273;371274;371275;371276;371277;371278;371279;371280;371281;371282;371283;371284;371285;371286 472070;472071;472072;472073;472074;472075;472076;472077;472078;472079;472080;472081;472082;472083;472084;472085;472086;472087;472088;472089;472090;472091;472092;472093;472094;472095;472096;472097;472098;472099;472100 472076 30 SSENFDELLK Unmodified 1180.5612 0.56118307 2292 P29762 CRABP1 Cellular retinoic acid-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.458 82.458 2 0.00014691 84970 QUIQUE_C1438_190116_001 122.13 100.67 4486300000 349410000 416850000 212450000 297090000 361120000 222280000 439070000 385140000 377470000 153890000 430660000 300300000 540550000 41542 2292 38768 371287;371288;371289;371290;371291;371292;371293;371294;371295;371296;371297;371298;371299 472101;472102;472103;472104;472105;472106;472107;472108;472109;472110;472111;472112;472113;472114;472115;472116;472117;472118;472119;472120;472121 472107 21 SSENGVDYVIMGMPHR Unmodified 1790.808 0.80798883 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 89.249 89.249 3 0.024011 90858 QUIQUE_C1368_190116_001 35.527 31.484 119510000 54859000 0 64652000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41543 903;2869 38769 371300;371301 472122;472123 472123 2 SSENPNEVFR Unmodified 1177.5364 0.53636531 2472 P45974 USP5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 34.271 34.271 2 1.4663E-11 28910 QUIQUE_C1368_190116_001 163.15 127.71 2010000000 0 207780000 384300000 237710000 0 0 297540000 183000000 164070000 0 0 217710000 317880000 41544 2472 38770 371302;371303;371304;371305;371306;371307;371308;371309;371310;371311;371312 472124;472125;472126;472127;472128;472129;472130;472131;472132;472133;472134;472135;472136;472137;472138;472139;472140;472141 472128 18 SSEPPPPPQPPTHQASVGLLDTPR Acetyl (Protein N-term) 2546.2765 0.2765158 4569 Q9Y2V2;H3BSW7;H3BUY4;H3BPY5;H3BNU9;H3BTK3;I3L3X8 CARHSP1 Calcium-regulated heat stable protein 1 yes no 1 0 0 1 1 92.048 92.048 3 2.2326E-07 93422 QUIQUE_C1403_190116_001 58.418 50.885 44505000 0 0 0 30562000 0 0 0 13943000 0 0 0 0 0 41545 4569 38771 371313;371314 472142;472143 472142 1 SSEPVQHEESIR Unmodified 1396.6583 0.65827136 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 15.842 15.842 3 0.0070685 7915 QUIQUE_DMIX8_190116_001 38.674 30.541 172210000 20970000 29741000 0 0 38474000 0 0 36978000 0 0 0 0 46046000 41546 345 38772 371315;371316;371317;371318;371319;371320;371321 472144;472145;472146;472147;472148;472149;472150 472150 7 SSEPVQLTEAETEYFVR Unmodified 1983.9426 0.94255129 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 118.84 118.84 2 3.9757E-53 124622 QUIQUE_C1438_190116_001 183.79 168.03 231860000 0 0 0 26932000 39106000 0 49093000 0 0 0 51235000 32968000 32526000 41547 4396 38773 371322;371323;371324;371325;371326;371327;371328;371329 472151;472152;472153;472154;472155;472156;472157;472158 472154 8 SSEYHLEDNAAYYLNDLER Unmodified 2301.0186 0.018569775 2142 P19086 GNAZ Guanine nucleotide-binding protein G(z) subunit alpha yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 2 1 1 2 1 2 117.45 117.45 2;3 6.0768E-23 122762 QUIQUE_C1218_190116_001 149.3 136.16 1503400000 93270000 117090000 158260000 137010000 107100000 136310000 173260000 84340000 88701000 0 174700000 85582000 147750000 41548 2142 38774 371330;371331;371332;371333;371334;371335;371336;371337;371338;371339;371340;371341;371342;371343;371344;371345;371346 472159;472160;472161;472162;472163;472164;472165;472166;472167;472168;472169;472170;472171;472172;472173;472174;472175;472176;472177;472178;472179;472180;472181;472182;472183;472184 472161 26 SSFADISNLLQIEPR Unmodified 1688.8733 0.87334951 3158 Q15785 TOMM34 Mitochondrial import receptor subunit TOM34 yes yes 0 0 0 1 148.35 148.35 2 0.001294 151247 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.933 55.302 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41549 3158 38775 371347 472185 472185 1 SSFDEMLPGTHFQR Unmodified 1650.746 0.7460405 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 87.13 87.13 2;3 0.0004612 89943 QUIQUE_C1218_190116_001 84.896 75.463 306830000 53611000 39151000 51622000 91708000 0 0 35838000 34899000 0 0 0 0 0 41550 903;2869 38776 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371358 472196 472196 1 SSFIIYDIMNELMGK Unmodified 1759.8525 0.85247941 3846 Q96EY7 PTCD3 Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 175.56 175.56 2 0.00065563 179642 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.76 69.267 38134000 0 0 0 0 0 0 0 0 9939000 0 18368000 9827000 0 41554 3846 38779 371359;371360;371361 472197;472198;472199 472197 3 SSFISVLQTSSSSLR Unmodified 1597.8312 0.83115034 2267 P27701;E9PJC7;E9PP61;E9PJB7;E9PJK9;E9PJ45;E9PM43 CD82 CD82 antigen;Tetraspanin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 115.07 115.07 2 6.8652E-06 119471 QUIQUE_C1576_190116_001 107.03 69.835 170640000 29167000 44159000 0 26427000 0 0 46885000 0 0 23997000 0 0 0 41555 2267 38780 371362;371363;371364;371365;371366 472200;472201;472202;472203;472204;472205 472204 6 SSFLIMWR Unmodified 1038.5321 0.53207197 4002 Q9BRG1;K7ENE3 VPS25 Vacuolar protein-sorting-associated protein 25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 120.41 120.41 2 0.026482 124878 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.32 81.423 47811000 0 0 0 0 0 0 0 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SSFQTMQGVITMDGTLQALAQIFK Unmodified 2614.3135 0.31349493 1283 J3KR97;Q9BTW9 TBCD Tubulin-specific chaperone D yes no 0 0 0 1 1 174.49 174.49 3 0.0023964 181628 QUIQUE_DMIX5_190116_001 36.295 29.525 31818000 0 0 0 0 0 0 0 0 10132000 0 21686000 0 0 41559 1283 38783 371386;371387 472228;472229 472229 2 SSFREEDNTYR Unmodified 1402.6113 0.61132116 1548 O43747;H3BNR4;H3BR36;H3BUN9;H3BN71;B4DGE1;H3BRM7;H3BN75;H3BS13;H3BV30 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes no 0 0 1 1 19.721 19.721 2 0.030486 12642 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.014 50.719 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41560 1548 38784 371388 472230 472230 1 SSFRGDTNFYGK Unmodified 1377.6313 0.63132832 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 1 1 35.905 35.905 3 0.0066826 31522 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.628 39.788 49513000 0 0 0 0 0 0 0 49513000 0 0 0 0 0 41561 2870 38785 371389 472231;472232 472231 2 SSFSITR Unmodified 796.40792 0.40791731 504 A0A3B3ITZ9;Q9Y2W1 THRAP3 Thyroid 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A1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 39.441 39.441 2;3 2.6402E-43 36768 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.71 145.34 4422100000 37069000 132870000 126110000 150840000 191970000 60864000 140480000 832540000 664840000 69798000 788100000 661140000 565510000 41582 1049 38806 371527;371528;371529;371530;371531;371532;371533;371534;371535;371536;371537;371538;371539;371540;371541;371542;371543 472419;472420;472421;472422;472423;472424;472425;472426;472427;472428;472429;472430;472431;472432;472433;472434;472435;472436;472437;472438;472439;472440;472441;472442;472443 472431 23 SSGQPVTFTDIFGMLIGETLIHNR Unmodified 2632.3319 0.33192219 2491 P47712 PLA2G4A Cytosolic phospholipase A2;Phospholipase A2;Lysophospholipase yes yes 0 0 0 1 1 171.5 171.5 3 2.9198E-06 175842 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.578 51.603 50575000 0 0 0 0 0 0 0 0 21555000 0 29021000 0 0 41583 2491 38807 371544;371545 472444;472445 472444 2 SSGSALTVWGTGNPR Unmodified 1488.7321 0.732105 3020 Q13630;E9PKL9 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.311 68.311 2 4.0355E-80 68330 QUIQUE_C1277_190116_001 214.04 195.36 949590000 73789000 80315000 0 78849000 78292000 71665000 100440000 89713000 88053000 0 102260000 82119000 104090000 41584 3020 38808 371546;371547;371548;371549;371550;371551;371552;371553;371554;371555;371556 472446;472447;472448;472449;472450;472451;472452;472453;472454;472455;472456;472457 472447 12 SSGSGSSVADERVDYVVVDQQK Unmodified 2311.0928 0.092797351 3000 Q13480;B7Z3B9 GAB1 GRB2-associated-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 59.023 59.023 3 0.051213 57952 QUIQUE_DMIX3_190116_001 32.695 23.599 64921000 0 0 0 0 0 0 0 0 64921000 0 0 0 0 41585 3000 38809 371557 472458 472458 1 SSGSLGHRPSQEMDK Unmodified 1614.742 0.74201776 3298 Q5SW79;H0Y2V6;H0YB66 CEP170 Centrosomal protein of 170 kDa yes no 0 0 1 1 10.501 10.501 3 0.002718 2858 QUIQUE_C1218_190116_001 61.444 56.388 7167900 7167900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41586 3298 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371756;371757;371758;371759;371760;371761;371762;371763;371764;371765;371766;371767;371768;371769;371770;371771;371772;371773;371774;371775;371776;371777;371778;371779;371780;371781;371782;371783;371784 472719;472720;472721;472722;472723;472724;472725;472726;472727;472728;472729;472730;472731;472732;472733;472734;472735;472736;472737;472738;472739;472740;472741;472742;472743;472744;472745;472746;472747;472748;472749;472750 472725 29 SSIIFAGGDK Unmodified 993.51311 0.51311067 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 46.91 46.91 2 0.00072191 43769 QUIQUE_C1368_190116_001 107.21 70.648 823930000 127460000 163210000 152660000 0 0 119650000 176250000 0 0 0 84695000 0 0 41607 3455 38831 371785;371786;371787;371788;371789;371790 472751;472752;472753;472754;472755;472756 472753 6 SSIIPQDHHEVK Unmodified 1388.7048 0.70482762 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 18.068 18.068 3 0.0037946 10697 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.405 34.21 166220000 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472785;472786;472787;472788;472789;472790;472791;472792;472793;472794;472795 472787 11 SSIQITGALEDQMNQLK Unmodified 1874.9408 0.94077715 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 1 1 118.11 118.11 2 1.0888E-06 122971 QUIQUE_C1576_190116_001 104.17 91.194 62997000 0 0 0 37174000 0 0 25822000 0 0 0 0 0 0 41614 2381 38837 371828;371829 472796;472797 472797 2 SSISGSLPSSGSLQAVSSR Unmodified 1805.9119 0.91191986 340 A0A1B0GTL5;Q9BXF6 RAB11FIP5 Rab11 family-interacting protein 5 yes no 0 0 0 1 1 76.424 76.424 2 0.0018367 76939 QUIQUE_C1277_190116_001 58.268 44.36 28224000 0 28224000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41615 340 38838 371830;371831 472798;472799;472800 472798 3 SSIWQFFSR Unmodified 1156.5665 0.56654322 1567 O60271 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 135.25 135.25 2 0.0021472 138035 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.367 83.33 101680000 17222000 28411000 0 0 0 0 0 27516000 0 0 0 28531000 0 41616 1567 38839 371832;371833;371834;371835 472801;472802;472803;472804;472805 472803 4 SSKPLAPNSNPPTK Unmodified 1436.7623 0.7623425 360 A0A1B0GWI0;A0A1B0GVV8;A0A1B0GW50;A0JP08;O60315;A0A1B0GV02 ZEB2 Zinc finger E-box-binding homeobox 2 yes no 0 0 1 1 13.385 13.385 3 0.019196 5518 QUIQUE_C1218_190116_001 46.318 30.18 4175400 4175400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41617 360 38840 371836 472806 472806 1 SSLAEVQSEIER Unmodified 1346.6678 0.66777341 332 A0A1B0GWF9;A0A1B0GUK4;A0A1B0GVB2;A0A1B0GTS4;A0A1B0GU53;E7EN11;A0A1B0GTF6;A0A1B0GTA9;A0A1B0GTN8;H0Y476;A0A1C7CYX2;A0A1B0GTX2;O00305;A0A1B0GXG0;A0A1B0GTP5;A0A1B0GVU5;A0A1B0GU07;Q02641 CACNB4;CACNB1 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4;Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1 no no 0 0 0 1 75.396 75.396 2 0.015208 71553 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.07 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41618 332 38841 371837 472807 472807 1 SSLDGPIVLAIEDFHK Unmodified 1739.9094 0.90940066 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;A0A087WZL7 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 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472829;472830;472831;472832;472833;472834;472835;472836;472837;472838;472839;472840;472841;472842;472843 472839 15 SSLESIPLTLLPAAAAAGAAAASGGEEGVGGAGGR Unmodified 3035.5524 0.55235631 3555 Q8IYI6 EXOC8 Exocyst complex component 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 161.36 161.36 3 3.8179E-15 163514 QUIQUE_C1563_190116_001 69.482 64.578 324960000 0 0 0 47697000 57198000 44873000 38546000 0 52343000 16246000 35055000 0 32998000 41621 3555 38844 371869;371870;371871;371872;371873;371874;371875;371876;371877;371878 472844;472845;472846;472847;472848;472849;472850;472851;472852;472853;472854;472855;472856;472857 472850 14 SSLGASFVQIK Acetyl (Protein N-term) 1177.6343 0.63428844 802 D4Q8H0;C9J3F7;Q9NYL2 pk;ZAK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase MLT yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 119.03 119.03 2 0.0017183 121806 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.816 30.78 52447000 0 0 0 12948000 17419000 22080000 0 0 0 0 0 0 0 41622 802 38845 371879;371880;371881;371882;371883;371884;371885;371886 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non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 1 3 3 2 2 2 1 1 1 3 4 2 125.81 125.81 2;3 0 131487 QUIQUE_C1218_190116_001 308.42 283.56 27934000000 1760100000 2465900000 2554500000 2174700000 2423900000 1779800000 2048300000 1809800000 2313000000 1082300000 2390600000 2470700000 2660100000 41635 267;275;3025 38857 372004;372005;372006;372007;372008;372009;372010;372011;372012;372013;372014;372015;372016;372017;372018;372019;372020;372021;372022;372023;372024;372025;372026;372027;372028;372029;372030 472994;472995;472996;472997;472998;472999;473000;473001;473002;473003;473004;473005;473006;473007;473008;473009;473010;473011;473012;473013;473014;473015;473016;473017;473018;473019;473020;473021;473022;473023;473024;473025;473026;473027;473028;473029;473030;473031;473032;473033;473034;473035;473036;473037;473038;473039;473040 472995 44 SSLSSHSHQSQIYR Unmodified 1615.7703 0.77028142 511 X6RGP5;A0A3F2YNX0;A0A3F2YNZ0;F1T0I1;O15027 SEC16A Protein transport protein Sec16A yes no 0 0 0 1 1 12.565 12.565 3 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473061;473062;473063;473064;473065;473066;473067 473066 7 SSMNPEYDYLFK Acetyl (Protein N-term);Oxidation (M) 1550.6599 0.65991084 2763 P62820;E7END7 RAB1A Ras-related protein Rab-1A yes no 1 1 0 1 126.19 126.19 2 0.020222 131372 QUIQUE_C1368_190116_001 70.977 57.624 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41641 2763 38862 372057 473068 473068 1 SSMSETTVGVVCR Unmodified 1411.6435 0.64354927 725 F5GZZ9;C9JHR8;Q86VB7 CD163 Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130;Soluble CD163 yes no 0 0 0 1 1 1 48.47 48.47 2 0.00054889 45609 QUIQUE_C1403_190116_001 89.171 64.396 65723000 0 0 0 40843000 0 0 0 24880000 0 0 0 0 0 41642 725 38863 372058;372059;372060 473069;473070;473071 473070 3 SSMSVTSLEAELQAK Oxidation (M) 1595.7713 0.7712522 4195 Q9H9B4 SFXN1 Sideroflexin-1 yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.831 85.831 2 1.6216E-05 87053 QUIQUE_C1403_190116_001 96.604 81.593 716730000 63367000 64010000 61542000 44695000 52693000 40092000 57578000 0 70321000 48147000 64589000 69147000 80552000 41643 4195 38864 372061;372062;372063;372064;372065;372066;372067;372068;372069;372070;372071;372072;372073;372074 473072;473073;473074;473075;473076;473077;473078;473079;473080;473081;473082;473083;473084;473085 473076 2881 13 SSMSVTSLEAELQAK Unmodified 1579.7763 0.77633758 4195 Q9H9B4 SFXN1 Sideroflexin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 1 108.47 108.47 2;3 1.3173E-24 111639 QUIQUE_C1277_190116_001 157.68 141.54 2334000000 204110000 210940000 198820000 188050000 140680000 224360000 214840000 180020000 141950000 74682000 216250000 215600000 123750000 41644 4195 38864 372075;372076;372077;372078;372079;372080;372081;372082;372083;372084;372085;372086;372087;372088;372089;372090;372091;372092;372093 473086;473087;473088;473089;473090;473091;473092;473093;473094;473095;473096;473097;473098;473099;473100;473101;473102;473103;473104;473105;473106;473107;473108 473089 23 SSMTFLTR Unmodified 941.46405 0.46405199 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 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372129;372130;372131 473145;473146;473147 473147 3 SSPATSLFVELDEEEVK Unmodified 1878.9099 0.90985417 4062 Q9BXK5;A0A087WX97;A0A087WTL4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 129.12 129.12 2 0.0026071 132205 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.898 45.935 106800000 0 0 0 0 0 0 0 42075000 0 0 0 0 64727000 41654 4062 38874 372132;372133 473148;473149 473148 2 SSPCIHYFTGTPDPSR Unmodified 1820.8152 0.8151827 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 59.708 59.708 2;3 0 59096 QUIQUE_DMIX1_190116_001 312.48 253.11 17489000000 1200800000 1366300000 1649500000 1354400000 1277200000 1156000000 1500600000 1457100000 1369800000 757910000 1353800000 1136800000 1909000000 41655 2941 38875 372134;372135;372136;372137;372138;372139;372140;372141;372142;372143;372144;372145;372146;372147;372148;372149;372150;372151;372152;372153;372154;372155;372156;372157;372158;372159 473150;473151;473152;473153;473154;473155;473156;473157;473158;473159;473160;473161;473162;473163;473164;473165;473166;473167;473168;473169;473170;473171;473172;473173;473174;473175;473176;473177;473178;473179;473180;473181;473182;473183;473184;473185;473186;473187;473188;473189;473190;473191;473192;473193;473194;473195;473196;473197;473198;473199;473200;473201;473202;473203;473204 473184 55 SSPDLTGVVHIYEELK Unmodified 1785.9149 0.91487997 3427 Q6ZVM7 TOM1L2 TOM1-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 129.15 129.15 3 0.00036717 134701 QUIQUE_C1218_190116_001 67.605 53.377 119200000 23266000 28202000 0 0 0 23167000 0 0 0 0 0 20928000 23634000 41656 3427 38876 372160;372161;372162;372163;372164;372165 473205;473206;473207;473208;473209;473210 473205 6 SSPDLTGVVHIYEELKR Unmodified 1942.016 0.015991 3427 Q6ZVM7 TOM1L2 TOM1-like protein 2 yes yes 0 0 1 2 2 2 1 3 2 1 1 1 2 116.41 116.41 3;4 5.8451E-06 120738 QUIQUE_C1277_190116_001 87.287 76.911 837450000 44061000 64941000 45943000 0 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157.43 2;3 1.132E-06 161258 QUIQUE_C1403_190116_001 103.85 90.136 739730000 70478000 50493000 70114000 48836000 73493000 44707000 72472000 31074000 80316000 30878000 90161000 76705000 0 41665 4459 38885 372256;372257;372258;372259;372260;372261;372262;372263;372264;372265;372266;372267;372268;372269;372270;372271;372272;372273;372274;372275;372276;372277;372278 473306;473307;473308;473309;473310;473311;473312;473313;473314;473315;473316;473317;473318;473319;473320;473321;473322;473323;473324;473325;473326;473327;473328;473329;473330 473313 25 SSPQFGVTLVTYELLQR Unmodified 1937.0258 0.025827405 1655 O75746 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 3 2 2 149.77 149.77 2;3 1.2031E-07 155008 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.22 93.951 1732000000 135230000 142080000 164640000 74223000 78948000 122110000 117450000 156490000 151040000 34198000 208380000 204810000 142430000 41666 1655 38886 372279;372280;372281;372282;372283;372284;372285;372286;372287;372288;372289;372290;372291;372292;372293;372294;372295;372296;372297;372298;372299;372300;372301;372302;372303 473331;473332;473333;473334;473335;473336;473337;473338;473339;473340;473341;473342;473343;473344;473345;473346;473347;473348;473349;473350;473351;473352;473353;473354;473355;473356;473357;473358;473359;473360;473361;473362;473363;473364;473365;473366;473367;473368;473369;473370;473371;473372;473373;473374;473375;473376;473377 473358 47 SSPSFSSLHYQDAGNYVCETALQEVEGLK Unmodified 3215.4717 0.47172272 3023 Q13740;F5GXJ9;H7C543 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 1 1 142.83 142.83 3 1.3568E-05 148031 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.694 44.084 207210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72305000 65484000 69423000 41667 3023 38887 372304;372305;372306 473378;473379;473380 473380 3 SSPSHTISRPIPMPIR Unmodified 1774.9512 0.95122267 4608;1367 M0QZ28;Q9Y4J8 DTNA Dystrobrevin alpha no no 0 0 1 1 1 43.033 43.033 4 0.00019377 39360 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473387;473388;473389;473390;473391;473392;473393;473394;473395;473396;473397;473398 473387 12 SSPVDLVTATDQKVEK Unmodified 1715.8941 0.89414453 2286 P29218;H0YBL1;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RG13;E5RIP7;E5RGY4;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 66.322 66.322 2;3 1.5215E-43 65700 QUIQUE_DMIX8_190116_001 182.1 167.4 927260000 0 0 0 0 36801000 0 0 141150000 129490000 0 137520000 265500000 216810000 41671 2286 38891 372323;372324;372325;372326;372327;372328;372329;372330 473399;473400;473401;473402;473403;473404;473405;473406;473407;473408 473407 9 SSPVEFECINEK Unmodified 1437.6446 0.64459513 1611 O75131;H0YB26 CPNE3 Copine-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.242 64.242 2 1.9925E-37 63610 QUIQUE_C1277_190116_001 190.96 174.96 2081700000 168570000 135840000 207270000 153820000 154740000 188270000 189120000 135640000 159780000 52717000 200320000 148900000 186710000 41672 1611 38892 372331;372332;372333;372334;372335;372336;372337;372338;372339;372340;372341;372342;372343 473409;473410;473411;473412;473413;473414;473415;473416;473417;473418;473419;473420;473421;473422 473411 14 SSPVVIDASTAIDAPSNLR Unmodified 1911.9902 0.99017018 1833 P02751;H0Y7Z1;H0Y4K8 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes no 0 0 0 1 102.64 102.64 2 0.003218 104186 QUIQUE_C1563_190116_001 66.688 53.708 35541000 0 0 0 0 0 35541000 0 0 0 0 0 0 0 41673 1833 38893 372344 473423 473423 1 SSPVVNDGVVR Unmodified 1127.5935 0.59348625 1011 H0Y8R1;F5H5I6;H0YAK1;Q12849;H0YAM1 GRSF1 G-rich sequence factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.982 29.982 2 0.0087472 24769 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.95 34.376 208210000 0 0 0 67753000 0 0 0 0 69699000 0 0 70754000 0 41674 1011 38894 372345;372346;372347;372348;372349;372350 473424;473425;473426;473427;473428;473429 473428 3 SSPVYVGR Unmodified 863.45012 0.45011648 2190 P21980;A2A299 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.651 21.651 2 0.0069326 14624 QUIQUE_C1368_190116_001 99.919 66.181 485580000 0 0 99316000 100160000 0 0 63378000 0 54204000 0 75031000 46089000 47405000 41675 2190 38895 372351;372352;372353;372354;372355;372356;372357 473430;473431;473432;473433;473434;473435;473436 473430 7 SSPWNFAFTVK Unmodified 1282.6346 0.63462279 4172;3243 Q9H4G0;A0A0C4DH22;Q4VXN5;Q4VXN0;Q4VXN1 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.05 121.05 2 0.00045661 126799 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.4 86.651 2836400000 137470000 219160000 193050000 171560000 202490000 165670000 229800000 294660000 225860000 66647000 318600000 335720000 275710000 41676 4172;3243 38896 372358;372359;372360;372361;372362;372363;372364;372365;372366;372367;372368;372369;372370 473437;473438;473439;473440;473441;473442;473443;473444;473445;473446;473447;473448;473449;473450;473451 473448 15 SSPYPTDVAR Unmodified 1091.5247 0.52473799 2869;903;4487 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3;Q9ULD0 OGDH;OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial;2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.348 32.348 2 0.014445 27427 QUIQUE_C1218_190116_001 87.308 64.236 1681300000 405530000 0 378900000 0 0 241920000 319410000 233700000 0 101820000 0 0 0 41677 903;2869;4487 38897 372371;372372;372373;372374;372375;372376 473452;473453;473454;473455;473456;473457 473452 1 SSQATYEIQFGHLQR Unmodified 1763.8591 0.85909643 4292 Q9NTJ4;A0A0C4DGU9 MAN2C1 Alpha-mannosidase 2C1 yes no 0 0 0 1 1 67.002 67.002 2 0.0021252 67390 QUIQUE_C1277_190116_001 68.676 53.41 14371000 0 0 0 0 0 14371000 0 0 0 0 0 0 0 41678 4292 38898 372377;372378 473458;473459 473458 2 SSQEQGELQGR Unmodified 1217.5636 0.56364269 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 0 1 14.985 14.985 2 0.0004357 7003 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.86 99.908 23846000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23846000 0 0 0 41679 1613 38899 372379 473460 473460 1 SSQIDQAIVK Unmodified 1087.5873 0.58733824 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 34.291 34.291 2 0.011995 30097 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.504 37.587 60812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60812000 0 0 41680 1187 38900 372380 473461 473461 1 SSQIGAVVSHQSSVIPDR Unmodified 1865.9595 0.95953875 4309 Q9NVS9;J3QQZ9;J3QQV6 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 3 58.204 58.204 2;3 1.0127E-38 55265 QUIQUE_C1563_190116_001 191.86 176.32 3327300000 339720000 335650000 431380000 400200000 297010000 463030000 356140000 0 57062000 113210000 231250000 152170000 150470000 41681 4309 38901 372381;372382;372383;372384;372385;372386;372387;372388;372389;372390;372391;372392;372393;372394;372395;372396;372397;372398;372399;372400;372401;372402;372403;372404;372405;372406 473462;473463;473464;473465;473466;473467;473468;473469;473470;473471;473472;473473;473474;473475;473476;473477;473478;473479;473480;473481;473482;473483;473484;473485;473486;473487;473488;473489;473490;473491 473477 29 SSQIGAVVSHQSSVIPDREYLR Unmodified 2427.2506 0.2506354 4309 Q9NVS9;J3QQZ9;J3QQV6 PNPO Pyridoxine-5'-phosphate oxidase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 74.323 74.323 3 1.2061E-09 74656 QUIQUE_C1368_190116_001 101.71 85.407 466030000 56307000 115220000 105370000 71289000 0 0 117850000 0 0 0 0 0 0 41682 4309 38902 372407;372408;372409;372410;372411 473492;473493;473494;473495;473496;473497;473498 473495 7 SSQLLWEALESLVNR Unmodified 1743.9155 0.91554867 3210 Q27J81 INF2 Inverted formin-2 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 1 168.68 168.68 2;3 5.139E-07 170566 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.04 90.499 175850000 18432000 0 0 0 0 0 51681000 69134000 16610000 0 0 19997000 0 41683 3210 38903 372412;372413;372414;372415;372416;372417;372418 473499;473500;473501;473502;473503;473504;473505 473503 7 SSQSLHCLSPR Unmodified 1270.6088 0.60881874 1745 O95741 CPNE6 Copine-6 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 1 2 2 19.421 19.421 2;3 1.3501E-29 12682 QUIQUE_C1218_190116_001 186.74 163.67 11610000000 915130000 1733700000 1025900000 744370000 937150000 1214100000 1092700000 734540000 663810000 66855000 666040000 810340000 1005400000 41684 1745 38904 372419;372420;372421;372422;372423;372424;372425;372426;372427;372428;372429;372430;372431;372432;372433;372434;372435;372436;372437;372438;372439;372440;372441 473506;473507;473508;473509;473510;473511;473512;473513;473514;473515;473516;473517;473518;473519;473520;473521;473522;473523;473524;473525;473526;473527;473528;473529 473506 19 SSQSSSQQFSGIGR Unmodified 1454.675 0.67498405 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 32.652 32.652 2 4.1092E-58 27784 QUIQUE_DMIX5_190116_001 245.08 197.37 377340000 0 88470000 0 0 0 0 0 0 92102000 0 121870000 74896000 0 41685 381 38905 372442;372443;372444;372445 473530;473531;473532;473533 473532 4 SSQTSGTNEQSSAIVSAR Unmodified 1808.85 0.85004788 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.875 26.875 2 4.327E-45 20757 QUIQUE_C1438_190116_001 205.61 180.75 920220000 72458000 87011000 47349000 69145000 83662000 52965000 92118000 84685000 64307000 26236000 98673000 70360000 71253000 41686 1591 38906 372446;372447;372448;372449;372450;372451;372452;372453;372454;372455;372456;372457;372458 473534;473535;473536;473537;473538;473539;473540;473541;473542;473543;473544;473545;473546 473538 13 SSRPEFDWQDPLVLEEQLTTDEILIR Unmodified 3128.5666 0.56660939 3771 Q92947;K7ES74;K7EKH1;K7ERX1 GCDH Glutaryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 166.24 166.24 3 1.4418E-69 168254 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.25 148.61 320180000 0 0 0 0 60641000 68239000 0 191300000 0 0 0 0 0 41687 3771 38907 372459;372460;372461 473547;473548;473549 473549 3 SSSADFGTFNTSQSHQTASAVSK Unmodified 2344.0567 0.056746196 2608 P52594;C9J2I0;B8ZZY2 AGFG1 Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.768 48.768 3 1.3757E-06 45771 QUIQUE_C1368_190116_001 71.634 64.012 820730000 19167000 44059000 70659000 97703000 67753000 67786000 49244000 83091000 67459000 36856000 69767000 48865000 98321000 41688 2608 38908 372462;372463;372464;372465;372466;372467;372468;372469;372470;372471;372472;372473;372474 473550;473551;473552;473553;473554;473555;473556;473557;473558;473559;473560;473561;473562 473552 13 SSSEEVSWISWFCGLR Acetyl (Protein N-term) 1970.8833 0.88326227 2790 P67870;Q5SRQ3;N0E472;A0A0G2JM12;N0E644;A0A0G2JM58 CSNK2B;CSNK2B-LY6G5B-1181;CSNK2B-LY6G5B--991;CSNK2B-LY6G5B-562 Casein kinase II subunit beta yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 174.75 174.75 2 1.6601E-09 178803 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.42 115.91 35612000 0 0 1751900 0 0 0 5507600 0 10705000 0 13838000 0 3809500 41689 2790 38909 372475;372476;372477;372478;372479 473563;473564;473565;473566;473567;473568 473565 6 SSSGLLEWESK Unmodified 1221.5877 0.58773217 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 76.199 76.199 2 5.0374E-08 78114 QUIQUE_C1218_190116_001 150.85 115.56 2414500000 442160000 0 0 0 0 0 305340000 322080000 283760000 0 416440000 334340000 310390000 41690 2082 38910 372480;372481;372482;372483;372484;372485;372486;372487 473569;473570;473571;473572;473573;473574;473575;473576;473577;473578;473579;473580 473569 12 SSSGTPDLPVLLTDLK Acetyl (Protein N-term) 1683.8931 0.8930819 1776 P00352;Q5SYQ9;Q5SYQ8;Q5SYQ7 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 161.3 161.3 2 2.1913E-13 163921 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.59 112.38 7000000000 386400000 363560000 557330000 718250000 599430000 728620000 444780000 559440000 501500000 290040000 578000000 750750000 521960000 41691 1776 38911 372488;372489;372490;372491;372492;372493;372494;372495;372496;372497;372498;372499;372500;372501 473581;473582;473583;473584;473585;473586;473587;473588;473589;473590;473591;473592;473593;473594;473595;473596;473597;473598;473599;473600;473601;473602;473603;473604;473605;473606;473607;473608;473609;473610;473611;473612;473613 473600 33 SSSISEEKGDSDDEKPR Unmodified 1864.8286 0.82864374 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 2 2 10.46 10.46 3;4 0.0021075 2903 QUIQUE_C1277_190116_001 75.463 70.145 5386000 0 5386000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41692 4745 38912 372502;372503 473614;473615 473614 2 SSSISSFKDPK Unmodified 1181.5928 0.59281755 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 1 1 19.926 19.926 2 0.046067 13023 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.881 48.094 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41693 2066 38913 372504 473616 473616 1 SSSLLIPPLETALANFSSGPEGGVMQPVR Oxidation (M) 2969.5168 0.51682242 3088 Q14894;I3L2W5;I3NI53 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 1 0 3 2 2 2 2 2 1 1 2 1 4 2 1 163.39 163.39 2;3 5.0052E-56 170553 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.04 128.85 2671200000 207290000 225310000 175200000 200890000 274680000 223010000 135190000 189840000 233440000 81423000 373960000 331510000 19496000 41694 3088 38914 372505;372506;372507;372508;372509;372510;372511;372512;372513;372514;372515;372516;372517;372518;372519;372520;372521;372522;372523;372524;372525;372526;372527;372528;372529 473617;473618;473619;473620;473621;473622;473623;473624;473625;473626;473627;473628;473629;473630;473631;473632;473633;473634;473635;473636;473637;473638;473639;473640;473641;473642;473643;473644;473645;473646;473647 473644 2532 30 SSSLLIPPLETALANFSSGPEGGVMQPVR Unmodified 2953.5219 0.5219078 3088 Q14894;I3L2W5;I3NI53 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 3 2 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 167.5 167.5 2;3 2.0907E-54 171553 QUIQUE_DMIX3_190116_001 142.22 124.72 9805500000 912610000 785480000 823570000 604110000 883290000 641810000 618450000 582610000 877980000 116260000 1476300000 769900000 713090000 41695 3088 38914 372530;372531;372532;372533;372534;372535;372536;372537;372538;372539;372540;372541;372542;372543;372544;372545;372546;372547;372548;372549;372550;372551;372552;372553;372554;372555;372556 473648;473649;473650;473651;473652;473653;473654;473655;473656;473657;473658;473659;473660;473661;473662;473663;473664;473665;473666;473667;473668;473669;473670;473671;473672;473673;473674;473675;473676;473677;473678;473679;473680;473681;473682;473683;473684;473685;473686 473675 37 SSSPAPEFLASSPPDNK Unmodified 1729.8159 0.81589421 734 C9JME2;Q9Y4F1;M0QXT1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 67.707 67.707 2 0.00016341 67254 QUIQUE_C1277_190116_001 90.861 84.757 76678000 0 45572000 0 0 0 0 31106000 0 0 0 0 0 0 41696 734 38915 372557;372558;372559 473687;473688;473689 473687 3 SSSPELVTHLK Unmodified 1196.6401 0.6401021 2912 Q07960;H0YE29;E9PNR6 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.828 29.828 2;3 0.0030082 24817 QUIQUE_C1218_190116_001 80.231 58.943 505550000 67959000 100900000 117810000 97601000 0 77243000 0 0 0 44031000 0 0 0 41697 2912 38916 372560;372561;372562;372563;372564;372565;372566 473690;473691;473692;473693;473694;473695;473696 473690 3 SSSPVNVK Acetyl (Protein N-term) 858.4447 0.44469675 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 1 0 0 2 30.268 30.268 1;2 0.0076395 24496 QUIQUE_C1277_190116_001 152.41 74.917 227480000 0 227480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41698 2849 38917 372567;372568 473697;473698 473698 1 SSSQIPEGFGLTSGGSNYSLAR Unmodified 2214.0553 0.055289633 4604 Q9Y4E6;A2RRE0 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 2 107.5 107.5 2 5.8369E-09 112508 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.694 84.007 157340000 0 0 0 24609000 0 0 0 0 0 0 46053000 86677000 0 41699 4604 38918 372569;372570;372571;372572 473699;473700;473701;473702 473700 4 SSSSGHYVSWVK Unmodified 1322.6255 0.62551466 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 32.226 32.226 2;3 1.6829E-09 26454 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.71 86.706 1453100000 290450000 118490000 164450000 108060000 0 79188000 184580000 229470000 0 37375000 241080000 0 0 41700 2642 38919 372573;372574;372575;372576;372577;372578;372579;372580;372581;372582;372583 473703;473704;473705;473706;473707;473708;473709;473710;473711;473712;473713 473713 7 SSSSQTLTQFDSNIAPADPDTAIVHPVPIR Unmodified 3163.5786 0.57857106 3829 Q96D71;H0YE73 REPS1 RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 116.12 116.12 3 0.0056433 119829 QUIQUE_C1403_190116_001 27.686 21.966 71231000 0 0 0 27956000 43276000 0 0 0 0 0 0 0 0 41701 3829 38920 372584;372585 473714;473715 473714 2 SSSSSPTSPGSFR Unmodified 1282.579 0.5789584 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 24.02 24.02 2 0.00339 17739 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.887 62.173 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41702 3596 38921 372586;372587 473716;473717 473717 2 SSSSSQESLNRPFSSK Unmodified 1726.8122 0.81220581 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;B3KR06;E7ENG2;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 1 1 1 23.1 23.1 2 0.00053078 17874 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.486 62.349 21021000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21021000 41703 310;830 38922 372588;372589 473718;473719 473718 2 SSSVGSSSSYPISPAVSR Unmodified 1753.8483 0.84825697 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.993 55.993 2 2.8294E-08 53874 QUIQUE_C1368_190116_001 109.44 95.536 640270000 49476000 33604000 69148000 0 43896000 71685000 96348000 0 134400000 32050000 65900000 0 43762000 41704 3117 38923 372590;372591;372592;372593;372594;372595;372596;372597;372598;372599;372600 473720;473721;473722;473723;473724;473725;473726;473727;473728;473729;473730 473722 10 SSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYK Acetyl (Protein N-term) 2853.2141 0.21409428 4069 Q9BY11 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes yes 1 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 2 157.44 157.44 2;3 1.2156E-113 164043 QUIQUE_C1438_190116_001 190.87 185.66 2647800000 372420000 391330000 275230000 242440000 283040000 262850000 209310000 93001000 85128000 101300000 47817000 140100000 143890000 41705 4069 38924 372601;372602;372603;372604;372605;372606;372607;372608;372609;372610;372611;372612;372613;372614;372615;372616;372617;372618;372619;372620;372621;372622;372623 473731;473732;473733;473734;473735;473736;473737;473738;473739;473740;473741;473742;473743;473744;473745;473746;473747;473748;473749;473750;473751;473752;473753;473754;473755;473756;473757;473758;473759 473745 29 SSSYDEASLAPEETTDSFWEVGNYKR Acetyl (Protein N-term) 3009.3152 0.31520531 4069 Q9BY11 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes yes 1 0 1 2 2 2 2 2 138.81 138.81 2;3 1.7209E-97 141863 QUIQUE_DMIX1_190116_001 231.23 221.17 1083600000 0 0 0 0 0 0 0 261200000 126240000 0 275460000 238320000 182390000 41706 4069 38925 372624;372625;372626;372627;372628;372629;372630;372631;372632;372633 473760;473761;473762;473763;473764;473765;473766;473767;473768;473769;473770;473771;473772;473773 473763 14 SSTGSPTSPLNAEK Unmodified 1374.6627 0.66268803 3154 Q15746 MYLK Myosin light chain kinase, smooth muscle;Myosin light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes yes 0 0 0 1 25.07 25.07 2 0.043389 18959 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.435 46.284 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41707 3154 38926 372634 473774 473774 1 SSTIQDQQLFDR Unmodified 1436.6896 0.68957148 3733 Q92558;Q5SZK5;Q5SZK4 WASF1 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.119 65.119 2 4.9206E-05 65092 QUIQUE_C1218_190116_001 126.39 95.59 110860000 49212000 0 0 61649000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41708 3733 38927 372635;372636;372637;372638;372639;372640;372641 473775;473776;473777;473778;473779;473780;473781 473775 7 SSTIQDQQLFDRK Unmodified 1564.7845 0.7845345 3733 Q92558;Q5SZK5;Q5SZK4 WASF1 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 1 yes no 0 0 1 1 1 43.203 43.203 3 0.0087006 39958 QUIQUE_DMIX8_190116_001 40.941 27.262 48654000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48654000 0 0 41709 3733 38928 372642;372643 473782;473783;473784 473784 3 SSTPLHSPSPIR Unmodified 1277.6728 0.67279921 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 0 1 1 24.003 24.003 3 0.0031111 18192 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.712 29.444 84610000 0 0 0 0 0 0 0 29546000 0 0 0 0 55063000 41710 1753 38929 372644;372645 473785;473786 473785 2 SSTPLPTISSSAENTR Unmodified 1646.8111 0.81114318 1095 G5E972;P42167;P42166;H0YJH7 TMPO Lamina-associated polypeptide 2, isoforms beta/gamma;Thymopoietin;Thymopentin;Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha;Thymopoietin;Thymopentin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 57.114 57.114 2 1.5098E-05 56138 QUIQUE_C1218_190116_001 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Unmodified 1736.7788 0.7787972 744 C9JTE9;Q9UHQ4;C9IYK6;H7C5E2;C9JGJ9;F8WB99 BCAP29 B-cell receptor-associated protein 29 yes no 0 0 1 1 1 1 1 15.345 15.345 3 2.0401E-05 7435 QUIQUE_C1368_190116_001 75.574 68.624 125160000 0 0 26732000 34981000 16686000 0 46765000 0 0 0 0 0 0 41714 744 38933 372663;372664;372665;372666 473805;473806;473807;473808 473805 4 SSTVQDQQVVSK Unmodified 1304.6572 0.65720872 4523 Q9UPY6 WASF3 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.231 18.231 2 0.00013408 10839 QUIQUE_DMIX3_190116_001 130.94 79.874 2187700000 140250000 170170000 141680000 191750000 157810000 188400000 157850000 157180000 186440000 67699000 227980000 174700000 225780000 41715 4523 38934 372667;372668;372669;372670;372671;372672;372673;372674;372675;372676;372677;372678;372679 473809;473810;473811;473812;473813;473814;473815;473816;473817;473818;473819;473820;473821 473817 8 SSTVTEAPIAVVTSR Unmodified 1516.8097 0.80968662 3678 Q8TD19 NEK9 Serine/threonine-protein kinase Nek9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 72.249 72.249 2 0.015438 72543 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.44 53.761 69644000 0 0 33278000 0 0 0 0 0 0 0 36366000 0 0 41716 3678 38935 372680;372681;372682;372683 473822;473823;473824;473825 473825 4 SSVAVLTQESFAEHR Acetyl (Protein N-term) 1701.8322 0.83221298 2 A0A024R4E5;Q00341;C9JIZ1;C9J5E5;C9JT62;C9JHS7;C9JK79;C9JHZ8;C9JES8;C9JZI8;C9JMQ6;C9JQ82;C9JBS3;C9JEJ8;C9JHN6;C9JHS9;C9J739 HDLBP Vigilin yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.27 103.27 2 1.5826E-09 105664 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.85 106.37 234560000 0 0 37968000 0 0 0 0 39891000 14309000 17349000 40921000 36522000 47598000 41717 2 38936 372684;372685;372686;372687;372688;372689;372690 473826;473827;473828;473829;473830;473831;473832 473827 5 SSVDPAIFAF Unmodified 1052.5179 0.51786169 1416 O00534 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes yes 0 0 0 1 1 148.92 148.92 1;2 0.057547 151849 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.426 36.91 31076000 0 0 0 0 0 0 0 11503000 0 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473839;473840;473841;473842;473843;473844;473845;473846;473847;473848;473849;473850;473851;473852;473853;473854;473855;473856;473857;473858;473859;473860;473861;473862;473863;473864;473865 473839 22 SSVLESLVGR Unmodified 1045.5768 0.57677356 1108;1404 G8JLD5;F8VUJ9;F8VYL3;F8VR28;H0YHY4;O00429;F8VZ52;B4DPZ9;B4DDQ3;F8W1W3 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.079 93.079 2 0.00031555 94856 QUIQUE_C1403_190116_001 133.23 107.5 1950900000 215290000 164610000 128520000 126140000 154990000 117940000 161600000 130090000 150630000 78687000 168260000 167020000 187080000 41721 1108;1404 38940 372719;372720;372721;372722;372723;372724;372725;372726;372727;372728;372729;372730;372731 473866;473867;473868;473869;473870;473871;473872;473873;473874;473875;473876;473877;473878;473879;473880;473881;473882 473871 16 SSVLIAQQTDTSDPEK Unmodified 1717.837 0.83702358 2476 P46060 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 47.713 47.713 2 3.3166E-13 44948 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secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 134.56 134.56 2 1.2814E-13 139506 QUIQUE_C1368_190116_001 150.05 102.75 1034200000 103310000 108790000 104480000 107610000 0 71555000 114700000 93504000 0 0 131010000 94383000 104880000 41725 981;4494 38944 372746;372747;372748;372749;372750;372751;372752;372753;372754;372755;372756 473898;473899;473900;473901;473902;473903;473904;473905;473906;473907;473908 473901 7 SSVNLLMANLESMPVSK Oxidation (M) 1834.9169 0.91687058 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 1 0 1 111.89 111.89 2 0.012866 115840 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.621 27.192 65320000 0 0 0 0 0 0 0 0 65320000 0 0 0 0 41726 981;4494 38944 372757 473909 473909 595 1 SSVQQQPPPPR Acetyl (Protein N-term) 1261.6415 0.64149908 1401 O00401 WASL Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 30.066 30.066 2 0.0020703 24692 QUIQUE_C1277_190116_001 76.1 53.27 26989000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26989000 0 41727 1401 38945 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nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.79 158.79 3 2.3229E-25 163275 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.024 87.019 800820000 30829000 79897000 36761000 0 34850000 28989000 59881000 85520000 116010000 0 99990000 125850000 102240000 41732 2769 38950 372796;372797;372798;372799;372800;372801;372802;372803;372804;372805;372806 473950;473951;473952;473953;473954;473955;473956;473957;473958;473959;473960;473961;473962;473963;473964;473965;473966;473967 473960 17 SSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLK Oxidation (M) 3486.5353 0.53526773 2767;4207 P62873;F6UT28;F6X3N5;Q9HAV0;H7C5J5 GNB1;GNB4 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.83 146.83 3 6.8891E-64 152200 QUIQUE_C1368_190116_001 145.19 143.28 1426500000 89560000 118830000 110290000 106100000 104440000 131080000 103010000 141140000 113740000 52672000 82545000 137030000 136100000 41733 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372872;372873;372874;372875;372876;372877;372878;372879;372880;372881;372882;372883 474045;474046;474047;474048;474049;474050;474051;474052;474053;474054;474055;474056;474057 474056 335 12 SSYLNIVGLVGSIDNDFCGTDMTIGTDSALHR Unmodified 3427.6024 0.60241932 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 166.64 166.64 3;4 1.2222E-256 173765 QUIQUE_DMIX5_190116_001 249.46 238.85 1674800000 73565000 0 174680000 0 99319000 0 227670000 102880000 231940000 0 253220000 374590000 136910000 41739 452 38955 372884;372885;372886;372887;372888;372889;372890;372891;372892;372893;372894 474058;474059;474060;474061;474062;474063;474064;474065;474066;474067;474068;474069;474070 474065 11 SSYPGQITGNMICVGFLEGGK Unmodified 2214.0449 0.044924642 761 CON__P00761 yes yes 0 0 0 1 136.9 136.9 3 0.0032887 133121 QUIQUE_DMIX4_190116_001 25.987 21.437 26362000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26362000 0 0 0 + 41740 761 38956 372895 474071 474071 1 SSYYVVSGNDPAAEEPSR Unmodified 1926.8595 0.85954994 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 2 1 64.6 64.6 2;3 9.7027E-105 63578 QUIQUE_DMIX1_190116_001 216.34 195.09 11385000000 1012600000 1093700000 1077000000 1022400000 709740000 931010000 924340000 870680000 935270000 373180000 763220000 924090000 748100000 41741 2483 38957 372896;372897;372898;372899;372900;372901;372902;372903;372904;372905;372906;372907;372908;372909;372910;372911;372912;372913;372914 474072;474073;474074;474075;474076;474077;474078;474079;474080;474081;474082;474083;474084;474085;474086;474087;474088;474089;474090;474091;474092;474093;474094;474095;474096;474097;474098;474099 474085 28 STAAFHISSLLEK Acetyl (Protein N-term) 1444.7562 0.75619449 1614 O75155;A0A3B3ISC4;F8WBB8 CAND2 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.45 119.45 2 5.8696E-13 123629 QUIQUE_C1277_190116_001 152.64 114.07 139240000 0 32024000 0 0 38135000 0 23186000 0 0 0 17495000 0 28396000 41742 1614 38958 372915;372916;372917;372918;372919;372920;372921;372922;372923;372924 474100;474101;474102;474103;474104;474105;474106;474107;474108;474109;474110 474101 11 STAALEEDAQILK Unmodified 1387.7195 0.71947463 465;3105 Q15052;B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E9PDQ5 ARHGEF6;ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 6;Rho guanine nucleotide exchange factor 7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.725 77.725 2 0.00036033 79300 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.34 86.605 361430000 0 0 64094000 63038000 0 0 54766000 0 0 38803000 75797000 0 64929000 41743 3105;465 38959 372925;372926;372927;372928;372929;372930 474111;474112;474113;474114;474115;474116 474115 5 STACQMLVCYAK Unmodified 1430.6356 0.63562712 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 2 1 4 1 1 1 1 1 1 1 75.275 75.275 2 0.00011195 75883 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.78 97.859 422020000 39332000 67525000 0 45384000 50566000 41095000 58840000 46106000 0 29564000 0 43612000 0 41744 1403 38960 372931;372932;372933;372934;372935;372936;372937;372938;372939;372940;372941;372942;372943;372944;372945;372946 474117;474118;474119;474120;474121;474122;474123;474124;474125;474126;474127;474128;474129;474130;474131;474132;474133;474134 474133 15 STAEDFWR Unmodified 1010.4458 0.44575938 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 67.318 67.318 2 0.046015 66914 QUIQUE_C1403_190116_001 56.721 43.454 29510000 0 0 0 15208000 14302000 0 0 0 0 0 0 0 0 41745 2217 38961 372947;372948 474135;474136 474135 2 STAFQLVELGPGR Unmodified 1373.7303 0.73031409 3443 Q7L592;C9J236;C9JS27;C9JP36;C9JEL7 NDUFAF7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] complex I, assembly factor 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 103.25 103.25 2 0.0021831 108123 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.944 54.156 76258000 0 15802000 20032000 0 0 0 0 0 0 0 24551000 0 15873000 41746 3443 38962 372949;372950;372951;372952;372953;372954 474137;474138;474139;474140;474141;474142 474140 6 STAGDTHLGGEDFDNR Unmodified 1690.7183 0.71830543 2010;2643 P11142;E9PKE3;E9PN89;P54652 HSPA8;HSPA2 Heat shock cognate 71 kDa protein;Heat shock-related 70 kDa protein 2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 36.534 36.534 2;3 1.7291E-283 32769 QUIQUE_C1218_190116_001 300.75 294.51 96384000000 7991500000 7776300000 7348200000 6441600000 9156600000 6361800000 7621200000 5062200000 8377500000 4039400000 9464900000 8037800000 8705500000 41747 2010;2643 38963 372955;372956;372957;372958;372959;372960;372961;372962;372963;372964;372965;372966;372967;372968;372969;372970;372971;372972;372973;372974;372975;372976;372977;372978;372979;372980;372981 474143;474144;474145;474146;474147;474148;474149;474150;474151;474152;474153;474154;474155;474156;474157;474158;474159;474160;474161;474162;474163;474164;474165;474166;474167;474168;474169;474170;474171;474172;474173;474174;474175;474176;474177;474178;474179;474180;474181;474182;474183;474184;474185;474186 474144 43 STAISLFYELSENDLNFIK Unmodified 2203.1049 0.10486559 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 168.59 168.59 2;3 6.6974E-74 175672 QUIQUE_DMIX5_190116_001 191.06 181.53 4061000000 130090000 39106000 140750000 26607000 66734000 0 269790000 442120000 593530000 14937000 1174900000 675010000 487370000 41748 2058 38964 372982;372983;372984;372985;372986;372987;372988;372989;372990;372991;372992;372993;372994;372995;372996;372997;372998;372999;373000;373001;373002;373003 474187;474188;474189;474190;474191;474192;474193;474194;474195;474196;474197;474198;474199;474200;474201;474202;474203;474204;474205;474206;474207;474208;474209;474210;474211;474212 474206 24 STALAAVCQVIGMYDYTAQNDDELAFNK Unmodified 3107.4216 0.42160141 3161 Q15811;F8W7U0 ITSN1 Intersectin-1 yes no 0 0 0 1 1 166.57 166.57 3 1.401E-15 169777 QUIQUE_C1403_190116_001 81.974 76.721 51104000 0 0 0 16912000 0 0 0 0 0 0 0 0 34192000 + 41749 3161 38965 373004;373005 474213;474214 474213 2 STAMDTLSSLVFQLGK Unmodified 1696.8706 0.87057232 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 164.41 164.41 2 0.00056805 167997 QUIQUE_C1277_190116_001 93.959 78.587 34878000 17548000 17330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41750 2447 38966 373006;373007 474215;474216;474217 474217 3 STANNVEIHIPVPNDADSPK Unmodified 2117.0389 0.038911287 4065 Q9BXS5;K7EJL1;K7EQX3 AP1M1 AP-1 complex subunit mu-1 yes no 0 0 0 1 75.068 75.068 3 0.016628 76139 QUIQUE_C1368_190116_001 19.752 12.219 46335000 0 0 46335000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41751 4065 38967 373008 474218 474218 1 STAPSAAASASASAAASSPAGGGAEALELLEHCGVCR Unmodified 3441.5889 0.58889452 2983 Q13263 TRIM28 Transcription intermediary factor 1-beta yes yes 0 0 0 1 1 1 123.12 123.12 3 6.4231E-78 128111 QUIQUE_C1218_190116_001 131.53 126.22 121760000 42694000 0 0 0 48901000 30169000 0 0 0 0 0 0 0 41752 2983 38968 373009;373010;373011 474219;474220;474221;474222 474219 4 STAQQELDGKPASPTPVIVASHTANKEEK Unmodified 3032.5415 0.54145727 2380 P35606;H0YAC7 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 2 1 1 39.948 39.948 4 4.054E-06 36398 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.158 43.566 105890000 0 0 0 0 0 59881000 0 0 46005000 0 0 0 0 41753 2380 38969 373012;373013 474223;474224 474224 2 STAYEDYYYHPPPR Unmodified 1757.7686 0.76855009 1525 O43390;B4DT28;A0A286YEZ8 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 58.047 58.047 2;3 1.6808E-17 56655 QUIQUE_C1277_190116_001 152.07 145.41 1207400000 100180000 124690000 117940000 142610000 0 161360000 99646000 105150000 98306000 41364000 0 120230000 95959000 41754 1525 38970 373014;373015;373016;373017;373018;373019;373020;373021;373022;373023;373024;373025;373026 474225;474226;474227;474228;474229;474230;474231;474232;474233;474234;474235;474236;474237;474238;474239;474240;474241;474242 474228 18 STCIYGGAPK Unmodified 1052.4961 0.4960804 381;1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3KRZ1;A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX5;DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5;Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 no no 0 0 0 1 23.829 23.829 2 0.037895 17330 QUIQUE_C1368_190116_001 51.864 32.228 93316000 0 0 93316000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41755 1290;381 38971 373027 474243 474243 1 STCTINYSK Unmodified 1072.4859 0.48590964 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.163 19.163 2 0.034243 11506 QUIQUE_C1277_190116_001 55.112 44.698 1659000000 0 596920000 0 0 134920000 0 0 0 0 316220000 0 610910000 0 41756 336 38972 373028;373029;373030;373031 474244;474245;474246;474247 474244 4 STCTYVGAAK Unmodified 1056.491 0.49099502 2405;61 A0A087WWM4;F8WAN9;H0YNJ6;Q9P2T1;H0YMB3;H0YLV5;H0YK13;H0YK71;H0YN22;H0YMW6;P36959 GMPR2;GMPR GMP reductase;GMP reductase 2;GMP reductase 1 no no 0 0 0 1 16.968 16.968 2 0.015116 9089 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.673 39.47 79055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 79055000 0 0 0 41757 61;2405 38973 373032 474248 474248 1 STDFAPIKEDFGQEK Unmodified 1710.8101 0.81008055 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 69.969 69.969 2;3 7.5403E-53 69600 QUIQUE_C1368_190116_001 187.78 171.4 5647600000 375340000 322560000 306560000 324970000 434020000 363010000 312900000 714270000 524960000 137950000 632310000 421050000 777760000 41758 2483 38974 373033;373034;373035;373036;373037;373038;373039;373040;373041;373042;373043;373044;373045;373046;373047;373048;373049;373050;373051;373052;373053;373054;373055;373056;373057;373058 474249;474250;474251;474252;474253;474254;474255;474256;474257;474258;474259;474260;474261;474262;474263;474264;474265;474266;474267;474268;474269;474270;474271;474272;474273;474274;474275;474276;474277;474278;474279;474280;474281 474255 29 STDFAPIKEDFGQEKK Unmodified 1838.905 0.90504357 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 2 1 53.398 53.398 3 0.04085 50957 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.723 26.665 42817000 0 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373085;373086;373087;373088;373089;373090;373091;373092;373093;373094 474315;474316;474317;474318;474319;474320;474321;474322;474323;474324;474325 474317 9 STDYGIFQINSR Unmodified 1399.6732 0.67319314 2728 P61626;F8VV32;A0A0B4J259 LYZ Lysozyme C;Lysozyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.956 94.956 2 0.0036975 98701 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.549 79.502 509180000 0 63991000 73288000 69848000 55702000 0 36169000 47334000 0 29514000 90021000 0 43318000 41765 2728 38980 373095;373096;373097;373098;373099;373100;373101;373102;373103 474326;474327;474328;474329;474330;474331;474332;474333;474334 474333 6 STEATLSFGYLDPFPPEERPEVR Unmodified 2636.2758 0.27584709 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 132.98 132.98 2;3 2.8161E-87 135485 QUIQUE_C1563_190116_001 181.26 175.97 7583700000 546600000 630010000 799960000 482450000 650260000 552670000 801230000 429540000 667280000 193640000 647500000 713870000 468680000 41766 2948 38981 373104;373105;373106;373107;373108;373109;373110;373111;373112;373113;373114;373115;373116;373117;373118;373119;373120;373121;373122;373123;373124;373125;373126;373127;373128 474335;474336;474337;474338;474339;474340;474341;474342;474343;474344;474345;474346;474347;474348;474349;474350;474351;474352;474353;474354;474355;474356;474357;474358;474359;474360;474361;474362;474363;474364;474365;474366;474367;474368;474369;474370;474371;474372;474373;474374;474375;474376 474354 42 STEFNEHELK Unmodified 1232.5673 0.56733108 2761 P62760;E7ER47;E9PE24 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 22.874 22.874 2;3 5.3013E-12 16019 QUIQUE_C1277_190116_001 166.33 113.16 6314800000 846830000 879860000 338890000 315190000 781730000 633510000 811510000 122530000 202920000 197470000 311460000 275600000 597340000 41767 2761 38982 373129;373130;373131;373132;373133;373134;373135;373136;373137;373138;373139;373140;373141;373142;373143;373144;373145;373146;373147;373148;373149 474377;474378;474379;474380;474381;474382;474383;474384;474385;474386;474387;474388;474389;474390;474391;474392;474393;474394;474395;474396;474397;474398;474399 474380 20 STEFNEHELKQWYK Unmodified 1837.8635 0.8635131 2761 P62760;E7ER47;E9PE24 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 63.092 63.092 3 0.0032377 62377 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.276 42.253 184440000 0 0 0 0 0 0 0 85123000 57687000 0 0 0 41627000 41768 2761 38983 373150;373151;373152 474400;474401;474402 474401 2 STEGTETIEGVYNTVLLAIGR Unmodified 2222.143 0.14304201 390 H0YBI6;A0A1W2PR67;H0YBQ0;Q86VQ6 TXNRD3 Thioredoxin reductase 3 yes no 0 0 0 1 168.84 168.84 3 8.9276E-07 173369 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.596 72.602 17610000 0 0 0 0 0 0 0 0 17610000 0 0 0 0 41769 390 38984 373153 474403 474403 1 STELDSNWNWFQLR Unmodified 1794.8325 0.83254733 268 A0A0D9SF70;G5E9L0;Q8N6H7;E9PQP3;E9PIY6;E9PMR9;E9PM63;H0YDX1;E9PJT7;E9PK28;E9PN48;H0YF45 ARFGAP2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 147.39 147.39 2 0.00027618 151412 QUIQUE_C1403_190116_001 117.67 104.8 33780000 0 0 0 17178000 0 16602000 0 0 0 0 0 0 0 41770 268 38985 373154;373155 474404;474405 474404 2 STELDSNWSWFQLR Unmodified 1767.8216 0.82164829 4235 Q9NP61;B0QYV9;B0QYV8 ARFGAP3 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3 yes no 0 0 0 1 146.49 146.49 2 0.05749 153972 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.885 43.195 31851000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31851000 0 0 41771 4235 38986 373156 474406 474406 1 STELIPR Unmodified 814.45487 0.45486751 1579 O60502;H7C3X0 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes no 0 0 0 1 31.492 31.492 2 0.046754 26350 QUIQUE_C1576_190116_001 77.374 46.929 98129000 0 0 0 0 0 0 98129000 0 0 0 0 0 0 41772 1579 38987 373157 474407 474407 1 STELLIR Unmodified 830.48617 0.48616764 1317 K7EK07;P84243;K7EMV3;K7EP01;B4DEB1;K7ES00;Q71DI3;Q16695;P68431 H3F3B;H3F3A;HIST2H3A;HIST3H3;HIST1H3A Histone H3;Histone H3.3;Histone H3.2;Histone H3.1t;Histone H3.1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.615 42.615 2 3.1953E-05 40516 QUIQUE_C1218_190116_001 175.93 74.605 13443000000 1248100000 1158800000 693060000 687380000 1752800000 1086800000 1820000000 768150000 1564500000 438100000 0 860050000 1365500000 41773 1317 38988 373158;373159;373160;373161;373162;373163;373164;373165;373166;373167;373168;373169 474408;474409;474410;474411;474412;474413;474414;474415;474416;474417;474418;474419;474420;474421;474422;474423;474424;474425;474426;474427;474428;474429;474430 474409 23 STESAHAATLPPR Unmodified 1336.6735 0.67352749 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 1 16.004 16.004 3 0.025086 8548 QUIQUE_C1218_190116_001 37.594 27.751 61413000 27064000 0 34349000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41774 1472 38989 373170;373171;373172 474431;474432;474433 474431 3 STESLQANVQR Unmodified 1231.6157 0.61567826 1306 J3QSB4;P26373 RPL13 60S ribosomal protein L13 yes no 0 0 0 1 1 1 23.928 23.928 2 0.00048107 17772 QUIQUE_C1403_190116_001 107.69 85.202 77090000 0 0 47390000 29700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41775 1306 38990 373173;373174;373175 474434;474435;474436 474435 3 STETALYR Unmodified 939.46616 0.46616048 3062 Q14318;U3KQ64;A0A0A0MTJ1 FKBP8 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.957 22.957 2 0.004682 16210 QUIQUE_C1403_190116_001 108.24 91.274 366060000 0 0 52332000 72542000 90106000 0 75458000 0 0 0 75619000 0 0 41776 3062 38991 373176;373177;373178;373179;373180;373181 474437;474438;474439;474440;474441;474442;474443 474439 7 STETGQYLAMDTDGLLYGSQTPNEECLFLER Unmodified 3537.5916 0.59157986 1884 P05230 FGF1 Fibroblast growth factor 1 yes yes 0 0 0 1 155.08 155.08 3 0.00089223 160123 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.798 29.379 28898000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28898000 41777 1884 38992 373182 474444 474444 1 STEVEVLLPK Unmodified 1113.6281 0.62814043 2564 P50453 SERPINB9 Serpin B9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.913 75.913 2 0.0040451 77457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.948 75.648 323440000 78161000 54050000 0 42265000 0 0 0 38031000 0 0 60886000 0 50049000 41778 2564 38993 373183;373184;373185;373186;373187;373188;373189 474445;474446;474447;474448;474449;474450;474451 474450 6 STEVLPEKTDAVNEALESLESVLR Unmodified 2628.3494 0.34940597 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 1 1 1 1 161.12 161.12 3 2.367E-18 163698 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.94 105.36 313730000 0 0 0 0 0 0 0 140730000 65631000 0 107370000 0 0 41779 2486 38994 373190;373191;373192 474452;474453;474454 474452 3 STFAVFTHLPGK Unmodified 1303.6925 0.69247202 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 1 80.852 80.852 3 0.024766 82568 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.809 17.233 30065000 15431000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14635000 0 0 41780 318 38995 373193;373194 474455;474456;474457 474457 3 STFFNVLTNSQASAENFPFCTIDPNESR Unmodified 3192.4458 0.44584232 1276 J3KQ32;Q9NTK5;C9JTK6 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 161.18 161.18 3 1.0245E-19 163406 QUIQUE_C1563_190116_001 92.819 82.49 988490000 64553000 78011000 82562000 72324000 68353000 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474475;474476;474477;474478;474479;474480;474481;474482;474483;474484;474485;474486;474487;474488;474489;474490;474491;474492;474493;474494;474495;474496 474489 21 STFVLDEFK Unmodified 1084.5441 0.54407645 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.472 97.472 2 0.01368 99943 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.598 36.16 555130000 144930000 0 115280000 0 84298000 0 89149000 0 59244000 0 0 0 62226000 41783 2255 38998 373226;373227;373228;373229;373230;373231 474497;474498;474499;474500;474501;474502 474502 6 STFVLDEFKR Unmodified 1240.6452 0.64518747 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 1 2 2 2 2 3 1 2 2 1 2 2 1 74.234 74.234 2;3 0.00040686 74346 QUIQUE_C1368_190116_001 96.342 76.58 4100600000 301860000 350740000 436900000 383220000 358130000 0 663200000 369490000 318580000 135470000 0 349820000 433210000 41784 2255 38999 373232;373233;373234;373235;373236;373237;373238;373239;373240;373241;373242;373243;373244;373245;373246;373247;373248;373249;373250;373251;373252;373253 474503;474504;474505;474506;474507;474508;474509;474510;474511;474512;474513;474514;474515;474516;474517;474518;474519;474520;474521;474522;474523;474524;474525;474526;474527;474528 474508 25 STGCDFAVSPK Unmodified 1167.523 0.52302343 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.226 35.226 2 0.00066494 29827 QUIQUE_DMIX4_190116_001 98.044 90.104 4366900000 476580000 488900000 0 453790000 0 556720000 554000000 216410000 268220000 129390000 370380000 396930000 455580000 41785 2673 39000 373254;373255;373256;373257;373258;373259;373260;373261;373262;373263;373264 474529;474530;474531;474532;474533;474534;474535;474536;474537;474538;474539;474540;474541 474538 13 STGDIAGTVVPETNKEPR Unmodified 1869.9432 0.94321999 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 47.274 47.274 2;3 3.5712E-44 44563 QUIQUE_DMIX3_190116_001 198.14 161.16 911030000 33277000 126300000 0 147550000 35430000 76089000 85339000 32573000 186960000 0 0 147620000 39889000 41786 345 39001 373265;373266;373267;373268;373269;373270;373271;373272;373273;373274;373275;373276;373277;373278 474542;474543;474544;474545;474546;474547;474548;474549;474550;474551;474552;474553;474554;474555;474556 474552 14 STGDPWLTDGSYLDGTGFAR Unmodified 2114.9545 0.95451296 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 136.81 136.81 2 1.8033E-25 139408 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.1 117.91 109620000 45614000 0 0 0 0 0 0 41714000 0 22287000 0 0 0 41787 1492 39002 373279;373280;373281 474557;474558;474559 474558 3 STGDSQNLGSSSPSK Unmodified 1450.6536 0.65357991 1597 O60861;A0A0A0MS68;J3QLH8;J3KTB1;J3QS26;J3KS47 GAS7 Growth arrest-specific protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.244 14.244 2 2.4873E-24 6700 QUIQUE_C1218_190116_001 156.69 139.25 129030000 22734000 14428000 14855000 17869000 16674000 0 0 0 23723000 0 0 0 18744000 41788 1597 39003 373282;373283;373284;373285;373286;373287;373288;373289 474560;474561;474562;474563;474564;474565;474566;474567 474560 8 STGEAFVQFASK Unmodified 1270.6194 0.61936665 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 71.91 71.91 1;2 8.171E-06 71812 QUIQUE_C1403_190116_001 141.95 115.28 3913100000 324370000 367460000 292170000 291240000 334320000 271790000 334630000 286280000 253750000 74344000 412280000 303290000 367150000 41789 2340 39004 373290;373291;373292;373293;373294;373295;373296;373297;373298;373299;373300;373301;373302;373303 474568;474569;474570;474571;474572;474573;474574;474575;474576;474577;474578;474579;474580;474581;474582;474583;474584;474585;474586;474587;474588 474573 17 STGEAFVQFASQEIAEK Unmodified 1840.8843 0.88430813 905;2672 E9PCY7;G8JLB6;P31943;D6RIU0;D6RBM0;E5RGV0;E7EN40;H0YB39;E5RGH4;P55795 HNRNPH1;HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 125.75 125.75 2 1.2886E-16 130629 QUIQUE_C1368_190116_001 166.6 149.18 9798000000 918590000 942210000 914010000 734350000 708790000 726830000 754650000 801780000 783720000 0 894960000 894010000 724120000 41790 905;2672 39005 373304;373305;373306;373307;373308;373309;373310;373311;373312;373313;373314;373315;373316;373317 474589;474590;474591;474592;474593;474594;474595;474596;474597;474598;474599;474600;474601;474602;474603;474604;474605;474606;474607;474608;474609;474610;474611;474612;474613;474614;474615;474616;474617;474618;474619;474620;474621;474622 474597 34 STGEALVQGLMGAAVTLK Unmodified 1744.9393 0.93932058 1617 O75208;H3BSJ5;H3BRC0 COQ9 Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.5 147.5 2;3 0.00016762 153494 QUIQUE_C1218_190116_001 48.855 45.076 87451000 22602000 0 11162000 0 0 0 13210000 0 0 4469200 0 11940000 24067000 41791 1617 39006 373318;373319;373320;373321;373322;373323 474623;474624;474625;474626;474627;474628 474623 6 STGEPLGHVPAR Unmodified 1219.6309 0.63093439 3781 Q93052;C9JUT4;C9JE51;C9J2R5;C9JIY7;C9JT42;C9J3U9;C9J1K7;C9J5C8;C9J4E3 LPP Lipoma-preferred partner yes no 0 0 0 1 1 1 1 21.146 21.146 3 0.011121 14378 QUIQUE_C1438_190116_001 46.592 35.379 198280000 0 63500000 0 0 63925000 0 25888000 0 0 0 0 44970000 0 41792 3781 39007 373324;373325;373326;373327 474629;474630;474631;474632 474630 4 STGFETLVVTSEDGITK Unmodified 1782.8887 0.8887248 236 A0A0C4DGA2;O75521;F8WAW4;F1LLU7;C9JB63 ECI2 Enoyl-CoA delta isomerase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.66 114.66 2 1.6963E-12 117222 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.08 135.42 599030000 0 62612000 126570000 0 0 81268000 0 72948000 112870000 40624000 0 102150000 0 41793 236 39008 373328;373329;373330;373331;373332;373333;373334;373335;373336;373337 474633;474634;474635;474636;474637;474638;474639;474640;474641;474642 474639 9 STGGAPTFNVTVTK Unmodified 1378.7092 0.70924429 1926 P07737;K7EJ44 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.751 59.751 2 0.00019577 58268 QUIQUE_C1563_190116_001 116.55 96.243 26655000000 1546900000 2061900000 2272800000 1848200000 2281100000 1488400000 1790800000 2246200000 2216500000 1020900000 3171500000 1939800000 2770200000 + 41794 1926 39009 373338;373339;373340;373341;373342;373343;373344;373345;373346;373347;373348;373349;373350 474643;474644;474645;474646;474647;474648;474649;474650;474651;474652;474653;474654;474655;474656;474657 474648 12 STGGDFGNPLR Acetyl (Protein N-term) 1161.5415 0.54145068 2167 P20340;F5H3K7;F5GX61 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.581 86.581 2 0.0031533 83254 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.621 54.853 539320000 77837000 0 72368000 0 61231000 81672000 71460000 0 0 51315000 60020000 0 63419000 41795 2167 39010 373351;373352;373353;373354;373355;373356;373357;373358 474658;474659;474660;474661;474662;474663;474664;474665 474663 4 STGGDFGNPLRK Acetyl (Protein N-term) 1289.6364 0.6364137 2167 P20340;F5H3K7;F5GX61 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes no 1 0 1 1 1 1 57.791 57.791 2 0.017376 57209 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.943 63.852 1002200000 0 0 0 0 0 0 0 327110000 0 0 391320000 0 283800000 41796 2167 39011 373359;373360;373361 474666;474667;474668 474666 3 STGGISVPGPMGPSGPR Unmodified 1552.7668 0.76677595 1818 P02452 COL1A1 Collagen alpha-1(I) chain yes yes 0 0 0 1 70.932 70.932 2 0.0031888 70617 QUIQUE_C1403_190116_001 57.792 42.526 44352000 0 0 0 44352000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41797 1818 39012 373362 474669 474669 1 STGLILDSGATHTTAIPVHDGYVLQQGIVK Unmodified 3090.635 0.63496372 1771 O96019 ACTL6A Actin-like protein 6A yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 105.45 105.45 3;4 1.5266E-19 108893 QUIQUE_C1368_190116_001 78.921 73.017 492750000 0 66995000 114390000 109780000 0 0 73761000 0 0 29935000 0 19514000 78373000 41798 1771 39013 373363;373364;373365;373366;373367;373368;373369;373370;373371;373372 474670;474671;474672;474673;474674;474675;474676;474677;474678;474679 474672 9 STGLNAVPSQILEGQWAAR Unmodified 1997.033 0.033038048 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 129.08 129.08 2;3 2.3541E-05 132232 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.07 108.52 1160500000 94541000 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474736;474737;474738;474739;474740;474741;474742;474743;474744;474745;474746;474747 474736 12 STGTFVVSQPLNYR Acetyl (Protein N-term) 1609.81 0.81002097 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.17 119.17 2 1.566E-72 124105 QUIQUE_C1218_190116_001 213.31 182.69 8207500000 421670000 483780000 603600000 545660000 659400000 524210000 611800000 810710000 791300000 432060000 769120000 685750000 868400000 41810 2522 39025 373435;373436;373437;373438;373439;373440;373441;373442;373443;373444;373445;373446;373447 474748;474749;474750;474751;474752;474753;474754;474755;474756;474757;474758;474759;474760;474761;474762;474763;474764;474765;474766;474767;474768;474769 474748 22 STGTFVVSQPLNYR Unmodified 1567.7995 0.79945628 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 83.348 83.348 2 0.012447 85760 QUIQUE_C1368_190116_001 66.55 51.859 845320000 0 0 467840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 377480000 41811 2522 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VPS16 Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 85.222 85.222 3;4 0.00099729 86949 QUIQUE_C1277_190116_001 54.974 45.051 291210000 0 78402000 0 61678000 0 75745000 0 0 41092000 0 0 34292000 0 41814 4140 39028 373463;373464;373465;373466;373467;373468;373469;373470 474785;474786;474787;474788;474789;474790;474791;474792 474786 8 STHNEDQASCEVLTVK Unmodified 1816.8261 0.82614132 4493 Q9ULR3 PPM1H Protein phosphatase 1H yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 1 1 1 32.669 32.669 2;3 8.5203E-19 27739 QUIQUE_C1277_190116_001 154.6 142.73 512230000 71285000 81970000 60921000 52324000 36008000 46519000 65342000 0 0 0 35997000 29227000 32637000 41815 4493 39029 373471;373472;373473;373474;373475;373476;373477;373478;373479;373480;373481;373482;373483 474793;474794;474795;474796;474797;474798;474799;474800;474801;474802;474803;474804;474805;474806 474796 14 STHTLDLSR Unmodified 1028.5251 0.52507234 2920 Q08380;K7EP36;K7ESM3;K7EKQ5;K7EJY8 LGALS3BP Galectin-3-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 19.304 19.304 2 0.021973 12148 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.78 25.019 187890000 51236000 0 0 0 0 0 49089000 0 49830000 0 0 37734000 0 41816 2920 39030 373484;373485;373486;373487 474807;474808;474809;474810 474809 4 STIGGQIMYLTGMVDKR Unmodified 1868.9488 0.94883941 2089 P15170;H3BR35;H3BSV8 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A yes no 0 0 1 1 125.5 125.5 3 0.00012393 128195 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.441 15.628 36156000 0 0 0 0 0 0 0 36156000 0 0 0 0 0 41817 2089 39031 373488 474811;474812 474811 2 STIGVEFATR Unmodified 1079.5611 0.56112349 3168 Q15907;H3BMH2;H3BSC1;P62491 RAB11B;RAB11A Ras-related protein Rab-11B;Ras-related protein Rab-11A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 61.215 61.215 2 0.0005169 59909 QUIQUE_C1403_190116_001 128.38 76.529 1372600000 118120000 157600000 0 137710000 99502000 115350000 103240000 151920000 114500000 106840000 0 121530000 146310000 41818 3168 39032 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474837;474838;474839;474840;474841;474842;474843;474844;474845 474840 8 STILYAGNDKWCLDPR Unmodified 1907.92 0.91998213 4372 Q9P121;F8VTR5 NTM Neurotrimin yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 1 92.455 92.455 2;3 7.8222E-18 95818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.38 107.97 1222500000 0 41211000 0 66678000 166050000 0 148260000 175580000 221530000 0 282880000 47528000 72823000 41821 4372 39035 373513;373514;373515;373516;373517;373518;373519;373520;373521;373522;373523;373524;373525;373526;373527 474846;474847;474848;474849;474850;474851;474852;474853;474854;474855;474856;474857;474858;474859;474860;474861;474862 474858 15 STIQNLQSFDPFADATK Acetyl (Protein N-term) 1923.9214 0.92142191 1589 O60739 EIF1B Eukaryotic translation initiation factor 1b yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 162.61 162.61 2 3.7304E-30 166404 QUIQUE_C1277_190116_001 176.08 164.11 224900000 63723000 46111000 32252000 0 0 43827000 0 0 28250000 10737000 0 0 0 41822 1589 39036 373528;373529;373530;373531;373532;373533;373534 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475105;475106 475105 2 STLMDTLFNTK Oxidation (M) 1285.6224 0.62240312 820;594;806 D6RDP1;D6R9Y6;D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.491 84.491 2 0.0003257 84771 QUIQUE_C1563_190116_001 120.31 91.388 1374400000 101730000 125120000 138470000 100400000 89312000 112720000 71662000 0 124110000 104480000 148380000 122310000 135750000 41843 806;820;594 39056 373720;373721;373722;373723;373724;373725;373726;373727;373728;373729;373730;373731;373732 475107;475108;475109;475110;475111;475112;475113;475114;475115;475116;475117;475118;475119 475113 390 9 STLMDTLFNTK Unmodified 1269.6275 0.6274885 820;594;806 D6RDP1;D6R9Y6;D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5;B1AMS2;Q14141 SEPT11;SEPT6 Septin-11;Septin-6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.72 123.72 2 5.5301E-37 127748 QUIQUE_DMIX7_190116_001 196.88 160.48 9270600000 743930000 871090000 1046800000 743340000 595410000 695380000 843530000 496160000 594640000 271940000 887140000 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QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.26 97.118 6982700000 333600000 425680000 763270000 629300000 617350000 591670000 572980000 0 546690000 281650000 879570000 638170000 702740000 41848 585;2493 39059 373775;373776;373777;373778;373779;373780;373781;373782;373783;373784;373785;373786 475182;475183;475184;475185;475186;475187;475188;475189;475190;475191;475192;475193;475194;475195;475196;475197;475198;475199;475200;475201;475202;475203;475204 475196 22 STLNELVDYITISR Unmodified 1622.8516 0.85155143 3180 Q16537 PPP2R5E Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit epsilon isoform yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 148.56 148.56 2;3 9.5543E-05 152915 QUIQUE_C1277_190116_001 101.3 90.259 641310000 78223000 74312000 38922000 97191000 45518000 48266000 14222000 0 59620000 15111000 68119000 74922000 26883000 41849 3180 39060 373787;373788;373789;373790;373791;373792;373793;373794;373795;373796;373797;373798;373799;373800;373801;373802 475205;475206;475207;475208;475209;475210;475211;475212;475213;475214;475215;475216;475217;475218;475219;475220;475221;475222 475209 17 STLNPQWNESFTFK Unmodified 1697.8049 0.80493559 2121 P17252;J3KRN5 PRKCA Protein kinase C alpha type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.62 110.62 2 1.6572E-17 114472 QUIQUE_C1277_190116_001 189.57 173.65 7647500000 793320000 546620000 577360000 504880000 605100000 444860000 531320000 633680000 759050000 285370000 730380000 690210000 545370000 41850 2121 39061 373803;373804;373805;373806;373807;373808;373809;373810;373811;373812;373813;373814;373815 475223;475224;475225;475226;475227;475228;475229;475230;475231;475232;475233;475234;475235;475236;475237;475238;475239;475240;475241;475242 475226 20 STLPDADRER Unmodified 1158.5629 0.56291441 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 15.69 15.69 2;3 0.0018316 8739 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.26 105.18 3601000000 0 288760000 175250000 209700000 360960000 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84.379 2 0.0036344 84299 QUIQUE_C1563_190116_001 107.79 86.324 424470000 87410000 0 0 0 42026000 59787000 0 57451000 80354000 26232000 0 71212000 0 41854 1713 39065 373834;373835;373836;373837;373838;373839;373840 475261;475262;475263;475264;475265;475266;475267 475263 5 STLTDSLVCK Unmodified 1122.5591 0.55907458 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.178 55.178 2 0.001456 51401 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.431 72.487 3994200000 312700000 353840000 364020000 425640000 396460000 305600000 400620000 231970000 174160000 116970000 319090000 269690000 323400000 41855 2058 39066 373841;373842;373843;373844;373845;373846;373847;373848;373849;373850;373851;373852;373853 475268;475269;475270;475271;475272;475273;475274;475275;475276;475277;475278;475279;475280;475281;475282 475278 13 STLVCPDCGNVSVTFDPFCYLSVPLPISHK Unmodified 3408.6193 0.61925536 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 1 164.46 164.46 3 2.3951E-19 168340 QUIQUE_C1277_190116_001 75.82 70.1 85675000 0 69249000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16426000 41856 1096 39067 373854;373855 475283;475284 475283 2 STLVCPECAK Unmodified 1163.5315 0.53147962 4605;2965 Q9Y4E8;Q13107;H7C189 USP15;USP4 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase no no 0 0 0 1 1 1 1 26.594 26.594 2 0.014657 20709 QUIQUE_C1277_190116_001 64.04 46.655 94979000 0 32186000 0 0 0 19041000 43752000 0 0 0 0 0 0 41857 4605;2965 39068 373856;373857;373858;373859 475285;475286;475287;475288 475285 4 STLVDALCR Unmodified 1033.5226 0.5226295 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 69.44 69.44 2 0.047113 68698 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.734 44.957 30445000 30445000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41858 2285 39069 373860;373861;373862 475289;475290;475291 475291 3 STLVHSLFLTDLYK Unmodified 1635.8872 0.88720866 3970;1092 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475344;475345;475346;475347;475348;475349;475350;475351;475352;475353;475354;475355;475356;475357;475358;475359;475360;475361;475362;475363 475355 20 STLVNSLFLTDLYR Unmodified 1640.8774 0.87737225 1514 O43236;J3QRT6;J3KSZ7;J3QLA8;J3QLR2;J3QRU3 SEPT4 Septin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 146.79 146.79 2 1.0712E-29 152780 QUIQUE_C1218_190116_001 176.95 152.09 2523600000 203050000 204240000 197280000 163870000 221140000 145840000 321630000 143380000 146900000 70479000 265540000 197770000 242450000 41862 1514 39073 373911;373912;373913;373914;373915;373916;373917;373918;373919;373920;373921;373922;373923 475364;475365;475366;475367;475368;475369;475370;475371;475372;475373;475374;475375;475376;475377 475364 13 STLVNTLFK Unmodified 1021.5808 0.5807963 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.921 85.921 2 0.00022039 87960 QUIQUE_C1277_190116_001 138.83 92.81 6091700000 515260000 522200000 551850000 449430000 446320000 411810000 519190000 360070000 492380000 169690000 524030000 559560000 569870000 41863 419;584 39074 373924;373925;373926;373927;373928;373929;373930;373931;373932;373933;373934;373935;373936 475378;475379;475380;475381;475382;475383;475384;475385;475386;475387;475388;475389;475390;475391;475392;475393 475379 16 STLYVSPHPDAFPSLR Acetyl (Protein N-term) 1827.9155 0.91554867 2254 P26640;A0A140T954;A2ABF4;A0A0G2JJT9 VARS Valine--tRNA ligase yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.46 118.46 2 1.4028E-24 123921 QUIQUE_C1438_190116_001 151.55 130.51 1011100000 87039000 159540000 146200000 83665000 65283000 100570000 104330000 0 73802000 39943000 150700000 0 0 41864 2254 39075 373937;373938;373939;373940;373941;373942;373943;373944;373945;373946 475394;475395;475396;475397;475398;475399;475400;475401;475402;475403;475404;475405;475406 475399 13 STMDNPTTTQYASLMHSFILK Unmodified 2385.1345 0.13446793 4240 Q9NP97;B1AKR6 DYNLRB1 Dynein light chain roadblock-type 1 yes no 0 0 0 1 1 132.3 132.3 3 1.5072E-05 135426 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.015 67.829 116440000 0 0 40458000 0 0 0 0 75982000 0 0 0 0 0 41865 4240 39076 373947;373948 475407;475408 475408 2 STMLELEK Unmodified 949.47903 0.47903335 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.091 47.091 2 0.016334 44051 QUIQUE_C1403_190116_001 83.313 66.02 7777700000 0 633210000 894070000 727120000 695990000 751920000 706840000 945740000 0 290300000 1099500000 0 1033000000 41866 2941 39077 373949;373950;373951;373952;373953;373954;373955;373956;373957;373958 475409;475410;475411;475412;475413;475414;475415;475416;475417;475418 475411 7 STMLELEK Oxidation (M) 965.47395 0.47394797 2941 Q12765 SCRN1 Secernin-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 27.937 27.937 2 0.044767 22389 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.962 27.959 331010000 0 0 122780000 0 0 0 0 92118000 0 0 116110000 0 0 41867 2941 39077 373959;373960;373961 475419;475420;475421 475421 3 STMMTQEQIQK Unmodified 1323.6163 0.61627189 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.675 30.675 2 0.00015356 25886 QUIQUE_C1218_190116_001 128 106.53 146750000 38509000 0 0 0 0 0 41230000 21082000 0 0 45933000 0 0 41868 153 39078 373962;373963;373964;373965;373966;373967;373968 475422;475423;475424;475425;475426;475427;475428 475422 5 STMQELNSR Unmodified 1064.4921 0.49205765 780 CON__P35527;P35527 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.189 21.189 2 0.00045345 13900 QUIQUE_C1277_190116_001 117.4 89.181 2913400000 97024000 114430000 40238000 156810000 390840000 137660000 109190000 226130000 208610000 179470000 422390000 381250000 449340000 + 41869 780 39079 373969;373970;373971;373972;373973;373974;373975;373976;373977;373978;373979;373980;373981 475429;475430;475431;475432;475433;475434;475435;475436;475437;475438;475439;475440;475441;475442 475431 14 STMVGTPYWMAPEVVTR Oxidation (M) 1939.9172 0.91720493 2970;2974;120 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475449;475450;475451;475452;475453 475450 5 STNCFGDNDPIDVCEIGSK Unmodified 2126.8885 0.88848358 4150 Q9H2U2;D6R967;H0Y9D8;D6RGV9 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 98.108 98.108 2 1.6033E-07 100370 QUIQUE_C1403_190116_001 125.54 119.82 362170000 39642000 47536000 68762000 41574000 45304000 38861000 43584000 0 0 0 0 0 36910000 41872 4150 39081 373992;373993;373994;373995;373996;373997;373998;373999 475454;475455;475456;475457;475458;475459;475460;475461 475457 8 STNEAMEWMNNK Unmodified 1453.5966 0.59659908 2363 P34932 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 69.954 69.954 2 0.0004975 70065 QUIQUE_C1277_190116_001 106.35 92.583 335380000 0 56289000 50519000 0 51631000 0 0 48402000 0 0 65634000 62910000 0 41873 2363 39082 374000;374001;374002;374003;374004;374005;374006 475462;475463;475464;475465;475466;475467;475468;475469 475462 7 STNGDTFLGGEDFDQALLR Unmodified 2054.9545 0.95451296 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, 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374214;374215;374216;374217;374218;374219;374220;374221 475703;475704;475705;475706;475707;475708;475709;475710 475703 8 STQAPLIIRPDSGNPLDTVLK Unmodified 2234.227 0.22704641 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 116.5 116.5 2;3 1.1776E-18 120494 QUIQUE_C1368_190116_001 145.1 104.62 3412500000 199440000 175850000 376650000 430600000 210860000 279970000 202130000 218640000 253200000 138990000 337430000 192900000 395880000 41895 2465 39104 374222;374223;374224;374225;374226;374227;374228;374229;374230;374231;374232;374233;374234;374235;374236;374237;374238;374239;374240;374241;374242;374243 475711;475712;475713;475714;475715;475716;475717;475718;475719;475720;475721;475722;475723;475724;475725;475726;475727;475728;475729;475730;475731;475732;475733;475734;475735;475736;475737 475717 26 STQDEINQAR Unmodified 1160.5422 0.54217896 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.356 19.356 2 1.999E-08 12084 QUIQUE_DMIX4_190116_001 158.07 121.5 893330000 0 193740000 0 158390000 0 0 154780000 0 130330000 47071000 0 0 209020000 41896 4394 39105 374244;374245;374246;374247;374248;374249 475738;475739;475740;475741;475742;475743 475742 3 STQDLSDVSMDEVGIPLR Unmodified 1960.9412 0.94117108 4058 Q9BX66;S4R303 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 123.23 123.23 2 9.8281E-11 120071 QUIQUE_DMIX4_190116_001 147.18 126.32 288710000 0 0 0 65736000 50548000 0 0 65812000 0 16539000 0 0 90070000 41897 4058 39106 374250;374251;374252;374253;374254;374255 475744;475745;475746;475747;475748;475749 475748 6 STQFEYAWCLVR Unmodified 1558.7238 0.7238485 4590 Q9Y3D6 FIS1 Mitochondrial fission 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 123.29 123.29 2 1.6569E-07 127362 QUIQUE_C1277_190116_001 147.75 133.33 1587700000 166780000 251100000 0 0 0 231250000 0 220960000 0 0 0 318390000 399220000 41898 4590 39107 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CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 86.392 86.392 3 0.012444 87772 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.267 50.326 412560000 0 0 73578000 0 0 0 0 93652000 0 0 140170000 0 105150000 41904 2807 39113 374283;374284;374285;374286 475780;475781;475782;475783 475783 2 STSEPAVPPEEAEPHTEPEEQVPVEAEPQNIEDEAK Unmodified 3937.7865 0.78651074 2944 Q12797;E5RG29;E5RG56;A0A087WUJ2 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 89.715 89.715 3 5.6323E-05 92820 QUIQUE_C1218_190116_001 40.146 35.614 190760000 49244000 0 53369000 0 0 0 0 36255000 0 0 51888000 0 0 41905 2944 39114 374287;374288;374289;374290 475784;475785;475786;475787 475784 4 STSESFIQHIVSLVHHVK Unmodified 2047.0851 0.085073618 4332 Q9NYF8;A0A1W2PQ43;E9PK09;E9PQN2;E9PKI6;E9PK91;E9PJA7 BCLAF1 Bcl-2-associated transcription factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 3 1 115.02 115.02 3;4 6.6183E-05 119705 QUIQUE_C1576_190116_001 82.007 72.843 1165000000 52887000 0 58842000 55896000 289910000 106950000 56616000 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light chain kinase, smooth muscle, deglutamylated form yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 107.83 107.83 3 0.0002215 110216 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.499 51.656 312750000 45636000 0 105600000 0 0 72089000 0 30334000 0 0 59090000 0 0 41908 3154 39117 374318;374319;374320;374321;374322 475815;475816;475817;475818;475819;475820 475819 5 STSGFDIINMLMGFDK Unmodified 1774.827 0.82699294 3309 Q5T2E6;Q5T2E7 C10orf76 UPF0668 protein C10orf76 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 172.89 172.89 2 2.9894E-05 177113 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.531 85.112 95751000 0 9777900 0 0 7170000 0 27206000 0 19713000 0 22171000 0 9712000 41909 3309 39118 374323;374324;374325;374326;374327;374328 475821;475822;475823;475824;475825;475826;475827 475824 6 STSGGTAALGCLVK Unmodified 1320.6708 0.6707503 161;398 A0A0A0MS08;P01857;A0A0A0MS07;A0A286YES1;P01860 IGHG1;IGHG3 Ig gamma-1 chain C region;Ig gamma-3 chain C region no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.317 59.317 2 5.8363E-07 58231 QUIQUE_C1277_190116_001 125.75 116.04 13930000000 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4333 39129 374407;374408 475933;475934 475934 2 STTLFSR Unmodified 810.42357 0.42356738 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 33.127 33.127 2 0.027861 28158 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.677 59.705 197710000 0 0 63905000 0 0 0 0 0 0 37560000 96246000 0 0 41922 2623 39130 374409;374410;374411 475935;475936;475937 475936 3 STTQVADSGYQR Unmodified 1311.6055 0.6055075 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 19.832 19.832 2 0.00053235 12959 QUIQUE_C1218_190116_001 100.58 75.73 132460000 35764000 0 45602000 51096000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41923 3797 39131 374412;374413;374414;374415;374416 475938;475939;475940;475941;475942 475938 5 STTSDIPHMLNQVESK Unmodified 1785.8567 0.85671317 3246 Q52LJ0;H0YNA1 FAM98B Protein FAM98B yes no 0 0 0 1 1 73.761 73.761 2 1.0721E-06 74397 QUIQUE_C1277_190116_001 98.406 73.553 24108000 0 0 0 24108000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41924 3246 39132 374417;374418 475943;475944 475943 1 STTSQVTPAEEK Unmodified 1276.6147 0.61467521 921 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374432;374433;374434;374435;374436;374437;374438;374439;374440;374441;374442;374443;374444;374445;374446;374447;374448;374449;374450;374451;374452;374453;374454;374455;374456 475958;475959;475960;475961;475962;475963;475964;475965;475966;475967;475968;475969;475970;475971;475972;475973;475974;475975;475976;475977;475978;475979;475980;475981;475982;475983 475958 17 STTTIGLVQALGAHLYQNVFACVR Unmodified 2618.3639 0.36389102 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 165.01 165.01 3 2.0995E-64 169024 QUIQUE_C1277_190116_001 167.53 148.15 2827400000 102420000 88775000 0 118300000 601970000 109700000 263110000 369440000 140610000 0 266710000 406640000 359730000 41930 1005;2027 39137 374457;374458;374459;374460;374461;374462;374463;374464;374465;374466;374467 475984;475985;475986;475987;475988;475989;475990;475991;475992;475993;475994;475995;475996 475985 12 STTTSDMIAEVGAAFSK Unmodified 1714.8084 0.80836599 3533 Q8IW45 CARKD ATP-dependent (S)-NAD(P)H-hydrate dehydratase yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 2 1 2 136.31 136.31 2;3 0.00018672 139395 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.595 49.481 1152700000 78871000 112600000 126060000 122050000 107740000 31183000 54199000 31652000 126060000 9924300 129320000 91047000 131970000 41931 3533 39138 374468;374469;374470;374471;374472;374473;374474;374475;374476;374477;374478;374479;374480;374481;374482;374483;374484;374485;374486;374487 475997;475998;475999;476000;476001;476002;476003;476004;476005;476006;476007;476008;476009;476010;476011;476012;476013;476014;476015;476016 476008 18 STTWLHPVTGEAVVTGHR Unmodified 1946.9963 0.99625861 4206 Q9HAU0 PLEKHA5 Pleckstrin homology domain-containing family A member 5 yes yes 0 0 0 1 60.56 60.56 3 0.01044 59371 QUIQUE_C1403_190116_001 37.624 27.343 38470000 0 0 0 38470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41932 4206 39139 374488 476017 476017 1 STVAQLVK Unmodified 844.50182 0.5018177 2243 P25705;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.458 28.458 2 0.01729 23162 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.784 46.706 18498000000 2813600000 2544200000 2723700000 2216800000 0 0 2525600000 2121000000 0 1124800000 0 2428100000 0 41933 2243 39140 374489;374490;374491;374492;374493;374494;374495;374496 476018;476019;476020;476021;476022;476023;476024;476025 476023 3 STVASMMHR Unmodified 1018.4688 0.46881979 412;3010;3299;896;803;1135 D6R938;Q13557;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2;A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3;Q13554;H7BXS4;H7BZC6 CAMK2D;CAMK2G;CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma;Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 21.487 21.487 2 5.4183E-05 14468 QUIQUE_C1368_190116_001 146.54 57.6 3608100000 0 548080000 323170000 389240000 394690000 249870000 351490000 396150000 182780000 0 304750000 280630000 187290000 41934 803;896;1135;412;3299;3010 39141 374497;374498;374499;374500;374501;374502;374503;374504;374505;374506;374507;374508 476026;476027;476028;476029;476030;476031;476032;476033;476034;476035;476036;476037;476038 476027 10 STVDAPTAAGR Unmodified 1044.52 0.51998696 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 18.546 18.546 2 0.039293 11016 QUIQUE_C1576_190116_001 47.706 25.32 50225000 0 0 0 0 0 0 50225000 0 0 0 0 0 0 41935 3977 39142 374509 476039 476039 1 STVDGLQVTQLNVDHTTENEDELFR Unmodified 2859.3523 0.35225951 3155 Q15750 TAB1 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 117.64 117.64 3 7.4796E-08 119835 QUIQUE_C1563_190116_001 63.115 50.176 135630000 0 0 0 37814000 0 35452000 35518000 0 0 26843000 0 0 0 41936 3155 39143 374510;374511;374512;374513 476040;476041;476042;476043 476041 4 STVDLLTSITFFR Unmodified 1498.8031 0.80314468 1043 F8VZH8;F8W0P6;F8W059;Q9UPW8 UNC13A Protein unc-13 homolog A no no 0 0 0 1 1 159.08 159.08 2 0.00027086 164442 QUIQUE_C1218_190116_001 112.13 94.617 33483000 18943000 0 0 0 0 0 0 0 14540000 0 0 0 0 41937 1043 39144 374514;374515 476044;476045 476044 2 STVEGIQASVK Unmodified 1117.5979 0.59790293 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 34.815 34.815 2 0.013359 29309 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.552 36.463 523240000 0 0 0 0 0 0 0 0 350340000 172900000 0 0 0 41938 2135 39145 374516;374517 476046;476047 476047 2 STVFGTALNYVSLR Unmodified 1526.8093 0.80929269 2507 P48449;C9J315 LSS Lanosterol synthase yes no 0 0 0 1 1 132.53 132.53 2 0.0011156 129031 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.146 73.514 32364000 0 0 0 18829000 0 0 0 0 0 13535000 0 0 0 41939 2507 39146 374518;374519 476048;476049 476049 2 STVHEILCK Acetyl (Protein N-term) 1127.5645 0.56449431 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;A6NMY6;H0YKS4;H0YNP5;H0YMM1;H0YKZ7;H0YLV6;H0YMT9;H0YKX9;H0YKL9;H0YKV8;H0YMD9;H0YNB8;H0YKN4 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.86 55.86 2 3.4961E-19 53976 QUIQUE_C1368_190116_001 195.06 148.07 16216000000 1320200000 1478700000 1071400000 2008800000 1432900000 1165500000 1359200000 825250000 1360500000 1049000000 897240000 892560000 1354900000 41940 1920 39147 374520;374521;374522;374523;374524;374525;374526;374527;374528;374529;374530;374531;374532 476050;476051;476052;476053;476054;476055;476056;476057;476058;476059;476060;476061;476062;476063;476064;476065;476066;476067;476068;476069;476070;476071;476072;476073;476074;476075;476076;476077;476078 476057 29 STVINAMLWDK Unmodified 1276.6486 0.64855829 1705 O95140 MFN2 Mitofusin-2 yes yes 0 0 0 1 103.31 103.31 2 0.037025 107140 QUIQUE_C1368_190116_001 54.784 26.702 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41941 1705 39148 374533 476079 476079 1 STVISYECCPGYEK Unmodified 1691.7171 0.71710814 3146 Q15582;H0Y8M8 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 0 1 58.611 58.611 2 0.0068877 56615 QUIQUE_C1563_190116_001 64.439 57.06 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41942 3146 39149 374534 476080 476080 1 STVLQQQYNR Unmodified 1235.6258 0.62584901 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.339 29.339 2 7.7445E-07 23580 QUIQUE_C1403_190116_001 163.77 127.08 427470000 0 0 48693000 62652000 0 50349000 34063000 43714000 58517000 25321000 68092000 36069000 0 41943 4600 39150 374535;374536;374537;374538;374539;374540;374541;374542;374543;374544 476081;476082;476083;476084;476085;476086;476087;476088;476089;476090;476091 476083 8 STVLSLDWHPNNVLLAAGSCDFK Unmodified 2543.2479 0.2478582 369;3752;1485 A0A1W2PNV4;E9PF58;O15143;C9JEY1;C9K057;Q92747 ARPC1A;ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B;Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 138.42 138.42 2;3 1.6327E-142 144919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 223.76 211.62 4255400000 269020000 333080000 341850000 243770000 299690000 202860000 424400000 345070000 373840000 93001000 564290000 427550000 336980000 41944 369;1485;3752 39151 374545;374546;374547;374548;374549;374550;374551;374552;374553;374554;374555;374556;374557;374558;374559;374560;374561;374562;374563;374564;374565;374566;374567;374568 476092;476093;476094;476095;476096;476097;476098;476099;476100;476101;476102;476103;476104;476105;476106;476107;476108;476109;476110;476111;476112;476113;476114;476115;476116;476117;476118 476113 26 STVLTIPEIIIK Unmodified 1325.817 0.81700383 1785 P00488 F13A1 Coagulation factor XIII A chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 130.19 130.19 2 0.00091271 126883 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.2 101.04 432800000 0 0 0 188880000 83552000 0 0 0 0 85187000 75187000 0 0 41945 1785 39152 374569;374570;374571;374572 476119;476120;476121;476122;476123 476121 4 STVPHAYATADCDLGAVLK Unmodified 1987.9673 0.96732625 1399 O00330 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 85.812 85.812 2;3 1.3536E-28 87432 QUIQUE_C1277_190116_001 146.96 116.75 658250000 176250000 158030000 110060000 0 108550000 105370000 0 0 0 0 0 0 0 41946 1399 39153 374573;374574;374575;374576;374577;374578;374579 476124;476125;476126;476127;476128;476129;476130;476131 476126 7 STVPTDFSSAK Unmodified 1138.5506 0.55061839 2925 Q08722;A0A2R8Y484 CD47 Leukocyte surface antigen CD47 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 37.934 37.934 2 0.0035438 34104 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.556 57.931 2765000000 0 0 589930000 0 415570000 0 0 264190000 346650000 0 456430000 285310000 406940000 41947 2925 39154 374580;374581;374582;374583;374584;374585;374586 476132;476133;476134;476135;476136;476137;476138 476137 5 STVPVNTNR Unmodified 986.51451 0.51450765 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 15.795 15.795 2 0.0019894 8305 QUIQUE_DMIX3_190116_001 98.009 62.564 33027000 0 0 0 0 0 0 0 0 33027000 0 0 0 0 41948 1408 39155 374587 476139;476140 476140 2 STVTLSWKPVQK Unmodified 1372.7715 0.77145062 1073 G3V1C3;Q9BZZ5 API5 Apoptosis inhibitor 5 no no 0 0 1 1 1 1 1 3 2 1 2 51.823 51.823 2;3 0.00032822 50554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.38 112.26 333340000 0 36510000 0 34891000 53662000 0 0 0 72659000 0 34449000 101170000 0 41949 1073 39156 374588;374589;374590;374591;374592;374593;374594;374595;374596;374597;374598;374599 476141;476142;476143;476144;476145;476146;476147;476148;476149;476150;476151;476152;476153;476154 476147 14 STWLILHHK Unmodified 1133.6346 0.63456321 1773 P00167 CYB5A Cytochrome b5 yes yes 0 0 0 1 1 1 32.642 32.642 2 0.028377 28338 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.177 41.796 54360000 23407000 0 0 0 0 0 0 13829000 17124000 0 0 0 0 41950 1773 39157 374600;374601;374602 476155;476156;476157 476156 3 STYNHLSSWLTDAR Unmodified 1649.7798 0.77978347 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 84.079 84.079 2;3 8.3654E-11 85481 QUIQUE_C1277_190116_001 104.09 91.708 4118500000 389390000 536850000 531900000 404680000 419050000 384700000 444010000 187920000 406040000 125230000 0 288680000 0 41951 2713 39158 374603;374604;374605;374606;374607;374608;374609;374610;374611;374612;374613;374614;374615;374616;374617;374618;374619;374620;374621;374622;374623;374624;374625 476158;476159;476160;476161;476162;476163;476164;476165;476166;476167;476168;476169;476170;476171;476172;476173;476174;476175;476176;476177;476178;476179;476180;476181;476182 476160 23 STYVTEVR Unmodified 953.48181 0.48181054 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;H0YJP2 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.351 24.351 2 0.0036758 17988 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.49 28.022 419140000 0 0 80917000 59793000 0 69945000 0 0 73625000 0 0 85560000 49297000 41952 3490 39159 374626;374627;374628;374629;374630;374631 476183;476184;476185;476186;476187;476188 476187 6 SVAADFIQQGIR Unmodified 1303.6884 0.68844927 4037 Q9BUT1;D6R9P2 BDH2;SLC9B2 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 1 2 1 90.262 90.262 2;3 2.8088E-22 92085 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.36 153.93 7567300000 458800000 407590000 779480000 578010000 600810000 545800000 417950000 719030000 633430000 272800000 761710000 608300000 783630000 41953 4037 39160 374632;374633;374634;374635;374636;374637;374638;374639;374640;374641;374642;374643;374644;374645;374646;374647;374648;374649;374650;374651;374652 476189;476190;476191;476192;476193;476194;476195;476196;476197;476198;476199;476200;476201;476202;476203;476204;476205;476206;476207;476208;476209;476210;476211;476212;476213;476214;476215;476216;476217;476218;476219;476220 476207 31 SVAAFTADPLSLLR Unmodified 1459.8035 0.80347903 3914 Q96P48;E7EU13;A0A0A0MSJ2 ARAP1 Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 79.294 79.294 2;4 0.0047563 147210 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476230;476231;476232;476233;476234;476235;476236;476237;476238;476239 476232 10 SVAFPCISTGIYGFPNEPAAVIALNTIK Unmodified 2949.531 0.53101592 464 A0A2R8YFN3;A1Z1Q3 MACROD2 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD2 yes no 0 0 0 1 1 1 166.6 166.6 3 2.0577E-09 172875 QUIQUE_C1438_190116_001 65.223 62.75 160240000 0 0 0 0 63867000 0 53723000 0 0 0 0 0 42651000 41957 464 39164 374670;374671;374672 476240;476241;476242 476240 3 SVAFPCISTGVFGYPCEAAAEIVLATLR Unmodified 2998.4933 0.49325021 3990 Q9BQ69 MACROD1 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD1 yes yes 0 0 0 1 174.85 174.85 3 0.012833 179619 QUIQUE_C1576_190116_001 30.602 24.636 15126000 0 0 0 0 0 0 15126000 0 0 0 0 0 0 41958 3990 39165 374673 476243 476243 0 SVAGGFVYTYK Unmodified 1190.5972 0.59717465 3135 Q15393 SF3B3 Splicing factor 3B subunit 3 yes yes 0 0 0 1 1 69.754 69.754 2 0.01432 69637 QUIQUE_C1277_190116_001 68.893 45.574 38123000 0 38123000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41959 3135 39166 374674;374675 476244;476245 476244 2 SVAGILEHMFK Unmodified 1230.6431 0.64307898 3402 Q6SZW1 SARM1 Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 117.56 117.56 2;3 0.0018638 121784 QUIQUE_C1368_190116_001 72.434 56.895 108730000 23913000 16335000 10729000 9983400 13504000 0 0 0 0 0 20723000 13542000 0 41960 3402 39167 374676;374677;374678;374679;374680;374681;374682;374683;374684;374685;374686;374687 476246;476247;476248;476249;476250;476251;476252;476253;476254;476255;476256;476257 476248 12 SVAQAGVR Unmodified 786.4348 0.43480077 375 A0A1W2PPJ5 yes yes 0 0 0 1 1 55.926 55.926 2 0.035882 54965 QUIQUE_C1218_190116_001 63.148 20.081 33847000 18931000 0 0 0 0 14916000 0 0 0 0 0 0 0 41961 375 39168 374688;374689 476258;476259;476260 476258 3 SVAQQASLTEQR Unmodified 1316.6684 0.66844211 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.199 26.199 2 1.5393E-45 20850 QUIQUE_C1218_190116_001 201.33 169.84 4188000000 409070000 385050000 248080000 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subunit 4 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 32.79 32.79 2;3 8.6643E-75 26713 QUIQUE_C1368_190116_001 217.12 201.58 1818800000 152080000 128530000 307560000 138450000 102860000 111710000 158580000 80472000 149040000 0 175040000 144860000 169590000 41965 4461 39172 374707;374708;374709;374710;374711;374712;374713;374714;374715;374716;374717;374718;374719;374720;374721;374722;374723;374724;374725;374726;374727;374728;374729 476279;476280;476281;476282;476283;476284;476285;476286;476287;476288;476289;476290;476291;476292;476293;476294;476295;476296;476297;476298;476299;476300;476301;476302;476303;476304 476285 25 SVASLFDAFHAGFHK Unmodified 1632.8049 0.80487601 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 108.12 108.12 3 0.00019567 111020 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.678 58.279 251120000 0 38849000 0 0 41831000 0 0 39375000 40228000 0 43855000 46978000 0 41966 3270 39173 374730;374731;374732;374733;374734;374735 476305;476306;476307;476308;476309;476310 476307 4 SVATGPMTPQAAAPPAFPEVR Unmodified 2094.0568 0.056809958 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 100.13 100.13 2 7.7998E-36 102606 QUIQUE_C1403_190116_001 148.72 126.85 170020000 0 42279000 46213000 41586000 0 39941000 0 0 0 0 0 0 0 41967 3452 39174 374736;374737;374738;374739;374740 476311;476312;476313;476314;476315 476314 5 SVAWAPSGNLLATCSR Unmodified 1688.8304 0.83043884 1682 O76071 CIAO1 Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 99.017 99.017 2 0.0037164 101760 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.74 62.111 287450000 0 0 75670000 64507000 0 0 0 0 0 0 84840000 62429000 0 41968 1682 39175 374741;374742;374743;374744;374745;374746;374747 476316;476317;476318;476319;476320;476321;476322 476321 5 SVCDYFFEAQER Unmodified 1549.6507 0.65074314 2632 P53677;E7ER80;E5RI83;E5RGF3 AP3M2 AP-3 complex subunit mu-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.06 106.06 2 0.0018542 108067 QUIQUE_C1563_190116_001 78.653 68.129 519480000 57779000 64499000 44380000 0 44973000 43910000 54139000 38257000 0 0 61127000 60131000 50285000 41969 2632 39176 374748;374749;374750;374751;374752;374753;374754;374755;374756;374757 476323;476324;476325;476326;476327;476328;476329;476330;476331;476332 476327 9 SVCGNQSNAYAR Unmodified 1325.5782 0.5782469 1268 J3KPF0;F8VU57 HECTD4 yes no 0 0 0 1 16.188 16.188 2 0.030367 8549 QUIQUE_C1368_190116_001 48.998 33.847 4645400 0 0 4645400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41970 1268 39177 374758 476333 476333 1 SVCTLQITDTTGSHQFPAMQR Unmodified 2377.1155 0.11546382 1703 O95057;K7EN06 DIRAS1 GTP-binding protein Di-Ras1 yes no 0 0 0 1 85.46 85.46 3 0.038827 86029 QUIQUE_C1563_190116_001 31.753 22.47 33819000 0 0 0 0 0 33819000 0 0 0 0 0 0 0 41971 1703 39178 374759 476334 476334 0 SVDCFLHDFASK Unmodified 1424.6395 0.63945017 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 89.007 89.007 2;3 0.0021644 90417 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.333 42.452 404770000 35473000 59454000 0 75488000 46370000 0 40631000 18314000 0 18122000 24407000 47616000 38895000 41972 1384 39179 374760;374761;374762;374763;374764;374765;374766;374767;374768;374769;374770;374771;374772 476335;476336;476337;476338;476339;476340;476341;476342;476343;476344;476345;476346;476347;476348;476349 476344 15 SVDDVLSHFAQR Unmodified 1372.6735 0.67352749 3520 Q86Y56;H0Y650 DNAAF5 Dynein assembly factor 5, axonemal yes no 0 0 0 1 1 88.309 88.309 3 0.017807 91157 QUIQUE_C1277_190116_001 43.382 35.078 14761000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14761000 41973 3520 39180 374773;374774 476350;476351 476350 2 SVDETTQAMAFDGIIFQGQSLK Unmodified 2385.1522 0.15222649 1338 K7ENG2;P26368 U2AF2 Splicing factor U2AF 65 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 144.72 144.72 2 5.9267E-08 150255 QUIQUE_C1218_190116_001 113.59 99.84 120100000 28975000 0 0 0 0 0 30984000 0 0 0 60141000 0 0 41974 1338 39181 374775;374776;374777;374778 476352;476353;476354;476355;476356 476352 5 SVDEVFDEVVQIFDK Unmodified 1767.8567 0.85669639 2306 P30085 CMPK1 UMP-CMP kinase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 171.53 171.53 2;3 7.8068E-36 176172 QUIQUE_C1368_190116_001 206.58 189.21 3653000000 371070000 399170000 399340000 225210000 294730000 176280000 332630000 111020000 414720000 72573000 258330000 268400000 329510000 41975 2306 39182 374779;374780;374781;374782;374783;374784;374785;374786;374787;374788;374789;374790;374791;374792;374793;374794;374795;374796;374797;374798;374799;374800;374801;374802 476357;476358;476359;476360;476361;476362;476363;476364;476365;476366;476367;476368;476369;476370;476371;476372;476373;476374;476375;476376;476377;476378;476379;476380;476381;476382 476361 25 SVDEVFDEVVQIFDKEG Unmodified 1953.9208 0.92075321 2306 P30085 CMPK1 UMP-CMP kinase yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 172.61 172.61 2;3 3.0717E-134 177897 QUIQUE_C1576_190116_001 234.71 203.84 3851500000 27269000 259170000 205820000 80086000 288320000 188110000 148590000 494070000 195100000 3991000 329050000 697400000 934490000 41976 2306 39183 374803;374804;374805;374806;374807;374808;374809;374810;374811;374812;374813;374814;374815;374816;374817;374818;374819;374820;374821;374822;374823;374824 476383;476384;476385;476386;476387;476388;476389;476390;476391;476392;476393;476394;476395;476396;476397;476398;476399;476400;476401;476402;476403;476404;476405 476395 22 SVDIPENR Unmodified 928.46141 0.46140945 3215 Q2TAA2;H7C5G1;C9JE02;C9JDY4;C9J5J2 IAH1 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 24.662 24.662 2 0.027967 18907 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.198 29.095 468480000 0 0 0 103450000 0 0 0 101080000 0 0 145260000 118690000 0 41977 3215 39184 374825;374826;374827;374828 476406;476407;476408;476409 476407 3 SVDLNFLPSVDPETVLQTGHELLSELQQR Unmodified 3263.6674 0.66738606 3502 Q86VW0;H7BZR8;H7BXT9 SESTD1 SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 172.51 172.51 3 1.2134E-31 179697 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.79 111.3 359520000 0 0 0 0 11470000 0 131020000 0 0 0 49282000 46894000 120860000 41978 3502 39185 374829;374830;374831;374832;374833 476410;476411;476412;476413;476414;476415 476412 6 SVDLVIQELINTVK Unmodified 1569.8978 0.89777334 4528;840 E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 1 165.16 165.16 2;3 1.4207E-29 170148 QUIQUE_C1368_190116_001 176.8 155.96 3079100000 233400000 455150000 327210000 143370000 369200000 142830000 268520000 152140000 173740000 56895000 244280000 210540000 301840000 41979 840;4528 39186 374834;374835;374836;374837;374838;374839;374840;374841;374842;374843;374844;374845;374846;374847;374848;374849;374850;374851;374852;374853;374854;374855;374856 476416;476417;476418;476419;476420;476421;476422;476423;476424;476425;476426;476427;476428;476429;476430;476431;476432;476433;476434;476435;476436;476437;476438 476420 21 SVDLVIQELINTVKK Unmodified 1697.9927 0.99273636 4528;840 E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM3 Dynamin-3 no no 0 0 1 1 1 1 147.24 147.24 3 5.8336E-05 150764 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.652 67.736 54293000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27570000 26723000 0 41980 840;4528 39187 374857;374858;374859 476439;476440;476441 476439 3 SVDPDSPAEASGLR Unmodified 1399.6579 0.657937 1441 O14745 SLC9A3R1 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.231 46.231 2 1.3828E-10 43419 QUIQUE_C1277_190116_001 136.5 114.41 5597800000 471930000 457940000 510280000 490530000 476840000 357300000 433810000 481500000 499260000 211130000 0 504220000 703110000 41981 1441 39188 374860;374861;374862;374863;374864;374865;374866;374867;374868;374869;374870;374871;374872 476442;476443;476444;476445;476446;476447;476448;476449;476450;476451;476452;476453;476454;476455;476456;476457 476443 16 SVDPENNPTLVEVLEGVVR Unmodified 2065.0691 0.069148783 4625 Q9Y5L0;E9PFH4 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.94 156.94 2;3 0.00010757 163584 QUIQUE_C1438_190116_001 70.335 64.061 275840000 21659000 33675000 26265000 0 24399000 22750000 15652000 23756000 25762000 0 24603000 38246000 19074000 41982 4625 39189 374873;374874;374875;374876;374877;374878;374879;374880;374881;374882;374883;374884 476458;476459;476460;476461;476462;476463;476464;476465;476466;476467;476468;476469 476462 11 SVDPGSPAAR Unmodified 955.47231 0.47230849 3147 Q15599;H3BUQ9;H3BN50;H3BQS0 SLC9A3R2 Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2 yes no 0 0 0 1 15.029 15.029 2 0.011915 7058 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.621 46.699 35485000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35485000 0 0 0 41983 3147 39190 374885 476470 476470 1 SVDPTLALSVYLR Unmodified 1432.7926 0.79257999 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 3 1 2 2 2 2 1 1 135.8 135.8 2;3 1.723E-07 138725 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.83 146.85 5322000000 476770000 333020000 279780000 279990000 441380000 357950000 395360000 531290000 517990000 147030000 471370000 563650000 526430000 41984 50 39191 374886;374887;374888;374889;374890;374891;374892;374893;374894;374895;374896;374897;374898;374899;374900;374901;374902;374903;374904;374905;374906;374907 476471;476472;476473;476474;476475;476476;476477;476478;476479;476480;476481;476482;476483;476484;476485;476486;476487;476488;476489;476490;476491;476492;476493;476494;476495;476496;476497;476498;476499;476500;476501;476502;476503;476504;476505 476490 35 SVDVGLQGLR Unmodified 1042.5771 0.57710791 3502 Q86VW0;H0Y774 SESTD1 SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 66.582 66.582 2 0.016175 62437 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.265 55.091 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41985 3502 39192 374908 476506 476506 1 SVDVTNTTFLLMAASIYLHDQNPDAALR Oxidation (M) 3091.5284 0.52844974 1359 M0QXB4;O14579 COPE Coatomer subunit epsilon yes no 0 1 0 1 164.69 164.69 3 3.4839E-06 167711 QUIQUE_C1403_190116_001 54.744 52.112 18857000 0 0 0 18857000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41986 1359 39193 374909 476507 476507 763 1 SVDVTNTTFLLMAASIYLHDQNPDAALR Unmodified 3075.5335 0.53353512 1359 M0QXB4;O14579 COPE Coatomer subunit epsilon yes no 0 0 0 1 167.9 167.9 3 0.0082499 169726 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.916 25.191 51935000 0 0 0 0 0 0 0 51935000 0 0 0 0 0 41987 1359 39193 374910 476508 476508 0 SVDYEVFGR Unmodified 1070.5033 0.50327426 2078 P14621;U3KPX1;E9PF46;F8WA34 ACYP2 Acylphosphatase-2;Acylphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.668 72.668 2 3.731E-05 73211 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.52 131.36 6435600000 388040000 427770000 529270000 198380000 373510000 402990000 495510000 484200000 420580000 214860000 737570000 754880000 1008100000 41988 2078 39194 374911;374912;374913;374914;374915;374916;374917;374918;374919;374920;374921;374922;374923 476509;476510;476511;476512;476513;476514;476515;476516;476517;476518;476519;476520;476521;476522;476523;476524;476525 476520 17 SVEAILEESTEK Unmodified 1333.6613 0.66129105 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 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61392 QUIQUE_DMIX4_190116_001 50.425 44.996 117190000 0 0 49708000 0 0 0 0 0 0 67486000 0 0 0 42036 2974 39238 375274;375275 476970;476971 476971 1 SVIDTSTIVR Unmodified 1089.603 0.60298831 1556 O43815 STRN Striatin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 61.955 61.955 2 0.0056282 61199 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.827 33.912 170710000 17209000 0 0 42352000 17257000 21660000 0 20399000 20268000 0 0 0 31567000 42037 1556 39239 375276;375277;375278;375279;375280;375281;375282 476972;476973;476974;476975;476976;476977;476978;476979 476976 8 SVIDYQTHFR Unmodified 1264.62 0.62003536 201 A0A0A6YYA0;Q9Y3B3 TMED7-TICAM2;TMED7 Transmembrane emp24 domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.066 51.066 2;3 0.013133 48139 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.908 32.9 640230000 113270000 0 0 0 0 0 134710000 96496000 0 0 169730000 0 126020000 42038 201 39240 375283;375284;375285;375286;375287 476980;476981;476982;476983;476984 476984 4 SVIEPLPVTPTR Unmodified 1307.7449 0.74490152 2970 Q13153;B3KNX7;E9PM17;H0YCM0 PAK1 Serine/threonine-protein kinase PAK 1;Non-specific serine/threonine protein kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.696 75.696 2 0.00070227 76202 QUIQUE_C1277_190116_001 89.827 73.624 2735900000 330860000 309180000 301950000 230330000 278110000 224210000 262340000 186520000 0 113950000 265760000 232730000 0 42039 2970 39241 375288;375289;375290;375291;375292;375293;375294;375295;375296;375297;375298 476985;476986;476987;476988;476989;476990;476991;476992;476993;476994;476995;476996;476997;476998 476987 10 SVIEQGGIQTVDQLIK Unmodified 1726.9465 0.94651445 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 2 116.12 116.12 2;3 3.0354E-44 119897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 225.97 190.31 2953600000 243590000 33791000 298330000 257430000 269680000 201480000 267440000 221410000 234530000 101550000 318170000 225230000 280980000 42040 3700 39242 375299;375300;375301;375302;375303;375304;375305;375306;375307;375308;375309;375310;375311;375312;375313;375314;375315;375316;375317 476999;477000;477001;477002;477003;477004;477005;477006;477007;477008;477009;477010;477011;477012;477013;477014;477015;477016;477017;477018;477019 477013 16 SVIGGMMAGVIGQFLANPTDLVK Unmodified 2317.2174 0.2174097 1759 O95847;Q5VTS8 SLC25A27 Mitochondrial uncoupling protein 4 yes no 0 0 0 1 1 172.35 172.35 3 2.4608E-05 173896 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.705 46.325 32827000 0 14017000 0 0 0 0 0 18810000 0 0 0 0 0 42041 1759 39243 375318;375319 477020;477021 477021 2 SVIGSGPQLLTHYYDDAR Unmodified 1990.9749 0.97485447 4476;703 Q9UKU0;E7ERD7;C9J3Z0;C9J4I1;C9JK59;C9JT10;C9JPA5;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 100.18 100.18 3 1.3416E-05 104216 QUIQUE_C1218_190116_001 77.023 71.313 201470000 52119000 47536000 0 0 0 0 38098000 0 63717000 0 0 0 0 42042 4476;703 39244 375320;375321;375322;375323 477022;477023;477024;477025;477026 477022 4 SVILDNLPHPYAIAVFK Unmodified 1896.0509 0.050919944 3747 Q92673 SORL1 Sortilin-related receptor yes yes 0 0 0 1 131.78 131.78 3 0.015538 134599 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.149 0 22011000 0 0 0 0 0 0 0 22011000 0 0 0 0 0 42043 3747 39245 375324 477027 477027 1 SVILEAFSSPSEEVK Unmodified 1620.8247 0.82466798 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.3 102.3 2 3.6144E-45 105307 QUIQUE_C1277_190116_001 186.46 170.92 7234400000 504420000 544110000 467320000 472110000 595670000 405940000 557070000 676210000 708790000 0 843960000 708840000 750010000 42044 3499 39246 375325;375326;375327;375328;375329;375330;375331;375332;375333;375334;375335;375336 477028;477029;477030;477031;477032;477033;477034;477035;477036;477037;477038;477039;477040;477041;477042 477030 14 SVILHLLSQLK Unmodified 1249.7758 0.77580772 4061 Q9BXB4 OSBPL11 Oxysterol-binding protein-related protein 11 yes yes 0 0 0 2 109.78 109.78 2 0.052804 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477046;477047;477048;477049;477050;477051;477052;477053;477054;477055;477056;477057;477058;477059;477060;477061;477062;477063;477064;477065;477066;477067;477068;477069;477070;477071;477072;477073;477074;477075;477076;477077;477078 477052 32 SVINLLFAAYTGDVSALRR Unmodified 2065.132 0.13202381 1700 O94925;B7Z509 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial no no 0 0 1 1 157.96 157.96 3 0.00032871 160565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.648 47.394 24812000 0 0 0 0 0 0 0 24812000 0 0 0 0 0 42048 1700 39250 375367 477079 477079 1 SVINLLR Unmodified 813.50724 0.50723743 3804 Q96AT9;C9J6A7;Q2QD12 RPE;RPEL1 Ribulose-phosphate 3-epimerase;Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 70.305 70.305 2 0.054113 69396 QUIQUE_C1563_190116_001 72.618 29.572 231980000 0 0 79851000 0 0 75463000 76665000 0 0 0 0 0 0 42049 3804 39251 375368;375369;375370 477080;477081;477082 477081 3 SVIPSDGPSVACVK Unmodified 1414.7126 0.71261511 1838 P02787;F8WCI6;C9JB55;F8WEK9 TF Serotransferrin yes no 0 0 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SVISGGLDALEFIGKK Unmodified 1632.9087 0.90867238 4279 Q9NRY5;E7ESJ7;E5RGF9 FAM114A2 Protein FAM114A2 yes no 0 0 1 1 123.8 123.8 3 0.0074322 126519 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.079 38.056 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42052 4279 39254 375396 477113 477113 1 SVITYVSSLYDAFPK Unmodified 1688.8661 0.86613887 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 155.17 155.17 2 0.00050464 161636 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.597 0 164050000 0 0 0 0 27287000 0 27610000 18298000 0 0 51538000 0 39314000 42053 2882 39255 375397;375398;375399;375400;375401 477114;477115;477116;477117;477118 477117 3 SVIVGAGYIAVEMAGILSALGSK Unmodified 2205.2079 0.20789087 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 6 3 176.14 176.14 2;3 1.2907E-13 182627 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.13 136.24 507290000 7390100 8628600 49592000 0 0 0 41706000 24424000 56414000 0 208820000 110310000 0 42054 1779 39256 375402;375403;375404;375405;375406;375407;375408;375409;375410;375411;375412;375413;375414;375415;375416;375417;375418 477119;477120;477121;477122;477123;477124;477125;477126;477127;477128;477129;477130;477131;477132;477133;477134;477135;477136;477137;477138;477139 477130 19 SVKPQILSVFGDIALAIGGEFK Unmodified 2288.278 0.27801935 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 170.06 170.06 2;3 5.3059E-11 174290 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.51 101.98 1067000000 33259000 66831000 33212000 0 67196000 0 168710000 30450000 237670000 0 214220000 157340000 58121000 42055 3090 39257 375419;375420;375421;375422;375423;375424;375425;375426;375427;375428;375429;375430 477140;477141;477142;477143;477144;477145;477146;477147;477148;477149;477150;477151 477147 11 SVKPQILSVFGDIALAIGGEFKK Unmodified 2416.373 0.37298236 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 2 5 2 2 3 1 164.16 164.16 3;4 9.4683E-14 167008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.67 101.14 1066100000 0 0 0 0 0 0 0 185610000 243930000 0 285710000 241310000 109510000 42056 3090 39258 375431;375432;375433;375434;375435;375436;375437;375438;375439;375440;375441;375442;375443 477152;477153;477154;477155;477156;477157;477158;477159;477160;477161;477162;477163;477164;477165;477166;477167 477153 12 SVLAALYSSEGSVMER Unmodified 1697.8294 0.82943578 1402 O00408;E9PEF1;H7C009;F5GXX2;C9JPD5 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 117.02 117.02 2 5.1922E-06 121661 QUIQUE_C1368_190116_001 102.87 85.847 64587000 0 0 64587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42057 1402 39259 375444;375445 477168;477169 477168 2 SVLAETEGILQK Unmodified 1286.7082 0.70818166 3490 Q86UP2;G3V4Y7;B7Z6P3;G3V5P0 KTN1 Kinectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.547 91.547 2 0.00051588 94927 QUIQUE_C1218_190116_001 94.309 75.629 736340000 72141000 64886000 62834000 63906000 73310000 72710000 61341000 60327000 0 22969000 57801000 58380000 65738000 42058 3490 39260 375446;375447;375448;375449;375450;375451;375452;375453;375454;375455;375456;375457;375458 477170;477171;477172;477173;477174;477175;477176;477177;477178;477179;477180;477181;477182;477183;477184 477171 14 SVLAVENLLTLDR Unmodified 1441.814 0.81404372 4257 Q9NQT8 KIF13B Kinesin-like protein KIF13B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 138.81 138.81 2 0.0097612 141545 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.927 21.527 195320000 57205000 0 0 50646000 0 0 0 42380000 45091000 0 0 0 0 42059 4257 39261 375459;375460;375461;375462 477185;477186;477187;477188 477187 4 SVLDAAQIVGLNCLR Unmodified 1627.8716 0.87157537 3738 Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 1 1 133.91 133.91 2;3 1.4153E-43 137849 QUIQUE_C1403_190116_001 177.44 150.77 2396700000 221260000 224910000 159790000 260420000 305480000 211850000 218870000 146460000 99963000 143030000 0 201870000 202840000 42060 3738 39262 375463;375464;375465;375466;375467;375468;375469;375470;375471;375472;375473;375474;375475;375476;375477;375478;375479;375480;375481 477189;477190;477191;477192;477193;477194;477195;477196;477197;477198;477199;477200;477201;477202;477203;477204;477205;477206;477207;477208;477209 477198 21 SVLDALWEDR Acetyl (Protein N-term) 1244.6037 0.60371659 894 F8WBR7;E9PBE3;Q8N3I7 BBS5 Bardet-Biedl syndrome 5 protein yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 166.01 166.01 2 0.00018704 170932 QUIQUE_C1368_190116_001 131.44 100.07 67277000 0 10396000 18778000 9107600 13538000 11322000 0 0 0 4134600 0 0 0 42061 894 39263 375482;375483;375484;375485;375486;375487 477210;477211;477212;477213;477214;477215;477216;477217 477212 8 SVLEGGDIPLQGLSGLK Unmodified 1681.9251 0.92505073 4058;309 A0A0U1RQI5;Q9BX66 SORBS1 Sorbin and SH3 domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.07 126.07 2 3.1703E-28 129107 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145 132.42 2374000000 132500000 141280000 107570000 246420000 198480000 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375503;375504;375505;375506;375507;375508;375509;375510;375511;375512 477235;477236;477237;477238;477239;477240;477241;477242;477243;477244;477245 477244 9 SVLENHHISSVFR Unmodified 1523.7845 0.78447492 614 B4DK72;Q01064 PDE1B Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B yes no 0 0 0 1 1 45.308 45.308 3 0.002855 42665 QUIQUE_C1576_190116_001 59.306 46.745 74272000 0 0 0 0 0 0 74272000 0 0 0 0 0 0 42065 614 39267 375513;375514 477246;477247 477246 2 SVLENHHLSAAYR Unmodified 1495.7532 0.75317479 168 A0A0A0MS69;Q14123 PDE1C Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C yes no 0 0 0 1 28.674 28.674 3 0.04409 23027 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.178 17.394 34110000 0 0 0 0 0 0 0 34110000 0 0 0 0 0 42066 168 39268 375515 477248 477248 1 SVLENHHVSAAYR Unmodified 1481.7375 0.73752473 2648 P54750 PDE1A Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A yes yes 0 0 0 1 20.707 20.707 3 0.060364 13353 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375543;375544;375545;375546;375547;375548;375549;375550;375551;375552;375553;375554;375555 477281;477282;477283;477284;477285;477286;477287;477288;477289;477290;477291;477292;477293;477294;477295;477296;477297;477298 477286 18 SVLIMDGASAFGTIAIQLAHHR Unmodified 2307.2158 0.21577022 1755 O95825;A6NND8;A6NHJ8;A6NMA8;C9JAL0;H7C3I5;C9K0F7;F8WF64;C9JZK8;H7C3S0;H7C338 CRYZL1 Quinone oxidoreductase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 142.36 142.36 4 2.2227E-15 149382 QUIQUE_DMIX5_190116_001 117.55 109.26 101480000 0 0 0 0 0 0 0 0 37284000 0 34063000 30131000 0 42072 1755 39274 375556;375557;375558 477299;477300;477301 477300 3 SVLITTGFPTHFNHEPPEETDGPPGAVALVAFLQALEK Unmodified 4029.0524 0.052383092 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 167.78 167.78 3;4 8.5934E-100 169620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.51 150.02 1790900000 0 0 0 0 96557000 0 323210000 84651000 358790000 0 456290000 471420000 0 42073 1140;3457 39275 375559;375560;375561;375562;375563;375564;375565;375566;375567;375568 477302;477303;477304;477305;477306;477307;477308;477309;477310;477311;477312;477313 477306 10 SVLLCGIEAQACILNTTLDLLDR Unmodified 2587.335 0.33495865 3799 Q96AB3;K7EKW4;K7ENV7 ISOC2 Isochorismatase domain-containing protein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 173.63 173.63 2;3 9.0375E-24 180871 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.22 135.38 168450000 0 31518000 0 0 0 0 0 30590000 0 0 16496000 0 89844000 42074 3799 39276 375569;375570;375571;375572 477314;477315;477316;477317 477316 4 SVLLEAIR Unmodified 899.54402 0.54401687 3733 Q92558 WASF1 Wiskott-Aldrich syndrome protein family member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 70.538 70.538 2 0.010167 71463 QUIQUE_C1218_190116_001 91.626 52.835 159790000 35208000 23573000 0 37721000 0 37960000 0 25327000 0 0 0 0 0 42075 3733 39277 375573;375574;375575;375576;375577;375578 477318;477319;477320;477321;477322;477323;477324 477319 7 SVLLLAYKPMEGNFEEIAR Oxidation (M) 2195.1296 0.12964055 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.81 111.81 2;3 0.00011545 116382 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.849 79.322 433270000 42877000 0 0 69061000 0 0 0 0 29070000 40975000 105000000 86781000 59509000 42076 3179 39278 375579;375580;375581;375582;375583;375584;375585;375586 477325;477326;477327;477328;477329;477330;477331;477332 477330 2610 7 SVLLLAYKPMEGNFEEIAR Unmodified 2179.1347 0.13472593 3179 Q16531;F5GY55 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 126.4 126.4 2;3 9.5754E-05 131056 QUIQUE_C1368_190116_001 80.975 72.374 859360000 93961000 0 141050000 72160000 0 65557000 113850000 0 0 0 154730000 113590000 104460000 42077 3179 39278 375587;375588;375589;375590;375591;375592;375593;375594;375595 477333;477334;477335;477336;477337;477338;477339;477340;477341;477342 477335 7 SVLMSLK Unmodified 776.44661 0.44661101 1967 P09497;D6RJD1 CLTB Clathrin light chain B yes no 0 0 0 1 48.845 48.845 2 0.04475 46641 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SVLTGGLDALEFIGK Unmodified 1518.8294 0.82935943 3537 Q8IWE2 FAM114A1 Protein NOXP20 yes yes 0 0 0 1 149.52 149.52 2 0.0014488 144936 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.721 57.507 11695000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11695000 0 0 0 42083 3537 39284 375630 477383 477383 1 SVLTGGLDALEFIGKK Unmodified 1646.9243 0.92432245 3537 Q8IWE2 FAM114A1 Protein NOXP20 yes yes 0 0 1 2 1 127.84 127.84 3 0.0026394 132129 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.026 33.93 28915000 0 0 0 0 0 0 0 14311000 0 0 0 0 14604000 42084 3537 39285 375631;375632;375633 477384;477385;477386 477386 1 SVLVAAGETATLR Unmodified 1286.7194 0.71941505 2803 P78324 SIRPA Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 66.171 66.171 2 0.00053302 63183 QUIQUE_DMIX4_190116_001 89.548 52.072 697110000 0 26541000 117740000 0 99026000 98370000 0 0 37505000 107570000 60864000 64319000 85178000 42085 2803 39286 375634;375635;375636;375637;375638;375639;375640;375641;375642;375643 477387;477388;477389;477390;477391;477392;477393;477394;477395;477396;477397;477398;477399 477392 10 SVLVDFLIGSGLK Unmodified 1346.781 0.78095267 4245 Q9NPH2 ISYNA1 Inositol-3-phosphate synthase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 153.47 153.47 2 0.00019559 157506 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.83 97.808 1361400000 82079000 129210000 75997000 113410000 123490000 79312000 109000000 86008000 108630000 68403000 102290000 135970000 147580000 42086 4245 39287 375644;375645;375646;375647;375648;375649;375650;375651;375652;375653;375654;375655;375656;375657 477400;477401;477402;477403;477404;477405;477406;477407;477408;477409;477410;477411;477412;477413;477414 477413 15 SVLVSAGNVK Unmodified 972.5604 0.56039521 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 29.33 29.33 2 0.021666 23941 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.332 30.33 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42087 3053 39288 375658;375659;375660;375661 477415;477416;477417;477418 477417 4 SVLVSAGNVKR Unmodified 1128.6615 0.66150624 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 20.603 20.603 3 0.011632 13851 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.64 28.378 20210000 0 0 0 0 0 0 0 20210000 0 0 0 0 0 42088 3053 39289 375662 477419 477419 1 SVLWVSADGLR Unmodified 1201.6455 0.64552182 243 A0A0C4DGH3;Q9Y6R0;M0QYC2;M0QXQ4;M0R0Q4;M0QZV7 NUMBL Numb-like protein yes no 0 0 0 1 1 99.648 99.648 2 0.037506 102379 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.608 35.337 33716000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33716000 0 0 42089 243 39290 375663;375664 477420;477421 477420 2 SVLWWLPVEK Unmodified 1255.6965 0.69649476 1279 J3KQJ1;Q8NBJ7;C9JL30;C9J660;F8WA42;E9PBT8;F8WEX5;E9PG02 SUMF2 Sulfatase-modifying factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 144.97 144.97 2 0.02681 150790 QUIQUE_C1218_190116_001 55.567 42.777 117910000 24955000 28944000 0 0 40095000 23913000 0 0 0 0 0 0 0 42090 1279 39291 375665;375666;375667;375668 477422;477423;477424;477425 477422 4 SVMAAAQVAGLNCLR Unmodified 1559.7912 0.79121656 1748 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HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 91.334 91.334 2 1.435E-05 88618 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.522 74.731 215200000 0 0 0 0 0 0 0 38867000 0 23556000 50032000 34505000 68239000 42094 2363 39293 375680;375681;375682;375683;375684;375685 477437;477438;477439;477440;477441;477442 477439 1763 6 SVMSLAEAGK Unmodified 991.50083 0.50083142 2201 P22676;H3BN14 CALB2 Calretinin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.196 48.196 2 0.0011057 45426 QUIQUE_C1563_190116_001 101.64 73.761 7302000000 578510000 576190000 724800000 508090000 655210000 465090000 636180000 477810000 566720000 0 671080000 619310000 822980000 42095 2201 39294 375686;375687;375688;375689;375690;375691;375692;375693;375694;375695;375696;375697 477443;477444;477445;477446;477447;477448;477449;477450;477451;477452;477453;477454;477455;477456;477457;477458;477459;477460;477461;477462;477463;477464 477452 22 SVMSLAEAGK Oxidation (M) 1007.4957 0.49574604 2201 P22676;H3BN14 CALB2 Calretinin yes no 0 1 0 1 1 1 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477471;477472;477473;477474;477475;477476;477477;477478;477479;477480;477481;477482;477483;477484;477485;477486;477487;477488;477489;477490;477491;477492;477493;477494;477495;477496;477497;477498;477499;477500;477501;477502;477503;477504;477505;477506;477507;477508;477509;477510;477511;477512;477513;477514;477515;477516;477517;477518 477480 46 SVNEVMEWMNNVMNAQAK Unmodified 2093.9333 0.9332657 3738;180 A0A0A0MSM0;Q5TBM3;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 159.75 159.75 2;3 1.1649E-181 162103 QUIQUE_DMIX1_190116_001 312.85 281.32 909820000 64645000 64005000 62201000 67000000 95893000 58766000 75227000 64762000 50618000 9419200 120310000 60010000 116960000 42098 180;3738 39296 375730;375731;375732;375733;375734;375735;375736;375737;375738;375739;375740;375741;375742;375743;375744;375745;375746;375747;375748;375749;375750;375751;375752;375753;375754 477519;477520;477521;477522;477523;477524;477525;477526;477527;477528;477529;477530;477531;477532;477533;477534;477535;477536;477537;477538;477539;477540;477541;477542;477543;477544;477545;477546;477547 477535 28 SVNFSLTPNEIK Unmodified 1347.7034 0.70343063 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.702 85.702 2 1.6331E-15 88570 QUIQUE_C1218_190116_001 167.93 138.85 4965500000 347260000 292250000 0 269830000 427410000 319110000 0 749910000 655830000 127040000 663080000 425580000 688210000 42099 2483 39297 375755;375756;375757;375758;375759;375760;375761;375762;375763;375764;375765 477548;477549;477550;477551;477552;477553;477554;477555;477556;477557;477558;477559;477560;477561;477562;477563 477549 16 SVNGLAFYDWDNTELIR Unmodified 2011.964 0.96395543 2380 P35606;H0Y938 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.55 145.55 2 1.5648E-16 148407 QUIQUE_DMIX1_190116_001 164.92 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39302 375801;375802;375803;375804;375805;375806;375807;375808;375809;375810;375811;375812;375813 477600;477601;477602;477603;477604;477605;477606;477607;477608;477609;477610;477611;477612;477613;477614;477615 477605 15 SVPDEIILLR Unmodified 1153.6707 0.67067394 4194 Q9H9A6 LRRC40 Leucine-rich repeat-containing protein 40 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.95 105.95 2 0.02052 110301 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.35 36.278 301100000 33605000 38274000 32315000 0 0 34654000 0 31320000 31664000 15921000 42809000 40540000 0 42105 4194 39303 375814;375815;375816;375817;375818;375819;375820;375821;375822 477616;477617;477618;477619;477620;477621;477622;477623;477624 477623 9 SVPEAPVGR Unmodified 910.48723 0.48723027 3787 Q969P0;C9J8Z4 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.037 24.037 2 0.0043746 17499 QUIQUE_DMIX8_190116_001 89.142 66.52 1976900000 191000000 119350000 256630000 145500000 175130000 113440000 222280000 0 128600000 0 183160000 218950000 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477682;477683;477684;477685;477686;477687;477688;477689;477690;477691;477692;477693;477694;477695;477696;477697;477698;477699;477700;477701;477702;477703;477704;477705;477706;477707;477708;477709;477710;477711;477712;477713 477690 32 SVPSLCGVDHTER Unmodified 1455.6776 0.67762659 1877 P05129;M0R0I9;H7BZ60 PRKCG Protein kinase C gamma type yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 36.177 36.177 2;3 0.0004293 31526 QUIQUE_C1368_190116_001 91.937 74.073 842560000 124150000 128140000 128280000 84082000 86728000 79577000 40762000 0 0 0 25313000 59631000 85891000 42113 1877 39310 375882;375883;375884;375885;375886;375887;375888;375889;375890;375891;375892;375893;375894;375895;375896;375897;375898;375899;375900 477714;477715;477716;477717;477718;477719;477720;477721;477722;477723;477724;477725;477726;477727;477728;477729;477730;477731;477732;477733 477719 18 SVPTFQSLPEEILSK Unmodified 1673.8876 0.88760259 3035 Q13976;A0A0A0MSB3 PRKG1 cGMP-dependent protein kinase 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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376263;376264;376265;376266;376267;376268;376269;376270;376271;376272;376273;376274;376275;376276;376277;376278;376279;376280;376281;376282;376283;376284 478195;478196;478197;478198;478199;478200;478201;478202;478203;478204;478205;478206;478207;478208;478209;478210;478211;478212;478213;478214;478215;478216;478217;478218 478197 21 SVVALHNLINNK Unmodified 1320.7514 0.75138388 2589 P51665 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 1 2 2 2 1 52.262 52.262 2;3 5.3135E-06 48874 QUIQUE_DMIX4_190116_001 135.55 117.73 1426900000 158050000 103020000 164160000 0 173060000 0 98227000 116680000 55869000 64960000 254970000 145030000 92916000 42160 2589 39357 376285;376286;376287;376288;376289;376290;376291;376292;376293;376294;376295;376296;376297;376298;376299;376300;376301;376302;376303;376304 478219;478220;478221;478222;478223;478224;478225;478226;478227;478228;478229;478230;478231;478232;478233;478234;478235;478236;478237;478238;478239 478234 16 SVVAPATDGGLNLTSTFLR Unmodified 1918.016 0.015991 2436 P41222;Q5SQ11 PTGDS Prostaglandin-H2 D-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 130.3 130.3 2 4.2916E-28 134837 QUIQUE_DMIX3_190116_001 141.46 118.24 88664000 0 0 0 0 0 0 0 21721000 28079000 0 0 0 38864000 42161 2436 39358 376305;376306;376307 478240;478241;478242 478241 3 SVVAPPGAPK Unmodified 921.52837 0.5283668 2089 P15170;H3BR35;H3BSV8 GSPT1 Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 25.265 25.265 2 0.035345 18784 QUIQUE_C1368_190116_001 52.716 41.421 278100000 53459000 0 56997000 0 62518000 0 0 0 0 0 0 0 105120000 42162 2089 39359 376308;376309;376310;376311 478243;478244;478245;478246 478244 4 SVVCQESDLPDELLYGR Unmodified 1978.9306 0.93060639 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.46 123.46 2;3 8.3029E-53 127397 QUIQUE_C1277_190116_001 180.61 151.31 1813500000 155960000 245740000 192070000 187330000 191270000 178330000 182730000 0 100590000 35273000 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1 2 1 155.7 155.7 2;3;4 4.0888E-54 162242 QUIQUE_C1438_190116_001 193.47 176.07 3502200000 136890000 212280000 325860000 234860000 295320000 288160000 299220000 188430000 328300000 79721000 431320000 284620000 397170000 42165 2026 39362 376338;376339;376340;376341;376342;376343;376344;376345;376346;376347;376348;376349;376350;376351;376352;376353;376354 478274;478275;478276;478277;478278;478279;478280;478281;478282;478283;478284;478285;478286;478287;478288;478289;478290;478291;478292;478293;478294;478295;478296;478297;478298;478299;478300 478283 27 SVVESIASPAVPNK Unmodified 1396.7562 0.75619449 120 A0A087X294;O75914 PAK3 Non-specific serine/threonine protein kinase;Serine/threonine-protein kinase PAK 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 62.212 62.212 2 0.00086316 61080 QUIQUE_C1403_190116_001 103.08 86.058 527130000 0 0 0 71039000 76150000 64625000 111690000 29237000 0 0 0 58593000 115800000 42166 120 39363 376355;376356;376357;376358;376359;376360;376361;376362 478301;478302;478303;478304;478305;478306;478307;478308 478301 7 SVVGIDLGFQSCYVAVAR Acetyl (Protein N-term) 1981.9931 0.99314707 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 1 0 0 1 1 3 176.41 176.41 2 0.00065161 180729 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.469 62.66 32725000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32725000 0 0 42167 2363 39364 376363;376364;376365;376366;376367 478309;478310;478311;478312;478313 478312 4 SVVLCLLEVAR Unmodified 1257.7115 0.7114929 513 A0A5E8;Q99501 GAS2L1 GAS2-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 127 127 2 0.023135 133586 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.303 41.782 25815000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25815000 0 0 42168 513 39365 376368;376369 478314;478315 478315 2 SVVLMSHLGRPDGVPMPDK Oxidation (M) 2050.034 0.033966025 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 1 3 2 3 1 2 2 2 4 3 5 2 2 3 63.378 63.378 3;4 7.2893E-11 64059 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.55 56.469 4198500000 449280000 349060000 426910000 239160000 218080000 329610000 278840000 250750000 296180000 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478634 2 SVYSWDIVVQR Unmodified 1350.6932 0.6932003 1500 O15371;B0QYA4 EIF3D Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 106.73 106.73 2 0.003942 104142 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.643 47.867 289400000 0 43939000 65884000 0 81246000 0 0 77410000 0 20920000 0 0 0 42191 1500 39383 376629;376630;376631;376632;376633;376634;376635;376636;376637 478636;478637;478638;478639;478640;478641;478642;478643;478644 478641 9 SVYVDDDSEAAGNR Unmodified 1496.6379 0.63792984 1698 O94910 LPHN1 Latrophilin-1 yes yes 0 0 0 1 31.869 31.869 2 0.012848 26526 QUIQUE_C1563_190116_001 58.829 46.039 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42192 1698 39384 376638 478645 478645 1 SWALYEDEGVIR Unmodified 1436.6936 0.69359423 4355 Q9NZQ3;H7C2K2 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 1 105.5 105.5 2 0.0018538 107188 QUIQUE_C1563_190116_001 78.655 55.227 91308000 0 0 0 0 0 24556000 66752000 0 0 0 0 0 0 42193 4355 39385 376639;376640 478646;478647 478646 2 SWAMLFASGGFQVK Unmodified 1527.7544 0.75442035 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A2R8Y4K2;A0A2R8Y7B4;A0A2R8Y5S5 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 144.42 144.42 2 0.00011695 147354 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.46 69.036 91322000 0 0 0 0 0 0 0 21738000 27163000 0 25465000 0 16955000 42194 4564 39386 376641;376642;376643;376644;376645;376646 478648;478649;478650;478651;478652;478653 478648 5 SWATAIQAQVNTLTPR Unmodified 1755.9268 0.92678206 2994 Q13424 SNTA1 Alpha-1-syntrophin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 134.81 134.81 2;3 2.276E-130 139277 QUIQUE_DMIX3_190116_001 190.86 178.94 4038400000 252190000 388040000 404710000 246160000 0 327350000 350450000 436460000 395860000 182180000 493640000 383190000 178210000 42195 2994 39387 376647;376648;376649;376650;376651;376652;376653;376654;376655;376656;376657;376658;376659;376660;376661;376662;376663;376664;376665;376666;376667;376668;376669;376670;376671 478654;478655;478656;478657;478658;478659;478660;478661;478662;478663;478664;478665;478666;478667;478668;478669;478670;478671;478672;478673;478674;478675;478676;478677;478678;478679;478680;478681;478682;478683;478684;478685;478686;478687;478688;478689;478690;478691;478692;478693;478694;478695;478696;478697 478682 43 SWCPDCVQAEPVVR Unmodified 1701.7603 0.76031036 4000 Q9BRA2;I3L0K2;I3L3M7 TXNDC17 Thioredoxin domain-containing protein 17 yes no 0 0 0 1 1 78.195 78.195 2 1.5428E-17 79837 QUIQUE_C1218_190116_001 152.62 93.64 340710000 163560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 177140000 42196 4000 39388 376672;376673 478698;478699;478700;478701 478698 4 SWDAINR Unmodified 860.41407 0.41406533 2455 P42785;E9PIG4;E9PQB5;E9PL85;E9PQN3;E9PKN6 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes no 0 0 0 1 1 39.157 39.157 2 0.049128 35383 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.311 27.069 72040000 0 0 0 0 0 0 0 0 40061000 0 0 31979000 0 42197 2455 39389 376674;376675 478702;478703 478703 2 SWDFGAFQSSSATDSSMEEIFQHLMAYHQEASK 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0 0 0 0 42230 2511 39419 376979 479065 479065 1 SWPEGHFATITLTFIDK Unmodified 1961.9887 0.98871362 1730 O95433;G3V438 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 135.08 135.08 3 0.002385 142228 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.208 33.151 38661000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 38661000 0 0 42231 1730 39420 376980 479066;479067 479067 2 SWPGCQECPACYR Unmodified 1669.6436 0.64356604 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 60.43 60.43 2 0.00030615 60711 QUIQUE_C1438_190116_001 111.06 104.82 29798000 0 0 0 0 29798000 0 0 0 0 0 0 0 0 42232 2008 39421 376981 479068 479068 1 SWQDELAQQAEEGSAR Unmodified 1803.8024 0.80236941 3489 Q86UE4 MTDH Protein LYRIC yes yes 0 0 0 1 99.309 99.309 2 0.001638 101755 QUIQUE_C1403_190116_001 91.441 68.205 33990000 0 0 0 33990000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42233 3489 39422 376982 479069 479069 0 SWQEEQSAQAQR Unmodified 1446.6488 0.6487693 4376 Q9P1Z2 CALCOCO1 Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 24.296 24.296 2 0.024484 18178 QUIQUE_C1438_190116_001 57.347 21.403 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42234 4376 39423 376983 479070 479070 1 SWQNVYCVLR Unmodified 1323.6394 0.63939059 1472 O15020;A4QPE4 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 99.668 99.668 2 0.000957 102096 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.56 57.845 153400000 0 0 0 42416000 0 0 51666000 0 0 0 0 59314000 0 42235 1472 39424 376984;376985;376986;376987;376988;376989;376990;376991 479071;479072;479073;479074;479075;479076;479077;479078 479078 8 SWSHYTVPAGMTVIQWVSDFSER Unmodified 2682.2537 0.25367186 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 159.82 159.82 3 8.6306E-18 164559 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.58 97.075 479480000 0 0 0 0 0 0 44396000 0 116390000 0 192580000 96349000 29763000 42236 3053 39425 376992;376993;376994;376995;376996 479079;479080;479081;479082;479083 479080 5 SWSIIATAVLLPCAFLK Unmodified 1889.0485 0.048477103 4176 Q9H598 SLC32A1 Vesicular inhibitory amino acid transporter yes yes 0 0 0 1 170.39 170.39 2 0.0020113 174349 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.479 39.937 16518000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16518000 0 42237 4176 39426 376997 479084 479084 1 SWSLATFR Unmodified 966.49232 0.49231565 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.791 91.791 2 2.4839E-06 95423 QUIQUE_C1218_190116_001 173.93 132.99 4172300000 355820000 278330000 294710000 106090000 307140000 114050000 249580000 558400000 483990000 289610000 473350000 497360000 163810000 42238 3117 39427 376998;376999;377000;377001;377002;377003;377004;377005;377006;377007;377008;377009;377010 479085;479086;479087;479088;479089;479090;479091;479092;479093;479094;479095;479096;479097;479098;479099;479100;479101;479102;479103;479104;479105;479106;479107;479108;479109;479110;479111;479112;479113 479086 29 SWTAADMAAQITK Unmodified 1392.6708 0.6707503 2063;393;280;1891 A0A0G2JI36;A0A1W2PSE7;A0A0G2JIF2;A0A0G2JL56;P30455;P30443;A0A1W2PQD0;Q09160;Q5SRN7;A0A1W2PS24;Q5SRN5;P04439;P05534;P13746 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-36 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-1 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-80 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-11 alpha chain no no 0 0 0 1 1 100.41 100.41 2 0.0023022 103772 QUIQUE_C1368_190116_001 74.611 37.42 130710000 0 0 130710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42239 280;393;1891;2063 39428 377011;377012 479114;479115 479115 2 SWTAADMAAQITQR Unmodified 1548.7355 0.73547582 2312;2313;2104 P16188;P30453;P30457;A0A140T8W8;A0A1W2PR61;A0A1W2PPF8;A0A140T8Y4;A0A0G2JPD3;P30450;P18462;P16190;P30456 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain no no 0 0 0 2 1 1 3 2 107.95 107.95 2;3 1.2114E-17 113189 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.95 136.08 381320000 17063000 0 0 66889000 0 0 69312000 0 0 0 168680000 0 59376000 42240 2104;2312;2313 39429 377013;377014;377015;377016;377017;377018;377019;377020;377021 479116;479117;479118;479119;479120;479121;479122;479123;479124;479125 479121 9 SWTAADMAAQITQR Oxidation (M) 1564.7304 0.73039044 2312;2313;2104 P16188;P30453;P30457;A0A140T8W8;A0A1W2PR61;A0A1W2PPF8;A0A140T8Y4;A0A0G2JPD3;P30450;P18462;P16190;P30456 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain no no 0 1 0 1 67.871 67.871 2 0.0010869 68705 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.245 53.356 45944000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45944000 0 0 42241 2104;2312;2313 39429 377022 479126 479126 1440 1 SWTAADMAAQTTK Oxidation (M) 1396.6293 0.62927941 1995;324 A0A140T955;A0A140T933;A0A1W2PRT9;A0A140T9I0;A0A140T9X5;A0A140T913;P01892;A0A1W2PPQ2;P10316 HLA-A HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain no no 0 1 0 1 1 32.936 32.936 2 0.025742 28130 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.864 34.054 18956000 0 0 0 0 0 0 0 0 18956000 0 0 0 0 42242 324;1995 39430 377023;377024 479127;479128 479128 2 SWTAADTAAQITQR Unmodified 1518.7427 0.74266969 2316;377;2315;325 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479139 1 SWTDVSLLPAFDAVGQLSSGTKPNPQVYSR Unmodified 3219.62 0.62004194 4655 Q9Y6K5 OAS3 2'-5'-oligoadenylate synthase 3 yes yes 0 0 1 1 151.89 151.89 3 1.3985E-24 157014 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.449 69.233 27749000 0 0 0 0 0 0 0 0 27749000 0 0 0 0 42245 4655 39433 377033 479140 479140 1 SWTWPEGPEQTLR Unmodified 1585.7525 0.75250609 4500 Q9UMF0 ICAM5 Intercellular adhesion molecule 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 108.73 108.73 2 0.00044576 113256 QUIQUE_C1576_190116_001 112.13 90.757 756800000 119710000 0 0 0 0 0 201030000 70855000 0 0 165450000 199760000 0 42246 4500 39434 377034;377035;377036;377037;377038;377039;377040 479141;479142;479143;479144;479145;479146;479147;479148 479144 7 SWVFDSYSLTGPSVCELVR Unmodified 2201.0463 0.046304851 3622 Q8NB37;H0YE25;H0YF25 PDDC1 Parkinson disease 7 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 151.93 151.93 2 2.1252E-11 156053 QUIQUE_C1403_190116_001 119.01 103.63 249690000 0 0 33872000 37061000 0 0 57500000 0 0 11226000 53326000 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Unmodified 1680.7413 0.74134906 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 1 71.852 71.852 2 1.7387E-06 72262 QUIQUE_C1403_190116_001 147.26 120.74 110880000 0 0 44911000 36511000 0 0 0 0 0 0 0 0 29463000 42250 2487 39438 377063;377064;377065 479174;479175;479176 479175 3 SWVPHTFESELSDPVELLVAES Unmodified 2470.1904 0.19038613 1858 P04217 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes yes 0 0 0 2 167.13 167.13 2;3 0.013072 173443 QUIQUE_C1438_190116_001 37.594 31.583 128860000 0 0 0 0 128860000 0 0 0 0 0 0 0 0 42251 1858 39439 377066;377067 479177;479178 479177 2 SWVQFNSNSQLMYGLPDSSHVGK Unmodified 2580.2067 0.20672167 3043 Q14118 DAG1 Dystroglycan;Alpha-dystroglycan;Beta-dystroglycan yes yes 0 0 0 1 119.84 119.84 3 9.0541E-06 125909 QUIQUE_C1438_190116_001 41.904 37.806 63604000 0 0 0 0 63604000 0 0 0 0 0 0 0 0 42252 3043 39440 377068 479179 479179 1 SWVTALQLMER Unmodified 1332.686 0.68600643 4292 Q9NTJ4 MAN2C1 Alpha-mannosidase 2C1 yes yes 0 0 0 1 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479181;479182;479183;479184;479185;479186;479187;479188;479189;479190;479191;479192 479190 11 SWWQVEK Unmodified 961.46577 0.46576654 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 73.519 73.519 2 0.064916 74427 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.993 47.147 108800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 108800000 42255 4226 39443 377081 479193 479193 1 SWWTLPGK Unmodified 973.50215 0.50215205 1361 M0QXN1;M0R122;M0QZ66;P54852 EMP3 Epithelial membrane protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.32 102.32 2 0.02309 105076 QUIQUE_C1403_190116_001 73.616 36.596 418940000 0 40071000 58352000 61753000 32877000 45789000 56420000 24316000 35851000 0 19135000 16355000 28015000 42256 1361 39444 377082;377083;377084;377085;377086;377087;377088;377089;377090;377091;377092 479194;479195;479196;479197;479198;479199;479200;479201;479202;479203;479204;479205;479206;479207 479199 14 SYADESFHFFQIGQESR Unmodified 2046.9072 0.90716883 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 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3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 160.87 160.87 3 1.8652E-05 165040 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.901 63.619 339680000 77732000 41713000 0 33253000 0 0 0 41293000 60866000 0 45346000 39476000 0 42260 1956 39448 377103;377104;377105;377106;377107;377108;377109;377110;377111;377112 479218;479219;479220;479221;479222;479223;479224;479225;479226;479227 479226 7 SYCNDQSTGDIK Unmodified 1386.5722 0.57215846 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.944 20.944 2 6.5104E-14 14028 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.63 150.41 3291400000 274990000 296880000 250670000 247830000 254280000 175110000 321920000 211670000 206030000 75553000 304220000 320560000 351660000 42261 1787 39449 377113;377114;377115;377116;377117;377118;377119;377120;377121;377122;377123;377124;377125 479228;479229;479230;479231;479232;479233;479234;479235;479236;479237;479238;479239;479240;479241;479242 479237 15 SYCYVSKEELK Unmodified 1404.6595 0.65951691 3032 Q13907 IDI1 Isopentenyl-diphosphate Delta-isomerase 1 yes yes 0 0 1 1 32.855 32.855 2 0.039762 28297 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.334 46.634 23789000 0 0 0 0 0 0 0 0 23789000 0 0 0 0 42262 3032 39450 377126 479243 479243 1 SYDAAGTIHDYVVAMLCGLPR Unmodified 2308.098 0.098022845 212 A0A0B4J2A0;Q9UHJ6 TRPV1;SHPK Sedoheptulokinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.44 166.44 3 1.8118E-35 169654 QUIQUE_C1403_190116_001 143.39 135.11 442860000 27010000 42162000 0 22493000 33703000 0 31695000 25834000 43692000 5286200 64403000 67122000 79463000 42263 212 39451 377127;377128;377129;377130;377131;377132;377133;377134;377135;377136;377137 479244;479245;479246;479247;479248;479249;479250;479251;479252;479253;479254 479246 11 SYDFEFMQVEKPYESYIGANVR Unmodified 2671.2265 0.22645406 1635 O75436;S4R3Q6 VPS26A Vacuolar protein sorting-associated protein 26A yes no 0 0 1 1 135.9 135.9 3 0.00093193 143054 QUIQUE_DMIX5_190116_001 46.569 39.036 78131000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 78131000 0 0 42264 1635 39452 377138 479255 479255 1 SYDVPPPPMEPDHPFYSNISK Oxidation (M) 2432.0995 0.099462633 2139 P18669;Q8N0Y7 PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 yes no 0 1 0 1 1 1 2 2 1 1 2 2 2 2 2 2 85.885 85.885 2;3 5.551E-35 87938 QUIQUE_DMIX3_190116_001 144.88 132.96 10058000000 138520000 109150000 89871000 75262000 917130000 84206000 66570000 1247100000 1501200000 1347100000 1511500000 1424700000 1545900000 42265 2139 39453 377139;377140;377141;377142;377143;377144;377145;377146;377147;377148;377149;377150;377151;377152;377153;377154;377155;377156;377157;377158;377159 479256;479257;479258;479259;479260;479261;479262;479263;479264;479265;479266;479267;479268;479269;479270;479271;479272;479273;479274;479275;479276;479277;479278;479279;479280;479281;479282;479283;479284;479285;479286;479287;479288;479289;479290;479291 479274 1486 36 SYDVPPPPMEPDHPFYSNISK Unmodified 2416.1045 0.10454801 2139 P18669;Q8N0Y7 PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 yes no 0 0 0 3 4 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 2 97.854 97.854 2;3 6.2501E-35 100849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.69 170.03 23315000000 2229100000 3848100000 2233800000 1870300000 1298400000 1638100000 1654100000 1372000000 1424300000 470340000 1864600000 1489000000 1922500000 42266 2139 39453 377160;377161;377162;377163;377164;377165;377166;377167;377168;377169;377170;377171;377172;377173;377174;377175;377176;377177;377178;377179;377180;377181;377182;377183;377184;377185;377186;377187;377188;377189;377190 479292;479293;479294;479295;479296;479297;479298;479299;479300;479301;479302;479303;479304;479305;479306;479307;479308;479309;479310;479311;479312;479313;479314;479315;479316;479317;479318;479319;479320;479321;479322;479323;479324;479325;479326;479327;479328;479329;479330;479331;479332;479333;479334;479335;479336;479337;479338;479339;479340;479341;479342;479343;479344;479345;479346;479347;479348;479349;479350;479351;479352;479353;479354;479355;479356;479357;479358;479359;479360;479361;479362;479363;479364;479365;479366;479367;479368;479369;479370;479371;479372;479373;479374;479375;479376;479377;479378;479379;479380;479381;479382;479383;479384;479385;479386 479352 95 SYDYDLIIIGGGSGGLAAAK Unmodified 1939.9891 0.98910755 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E9PKD3;A0A0B4J225;E9PIZ5;E9PLT3;E9PKI4;E9PQI3 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 133.18 133.18 2 1.762E-05 139923 QUIQUE_C1438_190116_001 75.483 69.297 62853000 0 23440000 0 0 39412000 0 0 0 0 0 0 0 0 42267 22 39454 377191;377192;377193;377194 479387;479388;479389;479390 479389 3 SYDYQSVCEPGAAPK Unmodified 1670.7246 0.72463636 2640 P54289 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.18 55.18 2 2.7018E-24 53462 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.51 137.76 1015300000 0 117190000 137480000 96996000 95333000 89251000 151070000 33316000 44346000 21552000 94338000 62601000 71841000 42268 2640 39455 377195;377196;377197;377198;377199;377200;377201;377202;377203;377204;377205;377206 479391;479392;479393;479394;479395;479396;479397;479398;479399;479400;479401;479402 479398 12 SYEAGTEISR Unmodified 1111.5146 0.51456723 1670 O75936 BBOX1 Gamma-butyrobetaine dioxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.786 25.786 2 0.00029763 18765 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.7 96.72 1206900000 84542000 111220000 0 130650000 0 110070000 115180000 131500000 172280000 77927000 0 94460000 179090000 42269 1670 39456 377207;377208;377209;377210;377211;377212;377213;377214;377215;377216 479403;479404;479405;479406;479407;479408;479409;479410;479411;479412;479413;479414 479414 10 SYEAYVLNIVR Unmodified 1325.698 0.69795133 1873 P05026;V9GYR2 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 118.5 118.5 2;3 4.1537E-46 122742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 206.09 166.04 17293000000 1189800000 1360500000 1360700000 1308600000 1175200000 1014400000 1434700000 1424500000 1449200000 486320000 1865700000 1665900000 1557400000 42270 1873 39457 377217;377218;377219;377220;377221;377222;377223;377224;377225;377226;377227;377228;377229;377230;377231;377232;377233;377234;377235;377236;377237;377238;377239;377240 479415;479416;479417;479418;479419;479420;479421;479422;479423;479424;479425;479426;479427;479428;479429;479430;479431;479432;479433;479434;479435;479436;479437;479438;479439;479440;479441;479442;479443;479444;479445;479446;479447;479448;479449;479450;479451;479452 479439 37 SYECQAQQTISLASSDPQK Unmodified 2139.9743 0.97426212 4458 Q9UJQ1 LAMP5 Lysosome-associated membrane glycoprotein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 80.021 80.021 2 1.2127E-45 81002 QUIQUE_C1277_190116_001 204.31 194.26 200570000 43276000 60335000 52125000 44833000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42271 4458 39458 377241;377242;377243;377244;377245;377246;377247 479453;479454;479455;479456;479457;479458;479459 479454 7 SYELPDGQVITIGNER Unmodified 1789.8846 0.88464248 2788;2696;2792;447;2759;526;3401;458;3261 A0A2R8Y793;P60709;P62736;P63267;P63261;P68032;P68133;Q562R1;A5A3E0;Q6S8J3;A0A2R8YEA7 ACTB;ACTA2;ACTG2;ACTG1;ACTC1;ACTA1;ACTBL2;POTEF;POTEE Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle;Beta-actin-like protein 2;POTE ankyrin domain family member F;POTE ankyrin domain family member E no no 0 0 0 11 7 8 11 10 8 12 7 4 5 8 4 9 139.02 139.02 1;2;3 1.7427E-167 120086 QUIQUE_DMIX5_190116_001 288.52 251.54 402230000000 28075000000 32999000000 34210000000 32508000000 31720000000 26569000000 33177000000 31975000000 30506000000 16078000000 35754000000 34026000000 34633000000 42272 447;2696;2759;2788;2792;3261;526;3401;458 39459 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479460;479461;479462;479463;479464;479465;479466;479467;479468;479469;479470;479471;479472;479473;479474;479475;479476;479477;479478;479479;479480;479481;479482;479483;479484;479485;479486;479487;479488;479489;479490;479491;479492;479493;479494;479495;479496;479497;479498;479499;479500;479501;479502;479503;479504;479505;479506;479507;479508;479509;479510;479511;479512;479513;479514;479515;479516;479517;479518;479519;479520;479521;479522;479523;479524;479525;479526;479527;479528;479529;479530;479531;479532;479533;479534;479535;479536;479537;479538;479539;479540;479541;479542;479543;479544;479545;479546;479547;479548;479549;479550;479551;479552;479553;479554;479555;479556;479557;479558;479559;479560;479561;479562;479563;479564;479565;479566;479567;479568;479569;479570;479571;479572;479573;479574;479575;479576;479577;479578;479579;479580;479581;479582;479583;479584;479585;479586;479587;479588;479589;479590;479591;479592;479593;479594;479595;479596;479597;479598;479599;479600;479601;479602;479603;479604;479605;479606;479607;479608;479609;479610;479611;479612;479613;479614;479615;479616;479617;479618;479619;479620;479621;479622;479623;479624;479625;479626;479627;479628;479629;479630;479631;479632;479633;479634;479635;479636;479637;479638;479639;479640;479641;479642;479643;479644;479645;479646;479647;479648;479649;479650;479651;479652;479653;479654;479655;479656;479657 479630 193 SYELQESNVR Unmodified 1223.5782 0.57823012 820;806 D6RDP1;D6R9Y6;D6RGI3;D6RER5;Q9NVA2;D6RDU5 SEPT11 Septin-11 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.102 36.102 2 6.7948E-19 32559 QUIQUE_C1218_190116_001 186.3 141.95 17072000000 1266900000 1235800000 1555600000 1326900000 1213100000 1228800000 1413100000 1139800000 1259100000 430360000 1909200000 1258200000 1835600000 42273 806;820 39460 377352;377353;377354;377355;377356;377357;377358;377359;377360;377361;377362;377363;377364 479658;479659;479660;479661;479662;479663;479664;479665;479666;479667;479668;479669;479670;479671;479672;479673 479658 16 SYEPLEDPGVK Unmodified 1232.5925 0.5924832 2409 P37837;F2Z393 TALDO1 Transaldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 53.147 53.147 1;2 0.00044842 51157 QUIQUE_C1403_190116_001 114.84 62.846 7722400000 951730000 962890000 602780000 692190000 684270000 680400000 408990000 974080000 365450000 420400000 369040000 273970000 336200000 42274 2409 39461 377365;377366;377367;377368;377369;377370;377371;377372;377373;377374;377375;377376;377377;377378 479674;479675;479676;479677;479678;479679;479680;479681;479682;479683;479684;479685;479686;479687;479688;479689;479690;479691;479692;479693 479680 19 SYETWIGIYTVK Unmodified 1458.7395 0.73948179 4499 Q9UM22;D6RIH7 EPDR1 Mammalian ependymin-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 122.3 122.3 2 0.0029628 125779 QUIQUE_DMIX8_190116_001 87.298 70.272 658560000 332960000 0 0 0 0 228420000 0 0 0 0 0 0 97179000 42275 4499 39462 377379;377380;377381 479694;479695;479696;479697 479696 4 SYFAFLQTVTGSGMSEVIANQGAENVER Unmodified 3004.4237 0.42365032 1534 O43592 XPOT Exportin-T yes yes 0 0 0 1 160.61 160.61 3 1.8299E-05 163883 QUIQUE_C1403_190116_001 47.919 37.082 18019000 0 0 0 18019000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42276 1534 39463 377382 479698 479698 1 SYFLIVR Unmodified 896.51199 0.51198846 1108;1404 G8JLD5;O00429 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 87.388 87.388 2 0.019541 89000 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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479711;479712;479713;479714;479715;479716;479717;479718 479713 8 SYFSEEGIGYNIIR Unmodified 1646.794 0.79403656 285 A0A0G2JNZ5;A0A0G2JLB3;P04062 GBA Glucosylceramidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 116.63 116.63 2 0.0049864 120257 QUIQUE_C1403_190116_001 64.439 41.066 234280000 0 0 0 39759000 53622000 0 28263000 0 0 0 0 63964000 48677000 42280 285 39467 377401;377402;377403;377404;377405 479719;479720;479721;479722;479723 479719 4 SYFSQYGEVVDCVIMK Unmodified 1923.8747 0.87467142 1319 K7EQ55;K7EK33;Q96EP5;K7EQ02 DAZAP1 DAZ-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 140.52 140.52 2 0.0033814 143390 QUIQUE_C1563_190116_001 77.593 64.393 23636000 0 0 0 0 0 23636000 0 0 0 0 0 0 0 42281 1319 39468 377406 479724 479724 1 SYFSSFTDDIISQPMLK Unmodified 1977.9394 0.93938016 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 152.07 152.07 2;3 1.778E-12 156341 QUIQUE_C1277_190116_001 149.26 141.16 1019000000 99642000 81958000 127960000 0 56278000 76298000 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yes 0 0 1 1 1 1 47.313 47.313 2 0.0043019 45083 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.65 37.8 147230000 0 0 0 0 0 0 0 0 45864000 0 0 60650000 40718000 42284 1513 39471 377431;377432;377433 479757;479758;479759 479757 3 SYGIPFIETSAK Unmodified 1311.6711 0.67106787 1807;1809 P01116;P01111 KRAS;NRAS GTPase KRas;GTPase KRas, N-terminally processed;GTPase NRas no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 104.86 104.86 2 0.00053519 108761 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.66 74.875 1402800000 105340000 122870000 135160000 124380000 106460000 118280000 134870000 95852000 93855000 48153000 127010000 86653000 103950000 42285 1809;1807 39472 377434;377435;377436;377437;377438;377439;377440;377441;377442;377443;377444;377445;377446;377447 479760;479761;479762;479763;479764;479765;479766;479767;479768;479769;479770;479771;479772;479773;479774;479775;479776;479777;479778;479779;479780;479781;479782;479783;479784;479785;479786;479787 479780 28 SYGIPYIETSAK Unmodified 1327.666 0.66598249 1808 P01112 HRAS GTPase HRas;GTPase HRas, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 3 1 87.716 87.716 2 0.0049558 90629 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.865 61.536 289270000 49908000 43171000 0 58001000 40027000 0 28132000 0 0 0 70035000 0 0 42286 1808 39473 377448;377449;377450;377451;377452;377453;377454;377455;377456;377457 479788;479789;479790;479791;479792;479793;479794;479795;479796;479797 479795 7 SYGPAPGAGHVQEESNLSLQALESR Unmodified 2596.2518 0.25175761 2971 Q13155 AIMP2 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 91.881 91.881 3 3.0157E-29 92560 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124 116.04 114710000 0 0 0 0 0 0 0 82126000 0 32588000 0 0 0 42287 2971 39474 377458;377459;377460 479798;479799;479800 479799 3 SYGRPPPDVEGMTSLK Acetyl (Protein N-term) 1774.856 0.85598488 1267 J3QL05;J3KP15;Q01130 SRSF2 Serine/arginine-rich splicing factor 2 yes no 1 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 3 88.537 88.537 2 5.4612E-29 92001 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.65 124.06 1140500000 0 103470000 0 0 143830000 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377476;377477;377478;377479;377480;377481;377482;377483;377484;377485;377486;377487;377488;377489;377490;377491;377492;377493;377494;377495;377496 479821;479822;479823;479824;479825;479826;479827;479828;479829;479830;479831;479832;479833;479834;479835;479836;479837;479838;479839;479840;479841;479842;479843 479833 19 SYIATQGCLQNTVNDFWR Unmodified 2172.0058 0.0058370195 2898 Q06124 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 133.21 133.21 2 3.4409E-141 137382 QUIQUE_C1277_190116_001 239.39 217.83 373640000 39839000 55854000 50032000 49203000 0 0 51363000 0 44499000 0 0 31289000 51561000 42291 2898 39477 377497;377498;377499;377500;377501;377502;377503;377504 479844;479845;479846;479847;479848;479849;479850;479851 479845 8 SYIEGYVPSQADVAVFEAVSSPPPADLCHALR Unmodified 3444.666 0.66600585 2229 P24534;C9JZW3;F2Z2G2 EEF1B2 Elongation factor 1-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 150.57 150.57 3 5.6983E-55 156027 QUIQUE_C1368_190116_001 136.66 127.04 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127.78 2 4.1333E-06 131450 QUIQUE_C1403_190116_001 147.51 134.13 646300000 45115000 56526000 66369000 60835000 44092000 46289000 48064000 74355000 0 25358000 67983000 49704000 61612000 42294 4250 39480 377523;377524;377525;377526;377527;377528;377529;377530;377531;377532;377533;377534 479878;479879;479880;479881;479882;479883;479884;479885;479886;479887;479888;479889;479890 479882 13 SYISFDILR Unmodified 1112.5866 0.58660996 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 121.75 121.75 2 0.0031968 126690 QUIQUE_C1576_190116_001 91.853 76.414 236330000 41698000 49246000 0 36029000 0 25961000 38749000 0 0 0 0 0 44648000 42295 617 39481 377535;377536;377537;377538;377539;377540 479891;479892;479893;479894;479895;479896;479897 479896 7 SYIYSGSHDGHINYWDSETGENDSFAGK Unmodified 3135.3119 0.31185126 1609 O75083 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 87.309 87.309 3;4 2.3379E-144 90211 QUIQUE_C1218_190116_001 202.33 201.42 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479959;479960;479961;479962;479963;479964;479965;479966;479967;479968;479969;479970;479971 479960 13 SYLLVYYPHIVVPPLPEK Unmodified 2126.1816 0.18159977 1715 O95219;F8W9T3 SNX4 Sorting nexin-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 136.48 136.48 3 0.001741 140728 QUIQUE_C1277_190116_001 52.298 47.94 116210000 0 20909000 21826000 23219000 20522000 0 29733000 0 0 0 0 0 0 42302 1715 39487 377611;377612;377613;377614;377615 479972;479973;479974;479975;479976;479977 479972 6 SYLMTNYESAPPSPQYK Unmodified 1974.9033 0.90332901 1618 O75223;M0QZK8;B8ZZK2;H7BZK5 GGCT Gamma-glutamylcyclotransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.304 84.304 2 6.5702E-23 85099 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.18 131.04 523530000 43202000 43296000 51376000 43916000 35504000 37628000 31580000 38290000 56198000 20938000 65815000 0 55785000 42303 1618 39488 377616;377617;377618;377619;377620;377621;377622;377623;377624;377625;377626;377627 479978;479979;479980;479981;479982;479983;479984;479985;479986;479987;479988;479989;479990;479991;479992;479993;479994 479989 17 SYLNIWSELQAYIK Unmodified 1726.893 0.89302232 2422 P40123;E9PDI2;F8WDB9 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 166.99 166.99 2 4.7869E-07 172456 QUIQUE_C1576_190116_001 126.67 92.139 578020000 0 30251000 60041000 0 33337000 0 66313000 54691000 52255000 0 125580000 155550000 0 42304 2422 39489 377628;377629;377630;377631;377632;377633;377634;377635 479995;479996;479997;479998;479999;480000;480001;480002 479998 8 SYLNMDAIMEAIK Unmodified 1497.7207 0.72073696 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1;A0A1B0GTR1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 148.21 148.21 2 0.00042604 154010 QUIQUE_C1218_190116_001 113.63 59.213 270680000 54875000 29826000 53241000 29971000 23560000 31617000 30418000 0 0 0 0 0 17170000 42305 1881 39490 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480048;480049;480050;480051;480052;480053 480051 6 SYLSSWFEDVVCPIQR Unmodified 1984.9353 0.93529784 1309 J9JIC5;Q9HAS0;K7ERX0;K7EIQ2;K7EII1;J3KRR1 C17orf75 Protein Njmu-R1 yes no 0 0 0 1 163.49 163.49 2 0.00048035 167775 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.82 72.939 19558000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19558000 0 42310 1309 39494 377678 480054 480054 1 SYLTEQVNQDLPK Unmodified 1533.7675 0.76748745 3200 Q16822;H0YML5 PCK2 Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial yes no 0 0 0 1 85.965 85.965 2 0.017376 87975 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.889 43.624 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42311 3200 39495 377679 480055 480055 1 SYLYFTQFK Unmodified 1195.5914 0.59136099 1365 M0QYN0;Q969H8;M0QXF7 MYDGF Myeloid-derived growth factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.05 105.05 2 0.00042893 102991 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.17 101.19 1268100000 108480000 107520000 0 142360000 111770000 128950000 0 94301000 99122000 54171000 160760000 111680000 149020000 42312 1365 39496 377680;377681;377682;377683;377684;377685;377686;377687;377688;377689;377690 480056;480057;480058;480059;480060;480061;480062;480063;480064;480065;480066;480067;480068;480069 480065 12 SYNCTPVSSPR Unmodified 1266.5663 0.56628523 3568 Q8N122 RPTOR Regulatory-associated protein of mTOR yes yes 0 0 0 1 1 24.624 24.624 2 0.028788 19309 QUIQUE_C1277_190116_001 67.726 33.929 10795000 0 0 10795000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42313 3568 39497 377691;377692 480070;480071 480070 1 SYNDELQFLEK Unmodified 1384.6511 0.65106071 4593 Q9Y3I0 RTCB tRNA-splicing ligase RtcB homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.44 102.44 2 0.00018514 104986 QUIQUE_C1403_190116_001 125.48 97.467 2200600000 206970000 227700000 225290000 172640000 0 190190000 207930000 189480000 234850000 0 253660000 0 291870000 42314 4593 39498 377693;377694;377695;377696;377697;377698;377699;377700;377701;377702 480072;480073;480074;480075;480076;480077;480078;480079;480080;480081;480082 480076 9 SYNPFDDDGEDEGARPAPWR Unmodified 2292.9672 0.96720291 1744 O95721 SNAP29 Synaptosomal-associated protein 29 yes yes 0 0 1 1 1 1 96.911 96.911 3 0.013976 101119 QUIQUE_C1438_190116_001 38.915 37.344 102810000 0 0 0 0 26934000 35998000 0 0 39876000 0 0 0 0 42315 1744 39499 377703;377704;377705 480083;480084;480085 480083 3 SYNQEHSQSFTFDDAQQEDR Unmodified 2430.9949 0.99487422 4247 Q9NPQ8;E9PI04 RIC8A Synembryn-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 56.37 56.37 3 6.924E-07 54934 QUIQUE_C1218_190116_001 91.64 87.745 99850000 35302000 0 0 46156000 0 0 0 0 0 18391000 0 0 0 42316 4247 39500 377706;377707;377708;377709 480086;480087;480088;480089 480086 4 SYNVTPPPIEESHPYYQEIYNDR Unmodified 2810.2824 0.28238904 1927 P07738 BPGM Bisphosphoglycerate mutase yes yes 0 0 0 1 101.21 101.21 3 9.2925E-06 104856 QUIQUE_C1368_190116_001 74.062 66.165 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42317 1927 39501 377710 480090 480090 1 SYPGHVQPATAR Unmodified 1282.6418 0.64183343 3500 Q86VS8;H0YDK4 HOOK3 Protein Hook homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 15.619 15.619 3 0.047128 7993 QUIQUE_C1438_190116_001 29.071 13.869 13816000 0 0 0 0 13816000 0 0 0 0 0 0 0 0 42318 3500 39502 377711;377712 480091;480092 480091 2 SYPGSQLDILIDQGK Unmodified 1632.8359 0.83590137 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.88 115.88 2;3 1.5833E-07 119507 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.49 89.86 2219900000 298640000 188630000 259830000 227530000 113790000 249810000 223660000 46400000 137770000 155340000 111540000 86845000 120080000 42319 2003 39503 377713;377714;377715;377716;377717;377718;377719;377720;377721;377722;377723;377724;377725;377726;377727 480093;480094;480095;480096;480097;480098;480099;480100;480101;480102;480103;480104;480105;480106;480107;480108;480109;480110 480110 15 SYPGSQLDILIDQGKDDQFLLDGQLLPDNFIAACTEK Unmodified 4137.0252 0.025241643 2003 P10768;X6RA14;H7BZT7;U3KQT1 ESD S-formylglutathione hydrolase yes no 0 0 1 1 1 167.27 167.27 3;4 0.011549 171775 QUIQUE_DMIX3_190116_001 24.667 20.434 314950000 0 0 0 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58.778 426760000 37048000 36088000 0 0 0 0 47643000 52813000 71788000 0 58523000 39590000 83263000 42323 2311 39507 377738;377739;377740;377741;377742;377743;377744;377745;377746;377747;377748 480122;480123;480124;480125;480126;480127;480128;480129;480130;480131;480132;480133;480134;480135;480136;480137 480133 16 SYQLRPGTMIEWGNYWAR Unmodified 2227.0633 0.063292319 1622 O75323;C9K068 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 127.59 127.59 3 2.372E-18 131280 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.08 127.46 1873700000 0 98925000 0 0 0 0 0 331740000 336810000 0 454360000 374100000 277810000 42324 1622 39508 377749;377750;377751;377752;377753;377754 480138;480139;480140;480141;480142;480143;480144;480145;480146 480139 9 SYQLRPGTMIEWGNYWAR Oxidation (M) 2243.0582 0.058206941 1622 O75323;C9K068 GBAS Protein NipSnap homolog 2 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 1 110.41 110.41 3 2.7242E-17 115033 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.51 127.52 1478100000 0 50769000 69238000 52861000 38112000 37011000 75400000 233370000 209880000 0 345210000 235110000 131170000 42325 1622 39508 377755;377756;377757;377758;377759;377760;377761;377762;377763;377764;377765;377766;377767;377768;377769 480147;480148;480149;480150;480151;480152;480153;480154;480155;480156;480157;480158;480159;480160;480161;480162 480157 877 11 SYQYLVESIR Unmodified 1256.6401 0.6401021 1037 F8VVX6;Q5HYK3;B4DP72 COQ5 2-methoxy-6-polyprenyl-1,4-benzoquinol methylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 87.048 87.048 2 0.0030277 87675 QUIQUE_C1563_190116_001 86.624 70.084 124460000 0 0 0 22197000 0 22698000 29327000 0 21008000 0 0 29230000 0 42326 1037 39509 377770;377771;377772;377773;377774 480163;480164;480165;480166;480167 480164 4 SYSCQVTHEGSTVEK Unmodified 1710.7519 0.75191374 209;1989 A0A0B4J231;B9A064;P0CG04;P0DOY3;P0DOY2;P0CF74 IGLL5;IGLC1;IGLC6 Immunoglobulin lambda-like polypeptide 5;Ig lambda-1 chain C regions;Ig lambda-6 chain C region no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 20.221 20.221 2;3 1.6085E-283 12550 QUIQUE_C1277_190116_001 305.51 236.24 17634000000 351150000 1165300000 2142800000 2357100000 3752800000 739870000 1229000000 654060000 780320000 360800000 2182600000 848360000 1069900000 42327 209;1989 39510 377775;377776;377777;377778;377779;377780;377781;377782;377783;377784;377785;377786;377787;377788;377789;377790;377791;377792;377793;377794;377795;377796;377797;377798;377799 480168;480169;480170;480171;480172;480173;480174;480175;480176;480177;480178;480179;480180;480181;480182;480183;480184;480185;480186;480187;480188;480189;480190;480191;480192 480170 23 SYSEDDIHR Unmodified 1120.4785 0.47851608 4075 Q9BYJ9;A0A024R7W5;A0A087X0Q1;A0A087WY31;Q7Z739 YTHDF1;YTHDF3 YTH domain-containing family protein 1;YTH domain-containing family protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.438 19.438 3 0.0017143 11718 QUIQUE_C1277_190116_001 85.731 76.517 247650000 48784000 55137000 47440000 0 0 0 0 26065000 0 22086000 0 0 48141000 42328 4075 39511 377800;377801;377802;377803;377804;377805 480193;480194;480195;480196;480197;480198 480194 6 SYSFDEIRK Unmodified 1143.556 0.55603812 2465 P43490 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 41.879 41.879 3 0.0029109 38132 QUIQUE_C1218_190116_001 63.216 50.638 122500000 27683000 0 0 0 0 0 0 61210000 0 33610000 0 0 0 42329 2465 39512 377806;377807;377808;377809 480199;480200;480201;480202;480203 480199 5 SYSFVLTNR Unmodified 1085.5506 0.55055881 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 70.844 70.844 2 0.064364 70227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 59.35 38.725 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42330 987 39513 377810 480204 480204 1 SYSLCVPVTPDAGCGAR Unmodified 1808.8186 0.81855352 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 85.848 85.848 2 6.9469E-05 88988 QUIQUE_C1438_190116_001 95.401 78.769 58290000 0 0 0 0 58290000 0 0 0 0 0 0 0 0 42331 3269 39514 377811 480205 480205 1 SYSMIVNNLLKPISVEGSSK Oxidation (M) 2181.1351 0.13511986 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 3 2 1 121.21 121.21 3 1.5235E-05 124535 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.031 72.811 469500000 21554000 29435000 0 34309000 0 68656000 0 48379000 0 28490000 104700000 72989000 60986000 42332 4212 39515 377812;377813;377814;377815;377816;377817;377818;377819;377820;377821;377822;377823;377824;377825;377826;377827 480206;480207;480208;480209;480210;480211;480212;480213;480214;480215;480216;480217;480218;480219;480220;480221 480219 2882 13 SYSMIVNNLLKPISVEGSSK Unmodified 2165.1402 0.14020524 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 2 1 1 124.97 124.97 2;3 1.6409E-135 128204 QUIQUE_DMIX1_190116_001 256.81 247.02 1169800000 106100000 101650000 88040000 95694000 66637000 111260000 78826000 74482000 98984000 34728000 130010000 91321000 92048000 42333 4212 39515 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annexin A2-like protein yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 93.262 93.262 2 0.001057 95805 QUIQUE_C1277_190116_001 85.958 72.504 1336700000 74625000 180950000 205450000 150550000 163540000 93951000 150330000 21769000 80814000 100760000 0 31968000 81952000 42335 1920 39517 377859;377860;377861;377862;377863;377864;377865;377866;377867;377868;377869;377870;377871;377872;377873;377874 480261;480262;480263;480264;480265;480266;480267;480268;480269;480270;480271;480272;480273;480274;480275;480276;480277;480278;480279;480280 480263 1144 19 SYSPYDMLESIR Unmodified 1459.6653 0.66533057 1920 P07355;H0YN42;H0YM50;A6NMY6;H0YN28;H0YL33 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.31 129.31 2 0.00085157 133648 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.22 94.217 7561700000 559880000 572260000 623260000 1163600000 590180000 596510000 736380000 216670000 567380000 380230000 545670000 360810000 648890000 42336 1920 39517 377875;377876;377877;377878;377879;377880;377881;377882;377883;377884;377885;377886;377887 480281;480282;480283;480284;480285;480286;480287;480288;480289;480290;480291;480292;480293;480294;480295;480296;480297;480298 480291 18 SYSPYDMLESIRK Unmodified 1587.7603 0.76029359 1920 P07355;H0YN42;H0YM50;A6NMY6;H0YN28;H0YL33 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 104.9 104.9 2;3 9.9133E-05 108919 QUIQUE_C1576_190116_001 77.527 58.796 2270200000 0 33128000 36518000 23303000 54582000 0 54670000 370390000 516390000 0 240340000 360160000 580680000 42337 1920 39518 377888;377889;377890;377891;377892;377893;377894;377895;377896;377897;377898;377899;377900;377901 480299;480300;480301;480302;480303;480304;480305;480306;480307;480308;480309;480310;480311;480312;480313;480314;480315;480316;480317 480303 19 SYSPYDMLESIRK Oxidation (M) 1603.7552 0.75520821 1920 P07355;H0YN42;H0YM50;A6NMY6;H0YN28;H0YL33 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 1 1 1 1 1 71.052 71.052 3 0.0018102 71615 QUIQUE_DMIX3_190116_001 65.805 54.331 198180000 0 0 0 0 0 0 0 0 74186000 0 0 49537000 74462000 42338 1920 39518 377902;377903;377904 480318;480319;480320 480318 1144 2 SYSQSILLDLTDNR Unmodified 1623.8104 0.8104149 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 1 1 121.3 121.3 2 0.015445 126506 QUIQUE_C1576_190116_001 65.395 56.207 71788000 0 0 0 0 40995000 0 30793000 0 0 0 0 0 0 42339 3420 39519 377905;377906 480321;480322 480322 1 SYSSGGEDGYVR Unmodified 1275.5368 0.53675924 2988 Q13347 EIF3I Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 27.906 27.906 2 0.0020259 22642 QUIQUE_C1218_190116_001 83.869 72.506 85827000 0 0 0 0 0 0 0 0 85827000 0 0 0 0 42340 2988 39520 377907;377908;377909;377910;377911;377912;377913;377914 480323;480324;480325;480326;480327;480328;480329;480330 480323 8 SYSSSSGSLMPSLENLDLSQVAAISNDLK Unmodified 3012.4598 0.45976105 1916 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480787 175 SYVSSGEMMVGGLAPGRR Unmodified 1852.8924 0.89238717 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;K7EJK1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 2 2 2 1 1 2 1 4 3 2 4 3 3 83.03 83.03 2;3 4.4821E-89 85801 QUIQUE_DMIX1_190116_001 227.2 195.76 77384000000 196330000 796240000 407000000 904580000 644160000 572100000 642560000 19721000000 15668000000 193950000 12789000000 10489000000 14360000000 42357 389;395;1336 39534 378252;378253;378254;378255;378256;378257;378258;378259;378260;378261;378262;378263;378264;378265;378266;378267;378268;378269;378270;378271;378272;378273;378274;378275;378276;378277;378278;378279;378280;378281 480874;480875;480876;480877;480878;480879;480880;480881;480882;480883;480884;480885;480886;480887;480888;480889;480890;480891;480892;480893;480894;480895;480896;480897;480898;480899;480900;480901;480902;480903;480904;480905;480906;480907;480908;480909;480910;480911;480912 480888 38 SYVSSGEMMVGGLAPGRR Oxidation 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481006;481007;481008;481009;481010;481011;481012;481013;481014;481015;481016;481017;481018;481019;481020;481021;481022;481023 481012 18 TAADELEAFLGGGAPGGR Unmodified 1687.8166 0.81656291 3229 Q3YEC7;H0Y4Z8 RABL6 Rab-like protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 143.94 143.94 2;3 2.7052E-05 149109 QUIQUE_DMIX8_190116_001 98.156 84.25 85068000 0 0 0 0 9528700 0 0 10370000 13614000 0 0 0 51556000 42369 3229 39544 378375;378376;378377;378378;378379;378380 481024;481025;481026;481027;481028;481029 481029 6 TAADTPAIMNWDLFFTMK Unmodified 2071.9747 0.97471981 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 0 1 167.56 167.56 2 3.988E-05 174969 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.88 108.61 50762000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50762000 0 0 42370 3239 39545 378381 481030 481030 1 TAAELLQSQGSQAGGSQTLK Unmodified 1974.0018 0.0017974991 594 B1AMS2;Q14141 SEPT6 Septin-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.648 60.648 2 6.8282E-134 56792 QUIQUE_DMIX4_190116_001 271.08 201.63 1445000000 130710000 132680000 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TAAFLLPILSQIYTDGPGEALK Unmodified 2317.2569 0.25694955 1504 O15523;C9J081 DDX3Y ATP-dependent RNA helicase DDX3Y yes no 0 0 0 1 1 1 169.61 169.61 2 1.0147E-14 171513 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.68 134.55 125960000 0 0 57487000 0 0 0 0 22968000 0 0 0 45508000 0 42377 1504 39552 378446;378447;378448 481098;481099;481100 481099 3 TAAFQQDLEAK Unmodified 1220.6037 0.60371659 3810 Q96BQ5 CCDC127 Coiled-coil domain-containing protein 127 yes yes 0 0 0 1 1 1 44.954 44.954 2 0.003944 41191 QUIQUE_C1277_190116_001 72.638 46.37 119900000 65828000 54068000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42378 3810 39553 378449;378450;378451 481101;481102;481103 481102 2 TAAFVLAMLSR Unmodified 1178.6482 0.64816436 1021 F6QDS0;I3L352;H0YD26;A0A1B0GV69;E9PR46;J3QL17;Q9UHL0 DDX19A;DDX25 ATP-dependent RNA helicase DDX25 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 129.56 129.56 2 0.00028151 132961 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.09 111.18 292920000 0 0 30409000 28818000 27961000 21894000 25785000 35139000 30489000 0 32857000 24258000 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481126;481127;481128;481129;481130;481131;481132;481133;481134;481135;481136;481137;481138;481139;481140;481141;481142;481143;481144;481145;481146;481147;481148;481149;481150;481151;481152;481153;481154;481155;481156;481157;481158;481159;481160;481161;481162;481163;481164;481165;481166;481167;481168;481169;481170 481131 43 TAATLATHELR Unmodified 1182.6357 0.63568542 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 2 1 2 23.955 23.955 2;3 1.126E-29 17242 QUIQUE_DMIX7_190116_001 218.48 183.18 2095300000 181530000 171370000 191350000 164900000 146210000 81916000 74900000 244370000 190840000 111010000 200530000 166940000 169440000 42384 3576 39559 378494;378495;378496;378497;378498;378499;378500;378501;378502;378503;378504;378505;378506;378507;378508;378509;378510;378511;378512;378513;378514 481171;481172;481173;481174;481175;481176;481177;481178;481179;481180;481181;481182;481183;481184;481185;481186;481187;481188;481189;481190;481191;481192;481193;481194;481195;481196;481197 481194 25 TAAVANSMNYLTK Unmodified 1382.6864 0.68640036 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 62.234 62.234 2 0.009754 61537 QUIQUE_C1277_190116_001 86.923 55.501 29975000 0 0 0 0 0 0 29975000 0 0 0 0 0 0 42385 4334 39560 378515;378516 481198;481199 481198 2 TAAVLLQNDPNPDVLSK Unmodified 1793.9523 0.95232811 2103 P16157 ANK1 Ankyrin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 90.215 90.215 2 1.0855E-16 92207 QUIQUE_C1277_190116_001 168.98 151.18 159640000 27288000 29172000 0 27634000 0 0 0 0 0 0 0 35096000 40452000 42386 2103 39561 378517;378518;378519;378520;378521;378522 481200;481201;481202;481203;481204;481205 481201 5 TAAVSAIATK Unmodified 931.53385 0.53384611 3088 Q14894;I3L325;I3L2W5;I3NI53 CRYM Ketimine reductase mu-crystallin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 20.913 20.913 2 0.00021354 13638 QUIQUE_C1403_190116_001 118.67 87.933 6155500000 849020000 1202300000 0 975600000 0 984340000 0 745540000 1087000000 311710000 0 0 0 42387 3088 39562 378523;378524;378525;378526;378527;378528;378529 481206;481207;481208;481209;481210;481211;481212 481208 2 TAAVWEEIVGESNDKLR Unmodified 1915.964 0.96395543 1331 K7ELV2;Q96EE3;K7EP88;K7EPZ5 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 1 1 108.78 108.78 3 0.049785 113995 QUIQUE_C1438_190116_001 32.926 22.826 28603000 0 0 0 0 28603000 0 0 0 0 0 0 0 0 42388 1331 39563 378530 481213 481213 0 TAAYGHFGR Unmodified 978.46716 0.46716353 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 18.976 18.976 2 0.0066675 11359 QUIQUE_C1403_190116_001 83.753 40.506 869430000 0 205930000 0 124600000 0 0 0 165780000 166640000 0 0 206470000 0 42389 2329 39564 378531;378532;378533;378534;378535;378536 481214;481215;481216;481217;481218;481219;481220 481215 5 TAAYVNAIEK Unmodified 1078.5659 0.56587452 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 37.335 37.335 2 0.0025948 32467 QUIQUE_C1563_190116_001 89.047 61.744 49325000000 3523500000 2819800000 4760600000 3443100000 3298900000 3473600000 3576800000 3874100000 3997900000 1960000000 6046900000 4049800000 4500200000 42390 1777 39565 378537;378538;378539;378540;378541;378542;378543;378544;378545;378546;378547;378548;378549;378550;378551 481221;481222;481223;481224;481225;481226;481227;481228;481229;481230;481231;481232;481233;481234;481235;481236;481237;481238;481239;481240 481227 16 TACGAPSGICLQVK Unmodified 1460.7116 0.71156925 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 60.298 60.298 2 0.036883 60353 QUIQUE_C1438_190116_001 71.555 57.552 67798000 0 0 0 0 67798000 0 0 0 0 0 0 0 0 42391 2207 39566 378552 481241 481241 0 TACNVEEAFINTAK Unmodified 1566.7348 0.73480712 3697 Q8WUD1;A0A3B3ITL1 RAB2B Ras-related protein Rab-2B yes no 0 0 0 1 85.265 85.265 2 0.041905 87127 QUIQUE_C1218_190116_001 43.713 28.123 55469000 55469000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42392 3697 39567 378553 481242 481242 1 TADAPSEPAASPHQR Unmodified 1533.7172 0.71718322 3334 Q5VUB5 FAM171A1 Protein FAM171A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 14.324 14.324 3 0.0053312 6790 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.128 55.926 127960000 0 0 0 27447000 27914000 0 0 0 0 0 26328000 16295000 29980000 42393 3334 39568 378554;378555;378556;378557;378558 481243;481244;481245;481246;481247;481248 481246 4 TADDPSLSLIK Unmodified 1158.6132 0.61321864 252 A0A0C4DGS1;P39656;U3KQ84 DDOST Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 69.523 69.523 2 0.0016065 70533 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.499 36.301 257550000 0 0 60858000 0 0 0 0 0 61089000 0 89624000 0 45983000 42394 252 39569 378559;378560;378561;378562 481249;481250;481251;481252 481251 2 TADFGIWER Unmodified 1093.5193 0.51925868 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 90.157 90.157 2 0.0042823 92371 QUIQUE_C1368_190116_001 89.355 61.181 179010000 0 27229000 49749000 0 23481000 0 0 18280000 22063000 0 38209000 0 0 42395 550 39570 378563;378564;378565;378566;378567;378568 481253;481254;481255;481256;481257;481258 481254 6 TADGIVSHLK Unmodified 1039.5662 0.56620887 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.621 27.621 2 0.0021986 22710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.265 69.519 1884000000 344310000 317740000 0 258730000 174290000 195060000 146800000 127220000 0 0 196630000 123250000 0 42396 2308 39571 378569;378570;378571;378572;378573;378574;378575;378576;378577;378578 481259;481260;481261;481262;481263;481264;481265;481266;481267;481268 481266 5 TADGIVSHLKK Unmodified 1167.6612 0.66117189 2308 P30101 PDIA3 Protein disulfide-isomerase A3 yes yes 0 0 1 1 19.58 19.58 3 0.011473 12438 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.73 33.524 439580000 0 0 0 0 0 0 0 439580000 0 0 0 0 0 42397 2308 39572 378579 481269 481269 1 TADLAPHPEEK Unmodified 1206.5881 0.58806652 320 F6XEV2;A0A0U1RRK1;A0A286YF11;Q9BPX6;S4R3D7;S4R3V1 MICU1 Calcium uptake protein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 16.883 16.883 3 0.013895 9302 QUIQUE_DMIX7_190116_001 46.706 25.334 42804000 0 0 0 11511000 0 0 18078000 0 0 0 0 13215000 0 42398 320 39573 378580;378581;378582 481270;481271;481272 481272 3 TADLDFFR Unmodified 983.47125 0.47124585 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.016 96.016 2 8.6889E-15 98906 QUIQUE_C1368_190116_001 190.88 136.35 1510300000 142760000 156180000 144990000 146370000 102590000 149590000 147400000 62923000 56115000 64348000 129350000 95014000 112640000 42399 921 39574 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481433;481434;481435;481436;481437;481438;481439;481440;481441;481442;481443;481444;481445;481446;481447;481448;481449;481450;481451;481452;481453;481454;481455;481456;481457;481458;481459;481460;481461;481462;481463 481457 31 TAFDDAIAELDTLNEDSYK Unmodified 2129.9641 0.96407459 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 160.1 160.1 2;3 3.0273E-195 165606 QUIQUE_C1368_190116_001 257.8 246.86 42620000000 4841000000 4516800000 5083400000 4012300000 2835200000 4030800000 4271600000 939670000 1751400000 2236700000 3387000000 2251400000 2463200000 42421 2736 39596 378741;378742;378743;378744;378745;378746;378747;378748;378749;378750;378751;378752;378753;378754;378755;378756;378757;378758;378759;378760;378761;378762;378763;378764;378765 481464;481465;481466;481467;481468;481469;481470;481471;481472;481473;481474;481475;481476;481477;481478;481479;481480;481481;481482;481483;481484;481485;481486;481487;481488;481489;481490;481491;481492;481493;481494;481495;481496;481497;481498;481499;481500;481501;481502 481473 36 TAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLR Oxidation (M) 3316.6021 0.60206819 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 1 1 1 2 1 1 173.29 173.29 3;4 2.9104E-92 177604 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.55 162.65 861670000 0 0 0 0 0 0 0 74597000 120990000 0 0 367500000 298580000 42422 2736 39597 378766;378767;378768;378769;378770 481503;481504;481505;481506;481507 481505 2171 5 TAFDDAIAELDTLNEDSYKDSTLIMQLLR Unmodified 3300.6072 0.60715357 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 2 176.02 176.02 3;4 4.1029E-32 179914 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.57 116.45 445150000 0 0 0 0 0 0 0 0 55522000 0 389630000 0 0 42423 2736 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246270000 230830000 210140000 48986000 182200000 221490000 152450000 42459 363;3596 39626 379105;379106;379107;379108;379109;379110;379111;379112;379113;379114;379115;379116;379117;379118;379119;379120;379121;379122;379123 481999;482000;482001;482002;482003;482004;482005;482006;482007;482008;482009;482010;482011;482012;482013;482014;482015;482016;482017;482018;482019;482020;482021;482022;482023 482005 23 TAHSSLALFR Unmodified 1101.5931 0.59309232 3712 Q8WW59 SPRYD4 SPRY domain-containing protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 40.297 40.297 3 0.0062384 36960 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.882 31.791 60258000 0 29145000 0 0 0 0 0 31113000 0 0 0 0 0 42460 3712 39627 379124;379125 482024;482025 482025 1 TAHYGSLPQK Unmodified 1100.5615 0.56145784 571;1217 J3QL64;A8MZH3;P02686;E9PJ72;E9PMR5;C9J6H1;H0YF02;H0YEA2;J3QKL5;J3QQK6;E9PNZ1;E9PKX9;H7BYR8 MBP Myelin basic protein no no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 15.586 15.586 2;3 7.942E-14 7645 QUIQUE_DMIX7_190116_001 168.25 122.92 36134000000 3596500000 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TAIEAFNETIK Unmodified 1235.6398 0.63976774 2270 P27986;H0YBC2;E5RJY0;F6TDL0;Q92569 PIK3R1;PIK3R3 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha;Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit gamma no no 0 0 0 1 1 1 1 73.808 73.808 2 0.0066444 75173 QUIQUE_C1438_190116_001 65.933 38.931 187160000 0 0 0 52524000 57178000 43419000 0 0 0 34042000 0 0 0 42463 2270 39630 379160;379161;379162;379163 482071;482072;482073;482074 482072 3 TAIEAMAAVFGGTQSLHTNSFDEALGLPTVK Unmodified 3175.586 0.58596462 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.13 158.13 3 1.6699E-13 163869 QUIQUE_C1218_190116_001 70.109 59.593 611460000 35979000 29351000 70994000 41493000 0 0 63489000 79407000 107260000 0 119610000 0 63870000 42464 2191 39631 379164;379165;379166;379167;379168;379169;379170;379171;379172 482075;482076;482077;482078;482079;482080;482081;482082;482083 482075 9 TAIGDYLGER Unmodified 1093.5404 0.54038805 270 A0A0D9SFG6;Q99418;Q15438;K7EKA2;K7ERV8;M0R2J0;F8W8E2;K7ENQ8;A0A286YF81;G5E9B7;K7ENH6 CYTH2;CYTH1 Cytohesin-2;Cytohesin-1 yes no 0 0 0 1 72.219 72.219 2 0.024222 72245 QUIQUE_C1277_190116_001 56.432 41.656 30856000 0 30856000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42465 270 39632 379173 482084 482084 1 TAIGNTLVQDICYSPDTQK Unmodified 2123.0205 0.020484031 2296 P30039;A0A0C4DFS0 PBLD Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 106.03 106.03 2 3.2283E-17 109653 QUIQUE_C1368_190116_001 164.93 136.65 60184000 0 0 35544000 24640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42466 2296 39633 379174;379175 482085;482086 482085 2 TAIHTAAMDMLGGPGIESQCR Oxidation (M) 2231.0133 0.013306938 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 1 0 1 1 66.52 66.52 3 0.00054893 66454 QUIQUE_C1277_190116_001 52.769 45.148 57912000 0 25043000 32869000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42467 3421 39634 379176;379177 482087;482088 482087 2655 2 TAIHTAAMDMLGGPGIESQCR Unmodified 2215.0184 0.018392316 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 88.308 88.308 3 0.00093903 90179 QUIQUE_C1368_190116_001 31.314 22.605 190600000 0 0 105120000 0 0 85480000 0 0 0 0 0 0 0 42468 3421 39634 379178;379179 482089;482090;482091 482090 2 TAIMSFINAVLNAGAGEDNLEFR Unmodified 2452.2057 0.20565904 305 A0A0J9YYF7;Q86T65 DAAM2 Disheveled-associated activator of morphogenesis 2 yes no 0 0 0 1 173.82 173.82 3 0.00070631 178031 QUIQUE_DMIX3_190116_001 43.523 36.725 11594000 0 0 0 0 0 0 0 0 11594000 0 0 0 0 42469 305 39635 379180 482092 482092 1 TAIPFTQEPQR Unmodified 1286.6619 0.66190017 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 58.834 58.834 2 0.024162 58093 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.04 49.833 341990000 0 0 0 0 0 0 117590000 0 0 0 0 113540000 110860000 42470 882 39636 379181;379182;379183 482093;482094;482095 482094 3 TAIQTTEIK Unmodified 1003.555 0.55497548 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 24.47 24.47 2 0.03141 17545 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yes no 0 0 0 3 1 2 2 2 2 3 2 3 2 1 3 3 129.05 129.05 2;3 1.7039E-17 134661 QUIQUE_DMIX5_190116_001 151.98 98.293 1684600000 145590000 117120000 135680000 102170000 149300000 132090000 179400000 130330000 117130000 62219000 114940000 150930000 147690000 42474 4542 39640 379199;379200;379201;379202;379203;379204;379205;379206;379207;379208;379209;379210;379211;379212;379213;379214;379215;379216;379217;379218;379219;379220;379221;379222;379223;379224;379225;379226;379227 482112;482113;482114;482115;482116;482117;482118;482119;482120;482121;482122;482123;482124;482125;482126;482127;482128;482129;482130;482131;482132;482133;482134;482135;482136;482137;482138;482139;482140;482141;482142;482143;482144;482145;482146;482147;482148;482149;482150 482143 35 TALALEVGDIVK Unmodified 1227.7075 0.70745338 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.3 105.3 2 0.0034429 108353 QUIQUE_C1403_190116_001 94.363 48.366 1075900000 85366000 89456000 87286000 79101000 77716000 104210000 64683000 106040000 115150000 37552000 129580000 0 99751000 42475 2480 39641 379228;379229;379230;379231;379232;379233;379234;379235;379236;379237;379238;379239 482151;482152;482153;482154;482155;482156;482157;482158;482159;482160;482161;482162 482154 7 TALALEVGELVK Unmodified 1241.7231 0.72310344 2479 P46108 CRK Adapter molecule crk yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.1 112.1 2 0.0016984 115226 QUIQUE_C1403_190116_001 79.659 48.025 315760000 38794000 39423000 26966000 56016000 0 31909000 0 49964000 0 0 47415000 25273000 0 42476 2479 39642 379240;379241;379242;379243;379244;379245;379246;379247;379248 482163;482164;482165;482166;482167;482168;482169;482170;482171 482166 7 TALAMGADR Unmodified 904.44365 0.44365089 2411 P38117 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.211 24.211 2 0.0078478 17520 QUIQUE_C1403_190116_001 80.438 44.043 1249200000 0 144540000 0 133230000 124030000 156710000 0 148030000 128430000 49568000 191390000 173220000 0 42477 2411 39643 379249;379250;379251;379252;379253;379254;379255;379256;379257 482172;482173;482174;482175;482176;482177;482178;482179;482180 482173 8 TALAQIFR Unmodified 918.5287 0.52870115 4053 Q9BW83;F5GZ09;B1AH58 IFT27 Intraflagellar transport protein 27 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 76.39 76.39 2 0.0025487 76799 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.87 94.363 66293000 0 0 0 0 0 0 0 28218000 38075000 0 0 0 0 42478 4053 39644 379258;379259;379260 482181;482182;482183;482184 482183 4 TALASGGVLDASGDYR Unmodified 1551.7529 0.75290002 1531 O43505 B4GAT1 Beta-1,4-glucuronyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 1 75.373 75.373 2 0.0010014 76086 QUIQUE_C1218_190116_001 82.34 67.367 49445000 33706000 0 0 0 0 0 0 0 0 15739000 0 0 0 42479 1531 39645 379261;379262 482185;482186;482187 482185 3 TALASVAAPAK Unmodified 998.57605 0.57604528 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 29.957 29.957 2 0.038644 24435 QUIQUE_C1403_190116_001 54.191 34.676 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42480 4340 39646 379263 482188 482188 1 TALDAFGR Unmodified 849.43447 0.43446642 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;E7ER27;A0A2R8YDT8;A0A2R8YF45 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.71 51.71 2 0.014079 50202 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.472 52.922 846900000 0 0 90956000 100760000 93254000 97800000 97535000 0 0 50060000 117510000 104540000 94485000 42481 455 39647 379264;379265;379266;379267;379268;379269;379270;379271;379272 482189;482190;482191;482192;482193;482194;482195;482196;482197 482195 9 TALEEQLSR Unmodified 1045.5404 0.54038805 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 38.297 38.297 2 0.047166 34014 QUIQUE_C1563_190116_001 51.528 21.687 83398000 0 0 0 0 0 44240000 0 0 39158000 0 0 0 0 42482 271 39648 379273;379274 482198;482199 482198 2 TALFEEISR Unmodified 1064.5502 0.55022446 3079 Q14683;G8JLG1;H0Y7K8 SMC1A Structural maintenance of chromosomes protein 1A;Structural maintenance of chromosomes protein yes no 0 0 0 1 77.982 77.982 2 0.0035378 77994 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.069 68.577 36192000 0 0 0 0 0 0 0 36192000 0 0 0 0 0 42483 3079 39649 379275 482200 482200 1 TALGIIEEEGFLK Unmodified 1418.7657 0.76569654 1759 O95847 SLC25A27 Mitochondrial uncoupling protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 128.65 128.65 2 0.00066276 131831 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.34 83.58 223450000 0 0 0 0 27452000 0 32437000 29923000 27088000 0 45173000 36259000 25122000 42484 1759 39650 379276;379277;379278;379279;379280;379281;379282 482201;482202;482203;482204;482205;482206;482207;482208 482203 8 TALGVAELTVTDLFR Unmodified 1604.8774 0.87737225 3646 Q8NF37;A0A0G2JQ62;A0A0G2JRI7 LPCAT1 Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 160.64 160.64 2 2.0781E-07 166104 QUIQUE_C1218_190116_001 120.86 102.8 63610000 19051000 0 16836000 0 0 0 0 27723000 0 0 0 0 0 42485 3646 39651 379283;379284;379285;379286;379287 482209;482210;482211;482212;482213 482209 5 TALHVAAAEGHVEVVK Unmodified 1629.8839 0.88385462 1700 O94925;B7Z509 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes no 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 3 2 2 3 1 36.971 36.971 2;3;4 1.3936E-54 33475 QUIQUE_C1218_190116_001 193 173.34 4340000000 703560000 251360000 521860000 260330000 414370000 243130000 360470000 255950000 406520000 118100000 218320000 548700000 37302000 42486 1700 39652 379288;379289;379290;379291;379292;379293;379294;379295;379296;379297;379298;379299;379300;379301;379302;379303;379304;379305;379306;379307;379308;379309;379310;379311;379312;379313;379314;379315;379316 482214;482215;482216;482217;482218;482219;482220;482221;482222;482223;482224;482225;482226;482227;482228;482229;482230;482231;482232;482233;482234;482235;482236;482237;482238;482239;482240;482241;482242;482243 482215 26 TALIHDGLAR Unmodified 1065.5931 0.59309232 2240 P25398 RPS12 40S ribosomal protein S12 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 2 2 29.13 29.13 2;3 0.0020785 23389 QUIQUE_C1403_190116_001 103.7 80.272 4816700000 521490000 481990000 587500000 410620000 161860000 413940000 0 323930000 412110000 91939000 423400000 472030000 515910000 42487 2240 39653 379317;379318;379319;379320;379321;379322;379323;379324;379325;379326;379327;379328;379329;379330;379331;379332;379333;379334;379335;379336;379337 482244;482245;482246;482247;482248;482249;482250;482251;482252;482253;482254;482255;482256;482257;482258;482259;482260;482261;482262;482263;482264;482265;482266 482250 18 TALINFLVQD Unmodified 1132.6128 0.61282471 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 153.45 153.45 2 0.039681 156129 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.59 55.899 18120000 0 6936700 0 0 0 0 0 11184000 0 0 0 0 0 42488 3100 39654 379338;379339 482267;482268 482268 2 TALINSTGEEVAMR Oxidation (M) 1506.7348 0.73480712 1819;3223 P02545;Q3BDU5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.566 50.566 2 0.0003346 48482 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.653 71.873 1008800000 85835000 102990000 0 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no no 0 1 1 1 36.455 36.455 3 0.0045439 32099 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.147 31.542 32779000 0 0 0 0 0 0 0 32779000 0 0 0 0 0 42491 1819;3223 39656 379365 482301 482301 1040 1 TALKEDGVLCCQGECQWLHLDLIK Unmodified 2885.3874 0.38740493 2150 P19623 SRM Spermidine synthase yes yes 0 0 1 2 1 1 123.14 123.14 3;4 1.2433E-06 127354 QUIQUE_C1277_190116_001 70.168 64.008 211800000 0 129220000 43811000 0 38771000 0 0 0 0 0 0 0 0 42492 2150 39657 379366;379367;379368;379369 482302;482303;482304;482305 482302 4 TALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPK Unmodified 2481.3942 0.39417132 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 7 4 3 4 4 4 6 5 7 1 4 2 3 179.64 179.64 2;3 5.6396E-265 182982 QUIQUE_C1368_190116_001 262.94 259.21 12965000000 1066100000 447750000 3121800000 415140000 1495600000 575290000 2375200000 522100000 1532100000 13444000 522340000 436790000 441040000 42493 2004 39658 379370;379371;379372;379373;379374;379375;379376;379377;379378;379379;379380;379381;379382;379383;379384;379385;379386;379387;379388;379389;379390;379391;379392;379393;379394;379395;379396;379397;379398;379399;379400;379401;379402;379403;379404;379405;379406;379407;379408;379409;379410;379411;379412;379413;379414;379415;379416;379417;379418;379419;379420;379421;379422;379423 482306;482307;482308;482309;482310;482311;482312;482313;482314;482315;482316;482317;482318;482319;482320;482321;482322;482323;482324;482325;482326;482327;482328;482329;482330;482331;482332;482333;482334;482335;482336;482337;482338;482339;482340;482341;482342;482343;482344;482345;482346;482347;482348;482349;482350;482351;482352;482353;482354;482355;482356;482357;482358;482359;482360;482361;482362;482363;482364;482365;482366;482367;482368;482369;482370 482320 60 TALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEK Unmodified 2867.5743 0.57432053 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 7 5 5 3 6 5 4 3 3 2 5 3 2 173.03 173.03 2;3;4 3.1463E-126 176644 QUIQUE_C1218_190116_001 189.2 177.99 32802000000 3973900000 1626100000 4516100000 1870700000 2205700000 1116500000 5993200000 1499400000 1178400000 614530000 1637100000 2040800000 4529800000 42494 2004 39659 379424;379425;379426;379427;379428;379429;379430;379431;379432;379433;379434;379435;379436;379437;379438;379439;379440;379441;379442;379443;379444;379445;379446;379447;379448;379449;379450;379451;379452;379453;379454;379455;379456;379457;379458;379459;379460;379461;379462;379463;379464;379465;379466;379467;379468;379469;379470;379471;379472;379473;379474;379475;379476 482371;482372;482373;482374;482375;482376;482377;482378;482379;482380;482381;482382;482383;482384;482385;482386;482387;482388;482389;482390;482391;482392;482393;482394;482395;482396;482397;482398;482399;482400;482401;482402;482403;482404;482405;482406;482407;482408;482409;482410;482411;482412;482413;482414;482415;482416;482417;482418;482419;482420;482421;482422;482423;482424;482425;482426;482427;482428;482429 482372 52 TALLDAAGVASLLTTAEVVVTEIPKEEKDPGMGAMGGMGGGMGGGMF Oxidation (M) 4539.1715 0.17153 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 1 2 1 175.57 175.57 4 1.2283E-05 182718 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.467 44.143 89185000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89185000 0 0 42495 2004 39660 379477 482430 482430 1279;1280;1281;1282;1283 1 TALLEANSTPVR Unmodified 1270.6881 0.68811492 995 F5GZH3;F5H866;F5GZ38;F5H1B8;F5H3M1;F5GYU9 PLEKHB1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.518 49.518 2 2.764E-05 47281 QUIQUE_DMIX3_190116_001 152.97 133.7 1112900000 79103000 72627000 87783000 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970.5699 0.56989727 3974 Q99766 ATP5S ATP synthase subunit s, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 76.043 76.043 2 0.061319 77172 QUIQUE_C1368_190116_001 47.603 20.078 58844000 0 0 58844000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42502 3974 39667 379537 482519 482519 1 TALPTSGSSAGELELLAGEVPAR Unmodified 2225.1539 0.15394104 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 2 2 2 2 1 2 2 129.68 129.68 2;3 5.1159E-87 135297 QUIQUE_C1218_190116_001 180.1 153.13 1457700000 152250000 151270000 83047000 81096000 92395000 154620000 98114000 165050000 121210000 0 70448000 118040000 170190000 42503 4654 39668 379538;379539;379540;379541;379542;379543;379544;379545;379546;379547;379548;379549;379550;379551;379552;379553;379554;379555;379556;379557 482520;482521;482522;482523;482524;482525;482526;482527;482528;482529;482530;482531;482532;482533;482534;482535;482536;482537;482538;482539;482540;482541;482542;482543;482544 482520 24 TALVANTSNMPVAAR Oxidation (M) 1530.7824 0.78242601 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.615 35.615 2 8.362E-19 30560 QUIQUE_C1368_190116_001 147.91 129.64 5528700000 300220000 361580000 338420000 296020000 338270000 283400000 285940000 417800000 510250000 387890000 751940000 589440000 667550000 42504 2414 39669 379558;379559;379560;379561;379562;379563;379564;379565;379566;379567;379568;379569;379570 482545;482546;482547;482548;482549;482550;482551;482552;482553;482554;482555;482556;482557;482558;482559;482560 482547 1828 16 TALVANTSNMPVAAR Unmodified 1514.7875 0.78751139 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.571 58.571 2 9.501E-29 58065 QUIQUE_C1218_190116_001 205.52 202.4 12854000000 1450600000 1488100000 1330900000 1113500000 917260000 911740000 1200300000 600920000 650300000 347620000 1024400000 918660000 899350000 42505 2414 39669 379571;379572;379573;379574;379575;379576;379577;379578;379579;379580;379581;379582;379583 482561;482562;482563;482564;482565;482566;482567;482568;482569;482570;482571;482572;482573;482574;482575;482576;482577;482578;482579;482580;482581;482582;482583;482584;482585 482561 25 TALVERDDFSSGTSSR Unmodified 1726.8122 0.81220581 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 39.55 39.55 2;3 0.026081 34945 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.802 41.912 52788000 0 0 0 0 0 0 0 52788000 0 0 0 0 0 42506 2463 39670 379584;379585 482586;482587 482587 2 TALYNYIFAK Unmodified 1202.6336 0.63356015 1202 H3BTB7;Q5JPH6 EARS2 Probable glutamate--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 110.34 110.34 2 0.01379 113066 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.734 39.597 47786000 0 0 0 0 0 0 0 16516000 0 7856800 0 23413000 0 42507 1202 39671 379586;379587;379588;379589 482588;482589;482590;482591 482591 4 TAMDQALQWLEDK Unmodified 1547.729 0.72899346 1983 Q6ICJ4;P0CG30;A0A087WY67;P0CG29 Em:AP000351.3;GSTT2B;GSTT2 Glutathione S-transferase theta-2B;Glutathione S-transferase theta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 148.88 148.88 2 2.3365E-22 155959 QUIQUE_DMIX5_190116_001 177.76 153.91 867900000 0 0 0 0 0 0 0 209870000 207260000 0 450770000 0 0 42508 1983 39672 379590;379591;379592;379593;379594 482592;482593;482594;482595;482596 482596 4 TAMDQALQWLEDK Oxidation (M) 1563.7239 0.72390808 1983 Q6ICJ4;P0CG30;A0A087WY67;P0CG29 Em:AP000351.3;GSTT2B;GSTT2 Glutathione S-transferase theta-2B;Glutathione S-transferase theta-2 yes no 0 1 0 1 115.22 115.22 2 0.03192 121305 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.568 31.201 56071000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56071000 0 0 42509 1983 39672 379595 482597 482597 1 TAMLLALQRPELVER Unmodified 1738.9764 0.97637479 3651 Q8NFV4 ABHD11 Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 11 yes yes 0 0 1 1 1 1 96.917 96.917 3 0.031667 99787 QUIQUE_C1277_190116_001 40.801 23.733 130020000 0 40863000 37845000 0 0 0 0 0 0 0 0 51311000 0 42510 3651 39673 379596;379597;379598 482598;482599;482600 482598 2 TAMNVNDLFLAIAK Unmodified 1519.8068 0.80684985 2708 P61020 RAB5B Ras-related protein Rab-5B yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 145.52 145.52 2;3 0.00022403 151356 QUIQUE_C1218_190116_001 115.18 100.48 1768200000 174940000 188430000 274540000 218880000 0 190360000 211110000 203030000 0 56994000 0 0 249950000 42511 2708 39674 379599;379600;379601;379602;379603;379604;379605;379606;379607;379608 482601;482602;482603;482604;482605;482606;482607;482608;482609;482610;482611 482601 9 TAMNVNEIFMAIAK Oxidation (M) 1567.7738 0.77383516 2575 P51148 RAB5C Ras-related protein Rab-5C yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 137.54 137.54 2 0.0012149 142418 QUIQUE_C1368_190116_001 79.23 65.324 345570000 57065000 47595000 55969000 45173000 0 46462000 0 0 64217000 29089000 0 0 0 42512 2575 39675 379609;379610;379611;379612;379613;379614;379615 482612;482613;482614;482615;482616;482617;482618;482619 482614 2024 7 TAMNVNEIFMAIAK Unmodified 1551.7789 0.77892054 2575 P51148 RAB5C Ras-related protein Rab-5C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 143.56 143.56 2 2.0598E-12 150612 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.86 124.89 718920000 0 0 0 0 0 0 0 0 172000000 52829000 291610000 0 202480000 42513 2575 39675 379616;379617;379618;379619 482620;482621;482622;482623 482622 2 TAMSTPHVAEPAENEQDEQDENGAEASADLR Unmodified 3311.412 0.41203559 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 1 2 67.541 67.541 3 2.4693E-64 67938 QUIQUE_DMIX5_190116_001 148.04 142.83 68329000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15794000 52534000 0 0 42514 2248 39676 379620;379621;379622 482624;482625;482626 482625 3 TANDMIHAENMR Unmodified 1401.6129 0.61291784 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 31.684 31.684 2;3 5.1751E-05 26441 QUIQUE_C1277_190116_001 136.96 125.81 2279800000 324650000 211520000 209360000 81710000 153720000 175120000 184870000 149830000 178090000 76271000 185670000 139310000 209680000 42515 2248 39677 379623;379624;379625;379626;379627;379628;379629;379630;379631;379632;379633;379634;379635;379636;379637;379638;379639;379640;379641;379642;379643;379644;379645;379646;379647 482627;482628;482629;482630;482631;482632;482633;482634;482635;482636;482637;482638;482639;482640;482641;482642;482643;482644;482645;482646;482647;482648;482649;482650;482651;482652 482630 20 TANDMIHAENMR Oxidation (M) 1417.6078 0.60783246 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 19.414 19.414 2;3 0.0050411 11172 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.343 46.972 205570000 0 0 0 48252000 0 0 0 25111000 45264000 0 57949000 0 28999000 42516 2248 39677 379648;379649;379650;379651;379652 482653;482654;482655;482656;482657 482656 1606;1607 5 TANDMIHAENMR 2 Oxidation (M) 1433.6027 0.60274709 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 2 0 1 1 10.744 10.744 3 0.015798 3060 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.568 34.604 31210000 0 0 0 0 0 0 0 13837000 0 17373000 0 0 0 42517 2248 39677 379653;379654 482658;482659 482659 1606;1607 2 TANEEEEIVHK Unmodified 1297.615 0.61500956 3359 Q6GMV2 SMYD5 SET and MYND domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 19.283 19.283 2;3 0.0058025 12038 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.727 45.451 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42518 3359 39678 379655;379656;379657;379658;379659;379660;379661 482660;482661;482662;482663;482664;482665;482666 482664 7 TANKDHLVTAYNHLFETK Unmodified 2101.0593 0.059252799 2846 Q00688 FKBP3 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP3 yes yes 0 0 1 1 57.826 57.826 4 0.039882 56154 QUIQUE_C1277_190116_001 31.753 21.965 135120000 0 135120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42519 2846 39679 379662 482667 482667 1 TAPGPATTQAGDAAR Unmodified 1383.6743 0.67425577 1550 O43761 SYNGR3 Synaptogyrin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.804 18.804 2 6.4675E-29 11678 QUIQUE_DMIX1_190116_001 161.99 152.56 3318300000 440640000 507720000 607410000 0 419080000 0 0 315760000 0 182520000 0 417670000 427540000 42520 1550 39680 379663;379664;379665;379666;379667;379668;379669;379670 482668;482669;482670;482671;482672;482673;482674;482675 482672 8 TAPSAGMQPQPSLCSSAMR Unmodified 1975.8914 0.89140089 412 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 61.862 61.862 2 4.7627E-06 60346 QUIQUE_C1368_190116_001 124.62 102.75 88521000 0 0 0 42758000 0 0 45763000 0 0 0 0 0 0 42521 412 39681 379671;379672;379673 482676;482677;482678 482676 3 TAPVTTTSAVSK Unmodified 1161.6241 0.62411768 4665 Q9Y6V0 PCLO Protein piccolo yes yes 0 0 0 1 1 1 1 18.939 18.939 2 0.017349 11535 QUIQUE_C1218_190116_001 54.784 35.469 1556800000 257910000 0 0 0 313560000 0 0 444030000 0 0 0 541290000 0 42522 4665 39682 379674;379675;379676;379677 482679;482680;482681;482682 482679 4 TAPYVVTGSVDQTVK Unmodified 1563.8144 0.81443765 2460 P43034;I3L3N5 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 62.163 62.163 2;3 2.1227E-35 62056 QUIQUE_DMIX1_190116_001 170.4 142.39 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protein sorting-associated protein VTA1 homolog yes no 0 0 2 2 1 25.212 25.212 3;4 7.709E-12 17814 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.633 80.667 191700000 0 0 0 0 0 0 0 137610000 0 0 0 0 54093000 42525 70 39685 379706;379707;379708 482723;482724;482725;482726 482726 4 TAQEVETYRR Unmodified 1251.6208 0.62076364 1290 J3KTA4;P17844;J3QRQ7;J3KRX8;J3KTQ4;J3QR02 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 14.79 14.79 3 0.00015758 7188 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.658 75.521 181960000 0 0 9143900 0 0 0 0 37713000 45509000 0 0 59370000 30225000 42526 1290 39686 379709;379710;379711;379712;379713 482727;482728;482729;482730;482731 482729 5 TAQGSLSLK Unmodified 903.50255 0.50254598 600 B3KS98;O15372;A0A087WZK9;E5RJT0;E5RGU4 EIF3H Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 22.214 22.214 2 0.025011 15516 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.597 11.423 185310000 0 0 0 68042000 0 76855000 0 0 0 40416000 0 0 0 42527 600 39687 379714;379715;379716 482732;482733;482734 482734 3 TAQLTSLAMLMLDSFYR Oxidation (M) 1975.9747 0.97471981 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 1 0 1 1 1 169.94 169.94 2 0.0053408 163871 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.314 27.904 12753000 0 0 9804100 0 0 0 0 0 0 2948900 0 0 0 42528 3003 39688 379717;379718;379719 482735;482736;482737 482737 2446 3 TAQLTSLAMLMLDSFYR Unmodified 1959.9798 0.97980519 3003 Q13496 MTM1 Myotubularin yes yes 0 0 0 1 1 2 171.93 171.93 2;3 0.00040932 179228 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.275 53.936 31317000 0 0 0 0 0 0 0 0 17387000 0 13931000 0 0 42529 3003 39688 379720;379721;379722;379723 482738;482739;482740;482741 482740 4 TAQLTSLAMLMLDSYYR Unmodified 1975.9747 0.97471981 1061 F8WA39;Q13613;H0YDX3 MTMR1 Myotubularin-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 166.53 166.53 2;3 0.0028544 169862 QUIQUE_C1403_190116_001 70.332 28.123 54709000 0 7819100 0 11232000 0 0 0 0 11656000 0 0 15655000 8346300 42530 1061 39689 379724;379725;379726;379727;379728 482742;482743;482744;482745;482746 482743 5 TAQNLSIFLGSFR Unmodified 1452.7725 0.77251325 279 H9KV28;A0A2R8Y5N1;A0A140T8Z0;A0A0G2JH68;O60610 DIAPH1 Protein diaphanous homolog 1 yes no 0 0 0 1 132.91 132.91 2 0.02072 136674 QUIQUE_C1403_190116_001 64.121 49.914 20634000 0 0 0 20634000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42531 279 39690 379729 482747 482747 1 TARPNITDNKDGTITVR Unmodified 1870.9861 0.98608786 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 2 1 31.582 31.582 4 0.034981 26632 QUIQUE_DMIX1_190116_001 24.793 15.005 37532000 0 0 0 0 0 0 0 37532000 0 0 0 0 0 42532 3061 39691 379730 482748 482748 1 TASDFITK Unmodified 881.44945 0.44944778 166 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396 GSN Gelsolin yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 30.421 30.421 1;2 0.015524 24747 QUIQUE_C1277_190116_001 84.568 56.145 10160000000 1420500000 1265700000 1681000000 233730000 1334800000 1476600000 0 1815400000 0 932490000 0 0 0 42533 166 39692 379731;379732;379733;379734;379735;379736;379737;379738;379739;379740;379741;379742;379743 482749;482750;482751;482752;482753;482754;482755;482756;482757;482758;482759;482760;482761 482751 7 TASDMVSTSR Unmodified 1053.4761 0.47607323 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.16 19.16 2 0.0039331 11744 QUIQUE_C1368_190116_001 82.645 67.863 835800000 0 122710000 111110000 0 0 91946000 93238000 62006000 72584000 0 107840000 83356000 91011000 42534 1389 39693 379744;379745;379746;379747;379748;379749;379750;379751;379752 482762;482763;482764;482765;482766;482767;482768;482769;482770 482763 7 TASEMVLADDNFSTIVAAVEEGR Unmodified 2424.1479 0.14786939 2112 P16615;H7C5W9;O14983 ATP2A2;ATP2A1 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 164.1 164.1 3 6.8661E-08 169203 QUIQUE_C1368_190116_001 75.646 67.842 228570000 0 17838000 27511000 29075000 0 21145000 26475000 21995000 42970000 0 41557000 0 0 42535 2112 39694 379753;379754;379755;379756;379757;379758;379759;379760 482771;482772;482773;482774;482775;482776;482777;482778;482779 482773 8 TASESISNLSEAGSIK Unmodified 1592.7893 0.78934511 2322 P30622;J3KP58;F5H6A0;F5H1T5 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 66.055 66.055 2 0.011186 65960 QUIQUE_C1218_190116_001 50.222 35.987 32655000 32655000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42536 2322 39695 379761 482780 482780 1 TASGSSVTSLDGTR Unmodified 1337.6423 0.64228694 3737 Q92597;E7ESM1;E5RJY1 NDRG1 Protein NDRG1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 29.097 29.097 2 2.6688E-10 23779 QUIQUE_DMIX5_190116_001 133.07 89.787 1105000000 208050000 0 0 44063000 0 0 0 0 171640000 0 248060000 214010000 219150000 42537 3737 39696 379762;379763;379764;379765;379766;379767;379768 482781;482782;482783;482784;482785;482786;482787 482784 5 TASGVNQLVDIYEK Unmodified 1535.7831 0.78313752 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.205 94.205 2 7.2461E-37 97513 QUIQUE_DMIX5_190116_001 182.71 152.1 1325900000 175410000 177770000 171630000 0 0 0 213180000 95389000 0 74250000 173930000 103840000 140530000 42538 2640 39697 379769;379770;379771;379772;379773;379774;379775;379776;379777 482788;482789;482790;482791;482792;482793;482794;482795;482796;482797;482798 482795 10 TASISIADPFFR Unmodified 1323.6823 0.68230126 1409 O00478;C9JUV8;P78410;S4R3N0 BTN3A3;BTN3A2 Butyrophilin subfamily 3 member A3;Butyrophilin subfamily 3 member A2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.07 122.07 2 0.00048712 126226 QUIQUE_C1368_190116_001 107.21 79.902 1046600000 53312000 77627000 84735000 115690000 94474000 82296000 82764000 66661000 79198000 40109000 106430000 57536000 105760000 42539 1409 39698 379778;379779;379780;379781;379782;379783;379784;379785;379786;379787;379788;379789;379790 482799;482800;482801;482802;482803;482804;482805;482806;482807;482808;482809;482810;482811;482812;482813 482801 15 TASLCQLESFK Unmodified 1282.6227 0.62273747 3304 Q5T0D9 TPRG1L Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.985 79.985 2 0.0019668 81478 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.263 67.545 453860000 0 0 66253000 62008000 71393000 0 74941000 0 0 0 50808000 59056000 69397000 42540 3304 39699 379791;379792;379793;379794;379795;379796;379797 482814;482815;482816;482817;482818;482819;482820;482821 482819 6 TASLTSAASVDGNR Unmodified 1348.6583 0.65827136 4506;169 A0A0A0MS87;G3V578;H0YJT9;Q9UN36 NDRG2 Protein NDRG2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 3 35.967 35.967 2 1.9487E-22 31952 QUIQUE_C1218_190116_001 199.08 186.29 9118900000 619780000 690530000 448770000 825370000 631750000 797140000 631050000 663030000 1026200000 265360000 593660000 630960000 1295300000 42541 169;4506 39700 379798;379799;379800;379801;379802;379803;379804;379805;379806;379807;379808;379809;379810;379811;379812;379813 482822;482823;482824;482825;482826;482827;482828;482829;482830;482831;482832;482833;482834;482835;482836;482837;482838;482839;482840;482841;482842;482843;482844;482845 482822 24 TASLTSASSVDGSR Unmodified 1337.6423 0.64228694 1191;4492 H3BQJ4;Q9ULP0 NDRG4 Protein NDRG4 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 30.211 30.211 2 6.4378E-07 24269 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.22 68.858 138330000 0 38392000 0 32630000 0 35994000 0 0 0 31317000 0 0 0 42542 1191;4492 39701 379814;379815;379816;379817;379818;379819 482846;482847;482848;482849;482850;482851 482851 5 TASNVEEAFINTAK Unmodified 1493.7362 0.73618733 2707 P61019;H7C125 RAB2A Ras-related protein Rab-2A yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.112 80.112 2;3 5.8345E-29 81395 QUIQUE_C1277_190116_001 211.46 180.24 4928000000 362390000 420640000 495710000 420270000 372930000 384670000 414870000 340740000 391210000 164400000 456480000 381240000 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A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 122.41 122.41 2 0.0013318 125074 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.423 44.055 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42562 506 39721 380049 483191 483191 1 TATVYPEPQNK Unmodified 1246.6194 0.61936665 2504 P48163 ME1 NADP-dependent malic enzyme yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.415 24.415 2 1.6574E-11 17119 QUIQUE_C1368_190116_001 159.37 112.48 577480000 0 55652000 0 60417000 0 54967000 66877000 0 176090000 82386000 0 0 81097000 42563 2504 39722 380050;380051;380052;380053;380054;380055;380056;380057;380058 483192;483193;483194;483195;483196;483197;483198;483199;483200;483201 483193 9 TAVADNLLFYLGSAK Unmodified 1581.8403 0.84025847 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 140.74 140.74 2 1.1358E-08 143931 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.64 89.107 1477800000 0 1433100000 0 0 0 0 0 44702000 0 0 0 0 0 42564 2225 39723 380059;380060 483202;483203;483204 483203 3 TAVAPIER Unmodified 855.48142 0.48141661 2038;2039;1878 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beta-4B chain;Tubulin beta-2A chain;Tubulin beta-8 chain;Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334;Tubulin beta-2B chain no no 0 0 0 18 3 19 11 3 5 23 22 5 6 12 4 5 34.456 34.456 2 3.0984E-07 30302 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.75 135.01 36132000000 3375400000 2511000000 3153900000 2658400000 3098000000 3222500000 1181100000 1245300000 2073800000 1127000000 4606900000 2895200000 4983200000 42566 1862;1922;2797;3030;3230;4044 39725 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483468 305 TAVDGPDLEMLTGQER Unmodified 1730.8145 0.814514 3062 Q14318;M0R2K9 FKBP8 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP8;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 107.86 107.86 2 3.888E-05 112027 QUIQUE_C1576_190116_001 90.731 66.439 305320000 53807000 57224000 65013000 69102000 0 60174000 0 0 0 0 0 0 0 42567 3062 39726 380209;380210;380211;380212;380213;380214;380215 483528;483529;483530;483531;483532;483533;483534 483533 7 TAVETAVLLLR Unmodified 1184.7129 0.71287311 2527 P49368;B4DUR8 CCT3 T-complex protein 1 subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.66 109.66 2 0.00045793 106992 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.52 90.854 5546800000 404420000 449730000 507080000 442590000 439560000 405550000 554910000 377510000 424140000 249880000 461910000 425820000 403650000 42568 2527 39727 380216;380217;380218;380219;380220;380221;380222;380223;380224;380225;380226;380227;380228 483535;483536;483537;483538;483539;483540;483541;483542;483543;483544;483545;483546;483547;483548;483549;483550;483551;483552;483553 483547 19 TAVGSAQLLMAQK Unmodified 1316.7122 0.71222118 1424 O14490;A8MYR7;A8MXQ8;A0A0A0MTP4 DLGAP1 Disks large-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.961 65.961 2 0.00059258 64820 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.134 60.269 364850000 35598000 37705000 39111000 34194000 32043000 45758000 0 0 26049000 0 46385000 36843000 31163000 42569 1424 39728 380229;380230;380231;380232;380233;380234;380235;380236;380237;380238 483554;483555;483556;483557;483558;483559;483560;483561;483562;483563;483564 483563 11 TAVHAGNINFK Acetyl (Protein N-term) 1212.6251 0.62512073 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RG03;E5RHV7;E5RGY6;E5RJL0;E5RIE0;E5RFM3;E5RJZ2;E5RIT8 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 55.765 55.765 2 0.00018414 53680 QUIQUE_C1368_190116_001 128.86 93.589 521300000 0 85594000 122120000 0 0 106860000 0 0 94887000 31912000 79923000 0 0 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2 65.185 65.185 2;3 0 65935 QUIQUE_C1218_190116_001 328.81 307.77 11201000000 663600000 850820000 1077700000 940340000 737780000 698540000 1047400000 739190000 1030700000 404560000 733930000 1017100000 1259300000 42583 2016;2017 39742 380313;380314;380315;380316;380317;380318;380319;380320;380321;380322;380323;380324;380325;380326;380327;380328;380329;380330;380331;380332;380333;380334;380335;380336;380337;380338;380339 483650;483651;483652;483653;483654;483655;483656;483657;483658;483659;483660;483661;483662;483663;483664;483665;483666;483667;483668;483669;483670;483671;483672;483673;483674;483675;483676;483677;483678;483679;483680;483681;483682;483683;483684;483685;483686;483687;483688;483689;483690;483691;483692 483652 43 TCDGVQCAFEELVEK Unmodified 1783.7757 0.77568565 4237 Q9NP72;A0A087X163;Q5W0J0;H0Y6T8 RAB18 Ras-related protein Rab-18 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.21 127.21 2 2.0934E-06 124052 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.77 110.24 578140000 53340000 72990000 74624000 0 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80.587 3 2.2115E-11 80475 QUIQUE_C1563_190116_001 97.284 93.68 173040000 29178000 33428000 39907000 43370000 0 27157000 0 0 0 0 0 0 0 42586 3861 39745 380364;380365;380366;380367;380368 483724;483725;483726;483727;483728;483729;483730 483730 6 TCEEHQLCVVAVLPHILDTGAAGR Unmodified 2645.3054 0.30538986 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 0 2 1 116.98 116.98 3;4 0.0029294 120551 QUIQUE_C1277_190116_001 48.115 35.186 118550000 0 42614000 0 0 0 0 75932000 0 0 0 0 0 0 42587 3109 39746 380369;380370;380371 483731;483732;483733 483731 2 TCEESSFCK Unmodified 1146.4322 0.43215951 3084 Q14697 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.857 18.857 2 0.00714 11358 QUIQUE_C1368_190116_001 82.426 71.204 931930000 89072000 128050000 114100000 106120000 85256000 121200000 108810000 0 39804000 18813000 25671000 43013000 52027000 42588 3084 39747 380372;380373;380374;380375;380376;380377;380378;380379;380380;380381;380382;380383 483734;483735;483736;483737;483738;483739;483740;483741;483742;483743;483744;483745 483736 12 TCESDTLEALLLTASERPK Unmodified 2133.0623 0.062348845 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 1 1 134.4 134.4 3 0.038963 139135 QUIQUE_C1218_190116_001 36.856 27.692 30499000 30499000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42589 4334 39748 380384 483746 483746 0 TCESLGAGGYR Unmodified 1169.5135 0.51352137 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 2 1 28.353 28.353 2 0.0017778 22868 QUIQUE_C1576_190116_001 115.7 87.481 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42590 2834 39749 380385;380386;380387;380388 483747;483748;483749;483750 483750 4 TCFETFPDK Unmodified 1143.4907 0.49066067 2016 P11216 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 55.576 55.576 2 0.00041537 51721 QUIQUE_DMIX4_190116_001 120.15 115.42 1484100000 326950000 0 0 0 334750000 310960000 0 130050000 0 95421000 0 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13 TCFSMVPALQQELDSRPQLR Oxidation (M) 2391.1675 0.16749939 3799 Q96AB3;K7EKW4;K7ENV7 ISOC2 Isochorismatase domain-containing protein 2, mitochondrial yes no 0 1 1 1 101.07 101.07 3 0.010587 106025 QUIQUE_DMIX5_190116_001 44.816 36.316 49359000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49359000 0 0 42594 3799 39752 380410 483775 483775 2736 1 TCFVSDLKR Unmodified 1124.5648 0.56482866 4337 Q9NZ32;V9GYX7;H0YJE8 ACTR10 Actin-related protein 10 yes no 0 0 1 1 32.43 32.43 3 0.028441 27681 QUIQUE_DMIX5_190116_001 40.331 28.117 57915000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57915000 0 0 42595 4337 39753 380411 483776 483776 1 TCGDVLDNLK Unmodified 1133.5387 0.53867349 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.726 62.726 2 0.0015737 58993 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.331 69.729 434220000 69451000 75714000 76870000 60231000 0 90150000 0 29330000 0 32473000 0 0 0 42596 2613 39754 380412;380413;380414;380415;380416;380417;380418 483777;483778;483779;483780;483781;483782;483783;483784 483784 5 TCGDVLDNLKGDCYQVLIEDCIPVLK Unmodified 3036.4606 0.46062945 2613 P52788 SMS Spermine synthase yes yes 0 0 1 1 1 1 154.31 154.31 3 1.4018E-10 157197 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.19 68.681 139370000 0 0 0 0 0 0 0 34475000 0 0 60123000 0 44769000 42597 2613 39755 380419;380420;380421 483785;483786;483787 483785 3 TCGFDFTGAVEDISK Unmodified 1645.7294 0.72938739 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 3 124.27 124.27 2;3 6.5575E-12 128635 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.56 121.32 6759700000 1283600000 959040000 654580000 711980000 564830000 887930000 565750000 185010000 220800000 0 0 444500000 281680000 42598 1788 39756 380422;380423;380424;380425;380426;380427;380428;380429;380430;380431;380432;380433;380434;380435;380436;380437;380438;380439;380440;380441 483788;483789;483790;483791;483792;483793;483794;483795;483796;483797;483798;483799;483800;483801;483802;483803;483804;483805;483806;483807;483808;483809;483810;483811;483812;483813;483814 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hydroxylase-interacting protein;Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.708 19.708 2 0.0036847 12872 QUIQUE_C1218_190116_001 122.13 62.487 1875200000 431210000 0 0 628140000 0 0 260510000 0 0 163200000 0 392090000 0 42609 3734;3850 39767 380521;380522;380523;380524;380525;380526 483924;483925;483926;483927;483928;483929 483924 4 TCNTMNQFVNK Unmodified 1355.5962 0.59620515 846 E7EM64;Q7L5N1 COPS6 COP9 signalosome complex subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.754 38.754 2 0.0024678 34824 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.9 86.314 166680000 0 0 0 0 0 46016000 60925000 0 0 0 59742000 0 0 42610 846 39768 380527;380528;380529;380530;380531;380532;380533;380534;380535 483930;483931;483932;483933;483934;483935;483936;483937;483938 483937 8 TCNVLVALEQQSPDIAQGVHLDR Unmodified 2562.286 0.28603463 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 130.44 130.44 4 3.986E-06 135929 QUIQUE_C1218_190116_001 64.68 55.823 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484188 1 TDDYLDQPCLETVNR Unmodified 1837.8152 0.81524228 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 3 89.343 89.343 2;3 2.2664E-94 91576 QUIQUE_C1368_190116_001 217.83 209.69 30726000000 2456200000 2912000000 2927400000 2605600000 2685200000 2300600000 2911700000 1465200000 1915000000 1003600000 2373400000 2319100000 2851100000 42648 2328 39805 380721;380722;380723;380724;380725;380726;380727;380728;380729;380730;380731;380732;380733;380734;380735;380736;380737;380738;380739;380740;380741;380742;380743;380744;380745 484189;484190;484191;484192;484193;484194;484195;484196;484197;484198;484199;484200;484201;484202;484203;484204;484205;484206;484207;484208;484209;484210;484211;484212;484213;484214;484215;484216;484217;484218;484219;484220;484221;484222;484223;484224;484225;484226;484227;484228;484229 484196 37 TDDYLDQPCYETINR Unmodified 1901.8102 0.8101569 2560 P50395;Q5SX87;Q5SX91 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes no 0 0 0 1 1 1 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484414;484415;484416;484417;484418;484419;484420;484421;484422;484423;484424;484425 484417 10 TDEGLGFNVMGGK Oxidation (M) 1339.6078 0.60781569 1456 O14910;H0YIA8;H0YI92 LIN7A Protein lin-7 homolog A yes no 0 1 0 1 63.858 63.858 2 0.021215 63425 QUIQUE_C1218_190116_001 65.933 48.463 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42657 1456 39813 380884 484426 484426 1 TDEQALLSSILAK Unmodified 1387.7559 0.75586013 3364 Q6IAA8;F5GX19;F5H3Y3;H0YFI1;F5H479 LAMTOR1 Ragulator complex protein LAMTOR1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.01 128.01 2 2.738E-23 132299 QUIQUE_DMIX3_190116_001 169.21 152.49 882860000 68006000 77002000 72123000 81167000 89342000 70884000 64877000 64642000 74073000 18717000 64852000 53180000 83995000 42658 3364 39814 380885;380886;380887;380888;380889;380890;380891;380892;380893;380894;380895;380896;380897 484427;484428;484429;484430;484431;484432;484433;484434;484435;484436;484437;484438;484439;484440;484441;484442;484443 484439 17 TDFEEFFLR Unmodified 1202.5608 0.56078914 589 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484458;484459;484460;484461;484462;484463;484464;484465;484466;484467;484468 484467 11 TDFGIFR Unmodified 854.42865 0.42865276 4223 Q9HCC0 MCCC2 Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.969 84.969 2 0.016314 86903 QUIQUE_C1576_190116_001 133.99 107.88 773850000 80324000 62563000 59223000 64638000 71816000 65680000 76316000 59468000 0 30741000 67805000 68418000 66853000 42661 4223 39817 380921;380922;380923;380924;380925;380926;380927;380928;380929;380930;380931;380932 484469;484470;484471;484472;484473;484474;484475;484476;484477;484478;484479;484480;484481;484482;484483;484484;484485 484477 17 TDFIPYR Unmodified 910.45487 0.45486751 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9;H7C0K6;A0A087WWA3;Q4R9M9;O60333 KIF1A;KIF1B;KIF1Bbeta Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 64.223 64.223 2 0.028328 63956 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484563;484564;484565;484566;484567;484568;484569;484570;484571;484572;484573;484574;484575 484566 13 TDHPEIGEGKPTPALSEEASSSSIR Unmodified 2594.246 0.24600353 3205 Q16891 IMMT MICOS complex subunit MIC60 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 53.026 53.026 3;4 7.8912E-70 51529 QUIQUE_C1218_190116_001 166.49 153.81 3619400000 434020000 564110000 450970000 503850000 351380000 324510000 372090000 50886000 133630000 239250000 0 69992000 124690000 42671 3205 39827 381016;381017;381018;381019;381020;381021;381022;381023;381024;381025;381026;381027;381028;381029;381030;381031;381032;381033;381034;381035;381036;381037 484576;484577;484578;484579;484580;484581;484582;484583;484584;484585;484586;484587;484588;484589;484590;484591;484592;484593;484594;484595;484596;484597;484598;484599;484600;484601;484602;484603;484604;484605;484606;484607;484608;484609;484610 484579 35 TDICQGALGDCWLLAAIASLTLNDTLLHR Unmodified 3210.6166 0.61655324 1921 P07384;E9PRM1;E9PJJ3;E9PLC9;E9PMC6;E9PJA6;E9PSA6;E9PQB3 CAPN1 Calpain-1 catalytic subunit yes no 0 0 0 1 175.51 175.51 3 2.8747E-38 182596 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.73 124.9 62310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62310000 0 0 42672 1921 39828 381038 484611 484611 1 TDIGDVQILSSFVR Unmodified 1548.8148 0.814772 4371 Q9P0Z9 PIPOX Peroxisomal sarcosine oxidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 141.9 141.9 2 2.1683E-17 146849 QUIQUE_DMIX3_190116_001 176.8 137.5 234930000 0 46465000 49965000 0 0 36030000 0 40477000 61994000 0 0 0 0 42673 4371 39829 381039;381040;381041;381042;381043;381044 484612;484613;484614;484615;484616;484617;484618 484618 7 TDIQCLIPCAIDQDPYFR Unmodified 2224.0293 0.029274578 2213 P23381;H0YJP3 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 149.8 149.8 2;3 8.0234E-05 154410 QUIQUE_C1277_190116_001 88.282 79.683 54441000 0 0 42376000 0 0 12064000 0 0 0 0 0 0 0 42674 2213 39830 381045;381046;381047;381048;381049;381050 484619;484620;484621;484622;484623;484624 484619 6 TDIQIALPSGCYGR Unmodified 1549.7559 0.75587691 2356 P33316;H0YNW5;H0YKC5;H0YKI0;A0A0C4DGL3;H0YMM5;H0YNJ9;H0YMP1 DUT Deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 96.098 96.098 2 0.00039004 99961 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.184 59.855 263130000 102550000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64576000 0 95998000 42675 2356 39831 381051;381052;381053 484625;484626;484627 484626 3 TDISTALK Unmodified 847.4651 0.46509784 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 33.882 33.882 2 0.0068603 29168 QUIQUE_C1277_190116_001 100.19 31.012 2502100000 446400000 446350000 310710000 0 0 0 693180000 0 227930000 0 0 0 377540000 42676 869 39832 381054;381055;381056;381057;381058;381059 484628;484629;484630;484631;484632;484633;484634 484630 7 TDITYPAGFMDVISIDK Unmodified 1884.9179 0.91791644 2757 P62701 RPS4X 40S ribosomal protein S4, X isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 149.79 149.79 2 0.0023075 156451 QUIQUE_C1438_190116_001 68.277 60.907 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42677 2757 39833 381060;381061;381062 484635;484636;484637 484636 3 TDKLDEALEDYK Unmodified 1438.6828 0.68275477 3962 Q99614;H0YB37 TTC1 Tetratricopeptide repeat protein 1 yes no 0 0 1 1 1 67.755 67.755 2 0.014692 68321 QUIQUE_C1438_190116_001 81.525 68.569 73296000 0 0 0 0 0 0 73296000 0 0 0 0 0 0 42678 3962 39834 381063;381064 484638;484639 484638 2 TDKTLVLLMGK Unmodified 1217.7053 0.70534489 1926 P07737;K7EJ44 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 70.497 70.497 2;3 0.00034216 71006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.66 98.165 724450000 0 0 0 0 0 0 0 380680000 54911000 0 90379000 141540000 56938000 + 42679 1926 39835 381065;381066;381067;381068;381069;381070;381071 484640;484641;484642;484643;484644;484645;484646;484647;484648 484641 8 TDKVFEVMLATDR Unmodified 1523.7654 0.76537896 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;F8WDT3;F8WAV5;F8WAX2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 1 1 2 1 1 3 2 2 87.92 87.92 2;3 0.00010955 89626 QUIQUE_DMIX8_190116_001 106.49 88.628 374900000 0 0 0 0 97258000 0 0 0 62170000 0 79679000 72852000 62946000 42680 150 39836 381072;381073;381074;381075;381076;381077;381078;381079;381080;381081;381082;381083 484649;484650;484651;484652;484653;484654;484655;484656;484657;484658;484659;484660;484661 484661 12 TDLAAVPASR Unmodified 999.53491 0.53490874 192 A0A0A0MT83;P26440;H7C4G6;H0YLC3;H0YKV0;H0YN10 IVD Isovaleryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.14 33.14 2 0.00023561 28245 QUIQUE_C1563_190116_001 117.89 67.186 2378100000 0 244170000 327800000 225160000 235550000 213780000 0 0 255250000 0 317810000 266120000 292430000 42681 192 39837 381084;381085;381086;381087;381088;381089;381090;381091;381092;381093;381094;381095;381096 484662;484663;484664;484665;484666;484667;484668;484669;484670;484671;484672;484673;484674 484667 12 TDLDLDGYVSGQEVK Unmodified 1637.7784 0.77844607 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.179 97.179 2 1.1091E-05 99332 QUIQUE_C1403_190116_001 95.401 76.158 153740000 0 52246000 36591000 0 0 40651000 0 0 0 24252000 0 0 0 42682 4394 39838 381097;381098;381099;381100;381101 484675;484676;484677;484678;484679 484677 5 TDLEELNLGPR Unmodified 1255.6408 0.64083038 2622 P53367 ARFIP1 Arfaptin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.684 85.684 2 0.0041938 87433 QUIQUE_C1277_190116_001 86.744 56.668 351220000 0 0 0 0 60662000 0 0 51155000 54360000 15679000 41580000 66186000 61595000 42683 2622 39839 381102;381103;381104;381105;381106;381107;381108;381109;381110;381111 484680;484681;484682;484683;484684;484685;484686;484687;484688;484689 484680 8 TDLEELSLGPR Unmodified 1228.6299 0.62993134 106 A0A087X1E4;P53365 ARFIP2 Arfaptin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 89.307 89.307 2 0.00044625 91752 QUIQUE_C1218_190116_001 104.42 60.975 165180000 78721000 86460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42684 106 39840 381112;381113;381114 484690;484691;484692 484690 3 TDLEKDIISDTSGDFR Unmodified 1810.8585 0.85848731 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;A6NMY6;H0YKS4;H0YNP5;H0YN28;H0YL33;H0YNA0;H0YN52 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 3 2 2 2 2 2 2 102.07 102.07 2;3 3.4759E-35 106403 QUIQUE_DMIX5_190116_001 172.1 140.26 3148100000 174960000 120340000 315130000 278990000 300210000 143890000 349210000 160850000 305020000 0 354820000 242270000 402410000 42685 1920 39841 381115;381116;381117;381118;381119;381120;381121;381122;381123;381124;381125;381126;381127;381128;381129;381130;381131;381132;381133;381134;381135;381136;381137 484693;484694;484695;484696;484697;484698;484699;484700;484701;484702;484703;484704;484705;484706;484707;484708;484709;484710;484711;484712;484713;484714;484715;484716;484717;484718;484719;484720 484714 23 TDLEKDIISDTSGDFRK Unmodified 1938.9535 0.95345032 1920 P07355;H0YN42;H0YMD0;H0YMU9;H0YM50;A6NMY6;H0YKS4;H0YNP5;H0YN28;H0YL33;H0YNA0;H0YN52 ANXA2;ANXA2P2 Annexin A2;Annexin;Putative annexin A2-like protein yes no 0 0 2 1 2 1 2 1 1 3 2 2 1 2 2 2 83.241 83.241 2;3;4 9.2047E-28 85408 QUIQUE_C1576_190116_001 144.5 130.34 9936100000 157150000 401710000 411960000 756960000 704760000 201710000 725480000 1055200000 1711100000 153430000 1228000000 904730000 1523900000 42686 1920 39842 381138;381139;381140;381141;381142;381143;381144;381145;381146;381147;381148;381149;381150;381151;381152;381153;381154;381155;381156;381157;381158;381159 484721;484722;484723;484724;484725;484726;484727;484728;484729;484730;484731;484732;484733;484734;484735;484736;484737;484738;484739;484740;484741;484742;484743;484744;484745 484732 22 TDLGHILDFTCR Unmodified 1446.6925 0.69254837 4556 Q9Y2I1;C9J715 NISCH Nischarin yes no 0 0 0 1 1 109.72 109.72 3 0.0022358 115024 QUIQUE_C1438_190116_001 53.001 39.883 17162000 0 0 0 0 17162000 0 0 0 0 0 0 0 0 42687 4556 39843 381160;381161 484746;484747 484746 2 TDLHAFENLEIIR Unmodified 1569.8151 0.81510635 1789 P00533;E9PFD7;Q504U8;A0A1W2PRR9 EGFR Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 111.84 111.84 3 0.00064982 109221 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.227 45.144 34760000 0 25828000 0 0 0 0 0 0 0 8931600 0 0 0 42688 1789 39844 381162;381163;381164;381165;381166 484748;484749;484750;484751;484752 484752 5 TDLLEEK Unmodified 846.43346 0.43346336 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 0 1 1 1 30.308 30.308 2 0.024263 25230 QUIQUE_C1368_190116_001 98.418 0 292270000 0 0 130840000 0 0 0 0 0 0 0 0 77246000 84186000 42689 3063 39845 381167;381168;381169 484753;484754;484755 484753 3 TDLLIVLSDVEGLFDSPPGSDDAK Unmodified 2502.2377 0.23773025 2650 P54886 ALDH18A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase;Glutamate 5-kinase;Gamma-glutamyl phosphate reductase yes yes 0 0 0 1 175.73 175.73 2 0.049005 182822 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.823 41.718 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42690 2650 39846 381170 484756 484756 1 TDLLLEPYNK Unmodified 1204.634 0.63395408 2378 P35579 MYH9 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kinase M-type, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 124.21 124.21 3 0.0079624 127100 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.482 34.206 52800000 0 0 0 0 0 0 0 52800000 0 0 0 0 0 42693 1905 39849 381188 484781 484781 0 TDLNNLEMAIK Unmodified 1260.6384 0.63838754 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 92.596 92.596 2 0.039226 94412 QUIQUE_C1403_190116_001 47.732 29.507 25935000 0 0 0 25935000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42694 3597 39850 381189 484782 484782 1 TDLNNLEMAIKEDQIADNFQGISGPK Unmodified 2860.3913 0.39128756 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 138.51 138.51 3 8.5712E-12 143493 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83.934 71.969 283500000 0 0 0 35921000 0 0 0 103090000 0 0 65570000 0 78923000 42695 3597 39851 381190;381191;381192;381193 484783;484784;484785;484786;484787 484787 5 TDLNPDNLQGGDDLDPNYVLSSR Unmodified 2517.1619 0.16193955 2044 P12277;G3V4N7;G3V461 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 5 4 2 4 3 3 2 3 124.73 124.73 2;3 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44 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 159.66 159.66 2;3 1.0575E-10 162070 QUIQUE_DMIX1_190116_001 129.93 118.46 210680000 20350000 23039000 0 0 84990000 33708000 0 48592000 0 0 0 0 0 42698 3277 39854 381236;381237;381238;381239;381240;381241;381242;381243 484876;484877;484878;484879;484880;484881;484882;484883 484882 7 TDLSNVQELLQFVK Unmodified 1632.8723 0.87228688 3624 Q8NBL1 POGLUT1 Protein O-glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 157.38 157.38 2 0.00017478 160893 QUIQUE_C1403_190116_001 101.93 76.543 13445000 0 0 0 13445000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42699 3624 39855 381244 484884 484884 0 TDLSYLCSR Unmodified 1113.5125 0.51245874 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 60.402 60.402 2 0.018828 59887 QUIQUE_C1368_190116_001 64.04 47.837 26393000 0 0 26393000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42700 550 39856 381245 484885 484885 1 TDLVAVWDVALSDGVHK Acetyl (Protein N-term) 1865.9523 0.95232811 714 C9JDZ2;Q9NVQ4 FAIM Fas apoptotic inhibitory 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1 78.808 78.808 2 0.0043396 80171 QUIQUE_C1368_190116_001 71.451 35.069 731480000 0 158930000 161560000 0 110540000 0 0 120810000 0 0 179640000 0 0 42717 2499 39869 381405;381406;381407;381408;381409 485101;485102;485103;485104;485105;485106 485102 1930 6 TDPTTLTDEEINR Unmodified 1503.7053 0.70528113 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 63.3 63.3 2 7.0825E-13 62506 QUIQUE_C1368_190116_001 155.11 136.51 1553300000 152530000 117080000 136660000 141220000 150060000 119570000 156250000 91966000 57602000 49321000 115800000 115670000 149580000 42718 1005;2027 39870 381410;381411;381412;381413;381414;381415;381416;381417;381418;381419;381420;381421;381422;381423 485107;485108;485109;485110;485111;485112;485113;485114;485115;485116;485117;485118;485119;485120;485121;485122;485123;485124;485125;485126 485110 20 TDPVPEEGEDVAATISATETLSEEEQEELRR Unmodified 3429.5907 0.59071146 2667 P55327;H0YC42;E5RFR7;H0YC44 TPD52 Tumor protein D52 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.4 143.4 3 2.3153E-25 147897 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.517 77.132 995360000 76304000 103950000 0 79737000 68275000 58972000 97175000 109440000 64533000 41979000 85712000 73668000 135620000 42719 2667 39871 381424;381425;381426;381427;381428;381429;381430;381431;381432;381433;381434;381435;381436 485127;485128;485129;485130;485131;485132;485133;485134;485135;485136;485137;485138;485139;485140;485141;485142;485143;485144;485145;485146;485147 485142 21 TDPVPVTIALDSLSWLLLR Unmodified 2108.1881 0.18814171 1248 I3L1Q3;Q8TE02;I3L2A9;I3L2T0;I3L3N8;I3L437;I3NI50;I3L200 ELP5 Elongator complex protein 5 yes no 0 0 0 1 179.66 179.66 3 0.0075167 186412 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.824 22.701 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TDQFPLFLIIMGK Unmodified 1521.8265 0.82652266 4513 Q9UNN5;B3KT28;B1ANM7 FAF1 FAS-associated factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 168.89 168.89 2 0.00059734 173504 QUIQUE_C1218_190116_001 98.048 78.262 177590000 16743000 19167000 0 14932000 25687000 28873000 32603000 29434000 0 10150000 0 0 0 42723 4513 39875 381454;381455;381456;381457;381458;381459;381460;381461 485169;485170;485171;485172;485173;485174;485175;485176;485177 485169 5 TDQVIQSLIALVNDPQPEHPLR Unmodified 2482.318 0.31798668 2793 P68036;A0A1B0GUS4 UBE2L3 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3 yes no 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 1 2 1 2 2 3 151.64 151.64 2;3;4 1.5658E-66 154597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.7 166.9 12090000000 922100000 983370000 840730000 825930000 803790000 1073600000 1000200000 884640000 1207700000 437070000 1115700000 1147000000 847950000 42724 2793 39876 381462;381463;381464;381465;381466;381467;381468;381469;381470;381471;381472;381473;381474;381475;381476;381477;381478;381479;381480;381481;381482;381483;381484;381485;381486;381487;381488 485178;485179;485180;485181;485182;485183;485184;485185;485186;485187;485188;485189;485190;485191;485192;485193;485194;485195;485196;485197;485198;485199;485200;485201;485202;485203;485204;485205;485206;485207;485208;485209 485197 31 TDRPLPENPYHSR Unmodified 1580.7696 0.76955314 2600 P51970 NDUFA8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 yes yes 0 0 1 2 3 2 2 2 1 2 1 1 1 2 1 1 22.89 22.89 2;3;4 0.00025376 16305 QUIQUE_C1218_190116_001 83.877 77.148 3256500000 267520000 577770000 322030000 289460000 246920000 217750000 386020000 81514000 165600000 78943000 258600000 175970000 188440000 42725 2600 39877 381489;381490;381491;381492;381493;381494;381495;381496;381497;381498;381499;381500;381501;381502;381503;381504;381505;381506;381507;381508;381509 485210;485211;485212;485213;485214;485215;485216;485217;485218;485219;485220;485221;485222;485223;485224;485225;485226;485227;485228;485229;485230;485231;485232;485233;485234 485210 23 TDSAPDQQVETGK Unmodified 1374.6263 0.62630252 3315 Q5T5U3;E7ESW5;F8W9U9;A0A1B0GV73 ARHGAP21 Rho GTPase-activating protein 21 yes no 0 0 0 1 1 18.353 18.353 2 0.0021831 10741 QUIQUE_C1403_190116_001 74.944 50.169 40332000 17310000 0 0 23022000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42726 3315 39878 381510;381511 485235;485236 485236 2 TDSDSDLQLYK Unmodified 1283.5881 0.5881261 2854 Q01433;H0Y360;H0YCL9;E9PIJ1 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.96 54.96 2 6.6384E-05 53145 QUIQUE_C1277_190116_001 135.71 105.14 787010000 101770000 93734000 70954000 71149000 0 69688000 72292000 59332000 63702000 0 72513000 59200000 52677000 42727 2854 39879 381512;381513;381514;381515;381516;381517;381518;381519;381520;381521;381522 485237;485238;485239;485240;485241;485242;485243;485244;485245;485246;485247;485248 485238 11 TDSDSDLQLYKEQGEGQGDR Unmodified 2239.9829 0.98291255 2854 Q01433;H0Y360;H0YCL9 AMPD2 AMP deaminase 2 yes no 0 0 1 1 51.247 51.247 3 0.00013705 48547 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.168 53.078 32392000 0 0 0 0 0 0 0 32392000 0 0 0 0 0 42728 2854 39880 381523 485249 485249 1 TDSEIALLEGLTVVYK Unmodified 1749.94 0.94003209 1034 F8VVA7;P61923;F8VXB1;F8W156;F8VYZ4;F8VXR1;F8VYE0 COPZ1 Coatomer subunit zeta-1 yes no 0 0 0 1 155.2 155.2 2 0.032641 150288 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.822 40.69 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42729 1034 39881 381524 485250 485250 1 TDSLTGEDSLLDCSLLSNPTTDLLEEFAPTAISAPVHK Unmodified 4056.9725 0.97253737 3212 Q2M2I8 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 170.28 170.28 3 1.9663E-16 173767 QUIQUE_C1277_190116_001 72.879 68.604 69480000 0 15205000 18604000 18563000 17108000 0 0 0 0 0 0 0 0 42730 3212 39882 381525;381526;381527;381528 485251;485252;485253;485254 485251 4 TDSQLEDLGYCVFNK Unmodified 1787.8036 0.80361496 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 121.79 121.79 2;3 1.2381E-18 125662 QUIQUE_C1403_190116_001 170.52 152.25 1912800000 194820000 0 309540000 214740000 222720000 311560000 162870000 134580000 0 0 217150000 144850000 0 42731 2009 39883 381529;381530;381531;381532;381533;381534;381535;381536;381537;381538 485255;485256;485257;485258;485259;485260;485261;485262;485263;485264;485265;485266 485257 7 TDSQSEAVAIQAIR Unmodified 1487.758 0.7579854 1036 J3KNM6;F8VVT9;Q99490 AGAP2 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 65.414 65.414 2 0.0036235 66052 QUIQUE_C1438_190116_001 78.908 63.018 272630000 24877000 41823000 36828000 57212000 42950000 0 49213000 0 0 0 19729000 0 0 42732 1036 39884 381539;381540;381541;381542;381543;381544;381545;381546 485267;485268;485269;485270;485271;485272;485273;485274 485271 8 TDSREDEISPPPPNPVVK Unmodified 1975.9851 0.9850848 2002 P10644;K7EPB2;K7EIE5;K7EID3;K7EJ40;K7EK41;K7EMU2;K7EMZ6 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 53.1 53.1 2;3 3.0869E-13 50602 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.87 98.471 385030000 0 0 0 0 0 0 100770000 132520000 72760000 0 0 78980000 0 42733 2002 39885 381547;381548;381549;381550;381551;381552;381553 485275;485276;485277;485278;485279;485280;485281 485280 7 TDSTSDGRPAWMR Oxidation (M) 1494.6521 0.65214012 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 1 1 22.462 22.462 3 0.028839 16046 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.189 29.38 51059000 0 0 0 0 0 0 0 0 51059000 0 0 0 0 42734 3053 39886 381554 485282 485282 1 TDTAADGETTATEELEK Unmodified 1780.785 0.78504759 560;298 A8K968;A0A0J9YWE1;A0A0J9YWN0 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 57.032 57.032 2 2.0066E-12 54566 QUIQUE_DMIX8_190116_001 149.69 133.32 336290000 0 0 0 47781000 0 0 0 120600000 0 46207000 0 40174000 81529000 42735 560;298 39887 381555;381556;381557;381558;381559;381560 485283;485284;485285;485286;485287;485288 485288 6 TDTEDEHSHHVMDSVR Unmodified 1893.7912 0.7911528 3566 Q8N0Z6 TTC5 Tetratricopeptide repeat protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 15.711 15.711 4 0.010921 8388 QUIQUE_C1218_190116_001 36.112 30.738 51616000 12332000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20641000 0 18643000 42736 3566 39888 381561;381562;381563 485289;485290;485291 485289 3 TDTESELDLISR Unmodified 1377.6624 0.66235368 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.64 85.64 2 1.1168E-54 87272 QUIQUE_C1277_190116_001 209.1 148.12 1767600000 0 165440000 209420000 157240000 0 169090000 0 187270000 189730000 80255000 203780000 172840000 232590000 42737 1005;2027 39889 381564;381565;381566;381567;381568;381569;381570;381571;381572;381573;381574;381575;381576 485292;485293;485294;485295;485296;485297;485298;485299;485300;485301;485302;485303;485304;485305;485306 485293 14 TDTGTESKPQGVIR Unmodified 1487.758 0.7579854 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 18.024 18.024 2;3 1.1114E-16 10818 QUIQUE_C1218_190116_001 162.26 121.54 543640000 100720000 77841000 60640000 16034000 23204000 0 60828000 20479000 56713000 16287000 18438000 0 92457000 42738 1255;2856 39890 381577;381578;381579;381580;381581;381582;381583;381584;381585;381586;381587;381588;381589;381590;381591 485307;485308;485309;485310;485311;485312;485313;485314;485315;485316;485317;485318;485319;485320;485321 485308 14 TDTLEDLFPTTK Unmodified 1379.682 0.68202649 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.91 114.91 2 5.6996E-20 119577 QUIQUE_C1218_190116_001 169.93 150.66 1762600000 160040000 177880000 163950000 145980000 181520000 159690000 168030000 81476000 109890000 75050000 127870000 108120000 103100000 42739 2051 39891 381592;381593;381594;381595;381596;381597;381598;381599;381600;381601;381602;381603;381604 485322;485323;485324;485325;485326;485327;485328;485329;485330;485331;485332;485333;485334;485335;485336;485337;485338;485339;485340;485341;485342;485343;485344;485345;485346;485347;485348;485349;485350;485351;485352;485353;485354;485355;485356;485357;485358;485359 485323 38 TDTLLYSVLPPSVANELR Unmodified 1987.0626 0.062606842 2867 Q02153;E9PCN2;B7Z685 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 153.3 153.3 2;3 0.00028067 159477 QUIQUE_C1576_190116_001 114.87 102.51 219480000 26567000 0 31275000 0 50458000 43771000 38377000 0 29029000 0 0 0 0 42740 2867 39892 381605;381606;381607;381608;381609;381610;381611;381612 485360;485361;485362;485363;485364;485365;485366;485367;485368 485367 8 TDTSHHDQDHPTFNK Unmodified 1778.7608 0.76083895 1799;4 A0A024R6I7;A0A0G2JRN3;G3V544;G3V5R8;G3V387;A0A0B4J278;P01009 SERPINA1 Alpha-1-antitrypsin;Short peptide from AAT no no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 1 10.276 10.276 3;4 8.0409E-186 2597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 268.41 256.49 522400000 11649000 216710000 0 0 0 200420000 0 25415000 22574000 32865000 0 12764000 0 42741 4;1799 39893 381613;381614;381615;381616;381617;381618;381619;381620;381621 485369;485370;485371;485372;485373;485374;485375;485376;485377 485374 9 TDTVFSNSSNR Acetyl (Protein N-term) 1268.5633 0.56330834 4558 Q9Y2J0;F8VP47;F8VNU2;F8VZS2;F8VR41;F8W131;F8VV58;F8W1A3;F8VNW3;F8VNP7;F8VVK8;F8W1K7;F8W045;F8W116;F8VRJ1 RPH3A Rabphilin-3A yes no 1 0 0 1 1 1 65.96 65.96 2 0.0019523 65180 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.643 63.885 69186000 0 17239000 0 25322000 0 0 0 26625000 0 0 0 0 0 42742 4558 39894 381622;381623;381624 485378;485379;485380 485380 2 TDTVLILCR Unmodified 1089.5852 0.58522975 4212 Q9HB71 CACYBP Calcyclin-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.33 73.33 2 0.0023082 74423 QUIQUE_C1438_190116_001 110.12 64.099 1474100000 154850000 0 125490000 170400000 138750000 146250000 153700000 0 105450000 85697000 129810000 128830000 134860000 42743 4212 39895 381625;381626;381627;381628;381629;381630;381631;381632;381633;381634;381635 485381;485382;485383;485384;485385;485386;485387;485388;485389;485390;485391 485384 9 TDTYVTDNGDGTYR Unmodified 1576.6641 0.66414459 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 42.572 42.572 2 4.2031E-08 39379 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.57 121.47 85467000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48300000 0 0 37167000 42744 3061 39896 381636;381637;381638 485392;485393;485394 485392 3 TDVAAPFGGFK Unmodified 1108.5553 0.55530983 1665 O75891 ALDH1L1 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.297 81.297 2 0.00088553 82267 QUIQUE_C1277_190116_001 93.467 63.994 2168300000 183290000 174370000 377040000 200010000 0 323280000 0 255240000 0 66862000 334230000 253920000 0 42745 1665 39897 381639;381640;381641;381642;381643;381644;381645;381646;381647 485395;485396;485397;485398;485399;485400;485401;485402;485403;485404 485396 9 TDVAAPFGGVK Unmodified 1060.5553 0.55530983 3228 Q3SY69 ALDH1L2 Mitochondrial 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 56.438 56.438 2 0.017777 55194 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.104 40.254 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42746 3228 39898 381648 485405 485405 1 TDVCVFAAQEDLETMQAFAQVFNK Unmodified 2761.2728 0.27275233 3437 Q7L1Q6;C9IZ80;C9JFN4;C9J188;C9JWF5 BZW1 Basic leucine zipper and W2 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 170.2 170.2 3 0.00406 175174 QUIQUE_C1368_190116_001 34.217 30.937 13897000 0 0 13897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42747 3437 39899 381649 485406 485406 1 TDVFQSLR Unmodified 964.49779 0.49779495 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 67.451 67.451 2 0.014365 66392 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.095 25.123 245260000 0 0 0 0 0 0 0 245260000 0 0 0 0 0 42748 882 39900 381650 485407 485407 1 TDVLILPEEVEWIK Unmodified 1682.9131 0.91308906 4336 Q9NZ08 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.36 150.36 2 0.0036235 155545 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.908 21.416 311990000 0 44065000 70617000 0 39003000 36723000 0 17407000 35349000 13688000 27058000 28075000 0 42749 4336 39901 381651;381652;381653;381654;381655;381656;381657;381658;381659 485408;485409;485410;485411;485412;485413;485414;485415;485416;485417 485413 9 TDVNKIEEFLEEVLCPPK Unmodified 2159.082 0.082021655 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 168.51 168.51 2;3 4.9703E-122 173734 QUIQUE_C1576_190116_001 174.59 156.53 5604900000 113900000 492530000 520060000 259150000 348210000 271170000 95011000 709540000 132970000 36836000 1027100000 177570000 1420800000 42750 4646 39902 381660;381661;381662;381663;381664;381665;381666;381667;381668;381669;381670;381671;381672;381673;381674;381675 485418;485419;485420;485421;485422;485423;485424;485425;485426;485427;485428;485429;485430;485431;485432;485433;485434;485435 485426 17 TDWLDGK Unmodified 833.39193 0.3919329 2310 P30405;E9PKY5;E9PEQ6;Q9UNP9 PPIF;PPIE Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase E yes no 0 0 0 1 1 52.109 52.109 2 0.021502 49616 QUIQUE_DMIX3_190116_001 104.76 71.793 212120000 0 0 0 0 0 0 0 0 149290000 62833000 0 0 0 42751 2310 39903 381676;381677 485436;485437 485436 2 TDYIPLLDVDEK Unmodified 1419.7133 0.71332662 880 E7EVA0;P27816;H7C456;A0A0J9YVV8;A0A0J9YW37 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 123.16 123.16 2 0.029237 125790 QUIQUE_C1563_190116_001 49.5 29.714 104270000 0 0 0 0 0 104270000 0 0 0 0 0 0 0 42752 880 39904 381678 485438 485438 1 TDYMVGSYGPR Unmodified 1244.5496 0.54957253 1293 J3KTF8;J3QQX2;P52565;J3KRE2 ARHGDIA Rho GDP-dissociation inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 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TDYNASVSVPDSSGPER Unmodified 1779.7911 0.79113602 2735;3319 P61978;Q5T6W2 HNRNPK Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 57.682 57.682 2;3 8.0735E-75 56618 QUIQUE_C1277_190116_001 197.36 185.2 13243000000 996440000 1185800000 1067400000 1056200000 1088400000 1332400000 1041500000 813200000 1013900000 483330000 1308700000 1134000000 721300000 42755 2735;3319 39906 381702;381703;381704;381705;381706;381707;381708;381709;381710;381711;381712;381713;381714;381715;381716 485468;485469;485470;485471;485472;485473;485474;485475;485476;485477;485478;485479;485480;485481;485482;485483;485484;485485;485486;485487;485488;485489;485490;485491;485492;485493;485494;485495 485471 28 TDYNLCNGK Unmodified 1083.4655 0.46550855 4494;981;1236 F1T0E5;Q9ULU8;H7C4T6 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 24.445 24.445 2 0.0091527 17527 QUIQUE_DMIX4_190116_001 76.774 47.625 10711000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10711000 0 0 0 42756 981;4494;1236 39907 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381817;381818;381819;381820;381821;381822;381823;381824;381825;381826;381827 485614;485615;485616;485617;485618;485619;485620;485621;485622;485623;485624 485615 11 TEALYYTDDTAMAR Unmodified 1619.7137 0.71373732 4321 Q9NX46 ADPRHL2 Poly(ADP-ribose) glycohydrolase ARH3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 73.475 73.475 2 0.00025234 73897 QUIQUE_C1403_190116_001 97.214 80.836 194550000 0 0 0 46672000 23274000 0 0 0 50988000 0 0 36179000 37434000 42767 4321 39918 381828;381829;381830;381831;381832 485625;485626;485627;485628;485629 485625 2 TEAPAAPAAQETK Unmodified 1283.6357 0.635745 2817 P80723 BASP1 Brain acid soluble protein 1 yes yes 0 0 0 1 18.936 18.936 2 0.02887 11466 QUIQUE_C1218_190116_001 47.559 27.782 15830000 15830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42768 2817 39919 381833 485630 485630 1 TEAPSATGQASSLLGGR Unmodified 1601.8009 0.80091285 2419 P39060;H7BXV5 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.915 65.915 2 1.5624E-16 65324 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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22 TEGCHIYLSEDALDCEIVSAK Unmodified 2409.0828 0.082826291 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 102.86 102.86 3 1.42E-07 105815 QUIQUE_C1368_190116_001 70.453 62.461 301130000 42571000 38882000 49386000 46389000 32098000 31533000 60269000 0 0 0 0 0 0 42817 2422 39968 382108;382109;382110;382111;382112;382113;382114 485935;485936;485937;485938;485939;485940;485941;485942 485937 6 TEGDGVYTLNDK Unmodified 1310.599 0.59902514 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;P00739;J3KRH2 HP;HPR Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain;Haptoglobin-related protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.408 43.408 2 8.2266E-06 39198 QUIQUE_DMIX4_190116_001 148.56 127.09 927150000 0 94574000 52579000 0 217340000 94423000 0 0 47443000 208830000 107870000 0 104100000 42818 1793 39969 382115;382116;382117;382118;382119;382120;382121;382122;382123 485943;485944;485945;485946;485947;485948;485949;485950;485951 485949 8 TEGDGVYTLNDKK Unmodified 1438.694 0.69398816 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;P00739;J3KRH2 HP;HPR Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain;Haptoglobin-related protein no no 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 1 25.621 25.621 2;3 7.9417E-13 18252 QUIQUE_DMIX8_190116_001 157.97 133.75 1100800000 0 156900000 0 0 142110000 26600000 0 63037000 49764000 244640000 260610000 0 157110000 42819 1793 39970 382124;382125;382126;382127;382128;382129;382130;382131;382132;382133;382134 485952;485953;485954;485955;485956;485957;485958;485959;485960;485961;485962;485963;485964 485964 12 TEGDGVYTLNNEK Unmodified 1438.6576 0.65760265 1793 P00738;J3QLC9;H3BS21;J3KRH2;J3KSV1;J3QQI8;H3BMJ7 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.447 41.447 2 5.5641E-41 37862 QUIQUE_DMIX5_190116_001 187.16 158.66 3076400000 23424000 513760000 82358000 39831000 527280000 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77.299 77.299 2 3.5516E-05 78001 QUIQUE_C1368_190116_001 102.03 90.163 243260000 53285000 57876000 50971000 0 35005000 0 46127000 0 0 0 0 0 0 42828 2263 39979 382215;382216;382217;382218;382219;382220 486067;486068;486069;486070;486071;486072 486069 3 TEHAEFLHCK Unmodified 1270.5765 0.57645598 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 15.213 15.213 2;3 0.00067832 8026 QUIQUE_C1218_190116_001 73.841 58.464 300860000 63165000 0 0 113660000 0 20578000 0 0 0 0 0 103460000 0 42829 2569 39980 382221;382222;382223;382224 486073;486074;486075;486076 486073 3 TEHALLEGFNIR Unmodified 1398.7256 0.72556306 4139 Q9H267;A0A2R8YDQ0;F5H008 VPS33B Vacuolar protein sorting-associated protein 33B yes no 0 0 0 1 80.287 80.287 3 0.026675 81921 QUIQUE_C1368_190116_001 37.94 22.4 33270000 0 0 33270000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42830 4139 39981 382225 486077 486077 1 TEHINIHQLR Unmodified 1259.6735 0.67346791 2072 P14317;E7EVW7 HCLS1 Hematopoietic lineage cell-specific protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 20.389 20.389 2;3 0.001386 13156 QUIQUE_C1403_190116_001 70.441 41.733 932970000 0 51799000 90831000 156380000 92642000 54890000 59366000 0 0 0 247740000 0 179310000 42831 2072 39982 382226;382227;382228;382229;382230;382231;382232;382233;382234 486078;486079;486080;486081;486082;486083;486084;486085;486086;486087 486080 10 TEHPFTVEEFVLPK Unmodified 1671.8508 0.85082315 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 105.14 105.14 2;3 7.1392E-07 109459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 124.6 104.94 2690000000 192250000 241670000 215460000 165140000 349980000 99177000 145090000 46592000 177210000 64519000 430050000 179980000 382900000 42832 1802 39983 382235;382236;382237;382238;382239;382240;382241;382242;382243;382244;382245;382246;382247;382248;382249;382250;382251;382252;382253;382254;382255;382256;382257;382258 486088;486089;486090;486091;486092;486093;486094;486095;486096;486097;486098;486099;486100;486101;486102;486103;486104;486105;486106;486107;486108;486109;486110;486111;486112;486113;486114;486115;486116;486117;486118;486119;486120 486114 31 TEIEDFPR Unmodified 1005.4767 0.47672516 1185 H3BS10;H3BP20;P06865;H3BU85;H3BTD4 HEXA Beta-hexosaminidase;Beta-hexosaminidase subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 53.708 53.708 2 0.031022 52550 QUIQUE_C1218_190116_001 66.429 32.691 74021000 23986000 0 0 0 28406000 0 21629000 0 0 0 0 0 0 42833 1185 39984 382259;382260;382261 486121;486122;486123 486121 3 TEIGVLLR Unmodified 899.54402 0.54401687 3182 Q16566;D6REY7;D6RE65 CAMK4 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV yes no 0 0 0 1 1 1 70.783 70.783 2 0.042451 70613 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.981 31.844 65531000 0 29108000 0 0 0 18783000 0 0 0 0 0 17641000 0 42834 3182 39985 382262;382263;382264 486124;486125;486126 486126 3 TEIIILATR Unmodified 1028.623 0.62299547 2214 P23396;E9PL09;E9PPU1;H0YEU2;F2Z2S8;H0YCJ7;H0YF32;E9PQ96;E9PJH4;E9PK82 RPS3 40S ribosomal protein S3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.28 78.28 2 0.00010272 79225 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.73 113.23 1313600000 74094000 102460000 123740000 98642000 75610000 97559000 95457000 137680000 116060000 43125000 123200000 123050000 102930000 42835 2214 39986 382265;382266;382267;382268;382269;382270;382271;382272;382273;382274;382275;382276;382277 486127;486128;486129;486130;486131;486132;486133;486134;486135;486136;486137;486138;486139;486140;486141;486142 486136 16 TEIIPDRDGSDPYQEPK Unmodified 1958.9222 0.92215019 3953 Q99447;I3L1L9;I3L3V9 PCYT2 Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 1 1 55.016 55.016 3 0.030114 54228 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.083 28.141 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42836 3953 39987 382278 486143 486143 1 TEILPPFFK Unmodified 1090.6063 0.60628277 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.35 117.35 2 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486156;486157;486158;486159;486160;486161;486162;486163;486164;486165;486166;486167;486168;486169;486170;486171;486172;486173;486174;486175;486176;486177;486178;486179;486180;486181;486182;486183;486184 486157 29 TEIPFEFPLHLK Unmodified 1469.7919 0.79185171 562 A8MTY9;O14972 DSCR3 Down syndrome critical region protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.89 123.89 3 0.00013382 128334 QUIQUE_C1368_190116_001 100.93 74.399 632560000 55751000 58660000 59228000 48180000 44634000 53333000 51278000 42718000 40100000 21865000 59278000 41139000 56397000 42839 562 39990 382312;382313;382314;382315;382316;382317;382318;382319;382320;382321;382322;382323;382324 486185;486186;486187;486188;486189;486190;486191;486192;486193;486194;486195;486196;486197;486198 486187 14 TEIQTLFK Unmodified 978.5386 0.53859714 268 A0A0D9SF70;G5E9L0;Q8N6H7;E9PQP3;E9PMU9;E9PIY6;E9PMR9;E9PM63;H0YDX1;E9PJT7;E9PK28;E9PN48;E9PNY8;E9PM18 ARFGAP2 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 70.888 70.888 2 0.032564 72063 QUIQUE_C1218_190116_001 65.252 17.404 90397000 31535000 23724000 35137000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42840 268 39991 382325;382326;382327 486199;486200;486201 486199 3 TEISFRPNDPK Unmodified 1302.6568 0.65681479 1873 P05026;V9GYR2 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.574 32.574 2 0.0024807 28828 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.01 92.238 7241900000 0 815140000 0 870510000 683180000 516290000 872470000 554570000 641390000 0 953980000 585400000 749020000 42841 1873 39992 382328;382329;382330;382331;382332;382333;382334;382335;382336;382337 486202;486203;486204;486205;486206;486207;486208;486209;486210;486211 486207 9 TEIVFTGEKEQLAQAVAR Unmodified 1989.0531 0.053104788 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394;H7C0A4 HDLBP Vigilin yes no 0 0 1 1 1 83.14 83.14 3 1.1167E-17 83581 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.34 103.48 31767000 0 0 0 0 0 0 0 31767000 0 0 0 0 0 42842 2 39993 382338;382339 486212;486213 486212 2 TEIVNPLR Unmodified 940.53418 0.53418046 4253 Q9NQC7;J3KRR7;H3BS09 CYLD Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD yes no 0 0 0 1 1 1 1 51.213 51.213 2 0.043406 49538 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.116 57.569 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42843 4253 39994 382340;382341;382342;382343 486214;486215;486216;486217 486216 4 TEIVQLLLQHMAHPDAATTNGYTPLHISAR Unmodified 3297.6928 0.69282973 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 135.29 135.29 4;5 1.006E-08 139600 QUIQUE_C1277_190116_001 59.65 51.486 1607600000 76166000 169150000 54355000 98912000 191310000 52527000 114830000 188300000 125040000 58079000 355600000 0 123310000 42844 1255;2856 39995 382344;382345;382346;382347;382348;382349;382350;382351;382352;382353;382354;382355;382356;382357;382358;382359 486218;486219;486220;486221;486222;486223;486224;486225;486226;486227;486228;486229;486230;486231;486232;486233;486234;486235;486236 486221 19 TEIVTTWQLR Unmodified 1245.6717 0.67173657 4712 no no 0 0 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486239;486240;486241;486242;486243;486244;486245;486246;486247;486248;486249;486250;486251;486252;486253;486254;486255;486256 486256 18 TELAEPIAIRPTSETVMYPAYAK Oxidation (M) 2566.2989 0.29889072 1929 P07814 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 1 1 1 1 1 1 95.424 95.424 3 4.0102E-06 97606 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.086 60.626 213870000 0 40793000 0 0 0 0 0 52583000 0 0 0 63181000 57309000 42848 1929 39998 382374;382375;382376;382377 486257;486258;486259;486260 486260 1156 4 TELATYPGIIVSNICPGPVQSNIVENSLAGEVTK Unmodified 3569.8287 0.82871409 4581 Q9Y394;A0A087X0Z7;H0YJ66;H0YJR8 DHRS7 Dehydrogenase/reductase SDR family member 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 155.91 155.91 3 1.0988E-51 161286 QUIQUE_C1368_190116_001 118.86 113.81 176150000 0 0 47221000 0 0 52827000 40428000 35676000 0 0 0 0 0 42849 4581 39999 382378;382379;382380;382381 486261;486262;486263;486264;486265;486266 486261 6 TELDAHFENLLAR Unmodified 1527.7682 0.76815616 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382467;382468;382469;382470;382471;382472;382473;382474;382475;382476;382477;382478;382479;382480 486384;486385;486386;486387;486388;486389;486390;486391;486392;486393;486394;486395;486396;486397;486398 486385 14 TELLTEVASVR Unmodified 1216.6663 0.66631685 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.006 86.006 2 0.00050204 87149 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.66 47.464 481000000 45938000 0 52121000 41797000 0 46935000 61188000 50854000 0 15203000 61115000 48623000 57226000 42858 1255;2856 40008 382481;382482;382483;382484;382485;382486;382487;382488;382489;382490 486399;486400;486401;486402;486403;486404;486405;486406;486407;486408 486404 10 TELNQTIQELEETLK Unmodified 1787.9153 0.9152739 3523 Q86YM7;Q86YM6 HOMER1 Homer protein homolog 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 148.97 148.97 2;3 3.5544E-79 153304 QUIQUE_C1277_190116_001 209.64 184.79 811160000 95398000 66526000 87271000 80459000 63300000 60631000 80102000 0 52727000 0 72402000 65112000 87237000 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382690;382691;382692;382693;382694;382695;382696;382697;382698;382699;382700;382701;382702;382703;382704;382705;382706;382707;382708;382709;382710;382711 486629;486630;486631;486632;486633;486634;486635;486636;486637;486638;486639;486640;486641;486642;486643;486644;486645;486646;486647;486648;486649;486650 486635 22 TENPLILIDEVDK Unmodified 1497.7926 0.79263957 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.65 130.65 2 0.00040916 134897 QUIQUE_C1403_190116_001 107.97 86.503 715070000 94044000 0 77390000 86514000 61134000 80404000 66765000 0 68057000 41927000 54416000 0 84425000 42880 1324 40030 382712;382713;382714;382715;382716;382717;382718;382719;382720;382721 486651;486652;486653;486654;486655;486656;486657;486658;486659;486660;486661;486662 486655 10 TENPLILIDEVDKIGR Unmodified 1823.9993 0.9992783 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 137.55 137.55 3 0.00050501 140272 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486685;486686;486687;486688;486689;486690;486691;486692;486693;486694 486690 9 TEPILESPLQR Unmodified 1281.6929 0.69286595 4473 Q9UKE5 TNIK TRAF2 and NCK-interacting protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 75.914 75.914 2 0.0071608 76501 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.347 39.961 48056000 0 0 0 0 0 0 0 23900000 0 0 0 0 24156000 42887 4473 40037 382752;382753 486695;486696 486695 2 TEPQWVPVSWVY Unmodified 1489.7242 0.72416608 159 B4DZ84;D3DX48;A0A0A0MRU0;A0A0D9SFF8;D3DX49;A0A0C4DH75;Q14168 MPP2 MAGUK p55 subfamily member 2 yes no 0 0 0 1 163.31 163.31 2 0.049493 168059 QUIQUE_C1218_190116_001 44.719 37.866 38031000 38031000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42888 159 40038 382754 486697 486697 1 TEPSLVVPGIDLPK Unmodified 1463.8235 0.82354577 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.04 118.04 2 0.00022089 122565 QUIQUE_C1277_190116_001 95.477 84.38 1716500000 233840000 157120000 146140000 197330000 188400000 206670000 88544000 111250000 86213000 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beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 1 0 0 1 1 58.129 58.129 2 0.023464 57995 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.833 46.389 94489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54175000 0 40314000 42897 2787 40047 382829;382830 486802;486803 486802 2 TEQQTADQLLAR Unmodified 1372.6947 0.69465686 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 54.596 54.596 2 7.2345E-05 49890 QUIQUE_DMIX4_190116_001 123.75 93.582 31026000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31026000 0 0 0 42898 2008 40048 382831 486804;486805 486805 2 TEQSVALLEQK Unmodified 1244.6612 0.66123147 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 48.927 48.927 2 0.0067611 47274 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.719 15.268 77739000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77739000 0 0 42899 1187 40049 382832 486806 486806 1 TEQSVTPEQQK Unmodified 1273.615 0.61500956 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 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20.654 2 0.009581 13328 QUIQUE_C1563_190116_001 74.841 49.267 160220000 0 48475000 0 38830000 0 48102000 0 0 0 24817000 0 0 0 42935 4186 40082 383063;383064;383065;383066 487090;487091;487092;487093 487092 4 TEVVDSDGSVKDK Unmodified 1377.6624 0.66235368 4186 Q9H845 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 15.804 15.804 2;3 0.00021543 8049 QUIQUE_DMIX7_190116_001 104.79 76.068 41558000 0 0 24736000 0 0 0 0 16823000 0 0 0 0 0 42936 4186 40083 383067;383068;383069;383070;383071;383072 487094;487095;487096;487097;487098;487099 487098 6 TEWETAAPAVAETPDIK Acetyl (Protein N-term) 1869.8996 0.89962384 1370 M0R0F0;M0R0R2;P46782;M0QZN2 RPS5 40S ribosomal protein S5;40S ribosomal protein S5, N-terminally processed yes no 1 0 0 1 1 1 128.26 128.26 2 1.29E-05 132317 QUIQUE_C1277_190116_001 100.22 85.021 260920000 0 85045000 0 100620000 75260000 0 0 0 0 0 0 0 0 42937 1370 40084 383073;383074;383075 487100;487101;487102 487100 3 TEWLDGK Unmodified 847.40758 0.40758296 2772 P62937;P0DN26;A0A0H2UH34;A0A0B4J2A2;A0A075B767;A0A075B759;Q9Y536;F5H284;P0DN37 PPIA;PPIAL4C;PPIAL4E;PPIAL4A;PPIAL4D Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4A/B/C;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A-like 4D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 40.623 40.623 2 0.019342 37465 QUIQUE_C1277_190116_001 114.72 94.874 20986000000 1983600000 1966500000 2159800000 1269700000 1822100000 1345400000 1442000000 1673900000 1610600000 894370000 1964000000 1573200000 1281300000 42938 2772 40085 383076;383077;383078;383079;383080;383081;383082;383083;383084;383085;383086;383087;383088;383089 487103;487104;487105;487106;487107;487108;487109;487110;487111;487112;487113;487114;487115;487116;487117;487118;487119;487120;487121;487122;487123;487124;487125;487126;487127;487128;487129 487106 27 TEWLDGKHVVFGK Unmodified 1514.7882 0.78816332 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 0 1 2 1 63.192 63.192 2;3 0.0055922 63033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.375 50.89 145570000 0 0 0 0 0 0 0 115820000 0 0 0 0 29746000 42939 2772 40086 383090;383091;383092 487130;487131;487132 487130 3 TEYLSNADER Unmodified 1196.5309 0.53094558 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.694 28.694 2 0.00014691 23372 QUIQUE_C1576_190116_001 122.13 104.62 1523000000 0 0 201740000 0 130430000 161620000 130560000 0 245220000 122630000 273510000 257290000 0 42940 3053 40087 383093;383094;383095;383096;383097;383098;383099;383100 487133;487134;487135;487136;487137;487138;487139;487140 487136 7 TEYSVAVQTAVK Unmodified 1294.6769 0.67688153 3734 Q92561;E5RHN5 PHYHIP Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 53.531 53.531 2 0.0074536 52517 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1535.7905 0.79053108 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 128.82 128.82 2;3 0.00032245 132808 QUIQUE_C1277_190116_001 78.505 71.889 3414900000 287130000 348760000 33674000 351590000 356560000 344950000 351360000 152690000 237710000 18291000 408790000 305870000 217540000 42945 2007 40092 383149;383150;383151;383152;383153;383154;383155;383156;383157;383158;383159;383160;383161;383162;383163;383164;383165;383166;383167;383168;383169;383170;383171;383172;383173 487200;487201;487202;487203;487204;487205;487206;487207;487208;487209;487210;487211;487212;487213;487214;487215;487216;487217;487218;487219;487220;487221;487222;487223;487224;487225;487226;487227;487228;487229;487230 487204 27 TFAPEEISAMVLTK Oxidation (M) 1551.7854 0.7854457 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 1 0 1 1 1 1 106.46 106.46 2 0.005201 111456 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.563 42.243 210120000 0 0 36959000 0 57178000 0 40332000 0 0 0 75647000 0 0 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carrier family 2, facilitated glucose transporter member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 87.2 87.2 2 0.00029763 88777 QUIQUE_C1403_190116_001 115.7 82.056 123990000 0 29180000 22946000 24482000 28520000 0 0 0 0 0 0 18858000 0 42955 2011 40101 383244;383245;383246;383247;383248 487318;487319;487320;487321;487322 487320 5 TFDHYCEYR Unmodified 1289.5135 0.51352137 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 32.585 32.585 3 0.0042928 28563 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.518 57.197 297680000 0 0 123340000 0 0 38937000 0 28143000 41518000 0 65737000 0 0 42956 3053 40102 383249;383250;383251;383252;383253 487323;487324;487325;487326;487327 487325 5 TFDLYANVRPCVSIEGYK Unmodified 2131.0408 0.040825542 2558 P50213;H0YLI6;H0YMU3;H0YKD0 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 1 1 3 2 2 1 2 1 2 2 2 111.22 111.22 2;3 3.6415E-121 114525 QUIQUE_C1277_190116_001 242.07 209.91 1519900000 147970000 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S;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 1 1 1 1 124.82 124.82 3 7.1283E-06 128808 QUIQUE_DMIX7_190116_001 86.546 79.897 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42959 2987 40105 383281;383282;383283 487362;487363;487364 487363 3 TFDQLTPDESK Unmodified 1279.5932 0.59321148 3128 Q15293 RCN1 Reticulocalbin-1 yes yes 0 0 0 1 51.586 51.586 2 0.027582 49864 QUIQUE_C1218_190116_001 68.49 51.465 89885000 89885000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42960 3128 40106 383284 487365 487365 0 TFDQLTPDESKER Unmodified 1564.7369 0.73691561 3128 Q15293 RCN1 Reticulocalbin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.143 39.143 2 0.00042399 35414 QUIQUE_C1277_190116_001 109.39 82.875 176770000 0 0 0 0 31338000 0 25266000 0 24760000 0 31837000 27341000 36226000 42961 3128 40107 383285;383286;383287;383288;383289;383290;383291;383292;383293;383294 487366;487367;487368;487369;487370;487371;487372;487373;487374;487375;487376 487366 11 TFDQLTPEESKER Unmodified 1578.7526 0.75256567 1557 O43852 CALU Calumenin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 37.293 37.293 3 0.01676 33026 QUIQUE_C1368_190116_001 40.552 33.144 216210000 0 38112000 51929000 0 0 0 58442000 0 0 0 67729000 0 0 42962 1557 40108 383295;383296;383297;383298 487377;487378;487379;487380 487378 3 TFDSIVMDPK Unmodified 1151.5533 0.55326092 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 76.093 76.093 2 0.019032 76313 QUIQUE_C1277_190116_001 74.173 56.787 132290000 38406000 0 0 0 0 0 39759000 0 0 22582000 31540000 0 0 42963 2059 40109 383299;383300;383301;383302;383303 487381;487382;487383;487384;487385 487382 5 TFDTFCPLGPALVTK Unmodified 1665.8436 0.84362928 3860;3380 Q6P2I3;Q96GK7 FAHD2B;FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B;Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.12 125.12 2 1.4503E-05 129700 QUIQUE_C1368_190116_001 122.55 104.49 1039700000 106790000 136020000 167110000 107600000 138440000 131240000 0 0 0 0 118770000 133690000 0 42964 3380;3860 40110 383304;383305;383306;383307;383308;383309;383310;383311;383312 487386;487387;487388;487389;487390;487391;487392;487393;487394;487395;487396 487388 8 TFDTNGDGTIDFR Unmodified 1457.6423 0.64228694 2407 P37235;E9PC71 HPCAL1 Hippocalcin-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 83.786 83.786 2 0.019763 84990 QUIQUE_C1277_190116_001 64.439 46.971 149670000 31751000 31286000 0 31026000 0 0 0 0 0 0 0 23844000 31765000 42965 2407 40111 383313;383314;383315;383316;383317 487397;487398;487399;487400;487401 487398 2 TFDTNSDGTIDFR Unmodified 1487.6529 0.65285163 2826 P84074 HPCA Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 83.022 83.022 2 0.00048761 85123 QUIQUE_C1576_190116_001 99.283 71.954 233440000 63895000 38489000 0 0 0 34108000 32779000 0 0 0 0 36520000 27653000 42966 2826 40112 383318;383319;383320;383321;383322;383323;383324;383325 487402;487403;487404;487405;487406;487407;487408;487409 487405 7 TFEDISEK Unmodified 967.44984 0.44984171 2513 P48637;A0A2R8Y430;A0A2R8Y5T7;A0A2R8Y6Q7;A0A2R8Y7I7 GSS Glutathione synthetase yes no 0 0 0 1 33.91 33.91 2 0.06321 27756 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.482 35.54 52299000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52299000 0 0 0 42967 2513 40113 383326 487410 487410 1 TFEEDPAVGAIVLTGGDK Unmodified 1817.9047 0.90470922 2305 P30084 ECHS1 Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 111.99 111.99 2 1.1384E-23 116619 QUIQUE_C1368_190116_001 146.96 133.3 290520000 0 0 290520000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42968 2305 40114 383327 487411 487411 1 TFEGIDPK Unmodified 905.44945 0.44944778 2560;3300 P50395;Q5SX87;Q5SX86 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta no no 0 0 0 1 2 1 1 38.973 38.973 1;2 0.030086 35311 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.277 42.279 657560000 0 0 0 0 40278000 0 0 440360000 56960000 119960000 0 0 0 42969 2560;3300 40115 383328;383329;383330;383331;383332 487412;487413;487414;487415;487416 487413 2 TFEGVDPQTTSMR Oxidation (M) 1483.6613 0.66130782 2328 P31150 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes yes 0 1 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487435;487436;487437;487438;487439;487440;487441;487442;487443;487444;487445;487446;487447;487448;487449;487450;487451;487452;487453;487454;487455;487456;487457;487458;487459;487460;487461;487462;487463;487464;487465;487466;487467;487468;487469;487470;487471;487472;487473;487474;487475;487476;487477;487478;487479;487480;487481;487482;487483;487484;487485;487486;487487 487478 53 TFEHVTSEIGAEEAEEVGVEHLLR Unmodified 2680.298 0.2980391 2589 P51665;H3BNT7;H3BTM8 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 3 1 2 2 2 118.56 118.56 3;4 2.3852E-19 123027 QUIQUE_C1368_190116_001 113.59 108.12 1378500000 65935000 111790000 80165000 137530000 50690000 123390000 54342000 136240000 126660000 21327000 164930000 148980000 156560000 42972 2589 40117 383358;383359;383360;383361;383362;383363;383364;383365;383366;383367;383368;383369;383370;383371;383372;383373;383374;383375;383376;383377;383378;383379;383380 487488;487489;487490;487491;487492;487493;487494;487495;487496;487497;487498;487499;487500;487501;487502;487503;487504;487505;487506;487507;487508;487509;487510;487511;487512;487513;487514;487515 487493 26 TFEINPR Unmodified 875.45012 0.45011648 2079 P14625;H0YIV0;Q58FF3 HSP90B1;HSP90B2P Endoplasmin;Putative endoplasmin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.779 38.779 2 0.019293 35929 QUIQUE_C1218_190116_001 114.02 56.559 3298200000 253270000 306470000 240170000 235480000 290580000 251740000 259660000 212490000 226250000 94515000 382070000 260980000 284570000 42973 2079 40118 383381;383382;383383;383384;383385;383386;383387;383388;383389;383390;383391;383392;383393 487516;487517;487518;487519;487520;487521;487522;487523;487524;487525;487526;487527;487528;487529;487530;487531;487532;487533;487534;487535;487536;487537;487538;487539;487540;487541;487542;487543;487544;487545 487516 30 TFELISVIK Unmodified 1048.6168 0.61684746 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 112.55 112.55 2 0.0075275 117396 QUIQUE_C1218_190116_001 90.657 72.621 96906000 22187000 20601000 19269000 18719000 0 16130000 0 0 0 0 0 0 0 42974 2217 40119 383394;383395;383396;383397;383398;383399 487546;487547;487548;487549;487550;487551 487546 6 TFEMSDFIVDTR Unmodified 1459.6653 0.66533057 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 127.86 127.86 2 0.0011262 130643 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.83 94.239 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42975 1628 40120 383400;383401;383402 487552;487553;487554 487552 3 TFESLVDFSK Unmodified 1171.5761 0.57610486 913 E9PF18;Q16836;A0A0A0MSE2;A0A0D9SFP2;A0A1W2PNM1;A0A1W2PQV5;A0A1W2PQ78;A0A1W2PQC2;A0A1W2PRT2 HADH Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.01 105.01 1;2 8.7997E-19 108311 QUIQUE_C1368_190116_001 242.08 167.95 2789700000 280360000 295160000 357400000 260510000 263320000 296160000 288150000 257150000 300850000 108170000 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487626;487627;487628;487629;487630;487631;487632;487633;487634;487635;487636;487637;487638;487639;487640;487641;487642;487643;487644;487645;487646;487647;487648;487649;487650;487651;487652;487653;487654;487655;487656;487657;487658;487659;487660;487661;487662;487663;487664;487665;487666;487667;487668;487669;487670;487671 487662 46 TFFPEEISSMVLTK Oxidation (M) 1643.8117 0.81166045 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 1 0 2 1 2 1 1 3 2 2 2 3 123.09 123.09 2;3 0.00038292 127552 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.764 69.559 1944600000 0 115900000 26995000 101020000 24053000 0 0 37835000 445160000 152240000 296030000 339730000 405670000 42982 2643 40126 383476;383477;383478;383479;383480;383481;383482;383483;383484;383485;383486;383487;383488;383489;383490;383491;383492;383493;383494 487672;487673;487674;487675;487676;487677;487678;487679;487680;487681;487682;487683;487684;487685;487686;487687;487688;487689;487690;487691;487692 487690 2087 18 TFGCGSAIASSSLATEWVK Unmodified 1970.9408 0.94077715 599 F5H5N2;B4DNC9;B3KQ30;Q9H1K1 ISCU Iron-sulfur cluster assembly enzyme ISCU, mitochondrial yes no 0 0 0 1 120.04 120.04 2 0.0010702 124388 QUIQUE_C1218_190116_001 62.68 47.478 32994000 32994000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42983 599 40127 383495 487693 487693 1 TFGENYVQELLEK Unmodified 1568.7722 0.77223848 1695 O94903;E5RFX7;E5RG77 PROSC Proline synthase co-transcribed bacterial homolog protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.8 135.8 2 2.9362E-07 140965 QUIQUE_C1368_190116_001 152.69 127.31 3221100000 252270000 206470000 250860000 213700000 220930000 224400000 240750000 241540000 258130000 81982000 429210000 280550000 320270000 42984 1695 40128 383496;383497;383498;383499;383500;383501;383502;383503;383504;383505;383506;383507;383508 487694;487695;487696;487697;487698;487699;487700;487701;487702;487703;487704;487705;487706 487696 8 TFGETHPFTK Unmodified 1163.5611 0.56112349 1977 P09960 LTA4H Leukotriene A-4 hydrolase yes yes 0 0 0 1 1 28.893 28.893 2 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487762;487763;487764;487765;487766;487767;487768;487769;487770;487771;487772;487773;487774;487775;487776;487777;487778;487779;487780;487781;487782;487783;487784;487785;487786;487787 487768 26 TFHIFYQLLSGAGEHLK Unmodified 1960.0207 0.020682448 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 121.39 121.39 3;4 9.7937E-05 127067 QUIQUE_C1438_190116_001 65.716 56.897 266410000 0 42585000 70971000 0 29082000 0 0 32868000 29531000 0 61378000 0 0 42992 2379 40136 383566;383567;383568;383569;383570;383571;383572;383573 487788;487789;487790;487791;487792;487793;487794;487795 487792 8 TFHIFYYLLSGAGEHLK Unmodified 1995.0254 0.025433475 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 2 132.72 132.72 3;4 0.00033248 137874 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.225 59.424 171050000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47601000 123440000 0 42993 2378 40137 383574;383575;383576;383577 487796;487797;487798;487799 487799 4 TFIAIKPDGVQR Unmodified 1343.7561 0.75613491 3222;2092 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2123.922 0.92201554 2213 P23381;G3V3H8;G3V3Y5 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 1 0 3 1 151.21 151.21 2 4.8481E-05 158052 QUIQUE_C1368_190116_001 95.631 83.071 106740000 0 0 93013000 0 0 0 0 13726000 0 0 0 0 0 42995 2213 40139 383608;383609;383610;383611 487841;487842;487843;487844 487842 1574;1575 3 TFIFSDLDYMGMSSGFYK Unmodified 2107.9271 0.92710092 2213 P23381;G3V3H8;G3V3Y5 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 0 0 1 1 161.26 161.26 2 1.7552E-05 166750 QUIQUE_C1368_190116_001 125.61 97.251 68631000 0 0 39909000 0 0 0 0 28722000 0 0 0 0 0 42996 2213 40139 383612;383613 487845;487846 487845 2 TFIFSDLDYMGMSSGFYK 2 Oxidation (M) 2139.9169 0.91693016 2213 P23381;G3V3H8;G3V3Y5 WARS Tryptophan--tRNA ligase, cytoplasmic;T1-TrpRS;T2-TrpRS yes no 0 2 0 1 138.73 138.73 2 0.00033005 134798 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.314 75.182 18125000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18125000 0 0 0 42997 2213 40139 383614 487847 487847 1574;1575 1 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488105 462 TFNLPLLMLGGGGYTIR Unmodified 1821.9811 0.98112582 3754 Q92769 HDAC2 Histone deacetylase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 161.62 161.62 2 0.00016528 166822 QUIQUE_C1368_190116_001 105.78 71.898 134490000 22664000 0 28619000 0 0 0 0 34691000 24592000 0 23926000 0 0 43019 3754 40160 384075;384076;384077;384078;384079;384080 488587;488588;488589;488590;488591;488592;488593 488589 7 TFNMDEYVGLPR Oxidation (M) 1456.6657 0.66566492 2484;3685 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;D6RB13;D6R917;Q8TDQ7 GNPDA1;GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase;Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 no no 0 1 0 1 1 81.742 81.742 2 0.043579 83831 QUIQUE_C1218_190116_001 60.518 38.949 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43020 2484;3685 40161 384081;384082 488594;488595 488594 2 TFNMDEYVGLPR Unmodified 1440.6708 0.6707503 2484;3685 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8;D6RB13;D6R917;Q8TDQ7 GNPDA1;GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase;Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 112.51 112.51 2 8.8011E-05 116008 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.85 102.52 503280000 0 162930000 0 0 0 0 0 150260000 0 0 190090000 0 0 43021 2484;3685 40161 384083;384084;384085;384086;384087;384088;384089;384090;384091;384092 488596;488597;488598;488599;488600;488601;488602;488603;488604;488605;488606;488607 488603 12 TFNTSTGGLLLPSDTK Unmodified 1650.8465 0.84646606 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.795 91.795 2 8.8912E-08 95116 QUIQUE_C1438_190116_001 148.96 131.49 1181400000 177800000 150770000 172080000 127570000 104260000 148920000 123350000 0 0 84074000 92580000 0 0 43022 2050 40162 384093;384094;384095;384096;384097;384098;384099;384100;384101 488608;488609;488610;488611;488612;488613;488614;488615;488616;488617 488613 10 TFNTSTGGLLLPSDTKR Unmodified 1806.9476 0.94757708 2050 P12956;B1AHC9 XRCC6 X-ray repair cross-complementing protein 6 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 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P02671 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes yes 0 1 0 1 155.83 155.83 2 0.0038686 160727 QUIQUE_DMIX8_190116_001 53.3 34.478 43122000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43122000 43027 1823 40166 384149 488666 488666 1045 1 TFPLDVGSIVGYSGQK Unmodified 1666.8566 0.85663681 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 132.75 132.75 2 0.00042508 137741 QUIQUE_C1368_190116_001 94.725 83.37 171320000 0 0 64901000 42695000 63727000 0 0 0 0 0 0 0 0 43028 2503 40167 384150;384151;384152 488667;488668;488669;488670 488667 4 TFPTVNPSTGEVICQVAEGDKEDVDK Unmodified 2834.328 0.3280186 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 107.69 107.69 2;3 4.0919E-57 111312 QUIQUE_C1277_190116_001 154.69 148.04 6703900000 725390000 588690000 873050000 620110000 513320000 676440000 591250000 266860000 292430000 187420000 453900000 356410000 558600000 43029 1875 40168 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489153;489154;489155;489156;489157;489158;489159;489160;489161;489162;489163;489164;489165;489166;489167;489168;489169;489170;489171;489172;489173;489174;489175;489176;489177;489178;489179;489180;489181;489182;489183;489184;489185;489186;489187;489188;489189;489190;489191;489192;489193;489194;489195;489196;489197;489198;489199;489200;489201;489202;489203;489204;489205;489206 489203 53 TFVNITPAEVGVLVGKDR Unmodified 1914.0575 0.057461884 1926 P07737;I3L3D5 PFN1 Profilin-1 yes no 0 0 1 1 119.53 119.53 3 0.00021076 122731 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.758 76.7 904790000 0 0 0 0 0 0 0 904790000 0 0 0 0 0 + 43070 1926 40207 384556 489207;489208;489209 489208 3 TFVQEDIYDEFVER Unmodified 1788.8206 0.82064524 1875 P05091;S4R3S4 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 4 2 2 134.74 134.74 2;3 1.3159E-100 140136 QUIQUE_C1218_190116_001 224.82 210.66 15435000000 1230100000 1203400000 1845800000 1114800000 937210000 1136000000 1093900000 1104200000 1149400000 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0.53940177 4207 Q9HAV0;H7C5J5 GNB4 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.689 23.689 2 0.00049693 17750 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.4 94.686 3823200000 298350000 300750000 463710000 392280000 281130000 339960000 360990000 301810000 285790000 186230000 0 254400000 357780000 43074 4207 40211 384604;384605;384606;384607;384608;384609;384610;384611;384612;384613;384614;384615 489334;489335;489336;489337;489338;489339;489340;489341;489342;489343;489344;489345 489341 12 TFVSQASATMQQYAQR Unmodified 1815.8574 0.85738187 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 1 2 2 103.37 103.37 2;3 7.0308E-07 107662 QUIQUE_C1218_190116_001 149.49 125.74 920180000 114650000 150210000 60659000 114010000 0 48471000 50140000 58007000 69873000 13742000 0 133380000 107030000 43075 3597 40212 384616;384617;384618;384619;384620;384621;384622;384623;384624;384625;384626;384627;384628;384629;384630;384631 489346;489347;489348;489349;489350;489351;489352;489353;489354;489355;489356;489357;489358;489359;489360;489361;489362;489363 489346 16 TFVVQGFGNVGLHSMR Oxidation (M) 1763.8777 0.87772338 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 83.367 83.367 2;3 1.7689E-13 84473 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.62 120.6 9264800000 151190000 622640000 1000000000 653340000 780160000 665370000 145110000 1396400000 1234600000 720530000 1235100000 323840000 336430000 43076 1777 40213 384632;384633;384634;384635;384636;384637;384638;384639;384640;384641;384642;384643;384644;384645;384646;384647;384648;384649;384650;384651;384652;384653;384654 489364;489365;489366;489367;489368;489369;489370;489371;489372;489373;489374;489375;489376;489377;489378;489379;489380;489381;489382;489383;489384;489385;489386;489387;489388;489389;489390;489391;489392;489393;489394;489395;489396 489382 978 32 TFVVQGFGNVGLHSMR Unmodified 1747.8828 0.88280876 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 2 3 4 2 3 2 4 2 2 2 4 3 5 96.607 96.607 2;3 5.9554E-46 99977 QUIQUE_C1218_190116_001 186.58 171.32 25454000000 1834200000 1671100000 2225800000 1619000000 2004600000 1594100000 1708100000 2353400000 1686100000 453780000 3670700000 2276400000 2357000000 43077 1777 40213 384655;384656;384657;384658;384659;384660;384661;384662;384663;384664;384665;384666;384667;384668;384669;384670;384671;384672;384673;384674;384675;384676;384677;384678;384679;384680;384681;384682;384683;384684;384685;384686;384687;384688;384689;384690;384691;384692 489397;489398;489399;489400;489401;489402;489403;489404;489405;489406;489407;489408;489409;489410;489411;489412;489413;489414;489415;489416;489417;489418;489419;489420;489421;489422;489423;489424;489425;489426;489427;489428;489429;489430;489431;489432;489433;489434;489435;489436;489437;489438;489439;489440;489441;489442;489443;489444;489445;489446;489447;489448;489449;489450;489451;489452;489453;489454;489455;489456;489457;489458;489459;489460;489461;489462;489463;489464;489465;489466;489467;489468;489469;489470;489471;489472;489473;489474;489475;489476 489399 77 TFYEPGEEITYSCK Unmodified 1722.7447 0.7447031 1831 P02749;J3QRN2 APOH Beta-2-glycoprotein 1 yes no 0 0 0 1 82.814 82.814 2 0.0031642 84796 QUIQUE_C1277_190116_001 69.451 33.13 50779000 0 50779000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43078 1831 40214 384693 489477 489477 1 TFYEPGEEITYSCKPGYVSR Unmodified 2382.0838 0.083812569 1831 P02749;J3QRN2 APOH Beta-2-glycoprotein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 82.536 82.536 3 0.0014323 83967 QUIQUE_C1368_190116_001 55.206 46.606 329850000 0 69147000 67422000 38542000 45372000 0 0 0 0 0 47506000 61858000 0 43079 1831 40215 384694;384695;384696;384697;384698;384699 489478;489479;489480;489481;489482;489483 489479 5 TFYGLHQDFPSVVLVGLGK Unmodified 2076.1044 0.10441208 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 1 1 136.48 136.48 2;3 9.8597E-86 142861 QUIQUE_DMIX5_190116_001 216.39 196.29 6537300000 406120000 379260000 714110000 557210000 486200000 465240000 352580000 687060000 487910000 224090000 910030000 426970000 440510000 43080 2282 40216 384700;384701;384702;384703;384704;384705;384706;384707;384708;384709;384710;384711;384712;384713;384714;384715;384716;384717;384718;384719;384720;384721 489484;489485;489486;489487;489488;489489;489490;489491;489492;489493;489494;489495;489496;489497;489498;489499;489500;489501;489502;489503;489504;489505;489506;489507;489508;489509;489510;489511;489512;489513;489514;489515;489516;489517;489518;489519;489520;489521;489522;489523 489517 40 TFYSCTTEGR Unmodified 1220.5132 0.51318702 1833 P02751 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes yes 0 0 0 1 1 32.074 32.074 2 0.012155 27481 QUIQUE_C1438_190116_001 66.27 57.348 51173000 0 0 0 20854000 30319000 0 0 0 0 0 0 0 0 43081 1833 40217 384722;384723 489524;489525;489526 489526 3 TGAAPIIDVVR Unmodified 1110.6397 0.63970816 943 E9PJD9;E9PLL6;P46776;E9PLX7 RPL27A 60S ribosomal protein L27a yes no 0 0 0 1 1 70.433 70.433 2 0.016843 70101 QUIQUE_C1403_190116_001 56.404 38.496 56390000 0 0 0 56390000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43082 943 40218 384724;384725 489527;489528 489528 2 TGAEGAVLDEAK Unmodified 1159.5721 0.57208211 2355;1568;2946 P33176;O60282;A0A0G2JMZ6;Q12840;J3KNA1 KIF5B;KIF5C;KIF5A Kinesin-1 heavy chain;Kinesin heavy chain isoform 5C;Kinesin heavy chain isoform 5A;Kinesin-like protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 36.908 36.908 2 0.00032134 32689 QUIQUE_C1403_190116_001 115.18 63.321 1055500000 0 0 0 354050000 246320000 0 0 0 0 110920000 344180000 0 0 43083 2355;1568;2946 40219 384726;384727;384728;384729;384730;384731;384732;384733;384734 489529;489530;489531;489532;489533;489534;489535;489536;489537;489538 489530 10 TGAFSIPVIQIVYETLK Unmodified 1878.0503 0.050251242 3726 Q92499 DDX1 ATP-dependent RNA helicase DDX1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 1 171.05 171.05 2;3 1.1605E-13 174562 QUIQUE_C1277_190116_001 106.6 94.08 1534400000 211010000 80472000 480920000 0 276410000 57389000 0 0 165460000 3074500 0 259620000 0 43084 3726 40220 384735;384736;384737;384738;384739;384740;384741;384742;384743;384744;384745;384746 489539;489540;489541;489542;489543;489544;489545;489546;489547;489548;489549;489550 489540 10 TGAFSIPVIQIVYETLKDQQEGK Unmodified 2563.3534 0.35336913 3726 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TGAIVDVPVGEELLGR Unmodified 1623.8832 0.88318591 2243;1351 K7ERX7;K7EQH4;P25705;K7EK77;K7EJP1 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 2 2 2 123.7 123.7 2;3 3.4152E-24 129171 QUIQUE_C1576_190116_001 150.06 131.31 57079000000 5150900000 4440600000 5512300000 3374700000 4118600000 4413100000 5043700000 3545300000 5411200000 2021400000 5138700000 4886100000 4022800000 43088 1351;2243 40224 384760;384761;384762;384763;384764;384765;384766;384767;384768;384769;384770;384771;384772;384773;384774;384775;384776;384777;384778;384779;384780;384781;384782;384783;384784;384785;384786;384787 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Phospholipase A-2-activating protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 79.856 79.856 2 5.1002E-23 81702 QUIQUE_C1218_190116_001 153.54 136.51 415490000 77508000 0 0 73835000 52947000 57768000 49651000 0 51652000 0 0 52132000 0 43101 4541 40237 384902;384903;384904;384905;384906;384907;384908;384909;384910;384911;384912 489794;489795;489796;489797;489798;489799;489800;489801;489802;489803;489804;489805 489794 11 TGDLLEVQQPVDLGALR Unmodified 1822.9789 0.97887721 1450 O14841 OPLAH 5-oxoprolinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.33 127.33 2 7.1318E-30 130033 QUIQUE_C1563_190116_001 150.06 100.56 519920000 48308000 46055000 61679000 0 37233000 46171000 39572000 47591000 53267000 0 61283000 32435000 46322000 43102 1450 40238 384913;384914;384915;384916;384917;384918;384919;384920;384921;384922;384923 489806;489807;489808;489809;489810;489811;489812;489813;489814;489815;489816;489817;489818 489810 13 TGDLPAFGECVGIASK Unmodified 1620.7818 0.78175731 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 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489930;489931;489932;489933;489934;489935;489936;489937;489938;489939;489940;489941;489942;489943 489940 2455 12 TGEMSGPVFTDSGIHIILR Unmodified 2029.0303 0.030260856 3008 Q13526;K7EN45 PIN1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 2 118.88 118.88 2;3 3.8267E-36 122647 QUIQUE_C1277_190116_001 167.98 139.22 2521500000 259630000 314040000 174820000 133880000 165620000 119370000 174380000 282960000 104570000 72186000 286890000 163000000 270170000 43117 3008 40251 385026;385027;385028;385029;385030;385031;385032;385033;385034;385035;385036;385037;385038;385039;385040;385041;385042;385043;385044;385045 489944;489945;489946;489947;489948;489949;489950;489951;489952;489953;489954;489955;489956;489957;489958;489959;489960;489961;489962;489963;489964;489965;489966;489967;489968 489947 25 TGENVEDAFLEAAK Unmodified 1492.7046 0.70455285 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.06 105.06 2 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35.386 2 0.00128 30620 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.573 84.422 561960000 0 0 0 0 0 0 80812000 152150000 152820000 0 0 0 176180000 43120 1345 40254 385069;385070;385071;385072 489993;489994;489995;489996 489994 2 TGEQAPASAPR Unmodified 1083.5309 0.530886 2987 Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S;Protein-tyrosine-phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.759 13.759 2 0.00043381 5697 QUIQUE_C1403_190116_001 103.26 90.164 399160000 0 0 0 34483000 34103000 2601700 51274000 63458000 57414000 0 33047000 36700000 86074000 43121 2987 40255 385073;385074;385075;385076;385077;385078;385079;385080;385081 489997;489998;489999;490000;490001;490002;490003;490004;490005 489997 9 TGEQAPSSPPR Unmodified 1125.5415 0.54145068 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.144 15.144 2 0.00020544 7526 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.86 105.6 222260000 26613000 0 0 0 38163000 0 29732000 0 26362000 0 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chain;Gamma-glutamyltransferase 5 light chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.84 131.84 2 0.0019817 137921 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.633 64.094 443280000 51945000 0 83482000 69167000 69786000 0 0 65875000 0 22584000 80437000 0 0 43143 2391 40277 385226;385227;385228;385229;385230;385231;385232;385233;385234;385235;385236 490156;490157;490158;490159;490160;490161;490162;490163;490164;490165;490166 490164 11 TGIISLCK Unmodified 890.48954 0.48953845 8 A0A087WV90;E9PDN5;A0A087WTU7;A0A075B6G3;P11532;E7EQR9;E7EQS5;F8VX32;E7ESB2;H0Y304;F5GZY3 DMD Dystrophin yes no 0 0 0 1 48.47 48.47 2 0.037751 46024 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.962 25.567 54229000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54229000 0 43144 8 40278 385237 490167 490167 1 TGIIVTTSEAVLLQLVADKDHPK Unmodified 2447.3635 0.36353989 3821 Q96CN7 ISOC1 Isochorismatase domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 138.87 138.87 3;4 2.9601E-35 142773 QUIQUE_DMIX7_190116_001 133.38 129.28 1271900000 107360000 93037000 77292000 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490187;490188;490189;490190;490191;490192 490187 5 TGISDVFAK Unmodified 936.49165 0.49164694 2145 P19338 NCL Nucleolin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 67.362 67.362 1;2 0.00042753 67304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.27 52.242 3856300000 334460000 275660000 127380000 192380000 410580000 269580000 256360000 298980000 368010000 140230000 488890000 348380000 345440000 43148 2145 40282 385263;385264;385265;385266;385267;385268;385269;385270;385271;385272;385273;385274;385275;385276 490193;490194;490195;490196;490197;490198;490199;490200;490201;490202;490203;490204;490205;490206;490207;490208;490209;490210 490202 17 TGISHGHTVYVVHDGFEGLAK Unmodified 2223.1073 0.10726562 2129 P17858 PFKL ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type yes yes 0 0 0 3 2 1 2 2 1 1 2 2 3 2 2 52.028 52.028 3;4;5 1.4686E-87 50150 QUIQUE_DMIX3_190116_001 194.92 174.32 3263800000 322720000 273900000 110910000 269860000 477570000 87563000 115010000 257890000 196430000 0 631240000 194490000 326250000 43149 2129 40283 385277;385278;385279;385280;385281;385282;385283;385284;385285;385286;385287;385288;385289;385290;385291;385292;385293;385294;385295;385296;385297;385298;385299 490211;490212;490213;490214;490215;490216;490217;490218;490219;490220;490221;490222;490223;490224;490225;490226;490227;490228;490229;490230;490231;490232;490233;490234;490235;490236;490237;490238;490239;490240;490241;490242;490243 490233 30 TGIVLPNGK Unmodified 897.52837 0.5283668 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 39.289 39.289 2 0.012015 35038 QUIQUE_C1277_190116_001 71.922 57.084 249520000 0 34050000 0 0 0 0 0 45852000 44214000 0 57342000 68064000 0 43150 921 40284 385300;385301;385302;385303;385304;385305 490244;490245;490246;490247;490248;490249 490244 6 TGKPFNPLLGETYELIR Unmodified 1947.0466 0.046562847 454 A0A2R8YEX0;A0A2R8YD49;Q9H1P3;A0A2R8YG59;A0A2R8Y5R1;A0A2R8Y362;A0A2R8Y690;A0A2R8YDU7;A0A2R8YG95;E7ET92;A0A087WTV1;A0A2R8YFT0 OSBPL2 Oxysterol-binding protein-related protein 2;Oxysterol-binding protein yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 117.78 117.78 2;3 1.0368E-05 123333 QUIQUE_C1218_190116_001 79.805 69.705 780410000 59311000 85440000 69082000 64735000 55079000 0 50599000 79956000 115230000 28994000 45529000 0 126460000 43151 454 40285 385306;385307;385308;385309;385310;385311;385312;385313;385314;385315;385316;385317;385318;385319;385320;385321 490250;490251;490252;490253;490254;490255;490256;490257;490258;490259;490260;490261;490262;490263;490264;490265;490266;490267 490250 18 TGKPFNPLLGETYELVR Unmodified 1933.0309 0.030912783 4066 Q9BXW6;J3QSB8 OSBPL1A Oxysterol-binding protein-related protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.05 109.05 3 0.00020622 112733 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.636 58.373 1185000000 86981000 110010000 119450000 111250000 0 97519000 0 117950000 128660000 0 182580000 102440000 128130000 43152 4066 40286 385322;385323;385324;385325;385326;385327;385328;385329;385330;385331 490268;490269;490270;490271;490272;490273;490274;490275;490276;490277;490278 490275 7 TGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQR Unmodified 2355.2621 0.26205171 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 1 2 1 152.19 152.19 2;3 3.0822E-14 157130 QUIQUE_C1218_190116_001 84.318 80.221 311120000 311120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43153 2414 40287 385332;385333;385334 490279;490280;490281;490282 490280 4 TGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPR Unmodified 4141.1882 0.18816507 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 2 166.12 166.12 3;4;5 0 170447 QUIQUE_DMIX3_190116_001 246.7 241.11 12603000000 136410000 333630000 189430000 0 335730000 432860000 1570000000 543180000 1016800000 0 3594100000 1551700000 2899200000 43154 2414 40288 385335;385336;385337;385338;385339;385340;385341;385342;385343;385344;385345;385346;385347;385348;385349;385350 490283;490284;490285;490286;490287;490288;490289;490290;490291;490292;490293;490294;490295;490296;490297;490298;490299;490300;490301 490292 19 TGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPR Oxidation (M) 4157.1831 0.18307969 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 153.27 153.27 4 3.495E-145 149117 QUIQUE_DMIX4_190116_001 183.89 179.02 4855800000 0 395610000 141740000 145350000 187910000 0 256830000 467980000 445770000 432590000 469940000 814860000 1097300000 43155 2414 40288 385351;385352;385353;385354;385355;385356;385357;385358;385359;385360;385361;385362;385363;385364;385365 490302;490303;490304;490305;490306;490307;490308;490309;490310;490311;490312;490313;490314;490315;490316;490317;490318;490319 490311 1829 15 TGLEAISNHK Unmodified 1068.5564 0.55637247 3070 Q14515 SPARCL1 SPARC-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 19.418 19.418 2 0.021406 12140 QUIQUE_C1576_190116_001 81.263 58.523 43764000 0 0 0 0 0 0 43764000 0 0 0 0 0 0 43156 3070 40289 385366 490320 490320 0 TGLEAISNHKETEEK Unmodified 1684.8268 0.82679325 3070 Q14515 SPARCL1 SPARC-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 19.073 19.073 3 6.3032E-29 12272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 159.18 132.45 295500000 0 0 0 0 0 0 0 96187000 43364000 0 55522000 37401000 63020000 43157 3070 40290 385367;385368;385369;385370;385371 490321;490322;490323;490324;490325 490321 4 TGLENGILLCELLNAIKPGLVK Unmodified 2364.3451 0.34505305 4520 Q9UPQ0;D6RD46 LIMCH1 LIM and calponin homology domains-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 166.57 166.57 3 1.5388E-05 160687 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.975 69.52 20479000 0 20479000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43158 4520 40291 385372;385373 490326;490327 490327 1 TGLEVKPFITNPR Unmodified 1470.8195 0.81946344 2468 P45381;I3L0T3 ASPA Aspartoacylase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 65.963 65.963 3 0.027066 66384 QUIQUE_C1438_190116_001 45.213 33.773 338230000 0 0 0 0 91764000 0 66619000 0 70486000 32506000 0 0 76859000 43159 2468 40292 385374;385375;385376;385377;385378 490328;490329;490330;490331;490332 490328 3 TGLFTPDLAFEAIVK Unmodified 1620.8763 0.87630962 2569 P50570 DNM2 Dynamin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 152.75 152.75 2 0.014119 159456 QUIQUE_C1438_190116_001 51.135 36.9 114080000 0 16408000 21945000 28329000 26821000 0 0 20577000 0 0 0 0 0 43160 2569 40293 385379;385380;385381;385382;385383 490333;490334;490335;490336;490337;490338 490337 5 TGLFTPDLAFEATVK Unmodified 1608.8399 0.83992412 269;1240 A0A0D9SFB1;H7C5U0 DNM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 133.19 133.19 2 0.0005349 140098 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.543 70.38 2970000000 0 0 0 0 517610000 0 612000000 314130000 297930000 0 420150000 485460000 322680000 43161 269;1240 40294 385384;385385;385386;385387;385388;385389;385390 490339;490340;490341;490342;490343;490344;490345;490346;490347;490348;490349 490345 11 TGLFTPDMAFEAIVK Unmodified 1638.8327 0.83273025 4528;840;1337 E5RHK8;E5RIK2;K7EMQ3;Q9UQ16 DNM3;DNM2 Dynamin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 150.99 150.99 2 7.7139E-06 157096 QUIQUE_C1218_190116_001 106.01 88.982 1993300000 179330000 201730000 181120000 139370000 147060000 156020000 173510000 101420000 169670000 36908000 205750000 151010000 150420000 43162 840;1337;4528 40295 385391;385392;385393;385394;385395;385396;385397;385398;385399;385400;385401;385402;385403 490350;490351;490352;490353;490354;490355;490356;490357;490358;490359;490360;490361;490362;490363 490350 12 TGLFTPDMAFEAIVKK Unmodified 1766.9277 0.92769326 4528;840;1337 E5RHK8;E5RIK2;K7EMQ3;Q9UQ16 DNM3;DNM2 Dynamin-3 no no 0 0 1 1 1 131.33 131.33 3 6.5189E-05 134421 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.138 83.366 57856000 0 0 0 0 0 0 0 33051000 0 0 0 24805000 0 43163 840;1337;4528 40296 385404;385405 490364;490365 490364 1 TGLFTPDMAFETIVK Unmodified 1668.8433 0.84329493 2893 Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 146.84 146.84 2 0.00046036 152316 QUIQUE_C1368_190116_001 95.401 79.438 2777600000 502210000 418610000 500030000 317610000 0 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119.45 3 1.1034E-10 124935 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.837 60.118 1086700000 0 116520000 161500000 176570000 143090000 0 144990000 0 0 68668000 157750000 117650000 0 43169 3763 40301 385438;385439;385440;385441;385442;385443;385444;385445 490409;490410;490411;490412;490413;490414;490415;490416;490417;490418 490417 9 TGLLGFIGPDNLVFIVGK Unmodified 1859.0557 0.05567097 3080 Q14689 DIP2A Disco-interacting protein 2 homolog A yes yes 0 0 0 1 168.12 168.12 2 0.000765 172223 QUIQUE_DMIX7_190116_001 66.393 56.881 26882000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26882000 0 43170 3080 40302 385446 490419 490419 1 TGLLGFVGPGGLVFVVGK Unmodified 1715.9974 0.99742781 315 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4 DIP2C Disco-interacting protein 2 homolog C yes no 0 0 0 1 161.36 161.36 2 0.0017631 163734 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.48 54.218 20184000 0 0 0 0 0 0 0 20184000 0 0 0 0 0 43171 315 40303 385447 490420 490420 1 TGLPPVTDENHVIVK Unmodified 1617.8726 0.87262123 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 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12 TGLQAGLTIDEFAPR Unmodified 1587.8257 0.82567103 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 116.27 116.27 2 0.00031617 119876 QUIQUE_C1277_190116_001 93.958 69.105 443800000 55288000 71414000 0 48939000 0 0 0 62290000 65297000 0 60758000 79810000 0 43174 2191 40306 385473;385474;385475;385476;385477;385478;385479;385480 490451;490452;490453;490454;490455;490456;490457;490458;490459 490453 8 TGLQEVEVK Unmodified 1001.5393 0.53932542 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.559 35.559 2 0.0018808 31082 QUIQUE_C1438_190116_001 99.139 57.951 1060300000 92039000 122330000 92359000 92496000 136720000 81885000 0 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Unmodified 1360.7384 0.73843593 2329 P31153 MAT2A S-adenosylmethionine synthase isoform type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 107.51 107.51 2 0.00070558 105025 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.03 67.878 556690000 41511000 50852000 43013000 45219000 29962000 46419000 34485000 58194000 44031000 38966000 0 42302000 81740000 43180 2329 40312 385519;385520;385521;385522;385523;385524;385525;385526;385527;385528;385529;385530;385531;385532 490506;490507;490508;490509;490510;490511;490512;490513;490514;490515;490516;490517;490518;490519;490520;490521;490522;490523;490524;490525;490526;490527;490528;490529 490523 24 TGMLPANYIEFVN Unmodified 1467.7068 0.70680145 1679 O76041 NEBL Nebulette yes yes 0 0 0 1 1 1 147.54 147.54 2 0.0015614 150526 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.939 64.248 246810000 0 0 63246000 0 0 0 0 105170000 0 0 78392000 0 0 43181 1679 40313 385533;385534;385535 490530;490531;490532 490531 3 TGMLPANYIEFVN Oxidation (M) 1483.7017 0.70171607 1679 O76041 NEBL Nebulette yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 131.42 131.42 2 0.0006754 136227 QUIQUE_DMIX3_190116_001 88.681 75.725 204250000 0 0 0 0 0 0 0 32006000 39510000 27937000 65072000 0 39723000 43182 1679 40313 385536;385537;385538;385539;385540;385541 490533;490534;490535;490536;490537;490538;490539;490540 490534 920 7 TGNAGEWCLMESDPGVFTELIK Acetyl (Protein N-term) 2495.1349 0.13486186 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 1 0 0 1 2 170.77 170.77 2;3 1.1351E-09 174418 QUIQUE_C1277_190116_001 98.439 93.809 21182000 0 0 21182000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43183 4622 40314 385542;385543;385544 490541;490542;490543;490544 490541 4 TGNESGSNLSDSGSVK Unmodified 1537.6856 0.68560832 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.398 18.398 2 2.0278E-29 10838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.31 137.96 589940000 52473000 61648000 31990000 25954000 47571000 23771000 46027000 33907000 62170000 15806000 73727000 53882000 61014000 43184 4414 40315 385545;385546;385547;385548;385549;385550;385551;385552;385553;385554;385555;385556;385557 490545;490546;490547;490548;490549;490550;490551;490552;490553;490554;490555;490556;490557 490555 13 TGNLETCLR Unmodified 1062.5128 0.51279309 245;1040 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;K7EN79;F8WAK2;F8VXI9;Q14161;R4GNG3;F8W822 GIT1;GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT1;ARF GTPase-activating protein GIT2 no no 0 0 0 1 1 1 1 33.257 33.257 2 0.0005118 28284 QUIQUE_C1403_190116_001 113.18 67.686 401970000 95779000 0 67239000 127610000 0 0 0 0 0 0 111340000 0 0 43185 245;1040 40316 385558;385559;385560;385561 490558;490559;490560;490561;490562 490560 4 TGNLFHRPA Unmodified 1011.525 0.52501276 62 A0A087WWM6;O43272;E7EQL6 PRODH Proline dehydrogenase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 21.304 21.304 2 0.0033257 14534 QUIQUE_C1368_190116_001 113.41 92.465 43027000 0 0 43027000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43186 62 40317 385562 490563 490563 1 TGNQHFGYLYGR Unmodified 1411.6633 0.66329715 3660 Q8TAT6 NPLOC4 Nuclear protein localization protein 4 homolog yes yes 0 0 0 1 45.803 45.803 3 0.013737 40422 QUIQUE_DMIX4_190116_001 36.847 28.118 21996000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21996000 0 0 0 43187 3660 40318 385563 490564 490564 1 TGPAATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFK Unmodified 2934.4862 0.4862338 1917 P07237;I3L312;I3L3P5 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 3 3 2 2 4 2 4 2 5 4 4 2 172.83 172.83 2;3 3.3337E-197 176781 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.55 161.9 5927100000 238300000 590350000 612680000 399590000 387370000 279390000 574890000 334590000 262350000 0 1136200000 760440000 350880000 43188 1917 40319 385564;385565;385566;385567;385568;385569;385570;385571;385572;385573;385574;385575;385576;385577;385578;385579;385580;385581;385582;385583;385584;385585;385586;385587;385588;385589;385590;385591;385592;385593;385594;385595;385596;385597;385598;385599;385600 490565;490566;490567;490568;490569;490570;490571;490572;490573;490574;490575;490576;490577;490578;490579;490580;490581;490582;490583;490584;490585;490586;490587;490588;490589;490590;490591;490592;490593;490594;490595;490596;490597;490598;490599;490600;490601;490602;490603;490604 490589 39 TGPAATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAK Unmodified 3765.8473 0.8472605 1917 P07237;I3L312;I3L3P5 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 1 1 174.6 174.6 3 2.4393E-07 175999 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.871 51.294 8677600 0 0 0 0 0 0 0 8677600 0 0 0 0 0 43189 1917 40320 385601 490605 490605 1 TGPDPASAPGR Unmodified 1024.4938 0.49377221 4558 Q9Y2J0;F8VP47 RPH3A Rabphilin-3A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.102 17.102 2 0.00082405 9579 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.692 35.711 861620000 94259000 74660000 83124000 73162000 50693000 51680000 72313000 54346000 54920000 22875000 84490000 55430000 89672000 43190 4558 40321 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490916;490917;490918;490919;490920;490921;490922;490923;490924;490925;490926;490927;490928;490929;490930;490931;490932;490933;490934;490935;490936;490937;490938;490939;490940;490941;490942;490943;490944;490945;490946;490947;490948;490949;490950;490951;490952;490953;490954;490955;490956;490957;490958;490959;490960;490961;490962;490963;490964;490965;490966 490918 51 TGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKK Oxidation (M) 2620.2261 0.22613648 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 2 86.568 86.568 2;3 3.3694E-73 88252 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.81 146.69 4922600000 173000000 263240000 373490000 235220000 265490000 171980000 240680000 588010000 549330000 0 730060000 608290000 723860000 43205 1790 40335 385845;385846;385847;385848;385849;385850;385851;385852;385853;385854;385855;385856;385857;385858;385859;385860;385861;385862;385863 490967;490968;490969;490970;490971;490972;490973;490974;490975;490976;490977;490978;490979;490980;490981;490982;490983;490984;490985;490986;490987 490980 1013 20 TGQATVASGIPAGWMGLDCGPESSKK Unmodified 2604.2312 0.23122186 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 3 1 2 2 2 2 1 2 3 2 101.33 101.33 2;3 2.7443E-113 104374 QUIQUE_DMIX3_190116_001 186.97 173.55 6678700000 342760000 472880000 547250000 454610000 392480000 272630000 383730000 766870000 503620000 111450000 1077500000 698900000 654010000 43206 1790 40335 385864;385865;385866;385867;385868;385869;385870;385871;385872;385873;385874;385875;385876;385877;385878;385879;385880;385881;385882;385883;385884;385885;385886;385887;385888;385889 490988;490989;490990;490991;490992;490993;490994;490995;490996;490997;490998;490999;491000;491001;491002;491003;491004;491005;491006;491007;491008;491009;491010;491011;491012;491013;491014;491015;491016;491017;491018;491019;491020;491021;491022;491023;491024;491025;491026;491027;491028;491029;491030;491031 491018 41 TGQCECQPGITGQHCER Unmodified 2016.82 0.82002686 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.555 18.555 3 0.00014193 11252 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.795 74.076 576910000 47181000 101610000 0 45717000 39208000 0 52929000 80751000 51739000 40226000 0 66222000 51327000 43207 2008 40336 385890;385891;385892;385893;385894;385895;385896;385897;385898;385899 491032;491033;491034;491035;491036;491037;491038;491039;491040;491041;491042 491040 11 TGQEIPVNVR Unmodified 1111.5986 0.59857163 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3QRH4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 40.282 40.282 2 2.9606E-08 37225 QUIQUE_C1218_190116_001 162.59 133.42 18130000000 0 0 2374000000 1520400000 1567800000 1440300000 1741000000 1438900000 1710400000 828350000 1917900000 1704100000 1886500000 43208 3897 40337 385900;385901;385902;385903;385904;385905;385906;385907;385908;385909;385910;385911;385912;385913 491043;491044;491045;491046;491047;491048;491049;491050;491051;491052;491053;491054;491055;491056;491057;491058;491059;491060;491061;491062 491043 19 TGQEVVFVAEPDNK Unmodified 1531.7518 0.75183739 1869 P04844 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 63.655 63.655 2 0.0024785 61858 QUIQUE_C1403_190116_001 87.18 61.241 70706000 45071000 0 0 0 0 0 0 0 0 25635000 0 0 0 43209 1869 40338 385914;385915;385916;385917;385918;385919;385920;385921 491063;491064;491065;491066;491067;491068;491069;491070;491071 491065 9 TGQPMINLYTDR Unmodified 1407.6816 0.68164933 1188 H3BPE7;P35637 FUS RNA-binding protein FUS yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 77.108 77.108 2 0.00075829 78109 QUIQUE_C1576_190116_001 88.681 70.816 397990000 84158000 98757000 0 80659000 62438000 0 71981000 0 0 0 0 0 0 43210 1188 40339 385922;385923;385924;385925;385926;385927;385928 491072;491073;491074;491075;491076;491077;491078;491079;491080 491080 9 TGQYSGIYDCAK Unmodified 1361.5922 0.59216562 3372 Q6NUK1 SLC25A24 Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-1 yes yes 0 0 0 1 42.719 42.719 2 0.048707 39105 QUIQUE_C1277_190116_001 44.847 33.357 51761000 0 51761000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43211 3372 40340 385929 491081 491081 1 TGREDIANLADEFK Unmodified 1577.7686 0.76855009 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 87.879 87.879 2;3 0.0015626 90484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.175 63.125 214540000 53631000 38185000 0 50711000 0 0 0 0 0 0 72012000 0 0 43212 3975 40341 385930;385931;385932;385933 491082;491083;491084;491085 491085 4 TGSDLMVLLLLGDESMQK Unmodified 1948.985 0.98495015 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 167.19 167.19 2;3 2.9997E-38 169130 QUIQUE_DMIX1_190116_001 200.21 163.76 576150000 53208000 54850000 0 0 84118000 0 0 101390000 136240000 0 35793000 0 110560000 43213 2605 40342 385934;385935;385936;385937;385938;385939;385940;385941;385942;385943;385944 491086;491087;491088;491089;491090;491091;491092;491093;491094;491095;491096;491097 491092 12 TGSDLMVLLLLGDESMQK Oxidation (M) 1964.9799 0.97986477 2605 P52306;H0Y8M2 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes no 0 1 0 1 2 1 161.29 161.29 2;3 3.3843E-17 163637 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.32 111.23 18981000 0 0 0 0 0 0 0 18981000 0 0 0 0 0 43214 2605 40342 385945;385946;385947;385948 491098;491099;491100;491101 491099 2066 4 TGSLCSLEVLITR Unmodified 1447.7705 0.77046434 2511 P48553;A0A096LPH7 TRAPPC10;LOC102724200 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 123.76 123.76 2 0.0015688 128316 QUIQUE_C1277_190116_001 98.353 82.814 62366000 0 0 0 0 0 21338000 0 0 16481000 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141947 QUIQUE_C1563_190116_001 53.995 40.316 12098000 0 0 0 0 0 12098000 0 0 0 0 0 0 0 43218 473 40346 385958 491111 491111 1 TGSPGSPGAGGVQSTAK Unmodified 1457.711 0.71103521 1515 O43237;J3KRI4;J3KRZ2 DYNC1LI2 Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 16.328 16.328 2 2.7922E-18 8634 QUIQUE_C1403_190116_001 158.11 123.36 1169300000 0 0 0 283400000 244840000 0 0 218250000 0 0 0 155260000 267530000 43219 1515 40347 385959;385960;385961;385962;385963 491112;491113;491114;491115;491116 491112 4 TGSSPTQGIVNK Unmodified 1187.6146 0.61461563 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 20.335 20.335 2 0.00092401 13478 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.29 65.004 85972000 32012000 0 24321000 0 0 0 0 29638000 0 0 0 0 0 43220 77 40348 385964;385965;385966 491117;491118;491119 491119 2 TGTAEMSSILEER Oxidation (M) 1438.661 0.66097347 2243;1351 K7ERX7;K7ESA0;P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 43.893 43.893 2 1.0394E-12 41142 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.24 133.37 5013300000 387530000 414140000 557550000 218460000 354860000 335650000 363420000 233130000 399010000 237450000 559620000 446600000 505840000 43221 1351;2243 40349 385967;385968;385969;385970;385971;385972;385973;385974;385975;385976;385977;385978;385979;385980 491120;491121;491122;491123;491124;491125;491126;491127;491128;491129;491130;491131;491132;491133;491134;491135;491136;491137;491138;491139;491140 491137 758 20 TGTAEMSSILEER Unmodified 1422.6661 0.66605885 2243;1351 K7ERX7;K7ESA0;P25705 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 79.24 79.24 2 2.976E-53 80359 QUIQUE_DMIX1_190116_001 203.94 189.28 26002000000 2557700000 2287000000 2629400000 1702500000 1439500000 2015700000 2199800000 1804700000 1921700000 673140000 2696500000 2050500000 2023800000 43222 1351;2243 40349 385981;385982;385983;385984;385985;385986;385987;385988;385989;385990;385991;385992;385993;385994;385995 491141;491142;491143;491144;491145;491146;491147;491148;491149;491150;491151;491152;491153;491154;491155;491156;491157;491158;491159;491160;491161;491162;491163;491164;491165;491166;491167;491168;491169;491170;491171;491172;491173;491174;491175;491176;491177;491178;491179 491161 38 TGTAYTFFTPNNIK Unmodified 1573.7777 0.77765821 1290 J3KTA4;P17844 DDX5 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5 yes no 0 0 0 1 97.838 97.838 2 0.02513 99213 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.344 32.647 66334000 0 0 0 0 0 0 0 66334000 0 0 0 0 0 43223 1290 40350 385996 491180 491180 1 TGTCGYCGLQFR Unmodified 1418.6071 0.60710418 1629 O75380 NDUFS6 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.337 66.337 2 1.3434E-37 67282 QUIQUE_C1218_190116_001 192.6 176.4 1682300000 136220000 195270000 159990000 101630000 124990000 127670000 134950000 119390000 122000000 45843000 141720000 145720000 126910000 43224 1629 40351 385997;385998;385999;386000;386001;386002;386003;386004;386005;386006;386007;386008;386009 491181;491182;491183;491184;491185;491186;491187;491188;491189;491190;491191;491192;491193;491194;491195 491182 15 TGTFCALSTVLER Unmodified 1453.7235 0.72351415 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 108.35 108.35 2 0.010069 112539 QUIQUE_C1368_190116_001 71.555 55.417 168020000 0 0 65458000 0 0 0 0 0 0 0 0 47126000 55433000 43225 2137 40352 386010;386011;386012 491196;491197;491198 491196 3 TGTFVVIDAMLDMMHTER Unmodified 2065.9635 0.9635032 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 161.89 161.89 3 0.00065785 168077 QUIQUE_C1576_190116_001 48.477 38.101 35461000 0 0 0 0 0 0 0 12127000 0 0 23333000 0 0 43226 2137 40353 386013;386014;386015 491199;491200;491201 491199 2 TGTHGLLVK Unmodified 924.53927 0.53926584 1802 P01023;H0YFH1 A2M Alpha-2-macroglobulin yes no 0 0 0 1 15.799 15.799 2 0.03732 7947 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.105 34.703 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43227 1802 40354 386016 491202 491202 1 TGTITTFEHAHNMR Unmodified 1614.7573 0.75727389 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 3 3 1 2 1 2 1 2 3 1 2 1 2 28.052 28.052 2;3;4 6.1182E-37 23043 QUIQUE_C1218_190116_001 183.33 176.48 2218500000 232650000 246900000 150310000 297090000 105600000 159410000 141150000 222860000 224620000 51866000 138800000 109860000 137390000 43228 2058 40355 386017;386018;386019;386020;386021;386022;386023;386024;386025;386026;386027;386028;386029;386030;386031;386032;386033;386034;386035;386036;386037;386038;386039;386040 491203;491204;491205;491206;491207;491208;491209;491210;491211;491212;491213;491214;491215;491216;491217;491218;491219;491220;491221;491222;491223;491224;491225;491226;491227;491228;491229;491230;491231;491232;491233;491234 491205 31 TGTITTFEHAHNMR Oxidation (M) 1630.7522 0.75218852 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 19.378 19.378 3 9.4052E-11 12592 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.06 111.98 425860000 0 0 0 0 0 0 108670000 217680000 0 99509000 0 0 0 43229 2058 40355 386041;386042;386043;386044 491235;491236;491237;491238 491236 1380 4 TGTIVVEGHELHDEDIR Unmodified 1918.9385 0.93846896 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 1 54.917 54.917 3;4 0.016974 54063 QUIQUE_C1438_190116_001 36.451 25.597 105110000 0 0 0 0 71930000 0 0 0 0 0 0 33181000 0 43230 2441 40356 386045;386046;386047 491239;491240;491241 491239 3 TGTLQFNTVSK Unmodified 1194.6245 0.62445203 1151 H0YEX9;P57087 JAM2 Junctional adhesion molecule B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.348 45.348 2 0.0004441 41711 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.31 91.795 1009200000 77682000 83432000 85901000 116590000 77345000 72820000 75692000 93438000 115260000 0 70413000 73452000 67165000 43231 1151 40357 386048;386049;386050;386051;386052;386053;386054;386055;386056;386057;386058;386059 491242;491243;491244;491245;491246;491247;491248;491249;491250;491251;491252;491253;491254;491255 491255 13 TGTLTTNQMSVCR Unmodified 1467.681 0.68099741 2112 P16615;H7C5W9;Q93084 ATP2A2;ATP2A3 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2;Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3 yes no 0 0 0 1 1 41.815 41.815 2 0.00043589 38178 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.855 76.882 21181000 0 0 0 0 0 0 0 21181000 0 0 0 0 0 43232 2112 40358 386060;386061 491256;491257 491257 2 TGTQYLLR Unmodified 950.51853 0.5185304 2371 P35237;A0A024QZX5;A0A087X1N8;A0A2R8YD12;A0A2R8Y6A7;C9JTJ8;C9JVA8 SERPINB6;SERPINB8 Serpin B6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.979 39.979 2 2.7278E-06 35290 QUIQUE_DMIX4_190116_001 173.59 92.272 4243500000 311060000 295850000 324610000 370150000 390170000 264100000 328360000 0 437580000 151160000 513980000 379720000 476740000 43233 2371 40359 386062;386063;386064;386065;386066;386067;386068;386069;386070;386071;386072;386073 491258;491259;491260;491261;491262;491263;491264;491265;491266;491267;491268;491269;491270 491266 10 TGTSCALDCGAGIGR Unmodified 1494.6555 0.65551094 4042 Q9BV86 NTMT1 N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1;N-terminal Xaa-Pro-Lys N-methyltransferase 1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.775 45.775 2 0.00032211 43734 QUIQUE_C1218_190116_001 99.522 82.086 254390000 28444000 31502000 44447000 29480000 20363000 34861000 35307000 0 0 0 0 0 29985000 43234 4042 40360 386074;386075;386076;386077;386078;386079;386080;386081;386082;386083 491271;491272;491273;491274;491275;491276;491277;491278;491279;491280;491281 491271 11 TGTSYFFGGCPK Unmodified 1320.5809 0.58087266 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.879 68.879 2 0.00122 68350 QUIQUE_C1368_190116_001 82.749 73.392 749170000 43376000 87262000 117090000 0 66935000 68070000 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.624 81.624 2 0.0020646 82764 QUIQUE_C1403_190116_001 75.566 57.702 231340000 0 0 0 56668000 0 0 40107000 0 49165000 0 0 51858000 33544000 43237 2858 40363 386100;386101;386102;386103;386104;386105;386106 491298;491299;491300;491301;491302;491303;491304 491299 7 TGVAVNKPAEFTVDAK Unmodified 1645.8675 0.86753585 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 49.742 49.742 2;3 2.0948E-12 47630 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.68 64.706 1977800000 50164000 241990000 196600000 219980000 287710000 44478000 175600000 72056000 307970000 104240000 88984000 187990000 0 43238 2178 40364 386107;386108;386109;386110;386111;386112;386113;386114;386115;386116;386117;386118;386119;386120;386121;386122;386123;386124 491305;491306;491307;491308;491309;491310;491311;491312;491313;491314;491315;491316;491317;491318;491319;491320;491321;491322 491317 15 TGVELGKPTHFTVNAK Unmodified 1697.9101 0.91006937 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 39.232 39.232 3;4 6.5935E-05 36018 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.8 75.172 892230000 38306000 64511000 69601000 68346000 0 35484000 0 211860000 187150000 0 0 216970000 0 43239 2178 40365 386125;386126;386127;386128;386129;386130;386131;386132;386133;386134;386135 491323;491324;491325;491326;491327;491328;491329;491330;491331;491332;491333;491334;491335;491336;491337 491331 14 TGVEVGKPTHFTVLTK Unmodified 1712.9461 0.94612052 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 46.165 46.165 3;4 0.0004789 42740 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.817 37.742 358460000 0 0 35825000 0 26172000 0 193880000 0 0 57305000 45277000 0 0 43240 3061 40366 386136;386137;386138;386139;386140;386141 491338;491339;491340;491341;491342;491343;491344 491343 7 TGVGYPQLSAVIECADSAHGLK Unmodified 2272.1158 0.1157814 2405 P36959 GMPR GMP reductase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 120.31 120.31 3 0.0030347 125793 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.768 39.009 168220000 0 0 0 0 0 114580000 0 0 0 20791000 32845000 0 0 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386156;386157;386158;386159;386160;386161;386162;386163;386164;386165;386166 491359;491360;491361;491362;491363;491364;491365;491366;491367;491368;491369;491370;491371;491372 491372 14 TGVIGVQPEEVTAAAK Unmodified 1568.841 0.84098675 3891 Q96JH7 VCPIP1 Deubiquitinating protein VCIP135 yes yes 0 0 0 1 70.142 70.142 2 0.0042355 70454 QUIQUE_C1368_190116_001 57.802 33.01 30887000 0 0 30887000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43244 3891 40370 386167 491373 491373 1 TGVLAAVLASQPSIPR Unmodified 1578.9093 0.90934108 3829 Q96D71;E9PMG1;H0YDT0;H0YE89;H0YCR2 REPS1 RalBP1-associated Eps domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 123.21 123.21 2;3 3.7276E-10 126450 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.35 100.25 106850000 0 0 0 0 0 18695000 0 33925000 36837000 0 0 0 17394000 43245 3829 40371 386168;386169;386170;386171;386172;386173;386174 491374;491375;491376;491377;491378;491379;491380 491376 7 TGVLAHLEEER Unmodified 1252.6412 0.64116473 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 46.749 46.749 3 0.020647 44735 QUIQUE_C1438_190116_001 36.284 11.941 91400000 0 0 0 0 60526000 0 0 0 30874000 0 0 0 0 43246 2385 40372 386175;386176 491381;491382 491381 2 TGVMICAYLLHR Unmodified 1432.7319 0.73191077 2692 P60484 PTEN Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN yes yes 0 0 0 1 91.874 91.874 3 0.042827 93770 QUIQUE_DMIX7_190116_001 30.563 22.258 9103200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9103200 0 43247 2692 40373 386177 491383 491383 1 TGVQFTVK Unmodified 878.48617 0.48616764 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 37.416 37.416 2 0.020389 33199 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.825 39.179 632190000 0 56942000 159240000 72400000 0 0 0 53400000 66305000 0 157430000 0 66472000 43248 2444 40374 386178;386179;386180;386181;386182;386183;386184 491384;491385;491386;491387;491388;491389;491390;491391;491392;491393;491394 491393 11 TGVTGPYVLGTGLILYALSK Unmodified 2022.1401 0.14012888 2230 P24539 ATP5F1 ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.21 168.21 2;3 3.3812E-37 172589 QUIQUE_DMIX3_190116_001 189.1 179.3 4098000000 345780000 483930000 517230000 253230000 304470000 460720000 435760000 141780000 221920000 148810000 192770000 432110000 159460000 43249 2230 40375 386185;386186;386187;386188;386189;386190;386191;386192;386193;386194;386195;386196;386197;386198;386199;386200;386201;386202;386203;386204;386205;386206;386207;386208;386209;386210 491395;491396;491397;491398;491399;491400;491401;491402;491403;491404;491405;491406;491407;491408;491409;491410;491411;491412;491413;491414;491415;491416;491417;491418;491419;491420;491421 491412 26 TGWFPSNYVR Unmodified 1225.588 0.58800695 465;3105 Q15052;C9JDI6;B1ANY6;E7ENL8;E7EU80;B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6 ARHGEF6;ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 6;Rho guanine nucleotide exchange factor 7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.589 93.589 2 0.0007724 96971 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.42 77.696 607060000 0 0 95062000 0 0 0 87118000 67763000 76007000 0 118980000 74085000 88048000 43250 3105;465 40376 386211;386212;386213;386214;386215;386216;386217 491422;491423;491424;491425;491426;491427;491428;491429;491430 491428 9 TGWISTSSIWK Unmodified 1264.6452 0.64518747 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 105.78 105.78 2 0.012077 109221 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.379 60.283 378480000 0 0 0 0 57617000 0 0 0 61882000 0 98917000 72893000 87172000 43251 4285 40377 386218;386219;386220;386221;386222 491431;491432;491433;491434;491435 491435 4 TGYESGEYEMLGEGLGVK Unmodified 1917.8666 0.86660915 3011 Q13561;F8W1I6;F8VW18;F8VX93;F8VRV7;H0YHL1 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.75 112.75 2 7.9205E-18 115847 QUIQUE_DMIX7_190116_001 177.81 161.18 2037800000 189830000 166780000 162160000 144600000 160130000 148080000 159510000 141370000 178050000 51166000 191610000 144500000 200010000 43252 3011 40378 386223;386224;386225;386226;386227;386228;386229;386230;386231;386232;386233;386234;386235 491436;491437;491438;491439;491440;491441;491442;491443;491444;491445;491446;491447;491448;491449 491448 13 TGYESGEYEMLGEGLGVK Oxidation (M) 1933.8615 0.86152377 3011 Q13561;F8W1I6;F8VW18;F8VX93;F8VRV7;H0YHL1 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 1 97.429 97.429 2 4.98E-05 100074 QUIQUE_C1277_190116_001 95.428 73.1 201700000 0 31175000 0 24806000 21643000 23922000 0 25801000 0 20376000 23133000 0 30846000 43253 3011 40378 386236;386237;386238;386239;386240;386241;386242;386243;386244 491450;491451;491452;491453;491454;491455;491456;491457;491458 491450 2460 9 TGYLGFLR Unmodified 925.50215 0.50215205 315;3080 E7EPU2;A0A0U1RQW6;Q9Y2E4;Q14689 DIP2C;DIP2A Disco-interacting protein 2 homolog C;Disco-interacting protein 2 homolog A no no 0 0 0 1 94.34 94.34 2 0.022199 95603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.423 30.003 19195000 0 0 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386254;386255;386256;386257;386258;386259;386260;386261;386262;386263 491468;491469;491470;491471;491472;491473;491474;491475;491476;491477;491478;491479 491469 9 THAVLVALK Unmodified 950.5913 0.59130141 2244 P25786;F5GX11;B4DEV8 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1;Proteasome subunit alpha type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.405 26.405 2 0.0071923 20358 QUIQUE_C1563_190116_001 82.279 56.34 1749300000 210510000 0 205500000 207660000 210870000 159960000 182970000 99263000 133490000 0 175490000 0 163560000 43257 2244 40382 386264;386265;386266;386267;386268;386269;386270;386271;386272;386273 491480;491481;491482;491483;491484;491485;491486;491487;491488;491489;491490 491485 3 THAVLVALKR Unmodified 1106.6924 0.69241244 2244 P25786;F5GX11;B4DEV8 PSMA1 Proteasome subunit alpha type-1;Proteasome subunit alpha type yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 19.229 19.229 2;3 0.00076489 12156 QUIQUE_DMIX3_190116_001 87.298 71.16 1125900000 0 0 0 0 19419000 0 0 234170000 154820000 0 288310000 242400000 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domain-containing linker protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.29 126.29 3 0.00015153 130396 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.648 55.744 294900000 42048000 28881000 0 0 32756000 31593000 52878000 0 31833000 17402000 30804000 0 26705000 43260 4414 40385 386304;386305;386306;386307;386308;386309;386310;386311;386312 491530;491531;491532;491533;491534;491535;491536;491537;491538 491535 9 THDGLAEVLVLESGR Unmodified 1594.8315 0.83148469 3612 Q8N7J2 AMER2 APC membrane recruitment protein 2 yes yes 0 0 0 1 96.771 96.771 3 0.01674 98041 QUIQUE_C1563_190116_001 38.613 32.136 27722000 0 0 0 0 0 27722000 0 0 0 0 0 0 0 43261 3612 40386 386313 491539 491539 1 THEAEIVEGENHTYCIR Unmodified 2056.9273 0.92725235 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5C6 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 45.576 45.576 3 0.00022187 42205 QUIQUE_C1218_190116_001 62.709 41.175 60302000 33441000 0 0 0 0 0 0 0 0 26861000 0 0 0 43262 2178 40387 386314;386315 491540;491541 491540 2 THEAQIQEMR Unmodified 1241.5823 0.58226964 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 16.968 16.968 2;3 0.00060188 9545 QUIQUE_C1438_190116_001 81.865 65.611 590490000 0 65525000 105830000 239530000 72740000 0 0 0 0 24601000 82264000 0 0 43263 2378 40388 386316;386317;386318;386319;386320;386321;386322 491542;491543;491544;491545;491546;491547;491548 491546 7 THFAASVTDPER Unmodified 1329.6313 0.63132832 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.181 28.181 2 0.00052555 21929 QUIQUE_C1368_190116_001 93.442 75.13 50536000 0 0 35693000 0 0 0 0 14843000 0 0 0 0 0 43264 205 40389 386323;386324;386325;386326;386327;386328;386329 491549;491550;491551;491552;491553;491554;491555 491549 7 THFEKEDLEGHR Unmodified 1496.7008 0.70080487 687 E7EW28;C9J240;Q6U841;F8WDX9 SLC4A10 Anion exchange protein;Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger yes no 0 0 1 1 1 1 14.687 14.687 4 0.001398 6992 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.951 46.9 71029000 0 0 19037000 0 0 0 24416000 0 0 0 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no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 105.97 105.97 3;4 4.5434E-23 109306 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.57 101.99 1527800000 0 114560000 200970000 242550000 55306000 53363000 196430000 0 189870000 0 258930000 110250000 105540000 43268 756 40393 386346;386347;386348;386349;386350;386351;386352;386353;386354;386355;386356;386357;386358;386359 491574;491575;491576;491577;491578;491579;491580;491581;491582;491583;491584;491585;491586;491587;491588;491589;491590;491591;491592 491588 17 THGSEIINDLQGR Unmodified 1438.7165 0.71645494 1610 O75116;E9PF63 ROCK2 Rho-associated protein kinase 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 49.939 49.939 2;3 0.00049572 47973 QUIQUE_C1218_190116_001 90.434 68.441 283280000 59842000 27122000 0 0 174010000 0 0 22307000 0 0 0 0 0 43269 1610 40394 386360;386361;386362;386363;386364 491593;491594;491595;491596;491597 491593 5 THIAHWWSPDGTR Unmodified 1562.7379 0.73785908 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 1 2 1 2 2 2 47.008 47.008 2;3;4 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491618;491619;491620;491621;491622;491623;491624;491625;491626;491627;491628;491629;491630;491631;491632;491633 491633 15 THIETVINALK Unmodified 1237.703 0.7030367 1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 65.795 65.795 2;3 1.6295E-06 62911 QUIQUE_DMIX4_190116_001 148.73 125.2 2371600000 240470000 241630000 221010000 0 194000000 179050000 257860000 256930000 191660000 71577000 246870000 0 270490000 43272 1701 40397 386398;386399;386400;386401;386402;386403;386404;386405;386406;386407;386408;386409;386410 491634;491635;491636;491637;491638;491639;491640;491641;491642;491643;491644;491645;491646;491647 491645 8 THILLFLPK Unmodified 1080.6696 0.66955173 1917 P07237;H7BZ94;I3L312;I3L398;I3L4M2 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 82.94 82.94 2;3 0.00045074 84337 QUIQUE_C1403_190116_001 143.61 127.84 2764200000 216850000 274150000 240250000 232700000 259810000 212760000 243740000 149490000 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491683 199 THKPDPGTPQHTSSRPPEPQK Unmodified 2321.1513 0.1512557 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IU51;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 1 2 10.165 10.165 4;5 1.6448E-35 2560 QUIQUE_DMIX8_190116_001 144.01 131.95 91956000 6100900 0 0 0 0 0 5533100 7892100 40479000 0 5648700 8952600 17349000 43275 345 40400 386609;386610;386611;386612;386613;386614;386615;386616;386617 491911;491912;491913;491914;491915;491916;491917;491918;491919 491918 9 THLAPYSDELR Unmodified 1300.6412 0.64116473 1821 P02647;F8W696 APOA1 Apolipoprotein A-I;Proapolipoprotein A-I;Truncated apolipoprotein A-I yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 39.919 39.919 2;3 3.971E-05 35227 QUIQUE_C1277_190116_001 104.79 91.839 4683400000 503460000 379030000 162400000 379110000 1200600000 457580000 250820000 28015000 139220000 63375000 190510000 166290000 763020000 43276 1821 40401 386618;386619;386620;386621;386622;386623;386624;386625;386626;386627;386628;386629;386630;386631;386632;386633;386634;386635;386636;386637;386638;386639;386640 491920;491921;491922;491923;491924;491925;491926;491927;491928;491929;491930;491931;491932;491933;491934;491935;491936;491937;491938;491939;491940;491941;491942;491943;491944 491922 25 THLDKPYCAPQK Unmodified 1456.7133 0.71328381 134 A0A3B3ISH2;A0A0A0MQY7;Q5VU97 CACHD1 VWFA and cache domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 13.811 13.811 3 0.00036156 6338 QUIQUE_C1218_190116_001 77.593 63.784 73727000 21253000 0 0 11460000 0 0 0 0 14174000 0 22074000 4766300 0 43277 134 40402 386641;386642;386643;386644;386645 491945;491946;491947;491948;491949 491945 5 THLGEALAPLSK Unmodified 1235.6874 0.68738664 1493 O15240;Q05BJ3 VGF Neurosecretory protein VGF;Neuroendocrine regulatory peptide-1;Neuroendocrine regulatory peptide-2;Antimicrobial peptide VGF[554-577] yes no 0 0 0 1 1 47.18 47.18 2 0.00043048 45086 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1 1 1 1 1 1 1 1 128.69 128.69 2;3 7.158E-14 132529 QUIQUE_C1403_190116_001 106.14 89.26 540150000 30004000 35927000 31134000 38085000 27477000 29068000 49628000 44990000 43061000 19516000 0 33271000 157990000 43281 1201 40406 386684;386685;386686;386687;386688;386689;386690;386691;386692;386693;386694;386695 492039;492040;492041;492042;492043;492044;492045;492046;492047;492048;492049;492050;492051;492052;492053;492054;492055;492056 492045 18 THLQAGLSPETLEK Acetyl (Protein N-term) 1564.8097 0.80968662 3301 Q5SYC1 CLVS2 Clavesin-2 yes yes 1 0 0 1 77.914 77.914 2 0.0001781 80202 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.163 76.233 35455000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35455000 0 0 43282 3301 40407 386696 492057 492057 1 THLQDLKEVTHNIHYETYR Unmodified 2396.1873 0.18730686 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 1 2 60.748 60.748 4;5 0.019051 59383 QUIQUE_DMIX1_190116_001 33.764 29.813 100590000 0 0 0 0 0 0 0 100590000 0 0 0 0 0 43283 419 40408 386697;386698 492058;492059 492059 2 THLSLSHNPEQK Unmodified 1389.7001 0.70007659 2027;1005 F5H2F4;V9GYY3;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 1 2 2 3 2 2 1 1 13.426 13.426 2;3 9.6103E-96 5657 QUIQUE_C1403_190116_001 225.63 191.81 1540300000 146140000 189120000 196320000 84361000 115730000 90228000 201910000 335110000 169350000 0 12043000 0 0 43284 1005;2027 40409 386699;386700;386701;386702;386703;386704;386705;386706;386707;386708;386709;386710;386711;386712;386713;386714;386715;386716 492060;492061;492062;492063;492064;492065;492066;492067;492068;492069;492070;492071;492072;492073;492074;492075;492076;492077;492078;492079;492080;492081 492068 17 THLTELQR Unmodified 996.53524 0.53524309 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 16.755 16.755 2 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THMQDLKDVTNNVHYENYR Oxidation (M) 2392.0866 0.086606536 3171 Q16181;E7ES33;E7EPK1;G3V1Q4 SEPT7 Septin-7 yes no 0 1 1 2 1 1 1 1 47.391 47.391 3;4 4.1787E-06 45755 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.059 95.619 910090000 0 0 0 0 0 0 0 351750000 226600000 0 91849000 130380000 109500000 43288 3171 40412 386734;386735;386736;386737;386738;386739 492101;492102;492103;492104;492105;492106;492107;492108;492109;492110 492103 2608 10 THMQDLKDVTR Oxidation (M) 1358.6612 0.66124824 1514 O43236;J3QRT6;J3KSZ7 SEPT4 Septin-4 yes no 0 1 1 1 12.406 12.406 3 0.052053 4779 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.28 37.669 5152700 0 0 0 0 0 0 0 5152700 0 0 0 0 0 43289 1514 40413 386740 492111 492111 1 THMQDLKDVTR Unmodified 1342.6663 0.66633362 1514 O43236;J3QRT6;J3KSZ7 SEPT4 Septin-4 yes no 0 0 1 1 20.78 20.78 3 0.0013392 14017 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.03 57.817 34372000 0 0 0 0 0 0 0 34372000 0 0 0 0 0 43290 1514 40413 386741 492112 492112 1 THMTHHPISDHEATLR Unmodified 1881.8904 0.89041333 2063;393;280;1891;2104 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histocompatibility antigen, A-36 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-1 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-80 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain no no 0 1 0 2 10.556 10.556 4;5 4.6375E-14 2773 QUIQUE_C1563_190116_001 137.19 127.23 18942000 0 0 0 0 0 18942000 0 0 0 0 0 0 0 43292 280;393;1891;2063;2104 40414 386745;386746 492117;492118 492117 208 2 THNDIIHNENMR Unmodified 1492.6841 0.68410895 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 0 0 3 3 2 2 3 3 3 3 3 3 2 3 3 16.343 16.343 2;3;4 3.4348E-45 9272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.44 131.13 7150700000 449960000 731490000 257930000 669200000 623540000 338230000 431980000 620480000 914180000 104580000 594180000 592740000 822170000 43293 859 40415 386747;386748;386749;386750;386751;386752;386753;386754;386755;386756;386757;386758;386759;386760;386761;386762;386763;386764;386765;386766;386767;386768;386769;386770;386771;386772;386773;386774;386775;386776;386777;386778;386779;386780;386781;386782 492119;492120;492121;492122;492123;492124;492125;492126;492127;492128;492129;492130;492131;492132;492133;492134;492135;492136;492137;492138;492139;492140;492141;492142;492143;492144;492145;492146;492147;492148;492149;492150;492151;492152;492153;492154;492155;492156;492157;492158 492142 33 THNDIIHNENMR Oxidation (M) 1508.679 0.67902357 859 E7EQR4;P15311 EZR Ezrin yes no 0 1 0 2 10.259 10.259 3;4 0.00014327 2650 QUIQUE_DMIX4_190116_001 96.371 89.79 91381000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91381000 0 0 0 43294 859 40415 386783;386784 492159;492160 492159 516 2 THNGESVSYLFSHVPL Unmodified 1785.8686 0.86859848 591;2030 B1ALA9;P60891;B7ZB02;H7C540;A0A0B4J207;P21108;P11908 PRPS1;PRPS2;PRPS1L1 Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1;Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3;Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2 no no 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 2 2 2 1 113.35 113.35 2;3 2.4891E-06 117995 QUIQUE_C1576_190116_001 119.39 110.17 2043100000 0 213490000 60964000 120530000 194640000 48694000 197140000 77224000 361130000 0 316000000 254330000 198960000 43295 591;2030 40416 386785;386786;386787;386788;386789;386790;386791;386792;386793;386794;386795;386796;386797;386798;386799;386800;386801 492161;492162;492163;492164;492165;492166;492167;492168;492169;492170;492171;492172;492173;492174;492175;492176;492177;492178 492169 17 THNLEPYFESFINNLR Unmodified 1992.9694 0.96937516 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 141.24 141.24 2;3 2.1546E-29 146002 QUIQUE_DMIX8_190116_001 187.62 177.01 7329600000 410200000 363340000 134740000 477970000 673300000 378730000 411220000 457990000 660980000 685890000 826720000 1005900000 842660000 + 43296 1859 40417 386802;386803;386804;386805;386806;386807;386808;386809;386810;386811;386812;386813;386814;386815;386816;386817;386818;386819;386820;386821;386822;386823;386824;386825;386826;386827 492179;492180;492181;492182;492183;492184;492185;492186;492187;492188;492189;492190;492191;492192;492193;492194;492195;492196;492197;492198;492199;492200;492201;492202;492203;492204;492205;492206;492207;492208;492209;492210;492211;492212;492213;492214;492215;492216;492217;492218;492219;492220;492221;492222;492223;492224;492225;492226;492227;492228;492229;492230 492228 51 THNLEPYFESFINNLRR Unmodified 2149.0705 0.070486187 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 yes no 0 0 1 3 130.13 130.13 3;4 6.4347E-25 132876 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.89 112.47 147750000 0 0 0 0 0 0 0 147750000 0 0 0 0 0 + 43297 1859 40418 386828;386829;386830 492231;492232;492233 492232 1 THNLNVEYNIFEGVECR Unmodified 2092.9636 0.96363785 1430 O14531 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 1 103.32 103.32 2;3 2.7807E-65 106310 QUIQUE_C1368_190116_001 234.22 207.25 1112800000 126660000 172250000 153460000 158920000 0 100720000 164460000 65319000 0 43491000 30888000 96621000 0 43298 1430 40419 386831;386832;386833;386834;386835;386836;386837;386838;386839;386840;386841;386842;386843;386844;386845;386846;386847 492234;492235;492236;492237;492238;492239;492240;492241;492242;492243;492244;492245;492246;492247;492248;492249;492250;492251;492252;492253 492241 19 THNSSLEYNIFEGMECR Oxidation (M) 2101.8833 0.88333862 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 76.068 76.068 2;3 3.5915E-223 76387 QUIQUE_DMIX1_190116_001 271.08 266 8264100000 497830000 730530000 691860000 608890000 435000000 564180000 534900000 508860000 630260000 841190000 615210000 739720000 865690000 43299 365 40420 386848;386849;386850;386851;386852;386853;386854;386855;386856;386857;386858;386859;386860;386861;386862;386863;386864;386865;386866;386867;386868;386869;386870;386871;386872;386873;386874 492254;492255;492256;492257;492258;492259;492260;492261;492262;492263;492264;492265;492266;492267;492268;492269;492270;492271;492272;492273;492274;492275;492276;492277;492278;492279;492280;492281;492282;492283;492284;492285;492286;492287;492288;492289;492290;492291;492292;492293;492294;492295;492296;492297;492298;492299;492300;492301 492284 263 48 THNSSLEYNIFEGMECR Unmodified 2085.8884 0.888424 365 A0A1C7CYX9;Q16555 DPYSL2 Dihydropyrimidinase-related protein 2 yes no 0 0 0 3 3 4 3 3 3 3 2 2 2 2 3 3 101.62 101.62 2;3 0 106209 QUIQUE_C1218_190116_001 347.6 329.94 42449000000 3809300000 4223000000 4250100000 3447200000 2883700000 3031700000 4209200000 2042000000 1969700000 1544500000 4140900000 3297300000 3600200000 43300 365 40420 386875;386876;386877;386878;386879;386880;386881;386882;386883;386884;386885;386886;386887;386888;386889;386890;386891;386892;386893;386894;386895;386896;386897;386898;386899;386900;386901;386902;386903;386904;386905;386906;386907;386908;386909;386910 492302;492303;492304;492305;492306;492307;492308;492309;492310;492311;492312;492313;492314;492315;492316;492317;492318;492319;492320;492321;492322;492323;492324;492325;492326;492327;492328;492329;492330;492331;492332;492333;492334;492335;492336;492337;492338;492339;492340;492341;492342;492343;492344;492345;492346;492347;492348;492349;492350;492351;492352;492353;492354;492355;492356;492357;492358;492359;492360;492361;492362;492363;492364;492365;492366;492367;492368;492369;492370;492371;492372;492373;492374;492375;492376;492377;492378;492379;492380 492303 77 THNVHVEIEQR Unmodified 1360.6848 0.68476088 1111;3416 H0Y2S9;Q6WCQ1;J3KSW8 MPRIP Myosin phosphatase Rho-interacting protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 14.156 14.156 3 0.00011335 6453 QUIQUE_C1576_190116_001 102.62 80.862 1372100000 0 37819000 0 0 54217000 93516000 44226000 40358000 54938000 0 25934000 0 1021100000 43301 1111;3416 40421 386911;386912;386913;386914;386915;386916;386917;386918 492381;492382;492383;492384;492385;492386;492387;492388 492384 6 THPGPVVHLSDSPR Unmodified 1497.7688 0.76882486 713 C9JPK3;C9K0E4;C9JCY1;C9JQS3;E9PFI2;Q9Y2K9 STXBP5L Syntaxin-binding protein 5-like yes no 0 0 0 1 21.785 21.785 3 0.0034934 14892 QUIQUE_C1576_190116_001 63.037 51.982 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43302 713 40422 386919 492389 492389 1 THPHFVIPYR Unmodified 1265.6669 0.66692597 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067;H7C0V9 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 1 1 40.536 40.536 3 0.004108 36954 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.653 85.395 122960000 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yes yes 0 0 0 1 1 1 68.504 68.504 2;3 0.00086847 68182 QUIQUE_C1277_190116_001 91.961 78.192 90196000 36800000 27324000 26071000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43305 1506 40425 386945;386946;386947 492428;492429;492430 492429 1 THQDLSITAK Acetyl (Protein N-term) 1154.5932 0.5931519 4134 Q9H1K4 SLC25A18 Mitochondrial glutamate carrier 2 yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.614 36.614 2 2.3952E-05 32288 QUIQUE_C1277_190116_001 143.5 116.81 717060000 0 76851000 94193000 47280000 49074000 86819000 61969000 60434000 0 30430000 76407000 57492000 76116000 43306 4134 40426 386948;386949;386950;386951;386952;386953;386954;386955;386956;386957;386958 492431;492432;492433;492434;492435;492436;492437;492438;492439;492440;492441 492431 9 THQEVPSEPGR Unmodified 1235.5895 0.58946351 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 1 1 14.263 14.263 2;3 0.00035758 6292 QUIQUE_C1368_190116_001 117.7 80.14 381290000 0 34798000 60676000 31158000 45887000 0 41207000 32107000 33587000 0 35708000 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128480000 100390000 57171000 43323 325 40443 387154;387155;387156;387157;387158;387159;387160;387161;387162;387163;387164;387165;387166;387167;387168;387169;387170;387171;387172 492738;492739;492740;492741;492742;492743;492744;492745;492746;492747;492748;492749;492750;492751;492752;492753;492754;492755;492756;492757;492758;492759;492760;492761;492762;492763;492764;492765;492766 492759 29 THVTHHPVSDHEATLR Unmodified 1835.9027 0.90269258 2318 P30685;P30491;P30498;P30490;P18464 HLA-B HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain no no 0 0 0 1 10.201 10.201 4 0.016269 2679 QUIQUE_C1218_190116_001 34.395 25.351 2960800 2960800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43324 2318 40444 387173 492767 492767 0 THWTLDK Unmodified 899.45012 0.45011648 3800 Q96AC1;H0YJ34;G3V281;G3V5R2;Q9BQL6;Q5JWV4 FERMT2;FERMT1 Fermitin family homolog 2;Fermitin family homolog 1 yes no 0 0 0 1 21.637 21.637 2 0.037538 14511 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.265 42.199 45099000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45099000 0 0 0 43325 3800 40445 387174 492768 492768 1 THYGLLFDEFQGLSHLEALEMLSQESEIK Unmodified 3363.6333 0.63330874 4279 Q9NRY5;E7ESJ7 FAM114A2 Protein FAM114A2 yes no 0 0 0 1 162.74 162.74 4 0.06295 167148 QUIQUE_DMIX7_190116_001 9.2745 5.3902 59135000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 59135000 0 43326 4279 40446 387175 492769 492769 1 THYIVGYNLPSYEYLYNLGDQYALK Unmodified 2996.4596 0.45962512 1868 P04843;B7Z4L4 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 148.94 148.94 3 3.8441E-19 153405 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.94 97.564 97059000 0 0 0 26516000 0 0 0 0 70543000 0 0 0 0 43327 1868 40447 387176;387177 492770;492771;492772 492772 3 THYPAQQGEYQTHQPVYHK Unmodified 2311.077 0.077028128 1753 O95817;C9JFK9 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 20.438 20.438 3;4 0.0015163 13520 QUIQUE_DMIX7_190116_001 42.913 39.25 888460000 69426000 49258000 0 136130000 90187000 0 76473000 80725000 0 37636000 76463000 133260000 138910000 43328 1753 40448 387178;387179;387180;387181;387182;387183;387184;387185;387186;387187;387188;387189 492773;492774;492775;492776;492777;492778;492779;492780;492781;492782;492783;492784 492782 10 THYQADIER Unmodified 1131.5309 0.530886 1737 O95573 ACSL3 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.619 16.619 2;3 0.0042823 8574 QUIQUE_C1277_190116_001 89.355 54.547 91345000 0 33047000 0 50311000 0 0 0 0 0 7987300 0 0 0 43329 1737 40449 387190;387191;387192;387193;387194;387195 492785;492786;492787;492788;492789;492790 492786 6 THYSELTTLTSQYIK Unmodified 1783.8992 0.89922991 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 93.434 93.434 2;3 1.3439E-18 90787 QUIQUE_DMIX4_190116_001 183.08 173.97 1930900000 0 228830000 0 0 0 0 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Unmodified 1373.5704 0.57038433 2369 P35221;G3XAM7 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 3 2 1 2 2 13.805 13.805 2;3 0.00047172 5708 QUIQUE_C1563_190116_001 108.47 85.829 428750000 30937000 39899000 83215000 37634000 30509000 67358000 42879000 17269000 0 0 36939000 0 42116000 43332 2369 40452 387229;387230;387231;387232;387233;387234;387235;387236;387237;387238;387239;387240;387241;387242;387243;387244;387245;387246;387247 492829;492830;492831;492832;492833;492834;492835;492836;492837;492838;492839;492840;492841;492842;492843;492844;492845;492846;492847;492848 492840 18 TIADLELHYQEFIR Unmodified 1746.8941 0.89408495 2096 P15924 DSP Desmoplakin yes yes 0 0 0 1 124.14 124.14 3 0.0003834 127619 QUIQUE_C1403_190116_001 76.548 49.819 23335000 0 0 0 23335000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43333 2096 40453 387248 492849 492849 1 TIAECLADELINAAK Unmodified 1630.8236 0.82362212 1370 M0R0F0;M0R0R2;P46782;M0QZN2 RPS5 40S ribosomal protein S5;40S ribosomal protein S5, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 152.73 152.73 2;3 8.8163E-25 155650 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.05 133.26 2817500000 177200000 211140000 23983000 265710000 163360000 288680000 274530000 237230000 456250000 83551000 200670000 204120000 231060000 43334 1370 40454 387249;387250;387251;387252;387253;387254;387255;387256;387257;387258;387259;387260;387261;387262;387263;387264;387265;387266;387267;387268;387269;387270;387271;387272 492850;492851;492852;492853;492854;492855;492856;492857;492858;492859;492860;492861;492862;492863;492864;492865;492866;492867;492868;492869;492870;492871;492872;492873;492874;492875;492876 492865 27 TIAEIFGNPNYLR Unmodified 1506.7831 0.78307794 3177 Q16401 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 118.43 118.43 2 1.2548E-12 122102 QUIQUE_C1403_190116_001 152.28 124.26 650340000 46473000 51469000 66871000 50094000 38977000 43837000 44010000 72787000 54818000 0 55991000 59222000 65787000 43335 3177 40455 387273;387274;387275;387276;387277;387278;387279;387280;387281;387282;387283;387284;387285 492877;492878;492879;492880;492881;492882;492883;492884;492885;492886;492887;492888;492889 492880 12 TIAFLLPMFR Unmodified 1207.6787 0.67873621 234 A0A0C4DG89;Q7L014;D6RJA6 DDX46 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX46 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 153.7 153.7 2 0.00014671 158638 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.13 99.98 93153000 0 11042000 7644800 9217200 0 0 11030000 9375200 10372000 0 14225000 10119000 10128000 43336 234 40456 387286;387287;387288;387289;387290;387291;387292;387293;387294;387295;387296;387297 492890;492891;492892;492893;492894;492895;492896;492897;492898;492899;492900;492901 492898 11 TIAIIAEGIPEALTR Unmodified 1566.8981 0.8981077 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 131.27 131.27 2;3 2.2351E-07 135512 QUIQUE_C1277_190116_001 89.136 80.144 2123200000 157520000 182350000 169190000 124190000 136430000 132560000 151690000 198340000 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no 0 1 0 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 2 48.532 48.532 2 4.7848E-05 46639 QUIQUE_DMIX3_190116_001 127.4 89.311 6514600000 623000000 350960000 412120000 238170000 262290000 320150000 253120000 535350000 823440000 232130000 957390000 787600000 718880000 43339 1900 40459 387326;387327;387328;387329;387330;387331;387332;387333;387334;387335;387336;387337;387338;387339;387340;387341;387342;387343;387344 492942;492943;492944;492945;492946;492947;492948;492949;492950;492951;492952;492953;492954;492955;492956;492957;492958;492959;492960;492961 492953 1118 19 TIAMDGTEGLVR Unmodified 1261.6336 0.63363651 1900 P06576;H0YH81;F8W079 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 69.64 69.64 2 4.4673E-07 69455 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.77 112.84 13577000000 2440600000 0 1187600000 726970000 673520000 909010000 980280000 1715000000 816590000 760570000 1525200000 927230000 914740000 43340 1900 40459 387345;387346;387347;387348;387349;387350;387351;387352;387353;387354;387355;387356;387357;387358;387359;387360;387361 492962;492963;492964;492965;492966;492967;492968;492969;492970;492971;492972;492973;492974;492975;492976;492977;492978;492979;492980;492981;492982;492983;492984;492985;492986;492987;492988;492989;492990;492991 492979 30 TIAPALVSK Unmodified 898.54877 0.54876789 1906 P06733;K7EM90;A0A2R8YEM5;A0A2R8Y879;K7ERS8;A0A2R8Y6I8 ENO1 Alpha-enolase;Enolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 37.351 37.351 1;2 0.014899 33576 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.897 44.878 88390000000 0 6421300000 7623500000 7342100000 5682700000 6116500000 8766200000 7764000000 8206300000 3401100000 9923300000 7562400000 9580300000 43341 1906 40460 387362;387363;387364;387365;387366;387367;387368;387369;387370;387371;387372;387373;387374 492992;492993;492994;492995;492996;492997;492998;492999;493000;493001;493002;493003;493004;493005;493006;493007;493008;493009;493010 493008 18 TIAPQNAPR Unmodified 966.52468 0.52467841 4332 Q9NYF8;A0A1W2PQ43;E9PK09;E9PQN2;E9PKI6;E9PK91;E9PJA7;H0YF00 BCLAF1 Bcl-2-associated transcription factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 16.929 16.929 2 0.00065622 9373 QUIQUE_C1438_190116_001 111.04 86.113 289980000 0 56111000 30379000 0 79003000 0 49846000 0 0 0 0 74640000 0 43342 4332 40461 387375;387376;387377;387378;387379 493011;493012;493013;493014;493015 493013 2 TIAQDYGVLK Unmodified 1106.5972 0.59717465 2904 Q06830;A0A0A0MSI0 PRDX1 Peroxiredoxin-1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 62.855 62.855 1;2 0.00032353 63627 QUIQUE_C1218_190116_001 176.33 127.23 55914000000 5271600000 4353800000 5248800000 6071600000 5186800000 0 0 5721400000 6865900000 2295800000 8987900000 5910700000 0 43343 2904 40462 387380;387381;387382;387383;387384;387385;387386;387387;387388;387389;387390;387391 493016;493017;493018;493019;493020;493021;493022;493023;493024;493025;493026;493027;493028;493029;493030;493031 493017 12 TIAQGNLSNTDVQAAK Unmodified 1629.8322 0.83221298 2202 P22695;H3BRG4 UQCRC2 Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.626 41.626 2 2.5719E-54 37031 QUIQUE_DMIX8_190116_001 190.46 155.04 15432000000 1520400000 1208900000 1312800000 970220000 1028600000 1480900000 1262900000 1042100000 1183300000 492460000 1291100000 1216800000 1421500000 43344 2202 40463 387392;387393;387394;387395;387396;387397;387398;387399;387400;387401;387402;387403;387404 493032;493033;493034;493035;493036;493037;493038;493039;493040;493041;493042;493043;493044;493045;493046;493047;493048;493049;493050;493051;493052;493053;493054;493055;493056;493057 493057 26 TIAQMIEDEQR Unmodified 1332.6344 0.63436479 851;1633 E7EMZ9;E9PBC6;O95359;Q4VXL4;D6RAA5;Q4VXL8;H0Y9C3;O75410;E7EVI4;E7ET87 TACC2;TACC1 Transforming acidic coiled-coil-containing protein 2;Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 82.303 82.303 2 0.0066238 84472 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.298 59.285 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43345 851;1633 40464 387405;387406;387407;387408 493058;493059;493060;493061 493061 4 TIAQVLVHLHR Unmodified 1285.7619 0.76188899 3973 Q99747 NAPG Gamma-soluble NSF attachment protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 2 58.518 58.518 2;3 6.8385E-05 57633 QUIQUE_C1277_190116_001 102.06 88.098 4047100000 321570000 420000000 454870000 307740000 382200000 295520000 411010000 192520000 265900000 72641000 314760000 302530000 305850000 43346 3973 40465 387409;387410;387411;387412;387413;387414;387415;387416;387417;387418;387419;387420;387421;387422;387423;387424;387425;387426;387427;387428;387429;387430;387431 493062;493063;493064;493065;493066;493067;493068;493069;493070;493071;493072;493073;493074;493075;493076;493077;493078;493079;493080;493081;493082;493083;493084;493085;493086;493087;493088;493089;493090;493091;493092 493066 28 TIAQYAR Unmodified 821.43955 0.43955179 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 20.069 20.069 2 0.025454 13272 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.957 61.133 250390000 0 0 0 0 0 0 0 166290000 36426000 0 0 47678000 0 43347 2017 40466 387432;387433;387434 493093;493094;493095 493093 3 TIAVDFASEDIYDKIK Unmodified 1826.9302 0.93019569 3252 Q53GQ0;A0A1B0GVY6;E9PI21 HSD17B12 Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase yes no 0 0 1 1 1 1 111.96 111.96 3 0.0026646 115413 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.09 29.39 310710000 0 0 0 0 0 0 0 0 121320000 0 91419000 97969000 0 43348 3252 40467 387435;387436;387437 493096;493097;493098 493098 2 TICAEFAILR Unmodified 1192.6274 0.62742892 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 1 103.21 103.21 2 0.011915 107916 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.621 22.174 29223000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11037000 18186000 0 43349 1650 40468 387438;387439 493099;493100 493099 2 TICAILENYQTEK Unmodified 1581.7709 0.77085827 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.738 94.738 2 2.8016E-17 97405 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60S ribosomal protein L9 yes no 0 1 0 1 20.694 20.694 2 0.0065333 14002 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.642 69.258 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43353 2353 40471 387453 493118 493118 1752 1 TIDAHGLMVLPGGVDVHTR Unmodified 1987.0309 0.030929558 1430 O14531 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 88.694 88.694 3;4 8.9276E-12 91259 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.332 71.11 2060600000 204710000 229700000 177980000 227780000 170150000 134160000 177430000 138990000 130080000 75927000 184020000 121090000 88617000 43354 1430 40472 387454;387455;387456;387457;387458;387459;387460;387461;387462;387463;387464;387465;387466;387467;387468;387469 493119;493120;493121;493122;493123;493124;493125;493126;493127;493128;493129;493130;493131;493132;493133;493134;493135;493136;493137;493138;493139;493140;493141;493142;493143;493144;493145;493146;493147 493144 29 TIDDLEDELYAQK Unmodified 1551.7304 0.73043325 435;1908 P06753;A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90 TPM3 Tropomyosin alpha-3 chain no no 0 0 0 1 1 1 107.15 107.15 2 0.00027086 104207 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.13 97.157 64088000 0 0 0 0 0 32287000 0 0 0 31801000 0 0 0 43355 1908;435 40473 387470;387471;387472 493148;493149;493150 493150 3 TIDDLEDKLK Unmodified 1188.6238 0.62378333 63;3271;1260 J3KN67;Q5HYB6;A0A087WWU8 TPM3;DKFZp686J1372 no no 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 57.908 57.908 2;3 0.00033843 56632 QUIQUE_C1277_190116_001 110.53 95.717 4415500000 137470000 609070000 682580000 242690000 266880000 237820000 249370000 226040000 820880000 102620000 299310000 264100000 276710000 43356 1260;3271;63 40474 387473;387474;387475;387476;387477;387478;387479;387480;387481;387482;387483;387484;387485;387486;387487;387488;387489 493151;493152;493153;493154;493155;493156;493157;493158;493159;493160;493161;493162;493163;493164;493165;493166;493167;493168;493169;493170;493171;493172;493173;493174;493175;493176;493177;493178 493155 28 TIDDLEEK Unmodified 961.46041 0.4604064 2791 P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;K7EPB9 TPM4 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0 0 0 1 63.303 63.303 2 0.058005 62510 QUIQUE_C1277_190116_001 60.255 38.569 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43379 2632 40496 387706 493467 493467 1 TIEIEGLR Unmodified 929.5182 0.51819605 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 61.702 61.702 2 0.0036009 61737 QUIQUE_C1438_190116_001 113.7 73.123 5779800000 836460000 647630000 574600000 395920000 565910000 0 674920000 0 443180000 0 624520000 496600000 520030000 43380 3176 40497 387707;387708;387709;387710;387711;387712;387713;387714;387715;387716;387717;387718;387719 493468;493469;493470;493471;493472;493473;493474;493475;493476;493477;493478;493479;493480;493481;493482;493483;493484;493485;493486;493487;493488 493474 21 TIEIQATNALDEK Unmodified 1444.7409 0.74093835 4249 Q9NQ48 LZTFL1 Leucine zipper transcription factor-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 68.752 68.752 2 0.00053673 69644 QUIQUE_C1438_190116_001 112.83 70.643 126000000 0 0 0 0 52347000 0 36131000 0 0 0 0 37523000 0 43381 4249 40498 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493501;493502;493503;493504;493505;493506;493507;493508;493509;493510;493511;493512;493513;493514;493515;493516;493517;493518 493501 13 TIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGK Oxidation (M) 3116.57 0.5699802 2135 P18206;A0A096LPE1 VCL Vinculin yes no 0 1 0 1 160.97 160.97 4 0.0002036 166516 QUIQUE_C1576_190116_001 43.895 32.688 215490000 0 0 0 0 0 0 215490000 0 0 0 0 0 0 43384 2135 40500 387746 493519 493519 1482 0 TIEYLEEVAITFAK Unmodified 1625.8552 0.85523983 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5;A0A2R8YG21;A0A2R8Y688 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 2 3 3 2 3 2 4 3 4 2 3 5 1 156.32 156.32 2;3 1.6375E-28 161559 QUIQUE_C1368_190116_001 170.52 121.88 867540000 42116000 70842000 112690000 0 53036000 51526000 145670000 74376000 64690000 31068000 89154000 70592000 61778000 43385 1153 40501 387747;387748;387749;387750;387751;387752;387753;387754;387755;387756;387757;387758;387759;387760;387761;387762;387763;387764;387765;387766;387767;387768;387769;387770;387771;387772;387773;387774;387775;387776;387777;387778;387779;387780;387781;387782;387783 493520;493521;493522;493523;493524;493525;493526;493527;493528;493529;493530;493531;493532;493533;493534;493535;493536;493537;493538;493539;493540;493541;493542;493543;493544;493545;493546;493547;493548;493549;493550;493551;493552;493553;493554;493555;493556;493557;493558;493559;493560;493561;493562;493563;493564;493565;493566;493567;493568;493569;493570;493571 493527 51 TIEYLQPNPASR Unmodified 1387.7096 0.70957864 3982;3981 Q99962;Q99961;M0R0I3;M0QYE0 SH3GL2;SH3GL1 Endophilin-A1;Endophilin-A2 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 59.08 59.08 2 2.0242E-37 59375 QUIQUE_C1218_190116_001 190.88 160.63 5385300000 430200000 456060000 422350000 401960000 444360000 318270000 463210000 385360000 294200000 172560000 524960000 444240000 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Q15124;Q5JTY7 PGM5 Phosphoglucomutase-like protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.919 80.919 3 0.018602 82018 QUIQUE_C1368_190116_001 39.622 19.788 152620000 21662000 26500000 19266000 18900000 20957000 10746000 0 0 0 0 15316000 19275000 0 43388 3115 40504 387812;387813;387814;387815;387816;387817;387818;387819 493619;493620;493621;493622;493623;493624;493625;493626;493627 493622 9 TIFKDFYELEPHK Unmodified 1665.8403 0.84025847 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 1 2 1 1 87.984 87.984 3 1.5453E-05 89495 QUIQUE_DMIX3_190116_001 92.457 81.187 259220000 0 0 0 0 0 0 0 185390000 0 0 73836000 0 0 43389 2017 40505 387820;387821;387822;387823 493628;493629;493630;493631 493630 4 TIFLLHR Unmodified 898.53887 0.53887191 3961 Q99598;C4P0D6;C4P0D8;C4P0D4;Q5VVQ1 TSNAX;DISC1 Translin-associated protein X yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 51.539 51.539 2 0.025454 50203 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.957 63.028 324600000 62540000 0 64972000 0 0 0 0 57759000 0 0 84324000 55003000 0 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no 0 0 0 1 124.25 124.25 2 0.039603 127877 QUIQUE_C1403_190116_001 60.788 24.908 5098500 0 0 0 5098500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43393 35 40508 387840 493650 493650 1 TIFQGIAAK Unmodified 947.54402 0.54401687 2602 P52209;K7EM49;K7EPF6;K7EMN2 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 55.988 55.988 1;2 6.1967E-05 54517 QUIQUE_DMIX5_190116_001 168.27 103.46 7031100000 518600000 429510000 587680000 589780000 506130000 424940000 539400000 621890000 538600000 275740000 737230000 539190000 722450000 43394 2602 40509 387841;387842;387843;387844;387845;387846;387847;387848;387849;387850;387851;387852;387853;387854;387855;387856 493651;493652;493653;493654;493655;493656;493657;493658;493659;493660;493661;493662;493663;493664;493665;493666;493667;493668 493663 12 TIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQK Unmodified 3437.6892 0.68918414 2933 Q09028 RBBP4 Histone-binding protein RBBP4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 147.8 147.8 4;5 3.7067E-05 154205 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387865 493677 493677 1 TIGAELMELVR Unmodified 1230.6642 0.66420836 4355 Q9NZQ3;C9JSC3;H7C2K2 NCKIPSD NCK-interacting protein with SH3 domain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.82 134.82 2 0.00074572 137947 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.342 62.089 198520000 0 37584000 34377000 30945000 0 25212000 0 29768000 0 8980300 0 0 31657000 43398 4355 40513 387866;387867;387868;387869;387870;387871;387872;387873;387874 493678;493679;493680;493681;493682;493683;493684;493685;493686 493683 8 TIGGGDDSFNTFFSETGAGK Unmodified 2006.8858 0.88576469 2795;3430;3992;1990;1031 F8VQQ4;F8VRZ4;F8VWV9;F8VX09;F8VRK0;F8VXZ7;P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;F8W0F6;P68363;F8VVB9;F8VS66;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2 TUBA1A;TUBA1B;TUBA3E;TUBA1C Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1B chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain no no 0 0 0 9 6 6 7 8 5 6 7 8 6 7 10 7 127.9 127.9 2;3 0 129225 QUIQUE_C1218_190116_001 330.26 307.73 240330000000 19750000000 23230000000 16737000000 18339000000 21532000000 17651000000 18191000000 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493689 181 TIGGGDDSFTTFFCETGAGK Unmodified 2066.8891 0.88913551 2796;737 C9JQ00;P68366;C9JJQ8;C9JEV8;C9JDL2 TUBA4A Tubulin alpha-4A chain no no 0 0 0 4 1 3 2 2 1 3 1 1 1 1 2 4 133.17 133.17 2;3 1.4582E-116 136243 QUIQUE_DMIX8_190116_001 215.61 210.53 11464000000 1233000000 1276300000 810440000 874480000 1128700000 838060000 1022000000 503830000 605420000 263100000 802360000 1024800000 1082000000 43400 737;2796 40515 387967;387968;387969;387970;387971;387972;387973;387974;387975;387976;387977;387978;387979;387980;387981;387982;387983;387984;387985;387986;387987;387988;387989;387990;387991;387992 493873;493874;493875;493876;493877;493878;493879;493880;493881;493882;493883;493884;493885;493886;493887;493888;493889;493890;493891;493892;493893;493894;493895;493896;493897;493898;493899;493900;493901;493902;493903;493904;493905;493906;493907;493908;493909;493910;493911;493912;493913;493914;493915;493916;493917;493918;493919;493920;493921;493922;493923;493924 493918 48 TIGILTKPDLVDK Unmodified 1411.8286 0.82863115 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 72.158 72.158 2;3 0.0013882 71916 QUIQUE_C1368_190116_001 75.462 54.111 626370000 30207000 0 342700000 0 0 0 0 57099000 0 24580000 171790000 0 0 43401 2168 40516 387993;387994;387995;387996;387997;387998 493925;493926;493927;493928;493929;493930;493931 493926 7 TIGILTKPDLVDKGTEDK Unmodified 1942.0623 0.062272491 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 2 1 1 1 61.494 61.494 3 4.2113E-13 61344 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.26 111.77 192640000 0 0 65323000 0 0 0 0 43478000 0 0 83844000 0 0 43402 2168 40517 387999;388000;388001 493932;493933;493934 493934 3 TIGTGLVTNTLAMTEEEK Oxidation (M) 1922.9507 0.95067313 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 98.716 98.716 2 1.2861E-53 101712 QUIQUE_C1277_190116_001 181.67 165.54 1360300000 116030000 124330000 161830000 104690000 103990000 122330000 99823000 56081000 92237000 47217000 113000000 113220000 105520000 43403 2529 40518 388002;388003;388004;388005;388006;388007;388008;388009;388010;388011;388012;388013;388014;388015;388016;388017;388018;388019;388020;388021;388022;388023;388024;388025;388026;388027 493935;493936;493937;493938;493939;493940;493941;493942;493943;493944;493945;493946;493947;493948;493949;493950;493951;493952;493953;493954;493955;493956;493957;493958;493959;493960;493961 493938 1971 27 TIGTGLVTNTLAMTEEEK Unmodified 1906.9558 0.95575851 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 114.86 114.86 2;3 1.5424E-54 117657 QUIQUE_DMIX1_190116_001 240.37 203.52 5636000000 507440000 425420000 591780000 460910000 415240000 388510000 382100000 291930000 403440000 144480000 535460000 661630000 427670000 43404 2529 40518 388028;388029;388030;388031;388032;388033;388034;388035;388036;388037;388038;388039;388040;388041;388042;388043;388044;388045 493962;493963;493964;493965;493966;493967;493968;493969;493970;493971;493972;493973;493974;493975;493976;493977;493978;493979;493980;493981 493974 18 TIGTGLVTNTLAMTEEEKNIK Unmodified 2262.1777 0.17771295 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 106.21 106.21 3 0.018904 108331 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.012 31.517 72183000 0 0 0 0 0 0 0 72183000 0 0 0 0 0 43405 2529 40519 388046 493982 493982 0 TIGVDFLER Unmodified 1048.5553 0.55530983 4485 Q9ULC3 RAB23 Ras-related protein Rab-23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.079 97.079 2 0.00040551 99377 QUIQUE_DMIX8_190116_001 120.87 88.741 523850000 0 41834000 52102000 43617000 44105000 48570000 56657000 0 50064000 23126000 63242000 55748000 44788000 43406 4485 40520 388047;388048;388049;388050;388051;388052;388053;388054;388055;388056;388057;388058;388059 493983;493984;493985;493986;493987;493988;493989;493990;493991;493992;493993;493994;493995;493996;493997;493998 493998 16 TIGVITK Unmodified 730.45889 0.45889025 2893;269;4528;2569;840 A0A0D9SFB1;A0A1B0GU67;A0A1B0GUX5;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;P50570;K7EPK9;E5RHK8;E5RIK2;Q9UQ16 DNM1;DNM2;DNM3 Dynamin-1;Dynamin-2;Dynamin-3 no no 0 0 0 1 23.803 23.803 2 0.01927 17557 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.7 46.702 285240000 0 0 0 0 0 0 0 285240000 0 0 0 0 0 43407 269;2893;2569;840;4528 40521 388060 493999 493999 1 TIGYPWTLVYGTGK Unmodified 1554.8082 0.80823006 3597 Q8N573;H0YC07 OXR1 Oxidation resistance protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 133.77 133.77 2 0.023436 139846 QUIQUE_C1218_190116_001 47.815 12.928 290680000 60696000 0 0 0 46026000 0 0 43567000 0 0 140390000 0 0 43408 3597 40522 388061;388062;388063;388064;388065 494000;494001;494002;494003;494004 494000 3 TIHGLIYNALK Unmodified 1241.7132 0.71320746 917;1163 E9PFR3;Q14738;H0Y8C4;H7C5Q9;H0YJ75;Q13362;H0YN84;H0YJ49 PPP2R5D;PPP2R5C Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit delta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A 56 kDa regulatory subunit gamma isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.029 67.029 2;3 0.0013802 66907 QUIQUE_C1277_190116_001 85.716 59.26 377680000 42586000 42114000 70939000 0 30018000 0 41944000 0 0 14306000 51359000 49438000 34973000 43409 917;1163 40523 388066;388067;388068;388069;388070;388071;388072;388073;388074 494005;494006;494007;494008;494009;494010;494011;494012;494013 494006 9 TIHMTFVPDEEVGGHQGMELFVQRPEFHALR Unmodified 3606.75 0.75002703 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86;A0A1B0GV31;F8WC59;C9JYZ0 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 1 1 1 1 113.89 113.89 5 1.0327E-19 117575 QUIQUE_DMIX7_190116_001 77.211 72.052 172370000 0 0 0 0 0 0 0 0 51494000 0 84161000 36711000 0 43410 2885 40524 388075;388076;388077 494014;494015;494016 494016 3 TIHQEDELIEIQSDTGTWYQR Unmodified 2561.2034 0.20341043 3434 Q7L0J3 SV2A Synaptic vesicle glycoprotein 2A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 110.64 110.64 2;3 1.2618E-55 115685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 199.41 188.31 857270000 72446000 74601000 86704000 0 73062000 70679000 87821000 102470000 0 0 112440000 78116000 98932000 43411 3434 40525 388078;388079;388080;388081;388082;388083;388084;388085;388086;388087;388088 494017;494018;494019;494020;494021;494022;494023;494024;494025;494026;494027 494025 10 TIHSEQAVFDIYYPTEQVTIQVLPPK Unmodified 3015.5593 0.55933916 3023 Q13740;F5GXJ9 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 138.43 138.43 3 0.0069482 143409 QUIQUE_DMIX3_190116_001 28.41 22.38 39171000 0 0 0 0 0 0 0 0 39171000 0 0 0 0 43412 3023 40526 388089 494028 494028 1 TIICHVEGFPK Unmodified 1299.6645 0.66454271 3023 Q13740;F5GXJ9;H7C543 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 2 1 1 53.989 53.989 2;3 0.0064758 52253 QUIQUE_C1403_190116_001 68.525 46.439 155380000 0 61398000 0 55155000 38829000 0 0 0 0 0 0 0 0 43413 3023 40527 388090;388091;388092;388093;388094 494029;494030;494031;494032;494033 494031 5 TIIFVETK Unmodified 949.54843 0.54843354 381 A0A1X7SBZ2;A0A1W2PQ51;Q92841 DDX17 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX17 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.376 61.376 2 0.016365 60549 QUIQUE_C1576_190116_001 83.265 68.328 691220000 73705000 97013000 89398000 0 83078000 68545000 69801000 46185000 0 0 96575000 66924000 0 43414 381 40528 388095;388096;388097;388098;388099;388100;388101;388102;388103 494034;494035;494036;494037;494038;494039;494040;494041;494042 494039 9 TIIGSFNGALAAVPVQDLGSTVIK Unmodified 2370.3159 0.31586142 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 152.36 152.36 2;3 2.7206E-12 158144 QUIQUE_C1218_190116_001 135.09 123.3 1749500000 98296000 117120000 109090000 117750000 137950000 93542000 60022000 217190000 186940000 17076000 220040000 198090000 176380000 43415 4054 40529 388104;388105;388106;388107;388108;388109;388110;388111;388112;388113;388114;388115;388116;388117;388118;388119;388120;388121;388122;388123;388124;388125;388126;388127;388128 494043;494044;494045;494046;494047;494048;494049;494050;494051;494052;494053;494054;494055;494056;494057;494058;494059;494060;494061;494062;494063;494064;494065;494066;494067;494068;494069;494070;494071;494072;494073;494074;494075;494076;494077;494078;494079;494080 494043 38 TIIIGHSSGAIAAMR Unmodified 1496.8133 0.81333221 1663 O75884 RBBP9 Putative hydrolase RBBP9 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 2 56.879 56.879 2;3 0.00010002 54580 QUIQUE_DMIX8_190116_001 81.619 55.901 667980000 0 53467000 50595000 52633000 0 38713000 41324000 73078000 60715000 19571000 75287000 42617000 159980000 43416 1663 40530 388129;388130;388131;388132;388133;388134;388135;388136;388137;388138;388139;388140;388141;388142;388143 494081;494082;494083;494084;494085;494086;494087;494088;494089;494090;494091;494092;494093;494094;494095;494096 494095 16 TIINADKDGDGR Unmodified 1273.6262 0.62624295 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3 PPP3R1 Calcineurin subunit B type 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 1 1 16.312 16.312 2;3 0.00038 8478 QUIQUE_C1403_190116_001 131.82 79.103 2521500000 123850000 231140000 225560000 207400000 203060000 132690000 271970000 113060000 139250000 93605000 380590000 185460000 213910000 43417 801 40531 388144;388145;388146;388147;388148;388149;388150;388151;388152;388153;388154;388155;388156;388157;388158;388159;388160;388161;388162;388163;388164 494097;494098;494099;494100;494101;494102;494103;494104;494105;494106;494107;494108;494109;494110;494111;494112;494113;494114;494115;494116;494117 494103 11 TIIPLISQCTPK Unmodified 1369.7639 0.7639224 2431 P40926;G3XAL0 MDH2 Malate dehydrogenase, mitochondrial;Malate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 3 3 2 2 1 3 1 1 1 1 1 1 90.311 90.311 2 0.00051879 91909 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.52 83.744 24201000000 1673000000 2195000000 2133300000 1616300000 2075500000 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494223;494224;494225;494226;494227;494228;494229;494230;494231;494232;494233;494234;494235;494236;494237;494238;494239;494240;494241;494242;494243;494244;494245;494246;494247;494248 494236 26 TIKDLQEEVSNLYNNIR Unmodified 2048.0538 0.05383307 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 1 3 1 1 139.27 139.27 3 0.00081794 142675 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.495 46.842 61619000 0 0 0 0 0 0 0 19746000 0 0 0 27025000 14848000 43426 1692 40540 388253;388254;388255;388256;388257 494249;494250;494251;494252;494253 494249 4 TILALMK Unmodified 788.483 0.48299651 2574 P50995 ANXA11 Annexin A11 yes yes 0 0 0 1 1 71.491 71.491 2 0.049128 72318 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.311 40.205 172330000 0 0 0 0 0 0 0 72084000 0 0 100250000 0 0 43427 2574 40541 388258;388259 494254;494255;494256 494254 3 TILEMLLGFLK Oxidation (M) 1292.7414 0.74139604 3947 Q96T76 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 171.96 171.96 2 0.00082304 176599 QUIQUE_DMIX3_190116_001 97.431 76.73 90625000 4808400 13562000 0 0 12605000 0 0 5312000 8132800 0 15033000 19013000 12158000 43428 3947 40542 388260;388261;388262;388263;388264;388265;388266;388267;388268 494257;494258;494259;494260;494261;494262;494263;494264;494265;494266 494263 2780 10 TILEMLLGFLK Unmodified 1276.7465 0.74648142 3947 Q96T76 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes yes 0 0 0 1 1 176.63 176.63 2 0.015219 180577 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.563 47.776 15516000 0 0 0 0 0 0 0 0 6034800 0 9480800 0 0 43429 3947 40542 388269;388270 494267;494268 494267 2 TILESNDVPGMLAYSLK Unmodified 1849.9496 0.94955092 3954 Q99460;A0A087WW66;C9J9M4;H7BZR6 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 133.13 133.13 2 0.0055133 137408 QUIQUE_DMIX7_190116_001 54.09 38.334 106460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62427000 44033000 0 43430 3954 40543 388271;388272 494269;494270;494271;494272 494271 4 TILETSFHQHR Unmodified 1367.6946 0.69459728 3284 Q5M775 SPECC1 Cytospin-B yes yes 0 0 0 1 1 25.23 25.23 3 0.0044674 19114 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.721 56.539 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43431 3284 40544 388273;388274 494273;494274 494273 2 TILEWEPKPVNQVYTVQISTK Unmodified 2472.3264 0.3264261 2062 P13726 F3 Tissue factor yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 2 1 1 114.39 114.39 2;3 2.5229E-64 118137 QUIQUE_DMIX3_190116_001 200.55 188.64 1828300000 74864000 104850000 184030000 163930000 90801000 78428000 109700000 254390000 254530000 43896000 215980000 140690000 112200000 43432 2062 40545 388275;388276;388277;388278;388279;388280;388281;388282;388283;388284;388285;388286;388287;388288;388289;388290;388291;388292;388293 494275;494276;494277;494278;494279;494280;494281;494282;494283;494284;494285;494286;494287;494288;494289;494290;494291;494292;494293;494294;494295;494296;494297 494291 23 TILFIDEIHR Unmodified 1255.6925 0.69247202 3938 Q96S55 WRNIP1 ATPase WRNIP1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.632 92.632 3 0.0093071 95136 QUIQUE_C1576_190116_001 60.064 42.697 38759000 12854000 0 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Unmodified 1254.668 0.66804818 1927 P07738 BPGM Bisphosphoglycerate mutase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 19.431 19.431 2;3 0.0022671 12533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.252 34.94 544840000 0 0 39074000 41220000 26343000 44513000 30015000 56633000 40814000 0 56568000 84837000 124820000 43436 1927 40549 388314;388315;388316;388317;388318;388319;388320;388321;388322;388323;388324;388325;388326 494320;494321;494322;494323;494324;494325;494326;494327;494328;494329;494330;494331;494332 494327 12 TILLLLLETLGDK Unmodified 1440.8803 0.88033237 310;830;1060 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122;F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP2;CLASP1 CLIP-associating protein 2;CLIP-associating protein 1 no no 0 0 0 1 171.9 171.9 2 0.020836 176115 QUIQUE_C1218_190116_001 57.019 45.656 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43437 310;830;1060 40550 388327 494333 494333 1 TILLLLLETLGDKEPTIR Unmodified 2037.2085 0.2085428 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4X8;H7C5M8;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 166.09 166.09 2;3 7.1316E-14 168229 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.26 121.84 378470000 30434000 38198000 0 24279000 31872000 8173600 0 12502000 0 0 139180000 93833000 0 43438 310;830 40551 388328;388329;388330;388331;388332;388333;388334;388335;388336;388337 494334;494335;494336;494337;494338;494339;494340;494341;494342;494343 494339 9 TILMMGR Unmodified 820.42992 0.42991509 2058 P13639 EEF2 Elongation factor 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.133 54.133 2 0.019355 53051 QUIQUE_C1576_190116_001 111.69 70.035 1388400000 126440000 141820000 166960000 173140000 152370000 0 162040000 0 0 0 172600000 116680000 176370000 43439 2058 40552 388338;388339;388340;388341;388342;388343;388344;388345;388346 494344;494345;494346;494347;494348;494349;494350;494351;494352;494353;494354 494351 11 TILPAAAQDVYYR Unmodified 1479.7722 0.7721789 1868 P04843;B7Z4L4 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 90.732 90.732 2 0.0042691 91950 QUIQUE_C1403_190116_001 78.908 52.31 60223000 0 0 0 36095000 0 0 0 0 0 24128000 0 0 0 43440 1868 40553 388347;388348 494355;494356 494355 2 TILQCALNR Unmodified 1087.5808 0.58081308 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 61.688 61.688 2 0.0065446 58841 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.097 49.845 426880000 0 0 0 0 140510000 0 150490000 0 0 63193000 0 72686000 0 43441 2161 40554 388349;388350;388351;388352 494357;494358;494359;494360 494359 3 TILQCALNRPAFFAER Unmodified 1905.9883 0.98833646 2161 P20073 ANXA7 Annexin A7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 105.94 105.94 2;3 5.683E-30 107977 QUIQUE_C1563_190116_001 146 128.72 3649200000 101770000 221320000 211440000 159530000 271740000 135190000 313900000 382450000 515840000 61582000 793930000 480500000 0 43442 2161 40555 388353;388354;388355;388356;388357;388358;388359;388360;388361;388362;388363;388364;388365;388366 494361;494362;494363;494364;494365;494366;494367;494368;494369;494370;494371;494372;494373;494374;494375;494376;494377;494378;494379;494380;494381;494382 494370 22 TILSDDWK Unmodified 976.48656 0.48656157 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 68.253 68.253 2 0.018737 68719 QUIQUE_C1576_190116_001 79.469 39.365 1948900000 0 0 365250000 226620000 0 0 435850000 140090000 195840000 108420000 0 206280000 270540000 43443 2948 40556 388367;388368;388369;388370;388371;388372;388373;388374 494383;494384;494385;494386;494387;494388;494389;494390;494391 494386 9 TILSDDWKDAK Unmodified 1290.6456 0.6455814 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 1 2 55.885 55.885 2;3 0.0065771 53691 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.584 70.612 96967000 0 0 0 0 0 0 0 96967000 0 0 0 0 0 43444 2948 40557 388375;388376 494392;494393;494394 494393 3 TILSELAPSLPSYHNLEWR Unmodified 2225.1481 0.14806781 3516 Q86X83;F8WBW1 COMMD2 COMM domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 139.45 139.45 3 0.008705 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TILTLTGVSTLGDVK Unmodified 1516.8712 0.87122424 531 A6NDG6;H3BV17 PGP Phosphoglycolate phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.79 117.79 2 1.1306E-07 120500 QUIQUE_C1563_190116_001 108.56 93.42 585840000 58556000 59787000 45030000 22889000 50346000 39099000 62872000 50890000 0 20550000 61549000 59668000 54606000 43448 531 40561 388395;388396;388397;388398;388399;388400;388401;388402;388403;388404;388405;388406 494413;494414;494415;494416;494417;494418;494419;494420;494421;494422;494423;494424;494425;494426 494418 13 TIMEQFNPSLR Unmodified 1334.6653 0.66527099 4531 Q9UQB8;I3L3C5 BAIAP2 Brain-specific angiogenesis inhibitor 1-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 89.078 89.078 2 0.00035148 92081 QUIQUE_C1218_190116_001 117.89 58.909 585790000 66061000 75370000 0 72122000 0 0 66879000 42303000 55857000 23341000 110980000 72872000 0 43449 4531 40562 388407;388408;388409;388410;388411;388412;388413;388414;388415;388416 494427;494428;494429;494430;494431;494432;494433;494434;494435;494436;494437 494428 10 TIMGWTLDFLR Unmodified 1351.6958 0.69584284 2909 Q07812;I6LPK7;K4JQN1;H0YA56 BAX Apoptosis regulator BAX yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 158.81 158.81 2 0.0025507 163015 QUIQUE_C1277_190116_001 89.247 68.918 40154000 0 9430300 0 0 0 0 0 7236700 0 0 0 23487000 0 43450 2909 40563 388417;388418;388419;388420;388421;388422;388423 494438;494439;494440;494441;494442;494443;494444 494438 7 TIMHLMINNTK Unmodified 1314.6788 0.67881256 2893;269;2569 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;P50570 DNM1;DNM2 Dynamin-1;Dynamin-2 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 50.752 50.752 2;3 0.00022168 49494 QUIQUE_C1218_190116_001 122.57 102.43 4800300000 715120000 711550000 598490000 189010000 510840000 429780000 375220000 144450000 0 139500000 437180000 318490000 230630000 43451 269;2893;2569 40564 388424;388425;388426;388427;388428;388429;388430;388431;388432;388433;388434;388435;388436;388437;388438;388439;388440;388441;388442 494445;494446;494447;494448;494449;494450;494451;494452;494453;494454;494455;494456;494457;494458;494459;494460;494461;494462;494463;494464;494465;494466;494467 494445 20 TIMHLMINNTK Oxidation (M) 1330.6737 0.67372718 2893;269;2569 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;P50570 DNM1;DNM2 Dynamin-1;Dynamin-2 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 37.709 37.709 2;3 0.0034048 32871 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.652 49.196 135440000 0 0 0 27261000 0 35490000 0 0 37628000 0 0 0 35063000 43452 269;2893;2569 40564 388443;388444;388445;388446;388447;388448 494468;494469;494470;494471;494472;494473 494473 194;195 6 TIMHLMINNTK 2 Oxidation (M) 1346.6686 0.66864181 2893;269;2569 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4;P50570 DNM1;DNM2 Dynamin-1;Dynamin-2 no no 0 2 0 1 1 1 20.902 20.902 2 0.0014036 13957 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.095 72.784 120130000 0 0 0 0 0 0 0 0 22715000 0 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26.478 26.478 2 0.042621 21122 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.422 31.401 91616000 0 0 0 0 0 0 0 29001000 0 0 62615000 0 0 43458 184 40569 388478;388479 494520;494521 494520 2 TINVYPNFRPTPK Unmodified 1545.8304 0.83036248 1709 O95168 NDUFB4 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 4 yes yes 0 0 1 1 59.228 59.228 3 0.0037639 59162 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.042 55.461 214090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 214090000 0 0 43459 1709 40570 388480 494522 494522 1 TIPDVFPHLPLIAITR Unmodified 1802.0454 0.045440635 1324 K7EKE6;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.13 144.13 2;3 0.00016654 149131 QUIQUE_C1368_190116_001 76.82 71.818 1243000000 122010000 124200000 153160000 95898000 91643000 112270000 99191000 35809000 88922000 33952000 95833000 90837000 99258000 43460 1324 40571 388481;388482;388483;388484;388485;388486;388487;388488;388489;388490;388491;388492;388493;388494;388495;388496 494523;494524;494525;494526;494527;494528;494529;494530;494531;494532;494533;494534;494535;494536;494537;494538;494539;494540;494541;494542;494543;494544;494545;494546;494547 494529 25 TIPGTALVEMGDEYAVER Unmodified 1949.9404 0.9404428 649 B7WPG3;C9IYN3;D6W592;Q8WVV9 HNRNPLL;HNRPLL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like yes no 0 0 0 2 1 1 127.26 127.26 2;3 0.00080312 131297 QUIQUE_C1277_190116_001 41.257 35.142 153120000 0 69546000 0 0 63669000 0 0 0 0 19903000 0 0 0 43461 649 40572 388497;388498;388499;388500 494548;494549;494550;494551 494549 4 TIPIDGDFFSYTR Unmodified 1530.7355 0.73545904 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 122.35 122.35 2;3 3.7464E-08 130895 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.25 108 13144000000 1120100000 1081600000 1328200000 929770000 841700000 874090000 815140000 1163300000 954020000 418310000 1276200000 1041200000 1300600000 43462 1875 40573 388501;388502;388503;388504;388505;388506;388507;388508;388509;388510;388511;388512;388513;388514;388515;388516 494552;494553;494554;494555;494556;494557;494558;494559;494560;494561;494562;494563;494564;494565;494566;494567;494568;494569;494570;494571;494572;494573;494574;494575;494576;494577;494578;494579;494580;494581;494582;494583;494584;494585;494586;494587;494588;494589;494590;494591 494573 39 TIPIDGNFFTYTR Unmodified 1543.7671 0.76709352 1776 P00352;Q5SYQ9;Q5SYQ8;Q5SYQ7 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 122.95 122.95 2 3.2352E-09 128920 QUIQUE_C1218_190116_001 140.07 100.77 9640200000 746050000 956530000 616740000 731030000 1132400000 682310000 1140200000 675640000 618930000 290130000 770520000 666680000 613150000 43463 1776 40574 388517;388518;388519;388520;388521;388522;388523;388524;388525;388526;388527;388528;388529;388530;388531;388532;388533 494592;494593;494594;494595;494596;494597;494598;494599;494600;494601;494602;494603;494604;494605;494606;494607;494608;494609;494610;494611;494612;494613;494614;494615;494616;494617;494618;494619;494620;494621;494622 494593 29 TIPNDPGFVVTLSNR Unmodified 1628.8522 0.85222014 3778 Q93009;H3BND8 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 78.895 78.895 3 0.046297 81053 QUIQUE_C1438_190116_001 19.271 0 60912000 0 0 0 0 60912000 0 0 0 0 0 0 0 0 43464 3778 40575 388534 494623 494623 1 TIPSWATLSASQLAR Unmodified 1600.8573 0.85730551 3297 Q5SSJ5;X6RGJ2;B0QZK4;Q5SWC8 HP1BP3 Heterochromatin protein 1-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 2 117.8 117.8 2;3 9.8585E-06 120033 QUIQUE_C1563_190116_001 103.43 87.543 229210000 0 61635000 0 58777000 0 78632000 0 0 0 30165000 0 0 0 43465 3297 40576 388535;388536;388537;388538;388539 494624;494625;494626;494627;494628 494626 5 TIPWFVSDTTIHDFNWLIEQVK Unmodified 2688.3588 0.35878886 4192 Q9H993;F5GZY1 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Epidermal growth factor receptor;Receptor protein-tyrosine kinase yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 170.97 170.97 2;3 2.8286E-31 175416 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.31 131.92 239040000 0 0 0 0 12069000 0 0 61603000 71704000 5578900 0 61394000 26689000 43471 1789 40582 388568;388569;388570;388571;388572;388573;388574;388575 494666;494667;494668;494669;494670;494671;494672;494673;494674 494670 9 TIQFVDWCPTGFK Unmodified 1597.7599 0.75989966 3430;3992;1990;688 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;Q71U36;Q9BQE3;F5H5D3;A0A1W2PQM2;C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA3E;TUBA1A;TUBA1C;TUBA8 Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-1A chain;Tubulin alpha-1C chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 0 0 7 6 7 6 6 3 6 5 4 4 4 5 5 136.34 136.34 1;2;3 2.8252E-105 135603 QUIQUE_C1218_190116_001 314.48 290.49 265960000000 21932000000 21465000000 20145000000 19419000000 20575000000 17223000000 25329000000 19520000000 21848000000 8467900000 23096000000 20873000000 26068000000 43472 1990;3430;3992;688 40583 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PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.69 169.69 3 2.1248E-84 174514 QUIQUE_C1368_190116_001 117.22 109.59 1116400000 105230000 59186000 161680000 48088000 70680000 39951000 159690000 58566000 73097000 0 107720000 122240000 110290000 43495 181 40604 388831;388832;388833;388834;388835;388836;388837;388838;388839;388840;388841;388842 495027;495028;495029;495030;495031;495032;495033;495034;495035;495036;495037;495038 495029 12 TISVILFLNK Unmodified 1146.7012 0.70124579 2778 P63092;Q5JWF2;A0A0A0MR13 GNAS Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 125.67 125.67 2 0.00026102 128683 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.81 120.81 985170000 49106000 54147000 87542000 55912000 72327000 99148000 67336000 93843000 111170000 25269000 98523000 116510000 54334000 43496 2778 40605 388843;388844;388845;388846;388847;388848;388849;388850;388851;388852;388853;388854;388855 495039;495040;495041;495042;495043;495044;495045;495046;495047;495048;495049;495050;495051;495052;495053;495054;495055;495056;495057;495058 495051 20 TITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPR Unmodified 3327.7384 0.73844252 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;A0A0J9YXP8;A0A0J9YYH3;A0A2R8Y6C7;K7ENA0;A0A0J9YXM3 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 3 3 2 2 165.84 165.84 3;4 3.1177E-214 169795 QUIQUE_C1277_190116_001 219.65 214.22 6649500000 357030000 387290000 120680000 151900000 292390000 106710000 577240000 479800000 834180000 0 1256200000 1558800000 527320000 43497 199 40606 388856;388857;388858;388859;388860;388861;388862;388863;388864;388865;388866;388867;388868;388869;388870;388871;388872;388873 495059;495060;495061;495062;495063;495064;495065;495066;495067;495068;495069;495070;495071;495072;495073;495074;495075;495076;495077;495078;495079;495080;495081;495082;495083 495062 22 TITDVINIGIGGSDLGPLMVTEALKPYSSGGPR Oxidation (M) 3343.7334 0.73335714 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;A0A0J9YXP8;A0A0J9YYH3;A0A2R8Y6C7;K7ENA0;A0A0J9YXM3 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 2 155.26 155.26 3;4 7.9917E-38 160313 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.807 82.885 1260700000 0 116730000 0 0 124790000 0 0 73050000 200680000 0 126560000 618890000 0 43498 199 40606 388874;388875;388876;388877;388878;388879;388880 495084;495085;495086;495087;495088;495089;495090 495089 125 4 TITELGEK Unmodified 889.47566 0.47566253 2404 P36957 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.406 24.406 2 0.0051926 17936 QUIQUE_C1368_190116_001 106.36 19.49 1731400000 369940000 288290000 416070000 0 0 0 0 0 0 0 0 327040000 330050000 43499 2404 40607 388881;388882;388883;388884;388885;388886;388887 495091;495092;495093;495094;495095;495096;495097;495098 495094 8 TITEYAR Unmodified 852.43413 0.43413207 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.497 21.497 2 0.019305 14888 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.19 47.192 4792600000 0 431950000 518750000 415560000 0 437060000 542170000 488500000 425050000 238220000 614700000 680630000 0 43500 2016 40608 388888;388889;388890;388891;388892;388893;388894;388895;388896;388897 495099;495100;495101;495102;495103;495104;495105;495106;495107;495108;495109;495110 495106 12 TITFEQFQEALEELAK Unmodified 1895.9517 0.95165941 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 0 2 3 5 1 3 4 1 2 2 1 1 1 3 168.07 168.07 2;3 3.1095E-112 172596 QUIQUE_C1218_190116_001 230.59 196.63 34906000000 3381000000 2649800000 3411100000 2258200000 2934100000 3088800000 3412100000 2210000000 1697200000 504180000 3795300000 2855400000 2708500000 43501 1687 40609 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carcinoma-amplified sequence 1 yes no 0 0 0 1 1 1 44.644 44.644 2 0.0059282 41205 QUIQUE_C1438_190116_001 60.49 43.016 58731000 0 58731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43505 1123 40613 388977;388978;388979 495222;495223;495224 495223 3 TITSEDVAEMHNILK Unmodified 1699.8451 0.84508585 2505 P48426 PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 87.618 87.618 2;3 5.2466E-05 90813 QUIQUE_C1218_190116_001 110.86 88.864 821960000 147830000 47149000 47729000 96162000 0 0 188000000 49544000 0 29623000 51149000 93029000 71744000 43506 2505 40614 388980;388981;388982;388983;388984;388985;388986;388987;388988;388989;388990;388991;388992 495225;495226;495227;495228;495229;495230;495231;495232;495233;495234;495235;495236;495237;495238;495239;495240 495226 15 TITSEDVAEMHNILKK Oxidation (M) 1843.935 0.93496349 2505 P48426 PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha yes yes 0 1 1 1 1 93.897 93.897 2 0.048856 95461 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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495403;495404;495405;495406;495407;495408;495409;495410;495411;495412;495413;495414;495415;495416;495417;495418 495411 15 TIVMGASFR Unmodified 980.51134 0.51133653 2409 P37837;F2Z393 TALDO1 Transaldolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.884 59.884 2 0.0021642 59046 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.19 37.586 639510000 0 0 0 0 0 153860000 0 167770000 153180000 0 0 0 164700000 43526 2409 40633 389143;389144;389145;389146;389147 495419;495420;495421;495422;495423;495424;495425 495421 7 TIVQSGGIK Unmodified 901.52328 0.52328142 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 20.784 20.784 2 0.023842 13919 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.436 22.878 1005700000 0 0 0 0 192040000 339840000 0 0 0 0 0 473830000 0 43527 2605 40634 389148;389149;389150 495426;495427;495428 495428 3 TIVSIGDPK Unmodified 928.52295 0.52294707 2974 Q13177 PAK2 Serine/threonine-protein kinase PAK 2;PAK-2p27;PAK-2p34 yes yes 0 0 0 1 1 40.477 40.477 2 0.023183 37228 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.91 21.948 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32.796 2 0.055583 28001 QUIQUE_DMIX3_190116_001 71.852 43.28 362260000 0 0 0 0 0 0 0 0 362260000 0 0 0 0 43531 2578 40638 389164 495442 495442 1 TIYAGNALCTVK Unmodified 1309.67 0.67002202 2067 P13804;H0YLU7;H0YK49;H0YNX6;H0YL12;H0YKF0 ETFA Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.162 57.162 2 0.0015274 56075 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.763 58.023 2178700000 229740000 0 284720000 212490000 263980000 0 230560000 0 166730000 0 300840000 220980000 268620000 43532 2067 40639 389165;389166;389167;389168;389169;389170;389171;389172;389173 495443;495444;495445;495446;495447;495448;495449;495450;495451 495450 7 TIYDIAWCQLTGALATACGDDAIR Unmodified 2654.2469 0.24687193 1682 O76071 CIAO1 Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 170 170 3 4.057E-24 175274 QUIQUE_C1576_190116_001 123.99 110.81 178580000 0 22314000 0 7440400 27044000 0 36672000 0 0 0 41430000 0 43676000 43533 1682 40640 389174;389175;389176;389177;389178;389179 495452;495453;495454;495455;495456;495457;495458 495456 6 TIYLEDIYVMPEYR Unmodified 1803.8753 0.87532334 3848 Q96F10 SAT2 Diamine acetyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 138.16 138.16 2 0.00097678 143205 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.215 73.173 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43534 3848 40641 389180 495459 495459 1 TIYTIDGLK Unmodified 1022.5648 0.56481189 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.071 72.071 2 0.011612 72400 QUIQUE_C1403_190116_001 72.485 51.826 984580000 141390000 119670000 92349000 153790000 0 104150000 0 28498000 50971000 67678000 74348000 71873000 79862000 43535 1478;3342 40642 389181;389182;389183;389184;389185;389186;389187;389188;389189;389190;389191;389192 495460;495461;495462;495463;495464;495465;495466;495467;495468;495469;495470;495471;495472 495464 13 TIYTIDGLKK Unmodified 1150.6598 0.6597749 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 45.194 45.194 2;3 0.0050538 41840 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.398 47.306 1593400000 35096000 158110000 50091000 75343000 70490000 0 118290000 294640000 137060000 79564000 106230000 328210000 140270000 43536 1478;3342 40643 389193;389194;389195;389196;389197;389198;389199;389200;389201;389202;389203;389204;389205;389206;389207;389208 495473;495474;495475;495476;495477;495478;495479;495480;495481;495482;495483;495484;495485;495486;495487;495488;495489 495482 14 TIYTPGSTVLYR Unmodified 1369.7242 0.72416608 1803 P01024;CON__Q2UVX4 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 1 1 1 77.406 77.406 2 0.013496 78792 QUIQUE_C1277_190116_001 66.962 44.725 675650000 0 182040000 0 0 271320000 0 0 0 0 0 0 0 222280000 43537 1803 40644 389209;389210;389211 495490;495491;495492 495490 2 TKAEQFYCGDTEGKK Unmodified 1760.8039 0.80394931 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 2 1 1 1 1 1 17.138 17.138 3 0.001646 10462 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.567 59.651 355180000 0 0 60946000 30110000 0 0 0 58503000 0 0 87961000 0 117660000 43538 903;2869 40645 389212;389213;389214;389215;389216 495493;495494;495495;495496;495497 495495 5 TKDDIIEFAHR Unmodified 1343.6834 0.68336389 3892 Q96JJ7 TMX3 Protein disulfide-isomerase TMX3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.217 39.217 3 0.0008321 36317 QUIQUE_C1218_190116_001 71.153 59.621 401740000 52634000 42849000 45688000 47716000 46895000 40472000 0 0 0 0 0 54618000 70866000 43539 3892 40646 389217;389218;389219;389220;389221;389222;389223;389224 495498;495499;495500;495501;495502;495503;495504;495505;495506;495507;495508 495499 11 TKDDIIICEIGDVFK Unmodified 1764.8968 0.89678707 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 135.05 135.05 2;3 9.957E-12 138127 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.53 94.58 1952800000 180460000 165780000 191790000 167710000 126870000 165780000 169020000 107240000 150970000 42206000 208640000 198330000 77991000 43540 4615 40647 389225;389226;389227;389228;389229;389230;389231;389232;389233;389234;389235;389236;389237;389238;389239;389240;389241;389242;389243;389244;389245;389246;389247;389248 495509;495510;495511;495512;495513;495514;495515;495516;495517;495518;495519;495520;495521;495522;495523;495524;495525;495526;495527;495528;495529;495530;495531;495532;495533;495534;495535 495525 26 TKDEYLINSQTTEHIVK Unmodified 2018.032 0.032034995 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.811 49.811 3 3.4447E-08 46580 QUIQUE_C1368_190116_001 90.422 75.5 893920000 70694000 90276000 116960000 72663000 0 74899000 99180000 103930000 112050000 41664000 0 111610000 0 43541 4285 40648 389249;389250;389251;389252;389253;389254;389255;389256;389257;389258 495536;495537;495538;495539;495540;495541;495542;495543;495544;495545;495546 495538 6 TKDGVVEITGK Unmodified 1145.6292 0.62920306 1866 P04792 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes yes 0 0 1 2 4 2 3 2 2 2 2 3 2 2 3 3 20.316 20.316 2;3 0.00070346 12528 QUIQUE_C1368_190116_001 76.326 56.684 9363500000 453110000 1048700000 680860000 997290000 549980000 937770000 103070000 605250000 929760000 145840000 1135700000 887770000 888420000 43542 1866 40649 389259;389260;389261;389262;389263;389264;389265;389266;389267;389268;389269;389270;389271;389272;389273;389274;389275;389276;389277;389278;389279;389280;389281;389282;389283;389284;389285;389286;389287;389288;389289;389290 495547;495548;495549;495550;495551;495552;495553;495554;495555;495556;495557;495558;495559;495560;495561;495562;495563;495564;495565;495566;495567;495568;495569;495570;495571;495572;495573;495574;495575;495576;495577;495578 495553 30 TKDGVVEITGKHEER Unmodified 1696.8744 0.87441214 1866 P04792 HSPB1 Heat shock protein beta-1 yes yes 0 0 2 1 2 2 1 2 2 13.375 13.375 3;4 2.5736E-12 5935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.48 100.72 1338500000 0 0 0 0 20885000 0 0 464430000 139140000 0 206000000 154850000 353230000 43543 1866 40650 389291;389292;389293;389294;389295;389296;389297;389298;389299;389300 495579;495580;495581;495582;495583;495584;495585;495586;495587;495588;495589;495590 495582 12 TKDIEDVFYK Unmodified 1256.6289 0.62886871 1294 J3KTL2;Q07955;J3QQV5;J3KSW7 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.622 59.622 3 0.0029925 59506 QUIQUE_C1218_190116_001 67.93 46.185 618530000 68464000 80510000 84076000 83476000 0 75250000 77881000 74930000 0 0 0 73942000 0 43544 1294 40651 389301;389302;389303;389304;389305;389306;389307;389308 495591;495592;495593;495594;495595;495596;495597;495598;495599 495591 9 TKDIVNGLR Unmodified 1014.5822 0.58219329 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 1 1 1 1 1 21.862 21.862 2 0.0077587 15717 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.04 67.25 337660000 0 0 0 0 0 0 0 72205000 80765000 0 105230000 0 79460000 43545 585;2493 40652 389309;389310;389311;389312 495600;495601;495602;495603;495604 495601 5 TKDLPVTEAVFSALVTGHAR Unmodified 2111.1375 0.13750312 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 116.49 116.49 3 0.002955 119948 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.31 45.782 137330000 0 0 0 0 0 0 0 35382000 34316000 0 0 38104000 29527000 43546 2452 40653 389313;389314;389315;389316 495605;495606;495607;495608 495607 3 TKDVWEIPR Unmodified 1142.6084 0.60840804 1898 P06241 FYN Tyrosine-protein kinase Fyn yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 53.12 53.12 3 0.0088902 51853 QUIQUE_C1218_190116_001 70.1 43.427 118340000 22273000 24520000 0 0 26649000 0 0 44899000 0 0 0 0 0 43547 1898 40654 389317;389318;389319;389320;389321;389322 495609;495610;495611;495612;495613;495614 495609 6 TKEEALELINGYIQK Unmodified 1747.9356 0.93561541 3008 Q13526;K7EMU7;K7EN45 PIN1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 yes no 0 0 1 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 102.35 102.35 2;3 3.8248E-78 106260 QUIQUE_DMIX5_190116_001 235.21 206.44 1471800000 263590000 100230000 84171000 0 164640000 89325000 77078000 231040000 100220000 69635000 103590000 94681000 93644000 43548 3008 40655 389323;389324;389325;389326;389327;389328;389329;389330;389331;389332;389333;389334;389335;389336;389337;389338 495615;495616;495617;495618;495619;495620;495621;495622;495623;495624;495625;495626;495627;495628;495629;495630;495631 495629 14 TKEEINELNR Unmodified 1244.6361 0.63607935 100 A0A087X106;CON__O43790;CON__Q14533;O43790;Q14533;CON__Q6NT21;CON__P78385;P78385;CON__P78386;A6NCN2;P78386;F5GYI5 KRT81;KRT86;KRT83;KRT87P;KRT85 Keratin, type II cuticular Hb6;Keratin, type II cuticular Hb1;Keratin, type II cuticular Hb3;Putative keratin-87 protein;Keratin, type II cuticular Hb5 yes no 0 0 1 1 1 19.079 19.079 3 0.0092219 12028 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.198 34.436 80611000 0 0 0 0 0 0 0 0 36353000 0 0 44257000 0 + 43549 100 40656 389339;389340 495632;495633 495632 2 TKEELEELMSDIK Unmodified 1563.7702 0.77018957 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 102.55 102.55 3 0.00031473 106727 QUIQUE_C1218_190116_001 98.582 92.175 221220000 57794000 35666000 51011000 33261000 0 43489000 0 0 0 0 0 0 0 43550 3185 40657 389341;389342;389343;389344;389345 495634;495635;495636;495637;495638;495639;495640 495635 7 TKEELEELMSDIKK Unmodified 1691.8652 0.86515259 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 2 3 2 3 2 1 1 2 1 2 1 2 1 2 83.489 83.489 2;3;4 1.0519E-16 86357 QUIQUE_C1218_190116_001 157.33 133.58 2870700000 265900000 361560000 396880000 319020000 165440000 148330000 309260000 95873000 160770000 58926000 248480000 131720000 208560000 43551 3185 40658 389346;389347;389348;389349;389350;389351;389352;389353;389354;389355;389356;389357;389358;389359;389360;389361;389362;389363;389364;389365;389366;389367;389368 495641;495642;495643;495644;495645;495646;495647;495648;495649;495650;495651;495652;495653;495654;495655;495656;495657;495658;495659;495660;495661;495662;495663;495664;495665;495666;495667;495668;495669;495670;495671;495672 495642 31 TKEGVLYVGSK Unmodified 1179.6499 0.6499385 2410;3170 P37840;E7EPV7;D6RA31;Q16143 SNCA;SNCB Alpha-synuclein;Beta-synuclein no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.976 21.976 2 0.0089402 16011 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.95 91.628 2011900000 0 97132000 0 0 145860000 0 112040000 336520000 205000000 0 493650000 247930000 373750000 43552 2410;3170 40659 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495809;495810;495811;495812;495813;495814;495815;495816;495817;495818;495819;495820;495821;495822;495823;495824;495825;495826;495827;495828;495829;495830;495831;495832;495833;495834;495835 495825 24 TKEQIENLLR Unmodified 1242.6932 0.6932003 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.893 49.893 3 0.008851 47511 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.297 36.333 919550000 0 120450000 0 0 101950000 0 98114000 115450000 110800000 0 110810000 151480000 110490000 43561 3390 40668 389514;389515;389516;389517;389518;389519;389520;389521 495836;495837;495838;495839;495840;495841;495842;495843 495842 5 TKEQILEEFSK Unmodified 1350.7031 0.70309628 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 1 2 57.37 57.37 2;3 0.0036746 55405 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.005 40.236 68329000 0 0 0 0 0 0 0 68329000 0 0 0 0 0 43562 1581 40669 389522;389523 495844;495845 495844 1 TKEQVTNVGGAVVTGVTAVAQK Unmodified 2156.1801 0.18009622 2410 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Unmodified 1614.8716 0.87161817 3007 Q13523 PRPF4B Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog yes yes 0 0 1 1 126.43 126.43 3 0.030201 129339 QUIQUE_DMIX1_190116_001 43.05 28.618 14302000 0 0 0 0 0 0 0 14302000 0 0 0 0 0 43572 3007 40679 389595 495933 495933 1 TKLETQPQEEYEIINVEVK Unmodified 2289.174 0.17400778 3239 Q4J6C6;C9JMT4 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes no 0 0 1 1 1 1 1 90.943 90.943 3 0.0019907 92872 QUIQUE_DMIX8_190116_001 48.968 40.781 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43573 3239 40680 389596;389597;389598;389599 495934;495935;495936;495937 495937 4 TKNNLASCYLK Unmodified 1310.6653 0.66527099 1050;4116;4286 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;Q9H0B6;A8MZ87;Q9NSK0;H7C4M1 KLC1;KLC2;KLC4 Kinesin light chain 1;Kinesin light chain 2;Kinesin light chain 4 no no 0 0 1 1 1 1 28.941 28.941 2 0.013395 23104 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.758 58.521 87751000 0 0 0 0 0 0 0 17415000 0 0 36190000 0 34147000 43574 1050;4116;4286 40681 389600;389601;389602 495938;495939;495940 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495951;495952;495953;495954;495955;495956;495957;495958;495959;495960;495961;495962;495963 495960 13 TKPQQPVSEPAAPEQPAPEPK Unmodified 2225.1328 0.13281167 4558 Q9Y2J0;F8VP47 RPH3A Rabphilin-3A yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.851 32.851 3 1.0018E-13 26548 QUIQUE_C1368_190116_001 91.964 89.297 711380000 130000000 75348000 259640000 0 57651000 0 0 0 46740000 0 0 56622000 85387000 43577 4558 40684 389623;389624;389625;389626;389627;389628;389629;389630 495964;495965;495966;495967;495968;495969;495970;495971 495966 8 TKPSDEEMLFIYGHYK Oxidation (M) 1972.9241 0.92406445 1914 P07108;B8ZWD1;A0A0A0MTI5 DBI Acyl-CoA-binding protein yes no 0 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 68.67 68.67 2;3 4.6397E-06 68178 QUIQUE_C1368_190116_001 116.54 104.18 3571900000 252290000 402090000 425330000 162230000 418070000 245630000 225520000 183400000 346980000 97538000 186840000 254480000 371490000 43578 1914 40685 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495993;495994;495995;495996;495997;495998;495999;496000;496001;496002;496003;496004;496005;496006;496007;496008;496009;496010;496011;496012;496013;496014;496015;496016;496017;496018;496019;496020;496021;496022;496023;496024;496025;496026;496027;496028;496029;496030;496031;496032;496033;496034;496035;496036;496037;496038;496039;496040;496041;496042;496043 496004 51 TKPSELDQGKYDADDNVK Unmodified 2021.9542 0.9541786 4400 Q9UNT1;Q9UBK7;B7ZBD5;A8MXF6;F2Z3A9;F2Z2E5;F2Z2T3;F2Z3J7;E7EWW3;B7ZBD4 RABL2B;RABL2A Rab-like protein 2B;Rab-like protein 2A yes no 0 0 2 1 1 25.064 25.064 3 0.0012446 17840 QUIQUE_DMIX8_190116_001 58.693 39.758 160790000 0 0 0 0 0 0 0 35162000 0 0 0 0 125630000 43580 4400 40686 389682;389683 496044;496045 496045 2 TKPSTVEVLESIDKEIQALEEFR Unmodified 2660.3909 0.39087685 4096 Q9C0E8;C9JM95;C9JL94 LNP;KIAA1715 Protein lunapark yes no 0 0 2 1 162.5 162.5 4 0.0026851 168018 QUIQUE_C1576_190116_001 30.585 23.861 36033000 0 0 0 0 0 0 36033000 0 0 0 0 0 0 43581 4096 40687 389684 496046 496046 1 TKPVTGNLRPEEALQALTIYEGK Unmodified 2527.3646 0.36460252 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 108.58 108.58 3;4 3.9174E-06 113310 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.398 62.838 1114900000 0 0 101820000 0 49567000 0 63107000 157700000 324990000 0 155950000 144220000 117540000 43582 3053 40688 389685;389686;389687;389688;389689;389690;389691;389692;389693 496047;496048;496049;496050;496051;496052;496053;496054;496055 496053 8 TKPYIQVDIGGGQTK Unmodified 1603.857 0.85697116 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 1 49.65 49.65 2;3 0.0001752 47820 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.811 56.274 2848500000 436580000 327180000 0 0 603080000 391570000 0 249710000 354370000 0 360970000 124990000 0 43583 2007 40689 389694;389695;389696;389697;389698;389699;389700;389701;389702;389703;389704;389705;389706;389707;389708;389709 496056;496057;496058;496059;496060;496061;496062;496063;496064;496065;496066;496067;496068;496069;496070;496071 496065 12 TKQDEVNAAWQR Unmodified 1444.7059 0.70589025 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 27.046 27.046 2;3 6.1296E-27 20588 QUIQUE_C1403_190116_001 178.08 163.94 18555000000 584200000 1950300000 975700000 1384000000 1706100000 1175100000 1655100000 1898300000 1737600000 245760000 1089600000 1891500000 2261900000 43584 267;275;3025 40690 389710;389711;389712;389713;389714;389715;389716;389717;389718;389719;389720;389721;389722;389723;389724;389725;389726;389727;389728;389729;389730;389731 496072;496073;496074;496075;496076;496077;496078;496079;496080;496081;496082;496083;496084;496085;496086;496087;496088;496089;496090;496091;496092;496093;496094 496076 21 TKQELEDLTADIK Unmodified 1502.7828 0.78280317 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 67.277 67.277 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496115;496116;496117;496118;496119;496120;496121;496122;496123;496124;496125;496126;496127;496128;496129;496130;496131;496132;496133;496134;496135;496136;496137 496134 17 TKSENGLEFTSSGSANTETTK Unmodified 2188.0132 0.013150046 2185;726 C9JI87;P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 32.164 32.164 2;3 0 27196 QUIQUE_C1218_190116_001 402.02 349.44 1000400000 57288000 30093000 64049000 24483000 26641000 16419000 29231000 465310000 49010000 39864000 92762000 49550000 55692000 43587 726;2185 40693 389768;389769;389770;389771;389772;389773;389774;389775;389776;389777;389778;389779;389780;389781 496138;496139;496140;496141;496142;496143;496144;496145;496146;496147;496148;496149;496150;496151;496152;496153 496138 16 TKTENPLILIDEVDK Unmodified 1726.9353 0.93528106 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 1 1 102.86 102.86 3 0.012757 106367 QUIQUE_DMIX3_190116_001 36.593 24.677 45591000 0 0 0 0 0 0 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167.52 167.52 3;4 3.7043E-12 169676 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.02 96.763 522430000 0 0 0 0 0 0 0 82966000 65658000 0 292640000 81165000 0 43591 2424 40697 389793;389794;389795;389796;389797;389798;389799;389800 496166;496167;496168;496169;496170;496171;496172;496173 496167 8 TKVIESTQDLGNDLAGVMALQR Unmodified 2358.2213 0.2213091 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 126.11 126.11 3 0.00043275 128818 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.817 30.13 27702000 0 0 0 0 0 0 0 27702000 0 0 0 0 0 43592 2851 40698 389801 496174 496174 1 TKVVVTMEHSAK Unmodified 1328.7122 0.71222118 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 13.198 13.198 3 0.0026523 4996 QUIQUE_DMIX7_190116_001 70.54 57.964 68709000 0 0 0 0 0 0 0 42249000 0 0 0 26460000 0 43593 2673 40699 389802;389803 496175;496176 496176 1 TKYEEEINKR Unmodified 1308.6674 0.66737948 779 CON__P19013;P19013 KRT4 Keratin, type II cytoskeletal 4 no no 0 0 2 1 13.367 13.367 3 0.014005 5517 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.417 66.877 12877000 0 0 0 0 0 0 0 0 12877000 0 0 0 0 + 43594 779 40700 389804 496177 496177 1 TKYWELIYEDSMDLIAK Oxidation (M) 2133.034 0.03400883 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 1 1 1 144.65 144.65 3 0.010471 147469 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.752 38.82 21030000 0 0 0 0 0 0 0 21030000 0 0 0 0 0 43595 612 40701 389805 496178 496178 400 1 TKYWELIYEDSMDLIAK Unmodified 2117.0391 0.039094208 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 155.81 155.81 3 0.0026392 158587 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.925 34.264 49259000 0 0 0 0 0 0 0 49259000 0 0 0 0 0 43596 612 40701 389806 496179 496179 1 TLAAEMQELR Unmodified 1160.586 0.58595803 3571 Q8N163;H0YB24;G3V119 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 73.295 73.295 2 0.034087 74964 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.928 42.743 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43597 3571 40702 389807 496180 496180 1 TLACTHSSAYENQR Unmodified 1636.7264 0.7263677 934 E9PHY8;Q8NDA8 MROH1 Maestro heat-like repeat-containing protein family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 17.204 17.204 3 0.0011345 9363 QUIQUE_C1368_190116_001 67.095 61.723 82991000 23461000 31366000 28163000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43598 934 40703 389808;389809;389810 496181;496182;496183 496183 3 TLADAEGDVFR Unmodified 1192.5724 0.57241646 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 76.073 76.073 1;2 4.3265E-24 76718 QUIQUE_DMIX1_190116_001 179.51 148.28 12935000000 1101300000 1046400000 1165300000 899010000 1112600000 947250000 954710000 949280000 984080000 497170000 1259900000 1053200000 965220000 43599 2870 40704 389811;389812;389813;389814;389815;389816;389817;389818;389819;389820;389821;389822;389823;389824 496184;496185;496186;496187;496188;496189;496190;496191;496192;496193;496194;496195;496196;496197;496198;496199;496200;496201;496202;496203;496204;496205;496206;496207;496208;496209;496210;496211;496212;496213 496203 29 TLADHLGMIAGGTGITPMLQLIR Unmodified 2378.2814 0.28140694 3354 Q6BCY4;E9PMI2 CYB5R2 NADH-cytochrome b5 reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 154.34 154.34 3 5.7203E-06 159154 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.606 55.803 159050000 0 0 32400000 0 36832000 12066000 28595000 0 49159000 0 0 0 0 43600 3354 40705 389825;389826;389827;389828;389829 496214;496215;496216;496217;496218 496218 4 TLADVLVQEVIK Unmodified 1326.7759 0.7758673 2531 P49441;E7ET59;E7EUX4;E7ENF2;C9J173;B8ZZF6;C9J128;C9J2Z6 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 2 2 2 1 1 1 144.43 144.43 2;3 5.42E-05 147553 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.1 121.02 3654500000 301980000 338280000 409810000 270060000 307150000 253120000 279160000 295970000 399240000 122570000 0 341060000 336090000 43601 2531 40706 389830;389831;389832;389833;389834;389835;389836;389837;389838;389839;389840;389841;389842;389843;389844;389845;389846;389847;389848 496219;496220;496221;496222;496223;496224;496225;496226;496227;496228;496229;496230;496231;496232;496233;496234;496235;496236;496237;496238;496239;496240;496241;496242;496243;496244;496245 496236 27 TLAEHQQLIPLVEK Unmodified 1617.909 0.90900673 4622 Q9Y5K5;Q5LJA5;Q5LJA9;H0Y6Y4;H0Y4E0;H0Y636;H0Y4K0 UCHL5 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 71.233 71.233 3 0.028177 70579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.193 15.608 68002000 0 0 0 0 0 0 0 68002000 0 0 0 0 0 43602 4622 40707 389849 496246 496246 1 TLAEIAK Unmodified 744.43815 0.43815481 3122;3719 Q15233;C9JYS8;C9IZL7;C9J4X2;Q8WXF1;X6RDA4 NONO;PSPC1 Non-POU domain-containing octamer-binding protein;Paraspeckle component 1 no no 0 0 0 1 22.896 22.896 2 0.038851 15850 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.244 9.8284 140030000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 140030000 0 0 0 43603 3122;3719 40708 389850 496247 496247 1 TLAEINANR Unmodified 1000.5302 0.53015772 2992 Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.954 26.954 2 8.3473E-07 20760 QUIQUE_C1368_190116_001 157.34 110.28 2583400000 179640000 179950000 199980000 205040000 211720000 210170000 255460000 158100000 204070000 113190000 210530000 210030000 245480000 43604 2992 40709 389851;389852;389853;389854;389855;389856;389857;389858;389859;389860;389861;389862;389863 496248;496249;496250;496251;496252;496253;496254;496255;496256;496257;496258;496259;496260;496261;496262;496263;496264;496265;496266 496251 19 TLAEINANRADAEEEAATR Unmodified 2043.9821 0.98212469 2992 Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 yes yes 0 0 1 1 54.285 54.285 3 0.00017707 51924 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.138 57.195 63426000 0 0 0 0 0 0 0 63426000 0 0 0 0 0 43605 2992 40710 389864 496267;496268 496267 2 TLAELYTYDK Unmodified 1215.6023 0.60231961 2541 P49754 VPS41 Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog yes yes 0 0 0 1 1 21.721 21.721 3 0.060712 14946 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.415 15.501 64071000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31224000 0 32846000 43606 2541 40711 389865;389866 496269;496270 496269 1 TLAESALQLLYTAK Unmodified 1520.845 0.84500949 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 1 1 2 2 2 2 1 2 144.94 144.94 2;3 4.9986E-07 147942 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.06 137.1 4200200000 256520000 243620000 436860000 342260000 563400000 244850000 251170000 335010000 397400000 118930000 419190000 271280000 319660000 43607 4600 40712 389867;389868;389869;389870;389871;389872;389873;389874;389875;389876;389877;389878;389879;389880;389881;389882;389883;389884;389885;389886;389887 496271;496272;496273;496274;496275;496276;496277;496278;496279;496280;496281;496282;496283;496284;496285;496286;496287;496288;496289;496290;496291;496292;496293;496294 496283 22 TLAESALQMLYAAK Unmodified 1508.7909 0.79086543 4606 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389903;389904;389905;389906;389907;389908;389909;389910;389911;389912;389913;389914;389915 496313;496314;496315;496316;496317;496318;496319;496320;496321;496322;496323;496324;496325;496326;496327 496313 15 TLAGAVSDLLK Unmodified 1086.6285 0.62847478 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 110.42 110.42 2 0.027675 113421 QUIQUE_C1277_190116_001 79.974 47.133 343130000 113780000 91934000 0 0 0 0 137420000 0 0 0 0 0 0 43610 4606 40715 389916;389917;389918 496328;496329;496330 496329 0 TLAGDVHIVR Unmodified 1079.6087 0.60874239 4403 Q9UBQ0;F8VXU5 VPS29 Vacuolar protein sorting-associated protein 29 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 37.689 37.689 2;3 0.00058217 34427 QUIQUE_C1218_190116_001 79.974 69.687 3627000000 304980000 316590000 310110000 243950000 216290000 282950000 446620000 201320000 265990000 62417000 344800000 306450000 324520000 43611 4403 40716 389919;389920;389921;389922;389923;389924;389925;389926;389927;389928;389929;389930;389931;389932 496331;496332;496333;496334;496335;496336;496337;496338;496339;496340;496341;496342;496343;496344;496345;496346;496347;496348;496349 496332 18 TLAGLPLLVAYKEDEIPVLKDELIHELK Unmodified 3158.7843 0.78425372 42 A0A087WUT6;O60841 EIF5B Eukaryotic translation initiation factor 5B yes no 0 0 2 1 152.41 152.41 5 6.6455E-05 159310 QUIQUE_C1438_190116_001 31.111 29.344 35553000 0 0 0 0 35553000 0 0 0 0 0 0 0 0 43612 42 40717 389933 496350 496350 1 TLAIELAPR Unmodified 982.58113 0.58113065 4027 Q9BTZ2;P0CG22 DHRS4;DHRS4L1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4;Putative dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.391 70.391 2 0.011065 70843 QUIQUE_C1576_190116_001 73.248 54.517 550730000 45930000 0 0 0 79450000 39671000 56845000 35368000 74579000 0 80753000 68843000 69292000 43613 4027 40718 389934;389935;389936;389937;389938;389939;389940;389941;389942 496351;496352;496353;496354;496355;496356;496357;496358;496359;496360 496354 8 TLALLAFDSPEESPFGDLLHTMQR Unmodified 2687.3265 0.32650246 4314 Q9NWU2 GID8 Glucose-induced degradation protein 8 homolog yes yes 0 0 0 1 1 165.68 165.68 3 2.106E-11 170500 QUIQUE_C1218_190116_001 84.689 77.577 46851000 23055000 23796000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43614 4314 40719 389943;389944 496361;496362;496363 496361 3 TLAMDTILANAK Unmodified 1260.6748 0.67477304 3685 Q8TDQ7 GNPDA2 Glucosamine-6-phosphate isomerase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 96.52 96.52 2 0.00023696 98974 QUIQUE_DMIX8_190116_001 117.53 98.255 362430000 0 0 0 0 0 0 0 59301000 64652000 0 102520000 63531000 72424000 43615 3685 40720 389945;389946;389947;389948;389949 496364;496365;496366;496367;496368 496368 5 TLAMDTILANAR Unmodified 1288.6809 0.68092105 2484 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8 GNPDA1 Glucosamine-6-phosphate isomerase 1;Glucosamine-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 100.88 100.88 2 0.00084542 102911 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.898 66.569 957930000 143190000 131420000 0 118120000 0 132810000 0 120120000 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496398;496399;496400;496401;496402;496403;496404;496405;496406;496407;496408;496409;496410;496411;496412;496413;496414;496415;496416;496417;496418;496419;496420;496421;496422;496423;496424;496425;496426;496427;496428;496429;496430;496431;496432;496433;496434;496435;496436;496437;496438;496439;496440;496441;496442;496443;496444;496445;496446;496447;496448;496449;496450;496451 496401 52 TLASAGGPDNLVLLNPEK Unmodified 1807.968 0.96797818 854 E7EV99;E7ENY0;P35611;A0A0A0MSR2;H0Y9H2 ADD1 Alpha-adducin yes no 0 0 0 3 2 3 2 3 2 2 1 2 3 2 2 2 103.81 103.81 2;3 3.102E-31 106225 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.32 159.3 22897000000 1532800000 1858100000 2038600000 1730800000 1649600000 1771900000 1956900000 1592000000 1839900000 760590000 2166900000 1732500000 2266100000 43620 854 40725 390004;390005;390006;390007;390008;390009;390010;390011;390012;390013;390014;390015;390016;390017;390018;390019;390020;390021;390022;390023;390024;390025;390026;390027;390028;390029;390030;390031;390032 496452;496453;496454;496455;496456;496457;496458;496459;496460;496461;496462;496463;496464;496465;496466;496467;496468;496469;496470;496471;496472;496473;496474;496475;496476;496477;496478;496479;496480;496481;496482;496483;496484;496485;496486;496487;496488;496489;496490;496491;496492;496493;496494;496495;496496;496497;496498;496499;496500;496501;496502;496503;496504;496505;496506;496507;496508;496509;496510;496511 496484 59 TLASENIPSLPPGGELASK Unmodified 1879.9891 0.98910755 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 0 1 95.643 95.643 2 0.02458 98475 QUIQUE_C1277_190116_001 73.082 38.818 57943000 0 57943000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43621 2387 40726 390033 496512 496512 0 TLASPNIVVILCGNKK Unmodified 1725.9811 0.98112582 2706 P61018;M0R0X1 RAB4B Ras-related protein Rab-4B yes no 0 0 1 1 1 1 1 95.417 95.417 3 5.9622E-05 97463 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.344 61.147 85948000 0 0 0 0 0 0 0 30830000 28695000 0 0 26423000 0 43622 2706 40727 390034;390035;390036;390037 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390050;390051;390052;390053;390054;390055;390056;390057;390058;390059;390060;390061;390062 496529;496530;496531;496532;496533;496534;496535;496536;496537;496538;496539;496540;496541;496542;496543;496544 496535 15 TLATGYQYSFPELGAALK Unmodified 1928.9884 0.98837927 4269 Q9NRG7;G3V5T1;Q86TZ5;F6RWC2;G3V4N6 SDR39U1 Epimerase family protein SDR39U1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.32 133.32 2 5.5803E-11 138978 QUIQUE_C1576_190116_001 119.69 98.736 833830000 118370000 61771000 97395000 72405000 77690000 86385000 91639000 0 105440000 26467000 96272000 0 0 43625 4269 40729 390063;390064;390065;390066;390067;390068;390069;390070;390071;390072 496545;496546;496547;496548;496549;496550;496551;496552;496553;496554;496555 496552 11 TLATPAVR Unmodified 827.4865 0.48650199 2014 P11182;Q5VVL7 DBT Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 23.873 23.873 2 0.044601 17336 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.178 43.073 0 0 0 0 0 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144.82 4 8.1857E-09 149244 QUIQUE_DMIX7_190116_001 60.79 54.759 333460000 0 0 0 0 63754000 0 43500000 41187000 30365000 0 78916000 75742000 0 43629 3415 40733 390088;390089;390090;390091;390092;390093 496571;496572;496573;496574;496575;496576 496576 5 TLAVITK Unmodified 744.47454 0.47454032 1108;1404 G8JLD5;O00429;F8VZ52 DNM1L Dynamin-1-like protein no no 0 0 0 1 1 25.908 25.908 2 0.053784 19802 QUIQUE_C1368_190116_001 72.789 3.6136 131480000 0 0 45894000 0 0 0 0 0 85585000 0 0 0 0 43630 1108;1404 40734 390094;390095 496577;496578 496577 2 TLAYIITELDER Unmodified 1435.7559 0.75586013 4624 Q9Y5K8;G3V2S6;H0YJH8;G3V2V6 ATP6V1D V-type proton ATPase subunit D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 129.67 129.67 2 0.0002832 126449 QUIQUE_DMIX4_190116_001 137.98 108.89 790340000 87794000 106530000 96617000 115530000 75916000 105760000 157040000 0 0 45145000 0 0 0 43631 4624 40735 390096;390097;390098;390099;390100;390101;390102;390103;390104;390105;390106;390107;390108;390109 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 40.764 40.764 2 0.001023 37134 QUIQUE_C1277_190116_001 109.29 52.113 218610000 59725000 60946000 0 0 0 0 0 0 0 0 51288000 46647000 0 43705 4471 40806 390663;390664;390665;390666;390667;390668;390669 497309;497310;497311;497312;497313;497314;497315;497316 497310 8 TLFDEVQFK Unmodified 1125.5706 0.57062555 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;H0Y325;H0Y326 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 104.85 104.85 2 0.025363 108216 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.046 60.844 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43706 228 40807 390670;390671;390672 497317;497318;497319 497319 3 TLFDQVLEFLCSPDDDSR Unmodified 2155.9732 0.97319949 728 C9JJN9;Q8N3P4 VPS8 Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog yes no 0 0 0 1 174.7 174.7 2 0.0051515 181921 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.646 69.574 13718000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13718000 0 0 43707 728 40808 390673 497320 497320 0 TLFGFLGK Unmodified 881.50109 0.50108942 2895 Q5T760;Q05519;B4DWT1;S4R3C4 SRSF11 Serine/arginine-rich splicing factor 11 yes no 0 0 0 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Unmodified 1904.8832 0.88324549 4558 Q9Y2J0;F8VP47 RPH3A Rabphilin-3A yes no 0 0 0 1 138.65 138.65 2 0.0028258 134771 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.593 64.166 20882000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20882000 0 0 0 43840 4558 40933 391804 498724 498724 1 TLNPTFDENFHFPVPYEELADR Unmodified 2650.234 0.23398228 400 A0A286YEX2;Q5T7P8 SYT6 Synaptotagmin-6 yes no 0 0 0 1 1 1 141.55 141.55 3 9.3434E-09 147436 QUIQUE_C1218_190116_001 90.464 67.828 133390000 53565000 52737000 0 0 0 0 0 0 0 0 27092000 0 0 43841 400 40934 391805;391806;391807 498725;498726;498727;498728 498725 3 TLNPVFNEQFTFK Unmodified 1583.7984 0.79839365 2182 P21579;J3KQA0 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 118.04 118.04 2;3 1.7012E-12 122196 QUIQUE_C1277_190116_001 149.96 137.8 11228000000 981860000 993840000 1037700000 899260000 827720000 783080000 1046200000 541310000 724310000 280290000 1090200000 1101600000 920750000 43842 2182 40935 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391911;391912;391913;391914;391915;391916;391917;391918;391919;391920;391921;391922;391923;391924;391925;391926;391927 498860;498861;498862;498863;498864;498865;498866;498867;498868;498869;498870;498871;498872;498873;498874;498875;498876;498877;498878;498879;498880;498881;498882;498883;498884;498885;498886;498887;498888;498889;498890;498891 498865 31 TLPGDPGSPTDVQLVTQQVIQCAYDIAK Unmodified 3013.5067 0.50665167 1040 F8WAK2;F8VXI9;Q14161 GIT2 ARF GTPase-activating protein GIT2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.44 169.44 3 2.1805E-27 171116 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.26 103.81 328340000 22273000 30636000 48060000 22408000 0 34054000 0 44883000 28850000 8941700 0 57208000 31021000 43852 1040 40945 391928;391929;391930;391931;391932;391933;391934;391935;391936;391937 498892;498893;498894;498895;498896;498897;498898;498899;498900;498901;498902 498897 11 TLPGPLALTSLEHK Unmodified 1475.8348 0.83477916 4375 Q9P1Y5 CAMSAP3 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 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2124.0786 0.078608032 2664 P55265 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes yes 0 0 0 1 1 100.29 100.29 4 0.00043473 103020 QUIQUE_C1368_190116_001 43.116 34.828 55785000 0 0 34944000 0 0 0 0 20841000 0 0 0 0 0 43859 2664 40952 391964;391965 498932;498933 498932 2 TLPQEPGKPQK Unmodified 1221.6717 0.67173657 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 14.937 14.937 2;3 0.0095556 6161 QUIQUE_C1563_190116_001 58.676 42.045 1065500000 71167000 202010000 0 91785000 110520000 287560000 0 61934000 0 30711000 120750000 0 89040000 43860 921 40953 391966;391967;391968;391969;391970;391971;391972;391973;391974;391975;391976 498934;498935;498936;498937;498938;498939;498940;498941;498942;498943;498944 498939 6 TLPQEPGKPQKDEVLR Unmodified 1833.9949 0.99486163 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 30.469 30.469 3 0.0020717 25339 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no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 69.568 69.568 3 1.4301E-06 70180 QUIQUE_C1576_190116_001 81.967 65.66 156690000 0 0 0 0 0 0 51843000 0 0 0 57433000 47415000 0 43864 3468 40957 391989;391990;391991;391992;391993;391994 498957;498958;498959;498960;498961;498962;498963;498964;498965 498959 9 TLPSGCFNTPSIEKP Unmodified 1646.7974 0.79740737 2008 P11047 LAMC1 Laminin subunit gamma-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 83.921 83.921 2 0.002717 86526 QUIQUE_C1438_190116_001 67.252 46.948 236220000 0 55480000 65718000 0 115030000 0 0 0 0 0 0 0 0 43865 2008 40958 391995;391996;391997 498966;498967;498968 498968 3 TLPSSGPQNLR Unmodified 1168.62 0.62003536 2897 Q05707;J3QT83 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 32.536 32.536 2 0.0057218 26988 QUIQUE_C1403_190116_001 68.224 44.069 222360000 0 0 0 71901000 55184000 0 0 0 26179000 24114000 0 0 44978000 43866 2897 40959 391998;391999;392000;392001;392002;392003 498969;498970;498971;498972;498973;498974;498975 498969 5 TLPTLQELHLSDNLLGDAGLQLLCEGLLDPQCR 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S27a;Polyubiquitin-B;Ubiquitin;Polyubiquitin-C;Ubiquitin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.027 38.027 2 5.4183E-05 33180 QUIQUE_DMIX4_190116_001 146.54 94.061 47134000000 2703300000 3796900000 3114400000 2515200000 3887300000 3532300000 3675500000 3659400000 4176400000 1201400000 5087600000 4192200000 5592100000 43899 623 40989 392233;392234;392235;392236;392237;392238;392239;392240;392241;392242;392243;392244;392245 499275;499276;499277;499278;499279;499280;499281;499282;499283;499284;499285;499286;499287;499288;499289;499290;499291;499292;499293;499294;499295;499296;499297;499298;499299;499300;499301;499302;499303;499304;499305;499306;499307;499308;499309 499300 35 TLSEVEESISTLISQPN Unmodified 1845.9208 0.92075321 3604 Q8N668;H7C377;H0Y7J4 COMMD1 COMM domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 165.38 165.38 2 0.010303 168406 QUIQUE_C1403_190116_001 48.284 32.897 23033000 0 0 0 23033000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43900 3604 40990 392246 499310 499310 1 TLSFGSDLNYATR Unmodified 1443.6994 0.69940789 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 91.515 91.515 2 0.00014941 92854 QUIQUE_DMIX1_190116_001 139.86 123.02 770870000 58296000 49429000 81169000 59245000 72885000 52780000 56016000 68596000 61870000 30039000 61597000 67964000 50983000 43901 3046 40991 392247;392248;392249;392250;392251;392252;392253;392254;392255;392256;392257;392258;392259;392260 499311;499312;499313;499314;499315;499316;499317;499318;499319;499320;499321;499322;499323;499324;499325;499326;499327 499319 17 TLSGGIQVNGPR Unmodified 1197.6466 0.64658446 2350 P32455 GBP1 Interferon-induced guanylate-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 42.705 42.705 2 0.051814 37692 QUIQUE_C1368_190116_001 64.841 28.394 12984000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12984000 0 0 0 43902 2350 40992 392261;392262 499328;499329 499328 2 TLSGLEVSMVTAVPGR Unmodified 1615.8603 0.86034198 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 112 112 2;3 3.1269E-09 117167 QUIQUE_DMIX5_190116_001 124.86 100.48 451590000 0 0 43342000 20534000 88362000 105270000 0 0 30482000 0 58751000 104850000 0 43903 1779 40993 392263;392264;392265;392266;392267;392268;392269 499330;499331;499332;499333;499334;499335;499336;499337;499338;499339;499340 499337 11 TLSGLEVSMVTAVPGR Oxidation (M) 1631.8553 0.8552566 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 89.448 89.448 2 9.8212E-05 90643 QUIQUE_C1403_190116_001 93.345 67.959 42535000 0 0 0 22498000 0 0 0 0 0 20037000 0 0 0 43904 1779 40993 392270;392271 499341;499342 499341 984 2 TLSGMESYCVR Unmodified 1301.5744 0.57440707 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.809 57.809 2 0.0028443 56743 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.502 87.576 1552700000 127020000 0 158350000 164660000 137660000 137070000 164260000 142780000 105640000 0 146560000 136850000 131870000 43905 2573 40994 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protein 2 yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 3 2 2 58.518 58.518 3;4;5 6.5157E-31 54762 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.38 98.729 2356600000 75406000 193600000 0 104430000 133890000 116550000 122140000 193140000 166440000 271620000 305780000 265030000 408610000 43948 2618 41035 392632;392633;392634;392635;392636;392637;392638;392639;392640;392641;392642;392643;392644;392645;392646;392647;392648;392649 499789;499790;499791;499792;499793;499794;499795;499796;499797;499798;499799;499800;499801;499802;499803;499804;499805;499806;499807;499808;499809;499810 499810 21 TLTPIIQEYFEHGDTNEVAEMLR Unmodified 2705.3007 0.30068164 3247 Q53EL6;Q5VZS7 PDCD4 Programmed cell death protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 148.76 148.76 3 3.0449E-12 151569 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.19 92.911 219490000 47997000 48172000 41084000 0 52322000 0 0 29912000 0 0 0 0 0 43949 3247 41036 392650;392651;392652;392653;392654 499811;499812;499813;499814;499815 499815 5 TLTPISAAYAR Unmodified 1162.6346 0.63462279 2339 P31939 ATIC 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41054 392804;392805;392806;392807;392808;392809;392810;392811;392812;392813;392814;392815;392816;392817;392818;392819;392820;392821;392822;392823;392824;392825;392826;392827;392828;392829;392830;392831;392832 500017;500018;500019;500020;500021;500022;500023;500024;500025;500026;500027;500028;500029;500030;500031;500032;500033;500034;500035;500036;500037;500038;500039;500040;500041;500042;500043;500044;500045;500046;500047;500048;500049;500050;500051;500052 500040 35 TLVMAVYDFDR Oxidation (M) 1344.6384 0.63838754 2182 P21579;J3KQA0 SYT1 Synaptotagmin-1 yes no 0 1 0 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 1 104.06 104.06 2 0.00038582 101853 QUIQUE_DMIX4_190116_001 118.71 102.83 1584900000 166490000 181830000 204320000 176570000 97601000 181910000 164240000 41667000 106790000 43907000 88990000 68412000 62205000 43969 2182 41055 392833;392834;392835;392836;392837;392838;392839;392840;392841;392842;392843;392844;392845;392846;392847;392848;392849;392850;392851;392852 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500217;500218;500219;500220;500221;500222;500223;500224;500225;500226;500227;500228;500229;500230;500231 500230 1487 14 TLWTVLDAIDQMWLPVVR Unmodified 2155.15 0.14998206 2139 P18669;Q8N0Y7 PGAM1;PGAM4 Phosphoglycerate mutase 1;Probable phosphoglycerate mutase 4 yes no 0 0 0 2 2 1 178.59 178.59 2;3 2.3711E-14 185313 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.9 119.71 388120000 0 0 0 0 0 0 0 0 22647000 0 316270000 49203000 0 43989 2139 41072 392972;392973;392974;392975;392976 500232;500233;500234;500235;500236;500237 500236 6 TLYDFPGNDAEDLPFK Unmodified 1840.8519 0.85194536 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 132.71 132.71 2 0.0015375 136588 QUIQUE_C1403_190116_001 65.408 51.25 294170000 0 0 33951000 143360000 116860000 0 0 0 0 0 0 0 0 43990 2480 41073 392977;392978;392979;392980 500238;500239;500240;500241;500242 500239 4 TLYEEAEEANDLSQQVANLAISPTTPGPTWPGDALR Unmodified 3853.8646 0.8646419 4393 Q9UBB6;H7C2R2 NCDN Neurochondrin yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 2 2 167.97 167.97 3;4 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TMHGHDHNVSSVAIMPNGDHIVSASR Unmodified 2768.2871 0.28711403 2460 P43034;I3L3N5 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes no 0 0 0 1 2 2 2 3 1 1 1 1 1 41.363 41.363 3;4;5 5.5939E-19 35713 QUIQUE_C1368_190116_001 86.776 84.368 1180700000 58954000 126580000 312050000 110320000 0 233510000 83731000 63463000 61530000 0 73437000 57101000 0 44014 2460 41092 393116;393117;393118;393119;393120;393121;393122;393123;393124;393125;393126;393127;393128;393129;393130 500388;500389;500390;500391;500392;500393;500394;500395;500396;500397;500398;500399;500400;500401;500402 500391 14 TMLDFPQHVSSDK Unmodified 1503.7028 0.70277871 4078 Q9BYT8 NLN Neurolysin, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 2 1 1 60.067 60.067 2;3 0.0043758 58820 QUIQUE_C1368_190116_001 81.865 38.583 115720000 0 23134000 57819000 17034000 0 17731000 0 0 0 0 0 0 0 44015 4078 41093 393131;393132;393133;393134;393135 500403;500404;500405;500406;500407;500408 500406 6 TMLDSLWAAGQELQAWK Unmodified 1946.956 0.95603328 3226 Q3LXA3;H0YCY6;I3L252 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 2 1 2 2 1 1 2 168.37 168.37 2;3 2.0888E-30 172351 QUIQUE_DMIX7_190116_001 150.05 139.95 889100000 45988000 96360000 32741000 29734000 85501000 42310000 87705000 37156000 148600000 13628000 62479000 52962000 153940000 44016 3226 41094 393136;393137;393138;393139;393140;393141;393142;393143;393144;393145;393146;393147;393148;393149;393150;393151;393152;393153;393154;393155 500409;500410;500411;500412;500413;500414;500415;500416;500417;500418;500419;500420;500421;500422;500423;500424;500425;500426;500427;500428;500429;500430 500428 21 TMLEDLGMDDEGDDDPVPLPNVNAAILK Unmodified 2996.3995 0.39946898 2784 P63208;E5RJR5;E7ERH2;F8W8N3;E5RGM3 SKP1 S-phase kinase-associated protein 1 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 1 2 1 161.17 161.17 2;3 3.4077E-37 167386 QUIQUE_C1576_190116_001 126.45 123.84 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TMLESLIADK Unmodified 1119.5846 0.58456105 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;A0A087WZL7;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.967 99.967 2 0.0060392 102594 QUIQUE_C1277_190116_001 89.08 65.311 524390000 55247000 61658000 0 70373000 41503000 0 59114000 71419000 0 33079000 61923000 70071000 0 44025 292;882;3442 41101 393250;393251;393252;393253;393254;393255;393256;393257;393258 500542;500543;500544;500545;500546;500547;500548;500549;500550;500551;500552 500544 7 TMLESSSYLIR Unmodified 1298.654 0.6540376 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 85.259 85.259 2 0.0028642 86498 QUIQUE_C1403_190116_001 86.624 68.805 123300000 0 54507000 0 68791000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44026 4606 41102 393259;393260 500553;500554;500555 500554 3 TMLFNIHSLEWDK Unmodified 1632.797 0.79701344 2348;3066 P32189;Q14409;Q14410 GK;GK3P;GK2 Glycerol kinase;Putative glycerol kinase 3;Glycerol kinase 2 no no 0 0 0 1 1 1 120.19 120.19 3 0.010658 125944 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.821 42.177 21781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21781000 0 44027 2348;3066 41103 393261;393262;393263 500556;500557;500558 500557 3 TMLHLTDIQLQDNK Unmodified 1668.8505 0.85050558 4293 Q9NTJ5 SACM1L Phosphatidylinositide phosphatase SAC1 yes yes 0 0 0 1 80.063 80.063 3 0.010442 82616 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.611 28.896 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44028 4293 41104 393264 500559 500559 1 TMLITHMQDLQEVTQDLHYENFR 2 Oxidation (M) 2893.3375 0.33747785 640;3097 B5MCX3;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 2 0 1 2 1 1 1 1 104.07 104.07 3 8.2852E-11 107714 QUIQUE_C1368_190116_001 89.402 77.878 219210000 18544000 0 34998000 0 46089000 0 0 18123000 33346000 0 68113000 0 0 44029 640;3097 41105 393265;393266;393267;393268;393269;393270;393271 500560;500561;500562;500563;500564;500565;500566 500561 412;413 6 TMLITHMQDLQEVTQDLHYENFR Oxidation (M) 2877.3426 0.34256323 640;3097 B5MCX3;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 1 0 3 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TMLITHMQDLQEVTQDLHYENFR Unmodified 2861.3476 0.3476486 640;3097 B5MCX3;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 131.03 131.03 3;4 6.1175E-249 134271 QUIQUE_DMIX1_190116_001 268.76 251.96 21948000000 1270600000 1565100000 1996500000 1576000000 1194200000 1529400000 1393600000 1877900000 1704700000 101680000 2575100000 2530800000 2632500000 44031 640;3097 41105 393309;393310;393311;393312;393313;393314;393315;393316;393317;393318;393319;393320;393321;393322;393323;393324;393325;393326;393327;393328;393329;393330;393331;393332;393333;393334 500631;500632;500633;500634;500635;500636;500637;500638;500639;500640;500641;500642;500643;500644;500645;500646;500647;500648;500649;500650;500651;500652;500653;500654;500655;500656;500657;500658;500659;500660;500661;500662;500663;500664;500665;500666;500667;500668;500669;500670;500671;500672;500673;500674;500675;500676;500677;500678;500679;500680;500681;500682;500683;500684;500685;500686;500687;500688;500689;500690;500691;500692 500666 62 TMLLLDILPSR Unmodified 1270.7319 0.73189399 2814 P78560;F8VV49;F5H7C2;F8VVY5 CRADD Death domain-containing protein CRADD yes no 0 0 0 1 1 1 1 145.25 145.25 2 0.0020367 150955 QUIQUE_C1218_190116_001 98.249 88.468 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44032 2814 41106 393335;393336;393337;393338 500693;500694;500695;500696 500693 4 TMLLQPAGSLGSYSYR Oxidation (M) 1758.8611 0.86107026 2436 P41222;H0Y5A1;Q5SQ11 PTGDS Prostaglandin-H2 D-isomerase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.336 93.336 2 2.0841E-14 90786 QUIQUE_DMIX4_190116_001 139.89 114.45 2637000000 122010000 180950000 315410000 146370000 264030000 156180000 177310000 234280000 181500000 122450000 252140000 249180000 235210000 44033 2436 41107 393339;393340;393341;393342;393343;393344;393345;393346;393347;393348;393349;393350;393351 500697;500698;500699;500700;500701;500702;500703;500704;500705;500706;500707;500708;500709;500710 500706 1859 14 TMLLQPAGSLGSYSYR Unmodified 1742.8662 0.86615564 2436 P41222;H0Y5A1;Q5SQ11 PTGDS Prostaglandin-H2 D-isomerase yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 105.38 105.38 2;3 5.5968E-45 108343 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.59 145.97 8786500000 490310000 669760000 971580000 670880000 766690000 516900000 788540000 717870000 602410000 250260000 748970000 882750000 709620000 44034 2436 41107 393352;393353;393354;393355;393356;393357;393358;393359;393360;393361;393362;393363;393364;393365;393366;393367;393368;393369;393370;393371 500711;500712;500713;500714;500715;500716;500717;500718;500719;500720;500721;500722;500723;500724;500725;500726;500727;500728;500729;500730;500731;500732;500733;500734;500735;500736;500737;500738 500731 28 TMLYTPQEMK Unmodified 1240.5832 0.58318084 4542 Q9Y265;E7ETR0;H7C4G5;J3QLR1 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.464 61.464 2 0.00028766 60729 QUIQUE_C1277_190116_001 116.05 95.721 451920000 59181000 47789000 42557000 43329000 33066000 61719000 40308000 36728000 49292000 0 0 0 37947000 44035 4542 41108 393372;393373;393374;393375;393376;393377;393378;393379;393380;393381;393382 500739;500740;500741;500742;500743;500744;500745;500746;500747;500748;500749;500750;500751 500742 13 TMMACGGSIQTSVNALSADVLGR Oxidation (M) 2354.1029 0.10285023 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 1 0 1 1 134.61 134.61 2 5.425E-14 139228 QUIQUE_C1277_190116_001 110.38 97.823 84508000 0 44463000 40045000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44036 3977 41109 393383;393384 500752;500753 500752 2815;2816 2 TMMACGGSIQTSVNALSADVLGR Unmodified 2338.1079 0.1079356 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 2 1 2 1 2 2 141.77 141.77 2;3 1.5024E-17 144969 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117 109.27 617710000 0 47970000 85327000 0 0 0 0 130400000 71672000 0 0 129280000 153070000 44037 3977 41109 393385;393386;393387;393388;393389;393390;393391;393392;393393;393394;393395 500754;500755;500756;500757;500758;500759;500760;500761;500762;500763;500764;500765;500766;500767;500768 500761 15 TMNDLEDSYGQEWTYEQR Unmodified 2263.9328 0.93279124 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 108.97 108.97 2 1.6471E-13 112807 QUIQUE_C1368_190116_001 159.52 147.14 103860000 0 0 35346000 28675000 0 0 0 39835000 0 0 0 0 0 44038 590 41110 393396;393397;393398 500769;500770;500771 500769 3 TMQALPYSTVGNSNNYLHLSVLR Oxidation (M) 2593.2959 0.29587103 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 112.65 112.65 3 8.2202E-18 117639 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.45 99.576 233310000 0 0 0 0 46802000 0 0 0 0 44707000 61575000 0 80229000 44039 1803 41111 393399;393400;393401;393402 500772;500773;500774;500775;500776 500774 1031 5 TMQFEPSTAVYDACR Unmodified 1774.7655 0.76545532 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 88.291 88.291 2 2.0266E-06 90501 QUIQUE_C1218_190116_001 100.02 87.808 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44040 4606 41112 393403 500777 500777 1 TMQFEPSTAVYDACR Oxidation (M) 1790.7604 0.76036994 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 71.832 71.832 2 2.5027E-10 72644 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.39 113.13 84420000 0 0 0 0 0 0 15419000 0 20927000 0 23118000 0 24956000 44041 4606 41112 393404;393405;393406;393407 500778;500779;500780;500781 500779 3041 2 TMQGSEVVNVLK Unmodified 1303.6806 0.6805867 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.83 68.83 2 0.0006885 68694 QUIQUE_C1403_190116_001 90.108 59.035 978090000 146890000 54693000 142180000 157710000 125620000 51276000 73962000 0 49130000 0 76989000 51632000 48003000 44042 3700 41113 393408;393409;393410;393411;393412;393413;393414;393415;393416;393417;393418 500782;500783;500784;500785;500786;500787;500788;500789;500790;500791;500792;500793;500794 500786 13 TMQGSEVVNVLK Oxidation (M) 1319.6755 0.67550132 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 1 0 1 53.818 53.818 2 0.032819 51383 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.194 20.385 48927000 0 0 0 0 0 0 0 48927000 0 0 0 0 0 44043 3700 41113 393419 500795 500795 1 TMQNTNDVETAR Oxidation (M) 1394.6096 0.6096066 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 13.886 13.886 2 7.8429E-20 6003 QUIQUE_C1438_190116_001 168.74 157.14 649470000 59047000 89900000 52464000 41150000 27436000 61085000 0 0 212260000 61873000 44265000 0 0 44044 425 41114 393420;393421;393422;393423;393424;393425;393426;393427;393428 500796;500797;500798;500799;500800;500801;500802;500803;500804 500800 308 9 TMQNTNDVETAR Unmodified 1378.6147 0.61469198 425 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(M) 2185.0732 0.073205078 2861 Q01813;B1APP6 PFKP ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type yes no 0 1 0 1 74.558 74.558 2 1.5034E-14 75551 QUIQUE_C1368_190116_001 115.83 102.4 28789000 0 0 28789000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44071 2861 41134 393568 500964 500964 2336 1 TNDQDGLISGILR Unmodified 1400.726 0.72595699 3669 Q8TC07;F8WDJ1;F8WF35;F8WCB5 TBC1D15 TBC1 domain family member 15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.2 105.2 2 0.0090262 108017 QUIQUE_C1403_190116_001 73.781 45.768 236510000 23070000 35693000 0 26039000 25295000 24769000 0 0 28375000 15445000 0 23206000 34619000 44072 3669 41135 393569;393570;393571;393572;393573;393574;393575;393576;393577 500965;500966;500967;500968;500969;500970;500971;500972;500973;500974;500975 500967 10 TNDQMVVVYLASLIR Unmodified 1720.9182 0.91819121 2589 P51665 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 166.05 166.05 2;3 2.5009E-20 170547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.3 133.16 539680000 0 0 37393000 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501059;501060;501061;501062;501063;501064;501065;501066;501067;501068;501069;501070;501071;501072;501073;501074;501075;501076;501077;501078;501079;501080;501081;501082;501083;501084;501085;501086;501087;501088;501089;501090;501091;501092;501093;501094;501095;501096;501097;501098;501099;501100;501101;501102;501103;501104;501105;501106;501107;501108;501109;501110;501111 501066 52 TNEQMHQLVAAYK Oxidation (M) 1547.7402 0.74022685 1936 P08133;E5RK63;E5RJF5 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.688 23.688 2 9.6034E-06 17148 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.2 80.461 1054500000 110620000 56474000 189870000 65735000 73429000 0 75029000 0 135990000 0 108800000 155950000 82639000 44081 1936 41143 393671;393672;393673;393674;393675;393676;393677;393678;393679;393680 501112;501113;501114;501115;501116;501117;501118;501119;501120;501121;501122;501123;501124;501125 501122 1173 13 TNEQMHQLVAAYK Unmodified 1531.7453 0.74531222 1936 P08133;E5RK63;E5RJF5 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 46.021 46.021 2;3 3.5505E-41 43582 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.36 158.86 12276000000 954940000 886030000 1371600000 943560000 678580000 756700000 1130000000 636930000 918840000 441320000 1378800000 1107500000 1071300000 44082 1936 41143 393681;393682;393683;393684;393685;393686;393687;393688;393689;393690;393691;393692;393693;393694;393695;393696;393697;393698;393699;393700;393701;393702;393703;393704;393705;393706;393707 501126;501127;501128;501129;501130;501131;501132;501133;501134;501135;501136;501137;501138;501139;501140;501141;501142;501143;501144;501145;501146;501147;501148;501149;501150;501151;501152;501153;501154;501155;501156;501157;501158;501159;501160;501161;501162;501163;501164 501150 37 TNFDAFPDK Unmodified 1053.4767 0.47672516 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 2 2 1 2 1 2 1 57.511 57.511 1;2 0.0017744 56579 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.25 76.722 2600400000 102540000 167870000 263830000 254630000 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44085 116 41146 393728 501189 501189 1 TNFFGTR Unmodified 841.40825 0.40825167 2102 P16152;E9PQ63;A8MTM1 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 43.343 43.343 2 0.0087951 40197 QUIQUE_DMIX5_190116_001 152.39 132.54 5578400000 0 0 0 0 987980000 0 1011900000 0 1000900000 428580000 964070000 0 1185000000 44086 2102 41147 393729;393730;393731;393732;393733;393734 501190;501191;501192;501193;501194;501195;501196;501197;501198;501199;501200 501198 11 TNFFIQLVRPGVAQPEDTVQFR Unmodified 2561.3391 0.33905647 545 H7C2P7;A6NJD9;A8MVT4;A8MYK1;Q16540 MRPL23 39S ribosomal protein L23, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 133.31 133.31 3 5.9148E-05 138218 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.678 40.3 93207000 0 0 0 0 0 0 0 0 51645000 0 0 41561000 0 44087 545 41148 393735;393736 501201;501202;501203 501202 2 TNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGK Unmodified 2742.3031 0.30314125 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0Y8W2;D6REE5;D6RHH4;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;H0Y8R5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 4 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 65.236 65.236 2;3;4 7.1862E-235 64463 QUIQUE_C1368_190116_001 274.95 243.88 3501000000 278860000 383590000 488860000 397070000 315670000 216460000 535040000 137570000 110470000 15373000 119770000 228110000 274130000 44088 2787 41149 393737;393738;393739;393740;393741;393742;393743;393744;393745;393746;393747;393748;393749;393750;393751;393752;393753;393754;393755;393756;393757;393758;393759;393760;393761;393762 501204;501205;501206;501207;501208;501209;501210;501211;501212;501213;501214;501215;501216;501217;501218;501219;501220;501221;501222;501223;501224;501225;501226;501227;501228;501229;501230;501231;501232;501233;501234;501235;501236;501237 501213 34 TNHLVTVEGGWPQFGVGAEICAR Unmodified 2497.2172 0.21722678 2013 P11177;C9J634 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 3 3 1 3 121.29 121.29 3 5.0198E-05 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501337;501338;501339;501340;501341;501342;501343;501344;501345;501346;501347;501348;501349;501350;501351;501352;501353;501354;501355;501356;501357;501358 501338 18 TNLEDVGR Unmodified 902.44576 0.44575938 2467 P43897 TSFM Elongation factor Ts, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 27.764 27.764 2 0.041274 21916 QUIQUE_C1218_190116_001 82.452 27.011 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44100 2467 41161 393870 501359 501359 1 TNLEFLQEQFNSIAAHVLHCTDSGFGAR Unmodified 3161.4989 0.49888095 7 A0A024RCR6;A0A0G2JK23;P46379;A0A0G2JL47 BAT3;BAG6 Large proline-rich protein BAG6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 163.12 163.12 3;4 1.0261E-44 167040 QUIQUE_DMIX7_190116_001 134.76 126.46 1421300000 53022000 0 90285000 104580000 63500000 0 60402000 0 119240000 0 178950000 503090000 248170000 44101 7 41162 393871;393872;393873;393874;393875;393876;393877;393878;393879;393880;393881 501360;501361;501362;501363;501364;501365;501366;501367;501368;501369;501370;501371;501372 501369 13 TNLESILSYPK Unmodified 1263.6711 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Unmodified 1180.536 0.53603095 4475 Q9UKG1 APPL1 DCC-interacting protein 13-alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 22.457 22.457 2 0.018901 15953 QUIQUE_C1218_190116_001 54.094 34.497 158210000 66609000 0 0 91599000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44114 4475 41175 393974;393975;393976 501473;501474;501475 501473 3 TNPLNITLPFSFIDYYK Unmodified 2045.051 0.050979523 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 167.43 167.43 2;3 7.5025E-13 170484 QUIQUE_C1403_190116_001 161.21 130.87 3086100000 471810000 52787000 496040000 354220000 0 272100000 45651000 0 0 82651000 395530000 442680000 472650000 44115 335;1521 41176 393977;393978;393979;393980;393981;393982;393983;393984;393985;393986;393987;393988;393989;393990 501476;501477;501478;501479;501480;501481;501482;501483;501484;501485;501486;501487;501488;501489;501490 501481 14 TNPLNITLPFSFIDYYKK Unmodified 2173.1459 0.14594254 1521;335 A0A1B0GTF3;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 1 2 1 1 2 1 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501723;501724;501725;501726;501727;501728;501729;501730;501731;501732;501733;501734;501735;501736;501737;501738;501739;501740 501725 18 TNVNGGAIALGHPLGGSGSR Unmodified 1833.9446 0.94455739 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 50.371 50.371 2;3 2.7388E-37 46989 QUIQUE_DMIX8_190116_001 151.62 120.4 3421100000 264220000 205620000 280600000 234130000 293910000 209150000 253330000 375600000 264300000 110440000 358760000 331080000 239980000 44139 2453 41198 394183;394184;394185;394186;394187;394188;394189;394190;394191;394192;394193;394194;394195;394196;394197;394198;394199;394200;394201;394202;394203;394204;394205;394206;394207 501741;501742;501743;501744;501745;501746;501747;501748;501749;501750;501751;501752;501753;501754;501755;501756;501757;501758;501759;501760;501761;501762;501763;501764;501765;501766;501767;501768;501769 501768 29 TNYNDRYDEIR Unmodified 1457.6535 0.65352033 2754 Q5T8U2;P62424 RPL7A 60S ribosomal protein L7a yes no 0 0 1 1 31.329 31.329 3 0.059815 25959 QUIQUE_C1277_190116_001 34.179 5.4704 49836000 0 49836000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44140 2754 41199 394208 501770 501770 1 TNYNDRYDEIRR Unmodified 1613.7546 0.75463136 2754 Q5T8U2;P62424 RPL7A 60S ribosomal protein L7a yes no 0 0 2 1 23.833 23.833 4 0.040259 17521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.066 33.589 24986000 0 0 0 0 0 0 0 24986000 0 0 0 0 0 44141 2754 41200 394209 501771 501771 1 TNYSSVLTNVGAALHGFHDVMK Unmodified 2360.1583 0.15831492 3423 Q6ZMI0 PPP1R21 Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 131.13 131.13 4 1.9011E-07 135527 QUIQUE_C1277_190116_001 75.646 62.219 139950000 0 32354000 0 38256000 0 0 0 0 32645000 0 0 0 36692000 44142 3423 41201 394210;394211;394212;394213 501772;501773;501774;501775;501776 501772 5 TPADCPVIAIDSFR Unmodified 1560.7606 0.76062794 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 1 106.12 106.12 2 0.022291 110011 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.513 34.306 121950000 0 0 0 0 0 0 0 0 121950000 0 0 0 0 44143 4007 41202 394214 501777 501777 1 TPAFAESVTEGDVR Unmodified 1477.7049 0.7048872 2404 P36957;Q86SW4;H0YJF9;G3V3F0;G3V5M3 DLST Dihydrolipoyllysine-residue succinyltransferase component of 2-oxoglutarate dehydrogenase complex, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 68.158 68.158 2 1.1158E-22 69150 QUIQUE_C1218_190116_001 166.14 148.91 8272300000 830340000 637410000 769820000 618870000 586490000 636860000 597560000 498220000 710520000 302740000 713580000 725910000 643960000 44144 2404 41203 394215;394216;394217;394218;394219;394220;394221;394222;394223;394224;394225;394226;394227;394228 501778;501779;501780;501781;501782;501783;501784;501785;501786;501787;501788;501789;501790;501791;501792;501793;501794;501795;501796 501778 19 TPAGNFVTLEEGK Unmodified 1361.6827 0.68269519 2465 P43490 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 70.428 70.428 2 0.00062474 69325 QUIQUE_C1368_190116_001 115.33 90.551 25359000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25359000 0 0 0 44145 2465 41204 394229;394230;394231 501797;501798;501799 501797 2 TPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFK Unmodified 3206.5772 0.57717407 2465 P43490 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 2 161.03 161.03 3;4 1.3441E-19 166040 QUIQUE_C1368_190116_001 90.397 79.766 4922200000 156310000 188100000 843100000 129350000 350110000 405330000 720170000 0 0 0 570620000 157900000 1401200000 44146 2465 41205 394232;394233;394234;394235;394236;394237;394238;394239;394240;394241;394242;394243;394244 501800;501801;501802;501803;501804;501805;501806;501807;501808;501809;501810;501811;501812;501813;501814;501815 501802 13 TPAILEASAGAIQNLCAGR Unmodified 1911.9836 0.98364501 759 C9JZR2;O60716 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 128.15 128.15 2;3 1.3663E-63 134401 QUIQUE_C1438_190116_001 182.07 149.57 508390000 40523000 72314000 109990000 49140000 88899000 0 33264000 46443000 0 18515000 0 49303000 0 44147 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ABHD14B Alpha/beta hydrolase domain-containing protein 14B yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 95.697 95.697 3 2.4638E-08 97302 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.107 76.114 551930000 0 0 0 0 0 0 0 87458000 104190000 57259000 90899000 95930000 116190000 44151 3881 41209 394289;394290;394291;394292;394293;394294 501873;501874;501875;501876;501877;501878;501879 501873 2758 7 TPALPGLPEDPWVR Unmodified 1546.8144 0.81437807 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 127.43 127.43 2 0.0010856 124568 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.655 60.387 300590000 0 0 49251000 0 0 0 0 52893000 57165000 23914000 60928000 0 56444000 44152 1510 41210 394295;394296;394297;394298;394299;394300;394301;394302;394303;394304 501880;501881;501882;501883;501884;501885;501886;501887;501888;501889 501886 9 TPALSPQRPLTTQQPQSGTLK Unmodified 2248.2175 0.21754435 3755;58 A0A087WW91;Q92777 SYN2 Synapsin-2 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 2 49.743 49.743 2;3 3.3027E-54 48529 QUIQUE_C1218_190116_001 147.49 141.82 4560800000 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502063;502064;502065;502066;502067;502068;502069;502070;502071;502072;502073;502074;502075;502076;502077;502078;502079;502080;502081;502082;502083;502084;502085;502086;502087;502088;502089;502090;502091;502092;502093;502094;502095;502096;502097;502098;502099;502100 502088 37 TPATAEAQHIIYK Unmodified 1441.7565 0.75652884 3666 Q8TBG4;E7ENR6 ETNPPL Ethanolamine-phosphate phospho-lyase yes no 0 0 0 1 40.008 40.008 3 0.037366 36402 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.572 22.315 29668000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29668000 0 44163 3666 41221 394447 502101 502101 1 TPATEEAAYLVSR Unmodified 1406.7042 0.70415892 3528 Q8IUZ5;H7BYK2 PHYKPL 5-phosphohydroxy-L-lysine phospho-lyase yes no 0 0 0 1 1 76.548 76.548 2 0.0012186 76877 QUIQUE_C1403_190116_001 110.08 65.7 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44164 3528 41222 394448;394449 502102;502103 502102 2 TPAVEGLTEAEEEELR Unmodified 1771.8476 0.84758827 80 A0A087WYR3;O43399;A0A087WZ51 TPD52L2 Tumor protein D54 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 94.977 94.977 2 2.8199E-36 98732 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502118;502119;502120;502121;502122;502123 502120 5 TPAVQPQHSHESVR Unmodified 1571.7805 0.78045218 3517 Q86XD5 FAM131B Protein FAM131B yes yes 0 0 0 2 2 10.493 10.493 3;4 4.3371E-30 3011 QUIQUE_C1563_190116_001 156.24 129.11 35854000 0 17037000 0 0 0 18818000 0 0 0 0 0 0 0 44168 3517 41226 394469;394470;394471;394472 502124;502125;502126;502127 502127 4 TPCAETPAEPVDWAFAQR Unmodified 2044.9313 0.93127509 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 111.25 111.25 2 3.158E-10 115307 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.65 99.807 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44169 497 41227 394473;394474 502128;502129 502129 2 TPCNAGTFSQPEK Unmodified 1435.6402 0.64017845 1307 J3QT28;O43684;J3QSX4 BUB3 Mitotic checkpoint protein BUB3 yes no 0 0 0 1 1 1 27.16 27.16 2 0.00090556 21743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.76 91.983 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44170 1307 41228 394475;394476;394477 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502172 8 TPDFESTGLYSAMPR Oxidation (M) 1686.7559 0.75593649 2563 P50440;H0YMX4 GATM Glycine amidinotransferase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 83.612 83.612 2 7.2122E-06 84968 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.97 95.39 315910000 0 32171000 0 35441000 21384000 28463000 0 20794000 49053000 0 45336000 44639000 38631000 44175 2563 41232 394524;394525;394526;394527;394528;394529;394530;394531;394532;394533 502184;502185;502186;502187;502188;502189;502190;502191;502192;502193 502190 2014 7 TPDGTENGDFLALDLGGTNFR Unmodified 2209.0287 0.028740531 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 3 1 1 2 2 1 141.15 141.15 2;3 6.6665E-146 147970 QUIQUE_DMIX5_190116_001 229.92 209.08 2706200000 182070000 0 117380000 165310000 214010000 62770000 274620000 362210000 93182000 69069000 404000000 584930000 176600000 44176 2146 41233 394534;394535;394536;394537;394538;394539;394540;394541;394542;394543;394544;394545;394546;394547;394548;394549;394550;394551 502194;502195;502196;502197;502198;502199;502200;502201;502202;502203;502204;502205;502206;502207;502208;502209;502210;502211;502212 502208 16 TPDIDLAK Unmodified 871.4651 0.46509784 265 A0A0D9SF30 NCAM1 yes yes 0 0 0 1 1 40.734 40.734 2 0.030205 37727 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.169 22.775 141670000 0 0 0 73789000 0 0 0 0 67885000 0 0 0 0 44177 265 41234 394552;394553 502213;502214 502214 2 TPDKVNHAVLAVGYGEK Unmodified 1796.9421 0.94209778 91 A0A087X0D5;P09668 CTSH Pro-cathepsin H;Cathepsin H mini chain;Cathepsin H;Cathepsin H heavy chain;Cathepsin H light chain yes no 0 0 1 1 2 38.868 38.868 2;3 2.4834E-12 34754 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.13 102.57 120650000 0 0 0 0 0 0 0 60203000 60447000 0 0 0 0 44178 91 41235 394554;394555;394556 502215;502216;502217;502218;502219 502219 5 TPDTSTYCYETAEK Unmodified 1664.6876 0.68758215 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.395 43.395 2 5.7968E-216 40351 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502248 502248 1 TPEDGDYSYEIIEK Unmodified 1657.7359 0.73591255 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.842 82.842 2 1.2828E-87 84851 QUIQUE_C1218_190116_001 223.31 190.22 4838700000 300580000 336450000 450880000 344570000 354240000 444610000 436480000 394890000 390620000 130620000 447810000 345550000 461410000 44182 2483 41239 394573;394574;394575;394576;394577;394578;394579;394580;394581;394582;394583;394584;394585 502249;502250;502251;502252;502253;502254;502255;502256;502257;502258;502259;502260;502261;502262;502263;502264;502265;502266;502267;502268;502269;502270;502271 502249 23 TPEEGGYSYDISEK Unmodified 1573.6784 0.67839767 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.392 56.392 2 1.5632E-36 55642 QUIQUE_DMIX5_190116_001 178.1 145.77 3838400000 207250000 236620000 381560000 256260000 279450000 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78.471 2 0.00042893 80344 QUIQUE_C1218_190116_001 119.17 82.617 293720000 54626000 0 60268000 0 0 42951000 42833000 0 32778000 19005000 0 41254000 0 44189 1039 41246 394645;394646;394647;394648;394649;394650;394651 502356;502357;502358;502359;502360;502361;502362 502356 6 TPELNLDQFHDK Unmodified 1455.6994 0.69940789 2269 P27824;H0Y9Q7;D6RGY2;D6RFL1;H0Y9H1 CANX Calnexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.959 67.959 3 1.8869E-10 67674 QUIQUE_C1403_190116_001 156.02 142.88 2387600000 310630000 202660000 255220000 361450000 0 266200000 263080000 113050000 170160000 128140000 174270000 0 142750000 44190 2269 41247 394652;394653;394654;394655;394656;394657;394658;394659;394660;394661;394662 502363;502364;502365;502366;502367;502368;502369;502370;502371;502372;502373;502374;502375 502366 13 TPELNLDQFHDKTPYTIMFGPDK Oxidation (M) 2722.2949 0.29486798 2269 P27824;H0Y9Q7;D6RGY2;D6RFL1;H0Y9H1 CANX Calnexin yes no 0 1 1 1 113.7 113.7 3 0.0039202 115949 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.396 37.055 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502379;502380;502381;502382;502383;502384;502385;502386;502387;502388;502389;502390;502391;502392;502393 502390 15 TPEMIIQKPK Unmodified 1183.6635 0.66348007 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.193 29.193 2;3 0.0050969 23524 QUIQUE_C1438_190116_001 58.63 45.122 432650000 50175000 45692000 37817000 55472000 56770000 54599000 36408000 41568000 26904000 0 27242000 0 0 44194 2935 41250 394679;394680;394681;394682;394683;394684;394685;394686;394687;394688 502394;502395;502396;502397;502398;502399;502400;502401;502402;502403 502398 10 TPEQCPSVVSLLSESYNPHVR Unmodified 2398.1587 0.15870885 3954 Q99460;A0A087WW66;H7C378 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 111 111 3 2.2523E-16 107809 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.4 99.113 201950000 201950000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44195 3954 41251 394689;394690 502404;502405 502405 2 TPESFLGPNAALVDLDSLVSR Unmodified 2200.1376 0.1375627 4654 Q9Y6I3 EPN1 Epsin-1 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2357.2478 0.24784143 2701 P60953;Q5JYX0 CDC42 Cell division control protein 42 homolog yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 128.71 128.71 2;3 6.5371E-19 131658 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.49 118.27 889920000 0 0 0 0 0 0 0 363590000 169850000 0 82488000 109010000 164980000 44207 2701 41263 394820;394821;394822;394823;394824;394825 502589;502590;502591;502592;502593;502594;502595;502596;502597;502598;502599 502591 11 TPGAAANLELIFVGPQHAGNYR Unmodified 2295.176 0.17601389 1858 P04217 A1BG Alpha-1B-glycoprotein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 112.9 112.9 3 1.6736E-11 116764 QUIQUE_DMIX8_190116_001 107.41 103.34 525970000 0 0 72109000 36580000 142920000 30905000 49525000 0 47552000 0 79185000 0 67193000 44208 1858 41264 394826;394827;394828;394829;394830;394831;394832;394833 502600;502601;502602;502603;502604;502605;502606;502607;502608;502609 502609 10 TPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAK Unmodified 2926.3735 0.37354578 2728 P61626 LYZ Lysozyme C yes yes 0 0 0 1 114.93 114.93 3 7.3641E-13 118185 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394972;394973;394974;394975;394976;394977;394978;394979;394980;394981;394982 502789;502790;502791;502792;502793;502794;502795;502796;502797;502798;502799;502800;502801;502802;502803 502789 13 TPHLILSSSSQR Unmodified 1324.7099 0.709913 272 A0A0D9SFU4;O95970 LGI1 Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 29.401 29.401 3 0.018997 24217 QUIQUE_C1218_190116_001 33.204 17.664 55334000 34969000 20364000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44225 272 41279 394983;394984;394985 502804;502805;502806 502804 3 TPHVLVLGSGVYR Unmodified 1396.7827 0.78268401 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 1 63.957 63.957 3 0.0011434 63094 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.11 48.102 24983000 0 0 0 0 24983000 0 0 0 0 0 0 0 0 44226 1029 41280 394986;394987;394988 502807;502808;502809;502810 502810 4 TPIAAGHPSMNLLLR Unmodified 1589.8712 0.87118144 2558 P50213;H0YLI6;H0YMU3;H0YKD0 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 78.588 78.588 2;3 1.4705E-36 80738 QUIQUE_C1218_190116_001 145.49 141.38 9550600000 657060000 779290000 863940000 592740000 711360000 581360000 900580000 518250000 912790000 188060000 1154800000 788780000 901480000 44227 2558 41281 394989;394990;394991;394992;394993;394994;394995;394996;394997;394998;394999;395000;395001;395002;395003;395004;395005;395006;395007;395008;395009;395010;395011;395012;395013;395014;395015 502811;502812;502813;502814;502815;502816;502817;502818;502819;502820;502821;502822;502823;502824;502825;502826;502827;502828;502829;502830;502831;502832;502833;502834;502835;502836;502837;502838;502839;502840;502841;502842;502843;502844;502845;502846;502847;502848 502812 38 TPIAAGHPSMNLLLR Oxidation (M) 1605.8661 0.86609606 2558 P50213;H0YLI6;H0YMU3;H0YKD0 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 2 1 54.952 54.952 2;3 8.2752E-05 53083 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395061;395062;395063;395064;395065;395066;395067;395068;395069;395070;395071 502906;502907;502908;502909;502910;502911;502912;502913;502914;502915;502916 502907 11 TPIQVLHEYGMK Unmodified 1414.7279 0.72787125 1646 O75569;G5E9Q4;F8WEG8;C9JMM3 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 71.957 71.957 3 0.0029796 72564 QUIQUE_C1368_190116_001 53.448 38.846 343430000 0 0 54072000 48926000 0 44719000 63789000 0 48941000 0 82983000 0 0 44232 1646 41285 395072;395073;395074;395075;395076;395077 502917;502918;502919;502920;502921;502922 502917 6 TPIQVLHEYGMK Oxidation (M) 1430.7228 0.72278587 1646 O75569;G5E9Q4;F8WEG8;C9JMM3 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes no 0 1 0 1 51.142 51.142 2 0.034277 49884 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.705 44.809 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44233 1646 41285 395078 502923 502923 1 TPITVVK Unmodified 756.47454 0.47454032 166;788 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Unmodified 1039.5662 0.56620887 900 E9PC69;Q7KZI7 MARK2 Serine/threonine-protein kinase MARK2 yes no 0 0 0 1 49.691 49.691 2 0.035453 47395 QUIQUE_C1218_190116_001 54.776 22.166 44820000 44820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44247 900 41298 395193 503063 503063 1 TPLQGILQLGQELKPK Unmodified 1762.0353 0.035269879 1613 O75146 HIP1R Huntingtin-interacting protein 1-related protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.44 130.44 3 0.00031094 135008 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.37 54.954 693600000 82754000 67292000 52663000 49899000 49066000 77302000 81970000 0 0 27731000 66650000 64853000 73420000 44248 1613 41299 395194;395195;395196;395197;395198;395199;395200;395201;395202;395203;395204 503064;503065;503066;503067;503068;503069;503070;503071;503072;503073;503074;503075;503076;503077 503077 13 TPLSAAAHTHPVYCVNVVGTQNAHNLISISTDGK Unmodified 3571.7842 0.78416393 2992 Q13409 DYNC1I2 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 92.78 92.78 4 1.5389E-99 95583 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0.17531025 2040 P12268 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 173.08 173.08 4 1.8136E-103 180206 QUIQUE_DMIX5_190116_001 140.94 133.5 125450000 0 0 0 0 0 0 31005000 0 22821000 0 71623000 0 0 44255 2040 41306 395272;395273;395274 503148;503149;503150 503150 3 TPLVSVLLEGPPHSGK Unmodified 1629.909 0.90900673 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 2 1 2 1 2 95.086 95.086 2;3 6.2381E-25 98239 QUIQUE_C1277_190116_001 132.44 116.89 11870000000 1259000000 1369800000 1253100000 1047000000 930360000 975620000 1252000000 453650000 657680000 405000000 830720000 719850000 715770000 44256 1245 41307 395275;395276;395277;395278;395279;395280;395281;395282;395283;395284;395285;395286;395287;395288;395289;395290;395291;395292 503151;503152;503153;503154;503155;503156;503157;503158;503159;503160;503161;503162;503163;503164;503165;503166;503167;503168;503169;503170;503171;503172;503173;503174;503175;503176;503177;503178;503179;503180;503181;503182;503183;503184;503185;503186;503187;503188;503189;503190;503191;503192;503193;503194 503155 43 TPMCAHCNQVIR Unmodified 1485.6639 0.66390755 3865 Q96HC4;H0Y8Y3;A0A0A0MSP3 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 19.973 19.973 3 0.015415 12665 QUIQUE_C1368_190116_001 35.006 26.186 101030000 0 0 46806000 0 0 0 29230000 0 0 0 0 24993000 0 44257 3865 41308 395293;395294;395295 503195;503196;503197 503195 3 TPMCAHCNQVIR Oxidation (M) 1501.6588 0.65882218 3865 Q96HC4;H0Y8Y3;A0A0A0MSP3 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 1 0 1 14.084 14.084 2 0.040815 6265 QUIQUE_DMIX8_190116_001 47.198 34.984 12699000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12699000 44258 3865 41308 395296 503198 503198 1 TPMGIVLDALEQQEEGINR Oxidation (M) 2128.047 0.047033132 1667 O75915 ARL6IP5 PRA1 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172.56 172.56 2;3 7.9422E-13 173810 QUIQUE_C1563_190116_001 143.42 126.48 1079000000 128460000 165270000 11893000 63377000 25472000 80587000 114090000 109830000 110650000 13566000 41175000 122910000 91748000 44261 1596 41310 395319;395320;395321;395322;395323;395324;395325;395326;395327;395328;395329;395330;395331;395332;395333;395334;395335;395336;395337 503224;503225;503226;503227;503228;503229;503230;503231;503232;503233;503234;503235;503236;503237;503238;503239;503240;503241;503242;503243 503233 16 TPMPPISSVLLAFSVLGELHSK Unmodified 2322.2657 0.2657401 1518 O43264 ZW10 Centromere/kinetochore protein zw10 homolog yes yes 0 0 0 1 169.52 169.52 3 0.053909 171359 QUIQUE_DMIX1_190116_001 22.409 15.421 6576600 0 0 0 0 0 0 0 6576600 0 0 0 0 0 44262 1518 41311 395338 503244 503244 1 TPNGLAIDHR Unmodified 1092.5676 0.56760585 2911 Q07954;H0YJI8 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes no 0 0 0 1 20.955 20.955 3 0.013295 14281 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.809 14.605 34010000 0 0 0 0 0 0 0 0 34010000 0 0 0 0 44263 2911 41312 395339 503245 503245 1 TPNGVVLAPVQLGK Unmodified 1391.8136 0.81364979 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.269 83.269 2 0.00053008 84696 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.27 87.946 637130000 0 0 48097000 0 0 36629000 39135000 96807000 114050000 35181000 108110000 91364000 67761000 44264 3053 41313 395340;395341;395342;395343;395344;395345;395346;395347;395348 503246;503247;503248;503249;503250;503251;503252;503253;503254 503250 5 TPNKIDLYDVR Unmodified 1332.7038 0.70376498 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 1 2 1 52.183 52.183 2;3 0.0064641 50097 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.855 48.342 149240000 0 0 0 0 0 0 0 105120000 44116000 0 0 0 0 44265 2640 41314 395349;395350;395351 503255;503256;503257 503256 3 TPNNPSCNADLINR Unmodified 1584.7315 0.73145307 2640 P54289;H0Y715 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 42.108 42.108 2 8.0107E-14 38878 QUIQUE_DMIX5_190116_001 140.78 118.06 352010000 0 0 0 73364000 63081000 0 92953000 0 0 12643000 57207000 0 52763000 44266 2640 41315 395352;395353;395354;395355;395356;395357;395358 503258;503259;503260;503261;503262;503263;503264;503265 503264 7 TPNTFAVCTEHR Unmodified 1431.6565 0.65649722 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;H7C3Y8 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 27.978 27.978 3 0.0067492 22316 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A0A087WW91 SYN2 yes yes 0 0 1 1 1 2 114.46 114.46 3 2.5129E-07 118310 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.694 50.819 190990000 0 0 0 41109000 0 0 0 0 0 0 0 0 149880000 44272 58 41321 395395;395396;395397;395398 503316;503317;503318;503319 503319 4 TPPQRPPPQGGPGQPQGMQPPGK Unmodified 2333.1699 0.16988266 3755 Q92777 SYN2 Synapsin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 3 31.764 31.764 3 1.9367E-17 26140 QUIQUE_C1368_190116_001 86.546 74.065 484550000 143390000 0 152730000 0 0 44734000 0 0 0 0 51529000 32302000 59866000 44273 3755 41322 395399;395400;395401;395402;395403;395404;395405;395406;395407;395408 503320;503321;503322;503323;503324;503325;503326;503327;503328;503329;503330 503322 9 TPPSEEDSAEAER Unmodified 1416.6005 0.6004817 1551 O43765;K7EMD6 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 18.666 18.666 2 0.0020782 11657 QUIQUE_C1218_190116_001 75.474 62.097 369990000 71523000 0 82057000 39240000 19697000 46362000 0 33964000 0 11900000 0 35097000 30151000 44274 1551 41323 395409;395410;395411;395412;395413;395414;395415;395416;395417;395418 503331;503332;503333;503334;503335;503336;503337;503338;503339;503340 503332 9 TPPYADPSLQAPVR Unmodified 1510.778 0.77799256 99 Q2TAM5;E9PKH5;A0A087X0W8;Q04206 RELA Transcription factor p65 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 69.664 69.664 2 0.0054845 69973 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.611 58.473 177410000 0 0 44951000 0 0 0 37720000 0 0 0 35431000 0 59310000 44275 99 41324 395419;395420;395421;395422;395423;395424 503341;503342;503343;503344;503345;503346 503344 4 TPQASTYSYETSDLCYTAEK Unmodified 2313.9947 0.99472279 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.18 81.18 2 4.1444E-75 83445 QUIQUE_C1218_190116_001 235.26 229.17 524360000 40152000 61983000 84089000 52496000 40975000 71728000 74109000 0 0 0 47512000 0 51314000 44276 2483 41325 395425;395426;395427;395428;395429;395430;395431;395432;395433 503347;503348;503349;503350;503351;503352;503353;503354;503355 503347 9 TPQASTYSYETSDLCYTAEKK Unmodified 2442.0897 0.089685808 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 64.969 64.969 3 0.00093792 65561 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.688 45.713 50265000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50265000 0 0 44277 2483 41326 395434 503356 503356 1 TPQIPEWLIILASLLALALILAVCIAVNSR Unmodified 3270.9142 0.91416246 1143 H0YD13;P16070;H0Y2P0;H0Y5E4;J3KN83;H0YF08 CD44 CD44 antigen yes no 0 0 0 1 191.97 191.97 3 0.00031392 197217 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.344 36.765 2540200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2540200 0 0 44278 1143 41327 395435 503357 503357 1 TPQIVALAK Unmodified 939.57532 0.57531699 1094 G5E953;Q13615;J3QR65;Q9NYA4 MTMR3;MTMR4 Myotubularin-related protein 3;Myotubularin-related protein 4 yes no 0 0 0 1 1 49.275 49.275 2 0.023727 47114 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.324 47.762 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44279 1094 41328 395436;395437 503358;503359 503358 2 TPQPDSALIR Unmodified 1096.5877 0.58767259 2559 P50336;H0YFP3 PPOX Protoporphyrinogen oxidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.184 42.184 2 0.0045713 39534 QUIQUE_C1218_190116_001 80.455 58.495 73041000 43369000 0 29672000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44280 2559 41329 395438;395439;395440;395441;395442 503360;503361;503362;503363;503364 503360 5 TPSAAYLWVGTGASEAEK Unmodified 1836.8894 0.8893935 166 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396 GSN Gelsolin yes no 0 0 0 3 2 3 3 2 2 3 5 5 2 6 6 5 101.06 101.06 2;3 1.6704E-224 102287 QUIQUE_DMIX5_190116_001 276.71 253.11 12067000000 868440000 823460000 898630000 963600000 776990000 875050000 784090000 1357600000 1011800000 789060000 840830000 1001700000 1075700000 44281 166 41330 395443;395444;395445;395446;395447;395448;395449;395450;395451;395452;395453;395454;395455;395456;395457;395458;395459;395460;395461;395462;395463;395464;395465;395466;395467;395468;395469;395470;395471;395472;395473;395474;395475;395476;395477;395478;395479;395480;395481;395482;395483;395484;395485;395486;395487;395488;395489 503365;503366;503367;503368;503369;503370;503371;503372;503373;503374;503375;503376;503377;503378;503379;503380;503381;503382;503383;503384;503385;503386;503387;503388;503389;503390;503391;503392;503393;503394;503395;503396;503397;503398;503399;503400;503401;503402;503403;503404;503405;503406;503407;503408;503409;503410;503411;503412;503413;503414;503415;503416;503417;503418;503419;503420;503421;503422;503423;503424;503425;503426;503427;503428;503429;503430;503431;503432;503433;503434;503435;503436;503437;503438;503439;503440;503441;503442;503443;503444;503445;503446;503447;503448;503449;503450;503451;503452;503453;503454;503455 503428 86 TPSALAILENANVLAR Unmodified 1651.9257 0.92571943 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 3 2 2 3 2 2 2 2 3 2 2 3 3 142.66 142.66 2;3 1.8855E-207 148918 QUIQUE_C1218_190116_001 276.2 258.73 116360000000 8510700000 8773000000 9552600000 7500100000 9268300000 7344800000 7444100000 10111000000 10130000000 4686900000 12085000000 10709000000 10248000000 44282 1978 41331 395490;395491;395492;395493;395494;395495;395496;395497;395498;395499;395500;395501;395502;395503;395504;395505;395506;395507;395508;395509;395510;395511;395512;395513;395514;395515;395516;395517;395518;395519;395520 503456;503457;503458;503459;503460;503461;503462;503463;503464;503465;503466;503467;503468;503469;503470;503471;503472;503473;503474;503475;503476;503477;503478;503479;503480;503481;503482;503483;503484;503485;503486;503487;503488;503489;503490;503491;503492;503493;503494;503495;503496;503497;503498;503499;503500;503501;503502;503503;503504;503505;503506;503507;503508;503509;503510;503511;503512;503513;503514;503515;503516;503517;503518;503519;503520;503521;503522;503523;503524;503525;503526;503527 503458 71 TPSFGISAPQVSIPDVNVNLK Unmodified 2182.1634 0.16338352 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 2 1 138.72 138.72 2;3 6.9155E-07 141560 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.36 112.73 148410000 0 0 0 18973000 0 20413000 0 88121000 0 0 0 20907000 0 44283 2935 41332 395521;395522;395523;395524;395525 503528;503529;503530;503531;503532;503533 503530 6 TPSFMYPQGTASSQMVLR Oxidation (M) 2015.9445 0.94448232 1691;1214 H7BY57;D6RBU5;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.339 95.339 2 2.4892E-45 97517 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.05 144.11 475140000 37867000 61805000 48285000 47674000 0 35833000 35286000 48616000 0 0 96046000 0 63733000 44284 1214;1691 41333 395526;395527;395528;395529;395530;395531;395532;395533;395534;395535 503534;503535;503536;503537;503538;503539;503540;503541;503542;503543 503540 702 10 TPSFMYPQGTASSQMVLR Unmodified 1999.9496 0.94956769 1691;1214 H7BY57;D6RBU5;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.73 105.73 2;3 4.7976E-76 109770 QUIQUE_C1576_190116_001 202.32 152.97 1399400000 131260000 168700000 185770000 127250000 95038000 73568000 133540000 71956000 83023000 18509000 115050000 102640000 93106000 44285 1214;1691 41333 395536;395537;395538;395539;395540;395541;395542;395543;395544;395545;395546;395547;395548;395549;395550 503544;503545;503546;503547;503548;503549;503550;503551;503552;503553;503554;503555;503556;503557;503558;503559 503553 16 TPSGLYLGTCER Unmodified 1352.6395 0.63945017 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.257 57.257 2 0.00031259 55065 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115.42 100.27 571790000 0 118580000 0 37593000 87985000 82233000 52426000 63885000 0 26964000 0 62018000 40099000 44286 2834 41334 395551;395552;395553;395554;395555;395556;395557;395558;395559;395560 503560;503561;503562;503563;503564;503565;503566;503567;503568;503569;503570;503571 503571 11 TPSISPVR Unmodified 855.48142 0.48141661 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;D6R9A8;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 26.775 26.775 2 0.031022 20611 QUIQUE_C1368_190116_001 66.429 20.477 207640000 0 0 75024000 0 0 0 0 0 0 0 77407000 55210000 0 44287 855;928 41335 395561;395562;395563;395564;395565;395566 503572;503573;503574;503575;503576;503577 503574 6 TPSLDAEGSNCPATK Unmodified 1546.6933 0.69333623 1408 O00468;A0A087X208 AGRN Agrin;Agrin N-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 110 kDa subunit;Agrin C-terminal 90 kDa fragment;Agrin C-terminal 22 kDa fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 31.336 31.336 2 1.0874E-08 26656 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.95 111.33 214390000 37789000 40539000 0 0 0 0 0 30964000 25691000 0 42200000 37210000 0 44288 1408 41336 395567;395568;395569;395570;395571;395572 503578;503579;503580;503581;503582;503583;503584 503580 7 TPSLPTPPTR Unmodified 1065.5819 0.58185893 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 49.552 49.552 2 0.00014691 46431 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.13 86.255 3162700000 340650000 352090000 331870000 322020000 315860000 286710000 355290000 142970000 216090000 0 0 208900000 290200000 44289 291;1247 41337 395573;395574;395575;395576;395577;395578;395579;395580;395581;395582;395583;395584;395585 503585;503586;503587;503588;503589;503590;503591;503592;503593;503594;503595;503596;503597;503598;503599;503600;503601;503602;503603;503604;503605;503606;503607;503608;503609;503610;503611 503603 27 TPSLPTPPTREPK Unmodified 1419.7722 0.7721789 291;1247 A0A0G2JQJ7;A0A0G2JS76;A0A0G2JPD5;A0A0G2JMX7;P10636;I3L170 MAPT Microtubule-associated protein tau;Microtubule-associated protein no no 0 0 1 1 1 1 1 39.314 39.314 2;3 0.021611 36113 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.887 58.736 12663000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12663000 0 0 44290 291;1247 41338 395586;395587;395588;395589 503612;503613;503614;503615 503614 4 TPSNELYKPLR Unmodified 1316.7089 0.70885036 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 2 1 1 2 1 2 33.309 33.309 2;3 1.4048E-11 28498 QUIQUE_C1277_190116_001 190.02 138.16 2642500000 34641000 240260000 203600000 243700000 307550000 147080000 291460000 206000000 172700000 73917000 357960000 58126000 305520000 44291 3700 41339 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sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 16.576 16.576 2 8.3422E-06 9389 QUIQUE_C1218_190116_001 145.46 97.501 221720000 36650000 42038000 15122000 57008000 25766000 32215000 12919000 0 0 0 0 0 0 44293 3234 41341 395619;395620;395621;395622;395623;395624;395625 503656;503657;503658;503659;503660;503661;503662 503656 5 TPSQLSDNNCRQ Unmodified 1418.6208 0.62083999 3234 Q4G0F5 VPS26B Vacuolar protein sorting-associated protein 26B yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 16.621 16.621 2 0.00012283 9099 QUIQUE_DMIX5_190116_001 108.47 91.838 56014000 0 0 0 14090000 13738000 0 0 0 0 0 0 12564000 15622000 44294 3234 41342 395626;395627;395628;395629;395630;395631 503663;503664;503665;503666;503667;503668 503666 6 TPSSDGTVEVR Unmodified 1146.5517 0.55168102 3879 Q96ID5 IGSF21 Immunoglobulin superfamily member 21 yes yes 0 0 0 1 1 1 19.976 19.976 2 0.001547 13118 QUIQUE_C1576_190116_001 83.869 51.934 200500000 0 0 0 0 64398000 0 69968000 0 0 0 0 0 66134000 44295 3879 41343 395632;395633;395634 503669;503670;503671 503670 2 TPSTEAAHIMLR Unmodified 1325.6762 0.67617003 1074 G3V1L9;Q07157 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 46.349 46.349 3 0.0036418 43184 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.069 30.128 18180000 0 0 0 0 0 0 0 18180000 0 0 0 0 0 44296 1074 41344 395635 503672 503672 1 TPTAVVAPVEK Unmodified 1110.6285 0.62847478 2322 P30622;J3KP58;F5H6A0;F5H1T5;F5H367;F5H270 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 32.858 32.858 2 0.00049653 27976 QUIQUE_C1403_190116_001 109.15 72.699 250330000 24546000 26362000 0 49240000 27908000 28053000 21160000 0 0 0 25706000 0 47355000 44297 2322 41345 395636;395637;395638;395639;395640;395641;395642;395643 503673;503674;503675;503676;503677;503678;503679;503680 503675 8 TPTEALASFDYIVR Unmodified 1581.8039 0.80387296 4184 Q9H7Z7;A6NHH0;X6RJ95 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 1 1 1 2 2 3 2 1 125.31 125.31 2;3 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503749;503750;503751;503752;503753;503754 503751 6 TPTQPLLESGFR Unmodified 1344.7038 0.70376498 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7;H0Y4U1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 75.076 75.076 2 0.055151 76624 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.791 32.972 141100000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 141100000 0 0 44305 422 41353 395712 503755 503755 1 TPTQPPPEPGDLPTIEEALQIIHSAEPR Unmodified 3032.5455 0.54548001 4375 Q9P1Y5 CAMSAP3 Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3 yes yes 0 0 0 1 161.23 161.23 3 1.0562E-05 163629 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.539 35.006 18917000 0 0 0 0 0 0 0 18917000 0 0 0 0 0 44306 4375 41354 395713 503756 503756 1 TPTTILLTPER Unmodified 1240.7027 0.70270235 1521;335 A0A1B0GTF3;K7ENF6;O43301 HSPA12A Heat shock 70 kDa protein 12A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.268 70.268 2 2.8827E-18 71771 QUIQUE_C1218_190116_001 169.41 139.6 4412200000 432700000 431300000 353560000 369420000 384110000 341720000 458860000 192250000 228330000 188980000 385220000 316610000 329120000 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TPVSEDMLGR Unmodified 1103.5281 0.52810881 2175;731 P21281;H0YC04;C9JL73;P15313;C9JNS9 ATP6V1B2;ATP6V1B1 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform;V-type proton ATPase subunit B, kidney isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.564 50.564 2 1.3157E-17 48935 QUIQUE_C1438_190116_001 178.94 146.59 9126700000 0 1135400000 956740000 816610000 702010000 689220000 904200000 633810000 628930000 202590000 895160000 801240000 760760000 44328 2175;731 41373 395914;395915;395916;395917;395918;395919;395920;395921;395922;395923;395924;395925;395926 503989;503990;503991;503992;503993;503994;503995;503996;503997;503998;503999;504000;504001;504002 503994 14 TPVSITEHPK Unmodified 1107.5924 0.59242362 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 17.35 17.35 2;3 0.0088029 9829 QUIQUE_DMIX7_190116_001 121.64 95.533 1294900000 0 0 217830000 41378000 36331000 52704000 134090000 0 340070000 111610000 273740000 87178000 0 44329 3053 41374 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504194;504195;504196;504197;504198;504199;504200;504201 504199 8 TQAETIVSALTALSNVSLDTIYK Unmodified 2437.2952 0.29518555 4105 Q9GZT6;E9PPJ7;H0YF06;J3KN19;E9PKQ5 CCDC90B Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 171.24 171.24 2;3 3.3385E-127 175927 QUIQUE_C1368_190116_001 212.69 188.26 1169500000 54515000 134580000 76736000 40421000 75909000 19092000 299760000 31832000 24906000 16080000 121550000 197230000 76882000 44342 4105 41386 396078;396079;396080;396081;396082;396083;396084;396085;396086;396087;396088;396089;396090;396091;396092;396093;396094;396095;396096 504202;504203;504204;504205;504206;504207;504208;504209;504210;504211;504212;504213;504214;504215;504216;504217;504218;504219;504220;504221 504207 20 TQAIVCQQLDLTHLK Unmodified 1766.9349 0.93490391 2718 P61221;D6R9I9;D6RGF4 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 82.506 82.506 3 0.00016487 84171 QUIQUE_C1277_190116_001 76.151 64.459 215140000 0 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396143;396144;396145;396146;396147;396148;396149;396150;396151;396152;396153;396154;396155;396156;396157;396158;396159;396160;396161;396162;396163;396164;396165;396166;396167;396168;396169;396170;396171;396172;396173;396174;396175;396176;396177;396178;396179;396180;396181;396182;396183;396184;396185;396186;396187;396188;396189;396190;396191;396192;396193;396194;396195;396196;396197;396198;396199;396200;396201;396202 504270;504271;504272;504273;504274;504275;504276;504277;504278;504279;504280;504281;504282;504283;504284;504285;504286;504287;504288;504289;504290;504291;504292;504293;504294;504295;504296;504297;504298;504299;504300;504301;504302;504303;504304;504305;504306;504307;504308;504309;504310;504311;504312;504313;504314;504315;504316;504317;504318;504319;504320;504321;504322;504323;504324;504325;504326;504327;504328;504329;504330;504331;504332;504333;504334;504335;504336;504337;504338;504339;504340;504341;504342;504343;504344;504345;504346;504347;504348;504349;504350;504351;504352;504353;504354;504355;504356;504357;504358;504359;504360;504361;504362;504363;504364;504365;504366;504367;504368;504369;504370;504371;504372;504373;504374;504375;504376;504377;504378;504379;504380;504381;504382;504383;504384;504385;504386;504387;504388;504389;504390;504391;504392;504393;504394;504395;504396;504397;504398;504399;504400;504401;504402;504403;504404;504405;504406;504407;504408;504409;504410;504411;504412;504413;504414 504278 145 TQDHDENVALEACEFWLTLAEQPICK Unmodified 3116.4219 0.42193576 1446 O14787;A0A075B780 TNPO2 Transportin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 166.91 166.91 3 2.2698E-20 172328 QUIQUE_C1576_190116_001 109.97 97.331 524770000 0 106430000 77027000 51970000 69971000 65074000 154300000 0 0 0 0 0 0 44350 1446 41394 396203;396204;396205;396206;396207;396208 504415;504416;504417;504418;504419;504420 504420 6 TQDPAKAPNTPDILEIEFKK Unmodified 2254.1845 0.18451289 1797 P00966 ASS1 Argininosuccinate synthase yes yes 0 0 2 1 85.678 85.678 4 0.008421 86361 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.615 35.192 48977000 0 0 0 0 0 0 0 48977000 0 0 0 0 0 44351 1797 41395 396209 504421 504421 1 TQDQDENVALEACEFWLTLAEQPICK Unmodified 3107.4216 0.42160141 3772 Q92973 TNPO1 Transportin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.01 172.01 3 7.7413E-39 176208 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.07 129.06 361670000 13154000 25805000 14580000 9456700 32705000 0 72683000 24141000 51983000 0 0 81241000 35923000 44352 3772 41396 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396238;396239;396240;396241;396242;396243;396244;396245;396246;396247;396248;396249 504454;504455;504456;504457;504458;504459;504460;504461;504462;504463;504464;504465;504466;504467;504468;504469;504470 504466 15 TQEPFREELAYDR Unmodified 1652.7794 0.77944912 3104 Q15049;A6PVC3 MLC1 Membrane protein MLC1 yes no 0 0 1 2 1 61.07 61.07 2;3 0.0020826 60109 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.321 41.323 125310000 0 0 0 0 0 0 0 81455000 43851000 0 0 0 0 44358 3104 41401 396250;396251;396252 504471;504472;504473 504472 3 TQEQCVHNETKNELEK Unmodified 1985.9113 0.91126793 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 1 2 15.222 15.222 3;4 1.0407E-06 8076 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.82 96.905 546610000 18215000 0 81018000 0 41258000 0 104810000 87612000 0 0 61066000 56686000 95948000 44359 831;1569 41402 396253;396254;396255;396256;396257;396258;396259;396260;396261;396262;396263;396264 504474;504475;504476;504477;504478;504479;504480;504481;504482;504483;504484;504485;504486 504481 13 TQEQLALEMAELTAR Unmodified 1702.856 0.85598488 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 2 4 2 2 2 2 2 2 124.09 124.09 2;3 2.3567E-28 126897 QUIQUE_C1563_190116_001 208.08 190.34 4135800000 240410000 234000000 316840000 336320000 236690000 301140000 277710000 413250000 420710000 295490000 340800000 341880000 380520000 44360 2248 41403 396265;396266;396267;396268;396269;396270;396271;396272;396273;396274;396275;396276;396277;396278;396279;396280;396281;396282;396283;396284;396285;396286;396287;396288;396289;396290;396291;396292;396293 504487;504488;504489;504490;504491;504492;504493;504494;504495;504496;504497;504498;504499;504500;504501;504502;504503;504504;504505;504506;504507;504508;504509;504510;504511;504512;504513;504514;504515;504516;504517;504518;504519;504520;504521;504522;504523;504524;504525 504505 36 TQEQLALEMAELTAR Oxidation (M) 1718.8509 0.85089951 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 1 0 1 1 86.255 86.255 2 0.0017882 87734 QUIQUE_C1403_190116_001 69.345 53.091 31058000 0 0 0 31058000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44361 2248 41403 396294;396295 504526;504527 504526 1608 2 TQETLSQAGQK Unmodified 1189.5939 0.59388018 80 A0A087WYR3;O43399 TPD52L2 Tumor protein D54 yes no 0 0 0 1 14.442 14.442 2 0.0010481 6504 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.919 52.501 14820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14820000 0 0 0 44362 80 41404 396296 504528 504528 1 TQETPSAQMEGFLNR Unmodified 1707.7886 0.7886336 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 92.366 92.366 2;3 2.3277E-129 94410 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396322;396323;396324;396325;396326;396327;396328;396329;396330;396331;396332;396333;396334;396335;396336;396337;396338;396339;396340;396341 504568;504569;504570;504571;504572;504573;504574;504575;504576;504577;504578;504579;504580;504581;504582;504583;504584;504585;504586;504587;504588;504589 504582 2318 22 TQFLPPNLLALFAPR Acetyl (Protein N-term) 1738.977 0.97702672 1950 P08621 SNRNP70 U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 180.37 180.37 2;3 2.6874E-09 183277 QUIQUE_DMIX7_190116_001 127.42 111.88 285940000 0 28973000 0 11704000 32830000 0 36153000 35596000 42947000 0 3779600 48502000 45455000 44365 1950 41406 396342;396343;396344;396345;396346;396347;396348;396349;396350 504590;504591;504592;504593;504594;504595;504596;504597;504598 504597 6 TQFLSPTQNESLLEENAEK Unmodified 2177.0488 0.048807271 2990 Q13367;A0A2R8Y2A8 AP3B2 AP-3 complex subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.968 97.968 2 2.1081E-63 101824 QUIQUE_C1218_190116_001 179.56 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Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 2 1 77.234 77.234 2;3 3.2079E-35 78855 QUIQUE_DMIX5_190116_001 147.83 134.15 2511600000 40696000 40105000 217980000 341110000 0 248760000 234930000 371610000 322210000 0 299360000 346900000 47928000 44373 3889 41414 396409;396410;396411;396412;396413;396414;396415;396416;396417;396418;396419;396420;396421;396422;396423;396424;396425;396426 504664;504665;504666;504667;504668;504669;504670;504671;504672;504673;504674;504675;504676;504677;504678;504679;504680;504681;504682;504683 504679 19 TQGVSTTDLVGR Unmodified 1232.6361 0.63607935 3953 Q99447;I3L1R7;I3L1L9;I3L2Q1;I3L1C4 PCYT2 Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 44.966 44.966 2 4.9206E-05 42147 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.39 110.19 670480000 114560000 0 0 65321000 0 0 90725000 235950000 0 56913000 107010000 0 0 44374 3953 41415 396427;396428;396429;396430;396431;396432 504684;504685;504686;504687;504688;504689;504690 504688 6 TQHGVLSQQFVELINK Unmodified 1839.9843 0.98429694 2947 Q12846 STX4 Syntaxin-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 95.744 95.744 2;3 0.00014127 98535 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.25 46.329 355380000 44603000 0 0 49768000 0 57642000 0 0 59724000 0 101020000 0 42622000 44375 2947 41416 396433;396434;396435;396436;396437;396438;396439 504691;504692;504693;504694;504695;504696;504697 504694 7 TQHHVEALVEHQNGK Unmodified 1725.8547 0.85467975 4125 Q9H0U6 MRPL18 39S ribosomal protein L18, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 12.175 12.175 4 3.2603E-06 4753 QUIQUE_DMIX7_190116_001 82.109 68.244 20874000 0 0 0 0 4528500 0 0 0 0 0 0 16346000 0 44376 4125 41417 396440;396441 504698;504699 504699 2 TQHLSNDHICYFLYQILR Unmodified 2320.1423 0.14227092 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 3 2 3 3 2 4 3 3 3 3 4 2 3 129.37 129.37 2;3;4 5.8827E-76 132657 QUIQUE_DMIX1_190116_001 201.65 182.25 12741000000 356740000 1023000000 1240900000 957980000 491320000 625250000 1329100000 1401000000 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504805;504806;504807;504808;504809;504810;504811;504812;504813;504814;504815;504816;504817;504818;504819;504820;504821;504822;504823;504824;504825;504826;504827;504828;504829;504830;504831;504832;504833;504834;504835;504836;504837;504838;504839;504840;504841;504842;504843;504844;504845;504846;504847;504848;504849;504850;504851;504852;504853;504854;504855;504856;504857;504858;504859;504860;504861;504862;504863;504864;504865 504817 61 TQILAASYELHK Unmodified 1372.7351 0.73506511 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 2 3 2 4 2 4 2 4 2 4 4 4 53.446 53.446 2;3 1.1738E-09 52019 QUIQUE_DMIX3_190116_001 172.88 124.09 16508000000 806900000 1854900000 908600000 1127500000 862490000 956930000 1611100000 1613500000 1674600000 1061100000 1460700000 1546500000 1023100000 44381 2851 41422 396544;396545;396546;396547;396548;396549;396550;396551;396552;396553;396554;396555;396556;396557;396558;396559;396560;396561;396562;396563;396564;396565;396566;396567;396568;396569;396570;396571;396572;396573;396574;396575;396576;396577;396578;396579;396580;396581 504866;504867;504868;504869;504870;504871;504872;504873;504874;504875;504876;504877;504878;504879;504880;504881;504882;504883;504884;504885;504886;504887;504888;504889;504890;504891;504892;504893;504894;504895;504896;504897;504898;504899;504900;504901;504902;504903;504904;504905;504906;504907;504908;504909;504910;504911;504912;504913;504914;504915;504916;504917;504918;504919;504920;504921;504922;504923;504924;504925;504926;504927;504928;504929;504930;504931;504932;504933;504934;504935;504936;504937;504938;504939;504940;504941;504942;504943;504944;504945;504946;504947;504948;504949 504920 82 TQIPILTYQGGSVEAAQAFLCK Unmodified 2394.2253 0.22533185 3457;1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;H0YB62;Q7Z3D6 C14orf159 UPF0317 protein C14orf159, mitochondrial no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 2 1 1 2 1 145.81 145.81 2;3 3.7614E-11 151037 QUIQUE_C1368_190116_001 137.19 118.13 1359100000 175060000 112340000 178450000 0 192080000 132150000 47578000 73168000 135160000 36212000 50271000 180280000 46301000 44382 1140;3457 41423 396582;396583;396584;396585;396586;396587;396588;396589;396590;396591;396592;396593;396594;396595;396596;396597;396598;396599;396600 504950;504951;504952;504953;504954;504955;504956;504957;504958;504959;504960;504961;504962;504963;504964;504965;504966;504967;504968;504969;504970;504971;504972 504956 21 TQIQSQESDLK Unmodified 1275.6307 0.63065962 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.81 22.81 2 1.2422E-06 15687 QUIQUE_DMIX8_190116_001 148.91 118.84 1193500000 128270000 108520000 108260000 102350000 116660000 100880000 96509000 33325000 69816000 53575000 97522000 87414000 90381000 44383 4394 41424 396601;396602;396603;396604;396605;396606;396607;396608;396609;396610;396611;396612;396613 504973;504974;504975;504976;504977;504978;504979;504980;504981;504982;504983;504984;504985;504986 504986 12 TQIQSQESDLKSQEDDLNR Unmodified 2233.0458 0.045847158 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 52.085 52.085 3 0.064422 50881 QUIQUE_DMIX5_190116_001 43.12 28.506 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44384 4394 41425 396614 504987 504987 1 TQIQSVEPYTK Unmodified 1292.6612 0.66123147 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.25 40.25 2 0.00046277 36664 QUIQUE_C1403_190116_001 105.98 59.513 546070000 36959000 35845000 59868000 43089000 75445000 0 0 0 65624000 0 81993000 56817000 90426000 44385 2427 41426 396615;396616;396617;396618;396619;396620;396621;396622;396623;396624 504988;504989;504990;504991;504992;504993;504994;504995;504996;504997;504998 504991 11 TQKPGESGINIVTADFVELGDFISTVIK Unmodified 2977.5648 0.56481847 3345 Q63HM9 PLCXD3 PI-PLC X domain-containing protein 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 175.28 175.28 3 3.8007E-31 178718 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.55 110.51 811260000 0 0 0 0 19131000 0 0 25159000 133700000 0 436110000 197160000 0 44386 3345 41427 396625;396626;396627;396628;396629;396630 504999;505000;505001;505002;505003;505004 505003 5 TQLASWSDPTEETGPVAGILDTETLEK Unmodified 2887.3975 0.39747837 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 2 2 1 3 2 1 3 2 2 2 2 2 2 146.96 146.96 2;3 2.3092E-92 150150 QUIQUE_DMIX1_190116_001 229.6 217.83 3501900000 137740000 133690000 178400000 154000000 184910000 174820000 276920000 660490000 524980000 123690000 353470000 331240000 267510000 44387 3117 41428 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505049;505050;505051;505052;505053;505054;505055;505056 505050 5 TQLEELEDELQATEDAK Unmodified 1960.9113 0.91131074 2378;2379;2385 P35579;P35749;P35580 MYH9;MYH11;MYH10 Myosin-9;Myosin-11;Myosin-10 no no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 1 1 2 133.49 133.49 2;3 2.9095E-104 139078 QUIQUE_C1576_190116_001 220.32 197.6 3543500000 352880000 395610000 313710000 483080000 283150000 288320000 211280000 231640000 211800000 137610000 226890000 221200000 186320000 44389 2378;2385;2379 41430 396665;396666;396667;396668;396669;396670;396671;396672;396673;396674;396675;396676;396677;396678;396679;396680;396681;396682;396683;396684;396685 505057;505058;505059;505060;505061;505062;505063;505064;505065;505066;505067;505068;505069;505070;505071;505072;505073;505074;505075;505076;505077;505078;505079;505080;505081;505082 505070 25 TQLGAIYIDASCLTWEGQQFQGK Unmodified 2613.2533 0.25333751 2734 P61970;H3BRV9 NUTF2 Nuclear transport factor 2 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 1 3 148.17 148.17 2;3 1.7014E-67 151208 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yes 0 0 0 1 66.454 66.454 2 0.050353 66719 QUIQUE_C1218_190116_001 55.531 38.983 16078000 16078000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44396 3098 41437 396713 505112 505112 1 TQLVNVAIFGPPWMAFK Unmodified 1918.0175 0.017511325 2461 P43121 MCAM Cell surface glycoprotein MUC18 yes yes 0 0 0 1 163.26 163.26 2 0.0094318 170789 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.515 68.229 17086000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17086000 0 0 44397 2461 41438 396714 505113 505113 0 TQLVSNLK Unmodified 901.52328 0.52328142 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 27.699 27.699 2 0.0086993 21357 QUIQUE_C1277_190116_001 93.561 37.47 1491700000 0 657260000 0 414590000 0 0 0 0 0 419810000 0 0 0 44398 1788 41439 396715;396716;396717 505114;505115;505116 505114 1 TQLVSNLKK Unmodified 1029.6182 0.61824444 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 16.173 16.173 2 0.00011004 8402 QUIQUE_DMIX7_190116_001 164.71 100.14 499250000 0 0 0 0 0 0 0 0 157350000 61348000 0 280550000 0 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396725;396726;396727;396728;396729;396730;396731;396732;396733;396734;396735;396736 505124;505125;505126;505127;505128;505129;505130;505131;505132;505133;505134;505135 505133 11 TQNDVDIADVAYYFEK Unmodified 1889.8683 0.86832371 634 B5MCA4;P16422 EPCAM Epithelial cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 143.33 143.33 2 0.00016883 139190 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.412 73.47 16800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16800000 0 0 0 44403 634 41444 396737 505136 505136 1 TQNDVLHAENVK Unmodified 1366.6841 0.68409218 434 A0A2R8Y5S7;P35241;A0A2R8Y4H6 RDX Radixin yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 1 1 2 22.212 22.212 2;3 4.9277E-07 15276 QUIQUE_DMIX5_190116_001 144.28 107.44 1701000000 191920000 141940000 114290000 196340000 45797000 168790000 177100000 53589000 179310000 114600000 44563000 59952000 212820000 44404 434 41445 396738;396739;396740;396741;396742;396743;396744;396745;396746;396747;396748;396749;396750;396751;396752;396753;396754;396755;396756;396757;396758;396759 505137;505138;505139;505140;505141;505142;505143;505144;505145;505146;505147;505148;505149;505150;505151;505152;505153;505154;505155;505156;505157;505158;505159 505156 22 TQNKEESYDFSK Unmodified 1474.6576 0.65760265 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.232 20.232 2 0.00034716 12874 QUIQUE_C1277_190116_001 138.51 120.07 465350000 0 41226000 0 57580000 66218000 40520000 44961000 25097000 76303000 0 68845000 44604000 0 44405 345 41446 396760;396761;396762;396763;396764;396765;396766;396767;396768;396769 505160;505161;505162;505163;505164;505165;505166;505167;505168;505169 505161 10 TQNLAALLHAIAR Unmodified 1390.8045 0.80448208 3377 Q6P179;H0Y9X9 ERAP2 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 2 yes no 0 0 0 1 1 110.45 110.45 3 0.0073511 113521 QUIQUE_C1403_190116_001 42.785 37.469 13834000 0 0 0 13834000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44406 3377 41447 396770;396771 505170;505171 505171 2 TQNPMVTGTSVLGVK Unmodified 1530.8076 0.80757813 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.824 81.824 2 1.5862E-12 84032 QUIQUE_C1218_190116_001 131.17 104.5 902190000 93691000 98728000 97194000 69593000 0 77184000 81830000 76595000 74719000 22764000 119370000 90523000 0 44407 2274 41448 396772;396773;396774;396775;396776;396777;396778;396779;396780;396781;396782 505172;505173;505174;505175;505176;505177;505178;505179;505180;505181;505182;505183;505184;505185;505186;505187;505188;505189;505190 505172 19 TQNPMVTGTSVLGVK Oxidation (M) 1546.8025 0.80249275 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 59.926 59.926 2 0.001055 56445 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.273 58.511 325840000 0 0 0 0 0 0 0 0 87350000 67820000 84367000 0 86301000 44408 2274 41448 396783;396784;396785;396786;396787 505191;505192;505193;505194;505195 505193 1643 4 TQNQVFKTELAR Unmodified 1433.7627 0.76267685 4376 Q9P1Z2 CALCOCO1 Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 28.223 28.223 4 0.058936 21459 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.185 0.6353 61502000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61502000 0 0 0 44409 4376 41449 396788 505196 505196 1 TQPGLFAEMFR Unmodified 1295.6332 0.63324258 550 A6NMN0;P46020;A6NIT2 PHKA1 Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform yes no 0 0 0 1 123.6 123.6 2 0.047701 126304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.927 42.146 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44410 550 41450 396789 505197 505197 1 TQPILDILLK Unmodified 1152.7118 0.71181048 4579 Q9Y376;A0A087X0K1 CAB39 Calcium-binding protein 39 yes no 0 0 0 1 1 1 131.6 131.6 2 0.045903 135151 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.828 5.7167 193880000 0 0 0 0 0 0 0 58745000 57724000 0 77415000 0 0 44411 4579 41451 396790;396791;396792 505198;505199;505200 505198 2 TQPIVEILLK Unmodified 1152.7118 0.71181048 4199 Q9H9S4;Q5TAW7;B7ZBJ4 CAB39L Calcium-binding protein 39-like yes no 0 0 0 1 131.6 131.6 2 0.046526 138108 QUIQUE_C1438_190116_001 59.35 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396794;396795;396796;396797;396798;396799;396800;396801;396802;396803;396804 505202;505203;505204;505205;505206;505207;505208;505209;505210;505211;505212;505213;505214;505215;505216;505217 505217 16 TQPMTAQAASYR Unmodified 1323.6241 0.62413446 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 31.634 31.634 2 0.00089137 25942 QUIQUE_C1368_190116_001 85.958 64.213 169360000 57793000 0 35998000 75572000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44414 3919 41454 396805;396806;396807;396808;396809 505218;505219;505220;505221;505222 505219 5 TQPNLDNCPFHDQPHLK Unmodified 2059.9534 0.95340752 1804 P01034 CST3 Cystatin-C yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 1 48.627 48.627 3;4 0.0018163 46741 QUIQUE_C1403_190116_001 40.962 31.432 508170000 0 80666000 78113000 39371000 98850000 0 61669000 0 0 0 33907000 73507000 42083000 44415 1804 41455 396810;396811;396812;396813;396814;396815;396816;396817;396818;396819;396820 505223;505224;505225;505226;505227;505228;505229;505230;505231;505232;505233;505234;505235;505236 505227 14 TQPPPKLPVGPSHK Unmodified 1481.8354 0.83544786 1711 O95182 NDUFA7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 7 yes yes 0 0 1 1 19.979 19.979 3 0.069689 12972 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.302 30.108 26795000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26795000 0 0 44416 1711 41456 396821 505237 505237 1 TQPVHSPPPREPSAPK Unmodified 1723.9006 0.90056731 112 A0A087X1V2 NCAM1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 14.477 14.477 3;4 0.0027074 6889 QUIQUE_DMIX5_190116_001 52.522 42.038 589510000 0 0 51591000 31903000 51230000 35409000 0 0 129270000 0 158030000 0 132080000 44417 112 41457 396822;396823;396824;396825;396826;396827;396828;396829 505238;505239;505240;505241;505242;505243;505244;505245;505246 505244 8 TQPVQGEPSAPK Unmodified 1237.6303 0.63026569 2057 P13591;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 19.902 19.902 2 0.00065813 12519 QUIQUE_C1368_190116_001 95.618 62.726 380050000 57699000 100300000 0 0 104600000 0 89949000 0 0 27507000 0 0 0 44418 2057 41458 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A0A3B3IT47;Q9Y2I8;C9JGR9;E7EQ49;A0A087WTQ2 WDR37 WD repeat-containing protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 123.52 123.52 3 0.0037924 127983 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.69 33.3 192860000 0 0 0 0 0 0 0 0 65564000 34780000 92513000 0 0 44420 498 41460 396867;396868;396869 505293;505294;505295 505293 1 TQPYDVYDQVEFDVPVGSR Unmodified 2213.0277 0.027677899 1620 O75306 NDUFS2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 1 2 128.33 128.33 2;3 1.2334E-45 134897 QUIQUE_DMIX5_190116_001 164.53 153.32 1832600000 177310000 169440000 126070000 148720000 106090000 80937000 123350000 152700000 208990000 67244000 143220000 183070000 145450000 44421 1620 41461 396870;396871;396872;396873;396874;396875;396876;396877;396878;396879;396880;396881;396882;396883;396884;396885;396886;396887;396888;396889;396890 505296;505297;505298;505299;505300;505301;505302;505303;505304;505305;505306;505307;505308;505309;505310;505311;505312;505313;505314;505315;505316;505317;505318;505319;505320;505321;505322;505323;505324;505325;505326;505327;505328;505329;505330;505331;505332 505326 35 TQQAAQANITLQEQIEAIHK Unmodified 2234.1655 0.16550878 3141 Q15459;H7C1L2 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 82.543 82.543 3 0.00062791 83782 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.208 40.28 174200000 0 0 0 57352000 38145000 0 0 44564000 34142000 0 0 0 0 44422 3141 41462 396891;396892;396893;396894 505333;505334;505335;505336;505337 505336 5 TQQFFDEMADPDLLEESSSLLEPSEMGR Unmodified 3200.4166 0.41657561 3780 Q93050;K7EPG4;K7EN36 ATP6V0A1 V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 1;V-type proton ATPase subunit a yes no 0 0 0 1 1 1 166.85 166.85 3 2.2734E-05 168605 QUIQUE_C1563_190116_001 47.099 41.379 84413000 0 0 0 0 28685000 23020000 0 0 0 0 0 0 32708000 44423 3780 41463 396895;396896;396897 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Unmodified 2464.1731 0.17311336 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.252 60.252 3 2.2379E-51 59323 QUIQUE_C1277_190116_001 152.35 138.11 1170700000 68899000 101940000 94637000 104630000 99976000 110240000 0 98271000 0 235340000 95025000 63313000 98426000 44436 3919 41476 396981;396982;396983;396984;396985;396986;396987;396988;396989;396990;396991 505437;505438;505439;505440;505441;505442;505443;505444;505445;505446;505447 505438 11 TQSSLVPALTDFVR Unmodified 1532.8199 0.81985737 1601 O60888;C9IZG4 CUTA Protein CutA yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 130.48 130.48 2;3 1.2038E-14 136239 QUIQUE_C1218_190116_001 148.18 128.42 4377900000 470780000 340060000 365010000 283870000 312890000 274660000 302100000 367360000 396620000 147370000 441630000 308090000 367440000 44437 1601 41477 396992;396993;396994;396995;396996;396997;396998;396999;397000;397001;397002;397003;397004;397005;397006;397007 505448;505449;505450;505451;505452;505453;505454;505455;505456;505457;505458;505459;505460;505461;505462;505463;505464;505465;505466;505467;505468;505469;505470;505471;505472;505473;505474;505475;505476;505477;505478;505479;505480;505481;505482;505483;505484 505449 37 TQSSSCEDLPSTTQPK Unmodified 1764.7836 0.7836078 472 A0A2U3TZM4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 29.805 29.805 2 1.198E-06 23867 QUIQUE_C1368_190116_001 111.31 96.634 171500000 33706000 0 25717000 22344000 29270000 23001000 37463000 0 0 0 0 0 0 44438 472 41478 397008;397009;397010;397011;397012;397013 505485;505486;505487;505488;505489;505490 505486 6 TQSTDDEYALDGK Unmodified 1441.6209 0.6208828 179 A0A0A0MSK6;Q13017 ARHGAP5 Rho GTPase-activating protein 5 yes no 0 0 0 1 1 36.593 36.593 2 0.020569 32383 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.164 43.572 23364000 0 23364000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44439 179 41479 397014;397015 505491;505492 505492 2 TQSTWVDSFFR Unmodified 1372.6412 0.64116473 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 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79.096 79.096 2;3 7.8653E-133 79433 QUIQUE_C1403_190116_001 279.86 266.15 9275600000 812310000 882700000 838600000 778480000 705070000 477470000 638320000 698340000 668210000 290220000 954820000 781290000 749810000 44442 2851 41481 397033;397034;397035;397036;397037;397038;397039;397040;397041;397042;397043;397044;397045;397046;397047;397048;397049;397050;397051;397052;397053 505515;505516;505517;505518;505519;505520;505521;505522;505523;505524;505525;505526;505527;505528;505529;505530;505531;505532;505533;505534;505535;505536;505537;505538;505539;505540;505541;505542;505543;505544;505545;505546;505547;505548 505524 33 TQTAVASEEGPATLPEAEALLAQHAALR Unmodified 2844.4618 0.46175038 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.83 126.83 3 1.5093E-65 131493 QUIQUE_C1368_190116_001 156.7 149.9 1508700000 153600000 173500000 128170000 121460000 158320000 112490000 125370000 110410000 0 0 183400000 118170000 123830000 44443 1472 41482 397054;397055;397056;397057;397058;397059;397060;397061;397062;397063;397064;397065 505549;505550;505551;505552;505553;505554;505555;505556;505557;505558;505559;505560;505561;505562;505563;505564;505565;505566;505567;505568;505569;505570;505571 505555 23 TQTGDSSSISSFSYR Unmodified 1621.722 0.72199382 3241 Q4V328;A0A075B793;A0A087WT45;A0A087WXA6 GRIPAP1 GRIP1-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.75 60.75 2 1.6035E-35 60605 QUIQUE_C1438_190116_001 172.11 136.57 502250000 56256000 53852000 45296000 40955000 56492000 29852000 45569000 39487000 42381000 0 51464000 0 40644000 44444 3241 41483 397066;397067;397068;397069;397070;397071;397072;397073;397074;397075;397076;397077 505572;505573;505574;505575;505576;505577;505578;505579;505580;505581;505582;505583;505584 505576 13 TQTPPLGQTPQLGLK Unmodified 1577.8777 0.8777066 798 D3DQV9;H0Y3P2;P78344;E9PKF8 EIF4G2 Eukaryotic translation initiation factor 4 gamma 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 78.959 78.959 2 0.0005428 79919 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99118 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.35 105.55 52885000 0 0 0 0 0 0 0 52885000 0 0 0 0 0 44447 3056 41486 397098 505613 505613 1 TQTSDPAMLPTMIGLLAEAGVR Unmodified 2271.1603 0.16028875 404 A0A286YF22;O43175;A0A286YFA2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 2 168.32 168.32 2;3 7.2425E-77 175507 QUIQUE_DMIX5_190116_001 226.67 201.35 26701000000 1365100000 2273000000 1553400000 1664800000 2276800000 2824700000 1535500000 1633700000 3102000000 433260000 2173500000 3363100000 2502000000 44448 404 41487 397099;397100;397101;397102;397103;397104;397105;397106;397107;397108;397109;397110;397111;397112;397113;397114;397115;397116;397117;397118;397119;397120;397121;397122;397123;397124;397125;397126 505614;505615;505616;505617;505618;505619;505620;505621;505622;505623;505624;505625;505626;505627;505628;505629;505630;505631;505632;505633;505634;505635;505636;505637;505638;505639;505640;505641;505642;505643 505636 24 TQTSDPAMLPTMIGLLAEAGVR Oxidation (M) 2287.1552 0.15520337 404 A0A286YF22;O43175;A0A286YFA2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 1 0 3 1 3 1 2 2 2 3 1 2 3 2 152.05 152.05 2;3 3.1426E-54 166387 QUIQUE_C1368_190116_001 162.29 140.09 1351200000 63133000 86399000 195490000 31472000 138350000 112800000 145330000 99658000 85050000 19109000 251840000 122540000 0 44449 404 41487 397127;397128;397129;397130;397131;397132;397133;397134;397135;397136;397137;397138;397139;397140;397141;397142;397143;397144;397145;397146;397147;397148;397149;397150;397151 505644;505645;505646;505647;505648;505649;505650;505651;505652;505653;505654;505655;505656;505657;505658;505659;505660;505661;505662;505663;505664;505665;505666;505667;505668 505650 289;290 19 TQTSDPAMLPTMIGLLAEAGVR 2 Oxidation (M) 2303.1501 0.150118 404 A0A286YF22;O43175;A0A286YFA2 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 2 0 1 1 1 134.88 134.88 2 9.4264E-20 139203 QUIQUE_C1277_190116_001 121.79 110.17 30727000 0 30727000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44450 404 41487 397152;397153;397154 505669;505670;505671 505669 289;290 3 TQTVCNFTDGALVQHQEWDGK Unmodified 2433.1019 0.10192225 2855 Q01469;I6L8B7;A8MUU1 FABP5;FABP5P3 Fatty acid-binding protein, epidermal;Putative fatty acid-binding protein 5-like protein 3 yes no 0 0 0 3 4 2 3 3 3 2 3 2 2 3 2 2 90.158 90.158 2;3 3.6307E-54 91705 QUIQUE_C1403_190116_001 166.29 163.28 19287000000 1800700000 1516200000 1799900000 1733200000 1183300000 1596900000 1494600000 1068500000 1857300000 639540000 1603800000 1219200000 1773900000 44451 2855 41488 397155;397156;397157;397158;397159;397160;397161;397162;397163;397164;397165;397166;397167;397168;397169;397170;397171;397172;397173;397174;397175;397176;397177;397178;397179;397180;397181;397182;397183;397184;397185;397186;397187;397188 505672;505673;505674;505675;505676;505677;505678;505679;505680;505681;505682;505683;505684;505685;505686;505687;505688;505689;505690;505691;505692;505693;505694;505695;505696;505697;505698;505699;505700;505701;505702;505703;505704;505705;505706;505707;505708;505709;505710;505711 505683 40 TQTVCNFTDGALVQHQEWDGKESTITR Unmodified 3120.4571 0.45707571 2855 Q01469;I6L8B7;A8MUU1 FABP5;FABP5P3 Fatty acid-binding protein, epidermal;Putative fatty acid-binding protein 5-like protein 3 yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 3 5 1 3 3 3 87.021 87.021 3;4 3.9776E-214 89552 QUIQUE_DMIX5_190116_001 239.13 227.82 5699500000 119280000 240870000 324560000 51105000 53023000 30640000 79735000 718670000 1739000000 64051000 833380000 837920000 607270000 44452 2855 41489 397189;397190;397191;397192;397193;397194;397195;397196;397197;397198;397199;397200;397201;397202;397203;397204;397205;397206;397207;397208;397209;397210;397211;397212;397213;397214;397215;397216 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505771 4 TQVLQPEEK Unmodified 1070.5608 0.56078914 4612 Q9Y4W6 AFG3L2 AFG3-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 20.482 20.482 2 0.0067828 13461 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.429 61.578 207030000 0 0 0 0 0 37105000 0 23591000 0 18079000 49181000 46254000 32823000 44458 4612 41495 397237;397238;397239;397240;397241;397242 505773;505774;505775;505776;505777;505778 505776 6 TQVNTQAEQLR Unmodified 1286.6579 0.65787742 1903 P06727 APOA4 Apolipoprotein A-IV yes yes 0 0 0 1 1 1 1 24.37 24.37 2 0.00049492 18259 QUIQUE_C1438_190116_001 135.43 55.263 159830000 0 0 0 0 81404000 0 41056000 0 0 0 0 37371000 0 44459 1903 41496 397243;397244;397245;397246 505779;505780;505781;505782 505780 4 TQVSYYAER Unmodified 1115.5247 0.52473799 3916 Q96PE3 INPP4A Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.377 29.377 2 0.0086759 24499 QUIQUE_C1218_190116_001 78.113 61.78 420750000 55620000 67426000 40674000 0 34493000 31080000 40679000 34872000 34540000 0 0 48309000 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2459 41499 397270 505811 505811 1 TQVVHESFQGR Unmodified 1286.6367 0.63674805 2173 P20916;M0QZU4;M0R3B9 MAG Myelin-associated glycoprotein yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 1 19.854 19.854 2;3 1.4098E-08 12450 QUIQUE_C1403_190116_001 156.57 134.61 2343400000 295020000 257770000 435510000 137640000 62528000 98150000 336480000 122470000 65859000 89014000 278480000 96903000 67572000 44463 2173 41500 397271;397272;397273;397274;397275;397276;397277;397278;397279;397280;397281;397282;397283;397284;397285;397286;397287;397288;397289;397290;397291;397292 505812;505813;505814;505815;505816;505817;505818;505819;505820;505821;505822;505823;505824;505825;505826;505827;505828;505829;505830;505831;505832;505833;505834;505835 505819 24 TQYEAMASSNMHEAEEWYR 2 Oxidation (M) 2363.9423 0.94231006 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;A0A1W2PRT3;K7EKH9;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 2 0 6 9 12 7 5 8 6 7 12 10 6 6 6 66.366 66.366 2;3 4.3137E-86 57703 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506470 807 TQYENPVLEAK Unmodified 1290.6456 0.6455814 1237 H7C4U7;H7C535;Q96QZ7;A0A087WXD2;H7C5T8;A0A087WT53;H7C4S7 MAGI1 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 27.54 27.54 2 0.016269 21483 QUIQUE_C1277_190116_001 63.534 37.912 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44467 1237 41502 398298 507391 507391 1 TQYLQSYGPEHLLTFSNLR Unmodified 2266.1382 0.1382314 4139 Q9H267;A0A2R8YDQ0;F5H008 VPS33B Vacuolar protein sorting-associated protein 33B yes no 0 0 0 1 1 1 1 120.25 120.25 3 0.0017881 124704 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.425 37.387 197370000 0 0 0 0 46257000 0 0 0 55600000 0 38032000 57479000 0 44468 4139 41503 398299;398300;398301;398302 507392;507393;507394;507395;507396;507397 507394 6 TQYSSAMLESLLPGIR Unmodified 1764.908 0.90802046 959 E9PLK3;P55786;H0YCQ5 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 3 143.32 143.32 2;3 2.8351E-30 147571 QUIQUE_C1277_190116_001 208.82 190.55 4660100000 372210000 405490000 423430000 357430000 390730000 349470000 373210000 382530000 344980000 112880000 429580000 353660000 364540000 44469 959 41504 398303;398304;398305;398306;398307;398308;398309;398310;398311;398312;398313;398314;398315;398316;398317;398318;398319;398320;398321;398322;398323;398324;398325;398326;398327;398328;398329;398330 507398;507399;507400;507401;507402;507403;507404;507405;507406;507407;507408;507409;507410;507411;507412;507413;507414;507415;507416;507417;507418;507419;507420;507421;507422;507423;507424;507425;507426;507427;507428;507429;507430;507431;507432;507433;507434;507435;507436;507437;507438;507439;507440;507441 507400 41 TQYSSAMLESLLPGIR Oxidation (M) 1780.9029 0.90293508 959 E9PLK3;P55786;H0YCQ5 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 1 0 1 1 1 127.29 127.29 2 0.00050227 132735 QUIQUE_C1576_190116_001 77.185 62.927 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44470 959 41504 398331;398332;398333 507442;507443;507444 507442 588 3 TRDDWLVSWVQSYCR Unmodified 1969.9105 0.91048007 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 140.34 140.34 3 0.0066115 146055 QUIQUE_C1368_190116_001 50.053 40.131 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44471 2813 41505 398334 507445 507445 1 TRDELEVIHLIEEHR Unmodified 1887.9803 0.9802742 1992 P10155 TROVE2 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 88.028 88.028 3;4 3.1698E-19 89967 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.85 124.04 1065100000 65138000 76075000 84124000 116670000 64238000 53466000 118160000 91746000 105890000 40670000 76823000 95313000 76744000 44472 1992 41506 398335;398336;398337;398338;398339;398340;398341;398342;398343;398344;398345;398346;398347;398348;398349 507446;507447;507448;507449;507450;507451;507452;507453;507454;507455;507456;507457;507458;507459;507460;507461;507462;507463;507464;507465;507466;507467;507468;507469 507461 24 TRDGLTPLHCAAR Unmodified 1466.7412 0.7412299 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 1 1 18.727 18.727 4 0.0036168 11461 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.726 39.933 26181000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26181000 0 44473 1255;2856 41507 398350 507470 507470 1 TRDLHIQSHISENRDEVEAVK Unmodified 2475.2466 0.24661265 4567 Q9Y2T3;Q5SZC5 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 2 1 35.32 35.32 5 0.029206 30711 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.055 17.207 41924000 0 0 0 0 0 0 0 41924000 0 0 0 0 0 44474 4567 41508 398351 507471 507471 1 TREEAELEANSVFR Unmodified 1649.8009 0.80091285 3269 Q5EBM0 CMPK2 UMP-CMP kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 60.582 60.582 2 0.040936 60627 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.185 36.595 30592000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30592000 0 0 44475 3269 41509 398352 507472 507472 1 TREEECHFYAGGQVYPGEASR Unmodified 2442.0659 0.065871094 2973 Q13162;A6NG45 PRDX4 Peroxiredoxin-4 yes no 0 0 1 1 1 1 49.967 49.967 4 0.0020377 47735 QUIQUE_C1277_190116_001 44.848 37.97 117350000 40894000 44828000 31630000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44476 2973 41510 398353;398354;398355 507473;507474;507475;507476 507475 2 TREEIQEVR Unmodified 1158.5993 0.59929991 1943 P08559;Q5JPU3;P29803 PDHA1;PDHA2 Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial;Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, testis-specific form, mitochondrial yes no 0 0 1 2 2 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 14.802 14.802 2;3 0.0001956 6177 QUIQUE_C1563_190116_001 147.95 87.357 2735500000 183120000 506010000 0 165310000 24093000 165200000 48493000 664290000 408210000 175200000 34470000 290240000 70893000 44477 1943 41511 398356;398357;398358;398359;398360;398361;398362;398363;398364;398365;398366;398367;398368;398369;398370;398371;398372 507477;507478;507479;507480;507481;507482;507483;507484;507485;507486;507487;507488;507489;507490;507491;507492;507493;507494 507484 18 TREGNDLYHEMIESGVINLK Unmodified 2317.1372 0.13724512 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W079;H0YI37;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 1 2 3 2 2 2 3 1 3 2 1 3 3 3 111.15 111.15 2;3;4 7.6066E-46 115766 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398526;398527 507685;507686 507685 1 TSAQVSLAAGHK Unmodified 1168.62 0.62003536 1416 O00534;B4DHS6 VWA5A von Willebrand factor A domain-containing protein 5A yes no 0 0 0 2 15.071 15.071 2;3 0.00061286 7161 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.656 70.192 44612000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44612000 0 0 0 44497 1416 41530 398528;398529 507687;507688 507687 2 TSAQVVLDGLVDK Unmodified 1343.7296 0.72964538 3037 Q14008 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.745 97.745 2 0.0039989 99691 QUIQUE_C1403_190116_001 69.864 47.778 221150000 39808000 36102000 45993000 35643000 0 0 44571000 0 0 19032000 0 0 0 44498 3037 41531 398530;398531;398532;398533;398534;398535 507689;507690;507691;507692;507693;507694;507695 507692 6 TSASDVTNIYPGDAGK Unmodified 1594.7475 0.74748029 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 64.51 64.51 2 3.8357E-05 64140 QUIQUE_C1218_190116_001 81.565 54.084 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44499 3102 41532 398536 507696 507696 1 TSASIGSLCADAR Unmodified 1307.614 0.6139637 2689 P60201 PLP1 Myelin proteolipid protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 48.185 48.185 2 9.1973E-42 45633 QUIQUE_C1403_190116_001 194.54 161.28 46521000000 2727700000 2459200000 8845300000 2369900000 2362100000 1889000000 7807300000 2043500000 1559200000 1495100000 7534900000 1989600000 3437700000 44500 2689 41533 398537;398538;398539;398540;398541;398542;398543;398544;398545;398546;398547;398548;398549;398550;398551 507697;507698;507699;507700;507701;507702;507703;507704;507705;507706;507707;507708;507709;507710;507711;507712;507713;507714;507715;507716;507717;507718;507719;507720;507721;507722;507723;507724;507725;507726;507727;507728;507729;507730;507731;507732 507707 35 TSASIILR Unmodified 859.51272 0.51271674 2132 P17987;E7ERF2;E7EQR6;F5H282;F5GZ03 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.854 38.854 2 5.2577E-06 34400 QUIQUE_DMIX8_190116_001 170.06 107.35 3298700000 247640000 283750000 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.601 80.601 2 1.055E-09 82113 QUIQUE_C1576_190116_001 158.76 83.543 1302000000 87397000 102010000 148580000 118780000 136510000 0 160460000 108290000 137140000 33182000 164700000 104960000 0 44503 1872 41536 398577;398578;398579;398580;398581;398582;398583;398584;398585;398586;398587 507765;507766;507767;507768;507769;507770;507771;507772;507773;507774;507775;507776;507777;507778 507771 10 TSAVPSPCGK Unmodified 1002.4804 0.48043033 2539 P49748 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 17.946 17.946 2 0.045139 10264 QUIQUE_C1563_190116_001 49.444 26.92 12179000 0 0 0 0 0 12179000 0 0 0 0 0 0 0 44504 2539 41537 398588 507779 507779 1 TSCEFTGDILR Unmodified 1297.5973 0.597251 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.052 76.052 2 2.5134E-12 76698 QUIQUE_C1368_190116_001 161.27 142.17 4441500000 595660000 583390000 477640000 376020000 534030000 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Q9UBC2;M0R165;M0R2S2 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 141.25 141.25 3 2.4691E-57 148254 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.73 139.64 281860000 0 0 0 0 0 0 0 42620000 51343000 0 72354000 45925000 69617000 44530 4394 41562 398776;398777;398778;398779;398780;398781 507998;507999;508000;508001;508002;508003;508004 508000 7 TSFDKPDQMAALFK Unmodified 1597.781 0.78102903 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 3 1 1 2 2 1 2 1 1 94.622 94.622 2;3 0.00014834 92230 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.55 75.838 1228800000 133090000 138040000 134780000 116420000 61192000 49557000 151930000 112740000 0 35804000 153770000 77970000 63478000 44531 4551 41563 398782;398783;398784;398785;398786;398787;398788;398789;398790;398791;398792;398793;398794;398795;398796;398797;398798;398799;398800;398801 508005;508006;508007;508008;508009;508010;508011;508012;508013;508014;508015;508016;508017;508018;508019;508020;508021;508022;508023;508024 508020 18 TSFEDGSGECEVFCK Unmodified 1750.6815 0.68145092 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 74.787 74.787 2 7.8774E-06 75406 QUIQUE_C1576_190116_001 121.02 117.7 94948000 45910000 49038000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44532 1748 41564 398802;398803;398804;398805 508025;508026;508027;508028 508028 4 TSFFLGEVGNAAK Unmodified 1339.6772 0.67721588 1335 K7EMM8;Q49A26 GLYR1 Putative oxidoreductase GLYR1 yes no 0 0 0 1 1 93.106 93.106 2 0.0057997 95670 QUIQUE_C1368_190116_001 69.01 49.739 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44533 1335 41565 398806;398807 508029;508030 508030 2 TSFFQALGITTK Unmodified 1312.7027 0.70270235 1888 P05388;F8VWS0;F8VW21;F8VU65;F8VPE8;G3V210;Q8NHW5 RPLP0;RPLP0P6 60S acidic ribosomal protein P0;60S acidic ribosomal protein P0-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.87 128.87 2 2.9925E-06 134760 QUIQUE_C1218_190116_001 137.98 117.46 3405800000 237500000 274240000 386200000 339610000 268690000 320110000 282260000 243870000 287790000 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no 0 0 0 1 54.168 54.168 2 0.035845 52548 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.549 28.394 25530000 0 0 0 0 0 0 0 0 25530000 0 0 0 0 44556 2406 41587 398978 508245 508245 1 TSGTLISFIYPAQNPELLNK Unmodified 2205.1681 0.16813455 2993 Q13423;E9PCX7;D6RAI5;D6RHU2;D6RCR6 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 142.47 142.47 2;3 4.8518E-18 147532 QUIQUE_C1368_190116_001 175.21 167.17 2361100000 205930000 160010000 224040000 150990000 0 182430000 163740000 230720000 309750000 84780000 344350000 170460000 133890000 44557 2993 41588 398979;398980;398981;398982;398983;398984;398985;398986;398987;398988;398989;398990;398991;398992;398993;398994;398995;398996;398997;398998;398999;399000 508246;508247;508248;508249;508250;508251;508252;508253;508254;508255;508256;508257;508258;508259;508260;508261;508262;508263;508264;508265;508266;508267;508268 508250 22 TSHGEVISVPHK Unmodified 1289.6728 0.67279921 3005 Q13505;A0A0C4DFQ1 MTX1 Metaxin-1 yes no 0 0 0 1 16.19 16.19 3 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508283 14 TSIAIDTIINQK Unmodified 1315.7347 0.73473076 2243 P25705;K7EK77;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 2 3 2 2 3 3 3 2 1 4 3 89.726 89.726 2;3 2.3285E-65 92054 QUIQUE_C1368_190116_001 214.83 169.5 26194000000 2526500000 2486500000 2149300000 1489000000 1839600000 2267000000 2180600000 2200800000 2378400000 1108300000 1346200000 2136300000 2085500000 44561 2243 41592 399018;399019;399020;399021;399022;399023;399024;399025;399026;399027;399028;399029;399030;399031;399032;399033;399034;399035;399036;399037;399038;399039;399040;399041;399042;399043;399044;399045;399046;399047;399048;399049;399050;399051 508288;508289;508290;508291;508292;508293;508294;508295;508296;508297;508298;508299;508300;508301;508302;508303;508304;508305;508306;508307;508308;508309;508310;508311;508312;508313;508314;508315;508316;508317;508318;508319;508320;508321;508322;508323;508324;508325;508326;508327;508328;508329;508330;508331;508332;508333;508334;508335;508336;508337;508338;508339;508340;508341 508298 53 TSIAIDTIINQKR Unmodified 1471.8358 0.83584179 2243 P25705;K7EK77;K7ENJ4 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 1 2 72.042 72.042 2;3 0.0024068 71485 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.082 61.616 57778000 0 0 0 0 0 0 0 57778000 0 0 0 0 0 44562 2243 41593 399052;399053 508342;508343 508343 1 TSIDAYDNFDNISLAQR Unmodified 1941.9068 0.90683448 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 115.84 115.84 2;3 0 119474 QUIQUE_C1277_190116_001 312.85 273.97 18163000000 1513000000 1761300000 1284100000 1264900000 1648500000 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399079;399080;399081;399082;399083;399084;399085;399086;399087;399088;399089;399090;399091;399092;399093;399094;399095 508376;508377;508378;508379;508380;508381;508382;508383;508384;508385;508386;508387;508388;508389;508390;508391;508392;508393;508394 508389 19 TSIFWNDVKDPVSIEER Unmodified 2034.0058 0.0058202445 2674 P55884;C9JZG1;C9JQN7 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 3 1 109.64 109.64 2;3 6.1301E-17 112157 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.71 131.68 1034200000 81048000 112950000 121980000 88082000 103220000 68624000 77362000 115450000 156500000 0 0 108960000 0 44565 2674 41596 399096;399097;399098;399099;399100;399101;399102;399103;399104;399105;399106;399107;399108;399109 508395;508396;508397;508398;508399;508400;508401;508402;508403;508404;508405;508406;508407;508408;508409;508410 508405 16 TSISGNWK Unmodified 891.44503 0.4450311 3755;1471;58 A0A087WW91;Q92777;O14994;A0A0A0MR68;A0A087WTG8 SYN2;SYN3 Synapsin-2;Synapsin-3 no no 0 0 0 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399119;399120;399121;399122;399123;399124;399125;399126;399127;399128;399129;399130 508420;508421;508422;508423;508424;508425;508426;508427;508428;508429;508430;508431;508432 508421 13 TSLALDESLFR Unmodified 1250.6507 0.65066678 3488 Q86U42;B4DEH8;G3V4T2;H0YJH9 PABPN1 Polyadenylate-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.68 109.68 2 0.00039512 113257 QUIQUE_C1277_190116_001 116.52 95.519 629830000 0 61822000 72984000 0 58602000 62389000 60050000 67903000 63370000 0 73202000 67730000 41777000 44569 3488 41600 399131;399132;399133;399134;399135;399136;399137;399138;399139;399140 508433;508434;508435;508436;508437;508438;508439;508440;508441;508442;508443;508444;508445 508433 11 TSLAPIIVFVK Unmodified 1186.7325 0.73254592 2639 P54284;F8VNV8;F8VUW8 CACNB3 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 yes no 0 0 0 1 1 119.92 119.92 2 0.017221 122191 QUIQUE_C1563_190116_001 56.258 44.211 39399000 0 21659000 0 0 0 17739000 0 0 0 0 0 0 0 44570 2639 41601 399141;399142 508446;508447 508447 2 TSLAPIIVHVK Unmodified 1176.723 0.72304386 332 A0A1B0GWF9;A0A1B0GUK4;A0A1B0GVB2;A0A1B0GTS4;A0A1B0GU53;E7EN11;A0A1B0GTF6;A0A1B0GTA9;A0A1B0GTN8;H0Y476;A0A1C7CYX2;A0A1B0GTX2;O00305;A0A1B0GXG0;A0A1B0GTP5;A0A1B0GVU5;A0A1B0GVF0;A0A1B0GTX8;A0A1B0GTK1;A0A1B0GU07 CACNB4 Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-4 yes no 0 0 0 1 57.073 57.073 3 0.018115 55915 QUIQUE_C1218_190116_001 44.024 25.856 18603000 18603000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44571 332 41602 399143 508448 508448 1 TSLAPLPCYVYLIEHPSLK Unmodified 2200.1602 0.1602124 2468 P45381 ASPA Aspartoacylase yes yes 0 0 0 1 1 1 139.22 139.22 3 0.0051372 143836 QUIQUE_C1277_190116_001 42.711 34.887 198900000 0 48317000 0 0 71701000 0 0 0 0 0 78879000 0 0 44572 2468 41603 399144;399145;399146 508449;508450;508451 508449 3 TSLATFHEGK Unmodified 1089.5455 0.54547343 3536 Q8IWB7 WDFY1 WD repeat and FYVE domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 22.429 22.429 3 0.047442 15943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 31.535 7.4457 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508486;508487;508488;508489;508490;508491;508492;508493;508494;508495;508496;508497;508498;508499;508500;508501;508502;508503;508504;508505;508506;508507;508508;508509;508510;508511;508512;508513;508514;508515;508516;508517;508518;508519;508520;508521 508489 36 TSLITEEEDSTSEVLDEELK Unmodified 2266.0588 0.058762835 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 137.89 137.89 2 1.3692E-18 141702 QUIQUE_C1403_190116_001 157.75 145.39 236290000 39081000 0 0 35845000 35243000 0 43923000 0 41996000 0 0 40201000 0 44577 4668 41608 399202;399203;399204;399205;399206;399207;399208 508522;508523;508524;508525;508526;508527;508528 508524 7 TSLMAFLR Unmodified 937.50552 0.50552287 1123 H0Y542;O75363 BCAS1 Breast carcinoma-amplified sequence 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 106.89 106.89 2 0.0049014 110769 QUIQUE_C1576_190116_001 107.43 84.807 73438000 12794000 21867000 0 0 0 0 19486000 0 0 0 19291000 0 0 44578 1123 41609 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1976.9336 0.93358328 3226 Q3LXA3;H0YCY6;I3L252 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 150 150 2;3 0.0055929 156899 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.472 51.214 207540000 35927000 0 35949000 36056000 0 0 0 53612000 0 0 0 45997000 0 44583 3226 41612 399245;399246;399247;399248;399249;399250;399251 508569;508570;508571;508572;508573;508574;508575 508574 6 TSLPHFHHPETSRPDSNIYK Unmodified 2362.1454 0.14544204 2923 Q08495;E5RFK4;E5RJC0;E5RGQ0;E5RGQ7 DMTN Dematin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.555 36.555 4 0.00041748 33009 QUIQUE_C1218_190116_001 56.9 49.062 1110000000 94790000 82625000 104740000 87372000 306680000 81602000 76466000 78076000 0 0 0 62533000 135090000 44584 2923 41613 399252;399253;399254;399255;399256;399257;399258;399259;399260;399261 508576;508577;508578;508579;508580;508581;508582;508583;508584;508585;508586;508587;508588 508576 12 TSLPSPMFSR 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508703;508704;508705;508706;508707;508708;508709;508710;508711;508712;508713;508714;508715;508716;508717;508718;508719;508720;508721;508722 508707 20 TSPATNQAAGQEEK Unmodified 1430.6638 0.66375066 546 A6NKN8 PCP4L1 Purkinje cell protein 4-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 10.533 10.533 2 0.00078034 2969 QUIQUE_DMIX4_190116_001 81.525 63.716 6199300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6199300 0 0 0 44597 546 41625 399380 508723 508723 1 TSPCQSPTISEGPVPSLPIRPSR Unmodified 2462.2588 0.25875724 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.071 85.071 3 2.3565E-05 87852 QUIQUE_C1438_190116_001 58.904 46.824 485400000 107840000 0 73247000 116280000 80778000 0 63481000 0 0 0 0 0 43774000 44598 723 41626 399381;399382;399383;399384;399385;399386 508724;508725;508726;508727;508728;508729;508730;508731;508732;508733 508728 10 TSPDAFVQLALQLAHYK Unmodified 1901.0047 0.0046980325 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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508816;508817 508817 2 TSQIGESFEEILEETVISTK Unmodified 2239.1107 0.11073883 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 2 2 5 2 3 2 2 2 2 2 2 2 3 165.9 165.9 2;3 5.8373E-117 169463 QUIQUE_C1277_190116_001 220.59 200.49 8228400000 1042000000 836530000 971420000 547310000 371510000 513470000 1116800000 633160000 412570000 265590000 539020000 480900000 498110000 44610 3176 41638 399458;399459;399460;399461;399462;399463;399464;399465;399466;399467;399468;399469;399470;399471;399472;399473;399474;399475;399476;399477;399478;399479;399480;399481;399482;399483;399484;399485;399486;399487;399488 508818;508819;508820;508821;508822;508823;508824;508825;508826;508827;508828;508829;508830;508831;508832;508833;508834;508835;508836;508837;508838;508839;508840;508841;508842;508843;508844;508845;508846;508847;508848;508849;508850;508851;508852;508853;508854;508855;508856;508857;508858;508859;508860;508861;508862;508863 508825 44 TSQLLETLNQLSTHTHVVDITR Unmodified 2505.3187 0.31871496 3052;890 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CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 96.107 96.107 2;3 2.9657E-05 99520 QUIQUE_C1218_190116_001 84.493 75.674 1294700000 140500000 56814000 0 124860000 0 70759000 76470000 79308000 109490000 259790000 0 194280000 182470000 + 44613 781;782 41641 399512;399513;399514;399515;399516;399517;399518;399519;399520;399521;399522 508887;508888;508889;508890;508891;508892;508893;508894;508895;508896;508897 508887 9 TSQNSELNNMQDLVEDYKK Oxidation (M) 2271.0325 0.03250528 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 1 1 1 1 54.139 54.139 3 0.00061845 49674 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.123 54.391 99650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61420000 38229000 0 0 + 44614 781;782 41641 399523;399524 508898;508899 508898 475 1 TSQTSLTASINK Unmodified 1249.6514 0.65139506 4668 Q9Y6X4;D6RB01 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 31.559 31.559 2 0.0053526 26138 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693;3205 41645 399571;399572;399573;399574;399575;399576;399577;399578;399579;399580;399581;399582;399583 508960;508961;508962;508963;508964;508965;508966;508967;508968;508969;508970;508971;508972;508973;508974;508975;508976;508977;508978;508979;508980;508981;508982;508983;508984 508963 25 TSSAQVEGGVHSLHSYEK Unmodified 1914.9072 0.90716883 2040 P12268;H0Y4R1 IMPDH2 Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.103 30.103 3 4.0615E-05 24837 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.049 72.927 899130000 74237000 67264000 115500000 85580000 86201000 57291000 103060000 51225000 64924000 0 60075000 49178000 84589000 44619 2040 41646 399584;399585;399586;399587;399588;399589;399590;399591;399592;399593;399594;399595 508985;508986;508987;508988;508989;508990;508991;508992;508993;508994;508995;508996;508997;508998 508995 14 TSSESIISVPASSTSGSPSR Unmodified 1935.9385 0.93852854 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 62.075 62.075 2 2.6094E-05 61547 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.3 67.522 129480000 0 0 0 0 30557000 0 0 0 32609000 0 36691000 29624000 0 44620 3362 41647 399596;399597;399598;399599;399600 508999;509000;509001;509002;509003 509000 5 TSSESIYSRPGSSIPGSPGHTIYAK Unmodified 2578.2663 0.26634504 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6;H0Y7N6;F6XFR5 ABLIM1 no no 0 0 1 1 1 2 55.59 55.59 3;4 6.7958E-17 53803 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.504 83.184 279080000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56932000 64777000 157370000 44621 151 41648 399601;399602;399603;399604 509004;509005;509006;509007;509008 509006 5 TSSGLGGSTTDFLEEWK Unmodified 1813.837 0.83702358 3883 Q96IZ0;A0A0B4J260;F8W1M8 PAWR PRKC apoptosis WT1 regulator protein yes no 0 0 0 1 1 127.66 127.66 2 0.00070849 131379 QUIQUE_C1403_190116_001 94.122 77.984 47295000 0 0 0 29228000 0 0 0 18067000 0 0 0 0 0 44622 3883 41649 399605;399606 509009;509010 509009 2 TSSGSDTDIYSFHSATEQEDLLSDIQQAIR Unmodified 3313.5222 0.52223797 4340 Q9NZ56 FMN2 Formin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 151.3 151.3 3 5.7195E-22 156089 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399639;399640;399641;399642;399643 509047;509048;509049;509050;509051 509049 4 TSSPSSTGSVSLGR Unmodified 1321.6474 0.64737232 3362 Q6H8Q1 ABLIM2 Actin-binding LIM protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.992 27.992 2 0.0027845 22172 QUIQUE_C1403_190116_001 73.632 42.558 255440000 66964000 0 0 0 0 52916000 0 0 0 0 49248000 38320000 47988000 44632 3362 41659 399644;399645;399646;399647;399648;399649;399650;399651;399652 509052;509053;509054;509055;509056;509057;509058;509059;509060 509055 9 TSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEK Oxidation (M) 2730.4455 0.44549538 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 170.36 170.36 3 1.4679E-08 171617 QUIQUE_C1563_190116_001 75.945 69.512 888140000 78144000 122680000 0 100980000 104050000 35542000 0 0 64842000 0 168810000 213090000 0 44633 2642 41660 399653;399654;399655;399656;399657;399658;399659;399660 509061;509062;509063;509064;509065;509066;509067;509068 509065 2081 4 TSSSIPPIILLQFLHMAFPQFAEK Unmodified 2714.4506 0.45058076 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 172.61 172.61 3 7.0742E-15 176976 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.98 104.83 524110000 0 0 0 0 0 0 0 0 231130000 0 168920000 124060000 0 44634 2642 41660 399661;399662;399663 509069;509070;509071 509069 3 TSTADYAMFK Unmodified 1133.5063 0.50631073 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.247 60.247 2 0.0056282 59597 QUIQUE_C1576_190116_001 76.827 50.443 2041300000 128850000 249120000 157800000 344670000 232230000 54002000 215710000 74148000 0 81532000 232830000 64422000 205950000 44635 710 41661 399664;399665;399666;399667;399668;399669;399670;399671;399672;399673;399674;399675 509072;509073;509074;509075;509076;509077;509078;509079;509080;509081;509082;509083;509084 509078 12 TSTAPAASPNVR Unmodified 1170.5993 0.59929991 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.47 17.47 2 4.4497E-05 10317 QUIQUE_C1218_190116_001 138.66 114.14 1015500000 110110000 69855000 90577000 64681000 89999000 68597000 93317000 84958000 93851000 34066000 124780000 90669000 0 44636 2026 41662 399676;399677;399678;399679;399680;399681;399682;399683;399684;399685;399686;399687 509085;509086;509087;509088;509089;509090;509091;509092;509093;509094;509095;509096;509097;509098;509099 509085 11 TSTAPSSPGVDSVPLQR Unmodified 1697.8584 0.85842773 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.132 57.132 2 1.1216E-22 55533 QUIQUE_C1277_190116_001 165.7 141.32 1639200000 80013000 91686000 100490000 161360000 114880000 188610000 86931000 145300000 168970000 39445000 105640000 110680000 245230000 44637 855;928 41663 399688;399689;399690;399691;399692;399693;399694;399695;399696;399697;399698;399699;399700 509100;509101;509102;509103;509104;509105;509106;509107;509108;509109;509110;509111;509112 509101 13 TSTDFSEVIKQELEDNDKYQQFR Unmodified 2819.325 0.32498213 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 2 1 127.82 127.82 4 0.00027288 130497 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.392 40.743 33860000 0 0 0 0 0 0 0 33860000 0 0 0 0 0 44638 1255;2856 41664 399701 509113 509113 1 TSTGQDSTTTR Acetyl (Protein N-term) 1195.5317 0.53167386 4402 Q9UBN7;A6NDI8;E7EPS2;C9J172;Q9BRX7;A0A2R8YCS4;E7EP63;E7ER52;C9JEF4 HDAC6 Histone deacetylase 6 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 1 16.303 16.303 2 0.0068832 8652 QUIQUE_C1438_190116_001 59.067 42.291 82681000 0 0 0 14773000 18277000 0 11233000 0 18238000 0 0 0 20159000 44639 4402 41665 399702;399703;399704;399705;399706;399707 509114;509115;509116;509117;509118;509119 509115 6 TSTGSASSSAAVAASSK Unmodified 1468.7005 0.7005301 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.16 16.16 2 1.8113E-37 8359 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400095;400096;400097;400098;400099;400100;400101;400102;400103;400104;400105;400106;400107 509604;509605;509606;509607;509608;509609;509610;509611;509612;509613;509614;509615;509616;509617 509613 13 TTDVMFGGK Unmodified 954.44807 0.44806757 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.91 38.91 2 0.00022039 35393 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.83 121.46 3890500000 303790000 303970000 263190000 284870000 252740000 286920000 303710000 341340000 331310000 128090000 430240000 308380000 351920000 44694 1558 41718 400108;400109;400110;400111;400112;400113;400114;400115;400116;400117;400118;400119;400120 509618;509619;509620;509621;509622;509623;509624;509625;509626;509627;509628;509629;509630;509631;509632;509633;509634;509635;509636;509637;509638;509639;509640;509641;509642;509643 509632 26 TTDVMFGGK Oxidation (M) 970.44298 0.44298219 1558 O43865 AHCYL1 Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 23.878 23.878 2 0.0075441 17495 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Q9H019;C9JF50;E9PLU1;E9PRK5;E9PLD2;E9PPQ0;E9PPF9 MTFR1L Mitochondrial fission regulator 1-like yes no 0 0 0 2 2 2 2 3 2 1 2 1 1 1 1 1 79.406 79.406 2;3 8.675E-10 80541 QUIQUE_C1277_190116_001 155.06 134.06 692620000 106120000 26933000 112480000 105300000 68514000 46341000 50721000 93223000 37305000 0 45681000 0 0 44701 4112 41724 400145;400146;400147;400148;400149;400150;400151;400152;400153;400154;400155;400156;400157;400158;400159;400160;400161;400162;400163;400164;400165 509668;509669;509670;509671;509672;509673;509674;509675;509676;509677;509678;509679;509680;509681;509682;509683;509684;509685;509686;509687;509688;509689;509690 509671 22 TTEQLIEAVNNGDFEAYAK Unmodified 2112.0011 0.0011287971 3010 Q13554;H7C394 CAMK2B Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta yes no 0 0 0 3 2 1 1 1 2 3 2 2 2 2 2 128.65 128.65 2;3 1.6037E-267 134173 QUIQUE_C1218_190116_001 278.82 250.06 4461500000 298240000 576240000 183490000 0 247710000 224130000 617230000 194870000 363770000 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509717;509718;509719;509720;509721;509722;509723;509724;509725;509726;509727;509728;509729;509730;509731;509732;509733;509734;509735;509736;509737;509738;509739;509740;509741;509742;509743;509744;509745;509746;509747;509748 509745 32 TTETGPDSEVKK Acetyl (Protein N-term) 1332.6409 0.64088996 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22;Q4VXN5;Q4VXN6;Q4VXN7;Q4VXN8 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 1 0 1 1 1 19.788 19.788 2 0.0034435 12656 QUIQUE_C1576_190116_001 130.94 87.694 154960000 0 0 0 0 0 0 69655000 0 0 0 0 0 85302000 44704 4172 41727 400213;400214 509749;509750 509749 1 TTETQVFVATPQK Unmodified 1448.7511 0.75110911 413 A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RB22;B4DQ67 HARS2 Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 49.141 49.141 2 0.037122 46660 QUIQUE_C1218_190116_001 62.166 51.015 17351000 17351000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44705 413 41728 400215 509751 509751 1 TTEVGSVSEVK Acetyl (Protein N-term) 1176.5874 0.58739782 933;1529 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4.1-like protein 2 no no 0 0 1 1 15.713 15.713 3 0.041648 8172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 33.192 7.149 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44708 933;1529 41730 400229 509765 509765 1 TTEYHDRDEQFYWIIEALGIR Unmodified 2654.2765 0.2765158 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 2 1 157.66 157.66 3;4 5.8913E-07 165105 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.945 82.745 336900000 0 0 0 0 0 0 0 0 21558000 0 265000000 50340000 0 44709 1929 41731 400230;400231;400232;400233 509766;509767;509768;509769;509770;509771 509769 6 TTFEDLIQR Unmodified 1121.5717 0.57168818 821 D6REX3;O94979;H7BXG7;H0Y8W8;H0YAF5 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 1 94.37 94.37 2 0.027289 90841 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.96 27.775 27776000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27776000 0 0 0 44710 821 41732 400234;400235;400236 509772;509773;509774 509774 3 TTFTVAQNER Unmodified 1165.5728 0.57275081 1201 H3BRY5;P50225;P50226;E9PKW4;A0A0A6YYL2;P0DMN0;P0DMM9 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1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 1 0 1 4 2 2 2 3 1 5 6 2 6 5 3 117.1 117.1 2;3;4 8.5747E-157 119570 QUIQUE_C1277_190116_001 203.59 187.65 95809000000 1149900000 11334000000 2452900000 1964100000 2166500000 1725800000 1998100000 15763000000 12842000000 4538800000 21244000000 14614000000 4017300000 44720 447;2696;2788;458 41741 400354;400355;400356;400357;400358;400359;400360;400361;400362;400363;400364;400365;400366;400367;400368;400369;400370;400371;400372;400373;400374;400375;400376;400377;400378;400379;400380;400381;400382;400383;400384;400385;400386;400387;400388;400389;400390;400391;400392;400393;400394;400395 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510087 224 TTGKPIEASIR Unmodified 1171.6561 0.65608651 1936 P08133 ANXA6 Annexin A6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 17.722 17.722 2;3 0.00080812 10248 QUIQUE_C1368_190116_001 88.056 75.481 15897000000 585440000 993500000 1556600000 1333200000 1747300000 1175200000 1632800000 0 2372500000 682910000 2041300000 0 1776200000 44722 1936 41742 400507;400508;400509;400510;400511;400512;400513;400514;400515;400516;400517;400518 510282;510283;510284;510285;510286;510287;510288;510289;510290;510291;510292;510293;510294 510284 6 TTGLEEAAEAETAK Unmodified 1419.6729 0.67291837 2808 P78362 SRPK2 SRSF protein kinase 2;SRSF protein kinase 2 N-terminal;SRSF protein kinase 2 C-terminal yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.313 54.313 2 0.00034815 52172 QUIQUE_C1403_190116_001 127.87 96.446 228370000 0 32458000 0 36318000 40526000 24958000 31275000 21658000 0 0 0 14818000 26362000 44723 2808 41743 400519;400520;400521;400522;400523;400524;400525;400526;400527;400528 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510471 6 TTIHEMFLSTLDPK Unmodified 1631.8229 0.82289384 4575 Q9Y305;H7C5Q2 ACOT9 Acyl-coenzyme A thioesterase 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 102.5 102.5 3 0.0099758 104238 QUIQUE_C1368_190116_001 40.278 33.84 19827000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19827000 0 0 0 44739 4575 41758 400654;400655 510473;510474 510473 2 TTIIWDAHTGEAK Unmodified 1441.7201 0.72014333 4086 Q9BZK7;A0A0D9SF63;A0A1B0GVH3;Q9BQ87 TBL1XR1;TBL1Y F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1;F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1Y no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 47.753 47.753 2;3 0.0034355 44133 QUIQUE_C1403_190116_001 56.414 37.789 36992000 0 0 0 25358000 0 0 0 0 0 11633000 0 0 0 44740 4086 41759 400656;400657;400658;400659;400660;400661;400662;400663;400664;400665 510475;510476;510477;510478;510479;510480;510481;510482;510483;510484 510479 10 TTIPEEEEEEEEAAGVVVEEELFHQQGTPR Unmodified 3410.5638 0.56376843 2171 P20700 LMNB1 Lamin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 149.3 149.3 3 8.7277E-55 153745 QUIQUE_C1403_190116_001 139.16 129.19 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510518;510519;510520;510521;510522;510523;510524;510525;510526;510527;510528;510529;510530;510531;510532;510533;510534;510535;510536;510537;510538;510539;510540;510541;510542;510543;510544;510545;510546;510547;510548;510549;510550;510551;510552;510553;510554;510555;510556;510557;510558;510559 510559 42 TTLEIHNTEER Unmodified 1341.6525 0.6524577 139 A0A0A0MR09;P43378 PTPN9 Protein-tyrosine-phosphatase;Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9 yes no 0 0 0 1 20.225 20.225 2 0.032206 13208 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.452 32.588 16763000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16763000 44750 139 41769 400722 510560 510560 1 TTLEVLQLFPINIK Unmodified 1627.9549 0.95489429 3312 Q5T4S7;A0A0A0MSW0 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 159.49 159.49 2 2.6951E-07 163753 QUIQUE_C1277_190116_001 128.51 113.37 106550000 0 16558000 0 0 17289000 0 13139000 0 20475000 0 20501000 18592000 0 44751 3312 41770 400723;400724;400725;400726;400727;400728 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receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 47.439 47.439 2;3 0.00052228 45402 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.096 68.241 336330000 0 0 0 0 0 0 0 91280000 51631000 0 101300000 47503000 44625000 44754 2911 41773 400746;400747;400748;400749;400750;400751;400752 510585;510586;510587;510588;510589;510590;510591 510586 7 TTLLHMLKDDR Unmodified 1341.7075 0.70747015 4648;4262 Q9NR31;Q5SQT8;X1WI22;D6RAA2;Q9Y6B6;D6RD69;D6RDB2 SAR1A;SAR1B GTP-binding protein SAR1a;GTP-binding protein SAR1b no no 0 0 1 1 1 1 1 47.548 47.548 3 0.02496 45028 QUIQUE_DMIX3_190116_001 40.725 27.767 161540000 0 0 0 0 0 0 0 43928000 38200000 0 0 28376000 51038000 44755 4262;4648 41774 400753;400754;400755;400756 510592;510593;510594;510595 510593 4 TTLLPGLLK Unmodified 954.61137 0.61136815 4284 Q9NSD9 FARSB 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no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 2 2 34.442 34.442 1;2 0.0007965 29156 QUIQUE_DMIX8_190116_001 109.71 63.742 7137500000 656510000 0 654670000 0 563380000 686300000 644050000 535230000 632760000 266720000 842080000 779670000 876110000 44762 2529 41781 400810;400811;400812;400813;400814;400815;400816;400817;400818;400819;400820;400821;400822;400823;400824 510676;510677;510678;510679;510680;510681;510682;510683;510684;510685;510686;510687;510688;510689;510690;510691;510692;510693 510692 14 TTLTGLRPGTEYGIGVSAVK Unmodified 2019.1001 0.10005498 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 82.977 82.977 2;3 3.4127E-29 84270 QUIQUE_C1368_190116_001 162.29 120.25 3242500000 0 0 194140000 122710000 193050000 258670000 140950000 239930000 682770000 227850000 367410000 397060000 417980000 44763 2233 41782 400825;400826;400827;400828;400829;400830;400831;400832;400833;400834;400835;400836;400837;400838;400839;400840;400841;400842;400843;400844;400845;400846 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510857;510858;510859;510860;510861;510862;510863;510864;510865;510866;510867;510868;510869;510870;510871;510872;510873;510874;510875;510876;510877;510878;510879;510880;510881;510882;510883;510884;510885;510886;510887;510888;510889;510890;510891;510892;510893;510894;510895;510896;510897;510898;510899;510900;510901;510902;510903;510904;510905 510862 49 TTPPVLDSDGSFFLYSR Unmodified 1900.9207 0.92069363 408 A0A286YFJ8;P01861 IGHG4 Ig gamma-4 chain C region yes no 0 0 0 1 1 1 133.19 133.19 2 0.00022777 139857 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.14 98.136 460800000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28069000 285070000 0 147660000 44789 408 41807 400997;400998;400999 510906;510907;510908;510909 510907 4 TTPQYMENMEQVFEQCQQFEEK Unmodified 2823.1826 0.18261669 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 141.41 141.41 2;3 2.6648E-36 145577 QUIQUE_C1277_190116_001 188.9 178.26 1603100000 259990000 299700000 190210000 215700000 172030000 128440000 41081000 31127000 39531000 42261000 88679000 0 94318000 44790 4069 41808 401000;401001;401002;401003;401004;401005;401006;401007;401008;401009;401010;401011;401012;401013;401014;401015;401016 510910;510911;510912;510913;510914;510915;510916;510917;510918;510919;510920;510921;510922;510923;510924;510925;510926;510927;510928;510929;510930 510914 18 TTPQYMENMEQVFEQCQQFEEKR Unmodified 2979.2837 0.28372772 4069 Q9BY11;F6U236 PACSIN1 Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.13 130.13 3 9.3054E-64 134525 QUIQUE_C1277_190116_001 167.45 160.94 693960000 0 60214000 48252000 37323000 73027000 0 50214000 101790000 50036000 0 89387000 101640000 82083000 44791 4069 41809 401017;401018;401019;401020;401021;401022;401023;401024;401025;401026 510931;510932;510933;510934;510935;510936;510937;510938;510939;510940;510941 510931 11 TTPSVVAFTADGER Unmodified 1449.71 0.70997257 2415 P38646;A0A3B3ITI4;D6RJI2;D6RA73 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.192 71.192 2 0.0013932 70773 QUIQUE_C1403_190116_001 84.479 68.341 9536000000 643940000 645750000 797210000 593580000 719190000 618710000 783910000 601000000 873300000 293060000 1024200000 895180000 1047000000 44792 2415 41810 401027;401028;401029;401030;401031;401032;401033;401034;401035;401036;401037;401038;401039 510942;510943;510944;510945;510946;510947;510948;510949;510950;510951;510952;510953;510954;510955;510956;510957;510958 510946 17 TTPSYVAFTDTER Unmodified 1486.694 0.69398816 2010;282;2643;2362;2117 P11142;E9PKE3;E9PNE6;E9PLF4;E9PQQ4;E9PQK7;E9PK54;E9PPY6;E9PN25;E9PI65;A0A0G2JIW1;P0DMV9;P0DMV8;Q53FA3;P34931;P17066;P48741;P54652 HSPA8;HSPA1B;HSPA1A;HSPA1L;HSPA6;HSPA7;HSPA2 Heat shock cognate 71 kDa protein;Heat shock 70 kDa protein 1B;Heat shock 70 kDa protein 1A;Heat shock 70 kDa protein 1-like;Heat shock 70 kDa protein 6;Putative heat shock 70 kDa protein 7;Heat shock-related 70 kDa protein 2 no no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 3 2 2 3 2 2 2 71.575 71.575 2;3 0.00012081 71718 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.875 69.23 96636000000 6509500000 7044400000 8682500000 7995600000 6698300000 5948700000 8204800000 6276200000 7637900000 4732400000 9743400000 7955800000 9206700000 44793 2010;282;2362;2117;2643 41811 401040;401041;401042;401043;401044;401045;401046;401047;401048;401049;401050;401051;401052;401053;401054;401055;401056;401057;401058;401059;401060;401061;401062;401063;401064;401065;401066;401067;401068 510959;510960;510961;510962;510963;510964;510965;510966;510967;510968;510969;510970;510971;510972;510973;510974;510975;510976;510977;510978;510979;510980;510981;510982;510983;510984;510985;510986;510987;510988;510989;510990;510991;510992;510993;510994;510995;510996;510997;510998;510999;511000;511001;511002;511003;511004;511005;511006;511007;511008;511009;511010;511011;511012;511013;511014;511015;511016;511017;511018;511019;511020;511021;511022 511003 64 TTPTGWTLDQCIQTGVDNPGHPFIK Unmodified 2782.3385 0.33846413 2046 P12532;F8WCN3;C9JSQ1;C9J995;C9J8F6;C9JT96;C9JJX8;C9J6W7 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 117.92 117.92 2;3 4.0551E-57 121740 QUIQUE_DMIX8_190116_001 220.27 191.45 12226000000 1081600000 1075500000 1030300000 1071000000 828750000 867970000 1089700000 880620000 770910000 282970000 1123900000 1009200000 1113600000 44794 2046 41812 401069;401070;401071;401072;401073;401074;401075;401076;401077;401078;401079;401080;401081;401082;401083;401084;401085;401086;401087;401088;401089;401090;401091;401092;401093 511023;511024;511025;511026;511027;511028;511029;511030;511031;511032;511033;511034;511035;511036;511037;511038;511039;511040;511041;511042;511043;511044;511045;511046;511047;511048;511049;511050;511051;511052;511053;511054;511055;511056;511057;511058;511059;511060;511061;511062;511063;511064;511065;511066;511067;511068;511069 511069 47 TTPYQIACGISQGLADNTVIAK Unmodified 2320.1733 0.17329628 2253 P26639;D6R9F8 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 1 143.37 143.37 2;3 1.2475E-08 147853 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.93 110.05 108350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 72971000 35377000 44795 2253 41813 401094;401095;401096 511070;511071;511072 511070 3 TTPYQVAAEISQELAESTVIAK Unmodified 2348.2111 0.21112157 521 A2RTX5;B7ZLP8 TARSL2 Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 167.92 167.92 2;3 1.0641E-10 174047 QUIQUE_C1438_190116_001 103.21 88.052 353420000 53384000 43692000 0 0 40679000 40155000 28598000 45792000 49105000 12470000 0 39544000 0 44796 521 41814 401097;401098;401099;401100;401101;401102;401103;401104;401105;401106;401107 511073;511074;511075;511076;511077;511078;511079;511080;511081;511082;511083 511075 9 TTQFSCTLGEK Unmodified 1270.5864 0.58635197 2855 Q01469;I6L8B7 FABP5 Fatty acid-binding protein, epidermal yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 40.413 40.413 2 9.3564E-05 35843 QUIQUE_DMIX8_190116_001 133.13 121.29 15660000000 1469200000 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QUIQUE_DMIX1_190116_001 142.98 137.65 4205200000 0 0 0 0 226010000 0 0 1005600000 1088200000 0 483560000 672700000 729120000 44799 2855 41817 401133;401134;401135;401136;401137;401138;401139;401140;401141;401142;401143;401144 511110;511111;511112;511113;511114;511115;511116;511117;511118;511119;511120;511121;511122;511123 511115 14 TTQGLTALLLSLK Unmodified 1357.8181 0.81806646 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;B7Z7G7 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.31 143.31 2 0.00040407 146470 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.63 102.82 720020000 72993000 99631000 107490000 61370000 0 0 97274000 28803000 55818000 35354000 58471000 45921000 56899000 44800 4276 41818 401145;401146;401147;401148;401149;401150;401151;401152;401153;401154;401155 511124;511125;511126;511127;511128;511129;511130;511131;511132;511133;511134 511129 11 TTQGLTALLLSLKK Unmodified 1485.913 0.91302948 4276 Q9NRW7;A0A087WU65;A0A2R8YE10;A0A2R8YD95;B7Z7G7 VPS45 Vacuolar protein sorting-associated protein 45 yes no 0 0 1 1 1 114.69 114.69 3 0.0018999 117519 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.102 43.723 61936000 0 0 0 0 0 0 0 33579000 0 0 0 28357000 0 44801 4276 41819 401156;401157 511135;511136 511135 1 TTQIGCLLR Unmodified 1060.5699 0.56991404 1701 O94973;A0A0G2JS82 AP2A2 AP-2 complex subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.925 60.925 2 0.00046275 60278 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.73 96.272 911180000 0 150350000 191890000 0 0 0 196080000 71655000 93554000 46099000 0 161550000 0 44802 1701 41820 401158;401159;401160;401161;401162;401163;401164 511137;511138;511139;511140;511141;511142;511143;511144;511145;511146;511147 511143 11 TTQIPQWCVEYMR Unmodified 1710.7858 0.78579683 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 106.79 106.79 2 0.0020267 108865 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.819 52.902 38379000 0 0 0 0 0 0 0 38379000 0 0 0 0 0 44803 1506 41821 401165 511148 511148 1 TTQQDLSALQK Unmodified 1231.6408 0.64083038 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;H0Y390;E9PNZ4 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 37.807 37.807 2 0.0015261 33759 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.998 63.026 211270000 0 0 34257000 0 0 0 0 56070000 40077000 0 80863000 0 0 44804 1187 41822 401166;401167;401168;401169 511149;511150;511151;511152 511152 4 TTQVPQFILDDFIQNDR Unmodified 2049.0167 0.016719282 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 150.96 150.96 2;3 1.7532E-05 156726 QUIQUE_C1218_190116_001 82.877 74.085 771420000 53679000 38125000 28504000 38002000 60240000 46833000 27979000 30481000 45837000 13750000 190490000 174950000 22554000 44805 2916 41823 401170;401171;401172;401173;401174;401175;401176;401177;401178;401179;401180;401181;401182;401183;401184;401185 511153;511154;511155;511156;511157;511158;511159;511160;511161;511162;511163;511164;511165;511166;511167;511168;511169;511170;511171;511172;511173;511174 511153 21 TTRYEFEQQR Unmodified 1356.6422 0.64222736 3235 Q4G0N4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 22.081 22.081 3 0.021521 15533 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.188 32.225 32186000 0 0 0 0 0 0 0 32186000 0 0 0 0 0 44806 3235 41824 401186 511175 511175 1 TTSASSHLNK Acetyl (Protein N-term) 1086.5306 0.53055165 2086 P15104 GLUL Glutamine synthetase yes yes 1 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 15.406 15.406 2 9.7537E-12 7727 QUIQUE_C1403_190116_001 160.69 142.55 92404000000 6605800000 5342700000 13325000000 7102500000 5472100000 4796800000 5591300000 6010200000 6882300000 1792300000 13716000000 7217200000 8550600000 44807 2086 41825 401187;401188;401189;401190;401191;401192;401193;401194;401195;401196;401197;401198;401199;401200;401201 511176;511177;511178;511179;511180;511181;511182;511183;511184;511185;511186;511187;511188;511189;511190;511191;511192;511193 511180 18 TTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEK Oxidation (M) 2703.3347 0.33468388 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 1 0 2 2 2 1 1 2 2 2 1 2 1 1 2 168.76 168.76 2;3 3.27E-113 170617 QUIQUE_DMIX1_190116_001 190.24 179.14 1203600000 90483000 66562000 96605000 12514000 80805000 131780000 91049000 152860000 94493000 81472000 115440000 46223000 143360000 44808 3202 41826 401202;401203;401204;401205;401206;401207;401208;401209;401210;401211;401212;401213;401214;401215;401216;401217;401218;401219;401220;401221;401222 511194;511195;511196;511197;511198;511199;511200;511201;511202;511203;511204;511205;511206;511207;511208;511209;511210;511211;511212;511213;511214;511215;511216 511208 2629 23 TTSDLLLVMSNLYSLNAGSLTMSEK Unmodified 2687.3398 0.33976926 3202 Q16851;A0A087WYS1;E7EUC7 UGP2 UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 170.27 170.27 2;3 7.4902E-46 177507 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.45 127.56 801550000 66560000 0 0 14962000 13228000 0 9374400 204790000 0 0 256780000 121660000 114190000 44809 3202 41826 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401235;401236;401237;401238;401239;401240;401241;401242;401243;401244;401245;401246;401247;401248;401249;401250;401251;401252;401253;401254;401255;401256;401257 511229;511230;511231;511232;511233;511234;511235;511236;511237;511238;511239;511240;511241;511242;511243;511244;511245;511246;511247;511248;511249;511250;511251;511252;511253 511244 25 TTSGALFPSLVPGSR Acetyl (Protein N-term) 1530.8042 0.80420731 3172 Q16186;A0A087WX59;A0A087WUX6 ADRM1 Proteasomal ubiquitin receptor ADRM1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 145.25 145.25 2 3.4969E-14 141006 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.99 122.79 613350000 70254000 50181000 72278000 78851000 0 67665000 73536000 63504000 54591000 0 0 0 82492000 44812 3172 41829 401258;401259;401260;401261;401262;401263;401264;401265;401266;401267;401268;401269 511254;511255;511256;511257;511258;511259;511260;511261;511262;511263;511264;511265;511266;511267;511268;511269;511270 511268 16 TTSLILPGIIK Unmodified 1154.7275 0.72746054 2865 Q02108 GUCY1A3 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 107.65 107.65 2 0.005558 113210 QUIQUE_C1218_190116_001 78.149 63.48 32863000 0 0 0 0 20580000 0 0 0 0 0 0 0 12282000 44813 2865 41830 401270;401271;401272;401273;401274;401275;401276;401277 511271;511272;511273;511274;511275;511276;511277;511278 511271 8 TTSPANTCSPEVIHLK Unmodified 1753.8669 0.86688392 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 45.459 45.459 2;3 3.5336E-05 42657 QUIQUE_C1277_190116_001 82.362 63.617 401440000 64345000 70957000 52819000 49046000 0 39369000 59099000 0 0 0 0 39673000 26130000 44814 636 41831 401278;401279;401280;401281;401282;401283;401284;401285;401286 511279;511280;511281;511282;511283;511284;511285;511286;511287;511288 511282 10 TTSPPEVSGYSYEK Unmodified 1543.7042 0.70421849 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 51.292 51.292 2 0.011342 48887 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41834 401303 511306 511306 1 TTTGSYIANR Unmodified 1082.5356 0.53563702 2275 P28072;A0A087X2I4;I3L3X7 PSMB6 Proteasome subunit beta type-6;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.715 20.715 2 0.00035402 13648 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.71 77.826 2967900000 274130000 334370000 283410000 261000000 270580000 253490000 0 232880000 254320000 91303000 356310000 356070000 0 44818 2275 41835 401304;401305;401306;401307;401308;401309;401310;401311;401312;401313;401314 511307;511308;511309;511310;511311;511312;511313;511314;511315;511316;511317;511318;511319 511318 13 TTTLSGTAPAAGVVPSR Unmodified 1584.8471 0.84713476 880;1058 E7EVA0;P27816;B5MEG9;F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 56.921 56.921 2 4.955E-07 56146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.59 88.833 2362800000 0 0 0 0 215180000 220780000 0 381110000 423780000 0 310490000 211140000 600350000 44819 880;1058 41836 401315;401316;401317;401318;401319;401320;401321 511320;511321;511322;511323;511324;511325;511326;511327;511328 511323 7 TTTNEELEDMLESGK Oxidation (M) 1711.7458 0.74582531 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 1 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 70.663 70.663 2 4.8346E-44 70925 QUIQUE_C1277_190116_001 184.03 165.29 581140000 49460000 64474000 60558000 64914000 39481000 108600000 55905000 0 0 48319000 43967000 0 45464000 44820 2721 41837 401322;401323;401324;401325;401326;401327;401328;401329;401330;401331;401332;401333;401334;401335;401336;401337;401338;401339;401340 511329;511330;511331;511332;511333;511334;511335;511336;511337;511338;511339;511340;511341;511342;511343;511344;511345;511346;511347;511348 511330 2156 18 TTTNEELEDMLESGK Unmodified 1695.7509 0.75091069 2721 P61266 STX1B Syntaxin-1B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.4 105.4 2 1.223E-79 110226 QUIQUE_C1218_190116_001 212.9 198.44 5750600000 555590000 621540000 641680000 619600000 393230000 423870000 494610000 264070000 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511369;511370;511371;511372;511373;511374;511375;511376;511377;511378;511379;511380;511381;511382;511383;511384;511385;511386;511387;511388;511389;511390;511391;511392;511393;511394;511395;511396;511397;511398;511399;511400;511401;511402;511403;511404;511405;511406;511407;511408 511371 39 TTTPVYVALGIFVQHR Unmodified 1800.9887 0.98865404 1042 F8VYY9;P54619;F8VPF5 PRKAG1 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 1 1 134.6 134.6 3 0.0086285 138685 QUIQUE_DMIX7_190116_001 41.378 30.893 64711000 0 0 0 14105000 0 0 0 0 0 0 27982000 22624000 0 44823 1042 41839 401381;401382;401383 511409;511410;511411 511411 0 TTTSEELEDMLESGNPAIFASGIIMDSSISK Oxidation (M) 3288.5265 0.52651999 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 168.8 168.8 3 3.8551E-36 171959 QUIQUE_C1368_190116_001 104.12 98.636 276440000 20073000 59819000 93007000 34448000 0 0 69091000 0 0 0 0 0 0 44824 3185 41840 401384;401385;401386;401387;401388;401389;401390;401391 511412;511413;511414;511415;511416;511417;511418;511419 511415 2612;2613 8 TTTSEELEDMLESGNPAIFASGIIMDSSISK Unmodified 3272.5316 0.53160537 3185 Q16623;A0A0C4DFZ1;A8MZ54 STX1A Syntaxin-1A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 172.55 172.55 3 4.5041E-54 173950 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.2 125.71 836300000 21684000 59064000 0 16372000 44480000 0 109390000 54785000 54927000 0 223500000 137920000 114170000 44825 3185 41840 401392;401393;401394;401395;401396;401397;401398;401399;401400;401401 511420;511421;511422;511423;511424;511425;511426;511427;511428;511429 511425 10 TTTSSGGLTISSLLK Unmodified 1464.8035 0.80353861 3331 Q5VIR6;F6VX93;E7EVT8 VPS53 Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 101.74 101.74 2 0.0056794 105962 QUIQUE_C1218_190116_001 76.326 62.633 98630000 21562000 28585000 20468000 28016000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44826 3331 41841 401402;401403;401404;401405;401406 511430;511431;511432;511433;511434;511435 511431 6 TTTTTGVLLGISSQK Unmodified 1505.8301 0.83008771 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 75.917 75.917 2 0.019592 77847 QUIQUE_C1438_190116_001 47.062 28.282 41680000 0 0 0 0 41680000 0 0 0 0 0 0 0 0 44827 2225 41842 401407 511436 511436 1 TTTVATDYDNIEIQQQYSDVNNR Acetyl (Protein N-term) 2729.2416 0.24164643 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 1 0 0 1 1 1 1 125.81 125.81 3 4.5381E-08 130872 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.847 70.894 242720000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56568000 0 90942000 95206000 44828 2851 41843 401408;401409;401410;401411 511437;511438;511439;511440;511441;511442;511443 511443 7 TTTVVNVEGDALGAGILHHLNQK Unmodified 2386.2605 0.2604718 2459 P43007 SLC1A4 Neutral amino acid transporter A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 101.48 101.48 4 6.8764E-12 105116 QUIQUE_C1438_190116_001 95.5 90.699 512750000 48269000 80979000 0 68378000 63249000 0 64887000 54387000 97802000 34801000 0 0 0 44829 2459 41844 401412;401413;401414;401415;401416;401417;401418;401419 511444;511445;511446;511447;511448;511449;511450;511451;511452;511453 511448 9 TTVDSVEGNASK Unmodified 1206.5728 0.57281039 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YGU1;A0A087WXD9;A0A2R8YG52;A0A2R8Y6B2;A0A2R8Y7D9 CCDC88A Girdin yes no 0 0 0 1 19.625 19.625 2 0.030406 12130 QUIQUE_C1277_190116_001 48.981 16.626 83919000 0 83919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44830 473 41845 401420 511454 511454 1 TTVGNQVIR Unmodified 986.55089 0.55089316 840 E5RHK8;E5RIK2 DNM3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.839 22.839 2 0.0017546 15908 QUIQUE_C1277_190116_001 100.45 44.44 641080000 123650000 117450000 74865000 75939000 0 68834000 0 61029000 0 0 119310000 0 0 44831 840 41846 401421;401422;401423;401424;401425;401426;401427 511455;511456;511457;511458;511459;511460;511461 511456 5 TTVGVDGSLYK Unmodified 1138.587 0.58700389 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 50.005 50.005 2 0.00012016 47937 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0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 162.39 162.39 2;3 7.1429E-19 164548 QUIQUE_C1563_190116_001 140.78 127.09 1341400000 74840000 80943000 91479000 107140000 81833000 74227000 87394000 102870000 148750000 42415000 141300000 151300000 156890000 44834 67 41849 401448;401449;401450;401451;401452;401453;401454;401455;401456;401457;401458;401459;401460;401461;401462;401463;401464;401465;401466;401467;401468;401469;401470;401471;401472 511487;511488;511489;511490;511491;511492;511493;511494;511495;511496;511497;511498;511499;511500;511501;511502;511503;511504;511505;511506;511507;511508;511509;511510;511511;511512 511498 23 TTVLAMDQVPR Unmodified 1229.6438 0.64380726 2993 Q13423;E9PCX7;D6RAI5;D6RHU2;D6RCR6 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.296 68.296 2 0.00052274 68615 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.61 93.698 1245000000 118060000 87774000 128980000 95112000 0 91768000 108290000 92490000 117730000 34548000 134490000 122290000 113490000 44835 2993 41850 401473;401474;401475;401476;401477;401478;401479;401480;401481;401482;401483;401484 511513;511514;511515;511516;511517;511518;511519;511520;511521;511522;511523;511524 511522 11 TTVLAMDQVPR Oxidation (M) 1245.6387 0.63872189 2993 Q13423;E9PCX7;D6RAI5;D6RHU2;D6RCR6 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 42.176 42.176 2 0.00069796 39548 QUIQUE_DMIX5_190116_001 99.653 78.914 37438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37438000 0 0 44836 2993 41850 401485;401486 511525;511526;511527 511527 2445 3 TTVLLADINDFNTVNEIYK Unmodified 2182.1158 0.11576462 2612 P52758;H0YBX3;H0YB34 HRSP12 Ribonuclease UK114 yes no 0 0 0 4 3 2 2 2 5 2 2 2 2 1 2 2 146.55 146.55 2;3 5.2881E-86 149493 QUIQUE_DMIX1_190116_001 249.66 235.4 8733600000 484560000 647180000 724640000 425640000 713140000 1311600000 482950000 929730000 849860000 312220000 737050000 563430000 551610000 44837 2612 41851 401487;401488;401489;401490;401491;401492;401493;401494;401495;401496;401497;401498;401499;401500;401501;401502;401503;401504;401505;401506;401507;401508;401509;401510;401511;401512;401513;401514;401515;401516;401517 511528;511529;511530;511531;511532;511533;511534;511535;511536;511537;511538;511539;511540;511541;511542;511543;511544;511545;511546;511547;511548;511549;511550;511551;511552;511553;511554;511555;511556;511557;511558;511559;511560;511561;511562;511563;511564;511565;511566;511567;511568;511569;511570;511571;511572;511573;511574;511575;511576;511577;511578 511560 47 TTVLTAALLLSGIPAEVINR Unmodified 2051.199 0.19904074 2521 P49069 CAMLG Calcium signal-modulating cyclophilin ligand yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.01 169.01 3 3.3677E-06 176204 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.238 71.074 280440000 18493000 17997000 16945000 9567400 0 19548000 33516000 32830000 41596000 0 41194000 29448000 19304000 44838 2521 41852 401518;401519;401520;401521;401522;401523;401524;401525;401526;401527;401528 511579;511580;511581;511582;511583;511584;511585;511586;511587;511588;511589 511587 9 TTVPCVTHAGFCCPLVVTMRPIPK Unmodified 2740.3685 0.36852416 1140 H0YB09;A0A0C4DGD4;H0YB62;E5RJ62;E5RIU5 C14orf159 yes no 0 0 1 1 1 1 97.213 97.213 4 0.0063437 100084 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.75 25.103 268220000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69091000 93274000 105850000 44839 1140 41853 401529;401530;401531 511590;511591;511592;511593 511591 4 TTVPEVEPPQDSHSR Unmodified 1677.7958 0.79582747 2435 P41219;H7C5W5 PRPH Peripherin yes no 0 0 0 1 1 33.273 33.273 3 0.0051823 27618 QUIQUE_DMIX4_190116_001 48.216 42.321 67754000 0 0 0 0 0 0 0 41663000 0 26092000 0 0 0 44840 2435 41854 401532;401533 511594;511595;511596 511596 3 TTVQQEPLESGAK Unmodified 1386.6991 0.69907354 2540 P49750;F8VU51 YLPM1 YLP motif-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 24.779 24.779 2 0.00032838 18700 QUIQUE_C1218_190116_001 110.38 77.004 149840000 22820000 0 0 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401603;401604;401605;401606;401607;401608;401609;401610;401611;401612;401613;401614;401615;401616;401617;401618;401619;401620;401621;401622;401623;401624;401625;401626;401627;401628;401629;401630;401631;401632;401633;401634;401635;401636;401637;401638;401639;401640;401641;401642;401643;401644;401645;401646;401647;401648;401649;401650;401651;401652;401653;401654;401655 511675;511676;511677;511678;511679;511680;511681;511682;511683;511684;511685;511686;511687;511688;511689;511690;511691;511692;511693;511694;511695;511696;511697;511698;511699;511700;511701;511702;511703;511704;511705;511706;511707;511708;511709;511710;511711;511712;511713;511714;511715;511716;511717;511718;511719;511720;511721;511722;511723;511724;511725;511726;511727;511728;511729;511730;511731;511732;511733;511734;511735;511736;511737;511738;511739;511740;511741;511742;511743;511744;511745;511746;511747;511748;511749;511750;511751;511752;511753;511754;511755;511756;511757;511758;511759;511760;511761;511762;511763;511764;511765;511766;511767;511768;511769;511770;511771;511772;511773;511774;511775;511776;511777;511778;511779;511780;511781;511782;511783;511784;511785;511786;511787;511788;511789;511790;511791;511792;511793;511794;511795;511796;511797;511798;511799;511800;511801;511802;511803;511804;511805;511806;511807;511808;511809;511810;511811;511812;511813;511814;511815;511816 511777 139 TVAATNMNETSSR Unmodified 1380.6303 0.63034205 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;F8W8V9;H7C0K6;A0A087WWA3;Q4R9M9;O60333 KIF1A;KIF1B;KIF1Bbeta Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF1B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.254 19.254 2 1.5806E-07 11708 QUIQUE_DMIX8_190116_001 131.82 89.22 442950000 55073000 53906000 52906000 54267000 53286000 45390000 48822000 0 37423000 0 0 0 41878000 44854 497 41868 401656;401657;401658;401659;401660;401661;401662;401663;401664 511817;511818;511819;511820;511821;511822;511823;511824;511825 511825 9 TVAEGHGDTLYVGTTR Unmodified 1675.8166 0.81656291 1757 O95834;K7EIK7;A0A0C4DGQ7;C9JRL6;K7EII6;K7EKG3;K7ELI8 EML2 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 34.204 34.204 2;3 0.032069 29723 QUIQUE_DMIX8_190116_001 33.547 21.632 39913000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39913000 44855 1757 41869 401665;401666 511826;511827 511827 2 TVAELEAEK Unmodified 988.50769 0.50769094 2993 Q13423;E9PCX7;H0Y8P5 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.565 26.565 2 0.0080421 20432 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.893 44.012 1021200000 124890000 60703000 124760000 129020000 81415000 0 0 0 138280000 51182000 165690000 145300000 0 44856 2993 41870 401667;401668;401669;401670;401671;401672;401673;401674;401675 511828;511829;511830;511831;511832;511833;511834;511835;511836;511837 511836 9 TVAFLNQFVVHTVQFLNR Unmodified 2132.1531 0.1530936 996 F5GZ97;Q9Y3C0;F5GWI9;F5GXZ7;F5H0A7;F5GXZ4;F5H2P1 CCDC53 WASH complex subunit CCDC53 yes no 0 0 0 1 1 2 1 155.98 155.98 3 3.9446E-05 159013 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.261 80.552 93383000 0 0 0 0 36429000 0 0 23171000 0 0 0 33782000 0 44857 996 41871 401676;401677;401678;401679;401680 511838;511839;511840;511841;511842 511839 5 TVAGIIVEPIQSEGGDNHASDDFFR Unmodified 2673.2671 0.26707332 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 3 2 2 2 1 3 2 2 3 1 2 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511901;511902;511903;511904;511905;511906;511907;511908;511909;511910;511911;511912;511913;511914;511915;511916;511917;511918;511919;511920;511921;511922;511923;511924;511925;511926;511927;511928;511929;511930;511931;511932;511933;511934;511935;511936;511937;511938;511939;511940;511941;511942;511943;511944;511945;511946;511947 511931 46 TVAGSEEPVHDR Unmodified 1295.6106 0.61059288 165 A0A0A0MS47;Q96PE5;A0A0A0MTN4 OPALIN Opalin yes no 0 0 0 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 12.575 12.575 2;3 5.3713E-10 3362 QUIQUE_C1563_190116_001 156.48 135.58 799360000 95496000 205310000 64694000 0 7006200 148950000 19983000 24317000 25571000 0 17796000 165910000 24327000 44861 165 41875 401746;401747;401748;401749;401750;401751;401752;401753;401754;401755;401756;401757;401758;401759;401760;401761;401762;401763;401764;401765 511948;511949;511950;511951;511952;511953;511954;511955;511956;511957;511958;511959;511960;511961;511962;511963;511964;511965;511966;511967 511955 20 TVAHHGGLYHTNAEVK Unmodified 1732.8645 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RBBP4;Histone-binding protein RBBP7 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 99.035 99.035 2 0.001227 100411 QUIQUE_C1563_190116_001 144.38 50.113 1690400000 143140000 145570000 140870000 145170000 125990000 119990000 132640000 135100000 119450000 58774000 141020000 151140000 131540000 44868 2933;3183 41881 401821;401822;401823;401824;401825;401826;401827;401828;401829;401830;401831;401832;401833;401834 512026;512027;512028;512029;512030;512031;512032;512033;512034;512035;512036;512037;512038;512039;512040;512041;512042;512043;512044;512045 512036 19 TVAMHEVFLCR Unmodified 1361.6584 0.65841147 148 A0A0A0MRI2;Q9UNH7;G3V5X9 SNX6 Sorting nexin-6;Sorting nexin-6, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.996 57.996 2;3 0.0018011 55375 QUIQUE_C1563_190116_001 67.153 46.313 723880000 0 114300000 77605000 61335000 76867000 45831000 82176000 33190000 52771000 11347000 66961000 52939000 48560000 44869 148 41882 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512109;512110;512111;512112;512113;512114;512115;512116;512117;512118;512119;512120;512121;512122;512123;512124;512125;512126;512127;512128;512129;512130;512131;512132;512133;512134 512116 26 TVATPLNQVANPNSAIFGGARPR Unmodified 2350.2506 0.25057582 3106 Q15056 EIF4H Eukaryotic translation initiation factor 4H yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 92.279 92.279 3 1.6171E-07 94134 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.358 53.759 1791500000 0 0 0 0 58272000 0 0 428130000 322010000 0 309120000 272080000 401880000 44875 3106 41888 401912;401913;401914;401915;401916;401917 512135;512136;512137;512138;512139;512140;512141 512141 7 TVAVITSDGR Unmodified 1017.5455 0.54547343 984 F2Z2Y6;O95777 LSM8 U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm8 yes no 0 0 0 1 28.349 28.349 2 0.058241 22579 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.334 9.8875 48157000 0 0 0 0 0 0 0 48157000 0 0 0 0 0 44876 984 41889 401918 512142 512142 1 TVAVWDSETGER Unmodified 1348.6259 0.62590859 3836 Q96DI7 SNRNP40 U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.899 55.899 2 0.00060313 54919 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.855 72.584 131800000 0 0 36040000 0 0 0 0 0 0 0 56108000 39654000 0 44877 3836 41890 401919;401920;401921;401922;401923;401924;401925;401926;401927;401928 512143;512144;512145;512146;512147;512148;512149;512150;512151;512152 512150 10 TVCDWETGHEPFNDPALR Unmodified 2142.9429 0.94290241 3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;A0A0G2JQH3;A0A087WVZ5;Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 91.866 91.866 3 0.021521 93700 QUIQUE_DMIX7_190116_001 41.86 26.439 26093000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26093000 0 44878 292;3442 41891 401929 512153 512153 0 TVCFQNLR Unmodified 1036.5124 0.51239916 3442 Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 48.084 48.084 2 0.010654 45223 QUIQUE_C1403_190116_001 90.986 40.946 304830000 0 35377000 43214000 37874000 58315000 28221000 53600000 0 0 0 0 48227000 0 44879 3442 41892 401930;401931;401932;401933;401934;401935;401936 512154;512155;512156;512157;512158;512159;512160;512161 512156 8 TVCGVVSR Unmodified 876.44874 0.44873627 2146 P19367 HK1 Hexokinase-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.067 18.067 2 0.0078552 10857 QUIQUE_C1218_190116_001 96.492 48.318 1541200000 105150000 0 0 102480000 0 149830000 0 547980000 114810000 252290000 0 223830000 44777000 44880 2146 41893 401937;401938;401939;401940;401941;401942;401943;401944 512162;512163;512164;512165;512166;512167;512168;512169;512170 512162 8 TVCIYGHLDVQPAALEDGWDSEPFTLVER Unmodified 3316.571 0.57104284 3897 Q96KP4;J3QKT2;J3KSV5;A0A087WYZ1;J3QR27;J3QLU1;J3QKQ0;J3QRD0;A0A087WVS2;J3QRH4;J3KRD5 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 153.89 153.89 3 5.0745E-45 161556 QUIQUE_DMIX5_190116_001 131.94 117.01 356660000 0 0 23875000 0 0 0 0 0 91230000 0 91601000 84672000 65281000 44881 3897 41894 401945;401946;401947;401948;401949;401950 512171;512172;512173;512174;512175;512176;512177 512175 7 TVCSNINETKR Unmodified 1320.6456 0.64559818 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 1 1 11.565 11.565 3 0.026832 3883 QUIQUE_DMIX7_190116_001 39.917 15.626 1589400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1589400 0 44882 3676 41895 401951 512178 512178 1 TVCVEMGDVESAF Unmodified 1442.6058 0.60576678 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.6 133.6 2 0.0040175 137802 QUIQUE_C1403_190116_001 69.812 64.871 544870000 50607000 62678000 72579000 61133000 56948000 0 36589000 55914000 37374000 36887000 0 33225000 40934000 44883 2522 41896 401952;401953;401954;401955;401956;401957;401958;401959;401960;401961;401962 512179;512180;512181;512182;512183;512184;512185;512186;512187;512188;512189;512190;512191;512192 512182 12 TVDCPFTVTFYGALFR Unmodified 1892.9131 0.91310583 2606 P52564;K7EIW3;K7ELM6 MAP2K6 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 6 yes no 0 0 0 1 158.43 158.43 2 0.001368 163443 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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401994;401995;401996;401997;401998;401999;402000;402001;402002;402003;402004;402005;402006;402007;402008;402009 512228;512229;512230;512231;512232;512233;512234;512235;512236;512237;512238;512239;512240;512241;512242;512243;512244;512245;512246;512247;512248;512249;512250;512251;512252;512253 512239 26 TVDLLAGLGAERPETANTAQSPYK Unmodified 2501.2762 0.27618145 2511 P48553 TRAPPC10 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes yes 0 0 1 1 101.37 101.37 3 8.8847E-05 104628 QUIQUE_C1218_190116_001 44.258 27.11 29472000 29472000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44892 2511 41905 402010 512254 512254 1 TVDLLCSIFPCEVAQQLWQGQVVQAK Unmodified 3016.515 0.51504828 2865 Q02108;J3KPQ8 GUCY1A3 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 169.22 169.22 3 4.2093E-09 170584 QUIQUE_C1563_190116_001 67.76 59.365 23394000 0 0 0 10531000 0 12862000 0 0 0 0 0 0 0 44893 2865 41906 402011;402012 512255;512256 512256 2 TVDLLYSIFPGDVAQQLWQGQQVQAR Unmodified 2959.5192 0.51920568 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 168.94 168.94 3 0.0027109 176136 QUIQUE_DMIX5_190116_001 34.493 24.345 101470000 18268000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47063000 0 36144000 44894 2357 41907 402013;402014;402015 512257;512258;512259 512258 1 TVDLSSHLAK Unmodified 1069.5768 0.57677356 1868 P04843;F8WF32 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 28.148 28.148 3 0.017439 22867 QUIQUE_C1218_190116_001 39.148 11.135 224410000 27621000 29952000 0 42024000 0 22171000 0 24266000 30680000 14670000 33029000 0 0 44895 1868 41908 402016;402017;402018;402019;402020;402021;402022;402023 512260;512261;512262;512263;512264;512265;512266;512267 512260 8 TVDNFVALATGEK Unmodified 1363.6983 0.69834526 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.609 99.609 2 3.365E-06 103727 QUIQUE_C1218_190116_001 156.58 123.74 4799700000 435550000 348420000 476530000 442780000 367110000 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1 2 2 170.42 170.42 2;3 1.2875E-16 172274 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.31 139.39 287990000 0 0 0 0 0 0 0 60462000 56605000 0 91950000 78977000 0 44898 903;2869;4487 41911 402042;402043;402044;402045;402046;402047;402048 512302;512303;512304;512305;512306;512307;512308;512309 512303 8 TVEAEAAHGTVTR Unmodified 1340.6684 0.66844211 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 16.561 16.561 2;3 1.1145E-07 9363 QUIQUE_DMIX1_190116_001 134.3 95.282 7362600000 145010000 619030000 490920000 943300000 541690000 236780000 550960000 578420000 628930000 186050000 1167700000 545800000 728030000 44899 1662 41912 402049;402050;402051;402052;402053;402054;402055;402056;402057;402058;402059;402060;402061;402062;402063;402064;402065;402066;402067;402068;402069;402070;402071;402072;402073;402074 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1661.8625 0.86245047 4496 Q9ULX6 AKAP8L A-kinase anchor protein 8-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 148.93 148.93 2;3 1.3863E-07 156132 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.4 83.516 43089000 0 0 0 0 43089000 0 0 0 0 0 0 0 0 44902 4496 41915 402084;402085;402086;402087;402088;402089;402090 512350;512351;512352;512353;512354;512355;512356 512355 6 TVEEAADLSLGYMK Unmodified 1525.7334 0.73341013 3438 Q7L266 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 101.02 101.02 2 0.00062848 104403 QUIQUE_C1368_190116_001 90.653 63.324 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44903 3438 41916 402091;402092;402093;402094 512357;512358;512359;512360 512357 4 TVEEAENIAVTSGVVR Unmodified 1672.8632 0.86317875 1681 O76070 SNCG Gamma-synuclein yes yes 0 0 0 3 2 2 2 1 1 2 1 1 1 2 2 2 83.307 83.307 2;3 2.1981E-44 86370 QUIQUE_C1218_190116_001 221.8 157.76 3319300000 414410000 405980000 287290000 369280000 225380000 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402158;402159;402160;402161;402162;402163;402164;402165;402166;402167;402168;402169;402170;402171;402172;402173;402174;402175;402176;402177;402178;402179;402180;402181;402182;402183;402184;402185;402186;402187;402188 512439;512440;512441;512442;512443;512444;512445;512446;512447;512448;512449;512450;512451;512452;512453;512454;512455;512456;512457;512458;512459;512460;512461;512462;512463;512464;512465;512466;512467;512468;512469;512470;512471;512472;512473;512474;512475;512476;512477;512478;512479;512480;512481;512482 512443 43 TVEGAGSIAAATGFVKK Unmodified 1605.8726 0.87262123 2410 P37840;E7EPV7;H6UYS7 SNCA Alpha-synuclein yes no 0 0 1 2 2 66.767 66.767 2;3 2.7153E-05 66525 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.97 87.427 271050000 0 0 0 0 0 0 0 160050000 0 0 111010000 0 0 44911 2410 41924 402189;402190;402191;402192 512483;512484;512485;512486 512484 3 TVEGVLIVHEHR Unmodified 1387.7572 0.75719754 1554 O43809;H3BND3;H3BV41 NUDT21 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 30.919 30.919 2;3 0.0014033 25205 QUIQUE_C1368_190116_001 79.201 53.263 1375100000 113010000 107680000 146120000 90360000 126780000 103340000 125500000 73485000 93042000 46358000 139010000 124040000 86323000 44912 1554 41925 402193;402194;402195;402196;402197;402198;402199;402200;402201;402202;402203;402204;402205;402206;402207;402208;402209;402210;402211;402212;402213;402214;402215 512487;512488;512489;512490;512491;512492;512493;512494;512495;512496;512497;512498;512499;512500;512501;512502;512503;512504;512505;512506;512507;512508;512509;512510;512511 512490 25 TVEHGFPNQPSALAFDPELR Unmodified 2224.0913 0.091281208 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 103.34 103.34 2;3 1.2704E-17 107640 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.91 123.7 3447100000 29875000 216880000 286930000 249940000 303790000 270710000 317270000 266000000 355030000 120910000 399370000 292420000 337990000 44913 57 41926 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Unmodified 1317.6161 0.61607219 3639 Q8NDH3 NPEPL1 Probable aminopeptidase NPEPL1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 24.319 24.319 2 3.8936E-05 17354 QUIQUE_C1368_190116_001 152.54 73.983 211270000 82991000 0 36906000 0 0 0 0 0 31994000 0 0 59383000 0 44915 3639 41928 402254;402255;402256;402257;402258;402259;402260;402261 512558;512559;512560;512561;512562;512563;512564;512565 512560 8 TVEIPDPVEAGEEVK Unmodified 1610.8039 0.80393254 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 2 2 1 91.28 91.28 2 0.0045213 94106 QUIQUE_C1438_190116_001 62.924 47.033 194850000 146280000 0 0 0 48564000 0 0 0 0 0 0 0 0 44916 2190 41929 402262;402263;402264;402265;402266 512566;512567;512568;512569;512570;512571 512568 6 TVEIVHIDIADR Unmodified 1379.7409 0.74087877 2519 P48739;A0A0A0MSW4;B3KYB6;B3KYB7 PITPNB Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 1 2 2 78.503 78.503 2;3 0.00022197 79149 QUIQUE_C1368_190116_001 74.46 45.12 585280000 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Unmodified 1275.6493 0.64928657 395;1336 A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 2 5 4 5 4 5 4 6 8 2 6 5 6 28.236 28.236 2;3 3.6656E-07 20437 QUIQUE_C1277_190116_001 149.96 89.049 199510000000 5871300000 10501000000 7120900000 17948000000 8664300000 16032000000 11926000000 21332000000 29546000000 4801900000 17692000000 19028000000 29042000000 44919 395;1336 41932 402298;402299;402300;402301;402302;402303;402304;402305;402306;402307;402308;402309;402310;402311;402312;402313;402314;402315;402316;402317;402318;402319;402320;402321;402322;402323;402324;402325;402326;402327;402328;402329;402330;402331;402332;402333;402334;402335;402336;402337;402338;402339;402340;402341;402342;402343;402344;402345;402346;402347;402348;402349;402350;402351;402352;402353;402354;402355;402356;402357;402358;402359 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76.969 2 1.5389E-18 77461 QUIQUE_C1368_190116_001 143.55 126.38 43175000 0 43175000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44937 1749 41948 402616;402617;402618;402619;402620 512998;512999;513000;513001;513002 512999 4 TVFETLDIGWQLLR Unmodified 1689.909 0.90900673 2175 P21281 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 3 1 2 3 2 165.57 165.57 2;3 1.3968E-43 169449 QUIQUE_DMIX7_190116_001 190.86 142.42 2994300000 206250000 240230000 248730000 20098000 193470000 136580000 328300000 225270000 275590000 9158400 503340000 381530000 225780000 44938 2175 41949 402621;402622;402623;402624;402625;402626;402627;402628;402629;402630;402631;402632;402633;402634;402635;402636;402637;402638;402639;402640;402641;402642;402643;402644;402645;402646 513003;513004;513005;513006;513007;513008;513009;513010;513011;513012;513013;513014;513015;513016;513017;513018;513019;513020;513021;513022;513023;513024;513025;513026;513027;513028;513029;513030;513031;513032;513033;513034 513032 30 TVFFESLER Unmodified 1126.5659 0.56587452 514 A0AVT1 UBA6 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 93.413 93.413 2 0.013805 90865 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.423 43.687 145300000 0 0 66048000 0 0 50197000 0 0 0 29052000 0 0 0 44939 514 41950 402647;402648;402649 513035;513036;513037 513037 3 TVFFWAPIMK Unmodified 1238.6522 0.65218711 1735 Q5R3B4;O95563 MPC2 Mitochondrial pyruvate carrier 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.12 141.12 2 0.0023586 145893 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.37 68.906 590540000 34353000 36947000 51735000 29172000 22762000 32038000 48070000 66430000 77588000 12664000 61499000 57284000 59997000 44940 1735 41951 402650;402651;402652;402653;402654;402655;402656;402657;402658;402659;402660;402661;402662 513038;513039;513040;513041;513042;513043;513044;513045;513046;513047;513048;513049;513050;513051;513052;513053;513054;513055 513050 18 TVFFWAPIMK Oxidation (M) 1254.6471 0.64710173 1735 Q5R3B4;O95563 MPC2 Mitochondrial pyruvate carrier 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 124.04 124.04 2 0.019595 121348 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.546 50.699 140490000 0 0 28187000 32855000 0 0 0 26477000 33170000 19796000 0 0 0 44941 1735 41951 402663;402664;402665;402666;402667 513056;513057;513058;513059;513060 513060 5 TVFGVEPDLTR Unmodified 1232.6401 0.6401021 3897 Q96KP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.364 86.364 2 7.0237E-13 88411 QUIQUE_C1368_190116_001 166.19 125.16 18689000000 1215900000 1124300000 1537000000 1392100000 1456600000 1340100000 1495700000 1449800000 1716400000 765770000 1787900000 1582800000 1824300000 44942 3897 41952 402668;402669;402670;402671;402672;402673;402674;402675;402676;402677;402678;402679;402680 513061;513062;513063;513064;513065;513066;513067;513068;513069;513070;513071;513072;513073;513074;513075;513076;513077;513078;513079;513080;513081;513082;513083;513084 513064 24 TVFVCDEDATLELK Unmodified 1638.7811 0.78108861 2484 P46926;D6RAY7;D6R9P4;D6RFF8 GNPDA1 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513147;513148;513149;513150;513151;513152;513153;513154;513155;513156;513157;513158;513159;513160;513161;513162;513163;513164;513165;513166;513167 513147 21 TVGIVGNQPK Unmodified 1011.5713 0.57129425 739 E9PDR0;C9JQS9;P05166;E7EX59;E7ETT1;E7ETT4;E7EUY3;F8WBI9;E9PEC3 PCCB Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.783 22.783 2 0.0031223 16731 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.095 56.945 405310000 56009000 39136000 38934000 34541000 33913000 35817000 46669000 30565000 27701000 15443000 0 46587000 0 44949 739 41959 402743;402744;402745;402746;402747;402748;402749;402750;402751;402752;402753 513168;513169;513170;513171;513172;513173;513174;513175;513176;513177;513178 513175 7 TVGLAVLQLR Unmodified 1068.6655 0.66552898 1043 F8VZH8;F8W0P6;F8W059;Q9UPW8 UNC13A Protein unc-13 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.32 100.32 2 0.019502 104783 QUIQUE_C1438_190116_001 73.248 46.864 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44950 1043 41960 402754;402755;402756;402757 513179;513180;513181;513182 513179 4 TVGLFLQGGK Unmodified 1018.5811 0.58113065 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 69.26 69.26 2 0.00069227 69440 QUIQUE_C1576_190116_001 107.66 79.491 606540000 0 77241000 110530000 88123000 0 0 101010000 58801000 0 61235000 109590000 0 0 44951 2463 41961 402758;402759;402760;402761;402762;402763;402764;402765 513183;513184;513185;513186;513187;513188;513189;513190;513191;513192;513193;513194;513195;513196;513197;513198;513199 513192 16 TVGMLSNMIAFYDMAR Oxidation (M) 1834.8416 0.84159715 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 1 0 1 2 2 3 2 2 2 3 3 2 2 2 3 147.01 147.01 2 1.36E-09 148450 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.67 111.65 1602500000 37997000 134590000 60870000 59140000 57106000 113610000 116960000 198510000 175520000 19567000 221870000 210620000 196120000 44952 2414 41962 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513237;513238;513239;513240;513241;513242;513243;513244;513245;513246;513247;513248;513249;513250;513251;513252;513253;513254;513255;513256;513257;513258;513259;513260;513261;513262;513263;513264;513265;513266;513267;513268;513269;513270 513252 33 TVGMLSNMIAFYDMAR 2 Oxidation (M) 1850.8365 0.83651177 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 2 0 1 1 2 2 132.64 132.64 2 0.00042266 135845 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.522 71.287 220590000 0 0 0 0 0 0 0 33105000 0 21550000 90278000 75661000 0 44954 2414 41962 402816;402817;402818;402819;402820;402821 513271;513272;513273;513274;513275;513276 513275 1830;1831;1832 5 TVGMVAGDEETYEVFADLFDPVIQER Oxidation (M) 2945.3641 0.36406975 2046 P12532;F8WCN3;C9JSQ1;C9J995;C9J8F6;C9JT96;C9J6W7 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 170.43 170.43 2;3 7.9812E-196 177596 QUIQUE_DMIX5_190116_001 234.57 217.08 3348800000 206870000 402750000 20566000 260160000 20840000 319270000 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513337 513337 1 TVGQCLETTAQR Unmodified 1362.6562 0.65616287 3819 Q96CM8;E9PF16;D6RF87 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.509 33.509 2 2.0292E-09 28522 QUIQUE_C1563_190116_001 177.06 120.81 352650000 41992000 0 71158000 56210000 66418000 43914000 0 0 0 26567000 0 46395000 0 44959 3819 41966 402877;402878;402879;402880;402881;402882;402883;402884;402885;402886 513338;513339;513340;513341;513342;513343;513344;513345;513346;513347;513348 513343 11 TVGTPIASVPGSTNTGTVPGSEK Unmodified 2156.0961 0.096091815 3954 Q99460;A0A087WW66;H7BZR6 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.778 69.778 2 2.9494E-30 69685 QUIQUE_C1277_190116_001 162.59 135.53 461320000 48701000 57055000 52355000 57680000 63681000 58544000 54934000 0 0 29265000 0 0 39100000 44960 3954 41967 402887;402888;402889;402890;402891;402892;402893;402894;402895 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Unmodified 1233.6969 0.69688869 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 66.155 66.155 3 0.00030165 65979 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.288 67.429 238110000 22714000 22778000 17870000 24651000 0 17545000 0 44455000 27175000 13085000 26008000 21825000 0 44988 4148 41995 403128;403129;403130;403131;403132;403133;403134;403135;403136;403137;403138 513681;513682;513683;513684;513685;513686;513687;513688;513689;513690;513691 513686 10 TVLAISRPFISVK Unmodified 1429.8657 0.86568536 3506 Q86WG3 ATCAY Caytaxin yes yes 0 0 1 1 1 1 83.562 83.562 3 0.016002 84420 QUIQUE_DMIX7_190116_001 50.088 30.693 91756000 0 0 0 0 0 0 0 41835000 21674000 0 0 28248000 0 44989 3506 41996 403139;403140;403141 513692;513693;513694 513694 3 TVLCGTCGQPADK Unmodified 1405.633 0.63298458 1819 P02545;A0A0C4DGC5 LMNA Prelamin-A/C;Lamin-A/C yes no 0 0 0 1 1 1 1 24.157 24.157 2 0.00041843 17969 QUIQUE_C1438_190116_001 129.89 96.89 240560000 0 0 72560000 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5584;515585;515586;515587;515588;515589;515590;515591;515592;515593;515594;515595;515596;515597;515598;515599;515600;515601;515602;515603;515604;515605;515606;515607;515608;515609;515610;515611;515612;515613;515614;515615;515616;515617;515618;515619;515620;515621;515622;515623;515624;515625;515626;515627;515628;515629;515630;515631;515632;515633;515634;515635;515636;515637;515638;515639;515640;515641;515642;515643;515644;515645;515646;515647;515648;515649;515650;515651;515652 515295 740 TVPPEPGAPVDFQLLTQQVIQCAYDIAK Unmodified 3097.5794 0.57942268 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 173.28 173.28 3 0.00031026 177840 QUIQUE_C1368_190116_001 40.819 36.539 119600000 0 0 24501000 0 0 0 95101000 0 0 0 0 0 0 45038 245 42040 404551;404552 515653;515654 515653 2 TVPQSSLTMGQLYEK Oxidation (M) 1696.8342 0.83418681 2694 P60520;H3BQ50 GABARAPL2 Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 60.325 60.325 2 1.2837E-05 59585 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.89 65.195 795400000 0 0 97603000 89596000 103380000 78470000 0 0 103680000 0 116880000 95848000 109950000 45039 2694 42041 404553;404554;404555;404556;404557;404558;404559;404560 515655;515656;515657;515658;515659;515660;515661;515662;515663;515664;515665 515662 2124 10 TVPQSSLTMGQLYEK Unmodified 1680.8393 0.83927219 2694 P60520;H3BQ50 GABARAPL2 Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 80.667 80.667 2 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Unmodified 1646.9356 0.93555583 2175 P21281;H0YC04;E5RGH6 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 96.812 96.812 2;3 1.0472E-13 100376 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.02 114.43 6866200000 612990000 595050000 442850000 452080000 526790000 453520000 581260000 539250000 377630000 213820000 781940000 625460000 663590000 45066 2175 42066 404746;404747;404748;404749;404750;404751;404752;404753;404754;404755;404756;404757;404758;404759;404760;404761;404762;404763;404764;404765;404766;404767;404768;404769;404770;404771;404772 515877;515878;515879;515880;515881;515882;515883;515884;515885;515886;515887;515888;515889;515890;515891;515892;515893;515894;515895;515896;515897;515898;515899;515900;515901;515902;515903;515904;515905;515906;515907;515908;515909;515910;515911;515912;515913;515914;515915;515916;515917;515918;515919;515920;515921;515922;515923;515924;515925;515926;515927;515928;515929;515930;515931;515932;515933;515934;515935;515936;515937;515938;515939;515940;515941;515942;515943;515944;515945;515946;515947;515948;515949;515950;515951;515952;515953 515940 77 TVSKVDDFLANEAK Unmodified 1535.7831 0.78313752 2602 P52209;K7EM49;K7EPF6;K7EMN2 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 1 2 61.876 61.876 2;3 0.0029272 60520 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.169 22.731 85390000 0 0 0 0 0 0 0 85390000 0 0 0 0 0 45067 2602 42067 404773;404774 515954;515955 515955 2 TVSLGAGAKDELHIVEAEAMNYEGSPIK Unmodified 2928.4539 0.45388781 1907 P06748 NPM1 Nucleophosmin yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 1 2 2 2 2 3 2 130.02 130.02 3;4 1.1035E-53 134355 QUIQUE_C1277_190116_001 125.74 114.1 2285200000 0 207850000 95270000 65603000 85847000 48956000 86002000 396130000 369960000 0 320980000 283930000 324630000 45068 1907 42068 404775;404776;404777;404778;404779;404780;404781;404782;404783;404784;404785;404786;404787;404788;404789;404790;404791;404792;404793;404794;404795 515956;515957;515958;515959;515960;515961;515962;515963;515964;515965;515966;515967;515968;515969;515970;515971;515972;515973;515974;515975;515976;515977;515978;515979;515980;515981;515982;515983;515984 515959 29 TVSLLDENNVSSYLSK Unmodified 1767.8891 0.88905915 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 115.37 115.37 2 4.5591E-10 119615 QUIQUE_C1368_190116_001 163.51 129.13 79712000 0 0 51915000 0 0 27797000 0 0 0 0 0 0 0 45069 2813 42069 404796;404797;404798 515985;515986;515987;515988 515985 4 TVSPALISR Unmodified 942.54983 0.54983053 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5;H0YH27 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 39.942 39.942 2 0.0041331 36614 QUIQUE_C1438_190116_001 89.698 46.698 2372500000 313580000 292740000 0 0 341790000 215720000 0 0 256130000 0 350020000 300360000 302160000 45070 3499 42070 404799;404800;404801;404802;404803;404804;404805;404806 515989;515990;515991;515992;515993;515994;515995;515996;515997 515992 9 TVSPDRLELEAAQK Unmodified 1555.8206 0.82058566 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 46.611 46.611 2;3 1.7501E-09 42719 QUIQUE_DMIX8_190116_001 133.05 84.626 3759300000 416450000 204490000 326920000 267290000 302740000 225960000 313640000 334970000 330690000 88952000 327490000 273150000 346540000 45071 3090 42071 404807;404808;404809;404810;404811;404812;404813;404814;404815;404816;404817;404818;404819;404820;404821;404822;404823;404824;404825;404826;404827;404828;404829;404830 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405151;405152;405153;405154;405155;405156;405157;405158;405159 516467;516468;516469;516470;516471;516472;516473;516474;516475 516467 9 TVVLHIDGLDDTSRR Unmodified 1695.8904 0.89039656 4310 Q9NVT9;E5RJ86 ARMC1 Armadillo repeat-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 60.187 60.187 3;4 0.00053203 59484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.894 45.065 631280000 0 50104000 0 30397000 29640000 0 0 89132000 104440000 0 112110000 103150000 112310000 45103 4310 42102 405160;405161;405162;405163;405164;405165;405166;405167;405168;405169;405170;405171;405172 516476;516477;516478;516479;516480;516481;516482;516483;516484;516485;516486;516487;516488;516489;516490;516491 516485 16 TVVNISSLCALQPFK Unmodified 1675.8967 0.89672749 2375 P35270 SPR Sepiapterin reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 133.25 133.25 2 2.105E-06 137172 QUIQUE_C1403_190116_001 135.66 111.32 98979000 0 0 0 34903000 0 64076000 0 0 0 0 0 0 0 45104 2375 42103 405173;405174;405175;405176 516492;516493;516494;516495;516496 516494 5 TVVNTITGSTNVGDQLPTGQLSVVPWR Unmodified 2838.4876 0.4875712 2632 P53677;E5RJ52;E7ER80 AP3M2 AP-3 complex subunit mu-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.46 142.46 3 2.8213E-12 145346 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.01 59.816 524040000 54764000 48789000 52291000 52714000 72268000 45544000 60707000 64261000 0 0 0 0 72704000 45105 2632 42104 405177;405178;405179;405180;405181;405182;405183;405184;405185 516497;516498;516499;516500;516501;516502;516503;516504;516505;516506;516507 516506 11 TVVSGLVNHVPLEQMQNR Unmodified 2020.0524 0.052393282 2950 Q12904 AIMP1 Aminoacyl tRNA synthase complex-interacting multifunctional protein 1;Endothelial monocyte-activating polypeptide 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 89.012 89.012 3 0.0014935 91007 QUIQUE_C1277_190116_001 53.453 18.841 255830000 0 57083000 45115000 48669000 0 40151000 0 0 0 20242000 0 0 44567000 45106 2950 42105 405186;405187;405188;405189;405190;405191 516508;516509;516510;516511;516512;516513;516514;516515;516516 516508 9 TVVSGLVQFVPK Unmodified 1272.7442 0.74417324 2641 P54577 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.81 111.81 2 0.0014385 117208 QUIQUE_C1218_190116_001 81.338 31.987 1338000000 164430000 126870000 184990000 117600000 133380000 104260000 67498000 61488000 77283000 55352000 134040000 0 110820000 45107 2641 42106 405192;405193;405194;405195;405196;405197;405198;405199;405200;405201;405202;405203 516517;516518;516519;516520;516521;516522;516523;516524;516525;516526;516527;516528;516529;516530;516531;516532;516533;516534;516535;516536;516537;516538 516518 22 TVVSSPGPGSGPGPGTTSGASSPAR Unmodified 2167.0505 0.050538606 3996 Q9BQI5 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 39.953 39.953 2 4.7246E-69 36135 QUIQUE_C1403_190116_001 173.58 162.97 176400000 31946000 27405000 54403000 35361000 0 0 27284000 0 0 0 0 0 0 45108 3996 42107 405204;405205;405206;405207;405208 516539;516540;516541;516542;516543 516542 5 TVVTGIEMFHK Unmodified 1260.6536 0.65364367 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 65.732 65.732 2;3 0.00012983 66796 QUIQUE_C1218_190116_001 90.685 74.929 8196200000 700750000 694160000 864010000 635960000 547290000 637950000 773220000 525500000 426980000 126330000 704450000 618840000 940770000 45109 2529 42108 405209;405210;405211;405212;405213;405214;405215;405216;405217;405218;405219;405220;405221;405222;405223;405224;405225;405226;405227;405228;405229;405230;405231;405232 516544;516545;516546;516547;516548;516549;516550;516551;516552;516553;516554;516555;516556;516557;516558;516559;516560;516561;516562;516563;516564;516565;516566;516567;516568;516569;516570;516571;516572;516573;516574;516575;516576;516577;516578 516545 33 TVVTGIEMFHK Oxidation (M) 1276.6486 0.64855829 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 48.667 48.667 3 0.010758 46101 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118.91 105.59 1426600000 0 72102000 58857000 54023000 0 0 99493000 130230000 156520000 0 493020000 196960000 165360000 45116 2079 42113 405253;405254;405255;405256;405257;405258;405259;405260;405261;405262;405263 516600;516601;516602;516603;516604;516605;516606;516607;516608;516609;516610;516611;516612;516613;516614;516615;516616 516603 16 TVWDWELMNDIKPIWQRPSK Oxidation (M) 2557.2788 0.2787644 2079 P14625 HSP90B1 Endoplasmin yes yes 0 1 2 1 127.44 127.44 4 0.0022783 130425 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.425 42.621 41326000 0 0 0 0 0 0 0 41326000 0 0 0 0 0 45117 2079 42113 405264 516617 516617 1410 1 TVWQDLICR Unmodified 1189.5914 0.59137776 4354 Q9NZN5;E9PMR6 ARHGEF12 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 109.73 109.73 2 0.0097087 112187 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.213 49.319 75106000 0 0 0 0 0 0 0 19529000 0 16267000 0 22937000 16372000 45118 4354 42114 405265;405266;405267;405268;405269;405270 516618;516619;516620;516621;516622;516623;516624 516619 7 TVWQYHFR Unmodified 1135.5563 0.55631289 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.539 57.539 3 0.0010568 56318 QUIQUE_C1576_190116_001 102.72 72.465 1812300000 114390000 160100000 149500000 130910000 88412000 137340000 163080000 111760000 171920000 73168000 162820000 164060000 184800000 45119 2898 42115 405271;405272;405273;405274;405275;405276;405277;405278;405279;405280;405281;405282;405283 516625;516626;516627;516628;516629;516630;516631;516632;516633;516634;516635;516636;516637;516638;516639;516640;516641;516642 516633 18 TVYFAEEVQCEGNSFHK Unmodified 2043.8996 0.89964061 2177 P21291;E9PS42 CSRP1 Cysteine and glycine-rich protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 81.541 81.541 2;3 1.6281E-201 83838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 315.13 305.08 24659000000 1437800000 1893300000 1666200000 1640800000 1291600000 1288800000 1286000000 2039200000 3509400000 1123400000 2612300000 2323100000 2546600000 45120 2177 42116 405284;405285;405286;405287;405288;405289;405290;405291;405292;405293;405294;405295;405296;405297;405298;405299;405300;405301;405302;405303;405304;405305;405306;405307;405308;405309 516643;516644;516645;516646;516647;516648;516649;516650;516651;516652;516653;516654;516655;516656;516657;516658;516659;516660;516661;516662;516663;516664;516665;516666;516667;516668;516669;516670;516671;516672;516673;516674;516675;516676;516677;516678;516679;516680;516681;516682;516683;516684;516685;516686;516687;516688;516689;516690;516691;516692;516693;516694;516695;516696;516697;516698;516699;516700 516691 57 TVYGGGCSEMLMAHAVTQLANR Unmodified 2365.0977 0.097705269 2810 P78371;F5GWF6 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 0 0 2 1 2 113.18 113.18 2;3 7.3605E-24 115999 QUIQUE_C1403_190116_001 136.51 122.16 451740000 162520000 99075000 0 190150000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45121 2810 42117 405310;405311;405312;405313;405314 516701;516702;516703;516704;516705 516705 4 TVYGGGCSEMLMAHAVTQLANR Oxidation (M) 2381.0926 0.092619891 2810 P78371;F5GWF6 CCT2 T-complex protein 1 subunit beta yes no 0 1 0 1 106.05 106.05 3 1.7776E-07 102760 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.08 68.371 33580000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33580000 0 0 0 45122 2810 42117 405315 516706 516706 2262 1 TVYHAEEVQCDGR Unmodified 1562.6784 0.67835487 3178 Q16527;F8VQR7;F8VW96 CSRP2 Cysteine and glycine-rich protein 2 yes no 0 0 0 1 21.606 21.606 3 0.00041617 14332 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.875 75.704 19790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19790000 0 0 0 45123 3178 42118 405316 516707 516707 1 TVYSHLFDHVVNR Unmodified 1585.8001 0.80012499 153 A0A0A0MRM8;E7EW20;Q9UM54;A0A0D9SGC1 MYO6 Unconventional myosin-VI yes no 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 3 2 3 2 1 70.479 70.479 2;3;4 5.5143E-05 71933 QUIQUE_C1218_190116_001 95.508 84.402 1600300000 119620000 113840000 163620000 138680000 107630000 106780000 150120000 112990000 165610000 59479000 184690000 133870000 43390000 45124 153 42119 405317;405318;405319;405320;405321;405322;405323;405324;405325;405326;405327;405328;405329;405330;405331;405332;405333;405334;405335;405336;405337;405338;405339;405340;405341;405342;405343;405344;405345 516708;516709;516710;516711;516712;516713;516714;516715;516716;516717;516718;516719;516720;516721;516722;516723;516724;516725;516726;516727;516728;516729;516730;516731;516732;516733;516734;516735;516736;516737;516738;516739;516740 516709 32 TVYSVFGFSFK Unmodified 1280.6441 0.64412484 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 139.17 139.17 2 0.0012818 142093 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.258 60.004 137420000 0 0 0 0 0 23511000 0 42615000 54413000 16879000 0 0 0 45125 2253 42120 405346;405347;405348;405349;405350 516741;516742;516743;516744;516745;516746;516747 516742 6 TWASPVVTPGAR Unmodified 1240.6564 0.65642086 3606 Q8N6C5 IGSF1 Immunoglobulin superfamily member 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 63.057 63.057 2 0.0027454 62576 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.655 42.775 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405537;405538;405539;405540;405541;405542;405543;405544;405545;405546;405547;405548;405549;405550;405551;405552;405553 516969;516970;516971;516972;516973;516974;516975;516976;516977;516978;516979;516980;516981;516982;516983;516984;516985;516986;516987;516988;516989;516990;516991;516992 516981 23 TYAEPLTAAMVEFYTMSQER Oxidation (M) 2353.0606 0.060634286 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y6H2 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 1 154.11 154.11 3 5.0596E-05 156834 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.952 54.642 27138000 0 0 0 0 0 0 0 27138000 0 0 0 0 0 45146 3053 42139 405554;405555 516993;516994;516995 516995 2507 3 TYAHYFDLTIINNEIDETIR Unmodified 2440.1911 0.19105483 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 150.25 150.25 3 2.6579E-07 157099 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.487 84.865 250700000 19896000 0 0 0 0 0 43873000 28350000 34108000 0 58734000 65736000 0 45147 472;1460 42140 405556;405557;405558;405559;405560;405561;405562 516996;516997;516998;516999;517000;517001;517002 517001 7 TYAICGAIR Unmodified 1023.5172 0.51715019 2785 Q8WVC2;P63220;Q9BYK1 RPS21 40S ribosomal protein S21 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.768 50.768 2 0.0088084 48064 QUIQUE_C1563_190116_001 77.741 59.05 880710000 0 0 95151000 0 85873000 45891000 102100000 32940000 75495000 20517000 138480000 128120000 156150000 45148 2785 42141 405563;405564;405565;405566;405567;405568;405569;405570;405571;405572 517003;517004;517005;517006;517007;517008;517009;517010;517011;517012;517013 517005 10 TYAIMISR Unmodified 953.50044 0.50043749 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 2 1 1 1 1 1 2 59.426 59.426 1;2 0.0025702 57899 QUIQUE_C1563_190116_001 135.77 107.25 10658000000 697390000 736910000 1134400000 765300000 828910000 702960000 937510000 919590000 785380000 324350000 1045900000 796850000 982670000 45149 2941 42142 405573;405574;405575;405576;405577;405578;405579;405580;405581;405582;405583;405584;405585;405586;405587;405588;405589 517014;517015;517016;517017;517018;517019;517020;517021;517022;517023;517024;517025;517026;517027;517028;517029;517030;517031;517032;517033;517034;517035;517036;517037;517038;517039;517040;517041;517042;517043 517025 26 TYAIMISR Oxidation (M) 969.49535 0.49535211 2941 Q12765;C9K052;B8ZZP4;C9J7U9 SCRN1 Secernin-1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.678 48.678 2 0.020008 44818 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.452 55.85 2206400000 0 159940000 215460000 0 168030000 166370000 140430000 214960000 229510000 141440000 276850000 245360000 248050000 45150 2941 42142 405590;405591;405592;405593;405594;405595;405596;405597;405598;405599;405600 517044;517045;517046;517047;517048;517049;517050;517051;517052;517053;517054 517051 11 TYAPVAFR Unmodified 923.4865 0.48650199 1570;553 O60331;A6PW57;Q99755 PIP5K1C;PIP5K1A Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma;Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.583 51.583 2 0.0036063 50633 QUIQUE_C1218_190116_001 114.19 90.213 1139300000 116510000 135160000 120820000 0 0 108570000 111370000 0 97552000 67949000 137090000 126630000 117670000 45151 1570;553 42143 405601;405602;405603;405604;405605;405606;405607;405608;405609;405610 517055;517056;517057;517058;517059;517060;517061;517062;517063;517064;517065;517066 517055 11 TYATAEPFIDAK Unmodified 1325.6503 0.65033243 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.322 71.322 2 0.0002832 71755 QUIQUE_DMIX3_190116_001 137.98 108.89 19013000000 1813900000 1788800000 1929600000 1579900000 1493800000 1103800000 1578700000 1162700000 941060000 590950000 1777200000 1666200000 1586900000 45152 2125 42144 405611;405612;405613;405614;405615;405616;405617;405618;405619;405620;405621;405622;405623 517067;517068;517069;517070;517071;517072;517073;517074;517075;517076;517077;517078;517079;517080;517081;517082;517083;517084;517085;517086;517087;517088;517089;517090;517091;517092;517093 517086 27 TYATTEAFIDSK Unmodified 1345.6402 0.64016167 1471 O14994;A0A0A0MR68;A0A087WTG8 SYN3 Synapsin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.741 64.741 2 0.00053447 63968 QUIQUE_C1403_190116_001 118.4 82.152 635680000 71231000 67632000 88201000 68342000 48837000 54919000 76692000 0 39621000 0 65143000 55060000 0 45153 1471 42145 405624;405625;405626;405627;405628;405629;405630;405631;405632;405633;405634;405635 517094;517095;517096;517097;517098;517099;517100;517101;517102;517103;517104;517105;517106 517098 12 TYCSEPEKVDKDNEDFQESNR Unmodified 2589.0925 0.092539354 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 2 1 33.901 33.901 3 3.2066E-34 29627 QUIQUE_C1438_190116_001 141.47 134.82 44253000 0 0 0 0 44253000 0 0 0 0 0 0 0 0 45154 1784 42146 405636 517107 517107 1 TYDATTHFETTCDDIK Unmodified 1916.8098 0.80982255 2560 P50395 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 56.005 56.005 2;3 0 53925 QUIQUE_C1403_190116_001 343.75 329.94 9380200000 751890000 763710000 917550000 879880000 754270000 677410000 830870000 641670000 578580000 350110000 708500000 591370000 934410000 45155 2560 42147 405637;405638;405639;405640;405641;405642;405643;405644;405645;405646;405647;405648;405649;405650;405651;405652;405653;405654;405655;405656;405657;405658;405659;405660;405661;405662;405663 517108;517109;517110;517111;517112;517113;517114;517115;517116;517117;517118;517119;517120;517121;517122;517123;517124;517125;517126;517127;517128;517129;517130;517131;517132;517133;517134;517135;517136;517137;517138;517139;517140;517141;517142;517143;517144;517145 517116 37 TYDATTHFETTCDDIKNIYK Unmodified 2435.0951 0.095105537 2560 P50395 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 83.304 83.304 3;4 0.00015041 85523 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.43 53.699 648530000 0 0 0 0 0 0 0 327060000 77582000 0 67611000 76318000 99961000 45156 2560 42148 405664;405665;405666;405667;405668;405669 517146;517147;517148;517149;517150;517151 517149 6 TYDETYQR Unmodified 1074.4618 0.46180338 1467 O14974;H0YIS3;H0YHI8;H0YIL7 PPP1R12A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 1 20.62 20.62 2 0.0036146 14069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.17 102.96 61486000 0 0 0 25704000 0 0 0 17378000 0 0 18404000 0 0 45157 1467 42149 405670;405671;405672 517152;517153;517154 517153 3 TYDLPGNFLTQALTQR Unmodified 1836.937 0.9370124 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 2 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 145.4 145.4 2;3 2.4815E-09 148259 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.1 102.73 1062800000 81298000 0 131720000 133330000 66333000 94483000 90182000 83069000 80815000 38493000 91187000 73285000 98632000 45158 1692 42150 405673;405674;405675;405676;405677;405678;405679;405680;405681;405682;405683;405684;405685;405686;405687;405688;405689 517155;517156;517157;517158;517159;517160;517161;517162;517163;517164;517165;517166;517167;517168;517169;517170;517171;517172;517173;517174;517175;517176;517177;517178 517167 22 TYDLVAAASK Unmodified 1037.5393 0.53932542 2867 Q02153;E9PCN2 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 51.024 51.024 2 0.020425 48803 QUIQUE_DMIX8_190116_001 59.426 33.867 95596000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47698000 47898000 45159 2867 42151 405690;405691 517179;517180;517181 517180 3 TYDLYITYDK Unmodified 1293.6129 0.61288429 4288 Q9NT62 ATG3 Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 88.879 88.879 2 0.0055595 92261 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.496 46.619 191930000 0 0 0 0 0 0 0 38512000 0 0 82191000 0 71226000 45160 4288 42152 405692;405693;405694;405695;405696 517182;517183;517184;517185;517186 517185 4 TYDRDNSGMIDKNELK Unmodified 1897.884 0.88399055 1623 O75340;A0A024QZ42 PDCD6 Programmed cell death protein 6 yes no 0 0 2 1 1 1 31.177 31.177 3 0.0012815 26815 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.478 65.332 115930000 0 0 0 0 0 0 0 38359000 0 0 41454000 0 36115000 45161 1623 42153 405697;405698;405699 517187;517188;517189;517190 517187 4 TYEAALETIQNMSK Unmodified 1597.7658 0.76577289 1388 O00231 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.72 110.72 2 0.0002018 114176 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.05 99.443 311020000 75267000 54800000 0 0 55691000 0 0 0 53966000 0 0 0 71298000 45162 1388 42154 405700;405701;405702;405703;405704;405705 517191;517192;517193;517194;517195;517196;517197 517195 6 TYEDIKENLESR Unmodified 1495.7155 0.71545188 2238 P25325;B1AH49 MPST 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase;Sulfurtransferase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.782 50.782 2 0.00063749 48834 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.34 93.11 500970000 43768000 48598000 38498000 41735000 46514000 23837000 46072000 0 47472000 0 71021000 36275000 57181000 45163 2238 42155 405706;405707;405708;405709;405710;405711;405712;405713;405714;405715;405716;405717;405718;405719 517198;517199;517200;517201;517202;517203;517204;517205;517206;517207;517208;517209;517210;517211 517206 11 TYEEGLKHEANNPQLK Unmodified 1869.9221 0.92209062 2343 P31948;F5H783;F5GXD8 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 29.989 29.989 2;3 6.1963E-111 23827 QUIQUE_DMIX8_190116_001 225.23 189.58 5223800000 246080000 367590000 424500000 303300000 407800000 250630000 467250000 371270000 480120000 132580000 679630000 507830000 585260000 45164 2343 42156 405720;405721;405722;405723;405724;405725;405726;405727;405728;405729;405730;405731;405732;405733;405734;405735;405736;405737;405738;405739;405740;405741;405742 517212;517213;517214;517215;517216;517217;517218;517219;517220;517221;517222;517223;517224;517225;517226;517227;517228;517229;517230;517231;517232;517233;517234;517235;517236;517237 517237 26 TYEEIASLVAEQPK Unmodified 1576.7985 0.79845323 4634 Q9Y5X1 SNX9 Sorting nexin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 105.52 105.52 2 0.0038805 108621 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.08 23.183 576360000 0 69594000 97733000 72001000 0 58456000 71444000 0 0 29756000 0 85638000 91738000 45165 4634 42157 405743;405744;405745;405746;405747;405748;405749;405750 517238;517239;517240;517241;517242;517243;517244;517245 517244 6 TYEHFNAMGK Unmodified 1196.5284 0.52844316 2109 P16435;H0Y4R2 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 0 1 26.26 26.26 2 0.022639 20085 QUIQUE_C1403_190116_001 69.716 60.322 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45166 2109 42158 405751 517246 517246 1 TYELQNQLAACTR Unmodified 1566.746 0.7460405 4024 Q9BTV5;M0R366;M0R2F6 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 68.921 68.921 2 0.00096931 69288 QUIQUE_C1218_190116_001 97.911 69.185 83475000 49067000 0 0 0 0 34408000 0 0 0 0 0 0 0 45167 4024 42159 405752;405753;405754 517247;517248;517249 517247 3 TYEQVLENLESK Unmodified 1451.7144 0.71438925 3193 Q16762 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 106.49 106.49 2 9.8062E-38 109545 QUIQUE_C1403_190116_001 193.52 163.27 1762700000 184290000 173540000 236820000 141390000 122220000 141830000 143880000 63612000 106060000 61051000 175170000 105000000 107810000 45168 3193 42160 405755;405756;405757;405758;405759;405760;405761;405762;405763;405764;405765;405766;405767 517250;517251;517252;517253;517254;517255;517256;517257;517258;517259;517260;517261;517262;517263;517264 517255 15 TYEQVLENLESKR Unmodified 1607.8155 0.81550028 3193 Q16762 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes yes 0 0 1 2 1 91.669 91.669 3 7.7863E-05 94484 QUIQUE_DMIX5_190116_001 86.803 72.45 31049000 0 0 0 31049000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45169 3193 42161 405768;405769;405770 517265;517266;517267 517267 3 TYETTLEK Unmodified 983.48114 0.48114184 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 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1739.789 0.78901076 3720 Q8WXF7;G3V5T4 ATL1 Atlastin-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 43.777 43.777 2;3 5.0444E-05 40545 QUIQUE_C1368_190116_001 69.456 61.072 856610000 51635000 74269000 99976000 77239000 65256000 53947000 102760000 0 71401000 0 108640000 68291000 83190000 45172 3720 42164 405795;405796;405797;405798;405799;405800;405801;405802;405803;405804;405805;405806;405807 517302;517303;517304;517305;517306;517307;517308;517309;517310;517311;517312;517313;517314;517315;517316 517305 15 TYFPHFDLSHGSAQVK Unmodified 1832.8846 0.8845829 2801;1075;762 P69905;A0A2R8Y7C0;CON__P01966;G3V1N2 HBA1;HBA2 Hemoglobin subunit alpha no no 0 0 0 5 7 8 4 7 5 4 4 4 3 7 7 6 74.737 74.737 2;3;4 4.9137E-66 76195 QUIQUE_C1277_190116_001 200.93 181.97 270470000000 27771000000 32928000000 25290000000 14363000000 26706000000 18677000000 14112000000 10501000000 17853000000 5309800000 26203000000 25848000000 24910000000 + 45173 2801;762;1075 42165 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517340 177 TYFSCTSAHTSTGDGTAMITR Unmodified 2263.9838 0.98378095 2326 P31040;D6RFM5 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 1 1 1 2 1 1 60.86 60.86 2;3 4.2636E-86 59920 QUIQUE_C1277_190116_001 186.77 181.62 1826600000 173520000 222080000 284700000 157940000 106450000 167260000 143080000 46309000 68721000 89651000 152910000 101080000 112890000 45174 2326 42166 405879;405880;405881;405882;405883;405884;405885;405886;405887;405888;405889;405890;405891;405892;405893;405894;405895;405896;405897;405898 517499;517500;517501;517502;517503;517504;517505;517506;517507;517508;517509;517510;517511;517512;517513;517514;517515;517516;517517;517518 517502 20 TYFSCTSAHTSTGDGTAMITR Oxidation (M) 2279.9787 0.97869557 2326 P31040;D6RFM5 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 48.509 48.509 3 0.00016206 44261 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.914 55.816 97920000 0 0 57413000 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 2567.39 0.39002941 572 A9C4B8;Q96N66;M0R1Z5 MBOAT7 Lysophospholipid acyltransferase 7 yes no 0 0 1 1 1 1 162.54 162.54 3 3.2421E-06 169788 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.758 66.398 87083000 0 0 0 0 0 0 0 18004000 20915000 0 48164000 0 0 45202 572 42192 406083;406084;406085 517729;517730;517731 517731 3 TYLEVVR Unmodified 878.48617 0.48616764 1692 O94874 UFL1 E3 UFM1-protein ligase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 48.63 48.63 2 0.057389 45825 QUIQUE_C1277_190116_001 70.912 54.759 94214000 0 31145000 0 0 0 0 0 32887000 30183000 0 0 0 0 45203 1692 42193 406086;406087;406088 517732;517733;517734 517732 3 TYLISSIPLQGAFNYK Unmodified 1813.9614 0.96143623 2043 P12273 PIP Prolactin-inducible protein yes yes 0 0 0 1 137.71 137.71 2 0.0010061 133884 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.653 84.652 12037000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 12037000 0 0 0 45204 2043 42194 406089 517735;517736 517736 2 TYLLDFR Unmodified 926.48617 0.48616764 2967 Q13131 PRKAA1 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1 yes yes 0 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no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 128.13 128.13 2;3 7.1251E-35 134137 QUIQUE_DMIX5_190116_001 170.49 158.57 3430400000 250460000 234710000 268170000 304790000 207090000 228840000 253650000 412210000 270130000 149430000 340100000 242120000 268670000 45217 735;3202 42207 406176;406177;406178;406179;406180;406181;406182;406183;406184;406185;406186;406187;406188;406189;406190 517832;517833;517834;517835;517836;517837;517838;517839;517840;517841;517842;517843;517844;517845;517846;517847;517848;517849;517850;517851 517849 20 TYPGVMHSSCPQEMAAVK Unmodified 1991.8903 0.89033826 1726 O95372;Q5QPQ0 LYPLA2 Acyl-protein thioesterase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 54.202 54.202 3 0.034225 53030 QUIQUE_C1576_190116_001 29.762 25.921 93392000 0 0 0 30568000 0 0 36823000 0 26001000 0 0 0 0 45218 1726 42208 406191;406192;406193 517852;517853;517854 517853 3 TYQLVYFLDK Unmodified 1288.6703 0.67033959 4169 Q9H4A4;A6NKB8 RNPEP Aminopeptidase B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.3 121.3 2 0.0062134 126702 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406223;406224;406225;406226;406227;406228;406229;406230;406231;406232;406233;406234;406235;406236;406237;406238;406239;406240;406241;406242;406243;406244;406245;406246;406247;406248;406249;406250;406251;406252;406253;406254;406255;406256;406257;406258;406259 517889;517890;517891;517892;517893;517894;517895;517896;517897;517898;517899;517900;517901;517902;517903;517904;517905;517906;517907;517908;517909;517910;517911;517912;517913;517914;517915;517916;517917;517918;517919;517920;517921;517922;517923;517924;517925;517926;517927;517928;517929;517930;517931;517932;517933;517934;517935;517936;517937;517938;517939;517940;517941;517942;517943;517944;517945;517946;517947;517948;517949;517950;517951;517952;517953;517954;517955;517956 517892 64 TYSTSFTPMYHAVTK Unmodified 1732.8131 0.81305744 1779 P00390 GSR Glutathione reductase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.553 65.553 2 1.4146E-05 65884 QUIQUE_DMIX3_190116_001 94.191 82.132 232610000 0 54116000 0 0 0 0 60984000 0 0 0 68342000 0 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E9PQD7;P15880;H0YEN5 RPS2 40S ribosomal protein S2 yes no 0 0 0 1 118.48 118.48 2 0.035201 121028 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.297 43.325 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45227 972 42216 406319 518049 518049 1 TYTAYVDLEK Unmodified 1201.5867 0.58666954 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 66.86 66.86 2 0.042361 64861 QUIQUE_C1563_190116_001 50.372 32.337 121250000 0 0 0 0 0 68578000 0 0 0 52676000 0 0 0 45228 2641 42217 406320;406321 518050;518051 518050 1 TYTAYVDLEKDFAAEVVHPGDLK Unmodified 2580.2748 0.27478446 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 1 1 134.11 134.11 3 3.7563E-06 138854 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.917 63.296 246440000 0 0 0 0 0 0 0 78714000 0 0 0 94562000 73161000 45229 2641 42218 406322;406323;406324;406325 518052;518053;518054;518055;518056 518056 5 TYTDAMQTYNGNDER Unmodified 1777.7213 0.7213419 606 B4DDG0;B4E171;P41732 TSPAN7 Tetraspanin;Tetraspanin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 52.679 52.679 2 1.2052E-43 50519 QUIQUE_C1368_190116_001 178.81 172.43 130150000 0 0 36763000 0 0 0 42850000 0 0 0 0 50534000 0 45230 606 42219 406326;406327;406328;406329;406330;406331;406332 518057;518058;518059;518060;518061;518062;518063 518059 7 TYTDELTPIESAVSVFK Unmodified 1898.9513 0.95132506 1639 O75489 NDUFS3 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 149.71 149.71 2;3 1.6545E-22 155487 QUIQUE_C1218_190116_001 178.15 159.96 5303200000 524800000 399650000 540840000 334230000 338010000 362720000 440720000 365060000 399570000 131100000 551380000 474250000 440840000 45231 1639 42220 406333;406334;406335;406336;406337;406338;406339;406340;406341;406342;406343;406344;406345;406346;406347;406348;406349 518064;518065;518066;518067;518068;518069;518070;518071;518072;518073;518074;518075;518076;518077;518078;518079;518080;518081;518082;518083;518084;518085;518086 518065 23 TYTIANQFPLNK Unmodified 1408.7351 0.73506511 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.656 85.656 2 8.6495E-05 87040 QUIQUE_C1403_190116_001 122.13 104.27 1645100000 169940000 169320000 162380000 108160000 142700000 143500000 124770000 0 0 75213000 213400000 170880000 164830000 45232 4284 42221 406350;406351;406352;406353;406354;406355;406356;406357;406358;406359;406360 518087;518088;518089;518090;518091;518092;518093;518094;518095;518096;518097;518098 518091 12 TYTSVGPTYSTAVLNCLK Unmodified 1973.9768 0.9768283 614 B4DK72;Q01064 PDE1B Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.3 110.3 2 2.0911E-38 114819 QUIQUE_C1218_190116_001 162.32 149.76 110260000 27733000 45347000 0 0 0 0 0 37179000 0 0 0 0 0 45233 614 42222 406361;406362;406363;406364;406365;406366 518099;518100;518101;518102;518103;518104 518099 6 TYTVSPR Unmodified 822.42357 0.42356738 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes yes 0 0 0 1 18.682 18.682 2 0.062383 11060 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.312 0 15926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15926000 0 0 0 45234 3452 42223 406367 518105 518105 1 TYVVTGNMGSNDK Oxidation (M) 1400.6242 0.62419403 2874 Q02413 DSG1 Desmoglein-1 yes yes 0 1 0 1 20.645 20.645 2 0.030124 13345 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.35 39.763 9921800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9921800 0 0 0 45235 2874 42224 406368 518106 518106 1 TYWEDNKNSLISYLEQIHR Unmodified 2408.1761 0.17607347 2113 P16870 CPE Carboxypeptidase E yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 131.68 131.68 3;4 4.1301E-06 134717 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.77 87.925 1764600000 0 50547000 53869000 29397000 129330000 42171000 154670000 191090000 190540000 0 287350000 263530000 372110000 45236 2113 42225 406369;406370;406371;406372;406373;406374;406375;406376;406377;406378;406379;406380;406381;406382;406383;406384;406385;406386 518107;518108;518109;518110;518111;518112;518113;518114;518115;518116;518117;518118;518119;518120;518121;518122;518123;518124 518116 12 TYYMSGGLQPVPIVFR Oxidation (M) 1842.9338 0.93384128 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.08 119.08 2 5.855E-08 116702 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.08 111.64 1875000000 130380000 130290000 150560000 103500000 135460000 140000000 131270000 144590000 164150000 89361000 223150000 149110000 183110000 45237 2013 42226 406387;406388;406389;406390;406391;406392;406393;406394;406395;406396;406397;406398;406399;406400 518125;518126;518127;518128;518129;518130;518131;518132;518133;518134;518135;518136;518137;518138;518139;518140 518136 1318 14 TYYMSGGLQPVPIVFR Unmodified 1826.9389 0.93892665 2013 P11177;C9J634;F8WF02 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 1 2 1 1 132.73 132.73 2;3 3.6843E-54 138700 QUIQUE_C1218_190116_001 188.06 163.72 5750500000 638290000 559550000 640690000 457090000 439840000 568590000 611880000 475970000 0 120190000 53740000 515320000 669380000 45238 2013 42226 406401;406402;406403;406404;406405;406406;406407;406408;406409;406410;406411;406412;406413;406414;406415;406416;406417;406418;406419;406420;406421;406422 518141;518142;518143;518144;518145;518146;518147;518148;518149;518150;518151;518152;518153;518154;518155;518156;518157;518158;518159;518160;518161;518162;518163;518164;518165;518166;518167;518168;518169;518170;518171;518172;518173;518174 518143 33 TYYSLITSFSELYLPSST Unmodified 2071.0038 0.003754559 4440 Q9UHY7;D6RA00 ENOPH1 Enolase-phosphatase E1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 173.97 173.97 2 0.0006851 177024 QUIQUE_C1277_190116_001 92.611 78.05 601500000 43927000 60662000 49901000 0 72472000 0 137130000 92214000 0 0 145190000 0 0 45239 4440 42227 406423;406424;406425;406426;406427;406428;406429 518175;518176;518177;518178;518179;518180;518181 518176 6 VAAAESMPLLLECAR Unmodified 1629.8218 0.82184798 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.73 110.73 2 7.6178E-05 114033 QUIQUE_DMIX8_190116_001 116.54 91.685 1698900000 208140000 160980000 139270000 144650000 131040000 143570000 160820000 160070000 121650000 47757000 0 130720000 150200000 45240 1403 42228 406430;406431;406432;406433;406434;406435;406436;406437;406438;406439;406440;406441 518182;518183;518184;518185;518186;518187;518188;518189;518190;518191;518192;518193;518194 518194 10 VAAAESMPLLLECAR Oxidation (M) 1645.8168 0.81676261 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 1 0 1 79.454 79.454 2 0.0054818 75623 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.255 35.402 15280000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15280000 0 0 0 45241 1403 42228 406442 518195 518195 783 1 VAAAFPGDVDR Unmodified 1116.5564 0.55637247 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 50.644 50.644 2 0.00066474 48485 QUIQUE_DMIX7_190116_001 98.048 80.013 704710000 0 0 0 0 0 0 0 0 362710000 0 0 342000000 0 45242 2017 42229 406443;406444 518196;518197;518198 518197 3 VAAALDDGSALGR Unmodified 1214.6255 0.62551466 2157 P19971;C9JGI3;A0A1W2PP80 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.744 50.744 2 2.9804E-06 49258 QUIQUE_C1438_190116_001 128.17 88.543 1102300000 0 0 296400000 163070000 112150000 22522000 50455000 98536000 94362000 0 240570000 24285000 0 45243 2157 42230 406445;406446;406447;406448;406449;406450;406451;406452;406453;406454 518199;518200;518201;518202;518203;518204;518205;518206;518207;518208 518201 5 VAAALENTHLLEVVNQCLSAR Unmodified 2307.2005 0.20051408 4589 Q9Y3D0 FAM96B Mitotic spindle-associated MMXD complex subunit MIP18 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.32 126.32 3 1.2237E-86 129409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.3 151.69 383950000 32276000 32752000 0 41364000 27804000 28813000 38598000 37055000 52114000 0 44362000 0 48812000 45244 4589 42231 406455;406456;406457;406458;406459;406460;406461;406462;406463;406464;406465 518209;518210;518211;518212;518213;518214;518215;518216;518217;518218;518219;518220 518215 11 VAAALPGMESTQDR Unmodified 1444.698 0.69802768 2167 P20340;F5H3K7 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes no 0 0 0 1 1 1 1 56.662 56.662 2 0.00028966 55422 QUIQUE_C1368_190116_001 102.52 76.585 248580000 0 0 248580000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45245 2167 42232 406466;406467;406468;406469 518221;518222;518223;518224 518221 4 VAAALPGMESTQDR Oxidation (M) 1460.6929 0.6929423 2167 P20340;F5H3K7 RAB6A Ras-related protein Rab-6A yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 35.773 35.773 2 0.0012252 30023 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.148 65.795 331810000 0 0 0 0 0 0 0 84815000 78745000 37621000 83521000 47113000 0 45246 2167 42232 406470;406471;406472;406473;406474;406475 518225;518226;518227;518228;518229;518230 518228 1513 6 VAAALTAMDKPLGR Unmodified 1412.781 0.78096945 2157 P19971;C9JGI3 TYMP Thymidine phosphorylase yes no 0 0 1 2 2 2 57.579 57.579 2;3 0.0010396 56207 QUIQUE_C1368_190116_001 74.769 64.291 480290000 0 0 203920000 102780000 0 0 0 0 0 0 173590000 0 0 45247 2157 42233 406476;406477;406478;406479;406480;406481 518231;518232;518233;518234;518235;518236;518237;518238 518232 7 VAAAVDLIIK Unmodified 1011.6328 0.63283187 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 1 84.931 84.931 2 0.012155 87431 QUIQUE_C1576_190116_001 66.27 41.376 203840000 32964000 15407000 13133000 0 35385000 22424000 21010000 21353000 0 0 0 22805000 19363000 45248 2524 42234 406482;406483;406484;406485;406486;406487;406488;406489;406490;406491;406492;406493;406494 518239;518240;518241;518242;518243;518244;518245;518246;518247;518248;518249;518250;518251 518248 13 VAAAVPVIISR Unmodified 1094.6812 0.68117905 711 E9PNC7;E9PQX9;C9JCC6;Q14919 DRAP1 Dr1-associated corepressor yes no 0 0 0 1 1 1 69.55 69.55 2 0.010025 69555 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.338 44.146 23176000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23176000 0 45249 711 42235 406495;406496;406497 518252;518253;518254 518253 3 VAACLPIDDVLR Unmodified 1340.7122 0.71222118 375 A0A1W2PPJ5;Q96SW2;J3QT87 CRBN Protein cereblon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.78 107.78 2 0.00084542 105218 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.898 60.96 396390000 0 43937000 0 63524000 36099000 53717000 0 41842000 34081000 14124000 58778000 0 50286000 45250 375 42236 406498;406499;406500;406501;406502;406503;406504;406505;406506;406507 518255;518256;518257;518258;518259;518260;518261;518262;518263;518264;518265;518266 518263 11 VAAEDWK Unmodified 817.39702 0.39701828 401;287;403 A0A0G2JMB2;A0A286YEY1;P01876;A0A286YEY5;P01877 IGHA1;IGHA2 Ig 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518291;518292;518293;518294;518295;518296;518297;518298;518299;518300;518301;518302;518303;518304;518305;518306 518301 14 VAAGVLCELAQDKEAADAIDAEGASAPLMELLHSR Unmodified 3620.7814 0.78144632 2084 P14923 JUP Junction plakoglobin yes yes 0 0 1 1 155.82 155.82 4 0.011452 159356 QUIQUE_C1403_190116_001 25.324 20.467 128560000 0 0 0 128560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45259 2084 42245 406546 518307 518307 1 VAAGVLCELAQDKEAAEAIEAEGATAPLTELLHSR Unmodified 3632.8356 0.83559038 425 A0A2R8Y804;A0A2R8Y543;A0A2R8YCH5;A0A2R8Y5A3;P35222;B4DGU4;A0A2R8Y7Z0;A0A2R8Y750;A0A2R8Y5C3;A0A2R8Y5Z1;A0A2R8Y6G0 CTNNB1 Catenin beta-1 yes no 0 0 1 1 2 3 2 2 1 2 3 2 2 2 1 155.91 155.91 3;4;5 2.9271E-75 162872 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.26 137.64 9929600000 230700000 900730000 1144100000 541440000 737510000 546750000 722320000 740260000 988610000 0 750830000 890890000 1735500000 45260 425 42246 406547;406548;406549;406550;406551;406552;406553;406554;406555;406556;406557;406558;406559;406560;406561;406562;406563;406564;406565;406566;406567;406568;406569 518308;518309;518310;518311;518312;518313;518314;518315;518316;518317;518318;518319;518320;518321;518322;518323;518324;518325;518326;518327;518328;518329;518330;518331;518332;518333;518334;518335;518336;518337 518332 29 VAAIEALNDGELQK Unmodified 1469.7726 0.77257283 2567 P50502;Q3KNR6;H7C3I1;F6VDH7;Q8IZP2 ST13;ST13P4 Hsc70-interacting protein;Putative protein FAM10A4 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 2 2 75.328 75.328 2 6.7703E-18 76627 QUIQUE_DMIX1_190116_001 183.03 146.7 12694000000 1082500000 966570000 718450000 849660000 1240400000 817800000 924240000 1039200000 988220000 725750000 1117100000 1066500000 1157400000 45261 2567 42247 406570;406571;406572;406573;406574;406575;406576;406577;406578;406579;406580;406581;406582;406583;406584;406585;406586;406587;406588 518338;518339;518340;518341;518342;518343;518344;518345;518346;518347;518348;518349;518350;518351;518352;518353;518354;518355;518356;518357;518358;518359;518360;518361;518362;518363;518364;518365;518366;518367;518368;518369 518357 32 VAAIQQILGK Unmodified 1039.639 0.63897988 3391 Q6PGP7;D6RCE2 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 75.346 75.346 2 0.011467 76110 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.277 44.235 21181000 0 0 0 0 0 0 0 0 21181000 0 0 0 0 45262 3391 42248 406589;406590;406591;406592;406593;406594 518370;518371;518372;518373;518374;518375 518374 6 VAALEASGTLAALYPVAFSSHLVPK Unmodified 2511.3737 0.37371065 3947 Q96T76;H0Y746 MMS19 MMS19 nucleotide excision repair protein homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 145.15 145.15 3 0.0052543 150036 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.36 24.713 254500000 0 0 0 0 0 0 38521000 48856000 56393000 0 56910000 0 53823000 45263 3947 42249 406595;406596;406597;406598;406599 518376;518377;518378;518379;518380;518381;518382 518378 6 VAALFPALR Unmodified 956.58074 0.58073672 3004 Q13501;E7EMC7;E3W990;D6RBF1;C9J6J8 SQSTM1 Sequestosome-1 yes no 0 0 0 1 1 92.237 92.237 2 0.020983 94355 QUIQUE_C1576_190116_001 81.297 42.505 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45264 3004 42250 406600;406601 518383;518384 518383 2 VAALFPALRPGGFQAHYR Unmodified 1970.0639 0.063884666 3004 Q13501;E7EMC7;E3W990;D6RBF1;C9J6J8 SQSTM1 Sequestosome-1 yes no 0 0 1 1 85.994 85.994 4 0.0043288 88018 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.438 36.274 89035000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 89035000 45265 3004 42251 406602 518385 518385 1 VAALLER Unmodified 770.46504 0.46503826 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 31.977 31.977 2 0.060325 27406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.383 17.811 68172000 0 0 0 0 37367000 0 0 30805000 0 0 0 0 0 45266 4161 42252 406603;406604 518386;518387 518387 2 VAALQGIR Unmodified 826.50249 0.5024864 624 B4DWG0;O95199 RCBTB2 RCC1 and BTB domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 32.414 32.414 2 0.033272 27206 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PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 22.766 22.766 2 0.0013112 15949 QUIQUE_DMIX4_190116_001 101.64 68.803 341230000 57710000 0 0 0 0 0 0 0 63408000 70532000 0 69796000 79790000 45279 2538 42264 406685;406686;406687;406688;406689 518482;518483;518484;518485;518486 518484 1987 4 VAASNIVQMKDDHDK Oxidation (M) 1685.8043 0.80428367 2538 P49721 PSMB2 Proteasome subunit beta type-2 yes yes 0 1 1 2 1 1 1 1 16.008 16.008 3;4 4.3992E-05 8044 QUIQUE_DMIX8_190116_001 92.38 73.322 320490000 0 0 0 0 0 0 0 83252000 46806000 0 64866000 62406000 63157000 45280 2538 42265 406690;406691;406692;406693;406694;406695 518487;518488;518489;518490;518491;518492 518492 1987 6 VAASQLTCLGCLELIAK Unmodified 1845.9692 0.9692405 1497 O15294 OGT UDP-N-acetylglucosamine--peptide N-acetylglucosaminyltransferase 110 kDa subunit yes yes 0 0 0 1 1 131.05 131.05 2 1.5495E-12 135158 QUIQUE_C1277_190116_001 124.86 108.32 114110000 0 50863000 0 0 0 63247000 0 0 0 0 0 0 0 45281 1497 42266 406696;406697 518493;518494 518493 2 VAASTGIDLLLLDDFK Unmodified 1689.9189 0.91890272 3644 Q8NE86;S4R468 MCU Calcium uniporter protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 156.5 156.5 2 3.1331E-05 161469 QUIQUE_C1218_190116_001 100.55 83.526 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45282 3644 42267 406698 518495 518495 1 VAASVLNPYVK Unmodified 1159.6601 0.66010926 2499 P48047;H7C0C1 ATP5O ATP synthase subunit O, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 64.572 64.572 2 7.0795E-09 63784 QUIQUE_C1368_190116_001 157.68 107.55 8162600000 759500000 610840000 779760000 493530000 545710000 439730000 537120000 717530000 528390000 329070000 1101900000 649760000 669760000 45283 2499 42268 406699;406700;406701;406702;406703;406704;406705;406706;406707;406708;406709;406710;406711;406712 518496;518497;518498;518499;518500;518501;518502;518503;518504;518505;518506;518507;518508;518509;518510;518511;518512;518513;518514;518515;518516;518517;518518;518519;518520;518521;518522;518523;518524;518525;518526;518527;518528;518529 518504 34 VAAVDADDGENAR Unmodified 1301.5848 0.58477206 4386 Q9P2E7 PCDH10 Protocadherin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.69 20.69 2 0.00051187 14098 QUIQUE_C1218_190116_001 90.05 75.377 251610000 21281000 21407000 26082000 30863000 29158000 21759000 27357000 0 22786000 0 29180000 21739000 0 45284 4386 42269 406713;406714;406715;406716;406717;406718;406719;406720;406721;406722;406723 518530;518531;518532;518533;518534;518535;518536;518537;518538;518539;518540 518530 11 VAAVGGQSYLSSILR Unmodified 1519.8358 0.83584179 3415 Q6VY07;B4DF77;E9PNZ9 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.69 110.69 2 5.4815E-05 115368 QUIQUE_C1218_190116_001 91.961 78.152 768560000 93893000 80357000 0 85543000 67221000 76627000 0 94286000 65217000 29389000 90641000 85386000 0 45285 3415 42270 406724;406725;406726;406727;406728;406729;406730;406731;406732;406733 518541;518542;518543;518544;518545;518546;518547;518548;518549;518550;518551 518541 10 VAAVQPSDNISR Unmodified 1255.6521 0.65206377 351 Q5VTI5;A0A1B0GUN5;Q9Y2H5 PLEKHA6 Pleckstrin homology domain-containing family A member 6 yes no 0 0 0 1 28.947 28.947 2 0.020355 23622 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.056 29.661 41839000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41839000 0 0 45286 351 42271 406734 518552 518552 1 VAAWSAWAADQGDFEKPR Unmodified 2003.949 0.94897407 424 A0A2R8Y4W2;A0A2R8YE63;Q12929 EPS8 Epidermal growth factor receptor kinase substrate 8 yes no 0 0 1 1 1 1 98.342 98.342 3 0.011742 101092 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.261 34.203 99827000 0 0 0 34992000 0 0 0 0 35402000 0 0 0 29433000 45287 424 42272 406735;406736;406737 518553;518554;518555 518555 2 VAAWVEALR Unmodified 1013.5658 0.56581494 4329 Q9NXV6;J3KNE1;D6RGD2 CDKN2AIP CDKN2A-interacting protein yes no 0 0 0 1 1 1 85.788 85.788 2 0.04949 88652 QUIQUE_C1218_190116_001 63.673 39.652 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45288 4329 42273 406738;406739;406740 518556;518557;518558 518556 3 VAAYAAQLEQYQK Unmodified 1481.7514 0.75144346 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.403 68.403 2 6.0073E-65 65756 QUIQUE_DMIX4_190116_001 212.21 185.46 11398000000 925230000 1056400000 935510000 895930000 790670000 697330000 1180200000 784400000 741410000 395000000 1002400000 1024300000 969320000 45289 4128 42274 406741;406742;406743;406744;406745;406746;406747;406748;406749;406750;406751;406752;406753 518559;518560;518561;518562;518563;518564;518565;518566;518567;518568;518569;518570;518571;518572;518573;518574;518575;518576;518577 518572 19 VAAYDKLEK Unmodified 1035.5601 0.56006086 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 19.647 19.647 2 0.051957 12753 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.165 41.747 206950000 0 0 0 124260000 0 0 0 82690000 0 0 0 0 0 45290 2378 42275 406754;406755 518578;518579 518579 2 VACAEEWQESR Unmodified 1363.5827 0.58266357 1651 O75663 TIPRL TIP41-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 37.496 37.496 2 5.6052E-08 33515 QUIQUE_C1576_190116_001 160.59 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ligase;Proline--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 141.86 141.86 3 0.0085829 146480 QUIQUE_DMIX7_190116_001 29.346 26.597 54504000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 54504000 0 45294 1929 42279 406766 518591 518591 1 VADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHK Oxidation (M) 3011.4771 0.47708287 2801;1075 P69905;A0A2R8Y7C0;G3V1N2 HBA1;HBA2 Hemoglobin subunit alpha no no 0 1 0 3 3 4 3 3 3 3 3 3 3 4 5 3 114.84 114.84 2;3;4;5 7.9593E-161 118902 QUIQUE_DMIX5_190116_001 209.45 199.11 105780000000 10192000000 12278000000 8231600000 4444900000 12454000000 9062200000 5028000000 2553000000 5094800000 2284200000 15543000000 9538800000 9077100000 45295 2801;1075 42280 406767;406768;406769;406770;406771;406772;406773;406774;406775;406776;406777;406778;406779;406780;406781;406782;406783;406784;406785;406786;406787;406788;406789;406790;406791;406792;406793;406794;406795;406796;406797;406798;406799;406800;406801;406802;406803;406804;406805;406806;406807;406808;406809 518592;518593;518594;518595;518596;518597;518598;518599;518600;518601;518602;518603;518604;518605;518606;518607;518608;518609;518610;518611;518612;518613;518614;518615;518616;518617;518618;518619;518620;518621;518622;518623;518624;518625;518626;518627;518628;518629;518630;518631;518632;518633;518634;518635;518636;518637;518638;518639;518640;518641;518642;518643;518644;518645;518646;518647;518648;518649;518650;518651;518652;518653;518654;518655;518656;518657;518658;518659;518660;518661;518662;518663;518664;518665;518666;518667;518668;518669;518670;518671;518672;518673;518674;518675;518676;518677;518678;518679 518661 630 88 VADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHK Unmodified 2995.4822 0.48216825 2801;1075 P69905;A0A2R8Y7C0;G3V1N2 HBA1;HBA2 Hemoglobin subunit alpha no no 0 0 0 4 5 5 3 6 5 4 3 3 4 6 4 7 132.79 132.79 2;3;4;5 0 138474 QUIQUE_C1368_190116_001 346.62 326.25 291390000000 25682000000 25556000000 33472000000 12744000000 34614000000 15905000000 17786000000 9795900000 17048000000 2828500000 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518680;518681;518682;518683;518684;518685;518686;518687;518688;518689;518690;518691;518692;518693;518694;518695;518696;518697;518698;518699;518700;518701;518702;518703;518704;518705;518706;518707;518708;518709;518710;518711;518712;518713;518714;518715;518716;518717;518718;518719;518720;518721;518722;518723;518724;518725;518726;518727;518728;518729;518730;518731;518732;518733;518734;518735;518736;518737;518738;518739;518740;518741;518742;518743;518744;518745;518746;518747;518748;518749;518750;518751;518752;518753;518754;518755;518756;518757;518758;518759;518760;518761;518762;518763;518764;518765;518766;518767;518768;518769;518770;518771;518772;518773;518774;518775;518776;518777;518778;518779;518780;518781;518782;518783;518784;518785;518786;518787;518788;518789;518790 518711 108 VADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLR Unmodified 3264.6673 0.66734326 2801;1075 P69905;A0A2R8Y7C0;G3V1N2 HBA1;HBA2 Hemoglobin subunit alpha no no 0 0 1 1 126.75 126.75 5 0.018475 133401 QUIQUE_DMIX5_190116_001 22.984 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518834;518835 518834 2 VADKIQLINNMLDK Unmodified 1613.8811 0.88107742 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 0 1 1 3 1 1 2 2 2 2 2 90.067 90.067 2;3 3.3596E-37 92051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 211.38 176.49 1985100000 0 32474000 65046000 0 38731000 0 35449000 320830000 336760000 0 441600000 316960000 397250000 45306 1790 42289 406909;406910;406911;406912;406913;406914;406915;406916;406917;406918;406919;406920;406921;406922;406923;406924 518836;518837;518838;518839;518840;518841;518842;518843;518844;518845;518846;518847;518848;518849;518850;518851;518852;518853 518845 18 VADKIQLINNMLDK Oxidation (M) 1629.876 0.87599205 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 1 3 2 61.604 61.604 2;3 0.00040474 61293 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.96 87.617 242120000 0 0 0 0 0 0 0 103810000 0 0 138310000 0 0 45307 1790 42289 406925;406926;406927;406928;406929 518854;518855;518856;518857;518858 518856 1008 2 VADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLK Oxidation (M) 3338.7441 0.74406194 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 1 2 2 1 2 166.17 166.17 4 9.776E-36 174673 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.02 99.237 309310000 0 0 0 0 0 0 0 82110000 0 0 108820000 118380000 0 45308 1790 42290 406930;406931;406932;406933;406934 518859;518860;518861;518862;518863 518861 1008;1009;1010 5 VADKIQLINNMLDKVNEMIIGGGMAFTFLK 2 Oxidation (M) 3354.739 0.73897656 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate kinase 1 yes yes 0 2 2 1 163.28 163.28 4 5.573E-25 170794 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.086 85.927 53919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53919000 0 0 45309 1790 42290 406935 518864 518864 1008;1009;1010 1 VADLELEEGLAEEK Unmodified 1543.7617 0.76173337 3182 Q16566 CAMK4 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV yes yes 0 0 0 1 1 1 90.499 90.499 2 0.0017124 92062 QUIQUE_C1403_190116_001 77.674 56.676 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45310 3182 42291 406936;406937;406938 518865;518866;518867 518865 3 VADLTEQYNEQYGAVR Unmodified 1854.8748 0.87480607 4055 Q9BWF3 RBM4 RNA-binding protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 76.236 76.236 2 3.6583E-06 76963 QUIQUE_DMIX8_190116_001 134.13 110.45 227720000 0 47127000 41738000 0 0 0 30400000 0 0 0 69333000 0 39118000 45311 4055 42292 406939;406940;406941;406942;406943;406944 518868;518869;518870;518871;518872;518873 518873 6 VADLYELVQYAGNIIPR Unmodified 1933.0309 0.030912783 3926 Q96QK1 VPS35 Vacuolar protein sorting-associated protein 35 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 168.45 168.45 2;3 1.1012E-17 172882 QUIQUE_DMIX3_190116_001 168.94 148.27 3229900000 144900000 419540000 488630000 137880000 242150000 35706000 197840000 177260000 192030000 69981000 370570000 358700000 394680000 45312 3926 42293 406945;406946;406947;406948;406949;406950;406951;406952;406953;406954;406955;406956;406957;406958;406959;406960;406961;406962;406963;406964;406965;406966;406967;406968;406969 518874;518875;518876;518877;518878;518879;518880;518881;518882;518883;518884;518885;518886;518887;518888;518889;518890;518891;518892;518893;518894;518895;518896;518897;518898;518899 518891 24 VADMALHYANK Oxidation (M) 1247.5969 0.59685707 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 20.999 20.999 2;3 0.0011058 13819 QUIQUE_C1277_190116_001 92.732 71.785 87748000 0 20999000 0 24978000 0 0 0 0 0 0 41771000 0 0 45313 2572 42294 406970;406971;406972;406973;406974;406975 518900;518901;518902;518903;518904;518905 518901 2020 6 VADMALHYANK Unmodified 1231.6019 0.60194245 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 1 1 1 34.156 34.156 2;3 0.00087106 28604 QUIQUE_DMIX8_190116_001 93.701 54.079 338310000 0 0 0 0 0 0 0 136490000 0 0 0 0 201820000 45314 2572 42294 406976;406977;406978 518906;518907;518908;518909;518910 518908 4 VADMATNTR Unmodified 977.46003 0.46002924 67 A0A087WXN9;Q765P7;H0YBL3 MTSS1L;MTSS1 MTSS1-like protein no no 0 0 0 1 15.106 15.106 2 0.052014 7205 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.546 35.584 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45315 67 42295 406979 518911 518911 1 VADNLAIQLAAVTEDKYEILQSVDDAAIVIK Unmodified 3327.7814 0.78135319 2951 Q12906;K7EKJ9;K7ER69;K7EQR9;K7EKY0 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes no 0 0 1 2 2 1 167.05 167.05 3;4 5.202E-20 171524 QUIQUE_DMIX3_190116_001 83.022 78.067 471430000 0 0 0 0 0 0 0 223960000 194830000 0 52645000 0 0 45316 2951 42296 406980;406981;406982;406983;406984 518912;518913;518914;518915;518916 518914 5 VADPAYLPTQQDVLR Unmodified 1684.8784 0.87843489 2556 P50148;B1AM21 GNAQ Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 91.981 91.981 2;3 1.0561E-05 95040 QUIQUE_C1218_190116_001 125.54 110 4589500000 365750000 294520000 468590000 359490000 384920000 337610000 408470000 268820000 410040000 136180000 461480000 312500000 381140000 45317 2556 42297 406985;406986;406987;406988;406989;406990;406991;406992;406993;406994;406995;406996;406997;406998;406999;407000;407001;407002;407003 518917;518918;518919;518920;518921;518922;518923;518924;518925;518926;518927;518928;518929;518930;518931;518932;518933;518934;518935;518936;518937 518917 18 VADPDHDHTGFLTEYVATR Unmodified 2142.997 0.99704647 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 4 3 2 3 3 3 2 4 4 3 3 3 3 77.093 77.093 2;3;4 2.638E-117 78984 QUIQUE_C1218_190116_001 195.78 171.74 26799000000 1910600000 2378300000 1532300000 1977800000 2123200000 1826200000 1233100000 2508300000 2484500000 1044800000 2588000000 2617100000 2575200000 45318 2281 42298 407004;407005;407006;407007;407008;407009;407010;407011;407012;407013;407014;407015;407016;407017;407018;407019;407020;407021;407022;407023;407024;407025;407026;407027;407028;407029;407030;407031;407032;407033;407034;407035;407036;407037;407038;407039;407040;407041;407042;407043 518938;518939;518940;518941;518942;518943;518944;518945;518946;518947;518948;518949;518950;518951;518952;518953;518954;518955;518956;518957;518958;518959;518960;518961;518962;518963;518964;518965;518966;518967;518968;518969;518970;518971;518972;518973;518974;518975;518976;518977;518978;518979;518980;518981;518982;518983;518984;518985;518986;518987;518988;518989;518990;518991;518992;518993;518994 518939 54 VADPTPFHIQAEVTMK Unmodified 1782.8975 0.89745577 2102 P16152;E9PQ63;A8MTM1 CBR1 Carbonyl reductase [NADPH] 1 yes no 0 0 0 3 2 3 2 2 3 3 2 2 2 3 2 2 85.905 85.905 2;3 4.1351E-36 87356 QUIQUE_DMIX1_190116_001 202.13 169.87 11648000000 690440000 854570000 773260000 812930000 1045600000 827700000 971830000 1069300000 1148400000 407180000 1059000000 930280000 1057300000 45319 2102 42299 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407075;407076;407077;407078;407079;407080;407081;407082;407083;407084;407085;407086;407087;407088;407089;407090;407091;407092 519050;519051;519052;519053;519054;519055;519056;519057;519058;519059;519060;519061;519062;519063;519064;519065;519066;519067 519062 1438 17 VADPVVTFCETVVETSSLK Unmodified 2080.0398 0.039822489 3099 Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 145.31 145.31 2;3 0.0050758 151877 QUIQUE_C1438_190116_001 79.875 64.33 687360000 0 0 31198000 0 266080000 31076000 0 144670000 214340000 0 0 0 0 45321 3099 42300 407093;407094;407095;407096;407097 519068;519069;519070;519071;519072 519069 4 VADPWGGSYMMECLTNDVYDAALK Unmodified 2705.1812 0.18116013 2191 P22033 MUT Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 169.23 169.23 2;3 7.0474E-07 173280 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.413 64.983 159700000 0 0 48073000 0 0 0 0 0 0 0 42247000 53254000 16123000 45322 2191 42301 407098;407099;407100;407101;407102 519073;519074;519075;519076;519077 519076 5 VADSSPFALELLISDDCFVLDNGLCGK Unmodified 2954.4042 0.40416043 2421 P40121;H7C0X8 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 170.98 170.98 3 7.5134E-15 178344 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.799 71.425 92202000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 92202000 0 0 45323 2421 42302 407103 519078 519078 1 VADWTGATYQDKR Unmodified 1509.7212 0.72120596 1500 O15371;B0QYA5;B0QYA8;B0QYA6 EIF3D Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D yes no 0 0 1 1 1 1 37.842 37.842 2;3 0.0069936 33941 QUIQUE_DMIX3_190116_001 48.532 39.02 152420000 0 0 0 0 0 0 0 0 152420000 0 0 0 0 45324 1500 42303 407104;407105;407106 519079;519080;519081 519080 3 VADYCENNYIQATDK Unmodified 1802.7781 0.77812849 157 B6VEX4;A0A0A0MRT6;Q8IZP0 ABI1 Abl interactor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.71 60.71 2 4.6525E-25 60222 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.4 149.19 711800000 31195000 64694000 58708000 64332000 55198000 68225000 60337000 39581000 51557000 53518000 43535000 49878000 71038000 45325 157 42304 407107;407108;407109;407110;407111;407112;407113;407114;407115;407116;407117;407118;407119 519082;519083;519084;519085;519086;519087;519088;519089;519090;519091;519092;519093;519094 519092 13 VADYCENNYIQATDKR Unmodified 1958.8792 0.87923952 157 B6VEX4;A0A0A0MRT6;Q8IZP0 ABI1 Abl interactor 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 48.464 48.464 3 0.0068852 46071 QUIQUE_C1277_190116_001 36.136 34.302 219050000 0 53259000 0 46753000 51438000 0 0 0 0 0 0 67605000 0 45326 157 42305 407120;407121;407122;407123 519095;519096;519097;519098 519095 4 VADYCENNYIQSADK Unmodified 1788.7625 0.76247843 226 E7EW77;E7EP65;A0A0C4DG21;F8WAL6;Q9NYB9;E9PEZ7;F8WBL5;F8WEB9 ABI2 Abl interactor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.576 59.576 2 4.0881E-36 58058 QUIQUE_C1368_190116_001 176.05 138.08 824430000 61549000 73465000 76680000 55924000 60703000 43701000 83393000 52540000 51575000 29098000 85257000 67667000 82880000 45327 226 42306 407124;407125;407126;407127;407128;407129;407130;407131;407132;407133;407134;407135;407136 519099;519100;519101;519102;519103;519104;519105;519106;519107;519108;519109;519110;519111 519101 13 VADYIPQLAK Unmodified 1116.6179 0.61791009 1700 O94925;H7BZD1 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.205 75.205 2 0.0023073 74925 QUIQUE_DMIX8_190116_001 90.657 65.734 2068800000 214440000 151790000 154970000 145830000 120980000 171650000 217440000 130920000 131710000 89203000 177680000 171490000 190710000 45328 1700 42307 407137;407138;407139;407140;407141;407142;407143;407144;407145;407146;407147;407148;407149 519112;519113;519114;519115;519116;519117;519118;519119;519120;519121;519122;519123;519124;519125;519126;519127;519128;519129 519128 18 VAEAFAR Unmodified 762.40244 0.40243801 2184;3579 Q8N335;P21695 GPD1L;GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic no no 0 0 0 1 1 20.668 20.668 2 0.035909 13412 QUIQUE_C1277_190116_001 86.512 49.925 144640000 0 81683000 0 0 0 62959000 0 0 0 0 0 0 0 45329 3579;2184 42308 407150;407151 519130;519131 519130 2 VAEAHENIIHGSGATGK Unmodified 1689.8434 0.84344636 2917 Q08257 CRYZ Quinone oxidoreductase yes yes 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 15.441 15.441 2;3;4 5.5821E-140 7726 QUIQUE_DMIX3_190116_001 252.43 226.31 11590000000 839330000 777370000 1356400000 1175900000 1063200000 507090000 689650000 904230000 920590000 511620000 962150000 968710000 913240000 45330 2917 42309 407152;407153;407154;407155;407156;407157;407158;407159;407160;407161;407162;407163;407164;407165;407166;407167;407168;407169;407170;407171;407172;407173;407174;407175;407176;407177;407178;407179;407180;407181;407182;407183;407184;407185;407186;407187;407188;407189;407190 519132;519133;519134;519135;519136;519137;519138;519139;519140;519141;519142;519143;519144;519145;519146;519147;519148;519149;519150;519151;519152;519153;519154;519155;519156;519157;519158;519159;519160;519161;519162;519163;519164;519165;519166;519167;519168;519169;519170;519171 519158 32 VAEAHVPNFIFDEFR Unmodified 1789.8788 0.87876924 2942 Q12768;E7EQI7 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 121.9 121.9 3 0.0043819 125459 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.613 28.332 113840000 0 0 22934000 0 0 0 19591000 17871000 0 0 34798000 18648000 0 45331 2942 42310 407191;407192;407193;407194;407195;407196;407197 519172;519173;519174;519175;519176;519177;519178 519175 3 VAEAVATFLIR Unmodified 1188.6867 0.68665836 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 105.09 105.09 2 1.1812E-06 108112 QUIQUE_C1277_190116_001 148.94 114.14 773120000 99154000 88435000 77636000 68863000 64298000 103080000 83597000 0 35614000 41202000 0 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407227;407228;407229;407230;407231;407232;407233;407234;407235;407236;407237;407238 519216;519217;519218;519219;519220;519221;519222;519223;519224;519225;519226;519227;519228;519229;519230;519231 519226 16 VAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPR 2 Oxidation (M) 3297.4839 0.48394367 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 2 0 1 1 1 1 1 1 1 141.68 141.68 3 2.0577E-31 146433 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.9 106.87 392250000 0 39984000 0 58516000 37804000 39330000 0 0 98534000 24714000 0 0 93368000 45337 267;275;3025 42315 407239;407240;407241;407242;407243;407244;407245 519232;519233;519234;519235;519236;519237;519238 519236 182;183 7 VAEDLESEGLMAEEVQAVQQQEVYGMMPR Oxidation (M) 3281.489 0.48902905 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 1 1 1 2 2 1 149.69 149.69 3 4.5976E-25 153667 QUIQUE_C1277_190116_001 100.7 89.49 435550000 0 28230000 0 68060000 0 20759000 0 147080000 121860000 0 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519261 519261 1 VAEELALEQAK Unmodified 1199.6398 0.63976774 741 C9JRZ6;Q9NX63;F8WAR4;A0A286YEX5 CHCHD3 MICOS complex subunit MIC19 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.25 51.25 2 2.4619E-06 49613 QUIQUE_C1218_190116_001 155.42 114.39 1302900000 403580000 357020000 0 306850000 0 0 0 130080000 0 105410000 0 0 0 45341 741 42318 407269;407270;407271;407272;407273;407274 519262;519263;519264;519265;519266;519267 519262 5 VAEELALEQAKK Unmodified 1327.7347 0.73473076 741 C9JRZ6;Q9NX63;F8WAR4;A0A286YEX5 CHCHD3 MICOS complex subunit MIC19 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 32.684 32.684 2 0.0010753 28570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.317 66.659 237460000 0 0 0 0 0 0 0 47431000 33712000 0 69305000 48286000 38726000 45342 741 42319 407275;407276;407277;407278;407279 519268;519269;519270;519271;519272 519268 5 VAEELVAAAR Unmodified 1027.5662 0.56620887 2535 P49593;B5MCT7 PPM1F Protein phosphatase 1F yes no 0 0 0 1 1 1 1 45.366 45.366 2 0.0030195 40947 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.67 33.116 280550000 0 0 0 83075000 96545000 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519279;519280;519281;519282;519283;519284;519285;519286;519287;519288;519289;519290;519291;519292;519293;519294;519295;519296;519297;519298;519299;519300;519301;519302;519303;519304;519305;519306;519307;519308;519309;519310;519311;519312;519313;519314;519315;519316;519317 519296 32 VAEGQTLDLK Unmodified 1072.5764 0.57643921 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 1 37.185 37.185 2 0.01651 33434 QUIQUE_DMIX3_190116_001 62.558 25.716 189010000 0 0 60648000 0 49731000 0 0 0 34931000 0 0 43696000 0 45346 2834 42323 407317;407318;407319;407320 519318;519319;519320;519321 519320 4 VAEGTQVLELPFK Unmodified 1429.7817 0.78168095 1798 P01008 SERPINC1 Antithrombin-III yes yes 0 0 0 1 1 1 1 110.44 110.44 2 0.00045895 115322 QUIQUE_C1218_190116_001 118.23 97.363 202010000 60910000 59947000 45771000 0 0 35380000 0 0 0 0 0 0 0 45347 1798 42324 407321;407322;407323;407324 519322;519323;519324;519325 519322 4 VAEGTQVLELPFKGDDITMVLILPKPEK Unmodified 3079.6879 0.6879105 1798 P01008 SERPINC1 Antithrombin-III yes yes 0 0 2 1 147.62 147.62 3 0.053851 155097 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.742 17.739 35210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35210000 0 0 45348 1798 42325 407325 519326 519326 1 VAEIPFNSTNK Unmodified 1218.6245 0.62445203 590;1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733;E9PRA5;P54707;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A3;ATP1A4;ATP12A;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Potassium-transporting ATPase alpha chain 2;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.055 50.055 2 0.00051497 47745 QUIQUE_C1403_190116_001 112.75 79.908 8605800000 651080000 583530000 1106400000 732950000 693250000 504290000 724890000 715240000 776010000 0 897300000 487850000 732990000 45349 1371;590 42326 407326;407327;407328;407329;407330;407331;407332;407333;407334;407335;407336;407337 519327;519328;519329;519330;519331;519332;519333;519334;519335;519336;519337;519338 519330 10 VAEKEGWPLDIR Unmodified 1411.746 0.74596415 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 73.105 73.105 3 0.0058205 73382 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.14 48.706 1077600000 0 0 0 0 0 0 0 259850000 191810000 0 266440000 189790000 169760000 45350 3975 42327 407338;407339;407340;407341;407342 519339;519340;519341;519342;519343;519344;519345 519345 7 VAEKLDEIYVAGLVAHSDLDER Unmodified 2441.2438 0.24381868 1581 O60506;F6UXX1 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 1 1 1 1 113.4 113.4 4 0.0011946 117119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.863 35.647 172970000 0 0 0 0 0 0 0 51079000 64052000 0 0 0 57841000 45351 1581 42328 407343;407344;407345 519346;519347;519348 519347 3 VAEKLEALSVK Unmodified 1185.6969 0.69688869 2464 P43487;F6WQW2;C9JXG8 RANBP1 Ran-specific GTPase-activating protein yes no 0 0 1 1 39.572 39.572 2 0.031257 36116 QUIQUE_DMIX3_190116_001 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519360;519361;519362;519363;519364;519365;519366 519362 7 VAELEPLKEQLR Unmodified 1423.8035 0.80347903 4376 Q9P1Z2 CALCOCO1 Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 58.705 58.705 3 0.04985 57456 QUIQUE_DMIX7_190116_001 36.107 24.164 48461000 0 0 0 0 0 0 28237000 0 0 0 0 20224000 0 45355 4376 42332 407364;407365 519367;519368 519368 2 VAELFEK Unmodified 834.44872 0.4487195 4636 Q9Y5X3;Q5QPE5;A0A087WUY5 SNX5 Sorting nexin-5 yes no 0 0 0 1 1 41.232 41.232 2 0.051507 37792 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.975 29.444 114100000 0 0 0 0 0 51331000 0 0 62768000 0 0 0 0 45356 4636 42333 407366;407367 519369;519370 519370 2 VAELLGESDGRR Unmodified 1300.6735 0.67352749 4286 Q9NSK0 KLC4 Kinesin light chain 4 yes yes 0 0 1 1 28.857 28.857 3 0.063932 23337 QUIQUE_DMIX8_190116_001 27.914 8.671 20140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20140000 45357 4286 42334 407368 519371 519371 1 VAELLLAK Unmodified 855.54295 0.54295423 3318 Q5T6V5 C9orf64 UPF0553 protein C9orf64 yes yes 0 0 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407376 519379 519379 1 VAEQLEVGMVGVNEGLISSVECPFGGVK Oxidation (M) 2919.4358 0.43579491 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 147.75 147.75 3 6.1766E-19 153616 QUIQUE_C1218_190116_001 89.723 77.41 544720000 97911000 98557000 128700000 0 101270000 118270000 0 0 0 0 0 0 0 45362 2588 42339 407377;407378;407379;407380;407381 519380;519381;519382;519383;519384;519385;519386;519387 519381 2039 8 VAEQLEVGMVGVNEGLISSVECPFGGVK Unmodified 2903.4409 0.44088029 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 158.54 158.54 2;3 9.5669E-37 162714 QUIQUE_C1277_190116_001 172.66 162.56 1850200000 250930000 172500000 158300000 100140000 0 191430000 143560000 186970000 155960000 63359000 139200000 146550000 141260000 45363 2588 42339 407382;407383;407384;407385;407386;407387;407388;407389;407390;407391;407392;407393;407394;407395;407396 519388;519389;519390;519391;519392;519393;519394;519395;519396;519397;519398;519399;519400;519401;519402;519403;519404;519405;519406;519407;519408;519409;519410;519411;519412 519391 25 VAEQTFIKDDYLETISSPK Unmodified 2183.0998 0.099780209 3996 Q9BQI5 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 102.75 102.75 3 0.00025958 104765 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.747 56.71 138280000 42964000 0 0 0 0 0 0 41703000 0 0 0 0 53609000 45364 3996 42340 407397;407398;407399 519413;519414;519415 519414 3 VAEQTPLSALYLASLIK Unmodified 1816.0346 0.034601177 2325 P30837 ALDH1B1 Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.64 154.64 2 2.1376E-12 158989 QUIQUE_C1277_190116_001 133.47 124.72 560540000 54520000 82959000 51467000 47985000 53382000 72922000 0 54773000 65884000 0 0 0 76647000 45365 2325 42341 407400;407401;407402;407403;407404;407405;407406;407407;407408 519416;519417;519418;519419;519420;519421;519422;519423;519424;519425 519418 8 VAEQTPLTALYVANLIK Unmodified 1843.0455 0.045500215 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 146.32 146.32 2;3 5.0614E-31 151691 QUIQUE_C1368_190116_001 198.74 186.17 27709000000 1890300000 2118400000 2397300000 2459000000 1996400000 2073400000 1692800000 2324900000 2490600000 599840000 2542600000 2100200000 3023100000 45366 1875 42342 407409;407410;407411;407412;407413;407414;407415;407416;407417;407418;407419;407420;407421;407422;407423;407424;407425;407426;407427;407428;407429;407430;407431;407432;407433;407434 519426;519427;519428;519429;519430;519431;519432;519433;519434;519435;519436;519437;519438;519439;519440;519441;519442;519443;519444;519445;519446;519447;519448;519449;519450;519451;519452;519453;519454;519455;519456;519457 519431 32 VAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGK Unmodified 3875.9463 0.94626304 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 0 1 2 1 2 1 2 1 2 2 2 1 2 2 1 163.78 163.78 3;4 1.0156E-144 166304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.28 177.28 12298000000 1162600000 1136100000 1473500000 295710000 662770000 361180000 1277400000 1280900000 797590000 52965000 1972300000 1084600000 740400000 45367 907 42343 407435;407436;407437;407438;407439;407440;407441;407442;407443;407444;407445;407446;407447;407448;407449;407450;407451;407452;407453;407454;407455 519458;519459;519460;519461;519462;519463;519464;519465;519466;519467;519468;519469;519470;519471;519472;519473;519474;519475;519476;519477;519478;519479;519480;519481 519471 23 VAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQHLNTLEGK Oxidation (M) 3891.9412 0.94117766 907 E9PDG8;O60641;E5RGY9 SNAP91 Clathrin coat assembly protein AP180 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 150.61 150.61 4 3.9861E-42 152642 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.507 90.337 471160000 72169000 120220000 53482000 0 0 0 61593000 163700000 0 0 0 0 0 45368 907 42343 407456;407457;407458;407459;407460 519482;519483;519484;519485;519486 519486 552 3 VAEQVGIDR Unmodified 985.51926 0.51925868 3002 Q13492 PICALM Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein yes yes 0 0 0 1 1 25.367 25.367 2 0.0066567 19469 QUIQUE_C1403_190116_001 83.783 28.252 209920000 0 0 85420000 124500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45369 3002 42344 407461;407462 519487;519488 519488 2 VAEQVLNAVNK Unmodified 1183.6561 0.65608651 4211 Q9HB40 SCPEP1 Retinoid-inducible serine carboxypeptidase yes yes 0 0 0 1 49.899 49.899 2 0.061524 46962 QUIQUE_C1403_190116_001 57.859 42.244 237610000 0 0 0 237610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45370 4211 42345 407463 519489 519489 0 VAESCKPGAGLLLVETLLDEEKR Unmodified 2526.3363 0.33633886 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 2 1 1 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 134.24 134.24 3;4 6.4983E-30 139180 QUIQUE_C1368_190116_001 113.24 102.55 1890400000 61456000 213930000 378480000 257560000 203700000 47559000 96565000 126040000 234330000 100860000 0 90273000 79611000 45371 1741 42346 407464;407465;407466;407467;407468;407469;407470;407471;407472;407473;407474;407475;407476;407477;407478;407479;407480 519490;519491;519492;519493;519494;519495;519496;519497;519498;519499;519500;519501;519502;519503;519504;519505;519506;519507;519508 519493 19 VAETANEEEVK Unmodified 1217.5776 0.57756142 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 16.463 16.463 2 0.0052982 8953 QUIQUE_C1438_190116_001 69.276 52.438 17771000 0 0 0 0 17771000 0 0 0 0 0 0 0 0 45372 2718 42347 407481;407482 519509;519510 519509 2 VAETANEEEVKK Unmodified 1345.6725 0.67252444 2718 P61221;D6R9I9 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 1 1 1 10.586 10.586 3 7.1665E-05 2958 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.54 103.14 81015000 0 0 0 0 0 0 0 37294000 0 43722000 0 0 0 45373 2718 42348 407483;407484 519511;519512 519511 1 VAETAVQLFISGDK Unmodified 1476.7824 0.78240924 2755 P62495;B7Z7P8;I3L492 ETF1 Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 yes no 0 0 0 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45376 446 42351 407499;407500;407501 519528;519529;519530 519528 2 VAEVLFDAADANAIEEVNLAYENVK Unmodified 2706.3388 0.33884128 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 160.06 160.06 2;3 4.2032E-05 165248 QUIQUE_C1368_190116_001 48.51 42.415 301740000 0 0 57548000 36348000 0 0 0 78613000 129230000 0 0 0 0 45377 3053 42352 407502;407503;407504;407505;407506 519531;519532;519533;519534;519535;519536 519531 6 VAEVLNDPENMEK Unmodified 1486.6974 0.69735898 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;H0YJU9;H0YJL0;H0YG16;H0YJT3;H0YGB8 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.041 59.041 2 5.9829E-05 57457 QUIQUE_C1368_190116_001 119.76 93.825 800600000 86792000 69704000 68809000 82997000 0 58472000 50622000 66504000 62381000 30602000 76903000 53799000 93017000 45378 1050 42353 407507;407508;407509;407510;407511;407512;407513;407514;407515;407516;407517;407518 519537;519538;519539;519540;519541;519542;519543;519544;519545;519546;519547;519548 519539 12 VAEVLNDPENMEK Oxidation (M) 1502.6923 0.6922736 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;H0YJU9;H0YJL0;H0YG16;H0YJT3;H0YGB8 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 40.078 40.078 2 0.001063 35278 QUIQUE_DMIX4_190116_001 83.397 64.082 150540000 0 0 0 25931000 0 0 0 0 0 29932000 0 36749000 57925000 45379 1050 42353 407519;407520;407521;407522;407523 519549;519550;519551;519552;519553 519550 624 4 VAEVLQVPPMR Unmodified 1237.6853 0.68527815 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 3 2 1 1 1 1 1 81.028 81.028 2 0.005558 82760 QUIQUE_C1403_190116_001 78.149 52.412 208720000 49836000 0 47528000 0 0 21162000 44757000 0 0 0 29949000 0 15484000 45380 856 42354 407524;407525;407526;407527;407528;407529;407530;407531;407532;407533 519554;519555;519556;519557;519558;519559;519560;519561;519562;519563;519564 519560 10 VAFDELVR Unmodified 947.50763 0.50763136 1583 O60547 GMDS GDP-mannose 4,6 dehydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.268 78.268 2 0.0028106 80123 QUIQUE_C1438_190116_001 134.66 91.89 535560000 42168000 43565000 40817000 41254000 37662000 35557000 43828000 39678000 43568000 21501000 52114000 43458000 50389000 45381 1583 42355 407534;407535;407536;407537;407538;407539;407540;407541;407542;407543;407544;407545;407546 519565;519566;519567;519568;519569;519570;519571;519572;519573;519574;519575;519576;519577;519578 519570 14 VAFDFAAR Unmodified 895.4552 0.45520186 4477 Q9UKU7;E9PLS3 ACAD8 Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.035 70.035 2 0.01729 71627 QUIQUE_C1218_190116_001 81.784 49.67 553470000 54232000 43956000 61298000 40594000 60394000 0 40919000 0 85152000 22129000 73857000 0 70941000 45382 4477 42356 407547;407548;407549;407550;407551;407552;407553;407554;407555;407556 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Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 50.424 50.424 2 3.8388E-07 48065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 156.35 107.25 6761200000 943200000 880730000 1331300000 787610000 0 0 643160000 319510000 463530000 436460000 494100000 461610000 0 45385 1875 42359 407570;407571;407572;407573;407574;407575;407576;407577;407578;407579;407580;407581;407582;407583 519604;519605;519606;519607;519608;519609;519610;519611;519612;519613;519614;519615;519616;519617;519618;519619;519620;519621;519622 519615 19 VAFTGSTEVGK Unmodified 1094.5608 0.56078914 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 35.452 35.452 2 0.00020548 30517 QUIQUE_C1368_190116_001 123.86 20.314 7770000000 460440000 460330000 684470000 847050000 755360000 760120000 638120000 454690000 520900000 291200000 727500000 604450000 565380000 45386 1776 42360 407584;407585;407586;407587;407588;407589;407590;407591;407592;407593;407594;407595;407596;407597 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520235 142 VAHEPVAPPEDK Unmodified 1287.6459 0.64591575 1742 O95674 CDS2 Phosphatidate cytidylyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 18.123 18.123 3 0.0027976 10543 QUIQUE_C1218_190116_001 48.568 28.444 40815000 40815000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45415 1742 42386 408096 520294 520294 1 VAHEPVAPPEDKESESEAK Unmodified 2047.9698 0.96982867 1742 O95674 CDS2 Phosphatidate cytidylyltransferase 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 18.742 18.742 3;4 1.1559E-16 11368 QUIQUE_C1403_190116_001 113.53 98.836 353450000 0 0 73022000 57529000 0 24157000 0 41150000 37617000 0 26414000 0 93565000 45416 1742 42387 408097;408098;408099;408100;408101;408102;408103;408104 520295;520296;520297;520298;520299;520300;520301;520302 520296 8 VAHGTNSHEMAIVFNQEGLNAIQPPCVVQNFINHNAVLYK Unmodified 4473.211 0.21104255 3013 Q13572;G3V5A3;G3V3C0;G3V4M9 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 143.77 143.77 5 9.7432E-05 148322 QUIQUE_C1277_190116_001 42.385 41.122 47346000 0 47346000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45417 3013 42388 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Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 1 0 1 2 2 1 2 1 2 2 1 2 2 1 103.78 103.78 2;3 3.9847E-38 106934 QUIQUE_DMIX3_190116_001 158.81 145.41 3007000000 147940000 241720000 243270000 183510000 231790000 169550000 173900000 331010000 47670000 0 473820000 283720000 479150000 45419 2851 42390 408132;408133;408134;408135;408136;408137;408138;408139;408140;408141;408142;408143;408144;408145;408146;408147;408148;408149;408150 520352;520353;520354;520355;520356;520357;520358;520359;520360;520361;520362;520363;520364;520365;520366;520367;520368;520369;520370;520371;520372 520366 2320 20 VAHMEFCYQELCQLAAER Unmodified 2253.9969 0.99692859 2851 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 118.68 118.68 2;3 1.9286E-45 124049 QUIQUE_C1218_190116_001 204.37 178.25 4396500000 384430000 411130000 407080000 470590000 505540000 309790000 587580000 115650000 193360000 72559000 354890000 270750000 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(M) 1314.635 0.63503349 2515 P48681 NES Nestin yes yes 0 1 0 1 1 1 12.303 12.303 3 0.0023342 4887 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.408 36.971 39486000 0 0 0 0 0 0 0 8348300 0 0 0 28786000 2352500 45422 2515 42391 408191;408192;408193 520426;520427;520428;520429 520427 1941 4 VAHNILSGASWVSWGLVK Unmodified 1923.0367 0.036666863 3565 Q8N0X7 SPG20 Spartin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 131.35 131.35 3 2.5061E-06 134331 QUIQUE_DMIX1_190116_001 77.506 70.187 254360000 0 0 0 0 0 18206000 34897000 55038000 41254000 20170000 0 35477000 49314000 45423 3565 42392 408194;408195;408196;408197;408198;408199;408200;408201 520430;520431;520432;520433;520434;520435;520436;520437 520432 7 VAHPIRPKPPSATSIPAILK Unmodified 2092.2521 0.25207937 4502 Q9UMS4;F5GY56 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes no 0 0 2 1 56.613 56.613 4 0.0085109 54455 QUIQUE_DMIX1_190116_001 41.513 38.984 39259000 0 0 0 0 0 0 0 39259000 0 0 0 0 0 45424 4502 42393 408202 520438 520438 1 VAHPQDPHHPSEKPVIHCHK Unmodified 2349.1549 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520444;520445;520446;520447;520448;520449;520450;520451;520452;520453;520454;520455;520456;520457;520458;520459;520460;520461;520462;520463;520464;520465;520466;520467;520468;520469;520470;520471;520472;520473;520474;520475;520476;520477;520478;520479 520450 34 VAHSFNCTPIEGMLSHQLK Unmodified 2168.0507 0.050678722 4530 Q9UQ80;F8VR77;F8W0A3 PA2G4 Proliferation-associated protein 2G4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 83.754 83.754 4 0.017115 81503 QUIQUE_DMIX4_190116_001 32.981 26.859 315930000 0 108830000 0 103490000 0 82923000 0 0 0 20681000 0 0 0 45427 4530 42396 408240;408241;408242;408243 520480;520481;520482;520483;520484 520484 4 VAIAALEVLEEENLAENADK Unmodified 2140.0899 0.089943804 1856 P04181 OAT Ornithine aminotransferase, mitochondrial;Ornithine aminotransferase, hepatic form;Ornithine aminotransferase, renal form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 141.59 141.59 2;3 3.1145E-101 145902 QUIQUE_C1277_190116_001 257.91 230.81 700560000 77762000 86818000 60434000 0 113120000 87946000 0 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0.74141522 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 2 3 2 2 2 3 2 1 2 2 2 1 2 2 75.245 75.245 3;4;5 6.8742E-257 76866 QUIQUE_C1218_190116_001 242.19 235.77 7436400000 883780000 686130000 765120000 740760000 939700000 528530000 523280000 718080000 392180000 166610000 226270000 442190000 423730000 45446 2009 42413 408423;408424;408425;408426;408427;408428;408429;408430;408431;408432;408433;408434;408435;408436;408437;408438;408439;408440;408441;408442;408443;408444;408445;408446;408447;408448 520712;520713;520714;520715;520716;520717;520718;520719;520720;520721;520722;520723;520724;520725;520726;520727;520728;520729;520730;520731;520732;520733;520734;520735;520736;520737;520738;520739;520740;520741;520742;520743;520744;520745;520746;520747;520748;520749 520714 36 VAKPDLVHQEAVDKEESYESSGEHESLTMESLK Oxidation (M) 3716.7363 0.73632984 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 2 1 63.767 63.767 4 5.3183E-10 62150 QUIQUE_C1563_190116_001 62.833 59.022 81408000 0 0 0 0 0 81408000 0 0 0 0 0 0 0 45447 2009 42413 408449 520750 520750 1306 1 VAKPVVEMDGDEMTR Oxidation (M) 1691.7859 0.78585641 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 1 1 3 2 3 1 1 1 3 1 3 2 3 29.841 29.841 2;3 2.4618E-06 23135 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.24 99.099 2117200000 326900000 77767000 280880000 30699000 0 39014000 0 153550000 233550000 54910000 341870000 242690000 335350000 45448 2518 42414 408450;408451;408452;408453;408454;408455;408456;408457;408458;408459;408460;408461;408462;408463;408464;408465;408466;408467;408468;408469;408470;408471;408472 520751;520752;520753;520754;520755;520756;520757;520758;520759;520760;520761;520762;520763;520764;520765;520766;520767;520768;520769;520770;520771;520772;520773;520774;520775 520774 1943;1944 25 VAKPVVEMDGDEMTR Unmodified 1675.7909 0.79094179 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 2 2 47.522 47.522 2;3 9.9475E-05 45037 QUIQUE_C1218_190116_001 110.38 100.95 6776900000 914080000 222510000 1107800000 935530000 0 184530000 578580000 654160000 208240000 0 240000000 987450000 744020000 45449 2518 42414 408473;408474;408475;408476;408477;408478;408479;408480;408481;408482;408483;408484;408485;408486;408487;408488;408489 520776;520777;520778;520779;520780;520781;520782;520783;520784;520785;520786;520787;520788;520789;520790;520791;520792 520776 12 VAKPVVEMDGDEMTR 2 Oxidation (M) 1707.7808 0.78077103 2518 P48735;H0YL11 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes no 0 2 1 1 1 19.156 19.156 2;3 0.0014207 11831 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.202 80.972 136880000 0 0 0 93018000 0 0 0 0 0 0 43863000 0 0 45450 2518 42414 408490;408491 520793;520794 520794 1943;1944 1 VALAGLLGFGLGK Unmodified 1214.7387 0.73869393 3262 Q56VL3 OCIAD2 OCIA domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.03 144.03 2 5.0049E-05 148273 QUIQUE_C1403_190116_001 120.12 94.382 487170000 53065000 27026000 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408506;408507;408508;408509;408510;408511;408512;408513;408514;408515;408516;408517;408518 520814;520815;520816;520817;520818;520819;520820;520821;520822;520823;520824;520825;520826;520827;520828 520818 15 VALEGLRPTIPPGISPHVCK Unmodified 2140.1827 0.18267917 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 85.057 85.057 4 0.016186 87916 QUIQUE_C1218_190116_001 33.248 29.062 783300000 43745000 71872000 70986000 81242000 92714000 104060000 67943000 53320000 60405000 16367000 61559000 0 59095000 45454 194 42418 408519;408520;408521;408522;408523;408524;408525;408526;408527;408528;408529;408530;408531 520829;520830;520831;520832;520833;520834;520835;520836;520837;520838;520839;520840;520841;520842;520843 520830 10 VALEIFQHSK Unmodified 1170.6397 0.63970816 724 C9JG87;Q9NYK5 MRPL39 39S ribosomal protein L39, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 54.158 54.158 2;3 0.00026362 52376 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.263 54.751 146510000 0 30232000 0 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Q9Y2Z9;A0A0D9SFJ1 COQ6 Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 26.07 26.07 2 0.028562 20663 QUIQUE_C1218_190116_001 54.982 38.055 71927000 25405000 0 21712000 0 0 0 0 0 24810000 0 0 0 0 45458 4574 42422 408548;408549;408550 520861;520862;520863 520861 3 VALIGSPVDLTYTYDHLGDSPK Unmodified 2360.19 0.1899922 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 129.77 129.77 2;3 7.7072E-55 126769 QUIQUE_DMIX4_190116_001 162.33 157.33 12611000000 1470200000 1060700000 1332600000 863250000 829200000 1071800000 1114600000 72356000 1179300000 424020000 1214800000 876870000 1101800000 45459 2280 42423 408551;408552;408553;408554;408555;408556;408557;408558;408559;408560;408561;408562;408563;408564;408565;408566;408567;408568;408569;408570;408571;408572;408573;408574;408575;408576 520864;520865;520866;520867;520868;520869;520870;520871;520872;520873;520874;520875;520876;520877;520878;520879;520880;520881;520882;520883;520884;520885;520886;520887;520888;520889;520890;520891;520892;520893;520894;520895;520896;520897;520898 520886 35 VALILQNVDLPN Unmodified 1307.7449 0.74490152 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes no 0 0 0 1 139.34 139.34 2 0.016784 144304 QUIQUE_C1218_190116_001 68.846 50.174 46367000 46367000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45460 2887 42424 408577 520899 520899 0 VALIQWR Unmodified 884.52322 0.52322184 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;A6PVV2;H0Y7R3 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 78.307 78.307 2 0.05653 79741 QUIQUE_C1576_190116_001 71.359 22.599 70273000 0 0 0 0 0 0 25328000 0 0 0 23229000 21716000 0 45461 1056 42425 408578;408579;408580;408581 520900;520901;520902;520903 520900 4 VALLDFGATR Unmodified 1061.5869 0.58694431 3657 Q8NI60 ADCK3 Atypical kinase ADCK3, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 96.589 96.589 2 0.033017 97604 QUIQUE_C1563_190116_001 53.493 16.733 43554000 0 0 0 0 0 43554000 0 0 0 0 0 0 0 45462 3657 42426 408582 520904 520904 1 VALLLLEK Unmodified 897.5899 0.58990443 2856;1255;4612 I6L894;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651;Q9Y4W6 ANK2;AFG3L2 Ankyrin-2;AFG3-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 90.95 90.95 2 0.021397 88593 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.213 14.705 1335400000 0 0 271570000 245490000 0 0 0 323120000 337470000 157770000 0 0 0 45463 1255;2856;4612 42427 408583;408584;408585;408586;408587 520905;520906;520907;520908;520909 520909 5 VALLSGGGSGHEPAHAGFIGK Unmodified 1961.0119 0.011908675 3226 Q3LXA3;H0YCY6;E9PJG8 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 50.587 50.587 3;4 2.3415E-08 47755 QUIQUE_C1368_190116_001 99.059 74.772 1148700000 102750000 99796000 119150000 92287000 96117000 63091000 90049000 0 94636000 93511000 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Unmodified 1227.6823 0.68230126 3899 Q96L92;A0A2R8Y8A7;A0A2R8Y3S6 SNX27 Sorting nexin-27 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 71.431 71.431 2 0.0020514 71412 QUIQUE_C1403_190116_001 77.379 48.98 562720000 0 80754000 62146000 59842000 65430000 60163000 0 58458000 57814000 29223000 88888000 0 0 45470 3899 42434 408623;408624;408625;408626;408627;408628;408629;408630;408631;408632 520946;520947;520948;520949;520950;520951;520952;520953;520954;520955;520956 520948 10 VALRGEDVPLTEQTVSQVLQSAK Unmodified 2467.3282 0.32821702 1034 F8VVA7;P61923;F8W651;F8VYK5 COPZ1 Coatomer subunit zeta-1 yes no 0 0 1 1 120.44 120.44 3 0.0083764 124252 QUIQUE_DMIX7_190116_001 35.812 28.451 57908000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 57908000 0 45471 1034 42435 408633 520957 520957 1 VALSEPQPERR Unmodified 1280.6837 0.68369824 4063 Q9BXP5;H7C3A1;H7C1K0 SRRT Serrate RNA effector molecule homolog yes no 0 0 1 1 1 20.966 20.966 3 0.025646 14181 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.384 14.705 159860000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69891000 89966000 0 45472 4063 42436 408634;408635 520958;520959 520958 2 VALSNMNVIDR Unmodified 1230.6391 0.63905624 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.641 71.641 2 0.00043299 71853 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.75 89.745 3707700000 503250000 650220000 0 0 0 0 0 500320000 472000000 0 590900000 436890000 554100000 45473 959 42437 408636;408637;408638;408639;408640;408641;408642;408643 520960;520961;520962;520963;520964;520965;520966;520967;520968 520963 8 VALSNMNVIDR Oxidation (M) 1246.634 0.63397086 959 E9PLK3;P55786;A6NEC2 NPEPPS;NPEPPSL1 Puromycin-sensitive aminopeptidase;Puromycin-sensitive aminopeptidase-like protein yes no 0 1 0 1 1 45.232 45.232 2 0.0014123 41636 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.681 54.72 335810000 0 0 0 0 0 0 0 196740000 0 139080000 0 0 0 45474 959 42437 408644;408645 520969;520970;520971;520972 520970 589 3 VALSPAGVQNLVK Unmodified 1294.7609 0.76088593 2993 Q13423;D6RAI5;D6RHU2 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.447 86.447 2 0.0049324 89584 QUIQUE_C1218_190116_001 79.986 64.371 1145700000 154840000 0 137780000 0 0 0 0 123820000 195600000 71108000 173510000 157480000 131580000 45475 2993 42438 408646;408647;408648;408649;408650;408651;408652;408653 520973;520974;520975;520976;520977;520978;520979;520980 520973 1 VALSSETEVALAR Unmodified 1344.7249 0.72489436 880 E7EVA0;P27816 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 yes no 0 0 0 2 1 1 2 3 1 1 2 68.96 68.96 2 0.00019393 65623 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.89 65.476 341220000 40574000 0 0 49934000 0 37265000 0 66372000 51749000 29262000 0 31546000 34523000 45476 880 42439 408654;408655;408656;408657;408658;408659;408660;408661;408662;408663;408664;408665;408666 520981;520982;520983;520984;520985;520986;520987;520988;520989;520990;520991;520992;520993;520994;520995;520996;520997 520993 15 VALTGLTVAEYFR Unmodified 1438.782 0.78201531 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 132.48 132.48 2;3 3.0367E-31 138575 QUIQUE_C1218_190116_001 178.08 154.29 61289000000 6160600000 5197500000 6000900000 3884100000 4755300000 5383200000 5403500000 2822800000 4615500000 2218600000 6079800000 4801900000 3965500000 45477 1900;1046 42440 408667;408668;408669;408670;408671;408672;408673;408674;408675;408676;408677;408678;408679;408680;408681;408682;408683;408684;408685;408686;408687;408688;408689;408690;408691;408692;408693 520998;520999;521000;521001;521002;521003;521004;521005;521006;521007;521008;521009;521010;521011;521012;521013;521014;521015;521016;521017;521018;521019;521020;521021;521022;521023;521024;521025;521026;521027;521028;521029;521030;521031;521032;521033;521034;521035;521036;521037;521038;521039;521040;521041;521042;521043;521044;521045;521046 520999 49 VALTIALFHVAGK Unmodified 1338.8024 0.80235682 3713 Q8WWI5 SLC44A1 Choline transporter-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 106.44 106.44 3 0.0099601 110226 QUIQUE_C1576_190116_001 46.378 38.467 47550000 0 0 0 19300000 0 0 28250000 0 0 0 0 0 0 45478 3713 42441 408694;408695;408696;408697 521047;521048;521049;521050 521050 4 VALVLSGCGVYDGTEIHEASAILVHLSR Unmodified 2965.5331 0.53314119 215 P0DPI2;A0A0B4J2D5;A0A0B4J2H4;F2Z2Q0;A0A096LP12;A0A2R8Y6K9 C21orf33 yes no 0 0 0 1 1 149.28 149.28 4 0.00034226 154792 QUIQUE_DMIX7_190116_001 38.843 36.164 50662000 0 0 0 0 0 0 0 0 23246000 0 0 27417000 0 45479 215 42442 408698;408699 521051;521052;521053 521053 3 VALVNDSLSDVTSTTSSR Unmodified 1850.9222 0.92215019 3453 Q7Z2W4 ZC3HAV1 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 87.415 87.415 2 1.8715E-38 88062 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.93 138.07 57992000 0 0 0 0 0 0 0 37270000 0 20722000 0 0 0 45480 3453 42443 408700;408701 521054;521055 521054 2 VALVTFNSAAHNKPSLIR Unmodified 1937.0847 0.084679688 3499 Q86VP6;A0A0C4DGH5 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 3 2 3 3 3 62.762 62.762 2;3;4 6.1762E-31 62452 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.62 131.53 4753100000 101430000 193650000 184290000 130740000 351230000 52571000 346920000 440320000 283070000 165300000 864990000 738350000 900200000 45481 3499 42444 408702;408703;408704;408705;408706;408707;408708;408709;408710;408711;408712;408713;408714;408715;408716;408717;408718;408719;408720;408721;408722;408723;408724;408725;408726;408727;408728;408729;408730 521056;521057;521058;521059;521060;521061;521062;521063;521064;521065;521066;521067;521068;521069;521070;521071;521072;521073;521074;521075;521076;521077;521078;521079;521080;521081;521082;521083;521084;521085;521086;521087;521088;521089;521090;521091;521092;521093;521094;521095 521081 38 VALVTGANR Unmodified 899.51886 0.51886475 1659 O75828 CBR3 Carbonyl reductase [NADPH] 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.762 23.762 2 0.011056 17619 QUIQUE_C1218_190116_001 73.26 17.584 402440000 60305000 0 0 83223000 56088000 61527000 0 67402000 73897000 0 0 0 0 45482 1659 42445 408731;408732;408733;408734;408735;408736 521096;521097;521098;521099;521100;521101 521096 3 VALVVHPGTAR Unmodified 1118.656 0.65602693 2947 Q12846;C9JFM5;A0A087WWW0;H3BMK2 STX4 Syntaxin-4 yes no 0 0 0 1 1 24.251 24.251 2 0.037025 17115 QUIQUE_C1368_190116_001 45.161 33.798 20334000 0 0 0 0 20334000 0 0 0 0 0 0 0 0 45483 2947 42446 408737;408738 521102;521103 521102 2 VALVYGQMNEPPGAR Oxidation (M) 1616.7981 0.79807608 1900;1046 P06576;H0YH81;F8W0P7 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta no no 0 1 0 1 1 5 2 1 3 3 2 1 2 3 3 2 56.966 56.966 2 8.362E-19 55206 QUIQUE_DMIX1_190116_001 147.91 138.9 2117800000 124790000 125100000 256700000 159610000 95183000 144080000 198200000 169650000 143900000 93570000 239730000 195300000 171990000 45484 1900;1046 42447 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540180000 865220000 889150000 689650000 750920000 259100000 1156600000 0 1047900000 45485 1900;1046 42447 408768;408769;408770;408771;408772;408773;408774;408775;408776;408777;408778;408779;408780;408781;408782;408783;408784;408785;408786;408787;408788;408789;408790;408791;408792;408793;408794;408795;408796;408797;408798 521171;521172;521173;521174;521175;521176;521177;521178;521179;521180;521181;521182;521183;521184;521185;521186;521187;521188;521189;521190;521191;521192;521193;521194;521195;521196;521197;521198;521199;521200;521201;521202;521203;521204;521205;521206;521207;521208;521209;521210;521211;521212;521213;521214;521215;521216;521217;521218;521219;521220;521221;521222;521223;521224;521225 521221 54 VALWNEVDGQTK Unmodified 1358.683 0.68302954 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 1 1 1 79.953 79.953 2 0.0020275 80667 QUIQUE_C1277_190116_001 77.533 63.415 247000000 95897000 91820000 0 59283000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45486 3277 42448 408799;408800;408801;408802 521226;521227;521228;521229;521230 521228 5 VAMANIQPQMLVAGATSIAR Unmodified 2041.0813 0.081250569 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.42 132.42 2 1.1602E-29 136317 QUIQUE_C1403_190116_001 176.08 155.24 650260000 33714000 52825000 50228000 41624000 57989000 39525000 47430000 58446000 56101000 0 78130000 56344000 77909000 45487 2135 42449 408803;408804;408805;408806;408807;408808;408809;408810;408811;408812;408813;408814 521231;521232;521233;521234;521235;521236;521237;521238;521239;521240;521241;521242;521243;521244 521234 13 VAMGAFDK Unmodified 837.40547 0.40547447 666 B7Z9I1;Q5T4U5;P11310;H0YDT5 ACADM Medium-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 36.365 36.365 2 0.057322 31714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.878 31.142 49568000 0 0 0 0 0 0 0 49568000 0 0 0 0 0 45488 666 42450 408815 521245 521245 1 VAMHILNNGR Unmodified 1123.592 0.59204647 2539 P49748;J3KSR4 ACADVL Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 26.663 26.663 3 0.050316 20721 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.692 13.822 56730000 0 0 0 0 0 0 0 56730000 0 0 0 0 0 45489 2539 42451 408816 521246 521246 1 VAMIDETR Unmodified 933.45897 0.45896661 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.688 30.688 2 0.034121 25477 QUIQUE_C1403_190116_001 64.265 31.91 1799000000 222200000 197590000 236310000 198900000 137140000 177880000 218370000 0 0 0 223310000 0 187360000 45490 693;3205 42452 408817;408818;408819;408820;408821;408822;408823;408824;408825 521247;521248;521249;521250;521251;521252;521253;521254;521255 521250 9 VAMIDETR Oxidation (M) 949.45388 0.45388123 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 1 0 1 18.347 18.347 2 0.063483 11138 QUIQUE_DMIX1_190116_001 54.776 32.39 45264000 0 0 0 0 0 0 0 45264000 0 0 0 0 0 45491 693;3205 42452 408826 521256 521256 1 VAMLEENGER Unmodified 1146.5339 0.53392246 3532 Q8IVD9 NUDCD3 NudC domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 32.368 32.368 2 0.0027159 27076 QUIQUE_C1277_190116_001 88.37 57.296 147970000 34067000 37792000 0 0 0 26147000 0 25038000 0 0 0 24924000 0 45492 3532 42453 408827;408828;408829;408830;408831 521257;521258;521259;521260;521261;521262 521259 6 VAMNVYELSSAAGLPCEIDPALVVALSSQK Unmodified 3131.5883 0.58827281 4551 Q9Y2A7 NCKAP1 Nck-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 167.41 167.41 3 6.9764E-31 171022 QUIQUE_C1277_190116_001 99.987 87.641 418060000 64895000 94372000 0 0 72764000 45396000 64328000 0 0 0 0 76305000 0 45493 4551 42454 408832;408833;408834;408835;408836;408837;408838 521263;521264;521265;521266;521267;521268;521269 521264 7 VAMQDATAQMAMLQFISSGLSK Oxidation (M) 2343.1273 0.12727406 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 1 0 4 6 4 3 3 2 2 4 6 3 5 3 5 157.38 157.38 2;3 8.0386E-114 164743 QUIQUE_C1368_190116_001 211.17 189.62 7006100000 413450000 623580000 510660000 271210000 333990000 246300000 179490000 671760000 851340000 209450000 864040000 504290000 1326600000 45494 3975 42455 408839;408840;408841;408842;408843;408844;408845;408846;408847;408848;408849;408850;408851;408852;408853;408854;408855;408856;408857;408858;408859;408860;408861;408862;408863;408864;408865;408866;408867;408868;408869;408870;408871;408872;408873;408874;408875;408876;408877;408878;408879;408880;408881;408882;408883;408884;408885;408886;408887;408888 521270;521271;521272;521273;521274;521275;521276;521277;521278;521279;521280;521281;521282;521283;521284;521285;521286;521287;521288;521289;521290;521291;521292;521293;521294;521295;521296;521297;521298;521299;521300;521301;521302;521303;521304;521305;521306;521307;521308;521309;521310;521311;521312;521313;521314;521315;521316;521317;521318;521319;521320;521321;521322;521323;521324;521325;521326;521327;521328 521285 2803;2804;2805 58 VAMQDATAQMAMLQFISSGLSK Unmodified 2327.1324 0.13235944 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 3 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 165.61 165.61 2;3 3.186E-88 169322 QUIQUE_C1277_190116_001 241.32 222.49 15323000000 1651200000 1624600000 2176500000 826360000 944780000 792320000 1045400000 1199600000 1047100000 255810000 879590000 1362800000 1517400000 45495 3975 42455 408889;408890;408891;408892;408893;408894;408895;408896;408897;408898;408899;408900;408901;408902;408903;408904;408905;408906;408907;408908;408909;408910;408911;408912;408913 521329;521330;521331;521332;521333;521334;521335;521336;521337;521338;521339;521340;521341;521342;521343;521344;521345;521346;521347;521348;521349;521350;521351;521352;521353;521354;521355;521356;521357;521358;521359;521360;521361;521362;521363;521364;521365;521366;521367;521368;521369;521370;521371 521335 42 VAMQDATAQMAMLQFISSGLSK 2 Oxidation (M) 2359.1222 0.12218869 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 2 0 2 141.83 141.83 3 3.0444E-05 127034 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.589 55.313 70490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 70490000 0 0 0 45496 3975 42455 408914;408915 521372;521373 521372 2803;2804;2805 2 VAMSHFEPNEYIHYDLLEK Oxidation (M) 2350.094 0.093983325 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 95.396 95.396 2;3;4 0.00010328 98791 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.763 62.993 3569200000 479710000 47378000 0 39874000 0 351300000 0 613960000 856830000 214420000 965770000 0 0 45497 3975 42456 408916;408917;408918;408919;408920;408921;408922;408923 521374;521375;521376;521377;521378;521379;521380;521381 521381 2806 6 VAMSHFEPNEYIHYDLLEK Unmodified 2334.0991 0.099068703 3975 Q99798;A2A274 ACO2 Aconitate hydratase, mitochondrial yes no 0 0 0 3 3 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 3 106.2 106.2 2;3;4 1.3949E-22 110917 QUIQUE_C1218_190116_001 148.7 129.49 16167000000 1847600000 1992200000 1751500000 1330600000 1075800000 858070000 845480000 913510000 1347900000 373560000 1543400000 1039300000 1248300000 45498 3975 42456 408924;408925;408926;408927;408928;408929;408930;408931;408932;408933;408934;408935;408936;408937;408938;408939;408940;408941;408942;408943;408944;408945;408946;408947;408948;408949;408950;408951;408952;408953;408954;408955;408956;408957;408958;408959;408960 521382;521383;521384;521385;521386;521387;521388;521389;521390;521391;521392;521393;521394;521395;521396;521397;521398;521399;521400;521401;521402;521403;521404;521405;521406;521407;521408;521409;521410;521411;521412;521413;521414;521415;521416;521417;521418;521419;521420;521421;521422;521423;521424;521425;521426;521427;521428;521429;521430;521431 521384 50 VANDNAPEHALRPGFLSTFALATDQGSK Unmodified 2926.4573 0.45733371 4426 Q9UHA4 LAMTOR3 Ragulator complex protein LAMTOR3 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 108.57 108.57 3;4 1.7125E-44 113149 QUIQUE_C1438_190116_001 131.57 120.66 1633600000 86989000 211030000 113640000 81441000 123660000 0 188220000 179110000 129860000 41249000 152350000 167670000 158400000 45499 4426 42457 408961;408962;408963;408964;408965;408966;408967;408968;408969;408970;408971;408972;408973;408974;408975 521432;521433;521434;521435;521436;521437;521438;521439;521440;521441;521442;521443;521444;521445;521446;521447;521448;521449;521450;521451;521452;521453;521454;521455 521440 23 VANEAEFILSR Unmodified 1247.651 0.65100113 910 E9PEM5;P50851;H0YAC6 LRBA Lipopolysaccharide-responsive and beige-like anchor protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 84.317 84.317 2 0.0026231 87171 QUIQUE_C1438_190116_001 77.192 48.495 161010000 0 0 29869000 0 20844000 14693000 29206000 0 0 0 36036000 30357000 0 45500 910 42458 408976;408977;408978;408979;408980;408981;408982 521456;521457;521458;521459;521460;521461;521462 521458 7 VANEPVLAFTQGSPER Unmodified 1713.8686 0.86859848 2295 P30038;Q5TF55 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 1 1 2 2 2 84.851 84.851 2;3 1.5827E-09 88034 QUIQUE_C1218_190116_001 160.18 144.55 8528100000 583340000 516580000 1197100000 627740000 599940000 670070000 691700000 558020000 541120000 351700000 888480000 653140000 649150000 45501 2295 42459 408983;408984;408985;408986;408987;408988;408989;408990;408991;408992;408993;408994;408995;408996;408997;408998;408999;409000;409001;409002 521463;521464;521465;521466;521467;521468;521469;521470;521471;521472;521473;521474;521475;521476;521477;521478;521479;521480;521481;521482;521483;521484 521464 22 VANIIAEVAK Unmodified 1026.6073 0.6073454 2605 P52306;D6RB97 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 no no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.567 68.567 2 0.0053249 67827 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.76 68.647 1151800000 379940000 352950000 0 0 0 0 0 290000000 0 128930000 0 0 0 45502 2605 42460 409003;409004;409005;409006;409007;409008;409009;409010;409011;409012;409013;409014;409015 521485;521486;521487;521488;521489;521490;521491;521492;521493;521494;521495;521496;521497;521498 521494 13 VANILHDDCAFLSAFGDVSKPER Unmodified 2560.238 0.2380218 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 123.05 123.05 3;4 6.7124E-12 128216 QUIQUE_C1218_190116_001 97.059 91.266 797910000 140840000 152430000 0 135700000 114280000 109650000 0 55130000 56997000 32878000 0 0 0 45503 4007 42461 409016;409017;409018;409019;409020;409021;409022;409023 521499;521500;521501;521502;521503;521504;521505;521506;521507;521508;521509 521499 11 VANILINLYGMTAVLSR Unmodified 1847.0339 0.033889671 4186 Q9H845;H0Y8Z9 ACAD9 Acyl-CoA dehydrogenase family member 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 166.43 166.43 3 0.0031078 171044 QUIQUE_DMIX3_190116_001 47.904 38.857 12639000 0 0 0 0 0 0 0 0 12639000 0 0 0 0 45504 4186 42462 409024 521510 521510 1 VANLLLCMYAK Unmodified 1294.6777 0.67774993 4563 Q9Y2Q5 LAMTOR2 Ragulator complex protein LAMTOR2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 109.46 109.46 2 0.0017574 113235 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.563 52.82 279570000 0 30406000 0 0 24653000 0 0 37178000 42857000 0 45907000 47280000 51285000 45505 4563 42463 409025;409026;409027;409028;409029;409030;409031;409032 521511;521512;521513;521514;521515;521516;521517;521518;521519 521515 9 VANPSGNLTETYVQDR Unmodified 1762.8486 0.84859132 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.72 63.72 2 3.9544E-55 63025 QUIQUE_C1277_190116_001 222.73 197.29 1570300000 84146000 138570000 120580000 149310000 166460000 100740000 138710000 151720000 0 96417000 169960000 145780000 107910000 45506 2178 42464 409033;409034;409035;409036;409037;409038;409039;409040;409041;409042;409043;409044 521520;521521;521522;521523;521524;521525;521526;521527;521528;521529;521530;521531;521532;521533;521534;521535 521522 16 VANVELYYR Unmodified 1125.5819 0.58185893 50 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.845 61.845 2 1.5312E-06 61785 QUIQUE_C1438_190116_001 174.27 145.12 13566000000 1071200000 1150600000 740800000 1106000000 1006300000 841380000 1002600000 1302300000 1259000000 572250000 1189700000 1103600000 1220700000 45507 50 42465 409045;409046;409047;409048;409049;409050;409051;409052;409053;409054;409055;409056;409057 521536;521537;521538;521539;521540;521541;521542;521543;521544;521545;521546;521547;521548;521549;521550;521551;521552;521553;521554;521555;521556 521543 21 VANYCSTHLLEHITTNEDFR Unmodified 2419.1227 0.12265769 1652 O75688;C9JIR6;A0A3B3IS24;B8ZZF0 PPM1B Protein phosphatase 1B yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 1 84.009 84.009 3;4 2.1728E-18 85264 QUIQUE_C1368_190116_001 101.94 94.663 755890000 65061000 66432000 133990000 95932000 82113000 81618000 132360000 0 0 31240000 67142000 0 0 45508 1652 42466 409058;409059;409060;409061;409062;409063;409064;409065;409066;409067;409068;409069 521557;521558;521559;521560;521561;521562;521563;521564;521565;521566;521567;521568;521569 521560 13 VAPAEPQEAPDSTAAGGSASK Unmodified 1939.9123 0.91231379 3226 Q3LXA3;H0YCY6;I3L252 DAK;TKFC Bifunctional ATP-dependent dihydroxyacetone kinase/FAD-AMP lyase (cyclizing);ATP-dependent dihydroxyacetone kinase;FAD-AMP lyase (cyclizing) yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 29.548 29.548 2;3 8.8877E-35 23506 QUIQUE_C1368_190116_001 181.97 171.36 1315100000 105260000 78955000 111200000 87511000 106110000 83941000 89483000 83012000 110640000 50949000 152990000 115770000 139260000 45509 3226 42467 409070;409071;409072;409073;409074;409075;409076;409077;409078;409079;409080;409081;409082;409083;409084;409085;409086;409087 521570;521571;521572;521573;521574;521575;521576;521577;521578;521579;521580;521581;521582;521583;521584;521585;521586;521587 521572 18 VAPAPAAVVPPTGPGMAPVPTGVFTDIPISNIR Oxidation (M) 3224.7268 0.72675562 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 146.9 146.9 3;4 8.781E-15 152039 QUIQUE_C1368_190116_001 71.118 65.517 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521601;521602;521603;521604;521605;521606;521607;521608;521609;521610;521611;521612;521613;521614;521615;521616;521617;521618;521619;521620;521621;521622;521623;521624;521625;521626;521627;521628;521629 521618 27 VAPAPARPSGPSK Unmodified 1233.683 0.68296996 2506 P48444;B0YIW6 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 11.056 11.056 3 0.0033008 3069 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.108 32.443 164830000 0 0 20200000 0 19757000 0 15597000 10768000 29540000 0 27391000 15270000 26305000 45512 2506 42469 409118;409119;409120;409121;409122;409123;409124;409125 521630;521631;521632;521633;521634;521635;521636;521637;521638;521639;521640;521641;521642;521643;521644 521641 15 VAPAQPSEEGPGR Unmodified 1293.6313 0.63132832 888 E7EX17;P23588 EIF4B Eukaryotic translation initiation factor 4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.855 19.855 2 8.1052E-10 12472 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.83 114.62 1248600000 170820000 0 122610000 116070000 155760000 124220000 94841000 65034000 99570000 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Unmodified 2294.2383 0.2382798 2788;2696;447 A0A2R8Y793;G5E9R0;E7EVS6;A0A2R8YGF8;P60709;P63261;I3L3I0;I3L1U9;I3L4N8;I3L3R2;J3KT65 ACTB;ACTG1 Actin, cytoplasmic 1;Actin, cytoplasmic 1, N-terminally processed;Actin, cytoplasmic 2;Actin, cytoplasmic 2, N-terminally processed no no 0 0 1 1 1 62.162 62.162 3;4 0.018465 61603 QUIQUE_C1368_190116_001 29.476 22.2 66950000 0 0 40192000 0 26758000 0 0 0 0 0 0 0 0 45517 447;2696;2788 42474 409201;409202 521839;521840 521839 2 VAPGYYTLTADQDAR Unmodified 1639.7842 0.78420015 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.236 70.236 2 1.4732E-05 70104 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.959 74.717 410160000 25985000 40693000 69574000 47595000 45966000 35770000 66181000 0 0 0 0 0 78392000 45518 2101 42475 409203;409204;409205;409206;409207;409208;409209;409210;409211 521841;521842;521843;521844;521845;521846;521847;521848;521849 521848 8 VAPHALSEEEK Unmodified 1208.6037 0.60371659 4445 Q9UI26;F8WDV0;D6RCN7;D6RJB1 IPO11 Importin-11 yes no 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Unmodified 2991.476 0.47602024 4109 Q9GZY8;C9JHF5;C9JU19 MFF Mitochondrial fission factor yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 137.35 137.35 3 3.9696E-06 144422 QUIQUE_DMIX5_190116_001 54.622 43.719 249130000 0 0 56271000 0 45166000 0 0 0 0 0 67686000 37234000 42769000 45522 4109 42479 409265;409266;409267;409268;409269 521945;521946;521947;521948;521949 521947 5 VAPQQDDLDSPQQISISNAEAR Unmodified 2381.1459 0.14589555 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 81.712 81.712 2 0.00088982 84392 QUIQUE_C1438_190116_001 88.507 76.147 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45523 2225 42480 409270 521950 521950 1 VAPSAVLGPNVSIGK Unmodified 1407.8086 0.80856441 3880 Q96IJ6;A0A087WUI8;A0A0U1RRC2 GMPPA Mannose-1-phosphate guanyltransferase alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 77.258 77.258 2 0.017464 77823 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.879 39.082 392830000 0 38602000 49305000 0 0 0 53370000 51537000 44419000 28287000 71166000 56148000 0 45524 3880 42481 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mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 20.176 20.176 2 0.017692 13303 QUIQUE_DMIX7_190116_001 127.68 80.105 1942000000 0 0 0 90285000 0 0 0 542370000 424430000 0 0 457940000 426950000 45535 2499 42492 409329;409330;409331;409332;409333 522010;522011;522012;522013;522014 522013 3 VAQLCDFNPK Unmodified 1190.5754 0.57539335 1967 P09497;D6RJD1 CLTB Clathrin light chain B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.64 56.64 2 0.00026909 55348 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.41 90.017 4812100000 530180000 548040000 517620000 415060000 511550000 397190000 446000000 150910000 221870000 75787000 355790000 292680000 349470000 45536 1967 42493 409334;409335;409336;409337;409338;409339;409340;409341;409342;409343;409344;409345;409346 522015;522016;522017;522018;522019;522020;522021;522022;522023;522024;522025;522026;522027;522028;522029;522030;522031;522032;522033;522034 522031 20 VAQLDQLLHYR Unmodified 1354.7357 0.73573382 1874 P05060 CHGB Secretogranin-1;PE-11;GAWK peptide;CCB peptide yes yes 0 0 0 1 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522044;522045;522046;522047;522048;522049;522050;522051;522052;522053;522054 522044 11 VAQLEQVYIR Unmodified 1217.6768 0.67682195 2752 P62318 SNRPD3 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.521 67.521 2 2.5411E-07 67161 QUIQUE_C1368_190116_001 149.65 68.357 2226800000 188020000 228430000 254070000 160190000 149740000 152120000 213300000 201990000 0 85994000 195810000 211370000 185790000 45540 2752 42497 409364;409365;409366;409367;409368;409369;409370;409371;409372;409373;409374;409375;409376 522055;522056;522057;522058;522059;522060;522061;522062;522063;522064;522065;522066;522067;522068 522057 14 VAQLLER Unmodified 827.4865 0.48650199 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 30.296 30.296 2 0.035447 25166 QUIQUE_C1218_190116_001 86.866 10.02 1763500000 507170000 506280000 0 0 0 0 0 750100000 0 0 0 0 0 45541 3117 42498 409377;409378;409379 522069;522070;522071 522069 3 VAQLPLSLK Unmodified 967.60662 0.60661712 396 A0A1X7SBT7;O95502 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522082;522083;522084;522085;522086;522087;522088;522089 522087 8 VAQPTITDNKDGTVTVR Unmodified 1813.9534 0.95339074 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;H0Y5F3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 46.165 46.165 2;3 1.5246E-11 43333 QUIQUE_DMIX5_190116_001 110.38 95.178 1696700000 57160000 88800000 106590000 107180000 146800000 48081000 138470000 215100000 232750000 0 198370000 237370000 120030000 45545 2178 42502 409395;409396;409397;409398;409399;409400;409401;409402;409403;409404;409405;409406;409407;409408;409409;409410;409411;409412;409413;409414;409415 522090;522091;522092;522093;522094;522095;522096;522097;522098;522099;522100;522101;522102;522103;522104;522105;522106;522107;522108;522109;522110;522111;522112 522107 23 VAQTACMSACK Unmodified 1225.5253 0.52534839 318 A0A0U1RRB6;Q9Y2D4 EXOC6B Exocyst complex component 6B yes no 0 0 0 1 16.204 16.204 2 0.026338 8471 QUIQUE_C1576_190116_001 52.725 36.252 12784000 0 0 0 0 0 0 12784000 0 0 0 0 0 0 45546 318 42503 409416 522113 522113 1 VAQTDGVNVDMHLK Oxidation (M) 1541.7508 0.75079153 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 1 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 30.524 30.524 2 0.00029813 25649 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.163 60.859 436720000 18914000 0 34426000 18385000 0 24134000 0 64408000 105750000 9069400 71678000 31148000 58809000 45547 2123 42504 409417;409418;409419;409420;409421;409422;409423;409424;409425;409426;409427;409428;409429 522114;522115;522116;522117;522118;522119;522120;522121;522122;522123;522124;522125;522126;522127 522119 1454 14 VAQTDGVNVDMHLK Unmodified 1525.7559 0.75587691 2123 P17302 GJA1 Gap junction alpha-1 protein yes yes 0 0 0 1 2 3 1 1 1 2 3 2 2 2 2 50.494 50.494 2;3 0.00012666 48290 QUIQUE_C1403_190116_001 68.044 55.064 4596100000 332150000 329070000 461410000 282860000 0 264700000 262540000 523540000 794510000 163840000 536260000 314760000 330430000 45548 2123 42504 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409533;409534;409535;409536;409537;409538;409539;409540;409541;409542;409543 522237;522238;522239;522240;522241;522242;522243;522244;522245;522246;522247 522245 10 VASGPSPGEGISPQSAQAPQAPGDNHVVPVLR Unmodified 3118.5796 0.57957411 3086 Q14764 MVP Major vault protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.395 84.395 3 4.1287E-26 81625 QUIQUE_DMIX4_190116_001 91.113 84.537 330270000 35215000 0 57106000 89421000 64168000 0 0 0 0 25632000 58731000 0 0 45560 3086 42515 409544;409545;409546;409547;409548;409549 522248;522249;522250;522251;522252;522253 522252 5 VASLEESEGNKQDLK Unmodified 1645.8159 0.81589421 2907 Q07065 CKAP4 Cytoskeleton-associated protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 23.372 23.372 3 0.0017673 16459 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.52 45.234 157000000 40846000 0 0 46558000 0 0 0 20956000 0 0 48634000 0 0 45561 2907 42516 409550;409551;409552;409553 522254;522255;522256;522257 522257 4 VASLFDSNQICEK Unmodified 1509.7133 0.71334339 3445 Q7L775 EPM2AIP1 EPM2A-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 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522810;522811;522812;522813;522814;522815;522816;522817 522815 5 VAVATLSHEQMIDLLR Unmodified 1794.9662 0.96620404 1511 O43166;F5GYF8 SIPA1L1 Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 106.21 106.21 3 0.0017333 108884 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.14 68.747 135890000 0 40822000 0 0 25312000 0 0 23281000 0 0 27290000 19183000 0 45600 1511 42551 409939;409940;409941;409942;409943 522818;522819;522820;522821;522822 522820 4 VAVCDIPPR Unmodified 1025.5328 0.53280025 3006;4033;4171 Q13509;A0A0B4J269;Q9BUF5;K7ESM5;Q9H4B7;CON__ENSEMBL:ENSBTAP00000025008 TUBB3;TUBB6;TUBB1 Tubulin beta-3 chain;Tubulin beta-6 chain;Tubulin beta-1 chain no no 0 0 0 8 4 6 8 10 7 5 5 6 4 5 5 4 42.692 42.692 2 0.00033092 34903 QUIQUE_C1403_190116_001 136.16 117.42 12709000000 1114500000 1154600000 1158200000 858390000 885920000 986460000 951690000 731240000 776610000 355500000 1354700000 873230000 1507600000 + 45601 3006;4033;4171 42552 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522887 286 VAVDGQHLFEYYHR Unmodified 1732.8322 0.8321534 1383 O00182 LGALS9 Galectin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 73.053 73.053 4 0.00015585 72837 QUIQUE_C1368_190116_001 68.034 49.205 223100000 0 0 72318000 48751000 0 0 0 35241000 0 17497000 49291000 0 0 45602 1383 42553 410021;410022;410023;410024;410025 523109;523110;523111;523112;523113;523114 523110 6 VAVEAPMREEYADFKPFER Unmodified 2283.0994 0.099403054 4252 Q9NQC3 RTN4 Reticulon-4 yes yes 0 0 2 2 1 1 2 2 2 1 2 2 2 1 2 91.571 91.571 3;4 1.0927E-06 93714 QUIQUE_C1277_190116_001 103.66 86.065 1987100000 305720000 61566000 67918000 212590000 182720000 166820000 93457000 193770000 162260000 0 194590000 61372000 284280000 45603 4252 42554 410026;410027;410028;410029;410030;410031;410032;410033;410034;410035;410036;410037;410038;410039;410040;410041;410042;410043;410044;410045 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Unmodified 1136.6594 0.65938097 3027 Q13838;Q5STU3;A0A0G2JJZ9;F6WLT2;A0A140T9X3;A0A0A0MT12;F6TRA5;F6S4E6;A0A140T9X9;A0A140T996;F6UJC5;A0A140TA18;A0A140T973;A0A140T9K1;A0A140T9L4;F6R6M7;F6QYI9;A0A0G2JJL7;A0A140T9K2;A0A140T9N3 DDX39B Spliceosome RNA helicase DDX39B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.6 120.6 2 0.0010057 126381 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.584 81.996 2207800000 153230000 221940000 199600000 162910000 195490000 167390000 145780000 180870000 194310000 99588000 178300000 179480000 128920000 45607 3027 42558 410093;410094;410095;410096;410097;410098;410099;410100;410101;410102;410103;410104;410105 523194;523195;523196;523197;523198;523199;523200;523201;523202;523203;523204;523205;523206;523207;523208;523209;523210;523211;523212;523213;523214;523215;523216;523217;523218;523219;523220;523221;523222 523218 29 VAVFFSNTPTR Unmodified 1237.6455 0.64552182 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.479 70.479 2 0.00043198 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VAVFQLVSSLPGR Unmodified 1371.7874 0.78743503 1474 O15040 TECPR2 Tectonin beta-propeller repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 124.96 124.96 2 0.005181 127521 QUIQUE_C1563_190116_001 84.658 73.85 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45610 1474 42561 410131 523260 523260 1 VAVFTENASEVK Unmodified 1292.6612 0.66123147 4073 Q9BYD6;H0Y8N7 MRPL1 39S ribosomal protein L1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 50.734 50.734 2 0.015605 49120 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.353 39.267 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45611 4073 42562 410132;410133 523261;523262 523262 2 VAVGAAAGGAGLR Unmodified 1068.604 0.60399136 1406 O00445 SYT5 Synaptotagmin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.855 32.855 2 0.0016621 28463 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.264 59.16 184010000 24128000 0 19962000 0 0 0 0 0 26973000 0 30165000 33571000 49206000 45612 1406 42563 410134;410135;410136;410137;410138;410139;410140;410141;410142 523263;523264;523265;523266;523267;523268;523269;523270;523271 523267 9 VAVGNQPADIGYK Unmodified 1330.6881 0.68811492 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 47.105 47.105 2 4.6184E-17 45051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.53 134.96 1470400000 73732000 64678000 307400000 0 59714000 0 117460000 155290000 103720000 33436000 486270000 0 68666000 45613 2168 42564 410143;410144;410145;410146;410147;410148;410149;410150;410151;410152;410153 523272;523273;523274;523275;523276;523277;523278;523279;523280;523281;523282;523283 523278 11 VAVGQEQAFSVNTR Unmodified 1504.7634 0.76340513 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 57.891 57.891 2 1.7706E-05 56648 QUIQUE_C1403_190116_001 120.32 101.79 194940000 0 0 0 49244000 0 0 58179000 0 0 0 0 32250000 55265000 45614 3061 42565 410154;410155;410156;410157;410158;410159 523284;523285;523286;523287;523288;523289;523290;523291;523292 523285 9 VAVGSDADLVIWNPK Unmodified 1582.8355 0.83550744 1430 O14531;Q5T0Q6 DPYSL4 Dihydropyrimidinase-related protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 110.24 110.24 2 6.2926E-12 113420 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.76 96.388 2130600000 198570000 208410000 232200000 176010000 136350000 164000000 197730000 211230000 166430000 100830000 0 140150000 198710000 45615 1430 42566 410160;410161;410162;410163;410164;410165;410166;410167;410168;410169;410170;410171;410172;410173;410174;410175 523293;523294;523295;523296;523297;523298;523299;523300;523301;523302;523303;523304;523305;523306;523307;523308;523309;523310;523311;523312;523313;523314;523315;523316;523317;523318 523310 26 VAVHHAEAEALAR Unmodified 1372.7211 0.72114638 3351 Q68D91 MBLAC2 Metallo-beta-lactamase domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 16.025 16.025 2;3 4.3408E-05 8343 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.36 100.06 1111100000 103310000 171490000 173650000 135360000 162690000 100620000 73152000 0 48177000 37322000 0 55706000 49605000 45616 3351 42567 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mitochondrial yes yes 0 0 0 4 2 2 2 2 3 2 2 2 4 2 2 4 151.69 151.69 2;3 6.3045E-74 145099 QUIQUE_DMIX4_190116_001 239.19 221.53 61668000000 5618700000 4580700000 4904900000 3684600000 4998600000 4816600000 3988700000 4118700000 5462000000 1623400000 6674200000 5165700000 6030800000 45621 2431 42572 410217;410218;410219;410220;410221;410222;410223;410224;410225;410226;410227;410228;410229;410230;410231;410232;410233;410234;410235;410236;410237;410238;410239;410240;410241;410242;410243;410244;410245;410246;410247;410248;410249 523362;523363;523364;523365;523366;523367;523368;523369;523370;523371;523372;523373;523374;523375;523376;523377;523378;523379;523380;523381;523382;523383;523384;523385;523386;523387;523388;523389;523390;523391;523392;523393;523394;523395;523396;523397;523398;523399;523400;523401;523402;523403;523404;523405;523406;523407;523408;523409;523410;523411;523412 523394 46 VAVLLLAGGQGTR Unmodified 1253.7456 0.74557022 3174;3225 Q16222;Q3KQV9 UAP1;UAP1L1 UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylgalactosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase;UDP-N-acetylhexosamine pyrophosphorylase-like protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.364 80.364 2 0.0016037 81283 QUIQUE_C1368_190116_001 78.655 8.7017 274660000 21113000 24286000 34612000 30009000 37729000 0 0 27082000 39154000 0 34352000 26326000 0 45622 3174;3225 42573 410250;410251;410252;410253;410254;410255;410256;410257;410258;410259;410260 523413;523414;523415;523416;523417;523418;523419;523420;523421;523422;523423 523415 10 VAVLQALASTVNR Unmodified 1340.7776 0.77759863 3846 Q96EY7;B8ZZQ4 PTCD3 Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 108.4 108.4 2 0.0017669 111459 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.771 60.399 40517000 0 0 0 0 0 0 0 0 40517000 0 0 0 0 45623 3846 42574 410261;410262 523424;523425 523424 2 VAVLSQNR Unmodified 885.50321 0.50321468 4054 Q9BWD1 ACAT2 Acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 19.724 19.724 2 0.0049318 12495 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.32 44.602 1046800000 0 154510000 0 124270000 0 149560000 0 129430000 121290000 135110000 0 162060000 70544000 45624 4054 42575 410263;410264;410265;410266;410267;410268;410269;410270 523426;523427;523428;523429;523430;523431;523432;523433 523432 4 VAVLVKPEHENR Unmodified 1389.7728 0.7728476 197 A0A0A0MTP6;O15357 INPPL1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 5-phosphatase 2 yes no 0 0 1 1 15.482 15.482 3 0.045473 7607 QUIQUE_C1403_190116_001 41.684 26.346 19079000 0 0 0 19079000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45625 197 42576 410271 523434 523434 1 VAVNDAHLLQYNHR Unmodified 1648.8434 0.84338678 2131 P17931 LGALS3 Galectin-3 yes yes 0 0 0 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 41.274 41.274 2;3;4 1.6643E-14 36775 QUIQUE_DMIX8_190116_001 170.62 145.76 8044200000 734980000 678130000 639850000 693380000 724850000 745000000 512640000 651060000 712700000 286920000 658620000 410780000 595310000 45626 2131 42577 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523496;523497;523498;523499;523500;523501;523502;523503;523504;523505;523506;523507;523508;523509;523510;523511;523512;523513;523514;523515;523516;523517;523518;523519;523520;523521;523522;523523;523524;523525;523526;523527;523528;523529;523530;523531;523532;523533;523534;523535;523536;523537;523538;523539;523540;523541 523520 45 VAVPYSPAAGVDFELESFSER Unmodified 2269.0903 0.090278155 2113 P16870 CPE Carboxypeptidase E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 145.43 145.43 2;3 9.5011E-20 152349 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.06 108.43 710390000 77835000 80148000 71696000 0 67301000 55919000 86166000 55244000 0 21735000 72228000 65825000 56291000 45629 2113 42580 410352;410353;410354;410355;410356;410357;410358;410359;410360;410361;410362;410363 523542;523543;523544;523545;523546;523547;523548;523549;523550;523551;523552;523553;523554;523555;523556;523557;523558;523559;523560;523561 523556 19 VAVQAISADEEAPDYGSGVR Unmodified 2032.9702 0.97016302 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;A0A3B3ITK3;F8W8V9 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.78 77.78 2 1.9742E-38 78420 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.8 112.18 624410000 47877000 61812000 57397000 59876000 57805000 43930000 66630000 0 48805000 0 54686000 65686000 59901000 45630 497 42581 410364;410365;410366;410367;410368;410369;410370;410371;410372;410373;410374;410375 523562;523563;523564;523565;523566;523567;523568;523569;523570;523571;523572;523573 523569 12 VAVQAVQAMNR Unmodified 1185.6288 0.6288259 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2;B1ANG9;B1ANH3 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.051 39.051 2 2.5021E-08 35497 QUIQUE_C1438_190116_001 193.86 142.8 1277900000 83058000 106320000 132840000 106440000 89415000 90828000 123520000 77055000 96601000 0 107910000 119280000 144610000 45631 3194 42582 410376;410377;410378;410379;410380;410381;410382;410383;410384;410385;410386;410387;410388 523574;523575;523576;523577;523578;523579;523580;523581;523582;523583;523584;523585;523586 523578 13 VAVQAVQAMNR Oxidation (M) 1201.6237 0.62374052 3194 Q16774;B1ANH5;B1ANH0;B1ANH6;B1ANH2;B1ANG9;B1ANH3 GUK1 Guanylate kinase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.202 21.202 2 0.00050714 14131 QUIQUE_DMIX5_190116_001 115.49 90.6 414690000 30654000 37289000 35685000 26372000 0 33173000 0 42044000 58863000 28786000 72920000 48903000 0 45632 3194 42582 410389;410390;410391;410392;410393;410394;410395;410396;410397;410398;410399 523587;523588;523589;523590;523591;523592;523593;523594;523595;523596;523597 523596 2619 9 VAVQGDVVR Unmodified 941.52943 0.52942943 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.432 24.432 2 0.0023457 18067 QUIQUE_C1563_190116_001 94.302 24.035 878060000 0 0 90504000 86986000 92286000 84142000 75501000 93015000 100790000 0 145640000 109200000 0 45633 1929 42583 410400;410401;410402;410403;410404;410405;410406;410407;410408 523598;523599;523600;523601;523602;523603;523604;523605;523606;523607;523608 523602 10 VAVSADPNVPNVVVTGLTLVCSSAPGPLELDLTGDLESFK Unmodified 4080.0977 0.097678304 1293 J3KTF8;J3QQX2;P52565;J3KRY1 ARHGDIA Rho GDP-dissociation inhibitor 1 yes no 0 0 0 1 174.61 174.61 3 3.7089E-07 178721 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.782 38.507 9074600 0 0 0 0 0 0 0 0 9074600 0 0 0 0 45634 1293 42584 410409 523609 523609 0 VAVSADPNVPNVVVTGLTLVCSSAPGPLELDLTGDLESFKK Unmodified 4208.1926 0.19264132 1293 J3KTF8;J3QQX2;P52565;J3KRY1 ARHGDIA Rho GDP-dissociation inhibitor 1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 2 4 6 3 3 170.16 170.16 3;4;5 4.9181E-128 174585 QUIQUE_DMIX7_190116_001 162.07 159.45 8621400000 47568000 76606000 25610000 0 496560000 0 65862000 753030000 2022100000 0 3536300000 1144900000 452890000 45635 1293 42585 410410;410411;410412;410413;410414;410415;410416;410417;410418;410419;410420;410421;410422;410423;410424;410425;410426;410427;410428;410429;410430;410431;410432;410433 523610;523611;523612;523613;523614;523615;523616;523617;523618;523619;523620;523621;523622;523623;523624;523625;523626;523627;523628;523629;523630;523631;523632;523633;523634;523635;523636 523633 24 VAVTEGCQPSR Unmodified 1202.5714 0.5713706 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 1 19.022 19.022 2 0.0024031 11686 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.556 45.924 98495000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27470000 0 0 71025000 45636 1628 42586 410434;410435;410436 523637;523638;523639 523638 3 VAVTPPGLAR Unmodified 979.58147 0.581465 2280 P28331;B4DJ81 NDUFS1 NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.502 46.502 2 0.0002786 43111 QUIQUE_C1368_190116_001 116.37 53.654 2042800000 368470000 226790000 287540000 199210000 175540000 216860000 271090000 0 0 0 297280000 0 0 45637 2280 42587 410437;410438;410439;410440;410441;410442;410443;410444;410445;410446;410447;410448;410449 523640;523641;523642;523643;523644;523645;523646;523647;523648;523649;523650;523651;523652;523653;523654;523655;523656;523657;523658 523642 19 VAVTWLNR Unmodified 957.5396 0.53960019 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 67.473 67.473 2 0.0030708 67537 QUIQUE_C1576_190116_001 133.47 81.897 711600000 117580000 128800000 0 0 0 74505000 140990000 0 86437000 49450000 113840000 0 0 45638 914 42588 410450;410451;410452;410453;410454;410455;410456 523659;523660;523661;523662;523663;523664;523665 523662 4 VAVVAGYGDVGK Unmodified 1133.6081 0.60807369 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.95 50.95 2 0.0005697 47972 QUIQUE_C1563_190116_001 92.538 67.088 4937100000 513130000 428470000 462430000 415150000 413030000 369570000 403690000 372090000 422660000 197420000 0 414180000 525270000 45639 2219 42589 410457;410458;410459;410460;410461;410462;410463;410464;410465;410466;410467;410468;410469 523666;523667;523668;523669;523670;523671;523672;523673;523674;523675;523676;523677;523678;523679;523680;523681;523682 523673 17 VAVVAPMSR Unmodified 928.51642 0.51642191 3031 Q13905 RAPGEF1 Rap guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 54.876 54.876 2 0.038368 52281 QUIQUE_C1563_190116_001 53.968 3.8413 75258000 0 0 0 30384000 0 19288000 25586000 0 0 0 0 0 0 45640 3031 42590 410470;410471;410472 523683;523684;523685 523684 3 VAVVCSSNQNR Unmodified 1232.5932 0.59316868 4238 Q9NP77 SSU72 RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72 yes yes 0 0 0 1 1 1 15.216 15.216 2 0.0032411 7935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.838 74.398 34505000 16632000 0 0 0 0 17873000 0 0 0 0 0 0 0 45641 4238 42591 410473;410474;410475 523686;523687;523688 523688 3 VAVVDYVEPSPQGTR Unmodified 1615.8206 0.82058566 330 A0A182DWF2;D3YTF8;A0A182DWF3;Q9NNW7;A0A096LPD9;E7EWK1 TXNRD2 Thioredoxin reductase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 71.678 71.678 2 0.0040724 71767 QUIQUE_C1277_190116_001 81.923 66.59 40278000 0 40278000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45642 330 42592 410476 523689 523689 1 VAVVNQIAR Unmodified 968.57671 0.57671398 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 34.119 34.119 2 4.0357E-09 30064 QUIQUE_C1218_190116_001 170.17 50.601 18751000000 1551400000 1898900000 1165200000 1300400000 2217400000 1040200000 1187300000 1274900000 1486300000 909520000 1818500000 1547000000 1353900000 45643 2851 42593 410477;410478;410479;410480;410481;410482;410483;410484;410485;410486;410487;410488;410489;410490 523690;523691;523692;523693;523694;523695;523696;523697;523698;523699;523700;523701;523702;523703;523704;523705;523706;523707;523708;523709;523710;523711;523712;523713;523714;523715;523716;523717;523718;523719;523720;523721;523722;523723;523724;523725;523726;523727;523728;523729 523691 40 VAVVQYSDR Unmodified 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523737;523738;523739;523740;523741;523742;523743;523744;523745;523746;523747;523748;523749;523750;523751;523752;523753;523754;523755;523756;523757;523758;523759;523760;523761;523762;523763 523758 27 VAVWGNK Unmodified 772.42317 0.42317345 2883 Q03013 GSTM4 Glutathione S-transferase Mu 4 yes yes 0 0 0 1 27.999 27.999 2 0.034454 22391 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.627 52.521 53172000 0 0 0 0 0 0 0 53172000 0 0 0 0 0 45646 2883 42596 410521 523764;523765 523765 2 VAWCLEAASLSHRPGPR Unmodified 1905.9632 0.96318434 979 E9PRY8;A0A087X1X7;H0YCK7;A0A0J9YXU2 EEF1D yes no 0 0 1 1 66.522 66.522 3 0.018623 67485 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.871 27.617 29746000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29746000 0 0 45647 979 42597 410522 523766 523766 1 VAWVSHDSTVCLADADKK Unmodified 2000.9626 0.96257522 369;1485 A0A1W2PNV4;O15143;C9JEY1;C9K057 ARPC1B Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 52.43 52.43 3 4.138E-08 50253 QUIQUE_C1403_190116_001 86.179 78.74 164170000 0 0 92321000 0 0 0 0 0 0 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VAYLDPLELSEGK Unmodified 1432.745 0.7449611 66 A0A087WXM8;P50895 BCAM Basal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.82 115.82 2 0.00083998 118164 QUIQUE_C1563_190116_001 83.775 65.463 502470000 54144000 60254000 57282000 37965000 56444000 39680000 51577000 0 60262000 30947000 53916000 0 0 45652 66 42602 410533;410534;410535;410536;410537;410538;410539;410540;410541;410542 523777;523778;523779;523780;523781;523782;523783;523784;523785;523786 523782 10 VAYSNDSANWTEYQDPR Unmodified 2014.8657 0.86569795 2921 Q08431 MFGE8 Lactadherin;Lactadherin short form;Medin yes yes 0 0 0 1 17.615 17.615 4 0.057207 10223 QUIQUE_C1438_190116_001 14.929 5.0066 28724000 0 0 0 0 28724000 0 0 0 0 0 0 0 0 45653 2921 42603 410543 523787 523787 1 VAYTTVLQEWLR Unmodified 1477.7929 0.79291434 3346 Q63ZY3;K7EIU4 KANK2 KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 145.14 145.14 2 0.00065972 151727 QUIQUE_C1438_190116_001 112.71 87.137 298820000 0 21415000 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523839;523840;523841;523842;523843;523844;523845;523846;523847;523848;523849;523850;523851;523852;523853;523854;523855;523856;523857;523858;523859;523860 523846 20 VCDQVFALIENLTHQIR Unmodified 2055.0571 0.057144309 652 F8W9A8;B7WPL9;Q6PFW1 PPIP5K1 Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 160.85 160.85 3 0.00083735 164686 QUIQUE_C1403_190116_001 58.98 53.65 115290000 15264000 29340000 0 20078000 27853000 0 0 0 0 0 0 0 22750000 45662 652 42612 410606;410607;410608;410609;410610 523861;523862;523863;523864;523865;523866 523863 6 VCDSCYDSIKDEDR Unmodified 1760.6982 0.69816361 3536 Q8IWB7 WDFY1 WD repeat and FYVE domain-containing protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 33.769 33.769 2;3 8.807E-12 28658 QUIQUE_C1277_190116_001 149.26 133.01 334380000 26586000 0 0 0 54553000 0 48426000 0 0 27334000 68307000 47753000 61423000 45663 3536 42613 410611;410612;410613;410614;410615;410616;410617;410618;410619;410620;410621 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523885;523886;523887;523888;523889;523890;523891;523892;523893;523894;523895;523896;523897 523893 13 VCEDFGVIATFDPK Unmodified 1596.7494 0.74939455 2086 P15104;A0A2R8YDT1 GLUL Glutamine synthetase yes no 0 0 0 1 3 3 1 1 1 1 1 1 2 6 1 1 122.1 122.1 2 1.1147E-14 126424 QUIQUE_C1368_190116_001 148.28 125.64 1889200000 226300000 143970000 326290000 156200000 90134000 180040000 103730000 51482000 38996000 160860000 261830000 63078000 86275000 45666 2086 42616 410640;410641;410642;410643;410644;410645;410646;410647;410648;410649;410650;410651;410652;410653;410654;410655;410656;410657;410658;410659;410660;410661;410662 523898;523899;523900;523901;523902;523903;523904;523905;523906;523907;523908;523909;523910;523911;523912;523913;523914;523915;523916;523917;523918;523919;523920;523921;523922;523923;523924;523925;523926;523927;523928;523929;523930;523931;523932;523933;523934;523935;523936;523937;523938;523939;523940;523941;523942;523943 523908 43 VCEDFGVIATFDPKPIPGNWNGAGCHTNFSTK Unmodified 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protein S17 yes no 0 0 1 1 1 1 47.41 47.41 3 0.0061132 44431 QUIQUE_DMIX8_190116_001 38.445 28.346 192700000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68033000 57255000 67416000 45669 1183 42619 410680;410681;410682 523970;523971;523972 523972 3 VCEHLNLLEK Unmodified 1253.6438 0.64380726 143;4559;560;933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;O43491;A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3QS55;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L2;EPB41L3 Band 4.1-like protein 2;Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 44.532 44.532 2;3 1.8953E-07 42221 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.37 121.77 11056000000 1071400000 1199500000 1011900000 1240500000 1024400000 877510000 1053900000 188930000 701960000 584770000 671310000 749040000 680610000 45670 933;1529;143;560;4559 42620 410683;410684;410685;410686;410687;410688;410689;410690;410691;410692;410693;410694;410695;410696;410697;410698;410699;410700;410701;410702;410703;410704;410705;410706;410707 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4598 42628 410756;410757;410758;410759;410760;410761;410762;410763;410764;410765 524081;524082;524083;524084;524085;524086;524087;524088;524089;524090;524091 524086 10 VCFQYLNR Unmodified 1098.528 0.52804923 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.637 64.637 2 0.0010602 63609 QUIQUE_DMIX8_190116_001 146.21 119.61 7523900000 434630000 273100000 525020000 689260000 528110000 525530000 761200000 647650000 682680000 348140000 658610000 596650000 853350000 45679 4560 42629 410766;410767;410768;410769;410770;410771;410772;410773;410774;410775;410776;410777;410778 524092;524093;524094;524095;524096;524097;524098;524099;524100;524101;524102;524103;524104;524105;524106;524107;524108;524109;524110;524111;524112;524113;524114;524115 524114 24 VCFSYIAVPSSYSPTVALDYVLDADTDRR Unmodified 3279.5758 0.57579386 3022 Q13683 ITGA7 Integrin alpha-7;Integrin alpha-7 heavy chain;Integrin alpha-7 light chain;Integrin alpha-7 70 kDa form yes yes 0 0 1 1 1 162.15 162.15 3 0.00033117 166811 QUIQUE_DMIX8_190116_001 37.637 27.308 86749000 0 0 0 0 29024000 0 0 0 0 0 0 0 57725000 45680 3022 42630 410779;410780 524116;524117;524118 524118 3 VCGCDLAQGGFFIK Unmodified 1570.7272 0.72721932 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104 104 2 7.7373E-05 108493 QUIQUE_C1218_190116_001 115.78 100.64 1371100000 77463000 140620000 98780000 111130000 95830000 78402000 107640000 130370000 122940000 66633000 101280000 105190000 134860000 45681 151 42631 410781;410782;410783;410784;410785;410786;410787;410788;410789;410790;410791;410792;410793 524119;524120;524121;524122;524123;524124;524125;524126;524127;524128;524129;524130;524131;524132;524133 524120 15 VCGDPEVTVDALR Unmodified 1429.6871 0.68712864 3311 Q5T447 HECTD3 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3 yes yes 0 0 0 1 75.028 75.028 2 0.014848 75858 QUIQUE_C1218_190116_001 60.255 46.562 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45682 3311 42632 410794 524134 524134 1 VCGDSDKGFVVINQK Unmodified 1664.8192 0.81920545 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 1 2 2 2 1 43.446 43.446 2;3 0.0029609 40681 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.657 54.28 388250000 0 0 0 0 0 0 0 0 38950000 0 145380000 124820000 79097000 45683 2424 42633 410795;410796;410797;410798;410799;410800;410801 524135;524136;524137;524138;524139;524140;524141 524135 7 VCGHQGNVLDIK Unmodified 1338.6714 0.671419 4526 Q9UQ03 CORO2B Coronin-2B yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 28.813 28.813 2;3 9.6796E-06 22673 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.98 90.259 1977400000 279970000 307680000 439650000 94452000 0 0 134780000 115180000 157300000 59602000 111230000 200680000 76879000 45684 4526 42634 410802;410803;410804;410805;410806;410807;410808;410809;410810;410811;410812;410813;410814;410815 524142;524143;524144;524145;524146;524147;524148;524149;524150;524151;524152;524153;524154;524155;524156;524157 524154 16 VCGSNLLSICK Unmodified 1249.6159 0.61587795 2689 P60201 PLP1 Myelin proteolipid protein yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.768 67.768 2 0.00048057 66988 QUIQUE_C1403_190116_001 118.18 89.959 27267000000 2725200000 2137300000 6755200000 1976300000 1515200000 1357800000 0 1409100000 1145100000 1029600000 3733200000 1320500000 2162600000 45685 2689 42635 410816;410817;410818;410819;410820;410821;410822;410823;410824;410825;410826;410827;410828;410829 524158;524159;524160;524161;524162;524163;524164;524165;524166;524167;524168;524169;524170;524171;524172;524173;524174;524175;524176;524177 524163 19 VCGYDTPFPHIFEPFYIPDK Unmodified 2441.1402 0.14020524 2188 P21953 BCKDHB 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 149.75 149.75 3 0.0010921 155476 QUIQUE_C1218_190116_001 39.825 32.203 189960000 31901000 0 0 50719000 0 0 0 0 0 0 52352000 0 54987000 45686 2188 42636 410830;410831;410832;410833 524178;524179;524180;524181 524178 4 VCGYDTPFPHIFEPFYIPDKWK Unmodified 2755.3145 0.31448121 2188 P21953 BCKDHB 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 146.55 146.55 4 0.01446 153556 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.765 25.118 165320000 0 0 0 0 0 0 0 34013000 0 0 64929000 66379000 0 45687 2188 42637 410834;410835;410836 524182;524183;524184 524183 3 VCHAHPTLSEAFR Unmodified 1523.7303 0.73033086 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 3 1 1 1 1 1 1 2 3 1 2 1 27.993 27.993 2;3;4 4.2689E-10 22403 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.99 120.37 7216900000 1130000000 587670000 704040000 568630000 478000000 661060000 533930000 660170000 836510000 217190000 430190000 0 409560000 45688 1971 42638 410837;410838;410839;410840;410841;410842;410843;410844;410845;410846;410847;410848;410849;410850;410851;410852;410853;410854 524185;524186;524187;524188;524189;524190;524191;524192;524193;524194;524195;524196;524197;524198;524199;524200;524201;524202;524203;524204;524205;524206;524207 524201 21 VCHLMGINVTDFTR Unmodified 1661.8018 0.80178124 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 97.014 97.014 2;3 0.0090241 100898 QUIQUE_C1438_190116_001 31.389 20.018 111160000 0 73018000 0 0 38137000 0 0 0 0 0 0 0 0 45689 2385 42639 410855;410856;410857;410858 524208;524209;524210;524211;524212 524210 4 VCIAQGYQR Unmodified 1093.5339 0.53386288 1004 F5H283;Q92563 SPOCK2 Testican-2 yes no 0 0 0 1 1 1 31.056 31.056 2 0.010786 25465 QUIQUE_C1403_190116_001 73.637 53.64 64677000 18107000 0 0 29486000 0 17084000 0 0 0 0 0 0 0 45690 1004 42640 410859;410860;410861 524213;524214;524215 524214 3 VCIEHHTFFR Unmodified 1344.6397 0.63972494 4172 Q9H4G0;A0A0C4DH22 EPB41L1 Band 4.1-like protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 36.301 36.301 2;3 1.6328E-11 33084 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.59 145.95 5487700000 423330000 512410000 388930000 442850000 481840000 436940000 468020000 365030000 444190000 116890000 410190000 377720000 619320000 45691 4172 42641 410862;410863;410864;410865;410866;410867;410868;410869;410870;410871;410872;410873;410874;410875;410876;410877;410878;410879;410880;410881;410882;410883;410884;410885;410886 524216;524217;524218;524219;524220;524221;524222;524223;524224;524225;524226;524227;524228;524229;524230;524231;524232;524233;524234;524235;524236;524237;524238;524239;524240;524241;524242;524243;524244;524245;524246;524247 524235 32 VCIESEHSMDTLLATLK Unmodified 1945.9489 0.94889899 835 E5RGN3;E5RIM7;O00244 ATOX1 Copper transport protein ATOX1 yes no 0 0 0 1 115.12 115.12 3 0.021601 119477 QUIQUE_DMIX8_190116_001 35.176 25.036 64231000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64231000 45692 835 42642 410887 524248 524248 1 VCIESEHSMDTLLATLKK Unmodified 2074.0439 0.04386201 835 E5RGN3;E5RIM7;O00244 ATOX1 Copper transport protein ATOX1 yes no 0 0 1 1 98.029 98.029 3 0.018189 102577 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.687 20.281 43659000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43659000 0 0 45693 835 42643 410888 524249 524249 1 VCIVGSGNWGSAIAK Unmodified 1517.766 0.76604767 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 89.426 89.426 2 8.0963E-09 90924 QUIQUE_C1403_190116_001 125.72 103.19 1023100000 190140000 0 89803000 109790000 0 152210000 99823000 160840000 62783000 0 80544000 77188000 0 45694 2184 42644 410889;410890;410891;410892;410893;410894;410895;410896;410897;410898;410899 524250;524251;524252;524253;524254;524255;524256;524257;524258;524259;524260;524261 524252 12 VCIVGSGNWGSAVAK Unmodified 1503.7504 0.7503976 3579 Q8N335;C9JM46 GPD1L Glycerol-3-phosphate dehydrogenase 1-like protein;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)] yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.743 79.743 2 1.2413E-05 80619 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.42 88.463 930020000 93245000 101320000 79840000 97721000 0 75484000 97246000 90181000 0 0 86219000 85100000 123660000 45695 3579 42645 410900;410901;410902;410903;410904;410905;410906;410907;410908;410909;410910 524262;524263;524264;524265;524266;524267;524268;524269;524270;524271;524272;524273;524274;524275;524276;524277 524272 16 VCLESAVELPK Unmodified 1243.6482 0.64822394 2481 P46736;X6RJS7;A0A087WZR3;H9KVA9;A0A0D9SF50 BRCC3 Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36 yes no 0 0 0 1 1 82.363 82.363 2 0.008287 83258 QUIQUE_C1403_190116_001 64.297 45.858 51346000 0 0 0 27078000 0 0 24269000 0 0 0 0 0 0 45696 2481 42646 410911;410912 524278;524279 524278 2 VCLIGCGFSTGYGSAVNVAK Unmodified 2058.9867 0.98668148 1774 P00325;D6RHZ6;V9HW50;P07327 ADH1B;HEL-S-117;ADH1A Alcohol dehydrogenase 1B;Alcohol dehydrogenase 1A yes no 0 0 0 1 1 1 109.35 109.35 2 9.5945E-06 111642 QUIQUE_C1563_190116_001 108.59 94.689 77235000 0 22786000 34245000 0 0 20204000 0 0 0 0 0 0 0 45697 1774 42647 410913;410914;410915 524280;524281;524282 524282 2 VCLLGCGISTGYGAAVNTAK Unmodified 2010.9867 0.98668148 2028 P11766;H0YAG8 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 2 2 1 2 1 102.89 102.89 2;3 6.458E-153 105712 QUIQUE_C1277_190116_001 233.24 222.02 6495400000 590280000 405560000 507820000 663820000 475770000 381380000 450880000 300430000 669510000 274880000 388480000 864260000 522300000 45698 2028 42648 410916;410917;410918;410919;410920;410921;410922;410923;410924;410925;410926;410927;410928;410929;410930;410931;410932;410933 524283;524284;524285;524286;524287;524288;524289;524290;524291;524292;524293;524294;524295;524296;524297;524298;524299;524300;524301;524302;524303;524304;524305;524306;524307;524308;524309;524310;524311;524312;524313;524314;524315;524316;524317;524318;524319;524320;524321 524288 38 VCLLGDTGVGK Unmodified 1117.5801 0.58014438 3021 Q13636;J3QR51 RAB31 Ras-related protein Rab-31 no no 0 0 0 1 1 1 1 60.75 60.75 2 0.0046406 59982 QUIQUE_C1368_190116_001 70.908 54.132 93897000 0 0 93897000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45699 3021 42649 410934;410935;410936;410937 524322;524323;524324;524325 524323 4 VCLNLPYFLR Unmodified 1293.6904 0.69036353 3312 Q5T4S7 UBR4 E3 ubiquitin-protein ligase UBR4 yes yes 0 0 0 1 1 134.76 134.76 2 0.016068 140006 QUIQUE_C1368_190116_001 101.33 89.48 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45700 3312 42650 410938;410939 524326;524327 524327 2 VCLQPIR Unmodified 884.49021 0.49020716 987;1998;2987 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9;H0Y380;Q3KPI9;F5GWR7;P23468;Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRF;PTPRD;PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F;Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 38.389 38.389 2 0.049861 32724 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.832 42.718 15031000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15031000 0 0 0 45701 1998;987;2987 42651 410940 524328 524328 1 VCLVQGTAEALNAVHSFIAEK Unmodified 2256.1573 0.15725228 4515 Q9UNW9 NOVA2 RNA-binding protein Nova-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 146.92 146.92 3 4.4515E-14 151072 QUIQUE_C1403_190116_001 116.98 109.44 1619400000 120520000 146890000 0 101050000 156410000 202700000 237970000 100700000 86497000 0 136680000 107250000 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168070000 125320000 168360000 45704 4567 42654 410954;410955;410956;410957;410958;410959;410960;410961;410962;410963;410964;410965;410966;410967 524343;524344;524345;524346;524347;524348;524349;524350;524351;524352;524353;524354;524355;524356;524357;524358 524349 14 VCMDLNDTFPEYK Oxidation (M) 1646.6956 0.69564442 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6 GDA Guanine deaminase yes no 0 1 0 1 1 79.433 79.433 2 0.0053049 80610 QUIQUE_C1368_190116_001 68.536 59.103 49728000 0 0 26497000 23231000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45705 4567 42654 410968;410969 524359;524360 524359 3021 1 VCMVYDLYK Unmodified 1189.5512 0.55115243 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 0 0 1 86.013 86.013 2 0.025868 87128 QUIQUE_C1403_190116_001 58.981 42.205 129360000 0 0 0 129360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45706 2339 42655 410970 524361 524361 1 VCNEVVDTCLYK Unmodified 1498.6796 0.67960042 2387 P35813 PPM1A Protein phosphatase 1A yes yes 0 0 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524368;524369;524370;524371;524372;524373;524374;524375;524376;524377;524378;524379;524380;524381;524382;524383;524384;524385;524386;524387;524388;524389;524390;524391;524392;524393;524394;524395;524396;524397;524398;524399;524400;524401;524402;524403;524404 524387 35 VCNLIDSGTK Unmodified 1105.5438 0.54375887 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.972 32.972 2 2.1985E-05 28102 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.79 102.06 17949000000 1266600000 1471500000 1619200000 1483900000 1325500000 1574200000 1470100000 1185400000 1431400000 583670000 1532600000 1324100000 1680500000 45709 2870 42658 411003;411004;411005;411006;411007;411008;411009;411010;411011;411012;411013;411014;411015 524405;524406;524407;524408;524409;524410;524411;524412;524413;524414;524415;524416;524417;524418;524419;524420;524421 524419 16 VCNPIITK Unmodified 943.51609 0.51608756 2010;558 A8K7Q2;E9PS65;P11142;E9PKE3;E9PNE6 HSPA8 Heat shock cognate 71 kDa protein no no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 2 2 1 29.511 29.511 1;2 0.0041713 23934 QUIQUE_C1277_190116_001 110.12 63.353 30873000000 2683700000 2791200000 2566200000 2793600000 2479500000 2555000000 2759300000 1319000000 1885200000 1057900000 2918500000 2479400000 2584300000 45710 558;2010 42659 411016;411017;411018;411019;411020;411021;411022;411023;411024;411025;411026;411027;411028;411029;411030;411031;411032;411033 524422;524423;524424;524425;524426;524427;524428;524429;524430;524431;524432;524433;524434;524435;524436;524437;524438;524439;524440;524441 524423 15 VCNQCGFNPNPHLTQVK Unmodified 2011.9356 0.93564896 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 1 1 47.101 47.101 3 0.0013183 44932 QUIQUE_C1218_190116_001 65.225 60.121 209500000 60803000 62183000 0 0 40236000 0 0 0 0 0 0 0 46277000 45711 4517 42660 411034;411035;411036;411037 524442;524443;524444;524445 524442 4 VCNQIEFLNTEFK Unmodified 1640.7868 0.78684269 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.64 109.64 2 7.9402E-08 114747 QUIQUE_DMIX5_190116_001 161.51 140.14 881390000 0 77506000 281220000 0 0 0 0 88511000 83843000 0 350310000 0 0 45712 1452 42661 411038;411039;411040;411041;411042;411043;411044;411045;411046 524446;524447;524448;524449;524450;524451;524452;524453;524454;524455 524455 9 VCNYGLTFTQK Unmodified 1329.6387 0.63872189 4545;832 E5RFP6;E5RK27;Q9Y277;E5RJN6;E5RHZ6;E5RHE1 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.374 68.374 2 4.1044E-05 67376 QUIQUE_DMIX8_190116_001 138.11 127.59 9647800000 1234600000 1005300000 960800000 0 744320000 826630000 910560000 864320000 820410000 519760000 892700000 0 868340000 45713 832;4545 42662 411047;411048;411049;411050;411051;411052;411053;411054;411055;411056;411057;411058;411059;411060 524456;524457;524458;524459;524460;524461;524462;524463;524464;524465;524466;524467;524468;524469;524470;524471;524472;524473;524474;524475;524476;524477;524478;524479;524480;524481;524482;524483;524484;524485 524482 30 VCNYVNWIQQTIAAN Unmodified 1792.8567 0.85665359 761 CON__P00761 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 159.71 159.71 2;3 1.2365E-29 163678 QUIQUE_C1277_190116_001 166.93 151.73 4345900000 327980000 578410000 508310000 504580000 840120000 515090000 556140000 70721000 91877000 161950000 0 86296000 104460000 + 45714 761 42663 411061;411062;411063;411064;411065;411066;411067;411068;411069;411070;411071;411072;411073;411074;411075;411076;411077;411078 524486;524487;524488;524489;524490;524491;524492;524493;524494;524495;524496;524497;524498;524499;524500;524501;524502;524503 524488 18 VCPFAGILENGAVR Unmodified 1501.7711 0.77113304 1831 P02749;J3QRN2;J3QLI0 APOH Beta-2-glycoprotein 1 yes no 0 0 0 1 111.51 111.51 2 0.014798 116903 QUIQUE_C1438_190116_001 53.08 41.867 26048000 0 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[NADP], mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 35.133 35.133 2 1.4282E-12 30032 QUIQUE_C1368_190116_001 152.54 129.8 3298700000 175490000 280430000 318690000 254170000 193140000 283800000 0 255380000 305370000 166200000 399890000 312860000 353310000 45730 2518 42678 411195;411196;411197;411198;411199;411200;411201;411202;411203;411204;411205;411206 524637;524638;524639;524640;524641;524642;524643;524644;524645;524646;524647;524648;524649 524639 1945 11 VCVETVESGAMTK Unmodified 1409.6531 0.65305132 2518 P48735 IDH2 Isocitrate dehydrogenase [NADP], mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 3 1 1 1 2 2 2 50.153 50.153 2 8.3494E-08 48586 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.8 94.766 7494300000 792960000 687760000 684420000 606420000 365730000 565990000 486540000 621560000 464730000 193750000 837360000 579240000 607850000 45731 2518 42678 411207;411208;411209;411210;411211;411212;411213;411214;411215;411216;411217;411218;411219;411220;411221;411222;411223;411224;411225 524650;524651;524652;524653;524654;524655;524656;524657;524658;524659;524660;524661;524662;524663;524664;524665;524666;524667;524668;524669;524670;524671;524672;524673;524674;524675;524676;524677 524672 27 VCVGTWNVNGGK Unmodified 1289.6187 0.61865515 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 61.098 61.098 2 0.017538 59900 QUIQUE_C1277_190116_001 65.347 40.528 68315000 0 68315000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45732 723 42679 411226 524678 524678 1 VCVIDEIGK Unmodified 1031.5321 0.53213155 3326 Q5TDF0;Q9BSD7 NTPCR Cancer-related nucleoside-triphosphatase yes no 0 0 0 1 62.889 62.889 2 0.026091 62669 QUIQUE_C1576_190116_001 76.478 39.457 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45733 3326 42680 411227 524679 524679 1 VCVNVHSFKPEELMVK Unmodified 1914.9696 0.96957485 4464 Q9UJY1 HSPB8 Heat shock protein beta-8 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 78.443 78.443 3;4 6.8497E-08 79377 QUIQUE_C1403_190116_001 112.8 103.38 892770000 34302000 40445000 121660000 66109000 44979000 0 153460000 46459000 83362000 0 48198000 48703000 205090000 45734 4464 42681 411228;411229;411230;411231;411232;411233;411234;411235;411236;411237;411238;411239;411240 524680;524681;524682;524683;524684;524685;524686;524687;524688;524689;524690;524691;524692;524693 524683 14 VCVSLLGTWIGK Unmodified 1331.7271 0.72714296 4094 Q9C0C9;K7ES11 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 129.79 129.79 2 0.0045435 133923 QUIQUE_C1277_190116_001 68.893 49.106 215780000 33576000 29706000 30695000 26442000 31022000 20716000 22715000 0 0 0 20909000 0 0 45735 4094 42682 411241;411242;411243;411244;411245;411246;411247;411248 524694;524695;524696;524697;524698;524699;524700;524701 524695 8 VCYEGQPVGEFIHCLQNHPEHM Unmodified 2680.1621 0.16209644 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 108.84 108.84 4 0.00022467 112259 QUIQUE_C1403_190116_001 48.229 45.755 72783000 0 0 0 42036000 0 0 0 0 0 0 0 0 30747000 45736 2184 42683 411249;411250 524702;524703 524702 2 VCYLPLNTFLLR Unmodified 1507.8221 0.82210598 734 C9JME2;Q9Y4F1;H0Y783;M0QXT1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 144.95 144.95 2 0.0021004 149187 QUIQUE_C1403_190116_001 83.948 66.922 334780000 46964000 56128000 56559000 50244000 43555000 0 0 0 0 15729000 38675000 26925000 0 45737 734 42684 411251;411252;411253;411254;411255;411256;411257;411258 524704;524705;524706;524707;524708;524709;524710;524711;524712 524708 9 VCYLPLNTFLLRPLHR Unmodified 2011.119 0.1189567 734 C9JME2;Q9Y4F1;H0Y783;M0QXT1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 121.23 121.23 4 2.416E-20 124856 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.47 123.87 78400000 0 0 0 0 0 0 0 26447000 0 0 21676000 30277000 0 45738 734 42685 411259;411260;411261 524713;524714;524715;524716 524716 4 VDAAPGIPPAVESIQDSPLPK Unmodified 2100.1103 0.11028532 3162 Q15814 TBCC Tubulin-specific chaperone C yes yes 0 0 0 1 1 118.33 118.33 2 0.01044 121393 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.3 39.043 40048000 0 0 17854000 0 0 0 0 22194000 0 0 0 0 0 45739 3162 42686 411262;411263 524717;524718 524718 2 VDACLELLIR Unmodified 1200.6536 0.65364367 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 1 35.664 35.664 3 0.058769 31112 QUIQUE_C1368_190116_001 26.673 0.63017 20798000 0 0 20798000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45740 2380 42687 411264 524719 524719 1 VDAFLGTWK Acetyl (Protein N-term) 1077.5495 0.54949617 1889 S4R371;P05413;S4R3A2 FABP3 Fatty acid-binding protein, heart yes no 1 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 161.16 161.16 1;2 2.1335E-05 166884 QUIQUE_C1218_190116_001 147.19 128.49 8774800000 973190000 848350000 637350000 465360000 754300000 556010000 680350000 545690000 660910000 263630000 616940000 848270000 924400000 45741 1889 42688 411265;411266;411267;411268;411269;411270;411271;411272;411273;411274;411275;411276;411277;411278;411279;411280;411281 524720;524721;524722;524723;524724;524725;524726;524727;524728;524729;524730;524731;524732;524733;524734;524735;524736;524737;524738;524739;524740;524741;524742;524743;524744;524745;524746;524747;524748;524749;524750;524751;524752;524753;524754 524722 32 VDAILCVAGGWAGGNAK Unmodified 1657.8246 0.82462518 1959 P09417;B7Z415;D6RGG7;H0Y8F7 QDPR Dihydropteridine reductase yes no 0 0 0 4 3 2 1 2 1 1 2 1 114.65 114.65 2 0.00028595 115275 QUIQUE_C1277_190116_001 86.463 70.209 1513000000 257340000 461670000 106970000 0 173140000 0 76004000 0 0 115290000 139360000 183260000 0 45742 1959 42689 411282;411283;411284;411285;411286;411287;411288;411289;411290;411291;411292;411293;411294;411295;411296;411297;411298 524755;524756;524757;524758;524759;524760;524761;524762;524763;524764;524765;524766;524767;524768;524769;524770;524771;524772;524773;524774;524775;524776;524777;524778;524779 524762 24 VDAILNR Unmodified 799.4552 0.45520186 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 29.573 29.573 2 0.019609 24521 QUIQUE_DMIX1_190116_001 127.66 34.065 732040000 0 0 0 0 279040000 0 0 168620000 0 106120000 0 178260000 0 45743 2037 42690 411299;411300;411301;411302 524780;524781;524782;524783 524781 3 VDALGEALQTTVSR Unmodified 1458.7678 0.7678218 3691 Q8TF42 UBASH3B Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B yes yes 0 0 0 1 1 1 95.282 95.282 2 0.00048621 97990 QUIQUE_C1277_190116_001 84.289 65.978 38454000 0 18649000 19805000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45744 3691 42691 411303;411304;411305 524784;524785;524786;524787 524784 4 VDALIDEIDFLR Unmodified 1417.7453 0.74529545 775 CON__P12035;P12035 KRT3 Keratin, type II cytoskeletal 3 yes no 0 0 0 1 1 150.72 150.72 2 0.03617 146389 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.278 40.788 33860000 0 0 0 0 0 0 0 0 33860000 0 0 0 0 + 45745 775 42692 411306;411307 524788;524789 524789 2 VDALMDEINFMK 2 Oxidation (M) 1456.6578 0.65780235 778;792 CON__P13647;P13647;H0YIN9;CON__Q5XQN5;CON__Q922U2 KRT5 Keratin, type II cytoskeletal 5 no no 0 2 0 1 88.137 88.137 2 0.0041977 84623 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.067 62.543 13251000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13251000 0 0 0 + 45746 778;792 42693 411308 524790 524790 469;470 1 VDAQFGGIDQR Unmodified 1204.5836 0.58364985 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 52.315 52.315 2 0.0027292 50268 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.456 47.416 201100000 0 107510000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 93582000 0 45747 2641 42694 411309;411310;411311;411312 524791;524792;524793;524794 524794 3 VDASVAVFCEIQNTLINTLIR Unmodified 2375.2519 0.25188095 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 177.39 177.39 2;3 8.153E-44 177887 QUIQUE_C1563_190116_001 155.98 136.65 863470000 23873000 19084000 48701000 5043600 97772000 47197000 69582000 71421000 151010000 0 161550000 141980000 26253000 45748 2470 42695 411313;411314;411315;411316;411317;411318;411319;411320;411321;411322;411323;411324;411325;411326;411327;411328;411329;411330;411331;411332;411333 524795;524796;524797;524798;524799;524800;524801;524802;524803;524804;524805;524806;524807;524808;524809;524810;524811;524812;524813;524814;524815;524816;524817;524818;524819 524805 24 VDATADYICK Unmodified 1154.5278 0.52777445 2623 P53396 ACLY ATP-citrate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.804 43.804 2 0.00091587 40415 QUIQUE_DMIX8_190116_001 104.2 65.238 1147200000 108860000 118500000 0 69264000 115940000 81328000 114340000 85117000 102840000 38381000 102640000 118990000 91016000 45749 2623 42696 411334;411335;411336;411337;411338;411339;411340;411341;411342;411343;411344;411345 524820;524821;524822;524823;524824;524825;524826;524827;524828;524829;524830;524831;524832;524833;524834;524835;524836 524836 17 VDATAETDLAK Unmodified 1132.5612 0.56118307 2059 P13667 PDIA4 Protein disulfide-isomerase A4 yes yes 0 0 0 1 1 1 34.868 34.868 2 0.00043556 30227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.42 71.659 100600000 0 0 0 0 0 0 0 39250000 0 61351000 0 0 0 45750 2059 42697 411346;411347;411348 524837;524838;524839 524838 2 VDATEESDLAQQYGVR Unmodified 1779.8275 0.82752153 1917 P07237;H7BZ94;I3NI03;I3L3U6 P4HB Protein disulfide-isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 3 1 1 1 86.133 86.133 2;3 2.9542E-207 88670 QUIQUE_C1218_190116_001 274.2 252.18 2621300000 221010000 218470000 212230000 213810000 223210000 194930000 242660000 142630000 203680000 135580000 231880000 164480000 216710000 45751 1917 42698 411349;411350;411351;411352;411353;411354;411355;411356;411357;411358;411359;411360;411361;411362;411363;411364;411365 524840;524841;524842;524843;524844;524845;524846;524847;524848;524849;524850;524851;524852;524853;524854;524855;524856;524857;524858;524859 524841 20 VDAVFVGTGDLFAAMLLAWTHK Unmodified 2361.2191 0.21912426 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 0 1 173.72 173.72 3 3.293E-06 177474 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.779 49.59 15801000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15801000 0 45752 1423 42699 411366 524860 524860 1 VDAVLVTHPGADSLPGLNSLLR Unmodified 2243.2274 0.22738076 3348 Q66K74 MAP1S Microtubule-associated protein 1S;MAP1S heavy chain;MAP1S light chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 130.75 130.75 3 2.399E-07 133821 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.064 61.652 768560000 98087000 70974000 76981000 83525000 76797000 0 92258000 38664000 64252000 0 47661000 63034000 56327000 45753 3348 42700 411367;411368;411369;411370;411371;411372;411373;411374;411375;411376;411377 524861;524862;524863;524864;524865;524866;524867;524868;524869;524870;524871;524872 524867 12 VDAYGNLLVCAHGFNFIR Unmodified 2065.0204 0.020364872 2552 P49902;Q5JUV4;Q5JUV3;H0YHR8 NT5C2 Cytosolic purine 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 132.32 132.32 2;3 3.1768E-05 135452 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.694 90.796 569350000 40044000 49277000 0 54593000 91690000 41355000 66804000 54098000 50760000 0 0 63779000 56955000 45754 2552 42701 411378;411379;411380;411381;411382;411383;411384;411385;411386;411387;411388 524873;524874;524875;524876;524877;524878;524879;524880;524881;524882;524883;524884 524881 12 VDCDQHSDIAQR Unmodified 1442.6208 0.62083999 4007 Q9BS26 ERP44 Endoplasmic reticulum resident protein 44 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 14.683 14.683 2;3 1.4572E-20 6888 QUIQUE_C1438_190116_001 175.49 165.26 1696400000 159070000 192350000 150160000 134040000 213390000 173410000 174600000 57503000 64060000 20156000 161200000 84975000 111440000 45755 4007 42702 411389;411390;411391;411392;411393;411394;411395;411396;411397;411398;411399;411400;411401;411402;411403;411404;411405;411406;411407;411408;411409;411410;411411;411412 524885;524886;524887;524888;524889;524890;524891;524892;524893;524894;524895;524896;524897;524898;524899;524900;524901;524902;524903;524904;524905;524906;524907;524908 524894 23 VDCQAYAQTCQK Unmodified 1470.6231 0.62314818 3546 Q8IXB1 DNAJC10 DnaJ homolog subfamily C member 10 yes yes 0 0 0 1 140.93 140.93 3 0.059811 136839 QUIQUE_DMIX4_190116_001 30.331 22.961 10312000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10312000 0 0 0 45756 3546 42703 411413 524909 524909 1 VDCTAHSDVCSAQGVR Unmodified 1760.757 0.7570159 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 20.958 20.958 2;3 1.7416E-12 14441 QUIQUE_C1438_190116_001 128.68 113.14 125970000 0 0 0 75394000 0 50574000 0 0 0 0 0 0 0 45757 3627 42704 411414;411415;411416;411417 524910;524911;524912;524913 524912 4 VDCTQHYELCSGNQVR Unmodified 1964.8469 0.84689354 3627 Q8NBS9 TXNDC5 Thioredoxin domain-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 37.854 37.854 3 3.5594E-10 33835 QUIQUE_C1277_190116_001 123.03 112.97 350460000 44065000 47701000 40902000 59643000 32323000 45951000 48550000 0 0 0 31322000 0 0 45758 3627 42705 411418;411419;411420;411421;411422;411423;411424;411425 524914;524915;524916;524917;524918;524919;524920;524921;524922;524923 524916 9 VDDAWDLLR Unmodified 1101.5455 0.54547343 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 116.28 116.28 2 0.039812 118564 QUIQUE_C1563_190116_001 67.993 41.031 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45759 2225 42706 411426 524924 524924 1 VDDFLANEAK Unmodified 1120.5401 0.5400537 2602 P52209;K7EM49;K7EPF6;K7EMN2 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.762 56.762 2 0.00017757 54861 QUIQUE_C1368_190116_001 123.21 70.271 6797900000 535900000 440650000 576130000 596500000 521110000 443120000 524060000 473830000 568610000 335560000 658080000 497700000 626670000 45760 2602 42707 411427;411428;411429;411430;411431;411432;411433;411434;411435;411436;411437;411438;411439 524925;524926;524927;524928;524929;524930;524931;524932;524933;524934;524935;524936;524937;524938;524939;524940;524941;524942;524943;524944;524945;524946;524947 524929 23 VDDIFSDLYYVR Unmodified 1503.7246 0.72456001 3216 Q2TAL8 QRICH1 Glutamine-rich protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 143.04 143.04 2 0.0023868 147783 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.096 73.825 110850000 27292000 30177000 27453000 0 0 0 0 0 0 0 0 25932000 0 45761 3216 42708 411440;411441;411442;411443;411444;411445 524948;524949;524950;524951;524952;524953 524952 6 VDDKDKIEGVGAATSAELDMPFYEDK Unmodified 2842.3219 0.32187059 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 2 1 1 112.85 112.85 4 0.028196 114604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 26.706 19.512 182880000 86757000 0 0 0 0 0 0 96122000 0 0 0 0 0 45762 2009 42709 411446;411447 524954;524955 524955 1 VDDKDKIEGVGAATSAELDMPFYEDK Oxidation (M) 2858.3168 0.31678521 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 1 2 1 100.45 100.45 3 0.00056634 102124 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.957 47.794 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45763 2009 42709 411448 524956 524956 1307 1 VDDKVNFHFILFNNVDGHLYELDGR Unmodified 2975.4566 0.45660543 1976 P09936;D6R956 UCHL1 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L1;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 4 1 1 4 1 10 5 8 28 18 11 143.51 143.51 3;4;5 8.9904E-196 140498 QUIQUE_DMIX5_190116_001 235.69 229.8 10434000000 0 366740000 51023000 75154000 229560000 65893000 1064800000 298300000 1266700000 0 2749300000 3059800000 1207000000 45764 1976 42710 411449;411450;411451;411452;411453;411454;411455;411456;411457;411458;411459;411460;411461;411462;411463;411464;411465;411466;411467;411468;411469;411470;411471;411472;411473;411474;411475;411476;411477;411478;411479;411480;411481;411482;411483;411484;411485;411486;411487;411488;411489;411490;411491;411492;411493;411494;411495;411496;411497;411498;411499;411500;411501;411502;411503;411504;411505;411506;411507;411508;411509;411510;411511;411512;411513;411514;411515;411516;411517;411518;411519;411520;411521;411522;411523;411524;411525;411526;411527;411528;411529;411530;411531;411532;411533;411534;411535;411536;411537;411538;411539 524957;524958;524959;524960;524961;524962;524963;524964;524965;524966;524967;524968;524969;524970;524971;524972;524973;524974;524975;524976;524977;524978;524979;524980;524981;524982;524983;524984;524985;524986;524987;524988;524989;524990;524991;524992;524993;524994;524995;524996;524997;524998;524999;525000;525001;525002;525003;525004;525005;525006;525007;525008;525009;525010;525011;525012;525013;525014;525015;525016;525017;525018;525019;525020;525021;525022;525023;525024;525025;525026;525027;525028;525029;525030;525031;525032;525033;525034;525035;525036;525037;525038;525039;525040;525041;525042;525043;525044;525045;525046;525047;525048;525049;525050;525051;525052;525053;525054;525055;525056;525057;525058;525059;525060;525061;525062;525063;525064;525065;525066;525067;525068;525069;525070;525071;525072;525073;525074;525075;525076;525077;525078;525079;525080;525081;525082;525083;525084;525085;525086;525087 525019 122 VDDLLIIEEK Unmodified 1185.6493 0.6492698 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 95.857 95.857 2 0.0023079 93266 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.06 81.115 1208900000 0 67142000 123120000 65877000 118560000 70388000 107080000 89123000 126670000 53034000 151580000 131820000 104470000 45765 3053 42711 411540;411541;411542;411543;411544;411545;411546;411547;411548;411549;411550;411551;411552 525088;525089;525090;525091;525092;525093;525094;525095;525096;525097;525098;525099;525100 525097 7 VDDNEETIK Unmodified 1061.4877 0.48768378 1791 Q5T9B7;P00568 AK1 Adenylate kinase isoenzyme 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.888 17.888 2 0.0025407 10145 QUIQUE_C1403_190116_001 150.05 83.06 3357300000 418150000 399040000 0 342840000 0 410840000 0 458190000 584270000 322830000 0 421160000 0 45766 1791 42712 411553;411554;411555;411556;411557;411558;411559;411560 525101;525102;525103;525104;525105;525106;525107;525108 525103 1 VDDQIAIVFK Unmodified 1146.6285 0.62847478 3123 Q15257;A6PVN5;F6WIT2;Q5T949;Q5T948;A6PVN9 PPP2R4 Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator yes no 0 0 0 1 1 1 1 95.889 95.889 2 1.2073E-06 97204 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.59 115.51 711530000 213480000 0 0 0 223630000 0 0 186050000 0 88373000 0 0 0 45767 3123 42713 411561;411562;411563;411564 525109;525110;525111;525112;525113;525114 525112 4 VDDSSEDKTEFTVK Unmodified 1598.7312 0.73116153 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 33.048 33.048 2;3 3.3596E-37 28159 QUIQUE_DMIX5_190116_001 223.22 198.36 5913000000 168150000 487230000 454360000 531490000 568840000 447940000 477210000 364640000 514310000 206170000 588190000 435530000 668930000 45768 2533 42714 411565;411566;411567;411568;411569;411570;411571;411572;411573;411574;411575;411576;411577;411578;411579;411580;411581;411582;411583;411584;411585;411586;411587;411588;411589;411590 525115;525116;525117;525118;525119;525120;525121;525122;525123;525124;525125;525126;525127;525128;525129;525130;525131;525132;525133;525134;525135;525136;525137;525138;525139;525140;525141;525142;525143;525144;525145;525146 525141 28 VDDSSGSIGR Unmodified 991.45705 0.45705235 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.335 16.335 2 0.0072196 8526 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.36 101.11 509560000 35047000 72287000 0 53050000 0 48871000 12304000 98513000 0 125620000 0 63872000 0 45769 2440 42715 411591;411592;411593;411594;411595;411596;411597;411598;411599 525147;525148;525149;525150;525151;525152;525153;525154;525155 525154 6 VDDVINVAGHR Unmodified 1193.6153 0.61528433 205 A0A0B4J1R2;Q9H6R3 ACSS3 Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 2 34.258 34.258 2;3 0.00029936 29063 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.841 55.079 897460000 43573000 47375000 86082000 107370000 94154000 98818000 68887000 51900000 52342000 32845000 105350000 54482000 54284000 45770 205 42716 411600;411601;411602;411603;411604;411605;411606;411607;411608;411609;411610;411611;411612;411613;411614;411615;411616;411617;411618;411619;411620;411621;411622 525156;525157;525158;525159;525160;525161;525162;525163;525164;525165;525166;525167;525168;525169;525170;525171;525172;525173;525174;525175;525176;525177;525178;525179;525180;525181 525174 26 VDEAVAVLQAHQAK Unmodified 1477.7889 0.7888916 2031 P11940;A0A087WTT1;E7EQV3;E7ERJ7;Q9H361;H0YAS6;H0YB75;H0YAS7;H0YC10 PABPC1;PABPC3 Polyadenylate-binding protein 1;Polyadenylate-binding protein;Polyadenylate-binding protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.458 46.458 3 0.0022435 42969 QUIQUE_C1403_190116_001 45.79 35.99 123820000 34127000 24295000 0 39774000 0 25623000 0 0 0 0 0 0 0 45771 2031 42717 411623;411624;411625;411626;411627 525182;525183;525184;525185;525186 525184 5 VDEEIALR Unmodified 943.49746 0.4974606 2107 P16298;Q5F2F8 PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.47 45.47 2 0.0048648 42508 QUIQUE_DMIX7_190116_001 158.08 116.96 1233400000 135620000 134470000 152820000 146440000 140340000 110430000 158960000 55666000 94638000 0 0 104030000 0 45772 2107 42718 411628;411629;411630;411631;411632;411633;411634;411635;411636;411637 525187;525188;525189;525190;525191;525192;525193;525194;525195;525196;525197;525198 525198 9 VDEFVTHNLSFDEINK Unmodified 1905.9109 0.91085723 2028 P11766 ADH5 Alcohol dehydrogenase class-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 2 96.721 96.721 2;3 3.0024E-256 99344 QUIQUE_DMIX3_190116_001 289.72 258.37 12911000000 867590000 1034900000 1415100000 1103600000 1147100000 1023100000 1000300000 939240000 299970000 608030000 1207800000 1035400000 1228800000 45773 2028 42719 411638;411639;411640;411641;411642;411643;411644;411645;411646;411647;411648;411649;411650;411651;411652;411653;411654;411655;411656;411657;411658;411659;411660;411661;411662;411663 525199;525200;525201;525202;525203;525204;525205;525206;525207;525208;525209;525210;525211;525212;525213;525214;525215;525216;525217;525218;525219;525220;525221;525222;525223;525224;525225 525216 27 VDEIVVLSGDNSK Unmodified 1373.7038 0.70382456 3057 Q14254;J3QLD9;E7EMK3 FLOT2 Flotillin-2 yes no 0 0 0 1 1 69.573 69.573 2 0.039139 70980 QUIQUE_DMIX5_190116_001 64.64 43.176 31236000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31236000 45774 3057 42720 411664;411665 525226;525227 525226 2 VDELISSAIFHFK Unmodified 1504.7926 0.79257999 2986 Q13325 IFIT5 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 5 yes yes 0 0 0 1 122.31 122.31 3 0.019517 126797 QUIQUE_C1218_190116_001 40.552 28.759 28219000 28219000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45775 2986 42721 411666 525228 525228 1 VDELSLYSVPEGQSK Unmodified 1649.8148 0.81483158 1229 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525700 1094 VDFSLAGALNAGFKETR Unmodified 1794.9264 0.92644771 395;1336;389 A0A1W2PR46;A0A1X7SCE1;K7EJU1;K7EKH9;K7ELP4;B4DIR1;A0A1X7SBR3;K7EMP8;P14136 GFAP Glial fibrillary acidic protein no no 0 0 1 7 1 1 125.64 125.64 2;3 2.3531E-43 126250 QUIQUE_DMIX1_190116_001 176.91 153.17 238190000 0 0 0 0 0 0 0 220920000 0 17270000 0 0 0 45790 389;395;1336 42735 412497;412498;412499;412500;412501;412502;412503;412504;412505 526599;526600;526601;526602;526603;526604;526605;526606;526607;526608 526599 10 VDFTEEEINNMK Unmodified 1467.6552 0.65515981 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YKA5 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 83.319 83.319 2 0.036795 84453 QUIQUE_C1403_190116_001 61.353 46.684 47294000 0 0 0 47294000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45791 2487 42736 412506 526609 526609 0 VDFVIPK Unmodified 816.47454 0.47454032 1645 O75534;E9PLT0 CSDE1 Cold shock domain-containing protein E1 yes no 0 0 0 1 1 1 70.629 70.629 2 0.053305 71569 QUIQUE_C1218_190116_001 73.039 41.736 100280000 35844000 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526718;526719;526720;526721;526722;526723;526724;526725;526726;526727;526728;526729;526730;526731;526732 526728 14 VDGNDVFAVYNATK Unmodified 1511.7256 0.72562264 1012 F5H5P2;P12694;F5GXU9 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 103.26 103.26 2 0.00081376 100061 QUIQUE_DMIX4_190116_001 86.288 67.508 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45801 1012 42746 412589 526733 526733 1 VDGVAAALDSFQAR Unmodified 1418.7154 0.7153923 2437 P41226 UBA7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 7 yes yes 0 0 0 1 107.98 107.98 2 0.048072 113480 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.004 31.75 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45802 2437 42747 412590 526734 526734 1 VDHESLNATPQVAMQVLEIHYTPSVK Unmodified 2905.4644 0.46439292 3582 Q8N3J6 CADM2 Cell adhesion molecule 2 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.62 119.62 3;4 1.4922E-84 123384 QUIQUE_C1277_190116_001 173.01 163.68 610000000 55821000 49256000 58815000 45863000 0 42822000 0 35868000 67152000 32406000 99267000 69186000 53545000 45803 3582 42748 412591;412592;412593;412594;412595;412596;412597;412598;412599;412600;412601;412602;412603;412604 526735;526736;526737;526738;526739;526740;526741;526742;526743;526744;526745;526746;526747;526748;526749;526750;526751;526752;526753 526738 19 VDHFGFNTVK Unmodified 1162.5771 0.57710791 2455 P42785;E9PNF7 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 44.066 44.066 3 0.0078098 41175 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.103 43.104 49643000 0 0 0 22353000 0 27290000 0 0 0 0 0 0 0 45804 2455 42749 412605;412606;412607 526754;526755;526756 526756 3 VDHGAEIITQSPGR Unmodified 1478.7478 0.74775506 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 31.067 31.067 2;3 7.0087E-101 26601 QUIQUE_C1218_190116_001 228.74 188.96 3667100000 339470000 372710000 237350000 531360000 228960000 292020000 184780000 369280000 355230000 28167000 369570000 233740000 124510000 45805 2009 42750 412608;412609;412610;412611;412612;412613;412614;412615;412616;412617;412618;412619;412620;412621;412622;412623;412624;412625;412626;412627;412628;412629;412630;412631 526757;526758;526759;526760;526761;526762;526763;526764;526765;526766;526767;526768;526769;526770;526771;526772;526773;526774;526775;526776;526777;526778;526779;526780;526781;526782;526783;526784 526758 24 VDHIIDICFLK Unmodified 1371.7221 0.72205759 1310 K4DI93;Q13620 CUL4B Cullin-4B yes no 0 0 0 1 1 1 106.29 106.29 3 0.011912 110315 QUIQUE_C1218_190116_001 66.262 55.714 36998000 16357000 16386000 0 0 0 0 0 0 0 4255400 0 0 0 45806 1310 42751 412632;412633;412634 526785;526786;526787 526785 2 VDHQTGPIVWGEPGTNGQHAFYQLIHQGTK Unmodified 3314.6221 0.62210763 199 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;K7ESF4 GPI Glucose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 2 3 3 3 3 3 2 2 105.64 105.64 3;4;5 1.9536E-102 110125 QUIQUE_C1438_190116_001 173.11 162.78 11258000000 560620000 989770000 859580000 856640000 875140000 454550000 726340000 1712100000 1162800000 384140000 872490000 1230200000 573490000 45807 199 42752 412635;412636;412637;412638;412639;412640;412641;412642;412643;412644;412645;412646;412647;412648;412649;412650;412651;412652;412653;412654;412655;412656;412657;412658;412659;412660;412661;412662;412663;412664;412665;412666;412667;412668;412669 526788;526789;526790;526791;526792;526793;526794;526795;526796;526797;526798;526799;526800;526801;526802;526803;526804;526805;526806;526807;526808;526809;526810;526811;526812;526813;526814;526815;526816;526817;526818;526819;526820;526821;526822;526823;526824;526825;526826;526827;526828;526829;526830;526831;526832;526833;526834 526803 46 VDHRPWVLR Unmodified 1176.6516 0.65161026 2807 P78357 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 32.38 32.38 3 0.021846 26728 QUIQUE_C1277_190116_001 47.187 17.413 109390000 0 65688000 0 0 0 0 0 0 27468000 16230000 0 0 0 45808 2807 42753 412670;412671;412672 526835;526836;526837 526835 3 VDHVQMIVLDEADK Unmodified 1610.7974 0.79740737 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 0 1 1 76.275 76.275 2 0.00081072 77251 QUIQUE_C1218_190116_001 81.239 71.286 28455000 28455000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45809 2249 42754 412673;412674 526838;526839 526838 2 VDIDAPDVDVHGPDWHLK Unmodified 2026.9749 0.97485447 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 3 3 3 3 2 3 2 3 93.026 93.026 2;3;4 7.465E-25 94558 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.32 122.91 6782500000 355380000 436210000 448030000 415240000 587400000 625960000 608630000 1023000000 378800000 160020000 701010000 412520000 630300000 45810 2935 42755 412675;412676;412677;412678;412679;412680;412681;412682;412683;412684;412685;412686;412687;412688;412689;412690;412691;412692;412693;412694;412695;412696;412697;412698;412699;412700;412701;412702;412703;412704;412705;412706;412707;412708;412709;412710 526840;526841;526842;526843;526844;526845;526846;526847;526848;526849;526850;526851;526852;526853;526854;526855;526856;526857;526858;526859;526860;526861;526862;526863;526864;526865;526866;526867;526868;526869;526870;526871;526872;526873;526874;526875;526876 526863 36 VDIDAPDVEVHDPDWHLK Unmodified 2098.996 0.99598384 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 92.936 92.936 3;4 0.00019743 94388 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.41 53.156 667440000 47685000 42244000 0 0 59919000 0 0 267600000 61166000 16515000 127970000 44340000 0 45811 2935 42756 412711;412712;412713;412714;412715;412716;412717;412718;412719;412720 526877;526878;526879;526880;526881;526882;526883;526884;526885;526886 526881 10 VDIDAPDVSIEGPDAK Unmodified 1639.7941 0.79409613 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 90.476 90.476 2 1.3329E-18 91416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.45 111.69 160900000 0 0 0 0 0 34446000 0 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526904;526905;526906;526907;526908;526909;526910;526911;526912;526913;526914;526915;526916;526917;526918;526919;526920;526921;526922;526923 526921 20 VDIDVPDVNIEGPDAK Unmodified 1694.8363 0.8362953 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 108.11 108.11 2 2.3393E-05 110056 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.72 10.477 938970000 82711000 71768000 0 0 101210000 147220000 133520000 256500000 0 0 0 146040000 0 45818 2935 42763 412749;412750;412751;412752;412753;412754;412755;412756 526924;526925;526926;526927;526928;526929;526930;526931 526930 8 VDIDVPDVNLEAPEGK Unmodified 1708.8519 0.85194536 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.85 110.85 2 2.3393E-05 113462 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.84 98.982 582410000 0 0 88000000 0 93010000 0 41907000 262940000 0 0 96549000 0 0 45819 2935 42764 412757;412758;412759;412760;412761;412762 526932;526933;526934;526935;526936;526937 526936 5 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yes 0 1 0 1 1 2 1 1 2 3 4 1 6 4 3 170.39 170.39 3;4 6.4149E-54 178277 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.75 135.72 25661000000 13479000 101280000 264280000 23617000 95544000 0 1224400000 1268300000 4387800000 21390000 10407000000 6503200000 1351200000 45844 1863 42785 412993;412994;412995;412996;412997;412998;412999;413000;413001;413002;413003;413004;413005;413006;413007;413008;413009;413010;413011;413012;413013;413014;413015;413016;413017;413018;413019;413020;413021 527207;527208;527209;527210;527211;527212;527213;527214;527215;527216;527217;527218;527219;527220;527221;527222;527223;527224;527225;527226;527227;527228;527229;527230;527231;527232;527233;527234;527235;527236;527237;527238;527239;527240 527227 1085;1086 32 VDIVAINDPFIDLNYMVYMFQYDSTHGK Unmodified 3307.557 0.55697268 1863 P04406 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 173.17 173.17 3;4 3.2948E-27 180277 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.72 102 3416100000 0 0 36348000 0 14245000 0 0 78604000 802710000 0 1934000000 494790000 55408000 45845 1863 42785 413022;413023;413024;413025;413026;413027;413028;413029;413030;413031;413032 527241;527242;527243;527244;527245;527246;527247;527248;527249;527250;527251;527252 527248 11 VDKDNEDFQESNR Unmodified 1594.6859 0.68594267 1784 P00450;E9PFZ2;H7C5R1 CP Ceruloplasmin yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 17.04 17.04 2;3 0.0048846 9356 QUIQUE_C1438_190116_001 100.55 87.598 325970000 35899000 17575000 0 46955000 122690000 37516000 0 0 0 31987000 33348000 0 0 45846 1784 42786 413033;413034;413035;413036;413037;413038;413039;413040 527253;527254;527255;527256;527257;527258;527259;527260 527257 7 VDKGGDPALIR Unmodified 1139.6299 0.62987176 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 21.256 21.256 3 0.0017 14248 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.159 52.202 213630000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 109610000 48282000 55737000 45847 2534 42787 413041;413042;413043 527261;527262;527263 527263 3 VDKGVVPLAGTDGETTTQGLDGLSER Unmodified 2614.3086 0.30860379 1978 P09972;A8MVZ9;J3KSV6;J3QKP5;C9J8F3;K7EKH5 ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase C;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 5 3 5 3 3 93.364 93.364 2;3 1.2535E-35 94102 QUIQUE_DMIX3_190116_001 173.98 155.85 6561000000 0 52743000 60542000 29601000 74284000 0 42988000 1389100000 755920000 0 2140100000 1088400000 927250000 45848 1978 42788 413044;413045;413046;413047;413048;413049;413050;413051;413052;413053;413054;413055;413056;413057;413058;413059;413060;413061;413062;413063;413064;413065;413066;413067;413068 527264;527265;527266;527267;527268;527269;527270;527271;527272;527273;527274;527275;527276;527277;527278;527279;527280;527281;527282;527283;527284;527285;527286;527287;527288 527276 23 VDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSER Unmodified 2613.3246 0.3245882 1851 P04075;J3KPS3;H3BQN4;H3BPS8;H3BUH7;H3BR04;H3BMQ8;H3BU78 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 1 1 1 2 2 2 2 1 86.886 86.886 2;3 3.3105E-113 88784 QUIQUE_DMIX3_190116_001 193.54 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71998 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.33 91.141 1388100000 0 93280000 0 0 0 0 0 264170000 261440000 0 380390000 26439000 362410000 45851 2777;2938 42791 413086;413087;413088;413089;413090;413091;413092;413093;413094;413095 527309;527310;527311;527312;527313;527314;527315;527316;527317;527318 527312 8 VDKLDASESLR Unmodified 1231.6408 0.64083038 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 2 28.728 28.728 2;3 2.8364E-05 23423 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.39 88.201 13277000000 857040000 1030900000 753040000 851310000 1018200000 657620000 1706600000 840280000 722690000 512210000 1754900000 858830000 1713100000 45852 50;1314 42792 413096;413097;413098;413099;413100;413101;413102;413103;413104;413105;413106;413107;413108;413109;413110;413111;413112;413113 527319;527320;527321;527322;527323;527324;527325;527326;527327;527328;527329;527330;527331;527332;527333;527334;527335;527336;527337;527338;527339;527340;527341;527342;527343;527344;527345;527346 527334 26 VDKLDASESLRK Unmodified 1359.7358 0.73579339 50;1314 A0A087WVQ6;Q00610;J3KS13;K7EJJ5 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 no no 0 0 2 1 1 1 1 19.089 19.089 2;3 0.039504 11993 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.05 60.171 442400000 0 0 0 0 0 0 0 47485000 49216000 0 57257000 0 288440000 45853 50;1314 42793 413114;413115;413116;413117 527347;527348;527349;527350 527348 4 VDKLESEVSR Unmodified 1160.6037 0.60371659 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8Y4X4;A0A2R8YG73;A0A2R8Y7B1;A0A2R8Y4W8;A0A2R8YGU1;A0A087WXD9;A0A2R8YG52;A0A2R8Y6B2;A0A2R8Y7D9;A0A2R8YD81 CCDC88A Girdin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 20.252 20.252 2;3 0.0038739 13500 QUIQUE_C1218_190116_001 72.434 50.375 148600000 39702000 37366000 0 0 0 0 0 28774000 42756000 0 0 0 0 45854 473 42794 413118;413119;413120;413121;413122 527351;527352;527353;527354;527355 527351 5 VDKLYAGLK Unmodified 1005.5859 0.58588168 2851 Q01082;A0A087WUZ3 SPTBN1 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1 yes no 0 0 1 1 28.954 28.954 2 0.029527 23706 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.819 64.962 112380000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112380000 0 0 45855 2851 42795 413123 527356 527356 1 VDKNDEAEYICIAENK Unmodified 1909.8728 0.87275716 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 1 2 69.317 69.317 2;3 9.5689E-05 69593 QUIQUE_C1368_190116_001 85.28 71.316 45204000 0 0 45204000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45856 1218;28;2057 42796 413124;413125 527357;527358 527358 2 VDLAPPALVVAWK Unmodified 1377.802 0.80202247 2401 P36915;A2AB27;A0A140T8Y2;A0A140T994 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 133.94 133.94 2 0.0055984 139471 QUIQUE_C1576_190116_001 81.338 60.56 446560000 60674000 48550000 0 44339000 56426000 0 61323000 0 41929000 0 41839000 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527488;527489;527490;527491;527492;527493;527494;527495;527496;527497;527498;527499;527500;527501 527489 13 VDLSFSPSQSLPASHAHLR Unmodified 2048.0439 0.043937085 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 2 1 73.258 73.258 3;4 1.6678E-08 73522 QUIQUE_C1277_190116_001 78.917 69.511 1903300000 159470000 253350000 70606000 196210000 365750000 26958000 66328000 0 165140000 106020000 117000000 143690000 232780000 45872 1802 42811 413243;413244;413245;413246;413247;413248;413249;413250;413251;413252;413253;413254;413255;413256;413257;413258;413259;413260;413261 527502;527503;527504;527505;527506;527507;527508;527509;527510;527511;527512;527513;527514;527515;527516;527517;527518;527519;527520;527521;527522;527523;527524;527525 527504 22 VDLSQPLIATCR Unmodified 1371.718 0.71803484 3193 Q16762 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 84.402 84.402 2 0.0067374 85004 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.847 40.67 23037000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23037000 0 0 0 45873 3193 42812 413262;413263;413264;413265;413266 527526;527527;527528;527529;527530 527529 4 VDLSSWR Unmodified 861.43447 0.43446642 2401 P36915;A0A140T8Y2 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 1 1 67.346 67.346 2 0.033929 67825 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.029 51.843 114500000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60090000 54408000 0 45874 2401 42813 413267;413268 527531;527532 527531 2 VDLSTSTDWK Unmodified 1150.5506 0.55061839 3990 Q9BQ69 MACROD1 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.527 65.527 2 0.0057685 64916 QUIQUE_C1277_190116_001 76.345 45.842 331750000 0 70498000 0 41943000 0 50416000 0 62880000 46968000 0 0 59046000 0 45875 3990 42814 413269;413270;413271;413272;413273;413274 527533;527534;527535;527536;527537;527538;527539 527533 7 VDLTPYPTISSINK Unmodified 1546.8243 0.82427405 216;1545 A0A0C4DFM0;G3V5T0;G3V4T6;A0A0A0MR33;G3V267;G3V3B9;O43708 GSTZ1 Maleylacetoacetate isomerase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.887 98.887 2 0.00078034 102367 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111.91 111.91 2 7.4889E-13 115075 QUIQUE_C1403_190116_001 158.79 128.23 1410300000 147950000 118270000 123320000 154220000 140760000 149150000 0 45174000 96516000 74012000 159370000 86100000 115410000 45879 2711 42818 413286;413287;413288;413289;413290;413291;413292;413293;413294;413295;413296;413297 527553;527554;527555;527556;527557;527558;527559;527560;527561;527562;527563;527564;527565;527566;527567;527568;527569;527570 527557 18 VDLVDENFTELRGEIAGPPDTPYEGGR Unmodified 2945.4043 0.40429509 2711 P61086;D6RDM7 UBE2K Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K yes no 0 0 1 1 134.24 134.24 3 0.010005 137038 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.206 18.439 58940000 0 0 0 0 0 0 0 58940000 0 0 0 0 0 45880 2711 42819 413298 527571 527571 1 VDLVDESGYVSGYK Unmodified 1529.725 0.72495394 1687 O94811 TPPP Tubulin polymerization-promoting protein yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 2 1 91.951 91.951 2 3.0619E-14 93482 QUIQUE_C1563_190116_001 146.16 130.02 12153000000 1087100000 1191800000 1147800000 866410000 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413333;413334;413335;413336;413337 527634;527635;527636;527637;527638 527634 5 VDNALQSGNSQESVTEQDSK Unmodified 2134.9614 0.96144883 1815 P01834 IGKC Ig kappa chain C region yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 1 2 2 1 1 37.056 37.056 2;3 7.0933E-117 32585 QUIQUE_DMIX3_190116_001 277.41 256.8 12176000000 621290000 1853700000 1452400000 881690000 1928600000 298810000 746320000 302280000 456980000 947500000 1671500000 275460000 739500000 45886 1815 42825 413338;413339;413340;413341;413342;413343;413344;413345;413346;413347;413348;413349;413350;413351;413352;413353;413354;413355;413356;413357 527639;527640;527641;527642;527643;527644;527645;527646;527647;527648;527649;527650;527651;527652;527653;527654;527655;527656;527657;527658;527659;527660;527661;527662 527653 23 VDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSK Unmodified 3618.7021 0.70205283 1815 P01834 IGKC Ig kappa chain C region yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 100.12 100.12 3 4.4637E-215 104755 QUIQUE_DMIX5_190116_001 222.95 216.77 728660000 0 48182000 0 0 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527679;527680;527681;527682;527683;527684;527685;527686;527687;527688;527689 527680 10 VDNDENEHQLSLR Unmodified 1567.7227 0.72266253 1907 P06748;E5RGW4 NPM1 Nucleophosmin yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 29.655 29.655 2;3 1.5943E-103 23659 QUIQUE_C1368_190116_001 239.48 201.17 14546000000 1346000000 1138300000 1045500000 1262000000 1423200000 1340400000 1249200000 566300000 1168200000 414880000 1501400000 974460000 1115900000 45890 1907 42829 413379;413380;413381;413382;413383;413384;413385;413386;413387;413388;413389;413390;413391;413392;413393;413394;413395;413396;413397;413398;413399;413400;413401;413402;413403;413404 527690;527691;527692;527693;527694;527695;527696;527697;527698;527699;527700;527701;527702;527703;527704;527705;527706;527707;527708;527709;527710;527711;527712;527713;527714;527715;527716;527717;527718;527719 527695 29 VDNEFDQR Unmodified 1021.4465 0.44648767 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542;A0A2R8Y6I5 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.794 23.794 2 0.0036011 16885 QUIQUE_C1368_190116_001 113.71 84.368 674850000 0 0 151610000 54719000 0 0 0 94688000 0 55281000 110920000 106880000 100750000 45891 3053 42830 413405;413406;413407;413408;413409;413410;413411;413412 527720;527721;527722;527723;527724;527725;527726;527727;527728 527721 8 VDNEFLNMLLDK Unmodified 1449.7174 0.71736614 1375 M0R3F6;M0R2Z9;Q8IX01 SUGP2 SURP and G-patch domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 150.41 150.41 2 0.0039769 153158 QUIQUE_C1563_190116_001 72.652 61.823 93195000 0 0 20854000 18508000 0 0 0 0 53833000 0 0 0 0 45892 1375 42831 413413;413414;413415;413416;413417;413418 527729;527730;527731;527732;527733;527734 527732 5 VDNEILDYKDLAAIPK Unmodified 1815.9618 0.96183016 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6;J3QSX6;H0Y7N6;F6XFR5 ABLIM1 no no 0 0 1 2 2 2 1 1 111.47 111.47 2;3 0.0022084 114104 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.32 81.47 772820000 0 0 0 0 0 0 0 189400000 207000000 0 165150000 63660000 147620000 45893 151 42832 413419;413420;413421;413422;413423;413424;413425;413426 527735;527736;527737;527738;527739;527740;527741;527742 527736 8 VDNEPIIR Unmodified 954.51345 0.51344502 702 F5GXT2;O43374;C9J798 RASA4B;RASA4 Ras GTPase-activating protein 4;Putative Ras GTPase-activating protein 4B yes no 0 0 0 1 30.429 30.429 2 0.034121 24070 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.265 43.639 15015000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15015000 0 0 0 45894 702 42833 413427 527743 527743 1 VDNHLFNK Unmodified 985.49813 0.49812931 2806;2505 P78356;A0A087WT35;P48426 PIP4K2B;PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta;Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha no no 0 0 0 1 20.889 20.889 2 0.030086 13856 QUIQUE_C1576_190116_001 67.277 46.995 125790000 0 0 0 0 0 0 125790000 0 0 0 0 0 0 45895 2806;2505 42834 413428 527744 527744 1 VDNLTYR Unmodified 879.44503 0.4450311 1267 J3QL05;J3KP15;Q01130;Q9BRL6 SRSF2;SRSF8 Serine/arginine-rich splicing factor 2;Serine/arginine-rich splicing factor 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 25.042 25.042 2 0.01947 18860 QUIQUE_DMIX7_190116_001 116.54 49.549 1609800000 0 0 0 0 0 265420000 0 0 321260000 0 435550000 276810000 310750000 45896 1267 42835 413429;413430;413431;413432;413433 527745;527746;527747;527748;527749;527750;527751 527749 7 VDNNAIEFLLLQASDGIHHWTPPK Unmodified 2714.3816 0.38164957 2571 P50583 NUDT2 Bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase [asymmetrical] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 154.62 154.62 3;4 1.9374E-15 158572 QUIQUE_C1403_190116_001 110.9 104.03 1113900000 54106000 60659000 80470000 66115000 78565000 29862000 92905000 168240000 123970000 19093000 108840000 111810000 119260000 45897 2571 42836 413434;413435;413436;413437;413438;413439;413440;413441;413442;413443;413444;413445;413446;413447 527752;527753;527754;527755;527756;527757;527758;527759;527760;527761;527762;527763;527764;527765;527766;527767;527768;527769;527770;527771;527772;527773 527756 22 VDNQHDFQDIASVVALTK Unmodified 1999.0011 0.0010692176 2125 P17600 SYN1 Synapsin-1 yes yes 0 0 0 3 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 116.91 116.91 2;3;4 6.1419E-182 120933 QUIQUE_C1277_190116_001 284.79 246.16 21201000000 2805800000 2347800000 2447100000 2006700000 1696600000 1647300000 2053000000 652130000 854300000 831000000 1336300000 1273200000 1250100000 45898 2125 42837 413448;413449;413450;413451;413452;413453;413454;413455;413456;413457;413458;413459;413460;413461;413462;413463;413464;413465;413466;413467;413468;413469;413470;413471;413472;413473;413474;413475 527774;527775;527776;527777;527778;527779;527780;527781;527782;527783;527784;527785;527786;527787;527788;527789;527790;527791;527792;527793;527794;527795;527796;527797;527798;527799;527800;527801;527802;527803;527804;527805;527806;527807;527808;527809;527810;527811;527812;527813;527814 527780 41 VDNSSLTGESEPQTR Unmodified 1618.7435 0.74345755 590;1371;1872 P05023;P20648;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2;B1AKY9;P50993 ATP1A1;ATP4A;ATP1A3;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Potassium-transporting ATPase alpha chain 1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.973 31.973 2 4.5341E-79 27756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 208.27 198.84 6483300000 525610000 430010000 948940000 511530000 441910000 337610000 593420000 447740000 518930000 139540000 713730000 318630000 555710000 45899 1872;1371;590 42838 413476;413477;413478;413479;413480;413481;413482;413483;413484;413485;413486;413487;413488 527815;527816;527817;527818;527819;527820;527821;527822;527823;527824;527825;527826;527827;527828;527829;527830;527831;527832;527833;527834;527835;527836;527837;527838 527828 24 VDNVNAFIER Unmodified 1175.5935 0.59348625 2021 P11277;H0YJE6 SPTB Spectrin beta chain, erythrocytic yes no 0 0 0 1 1 66.825 66.825 2 0.016065 66142 QUIQUE_C1277_190116_001 93.096 47.416 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45900 2021 42839 413489;413490 527839;527840 527839 2 VDPAFDKDR Unmodified 1061.5142 0.5141733 1535 O43615;M0QXM9 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 18.667 18.667 3 0.0052376 11370 QUIQUE_C1218_190116_001 70.056 57.02 296680000 61635000 67124000 65992000 0 0 0 0 45055000 56874000 0 0 0 0 45901 1535 42840 413491;413492;413493;413494;413495 527841;527842;527843;527844;527845 527841 5 VDPEIQNVK Unmodified 1040.5502 0.55022446 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.439 29.439 2 0.00092958 23879 QUIQUE_DMIX4_190116_001 108.46 70.902 2811800000 0 0 0 0 229150000 173670000 205930000 144320000 263900000 483890000 382270000 462800000 465840000 + 45902 781;782 42841 413496;413497;413498;413499;413500;413501;413502;413503;413504 527846;527847;527848;527849;527850;527851;527852;527853;527854 527851 8 VDPLETELGVK Unmodified 1198.6445 0.64451877 274 A0A0D9SG77;A0A1B0GVL3;Q05086 UBE3A Ubiquitin-protein ligase E3A yes no 0 0 0 1 1 87.286 87.286 2 0.026717 88659 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1 162.9 162.9 5 0.022094 170309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 20.23 18.74 132470000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 132470000 0 0 45908 2801;1075 42847 413533 527885 527885 1 VDPVSLGK Unmodified 813.45962 0.45961853 3452 Q7Z2K8 GPRIN1 G protein-regulated inducer of neurite outgrowth 1 yes no 0 0 0 1 1 1 33.029 33.029 2 0.037751 27726 QUIQUE_C1277_190116_001 61.962 29.492 206540000 0 122160000 0 0 0 0 0 0 65498000 18885000 0 0 0 45909 3452 42848 413534;413535;413536 527886;527887;527888 527886 3 VDQALHTQTDADPAEEYAR Unmodified 2128.9661 0.96614027 2615 P52888;K7EP46;K7EL02;K7EIK4;K7EL32 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.361 51.361 3 1.9538E-11 49409 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.406 72.21 817770000 0 103440000 100250000 78963000 88079000 73433000 75959000 50820000 0 48611000 106160000 92048000 0 45910 2615 42849 413537;413538;413539;413540;413541;413542;413543;413544;413545;413546 527889;527890;527891;527892;527893;527894;527895;527896;527897;527898;527899 527898 11 VDQDQNVVHPQLLSLTSQLK Unmodified 2261.2016 0.20155994 4152 Q9H2X9 SLC12A5 Solute carrier family 12 member 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 103.87 103.87 3 1.0155E-06 108549 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.698 62.742 246220000 0 35574000 0 0 0 0 0 40530000 53646000 0 70604000 0 45870000 45911 4152 42850 413547;413548;413549;413550;413551 527900;527901;527902;527903;527904;527905 527903 6 VDQDSALHNDLQILK Unmodified 1707.8792 0.87916317 3473 Q7Z7E8 UBE2Q1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 81.966 81.966 3 0.0043819 84292 QUIQUE_DMIX5_190116_001 38.613 28.767 135390000 0 37975000 0 0 0 0 0 29283000 0 0 37220000 0 30908000 45912 3473 42851 413552;413553;413554;413555 527906;527907;527908;527909 527908 4 VDQEIINIMQDR Unmodified 1472.7293 0.72932781 1767 O96000;H3BPJ9;H3BV16 NDUFB10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.67 105.67 2;3 3.2859E-10 108934 QUIQUE_C1368_190116_001 157.38 115.38 1376100000 268250000 218020000 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1 1 1 86.813 86.813 3 0.0068447 87565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.831 35.902 33003000 0 0 0 0 0 0 0 33003000 0 0 0 0 0 45915 4281 42853 413587 527943 527943 2899 1 VDQGTLFELILAANYLDIK Unmodified 2135.1514 0.15142185 2784 P63208;E7ERH2;F8W8N3 SKP1 S-phase kinase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 2 2 174.09 174.09 2;3 3.4795E-28 175408 QUIQUE_DMIX1_190116_001 174.83 139.18 805100000 0 0 8549600 0 0 0 62618000 88775000 218570000 0 207230000 98199000 121160000 45916 2784 42854 413588;413589;413590;413591;413592;413593;413594;413595;413596;413597;413598;413599 527944;527945;527946;527947;527948;527949;527950;527951;527952;527953;527954;527955;527956 527947 12 VDQIIMAK Oxidation (M) 932.5001 0.50010314 2572 P50990;H7C2U0 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 1 0 1 24.803 24.803 2 0.047161 18617 QUIQUE_C1218_190116_001 60.682 23.981 26712000 26712000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45917 2572 42855 413600 527957 527957 1 VDQIQEIVTGNPTVIK Unmodified 1752.9622 0.96216452 2487 P46940;A0A0J9YXZ5;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 2 103.61 103.61 2;3 0.00062544 106351 QUIQUE_C1403_190116_001 75.012 56.387 91982000 0 0 36551000 55432000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45918 2487 42856 413601;413602;413603 527958;527959;527960 527959 3 VDQLSGEQEVLR Unmodified 1371.6994 0.69940789 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 58.541 58.541 2 0.00050915 56975 QUIQUE_C1368_190116_001 105.4 66.643 673380000 90635000 79665000 78715000 75131000 81712000 48032000 66057000 33708000 0 0 0 59753000 59976000 45919 77 42857 413604;413605;413606;413607;413608;413609;413610;413611;413612;413613;413614 527961;527962;527963;527964;527965;527966;527967;527968;527969;527970;527971 527963 11 VDQLTAQLADLAAR Unmodified 1483.7995 0.79945628 2135 P18206 VCL Vinculin yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 1 117.34 117.34 2;3 9.7185E-07 121224 QUIQUE_DMIX3_190116_001 149.23 127.85 1997600000 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(Protein N-term) 1155.6248 0.62478638 2736 P61981 YWHAG 14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed yes yes 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.221 38.221 2 0.0082429 33802 QUIQUE_C1403_190116_001 80.165 44.285 20683000000 439450000 1093700000 0 299400000 1544100000 217970000 1246500000 3262400000 2549000000 123340000 3806500000 3372900000 2727800000 45925 2736 42863 413656;413657;413658;413659;413660;413661;413662;413663;413664;413665;413666;413667;413668 528017;528018;528019;528020;528021;528022;528023;528024;528025;528026;528027;528028;528029;528030;528031;528032 528022 12 VDSAATSGYEIGNPPDYR Unmodified 1910.8646 0.86463532 2231 P24666;G5E9R5 ACP1 Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.688 76.688 2 1.4208E-273 77256 QUIQUE_DMIX1_190116_001 292.73 276.59 879650000 90717000 60560000 74965000 37929000 75561000 46283000 67398000 67098000 73006000 25352000 90969000 80509000 89300000 45926 2231 42864 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0.54659564 883 E7EVX8;Q8WWY3 PRPF31 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 yes no 0 0 0 2 14.224 14.224 2;3 0.0032572 6274 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.841 39.225 10893000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 10893000 0 0 0 45930 883 42868 413719;413720 528098;528099 528098 2 VDSGIQPGSDISIYYDPMISK Unmodified 2284.0933 0.093314623 1881 P05165;A0A1B0GU58;H0Y5U0 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 131.91 131.91 2 0.00023573 137330 QUIQUE_C1368_190116_001 107.61 93.929 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45931 1881 42869 413721 528100 528100 1 VDSILLTHIGDDNLPGINSMLQR Unmodified 2520.3006 0.30062206 2483 P46821;D6RA32;D6RA40 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes no 0 0 0 2 2 3 2 1 2 2 1 2 1 2 2 2 142.23 142.23 2;3;4 3.7561E-100 149067 QUIQUE_DMIX5_190116_001 233.52 217.1 6404700000 499800000 708790000 881910000 341630000 616860000 508930000 887220000 206170000 345290000 98961000 513280000 450520000 345320000 45932 2483 42870 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1069.6172 0.61718181 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 127.14 127.14 2 0.029012 129474 QUIQUE_C1563_190116_001 56.721 42.564 60601000 0 20057000 0 0 0 17604000 0 22941000 0 0 0 0 0 45934 1187 42871 413758;413759;413760 528147;528148;528149 528148 3 VDSLLENLEK Unmodified 1158.6132 0.61321864 598 G3V4W0;B4DY08;B2R5W2;G3V4C1;P07910;G3V576;G3V2Q1;G3V2D6;G3V5V7;A0A0G2JPF8;A0A0G2JNQ3;P0DMR1;O60812;B7ZW38;B2RXH8 HNRNPC;HNRNPCL4;HNRNPCL1;HNRNPCL3;HNRNPCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 4;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 1;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.658 89.658 2 0.00016722 90341 QUIQUE_C1563_190116_001 120.31 52.082 3147100000 380100000 328420000 238930000 285370000 274140000 389390000 278350000 155030000 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protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.931 94.931 2 0.0011382 95904 QUIQUE_C1563_190116_001 101.25 82.941 745210000 81089000 70567000 111250000 74155000 78390000 51864000 105560000 0 55191000 24583000 0 0 92553000 45940 2807 42877 413793;413794;413795;413796;413797;413798;413799;413800;413801;413802 528192;528193;528194;528195;528196;528197;528198;528199;528200;528201 528197 9 VDSYGGSLR Unmodified 952.46141 0.46140945 2834 P98160 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes yes 0 0 0 1 1 1 26.089 26.089 2 0.0071305 20168 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.452 51.734 213650000 0 0 0 0 0 0 0 81538000 71496000 0 0 0 60615000 45941 2834 42878 413803;413804;413805 528202;528203;528204;528205 528203 4 VDTDGNGYISFNELNDLFK Unmodified 2160.0011 0.0011287971 2066 P13796;Q5TBN3;Q5TBN5 LCP1 Plastin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 159.91 159.91 2 2.4139E-05 164542 QUIQUE_DMIX3_190116_001 119.32 98.363 262580000 24675000 0 0 0 0 0 0 68343000 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82.419 2 0.0036217 83917 QUIQUE_C1277_190116_001 69.815 55.657 128520000 0 18373000 0 0 0 0 0 0 27669000 0 50526000 31948000 0 45945 1470 42882 413816;413817;413818;413819 528218;528219;528220;528221 528218 815 4 VDTILEFSQNMNTK Unmodified 1638.7923 0.792322 1470 O14980;C9JKM9;C9J673;C9IZS4;C9JQ02;C9JV99;F8WF71;H7BZC5 XPO1 Exportin-1 yes no 0 0 0 1 103.27 103.27 2 0.05448 108225 QUIQUE_C1438_190116_001 52.391 41.035 21352000 0 0 0 0 21352000 0 0 0 0 0 0 0 0 45946 1470 42882 413820 528222 528222 0 VDTLSQPEALSR Unmodified 1314.6779 0.67794416 3468 Q7Z6G3;H3BQC7 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 52.653 52.653 2 0.015751 50870 QUIQUE_C1218_190116_001 82.171 55.056 134330000 134330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45947 3468 42883 413821 528223 528223 0 VDTNAPDLSLEGPEGK Unmodified 1640.7893 0.78934511 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 75.705 75.705 2 4.1917E-05 72491 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.65 92.225 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528228;528229;528230;528231;528232;528233;528234;528235;528236;528237;528238;528239;528240;528241;528242;528243;528244;528245;528246;528247;528248;528249;528250;528251;528252;528253;528254;528255;528256;528257;528258;528259;528260;528261;528262;528263;528264;528265;528266;528267;528268;528269;528270;528271;528272;528273;528274;528275;528276;528277;528278;528279;528280;528281;528282;528283;528284;528285 528229 57 VDVADQAQDKDRDDR Unmodified 1744.7976 0.79761838 888 E7EX17;P23588;F8VP89;F8VSC7;F8W0K0 EIF4B Eukaryotic translation initiation factor 4B yes no 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 15.706 15.706 3;4 2.7162E-18 8413 QUIQUE_C1218_190116_001 126.48 109.42 771580000 88786000 146070000 0 113580000 158010000 59197000 0 38142000 0 53365000 114420000 0 0 45950 888 42886 413860;413861;413862;413863;413864;413865;413866;413867;413868 528286;528287;528288;528289;528290;528291;528292;528293;528294 528286 1 VDVAVNCAGIAVASK Unmodified 1472.7657 0.76571331 3969 Q99714;Q5H928 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA 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414137;414138;414139;414140;414141;414142;414143;414144;414145;414146;414147;414148;414149;414150;414151;414152;414153;414154;414155;414156;414157;414158;414159;414160 528599;528600;528601;528602;528603;528604;528605;528606;528607;528608;528609;528610;528611;528612;528613;528614;528615;528616;528617;528618;528619;528620;528621;528622;528623;528624;528625;528626;528627;528628;528629;528630;528631;528632;528633;528634;528635;528636;528637;528638;528639;528640 528625 39 VEAFLITMEK Unmodified 1179.6209 0.62094656 490 A0A3B3ISG5;P14735 IDE Insulin-degrading enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 97.707 97.707 2 0.0095369 102142 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.1 52.588 59372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15773000 17290000 26309000 45996 490 42930 414161;414162;414163 528641;528642;528643 528641 3 VEAFQTTISK Unmodified 1122.5921 0.59208927 114 A0A087X1Z3;Q9UL46;H0YM70 PSME2 Proteasome activator complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 45.286 45.286 2 0.001302 42106 QUIQUE_C1368_190116_001 113.62 93.484 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528695;528696;528697;528698;528699;528700;528701;528702;528703;528704;528705;528706;528707;528708;528709 528697 14 VEAQVYILSK Unmodified 1148.6441 0.64412484 2529 P49411 TUFM Elongation factor Tu, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 66.443 66.443 2 0.00033166 66489 QUIQUE_DMIX1_190116_001 114.5 78.616 3261300000 277550000 261080000 297870000 195730000 208040000 229570000 218560000 268880000 318890000 115370000 308380000 311390000 249940000 46008 2529 42941 414226;414227;414228;414229;414230;414231;414232;414233;414234;414235;414236;414237;414238;414239;414240 528710;528711;528712;528713;528714;528715;528716;528717;528718;528719;528720;528721;528722;528723;528724;528725;528726;528727;528728;528729;528730;528731;528732;528733;528734 528723 25 VEAVNMAEGIIHDTETK Unmodified 1855.8986 0.89857798 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 102.94 102.94 2;3 2.0848E-88 107489 QUIQUE_C1218_190116_001 237.48 214.76 6873200000 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P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.379 40.379 2 3.1888E-06 36851 QUIQUE_DMIX5_190116_001 149.65 96.97 10412000000 948270000 830940000 794580000 726290000 868350000 804890000 951620000 735520000 812500000 430160000 824220000 866770000 817420000 46027 2016 42959 414394;414395;414396;414397;414398;414399;414400;414401;414402;414403;414404;414405;414406 528930;528931;528932;528933;528934;528935;528936;528937;528938;528939;528940;528941;528942;528943;528944 528942 11 VEDVEALDRK Unmodified 1172.6037 0.60371659 2016 P11216;H0Y4Z6 PYGB Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 2 2 2 24.457 24.457 2;3 0.00088149 17821 QUIQUE_DMIX8_190116_001 84.817 50.611 2047200000 0 0 36003000 56167000 80656000 0 0 160220000 296210000 0 556110000 384910000 476900000 46028 2016 42960 414407;414408;414409;414410;414411;414412;414413;414414;414415;414416;414417;414418 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529213;529214;529215;529216;529217;529218;529219;529220;529221;529222;529223;529224;529225;529226;529227;529228;529229;529230;529231;529232;529233;529234;529235;529236;529237;529238 529213 26 VEEQKEEQKELEK Unmodified 1644.8206 0.82064524 3545 Q8IX12;A0A0C4DGG8;F5H1H2;F5H2E6;H0YFJ7 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 10.541 10.541 3 6.1473E-12 3082 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.69 107.31 202580000 12748000 0 23551000 23481000 28328000 0 18620000 23481000 24068000 0 0 48303000 0 46054 3545 42986 414648;414649;414650;414651;414652;414653;414654;414655 529239;529240;529241;529242;529243;529244;529245;529246;529247;529248 529245 9 VEESGEHVILGTGELYLDCVMHDLR Unmodified 2870.3579 0.35787894 3099 Q15029 EFTUD2 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component yes yes 0 0 0 1 152.33 152.33 4 4.6268E-09 156793 QUIQUE_C1277_190116_001 71.091 64.06 28679000 0 28679000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46055 3099 42987 414656 529249 529249 1 VEESSWLIEDGK Unmodified 1390.6616 0.6616254 4543 Q9Y266 NUDC Nuclear migration protein nudC yes yes 0 0 0 1 1 1 3 1 1 1 1 1 2 1 1 1 76.007 76.007 2;3 7.196E-05 82116 QUIQUE_C1218_190116_001 123.79 84.17 1322100000 101060000 112780000 124010000 107430000 132540000 124940000 144060000 0 81896000 125750000 98003000 75801000 93843000 46056 4543 42988 414657;414658;414659;414660;414661;414662;414663;414664;414665;414666;414667;414668;414669;414670;414671;414672 529250;529251;529252;529253;529254;529255;529256;529257;529258;529259;529260;529261;529262;529263;529264;529265;529266;529267;529268;529269;529270;529271;529272 529250 22 VEESTQVGGDPFPAVFGDFLGR Unmodified 2323.1121 0.11207623 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 163.72 163.72 2;3 1.6844E-113 169527 QUIQUE_C1576_190116_001 206.06 185.63 907850000 41214000 0 0 74440000 96515000 63473000 198700000 90756000 48720000 30078000 121020000 90190000 52747000 46057 3061 42989 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142.24 142.24 2 0.00046832 148827 QUIQUE_C1438_190116_001 122.42 58.124 950420000 82333000 97228000 69900000 59820000 111170000 0 89987000 50228000 79052000 20019000 123910000 107660000 59109000 46064 89 42996 414728;414729;414730;414731;414732;414733;414734;414735;414736;414737;414738;414739 529335;529336;529337;529338;529339;529340;529341;529342;529343;529344;529345;529346 529339 10 VEFILEQMR Unmodified 1163.6009 0.60087982 1389 O00232 PSMD12 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 101.53 101.53 2 0.0042823 105708 QUIQUE_C1438_190116_001 89.355 56.092 190940000 0 0 0 50504000 38979000 42770000 58682000 0 0 0 0 0 0 46065 1389 42997 414740;414741;414742;414743 529347;529348;529349;529350 529348 4 VEFLLNAHSSKDEVQNAVQR Unmodified 2283.1608 0.16075776 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 68.373 68.373 3;4 1.3173E-117 68161 QUIQUE_DMIX3_190116_001 185.13 151.43 1571400000 0 139800000 62188000 189050000 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91.072 3 0.00018322 93104 QUIQUE_C1277_190116_001 98.439 74.608 316130000 68995000 77590000 34014000 41811000 0 0 93722000 0 0 0 0 0 0 46068 3121 43000 414774;414775;414776;414777;414778;414779;414780;414781;414782;414783;414784;414785 529388;529389;529390;529391;529392;529393;529394;529395;529396;529397;529398;529399;529400 529390 13 VEFMDDTSR Unmodified 1098.4652 0.4651742 2766 P62857 RPS28 40S ribosomal protein S28 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 47.875 47.875 2 0.03011 44979 QUIQUE_C1368_190116_001 56.258 36.781 291160000 34812000 32956000 30856000 0 0 0 36136000 0 0 0 74456000 30275000 51671000 46069 2766 43001 414786;414787;414788;414789;414790;414791;414792 529401;529402;529403;529404;529405;529406;529407;529408 529403 6 VEFQELR Unmodified 919.47633 0.47633123 4725 yes no 0 0 0 1 1 1 1 97.931 97.931 2 0.036465 101654 QUIQUE_C1438_190116_001 86.086 19.052 277250000 79934000 0 0 70008000 67484000 0 59825000 0 0 0 0 0 0 + 46070 4725 43002 414793;414794;414795;414796 529409;529410;529411;529412;529413 529411 5 VEGAETLAYLIEPDVELQR Unmodified 2144.1001 0.10011456 1102 G5E9V7;G5E9V6;Q8IUR7;B7Z637;C9J2I1 ARMC8 Armadillo repeat-containing protein 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 148.21 148.21 2;3 1.549E-07 152293 QUIQUE_C1277_190116_001 107.46 86.214 76834000 21211000 22267000 0 17627000 0 15729000 0 0 0 0 0 0 0 46071 1102 43003 414797;414798;414799;414800 529414;529415;529416;529417 529415 4 VEGANPHLEMR Unmodified 1251.603 0.60300508 4219 Q9HBT6 CDH20 Cadherin-20 yes yes 0 0 0 1 25.554 25.554 3 0.04088 19110 QUIQUE_C1277_190116_001 36.982 26.076 43007000 0 43007000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46072 4219 43004 414801 529418;529419 529419 2 VEGDLKGPEIDVK Unmodified 1397.7402 0.74021007 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 46.608 46.608 2 0.0033634 44938 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.71 3.3044 63757000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63757000 0 0 46073 2935 43005 414802 529420 529420 1 VEGDLKGPEVDIR Unmodified 1425.7464 0.74635808 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 51.285 51.285 2 0.016117 48531 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.326 58.014 30771000 0 0 0 0 0 0 0 30771000 0 0 0 0 0 46074 2935 43006 414803 529421 529421 0 VEGDLKGPEVDIRDPK Unmodified 1765.921 0.92102798 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 2 1 46.216 46.216 3 0.025488 43056 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.707 52.285 67573000 0 0 0 0 0 0 0 67573000 0 0 0 0 0 46075 2935 43007 414804 529422 529422 0 VEGDLKGPEVDLK Unmodified 1397.7402 0.74021007 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 1 3 1 1 1 1 47.562 47.562 2;3 0.0016996 45067 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.927 0 909030000 0 0 0 0 0 0 48007000 530250000 68514000 0 195010000 67249000 0 46076 2935 43008 414805;414806;414807;414808;414809;414810;414811;414812;414813 529423;529424;529425;529426;529427;529428;529429;529430;529431;529432;529433 529427 11 VEGDLKGPEVDLKGPK Unmodified 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Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 1 1 1 35.081 35.081 2;3 0.036034 30210 QUIQUE_DMIX5_190116_001 48.115 29.925 280670000 0 0 0 0 0 0 0 61198000 0 0 219480000 0 0 46115 3956 43045 415092;415093 529780;529781 529781 1 VEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILK Unmodified 3059.5896 0.58957666 166;3305;311 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0;A0A0U1RQL8 GSN Gelsolin no no 0 0 1 1 166.6 166.6 3 1.2537E-18 168541 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.974 84.679 218890000 0 0 0 0 0 0 0 218890000 0 0 0 0 0 46116 166;3305;311 43046 415094 529782 529782 1 VEKPTMQASR Unmodified 1145.5863 0.58629239 3021 Q13636 RAB31 Ras-related protein Rab-31 yes yes 0 0 1 1 1 1 12.294 12.294 3 0.00011446 3321 QUIQUE_C1563_190116_001 115.78 88.995 78499000 3960100 0 0 0 0 69919000 0 4619700 0 0 0 0 0 46117 3021 43047 415095;415096;415097 529783;529784;529785 529784 2 VELAEEDDGEK Unmodified 1232.5408 0.54084156 988 F5GWT4;Q9H4A3 WNK1 Serine/threonine-protein kinase WNK1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 26.553 26.553 2 0.0016501 20498 QUIQUE_DMIX3_190116_001 114.5 83.926 57294000 21862000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35432000 46118 988 43048 415098;415099;415100;415101;415102;415103;415104 529786;529787;529788;529789;529790;529791;529792 529787 7 VELAEEDHGR Unmodified 1153.5364 0.53636531 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;A6PVV2;H0Y7R3 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 15.872 15.872 3 0.02296 7837 QUIQUE_C1277_190116_001 50.194 39.836 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46119 1056 43049 415105;415106 529793;529794 529793 2 VELAPLPSWQPVGK Unmodified 1519.8399 0.83986454 1885 P05362 ICAM1 Intercellular adhesion molecule 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 114.26 114.26 2 0.01242 118292 QUIQUE_C1368_190116_001 66.56 39.445 164760000 0 0 56750000 70405000 37609000 0 0 0 0 0 0 0 0 46120 1885 43050 415107;415108;415109 529795;529796;529797 529795 0 VELAQLQEEWNEHNAK Unmodified 1936.9279 0.92790427 4153 Q9H307 PNN Pinin yes yes 0 0 0 2 90.798 90.798 2;3 0.0071668 93302 QUIQUE_C1218_190116_001 58.83 47.775 73624000 73624000 0 0 0 0 0 0 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2585 3 VELDTHGCGLR Unmodified 1255.5979 0.5979197 65;4141 A0A087WXL6;B7Z879;Q9H270 VPS11 Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 33.353 33.353 2;3 0.011127 28317 QUIQUE_C1403_190116_001 61.65 37.495 115060000 10491000 41512000 0 11851000 15315000 13737000 22155000 0 0 0 0 0 0 46124 65;4141 43053 415130;415131;415132;415133;415134;415135;415136;415137 529819;529820;529821;529822;529823;529824;529825;529826;529827 529823 9 VELEDWNGR Unmodified 1116.52 0.51998696 710 C9JEU5;C9JC84;P02679 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.18 63.18 2 0.00043776 61974 QUIQUE_C1403_190116_001 148.38 106.73 1577100000 80209000 157580000 72245000 205170000 194600000 45270000 156760000 81774000 88452000 112410000 174610000 71620000 136390000 46125 710 43054 415138;415139;415140;415141;415142;415143;415144;415145;415146;415147;415148;415149;415150 529828;529829;529830;529831;529832;529833;529834;529835;529836;529837;529838;529839;529840;529841;529842;529843;529844;529845;529846;529847;529848;529849;529850;529851 529833 23 VELFFKDDANNDPQWSEEQLIAAK Unmodified 2806.345 0.34498929 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 128.85 128.85 2;3 6.3252E-09 132993 QUIQUE_C1403_190116_001 82.885 79.95 2471000000 123960000 0 148490000 170220000 121270000 0 205940000 497360000 426820000 71174000 376340000 329390000 0 46126 2195 43055 415151;415152;415153;415154;415155;415156;415157;415158;415159;415160;415161;415162 529852;529853;529854;529855;529856;529857;529858;529859;529860;529861;529862;529863;529864;529865;529866;529867;529868;529869 529855 17 VELHKNPEKEPYK Unmodified 1609.8464 0.84640648 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5;A0A1B0GTE6;A0A0D9SFK7;A0A1B0GVY9 KIAA1279;KIF1BP KIF1-binding protein yes no 0 0 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503 43070 415304;415305;415306;415307;415308;415309;415310;415311;415312;415313;415314;415315;415316;415317;415318;415319 530067;530068;530069;530070;530071;530072;530073;530074;530075;530076;530077;530078;530079;530080;530081;530082;530083;530084;530085;530086;530087;530088;530089;530090;530091;530092;530093;530094;530095;530096;530097;530098;530099;530100;530101;530102 530102 36 VELVQLK Unmodified 827.51165 0.5116541 3035 Q13976;A0A0A0MSB3 PRKG1 cGMP-dependent protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 52.278 52.278 2 0.028495 47380 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.191 34.856 24310000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24310000 0 0 0 46143 3035 43071 415320 530103 530103 1 VELVTGEEDEK Unmodified 1246.5929 0.59287713 2548 P49792 RANBP2 E3 SUMO-protein ligase RanBP2 yes yes 0 0 0 1 36.457 36.457 2 0.013608 31961 QUIQUE_C1277_190116_001 66.056 39.672 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46144 2548 43072 415321 530104 530104 1 VEMEIVSMLEK Unmodified 1306.6513 0.65126041 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.41 122.41 2 0.00046729 127580 QUIQUE_C1218_190116_001 106.4 59.508 309270000 54365000 53049000 44950000 44691000 31176000 38856000 0 0 0 14104000 0 28078000 0 46145 2279 43073 415322;415323;415324;415325;415326;415327;415328;415329;415330;415331 530105;530106;530107;530108;530109;530110;530111;530112;530113;530114;530115;530116;530117;530118 530105 13 VEMLEIIEAIYK Unmodified 1449.7789 0.77890376 2761 P62760 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes yes 0 0 0 2 3 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 2 163.15 163.15 2;3 7.9618E-06 166991 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.78 97.627 4543100000 341090000 412370000 332830000 299550000 371600000 316750000 410760000 195880000 361990000 100130000 365710000 516420000 518050000 46146 2761 43074 415332;415333;415334;415335;415336;415337;415338;415339;415340;415341;415342;415343;415344;415345;415346;415347;415348;415349;415350;415351;415352;415353;415354;415355 530119;530120;530121;530122;530123;530124;530125;530126;530127;530128;530129;530130;530131;530132;530133;530134;530135;530136;530137;530138;530139;530140;530141;530142;530143;530144;530145;530146;530147;530148;530149;530150;530151;530152;530153;530154;530155 530151 37 VEMLEIIEAIYK Oxidation (M) 1465.7738 0.77381838 2761 P62760 VSNL1 Visinin-like protein 1 yes yes 0 1 0 1 1 130.03 130.03 2 0.013056 134277 QUIQUE_C1277_190116_001 80.706 69.113 77138000 0 77138000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46147 2761 43074 415356;415357 530156;530157 530156 2194 1 VEMQPTELVSK Oxidation (M) 1275.6381 0.63805318 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;E9PQD2;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 1 0 1 1 1 1 1 34.627 34.627 2 0.0020329 29654 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.831 53.357 367640000 0 0 0 0 57380000 0 61639000 0 0 0 101100000 0 147520000 46148 933;1529 43075 415358;415359;415360;415361;415362 530158;530159;530160;530161;530162 530162 574 5 VENACYALK Unmodified 1066.5117 0.51173046 3961 Q99598 TSNAX Translin-associated protein X yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 29.263 29.263 2 0.00040237 23572 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.99 83.197 790610000 85598000 95797000 137840000 72960000 0 0 77860000 0 113330000 0 114520000 0 92709000 46149 3961 43076 415363;415364;415365;415366;415367;415368;415369;415370 530163;530164;530165;530166;530167;530168;530169;530170;530171 530170 9 VENEDMNKDQILLEK Unmodified 1816.8877 0.88767894 640;3097 B5MCX3;H7C2Y0;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 54.778 54.778 2;3 5.2166E-05 53894 QUIQUE_C1218_190116_001 96.163 46.854 924790000 204370000 79655000 140470000 0 0 45081000 57231000 44802000 69364000 41801000 99103000 76605000 66311000 46150 640;3097 43077 415371;415372;415373;415374;415375;415376;415377;415378;415379;415380;415381;415382;415383 530172;530173;530174;530175;530176;530177;530178;530179;530180;530181;530182;530183;530184 530173 11 VENEDMNKDQILLEK Oxidation (M) 1832.8826 0.88259357 640;3097 B5MCX3;H7C2Y0;Q15019 SEPT2 Septin-2 no no 0 1 1 1 40.891 40.891 3 0.037525 35339 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.813 7.4841 31222000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31222000 0 0 0 46151 640;3097 43077 415384 530185 530185 407 1 VENFEAAVHFYGK Unmodified 1509.7252 0.72522871 1551 O43765;K7EMD6 SGTA Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.917 81.917 3 0.00015973 83201 QUIQUE_C1368_190116_001 73.848 66.123 988070000 76897000 89975000 63314000 81988000 96381000 96446000 83740000 67710000 83707000 38958000 57527000 68048000 83382000 46152 1551 43078 415385;415386;415387;415388;415389;415390;415391;415392;415393;415394;415395;415396;415397 530186;530187;530188;530189;530190;530191;530192;530193;530194;530195;530196;530197;530198;530199;530200 530190 14 VENFFTLYNVK Unmodified 1372.7027 0.70270235 2511 P48553 TRAPPC10 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 120.36 120.36 2 0.016533 126118 QUIQUE_C1438_190116_001 63.283 42.98 39987000 0 21461000 0 0 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530327;530328;530329;530330;530331;530332;530333;530334;530335;530336;530337;530338;530339;530340 530335 5 VEPATPLAVR Unmodified 1051.6026 0.60259438 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 44.438 44.438 2 0.014217 41174 QUIQUE_C1277_190116_001 92.439 62.254 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46164 4148 43090 415511;415512;415513;415514;415515 530341;530342;530343;530344;530345 530342 5 VEPGELR Unmodified 798.42357 0.42356738 4108 Q9GZV7;Q5T3J1 HAPLN2 Hyaluronan and proteoglycan link protein 2 yes no 0 0 0 1 1 20.327 20.327 2 0.024917 13517 QUIQUE_DMIX7_190116_001 97.068 35.07 137290000 0 0 19405000 0 0 0 0 0 0 0 0 117890000 0 46165 4108 43091 415516;415517 530346;530347 530347 2 VEPGGGAAEEAAPPWALGLGAAGLLALAALAR Unmodified 2939.5869 0.58689132 3642 Q8NE01 CNNM3 Metal transporter CNNM3 yes yes 0 0 0 1 1 1 177.97 177.97 3 2.5443E-06 181384 QUIQUE_DMIX7_190116_001 49.095 47.189 27182000 0 0 0 0 0 0 0 8281100 11889000 0 0 7012300 0 46166 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530488;530489;530490;530491;530492;530493;530494;530495;530496;530497;530498;530499;530500;530501;530502;530503;530504;530505;530506;530507;530508;530509;530510;530511;530512;530513;530514;530515;530516;530517;530518;530519 530499 32 VEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNAR Unmodified 2807.3614 0.36136764 2047;1242 H9KV75;H7C5W8;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 2 157.18 157.18 2;3 5.322E-39 163684 QUIQUE_C1438_190116_001 165.71 154.66 619250000 203680000 190830000 27569000 40620000 34414000 17281000 0 0 0 104850000 0 0 0 46186 1242;2047 43111 415641;415642;415643;415644;415645;415646;415647;415648;415649;415650 530520;530521;530522;530523;530524;530525;530526;530527;530528;530529;530530;530531 530528 10 VEQIEAGTPGR Unmodified 1155.5884 0.58840088 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.237 25.237 2 1.5316E-05 18549 QUIQUE_C1368_190116_001 161.63 114.44 1840600000 163260000 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530547;530548;530549;530550;530551 530550 5 VEQLLASSLLQLDHGR Unmodified 1777.9686 0.96864688 179 A0A0A0MSK6;Q13017 ARHGAP5 Rho GTPase-activating protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 111.17 111.17 3 0.0013385 108614 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.851 50.249 151790000 23966000 0 0 39571000 0 25233000 43585000 0 0 19439000 0 0 0 46190 179 43115 415670;415671;415672;415673;415674 530552;530553;530554;530555;530556 530556 4 VEQQLSDLDTSVQK Unmodified 1588.7944 0.79443049 2856;1255 I6L894;Q01484 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 59.54 59.54 2 0.0013715 57825 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.82 76.533 30158000 0 0 0 0 0 0 0 30158000 0 0 0 0 0 46191 1255;2856 43116 415675;415676 530557;530558 530557 2 VEQRIDSNINGDSVR Unmodified 1700.8442 0.84417465 4674 yes no 0 0 1 1 64.577 64.577 3 0.033974 64301 QUIQUE_C1576_190116_001 40.025 13.484 230430000 0 0 0 0 0 0 230430000 0 0 0 0 0 0 + 46192 4674 43117 415677 530559 530559 1 VEQVLSLEPQHELK Unmodified 1647.8832 0.88318591 1719 O95292;E5RK64 VAPB Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 65.476 65.476 2;3 7.3865E-05 66011 QUIQUE_C1218_190116_001 82.102 71.617 4601000000 422900000 486110000 446200000 261730000 351730000 301580000 526090000 250450000 231900000 105490000 327570000 336040000 553180000 46193 1719 43118 415678;415679;415680;415681;415682;415683;415684;415685;415686;415687;415688;415689;415690;415691;415692;415693;415694;415695;415696;415697;415698;415699;415700 530560;530561;530562;530563;530564;530565;530566;530567;530568;530569;530570;530571;530572;530573;530574;530575;530576;530577;530578;530579;530580;530581;530582;530583;530584;530585;530586;530587;530588;530589;530590;530591 530562 32 VEQVPCSR Unmodified 973.46511 0.46511462 2228 P24386;P26374 CHM;CHML Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1;Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2 yes no 0 0 0 1 1 16.014 16.014 2 0.04058 8148 QUIQUE_C1277_190116_001 84.743 34.704 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46194 2228 43119 415701;415702 530592;530593 530592 2 VESAIAEGGASR Unmodified 1145.5677 0.56766543 798 D3DQV9;H0Y3P2;H0YCH5;H0YD77;H0YEC5;H0YCF8;H0YEN8;H0YDC0;H0YE87;H0YEI7;H0YD99 EIF4G2 yes no 0 0 0 1 29.69 29.69 2 0.013641 24160 QUIQUE_C1368_190116_001 56.432 18.704 99144000 0 0 99144000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46195 798 43120 415703 530594 530594 1 VESEIKVPDVELK Unmodified 1483.8134 0.81337501 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 76.331 76.331 3 0.0013435 77064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.911 54.66 314370000 0 34736000 0 0 40541000 0 34746000 75394000 37742000 0 0 49544000 41663000 46196 2935 43121 415704;415705;415706;415707;415708;415709;415710 530595;530596;530597;530598;530599;530600;530601 530598 5 VESGALDVFHK Unmodified 1200.6139 0.61388734 4728 no no 0 0 0 1 45.732 45.732 2 0.025974 42682 QUIQUE_C1218_190116_001 52.867 24.468 44923000 44923000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 + 46197 4728 43122 415711 530602 530602 1 VESGAWAYLSPLVLR Unmodified 1659.8984 0.89844205 1608 O75064 DENND4B DENN domain-containing protein 4B yes yes 0 0 0 1 148.94 148.94 2 0.011377 153495 QUIQUE_C1277_190116_001 65.395 45.265 12662000 0 12662000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46198 1608 43123 415712 530603 530603 1 VESIIHSYPEFSCK Unmodified 1694.7974 0.79740737 684 C9J0G0;Q99424;C9JY29 ACOX2 Acyl-coenzyme A oxidase;Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 165.43 165.43 3 0.023154 167492 QUIQUE_DMIX1_190116_001 25.982 0 75628000 0 0 0 0 0 0 0 24107000 0 26987000 0 0 24535000 46199 684 43124 415713;415714;415715 530604;530605;530606 530604 3 VESLEQEAANER Unmodified 1373.6423 0.64228694 147 A0A0A0MRG2;E9PG40;P05067;H7C0V9 APP Amyloid beta A4 protein;N-APP;Soluble APP-alpha;Soluble APP-beta;C99;Beta-amyloid protein 42;Beta-amyloid protein 40;C83;P3(42);P3(40);C80;Gamma-secretase C-terminal fragment 59;Gamma-secretase C-terminal fragment 57;Gamma-secretase C-terminal fragment 50;C31 yes no 0 0 0 1 43.632 43.632 2 0.0091157 41236 QUIQUE_C1438_190116_001 66.758 46.428 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46200 147 43125 415716 530607 530607 1 VESLESLYFTPIPAR Unmodified 1720.9036 0.903587 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 131.82 131.82 2 1.2078E-05 135634 QUIQUE_C1403_190116_001 118.48 79.679 244260000 31018000 28367000 33785000 30273000 37483000 40695000 34141000 0 0 8500700 0 0 0 46201 3091 43126 415717;415718;415719;415720;415721;415722;415723;415724;415725 530608;530609;530610;530611;530612;530613;530614;530615;530616;530617 530611 10 VESLESQTR Unmodified 1047.5197 0.51965261 1567 O60271;A0A087X2D8 SPAG9 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4 yes no 0 0 0 1 1 18.94 18.94 2 0.019692 11536 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.419 18.972 84976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43915000 0 0 41061000 46202 1567 43127 415726;415727 530618;530619 530618 2 VESLLDELAFVR Unmodified 1389.7504 0.75038083 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.33 149.33 2;3 6.3789E-14 155025 QUIQUE_C1218_190116_001 161.76 115.77 1643600000 260640000 205980000 267340000 84333000 139790000 210780000 148600000 0 0 0 172810000 78959000 74385000 46203 3176 43128 415728;415729;415730;415731;415732;415733;415734;415735;415736;415737;415738;415739 530620;530621;530622;530623;530624;530625;530626;530627;530628;530629;530630;530631;530632;530633 530620 14 VESLLVTAISK Unmodified 1158.686 0.68598966 1506 O43143 DHX15 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX15 yes yes 0 0 0 1 1 87.277 87.277 2 0.013313 89541 QUIQUE_C1218_190116_001 76.143 59.94 95199000 73837000 0 0 0 0 0 0 0 0 21362000 0 0 0 46204 1506 43129 415740;415741 530634;530635 530634 1 VESLQEEIAFLK Unmodified 1404.75 0.75004648 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 0 1 1 2 2 1 2 2 1 1 2 1 1 1 122.49 122.49 2;3 1.5393E-45 120040 QUIQUE_DMIX4_190116_001 201.33 140.17 8338100000 907020000 708420000 983380000 1129900000 812000000 963380000 592810000 222660000 446070000 546680000 355610000 321750000 348430000 46205 1952 43130 415742;415743;415744;415745;415746;415747;415748;415749;415750;415751;415752;415753;415754;415755;415756;415757;415758;415759 530636;530637;530638;530639;530640;530641;530642;530643;530644;530645;530646;530647;530648;530649;530650;530651;530652;530653;530654;530655;530656;530657;530658;530659;530660;530661;530662;530663;530664;530665;530666;530667;530668;530669 530660 34 VESLQEEIAFLKK Unmodified 1532.845 0.84500949 1952 P08670;B0YJC4;B0YJC5 VIM Vimentin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 96.615 96.615 2;3 0.00015189 94472 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.089 32.476 2512000000 0 161280000 210040000 212360000 239690000 190060000 181930000 180800000 223770000 116980000 389090000 203920000 202120000 46206 1952 43131 415760;415761;415762;415763;415764;415765;415766;415767;415768;415769;415770;415771;415772;415773;415774 530670;530671;530672;530673;530674;530675;530676;530677;530678;530679;530680;530681;530682;530683;530684 530679 15 VESLSQVEVILQHSAADIAR Unmodified 2164.1488 0.14879609 1093 G3XAI2;P07942 LAMB1 Laminin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 138.11 138.11 3 3.6197E-06 144780 QUIQUE_C1438_190116_001 79.568 61.811 308770000 0 0 0 0 117850000 0 0 39227000 40700000 14385000 32291000 38496000 25823000 46207 1093 43132 415775;415776;415777;415778;415779;415780;415781 530685;530686;530687;530688;530689;530690;530691 530685 5 VESPEEIQWFADK Unmodified 1576.7409 0.74093835 3564 Q8N0X4;Q5JVC2 CLYBL Citrate lyase subunit beta-like protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.69 107.69 2 0.00053911 112274 QUIQUE_C1576_190116_001 89.403 38.136 205600000 0 45626000 0 0 0 35466000 27062000 0 0 0 40685000 31461000 25301000 46208 3564 43133 415782;415783;415784;415785;415786;415787 530692;530693;530694;530695;530696;530697 530694 6 VESTDVSDLLHQYR Unmodified 1660.8057 0.80566387 2272 X5D2R7;P28062;Q5JNW7;A0A140T998 PSM8;PSMB8 Proteasome subunit beta type;Proteasome subunit beta type-8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.917 88.917 3 5.8886E-05 89952 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.631 75.204 1340900000 104890000 106220000 176350000 142610000 129730000 110290000 110860000 107830000 95560000 58033000 0 83690000 114830000 46209 2272 43134 415788;415789;415790;415791;415792;415793;415794;415795;415796;415797;415798;415799 530698;530699;530700;530701;530702;530703;530704;530705;530706;530707;530708;530709;530710 530705 13 VESTGAVPEFK Unmodified 1162.587 0.58700389 3421 Q6YN16 HSDL2 Hydroxysteroid dehydrogenase-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 47.97 47.97 2 0.037801 45179 QUIQUE_C1218_190116_001 48.284 15.964 22297000 22297000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46210 3421 43135 415800 530711 530711 1 VESVEPSENEASK Unmodified 1403.6416 0.64161824 4153 Q9H307 PNN Pinin yes yes 0 0 0 1 1 20.24 20.24 2 0.0013457 12709 QUIQUE_C1277_190116_001 87.713 58.627 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46211 4153 43136 415801;415802 530712;530713 530712 2 VESVFETLVEDSAEEESTLTK Unmodified 2341.106 0.10604738 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 162.04 162.04 2;3 1.1846E-75 166004 QUIQUE_C1277_190116_001 221.91 189.62 618530000 62504000 81323000 75919000 0 105490000 34827000 60159000 59302000 0 14228000 73367000 51410000 0 46212 89 43137 415803;415804;415805;415806;415807;415808;415809;415810;415811;415812;415813;415814 530714;530715;530716;530717;530718;530719;530720;530721;530722;530723;530724;530725;530726 530715 11 VETETVLSFVDDIISGAK Unmodified 1921.9884 0.98843885 1429 O14525;B1AJS1 ASTN1 Astrotactin-1 yes no 0 0 0 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 171.84 171.84 2;3 1.3898E-75 173122 QUIQUE_C1563_190116_001 241.51 217.17 1101100000 51927000 126840000 34870000 145150000 177020000 361460000 0 87535000 69751000 10067000 0 0 36457000 46213 1429 43138 415815;415816;415817;415818;415819;415820;415821;415822;415823;415824;415825;415826;415827 530727;530728;530729;530730;530731;530732;530733;530734;530735;530736;530737;530738;530739 530735 12 VETFSGVYK Unmodified 1028.5179 0.51786169 2738 P62081;A0A2R8Y623 RPS7 40S ribosomal protein S7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.21 47.21 2 0.012734 43800 QUIQUE_C1563_190116_001 70.919 26.472 376730000 92905000 70828000 59115000 0 0 79866000 74019000 0 0 0 0 0 0 46214 2738 43139 415828;415829;415830;415831;415832 530740;530741;530742;530743;530744;530745;530746 530744 7 VETGILR Unmodified 786.45995 0.45995289 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 0 1 1 1 29.963 29.963 2 0.023536 24288 QUIQUE_C1277_190116_001 99.919 11.185 225280000 90398000 72172000 0 0 0 62707000 0 0 0 0 0 0 0 46215 469 43140 415833;415834;415835 530747;530748;530749 530748 3 VETGILRPGMVVTFAPVNITTEVK Oxidation (M) 2586.4091 0.40910987 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 123.12 123.12 2;3 7.0189E-11 125644 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.68 78.943 1483200000 146670000 189240000 0 0 128790000 154910000 144700000 206960000 0 238590000 24956000 248430000 0 46216 469 43141 415836;415837;415838;415839;415840;415841;415842;415843;415844;415845 530750;530751;530752;530753;530754;530755;530756;530757;530758;530759;530760;530761 530757 345 11 VETGILRPGMVVTFAPVNITTEVK Unmodified 2570.4142 0.41419525 469 A0A2U3TZH3;Q05639 EEF1A2 Elongation factor 1-alpha 2 yes no 0 0 1 2 1 133.99 133.99 2;3 2.9242E-13 139287 QUIQUE_C1218_190116_001 125.18 107.55 1141800000 1033600000 0 108240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46217 469 43141 415846;415847;415848 530762;530763;530764;530765 530762 4 VETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVK Oxidation (M) 2530.3717 0.37166174 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3 yes no 0 1 1 3 3 4 3 4 4 3 3 3 4 4 3 4 108.78 108.78 2;3 2.8737E-112 112442 QUIQUE_C1277_190116_001 199.91 189.99 16917000000 504000000 750790000 1941600000 901290000 1316900000 1357100000 667470000 1232200000 1334200000 1601500000 2499500000 1013300000 1796900000 46218 2794 43142 415849;415850;415851;415852;415853;415854;415855;415856;415857;415858;415859;415860;415861;415862;415863;415864;415865;415866;415867;415868;415869;415870;415871;415872;415873;415874;415875;415876;415877;415878;415879;415880;415881;415882;415883;415884;415885;415886;415887;415888;415889;415890;415891;415892;415893 530766;530767;530768;530769;530770;530771;530772;530773;530774;530775;530776;530777;530778;530779;530780;530781;530782;530783;530784;530785;530786;530787;530788;530789;530790;530791;530792;530793;530794;530795;530796;530797;530798;530799;530800;530801;530802;530803;530804;530805;530806;530807;530808;530809;530810;530811;530812;530813;530814;530815;530816;530817 530772 2242 52 VETGVLKPGMVVTFAPVNVTTEVK Unmodified 2514.3767 0.37674711 2794 P68104;Q5VTE0;A0A087WVQ9 EEF1A1;EEF1A1P5 Elongation factor 1-alpha 1;Putative elongation factor 1-alpha-like 3 yes no 0 0 1 2 4 3 3 3 3 2 3 3 2 3 3 3 120.36 120.36 2;3;4 1.1696E-126 124714 QUIQUE_C1368_190116_001 267.36 235.84 62258000000 4278600000 3906600000 6170800000 6166000000 3842800000 5584000000 4701200000 5543700000 4980300000 2202800000 5899800000 4416600000 4565300000 46219 2794 43142 415894;415895;415896;415897;415898;415899;415900;415901;415902;415903;415904;415905;415906;415907;415908;415909;415910;415911;415912;415913;415914;415915;415916;415917;415918;415919;415920;415921;415922;415923;415924;415925;415926;415927;415928;415929;415930 530818;530819;530820;530821;530822;530823;530824;530825;530826;530827;530828;530829;530830;530831;530832;530833;530834;530835;530836;530837;530838;530839;530840;530841;530842;530843;530844;530845;530846;530847;530848;530849;530850;530851;530852;530853;530854;530855;530856;530857;530858;530859;530860;530861;530862;530863;530864;530865;530866;530867;530868;530869;530870;530871;530872;530873;530874;530875;530876;530877 530829 57 VETIGDAYCVAAGLHR Unmodified 1730.841 0.84100352 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 86.747 86.747 3 0.00067039 87577 QUIQUE_C1563_190116_001 56.599 44.216 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46220 2357 43143 415931;415932;415933 530878;530879;530880 530879 3 VETIGDAYCVAAGLHRK Unmodified 1858.936 0.93596654 2357 P33402 GUCY1A2 Guanylate cyclase soluble subunit alpha-2 yes yes 0 0 1 1 82.757 82.757 3 0.035216 83842 QUIQUE_DMIX7_190116_001 21.534 2.7018 85034000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85034000 0 46221 2357 43144 415934 530881 530881 1 VETLHDFEAANSDELTLQR Unmodified 2187.0444 0.044390595 2530 P49418;H0Y7T8 AMPH Amphiphysin yes no 0 0 0 2 2 3 3 2 3 2 2 3 2 1 2 98.209 98.209 2;3 7.1234E-219 102258 QUIQUE_C1438_190116_001 261.27 234.31 3902700000 408850000 347520000 396030000 366260000 317420000 295960000 252470000 317400000 385690000 0 331670000 58804000 424660000 46222 2530 43145 415935;415936;415937;415938;415939;415940;415941;415942;415943;415944;415945;415946;415947;415948;415949;415950;415951;415952;415953;415954;415955;415956;415957;415958;415959;415960;415961 530882;530883;530884;530885;530886;530887;530888;530889;530890;530891;530892;530893;530894;530895;530896;530897;530898;530899;530900;530901;530902;530903;530904;530905;530906;530907;530908;530909;530910;530911;530912;530913;530914;530915;530916;530917 530898 35 VETNMAFSPFSIASLLTQVLLGAGENTK Oxidation (M) 2953.5107 0.51067441 1879 P05155;H9KV48;E9PGN7 SERPING1 Plasma protease C1 inhibitor yes no 0 1 0 1 180.91 180.91 3 9.1934E-07 187413 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.021 49.445 21421000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21421000 0 0 46223 1879 43146 415962 530918 530918 1104 1 VETPVLPPVLVPR Unmodified 1414.8548 0.85478632 663 B7Z5N5;Q15796;H3BVD1;K7EJX0;P84022;O15198;H0YMP2;H0YL71;H3BP09 SMAD2;SMAD3;SMAD9 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 2;Mothers against decapentaplegic homolog 3;Mothers against decapentaplegic homolog 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 115.83 115.83 2 0.00072176 120978 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.277 93.577 226020000 30733000 32635000 0 28722000 0 0 0 29065000 37329000 0 37357000 30180000 0 46224 663 43147 415963;415964;415965;415966;415967;415968;415969 530919;530920;530921;530922;530923;530924;530925 530924 4 VETQPEVQLPGPAPNLR Unmodified 1843.9792 0.97921156 3760 Q92859;Q59FP8 NEO1 Neogenin yes no 0 0 0 1 1 89.428 89.428 2 0.0030038 93191 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.137 69.475 76666000 0 0 0 0 0 0 0 0 42071000 0 34594000 0 0 46225 3760 43148 415970;415971 530926;530927 530927 2 VETSDEEIHDLHQR Unmodified 1706.786 0.78599106 1912 P07099;B1AQP9;B1AQP8 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 24.479 24.479 4 0.0020638 17992 QUIQUE_DMIX4_190116_001 58.32 38.214 618620000 0 94945000 0 167820000 0 97572000 153920000 57393000 0 46971000 0 0 0 46226 1912 43149 415972;415973;415974;415975;415976;415977 530928;530929;530930;530931;530932;530933 530933 6 VETTEDLVAK Unmodified 1103.571 0.57101948 2411 P38117 ETFB Electron transfer flavoprotein subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.698 34.698 2 0.00025009 29919 QUIQUE_C1277_190116_001 144.09 86.808 3095300000 254620000 263480000 237400000 222260000 320590000 283810000 281650000 0 237360000 142490000 289210000 253390000 309010000 46227 2411 43150 415978;415979;415980;415981;415982;415983;415984;415985;415986;415987;415988;415989 530934;530935;530936;530937;530938;530939;530940;530941;530942;530943;530944;530945;530946;530947 530935 13 VETTVTSLK Unmodified 976.54408 0.54407645 970 E9PPQ1;J3KNE7;Q16890;E9PNK6 TPD52L1 Tumor protein D53 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 27.632 27.632 2 0.0018808 21412 QUIQUE_C1277_190116_001 99.139 47.351 225760000 93996000 60360000 0 0 0 71409000 0 0 0 0 0 0 0 46228 970 43151 415990;415991;415992;415993;415994;415995;415996;415997 530948;530949;530950;530951;530952;530953;530954;530955;530956 530949 9 VETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGK Unmodified 3344.5759 0.57585344 1402 O00408;F5H3Z7;F5H130;F5H5P8 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 144.12 144.12 3 3.1954E-38 148512 QUIQUE_C1277_190116_001 129.61 124.55 422690000 60070000 76106000 55076000 75110000 58396000 46256000 0 0 0 0 0 0 51674000 46229 1402 43152 415998;415999;416000;416001;416002;416003;416004 530957;530958;530959;530960;530961;530962;530963;530964 530958 8 VETYLNENLR Unmodified 1249.6303 0.63026569 4532 Q9UQE7 SMC3 Structural maintenance of chromosomes protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.085 59.085 2 0.00021847 57930 QUIQUE_C1277_190116_001 118.5 87.421 347860000 0 72185000 0 0 65163000 0 49107000 0 0 36148000 61588000 0 63673000 46230 4532 43153 416005;416006;416007;416008;416009;416010;416011;416012;416013;416014 530965;530966;530967;530968;530969;530970;530971;530972;530973;530974;530975 530966 9 VEVALSNIK Unmodified 971.56515 0.56514624 1481 O15111 CHUK Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 50.463 50.463 2 0.0081912 48314 QUIQUE_C1403_190116_001 79.474 30.116 75361000 0 0 21138000 17225000 0 19111000 0 0 0 0 17887000 0 0 46231 1481 43154 416015;416016;416017;416018 530976;530977;530978;530979 530977 4 VEVAPGYVVTVLTWPGTNPTLSSILLNSHTDVVPVFK Unmodified 3949.1241 0.12409147 2885 Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GV31;F8WC59;A0A1B0GTG3 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 2 2 1 1 2 169.26 169.26 3;4 2.0362E-23 176629 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.829 73.883 591020000 0 0 0 0 25405000 0 79231000 95428000 26279000 0 123350000 241320000 0 46232 2885 43155 416019;416020;416021;416022;416023;416024;416025;416026;416027 530980;530981;530982;530983;530984;530985;530986;530987;530988 530986 9 VEVDGSIMEGGGQILR Unmodified 1658.8298 0.82977013 1405 O00442;A6NIC1 RTCA RNA 3'-terminal phosphate cyclase yes no 0 0 0 1 100.3 100.3 2 0.052568 103262 QUIQUE_C1277_190116_001 65.842 47.945 49836000 0 49836000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46233 1405 43156 416028 530989 530989 0 VEVDMEK Unmodified 848.39497 0.39496937 1245;423 I3L0N3;P46459;A0A2R8Y765;J3QKS7;A0A2R8Y7U4;A0A2U3TZQ7;A0A2R8Y7I9;A0A2R8Y4T4;A0A2R8Y855;B4DGM3;Q969G3;K7EMQ8;A0A2R8YES3;H7C048 NSF;SMARCE1 Vesicle-fusing ATPase;SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1 no no 0 0 0 1 1 22.273 22.273 2 0.04475 15181 QUIQUE_C1277_190116_001 79.116 36.116 876050000 0 668660000 0 0 0 0 0 0 0 207390000 0 0 0 46234 1245;423 43157 416029;416030 530990;530991 530990 2 VEVDMEKAESLQVTR Unmodified 1732.8665 0.86654957 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 1 1 1 68.177 68.177 2 2.365E-05 68315 QUIQUE_DMIX7_190116_001 107.85 82.41 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46235 1245 43158 416031;416032 530992;530993 530992 2 VEVECSSLQEAVQAAEAGADLVLLDNFKPEELHPTATVLK Unmodified 4320.1835 0.1835332 3124 Q15274;H3BP73 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes no 0 0 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 167.76 167.76 3;4;5 3.663E-178 171959 QUIQUE_DMIX8_190116_001 187.09 183.09 4109200000 126560000 381680000 1098100000 677800000 0 0 446970000 318500000 234790000 0 391520000 0 433280000 46236 3124 43159 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531006;531007;531008;531009;531010;531011;531012;531013;531014;531015;531016;531017;531018;531019;531020;531021;531022;531023;531024;531025;531026;531027;531028;531029;531030;531031;531032;531033;531034;531035;531036 531006 31 VEVEEVTVPEGFVQK Unmodified 1687.8669 0.86686715 3563 Q8N0W3;J3KSP6 FUK L-fucose kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 99.159 99.159 2 2.1711E-06 102986 QUIQUE_C1218_190116_001 99.439 75.35 35695000 0 0 0 0 0 35695000 0 0 0 0 0 0 0 46238 3563 43161 416064;416065;416066;416067;416068 531037;531038;531039;531040;531041 531037 5 VEVERDNLAEDIMR Unmodified 1687.8199 0.81993373 1952 P08670;B0YJC4 VIM Vimentin yes no 0 0 1 1 1 1 2 2 2 2 2 77.61 77.61 2;3 5.3727E-14 78290 QUIQUE_DMIX8_190116_001 140.74 127.32 7665600000 0 0 43943000 33993000 84864000 0 0 1649500000 834120000 0 2616500000 1339700000 1063000000 46239 1952 43162 416069;416070;416071;416072;416073;416074;416075;416076;416077;416078;416079;416080;416081 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531144;531145;531146;531147;531148;531149;531150;531151;531152;531153;531154;531155;531156;531157;531158;531159;531160 531155 15 VEYGFQVK Unmodified 968.49673 0.49673232 290;327;328 A0A0G2JPR0;A0A140TA49;A0A140TA29;A0A0G2JL54;F5GXS0;A0A140TA32;A0A140TA44 C4B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.865 51.865 2 0.0064558 49784 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.69 53.187 519880000 41289000 63866000 44742000 58049000 107120000 36037000 80846000 0 0 0 0 87939000 0 46255 290;327;328 43176 416171;416172;416173;416174;416175;416176;416177;416178;416179 531161;531162;531163;531164;531165;531166;531167;531168;531169;531170;531171 531170 11 VEYHAGGSTQNSIK Unmodified 1489.7161 0.71612059 2663 P55263 ADK Adenosine kinase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 1 2 1 2 1 1 16.477 16.477 2;3 6.0912E-05 8575 QUIQUE_C1368_190116_001 101.43 85.49 935070000 72154000 96855000 76171000 114010000 91260000 44482000 82408000 52518000 76856000 20169000 130150000 9131700 68907000 46256 2663 43177 416180;416181;416182;416183;416184;416185;416186;416187;416188;416189;416190;416191;416192;416193;416194;416195;416196;416197;416198;416199 531172;531173;531174;531175;531176;531177;531178;531179;531180;531181;531182;531183;531184;531185;531186;531187;531188;531189;531190;531191 531176 20 VEYHFLSPYVSPK Unmodified 1564.7926 0.79257999 1837 P02786;G3V0E5 TFRC Transferrin receptor protein 1;Transferrin receptor protein 1, serum form yes no 0 0 0 1 1 82.733 82.733 3 0.037666 84272 QUIQUE_C1277_190116_001 33.147 17.263 36489000 0 0 0 36489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46257 1837 43178 416200;416201 531192;531193 531192 2 VEYPDLTIDDSYWYR Unmodified 1933.8734 0.87340909 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 139.31 139.31 2 0.00064687 144346 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.814 76.204 79356000 0 0 0 0 0 0 0 22384000 24167000 0 32805000 0 0 46258 2225 43179 416202;416203;416204 531194;531195;531196 531195 2 VEYPIMYSTDPENGHIFNCIQR Oxidation (M) 2698.2156 0.2155718 1453 Q5VV89;O14880;Q5VV87 MGST3 Microsomal glutathione S-transferase 3 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.94 104.94 3 1.5573E-11 108367 QUIQUE_C1368_190116_001 107.45 95.487 970860000 76266000 68803000 91029000 31183000 45226000 55082000 69293000 85016000 0 0 176850000 149360000 122740000 46259 1453 43180 416205;416206;416207;416208;416209;416210;416211;416212;416213;416214;416215 531197;531198;531199;531200;531201;531202;531203;531204;531205;531206;531207;531208;531209 531200 809 13 VEYQEDRNDLVISETELK Unmodified 2179.0645 0.064457335 2422 P40123;E9PDI2;A0A087WZ15;A0A087X0J3;B7Z385 CAP2 Adenylyl cyclase-associated protein 2;Adenylyl cyclase-associated protein yes no 0 0 1 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 81.692 81.692 2;3 1.8686E-44 83917 QUIQUE_C1218_190116_001 184.31 125.82 1757100000 214320000 220530000 249650000 227910000 0 139430000 262470000 34519000 0 86948000 268880000 0 52505000 46260 2422 43181 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531433;531434;531435;531436;531437;531438;531439;531440;531441;531442;531443;531444;531445;531446;531447;531448;531449;531450;531451;531452;531453;531454;531455;531456;531457;531458;531459;531460 531436 28 VFAVGVR Unmodified 746.44391 0.44390889 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 38.795 38.795 2 0.019665 35005 QUIQUE_C1403_190116_001 126.07 51.653 1205000000 0 0 119310000 196370000 252880000 256060000 0 0 117960000 86713000 0 0 175660000 46282 2037 43202 416413;416414;416415;416416;416417;416418;416419 531461;531462;531463;531464;531465;531466;531467 531462 7 VFAVVITDGR Unmodified 1075.6026 0.60259438 2036 P12110 COL6A2 Collagen alpha-2(VI) chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 77.439 77.439 2 0.00020677 77012 QUIQUE_C1563_190116_001 124.23 86.097 2164200000 105010000 121780000 107920000 167510000 311920000 248110000 147050000 146160000 154980000 112820000 180620000 168520000 191800000 46283 2036 43203 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531691;531692;531693;531694;531695;531696;531697;531698;531699;531700;531701;531702;531703;531704;531705;531706;531707 531701 15 VFDMLNR Unmodified 893.44292 0.44292261 2697;3055 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25;Q14240;E7EQG2 EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.259 67.259 2 0.0034246 67496 QUIQUE_C1576_190116_001 163.34 132.9 2588900000 278660000 298080000 296100000 296380000 236360000 235250000 232050000 96518000 130490000 0 183840000 143470000 161690000 46299 2697;3055 43216 416592;416593;416594;416595;416596;416597;416598;416599;416600;416601;416602;416603 531708;531709;531710;531711;531712;531713;531714;531715;531716;531717;531718;531719;531720 531715 10 VFDMLNRR Unmodified 1049.544 0.54403364 2697;3055 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25;Q14240;E7EQG2 EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 0 1 1 46.668 46.668 2 0.038545 43373 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.038 20.591 92320000 0 0 0 0 0 0 0 92320000 0 0 0 0 0 46300 2697;3055 43217 416604 531721 531721 1 VFDMLNRR Oxidation (M) 1065.5389 0.53894826 2697;3055 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3KSZ0;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25;Q14240;E7EQG2 EIF4A1;EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-I;Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed no no 0 1 1 1 23.542 23.542 3 0.044801 17260 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.029 19.179 36113000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36113000 0 0 46301 2697;3055 43217 416605 531722 531722 1 VFDPQNDKPSK Unmodified 1273.6303 0.63026569 1487 O15145 ARPC3 Actin-related protein 2/3 complex subunit 3 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 18.644 18.644 2;3 0.0002052 11088 QUIQUE_C1277_190116_001 119.27 104.59 6942800000 434680000 646880000 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carboxylase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.55 114.55 2 0.00048665 111810 QUIQUE_DMIX4_190116_001 107.24 91.978 1875100000 134380000 133940000 215880000 152520000 146980000 150850000 166000000 114400000 0 72493000 222000000 183560000 182110000 46309 2026 43225 416669;416670;416671;416672;416673;416674;416675;416676;416677;416678;416679;416680 531794;531795;531796;531797;531798;531799;531800;531801;531802;531803;531804;531805 531802 7 VFEDESGKHWSK Unmodified 1447.6732 0.67319314 3688 Q8TEA8;A0A2R8YCT7;A0A2R8Y6X2;A0A087WZV9 DTD1 D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase 1;D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 21.131 21.131 3;4 0.002682 14572 QUIQUE_C1218_190116_001 70.412 54.275 999320000 60042000 0 90494000 0 0 0 163190000 195320000 185640000 0 0 255320000 49315000 46310 3688 43226 416681;416682;416683;416684;416685;416686;416687;416688;416689;416690 531806;531807;531808;531809;531810;531811;531812;531813;531814;531815 531806 9 VFEEDALSWEDK Unmodified 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box-dependent-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 158.68 158.68 2;3 2.1118E-56 163586 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.87 204.9 228030000 0 0 0 0 0 0 0 32203000 35653000 0 121250000 38924000 0 46313 1412 43229 416708;416709;416710;416711;416712;416713 531838;531839;531840;531841;531842;531843 531840 4 VFEFGGPEVLK Unmodified 1220.6441 0.64412484 2917 Q08257;A6NP24;C9JH92 CRYZ Quinone oxidoreductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.92 101.92 2 0.00051965 106352 QUIQUE_C1218_190116_001 101.11 87.526 3247800000 254590000 264730000 335550000 246460000 284010000 230850000 131820000 266490000 269790000 0 295580000 285630000 382350000 46314 2917 43230 416714;416715;416716;416717;416718;416719;416720;416721;416722;416723;416724;416725 531844;531845;531846;531847;531848;531849;531850;531851;531852;531853;531854;531855;531856;531857 531844 14 VFEGNRPTNSIVFTK Unmodified 1707.8944 0.8944193 199;790 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 56.953 56.953 2;3 7.7294E-12 56279 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.24 105.55 39808000000 3779600000 4127100000 2600000000 2519800000 3417800000 1418700000 2855800000 3050400000 2842200000 1130300000 4132100000 3842900000 4090900000 + 46315 199;790 43231 416726;416727;416728;416729;416730;416731;416732;416733;416734;416735;416736;416737;416738;416739;416740;416741;416742;416743;416744;416745;416746;416747;416748;416749;416750 531858;531859;531860;531861;531862;531863;531864;531865;531866;531867;531868;531869;531870;531871;531872;531873;531874;531875;531876;531877;531878;531879;531880;531881;531882;531883;531884;531885;531886;531887 531875 27 VFEHDSVELNCK Unmodified 1475.6715 0.67147858 2003 P10768 ESD S-formylglutathione hydrolase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 39.174 39.174 2;3 1.4352E-146 35939 QUIQUE_C1218_190116_001 265.67 250.08 11656000000 822610000 802370000 1053000000 886300000 491260000 670860000 1087600000 905210000 1011800000 560530000 940320000 961070000 1463600000 46316 2003 43232 416751;416752;416753;416754;416755;416756;416757;416758;416759;416760;416761;416762;416763;416764;416765;416766;416767;416768;416769;416770;416771;416772;416773;416774;416775;416776;416777 531888;531889;531890;531891;531892;531893;531894;531895;531896;531897;531898;531899;531900;531901;531902;531903;531904;531905;531906;531907;531908;531909;531910;531911;531912;531913;531914;531915;531916;531917;531918;531919;531920;531921;531922;531923;531924;531925;531926;531927;531928;531929;531930;531931;531932;531933;531934;531935;531936;531937;531938 531891 51 VFEISPFEPWITR Unmodified 1619.8348 0.83477916 3197 Q16795;A0A3B3ISG8;H3BRM9;F5H0J3 NDUFA9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.76 151.76 2 0.00011741 157176 QUIQUE_C1368_190116_001 117.67 70.782 1576600000 0 0 163690000 160220000 137000000 130770000 194920000 86721000 251980000 80775000 229740000 140750000 0 46317 3197 43233 416778;416779;416780;416781;416782;416783;416784;416785;416786;416787;416788 531939;531940;531941;531942;531943;531944;531945;531946;531947;531948;531949;531950 531941 10 VFELMTSLHTK Unmodified 1304.6799 0.67985842 2901 Q06323;H0YLU2 PSME1 Proteasome activator complex subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.124 76.124 3 3.5173E-05 77072 QUIQUE_C1277_190116_001 110.08 94.875 1620300000 152550000 114950000 176080000 131200000 132900000 90542000 86965000 148550000 134140000 60613000 166560000 107260000 118030000 46318 2901 43234 416789;416790;416791;416792;416793;416794;416795;416796;416797;416798;416799;416800;416801 531951;531952;531953;531954;531955;531956;531957;531958;531959;531960;531961;531962;531963;531964;531965;531966;531967;531968;531969;531970;531971;531972 531954 22 VFEPNEEALGVVLHK Unmodified 1679.8883 0.88827129 1535 O43615;M0QXU7 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 96.482 96.482 2;3 0.0002658 98604 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.156 69.096 1038200000 107980000 99637000 154180000 0 76039000 0 0 69992000 100900000 42251000 152830000 103580000 130790000 46319 1535 43235 416802;416803;416804;416805;416806;416807;416808;416809;416810;416811;416812 531973;531974;531975;531976;531977;531978;531979;531980;531981;531982;531983 531978 11 VFESIGK Unmodified 778.4225 0.42250475 2370 P35232;C9JW96;C9JZ20;E7ESE2;E9PCW0;D6RBK0 PHB Prohibitin yes no 0 0 0 1 31.048 31.048 2 0.060325 25348 QUIQUE_C1277_190116_001 69.383 24.41 232790000 0 232790000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46320 2370 43236 416813 531984 531984 1 VFESVVVDVLNR Unmodified 1374.7507 0.75071518 3931 Q96RL7 VPS13A Vacuolar protein sorting-associated protein 13A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 125.49 125.49 2 0.00046931 129496 QUIQUE_C1277_190116_001 108.67 87.098 36602000 0 14912000 0 0 0 0 21690000 0 0 0 0 0 0 46321 3931 43237 416814;416815;416816;416817 531985;531986;531987;531988 531985 4 VFETFEAK Unmodified 969.48075 0.48074791 1913 P07101 TH Tyrosine 3-monooxygenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.926 51.926 2 0.012053 49310 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.142 60.72 91791000 59797000 0 0 0 0 0 0 31995000 0 0 0 0 0 46322 1913 43238 416818;416819;416820;416821;416822;416823 531989;531990;531991;531992;531993;531994 531992 6 VFEVMLATDR Oxidation (M) 1195.5907 0.59070906 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;F8WDT3;F8WAV5;F8WAX2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 1 0 1 1 2 2 1 1 75.065 75.065 2 0.0037798 71337 QUIQUE_DMIX4_190116_001 85.731 67.328 165880000 65078000 62565000 0 0 0 0 0 0 0 38233000 0 0 0 46323 150 43239 416824;416825;416826;416827;416828;416829;416830;416831 531995;531996;531997;531998;531999;532000;532001;532002 532001 88 8 VFEVMLATDR Unmodified 1179.5958 0.59579444 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;F8WDT3;F8WAV5;F8WAX2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.945 89.945 2 0.00014691 92993 QUIQUE_C1218_190116_001 122.13 85.74 2493700000 253040000 260040000 246800000 197710000 195750000 223560000 220030000 122630000 159460000 91495000 175480000 160820000 186830000 46324 150 43239 416832;416833;416834;416835;416836;416837;416838;416839;416840;416841;416842;416843;416844;416845 532003;532004;532005;532006;532007;532008;532009;532010;532011;532012;532013;532014;532015;532016;532017;532018;532019;532020;532021;532022;532023 532003 20 VFEVNASNLEK Unmodified 1248.635 0.63501672 4389 Q9P2J5;A0A087WXY1 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 64.883 64.883 2 0.0012818 64277 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.258 55.306 226830000 0 0 0 0 0 0 0 61852000 72764000 0 0 92214000 0 46325 4389 43240 416846;416847;416848 532024;532025;532026 532024 3 VFEVSLADLQNDEVAFRK Unmodified 2079.0637 0.063669474 809 D6RG13;D6RAT0;P61247;D6RB09;D6RAS7;H0Y8L7;E9PFI5;D6RED7;D6RGE0;D6RI02 RPS3A 40S ribosomal protein S3a yes no 0 0 1 1 1 127.69 127.69 3 0.0013325 131956 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.504 11.46 109820000 0 0 0 0 0 0 0 59454000 50362000 0 0 0 0 46326 809 43241 416849;416850 532027;532028 532028 2 VFEYEPTIFYPTR Unmodified 1660.8137 0.81370936 852;554 E7ENQ6;A6XGL0 YJEFN3 YjeF N-terminal domain-containing protein 3 no no 0 0 0 1 1 1 124.98 124.98 2 6.5921E-05 127218 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.77 91.911 34028000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34028000 0 0 0 46327 852;554 43242 416851;416852;416853 532029;532030;532031 532029 3 VFFASDPIK Unmodified 1022.5437 0.54368251 3666 Q8TBG4;D6R9Y3 ETNPPL Ethanolamine-phosphate phospho-lyase yes no 0 0 0 1 1 78.841 78.841 2 0.023183 79387 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.91 26.658 55071000 0 0 0 0 0 0 0 26251000 28820000 0 0 0 0 46328 3666 43243 416854;416855 532032;532033;532034 532032 3 VFFASVR Unmodified 824.45447 0.45447358 4473;3590;263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62;H7C0P6;Q8N4C8;Q9UKE5 MAP4K4;MINK1;TNIK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4;Misshapen-like kinase 1;TRAF2 and NCK-interacting protein kinase no no 0 0 0 1 1 57.687 57.687 2 0.053305 54012 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.039 36.452 96167000 0 0 0 0 68945000 0 0 0 0 27222000 0 0 0 46329 263;3590;4473 43244 416856;416857 532035;532036 532036 2 VFFDLMR Unmodified 926.46841 0.46840908 2019;2018 P11234;P11233 RALB;RALA Ras-related protein Ral-B;Ras-related protein Ral-A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.64 112.64 2 0.0098368 116827 QUIQUE_C1368_190116_001 149.06 126.44 2006300000 161820000 148730000 215270000 215040000 108260000 180810000 211710000 117420000 157070000 48691000 179240000 119820000 142450000 46330 2019;2018 43245 416858;416859;416860;416861;416862;416863;416864;416865;416866;416867;416868;416869;416870 532037;532038;532039;532040;532041;532042;532043;532044;532045;532046;532047;532048;532049;532050;532051;532052;532053;532054;532055;532056;532057 532041 21 VFFDLMR Oxidation (M) 942.46332 0.4633237 2019;2018 P11234;P11233 RALB;RALA Ras-related protein Ral-B;Ras-related protein Ral-A no no 0 1 0 1 86.314 86.314 2 0.046676 89598 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.801 62.647 51865000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51865000 0 0 46331 2019;2018 43245 416871 532058 532058 1 VFFDVDIGGER Unmodified 1252.6088 0.60880197 2926 Q08752 PPID Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D yes yes 0 0 0 1 1 1 112.89 112.89 2 0.0044631 115852 QUIQUE_C1277_190116_001 71.349 34.196 55520000 29849000 25671000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46332 2926 43246 416872;416873;416874 532059;532060;532061;532062 532061 4 VFFINDQLR Unmodified 1150.6135 0.61349341 951 E9PKC0;Q6IQ23 PLEKHA7 Pleckstrin homology domain-containing family A member 7 yes no 0 0 0 1 1 98.062 98.062 2 0.0074526 101210 QUIQUE_C1277_190116_001 81.548 44.527 36220000 0 15489000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20731000 46333 951 43247 416875;416876 532063;532064 532063 2 VFFLPSK Unmodified 836.47963 0.47962569 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 81.285 81.285 2 0.037414 84012 QUIQUE_C1218_190116_001 85.359 40.387 115440000 30462000 0 25428000 0 0 0 0 24600000 0 0 34952000 0 0 46334 1473 43248 416877;416878;416879;416880 532065;532066;532067;532068 532065 4 VFFNILEEAR Unmodified 1236.6503 0.65027285 4544 Q9Y276;C9J8G3;C9J1S9 BCS1L Mitochondrial chaperone BCS1 yes no 0 0 0 1 124.42 124.42 2 0.023511 128435 QUIQUE_C1277_190116_001 91.867 62.718 18147000 0 18147000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46335 4544 43249 416881 532069 532069 0 VFFPLCGK Unmodified 966.49971 0.49970921 2586 P51580 TPMT Thiopurine S-methyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 86.071 86.071 2 0.026786 87723 QUIQUE_C1368_190116_001 70.268 33.174 144050000 19889000 0 28452000 26564000 0 21910000 0 27835000 19405000 0 0 0 0 46336 2586 43250 416882;416883;416884;416885;416886;416887 532070;532071;532072;532073;532074;532075;532076 532071 7 VFFTDYGQIPK Unmodified 1313.6656 0.66558856 2911 Q07954;Q6PJ72 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 101.31 101.31 2 0.0029153 104278 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.378 58.353 261060000 0 0 0 0 0 0 0 65011000 51599000 0 57953000 48885000 37614000 46337 2911 43251 416888;416889;416890;416891;416892;416893 532077;532078;532079;532080;532081;532082;532083 532080 7 VFFVESVCDDPDVIAANILEVK Unmodified 2478.2352 0.23522783 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 165.71 165.71 2;3 3.784E-08 172039 QUIQUE_C1438_190116_001 119.32 113.41 369410000 55376000 0 49159000 18397000 43115000 19619000 0 0 0 0 77130000 42287000 64332000 46338 1594 43252 416894;416895;416896;416897;416898;416899;416900;416901;416902;416903 532084;532085;532086;532087;532088;532089;532090;532091;532092;532093;532094 532087 11 VFFVHEGYQGLVDGGDHIK Unmodified 2116.0378 0.037789075 452 A0A2R8Y891;P08237;F8VZI0;F8VX13;F8VNX2;F8VZQ1;F8VSL1;F8VW30;F8W1J8;F8VSF7;F8VUB8;F8VYK8;F8VTQ3 PFKM ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type yes no 0 0 0 4 3 2 2 3 2 2 3 3 4 3 2 2 86.807 86.807 2;3;4 1.2376E-188 88172 QUIQUE_DMIX3_190116_001 248.23 227.76 8849000000 1060900000 773900000 772770000 599890000 642580000 494810000 633780000 630690000 348140000 535450000 1223400000 343590000 789090000 46339 452 43253 416904;416905;416906;416907;416908;416909;416910;416911;416912;416913;416914;416915;416916;416917;416918;416919;416920;416921;416922;416923;416924;416925;416926;416927;416928;416929;416930;416931;416932;416933;416934;416935;416936;416937;416938 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532311;532312;532313;532314;532315;532316;532317;532318;532319;532320;532321;532322;532323;532324;532325;532326;532327;532328;532329;532330;532331;532332 532324 19 VFHLPTTTFIGGQESALPLR Unmodified 2183.1739 0.17388863 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;Q02218;A0A0D9SFS3;C9J4G7 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 2 1 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 125.48 125.48 2;3 7.4771E-09 129663 QUIQUE_C1403_190116_001 102.89 95.321 1828600000 287310000 148380000 216850000 147850000 175250000 157710000 191260000 56118000 100290000 77775000 115370000 47705000 106740000 46358 903;2869 43271 417060;417061;417062;417063;417064;417065;417066;417067;417068;417069;417070;417071;417072;417073;417074;417075 532333;532334;532335;532336;532337;532338;532339;532340;532341;532342;532343;532344;532345;532346;532347;532348;532349;532350;532351;532352;532353 532341 20 VFIASSSGFVAIK Unmodified 1324.7391 0.73908786 4456 Q9UJC5 SH3BGRL2 SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 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172573 QUIQUE_DMIX3_190116_001 279.77 267.14 16813000000 696440000 1802900000 909960000 677630000 1597300000 1062800000 2584500000 1033000000 1252200000 173300000 1715800000 2101800000 1205000000 46365 1931 43277 417140;417141;417142;417143;417144;417145;417146;417147;417148;417149;417150;417151;417152;417153;417154;417155;417156;417157;417158;417159;417160;417161;417162;417163;417164;417165 532455;532456;532457;532458;532459;532460;532461;532462;532463;532464;532465;532466;532467;532468;532469;532470;532471;532472;532473;532474;532475;532476;532477;532478;532479;532480;532481;532482 532472 27 VFIMDSCDELIPEYLNFIR Oxidation (M) 2389.1334 0.1334053 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 1 0 1 2 2 1 3 2 2 2 2 2 2 2 2 164.75 164.75 2;3 1.6058E-151 169269 QUIQUE_DMIX8_190116_001 235.21 222.07 2390800000 85558000 265690000 154050000 102340000 287660000 225740000 287370000 108170000 137840000 95124000 209500000 277070000 154660000 46366 1938 43278 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Unmodified 1296.7013 0.70126256 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 2 2 2 2 1 2 1 1 1 2 2 83.7 83.7 2;3 0.0014679 84294 QUIQUE_C1563_190116_001 69.979 52.543 4088800000 373170000 413300000 411290000 370170000 350670000 288210000 322820000 247480000 200910000 40424000 318070000 330910000 421320000 46368 1787 43279 417206;417207;417208;417209;417210;417211;417212;417213;417214;417215;417216;417217;417218;417219;417220;417221;417222;417223;417224;417225 532528;532529;532530;532531;532532;532533;532534;532535;532536;532537;532538;532539;532540;532541;532542;532543;532544;532545;532546;532547;532548;532549;532550;532551;532552;532553 532540 23 VFIPHGLIMDR Oxidation (M) 1312.6962 0.69617719 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 69.22 69.22 3 0.0075783 68887 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.247 45.119 247500000 0 0 0 0 48539000 0 48422000 0 51824000 0 0 0 98712000 46369 1787 43279 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T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 160.6 160.6 3 4.7007E-06 164592 QUIQUE_C1277_190116_001 55.247 48.952 110850000 0 30042000 0 29852000 0 0 0 0 50956000 0 0 0 0 46380 955 43288 417306;417307;417308 532655;532656;532657;532658 532656 3 VFLFQAPSKEEMLSWILR Unmodified 2193.1656 0.16563213 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 1 1 160.37 160.37 3 0.0060437 164877 QUIQUE_DMIX7_190116_001 48.053 38.638 20501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20501000 0 46381 3997 43289 417309 532659 532659 1 VFLIDLNSTHGTFLGHIR Unmodified 2039.0952 0.095244374 2956 Q12972 PPP1R8 Nuclear inhibitor of protein phosphatase 1;Activator of RNA decay yes yes 0 0 0 1 1 1 1 115.17 115.17 4 2.1349E-08 118787 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.06 100.45 117110000 15924000 0 0 0 0 0 0 19300000 30106000 0 51781000 0 0 46382 2956 43290 417310;417311;417312;417313 532660;532661;532662;532663;532664;532665 532663 6 VFLIYEGYEGLVEGGENIK Unmodified 2128.0728 0.072837177 2129 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532855;532856;532857;532858;532859;532860;532861;532862;532863;532864;532865;532866 532864 12 VFLYELLPESPFFLECNSFTSPDPHK Unmodified 3112.4892 0.48921069 204 A0A0A6YYL4;P57737;I3L351 CORO7-PAM16;CORO7 Coronin;Coronin-7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 167.34 167.34 3 4.716E-18 172278 QUIQUE_C1368_190116_001 100.62 90.105 356730000 0 94527000 73768000 0 48840000 24851000 57809000 56932000 0 0 0 0 0 46396 204 43304 417464;417465;417466;417467;417468;417469 532867;532868;532869;532870;532871;532872;532873;532874 532868 8 VFMKPGLPTTFATLDIDGVR Unmodified 2177.1555 0.15546137 998 F5H039;Q9NQX3;H0YJR5 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 131.02 131.02 3 0.0060772 136974 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.844 42.09 363040000 50835000 72117000 0 40032000 66414000 0 0 0 0 0 75130000 58508000 0 46397 998 43305 417470;417471;417472;417473;417474;417475 532875;532876;532877;532878;532879;532880 532879 6 VFMQEFK Unmodified 927.45242 0.45242467 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protein G(s) subunit alpha isoforms XLas;Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha no no 0 0 1 1 45.832 45.832 2 0.0033715 42648 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.63 87.23 62686000 0 0 0 0 0 0 0 62686000 0 0 0 0 0 46400 2778;2413 43308 417490 532898 532898 1 VFNDLWGK Unmodified 977.49707 0.49706667 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 1 1 1 83.799 83.799 2 0.020244 85693 QUIQUE_C1277_190116_001 77.058 26.092 110400000 0 28563000 0 0 0 36949000 23609000 0 0 0 0 0 21279000 46401 699 43309 417491;417492;417493;417494 532899;532900;532901;532902 532899 4 VFNETPINPR Unmodified 1185.6142 0.6142217 4645 Q9Y678 COPG1 Coatomer subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 48.859 48.859 2 0.0054852 46103 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.318 62.453 164440000 0 0 0 0 0 0 0 54618000 0 29322000 80501000 0 0 46402 4645 43310 417495;417496;417497;417498 532903;532904;532905;532906 532906 4 VFNFLWR Unmodified 980.52322 0.52322184 3826 Q96CW5 TUBGCP3 Gamma-tubulin complex component 3 yes yes 0 0 0 1 122.33 122.33 2 0.039103 126542 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.025 62.478 15963000 0 0 0 0 0 0 0 0 15963000 0 0 0 0 46403 3826 43311 417499 532907 532907 1 VFNGSGKPIDR Unmodified 1188.6251 0.62512073 2175 P21281;H0YC04 ATP6V1B2 V-type proton ATPase subunit B, brain isoform yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 1 2 1 17.635 17.635 2;3 0.0033752 10329 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.593 58.462 1886100000 0 136970000 112920000 0 93520000 114190000 194530000 0 192610000 90380000 327790000 335370000 287860000 46404 2175 43312 417500;417501;417502;417503;417504;417505;417506;417507;417508;417509;417510;417511;417512 532908;532909;532910;532911;532912;532913;532914;532915;532916;532917;532918;532919;532920 532917 9 VFNLFCLYGNIEK Unmodified 1615.8068 0.80684985 649 B7WPG3;C9IYN3;D6W592;Q8WVV9 HNRNPLL;HNRPLL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L-like yes no 0 0 0 1 1 1 1 149.14 149.14 2 0.0088762 154680 QUIQUE_C1368_190116_001 65.5 51.04 69887000 0 0 0 0 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239920000 504070000 490400000 305570000 99725000 560050000 433970000 339920000 46415 4593 43322 417591;417592;417593;417594;417595;417596;417597;417598;417599;417600;417601;417602;417603;417604;417605;417606;417607;417608;417609;417610;417611 533068;533069;533070;533071;533072;533073;533074;533075;533076;533077;533078;533079;533080;533081;533082;533083;533084;533085;533086;533087;533088;533089;533090;533091;533092 533070 23 VFNYNTLER Unmodified 1154.572 0.57202253 2380 P35606;D6R997;D6RBZ7;D6RCL6;D6RBG7;D6RBT6 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.516 62.516 2 0.0017963 62118 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.02 78.315 453190000 0 0 0 0 57673000 45877000 82352000 0 0 36103000 103830000 56602000 70758000 46416 2380 43323 417612;417613;417614;417615;417616;417617;417618 533093;533094;533095;533096;533097;533098;533099 533097 6 VFPDKEVMLDAALALAAEISSK Unmodified 2317.2239 0.22393487 2959 Q13011;M0R248 ECH1 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial yes no 0 0 1 4 3 3 2 3 2 2 4 3 1 3 3 3 169.17 169.17 2;3;4 3.5668E-10 171230 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.66 94.666 5006800000 345490000 354170000 533640000 221600000 338620000 160530000 283420000 403030000 617250000 30232000 779580000 496830000 442390000 46417 2959 43324 417619;417620;417621;417622;417623;417624;417625;417626;417627;417628;417629;417630;417631;417632;417633;417634;417635;417636;417637;417638;417639;417640;417641;417642;417643;417644;417645;417646;417647;417648;417649;417650;417651;417652;417653;417654 533100;533101;533102;533103;533104;533105;533106;533107;533108;533109;533110;533111;533112;533113;533114;533115;533116;533117;533118;533119;533120;533121;533122;533123;533124;533125;533126;533127;533128;533129;533130;533131;533132;533133;533134;533135;533136;533137;533138 533123 37 VFPEHIGEDVLRPAMLAK Unmodified 2021.0768 0.076817118 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 1 1 99.05 99.05 4 0.049835 100540 QUIQUE_C1563_190116_001 27.149 16.773 9082300 0 0 0 0 0 9082300 0 0 0 0 0 0 0 46418 348 43325 417655 533139 533139 1 VFPLSCAVQQYAWGK Unmodified 1752.8658 0.86576171 2365 P34949;H3BMZ9;H3BPP3;H3BUZ9;H3BNY8;H3BQX0;H3BU66;H3BN01;H3BUG1 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 130.7 130.7 2;3 7.4779E-06 136700 QUIQUE_C1438_190116_001 106.29 90.153 979250000 0 0 303570000 0 303160000 0 294510000 0 0 78007000 0 0 0 46419 2365 43326 417656;417657;417658;417659;417660 533140;533141;533142;533143;533144;533145;533146;533147 533141 8 VFPPEIVEQMGCK Unmodified 1532.7367 0.73672137 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 3 5 5 1 2 3 3 1 1 2 1 104.69 104.69 2;3 6.7748E-08 106792 QUIQUE_C1277_190116_001 136.63 126.4 1370200000 79236000 126600000 214950000 82935000 168520000 164040000 226560000 33835000 0 0 77410000 117210000 78876000 46420 1245 43327 417661;417662;417663;417664;417665;417666;417667;417668;417669;417670;417671;417672;417673;417674;417675;417676;417677;417678;417679;417680;417681;417682;417683;417684;417685;417686;417687 533148;533149;533150;533151;533152;533153;533154;533155;533156;533157;533158;533159;533160;533161;533162;533163;533164;533165;533166;533167;533168;533169;533170;533171;533172;533173;533174;533175;533176;533177;533178;533179;533180;533181;533182;533183 533152 31 VFPSHFTQQR Unmodified 1245.6255 0.62545508 3471 Q7Z6Z7;H0Y659 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes no 0 0 0 1 1 1 28.284 28.284 2;3 0.013236 22247 QUIQUE_C1368_190116_001 47.706 25.065 73554000 0 18742000 31005000 0 0 23808000 0 0 0 0 0 0 0 46421 3471 43328 417688;417689;417690 533184;533185;533186 533185 3 VFQAENPFDFMENISLEGK Unmodified 2214.0303 0.030320436 3449 Q7LG56;H0YAV1;A0A0C4DGZ6 RRM2B Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 162.91 162.91 2 2.642E-17 165093 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.24 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533214;533215;533216;533217;533218;533219;533220;533221;533222;533223;533224;533225;533226;533227;533228;533229;533230;533231;533232;533233;533234;533235;533236;533237;533238;533239;533240;533241;533242;533243;533244;533245;533246;533247;533248;533249;533250;533251;533252;533253;533254;533255;533256;533257;533258;533259;533260;533261;533262;533263;533264;533265;533266;533267;533268;533269;533270;533271;533272;533273;533274;533275;533276;533277 533217 61 VFQSSANYAENFIQSIISTVEPAQR Unmodified 2798.3875 0.38752281 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 3 1 3 2 2 173.16 173.16 2;3;4 1.1203E-239 177823 QUIQUE_C1368_190116_001 328.73 305.59 8926600000 215660000 333430000 425000000 142260000 392580000 458230000 909330000 597190000 1499300000 52621000 1926700000 1132300000 842020000 46430 2400 43337 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protein RAD50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 155.04 155.04 3 0.00021879 160692 QUIQUE_C1218_190116_001 43.848 29.863 133160000 29336000 19063000 37088000 0 31574000 0 0 16099000 0 0 0 0 0 46432 3762 43339 417796;417797;417798;417799;417800 533320;533321;533322;533323;533324;533325 533320 6 VFQVEYAMK Unmodified 1113.5529 0.55286699 2245 P25788;G3V3W4;G3V5N4 PSMA3 Proteasome subunit alpha type-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 71.161 71.161 2 0.015924 72542 QUIQUE_C1438_190116_001 95.909 76.815 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46433 2245 43340 417801;417802;417803;417804;417805;417806;417807 533326;533327;533328;533329;533330;533331;533332 533327 7 VFQVMNLR Unmodified 1005.543 0.54297101 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 77.11 77.11 2 0.023727 79055 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.039 41.103 114420000 0 0 54011000 0 0 0 0 0 0 0 60410000 0 0 46434 119 43341 417808;417809 533333;533334 533334 2 VFSATLGLVDIVK Unmodified 1360.7966 0.79660274 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20371000 28859000 46453 1780 43360 417970;417971;417972;417973;417974;417975;417976 533541;533542;533543;533544;533545;533546;533547;533548 533543 7 VFTAIANQPWAQK Unmodified 1472.7776 0.77759863 3177 Q16401 PSMD5 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.218 87.218 2 4.1159E-07 88398 QUIQUE_DMIX1_190116_001 130.66 102.26 1041400000 84370000 79153000 93676000 76496000 73755000 77110000 64418000 74660000 74219000 32932000 126140000 89755000 94756000 46454 3177 43361 417977;417978;417979;417980;417981;417982;417983;417984;417985;417986;417987;417988;417989 533549;533550;533551;533552;533553;533554;533555;533556;533557;533558;533559;533560;533561 533556 12 VFTEGEPLALR Unmodified 1230.6608 0.66083754 742 C9JSN8;P12314 FCGR1A High affinity immunoglobulin gamma Fc receptor I yes no 0 0 0 1 80.927 80.927 2 0.01905 77127 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.549 40.289 18273000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18273000 0 0 0 46455 742 43362 417990 533562 533562 1 VFTFSVGQHNYDR Unmodified 1568.7372 0.73719038 2640 P54289 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 1 2 65.843 65.843 2;3 1.6857E-07 64344 QUIQUE_C1563_190116_001 137.17 123.4 2459200000 185610000 291120000 263580000 169700000 227800000 196750000 408440000 112110000 176050000 59964000 185330000 182760000 0 46456 2640 43363 417991;417992;417993;417994;417995;417996;417997;417998;417999;418000;418001;418002;418003;418004;418005;418006;418007;418008;418009 533563;533564;533565;533566;533567;533568;533569;533570;533571;533572;533573;533574;533575;533576;533577;533578;533579;533580;533581 533572 18 VFTPEEAVNFILSCLEDEK Unmodified 2239.0719 0.071850899 4117 Q9H0C8;F8SNU7 ILKAP;ILKAP3 Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C yes no 0 0 0 1 176.61 176.61 3 0.00044781 180573 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.034 51.534 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3999 43369 418031;418032;418033;418034;418035;418036;418037;418038;418039;418040 533607;533608;533609;533610;533611;533612;533613;533614;533615;533616 533611 4 VFTTQELVQAFTHAPATLEADR Unmodified 2444.2336 0.23358835 1730 O95433;G3V438;H0YJG7;H0YJ63 AHSA1 Activator of 90 kDa heat shock protein ATPase homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 2 2 2 1 1 1 3 1 1 1 2 148.54 148.54 2;3 1.8581E-77 153312 QUIQUE_C1277_190116_001 180.32 164.62 6406000000 440630000 423140000 427520000 566590000 520870000 491690000 577830000 439460000 507820000 174510000 649300000 528240000 658420000 46463 1730 43370 418041;418042;418043;418044;418045;418046;418047;418048;418049;418050;418051;418052;418053;418054;418055;418056;418057;418058;418059 533617;533618;533619;533620;533621;533622;533623;533624;533625;533626;533627;533628;533629;533630;533631;533632;533633;533634;533635;533636;533637;533638;533639;533640;533641;533642;533643;533644 533619 27 VFTTVGSAEK Unmodified 1037.5393 0.53932542 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.6 26.6 2 0.0058427 20606 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.94 51.731 1546400000 138390000 150220000 150030000 175540000 177240000 120320000 179290000 132200000 142060000 0 0 181090000 0 46464 2524 43371 418060;418061;418062;418063;418064;418065;418066;418067;418068;418069 533645;533646;533647;533648;533649;533650;533651;533652;533653;533654 533653 2 VFVANPNK Unmodified 887.4865 0.48650199 4579 Q9Y376;A0A087X0K1 CAB39 Calcium-binding protein 39 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.152 20.152 2 0.0070768 12613 QUIQUE_DMIX8_190116_001 99.384 65.646 1471700000 0 157960000 123010000 0 118240000 139270000 125010000 123260000 157380000 65919000 136960000 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533666;533667;533668;533669;533670;533671;533672;533673;533674;533675;533676;533677;533678;533679;533680;533681;533682;533683;533684;533685;533686;533687;533688;533689;533690;533691;533692;533693;533694;533695;533696;533697;533698;533699;533700;533701;533702;533703;533704 533690 38 VFVESVLR Unmodified 947.54402 0.54401687 2176 P21283;E7EV59;A0A0U1RR16;Q8NEY4 ATP6V1C1;ATP6V1C2 V-type proton ATPase subunit C 1;V-type proton ATPase subunit C 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 71.659 71.659 2 0.030962 72239 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.45 68.403 1823200000 0 0 0 291690000 0 245010000 282950000 224640000 0 119310000 349470000 0 310110000 46467 2176 43374 418108;418109;418110;418111;418112;418113;418114 533705;533706;533707;533708;533709;533710;533711;533712 533709 6 VFVEYIQPK Unmodified 1121.6121 0.61209643 3044 Q14139 UBE4A Ubiquitin conjugation factor E4 A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.479 72.479 2 0.0053947 72587 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.794 60.9 455120000 45319000 37095000 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418167;418168;418169;418170;418171;418172;418173;418174;418175;418176;418177;418178;418179 533769;533770;533771;533772;533773;533774;533775;533776;533777;533778;533779;533780;533781;533782;533783;533784;533785;533786 533773 18 VFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPK Unmodified 3308.5877 0.58773876 2042 P12271;H3BN92 RLBP1 Retinaldehyde-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 160.34 160.34 3 6.8565E-88 164871 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.19 139.76 294580000 0 0 24480000 40583000 0 55749000 59387000 42813000 61957000 9611700 0 0 0 46475 2042 43381 418180;418181;418182;418183;418184;418185;418186 533787;533788;533789;533790;533791;533792;533793 533792 6 VFVHYTGWLLDGTK Unmodified 1634.8457 0.84567819 2876 Q02790;F5H1U3 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 1 105.98 105.98 3 0.0050371 109179 QUIQUE_C1277_190116_001 46.206 35.262 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46476 2876 43382 418187 533794 533794 1 VFVLDEADVMIATQGHQDQSIR Unmodified 2471.2115 0.2114727 1021 F6QDS0;I3L352 DDX19A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 125.81 125.81 3 5.2901E-10 128351 QUIQUE_C1563_190116_001 101.71 92.998 459540000 111630000 38350000 60329000 49043000 0 58781000 0 71157000 0 26501000 43755000 0 0 46477 1021 43383 418188;418189;418190;418191;418192;418193;418194;418195 533795;533796;533797;533798;533799;533800;533801;533802 533799 5 VFVLPCIQQIQR Unmodified 1499.8283 0.82825399 1673 O75955;A2AB12;A2AB10;A2AB13;A0A0G2JJQ6;A2AB11 FLOT1 Flotillin-1 yes no 0 0 0 1 1 115.39 115.39 2 0.0076381 120058 QUIQUE_C1368_190116_001 67.897 47.693 49096000 0 0 49096000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46478 1673 43384 418196;418197 533803;533804 533803 2 VFVSLPTELEDLIPEVEEFYK Unmodified 2495.2723 0.27232485 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 174.59 174.59 3 0.028416 181767 QUIQUE_DMIX5_190116_001 27.129 24.634 20138000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20138000 0 0 46479 3779 43385 418198 533805 533805 1 VFVSPLAK Unmodified 859.51674 0.51673948 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 51.316 51.316 2 0.014995 49664 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.265 46.047 1681100000 0 0 0 0 0 320870000 357860000 209810000 286080000 161640000 0 0 344800000 46480 1997 43386 418199;418200;418201;418202;418203;418204 533806;533807;533808;533809;533810;533811;533812 533809 7 VFVVGESYTVVQR Unmodified 1481.7878 0.78782897 3013 Q13572;G3V3C0;G3V4M9 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 87.025 87.025 2 0.00031095 84539 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.456 75.37 73499000 0 21483000 24248000 27768000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46481 3013 43387 418205;418206;418207;418208;418209 533813;533814;533815;533816;533817 533817 4 VFVVGESYTVVQRPSLK Unmodified 1907.0516 0.051648225 3013 Q13572;G3V3C0;G3V4M9 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 85.791 85.791 3 1.0341E-12 87372 QUIQUE_DMIX3_190116_001 102.78 86.283 742070000 29772000 38680000 38069000 43623000 57461000 39197000 47143000 83375000 87235000 25152000 89125000 75494000 87749000 46482 3013 43388 418210;418211;418212;418213;418214;418215;418216;418217;418218;418219;418220;418221;418222;418223 533818;533819;533820;533821;533822;533823;533824;533825;533826;533827;533828;533829;533830;533831;533832;533833;533834;533835 533829 18 VFVVGVGMTK Unmodified 1035.5787 0.57868781 2196 P22307;E9PLD1 SCP2 Non-specific lipid-transfer protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 72.335 72.335 2 0.0034764 72318 QUIQUE_C1277_190116_001 84.213 49.405 109230000 34324000 22180000 30505000 0 0 0 0 22219000 0 0 0 0 0 46483 2196 43389 418224;418225;418226;418227;418228;418229 533836;533837;533838;533839;533840;533841;533842 533837 7 VFWLLSGSDSQVTR Unmodified 1593.8151 0.81510635 3522 Q86YJ6;A8K0C1 THNSL2 Threonine synthase-like 2 yes no 0 0 0 1 1 126.69 126.69 2 0.008881 130602 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.149 37.387 57923000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14722000 0 0 43201000 46484 3522 43390 418230;418231 533843;533844 533844 2 VFYELQHSDKPVGTK Unmodified 1746.8941 0.89408495 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 1 1 1 35.8 35.8 3 7.5048E-05 32075 QUIQUE_C1438_190116_001 89.466 64.746 204140000 0 0 0 0 132730000 0 0 0 0 0 0 0 71405000 46485 3778 43391 418232;418233 533845;533846 533845 2 VFYIGLR Unmodified 866.50142 0.50142377 4103 Q9GZP4;X6R8S9 PITHD1 PITH domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.942 83.942 2 0.020857 86415 QUIQUE_DMIX5_190116_001 106.84 75.785 1460300000 132150000 212000000 137580000 110540000 0 117470000 130310000 99727000 0 80548000 171090000 124430000 144440000 46486 4103 43392 418234;418235;418236;418237;418238;418239;418240;418241;418242;418243;418244;418245 533847;533848;533849;533850;533851;533852;533853;533854;533855;533856;533857;533858;533859;533860;533861;533862;533863 533859 17 VFYSLMR Unmodified 914.46841 0.46840908 1912 P07099 EPHX1 Epoxide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.544 74.544 2 0.023846 71653 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.279 77.508 204220000 57508000 0 0 0 0 0 0 0 57081000 20048000 69582000 0 0 46487 1912 43393 418246;418247;418248;418249 533864;533865;533866;533867 533866 4 VFYYLVQDLK Unmodified 1286.6911 0.69107503 3798 Q96A72 MAGOHB Protein mago nashi homolog 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 114.9 114.9 2 0.0053804 120137 QUIQUE_C1218_190116_001 77.677 57.891 256040000 50988000 55258000 0 0 0 0 0 25963000 52891000 0 40121000 30817000 0 46488 3798 43394 418250;418251;418252;418253;418254;418255 533868;533869;533870;533871;533872;533873;533874 533869 6 VGAAEIISR Unmodified 914.51853 0.5185304 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 38.82 38.82 2 0.045114 35410 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.516 41.959 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yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 1 1 57.684 57.684 2 0.00055764 55833 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.605 73.847 452620000 24851000 0 0 0 0 0 0 52055000 132330000 28354000 86332000 62961000 65732000 46492 2533 43398 418272;418273;418274;418275;418276;418277;418278;418279 533891;533892;533893;533894;533895;533896;533897;533898 533892 1982 8 VGAEDADGIDMAYR Unmodified 1481.6457 0.64565776 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.346 73.346 2 1.6723E-43 73602 QUIQUE_C1368_190116_001 189.57 161.56 2497000000 183620000 224780000 243840000 251790000 186640000 208450000 203580000 145080000 180440000 0 215580000 200870000 252370000 46493 2533 43398 418280;418281;418282;418283;418284;418285;418286;418287;418288;418289;418290;418291 533899;533900;533901;533902;533903;533904;533905;533906;533907;533908;533909;533910;533911 533901 11 VGAENVAIVEPSER Unmodified 1468.7522 0.75217174 4660 Q9Y6N5;H3BNX3;H3BMS6;A0A1B0GXB4;H3BV36 SQRDL Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 57.638 57.638 2 8.7051E-05 54284 QUIQUE_DMIX4_190116_001 99.283 64.59 127300000 0 0 44550000 0 0 26033000 0 0 0 0 56716000 0 0 46494 4660 43399 418292;418293;418294;418295;418296;418297;418298 533912;533913;533914;533915;533916;533917;533918 533916 7 VGAFNVGK Unmodified 790.43374 0.43373813 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 31.53 31.53 2 0.0067305 24314 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.67 60.098 229530000 0 0 28932000 0 0 0 0 63450000 0 0 48167000 43905000 45075000 46495 4148 43400 418299;418300;418301;418302;418303;418304 533919;533920;533921;533922;533923;533924 533923 6 VGAFTMVCK Unmodified 1011.4882 0.48815825 1788 P00505 GOT2 Aspartate aminotransferase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.976 53.976 1;2 2.3696E-07 51735 QUIQUE_C1368_190116_001 162.5 141.98 11017000000 1101600000 1204200000 1037700000 828520000 834350000 768680000 918610000 580040000 593250000 187420000 1104300000 871300000 986790000 46496 1788 43401 418305;418306;418307;418308;418309;418310;418311;418312;418313;418314;418315;418316;418317;418318 533925;533926;533927;533928;533929;533930;533931;533932;533933;533934;533935;533936;533937;533938;533939;533940;533941;533942;533943;533944;533945;533946;533947;533948;533949;533950;533951;533952 533930 27 VGAGAPVYMAAVLEYLTAEILELAGNAAR Oxidation (M) 2948.5317 0.53174421 3196 Q16777;Q6FI13 HIST2H2AC;HIST2H2AA3 Histone H2A type 2-C;Histone H2A type 2-A yes no 0 1 0 1 1 180.35 180.35 3 3.3918E-25 183299 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.3 94.721 48518000 0 0 0 0 0 0 0 0 15618000 0 0 32900000 0 46497 3196 43402 418319;418320 533953;533954 533954 2624 2 VGAGSLPDFLPFLLEQIEAEPR Unmodified 2397.258 0.25801219 1614 O75155 CAND2 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 173.34 173.34 3 9.7736E-09 178368 QUIQUE_C1576_190116_001 90.22 75.058 29753000 0 0 0 0 0 0 8055200 0 0 0 21698000 0 0 46498 1614 43403 418321;418322 533955;533956 533955 2 VGAHAGEYGAEALER Unmodified 1528.727 0.72701962 2801 P69905;A0A2R8Y7C0 HBA1 Hemoglobin subunit alpha yes no 0 0 0 8 19 3 4 13 7 6 5 5 2 32 15 6 48.394 48.394 1;2;3 4.9732E-54 32537 QUIQUE_DMIX3_190116_001 225.15 88.616 312870000000 28136000000 32795000000 24891000000 14201000000 50238000000 21598000000 19149000000 10807000000 15582000000 4761800000 38186000000 24152000000 28369000000 46499 2801 43404 418323;418324;418325;418326;418327;418328;418329;418330;418331;418332;418333;418334;418335;418336;418337;418338;418339;418340;418341;418342;418343;418344;418345;418346;418347;418348;418349;418350;418351;418352;418353;418354;418355;418356;418357;418358;418359;418360;418361;418362;418363;418364;418365;418366;418367;418368;418369;418370;418371;418372;418373;418374;418375;418376;418377;418378;418379;418380;418381;418382;418383;418384;418385;418386;418387;418388;418389;418390;418391;418392;418393;418394;418395;418396;418397;418398;418399;418400;418401;418402;418403;418404;418405;418406;418407;418408;418409;418410;418411;418412;418413;418414;418415;418416;418417;418418;418419;418420;418421;418422;418423;418424;418425;418426;418427;418428;418429;418430;418431;418432;418433;418434;418435;418436;418437;418438;418439;418440;418441;418442;418443;418444;418445;418446;418447 533957;533958;533959;533960;533961;533962;533963;533964;533965;533966;533967;533968;533969;533970;533971;533972;533973;533974;533975;533976;533977;533978;533979;533980;533981;533982;533983;533984;533985;533986;533987;533988;533989;533990;533991;533992;533993;533994;533995;533996;533997;533998;533999;534000;534001;534002;534003;534004;534005;534006;534007;534008;534009;534010;534011;534012;534013;534014;534015;534016;534017;534018;534019;534020;534021;534022;534023;534024;534025;534026;534027;534028;534029;534030;534031;534032;534033;534034;534035;534036;534037;534038;534039;534040;534041;534042;534043;534044;534045;534046;534047;534048;534049;534050;534051;534052;534053;534054;534055;534056;534057;534058;534059;534060;534061;534062;534063;534064;534065;534066;534067;534068;534069;534070;534071;534072;534073;534074;534075;534076;534077;534078;534079;534080;534081;534082;534083;534084;534085;534086;534087;534088;534089;534090;534091;534092;534093;534094;534095;534096;534097;534098;534099;534100;534101;534102;534103;534104;534105;534106;534107;534108;534109;534110;534111;534112;534113;534114;534115;534116;534117;534118;534119;534120;534121;534122;534123;534124;534125;534126;534127;534128;534129;534130;534131;534132;534133;534134;534135;534136;534137;534138;534139;534140;534141;534142;534143;534144;534145;534146;534147;534148;534149;534150;534151;534152;534153;534154;534155;534156;534157;534158;534159 534068 183 VGAIPANALDDGQWSQGLISAAR Unmodified 2309.1764 0.17640782 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 1 1 135.01 135.01 2;3 3.3973E-30 139747 QUIQUE_C1368_190116_001 169.09 153.93 2284700000 179510000 207080000 253330000 283900000 133260000 154200000 87146000 238540000 120000000 99823000 303430000 113690000 110770000 46500 4600 43405 418448;418449;418450;418451;418452;418453;418454;418455;418456;418457;418458;418459;418460;418461;418462;418463;418464;418465;418466;418467;418468 534160;534161;534162;534163;534164;534165;534166;534167;534168;534169;534170;534171;534172;534173;534174;534175;534176;534177;534178;534179;534180;534181;534182;534183 534165 23 VGALASLIR Unmodified 898.56 0.56000128 4642 Q9Y646 CPQ Carboxypeptidase Q yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 74.413 74.413 2 0.047113 76560 QUIQUE_C1218_190116_001 64.734 35.375 53422000 0 0 0 0 0 0 30265000 0 0 0 0 23157000 0 46501 4642 43406 418469;418470;418471;418472;418473;418474 534184;534185;534186;534187;534188;534189 534184 6 VGAPLVCCEIK Unmodified 1244.6257 0.62571436 1737 O95573 ACSL3 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3 yes yes 0 0 0 1 59.84 59.84 2 0.023754 58526 QUIQUE_C1403_190116_001 59.645 42.876 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46502 1737 43407 418475 534190 534190 1 VGASASDGSVCVLDLR Unmodified 1604.7828 0.78281994 4086 Q9BZK7;A0A0D9SFI2 TBL1XR1 F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1 no no 0 0 0 1 87.491 87.491 2 0.033114 87865 QUIQUE_C1563_190116_001 51.569 35.939 26602000 0 0 0 0 0 26602000 0 0 0 0 0 0 0 46503 4086 43408 418476 534191 534191 0 VGASEAALFLK Unmodified 1104.6179 0.61791009 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R1V5;K7EJR2;M0R330;M0QX30 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 83.814 83.814 2 0.0055961 85848 QUIQUE_C1277_190116_001 83.998 38.617 449120000 0 138920000 109030000 0 0 0 0 0 0 0 109290000 0 91876000 46504 4394 43409 418477;418478;418479;418480 534192;534193;534194;534195 534192 1 VGASEAALFLKK Unmodified 1232.7129 0.71287311 4394 Q9UBC2;M0R165;M0R1V5;K7EJR2;M0R330;M0QX30 EPS15L1 Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1 yes no 0 0 1 1 1 1 57.947 57.947 3 0.0031695 57588 QUIQUE_DMIX5_190116_001 49.28 30.017 35400000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35400000 0 0 46505 4394 43410 418481;418482;418483 534196;534197;534198 534198 3 VGATLALMWLK Unmodified 1201.6893 0.68930089 4344 Q9NZD2 GLTP Glycolipid transfer protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 121.46 121.46 2;3 0.00049474 140886 QUIQUE_C1218_190116_001 108.98 78.723 600560000 22707000 28542000 15668000 0 35977000 0 51123000 29179000 0 0 32408000 384960000 0 46506 4344 43411 418484;418485;418486;418487;418488;418489;418490;418491;418492;418493 534199;534200;534201;534202;534203;534204;534205;534206;534207;534208 534199 8 VGATLALMWLK Oxidation (M) 1217.6842 0.68421552 4344 Q9NZD2 GLTP Glycolipid transfer protein yes yes 0 1 0 1 121.18 121.18 2 0.015194 123796 QUIQUE_DMIX1_190116_001 76.827 40.133 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46507 4344 43411 418494 534209 534209 1 VGAVDADKHHSLGGQYGVQGFPTIK Unmodified 2580.3085 0.30848463 3109 Q15084 PDIA6 Protein disulfide-isomerase A6 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 2 2 2 68.32 68.32 3;4;5 7.7438E-99 68813 QUIQUE_DMIX1_190116_001 184.76 175.59 2555300000 116000000 163590000 312840000 207460000 205180000 140810000 0 239390000 211660000 51303000 355060000 270000000 281990000 46508 3109 43412 418495;418496;418497;418498;418499;418500;418501;418502;418503;418504;418505;418506;418507;418508;418509;418510;418511 534210;534211;534212;534213;534214;534215;534216;534217;534218;534219;534220;534221;534222;534223;534224;534225;534226 534218 16 VGCDREDSAEAVECLR Unmodified 1864.8044 0.80436002 3654 Q8NFZ4;I3L498 NLGN2 Neuroligin-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 47.61 47.61 3 0.00061372 44999 QUIQUE_C1403_190116_001 56.215 44.299 159350000 0 29373000 29645000 56356000 0 22441000 0 0 0 0 21535000 0 0 46509 3654 43413 418512;418513;418514;418515;418516 534227;534228;534229;534230;534231 534229 5 VGCFDPYSDDPR Unmodified 1426.5823 0.58232922 57 A0A087WW77;Q15334 LLGL1 Lethal(2) giant larvae protein homolog 1 yes no 0 0 0 1 66.426 66.426 2 0.053964 62064 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.79 41.3 53040000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53040000 0 0 0 46510 57 43414 418517 534232 534232 1 VGCLQLINALITPAEELDFR Unmodified 2271.1933 0.19330344 279 H9KV28;A0A2R8Y5N1;A0A140T8Z0;A0A0G2JH68;O60610 DIAPH1 Protein diaphanous homolog 1 yes no 0 0 0 1 167.82 167.82 3 0.06209 175257 QUIQUE_DMIX5_190116_001 18.555 13.555 44840000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44840000 0 0 46511 279 43415 418518 534233 534233 1 VGCNPNEDVAIFAVDSLR Unmodified 1974.9469 0.94692516 4651;4652 Q9Y6D5;Q9Y6D6;E5RIF2;E5RHL7 ARFGEF2;ARFGEF1 Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2;Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 no no 0 0 0 1 1 132.22 132.22 2 0.0028814 137396 QUIQUE_C1218_190116_001 67.93 50.988 106810000 50688000 0 0 0 56120000 0 0 0 0 0 0 0 0 46512 4651;4652 43416 418519;418520 534234;534235 534234 2 VGCVELLNTVQR Unmodified 1386.7289 0.72893388 3157 Q15777;O15442 MPPED2;MPPED1 Metallophosphoesterase MPPED2;Metallophosphoesterase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 77.781 77.781 2 0.011942 78842 QUIQUE_C1277_190116_001 58.37 39.59 133740000 0 56493000 0 0 77245000 0 0 0 0 0 0 0 0 46513 3157 43417 418521;418522 534236;534237 534236 2 VGDAIPAVEVFEGEPGNK Unmodified 1826.905 0.90504357 2300 P30044 PRDX5 Peroxiredoxin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 5 2 2 2 2 2 2 3 3 3 2 2 112.85 112.85 2;3 8.2868E-18 116514 QUIQUE_C1277_190116_001 176.05 146.71 12184000000 1053900000 1141900000 1011900000 904480000 1045500000 994700000 1041400000 635990000 860130000 453020000 1106700000 860530000 1073900000 46514 2300 43418 418523;418524;418525;418526;418527;418528;418529;418530;418531;418532;418533;418534;418535;418536;418537;418538;418539;418540;418541;418542;418543;418544;418545;418546;418547;418548;418549;418550;418551;418552;418553;418554;418555 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534333 1 VGDGMNAYMAYR Unmodified 1346.5747 0.57474142 1590 O60749;D6RC15 SNX2 Sorting nexin-2 yes no 0 0 0 1 75.068 75.068 2 0.0033572 74690 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.325 61.868 50455000 0 0 0 0 0 0 0 50455000 0 0 0 0 0 46519 1590 43423 418579 534334 534334 1 VGDGMNAYMAYR Oxidation (M) 1362.5697 0.56965604 1590 O60749;D6RC15 SNX2 Sorting nexin-2 yes no 0 1 0 1 50.303 50.303 2 0.0085324 48378 QUIQUE_DMIX3_190116_001 75.378 62.751 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46520 1590 43423 418580 534335 534335 865 1 VGDIIQIISK Unmodified 1084.6492 0.64921022 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.507 94.507 2 0.0012577 96933 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.815 68.511 452680000 15236000 30640000 36336000 0 0 0 0 57551000 75674000 0 68452000 110480000 58308000 46521 472;1460 43424 418581;418582;418583;418584;418585;418586;418587;418588;418589 534336;534337;534338;534339;534340;534341;534342;534343;534344 534340 8 VGDLYSDLR Unmodified 1036.5189 0.51892433 1472 O15020;A4QPE4;E9PJZ2 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.645 65.645 2 0.0020914 64118 QUIQUE_C1563_190116_001 96.948 55.295 795960000 108230000 95134000 0 73749000 0 67232000 106940000 52776000 69434000 31322000 106830000 0 84309000 46522 1472 43425 418590;418591;418592;418593;418594;418595;418596;418597;418598;418599;418600 534345;534346;534347;534348;534349;534350;534351;534352;534353;534354;534355;534356 534350 12 VGDPAEDFGTFFSAVIDAK Unmodified 1984.9418 0.941823 2295 P30038 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.79 168.79 2;3 4.8768E-266 176108 QUIQUE_DMIX5_190116_001 287.14 251.46 7473500000 455220000 385740000 809490000 414310000 696430000 497230000 631490000 667730000 628600000 235060000 819030000 618150000 615080000 46523 2295 43426 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VGEIEFEGLMR Unmodified 1278.6278 0.62782285 4418 Q9UEY8 ADD3 Gamma-adducin yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.4 109.4 2 1.0701E-29 111716 QUIQUE_DMIX1_190116_001 188.66 164.63 8455600000 539370000 830060000 745810000 626320000 570710000 618950000 737380000 598100000 688040000 311420000 810850000 677430000 701080000 46546 4418 43448 418814;418815;418816;418817;418818;418819;418820;418821;418822;418823;418824;418825;418826;418827 534603;534604;534605;534606;534607;534608;534609;534610;534611;534612;534613;534614;534615;534616;534617;534618;534619;534620;534621;534622;534623;534624;534625;534626;534627;534628;534629;534630;534631;534632;534633;534634;534635;534636;534637;534638 534622 36 VGELFQR Unmodified 847.4552 0.45520186 3176 Q16352 INA Alpha-internexin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.454 43.454 2 0.019305 40309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.75 76.072 9871700000 1115000000 982470000 770370000 0 934900000 652430000 1012500000 743360000 619250000 370920000 1064900000 784450000 821160000 46547 3176 43449 418828;418829;418830;418831;418832;418833;418834;418835;418836;418837;418838;418839 534639;534640;534641;534642;534643;534644;534645;534646;534647;534648;534649;534650;534651 534649 13 VGELKDDDFEK Unmodified 1293.6089 0.60886155 2875 Q02750 MAP2K1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 yes yes 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 34.335 34.335 2;3 0.00199 29298 QUIQUE_C1277_190116_001 91.937 67.683 3577700000 540000000 397140000 386600000 322680000 312610000 239580000 321890000 146150000 175660000 193260000 282600000 259520000 0 46548 2875 43450 418840;418841;418842;418843;418844;418845;418846;418847;418848;418849;418850;418851;418852;418853;418854 534652;534653;534654;534655;534656;534657;534658;534659;534660;534661;534662;534663;534664;534665;534666;534667;534668;534669 534654 13 VGELKDDDFEKISELGAGNGGVVFK Unmodified 2622.3177 0.31771191 2875 Q02750 MAP2K1 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1 yes yes 0 0 2 2 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17.973 17.973 2;3 1.8819E-16 10935 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.2 138.62 954560000 73118000 71410000 16098000 80825000 97231000 54675000 29721000 156770000 125840000 35579000 96648000 0 116660000 46555 4058 43456 418907;418908;418909;418910;418911;418912;418913;418914;418915;418916;418917;418918;418919;418920;418921 534759;534760;534761;534762;534763;534764;534765;534766;534767;534768;534769;534770;534771;534772;534773 534767 12 VGESVFHTTR Unmodified 1131.5673 0.5672715 4364 Q9P0J0 NDUFA13 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 24.576 24.576 2;3 0.00050215 18008 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.201 59.959 4100200000 487130000 347470000 258770000 260220000 228630000 312060000 311500000 283560000 406050000 110540000 480550000 439180000 174570000 46556 4364 43457 418922;418923;418924;418925;418926;418927;418928;418929;418930;418931;418932;418933;418934;418935;418936 534774;534775;534776;534777;534778;534779;534780;534781;534782;534783;534784;534785;534786;534787;534788;534789;534790;534791;534792 534790 19 VGETAPPNAYTVTDLVEYSIVIQQLSNGK Unmodified 3105.587 0.58701048 252 A0A0C4DGS1;P39656 DDOST Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit yes no 0 0 0 1 168.47 168.47 3 6.8174E-09 170347 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.323 52.32 40344000 0 0 0 0 0 0 0 40344000 0 0 0 0 0 46557 252 43458 418937 534793 534793 1 VGETFHASQPSLTVDGFTDPSNSER Unmodified 2677.2256 0.22560244 663 B7Z5N5;Q15796 SMAD2 Mothers against decapentaplegic homolog;Mothers against decapentaplegic homolog 2 yes no 0 0 0 1 95.128 95.128 3 0.011616 97462 QUIQUE_DMIX7_190116_001 27.737 22.804 43965000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43965000 0 46558 663 43459 418938 534794 534794 1 VGEVCHITCKPEYAYGSAGSPPK Unmodified 2506.1621 0.16207966 2876 Q02790;F5H1U3 FKBP4 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 1 3 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.008 47.008 2;3;4 5.5025E-126 44476 QUIQUE_C1218_190116_001 243.29 225.54 1629400000 890870000 88955000 65986000 82207000 64049000 97831000 103420000 41725000 67334000 0 66086000 60964000 0 46559 2876 43460 418939;418940;418941;418942;418943;418944;418945;418946;418947;418948;418949;418950;418951 534795;534796;534797;534798;534799;534800;534801;534802;534803;534804;534805;534806;534807;534808;534809;534810;534811;534812 534798 17 VGEVEQEAETAR Unmodified 1316.6208 0.62082322 1078 G3V200;O75334;H0YHK3;H0YH95 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.165 29.165 2 3.9125E-20 23358 QUIQUE_C1277_190116_001 172.27 143.11 786470000 107400000 87145000 78543000 105420000 56083000 54933000 80343000 40488000 43087000 0 57241000 34941000 40843000 46560 1078 43461 418952;418953;418954;418955;418956;418957;418958;418959;418960;418961;418962;418963;418964 534813;534814;534815;534816;534817;534818;534819;534820;534821;534822;534823;534824;534825;534826;534827;534828 534815 16 VGEVEQEAETARK Unmodified 1444.7158 0.71578623 1078 G3V200;O75334;H0YHK3;H0YH95 PPFIA2 Liprin-alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 19.909 19.909 3 0.022694 12695 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.891 21.861 74976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 45207000 29769000 0 46561 1078 43462 418965;418966 534829;534830 534829 1 VGEVIVTK Unmodified 843.50657 0.50656873 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 25.169 25.169 1;2 0.0036304 19726 QUIQUE_C1218_190116_001 116.37 59.194 21801000000 1813300000 1521600000 2695100000 1612300000 1677900000 2139000000 2001100000 792900000 1318700000 1009600000 1622900000 1237600000 2358900000 46562 2004 43463 418967;418968;418969;418970;418971;418972;418973;418974;418975;418976;418977;418978;418979;418980;418981;418982 534831;534832;534833;534834;534835;534836;534837;534838;534839;534840;534841;534842;534843;534844;534845;534846;534847;534848;534849;534850;534851;534852;534853;534854 534831 19 VGEVIVTKDDAMLLK Unmodified 1629.9011 0.90114416 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 81.44 81.44 2 3.3744E-05 82908 QUIQUE_DMIX8_190116_001 96.64 84.024 513870000 0 0 36099000 0 0 0 0 0 209930000 0 0 0 267840000 46563 2004 43464 418983;418984;418985 534855;534856;534857 534857 3 VGEVIVTKDDAMLLK Oxidation (M) 1645.8961 0.89605879 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 1 69.942 69.942 2 2.9217E-06 70767 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.57 98.888 189520000 0 0 0 0 0 0 0 53358000 0 0 70160000 0 66005000 46564 2004 43464 418986;418987;418988 534858;534859;534860 534859 1285 3 VGEVTYVELFK Unmodified 1282.6809 0.68090428 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.36 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6;Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 79.287 79.287 2 0.0012826 79140 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.14 59.007 54344000 0 0 0 0 0 0 0 54344000 0 0 0 0 0 46571 4476;703 43471 419048;419049;419050;419051;419052;419053;419054 534931;534932;534933;534934;534935;534936;534937;534938 534936 8 VGFGNVEDEFWLGLDNIHR Unmodified 2216.0651 0.065066458 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 151.82 151.82 2;3 1.4295E-74 156327 QUIQUE_DMIX7_190116_001 174.23 158.51 15092000000 670340000 996080000 911950000 574120000 837200000 442350000 1512400000 1465100000 1871100000 19312000 2320400000 2388400000 1083700000 46572 3753 43472 419055;419056;419057;419058;419059;419060;419061;419062;419063;419064;419065;419066;419067;419068;419069;419070;419071;419072;419073;419074;419075;419076;419077;419078;419079 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VGGTSDVEVNEK Unmodified 1232.5885 0.58846046 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 2 2 3 3 3 2 1 3 1 3 2 2 21.65 21.65 2 2.2966E-93 14212 QUIQUE_C1368_190116_001 241.13 205.83 27094000000 2745500000 2252700000 2511900000 2324500000 1783100000 2421100000 2439000000 1212600000 1691900000 1349800000 1960200000 1960400000 2441100000 46599 2004 43498 419259;419260;419261;419262;419263;419264;419265;419266;419267;419268;419269;419270;419271;419272;419273;419274;419275;419276;419277;419278;419279;419280;419281;419282;419283;419284;419285;419286;419287;419288 535179;535180;535181;535182;535183;535184;535185;535186;535187;535188;535189;535190;535191;535192;535193;535194;535195;535196;535197;535198;535199;535200;535201;535202;535203;535204;535205;535206;535207;535208;535209;535210;535211;535212;535213;535214;535215;535216;535217;535218;535219;535220;535221;535222;535223;535224 535188 43 VGGTSDVEVNEKK Unmodified 1360.6834 0.68342347 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 3 2 1 2 1 2 2 2 2 2 2 13.885 13.885 2;3 1.009E-137 6225 QUIQUE_DMIX3_190116_001 282.13 245.75 4428100000 111520000 130520000 277780000 21584000 261420000 6303900 390170000 987410000 919080000 52786000 784160000 485390000 0 46600 2004 43499 419289;419290;419291;419292;419293;419294;419295;419296;419297;419298;419299;419300;419301;419302;419303;419304;419305;419306;419307;419308;419309;419310;419311 535225;535226;535227;535228;535229;535230;535231;535232;535233;535234;535235;535236;535237;535238;535239;535240;535241;535242;535243;535244;535245;535246;535247;535248;535249 535242 21 VGGTSDVEVNEKKDR Unmodified 1631.8115 0.81147753 2004 P10809 HSPD1 60 kDa heat shock protein, mitochondrial yes yes 0 0 2 2 2 2 2 2 10.89 10.89 3;4 1.0614E-35 3580 QUIQUE_DMIX1_190116_001 145.29 126.46 235560000 0 0 0 0 0 0 0 112530000 42435000 0 22609000 32235000 25754000 46601 2004 43500 419312;419313;419314;419315;419316;419317;419318;419319;419320;419321 535250;535251;535252;535253;535254;535255;535256;535257;535258;535259;535260;535261;535262;535263;535264;535265 535251 16 VGGVQSLGGTGALR Unmodified 1270.6993 0.69934831 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.02 54.02 2 3.5631E-58 52406 QUIQUE_DMIX1_190116_001 199.09 148.48 10430000000 1261400000 1149300000 870970000 829210000 939710000 744770000 826070000 697060000 485960000 505390000 821520000 656130000 642370000 46602 2120 43501 419322;419323;419324;419325;419326;419327;419328;419329;419330;419331;419332;419333;419334;419335 535266;535267;535268;535269;535270;535271;535272;535273;535274;535275;535276;535277;535278;535279;535280;535281;535282;535283;535284;535285;535286;535287;535288;535289;535290;535291;535292;535293;535294;535295;535296;535297;535298;535299;535300;535301;535302;535303;535304;535305;535306;535307;535308 535293 43 VGGYILGEFGNLIAGDPR Unmodified 1846.9577 0.95774784 1749;1701 O94973;A0A0G2JS82;A0A0G2JQM1;O95782 AP2A2;AP2A1 AP-2 complex subunit alpha-2;AP-2 complex subunit alpha-1 no no 0 0 0 2 3 3 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 154.74 154.74 2;3 6.7098E-11 157785 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.133 82.753 5556800000 279270000 853070000 462610000 289760000 411570000 290300000 490770000 302790000 508440000 141240000 678510000 482440000 366050000 46603 1701;1749 43502 419336;419337;419338;419339;419340;419341;419342;419343;419344;419345;419346;419347;419348;419349;419350;419351;419352;419353;419354;419355;419356;419357;419358;419359;419360;419361;419362;419363;419364;419365 535309;535310;535311;535312;535313;535314;535315;535316;535317;535318;535319;535320;535321;535322;535323;535324;535325;535326;535327;535328;535329;535330;535331;535332;535333;535334;535335;535336;535337;535338;535339;535340;535341;535342;535343;535344;535345;535346;535347;535348;535349;535350;535351;535352;535353;535354;535355;535356;535357;535358;535359;535360;535361;535362 535341 54 VGHAVLAINGMDVNGRYTADGK Unmodified 2257.1273 0.12734914 4550 Q9Y296;E9PN70;J3KP27;G3V1A0;G5EA23 TRAPPC4 Trafficking protein particle complex subunit 4 yes no 0 0 1 1 73.34 73.34 3 0.026482 72471 QUIQUE_C1563_190116_001 21.599 13.447 50569000 0 0 0 0 0 50569000 0 0 0 0 0 0 0 46604 4550 43503 419366 535363 535363 1 VGHDYQWIGLNDK Unmodified 1543.7419 0.74194141 912 E9PF17;P13611 VCAN Versican core protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 1 1 2 2 2 69.931 69.931 2;3 3.8216E-10 70202 QUIQUE_DMIX5_190116_001 146.36 123.88 4702700000 93776000 117870000 706400000 119080000 0 0 288200000 865430000 385110000 169770000 653750000 738660000 564600000 46605 912 43504 419367;419368;419369;419370;419371;419372;419373;419374;419375;419376;419377;419378;419379;419380;419381;419382 535364;535365;535366;535367;535368;535369;535370;535371;535372;535373;535374;535375;535376;535377;535378;535379;535380;535381;535382;535383;535384;535385;535386 535379 22 VGHFDPVTR Unmodified 1026.5247 0.52467841 4509 Q9UNE7;H3BTA3 STUB1 E3 ubiquitin-protein ligase CHIP yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.544 22.544 2 0.021517 15296 QUIQUE_C1563_190116_001 62.107 29.497 531770000 85406000 55623000 0 0 0 58942000 61110000 53253000 67658000 22894000 57213000 0 69676000 46606 4509 43505 419383;419384;419385;419386;419387;419388;419389;419390;419391 535387;535388;535389;535390;535391;535392;535393;535394;535395;535396 535389 9 VGHLYAAWK Unmodified 1043.5553 0.55525025 4108 Q9GZV7 HAPLN2 Hyaluronan and proteoglycan link protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.147 37.147 2 0.0036952 32680 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.706 62.6 739350000 0 121490000 0 0 53616000 0 183750000 47751000 49806000 0 126790000 69047000 87107000 46607 4108 43506 419392;419393;419394;419395;419396;419397;419398;419399;419400;419401;419402;419403 535397;535398;535399;535400;535401;535402;535403;535404;535405;535406;535407;535408 535406 8 VGHNEIIGVCR Unmodified 1252.6346 0.63463956 400 A0A286YEX2;Q5T7P8 SYT6 Synaptotagmin-6 yes no 0 0 0 2 1 22.942 22.942 2;3 0.00049397 20895 QUIQUE_C1277_190116_001 101.65 81.317 186250000 0 142000000 0 0 0 0 0 0 0 0 44254000 0 0 46608 400 43507 419404;419405;419406 535409;535410;535411;535412 535410 4 VGHSELVGEIIR Unmodified 1307.7197 0.7197494 2414 P38606;C9JVW8;C9JA17 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 58.228 58.228 2;3 5.6622E-05 56333 QUIQUE_DMIX8_190116_001 148.32 134.11 25505000000 948740000 2949200000 2282700000 2133300000 2244500000 1579500000 2464800000 1504600000 1708000000 860580000 2684800000 2182700000 1961500000 46609 2414 43508 419407;419408;419409;419410;419411;419412;419413;419414;419415;419416;419417;419418;419419;419420;419421;419422;419423;419424;419425;419426;419427;419428;419429;419430;419431 535413;535414;535415;535416;535417;535418;535419;535420;535421;535422;535423;535424;535425;535426;535427;535428;535429;535430;535431;535432;535433;535434;535435;535436;535437;535438;535439;535440;535441;535442;535443;535444;535445;535446;535447 535447 33 VGHSTAHDEIIPMSIR Unmodified 1761.8832 0.88320269 3048 Q14165;F5H1S8;H0YG07 MLEC Malectin yes no 0 0 0 1 48.45 48.45 4 0.04126 45936 QUIQUE_DMIX7_190116_001 29.341 17.867 15245000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15245000 0 46610 3048 43509 419432 535448 535448 0 VGHVGPLQIGQAVK Unmodified 1401.8092 0.80923311 2962 Q13049 TRIM32 E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32 yes yes 0 0 0 1 1 1 49.876 49.876 3 0.016681 47876 QUIQUE_C1277_190116_001 40.725 30.24 47945000 0 25556000 0 0 22389000 0 0 0 0 0 0 0 0 46611 2962 43510 419433;419434;419435 535449;535450;535451 535450 3 VGIEAAEMLLANLR Unmodified 1498.8177 0.81774889 1405 O00442 RTCA RNA 3'-terminal phosphate cyclase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 2 2 2 1 2 1 2 2 156.6 156.6 2;3 0.00031781 159339 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VGNVEYFGLGNSPGFPLQYYPYYGK Unmodified 2828.3486 0.34861811 1873 P05026 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 156.28 156.28 2;3 1.1805E-69 160596 QUIQUE_C1403_190116_001 220.6 216.42 14849000000 1035500000 1141700000 1338200000 1027200000 936890000 902260000 1487200000 630920000 1267900000 487870000 1721400000 1360600000 1511100000 46674 1873 43567 420015;420016;420017;420018;420019;420020;420021;420022;420023;420024;420025;420026;420027;420028;420029;420030;420031;420032;420033;420034;420035;420036;420037;420038;420039;420040 536289;536290;536291;536292;536293;536294;536295;536296;536297;536298;536299;536300;536301;536302;536303;536304;536305;536306;536307;536308;536309;536310;536311;536312;536313;536314;536315;536316;536317;536318;536319;536320;536321;536322;536323;536324;536325;536326;536327;536328;536329;536330;536331;536332;536333;536334;536335;536336;536337;536338;536339;536340;536341 536303 53 VGNVGQTNYAASK Unmodified 1307.647 0.64697839 3728 Q92506 HSD17B8 Estradiol 17-beta-dehydrogenase 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.13 21.13 2 2.2838E-10 14203 QUIQUE_C1438_190116_001 147.62 122.06 1576700000 120090000 137090000 147800000 133160000 174580000 138110000 110020000 136010000 171580000 0 0 149120000 159170000 46675 3728 43568 420041;420042;420043;420044;420045;420046;420047;420048;420049;420050;420051;420052 536342;536343;536344;536345;536346;536347;536348;536349;536350;536351;536352;536353 536346 12 VGNVQELSELSEQVLETLHDAMHETLCPGVTDAAK Oxidation (M) 3835.8244 0.82443335 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 1 0 1 163.75 163.75 4 6.2837E-22 170037 QUIQUE_C1438_190116_001 81.566 77.966 154070000 0 0 0 0 154070000 0 0 0 0 0 0 0 0 46676 2037 43569 420053 536354 536354 1346 1 VGNVQELSELSEQVLETLHDAMHETLCPGVTDAAK Unmodified 3819.8295 0.82951872 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 2 170.47 170.47 4 8.3799E-87 177431 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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420063 536365 536365 1 VGPSDDTPR Unmodified 942.44067 0.44067401 3959 Q99570 PIK3R4 Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4 yes yes 0 0 0 1 1 16.675 16.675 2 0.027804 8553 QUIQUE_C1277_190116_001 57.59 38.495 18876000 0 18876000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46681 3959 43573 420064;420065 536366;536367 536367 2 VGQALLQGNTER Unmodified 1284.6786 0.67861287 2898 Q06124 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.448 36.448 2 0.00013835 32157 QUIQUE_DMIX3_190116_001 120.27 79.77 582160000 0 40588000 0 41332000 60918000 46780000 50819000 44269000 71610000 24533000 70808000 59768000 70731000 46682 2898 43574 420066;420067;420068;420069;420070;420071;420072;420073;420074;420075;420076;420077 536368;536369;536370;536371;536372;536373;536374;536375;536376;536377;536378;536379 536375 12 VGQAVALR Unmodified 812.48684 0.48683634 2989 Q13363;D6RAX2;H0Y8W7;H0Y9M9 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 21.464 21.464 2 0.006157 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1 1 24.004 24.004 2 0.0031476 17196 QUIQUE_C1277_190116_001 133.12 72.328 6311800000 646190000 454710000 719520000 345450000 443770000 344520000 399420000 380320000 535510000 185160000 631410000 648750000 577060000 46685 2890 43577 420098;420099;420100;420101;420102;420103;420104;420105;420106;420107;420108;420109;420110 536401;536402;536403;536404;536405;536406;536407;536408;536409;536410;536411;536412;536413;536414;536415;536416;536417;536418;536419 536403 17 VGQDSELENQDK Unmodified 1360.6107 0.61065246 1435 O14576;A0A0A0MTG2 DYNC1I1 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.21 20.21 2 4.3854E-46 13093 QUIQUE_DMIX4_190116_001 204.17 164.55 2446000000 220830000 257150000 233550000 222820000 229080000 212320000 225200000 96654000 139840000 87216000 190700000 140460000 190140000 46686 1435 43578 420111;420112;420113;420114;420115;420116;420117;420118;420119;420120;420121;420122;420123 536420;536421;536422;536423;536424;536425;536426;536427;536428;536429;536430;536431;536432 536429 13 VGQDSELENQDKK Unmodified 1488.7056 0.70561548 1435 O14576;A0A0A0MTG2 DYNC1I1 Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 2 13.789 13.789 2;3 0.00014895 5834 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.28 110.63 219950000 97661000 0 0 0 0 29403000 0 0 0 0 13238000 18063000 61582000 46687 1435 43579 420124;420125;420126;420127;420128;420129;420130;420131;420132 536433;536434;536435;536436;536437;536438;536439;536440;536441 536437 7 VGQEIEVRPGIVSK Unmodified 1509.8515 0.85149185 2432 P41091 EIF2S3 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 45.745 45.745 2;3 0.012509 43286 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.831 44.549 233610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 213040000 20572000 0 46688 2432 43580 420133;420134;420135;420136;420137 536442;536443;536444;536445;536446 536444 5 VGQGLIER Unmodified 870.49232 0.49231565 3482 Q86SZ2;G3V2H7;G3V4C3 TRAPPC6B Trafficking protein particle complex subunit 6B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 28.923 28.923 2 0.022463 23199 QUIQUE_C1576_190116_001 74.184 15.203 319420000 0 0 0 0 40053000 0 54083000 37567000 49593000 14459000 0 63861000 59810000 46689 3482 43581 420138;420139;420140;420141;420142;420143;420144 536447;536448;536449;536450;536451;536452;536453 536448 6 VGQGYPHDPPK Unmodified 1193.5829 0.58292157 2710 P61081;M0QYI6 UBE2M NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 yes no 0 0 0 1 1 1 15.693 15.693 3 0.024853 7633 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.616 27.496 196240000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25866000 84722000 0 85652000 46690 2710 43582 420145;420146;420147 536454;536455;536456 536454 3 VGQISFDLPR Unmodified 1130.6084 0.60840804 4612 Q9Y4W6 AFG3L2 AFG3-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 92.158 92.158 2 0.0015474 93571 QUIQUE_C1368_190116_001 96.331 65.644 153200000 59998000 0 72036000 0 0 0 0 0 0 21162000 0 0 0 46691 4612 43583 420148;420149;420150 536457;536458;536459 536458 3 VGQLFAAWK Unmodified 1018.56 0.56000128 3493 Q86UW8 HAPLN4 Hyaluronan and proteoglycan link protein 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 86.898 86.898 2 0.0015371 84820 QUIQUE_DMIX4_190116_001 102.71 0 2177400000 177540000 205460000 177270000 138350000 151580000 102940000 307840000 112680000 141650000 57114000 161840000 271390000 171760000 46692 3493 43584 420151;420152;420153;420154;420155;420156;420157;420158;420159;420160;420161;420162;420163;420164 536460;536461;536462;536463;536464;536465;536466;536467;536468;536469;536470;536471;536472;536473 536469 11 VGQLSEGAIAAIMQK Unmodified 1514.8127 0.81266351 2265 P27694 RPA1 Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit;Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 110.44 110.44 2 0.014478 107282 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.451 59.142 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46693 2265 43585 420165 536474 536474 1 VGQTAFDVADEDILGYLEELQK Unmodified 2452.201 0.20095082 1467 O14974;F8VZN8 PPP1R12A Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 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Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 106.51 106.51 3 4.0068E-08 109799 QUIQUE_C1368_190116_001 85.805 71.973 664580000 73421000 58682000 49113000 80506000 60467000 47112000 0 68434000 79980000 0 0 78833000 68029000 46698 295 43590 420208;420209;420210;420211;420212;420213;420214;420215;420216;420217;420218;420219 536517;536518;536519;536520;536521;536522;536523;536524;536525;536526;536527;536528 536520 9 VGSAADIPINISETDLSLLTATVVPPSGR Unmodified 2892.5444 0.54441738 2178 P21333;Q60FE5;H0Y5F3;H7C2E7 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 1 2 1 167.75 167.75 2;3 4.911E-37 174921 QUIQUE_DMIX5_190116_001 162.33 151.85 3543100000 292100000 277130000 382720000 366170000 441700000 219080000 213770000 41825000 429110000 190400000 68022000 488170000 132880000 46699 2178 43591 420220;420221;420222;420223;420224;420225;420226;420227;420228;420229;420230;420231;420232;420233;420234;420235;420236;420237;420238;420239;420240;420241 536529;536530;536531;536532;536533;536534;536535;536536;536537;536538;536539;536540;536541;536542;536543;536544;536545;536546;536547;536548;536549;536550;536551 536548 21 VGSDDLER Unmodified 889.41412 0.4141249 3997 Q9BQI7 PSD2 PH and SEC7 domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 19.929 19.929 2 0.036831 12633 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.546 40.8 166920000 0 0 0 0 0 51541000 0 27664000 0 0 43620000 0 44099000 46700 3997 43592 420242;420243;420244;420245 536552;536553;536554;536555 536555 4 VGSGDTNNFPYLEK Unmodified 1539.7205 0.72053726 4263 Q9NR45 NANS Sialic acid synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.756 76.756 2 2.1595E-47 77184 QUIQUE_DMIX1_190116_001 234.65 200.12 1380200000 124930000 105400000 102140000 106570000 111040000 79026000 118220000 125680000 111460000 62237000 120680000 98987000 113800000 46701 4263 43593 420246;420247;420248;420249;420250;420251;420252;420253;420254;420255;420256;420257;420258 536556;536557;536558;536559;536560;536561;536562;536563;536564;536565;536566;536567;536568;536569;536570;536571;536572;536573;536574;536575;536576 536569 21 VGSGGATLNALLVAAEHLSAR Unmodified 2006.0909 0.090887278 3563 Q8N0W3;I3L3J1;I3L106;I3L171;I3L1X0 FUK L-fucose kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.24 144.24 3 2.0636E-14 147335 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.663 71.984 761640000 44564000 59122000 98452000 39477000 89243000 46710000 0 46576000 60581000 28307000 104810000 73305000 70493000 46702 3563 43594 420259;420260;420261;420262;420263;420264;420265;420266;420267;420268;420269;420270 536577;536578;536579;536580;536581;536582;536583;536584;536585;536586;536587;536588;536589;536590 536585 13 VGSGSLDNLGR Unmodified 1073.5465 0.54653606 448 A0A2R8Y7R9;Q13136;H0YDW2 PPFIA1 Liprin-alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 40.198 40.198 2 0.03246 36689 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.353 24.794 49529000 0 0 0 0 0 23206000 0 26323000 0 0 0 0 0 46703 448 43595 420271;420272 536591;536592 536592 2 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536659;536660;536661;536662;536663;536664;536665;536666;536667;536668;536669;536670;536671;536672;536673;536674;536675 536661 17 VGSIFLQLK Unmodified 1003.6066 0.60661712 414 A0A2R8Y620;A0A2R8Y7U2;A0A2R8Y600;A0A2R8Y455;Q86VX2 COMMD7 COMM domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 94.014 94.014 2 0.0075799 97287 QUIQUE_C1438_190116_001 81.191 56.296 87507000 18458000 17117000 15282000 0 21662000 14988000 0 0 0 0 0 0 0 46707 414 43599 420332;420333;420334;420335;420336;420337 536676;536677;536678;536679;536680;536681 536679 6 VGSLDNAHHVPGGGNVK Unmodified 1656.8332 0.83321603 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 19.016 19.016 2;3;4 2.2601E-223 12176 QUIQUE_DMIX1_190116_001 273.27 228.42 7427000000 869970000 546280000 529380000 829320000 337920000 591410000 426900000 826570000 643860000 118250000 639660000 445110000 622350000 46708 2009 43600 420338;420339;420340;420341;420342;420343;420344;420345;420346;420347;420348;420349;420350;420351;420352;420353;420354;420355;420356;420357;420358;420359;420360;420361;420362;420363 536682;536683;536684;536685;536686;536687;536688;536689;536690;536691;536692;536693;536694;536695;536696;536697;536698;536699;536700;536701;536702;536703;536704;536705;536706;536707;536708;536709 536697 26 VGSLDNVGHLPAGGAVK Unmodified 1589.8526 0.85255449 880;1058 E7EVA0;P27816;F8W9U4 MAP4 Microtubule-associated protein;Microtubule-associated protein 4 no no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 2 2 2 1 54.574 54.574 2;3 1.1127E-44 52532 QUIQUE_DMIX3_190116_001 207.97 159.53 4992000000 399270000 336870000 66907000 517470000 501280000 263230000 52215000 613230000 876920000 133700000 553480000 0 677470000 46709 880;1058 43601 420364;420365;420366;420367;420368;420369;420370;420371;420372;420373;420374;420375;420376;420377;420378;420379;420380;420381;420382 536710;536711;536712;536713;536714;536715;536716;536717;536718;536719;536720;536721;536722;536723;536724;536725;536726;536727;536728 536723 17 VGSLYPEMSAHER Unmodified 1474.6875 0.68746299 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 2 1 43.419 43.419 2;3 0.0075717 40143 QUIQUE_C1218_190116_001 73.499 52.722 69817000 69817000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46710 890;3052 43602 420383;420384;420385 536729;536730;536731;536732 536731 4 VGSLYPEMSAHER Oxidation (M) 1490.6824 0.68237762 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 1 0 1 1 1 1 24.509 24.509 2 0.0033846 18300 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.067 56.041 35766000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35766000 0 0 46711 890;3052 43602 420386;420387;420388;420389 536733;536734;536735;536736 536735 531 4 VGSPFELVVSGNK Unmodified 1331.7085 0.70851601 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 1 1 97.214 97.214 2 0.011571 100308 QUIQUE_C1277_190116_001 70.942 40.146 139450000 0 139450000 0 0 0 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DDX3X;ATP-dependent RNA helicase DDX3Y no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 15.427 15.427 2 4.4089E-24 7688 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.37 129.25 1503700000 165070000 243040000 0 0 0 174170000 0 178190000 271010000 111230000 56122000 304820000 0 46715 266;1504 43606 420397;420398;420399;420400;420401;420402;420403;420404 536745;536746;536747;536748;536749;536750;536751;536752;536753 536752 7 VGSVLQEGCGK Unmodified 1132.5547 0.55465791 2326 P31040;A0A087X1I3 SDHA Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.607 24.607 2 3.6609E-13 18252 QUIQUE_C1277_190116_001 171.36 124.16 4998500000 471590000 358670000 557110000 317330000 372500000 315850000 441330000 251940000 428420000 137190000 490270000 421360000 434980000 46716 2326 43607 420405;420406;420407;420408;420409;420410;420411;420412;420413;420414;420415;420416;420417 536754;536755;536756;536757;536758;536759;536760;536761;536762;536763;536764;536765;536766 536755 7 VGTALPGK Unmodified 741.43849 0.43848916 2887 Q04446;E9PGM4 GBE1 1,4-alpha-glucan-branching enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.805 18.805 2 0.025651 11085 QUIQUE_C1277_190116_001 71.296 24.632 293440000 46611000 44412000 0 30344000 13952000 26725000 0 33827000 30434000 28390000 0 38749000 0 46717 2887 43608 420418;420419;420420;420421;420422;420423;420424;420425;420426 536767;536768;536769;536770;536771;536772;536773;536774;536775 536768 9 VGTAQLALVAR Unmodified 1097.6557 0.65569258 26 A0A087WTA5;E7ERK9;Q9UI10 EIF2B4 Translation initiation factor eIF-2B subunit delta yes no 0 0 0 1 1 63.025 63.025 2 0.048545 61882 QUIQUE_DMIX1_190116_001 61.691 43.429 74281000 0 0 0 0 0 0 0 26065000 0 48217000 0 0 0 46718 26 43609 420427;420428 536776;536777 536776 1 VGTDLLEEEITKFEEHVQSVDIAAFNK Unmodified 3060.5292 0.52916125 979;2291 E9PRY8;H0YE72;P29692;E9PQZ1 EEF1D Elongation factor 1-delta no no 0 0 1 1 163.73 163.73 4 2.6639E-12 166822 QUIQUE_C1403_190116_001 67.832 55.98 86660000 0 0 0 86660000 0 0 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101550000 217910000 310020000 440250000 46722 2602 43613 420432;420433;420434;420435;420436;420437;420438;420439;420440;420441;420442;420443;420444;420445;420446;420447;420448;420449;420450;420451 536781;536782;536783;536784;536785;536786;536787;536788;536789;536790;536791;536792;536793;536794;536795;536796;536797;536798;536799;536800;536801;536802;536803;536804;536805;536806;536807 536787 25 VGTLDVLVGLSDELAK Unmodified 1627.9033 0.90325265 2176 P21283 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 158.51 158.51 2;3 6.3686E-36 153451 QUIQUE_DMIX4_190116_001 171.05 147.2 6791200000 605330000 873290000 508640000 566760000 445250000 557940000 581850000 389620000 517050000 249100000 541200000 468850000 486260000 46723 2176 43614 420452;420453;420454;420455;420456;420457;420458;420459;420460;420461;420462;420463;420464;420465;420466;420467;420468;420469;420470;420471;420472;420473;420474;420475;420476;420477 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NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 yes no 0 0 1 1 2 2 2 1 24.499 24.499 2;3 0.00059962 18256 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.91 93.753 469310000 0 0 0 0 0 0 0 26185000 94307000 0 178210000 115400000 55212000 46726 4442 43617 420483;420484;420485;420486;420487;420488;420489;420490 536846;536847;536848;536849;536850;536851;536852;536853;536854;536855;536856;536857;536858 536855 12 VGTPHFMAPEVVK Unmodified 1410.733 0.73295662 1460;472 A0A2U3TZM4;A0A2U3TZN6;O14936;A0A2U3TZM1;A0A2R8YE77;Q5JS74 CASK Peripheral plasma membrane protein CASK no no 0 0 0 1 2 60.616 60.616 2;3 0.00052516 58653 QUIQUE_C1277_190116_001 62.891 51.025 164360000 72435000 91926000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46727 472;1460 43618 420491;420492;420493 536859;536860;536861;536862 536861 4 VGTVLQLMHTLK Unmodified 1338.7693 0.76934213 264 Q5T321;A0A0D9SF28;F5GXV7;Q8NFP9 NBEA Neurobeachin yes no 0 0 0 1 1 1 90.041 90.041 3 0.0012324 93632 QUIQUE_C1218_190116_001 71.085 52.948 10601000 0 10601000 0 0 0 0 0 0 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Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 1 1 142.7 142.7 3 5.6884E-06 150242 QUIQUE_DMIX5_190116_001 50.426 42.98 58819000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 58819000 0 0 46757 3208 43647 420772 537201 537201 1 VGWVLGPDHIMK Unmodified 1350.7118 0.71182725 660 B7Z4W5;Q16773 CCBL1 Kynurenine--oxoglutarate transaminase 1 yes no 0 0 0 1 1 85.96 85.96 3 0.024841 87227 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.96 27.747 80997000 0 0 0 0 46384000 0 0 34613000 0 0 0 0 0 46758 660 43648 420773;420774 537202;537203 537203 2 VGYFPSSLGEAIVK Unmodified 1465.7817 0.78168095 3718 Q8WXD9 CASKIN1 Caskin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.91 114.91 2 0.00032802 118401 QUIQUE_C1403_190116_001 101.39 86.759 869720000 88177000 111090000 0 80056000 82065000 79470000 84936000 0 76127000 0 100920000 88091000 78797000 46759 3718 43649 420775;420776;420777;420778;420779;420780;420781;420782;420783;420784 537204;537205;537206;537207;537208;537209;537210;537211;537212;537213;537214;537215 537206 12 VGYTPDVLTDTTAELAVSLLLTTCR Unmodified 2708.3942 0.39424767 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 2 1 1 1 3 1 2 5 7 3 2 176.37 176.37 2;3 5.4808E-114 176600 QUIQUE_DMIX1_190116_001 192.09 187.04 1091700000 65094000 20520000 16280000 0 58961000 0 27298000 131940000 311740000 0 265390000 146580000 47852000 46760 4405 43650 420785;420786;420787;420788;420789;420790;420791;420792;420793;420794;420795;420796;420797;420798;420799;420800;420801;420802;420803;420804;420805;420806;420807;420808;420809;420810;420811;420812 537216;537217;537218;537219;537220;537221;537222;537223;537224;537225;537226;537227;537228;537229;537230;537231;537232;537233;537234;537235;537236;537237;537238;537239;537240;537241;537242;537243;537244;537245;537246;537247 537226 30 VGYTPDWIFLLR Unmodified 1478.7922 0.79218606 50;2631 A0A087WVQ6;Q00610;P53675;A0A087WX41 CLTC;CLTCL1 Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1;Clathrin heavy chain 2 no no 0 0 0 2 3 2 1 3 1 2 2 1 2 2 3 4 158.45 158.45 2;3 3.2343E-05 163645 QUIQUE_C1368_190116_001 96.113 82.913 24708000000 2011000000 2419400000 2007000000 1972700000 2279100000 1390800000 2391300000 1270900000 1744600000 601580000 2550400000 2154900000 1913900000 46761 50;2631 43651 420813;420814;420815;420816;420817;420818;420819;420820;420821;420822;420823;420824;420825;420826;420827;420828;420829;420830;420831;420832;420833;420834;420835;420836;420837;420838;420839;420840 537248;537249;537250;537251;537252;537253;537254;537255;537256;537257;537258;537259;537260;537261;537262;537263;537264;537265;537266;537267;537268;537269;537270;537271;537272;537273;537274;537275;537276;537277;537278;537279;537280;537281;537282;537283;537284;537285;537286;537287;537288;537289 537256 41 VGYVSGWGR Unmodified 979.48756 0.48756462 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08;H3BS21 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 56.689 56.689 2 0.00011357 55043 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.11 119.34 5797800000 0 558530000 106870000 0 691190000 224220000 607860000 358280000 416490000 679900000 1320000000 238740000 595650000 46762 1793 43652 420841;420842;420843;420844;420845;420846;420847;420848;420849;420850;420851 537290;537291;537292;537293;537294;537295;537296;537297;537298;537299;537300;537301;537302;537303;537304;537305;537306;537307;537308 537299 19 VGYWLSEK Unmodified 980.49673 0.49673232 3013 Q13572;G3V5A3;G3V588;G3V3C0 ITPK1 Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase yes no 0 0 0 1 1 65.312 65.312 2 0.056145 64297 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.157 20.607 61320000 0 0 0 0 0 0 0 0 45776000 15543000 0 0 0 46763 3013 43653 420852;420853 537309;537310 537309 2 VGYYVNNEYTETELR Unmodified 1848.853 0.853008 4548 Q9Y294 ASF1A Histone chaperone ASF1A yes yes 0 0 0 1 83.009 83.009 2 0.00056852 84899 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.062 67.407 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46764 4548 43654 420854 537311 537311 1 VHACGVNPVETYIR Unmodified 1613.7984 0.79841043 2917 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0.23179744 3729 Q92526;J3KRI6 CCT6B T-complex protein 1 subunit zeta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 172.32 172.32 3 1.1025E-20 176816 QUIQUE_C1218_190116_001 130.56 117.52 83232000 13074000 0 0 0 13708000 0 0 20498000 11316000 0 24636000 0 0 46768 3729 43658 420917;420918;420919;420920;420921 537385;537386;537387;537388;537389 537385 5 VHAENGELVAEGAK Unmodified 1422.7103 0.71030693 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 20.14 20.14 2;3 8.2761E-101 13455 QUIQUE_C1218_190116_001 227.93 203.08 13349000000 1065400000 1208600000 1019200000 1041200000 1142600000 909960000 1018700000 796610000 1160100000 160410000 1649700000 902460000 1274200000 46769 3984 43659 420922;420923;420924;420925;420926;420927;420928;420929;420930;420931;420932;420933;420934;420935;420936;420937;420938;420939;420940;420941;420942;420943;420944;420945;420946 537390;537391;537392;537393;537394;537395;537396;537397;537398;537399;537400;537401;537402;537403;537404;537405;537406;537407;537408;537409;537410;537411;537412;537413;537414 537391 24 VHAIPLR Unmodified 804.49701 0.49700709 2767;2769 P62873;F6UT28;B1AKQ8;F6X3N5;F5H8J8;F5H100;F5H0S8;E9PCP0;P16520;P62879;C9JXA5;E7EP32;C9JIS1;C9JZN1 GNB1;GNB3;GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.593 18.593 2 0.019438 10936 QUIQUE_C1438_190116_001 116.09 74.374 36369000000 2605400000 5820500000 1022100000 3161600000 730420000 3530800000 1141700000 5317700000 3750400000 2805500000 227640000 4869900000 1385500000 46770 2767;2769 43660 420947;420948;420949;420950;420951;420952;420953;420954;420955;420956;420957;420958;420959 537415;537416;537417;537418;537419;537420;537421;537422;537423;537424;537425;537426;537427;537428;537429;537430 537420 16 VHAIQCDVR Unmodified 1096.5448 0.54476192 3190 Q16698;E5RJG7;E5RFV2;E5RJD2 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 14.933 14.933 2;3 0.00045345 6368 QUIQUE_C1563_190116_001 117.4 94.379 474740000 76334000 68572000 0 0 34376000 233900000 38413000 0 0 23141000 0 0 0 46771 3190 43661 420960;420961;420962;420963;420964;420965;420966;420967 537431;537432;537433;537434;537435;537436;537437;537438;537439;537440 537438 8 VHAIQCDVRDPDMVQNTVSELIK Unmodified 2666.3156 0.31562019 3190 Q16698;E5RJG7;E5RFV2;E5RJD2 DECR1 2,4-dienoyl-CoA reductase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.43 108.43 3;4 0.0001029 113316 QUIQUE_C1218_190116_001 51.029 47.631 1203000000 43620000 116290000 57199000 103440000 91468000 81427000 152450000 76412000 65273000 0 106390000 98965000 210070000 46772 3190 43662 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Unmodified 1196.6666 0.66659162 2942 Q12768;E7EQI7 KIAA0196 WASH complex subunit strumpellin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 36.465 36.465 2;3 0.00084818 32808 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.25 87.623 195360000 32283000 0 0 14218000 31295000 0 31515000 33370000 27757000 0 0 24926000 0 46775 2942 43665 420993;420994;420995;420996;420997;420998;420999;421000;421001 537468;537469;537470;537471;537472;537473;537474;537475;537476 537473 9 VHASRPASLDSGR Unmodified 1351.6957 0.69565991 473 A0A2U3TZV9;Q3V6T2;A0A2R8YCU9;A0A2R8YDS8;A0A2R8Y885;H7C2C6;A0A2R8Y5D7;H0Y7U8;H0Y470;A0A2R8Y802 CCDC88A Girdin yes no 0 0 1 1 10.347 10.347 3 0.0043294 2709 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.224 44.021 12999000 0 0 0 0 0 0 0 12999000 0 0 0 0 0 46776 473 43666 421002 537477 537477 1 VHAYIISSLK Unmodified 1129.6495 0.64954457 4352;4175 Q9NZN3;Q9H4M9;A0A024R571;C9JC03;C9J2Z4 EHD3;EHD1 EH domain-containing protein 3;EH domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 46.054 46.054 2;3 0.0067774 43284 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VHCCLYFISPTGHSLRPLDLEFMK Unmodified 2919.4234 0.4233965 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 0 1 1 1 2 3 2 119.67 119.67 3;4;5 3.1265E-14 124631 QUIQUE_DMIX7_190116_001 103.95 36.081 881120000 0 0 0 0 0 0 0 0 80940000 30160000 241900000 425240000 102880000 46784 419 43673 421062;421063;421064;421065;421066;421067;421068;421069;421070 537550;537551;537552;537553;537554;537555;537556;537557;537558;537559;537560 537557 10 VHCCLYFISPTGHSLRPLDLEFMK Oxidation (M) 2935.4183 0.41831113 419 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 yes no 0 1 1 1 109.55 109.55 4 0.00066719 113586 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.476 37.756 191370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 191370000 46785 419 43673 421071 537561 537561 302 1 VHCLNTLFSR Unmodified 1245.6288 0.6288259 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 50.95 50.95 2;3 0.0044023 48780 QUIQUE_DMIX8_190116_001 63.734 38.348 132330000 0 0 0 0 30723000 0 0 0 0 0 41556000 0 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537571;537572;537573;537574;537575;537576;537577;537578;537579;537580;537581;537582;537583;537584;537585;537586;537587;537588;537589;537590;537591;537592;537593;537594;537595;537596;537597;537598 537578 26 VHEDIEMTK Unmodified 1100.5172 0.51720977 2458 P43004;A0A2R8YFE3;A0A2U3TZS7;A0A2R8Y4W1;A0A2R8Y860;A0A2R8YD46;A0A2U3U0E3;A0A2R8YG01;A0A163QEF0;H0YEK4;A0A2R8Y6B8;A0A2R8Y6J5;A0A2R8Y862;A0A2R8Y740;A0A2R8Y5Y1;A0A2R8Y642;A0A2R8Y4N0;A0A2R8YHI4;H0YEB1 SLC1A2 Excitatory amino acid transporter 2;Amino acid transporter yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 18.947 18.947 2;3 2.1015E-07 11837 QUIQUE_C1218_190116_001 163.15 136.19 6208000000 506010000 419570000 625920000 645540000 337250000 211610000 389950000 522070000 735610000 168670000 733130000 403760000 508880000 46789 2458 43677 421107;421108;421109;421110;421111;421112;421113;421114;421115;421116;421117;421118;421119;421120;421121;421122;421123;421124;421125;421126;421127;421128;421129;421130;421131 537599;537600;537601;537602;537603;537604;537605;537606;537607;537608;537609;537610;537611;537612;537613;537614;537615;537616;537617;537618;537619;537620;537621;537622;537623;537624;537625;537626;537627;537628 537601 29 VHEEEIAELQAQIQYAQISVEMDVTKPDLSAALK Oxidation (M) 3811.919 0.91898566 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 1 1 1 156.79 156.79 4 2.5088E-29 161138 QUIQUE_C1277_190116_001 88.744 83.017 166130000 0 166130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46790 1916 43678 421132 537629 537629 1143 1 VHEEEIAELQAQIQYAQISVEMDVTKPDLSAALK Unmodified 3795.9241 0.92407104 1916 P07196 NEFL Neurofilament light polypeptide yes yes 0 0 1 2 159.66 159.66 4 6.9598E-22 166896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.198 74.31 133210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 133210000 0 0 46791 1916 43678 421133;421134 537630;537631;537632 537631 3 VHELCDNFCHR Unmodified 1485.6242 0.62415123 1442 O14770;H0YMX5;U3KQI2;F5GYS8;H0YNY8;U3KPR8;O00470;H0YKE5;H0YKN2;U3KQ95;E9PDC4 MEIS2;MEIS1 Homeobox protein Meis2;Homeobox protein Meis1 yes no 0 0 0 1 23.187 23.187 3 0.061708 16522 QUIQUE_C1576_190116_001 30.889 25.283 35194000 0 0 0 0 0 0 35194000 0 0 0 0 0 0 46792 1442 43679 421135 537633 537633 1 VHELNEEIGK Unmodified 1166.5932 0.5931519 4580;569 A8MYV2;Q9NQ29;B8ZZ10;B8ZZ09;Q9Y383;A0A0A6YYJ8 LUC7L;LUC7L2 Putative RNA-binding protein Luc7-like 1;Putative RNA-binding protein Luc7-like 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 21.882 21.882 2;3 0.01075 15256 QUIQUE_C1218_190116_001 42.21 16.972 92931000 33008000 0 0 0 0 0 0 0 0 25896000 34027000 0 0 46793 569;4580 43680 421136;421137;421138;421139 537634;537635;537636;537637;537638 537634 5 VHELQGNAPSDPDAVSAEEALK Unmodified 2276.0921 0.092069069 1707 O95163;F5H2T0 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 66.611 66.611 3 6.8524E-06 63282 QUIQUE_DMIX4_190116_001 67.76 49.465 274500000 0 46970000 42235000 0 0 43758000 25116000 58412000 0 21485000 0 36527000 0 46794 1707 43681 421140;421141;421142;421143;421144;421145;421146 537639;537640;537641;537642;537643;537644;537645 537644 4 VHENENIGTTEPGEHQEAK Unmodified 2117.9614 0.96138925 3070 Q14515 SPARCL1 SPARC-like protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 15.602 15.602 3;4 3.1341E-05 8222 QUIQUE_C1218_190116_001 85.087 79.507 269000000 51827000 27264000 0 0 90036000 23054000 29893000 0 0 16301000 30628000 0 0 46795 3070 43682 421147;421148;421149;421150;421151;421152;421153;421154;421155;421156 537646;537647;537648;537649;537650;537651;537652;537653;537654;537655 537646 10 VHEYLGWHADCIR Unmodified 1654.7674 0.76744465 1983 Q6ICJ4;P0CG30;A0A087WY67;P0CG29 Em:AP000351.3;GSTT2B;GSTT2 Glutathione S-transferase theta-2B;Glutathione S-transferase theta-2 yes no 0 0 0 3 3 3 3 2 2 1 3 53.641 53.641 2;3;4 4.977E-17 51615 QUIQUE_DMIX3_190116_001 159.94 134.01 2213400000 404570000 399060000 274280000 0 0 0 489730000 198060000 85859000 13862000 348000000 0 0 46796 1983 43683 421157;421158;421159;421160;421161;421162;421163;421164;421165;421166;421167;421168;421169;421170;421171;421172;421173;421174;421175;421176 537656;537657;537658;537659;537660;537661;537662;537663;537664;537665;537666;537667;537668;537669;537670;537671;537672;537673;537674;537675;537676;537677;537678;537679 537673 22 VHEYNVLLETLSR Unmodified 1571.8308 0.83075641 2321 P30533;A0A3B3IRQ7 LRPAP1 Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 98.312 98.312 2;3 0.00026239 102199 QUIQUE_C1218_190116_001 68.83 48.594 443580000 69847000 0 74451000 0 0 0 49795000 0 59486000 47330000 72817000 69859000 0 46797 2321 43684 421177;421178;421179;421180;421181;421182;421183;421184 537680;537681;537682;537683;537684;537685;537686;537687 537680 8 VHFALLGTWDEK Unmodified 1414.7245 0.72450043 2192 P22059 OSBP Oxysterol-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 103.1 103.1 3 0.0015675 105337 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.435 52.241 67869000 0 0 19514000 0 0 17909000 0 0 0 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3453;1100 Q7Z2W4;C9J6P4;H7C5K1;G5E9U9;Q9H0J9 ZC3HAV1;PARP12 Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1;Poly [ADP-ribose] polymerase 12 no no 0 0 0 1 1 1 1 35.79 35.79 3 0.0093384 30992 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.547 40.344 72399000 0 0 0 17675000 0 0 0 0 0 0 23909000 13194000 17620000 46801 3453;1100 43688 421207;421208;421209;421210 537713;537714;537715;537716 537716 4 VHFQHSAELIK Unmodified 1307.6986 0.69862003 3603 Q8N608 DPP10 Inactive dipeptidyl peptidase 10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 24.472 24.472 2;3 0.0045506 17637 QUIQUE_C1277_190116_001 93.325 70.005 134100000 73415000 0 0 0 0 0 0 60685000 0 0 0 0 0 46802 3603 43689 421211;421212;421213;421214;421215 537717;537718;537719;537720;537721 537718 5 VHGPGIQSGTTNKPNK Unmodified 1633.8536 0.85361712 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 1 2 1 10.424 10.424 3;4 1.6846E-44 2755 QUIQUE_C1563_190116_001 181.71 151.27 95421000 0 0 0 0 0 92294000 0 3127400 0 0 0 0 0 46803 2178 43690 421216;421217;421218 537722;537723;537724 537722 3 VHIDIGADGR Unmodified 1051.5411 0.54105675 2340 P31942 HNRNPH3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 2 1 1 32.138 32.138 2;3 0.0080205 26861 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.425 31.047 1449200000 176460000 184420000 131580000 0 0 347440000 0 264690000 0 104150000 0 128470000 112030000 46804 2340 43691 421219;421220;421221;421222;421223;421224;421225;421226;421227;421228;421229 537725;537726;537727;537728;537729;537730;537731;537732;537733;537734;537735 537734 7 VHIEIGPDGR Unmodified 1091.5724 0.57235688 2609;905;2672 P52597;E9PCY7;G8JLB6;P31943;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7;P55795 HNRNPF;HNRNPH1;HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein F, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 33.77 33.77 2;3 0.0001715 28626 QUIQUE_C1403_190116_001 120.15 106.58 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421259;421260;421261;421262;421263;421264;421265;421266;421267;421268;421269;421270;421271;421272;421273;421274;421275;421276;421277;421278;421279;421280;421281;421282 537795;537796;537797;537798;537799;537800;537801;537802;537803;537804;537805;537806;537807;537808;537809;537810;537811;537812;537813;537814;537815;537816;537817;537818;537819;537820;537821;537822;537823;537824;537825;537826;537827;537828 537798 34 VHIPESILIFR Unmodified 1322.7711 0.77105669 3484 Q86TP1;A0A3B3ITN0 PRUNE Protein prune homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.65 107.65 3 2.611E-05 110877 QUIQUE_C1277_190116_001 112.75 88.999 76062000 16800000 11725000 12873000 10911000 10404000 13349000 0 0 0 0 0 0 0 46810 3484 43697 421283;421284;421285;421286;421287;421288;421289;421290;421291;421292 537829;537830;537831;537832;537833;537834;537835;537836;537837;537838 537830 10 VHIPNDDAQFDASHCDSDKGEFGGFGSVTGK Unmodified 3293.432 0.43198317 3183 Q16576;Q5JP01 RBBP7 Histone-binding protein RBBP7 yes no 0 0 1 1 1 1 82.714 82.714 4 2.7447E-07 84191 QUIQUE_C1368_190116_001 56.156 53.962 150940000 0 49223000 49863000 0 0 0 51855000 0 0 0 0 0 0 46811 3183 43698 421293;421294;421295 537839;537840;537841 537840 3 VHIQSSQTVESSGLYTLQSILK Unmodified 2417.2802 0.28020419 2461 P43121 MCAM Cell surface glycoprotein MUC18 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 126.46 126.46 3 7.7814E-08 130931 QUIQUE_C1368_190116_001 81.884 73.697 199800000 0 34641000 59733000 42122000 63305000 0 0 0 0 0 0 0 0 46812 2461 43699 421296;421297;421298;421299 537842;537843;537844;537845;537846;537847;537848 537845 7 VHISDASTHQPVADALIEIFTNQASIASGTSGTDGVAFIK Unmodified 4068.044 0.04400325 3334 Q5VUB5;Q5SW12 FAM171A1 Protein FAM171A1 yes no 0 0 0 1 1 163.13 163.13 4 0.0016394 167865 QUIQUE_DMIX3_190116_001 29.034 27.531 89339000 0 38197000 0 0 0 0 0 0 51142000 0 0 0 0 46813 3334 43700 421300;421301 537849;537850 537850 1 VHIYHHTGNNTFR Unmodified 1594.7753 0.77530722 3615 Q8N8S7;A0A0U1RRM6;A0A075B6E5 ENAH Protein enabled homolog yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 2 2 13.264 13.264 3;4 1.669E-32 5318 QUIQUE_C1438_190116_001 152.4 133.19 1813400000 84771000 0 50859000 0 250630000 0 0 374290000 61539000 17969000 326390000 255180000 391790000 46814 3615 43701 421302;421303;421304;421305;421306;421307;421308;421309;421310;421311;421312;421313;421314;421315;421316;421317 537851;537852;537853;537854;537855;537856;537857;537858;537859;537860;537861;537862;537863;537864;537865;537866;537867;537868;537869 537858 18 VHKEDDGVPVICQVEHPAVTGNLQTQR Unmodified 3025.504 0.50396633 113 A0A087X1W8;A0A0A0MTJ8;X5DQS5;Q9BY67;A0A087X0T8;F5H8J9 CADM1 Cell adhesion molecule 1 yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 2 2 1 1 1 66.139 66.139 3;4 1.6601E-77 66648 QUIQUE_C1277_190116_001 163.94 151.86 1239700000 0 50300000 186940000 187790000 111540000 285910000 246210000 0 0 0 64711000 64758000 41525000 46815 113 43702 421318;421319;421320;421321;421322;421323;421324;421325;421326;421327;421328;421329;421330;421331 537870;537871;537872;537873;537874;537875;537876;537877;537878;537879;537880;537881;537882;537883;537884;537885;537886;537887 537872 17 VHLENMGSHDIVDGNHR Oxidation (M) 1944.8861 0.88605623 2851;1472;2021 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4 SPTBN1;SPTB;SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 no no 0 1 0 3 3 2 2 2 2 2 2 3 3 2 3 2 18.925 18.925 2;3;4 4.469E-121 12045 QUIQUE_DMIX1_190116_001 226.19 207.05 13077000000 1328000000 2086000000 513260000 472400000 467180000 303860000 335550000 661870000 2572000000 1070300000 716030000 1906900000 644120000 46816 2851;2021;1472 43703 421332;421333;421334;421335;421336;421337;421338;421339;421340;421341;421342;421343;421344;421345;421346;421347;421348;421349;421350;421351;421352;421353;421354;421355;421356;421357;421358;421359;421360;421361;421362 537888;537889;537890;537891;537892;537893;537894;537895;537896;537897;537898;537899;537900;537901;537902;537903;537904;537905;537906;537907;537908;537909;537910;537911;537912;537913;537914;537915;537916;537917;537918;537919 537906 817 29 VHLENMGSHDIVDGNHR Unmodified 1928.8911 0.89114161 2851;1472;2021 Q01082;A0A087WUZ3;F8W6C1;P11277;O15020;A4QPE4 SPTBN1;SPTB;SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1;Spectrin beta chain, erythrocytic;Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 no no 0 0 0 2 3 3 3 3 3 3 4 2 2 3 3 3 29.573 29.573 2;3;4;5 2.8905E-201 23577 QUIQUE_C1368_190116_001 318.07 304.41 12775000000 434110000 1245000000 1323200000 1329300000 1509800000 1101200000 1093100000 900650000 295230000 308150000 1203800000 1137500000 893460000 46817 2851;2021;1472 43703 421363;421364;421365;421366;421367;421368;421369;421370;421371;421372;421373;421374;421375;421376;421377;421378;421379;421380;421381;421382;421383;421384;421385;421386;421387;421388;421389;421390;421391;421392;421393;421394;421395;421396;421397;421398;421399 537920;537921;537922;537923;537924;537925;537926;537927;537928;537929;537930;537931;537932;537933;537934;537935;537936;537937;537938;537939;537940;537941;537942;537943;537944;537945;537946;537947;537948;537949;537950;537951;537952;537953;537954;537955;537956;537957;537958;537959;537960;537961;537962;537963;537964;537965;537966;537967;537968;537969 537928 45 VHLIVQVSPK Unmodified 1118.6812 0.68117905 4372 Q9P121;F8VTR5 NTM Neurotrimin yes no 0 0 0 2 2 2 3 1 2 2 2 2 2 2 1 2 40.832 40.832 2;3 0.00031363 37185 QUIQUE_C1576_190116_001 115.13 85.984 3408800000 336880000 323200000 291660000 316650000 153360000 197860000 330910000 320970000 356410000 169800000 300840000 74076000 236240000 46818 4372 43704 421400;421401;421402;421403;421404;421405;421406;421407;421408;421409;421410;421411;421412;421413;421414;421415;421416;421417;421418;421419;421420;421421;421422;421423;421424 537970;537971;537972;537973;537974;537975;537976;537977;537978;537979;537980;537981;537982;537983;537984;537985;537986;537987;537988;537989;537990;537991;537992;537993;537994;537995;537996;537997;537998;537999;538000;538001;538002;538003;538004 537990 32 VHLQLWDTAGQER Unmodified 1551.7794 0.77938954 1385 O00194;K7ES41 RAB27B Ras-related protein Rab-27B yes no 0 0 0 1 1 1 70.876 70.876 3 0.0042549 70440 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.043 46.94 38700000 0 0 0 18797000 0 0 19903000 0 0 0 0 0 0 46819 1385 43705 421425;421426;421427 538005;538006;538007 538007 3 VHLSTGELGIIDSAFGQSGK Unmodified 2015.0324 0.032369346 2685 P57772 EEFSEC Selenocysteine-specific elongation factor yes yes 0 0 0 1 1 1 114.52 114.52 3 0.0014478 117087 QUIQUE_C1563_190116_001 50.425 33.486 81630000 0 31783000 21211000 0 0 28637000 0 0 0 0 0 0 0 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538017;538018;538019;538020;538021;538022;538023;538024 538023 6 VHLTPEEKSAVTALWGK Unmodified 1865.0047 0.0046980325 2799 P68871;A0A2R8Y7R2;F8W6P5;A0A0J9YWK4 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes no 0 0 1 1 1 83.924 83.924 3 0.0017258 87119 QUIQUE_C1438_190116_001 51.235 40.577 80618000 0 0 0 0 29304000 0 0 0 0 0 51315000 0 0 46823 2799 43708 421445;421446 538025;538026 538025 2 VHLTPVEGVPDSDYINASFINGYQEK Unmodified 2891.3978 0.39775314 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 126.22 126.22 3 1.0417E-14 132477 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.297 83.456 274880000 0 0 48550000 0 0 0 62215000 0 40155000 0 71930000 52028000 0 46824 2137 43709 421447;421448;421449;421450;421451 538027;538028;538029;538030;538031 538030 5 VHLTPYTVDSPICDFLELQR Unmodified 2402.194 0.19403172 3571 Q8N163;E5RHJ4 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 144.98 144.98 3 4.2075E-38 148081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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translation initiation factor 5A-2 yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 103.72 103.72 2;3 1.994E-05 107283 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.34 92.732 11799000000 1030200000 1180400000 1294600000 671260000 985230000 776030000 869210000 705610000 1010100000 283390000 1315000000 834700000 843110000 46827 2786 43712 421469;421470;421471;421472;421473;421474;421475;421476;421477;421478;421479;421480;421481;421482;421483;421484;421485;421486;421487;421488;421489;421490;421491;421492;421493;421494;421495 538050;538051;538052;538053;538054;538055;538056;538057;538058;538059;538060;538061;538062;538063;538064;538065;538066;538067;538068;538069;538070;538071;538072;538073;538074;538075;538076;538077;538078;538079;538080;538081;538082;538083;538084;538085;538086;538087;538088;538089;538090;538091;538092;538093;538094;538095;538096;538097;538098;538099 538081 49 VHLVGIDIFTGKK Unmodified 1425.8344 0.83438523 2786 P63241;I3L397;I3L504;Q6IS14;F8WCJ1;C9J7B5;C9J4W5;Q9GZV4 EIF5A;EIF5AL1;EIF5A2 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like;Eukaryotic translation initiation factor 5A-2 yes no 0 0 1 2 2 1 1 1 79.062 79.062 3;4 0.0035191 80023 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.356 46.994 306210000 0 0 0 0 0 0 0 72706000 93559000 0 67172000 24875000 47898000 46828 2786 43713 421496;421497;421498;421499;421500;421501;421502 538100;538101;538102;538103;538104;538105;538106;538107 538104 7 VHMEVMPLFAGYLPLPDVR Unmodified 2183.1271 0.12713813 2511 P48553;A0A096LPH7 TRAPPC10;LOC102724200 Trafficking protein particle complex subunit 10 yes no 0 0 0 1 156.76 156.76 3 0.0058419 161747 QUIQUE_C1218_190116_001 33.972 25.98 17290000 17290000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46829 2511 43714 421503 538108 538108 1 VHMFEAHSDYIR Unmodified 1503.6929 0.69288272 2380 P35606;D6R997;D6RBZ7;D6RCL6;D6RBG7;D6RBT6 COPB2 Coatomer subunit beta' yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 1 2 41.926 41.926 2;3;4 0.00011957 37376 QUIQUE_DMIX8_190116_001 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yes yes 0 0 0 1 84.123 84.123 3 0.054206 86337 QUIQUE_C1368_190116_001 30.905 19.635 18052000 0 0 18052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46840 1520 43725 421573 538183 538183 1 VHQLEDTASIFSLK Unmodified 1586.8304 0.83042206 2905 Q07002 CDK18 Cyclin-dependent kinase 18 yes yes 0 0 0 1 89.328 89.328 2 0.036182 92108 QUIQUE_C1368_190116_001 44.847 27.448 29883000 0 0 29883000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46841 2905 43726 421574 538184 538184 1 VHQLLLQNK Unmodified 1091.6451 0.64512789 1606 O75052 NOS1AP Carboxyl-terminal PDZ ligand of neuronal nitric oxide synthase protein yes yes 0 0 0 1 1 1 21.135 21.135 2;3 0.006761 14009 QUIQUE_C1368_190116_001 49.536 31.274 68246000 17626000 0 30151000 0 0 20468000 0 0 0 0 0 0 0 46842 1606 43727 421575;421576;421577 538185;538186;538187;538188 538187 4 VHQLYETIQR Unmodified 1285.6779 0.67788459 3011 Q13561;H0YI98 DCTN2 Dynactin subunit 2 yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 2 2 2 32.123 32.123 2;3 2.5819E-11 26527 QUIQUE_C1368_190116_001 159.37 98.779 6729500000 469740000 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anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 94.672 94.672 2;3 2.3778E-24 97112 QUIQUE_C1277_190116_001 182.02 134.73 1433000000 147790000 128560000 39037000 117310000 190440000 119280000 97722000 56003000 39652000 84662000 188990000 76542000 146950000 46845 1803 43730 421606;421607;421608;421609;421610;421611;421612;421613;421614;421615;421616;421617;421618;421619;421620;421621;421622;421623;421624;421625;421626;421627;421628 538217;538218;538219;538220;538221;538222;538223;538224;538225;538226;538227;538228;538229;538230;538231;538232;538233;538234;538235;538236;538237;538238;538239;538240;538241;538242;538243 538219 27 VHSAVITVPAYFNDSQR Unmodified 1902.9588 0.95881047 2643 P54652 HSPA2 Heat shock-related 70 kDa protein 2 yes yes 0 0 0 1 3 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 81.401 81.401 2;3 1.1763E-201 82905 QUIQUE_C1277_190116_001 267.43 229.41 4272200000 130250000 145680000 148750000 124660000 154910000 155260000 662950000 150380000 214680000 56827000 765530000 688430000 873840000 46846 2643 43731 421629;421630;421631;421632;421633;421634;421635;421636;421637;421638;421639;421640;421641;421642;421643;421644;421645;421646;421647 538244;538245;538246;538247;538248;538249;538250;538251;538252;538253;538254;538255;538256;538257;538258;538259;538260;538261;538262;538263;538264;538265;538266;538267;538268;538269;538270;538271;538272;538273;538274;538275;538276;538277 538245 34 VHSDFTAAATR Unmodified 1174.5731 0.57308516 1251 I3L2B0;K7EIG1;O75153 CLUH Clustered mitochondria protein homolog yes no 0 0 0 1 1 16.607 16.607 3 0.04088 12646 QUIQUE_C1218_190116_001 28.764 16.528 24922000 14911000 0 0 0 0 0 0 0 0 10011000 0 0 0 46847 1251 43732 421648;421649 538278;538279 538278 2 VHSDSETDDIGFIPSK Unmodified 1745.8108 0.81080883 487 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121 43737 421683;421684 538315;538316 538316 2 VHTDFTPSPYDHDSLK Unmodified 1857.8533 0.85334235 1675 O75995 SASH3 SAM and SH3 domain-containing protein 3 yes yes 0 0 0 1 46.928 46.928 3 0.0034568 43919 QUIQUE_C1403_190116_001 49.621 42.49 46291000 0 0 0 46291000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46853 1675 43738 421685 538317 538317 1 VHTECCHGDLLECADDR Unmodified 2085.8303 0.83025719 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 0 4 3 3 3 3 3 3 1 1 1 1 2 33.686 33.686 2;3;4 0 28993 QUIQUE_C1277_190116_001 326.81 326.67 10754000000 970360000 1947800000 604430000 1932800000 1956300000 1474700000 1320200000 0 75987000 62811000 52458000 96942000 258720000 + 46854 769 43739 421686;421687;421688;421689;421690;421691;421692;421693;421694;421695;421696;421697;421698;421699;421700;421701;421702;421703;421704;421705;421706;421707;421708;421709;421710;421711;421712;421713 538318;538319;538320;538321;538322;538323;538324;538325;538326;538327;538328;538329;538330;538331;538332;538333;538334;538335;538336;538337;538338;538339;538340;538341;538342;538343;538344;538345;538346;538347;538348;538349;538350;538351;538352;538353;538354;538355;538356;538357;538358;538359;538360;538361;538362;538363;538364;538365;538366;538367;538368 538332 50 VHTECCHGDLLECADDRADLAK Unmodified 2584.1105 0.1104548 769 CON__P02768-1;P02768;A0A0C4DGB6;B7WNR0;H0YA55;D6RHD5;C9JKR2 ALB Serum albumin yes no 0 0 1 3 2 2 2 3 2 2 1 2 2 2 2 48.742 48.742 3;4;5 6.1978E-114 45439 QUIQUE_DMIX8_190116_001 209.9 206.5 4729100000 278300000 419690000 203190000 385510000 2187000000 195120000 298280000 26823000 93093000 0 102610000 177640000 361790000 + 46855 769 43740 421714;421715;421716;421717;421718;421719;421720;421721;421722;421723;421724;421725;421726;421727;421728;421729;421730;421731;421732;421733;421734;421735;421736;421737;421738 538369;538370;538371;538372;538373;538374;538375;538376;538377;538378;538379;538380;538381;538382;538383;538384;538385;538386;538387;538388;538389;538390;538391;538392;538393;538394;538395;538396;538397;538398;538399 538398 28 VHTPSGAVEECYVSELDSDKHTIR Unmodified 2728.2763 0.2762578 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 1 1 2 67.448 67.448 4;5 3.1489E-06 67308 QUIQUE_DMIX8_190116_001 57.278 44.74 179890000 0 0 0 0 0 0 76624000 0 0 0 0 0 103260000 46856 3061 43741 421739;421740;421741 538400;538401;538402;538403 538402 4 VHTVEDYQAIVDAEWNILYDKLEK Unmodified 2890.4389 0.43888968 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 1 1 2 2 2 3 1 2 2 2 2 1 2 156.71 156.71 3;4 1.1968E-24 163467 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.95 126.22 4863500000 21201000 264540000 335860000 88600000 138320000 43820000 806300000 391370000 717930000 0 1292600000 259480000 503400000 46857 3977 43742 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538602;538603;538604;538605;538606;538607;538608;538609;538610;538611;538612;538613;538614;538615;538616;538617;538618;538619;538620;538621;538622;538623;538624;538625;538626;538627;538628;538629;538630;538631;538632;538633;538634;538635;538636;538637;538638;538639;538640;538641;538642;538643;538644;538645;538646;538647;538648;538649;538650;538651;538652 538606 49 VHVSEEGTEPEAMLQVLGPKPALPAGTEDTAK Unmodified 3300.6548 0.65477247 166;3305 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0 GSN Gelsolin no no 0 0 1 1 106.74 106.74 3 1.98E-13 110368 QUIQUE_DMIX3_190116_001 68.269 59.506 33347000 0 0 0 0 0 0 0 0 33347000 0 0 0 0 46867 166;3305 43750 421922 538653 538653 1 VHVSEEGTEPEAMLQVLGPKPALPAGTEDTAKEDAANR Unmodified 3956.9426 0.94257465 166;3305 A0A0A0MS51;A0A0A0MT01;P06396;Q5T0I0 GSN Gelsolin no no 0 0 2 1 1 1 1 99.859 99.859 5 3.5357E-23 104107 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.308 73.311 482620000 0 0 0 0 0 0 0 0 89238000 0 183180000 86608000 123590000 46868 166;3305 43751 421923;421924;421925;421926 538654;538655;538656;538657;538658 538655 3 VHVTQEDFEMAVAK Unmodified 1602.7712 0.77119262 2743 P62195 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 66.669 66.669 2;3 9.5462E-08 66333 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.76 98.22 432340000 79043000 45866000 47552000 63049000 0 64689000 30606000 27388000 28779000 18287000 0 0 27087000 46869 2743 43752 421927;421928;421929;421930;421931;421932;421933;421934;421935;421936;421937;421938;421939;421940 538659;538660;538661;538662;538663;538664;538665;538666;538667;538668;538669;538670;538671;538672 538670 14 VHYGCVIFVR Unmodified 1248.6437 0.64374769 4391 Q9P2U7 SLC17A7 Vesicular glutamate transporter 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 59.288 59.288 3 0.0069653 58912 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.729 44.566 93654000 0 0 0 0 0 0 0 20061000 0 0 24748000 21259000 27587000 46870 4391 43753 421941;421942;421943;421944 538673;538674;538675;538676 538673 4 VHYLEQQNKEIEAEIQALR Unmodified 2310.1968 0.19680891 869 E7ESP9;P07197;E7EMV2 NEFM Neurofilament medium polypeptide yes no 0 0 1 1 1 2 1 99.935 99.935 3;4 0.0012585 102721 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.504 46.173 376290000 0 0 0 0 0 0 0 182720000 72047000 0 0 57123000 64401000 46871 869 43754 421945;421946;421947;421948;421949 538677;538678;538679;538680;538681;538682;538683 538679 6 VIAAEGEMNASR Oxidation (M) 1262.5925 0.59249998 2258 P27105 STOM Erythrocyte band 7 integral membrane protein yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.479 17.479 2 0.00073292 9835 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.549 69.463 775360000 86433000 0 69260000 0 61024000 0 57037000 87739000 70236000 0 84027000 43894000 215710000 46872 2258 43755 421950;421951;421952;421953;421954;421955;421956;421957;421958 538684;538685;538686;538687;538688;538689;538690;538691;538692;538693 538692 1620 10 VIAALLQTMEDQGNQR Unmodified 1785.9043 0.90433206 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 114.29 114.29 2 2.2897E-165 117194 QUIQUE_DMIX1_190116_001 257.42 238.68 947460000 98416000 90100000 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VIAGFSLLNLLFK Unmodified 1433.8646 0.86462272 4226 Q9HCJ6 VAT1L Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 170.92 170.92 2 3.8046E-08 175776 QUIQUE_C1368_190116_001 138.22 91.757 4110500000 134420000 338050000 266010000 67524000 253650000 197250000 695450000 253430000 331700000 0 393680000 855620000 323680000 46880 4226 43762 422021;422022;422023;422024;422025;422026;422027;422028;422029;422030;422031;422032 538766;538767;538768;538769;538770;538771;538772;538773;538774;538775;538776;538777;538778;538779 538769 14 VIAINEVGSSHPSLPSER Unmodified 1890.9799 0.97993985 1691;1214 H7BY57;O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 67.863 67.863 2;3 6.0738E-54 68737 QUIQUE_C1218_190116_001 215.09 194.43 5811800000 576950000 607920000 557370000 431850000 480550000 216640000 557760000 380740000 507930000 227650000 501660000 414360000 350370000 46881 1214;1691 43763 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1088.5714 0.57135383 4037 Q9BUT1;D6R9U8;D6RIR6;D6RFG2;D6RBF6 BDH2 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.723 25.723 2 0.00028766 19558 QUIQUE_DMIX5_190116_001 116.05 84.209 6707600000 523700000 460000000 613810000 0 736270000 603630000 0 647970000 599310000 262510000 855820000 708140000 696460000 46890 4037 43772 422122;422123;422124;422125;422126;422127;422128;422129;422130;422131;422132 538888;538889;538890;538891;538892;538893;538894;538895;538896;538897;538898 538896 8 VIATDINESKLQELEK Unmodified 1828.9782 0.97820851 4037 Q9BUT1;D6R9U8;D6RIR6;D6RFG2;D6RBF6 BDH2 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 yes no 0 0 1 1 76.504 76.504 3 0.025535 76371 QUIQUE_DMIX1_190116_001 40.856 9.0283 40215000 0 0 0 0 0 0 0 40215000 0 0 0 0 0 46891 4037 43773 422133 538899 538899 1 VIATDINESKLQELEKYPGIQTR Unmodified 2644.4072 0.40719562 4037 Q9BUT1;D6R9U8;D6RIR6;D6RFG2 BDH2 3-hydroxybutyrate dehydrogenase type 2 yes no 0 0 2 1 98.136 98.136 3 2.0351E-13 99541 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538939;538940;538941;538942;538943;538944;538945;538946;538947;538948;538949;538950;538951;538952;538953;538954;538955;538956;538957;538958;538959;538960;538961;538962;538963;538964;538965;538966;538967;538968;538969;538970;538971;538972;538973;538974 538967 30 VICLVGAGISTSAGIPDFR Unmodified 1932.0139 0.01388251 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0;F8WCF4;C9JR33;C9J3U7 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 3 2 1 1 1 1 3 135.9 135.9 2;3 6.5433E-55 140610 QUIQUE_C1368_190116_001 172.09 123.35 661070000 68093000 87731000 54507000 35931000 54385000 46217000 60947000 44788000 47666000 49768000 45258000 0 65775000 46900 3549 43782 422185;422186;422187;422188;422189;422190;422191;422192;422193;422194;422195;422196;422197;422198;422199;422200;422201;422202;422203;422204;422205 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16.656 3 0.00229 9241 QUIQUE_C1438_190116_001 60.641 45.051 88089000 0 0 0 0 41078000 0 0 0 0 0 0 47011000 0 46908 2021 43790 422243;422244 539036;539037 539036 2 VIDIFDTDGNGEVDFK Unmodified 1782.8312 0.83120992 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3 PPP3R1 Calcineurin subunit B type 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 132.28 132.28 2 2.8377E-20 137623 QUIQUE_C1218_190116_001 180.18 154.96 546560000 147390000 108130000 70394000 80969000 0 98541000 0 0 0 41132000 0 0 0 46909 801 43791 422245;422246;422247;422248;422249;422250 539038;539039;539040;539041;539042;539043;539044;539045 539039 8 VIDIFDTDGNGEVDFKEFIEGVSQFSVK Unmodified 3133.5132 0.51317683 801 F6U1T9;D3YTA9;P63098;H7BYZ3 PPP3R1 Calcineurin subunit B type 1 yes no 0 0 1 1 170.32 170.32 3 0.00027818 174346 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.931 38.636 42646000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42646000 0 46910 801 43792 422251 539046 539046 1 VIDLDMFK Unmodified 979.50485 0.50485417 3239 Q4J6C6 PREPL Prolyl endopeptidase-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 110.13 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1559.842 0.8419898 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 1 61.462 61.462 2;3 4.1068E-14 61335 QUIQUE_C1438_190116_001 161.99 140.44 3361400000 0 41415000 0 0 94996000 0 74648000 1165800000 508270000 0 597080000 604930000 274290000 46920 3117 43802 422327;422328;422329;422330;422331;422332;422333;422334;422335;422336;422337;422338 539142;539143;539144;539145;539146;539147;539148;539149;539150;539151;539152;539153;539154 539144 10 VIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAK Unmodified 2690.3626 0.36255361 1411 O00487 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 152.05 152.05 2;3 2.6953E-07 159031 QUIQUE_DMIX5_190116_001 81.317 81.039 157820000 84426000 0 0 0 0 0 0 0 0 39915000 33474000 0 0 46921 1411 43803 422339;422340;422341;422342 539155;539156;539157;539158 539158 4 VIDVFAMPQSGTGVSVEAVDPVFQAK Oxidation (M) 2706.3575 0.35746823 1411 O00487 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes yes 0 1 0 1 141.76 141.76 3 0.0063484 137746 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117630000 48470000 163490000 129940000 0 46930 2452 43811 422374;422375;422376;422377;422378;422379;422380;422381;422382;422383;422384;422385 539194;539195;539196;539197;539198;539199;539200;539201;539202;539203;539204;539205 539196 11 VIEEVSDMFAFIAR Unmodified 1625.8123 0.81232916 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 157.89 157.89 2;3 6.9514E-14 163438 QUIQUE_C1218_190116_001 141.93 129.36 424250000 52343000 45698000 0 49444000 37763000 27141000 0 40339000 0 18234000 54088000 54134000 45067000 46931 2503 43812 422386;422387;422388;422389;422390;422391;422392;422393;422394;422395;422396;422397;422398;422399;422400;422401;422402 539206;539207;539208;539209;539210;539211;539212;539213;539214;539215;539216;539217;539218;539219;539220;539221;539222;539223;539224 539206 19 VIEGDVVSALNK Unmodified 1242.682 0.68196691 2501 P48059;A0A0M3HER1;A0A0J9YXC7 LIMS1 LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 72.902 72.902 2 0.023236 73307 QUIQUE_C1368_190116_001 52.167 27.946 331870000 0 0 103410000 117590000 0 0 0 0 0 0 0 110870000 0 46932 2501 43813 422403;422404;422405 539225;539226;539227 539225 3 VIEHIMEDLDTNADK Unmodified 1741.8193 0.81926503 1901 P06702 S100A9 Protein S100-A9 yes yes 0 0 0 1 77.299 77.299 2 2.66E-29 77797 QUIQUE_C1403_190116_001 165.58 154.26 36814000 0 0 0 36814000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46933 1901 43814 422406 539228 539228 1 VIEINPYLLGTMAGGAADCSFWER Unmodified 2669.2618 0.26179371 2276 P28074;H0YJM8 PSMB5 Proteasome subunit beta type-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.69 164.69 3 1.3467E-18 166852 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.55 108.28 305780000 0 30815000 23543000 0 23559000 13753000 36936000 28079000 31618000 0 38482000 41649000 37347000 46934 2276 43815 422407;422408;422409;422410;422411;422412;422413;422414;422415;422416 539229;539230;539231;539232;539233;539234;539235;539236;539237;539238 539234 10 VIELENWTEGK Unmodified 1316.6612 0.66123147 4294 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non-erythrocytic 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 139.01 139.01 2;3 6.626E-134 144234 QUIQUE_C1368_190116_001 268.35 246.59 16357000000 1455300000 1670000000 1570300000 1205000000 1630500000 945250000 1220800000 948380000 1239100000 414950000 1503700000 1252300000 1301700000 46952 2851 43832 422562;422563;422564;422565;422566;422567;422568;422569;422570;422571;422572;422573;422574;422575;422576;422577;422578;422579;422580;422581;422582;422583;422584;422585;422586;422587 539403;539404;539405;539406;539407;539408;539409;539410;539411;539412;539413;539414;539415;539416;539417;539418;539419;539420;539421;539422;539423;539424;539425;539426;539427;539428;539429;539430;539431;539432;539433;539434;539435;539436;539437;539438;539439;539440;539441;539442;539443;539444 539414 42 VIESTQGLGNDLAGVLALQR Unmodified 2053.1168 0.11676768 1472 O15020 SPTBN2 Spectrin beta chain, non-erythrocytic 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 137.83 137.83 2;3 2.8688E-56 144620 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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539487;539488;539489;539490;539491;539492;539493;539494;539495;539496;539497;539498;539499;539500;539501;539502;539503;539504;539505;539506;539507;539508;539509;539510;539511;539512 539487 26 VIFHPEFLSSTSPLLPVDYEEFVR Unmodified 2820.4374 0.43743311 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.43 157.43 3 1.7697E-41 163474 QUIQUE_C1576_190116_001 128.67 119.94 2959000000 171810000 192090000 211270000 140580000 305520000 167080000 401780000 185250000 227300000 71219000 376960000 205450000 302670000 46957 2068 43837 422629;422630;422631;422632;422633;422634;422635;422636;422637;422638;422639;422640;422641 539513;539514;539515;539516;539517;539518;539519;539520;539521;539522;539523;539524;539525;539526;539527;539528;539529;539530 539524 17 VIFHPVFSVMVSASEDATIK Unmodified 2176.1238 0.12382689 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 1 137.83 137.83 3 0.065313 140808 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422647;422648;422649;422650;422651;422652;422653;422654;422655;422656;422657;422658;422659 539536;539537;539538;539539;539540;539541;539542;539543;539544;539545;539546;539547;539548;539549;539550;539551;539552;539553;539554;539555;539556 539547 21 VIFLQGGGCGQFSAVPLNLIGLK Unmodified 2387.3035 0.30352259 4639 Q9Y617 PSAT1 Phosphoserine aminotransferase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 161.22 161.22 2;3 6.3952E-12 166453 QUIQUE_C1218_190116_001 141.82 130.34 15943000000 594060000 820530000 1162100000 962290000 1042600000 809950000 1053800000 1835200000 1845800000 267000000 1706300000 1753000000 2090300000 46961 4639 43841 422660;422661;422662;422663;422664;422665;422666;422667;422668;422669;422670;422671;422672;422673;422674;422675;422676;422677;422678;422679;422680;422681;422682;422683;422684;422685;422686 539557;539558;539559;539560;539561;539562;539563;539564;539565;539566;539567;539568;539569;539570;539571;539572;539573;539574;539575;539576;539577;539578;539579;539580;539581;539582;539583;539584;539585;539586;539587;539588;539589;539590;539591;539592;539593;539594;539595;539596;539597;539598;539599;539600 539559 44 VIFLQQGSAPFLESQTK Unmodified 1892.0044 0.0043636815 298 A0A0J9YWE1;A0A0J9YWN0 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.65 119.65 2 3.8758E-10 122347 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.93 93.641 1283400000 98355000 98763000 105560000 102300000 94361000 116680000 97096000 115380000 71012000 27755000 141300000 92105000 122700000 46962 298 43842 422687;422688;422689;422690;422691;422692;422693;422694;422695;422696;422697;422698;422699 539601;539602;539603;539604;539605;539606;539607;539608;539609;539610;539611;539612;539613 539608 12 VIFPAAEDKDQDLITIIGK Unmodified 2085.1358 0.13577179 2 A0A024R4E5;Q00341;H0Y394;H7C2D1 HDLBP Vigilin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 123.31 123.31 3 0.001021 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539625;539626;539627;539628;539629;539630;539631;539632;539633;539634;539635;539636 539630 12 VIFPYEAQNDDELTIK Unmodified 1893.936 0.93600934 3806 Q96B97;Q5JPT2;Q5VSN0 SH3KBP1 SH3 domain-containing kinase-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 115.33 115.33 2 0.00017071 120308 QUIQUE_C1218_190116_001 117.95 78.292 205600000 51852000 0 52423000 58088000 43235000 0 0 0 0 0 0 0 0 46966 3806 43846 422719;422720;422721;422722 539637;539638;539639;539640 539637 4 VIFYLDSYHFSK Unmodified 1517.7555 0.7554662 3676 Q8TCU6;H0YDZ4 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 102.33 102.33 2;3 0.00020154 104797 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.479 63.865 540340000 26899000 25874000 104030000 28402000 30866000 27812000 36915000 33512000 31887000 17605000 109860000 33448000 33220000 46967 3676 43847 422723;422724;422725;422726;422727;422728;422729;422730;422731;422732;422733;422734;422735;422736;422737 539641;539642;539643;539644;539645;539646;539647;539648;539649;539650;539651;539652;539653;539654;539655;539656;539657;539658;539659;539660 539659 20 VIGDGNFAVVK Unmodified 1117.6132 0.61315906 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70;A0A1B0GTZ4;Q9C098 DCLK2;DCLK3 Serine/threonine-protein kinase DCLK2;Serine/threonine-protein kinase DCLK3 yes no 0 0 0 1 1 65.901 65.901 2 0.01095 66101 QUIQUE_DMIX7_190116_001 76.679 47.53 310890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 165550000 145350000 46968 3596 43848 422738;422739 539661;539662 539661 1 VIGGDDLSTLTGK Unmodified 1274.6718 0.67179615 1787 P00492 HPRT1 Hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.6 80.6 2 0.00018618 81596 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.18 77.7 6878500000 580080000 616250000 654620000 501950000 607120000 409330000 560750000 372730000 418150000 201260000 702590000 559060000 694580000 46969 1787 43849 422740;422741;422742;422743;422744;422745;422746;422747;422748;422749;422750;422751;422752;422753 539663;539664;539665;539666;539667;539668;539669;539670;539671;539672;539673;539674;539675;539676;539677;539678;539679;539680 539679 17 VIGIDHIK Unmodified 893.53345 0.53345218 150 A0A0A0MRJ6;H7BY58;P22061;F6S8N6;A0A3F2YNX8;C9J0F2 PCMT1 Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase;Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 31.95 31.95 2 0.060338 25574 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.163 3.7565 183820000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 183820000 0 0 0 46970 150 43850 422754 539681 539681 1 VIGIECSSISDYAVK Unmodified 1639.8127 0.81272309 953 E9PKG1;Q99873;E9PQ98;E9PIX6;H0YDE4;E9PNR9;E9PMW9 PRMT1 Protein arginine N-methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 95.886 95.886 2 8.3788E-05 98367 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.86 81.454 401380000 0 0 69742000 86242000 0 0 0 0 52159000 39072000 51807000 56353000 46006000 46971 953 43851 422755;422756;422757;422758;422759;422760;422761 539682;539683;539684;539685;539686;539687;539688 539687 6 VIGILQDGFPIR Unmodified 1326.766 0.76597131 4025 Q9BTX7 TTPAL Alpha-tocopherol transfer protein-like yes yes 0 0 0 1 1 124.39 124.39 2 0.010215 128515 QUIQUE_C1277_190116_001 74.376 60.169 18432000 0 18432000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46972 4025 43852 422762;422763 539689;539690 539690 1 VIGLSSDLQQVGGASAR Unmodified 1656.8795 0.87949752 1396 O00303;H0YDT6 EIF3F Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.246 84.246 2 2.6718E-44 87069 QUIQUE_C1438_190116_001 170.66 131.04 1062000000 88355000 84340000 113200000 108640000 91109000 86900000 82955000 0 93556000 0 113460000 101150000 98282000 46973 1396 43853 422764;422765;422766;422767;422768;422769;422770;422771;422772;422773;422774 539691;539692;539693;539694;539695;539696;539697;539698;539699;539700;539701 539695 11 VIGMHYFSPVDK Unmodified 1391.6908 0.69075746 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.788 68.788 3 0.00029274 68073 QUIQUE_DMIX8_190116_001 72.089 52.349 3202500000 262480000 243470000 447920000 292010000 190500000 223170000 237560000 165540000 227500000 80491000 331120000 243190000 257590000 46974 1153 43854 422775;422776;422777;422778;422779;422780;422781;422782;422783;422784;422785;422786;422787 539702;539703;539704;539705;539706;539707;539708;539709;539710;539711;539712;539713;539714;539715;539716;539717;539718;539719;539720 539720 19 VIGMHYFSPVDK Oxidation (M) 1407.6857 0.68567208 1153 H0YFD6;P40939;A0A2R8Y4F5 HADHA Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial;Long-chain enoyl-CoA hydratase;Long chain 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase yes no 0 1 0 2 1 2 1 3 2 1 1 48.516 48.516 2;3 0.00062881 45001 QUIQUE_C1403_190116_001 99.788 72.36 591370000 0 0 103300000 26538000 0 0 0 97538000 52092000 90497000 125290000 42761000 53348000 46975 1153 43854 422788;422789;422790;422791;422792;422793;422794;422795;422796;422797;422798;422799;422800 539721;539722;539723;539724;539725;539726;539727;539728;539729;539730;539731;539732;539733;539734;539735 539723 675 14 VIGNQSLVNELAFTAR Unmodified 1730.9315 0.93153309 2959 Q13011 ECH1 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 116.49 116.49 2;3 1.3962E-29 120788 QUIQUE_C1368_190116_001 164.11 138.45 3747800000 259970000 284480000 306790000 112960000 325400000 242590000 218080000 345590000 415190000 127050000 421650000 331990000 356020000 46976 2959 43855 422801;422802;422803;422804;422805;422806;422807;422808;422809;422810;422811;422812;422813;422814 539736;539737;539738;539739;539740;539741;539742;539743;539744;539745;539746;539747;539748;539749;539750;539751;539752;539753;539754;539755;539756;539757;539758;539759;539760;539761;539762;539763;539764 539742 29 VIGPFYEIVEDKK Unmodified 1535.8235 0.82354577 654 B7Z2R7;Q5T8D3;X6RDD7;Q5T8E0 ACBD5 Acyl-CoA-binding domain-containing protein 5 yes no 0 0 1 1 1 91.297 91.297 3 0.018477 93812 QUIQUE_C1368_190116_001 46.797 33.919 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46977 654 43856 422815;422816 539765;539766 539765 2 VIGQDVVLPCVASGLPTPTIK Unmodified 2163.1973 0.19732618 3760 Q92859 NEO1 Neogenin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 134.23 134.23 2 2.2696E-07 138983 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.237 79.81 115580000 0 0 23796000 0 20433000 0 21959000 0 23517000 0 25873000 0 0 46978 3760 43857 422817;422818;422819;422820;422821 539767;539768;539769;539770;539771;539772 539770 6 VIGSELVQK Unmodified 971.56515 0.56514624 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 47.291 47.291 2 0.0043079 37046 QUIQUE_C1438_190116_001 89.296 22.303 796050000 158030000 154480000 0 0 149980000 0 0 161650000 0 0 0 0 171910000 46979 2389 43858 422822;422823;422824;422825;422826;422827 539773;539774;539775;539776;539777;539778 539775 3 VIGSGCNLDSAR Unmodified 1247.5928 0.59283433 1775;1915 P07195;A0A3B3IS95;A8MW50;A0A087WUM2;Q6ZMR3;P00338 LDHB;LDHAL6A;LDHA L-lactate dehydrogenase B chain;L-lactate dehydrogenase;L-lactate dehydrogenase A-like 6A;L-lactate dehydrogenase A chain no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 30.924 30.924 2 1.5832E-09 26540 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.16 78.202 150340000000 11982000000 12475000000 14588000000 12632000000 12324000000 10813000000 13548000000 8791900000 9992600000 5262600000 12982000000 11545000000 13407000000 46980 1915;1775 43859 422828;422829;422830;422831;422832;422833;422834;422835;422836;422837;422838;422839;422840;422841;422842 539779;539780;539781;539782;539783;539784;539785;539786;539787;539788;539789;539790;539791;539792;539793;539794;539795;539796;539797;539798;539799;539800;539801;539802;539803;539804;539805;539806;539807 539794 29 VIGTLLGTVDK Unmodified 1114.6598 0.65977491 1396 O00303 EIF3F Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 78.579 78.579 2 0.00017468 79704 QUIQUE_DMIX1_190116_001 126.31 72.156 735340000 0 0 0 88740000 0 83371000 92726000 79239000 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Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 0 8 6 7 7 8 6 6 6 7 7 7 7 6 136.35 136.35 2;3;4 0 139262 QUIQUE_C1277_190116_001 281.5 268.08 199810000000 10014000000 17379000000 27750000000 14813000000 12897000000 13670000000 13405000000 17658000000 16475000000 10252000000 15677000000 13098000000 16723000000 46984 1863 43863 422858;422859;422860;422861;422862;422863;422864;422865;422866;422867;422868;422869;422870;422871;422872;422873;422874;422875;422876;422877;422878;422879;422880;422881;422882;422883;422884;422885;422886;422887;422888;422889;422890;422891;422892;422893;422894;422895;422896;422897;422898;422899;422900;422901;422902;422903;422904;422905;422906;422907;422908;422909;422910;422911;422912;422913;422914;422915;422916;422917;422918;422919;422920;422921;422922;422923;422924;422925;422926;422927;422928;422929;422930;422931;422932;422933;422934;422935;422936;422937;422938;422939;422940;422941;422942;422943;422944;422945 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VIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQK Unmodified 2594.3527 0.35265763 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 13 10 7 13 8 6 10 12 15 6 19 12 19 166.82 166.82 2;3;4 0 157853 QUIQUE_C1218_190116_001 361.37 347.85 750940000000 34682000000 81181000000 61638000000 44993000000 33383000000 62026000000 53681000000 70496000000 74610000000 8194500000 64870000000 71288000000 89901000000 46985 1863 43863 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539972 185 VIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQKTVDGPSGK Unmodified 3335.7184 0.71837578 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 1 145.65 145.65 4 1.7546E-14 150120 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.761 68.16 285800000 69941000 0 0 0 0 0 72212000 69556000 74088000 0 0 0 0 46986 1863 43864 423096;423097;423098;423099 540165;540166;540167;540168;540169 540169 5 VIHELANER Unmodified 1079.5724 0.57235688 2879 Q02880;E9PCY5 TOP2B DNA topoisomerase 2-beta;DNA topoisomerase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.572 16.572 3 0.00039716 8723 QUIQUE_C1368_190116_001 89.886 76.077 309450000 23987000 34008000 32725000 0 24098000 20153000 31942000 15556000 28959000 6251000 41283000 27547000 22937000 46987 2879 43865 423100;423101;423102;423103;423104;423105;423106;423107;423108;423109;423110;423111 540170;540171;540172;540173;540174;540175;540176;540177;540178;540179;540180;540181 540172 12 VIHIINAEMENYEAGVYTEK Unmodified 2322.1202 0.12019808 2250 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540301;540302;540303;540304;540305;540306;540307;540308;540309;540310;540311;540312;540313;540314;540315;540316;540317;540318;540319;540320;540321;540322;540323;540324;540325;540326;540327;540328;540329;540330;540331;540332;540333;540334;540335;540336;540337;540338;540339;540340;540341;540342;540343;540344;540345;540346;540347;540348;540349;540350;540351;540352;540353;540354;540355;540356;540357;540358;540359;540360;540361;540362;540363 540328 53 VIIPLLKDEGFAVK Unmodified 1540.9229 0.92286588 4324 Q9NXC2;S4R302 GFOD1 Glucose-fructose oxidoreductase domain-containing protein 1 yes no 0 0 1 2 110.33 110.33 3 0.0025826 112417 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.115 53.979 12783000 0 0 0 0 0 0 0 12783000 0 0 0 0 0 46996 4324 43874 423257;423258 540364;540365 540364 2 VIISAPSADAPMFVMGVNHEK 2 Oxidation (M) 2244.0919 0.091874835 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 2 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 82.501 82.501 2;3 5.2592E-07 83497 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.441 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43875 423284;423285;423286;423287;423288;423289;423290;423291;423292;423293;423294;423295;423296;423297;423298;423299;423300;423301;423302;423303;423304;423305;423306;423307;423308;423309;423310;423311;423312;423313;423314;423315;423316;423317;423318;423319;423320;423321;423322;423323;423324;423325;423326;423327;423328;423329;423330;423331;423332;423333;423334;423335;423336 540398;540399;540400;540401;540402;540403;540404;540405;540406;540407;540408;540409;540410;540411;540412;540413;540414;540415;540416;540417;540418;540419;540420;540421;540422;540423;540424;540425;540426;540427;540428;540429;540430;540431;540432;540433;540434;540435;540436;540437;540438;540439;540440;540441;540442;540443;540444;540445;540446;540447;540448;540449;540450;540451;540452;540453;540454;540455;540456;540457;540458;540459;540460;540461;540462;540463;540464;540465;540466;540467;540468;540469;540470;540471;540472;540473 540417 1083;1084 75 VIISAPSADAPMFVMGVNHEK Unmodified 2212.102 0.10204559 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 2 111.17 111.17 2;3 8.7715E-77 113344 QUIQUE_C1218_190116_001 212.24 199.36 264770000000 23875000000 23704000000 27136000000 23659000000 16680000000 18658000000 20858000000 16553000000 18623000000 7358400000 27568000000 19439000000 20661000000 46999 1863 43875 423337;423338;423339;423340;423341;423342;423343;423344;423345;423346;423347;423348;423349;423350;423351;423352;423353;423354;423355;423356;423357;423358;423359;423360;423361;423362;423363;423364 540474;540475;540476;540477;540478;540479;540480;540481;540482;540483;540484;540485;540486;540487;540488;540489;540490;540491;540492;540493;540494;540495;540496;540497;540498;540499;540500;540501;540502;540503;540504;540505;540506;540507;540508;540509;540510;540511;540512;540513;540514;540515;540516;540517;540518;540519;540520;540521;540522;540523;540524;540525;540526;540527;540528;540529;540530;540531;540532;540533;540534;540535 540478 62 VIISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLK Unmodified 2932.4463 0.44630002 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 2 1 3 2 2 107.88 107.88 3;4 1.9622E-31 110953 QUIQUE_DMIX1_190116_001 120.66 108.92 3664000000 52823000 0 0 0 0 0 0 2272000000 322570000 0 328140000 404860000 283610000 47000 1863 43876 423365;423366;423367;423368;423369;423370;423371;423372;423373;423374;423375 540536;540537;540538;540539;540540;540541;540542;540543;540544;540545;540546;540547;540548;540549 540538 13 VIISAPSADAPMFVMGVNHEKYDNSLK Oxidation (M) 2948.4412 0.44121464 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 1 3 97.424 97.424 3;4 1.6168E-30 99238 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.38 104.98 568530000 0 0 0 0 0 0 0 568530000 0 0 0 0 0 47001 1863 43876 423376;423377;423378 540550;540551;540552;540553 540553 1083;1084 4 VIISDIDGTITR Unmodified 1301.7191 0.7190807 3081 Q14693 LPIN1 Phosphatidate phosphatase LPIN1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 84.711 84.711 2 0.010628 86147 QUIQUE_C1277_190116_001 59.908 17.62 45407000 0 15433000 0 29974000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47002 3081 43877 423379;423380;423381;423382 540554;540555;540556;540557 540554 4 VIITNFPAAK Unmodified 1072.6281 0.62808085 2496 P47897;A0A1B0GVU9;B4DDN1;H7C0R3 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 64.024 64.024 2 0.015433 63681 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.419 6.2414 72568000 0 0 0 0 0 0 0 32474000 0 0 40095000 0 0 47003 2496 43878 423383;423384 540558;540559 540559 2 VIIYQEK Unmodified 891.50657 0.50656873 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 27.304 27.304 2 0.060724 21464 QUIQUE_DMIX8_190116_001 69.176 35.172 64817000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64817000 47004 295 43879 423385 540560 540560 1 VIKDFMIQGGDFTR Unmodified 1625.8236 0.82356254 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 87.124 87.124 2;3 0.00013244 88870 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.789 49.468 736580000 0 0 0 0 29322000 0 34240000 145170000 0 0 202350000 117760000 207750000 47005 2210 43880 423386;423387;423388;423389;423390;423391;423392;423393 540561;540562;540563;540564;540565;540566;540567;540568;540569 540569 9 VILALGDYMGATCHACIGGTNVR Oxidation (M) 2464.1661 0.16611919 3055 Q14240;E7EQG2 EIF4A2 Eukaryotic initiation factor 4A-II;Eukaryotic initiation factor 4A-II, N-terminally processed yes no 0 1 0 1 91.499 91.499 3 5.1443E-05 94198 QUIQUE_C1368_190116_001 53.779 46.081 34742000 0 0 34742000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47006 3055 43881 423394 540570 540570 2516 1 VILDGNSLEK Unmodified 1086.5921 0.59208927 3614 Q8N8N7;G3V3Y1 PTGR2 Prostaglandin reductase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.445 51.445 2 0.0015721 49303 QUIQUE_DMIX1_190116_001 96.034 70.475 2651800000 254480000 263630000 0 297820000 396210000 0 247260000 268790000 0 158700000 458860000 306020000 0 47007 3614 43882 423395;423396;423397;423398;423399;423400;423401;423402;423403 540571;540572;540573;540574;540575;540576;540577;540578;540579;540580;540581 540578 9 VILDLTPNYR Unmodified 1202.6659 0.66592292 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 89.056 89.056 2 1.7135E-07 86805 QUIQUE_DMIX4_190116_001 152.63 107.55 4566100000 257770000 335770000 246380000 344890000 307110000 221160000 340480000 326780000 500260000 177960000 581530000 374930000 551060000 47008 997 43883 423404;423405;423406;423407;423408;423409;423410;423411;423412;423413;423414;423415;423416;423417 540582;540583;540584;540585;540586;540587;540588;540589;540590;540591;540592;540593;540594;540595;540596;540597;540598;540599;540600;540601;540602;540603 540597 22 VILEDVAMLHIKPDQFTYTSDHFETIMK Unmodified 3320.6461 0.64612204 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 1 135.75 135.75 4 0.00010031 140724 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.511 28.295 152850000 0 0 0 0 0 0 0 0 73046000 0 79801000 0 0 47009 1929 43884 423418;423419 540604;540605 540604 2 VILEIDNAR Unmodified 1041.5819 0.58185893 760;777 K7ERE3;CON__ENSEMBL:ENSP00000377550;P13646;K7EMD9;CON__P13646-1 KRT13 Keratin, type I cytoskeletal 13 no no 0 0 0 1 1 1 58.776 58.776 2 0.023842 56863 QUIQUE_DMIX3_190116_001 60.436 35.514 145040000 20162000 0 0 0 0 0 0 0 73922000 50955000 0 0 0 + 47010 760;777 43885 423420;423421;423422 540606;540607;540608 540607 3 VILFNPLDACR Unmodified 1316.6911 0.69109181 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.61 116.61 2 0.00042066 120075 QUIQUE_C1403_190116_001 115.71 88.46 625620000 25095000 42199000 71082000 42548000 58587000 41547000 62175000 32823000 58011000 22883000 45097000 56045000 67531000 47011 506 43886 423423;423424;423425;423426;423427;423428;423429;423430;423431;423432;423433;423434;423435 540609;540610;540611;540612;540613;540614;540615;540616;540617;540618;540619;540620;540621;540622;540623;540624;540625 540614 17 VILGNELPK Unmodified 981.58588 0.58588168 283 A2ACR1;A0A0G2JJA7;P28065 PSMB9 Proteasome subunit beta type;Proteasome subunit beta type-9 yes no 0 0 0 1 1 1 57.961 57.961 2 0.045989 54984 QUIQUE_DMIX4_190116_001 51.854 35.652 207680000 0 0 98918000 0 0 0 0 0 0 38554000 0 0 70211000 47012 283 43887 423436;423437;423438 540626;540627;540628 540627 3 VILGSEAAQQHPEEVR Unmodified 1761.901 0.90096124 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180;E9PQ14;E9PKK8;E9PPK9;E9PNX5 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 2 39.045 39.045 2;3 3.4842E-44 35794 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.5 151.36 2409000000 201740000 147780000 192460000 203020000 180110000 145250000 208710000 185560000 169400000 123180000 228020000 173610000 250120000 47013 4330 43888 423439;423440;423441;423442;423443;423444;423445;423446;423447;423448;423449;423450;423451;423452;423453;423454;423455;423456;423457;423458 540629;540630;540631;540632;540633;540634;540635;540636;540637;540638;540639;540640;540641;540642;540643;540644;540645;540646;540647;540648;540649;540650;540651;540652 540641 22 VILHGEHAVVHGK Unmodified 1394.7783 0.77826733 1020 F5H8H2;Q03426;F5H163;F5H368;A0A1W2PS16;F5GXC0;F5H092 MVK Mevalonate kinase yes no 0 0 0 1 1 10.496 10.496 3 0.0001123 2822 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.122 79.769 15024000 0 0 0 0 0 0 0 9839000 0 5185500 0 0 0 47014 1020 43889 423459;423460 540653;540654 540653 2 VILHLKEDQTEYLEER Unmodified 2014.0371 0.037120373 1931;1938;3263 P08238;Q58FF7;P07900;G3V2J8;Q58FF6 HSP90AB1;HSP90AB3P;HSP90AA1;HSP90AB4P Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3;Heat shock protein HSP 90-alpha;Putative heat shock protein HSP 90-beta 4 no no 0 0 1 1 2 2 1 3 2 3 4 4 1 3 3 3 66.332 66.332 2;3;4 4.0769E-94 66146 QUIQUE_DMIX1_190116_001 218.85 203.97 8234100000 76918000 282430000 166280000 150970000 661290000 307640000 629970000 1183100000 953680000 31678000 1177600000 1077400000 1535100000 47015 1938;1931;3263 43890 423461;423462;423463;423464;423465;423466;423467;423468;423469;423470;423471;423472;423473;423474;423475;423476;423477;423478;423479;423480;423481;423482;423483;423484;423485;423486;423487;423488;423489;423490;423491;423492 540655;540656;540657;540658;540659;540660;540661;540662;540663;540664;540665;540666;540667;540668;540669;540670;540671;540672;540673;540674;540675;540676;540677;540678;540679;540680;540681;540682;540683;540684;540685;540686;540687;540688;540689;540690;540691;540692;540693;540694;540695;540696;540697;540698;540699;540700;540701;540702;540703 540676 49 VILHLKEDQTEYLEERR Unmodified 2170.1382 0.1382314 1931;1938 P08238;Q58FF7;P07900;G3V2J8 HSP90AB1;HSP90AB3P;HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-beta;Putative heat shock protein HSP 90-beta-3;Heat shock protein HSP 90-alpha no no 0 0 2 3 1 1 1 55.654 55.654 3;4;5 0.00030344 54184 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.12 41.57 1002400000 0 0 0 0 0 0 0 834420000 68128000 0 0 50587000 49290000 47016 1938;1931 43891 423493;423494;423495;423496;423497;423498 540704;540705;540706;540707;540708;540709 540705 5 VILHPTPNSPK Unmodified 1201.6819 0.68190733 4494;981 F1T0E5;Q9ULU8 CADPS Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 2 19.434 19.434 2;3 0.0012865 11972 QUIQUE_C1576_190116_001 103.55 82.246 2391300000 49791000 362000000 191260000 287200000 228700000 200560000 251190000 238360000 120830000 0 91089000 51174000 319120000 47017 981;4494 43892 423499;423500;423501;423502;423503;423504;423505;423506;423507;423508;423509;423510;423511;423512;423513;423514;423515;423516;423517 540710;540711;540712;540713;540714;540715;540716;540717;540718;540719;540720;540721;540722;540723;540724;540725;540726;540727;540728 540721 16 VILITPTPLCETAWEEQCIIQGCK Unmodified 2858.4017 0.40165801 3215 Q2TAA2;H7C5G1;C9JE02;C9JDY4;C9J5J2 IAH1 Isoamyl acetate-hydrolyzing esterase 1 homolog yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 149.73 149.73 2;3 1.9751E-51 154101 QUIQUE_C1403_190116_001 153.11 146.13 896700000 12009000 117130000 156950000 90174000 106470000 80616000 112540000 0 0 0 83928000 47531000 89357000 47018 3215 43893 423518;423519;423520;423521;423522;423523;423524;423525;423526;423527;423528 540729;540730;540731;540732;540733;540734;540735;540736;540737;540738;540739;540740;540741 540733 11 VILLAVTGETPGGPNEHPATLDDHPEPK Unmodified 2903.4665 0.46650141 656 F8W1R0;B7Z493;E9PJX4;F8VWL3;Q96M96 FGD4 FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4 yes no 0 0 0 1 84.66 84.66 4 4.269E-06 86514 QUIQUE_C1218_190116_001 54.141 44.808 73115000 73115000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47019 656 43894 423529 540742 540742 1 VILLDGSEYTCDVEK Unmodified 1739.8288 0.82876708 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3QS55;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.615 98.615 2 2.0693E-29 102736 QUIQUE_C1218_190116_001 166.14 151.32 2881500000 345370000 336520000 285790000 364580000 201580000 353750000 354000000 60480000 82497000 124590000 121160000 107290000 143930000 47020 143;560;4559 43895 423530;423531;423532;423533;423534;423535;423536;423537;423538;423539;423540;423541;423542 540743;540744;540745;540746;540747;540748;540749;540750;540751;540752;540753;540754;540755;540756;540757;540758;540759 540744 17 VILLDGSEYTCDVEKR Unmodified 1895.9299 0.92987811 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A0A1B0GTF8;J3QS55;A8K968;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 3 1 1 2 1 83.46 83.46 2;3 9.4172E-36 84452 QUIQUE_C1403_190116_001 171.05 148.52 211100000 0 0 0 63082000 0 0 66645000 0 0 0 0 81374000 0 47021 143;560;4559 43896 423543;423544;423545;423546;423547;423548;423549;423550;423551;423552;423553;423554;423555;423556;423557 540760;540761;540762;540763;540764;540765;540766;540767;540768;540769;540770;540771;540772;540773;540774 540763 15 VILLDVAR Unmodified 897.56475 0.56475231 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.766 76.766 2 0.008111 77185 QUIQUE_C1277_190116_001 95.541 50.147 381700000 43247000 51406000 0 33493000 48266000 35174000 48850000 34277000 30434000 13858000 0 42698000 0 47022 4148 43897 423558;423559;423560;423561;423562;423563;423564;423565;423566;423567 540775;540776;540777;540778;540779;540780;540781;540782;540783;540784 540776 10 VILLGDGGVGK Unmodified 1026.6073 0.6073454 2577 P51151;A0A1B0GUI0;Q9NP90 RAB9A;RAB9B Ras-related protein Rab-9A;Ras-related protein Rab-9B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.604 65.604 2 0.0014915 65552 QUIQUE_C1277_190116_001 84.213 32.358 528380000 0 60033000 58510000 49090000 40390000 46407000 80286000 0 42841000 23410000 63387000 0 64031000 47023 2577 43898 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protein alpha isoform yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 1 3 2 2 148.56 148.56 2;3 1.2922E-17 153114 QUIQUE_DMIX3_190116_001 147.24 139.46 7872200000 643480000 545810000 560140000 631690000 583120000 784840000 563190000 525190000 753350000 182660000 907840000 665760000 525180000 47026 2842 43901 423587;423588;423589;423590;423591;423592;423593;423594;423595;423596;423597;423598;423599;423600;423601;423602;423603;423604;423605;423606;423607;423608;423609;423610;423611;423612;423613 540806;540807;540808;540809;540810;540811;540812;540813;540814;540815;540816;540817;540818;540819;540820;540821;540822;540823;540824;540825;540826;540827;540828;540829;540830;540831;540832;540833;540834;540835;540836;540837;540838;540839;540840;540841;540842;540843;540844;540845;540846;540847;540848;540849;540850;540851;540852 540838 46 VILQDFTGVPAVVDFAAMR Oxidation (M) 2064.0714 0.071397389 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 153 153 2 8.992E-11 158720 QUIQUE_C1218_190116_001 112.42 79.228 294330000 31352000 68065000 41027000 26601000 0 39322000 0 0 45595000 0 0 42365000 0 47027 2180 43902 423614;423615;423616;423617;423618;423619;423620;423621 540853;540854;540855;540856;540857;540858;540859;540860;540861 540854 1535 9 VILQDFTGVPAVVDFAAMR Unmodified 2048.0765 0.076482767 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 2 3 3 160.51 160.51 2;3 1.2981E-28 165025 QUIQUE_DMIX8_190116_001 184.76 150.8 1968500000 164540000 167480000 141910000 98867000 160130000 75745000 113000000 142990000 181060000 30577000 260330000 241290000 190570000 47028 2180 43902 423622;423623;423624;423625;423626;423627;423628;423629;423630;423631;423632;423633;423634;423635;423636;423637;423638;423639;423640;423641;423642;423643;423644;423645;423646 540862;540863;540864;540865;540866;540867;540868;540869;540870;540871;540872;540873;540874;540875;540876;540877;540878;540879;540880;540881;540882;540883;540884;540885;540886;540887;540888;540889;540890;540891;540892;540893;540894 540892 31 VILSLVSTR Unmodified 986.61243 0.61243078 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 74.213 74.213 2 0.045636 74192 QUIQUE_C1277_190116_001 78.149 38.931 135770000 0 37776000 0 36709000 0 0 0 40283000 0 21003000 0 0 0 47029 2217 43903 423647;423648;423649;423650 540895;540896;540897;540898 540895 2 VILSSSTSCLMPSK Oxidation (M) 1524.7528 0.75276537 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A087WW38 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.773 54.773 2 0.00026326 53290 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.35 81.25 1074900000 61837000 71129000 90275000 76973000 61883000 84530000 80423000 63170000 92120000 68276000 117790000 93721000 112810000 47030 4564 43904 423651;423652;423653;423654;423655;423656;423657;423658;423659;423660;423661;423662;423663 540899;540900;540901;540902;540903;540904;540905;540906;540907;540908;540909;540910;540911;540912;540913;540914 540908 3016 16 VILSSSTSCLMPSK Unmodified 1508.7579 0.75785074 4564 Q9Y2S2;A0A2R8YCZ4;A0A2R8YFQ7;A0A087WW38 CRYL1 Lambda-crystallin homolog yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 74.134 74.134 2 7.658E-10 75083 QUIQUE_C1277_190116_001 124.42 97.308 1759100000 169160000 175030000 196890000 155650000 163940000 152310000 119640000 85632000 112810000 0 151100000 120340000 156570000 47031 4564 43904 423664;423665;423666;423667;423668;423669;423670;423671;423672;423673;423674;423675 540915;540916;540917;540918;540919;540920;540921;540922;540923;540924;540925;540926;540927;540928;540929;540930;540931 540917 16 VILTSIDGVPGSDYINANYIDGYR Unmodified 2614.2915 0.29149716 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9;H0Y380 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 145.06 145.06 3 0.070688 152457 QUIQUE_DMIX5_190116_001 18.078 0.84435 56627000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56627000 0 0 47032 1998 43905 423676 540932 540932 1 VIMDYESLEK Unmodified 1225.59 0.59004036 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.632 72.632 2;3 0.0025591 78804 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.247 38.369 2029700000 175340000 179950000 188180000 172250000 222840000 0 152500000 46103000 261500000 106640000 0 223540000 300890000 47033 1786 43906 423677;423678;423679;423680;423681;423682;423683;423684;423685;423686;423687 540933;540934;540935;540936;540937;540938;540939;540940;540941;540942;540943;540944;540945 540942 11 VIMDYESLEK Oxidation (M) 1241.585 0.58495498 1786 P00491 PNP Purine nucleoside phosphorylase yes yes 0 1 0 1 1 55.312 55.312 2 0.03822 53120 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.756 40.719 70793000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16002000 0 54791000 0 47034 1786 43906 423688;423689 540946;540947 540947 2 VIMVGSGGVGK Oxidation (M) 1018.5481 0.54811597 2019;2018 P11234;C9J6B1;C9JQB3;F8WEQ6;C9JPE8;C9JYR1;P11233;H7C3P7 RALB;RALA Ras-related protein Ral-B;Ras-related protein Ral-A no no 0 1 0 1 1 1 1 1 28.281 28.281 2 0.032673 22946 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.255 16.96 129900000 0 46344000 0 0 0 0 0 0 30476000 20585000 0 0 32498000 47035 2019;2018 43907 423690;423691;423692;423693;423694 540948;540949;540950;540951;540952 540950 5 VIMVGSGGVGK Unmodified 1002.5532 0.55320134 2019;2018 P11234;C9J6B1;C9JQB3;F8WEQ6;C9JPE8;C9JYR1;P11233;H7C3P7 RALB;RALA Ras-related protein Ral-B;Ras-related protein Ral-A no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 37.976 37.976 2 0.0015261 34784 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.998 32.144 2173700000 0 314750000 0 0 0 301210000 0 203680000 293210000 118830000 373400000 252720000 315930000 47036 2019;2018 43907 423695;423696;423697;423698;423699;423700;423701;423702 540953;540954;540955;540956;540957;540958;540959;540960;540961 540956 7 VIMVTGDHPITAK Unmodified 1380.7435 0.74352131 590;1371;1872 P05023;P20648;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733;P54707;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP4A;ATP1A3;ATP1A4;ATP12A;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Potassium-transporting ATPase alpha chain 1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Potassium-transporting ATPase alpha chain 2;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 39.326 39.326 2;3 0.00014862 34731 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.644 63.68 10674000000 866140000 625650000 1458000000 988070000 600370000 478330000 1071300000 807860000 708260000 171100000 1087400000 566680000 1245300000 47037 1872;1371;590 43908 423703;423704;423705;423706;423707;423708;423709;423710;423711;423712;423713;423714;423715;423716;423717;423718;423719;423720;423721 540962;540963;540964;540965;540966;540967;540968;540969;540970;540971;540972;540973;540974;540975;540976;540977;540978;540979;540980;540981;540982;540983;540984;540985;540986;540987;540988 540982 27 VIMVTGDHPITAK Oxidation (M) 1396.7384 0.73843593 590;1371;1872 P05023;P20648;M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;Q13733;P54707;B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A1;ATP4A;ATP1A3;ATP1A4;ATP12A;ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1;Potassium-transporting ATPase alpha chain 1;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4;Potassium-transporting ATPase alpha chain 2;Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 no no 0 1 0 1 2 2 1 2 30.947 30.947 2;3 0.0021465 25742 QUIQUE_C1368_190116_001 62.232 40.538 330790000 0 14550000 144730000 0 0 0 0 53927000 0 22856000 94723000 0 0 47038 1872;1371;590 43908 423722;423723;423724;423725;423726;423727;423728;423729 540989;540990;540991;540992;540993;540994;540995;540996 540991 386 7 VINAAHSFYNGTTTLPISDEDR Unmodified 2420.1608 0.16081734 2554 P49915 GMPS GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 89.883 89.883 3 6.0365E-09 91247 QUIQUE_C1403_190116_001 92.336 77.208 189390000 35849000 0 0 41973000 0 38238000 0 0 0 23873000 49457000 0 0 47039 2554 43909 423730;423731;423732;423733;423734 540997;540998;540999;541000;541001 540998 4 VINDGLFYYEQDLWAEK Unmodified 2101.9997 0.99967223 3397 Q6PKG0;A0A0B4J210;E5RH50 LARP1 La-related protein 1 yes no 0 0 0 1 147.29 147.29 2 0.0047845 153067 QUIQUE_C1368_190116_001 71.548 63.035 27731000 0 0 27731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47040 3397 43910 423735 541002 541002 1 VINDKHDDVMAK Unmodified 1383.6816 0.68164933 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 12.768 12.768 3 0.00034936 5403 QUIQUE_C1218_190116_001 87.216 65.188 109310000 14619000 0 0 0 2668800 0 0 10489000 0 0 0 81537000 0 47041 3954 43911 423736;423737;423738;423739 541003;541004;541005;541006 541003 3 VINDLFSDVLEEGELDMEK Unmodified 2194.0351 0.035131042 4258 Q9NQW6 ANLN Actin-binding protein anillin yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 165.65 165.65 2;3 2.9301E-07 169920 QUIQUE_DMIX8_190116_001 130.24 117.04 106750000 34871000 46636000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25244000 47042 4258 43912 423740;423741;423742;423743;423744;423745 541007;541008;541009;541010;541011;541012;541013 541013 7 VINDPIHGHIELHPLLVR Unmodified 2071.1691 0.16907802 4598 Q9Y3Z3;A0A2R8YCS7;A0A2R8YD90;A0A2R8YF51;A0A2R8Y5D2;A0A2R8Y586;A0A2R8Y6J9 SAMHD1 Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 80.208 80.208 4 0.00033571 81820 QUIQUE_C1368_190116_001 63.337 54.241 480490000 0 0 151420000 0 87728000 0 0 0 0 0 109280000 51204000 80854000 47043 4598 43913 423746;423747;423748;423749;423750 541014;541015;541016;541017;541018 541014 5 VINEPTAAALAYGLDK Unmodified 1644.8723 0.87228688 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 104.05 104.05 2;3 4.4075E-19 107521 QUIQUE_DMIX3_190116_001 146.5 113.28 13519000000 1344800000 950920000 1416600000 958640000 934750000 1091800000 1184900000 728170000 1056700000 652810000 1191500000 848850000 1158200000 47044 2415 43914 423751;423752;423753;423754;423755;423756;423757;423758;423759;423760;423761;423762;423763;423764;423765;423766;423767;423768;423769;423770;423771;423772;423773;423774;423775 541019;541020;541021;541022;541023;541024;541025;541026;541027;541028;541029;541030;541031;541032;541033;541034;541035;541036;541037;541038;541039;541040;541041;541042;541043;541044 541036 25 VINEPTAAALAYGLDKSEDK Unmodified 2104.0688 0.068814432 2415 P38646 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 93.46 93.46 2;3 7.247E-29 96993 QUIQUE_DMIX5_190116_001 143.97 121.4 1566400000 0 0 72597000 0 101550000 0 90068000 155190000 312230000 0 422270000 252220000 160240000 47045 2415 43915 423776;423777;423778;423779;423780;423781;423782;423783;423784 541045;541046;541047;541048;541049;541050;541051;541052;541053;541054;541055 541052 8 VINIDFR Unmodified 875.4865 0.48650199 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 1 1 71.947 71.947 2 0.01978 72741 QUIQUE_C1218_190116_001 122.79 34.056 72686000 45516000 27171000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47046 2503 43916 423785;423786 541056;541057;541058;541059;541060 541057 5 VINIDFRDPEESK Unmodified 1560.7784 0.77838649 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 73.723 73.723 2;3 4.8085E-07 74060 QUIQUE_C1277_190116_001 148.18 101.85 1109000000 124900000 151810000 164050000 167080000 101790000 100400000 0 36680000 0 76528000 76138000 0 109580000 47047 2503 43917 423787;423788;423789;423790;423791;423792;423793;423794;423795;423796;423797;423798;423799;423800;423801;423802 541061;541062;541063;541064;541065;541066;541067;541068;541069;541070;541071;541072;541073;541074;541075;541076;541077;541078 541066 16 VINLNDNTFTEK Unmodified 1406.7042 0.70415892 2476 P46060;H0Y4Q3 RANGAP1 Ran GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 71.974 71.974 2 0.0007119 68058 QUIQUE_DMIX4_190116_001 106.62 77.145 88020000 51748000 0 0 0 0 0 0 0 0 36272000 0 0 0 47048 2476 43918 423803;423804 541079;541080;541081 541081 3 VINLSQYGPAYFGQEHAR Unmodified 2049.0068 0.0068232975 3684 Q8TDJ6 DMXL2 DmX-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 97.33 97.33 3 0.0075415 101525 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.625 26.529 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47049 3684 43919 423805;423806 541082;541083 541082 2 VINPAVGSGLSPLLPLAMSAR Unmodified 2062.1609 0.1608811 1595 O60826 CCDC22 Coiled-coil domain-containing protein 22 yes yes 0 0 0 2 146.03 146.03 2;3 2.5444E-07 151181 QUIQUE_DMIX8_190116_001 124.62 116.24 39527000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39527000 47050 1595 43920 423807;423808 541084;541085 541084 2 VINQILTEMDGMSTK Oxidation (M) 1694.8219 0.82190756 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 1 0 1 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 96.864 96.864 2 1.538E-05 99445 QUIQUE_C1277_190116_001 97.911 84.511 439780000 39898000 65808000 53588000 31340000 39277000 39884000 46175000 47500000 0 24981000 51325000 0 0 47051 2658 43921 423809;423810;423811;423812;423813;423814;423815;423816;423817;423818;423819;423820;423821;423822 541086;541087;541088;541089;541090;541091;541092;541093;541094;541095;541096;541097;541098;541099 541087 2104;2105 13 VINQILTEMDGMSTK Unmodified 1678.827 0.82699294 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 3 1 2 1 3 2 2 115.2 115.2 2;3 2.5387E-29 120681 QUIQUE_C1218_190116_001 165.7 142.32 3896200000 327170000 339360000 318280000 378020000 296630000 287070000 378790000 163560000 256930000 67195000 414800000 318520000 349920000 47052 2658 43921 423823;423824;423825;423826;423827;423828;423829;423830;423831;423832;423833;423834;423835;423836;423837;423838;423839;423840;423841;423842;423843;423844;423845;423846;423847 541100;541101;541102;541103;541104;541105;541106;541107;541108;541109;541110;541111;541112;541113;541114;541115;541116;541117;541118;541119;541120;541121;541122;541123;541124;541125;541126;541127;541128;541129;541130;541131;541132;541133;541134;541135;541136 541101 35 VINQILTEMDGMSTK 2 Oxidation (M) 1710.8168 0.81682219 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 2 0 1 58.53 58.53 2 0.0031715 53967 QUIQUE_DMIX4_190116_001 65.179 51.745 20842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 20842000 0 0 0 47053 2658 43921 423848 541137 541137 2104;2105 1 VINQILTEMDGMSTKK Unmodified 1806.922 0.92195596 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 93.474 93.474 3 9.0533E-10 95416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 124.25 113.78 223160000 0 0 0 0 0 0 0 82734000 36717000 0 0 41646000 62063000 47054 2658 43922 423849;423850;423851;423852 541138;541139;541140;541141 541138 3 VINQYQVVKPTAER Unmodified 1643.8995 0.89950468 3082 Q14694 USP10 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10 yes yes 0 0 1 1 1 36.276 36.276 3 0.0053825 31565 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.532 27.693 46457000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13703000 32754000 0 0 47055 3082 43923 423853;423854 541142;541143 541142 1 VINSVDIK Unmodified 886.51238 0.51238239 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 30.326 30.326 2 0.012053 24911 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.142 4.8986 4278700000 732840000 685030000 876590000 0 0 0 0 0 782270000 438980000 762980000 0 0 47056 1609 43924 423855;423856;423857;423858;423859;423860 541144;541145;541146;541147;541148;541149 541147 1 VINTSHLSIHK Unmodified 1247.6986 0.69862003 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 0 2 1 19.287 19.287 2;3 0.0066117 11937 QUIQUE_C1403_190116_001 75.509 50.615 177950000 0 0 0 92479000 0 0 0 0 85468000 0 0 0 0 47057 877 43925 423861;423862;423863 541150;541151;541152 541151 3 VINYEEFK Unmodified 1040.5179 0.51786169 4050 Q9BW30 TPPP3 Tubulin polymerization-promoting protein family member 3 yes yes 0 0 0 1 60.566 60.566 2 0.0075036 59551 QUIQUE_C1218_190116_001 97.798 70.273 593330000 593330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47058 4050 43926 423864 541153 541153 1 VIPAADLSEQISTAGTEASGTGNMK Unmodified 2447.185 0.18498318 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 104.71 104.71 2;3 1.4902E-56 106691 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.51 134.77 837670000 0 21562000 41267000 37313000 27101000 0 253360000 226270000 61467000 16359000 31516000 61108000 60343000 47059 2017 43927 423865;423866;423867;423868;423869;423870;423871;423872;423873;423874;423875;423876;423877 541154;541155;541156;541157;541158;541159;541160;541161;541162;541163;541164;541165;541166;541167;541168 541160 14 VIPAADLSEQISTAGTEASGTGNMK Oxidation (M) 2463.1799 0.1798978 2017 P11217 PYGM Glycogen phosphorylase, muscle form yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 96.832 96.832 2;3 2.8279E-21 99141 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.22 98.777 303940000 0 0 72596000 86768000 0 0 0 131270000 0 13310000 0 0 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brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase yes no 0 0 0 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 101.11 101.11 2;3 9.9436E-114 103641 QUIQUE_C1277_190116_001 266.44 246.7 8109300000 721360000 701180000 888730000 470240000 550840000 428730000 600690000 842210000 593680000 253420000 841750000 704580000 511900000 47062 2016 43928 423907;423908;423909;423910;423911;423912;423913;423914;423915;423916;423917;423918;423919;423920;423921;423922;423923;423924;423925;423926;423927;423928;423929;423930;423931;423932;423933 541201;541202;541203;541204;541205;541206;541207;541208;541209;541210;541211;541212;541213;541214;541215;541216;541217;541218;541219;541220;541221;541222;541223;541224;541225;541226;541227;541228;541229;541230;541231;541232;541233;541234;541235;541236;541237;541238;541239;541240;541241;541242 541209 41 VIPAEVKFLDTMAGR Unmodified 1645.8862 0.8861628 3426 Q6ZTR5 CXorf22 Uncharacterized protein CXorf22 yes yes 0 0 1 1 107.45 107.45 3 0.023617 112973 QUIQUE_DMIX5_190116_001 32.734 4.8723 171470000 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47074 4304 43940 424006;424007;424008;424009;424010;424011;424012;424013;424014;424015;424016;424017 541361;541362;541363;541364;541365;541366;541367;541368;541369;541370;541371;541372 541365 12 VIQATTYFLQK Unmodified 1310.7234 0.72343779 2526 P49356;B4DL54 FNTB;CHURC1-FNTB Protein farnesyltransferase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 84.092 84.092 2 0.0012231 85420 QUIQUE_C1403_190116_001 88.177 68.39 151090000 0 0 29784000 30528000 25241000 23744000 22355000 0 0 0 19437000 0 0 47075 2526 43941 424018;424019;424020;424021;424022;424023 541373;541374;541375;541376;541377;541378 541374 3 VIQCFAETGQVQK Unmodified 1506.7501 0.75006325 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 2 2 2 2 3 48.387 48.387 2;3 2.7434E-10 46320 QUIQUE_C1218_190116_001 180.67 170.75 17761000000 961660000 1361900000 1397700000 1208900000 1888400000 1022600000 1760000000 1097100000 1275800000 468250000 1785600000 1729400000 1803900000 47076 50 43942 424024;424025;424026;424027;424028;424029;424030;424031;424032;424033;424034;424035;424036;424037;424038;424039;424040;424041;424042;424043;424044 541379;541380;541381;541382;541383;541384;541385;541386;541387;541388;541389;541390;541391;541392;541393;541394;541395;541396;541397;541398;541399;541400;541401;541402;541403;541404;541405;541406;541407;541408;541409 541379 27 VIQDCEDENIQR Unmodified 1517.678 0.67802052 2678 P56199 ITGA1 Integrin alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 31.328 31.328 2 0.00015961 25871 QUIQUE_C1277_190116_001 119.68 87.36 32217000 0 32217000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47077 2678 43943 424045;424046;424047;424048;424049 541410;541411;541412;541413;541414 541410 5 VIQDSNNELLEPVCHQLFELYR Unmodified 2715.3327 0.33265047 3551 Q8IXS8;C9JNS4;C9JTA1 FAM126B Protein FAM126B yes no 0 0 0 1 1 1 140.81 140.81 3 1.8557E-08 146161 QUIQUE_C1218_190116_001 85.248 72.06 105640000 36854000 0 0 0 0 0 43073000 0 0 25710000 0 0 0 47078 3551 43944 424050;424051;424052 541415;541416;541417;541418 541415 4 VIQEIVDK Unmodified 942.5386 0.53859714 625 B4DXZ6;P51114;E7EU85;E9PFF5 FXR1 Fragile X mental retardation syndrome-related protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 33.652 33.652 2 0.028866 28276 QUIQUE_C1368_190116_001 68.383 22.031 135630000 0 28318000 43031000 0 0 0 44782000 0 0 19503000 0 0 0 47079 625 43945 424053;424054;424055;424056;424057 541419;541420;541421;541422;541423 541420 5 VIQELVDTEK Unmodified 1172.6289 0.62886871 955 E9PKT1;Q8IVF5;E9PMZ8;H7C5V6 TIAM2 T-lymphoma invasion and metastasis-inducing protein 2 yes no 0 0 0 1 51.761 51.761 2 0.064379 49544 QUIQUE_C1403_190116_001 68.371 26.869 56034000 0 0 0 56034000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47080 955 43946 424058 541424 541424 0 VIQGDGVDINTLQEIVEGMK Unmodified 2157.0987 0.098734352 2465 P43490 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes yes 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 1 2 159.84 159.84 2;3 6.927E-18 164457 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.86 137.24 2089100000 146780000 123240000 273550000 247500000 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subunit alpha-2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 80.3 80.3 3 0.003969 81118 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.565 36.312 283970000 0 0 0 0 0 0 0 98860000 37536000 0 72204000 75372000 0 47085 1701 43951 424110;424111;424112;424113 541482;541483;541484;541485;541486 541486 5 VIQIVLMR Unmodified 970.59976 0.59975761 2896 Q05655;C9JZU8;C9J9P1;C9K0E3 PRKCD Protein kinase C delta type;Protein kinase C delta type regulatory subunit;Protein kinase C delta type catalytic subunit yes no 0 0 0 1 88.779 88.779 2 0.049392 91036 QUIQUE_C1218_190116_001 74.415 35.624 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47086 2896 43952 424114 541487 541487 1 VIQLKMDFTAAR Unmodified 1391.7595 0.75950572 2977 X6R9L0;Q13217 DNAJC3 DnaJ homolog subfamily C member 3 yes no 0 0 1 1 30.174 30.174 3 0.031563 24834 QUIQUE_C1368_190116_001 45.077 37.622 54207000 0 0 54207000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47087 2977 43953 424115 541488 541488 1 VIQNIIYYK Unmodified 1152.6543 0.6542956 3782;1249 I3L213;Q93100 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta no no 0 0 0 1 1 70.729 70.729 2 0.026913 71769 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.296 40.792 62551000 0 0 0 0 0 0 0 0 34711000 0 27840000 0 0 47088 1249;3782 43954 424116;424117 541489;541490 541490 2 VIQNLANFSK Unmodified 1132.6241 0.6240581 135 A0A2R8YDS2;A0A0A0MQZ2;B7ZCA0;A0A2R8Y6T2;Q96PV0 SYNGAP1 Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP yes no 0 0 0 1 1 1 1 58.223 58.223 2 0.0021986 57033 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.265 44.271 201880000 0 89667000 0 0 0 66243000 0 45968000 0 0 0 0 0 47089 135 43955 424118;424119;424120;424121 541491;541492;541493;541494 541493 2 VIQQLEGAFALVFK Unmodified 1561.8868 0.88681473 2900 Q06210;E5RJP4;O94808 GFPT1;GFPT2 Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1;Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 156.41 156.41 2 0.00023418 159481 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.6 95.982 53302000 0 0 15562000 0 0 0 0 11518000 14100000 0 0 12122000 0 47090 2900 43956 424122;424123;424124;424125 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541549;541550;541551;541552;541553;541554;541555;541556;541557;541558;541559;541560;541561;541562;541563;541564;541565;541566;541567;541568 541559 20 VIQVAAGSSNLKR Unmodified 1341.7728 0.7728476 1875 P05091 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 1 2 1 1 2 2 3 1 3 1 3 23.905 23.905 2;3 3.8266E-23 17631 QUIQUE_C1438_190116_001 169.65 88.107 7109600000 0 138530000 0 49399000 108480000 0 227240000 1539700000 1252700000 43756000 1810900000 821250000 1117600000 47098 1875 43964 424185;424186;424187;424188;424189;424190;424191;424192;424193;424194;424195;424196;424197;424198;424199;424200;424201;424202;424203 541569;541570;541571;541572;541573;541574;541575;541576;541577;541578;541579;541580;541581;541582;541583;541584;541585;541586;541587;541588 541572 20 VIQWCTHHK Unmodified 1207.592 0.59204647 2784 P63208;E5RJR5;E7ERH2;F8W8N3;E5RGM3 SKP1 S-phase kinase-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 14.596 14.596 3 0.032937 6560 QUIQUE_DMIX4_190116_001 35.826 20.678 34837000 0 0 0 0 0 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541590;541591;541592;541593;541594;541595;541596;541597;541598;541599;541600;541601;541602;541603;541604;541605;541606;541607;541608;541609;541610;541611;541612;541613;541614;541615;541616;541617;541618;541619;541620;541621;541622;541623;541624;541625;541626;541627;541628;541629;541630;541631;541632;541633;541634;541635;541636;541637;541638;541639 541639 48 VIQYLAHVASSHK Unmodified 1451.7885 0.78849767 2379 P35580 MYH10 Myosin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 33.784 33.784 3 0.00099683 28783 QUIQUE_C1277_190116_001 58.338 45.542 502120000 33046000 73836000 0 59855000 58393000 48208000 61442000 0 103610000 0 0 63721000 0 47101 2379 43967 424241;424242;424243;424244;424245;424246;424247;424248 541640;541641;541642;541643;541644;541645;541646;541647;541648 541641 9 VIQYLAHVASSPK Unmodified 1411.7823 0.78234966 3459 Q7Z406;M0QY43;A0A2R8Y4C3 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.884 48.884 2;3 0.00073492 46913 QUIQUE_C1438_190116_001 103.21 46.65 207860000 0 0 18069000 0 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424266;424267;424268;424269;424270;424271;424272;424273;424274;424275;424276;424277;424278;424279 541669;541670;541671;541672;541673;541674;541675;541676;541677;541678;541679;541680;541681;541682 541682 14 VIRPLDQPSSFDATPYIK Unmodified 2046.0786 0.078591257 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 93.975 93.975 2;3 5.4949E-89 96240 QUIQUE_DMIX3_190116_001 212.24 166.88 6725500000 570780000 628550000 419120000 0 577570000 405360000 626460000 759120000 780900000 246350000 826120000 88430000 796730000 47105 3499 43971 424280;424281;424282;424283;424284;424285;424286;424287;424288;424289;424290;424291;424292;424293;424294;424295;424296;424297;424298;424299;424300;424301;424302 541683;541684;541685;541686;541687;541688;541689;541690;541691;541692;541693;541694;541695;541696;541697;541698;541699;541700;541701;541702;541703;541704;541705;541706;541707 541699 20 VISALAEMDSGPNK Unmodified 1430.7075 0.70752973 497 A0A3F2YNW9;A0A3B3IUA1;A0A3B3IU40;A0A3B3IT28;A0A3B3ITE5;A0A3B3ITF7;A0A3B3ITW6;Q12756;F8W8V9;H7C0K6 KIF1A Kinesin-like protein KIF1A;Kinesin-like protein yes no 0 0 0 1 71.059 71.059 2 0.016684 71180 QUIQUE_DMIX7_190116_001 64.918 45.603 39832000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39832000 0 47106 497 43972 424303 541708 541708 0 VISFEEQVASIR Unmodified 1376.73 0.72997974 824 D6RFN0;Q9BT78;D6RAX7 COPS4 COP9 signalosome complex subunit 4 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.713 98.713 2;3 0.00046016 101237 QUIQUE_C1368_190116_001 109.42 76.578 2487400000 246820000 238830000 207390000 193960000 185390000 214570000 252190000 0 194950000 91009000 236850000 207010000 218410000 47107 824 43973 424304;424305;424306;424307;424308;424309;424310;424311;424312;424313;424314;424315;424316 541709;541710;541711;541712;541713;541714;541715;541716;541717;541718;541719;541720;541721;541722;541723;541724;541725 541713 16 VISGQQLPK Unmodified 968.56548 0.56548059 2578 P51178 PLCD1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.001 25.001 2 0.021668 17313 QUIQUE_C1368_190116_001 61.999 16.281 1725600000 164510000 117810000 213860000 167660000 0 177250000 0 244500000 302270000 159710000 0 178010000 0 47108 2578 43974 424317;424318;424319;424320;424321;424322;424323;424324;424325 541726;541727;541728;541729;541730;541731;541732;541733;541734;541735;541736 541728 11 VISGVLQLGNIVFK Unmodified 1485.8919 0.89190011 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 1 1 1 142.83 142.83 2;3 1.2001E-10 149319 QUIQUE_C1438_190116_001 166.97 140.91 4144400000 241820000 317110000 380760000 388840000 565660000 212010000 289730000 218540000 327810000 152490000 468910000 316950000 263780000 47109 2378 43975 424326;424327;424328;424329;424330;424331;424332;424333;424334;424335;424336;424337;424338;424339;424340;424341 541737;541738;541739;541740;541741;541742;541743;541744;541745;541746;541747;541748;541749;541750;541751;541752;541753;541754;541755 541742 19 VISGVLQLGNIVFKK Unmodified 1613.9869 0.98686312 2378 P35579 MYH9 Myosin-9 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 119.63 119.63 3 0.00014827 123355 QUIQUE_DMIX7_190116_001 58.831 54.515 166660000 0 0 0 0 0 0 0 84579000 20468000 0 0 32625000 28987000 47110 2378 43976 424342;424343;424344;424345;424346 541756;541757;541758;541759;541760 541759 5 VISHPTLPISITAHEDR Unmodified 1885.0058 0.005760665 1556 O43815 STRN Striatin yes yes 0 0 0 1 1 1 63.667 63.667 4 0.0030342 64227 QUIQUE_C1218_190116_001 46.873 36.591 103280000 30849000 0 0 0 0 0 37053000 0 0 0 35378000 0 0 47111 1556 43977 424347;424348;424349 541761;541762;541763 541761 3 VISLEDFMEK Unmodified 1209.5951 0.59512574 4167 Q9H488 POFUT1 GDP-fucose protein O-fucosyltransferase 1 yes yes 0 0 0 1 122.54 122.54 2 0.033524 129017 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.823 41.953 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47112 4167 43978 424350 541764 541764 1 VISNEFNSR Unmodified 1064.5251 0.52507234 274 A0A0D9SG77;A0A1B0GVL3;Q05086 UBE3A Ubiquitin-protein ligase E3A yes no 0 0 0 1 1 1 29.064 29.064 2 0.0075712 24025 QUIQUE_C1218_190116_001 81.215 18.751 176070000 42993000 56700000 0 0 0 0 0 0 0 0 76376000 0 0 47113 274 43979 424351;424352;424353 541765;541766;541767;541768 541765 4 VISSGSVASYVTSPQGFQFR Unmodified 2116.0589 0.058918447 2834 P98160;A0A3B3IT11 HSPG2 Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein;Endorepellin;LG3 peptide yes no 0 0 0 1 1 1 121.15 121.15 2 1.3721E-17 123844 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.02 107.48 59245000 0 0 0 0 22590000 0 0 36655000 0 0 0 0 0 47114 2834 43980 424354;424355;424356 541769;541770;541771 541770 3 VISSVSYYTHR Unmodified 1310.6619 0.66190017 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 2 1 1 37.454 37.454 2;3 0.003942 32990 QUIQUE_DMIX7_190116_001 72.643 50.557 79318000 0 0 0 36283000 0 0 0 24854000 0 0 0 18181000 0 47115 1414;3777 43981 424357;424358;424359;424360 541772;541773;541774;541775 541775 4 VISTITNNIQQIIEIEDTFETLR Unmodified 2689.4174 0.41742595 3146 Q15582;H0Y9D7 TGFBI Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 169.9 169.9 2;3 7.4633E-63 171554 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.41 156.14 453960000 0 27012000 0 18873000 50508000 69846000 67182000 75292000 0 5690200 0 68211000 71342000 47116 3146 43982 424361;424362;424363;424364;424365;424366;424367;424368;424369;424370 541776;541777;541778;541779;541780;541781;541782;541783;541784;541785 541781 9 VISTMSVGIDHLALDEIK Unmodified 1940.0289 0.028863873 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 116.38 116.38 2;3 7.4164E-24 118702 QUIQUE_C1563_190116_001 130.39 114.87 3658000000 326780000 383490000 385950000 380980000 357580000 278930000 68253000 380690000 0 93457000 135200000 483970000 382740000 47117 4405 43983 424371;424372;424373;424374;424375;424376;424377;424378;424379;424380;424381;424382;424383;424384;424385;424386;424387;424388;424389;424390 541786;541787;541788;541789;541790;541791;541792;541793;541794;541795;541796;541797;541798;541799;541800;541801;541802;541803;541804;541805;541806;541807 541799 20 VISTMSVGIDHLALDEIK Oxidation (M) 1956.0238 0.023778495 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 1 0 1 102.93 102.93 3 0.002723 99720 QUIQUE_DMIX4_190116_001 47.082 36.22 43190000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43190000 0 0 0 47118 4405 43983 424391 541808 541808 2935 1 VISTMSVGIDHLALDEIKK Unmodified 2068.1238 0.12382689 4405 Q9UBQ7;U3KQ56 GRHPR Glyoxylate reductase/hydroxypyruvate reductase yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 97.287 97.287 3;4 1.2544E-05 100001 QUIQUE_C1277_190116_001 89.049 78.71 1016200000 50791000 81263000 113450000 91357000 55127000 57916000 76296000 71073000 72920000 0 170250000 76765000 98947000 47119 4405 43984 424392;424393;424394;424395;424396;424397;424398;424399;424400;424401;424402;424403;424404;424405;424406 541809;541810;541811;541812;541813;541814;541815;541816;541817;541818;541819;541820;541821;541822;541823;541824;541825;541826;541827;541828 541810 20 VISTTDAER Unmodified 990.49819 0.49818889 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27;H0Y8I3;H0Y987 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 16.52 16.52 2 0.013518 8898 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.825 18.037 359310000 0 39427000 0 25253000 0 44933000 0 0 46480000 126910000 0 76314000 0 47120 1728 43985 424407;424408;424409;424410;424411;424412 541829;541830;541831;541832;541833;541834;541835 541833 5 VISYEEGK Unmodified 923.46001 0.46001246 3133 Q15382;C9J931 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 0 0 1 1 20.978 20.978 2 0.019453 13795 QUIQUE_DMIX4_190116_001 78.324 46.369 199900000 0 0 0 0 0 0 0 142160000 0 57745000 0 0 0 47121 3133 43986 424413;424414 541836;541837 541837 2 VISYGDDYADLPEYFK Unmodified 1893.8673 0.86726108 962 E9PMJ2;J3KP39;Q9BPY3;G3V179 FAM118B Protein FAM118B yes no 0 0 0 1 1 1 133.86 133.86 2 0.0015782 136504 QUIQUE_C1563_190116_001 75.78 61.874 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47122 962 43987 424415;424416;424417 541838;541839;541840 541839 3 VITEYLNAQESAK Unmodified 1464.746 0.74602373 3432 Q7KZF4 SND1 Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 64.34 64.34 2 9.1697E-05 64122 QUIQUE_C1218_190116_001 132.85 76.941 70860000 0 0 0 0 0 0 0 70860000 0 0 0 0 0 47123 3432 43988 424418;424419 541841;541842 541841 2 VITFIDLAGHEK Unmodified 1341.7293 0.72925145 1382 O00178 GTPBP1 GTP-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.484 84.484 3 0.0025659 86999 QUIQUE_C1438_190116_001 62.088 54.409 406150000 30257000 35071000 41042000 37944000 39002000 31795000 39936000 28072000 34580000 0 36003000 27901000 24545000 47124 1382 43989 424420;424421;424422;424423;424424;424425;424426;424427;424428;424429;424430;424431 541843;541844;541845;541846;541847;541848;541849;541850;541851;541852;541853;541854 541847 12 VITIANR Unmodified 785.47594 0.4759373 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 23.208 23.208 2 0.0058587 16794 QUIQUE_C1438_190116_001 159.75 25.762 3428400000 0 720710000 0 0 246020000 541190000 0 0 524940000 256710000 103440000 700950000 334460000 47125 3984 43990 424432;424433;424434;424435;424436;424437;424438;424439 541855;541856;541857;541858;541859;541860;541861;541862;541863 541856 6 VITIMQNPR Unmodified 1070.5906 0.59064948 2746 P62269 RPS18 40S ribosomal protein S18 yes yes 0 0 0 1 47.949 47.949 2 0.039138 45347 QUIQUE_C1218_190116_001 53.754 25.536 19285000 19285000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47126 2746 43991 424440 541864 541864 1 VITMFVQR Oxidation (M) 1008.5426 0.54263666 2051 P13010;C9JZ81;H7C0H9 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 43.913 43.913 2 0.0073101 41603 QUIQUE_DMIX1_190116_001 102.77 76.171 386270000 44014000 0 0 0 33116000 0 32608000 37030000 44420000 0 60200000 72549000 62331000 47127 2051 43992 424441;424442;424443;424444;424445;424446;424447;424448 541865;541866;541867;541868;541869;541870;541871;541872;541873;541874;541875 541869 1371 11 VITMFVQR Unmodified 992.54772 0.54772204 2051 P13010;C9JZ81;H7C0H9 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.905 65.905 2 0.0018988 62910 QUIQUE_DMIX4_190116_001 138.85 116.36 1754900000 200610000 211590000 221870000 168620000 203860000 150310000 168200000 117230000 118760000 48248000 0 145560000 0 47128 2051 43992 424449;424450;424451;424452;424453;424454;424455;424456;424457;424458;424459 541876;541877;541878;541879;541880;541881;541882;541883;541884;541885;541886;541887;541888;541889;541890;541891 541889 15 VITTDALHSLQSGSK Unmodified 1555.8206 0.82058566 1237 H7C4U7;H7C535;Q96QZ7 MAGI1 Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 57.823 57.823 3 0.0030179 56567 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.69 42.307 90223000 18438000 0 14848000 0 0 0 0 20163000 16924000 0 0 19850000 0 47129 1237 43993 424460;424461;424462;424463;424464 541892;541893;541894;541895;541896 541894 4 VITTHTSGWDSSPGAGFQVPEVR Unmodified 2427.1819 0.18188713 4197 Q9H9H5;A0A1W2PP11 MAP6D1 MAP6 domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.4 95.4 3 1.9683E-07 97766 QUIQUE_C1277_190116_001 74.742 66.033 377520000 0 43614000 0 42642000 0 21815000 48160000 53867000 0 19675000 50579000 38028000 59137000 47130 4197 43994 424465;424466;424467;424468;424469;424470;424471;424472;424473 541897;541898;541899;541900;541901;541902;541903;541904;541905;541906;541907;541908 541897 10 VITVDGNICTGK Unmodified 1275.6493 0.64928657 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;C9J6X0;Q8N1B9 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 49.346 49.346 2 5.2876E-05 45026 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.97 81.62 1667800000 0 180920000 169670000 153620000 144870000 146680000 136930000 136150000 121900000 103670000 127180000 0 246230000 47131 64 43995 424474;424475;424476;424477;424478;424479;424480;424481;424482;424483;424484;424485;424486;424487;424488 541909;541910;541911;541912;541913;541914;541915;541916;541917;541918;541919;541920;541921;541922;541923;541924;541925;541926;541927;541928;541929 541924 20 VITWTTEPK Unmodified 1073.5757 0.57571092 310;830 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;H7C4I5;E3W994;J3KR49;O75122 CLASP2 CLIP-associating protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 51.49 51.49 2 0.019682 49706 QUIQUE_C1403_190116_001 75.696 39.189 195160000 0 0 0 63849000 81475000 0 0 0 0 0 0 0 49833000 47132 310;830 43996 424489;424490;424491 541930;541931;541932 541930 3 VIVDANNLTVEIENELNIIHK Unmodified 2389.2853 0.28528957 883 E7EVX8;Q8WWY3;E7EU94;E7ESX0;E7EN72 PRPF31 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.7 155.7 3 4.8307E-06 161493 QUIQUE_C1218_190116_001 74.364 66.372 655250000 46800000 37295000 114980000 67808000 55824000 0 0 52522000 108780000 0 72364000 98878000 0 47133 883 43997 424492;424493;424494;424495;424496;424497;424498;424499;424500 541933;541934;541935;541936;541937;541938;541939;541940;541941;541942 541933 10 VIVDFSSPNIAK Unmodified 1288.7027 0.70270235 2638 P54136 RARS Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.202 84.202 2 0.00074036 86897 QUIQUE_C1218_190116_001 89.047 44.67 732130000 64969000 44921000 54099000 67178000 63031000 48090000 50335000 46634000 54616000 24355000 84785000 60705000 68410000 47134 2638 43998 424501;424502;424503;424504;424505;424506;424507;424508;424509;424510;424511;424512;424513 541943;541944;541945;541946;541947;541948;541949;541950;541951;541952;541953;541954;541955;541956 541943 14 VIVDKYRDGTK Unmodified 1292.7089 0.70885036 1969 P09543;K7ERC4;C9K0L8;K7ERZ0;K7EN66 CNP 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase yes no 0 0 2 1 14.876 14.876 3 0.025778 7147 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.557 29.266 220890000 0 0 0 0 0 0 0 220890000 0 0 0 0 0 47135 1969 43999 424514 541957 541957 1 VIVGGVDLLAK Unmodified 1082.6699 0.66994566 88 J3KPF9;A0A087X011;E9PES4;Q9Y496;H7C2F6 KIF3A Kinesin-like protein;Kinesin-like protein KIF3A yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 93.195 93.195 2 0.0098689 93964 QUIQUE_C1563_190116_001 62.823 31.401 187560000 32434000 20006000 21204000 23234000 18294000 23075000 19005000 0 19764000 10549000 0 0 0 47136 88 44000 424515;424516;424517;424518;424519;424520;424521;424522;424523;424524 541958;541959;541960;541961;541962;541963;541964;541965;541966;541967;541968 541965 10 VIVLSGLCSNDCPR Unmodified 1588.7701 0.77014677 991 F5GXC5;Q8TB96;H3BUJ1 ITFG1 T-cell immunomodulatory protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 80.819 80.819 2 0.0044345 82321 QUIQUE_C1277_190116_001 80.979 68.766 205040000 0 56759000 65743000 0 59698000 0 0 0 0 0 0 22836000 0 47137 991 44001 424525;424526;424527;424528 541969;541970;541971;541972 541969 3 VIVLWTANTER Unmodified 1300.7139 0.71393574 4245 Q9NPH2;J3KRH4 ISYNA1 Inositol-3-phosphate synthase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 87.411 87.411 2 0.00012979 89076 QUIQUE_C1403_190116_001 152.34 122.53 1021500000 103490000 73479000 85844000 109350000 105700000 96012000 108370000 55594000 80275000 0 52001000 73469000 77892000 47138 4245 44002 424529;424530;424531;424532;424533;424534;424535;424536;424537;424538;424539;424540;424541 541973;541974;541975;541976;541977;541978;541979;541980;541981;541982;541983;541984;541985;541986 541976 13 VIVNSLK Unmodified 771.48544 0.48543935 341 E7EMM4;A0A1B0GW68;A0A1B0GUA4;A0A1B0GTM3;A0A1B0GTZ5;Q13510;A0A1B0GUE3;A0A1B0GUW4;A0A1B0GTP7;A0A1B0GUB3;A0A1B0GVG2;A0A1B0GW48;A0A1B0GVJ1;A0A1B0GVE7;A0A1B0GU62;A0A1B0GU06;A0A1B0GUJ3;A0A1B0GVA3;A0A1B0GW66 ASAH1 Acid ceramidase;Acid ceramidase subunit alpha;Acid ceramidase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 24.05 24.05 2 0.040989 17955 QUIQUE_C1218_190116_001 82.386 16.248 1403300000 221490000 223260000 0 0 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424566;424567;424568;424569;424570;424571;424572;424573;424574 542025;542026;542027;542028;542029;542030;542031;542032;542033;542034 542032 10 VIVWDSFTTNK Unmodified 1308.6714 0.67140222 1444;1173 H0YNW7;Q96F32;O14775 GNB5 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-5 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.292 99.292 2 0.0014325 102089 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.06 90.162 1013900000 115870000 117050000 107610000 99366000 0 0 109360000 87957000 96767000 37934000 0 123700000 118300000 47145 1173;1444 44009 424575;424576;424577;424578;424579;424580;424581;424582;424583;424584 542035;542036;542037;542038;542039;542040;542041;542042;542043;542044;542045 542042 8 VIWAYHHEDAGEAGPK Unmodified 1778.8376 0.8376327 3405 Q6UVY6 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 2 1 36.982 36.982 3;4 0.0003947 32928 QUIQUE_DMIX3_190116_001 51.265 39.622 292220000 0 0 66765000 41161000 0 0 0 0 145130000 0 0 39165000 0 47146 3405 44010 424585;424586;424587;424588;424589 542046;542047;542048;542049;542050;542051 542050 6 VIWTAGDVQK Unmodified 1115.5975 0.597509 3750 Q92696;H0YLH3 RABGGTA Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 53.855 53.855 2 0.010372 49324 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.178 56.157 298160000 0 0 0 0 197450000 0 0 44109000 0 56594000 0 0 0 47147 3750 44011 424590;424591;424592;424593;424594;424595 542052;542053;542054;542055;542056;542057 542057 5 VIYPAVEGR Unmodified 1002.5498 0.54983053 2183 P21589 NT5E 5'-nucleotidase yes yes 0 0 0 1 1 42.722 42.722 2 0.026913 39699 QUIQUE_C1218_190116_001 58.23 18.567 46975000 27518000 19457000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47148 2183 44012 424596;424597 542058;542059 542058 2 VIYPTDSR Unmodified 949.4869 0.48689592 3535 Q8IWA5;K7ER17 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 26.634 26.634 2 0.018262 20682 QUIQUE_C1368_190116_001 80.229 41.011 2468800000 0 297220000 342820000 0 0 287260000 384970000 0 336150000 0 306350000 237630000 276450000 47149 3535 44013 424598;424599;424600;424601;424602;424603;424604;424605 542060;542061;542062;542063;542064;542065;542066;542067 542061 6 VIYVLPMLTIK Unmodified 1288.7829 0.78286693 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 141.49 141.49 2 0.028915 146005 QUIQUE_C1403_190116_001 66.962 57.275 150840000 0 27521000 35294000 41852000 0 0 0 0 0 0 0 23721000 22452000 47150 4389 44014 424606;424607;424608;424609;424610 542068;542069;542070;542071;542072 542070 5 VIYVLPMLTIK Oxidation (M) 1304.7778 0.77778155 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 1 0 1 125.13 125.13 2 0.050258 121740 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.973 42.193 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47151 4389 44014 424611 542073 542073 1 VKAEEDKIPLLVVGNK Unmodified 1751.0193 0.019285464 2019 P11234;C9J6B1;C9JQB3 RALB Ras-related protein Ral-B yes no 0 0 2 1 1 63.208 63.208 3 0.019706 62403 QUIQUE_C1368_190116_001 40.857 36.755 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47152 2019 44015 424612;424613 542074;542075 542075 2 VKAEMETLVR Unmodified 1174.638 0.63799361 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 33.096 33.096 3 0.011098 28707 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.237 37.608 382390000 0 0 40919000 0 0 0 0 0 61366000 0 170280000 109830000 0 47153 3984 44016 424614;424615;424616;424617 542076;542077;542078;542079 542077 2 VKAEVQNLGGELVVSGVDSAMSLIQAAK Unmodified 2812.5004 0.50044408 2369 P35221 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 165.14 165.14 3 4.8462E-15 167469 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.733 73.858 249010000 0 0 0 0 0 0 0 58763000 46646000 0 39317000 29612000 74676000 47154 2369 44017 424618;424619;424620;424621;424622 542080;542081;542082;542083;542084;542085 542081 6 VKDALEFWLQAGVDGFQVR Unmodified 2177.1269 0.12693843 997 F5GZS6;J3KPF3;P08195 SLC3A2 4F2 cell-surface antigen heavy chain yes no 0 0 1 1 1 1 1 156.96 156.96 3 0.00053229 161648 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.249 56.627 258340000 0 0 0 0 0 0 0 48183000 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Unmodified 1572.8148 0.814772 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 2 1 1 34.829 34.829 2;3 2.5089E-08 29054 QUIQUE_DMIX5_190116_001 159.64 118.35 79769000 0 0 0 0 0 0 0 79769000 0 0 0 0 0 47158 3053 44021 424645;424646 542113;542114 542114 1 VKDEFSVDK Unmodified 1065.5342 0.53424004 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.424 20.424 3 0.015948 13834 QUIQUE_C1218_190116_001 53.567 23.8 2115600000 397360000 243330000 289890000 268050000 229660000 431550000 158100000 0 0 0 0 0 97657000 47159 2009 44022 424647;424648;424649;424650;424651;424652;424653;424654 542115;542116;542117;542118;542119;542120;542121;542122 542115 6 VKDEFSVDKEASAHISGDK Unmodified 2061.0015 0.0014631481 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 2 1 3 2 1 2 1 4 1 1 1 35.137 35.137 2;3;4;5 5.3342E-62 30003 QUIQUE_DMIX5_190116_001 223.06 201.5 1831500000 108880000 113010000 0 190190000 164090000 120750000 119880000 659510000 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Microtubule-associated protein 6 yes yes 0 0 2 1 34.7 34.7 3 0.0047957 29729 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.327 43.835 48598000 0 0 0 0 0 0 0 48598000 0 0 0 0 0 47169 3889 44032 424736 542220 542220 1 VKDSDDVPMVLVGNK Unmodified 1614.8287 0.8287075 1808;1807 P01112;P01111 HRAS;NRAS GTPase HRas;GTPase HRas, N-terminally processed;GTPase NRas no no 0 0 1 1 2 1 1 1 64.275 64.275 2;3 2.0827E-13 63103 QUIQUE_C1277_190116_001 140.01 116.16 58668000 23682000 34986000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47170 1808;1807 44033 424737;424738;424739;424740;424741;424742 542221;542222;542223;542224;542225;542226 542222 6 VKDSEDVPMVLVGNK Unmodified 1628.8444 0.84435757 1809 P01116 KRAS GTPase KRas;GTPase KRas, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 63.782 63.782 2;3 2.1555E-23 62465 QUIQUE_C1563_190116_001 156 125.44 337230000 0 0 43515000 56506000 44926000 42935000 48885000 0 35429000 0 35944000 29093000 0 47171 1809 44034 424743;424744;424745;424746;424747;424748;424749;424750;424751;424752;424753;424754 542227;542228;542229;542230;542231;542232;542233;542234;542235;542236;542237;542238;542239 542234 12 VKDTDDVPMILVGNK Unmodified 1642.86 0.86000763 2719 P61224;E7ESV4;F5H7Y6;F5GX62;A6NIZ1;F5H6R7;F5H004;F5H823;B7ZB78;F5GZG1 RAP1B Ras-related protein Rap-1b;Ras-related protein Rap-1b-like protein yes no 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 1 1 75.731 75.731 2;3 3.4868E-23 76140 QUIQUE_C1368_190116_001 154.28 120.39 1897700000 114940000 134690000 393150000 394910000 90004000 89600000 275410000 0 114060000 0 129430000 61833000 99624000 47172 2719 44035 424755;424756;424757;424758;424759;424760;424761;424762;424763;424764;424765;424766;424767;424768 542240;542241;542242;542243;542244;542245;542246;542247;542248;542249;542250;542251;542252;542253;542254 542243 14 VKDTEDVPMILVGNK Unmodified 1656.8757 0.87565769 2765 P62834;A0A075B6Q0 RAP1A Ras-related protein Rap-1A yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 1 75.522 75.522 2;3 2.6571E-12 77443 QUIQUE_C1218_190116_001 137.88 113.02 2852100000 207460000 244140000 391310000 288700000 232410000 223120000 296490000 190430000 194750000 55052000 264500000 94256000 169440000 47173 2765 44036 424769;424770;424771;424772;424773;424774;424775;424776;424777;424778;424779;424780;424781;424782;424783;424784;424785;424786;424787;424788;424789;424790;424791 542255;542256;542257;542258;542259;542260;542261;542262;542263;542264;542265;542266;542267;542268;542269;542270;542271;542272;542273;542274;542275;542276;542277;542278;542279;542280 542256 25 VKDTFNGNLPFLFK Unmodified 1638.877 0.87697832 2365 P34949;H3BPB8;F5GX71;H3BMZ9;H3BPP3;H3BP57;H3BUZ9;H3BT48;H3BPM5;H3BNY8;H3BQX0;H3BT46;H3BPU7;H3BN01;B4DYB8 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 1 113.77 113.77 2;3 0.0011362 116851 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.29 63.937 916030000 0 0 37837000 34862000 46442000 18594000 37301000 180620000 174620000 25510000 212850000 42691000 104700000 47174 2365 44037 424792;424793;424794;424795;424796;424797;424798;424799;424800;424801;424802;424803;424804;424805 542281;542282;542283;542284;542285;542286;542287;542288;542289;542290;542291;542292;542293;542294;542295 542287 12 VKEDENVPFLLVGNK Unmodified 1699.9145 0.91448604 2018 P11233;H7C3P7 RALA Ras-related protein Ral-A yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 88.141 88.141 2;3 2.7036E-43 90007 QUIQUE_C1277_190116_001 219.42 178.25 4417200000 352670000 383970000 435670000 334670000 292640000 294180000 381650000 352920000 341510000 152700000 430680000 293190000 370690000 47175 2018 44038 424806;424807;424808;424809;424810;424811;424812;424813;424814;424815;424816;424817;424818;424819;424820;424821;424822;424823;424824;424825;424826;424827;424828;424829;424830;424831;424832 542296;542297;542298;542299;542300;542301;542302;542303;542304;542305;542306;542307;542308;542309;542310;542311;542312;542313;542314;542315;542316;542317;542318;542319;542320;542321;542322;542323;542324;542325;542326;542327;542328 542300 32 VKEEESLENISSVK Unmodified 1589.8148 0.81483158 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 45.254 45.254 2 0.029499 42559 QUIQUE_C1576_190116_001 65.329 27.738 38046000 0 0 0 0 0 0 38046000 0 0 0 0 0 0 47176 3102 44039 424833 542329 542329 1 VKEEIIDAIR Unmodified 1184.6765 0.6764876 4441 Q9UI08;H0YJN0 EVL Ena/VASP-like protein yes no 0 0 1 1 50.028 50.028 2 0.05633 48519 QUIQUE_DMIX5_190116_001 71.451 46.675 29360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29360000 0 0 47177 4441 44040 424834 542330 542330 1 VKEEIIEAFVQELR Unmodified 1701.9301 0.93013611 2568 P50552 VASP Vasodilator-stimulated phosphoprotein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 135.47 135.47 3 0.00075752 141015 QUIQUE_C1218_190116_001 78.191 61.05 192710000 29723000 28828000 0 44088000 0 32808000 0 0 0 19500000 0 0 37763000 47178 2568 44041 424835;424836;424837;424838;424839;424840 542331;542332;542333;542334;542335;542336 542331 5 VKEENPEIAVSASTIPEQIQSLSVHDSQGPPNANEDYR Unmodified 4147.9934 0.99342424 4417 Q9UEW8 STK39 STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase yes yes 0 0 1 1 114.49 114.49 4 6.5779E-16 118254 QUIQUE_C1277_190116_001 68.101 63.479 55139000 0 55139000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47179 4417 44042 424841 542337 542337 1 VKEESQLPGTGGPEDVLQPVQR Unmodified 2362.2129 0.21285291 2880 Q02952 AKAP12 A-kinase anchor protein 12 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.641 77.641 3 0.00016421 79048 QUIQUE_C1218_190116_001 55.128 47.734 692670000 70096000 80390000 0 71569000 0 85868000 0 103020000 0 26487000 0 100400000 154830000 47180 2880 44043 424842;424843;424844;424845;424846;424847;424848;424849;424850;424851 542338;542339;542340;542341;542342;542343;542344;542345;542346;542347 542338 8 VKEESSYILESNR Unmodified 1552.7733 0.77330111 3433 Q7L099 RUFY3 Protein RUFY3 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 34.009 34.009 2;3 1.7749E-12 28480 QUIQUE_C1368_190116_001 180.18 153.07 830290000 0 0 56876000 174370000 0 84948000 88944000 144830000 57080000 0 76008000 44458000 102770000 47181 3433 44044 424852;424853;424854;424855;424856;424857;424858;424859;424860;424861;424862;424863;424864 542348;542349;542350;542351;542352;542353;542354;542355;542356;542357;542358;542359;542360;542361 542349 14 VKEFCENLSADCR Unmodified 1626.713 0.71302582 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 39.239 39.239 2;3 0.0024034 35657 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.61 101.55 821380000 43910000 71031000 165380000 64565000 61198000 33419000 0 56559000 75038000 0 77437000 60278000 112560000 47182 2309 44045 424865;424866;424867;424868;424869;424870;424871;424872;424873;424874;424875;424876 542362;542363;542364;542365;542366;542367;542368;542369;542370;542371;542372;542373;542374 542370 13 VKEFGIDPQNMFEFWDWVGGR Unmodified 2556.1896 0.18961504 199;790 A0A0A0MTS2;A0A2U3TZU2;P06744;K7EQ48;CON__Q3ZBD7 GPI Glucose-6-phosphate isomerase no no 0 0 1 1 1 1 1 168.32 168.32 2;3 1.5114E-10 175692 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.5 102.02 510990000 0 0 0 0 0 0 0 50980000 158570000 0 31029000 270410000 0 + 47183 199;790 44046 424877;424878;424879;424880 542375;542376;542377;542378 542377 3 VKEGMNIVEAMER Oxidation (M) 1520.7327 0.73269863 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 1 1 1 2 3 4 4 4 3 42.392 42.392 2;3 1.445E-06 45292 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.79 104.78 5046300000 29378000 0 0 0 0 0 209250000 684790000 1015700000 0 1425200000 1008100000 673890000 47184 2772 44047 424881;424882;424883;424884;424885;424886;424887;424888;424889;424890;424891;424892;424893;424894;424895;424896;424897;424898;424899;424900;424901 542379;542380;542381;542382;542383;542384;542385;542386;542387;542388;542389;542390;542391;542392;542393;542394;542395;542396;542397;542398;542399;542400;542401;542402;542403 542394 2203;2204 22 VKEGMNIVEAMER Unmodified 1504.7378 0.737784 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 2 3 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 68.424 68.424 2;3 5.9026E-09 68501 QUIQUE_DMIX7_190116_001 142.07 113.34 11285000000 159770000 652710000 497240000 454750000 526620000 257360000 513810000 1584800000 1609600000 42299000 1765400000 1482000000 1739000000 47185 2772 44047 424902;424903;424904;424905;424906;424907;424908;424909;424910;424911;424912;424913;424914;424915;424916;424917;424918;424919;424920;424921;424922;424923;424924;424925;424926;424927 542404;542405;542406;542407;542408;542409;542410;542411;542412;542413;542414;542415;542416;542417;542418;542419;542420;542421;542422;542423;542424;542425;542426;542427;542428;542429;542430;542431;542432;542433;542434;542435;542436;542437;542438;542439;542440;542441;542442;542443;542444;542445 542441 42 VKEGMNIVEAMER 2 Oxidation (M) 1536.7276 0.72761325 2772 P62937 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed yes yes 0 2 1 1 20.746 20.746 2 0.026176 13846 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.469 63.837 205610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 205610000 0 0 47186 2772 44047 424928 542446 542446 2203;2204 1 VKEHINSVSAMK Unmodified 1341.7075 0.70747015 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 13.425 13.425 3 0.00032002 5234 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102.62 77.184 201910000 0 0 0 0 0 0 16524000 63714000 26693000 0 11390000 36117000 47470000 47187 3053 44048 424929;424930;424931;424932;424933;424934;424935 542447;542448;542449;542450;542451;542452;542453 542453 7 VKELEEQLENETLHK Unmodified 1837.9422 0.94215736 515 A0MZ66 KIAA1598 Shootin-1 yes yes 0 0 1 1 54.577 54.577 2 2.9015E-09 53707 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.1 99.548 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47188 515 44049 424936 542454 542454 1 VKELLTLIR Unmodified 1083.7016 0.70158014 3107 Q15067;K7ESC7;K7ENF1 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 68.744 68.744 3 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542462;542463;542464;542465;542466;542467;542468;542469;542470;542471;542472;542473;542474;542475;542476;542477;542478;542479 542475 11 VKETELELKEK Unmodified 1344.75 0.75004648 3739;535 A6NFQ9;F8W8I8;A0A087X142;Q92599;A6NMH6 SEPT8 Septin-8 no no 0 0 2 1 1 18.298 18.298 3 0.0017359 11276 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.88 66.899 534130000 0 0 0 0 0 0 0 363020000 171120000 0 0 0 0 47192 535;3739 44053 424961;424962 542480;542481 542480 1 VKETQEDKLEGGAAK Unmodified 1601.8261 0.82606496 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 2 3 2 3 3 1 3 3 2 1 4 2 10.513 10.513 2;3;4 1.2847E-205 2828 QUIQUE_DMIX7_190116_001 276.97 194.23 5139700000 183180000 0 147930000 786230000 342840000 0 23193000 790420000 1127900000 151950000 21121000 1366800000 198160000 47193 933;1529 44054 424963;424964;424965;424966;424967;424968;424969;424970;424971;424972;424973;424974;424975;424976;424977;424978;424979;424980;424981;424982;424983;424984;424985;424986;424987;424988;424989 542482;542483;542484;542485;542486;542487;542488;542489;542490;542491;542492;542493;542494;542495;542496;542497;542498;542499;542500;542501;542502;542503;542504;542505;542506;542507;542508 542504 25 VKEVLLDEDDDLWIALR Unmodified 2041.0732 0.073171528 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 1 1 2 3 4 1 139 139 2;3 6.847E-07 142537 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.53 102.45 471160000 0 34923000 0 0 0 0 0 20455000 0 0 181350000 179540000 54889000 47194 273;342 44055 424990;424991;424992;424993;424994;424995;424996;424997;424998;424999;425000 542509;542510;542511;542512;542513;542514;542515;542516;542517;542518;542519;542520 542519 10 VKEYQVETIVDTLCTNMLSDKEQLR Unmodified 3011.4944 0.49437242 3499 Q86VP6 CAND1 Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 yes yes 0 0 2 2 1 1 1 135.42 135.42 3 2.1427E-77 138731 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167 149.09 305080000 0 0 0 0 0 0 0 63706000 53818000 0 90946000 96611000 0 47195 3499 44056 425001;425002;425003;425004;425005 542521;542522;542523;542524;542525;542526 542522 4 VKGDMDVSVPK Unmodified 1173.6064 0.60635913 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 28.058 28.058 2 0.0079725 22288 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.24 71.464 49707000 0 0 0 0 0 0 0 49707000 0 0 0 0 0 47196 2935 44057 425006 542527 542527 1 VKGDVDISLPK Unmodified 1169.6656 0.66558856 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 45.858 45.858 2 0.0027093 42633 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.91 10.392 47994000 0 0 0 0 0 0 0 47994000 0 0 0 0 0 47197 2935 44058 425007 542528 542528 1 VKGDVDVSLPK Unmodified 1155.6499 0.6499385 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 35.081 35.081 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yes 0 0 1 1 43.75 43.75 3 0.0055771 40635 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.409 46.378 39975000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 39975000 0 47201 3163 44062 425022 542543 542543 1 VKIPEGTILTMDMLTVK Unmodified 1888.0413 0.041342814 4263 Q9NR45 NANS Sialic acid synthase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 127.18 127.18 3 0.00039705 130148 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.983 62.463 469410000 15748000 21429000 19110000 19526000 32819000 0 29346000 85035000 67037000 0 96538000 0 82820000 47202 4263 44063 425023;425024;425025;425026;425027;425028;425029;425030;425031;425032 542544;542545;542546;542547;542548;542549;542550;542551;542552;542553;542554;542555;542556 542553 12 VKLDHDGAILDVDEDDVEK Unmodified 2124.0223 0.02225817 271 A0A0D9SFK2;Q92614;H0YEV9 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 1 1 72.063 72.063 3 0.017212 73173 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.985 20.731 114170000 0 0 0 34432000 0 0 0 0 23129000 0 56606000 0 0 47203 271 44064 425033;425034;425035 542557;542558;542559 542559 2 VKLEEQLKETVEK Unmodified 1571.877 0.8770379 4209 Q9HAV7 GRPEL1 GrpE protein homolog 1, mitochondrial yes yes 0 0 2 1 46.906 46.906 3 0.03534 43878 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.482 31.386 24769000 0 0 0 0 0 0 0 24769000 0 0 0 0 0 47204 4209 44065 425036 542560 542560 1 VKLERPVIYIDQTR Unmodified 1728.9887 0.98865404 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 56.715 56.715 3 0.0002223 55801 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.37 106.11 2159900000 0 0 0 0 0 0 0 462660000 406010000 0 494420000 343700000 453150000 47205 2261 44066 425037;425038;425039;425040;425041 542561;542562;542563;542564;542565 542562 1 VKPAPDETSFSEALLK Unmodified 1730.9091 0.90906631 626 B4DY09;Q12905;X6R6Z1;A0A0A0MRL0 ILF2 Interleukin enhancer-binding factor 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 79.468 79.468 2;3 0.00035845 80600 QUIQUE_C1277_190116_001 54.953 46.13 1372300000 318880000 300400000 0 0 0 213280000 0 154850000 210560000 87580000 86744000 0 0 47206 626 44067 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542576;542577;542578;542579;542580;542581;542582;542583;542584;542585;542586;542587;542588;542589;542590;542591;542592;542593;542594;542595;542596;542597;542598 542595 18 VKPFMTGAAEQIK Oxidation (M) 1434.7541 0.754086 214 Q5W0H4;A0A0B4J2C3;P13693;J3KPG2;E9PJF7;Q56UQ5 TPT1 Translationally-controlled tumor protein;TPT1-like protein yes no 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 31.094 31.094 2;3 0.0047721 25636 QUIQUE_C1277_190116_001 98.156 63.77 2179600000 160300000 269590000 178730000 0 153320000 0 0 127330000 374980000 195700000 362370000 357250000 0 47209 214 44069 425070;425071;425072;425073;425074;425075;425076;425077;425078;425079 542599;542600;542601;542602;542603;542604;542605;542606;542607;542608 542600 130 2 VKPLLQVTR Unmodified 1052.6706 0.67061436 2379;3459;2385 P35749;Q7Z406;M0QY43;P35580 MYH11;MYH14;MYH10 Myosin-11;Myosin-14;Myosin-10 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 29.738 29.738 3 0.00053158 24017 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.048 74.62 1209700000 171740000 0 0 221690000 0 173820000 0 114620000 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542656 2919 3 VKPWNYTYDPK Unmodified 1409.698 0.69795133 2489 P46976;C9JQ42 GYG1 Glycogenin-1 yes no 0 0 1 1 1 50.705 50.705 3 0.018348 48177 QUIQUE_C1403_190116_001 43.544 32.899 470070000 0 220430000 0 249630000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47215 2489 44074 425126;425127 542659;542660 542660 2 VKQQFMTTQDASK Oxidation (M) 1526.7399 0.73989249 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 1 1 1 12.514 12.514 3 0.052796 4671 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.785 33.788 14364000 0 0 0 0 0 0 0 14364000 0 0 0 0 0 47216 1678 44075 425128 542661 542661 917 1 VKSLQAVITNLTQGEEYLFR Unmodified 2308.2427 0.24269647 200 A0A0A0MTS7;A0A0A0MRA3;Q8WZ42 TTN Titin yes no 0 0 1 1 112.59 112.59 4 0.064748 114631 QUIQUE_C1563_190116_001 22.985 2.5959 25462000 0 0 0 0 0 25462000 0 0 0 0 0 0 0 47217 200 44076 425129 542662 542662 1 VKTDRPLPENPYHSR Unmodified 1807.9329 0.93293007 2600 P51970 NDUFA8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8 yes yes 0 0 2 1 19.562 19.562 3 0.022019 12328 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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protein A 70 kDa DNA-binding subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 17.627 17.627 2;3 0.006546 10186 QUIQUE_C1438_190116_001 91.658 79.611 321530000 30281000 16774000 20909000 0 113830000 0 0 22587000 31846000 0 39923000 20332000 25045000 47224 2265 44083 425198;425199;425200;425201;425202;425203;425204;425205;425206;425207 542767;542768;542769;542770;542771;542772;542773;542774;542775;542776 542771 8 VKVPLQDLMVR Unmodified 1296.7588 0.75877744 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 1 1 1 1 81.715 81.715 3 0.0069111 83119 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.611 69.895 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47225 1 44084 425208;425209;425210 542777;542778;542779 542779 3 VKWDAVPGASGYLILYAPLTEGLAGDEK Unmodified 2932.5222 0.52222538 2897 Q05707;J3QT83;Q4G0W3;H0YBB2 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 1 1 156.99 156.99 3 0.009275 161948 QUIQUE_DMIX8_190116_001 28.567 22.407 28128000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 28128000 47226 2897 44085 425211 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Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase;Fructose-bisphosphate aldolase B;Fructose-bisphosphate aldolase C no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 27.587 27.587 2 0.037484 22099 QUIQUE_DMIX5_190116_001 85.306 10.475 72256000000 0 8440700000 6647300000 6564400000 6266600000 6344300000 5829700000 0 7146200000 4650100000 7930800000 7118600000 5317000000 47233 1851;1978 44092 425256;425257;425258;425259;425260;425261;425262;425263;425264;425265;425266 542854;542855;542856;542857;542858;542859;542860;542861;542862;542863;542864;542865;542866;542867;542868;542869;542870;542871;542872;542873;542874;542875;542876;542877;542878;542879;542880;542881;542882 542877 29 VLACGGDGTVGWVLDCIEK Unmodified 2047.9707 0.97069707 636 B5MCD5;B5MBY2;Q9Y6T7 DGKB Diacylglycerol kinase;Diacylglycerol kinase beta yes no 0 0 0 1 1 148.38 148.38 3 0.017109 153703 QUIQUE_C1368_190116_001 24.3 15.986 29912000 0 0 11708000 18204000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47234 636 44093 425267;425268 542883;542884 542883 2 VLADLGVTPDK Unmodified 1126.6234 0.6233894 2868 Q02156;E9PBI2 PRKCE Protein kinase C epsilon type yes no 0 0 0 1 1 1 1 60.58 60.58 2 0.012997 62159 QUIQUE_C1576_190116_001 59.908 28.834 184420000 0 0 0 93239000 0 0 31790000 0 0 0 35997000 23399000 0 47235 2868 44094 425269;425270;425271;425272 542885;542886;542887;542888 542886 4 VLADPSDDTK Unmodified 1059.5084 0.50841922 3117;13 Q15149;H0YDN1;A0A075B730;P58107 PLEC;EPPK1 Plectin;Epiplakin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.169 21.169 2 0.00029718 14003 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.71 96.62 5197700000 1453100000 0 0 0 0 942990000 0 1838000000 0 963660000 0 0 0 47236 3117;13 44095 425273;425274;425275;425276;425277;425278;425279;425280;425281;425282;425283 542889;542890;542891;542892;542893;542894;542895;542896;542897;542898;542899;542900 542899 12 VLADPSDDTKGFFDPNTHENLTYR Unmodified 2751.2776 0.27763801 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 1 1 95.784 95.784 3 2.8131E-06 97081 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.256 51.701 46878000 0 0 0 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19 VLAELYVSDR Unmodified 1163.6186 0.61863837 1553 O43776;K7EIU7;K7EQ35;K7EJ19 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 2 1 2 3 2 1 2 1 1 1 1 72.539 72.539 2 0.0015194 73700 QUIQUE_C1218_190116_001 96.668 61.86 258630000 51013000 0 37475000 0 20106000 36940000 0 24256000 0 20283000 29730000 16777000 22047000 47240 1553 44099 425303;425304;425305;425306;425307;425308;425309;425310;425311;425312;425313;425314;425315;425316;425317;425318;425319;425320;425321 542922;542923;542924;542925;542926;542927;542928;542929;542930;542931;542932;542933;542934;542935;542936;542937;542938;542939;542940;542941;542942 542922 19 VLAFFETDMER Unmodified 1356.6384 0.63838754 348 A0A1B0GUA3;Q96EK5 KIAA1279 KIF1-binding protein yes no 0 0 0 1 1 114.58 114.58 2 0.060024 118262 QUIQUE_C1277_190116_001 53.327 34.547 55132000 0 21803000 0 0 0 33329000 0 0 0 0 0 0 0 47241 348 44100 425322;425323 542943;542944 542943 2 VLAFTAVGDGPPSPTIQVK Unmodified 1896.0357 0.03566381 1998 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Alpha-actinin-4 no no 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 76.552 76.552 2;3 0.00011079 77728 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.148 50.301 1199000000 40208000 77968000 56456000 40273000 132490000 31803000 66227000 114500000 155850000 0 188930000 113600000 180690000 47244 1228;1544 44103 425340;425341;425342;425343;425344;425345;425346;425347;425348;425349;425350;425351;425352;425353 542961;542962;542963;542964;542965;542966;542967;542968;542969;542970;542971;542972;542973;542974;542975 542971 15 VLAGDKNFITAEELRR Unmodified 1830.9952 0.99519598 1544;1228 H7C144;O43707;F5GXS2 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 2 2 1 1 2 1 61.358 61.358 3;4 9.1272E-07 60889 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.83 94.913 705510000 0 0 0 0 0 0 0 338810000 108120000 0 46919000 138800000 72858000 47245 1228;1544 44104 425354;425355;425356;425357;425358;425359;425360 542976;542977;542978;542979;542980;542981;542982 542977 6 VLAGETLSVNDPPDVLDR Unmodified 1908.9793 0.97927114 2951 Q12906;K7EKJ9;K7EQR9 ILF3 Interleukin enhancer-binding factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 2 107.52 107.52 2;3 3.2234E-38 109982 QUIQUE_DMIX1_190116_001 198.14 168.84 2557300000 181000000 216030000 254960000 144190000 160860000 197500000 196140000 194630000 232900000 71035000 253310000 279730000 175000000 47246 2951 44105 425361;425362;425363;425364;425365;425366;425367;425368;425369;425370;425371;425372;425373;425374;425375;425376 542983;542984;542985;542986;542987;542988;542989;542990;542991;542992;542993;542994;542995;542996;542997;542998;542999;543000;543001;543002 542992 18 VLAGQEYAAK Unmodified 1048.5553 0.55530983 4533 Q9UQM7;D6RFJ0 CAMK2A Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.328 23.328 2 0.00032039 17009 QUIQUE_C1218_190116_001 114.89 69.176 21285000000 2286100000 2465700000 1328900000 1447200000 2014900000 805710000 2016500000 1091500000 1161800000 601540000 2136700000 2170800000 1757700000 47247 4533 44106 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543129;543130;543131;543132;543133;543134;543135;543136;543137;543138;543139;543140;543141;543142;543143;543144;543145;543146;543147;543148;543149;543150;543151;543152;543153;543154;543155;543156;543157;543158;543159;543160;543161;543162;543163;543164;543165;543166;543167;543168;543169;543170;543171;543172;543173;543174;543175;543176;543177;543178;543179;543180;543181;543182;543183;543184;543185 543141 55 VLALPEPSPAAPTLR Unmodified 1530.877 0.87697832 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 1 96.8 96.8 2;3 2.5934E-06 99164 QUIQUE_DMIX7_190116_001 113.63 101.05 11686000000 845730000 859400000 1024400000 332980000 940400000 476290000 808750000 1039900000 1187800000 607090000 1631600000 1211400000 720410000 47257 3117 44116 425514;425515;425516;425517;425518;425519;425520;425521;425522;425523;425524;425525;425526;425527;425528 543186;543187;543188;543189;543190;543191;543192;543193;543194;543195;543196;543197;543198;543199;543200;543201;543202;543203;543204;543205;543206;543207;543208;543209;543210;543211;543212;543213;543214 543211 29 VLALPGKPPFLTQLHSCFQTMDR Unmodified 2655.3665 0.36653355 1894 P05771;H3BV73 PRKCB Protein kinase C beta type yes no 0 0 1 1 2 1 123.17 123.17 4 2.1285E-06 127449 QUIQUE_C1277_190116_001 69.922 66.195 183570000 0 42694000 0 0 0 0 92612000 0 0 0 48264000 0 0 47258 1894 44117 425529;425530;425531;425532 543215;543216;543217;543218;543219 543216 4 VLALSFDAPGR Unmodified 1144.6241 0.6240581 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 91.265 91.265 2 0.00074623 92891 QUIQUE_DMIX7_190116_001 96.331 65.258 100380000 0 0 0 33693000 0 29054000 0 0 0 0 0 37632000 0 47259 4137 44118 425533;425534;425535;425536;425537;425538;425539;425540 543220;543221;543222;543223;543224;543225;543226;543227;543228;543229 543227 9 VLALSVETDYTFPLAEK Unmodified 1894.9928 0.99279594 1888 P05388;F8VWS0;F8VW21;F8VZS0;F8W1K8 RPLP0 60S acidic ribosomal protein P0 yes no 0 0 0 1 2 1 140.12 140.12 2 1.9799E-06 144463 QUIQUE_DMIX7_190116_001 110.29 79.855 143220000 0 0 36629000 0 0 0 0 0 0 0 106590000 0 0 47260 1888 44119 425541;425542;425543;425544 543230;543231;543232;543233 543233 2 VLAMSGDPNYLHR Oxidation (M) 1487.7191 0.71909747 2309 P30153;B3KQV6;E9PH38 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.752 37.752 3 0.00057101 34139 QUIQUE_C1218_190116_001 75.479 62.601 1897500000 140220000 188290000 167050000 0 110730000 158750000 114500000 154150000 194630000 191650000 280650000 196910000 0 47261 2309 44120 425545;425546;425547;425548;425549;425550;425551;425552;425553;425554;425555 543234;543235;543236;543237;543238;543239;543240;543241;543242;543243;543244;543245 543234 1702 7 VLAMSGDPNYLHR Unmodified 1471.7242 0.72418285 2309 P30153;B3KQV6;E9PH38 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 2 57.313 57.313 2;3 2.8919E-06 56545 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.56 103.76 9587400000 717380000 880210000 798060000 789660000 642120000 985930000 815150000 534100000 692460000 133080000 872400000 719850000 1007000000 47262 2309 44120 425556;425557;425558;425559;425560;425561;425562;425563;425564;425565;425566;425567;425568;425569;425570;425571;425572;425573;425574;425575;425576;425577;425578;425579;425580;425581 543246;543247;543248;543249;543250;543251;543252;543253;543254;543255;543256;543257;543258;543259;543260;543261;543262;543263;543264;543265;543266;543267;543268;543269;543270;543271;543272;543273 543262 23 VLANNSLSFEK Unmodified 1220.6401 0.6401021 1683 O76094;D6RDY6;R4GNC1 SRP72 Signal recognition particle subunit SRP72 yes no 0 0 0 1 56.729 56.729 2 0.0042686 55423 QUIQUE_C1218_190116_001 85.807 44.233 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47263 1683 44121 425582 543274 543274 1 VLANPGNSQVAR Unmodified 1224.6575 0.65748349 3090 Q14974;J3QR48 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 22.634 22.634 2 0.0001613 16076 QUIQUE_C1403_190116_001 127.4 94.02 4755100000 0 0 634960000 554830000 0 518660000 0 0 585820000 276510000 747170000 660770000 776440000 47264 3090 44122 425583;425584;425585;425586;425587;425588;425589;425590 543275;543276;543277;543278;543279;543280;543281;543282;543283 543277 3 VLAPEHEVR Unmodified 1048.5665 0.56654322 3856 Q96FT9 IFT43 Intraflagellar transport protein 43 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 16.123 16.123 3 0.0061197 8295 QUIQUE_C1368_190116_001 53.751 45.596 51061000 0 15655000 16784000 0 0 0 18621000 0 0 0 0 0 0 47265 3856 44123 425591;425592;425593 543284;543285;543286 543285 3 VLAPGASHPGEEEGAR Unmodified 1575.7641 0.76413341 340 A0A1B0GTL5;Q9BXF6 RAB11FIP5 Rab11 family-interacting protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 19.675 19.675 3 0.00044389 12169 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.467 40.771 522150000 62215000 88879000 0 0 107480000 117220000 0 63248000 0 0 0 0 83107000 47266 340 44124 425594;425595;425596;425597;425598;425599 543287;543288;543289;543290;543291;543292 543292 5 VLAPPPEEVQK Unmodified 1205.6656 0.66558856 4287 Q9NSY0;H0YCB1 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 36.246 36.246 2 0.041247 32408 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.432 31.537 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47267 4287 44125 425600 543293 543293 1 VLAPQISFAPEIASEEER Unmodified 1985.0106 0.010571271 2099 P16083;Q5TD07 NQO2 Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase [quinone] yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 120.33 120.33 2;3 5.606E-11 124234 QUIQUE_DMIX3_190116_001 134.61 111.74 2004400000 51869000 161630000 156330000 195780000 288670000 165860000 116710000 78163000 185630000 0 131720000 150520000 321510000 47268 2099 44126 425601;425602;425603;425604;425605;425606;425607;425608;425609;425610;425611;425612;425613;425614;425615;425616;425617;425618;425619;425620;425621 543294;543295;543296;543297;543298;543299;543300;543301;543302;543303;543304;543305;543306;543307;543308;543309;543310;543311;543312;543313;543314;543315;543316;543317 543310 23 VLAPQISFAPEIASEEERK Unmodified 2113.1055 0.10553429 2099 P16083;Q5TD07 NQO2 Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase [quinone] yes no 0 0 1 1 1 1 100.28 100.28 3 0.00047309 103388 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.49 42.367 130390000 0 0 0 0 0 0 0 0 59245000 0 0 71144000 0 47269 2099 44127 425622;425623;425624 543318;543319;543320;543321 543319 4 VLAQATSDLVNAMR Unmodified 1487.7766 0.77661235 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.999 99.999 2 1.4181E-17 103585 QUIQUE_C1576_190116_001 153.12 119.89 607730000 60163000 57167000 77388000 77685000 65288000 61541000 70923000 0 0 0 50359000 0 87214000 47270 4606 44128 425625;425626;425627;425628;425629;425630;425631;425632;425633;425634;425635 543322;543323;543324;543325;543326;543327;543328;543329;543330;543331;543332;543333;543334 543328 12 VLAQATSDLVNAMR Oxidation (M) 1503.7715 0.77152697 4606 Q9Y4G6 TLN2 Talin-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 64.573 64.573 2 0.0061256 64475 QUIQUE_C1368_190116_001 64.103 35.704 66336000 0 0 39280000 0 0 0 0 0 0 0 27057000 0 0 47271 4606 44128 425636;425637;425638;425639 543335;543336;543337;543338 543335 3042 4 VLAQDVYAK Unmodified 1005.5495 0.54949617 998 F5H039;Q9NQX3 GPHN Gephyrin;Molybdopterin adenylyltransferase;Molybdopterin molybdenumtransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.399 33.399 2 0.0021352 28255 QUIQUE_C1403_190116_001 96.492 53.245 1903100000 151660000 227030000 160150000 153860000 198890000 118250000 128320000 165600000 121520000 66689000 164010000 157010000 90081000 47272 998 44129 425640;425641;425642;425643;425644;425645;425646;425647;425648;425649;425650;425651;425652 543339;543340;543341;543342;543343;543344;543345;543346;543347;543348;543349;543350;543351;543352;543353;543354;543355 543346 15 VLAQLLGMVCDVR Unmodified 1472.7843 0.78434027 1740 O95670;H0Y474 ATP6V1G2 V-type proton ATPase subunit G 2 yes no 0 0 0 1 1 139.3 139.3 3 0.015965 143758 QUIQUE_C1277_190116_001 31.215 21.927 8177300 0 8177300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47273 1740 44130 425653;425654 543356;543357 543356 2 VLAQLLGMVCDVRPQVHPNYR Oxidation (M) 2480.2781 0.2780529 1740 O95670;H0Y474 ATP6V1G2 V-type proton ATPase subunit G 2 yes no 0 1 1 1 2 2 2 1 97.47 97.47 3;4 0.00016264 100196 QUIQUE_C1368_190116_001 65.423 57.43 378760000 38782000 98559000 88137000 0 0 0 94354000 0 0 0 0 0 58924000 47274 1740 44131 425655;425656;425657;425658;425659;425660;425661;425662 543358;543359;543360;543361;543362;543363;543364;543365 543362 949 8 VLAQLLGMVCDVRPQVHPNYR Unmodified 2464.2831 0.28313827 1740 O95670;H0Y474 ATP6V1G2 V-type proton ATPase subunit G 2 yes no 0 0 1 2 1 1 1 2 1 2 1 2 2 1 1 117.27 117.27 3;4 4.5579E-10 120589 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.85 85.291 1855600000 77155000 173850000 130610000 109800000 163710000 55706000 228530000 117280000 283130000 0 263520000 137470000 114770000 47275 1740 44131 425663;425664;425665;425666;425667;425668;425669;425670;425671;425672;425673;425674;425675;425676;425677;425678;425679 543366;543367;543368;543369;543370;543371;543372;543373;543374;543375;543376;543377;543378;543379;543380;543381;543382;543383;543384;543385;543386;543387;543388;543389;543390 543379 24 VLAQLLR Unmodified 811.52797 0.52797287 4434 Q9UHG2;Q9NPY3 PCSK1N;CD93 ProSAAS;KEP;Big SAAS;Little SAAS;Big PEN-LEN;PEN;Little LEN;Big LEN;Complement component C1q receptor yes no 0 0 0 1 1 1 58.323 58.323 2 0.019765 57131 QUIQUE_C1218_190116_001 120.76 33.174 202500000 52311000 121620000 0 0 0 0 0 0 0 28571000 0 0 0 47276 4434 44132 425680;425681;425682 543391;543392;543393 543391 2 VLAQNSGFDLQETLVK Unmodified 1760.9309 0.93086439 2424 P40227 CCT6A T-complex protein 1 subunit zeta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.97 104.97 2 1.3513E-44 108184 QUIQUE_C1277_190116_001 184.03 141.63 3429900000 371550000 322250000 438830000 341360000 423090000 364200000 0 323610000 274580000 222180000 0 0 348270000 47277 2424 44133 425683;425684;425685;425686;425687;425688;425689;425690;425691;425692;425693;425694;425695 543394;543395;543396;543397;543398;543399;543400;543401;543402;543403;543404;543405;543406;543407 543395 13 VLAQQGEYSEAIPILR Unmodified 1785.9625 0.96249887 3062 Q14318;A0A0A0MTJ1;U3KQI1 FKBP8 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.18 108.18 2 2.5538E-29 111325 QUIQUE_DMIX7_190116_001 201 183.97 969230000 69441000 73517000 79191000 85822000 83256000 87159000 0 73845000 89807000 39851000 97946000 81796000 107600000 47278 3062 44134 425696;425697;425698;425699;425700;425701;425702;425703;425704;425705;425706;425707 543408;543409;543410;543411;543412;543413;543414;543415;543416;543417;543418;543419;543420 543419 13 VLASDAAAFLK Unmodified 1104.6179 0.61791009 2449 P42566;B1AUU8;S4R3U1 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 89.396 89.396 2 0.0039383 91946 QUIQUE_C1576_190116_001 85.731 70.149 386500000 41320000 0 0 42042000 0 42206000 53518000 0 48942000 0 45755000 48251000 64467000 47279 2449 44135 425708;425709;425710;425711;425712;425713;425714;425715 543421;543422;543423;543424;543425;543426;543427;543428 543424 7 VLASDAAAFLKK Unmodified 1232.7129 0.71287311 2449 P42566;B1AUU8;S4R3U1 EPS15 Epidermal growth factor receptor substrate 15 yes no 0 0 1 1 1 1 1 66.267 66.267 3 0.0020843 66143 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.551 45.315 75834000 0 0 0 0 0 0 0 23288000 15459000 0 21289000 15797000 0 47280 2449 44136 425716;425717;425718;425719 543429;543430;543431;543432 543429 4 VLASLIIR Unmodified 883.58549 0.58548775 3762 Q92878;A0A1W2PQ90;H7C0V2 RAD50 DNA repair protein RAD50 yes no 0 0 0 1 1 1 77.708 77.708 2 0.027083 78524 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.998 33.813 24702000 0 11309000 0 0 0 0 0 0 13394000 0 0 0 0 47281 3762 44137 425720;425721;425722 543433;543434;543435 543434 3 VLASNPIMESIGNAK Unmodified 1542.8076 0.80757813 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 93.009 93.009 2 6.8856E-10 97047 QUIQUE_DMIX5_190116_001 132.32 114.46 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47282 4607 44138 425723 543436 543436 1 VLATAFDTTLGGR Unmodified 1320.7038 0.70376498 2363 P34932;A0A087WYC1;A0A087WTS8 HSPA4 Heat shock 70 kDa protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.449 87.449 2 8.8668E-06 90306 QUIQUE_C1218_190116_001 150.1 111.08 5794900000 496450000 489110000 500510000 517820000 555220000 466150000 567170000 316520000 373880000 241520000 475990000 393830000 400720000 47283 2363 44139 425724;425725;425726;425727;425728;425729;425730;425731;425732;425733;425734;425735;425736 543437;543438;543439;543440;543441;543442;543443;543444;543445;543446;543447;543448;543449;543450;543451;543452;543453;543454;543455;543456;543457;543458;543459;543460;543461;543462;543463;543464;543465 543437 29 VLATTFDPYLGGR Unmodified 1408.7351 0.73506511 1748 O95757;E9PDE8;D6RJ96 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.39 102.39 2 0.00035011 105364 QUIQUE_C1368_190116_001 112.36 74.882 3375400000 289960000 273550000 256900000 246480000 265970000 231300000 305030000 229050000 213100000 98230000 362490000 285000000 318290000 47284 1748 44140 425737;425738;425739;425740;425741;425742;425743;425744;425745;425746;425747;425748;425749 543466;543467;543468;543469;543470;543471;543472;543473;543474;543475;543476;543477;543478;543479 543469 11 VLAVNQENEHLMEDYEK Unmodified 2059.9521 0.95207011 1544;1313 O43707;K7EJH8 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 72.422 72.422 2;3 1.2494E-52 72628 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.54 148.73 5053800000 446670000 546820000 425830000 468060000 489230000 371510000 498340000 285770000 326610000 115050000 458210000 279540000 342170000 47285 1544;1313 44141 425750;425751;425752;425753;425754;425755;425756;425757;425758;425759;425760;425761;425762;425763;425764;425765;425766;425767;425768;425769;425770;425771;425772;425773 543480;543481;543482;543483;543484;543485;543486;543487;543488;543489;543490;543491;543492;543493;543494;543495;543496;543497;543498;543499;543500;543501;543502;543503;543504;543505;543506 543496 27 VLAVNQENEHLMEDYEK Oxidation (M) 2075.947 0.94698474 1544;1313 O43707;K7EJH8 ACTN4 Alpha-actinin-4 no no 0 1 0 1 1 2 53.566 53.566 3 0.00013519 51311 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.468 61.162 171190000 0 0 0 0 36998000 0 0 0 28944000 105240000 0 0 0 47286 1544;1313 44141 425774;425775;425776;425777 543507;543508;543509;543510 543508 747 3 VLAVNQENEQLMEDYEK Unmodified 2050.9517 0.95173576 2047;1242 H9KV75;G3V2W4;P12814;G3V2N5 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.389 94.389 2 3.2818E-122 96444 QUIQUE_DMIX8_190116_001 232.6 217.73 1292400000 116470000 125170000 124160000 149480000 128390000 87561000 110350000 73232000 0 46970000 105480000 112130000 113010000 47287 1242;2047 44142 425778;425779;425780;425781;425782;425783;425784;425785;425786;425787;425788;425789;425790 543511;543512;543513;543514;543515;543516;543517;543518;543519;543520;543521;543522;543523;543524;543525 543524 15 VLAVNQENEQLMEDYEK Oxidation (M) 2066.9467 0.94665039 2047;1242 H9KV75;G3V2W4;P12814;G3V2N5 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 0 1 0 1 1 73.91 73.91 2 0.0011555 75708 QUIQUE_C1438_190116_001 66.023 55.076 25095000 0 0 0 0 25095000 0 0 0 0 0 0 0 0 47288 1242;2047 44142 425791;425792 543526;543527 543526 717 2 VLAVNQENER Unmodified 1170.5993 0.59929991 2381 P35609;F6THM6 ACTN2 Alpha-actinin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 21.198 21.198 2 0.00068152 14673 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.98 84.458 525700000 0 0 0 0 199750000 0 237680000 88266000 0 0 0 0 0 47289 2381 44143 425793;425794;425795 543528;543529;543530 543530 3 VLAVTAIR Unmodified 841.53854 0.53853756 2194 P22102 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 46.54 46.54 2 0.048788 44960 QUIQUE_C1218_190116_001 55.902 5.004 271660000 126360000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 145310000 47290 2194 44144 425796;425797 543531;543532 543531 1 VLCALTEANVQYAAVR Unmodified 1776.9193 0.91925384 4161 Q9H3S7 PTPN23 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 23 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 94.881 94.881 2 3.891E-09 98767 QUIQUE_C1438_190116_001 149.96 132.93 156810000 0 31781000 34168000 0 29849000 26798000 34218000 0 0 0 0 0 0 47291 4161 44145 425798;425799;425800;425801;425802;425803 543533;543534;543535;543536;543537;543538 543535 6 VLCELADLQDK Unmodified 1302.649 0.64895222 2132 P17987;E7ERF2;F5H136;F5GZI8;F5H676;F5H726 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.673 78.673 2 4.2741E-05 79514 QUIQUE_C1277_190116_001 137.95 96.966 1002700000 191590000 131660000 158900000 0 92632000 156360000 121810000 0 18381000 87427000 0 0 43968000 47292 2132 44146 425804;425805;425806;425807;425808;425809;425810;425811;425812;425813 543539;543540;543541;543542;543543;543544;543545;543546;543547;543548;543549;543550;543551 543540 13 VLCELADLQDKEVGDGTTSVVIIAAELLK Unmodified 3098.6421 0.64208252 2132 P17987;E7ERF2;F5H136;F5H676;F5H726 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 3 1 167.75 167.75 2;3;4 1.2096E-143 174891 QUIQUE_DMIX5_190116_001 252.4 220.01 7119000000 147780000 600310000 471970000 157520000 449440000 0 1418100000 619720000 944460000 24399000 1604200000 681060000 0 47293 2132 44147 425814;425815;425816;425817;425818;425819;425820;425821;425822;425823;425824;425825;425826;425827;425828 543552;543553;543554;543555;543556;543557;543558;543559;543560;543561;543562;543563;543564;543565;543566 543565 15 VLCGGDIYVPEDPK Unmodified 1560.7494 0.74939455 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.624 78.624 2 0.00013973 79570 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.63 92.498 10046000000 757520000 1047500000 1233400000 1038100000 861610000 1019400000 992580000 541250000 589470000 562880000 712490000 0 690230000 47294 2522 44148 425829;425830;425831;425832;425833;425834;425835;425836;425837;425838;425839;425840 543567;543568;543569;543570;543571;543572;543573;543574;543575;543576;543577;543578;543579 543575 13 VLCGGDIYVPEDPKLK Unmodified 1801.9284 0.92842155 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 1 1 1 1 2 2 1 2 2 78.841 78.841 2;3 1.3283E-12 79584 QUIQUE_DMIX8_190116_001 136.7 122.79 2851300000 0 0 75558000 52539000 0 0 0 787090000 486860000 0 389110000 517990000 542160000 47295 2522 44149 425841;425842;425843;425844;425845;425846;425847;425848;425849;425850;425851;425852 543580;543581;543582;543583;543584;543585;543586;543587;543588;543589;543590;543591 543590 11 VLCIINPGNPTGQVQSR Unmodified 1851.9625 0.96251564 3680 Q8TD30 GPT2 Alanine aminotransferase 2 yes yes 0 0 0 1 1 83.374 83.374 2 0.00535 84994 QUIQUE_C1368_190116_001 63.181 48.305 37122000 0 0 20399000 0 0 0 16724000 0 0 0 0 0 0 47296 3680 44150 425853;425854 543592;543593 543592 2 VLCIIQDTTNSK Unmodified 1390.7126 0.71261511 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 62.111 62.111 2 0.0005697 62437 QUIQUE_C1218_190116_001 92.538 63.842 172750000 26220000 30497000 29061000 24803000 34671000 0 0 0 0 0 0 0 27500000 47297 3895 44151 425855;425856;425857;425858;425859;425860;425861 543594;543595;543596;543597;543598;543599;543600;543601;543602;543603 543594 9 VLCLAVAVGHVK Unmodified 1264.7326 0.73256269 2770 P62906 RPL10A 60S ribosomal protein L10a yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.336 63.336 3 0.00040728 61928 QUIQUE_C1368_190116_001 57.293 48.893 46764000 0 0 19815000 0 17264000 0 0 0 0 9685100 0 0 0 47298 2770 44152 425862;425863;425864;425865;425866;425867 543604;543605;543606;543607;543608;543609 543605 6 VLCPIIQTADYPINLAAIK Unmodified 2112.1653 0.16529777 310;830;1060 A0A0U1RQI6;E7ERI8;E7EW49;E3W994;J3KR49;O75122;F8WA11;Q7Z460;H0Y5T1 CLASP2;CLASP1 CLIP-associating protein 2;CLIP-associating protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.14 144.14 2 2.6824E-06 150013 QUIQUE_C1218_190116_001 136.7 123.02 1161700000 95310000 114800000 83538000 66067000 107290000 86486000 112910000 71731000 72571000 27680000 99990000 120650000 102660000 47299 310;830;1060 44153 425868;425869;425870;425871;425872;425873;425874;425875;425876;425877;425878;425879;425880 543610;543611;543612;543613;543614;543615;543616;543617;543618;543619;543620;543621;543622;543623 543610 14 VLCPINYPLSPTR Unmodified 1528.8072 0.8071842 3900 Q96LD4 TRIM47 Tripartite motif-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 91.688 91.688 2 0.0017146 93965 QUIQUE_C1277_190116_001 91.855 69.769 493160000 45992000 63865000 37394000 49678000 51001000 0 58179000 46876000 0 0 43492000 40220000 56461000 47300 3900 44154 425881;425882;425883;425884;425885;425886;425887;425888;425889;425890 543624;543625;543626;543627;543628;543629;543630;543631;543632;543633 543625 9 VLCPVIGK Unmodified 884.51536 0.51535927 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 45.019 45.019 2 0.042358 41537 QUIQUE_C1277_190116_001 79.939 42.911 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47301 1741 44155 425891;425892;425893;425894 543634;543635;543636;543637 543635 4 VLCQGFAFDIPGFYDSGLLQGK Unmodified 2431.1882 0.18821806 2099 P16083 NQO2 Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase [quinone] yes yes 0 0 0 1 1 164.13 164.13 2;3 0.00085195 168356 QUIQUE_DMIX7_190116_001 44.312 34.535 108230000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 64507000 43727000 47302 2099 44156 425895;425896 543638;543639 543638 2 VLCQGLK Unmodified 816.45276 0.45275902 2055 P13489;E9PIM9 RNH1 Ribonuclease inhibitor yes no 0 0 0 1 20.031 20.031 2 0.039103 12609 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.025 47.367 125300000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 125300000 0 0 0 47303 2055 44157 425897 543640;543641;543642 543641 3 VLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGK Unmodified 2435.1977 0.19773689 2414 P38606 ATP6V1A V-type proton ATPase catalytic subunit A yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 2 1 146.38 146.38 2;3 1.513E-23 152383 QUIQUE_C1218_190116_001 160.8 156.41 7712300000 651260000 919340000 803160000 983810000 911040000 753450000 810910000 114170000 144380000 181110000 639760000 544910000 255010000 47304 2414 44158 425898;425899;425900;425901;425902;425903;425904;425905;425906;425907;425908;425909;425910;425911;425912;425913;425914;425915;425916;425917;425918;425919;425920 543643;543644;543645;543646;543647;543648;543649;543650;543651;543652;543653;543654;543655;543656;543657;543658;543659;543660;543661;543662;543663;543664;543665;543666;543667;543668;543669;543670;543671;543672;543673;543674;543675;543676;543677;543678;543679;543680;543681;543682;543683;543684;543685;543686;543687 543644 45 VLDALQAIK Unmodified 969.58588 0.58588168 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RFE7;H0YBE2;E5RJI8;E5RJF6 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 75.475 75.475 2 0.00034385 76737 QUIQUE_C1438_190116_001 135.84 61.427 8490200000 629920000 561690000 713380000 431500000 1271600000 763650000 402900000 234110000 352530000 159800000 1203100000 964290000 801680000 47305 1795 44159 425921;425922;425923;425924;425925;425926;425927;425928;425929;425930;425931;425932;425933;425934 543688;543689;543690;543691;543692;543693;543694;543695;543696;543697;543698;543699;543700;543701;543702;543703;543704;543705;543706;543707;543708;543709;543710;543711;543712;543713;543714;543715;543716;543717;543718;543719;543720;543721;543722;543723;543724;543725 543699 38 VLDALVAR Unmodified 855.5178 0.51780212 3527 Q8IUR0 TRAPPC5 Trafficking protein particle complex subunit 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 54 54 2 0.02931 51931 QUIQUE_C1403_190116_001 67.981 31.006 76211000 0 22804000 0 29085000 0 0 0 0 24322000 0 0 0 0 47306 3527 44160 425935;425936;425937;425938 543726;543727;543728;543729 543728 4 VLDAMLPYLINYYGNPHSR Unmodified 2235.1147 0.11465919 4647 Q9Y697;F2Z2E7;F8WER8;A2A2M1;F8WB23;Q8WV90 NFS1 Cysteine desulfurase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 144.97 144.97 3 0.00011732 152110 QUIQUE_DMIX5_190116_001 69.422 54.302 285340000 0 0 34094000 0 0 0 0 0 0 0 86330000 94492000 70425000 47307 4647 44161 425939;425940;425941;425942 543730;543731;543732;543733;543734 543731 5 VLDAPGGGSVLVMEHMDMR Unmodified 2012.9482 0.94818749 4200 Q9HA64;I3L2G3;I3L139;I3L3W5 FN3KRP Ketosamine-3-kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 104.93 104.93 3 0.0013438 108032 QUIQUE_C1403_190116_001 50.938 40.563 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47308 4200 44162 425943;425944;425945;425946;425947;425948;425949 543735;543736;543737;543738;543739;543740;543741 543737 7 VLDAPVPDCLGVHCDFHQGLLSFYNAR Unmodified 3099.4695 0.46949507 4024 Q9BTV5 FSD1 Fibronectin type III and SPRY domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 133.67 133.67 4 9.9218E-09 137809 QUIQUE_C1403_190116_001 63.361 56.785 332270000 44213000 0 54277000 52034000 42718000 0 83164000 0 0 0 0 0 55862000 47309 4024 44163 425950;425951;425952;425953;425954;425955 543742;543743;543744;543745;543746;543747 543744 6 VLDASWYSPGTR Unmodified 1350.6568 0.65681479 3193 Q16762;B1AH48 TST Thiosulfate sulfurtransferase yes no 0 0 0 1 81.394 81.394 2 7.7926E-14 83186 QUIQUE_DMIX3_190116_001 160.36 119.33 319810000 0 0 0 0 0 0 0 0 319810000 0 0 0 0 47310 3193 44164 425956 543748 543748 1 VLDAYGLLGVLR Unmodified 1287.7551 0.75507227 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6;C9JW66;C9J1Z6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.48 145.48 2 8.2408E-06 150148 QUIQUE_C1277_190116_001 141.88 105.93 2288200000 242090000 254420000 146420000 228410000 196920000 160870000 196190000 124460000 128870000 75244000 171770000 201070000 161480000 47311 723 44165 425957;425958;425959;425960;425961;425962;425963;425964;425965;425966;425967;425968;425969 543749;543750;543751;543752;543753;543754;543755;543756;543757;543758;543759;543760;543761;543762;543763;543764;543765 543750 16 VLDCDTISQAK Unmodified 1248.602 0.60200203 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 39.837 39.837 2 0.0018044 35971 QUIQUE_C1576_190116_001 99.815 58.367 311430000 108100000 0 0 203330000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47312 1510 44166 425970;425971;425972 543766;543767;543768 543768 3 VLDDGELLVQQTK Unmodified 1456.7773 0.77732386 1245 I3L0N3;P46459 NSF Vesicle-fusing ATPase yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 79.344 79.344 2;3 1.9266E-52 80218 QUIQUE_C1403_190116_001 196.48 157.18 15247000000 1367100000 1452400000 1396600000 1240200000 1172900000 1098700000 1400900000 670770000 891840000 629430000 1471000000 1193000000 1262200000 47313 1245 44167 425973;425974;425975;425976;425977;425978;425979;425980;425981;425982;425983;425984;425985;425986;425987 543769;543770;543771;543772;543773;543774;543775;543776;543777;543778;543779;543780;543781;543782;543783;543784;543785;543786;543787;543788;543789;543790;543791;543792;543793;543794;543795;543796;543797 543775 29 VLDEFSK Unmodified 836.42798 0.42798405 1502 O15498 YKT6 Synaptobrevin homolog YKT6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 37.699 37.699 2 0.026275 34038 QUIQUE_C1576_190116_001 94.262 57.168 436290000 0 0 0 87507000 0 0 123760000 0 0 0 0 82947000 142080000 47314 1502 44168 425988;425989;425990;425991 543798;543799;543800;543801 543799 4 VLDELTLAR Unmodified 1028.5866 0.58660996 763;774;773 CON__P02533;P02533;CON__Q6IFX2;CON__A2A4G1;K7EPJ9;A8MT21;K7EMS3;C9JTG5;CON__P08779;P08779;CON__P08727;P08727;C9JM50;CON__P19001 KRT14;KRT17;KRT15;KRT19;KRT16 Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16;Keratin, type I cytoskeletal 19 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 76.927 76.927 2 0.0037167 77282 QUIQUE_C1403_190116_001 90.657 44.939 491130000 0 0 0 55136000 39320000 41344000 0 107090000 0 117240000 63829000 67172000 0 + 47315 763;774;773 44169 425992;425993;425994;425995;425996;425997;425998 543802;543803;543804;543805;543806;543807;543808;543809;543810;543811 543802 10 VLDELTLTK Unmodified 1030.591 0.59102664 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 71.307 71.307 1;2 0.00164 71134 QUIQUE_DMIX7_190116_001 101.64 57.249 8591000000 708820000 483530000 363730000 591670000 510900000 472070000 342160000 533260000 494880000 1266600000 731670000 1151400000 940340000 + 47316 776 44170 425999;426000;426001;426002;426003;426004;426005;426006;426007;426008;426009;426010;426011;426012;426013 543812;543813;543814;543815;543816;543817;543818;543819;543820;543821;543822;543823;543824;543825;543826;543827;543828;543829;543830 543827 16 VLDFEHFLPMLQTVAK Oxidation (M) 1902.9914 0.99135615 1048 F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;G3V1Y7;F8VPF3;F8VZU9;F8W180 MYL6 Myosin light polypeptide 6 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 141.98 141.98 2;3 2.4688E-05 148191 QUIQUE_C1218_190116_001 93.106 76.227 1245200000 128770000 122310000 131820000 85298000 155400000 96152000 103860000 53206000 100480000 41385000 0 120000000 106490000 47317 1048 44171 426014;426015;426016;426017;426018;426019;426020;426021;426022;426023;426024;426025;426026 543831;543832;543833;543834;543835;543836;543837;543838;543839;543840;543841;543842;543843;543844;543845;543846;543847;543848;543849;543850 543832 618 20 VLDFEHFLPMLQTVAK Unmodified 1886.9964 0.99644153 1048 F8W1R7;G3V1V0;P60660;J3KND3;G8JLA2;B7Z6Z4;G3V1Y7;F8VPF3;F8VZU9;F8W180 MYL6 Myosin light polypeptide 6 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 1 155.57 155.57 2;3 1.0322E-09 159838 QUIQUE_C1277_190116_001 156.69 131.35 3990900000 380430000 424810000 392370000 349450000 455680000 222860000 356640000 195830000 233020000 47081000 272020000 254810000 405920000 47318 1048 44171 426027;426028;426029;426030;426031;426032;426033;426034;426035;426036;426037;426038;426039;426040;426041;426042;426043;426044;426045;426046;426047 543851;543852;543853;543854;543855;543856;543857;543858;543859;543860;543861;543862;543863;543864;543865;543866;543867;543868;543869;543870;543871;543872;543873;543874;543875;543876;543877;543878;543879;543880;543881;543882;543883;543884 543855 32 VLDFHHPHQLLEGMEGFNLELSDHPESLEQILVDCR Unmodified 4253.031 0.031012498 3950 Q99259;F8WD43 GAD1 Glutamate decarboxylase 1 yes no 0 0 0 1 150.93 150.93 5 3.9728E-32 155605 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.239 79.858 88434000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 88434000 0 47319 3950 44172 426048 543885 543885 1 VLDILQHIQTLDPGQHGAVGYLVQHTLEHIER Unmodified 3628.9114 0.91141335 1162 H0YIE9;Q4G104;O94952;H0YHF6 FBXO21 F-box only protein 21 yes no 0 0 0 1 145.33 145.33 5 0.0083832 152818 QUIQUE_DMIX5_190116_001 28.443 23.586 62478000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62478000 0 0 47320 1162 44173 426049 543886 543886 0 VLDLDLFR Unmodified 989.55458 0.55458155 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.83 124.83 2 1.591E-15 122118 QUIQUE_DMIX4_190116_001 195.06 13.388 1085200000 171090000 126900000 105800000 122870000 0 0 0 0 126670000 86124000 171560000 131800000 42394000 47321 2534 44174 426050;426051;426052;426053;426054;426055;426056;426057;426058;426059 543887;543888;543889;543890;543891;543892;543893;543894;543895;543896;543897 543894 11 VLDLDLFRVDK Unmodified 1331.7449 0.74490152 2534 Q5T5C7;P49591 SARS Serine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 113.77 113.77 3 0.060124 116132 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.612 21.695 8639600 0 0 0 0 0 0 0 8639600 0 0 0 0 0 47322 2534 44175 426060 543898 543898 1 VLDLELK Unmodified 828.49567 0.49566969 1853 P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 70.338 70.338 2 0.020425 69869 QUIQUE_C1563_190116_001 108.24 19.504 1288900000 0 200710000 310180000 0 0 314820000 0 0 168970000 0 212150000 82100000 0 47323 1853 44176 426061;426062;426063;426064;426065;426066 543899;543900;543901;543902;543903;543904 543901 6 VLDLELKGDIEK Unmodified 1370.7657 0.76569654 1853 P04083 ANXA1 Annexin A1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 73.16 73.16 3 0.00038022 73429 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.088 53.692 286470000 0 0 0 0 0 0 39542000 79180000 70180000 0 39319000 0 58248000 47324 1853 44177 426067;426068;426069;426070;426071 543905;543906;543907;543908;543909 543909 4 VLDLGSPQLAMHSIR Oxidation (M) 1651.8716 0.87157537 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 1 0 1 1 1 71.146 71.146 3 0.0051192 71226 QUIQUE_C1403_190116_001 47.545 33.192 68980000 0 0 0 19255000 0 0 0 0 26723000 0 23001000 0 0 47325 1 44178 426072;426073;426074 543910;543911;543912 543910 2 3 VLDLGSPQLAMHSIR Unmodified 1635.8767 0.87666075 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 90.018 90.018 3 0.0074782 91687 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.723 31.694 90814000 0 0 0 0 0 0 0 38630000 0 0 0 0 52184000 47326 1 44178 426075;426076 543913;543914 543913 2 VLDLHDNQLTALPDDLGQLTALQVLNVER Unmodified 3212.7041 0.70410592 3406 Q6UWE0 LRSAM1 E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 164.3 164.3 3 8.505E-16 166301 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.9 69.57 343460000 38154000 0 0 0 87089000 0 0 37656000 82202000 0 0 98361000 0 47327 3406 44179 426077;426078;426079;426080;426081;426082 543915;543916;543917;543918;543919;543920;543921;543922 543919 7 VLDLQQIK Unmodified 955.57023 0.57023162 4512 Q9UNM6;J3KNQ3 PSMD13 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.375 60.375 2 0.021411 59871 QUIQUE_C1438_190116_001 75.189 31.943 1568100000 170280000 0 163720000 128350000 149010000 128880000 156360000 0 117330000 69666000 173870000 154060000 156520000 47328 4512 44180 426083;426084;426085;426086;426087;426088;426089;426090;426091;426092;426093 543923;543924;543925;543926;543927;543928;543929;543930;543931;543932;543933 543926 8 VLDLSCNR Unmodified 975.48076 0.48076468 1945 P08571 CD14 Monocyte differentiation antigen CD14;Monocyte differentiation antigen CD14, urinary form;Monocyte differentiation antigen CD14, membrane-bound form yes yes 0 0 0 1 36.256 36.256 2 0.02842 30297 QUIQUE_DMIX4_190116_001 68.787 40.533 19441000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19441000 0 0 0 47329 1945 44181 426094 543934 543934 1 VLDLSGNALEALPPGQGLGPAEPPGLPQLQSLNLSGNR Unmodified 3789.0061 0.0061016011 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 2 1 1 1 1 162.82 162.82 3;4 4.3356E-07 166980 QUIQUE_C1403_190116_001 53.648 49.495 477360000 0 46158000 55877000 48260000 16079000 25109000 47006000 53083000 37824000 0 44780000 71557000 31625000 47330 3576 44182 426095;426096;426097;426098;426099;426100;426101;426102;426103;426104;426105;426106;426107;426108 543935;543936;543937;543938;543939;543940;543941;543942;543943;543944;543945;543946;543947;543948;543949;543950;543951 543939 14 VLDMENSFK Oxidation (M) 1097.5063 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543981;543982;543983;543984;543985;543986;543987;543988;543989;543990;543991;543992;543993;543994;543995;543996;543997;543998;543999;544000;544001;544002;544003;544004;544005;544006 543997 26 VLDPAIPIPDPYSSR Unmodified 1638.8617 0.86172219 2665 P55268;F5H520 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.5 117.5 2 0.00089004 123183 QUIQUE_C1438_190116_001 96.229 85.998 374850000 0 86201000 69395000 0 0 0 71857000 70564000 76831000 0 0 0 0 47335 2665 44187 426150;426151;426152;426153;426154;426155;426156 544007;544008;544009;544010;544011;544012;544013;544014 544009 8 VLDPFTIKPLDR Unmodified 1412.8028 0.80275075 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 98.618 98.618 2;3 0.0001818 101592 QUIQUE_C1368_190116_001 116.54 95.682 43942000000 3143200000 3424200000 3729500000 3286400000 3851800000 3005600000 3444100000 2664000000 4065700000 1739100000 3848900000 3657000000 4082400000 47336 2288 44188 426157;426158;426159;426160;426161;426162;426163;426164;426165;426166;426167;426168;426169;426170;426171;426172;426173;426174;426175;426176;426177;426178;426179;426180;426181;426182 544015;544016;544017;544018;544019;544020;544021;544022;544023;544024;544025;544026;544027;544028;544029;544030;544031;544032;544033;544034;544035;544036;544037;544038;544039;544040;544041;544042;544043;544044;544045;544046;544047;544048;544049;544050;544051;544052;544053;544054;544055;544056;544057;544058;544059;544060;544061;544062;544063;544064;544065;544066 544024 51 VLDPFTIKPLDRK Unmodified 1540.8977 0.89771377 2288 P29401;A0A0B4J1R6 TKT Transketolase yes no 0 0 2 2 2 3 2 1 75.735 75.735 3;4 0.00026212 76368 QUIQUE_DMIX1_190116_001 100.22 88.303 1178700000 0 0 0 0 0 0 0 340050000 242640000 0 294270000 216930000 84849000 47337 2288 44189 426183;426184;426185;426186;426187;426188;426189;426190;426191;426192 544067;544068;544069;544070;544071;544072;544073;544074;544075;544076;544077;544078;544079;544080;544081 544067 13 VLDQFQVMPLQFSK Unmodified 1678.8753 0.87526376 647 B5MED8;Q96PQ0 SORCS2 VPS10 domain-containing receptor SorCS2 yes no 0 0 0 1 134.02 134.02 2 0.0031271 136910 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.34 56.449 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47338 647 44190 426193 544082 544082 1 VLDQIEFLDTK Unmodified 1319.6973 0.69728262 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 107.73 107.73 2 0.00043299 111747 QUIQUE_C1368_190116_001 135.55 105.38 1099800000 0 0 314770000 0 0 0 111810000 129770000 0 0 404240000 0 139190000 47339 1975 44191 426194;426195;426196;426197;426198 544083;544084;544085;544086;544087 544083 5 VLDQVETELQR Unmodified 1328.6936 0.69359423 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.347 71.347 2 1.0013E-05 72644 QUIQUE_C1438_190116_001 161.76 122.74 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mTOR yes no 0 0 0 1 64.496 64.496 2 0.0043179 63617 QUIQUE_C1403_190116_001 54.524 40.289 42216000 0 0 0 42216000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47346 3568 44198 426259 544174 544174 1 VLDVGFVGR Unmodified 960.53927 0.53926584 4010 Q9BSF4 C19orf52 Uncharacterized protein C19orf52 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 75.359 75.359 2 0.0043079 75092 QUIQUE_C1563_190116_001 89.296 57.341 113990000 19173000 0 21285000 16832000 0 13454000 0 0 0 0 24258000 0 18991000 47347 4010 44199 426260;426261;426262;426263;426264;426265;426266 544175;544176;544177;544178;544179;544180;544181 544178 6 VLDVNDNAPEFPR Unmodified 1484.726 0.72595699 4219 Q9HBT6 CDH20 Cadherin-20 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.109 82.109 2 7.1708E-06 83508 QUIQUE_C1277_190116_001 124.1 97.589 684880000 0 71373000 66511000 64614000 0 66989000 62459000 50809000 77798000 41468000 68399000 40734000 73723000 47348 4219 44200 426267;426268;426269;426270;426271;426272;426273;426274;426275;426276;426277 544182;544183;544184;544185;544186;544187;544188;544189;544190;544191;544192;544193;544194;544195 544182 12 VLDVNLMGTFNVIR Unmodified 1589.8599 0.85994805 3969 Q99714;Q5H928 HSD17B10 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase type-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 1 1 143.72 143.72 2 2.4374E-22 146487 QUIQUE_DMIX1_190116_001 163.83 135.43 701370000 56535000 48337000 47010000 35402000 42458000 87430000 48082000 53165000 77955000 11728000 69999000 61516000 61756000 47349 3969 44201 426278;426279;426280;426281;426282;426283;426284;426285;426286;426287;426288;426289;426290;426291;426292 544196;544197;544198;544199;544200;544201;544202;544203;544204;544205;544206;544207;544208;544209;544210;544211;544212;544213;544214;544215;544216;544217;544218;544219 544210 23 VLDVSDLESVTSK Unmodified 1390.7191 0.71914028 3687 Q8TE77;E9PIT5;A0A087WWG1 SSH3 Protein phosphatase Slingshot homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 100.22 100.22 2 0.00053911 104190 QUIQUE_C1218_190116_001 89.403 53.46 129200000 34934000 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1 23.419 23.419 2 0.0046555 16849 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.165 27.449 51279000 19008000 15505000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16766000 0 47353 684 44205 426306;426307;426308 544235;544236;544237 544237 2 VLEAAAQAAR Unmodified 998.55089 0.55089316 4242 Q9NPD3;E9PI41 EXOSC4 Exosome complex component RRP41 yes no 0 0 0 1 1 23.144 23.144 2 0.011867 16892 QUIQUE_DMIX5_190116_001 66.692 23.609 287280000 0 0 0 123310000 0 0 0 0 0 0 163980000 0 0 47354 4242 44206 426309;426310 544238;544239 544239 2 VLEAAVAAK Unmodified 870.51747 0.51746776 3054 Q14232;F5H0D0 EIF2B1 Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.561 23.561 2 0.012898 17676 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.69 21.1 179770000 0 34040000 0 0 27207000 0 31582000 21751000 0 0 35679000 0 29512000 47355 3054 44207 426311;426312;426313;426314;426315;426316;426317 544240;544241;544242;544243;544244;544245;544246;544247 544244 8 VLEACSIACNK Unmodified 1263.5951 0.59514251 2359 P34896 SHMT1 Serine hydroxymethyltransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 38.174 38.174 2 0.017398 34291 QUIQUE_C1368_190116_001 62.463 41.943 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47356 2359 44208 426318 544248 544248 1 VLEAELLVLR Unmodified 1153.7071 0.70705945 1916 P07196;A0A0S2Z436;A0A087X0W2 NEFL Neurofilament light polypeptide yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 2 2 2 1 1 2 1 1 116.38 116.38 2 3.2751E-39 120810 QUIQUE_C1576_190116_001 207.95 153.4 11558000000 1178800000 1099700000 657220000 598890000 874080000 603480000 1420300000 791160000 759940000 476230000 1274400000 845360000 978790000 47357 1916 44209 426319;426320;426321;426322;426323;426324;426325;426326;426327;426328;426329;426330;426331;426332;426333;426334;426335;426336 544249;544250;544251;544252;544253;544254;544255;544256;544257;544258;544259;544260;544261;544262;544263;544264;544265;544266;544267;544268;544269;544270;544271;544272;544273;544274;544275;544276;544277;544278;544279;544280;544281;544282;544283;544284;544285;544286;544287;544288;544289;544290;544291;544292;544293;544294;544295 544271 47 VLEAEVLALK Unmodified 1083.654 0.65396125 2372 P35240 NF2 Merlin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.629 89.629 2 0.0037809 92632 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.168 48.018 131210000 12926000 13043000 0 12595000 0 16394000 21514000 0 19991000 0 18531000 0 16218000 47358 2372 44210 426337;426338;426339;426340;426341;426342;426343;426344;426345;426346 544296;544297;544298;544299;544300;544301;544302;544303;544304;544305 544304 10 VLEAGDKHYHPSCAR Unmodified 1738.8209 0.82093678 151 F8W8M4;A0A0A0MRL6 ABLIM1 no no 0 0 1 1 2 1 2 2 1 13.027 13.027 3;4 4.2016E-06 4608 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.069 64.656 771670000 0 0 0 0 35303000 0 0 230760000 107890000 0 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104.85 2 0.0021582 109096 QUIQUE_C1218_190116_001 96.253 77.562 1808000000 120760000 118500000 157180000 136340000 141600000 109480000 140240000 137300000 124410000 71690000 186520000 162520000 201440000 47361 2524 44213 426361;426362;426363;426364;426365;426366;426367;426368;426369;426370;426371;426372;426373;426374 544323;544324;544325;544326;544327;544328;544329;544330;544331;544332;544333;544334;544335;544336;544337;544338;544339;544340;544341;544342;544343;544344;544345;544346;544347;544348 544323 26 VLEALQVLR Unmodified 1039.639 0.63897988 4182 Q9H7D7;C9JCS7 WDR26 WD repeat-containing protein 26 yes no 0 0 0 1 1 1 1 95.369 95.369 2 0.0092583 97321 QUIQUE_C1277_190116_001 76.478 46.13 59766000 0 23196000 0 22477000 0 0 0 0 0 14093000 0 0 0 47362 4182 44214 426375;426376;426377;426378 544349;544350;544351;544352 544350 4 VLECDIIK Unmodified 988.52632 0.52631789 4055 Q9BWF3;E9PB51;D6R9K7;J3QRR5 RBM4 RNA-binding protein 4 no no 0 0 0 1 54.091 54.091 2 0.059892 49262 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55699 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.37 148.56 220240000 0 0 0 0 0 0 0 83349000 40390000 0 0 38089000 58409000 47366 1377 44218 426392;426393;426394;426395;426396 544367;544368;544369;544370;544371 544368 5 VLEDNKLPGAICSLTCGGADIGTAMAK Oxidation (M) 2777.3398 0.33978603 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;H0YHM6 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 107.67 107.67 3 3.6589E-18 110871 QUIQUE_C1277_190116_001 88.278 80.918 1191000000 91917000 137230000 170290000 122550000 148530000 180050000 0 0 0 0 0 144430000 195980000 47367 336 44219 426397;426398;426399;426400;426401;426402;426403;426404 544372;544373;544374;544375;544376;544377;544378;544379;544380;544381;544382;544383 544373 238 11 VLEDNKLPGAICSLTCGGADIGTAMAK Unmodified 2761.3449 0.34487141 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49;A0A0J9YWF7;A0A1B0GUY0;H0YHM6 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 122.35 122.35 2;3 1.1055E-36 128119 QUIQUE_C1576_190116_001 127.17 124.11 4650500000 434180000 546760000 690320000 404590000 444280000 428200000 474350000 154360000 178630000 67693000 250230000 254140000 322770000 47368 336 44219 426405;426406;426407;426408;426409;426410;426411;426412;426413;426414;426415;426416;426417;426418;426419;426420;426421;426422 544384;544385;544386;544387;544388;544389;544390;544391;544392;544393;544394;544395;544396;544397;544398;544399;544400;544401;544402;544403;544404;544405;544406 544398 22 VLEDQLTQILR Unmodified 1326.7507 0.75071518 1268 J3KPF0;F8VWT9;Q9Y4D8 HECTD4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4 yes no 0 0 0 1 1 114.02 114.02 2 0.043489 116177 QUIQUE_C1563_190116_001 63.184 39.865 20213000 0 12177000 0 0 0 8036000 0 0 0 0 0 0 0 47369 1268 44220 426423;426424 544407;544408 544408 0 VLEDSDLK Unmodified 917.47058 0.47057715 2007 P11021 HSPA5 78 kDa 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0.59421454 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 1 1 2 13.091 13.091 2;3 0.00010646 5516 QUIQUE_C1438_190116_001 106.42 84.186 466100000 15095000 11011000 12859000 1473500 87706000 3816800 29648000 104310000 47248000 0 14327000 43382000 95218000 47373 926;889 44224 426438;426439;426440;426441;426442;426443;426444;426445;426446;426447;426448;426449;426450;426451;426452;426453;426454;426455 544425;544426;544427;544428;544429;544430;544431;544432;544433;544434;544435;544436;544437;544438;544439;544440;544441;544442;544443;544444 544431 20 VLEEEKEAINQETVQQR Unmodified 2042.028 0.02801225 2009 P11137;E7EV03 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 54.617 54.617 2;3 1.5948E-202 53327 QUIQUE_C1438_190116_001 263.88 223.29 4642900000 589470000 257080000 435660000 402390000 459110000 416130000 94239000 546020000 343650000 72804000 384920000 232690000 408700000 47374 2009 44225 426456;426457;426458;426459;426460;426461;426462;426463;426464;426465;426466;426467;426468;426469;426470;426471;426472;426473;426474;426475;426476;426477;426478;426479 544445;544446;544447;544448;544449;544450;544451;544452;544453;544454;544455;544456;544457;544458;544459;544460;544461;544462;544463;544464;544465;544466;544467;544468 544454 24 VLEEHGEWWK Unmodified 1311.6248 0.62478638 1934 P07948;E5RJ37 LYN Tyrosine-protein kinase Lyn yes no 0 0 0 1 1 60.448 60.448 3 0.031875 59382 QUIQUE_C1368_190116_001 39.657 15.907 44045000 0 0 24086000 19959000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47375 1934 44226 426480;426481 544469;544470 544469 2 VLEEMEAR Unmodified 975.46953 0.46953129 1456;4204 O14910;Q9HAP6 LIN7A;LIN7B Protein lin-7 homolog A;Protein lin-7 homolog B no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 33.722 33.722 2 0.0067895 28490 QUIQUE_C1368_190116_001 100.45 60.909 512190000 0 0 88911000 94985000 103510000 0 95759000 0 0 0 129020000 0 0 47376 1456;4204 44227 426482;426483;426484;426485;426486;426487;426488 544471;544472;544473;544474;544475;544476;544477 544472 7 VLEEMESR Unmodified 991.46445 0.46444592 4298 Q9NUP9;G3V1D4 LIN7C Protein lin-7 homolog C yes no 0 0 0 1 1 1 1 31.013 31.013 2 0.021068 25920 QUIQUE_C1218_190116_001 75.738 13.08 262090000 99615000 87728000 0 0 0 0 0 74751000 0 0 0 0 0 47377 4298 44228 426489;426490;426491;426492 544478;544479;544480;544481 544478 4 VLEENQEHYHIVQK Unmodified 1764.8795 0.87949752 2684 P57740 NUP107 Nuclear pore complex protein Nup107 yes yes 0 0 0 1 25.148 25.148 3 0.010528 18722 QUIQUE_C1403_190116_001 44.89 28.361 36918000 0 0 0 36918000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47378 2684 44229 426493 544482 544482 1 VLEEQAQNLGLEGTLVSLAR Unmodified 2139.1535 0.15354711 950 E9PK67;E9PNI7;Q53GL7;E9PJI2;E9PPV8;E9PPE7;F8W8G7 PARP10 Poly [ADP-ribose] polymerase 10 yes no 0 0 0 1 1 138.48 138.48 3 0.023806 143928 QUIQUE_C1218_190116_001 28.813 24.785 52324000 18566000 0 0 0 33758000 0 0 0 0 0 0 0 0 47379 950 44230 426494;426495 544483;544484 544483 2 VLEEQINEGEQQLK Unmodified 1655.8366 0.83662965 1715 O95219 SNX4 Sorting nexin-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.844 73.844 2 1.2441E-28 73933 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.17 137.48 562070000 70955000 0 0 45734000 55378000 45921000 46781000 55832000 53890000 15462000 81125000 56380000 34614000 47380 1715 44231 426496;426497;426498;426499;426500;426501;426502;426503;426504;426505;426506 544485;544486;544487;544488;544489;544490;544491;544492;544493;544494;544495 544490 10 VLEESELAR Unmodified 1044.5451 0.54513908 800 D3DTX6;Q96SB3 PPP1R9B Neurabin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 39.543 39.543 2 0.0029423 34216 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.439 43.878 188360000 84005000 0 0 0 0 0 0 0 71838000 32519000 0 0 0 47381 800 44232 426507;426508;426509;426510 544496;544497;544498;544499;544500 544500 5 VLEFNCR Unmodified 936.44874 0.44873627 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 40.738 40.738 2 0.039952 36872 QUIQUE_C1563_190116_001 83.287 51.708 212340000 0 0 0 61792000 0 55088000 53364000 0 0 0 0 0 42093000 47382 2194 44233 426511;426512;426513;426514 544501;544502;544503;544504;544505 544503 5 VLEGMEVVR Unmodified 1030.5481 0.54811597 2210 P23284 PPIB Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 60.582 60.582 2 0.0081912 60271 QUIQUE_C1218_190116_001 79.474 52.781 1284900000 352020000 442230000 0 0 0 0 0 0 0 121640000 0 0 368980000 47383 2210 44234 426515;426516;426517;426518;426519;426520;426521 544506;544507;544508;544509;544510;544511;544512 544506 6 VLEGNEQFINAAK Unmodified 1431.7358 0.73579339 595 B1AN99;P35030 PRSS3 Trypsin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.629 63.629 2 2.9453E-05 62832 QUIQUE_DMIX3_190116_001 128.27 98.015 696220000 0 0 60534000 0 0 32147000 0 82467000 0 268520000 95469000 83996000 73096000 47384 595 44235 426522;426523;426524;426525;426526;426527;426528;426529;426530 544513;544514;544515;544516;544517;544518;544519;544520;544521 544517 9 VLEGSELELAK Unmodified 1186.6445 0.64451877 3091 Q14980 NUMA1 Nuclear mitotic apparatus protein 1 no no 0 0 0 1 1 65.129 65.129 2 0.01794 63873 QUIQUE_C1563_190116_001 70.552 30.905 98151000 0 0 56731000 0 0 41420000 0 0 0 0 0 0 0 47385 3091 44236 426531;426532 544522;544523 544523 1 VLEGVWIFYELPNYR Unmodified 1896.9774 0.97742065 2204 P22914 CRYGS Beta-crystallin S yes yes 0 0 0 1 163.09 163.09 2 0.00079307 167797 QUIQUE_DMIX3_190116_001 93.258 80.303 26781000 0 0 0 0 0 0 0 0 26781000 0 0 0 0 47386 2204 44237 426533 544524 544524 1 VLEILEVLVSR Unmodified 1268.7704 0.77038799 3267 Q5EBL4;A0A1B0GVV3 RILPL1 RILP-like protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 157.05 157.05 2 0.00026268 162400 QUIQUE_C1368_190116_001 120.68 76.875 196380000 13608000 18975000 14706000 0 0 21054000 18657000 15690000 27751000 0 22787000 29743000 13411000 47387 3267 44238 426534;426535;426536;426537;426538;426539;426540;426541;426542;426543 544525;544526;544527;544528;544529;544530;544531;544532;544533;544534;544535 544527 11 VLEILGK Unmodified 770.49019 0.49019038 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 59.755 59.755 2 0.036465 59112 QUIQUE_C1576_190116_001 86.086 10.776 640030000 0 67585000 0 155600000 0 0 76999000 0 0 53767000 133880000 0 152190000 47388 2465 44239 426544;426545;426546;426547;426548;426549 544536;544537;544538;544539;544540;544541;544542 544539 7 VLELAQLLDQIWR Unmodified 1595.9035 0.90352742 4388 Q9P2I0 CPSF2 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 171.2 171.2 2 1.1171E-09 175530 QUIQUE_DMIX3_190116_001 140.3 115.08 95158000 4407700 31540000 0 4127900 11799000 0 0 14934000 28350000 0 0 0 0 47389 4388 44240 426550;426551;426552;426553;426554;426555 544543;544544;544545;544546;544547;544548 544548 5 VLELDNVK Unmodified 928.52295 0.52294707 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.018 48.018 2 0.0074468 46192 QUIQUE_C1218_190116_001 98.009 34.799 7149400000 940990000 955390000 847010000 0 705030000 703480000 0 824960000 0 425650000 883730000 0 863150000 47390 2309 44241 426556;426557;426558;426559;426560;426561;426562;426563;426564 544549;544550;544551;544552;544553;544554;544555;544556;544557;544558 544549 9 VLELDPALAPVVSR Unmodified 1477.8504 0.85042922 1381 O00170 AIP AH receptor-interacting protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.04 114.04 2 0.00023728 116845 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.353 58.644 1492100000 102530000 112050000 131860000 130150000 103900000 131320000 136420000 120150000 96094000 48095000 140850000 95890000 142800000 47391 1381 44242 426565;426566;426567;426568;426569;426570;426571;426572;426573;426574;426575;426576;426577 544559;544560;544561;544562;544563;544564;544565;544566;544567;544568;544569;544570;544571;544572 544566 8 VLELDTLVDNLSIDPSSGDIWVGCHPNGQK Unmodified 3277.5925 0.59250656 300 A0A0J9YXF2;A0A0J9YYG4;Q15165;J3QT77 PON2 Serum paraoxonase/arylesterase 2 yes no 0 0 0 1 1 157.18 157.18 3 7.5117E-06 162191 QUIQUE_DMIX3_190116_001 50.705 45.044 168910000 0 0 0 0 0 0 0 0 127290000 0 0 41622000 0 47392 300 44243 426578;426579 544573;544574 544573 2 VLELEDELQESR Unmodified 1458.7202 0.72020291 2919 Q08378 GOLGA3 Golgin subfamily A member 3 yes yes 0 0 0 1 89.305 89.305 2 0.01168 92791 QUIQUE_C1438_190116_001 58.676 29.95 26045000 0 0 0 0 26045000 0 0 0 0 0 0 0 0 47393 2919 44244 426580 544575 544575 1 VLELEGEK Unmodified 915.49131 0.49131259 2717 P61201;H0YKU5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 34.33 34.33 2 0.054229 29176 QUIQUE_C1563_190116_001 54.611 21.254 108110000 0 0 0 44060000 0 64054000 0 0 0 0 0 0 0 47394 2717 44245 426581;426582 544576;544577 544577 2 VLELEGEKGEWGFK Unmodified 1619.8195 0.81952302 2717 P61201;H0YKU5 COPS2 COP9 signalosome complex subunit 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 90.068 90.068 2;3 0.00018681 92954 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.592 86.534 710470000 215510000 0 0 151840000 0 0 0 0 33203000 0 0 259820000 50091000 47395 2717 44246 426583;426584;426585;426586;426587;426588;426589;426590;426591;426592;426593;426594;426595;426596 544578;544579;544580;544581;544582;544583;544584;544585;544586;544587;544588;544589;544590;544591 544588 13 VLELLLPIR Unmodified 1064.6958 0.69576648 3289 Q5R3I4;H7C089 TTC38 Tetratricopeptide repeat protein 38 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.18 131.18 2 0.00039627 135498 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.62 79.966 236280000 21591000 0 27737000 26465000 13303000 18721000 14421000 6163000 25120000 9869600 29963000 0 42922000 47396 3289 44247 426597;426598;426599;426600;426601;426602;426603;426604;426605;426606;426607;426608;426609 544592;544593;544594;544595;544596;544597;544598;544599;544600;544601;544602;544603;544604;544605;544606;544607 544603 16 VLELPYQGEELSMVILLPDDIEDESTGLK Oxidation (M) 3260.6262 0.62615768 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 0 1 0 1 167.68 167.68 3 8.424E-13 169653 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.641 57.126 39964000 0 0 0 0 0 0 0 39964000 0 0 0 0 0 47397 2324 44248 426610 544608 544608 1707 1 VLELPYQGEELSMVILLPDDIEDESTGLKK Unmodified 3372.7262 0.72620608 2324 P30740 SERPINB1 Leukocyte elastase inhibitor yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 164.98 164.98 3 4.3312E-36 167058 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.65 96.036 505260000 0 0 0 0 0 0 52491000 123300000 96170000 0 88529000 58013000 86754000 47398 2324 44249 426611;426612;426613;426614;426615;426616 544609;544610;544611;544612;544613;544614 544610 5 VLELSIPASAEQIQHLAGAIAER Unmodified 2415.3122 0.31217302 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 149.06 149.06 3;4 1.9005E-23 155540 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59302000 24559000 35370000 47754000 68684000 47401 2360 44252 426632;426633;426634;426635;426636;426637;426638;426639;426640;426641 544633;544634;544635;544636;544637;544638;544639;544640;544641;544642;544643 544643 6 VLEMSDIVLLITDIR Unmodified 1728.9696 0.96955808 2401 P36915;A2AB27 GNL1 Guanine nucleotide-binding protein-like 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 2 2 2 2 173.02 173.02 2;3 4.1964E-29 176688 QUIQUE_DMIX7_190116_001 164.13 150.47 270130000 10047000 6176700 0 4331200 0 0 43514000 14813000 64350000 0 60856000 43386000 22654000 47402 2401 44253 426642;426643;426644;426645;426646;426647;426648;426649;426650;426651;426652;426653;426654;426655;426656 544644;544645;544646;544647;544648;544649;544650;544651;544652;544653;544654;544655;544656;544657;544658 544655 15 VLENAEGAR Unmodified 957.48796 0.48795855 2415 P38646;A0A3B3ITI4;D6RJI2;D6RA73 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.992 15.992 2 0.00025853 7980 QUIQUE_C1277_190116_001 137.9 94.99 3851500000 242510000 486350000 77427000 174490000 85716000 369950000 82062000 558830000 517710000 571200000 28607000 575050000 81573000 47403 2415 44254 426657;426658;426659;426660;426661;426662;426663;426664;426665;426666;426667;426668;426669 544659;544660;544661;544662;544663;544664;544665;544666;544667;544668;544669;544670;544671;544672;544673;544674;544675;544676 544662 18 VLENIELNK Unmodified 1070.5972 0.59717465 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 1 1 1 1 54.659 54.659 2 0.011794 51892 QUIQUE_C1563_190116_001 72.23 7.6628 52968000 18389000 18399000 0 0 0 16179000 0 0 0 0 0 0 0 47404 574 44255 426670;426671;426672;426673 544677;544678;544679;544680 544679 4 VLENIELNKK Unmodified 1198.6921 0.69213767 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 32.66 32.66 2 0.0086355 27977 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.1 31.705 96463000 0 0 0 0 0 0 0 0 22710000 0 26022000 23525000 24206000 47405 574 44256 426674;426675;426676;426677;426678 544681;544682;544683;544684;544685 544683 5 VLENILQPMIVSGMLEHETIQGVSGVKPTGLR Unmodified 3444.8473 0.84728146 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 149.19 149.19 4 2.2519E-06 152345 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.261 45.102 557240000 0 143470000 107920000 0 0 0 65773000 141990000 0 0 98085000 0 0 47406 4607 44257 426679;426680;426681;426682;426683 544686;544687;544688;544689;544690 544689 5 VLENVEGLPSPGSQAAEDLQQDINAQSLEK Unmodified 3178.563 0.56298057 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.9 138.9 3 1.3704E-46 144546 QUIQUE_C1218_190116_001 128.06 121.67 241390000 41292000 0 54599000 0 0 37235000 32656000 54293000 0 21319000 0 0 0 47407 3676 44258 426684;426685;426686;426687;426688;426689 544691;544692;544693;544694;544695;544696 544691 5 VLENWWSVLEPPLFLK Unmodified 1969.0713 0.071321035 3270 Q5GLZ8 HERC4 Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4 yes yes 0 0 0 1 171.25 171.25 2 0.041571 174799 QUIQUE_C1277_190116_001 51.612 43.099 17740000 0 17740000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47408 3270 44259 426690 544697 544697 1 VLEPMPSTAEISTSGAVLK Oxidation (M) 1945.0078 0.0077940794 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.316 86.316 2 3.3127E-28 86805 QUIQUE_C1563_190116_001 144.27 110.39 2396100000 122790000 165660000 207430000 145650000 119930000 115570000 142470000 160440000 309040000 160310000 264290000 238420000 244150000 47409 2948 44260 426691;426692;426693;426694;426695;426696;426697;426698;426699;426700;426701;426702;426703 544698;544699;544700;544701;544702;544703;544704;544705;544706;544707;544708;544709;544710 544703 2417 13 VLEPMPSTAEISTSGAVLK Unmodified 1929.0129 0.012879457 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.53 102.53 2 2.7935E-28 105427 QUIQUE_C1368_190116_001 144.27 130.6 4058700000 414670000 441120000 496170000 319880000 333800000 384600000 383870000 264850000 270610000 123960000 302640000 0 322510000 47410 2948 44260 426704;426705;426706;426707;426708;426709;426710;426711;426712;426713;426714;426715 544711;544712;544713;544714;544715;544716;544717;544718;544719;544720;544721;544722;544723;544724;544725;544726;544727;544728;544729;544730;544731 544713 21 VLEPTLK Unmodified 798.48511 0.485105 822 D6RF35;P02774 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 1 1 1 33.169 33.169 2 0.035447 28819 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.866 36.747 362550000 0 0 0 0 170290000 0 0 0 51461000 0 140800000 0 0 47411 822 44261 426716;426717;426718 544732;544733;544734 544733 3 VLEPYPSK Unmodified 931.50148 0.50148335 4389 Q9P2J5 LARS Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 30.667 30.667 2 0.040092 25914 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.478 26.375 91249000 0 0 0 43086000 0 0 0 48164000 0 0 0 0 0 47412 4389 44262 426719;426720 544735;544736 544736 2 VLEQLIVAHFPMQSR Unmodified 1766.9502 0.95016004 2813 P78527 PRKDC DNA-dependent protein kinase catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 113.3 113.3 3 0.0079905 117376 QUIQUE_DMIX3_190116_001 45.33 32.947 12295000 0 0 0 0 0 0 0 0 12295000 0 0 0 0 47413 2813 44263 426721 544737 544737 1 VLEQLQR Unmodified 884.50797 0.50796571 2025 Q5HY81;P11441 UBL4A Ubiquitin-like protein 4A yes no 0 0 0 1 1 30.937 30.937 2 0.04113 25648 QUIQUE_C1368_190116_001 82.263 28.911 67027000 0 0 38440000 0 0 0 0 0 0 0 28587000 0 0 47414 2025 44264 426722;426723 544738;544739 544738 2 VLEQLTGQTPVFSK Unmodified 1545.8403 0.84025847 2771 P62913;Q5VVC8 RPL11 60S ribosomal protein L11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.998 92.998 2 1.5753E-10 96106 QUIQUE_C1576_190116_001 135.99 109.87 2928600000 169340000 197150000 226530000 207690000 197010000 188950000 226620000 237500000 275530000 116270000 331770000 259130000 295160000 47415 2771 44265 426724;426725;426726;426727;426728;426729;426730;426731;426732;426733;426734;426735;426736 544740;544741;544742;544743;544744;544745;544746;544747;544748;544749;544750;544751;544752;544753 544747 14 VLEQPVVVQSVGTDGR Unmodified 1681.8999 0.89989861 4081 S4R369;Q9BZE1;H0Y4J2;A6NHR2 MRPL37 39S ribosomal protein L37, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 70.867 70.867 2 2.0099E-14 70776 QUIQUE_C1368_190116_001 131.06 95.1 150180000 26934000 0 42064000 16884000 0 0 33202000 0 31097000 0 0 0 0 47416 4081 44266 426737;426738;426739;426740;426741 544754;544755;544756;544757;544758 544755 4 VLESEEQVLVMYHR Unmodified 1730.8662 0.86615564 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.501 86.501 3 0.0010548 88776 QUIQUE_C1576_190116_001 67.997 39.451 319850000 34761000 37436000 56650000 31209000 44778000 37977000 43788000 33253000 0 0 0 0 0 47417 196 44267 426742;426743;426744;426745;426746;426747;426748;426749;426750 544759;544760;544761;544762;544763;544764;544765;544766;544767;544768;544769 544767 10 VLESINVQMDENTLHEILNEVDLNK Oxidation (M) 2924.4437 0.44371706 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 1 1 2 158.05 158.05 3 4.67E-09 161956 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.428 53.634 405780000 0 0 132650000 0 46038000 0 71611000 0 0 0 60123000 95351000 0 47418 2463 44268 426751;426752;426753;426754;426755;426756 544770;544771;544772;544773;544774;544775 544774 1894 6 VLESINVQMDENTLHEILNEVDLNK Unmodified 2908.4488 0.44880244 2463 P43304 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 162.07 162.07 3 1.9308E-19 166704 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.84 90.434 1533700000 0 0 222750000 0 0 63018000 251530000 201450000 195020000 0 371560000 228400000 0 47419 2463 44268 426757;426758;426759;426760;426761;426762;426763 544776;544777;544778;544779;544780;544781;544782 544780 6 VLESSLWR Unmodified 988.53418 0.53418046 647 B5MED8;Q96PQ0 SORCS2 VPS10 domain-containing receptor SorCS2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 69.868 69.868 2 0.018737 71021 QUIQUE_C1218_190116_001 79.469 29.429 64226000 37616000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 26610000 47420 647 44269 426764;426765;426766;426767;426768;426769;426770;426771;426772 544783;544784;544785;544786;544787;544788;544789;544790;544791 544783 9 VLESTPNNGYLYHQIGCCYK Unmodified 2415.0988 0.098751127 1452 O14879 IFIT3 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 78.145 78.145 3 3.0777E-18 79143 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.56 86.958 249080000 0 0 0 0 0 0 0 45427000 38496000 0 123300000 0 41858000 47421 1452 44270 426773;426774;426775;426776 544792;544793;544794;544795;544796 544793 4 VLESVAR Unmodified 772.4443 0.44430282 3601 Q8N5K1;A0A2R8Y540;I3L1N9 CISD2 CDGSH iron-sulfur domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 19.961 19.961 2 0.050616 13004 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.439 5.5236 150360000 0 0 0 0 0 0 0 0 150360000 0 0 0 0 47422 3601 44271 426777 544797 544797 1 VLESVVADLLNR Unmodified 1326.7507 0.75071518 3428 Q709C8 VPS13C Vacuolar protein sorting-associated protein 13C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 136.39 136.39 2 0.00073346 142346 QUIQUE_C1576_190116_001 110.53 70.182 129150000 0 0 32319000 0 0 0 26906000 0 24661000 20621000 0 0 24643000 47423 3428 44272 426778;426779;426780;426781;426782 544798;544799;544800;544801;544802 544799 3 VLETAEDIQER Unmodified 1301.6463 0.64630969 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFF6;A0A1B0GTB7;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 43.752 43.752 2 4.1346E-08 41160 QUIQUE_C1438_190116_001 152.28 109.03 31237000000 1772200000 2454100000 2390700000 2400100000 3226000000 2144500000 2128800000 2138000000 2668800000 858460000 2761700000 2769800000 3523600000 47424 267;275;3025 44273 426783;426784;426785;426786;426787;426788;426789;426790;426791;426792;426793;426794;426795;426796;426797 544803;544804;544805;544806;544807;544808;544809;544810;544811;544812;544813;544814;544815;544816;544817;544818;544819;544820;544821;544822;544823;544824;544825;544826;544827 544811 25 VLETAEDIQERR Unmodified 1457.7474 0.74742071 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SFF6;A0A1B0GTB7;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 2 1 33.82 33.82 2;3 0.0077767 28366 QUIQUE_DMIX3_190116_001 56.225 27.419 468130000 0 0 0 0 0 0 0 468130000 0 0 0 0 0 47425 267;275;3025 44274 426798;426799;426800 544828;544829;544830 544830 3 VLETAEEIQER Unmodified 1315.662 0.66195975 1820 P02549 SPTA1 Spectrin alpha chain, erythrocytic 1 yes yes 0 0 0 1 1 45.331 45.331 2 0.0056344 43039 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.974 33.816 36688000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36688000 0 0 47426 1820 44275 426801;426802 544831;544832 544831 2 VLETFLAK Unmodified 919.53787 0.53786886 3059 Q14258;A0A3B3IUA7 TRIM25 E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.636 67.636 2 0.014995 67424 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.265 13.316 240380000 0 0 25282000 22890000 29392000 0 25496000 31111000 29058000 14371000 32104000 30673000 0 47427 3059 44276 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427079 545179 545179 1 VLFPLGLGHAAEYVRPR Unmodified 1894.0577 0.057736656 4574 Q9Y2Z9;A0A0D9SFJ1 COQ6 Ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ6, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 98.083 98.083 4 2.8797E-07 100696 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.31 88.428 164700000 0 24934000 24744000 0 0 0 36285000 30972000 47770000 0 0 0 0 47458 4574 44306 427080;427081;427082;427083;427084 545180;545181;545182;545183;545184 545184 3 VLFPLLTK Unmodified 929.59499 0.5949898 3730 Q92538 GBF1 Golgi-specific brefeldin A-resistance guanine nucleotide exchange factor 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 110.2 110.2 2 0.044926 115501 QUIQUE_C1218_190116_001 77.923 26.35 8303400 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8303400 0 47459 3730 44307 427085;427086;427087 545185;545186;545187 545185 3 VLFSNIEDILEVHK Unmodified 1654.893 0.89302232 3676 Q8TCU6 PREX1 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.24 136.24 3 6.0687E-05 140418 QUIQUE_C1277_190116_001 94.728 83.114 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545207;545208;545209;545210;545211;545212;545213;545214;545215;545216;545217;545218;545219;545220;545221;545222;545223;545224;545225;545226;545227;545228;545229;545230;545231;545232;545233;545234;545235;545236;545237;545238;545239;545240;545241;545242;545243;545244;545245;545246;545247;545248;545249;545250;545251;545252;545253;545254;545255;545256;545257;545258;545259;545260;545261;545262;545263;545264;545265;545266;545267;545268;545269;545270;545271;545272;545273;545274;545275;545276;545277;545278;545279;545280;545281;545282;545283;545284;545285;545286;545287;545288;545289;545290;545291;545292;545293;545294;545295;545296;545297;545298;545299;545300;545301;545302;545303;545304;545305;545306;545307;545308;545309;545310;545311;545312;545313;545314;545315;545316;545317;545318;545319;545320;545321;545322;545323;545324;545325;545326;545327;545328;545329;545330;545331;545332;545333;545334;545335;545336;545337;545338;545339;545340;545341;545342;545343;545344;545345;545346;545347;545348;545349;545350;545351;545352;545353;545354;545355;545356;545357;545358;545359;545360;545361;545362;545363;545364;545365;545366;545367;545368;545369;545370;545371;545372;545373;545374;545375;545376;545377;545378;545379;545380;545381;545382;545383;545384;545385;545386 545234 167 VLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDK Unmodified 3128.5601 0.56008422 2799 P68871;A0A2R8Y7R2 HBB Hemoglobin subunit beta;LVV-hemorphin-7;Spinorphin yes no 0 0 1 1 2 1 139.46 139.46 4;5 7.8649E-09 146545 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.085 51.023 218300000 0 0 0 0 45102000 0 0 0 0 0 149580000 23619000 0 47467 2799 44315 427207;427208;427209;427210 545387;545388;545389;545390 545389 4 VLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDIAR Oxidation (M) 3369.6333 0.63332552 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 1 0 1 2 2 1 3 1 2 2 1 2 1 145.7 145.7 3;4 1.733E-75 151212 QUIQUE_C1368_190116_001 148.22 131.82 872210000 56302000 89036000 171790000 32941000 136160000 26358000 101990000 0 103340000 16443000 0 137840000 0 47468 1971 44316 427211;427212;427213;427214;427215;427216;427217;427218;427219;427220;427221;427222;427223;427224;427225;427226;427227;427228 545391;545392;545393;545394;545395;545396;545397;545398;545399;545400;545401;545402;545403;545404;545405;545406;545407;545408;545409;545410;545411;545412;545413;545414 545395 1243 22 VLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDIAR Unmodified 3353.6384 0.6384109 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 2 2 1 2 2 1 165.57 165.57 3;4 5.6913E-75 170645 QUIQUE_DMIX3_190116_001 145.57 122.18 3102400000 163080000 264500000 598090000 153130000 180510000 163340000 301560000 168150000 207030000 13086000 303940000 373420000 212550000 47469 1971 44316 427229;427230;427231;427232;427233;427234;427235;427236;427237;427238;427239;427240;427241;427242;427243;427244;427245;427246;427247 545415;545416;545417;545418;545419;545420;545421;545422;545423;545424;545425;545426;545427;545428;545429;545430;545431;545432;545433;545434;545435;545436;545437;545438;545439;545440;545441;545442 545435 26 VLGALLFVK Unmodified 958.62154 0.62153891 3527 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545452;545453;545454;545455;545456;545457;545458;545459;545460;545461;545462;545463;545464 545454 12 VLGATLLPDLIQK Unmodified 1379.8388 0.8388019 959 E9PLK3;P55786;H0YDG0 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 129.93 129.93 2;3 2.8398E-54 134540 QUIQUE_DMIX3_190116_001 205.18 167.83 12802000000 858140000 1111500000 989700000 1041200000 1154100000 1084900000 930780000 937130000 1007000000 435760000 1069000000 980750000 1201900000 47472 959 44319 427268;427269;427270;427271;427272;427273;427274;427275;427276;427277;427278;427279;427280;427281;427282 545465;545466;545467;545468;545469;545470;545471;545472;545473;545474;545475;545476;545477;545478;545479;545480;545481;545482;545483;545484;545485;545486;545487;545488;545489;545490;545491;545492;545493;545494;545495 545486 31 VLGDIHTTLLSAVIPNAFR Unmodified 2036.1419 0.14186022 3907 Q96MZ0;H0UIB3;Q5TE61;A0A087WWT8 GDAP1L1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1-like 1 yes no 0 0 0 1 1 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545568;545569;545570;545571;545572;545573;545574;545575;545576;545577;545578;545579;545580 545568 9 VLGEAMTGISQNAK Unmodified 1417.7235 0.72351415 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.159 59.159 2 1.9459E-86 58098 QUIQUE_DMIX3_190116_001 214.82 158.57 1115800000 80617000 76983000 123780000 146740000 124470000 52655000 79247000 91676000 104970000 0 135250000 99423000 0 47480 4600 44327 427336;427337;427338;427339;427340;427341;427342;427343;427344;427345;427346 545581;545582;545583;545584;545585;545586;545587;545588;545589;545590;545591;545592;545593;545594 545592 13 VLGEAMTGISQNAK Oxidation (M) 1433.7184 0.71842877 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 1 0 1 1 35.142 35.142 2 0.00041779 30372 QUIQUE_C1403_190116_001 100.69 65.242 55119000 0 0 0 35556000 0 0 0 0 0 19563000 0 0 0 47481 4600 44327 427347;427348 545595;545596 545595 3035 1 VLGEEVSFPLTGCLGQVVEDK Unmodified 2275.1406 0.14059917 1402 O00408;E9PEF1;H0YFL1;H0YG13 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 0 1 1 1 145 145 2;3 0.0020794 150364 QUIQUE_C1218_190116_001 44.441 31.014 92064000 34713000 35028000 0 22323000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47482 1402 44328 427349;427350;427351 545597;545598;545599 545597 3 VLGEEVSFPLTGCLGQVVEDKK Unmodified 2403.2356 0.23556218 1402 O00408;E9PEF1;H0YFL1;H0YG13 PDE2A cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 127.76 127.76 3 0.00012991 133574 QUIQUE_C1576_190116_001 52.509 44.887 431290000 0 91500000 54333000 0 62447000 0 89041000 0 0 0 77810000 56163000 0 47483 1402 44329 427352;427353;427354;427355;427356;427357 545600;545601;545602;545603;545604;545605 545603 6 VLGEKPELPDGGDDDDIIADISNRK Unmodified 2680.3192 0.31916847 4664 Q9Y6U3;E5RHN8;E5RHX6 SCIN Adseverin yes no 0 0 2 1 105.27 105.27 3 1.3784E-09 107099 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.237 72.438 39981000 0 0 0 0 0 0 0 39981000 0 0 0 0 0 47484 4664 44330 427358 545606 545606 1 VLGELWPLFGGR Unmodified 1342.7398 0.73975656 2278 P28288 ABCD3 ATP-binding cassette sub-family D member 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 151.86 151.86 2 0.0040935 154716 QUIQUE_DMIX1_190116_001 95.311 68.007 85169000 0 0 0 20389000 0 29075000 0 29835000 0 0 0 0 5870800 47485 2278 44331 427359;427360;427361;427362;427363;427364;427365 545607;545608;545609;545610;545611;545612;545613 545612 5 VLGESMAGISQNAK Unmodified 1403.7079 0.70786408 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 56.794 56.794 2 0.00019649 54856 QUIQUE_C1563_190116_001 100.69 77.615 755860000 51242000 77669000 82061000 64178000 49164000 51255000 62154000 0 43169000 0 97885000 64998000 112090000 47486 4606 44332 427366;427367;427368;427369;427370;427371;427372;427373;427374;427375;427376;427377;427378 545614;545615;545616;545617;545618;545619;545620;545621;545622;545623;545624;545625;545626 545619 12 VLGESMAGISQNAK Oxidation (M) 1419.7028 0.70277871 4606 Q9Y4G6;A0A1B0GVU7;H0YMT1 TLN2 Talin-2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 32.419 32.419 2 0.0088268 27111 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111.96 111.96 2;3 7.4189E-13 114615 QUIQUE_DMIX1_190116_001 133.05 111.42 2442200000 169530000 213920000 381140000 221260000 186000000 145040000 292990000 117780000 194810000 0 192660000 143230000 183900000 47489 1371 44334 427397;427398;427399;427400;427401;427402;427403;427404;427405;427406;427407;427408;427409;427410;427411;427412;427413;427414;427415;427416 545653;545654;545655;545656;545657;545658;545659;545660;545661;545662;545663;545664;545665;545666;545667;545668;545669;545670;545671;545672;545673;545674;545675;545676;545677;545678;545679;545680;545681;545682;545683;545684;545685;545686;545687;545688 545680 34 VLGFCQLNLPSGK Unmodified 1431.7544 0.75442035 590 B1AKY9;P50993;H0Y7C1 ATP1A2 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.14 108.14 2 4.2689E-10 113264 QUIQUE_C1218_190116_001 145.99 122.92 3295300000 229380000 182730000 376040000 258590000 227750000 161570000 203090000 402180000 381910000 60137000 314640000 224320000 272960000 47490 590 44335 427417;427418;427419;427420;427421;427422;427423;427424;427425;427426;427427;427428;427429 545689;545690;545691;545692;545693;545694;545695;545696;545697;545698;545699;545700;545701;545702;545703 545689 15 VLGFLIENFK Unmodified 1178.6699 0.66994566 3888 Q96JC1 VPS39 Vam6/Vps39-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 130.94 130.94 2 0.0076585 136425 QUIQUE_C1218_190116_001 88.37 50.209 57357000 21308000 20411000 0 0 15638000 0 0 0 0 0 0 0 0 47491 3888 44336 427430;427431;427432;427433;427434 545704;545705;545706;545707;545708 545704 5 VLGFSHEEIISMLR Unmodified 1629.8549 0.85486267 3459 Q7Z406;M0QY43 MYH14 Myosin-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.62 119.62 3 9.5462E-08 122751 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.76 92.207 433510000 41969000 49719000 38718000 46890000 0 37186000 37990000 31721000 32368000 0 50593000 32238000 34119000 47492 3459 44337 427435;427436;427437;427438;427439;427440;427441;427442;427443;427444;427445 545709;545710;545711;545712;545713;545714;545715;545716;545717;545718;545719 545715 11 VLGGSFADQK Unmodified 1020.524 0.52400971 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 37.332 37.332 2 0.0016705 33042 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.85 42.167 48979000 0 0 0 0 0 0 0 48979000 0 0 0 0 0 47493 1414;3777 44338 427446 545720 545720 1 VLGHVNNILISAVLPTAFR Unmodified 2033.1786 0.17858007 3662 Q8TB36 GDAP1 Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 2 2 2 138.42 138.42 2;3 8.7067E-46 142818 QUIQUE_C1403_190116_001 119.68 116.19 2810500000 232310000 157600000 191070000 133060000 105780000 106300000 240520000 218140000 335580000 89320000 389810000 243560000 367390000 47494 3662 44339 427447;427448;427449;427450;427451;427452;427453;427454;427455;427456;427457;427458;427459;427460;427461;427462;427463;427464;427465 545721;545722;545723;545724;545725;545726;545727;545728;545729;545730;545731;545732;545733;545734;545735;545736;545737;545738;545739;545740 545725 20 VLGIESHHDFLVK Unmodified 1492.8038 0.80381338 4424 Q9UH62 ARMCX3 Armadillo repeat-containing X-linked protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 61.264 61.264 3 0.0003968 61560 QUIQUE_C1218_190116_001 80.318 63.107 128770000 35778000 24228000 33259000 0 0 0 35508000 0 0 0 0 0 0 47495 4424 44340 427466;427467;427468;427469 545741;545742;545743;545744 545741 4 VLGILAMIDEGETDWK Oxidation (M) 1804.8917 0.89170169 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.81 140.81 2 1.1347E-06 145542 QUIQUE_DMIX8_190116_001 111.94 104.37 1295000000 167710000 110790000 176990000 73581000 215480000 0 125450000 115930000 0 30438000 0 136680000 141900000 47496 3120 44341 427470;427471;427472;427473;427474;427475;427476;427477;427478;427479 545745;545746;545747;545748;545749;545750;545751;545752;545753;545754;545755 545754 2582 10 VLGILAMIDEGETDWK Unmodified 1788.8968 0.89678707 3120 Q15181;Q5SQT6 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes no 0 0 0 2 2 2 1 3 2 2 2 1 1 1 1 162.2 162.2 2;3 2.8286E-24 167493 QUIQUE_C1218_190116_001 176.42 153.78 7724400000 675130000 426920000 507240000 270560000 613850000 235300000 627160000 1346400000 72391000 71350000 1015100000 0 1863000000 47497 3120 44341 427480;427481;427482;427483;427484;427485;427486;427487;427488;427489;427490;427491;427492;427493;427494;427495;427496;427497;427498;427499 545756;545757;545758;545759;545760;545761;545762;545763;545764;545765;545766;545767;545768;545769;545770;545771;545772;545773;545774;545775;545776;545777;545778;545779;545780;545781;545782;545783;545784;545785;545786;545787;545788;545789;545790;545791;545792 545756 35 VLGISPDEQK Unmodified 1084.5764 0.57643921 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 42.22 42.22 2 0.025385 38501 QUIQUE_C1368_190116_001 68.016 46.426 76266000 0 0 42422000 33843000 0 0 0 0 0 0 0 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33.867 109990000 41809000 33412000 0 0 34771000 0 0 0 0 0 0 0 0 47501 3312 44345 427514;427515;427516 545809;545810;545811 545811 3 VLGLGLGCLR Unmodified 1056.6114 0.61138492 4003 Q9BRJ7;K7EIN2;K7ENA3;W4VSQ8 NUDT16L1 Protein syndesmos yes no 0 0 0 1 1 1 99.607 99.607 2 0.0059115 101630 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.854 38.834 197910000 0 0 0 54221000 0 51404000 0 92288000 0 0 0 0 0 47502 4003 44346 427517;427518;427519 545812;545813;545814 545814 3 VLGLLGALDPYK Unmodified 1257.7333 0.7332742 2447 P42345 MTOR Serine/threonine-protein kinase mTOR yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.17 138.17 2 0.0020052 142795 QUIQUE_DMIX8_190116_001 77.677 56.776 255730000 19128000 29551000 21469000 12454000 22172000 15036000 0 20659000 31084000 0 30298000 29085000 24797000 47503 2447 44347 427520;427521;427522;427523;427524;427525;427526;427527;427528;427529;427530 545815;545816;545817;545818;545819;545820;545821;545822;545823;545824;545825;545826 545826 12 VLGLQDTITAELVVIEDAAEPK Unmodified 2323.2523 0.25225811 1656 O75781;A0A087WTK8;A0A087WWY4 PALM Paralemmin-1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 3 2 2 2 2 2 2 171.24 171.24 2;3 2.3642E-45 175931 QUIQUE_C1368_190116_001 154.6 146.19 1316600000 50335000 233690000 38954000 14622000 70282000 0 530720000 28227000 112130000 10342000 94175000 91347000 41801000 47504 1656 44348 427531;427532;427533;427534;427535;427536;427537;427538;427539;427540;427541;427542;427543;427544;427545;427546;427547;427548;427549;427550;427551;427552;427553 545827;545828;545829;545830;545831;545832;545833;545834;545835;545836;545837;545838;545839;545840;545841;545842;545843;545844;545845;545846;545847;545848;545849;545850;545851 545832 23 VLGLVLLR Unmodified 881.60622 0.60622319 1298 J3QLE5;P63162;P14678 SNRPN;SNRPB Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N;Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.9 108.9 2 0.0036102 113271 QUIQUE_DMIX5_190116_001 114.54 77.983 1744500000 150910000 167030000 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A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 112.97 112.97 2 0.0048763 118285 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.93 44.502 347040000 0 47531000 0 0 0 0 0 0 65322000 0 85941000 67050000 81194000 47509 173 44352 427600;427601;427602;427603;427604 545917;545918;545919;545920;545921 545919 2 VLGPCSDILK Unmodified 1100.59 0.58998078 2002 P10644 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 67.051 67.051 2 0.018652 68395 QUIQUE_C1218_190116_001 74.92 51.849 162940000 0 0 0 0 0 162940000 0 0 0 0 0 0 0 47510 2002 44353 427605;427606;427607;427608 545922;545923;545924;545925 545922 3 VLGPCSDILKR Unmodified 1256.6911 0.69109181 2002 P10644 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 1 1 1 1 1 50.272 50.272 3 0.00028062 47846 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.653 58.891 570570000 0 0 0 0 0 0 0 151450000 131270000 0 163800000 124050000 0 47511 2002 44354 427609;427610;427611;427612 545926;545927;545928;545929 545929 3 VLGPCSEILKR Unmodified 1270.7067 0.70674187 2330 P31321;H7BYW5 PRKAR1B cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit yes no 0 0 1 1 1 48.213 48.213 3 0.00097455 45811 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.355 44.814 41446000 0 0 0 0 0 0 0 16055000 0 0 0 25391000 0 47512 2330 44355 427613;427614 545930;545931 545930 1 VLGPYTFSICDTSNFSDYIR Unmodified 2354.0889 0.088897947 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 150.9 150.9 2 1.7343E-12 153384 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.93 102.9 860800000 38996000 48505000 48204000 39454000 73309000 40194000 88851000 97008000 86456000 0 90327000 104930000 104560000 47513 2197 44356 427615;427616;427617;427618;427619;427620;427621;427622;427623;427624;427625;427626;427627 545932;545933;545934;545935;545936;545937;545938;545939;545940;545941;545942;545943;545944;545945;545946;545947;545948;545949;545950;545951;545952;545953;545954;545955;545956;545957;545958 545948 27 VLGQGSYGK Unmodified 907.47633 0.47633123 982 F2Z2J1;Q15349;D6RE03;D6RA62 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 20.34 20.34 2 0.042881 13037 QUIQUE_DMIX8_190116_001 52.716 21.427 98285000 0 0 0 0 0 0 0 46058000 0 0 0 0 52227000 47514 982 44357 427628;427629 545959;545960 545960 2 VLGQPHHELDSK Unmodified 1358.6943 0.69426293 609;1292 B4DHE8;Q96DH6;J3QKT5;J3KTC1 MSI2 RNA-binding protein Musashi homolog 2 no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 13.698 13.698 2;3 0.00052347 6041 QUIQUE_C1576_190116_001 104.22 75.264 201330000 0 37489000 0 0 6639700 0 13856000 0 117450000 0 0 3571500 22319000 47515 609;1292 44358 427630;427631;427632;427633;427634;427635;427636 545961;545962;545963;545964;545965;545966;545967 545964 6 VLGSEPAPVSAETLLSQAVEQLR Unmodified 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545984;545985;545986;545987;545988;545989;545990;545991;545992;545993;545994;545995;545996;545997;545998;545999;546000;546001;546002;546003;546004;546005;546006;546007;546008;546009;546010;546011;546012;546013;546014;546015;546016;546017;546018;546019;546020;546021;546022;546023;546024;546025;546026;546027;546028;546029;546030;546031;546032;546033;546034;546035;546036;546037;546038;546039;546040 546006 57 VLGSQEALHPVHYEEK Unmodified 1834.9214 0.92136233 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 3 2 1 3 2 3 3 3 2 1 1 2 37.47 37.47 2;3;4 4.3419E-165 33953 QUIQUE_C1218_190116_001 254.1 215.47 3456300000 519310000 288830000 40246000 435690000 275220000 517470000 519800000 230630000 266650000 61878000 51773000 248780000 0 47519 2179 44362 427678;427679;427680;427681;427682;427683;427684;427685;427686;427687;427688;427689;427690;427691;427692;427693;427694;427695;427696;427697;427698;427699;427700;427701;427702;427703 546041;546042;546043;546044;546045;546046;546047;546048;546049;546050;546051;546052;546053;546054;546055;546056;546057;546058;546059;546060;546061;546062;546063;546064;546065;546066;546067 546042 20 VLGTAFDPFLGGK Unmodified 1320.7078 0.70778773 3738 Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 124.52 124.52 2 2.9826E-13 127577 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.24 104.07 2598900000 223150000 264470000 194660000 224600000 292900000 145900000 202580000 138040000 156110000 119570000 243700000 190550000 202630000 47520 3738 44363 427704;427705;427706;427707;427708;427709;427710;427711;427712;427713;427714;427715;427716 546068;546069;546070;546071;546072;546073;546074;546075;546076;546077;546078;546079;546080;546081;546082;546083;546084;546085;546086;546087;546088;546089;546090;546091 546080 23 VLGTEDLYDYIDK Unmodified 1542.7454 0.74535503 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2 CSNK2A1 Casein kinase II subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 124.43 124.43 2 0.00050632 129785 QUIQUE_C1218_190116_001 117.94 90.823 534330000 104700000 70649000 49350000 64656000 0 91871000 103960000 0 0 49146000 0 0 0 47521 456 44364 427717;427718;427719;427720;427721;427722;427723;427724 546092;546093;546094;546095;546096;546097;546098;546099 546092 7 VLGTEDLYDYIDKYNIELDPR Unmodified 2543.2431 0.24314998 456 A0A2R8YD58;E7EU96;P68400;A0A2R8Y5A0;A0A2R8YF43;A0A2R8YFU2;A0A2R8YDP2 CSNK2A1 Casein kinase II subunit alpha yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 151.42 151.42 3 3.8737E-06 153994 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.009 35.88 1506200000 0 0 197700000 0 0 0 262580000 252320000 302560000 60083000 0 431000000 0 47522 456 44365 427725;427726;427727;427728;427729;427730 546100;546101;546102;546103;546104;546105;546106;546107;546108;546109 546103 10 VLGTEELYGYLK Unmodified 1383.7286 0.72858275 2152 P19784;H3BSA1;H3BV19 CSNK2A2 Casein kinase II subunit alpha' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.92 115.92 2 7.1368E-05 121071 QUIQUE_C1218_190116_001 123.86 91.926 476180000 60246000 0 47501000 52645000 44833000 0 47505000 27627000 43342000 0 46406000 61181000 44893000 47523 2152 44366 427731;427732;427733;427734;427735;427736;427737;427738;427739;427740 546110;546111;546112;546113;546114;546115;546116;546117;546118;546119;546120;546121 546110 9 VLGTEELYGYLKK Unmodified 1511.8235 0.82354577 2152 P19784;H3BSA1;H3BV19 CSNK2A2 Casein kinase II subunit alpha' yes no 0 0 1 1 1 1 1 94.083 94.083 3 0.00011464 96470 QUIQUE_DMIX7_190116_001 91.858 66.536 75029000 0 0 0 0 0 0 0 28182000 0 0 21747000 25101000 0 47524 2152 44367 427741;427742;427743;427744 546122;546123;546124;546125;546126;546127;546128;546129 546128 8 VLGTNHPDVAK Unmodified 1149.6142 0.6142217 4286 Q9NSK0;H7C4M1 KLC4 Kinesin light chain 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 16.25 16.25 2;3 0.00094481 8637 QUIQUE_DMIX5_190116_001 92.538 43.977 116000000 0 0 14645000 15783000 0 0 0 0 0 16631000 68944000 0 0 47525 4286 44368 427745;427746;427747;427748;427749;427750;427751 546130;546131;546132;546133;546134;546135;546136 546136 7 VLGTPVETIELTEDRR Unmodified 1826.9738 0.97379183 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 1 1 1 1 1 83.665 83.665 3 0.0022328 85108 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.823 30.983 158280000 0 0 0 0 39250000 0 0 0 52072000 8982500 57973000 0 0 47526 1029 44369 427752;427753;427754;427755 546137;546138;546139;546140 546138 2 VLGVENLR Unmodified 898.52362 0.52361577 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 55.42 55.42 2 0.018737 54553 QUIQUE_C1218_190116_001 79.469 37.966 677160000 163220000 0 131850000 0 0 81772000 0 95822000 0 66207000 0 138290000 0 47527 3643 44370 427756;427757;427758;427759;427760;427761 546141;546142;546143;546144;546145;546146 546141 5 VLGVLEVSR Unmodified 970.58113 0.58113065 4117 Q9H0C8;F8SNU7;H7C2I8 ILKAP;ILKAP3 Integrin-linked kinase-associated serine/threonine phosphatase 2C yes no 0 0 0 1 69.235 69.235 2 0.020921 68287 QUIQUE_C1563_190116_001 81.548 38.775 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47528 4117 44371 427762 546147 546147 1 VLGVPIIVQASQAEK Unmodified 1550.9032 0.90319307 3069 Q14498;G3XAC6;A0A0U1RQH7;H0Y4X3;Q5QP23 RBM39 RNA-binding protein 39 yes no 0 0 0 1 1 103.43 103.43 2 0.0018646 105585 QUIQUE_C1403_190116_001 67.08 51.814 47689000 25443000 0 0 22246000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47529 3069 44372 427763;427764 546148;546149 546149 2 VLGVPPPQIFWK Unmodified 1379.7965 0.79654316 3716 Q8WX93;H0YA05 PALLD Palladin yes no 0 0 0 1 1 128.92 128.92 2 0.029237 134791 QUIQUE_C1438_190116_001 37.476 31.695 30163000 0 0 0 0 15187000 0 0 0 0 14976000 0 0 0 47530 3716 44373 427765;427766 546150;546151 546150 2 VLHEAEGHIVTCETNTGEVYR Unmodified 2413.1332 0.13322238 2752 P62318;H3BT13 SNRPD3 Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 48.517 48.517 3;4 1.5477E-54 46431 QUIQUE_DMIX1_190116_001 136.49 128 663130000 98576000 49352000 123380000 62665000 0 57052000 64402000 35306000 36692000 39855000 55625000 40225000 0 47531 2752 44374 427767;427768;427769;427770;427771;427772;427773;427774;427775;427776;427777;427778 546152;546153;546154;546155;546156;546157;546158;546159;546160;546161;546162;546163;546164 546159 13 VLHEEHVELLMEEFAFLK Unmodified 2212.1238 0.12382689 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 0 1 1 2 2 144.75 144.75 3;4 6.4865E-05 149159 QUIQUE_DMIX7_190116_001 84.653 76.661 163310000 0 0 0 0 0 0 23303000 0 0 4965500 79158000 55884000 0 47532 2620 44375 427779;427780;427781;427782;427783;427784 546165;546166;546167;546168;546169;546170 546169 5 VLHEEHVELLMEEFAFLKK Unmodified 2340.2188 0.21878991 2620 P53004 BLVRA Biliverdin reductase A yes yes 0 0 1 1 130.95 130.95 3 0.011093 133698 QUIQUE_DMIX1_190116_001 36.127 32.323 22338000 0 0 0 0 0 0 0 22338000 0 0 0 0 0 47533 2620 44376 427785 546171 546171 1 VLHGEQYLELYKPLPR Unmodified 1954.0676 0.06763264 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7ER27;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 1 3 1 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 81.093 81.093 2;3;4 3.6993E-36 82952 QUIQUE_DMIX5_190116_001 191.05 167.67 4604000000 343050000 248810000 472620000 408230000 310200000 326720000 370840000 273000000 417050000 127360000 540580000 396670000 368850000 47534 455 44377 427786;427787;427788;427789;427790;427791;427792;427793;427794;427795;427796;427797;427798;427799;427800;427801;427802;427803;427804;427805;427806;427807;427808;427809;427810;427811;427812 546172;546173;546174;546175;546176;546177;546178;546179;546180;546181;546182;546183;546184;546185;546186;546187;546188;546189;546190;546191;546192;546193;546194;546195;546196;546197;546198;546199;546200;546201;546202;546203;546204;546205;546206 546200 31 VLHIPEFYVGSILR Unmodified 1641.9243 0.92426287 146 A0A0A0MRF4;P49406;S4R3W9 MRPL19 39S ribosomal protein L19, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 130.71 130.71 3 0.0041519 136523 QUIQUE_C1218_190116_001 61.212 42.755 26067000 0 0 0 11426000 14641000 0 0 0 0 0 0 0 0 47535 146 44378 427813;427814;427815 546207;546208;546209 546207 3 VLHLLEQIR Unmodified 1119.6764 0.67642802 2235 P25054;E9PFT7;A0A2Q2SV78 APC Adenomatous polyposis coli protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 65.108 65.108 3 0.0026496 64405 QUIQUE_C1403_190116_001 68.625 56.049 6934600 0 0 0 6934600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47536 2235 44379 427816;427817;427818;427819 546210;546211;546212;546213 546212 4 VLHMDRNPYYGGESASITPLEDLYKR Oxidation (M) 3039.476 0.47602024 2560 P50395;Q5SX87;V9GYF8;Q5SX90;V9GYJ7 GDI2 Rab GDP dissociation inhibitor beta yes no 0 1 2 1 90.746 90.746 4 1.4403E-14 91915 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.829 81.096 68827000 0 0 0 0 0 0 0 68827000 0 0 0 0 0 47537 2560 44380 427820 546214;546215 546215 2008 2 VLHMDRNPYYGGESSSITPLEELYK Oxidation (M) 2913.3855 0.3854739 2328 P31150;G5E9U5 GDI1 Rab GDP dissociation inhibitor alpha yes no 0 1 1 1 99.049 99.049 4 4.3451E-05 100597 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.271 43.547 96965000 0 0 0 0 0 0 0 96965000 0 0 0 0 0 47538 2328 44381 427821 546216;546217 546216 1723 2 VLHMVGDKPVFSFQPR Unmodified 1855.9767 0.97670914 1358 M0QWZ7;Q9NP81;M0R2C6 SARS2 Serine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 78.146 78.146 4 0.0042966 80482 QUIQUE_DMIX5_190116_001 47.545 30.879 111290000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48266000 0 63027000 47539 1358 44382 427822;427823 546218;546219;546220;546221 546219 4 VLHNQLVLFHNAIAAYFAGNQK Unmodified 2467.3124 0.31244779 2622 P53367 ARFIP1 Arfaptin-1 yes yes 0 0 0 1 1 132.56 132.56 3;4 0.0015733 136876 QUIQUE_DMIX7_190116_001 40.638 34.379 68444000 0 0 23074000 0 0 0 0 0 0 0 0 45370000 0 47540 2622 44383 427824;427825 546222;546223 546223 2 VLHPLEGAVVIIFK Unmodified 1533.9283 0.92828561 3023 Q13740;F5GXJ9;H7C543 ALCAM CD166 antigen yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 1 118.93 118.93 2;3 5.1333E-08 122856 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.34 121.97 859370000 42358000 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546246;546247;546248;546249;546250;546251;546252;546253;546254;546255;546256;546257;546258;546259;546260;546261;546262;546263;546264;546265;546266;546267;546268;546269;546270;546271;546272;546273;546274;546275;546276;546277 546276 31 VLHYGDLEESPQGEVPHDSLQDK Unmodified 2591.214 0.21397512 3732 Q92556 ELMO1 Engulfment and cell motility protein 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 2 70.765 70.765 3;4 3.6299E-11 70549 QUIQUE_C1277_190116_001 59.212 52.259 292800000 64992000 43235000 54299000 41421000 0 52054000 0 0 0 36804000 0 0 0 47543 3732 44386 427869;427870;427871;427872;427873;427874;427875;427876 546278;546279;546280;546281;546282;546283;546284;546285 546280 8 VLHYLAIQK Unmodified 1083.6441 0.64406526 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 40.287 40.287 3 0.0054313 36540 QUIQUE_C1218_190116_001 49.96 38.247 19173000 19173000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47544 3102 44387 427877 546286 546286 1 VLHYLAIQKPADLAR Unmodified 1706.9832 0.98317473 3102 Q15042 RAB3GAP1 Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 62.152 62.152 4 0.009345 62453 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.163 36.967 37785000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37785000 0 0 47545 3102 44388 427878 546287 546287 1 VLIAAHGNSLR Unmodified 1149.6618 0.66184059 2139;2090 P15259;P18669 PGAM2;PGAM1 Phosphoglycerate mutase 2;Phosphoglycerate mutase 1 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 24.412 24.412 2;3 0.00012832 17872 QUIQUE_DMIX5_190116_001 119.75 109.04 91981000000 6606200000 6230200000 9881300000 5441200000 6206100000 3572800000 4253000000 8163200000 7291500000 2034000000 9800400000 13169000000 9332600000 47546 2090;2139 44389 427879;427880;427881;427882;427883;427884;427885;427886;427887;427888;427889;427890;427891;427892;427893;427894;427895;427896;427897;427898;427899;427900;427901;427902;427903;427904 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0.11788989 2944 Q12797 ASPH Aspartyl/asparaginyl beta-hydroxylase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 157.92 157.92 3 3.9916E-09 163223 QUIQUE_C1368_190116_001 85.927 80.67 288050000 0 0 38866000 25438000 0 20814000 41288000 24873000 0 0 81743000 28974000 26054000 47555 2944 44398 427965;427966;427967;427968;427969;427970;427971;427972 546411;546412;546413;546414;546415;546416;546417;546418;546419 546411 7 VLIFQEENEIPASVFVK Unmodified 1961.051 0.050979523 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 141.61 141.61 2 2.0591E-44 148203 QUIQUE_C1438_190116_001 208.27 181.73 880480000 69968000 60039000 40717000 96443000 103600000 38456000 64561000 53073000 66701000 41059000 98882000 72705000 74274000 47556 1751 44399 427973;427974;427975;427976;427977;427978;427979;427980;427981;427982;427983;427984;427985 546420;546421;546422;546423;546424;546425;546426;546427;546428;546429;546430;546431;546432;546433 546425 14 VLIGALSPGLAADFLLK Unmodified 1697.0127 0.012743523 501 A0A3B3ITP4;Q495G5;Q8IVH4 MMAA Methylmalonic aciduria type A protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 160.56 160.56 2 0.00047356 165054 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.324 62.952 180410000 22642000 23325000 29674000 21302000 0 0 0 28418000 44895000 10151000 0 0 0 47557 501 44400 427986;427987;427988;427989;427990;427991;427992 546434;546435;546436;546437;546438;546439;546440 546439 7 VLIGENEK Unmodified 900.49165 0.49164694 2664 P55265;A0A3B3IRQ9;H0YCK3 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 21.877 21.877 2 0.057513 14898 QUIQUE_C1277_190116_001 53.833 1.1963 93657000 0 93657000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47558 2664 44401 427993 546441 546441 1 VLIHFNVR Unmodified 996.58688 0.58688473 995 F5GZH3;F5H866;F5GZ38;F5H1B8;Q9UF11;F5H3M1;F5H114;F5H0R6;F5GY87;F5H190;F5GY96 PLEKHB1 Pleckstrin homology domain-containing family B member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 51.752 51.752 2 0.015681 49751 QUIQUE_C1403_190116_001 84.359 66.034 63913000 0 0 40942000 22971000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47559 995 44402 427994;427995;427996;427997 546442;546443;546444;546445;546446 546444 5 VLIIFNAPSLQDR Unmodified 1484.8351 0.83511351 388 A0A1W2PRJ5;A0A1W2PR28;Q5JU85;A0A1W2PPE7;A0A1W2PQ34;A0A1W2PPU7;A0A1W2PQS2 IQSEC2 IQ motif and SEC7 domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 122.43 122.43 2 0.022034 126393 QUIQUE_C1277_190116_001 51.092 33.228 23535000 0 23535000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47560 388 44403 427998 546447 546447 1 VLIIGGGDGGVLR Unmodified 1224.719 0.71902112 2150 P19623;K7ESL0 SRM Spermidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.109 90.109 2 0.007112 91914 QUIQUE_C1368_190116_001 63.283 40.543 2289600000 261150000 242140000 192480000 183110000 180350000 191530000 171470000 109870000 144070000 80690000 189670000 134230000 208850000 47561 2150 44404 427999;428000;428001;428002;428003;428004;428005;428006;428007;428008;428009;428010;428011 546448;546449;546450;546451;546452;546453;546454;546455;546456;546457;546458;546459;546460 546450 12 VLIIGSGGR Unmodified 870.5287 0.52870115 2194 P22102;F8WD69 GART Trifunctional purine biosynthetic protein adenosine-3;Phosphoribosylamine--glycine ligase;Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase;Phosphoribosylglycinamide formyltransferase no no 0 0 0 1 1 1 1 41.489 41.489 2 0.014551 38905 QUIQUE_C1218_190116_001 68.383 10.919 417810000 96469000 0 111590000 0 0 0 0 0 0 0 128370000 81375000 0 47562 2194 44405 428012;428013;428014;428015 546461;546462;546463;546464;546465 546461 4 VLILADGDPSSFLSR Unmodified 1588.8461 0.84607213 321 A0A0U1RRL8;Q8TB22 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 130.28 130.28 2 0.054666 136957 QUIQUE_C1438_190116_001 39.179 14.341 69234000 0 0 0 0 69234000 0 0 0 0 0 0 0 0 47563 321 44406 428016 546466 546466 1 VLILVVSAEK Unmodified 1069.6747 0.67469669 2626 P53602;H3BP35 MVD Diphosphomevalonate decarboxylase yes no 0 0 0 1 82.002 82.002 2 0.026863 78148 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.549 20.742 9924800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 9924800 0 0 0 47564 2626 44407 428017 546467 546467 1 VLIMHGGLFSEDGVTLDDIR Unmodified 2186.1042 0.10415408 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 3 1 1 2 1 1 1 131.33 131.33 3 3.755E-07 136179 QUIQUE_C1218_190116_001 69.422 60.007 217610000 86142000 45427000 0 0 0 36113000 0 0 0 20394000 0 29533000 0 47565 1148 44408 428018;428019;428020;428021;428022;428023;428024;428025;428026;428027 546468;546469;546470;546471;546472;546473;546474;546475;546476;546477 546468 9 VLIMHGGLFSEDGVTLDDIRK Unmodified 2314.1991 0.1991171 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 1 1 111.24 111.24 4 0.022382 114651 QUIQUE_C1277_190116_001 25.951 18.054 45610000 0 45610000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47566 1148 44409 428028 546478 546478 1 VLIPSYAAGSIIGK Unmodified 1387.8075 0.80750177 4515;2581 Q9UNW9;I3L2B5;F8VWX1;F8W659;J3KQU3;F8VYI3;P51513 NOVA2;NOVA1 RNA-binding protein Nova-2;RNA-binding protein Nova-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.49 105.49 2 0.0035817 108158 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.069 40.954 1241000000 117160000 0 128330000 91386000 110000000 98556000 92625000 93113000 96017000 43161000 161400000 105680000 103620000 47567 4515;2581 44410 428029;428030;428031;428032;428033;428034;428035;428036;428037;428038;428039;428040 546479;546480;546481;546482;546483;546484;546485;546486;546487;546488;546489;546490 546490 7 VLIQPSNR Unmodified 925.53451 0.53451481 4413 Q9UDR5;F8WAH1;F8WE53 AASS Alpha-aminoadipic semialdehyde synthase, mitochondrial;Lysine ketoglutarate reductase;Saccharopine dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.301 22.301 2 0.0083476 15237 QUIQUE_C1403_190116_001 94.662 60.924 228040000 48977000 38317000 41904000 31560000 0 0 0 0 49675000 17611000 0 0 0 47568 4413 44411 428041;428042;428043;428044;428045;428046 546491;546492;546493;546494;546495;546496;546497 546495 7 VLIQVGYEPLPPTIGR Unmodified 1750.9982 0.99815609 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 2 3 3 3 3 2 1 4 2 2 3 2 2 121.5 121.5 2 1.8139E-06 124399 QUIQUE_DMIX1_190116_001 109.72 65.296 826420000 39146000 101240000 80403000 55175000 54152000 67128000 26671000 88361000 47153000 33751000 82458000 77161000 73627000 47569 4650 44412 428047;428048;428049;428050;428051;428052;428053;428054;428055;428056;428057;428058;428059;428060;428061;428062;428063;428064;428065;428066;428067;428068;428069;428070;428071;428072;428073;428074;428075;428076;428077;428078 546498;546499;546500;546501;546502;546503;546504;546505;546506;546507;546508;546509;546510;546511;546512;546513;546514;546515;546516;546517;546518;546519;546520;546521;546522;546523;546524;546525;546526;546527;546528;546529;546530;546531;546532 546517 32 VLISDSLDPCCR Unmodified 1433.6643 0.66428471 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34;A0A286YFF3;A0A286YFK5 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.837 80.837 2 0.00011264 81994 QUIQUE_C1368_190116_001 120.99 106.99 10168000000 797680000 990660000 1190000000 903120000 820460000 1044800000 1122200000 435580000 577170000 260310000 504120000 676610000 844800000 47570 404 44413 428079;428080;428081;428082;428083;428084;428085;428086;428087;428088;428089;428090;428091 546533;546534;546535;546536;546537;546538;546539;546540;546541;546542;546543;546544;546545;546546;546547;546548;546549;546550;546551;546552;546553;546554;546555 546536 23 VLISDSLDPCCRK Unmodified 1561.7592 0.75924773 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34;A0A286YFF3;A0A286YFK5 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 58.011 58.011 2;3 0.0025354 57225 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.346 24.209 495780000 0 0 0 19042000 25976000 0 0 166690000 30972000 0 43892000 95680000 113520000 47571 404 44414 428092;428093;428094;428095;428096;428097;428098;428099;428100;428101 546556;546557;546558;546559;546560;546561;546562;546563;546564;546565 546560 9 VLISNLLDLLTEVGVSGQGR Unmodified 2082.1685 0.1684689 371 A0A1W2PNX8;Q9H3U1 UNC45A Protein unc-45 homolog A yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 173.02 173.02 2;3 7.0384E-40 180234 QUIQUE_DMIX5_190116_001 189.1 164.81 210270000 0 11224000 0 0 20646000 0 0 53903000 49096000 0 75396000 0 0 47572 371 44415 428102;428103;428104;428105;428106;428107;428108 546566;546567;546568;546569;546570;546571;546572 546572 6 VLISSLQDCLHGIESK Unmodified 1797.9295 0.92948418 1068 F8WJN3;Q16630 CPSF6 Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6 yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 2 1 2 1 103.44 103.44 2;3 1.2757E-18 106206 QUIQUE_C1403_190116_001 137.59 121.7 1038200000 114010000 102160000 89724000 127200000 104800000 66860000 109480000 78572000 75640000 0 0 81281000 88509000 47573 1068 44416 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546616;546617;546618;546619;546620;546621;546622;546623;546624;546625;546626;546627;546628;546629;546630;546631 546629 16 VLIVSEDPELPYMRPPLSK Unmodified 2182.1708 0.17077708 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 116.83 116.83 3 0.0002392 120383 QUIQUE_C1403_190116_001 70.584 46.297 1605700000 139380000 122070000 96451000 156770000 230280000 84161000 102380000 87707000 184750000 59286000 147400000 82331000 112710000 47577 1756 44420 428158;428159;428160;428161;428162;428163;428164;428165;428166;428167;428168;428169;428170;428171;428172;428173 546632;546633;546634;546635;546636;546637;546638;546639;546640;546641;546642;546643;546644;546645;546646;546647;546648;546649;546650;546651 546636 19 VLIVSEDPELPYMRPPLSK Oxidation (M) 2198.1657 0.1656917 1756 O95831 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes yes 0 1 1 1 1 98.508 98.508 3 0.010081 100747 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.159 22.83 74963000 0 0 0 0 0 0 0 0 35634000 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546662;546663;546664;546665;546666;546667;546668;546669;546670;546671;546672;546673;546674;546675;546676 546662 15 VLKDEFLGQVHLK Unmodified 1524.8664 0.86641364 877 E7EV01;O15484;A0A3B3IRX8 CAPN5 Calpain-5 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 67.095 67.095 3;4 0.0022824 66892 QUIQUE_C1403_190116_001 49.423 37.918 470560000 49206000 37122000 159490000 37932000 45460000 35571000 0 0 0 24402000 46917000 34462000 0 47581 877 44423 428197;428198;428199;428200;428201;428202;428203;428204;428205;428206 546677;546678;546679;546680;546681;546682;546683;546684;546685;546686;546687;546688 546682 12 VLKDQPPNSVEGLLNALR Unmodified 1962.0898 0.089824645 4300 Q9NUQ9 FAM49B Protein FAM49B yes yes 0 0 1 2 1 1 1 122.51 122.51 3 1.3387E-07 126476 QUIQUE_DMIX8_190116_001 109.42 99.89 312780000 0 0 0 0 0 0 0 80095000 0 0 125030000 60278000 47381000 47582 4300 44424 428207;428208;428209;428210;428211 546689;546690;546691;546692;546693 546693 4 VLKEPLAFLR Unmodified 1184.7281 0.72812924 1066 F8WE43;F8WF23 SYNPR yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 79.639 79.639 3 0.00657 81230 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.309 61.265 292650000 0 0 0 0 20141000 0 36573000 60849000 42974000 0 53713000 39438000 38957000 47583 1066 44425 428212;428213;428214;428215;428216;428217;428218;428219 546694;546695;546696;546697;546698;546699;546700;546701 546697 7 VLKPNFAAAWEEVGDTFEKEETFALSSTK Unmodified 3243.5976 0.59757516 4396 Q9UBF2 COPG2 Coatomer subunit gamma-2 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 159.32 159.32 4 3.0537E-08 164079 QUIQUE_DMIX3_190116_001 59.555 53.589 194630000 0 0 0 0 0 0 53573000 29348000 47901000 0 0 0 63810000 47584 4396 44426 428220;428221;428222;428223 546702;546703;546704;546705 546704 4 VLLAAAVCTK Unmodified 1044.6002 0.60015154 2506 P48444;Q6P1Q5;E9PK34 ARCN1 Coatomer subunit delta yes no 0 0 0 1 51.247 51.247 2 0.0077984 49924 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.643 41.354 32710000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 32710000 0 0 47585 2506 44427 428224 546706 546706 1 VLLATLSIPITPER Unmodified 1521.913 0.91302948 3046 Q14152 EIF3A Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A yes yes 0 0 0 1 1 1 128.82 128.82 2 0.014381 133170 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.693 76.939 166550000 0 0 0 0 0 0 0 62512000 51027000 0 0 0 53012000 47586 3046 44428 428225;428226;428227 546707;546708;546709 546708 0 VLLDAGFTNELVQNYWSK Unmodified 2096.0579 0.057855815 2640 P54289;H0Y715 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 2 2 1 2 154.75 154.75 2;3 6.2022E-39 158647 QUIQUE_C1403_190116_001 166.38 152.7 939270000 42664000 43420000 41765000 101490000 31470000 85826000 120240000 27710000 123290000 0 129840000 79742000 111820000 47587 2640 44429 428228;428229;428230;428231;428232;428233;428234;428235;428236;428237;428238;428239;428240;428241;428242;428243;428244;428245 546710;546711;546712;546713;546714;546715;546716;546717;546718;546719;546720;546721;546722;546723;546724;546725;546726;546727;546728;546729;546730;546731;546732;546733 546716 24 VLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHK Unmodified 3013.4644 0.46439292 734;357 A0A1B0GV68;M0QYB0;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 149.6 149.6 4 3.1468E-09 155186 QUIQUE_C1218_190116_001 68.689 62.325 344860000 61334000 79762000 110870000 0 0 0 79168000 0 0 13723000 0 0 0 47588 357;734 44430 428246;428247;428248;428249;428250 546734;546735;546736;546737;546738 546734 4 VLLDAVCNHLNLVEGDYFGLEFPDHKK Unmodified 3141.5594 0.55935594 734;357 A0A1B0GV68;M0QYB0;C9JME2;Q9Y4F1 FARP1 FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 138.16 138.16 5 8.7726E-08 142809 QUIQUE_DMIX8_190116_001 56.947 50.583 329550000 19207000 0 0 0 27777000 27940000 0 49750000 86041000 0 65869000 0 52965000 47589 357;734 44431 428251;428252;428253;428254;428255;428256;428257 546739;546740;546741;546742;546743;546744;546745;546746 546746 5 VLLDGVQNPR Unmodified 1109.6193 0.61930707 1803 P01024 C3 Complement C3;Complement C3 beta chain;C3-beta-c;Complement C3 alpha chain;C3a anaphylatoxin;Acylation stimulating protein;Complement C3b alpha' chain;Complement C3c alpha' chain fragment 1;Complement C3dg fragment;Complement C3g fragment;Complement C3d fragment;Complement C3f fragment;Complement C3c alpha' chain fragment 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 49.666 49.666 2 0.0051766 47005 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.377 46.535 243360000 0 89690000 0 0 103160000 0 0 0 0 0 0 0 50502000 47590 1803 44432 428258;428259;428260 546747;546748;546749;546750 546750 4 VLLDLSAFLK Unmodified 1117.6747 0.67469669 3231 Q3ZCQ8;M0R0C3;M0R2F8;M0R003 TIMM50 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.48 153.48 2 0.0026126 159957 QUIQUE_C1438_190116_001 88.948 55.151 674580000 64538000 82645000 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63533 QUIQUE_DMIX5_190116_001 105.27 4.9961 1488700000 0 179980000 205120000 143420000 0 180970000 0 145790000 157670000 89339000 225700000 160660000 0 47593 4234 44435 428282;428283;428284;428285;428286;428287;428288;428289;428290 546777;546778;546779;546780;546781;546782;546783;546784;546785;546786 546785 10 VLLEAAIR Unmodified 883.5491 0.54910224 2180 P21399 ACO1 Cytoplasmic aconitate hydratase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.98 60.98 2 0.0067112 61162 QUIQUE_C1438_190116_001 100.74 35.939 3063100000 447910000 322000000 299690000 279700000 297360000 291810000 0 295350000 248960000 0 0 273790000 306530000 47594 2180 44436 428291;428292;428293;428294;428295;428296;428297;428298;428299;428300 546787;546788;546789;546790;546791;546792;546793;546794;546795;546796;546797;546798;546799 546792 13 VLLEAGEGLVTITPTTGSDGRPDAR Unmodified 2524.3133 0.31329523 4330 Q9NY33;G3V1D3;G3V180 DPP3 Dipeptidyl peptidase 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 103.68 103.68 3 6.9655E-99 106803 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0 0 0 1 2 1 2 1 1 2 1 1 2 1 69.21 69.21 2;3 4.3357E-05 69144 QUIQUE_C1403_190116_001 160.59 125.29 772180000 114930000 69683000 61773000 74676000 108960000 0 25050000 77550000 68262000 17274000 101290000 0 52737000 47597 981;4494;1236 44439 428323;428324;428325;428326;428327;428328;428329;428330;428331;428332;428333;428334;428335;428336;428337 546829;546830;546831;546832;546833;546834;546835;546836;546837;546838;546839;546840;546841;546842;546843;546844 546834 14 VLLESEQFLTELTR Unmodified 1676.8985 0.89850163 2406 P37108;H0YLA2 SRP14 Signal recognition particle 14 kDa protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.08 142.08 2 6.8265E-14 138302 QUIQUE_DMIX4_190116_001 142.07 94.808 1923200000 258460000 239090000 0 223600000 212610000 199920000 199660000 0 0 79824000 274590000 235480000 0 47598 2406 44440 428338;428339;428340;428341;428342;428343;428344;428345;428346 546845;546846;546847;546848;546849;546850;546851;546852;546853;546854 546852 8 VLLFQTQSPEEMQGWINK Unmodified 2147.0721 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protein S11 yes no 0 0 0 1 1 24.517 24.517 2 0.039433 18498 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.895 25.089 55761000 0 0 0 39732000 0 0 0 16029000 0 0 0 0 0 47601 2747 44442 428364;428365 546878;546879 546879 2 VLLGGPGSFYWQGQLISDQVAEIVSK Unmodified 2790.4592 0.45923119 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 169.05 169.05 3 1.2138E-14 172724 QUIQUE_C1277_190116_001 88.573 82.139 120730000 0 89080000 0 0 0 0 0 0 31652000 0 0 0 0 47602 1909 44443 428366;428367 546880;546881 546880 2 VLLGLSEPIFQLPR Unmodified 1580.929 0.92901389 3534 Q8IWA4 MFN1 Mitofusin-1 yes yes 0 0 0 1 149.55 149.55 2 0.020464 145105 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.757 44.492 4498900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4498900 0 0 0 47603 3534 44444 428368 546882 546882 1 VLLGSVSGLAGGFVGTPADLVNVR Unmodified 2297.2743 0.27433095 618 B4DLN1;Q9UBX3;I3L1E8;F6RGN5 SLC25A10 Mitochondrial dicarboxylate carrier yes no 0 0 0 1 154.55 154.55 3 3.3399E-05 159591 QUIQUE_C1218_190116_001 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428393;428394;428395;428396;428397;428398;428399;428400;428401;428402;428403;428404;428405 546909;546910;546911;546912;546913;546914;546915;546916;546917;546918;546919;546920;546921 546918 13 VLLLHLEEGK Unmodified 1149.6758 0.67575932 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;G3V3C9 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 63.155 63.155 3 0.017494 62354 QUIQUE_C1277_190116_001 56.043 40.453 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47610 4607 44451 428406 546922 546922 1 VLLLHLEEGKDLEYHLDPK Unmodified 2260.2103 0.21033371 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 93.679 93.679 3;4 0.013951 96016 QUIQUE_C1368_190116_001 41.107 32.613 389390000 0 144930000 41585000 0 44073000 0 0 68562000 0 0 90242000 0 0 47611 4607 44452 428407;428408;428409;428410;428411 546923;546924;546925;546926;546927 546924 5 VLLLIDDEYK Unmodified 1219.67 0.67000524 3611 Q8N766 EMC1 ER membrane protein complex subunit 1 yes yes 0 0 0 1 103.83 103.83 2 0.034087 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129.33 129.33 2 6.1032E-07 133664 QUIQUE_C1277_190116_001 143.03 102.05 338580000 26544000 34105000 27560000 24009000 23116000 23509000 26617000 27330000 22569000 7901800 31033000 31212000 33073000 47614 3559 44455 428429;428430;428431;428432;428433;428434;428435;428436;428437;428438;428439;428440;428441 546967;546968;546969;546970;546971;546972;546973;546974;546975;546976;546977;546978;546979;546980 546969 13 VLLLSSPGLEELYR Unmodified 1587.8872 0.88720866 3571 Q8N163;E5RHJ4 CCAR2 Cell cycle and apoptosis regulator protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.49 134.49 2 0.00020732 138945 QUIQUE_DMIX3_190116_001 112.15 92.386 1157300000 141960000 133310000 0 111040000 0 0 100430000 103160000 111910000 43498000 121820000 151020000 139150000 47615 3571 44456 428442;428443;428444;428445;428446;428447;428448;428449;428450;428451 546981;546982;546983;546984;546985;546986;546987;546988;546989;546990;546991;546992;546993 546988 13 VLLMELEEAR Unmodified 1201.6377 0.63765925 2041 P12270 TPR Nucleoprotein TPR yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 98.587 98.587 2 0.013023 103395 QUIQUE_DMIX5_190116_001 65.347 35.537 37543000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37543000 0 0 47616 2041 44457 428452;428453;428454;428455;428456 546994;546995;546996;546997;546998 546997 5 VLLNDGGYYDPETGVFTAPLAGR Unmodified 2424.1961 0.19614021 4649 Q9Y6C2;A0A0A0MT20 EMILIN1 EMILIN-1 yes no 0 0 0 1 138.51 138.51 2 1.3025E-14 141471 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.74 91.359 28676000 0 0 0 0 0 0 0 28676000 0 0 0 0 0 47617 4649 44458 428457 546999 546999 1 VLLPAQDQEDPEEFYVLSETTLAQPQSLER Unmodified 3444.6937 0.69366039 4088 Q9BZV1;K7EP32 UBXN6 UBX domain-containing protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 156.85 156.85 3 6.8069E-31 151887 QUIQUE_DMIX4_190116_001 100.06 94.952 813310000 0 0 0 0 0 79432000 95048000 98482000 102330000 31765000 153810000 126550000 125890000 47618 4088 44459 428458;428459;428460;428461;428462;428463;428464;428465 547000;547001;547002;547003;547004;547005;547006;547007;547008;547009 547005 10 VLLPEYGGTK Unmodified 1075.5914 0.59136099 2727 P61604;B8ZZL8;B8ZZ54 HSPE1 10 kDa heat shock protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.155 59.155 2 0.00014691 58311 QUIQUE_C1277_190116_001 122.13 76.417 9526500000 1002000000 1159200000 949060000 269930000 851270000 419450000 858260000 480790000 724200000 207890000 943510000 776760000 884230000 47619 2727 44460 428466;428467;428468;428469;428470;428471;428472;428473;428474;428475;428476;428477;428478 547010;547011;547012;547013;547014;547015;547016;547017;547018;547019;547020;547021;547022;547023;547024;547025;547026;547027;547028;547029;547030;547031;547032;547033;547034;547035;547036 547014 27 VLLPVLLNK Unmodified 1007.6743 0.67430276 1384 O00186 STXBP3 Syntaxin-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.73 102.73 2 0.0010391 106196 QUIQUE_DMIX3_190116_001 107.43 99.011 1036900000 0 88208000 101690000 86274000 77808000 74381000 88577000 83282000 91708000 42816000 101230000 86058000 114920000 47620 1384 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reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 2 3 2 2 139.46 139.46 3;4;5 2.8561E-13 144870 QUIQUE_C1368_190116_001 69.016 56.026 2884400000 51204000 291030000 116520000 0 87490000 0 238630000 208550000 356690000 0 770270000 529160000 234880000 47630 2524 44471 428577;428578;428579;428580;428581;428582;428583;428584;428585;428586;428587;428588;428589;428590;428591;428592;428593;428594;428595 547160;547161;547162;547163;547164;547165;547166;547167;547168;547169;547170;547171;547172;547173;547174;547175;547176;547177;547178;547179;547180;547181;547182;547183 547167 19 VLLSPDYLPAMR Unmodified 1373.7377 0.73770765 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 116.04 116.04 2 0.063275 118671 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.55 41.584 20398000 0 0 0 0 0 0 0 20398000 0 0 0 0 0 47631 3471 44472 428596 547184 547184 1 VLLSVACILAQEQLVVGVADKDLLK Unmodified 2693.5401 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VLMASTSYLPSQVTEMFNQGR Unmodified 2358.1348 0.13480228 4611 Q9Y4P8 WIPI2 WD repeat domain phosphoinositide-interacting protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 147.83 147.83 2 2.9399E-07 153181 QUIQUE_C1368_190116_001 121.76 111.71 126280000 0 39600000 50988000 0 0 0 35689000 0 0 0 0 0 0 47647 4611 44487 428723;428724;428725;428726 547363;547364;547365;547366 547364 3 VLMATNRPDTLDPALMR Unmodified 1912.9863 0.98628755 2389 P35998;A0A1W2PQS1 PSMC2 26S protease regulatory subunit 7 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 85.626 85.626 3 3.9771E-07 88412 QUIQUE_C1218_190116_001 83.966 63.229 280170000 78946000 0 41329000 59258000 0 59605000 41031000 0 0 0 0 0 0 47648 2389 44488 428727;428728;428729;428730;428731 547367;547368;547369;547370;547371;547372 547367 6 VLMEDDDLYSCMVENPISQGR Unmodified 2470.0814 0.081446082 3093 Q14CZ8 HEPACAM Hepatocyte cell adhesion molecule yes yes 0 0 0 2 2 1 2 136.78 136.78 2;3 1.2893E-75 139409 QUIQUE_DMIX1_190116_001 178.07 170.35 235560000 0 0 0 100810000 0 0 74777000 37473000 0 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C-terminal-binding protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 2 2 2 1 2 2 1 132.05 132.05 2;3 5.423E-39 138100 QUIQUE_DMIX5_190116_001 166.6 138.63 3534100000 338200000 414770000 372360000 288300000 284580000 436590000 255790000 158890000 204220000 52935000 278190000 250010000 199280000 47656 2989 44496 428752;428753;428754;428755;428756;428757;428758;428759;428760;428761;428762;428763;428764;428765;428766;428767;428768;428769;428770;428771;428772;428773;428774;428775;428776 547395;547396;547397;547398;547399;547400;547401;547402;547403;547404;547405;547406;547407;547408;547409;547410;547411;547412;547413;547414;547415;547416;547417;547418;547419;547420;547421;547422;547423;547424;547425 547421 27 VLNEAVGALMYHTITLTR Oxidation (M) 2017.0666 0.066646362 2989 Q13363;D6RAX2;E7ESU7;E7EPF8;E9PGB1 CTBP1 C-terminal-binding protein 1 yes no 0 1 0 1 101.88 101.88 3 0.005458 105271 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.499 47.442 38317000 0 0 0 0 0 0 0 0 38317000 0 0 0 0 47657 2989 44496 428777 547426 547426 2441 0 VLNEAVGAMMYHTITLTR Unmodified 2019.0282 0.028152366 2682 Q5SQP8;P56545 CTBP2 C-terminal-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 122.82 122.82 3 0.015931 127922 QUIQUE_C1368_190116_001 33.773 29.181 18938000 0 0 18938000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47658 2682 44497 428778 547427 547427 1 VLNEECDQNWYK Unmodified 1596.6879 0.68785692 2774 P62993;J3KT38;J3QRL5 GRB2 Growth factor receptor-bound protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 66.622 66.622 2 3.4174E-20 66225 QUIQUE_DMIX3_190116_001 199.67 181.61 2613500000 245080000 243900000 242370000 186090000 210860000 241490000 225760000 187310000 147730000 86331000 230500000 177840000 188200000 47659 2774 44498 428779;428780;428781;428782;428783;428784;428785;428786;428787;428788;428789;428790;428791 547428;547429;547430;547431;547432;547433;547434;547435;547436;547437;547438;547439;547440;547441;547442;547443;547444 547437 17 VLNLIQSWADAFR Unmodified 1531.8147 0.81471242 1592 O60784;B0QY01;V9GYF4;B0QY02;Q6UW50;V9GZ68 TOM1 Target of Myb protein 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.91 162.91 2;3 1.9586E-06 166229 QUIQUE_C1403_190116_001 129.16 109.17 1464800000 224200000 216770000 205400000 100700000 0 141820000 189100000 135540000 0 42363000 0 0 208940000 47660 1592 44499 428792;428793;428794;428795;428796;428797;428798;428799;428800;428801;428802;428803;428804;428805 547445;547446;547447;547448;547449;547450;547451;547452;547453;547454;547455;547456;547457;547458;547459;547460;547461;547462 547451 18 VLNLNAGEILQMFGK Unmodified 1645.8862 0.8861628 2867 Q02153;E9PCN2 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 0 0 1 1 157.81 157.81 2 4.4028E-05 164059 QUIQUE_C1218_190116_001 87.667 69.608 91775000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91775000 0 0 47661 2867 44500 428806;428807 547463;547464;547465 547463 3 VLNLNAGEILQMFGK Oxidation (M) 1661.8811 0.88107742 2867 Q02153;E9PCN2 GUCY1B3 Guanylate cyclase soluble subunit beta-1 yes no 0 1 0 1 142.99 142.99 2 0.0012552 147540 QUIQUE_C1277_190116_001 72.2 57.189 13413000 0 13413000 0 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.36 118.36 2 2.7482E-10 123838 QUIQUE_DMIX5_190116_001 158.41 139.66 2023200000 184500000 226090000 199560000 127270000 163090000 0 218110000 142930000 143920000 69662000 204370000 191020000 152690000 47664 4607 44502 428835;428836;428837;428838;428839;428840;428841;428842;428843;428844;428845;428846 547497;547498;547499;547500;547501;547502;547503;547504;547505;547506;547507;547508;547509;547510;547511 547509 15 VLNMAAENNPNIK Unmodified 1426.7238 0.7238485 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;Q9Y4C0;A0A0C4DGK4;Q9HDB5 NRXN3 Neurexin-3;Neurexin-3-beta;Neurexin-3-beta, soluble form;Neurexin-3-beta, C-terminal fragment yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 47.203 47.203 2 0.000475 44166 QUIQUE_C1563_190116_001 107.24 81.685 313780000 69897000 0 73325000 64866000 0 47078000 0 0 0 0 58610000 0 0 47665 319 44503 428847;428848;428849;428850;428851 547512;547513;547514;547515;547516 547515 5 VLNNMEIGTSLFDEEGAK Oxidation (M) 1981.9303 0.93027204 1790 P00558 PGK1 Phosphoglycerate 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429611;429612 548439;548440 548439 2511 2 VLSALQAVQGLLVAQGR Unmodified 1722.0152 0.015203139 1801 P01019 AGT Angiotensinogen;Angiotensin-1;Angiotensin-2;Angiotensin-3;Angiotensin-4;Angiotensin 1-9;Angiotensin 1-7;Angiotensin 1-5;Angiotensin 1-4 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 151.88 151.88 2;3 8.6532E-45 154723 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.94 159 2025200000 161390000 96837000 165880000 120440000 253640000 151450000 144590000 97120000 127860000 114810000 165400000 255150000 170640000 47757 1801 44589 429613;429614;429615;429616;429617;429618;429619;429620;429621;429622;429623;429624;429625;429626;429627;429628;429629;429630;429631;429632;429633;429634;429635;429636;429637;429638 548441;548442;548443;548444;548445;548446;548447;548448;548449;548450;548451;548452;548453;548454;548455;548456;548457;548458;548459;548460;548461;548462;548463;548464;548465;548466;548467;548468;548469;548470 548456 29 VLSAMIR Unmodified 788.45784 0.4578444 1133 H0Y8X4;O43598 DNPH1 2'-deoxynucleoside 5'-phosphate N-hydrolase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 40.32 40.32 2 0.019482 37097 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.28 73.076 561020000 0 0 108910000 0 0 0 103860000 79797000 92069000 26573000 0 0 149810000 47758 1133 44590 429639;429640;429641;429642;429643;429644 548471;548472;548473;548474;548475;548476;548477;548478 548476 8 VLSAPELLEFLEDQGEEGATLAR Unmodified 2486.254 0.25404902 3580 Q8N3E9 PLCD3 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase delta-3 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 1 168.52 168.52 2;3 8.1069E-129 172227 QUIQUE_C1277_190116_001 159.77 135.22 1975000000 58220000 199950000 232120000 11197000 0 0 161430000 152870000 253970000 32513000 421730000 285390000 165620000 47759 3580 44591 429645;429646;429647;429648;429649;429650;429651;429652;429653;429654;429655;429656;429657;429658;429659;429660;429661;429662 548479;548480;548481;548482;548483;548484;548485;548486;548487;548488;548489;548490;548491;548492;548493;548494;548495;548496;548497;548498 548483 19 VLSAPPHFHFGQTNR Unmodified 1706.8641 0.86412223 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 2 1 3 3 2 1 2 2 2 2 2 2 2 49.141 49.141 2;3;4 7.5776E-07 47397 QUIQUE_DMIX1_190116_001 115.18 90.321 2942100000 224450000 203760000 237710000 238400000 347230000 178290000 194180000 167650000 179950000 79948000 361810000 166830000 361880000 47760 2255 44592 429663;429664;429665;429666;429667;429668;429669;429670;429671;429672;429673;429674;429675;429676;429677;429678;429679;429680;429681;429682;429683;429684;429685;429686;429687;429688 548499;548500;548501;548502;548503;548504;548505;548506;548507;548508;548509;548510;548511;548512;548513;548514;548515;548516;548517;548518;548519;548520;548521;548522;548523;548524;548525;548526;548527;548528;548529;548530;548531;548532;548533;548534;548535;548536;548537;548538;548539;548540;548541;548542;548543;548544;548545;548546;548547;548548;548549;548550;548551;548552;548553;548554;548555;548556;548557;548558;548559;548560;548561;548562;548563;548564;548565 548539 67 VLSAVGSAQLLMSQK Unmodified 1530.844 0.84396364 4554 Q9Y2H0;F8WF49;A0A0B4J2C2 DLGAP4 Disks large-associated protein 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 100.83 100.83 2 0.0045213 103148 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.548 64.957 204020000 36861000 0 24805000 28392000 0 0 0 21450000 0 0 32262000 35196000 25059000 47761 4554 44593 429689;429690;429691;429692;429693;429694;429695 548566;548567;548568;548569;548570;548571;548572;548573 548569 8 VLSEAAISASLEKFEIPVK Unmodified 2030.13 0.12995813 1737 O95573 ACSL3 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3 yes yes 0 0 1 1 1 1 135.48 135.48 3 0.016354 141950 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.385 30.202 79683000 0 0 0 0 0 0 0 28877000 18595000 0 32212000 0 0 47762 1737 44594 429696;429697;429698 548574;548575;548576 548576 3 VLSECSPLMNDIFNK Unmodified 1765.8379 0.83789198 2629 P53618 COPB1 Coatomer subunit beta yes yes 0 0 0 1 122.95 122.95 2 0.040225 125670 QUIQUE_C1563_190116_001 42.425 33.526 47997000 0 0 0 0 0 47997000 0 0 0 0 0 0 0 47763 2629 44595 429699 548577 548577 1 VLSEHGFGPITTDIR Unmodified 1640.8522 0.85222014 4454 Q9UJ68 MSRA Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 79.113 79.113 3 0.0022114 80512 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.265 47.519 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47764 4454 44596 429700;429701;429702;429703 548578;548579;548580;548581 548581 4 VLSEIFSPMLFR Unmodified 1437.769 0.76900778 2270 P27986 PIK3R1 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 148.09 148.09 2 0.0018573 152596 QUIQUE_C1277_190116_001 109.44 88.661 137560000 0 34161000 29563000 20926000 0 19755000 0 0 0 0 0 0 33156000 47765 2270 44597 429704;429705;429706;429707;429708;429709 548582;548583;548584;548585;548586;548587 548582 5 VLSELGR Unmodified 772.4443 0.44430282 4285 Q9NSE4 IARS2 Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 28.451 28.451 2 0.041589 22894 QUIQUE_C1368_190116_001 81.864 13.975 119300000 0 0 55507000 0 0 0 0 0 0 0 63796000 0 0 47766 4285 44598 429710;429711 548588;548589 548588 2 VLSEPNPR Unmodified 910.48723 0.48723027 1029 F8VPD4;P27708 CAD CAD protein;Glutamine-dependent carbamoyl-phosphate synthase;Aspartate carbamoyltransferase;Dihydroorotase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 19.463 19.463 2 0.020244 12127 QUIQUE_C1403_190116_001 77.058 43.319 181280000 0 0 41136000 43130000 35145000 0 30798000 0 31073000 0 0 0 0 47767 1029 44599 429712;429713;429714;429715;429716 548590;548591;548592;548593;548594 548591 5 VLSGDLGQLPTGIR Unmodified 1424.7987 0.798728 3200 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548613 18 VLSHQDDTALLK Unmodified 1338.7143 0.71432967 3779 Q93034 CUL5 Cullin-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 34.977 34.977 2;3 0.0022096 30093 QUIQUE_C1277_190116_001 94.363 54.514 228750000 71024000 25775000 18264000 0 33667000 21590000 0 0 0 34050000 0 24380000 0 47770 3779 44602 429740;429741;429742;429743;429744;429745;429746;429747;429748;429749 548620;548621;548622;548623;548624;548625;548626;548627;548628;548629 548621 10 VLSIGDGIAR Unmodified 999.57129 0.57129425 2243;1351 K7ERX7;K7EQH4;P25705;K7EK77;K7EJP1 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.185 63.185 2 2.1568E-07 62437 QUIQUE_DMIX3_190116_001 151.04 78.897 29661000000 3479100000 2435700000 2441700000 1648700000 1826800000 2161200000 2197200000 2538600000 2570000000 1164800000 2577100000 2355100000 2265200000 47771 1351;2243 44603 429750;429751;429752;429753;429754;429755;429756;429757;429758;429759;429760;429761;429762;429763 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549233;549234;549235;549236;549237;549238;549239;549240;549241;549242;549243;549244;549245;549246;549247;549248;549249 549235 16 VLTLSEDSPYETLHSFISNAVAPFFK Unmodified 2911.4644 0.46437615 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 171.62 171.62 3 5.5808E-10 178948 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.222 64.102 1000600000 0 0 0 0 0 0 0 112370000 324660000 0 563610000 0 0 47831 3053 44660 430226;430227;430228 549250;549251;549252 549252 3 VLTLSERPLDFLDLERPPTTPQNEEIR Unmodified 3177.667 0.66699213 4109;162 A0A0A0MS29;Q9GZY8;C9JHF5 MFF Mitochondrial fission factor no no 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.94 131.94 4 3.0713E-44 136137 QUIQUE_C1277_190116_001 134.76 112.03 1466100000 84523000 107140000 130020000 116870000 148490000 162120000 117320000 97420000 106480000 28830000 124800000 106060000 135990000 47832 162;4109 44661 430229;430230;430231;430232;430233;430234;430235;430236;430237;430238;430239;430240;430241 549253;549254;549255;549256;549257;549258;549259;549260;549261;549262;549263;549264;549265;549266;549267;549268;549269;549270;549271 549255 19 VLTMAPGLITLEIVPFR Unmodified 1869.0798 0.079777231 1517 O43252 PAPSS1 Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1;Sulfate adenylyltransferase;Adenylyl-sulfate kinase yes yes 0 0 0 1 1 164.7 164.7 2 0.0004071 166955 QUIQUE_DMIX1_190116_001 81.431 75.111 23732000 0 12384000 0 0 0 0 0 11349000 0 0 0 0 0 47833 1517 44662 430242;430243 549272;549273 549273 2 VLTMPETCR Unmodified 1105.526 0.52600031 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 43.181 43.181 2 0.01368 39485 QUIQUE_C1277_190116_001 69.598 46.556 96717000 0 28924000 0 40147000 0 27646000 0 0 0 0 0 0 0 47834 3954 44663 430244;430245;430246 549274;549275;549276 549274 3 VLTMPETCRYQPFK Unmodified 1768.864 0.86404715 3954 Q99460;A0A087WW66 PSMD1 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1 yes no 0 0 1 1 91.068 91.068 3 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549279;549280;549281;549282;549283;549284;549285;549286;549287;549288;549289;549290;549291;549292;549293;549294;549295;549296;549297;549298;549299 549290 20 VLTPELYAELR Unmodified 1302.7184 0.71835242 2044 P12277;G3V4N7;G3V461 CKB Creatine kinase B-type yes no 0 0 0 6 3 6 3 3 9 3 6 6 1 10 5 6 128.84 128.84 1;2;3 1.0245E-12 103315 QUIQUE_C1403_190116_001 196.88 136.29 179800000000 14755000000 14922000000 15361000000 12612000000 14008000000 16662000000 13648000000 20024000000 15934000000 6893400000 18750000000 37894000 16193000000 47838 2044 44667 430266;430267;430268;430269;430270;430271;430272;430273;430274;430275;430276;430277;430278;430279;430280;430281;430282;430283;430284;430285;430286;430287;430288;430289;430290;430291;430292;430293;430294;430295;430296;430297;430298;430299;430300;430301;430302;430303;430304;430305;430306;430307;430308;430309;430310;430311;430312;430313;430314;430315;430316;430317;430318;430319;430320;430321;430322;430323;430324;430325;430326;430327;430328;430329;430330;430331;430332 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GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 73.841 73.841 2 0.0085022 74344 QUIQUE_C1277_190116_001 71.614 28.49 392200000 71664000 68301000 53461000 0 80571000 0 0 0 50602000 0 0 67595000 0 47844 2413 44673 430364;430365;430366;430367;430368;430369 549445;549446;549447;549448;549449;549450;549451 549446 5 VLTSLGDAIK Unmodified 1015.5914 0.59136099 2800 P69892;A0A2R8Y7X9;P69891;E9PBW4 HBG2;HBG1 Hemoglobin subunit gamma-2;Hemoglobin subunit gamma-1 yes no 0 0 0 1 65.686 65.686 2 0.022384 65196 QUIQUE_C1218_190116_001 57.859 25.018 149350000 149350000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47845 2800 44674 430370 549452 549452 1 VLTTAGSYVR Unmodified 1065.5819 0.58185894 1548 O43747 AP1G1 AP-1 complex subunit gamma-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.375 37.375 2 0.0051889 33067 QUIQUE_DMIX7_190116_001 78.334 52.598 1609900000 144250000 127710000 137800000 148160000 107640000 106710000 159860000 89635000 116880000 37697000 163620000 138600000 131310000 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alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.278 55.278 2 0.0011812 53253 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83 34.204 349990000 0 0 0 0 0 0 0 57265000 0 41611000 155510000 0 95605000 47854 1701 44682 430458;430459;430460;430461 549543;549544;549545;549546 549546 3 VLVALADGTLAIFHR Unmodified 1594.9195 0.91951184 77 E9PFH7;A0A087WYG2;Q9UPT6 MAPK8IP3 C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.82 128.82 3 4.4203E-25 132008 QUIQUE_DMIX1_190116_001 157.52 144.89 486800000 60167000 33827000 39752000 36098000 43943000 44772000 42800000 31647000 0 18966000 43408000 53233000 38183000 47855 77 44683 430462;430463;430464;430465;430466;430467;430468;430469;430470;430471;430472;430473 549547;549548;549549;549550;549551;549552;549553;549554;549555;549556;549557;549558;549559 549555 13 VLVALASEELAK Unmodified 1241.7231 0.72310344 69 H7BXI1;A0A087WXU3;A0FGR8 ESYT2 Extended synaptotagmin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 86.718 86.718 2 0.0041263 89103 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.1 29.113 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0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.189 76.189 2 0.0036393 77088 QUIQUE_C1277_190116_001 117.18 86.732 466000000 29520000 31165000 37271000 27488000 43208000 0 32308000 60597000 12893000 0 66882000 65292000 59373000 47904 1473 44729 430943;430944;430945;430946;430947;430948;430949;430950;430951;430952;430953 550143;550144;550145;550146;550147;550148;550149;550150;550151;550152;550153;550154;550155 550144 13 VLYAYGYYTGEPSK Unmodified 1609.7664 0.76642482 1453 Q5VV89;O14880 MGST3 Microsomal glutathione S-transferase 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.963 82.963 2 9.6117E-07 84604 QUIQUE_C1368_190116_001 122.42 105.4 4202400000 278770000 355880000 438670000 259430000 201410000 221560000 337050000 302370000 386590000 216950000 415900000 390840000 396980000 47905 1453 44730 430954;430955;430956;430957;430958;430959;430960;430961;430962;430963;430964;430965;430966 550156;550157;550158;550159;550160;550161;550162;550163;550164;550165;550166;550167;550168;550169;550170;550171;550172;550173;550174;550175;550176;550177;550178 550160 23 VLYAYGYYTGEPSKR Unmodified 1765.8675 0.86753585 1453 Q5VV89;O14880 MGST3 Microsomal glutathione S-transferase 3 yes no 0 0 1 1 3 2 2 3 62.391 62.391 2;3 9.1374E-08 62129 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.55 57.042 1261300000 0 0 0 0 0 0 0 76873000 56748000 0 447220000 295900000 384560000 47906 1453 44731 430967;430968;430969;430970;430971;430972;430973;430974;430975;430976;430977 550179;550180;550181;550182;550183;550184;550185;550186;550187;550188;550189;550190 550183 11 VLYDAEISQIHQSVTDTNVILSMDNSR Unmodified 3047.487 0.48697886 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 137.96 137.96 3 4.2472E-37 142750 QUIQUE_DMIX8_190116_001 127.63 109.98 728840000 67783000 0 0 52684000 49910000 36809000 0 0 0 100210000 180540000 118220000 122680000 + 47907 781;782 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activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.863 77.863 2 4.3408E-05 79116 QUIQUE_C1368_190116_001 120.36 89.287 1050800000 79653000 80538000 162480000 85000000 64105000 54202000 60467000 63543000 81961000 0 185680000 60183000 73017000 47922 2444 44745 431108;431109;431110;431111;431112;431113;431114;431115;431116;431117;431118;431119 550350;550351;550352;550353;550354;550355;550356;550357;550358;550359;550360;550361;550362;550363;550364;550365 550354 16 VMAAENIPENPLK Oxidation (M) 1440.7283 0.72826518 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 1 0 1 1 65.246 65.246 2 0.00047515 64527 QUIQUE_C1368_190116_001 95.483 79.854 141420000 0 44450000 96967000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47923 2444 44745 431120;431121 550366;550367 550367 1868 1 VMAGALEGDLFIGPK Unmodified 1516.796 0.79595081 2442 P42025 ACTR1B Beta-centractin yes yes 0 0 0 3 2 3 3 2 2 4 3 1 2 4 5 2 119.2 119.2 2 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1109.5903 0.59031513 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3KSZ5;J3QS45 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 1 0 1 1 1 30.676 30.676 3 0.013572 25420 QUIQUE_C1277_190116_001 48.028 40.419 68105000 0 27368000 0 0 0 0 0 12610000 0 0 0 28127000 0 47928 3464 44749 431174;431175;431176 550438;550439;550440;550441 550438 2669 4 VMATIGVTR Unmodified 946.52699 0.52698659 4493;3275 Q5JR12;Q9ULR3 PPM1J;PPM1H Protein phosphatase 1J;Protein phosphatase 1H no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.435 38.435 2 0.0023637 34271 QUIQUE_C1576_190116_001 94.114 45.999 5862500000 431280000 446330000 213420000 464820000 0 392140000 365940000 0 0 0 1043300000 1255200000 1250000000 47929 3275;4493 44750 431177;431178;431179;431180;431181;431182;431183;431184;431185 550442;550443;550444;550445;550446;550447;550448;550449;550450;550451 550448 10 VMATTGGMGMGPGGPGMITIPPSILNNPNIPNEIIHALQAGR Unmodified 4194.121 0.12103025 2603 P52272;A0A087X0X3;M0R2T0 HNRNPM Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M yes no 0 0 0 1 1 1 168.33 168.33 4 9.8298E-05 172007 QUIQUE_C1277_190116_001 42.59 39.813 173040000 0 45921000 0 0 0 0 0 41723000 0 0 0 0 85395000 47930 2603 44751 431186;431187;431188 550452;550453;550454 550452 3 VMATTGGTNLR Unmodified 1119.5706 0.57064232 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 23.72 23.72 2 0.00045661 17593 QUIQUE_C1218_190116_001 105.4 60.949 427880000 87779000 78579000 0 85478000 53051000 0 62962000 0 0 0 60028000 0 0 47931 2249 44752 431189;431190;431191;431192;431193;431194 550455;550456;550457;550458;550459;550460;550461 550455 7 VMATTGGTNLRDDIMR Unmodified 1749.8502 0.850188 2249 P26196 DDX6 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6 yes yes 0 0 1 1 62.391 62.391 3 0.018734 62147 QUIQUE_C1576_190116_001 31.876 23.534 31678000 0 0 0 0 0 0 31678000 0 0 0 0 0 0 47932 2249 44753 431195 550462 550462 1 VMAVNSIGK Unmodified 917.50044 0.50043749 756 C9JYY6;Q92823;F8W775;A0A087X2B3 NRCAM Neuronal cell adhesion molecule yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.714 30.714 2 0.0071305 25472 QUIQUE_C1277_190116_001 82.452 45.359 2212200000 197550000 216430000 231840000 224720000 188950000 161120000 0 151130000 179080000 0 216060000 233800000 211490000 47933 756 44754 431196;431197;431198;431199;431200;431201;431202;431203;431204;431205;431206 550463;550464;550465;550466;550467;550468;550469;550470;550471;550472;550473;550474;550475 550465 11 VMCIEHEIK Unmodified 1157.5573 0.55730044 2444 P42224;J3KPM9;E7EPD2;D2KFR9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 30.824 30.824 3 0.004744 24822 QUIQUE_C1368_190116_001 66.27 36.797 177130000 47688000 0 129450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47934 2444 44755 431207;431208 550476;550477 550477 2 VMDDLDR Unmodified 862.38547 0.38546731 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 27.61 27.61 2 0.037418 21260 QUIQUE_DMIX8_190116_001 85.357 64.372 410030000 0 0 0 79006000 0 0 76844000 78114000 0 0 0 70162000 105900000 47935 2533 44756 431209;431210;431211;431212;431213 550478;550479;550480;550481;550482;550483 550483 6 VMDLICEK Unmodified 1006.4827 0.48273852 3531 Q8IV38;G3V0G5 ANKMY2 Ankyrin repeat and MYND domain-containing protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 55.635 55.635 2 0.021097 54043 QUIQUE_C1277_190116_001 75.692 45.272 133900000 0 39477000 0 39235000 0 0 24827000 0 30357000 0 0 0 0 47936 3531 44757 431214;431215;431216;431217 550484;550485;550486;550487 550484 4 VMDMLHSMGPDTVVITSSDLPSPQGSNYLIVLGSQR Unmodified 3843.8845 0.88453118 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 156.72 156.72 3 2.7991E-42 162185 QUIQUE_C1368_190116_001 96.024 90.643 411390000 41086000 0 56947000 24915000 0 0 0 70956000 67000000 0 0 80398000 70087000 47937 1423 44758 431218;431219;431220;431221;431222;431223;431224 550488;550489;550490;550491;550492;550493;550494;550495;550496 550491 9 VMDMLHSMGPDTVVITSSDLPSPQGSNYLIVLGSQR Oxidation (M) 3859.8794 0.8794458 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 1 0 1 148.64 148.64 3 2.6515E-23 156189 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.31 73.382 25483000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25483000 0 0 47938 1423 44758 431225 550497 550497 797;798;799 1 VMDRPGNYVEPTIVTGLGHDASIAHTETFAPILYVFK Oxidation (M) 4074.0561 0.056088261 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 1 1 3 2 1 2 2 3 1 3 2 2 3 3 2 144.26 144.26 3;4;5 7.0567E-279 149706 QUIQUE_C1368_190116_001 233.27 225.95 20449000000 1223500000 1119600000 1092000000 650810000 907970000 1820200000 355860000 2031600000 899380000 1271000000 2644500000 3579700000 2852800000 47939 336 44759 431226;431227;431228;431229;431230;431231;431232;431233;431234;431235;431236;431237;431238;431239;431240;431241;431242;431243;431244;431245;431246;431247;431248;431249;431250;431251;431252;431253;431254 550498;550499;550500;550501;550502;550503;550504;550505;550506;550507;550508;550509;550510;550511;550512;550513;550514;550515;550516;550517;550518;550519;550520;550521;550522;550523;550524;550525;550526;550527;550528;550529;550530;550531;550532;550533;550534;550535 550503 239 37 VMDRPGNYVEPTIVTGLGHDASIAHTETFAPILYVFK Unmodified 4058.0612 0.061173639 336 A0A1B0GTG2;A0A1B0GW77;P49419;A0A1B0GUA1;A0A1B0GW82;A0A1B0GTY9;A0A1B0GTJ4;A0A1B0GV49 ALDH7A1 Alpha-aminoadipic semialdehyde dehydrogenase yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 3 3 2 3 3 3 146.21 146.21 3;4;5 0 152645 QUIQUE_C1576_190116_001 260.86 252.31 17670000000 31554000 324140000 829280000 755880000 449980000 694700000 734580000 2764800000 2615000000 296630000 2828300000 2584700000 2760700000 47940 336 44759 431255;431256;431257;431258;431259;431260;431261;431262;431263;431264;431265;431266;431267;431268;431269;431270;431271;431272;431273;431274;431275;431276;431277;431278;431279;431280 550536;550537;550538;550539;550540;550541;550542;550543;550544;550545;550546;550547;550548;550549;550550;550551;550552;550553;550554;550555;550556;550557;550558;550559;550560;550561;550562;550563;550564;550565;550566;550567;550568;550569 550548 31 VMEAFEQAER Unmodified 1208.5496 0.54957253 1012 F5H5P2;P12694 BCKDHA 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 51.477 51.477 2 0.0027032 49938 QUIQUE_DMIX5_190116_001 98.249 61.228 133840000 0 41012000 41015000 0 0 0 0 0 0 0 51810000 0 0 47941 1012 44760 431281;431282;431283;431284 550570;550571;550572;550573 550572 4 VMEGLDAFDDLMQHTHIQPWYLR Oxidation (M) 2830.3207 0.32070557 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 1 0 1 1 147.59 147.59 4 6.3954E-07 154822 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.405 66.756 63341000 0 0 21742000 0 0 0 0 0 0 0 41599000 0 0 47942 4184 44761 431285;431286 550574;550575;550576 550575 2878 3 VMEGLDAFDDLMQHTHIQPWYLR Unmodified 2814.3258 0.32579095 4184 Q9H7Z7;A6NHH0 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 1 1 1 1 155.31 155.31 3;4 1.7839E-14 162613 QUIQUE_DMIX5_190116_001 109.75 104.05 224230000 0 0 0 0 0 0 0 38010000 71604000 0 34475000 0 80141000 47943 4184 44761 431287;431288;431289;431290 550577;550578;550579;550580;550581 550580 5 VMEGTVAAQDEFYR Unmodified 1614.7348 0.73480712 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 0 1 76.257 76.257 2 0.00096169 77403 QUIQUE_C1368_190116_001 79.82 69.068 27653000 0 0 27653000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47944 2439 44762 431291 550582 550582 1 VMEHFIK Unmodified 902.46841 0.46840908 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 0 1 1 25.533 25.533 2 0.055848 19364 QUIQUE_DMIX7_190116_001 71.715 38.744 231960000 0 0 0 0 0 131790000 0 0 0 0 0 100170000 0 47945 2007 44763 431292;431293 550583;550584 550584 2 VMEIVDADEK Unmodified 1147.5431 0.54309017 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 1 48.523 48.523 2 0.01326 45617 QUIQUE_C1277_190116_001 65.157 45.643 45616000 0 45616000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47946 4620 44764 431294;431295 550585;550586 550585 2 VMEKPSPLLVGR Unmodified 1324.7537 0.75369207 4508;2984 Q9UN86;D6RAC7;D6RB17;D6RGJ4;D6RBM9;D6REX8;D6RBR0;D6RE13;D6RBW8;D6R9X5;D6R9A4;Q13283;E5RIZ6;E5RI46;E5RIF8;E5RH42;E5RJU8;E5RH00 G3BP2;G3BP1 Ras GTPase-activating protein-binding protein 2;Ras GTPase-activating protein-binding protein 1 no no 0 0 1 1 46.033 46.033 3 0.028483 43369 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.809 27.08 22273000 0 0 0 0 0 0 0 0 22273000 0 0 0 0 47947 4508;2984 44765 431296 550587 550587 1 VMELFFTVHR Unmodified 1277.6591 0.6590634 983 F2Z2X4;Q9C0E2 XPO4 Exportin-4 yes no 0 0 0 1 98.321 98.321 3 0.014231 101691 QUIQUE_C1576_190116_001 40.715 23.689 12498000 0 0 0 0 0 0 12498000 0 0 0 0 0 0 47948 983 44766 431297 550588;550589 550588 2 VMEMYQPSAVVLQCGADSLSGDR Unmodified 2512.1396 0.13962966 3754 Q92769 HDAC2 Histone deacetylase 2 yes yes 0 0 0 1 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431312;431313 550607;550608 550608 1 VMEYINR Oxidation (M) 939.4484 0.44840192 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 1 21.974 21.974 2 0.022815 15175 QUIQUE_DMIX4_190116_001 113.25 73.71 3864700000 176350000 193000000 129840000 155100000 177990000 91505000 133070000 524340000 278390000 350540000 819940000 610020000 224580000 47952 50 44770 431314;431315;431316;431317;431318;431319;431320;431321;431322;431323;431324;431325;431326;431327;431328;431329;431330 550609;550610;550611;550612;550613;550614;550615;550616;550617;550618;550619;550620;550621;550622;550623;550624;550625;550626;550627;550628 550622 20 VMEYINR Unmodified 923.45349 0.4534873 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 36.128 36.128 2 0.019551 32611 QUIQUE_C1218_190116_001 117.7 61.189 2944900000 852040000 0 0 784320000 657900000 0 0 0 0 0 0 0 650600000 47953 50 44770 431331;431332;431333;431334 550629;550630;550631;550632 550629 3 VMFSPFGQIEECR Unmodified 1598.7221 0.72213394 299 V9GYD9;Q5VZZ6;A0A0J9YX66;A0A1B0GU44;E9PC62;A0A1B0GUN8;A0A0J9YXJ0;O95319 CELF2 CUGBP Elav-like family member 2 yes no 0 0 0 1 1 116.52 116.52 2 0.010442 121778 QUIQUE_C1218_190116_001 66.663 54.047 178770000 72580000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 106190000 0 0 47954 299 44771 431335;431336 550633;550634 550633 1 VMFSSFGQIEECR Unmodified 1588.7014 0.7013985 1106 G5EA30;Q92879 CELF1 CUGBP Elav-like family member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 102.92 102.92 2 9.7295E-05 105851 QUIQUE_C1277_190116_001 118.4 106.19 179620000 32921000 34819000 32538000 32018000 0 25709000 21613000 0 0 0 0 0 0 47955 1106 44772 431337;431338;431339;431340;431341;431342 550635;550636;550637;550638;550639;550640 550636 6 VMGWVSGLGLK Unmodified 1145.6267 0.62670064 1612 O75145;A0A0C4DGR8;A0A0C4DGR7 PPFIA3 Liprin-alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 110.9 110.9 2 0.026423 112976 QUIQUE_C1563_190116_001 52.278 30.83 27267000 0 0 0 15979000 0 11288000 0 0 0 0 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adhesion molecule L1-like protein;Processed neural cell adhesion molecule L1-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 85.18 85.18 2 0.0017172 87883 QUIQUE_C1218_190116_001 97.813 81.597 353500000 51937000 55977000 51882000 0 57219000 38224000 0 0 51307000 0 0 46958000 0 47999 92 44806 431655;431656;431657;431658;431659;431660;431661;431662 551000;551001;551002;551003;551004;551005;551006;551007;551008 551000 9 VMVAEALDISR Unmodified 1202.6329 0.63290823 3878 Q96I99;E9PDQ8;H0Y852 SUCLG2 Succinyl-CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial yes no 0 0 0 1 85.652 85.652 2 0.0063248 88895 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.228 27.434 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48000 3878 44807 431663 551009 551009 1 VMVALGEEDLSIK Unmodified 1402.7378 0.73776723 3112 Q15119;D6RDN9 PDK2 [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 103.86 103.86 2 0.0059349 106101 QUIQUE_DMIX7_190116_001 65.056 41.627 39236000 20274000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18962000 0 48001 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551138;551139;551140;551141;551142;551143;551144;551145;551146;551147;551148;551149;551150;551151;551152;551153;551154;551155;551156;551157;551158;551159;551160;551161;551162;551163;551164;551165;551166;551167;551168;551169;551170 551170 33 VNAELQAR Unmodified 899.48248 0.48247924 1756 O95831;E9PMA0 AIFM1 Apoptosis-inducing factor 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 18.189 18.189 2 0.0044957 11182 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.92 59.866 82290000 0 0 0 0 0 0 0 65358000 16932000 0 0 0 0 48021 1756 44823 431805;431806 551171;551172 551171 2 VNAFNQDITALMQGEETVGEEDIR Unmodified 2678.2494 0.24937435 2168 P20591;F8W8T1 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 151.91 151.91 3 0.0019261 158815 QUIQUE_C1438_190116_001 50.827 39.196 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48022 2168 44824 431807 551173 551173 1 VNAGDQPGADLGPLITPQAK Unmodified 1961.0218 0.02180466 2870 Q02252;G3V4Z4 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 2 1 1 94.498 94.498 2;3 1.1656E-46 91824 QUIQUE_DMIX4_190116_001 159.12 149.34 7682400000 476100000 525450000 606110000 512670000 648980000 566700000 565230000 591970000 622080000 367880000 1028400000 528590000 642280000 48023 2870 44825 431808;431809;431810;431811;431812;431813;431814;431815;431816;431817;431818;431819;431820;431821;431822;431823;431824 551174;551175;551176;551177;551178;551179;551180;551181;551182;551183;551184;551185;551186;551187;551188;551189;551190;551191;551192;551193;551194;551195;551196;551197;551198;551199;551200;551201;551202;551203;551204;551205 551195 31 VNAGTLAVLQR Unmodified 1140.6615 0.66150624 523 A3KMH1 VWA8 von Willebrand factor A domain-containing protein 8 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 64.393 64.393 2 0.0098689 63553 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.823 45.437 116900000 36137000 29266000 0 0 0 0 37896000 13596000 0 0 0 0 0 48024 523 44826 431825;431826;431827;431828 551206;551207;551208;551209 551209 4 VNAIEEVNNNVK Unmodified 1341.6888 0.6888432 4465 Q9UJY5;B0QYR6 GGA1 ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.872 48.872 2 0.00074127 46994 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.029 73.147 220700000 0 0 0 42411000 37979000 37235000 0 0 23042000 0 42184000 0 37852000 48025 4465 44827 431829;431830;431831;431832;431833;431834;431835;431836;431837 551210;551211;551212;551213;551214;551215;551216;551217;551218 551217 9 VNAIEHVIIPR Unmodified 1259.735 0.73500553 4624 Q9Y5K8;G3V2S6;H0YJH8;G3V2V6 ATP6V1D V-type proton ATPase subunit D yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 2 2 1 1 1 1 58.481 58.481 2;3 1.7073E-05 57307 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.48 118.67 2485100000 223000000 227820000 235630000 227220000 153120000 166980000 213010000 169230000 172890000 75157000 241270000 191680000 188130000 48026 4624 44828 431838;431839;431840;431841;431842;431843;431844;431845;431846;431847;431848;431849;431850;431851;431852;431853;431854;431855 551219;551220;551221;551222;551223;551224;551225;551226;551227;551228;551229;551230;551231;551232;551233;551234;551235;551236 551234 18 VNAPILTNTTLNVIR Unmodified 1637.9465 0.94645487 3890 Q96JG6;H0Y7Q2 CCDC132 Coiled-coil domain-containing protein 132 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 107.24 107.24 2 0.0061523 112107 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.951 43.971 160210000 0 0 0 25681000 0 20713000 39236000 0 0 0 41835000 0 32748000 48027 3890 44829 431856;431857;431858;431859;431860;431861 551237;551238;551239;551240;551241;551242;551243 551242 7 VNAQAAAYEYMAAYIENAK Unmodified 2089.9779 0.97789093 3767 Q92905;E5RHF2 COPS5 COP9 signalosome complex subunit 5 no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 147.83 147.83 2;3 2.7092E-36 154716 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.48 114.09 929790000 35237000 96024000 69217000 85128000 82023000 70277000 35858000 86220000 84888000 29526000 124930000 28244000 102220000 48028 3767 44830 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551281 1 VNAVFEWHITK Unmodified 1342.7034 0.70337105 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 80.578 80.578 3 0.052019 80371 QUIQUE_C1563_190116_001 26.124 20.81 20085000 0 0 0 0 0 20085000 0 0 0 0 0 0 0 48031 455 44833 431893 551282 551282 1 VNAVNPTVVMTSMGQATWSDPHK Unmodified 2469.1781 0.17806408 3464 Q7Z4W1;J3KS22;J3QS36;J3QL34;J3QRQ2 DCXR L-xylulose reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 111.39 111.39 3 2.6428E-05 116426 QUIQUE_DMIX5_190116_001 41.087 37.211 260330000 0 0 0 0 0 0 0 84478000 0 0 93812000 82044000 0 48032 3464 44834 431894;431895;431896;431897 551283;551284;551285;551286 551284 3 VNCIQWICK Unmodified 1219.5842 0.5841839 3363 Q6IA86;K7ER35;F5GYE9 ELP2 Elongator complex protein 2 yes no 0 0 0 1 72.458 72.458 2 0.058395 72677 QUIQUE_C1277_190116_001 60.682 40.895 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48033 3363 44835 431898 551287 551287 1 VNCLAPGLIK Unmodified 1083.6111 0.61105057 4027 Q9BTZ2;P0CG22;H0YNP7 DHRS4;DHRS4L1 Dehydrogenase/reductase SDR family member 4;Putative dehydrogenase/reductase SDR family member 4-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 61.569 61.569 2 0.023883 60628 QUIQUE_C1368_190116_001 56.659 35.371 219410000 0 0 85911000 0 0 47879000 85625000 0 0 0 0 0 0 48034 4027 44836 431899;431900;431901 551288;551289;551290 551288 3 VNCSFYFK Unmodified 1063.4797 0.47970205 1987 P0DN76;Q01081;Q8WU68;A0A1B0GW87;M0QYK5;M0R2N4 U2AF1;U2AF1L4 Splicing factor U2AF 35 kDa subunit;Splicing factor U2AF 26 kDa subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.365 61.365 2 0.02842 60188 QUIQUE_C1403_190116_001 68.787 51.401 503420000 43510000 61266000 48040000 37881000 37135000 44762000 45316000 21054000 26851000 0 58922000 38649000 40030000 48035 1987 44837 431902;431903;431904;431905;431906;431907;431908;431909;431910;431911;431912;431913 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1322.7234 0.72343779 3037 Q14008;H0YDX5 CKAP5 Cytoskeleton-associated protein 5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.58 117.58 3 0.00030664 123166 QUIQUE_C1438_190116_001 90.913 70.056 172000000 0 0 17145000 0 24103000 0 20645000 18306000 31347000 0 29595000 30857000 0 48040 3037 44842 431958;431959;431960;431961;431962;431963;431964;431965;431966;431967;431968 551354;551355;551356;551357;551358;551359;551360;551361;551362;551363;551364 551358 11 VNDKNPHVALYALEVMESVVK Unmodified 2354.2304 0.23041723 1464 O14964;I3L1P5 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.45 140.45 3;4 9.3545E-08 145411 QUIQUE_DMIX3_190116_001 67.76 55.865 322690000 0 51221000 28787000 0 31109000 0 35309000 25937000 43161000 0 0 43595000 63568000 48041 1464 44843 431969;431970;431971;431972;431973;431974;431975;431976 551365;551366;551367;551368;551369;551370;551371;551372 551370 7 VNDTIQIDLETGK Unmodified 1444.7409 0.74093835 2757 P62701 RPS4X 40S ribosomal 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non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 35.427 35.427 2;3 1.4011E-17 31050 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155 129.62 2758800000 0 56073000 50083000 39708000 110160000 0 77551000 457420000 454940000 0 592110000 476190000 444610000 48044 267;275;3025 44846 431992;431993;431994;431995;431996;431997;431998;431999;432000;432001;432002;432003;432004;432005;432006 551399;551400;551401;551402;551403;551404;551405;551406;551407;551408;551409;551410;551411;551412;551413;551414;551415;551416;551417 551410 19 VNDVVPWVLDVILNK Unmodified 1721.9716 0.97160699 1259 J3KN16;Q5VYK3 KIAA0368;ECM29 Proteasome-associated protein ECM29 homolog yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 1 1 1 1 170.75 170.75 2;3 0.00016046 176901 QUIQUE_C1438_190116_001 60.918 57.146 209770000 11694000 30264000 0 0 26370000 0 0 27971000 24217000 2244200 24902000 21274000 40830000 48045 1259 44847 432007;432008;432009;432010;432011;432012;432013;432014;432015;432016;432017;432018;432019 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432083;432084;432085;432086;432087;432088;432089;432090;432091;432092;432093;432094;432095;432096;432097;432098;432099;432100;432101;432102;432103;432104;432105;432106;432107;432108;432109;432110;432111;432112;432113;432114 551512;551513;551514;551515;551516;551517;551518;551519;551520;551521;551522;551523;551524;551525;551526;551527;551528;551529;551530;551531;551532;551533;551534;551535;551536;551537;551538;551539;551540;551541;551542;551543;551544;551545;551546;551547;551548;551549 551520 36 VNESSHYDLAFTDVHFKPGQIR Unmodified 2559.2506 0.2506354 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.297 82.297 5 1.2406E-05 83284 QUIQUE_C1403_190116_001 63.69 61.377 610490000 30979000 42844000 51231000 63802000 82161000 31196000 48258000 37714000 54935000 0 55774000 49690000 61908000 48055 2285 44855 432115;432116;432117;432118;432119;432120;432121;432122;432123;432124;432125;432126 551550;551551;551552;551553;551554;551555;551556;551557;551558;551559;551560;551561;551562;551563 551554 14 VNESSLNWPQLENIGNFIK Unmodified 2201.1117 0.1116823 3137;908 Q15417;E9PDU6 CNN3 Calponin-3;Calponin no no 0 0 0 2 3 3 2 1 2 2 3 2 3 2 1 1 153.65 153.65 2;3 1.4087E-99 160186 QUIQUE_C1438_190116_001 206.32 184.76 2029200000 118750000 206980000 191800000 193860000 106350000 186110000 130200000 210410000 177800000 73565000 190830000 90715000 151800000 48056 3137;908 44856 432127;432128;432129;432130;432131;432132;432133;432134;432135;432136;432137;432138;432139;432140;432141;432142;432143;432144;432145;432146;432147;432148;432149;432150;432151;432152;432153 551564;551565;551566;551567;551568;551569;551570;551571;551572;551573;551574;551575;551576;551577;551578;551579;551580;551581;551582;551583;551584;551585;551586;551587;551588;551589;551590;551591;551592;551593;551594;551595;551596;551597;551598;551599;551600;551601;551602;551603;551604;551605;551606;551607;551608 551585 45 VNEVDVSEVSHSK Unmodified 1427.6892 0.68923713 655 B7Z2T4;E9PN83;F8VYC1;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIW2;Q6ZSU2;A8MUT9 DLG2 Disks large homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 28.058 28.058 2 8.1863E-05 21321 QUIQUE_C1277_190116_001 132.32 112.56 31324000 31324000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48057 655 44857 432154;432155;432156;432157;432158;432159 551609;551610;551611;551612;551613;551614 551610 6 VNEVDVSEVVHSR Unmodified 1467.7318 0.73177065 3279 Q5JUW8;Q92796 DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 53.808 53.808 2 0.0019218 52352 QUIQUE_C1438_190116_001 76.522 65.371 62961000 36767000 0 0 0 26195000 0 0 0 0 0 0 0 0 48058 3279 44858 432160;432161 551615;551616 551616 2 VNEVNQFAAK Unmodified 1118.572 0.57202253 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.239 30.239 2 1.77E-23 25169 QUIQUE_C1438_190116_001 193.28 142.67 35890000000 2394700000 2873800000 3209500000 2642500000 3711900000 2534400000 3207400000 2064700000 3086900000 1121100000 2119600000 3306200000 3617600000 48059 267;275;3025 44859 432162;432163;432164;432165;432166;432167;432168;432169;432170;432171;432172;432173;432174 551617;551618;551619;551620;551621;551622;551623;551624;551625;551626;551627;551628;551629;551630;551631;551632;551633;551634;551635 551623 19 VNFAMNVGK Unmodified 978.49569 0.49568646 2077 P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase PKM;Pyruvate kinase no no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1 53.973 53.973 1;2 1.1391E-56 52487 QUIQUE_C1277_190116_001 229.09 203.36 37679000000 3472400000 3405100000 2721300000 3067500000 2274800000 2017700000 2586700000 3279000000 3069500000 1265000000 4038300000 3081300000 3400100000 48060 2077 44860 432175;432176;432177;432178;432179;432180;432181;432182;432183;432184;432185;432186;432187;432188;432189;432190;432191;432192;432193 551636;551637;551638;551639;551640;551641;551642;551643;551644;551645;551646;551647;551648;551649;551650;551651;551652;551653;551654;551655;551656;551657;551658;551659;551660;551661;551662;551663;551664;551665 551638 24 VNFAMNVGK Oxidation (M) 994.4906 0.49060109 2077 P14618;B4DNK4 PKM Pyruvate kinase PKM;Pyruvate kinase no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 31.165 31.165 2 0.00049188 26748 QUIQUE_DMIX1_190116_001 122.74 100.25 8516600000 0 0 0 787550000 655490000 628150000 0 844390000 1121400000 733410000 1370800000 1183100000 1192300000 48061 2077 44860 432194;432195;432196;432197;432198;432199;432200;432201;432202 551666;551667;551668;551669;551670;551671;551672;551673;551674 551669 1402 6 VNFEDDSR Unmodified 980.41994 0.41993856 821 D6REX3;O94979;D6RHZ5;H7BXG7;H0YAB3;H0Y8V7;H0Y9K1 SEC31A Protein transport protein Sec31A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 25.115 25.115 2 0.020235 18413 QUIQUE_C1368_190116_001 77.072 54.941 384880000 39370000 44119000 60967000 38231000 45672000 0 47925000 0 0 0 0 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short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas;Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 2 1 2 1 81.019 81.019 2;3 0.00015343 81929 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.543 74.03 1828300000 0 265980000 273640000 0 126430000 171970000 215630000 167730000 254740000 64855000 0 140010000 147360000 48065 2778;2413 44864 432263;432264;432265;432266;432267;432268;432269;432270;432271;432272;432273;432274;432275 551743;551744;551745;551746;551747;551748;551749;551750;551751;551752;551753;551754;551755;551756 551748 13 VNFHMFDVGGQR Oxidation (M) 1421.651 0.65101791 2778;2413 P63092;Q5JWF2;P38405;K7EPE2;K7EQ80 GNAS;GNAL Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms short;Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha isoforms XLas;Guanine nucleotide-binding protein G(olf) subunit alpha no no 0 1 0 1 58.148 58.148 3 0.031623 55943 QUIQUE_C1563_190116_001 53.448 34.702 31550000 0 0 0 0 0 31550000 0 0 0 0 0 0 0 48066 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10 VNFLVNAAGINR Unmodified 1286.7095 0.70951906 3594 Q8N4T8;H0Y962 CBR4 Carbonyl reductase family member 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.896 89.896 2 0.00073059 92785 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.247 64.11 723790000 55950000 0 66730000 40187000 55608000 50437000 48470000 65455000 91463000 0 104420000 79881000 65189000 48069 3594 44867 432288;432289;432290;432291;432292;432293;432294;432295;432296;432297;432298 551771;551772;551773;551774;551775;551776;551777;551778;551779;551780;551781 551779 10 VNFPENGFLSPDK Unmodified 1462.7092 0.70924429 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 0 1 98.546 98.546 2 0.0020452 102989 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.695 59.063 95243000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 95243000 0 0 48070 2334 44868 432299 551782 551782 1 VNFPENGFLSPDKLSLLEK Unmodified 2146.131 0.13102076 2334 P31689 DNAJA1 DnaJ homolog subfamily A member 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 134.15 134.15 3 0.021569 137616 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.702 38.208 178230000 0 0 0 0 0 0 0 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Unmodified 1343.6317 0.63172225 2293 P29966 MARCKS Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 16.525 16.525 2 0.0014496 9320 QUIQUE_C1438_190116_001 69.716 58.886 1824500000 79826000 0 0 109980000 83848000 0 975440000 0 0 367480000 82254000 47859000 77789000 48074 2293 44872 432319;432320;432321;432322;432323;432324;432325;432326;432327 551804;551805;551806;551807;551808;551809;551810;551811;551812 551806 6 VNGEVVQSGNTNQMVFK Unmodified 1849.8992 0.89924668 3860 Q96GK7 FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A yes yes 0 0 0 1 65.159 65.159 2 0.0002505 64051 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.766 73.562 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48075 3860 44873 432328 551813 551813 1 VNGVLTALPVSVADGR Unmodified 1566.873 0.87295558 4663 Q9Y6R7;A0A087WXI2;A0A087WUZ2 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 106.5 106.5 2 0.036149 103262 QUIQUE_DMIX4_190116_001 55.261 47.547 42504000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42504000 0 0 0 48076 4663 44874 432329 551814 551814 1 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432835;432836;432837;432838;432839;432840;432841;432842;432843;432844;432845;432846;432847 552456;552457;552458;552459;552460;552461;552462;552463;552464;552465;552466;552467;552468;552469;552470;552471 552457 16 VNNASLIGLGYTQTLRPGVK Unmodified 2100.1691 0.1691376 4545 Q9Y277 VDAC3 Voltage-dependent anion-selective channel protein 3 yes yes 0 0 1 1 91.07 91.07 3 0.00068127 91874 QUIQUE_C1563_190116_001 84.249 73.873 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48133 4545 44927 432848 552472 552472 1 VNNFGSGLTALGLKPK Unmodified 1614.9093 0.90934108 1577 O60488;D6RF95 ACSL4 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 84.242 84.242 3 0.00033632 85514 QUIQUE_C1403_190116_001 79.022 75.107 188010000 20008000 0 29448000 31398000 24821000 0 21504000 0 0 0 32345000 0 28485000 48134 1577 44928 432849;432850;432851;432852;432853;432854;432855 552473;552474;552475;552476;552477;552478;552479 552475 6 VNNFPPLPK Unmodified 1024.5706 0.57056597 3658 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P21796 VDAC1 Voltage-dependent anion-selective channel protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 91.444 91.444 2;3 3.7249E-100 93795 QUIQUE_C1277_190116_001 245.39 195.19 70405000000 6225000000 6086100000 5938200000 5230300000 4525300000 5054100000 5469100000 5468100000 6715200000 2390500000 5561500000 5739100000 6002700000 48137 2185 44931 432879;432880;432881;432882;432883;432884;432885;432886;432887;432888;432889;432890;432891;432892;432893;432894;432895;432896;432897;432898;432899;432900;432901;432902;432903;432904 552503;552504;552505;552506;552507;552508;552509;552510;552511;552512;552513;552514;552515;552516;552517;552518;552519;552520;552521;552522;552523;552524;552525;552526;552527;552528;552529;552530;552531;552532;552533;552534;552535;552536;552537;552538;552539;552540;552541;552542;552543;552544;552545;552546;552547;552548;552549;552550;552551;552552;552553;552554;552555;552556;552557;552558;552559;552560 552513 58 VNNSSLIGVGYTQTLR Unmodified 1720.9108 0.91079765 2469 P45880;A0A0A0MR02 VDAC2 Voltage-dependent anion-selective channel protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 88.109 88.109 2 2.4836E-09 89472 QUIQUE_C1403_190116_001 126.1 82 883950000 251280000 139430000 0 170250000 111180000 136800000 0 0 0 75014000 0 0 0 48138 2469 44932 432905;432906;432907;432908;432909;432910 552561;552562;552563;552564;552565;552566;552567;552568 552565 8 VNNSSLIGVGYTQTLRPGVK Unmodified 2102.1484 0.14840216 2469 P45880;A0A0A0MR02 VDAC2 Voltage-dependent anion-selective channel protein 2 yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 2 2 2 78.35 78.35 2;3 1.5256E-64 79825 QUIQUE_C1438_190116_001 184.48 172.5 49273000000 3083700000 3783400000 4064700000 3914100000 3372900000 3503200000 3882400000 3549500000 4319300000 1407800000 5715100000 4186000000 4490200000 48139 2469 44933 432911;432912;432913;432914;432915;432916;432917;432918;432919;432920;432921;432922;432923;432924;432925;432926;432927;432928;432929;432930;432931;432932;432933;432934;432935;432936;432937 552569;552570;552571;552572;552573;552574;552575;552576;552577;552578;552579;552580;552581;552582;552583;552584;552585;552586;552587;552588;552589;552590;552591;552592;552593;552594;552595;552596;552597;552598;552599;552600;552601;552602;552603;552604;552605;552606;552607;552608;552609;552610;552611;552612;552613 552583 45 VNNSTMLGASGDYADFQYLK Unmodified 2193.0048 0.0048339665 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 122.27 122.27 2 2.6273E-18 125824 QUIQUE_C1277_190116_001 129.38 115.03 320450000 76444000 70860000 0 0 42506000 51684000 0 55047000 0 23909000 0 0 0 48140 2274 44934 432938;432939;432940;432941;432942;432943;432944;432945 552614;552615;552616;552617;552618;552619;552620;552621 552615 8 VNNSTMLGASGDYADFQYLK Oxidation (M) 2208.9997 0.99974859 2274 P28070 PSMB4 Proteasome subunit beta type-4 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 107.45 107.45 2 7.4351E-47 112255 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.27 150.5 263920000 0 33148000 25834000 0 0 18220000 0 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433397;433398;433399;433400;433401;433402;433403;433404;433405;433406;433407;433408 553365;553366;553367;553368;553369;553370;553371;553372;553373;553374;553375;553376 553374 1 VNSLPEVLPILNSDEPK Unmodified 1862.9989 0.99894395 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 130.09 130.09 2 3.005E-10 134398 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.76 103.37 146630000 0 0 0 0 63644000 0 0 0 61015000 21974000 0 0 0 48171 2207 44963 433409;433410;433411;433412 553377;553378;553379;553380;553381 553378 5 VNSQRPFNAEPPPELLTENYITPNPIFFTR Unmodified 3500.7729 0.77285419 2591 P51687 SUOX Sulfite oxidase, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 148.37 148.37 3 1.7517E-20 152909 QUIQUE_C1403_190116_001 84.097 78.58 276770000 0 0 0 26134000 0 0 0 41240000 0 0 72479000 72264000 64648000 48172 2591 44964 433413;433414;433415;433416;433417 553382;553383;553384;553385;553386 553382 5 VNSSLSDELR Unmodified 1118.5568 0.5567664 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QLH1 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 43.328 43.328 2 0.0018569 40569 QUIQUE_C1218_190116_001 93.178 63.802 209210000 60574000 32300000 0 39519000 37653000 39162000 0 0 0 0 0 0 0 48173 245 44965 433418;433419;433420;433421;433422 553387;553388;553389;553390;553391;553392;553393 553387 7 VNSSLSDELRR Unmodified 1274.6579 0.65787742 245 A0A0C4DGN6;Q9Y2X7;J3QRU8;J3QLH1 GIT1 ARF GTPase-activating protein GIT1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 2 32.394 32.394 2;3 0.00033846 26853 QUIQUE_C1368_190116_001 87.184 63.808 247240000 39400000 0 76168000 0 37359000 0 0 0 44859000 0 49453000 0 0 48174 245 44966 433423;433424;433425;433426;433427;433428 553394;553395;553396;553397;553398;553399 553395 6 VNSVSSGLAEEDLETLLQSR Unmodified 2146.0754 0.075356373 3564 Q8N0X4;Q5JVC2;Q5JVC1 CLYBL Citrate lyase subunit beta-like protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 144.1 144.1 2 7.4161E-09 148433 QUIQUE_C1403_190116_001 132.05 120.07 295440000 0 0 0 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0.033128 15920 QUIQUE_C1277_190116_001 88.643 47.791 351270000 0 351270000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48177 467 44969 433454 553428 553428 1 VNTENLLQVENTGK Unmodified 1557.7999 0.79985021 2296 P30039;A0A0C4DFS0;V9GY00 PBLD Phenazine biosynthesis-like domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.006 71.006 2 9.6243E-18 70904 QUIQUE_DMIX1_190116_001 154.94 135.34 842380000 47186000 0 85839000 97289000 43764000 70840000 88222000 77158000 0 35909000 114630000 61579000 119960000 48178 2296 44970 433455;433456;433457;433458;433459;433460;433461;433462;433463;433464;433465;433466 553429;553430;553431;553432;553433;553434;553435;553436;553437;553438;553439;553440 553436 11 VNTFSALLLEPYKPPSAQ Unmodified 1974.0462 0.046228496 1543 O43681;A0A087WXS7 ASNA1 ATPase ASNA1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 136.23 136.23 2 3.2388E-07 140711 QUIQUE_DMIX8_190116_001 151.66 142.71 1090100000 158570000 157100000 114710000 0 0 108340000 100330000 63307000 90537000 55338000 60048000 74625000 107230000 48179 1543 44971 433467;433468;433469;433470;433471;433472;433473;433474;433475;433476;433477 553441;553442;553443;553444;553445;553446;553447;553448;553449;553450;553451;553452 553452 12 VNTHGIFTISTASMVEK Unmodified 1833.9295 0.92948418 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 2 1 2 2 1 1 86.131 86.131 2;3 1.0272E-52 87359 QUIQUE_C1277_190116_001 179.17 148.44 515450000 176400000 35671000 0 147860000 0 111200000 0 0 0 44316000 0 0 0 48180 180;3738 44972 433478;433479;433480;433481;433482;433483;433484;433485;433486 553453;553454;553455;553456;553457;553458;553459;553460;553461;553462;553463;553464 553457 11 VNTPTTTVYR Unmodified 1150.5982 0.59823728 2253 P26639 TARS Threonine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 31.31 31.31 2 0.051775 25983 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.228 8.2264 82380000 0 0 0 0 0 0 0 82380000 0 0 0 0 0 48181 2253 44973 433487 553465 553465 1 VNTQDFR Unmodified 878.42463 0.42463001 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.355 21.355 2 0.0030846 14370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 163.84 69.442 578350000 91533000 0 0 78177000 80612000 0 79401000 0 0 0 88514000 85620000 74495000 48182 345 44974 433488;433489;433490;433491;433492;433493;433494 553466;553467;553468;553469;553470;553471;553472;553473;553474 553472 9 VNVADILTK Unmodified 971.56515 0.56514624 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.088 81.088 2 0.016045 77880 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.299 35.009 1209000000 216780000 128330000 149470000 138380000 104670000 145560000 143380000 0 48307000 73959000 0 60164000 0 48183 1255;2856 44975 433495;433496;433497;433498;433499;433500;433501;433502;433503;433504 553475;553476;553477;553478;553479;553480;553481;553482;553483;553484;553485 553483 8 VNVAGLVLAGSADFK Unmodified 1459.8035 0.80347903 2755 P62495;B7Z7P8;I3L492 ETF1 Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 130.13 130.13 2;3 1.4314E-05 132879 QUIQUE_C1563_190116_001 95.417 78.187 202230000 0 36369000 30805000 30450000 0 44078000 25948000 0 25227000 9348100 0 0 0 48184 2755 44976 433505;433506;433507;433508;433509;433510;433511;433512 553486;553487;553488;553489;553490;553491;553492;553493 553489 5 VNVDAVGGEALGR Unmodified 1255.6521 0.65206377 1817 P02042;E9PFT6;E9PEW8 HBD Hemoglobin subunit delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.316 61.316 2 2.8672E-05 61077 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.09 121.37 11744000000 1199900000 1317200000 1162100000 500540000 1056900000 790530000 671870000 344340000 0 174750000 1819300000 1469000000 1237700000 48185 1817 44977 433513;433514;433515;433516;433517;433518;433519;433520;433521;433522;433523;433524 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VPAATSAIITNDGIGINPAQTAGNVFLK Unmodified 2752.4759 0.47594389 2731 P61960 UFM1 Ubiquitin-fold modifier 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 141.25 141.25 3 5.9313E-06 146805 QUIQUE_C1218_190116_001 53.705 51.361 70637000 29823000 0 0 0 28197000 0 0 0 0 12617000 0 0 0 48209 2731 45001 433766;433767;433768 553890;553891;553892;553893 553890 4 VPADLGAEAGLQQLLGALR Unmodified 1891.0527 0.052710858 2375 P35270 SPR Sepiapterin reductase yes yes 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 162.67 162.67 2;3 1.4543E-73 169013 QUIQUE_C1438_190116_001 190.37 178.86 2266100000 129760000 181460000 58634000 158370000 183990000 0 201340000 159070000 277820000 40711000 433660000 166320000 274920000 48210 2375 45002 433769;433770;433771;433772;433773;433774;433775;433776;433777;433778;433779;433780;433781;433782;433783;433784;433785;433786;433787;433788;433789;433790 553894;553895;553896;553897;553898;553899;553900;553901;553902;553903;553904;553905;553906;553907;553908;553909;553910;553911;553912;553913;553914;553915;553916 553902 17 VPADTEVVCAPPTAYIDFAR Unmodified 2191.062 0.061954915 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 0 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 2 127.02 127.02 2;3 4.1797E-243 130864 QUIQUE_C1277_190116_001 274.09 247.97 43905000000 3916900000 4088600000 4163600000 3664400000 3765600000 3412500000 3698000000 2690400000 2528800000 1199700000 3818100000 3419900000 3538200000 48211 2688 45003 433791;433792;433793;433794;433795;433796;433797;433798;433799;433800;433801;433802;433803;433804;433805;433806;433807;433808;433809;433810;433811;433812;433813;433814;433815;433816;433817;433818 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554141;554142;554143;554144;554145;554146;554147;554148;554149;554150;554151;554152;554153;554154;554155;554156;554157;554158;554159;554160;554161;554162 554142 22 VPDGKPENEFAFNAEFK Unmodified 1937.9159 0.9159426 3120 Q15181 PPA1 Inorganic pyrophosphatase yes yes 0 0 1 4 2 2 2 2 1 1 1 1 2 86.002 86.002 2;3 1.3987E-12 88501 QUIQUE_C1218_190116_001 107.46 84.887 1759500000 288670000 184890000 228540000 140670000 203220000 94519000 173700000 0 0 0 127420000 98538000 219320000 48229 3120 45021 433934;433935;433936;433937;433938;433939;433940;433941;433942;433943;433944;433945;433946;433947;433948;433949;433950;433951 554163;554164;554165;554166;554167;554168;554169;554170;554171;554172;554173;554174;554175;554176;554177;554178;554179;554180;554181;554182;554183;554184;554185;554186;554187;554188;554189;554190;554191 554167 28 VPDGKPENQFAFNGEFK Unmodified 1922.9163 0.91627696 4150 Q9H2U2;D6R967 PPA2 Inorganic pyrophosphatase 2, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 76.03 76.03 3 0.00047266 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554201;554202;554203;554204;554205;554206;554207;554208;554209;554210;554211;554212;554213;554214;554215;554216;554217;554218;554219;554220;554221;554222;554223 554201 23 VPDLKDLDPIGK Unmodified 1308.7289 0.7289171 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 90.047 90.047 3 0.0013691 92165 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.46 54.451 130460000 0 0 0 0 0 0 0 35273000 27959000 0 21622000 21228000 24373000 48233 3700 45025 433973;433974;433975;433976;433977 554224;554225;554226;554227;554228;554229;554230;554231 554225 8 VPDNYGDEIAIELR Unmodified 1602.789 0.78895118 3766 Q92900 UPF1 Regulator of nonsense transcripts 1 yes yes 0 0 0 1 107.76 107.76 2 0.010732 111067 QUIQUE_C1277_190116_001 60.157 34.94 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48234 3766 45026 433978 554232 554232 1 VPDSTYEMIGGLDK Unmodified 1523.7178 0.71776007 2743 P62195;J3QSA9;J3QQM1;J3KRP2;J3QLH6;J3QRW1;J3QSE0 PSMC5 26S protease regulatory subunit 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.164 95.164 2 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79.632 79.632 2;3 1.1092E-05 80742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.39 89.18 1811900000 326100000 238670000 45229000 31639000 41284000 34250000 0 173970000 261520000 165620000 247710000 195390000 50497000 48239 2470 45031 434019;434020;434021;434022;434023;434024;434025;434026;434027;434028;434029;434030;434031;434032;434033;434034 554289;554290;554291;554292;554293;554294;554295;554296;554297;554298;554299;554300;554301;554302;554303;554304 554298 14 VPEANSSWMDTVIR Oxidation (M) 1619.7614 0.76135622 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.192 78.192 2 0.00026066 78869 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.417 73.371 469630000 40922000 0 0 0 30786000 0 32995000 47256000 55547000 59351000 76166000 58492000 68114000 48240 1997 45032 434035;434036;434037;434038;434039;434040;434041;434042;434043 554305;554306;554307;554308;554309;554310;554311;554312;554313;554314 554309 1263 9 VPEANSSWMDTVIR Unmodified 1603.7664 0.7664416 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.55 105.55 2 1.4844E-17 109492 QUIQUE_C1368_190116_001 152.85 136.02 1926000000 192610000 153660000 200500000 144360000 91241000 164480000 188570000 88795000 147690000 55492000 176830000 169310000 152440000 48241 1997 45032 434044;434045;434046;434047;434048;434049;434050;434051;434052;434053;434054;434055;434056 554315;554316;554317;554318;554319;554320;554321;554322;554323;554324;554325;554326;554327;554328;554329;554330;554331;554332;554333;554334;554335;554336 554320 22 VPEDPTQCFLLFANQTEK Unmodified 2136.0198 0.019755749 4437 Q9UHQ9;H7C0R7 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 3 2 2 1 1 2 1 1 3 138.3 138.3 2;3 7.7612E-225 143967 QUIQUE_C1218_190116_001 278.33 255.21 1714600000 247840000 118960000 164190000 150150000 132910000 150050000 171250000 71539000 97840000 23745000 147300000 86191000 152630000 48242 4437 45033 434057;434058;434059;434060;434061;434062;434063;434064;434065;434066;434067;434068;434069;434070;434071;434072;434073;434074;434075;434076;434077;434078 554337;554338;554339;554340;554341;554342;554343;554344;554345;554346;554347;554348;554349;554350;554351;554352;554353;554354;554355;554356;554357;554358;554359;554360;554361;554362;554363;554364 554338 26 VPEDPTQCFLLFANQTEKDIILR Unmodified 2746.4 0.40000175 4437 Q9UHQ9;H7C0R7 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 2 160.86 160.86 3 1.9407E-30 165089 QUIQUE_DMIX7_190116_001 132.83 125.72 327400000 0 0 0 0 0 0 0 37130000 63598000 0 78382000 148290000 0 48243 4437 45034 434079;434080;434081;434082;434083 554365;554366;554367;554368;554369;554370 554369 6 VPEDPTQCFLLFANQTEKDIILREDLEELQAR Unmodified 3829.9197 0.91965436 4437 Q9UHQ9;H7C0R7 CYB5R1 NADH-cytochrome b5 reductase 1 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 161.22 161.22 4 4.6512E-88 166010 QUIQUE_DMIX8_190116_001 160.99 152.07 532840000 0 0 0 0 0 0 0 46365000 84991000 0 112250000 175770000 113460000 48244 4437 45035 434084;434085;434086;434087;434088 554371;554372;554373;554374;554375;554376 554376 6 VPEEEKDTNVQVLMVLGAGR Unmodified 2183.1256 0.1256178 1440 O14744;H0YJX6;H0YJ77 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 106.23 106.23 3 9.7872E-05 103620 QUIQUE_DMIX4_190116_001 56.54 48.451 833650000 85795000 74246000 77002000 50055000 86724000 74128000 96608000 35286000 45803000 44762000 54930000 44186000 64120000 48245 1440 45036 434089;434090;434091;434092;434093;434094;434095;434096;434097;434098;434099;434100;434101;434102 554377;554378;554379;554380;554381;554382;554383;554384;554385;554386;554387;554388;554389;554390;554391;554392;554393;554394 554391 16 VPEEQPPNTLIGSLAADYGFPDVGHLYK Unmodified 3026.5026 0.50255257 2914 Q08174;D6RBG2 PCDH1 Protocadherin-1 no no 0 0 0 1 157.1 157.1 3 1.8263E-08 152123 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.951 56.12 27348000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27348000 0 0 0 48246 2914 45037 434103 554395 554395 1 VPEFQFLIGDEAATHLK Unmodified 1913.9887 0.98871362 2365 P34949;H3BPB8;F5GX71;H3BMZ9;H3BPP3;H3BP57;H3BUZ9;H3BT48;H3BPM5;H3BNY8;H3BQX0;H3BU66 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 122.92 122.92 3 0.00015093 126862 QUIQUE_C1368_190116_001 60.949 50.094 429440000 93909000 68740000 64366000 76912000 0 62230000 0 0 0 63285000 0 0 0 48247 2365 45038 434104;434105;434106;434107;434108;434109;434110;434111 554396;554397;554398;554399;554400;554401;554402;554403;554404;554405;554406 554400 11 VPEGGEGIGANDVEVK Unmodified 1568.7682 0.76821573 2882 Q03001;F8W9J4 DST Dystonin no no 0 0 0 1 54.141 54.141 2 0.0099671 52943 QUIQUE_DMIX5_190116_001 72.496 55.47 24605000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24605000 0 0 48248 2882 45039 434112 554407 554407 0 VPEGGEGISATEVDSR Unmodified 1601.7533 0.75329395 1187 H3BPE1;H3BQK9;Q9UPN3;E9PNZ4;E9PLY5;E9PLY0 MACF1 Microtubule-actin cross-linking factor 1, isoforms 1/2/3/5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 49.315 49.315 2 4.9619E-13 46209 QUIQUE_C1368_190116_001 131.66 116.33 159020000 41119000 20438000 37316000 0 0 0 0 0 39681000 0 0 20467000 0 48249 1187 45040 434113;434114;434115;434116;434117 554408;554409;554410;554411;554412 554410 5 VPEILQLSDALR Unmodified 1352.7664 0.76636524 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.56 126.56 2 0.0011039 131002 QUIQUE_C1368_190116_001 83.499 60.145 948610000 0 124630000 105810000 88953000 83306000 70958000 92537000 43567000 78263000 0 75067000 96063000 89452000 48250 617 45041 434118;434119;434120;434121;434122;434123;434124;434125;434126;434127;434128 554413;554414;554415;554416;554417;554418;554419;554420;554421;554422;554423;554424;554425 554415 11 VPEILQLSDALRDNILPELGVR Unmodified 2459.3748 0.37477328 617 B4DKY1;P49589 CARS Cysteine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 165.8 165.8 3 2.2529E-07 167965 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.98 71 30107000 0 0 0 0 0 0 0 30107000 0 0 0 0 0 48251 617 45042 434129 554426 554426 1 VPELFANR Unmodified 944.50797 0.50796571 692 C9JRH2;C9J3R0;C9JMJ4;C9JQZ4;C9JW69;P18754 RCC1 Regulator of chromosome condensation yes no 0 0 0 1 1 1 58.82 58.82 2 0.046289 57769 QUIQUE_C1368_190116_001 56.547 12.016 92136000 0 0 32103000 0 0 0 0 0 0 0 0 34228000 25805000 48252 692 45043 434130;434131;434132 554427;554428;554429 554427 3 VPENLLPFAVQCR Unmodified 1541.8024 0.80243317 3044 Q14139 UBE4A Ubiquitin conjugation factor E4 A yes yes 0 0 0 1 1 112.76 112.76 2 0.010425 118535 QUIQUE_C1438_190116_001 63.734 45.901 30898000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30898000 48253 3044 45044 434133;434134 554430;554431 554430 2 VPENPPSMVFK Oxidation (M) 1259.622 0.62200919 2864 Q01995;H0YCU9;E9PJ32 TAGLN Transgelin yes no 0 1 0 1 1 1 46.072 46.072 2 0.0005627 44385 QUIQUE_C1438_190116_001 107.08 77.411 455910000 146930000 0 0 149250000 159730000 0 0 0 0 0 0 0 0 48254 2864 45045 434135;434136;434137 554432;554433;554434;554435 554435 2341 4 VPENPPSMVFK Unmodified 1243.6271 0.62709457 2864 Q01995;H0YCU9;E9PJ32 TAGLN Transgelin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.292 67.292 2 1.553E-12 66769 QUIQUE_C1277_190116_001 163.88 149.34 1963300000 182410000 425270000 164220000 180360000 288560000 167490000 220770000 96774000 0 53756000 102480000 81243000 0 48255 2864 45045 434138;434139;434140;434141;434142;434143;434144;434145;434146;434147;434148 554436;554437;554438;554439;554440;554441;554442;554443;554444;554445;554446;554447;554448;554449;554450;554451;554452;554453;554454;554455;554456;554457;554458;554459 554438 24 VPENTMHAMQQK Unmodified 1412.6541 0.65405438 2047;1242 H9KV75;P12814 ACTN1 Alpha-actinin-1 no no 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transducing adapter molecule 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 138.48 138.48 3 3.6528E-08 143532 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.526 72.258 220440000 0 0 37559000 0 29359000 0 31520000 0 49448000 0 30694000 0 41863000 48295 1664 45080 434434;434435;434436;434437;434438;434439 554827;554828;554829;554830;554831;554832;554833;554834 554830 7 VPHWYHFSCFWK Unmodified 1692.766 0.76598809 1974 P09874;Q5VX84;Q5VX85 PARP1 Poly [ADP-ribose] polymerase 1 yes no 0 0 0 1 1 95.384 95.384 3 0.0025123 98146 QUIQUE_DMIX7_190116_001 62.924 56.447 79621000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29020000 50601000 0 48296 1974 45081 434440;434441 554835;554836;554837 554836 3 VPIHDIAAVSYVR Unmodified 1438.7932 0.79324869 191 C9JUH3;A0A0A0MT72;Q9BSQ5;A0A3B3IRS0;E9PEC4 CCM2 Cerebral cavernous malformations 2 protein yes no 0 0 0 1 1 67.07 67.07 3 0.004472 64078 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.146 20.613 36461000 0 0 0 0 0 21189000 0 0 0 15272000 0 0 0 48297 191 45082 434442;434443 554838;554839 554839 2 VPIIGVGGVSSGQDALEK Unmodified 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beta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 165.55 165.55 2;3 0.00037384 170382 QUIQUE_C1368_190116_001 94.309 83.786 1237500000 102660000 94953000 111120000 82670000 82340000 74618000 110680000 127290000 89638000 20028000 135750000 81048000 124710000 48300 2990;1386 45084 434457;434458;434459;434460;434461;434462;434463;434464;434465;434466;434467;434468;434469;434470;434471 554853;554854;554855;554856;554857;554858;554859;554860;554861;554862;554863;554864;554865;554866;554867 554855 15 VPILVAQEGESSQQLNDSSVIISALK Unmodified 2724.4545 0.45453974 4184 Q9H7Z7;X6RJ95 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 1 141.36 141.36 3 0.0043012 137322 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.771 24.782 22587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 22587000 0 0 0 48301 4184 45085 434472 554868 554868 1 VPIMELPTYTGSIYPTVKPYHYPK Unmodified 2793.4452 0.44516103 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 1 1 1 115.04 115.04 3;4 7.615E-05 119459 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synaptotagmin-2 yes no 0 0 0 1 118.6 118.6 3 0.02407 121918 QUIQUE_C1403_190116_001 43.37 32.582 15842000 0 0 0 15842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48330 69 45113 434707 555151 555151 0 VPLVAEKPLK Unmodified 1092.6907 0.6906811 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 1 1 1 1 31.14 31.14 3 0.052536 25656 QUIQUE_C1277_190116_001 45.307 23.737 117270000 0 33897000 0 0 53760000 0 0 0 0 29612000 0 0 0 48331 2440 45114 434708;434709;434710 555152;555153;555154 555152 3 VPLVAEKPLKEPK Unmodified 1446.881 0.88100107 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 2 1 1 1 27.722 27.722 3 0.031435 21731 QUIQUE_C1438_190116_001 69.716 63.996 348000000 0 0 0 145570000 104370000 0 98059000 0 0 0 0 0 0 48332 2440 45115 434711;434712;434713 555155;555156;555157 555156 0 VPLVAPEDLR Unmodified 1107.6288 0.62880913 1440 O14744;H0YJX6;G3V580;G3V2X6;G3V5L5;C9JSX3 PRMT5 Protein arginine N-methyltransferase 5;Protein arginine N-methyltransferase 5, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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alpha-1(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.624 76.624 2 1.8541E-06 77966 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.01 132.24 3314200000 265900000 188130000 199150000 306710000 474210000 378240000 225950000 210130000 204610000 115470000 262330000 230020000 253320000 48376 96 45155 435255;435256;435257;435258;435259;435260;435261;435262;435263;435264;435265;435266;435267 555935;555936;555937;555938;555939;555940;555941;555942;555943;555944;555945;555946;555947;555948;555949;555950 555947 16 VPTADLEDVLPLAEDITNILSK Unmodified 2365.2628 0.26282279 822 D6RF35;P02774;D6RBJ7 GC Vitamin D-binding protein yes no 0 0 0 2 2 1 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 174.9 174.9 2;3 1.6956E-20 178335 QUIQUE_DMIX7_190116_001 172.82 160.44 1811600000 88393000 139780000 21572000 27995000 423370000 161850000 77473000 60023000 124160000 19516000 224470000 253250000 189700000 48377 822 45156 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Unmodified 1838.9098 0.90975179 3643 Q8NE62 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.91 55.91 3 1.0313E-14 54427 QUIQUE_DMIX5_190116_001 139.58 130.87 1043800000 118520000 95578000 118090000 58569000 72923000 57200000 86178000 49680000 104370000 0 93069000 83758000 105920000 48386 3643 45165 435367;435368;435369;435370;435371;435372;435373;435374;435375;435376;435377;435378 556104;556105;556106;556107;556108;556109;556110;556111;556112;556113;556114;556115;556116 556114 13 VPTTGIIEYPFDLENIIFR Unmodified 2236.178 0.17797095 2294;1758 P29992;K7EL62;A0A087WVZ3;O95837 GNA11;GNA14 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11;Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-14 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 169.92 169.92 2;3 8.6483E-64 175937 QUIQUE_C1438_190116_001 218.5 187.93 4748800000 255500000 306810000 413130000 86962000 334900000 184640000 965140000 168590000 681840000 45870000 521470000 415440000 368510000 48387 2294;1758 45166 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VQAAVGTSAAPVPSDNH Unmodified 1619.7903 0.79034816 1822 P02649 APOE Apolipoprotein E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.048 41.048 2 9.2788E-06 37745 QUIQUE_C1218_190116_001 130.1 108.73 1319700000 126900000 122600000 0 122050000 0 148700000 99858000 102910000 158490000 80389000 200050000 0 157730000 48430 1822 45208 435812;435813;435814;435815;435816;435817;435818;435819;435820;435821;435822 556670;556671;556672;556673;556674;556675;556676;556677;556678;556679;556680;556681;556682 556670 10 VQADEQFGIWLDSSSPEQTVPYLWSEETPATPIGQAIHR Unmodified 4382.1131 0.11314545 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y542 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 162.53 162.53 3;4 1.701E-06 165114 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.148 44.914 82903000 0 0 0 0 0 0 0 16485000 66418000 0 0 0 0 48431 3053 45209 435823;435824 556683;556684;556685 556684 3 VQADVGTIGGTVSHEFQLPVDIGEDR Unmodified 2738.3511 0.3511373 3440 Q7L3T8 PARS2 Probable proline--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 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556695;556696;556697;556698;556699;556700;556701;556702;556703;556704;556705;556706;556707;556708 556701 10 VQAENDFGKGPEPESVIGYSGEDYPR Unmodified 2839.2937 0.293682 1691 O94856;X6RKN2 NFASC Neurofascin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 93.923 93.923 3 1.239E-19 96388 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.397 78.317 292380000 0 31957000 0 30491000 0 0 0 57728000 61063000 0 67279000 0 43863000 48435 1691 45213 435845;435846;435847;435848;435849;435850 556709;556710;556711;556712;556713;556714 556712 6 VQAGDVITIDK Unmodified 1157.6292 0.62920306 4536 Q9Y230;M0R0Y3 RUVBL2 RuvB-like 2 yes no 0 0 0 1 57.602 57.602 2 0.025987 56454 QUIQUE_C1218_190116_001 69.346 23.217 65057000 65057000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48436 4536 45214 435851 556715 556715 0 VQAHAAAALINFTEDCPK Unmodified 1954.9571 0.95709591 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 82.205 82.205 2;3 1.9106E-53 83664 QUIQUE_C1277_190116_001 177.84 145.32 2037700000 149060000 171960000 158820000 205960000 174080000 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2535.2704 0.27042737 455 A0A2R8YD50;P51659;E7EWE5;G5E9S2;E7ET17;A0A2R8Y7L2;E7EPL9 HSD17B4 Peroxisomal multifunctional enzyme type 2;(3R)-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase;Enoyl-CoA hydratase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 2 118.91 118.91 2;3 4.1046E-23 121442 QUIQUE_DMIX1_190116_001 150.45 130.84 261420000 29955000 0 0 0 32499000 0 0 69681000 0 58680000 70606000 0 0 48488 455 45264 436328;436329;436330;436331;436332;436333;436334;436335;436336 557270;557271;557272;557273;557274;557275;557276;557277;557278;557279 557274 9 VQEVAELRR Unmodified 1098.6146 0.61455605 2322 P30622;J3KP58;F5H0N7;F5H6A0 CLIP1 CAP-Gly domain-containing linker protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 20.089 20.089 3 0.00010425 13356 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.98 42.356 137810000 0 0 0 0 0 0 0 0 39987000 0 38356000 27981000 31485000 48489 2322 45265 436337;436338;436339;436340 557280;557281;557282;557283 557280 4 VQEVQVVGVK Unmodified 1083.6288 0.62880913 3819 Q96CM8;E9PF16 ACSF2 Acyl-CoA synthetase family member 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 38.285 38.285 2 0.0020582 34069 QUIQUE_C1563_190116_001 92.051 48.282 63396000 0 0 37540000 0 0 25856000 0 0 0 0 0 0 0 48490 3819 45266 436341;436342;436343;436344;436345 557284;557285;557286;557287;557288;557289 557286 6 VQEYFEWAAQVVK Unmodified 1595.7984 0.79839365 3591 Q8N4P3;H0YKT9 HDDC3 Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.51 129.51 2 0.0018807 133753 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.24 44.826 249930000 22277000 40357000 42733000 0 37689000 0 30256000 24909000 0 0 0 0 51713000 48491 3591 45267 436346;436347;436348;436349;436350;436351;436352;436353;436354;436355 557290;557291;557292;557293;557294;557295;557296;557297;557298;557299 557296 9 VQFELHYQEVK Unmodified 1418.7194 0.71941505 2153 Q5T985;P19823;Q5T987;CON__Q9TRI1 ITIH2 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2 yes no 0 0 0 1 13.917 13.917 3 0.01158 5684 QUIQUE_C1277_190116_001 37.968 4.8799 54656000 0 54656000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48492 2153 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557348 557348 1 VQGSDSDEEVVVATTR Unmodified 1690.801 0.80097243 2254 P26640;A0A140T936 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.935 50.935 2 3.4678E-66 48274 QUIQUE_C1368_190116_001 200.76 152.34 708180000 62443000 59497000 75815000 71887000 51350000 47495000 52645000 40094000 49334000 22535000 55027000 69575000 50478000 48501 2254 45277 436402;436403;436404;436405;436406;436407;436408;436409;436410;436411;436412;436413;436414 557349;557350;557351;557352;557353;557354;557355;557356;557357;557358;557359;557360;557361;557362;557363;557364;557365 557352 17 VQGVCFR Unmodified 864.42761 0.4276069 2078 P14621;U3KPX1;E9PF46;F8WA34 ACYP2 Acylphosphatase-2;Acylphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.166 31.166 2 0.010138 26700 QUIQUE_DMIX1_190116_001 140.01 98.804 4082500000 369960000 0 0 221650000 0 501560000 537850000 476260000 0 252940000 721580000 0 1000700000 48502 2078 45278 436415;436416;436417;436418;436419;436420;436421;436422 557366;557367;557368;557369;557370;557371;557372;557373 557370 7 VQGVFFR Unmodified 851.46537 0.46537261 1919 P07311;G3V2U7;G3V3F8;G3V597 ACYP1 Acylphosphatase-1;Acylphosphatase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.206 57.206 2 0.016314 57359 QUIQUE_C1218_190116_001 133.99 97.401 882370000 69828000 102050000 62141000 26366000 22306000 46339000 76898000 71883000 77898000 0 123560000 99390000 103700000 48503 1919 45279 436423;436424;436425;436426;436427;436428;436429;436430;436431;436432;436433;436434 557374;557375;557376;557377;557378;557379;557380;557381;557382;557383;557384;557385 557374 12 VQGVSLTALR Unmodified 1042.6135 0.61349341 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.637 63.637 2 7.3656E-05 62858 QUIQUE_C1277_190116_001 140.35 76.089 4337300000 269440000 329880000 352020000 399080000 362100000 0 363770000 371100000 480080000 228910000 363140000 397070000 420670000 48504 1688 45280 436435;436436;436437;436438;436439;436440;436441;436442;436443;436444;436445;436446 557386;557387;557388;557389;557390;557391;557392;557393;557394;557395;557396;557397 557387 12 VQHCICSVASDHSVGLLSLR Unmodified 2237.1045 0.10450521 4604 Q9Y4E6 WDR7 WD repeat-containing protein 7 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 76.54 76.54 3;4 1.4969E-06 77152 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.276 52.022 205970000 18346000 37935000 0 0 38284000 0 0 0 0 0 0 63297000 48107000 48505 4604 45281 436447;436448;436449;436450;436451;436452 557398;557399;557400;557401;557402;557403;557404 557402 7 VQHIQLLQK Unmodified 1105.6608 0.66077796 1823 P02671;A0A087WUA0 FGA Fibrinogen alpha chain;Fibrinopeptide A;Fibrinogen alpha chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 2 2 28.607 28.607 2;3 0.00014693 24164 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.635 75.642 5293700000 395600000 658780000 412340000 675540000 672350000 150760000 552000000 257100000 309240000 195970000 209720000 202590000 601700000 48506 1823 45282 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yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 64.791 64.791 2;3 0.00016973 64378 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.71 94.293 1021300000 76240000 88081000 97164000 101960000 89426000 75702000 102220000 41033000 96168000 0 253290000 0 0 48512 1388 45287 436525;436526;436527;436528;436529;436530;436531;436532;436533;436534;436535 557496;557497;557498;557499;557500;557501;557502;557503;557504;557505;557506 557504 9 VQIFDLMDAK Unmodified 1178.6005 0.60054547 3686 Q8TDX7;F8WAG2 NEK7 Serine/threonine-protein kinase Nek7 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 118.75 118.75 2 0.0022628 122673 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.906 53.714 129710000 16598000 18098000 0 0 0 22775000 26618000 0 25354000 0 20272000 0 0 48513 3686 45288 436536;436537;436538;436539;436540;436541;436542;436543;436544;436545;436546 557507;557508;557509;557510;557511;557512;557513;557514;557515;557516;557517 557515 11 VQIFEYNENTR Unmodified 1411.6732 0.67319314 1331 K7ELV2;Q96EE3;K7ENI5 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 70.398 70.398 2 0.00011901 71060 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.75 119.38 198130000 0 48984000 0 0 0 0 0 29961000 46404000 0 72782000 0 0 48514 1331 45289 436547;436548;436549;436550 557518;557519;557520;557521 557521 4 VQIPIMLVGNK Oxidation (M) 1226.7057 0.70567924 3133 Q15382;C9J931;C9J469 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 1 0 1 1 1 1 88.387 88.387 2 0.0033261 90507 QUIQUE_C1277_190116_001 76.064 24.718 197430000 0 36111000 72447000 0 49916000 38955000 0 0 0 0 0 0 0 48515 3133 45290 436551;436552;436553;436554 557522;557523;557524;557525;557526 557522 2593 5 VQIPIMLVGNK Unmodified 1210.7108 0.71076462 3133 Q15382;C9J931;C9J469 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 104.45 104.45 2 0.0029193 107543 QUIQUE_C1277_190116_001 109.21 91.35 356580000 0 103790000 0 97942000 0 0 0 37318000 0 0 0 50585000 66943000 48516 3133 45290 436555;436556;436557;436558;436559 557527;557528;557529;557530;557531;557532;557533;557534 557527 6 VQIPIMLVGNKK Oxidation (M) 1354.8006 0.80064226 3133 Q15382;C9J931;C9J469 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 1 1 1 1 1 62.387 62.387 3 0.008377 62014 QUIQUE_DMIX1_190116_001 51.286 23.003 152100000 0 0 0 0 0 0 0 50691000 53831000 0 0 0 47577000 48517 3133 45291 436560;436561;436562 557535;557536;557537 557535 2593 3 VQIPIMLVGNKK Unmodified 1338.8057 0.80572764 3133 Q15382;C9J931;C9J469 RHEB GTP-binding protein Rheb yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 75.509 75.509 3 0.00020625 76767 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.155 78.355 325460000 0 0 0 0 0 0 0 45456000 62197000 0 89834000 62688000 65288000 48518 3133 45291 436563;436564;436565;436566;436567 557538;557539;557540;557541;557542;557543;557544 557542 7 VQIQESVR Unmodified 957.52434 0.52434406 1565 O60256;E7EPA1;C9JJS3;C9K0K7;C9JDU5;C9JDH0;E7EW35;I3L331;I3L164 PRPSAP2 Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2 yes no 0 0 0 1 1 23.929 23.929 2 0.0065653 17788 QUIQUE_C1277_190116_001 101.28 27.668 2725700000 0 1088700000 0 0 1637000000 0 0 0 0 0 0 0 0 48519 1565 45292 436568;436569 557545;557546 557545 1 VQIQLENLESSVR Unmodified 1513.81 0.81002097 1510 O43157 PLXNB1 Plexin-B1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 96.937 96.937 2 0.0017172 99005 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.813 45.887 381600000 0 29824000 30648000 30260000 32699000 0 0 46705000 0 0 80114000 64351000 66998000 48520 1510 45293 436570;436571;436572;436573;436574;436575;436576;436577 557547;557548;557549;557550;557551;557552;557553;557554;557555 557552 9 VQISAVHSEEDIDR Unmodified 1596.7744 0.77436375 1648 O75600 GCAT 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 41.3 41.3 3 0.0019822 37012 QUIQUE_C1563_190116_001 61.097 49.182 73920000 41645000 0 0 0 0 32275000 0 0 0 0 0 0 0 48521 1648 45294 436578;436579;436580;436581 557556;557557;557558;557559;557560 557559 4 VQISPDSGGLPER Unmodified 1353.6888 0.6888432 3770 Q92945;A0A087WTP3;M0QYH3;M0QXW7 KHSRP Far upstream element-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 54.302 54.302 2 8.6876E-13 52440 QUIQUE_C1277_190116_001 171.85 133.56 3667400000 335460000 382670000 336120000 338420000 366490000 229880000 301800000 267000000 313080000 0 425000000 0 371440000 48522 3770 45295 436582;436583;436584;436585;436586;436587;436588;436589;436590;436591;436592;436593 557561;557562;557563;557564;557565;557566;557567;557568;557569;557570;557571;557572 557562 12 VQITAIGDVLGPSINGLASLIR Unmodified 2206.2685 0.26851729 3420 Q6YHK3 CD109 CD109 antigen yes yes 0 0 0 1 168.92 168.92 3 4.6463E-06 173576 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.106 43.896 16357000 0 0 0 0 0 0 0 0 16357000 0 0 0 0 48523 3420 45296 436594 557573 557573 1 VQIVSIKDYFLEFEGDPHCLR Unmodified 2564.2733 0.27334467 3063 Q14344 GNA13 Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-13 yes yes 0 0 1 1 1 2 2 1 136.2 136.2 3;4 2.2487E-05 139626 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.21 68.557 393660000 0 0 0 0 0 0 0 33955000 65602000 0 135900000 125620000 32589000 48524 3063 45297 436595;436596;436597;436598;436599;436600;436601 557574;557575;557576;557577;557578;557579;557580;557581 557574 8 VQIVYKPVDLSK Unmodified 1387.8075 0.80750177 1247 I3L170 MAPT Microtubule-associated protein yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 2 1 1 1 2 2 2 2 60.475 60.475 2;3 3.5233E-24 59103 QUIQUE_C1368_190116_001 195.51 132.09 12286000000 387500000 1098300000 850970000 1161000000 612620000 852240000 263620000 813500000 450780000 350510000 998610000 2015700000 2430800000 48525 1247 45298 436602;436603;436604;436605;436606;436607;436608;436609;436610;436611;436612;436613;436614;436615;436616;436617;436618;436619;436620;436621;436622 557582;557583;557584;557585;557586;557587;557588;557589;557590;557591;557592;557593;557594;557595;557596;557597;557598;557599;557600;557601;557602;557603;557604 557586 17 VQIYHNPTANSFR Unmodified 1545.7688 0.76882486 2568 P50552;K7ENR7;K7ENL7 VASP Vasodilator-stimulated phosphoprotein yes no 0 0 0 1 1 1 1 43.747 43.747 3 0.014815 40274 QUIQUE_C1403_190116_001 41.825 33.979 233370000 0 0 0 76903000 63586000 0 0 45602000 47280000 0 0 0 0 48526 2568 45299 436623;436624;436625;436626 557605;557606;557607;557608 557605 3 VQLAEDLKK Unmodified 1042.6023 0.60226003 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;H7C141;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.837 22.837 2 0.012617 15751 QUIQUE_DMIX8_190116_001 78.516 27.17 515150000 0 94555000 82985000 85974000 0 0 93817000 0 0 41264000 0 0 116550000 48527 831;1569 45300 436627;436628;436629;436630;436631;436632 557609;557610;557611;557612;557613;557614 557614 6 VQLATSIGNPPVSLLQQCTNILSQGSK Unmodified 2852.5066 0.50659209 1591 O60763 USO1 General vesicular transport factor p115 yes yes 0 0 0 1 142.3 142.3 3 0.041355 146151 QUIQUE_C1403_190116_001 21.453 12.279 65572000 0 0 0 65572000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48528 1591 45301 436633 557615 557615 1 VQLDLAETDLSQGVAR Unmodified 1713.8897 0.88972785 4014 Q9BSJ8 ESYT1 Extended synaptotagmin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 101.94 101.94 2 0.00091508 104900 QUIQUE_DMIX8_190116_001 91.62 62.662 306640000 0 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1 VRPAELEQFESTIGFK Unmodified 1849.9574 0.95741349 933;1529 E9PHY5;E9PK52;E9PII3;A0A2R8Y5B3;O43491 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 2 112.83 112.83 2;3 8.3545E-19 115116 QUIQUE_C1563_190116_001 141 134.59 6194200000 312340000 420710000 502040000 611390000 506330000 335210000 348770000 457300000 655810000 306360000 425710000 619290000 692890000 48620 933;1529 45392 437245;437246;437247;437248;437249;437250;437251;437252;437253;437254;437255;437256;437257;437258;437259;437260;437261;437262;437263;437264;437265;437266;437267;437268 558349;558350;558351;558352;558353;558354;558355;558356;558357;558358;558359;558360;558361;558362;558363;558364;558365;558366;558367;558368;558369;558370;558371;558372;558373;558374;558375;558376;558377;558378;558379;558380;558381;558382;558383 558362 33 VRPASTGGLSLLPPPPGGK Unmodified 1800.0258 0.025767826 4311 Q9NVZ3;D6RB24 NECAP2 Adaptin ear-binding coat-associated protein 2 yes no 0 0 1 1 71.047 71.047 3 0.016354 70939 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Unmodified 2959.6026 0.60255816 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 1 1 2 1 141.99 141.99 3;4 1.8371E-25 148964 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.615 88.983 220530000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 91220000 92959000 36350000 48625 2524 45397 437296;437297;437298;437299 558418;558419;558420;558421;558422 558418 4 VRPGFCFHLCSR Unmodified 1534.7286 0.72855672 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 50.259 50.259 3;4 0.0018804 48348 QUIQUE_C1576_190116_001 59.116 45.21 304360000 0 40542000 0 25982000 42460000 0 38776000 99777000 0 0 39813000 0 17013000 48626 2916 45398 437300;437301;437302;437303;437304;437305;437306;437307 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Oxidation (M) 2431.1036 0.10356173 2767;2769;602 P62873;P62879;E7EP32;B3KVK2 GNB1;GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 no no 0 1 0 3 2 4 2 2 4 2 1 2 2 3 3 3 141.45 141.45 2;3 2.4634E-100 145470 QUIQUE_C1277_190116_001 191.96 174.22 2914200000 276470000 292860000 371840000 231740000 255930000 330620000 191790000 83948000 122330000 168230000 187040000 180780000 220600000 48656 2767;2769;602 45428 437517;437518;437519;437520;437521;437522;437523;437524;437525;437526;437527;437528;437529;437530;437531;437532;437533;437534;437535;437536;437537;437538;437539;437540;437541;437542;437543;437544;437545;437546;437547;437548;437549 558661;558662;558663;558664;558665;558666;558667;558668;558669;558670;558671;558672;558673;558674;558675;558676;558677;558678;558679;558680;558681;558682;558683;558684;558685;558686;558687;558688;558689;558690;558691;558692;558693;558694;558695;558696;558697;558698;558699;558700;558701;558702;558703;558704;558705;558706;558707;558708;558709;558710;558711;558712;558713;558714 558668 394 54 VSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLK Unmodified 2415.1086 0.10864711 2767;2769;602 P62873;P62879;E7EP32;B3KVK2 GNB1;GNB2 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1;Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-2 no no 0 0 0 5 5 11 4 6 3 11 6 6 3 14 8 5 157.47 157.47 2;3 4.9754E-248 158797 QUIQUE_DMIX3_190116_001 266.45 247.86 18376000000 1528500000 2058400000 1890200000 1147100000 1296900000 1264400000 1909600000 1521300000 1133100000 266430000 1423000000 1506800000 1430300000 48657 2767;2769;602 45428 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coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 2 yes no 0 0 1 1 15.145 15.145 2 0.012056 7428 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.029 56.469 21438000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 21438000 0 0 48685 108 45455 438073 559405 559405 1 VSEEWYNR Unmodified 1081.4829 0.48287317 2897 Q05707;J3QT83 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 43.412 43.412 2 0.029396 40871 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.903 56.534 64918000 0 0 0 0 32313000 0 0 0 0 0 32605000 0 0 48686 2897 45456 438074;438075;438076;438077 559406;559407;559408;559409 559409 4 VSEFYEETK Unmodified 1130.5132 0.51317025 1741 O95671 ASMTL N-acetylserotonin O-methyltransferase-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.576 36.576 2 0.0018811 32425 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.136 73.399 849670000 0 98404000 134220000 70983000 54715000 67143000 60462000 0 118980000 66455000 0 100790000 77523000 48687 1741 45457 438078;438079;438080;438081;438082;438083;438084;438085;438086;438087 559410;559411;559412;559413;559414;559415;559416;559417;559418;559419;559420;559421;559422;559423 559417 11 VSEGGPAEIAGLQIGDK Unmodified 1639.8417 0.84171503 1454 O14907 TAX1BP3 Tax1-binding protein 3 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 90.54 90.54 2 4.8415E-06 92364 QUIQUE_C1277_190116_001 115.8 94.971 1419400000 120790000 147580000 139040000 0 0 190540000 72948000 120270000 166920000 58846000 158250000 133760000 110410000 48688 1454 45458 438088;438089;438090;438091;438092;438093;438094;438095;438096;438097;438098;438099;438100;438101 559424;559425;559426;559427;559428;559429;559430;559431;559432;559433;559434;559435;559436;559437;559438;559439;559440 559425 15 VSEIHSLVHR Unmodified 1175.6411 0.64110515 466 A0A2R8YGB3;Q9UNA1;H0Y835;H0Y4P9;H7BZZ0 ARHGAP26 Rho GTPase-activating protein 26 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.506 19.506 3 0.014108 12678 QUIQUE_DMIX1_190116_001 39.785 28.572 531940000 58120000 71237000 0 0 0 65078000 63921000 50869000 35690000 28596000 90182000 68249000 0 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11.335 11.335 3 0.012552 3747 QUIQUE_DMIX4_190116_001 45.368 27.309 1920500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1920500 0 0 0 48691 4069 45461 438128 559472 559472 1 VSELKEELK Unmodified 1073.5968 0.5968403 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 1 2 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 20.805 20.805 2;3 0.0026629 13793 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.28 89.389 3922000000 501220000 347070000 390890000 349170000 289620000 288760000 0 254290000 248770000 72876000 454000000 424680000 300650000 48692 2849 45462 438129;438130;438131;438132;438133;438134;438135;438136;438137;438138;438139;438140;438141;438142;438143;438144 559473;559474;559475;559476;559477;559478;559479;559480;559481;559482;559483;559484;559485;559486;559487;559488 559486 14 VSELKEELKK Unmodified 1201.6918 0.69180331 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 2 1 1 1 2 1 1 1 14.418 14.418 2;3 0.0089236 6032 QUIQUE_C1277_190116_001 132.39 78.635 1223100000 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cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 0 3 2 1 2 2 1 1 2 1 2 2 1 2 102.74 102.74 1;2 0.00030378 106598 QUIQUE_C1218_190116_001 160.56 87.237 67478000000 7046800000 6723900000 5513600000 5126100000 5513600000 5095200000 5406800000 4015300000 5305300000 2557700000 5648700000 4361200000 5163400000 48706 2772 45475 438226;438227;438228;438229;438230;438231;438232;438233;438234;438235;438236;438237;438238;438239;438240;438241;438242;438243;438244;438245;438246;438247 559575;559576;559577;559578;559579;559580;559581;559582;559583;559584;559585;559586;559587;559588;559589;559590;559591;559592;559593;559594;559595;559596;559597;559598;559599;559600;559601;559602;559603;559604;559605;559606;559607;559608;559609;559610;559611;559612;559613;559614;559615;559616;559617;559618;559619;559620;559621;559622;559623;559624;559625;559626;559627;559628;559629;559630;559631;559632;559633;559634;559635;559636;559637;559638;559639;559640;559641;559642 559578 64 VSFELFADKVPK Unmodified 1378.7497 0.74965254 2772 P62937;F8WE65;C9J5S7 PPIA Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, N-terminally processed;Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase yes no 0 0 1 2 2 3 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 95.432 95.432 2;3 4.9507E-09 97794 QUIQUE_DMIX1_190116_001 155.53 136.43 26445000000 250300000 419840000 165390000 128350000 747860000 78608000 314790000 5221100000 3563400000 20355000 7108800000 4740900000 3685100000 48707 2772 45476 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VSFYQLSHFLQCK Unmodified 1655.813 0.81299786 2112 P16615;H7C5W9 ATP2A2 Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 119.15 119.15 3 0.00036632 122917 QUIQUE_C1403_190116_001 65.043 53.938 417300000 0 0 97565000 45121000 0 0 66740000 38633000 0 15242000 88001000 0 65995000 48716 2112 45484 438331;438332;438333;438334;438335;438336;438337 559747;559748;559749;559750;559751;559752;559753;559754 559749 8 VSGAQEMVSSAK Unmodified 1192.5758 0.57578728 1586 O60664;K7ERZ3;K7EL96;K7ER39 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.516 26.516 2 0.00037478 20080 QUIQUE_DMIX8_190116_001 113.69 48.462 1395600000 76963000 96499000 0 165040000 87176000 118390000 83958000 196850000 147500000 52674000 149200000 116400000 104920000 48717 1586 45485 438338;438339;438340;438341;438342;438343;438344;438345;438346;438347;438348;438349 559755;559756;559757;559758;559759;559760;559761;559762;559763;559764;559765;559766;559767;559768 559768 14 VSGAQEMVSSAK Oxidation (M) 1208.5707 0.5707019 1586 O60664;K7ERZ3;K7EL96;K7ER39 PLIN3 Perilipin-3 yes no 0 1 0 1 13.36 13.36 2 0.00020395 5413 QUIQUE_DMIX4_190116_001 119.34 59.986 4244900 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4244900 0 0 0 48718 1586 45485 438350 559769 559769 863 1 VSGELFAQAPVEQYPGIAVETVTDSSR Unmodified 2849.4083 0.40831783 387 F5GYH1;A0A1W2PRM0;A0A1W2PRL5;A0A1W2PR09;Q8NC96;A0A1W2PR27;A0A1W2PPF5;A0A1W2PRQ7 NECAP1 Adaptin ear-binding coat-associated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 1 1 1 1 1 142.89 142.89 2;3 9.9169E-66 148444 QUIQUE_C1218_190116_001 116.24 109.28 838810000 125430000 22741000 109960000 99237000 107630000 94631000 114240000 0 0 84062000 0 0 80880000 48719 387 45486 438351;438352;438353;438354;438355;438356;438357;438358;438359;438360;438361 559770;559771;559772;559773;559774;559775;559776;559777;559778;559779;559780;559781;559782;559783;559784;559785;559786;559787 559770 18 VSGFSDLIEDVK Unmodified 1307.6609 0.66089712 2095 P15882 CHN1 N-chimaerin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.67 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560083;560084;560085;560086;560087;560088;560089;560090;560091;560092;560093;560094;560095;560096;560097;560098;560099;560100;560101;560102;560103;560104;560105;560106;560107;560108;560109;560110;560111;560112;560113;560114;560115;560116;560117;560118;560119;560120;560121;560122;560123;560124;560125;560126;560127;560128;560129;560130;560131;560132;560133;560134;560135;560136;560137;560138;560139;560140;560141;560142;560143;560144;560145;560146;560147;560148;560149;560150;560151;560152;560153;560154;560155;560156;560157;560158;560159;560160;560161;560162;560163;560164;560165;560166;560167;560168;560169;560170;560171;560172;560173;560174;560175;560176;560177;560178;560179;560180;560181;560182;560183;560184;560185;560186;560187;560188;560189;560190;560191;560192;560193;560194;560195;560196;560197;560198;560199;560200;560201;560202;560203;560204;560205;560206;560207;560208;560209;560210;560211;560212;560213 560084 129 VSHYIINSLPNR Unmodified 1411.7572 0.75719754 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 50.258 50.258 2;3 0.00045051 47603 QUIQUE_C1403_190116_001 65.179 49.042 969470000 155740000 0 0 110060000 97100000 113670000 97870000 49509000 121440000 46188000 63133000 51714000 63061000 48757 2480 45523 438683;438684;438685;438686;438687;438688;438689;438690;438691;438692;438693;438694;438695;438696 560214;560215;560216;560217;560218;560219;560220;560221;560222;560223;560224;560225;560226;560227;560228;560229;560230 560217 15 VSHYIINSLPNRR Unmodified 1567.8583 0.85830857 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 1 1 1 35.184 35.184 3;4 0.04311 31560 QUIQUE_DMIX1_190116_001 27.649 14.512 106890000 0 0 0 0 0 0 0 60067000 0 0 0 0 46818000 48758 2480 45524 438697;438698 560231;560232 560231 2 VSHYIINSSGPRPPVPPSPAQPPPGVSPSR Unmodified 3073.6098 0.60975203 2479 P46108;I3L297 CRK Adapter molecule crk yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 72.582 72.582 4 2.5682E-13 72814 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.647 67.838 751310000 0 60677000 0 86673000 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kinase kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 51.404 51.404 2 0.0024527 49626 QUIQUE_DMIX3_190116_001 164.78 63.447 1595400000 143460000 123170000 138940000 119390000 144810000 116750000 132330000 111400000 121510000 0 168480000 123340000 151850000 48762 2395 45528 438714;438715;438716;438717;438718;438719;438720;438721;438722;438723;438724;438725 560251;560252;560253;560254;560255;560256;560257;560258;560259;560260;560261;560262;560263;560264;560265;560266;560267;560268 560263 18 VSIDGVEWSDIK Unmodified 1346.6718 0.67179615 3415 Q6VY07;B4DF77;E9PSG7;H0YCU5;E9PSE1 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.54 109.54 2 0.00033361 113278 QUIQUE_C1368_190116_001 114.83 96.522 451620000 50475000 0 32471000 0 54711000 38141000 36012000 42235000 47790000 0 62684000 52986000 34113000 48763 3415 45529 438726;438727;438728;438729;438730;438731;438732;438733;438734;438735 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560307;560308;560309;560310;560311;560312;560313;560314;560315;560316;560317;560318;560319;560320;560321;560322;560323;560324 560308 18 VSILESLDKWER Unmodified 1473.7827 0.78274359 2002 P10644;K7EPB2;K7EM13 PRKAR1A cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit;cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, N-terminally processed yes no 0 0 1 2 3 2 2 1 2 2 1 2 3 2 112.96 112.96 2;3 0.0001668 116396 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.72 78.712 2799700000 0 274560000 334650000 252610000 233740000 0 228070000 250760000 300880000 77440000 249540000 219460000 377970000 48768 2002 45533 438767;438768;438769;438770;438771;438772;438773;438774;438775;438776;438777;438778;438779;438780;438781;438782;438783;438784;438785;438786;438787;438788 560325;560326;560327;560328;560329;560330;560331;560332;560333;560334;560335;560336;560337;560338;560339;560340;560341;560342;560343;560344;560345;560346;560347;560348;560349;560350;560351;560352;560353;560354;560355;560356;560357;560358;560359;560360;560361;560362 560347 36 VSILESLEK Unmodified 1016.5754 0.57537657 2330 P31321;H7BYW5;C9JSK5 PRKAR1B cAMP-dependent protein kinase type I-beta regulatory subunit yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 87.799 87.799 2 0.0054484 90740 QUIQUE_C1218_190116_001 86.67 57.752 208180000 39683000 0 31635000 0 36358000 34110000 48147000 0 0 18248000 0 0 0 48769 2330 45534 438789;438790;438791;438792;438793;438794;438795 560363;560364;560365;560366;560367;560368;560369 560363 6 VSILFGHENR Unmodified 1170.6146 0.61455605 1444 O14775 GNB5 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-5 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 42.07 42.07 2;3 0.0043648 37654 QUIQUE_C1368_190116_001 81.163 59.077 990140000 83164000 0 165000000 41317000 61882000 91298000 105170000 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Unmodified 860.49673 0.49673232 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 1 1 29.767 29.767 2 0.01606 24017 QUIQUE_C1563_190116_001 83.753 42.525 252840000 0 138470000 0 0 0 114370000 0 0 0 0 0 0 0 48773 3455 45538 438815;438816 560390;560391;560392 560392 3 VSITEAMHR Oxidation (M) 1058.5179 0.51787847 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 1 15.898 15.898 3 0.0021836 8065 QUIQUE_DMIX3_190116_001 80.165 58.079 658220000 0 166440000 0 49639000 0 0 44016000 157290000 240840000 0 0 0 0 48774 3117 45539 438817;438818;438819;438820;438821;438822;438823 560393;560394;560395;560396;560397;560398;560399 560399 2578 5 VSITEAMHR Unmodified 1042.523 0.52296385 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 31.879 31.879 2 0.0068239 26270 QUIQUE_C1368_190116_001 83.313 57.419 1556500000 368630000 0 345180000 0 205340000 114140000 278120000 245140000 0 0 0 0 0 48775 3117 45539 438824;438825;438826;438827;438828;438829 560400;560401;560402;560403;560404;560405 560401 4 VSIVNHLEFLR Unmodified 1325.7456 0.74557022 3471 Q7Z6Z7 HUWE1 E3 ubiquitin-protein ligase HUWE1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 89.109 89.109 3 0.00032196 90692 QUIQUE_C1368_190116_001 77.593 52.74 56471000 0 18543000 15089000 0 0 11844000 0 0 0 10995000 0 0 0 48776 3471 45540 438830;438831;438832;438833;438834;438835;438836 560406;560407;560408;560409;560410;560411;560412;560413 560409 8 VSIVTPEDILR Unmodified 1240.7027 0.70270235 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 110.93 110.93 2 0.00041714 108477 QUIQUE_DMIX4_190116_001 115.82 72.017 166070000 0 0 0 57774000 66001000 0 0 0 0 42296000 0 0 0 48777 2642 45541 438837;438838;438839 560414;560415;560416 560416 3 VSIYEAMR Oxidation (M) 983.47462 0.47461667 3117 Q15149;H0YDN1 PLEC Plectin yes no 0 1 0 1 32.68 32.68 2 0.04193 27612 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.48 43.843 168140000 0 0 0 0 0 0 0 168140000 0 0 0 0 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1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 1 11.314 11.314 2;3 7.3262E-09 3397 QUIQUE_C1368_190116_001 126.32 115.06 254080000 6186600 0 19766000 19475000 27801000 0 31895000 0 44101000 0 46859000 20347000 37647000 48830 4395 45588 439288;439289;439290;439291;439292;439293;439294;439295;439296;439297;439298;439299 560916;560917;560918;560919;560920;560921;560922;560923;560924;560925;560926;560927;560928;560929;560930;560931 560917 15 VSQMAQYFEPLTLAAVGAASK Unmodified 2181.114 0.11399049 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 150.78 150.78 2 8.9113E-19 157979 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.91 137.81 651170000 0 53267000 120600000 103030000 73600000 48033000 72969000 84043000 0 0 95618000 0 0 48831 4600 45589 439300;439301;439302;439303;439304;439305;439306;439307 560932;560933;560934;560935;560936;560937;560938;560939;560940;560941 560941 10 VSQPIEGHAASFAQFK Unmodified 1715.8631 0.86311917 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 61.939 61.939 2;3 1.2382E-29 59243 QUIQUE_DMIX4_190116_001 164.56 144.35 12210000000 479920000 2109700000 379790000 472860000 0 298330000 500370000 1535900000 1343700000 832360000 1451600000 1410200000 1394900000 48832 50 45590 439308;439309;439310;439311;439312;439313;439314;439315;439316;439317;439318;439319;439320;439321;439322;439323;439324;439325;439326 560942;560943;560944;560945;560946;560947;560948;560949;560950;560951;560952;560953;560954;560955;560956;560957;560958;560959;560960;560961;560962 560955 18 VSQSEALQILTAASILQIK Unmodified 2012.1518 0.1517562 4221 Q9HC78 ZBTB20 Zinc finger and BTB domain-containing protein 20 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 2 1 1 159.65 159.65 2;3 0.0013196 164529 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.866 42.005 226080000 9049200 12859000 22280000 0 63014000 31631000 0 10658000 42751000 0 16412000 17429000 0 48833 4221 45591 439327;439328;439329;439330;439331;439332;439333;439334;439335;439336;439337;439338 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561014;561015;561016;561017;561018;561019;561020;561021;561022;561023;561024;561025;561026;561027;561028;561029;561030;561031;561032;561033;561034;561035;561036;561037;561038;561039;561040;561041;561042;561043;561044;561045;561046 561022 33 VSSLQAEPLPR Unmodified 1195.6561 0.65608651 4148 Q9H2M9 RAB3GAP2 Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.756 47.756 2 0.00023658 45461 QUIQUE_C1218_190116_001 121.5 63.077 908610000 60882000 71043000 55656000 72952000 98488000 63849000 83269000 45178000 53658000 18909000 105680000 79851000 99193000 48841 4148 45599 439389;439390;439391;439392;439393;439394;439395;439396;439397;439398;439399;439400;439401 561047;561048;561049;561050;561051;561052;561053;561054;561055;561056;561057;561058;561059 561047 12 VSSLTLK Unmodified 746.4538 0.45380487 2057;28;1218 H7BYX6;A0A087WTE4;A0A087WVD0;A0A087WTF6;A0A087WV75;P13591;A0A087WX77;A0A087WWD4 NCAM1 Neural cell adhesion molecule 1 no no 0 0 0 1 1 24.836 24.836 2 0.055034 18242 QUIQUE_C1277_190116_001 72.138 7.3351 527040000 0 182480000 0 0 0 0 0 0 0 344560000 0 0 0 48842 1218;28;2057 45600 439402;439403 561060;561061 561060 2 VSSPDYPER Unmodified 1048.4825 0.48253882 1594 O60825 PFKFB2 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2;6-phosphofructo-2-kinase;Fructose-2,6-bisphosphatase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.979 22.979 2 0.0016325 16480 QUIQUE_C1218_190116_001 101.72 57 1056500000 122350000 0 0 145390000 0 0 143460000 0 162880000 0 174870000 115170000 192390000 48843 1594 45601 439404;439405;439406;439407;439408;439409;439410 561062;561063;561064;561065;561066;561067;561068 561062 7 VSSPVASGMSSPSGGSTVSFSHTLPDFSK Unmodified 2839.3334 0.33343833 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;A0A087WWW7;H0Y4U1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 1 104.59 104.59 3 0.00035676 109095 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.678 30.402 77946000 0 0 0 0 0 0 0 36470000 0 0 41476000 0 0 48844 422 45602 439411;439412 561069;561070 561070 2 VSSSGLDSLGR Unmodified 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Abro1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 23.869 23.869 2 7.1708E-06 18005 QUIQUE_C1218_190116_001 124.1 86.912 181750000 59200000 0 46063000 0 0 0 0 0 0 0 0 76488000 0 48850 3096 45608 439447;439448;439449;439450;439451 561108;561109;561110;561111;561112 561108 5 VSTALSCLLGLPLR Unmodified 1498.8541 0.85413439 1405 O00442;A6NIC1 RTCA RNA 3'-terminal phosphate cyclase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.51 145.51 2 0.00036198 141803 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.86 89.61 973030000 64736000 77534000 73712000 93673000 70728000 86736000 76130000 76765000 74971000 22632000 59601000 68098000 127710000 48851 1405 45609 439452;439453;439454;439455;439456;439457;439458;439459;439460;439461;439462;439463;439464 561113;561114;561115;561116;561117;561118;561119;561120;561121;561122;561123;561124;561125;561126 561123 14 VSTIDGTVITTATYWANLWK Unmodified 2239.1525 0.15248448 2809 P78369 CLDN10 Claudin-10 yes yes 0 0 0 1 1 1 170 170 3 0.0066032 173979 QUIQUE_DMIX7_190116_001 37.969 29.782 67808000 0 0 0 0 0 0 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561203;561204;561205;561206;561207;561208;561209;561210;561211;561212;561213;561214;561215;561216;561217;561218;561219;561220;561221;561222;561223 561208 19 VSVINTVDTSHEDMIHDAQMDYYGTR Acetyl (Protein N-term) 3038.3386 0.33860006 2669 P55735 SEC13 Protein SEC13 homolog yes yes 1 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.69 134.69 3 3.1708E-57 140210 QUIQUE_C1218_190116_001 150.59 145.76 1670500000 135280000 138050000 176010000 106620000 120650000 123900000 123040000 129010000 126440000 37441000 208360000 104330000 141330000 48864 2669 45622 439545;439546;439547;439548;439549;439550;439551;439552;439553;439554;439555;439556;439557 561224;561225;561226;561227;561228;561229;561230;561231;561232;561233;561234;561235;561236;561237;561238;561239 561224 15 VSVIQFLEAPIGDEDAEEAAAEKR Unmodified 2586.2813 0.2813264 289 A0A0G2JNZ2;A0A0G2JPP5;Q14160;A0A0G2JMS7 SCRIB Protein scribble homolog yes no 0 0 1 1 1 1 1 138.58 138.58 3 1.6076E-11 141903 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.211 79.1 187450000 0 0 0 0 39795000 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561456;561457;561458;561459;561460;561461;561462;561463;561464;561465;561466;561467;561468;561469;561470 561465 15 VSWAPALGSAAALGYHVQFGPLR Unmodified 2367.2488 0.2487849 3388 Q6PCB0 VWA1 von Willebrand factor A domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 141.18 141.18 3 8.6619E-06 144166 QUIQUE_DMIX1_190116_001 74.698 66.801 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48880 3388 45637 439729 561471 561471 1 VSWDPSPSPVLGYK Unmodified 1530.7718 0.77184455 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 99.364 99.364 2 0.046571 102698 QUIQUE_DMIX8_190116_001 42.788 31.195 63513000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63513000 48881 90 45638 439730 561472 561472 1 VSWQDLK Unmodified 874.45487 0.45486751 2981 Q13243 SRSF5 Serine/arginine-rich splicing factor 5 yes yes 0 0 0 1 1 61.832 61.832 2 0.033929 61228 QUIQUE_DMIX8_190116_001 88.029 40.984 92744000 0 0 0 0 0 0 0 0 47673000 0 0 0 45071000 48882 2981 45639 439731;439732 561473;561474;561475 561475 3 VSWQDLKDFMR Unmodified 1423.6918 0.69182009 2981 Q13243 SRSF5 Serine/arginine-rich splicing factor 5 yes yes 0 0 1 1 122.89 122.89 3 0.0074909 125486 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.49 46.46 20843000 0 0 0 0 0 0 0 20843000 0 0 0 0 0 48883 2981 45640 439733 561476 561476 1 VSWSPAEDHNAPIEK Unmodified 1678.7951 0.79509919 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 47.117 47.117 2;3 3.9819E-44 44642 QUIQUE_C1277_190116_001 184.1 125.4 1194700000 320420000 67026000 273900000 0 276220000 41750000 68230000 0 0 0 62590000 27443000 57101000 48884 2345 45641 439734;439735;439736;439737;439738;439739;439740;439741;439742;439743;439744;439745 561477;561478;561479;561480;561481;561482;561483;561484;561485;561486;561487;561488 561478 12 VSYALLFGDYLPQNIQAAR Unmodified 2138.116 0.1160394 4409 Q9UBV2 SEL1L Protein sel-1 homolog 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 152.24 152.24 2 0.00014788 159257 QUIQUE_C1438_190116_001 80.469 58.237 185720000 0 24725000 0 0 34001000 0 0 0 37020000 0 53554000 36424000 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115830000 0 0 0 0 0 0 0 57106000 58728000 0 0 0 0 48888 1628 45645 439756;439757 561499;561500 561500 2 VSYGIGDEEHDQEGR Unmodified 1689.7231 0.72305646 2266 P27695;G3V3M6;G3V3C7;G3V5M0;G3V359 APEX1 DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase;DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 33.575 33.575 2;3 9.9372E-44 29625 QUIQUE_C1218_190116_001 180.2 165.52 1659400000 170570000 300040000 109370000 129700000 90521000 0 133620000 0 250440000 0 182000000 154320000 138840000 48889 2266 45646 439758;439759;439760;439761;439762;439763;439764;439765;439766;439767;439768;439769;439770;439771;439772;439773;439774;439775;439776 561501;561502;561503;561504;561505;561506;561507;561508;561509;561510;561511;561512;561513;561514;561515;561516;561517;561518;561519;561520;561521;561522;561523;561524;561525;561526;561527 561506 26 VSYIGVCQSK Unmodified 1139.5645 0.56449431 3262 Q56VL3 OCIAD2 OCIA domain-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 36.236 36.236 2 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Autophagy protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 90.274 90.274 2 0.008683 93630 QUIQUE_C1438_190116_001 71.349 47.146 109380000 29525000 0 25844000 29989000 24019000 0 0 0 0 0 0 0 0 48893 4136 45650 439789;439790;439791;439792 561540;561541;561542;561543 561543 4 VSYLVFDEADR Unmodified 1312.6299 0.62993134 175 A0A0A0MSJ0;Q86XP3 DDX42 ATP-dependent RNA helicase DDX42 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 97.372 97.372 2 0.0058653 98966 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.379 61.717 23857000 13830000 0 0 0 0 0 0 0 0 10027000 0 0 0 48894 175 45651 439793;439794;439795;439796;439797 561544;561545;561546;561547;561548 561546 5 VSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSK Unmodified 3110.4374 0.43739159 2703;1562 P60983;G3V4P8;O60234;M0R0C1;M0QYJ8;M0QYG8;M0R1D2 GMFB;GMFG Glia maturation factor beta;Glia maturation factor gamma no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.46 142.46 3 2.9068E-15 145919 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.088 72.184 705920000 0 48106000 0 0 39279000 0 54290000 95336000 99415000 0 129380000 102700000 137410000 48895 2703;1562 45652 439798;439799;439800;439801;439802;439803;439804;439805 561549;561550;561551;561552;561553;561554;561555;561556;561557;561558;561559;561560;561561 561557 13 VSYPLCFIFSSPVGCKPEQQMMYAGSK Oxidation (M) 3126.4323 0.43230621 2703;1562 P60983;G3V4P8;O60234;M0R0C1;M0QYJ8;M0QYG8;M0R1D2 GMFB;GMFG Glia maturation factor beta;Glia maturation factor gamma no no 0 1 1 1 1 134.72 134.72 3 0.00046344 139888 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.269 39.303 123920000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 63414000 0 60503000 48896 2703;1562 45652 439806;439807 561562;561563 561563 855;856 2 VSYPLLIR Unmodified 959.5804 0.58040237 2807 P78357;K7EMM9 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 83.539 83.539 2 0.00068617 86434 QUIQUE_C1218_190116_001 151.17 121.83 754990000 65128000 69409000 67131000 62017000 56523000 39698000 68318000 46030000 50454000 19701000 89820000 50764000 69996000 48897 2807 45653 439808;439809;439810;439811;439812;439813;439814;439815;439816;439817;439818;439819;439820 561564;561565;561566;561567;561568;561569;561570;561571;561572;561573;561574;561575;561576;561577;561578;561579 561564 16 VSYQDYEIEISDASEVEK Unmodified 2102.9532 0.95317555 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 116.54 116.54 2 8.776E-06 120773 QUIQUE_C1368_190116_001 131.06 122.76 402200000 0 0 67448000 0 0 0 0 0 0 0 334750000 0 0 48898 2168 45654 439821;439822;439823 561580;561581;561582;561583 561581 4 VSYQDYEIEISDASEVEKEINK Unmodified 2587.2177 0.21772309 2168 P20591;F8W8T1;H9KVC7;H9KVC9 MX1 Interferon-induced GTP-binding protein Mx1;Interferon-induced GTP-binding protein Mx1, N-terminally processed yes no 0 0 1 1 1 129.07 129.07 3 1.5382E-05 132091 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.877 65.404 376870000 0 0 0 0 0 0 0 81041000 0 0 295830000 0 0 48899 2168 45655 439824;439825 561584;561585;561586 561584 3 VSYRPTQVGR Unmodified 1161.6255 0.62545508 3753 Q92752 TNR Tenascin-R yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 18.851 18.851 2;3 0.0005348 11617 QUIQUE_DMIX3_190116_001 105.98 76.232 11205000000 714640000 1071100000 996980000 0 922040000 194680000 0 1346300000 1408300000 511880000 1357600000 1676000000 1005200000 48900 3753 45656 439826;439827;439828;439829;439830;439831;439832;439833;439834;439835;439836 561587;561588;561589;561590;561591;561592;561593;561594;561595;561596;561597 561593 6 VTAADAFLDLIR Unmodified 1303.7136 0.71360139 2457 P43003;A0A087X0U3;A0A087WT87 SLC1A3 Excitatory amino acid transporter 1;Amino acid transporter yes no 0 0 0 2 3 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 151.81 151.81 2;3 6.2627E-05 157479 QUIQUE_C1368_190116_001 146.11 111.54 16450000000 1483700000 996140000 1675400000 1891100000 852770000 1108900000 973270000 1773200000 1664900000 452290000 1507300000 901800000 1168900000 48901 2457 45657 439837;439838;439839;439840;439841;439842;439843;439844;439845;439846;439847;439848;439849;439850;439851;439852;439853;439854;439855;439856;439857;439858;439859;439860;439861 561598;561599;561600;561601;561602;561603;561604;561605;561606;561607;561608;561609;561610;561611;561612;561613;561614;561615;561616;561617;561618;561619;561620;561621;561622;561623;561624;561625;561626;561627;561628 561604 31 VTAAPQSVCALR Unmodified 1271.6656 0.66560534 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.636 43.636 2 0.00031591 40210 QUIQUE_C1277_190116_001 128.27 97.583 1754700000 123380000 169690000 172830000 138380000 351390000 79696000 142570000 30379000 95229000 56882000 275470000 118770000 0 48902 1802 45658 439862;439863;439864;439865;439866;439867;439868;439869;439870;439871;439872;439873 561629;561630;561631;561632;561633;561634;561635;561636;561637;561638;561639;561640 561630 8 VTADGEQTGQDAER Unmodified 1475.6488 0.64882888 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 16.168 16.168 2 5.5773E-07 8364 QUIQUE_C1218_190116_001 151.98 133.23 30139000 30139000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48903 2225 45659 439874 561641 561641 1 VTADVINAAEK Unmodified 1129.5979 0.59790293 404 A0A286YF22;O43175;A0A2C9F2M7;A0A286YFA2;A0A286YFL2;A0A286YFM8;A0A286YFC8;A0A286YFB2;A0A286YER3;A0A286YF34 PHGDH D-3-phosphoglycerate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.164 40.164 2 0.001372 36681 QUIQUE_C1277_190116_001 98.943 64.135 19998000000 1714100000 1899500000 0 0 0 2057500000 1987500000 1751600000 2289100000 953700000 2496100000 2230600000 2617800000 48904 404 45660 439875;439876;439877;439878;439879;439880;439881;439882;439883;439884;439885 561642;561643;561644;561645;561646;561647;561648;561649;561650;561651;561652;561653;561654;561655;561656 561645 15 VTAEVVLAHLGGGSTSR Unmodified 1652.8846 0.8845829 1868 P04843;F8WF32 RPN1 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 2 1 2 2 2 77.931 77.931 2;3 4.7838E-10 79083 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.07 83.197 660710000 60970000 26633000 24843000 20740000 34196000 22103000 33477000 22399000 91764000 8470400 140460000 86736000 87919000 48905 1868 45661 439886;439887;439888;439889;439890;439891;439892;439893;439894;439895;439896;439897;439898;439899;439900;439901;439902;439903 561657;561658;561659;561660;561661;561662;561663;561664;561665;561666;561667;561668;561669;561670;561671;561672;561673;561674;561675 561668 14 VTAFLDDLSQK Unmodified 1235.6398 0.63976774 4078 Q9BYT8;E9PCB6;H0YAK4 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 86.843 86.843 2 0.001687 88310 QUIQUE_DMIX8_190116_001 83 50.159 486960000 64749000 0 71129000 0 0 0 48807000 0 58588000 29353000 82944000 56887000 74499000 48906 4078 45662 439904;439905;439906;439907;439908;439909;439910;439911 561676;561677;561678;561679;561680;561681;561682;561683 561683 6 VTAGISFAIPSDR Unmodified 1332.7038 0.70376498 229 A0A0C4DG44;O43464;P83110 HTRA2;HTRA3 Serine protease HTRA2, mitochondrial;Serine protease HTRA3 yes no 0 0 0 1 1 1 94.906 94.906 2 7.744E-06 99069 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.17 91.171 48032000 0 0 26398000 0 0 0 0 0 0 0 0 21633000 0 48907 229 45663 439912;439913;439914 561684;561685;561686;561687 561686 3 VTAIDFR Unmodified 820.4443 0.44430282 4459 Q9UJS0 SLC25A13 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 48.475 48.475 2 0.020425 46109 QUIQUE_DMIX3_190116_001 108.24 30.49 420880000 55659000 0 0 0 41521000 38268000 55458000 0 61674000 20430000 76174000 0 71694000 48908 4459 45664 439915;439916;439917;439918;439919;439920;439921;439922 561688;561689;561690;561691;561692;561693;561694;561695;561696;561697;561698 561694 11 VTAIHIDPATHR Unmodified 1329.7153 0.71533272 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 22.657 22.657 2;3 0.0013486 15708 QUIQUE_C1403_190116_001 98.257 67.693 236610000 20304000 23521000 0 23350000 25491000 0 0 0 25161000 91853000 26932000 0 0 48909 2524 45665 439923;439924;439925;439926;439927;439928;439929;439930;439931 561699;561700;561701;561702;561703;561704;561705;561706;561707;561708 561701 9 VTAPDVDLHLK Unmodified 1206.6608 0.66083754 2935 Q09666 AHNAK Neuroblast differentiation-associated protein AHNAK yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.082 60.082 3 0.00081359 58856 QUIQUE_C1403_190116_001 60.641 35.787 558750000 27590000 34931000 34057000 41799000 41517000 67345000 35453000 124000000 36836000 20390000 51904000 42932000 0 48910 2935 45666 439932;439933;439934;439935;439936;439937;439938;439939;439940;439941;439942;439943 561709;561710;561711;561712;561713;561714;561715;561716;561717;561718;561719;561720;561721 561713 10 VTAQFISK Unmodified 892.50182 0.5018177 4273 Q9NRS6;E9PNI5 SNX15 Sorting nexin-15 yes no 0 0 0 1 1 30.835 30.835 2 0.017978 25564 QUIQUE_DMIX8_190116_001 80.684 34.802 50858000 0 0 23262000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 27597000 48911 4273 45667 439944;439945 561722;561723 561723 2 VTAQGPGLEPSGNIANK Unmodified 1651.8529 0.85294842 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.172 46.172 2 5.7466E-63 42020 QUIQUE_DMIX4_190116_001 189.3 155.42 1893900000 115840000 130790000 194920000 161590000 154370000 94648000 143270000 137430000 159750000 92098000 169430000 189200000 150530000 48912 2178 45668 439946;439947;439948;439949;439950;439951;439952;439953;439954;439955;439956;439957;439958 561724;561725;561726;561727;561728;561729;561730;561731;561732;561733;561734;561735;561736;561737 561734 14 VTASDPLDTLGSEGALSPGGVASLLR Unmodified 2482.2915 0.29149716 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26.627 3 8.8316E-05 20457 QUIQUE_C1277_190116_001 91.657 75.475 475120000 36003000 55692000 41599000 28181000 53710000 36212000 41513000 41194000 32118000 16884000 50216000 41795000 0 48922 1408 45678 440053;440054;440055;440056;440057;440058;440059;440060;440061;440062;440063;440064 561863;561864;561865;561866;561867;561868;561869;561870;561871;561872;561873;561874 561864 11 VTCDQTYLLR Unmodified 1267.6231 0.62307182 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.741 57.741 2 1.6424E-09 56466 QUIQUE_C1368_190116_001 170.22 109.24 1319200000 0 0 179080000 172240000 158020000 131160000 191010000 0 0 0 187960000 164040000 135650000 48923 4281 45679 440065;440066;440067;440068;440069;440070;440071;440072;440073 561875;561876;561877;561878;561879;561880;561881;561882;561883 561876 6 VTCIDPNPNFEK Unmodified 1432.6657 0.66566492 1159 H0YI09;Q9H8H3;F8VQX6 METTL7A Methyltransferase-like protein 7A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.273 55.273 2 2.6863E-08 53760 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561915;561916;561917;561918;561919;561920;561921;561922;561923;561924;561925;561926;561927 561918 11 VTDETSGCSLTCAQFHPDGLIFGTGTMDSQIK Unmodified 3472.5585 0.55850559 4502 Q9UMS4;H0YGZ5 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes no 0 0 0 1 1 2 130.07 130.07 3 7.9218E-37 134724 QUIQUE_C1368_190116_001 117.04 108.35 141150000 43504000 59592000 38055000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48929 4502 45685 440113;440114;440115;440116 561928;561929;561930;561931 561931 4 VTDFGDKVEDPTFLNQLQSGVNR Unmodified 2578.2663 0.26634504 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 118.41 118.41 2;3 1.3327E-49 122331 QUIQUE_DMIX3_190116_001 195.15 176.79 3106500000 84653000 168470000 308040000 195450000 203610000 201310000 234930000 342130000 428030000 138400000 275530000 254250000 271720000 48930 3053 45686 440117;440118;440119;440120;440121;440122;440123;440124;440125;440126;440127;440128;440129;440130;440131 561932;561933;561934;561935;561936;561937;561938;561939;561940;561941;561942;561943;561944;561945;561946;561947;561948;561949;561950;561951;561952;561953 561944 22 VTDFLFLLGK Unmodified 1151.659 0.65904662 3535;1356 Q8IWA5;K7ESP7 SLC44A2 Choline transporter-like protein 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 151.12 151.12 2 0.0050955 153904 QUIQUE_DMIX1_190116_001 90.657 41.239 643590000 42780000 55639000 89719000 87674000 59534000 70487000 80692000 21797000 39643000 39923000 27449000 28258000 0 48931 3535;1356 45687 440132;440133;440134;440135;440136;440137;440138;440139;440140;440141;440142;440143 561954;561955;561956;561957;561958;561959;561960;561961;561962;561963;561964;561965;561966 561962 12 VTDKLTPIHDR Unmodified 1293.7041 0.70409934 2275 P28072;A0A087X2I4;I3L3X7 PSMB6 Proteasome subunit beta type-6;Proteasome subunit beta type yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 17.005 17.005 2;3 0.002517 9331 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.76 63.227 473090000 0 0 0 0 0 0 0 138370000 79621000 0 79735000 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VTEGLTDVILYHQPDDK Unmodified 1941.9684 0.96837211 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 92.216 92.216 2 1.1682E-52 94277 QUIQUE_C1368_190116_001 210.64 188.41 397730000 38979000 43726000 41909000 40411000 31922000 27051000 47114000 0 31911000 11729000 40772000 0 42210000 48947 1581 45703 440242;440243;440244;440245;440246;440247;440248;440249;440250;440251;440252 562076;562077;562078;562079;562080;562081;562082;562083;562084;562085;562086 562078 11 VTEGLTDVILYHQPDDKKK Unmodified 2198.1583 0.15829814 1581 O60506;B7Z645 SYNCRIP Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q yes no 0 0 2 1 61.938 61.938 3 0.007087 60450 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.49 49.084 29602000 0 0 0 0 0 0 0 29602000 0 0 0 0 0 48948 1581 45704 440253 562087 562087 1 VTEGLVDVILYHQPDDK Unmodified 1939.9891 0.98910755 1525 O43390;B4DT28 HNRNPR Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R yes no 0 0 0 1 1 1 112.38 112.38 3 0.013078 116294 QUIQUE_DMIX8_190116_001 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VTENYLCKPEDNIYSIDFTR Unmodified 2476.158 0.15804014 542 A6NIH7 UNC119B Protein unc-119 homolog B yes yes 0 0 1 1 1 111.05 111.05 3 0.015923 115258 QUIQUE_C1218_190116_001 37.686 29.597 70209000 35616000 0 0 0 0 0 0 34593000 0 0 0 0 0 48957 542 45713 440294;440295 562138;562139 562138 2 VTEQEWR Unmodified 946.45084 0.45084476 1967 P09497 CLTB Clathrin light chain B yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.668 23.668 2 0.011709 16884 QUIQUE_C1277_190116_001 138.48 62.564 1458700000 0 281960000 0 243710000 315340000 0 223250000 71149000 130280000 0 192960000 0 0 48958 1967 45714 440296;440297;440298;440299;440300;440301;440302 562140;562141;562142;562143;562144;562145;562146 562140 6 VTEQLIEAINNGDFEAYTK Unmodified 2154.0481 0.04807899 896;803;1135 D6R938;Q13557;H0Y9J2;E9PBG7;E9PF82;H0Y9C2 CAMK2D Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 134.77 134.77 2;3 9.0119E-117 139053 QUIQUE_DMIX7_190116_001 223.72 191.65 3379500000 310610000 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VTFDPTSSYTLEDLKPDTLYR Unmodified 2460.206 0.20603619 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 129.54 129.54 3 1.7294E-06 135203 QUIQUE_C1218_190116_001 95.48 83.514 829580000 77064000 93405000 85298000 72691000 89742000 40102000 72634000 0 69950000 27349000 70830000 64702000 65811000 48965 1998 45720 440373;440374;440375;440376;440377;440378;440379;440380;440381;440382;440383;440384 562247;562248;562249;562250;562251;562252;562253;562254;562255;562256;562257;562258 562247 10 VTFLCGDAGPLAVGAVIYHK Unmodified 2087.0874 0.087381804 4281 Q9NS86 LANCL2 LanC-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 1 127.35 127.35 2;3 2.4456E-30 131385 QUIQUE_C1403_190116_001 145.33 133.06 2257200000 194410000 237520000 208760000 175680000 149920000 140220000 172200000 135590000 180130000 48541000 286440000 162880000 164910000 48966 4281 45721 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dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.101 62.101 2 0.00052414 61691 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.456 61.513 1102600000 125270000 109930000 158910000 76654000 0 123190000 154630000 0 0 45237000 174020000 134760000 0 48974 2013 45729 440435;440436;440437;440438;440439;440440;440441;440442;440443;440444;440445 562321;562322;562323;562324;562325;562326;562327;562328;562329;562330;562331 562330 9 VTGADVPMPYAK Oxidation (M) 1263.6169 0.61692381 2013 P11177 PDHB Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 1 45.662 45.662 2 0.023329 42487 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.751 29.796 149220000 0 0 43591000 0 21525000 32353000 0 0 51755000 0 0 0 0 48975 2013 45729 440446;440447;440448;440449;440450;440451;440452 562332;562333;562334;562335;562336;562337;562338 562337 6 VTGDEWGDNYFLVGPYTEQGVR Unmodified 2501.1499 0.1499183 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 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562439;562440;562441;562442;562443;562444;562445;562446;562447;562448;562449;562450;562451;562452;562453;562454;562455;562456;562457;562458;562459;562460;562461;562462;562463;562464;562465;562466;562467;562468;562469;562470;562471;562472;562473;562474;562475;562476;562477;562478;562479;562480;562481;562482 562452 42 VTHELQAMK Unmodified 1055.5434 0.54336494 4672 R4GNH3;P17980;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50;E9PLG2 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 0 1 1 15.299 15.299 3 0.00011983 7314 QUIQUE_DMIX4_190116_001 134.26 113.48 34258000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34258000 0 0 0 48990 4672 45744 440571;440572 562483;562484;562485 562485 3 VTHELQAMKDK Unmodified 1298.6653 0.66527099 4672 R4GNH3;P17980;E9PMD8;E9PKD5;E9PN50;E9PLG2 PSMC3 26S protease regulatory subunit 6A yes no 0 0 1 1 11.563 11.563 3 0.003729 3757 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.632 52.481 5602100 0 0 0 0 0 0 0 5602100 0 0 0 0 0 48991 4672 45745 440573 562486;562487 562486 2 VTHETSAHEGQTEAPSIDEK Unmodified 2164.9873 0.98726965 2091 P15374;A0A087WTB8 UCHL3 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 3 2 3 2 3 3 2 2 2 2 1 2 18.542 18.542 2;3;4 1.2291E-134 10955 QUIQUE_C1277_190116_001 231.71 194.53 2406800000 65734000 273100000 244990000 261600000 184130000 280010000 354300000 90247000 165820000 110170000 215540000 70332000 90863000 48992 2091 45746 440574;440575;440576;440577;440578;440579;440580;440581;440582;440583;440584;440585;440586;440587;440588;440589;440590;440591;440592;440593;440594;440595;440596;440597;440598;440599;440600;440601 562488;562489;562490;562491;562492;562493;562494;562495;562496;562497;562498;562499;562500;562501;562502;562503;562504;562505;562506;562507;562508;562509;562510;562511;562512;562513;562514;562515;562516 562491 29 VTHFSIVLTAK Unmodified 1214.7023 0.70230842 3371 Q8TCE6;Q6NSW5 FAM45A;FAM45B Protein FAM45A;Protein FAM45B yes no 0 0 0 1 57.725 57.725 3 0.031506 56731 QUIQUE_C1576_190116_001 26.659 15.753 8027000 0 0 0 0 0 0 8027000 0 0 0 0 0 0 48993 3371 45747 440602 562517 562517 1 VTHTGQVYDDKDYR Unmodified 1695.7853 0.78526278 1629 O75380;D6RBT3 NDUFS6 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial yes no 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 2 1 18.414 18.414 2;3;4 7.8891E-71 10740 QUIQUE_C1277_190116_001 209.64 162.45 807670000 35080000 379320000 30567000 25788000 20891000 27107000 39376000 36186000 88361000 93961000 31032000 0 0 48994 1629 45748 440603;440604;440605;440606;440607;440608;440609;440610;440611;440612;440613;440614;440615;440616 562518;562519;562520;562521;562522;562523;562524;562525;562526;562527;562528;562529;562530;562531 562519 12 VTHTGQVYDDKDYRR Unmodified 1851.8864 0.88637381 1629 O75380;D6RBT3 NDUFS6 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 6, mitochondrial yes no 0 0 2 1 1 2 2 1 1 2 1 2 14.497 14.497 3;4;5 2.4926E-13 6880 QUIQUE_DMIX5_190116_001 124.45 108.31 1251500000 0 20449000 15502000 0 32134000 0 114380000 133710000 83107000 0 484940000 63524000 303750000 48995 1629 45749 440617;440618;440619;440620;440621;440622;440623;440624;440625;440626;440627;440628;440629 562532;562533;562534;562535;562536;562537;562538;562539;562540;562541;562542;562543;562544;562545 562542 11 VTHYFIDLNK Unmodified 1248.6503 0.65027285 3734 Q92561 PHYHIP Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 1 1 2 1 1 60.077 60.077 2;3 0.0013792 58759 QUIQUE_C1403_190116_001 108.67 74.801 923820000 170580000 179190000 122860000 104070000 72772000 91315000 109060000 0 23652000 0 50321000 0 0 48996 3734 45750 440630;440631;440632;440633;440634;440635;440636;440637;440638;440639;440640;440641;440642;440643 562546;562547;562548;562549;562550;562551;562552;562553;562554;562555;562556;562557;562558;562559;562560;562561 562554 12 VTHYFIDLNKK Unmodified 1376.7452 0.74523587 3734 Q92561 PHYHIP Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein yes yes 0 0 1 1 1 39.946 39.946 2 0.004784 36772 QUIQUE_C1218_190116_001 94.66 64.405 86995000 40179000 0 0 0 0 0 0 0 46816000 0 0 0 0 48997 3734 45751 440644;440645 562562;562563 562562 0 VTIAQGGVLPNIQAVLLPK Unmodified 1930.1615 0.16153303 3196;1871 Q93077;Q7L7L0;P04908;Q16777;Q6FI13;A0A0U1RR32;A0A0U1RRH7;Q99878;Q96KK5;Q9BTM1;P20671;P0C0S8;H0YFX9 HIST1H2AC;HIST3H2A;HIST1H2AB;HIST2H2AC;HIST2H2AA3;HIST1H2AJ;HIST1H2AH;H2AFJ;HIST1H2AD;HIST1H2AG Histone H2A type 1-C;Histone H2A type 3;Histone H2A type 1-B/E;Histone H2A type 2-C;Histone H2A type 2-A;Histone H2A type 1-J;Histone H2A type 1-H;Histone H2A.J;Histone H2A type 1-D;Histone H2A type 1;Histone H2A no no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 146.33 146.33 2;3 8.3851E-100 149509 QUIQUE_DMIX1_190116_001 209.67 199.35 21215000000 2036900000 1510500000 1674300000 2275400000 1657000000 2054500000 1240400000 1460200000 2397300000 466430000 1397200000 1342200000 1702900000 48998 1871;3196 45752 440646;440647;440648;440649;440650;440651;440652;440653;440654;440655;440656;440657;440658;440659;440660;440661;440662;440663;440664;440665;440666;440667;440668;440669;440670;440671;440672;440673 562564;562565;562566;562567;562568;562569;562570;562571;562572;562573;562574;562575;562576;562577;562578;562579;562580;562581;562582;562583;562584;562585;562586;562587;562588;562589;562590;562591;562592;562593;562594;562595;562596;562597;562598;562599;562600;562601;562602;562603;562604;562605;562606;562607;562608;562609;562610;562611;562612;562613;562614;562615;562616;562617;562618;562619;562620;562621;562622;562623;562624;562625;562626;562627;562628;562629;562630;562631 562602 68 VTIAQGYDALSSMANIAGYK Unmodified 2072.0248 0.024841127 2993 Q13423;E9PCX7;D6RAI5 NNT NAD(P) transhydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 150.28 150.28 2;3 2.4647E-13 155355 QUIQUE_C1368_190116_001 148.91 138.59 1574400000 142660000 81154000 157400000 132080000 36242000 105670000 133490000 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Unmodified 824.44661 0.44661101 1148 H0YDU8;P53041;A8MU39 PPP5C Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 64.479 64.479 2 0.039576 63936 QUIQUE_C1277_190116_001 83.614 30.931 473150000 0 84207000 68290000 73698000 47868000 51133000 0 38843000 40529000 0 0 68588000 0 49006 1148 45760 440764;440765;440766;440767;440768;440769;440770;440771 562740;562741;562742;562743;562744;562745;562746;562747;562748 562740 9 VTITGSPAATQAAQYLISQR Unmodified 2075.1011 0.10111761 4515 Q9UNW9 NOVA2 RNA-binding protein Nova-2 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 120.1 120.1 2;3 5.118E-06 123651 QUIQUE_C1403_190116_001 75.589 60.334 383960000 72262000 70194000 37290000 33877000 34295000 46945000 0 25319000 20183000 15114000 0 28476000 0 49007 4515 45761 440772;440773;440774;440775;440776;440777;440778;440779;440780;440781;440782;440783 562749;562750;562751;562752;562753;562754;562755;562756;562757;562758;562759;562760;562761 562754 9 VTITGTSQNWTPDLTNLMTR Oxidation (M) 2264.1107 0.11069602 2495 P47874 OMP Olfactory marker protein yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 119.1 119.1 2 1.8279E-29 124290 QUIQUE_C1218_190116_001 141.82 120.26 593880000 61584000 48148000 36001000 0 0 0 0 97385000 153850000 0 0 99603000 97303000 49008 2495 45762 440784;440785;440786;440787;440788;440789;440790;440791 562762;562763;562764;562765;562766;562767;562768;562769 562762 1925 6 VTITGTSQNWTPDLTNLMTR Unmodified 2248.1158 0.1157814 2495 P47874 OMP Olfactory marker protein yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 138.48 138.48 2;3 3.7296E-118 142740 QUIQUE_DMIX7_190116_001 223.7 201.94 3088800000 307500000 174940000 157760000 115330000 256240000 26225000 144860000 316500000 606360000 0 320560000 344590000 317890000 49009 2495 45762 440792;440793;440794;440795;440796;440797;440798;440799;440800;440801;440802;440803;440804;440805;440806;440807;440808;440809;440810;440811;440812;440813;440814 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Unmodified 815.47527 0.4752686 1875;1776;2325;1169;1113 H0Y2X5;P47895;H0YMG7;O94788;P00352;P05091;P30837 ALDH1A3;ALDH1A2;ALDH1A1;ALDH2;ALDH1B1 Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3;Retinal dehydrogenase 2;Retinal dehydrogenase 1;Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial;Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 40.704 40.704 1;2 0.0085625 37177 QUIQUE_DMIX7_190116_001 161.68 6.1717 10459000000 904850000 747520000 1060400000 787340000 855070000 804520000 699690000 716980000 918480000 487500000 853600000 933870000 689470000 49019 1113;1169;1776;1875;2325 45772 440869;440870;440871;440872;440873;440874;440875;440876;440877;440878;440879;440880;440881;440882;440883 562861;562862;562863;562864;562865;562866;562867;562868;562869;562870;562871;562872;562873;562874;562875;562876;562877;562878;562879;562880;562881;562882;562883;562884;562885;562886;562887;562888;562889;562890;562891;562892;562893;562894;562895;562896 562895 34 VTLEVGK Unmodified 744.43815 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Unmodified 1533.8304 0.83036248 1569;831 E5KLJ9;A0A2R8YFD1;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 3 2 3 2 2 2 1 3 3 1 2 1 3 48.828 48.828 2;3;4 7.2021E-05 46424 QUIQUE_C1277_190116_001 122.69 95.576 2224400000 263970000 154670000 254530000 109710000 145670000 137770000 21009000 241660000 204120000 38982000 206760000 104580000 340980000 49036 831;1569 45789 441001;441002;441003;441004;441005;441006;441007;441008;441009;441010;441011;441012;441013;441014;441015;441016;441017;441018;441019;441020;441021;441022;441023;441024;441025;441026;441027;441028 563027;563028;563029;563030;563031;563032;563033;563034;563035;563036;563037;563038;563039;563040;563041;563042;563043;563044;563045;563046;563047;563048;563049;563050;563051;563052;563053;563054;563055;563056;563057;563058 563031 32 VTLSFPSTLQTGTGTLK Unmodified 1749.9513 0.95126548 959 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563152;563153;563154;563155;563156;563157;563158;563159;563160;563161;563162;563163;563164;563165;563166;563167;563168;563169;563170;563171;563172;563173;563174;563175;563176;563177;563178;563179;563180;563181;563182;563183;563184;563185;563186;563187;563188 563167 35 VTLVVGASQDIIPQLK Unmodified 1679.9822 0.98217168 2189 P21964;E7EMS6;E7EUU8;H7BZ45 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 0 1 125.82 125.82 2 0.0011834 130353 QUIQUE_C1218_190116_001 68.44 54.535 60853000 60853000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49041 2189 45794 441105 563189 563189 1 VTMDAPVSSVALR Unmodified 1344.7071 0.7071358 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.653 75.653 2 0.0014539 75347 QUIQUE_C1563_190116_001 79.659 50.186 1688400000 117840000 173580000 0 191550000 129490000 156590000 0 0 343500000 74577000 141100000 150560000 209600000 49042 3143 45795 441106;441107;441108;441109;441110;441111;441112;441113;441114;441115 563190;563191;563192;563193;563194;563195;563196;563197;563198;563199;563200 563194 8 VTMDAPVSSVALR Oxidation (M) 1360.7021 0.70205043 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 1 0 1 1 1 52.618 52.618 2 0.00079206 50030 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.344 60.77 85752000 0 0 0 0 0 0 0 35342000 0 50410000 0 0 0 49043 3143 45795 441116;441117;441118 563201;563202;563203 563201 2600 2 VTMILQSPSFR Unmodified 1277.6802 0.68019277 2382 P35612;C9JTM0;C9J080;A0A1C7CYY0;C9J299 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 91.719 91.719 2 3.647E-08 95469 QUIQUE_C1218_190116_001 153.05 128.15 1145300000 217010000 165940000 137580000 142290000 114490000 134540000 151800000 0 0 0 0 81609000 0 49044 2382 45796 441119;441120;441121;441122;441123;441124;441125;441126;441127 563204;563205;563206;563207;563208;563209;563210;563211;563212;563213;563214;563215 563204 12 VTMILQSPSFREELEGLIQEQMK Unmodified 2705.3768 0.37682347 2382 P35612;C9JTM0;C9J080;A0A1C7CYY0;C9J299 ADD2 Beta-adducin yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 155.8 155.8 3 2.7063E-62 160221 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.39 100.45 483210000 0 0 0 0 43279000 0 63564000 0 104710000 0 185550000 86103000 0 49045 2382 45797 441128;441129;441130;441131;441132 563216;563217;563218;563219;563220 563220 3 VTMLFLGLHNVR Unmodified 1398.7806 0.78057552 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 95.931 95.931 2;3 0.00015688 98402 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.95 95.073 2389900000 127290000 163040000 172790000 158230000 153960000 153160000 215800000 218890000 166630000 62386000 329340000 251420000 217000000 49046 2083 45798 441133;441134;441135;441136;441137;441138;441139;441140;441141;441142;441143;441144;441145;441146;441147 563221;563222;563223;563224;563225;563226;563227;563228;563229;563230;563231;563232;563233;563234;563235;563236;563237;563238;563239;563240;563241;563242;563243;563244;563245;563246 563237 26 VTMLFLGLHNVR Oxidation (M) 1414.7755 0.77549014 2083 P14868;H7BZ35 DARS Aspartate--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 1 0 1 1 74.12 74.12 3 0.0035992 73473 QUIQUE_C1563_190116_001 57.019 51.051 34224000 0 0 0 0 0 34224000 0 0 0 0 0 0 0 49047 2083 45798 441148;441149 563247;563248 563247 1416 2 VTMQNLNDR Unmodified 1089.5237 0.52369213 776;763;774;789;794 CON__P13645;P13645;CON__P02535-1;CON__Q7Z3Y7;Q7Z3Y7;CON__Q148H6;CON__Q7Z3Z0;CON__Q7Z3Y8;Q7Z3Z0;Q7Z3Y8;CON__P02533;P02533;CON__A2A4G1;CON__P08779;P08779;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8;CON__Q7Z3Y9;Q7Z3Y9 KRT10;KRT28;KRT25;KRT27;KRT14;KRT16;KRT26 Keratin, type I cytoskeletal 10;Keratin, type I cytoskeletal 28;Keratin, type I cytoskeletal 25;Keratin, type I cytoskeletal 27;Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16;Keratin, type I cytoskeletal 26 no no 0 0 0 1 1 1 1 29.249 29.249 2 0.00058153 23372 QUIQUE_DMIX4_190116_001 111.74 67.39 2886900000 281150000 0 0 0 0 0 0 0 0 709620000 0 945600000 950580000 + 49048 776;763;774;789;794 45799 441150;441151;441152;441153 563249;563250;563251;563252;563253 563251 4 VTMQNLNDR Oxidation (M) 1105.5186 0.51860675 776;763;774;789;794 CON__P13645;P13645;CON__P02535-1;CON__Q7Z3Y7;Q7Z3Y7;CON__Q148H6;CON__Q7Z3Z0;CON__Q7Z3Y8;Q7Z3Z0;Q7Z3Y8;CON__P02533;P02533;CON__A2A4G1;CON__P08779;P08779;CON__Q9Z2K1;CON__Q3ZAW8;CON__Q7Z3Y9;Q7Z3Y9 KRT10;KRT28;KRT25;KRT27;KRT14;KRT16;KRT26 Keratin, type I cytoskeletal 10;Keratin, type I cytoskeletal 28;Keratin, type I cytoskeletal 25;Keratin, type I cytoskeletal 27;Keratin, type I cytoskeletal 14;Keratin, type I cytoskeletal 16;Keratin, type I cytoskeletal 26 no no 0 1 0 1 14.165 14.165 2 0.0034891 6042 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.439 47.992 181830000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 181830000 0 0 0 + 49049 776;763;774;789;794 45799 441154 563254 563254 453 1 VTMSQASTEASSDK Oxidation (M) 1456.6352 0.63515265 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 10.688 10.688 2 1.0045E-100 3221 QUIQUE_C1563_190116_001 227.81 190.74 500920000 27301000 0 37648000 56187000 24379000 3009200 22064000 51502000 90948000 89169000 0 64912000 33798000 49050 4560 45800 441155;441156;441157;441158;441159;441160;441161;441162;441163;441164;441165 563255;563256;563257;563258;563259;563260;563261;563262;563263;563264;563265;563266 563259 3015 12 VTMSQASTEASSDK Unmodified 1440.6402 0.64023803 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 23.092 23.092 2 9.843E-19 16969 QUIQUE_DMIX1_190116_001 158.4 138.1 9724500000 673860000 430050000 1184400000 1138100000 630240000 850100000 1270200000 329700000 596610000 509570000 804310000 436470000 871030000 49051 4560 45800 441166;441167;441168;441169;441170;441171;441172;441173;441174;441175;441176;441177;441178 563267;563268;563269;563270;563271;563272;563273;563274;563275;563276;563277;563278;563279;563280 563274 14 VTMWVFEEDIGGK Unmodified 1509.7174 0.71736614 2184 P21695 GPD1 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 132.22 132.22 2 0.00208 136230 QUIQUE_C1403_190116_001 91.752 67.901 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563287;563288;563289;563290;563291;563292;563293;563294;563295;563296;563297;563298;563299;563300;563301;563302 563299 15 VTNELYTVMK Unmodified 1196.6111 0.61111015 1520 O43295;A0A087WZH4 SRGAP3 SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 67.376 67.376 2 0.032948 66592 QUIQUE_DMIX7_190116_001 53.517 21.582 47742000 0 0 0 0 0 0 0 21177000 0 0 0 26566000 0 49055 1520 45804 441198;441199;441200 563303;563304;563305 563305 3 VTNEYNESLLYSPEEPK Unmodified 2010.9422 0.94221693 3235 Q4G0N4;B7Z8V7;A0A0C4DGV3 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 87.523 87.523 2 3.7872E-140 89095 QUIQUE_DMIX3_190116_001 237.07 222.2 1624400000 100320000 116710000 179760000 134440000 123170000 122480000 151700000 101340000 154580000 44943000 142800000 139150000 112980000 49056 3235 45805 441201;441202;441203;441204;441205;441206;441207;441208;441209;441210;441211;441212;441213 563306;563307;563308;563309;563310;563311;563312;563313;563314;563315;563316;563317;563318;563319;563320 563315 15 VTNFVAQR Unmodified 933.50321 0.50321468 3155 Q15750 TAB1 TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.017 25.017 2 0.038384 18992 QUIQUE_DMIX7_190116_001 61.561 42.83 140950000 0 0 34284000 0 0 0 33259000 0 0 0 43507000 29896000 0 49057 3155 45806 441214;441215;441216;441217;441218 563321;563322;563323;563324;563325 563325 5 VTNGAFTGEISPGMIK Unmodified 1620.8181 0.81814282 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.382 89.382 2 2.2387E-13 90923 QUIQUE_DMIX7_190116_001 166.48 154.55 14804000000 1010200000 1197300000 1237400000 1065100000 889620000 806820000 1013400000 1317900000 1177200000 326010000 2090900000 1370900000 1300900000 49058 2688 45807 441219;441220;441221;441222;441223;441224;441225;441226;441227;441228;441229;441230;441231 563326;563327;563328;563329;563330;563331;563332;563333;563334;563335;563336;563337;563338;563339;563340;563341;563342;563343;563344 563342 19 VTNGAFTGEISPGMIK Oxidation (M) 1636.8131 0.81305744 2688 P60174 TPI1 Triosephosphate isomerase yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 2 73.596 73.596 2 6.5094E-08 71045 QUIQUE_DMIX4_190116_001 121.01 103.85 5873200000 95764000 192320000 156990000 147960000 112340000 295590000 130410000 707460000 669880000 472100000 1108200000 873710000 910500000 49059 2688 45807 441232;441233;441234;441235;441236;441237;441238;441239;441240;441241;441242;441243;441244;441245;441246;441247;441248;441249;441250;441251 563345;563346;563347;563348;563349;563350;563351;563352;563353;563354;563355;563356;563357;563358;563359;563360;563361;563362;563363;563364;563365;563366;563367;563368 563361 2122 22 VTNGELLAQYMADAASELGPTTPYGK Unmodified 2696.3003 0.30034729 667;668 B7ZC38;Q9NR46;B7ZC39 SH3GLB2 Endophilin-B2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 2 2 162.14 162.14 2;3 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441302;441303;441304;441305;441306;441307;441308;441309;441310;441311;441312;441313;441314;441315;441316;441317;441318;441319 563422;563423;563424;563425;563426;563427;563428;563429;563430;563431;563432;563433;563434;563435;563436;563437;563438;563439 563428 5 VTNSTELQHQLDK Unmodified 1511.758 0.7579854 3108 Q15075 EEA1 Early endosome antigen 1 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 26.843 26.843 2;3 7.1645E-06 21134 QUIQUE_C1277_190116_001 108.98 64.231 40125000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40125000 0 0 49067 3108 45815 441320;441321;441322;441323;441324;441325;441326;441327;441328 563440;563441;563442;563443;563444;563445;563446;563447;563448 563442 9 VTNVEWLLDALYGK Unmodified 1619.8559 0.85590853 4497 Q9ULZ3 PYCARD Apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 164.71 164.71 2 0.0013932 168214 QUIQUE_C1403_190116_001 94.767 69.929 298370000 0 0 50105000 83124000 34586000 0 0 36125000 28891000 0 65538000 0 0 49068 4497 45816 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563778;563779;563780;563781;563782;563783;563784;563785;563786;563787;563788;563789;563790;563791;563792;563793;563794;563795;563796;563797;563798;563799;563800;563801;563802;563803;563804;563805;563806;563807;563808;563809;563810;563811;563812;563813;563814;563815;563816;563817;563818;563819;563820;563821;563822;563823;563824;563825;563826;563827;563828;563829;563830;563831;563832;563833;563834;563835;563836;563837;563838;563839;563840;563841;563842;563843;563844;563845;563846;563847;563848;563849;563850;563851 563793 74 VTSEGAGLQLQK Unmodified 1229.6616 0.66156582 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 34.946 34.946 2 0.0076225 30544 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.426 31.012 211020000 0 0 84109000 0 0 67911000 0 0 0 0 0 59000000 0 49102 1993 45847 441615;441616;441617 563852;563853;563854 563854 2 VTSELLR Unmodified 816.47052 0.47051757 4259 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509660000 644790000 792410000 2307300000 292440000 1010300000 49105 1793 45850 441623;441624;441625;441626;441627;441628;441629;441630;441631;441632;441633;441634 563861;563862;563863;563864;563865;563866;563867;563868;563869;563870;563871;563872;563873;563874;563875;563876;563877;563878;563879;563880;563881;563882;563883;563884;563885;563886;563887;563888;563889;563890 563863 30 VTSLEEELTDLR Unmodified 1403.7144 0.71438925 190 A0A0A0MT60;Q5T1M5 FKBP15 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase;FK506-binding protein 15 yes no 0 0 0 1 1 114.19 114.19 2 0.010547 118319 QUIQUE_C1368_190116_001 65.5 44.128 46657000 0 0 0 0 0 46657000 0 0 0 0 0 0 0 49106 190 45851 441635;441636 563891;563892 563891 1 VTSLTACLVDQSLR Unmodified 1561.8134 0.81339179 938 E9PIM6;E9PNQ8;P04216 THY1 Thy-1 membrane glycoprotein yes no 0 0 0 4 4 4 3 3 2 3 3 3 4 3 3 2 97.196 97.196 2;3 5.2352E-23 102032 QUIQUE_DMIX1_190116_001 167.18 140.74 15596000000 1289500000 1549100000 1723100000 1523300000 1457800000 986100000 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A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 0 1 26.651 26.651 2 0.056943 20970 QUIQUE_DMIX5_190116_001 53.968 18.335 62886000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 62886000 0 0 49111 352 45856 441694 563970 563970 1 VTSTNNMAYNK Unmodified 1241.571 0.57103625 3865 Q96HC4;A0A0D9SFR4 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 17.664 17.664 2 0.002534 10246 QUIQUE_DMIX3_190116_001 96.668 75.766 112190000 0 0 0 33117000 0 27348000 0 0 34608000 0 17115000 0 0 49112 3865 45857 441695;441696;441697;441698 563971;563972;563973;563974 563973 2 VTSVGNPTIKPHSVPSHTLPSHPVTPSSK Unmodified 2987.5829 0.58286857 465 B1ALK7;A0A2R8YG42;Q14155;E7EUY6;E9PDQ5 ARHGEF7 Rho guanine nucleotide exchange factor 7 yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 35.868 35.868 4;5 8.3529E-06 32338 QUIQUE_DMIX1_190116_001 50.857 40.053 476050000 0 0 0 68291000 89974000 0 0 82982000 63983000 0 69555000 0 101260000 49113 465 45858 441699;441700;441701;441702;441703;441704;441705 563975;563976;563977;563978;563979;563980;563981 563977 7 VTSVSSDSQTGMDR Oxidation (M) 1484.6413 0.64130066 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 14.788 14.788 2 0.00035675 6765 QUIQUE_C1368_190116_001 105.2 85.213 118260000 18266000 20835000 18862000 0 20553000 0 15382000 0 15906000 8455800 0 0 0 49114 2217 45859 441706;441707;441708;441709;441710;441711;441712 563982;563983;563984;563985;563986;563987;563988 563984 1579 7 VTSVVFHPSQDLVFSASPDATIR Unmodified 2472.2649 0.26488848 4502 Q9UMS4 PRPF19 Pre-mRNA-processing factor 19 yes yes 0 0 0 1 1 1 113.12 113.12 3 3.1134E-18 110210 QUIQUE_DMIX4_190116_001 92.336 62.57 316800000 154120000 0 0 0 0 0 0 0 0 64513000 0 98162000 0 49115 4502 45860 441713;441714;441715 563989;563990;563991 563990 2 VTSVVVDVVPR Unmodified 1168.6816 0.68157298 727 C9JIF9;P13798;H7C1U0 APEH Acylamino-acid-releasing enzyme yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 71.766 71.766 2 0.0024031 73122 QUIQUE_C1438_190116_001 78.556 60.117 566760000 70043000 0 71410000 0 73450000 0 0 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564009;564010;564011;564012;564013;564014 564011 4 VTTADPYASGK Unmodified 1108.5401 0.5400537 146 A0A0A0MRF4;P49406;S4R3W9 MRPL19 39S ribosomal protein L19, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 21.102 21.102 2 0.020251 14213 QUIQUE_C1576_190116_001 55.084 30.881 55708000 0 0 0 0 0 0 20728000 0 0 0 0 34980000 0 49119 146 45864 441739;441740 564015;564016 564015 1 VTTALLAR Unmodified 843.5178 0.51780212 321 A0A0U1RRL8;Q8TB22;H0Y9M1 SPATA20 Spermatogenesis-associated protein 20 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 36.46 36.46 2 0.030357 32111 QUIQUE_C1438_190116_001 67.032 25.53 191360000 43769000 24853000 24413000 0 35549000 0 30340000 0 0 0 32440000 0 0 49120 321 45865 441741;441742;441743;441744;441745;441746 564017;564018;564019;564020;564021;564022 564020 6 VTTCGTDVIALTK Unmodified 1377.7174 0.71736614 206 A0A0B4J1R7;Q96B45 C10orf32-ASMT;C10orf32 UPF0693 protein C10orf32 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 65.802 65.802 2 0.001031 66571 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.494 26.061 128480000 0 0 36036000 0 0 0 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VTVAGGVHISGLHTESAPR Unmodified 1886.9963 0.99625861 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 46.925 46.925 3;4 0.0025615 43287 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.764 44.079 921800000 305560000 111880000 0 0 0 78022000 124540000 0 83462000 34950000 88702000 0 94675000 49136 2524 45880 441930;441931;441932;441933;441934;441935;441936;441937;441938;441939 564231;564232;564233;564234;564235;564236;564237;564238;564239;564240 564238 8 VTVAGLAGK Unmodified 814.49125 0.49125301 3956 Q99497;K7ELW0 PARK7 Protein deglycase DJ-1 yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 2 2 1 1 1 2 33.136 33.136 1;2 2.453E-05 29061 QUIQUE_DMIX1_190116_001 169.57 45.225 28439000000 2692600000 2651700000 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564259;564260;564261;564262;564263;564264;564265;564266;564267;564268;564269;564270;564271;564272;564273;564274;564275;564276;564277;564278;564279;564280;564281;564282;564283;564284;564285;564286;564287;564288;564289;564290;564291;564292;564293;564294 564291 36 VTVDQVTDR Unmodified 1031.5247 0.52473799 3623 Q8NBF2 NHLRC2 NHL repeat-containing protein 2 yes yes 0 0 0 1 30.847 30.847 2 0.043137 26100 QUIQUE_DMIX3_190116_001 79.906 45.099 74483000 0 0 0 0 0 0 0 0 74483000 0 0 0 0 49139 3623 45883 441981 564295 564295 0 VTVEDLFSEDFK Unmodified 1427.682 0.68202649 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.9 140.9 2 0.00053227 146529 QUIQUE_C1218_190116_001 114.83 95.047 1341500000 136940000 166860000 167850000 136520000 108690000 110220000 147390000 50493000 70952000 47471000 103100000 95041000 0 49140 914 45884 441982;441983;441984;441985;441986;441987;441988;441989;441990;441991;441992;441993 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VTVFPIGIGDR Unmodified 1172.6554 0.65535823 1861 P04275 VWF von Willebrand factor;von Willebrand antigen 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 102.57 102.57 2 0.00095077 106925 QUIQUE_C1218_190116_001 92.445 56.234 279930000 32173000 44785000 0 25151000 50361000 18032000 23983000 0 13645000 10301000 16888000 21854000 22754000 49142 1861 45886 442020;442021;442022;442023;442024;442025;442026;442027;442028;442029;442030 564352;564353;564354;564355;564356;564357;564358;564359;564360;564361;564362;564363;564364 564352 13 VTVGDITCTGEGTSK Unmodified 1523.7137 0.71373732 1646 O75569;G5E9Q4;F8WEG8;C9JMM3 PRKRA Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A yes no 0 0 0 1 1 1 1 52.256 52.256 2 0.0015995 51153 QUIQUE_C1218_190116_001 90.793 73.357 67049000 0 0 67049000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49143 1646 45887 442031;442032;442033;442034 564365;564366;564367;564368 564365 4 VTVLASDGSSTPAR Unmodified 1359.6994 0.69940789 673 Q5VT82;B7ZM79;Q9HC56 PCDH9 Protocadherin-9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.131 34.131 2 3.4283E-07 28820 QUIQUE_C1368_190116_001 127.87 88.72 281330000 0 26080000 35753000 29514000 39874000 31912000 31265000 31109000 0 0 0 0 55821000 49144 673 45888 442035;442036;442037;442038;442039;442040;442041;442042;442043;442044;442045;442046 564369;564370;564371;564372;564373;564374;564375;564376;564377;564378;564379;564380 564371 12 VTVLDTNDNAPK Unmodified 1285.6514 0.65139506 2914 Q08174;H0Y9F5 PCDH1 Protocadherin-1 no no 0 0 0 1 1 36.854 36.854 2 0.00054247 33183 QUIQUE_C1438_190116_001 93.096 59.833 177730000 0 0 0 0 80319000 97413000 0 0 0 0 0 0 0 49145 2914 45889 442047;442048 564381;564382;564383 564381 3 VTVLFAGQHIAK Unmodified 1282.7398 0.73975656 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;F8WE98 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 2 1 2 2 3 2 2 2 2 2 1 2 1 52.789 52.789 2;3 0.00035684 50405 QUIQUE_DMIX7_190116_001 114.19 53.597 2054900000 208810000 95603000 179490000 271750000 249780000 145750000 109220000 257370000 206470000 60279000 58867000 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564451;564452;564453;564454;564455;564456;564457;564458;564459;564460 564457 10 VTVNYPPTITESK Unmodified 1447.7559 0.75586013 1175 H3BLU2;Q13449;F5H5G1 LSAMP Limbic system-associated membrane protein yes no 0 0 0 3 3 7 1 3 2 4 4 1 1 3 2 2 63.34 63.34 2 0.00038085 60540 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.616 67.287 1315800000 96956000 119350000 272110000 69979000 89361000 116150000 95254000 121920000 33080000 18276000 109720000 61811000 111860000 49153 1175 45897 442120;442121;442122;442123;442124;442125;442126;442127;442128;442129;442130;442131;442132;442133;442134;442135;442136;442137;442138;442139;442140;442141;442142;442143;442144;442145;442146;442147;442148;442149;442150;442151;442152;442153;442154;442155 564461;564462;564463;564464;564465;564466;564467;564468;564469;564470;564471;564472;564473;564474;564475;564476;564477;564478;564479;564480;564481;564482;564483;564484;564485;564486;564487;564488;564489;564490;564491;564492;564493;564494;564495;564496;564497;564498;564499;564500;564501 564489 36 VTVNYPPYISEAK Unmodified 1479.7609 0.76094551 4372 Q9P121;F6WFR7 NTM Neurotrimin no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 80.582 80.582 2 0.00037937 81895 QUIQUE_C1277_190116_001 112.13 76.901 3755000000 246910000 325870000 348740000 298900000 355030000 242360000 355230000 213680000 308940000 133820000 373330000 230880000 321300000 49154 4372 45898 442156;442157;442158;442159;442160;442161;442162;442163;442164;442165;442166;442167;442168 564502;564503;564504;564505;564506;564507;564508;564509;564510;564511;564512;564513;564514;564515;564516;564517;564518;564519;564520;564521;564522;564523;564524;564525;564526;564527;564528;564529;564530;564531;564532 564505 31 VTVQAACGNSVLQDSR Unmodified 1703.8261 0.82608174 647 B5MED8;Q96PQ0 SORCS2 VPS10 domain-containing receptor SorCS2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.837 53.837 2 4.3704E-09 52153 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.46 96.414 247970000 0 0 0 26351000 35947000 19096000 42107000 0 26945000 0 29137000 28664000 39718000 49155 647 45899 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116.85 3 0.00098043 120284 QUIQUE_C1403_190116_001 41.703 38.979 70551000 0 0 0 35279000 0 35272000 0 0 0 0 0 0 0 49160 2339 45904 442205;442206;442207 564571;564572;564573 564572 3 VTVVDVNESR Unmodified 1116.5775 0.57750184 1588 O60701;D6RHF4;E9PBD2;E7ER95;E7ER83;E7ETF4;E7EV97 UGDH UDP-glucose 6-dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 34.87 34.87 2 0.033784 30210 QUIQUE_C1403_190116_001 62.463 32.278 67922000 0 0 0 41286000 0 26636000 0 0 0 0 0 0 0 49161 1588 45905 442208;442209 564574;564575 564574 2 VTVVEAQGK Unmodified 929.5182 0.51819605 3267 Q5EBL4;A0A1B0GVV3 RILPL1 RILP-like protein 1 yes no 0 0 0 1 16.604 16.604 2 0.019692 8806 QUIQUE_DMIX4_190116_001 63.419 20.82 4884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4884000 0 0 0 49162 3267 45906 442210 564576 564576 1 VTVVFSTVFK Unmodified 1125.6434 0.64339656 1486 O15144 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 104.51 104.51 2 0.02277 108156 QUIQUE_C1218_190116_001 57.55 35.464 11307000 11307000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49163 1486 45907 442211 564577 564577 1 VTWAHPEFGQVLASCSFDR Unmodified 2206.0266 0.026572462 1331 K7ELV2;Q96EE3;K7EP88;K7EPZ5 SEH1L Nucleoporin SEH1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 115.67 115.67 3 0.00047438 119559 QUIQUE_C1403_190116_001 59.512 43.746 497870000 0 38990000 49358000 58293000 58778000 0 49107000 41917000 37340000 0 39374000 75276000 49436000 49164 1331 45908 442212;442213;442214;442215;442216;442217;442218;442219;442220;442221;442222 564578;564579;564580;564581;564582;564583;564584;564585;564586;564587;564588 564580 8 VTWAPPPSIDLTNFLVR Unmodified 1925.0411 0.041083539 1833 P02751;H0Y7Z1 FN1 Fibronectin;Anastellin;Ugl-Y1;Ugl-Y2;Ugl-Y3 yes no 0 0 0 1 159.48 159.48 2 0.0065266 166084 QUIQUE_C1438_190116_001 72.29 64.92 83970000 0 0 0 0 83970000 0 0 0 0 0 0 0 0 49165 1833 45909 442223 564589 564589 1 VTWDGHSGSMAR Unmodified 1302.5775 0.57751861 3141 Q15459 SF3A1 Splicing factor 3A subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 29.283 29.283 3 0.0014481 24147 QUIQUE_DMIX1_190116_001 56.122 46.69 53939000 0 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186100000 49168 3999 45912 442238;442239;442240;442241;442242;442243;442244;442245;442246;442247;442248;442249;442250 564605;564606;564607;564608;564609;564610;564611;564612;564613;564614;564615;564616;564617;564618;564619;564620;564621;564622 564618 17 VTWHPLSADEGLHK Unmodified 1588.7998 0.79979063 2897 Q05707;J3QT83 COL14A1 Collagen alpha-1(XIV) chain yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 1 48.287 48.287 3;4 0.0026174 46117 QUIQUE_C1218_190116_001 47.037 29.531 421120000 78236000 0 0 158620000 90934000 0 23156000 0 0 32253000 0 0 37922000 49169 2897 45913 442251;442252;442253;442254;442255;442256;442257;442258;442259 564623;564624;564625;564626;564627;564628;564629;564630;564631 564623 8 VTWLAETTHALPIPVICVTYEHLITKPVLGK Unmodified 3498.9313 0.93126909 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 1 1 148.92 148.92 5 0.011275 154703 QUIQUE_C1368_190116_001 25.361 23.719 41153000 0 0 41153000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49170 1929 45914 442260 564632 564632 1 VTWLAETTHALPIPVICVTYEHLITKPVLGKDEDFK Unmodified 4133.1911 0.19112518 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 2 1 1 145.65 145.65 5 0.015702 150962 QUIQUE_DMIX3_190116_001 23.559 19.712 131810000 0 0 0 0 0 0 0 0 76462000 0 0 55348000 0 49171 1929 45915 442261;442262 564633;564634 564633 2 VTWRLPPELIPR Unmodified 1475.8613 0.86126868 2101 P16144 ITGB4 Integrin beta-4 yes yes 0 0 1 1 80.916 80.916 3 0.044076 81194 QUIQUE_DMIX1_190116_001 45.077 25.866 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49172 2101 45916 442263 564635 564635 1 VTWTEAAGSIR Unmodified 1189.6091 0.60913632 1755 O95825;A6NND8;A6NHJ8;A6NMA8;C9JAL0;H7C3I5;C9K0F7;F8WF64;C9JZK8;H7C3S0;C9JQD0 CRYZL1 Quinone oxidoreductase-like protein 1 yes no 0 0 0 1 72.029 72.029 2 0.0016576 71476 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.048 50.851 44728000 0 0 0 0 0 0 0 44728000 0 0 0 0 0 49173 1755 45917 442264 564636 564636 1 VTYCPTEPGTYIINIK Unmodified 1867.939 0.93898623 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 108.44 108.44 2 0.013933 112451 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.78 64.875 43679000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 43679000 49174 3061 45918 442265 564637 564637 0 VTYHPDGPEGQAYDVDFTPPFR Unmodified 2507.1394 0.13935361 3103 Q15046 KARS Lysine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 1 1 1 1 1 1 111.15 111.15 3 4.8755E-15 115134 QUIQUE_C1368_190116_001 114.02 110.22 1062300000 94398000 103200000 99056000 66956000 87726000 106600000 83175000 54932000 76132000 46527000 82990000 82827000 77750000 49175 3103 45919 442266;442267;442268;442269;442270;442271;442272;442273;442274;442275;442276;442277;442278;442279;442280;442281 564638;564639;564640;564641;564642;564643;564644;564645;564646;564647;564648;564649;564650;564651;564652;564653;564654;564655;564656 564640 19 VTYLVHNFEEGGGVAMGMYNQDK Unmodified 2558.157 0.15699429 1662 O75874 IDH1 Isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 109.54 109.54 3 8.3976E-06 112001 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442309;442310;442311;442312;442313;442314;442315;442316;442317;442318;442319 564687;564688;564689;564690;564691;564692;564693;564694;564695;564696;564697 564693 11 VTYTPMAPGSYLISIK Unmodified 1739.9168 0.91679423 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 123.73 123.73 2 0.013053 126733 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.034 38.799 724930000 0 96874000 135710000 118730000 0 0 0 100540000 75529000 51146000 146400000 0 0 49185 2178 45927 442320;442321;442322;442323;442324;442325;442326 564698;564699;564700;564701;564702;564703;564704 564701 7 VTYTPMAPGSYLISIK Oxidation (M) 1755.9117 0.91170885 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 1 0 1 1 1 1 110.6 110.6 2 0.009805 114095 QUIQUE_DMIX3_190116_001 53.034 32.257 215830000 0 0 0 0 50002000 0 0 57584000 52596000 0 0 55650000 0 49186 2178 45927 442327;442328;442329;442330 564705;564706;564707;564708 564707 1534 3 VTYVVLDEADR Unmodified 1278.6456 0.6455814 234 A0A0C4DG89;Q7L014 DDX46 Probable ATP-dependent 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NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 35.059 35.059 2 0.017081 30491 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.596 41.82 27471000 0 0 0 0 0 0 0 27471000 0 0 0 0 0 49190 2280 45929 442340;442341 564719;564720;564721 564720 1656;1657 3 VVAAPQRPGTEPQPEMPDTVLQSETLK Unmodified 2917.4855 0.48552229 1713 O95202 LETM1 LETM1 and EF-hand domain-containing protein 1, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 90.104 90.104 3 1.827E-30 93050 QUIQUE_C1218_190116_001 112.99 105.31 377820000 116530000 62532000 57028000 35091000 0 48815000 0 0 31372000 26457000 0 0 0 49191 1713 45930 442342;442343;442344;442345;442346;442347;442348;442349 564722;564723;564724;564725;564726;564727;564728;564729;564730;564731;564732 564722 10 VVACNLYPFVK Unmodified 1308.69 0.69002918 2339 P31939;C9JLK0 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 92.819 92.819 2 0.0012157 96862 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564756;564757;564758;564759;564760;564761;564762;564763;564764;564765;564766;564767;564768;564769;564770;564771;564772;564773;564774;564775;564776;564777;564778 564776 23 VVACTSAFLLWDPTKVPPR Unmodified 2156.1452 0.14523103 2299 P30043 BLVRB Flavin reductase (NADPH) yes yes 0 0 1 3 3 5 128.41 128.41 3 0.00095956 131487 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.564 53.466 264480000 0 0 0 0 0 0 0 91248000 66917000 0 106320000 0 0 49194 2299 45933 442376;442377;442378;442379;442380;442381;442382;442383;442384;442385;442386 564779;564780;564781;564782;564783;564784;564785;564786;564787;564788;564789 564779 7 VVAEGFDSANGINISPDDK Unmodified 1946.9222 0.92215019 300 A0A0J9YXF2;A0A0J9YYG4;Q15165;J3QT77;A0A0J9YYJ1 PON2 Serum paraoxonase/arylesterase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 92.026 92.026 2 2.4674E-07 88947 QUIQUE_DMIX4_190116_001 128.9 115.24 192450000 42079000 0 0 41164000 0 0 0 0 0 109210000 0 0 0 49195 300 45934 442387;442388;442389 564790;564791;564792;564793 564793 4 VVAEGFDSANGINISPDDKYIYVADILAHEIHVLEK Unmodified 3954.0051 0.0050985481 300 A0A0J9YXF2;A0A0J9YYG4;Q15165;J3QT77;A0A0J9YYJ1 PON2 Serum paraoxonase/arylesterase 2 yes no 0 0 1 1 2 2 160.2 160.2 4;5 1.0347E-23 166766 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.91 80.3 1442400000 0 0 0 0 0 0 0 279970000 0 0 857560000 304890000 0 49196 300 45935 442390;442391;442392;442393;442394 564794;564795;564796;564797;564798 564798 5 VVAELQAGTCFINNYNVSPVELPFGGYK Unmodified 3085.5219 0.5219078 2522 P49189 ALDH9A1 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 2 1 1 1 156.86 156.86 3 1.0245E-19 161187 QUIQUE_C1277_190116_001 92.819 86.455 938610000 0 111080000 146690000 72859000 99820000 70096000 0 87089000 115100000 56658000 0 102090000 77139000 49197 2522 45936 442395;442396;442397;442398;442399;442400;442401;442402;442403;442404;442405;442406 564799;564800;564801;564802;564803;564804;564805;564806;564807;564808;564809;564810;564811;564812;564813;564814;564815;564816;564817;564818;564819;564820 564800 19 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2004.9945 0.99452728 3086 Q14764;H3BQK6 MVP Major vault protein yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 2 1 144.74 144.74 2;3 3.7302E-13 148749 QUIQUE_C1403_190116_001 151.7 139.14 565170000 11443000 65540000 92476000 89454000 75526000 77436000 57141000 0 0 41851000 0 0 54305000 49203 3086 45942 442465;442466;442467;442468;442469;442470;442471;442472;442473;442474;442475;442476 564916;564917;564918;564919;564920;564921;564922;564923;564924;564925;564926;564927;564928 564920 12 VVAGEVQVQR Unmodified 1083.6037 0.60365701 3787 Q969P0;C9J8Z4 IGSF8 Immunoglobulin superfamily member 8 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.39 25.39 2 0.0034764 19498 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.213 62.467 3397000000 261940000 266540000 322830000 0 348380000 219770000 484310000 0 238010000 132260000 312340000 238800000 571870000 49204 3787 45943 442477;442478;442479;442480;442481;442482;442483;442484;442485;442486;442487 564929;564930;564931;564932;564933;564934;564935;564936;564937;564938;564939 564936 7 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565061 1 VVAIQGVK Unmodified 812.51199 0.51198846 2723 P61328;C9JIN3;C9JUK8;C9JEN8;Q92915 FGF12;FGF14 Fibroblast growth factor 12;Fibroblast growth factor;Fibroblast growth factor 14 yes no 0 0 0 1 1 25.576 25.576 2 0.04028 19020 QUIQUE_C1576_190116_001 60.358 36.386 125070000 0 60196000 0 0 0 0 64877000 0 0 0 0 0 0 49210 2723 45949 442546;442547 565062;565063 565063 2 VVAIYDYTK Unmodified 1070.5648 0.56481189 157;226 B6VEX4;A0A0A0MRT6;Q8IZP0;E7EW77;E7EP65;A0A0C4DG21;F8WAL6;Q9NYB9;E9PEZ7;B7Z836;H0Y6B5 ABI1;ABI2 Abl interactor 1;Abl interactor 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.161 62.161 2 0.0037167 59096 QUIQUE_DMIX4_190116_001 90.657 63.527 2391500000 173990000 0 193480000 241620000 203190000 213090000 190900000 194920000 203120000 92358000 208310000 192020000 284470000 49211 157;226 45950 442548;442549;442550;442551;442552;442553;442554;442555;442556;442557;442558;442559 565064;565065;565066;565067;565068;565069;565070;565071;565072;565073;565074;565075 565072 6 VVALAEGR Unmodified 813.47085 0.47085192 3610 Q8N6T3;F8VWH9;F8W1U7;E5RHT6;E5RHC5;F8VWB3 ARFGAP1 ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 22.389 22.389 2 0.042552 15282 QUIQUE_C1403_190116_001 58.917 22.732 203670000 83223000 66690000 0 53761000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49212 3610 45951 442560;442561;442562 565076;565077;565078 565078 3 VVALEQSR Unmodified 900.50288 0.50288033 3116 Q15126 PMVK Phosphomevalonate kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 20.532 20.532 2 0.014268 13131 QUIQUE_C1277_190116_001 133.81 90.898 454540000 0 118740000 0 0 0 0 0 120980000 139320000 75495000 0 0 0 49213 3116 45952 442563;442564;442565;442566 565079;565080;565081;565082 565079 3 VVALIGVATAADTLVTK Unmodified 1640.9713 0.97127264 4297 Q9NUJ1 ABHD10 Mycophenolic acid acyl-glucuronide esterase, mitochondrial yes yes 0 0 0 3 3 2 2 3 3 3 4 3 2 2 2 2 133.5 133.5 2;3 7.5747E-23 137786 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.43 99.819 3819400000 388260000 307580000 323680000 259760000 288860000 350630000 313310000 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VVALSMSPVDDTFISGSLDK Unmodified 2080.0398 0.039822489 3413 Q6UXN9 WDR82 WD repeat-containing protein 82 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.06 138.06 2 4.9195E-07 142596 QUIQUE_DMIX7_190116_001 123.38 109.7 453520000 0 0 55900000 54251000 46699000 45070000 0 39246000 44055000 0 70206000 57695000 40395000 49216 3413 45955 442605;442606;442607;442608;442609;442610;442611;442612;442613 565133;565134;565135;565136;565137;565138;565139;565140;565141;565142 565141 10 VVANSGFDVLCHALESYTTLPYHLR Unmodified 2861.417 0.4170488 3542 Q8IWW8 ADHFE1 Hydroxyacid-oxoacid transhydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 153.05 153.05 4 0.00048843 157861 QUIQUE_DMIX3_190116_001 41.482 38.905 696060000 0 0 0 0 46185000 64119000 64184000 0 120090000 0 0 209000000 192470000 49217 3542 45956 442614;442615;442616;442617;442618;442619 565143;565144;565145;565146;565147;565148 565146 6 VVAPTISSPVCQEQLVEAGR Unmodified 2139.0994 0.099403054 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 1 1 1 2 1 1 2 96.645 96.645 2;3 3.2308E-37 99102 QUIQUE_C1368_190116_001 150.34 123.33 1441600000 68776000 141030000 239330000 230820000 141280000 70846000 68073000 43427000 118800000 26107000 128560000 0 164560000 49218 4600 45957 442620;442621;442622;442623;442624;442625;442626;442627;442628;442629;442630;442631;442632;442633;442634;442635;442636 565149;565150;565151;565152;565153;565154;565155;565156;565157;565158;565159;565160;565161;565162;565163;565164;565165;565166;565167;565168;565169;565170 565153 22 VVAQGTGSTTDLEAALSIAQTYALSQL Unmodified 2707.3916 0.39160513 3278 Q5JTZ9 AARS2 Alanine--tRNA ligase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 176.56 176.56 3 0.00042829 182229 QUIQUE_C1438_190116_001 40.533 36.551 65581000 0 0 0 0 7851900 0 0 0 57729000 0 0 0 0 49219 3278 45958 442637;442638 565171;565172 565171 2 VVAQGVGIPEDSIFTMADR Unmodified 2003.9986 0.99862638 1834 P02760;S4R3Y4;S4R471 AMBP Protein AMBP;Alpha-1-microglobulin;Inter-alpha-trypsin inhibitor light chain;Trypstatin yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 130.36 130.36 2;3 1.3223E-07 134972 QUIQUE_C1368_190116_001 108.17 88.074 357620000 65315000 126020000 54734000 0 57879000 0 0 0 0 20494000 0 33184000 0 49220 1834 45959 442639;442640;442641;442642;442643;442644;442645 565173;565174;565175;565176;565177;565178;565179 565176 6 VVAQGVGIPEDSIFTMADR Oxidation (M) 2019.9935 0.993541 1834 P02760;S4R3Y4;S4R471 AMBP Protein AMBP;Alpha-1-microglobulin;Inter-alpha-trypsin inhibitor light chain;Trypstatin yes no 0 1 0 1 113.77 113.77 2 5.3066E-05 117181 QUIQUE_C1277_190116_001 91.62 77.363 20940000 0 20940000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49221 1834 45959 442646 565180 565180 1052 1 VVAQSTNSEEIIEGEYNTVMLAIGR Unmodified 2722.3484 0.34836011 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 2 2 1 1 2 1 2 1 1 2 2 2 162.2 162.2 2;3 6.9836E-57 164325 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.94 146.24 1944400000 139450000 142210000 131540000 110600000 114770000 107760000 157590000 194400000 172710000 35482000 231060000 187160000 219700000 49222 22 45960 442647;442648;442649;442650;442651;442652;442653;442654;442655;442656;442657;442658;442659;442660;442661;442662;442663;442664;442665;442666;442667 565181;565182;565183;565184;565185;565186;565187;565188;565189;565190;565191;565192;565193;565194;565195;565196;565197;565198;565199;565200;565201;565202;565203;565204 565194 23 VVAQYAQR Unmodified 933.50321 0.50321468 3391 Q6PGP7 TTC37 Tetratricopeptide repeat protein 37 yes yes 0 0 0 1 16.96 16.96 2 0.045047 9132 QUIQUE_DMIX4_190116_001 57.335 10.533 7020500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7020500 0 0 0 49223 3391 45961 442668 565205 565205 1 VVASGPGLEHGK Unmodified 1149.6142 0.6142217 1628 O75369;E7EN95 FLNB Filamin-B yes no 0 0 0 1 1 14.252 14.252 2;3 0.0030624 6602 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.557 42.238 43157000 0 0 0 0 0 0 0 34733000 0 0 0 8424000 0 49224 1628 45962 442669;442670 565206;565207 565206 2 VVASSTGHLADSSR Unmodified 1385.6899 0.68990583 1056 F8W9F9;H0Y7T5;Q9Y3S1;H0Y493;H0Y7J9;E9PCD1 WNK2 Serine/threonine-protein kinase WNK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 14.907 14.907 2;3 0.0033912 7844 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.001 66.672 262770000 0 0 0 0 24244000 0 189530000 0 0 0 0 0 48995000 49225 1056 45963 442671;442672;442673;442674 565208;565209;565210;565211 565210 3 VVATNTLGR Unmodified 929.52943 0.52942943 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 20.783 20.783 2 0.01521 13676 QUIQUE_C1438_190116_001 67.464 19.615 10025000000 0 1334100000 1600000000 1107700000 1633500000 0 1836000000 702720000 0 341470000 1469600000 0 0 49226 2948 45964 442675;442676;442677;442678;442679;442680;442681;442682 565212;565213;565214;565215;565216;565217;565218;565219 565215 8 VVAVNNIGR Unmodified 940.54541 0.54541385 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.762 28.762 2 0.00049109 23950 QUIQUE_C1218_190116_001 132.29 110.05 493090000 60390000 58347000 41114000 46342000 50308000 40764000 56226000 45615000 0 0 0 56808000 37173000 49227 987 45965 442683;442684;442685;442686;442687;442688;442689;442690;442691;442692 565220;565221;565222;565223;565224;565225;565226;565227;565228;565229;565230 565220 11 VVCAVATALR Unmodified 1058.5906 0.59064948 855;928 E7EPC8;Q9UQB3;B4DRK2;E9PHB5 CTNND2 Catenin delta-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.673 46.673 2 0.0021062 44225 QUIQUE_C1576_190116_001 91.783 58.52 1590000000 213910000 176230000 150230000 181170000 176950000 134990000 157290000 0 0 0 166060000 108340000 124840000 49228 855;928 45966 442693;442694;442695;442696;442697;442698;442699;442700;442701;442702 565231;565232;565233;565234;565235;565236;565237;565238;565239;565240 565237 10 VVCQYLK Unmodified 908.47897 0.47897377 2455 P42785;E9PIG4 PRCP Lysosomal Pro-X carboxypeptidase yes no 0 0 0 1 1 29.238 29.238 2 0.040182 23927 QUIQUE_C1218_190116_001 83.087 59.23 103050000 46028000 57022000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49229 2455 45967 442703;442704 565241;565242 565241 2 VVCVGMNYVDHCK Unmodified 1579.6945 0.69453898 3860;3380 Q6P2I3;Q96GK7;C9JGM0 FAHD2B;FAHD2A Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2B;Fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2A no no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 49.26 49.26 2;3 0.00032838 46433 QUIQUE_C1368_190116_001 110.38 99.162 512600000 0 97649000 108560000 67610000 60215000 78155000 71694000 0 0 28718000 0 0 0 49230 3380;3860 45968 442705;442706;442707;442708;442709;442710;442711;442712;442713 565243;565244;565245;565246;565247;565248;565249;565250;565251 565246 9 VVDALGNAIDGK Unmodified 1170.6245 0.62445203 2243;1351 K7ERX7;K7EQH4;P25705;K7EK77;K7ENJ4;K7EJP1 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 0 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 2 2 2 58.571 58.571 2 3.5974E-10 59689 QUIQUE_DMIX8_190116_001 157.24 112.8 51080000000 5567900000 4655100000 4759300000 3025800000 3592900000 4360900000 4173600000 2385100000 3771200000 1907100000 4667100000 3968600000 4245200000 49231 1351;2243 45969 442714;442715;442716;442717;442718;442719;442720;442721;442722;442723;442724;442725;442726;442727;442728;442729;442730;442731;442732;442733;442734 565252;565253;565254;565255;565256;565257;565258;565259;565260;565261;565262;565263;565264;565265;565266;565267;565268;565269;565270;565271;565272;565273;565274;565275;565276;565277;565278;565279;565280;565281;565282;565283;565284;565285;565286;565287;565288;565289;565290 565289 37 VVDALGNAIDGKGPIGSK Unmodified 1709.9312 0.93119874 2243;1351 K7ERX7;P25705;K7EK77;K7ENJ4;K7EJP1 ATP5A1 ATP synthase subunit alpha, mitochondrial no no 0 0 1 2 2 2 1 2 69.226 69.226 2;3 1.5348E-16 69211 QUIQUE_DMIX1_190116_001 177.93 152.63 2790000000 0 0 0 0 0 0 0 1165400000 491640000 0 359890000 375940000 397120000 49232 1351;2243 45970 442735;442736;442737;442738;442739;442740;442741;442742;442743 565291;565292;565293;565294;565295;565296;565297;565298;565299;565300;565301;565302;565303;565304 565293 14 VVDDELATR Unmodified 1016.5138 0.51383895 1399 O00330;H0YD97 PDHX Pyruvate dehydrogenase protein X component, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 29.516 29.516 2 0.0035378 23959 QUIQUE_C1563_190116_001 91.069 66.078 498800000 0 0 0 0 0 269490000 0 0 0 0 0 229300000 0 49233 1399 45971 442744;442745 565305;565306 565305 2 VVDEHESVEQSR Unmodified 1412.6532 0.65318598 1346 K7EQL6;Q8NFA0 USP32 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 32 yes no 0 0 0 1 1 14.654 14.654 3 0.0059583 6905 QUIQUE_C1218_190116_001 53.448 48.353 36567000 18165000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18402000 0 0 49234 1346 45972 442746;442747 565307;565308;565309 565307 3 VVDELNLLHTELAK Unmodified 1592.8774 0.87737225 3645 Q8NEU8;F8VXB0;F8VWV2 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 1 2 2 98.991 98.991 2;3 9.1967E-06 101558 QUIQUE_C1277_190116_001 101.43 90.326 1342000000 116250000 92523000 99813000 81813000 121310000 116850000 142190000 84350000 48217000 34730000 110190000 114520000 179270000 49235 3645 45973 442748;442749;442750;442751;442752;442753;442754;442755;442756;442757;442758;442759;442760;442761;442762;442763;442764;442765;442766;442767;442768;442769 565310;565311;565312;565313;565314;565315;565316;565317;565318;565319;565320;565321;565322;565323;565324;565325;565326;565327;565328;565329;565330;565331;565332;565333;565334;565335 565312 24 VVDEREQMAISGGFIR Unmodified 1805.9094 0.90941744 2699 P60880 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 80.635 80.635 2;3 3.5186E-13 82896 QUIQUE_DMIX5_190116_001 107.34 85.125 855560000 0 38841000 0 0 59137000 0 0 179200000 117230000 0 91407000 111430000 258320000 49236 2699 45974 442770;442771;442772;442773;442774;442775;442776;442777 565336;565337;565338;565339;565340;565341;565342;565343;565344;565345;565346 565343 11 VVDEREQMAISGGFIR Oxidation (M) 1821.9043 0.90433206 2699 P60880 SNAP25 Synaptosomal-associated protein 25 yes yes 0 1 1 1 1 65.946 65.946 3 0.0053075 66941 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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442781;442782;442783;442784;442785;442786;442787;442788;442789;442790;442791;442792;442793;442794;442795;442796;442797;442798;442799;442800;442801;442802;442803;442804;442805;442806;442807;442808;442809;442810;442811;442812 565350;565351;565352;565353;565354;565355;565356;565357;565358;565359;565360;565361;565362;565363;565364;565365;565366;565367;565368;565369;565370;565371;565372;565373;565374;565375;565376;565377;565378;565379;565380;565381;565382;565383;565384 565354 32 VVDGAVGAQWLAEFRK Unmodified 1744.9261 0.92605378 1997 P10515;H0YDD4;E9PEJ4 DLAT Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial;Acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex yes no 0 0 1 2 1 1 111.39 111.39 3 6.1999E-05 114120 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.133 72.497 147100000 0 0 0 0 0 0 0 77193000 40784000 0 0 29118000 0 49240 1997 45977 442813;442814;442815;442816 565385;565386;565387;565388 565385 3 VVDHYENPR Unmodified 1127.536 0.53597137 599 F5H5N2;B4DNC9;B3KQ30;Q9H1K1 ISCU Iron-sulfur cluster assembly enzyme ISCU, mitochondrial yes no 0 0 0 1 13.433 13.433 3 0.025074 5438 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.556 24.98 7536200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7536200 0 0 0 49241 599 45978 442817 565389 565389 1 VVDLEGSLK Unmodified 958.53351 0.53351176 3576 Q8N1G4 LRRC47 Leucine-rich repeat-containing protein 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 53.315 53.315 2 0.022221 51400 QUIQUE_C1368_190116_001 61.602 36.679 365910000 0 0 147610000 0 0 0 0 0 90051000 0 0 0 128250000 49242 3576 45979 442818;442819;442820 565390;565391;565392 565390 3 VVDLLAPYAK Unmodified 1087.6277 0.6277465 1900 P06576;H0YH81;F8W079 ATP5B ATP synthase subunit beta, mitochondrial;ATP synthase subunit beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 89.995 89.995 2 0.0010709 92328 QUIQUE_C1277_190116_001 117.04 81.156 46849000000 4160200000 3289900000 4488200000 2809700000 2994500000 3763200000 3951700000 3137600000 4118200000 1513700000 4661400000 3678300000 4282700000 49243 1900 45980 442821;442822;442823;442824;442825;442826;442827;442828;442829;442830;442831;442832;442833;442834 565393;565394;565395;565396;565397;565398;565399;565400;565401;565402;565403;565404;565405;565406;565407;565408;565409;565410;565411;565412;565413;565414;565415;565416;565417 565396 25 VVDLLVIK Unmodified 897.5899 0.58990443 251 A0A0C4DGS0;A0A2Y9D025;P56556;R4GN43 NDUFA6 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.647 90.647 2 0.020421 93666 QUIQUE_C1576_190116_001 76.774 12.567 4656500000 457670000 401850000 271570000 245490000 410300000 214510000 355280000 323120000 337470000 0 636470000 576280000 426510000 49244 251 45981 442835;442836;442837;442838;442839;442840;442841;442842;442843;442844;442845;442846 565418;565419;565420;565421;565422;565423;565424;565425;565426;565427;565428;565429;565430;565431 565424 14 VVDLMAHMASK Oxidation (M) 1216.5944 0.59441423 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 0 7 3 5 4 4 4 3 4 4 6 5 2 2 27.529 27.529 2;3 3.2049E-12 21612 QUIQUE_C1368_190116_001 160.75 139.31 20921000000 3462900000 1228400000 3570700000 2897100000 1127700000 1361400000 999940000 401640000 997090000 2048800000 1519500000 485260000 820510000 49245 1863 45982 442847;442848;442849;442850;442851;442852;442853;442854;442855;442856;442857;442858;442859;442860;442861;442862;442863;442864;442865;442866;442867;442868;442869;442870;442871;442872;442873;442874;442875;442876;442877;442878;442879;442880;442881;442882;442883;442884;442885;442886;442887;442888;442889;442890;442891;442892;442893;442894;442895;442896;442897;442898;442899 565432;565433;565434;565435;565436;565437;565438;565439;565440;565441;565442;565443;565444;565445;565446;565447;565448;565449;565450;565451;565452;565453;565454;565455;565456;565457;565458;565459;565460;565461;565462;565463;565464;565465;565466;565467;565468;565469;565470;565471;565472;565473;565474;565475;565476;565477;565478;565479;565480;565481;565482;565483;565484;565485;565486;565487;565488;565489;565490 565445 1088;1089 57 VVDLMAHMASK Unmodified 1200.5995 0.59949961 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 49.895 49.895 2;3 6.8099E-05 47553 QUIQUE_C1403_190116_001 135.55 120.29 71167000000 8564500000 8092400000 8176500000 8290400000 4331400000 6353900000 6105700000 2173100000 3278400000 2598000000 5746100000 3007700000 4448200000 49246 1863 45982 442900;442901;442902;442903;442904;442905;442906;442907;442908;442909;442910;442911;442912;442913;442914;442915;442916;442917;442918;442919;442920;442921;442922;442923;442924;442925 565491;565492;565493;565494;565495;565496;565497;565498;565499;565500;565501;565502;565503;565504;565505;565506;565507;565508;565509;565510;565511;565512;565513;565514;565515;565516;565517;565518;565519;565520;565521;565522;565523;565524;565525;565526;565527;565528;565529;565530;565531;565532;565533;565534;565535;565536;565537;565538;565539;565540;565541;565542;565543;565544;565545;565546 565506 56 VVDLMAHMASK 2 Oxidation (M) 1232.5893 0.58932885 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 2 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 16.118 16.118 2;3 0.00096999 8257 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.957 71.819 1782400000 0 144790000 0 0 111680000 0 140540000 59458000 123040000 977750000 127880000 97297000 0 49247 1863 45982 442926;442927;442928;442929;442930;442931;442932;442933;442934;442935;442936 565547;565548;565549;565550;565551;565552;565553;565554;565555;565556;565557;565558 565557 1088;1089 11 VVDLMAHMASKE 2 Oxidation (M) 1361.6319 0.63192195 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 2 1 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 18.311 18.311 2;3 0.00054864 10678 QUIQUE_C1438_190116_001 78.324 73.709 10882000000 385700000 825600000 737210000 156330000 679320000 445530000 569180000 1481600000 1542100000 557770000 467990000 1423300000 1610400000 49248 1863 45983 442937;442938;442939;442940;442941;442942;442943;442944;442945;442946;442947;442948;442949;442950;442951;442952;442953;442954;442955;442956;442957;442958;442959;442960 565559;565560;565561;565562;565563;565564;565565;565566;565567;565568;565569;565570;565571;565572;565573;565574;565575;565576;565577;565578;565579;565580;565581;565582 565567 1088;1089 20 VVDLMAHMASKE Unmodified 1329.6421 0.64209271 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 1 2 2 3 2 2 2 1 3 3 2 4 3 3 56.548 56.548 2;3 3.0338E-09 54198 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.96 138.37 72970000000 2086000000 5076400000 4818300000 4162100000 4046700000 2297800000 3201700000 9630400000 7974500000 660230000 10988000000 8521100000 9506800000 49249 1863 45983 442961;442962;442963;442964;442965;442966;442967;442968;442969;442970;442971;442972;442973;442974;442975;442976;442977;442978;442979;442980;442981;442982;442983;442984;442985;442986;442987;442988;442989;442990;442991;442992 565583;565584;565585;565586;565587;565588;565589;565590;565591;565592;565593;565594;565595;565596;565597;565598;565599;565600;565601;565602;565603;565604;565605;565606;565607;565608;565609;565610;565611;565612;565613;565614;565615;565616;565617;565618;565619;565620;565621;565622;565623;565624;565625;565626;565627;565628;565629;565630;565631;565632;565633;565634;565635;565636;565637;565638;565639;565640;565641;565642;565643;565644;565645;565646;565647;565648;565649 565606 67 VVDLMAHMASKE Oxidation (M) 1345.637 0.63700733 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 1 1 3 5 2 3 2 4 6 4 2 4 5 3 30.301 30.301 2;3 0.00028287 26386 QUIQUE_DMIX3_190116_001 86.772 83.998 25776000000 517270000 1987200000 2714200000 761260000 925010000 480490000 1656900000 3746600000 2215900000 165850000 4385500000 4123100000 2096400000 49250 1863 45983 442993;442994;442995;442996;442997;442998;442999;443000;443001;443002;443003;443004;443005;443006;443007;443008;443009;443010;443011;443012;443013;443014;443015;443016;443017;443018;443019;443020;443021;443022;443023;443024;443025;443026;443027;443028;443029;443030;443031;443032;443033;443034;443035;443036 565650;565651;565652;565653;565654;565655;565656;565657;565658;565659;565660;565661;565662;565663;565664;565665;565666;565667;565668;565669;565670;565671;565672;565673;565674;565675;565676;565677;565678;565679;565680;565681;565682;565683;565684;565685;565686;565687;565688;565689;565690;565691;565692;565693;565694;565695 565680 1088;1089 39 VVDNEGTLQLK Unmodified 1214.6507 0.65066678 4137 Q9H1Z4 WDR13 WD repeat-containing protein 13 no no 0 0 0 1 1 45.135 45.135 2 0.011443 41238 QUIQUE_C1277_190116_001 88.136 55.994 24399000 24399000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49251 4137 45984 443037;443038 565696;565697 565697 1 VVDNPIYLSDMGAALTGAESHELQDVLEETNIPK Unmodified 3667.7927 0.79272251 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.09 166.09 3;4 0 170481 QUIQUE_DMIX3_190116_001 256.21 246.83 2883200000 211230000 221730000 649850000 172600000 238260000 91364000 106790000 181660000 220730000 42756000 144400000 270340000 331490000 49252 1324 45985 443039;443040;443041;443042;443043;443044;443045;443046;443047;443048;443049;443050;443051;443052;443053 565698;565699;565700;565701;565702;565703;565704;565705;565706;565707;565708;565709;565710;565711;565712;565713;565714 565710 17 VVDNPIYLSDMGAALTGAESHELQDVLEETNIPK Oxidation (M) 3683.7876 0.78763713 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 154.58 154.58 3 7.4658E-30 160078 QUIQUE_C1368_190116_001 91.603 82.912 99547000 0 20423000 44418000 34707000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49253 1324 45985 443054;443055;443056 565715;565716;565717 565716 751 3 VVDPLAFTDVFVALGPQHR Unmodified 2080.1106 0.11056009 3493 Q86UW8 HAPLN4 Hyaluronan and proteoglycan link protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 155.57 155.57 3 7.6122E-08 160842 QUIQUE_C1368_190116_001 104.2 87.511 112800000 16945000 23981000 18410000 14774000 0 0 0 17117000 0 0 0 0 21573000 49254 3493 45986 443057;443058;443059;443060;443061;443062 565718;565719;565720;565721;565722;565723 565720 6 VVDSLAPSITNVLVQGK Unmodified 1738.9829 0.98289996 1249 I3L213 PHKB yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 120.15 120.15 2 1.4206E-12 123924 QUIQUE_C1277_190116_001 125.36 97.877 600510000 43294000 35225000 56834000 40380000 67000000 54475000 49457000 48421000 56672000 27628000 65586000 55535000 0 49255 1249 45987 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49258 4547 45989 443077 565738 565738 1 VVDTFQDYFGVCSEPVIK Unmodified 2102.003 0.0030430525 2632 P53677;E7ER80;E5RI83 AP3M2 AP-3 complex subunit mu-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 134.95 134.95 2 8.5585E-31 140629 QUIQUE_C1576_190116_001 152.16 139.6 341390000 47500000 67577000 0 39532000 43589000 34960000 39599000 0 0 0 0 34528000 34105000 49259 2632 45990 443078;443079;443080;443081;443082;443083;443084;443085 565739;565740;565741;565742;565743;565744;565745;565746;565747 565745 9 VVDTLYDGK Unmodified 1008.5128 0.51277632 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 1 2 1 37.032 37.032 2 0.0062856 32491 QUIQUE_C1563_190116_001 84.743 38.08 1251400000 95884000 96854000 94466000 131040000 132680000 69135000 194690000 135710000 0 0 129220000 0 171680000 49260 345 45991 443086;443087;443088;443089;443090;443091;443092;443093;443094;443095;443096;443097 565748;565749;565750;565751;565752;565753;565754;565755;565756;565757;565758;565759;565760;565761 565753 12 VVDTLYNGK Unmodified 1007.5288 0.52876073 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 32.17 32.17 2 0.015357 26488 QUIQUE_DMIX5_190116_001 97.093 50.723 38367000 0 0 0 0 0 0 0 38367000 0 0 0 0 0 49261 1074 45992 443098;443099;443100;443101 565762;565763;565764;565765 565764 4 VVDVIGAHYPGTHSAK Unmodified 1649.8526 0.85255449 2649 P54803;A0A087WX10;G3V255 GALC Galactocerebrosidase yes no 0 0 0 1 1 34.114 34.114 3 0.00090376 28547 QUIQUE_C1368_190116_001 51.193 40.997 81944000 46464000 0 35480000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49262 2649 45993 443102;443103 565766;565767 565767 2 VVDVIGTK Unmodified 829.49092 0.49091866 2331 P31323 PRKAR2B cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 29.414 29.414 2 0.014384 24646 QUIQUE_C1218_190116_001 135.84 73.845 1831800000 314400000 270850000 0 228310000 0 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1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.074 86.074 2 1.7632E-241 89085 QUIQUE_C1438_190116_001 270.8 266 724820000 86211000 59459000 24136000 49092000 88320000 65074000 60055000 0 81215000 23283000 39246000 78437000 70295000 49265 4130 45996 443125;443126;443127;443128;443129;443130;443131;443132;443133;443134;443135;443136 565804;565805;565806;565807;565808;565809;565810;565811;565812;565813;565814;565815;565816 565809 13 VVDYTTAK Unmodified 895.4651 0.46509784 2763 P62820;E7END7 RAB1A Ras-related protein Rab-1A yes no 0 0 0 1 18.405 18.405 2 0.027186 10704 QUIQUE_DMIX4_190116_001 69.905 49.35 24178000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24178000 0 0 0 49266 2763 45997 443137 565817 565817 1 VVECQLETHNRK Unmodified 1511.7515 0.75146023 988 F5GWT4;Q9H4A3 WNK1 Serine/threonine-protein kinase WNK1 yes no 0 0 1 1 10.415 10.415 3 0.0026589 2798 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.674 51.304 5053700 0 0 0 0 0 0 0 5053700 0 0 0 0 0 49267 988 45998 443138 565818 565818 1 VVEDGILK Unmodified 871.50148 0.50148335 2369 P35221;G3XAM7;E5RIB1;E5RJ41 CTNNA1 Catenin alpha-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 37.362 37.362 2 0.018957 33038 QUIQUE_C1403_190116_001 79.116 24.591 344590000 0 0 0 61402000 0 58515000 37230000 0 49679000 0 0 57948000 79817000 49268 2369 45999 443139;443140;443141;443142;443143;443144 565819;565820;565821;565822;565823;565824 565819 6 VVEDIEYLK Unmodified 1106.5859 0.58594126 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;H7C2W5;H7C1Y7;H7C2X4 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 69.539 69.539 2 0.0029423 69505 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.439 65.302 1022700000 210390000 172890000 98824000 95792000 0 110150000 0 137030000 83973000 113710000 0 0 0 49269 64 46000 443145;443146;443147;443148;443149;443150;443151;443152;443153 565825;565826;565827;565828;565829;565830;565831;565832;565833;565834 565830 7 VVEEAPSIFLDAETR Unmodified 1674.8465 0.84646606 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 109.81 109.81 2 1.0561E-05 114525 QUIQUE_C1218_190116_001 123.84 111.62 386820000 99829000 71013000 131420000 84560000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49270 1881 46001 443154;443155;443156;443157 565835;565836;565837;565838;565839 565836 5 VVEEAPSIFLDAETRR Unmodified 1830.9476 0.94757708 1881 P05165;A0A1B0GU58;A0A1B0GUX9;A0A1B0GWI4;A0A1B0GWA1 PCCA Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 89.985 89.985 3 9.4386E-07 91915 QUIQUE_DMIX8_190116_001 105.14 87.885 249860000 0 0 0 0 0 0 0 50733000 46255000 0 50946000 50609000 51315000 49271 1881 46002 443158;443159;443160;443161;443162 565840;565841;565842;565843;565844 565844 5 VVEELTR Unmodified 844.46543 0.46543219 3179 Q16531 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 23.418 23.418 2 0.024917 16773 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.068 56.799 542750000 0 0 0 0 158440000 0 147610000 0 99583000 0 0 0 137120000 49272 3179 46003 443163;443164;443165;443166 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443205;443206;443207;443208;443209;443210;443211;443212;443213;443214;443215;443216;443217;443218;443219;443220;443221;443222;443223;443224;443225;443226;443227 565906;565907;565908;565909;565910;565911;565912;565913;565914;565915;565916;565917;565918;565919;565920;565921;565922;565923;565924;565925;565926;565927;565928;565929;565930;565931;565932 565917 21 VVEIVDEK Unmodified 929.50696 0.50696266 3397 Q6PKG0;A0A0B4J210;E5RH50;H0YC73;H0YBW1 LARP1 La-related protein 1 yes no 0 0 0 1 31.038 31.038 2 0.063598 25898 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.464 21.443 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49280 3397 46011 443228 565933 565933 1 VVENLQDDFDFNYK Unmodified 1744.7944 0.79443049 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 114.43 114.43 2 3.4727E-06 119322 QUIQUE_C1576_190116_001 107.85 93.941 254300000 0 50446000 0 32273000 0 0 0 45738000 40452000 41984000 43406000 0 0 49281 2427 46012 443229;443230;443231;443232;443233;443234;443235;443236 565934;565935;565936;565937;565938;565939;565940;565941;565942 565936 7 VVEQMCITQYER Unmodified 1554.717 0.71704856 517 A2A2V1;P04156 PRNP Major prion protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.894 71.894 2 6.2401E-20 71964 QUIQUE_C1277_190116_001 194.54 171.22 5146200000 413400000 486440000 553300000 462270000 504870000 374830000 666280000 322240000 389200000 97845000 520010000 355510000 0 49282 517 46013 443237;443238;443239;443240;443241;443242;443243;443244;443245;443246;443247;443248 565943;565944;565945;565946;565947;565948;565949;565950;565951;565952;565953;565954;565955;565956 565944 14 VVEQMCITQYER Oxidation (M) 1570.712 0.71196318 517 A2A2V1;P04156 PRNP Major prion protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 50.001 50.001 2 0.00062267 48783 QUIQUE_C1438_190116_001 97.813 85.766 219470000 0 0 63586000 0 67010000 0 0 0 0 0 46711000 0 42167000 49283 517 46013 443249;443250;443251;443252;443253;443254;443255 565957;565958;565959;565960;565961;565962;565963 565959 359 5 VVEREEAVPEASPVTQAGASVITVETVIQENVGAQK Unmodified 3733.9374 0.93741291 933;1529 E9PHY5;O43491;Q6R5J7;E9PMV8 EPB41L2 Band 4.1-like protein 2 no no 0 0 1 1 1 1 1 146.88 146.88 3 6.4409E-23 152012 QUIQUE_DMIX3_190116_001 77.308 71.134 258190000 0 0 0 0 0 0 0 0 82106000 0 68215000 53110000 54758000 49284 933;1529 46014 443256;443257;443258;443259 565964;565965;565966;565967;565968 565964 4 VVESCQAEVNK Unmodified 1261.5973 0.597251 3096 Q15018 FAM175B BRISC complex subunit Abro1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 15.702 15.702 2 4.25E-05 7777 QUIQUE_C1403_190116_001 137.98 106.22 390540000 47544000 54015000 59302000 54419000 0 45764000 37516000 0 0 26252000 65725000 0 0 49285 3096 46015 443260;443261;443262;443263;443264;443265;443266;443267 565969;565970;565971;565972;565973;565974;565975;565976 565972 8 VVESLDVGQDR Unmodified 1215.6095 0.60953025 2037 P12111;E7ENL6 COL6A3 Collagen alpha-3(VI) chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 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565992;565993;565994;565995;565996 565993 5 VVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKR Unmodified 3080.4947 0.49470677 2658 P55072;C9IZA5 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes no 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 1 1 1 94.62 94.62 3;4 1.4323E-108 96778 QUIQUE_C1368_190116_001 177.41 166.31 2226400000 216100000 194140000 234260000 345570000 329740000 271920000 339360000 0 0 0 67924000 72802000 154550000 49289 2658 46019 443285;443286;443287;443288;443289;443290;443291;443292;443293;443294;443295;443296;443297;443298;443299;443300 565997;565998;565999;566000;566001;566002;566003;566004;566005;566006;566007;566008;566009;566010;566011;566012;566013;566014 566000 18 VVETEDAYK Unmodified 1052.5026 0.50260556 3126 Q15286;F5H157 RAB35 Ras-related protein Rab-35 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 20.837 20.837 2 0.01031 13939 QUIQUE_DMIX3_190116_001 74.301 55.044 1069400000 251100000 0 0 0 0 0 244540000 0 193040000 0 0 171140000 209610000 49290 3126 46020 443301;443302;443303;443304;443305 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443686;443687;443688;443689;443690;443691;443692 566560;566561;566562;566563;566564;566565;566566 566565 7 VVHQDVAFTDPTLDSTEINVPQDILGIWVDPIDSTYQYIK Unmodified 4544.2639 0.26389201 2531 P49441;E7ET59;E7EUX4;E7ENF2 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes no 0 0 0 1 2 171.07 171.07 3;4 1.5105E-55 178330 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.24 99.805 279430000 0 0 0 0 0 0 0 0 68480000 0 210950000 0 0 49339 2531 46065 443693;443694;443695 566567;566568;566569;566570 566569 4 VVHSYEELEENYTR Unmodified 1766.8111 0.81114318 2026 P11498;E9PRE7 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 62.682 62.682 2;3 1.344E-10 61717 QUIQUE_C1368_190116_001 167.18 152.73 389700000 65195000 171060000 83588000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 69860000 49340 2026 46066 443696;443697;443698;443699;443700;443701;443702;443703 566571;566572;566573;566574;566575;566576;566577;566578 566574 7 VVHVNGYGK Unmodified 971.51886 0.51886475 1971 P09622;E9PEX6 DLD Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial;Dihydrolipoyl dehydrogenase yes no 0 0 0 1 13.973 13.973 2 0.0031765 6218 QUIQUE_DMIX1_190116_001 91.9 69.278 56566000 0 0 0 0 0 0 0 56566000 0 0 0 0 0 49341 1971 46067 443704 566579 566579 1 VVIDAFR Unmodified 818.46504 0.46503826 1411 O00487 PSMD14 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 59.077 59.077 2 0.023536 58716 QUIQUE_C1277_190116_001 99.919 63.332 338510000 0 108180000 117640000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 112680000 49342 1411 46068 443705;443706;443707 566580;566581;566582;566583 566581 3 VVIEACDELGIILAHTNLR Unmodified 2135.1409 0.14087394 2339 P31939 ATIC Bifunctional purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 2 142.45 142.45 3 1.9511E-11 148980 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.53 104.71 910570000 90940000 116090000 0 97925000 164880000 115330000 94718000 17589000 0 85138000 53177000 31527000 43256000 49343 2339 46069 443708;443709;443710;443711;443712;443713;443714;443715;443716;443717;443718;443719;443720;443721;443722;443723 566584;566585;566586;566587;566588;566589;566590;566591;566592;566593;566594;566595;566596;566597;566598;566599 566596 13 VVIEDEQLVLGASQEPVGR Unmodified 2037.0742 0.074234161 3365 Q6IBS0;D6RG15 TWF2 Twinfilin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 3 108.84 108.84 2;3 1.8253E-11 112212 QUIQUE_C1277_190116_001 151.56 129.9 789680000 34320000 35967000 40388000 100660000 56320000 75929000 54691000 52765000 0 28844000 92271000 95090000 122430000 49344 3365 46070 443724;443725;443726;443727;443728;443729;443730;443731;443732;443733;443734;443735;443736;443737;443738;443739;443740;443741 566600;566601;566602;566603;566604;566605;566606;566607;566608;566609;566610;566611;566612;566613;566614;566615;566616;566617;566618;566619;566620 566603 18 VVIEFNKDQLEEFKEAFELFDR Unmodified 2744.3697 0.36974748 2080 P14649;F8W1I5 MYL6B Myosin light chain 6B yes no 0 0 2 1 1 1 160.83 160.83 4 0.00847 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VVLAETTTAHATLTGLHYYHQDWSHAAAYVTVPPLR Unmodified 3989.0224 0.022420367 3984 Q9BPU6 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes yes 0 0 0 1 2 1 2 3 1 2 2 2 119.72 119.72 4;5;6 2.776E-32 122921 QUIQUE_DMIX7_190116_001 89.297 84.896 2027900000 0 103410000 0 145550000 0 0 140630000 178050000 405460000 48434000 431340000 370630000 204440000 49368 3984 46091 444429;444430;444431;444432;444433;444434;444435;444436;444437;444438;444439;444440;444441;444442;444443;444444 567615;567616;567617;567618;567619;567620;567621;567622;567623;567624;567625;567626;567627;567628;567629;567630;567631;567632;567633 567631 18 VVLAEVIQAFSAPENAVR Unmodified 1912.0418 0.04181182 992 F5GXW5;U3KQ07;Q99622 C12orf57 Protein C10 yes no 0 0 0 1 1 154.43 154.43 2;3 0.0082365 158933 QUIQUE_DMIX7_190116_001 24.367 18.938 21004000 0 6665100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 14339000 0 49369 992 46092 444445;444446 567634;567635 567635 1 VVLAGGVAPALFR Unmodified 1268.7605 0.760492 3495 Q86UX7;F5H1C6 FERMT3 Fermitin family homolog 3 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Putative adenosylhomocysteinase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.56 41.56 2 0.00037146 36866 QUIQUE_DMIX4_190116_001 158.08 66.499 23639000000 861820000 795230000 734620000 915300000 897030000 890200000 855830000 961290000 1148400000 12238000000 1214500000 991050000 1135700000 49383 1558 46106 444637;444638;444639;444640;444641;444642;444643;444644;444645;444646;444647;444648;444649 567917;567918;567919;567920;567921;567922;567923;567924;567925;567926;567927;567928;567929 567926 13 VVLLEDLASQVGLR Unmodified 1510.8719 0.87189295 3873 Q96HY6;A0A0A0MRX2 DDRGK1 DDRGK domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 1 1 147.97 147.97 2;3 0.00011444 152152 QUIQUE_C1403_190116_001 87.155 69.433 381400000 36231000 24094000 35538000 47208000 17375000 71726000 23374000 20070000 55806000 9266400 24658000 0 16053000 49384 3873 46107 444650;444651;444652;444653;444654;444655;444656;444657;444658;444659;444660;444661;444662;444663;444664;444665;444666;444667 567930;567931;567932;567933;567934;567935;567936;567937;567938;567939;567940;567941;567942;567943;567944;567945;567946;567947 567937 18 VVLLGEGCVGK Unmodified 1129.6165 0.61652988 4483 Q9UL25 RAB21 Ras-related protein Rab-21 yes yes 0 0 0 1 1 60.176 60.176 2 0.0012786 58688 QUIQUE_C1368_190116_001 87.308 45.859 199770000 0 0 147980000 0 0 0 0 0 0 51793000 0 0 0 49385 4483 46108 444668;444669 567948;567949 567948 1 VVLLGMDILSALVTR Unmodified 1598.9429 0.9429494 1060 F8WA11;Q7Z460 CLASP1 CLIP-associating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 171.27 171.27 2;3 9.56E-06 178439 QUIQUE_DMIX5_190116_001 128.85 105 475250000 13497000 0 28763000 7868600 18825000 0 144130000 20944000 32553000 4551700 117130000 71717000 15260000 49386 1060 46109 444670;444671;444672;444673;444674;444675;444676;444677;444678;444679;444680;444681 567950;567951;567952;567953;567954;567955;567956;567957;567958;567959;567960;567961;567962;567963 567960 14 VVLPIEAPIR Unmodified 1105.6859 0.68593008 1781 P00403 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0.28052723 3679 Q8TD22 SFXN5 Sideroflexin-5 yes yes 0 2 0 1 172.83 172.83 3 0.0091765 175312 QUIQUE_C1403_190116_001 40.52 24.928 9370600 0 0 0 9370600 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49389 3679 46111 444701 567996 567996 2707;2708;2709 1 VVLPMPILVLPPIVMSMLEK Oxidation (M) 2234.2856 0.28561261 3679 Q8TD22 SFXN5 Sideroflexin-5 yes yes 0 1 0 1 175.09 175.09 2 0.0050865 178693 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.546 44.416 24130000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24130000 0 49390 3679 46111 444702 567997 567997 2707;2708;2709 1 VVLPTFILEK Unmodified 1157.706 0.70599682 4061 Q9BXB4;H7C487;Q9BXB5 OSBPL11;OSBPL10 Oxysterol-binding protein-related protein 11;Oxysterol-binding protein;Oxysterol-binding protein-related protein 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 121.69 121.69 2 0.020211 125467 QUIQUE_C1403_190116_001 59.597 36.577 68288000 0 0 27422000 18271000 0 0 0 0 0 5423400 0 0 17171000 49391 4061 46112 444703;444704;444705;444706;444707 567998;567999;568000;568001;568002 567999 5 VVLPTFILEPR Unmodified 1282.7649 0.76490868 4083 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phosphodiesterase beta-3 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 104.16 104.16 2 0.017682 106464 QUIQUE_C1403_190116_001 76.827 39.668 25319000 0 10624000 0 0 0 0 0 10319000 0 4375400 0 0 0 49394 2863 46115 444720;444721;444722;444723;444724;444725;444726;444727;444728 568016;568017;568018;568019;568020;568021;568022;568023;568024 568019 9 VVLQAANADIQQAWVQDINQVLETQR Unmodified 2949.5308 0.530833 1212 H7BXZ5;J3QSW6;O60229 KALRN Kalirin yes no 0 0 0 1 1 2 1 166.08 166.08 3 1.0761E-17 170489 QUIQUE_DMIX8_190116_001 97.542 91.381 141770000 0 27353000 48269000 0 0 0 0 0 37817000 0 0 0 28330000 49395 1212 46116 444729;444730;444731;444732;444733 568025;568026;568027;568028;568029 568029 5 VVLQELR Unmodified 855.5178 0.51780212 3164;1244 Q15819;G3V113;I3L0A0;Q13404;G3V2F7;A0A0A0MSL3 UBE2V2;TMEM189-UBE2V1;UBE2V1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.266 43.266 2 0.0092409 39674 QUIQUE_C1368_190116_001 151.14 24.985 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568071;568072;568073;568074;568075;568076;568077;568078;568079;568080;568081;568082;568083;568084;568085;568086;568087 568087 16 VVLWGSDYSK Unmodified 1152.5815 0.58152458 1757 O95834;K7EIK7;A0A0C4DGQ7;C9JRL6;K7EII6;K7EKG3 EML2 Echinoderm microtubule-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 78.484 78.484 2 0.012136 74714 QUIQUE_DMIX4_190116_001 66.299 44.771 15806000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15806000 0 0 0 49403 1757 46124 444779 568088 568088 1 VVLYVLNR Unmodified 974.5913 0.59130141 4668 Q9Y6X4;D6RB01;D6R953;D6RC41 FAM169A Soluble lamin-associated protein of 75 kDa yes no 0 0 0 1 1 1 77.041 77.041 2 0.0050599 77194 QUIQUE_DMIX1_190116_001 106.85 83.536 231500000 0 0 0 0 0 0 0 70396000 0 31797000 129310000 0 0 49404 4668 46125 444780;444781;444782 568089;568090;568091;568092 568090 3 VVMALGDYMGASCHACIGGTNVR Unmodified 2438.0963 0.096325061 2697 P60842;J3KT12;J3QS69;J3KTB5;J3QL43;J3QR64;J3QLN6;J3QKZ9;J3KS25 EIF4A1 Eukaryotic initiation factor 4A-I yes no 0 0 0 1 96.641 96.641 3 0.00045242 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2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 112.12 112.12 2;3 1.4416E-65 117120 QUIQUE_C1218_190116_001 179.79 166.96 2102200000 242740000 148980000 168980000 180830000 150820000 136940000 171590000 121340000 199450000 52620000 209800000 153400000 164720000 49410 903;2869 46131 444813;444814;444815;444816;444817;444818;444819;444820;444821;444822;444823;444824;444825;444826 568125;568126;568127;568128;568129;568130;568131;568132;568133;568134;568135;568136;568137;568138;568139;568140;568141;568142;568143;568144 568126 20 VVNDDCTHEADVYIENGIIQQVGR Unmodified 2743.2872 0.28715684 3984 Q9BPU6;E7EWB4;E9PHT0;E7ESV0 DPYSL5 Dihydropyrimidinase-related protein 5 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 1 1 1 1 115.14 115.14 2;3 1.0079E-40 118856 QUIQUE_C1277_190116_001 182.07 171.28 2843700000 312440000 294990000 356560000 271890000 344340000 146970000 463760000 0 0 0 0 307610000 345100000 49411 3984 46132 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3035.5379 0.53793502 16;1475 A0A075B7B1;H0YL34;O15061 SYNM Synemin no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 139.06 139.06 3 2.7398E-53 141766 QUIQUE_C1563_190116_001 141.48 117.2 962600000 88968000 70015000 127900000 84851000 51604000 92402000 58700000 63436000 98361000 28811000 69100000 53900000 74551000 49426 16;1475 46147 444918;444919;444920;444921;444922;444923;444924;444925;444926;444927;444928;444929;444930 568288;568289;568290;568291;568292;568293;568294;568295;568296;568297;568298;568299;568300 568293 13 VVNVELPIEANLVWQLGK Unmodified 2020.1357 0.13571221 3738;180 A0A0A0MSM0;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 158.19 158.19 2;3 0.00069953 160730 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.712 55.409 705120000 65718000 69554000 31482000 0 17207000 0 81312000 125980000 15289000 0 114580000 100940000 83066000 49427 180;3738 46148 444931;444932;444933;444934;444935;444936;444937;444938;444939;444940;444941 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568424 33 VVPLADIITPNQFEAELLSGRK Unmodified 2409.3268 0.32676045 1423 O00764;F2Z2Y4 PDXK Pyridoxal kinase yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 149.7 149.7 3;4 2.9403E-05 156605 QUIQUE_DMIX5_190116_001 57.293 54.024 654970000 0 0 0 0 0 0 0 176890000 97328000 0 147780000 127680000 105290000 49438 1423 46158 445043;445044;445045;445046;445047;445048 568433;568434;568435;568436;568437;568438 568436 5 VVPLHSLK Unmodified 891.55419 0.55418762 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 19.779 19.779 2 0.026319 12432 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.69 48.762 172050000 0 0 0 0 0 51825000 0 0 0 0 67481000 0 52745000 49439 2503 46159 445049;445050;445051 568439;568440;568441 568441 3 VVPQAVLDLLTWQELEK Unmodified 1980.0932 0.093178689 3311 Q5T447 HECTD3 E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 164.33 164.33 2;3 0.00061966 169515 QUIQUE_C1218_190116_001 79.633 59.17 85423000 11766000 12988000 14181000 24895000 13117000 0 0 8476700 0 0 0 0 0 49440 3311 46160 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568472;568473;568474;568475;568476;568477;568478;568479 568479 7 VVQCSDLGLK Unmodified 1117.5801 0.58014438 2186 P21810;C9JKG1 BGN Biglycan yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.018 44.018 2 0.00023561 40908 QUIQUE_C1277_190116_001 117.89 88.514 971760000 102620000 149910000 59215000 115830000 105400000 0 189640000 0 0 51259000 53615000 87596000 56683000 49446 2186 46166 445089;445090;445091;445092;445093;445094;445095;445096;445097;445098;445099 568480;568481;568482;568483;568484;568485;568486;568487;568488;568489;568490;568491 568481 12 VVQDAQTFAEWK Unmodified 1420.6987 0.69867961 2116 P17050 NAGA Alpha-N-acetylgalactosaminidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 77.254 77.254 2 0.00051979 77904 QUIQUE_C1368_190116_001 104.52 87.891 200420000 41621000 56980000 58256000 0 0 0 43562000 0 0 0 0 0 0 49447 2116 46167 445100;445101;445102;445103;445104;445105 568492;568493;568494;568495;568496;568497;568498;568499 568496 7 VVQDFIDIFSDYANFK Unmodified 1919.9305 0.93053004 2216 P23469 PTPRE Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon yes yes 0 0 0 1 1 1 167.53 167.53 3 0.006446 172513 QUIQUE_C1368_190116_001 45.14 42.079 20451000 0 0 8297500 5934600 6219000 0 0 0 0 0 0 0 0 49448 2216 46168 445106;445107;445108 568500;568501;568502 568500 3 VVQDLIPWDAGTDSGVTYESPNKPTIPQEK Unmodified 3283.6249 0.62485255 4222 Q9HCB6 SPON1 Spondin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.48 119.48 3 2.5392E-05 122969 QUIQUE_DMIX7_190116_001 47.919 42.317 316580000 45275000 0 0 39104000 0 42540000 48775000 0 61767000 15922000 0 63199000 0 49449 4222 46169 445109;445110;445111;445112;445113;445114;445115;445116 568503;568504;568505;568506;568507;568508;568509;568510 568510 7 VVQDLSGEHMGAVWTMK Unmodified 1886.9019 0.90188922 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 1 87.876 87.876 3 0.03264 89839 QUIQUE_C1277_190116_001 39.657 31.057 58906000 0 23155000 0 35751000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49450 3277 46170 445117;445118 568511;568512 568511 1 VVQDTYQIMK Unmodified 1223.622 0.62200919 1464 O14964;I3L1P5;I3L165 HGS Hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 52.467 52.467 2 0.0017155 50498 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.17 73.44 70752000 0 0 0 0 0 0 0 43549000 0 0 0 27202000 0 49451 1464 46171 445119;445120;445121;445122;445123;445124;445125 568513;568514;568515;568516;568517;568518;568519 568516 7 VVQETVLVEER Unmodified 1299.7034 0.70343063 143;4559;560 A0A0A0MRA8;A0A0A0MSA4;A8K968;A0A0J9YW31;Q9Y2J2 EPB41L3 Band 4.1-like protein 3;Band 4.1-like protein 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 2 3 1 1 1 1 1 1 1 3 2 3 52.62 52.62 2 0.00049749 50888 QUIQUE_C1277_190116_001 125.48 98.365 2878200000 274350000 245220000 285670000 263450000 202880000 233160000 244940000 296790000 183780000 102630000 208630000 157420000 179290000 49452 143;560;4559 46172 445126;445127;445128;445129;445130;445131;445132;445133;445134;445135;445136;445137;445138;445139;445140;445141;445142;445143;445144;445145;445146 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subcomplex subunit 9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 69.049 69.049 3 0.005253 67100 QUIQUE_DMIX4_190116_001 33.759 29.588 463260000 0 0 0 63621000 78069000 0 84998000 0 72064000 31075000 112140000 0 21297000 49457 3197 46177 445169;445170;445171;445172;445173;445174;445175;445176;445177 568574;568575;568576;568577;568578;568579;568580;568581;568582;568583;568584 568581 9 VVQQEEGWFR Unmodified 1276.62 0.62003536 702 F5GXT2;O43374;C9J798;F8W6L0;E7ERK1;H0YBU2;E5RK78 RASA4B;RASA4 Ras GTPase-activating protein 4;Putative Ras GTPase-activating protein 4B yes no 0 0 0 1 1 1 67.43 67.43 2 0.016479 67803 QUIQUE_DMIX8_190116_001 62.582 53.669 42722000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 42722000 49458 702 46178 445178;445179;445180 568585;568586;568587 568587 3 VVQSLEQTAR Unmodified 1129.6091 0.60913632 924 E9PGT1;Q15631;H7C1D4;A0A0J9YVW2 TSN Translin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.023 24.023 2 0.00035641 17639 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.62 67.196 2493200000 355460000 202120000 225840000 0 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cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 152.35 152.35 3 4.3085E-114 158023 QUIQUE_C1368_190116_001 169.5 160.48 1630100000 122380000 126170000 146990000 118430000 137110000 119980000 175170000 83073000 69659000 39679000 182900000 144900000 163620000 49473 2533 46193 445287;445288;445289;445290;445291;445292;445293;445294;445295;445296;445297;445298;445299;445300 568705;568706;568707;568708;568709;568710;568711;568712;568713;568714;568715;568716;568717;568718;568719;568720;568721;568722;568723;568724;568725;568726;568727;568728;568729;568730 568711 26 VVSIIAELLSTK Unmodified 1271.7701 0.77005364 1302 K7EIG7;J3QRN6;O94832;J3KRL0 MYO1D Unconventional myosin-Id yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.02 149.02 2 0.00026424 152118 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.77 101.52 183520000 13831000 13405000 15059000 6558800 21636000 8680500 18873000 8920400 18551000 7217200 22759000 10333000 17699000 49474 1302 46194 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445359;445360;445361;445362;445363;445364;445365;445366;445367;445368;445369;445370 568808;568809;568810;568811;568812;568813;568814;568815;568816;568817;568818;568819;568820;568821;568822;568823;568824;568825;568826;568827;568828;568829;568830 568826 22 VVSQYHELVVQAR Unmodified 1526.8205 0.82052608 3205;693 C9J406;H7C463;Q16891;B9A067 IMMT MICOS complex subunit MIC60 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 43.212 43.212 2;3 1.98E-52 39408 QUIQUE_C1368_190116_001 196.24 156.93 6575300000 613760000 711420000 588830000 668400000 611900000 257380000 645830000 472880000 140290000 282790000 696480000 555380000 329920000 49481 693;3205 46200 445371;445372;445373;445374;445375;445376;445377;445378;445379;445380;445381;445382;445383;445384;445385;445386;445387;445388;445389;445390;445391;445392;445393;445394 568831;568832;568833;568834;568835;568836;568837;568838;568839;568840;568841;568842;568843;568844;568845;568846;568847;568848;568849;568850;568851;568852;568853;568854;568855;568856;568857;568858;568859;568860;568861;568862;568863;568864;568865 568838 33 VVSQYSSLLSPMSVNAVMK Unmodified 2039.0431 0.043133728 2573 P50991 CCT4 T-complex protein 1 subunit delta yes yes 0 0 0 1 1 2 2 1 1 2 3 1 1 1 1 129.6 129.6 2;3 4.5333E-17 133797 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.77 116.97 1254100000 66632000 76039000 123070000 105900000 60547000 26672000 124110000 193390000 95857000 0 150810000 103240000 127870000 49482 2573 46201 445395;445396;445397;445398;445399;445400;445401;445402;445403;445404;445405;445406;445407;445408;445409;445410;445411 568866;568867;568868;568869;568870;568871;568872;568873;568874;568875;568876;568877;568878;568879;568880;568881;568882;568883;568884;568885;568886;568887 568884 21 VVSSSIVDK Unmodified 932.51786 0.51786169 124 A0A087X2I1;P62333;H0YJC0;H0YJS8 PSMC6 26S protease 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569232;569233;569234;569235;569236;569237;569238;569239;569240;569241;569242;569243;569244;569245;569246;569247;569248;569249;569250 569237 19 VVVCDNGTGFVK Unmodified 1293.6387 0.63872189 2715 P61160;A0A1B0GWD0;A0A1B0GWH0 ACTR2 Actin-related protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 51.323 51.323 2 0.002594 48833 QUIQUE_DMIX7_190116_001 74.533 59.86 515930000 0 0 108520000 0 0 0 92947000 0 0 235940000 0 78523000 0 49511 2715 46228 445674;445675;445676;445677 569251;569252;569253;569254;569255 569255 5 VVVDALSGLK Unmodified 999.59645 0.59644637 2046 P12532;F8WCN3;C9JSQ1 CKMT1A;CKMT1B Creatine kinase U-type, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 74.772 74.772 1;2 0.001456 71333 QUIQUE_DMIX4_190116_001 97.431 63.692 3931100000 1253600000 932850000 0 0 58463000 0 0 724170000 0 334840000 0 627200000 0 49512 2046 46229 445678;445679;445680;445681;445682;445683;445684;445685;445686;445687;445688 569256;569257;569258;569259;569260;569261;569262;569263;569264;569265;569266;569267 569264 6 VVVEEVQVVELK Unmodified 1368.7864 0.78643198 4094 Q9C0C9;K7EQ12 UBE2O E2/E3 hybrid ubiquitin-protein ligase UBE2O yes no 0 0 0 1 1 1 89.428 89.428 2 0.0086991 86526 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.166 49.59 59735000 0 22508000 0 21348000 0 0 0 0 0 15879000 0 0 0 49513 4094 46230 445689;445690;445691 569268;569269;569270 569270 3 VVVEQLNLLVK Unmodified 1252.7755 0.77547336 2365 P34949;H3BPB8;F5GX71;H3BMZ9;H3BPP3;H3BP57;H3BUZ9;H3BT48 MPI Mannose-6-phosphate isomerase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.49 105.49 2 0.00048933 107809 QUIQUE_DMIX1_190116_001 131.06 111.07 1191000000 133410000 109030000 0 114080000 0 107620000 118710000 111990000 134940000 76171000 155910000 0 129170000 49514 2365 46231 445692;445693;445694;445695;445696;445697;445698;445699;445700;445701 569271;569272;569273;569274;569275;569276;569277;569278;569279;569280 569276 2 VVVFGAGGVGK Unmodified 988.57057 0.57056597 1703 O95057;K7EN06 DIRAS1 GTP-binding protein Di-Ras1 yes no 0 0 0 1 53.704 53.704 2 0.039569 51618 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P51665;H3BNT7;H3BTM8;H3BQV2 PSMD7 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7 yes no 0 0 0 2 1 2 2 4 2 2 2 2 1 3 2 3 126.63 126.63 3;4 5.1083E-38 132026 QUIQUE_DMIX5_190116_001 160.47 156.98 2610000000 142990000 100100000 141550000 191480000 235400000 181570000 244170000 229890000 265000000 48425000 244110000 305630000 279730000 49518 2589 46235 445720;445721;445722;445723;445724;445725;445726;445727;445728;445729;445730;445731;445732;445733;445734;445735;445736;445737;445738;445739;445740;445741;445742;445743;445744;445745;445746;445747 569301;569302;569303;569304;569305;569306;569307;569308;569309;569310;569311;569312;569313;569314;569315;569316;569317;569318;569319;569320;569321;569322;569323;569324;569325;569326;569327;569328;569329;569330;569331;569332;569333;569334;569335;569336;569337;569338;569339;569340;569341;569342;569343;569344;569345;569346;569347;569348;569349;569350;569351;569352;569353;569354;569355;569356 569345 56 VVVITQNIDELHR Unmodified 1534.8467 0.84674083 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.104 68.104 3 0.00012756 67765 QUIQUE_C1368_190116_001 91.858 84.976 323580000 48728000 33357000 33536000 27845000 34251000 37281000 22322000 0 0 24160000 35855000 0 26250000 49519 4323 46236 445748;445749;445750;445751;445752;445753;445754;445755;445756;445757;445758 569357;569358;569359;569360;569361;569362;569363;569364;569365;569366;569367;569368 569360 12 VVVLGLLPR Unmodified 964.64334 0.64333698 3110 Q15102;M0R389 PAFAH1B3 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 101.72 101.72 2 0.00034292 104865 QUIQUE_C1576_190116_001 135.87 117.08 4932900000 374010000 403380000 363810000 304520000 413690000 376210000 383690000 428040000 404380000 136470000 471400000 429250000 444080000 49520 3110 46237 445759;445760;445761;445762;445763;445764;445765;445766;445767;445768;445769;445770;445771;445772 569369;569370;569371;569372;569373;569374;569375;569376;569377;569378;569379;569380;569381;569382;569383;569384;569385;569386;569387;569388;569389;569390;569391;569392;569393;569394;569395;569396;569397;569398 569383 30 VVVLGSGGVGK Unmodified 970.58113 0.58113065 2720;1991;4595 P61225;F6U784;Q9Y3L5;P10114 RAP2B;RAP2A;RAP2C Ras-related protein Rap-2b;Ras-related protein Rap-2c;Ras-related protein Rap-2a no no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 37.71 37.71 2 0.00087395 33559 QUIQUE_C1368_190116_001 93.649 59.646 2856000000 271650000 275740000 332030000 261940000 301960000 242660000 310070000 0 0 139990000 242240000 198540000 279190000 49521 2720;4595;1991 46238 445773;445774;445775;445776;445777;445778;445779;445780;445781;445782;445783;445784 569399;569400;569401;569402;569403;569404;569405;569406;569407;569408;569409;569410 569401 4 VVVLMGSTSDLGHCEK Unmodified 1730.8331 0.83314095 2195 P22234;E9PBS1;D6RF62 PAICS Multifunctional protein ADE2;Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase;Phosphoribosylaminoimidazole carboxylase yes no 0 0 0 1 2 1 1 2 2 1 2 2 2 2 2 2 59.553 59.553 2;3 4.7189E-09 58941 QUIQUE_C1438_190116_001 137.16 105.15 5817300000 508870000 580230000 534870000 596150000 596010000 455330000 104480000 459180000 88378000 177690000 613790000 501420000 600880000 49522 2195 46239 445785;445786;445787;445788;445789;445790;445791;445792;445793;445794;445795;445796;445797;445798;445799;445800;445801;445802;445803;445804;445805;445806 569411;569412;569413;569414;569415;569416;569417;569418;569419;569420;569421;569422;569423;569424;569425;569426;569427;569428;569429;569430;569431;569432;569433;569434;569435 569417 22 VVVMNNILPR Unmodified 1153.6641 0.66414878 1570 O60331 PIP5K1C Phosphatidylinositol 4-phosphate 5-kinase type-1 gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 81.732 81.732 2 0.0025505 82753 QUIQUE_C1403_190116_001 89.296 73.414 379300000 59113000 59471000 0 57168000 46959000 47026000 67852000 0 0 0 0 41708000 0 49523 1570 46240 445807;445808;445809;445810;445811;445812;445813 569436;569437;569438;569439;569440;569441;569442 569438 7 VVVNFAPTIQEIK Unmodified 1456.829 0.8289655 3455 Q7Z3B1 NEGR1 Neuronal growth regulator 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 1 2 103.84 103.84 2;3 0.00041105 106562 QUIQUE_C1277_190116_001 92.445 84.443 5965500000 464430000 574520000 639740000 579210000 499570000 449630000 708550000 318580000 290890000 150260000 464270000 296880000 529010000 49524 3455 46241 445814;445815;445816;445817;445818;445819;445820;445821;445822;445823;445824;445825;445826;445827;445828;445829;445830;445831 569443;569444;569445;569446;569447;569448;569449;569450;569451;569452;569453;569454;569455;569456;569457;569458;569459;569460;569461;569462 569445 19 VVVPGVVGAR Unmodified 951.58655 0.58655038 2591 P51687 SUOX Sulfite oxidase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.058 50.058 2 0.0029974 48185 QUIQUE_C1576_190116_001 86.794 59.269 525310000 0 54317000 65271000 63790000 0 0 52643000 34726000 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124690000 72050000 0 49527 3304 46244 445852;445853;445854;445855;445856;445857;445858;445859;445860;445861 569484;569485;569486;569487;569488;569489;569490;569491;569492;569493;569494;569495;569496 569486 12 VVVRPVEDGEIQGVWLLTEVDHWNNEKER Unmodified 3444.7426 0.74261669 3304 Q5T0D9 TPRG1L Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein yes yes 0 0 2 2 2 134.86 134.86 4;5 2.7124E-05 138393 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.646 40.078 291400000 0 0 0 0 0 0 0 109600000 0 0 181800000 0 0 49528 3304 46245 445862;445863;445864;445865 569497;569498;569499;569500 569498 4 VVVSGLPPSGSWQDLK Unmodified 1667.8883 0.88827129 1294 J3KTL2;Q07955;J3KSR8 SRSF1 Serine/arginine-rich splicing factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 104.42 104.42 2 0.0028708 108078 QUIQUE_C1368_190116_001 88.155 75.175 185870000 0 58839000 53506000 0 73526000 0 0 0 0 0 0 0 0 49529 1294 46246 445866;445867;445868 569501;569502;569503 569502 3 VVVTMEHSAK Unmodified 1099.5696 0.56957969 2673 P55809;E9PDW2 OXCT1 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 15.237 15.237 3 0.00038462 7714 QUIQUE_C1218_190116_001 86.18 71.973 579780000 21152000 65286000 0 0 0 0 0 214110000 46828000 168390000 0 64013000 0 49530 2673 46247 445869;445870;445871;445872;445873;445874 569504;569505;569506;569507;569508;569509 569504 4 VVVVDDLLATGGTMNAACELLGR Unmodified 2373.2032 0.2032162 1928 P07741;H3BQZ9 APRT Adenine phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 2 1 1 1 2 158.18 158.18 2;3 5.1449E-87 163001 QUIQUE_DMIX3_190116_001 180.06 159.68 1802600000 52903000 118310000 242140000 149140000 125780000 105320000 116210000 136170000 257060000 39271000 152560000 78606000 229090000 49531 1928 46248 445875;445876;445877;445878;445879;445880;445881;445882;445883;445884;445885;445886;445887;445888;445889;445890;445891;445892;445893;445894;445895;445896;445897 569510;569511;569512;569513;569514;569515;569516;569517;569518;569519;569520;569521;569522;569523;569524;569525;569526;569527;569528;569529;569530;569531;569532;569533;569534;569535;569536 569530 27 VVVVGDQSAGK Unmodified 1057.5768 0.57677356 1569;831 E5KLJ9;O60313;A0A2R8YDM2;A0A2R8Y3X5;A0A2R8YE78;C9JMB8;A0A2R8YGE5;A0A2R8YD53;A0A2R8Y4Q3;A0A2R8Y4G4 OPA1 Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial;Dynamin-like 120 kDa protein, form S1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 21.133 21.133 2 0.0016372 14486 QUIQUE_DMIX1_190116_001 83.309 52.697 4161400000 363790000 380880000 326410000 301350000 320010000 282920000 392130000 226010000 285820000 125430000 452040000 341160000 363460000 49532 831;1569 46249 445898;445899;445900;445901;445902;445903;445904;445905;445906;445907;445908;445909;445910 569537;569538;569539;569540;569541;569542;569543;569544;569545;569546;569547;569548;569549 569544 9 VVVVQAISALCQK Unmodified 1413.8014 0.80137054 4645;4396 Q9Y678;Q9UBF2 COPG1;COPG2 Coatomer subunit gamma-1;Coatomer subunit gamma-2 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 2 1 2 1 2 95.482 95.482 2;3 0.00038057 97992 QUIQUE_C1403_190116_001 80.69 73.32 650910000 0 0 77337000 106440000 79128000 14867000 90314000 26169000 69178000 12994000 91225000 21375000 61888000 49533 4645;4396 46250 445911;445912;445913;445914;445915;445916;445917;445918;445919;445920;445921;445922;445923;445924;445925;445926;445927;445928 569550;569551;569552;569553;569554;569555;569556;569557;569558;569559;569560;569561;569562;569563;569564;569565;569566;569567;569568;569569;569570 569553 21 VVVVTAEK Unmodified 843.50657 0.50656873 4001 Q9BRF8 CPPED1 Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1 yes yes 0 0 0 1 19.405 19.405 2 0.023483 11891 QUIQUE_DMIX4_190116_001 73.26 34.468 44711000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44711000 0 0 0 49534 4001 46251 445929 569571 569571 1 VVVVVPNEEDWKK Unmodified 1539.8297 0.82969378 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 1 1 67.219 67.219 3 0.0057029 67231 QUIQUE_DMIX3_190116_001 37.998 30.391 30455000 0 0 0 0 0 0 0 0 30455000 0 0 0 0 49535 3208 46252 445930 569572 569572 1 VVVYSNTIQSIIAIIR Unmodified 1788.0509 0.050919944 1953 P08754 GNAI3 Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha yes yes 0 0 0 1 2 2 1 3 2 2 2 2 2 1 1 161.22 161.22 2;3 2.5494E-09 155826 QUIQUE_DMIX4_190116_001 125.97 107.7 806370000 30153000 93172000 82030000 67111000 0 97372000 60020000 95715000 43013000 113450000 108050000 0 16282000 49536 1953 46253 445931;445932;445933;445934;445935;445936;445937;445938;445939;445940;445941;445942;445943;445944;445945;445946;445947;445948;445949;445950;445951 569573;569574;569575;569576;569577;569578;569579;569580;569581;569582;569583;569584;569585;569586;569587;569588;569589;569590;569591;569592;569593;569594;569595 569589 23 VVWPGPVPASLSLALLESVLR Unmodified 2202.2776 0.27762542 1608 O75064 DENND4B DENN domain-containing protein 4B yes yes 0 0 0 1 1 1 174.86 174.86 3 0.0042343 179017 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ATP-dependent RNA helicase DDX3X yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 30.908 30.908 3 0.0053985 25802 QUIQUE_C1218_190116_001 50.284 39.378 454270000 77787000 56426000 0 123820000 0 73544000 0 65222000 0 57478000 0 0 0 49540 266 46257 445961;445962;445963;445964;445965;445966 569605;569606;569607;569608;569609;569610;569611 569606 7 VVYDTMIEK Unmodified 1096.5474 0.54744726 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 50.218 50.218 2 0.00050446 53119 QUIQUE_C1218_190116_001 113.71 90.815 4067800000 330290000 0 627580000 454480000 349500000 117390000 565000000 306410000 425520000 219040000 493590000 179020000 0 49541 2217 46258 445967;445968;445969;445970;445971;445972;445973;445974;445975;445976;445977;445978;445979;445980;445981;445982;445983;445984;445985 569612;569613;569614;569615;569616;569617;569618;569619;569620;569621;569622;569623;569624;569625;569626;569627;569628;569629;569630;569631;569632;569633 569612 15 VVYDTMIEK Oxidation (M) 1112.5424 0.54236189 2217 P23471 PTPRZ1 Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta yes yes 0 1 0 1 1 2 1 1 34.043 34.043 2 0.010118 28446 QUIQUE_DMIX3_190116_001 78.516 56.988 290480000 0 42883000 0 0 0 0 42601000 0 96107000 0 56973000 51912000 0 49542 2217 46258 445986;445987;445988;445989;445990;445991 569634;569635;569636;569637;569638;569639 569636 1580 6 VVYENAYGQFIGPHR Unmodified 1748.8635 0.86345352 22 E9PIR7;F8W809;A0A087WSW9;A0A182DWI3;A0A087WSY9;Q16881;E2QRB9;E9PKD3 TXNRD1 Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 75.678 75.678 2;3 1.0667E-29 75626 QUIQUE_C1403_190116_001 167.09 151.94 2363600000 216900000 218510000 151150000 221890000 215130000 164120000 176510000 199710000 249130000 103870000 242430000 204270000 0 49543 22 46259 445992;445993;445994;445995;445996;445997;445998;445999;446000;446001;446002;446003;446004;446005;446006;446007;446008;446009;446010;446011;446012;446013;446014;446015 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569727 0 VWCDGCYDMVHYGHSNQLR Unmodified 2395.9885 0.98848917 3953 Q99447;I3L1R7;I3L1L9;I3L2Q1 PCYT2 Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase yes no 0 0 0 1 70.662 70.662 3 0.0026421 71250 QUIQUE_C1576_190116_001 56.121 52.388 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49554 3953 46269 446067 569728 569728 1 VWCVASLR Unmodified 989.51167 0.51167088 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.774 71.774 2 0.0057754 72200 QUIQUE_DMIX1_190116_001 104.21 76.385 396590000 43444000 0 45615000 0 47481000 40730000 72449000 36250000 0 16780000 0 46781000 47056000 49555 2380 46270 446068;446069;446070;446071;446072;446073;446074;446075;446076 569729;569730;569731;569732;569733;569734;569735;569736;569737;569738 569735 9 VWDAVSGDELMTLAHK Unmodified 1770.8611 0.86107026 4592 Q9Y3F4 STRAP Serine-threonine kinase receptor-associated protein yes yes 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 2 1 2 1 110.24 110.24 2;3 2.1044E-06 107833 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.909 83.713 2012200000 159800000 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EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 0 1 118.24 118.24 2 0.053626 122108 QUIQUE_C1277_190116_001 66.568 54.521 22884000 0 22884000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49561 645 46275 446116 569783 569783 0 VWDLFPEADKVR Unmodified 1473.7616 0.76161421 645 Q99613;B5ME19 EIF3C;EIF3CL Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C;Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.53 103.53 3 0.0070548 107514 QUIQUE_DMIX5_190116_001 59.975 52.064 317980000 0 23718000 21602000 0 27104000 0 35560000 43328000 45098000 8832200 42288000 43824000 26630000 49562 645 46276 446117;446118;446119;446120;446121;446122;446123;446124;446125;446126 569784;569785;569786;569787;569788;569789;569790;569791;569792;569793;569794;569795 569792 9 VWDLNMESRPVETHQVHEYLR Unmodified 2637.2758 0.27580429 3349 Q66LE6 PPP2R2D Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 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dismutase;Superoxide dismutase [Cu-Zn] yes no 0 0 0 1 1 1 69.243 69.243 2 0.01933 69747 QUIQUE_C1438_190116_001 114.54 69.929 219670000 76202000 66683000 0 0 76783000 0 0 0 0 0 0 0 0 49566 1262 46280 446131;446132;446133 569801;569802;569803 569803 3 VWDVNTGEVLNTLIHHNEAVLHLR Unmodified 2778.4565 0.45654585 4472 Q9UKB1 FBXW11 F-box/WD repeat-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 138.97 138.97 5 0.0011291 146286 QUIQUE_DMIX5_190116_001 37.065 34.068 34905000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34905000 0 0 49567 4472 46281 446134 569804 569804 1 VWDYETGDFER Unmodified 1415.5994 0.59935949 2460 P43034 PAFAH1B1 Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 88.884 88.884 2 2.1399E-08 91877 QUIQUE_C1218_190116_001 155.42 123.1 5249900000 374710000 383860000 527890000 371940000 422310000 307090000 443780000 357200000 397680000 142030000 551520000 425090000 544820000 49568 2460 46282 446135;446136;446137;446138;446139;446140;446141;446142;446143;446144;446145;446146;446147;446148 569805;569806;569807;569808;569809;569810;569811;569812;569813;569814;569815;569816;569817;569818;569819;569820;569821;569822;569823;569824;569825;569826;569827;569828;569829;569830 569807 26 VWEFYHYR Unmodified 1198.556 0.55597854 4323 Q9NXA8 SIRT5 NAD-dependent protein deacylase sirtuin-5, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.099 73.099 3 0.0078407 73264 QUIQUE_DMIX7_190116_001 63.48 56.591 369600000 18778000 29375000 28647000 30122000 0 25301000 33125000 26539000 36056000 18050000 49430000 38250000 35929000 49569 4323 46283 446149;446150;446151;446152;446153;446154;446155;446156;446157;446158;446159;446160 569831;569832;569833;569834;569835;569836;569837;569838;569839;569840;569841;569842;569843;569844 569842 14 VWEQIDQMK Unmodified 1175.5645 0.56449431 3053 Q14204 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 66.939 66.939 2 0.0071923 65561 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2494 P47813;X6RAC9;O14602 EIF1AX;EIF1AY Eukaryotic translation initiation factor 1A, X-chromosomal;Eukaryotic translation initiation factor 1A, Y-chromosomal yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 149.99 149.99 2 9.1678E-12 152743 QUIQUE_DMIX1_190116_001 132.91 106.13 224550000 20352000 16897000 0 0 19768000 12969000 24842000 32063000 33871000 7550100 0 33134000 23100000 49575 2494 46289 446191;446192;446193;446194;446195;446196;446197;446198;446199;446200;446201 569890;569891;569892;569893;569894;569895;569896;569897;569898;569899;569900;569901 569895 10 VWIPDPEEVWK Unmodified 1396.7027 0.70270235 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;Q9NQX4;H0YMK3;G3V3C9;H0YM96 MYO5A;MYO5C Unconventional myosin-Va;Unconventional myosin-Vc yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.05 134.05 2 0.0092409 136836 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.378 65.146 658260000 60788000 69868000 60211000 68475000 64884000 74370000 58845000 55815000 0 0 61405000 41587000 42011000 49576 4607 46290 446202;446203;446204;446205;446206;446207;446208;446209;446210;446211;446212;446213 569902;569903;569904;569905;569906;569907;569908;569909;569910;569911;569912;569913;569914;569915;569916 569912 14 VWKPQLFER Unmodified 1201.6608 0.66077796 519 A2IDC6;Q13084;Q4TT37;A2IDC7 MRPL28 39S ribosomal protein L28, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 1 65.744 65.744 3 0.015414 64850 QUIQUE_C1368_190116_001 54.608 37.976 58726000 13781000 18060000 12676000 0 0 0 0 0 14209000 0 0 0 0 49577 519 46291 446214;446215;446216;446217 569917;569918;569919;569920 569919 4 VWLEDPASPEEPGEPAPVPPGFGAVYGEPDLVLEVSGR Unmodified 3957.9313 0.9312649 1688 O94819 KBTBD11 Kelch repeat and BTB domain-containing protein 11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 166.74 166.74 3 1.4795E-23 171253 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.384 78.225 394010000 0 0 0 0 31373000 21299000 0 37769000 106680000 0 76170000 57398000 63316000 49578 1688 46292 446218;446219;446220;446221;446222;446223;446224 569921;569922;569923;569924;569925;569926;569927 569924 7 VWLEVEPVGMLK Unmodified 1398.7581 0.75810874 2461 P43121 MCAM Cell surface glycoprotein MUC18 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 127.96 127.96 2 0.0021929 132576 QUIQUE_C1368_190116_001 76.465 35.876 195400000 43186000 42860000 44401000 38635000 0 0 0 0 0 0 26318000 0 0 49579 2461 46293 446225;446226;446227;446228;446229 569928;569929;569930;569931;569932;569933;569934 569931 6 VWLEVEPVGMLK Oxidation (M) 1414.753 0.75302336 2461 P43121 MCAM Cell surface glycoprotein MUC18 yes yes 0 1 0 1 1 109.26 109.26 2 0.0092523 111546 QUIQUE_C1563_190116_001 63.216 44.948 42432000 0 0 0 0 23360000 19073000 0 0 0 0 0 0 0 49580 2461 46293 446230;446231 569935;569936 569936 1890 2 VWLQSEK Unmodified 888.47052 0.47051757 4336 Q9NZ08;H0Y9X5 ERAP1 Endoplasmic reticulum aminopeptidase 1 yes no 0 0 0 1 31.137 31.137 2 0.049176 26012 QUIQUE_C1368_190116_001 75.269 45.958 48993000 0 0 48993000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49581 4336 46294 446232 569937 569937 1 VWMIDFGK Unmodified 994.49462 0.49462383 2271 P27987;Q96DU7 ITPKB;ITPKC Inositol-trisphosphate 3-kinase B;Inositol-trisphosphate 3-kinase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.1 115.1 2 0.010812 120211 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.777 77.269 335360000 20571000 16671000 45903000 33814000 22263000 28402000 21010000 31677000 27475000 15201000 36549000 0 35826000 49582 2271 46295 446233;446234;446235;446236;446237;446238;446239;446240;446241;446242;446243;446244 569938;569939;569940;569941;569942;569943;569944;569945;569946;569947;569948;569949;569950 569948 13 VWNLANCK Unmodified 1003.4909 0.49093544 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0Y8W2;D6REE5;D6RHH4;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;D6RBD0;H0Y8R5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.99 46.99 2 0.00087247 44029 QUIQUE_C1277_190116_001 148.28 96.494 1061000000 134650000 161490000 163080000 0 0 84615000 119130000 116350000 90665000 44742000 146230000 0 0 49583 2787 46296 446245;446246;446247;446248;446249;446250;446251;446252;446253;446254;446255 569951;569952;569953;569954;569955;569956;569957;569958;569959;569960;569961 569952 11 VWNLVTGQEIMSLGGHPNNVVSVK Unmodified 2577.3373 0.33734191 356 A0A1B0GV47;Q7Z4S6;H0YHT2;H0YI78 KIF21A Kinesin-like protein KIF21A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 128.78 128.78 3 1.0575E-06 133591 QUIQUE_C1368_190116_001 64.954 57.332 440310000 45645000 47343000 57331000 47819000 0 0 63896000 0 0 0 57794000 69531000 50947000 49584 356 46297 446256;446257;446258;446259;446260;446261;446262;446263 569962;569963;569964;569965;569966;569967;569968;569969;569970;569971;569972 569966 11 VWNSQLIR Unmodified 1014.5611 0.56106391 699 C9J5P6;P29475 NOS1 Nitric oxide synthase;Nitric oxide synthase, brain yes no 0 0 0 1 58.3 58.3 2 0.030357 57205 QUIQUE_DMIX7_190116_001 67.032 22.311 74821000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 74821000 0 49585 699 46298 446264 569973;569974 569974 2 VWQILER Unmodified 942.5287 0.52870115 3782 Q93100 PHKB Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 78.936 78.936 2 0.019688 79770 QUIQUE_DMIX3_190116_001 110.61 26.368 157710000 0 0 0 0 0 0 0 36731000 46374000 14850000 34029000 0 25722000 49586 3782 46299 446265;446266;446267;446268;446269 569975;569976;569977;569978;569979;569980 569977 6 VWQIQSCSALTGEGVQDGMNWVCK Unmodified 2752.2407 0.24074069 2393 P36405 ARL3 ADP-ribosylation factor-like protein 3 yes yes 0 0 0 1 138.79 138.79 3 0.049849 141789 QUIQUE_DMIX1_190116_001 21.349 11.091 54051000 0 0 0 0 0 0 0 54051000 0 0 0 0 0 49587 2393 46300 446270 569981 569981 1 VWQLGSSSPNFTLEGHEK Unmodified 2014.9749 0.97485447 2380 P35606 COPB2 Coatomer subunit beta' yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 1 2 91.389 91.389 2;3 2.9205E-05 94672 QUIQUE_C1218_190116_001 95.094 85.345 1036000000 78544000 94903000 107940000 84970000 72853000 68749000 93349000 92720000 75956000 37154000 66567000 83373000 78907000 49588 2380 46301 446271;446272;446273;446274;446275;446276;446277;446278;446279;446280;446281;446282;446283;446284;446285;446286;446287;446288;446289 569982;569983;569984;569985;569986;569987;569988;569989;569990;569991;569992;569993;569994;569995;569996;569997;569998;569999;570000 569983 18 VWQVTIGTR Unmodified 1058.5873 0.58727866 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;D6RHH4;D6RF23;H0Y8R5;D6RHJ5 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 70.196 70.196 2 0.015523 71432 QUIQUE_DMIX5_190116_001 103.56 55.989 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49589 2787 46302 446290 570001 570001 1 VWSGPPAVGQER Unmodified 1281.6466 0.64658446 4133 Q9H1K0 RBSN Rabenosyn-5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 51.508 51.508 2 0.01603 49125 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.161 45.499 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49590 4133 46303 446291;446292;446293;446294 570002;570003;570004;570005 570005 4 VWSPLVTEEGKR Unmodified 1399.746 0.74596415 1378 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cytidylyltransferase A;Choline-phosphate cytidylyltransferase B yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 2 1 1 1 2 107.21 107.21 3;4 0.00014435 110794 QUIQUE_C1277_190116_001 64.136 59.081 654370000 0 64489000 81401000 68259000 66032000 26983000 58351000 20892000 99231000 9594300 37323000 45130000 76689000 49603 717 46316 446428;446429;446430;446431;446432;446433;446434;446435;446436;446437;446438;446439;446440;446441;446442;446443;446444;446445;446446 570198;570199;570200;570201;570202;570203;570204;570205;570206;570207;570208;570209;570210;570211;570212;570213;570214;570215;570216;570217;570218;570219;570220;570221;570222;570223;570224 570199 27 VYAEADSQESADHLAHEVSLAVFQLAGGIGERPQPGF Unmodified 3894.8813 0.88129502 1728 O95394;J3KN95;H0Y8I3 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 166.55 166.55 3;4 5.941E-78 171674 QUIQUE_C1368_190116_001 132.57 128.04 2789700000 58980000 0 151160000 90341000 219850000 113810000 300390000 0 345480000 17280000 150390000 837020000 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446479;446480;446481;446482;446483;446484;446485;446486;446487;446488;446489;446490;446491;446492;446493;446494;446495;446496;446497;446498;446499;446500;446501;446502;446503;446504;446505 570260;570261;570262;570263;570264;570265;570266;570267;570268;570269;570270;570271;570272;570273;570274;570275;570276;570277;570278;570279;570280;570281;570282;570283;570284;570285;570286;570287;570288;570289;570290;570291;570292;570293;570294;570295;570296;570297;570298;570299;570300;570301;570302;570303;570304;570305;570306;570307;570308;570309;570310;570311;570312;570313 570266 54 VYALPEDLVEVNPK Unmodified 1584.8399 0.83992412 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 110.48 110.48 2 0.00041234 113881 QUIQUE_C1403_190116_001 97.813 87.926 741260000 0 0 0 222920000 123870000 0 114960000 0 192970000 0 0 86543000 0 49609 2066 46322 446506;446507;446508;446509;446510;446511;446512 570314;570315;570316;570317;570318;570319;570320 570314 5 VYASNQEFESVR Unmodified 1427.6681 0.66810776 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.555 49.555 2 3.7127E-05 47150 QUIQUE_C1277_190116_001 127.76 106.79 412050000 35709000 39295000 38247000 33069000 37078000 0 43110000 31136000 31020000 20082000 45399000 31702000 26202000 49610 3895 46323 446513;446514;446515;446516;446517;446518;446519;446520;446521;446522;446523;446524;446525 570321;570322;570323;570324;570325;570326;570327;570328;570329;570330;570331;570332;570333;570334 570322 14 VYATILNAGTNTDGFK Unmodified 1683.8468 0.84680041 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 92.629 92.629 2 1.0903E-18 95969 QUIQUE_C1218_190116_001 174.42 161.84 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446553;446554;446555;446556;446557;446558;446559;446560;446561;446562;446563;446564;446565;446566;446567;446568;446569;446570;446571;446572;446573;446574;446575;446576;446577 570362;570363;570364;570365;570366;570367;570368;570369;570370;570371;570372;570373;570374;570375;570376;570377;570378;570379;570380;570381;570382;570383;570384;570385;570386;570387;570388;570389;570390 570372 27 VYDEEVEEPVLK Unmodified 1447.7082 0.70824124 74 A0A087WYF6;E7ESD2;A0A0A0MR88;A0A096LPC5;Q9Y4E1;Q641Q2;F8W7U3;J3KP36;A0A0A0MT65 FAM21A;FAM21C WASH complex subunit FAM21C;WASH complex subunit FAM21A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 69.165 69.165 2 0.0023597 69581 QUIQUE_DMIX8_190116_001 75.387 66.629 30982000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30982000 49618 74 46331 446578;446579;446580;446581;446582;446583;446584;446585 570391;570392;570393;570394;570395;570396;570397;570398 570398 8 VYDESIQLDHK Unmodified 1345.6514 0.65139506 2911 Q07954 LRP1 Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 85 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 0 1 1 1 37.185 37.185 2 0.00109 33289 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.263 57.422 31679000 0 0 0 0 0 0 0 0 31679000 0 0 0 0 49619 2911 46332 446586;446587;446588 570399;570400;570401 570399 3 VYDFLSTFITSGMR Unmodified 1635.7967 0.79667909 2656 P55058 PLTP Phospholipid transfer protein yes yes 0 0 0 1 1 160.5 160.5 2 0.0088428 164529 QUIQUE_DMIX8_190116_001 61.344 50.131 30329000 0 0 0 30329000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49620 2656 46333 446589;446590 570402;570403 570403 1 VYDPSTSTLNVR Unmodified 1350.6779 0.67794416 90 A0A087X0A8;D6RGG3;Q99715;H0Y4P7 COL12A1 Collagen alpha-1(XII) chain yes no 0 0 0 1 1 1 56.678 56.678 2 0.0019401 55980 QUIQUE_C1218_190116_001 78.098 58.311 126810000 78543000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 48269000 0 0 49621 90 46334 446591;446592;446593 570404;570405;570406;570407 570405 4 VYDQMPEPR Unmodified 1133.5175 0.51754412 1619 O75251;F5H5N1;F5GXJ1 NDUFS7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 40.697 40.697 2 0.020318 36905 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.969 42.828 58623000 20314000 0 0 0 0 0 0 38308000 0 0 0 0 0 49622 1619 46335 446594;446595 570408;570409;570410 570409 3 VYDQVVEDLNSR Unmodified 1435.6943 0.69432251 4238 Q9NP77 SSU72 RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 76.274 76.274 2 0.00081229 77533 QUIQUE_DMIX3_190116_001 118.4 106.91 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49623 4238 46336 446596;446597;446598;446599 570411;570412;570413;570414 570412 4 VYDSLLALPQDLQAAR Unmodified 1771.9468 0.9468488 1425 O14493;O95484;P56747;O15551 CLDN4;CLDN9;CLDN6;CLDN3 Claudin-4;Claudin-9;Claudin-6;Claudin-3 yes no 0 0 0 1 133.08 133.08 2 0.00095309 138067 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.153 37.267 37118000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37118000 49624 1425 46337 446600 570415 570415 1 VYEDPALSAIFLHNNYNYILK Unmodified 2496.2689 0.26891122 173 A0A0A0MSB8;Q9UPT5;B4DJ07;A0A0A0MRE1 EXOC7 Exocyst complex component 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 143.15 143.15 3 9.5703E-10 149078 QUIQUE_C1218_190116_001 102.89 95.449 581040000 54682000 51535000 0 51020000 64004000 0 62220000 57385000 64386000 25094000 72521000 78188000 0 49625 173 46338 446601;446602;446603;446604;446605;446606;446607;446608;446609;446610 570416;570417;570418;570419;570420;570421;570422;570423;570424;570425;570426;570427 570417 12 VYEFLDKLDVVR Unmodified 1494.8082 0.80823006 1516 O43242;H0YGV8 PSMD3 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 1 110.17 110.17 2;3 0.00034693 113867 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.258 72.381 393810000 0 0 24549000 0 31109000 0 20566000 37411000 75851000 0 103000000 56027000 45300000 49626 1516 46339 446611;446612;446613;446614;446615;446616;446617;446618;446619;446620;446621;446622;446623;446624;446625 570428;570429;570430;570431;570432;570433;570434;570435;570436;570437;570438;570439;570440;570441;570442;570443 570436 16 VYEGERPLTK Unmodified 1190.6295 0.62953741 2007 P11021 HSPA5 78 kDa glucose-regulated protein yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 1 18.458 18.458 2;3 0.0014908 10961 QUIQUE_C1576_190116_001 75.509 44.015 13130000000 1199200000 1541400000 1155600000 1294200000 1449800000 1258300000 1389400000 497670000 0 454830000 1860400000 784350000 245150000 49627 2007 46340 446626;446627;446628;446629;446630;446631;446632;446633;446634;446635;446636;446637;446638;446639;446640;446641;446642;446643;446644;446645;446646 570444;570445;570446;570447;570448;570449;570450;570451;570452;570453;570454;570455;570456;570457;570458;570459;570460;570461;570462;570463;570464 570457 18 VYEGGSNVDQFVTR Unmodified 1569.7423 0.74233534 3468 Q7Z6G3;H3BPH6 NECAB2 N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 68.994 68.994 2 1.6902E-07 69481 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Unmodified 1632.8763 0.87630962 4081 S4R369;Q9BZE1 MRPL37 39S ribosomal protein L37, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 136.09 136.09 2 0.012726 140349 QUIQUE_DMIX7_190116_001 51.841 37.422 44185000 0 0 0 0 0 0 0 17241000 0 0 0 26945000 0 49631 4081 46344 446667;446668 570485;570486 570486 2 VYEIQDIYENSWTK Unmodified 1786.8414 0.84138068 574 B0QY89;Q9Y262;C9JHP4;C9K0Q7 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 122.66 122.66 2 3.0612E-14 119600 QUIQUE_DMIX4_190116_001 146.16 123.48 250790000 68379000 78010000 0 72746000 0 0 0 0 0 31654000 0 0 0 49632 574 46345 446669;446670;446671;446672;446673;446674;446675;446676;446677 570487;570488;570489;570490;570491;570492;570493;570494;570495;570496 570494 10 VYELIDALSK Unmodified 1149.6281 0.62814043 4133 Q9H1K0;H7C204 RBSN Rabenosyn-5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 106.53 106.53 2 0.016133 103830 QUIQUE_DMIX4_190116_001 82.749 68.235 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49633 4133 46346 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non-receptor type 11 yes yes 0 1 0 1 1 35.834 35.834 2 0.0045603 31326 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.716 73.475 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49636 2898 46348 446695;446696 570515;570516 570516 2380 2 VYENYPTYDLTER Unmodified 1661.7573 0.7573167 2384 P35659;B4DFG0;H0Y993 DEK Protein DEK yes no 0 0 0 1 1 81.882 81.882 2 0.0076935 84522 QUIQUE_DMIX5_190116_001 62.408 55.434 70041000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 37273000 32768000 0 49637 2384 46349 446697;446698 570517;570518 570517 1 VYESIGQYGGETVK Unmodified 1528.7409 0.74093835 3583 Q8N3R9 MPP5 MAGUK p55 subfamily member 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 60.509 60.509 2 0.00085931 59489 QUIQUE_C1277_190116_001 80.782 55.929 120800000 0 39568000 0 0 45845000 0 0 0 0 0 0 35389000 0 49638 3583 46350 446699;446700;446701;446702;446703;446704;446705;446706 570519;570520;570521;570522;570523;570524;570525;570526 570520 8 VYEVATFYTMYNR Unmodified 1655.7654 0.76537896 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 115.62 115.62 2;3 1.5551E-05 119318 QUIQUE_C1277_190116_001 151.22 94.653 1046400000 15646000 110570000 66378000 0 58329000 72981000 80376000 139530000 105890000 0 124220000 139500000 132990000 49639 856 46351 446707;446708;446709;446710;446711;446712;446713;446714;446715;446716;446717;446718;446719 570527;570528;570529;570530;570531;570532;570533;570534;570535;570536;570537;570538;570539;570540;570541;570542 570528 14 VYEVATFYTMYNR Oxidation (M) 1671.7603 0.76029359 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 100.56 100.56 2 0.063794 103742 QUIQUE_DMIX3_190116_001 54.471 42.605 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49640 856 46351 446720 570543 570543 1 VYFGGFFIR Unmodified 1104.5757 0.57565135 4304 Q9NVE7;A0A0G2JR38;E9PHT6;H0YA26;H0YA31 PANK4 Pantothenate kinase 4 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 128.82 128.82 2 0.025868 132659 QUIQUE_DMIX7_190116_001 69.176 37.24 372680000 38603000 0 70723000 0 0 0 0 50773000 61531000 0 0 72185000 78863000 49641 4304 46352 446721;446722;446723;446724;446725;446726 570544;570545;570546;570547;570548;570549 570548 6 VYFHTDAAQAVGK Unmodified 1405.699 0.69901396 4647 Q9Y697;F2Z2E7 NFS1 Cysteine desulfurase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 41.853 41.853 3 0.036585 38415 QUIQUE_C1218_190116_001 21.668 13.802 40747000 40747000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49642 4647 46353 446727 570550 570550 1 VYFTWLAPSDEDK Unmodified 1569.7351 0.73512469 3419 Q6Y288 B3GALTL Beta-1,3-glucosyltransferase yes yes 0 0 0 1 1 122.78 122.78 2 0.0019607 126893 QUIQUE_C1277_190116_001 89.548 71.684 39210000 0 39210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49643 3419 46354 446728;446729 570551;570552;570553;570554 570553 4 VYFVNHNTR Unmodified 1148.5727 0.57269123 3884 Q96J02 ITCH E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 19.597 19.597 3 0.0057643 12179 QUIQUE_C1277_190116_001 56.013 46.217 97317000 0 43380000 0 0 0 0 53937000 0 0 0 0 0 0 49644 3884 46355 446730;446731;446732 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570560;570561;570562;570563;570564;570565;570566;570567;570568;570569;570570;570571;570572;570573;570574;570575;570576;570577;570578;570579;570580;570581;570582;570583;570584;570585;570586;570587;570588 570583 29 VYGAQNEMCLATQQLSK Unmodified 1939.9132 0.91318219 3645 Q8NEU8;F8VXB0;F8W124 APPL2 DCC-interacting protein 13-beta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.777 88.777 2 1.212E-52 90692 QUIQUE_C1277_190116_001 177.81 166.18 220650000 43243000 44933000 0 0 0 0 32113000 0 0 0 0 52409000 47955000 49647 3645 46358 446748;446749;446750;446751;446752;446753;446754;446755;446756;446757 570589;570590;570591;570592;570593;570594;570595;570596;570597;570598 570590 6 VYGDIIHTPAK Unmodified 1212.6503 0.65027285 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 3 2 2 2 1 2 2 2 2 40.191 40.191 2;3 1.1955E-05 36200 QUIQUE_C1277_190116_001 143.7 128.04 5305800000 518540000 584170000 0 576140000 662770000 431400000 811920000 261870000 0 111660000 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VYGPGVEK Unmodified 847.44397 0.44396847 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 19.454 19.454 2 0.018748 12377 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.451 44.25 75785000 0 0 0 0 0 0 0 28280000 0 47504000 0 0 0 49651 3061 46362 446783;446784 570636;570637 570636 1 VYGSFLVNPESGYNVSLLYDLENLPASK Unmodified 3087.5441 0.54408303 1486 O15144 ARPC2 Actin-related protein 2/3 complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 167.7 167.7 2;3 6.4052E-65 169652 QUIQUE_DMIX1_190116_001 194.19 184.4 1687900000 0 0 180830000 0 32725000 63940000 355970000 52447000 54900000 0 865260000 81804000 0 49652 1486 46363 446785;446786;446787;446788;446789;446790;446791;446792;446793;446794 570638;570639;570640;570641;570642;570643;570644;570645;570646;570647;570648 570643 11 VYGTAAVNSPVVSWK Unmodified 1576.8249 0.82494275 2250 P26232;A0A0A0MRI5;A0A0A0MTJ6 CTNNA2 Catenin alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.847 86.847 2 7.9614E-13 89240 QUIQUE_C1576_190116_001 135.66 121.76 2533300000 159210000 180180000 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571301;571302;571303;571304;571305;571306;571307;571308;571309;571310;571311;571312;571313;571314;571315;571316;571317;571318;571319;571320 571320 18 VYTIRPYFPK Unmodified 1282.7074 0.7073938 1579 O60502 MGEA5 Protein O-GlcNAcase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 65.997 65.997 3 0.0018929 64426 QUIQUE_DMIX8_190116_001 70.399 57.444 442140000 0 29227000 0 0 41177000 29308000 60140000 66248000 48370000 0 0 56691000 110980000 49715 1579 46423 447343;447344;447345;447346;447347;447348;447349;447350 571321;571322;571323;571324;571325;571326;571327;571328;571329 571329 9 VYTITPLLSDNR Unmodified 1390.7456 0.7456298 2347 P32121;K7EL17;Q68DZ5 ARRB2;DKFZp686L0365 Beta-arrestin-2 yes no 0 0 0 1 1 95.595 95.595 2 0.03525 93147 QUIQUE_DMIX4_190116_001 52.49 27.652 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49716 2347 46424 447351;447352 571330;571331 571330 2 VYTLSVSGDR Unmodified 1095.556 0.55603812 1307 J3QT28;O43684 BUB3 Mitotic checkpoint protein BUB3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.147 49.147 2 0.0011057 46252 QUIQUE_C1403_190116_001 101.64 72.917 692020000 62646000 75113000 93291000 61035000 70410000 63199000 63315000 57135000 58879000 20154000 0 0 66844000 49717 1307 46425 447353;447354;447355;447356;447357;447358;447359;447360;447361;447362;447363 571332;571333;571334;571335;571336;571337;571338;571339;571340;571341;571342 571335 11 VYTLTPFLANNR Unmodified 1407.751 0.75104953 2528;1150 P49407;H0YET9 ARRB1 Beta-arrestin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 104.01 104.01 2 0.00037685 106950 QUIQUE_DMIX1_190116_001 135.79 107.39 1368700000 0 0 0 0 49994000 0 0 376980000 292300000 0 158010000 212260000 279120000 49718 2528;1150 46426 447364;447365;447366;447367;447368;447369 571343;571344;571345;571346;571347;571348;571349 571344 7 VYTPVGK Unmodified 762.42759 0.42759012 959 E9PLK3;P55786 NPEPPS Puromycin-sensitive aminopeptidase yes no 0 0 0 1 19.201 19.201 2 0.049128 12006 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.311 53.608 223620000 0 0 0 0 0 0 0 223620000 0 0 0 0 0 49719 959 46427 447370 571350 571350 1 VYTSMSDCLIK Oxidation (M) 1331.6101 0.61012387 4190 Q9H936;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;E9PS95;K4DIB6;K4DIB3;A0A0D9SFA8;K4DIB0;K4DIA2;A0A0D9SG84;E9PI74;E9PQ36;E9PJY0;A0A0A6YYN8;K4DIB4 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 1 0 1 1 45.938 45.938 2 0.021171 42985 QUIQUE_C1218_190116_001 56.013 27.096 25506000 25506000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49720 4190 46428 447371;447372 571351;571352 571351 2 VYTSMSDCLIK Unmodified 1315.6152 0.61520925 4190 Q9H936;A0A0D9SFE1;A0A0D9SEI9;K4DIA8;K4DIB8;E9PS95;K4DIB6;K4DIB3;A0A0D9SFA8;K4DIB0;K4DIA2;A0A0D9SG84;E9PI74;E9PQ36;E9PJY0;A0A0A6YYN8;K4DIB4 SLC25A22 Mitochondrial glutamate carrier 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 69.375 69.375 2 0.0046107 69670 QUIQUE_C1277_190116_001 81.525 58.096 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49721 4190 46428 447373;447374;447375;447376 571353;571354;571355;571356 571353 4 VYTVGPDYAHAEAR Unmodified 1547.7369 0.73685603 652 F8W9A8;B7WPL9;Q6PFW1;A0A087WZV0;O43314;D6RBU4 PPIP5K1;PPIP5K2 Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 1;Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 41.859 41.859 3 0.049167 39059 QUIQUE_C1438_190116_001 42.568 32.243 99521000 0 0 0 0 25285000 0 0 0 0 0 46756000 27480000 0 49722 652 46429 447377;447378;447379 571357;571358;571359 571357 2 VYTVVDEMFLAGEIR Unmodified 1740.8757 0.87565769 1366 M0R0N4;M0QYZ2;P53680;X6R390;M0QZ21 AP2S1 AP-2 complex subunit sigma no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 148.9 148.9 2;3 1.8947E-06 153358 QUIQUE_DMIX7_190116_001 100.55 85.352 70639000 22305000 0 0 0 0 0 16199000 0 24915000 7218400 0 0 0 49723 1366 46430 447380;447381;447382;447383;447384;447385;447386;447387 571360;571361;571362;571363;571364;571365;571366;571367 571367 5 VYTVVDEMFLAGEIR Oxidation (M) 1756.8706 0.87057232 1366 M0R0N4;M0QYZ2;P53680;X6R390;M0QZ21 AP2S1 AP-2 complex subunit sigma no no 0 1 0 1 124.12 124.12 2 0.022698 129277 QUIQUE_C1576_190116_001 58.274 40.907 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 49724 1366 46430 447388 571368 571368 1 VYVAESLISSAGEGLFSK Unmodified 1855.9567 0.95674479 3693 Q8WTS6;D6RJA0 SETD7 Histone-lysine N-methyltransferase SETD7 yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 2 1 1 1 141.85 141.85 2;3 0.00029303 147126 QUIQUE_C1368_190116_001 101.62 85.868 858030000 60162000 67735000 117560000 89797000 71888000 62344000 101370000 15596000 94813000 38304000 73742000 0 64707000 49725 3693 46431 447389;447390;447391;447392;447393;447394;447395;447396;447397;447398;447399;447400;447401;447402;447403 571369;571370;571371;571372;571373;571374;571375;571376;571377;571378;571379;571380;571381;571382;571383 571372 11 VYVANAGDSR Unmodified 1050.5094 0.50942227 3275 Q5JR12;S4R3I3 PPM1J Protein phosphatase 1J yes no 0 0 0 1 1 1 17.867 17.867 2 0.0065533 9972 QUIQUE_C1277_190116_001 74.464 48.728 64969000 25769000 21702000 0 0 0 17498000 0 0 0 0 0 0 0 49726 3275 46432 447404;447405;447406 571384;571385;571386 571385 3 VYVGNLGNNGNK Unmodified 1247.6258 0.62584901 2831 P84103;A0A087X2D0 SRSF3 Serine/arginine-rich splicing factor 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.536 29.536 2 0.0006617 23685 QUIQUE_C1403_190116_001 90.657 59.583 1392300000 80865000 87057000 0 69136000 132190000 116240000 86753000 132170000 191610000 57648000 243750000 194900000 0 49727 2831 46433 447407;447408;447409;447410;447411;447412;447413;447414;447415;447416;447417 571387;571388;571389;571390;571391;571392;571393;571394;571395;571396;571397 571389 11 VYVGNLGNNGNKTELER Unmodified 1875.9439 0.94388869 2831 P84103;A0A087X2D0 SRSF3 Serine/arginine-rich splicing factor 3 yes no 0 0 1 1 1 1 43.794 43.794 2;3 1.1661E-11 40624 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.95 100.72 149430000 0 0 0 0 0 0 0 126900000 0 0 22532000 0 0 49728 2831 46434 447418;447419;447420 571398;571399;571400 571399 3 VYVGNLGTGAGK Unmodified 1134.6033 0.60332266 208 A0A0B4J1Z1;C9JAB2;Q16629 SRSF7 Serine/arginine-rich splicing factor 7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.726 38.726 2 4.9858E-05 34287 QUIQUE_C1368_190116_001 126.31 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Epoxide hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 149.69 149.69 2;3 1.215E-05 145519 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.207 65.607 2458700000 87432000 133450000 146670000 174520000 137700000 126440000 189820000 271160000 324080000 38552000 331450000 217080000 280370000 49732 1912 46438 447436;447437;447438;447439;447440;447441;447442;447443;447444;447445;447446;447447;447448;447449 571419;571420;571421;571422;571423;571424;571425;571426;571427;571428;571429;571430;571431;571432;571433;571434;571435;571436 571431 18 VYVQHLLK Unmodified 998.5913 0.59130141 2109 P16435;H0Y4R2;E7EMD0 POR NADPH--cytochrome P450 reductase yes no 0 0 0 1 1 1 1 31.779 31.779 2 0.027762 25841 QUIQUE_C1403_190116_001 69.383 38.665 73853000 29267000 0 0 34224000 0 0 0 0 0 10361000 0 0 0 49733 2109 46439 447450;447451;447452;447453 571437;571438;571439;571440 571438 4 VYVQQNNVENVYNLGLIIFR Unmodified 2394.2696 0.26957993 3017 Q13618;H7C1L6 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 162.03 162.03 2;3 2.4516E-38 164408 QUIQUE_DMIX1_190116_001 194.24 182.45 217980000 0 27600000 0 0 0 41198000 0 18981000 33301000 22522000 40238000 34142000 0 49734 3017 46440 447454;447455;447456;447457;447458;447459;447460;447461 571441;571442;571443;571444;571445;571446;571447;571448 571443 7 VYVSGLMK Unmodified 895.48372 0.48372479 4234 Q9HDC9;H0Y512 APMAP Adipocyte plasma membrane-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 49.381 49.381 2 0.023413 46885 QUIQUE_C1368_190116_001 73.324 48.473 235990000 0 55423000 62937000 0 0 58340000 0 0 0 0 0 0 59290000 49735 4234 46441 447462;447463;447464;447465 571449;571450;571451;571452 571450 4 VYVSLDQPVTALNLFK Unmodified 1805.9927 0.99273636 244 A0A0C4DGH8;A0A0C4DGY3;A0A0C4DGX9;Q8TAM2;H0YJQ3;A0A0C4DFT4;H0YJX0 TTC8 Tetratricopeptide repeat protein 8 yes no 0 0 0 1 1 1 148.88 148.88 2 3.0122E-05 151965 QUIQUE_DMIX1_190116_001 99.5 86.072 57123000 0 0 18818000 0 0 0 0 16481000 0 0 0 21823000 0 49736 244 46442 447466;447467;447468 571453;571454;571455;571456 571454 2 VYVTLTCAFR Unmodified 1228.6274 0.62742892 2528 P49407;E9PM35;E7ESX4;P10523 ARRB1;SAG Beta-arrestin-1;S-arrestin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 90.317 90.317 2 2.5411E-07 92076 QUIQUE_C1403_190116_001 149.65 109.61 1311200000 82538000 116970000 127760000 92373000 160290000 0 79444000 111600000 113100000 51360000 138310000 237430000 0 49737 2528 46443 447469;447470;447471;447472;447473;447474;447475;447476;447477;447478;447479 571457;571458;571459;571460;571461;571462;571463;571464;571465;571466;571467;571468;571469;571470;571471 571461 15 VYWDNGAQIISPHDK Unmodified 1741.8424 0.84238373 3857 Q96G03 PGM2 Phosphoglucomutase-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 74.18 74.18 2;3 0.0028037 75251 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.719 62.502 273200000 0 0 82975000 61135000 0 0 0 66927000 0 0 0 62164000 0 49738 3857 46444 447480;447481;447482;447483;447484;447485 571472;571473;571474;571475;571476;571477 571476 3 VYWETGAQITSPHDK Unmodified 1730.8264 0.82639932 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 59.847 59.847 2;3 2.5536E-35 59925 QUIQUE_C1218_190116_001 168.98 126.51 990720000 91573000 80498000 127810000 112320000 0 0 504670000 0 0 73838000 0 0 0 49739 3390 46445 447486;447487;447488;447489;447490;447491;447492 571478;571479;571480;571481;571482;571483;571484 571478 7 VYWETGAQITSPHDKEILK Unmodified 2214.1321 0.13208339 3390 Q6PCE3 PGM2L1 Glucose 1,6-bisphosphate synthase yes yes 0 0 1 2 2 1 2 2 2 2 1 3 73.232 73.232 2;3;4 7.9758E-07 73229 QUIQUE_DMIX7_190116_001 115.8 95.378 2321900000 234560000 348690000 120230000 255190000 242940000 0 0 255650000 225090000 0 213380000 426130000 0 49740 3390 46446 447493;447494;447495;447496;447497;447498;447499;447500;447501;447502;447503;447504;447505;447506;447507;447508;447509 571485;571486;571487;571488;571489;571490;571491;571492;571493;571494;571495;571496;571497;571498;571499;571500;571501;571502;571503;571504 571503 16 VYWVEESTAR Unmodified 1238.5932 0.5931519 2448 P42356;C9JLI1 PI4KA 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447514;447515;447516;447517;447518;447519;447520;447521;447522;447523;447524;447525;447526;447527;447528;447529;447530;447531;447532;447533;447534 571509;571510;571511;571512;571513;571514;571515;571516;571517;571518;571519;571520;571521;571522;571523;571524;571525;571526;571527;571528;571529;571530 571513 21 VYYFNHITNASQWERPSGNSSSGGK Unmodified 2785.2845 0.28445472 3008 Q13526;K7EMU7 PIN1 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 71.266 71.266 3;4 3.1708E-20 72069 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.67 100.25 689880000 0 0 0 0 0 0 0 39546000 134150000 0 145700000 164700000 205780000 49744 3008 46450 447535;447536;447537;447538;447539;447540;447541;447542;447543 571531;571532;571533;571534;571535;571536;571537;571538;571539;571540 571531 10 VYYLSWLR Unmodified 1098.5862 0.58621603 4473;3590;263 E7ENQ1;G3XAA2;H7C360;G5E948;E7EN19;A0A0D9SEY1;O95819;C9J840;E7EX83;A0A0D9SG62;H7C0P6;Q8N4C8;Q9UKE5 MAP4K4;MINK1;TNIK Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4;Misshapen-like kinase 1;TRAF2 and NCK-interacting protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 123.6 123.6 2 0.0036477 128379 QUIQUE_C1218_190116_001 117.93 79.142 167250000 42263000 57948000 0 0 0 0 0 45305000 0 21730000 0 0 0 49745 263;3590;4473 46451 447544;447545;447546;447547;447548 571541;571542;571543;571544;571545;571546;571547;571548;571549 571541 9 VYYTAGYNSPVK Unmodified 1360.6663 0.66631685 4638 Q9Y5Z4 HEBP2 Heme-binding protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.619 54.619 2 4.2751E-06 53111 QUIQUE_C1277_190116_001 136.63 100.24 2690100000 238740000 235820000 222140000 235500000 253210000 0 196870000 235080000 217490000 0 313630000 211370000 330220000 49746 4638 46452 447549;447550;447551;447552;447553;447554;447555;447556;447557;447558;447559 571550;571551;571552;571553;571554;571555;571556;571557;571558;571559;571560;571561 571551 12 VYYVATSSDQPLK Unmodified 1469.7402 0.74021007 866 E7ESC9;Q8IZU2 WDR17 WD repeat-containing protein 17 yes no 0 0 0 1 1 1 58.232 58.232 2 0.0021196 57773 QUIQUE_C1218_190116_001 75.197 36.049 147440000 42499000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56260000 48678000 49747 866 46453 447560;447561;447562 571562;571563;571564;571565 571562 3 WAASLENLLEDPEGVKR Unmodified 1925.9847 0.98469087 1540 O43665 RGS10 Regulator of G-protein signaling 10 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 121.52 121.52 3 4.8502E-17 125623 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.31 89.803 387490000 45575000 37167000 48471000 0 0 35983000 38863000 0 53512000 0 47303000 40109000 40501000 49748 1540 46454 447563;447564;447565;447566;447567;447568;447569;447570;447571 571566;571567;571568;571569;571570;571571;571572;571573;571574;571575;571576;571577;571578 571575 12 WAAVAGR Unmodified 729.39221 0.39220767 201 A0A0A6YYA0;Q9Y3B3;G3V2Y2 TMED7-TICAM2;TMED7 Transmembrane emp24 domain-containing protein 7 yes no 0 0 0 1 1 22.593 22.593 2 0.049861 15760 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.832 52.21 62554000 0 0 0 0 0 0 0 0 41866000 0 0 0 20687000 49749 201 46455 447572;447573 571579;571580 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histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 69.827 69.827 2 7.4916E-06 70646 QUIQUE_C1218_190116_001 123.79 108.38 2341900000 84605000 145030000 386180000 303680000 193760000 137870000 184110000 167550000 142930000 50936000 264560000 90664000 190060000 49750 280;377;393;1891;2063;2104;2314;2315;2316;2317;2318;278;2064 46456 447574;447575;447576;447577;447578;447579;447580;447581;447582;447583;447584;447585;447586;447587 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571705;571706;571707;571708;571709;571710;571711;571712;571713;571714;571715;571716 571705 12 WAHLDIAGVMTNKDEVPYLR Unmodified 2327.1732 0.1732367 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 119.11 119.11 3;4 2.6174E-65 123143 QUIQUE_DMIX3_190116_001 157.12 141.23 2033100000 59371000 116500000 192570000 149120000 133560000 78170000 109720000 398420000 147460000 0 327970000 186680000 133600000 49761 2282 46467 447669;447670;447671;447672;447673;447674;447675;447676;447677;447678;447679;447680;447681 571717;571718;571719;571720;571721;571722;571723;571724;571725;571726;571727;571728;571729;571730;571731;571732;571733;571734;571735;571736;571737;571738 571731 21 WAHLDIAGVMTNKDEVPYLR Oxidation (M) 2343.1682 0.16815132 2282 P28838 LAP3 Cytosol aminopeptidase yes yes 0 1 1 1 1 1 1 101.54 101.54 4 5.9197E-05 104791 QUIQUE_C1368_190116_001 70.114 61.291 253790000 0 0 62119000 0 0 0 0 69094000 0 0 80765000 41814000 0 49762 2282 46467 447682;447683;447684;447685 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WDQTADQTPGATPK Unmodified 1514.7001 0.70013617 1644 O75533 SF3B1 Splicing factor 3B subunit 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 35.917 35.917 2 0.011219 31751 QUIQUE_DMIX5_190116_001 55.261 36.821 90293000 0 0 0 0 0 0 0 0 31895000 0 36765000 21633000 0 49817 1644 46521 448052;448053;448054;448055 572155;572156;572157;572158 572157 4 WDRPQIVCTKPR Unmodified 1554.8089 0.80891553 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 2 1 1 1 1 34.986 34.986 3;4 0.020964 29649 QUIQUE_DMIX3_190116_001 46.159 30.021 200980000 0 0 0 0 0 0 0 53905000 53347000 20922000 0 72802000 0 49818 1436 46522 448056;448057;448058;448059 572159;572160;572161;572162 572160 4 WDSCAAHAILR Unmodified 1298.619 0.6189895 2531 P49441 INPP1 Inositol polyphosphate 1-phosphatase yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 54.685 54.685 2;3 0.0019052 52956 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.08 41.214 613450000 0 57198000 158350000 42440000 81526000 37716000 0 37982000 68985000 21488000 0 107770000 0 49819 2531 46523 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1 yes yes 0 0 0 1 149.86 149.86 2 0.00038085 157473 QUIQUE_DMIX5_190116_001 94.616 74.854 30664000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30664000 0 0 49890 2192 46592 448567 572794 572794 1 WFVLVDR Unmodified 933.50724 0.50723743 351 Q5VTI5;A0A1B0GUN5;Q9Y2H5 PLEKHA6 Pleckstrin homology domain-containing family A member 6 yes no 0 0 0 1 101.54 101.54 2 0.062051 106236 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.485 49.008 15398000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15398000 0 0 49891 351 46593 448568 572795 572795 1 WFVTCVR Unmodified 966.47456 0.47455709 2254 P26640;A0A140T936;A0A140T954 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 71.831 71.831 2 0.02784 72647 QUIQUE_DMIX1_190116_001 92.692 20.672 269440000 0 37516000 0 42836000 43096000 0 0 41288000 0 0 62139000 0 42562000 49892 2254 46594 448569;448570;448571;448572;448573;448574 572796;572797;572798;572799;572800;572801;572802 572800 7 WFYIASAFR Unmodified 1159.5815 0.581465 1835;2151 P19652;P02763 ORM2;ORM1 Alpha-1-acid glycoprotein 2;Alpha-1-acid glycoprotein 1 no no 0 0 0 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WGASTATTQK Unmodified 1049.5142 0.5141733 4745 S4R3H4;E7EQT4;Q9UKV3;G3V3B0;G3V3T3 ACIN1 Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus yes no 0 0 0 1 1 19.487 19.487 2 0.015687 12155 QUIQUE_C1438_190116_001 63.216 38.365 128320000 0 0 0 0 50404000 0 0 77920000 0 0 0 0 0 49897 4745 46599 448615;448616 572861;572862 572861 2 WGDAGAEYVVESTGVFTTMEK Oxidation (M) 2292.0256 0.025628988 1863 P04406;E7EUT5 GAPDH Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 1 0 29 35 58 25 13 19 16 29 44 15 36 27 21 149.97 149.97 2;3 5.6558E-146 141604 QUIQUE_DMIX5_190116_001 230.86 218.94 11648000000 1003600000 1299100000 1630900000 908200000 440670000 732290000 570200000 776500000 773740000 927310000 914990000 1075400000 595180000 49898 1863 46600 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Unmodified 1097.5658 0.56581494 3352 Q68DU8 KCTD16 BTB/POZ domain-containing protein KCTD16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 111.9 111.9 2 0.018828 116530 QUIQUE_C1218_190116_001 73.26 44.748 62604000 31982000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 30622000 0 49907 3352 46608 450047;450048;450049;450050;450051;450052;450053;450054;450055 574918;574919;574920;574921;574922;574923;574924;574925;574926 574918 9 WGFSFDEILK Unmodified 1240.6128 0.61282471 32 A0A0A0MRA9;B7Z2N1;A0A087WTW9;P49758;B7Z7N5 RGS6 Regulator of G-protein signaling 6 yes no 0 0 0 1 1 1 107.45 107.45 2;3 0.028562 155492 QUIQUE_C1368_190116_001 54.982 35.195 36387000 0 0 9350200 0 0 0 0 0 0 0 27036000 0 0 49908 32 46609 450056;450057;450058 574927;574928;574929 574927 3 WGGSSFQDIQR Unmodified 1279.5945 0.59454889 272 A0A0D9SFU4;O95970;A0A1B0GVF6 LGI1 Leucine-rich glioma-inactivated protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 67.88 67.88 2 0.02458 67125 QUIQUE_C1403_190116_001 70.1 52.714 128330000 0 64963000 0 43290000 0 0 0 0 0 20080000 0 0 0 49909 272 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no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.486 67.486 2 3.0378E-23 66981 QUIQUE_DMIX3_190116_001 199.08 152.61 5110000000 432000000 500290000 404380000 416230000 439820000 277560000 423810000 386470000 380750000 172610000 456390000 438920000 380800000 49948 3123 46648 450380;450381;450382;450383;450384;450385;450386;450387;450388;450389;450390;450391;450392 575300;575301;575302;575303;575304;575305;575306;575307;575308;575309;575310;575311;575312;575313;575314;575315;575316;575317;575318;575319;575320;575321;575322;575323;575324;575325;575326;575327;575328;575329;575330;575331 575319 32 WIDIHNPATNEVIGR Unmodified 1733.8849 0.88491725 2870 Q02252 ALDH6A1 Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial yes yes 0 0 0 3 2 4 2 2 2 2 3 2 2 2 2 2 90.39 90.39 2;3 9.5781E-36 92358 QUIQUE_C1368_190116_001 174.24 141.3 7977800000 965500000 727350000 942020000 774610000 650970000 822000000 766150000 231050000 389420000 395940000 542440000 366990000 403330000 49949 2870 46649 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heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 3 3 3 2 2 3 3 3 3 3 2 3 2 117.74 117.74 2;3 5.0075E-41 123309 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.04 161.53 11281000000 1023400000 1072400000 771100000 849220000 1089800000 700280000 915100000 788630000 894810000 410140000 946690000 1041100000 778600000 50022 50 46717 451038;451039;451040;451041;451042;451043;451044;451045;451046;451047;451048;451049;451050;451051;451052;451053;451054;451055;451056;451057;451058;451059;451060;451061;451062;451063;451064;451065;451066;451067;451068;451069;451070;451071;451072 576126;576127;576128;576129;576130;576131;576132;576133;576134;576135;576136;576137;576138;576139;576140;576141;576142;576143;576144;576145;576146;576147;576148;576149;576150;576151;576152;576153;576154;576155;576156;576157;576158;576159;576160;576161;576162;576163;576164;576165;576166;576167;576168;576169;576170;576171;576172;576173;576174;576175;576176;576177;576178;576179;576180;576181;576182;576183;576184;576185;576186;576187;576188;576189;576190;576191;576192;576193;576194;576195;576196;576197;576198;576199 576184 74 WLLNEFPVFITMDK Oxidation (M) 1767.8906 0.89057948 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 1 0 2 2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 160.92 160.92 2;3 1.8681E-10 166909 QUIQUE_C1576_190116_001 135.99 113.11 3897700000 272110000 331880000 392750000 297800000 294100000 337630000 361480000 269570000 300770000 155760000 306590000 327840000 249400000 50023 2948 46718 451073;451074;451075;451076;451077;451078;451079;451080;451081;451082;451083;451084;451085;451086;451087;451088;451089;451090;451091;451092;451093 576200;576201;576202;576203;576204;576205;576206;576207;576208;576209;576210;576211;576212;576213;576214;576215;576216;576217;576218;576219;576220;576221;576222;576223;576224;576225;576226;576227;576228;576229;576230;576231;576232;576233;576234;576235 576220 2421 36 WLLNEFPVFITMDK Unmodified 1751.8957 0.89566485 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.54 167.54 2 8.0936E-07 169598 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.26 132.13 6160000000 406720000 504380000 858080000 0 453050000 0 691660000 398830000 824420000 71479000 881930000 572020000 497400000 50024 2948 46718 451094;451095;451096;451097;451098;451099;451100;451101;451102;451103;451104 576236;576237;576238;576239;576240;576241;576242;576243;576244;576245;576246;576247;576248 576243 13 WLLNEFPVFITMDKR Unmodified 1907.9968 0.99677588 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 153.25 153.25 2;3 5.8873E-07 160411 QUIQUE_DMIX5_190116_001 101.36 84.828 398340000 0 0 0 0 0 0 0 45772000 60516000 0 131730000 76516000 83811000 50025 2948 46719 451105;451106;451107;451108;451109;451110 576249;576250;576251;576252;576253;576254;576255;576256 576252 8 WLLSPSTTLR Unmodified 1172.6554 0.65535823 4560 Q9Y2J8 PADI2 Protein-arginine deiminase type-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.752 98.752 2 0.0001578 101139 QUIQUE_DMIX8_190116_001 122.52 93.599 12409000000 759420000 548210000 937380000 910290000 868210000 951650000 1209600000 1066500000 1092500000 634170000 1008300000 928660000 1493600000 50026 4560 46720 451111;451112;451113;451114;451115;451116;451117;451118;451119;451120;451121;451122;451123 576257;576258;576259;576260;576261;576262;576263;576264;576265;576266;576267;576268;576269;576270;576271;576272;576273;576274;576275;576276;576277;576278;576279;576280 576280 24 WLLYLVK Unmodified 933.56878 0.56877505 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 0 1 120.31 120.31 2 0.05526 116851 QUIQUE_DMIX4_190116_001 72.021 38.329 24191000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24191000 0 0 0 50027 2207 46721 451124 576281 576281 1 WLMDGTVLCK Oxidation (M) 1237.5835 0.58351519 4444 Q9UI15 TAGLN3 Transgelin-3 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 74.377 74.377 2 0.013366 75615 QUIQUE_C1218_190116_001 67.563 42.64 276160000 54376000 60703000 0 0 37417000 46673000 0 0 0 0 0 76995000 0 50028 4444 46722 451125;451126;451127;451128;451129;451130;451131 576282;576283;576284;576285;576286;576287;576288;576289;576290 576282 2967 9 WLMDGTVLCK Unmodified 1221.5886 0.58860057 4444 Q9UI15 TAGLN3 Transgelin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.31 105.31 2 0.0012888 108470 QUIQUE_C1277_190116_001 99.442 88.29 3330200000 344920000 382750000 278030000 250390000 222130000 223250000 307460000 213930000 193330000 70877000 266820000 250830000 325470000 50029 4444 46722 451132;451133;451134;451135;451136;451137;451138;451139;451140;451141;451142;451143;451144 576291;576292;576293;576294;576295;576296;576297;576298;576299;576300;576301;576302;576303;576304;576305;576306;576307 576292 17 WLMHLAPGFK Unmodified 1198.6321 0.63212037 4156 Q9H3H3 C11orf68 UPF0696 protein C11orf68 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.347 89.347 3 0.0069684 93173 QUIQUE_C1218_190116_001 51.528 39.321 294550000 22194000 28638000 27972000 20837000 25705000 19226000 29434000 19187000 19175000 0 35409000 21604000 25173000 50030 4156 46723 451145;451146;451147;451148;451149;451150;451151;451152;451153;451154;451155;451156 576308;576309;576310;576311;576312;576313;576314;576315;576316;576317;576318;576319 576308 12 WLNENAVEK Unmodified 1101.5455 0.54547343 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.626 43.626 2 0.0016605 39889 QUIQUE_DMIX8_190116_001 101.43 52.869 3369700000 372810000 364820000 283850000 0 267010000 283680000 280890000 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Unmodified 1276.6564 0.65642086 2382 P35612 ADD2 Beta-adducin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 84.939 84.939 2 2.1363E-11 86152 QUIQUE_DMIX1_190116_001 160.88 103.6 2970700000 224190000 300970000 255550000 0 253120000 177140000 297110000 275810000 243180000 77569000 303590000 237070000 325390000 50034 2382 46726 451180;451181;451182;451183;451184;451185;451186;451187;451188;451189;451190;451191 576347;576348;576349;576350;576351;576352;576353;576354;576355;576356;576357;576358;576359;576360;576361;576362;576363;576364;576365;576366 576357 20 WLNVHYHCSGAPAAPLQ Unmodified 1919.9101 0.91008614 412;3299 A0A2Q3DQE3;Q13555;H0Y6G2;Q5SWX3 CAMK2G Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit gamma no no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 2 2 1 1 1 2 2 75.872 75.872 2;3 1.7466E-05 77706 QUIQUE_C1438_190116_001 96.489 79.349 3391600000 346050000 409580000 324970000 339790000 146200000 244660000 440680000 184690000 94115000 102130000 218190000 280680000 259870000 50035 412;3299 46727 451192;451193;451194;451195;451196;451197;451198;451199;451200;451201;451202;451203;451204;451205;451206;451207;451208;451209;451210;451211;451212;451213 576367;576368;576369;576370;576371;576372;576373;576374;576375;576376;576377;576378;576379;576380;576381;576382;576383;576384;576385;576386;576387;576388;576389;576390 576375 23 WLPAAATFPVQDPASGAALGMVADCGVR Oxidation (M) 2843.3735 0.37346942 2588 P51649;C9J8Q5 ALDH5A1 Succinate-semialdehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 2 2 2 1 1 2 2 141.39 141.39 2;3 6.6908E-44 145778 QUIQUE_C1277_190116_001 131.45 122.16 1285800000 105570000 149820000 186480000 0 149600000 139620000 102080000 112980000 0 0 186460000 153180000 0 50036 2588 46728 451214;451215;451216;451217;451218;451219;451220;451221;451222;451223;451224;451225;451226;451227;451228 576391;576392;576393;576394;576395;576396;576397;576398;576399;576400;576401;576402;576403;576404;576405 576393 2040 14 WLPAAATFPVQDPASGAALGMVADCGVR Unmodified 2827.3786 0.3785548 2588 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acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 2 98.562 98.562 2;3 0.00033844 101082 QUIQUE_DMIX3_190116_001 100.38 70.318 456370000 0 0 0 148230000 0 0 0 114080000 194060000 0 0 0 0 50064 2524 46753 451468;451469;451470;451471 576719;576720;576721;576722 576721 2 WLTIQSGEQPYK Unmodified 1448.73 0.72997974 1559 O43920 NDUFS5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 81.356 81.356 2 9.249E-06 82872 QUIQUE_C1576_190116_001 154.56 73.008 2370400000 201120000 218410000 174580000 140500000 133330000 133360000 214260000 188670000 177660000 60621000 271760000 241310000 214790000 50065 1559 46754 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Q03154;A0A1B0GW23;A0A1B0GU86 ACY1 Aminoacylase-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 138.31 138.31 3 2.2651E-07 145015 QUIQUE_DMIX5_190116_001 87.156 65.758 223430000 0 0 0 0 0 0 0 45797000 0 0 74886000 54325000 48424000 50086 2885 46773 451588;451589;451590;451591 576845;576846;576847;576848 576846 3 WMIDSRDDFTEER Unmodified 1698.7308 0.73078437 2187 P21912 SDHB Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial yes yes 0 0 1 1 84.79 84.79 3 0.061541 85508 QUIQUE_DMIX1_190116_001 37.156 24.773 28808000 0 0 0 0 0 0 0 28808000 0 0 0 0 0 50087 2187 46774 451592 576849 576849 1 WMIPSEAK Oxidation (M) 976.4688 0.46880301 2558 P50213;H0YL72;H0YLI6;H0YMU3;H0YKD0;H0YM64 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 1 56.813 56.813 2 0.033164 56929 QUIQUE_C1218_190116_001 69.198 45.674 335570000 76679000 0 77852000 0 66392000 0 0 0 0 0 114650000 0 0 50088 2558 46775 451593;451594;451595;451596 576850;576851;576852;576853;576854 576851 5 WMIPSEAK Unmodified 960.47389 0.47388839 2558 P50213;H0YL72;H0YLI6;H0YMU3;H0YKD0;H0YM64 IDH3A Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.59 64.59 2 0.01526 64234 QUIQUE_DMIX1_190116_001 84.916 57.211 2189700000 231550000 210900000 208490000 161580000 0 161360000 232320000 128380000 173020000 0 249870000 227820000 204360000 50089 2558 46775 451597;451598;451599;451600;451601;451602;451603;451604;451605;451606;451607 576855;576856;576857;576858;576859;576860;576861;576862;576863;576864;576865;576866;576867;576868;576869 576863 15 WMIQYNNLNLK Unmodified 1435.7282 0.7282056 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 110.47 110.47 2 0.00049095 114020 QUIQUE_DMIX3_190116_001 113.5 91.758 1060500000 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Unmodified 1120.6029 0.60292873 4615 Q9Y512 SAMM50 Sorting and assembly machinery component 50 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 95.692 95.692 2 0.0047874 92834 QUIQUE_DMIX4_190116_001 79.713 57.753 113500000 0 41264000 0 0 0 0 0 45646000 0 26589000 0 0 0 50209 4615 46889 452723;452724;452725 578365;578366;578367;578368 578368 4 WTAISALEYGVPVTLIGEAVFAR Unmodified 2462.3209 0.32094679 2602 P52209;K7ELN9 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 1 2 2 2 172.49 172.49 2;3 4.1E-62 173898 QUIQUE_DMIX1_190116_001 215.37 203.9 4071100000 41833000 29336000 184870000 67887000 26131000 0 278670000 455410000 534360000 3198700 1178000000 1002400000 269030000 50210 2602 46890 452726;452727;452728;452729;452730;452731;452732;452733;452734;452735;452736;452737;452738;452739;452740;452741;452742;452743;452744 578369;578370;578371;578372;578373;578374;578375;578376;578377;578378;578379;578380;578381;578382;578383;578384;578385;578386;578387;578388 578379 19 WTAPEALR Unmodified 942.49232 0.49231565 2439 P41240 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes yes 0 0 0 1 56.728 56.728 2 0.035224 54855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.565 0 35778000 0 0 0 0 0 0 0 35778000 0 0 0 0 0 50211 2439 46891 452745 578389 578389 1 WTCCALLAGSEYLK Unmodified 1670.7796 0.77964882 1500 O15371 EIF3D Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 117.78 117.78 2 0.0012984 121614 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.655 61.083 418960000 0 46910000 20625000 33519000 28738000 0 39258000 38200000 59522000 18300000 38259000 59463000 36165000 50212 1500 46892 452746;452747;452748;452749;452750;452751;452752;452753;452754;452755;452756 578390;578391;578392;578393;578394;578395;578396;578397;578398;578399;578400 578400 11 WTDGSTLQYENWR Unmodified 1654.7376 0.73758431 912 E9PF17;P13611 VCAN Versican core protein yes no 0 0 0 1 1 96.057 96.057 2 0.000373 98481 QUIQUE_C1368_190116_001 115.57 102.48 157200000 0 0 115580000 0 0 0 0 0 0 41626000 0 0 0 50213 912 46893 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UBE2V2;UBE2V1;TMEM189-UBE2V1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2;Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.417 89.417 2 0.00015399 91205 QUIQUE_DMIX1_190116_001 137.9 118.13 4917700000 380520000 446290000 433610000 417030000 359240000 343410000 421200000 340570000 364800000 111770000 410410000 371610000 517260000 50223 3164;1244 46901 452810;452811;452812;452813;452814;452815;452816;452817;452818;452819;452820;452821;452822 578483;578484;578485;578486;578487;578488;578489;578490;578491;578492;578493;578494;578495;578496;578497;578498;578499;578500;578501;578502 578494 20 WTLGFCDER Unmodified 1182.5128 0.51279309 1723 O95336;M0R261;M0R1L2;M0R0U3 PGLS 6-phosphogluconolactonase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.063 95.063 2 0.015672 97268 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.54 87.385 2626100000 227800000 203550000 217780000 208070000 205710000 200380000 225110000 228100000 229750000 93742000 281960000 0 304140000 50224 1723 46902 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WTSTSMPWAAAK Oxidation (M) 1351.6231 0.62307182 3438 Q7L266 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes yes 0 1 0 1 1 1 61.191 61.191 2 0.010479 60678 QUIQUE_C1218_190116_001 62.005 43.225 131760000 38571000 45994000 0 0 0 0 0 0 0 47199000 0 0 0 50234 3438 46912 452878;452879;452880 578559;578560;578561 578559 2661 3 WTSTSMPWAAAK Unmodified 1335.6282 0.6281572 3438 Q7L266 ASRGL1 Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase alpha chain;Isoaspartyl peptidase/L-asparaginase beta chain yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 85.705 85.705 2 0.0058997 87570 QUIQUE_DMIX7_190116_001 81.338 62.067 1336600000 0 0 221620000 0 172410000 178120000 0 203870000 0 0 186470000 150200000 223910000 50235 3438 46912 452881;452882;452883;452884;452885;452886;452887 578562;578563;578564;578565;578566;578567;578568 578567 1 WTTAPKPTMADELYNQDYPIHSVEDR Unmodified 3076.4237 0.42365032 2563 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126160 QUIQUE_DMIX5_190116_001 121.62 113.65 893770000 38687000 0 61269000 44075000 60296000 0 62057000 117940000 126280000 0 121040000 108910000 153220000 50340 903;2869 47013 453848;453849;453850;453851;453852;453853;453854;453855;453856;453857;453858 579815;579816;579817;579818;579819;579820;579821;579822;579823;579824;579825;579826;579827;579828 579824 14 YAELSEEDLK Unmodified 1195.5608 0.56084872 3235 Q4G0N4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 56.136 56.136 2 0.04814 55006 QUIQUE_C1368_190116_001 60.717 18.608 230370000 0 0 230370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50341 3235 47014 453859 579829 579829 1 YAELVLER Unmodified 991.53385 0.53384611 110 A0A087X1P2;Q9UN70 PCDHGC3 Protocadherin gamma-C3 yes no 0 0 0 1 62.31 62.31 2 0.035224 61864 QUIQUE_DMIX3_190116_001 63.565 21.101 19554000 0 0 0 0 0 0 0 0 19554000 0 0 0 0 50342 110 47015 453860 579830 579830 1 YAEYFLRPMLQYVCDNSPEVR Oxidation (M) 2665.2305 0.23049358 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 1 1 1 1 1 1 113.71 113.71 3 4.1141E-06 116461 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.413 66.672 312340000 0 28518000 0 0 0 0 0 98748000 0 0 82765000 102310000 0 50343 1403 47016 453861;453862;453863;453864 579831;579832;579833;579834 579832 785 4 YAEYFLRPMLQYVCDNSPEVR Unmodified 2649.2356 0.23557896 1403 O00410;H0Y8C6 IPO5 Importin-5 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.19 145.19 3 1.4253E-19 150259 QUIQUE_DMIX3_190116_001 129.02 121.99 418930000 0 59594000 27592000 0 24299000 0 44461000 50293000 48287000 0 63285000 45671000 55444000 50344 1403 47016 453865;453866;453867;453868;453869;453870;453871;453872;453873;453874 579835;579836;579837;579838;579839;579840;579841;579842;579843;579844;579845;579846;579847;579848 579843 13 YAFGQETNVPLNNFSADQVTR Unmodified 2370.124 0.1240379 1542 O43678 NDUFA2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 2 2 1 2 2 1 2 2 114.27 114.27 2;3 1.8843E-64 119418 QUIQUE_DMIX5_190116_001 171.08 158.72 1968300000 237350000 226200000 169210000 55881000 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50366 1700 47037 454093;454094;454095;454096;454097;454098;454099;454100;454101;454102;454103;454104;454105;454106;454107;454108;454109;454110;454111;454112 580113;580114;580115;580116;580117;580118;580119;580120;580121;580122;580123;580124;580125;580126;580127;580128;580129;580130;580131;580132;580133 580115 20 YAIGSLNEGR Unmodified 1078.5407 0.5407224 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.334 49.334 2 0.0036481 47390 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.623 57.797 719580000 0 0 99196000 77716000 0 0 90523000 0 114750000 0 92248000 126560000 118590000 50367 2470 47038 454113;454114;454115;454116;454117;454118;454119 580134;580135;580136;580137;580138;580139;580140;580141;580142 580139 9 YAIQLITAASLVCR Unmodified 1577.8599 0.85994805 4536 Q9Y230 RUVBL2 RuvB-like 2 yes yes 0 0 0 1 131.59 131.59 2 0.010031 134425 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.598 40.836 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50368 4536 47039 454120 580143 580143 1 YAISMAR Unmodified 810.40581 0.40580882 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 37.378 37.378 2 0.019316 33233 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.81 94.886 195830000 33601000 0 88482000 0 0 0 0 0 0 0 73747000 0 0 50369 2066 47040 454121;454122;454123 580144;580145;580146;580147 580146 4 YAIYFEAR Unmodified 1031.5076 0.50763136 2225 P24043;A0A087WYF1;A0A087WX80 LAMA2 Laminin subunit alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 75.393 75.393 2 0.027967 76147 QUIQUE_DMIX3_190116_001 69.198 27.896 85110000 0 0 0 16498000 32048000 0 0 0 36564000 0 0 0 0 50370 2225 47041 454124;454125;454126 580148;580149;580150 580150 3 YALLPHLYTLFHQAHVAGETVAR Unmodified 2606.3758 0.37577633 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 118.83 118.83 4 1.3629E-11 122342 QUIQUE_DMIX7_190116_001 93.006 79.685 251060000 0 35322000 0 0 0 0 0 0 67806000 0 83758000 64178000 0 50371 1993 47042 454127;454128;454129;454130 580151;580152;580153;580154;580155;580156 580156 6 YALNHPDTVEGLVLINIDPNAK Unmodified 2405.2591 0.25907482 4506;169 A0A0A0MS87;G3V578;H0YJT9;G3V5L7;A0A0U1RR50;H0YJ56;Q9UN36;G3V2I9;G3V5S0;G3V383 NDRG2 Protein NDRG2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 3 2 3 4 2 132.43 132.43 2;3 9.1156E-130 137248 QUIQUE_DMIX3_190116_001 253.36 242.09 21908000000 1386500000 1570600000 1438100000 1435500000 1547300000 1532200000 1616200000 2246900000 2492300000 615850000 1855300000 1973100000 2197800000 50372 169;4506 47043 454131;454132;454133;454134;454135;454136;454137;454138;454139;454140;454141;454142;454143;454144;454145;454146;454147;454148;454149;454150;454151;454152;454153;454154;454155;454156;454157;454158;454159;454160 580157;580158;580159;580160;580161;580162;580163;580164;580165;580166;580167;580168;580169;580170;580171;580172;580173;580174;580175;580176;580177;580178;580179;580180;580181;580182;580183;580184;580185;580186;580187;580188;580189;580190;580191;580192;580193;580194;580195;580196;580197;580198;580199;580200;580201 580187 44 YALQSQQR Unmodified 992.50394 0.50394297 2453 P42765;A0A0B4J2A4;K7EME0 ACAA2 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 18.928 18.928 2 0.00012115 11784 QUIQUE_C1218_190116_001 164.89 126.65 1535800000 312460000 0 292340000 0 0 330920000 227220000 81712000 131420000 159730000 0 0 0 50373 2453 47044 454161;454162;454163;454164;454165;454166;454167;454168 580202;580203;580204;580205;580206;580207;580208;580209 580202 6 YALSGGNWDSISDAAK Unmodified 1653.7635 0.76346471 982 F2Z2J1;Q15349;B7Z3B5 RPS6KA2 Ribosomal protein S6 kinase;Ribosomal protein S6 kinase alpha-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.814 96.814 2 1.1014E-05 99327 QUIQUE_C1277_190116_001 129.37 82.181 570730000 40185000 50307000 0 62923000 0 43508000 52972000 51129000 62696000 28641000 63384000 61352000 53639000 50374 982 47045 454169;454170;454171;454172;454173;454174;454175;454176;454177;454178;454179 580210;580211;580212;580213;580214;580215;580216;580217;580218;580219;580220;580221 580211 12 YALSNSIGPVR Unmodified 1175.6299 0.62987176 2075 P14543 NID1 Nidogen-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 61.95 61.95 2 7.0453E-19 61506 QUIQUE_DMIX5_190116_001 175.44 102.18 1414500000 0 135790000 160620000 96952000 0 87115000 123280000 150040000 181600000 52307000 151330000 140840000 134600000 50375 2075 47046 454180;454181;454182;454183;454184;454185;454186;454187;454188;454189;454190;454191;454192 580222;580223;580224;580225;580226;580227;580228;580229;580230;580231;580232;580233;580234;580235;580236;580237;580238;580239;580240 580236 19 YALSVGYR Unmodified 927.48142 0.48141661 2076 P14550;Q5T621;V9GYG2;V9GYP9 AKR1A1 Alcohol dehydrogenase [NADP(+)] yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 55.723 55.723 2 6.2018E-06 53215 QUIQUE_DMIX8_190116_001 168.74 103.97 2630000000 198590000 192810000 152200000 220340000 197410000 173620000 190130000 241440000 248820000 122820000 260210000 195300000 236330000 50376 2076 47047 454193;454194;454195;454196;454197;454198;454199;454200;454201;454202;454203;454204;454205 580241;580242;580243;580244;580245;580246;580247;580248;580249;580250;580251;580252;580253;580254 580254 14 YALTFAEAQEACR Unmodified 1528.698 0.69802768 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.885 80.885 2 1.2257E-07 82940 QUIQUE_C1218_190116_001 154.35 140.44 1496200000 216050000 240090000 198490000 0 173830000 138050000 323650000 0 0 82378000 123700000 0 0 50377 1436 47048 454206;454207;454208;454209;454210;454211;454212;454213 580255;580256;580257;580258;580259;580260;580261;580262;580263;580264;580265;580266;580267 580255 13 YALTGDEVK Unmodified 994.49713 0.49712625 2757 P62701;C9JEH7;P22090;Q8TD47 RPS4X;RPS4Y1;RPS4Y2 40S ribosomal protein S4, X isoform;40S ribosomal protein S4, Y isoform 1;40S ribosomal protein S4, Y isoform 2 yes no 0 0 0 1 1 38.014 38.014 2 0.01368 34150 QUIQUE_C1218_190116_001 69.598 43.861 66602000 36966000 29635000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50378 2757 47049 454214;454215 580268;580269 580268 2 YALTGDEVKK Unmodified 1122.5921 0.59208927 2757 P62701;C9JEH7;P22090;Q8TD47 RPS4X;RPS4Y1;RPS4Y2 40S ribosomal protein S4, X isoform;40S ribosomal protein S4, Y isoform 1;40S ribosomal protein S4, Y isoform 2 yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 1 22.067 22.067 2;3 0.015729 15133 QUIQUE_DMIX8_190116_001 76.605 50.433 229040000 0 22623000 0 21335000 62034000 0 0 0 29764000 0 55100000 0 38184000 50379 2757 47050 454216;454217;454218;454219;454220;454221;454222;454223 580270;580271;580272;580273;580274;580275;580276;580277 580277 7 YALVLQDVR Unmodified 1075.6026 0.60259438 647 B5MED8;Q96PQ0 SORCS2 VPS10 domain-containing receptor SorCS2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 79.198 79.198 2 0.0029423 80914 QUIQUE_C1438_190116_001 92.439 49.193 219130000 38689000 48509000 0 0 44998000 33262000 0 0 0 13186000 0 40483000 0 50380 647 47051 454224;454225;454226;454227;454228;454229 580278;580279;580280;580281;580282;580283 580280 6 YALVVEYANEDAR Unmodified 1511.7256 0.72562264 1492 O15230 LAMA5 Laminin subunit alpha-5 yes yes 0 0 0 1 83.776 83.776 2 0.0031632 80271 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.841 54.851 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50381 1492 47052 454230 580284 580284 1 YALYDASFETK Unmodified 1306.6081 0.60813326 2702 P60981;F6RFD5 DSTN Destrin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 84.533 84.533 2 3.1025E-18 87008 QUIQUE_C1218_190116_001 168.8 145.37 11705000000 870700000 949220000 1139100000 874310000 965660000 870870000 1063200000 909830000 1208000000 438600000 0 1107700000 1308000000 50382 2702 47053 454231;454232;454233;454234;454235;454236;454237;454238;454239;454240;454241;454242;454243;454244 580285;580286;580287;580288;580289;580290;580291;580292;580293;580294;580295;580296;580297;580298;580299;580300;580301;580302;580303 580285 19 YALYDATYETK Unmodified 1336.6187 0.61869795 2220;4546 P23528;G3V1A4;E9PK25;E9PP50;E9PQB7;E9PLJ3;Q9Y281 CFL1;CFL2 Cofilin-1;Cofilin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 2 3 2 1 2 2 3 2 3 69.172 69.172 1;2 4.3722E-86 68972 QUIQUE_DMIX8_190116_001 264.3 225.52 57180000000 4596300000 4953700000 4706000000 5104200000 5132900000 4306000000 3306900000 5101200000 5096200000 2479800000 3899600000 4951700000 3545100000 50383 2220;4546 47054 454245;454246;454247;454248;454249;454250;454251;454252;454253;454254;454255;454256;454257;454258;454259;454260;454261;454262;454263;454264;454265;454266;454267;454268 580304;580305;580306;580307;580308;580309;580310;580311;580312;580313;580314;580315;580316;580317;580318;580319;580320;580321;580322;580323;580324;580325;580326;580327;580328;580329;580330;580331;580332;580333;580334 580334 28 YAMEQSIK Unmodified 968.46372 0.46371763 295 A0A0J9YYL3;A0A0J9YVP6;A0A0J9YXJ8;A0A0J9YXX5;Q9UHX1;A0A0J9YVR6;E9PQ56;A0A0J9YWM1;H0YEM1;E9PN18;E9PMU7;E9PL19 PUF60 Poly(U)-binding-splicing factor PUF60 yes no 0 0 0 1 1 30.52 30.52 2 0.020421 24587 QUIQUE_C1403_190116_001 76.774 47.398 45379000 18692000 0 0 26687000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50384 295 47055 454269;454270 580335;580336 580336 2 YANEVNSDAGAFK Unmodified 1384.6259 0.62590859 4428 Q9UHB9 SRP68 Signal recognition particle subunit SRP68 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 42.942 42.942 2 4.9131E-10 40292 QUIQUE_C1218_190116_001 145.46 101.11 433420000 44579000 53106000 0 46915000 0 44843000 40537000 40008000 48575000 0 73371000 41485000 0 50385 4428 47056 454271;454272;454273;454274;454275;454276;454277;454278;454279;454280;454281;454282 580337;580338;580339;580340;580341;580342;580343;580344;580345;580346;580347;580348 580337 12 YANVIAYDHSR Unmodified 1307.6258 0.62584901 987;1998;2987 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1;H0Y7Z9;H0Y380;Q3KPI9;F5GWR7;P23468;Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRF;PTPRD;PTPRS Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F;Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 1 1 2 1 33.895 33.895 2;3 0.00041853 28940 QUIQUE_C1277_190116_001 115.78 56.136 230820000 26961000 37664000 0 32841000 0 77376000 0 0 0 0 55981000 0 0 50386 1998;987;2987 47057 454283;454284;454285;454286;454287;454288 580349;580350;580351;580352;580353;580354 580350 6 YAPISGGDHAEVDVPK Unmodified 1653.7999 0.79985021 2233 P24821;J3QSU6;E9PC84;F5H7V9 TNC Tenascin yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 2 1 2 2 49.469 49.469 2;3 1.7589E-13 47089 QUIQUE_DMIX3_190116_001 166.45 148.97 2430400000 0 29726000 49653000 40857000 242260000 53743000 32867000 474310000 219770000 233010000 94687000 487600000 471900000 50387 2233 47058 454289;454290;454291;454292;454293;454294;454295;454296;454297;454298;454299;454300;454301;454302;454303;454304;454305 580355;580356;580357;580358;580359;580360;580361;580362;580363;580364;580365;580366;580367;580368;580369;580370;580371 580364 17 YAPLHLVPLIER Unmodified 1419.8238 0.82382054 882;3442 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576;H0YL50 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 3 2 2 2 2 3 2 97.383 97.383 2;3 0.00015092 99436 QUIQUE_C1403_190116_001 94.191 79.839 3385200000 276170000 286820000 275560000 184730000 279080000 179850000 292300000 322010000 231620000 96698000 289480000 332030000 338870000 50388 882;3442 47059 454306;454307;454308;454309;454310;454311;454312;454313;454314;454315;454316;454317;454318;454319;454320;454321;454322;454323;454324;454325;454326;454327;454328;454329;454330;454331;454332 580372;580373;580374;580375;580376;580377;580378;580379;580380;580381;580382;580383;580384;580385;580386;580387;580388;580389;580390;580391;580392;580393;580394;580395;580396;580397;580398;580399;580400;580401;580402 580379 29 YAPSEAGLHEMDIR Unmodified 1587.7351 0.73514147 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3;H0Y5F3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 2 1 2 61.611 61.611 2;3 0.00030346 61235 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.04 74.6 1499100000 103510000 163580000 122860000 184000000 185820000 98218000 115530000 75902000 82327000 26890000 137470000 97037000 106010000 50389 2178 47060 454333;454334;454335;454336;454337;454338;454339;454340;454341;454342;454343;454344;454345;454346;454347;454348;454349;454350;454351;454352;454353;454354;454355 580403;580404;580405;580406;580407;580408;580409;580410;580411;580412;580413;580414;580415;580416;580417;580418;580419;580420;580421;580422;580423;580424;580425;580426;580427;580428;580429;580430 580427 26 YAPSGFYIASGDVSGK Unmodified 1617.7675 0.76748745 1609 O75083;D6RD66 WDR1 WD repeat-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 86.726 86.726 2 0.0036323 89712 QUIQUE_DMIX5_190116_001 73.927 58.298 8842300000 668250000 678180000 902490000 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580444;580445;580446;580447;580448;580449;580450;580451;580452;580453;580454;580455;580456;580457;580458;580459;580460;580461;580462;580463;580464;580465;580466;580467;580468;580469;580470;580471;580472;580473;580474;580475;580476;580477 580471 34 YAPTIAPSPEDGFEVQPLHPDK Unmodified 2407.1696 0.16959111 662 B7Z589;P48067 SLC6A9 Transporter;Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 98.765 98.765 3 8.6227E-06 100973 QUIQUE_C1403_190116_001 48.229 44.566 187730000 28925000 0 45361000 36500000 0 0 0 36245000 40700000 0 0 0 0 50392 662 47063 454393;454394;454395;454396;454397 580478;580479;580480;580481;580482;580483 580481 5 YAQAGFEGFK Unmodified 1116.524 0.52400971 1650 O75643 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes yes 0 0 0 1 1 1 60.606 60.606 2 0.027226 60370 QUIQUE_C1218_190116_001 76.827 62.051 71712000 21018000 0 0 0 0 0 0 19254000 0 0 31441000 0 0 50393 1650 47064 454398;454399;454400 580484;580485;580486 580484 1 YAQDDFSLDENECR Unmodified 1760.6948 0.6947928 363 H3BLV5;A0A1B0GWD1;A8K340;O43602 DCX Neuronal migration protein doublecortin yes no 0 0 0 1 1 72.425 72.425 2 0.0002629 72288 QUIQUE_C1403_190116_001 119.39 114.49 49065000 0 22175000 0 26890000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50394 363 47065 454401;454402 580487;580488 580488 2 YAQDDFVLDHSECR Unmodified 1753.7366 0.73659803 3596 Q8N568;G5E9L9;A0A0U1RR70 DCLK2 Serine/threonine-protein kinase DCLK2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 61.025 61.025 2;3 1.4321E-05 59888 QUIQUE_C1368_190116_001 120.57 97.254 202800000 0 0 44724000 0 0 28102000 33652000 50757000 0 0 0 0 45564000 50395 3596 47066 454403;454404;454405;454406;454407 580489;580490;580491;580492;580493 580489 4 YAQEVAGLK Unmodified 977.5182 0.51819605 4414 Q9UDT6 CLIP2 CAP-Gly domain-containing linker protein 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 31.015 31.015 2 0.011056 25938 QUIQUE_C1277_190116_001 73.26 27.378 165640000 0 49844000 62297000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53494000 50396 4414 47067 454408;454409;454410 580494;580495;580496 580494 3 YAQVKPDGTYVKPLSNK Unmodified 1907.0153 0.015262719 3107 Q15067 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes yes 0 0 2 1 1 1 1 35.605 35.605 3;4 0.029839 31034 QUIQUE_DMIX5_190116_001 29.216 19.686 307700000 0 102360000 0 0 50573000 0 0 0 98948000 0 55823000 0 0 50397 3107 47068 454411;454412;454413;454414 580497;580498;580499;580500 580500 1 YASFQVENDQER Unmodified 1484.6532 0.65318598 2636 P53992;G5EA31 SEC24C Protein transport protein Sec24C yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 47.552 47.552 2 0.00046016 44935 QUIQUE_DMIX3_190116_001 109.42 91.107 586920000 31726000 35580000 45598000 29716000 62352000 46203000 45487000 35829000 41759000 24350000 75133000 58768000 54423000 50398 2636 47069 454415;454416;454417;454418;454419;454420;454421;454422;454423;454424;454425;454426;454427 580501;580502;580503;580504;580505;580506;580507;580508;580509;580510;580511;580512;580513;580514 580510 14 YASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLK Unmodified 3019.4961 0.49608698 1851;1978 P04075;H3BQN4;H3BPS8;P09972 ALDOA;ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase;Fructose-bisphosphate aldolase C no no 0 0 0 2 2 2 3 2 2 2 1 2 1 2 2 1 129.53 129.53 2;3 3.368E-77 133596 QUIQUE_C1277_190116_001 214.24 196.61 17850000000 2556900000 1964400000 1823000000 1757900000 1003900000 1478200000 1119500000 539170000 995600000 1176000000 1468600000 1095600000 871500000 50399 1851;1978 47070 454428;454429;454430;454431;454432;454433;454434;454435;454436;454437;454438;454439;454440;454441;454442;454443;454444;454445;454446;454447;454448;454449;454450;454451 580515;580516;580517;580518;580519;580520;580521;580522;580523;580524;580525;580526;580527;580528;580529;580530;580531;580532;580533;580534;580535;580536;580537;580538;580539;580540;580541;580542;580543;580544;580545;580546;580547;580548;580549;580550;580551;580552;580553 580523 38 YASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKR Unmodified 3175.5972 0.59719801 1851;1978 P04075;H3BQN4;H3BPS8;P09972 ALDOA;ALDOC Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase;Fructose-bisphosphate aldolase C no no 0 0 1 3 3 3 3 3 2 3 4 3 2 6 3 4 114.98 114.98 2;3;4;5 2.5922E-160 118088 QUIQUE_DMIX7_190116_001 280.43 264.92 105390000000 5969900000 9263300000 8620500000 6788500000 7006300000 4942400000 7472000000 10334000000 10572000000 3606400000 10405000000 9869600000 10542000000 50400 1851;1978 47071 454452;454453;454454;454455;454456;454457;454458;454459;454460;454461;454462;454463;454464;454465;454466;454467;454468;454469;454470;454471;454472;454473;454474;454475;454476;454477;454478;454479;454480;454481;454482;454483;454484;454485;454486;454487;454488;454489;454490;454491;454492;454493 580554;580555;580556;580557;580558;580559;580560;580561;580562;580563;580564;580565;580566;580567;580568;580569;580570;580571;580572;580573;580574;580575;580576;580577;580578;580579;580580;580581;580582;580583;580584;580585;580586;580587;580588;580589;580590;580591;580592;580593;580594;580595;580596;580597;580598;580599;580600;580601;580602;580603;580604;580605;580606;580607;580608;580609;580610;580611;580612;580613;580614;580615;580616;580617;580618 580612 63 YASNAVSEALIR Unmodified 1292.6725 0.67246486 1 A0A024R442;E7ETB3;Q9ULA0;E7EMB6 DNPEP Aspartyl aminopeptidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 68.729 68.729 2 0.0032982 68574 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.958 46.336 1114400000 97975000 110630000 113280000 116670000 101080000 82617000 91624000 122650000 123090000 0 0 73509000 81263000 50401 1 47072 454494;454495;454496;454497;454498;454499;454500;454501;454502;454503;454504;454505 580619;580620;580621;580622;580623;580624;580625;580626;580627;580628;580629;580630 580626 5 YATALYSAASK Unmodified 1144.5764 0.57643921 2499 P48047;H7C0C1;H7C086 ATP5O ATP synthase subunit O, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 2 2 1 1 1 1 2 1 1 40.723 40.723 2 1.0008E-05 38378 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.65 127.14 7119100000 608600000 658080000 724790000 480420000 674870000 492150000 0 451640000 526710000 167030000 1009600000 707130000 618050000 50402 2499 47073 454506;454507;454508;454509;454510;454511;454512;454513;454514;454515;454516;454517;454518;454519;454520 580631;580632;580633;580634;580635;580636;580637;580638;580639;580640;580641;580642;580643;580644;580645;580646;580647;580648;580649;580650;580651;580652;580653;580654;580655;580656 580647 26 YATDTFAGLCHQLTNALVER Unmodified 2279.1005 0.10046569 4514 Q9UNS2;H7C3P9;C9JLV5;J3QKR0;K7ES36 COPS3 COP9 signalosome complex subunit 3 yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 1 2 1 2 2 2 136.18 136.18 2;3 2.2278E-56 139342 QUIQUE_DMIX1_190116_001 172.82 157.43 2200200000 177460000 187820000 211160000 152650000 193550000 130590000 252350000 0 201390000 64715000 213490000 207440000 207610000 50403 4514 47074 454521;454522;454523;454524;454525;454526;454527;454528;454529;454530;454531;454532;454533;454534;454535;454536;454537;454538;454539;454540;454541;454542;454543 580657;580658;580659;580660;580661;580662;580663;580664;580665;580666;580667;580668;580669;580670;580671;580672;580673;580674;580675;580676;580677;580678;580679;580680;580681 580672 24 YATLATVSR Unmodified 980.5291 0.52909508 3053 Q14204;A0A2R8YFZ7;A0A2R8YGC7 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 36.565 36.565 2 0.00055943 32186 QUIQUE_DMIX3_190116_001 111.95 79.107 1619200000 36393000 63568000 242260000 105200000 79428000 135330000 0 184040000 245540000 93017000 0 220040000 214390000 50404 3053 47075 454544;454545;454546;454547;454548;454549;454550;454551;454552;454553;454554 580682;580683;580684;580685;580686;580687;580688;580689;580690;580691;580692 580689 11 YATPAPSAK Unmodified 904.46543 0.46543219 3050 Q14194;E9PD68 CRMP1 Dihydropyrimidinase-related protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.177 17.177 2 0.00046932 9380 QUIQUE_C1403_190116_001 116.25 74.748 6740600000 866630000 756530000 632180000 550630000 536380000 525660000 632490000 0 633080000 267440000 676790000 662810000 0 50405 3050 47076 454555;454556;454557;454558;454559;454560;454561;454562;454563;454564;454565 580693;580694;580695;580696;580697;580698;580699;580700;580701;580702;580703;580704;580705;580706;580707 580698 15 YATSCYSCCPR Unmodified 1423.5319 0.53189033 2963 Q13057;K7EN91;K7ES73;K7EPC2 COASY Bifunctional coenzyme A synthase;Phosphopantetheine adenylyltransferase;Dephospho-CoA kinase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 27.825 27.825 2 0.0028442 22077 QUIQUE_C1576_190116_001 81.338 78.499 85929000 0 0 0 0 0 0 37515000 0 0 0 0 48414000 0 50406 2963 47077 454566;454567;454568;454569;454570;454571;454572 580708;580709;580710;580711;580712;580713;580714 580710 7 YATSVSER Unmodified 911.43486 0.43486035 3417 Q6WKZ4 RAB11FIP1 Rab11 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580723;580724;580725;580726;580727;580728;580729;580730;580731;580732 580724 9 YAVDDVQYVDEIASVLTSQKPSVLLTLR Unmodified 3121.6547 0.65469611 2049 P12955 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes yes 0 0 1 1 1 2 2 2 1 168.74 168.74 3;4 3.9895E-126 174061 QUIQUE_C1576_190116_001 187.38 181.72 3141700000 19954000 0 0 0 0 0 307410000 1019300000 707560000 0 509370000 0 578100000 50410 2049 47081 454590;454591;454592;454593;454594;454595;454596;454597;454598 580733;580734;580735;580736;580737;580738;580739;580740;580741 580734 8 YAVELEGQQPISVPPSTNSTVYR Unmodified 2534.2653 0.26528241 2295 P30038;Q5TF55 ALDH4A1 Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 102.37 102.37 2 0.00021061 105270 QUIQUE_DMIX7_190116_001 73.022 53.699 13781000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 13781000 0 50411 2295 47082 454599 580742 580742 1 YAVIGADLR Unmodified 976.53418 0.53418046 4448 Q9UIC8;I3L4A2 LCMT1 Leucine carboxyl methyltransferase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.246 63.246 2 0.0071031 63450 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Unmodified 1355.7125 0.71253876 1010;1033 F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;F8W020;F8W0J6;H0YH88;H0YHC3;F8VXI6;F8VUX1;F8VVB5;F8W118;F8VV59;F8VRJ2;B7Z9C2 NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111.91 111.91 2 0.00015012 115776 QUIQUE_C1368_190116_001 128.27 107.94 1543000000 0 215400000 163590000 232740000 201170000 252030000 178120000 0 102380000 85746000 111870000 0 0 50415 1010;1033 47086 454617;454618;454619;454620;454621;454622;454623;454624;454625 580760;580761;580762;580763;580764;580765;580766;580767;580768;580769;580770;580771 580762 11 YAVLYQPLFDKR Unmodified 1511.8136 0.81364979 1010;1033 F8VY35;F5H4R6;H0YIV4;P55209;F8W020;F8W0J6;H0YH88;H0YHC3;F8VVB5;F8W118;F8VV59;F8VRJ2;B7Z9C2 NAP1L1 Nucleosome assembly protein 1-like 1 no no 0 0 1 2 1 2 1 2 2 1 2 2 2 89 89 2;3 0.00014131 90706 QUIQUE_DMIX7_190116_001 102.4 88.997 1417400000 0 42259000 0 0 40779000 0 72621000 175450000 216570000 34230000 298780000 266500000 270220000 50416 1010;1033 47087 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580812;580813;580814;580815;580816;580817;580818;580819;580820;580821;580822 580812 2143 11 YAVWFGGSMLASTPEFYQVCHTK Unmodified 2678.2298 0.2297653 2714 P61158;B4DXW1 ACTR3 Actin-related protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.93 139.93 3 0.00042164 146626 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.413 26.904 514820000 0 64190000 57719000 0 0 0 0 74482000 47152000 0 87537000 99985000 83752000 50421 2714 47091 454671;454672;454673;454674;454675;454676;454677 580823;580824;580825;580826;580827;580828;580829 580827 6 YAWQGVALLPFVDER Unmodified 1762.9043 0.90425571 4118 Q9H0D6 XRN2 5'-3' exoribonuclease 2 yes yes 0 0 0 1 154.64 154.64 2 0.022582 162277 QUIQUE_DMIX5_190116_001 67.999 37.127 35248000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35248000 0 0 50422 4118 47092 454678 580830 580830 1 YAWSILLDR Unmodified 1135.6026 0.60259438 1271 J3KPT0;Q6V1X1 DPP8 Dipeptidyl peptidase 8 yes no 0 0 0 1 1 129.84 129.84 2 0.025833 133638 QUIQUE_C1403_190116_001 76.679 50.785 10014000 0 0 0 0 0 10014000 0 0 0 0 0 0 0 50423 1271 47093 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580935;580936;580937;580938;580939;580940;580941;580942;580943;580944;580945;580946 580938 12 YCGLCDSIITIYR Unmodified 1632.764 0.76399876 4650 Q9Y6C9;E9PIE4 MTCH2 Mitochondrial carrier homolog 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 118.4 118.4 2 0.0005083 122487 QUIQUE_C1368_190116_001 120.09 109.33 1569500000 128270000 154830000 145220000 163860000 122660000 132870000 165160000 53798000 84536000 53701000 121230000 120200000 123180000 50437 4650 47107 454783;454784;454785;454786;454787;454788;454789;454790;454791;454792;454793;454794;454795 580947;580948;580949;580950;580951;580952;580953;580954;580955;580956;580957;580958;580959;580960;580961;580962 580951 16 YCGQLQMIQEQISNLEAQITDVR Oxidation (M) 2752.316 0.31601412 780 CON__P35527;P35527;K7EQQ3 KRT9 Keratin, type I cytoskeletal 9 yes no 0 1 0 1 2 1 1 1 2 2 1 2 1 2 1 167.63 167.63 2;3 0 171657 QUIQUE_DMIX7_190116_001 294 282.74 2892700000 120020000 152050000 89536000 86350000 38731000 209320000 0 516060000 312640000 262210000 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14.742 2;3 1.8679E-11 7017 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.79 126.98 932670000 86402000 18447000 79640000 79455000 91062000 70920000 21527000 64506000 118800000 17790000 135210000 85281000 63633000 50440 472;1460 47109 454822;454823;454824;454825;454826;454827;454828;454829;454830;454831;454832;454833;454834;454835;454836;454837;454838;454839;454840;454841 580991;580992;580993;580994;580995;580996;580997;580998;580999;581000;581001;581002;581003;581004;581005;581006;581007;581008;581009;581010 581004 20 YCIGLNETQLGIIAPFWLK Unmodified 2235.1762 0.17619681 2443 P42126;Q96DC0;H3BS70 ECI1;DCI Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 2 2 1 1 167.27 167.27 2;3 8.0247E-36 171226 QUIQUE_DMIX7_190116_001 195.71 183.74 823530000 36321000 35717000 0 38168000 80632000 0 0 87903000 60229000 0 143490000 214320000 126760000 50441 2443 47110 454842;454843;454844;454845;454846;454847;454848;454849;454850;454851;454852;454853 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Tubulointerstitial nephritis antigen-like yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 28.805 28.805 2 6.4281E-05 22841 QUIQUE_C1403_190116_001 141.52 134.39 1325100000 92465000 251140000 142440000 109550000 149410000 121120000 157290000 52011000 45805000 34225000 44945000 55688000 68966000 50447 4100 47115 454875;454876;454877;454878;454879;454880;454881;454882;454883;454884;454885;454886;454887 581053;581054;581055;581056;581057;581058;581059;581060;581061;581062;581063;581064;581065;581066 581056 14 YCRPESQEHPEADPGSAAPYLK Unmodified 2501.1281 0.128137 2427 P40763;G8JLH9 STAT3 Signal transducer and activator of transcription 3;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 1 1 1 47.524 47.524 3;4 0.00028788 45015 QUIQUE_C1403_190116_001 43.611 39.807 145220000 103230000 0 0 41987000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50448 2427 47116 454888;454889 581067;581068 581068 2 YCSSDQVEIFSSLLQR Unmodified 1930.9095 0.90947702 2448 P42356;Q8N8J0;A4QPH2 PI4KA;PI4KAP1;PI4KAP2 Phosphatidylinositol 4-kinase alpha;Putative inactive phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P1;Putative phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P2 yes no 0 0 0 1 1 138.96 138.96 2 0.0023914 143691 QUIQUE_C1277_190116_001 61.235 44.293 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50449 2448 47117 454890;454891 581069;581070 581069 2 YCTDTGVLFR Unmodified 1230.5703 0.57030797 2049 P12955 PEPD Xaa-Pro dipeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.284 75.284 2 0.00033775 74678 QUIQUE_C1563_190116_001 114.28 101.24 1664400000 134760000 140870000 186440000 145970000 143470000 123340000 157080000 0 97925000 38509000 178980000 130470000 186600000 50450 2049 47118 454892;454893;454894;454895;454896;454897;454898;454899;454900;454901;454902;454903;454904 581071;581072;581073;581074;581075;581076;581077;581078;581079;581080;581081;581082;581083;581084 581076 14 YCTFNDDIQGTAAVALAGLLAAQK Unmodified 2510.2475 0.24752385 374 A0A1W2PPH1;A0A1W2PQH3;P23368;A0A1W2PQT3;A0A1W2PQY8;A0A1W2PQ37;A0A1W2PQF8;A0A1W2PR68 ME2 NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 167.29 167.29 3 4.8047E-41 170405 QUIQUE_C1403_190116_001 147.35 139.64 752050000 57969000 92190000 118770000 58216000 47598000 60521000 51953000 52028000 0 50603000 0 117620000 44572000 50451 374 47119 454905;454906;454907;454908;454909;454910;454911;454912;454913;454914;454915 581085;581086;581087;581088;581089;581090;581091;581092;581093;581094;581095;581096;581097 581088 13 YCVHYLEDVGSFEYTR Unmodified 2036.8938 0.89382695 1747 O95749 GGPS1 Geranylgeranyl pyrophosphate synthase yes yes 0 0 0 1 1 1 103 103 3 0.0015256 106023 QUIQUE_DMIX8_190116_001 38.116 33.011 103910000 0 0 0 0 0 0 0 35567000 41813000 0 0 0 26530000 50452 1747 47120 454916;454917;454918 581098;581099;581100 581100 1 YCVLGCENFTSGR Unmodified 1561.6653 0.66534734 1409 O00478;C9JZT5 BTN3A3 Butyrophilin subfamily 3 member A3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 80.345 80.345 2 0.0044735 81525 QUIQUE_DMIX7_190116_001 68.536 53.27 463120000 0 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581141 8 YDADLENKLVDWIILQCAEDIEHPPPGR Unmodified 3305.6027 0.60267732 4444 Q9UI15;C9JCX3 TAGLN3 Transgelin-3 yes no 0 0 1 1 164.03 164.03 4 1.7753E-05 166203 QUIQUE_DMIX1_190116_001 48.579 42.86 14452000 0 0 0 0 0 0 0 14452000 0 0 0 0 0 50458 4444 47126 454962 581147 581147 1 YDADSSGFISAAELR Unmodified 1600.7369 0.73691561 1678 O76038 SCGN Secretagogin yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 102.92 102.92 2 1.5747E-12 105719 QUIQUE_DMIX3_190116_001 158.42 134.57 1232700000 135730000 119440000 154400000 79847000 0 149140000 139440000 54112000 90519000 31281000 164620000 114180000 0 50459 1678 47127 454963;454964;454965;454966;454967;454968;454969;454970;454971;454972;454973;454974 581148;581149;581150;581151;581152;581153;581154;581155;581156;581157;581158;581159;581160 581156 12 YDAGEHGLQEAEK Unmodified 1445.6423 0.64228694 3778 Q93009;H3BND8;F5H2X1 USP7 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 23.481 23.481 2 0.00058876 17226 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168.32 3 0.0035224 172883 QUIQUE_DMIX3_190116_001 18.524 15.157 43693000 0 0 0 0 0 0 0 0 43693000 0 0 0 0 50463 2190 47131 454986 581172 581172 1 YDCGEEILITVLSAMTEEAAVAIK Unmodified 2625.2918 0.29175643 2786 P63241;Q6IS14 EIF5A;EIF5AL1 Eukaryotic translation initiation factor 5A-1;Eukaryotic translation initiation factor 5A-1-like yes no 0 0 0 1 4 182.51 182.51 3 1.1524E-09 185215 QUIQUE_DMIX3_190116_001 95.624 89.462 116320000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 116320000 0 0 50464 2786 47132 454987;454988;454989;454990;454991 581173;581174;581175;581176;581177 581173 4 YDDAIQLYDR Unmodified 1270.583 0.58298115 3094 Q15006;H0YAS9 EMC2 ER membrane protein complex subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 75.355 75.355 2 0.063916 75983 QUIQUE_C1576_190116_001 53.751 41.525 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50465 3094 47133 454992;454993 581178;581179 581179 2 YDDEDISEDIK Unmodified 1340.562 0.56197093 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 63.961 63.961 2 0.00080496 63052 QUIQUE_C1403_190116_001 112.36 91.456 790300000 137900000 109220000 86676000 82132000 70817000 0 100520000 0 35975000 59218000 0 57376000 50461000 50466 4443 47134 454994;454995;454996;454997;454998;454999;455000;455001;455002;455003 581180;581181;581182;581183;581184;581185;581186;581187;581188;581189;581190 581183 11 YDDMAAAMK Oxidation (M) 1030.41 0.4099675 2341;2736 P31946;Q4VY20;Q4VY19;A0A0J9YWE8;P61981 YWHAB;YWHAG 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 20.635 20.635 2 0.0011023 13757 QUIQUE_C1576_190116_001 108.46 23.249 4440500000 322270000 562470000 456130000 0 0 344680000 279670000 194650000 297700000 155470000 849710000 305890000 671820000 50467 2341;2736 47135 455004;455005;455006;455007;455008;455009;455010;455011;455012;455013;455014;455015;455016 581191;581192;581193;581194;581195;581196;581197;581198;581199;581200;581201;581202;581203 581195 1744 7 YDDMAAAMK Unmodified 1014.4151 0.41505288 2341;2736 P31946;Q4VY20;Q4VY19;A0A0J9YWE8;P61981 YWHAB;YWHAG 14-3-3 protein beta/alpha;14-3-3 protein beta/alpha, N-terminally processed;14-3-3 protein gamma;14-3-3 protein gamma, N-terminally processed no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 39.358 39.358 2 0.011065 36335 QUIQUE_DMIX1_190116_001 73.248 64.908 21431000000 1771000000 2104000000 1905000000 1610400000 1380900000 1476500000 1949700000 1326000000 1238600000 514320000 2393800000 1710700000 2049700000 50468 2341;2736 47135 455017;455018;455019;455020;455021;455022;455023;455024;455025;455026;455027;455028;455029 581204;581205;581206;581207;581208;581209;581210;581211;581212;581213;581214;581215;581216;581217;581218;581219 581213 15 YDDMAACMK Unmodified 1103.4086 0.4085873 2780 P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.006 38.006 2 0.001987 33717 QUIQUE_C1368_190116_001 109.86 103.41 18594000000 1658100000 2000100000 1708400000 1558400000 1283700000 1387700000 1751200000 1014000000 1145700000 341360000 1721800000 1310000000 1713700000 50469 2780 47136 455030;455031;455032;455033;455034;455035;455036;455037;455038;455039;455040;455041;455042 581220;581221;581222;581223;581224;581225;581226;581227;581228;581229;581230;581231;581232;581233;581234;581235 581223 13 YDDMAACMK Oxidation (M) 1119.4035 0.40350192 2780 P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 1 0 3 2 2 2 1 2 3 2 1 2 2 2 20.924 20.924 2 0.0081126 14786 QUIQUE_C1277_190116_001 83.265 83.265 6484500000 0 1168100000 873990000 614340000 528790000 63076000 516570000 468680000 460620000 62437000 646850000 438090000 642980000 50470 2780 47136 455043;455044;455045;455046;455047;455048;455049;455050;455051;455052;455053;455054;455055;455056;455057;455058;455059;455060;455061;455062;455063;455064;455065;455066 581236;581237;581238;581239;581240;581241;581242;581243;581244;581245;581246;581247;581248;581249;581250;581251;581252;581253;581254;581255;581256;581257;581258;581259;581260 581238 2226;2227 25 YDDMAACMK 2 Oxidation (M) 1135.3984 0.39841654 2780 P63104;E7EX29;E7ESK7;E9PD24;E7EVZ2;E5RIR4;E5RGE1 YWHAZ 14-3-3 protein zeta/delta yes no 0 2 0 1 13.4 13.4 2 0.029127 5464 QUIQUE_DMIX4_190116_001 62.107 58.173 3947200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3947200 0 0 0 50471 2780 47136 455067 581261 581261 2226;2227 1 YDDMASAMK Unmodified 1030.41 0.4099675 2891 Q04917;F8WEB6;A2IDB1 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 36.834 36.834 2 0.015672 31989 QUIQUE_C1563_190116_001 101.54 14.219 2785300000 418460000 452150000 0 333660000 0 351940000 0 339940000 350680000 155480000 0 382960000 0 50472 2891 47137 455068;455069;455070;455071;455072;455073;455074;455075 581262;581263;581264;581265;581266;581267;581268;581269 581265 1 YDDMASAMK Oxidation (M) 1046.4049 0.40488213 2891 Q04917;F8WEB6;A2IDB1 YWHAH 14-3-3 protein eta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 18.7 18.7 2 0.016041 11187 QUIQUE_C1368_190116_001 69.812 10.997 419740000 0 145430000 85912000 0 0 0 0 0 71652000 0 44546000 72205000 0 50473 2891 47137 455076;455077;455078;455079;455080 581270;581271;581272;581273;581274 581271 5 YDDMATCMK Oxidation (M) 1149.4141 0.4140666 2262 P27348;E9PG15 YWHAQ 14-3-3 protein theta yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.795 20.795 2 0.010118 13330 QUIQUE_C1563_190116_001 78.516 70.176 924500000 81352000 98104000 90531000 63899000 65420000 63383000 54407000 55852000 74948000 34881000 96616000 72102000 73003000 50474 2262 47138 455081;455082;455083;455084;455085;455086;455087;455088;455089;455090;455091;455092;455093 581275;581276;581277;581278;581279;581280;581281;581282;581283;581284;581285;581286;581287 581280 1631 13 YDDMATCMK Unmodified 1133.4192 0.41915198 2262 P27348;E9PG15 YWHAQ 14-3-3 protein theta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 2 33.165 33.165 2 0.015867 31794 QUIQUE_C1218_190116_001 66.546 59.722 6085700000 562380000 677080000 530950000 548390000 430050000 505020000 571710000 375350000 486450000 151860000 656380000 590070000 0 50475 2262 47138 455094;455095;455096;455097;455098;455099;455100;455101;455102;455103;455104;455105;455106;455107;455108 581288;581289;581290;581291;581292;581293;581294;581295;581296;581297;581298;581299;581300;581301;581302;581303;581304 581288 15 YDDPEVQK Unmodified 992.44509 0.44509068 2415 P38646;A0A3B3ITI4;D6RJI2 HSPA9 Stress-70 protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.759 19.759 2 0.0036756 12549 QUIQUE_DMIX5_190116_001 123.69 77.674 857300000 109900000 92007000 85467000 67177000 76506000 64748000 73618000 39835000 0 44075000 91026000 61946000 50994000 50476 2415 47139 455109;455110;455111;455112;455113;455114;455115;455116;455117;455118;455119;455120;455121 581305;581306;581307;581308;581309;581310;581311;581312;581313;581314;581315;581316;581317;581318 581316 14 YDDPPDWQEILTYFR Unmodified 1956.8894 0.8893935 2718 P61221;D6R9I9;D6RGF4;H0Y990 ABCE1 ATP-binding cassette sub-family E member 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 168.49 168.49 2 8.5264E-06 172078 QUIQUE_C1277_190116_001 105.03 99.19 210540000 0 15432000 11826000 7864100 17011000 0 20637000 15890000 31325000 3130600 45267000 24428000 17727000 50477 2718 47140 455122;455123;455124;455125;455126;455127;455128;455129;455130;455131;455132 581319;581320;581321;581322;581323;581324;581325;581326;581327;581328;581329 581319 11 YDEAASYIQSK Unmodified 1273.5826 0.5826468 1870 P04899 GNAI2 Guanine nucleotide-binding protein G(i) subunit alpha-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.113 46.113 2 0.00027 43101 QUIQUE_C1277_190116_001 120.45 71.656 6324100000 594090000 615860000 807230000 622750000 534450000 513020000 812930000 209840000 394130000 297030000 449660000 0 473120000 50478 1870 47141 455133;455134;455135;455136;455137;455138;455139;455140;455141;455142;455143;455144 581330;581331;581332;581333;581334;581335;581336;581337;581338;581339;581340;581341;581342;581343 581331 13 YDECLAVYR Unmodified 1187.5281 0.5281088 1683 O76094;D6RDY6;R4GNC1 SRP72 Signal recognition particle subunit SRP72 yes no 0 0 0 1 1 1 1 61.553 61.553 2 0.030636 60754 QUIQUE_DMIX5_190116_001 83.206 56.244 93292000 33863000 24112000 0 0 0 0 35317000 0 0 0 0 0 0 50479 1683 47142 455145;455146;455147;455148 581344;581345;581346;581347 581347 3 YDEEGGGEEDQDYDLSQLQQPDTVEPDAIKPVGIR Unmodified 3904.7763 0.7762804 2141 P19022 CDH2 Cadherin-2 yes yes 0 0 1 1 2 1 2 1 2 1 2 1 2 2 122.65 122.65 3;4 9.2254E-58 127817 QUIQUE_C1218_190116_001 127.95 126.47 913880000 32779000 75986000 49436000 134200000 0 102930000 0 89250000 147060000 0 55416000 85038000 141790000 50480 2141 47143 455149;455150;455151;455152;455153;455154;455155;455156;455157;455158;455159;455160;455161;455162;455163;455164;455165 581348;581349;581350;581351;581352;581353;581354;581355;581356;581357;581358;581359;581360;581361;581362;581363;581364;581365;581366 581348 18 YDEFHDYLER Unmodified 1385.5888 0.58879481 3895 Q96K76 USP47 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47 yes yes 0 0 0 1 1 1 70.33 70.33 2 0.026863 70603 QUIQUE_C1368_190116_001 55.549 44.398 54628000 0 16796000 15380000 0 0 0 0 0 0 0 22452000 0 0 50481 3895 47144 455166;455167;455168 581367;581368;581369 581368 2 YDEMVESMK 2 Oxidation (M) 1162.4522 0.45222625 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 2 0 2 2 2 1 1 1 2 1 1 1 1 17.93 17.93 2 0.0027416 10207 QUIQUE_C1368_190116_001 97.635 84.808 726120000 99331000 151350000 166600000 33209000 41645000 56239000 78797000 0 18909000 34973000 21571000 0 23488000 50482 2745 47145 455169;455170;455171;455172;455173;455174;455175;455176;455177;455178;455179;455180;455181;455182;455183 581370;581371;581372;581373;581374;581375;581376;581377;581378;581379;581380;581381;581382;581383;581384;581385;581386;581387 581376 2177;2178 16 YDEMVESMK Oxidation (M) 1146.4573 0.45731163 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 1 0 3 2 2 2 2 1 1 1 2 3 1 1 1 28.603 28.603 2 0.0083298 25204 QUIQUE_C1218_190116_001 82.75 70.544 4285200000 649410000 630300000 682740000 401130000 430190000 350250000 167260000 0 220820000 371730000 116700000 91340000 173310000 50483 2745 47145 455184;455185;455186;455187;455188;455189;455190;455191;455192;455193;455194;455195;455196;455197;455198;455199;455200;455201;455202;455203;455204;455205 581388;581389;581390;581391;581392;581393;581394;581395;581396;581397;581398;581399;581400;581401;581402;581403;581404;581405;581406;581407;581408;581409;581410;581411 581389 2177;2178 21 YDEMVESMK Unmodified 1130.4624 0.46239701 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.789 46.789 2 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455259;455260;455261;455262;455263;455264;455265;455266;455267;455268;455269;455270;455271;455272;455273 581471;581472;581473;581474;581475;581476;581477;581478;581479;581480;581481;581482;581483;581484;581485 581484 11 YDEMVESMKK 2 Oxidation (M) 1290.5472 0.54718927 2745 P62258;B4DJF2;I3L3T1 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 2 1 2 10.731 10.731 3 0.0093741 3273 QUIQUE_DMIX4_190116_001 60.547 54.514 85483000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 85483000 0 0 0 50487 2745 47146 455274;455275 581486;581487 581487 2177;2178 1 YDENMVLVSLLK Unmodified 1422.7429 0.74285261 1725 O95352;H7C059 ATG7 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.3 140.3 2 0.00036399 146163 QUIQUE_C1576_190116_001 136.02 86.209 496290000 48236000 49215000 48570000 67590000 0 42470000 55370000 54796000 53412000 25012000 0 0 51618000 50488 1725 47147 455276;455277;455278;455279;455280;455281;455282;455283;455284;455285 581488;581489;581490;581491;581492;581493;581494;581495;581496;581497;581498 581494 11 YDEPLGK Unmodified 820.39668 0.39668393 3951 Q99426;K7EP07 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.836 24.836 2 0.036465 18600 QUIQUE_C1576_190116_001 86.086 69.16 2354700000 0 0 266510000 249550000 275170000 315360000 357580000 266220000 279280000 101470000 0 243550000 0 50489 3951 47148 455286;455287;455288;455289;455290;455291;455292;455293;455294 581499;581500;581501;581502;581503;581504;581505;581506;581507 581503 9 YDESDNAFIR Unmodified 1228.536 0.53603095 1535 O43615;M0QXU7 TIMM44 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 59.655 59.655 2 0.013795 57695 QUIQUE_C1563_190116_001 78.149 66.659 26065000 0 0 0 0 0 26065000 0 0 0 0 0 0 0 50490 1535 47149 455295;455296;455297;455298;455299 581508;581509;581510;581511;581512 581511 5 YDEYVNVK Unmodified 1028.4815 0.48147619 3700 Q8WUM4 PDCD6IP Programmed cell death 6-interacting protein yes yes 0 0 0 1 37.966 37.966 2 0.058161 33813 QUIQUE_C1403_190116_001 53.679 38.047 55126000 0 0 0 55126000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50491 3700 47150 455300 581513 581513 1 YDFISLQCQQVVR Unmodified 1654.8137 0.81372614 3304 Q5T0D9 TPRG1L Tumor protein p63-regulated gene 1-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 106.71 106.71 2 0.00050772 109482 QUIQUE_C1403_190116_001 90.149 71.814 118220000 0 0 0 59127000 0 59097000 0 0 0 0 0 0 0 50492 3304 47151 455301;455302;455303 581514;581515;581516 581515 3 YDGHLPIEIK Unmodified 1183.6237 0.62372375 2465 P43490;A0A0C4DFS8 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 64.681 64.681 2;3 0.008856 63045 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.189 28.319 75675000 0 0 0 0 0 0 0 34993000 0 40682000 0 0 0 50493 2465 47152 455304;455305;455306;455307;455308;455309;455310 581517;581518;581519;581520;581521;581522;581523 581520 7 YDGIILPGK Unmodified 974.54368 0.54368251 2771 P62913;Q5VVC8 RPL11 60S ribosomal protein L11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 69.831 69.831 2 0.0097456 70843 QUIQUE_C1218_190116_001 75.109 46.855 1789400000 138370000 123480000 147160000 141030000 121460000 133630000 137790000 128950000 186230000 0 203180000 163270000 164820000 50494 2771 47153 455311;455312;455313;455314;455315;455316;455317;455318;455319;455320;455321;455322;455323 581524;581525;581526;581527;581528;581529;581530;581531;581532;581533;581534;581535;581536;581537 581525 12 YDGKWEVEEMK Unmodified 1412.6282 0.62821678 2269 P27824;H0Y9Q7;D6RDP7;D6RB85;D6RAU8 CANX Calnexin yes no 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 55.942 55.942 2;3 0.0012316 54307 QUIQUE_C1403_190116_001 125.23 101.7 506670000 0 0 61517000 167760000 0 0 72633000 46068000 43287000 0 115400000 0 0 50495 2269 47154 455324;455325;455326;455327;455328;455329;455330;455331;455332 581538;581539;581540;581541;581542;581543;581544;581545;581546 581540 9 YDGKWEVEEMKESK Unmodified 1756.7978 0.7978013 2269 P27824;H0Y9Q7;D6RDP7;D6RB85;D6RAU8 CANX Calnexin yes no 0 0 2 1 2 43.825 43.825 2;3 4.5142E-16 40514 QUIQUE_DMIX3_190116_001 162.22 140.65 242020000 0 0 0 0 0 0 0 111010000 131010000 0 0 0 0 50496 2269 47155 455333;455334;455335 581547;581548;581549 581549 3 YDGLVGMFDPK Unmodified 1240.5798 0.57981002 2035;413 A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RB22;B4DQ67;P12081;B4DDD8;B3KWE1;E7ETE2;B4E1C5 HARS2;HARS Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial;Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic no no 0 0 0 1 1 1 1 114.08 114.08 2 0.010389 119693 QUIQUE_DMIX5_190116_001 75.387 50.612 175150000 0 0 36659000 0 0 0 32173000 0 0 0 57569000 0 48748000 50497 413;2035 47156 455336;455337;455338;455339 581550;581551;581552;581553 581552 4 YDGNHIPGSPLQFYVDAINSR Unmodified 2362.1342 0.13420866 3061 Q14315 FLNC Filamin-C yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 139.06 139.06 3 2.2142E-10 135697 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.326 79.909 399010000 62093000 0 82827000 0 0 0 0 0 70083000 43357000 0 39630000 101020000 50498 3061 47157 455340;455341;455342;455343;455344;455345;455346 581554;581555;581556;581557;581558;581559;581560;581561 581558 8 YDGNVYENLFEWAK Unmodified 1746.789 0.78895118 3107 Q15067;K7ESC7;K7ENF1 ACOX1 Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.9 149.9 2 3.2897E-14 154645 QUIQUE_DMIX8_190116_001 145.91 137.61 766560000 38465000 56362000 68592000 50504000 43872000 63373000 56786000 64218000 83648000 8654200 82538000 74392000 75162000 50499 3107 47158 455347;455348;455349;455350;455351;455352;455353;455354;455355;455356;455357;455358;455359;455360;455361 581562;581563;581564;581565;581566;581567;581568;581569;581570;581571;581572;581573;581574;581575;581576 581576 13 YDGQVAVFGSDLQEK Unmodified 1654.7839 0.7838658 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 0 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 88.797 88.797 2;3 1.0874E-08 89973 QUIQUE_C1563_190116_001 123.95 111.99 9797000000 0 767100000 864990000 825700000 1101300000 747570000 916330000 706300000 738250000 367870000 927260000 821580000 1012800000 50500 2197 47159 455362;455363;455364;455365;455366;455367;455368;455369;455370;455371;455372;455373;455374;455375;455376;455377;455378;455379 581577;581578;581579;581580;581581;581582;581583;581584;581585;581586;581587;581588;581589;581590;581591;581592;581593;581594;581595;581596;581597;581598;581599 581585 23 YDGSTIVPGEQGAEYQHFIQQCTDDVR Unmodified 3112.3832 0.38324207 3040 Q14019 COTL1 Coactosin-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 2 116.03 116.03 2;3 1.4873E-126 120396 QUIQUE_C1368_190116_001 191.69 180.58 9219100000 558460000 677850000 763880000 538790000 458890000 737780000 664030000 769160000 696900000 398340000 1156100000 654220000 1144700000 50501 3040 47160 455380;455381;455382;455383;455384;455385;455386;455387;455388;455389;455390;455391;455392;455393;455394 581600;581601;581602;581603;581604;581605;581606;581607;581608;581609;581610;581611;581612;581613;581614;581615;581616;581617;581618;581619;581620;581621;581622;581623;581624;581625 581604 26 YDHLDPTEMEK Unmodified 1376.5918 0.59183127 1748 O95757;E9PDE8 HSPA4L Heat shock 70 kDa protein 4L yes no 0 0 0 1 45.914 45.914 2 0.0010122 42832 QUIQUE_C1277_190116_001 114.4 91.047 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50502 1748 47161 455395 581626 581626 1 YDHQAEEDLR Unmodified 1274.5527 0.55274365 3137 Q15417 CNN3 Calponin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 19.46 19.46 2;3 0.00046019 12068 QUIQUE_DMIX8_190116_001 79.07 73.037 2739100000 0 0 310720000 321770000 380560000 590930000 373580000 0 116800000 249600000 238350000 0 156770000 50503 3137 47162 455396;455397;455398;455399;455400;455401;455402;455403;455404 581627;581628;581629;581630;581631;581632;581633;581634;581635 581635 5 YDIDLPNK Unmodified 976.48656 0.48656157 835 E5RGN3;E5RIM7;O00244 ATOX1 Copper transport protein ATOX1 yes no 0 0 0 1 1 60.234 60.234 2 0.042765 59261 QUIQUE_DMIX3_190116_001 58.782 28.278 75182000 0 36764000 0 0 0 0 0 0 38419000 0 0 0 0 50504 835 47163 455405;455406 581636;581637 581637 2 YDIDLPNKK Unmodified 1104.5815 0.58152458 835 E5RGN3;E5RIM7;O00244 ATOX1 Copper transport protein ATOX1 yes no 0 0 1 1 1 38.978 38.978 2 0.023558 34880 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.457 51.681 118330000 0 0 0 0 0 0 0 57108000 61218000 0 0 0 0 50505 835 47164 455407;455408 581638;581639 581639 2 YDIDMTK Unmodified 884.39497 0.39496937 1387 O00217;E9PPW7;E9PKH6 NDUFS8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 42.378 42.378 2 0.019394 39343 QUIQUE_DMIX3_190116_001 115.46 94.599 188130000 0 0 0 0 0 0 0 0 85110000 0 103020000 0 0 50506 1387 47165 455409;455410 581640;581641 581640 2 YDIEFEDK Unmodified 1057.4604 0.4604064 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 0 1 1 67.196 67.196 2 0.032574 67141 QUIQUE_C1576_190116_001 65.246 45.543 68824000 42795000 0 0 0 0 0 26029000 0 0 0 0 0 0 50507 2345 47166 455411;455412 581642;581643 581643 2 YDIEFEDKEMAPEK Unmodified 1742.7709 0.77091785 2345 P32004 L1CAM Neural cell adhesion molecule L1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 2 2 72.678 72.678 2;3 0.00019426 73311 QUIQUE_C1277_190116_001 90.367 63.825 409940000 0 49399000 66058000 41239000 27338000 26999000 117210000 0 0 0 0 0 81702000 50508 2345 47167 455413;455414;455415;455416;455417;455418;455419;455420;455421 581644;581645;581646;581647;581648;581649;581650;581651;581652;581653 581644 10 YDIVGELR Unmodified 963.50255 0.50254598 4735 yes yes 0 0 0 1 1 92.115 92.115 2 0.033344 95223 QUIQUE_C1438_190116_001 64.757 31.4 63082000 33290000 0 0 0 29792000 0 0 0 0 0 0 0 0 + 50509 4735 47168 455422;455423 581654;581655 581655 2 YDKLTVPDDIAANCIYLNIPNK Unmodified 2549.2836 0.28357501 1684 O94760;B4DYP1 DDAH1 N(G),N(G)-dimethylarginine dimethylaminohydrolase 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 125.6 125.6 2;3 7.1081E-14 129860 QUIQUE_DMIX3_190116_001 152.99 111.35 2161500000 60714000 103870000 95455000 86339000 118150000 61934000 106660000 227160000 282960000 0 400520000 332210000 285510000 50510 1684 47169 455424;455425;455426;455427;455428;455429;455430;455431;455432;455433;455434;455435;455436;455437;455438;455439 581656;581657;581658;581659;581660;581661;581662;581663;581664;581665;581666;581667;581668;581669;581670;581671;581672;581673;581674;581675;581676;581677;581678 581669 23 YDKNSDGKIEMAELAQILPTEENFLLCFR Unmodified 3443.6741 0.6741277 2201 P22676;H3BN14;A6NER6 CALB2 Calretinin yes no 0 0 2 1 1 1 1 164.23 164.23 4 1.9057E-08 171408 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.89 52.093 224370000 0 0 0 0 0 0 0 15365000 35648000 0 123370000 49990000 0 50511 2201 47170 455440;455441;455442;455443 581679;581680;581681;581682;581683;581684 581683 6 YDLAFVVASQATK Unmodified 1411.7347 0.73473076 4663 Q9Y6R7;A0A286YF91 FCGBP IgGFc-binding protein yes no 0 0 0 1 109.85 109.85 2 0.002249 106499 QUIQUE_DMIX4_190116_001 74.76 60.125 36722000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 36722000 0 0 0 50512 4663 47171 455444 581685 581685 1 YDLASHLGIR Unmodified 1143.6037 0.60365701 947 E9PJP2;Q5TF21;H3BRB8 SOGA3 Protein SOGA3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 68.942 68.942 3 0.00036324 69763 QUIQUE_C1218_190116_001 83.499 69.292 59726000 22003000 19539000 0 0 0 0 18184000 0 0 0 0 0 0 50513 947 47172 455445;455446;455447;455448;455449 581686;581687;581688;581689;581690 581686 5 YDLDACDIQEK Unmodified 1368.5867 0.5867459 1469 O14976 GAK Cyclin-G-associated kinase yes yes 0 0 0 1 63.217 63.217 2 0.022612 63653 QUIQUE_C1438_190116_001 60.064 46.061 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50514 1469 47173 455450 581691 581691 1 YDLDFKSPDDPSR Unmodified 1553.6998 0.69980182 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 2 2 68.218 68.218 2;3 2.3552E-23 67717 QUIQUE_DMIX3_190116_001 176.32 162.8 7807200000 0 53231000 0 0 269760000 0 0 2154700000 1637300000 0 967520000 1238500000 1486200000 50515 1906 47174 455451;455452;455453;455454;455455;455456;455457;455458;455459;455460;455461;455462;455463 581692;581693;581694;581695;581696;581697;581698;581699;581700;581701;581702;581703;581704;581705;581706;581707;581708;581709;581710;581711;581712;581713 581699 22 YDLDFKSPTDPSR Unmodified 1539.7205 0.72053726 1955 P09104;F5H0C8;U3KQP4 ENO2 Gamma-enolase;Enolase yes no 0 0 1 1 70.408 70.408 2 0.0024586 69774 QUIQUE_DMIX1_190116_001 97.214 77.427 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50516 1955 47175 455464 581714 581714 1 YDLFSDDYDTSEK Unmodified 1596.6468 0.6467632 723 C9JFZ1;J3KQV8;O43426;J3KPK1;A0A0D9SGJ6 SYNJ1 Synaptojanin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.544 98.544 2 0.00046635 100218 QUIQUE_DMIX1_190116_001 98.353 91.38 999770000 96461000 97155000 93524000 70430000 73446000 72549000 91995000 68117000 54129000 30789000 85459000 92149000 73565000 50517 723 47176 455465;455466;455467;455468;455469;455470;455471;455472;455473;455474;455475;455476;455477 581715;581716;581717;581718;581719;581720;581721;581722;581723;581724;581725;581726;581727;581728;581729;581730 581724 13 YDLGGLVMVK Unmodified 1093.5842 0.58416712 3124 Q15274 QPRT Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 107.47 107.47 2 0.0089771 110137 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.919 52.136 440730000 37468000 33072000 70136000 46902000 0 0 54066000 71923000 62431000 0 64736000 0 0 50518 3124 47177 455478;455479;455480;455481;455482;455483;455484;455485 581731;581732;581733;581734;581735;581736;581737;581738;581739;581740 581738 9 YDLIAVSNHYGGMR Unmodified 1594.7562 0.75621126 1096 G5E9A6;P51784 USP11 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11 yes no 0 0 0 1 80.29 80.29 2 0.060733 82001 QUIQUE_C1576_190116_001 31.185 23.26 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50519 1096 47178 455486 581741 581741 1 YDLLCLEGLVR Unmodified 1349.7013 0.70132214 4284 Q9NSD9 FARSB Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.35 142.35 2 0.00044077 148235 QUIQUE_C1218_190116_001 109.66 81.922 1554300000 171150000 161510000 115180000 69254000 158310000 154220000 150870000 40627000 74675000 47728000 168970000 126070000 115710000 50520 4284 47179 455487;455488;455489;455490;455491;455492;455493;455494;455495;455496;455497;455498;455499 581742;581743;581744;581745;581746;581747;581748;581749;581750;581751;581752;581753;581754;581755 581743 13 YDLLVSNAIQFLASVCERPHYK Unmodified 2622.3264 0.32644288 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 155.25 155.25 4 7.9788E-08 157546 QUIQUE_C1563_190116_001 81.967 74.691 347100000 28368000 40079000 0 34242000 27758000 24007000 38323000 28886000 47690000 0 0 77750000 0 50521 2657 47180 455500;455501;455502;455503;455504;455505;455506;455507;455508 581756;581757;581758;581759;581760;581761;581762;581763;581764 581760 8 YDLNWLVK Unmodified 1049.5546 0.55458155 4307 Q9NVH6 TMLHE Trimethyllysine dioxygenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.64 117.64 2 0.018116 123257 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.462 64.83 277980000 0 0 35142000 36478000 0 0 24820000 53547000 43955000 0 32764000 51274000 0 50522 4307 47181 455509;455510;455511;455512;455513;455514;455515 581765;581766;581767;581768;581769;581770;581771 581770 7 YDLSGRPLNIK Unmodified 1274.6983 0.69828568 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 57.295 57.295 2;3 0.010249 55829 QUIQUE_C1218_190116_001 49.777 26.1 120790000 45121000 55661000 0 0 0 0 0 0 0 20005000 0 0 0 50523 140 47182 455516;455517;455518;455519 581772;581773;581774;581775 581772 4 YDLSGRPLNIKEDPDGENAR Unmodified 2258.0927 0.092737771 140 A0A0A0MR39;A0A0A0MQW0;Q9P2K5;A0A087WUT0 MYEF2 Myelin expression factor 2 yes no 0 0 2 1 1 1 1 1 58.807 58.807 3 4.9026E-05 58068 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.511 70.802 282200000 0 0 0 0 63833000 0 90109000 0 43637000 0 42494000 0 42124000 50524 140 47183 455520;455521;455522;455523;455524 581776;581777;581778;581779;581780 581779 5 YDLSLPVER Unmodified 1090.5659 0.56587452 3588 Q8N465;B5MCV2;H7BZ32;H7C0N1 D2HGDH D-2-hydroxyglutarate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 87.122 87.122 2 0.015303 88518 QUIQUE_DMIX3_190116_001 76.064 56.428 131810000 38508000 0 0 0 0 0 0 34367000 58934000 0 0 0 0 50525 3588 47184 455525;455526;455527 581781;581782;581783 581783 3 YDLTVPFAR Unmodified 1080.5604 0.56039521 2035;413 A0A2R8Y6I1;A0A2R8Y3N3;A0A2R8Y5P7;P49590;D6RJE6;A0A2R8Y4X6;A0A2R8Y5E8;P12081;B3KWE1 HARS2;HARS Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial;Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 101.54 101.54 2 0.00049652 105538 QUIQUE_C1218_190116_001 114.28 80.278 806640000 83823000 87973000 91201000 77701000 0 65111000 71839000 85529000 89578000 39690000 114190000 0 0 50526 413;2035 47185 455528;455529;455530;455531;455532;455533;455534;455535;455536;455537 581784;581785;581786;581787;581788;581789;581790;581791;581792;581793;581794 581784 10 YDNIVIGAGFSGHGFK Unmodified 1680.826 0.82600539 4371 Q9P0Z9 PIPOX Peroxisomal sarcosine oxidase yes yes 0 0 0 1 90.22 90.22 3 0.0035515 91311 QUIQUE_DMIX1_190116_001 46.571 34.957 21154000 0 0 0 0 0 0 0 21154000 0 0 0 0 0 50527 4371 47186 455538 581795 581795 1 YDNMAELFAVVK Unmodified 1398.6853 0.68533773 4467 Q9UK41;E9PQR7;E9PM90;E9PR04 VPS28 Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog yes no 0 0 0 1 134.52 134.52 2 0.051772 139682 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.451 58.398 52460000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52460000 50528 4467 47187 455539 581796 581796 0 YDPGALVIPFSGALELK Unmodified 1788.9662 0.96618726 1276 J3KQ32;Q9NTK5 OLA1 Obg-like ATPase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.88 156.88 2 8.3494E-10 161004 QUIQUE_C1277_190116_001 113.69 98.492 696400000 57076000 95183000 0 26994000 47856000 54347000 83655000 52136000 76216000 28959000 87288000 48814000 37877000 50529 1276 47188 455540;455541;455542;455543;455544;455545;455546;455547;455548;455549;455550;455551 581797;581798;581799;581800;581801;581802;581803;581804;581805;581806;581807;581808 581798 12 YDPNVYSIK Unmodified 1097.5393 0.53932542 1909 P06756 ITGAV Integrin alpha-V;Integrin alpha-V heavy chain;Integrin alpha-V light chain yes yes 0 0 0 1 1 57.31 57.31 2 0.034243 54848 QUIQUE_DMIX1_190116_001 55.112 38.148 79987000 0 0 0 0 0 0 0 51113000 0 28875000 0 0 0 50530 1909 47189 455552;455553 581809;581810 581809 2 YDPPLEDGAMPSAR Oxidation (M) 1533.677 0.67695789 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 51.531 51.531 2 0.0014884 47266 QUIQUE_DMIX4_190116_001 77.062 59.626 385100000 50206000 50399000 51001000 55282000 0 47442000 0 0 0 75066000 55704000 0 0 50531 585;2493 47190 455554;455555;455556;455557;455558;455559;455560 581811;581812;581813;581814;581815;581816;581817;581818;581819 581818 380 9 YDPPLEDGAMPSAR Unmodified 1517.682 0.68204326 585;2493 B1AK87;B1AK88;P47756;B1AK85 CAPZB F-actin-capping protein subunit beta no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 71.97 71.97 2 0.00026901 72188 QUIQUE_C1277_190116_001 113.61 96.378 1005200000 195910000 174010000 191400000 182880000 0 170900000 0 39813000 0 50257000 0 0 0 50532 585;2493 47190 455561;455562;455563;455564;455565;455566;455567 581820;581821;581822;581823;581824;581825;581826;581827 581821 8 YDPSLKPLSVSYDQATSLR Unmodified 2139.0848 0.084798847 1796 P00918;E5RID5;E5RK37 CA2 Carbonic anhydrase 2 yes no 0 0 1 2 2 2 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 97.689 97.689 2;3 1.6173E-100 100658 QUIQUE_DMIX3_190116_001 165.66 156.84 23770000000 1280100000 272340000 2040400000 1665200000 1878100000 1580000000 1966500000 1823300000 2264900000 1018900000 3231500000 2570600000 2178600000 50533 1796 47191 455568;455569;455570;455571;455572;455573;455574;455575;455576;455577;455578;455579;455580;455581;455582;455583;455584;455585;455586;455587;455588;455589;455590;455591;455592;455593;455594 581828;581829;581830;581831;581832;581833;581834;581835;581836;581837;581838;581839;581840;581841;581842;581843;581844;581845;581846;581847;581848;581849;581850;581851;581852;581853;581854;581855;581856;581857;581858;581859;581860;581861;581862;581863;581864;581865;581866 581855 39 YDPTIEDFYR Unmodified 1317.5877 0.58773217 2720;1991;4595 P61225;F6U784;Q9Y3L5;P10114 RAP2B;RAP2A;RAP2C Ras-related protein Rap-2b;Ras-related protein Rap-2c;Ras-related protein Rap-2a no no 0 0 0 1 1 1 1 101.45 101.45 2 0.010394 105457 QUIQUE_C1218_190116_001 68.846 55.726 336900000 134510000 142420000 0 0 0 0 0 59973000 0 0 0 0 0 50534 2720;4595;1991 47192 455595;455596;455597;455598 581867;581868;581869;581870 581867 4 YDPTIEDFYRK Unmodified 1445.6827 0.68269519 2720;1991;4595 P61225;F6U784;Q9Y3L5;P10114 RAP2B;RAP2A;RAP2C Ras-related protein Rap-2b;Ras-related protein Rap-2c;Ras-related protein Rap-2a no no 0 0 1 1 1 1 76.384 76.384 3 0.033788 77298 QUIQUE_DMIX7_190116_001 31.04 25.774 80169000 0 0 0 0 0 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2 1 36.041 36.041 2;3 1.7678E-05 31959 QUIQUE_DMIX3_190116_001 143.7 118.93 1231300000 0 0 67906000 61799000 0 29442000 70022000 91587000 282380000 14720000 389490000 0 223950000 50537 2719;2765 47195 455610;455611;455612;455613;455614;455615;455616;455617;455618;455619;455620 581882;581883;581884;581885;581886;581887;581888;581889;581890;581891;581892 581888 10 YDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVR Oxidation (M) 2979.3478 0.34776776 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 1 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 171.37 171.37 3 1.2443E-12 173892 QUIQUE_C1277_190116_001 71.297 58.864 247860000 12777000 40575000 25462000 22350000 19371000 26803000 0 40320000 28122000 0 0 32081000 0 50538 4600 47196 455621;455622;455623;455624;455625;455626;455627;455628;455629;455630 581893;581894;581895;581896;581897;581898;581899;581900;581901;581902 581894 3037;3038 10 YDQATDTILTVTENIFSSMGDAGEMVR 2 Oxidation (M) 2995.3427 0.34268239 4600 Q9Y490 TLN1 Talin-1 yes yes 0 2 0 1 1 1 168.48 168.48 3 3.4643E-06 171494 QUIQUE_C1403_190116_001 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yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 116.96 116.96 2 0.012404 120413 QUIQUE_C1277_190116_001 71.379 52.94 511220000 50082000 44721000 49736000 43335000 45375000 38226000 41720000 42113000 41329000 17874000 54748000 41960000 0 50555 3099 47211 455719;455720;455721;455722;455723;455724;455725;455726;455727;455728;455729;455730 581998;581999;582000;582001;582002;582003;582004;582005;582006;582007;582008;582009;582010;582011 582000 14 YDWLDIWDGIPHVGPLIGK Unmodified 2193.1259 0.1258758 1574 O60462 NRP2 Neuropilin-2 yes yes 0 0 0 1 167.76 167.76 3 0.014668 173003 QUIQUE_C1576_190116_001 35.176 27.087 21183000 0 0 0 0 0 0 21183000 0 0 0 0 0 0 50556 1574 47212 455731 582012 582012 1 YDYEEVEAEGANK Unmodified 1515.6365 0.63653286 2400 P36871;A0A3B3ITK7 PGM1 Phosphoglucomutase-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.263 57.263 2 6.862E-18 53381 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.97 162.92 7705700000 541730000 591360000 802720000 612360000 520530000 0 586450000 535150000 687960000 374570000 798180000 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71.94 71269000 0 36419000 0 0 34851000 0 0 0 0 0 0 0 0 50561 1152 47217 455775;455776;455777 582073;582074;582075 582075 3 YEAANWK Unmodified 880.40792 0.40791731 1091 G3V5Z7;P60900;G3V295;G3V3I1 PSMA6 Proteasome subunit alpha type;Proteasome subunit alpha type-6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 26.411 26.411 2 0.038719 20871 QUIQUE_DMIX4_190116_001 84.359 63.374 779010000 0 0 291280000 200780000 0 0 0 0 0 73128000 0 0 213820000 50562 1091 47218 455778;455779;455780;455781 582076;582077;582078;582079 582078 4 YEALKEPMVAR Oxidation (M) 1321.67 0.67002202 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 1 2 3 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 2 33.085 33.085 2;3 0.001736 28094 QUIQUE_C1277_190116_001 82.417 74.017 9338200000 357450000 656760000 593800000 409100000 740140000 370450000 274190000 1137800000 1221900000 384180000 1077600000 923030000 1191900000 50563 267;275;3025 47219 455782;455783;455784;455785;455786;455787;455788;455789;455790;455791;455792;455793;455794;455795;455796;455797;455798;455799;455800;455801;455802;455803;455804;455805;455806;455807;455808;455809;455810 582080;582081;582082;582083;582084;582085;582086;582087;582088;582089;582090;582091;582092;582093;582094;582095;582096;582097;582098;582099;582100;582101;582102;582103;582104;582105;582106;582107;582108;582109;582110;582111;582112;582113;582114;582115;582116;582117;582118;582119 582083 185 38 YEALKEPMVAR Unmodified 1305.6751 0.67510739 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 1 1 1 1 1 39.821 39.821 3 0.026683 35782 QUIQUE_C1368_190116_001 49.466 41.183 1515500000 0 0 565230000 0 369830000 0 334740000 0 0 0 245750000 0 0 50564 267;275;3025 47219 455811;455812;455813;455814 582120;582121;582122;582123 582120 1 YEAPQATDGLAGALDAR Unmodified 1717.8271 0.8271276 1592 O60784 TOM1 Target of Myb protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.657 91.657 2 1.6689E-13 95127 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.24 94.695 644430000 100730000 96089000 0 0 111230000 0 0 82317000 0 0 109720000 0 144350000 50565 1592 47220 455815;455816;455817;455818;455819;455820;455821 582124;582125;582126;582127;582128;582129;582130;582131 582130 8 YEASILTHDSSIR Unmodified 1490.7365 0.73652168 710 C9JEU5;C9JC84;P02679;C9JPQ9;C9JU00 FGG Fibrinogen gamma chain yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 3 1 2 1 2 2 3 51.948 51.948 2;3 6.1784E-76 50180 QUIQUE_C1403_190116_001 220.25 171.46 3789500000 327430000 317690000 222710000 527230000 818650000 0 162130000 73125000 55386000 157690000 581100000 124990000 421330000 50566 710 47221 455822;455823;455824;455825;455826;455827;455828;455829;455830;455831;455832;455833;455834;455835;455836;455837;455838;455839;455840;455841;455842;455843;455844;455845 582132;582133;582134;582135;582136;582137;582138;582139;582140;582141;582142;582143;582144;582145;582146;582147;582148;582149;582150;582151;582152;582153;582154;582155;582156;582157;582158;582159;582160;582161;582162;582163;582164;582165;582166;582167;582168 582140 35 YEAVGSVHQAWEAIR Unmodified 1714.8427 0.84271808 4039 Q9BV20 MRI1 Methylthioribose-1-phosphate isomerase yes yes 0 0 0 1 82.286 82.286 3 0.0099952 78795 QUIQUE_DMIX4_190116_001 43.791 39.95 16937000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16937000 0 0 0 50567 4039 47222 455846 582169;582170 582169 2 YECVATNSAGTR Unmodified 1327.5827 0.58266357 987;1998 P10586;A2A437;Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRF;PTPRD Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F;Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta no no 0 0 0 1 1 20.567 20.567 2 0.0010001 13829 QUIQUE_C1218_190116_001 84.17 57.656 57308000 20990000 36318000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50568 1998;987 47223 455847;455848 582171;582172 582171 2 YEDAVQFIR Unmodified 1139.5611 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DLG3 Disks large homolog 3 yes no 0 0 0 1 60.316 60.316 2 0.040655 59441 QUIQUE_C1218_190116_001 84.498 53.886 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50582 3279 47236 455986 582324 582324 1 YEELFPAFSDSR Unmodified 1459.662 0.66195975 2651 P54920;M0R0Y2;M0R2M1;M0R0I4;M0R213 NAPA Alpha-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 114.65 114.65 2 1.3177E-09 118995 QUIQUE_C1368_190116_001 153.12 132.82 2541500000 190730000 183090000 255030000 208830000 202390000 207960000 224390000 162780000 193590000 103010000 206210000 198360000 205130000 50583 2651 47237 455987;455988;455989;455990;455991;455992;455993;455994;455995;455996;455997;455998;455999 582325;582326;582327;582328;582329;582330;582331;582332;582333;582334;582335;582336;582337;582338;582339;582340;582341;582342;582343;582344;582345;582346;582347;582348;582349;582350;582351;582352 582331 28 YEELQITAGR Unmodified 1178.5932 0.5931519 1859 P04264;CON__P04264 KRT1 Keratin, type II cytoskeletal 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 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53.68 53.68 2 0.011995 52083 QUIQUE_DMIX8_190116_001 66.504 6.9076 44083000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 44083000 + 50586 772 47240 456016 582380 582380 1 YEELQVTAGR Unmodified 1164.5775 0.57750184 764 CON__P48668;CON__P02538;P48668;P02538;CON__P04259 KRT6C;KRT6A Keratin, type II cytoskeletal 6C;Keratin, type II cytoskeletal 6A no no 0 0 0 1 1 45.619 45.619 2 0.002445 42384 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.886 70.792 32595000 0 0 0 0 0 0 0 32595000 0 0 0 0 0 + 50587 764 47241 456017;456018 582381;582382 582381 2 YEELQVTVGR Unmodified 1192.6088 0.60880197 781;782 CON__P35908;CON__P35908v2;P35908 KRT2 Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 61.6 61.6 2 1.6824E-23 57432 QUIQUE_DMIX4_190116_001 193.41 146.34 636820000 81750000 39105000 0 44945000 0 0 0 0 66146000 218400000 59180000 127300000 0 + 50588 781;782 47242 456019;456020;456021;456022;456023;456024;456025;456026;456027;456028;456029 582383;582384;582385;582386;582387;582388;582389;582390;582391;582392;582393;582394;582395;582396 582389 13 YEEMFPAFTDSR Oxidation (M) 1507.6289 0.62894506 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 88.401 88.401 2 0.001057 89816 QUIQUE_C1277_190116_001 85.958 65.088 299190000 50064000 100710000 59522000 0 0 0 0 27158000 0 61738000 0 0 0 50589 4128 47243 456030;456031;456032;456033;456034;456035 582397;582398;582399;582400;582401;582402;582403 582398 2871 7 YEEMFPAFTDSR Unmodified 1491.634 0.63403044 4128 Q9H115;A0A087WZQ7 NAPB Beta-soluble NSF attachment protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.96 108.96 2 5.2656E-06 111771 QUIQUE_DMIX1_190116_001 143.89 105.8 3061800000 276930000 358140000 286030000 247790000 213390000 228140000 300270000 136050000 158360000 92538000 290570000 220600000 252990000 50590 4128 47243 456036;456037;456038;456039;456040;456041;456042;456043;456044;456045;456046;456047;456048 582404;582405;582406;582407;582408;582409;582410;582411;582412;582413;582414;582415;582416;582417 582412 14 YEETVFYGLQYILNK Unmodified 1878.9404 0.94036644 2465 P43490;A0A0C4DFS8;C9JG65 NAMPT Nicotinamide phosphoribosyltransferase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 156.6 156.6 2;3 0.00052105 161980 QUIQUE_C1218_190116_001 104.43 80.143 292620000 62224000 70272000 0 135070000 0 0 0 0 0 25051000 0 0 0 50591 2465 47244 456049;456050;456051;456052;456053;456054 582418;582419;582420;582421;582422;582423 582418 6 YEEVEYYYQR Unmodified 1440.6198 0.61976058 1050 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866 KLC1 Kinesin light chain 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 67.153 67.153 2 0.00069809 66485 QUIQUE_DMIX1_190116_001 107.57 75.64 639840000 80601000 83865000 0 86428000 0 68336000 0 48315000 60306000 56821000 0 80905000 74267000 50592 1050 47245 456055;456056;456057;456058;456059;456060;456061;456062;456063 582424;582425;582426;582427;582428;582429;582430;582431;582432;582433;582434 582430 11 YEEVSVSGFEEFHR Unmodified 1713.7635 0.76346471 4000 Q9BRA2;I3L0K2;I3L3M7;I3L2R6 TXNDC17 Thioredoxin domain-containing protein 17 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 3 2 2 2 2 86.848 86.848 2;3 0.00020161 89680 QUIQUE_C1438_190116_001 110.93 90.628 2265700000 168640000 199440000 195740000 54459000 151780000 160560000 193470000 170540000 279620000 71636000 182630000 175880000 261330000 50593 4000 47246 456064;456065;456066;456067;456068;456069;456070;456071;456072;456073;456074;456075;456076;456077;456078;456079;456080;456081;456082;456083;456084;456085;456086;456087;456088;456089 582435;582436;582437;582438;582439;582440;582441;582442;582443;582444;582445;582446;582447;582448;582449;582450;582451;582452;582453;582454;582455;582456;582457;582458;582459;582460;582461;582462;582463;582464 582443 29 YEFEQQR Unmodified 998.44576 0.44575938 3235 Q4G0N4 NADK2 NAD kinase 2, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 28.448 28.448 2 0.040989 22977 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.386 26.944 144410000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 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456172;456173;456174;456175;456176;456177;456178;456179;456180;456181;456182;456183;456184;456185;456186;456187;456188;456189;456190;456191;456192;456193;456194;456195;456196;456197;456198;456199;456200;456201;456202;456203;456204;456205;456206;456207;456208;456209;456210;456211;456212;456213;456214;456215;456216;456217;456218;456219;456220;456221;456222;456223;456224;456225;456226;456227;456228;456229 582584;582585;582586;582587;582588;582589;582590;582591;582592;582593;582594;582595;582596;582597;582598;582599;582600;582601;582602;582603;582604;582605;582606;582607;582608;582609;582610;582611;582612;582613;582614;582615;582616;582617;582618;582619;582620;582621;582622;582623;582624;582625;582626;582627;582628;582629;582630;582631;582632;582633;582634;582635;582636;582637;582638;582639;582640;582641;582642;582643;582644;582645;582646;582647;582648;582649;582650;582651;582652;582653;582654;582655;582656;582657;582658;582659;582660;582661;582662;582663 582600 80 YEGSYALTSEEAER Unmodified 1603.7002 0.70019575 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 0 0 0 1 1 1 55.327 55.327 2 0.00034625 53025 QUIQUE_C1403_190116_001 102.4 82.097 72187000 0 26145000 0 32565000 0 0 0 0 0 13477000 0 0 0 50604 1751 47256 456230;456231;456232 582664;582665;582666 582665 3 YEGVVDIFQTVK Unmodified 1396.7238 0.72383172 987;2987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468;Q13332;G8JL96;A0A0A0MR60 PTPRD;PTPRS Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S no no 0 0 0 1 1 1 119.78 119.78 2 0.0036258 123201 QUIQUE_C1403_190116_001 84.658 54.088 128560000 0 0 0 43919000 0 31832000 52806000 0 0 0 0 0 0 50605 987;2987 47257 456233;456234;456235 582667;582668;582669;582670;582671 582667 5 YEHAFNSIVWR Unmodified 1420.6888 0.68878362 506 A0A3B3IU55;Q8WXE9;H0YJ05 STON2 Stonin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 73.797 73.797 3 0.0049082 73985 QUIQUE_DMIX3_190116_001 42.243 24.434 178610000 18379000 0 0 48896000 0 0 56891000 0 54439000 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Unmodified 1340.6347 0.63474195 889;926 E9PGZ1;C9J813;E7EX44;Q05682 CALD1 Caldesmon no no 0 0 0 1 49.107 49.107 2 0.0008428 43853 QUIQUE_DMIX4_190116_001 94.297 73.395 41782000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 41782000 0 0 0 50610 926;889 47262 456293 582740 582740 1 YEIKMETEIANDLK Oxidation (M) 1711.8339 0.83385246 4674 yes no 0 1 1 2 1 71.263 71.263 2 0.026127 71657 QUIQUE_DMIX8_190116_001 71.555 16.129 148220000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 96906000 0 51313000 + 50611 4674 47263 456294;456295;456296 582741;582742;582743 582743 2 YEILAANAIPK Unmodified 1201.6707 0.67067394 2385 P35749 MYH11 Myosin-11 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 83.146 83.146 2 0.027552 85373 QUIQUE_C1438_190116_001 52.255 39.218 162760000 34270000 58709000 23258000 0 34369000 0 0 0 0 12151000 0 0 0 50612 2385 47264 456297;456298;456299;456300;456301 582744;582745;582746;582747;582748 582747 3 YEILTPNAIPK Unmodified 1257.6969 0.69688869 2379;3459 Q7Z406;M0QY43;P35580 MYH14;MYH10 Myosin-14;Myosin-10 no no 0 0 0 1 1 1 1 85.591 85.591 2 0.021974 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582766;582767;582768;582769;582770;582771;582772;582773;582774;582775;582776;582777;582778;582779;582780;582781;582782;582783;582784;582785;582786;582787;582788 582780 23 YEISPDREYALFSYNVEPIYQHSYTGYYVLSK Unmodified 3893.8465 0.84647264 914 E9PF59;P42658 DPP6 Dipeptidyl aminopeptidase-like protein 6 yes no 0 0 1 1 143.32 143.32 4 5.1732E-05 147927 QUIQUE_DMIX7_190116_001 39.701 35.214 47767000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 47767000 0 50619 914 47271 456331 582789 582789 1 YEISSVPTFLFFK Unmodified 1576.8177 0.81773211 1676 O76003 GLRX3 Glutaredoxin-3 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 154.68 154.68 2 0.00045506 158672 QUIQUE_C1403_190116_001 116.77 91.974 860100000 0 102690000 105400000 97829000 123160000 0 90314000 38408000 75124000 31909000 125680000 69586000 0 50620 1676 47272 456332;456333;456334;456335;456336;456337;456338;456339;456340;456341 582790;582791;582792;582793;582794;582795;582796;582797;582798;582799;582800;582801 582792 11 YEITTIHNLFR Unmodified 1405.7354 0.73539946 1892 P05546 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YELTGKFER Unmodified 1141.5768 0.57677356 1936 P08133;E5RK63;E5RFF0;E5RI05;E5RJF5;E5RJR0;E5RIU8 ANXA6 Annexin A6;Annexin yes no 0 0 1 1 1 39.003 39.003 3 0.029667 35607 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.908 42.182 170900000 0 0 0 0 0 0 0 108400000 0 0 0 62498000 0 50630 1936 47282 456416;456417 582891;582892 582891 0 YEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQR Unmodified 3399.6704 0.67037973 4351 Q9NZL9 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes yes 0 0 1 1 142.33 142.33 4 0.00046314 148067 QUIQUE_C1576_190116_001 36.202 30.482 41546000 0 0 0 0 0 0 41546000 0 0 0 0 0 0 50631 4351 47283 456418 582893 582893 1 YEMACAIADAFNLPSSHLRPITDSPVLGAQRPR Unmodified 3652.8243 0.82425461 4351 Q9NZL9 MAT2B Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta yes yes 0 0 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 132.82 132.82 5 1.0612E-14 135749 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.632 68.138 1463700000 35480000 78300000 83519000 76912000 64761000 68905000 55634000 149640000 164360000 22615000 257710000 197290000 208590000 50632 4351 47284 456419;456420;456421;456422;456423;456424;456425;456426;456427;456428;456429;456430;456431 582894;582895;582896;582897;582898;582899;582900;582901;582902;582903;582904;582905;582906;582907;582908 582903 15 YEMFAQTLQQSR Unmodified 1500.7031 0.70311306 2658 P55072 VCP Transitional endoplasmic reticulum ATPase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 81.2 81.2 2 0.0036234 81877 QUIQUE_DMIX1_190116_001 71.555 48.236 201430000 45831000 0 0 0 0 0 0 50852000 57178000 15248000 32316000 0 0 50633 2658 47285 456432;456433;456434;456435;456436 582909;582910;582911;582912;582913;582914 582911 6 YEMYPLGVK Unmodified 1098.542 0.54196796 2872 Q02338;E9PCG9;C9K0G7;H7C2W1 BDH1 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 76.935 76.935 2 0.04263 77901 QUIQUE_DMIX7_190116_001 52.786 26.892 99501000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 99501000 0 50634 2872 47286 456437 582915 582915 1 YEMYVSILK Unmodified 1144.5838 0.58383277 616 B4DKF8;E5RJ29;Q9NYI0;A0A087X1Z0;A0A087WXD8 PSD3 PH and SEC7 domain-containing protein 3 yes no 0 0 0 1 1 1 98.946 98.946 2 0.011794 101473 QUIQUE_C1277_190116_001 72.23 48.462 110750000 0 58399000 0 39887000 0 0 0 0 0 12464000 0 0 0 50635 616 47287 456438;456439;456440 582916;582917;582918 582916 3 YENEVALR Unmodified 992.49271 0.49270958 776 CON__P13645;P13645 KRT10 Keratin, type I cytoskeletal 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 31.967 31.967 2 0.0065653 26615 QUIQUE_C1403_190116_001 101.28 53.436 2208800000 417820000 0 0 239760000 0 195560000 154350000 0 153530000 590090000 230290000 227380000 0 + 50636 776 47288 456441;456442;456443;456444;456445;456446;456447;456448 582919;582920;582921;582922;582923;582924;582925;582926 582920 6 YENNVMNIR Unmodified 1151.5393 0.53934219 2915;2107;2508 P48454;H0YC26;Q08209;E7ETC2;P16298;Q5F2F8 PPP3CC;PPP3CA;PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 48.376 48.376 2 4.0212E-07 45882 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.21 109.21 4796400000 358680000 460570000 478620000 416280000 329360000 309370000 441710000 306530000 275410000 128880000 440380000 413640000 436940000 50637 2508;2915;2107 47289 456449;456450;456451;456452;456453;456454;456455;456456;456457;456458;456459;456460;456461 582927;582928;582929;582930;582931;582932;582933;582934;582935;582936;582937;582938;582939;582940;582941 582939 13 YENNVMNIR Oxidation (M) 1167.5343 0.53425682 2915;2107;2508 P48454;H0YC26;Q08209;E7ETC2;P16298;Q5F2F8 PPP3CC;PPP3CA;PPP3CB Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit gamma isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit beta isoform no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.902 24.902 2 0.001521 18845 QUIQUE_C1277_190116_001 105.14 87.15 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1 1 1 153.97 153.97 3 4.8296E-127 158085 QUIQUE_C1277_190116_001 188.69 186.28 1723500000 115210000 226800000 150090000 111940000 128830000 94087000 188600000 116030000 119530000 0 149020000 195050000 128310000 50640 2642 47291 456483;456484;456485;456486;456487;456488;456489;456490;456491;456492;456493;456494 582967;582968;582969;582970;582971;582972;582973;582974;582975;582976;582977;582978;582979;582980 582968 13 YEQACNEFTTHVMNLLR Unmodified 2124.9721 0.97209405 93 H0YKH1;A0A087X0P4;H0YLF5;A0A0A0MTI0;P40424;H0YLD4;H0YLT4;H0YLB0;H0YLM3;U3KQA2;H0Y5D0;Q5JS98;P40426 PBX1;PBX3 Pre-B-cell leukemia transcription factor 1;Pre-B-cell leukemia transcription factor 3 no no 0 0 0 1 121.02 121.02 3 0.0059275 124949 QUIQUE_C1277_190116_001 44.299 38.032 30976000 0 30976000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50641 93 47292 456495 582981 582981 1 YEQAIQCYTEAISLCPTEK Unmodified 2303.045 0.044984222 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 0 1 2 1 1 1 1 115.48 115.48 2;3 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chain LC1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.023 49.023 2 0.00044836 47099 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.39 97.268 276990000 0 0 27742000 20076000 33240000 34496000 30919000 25922000 0 0 28643000 23351000 52604000 50658 2483 47309 456647;456648;456649;456650;456651;456652;456653;456654;456655;456656;456657 583164;583165;583166;583167;583168;583169;583170;583171;583172;583173;583174;583175;583176;583177 583172 14 YESSLYSQEYSKPADVTPLNGFSEGSK Unmodified 2982.3771 0.37707728 2483 P46821 MAP1B Microtubule-associated protein 1B;MAP1B heavy chain;MAP1 light chain LC1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 99.978 99.978 3 1.3671E-16 102843 QUIQUE_DMIX3_190116_001 84.312 74.33 416640000 0 0 0 0 0 0 0 96742000 98800000 0 0 75706000 145400000 50659 2483 47310 456658;456659;456660;456661 583178;583179;583180;583181 583179 2 YESSSYTDQFSR Unmodified 1468.6107 0.61065246 1074 G3V1L9;Q07157;A0A087X0K9;G5E9E7 TJP1 Tight junction protein ZO-1 yes no 0 0 0 1 53.839 53.839 2 0.0035429 53089 QUIQUE_C1438_190116_001 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YEVALAGPALELHNCMAK Unmodified 1985.9703 0.97030314 1281 J3KQS6;Q9NWV8 BABAM1 BRISC and BRCA1-A complex member 1 yes no 0 0 0 1 1 98.181 98.181 3 0.00064716 100772 QUIQUE_C1277_190116_001 59.502 50.683 20120000 0 20120000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50666 1281 47317 456684;456685 583209;583210 583209 2 YEVAVPLCK Unmodified 1077.5529 0.55286699 1050;4116;4286 F8W6L3;G5E9S8;G3V2E7;G3V3H3;G3V5R9;E7EVH7;Q07866;Q9H0B6;A8MZ87;A8MX29;E9PQ02;Q9NSK0;C9J8T5;C9JZE5 KLC1;KLC2;KLC4 Kinesin light chain 1;Kinesin light chain 2;Kinesin light chain 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 65.155 65.155 2 0.021517 63499 QUIQUE_DMIX1_190116_001 62.107 31.034 132900000 0 0 0 0 0 0 0 88857000 0 44047000 0 0 0 50667 1050;4116;4286 47318 456686;456687;456688;456689;456690;456691 583211;583212;583213;583214;583215;583216 583213 6 YEVDTVLR Unmodified 993.51311 0.51311067 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.426 60.426 2 0.0036296 59351 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.3 53.012 9844300000 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370000000 567110000 547790000 585920000 288860000 739500000 582570000 821700000 50678 1609 47329 456752;456753;456754;456755;456756;456757;456758;456759;456760;456761;456762;456763;456764 583287;583288;583289;583290;583291;583292;583293;583294;583295;583296;583297;583298;583299;583300;583301;583302;583303 583287 17 YFAATQFEPLAAR Unmodified 1483.746 0.74596415 4451 Q9UIQ6 LNPEP Leucyl-cystinyl aminopeptidase;Leucyl-cystinyl aminopeptidase, pregnancy serum form yes yes 0 0 0 1 102.59 102.59 2 0.032168 107331 QUIQUE_C1438_190116_001 51.927 41.64 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50679 4451 47330 456765 583304 583304 1 YFACLMR Unmodified 959.43573 0.43572874 4658 Q9Y6M9;A0A3B3IT57;E7EWZ0;E9PF49 NDUFB9 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9 yes no 0 0 0 1 1 1 1 69.393 69.393 2 0.022903 69322 QUIQUE_DMIX1_190116_001 101.23 72.362 542700000 117170000 0 185880000 142660000 0 0 0 96980000 0 0 0 0 0 50680 4658 47331 456766;456767;456768;456769 583305;583306;583307;583308 583308 4 YFADTQPAYR Unmodified 1230.5669 0.56693715 3539 Q8IWT6 LRRC8A Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A yes yes 0 0 0 1 47.834 47.834 2 0.016116 46021 QUIQUE_DMIX5_190116_001 79.906 67.67 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50681 3539 47332 456770 583309 583309 1 YFAEALGPLQSFQARPDDLLISTYPK Unmodified 2939.5069 0.50690966 1201 H3BRY5;P50225;P50226;E9PKW4;H3BQX5;E9PKR8;E9PM76 SULT1A1;SULT1A2 Sulfotransferase;Sulfotransferase 1A1;Sulfotransferase 1A2 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 149.64 149.64 3 1.3972E-19 154751 QUIQUE_DMIX3_190116_001 106.04 94.41 580670000 0 44567000 0 48228000 0 37004000 63951000 107390000 143110000 0 69783000 66641000 0 50682 1201 47333 456771;456772;456773;456774;456775;456776;456777;456778 583310;583311;583312;583313;583314;583315;583316;583317;583318 583316 9 YFAGNLASGGAAGATSLCFVYPLDFAR Unmodified 2795.3377 0.33773584 2038;2039 P12235;V9GYG0;P12236 SLC25A4;SLC25A6 ADP/ATP translocase 1;ADP/ATP translocase 3;ADP/ATP translocase 3, N-terminally processed no no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 1 1 2 1 3 2 3 160.06 160.06 2;3 9.0766E-126 164925 QUIQUE_DMIX3_190116_001 245.66 227.3 2403400000 63543000 81822000 271060000 88926000 69237000 35416000 85179000 110680000 507740000 15243000 546310000 170100000 358190000 50683 2038;2039 47334 456779;456780;456781;456782;456783;456784;456785;456786;456787;456788;456789;456790;456791;456792;456793;456794;456795;456796;456797;456798;456799;456800;456801;456802 583319;583320;583321;583322;583323;583324;583325;583326;583327;583328;583329;583330;583331;583332;583333;583334;583335;583336;583337;583338;583339;583340;583341;583342;583343;583344;583345;583346;583347;583348;583349;583350;583351;583352;583353;583354;583355;583356;583357 583338 37 YFAGTMAEETAPAVLER Unmodified 1854.8822 0.88219964 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 103.41 103.41 2 1.7295E-16 106805 QUIQUE_DMIX3_190116_001 131.69 118.74 710860000 73292000 0 0 0 70016000 90162000 76558000 0 189970000 0 0 69821000 141040000 50684 3143 47335 456803;456804;456805;456806;456807;456808;456809 583358;583359;583360;583361;583362;583363;583364;583365;583366;583367 583364 8 YFAGTMAEETAPAVLER Oxidation (M) 1870.8771 0.87711426 3143 Q15493 RGN Regucalcin yes yes 0 1 0 1 1 1 84.755 84.755 2 0.00019162 86556 QUIQUE_DMIX3_190116_001 90.926 81.737 178530000 0 0 0 0 0 0 0 0 84070000 0 53213000 41246000 0 50685 3143 47335 456810;456811;456812 583368;583369;583370 583368 2601 3 YFAGWCDK Unmodified 1045.4328 0.43275186 1665;3228 O75891;Q3SY69 ALDH1L1;ALDH1L2 Cytosolic 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase;Mitochondrial 10-formyltetrahydrofolate dehydrogenase no no 0 0 0 1 1 61.935 61.935 2 0.015148 60750 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.064 79.154 218540000 0 0 0 0 0 0 0 103210000 115320000 0 0 0 0 50686 1665;3228 47336 456813;456814 583371;583372 583372 2 YFAHSILTVSEEEWNTGETYTCVVAHEALPNR Unmodified 3722.7311 0.73112531 352 A0A1B0GUU9;P01871 IGHM Ig mu chain C region yes no 0 0 0 1 146.27 146.27 4 5.9124E-26 153806 QUIQUE_DMIX5_190116_001 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456836;456837;456838;456839;456840;456841;456842;456843;456844;456845;456846;456847;456848 583396;583397;583398;583399;583400;583401;583402;583403;583404;583405;583406;583407;583408;583409;583410;583411;583412;583413;583414;583415;583416;583417;583418;583419;583420;583421;583422;583423;583424;583425;583426 583405 31 YFATVSGSASEANVEEK Unmodified 1787.8214 0.82137352 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 58.401 58.401 2 1.3413E-06 57938 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.348 75.981 28868000 0 0 0 0 0 28868000 0 0 0 0 0 0 0 50693 4607 47343 456849;456850;456851 583427;583428;583429 583429 3 YFAVDFK Unmodified 888.43815 0.43815481 918 E9PFU5;P41586 ADCYAP1R1 Pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide type I receptor yes no 0 0 0 1 1 77.416 77.416 2 0.055848 79123 QUIQUE_C1576_190116_001 71.715 45.236 88372000 0 0 0 0 0 0 39562000 0 0 0 0 0 48810000 50694 918 47344 456852;456853 583430;583431 583430 2 YFCQLYTDPPQESYTTITVLVPPR 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chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain no no 0 0 0 1 1 69.025 69.025 2 0.012067 69420 QUIQUE_DMIX3_190116_001 89.123 24.347 121610000 0 0 0 0 84377000 0 0 0 37229000 0 0 0 0 50723 280;324;393 47372 457144;457145 583759;583760;583761;583762 583761 4 YFFYSSGEK Unmodified 1126.4971 0.49712625 2550;2551 P49840;A8MT37;M0QYV0;P49841;A0A3B3ITW1 GSK3A;GSK3B Glycogen synthase kinase-3 alpha;Glycogen synthase kinase-3 beta no no 0 0 0 1 67.053 67.053 2 0.027289 65895 QUIQUE_C1563_190116_001 57.96 42.078 39885000 0 0 0 0 0 39885000 0 0 0 0 0 0 0 50724 2550;2551 47373 457146 583763 583763 1 YFGDIISVGQR Unmodified 1253.6404 0.64043645 3821 Q96CN7;D6RGE2 ISOC1 Isochorismatase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 98.924 98.924 2 0.00048719 102807 QUIQUE_DMIX5_190116_001 113.62 99.619 908400000 174130000 174610000 0 172910000 0 0 0 164760000 0 70005000 151990000 0 0 50725 3821 47374 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584027;584028;584029;584030;584031;584032;584033;584034;584035;584036;584037;584038;584039;584040;584041;584042;584043 584033 17 YFLQTTTPLDYEK Unmodified 1617.7926 0.79263957 2914 Q08174 PCDH1 Protocadherin-1 yes yes 0 0 0 1 104.78 104.78 2 0.0012157 106714 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.548 64.162 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50751 2914 47398 457381 584044 584044 1 YFLSGSLDGK Unmodified 1085.5393 0.53932542 3277 Q5JSH3;H7BY83 WDR44 WD repeat-containing protein 44 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 76.576 76.576 2 0.0017155 77197 QUIQUE_C1368_190116_001 94.309 57.753 273610000 49435000 0 36112000 44355000 0 40664000 0 0 26685000 0 48479000 27878000 0 50752 3277 47399 457382;457383;457384;457385;457386;457387;457388 584045;584046;584047;584048;584049;584050;584051 584046 6 YFLVGAGAIGCELLK Unmodified 1609.8538 0.85380004 2197 P22314 UBA1 Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 3 1 139.63 139.63 2;3 0.00011073 145130 QUIQUE_C1368_190116_001 107.18 92.485 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584202;584203;584204;584205;584206;584207;584208;584209;584210;584211;584212;584213;584214;584215;584216;584217;584218;584219;584220;584221;584222;584223;584224;584225;584226;584227;584228;584229;584230;584231;584232;584233;584234 584223 28 YFQGLGPPPK Unmodified 1102.5811 0.58113065 2850 Q00978;H7BXP4 IRF9 Interferon regulatory factor 9 yes no 0 0 0 1 57.383 57.383 2 0.017254 57031 QUIQUE_DMIX5_190116_001 61.962 39.831 29705000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 29705000 0 0 50764 2850 47411 457516 584235 584235 1 YFQHLLGK Unmodified 1004.5444 0.54435122 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2;J3KTF1;J3QL06;J3QQH7;J3QLE9 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 no no 0 0 0 1 1 45.075 45.075 2 0.01188 41495 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.369 35.66 79372000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 23213000 56159000 0 0 50765 89 47412 457517;457518 584236;584237 584237 2 YFQLDENTIGYFK Unmodified 1636.7773 0.77732386 3290 Q5RGS4;Q9HB21 PLEKHA1 Pleckstrin homology domain-containing family A member 1 yes no 0 0 0 1 129.39 129.39 2 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584392;584393 584392 2 YFVSEGFEFFCAQSFSK Unmodified 2078.9084 0.90841439 2120 P17174 GOT1 Aspartate aminotransferase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 1 3 152.33 152.33 2 0.00044913 158398 QUIQUE_DMIX7_190116_001 79.466 70.416 65101000 0 0 0 0 0 0 0 23944000 0 0 0 41157000 0 50785 2120 47430 457640;457641;457642;457643 584394;584395;584396;584397;584398 584397 5 YFVTSYYTCLK Unmodified 1443.6744 0.67443869 4174 Q9H4M3 FBXO44 F-box only protein 44 yes yes 0 0 0 1 1 97.572 97.572 2 0.049108 95369 QUIQUE_DMIX4_190116_001 53.683 33.896 42047000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11272000 30775000 0 0 50786 4174 47431 457644;457645 584399;584400 584399 2 YFYFYNTGLQNQR Unmodified 1712.7947 0.79470526 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 105.98 105.98 2 4.9641E-24 107784 QUIQUE_DMIX1_190116_001 175.91 161.24 161250000 83309000 0 0 0 0 0 0 77938000 0 0 0 0 0 50787 2503 47432 457646;457647;457648 584401;584402;584403 584402 3 YFYHQEEYVR Unmodified 1432.6412 0.64116473 2065 P13760 HLA-DRB1 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-4 beta chain yes yes 0 0 0 2 1 44.482 44.482 3 0.0016475 41267 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.595 52.15 28937000 0 0 0 0 0 0 0 28937000 0 0 0 0 0 50788 2065 47433 457649;457650;457651 584404;584405;584406 584406 3 YFYLFPNR Unmodified 1118.5549 0.5549159 2236 P25098;P35626 ADRBK1;ADRBK2 Beta-adrenergic receptor kinase 1;Beta-adrenergic receptor kinase 2 yes no 0 0 0 1 108.32 108.32 2 0.01997 111194 QUIQUE_C1403_190116_001 77.496 66.804 48811000 0 0 0 48811000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50789 2236 47434 457652 584407 584407 1 YFYNQEESVR Unmodified 1333.5939 0.59388018 3211 Q29974 HLA-DRB1 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-16 beta chain no no 0 0 0 1 53.61 53.61 2 0.024763 51595 QUIQUE_C1277_190116_001 68.371 52.781 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50790 3211 47435 457653 584408 584408 1 YFYNQEEYVR Unmodified 1409.6252 0.62518031 2159 P20039 HLA-DRB1 HLA class II histocompatibility antigen, DRB1-11 beta chain no no 0 0 0 1 1 71.338 71.338 2 0.00046618 72074 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dehydrogenase yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 125.96 125.96 2 2.3505E-07 131175 QUIQUE_C1218_190116_001 119.39 102.77 264260000 42269000 45798000 0 35261000 0 46253000 0 0 56079000 38600000 0 0 0 50796 2463 47441 457666;457667;457668;457669;457670;457671 584421;584422;584423;584424;584425;584426;584427 584421 1895 7 YGAATANYMEVVSLLK Unmodified 1728.8757 0.87565769 2463 P43304;F5GYK7 GPD2 Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial;Glycerol-3-phosphate dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.52 140.52 2 1.1515E-06 146218 QUIQUE_C1218_190116_001 137.16 113.93 2361400000 200120000 0 296960000 205700000 178350000 238550000 233160000 149710000 192070000 98967000 335080000 232740000 0 50797 2463 47441 457672;457673;457674;457675;457676;457677;457678;457679;457680;457681;457682 584428;584429;584430;584431;584432;584433;584434;584435;584436;584437;584438;584439;584440;584441 584428 14 YGAATFTR Unmodified 885.43447 0.43446642 1802 P01023;P20742 A2M;PZP Alpha-2-macroglobulin;Pregnancy zone protein yes no 0 0 0 1 1 30.295 30.295 2 0.016005 25461 QUIQUE_DMIX3_190116_001 125.01 50.816 358600000 0 0 0 0 0 0 0 0 111100000 0 0 0 247500000 50798 1802 47442 457683;457684 584442;584443 584442 0 YGADALR Unmodified 764.3817 0.38170256 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 24.877 24.877 2 0.060883 18700 QUIQUE_DMIX1_190116_001 69.093 42.984 30369000 0 0 0 0 0 0 0 30369000 0 0 0 0 0 50799 2441 47443 457685 584444 584444 1 YGAFGLPITVAHVDGQTHMLFGSDR Unmodified 2688.3119 0.31185545 4562 Q9Y2Q3 GSTK1 Glutathione S-transferase kappa 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 129.23 129.23 4 8.1247E-05 133333 QUIQUE_C1403_190116_001 46.66 39.384 181990000 0 0 0 40200000 0 34922000 50792000 0 0 0 0 0 56076000 50800 4562 47444 457686;457687;457688;457689 584445;584446;584447;584448 584445 3 YGAFVKPAVVTVGDFPEEDYGLDEI Unmodified 2729.3112 0.31122955 3951 Q99426 TBCB Tubulin-folding cofactor B yes yes 0 0 1 1 1 2 1 2 1 1 2 1 2 2 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584467;584468;584469;584470;584471;584472;584473;584474;584475 584467 6 YGALALQEIFDGIQPK Unmodified 1761.9301 0.93013611 2657 P55060 CSE1L Exportin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.14 152.14 2 8.7164E-11 156883 QUIQUE_DMIX8_190116_001 164.04 88.219 956850000 70378000 88792000 79428000 69593000 100290000 62755000 85738000 52939000 61985000 29893000 92275000 77414000 85365000 50803 2657 47447 457717;457718;457719;457720;457721;457722;457723;457724;457725;457726;457727;457728;457729 584476;584477;584478;584479;584480;584481;584482;584483;584484;584485;584486;584487;584488;584489;584490;584491 584491 16 YGALPDQGIAK Unmodified 1131.5924 0.59242362 2802 P78318 IGBP1 Immunoglobulin-binding protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 49.997 49.997 2 0.01917 47062 QUIQUE_C1403_190116_001 55.503 37.356 72583000 37313000 0 0 35269000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50804 2802 47448 457730;457731;457732 584492;584493;584494;584495 584494 4 YGALVICETSEQK Unmodified 1496.7181 0.71809442 2467 P43897 TSFM Elongation factor Ts, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.283 61.283 2 0.00036659 60484 QUIQUE_DMIX3_190116_001 126.67 108.61 719870000 0 64631000 102270000 73885000 45004000 52625000 78409000 0 58760000 24221000 64093000 81892000 74082000 50805 2467 47449 457733;457734;457735;457736;457737;457738;457739;457740;457741;457742;457743 584496;584497;584498;584499;584500;584501;584502;584503;584504;584505;584506 584502 11 YGASLLHTYAGPSLLVLGPR Unmodified 2084.1419 0.14186022 271 A0A0D9SFK2;Q92614;H0YEV9 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.43 126.43 3 1.0912E-06 130278 QUIQUE_C1403_190116_001 89.049 80.042 662800000 54683000 54870000 64145000 49781000 55131000 48911000 54961000 31131000 42409000 21881000 73142000 65397000 46357000 50806 271 47450 457744;457745;457746;457747;457748;457749;457750;457751;457752;457753;457754;457755;457756 584507;584508;584509;584510;584511;584512;584513;584514;584515;584516;584517;584518;584519;584520;584521;584522 584511 15 YGDFFIR Unmodified 916.4443 0.44430282 574 B0QY89;Q9Y262;B0QY90;H0Y7E6 EIF3L Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L yes no 0 0 0 1 1 1 1 86.47 86.47 2 0.021346 87376 QUIQUE_C1403_190116_001 105.27 68.24 141890000 37815000 0 0 44663000 0 0 0 0 36901000 22510000 0 0 0 50807 574 47451 457757;457758;457759;457760 584523;584524;584525;584526 584524 4 YGDFNKEVHK Unmodified 1235.5935 0.59348625 2248 P26038 MSN Moesin yes yes 0 0 1 1 17.013 17.013 3 0.0026694 9489 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.417 37.992 91615000 0 0 0 0 0 0 0 91615000 0 0 0 0 0 50808 2248 47452 457761 584527;584528 584527 2 YGDGGSSFQSTTGHCVHMR Unmodified 2082.8636 0.86360623 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 31.899 31.899 2;3;4 4.3043E-64 26919 QUIQUE_C1218_190116_001 181.72 177.84 2519200000 787680000 159680000 569550000 142720000 280820000 82545000 90824000 82887000 60138000 11905000 75930000 67181000 107340000 50809 2672 47453 457762;457763;457764;457765;457766;457767;457768;457769;457770;457771;457772;457773;457774;457775;457776;457777;457778 584529;584530;584531;584532;584533;584534;584535;584536;584537;584538;584539;584540;584541;584542;584543;584544;584545 584530 14 YGDGGSSFQSTTGHCVHMR Oxidation (M) 2098.8585 0.85852086 2672 P55795 HNRNPH2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H2 yes yes 0 1 0 1 20.825 20.825 3 0.0036565 13996 QUIQUE_DMIX5_190116_001 51.495 48.169 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50810 2672 47453 457779 584546 584546 2114 1 YGDGGSTFQSTTGHCVHMR Unmodified 2096.8793 0.8792563 905 E9PCY7;G8JLB6;P31943;D6RIT2;H0YB39;H0YBG7;H0YBD7 HNRNPH1 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H;Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 34.321 34.321 3;4 2.4644E-29 28776 QUIQUE_DMIX8_190116_001 147.92 139.63 1706300000 59565000 206890000 0 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584567;584568;584569;584570;584571;584572;584573;584574;584575;584576;584577;584578;584579;584580;584581 584569 11 YGDLANWMIPGK Unmodified 1363.6595 0.65945733 2673 P55809;E9PDW2;Q9BYC2 OXCT1;OXCT2 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial;Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.76 119.76 2 0.00051689 123333 QUIQUE_DMIX7_190116_001 94.692 66.95 5009000000 478580000 403500000 446880000 342690000 278230000 387600000 420630000 310350000 363060000 84628000 497450000 463320000 532020000 50813 2673 47456 457811;457812;457813;457814;457815;457816;457817;457818;457819;457820;457821;457822;457823 584582;584583;584584;584585;584586;584587;584588;584589;584590;584591;584592;584593;584594;584595;584596;584597 584596 13 YGDLANWMIPGK Oxidation (M) 1379.6544 0.65437195 2673 P55809;E9PDW2;Q9BYC2 OXCT1;OXCT2 Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial;Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2, mitochondrial yes no 0 1 0 1 100.35 100.35 2 0.063514 105091 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.916 45.696 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50814 2673 47456 457824 584598 584598 1 YGDLIALGFK Unmodified 1095.5964 0.59644637 3861 Q96GR2;H0YMZ0;H0YMC3;H0YNX0 ACSBG1 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 113.74 113.74 2 0.0024053 111506 QUIQUE_DMIX4_190116_001 103.56 79.408 325100000 40802000 0 0 0 0 70200000 39833000 0 31772000 23830000 33792000 33709000 51167000 50815 3861 47457 457825;457826;457827;457828;457829;457830;457831;457832 584599;584600;584601;584602;584603;584604;584605;584606;584607 584604 6 YGDLLPADGILIQGNDLK Unmodified 1914.0098 0.0098429899 2158;2222 P20020;P23634 ATP2B1;ATP2B4 Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1;Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.22 135.22 2 0.0016748 140055 QUIQUE_C1368_190116_001 80.96 33.771 930460000 48483000 68010000 133150000 90283000 88999000 66021000 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ribonucleoprotein F, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.492 49.492 3 0.00012722 47701 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.494 62.914 194330000 0 0 0 34448000 30989000 0 51844000 0 0 0 45998000 0 31051000 50821 2609 47463 457873;457874;457875;457876;457877;457878;457879 584652;584653;584654;584655;584656;584657;584658 584657 7 YGDSGEQIAGFVK Unmodified 1369.6514 0.65139506 4748 X6R5C5;X6R8A1;P10619 CTSA Carboxypeptidase;Lysosomal protective protein;Lysosomal protective protein 32 kDa chain;Lysosomal protective protein 20 kDa chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 74.629 74.629 2 0.00053696 75277 QUIQUE_C1277_190116_001 95.483 68.368 31587000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31587000 0 50822 4748 47464 457880;457881;457882;457883;457884;457885 584659;584660;584661;584662;584663;584664 584660 5 YGEAGEGPGWGGAHPR Unmodified 1596.707 0.70695288 2254 P26640;A0A140T954;A2ABF4;A0A0G2JJT9 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 34.272 34.272 3 0.00016445 29490 QUIQUE_C1277_190116_001 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584682;584683;584684;584685;584686 584682 5 YGELEEGIDVLDSDGNLVGSSK Unmodified 2295.0754 0.075415952 3679 Q8TD22 SFXN5 Sideroflexin-5 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 2 1 138.1 138.1 2;3 5.6336E-187 143665 QUIQUE_C1218_190116_001 246.18 208.57 1507400000 148160000 120960000 156150000 158910000 114940000 118040000 71610000 117670000 111230000 0 178420000 130840000 80453000 50826 3679 47468 457907;457908;457909;457910;457911;457912;457913;457914;457915;457916;457917;457918;457919;457920;457921;457922;457923;457924;457925;457926 584687;584688;584689;584690;584691;584692;584693;584694;584695;584696;584697;584698;584699;584700;584701;584702;584703;584704;584705;584706;584707;584708;584709;584710 584688 21 YGEMPVDK Unmodified 937.42152 0.42151847 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 0 0 1 1 29.344 29.344 2 0.017005 24188 QUIQUE_C1218_190116_001 82.241 55.444 71415000 35377000 0 0 0 0 0 0 0 36038000 0 0 0 0 50827 194 47469 457927;457928 584711;584712 584711 2 YGEMPVDK Oxidation (M) 953.41643 0.41643309 194 A0A0A0MTH3;Q13418 ILK Integrin-linked protein kinase yes no 0 1 0 1 15.749 15.749 2 0.040463 7831 QUIQUE_DMIX4_190116_001 64.265 41.642 25484000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 25484000 0 0 0 50828 194 47469 457929 584713 584713 1 YGEPGEVFINK Unmodified 1251.6136 0.61355299 2208 P23246 SFPQ Splicing factor, proline- and glutamine-rich yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 67.103 67.103 2 0.0013401 67512 QUIQUE_C1438_190116_001 106.6 90.957 2694100000 387750000 0 0 334890000 372580000 0 348960000 0 343360000 144650000 453860000 0 308060000 50829 2208 47470 457930;457931;457932;457933;457934;457935;457936;457937 584714;584715;584716;584717;584718;584719;584720;584721 584716 6 YGEPSEVFINR Unmodified 1309.6303 0.63026569 3719 Q8WXF1;X6RDA4 PSPC1 Paraspeckle component 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.992 71.992 2 0.00033958 71855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 118.26 104.49 1548700000 160970000 190050000 179320000 144990000 0 0 164930000 124690000 147480000 82786000 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mitochondrial yes yes 0 0 0 2 2 3 2 2 3 2 2 2 2 2 1 1 171.6 171.6 2;3 8.6013E-07 176216 QUIQUE_C1368_190116_001 118.4 106.43 9106000000 316630000 717560000 409170000 152050000 609470000 1488400000 1165500000 404940000 897530000 103520000 1456100000 781450000 603730000 50874 2230 47514 458290;458291;458292;458293;458294;458295;458296;458297;458298;458299;458300;458301;458302;458303;458304;458305;458306;458307;458308;458309;458310;458311;458312;458313;458314;458315 585197;585198;585199;585200;585201;585202;585203;585204;585205;585206;585207;585208;585209;585210;585211;585212;585213;585214;585215;585216;585217;585218;585219;585220;585221;585222;585223;585224;585225;585226;585227;585228;585229;585230;585231;585232;585233;585234 585204 38 YGLKPPTL Unmodified 887.51165 0.5116541 1689 O94826 TOMM70A Mitochondrial import receptor subunit TOM70 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 72.029 72.029 2 0.023563 71684 QUIQUE_C1403_190116_001 113.89 100.22 303040000 0 55128000 0 67247000 0 0 0 44316000 56366000 0 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585249;585250;585251;585252;585253;585254;585255;585256;585257;585258;585259;585260;585261 585251 13 YGLPVNFQAMLLQPNK Unmodified 1831.9655 0.96547575 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.41 145.41 2;3 4.2267E-07 152322 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.98 116.11 1391900000 103590000 218410000 162450000 136420000 123700000 92511000 137770000 68240000 84628000 21001000 86722000 60353000 96144000 50878 2176 47518 458342;458343;458344;458345;458346;458347;458348;458349;458350;458351;458352;458353;458354;458355 585262;585263;585264;585265;585266;585267;585268;585269;585270;585271;585272;585273;585274;585275;585276 585274 15 YGLPVNFQAMLLQPNKK Oxidation (M) 1976.0554 0.055353394 2176 P21283;E7EV59 ATP6V1C1 V-type proton ATPase subunit C 1 yes no 0 1 1 1 1 1 1 105.46 105.46 3 0.0010596 108966 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.788 51.944 183040000 0 0 0 0 0 0 0 41715000 45680000 0 0 46337000 49311000 50879 2176 47519 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purine biosynthesis protein PURH;Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase;IMP cyclohydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 2 74.518 74.518 3 1.4883E-05 75241 QUIQUE_C1277_190116_001 93.812 90.424 423700000 57755000 68744000 139650000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 157560000 50890 2339 47527 458410;458411;458412;458413;458414;458415;458416;458417 585335;585336;585337;585338;585339;585340;585341;585342 585336 5 YGMWHFLLGDK Oxidation (M) 1381.6489 0.64889264 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;C9J6X0;Q8N1B9 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 1 0 2 1 2 2 1 1 2 2 2 1 3 2 2 97.275 97.275 2;3 0.0010958 100249 QUIQUE_C1368_190116_001 72.531 64.644 790890000 75231000 37972000 78461000 67253000 44269000 39473000 82442000 58863000 72101000 30619000 87371000 56940000 59899000 50891 64 47528 458418;458419;458420;458421;458422;458423;458424;458425;458426;458427;458428;458429;458430;458431;458432;458433;458434;458435;458436;458437;458438;458439;458440 585343;585344;585345;585346;585347;585348;585349;585350;585351;585352;585353;585354;585355;585356;585357;585358;585359;585360;585361;585362;585363;585364;585365;585366;585367;585368 585348 55 26 YGMWHFLLGDK Unmodified 1365.654 0.65397802 64 A0A087WXC5;E7ESZ7;O95299;C9J6X0;Q8N1B9 NDUFA10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 10, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 2 1 1 120.07 120.07 2;3 2.1041E-18 123301 QUIQUE_DMIX1_190116_001 171.56 148.92 1088000000 33916000 147820000 79881000 51011000 48594000 29764000 102130000 81673000 84442000 11499000 210120000 119870000 87236000 50892 64 47528 458441;458442;458443;458444;458445;458446;458447;458448;458449;458450;458451;458452;458453;458454;458455;458456 585369;585370;585371;585372;585373;585374;585375;585376;585377;585378;585379;585380;585381;585382;585383;585384;585385;585386;585387 585381 19 YGNANAWR Unmodified 950.43586 0.4358634 1421 O00743 PPP6C Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase 6 catalytic subunit, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 25.924 25.924 2 0.019665 19943 QUIQUE_DMIX5_190116_001 77.984 58.507 208080000 0 0 0 0 0 0 89032000 0 0 0 119050000 0 0 50893 1421 47529 458457;458458 585388;585389;585390 585390 2 YGNANVWK Unmodified 950.46102 0.46101552 2758;2789 P62714;E5RHC1;E7ESG8;E5RFI3;E5RHP4;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 32.947 32.947 2 0.0036108 28048 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.59 91.657 2240100000 220820000 206610000 185250000 165010000 186450000 147310000 181150000 172120000 137080000 82372000 224380000 170550000 161010000 50894 2758;2789 47530 458459;458460;458461;458462;458463;458464;458465;458466;458467;458468;458469;458470;458471 585391;585392;585393;585394;585395;585396;585397;585398;585399;585400;585401;585402;585403;585404;585405 585402 15 YGNFQLYQMK Unmodified 1290.6067 0.60669348 119 A0A087X279;P09913 IFIT2 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 2 yes no 0 0 0 1 1 84.427 84.427 2 0.001534 87651 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.492 74.641 52731000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52731000 0 0 50895 119 47531 458472;458473 585406;585407;585408 585408 3 YGNPWEK Unmodified 892.40792 0.40791731 2016;2017;948 P11216;E9PK47;P06737;P11217 PYGB;PYGL;PYGM Glycogen phosphorylase, brain form;Alpha-1,4 glucan phosphorylase;Glycogen phosphorylase, liver form;Glycogen phosphorylase, muscle form no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.311 38.311 2 0.019598 35394 QUIQUE_C1218_190116_001 110.9 78.392 5257600000 324080000 388630000 452310000 354600000 351750000 358460000 462630000 466220000 542470000 113850000 480620000 502710000 459230000 50896 2016;948;2017 47532 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1 93.861 93.861 2 0.012022 97184 QUIQUE_C1218_190116_001 54.772 39.799 365300000 88634000 0 0 0 95884000 0 79300000 0 0 0 0 101480000 0 50905 3014 47541 458553;458554;458555;458556 585511;585512;585513;585514 585511 4 YGPMEEPLVIEK Oxidation (M) 1419.6956 0.69556806 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 69.52 69.52 2 4.7026E-06 66142 QUIQUE_DMIX4_190116_001 136.96 93.446 826740000 74338000 45101000 0 0 0 107260000 55348000 79681000 72623000 80442000 119250000 101640000 91050000 50906 23 47542 458557;458558;458559;458560;458561;458562;458563;458564;458565;458566;458567;458568 585515;585516;585517;585518;585519;585520;585521;585522;585523;585524;585525;585526;585527;585528;585529;585530;585531 585526 13 17 YGPMEEPLVIEK Unmodified 1403.7007 0.70065344 23 K7ERP4;A0A087X2I2;A0A087WT12;P36969 GPX4 Glutathione peroxidase;Phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.705 88.705 2 3.1482E-14 90260 QUIQUE_C1403_190116_001 164.97 129.43 1816500000 204680000 224970000 235190000 205320000 173800000 148820000 147330000 0 124520000 45712000 0 143800000 162330000 50907 23 47542 458569;458570;458571;458572;458573;458574;458575;458576;458577;458578;458579 585532;585533;585534;585535;585536;585537;585538;585539;585540;585541;585542;585543;585544;585545;585546;585547;585548;585549;585550 585537 16 YGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSK Oxidation (M) 3799.7981 0.79808266 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L yes no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 104.04 104.04 4 1.3068E-29 106889 QUIQUE_DMIX3_190116_001 85.044 77.365 623370000 56183000 78427000 67332000 63893000 0 61184000 0 0 66784000 37966000 111020000 0 80582000 50908 2082 47543 458580;458581;458582;458583;458584;458585;458586;458587;458588 585551;585552;585553;585554;585555;585556;585557;585558;585559 585556 1413 9 YGPQYGHPPPPPPPPEYGPHADSPVLMVYGLDQSK Unmodified 3783.8032 0.80316804 2082 P14866;M0QXS5;A0A3B3ITJ4 HNRNPL Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 2 1 1 1 2 2 113.27 113.27 3;4 1.9465E-75 117056 QUIQUE_C1403_190116_001 143.75 134.45 4154600000 304520000 342900000 329110000 496200000 317170000 277030000 312250000 348770000 315140000 0 295840000 371120000 444560000 50909 2082 47543 458589;458590;458591;458592;458593;458594;458595;458596;458597;458598;458599;458600;458601;458602;458603;458604;458605;458606 585560;585561;585562;585563;585564;585565;585566;585567;585568;585569;585570;585571;585572;585573;585574;585575;585576;585577;585578;585579;585580;585581;585582;585583;585584;585585;585586;585587;585588;585589;585590;585591;585592;585593;585594;585595;585596 585572 37 YGPSLMPGGNK Unmodified 1119.5383 0.53827956 2602 P52209;K7EM49;K7EPF6;K7EMN2 PGD 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 50.793 50.793 2 0.0021878 47899 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Unmodified 1652.8522 0.85222014 2528 P49407;E9PM35 ARRB1 Beta-arrestin-1 yes no 0 0 1 1 2 2 2 2 1 1 2 2 1 2 1 121.18 121.18 2;3 4.9267E-07 124719 QUIQUE_DMIX7_190116_001 105.78 20.699 2852900000 0 209100000 280170000 230880000 225560000 169930000 107810000 337870000 454360000 0 245520000 347980000 243690000 50917 2528 47551 458652;458653;458654;458655;458656;458657;458658;458659;458660;458661;458662;458663;458664;458665;458666;458667;458668;458669;458670 585647;585648;585649;585650;585651;585652;585653;585654;585655;585656;585657;585658;585659;585660;585661;585662;585663;585664;585665;585666;585667;585668;585669 585666 21 YGRVAGCSVHK Unmodified 1232.6084 0.60842481 3287 Q5QPL9;Q9UKM9;Q5QPM2;Q5QPM1 RALY RNA-binding protein Raly yes no 0 0 1 1 61.908 61.908 3 0.050421 61096 QUIQUE_C1218_190116_001 42.001 24.181 674670000 674670000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50918 3287 47552 458671 585670;585671 585670 2 YGSDIVPFSK Unmodified 1111.555 0.55497548 2051 P13010 XRCC5 X-ray repair cross-complementing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.073 73.073 2 0.0036969 73157 QUIQUE_C1368_190116_001 83.456 70.868 2498200000 0 216390000 210040000 147120000 249380000 121290000 0 269710000 285330000 41029000 352720000 310310000 294840000 50919 2051 47553 458672;458673;458674;458675;458676;458677;458678;458679;458680;458681;458682 585672;585673;585674;585675;585676;585677;585678;585679;585680;585681;585682;585683;585684 585673 10 YGSLDVAK Unmodified 851.43888 0.43888309 2856;1255 I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.322 29.322 2 0.0057754 23789 QUIQUE_DMIX7_190116_001 104.21 62.707 4063900000 366530000 375880000 0 0 396520000 269690000 487500000 230160000 358720000 126670000 477750000 453380000 521080000 50920 1255;2856 47554 458683;458684;458685;458686;458687;458688;458689;458690;458691;458692;458693 585685;585686;585687;585688;585689;585690;585691;585692;585693;585694;585695 585694 10 YGSPYPWPLNHILAYQK Unmodified 2046.0363 0.036332512 1634 O75431;C9JNK6 MTX2 Metaxin-2 yes no 0 0 0 1 2 1 130.78 130.78 3 0.0057026 133621 QUIQUE_DMIX1_190116_001 30.072 21.472 95552000 0 0 0 0 0 0 23806000 41900000 0 0 29847000 0 0 50921 1634 47555 458694;458695;458696;458697 585696;585697;585698;585699 585697 4 YGSVAFPNFEQGVACLR Unmodified 1913.9094 0.90941744 362 A0A1B0GWA2;A0A2R8YEL0;O00116 AGPS Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal yes no 0 0 0 1 1 130.68 130.68 2 0.00052518 135627 QUIQUE_C1576_190116_001 90.614 72.805 81047000 33961000 0 0 0 0 0 47085000 0 0 0 0 0 0 50922 362 47556 458698;458699 585700;585701;585702 585702 3 YGTCPHGGYGLGLER Unmodified 1635.7464 0.74637486 1553 O43776 NARS Asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 50.401 50.401 2;3 3.0915E-06 49202 QUIQUE_C1218_190116_001 102.38 95.487 2046100000 188430000 192820000 213660000 0 199020000 169640000 240070000 119600000 143020000 77866000 144150000 175920000 181890000 50923 1553 47557 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458937;458938;458939;458940;458941;458942;458943;458944;458945;458946;458947;458948;458949 585986;585987;585988;585989;585990;585991;585992;585993;585994;585995;585996;585997;585998;585999 585993 14 YHEQLSTQSLIELFESFK Unmodified 2198.0895 0.089549874 50 A0A087WVQ6;Q00610 CLTC Clathrin heavy chain;Clathrin heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 3 2 3 2 4 3 3 3 4 1 5 161.65 161.65 2;3 1.0417E-225 168340 QUIQUE_DMIX5_190116_001 328.71 302.58 13599000000 472200000 779810000 700450000 649180000 796810000 664350000 1434400000 727720000 1275100000 230820000 3049000000 1387000000 1431900000 50956 50 47588 458950;458951;458952;458953;458954;458955;458956;458957;458958;458959;458960;458961;458962;458963;458964;458965;458966;458967;458968;458969;458970;458971;458972;458973;458974;458975;458976;458977;458978;458979;458980;458981;458982;458983;458984;458985;458986 586000;586001;586002;586003;586004;586005;586006;586007;586008;586009;586010;586011;586012;586013;586014;586015;586016;586017;586018;586019;586020;586021;586022;586023;586024;586025;586026;586027;586028;586029;586030;586031;586032;586033;586034;586035;586036;586037;586038;586039;586040;586041;586042;586043;586044;586045;586046;586047;586048;586049;586050;586051;586052;586053;586054;586055 586045 52 YHFFLYK Unmodified 1016.512 0.51198846 2943;3365 Q12792;F8VS81;Q6IBS0;D6RG15 TWF1;TWF2 Twinfilin-1;Twinfilin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 72.708 72.708 2 0.019338 72830 QUIQUE_C1277_190116_001 114.67 80.976 1223300000 107330000 128300000 146350000 132750000 132280000 114580000 0 113280000 145110000 31052000 0 172310000 0 50957 2943;3365 47589 458987;458988;458989;458990;458991;458992;458993;458994;458995;458996 586056;586057;586058;586059;586060;586061;586062;586063;586064;586065;586066;586067;586068;586069 586057 14 YHFNMGLLMGEAR Unmodified 1537.717 0.71698898 2496 P47897;A0A1B0GVU9;A0A0U1RQT0;C9J165;A0A0U1RQM8;A0A0U1RRI9;A0A0U1RQE9 QARS Glutamine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 105.37 105.37 3 0.050937 109136 QUIQUE_DMIX3_190116_001 31.656 13.856 39594000 0 0 0 11249000 0 0 0 0 12043000 0 16303000 0 0 50958 2496 47590 458997;458998;458999 586070;586071;586072 586071 3 YHFPSLFFR Unmodified 1212.608 0.60801411 2419 P39060 COL18A1 Collagen alpha-1(XVIII) chain;Endostatin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 110.42 110.42 2;3 0.00010038 115286 QUIQUE_C1218_190116_001 116.73 98.286 279100000 19842000 37368000 29717000 0 39415000 16415000 0 18822000 45717000 32797000 0 39008000 0 50959 2419 47591 459000;459001;459002;459003;459004;459005;459006;459007;459008;459009;459010;459011 586073;586074;586075;586076;586077;586078;586079;586080;586081;586082;586083;586084 586073 12 YHFVPGTTAVLTQTVKPLTLELVEETVQAMEVE Unmodified 3671.9008 0.9008164 2425 P40306 PSMB10 Proteasome subunit beta type-10 yes yes 0 0 1 2 170.8 170.8 3;4 3.9391E-75 178142 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mitochondrial;Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, testis-specific form, mitochondrial yes no 0 0 0 2 1 1 1 2 21.099 21.099 2;3;4 0.00085404 14708 QUIQUE_C1218_190116_001 123.42 101.96 771000000 84765000 48849000 0 144780000 0 0 0 27376000 0 0 465230000 0 0 50962 1943 47593 459028;459029;459030;459031;459032;459033;459034 586102;586103;586104;586105;586106;586107;586108 586103 5 YHGNVMLLR Unmodified 1101.5753 0.57533377 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 2 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 38.113 38.113 2;3 0.0018455 33837 QUIQUE_C1403_190116_001 81.296 43.738 576090000 60203000 44901000 76335000 44420000 50346000 34301000 51698000 37761000 38850000 0 49264000 46662000 41343000 50963 2524 47594 459035;459036;459037;459038;459039;459040;459041;459042;459043;459044;459045;459046;459047;459048 586109;586110;586111;586112;586113;586114;586115;586116;586117;586118;586119;586120;586121;586122;586123;586124 586115 16 YHIDLDPHFNDILGQHSR Unmodified 2176.045 0.044999718 2152 P19784;H3BSA1;H3BV19 CSNK2A2 Casein kinase II subunit alpha' yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 96.712 96.712 4 0.00041381 98895 QUIQUE_C1403_190116_001 61.957 52.427 350660000 65258000 55042000 46603000 58082000 0 0 66121000 0 0 0 0 0 59555000 50964 2152 47595 459049;459050;459051;459052;459053;459054 586125;586126;586127;586128;586129;586130;586131 586129 7 YHIIHADIYR Unmodified 1299.6724 0.67240528 2677 P56192;H0YHV5 MARS Methionine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 37.65 37.65 3 0.0016986 33178 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.228 66.156 607340000 53795000 70744000 82235000 66563000 50784000 75541000 64607000 0 0 24952000 53002000 34965000 30152000 50965 2677 47596 459055;459056;459057;459058;459059;459060;459061;459062;459063;459064;459065 586132;586133;586134;586135;586136;586137;586138;586139;586140;586141;586142;586143 586140 10 YHILQESLIK Unmodified 1242.6972 0.69722304 3925 Q96QG7 MTMR9 Myotubularin-related protein 9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 63.754 63.754 2 0.0036412 62801 QUIQUE_C1277_190116_001 83.647 55.765 189020000 48867000 45948000 0 0 0 0 0 35750000 0 0 58450000 0 0 50966 3925 47597 459066;459067;459068;459069;459070;459071;459072;459073;459074;459075 586144;586145;586146;586147;586148;586149;586150;586151;586152;586153 586145 10 YHIQVCTTTPCMLR Unmodified 1778.8266 0.82661579 856 E7EPT4;P19404 NDUFV2 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 71.71 71.71 2 0.0044191 71717 QUIQUE_C1277_190116_001 65.5 49.123 117100000 35894000 50323000 30882000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50967 856 47598 459076;459077;459078 586154;586155;586156 586155 2 YHLGMYHER Oxidation (M) 1220.5397 0.53967654 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 1 0 1 17.345 17.345 3 0.027991 9544 QUIQUE_DMIX4_190116_001 42.348 32.16 6364300 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6364300 0 0 0 50968 4487 47599 459079 586157 586157 1 YHLGMYHER Unmodified 1204.5448 0.54476192 4487 Q9ULD0 OGDHL 2-oxoglutarate dehydrogenase-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 21.584 21.584 3 0.014294 14691 QUIQUE_DMIX8_190116_001 43.77 32.55 61842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 61842000 50969 4487 47599 459080 586158 586158 1 YHLGMYHR Unmodified 1075.5022 0.50216883 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 21.503 21.503 2;3 0.0010521 14531 QUIQUE_C1576_190116_001 98.418 59.642 429520000 62459000 47717000 84549000 0 44367000 0 66243000 50734000 0 0 73451000 0 0 50970 903;2869 47600 459081;459082;459083;459084;459085;459086;459087;459088;459089;459090;459091;459092;459093;459094 586159;586160;586161;586162;586163;586164;586165;586166;586167;586168;586169;586170;586171;586172 586167 13 YHLGMYHR Oxidation (M) 1091.4971 0.49708345 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 1 0 1 1 1 1 1 1 2 1 16.146 16.146 3 0.0058847 8845 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.189 61.032 261970000 0 19565000 25074000 30770000 0 14422000 0 42630000 28275000 34118000 0 67115000 0 50971 903;2869 47600 459095;459096;459097;459098;459099;459100;459101;459102;459103 586173;586174;586175;586176;586177;586178;586179;586180;586181 586177 549 9 YHLLLQELVK Unmodified 1254.7336 0.73360855 1146 H0YDG2;Q9UKW4;F5H5P4;Q96D37;A0A0A0MR07;P15498 VAV3;VAV1 Guanine nucleotide exchange factor VAV3;Proto-oncogene vav yes no 0 0 0 1 1 1 1 93.171 93.171 3 0.00089423 96883 QUIQUE_DMIX5_190116_001 68.371 46.343 23894000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 11334000 12559000 0 50972 1146 47601 459104;459105;459106;459107 586182;586183;586184;586185 586184 4 YHLPYPEAIFEISYFK Unmodified 2016.0033 0.003301049 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0;F8WCF4 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 147.07 147.07 2;3 8.0302E-08 151753 QUIQUE_DMIX7_190116_001 118.52 98.61 1241000000 36287000 67537000 104250000 39958000 44546000 29914000 162850000 56447000 95070000 24745000 332740000 164010000 82682000 50973 3549 47602 459108;459109;459110;459111;459112;459113;459114;459115;459116;459117;459118;459119;459120;459121;459122 586186;586187;586188;586189;586190;586191;586192;586193;586194;586195;586196;586197;586198;586199;586200;586201;586202;586203;586204;586205;586206;586207;586208;586209;586210;586211 586209 26 YHLPYPEAIFEISYFKK Unmodified 2144.0983 0.098264067 3549 Q8IXJ6;A0A087WYM3;A0A0A0MRF5;E7EWX6;B5MCS1;C9JZQ0;F8WCF4 SIRT2 NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-2 yes no 0 0 1 1 130.82 130.82 3 5.4005E-05 133682 QUIQUE_DMIX1_190116_001 89.358 81.272 32378000 0 0 0 0 0 0 0 32378000 0 0 0 0 0 50974 3549 47603 459123 586212 586212 1 YHPDKNPDEGEKFK Unmodified 1702.7951 0.79509919 3711 Q8WW22;C9JDE6;F5H170;F8WF76 DNAJA4 DnaJ homolog subfamily A member 4 yes no 0 0 2 1 1 1 13.503 13.503 3 0.0033947 5235 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.83 61.939 178690000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77357000 28015000 73322000 50975 3711 47604 459124;459125;459126 586213;586214;586215 586215 3 YHPDKNPDNPEAADK Unmodified 1709.7645 0.76452734 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 1 3 2 4 2 2 4 4 2 2 2 2 4 12.013 12.013 2;3;4 1.4627E-93 3254 QUIQUE_C1563_190116_001 217.91 189.2 1137300000 46702000 89153000 124660000 9157800 97050000 239210000 106330000 18133000 22690000 0 72080000 190650000 121520000 50976 4162 47605 459127;459128;459129;459130;459131;459132;459133;459134;459135;459136;459137;459138;459139;459140;459141;459142;459143;459144;459145;459146;459147;459148;459149;459150;459151;459152;459153;459154;459155;459156;459157;459158;459159 586216;586217;586218;586219;586220;586221;586222;586223;586224;586225;586226;586227;586228;586229;586230;586231;586232;586233;586234;586235;586236;586237;586238;586239;586240;586241;586242;586243;586244;586245;586246;586247;586248;586249;586250;586251;586252;586253;586254;586255;586256;586257 586234 37 YHPDKNPDNPEAADKFK Unmodified 1984.9279 0.92790427 4162 Q9H3Z4 DNAJC5 DnaJ homolog subfamily C member 5 yes yes 0 0 2 1 3 3 4 2 1 2 3 2 1 4 2 3 19.459 19.459 2;3;4;5 2.8131E-74 12103 QUIQUE_DMIX5_190116_001 204.35 181.77 12383000000 128890000 1313900000 1622800000 1863000000 353000000 745910000 357540000 981220000 305100000 0 2085200000 286110000 2340500000 50977 4162 47606 459160;459161;459162;459163;459164;459165;459166;459167;459168;459169;459170;459171;459172;459173;459174;459175;459176;459177;459178;459179;459180;459181;459182;459183;459184;459185;459186;459187;459188;459189;459190 586258;586259;586260;586261;586262;586263;586264;586265;586266;586267;586268;586269;586270;586271;586272;586273;586274;586275;586276;586277;586278;586279;586280;586281;586282;586283;586284;586285;586286;586287;586288;586289;586290;586291;586292 586286 32 YHPMDYYWWLR Oxidation (M) 1644.7184 0.71836919 2872 Q02338;E9PCG9 BDH1 D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 110.95 110.95 3 0.022741 114878 QUIQUE_DMIX3_190116_001 49.35 42.873 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50978 2872 47607 459191 586293 586293 1 YHQFIVECHGNTLLPQFLGMYR Oxidation (M) 2738.3097 0.30974696 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 1 0 1 118.44 118.44 4 0.0013443 123403 QUIQUE_C1576_190116_001 41.115 37.779 65236000 0 0 0 0 0 0 65236000 0 0 0 0 0 0 50979 2806 47608 459192 586294 586294 2253 1 YHQFIVECHGNTLLPQFLGMYR Unmodified 2722.3148 0.31483233 2806 P78356 PIP4K2B Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta yes yes 0 0 0 2 3 2 127.41 127.41 3;4 2.3145E-10 133288 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.37 94.156 233980000 0 0 0 0 0 0 50242000 0 50631000 0 133110000 0 0 50980 2806 47608 459193;459194;459195;459196;459197;459198;459199 586295;586296;586297;586298;586299;586300;586301 586301 6 YHQYIVECHGITLLPQFLGMYR Unmodified 2737.3509 0.35088349 2505 P48426;H7BXS3;S4R320 PIP4K2A Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha yes no 0 0 0 1 1 134.12 134.12 4 1.5913E-20 138425 QUIQUE_DMIX7_190116_001 122.57 116.41 103490000 0 0 0 0 0 0 0 0 50807000 0 0 52683000 0 50981 2505 47609 459200;459201 586302;586303;586304 586303 2 YHRPEFESFFNK Unmodified 1599.747 0.74702678 3621 Q8NB14 USP38 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38 yes yes 0 0 1 1 1 2 10.414 10.414 3;4 0.019637 2700 QUIQUE_C1218_190116_001 38.402 27.031 81732000 10107000 47263000 0 0 0 0 0 24361000 0 0 0 0 0 50982 3621 47610 459202;459203;459204;459205 586305;586306;586307;586308 586305 4 YHSDEYIK Unmodified 1053.4767 0.47672516 3754 Q92769;E5RFI6;E5RJ04;E5RGV4;E5RHE7;E5RH52;E5RG37;E5RFP9;H3BM24;E5RK19 HDAC2 Histone deacetylase 2 yes no 0 0 0 1 16.889 16.889 3 0.047837 8972 QUIQUE_DMIX4_190116_001 32.355 10.827 5681100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5681100 0 0 0 50983 3754 47611 459206 586309 586309 1 YHSLAPMYYR Unmodified 1299.607 0.60702783 2575;2166;2708 P51148;K7ERI8;K7ERQ8;F8VVK3;K7ENY4;F8VVZ0;P20339;P61020;F8VUA5 RAB5C;RAB5B;RAB5A Ras-related protein Rab-5C;Ras-related protein Rab-5A;Ras-related protein Rab-5B no no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 1 2 2 2 2 48.284 48.284 2;3 1.2704E-17 45899 QUIQUE_C1403_190116_001 179.21 145.57 3494200000 166080000 206610000 495790000 385470000 293430000 287180000 298630000 0 388170000 0 374650000 286700000 311440000 50984 2575;2166;2708 47612 459207;459208;459209;459210;459211;459212;459213;459214;459215;459216;459217;459218;459219;459220;459221;459222;459223;459224;459225;459226;459227 586310;586311;586312;586313;586314;586315;586316;586317;586318;586319;586320;586321;586322;586323;586324;586325;586326;586327;586328;586329;586330;586331;586332;586333;586334;586335;586336;586337 586318 26 YHSLAPMYYR Oxidation (M) 1315.6019 0.60194245 2575;2166;2708 P51148;K7ERI8;K7ERQ8;F8VVK3;K7ENY4;F8VVZ0;P20339;P61020;F8VUA5 RAB5C;RAB5B;RAB5A Ras-related protein Rab-5C;Ras-related protein Rab-5A;Ras-related protein Rab-5B no no 0 1 0 2 2 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 2 36.852 36.852 2;3 3.0781E-08 32363 QUIQUE_DMIX5_190116_001 157.86 142.2 1006200000 65543000 108730000 55771000 41868000 68343000 108280000 39558000 0 173150000 48479000 79971000 39230000 177310000 50985 2575;2166;2708 47612 459228;459229;459230;459231;459232;459233;459234;459235;459236;459237;459238;459239;459240;459241;459242;459243;459244;459245 586338;586339;586340;586341;586342;586343;586344;586345;586346;586347;586348;586349;586350;586351;586352;586353;586354;586355;586356;586357;586358;586359 586355 1510 18 YHSQYHTVAGNDIK Unmodified 1631.7692 0.76921879 2448 P42356 PI4KA Phosphatidylinositol 4-kinase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 17.371 17.371 3 0.0069533 10009 QUIQUE_C1438_190116_001 47.621 38.801 84213000 0 0 0 0 31369000 0 33110000 0 0 0 0 19734000 0 50986 2448 47613 459246;459247;459248;459249 586360;586361;586362;586363 586361 4 YHSVSTETPHER Unmodified 1441.6586 0.65860571 1132 H7C380;H0Y8P0;Q86TI0;H0YA01;H7C0Z7;C9JIE2 TBC1D1 TBC1 domain family member 1 yes no 0 0 0 1 10.403 10.403 3 0.0072834 2844 QUIQUE_C1403_190116_001 46.063 32.926 8943700 0 0 0 8943700 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50987 1132 47614 459250 586364 586364 1 YHTEIVFAR Unmodified 1134.5822 0.58219329 1872 P05023 ATP1A1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 43.828 43.828 2;3 0.0006414 41038 QUIQUE_C1576_190116_001 95.909 75.039 960770000 39561000 63647000 105990000 68046000 75165000 45390000 86967000 87394000 162300000 0 81077000 53116000 92111000 50988 1872 47615 459251;459252;459253;459254;459255;459256;459257;459258;459259;459260;459261;459262;459263;459264 586365;586366;586367;586368;586369;586370;586371;586372;586373;586374;586375;586376;586377;586378 586371 12 YHTINGHNAEVR Unmodified 1409.68 0.68000985 2200 P22626;A0A087WUI2 HNRNPA2B1 Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins A2/B1 yes no 0 0 0 2 3 3 3 2 4 3 3 4 3 3 4 3 11.436 11.436 2;3;4 8.0914E-15 4298 QUIQUE_DMIX1_190116_001 165.35 134.53 4132200000 40632000 13125000 375550000 496100000 133660000 27194000 395320000 350890000 1016300000 50065000 102100000 684660000 446620000 50989 2200 47616 459265;459266;459267;459268;459269;459270;459271;459272;459273;459274;459275;459276;459277;459278;459279;459280;459281;459282;459283;459284;459285;459286;459287;459288;459289;459290;459291;459292;459293;459294;459295;459296;459297;459298;459299;459300;459301;459302;459303;459304 586379;586380;586381;586382;586383;586384;586385;586386;586387;586388;586389;586390;586391;586392;586393;586394;586395;586396;586397;586398;586399;586400;586401;586402;586403;586404;586405;586406;586407;586408;586409;586410;586411;586412;586413;586414;586415;586416;586417;586418;586419;586420;586421;586422;586423;586424;586425;586426;586427;586428;586429;586430;586431;586432;586433;586434;586435;586436;586437;586438;586439;586440;586441;586442;586443;586444 586412 64 YHTINGHNCEVK Unmodified 1470.6674 0.66739625 2601 P51991 HNRNPA3 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A3 yes yes 0 0 0 1 10.256 10.256 3 0.0053442 2770 QUIQUE_DMIX4_190116_001 70.488 60.955 66332000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 66332000 0 0 0 50990 2601 47617 459305 586445 586445 0 YHTSQSGDEMTSLSEYVSR Unmodified 2175.9379 0.93787661 1938 P08238 HSP90AB1 Heat shock protein HSP 90-beta yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 79.893 79.893 2;3 2.1972E-265 81885 QUIQUE_C1218_190116_001 280.5 263.96 6549100000 681150000 686820000 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459332;459333;459334;459335;459336;459337;459338;459339;459340;459341;459342;459343;459344;459345;459346 586487;586488;586489;586490;586491;586492;586493;586494;586495;586496;586497;586498;586499;586500;586501 586488 1181 15 YHVPVVVVPEGSASDTHEQAILR Unmodified 2502.2867 0.28668655 1869 P04844;Q5JYR7;Q5JYR4 RPN2 Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 82.574 82.574 4 7.5989E-09 83885 QUIQUE_C1368_190116_001 83.251 74.86 571730000 48119000 0 41226000 60334000 34789000 56065000 62337000 37730000 48200000 25651000 59046000 35117000 63112000 50993 1869 47619 459347;459348;459349;459350;459351;459352;459353;459354;459355;459356;459357;459358 586502;586503;586504;586505;586506;586507;586508;586509;586510;586511;586512;586513 586503 11 YHVSEKPYGIVEK Unmodified 1547.7984 0.79839365 1704 O95139 NDUFB6 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 6 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 32.238 32.238 2;3 0.0025133 26257 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shock protein HSP 90-alpha A2 no no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 33.023 33.023 2 1.7457E-09 28396 QUIQUE_C1576_190116_001 174.27 110.71 56976000000 3929000000 4979300000 3213200000 4113900000 5280000000 4463100000 5663600000 3545000000 3843500000 1731600000 6438600000 4366100000 5409400000 51015 1938;3264;1931 47641 459550;459551;459552;459553;459554;459555;459556;459557;459558;459559;459560;459561;459562;459563 586758;586759;586760;586761;586762;586763;586764;586765;586766;586767;586768;586769;586770;586771;586772;586773;586774;586775;586776;586777;586778;586779;586780;586781;586782;586783;586784;586785;586786;586787;586788;586789;586790 586773 33 YIDSADLEPITSQEEPVR Unmodified 2060.9902 0.99022976 476 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;B4E1E0 CTPS1 CTP synthase 1;CTP synthase yes no 0 0 0 1 1 98.838 98.838 2 1.4778E-75 100300 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.11 179.58 62533000 0 0 0 0 0 0 0 36671000 0 25862000 0 0 0 51016 476 47642 459564;459565 586791;586792 586791 2 YIDTEHGGSQAR 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586997 1 YIHKLCDMHLQAENYTEAAFTLLLYCELLQWEDR Unmodified 4286.0275 0.027507024 3562 Q8IZD9 DOCK3 Dedicator of cytokinesis protein 3 yes yes 0 0 1 1 130.15 130.15 4 0.043194 135428 QUIQUE_C1368_190116_001 18.101 10.36 82251000 0 0 82251000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51039 3562 47664 459755 586999 586999 1 YIHLENLLAR Unmodified 1240.6928 0.69280637 3217 Q2TAY7 SMU1 WD40 repeat-containing protein SMU1;WD40 repeat-containing protein SMU1, N-terminally processed yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.026 88.026 3 8.6436E-05 90703 QUIQUE_C1438_190116_001 115.78 98.756 277890000 53744000 36740000 0 25601000 41930000 0 51384000 30318000 0 0 38173000 0 0 51040 3217 47665 459756;459757;459758;459759;459760;459761;459762;459763;459764;459765;459766;459767 587000;587001;587002;587003;587004;587005;587006;587007;587008;587009;587010;587011 587004 12 YIHSADIIHR Unmodified 1223.6411 0.64110515 627 B4E0K5;Q16539;E7EX54;B5TY33 MAPK14 Mitogen-activated protein kinase 14 yes no 0 0 0 1 24.592 24.592 3 0.022348 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587013;587014;587015;587016;587017;587018;587019;587020;587021;587022;587023;587024;587025;587026;587027;587028;587029;587030;587031;587032;587033;587034;587035;587036;587037;587038;587039;587040;587041;587042;587043;587044;587045;587046;587047;587048;587049;587050 587016 34 YIIAQLMR Unmodified 1006.5634 0.5633721 1750 O95786;A2A376 DDX58 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 89.383 89.383 2 0.0061089 92617 QUIQUE_DMIX5_190116_001 102.98 46.47 88480000 0 0 34580000 0 0 0 0 0 16054000 0 20204000 17642000 0 51043 1750 47668 459795;459796;459797;459798;459799 587051;587052;587053;587054;587055 587054 5 YIIIGDMGVGK Unmodified 1164.6213 0.62128091 2713 P61106;X6RFL8 RAB14 Ras-related protein Rab-14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 97.635 97.635 2 0.0018206 101488 QUIQUE_C1218_190116_001 96.331 40.801 1744100000 137430000 175170000 173960000 157340000 100960000 142710000 149610000 100430000 105630000 46246000 180850000 113380000 160400000 51044 2713 47669 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587097;587098;587099;587100;587101;587102;587103 587102 7 YIINTADISTVIVDKPQK Unmodified 2017.1096 0.10955703 4476;703 Q9UKU0;C9J3Z0;C9J8C7 ACSL6 Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6 no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 101.78 101.78 2;3 2.8318E-24 106091 QUIQUE_DMIX5_190116_001 169.04 158.56 907120000 106120000 0 89220000 86194000 0 0 0 78418000 94265000 51579000 196720000 104810000 99790000 51049 4476;703 47673 459845;459846;459847;459848;459849;459850;459851;459852;459853;459854 587104;587105;587106;587107;587108;587109;587110;587111;587112;587113 587111 5 YIIVTQVGPGPQILDDPCAHLLGPDGLPKPAA Unmodified 3321.7431 0.74313396 2626 P53602 MVD Diphosphomevalonate decarboxylase yes yes 0 0 1 1 1 143.84 143.84 3 3.8585E-06 148402 QUIQUE_C1277_190116_001 51.566 46.08 109820000 0 65271000 44545000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51050 2626 47674 459855;459856 587114;587115 587114 1 YILAATLDNTLK Unmodified 1334.7446 0.74456717 2733 P61964 WDR5 WD repeat-containing protein 5 yes yes 0 0 0 1 1 1 102.41 102.41 2 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protein KCTD12;BTB/POZ domain-containing protein KCTD16 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 103.13 103.13 2 0.0099023 105382 QUIQUE_DMIX1_190116_001 144.29 82.298 2558100000 196490000 222220000 252700000 233670000 250950000 154350000 198800000 223250000 221300000 116510000 0 233680000 254170000 51054 3827;3352 47678 459868;459869;459870;459871;459872;459873;459874;459875;459876;459877;459878;459879 587129;587130;587131;587132;587133;587134;587135;587136;587137;587138;587139;587140;587141;587142;587143;587144;587145;587146;587147;587148 587140 20 YILGNPLTPGVTQGPQIDK Unmodified 2010.0786 0.078591257 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 110.37 110.37 2;3 3.7057E-55 115107 QUIQUE_C1218_190116_001 174.39 162.78 830930000 95801000 56391000 91116000 100240000 75746000 189570000 68779000 0 25852000 44751000 53161000 29525000 0 51055 1776 47679 459880;459881;459882;459883;459884;459885;459886;459887;459888;459889;459890;459891 587149;587150;587151;587152;587153;587154;587155;587156;587157;587158;587159;587160 587149 12 YILGNPLTPGVTQGPQIDKEQYDK Unmodified 2673.365 0.36499645 1776 P00352 ALDH1A1 Retinal dehydrogenase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 2 1 2 3 1 2 2 1 100.64 100.64 2;3 9.3922E-74 103310 QUIQUE_C1277_190116_001 210.37 198.46 6794300000 308120000 53496000 70710000 988980000 98033000 817050000 49313000 949320000 892380000 354780000 1347200000 801360000 63528000 51056 1776 47680 459892;459893;459894;459895;459896;459897;459898;459899;459900;459901;459902;459903;459904;459905;459906;459907;459908;459909;459910;459911 587161;587162;587163;587164;587165;587166;587167;587168;587169;587170;587171;587172;587173;587174;587175;587176;587177;587178;587179;587180;587181;587182;587183;587184;587185;587186;587187 587162 25 YILNFLR Unmodified 937.53854 0.53853756 3237 Q4G0X4;E9PRT1;E9PJJ5;E9PMS5;E9PK99;J3KSG1;J3QRK1;A0A2U3U043;Q719H9 KCTD21;KCTD1 BTB/POZ domain-containing protein KCTD21;BTB/POZ domain-containing protein KCTD1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 109.52 109.52 2 0.023734 112419 QUIQUE_DMIX7_190116_001 99.511 81.475 386760000 26199000 24929000 37681000 37070000 31870000 25274000 35615000 28307000 29204000 18119000 28583000 27493000 36414000 51057 3237 47681 459912;459913;459914;459915;459916;459917;459918;459919;459920;459921;459922;459923;459924 587188;587189;587190;587191;587192;587193;587194;587195;587196;587197;587198;587199;587200 587199 13 YILPDEPAIIVHPNWAAK Unmodified 2046.0938 0.093847391 3545 Q8IX12;A0A0C4DGG8;F5H1H2;F5H2E6;H0YFJ7 CCAR1 Cell division cycle and apoptosis regulator protein 1 yes no 0 0 0 1 1 118.3 118.3 3 0.0052597 122957 QUIQUE_C1576_190116_001 27.526 18.011 66949000 0 0 0 27578000 0 0 39370000 0 0 0 0 0 0 51058 3545 47682 459925;459926 587201;587202 587202 1 YILSDSSPAPEFPLAYLTSENR Unmodified 2469.2064 0.20637055 2223 P23786;A0A1B0GTB8;A0A1B0GWC0;A0A1B0GVF3;A0A1B0GV75 CPT2 Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.93 153.93 2 2.5275E-36 158883 QUIQUE_DMIX3_190116_001 167.88 159.91 757750000 55948000 81529000 78590000 62612000 52847000 47000000 0 48802000 57497000 25381000 90140000 97295000 60106000 51059 2223 47683 459927;459928;459929;459930;459931;459932;459933;459934;459935;459936;459937;459938 587203;587204;587205;587206;587207;587208;587209;587210;587211;587212;587213;587214 587210 12 YILVTGGVISGIGK Unmodified 1375.8075 0.80750177 476;4267 A0A3B3IRI2;P17812;A0A3B3IRQ8;A0A3B3ITF6;A0A3B3ITB8;A0A3B3ITH9;Q9NRF8 CTPS1;CTPS2 CTP synthase 1;CTP synthase 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 108.23 108.23 2 0.00086135 111097 QUIQUE_DMIX7_190116_001 80.763 60.977 465030000 46828000 40306000 38935000 38408000 39806000 44436000 43780000 42198000 29750000 28407000 0 33448000 38725000 51060 476;4267 47684 459939;459940;459941;459942;459943;459944;459945;459946;459947;459948;459949;459950;459951 587215;587216;587217;587218;587219;587220;587221;587222;587223;587224;587225;587226;587227;587228;587229;587230;587231 587229 16 YINENLIVNTDELGR Unmodified 1761.8897 0.88972785 2132 P17987;E7ERF2;F5H136;F5H7Y1 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 105.29 105.29 2 9.0406E-54 109165 QUIQUE_C1218_190116_001 189.56 153.56 1060000000 321670000 0 0 289750000 0 0 0 291880000 0 156680000 0 0 0 51061 2132 47685 459952;459953;459954;459955;459956;459957 587232;587233;587234;587235;587236;587237 587232 4 YINENLIVNTDELGRDCLINAAK Unmodified 2647.3276 0.32756509 2132 P17987;E7ERF2;F5H136;F5H7Y1 TCP1 T-complex protein 1 subunit alpha yes no 0 0 1 1 122.5 122.5 3 0.0034255 125088 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.237 26.985 68370000 0 0 0 0 0 0 0 68370000 0 0 0 0 0 51062 2132 47686 459958 587238 587238 1 YINEQYEK Unmodified 1085.5029 0.50293991 419;584 A0A2R8Y4H2;Q9UH03;B1AHR1;B1AHR2 SEPT3 Neuronal-specific septin-3 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 22.392 22.392 2 0.0036606 15352 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459975;459976;459977 587256;587257;587258 587256 2 YIPDAMNLILLLVTEK Oxidation (M) 1861.0271 0.027072958 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 1 0 2 2 1 2 1 1 2 169.47 169.47 2;3 0.0005132 175635 QUIQUE_C1438_190116_001 81.431 67.012 157800000 32545000 26977000 19414000 32897000 13218000 17695000 0 0 0 15049000 0 0 0 51066 2452 47690 459978;459979;459980;459981;459982;459983;459984;459985;459986;459987;459988 587259;587260;587261;587262;587263;587264;587265;587266;587267;587268;587269 587266 1873 6 YIPDAMNLILLLVTEK Unmodified 1845.0322 0.032158336 2452 P42704;B8ZZ38;A0A0C4DG06;C9JCA9 LRPPRC Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 175.66 175.66 2;3 0.00033123 180014 QUIQUE_C1368_190116_001 90.926 76.768 164230000 6076700 0 2707200 0 0 0 70071000 0 22145000 0 34907000 21045000 7279800 51067 2452 47690 459989;459990;459991;459992;459993;459994;459995;459996 587270;587271;587272;587273;587274;587275;587276;587277;587278 587272 9 YIQAEPPTNK Unmodified 1159.5873 0.58733824 1039 F8VXC8;Q8TAQ2;F8VZW6 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 0 1 24.167 24.167 2 0.01637 17963 QUIQUE_DMIX1_190116_001 85.666 36.569 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51068 1039 47691 459997 587279 587279 1 YIQELWR Unmodified 1006.5236 0.52361577 460 A0A2R8YEM3;E7EQV9;P61313;E7EX53;A0A2R8Y738;E7ENU7 RPL15 Ribosomal protein L15;60S ribosomal protein L15 yes no 0 0 0 1 76.014 76.014 2 0.047361 76409 QUIQUE_C1403_190116_001 76.847 33.723 14090000 0 0 0 14090000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51069 460 47692 459998 587280 587280 1 YISAAPGAEAK Unmodified 1076.5502 0.55022446 976 E9PR38;H0YEH2;Q5T1Z4;Q5T1Z8;Q14671;H0YDK8;A0A0C4DG68;A0A0A0MR59;Q8TB72 PUM1;PUM2 Pumilio homolog 1;Pumilio homolog 2 yes no 0 0 0 1 22.066 22.066 2 0.016001 15618 QUIQUE_DMIX3_190116_001 57.108 37.331 26002000 0 0 0 0 0 0 0 0 26002000 0 0 0 0 51070 976 47693 459999 587281 587281 1 YISKPENLK Unmodified 1090.6023 0.60226003 4199;4579 Q9Y376;A0A087X0K1;Q9H9S4;Q5TAW7;B7ZBJ4 CAB39;CAB39L Calcium-binding protein 39;Calcium-binding protein 39-like no no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 17.469 17.469 3 0.043319 9650 QUIQUE_C1403_190116_001 72.643 50.557 1387400000 249280000 143020000 0 105310000 159040000 138520000 171470000 0 0 0 169970000 0 250830000 51071 4579;4199 47694 460000;460001;460002;460003;460004;460005;460006;460007 587282;587283;587284;587285;587286;587287;587288;587289 587284 2 YISLIYTNYEAGK Unmodified 1533.7715 0.7715102 1957 P09211 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.417 99.417 2 1.4701E-08 102154 QUIQUE_C1368_190116_001 166.97 149.11 1879900000 337680000 0 292390000 156830000 100200000 334630000 0 0 148210000 227990000 120720000 107220000 54019000 51072 1957 47695 460008;460009;460010;460011;460012;460013;460014;460015;460016;460017;460018 587290;587291;587292;587293;587294;587295;587296;587297;587298;587299;587300;587301;587302;587303;587304 587292 15 YISLIYTNYEAGKDDYVK Unmodified 2154.0521 0.052101735 1957 P09211 GSTP1 Glutathione S-transferase P yes yes 0 0 1 2 1 2 2 2 2 2 3 2 2 3 2 2 98.88 98.88 2;3 6.038E-104 101416 QUIQUE_DMIX1_190116_001 235.21 225.69 39710000000 2805700000 216860000 4041200000 1937800000 1833100000 2986200000 198520000 4355700000 5799900000 1860600000 6174200000 4456800000 3043100000 51073 1957 47696 460019;460020;460021;460022;460023;460024;460025;460026;460027;460028;460029;460030;460031;460032;460033;460034;460035;460036;460037;460038;460039;460040;460041;460042;460043;460044;460045 587305;587306;587307;587308;587309;587310;587311;587312;587313;587314;587315;587316;587317;587318;587319;587320;587321;587322;587323;587324;587325;587326;587327;587328;587329;587330;587331;587332;587333;587334;587335;587336;587337;587338;587339;587340;587341;587342;587343 587325 39 YISLNDLQQVK Unmodified 1319.7085 0.70851601 3409 Q6UWR7;D6R9P1 ENPP6 Ectonucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 89.936 89.936 2 0.00044352 92058 QUIQUE_C1277_190116_001 104.17 74.358 1239000000 0 136530000 149710000 0 0 94348000 252910000 82663000 105940000 0 160930000 92264000 163740000 51074 3409 47697 460046;460047;460048;460049;460050;460051;460052;460053;460054 587344;587345;587346;587347;587348;587349;587350;587351;587352 587344 9 YISPDQLADLYK Unmodified 1424.7187 0.71874635 1906 P06733;A0A2R8Y6G6 ENO1 Alpha-enolase yes no 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 3 2 1 2 1 1 118.32 118.32 2 6.5503E-28 118314 QUIQUE_C1277_190116_001 180.67 162.81 146880000000 9892200000 9594900000 12269000000 11338000000 11272000000 9010300000 10663000000 12285000000 13623000000 5462300000 15428000000 11584000000 14455000000 51075 1906 47698 460055;460056;460057;460058;460059;460060;460061;460062;460063;460064;460065;460066;460067;460068;460069;460070;460071;460072 587353;587354;587355;587356;587357;587358;587359;587360;587361;587362;587363;587364;587365;587366;587367;587368;587369;587370;587371;587372;587373;587374;587375;587376;587377;587378;587379;587380;587381;587382;587383;587384;587385;587386;587387;587388;587389;587390;587391;587392;587393;587394;587395;587396;587397;587398;587399;587400;587401;587402;587403;587404;587405 587359 52 YISQCIDEIKQELK Unmodified 1765.892 0.89203604 1437 O14617 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes yes 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 96.817 96.817 2;3 0.00014768 99475 QUIQUE_C1368_190116_001 70.373 58.73 423840000 55903000 70042000 35630000 43346000 51628000 31146000 64474000 0 0 0 37286000 34387000 0 51076 1437 47699 460073;460074;460075;460076;460077;460078;460079;460080;460081;460082;460083 587406;587407;587408;587409;587410;587411;587412;587413;587414;587415;587416;587417 587410 12 YISSQIERPIR Unmodified 1360.7463 0.7462985 1650 O75643;B4E0P5 SNRNP200 U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase yes no 0 0 1 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49.827 303590000 20471000 0 0 21862000 34132000 0 19360000 36753000 51759000 0 78625000 40631000 0 51095 1050 47717 460261;460262;460263;460264;460265;460266;460267;460268 587670;587671;587672;587673;587674;587675;587676;587677;587678 587675 8 YKDAIHFYNK Unmodified 1297.6455 0.64552182 2343 P31948 STIP1 Stress-induced-phosphoprotein 1 yes yes 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 27.514 27.514 2;3 0.0012477 21495 QUIQUE_C1277_190116_001 142 111.31 799000000 0 261330000 0 42842000 79556000 0 0 75686000 88031000 0 95563000 77606000 78390000 51096 2343 47718 460269;460270;460271;460272;460273;460274;460275;460276;460277;460278 587679;587680;587681;587682;587683;587684;587685;587686;587687;587688;587689 587681 11 YKDDADSPTEDGDKPR Unmodified 1807.7861 0.78605064 621 B4DR12;K7EIM7;K7EPJ5;O60291;K7ERA1;K7EJN3 MGRN1 E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1 yes no 0 0 2 1 1 1 12.364 12.364 3;4 4.7153E-05 5068 QUIQUE_C1368_190116_001 101.96 91.899 11576000 0 0 7721800 0 2747000 0 1106900 0 0 0 0 0 0 51097 621 47719 460279;460280;460281 587690;587691;587692 587690 3 YKDEAQLYK Unmodified 1156.5764 0.57643921 1585 O60645;D6RB59;H0Y995 EXOC3 Exocyst complex component 3 yes no 0 0 1 1 20.718 20.718 3 0.01577 13603 QUIQUE_C1218_190116_001 49.16 22.271 31278000 31278000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51098 1585 47720 460282 587693 587693 1 YKDLDEDELLGNLSETELK Unmodified 2223.0794 0.079438698 4333 Q9NYL9;H0YNU8 TMOD3 Tropomodulin-3 yes no 0 0 1 1 118.71 118.71 3 0.00051554 115461 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.973 41.264 24930000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 24930000 0 0 0 51099 4333 47721 460283 587694 587694 1 YKDLVPDNSK Unmodified 1177.5979 0.59790293 4535 Q9Y224;G3V4C6;H0YJB9 C14orf166 UPF0568 protein C14orf166 yes no 0 0 1 1 1 20.915 20.915 2 0.014577 14056 QUIQUE_DMIX5_190116_001 91.095 67.327 40797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40797000 0 0 51100 4535 47722 460284;460285 587695;587696 587696 2 YKDSAQRDDMIFEDCGDVPSEPK Unmodified 2701.1636 0.16359581 1873 P05026;V9GYR2 ATP1B1 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1 yes no 0 0 2 1 2 1 70.098 70.098 3;4 7.1566E-10 70402 QUIQUE_DMIX7_190116_001 88.836 84.647 216910000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 68274000 90590000 58042000 51101 1873 47723 460286;460287;460288;460289 587697;587698;587699;587700 587699 4 YKEENIELAFDDLEPPTDDSVAAVDQASHQSLVR Unmodified 3800.8017 0.80170729 271 A0A0D9SFK2;Q92614 MYO18A Unconventional myosin-XVIIIa yes no 0 0 1 1 132.86 132.86 4 0.0043211 135693 QUIQUE_DMIX1_190116_001 29.609 24.703 36066000 0 0 0 0 0 0 0 36066000 0 0 0 0 0 51102 271 47724 460290 587701 587701 0 YKEEYAVLISEAQAIK Unmodified 1853.9775 0.97748023 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 2 3 2 1 2 1 1 2 2 2 1 108.35 108.35 2;3 5.1342E-06 111719 QUIQUE_C1368_190116_001 112.72 94.359 1532100000 26533000 51860000 170720000 131800000 66076000 79408000 178210000 173510000 139070000 80227000 172990000 155740000 105920000 51103 3053 47725 460291;460292;460293;460294;460295;460296;460297;460298;460299;460300;460301;460302;460303;460304;460305;460306;460307;460308;460309;460310;460311 587702;587703;587704;587705;587706;587707;587708;587709;587710;587711;587712;587713;587714;587715;587716;587717;587718;587719;587720;587721;587722;587723;587724;587725;587726;587727 587706 24 YKETDLLILFK Unmodified 1381.7857 0.7857037 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 120.4 120.4 2;3 0.0043296 124026 QUIQUE_C1403_190116_001 113.93 96.458 485660000 41244000 0 0 103450000 49551000 38247000 0 33405000 36456000 23103000 66522000 51107000 42568000 51104 1890 47726 460312;460313;460314;460315;460316;460317;460318;460319;460320;460321;460322;460323 587728;587729;587730;587731;587732;587733;587734;587735;587736;587737;587738;587739;587740 587731 12 YKETDLLILFKDDYFAK Unmodified 2121.1034 0.10340902 1890 P05455 SSB Lupus La protein yes yes 0 0 2 2 2 2 2 1 137.08 137.08 3;4 2.3264E-12 140393 QUIQUE_DMIX1_190116_001 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56.782 619390000 54149000 41212000 64741000 54188000 62744000 57161000 56120000 47022000 23787000 0 94051000 64219000 0 51115 3098 47737 460429;460430;460431;460432;460433;460434;460435;460436;460437;460438;460439;460440;460441;460442 587869;587870;587871;587872;587873;587874;587875;587876;587877;587878;587879;587880;587881;587882 587874 4 YKQDVYLLPK Unmodified 1265.702 0.70197407 1558;3868;1131 H0Y8B3;O43865;Q96HN2 AHCYL2;AHCYL1 Adenosylhomocysteinase;Putative adenosylhomocysteinase 2;Putative adenosylhomocysteinase 3 no no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 2 2 2 1 2 2 1 50.746 50.746 2;3 0.0081489 49450 QUIQUE_DMIX1_190116_001 66.19 56.702 14239000000 480410000 617910000 940410000 351300000 1233900000 861230000 1136000000 1504400000 1298500000 525440000 2699400000 1243000000 1346600000 51116 1131;1558;3868 47738 460443;460444;460445;460446;460447;460448;460449;460450;460451;460452;460453;460454;460455;460456;460457;460458;460459;460460;460461;460462;460463 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yes yes 0 0 1 1 102.71 102.71 3 0.054396 106146 QUIQUE_DMIX8_190116_001 25.957 15.472 51174000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51174000 51125 2323 47746 460537 588009 588009 1 YKWCEYGLTFTEK Unmodified 1723.7916 0.79159371 2469 P45880;A0A0A0MR02;Q5JSD2;Q5JSD1;A2A3S1 VDAC2 Voltage-dependent anion-selective channel protein 2 yes no 0 0 1 1 96.826 96.826 3 0.037233 98156 QUIQUE_DMIX1_190116_001 42.495 34.37 54165000 0 0 0 0 0 0 0 54165000 0 0 0 0 0 51126 2469 47747 460538 588010 588010 1 YLAADKDGNVTCER Unmodified 1610.7359 0.73586975 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 1 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 2 2 24.369 24.369 2;3 1.0539E-114 16786 QUIQUE_C1368_190116_001 236.57 207.09 6613800000 1261400000 729310000 767080000 399960000 499560000 106990000 494700000 289250000 202010000 120780000 226530000 1107200000 409090000 51127 3187 47748 460539;460540;460541;460542;460543;460544;460545;460546;460547;460548;460549;460550;460551;460552;460553;460554;460555;460556;460557;460558;460559;460560;460561;460562 588011;588012;588013;588014;588015;588016;588017;588018;588019;588020;588021;588022;588023;588024;588025;588026;588027;588028;588029;588030;588031;588032;588033;588034 588015 23 YLAEFATGNDR Unmodified 1255.5833 0.5833155 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 59.449 59.449 2 4.3265E-24 58637 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.51 136.39 43073000000 4294100000 4231600000 4783000000 3845200000 3501400000 4111600000 4214100000 1481900000 2287200000 2129600000 3105600000 2233200000 2854200000 51128 2745 47749 460563;460564;460565;460566;460567;460568;460569;460570;460571;460572;460573;460574;460575 588035;588036;588037;588038;588039;588040;588041;588042;588043;588044;588045;588046;588047;588048;588049;588050;588051;588052;588053;588054;588055;588056;588057;588058;588059;588060;588061;588062;588063 588058 29 YLAEFATGNDRK Unmodified 1383.6783 0.67827852 2745 P62258;K7EM20 YWHAE 14-3-3 protein epsilon yes no 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 37.127 37.127 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460830;460831;460832;460833;460834;460835;460836;460837;460838;460839;460840;460841;460842;460843;460844;460845;460846;460847;460848;460849;460850;460851;460852;460853;460854;460855;460856;460857;460858;460859;460860;460861;460862;460863;460864;460865;460866 588430;588431;588432;588433;588434;588435;588436;588437;588438;588439;588440;588441;588442;588443;588444;588445;588446;588447;588448;588449;588450;588451;588452;588453;588454;588455;588456;588457;588458;588459;588460;588461;588462;588463;588464;588465;588466;588467;588468;588469;588470;588471;588472;588473;588474;588475 588432 43 YLATLNFVHR Unmodified 1232.6666 0.66659162 187 A0A0G2JNZ7;A0A0A0MSX3;Q08345;H0Y9F4;A0A0G2JI85 DDR1 Epithelial discoidin domain-containing receptor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.752 71.752 3 0.00017783 71209 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.98 72.284 14674000 0 0 0 0 0 0 0 14674000 0 0 0 0 0 51149 187 47768 460867;460868;460869;460870;460871;460872;460873;460874;460875 588476;588477;588478;588479;588480;588481;588482;588483;588484 588481 9 YLAVESPFLK Unmodified 1165.6383 0.63831118 2562 P50416 CPT1A Carnitine O-palmitoyltransferase 1, liver isoform yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 100.87 100.87 2 0.01082 102497 QUIQUE_DMIX1_190116_001 68.224 31.828 19936000 0 0 0 0 0 0 0 19936000 0 0 0 0 0 51150 2562 47769 460876;460877;460878;460879;460880 588485;588486;588487;588488;588489 588489 5 YLCAGAVDFYNNLENFNVDK Unmodified 2365.0685 0.068496856 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 0 1 1 1 146.8 146.8 2 0.0042514 152700 QUIQUE_C1576_190116_001 77.192 67.659 137030000 28716000 0 0 0 0 40479000 67833000 0 0 0 0 0 0 51151 2068 47770 460881;460882;460883 588490;588491;588492;588493 588493 4 YLCAGAVDFYNNLENFNVDKEAGER Unmodified 2907.3134 0.31337159 2068 P13807 GYS1 Glycogen [starch] synthase, muscle yes yes 0 0 1 1 1 1 1 134.84 134.84 3 2.1747E-23 139673 QUIQUE_DMIX3_190116_001 117.43 110.85 205350000 0 0 0 0 0 0 0 46373000 36367000 0 0 66358000 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5;Glutathione S-transferase Mu 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.991 49.991 2 0.0041198 47255 QUIQUE_DMIX1_190116_001 110.31 98.661 6206500000 1352700000 0 0 1800200000 0 1196400000 0 1725700000 0 131440000 0 0 0 51177 481;1965 47794 461089;461090;461091;461092;461093;461094;461095 588735;588736;588737;588738;588739;588740;588741;588742;588743;588744;588745 588741 11 YLEELPEKLK Unmodified 1260.6966 0.69655434 1965;481 A0A3B3IRM5;P46439;Q5T8R1;A0A3B3IU61;P09488;E7EWW9;H3BRM6 GSTM5;GSTM1 Glutathione S-transferase Mu 5;Glutathione S-transferase Mu 1 no no 0 0 1 2 60.909 60.909 2;3 0.030338 59367 QUIQUE_DMIX1_190116_001 60.547 44.584 1295400000 0 0 0 0 0 0 0 1295400000 0 0 0 0 0 51178 481;1965 47795 461096;461097 588746;588747 588747 2 YLEEVMK Unmodified 910.447 0.44700494 1728 O95394;J3KN95;A0A087WT27 PGM3 Phosphoacetylglucosamine mutase yes no 0 0 0 1 1 1 48.19 48.19 2 0.053305 46034 QUIQUE_DMIX3_190116_001 73.039 31.537 182060000 0 0 0 0 0 0 0 0 60242000 0 0 55063000 66759000 51179 1728 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Unmodified 3994.7769 0.77694911 4408 Q9UBT2;K7EPL2 UBA2 SUMO-activating enzyme subunit 2 yes no 0 0 1 1 149.33 149.33 3 3.1465E-51 152193 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.7 108.18 29151000 0 0 0 0 0 0 0 29151000 0 0 0 0 0 51207 4408 47824 461315 589023 589023 1 YLFTGLK Unmodified 840.47454 0.47454032 2642 P54578;A6NJA2 USP14 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14;Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase yes no 0 0 0 1 1 73.533 73.533 2 0.035909 72779 QUIQUE_C1403_190116_001 86.512 51.435 263780000 0 0 0 188720000 0 0 0 0 0 75058000 0 0 0 51208 2642 47825 461316;461317 589024;589025 589024 2 YLGEEYVK Unmodified 999.49131 0.49131259 1838 P02787 TF Serotransferrin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 59.677 59.677 2 0.022525 58369 QUIQUE_C1277_190116_001 74.127 37.107 984210000 217750000 275830000 0 269440000 0 221190000 0 0 0 0 0 0 0 51209 1838 47826 461318;461319;461320;461321 589026;589027;589028;589029;589030 589028 5 YLGEGPR Unmodified 790.39735 0.39735263 2466 P43686 PSMC4 26S protease regulatory 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+ 51225 765 47841 461430;461431;461432;461433;461434;461435;461436;461437;461438;461439;461440;461441;461442 589185;589186;589187;589188;589189;589190;589191;589192;589193;589194;589195;589196;589197 589189 13 YLHDESGLNR Unmodified 1202.568 0.56799978 640;3097 B5MCX3;C9J2Q4;C9IY94;H7C310;Q15019;C9JB25;C9J938 SEPT2 Septin-2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 1 2 20.232 20.232 2;3 1.3007E-11 13438 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.34 142.25 15957000000 1559600000 1684700000 1806200000 1800400000 1430000000 1359000000 1297000000 686790000 959050000 842480000 889070000 494560000 1147700000 51226 640;3097 47842 461443;461444;461445;461446;461447;461448;461449;461450;461451;461452;461453;461454;461455;461456;461457;461458;461459;461460;461461;461462;461463;461464;461465 589198;589199;589200;589201;589202;589203;589204;589205;589206;589207;589208;589209;589210;589211;589212;589213;589214;589215;589216;589217;589218;589219;589220 589216 22 YLHDESGLNRR Unmodified 1358.6691 0.66911081 640;3097 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YLHPSSYTK Unmodified 1094.5397 0.53965977 196 A0A0A0MTN0;Q13617;Q5T2B5 CUL2 Cullin-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 17.617 17.617 3 0.022116 9673 QUIQUE_DMIX8_190116_001 45.598 34.964 196410000 0 0 21855000 24409000 41997000 24045000 0 0 0 13402000 20246000 21387000 29067000 51235 196 47851 461551;461552;461553;461554;461555;461556;461557;461558 589317;589318;589319;589320;589321;589322;589323;589324 589324 7 YLHSCPESVK Unmodified 1218.5703 0.57030797 3327 Q5TFE4;H0YDA5 NT5DC1 5'-nucleotidase domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 15.273 15.273 2;3 0.0017095 7382 QUIQUE_C1368_190116_001 71.221 56.548 274220000 46692000 34982000 58551000 0 0 14727000 47985000 0 0 0 30034000 19894000 21360000 51236 3327 47852 461559;461560;461561;461562;461563;461564;461565;461566;461567 589325;589326;589327;589328;589329;589330;589331;589332;589333 589327 7 YLHSLNIVHR Unmodified 1250.6884 0.68838969 1478 O15075 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 1 2 1 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factor 7 yes no 0 0 0 1 174.18 174.18 2 0.00073904 181370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 70.622 58.262 18617000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 18617000 0 0 51263 465 47877 461777 589597 589597 1 YLLLGAIHK Unmodified 1026.6226 0.62260154 3598 Q8N584;G3V1P2 TTC39C Tetratricopeptide repeat protein 39C yes no 0 0 0 1 1 1 1 64.829 64.829 2 0.045399 64652 QUIQUE_DMIX3_190116_001 52.018 13.264 90388000 0 26698000 0 0 0 0 0 0 29004000 0 34686000 0 0 51264 3598 47878 461778;461779;461780;461781 589598;589599;589600;589601 589599 4 YLLLGQGDFIR Unmodified 1293.7081 0.70812208 3826 Q96CW5;A0A3B3ITE3 TUBGCP3 Gamma-tubulin complex component 3 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 119.33 119.33 2 0.00074623 124368 QUIQUE_C1576_190116_001 96.331 74.245 157990000 27714000 21157000 0 0 0 19719000 23073000 0 16296000 0 0 21545000 28483000 51265 3826 47879 461782;461783;461784;461785;461786;461787;461788;461789;461790 589602;589603;589604;589605;589606;589607;589608;589609;589610;589611 589607 10 YLLLMAQEHLEFR Oxidation (M) 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589640;589641;589642;589643;589644;589645;589646;589647;589648;589649;589650;589651;589652;589653 589640 14 YLLNLNLEPFSEK Unmodified 1578.8294 0.82935943 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.67 140.67 2 0.00038249 145264 QUIQUE_DMIX8_190116_001 115 79.061 1312000000 118440000 0 168840000 88826000 238150000 0 70869000 121480000 96969000 64920000 131840000 89196000 122430000 51271 2190 47884 461826;461827;461828;461829;461830;461831;461832;461833;461834;461835;461836 589654;589655;589656;589657;589658;589659;589660;589661;589662;589663;589664;589665 589665 11 YLLPLILGGR Unmodified 1113.691 0.69101545 1630 O75381;K7EK59 PEX14 Peroxisomal membrane protein PEX14 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 134.71 134.71 2 0.0036016 139287 QUIQUE_C1277_190116_001 89.142 62.18 151370000 0 18724000 0 0 18920000 21398000 17877000 0 15796000 0 20128000 19226000 19300000 51272 1630 47885 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589751;589752;589753;589754;589755;589756;589757;589758;589759;589760;589761;589762;589763;589764;589765;589766;589767;589768;589769;589770;589771;589772;589773;589774;589775;589776;589777 589769 26 YLLVVSTR Unmodified 949.55967 0.55966693 3687 Q8TE77;A0A087WWG1;C9JUG3 SSH3 Protein phosphatase Slingshot homolog 3 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 63.672 63.672 2 0.037751 63173 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.962 39.071 24338000 0 0 0 0 0 0 0 0 24338000 0 0 0 0 51281 3687 47894 461934;461935;461936;461937;461938;461939 589778;589779;589780;589781;589782;589783 589783 6 YLMEEDEDAYKK Unmodified 1532.6705 0.67047553 442 A0A2R8Y6J3;P46777 RPL5 60S ribosomal protein L5 yes no 0 0 1 1 45.508 45.508 3 0.008506 40220 QUIQUE_DMIX4_190116_001 40.373 26.343 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51282 442 47895 461940 589784 589784 1 YLMIEEYLTK Unmodified 1301.6577 0.65772599 1753 O95817 BAG3 BAG family molecular chaperone regulator 3 yes yes 0 0 0 1 1 1 124.95 124.95 2 0.01073 127532 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.231 53.629 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Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes no 0 0 0 1 83.526 83.526 2 0.0034764 85458 QUIQUE_C1368_190116_001 98.299 0 31013000 0 0 31013000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51286 4289 47899 461955 589800 589800 1 YLNLQENGIQVIR Unmodified 1558.8467 0.84674083 4289 Q9NT99;M0R2G0 LRRC4B Leucine-rich repeat-containing protein 4B yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 93.059 93.059 2;3 1.2414E-06 102072 QUIQUE_DMIX5_190116_001 129.85 104.47 253660000 26331000 0 0 0 0 25166000 0 17640000 54283000 0 64918000 32869000 32452000 51287 4289 47900 461956;461957;461958;461959;461960;461961;461962;461963;461964 589801;589802;589803;589804;589805;589806;589807;589808;589809 589807 8 YLNQDYEALR Unmodified 1283.6146 0.61461563 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 62.867 62.867 2 3.742E-18 61286 QUIQUE_C1563_190116_001 184.49 121.84 2513200000 290530000 230540000 210430000 200680000 297330000 193190000 226380000 69983000 116230000 189470000 174400000 133740000 180250000 51288 2127 47901 461965;461966;461967;461968;461969;461970;461971;461972;461973;461974;461975;461976;461977 589810;589811;589812;589813;589814;589815;589816;589817;589818;589819;589820;589821;589822;589823;589824;589825;589826;589827;589828;589829 589818 20 YLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGFK Unmodified 3973.9197 0.91965436 2127 P17655 CAPN2 Calpain-2 catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 2 3 1 2 2 164.34 164.34 3;4 2.0788E-22 168898 QUIQUE_DMIX3_190116_001 81.91 77.101 984260000 0 26181000 0 0 21902000 0 46278000 128710000 179530000 0 134420000 349550000 97689000 51289 2127 47902 461978;461979;461980;461981;461982;461983;461984;461985;461986;461987;461988;461989;461990 589830;589831;589832;589833;589834;589835;589836;589837;589838;589839;589840;589841;589842;589843;589844;589845 589837 16 YLNTNPVGGLLEYAR Unmodified 1678.8679 0.8678702 2664 P55265;A0A3B3IRQ9;H0YCK3;A0A3B3ISX1 ADAR Double-stranded RNA-specific adenosine deaminase yes no 0 0 0 1 1 125.2 125.2 2 0.017118 129578 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YLPALGYSK Unmodified 1010.5437 0.54368251 2641 P54577;A0A0C4DGZ5 YARS Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic;Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, N-terminally processed;Tyrosine--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 62.18 62.18 2 0.027289 62015 QUIQUE_C1438_190116_001 57.96 40.574 236830000 0 123280000 0 0 113550000 0 0 0 0 0 0 0 0 51292 2641 47905 462006;462007 589868;589869;589870 589869 3 YLPDTLLLEECGLLR Unmodified 1803.9441 0.94407161 2189 P21964;E7EMS6 COMT Catechol O-methyltransferase yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 147.74 147.74 2;3 2.1635E-13 152964 QUIQUE_C1368_190116_001 112.72 101.46 3450200000 210540000 209230000 315070000 503950000 184940000 341870000 360970000 284580000 304020000 91603000 276120000 145470000 221880000 51293 2189 47906 462008;462009;462010;462011;462012;462013;462014;462015;462016;462017;462018;462019;462020;462021;462022;462023;462024;462025;462026;462027;462028;462029;462030;462031;462032;462033 589871;589872;589873;589874;589875;589876;589877;589878;589879;589880;589881;589882;589883;589884;589885;589886;589887;589888;589889;589890;589891;589892;589893;589894;589895;589896;589897;589898;589899;589900;589901;589902;589903;589904 589879 34 YLPELMAEK Unmodified 1092.5525 0.55253264 2908;1642 Q07666;Q5VWX1;O75525 KHDRBS1;KHDRBS2;KHDRBS3 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1;KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 2;KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 3 no no 0 0 0 1 1 17.893 17.893 2 0.032208 10364 QUIQUE_C1576_190116_001 55.676 16.884 46969000 0 0 0 0 29973000 0 16997000 0 0 0 0 0 0 51294 2908;1642 47907 462034;462035 589905;589906 589906 2 YLPELMAEKDSLDPSFTHAMQLLTAEIEK Unmodified 3319.6356 0.63561693 2908 Q07666 KHDRBS1 KH domain-containing, RNA-binding, signal transduction-associated protein 1 yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 163.96 163.96 3;4 3.3579E-19 168494 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2374.1693 0.16925676 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 0 3 2 2 1 2 2 1 1 1 1 2 1 2 105.69 105.69 2;3 4.6394E-20 109141 QUIQUE_C1368_190116_001 145.52 125.77 2860600000 273470000 242530000 284290000 156050000 261720000 297920000 208730000 241500000 154130000 76880000 315520000 135340000 212530000 51298 921 47911 462050;462051;462052;462053;462054;462055;462056;462057;462058;462059;462060;462061;462062;462063;462064;462065;462066;462067;462068;462069;462070 589922;589923;589924;589925;589926;589927;589928;589929;589930;589931;589932;589933;589934;589935;589936;589937;589938;589939;589940;589941;589942;589943;589944;589945 589930 24 YLPGPLQDMFK Unmodified 1307.6584 0.6583947 3400 Q6PUV4 CPLX2 Complexin-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 130.16 130.16 2 0.010988 135656 QUIQUE_C1576_190116_001 61.78 45.127 188810000 0 0 0 75238000 38168000 47845000 27562000 0 0 0 0 0 0 51299 3400 47912 462071;462072;462073;462074;462075 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590177 1 YLSGIAHFLEK Unmodified 1276.6816 0.68157298 2940 Q10713 PMPCA Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 87.913 87.913 3 0.00064136 88940 QUIQUE_DMIX8_190116_001 112.13 78.897 46031000 0 0 0 0 19006000 0 0 0 0 10837000 16188000 0 0 51332 2940 47945 462260;462261;462262;462263;462264;462265;462266;462267 590178;590179;590180;590181;590182;590183;590184;590185 590185 8 YLSLGEHDR Unmodified 1088.5251 0.52507234 3721 Q8WXG6;A0A0A0MRB5;F8W8U2 MADD MAP kinase-activating death domain protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 25.938 25.938 3 0.012791 20515 QUIQUE_C1218_190116_001 52.49 31.026 153900000 31362000 21435000 22381000 0 0 16757000 0 16734000 25147000 0 0 20087000 0 51333 3721 47946 462268;462269;462270;462271;462272;462273;462274 590186;590187;590188;590189;590190;590191;590192;590193;590194 590186 9 YLSNAYAR Unmodified 956.47158 0.4715802 1395 O00299 CLIC1 Chloride intracellular channel protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 25.97 25.97 2 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462286;462287;462288;462289;462290;462291;462292;462293;462294;462295;462296 590207;590208;590209;590210;590211;590212;590213;590214;590215;590216;590217;590218 590218 12 YLTAEAFGFK Unmodified 1145.5757 0.57571092 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 102.17 102.17 1;2 1.0112E-06 99870 QUIQUE_DMIX4_190116_001 166.52 113.58 7620500000 669550000 650540000 597960000 506670000 570900000 446660000 582620000 630090000 617390000 288330000 765170000 555980000 738620000 51337 3187 47950 462297;462298;462299;462300;462301;462302;462303;462304;462305;462306;462307;462308;462309;462310 590219;590220;590221;590222;590223;590224;590225;590226;590227;590228;590229;590230;590231;590232;590233;590234;590235;590236;590237;590238 590233 19 YLTAEETDKIINYLR Unmodified 1840.9571 0.95707914 4224 Q9HCD5 NCOA5 Nuclear receptor coactivator 5 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 119.36 119.36 3 7.4115E-09 122576 QUIQUE_DMIX1_190116_001 103.21 77.089 177720000 0 0 0 0 0 0 0 29044000 28892000 0 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Unmodified 868.48069 0.48068833 198 F5H7G2;A0A0A0MTQ4;Q96B86 RGMA Repulsive guidance molecule A yes no 0 0 0 1 1 1 1 67.037 67.037 2 0.02541 68238 QUIQUE_C1218_190116_001 96.048 38.595 115210000 26205000 0 25000000 22413000 0 0 0 0 0 0 41590000 0 0 51341 198 47954 462329;462330;462331;462332 590260;590261;590262;590263;590264 590260 5 YLTGEQTEK Unmodified 1067.5135 0.5135046 2648 P54750 PDE1A Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A yes yes 0 0 0 1 17.319 17.319 2 0.066018 9969 QUIQUE_DMIX1_190116_001 58.981 17.479 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51342 2648 47955 462333 590265 590265 1 YLTGTYVQEESPEGGR Unmodified 1784.8217 0.82170787 3913;876;4521 Q96P47;E7ESL9;C9J975;H7C4F1;A0A087X044;C9J8Z2;E7EUN2;A0A087X1U1;F5GXM9;Q9UPQ3 AGAP3;AGAP1 Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3;Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 61.932 61.932 2 2.0147E-79 61126 QUIQUE_DMIX1_190116_001 206.1 173.77 699610000 63021000 73022000 43857000 66361000 71675000 46131000 0 44750000 42801000 18654000 86123000 72540000 70675000 51343 3913;876;4521 47956 462334;462335;462336;462337;462338;462339;462340;462341;462342;462343;462344;462345;462346 590266;590267;590268;590269;590270;590271;590272;590273;590274;590275;590276;590277;590278 590273 13 YLTLDGFDAMFR Unmodified 1447.6806 0.6805867 3442 Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 152.38 152.38 2 0.0028175 156786 QUIQUE_C1277_190116_001 73.887 52.38 213270000 0 47741000 0 0 0 0 0 54489000 42621000 0 68424000 0 0 51344 3442 47957 462347;462348;462349;462350 590279;590280;590281;590282 590279 4 YLTLDGFDAMFR Oxidation (M) 1463.6755 0.67550132 3442 Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 yes yes 0 1 0 1 131.12 131.12 2 0.019401 133855 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.294 69.031 39102000 0 0 0 0 0 0 0 39102000 0 0 0 0 0 51345 3442 47957 462351 590283 590283 0 YLTLDSFDAMFR Unmodified 1477.6912 0.69115139 292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1 yes no 0 0 0 1 155 155 2 0.00061637 159973 QUIQUE_DMIX3_190116_001 91.584 70.714 24328000 0 0 0 0 0 0 0 0 24328000 0 0 0 0 51346 292 47958 462352 590284 590284 1 YLTMDDLTTALEGNR Unmodified 1711.8087 0.80870034 2644 P54687 BCAT1 Branched-chain-amino-acid aminotransferase, cytosolic yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 142.71 142.71 2 2.6624E-28 145538 QUIQUE_C1563_190116_001 166.14 151.72 1173400000 130210000 108470000 100010000 113550000 85869000 93954000 91756000 91848000 79708000 34434000 154750000 88812000 0 51347 2644 47959 462353;462354;462355;462356;462357;462358;462359;462360;462361;462362;462363;462364;462365 590285;590286;590287;590288;590289;590290;590291;590292;590293;590294;590295;590296;590297;590298;590299 590290 14 YLTNAYSR Unmodified 986.48214 0.48214489 4646 Q9Y696 CLIC4 Chloride intracellular channel protein 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 29.12 29.12 2 0.0036361 22961 QUIQUE_DMIX8_190116_001 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Unmodified 1038.5862 0.58621603 2797;1862;1922 P04350;Q5JP53;P07437;Q5ST81;P68371 TUBB4A;TUBB;TUBB4B Tubulin beta-4A chain;Tubulin beta chain;Tubulin beta-4B chain no no 0 0 0 2 4 4 1 2 2 2 2 1 1 6 3 2 98.221 98.221 2 3.9101E-14 99642 QUIQUE_C1403_190116_001 186.43 131.9 132380000000 10416000000 11238000000 8437300000 7866000000 10532000000 8758500000 11850000000 10934000000 11142000000 5391000000 13337000000 11701000000 10773000000 51352 1862;1922;2797 47964 462472;462473;462474;462475;462476;462477;462478;462479;462480;462481;462482;462483;462484;462485;462486;462487;462488;462489;462490;462491;462492;462493;462494;462495;462496;462497;462498;462499;462500;462501;462502;462503 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membrane translocase subunit Tim23;Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 118.09 118.09 2 1.8625E-12 120959 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.64 83.05 280300000 48124000 0 49004000 0 0 0 0 21443000 40639000 0 54372000 30954000 35760000 51365 607 47977 462598;462599;462600;462601;462602;462603;462604 590693;590694;590695;590696;590697;590698;590699 590695 6 YLVSLGCIKPLCDLLTVMDSK Unmodified 2424.2467 0.24666092 1587 O60684 KPNA6 Importin subunit alpha-7 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 164.46 164.46 3 2.0243E-14 168328 QUIQUE_C1277_190116_001 93.73 57.983 511570000 23558000 82432000 0 0 0 0 52713000 44907000 34162000 0 125220000 100610000 47966000 51366 1587 47978 462605;462606;462607;462608;462609;462610;462611;462612 590700;590701;590702;590703;590704;590705;590706;590707;590708 590701 8 YLVVNADEGEPGTCK Unmodified 1650.7559 0.75593649 1069 G3V0I5;P49821;B4DE93;E9PMX3;E9PQP1;E9PPR0;E9PLC6;E9PJL9;E9PPD6 NDUFV1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.387 57.387 2 6.8194E-36 55518 QUIQUE_C1368_190116_001 212.89 200.83 2299700000 276980000 300770000 313000000 235850000 228950000 291980000 263340000 62011000 75312000 0 0 121120000 130390000 51367 1069 47979 462613;462614;462615;462616;462617;462618;462619;462620;462621;462622;462623 590709;590710;590711;590712;590713;590714;590715;590716;590717;590718;590719;590720;590721;590722;590723 590714 13 YLWESPSLAIKPWK Unmodified 1716.9239 0.92392852 1707 O95163;F5H2T0 IKBKAP Elongator complex protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 119.5 119.5 3 0.00088773 123418 QUIQUE_C1277_190116_001 76.357 66.018 96101000 17034000 28460000 17408000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33198000 51368 1707 47980 462624;462625;462626;462627 590724;590725;590726;590727 590725 2 YLWNNIK Unmodified 949.50215 0.50215205 247;1323 A0A0C4DGQ5;P04632;K7ELJ7;A0A075B7C0;U3KQE2;K7EIV0;U3KPR7;Q96L46;K7EKD8 CAPNS1;CAPNS2 Calpain small subunit 1;Calpain small subunit 2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.333 77.333 2 0.021446 78250 QUIQUE_C1368_190116_001 104.94 76.046 4374400000 305750000 306070000 298550000 276670000 292380000 290000000 340650000 363320000 449810000 220210000 402020000 347060000 481880000 51369 247;1323 47981 462628;462629;462630;462631;462632;462633;462634;462635;462636;462637;462638;462639;462640 590728;590729;590730;590731;590732;590733;590734;590735;590736;590737;590738;590739;590740;590741;590742;590743;590744 590730 17 YLWNNIKR Unmodified 1105.6033 0.60326308 247;1323 A0A0C4DGQ5;P04632;K7ELJ7;A0A075B7C0;U3KQE2;K7EIV0;U3KPR7;K7EKD8 CAPNS1 Calpain small subunit 1 no no 0 0 1 1 53.797 53.797 3 0.019838 51459 QUIQUE_DMIX1_190116_001 52.403 27.149 16980000 0 0 0 0 0 0 0 16980000 0 0 0 0 0 51370 247;1323 47982 462641 590745 590745 1 YLYDQLATICPIVMALSAASPFYR Unmodified 2762.3812 0.38118056 2509 P48506;A0A2R8YEL6;B4E2I4;E1CEI4 GCLC Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit yes no 0 0 0 1 175.92 175.92 3 5.9506E-07 182919 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80.385 2 2.6202E-06 79764 QUIQUE_DMIX1_190116_001 151.51 131.18 120460000000 7953800000 11973000000 9640300000 8563500000 9566300000 7392700000 13315000000 9568400000 7506900000 2111000000 10647000000 10349000000 11872000000 51380 2795;2796;3430;3992;539 47991 462730;462731;462732;462733;462734;462735;462736;462737;462738;462739;462740;462741;462742;462743 590859;590860;590861;590862;590863;590864;590865;590866;590867;590868;590869;590870;590871;590872;590873;590874;590875;590876;590877;590878;590879;590880;590881;590882;590883;590884;590885;590886;590887;590888;590889;590890;590891;590892;590893;590894;590895;590896;590897;590898;590899;590900 590882 42 YMACCMLYR Oxidation (M) 1282.4967 0.4966908 1990;688 P0DPH8;P0DPH7;Q6PEY2;C9J2C0;Q9NY65;V9GZ17 TUBA3E;TUBA8 Tubulin alpha-3E chain;Tubulin alpha-8 chain no no 0 1 0 1 1 1 1 2 1 1 1 56.494 56.494 2 0.018601 46475 QUIQUE_DMIX3_190116_001 66.799 62.782 269630000 0 29254000 0 0 21545000 0 17221000 31370000 83321000 9313200 0 31387000 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YMEAFKPFLGIGLK Unmodified 1612.8687 0.86872182 3090 Q14974;J3KTM9 KPNB1 Importin subunit beta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 129.01 129.01 3 0.00046136 134773 QUIQUE_C1576_190116_001 82.362 77.56 834100000 0 185720000 0 0 0 0 205820000 0 206880000 0 0 0 235680000 51390 3090 47999 462784;462785;462786;462787;462788 590948;590949;590950;590951;590952 590949 4 YMEEMADTADAIEMATLDK Unmodified 2146.9109 0.91085851 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 0 1 1 145.68 145.68 2 6.506E-11 150940 QUIQUE_C1218_190116_001 113.72 106.83 47092000 26328000 0 0 0 0 20764000 0 0 0 0 0 0 0 51391 890;3052 48000 462789;462790 590953;590954 590953 2 YMEEMADTADAIEMATLDKEMAEER Unmodified 2892.2173 0.21734722 3052;890 E7EX90;Q6AWB1;Q14203 DCTN1;DKFZp686E0752 Dynactin subunit 1 no no 0 0 1 1 1 1 140.36 140.36 3 2.3569E-29 143539 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.52 117.22 183220000 0 0 0 0 0 0 0 61369000 0 0 0 65693000 56155000 51392 890;3052 48001 462791;462792;462793 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590983;590984;590985;590986;590987;590988;590989;590990;590991;590992 590983 10 YMGDLSGGQVLK Unmodified 1266.6278 0.62782285 2319 P30519;A0A087WT44;I3L159;I3L1F5 HMOX2 Heme oxygenase 2 yes no 0 0 0 1 1 1 69.404 69.404 2 0.0057979 70296 QUIQUE_C1438_190116_001 78.655 65.076 78099000 0 0 0 0 33591000 0 44508000 0 0 0 0 0 0 51398 2319 48007 462827;462828;462829 590993;590994;590995;590996 590995 4 YMHLFSTIK Unmodified 1138.5845 0.58450147 2257 P26992;Q5T8H6 CNTFR Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 61.598 61.598 3 0.0097511 61082 QUIQUE_C1277_190116_001 46.819 33.637 318080000 54317000 78159000 39533000 0 31680000 0 0 0 39709000 0 0 36603000 38075000 51399 2257 48008 462830;462831;462832;462833;462834;462835;462836 590997;590998;590999;591000;591001;591002;591003;591004 590998 8 YMHLFSTIK Oxidation (M) 1154.5794 0.57941609 2257 P26992;Q5T8H6 CNTFR Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha yes no 0 1 0 1 40.175 40.175 3 0.022399 37067 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591062 10 YMLPLDNLK Oxidation (M) 1121.5791 0.57908174 4528;2569;840 P50570;E5RHK8;Q9UQ16 DNM2;DNM3 Dynamin-2;Dynamin-3 no no 0 1 0 1 1 1 86.085 86.085 2 0.0085452 89502 QUIQUE_DMIX5_190116_001 82.241 57.39 104010000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 46982000 30672000 26355000 51407 2569;840;4528 48012 462897;462898;462899 591070;591071;591072;591073 591071 491 4 YMLSVDNLK Unmodified 1081.5478 0.54778161 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 3 1 1 1 1 1 1 80.133 80.133 2 0.0004112 80115 QUIQUE_C1563_190116_001 120.46 77.457 2920200000 409530000 382510000 307380000 276990000 233440000 243290000 0 226640000 0 101140000 264220000 244550000 230530000 51408 269;2893 48013 462900;462901;462902;462903;462904;462905;462906;462907;462908;462909;462910;462911;462912;462913;462914 591074;591075;591076;591077;591078;591079;591080;591081;591082;591083;591084;591085;591086;591087;591088;591089;591090;591091 591081 17 YMLSVDNLK Oxidation (M) 1097.5427 0.54269624 2893;269 A0A0D9SFB1;Q05193;A0A0U1RQP1;A0A0D9SFE4 DNM1 Dynamin-1 no no 0 1 0 1 1 1 68.287 68.287 2 0.002817 64733 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.992 78.359 238620000 0 0 0 0 0 64914000 0 89729000 0 83973000 0 0 0 51409 269;2893 48013 462915;462916;462917 591092;591093;591094;591095 591095 197 4 YMMIVDPAISSSGPAGSYRPYDEGLRR Unmodified 2987.427 0.42696156 1993 P10253 GAA Lysosomal alpha-glucosidase;76 kDa lysosomal alpha-glucosidase;70 kDa lysosomal alpha-glucosidase yes yes 0 0 2 1 1 2 1 104.17 104.17 3;4 1.2674E-23 108762 QUIQUE_DMIX5_190116_001 96.54 89.891 315790000 0 0 0 0 0 0 0 43869000 53038000 0 134640000 0 84249000 51410 1993 48014 462918;462919;462920;462921;462922 591096;591097;591098;591099;591100 591098 5 YMNSGPVVAMVWEGLNVVK Oxidation (M) 2108.0435 0.043468079 3222;1572 O60361;Q32Q12;P22392 NME2P1;NME1-NME2;NME2 Putative nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B no no 0 1 0 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 157.37 157.37 2;3 8.7278E-64 162178 QUIQUE_DMIX8_190116_001 184.21 165.38 1635800000 121980000 99920000 169940000 97820000 33860000 95973000 112430000 157400000 167660000 54666000 223260000 132480000 168470000 51411 1572;3222 48015 462923;462924;462925;462926;462927;462928;462929;462930;462931;462932;462933;462934;462935;462936;462937;462938;462939;462940;462941;462942;462943;462944;462945;462946;462947 591101;591102;591103;591104;591105;591106;591107;591108;591109;591110;591111;591112;591113;591114;591115;591116;591117;591118;591119;591120;591121;591122;591123;591124;591125;591126;591127;591128;591129;591130;591131;591132;591133;591134;591135;591136;591137;591138;591139;591140;591141;591142;591143 591142 859 43 YMNSGPVVAMVWEGLNVVK Unmodified 2092.0486 0.048553457 3222;1572 O60361;Q32Q12;P22392 NME2P1;NME1-NME2;NME2 Putative nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase;Nucleoside diphosphate kinase B no no 0 0 0 1 2 2 2 2 4 164.31 164.31 2;3 3.3199E-08 166672 QUIQUE_DMIX1_190116_001 108.75 100.36 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double-stranded RNA-activated protein kinase yes yes 0 0 0 1 1 1 64.237 64.237 2 0.0065865 64370 QUIQUE_DMIX5_190116_001 78.903 61.039 105370000 0 0 31142000 0 0 0 0 32130000 0 0 42095000 0 0 51417 2149 48020 462986;462987;462988 591190;591191;591192 591192 2 YMSPMEAQEFGILDK Unmodified 1757.8004 0.80044384 3192 Q16740;M0R208 CLPP ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial;ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit yes no 0 0 0 1 1 119.17 119.17 2 0.00055615 121992 QUIQUE_C1563_190116_001 76.326 64.163 53193000 0 0 0 0 0 22410000 0 0 0 0 0 0 30783000 51418 3192 48021 462989;462990 591193;591194 591193 1 YMSVIAELEQSGLGAELK Unmodified 1936.9816 0.98157933 1253 I3L448;A8MRA7;Q5TC12;H0YEW4;H0YD21 ATPAF1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 154.36 154.36 2 1.0774E-10 158818 QUIQUE_C1277_190116_001 117.92 77.999 468280000 0 81588000 91703000 0 62702000 46478000 83058000 39366000 0 0 0 0 63386000 51419 1253 48022 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591204;591205;591206;591207;591208;591209;591210;591211;591212;591213;591214;591215;591216;591217;591218;591219;591220;591221;591222;591223;591224;591225;591226;591227;591228;591229;591230;591231;591232;591233 591219 1206 29 YMTISGFQIEETIDR Unmodified 1801.8557 0.85565053 1954 P08758;D6RBL5;D6RBE9 ANXA5 Annexin A5;Annexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 129.28 129.28 2 1.4318E-12 135730 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.15 140.99 1030900000 0 0 0 264320000 0 358790000 0 0 0 258850000 148930000 0 0 51422 1954 48024 463018;463019;463020;463021 591234;591235;591236;591237;591238;591239;591240;591241;591242;591243 591243 10 YMTPEDFVQR Unmodified 1284.5809 0.58087266 1655 O75746;F8W9J0;H0YFB2;B4DGK6 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 1 3 90.481 90.481 2 0.00013182 93948 QUIQUE_C1218_190116_001 138.54 77.757 547010000 99948000 0 0 70256000 0 67750000 0 49857000 49188000 26183000 0 73243000 110590000 51423 1655 48025 463022;463023;463024;463025;463026;463027;463028;463029;463030;463031;463032;463033;463034;463035;463036 591244;591245;591246;591247;591248;591249;591250;591251;591252;591253;591254;591255;591256;591257;591258;591259;591260;591261;591262;591263;591264 591245 19 YMTPEDFVQR Oxidation (M) 1300.5758 0.57578728 1655 O75746;F8W9J0;H0YFB2;B4DGK6 SLC25A12 Calcium-binding mitochondrial carrier protein Aralar1 yes no 0 1 0 2 1 1 1 1 67.065 67.065 2 0.0022053 64307 QUIQUE_DMIX4_190116_001 93.162 66.56 163800000 0 55339000 0 0 0 0 0 17337000 28210000 18869000 44042000 0 0 51424 1655 48025 463037;463038;463039;463040;463041;463042 591265;591266;591267;591268;591269;591270 591269 891 6 YMVADKFTELQK Unmodified 1471.7381 0.73810158 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 0 1 1 1 2 1 2 2 66.354 66.354 2;3 1.2789E-27 66357 QUIQUE_DMIX3_190116_001 184.9 151.03 1289700000 0 0 0 0 0 0 37107000 238050000 310930000 0 145650000 299260000 258700000 51425 2309 48026 463043;463044;463045;463046;463047;463048;463049;463050;463051 591271;591272;591273;591274;591275;591276;591277;591278;591279;591280;591281 591273 10 YMVADKFTELQK Oxidation (M) 1487.733 0.7330162 2309 P30153;B3KQV6;C9J9C1 PPP2R1A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 65 kDa regulatory subunit A alpha isoform yes no 0 1 1 1 1 2 1 55.966 55.966 2;3 0.00010044 54944 QUIQUE_DMIX5_190116_001 130.94 104.05 301690000 0 0 0 0 0 0 0 69417000 46633000 0 124930000 0 60712000 51426 2309 48026 463052;463053;463054;463055;463056 591282;591283;591284;591285;591286;591287;591288 591286 1703 7 YNACILEYK Unmodified 1172.5536 0.55359527 3179 Q16531;F5GY55;F5H2L3;F5GWI0;F5GZY8;F5GYG8 DDB1 DNA damage-binding protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 67.796 67.796 2 0.0018158 67387 QUIQUE_DMIX1_190116_001 111.95 94.562 379510000 73105000 92712000 0 0 64714000 0 0 69883000 0 0 0 79095000 0 51427 3179 48027 463057;463058;463059;463060;463061 591289;591290;591291;591292;591293 591292 3 YNADYDLSAR Unmodified 1186.5255 0.52546627 3005 Q13505 MTX1 Metaxin-1 yes yes 0 0 0 1 47.752 47.752 2 0.0029145 45092 QUIQUE_C1218_190116_001 87.258 68.934 35615000 35615000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51428 3005 48028 463062 591294 591294 1 YNADYELSAK Unmodified 1172.535 0.53496832 3272 Q5HYI7 MTX3 Metaxin-3 yes yes 0 0 0 1 1 42.982 42.982 2 0.019822 39561 QUIQUE_C1277_190116_001 59.908 40.842 23210000 0 23210000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51429 3272 48029 463063;463064 591295;591296 591295 2 YNALLAVQK Unmodified 1018.5811 0.58113065 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.316 52.316 2 0.00045675 50704 QUIQUE_DMIX1_190116_001 117.16 80.459 1790900000 213940000 187470000 135090000 128870000 0 95539000 0 176130000 116520000 98569000 237260000 193220000 208290000 51430 4443 48030 463065;463066;463067;463068;463069;463070;463071;463072;463073;463074;463075 591297;591298;591299;591300;591301;591302;591303;591304;591305;591306;591307;591308;591309;591310;591311 591304 14 YNCPSFLAAALAR Unmodified 1452.7184 0.71836919 3722 Q8WY54 PPM1E Protein phosphatase 1E yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.78 113.78 2 5.7509E-06 116984 QUIQUE_C1403_190116_001 125.48 107.66 1428900000 124630000 161490000 129200000 122430000 0 120580000 140070000 91473000 83426000 53860000 133440000 137330000 130960000 51431 3722 48031 463076;463077;463078;463079;463080;463081;463082;463083;463084;463085;463086;463087 591312;591313;591314;591315;591316;591317;591318;591319;591320;591321;591322;591323;591324;591325;591326;591327;591328;591329 591317 18 YNDPIYVK Unmodified 1010.5073 0.50729701 2777;2938 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;Q10567;C9J1E7 AP2B1;AP1B1 AP-2 complex subunit beta;AP-1 complex subunit beta-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 44.915 44.915 2 0.0011393 41633 QUIQUE_DMIX7_190116_001 145.34 123.57 4910100000 507360000 463020000 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318420000 522040000 284080000 671160000 417090000 443570000 51434 5 48034 463101;463102;463103;463104;463105;463106;463107;463108;463109;463110;463111;463112;463113;463114;463115;463116;463117;463118;463119;463120 591353;591354;591355;591356;591357;591358;591359;591360;591361;591362;591363;591364;591365;591366;591367;591368;591369;591370;591371;591372;591373;591374;591375 591359 21 YNEIQNDYLR Unmodified 1326.6204 0.62042929 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2;A0A1B0GW62;A0A0D9SGI7 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 1 1 62.885 62.885 2 0.00014789 61210 QUIQUE_C1563_190116_001 120.99 93.685 119140000 52685000 0 0 0 32346000 34106000 0 0 0 0 0 0 0 51435 4250 48035 463121;463122;463123;463124 591376;591377;591378;591379 591379 3 YNEQHVPGSPFTAR Unmodified 1601.7587 0.7586541 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 2 2 2 2 1 46.488 46.488 2;3 2.6775E-05 44012 QUIQUE_DMIX1_190116_001 87.363 63.087 2199700000 168380000 218930000 247470000 0 220630000 42080000 55895000 248950000 318200000 118230000 343350000 217550000 0 51436 2178 48036 463125;463126;463127;463128;463129;463130;463131;463132;463133;463134;463135;463136;463137;463138;463139;463140;463141;463142;463143;463144 591380;591381;591382;591383;591384;591385;591386;591387;591388;591389;591390;591391;591392;591393;591394;591395;591396;591397;591398;591399;591400;591401;591402 591394 23 YNFFTGCPK Unmodified 1132.5012 0.50116577 3977 Q99832 CCT7 T-complex protein 1 subunit eta yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 73.209 73.209 2 0.0016056 73461 QUIQUE_DMIX8_190116_001 102 94.355 2512400000 218970000 295650000 284010000 0 201640000 179960000 330680000 181160000 133590000 0 222410000 211580000 252780000 51437 3977 48037 463145;463146;463147;463148;463149;463150;463151;463152;463153;463154;463155 591403;591404;591405;591406;591407;591408;591409;591410;591411;591412;591413;591414;591415 591415 9 YNFHGTAEQDLPFCK Unmodified 1825.8094 0.80936904 2439 P41240;H3BUM9;H3BN15 CSK Tyrosine-protein kinase CSK yes no 0 0 0 1 1 79.198 79.198 3 0.033704 78969 QUIQUE_DMIX1_190116_001 34.182 30.279 57623000 0 0 0 0 0 0 0 41241000 0 16382000 0 0 0 51438 2439 48038 463156;463157 591416;591417 591416 2 YNFQAPATNAR Unmodified 1251.5996 0.59963426 4429 Q9UHC6;A0A0J9YYA0;A0A0J9YWG3;B7Z1Y6 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 45.604 45.604 2 0.022606 43635 QUIQUE_C1438_190116_001 81.263 57.142 101850000 0 0 54500000 0 47355000 0 0 0 0 0 0 0 0 51439 4429 48039 463158;463159 591418;591419 591419 1 YNGVFQECCQAEDK Unmodified 1746.6978 0.69776968 770 CON__P02769 yes yes 0 0 0 1 1 1 50.671 50.671 2 7.0415E-18 48136 QUIQUE_DMIX3_190116_001 155.98 147.84 103420000 0 0 0 0 0 23312000 0 0 37285000 42822000 0 0 0 + 51440 770 48040 463160;463161;463162 591420;591421;591422 591421 3 YNHIDESEMK Unmodified 1264.5394 0.53940177 3738;180 A0A0A0MSM0;Q5TBM3;Q92598 HSPH1 Heat shock protein 105 kDa no no 0 0 0 1 2 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 20.596 20.596 2;3 2.9596E-05 13037 QUIQUE_C1277_190116_001 145.84 133.6 791700000 62640000 158160000 53762000 76252000 54398000 96649000 57043000 23835000 37982000 12496000 56952000 42809000 58726000 51441 180;3738 48041 463163;463164;463165;463166;463167;463168;463169;463170;463171;463172;463173;463174;463175;463176;463177 591423;591424;591425;591426;591427;591428;591429;591430;591431;591432;591433;591434;591435;591436;591437 591425 15 YNHSHDQLVLTGSSDSR Unmodified 1914.882 0.88201671 564 A8MUM1;Q53HC9;C9JVR6 TSSC1 Protein TSSC1 yes no 0 0 0 2 1 1 2 2 1 1 1 1 23.433 23.433 2;3 9.545E-18 16991 QUIQUE_C1277_190116_001 144.12 122.89 523740000 0 69311000 0 42282000 60837000 53338000 107400000 0 60236000 0 61650000 0 68694000 51442 564 48042 463178;463179;463180;463181;463182;463183;463184;463185;463186;463187;463188;463189 591438;591439;591440;591441;591442;591443;591444;591445;591446;591447;591448;591449 591439 12 YNIEKDIAAHIK Unmodified 1413.7616 0.76161421 2782 P63167;F8VXL2;F8VRV5 DYNLL1 Dynein light chain 1, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 64.275 64.275 3 0.0051479 62918 QUIQUE_DMIX1_190116_001 49.483 42.599 106670000 0 0 0 0 0 0 0 106670000 0 0 0 0 0 51443 2782 48043 463190 591450 591450 1 YNIEKDIAAYIK Unmodified 1439.766 0.76603089 3852 Q96FJ2 DYNLL2 Dynein light chain 2, cytoplasmic yes yes 0 0 1 1 1 103.11 103.11 3 0.00031482 107917 QUIQUE_DMIX5_190116_001 89.43 70.7 87951000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 56646000 0 31305000 51444 3852 48044 463191;463192 591451;591452;591453 591451 3 YNIIPVLSDILQESVK Unmodified 1830.0139 0.013865735 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 168.52 168.52 2;3 9.122E-14 162562 QUIQUE_DMIX4_190116_001 126.83 94.334 8254200000 553510000 86358000 1481400000 302060000 676870000 0 448740000 594940000 496730000 257990000 1159600000 932940000 1263100000 51445 4443 48045 463193;463194;463195;463196;463197;463198;463199;463200;463201;463202;463203;463204;463205;463206;463207;463208;463209;463210;463211;463212;463213;463214;463215 591454;591455;591456;591457;591458;591459;591460;591461;591462;591463;591464;591465;591466;591467;591468;591469;591470;591471;591472;591473;591474;591475;591476;591477 591471 23 YNIIPVLSDILQESVKEK Unmodified 2087.1514 0.15142185 4443 Q9UI12;G3V126 ATP6V1H V-type proton ATPase subunit H yes no 0 0 1 1 158.11 158.11 3 0.00021112 160725 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.78 63.852 31628000 0 0 0 0 0 0 0 31628000 0 0 0 0 0 51446 4443 48046 463216 591478;591479;591480 591480 3 YNILGTNTIMDK Unmodified 1381.6912 0.69115139 2849 Q00839;A0A1X7SBS1;A0A1W2PPS1;A0A1W2PP35;Q5RI18;A0A1W2PPL4;A0A1W2PPH7;A0A1W2PQL0;A0A1W2PP34;A0A1W2PQ74;A0A1W2PRZ7;A0A1W2PQD4 HNRNPU Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 93.476 93.476 2 0.0003528 97054 QUIQUE_DMIX5_190116_001 138.22 123.55 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YNILPEKEEFPFALGVQTLPQTCDEPK Unmodified 3162.5584 0.55835289 1802 P01023 A2M Alpha-2-macroglobulin yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 140.43 140.43 3 1.4557E-30 144673 QUIQUE_C1277_190116_001 114.74 109.02 680870000 63779000 83097000 63485000 65049000 137480000 51439000 0 0 0 20960000 90577000 0 105010000 51449 1802 48048 463241;463242;463243;463244;463245;463246;463247;463248;463249 591508;591509;591510;591511;591512;591513;591514;591515;591516;591517 591509 10 YNIMLVR Unmodified 907.49496 0.49495818 2572 P50990;H7C4C8 CCT8 T-complex protein 1 subunit theta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 71.488 71.488 2 0.0098361 72095 QUIQUE_DMIX1_190116_001 149.11 102.07 2653900000 296740000 267200000 254340000 294180000 214310000 0 272020000 178020000 153870000 87055000 232520000 181770000 221890000 51450 2572 48049 463250;463251;463252;463253;463254;463255;463256;463257;463258;463259;463260;463261 591518;591519;591520;591521;591522;591523;591524;591525;591526;591527;591528;591529;591530;591531;591532;591533;591534;591535 591526 18 YNIPHGPVVGSTR Unmodified 1395.7259 0.72589741 2561 P50402 EMD Emerin yes yes 0 0 0 1 1 46.828 46.828 3 0.023756 43510 QUIQUE_C1403_190116_001 29.491 18.256 74847000 0 0 0 44473000 0 30374000 0 0 0 0 0 0 0 51451 2561 48050 463262;463263 591536;591537 591536 2 YNLDFWR Unmodified 1012.4767 0.47666558 3020 Q13630;E9PKL9;E9PP14;A0A0J9YX13;E9PLH9;H0YE90 TSTA3 GDP-L-fucose synthase yes no 0 0 0 1 1 1 111.22 111.22 2 0.030434 115742 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.706 74.552 199520000 58152000 0 0 61305000 0 0 0 0 0 0 80060000 0 0 51452 3020 48051 463264;463265;463266 591538;591539;591540 591540 3 YNLEELYQAVENLCSHK Unmodified 2108.9837 0.98370459 3018 Q13619;A0A087WWN2 CUL4A Cullin-4A yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 152.97 152.97 3 0.00028525 158444 QUIQUE_C1368_190116_001 66.022 57.897 274510000 23581000 18674000 28268000 0 29386000 25028000 0 0 46085000 0 28788000 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0 0 0 1 1 1 1 1 78.551 78.551 2 0.0018106 80154 QUIQUE_C1576_190116_001 78.934 46.122 277560000 65693000 0 62303000 0 0 0 42804000 0 0 0 54725000 52036000 0 51458 4517 48057 463303;463304;463305;463306;463307 591591;591592;591593;591594;591595;591596 591594 4 YNLQSALR Unmodified 963.51378 0.51377937 2807 P78357 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 54.17 54.17 2 0.0055497 52468 QUIQUE_DMIX1_190116_001 105.04 77.515 845130000 110380000 133820000 141770000 116990000 96534000 0 146790000 98853000 0 0 0 0 0 51459 2807 48058 463308;463309;463310;463311;463312;463313;463314 591597;591598;591599;591600;591601;591602;591603 591603 6 YNLSPSIFFCATPPDDGNLCR Unmodified 2443.0937 0.093665749 2848 Q00796;H0YLA4 SORD Sorbitol dehydrogenase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 144.34 144.34 2 2.5074E-13 148533 QUIQUE_C1277_190116_001 140.74 133.7 678450000 30974000 49303000 65046000 60622000 44683000 35600000 85793000 60685000 52371000 15227000 55668000 53326000 69150000 51460 2848 48059 463315;463316;463317;463318;463319;463320;463321;463322;463323;463324;463325;463326;463327 591604;591605;591606;591607;591608;591609;591610;591611;591612;591613;591614;591615;591616;591617;591618;591619 591607 14 YNMGLPVDFDQYNELHLPAVILK Unmodified 2688.3622 0.36215968 2912 Q07960;H0YE29 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 156.08 156.08 3 3.8784E-12 161446 QUIQUE_C1368_190116_001 99.407 95.218 2266800000 0 191580000 353190000 199080000 196840000 0 311970000 151960000 259680000 0 324080000 278440000 0 51461 2912 48060 463328;463329;463330;463331;463332;463333;463334;463335;463336 591620;591621;591622;591623;591624;591625;591626;591627;591628;591629 591622 10 YNMGLPVDFDQYNELHLPAVILK Oxidation (M) 2704.3571 0.3570743 2912 Q07960;H0YE29 ARHGAP1 Rho GTPase-activating protein 1 yes no 0 1 0 1 1 1 148.12 148.12 3 4.4919E-05 153782 QUIQUE_C1368_190116_001 54.223 47.789 377480000 0 0 125450000 170080000 81958000 0 0 0 0 0 0 0 0 51462 2912 48060 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23 YNPTWHCIVGR Unmodified 1401.6612 0.66118866 2782;3852 P63167;Q96FJ2 DYNLL1;DYNLL2 Dynein light chain 1, cytoplasmic;Dynein light chain 2, cytoplasmic no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 58.74 58.74 2;3 0.00016973 58731 QUIQUE_C1218_190116_001 151.44 133.58 12206000000 478880000 830670000 739500000 276520000 811680000 461820000 1040000000 1133100000 1473800000 157600000 1659000000 1560500000 1583300000 51472 2782;3852 48070 463386;463387;463388;463389;463390;463391;463392;463393;463394;463395;463396;463397;463398;463399;463400;463401;463402;463403;463404;463405;463406;463407;463408;463409;463410 591691;591692;591693;591694;591695;591696;591697;591698;591699;591700;591701;591702;591703;591704;591705;591706;591707;591708;591709;591710;591711;591712;591713;591714;591715;591716;591717;591718;591719;591720;591721;591722;591723;591724;591725;591726;591727;591728;591729;591730;591731;591732;591733;591734;591735;591736;591737;591738;591739;591740;591741;591742 591693 51 YNQATPTFHQWR Unmodified 1547.727 0.72696004 4441 Q9UI08;G3V2K5;G3V3G2;G3V535;G3V5F7;A0A087WYI2 EVL Ena/VASP-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 2 1 1 1 48.578 48.578 2;3 0.0017985 46465 QUIQUE_DMIX3_190116_001 55.258 47.154 514440000 0 0 79018000 73991000 64075000 0 52187000 0 59800000 0 75401000 53985000 55987000 51473 4441 48071 463411;463412;463413;463414;463415;463416;463417;463418;463419;463420 591743;591744;591745;591746;591747;591748;591749;591750;591751;591752;591753 591748 8 YNQATQTFHQWR Unmodified 1578.7328 0.7327737 3615 Q8N8S7;A0A0U1RRM6;A0A075B6E5;A0A0U1RQP7 ENAH Protein enabled homolog yes no 0 0 0 1 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 2 41.393 41.393 2;3 1.4179E-146 38091 QUIQUE_DMIX3_190116_001 280.71 247.44 1121900000 54782000 227580000 66290000 53203000 70232000 70589000 75820000 48888000 69716000 0 70724000 52276000 261750000 51474 3615 48072 463421;463422;463423;463424;463425;463426;463427;463428;463429;463430;463431;463432;463433;463434;463435 591754;591755;591756;591757;591758;591759;591760;591761;591762;591763;591764;591765;591766;591767;591768;591769;591770;591771;591772 591767 19 YNQPFFVTSLPDDKIPK Unmodified 2008.0306 0.030578432 2285 Q5VZU9;P29144 TPP2 Tripeptidyl-peptidase 2 yes no 0 0 1 1 1 1 108.26 108.26 3 0.023561 113135 QUIQUE_DMIX5_190116_001 39.523 30.477 167520000 0 0 0 0 0 0 0 54618000 0 0 55700000 57200000 0 51475 2285 48073 463436;463437;463438 591773;591774;591775 591774 3 YNRPVEEWLQEK Unmodified 1589.7838 0.78380622 319 A0A0U1RRJ0;A0A0U1RQC5;A0A0C4DGK4 NRXN3 yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 1 64.833 64.833 2;3 1.786E-05 64100 QUIQUE_C1403_190116_001 138.25 45.192 112520000 0 0 0 64170000 0 48347000 0 0 0 0 0 0 0 51476 319 48074 463439;463440;463441;463442;463443;463444;463445 591776;591777;591778;591779;591780;591781;591782 591776 7 YNSHLVPEDGTLTCSDPGIYVLR Unmodified 2605.2483 0.24825214 1680 O76054;B3KRD8 SEC14L2 SEC14-like protein 2 yes no 0 0 0 2 1 2 2 2 2 1 2 1 1 2 1 2 110.75 110.75 2;3 5.0066E-40 114336 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Unmodified 1697.9828 0.98284038 188 A0A2P0CTB1;A0A0A0MT35;Q8TBF2;J3QKK8;A0A0G2JSF1;A0A2P0CTH9;J3KRV9;A0A2P0CU24;A0A0A0MRV4;A0A0G2JRR6;J3KPF6;J3KPF5 FAM213B Prostamide/prostaglandin F synthase yes no 0 0 1 1 1 1 1 96.462 96.462 3 0.0021764 98937 QUIQUE_DMIX8_190116_001 60.549 49.762 230190000 0 0 0 0 0 0 0 67579000 0 0 66068000 52173000 44369000 51479 188 48077 463471;463472;463473;463474 591814;591815;591816;591817;591818 591818 5 YNSMVLICALMGSECLHK Unmodified 2124.9829 0.98285843 2605 P52306 RAP1GDS1 Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 140.56 140.56 2;3 5.5799E-31 147273 QUIQUE_DMIX5_190116_001 154.47 140.74 701260000 0 162150000 0 0 0 100140000 0 96098000 125490000 0 38566000 178820000 0 51480 2605 48078 463475;463476;463477;463478;463479;463480 591819;591820;591821;591822;591823;591824 591823 5 YNSPELDEEGYSIRPEEPGSTK Unmodified 2496.1292 0.12924244 3996 Q9BQI5;F6R8P8 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 76.899 76.899 3 2.1828E-20 78547 QUIQUE_C1218_190116_001 126.61 120.39 688080000 67637000 64253000 68092000 63127000 66957000 68474000 70969000 61973000 45673000 0 64425000 46504000 0 51481 3996 48079 463481;463482;463483;463484;463485;463486;463487;463488;463489;463490;463491 591825;591826;591827;591828;591829;591830;591831;591832;591833;591834;591835;591836 591825 12 YNSQNQSNNQFVLYR Unmodified 1873.8707 0.87072375 1806 P01042 KNG1 Kininogen-1;Kininogen-1 heavy chain;T-kinin;Bradykinin;Lysyl-bradykinin;Kininogen-1 light chain;Low molecular weight growth-promoting factor yes yes 0 0 0 1 66.927 66.927 2 4.7793E-05 67650 QUIQUE_C1438_190116_001 111.5 97.077 67398000 0 0 0 0 67398000 0 0 0 0 0 0 0 0 51482 1806 48080 463492 591837 591837 1 YNSWPSSLQELLRPTFPGVIR Unmodified 2459.2961 0.29612903 4334 Q9NYU2 UGGT1 UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 153.95 153.95 3 1.0981E-06 158200 QUIQUE_C1277_190116_001 83.213 75.221 426350000 25961000 57036000 31449000 34766000 32944000 0 44473000 0 0 0 72594000 71434000 55690000 51483 4334 48081 463493;463494;463495;463496;463497;463498;463499;463500;463501 591838;591839;591840;591841;591842;591843;591844;591845;591846;591847 591839 10 YNTDAMTTAVALNNVQFLVPIDGGVTK Unmodified 2851.4426 0.44259485 3996 Q9BQI5;Q6ZV33 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 157.89 157.89 3 5.8917E-06 163183 QUIQUE_C1218_190116_001 54.167 47.663 80198000 42120000 38078000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51484 3996 48082 463502;463503 591848;591849;591850;591851 591848 4 YNTDCVQGLTHSK Unmodified 1521.6882 0.68819127 1371 M0R116;P13637;A0A2R8YEY8;A0A0A0MT26;M0QXF2 ATP1A3 Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3 yes no 0 0 0 1 1 34.449 34.449 2 0.0032725 30179 QUIQUE_C1438_190116_001 71.896 54.871 145180000 0 0 0 65857000 79319000 0 0 0 0 0 0 0 0 51485 1371 48083 463504;463505 591852;591853 591853 2 YNTLPSR Unmodified 849.43447 0.43446642 3921 Q96PY5 FMNL2 Formin-like protein 2 yes yes 0 0 0 1 20.852 20.852 2 0.042446 13708 QUIQUE_C1403_190116_001 81.119 47.603 35620000 0 0 0 35620000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51486 3921 48084 463506 591854 591854 1 YNTPGFSGCLSGVR Unmodified 1513.6984 0.69836203 2807 P78357 CNTNAP1 Contactin-associated protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.888 77.888 2 0.0002983 79853 QUIQUE_C1438_190116_001 99.752 77.111 1055200000 0 0 110920000 122240000 105510000 80765000 151230000 68937000 93652000 0 126350000 67862000 127740000 51487 2807 48085 463507;463508;463509;463510;463511;463512;463513;463514;463515;463516 591855;591856;591857;591858;591859;591860;591861;591862;591863;591864;591865 591858 11 YNTSNFPIEAK Unmodified 1282.6194 0.61936665 4692 yes no 0 0 0 1 1 51.445 51.445 3 0.026067 47114 QUIQUE_DMIX4_190116_001 31.843 18.751 220080000 0 0 0 0 202660000 0 0 0 0 17418000 0 0 0 + 51488 4692 48086 463517;463518 591866;591867 591867 2 YNVLGAETVLNQMR Unmodified 1606.8137 0.81372614 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 117.77 117.77 2 4.7869E-07 123591 QUIQUE_DMIX5_190116_001 126.67 92.785 1726900000 332240000 339780000 0 0 0 0 0 217040000 195660000 0 225750000 230200000 186230000 51489 3208 48087 463519;463520;463521;463522;463523;463524;463525 591868;591869;591870;591871;591872;591873;591874 591872 7 YNVLGAETVLNQMR Oxidation (M) 1622.8086 0.80864076 3208 Q1KMD3;H3BQZ7 HNRNPUL2;HNRNPUL2-BSCL2 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like protein 2 yes no 0 1 0 1 1 1 1 93.085 93.085 2 0.00032502 95504 QUIQUE_C1277_190116_001 90.913 72.601 196840000 0 57070000 56761000 42492000 0 40513000 0 0 0 0 0 0 0 51490 3208 48087 463526;463527;463528;463529 591875;591876;591877;591878;591879;591880;591881 591876 2632 7 YNVSQLEEWLR Unmodified 1435.7096 0.70957864 4607 Q9Y4I1;A0A087WY00;G3V394;F8W6H6;F8WE88;E7ERV5 MYO5A Unconventional myosin-Va yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 135.53 135.53 2 5.2892E-08 142011 QUIQUE_C1438_190116_001 176.38 144.96 1121900000 98680000 101460000 108680000 0 111320000 84484000 143640000 0 91569000 59941000 141590000 95276000 85300000 51491 4607 48088 463530;463531;463532;463533;463534;463535;463536;463537;463538;463539;463540 591882;591883;591884;591885;591886;591887;591888;591889;591890;591891;591892;591893;591894 591886 12 YNVYPTYDFACPIVDSIEGVTHALR Unmodified 2899.3851 0.38507997 1929 P07814;V9GYZ6 EPRS Bifunctional glutamate/proline--tRNA ligase;Glutamate--tRNA ligase;Proline--tRNA ligase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 165.21 165.21 3 7.3556E-11 170086 QUIQUE_C1218_190116_001 80.683 74.803 799280000 73913000 92055000 0 113360000 0 81730000 149250000 123000000 0 0 0 0 165970000 51492 1929 48089 463541;463542;463543;463544;463545;463546;463547;463548 591895;591896;591897;591898;591899;591900;591901;591902;591903;591904 591895 9 YNWCYHTEVQR Unmodified 1554.6674 0.66739625 3643 Q8NE62;C9JYW4;C9J7D8 CHDH Choline dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 0 2 2 2 2 1 2 1 1 1 48.897 48.897 2;3 0.0010972 45822 QUIQUE_C1368_190116_001 90.15 63.036 379930000 49749000 39988000 85451000 35831000 24659000 58515000 40417000 0 0 22774000 22549000 0 0 51493 3643 48090 463549;463550;463551;463552;463553;463554;463555;463556;463557;463558;463559;463560;463561;463562 591905;591906;591907;591908;591909;591910;591911;591912;591913;591914;591915;591916;591917;591918 591910 14 YNYHLDSSGSYVFENTVATVMALR Unmodified 2736.2854 0.28536592 2533 P49588 AARS Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 157.47 157.47 3 3.0874E-19 162024 QUIQUE_DMIX3_190116_001 116.45 111.48 306740000 0 62240000 0 38067000 0 0 0 0 101220000 21448000 48177000 0 35593000 51494 2533 48091 463563;463564;463565;463566;463567;463568;463569 591919;591920;591921;591922;591923;591924;591925 591922 3 YNYIEGTK Unmodified 986.47091 0.4709115 3897 Q96KP4 CNDP2 Cytosolic non-specific dipeptidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 30.867 30.867 2 0.021054 25979 QUIQUE_DMIX1_190116_001 75.761 40.512 7887800000 716010000 0 0 911620000 761450000 759450000 0 928320000 1131700000 522430000 0 972070000 1184800000 51495 3897 48092 463570;463571;463572;463573;463574;463575;463576;463577;463578 591926;591927;591928;591929;591930;591931;591932;591933;591934 591930 6 YNYTSEEK Unmodified 1032.44 0.4400053 882;3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33;Q7L576 CYFIP2;CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2;Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 18.634 18.634 2 0.011168 11389 QUIQUE_DMIX7_190116_001 90.308 69.754 242810000 0 0 0 79912000 0 0 0 0 0 0 0 123000000 39901000 51496 292;882;3442 48093 463579;463580;463581 591935;591936;591937 591936 3 YPALHKPENQDIDWGALEGETR Unmodified 2538.2139 0.21391554 2066 P13796 LCP1 Plastin-2 yes yes 0 0 1 1 1 1 2 1 1 92.102 92.102 3;4 6.442E-11 93320 QUIQUE_C1403_190116_001 104.06 96.61 209180000 0 0 0 85029000 0 0 0 56540000 0 67607000 0 0 0 51497 2066 48094 463582;463583;463584;463585;463586;463587;463588 591938;591939;591940;591941;591942;591943;591944 591939 7 YPALTKPENQDIDWTLLEGETR Unmodified 2588.2758 0.27584709 181 A0A0A0MSQ0;P13797;H7C4N2 PLS3 Plastin-3 yes no 0 0 1 1 1 1 1 123.31 123.31 3 0.0042784 127366 QUIQUE_C1403_190116_001 45.885 33.757 260310000 0 0 0 56159000 79087000 0 71703000 0 0 0 0 0 53357000 51498 181 48095 463589;463590;463591;463592 591945;591946;591947;591948 591945 1 YPDQWIVPGGGMEPEEEPGGAAVR Unmodified 2540.1642 0.16418816 6;4349 A0A024RBG1;Q9NZJ9 NUDT4 Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 2 no no 0 0 0 1 121.83 121.83 3 0.00053022 125295 QUIQUE_C1403_190116_001 43.241 36.288 41176000 0 0 0 41176000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51499 6;4349 48096 463593 591949 591949 1 YPEAPPFVR Unmodified 1074.5498 0.54983053 1244 I3L0A0;Q13404;G3V2F7;A0A0A0MSL3 TMEM189-UBE2V1;UBE2V1 Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 71.247 71.247 2 1.8541E-06 71151 QUIQUE_C1368_190116_001 154.01 130.94 1823300000 0 0 357990000 0 0 0 327760000 331670000 343460000 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gamma-glutamyltransferase 4 yes no 0 0 0 1 13.543 13.543 2 0.054756 5555 QUIQUE_DMIX4_190116_001 49.423 10.205 7437500 0 0 0 0 0 0 0 0 0 7437500 0 0 0 51505 2190 48102 463621 591995 591995 1 YPENFFLLR Unmodified 1197.6182 0.61824444 2740;2739;1041 P62140;E7ETD8;C9J9S3;C9JP48;F8VYE8;P36873;F8VR82;F8W0W8;A0A087WYY5;P62136;E9PMD7 PPP1CB;PPP1CC;PPP1CA Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit;Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 121.59 121.59 2 0.0012418 127159 QUIQUE_C1218_190116_001 120.46 66.3 1570200000 148440000 140840000 160970000 150820000 136730000 170650000 161440000 54971000 86783000 67724000 137230000 61978000 91643000 51506 2740;1041;2739 48103 463622;463623;463624;463625;463626;463627;463628;463629;463630;463631;463632;463633;463634;463635;463636 591996;591997;591998;591999;592000;592001;592002;592003;592004;592005;592006;592007;592008;592009;592010;592011;592012;592013;592014;592015;592016;592017;592018;592019;592020;592021;592022;592023;592024 591996 28 YPEPMTPDTMIK Unmodified 1421.6571 0.65707407 1718 O95278;H0Y6I8;A0A1W2PPT8;H0Y7S8 EPM2A Laforin yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 82.316 82.316 2 0.0080519 83371 QUIQUE_DMIX8_190116_001 74.162 52.076 191020000 0 70528000 0 0 0 15672000 31323000 0 0 0 29503000 0 43999000 51507 1718 48104 463637;463638;463639;463640;463641;463642 592025;592026;592027;592028;592029;592030;592031 592031 6 YPESLRPAFPR Unmodified 1331.6986 0.69862003 1437 O14617;A0A2R8Y4J3;A0A087WYN6 AP3D1 AP-3 complex subunit delta-1 yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 59.311 59.311 3 0.0079561 58515 QUIQUE_DMIX1_190116_001 47.894 36.163 454740000 59011000 76453000 77787000 52148000 0 0 76670000 31680000 0 0 80987000 0 0 51508 1437 48105 463643;463644;463645;463646;463647;463648;463649 592032;592033;592034;592035;592036;592037;592038 592037 4 YPEWLQSHR Unmodified 1214.5833 0.58325592 2429 P40855;Q5QNY5;H0YJ60;H0YDY4;G3V3G9 PEX19 Peroxisomal biogenesis factor 19 yes no 0 0 0 1 1 1 51.284 51.284 3 0.012799 49163 QUIQUE_DMIX3_190116_001 44.863 34.34 51194000 0 0 19795000 0 0 22212000 0 0 9187500 0 0 0 0 51509 2429 48106 463650;463651;463652 592039;592040;592041 592041 2 YPFILPHQQVDK Unmodified 1483.7823 0.78234966 4486;485 A0A3B3IRV3;Q9ULC4 MCTS1 Malignant T-cell-amplified sequence 1 no no 0 0 0 1 2 1 1 1 1 67.656 67.656 2;3 0.0050549 68098 QUIQUE_C1438_190116_001 67.414 48.634 339670000 0 0 42147000 0 102750000 0 0 0 0 31685000 0 78867000 84216000 51510 485;4486 48107 463653;463654;463655;463656;463657;463658;463659 592042;592043;592044;592045;592046;592047;592048 592043 6 YPFIVTSDDGR Unmodified 1268.6037 0.60371659 2183 P21589;H0Y7R7 NT5E 5'-nucleotidase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 79.904 79.904 2 0.0016238 81021 QUIQUE_C1403_190116_001 101.65 69.712 123590000 0 0 41870000 0 0 29495000 36885000 0 0 15345000 0 0 0 51511 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140.59 504930000 46285000 94129000 91265000 67964000 0 57641000 0 0 0 33220000 52065000 26409000 35953000 51518 3012 48115 463714;463715;463716;463717;463718;463719;463720;463721;463722;463723;463724;463725 592111;592112;592113;592114;592115;592116;592117;592118;592119;592120;592121;592122;592123;592124;592125 592113 15 YPGYMNNDLIGLIASLIPTPR Oxidation (M) 2333.209 0.2089535 2209;4270 P23258;Q9NRH3 TUBG1;TUBG2 Tubulin gamma-1 chain;Tubulin gamma-2 chain no no 0 1 0 1 175.28 175.28 3 7.6791E-05 176605 QUIQUE_DMIX1_190116_001 63.69 52.701 10414000 0 0 0 0 0 0 0 10414000 0 0 0 0 0 51519 2209;4270 48116 463726 592126 592126 1568 1 YPGYMNNDLIGLIASLIPTPR Unmodified 2317.214 0.21403888 2209;4270 P23258;Q9NRH3 TUBG1;TUBG2 Tubulin gamma-1 chain;Tubulin gamma-2 chain no no 0 0 0 1 2 1 176.99 176.99 2;3 1.4332E-07 184015 QUIQUE_DMIX5_190116_001 90.316 81.497 64278000 0 0 0 0 0 0 0 0 14157000 0 45357000 0 4763400 51520 2209;4270 48116 463727;463728;463729;463730 592127;592128;592129;592130 592128 4 YPHLVAGALAASAPVLAVAGLGDSNQFFR Unmodified 2911.5345 0.53446182 4436 Q9UHL4 DPP7 Dipeptidyl peptidase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 160.92 160.92 3 4.2583E-45 166042 QUIQUE_C1368_190116_001 133.27 123.93 217080000 0 63223000 65990000 24888000 0 0 26173000 0 23363000 13448000 0 0 0 51521 4436 48117 463731;463732;463733;463734;463735;463736;463737 592131;592132;592133;592134;592135;592136;592137 592132 6 YPHYFPLLK Unmodified 1176.6332 0.63316622 2615 P52888;K7EP46 THOP1 Thimet oligopeptidase yes no 0 0 0 1 1 85.475 85.475 3 0.00092905 85759 QUIQUE_DMIX1_190116_001 79.906 65.7 28363000 0 0 0 0 0 0 0 17426000 0 10937000 0 0 0 51522 2615 48118 463738;463739 592138;592139;592140 592138 3 YPHYFPVMK Unmodified 1180.5739 0.57393679 4078 Q9BYT8;E9PCB6 NLN Neurolysin, mitochondrial yes no 0 0 0 1 63.355 63.355 3 0.026622 63007 QUIQUE_C1368_190116_001 51.066 36.128 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51523 4078 48119 463740 592141 592141 1 YPIEHGIITNWDDMEK Oxidation (M) 1975.8986 0.89857798 2792;2759;548 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592142;592143;592144;592145;592146;592147;592148;592149;592150;592151;592152;592153;592154;592155;592156;592157;592158;592159;592160;592161;592162;592163;592164;592165;592166;592167;592168;592169;592170;592171;592172;592173;592174;592175;592176;592177;592178;592179;592180;592181;592182;592183;592184;592185;592186;592187;592188;592189;592190;592191;592192;592193;592194;592195;592196;592197;592198;592199;592200;592201;592202;592203;592204;592205;592206;592207;592208;592209;592210;592211;592212;592213;592214;592215;592216;592217;592218;592219;592220;592221;592222;592223;592224;592225;592226;592227;592228;592229;592230;592231;592232;592233;592234;592235;592236;592237;592238;592239;592240;592241;592242;592243;592244;592245 592204 367;2190 100 YPIEHGIITNWDDMEK Unmodified 1959.9037 0.90366336 2792;2759;548 A6NL76;F8WB63;B8ZZJ2;P62736;P63267;C9JFL5;F6UVQ4;F6QUT6;P68032;P68133 ACTA1;ACTG2;ACTA2;ACTC1 Actin, aortic smooth muscle;Actin, gamma-enteric smooth muscle;Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 0 0 4 3 3 3 2 2 2 2 2 2 3 2 2 94.522 94.522 2;3 0 92232 QUIQUE_DMIX4_190116_001 280.57 255.1 365370000000 28279000000 29348000000 29038000000 32327000000 27215000000 28340000000 30321000000 24451000000 23947000000 12478000000 36305000000 29032000000 34290000000 51525 548;2759;2792 48120 463809;463810;463811;463812;463813;463814;463815;463816;463817;463818;463819;463820;463821;463822;463823;463824;463825;463826;463827;463828;463829;463830;463831;463832;463833;463834;463835;463836;463837;463838;463839;463840 592246;592247;592248;592249;592250;592251;592252;592253;592254;592255;592256;592257;592258;592259;592260;592261;592262;592263;592264;592265;592266;592267;592268;592269;592270;592271;592272;592273;592274;592275;592276;592277;592278;592279;592280;592281;592282;592283;592284;592285;592286;592287;592288;592289;592290;592291;592292;592293;592294;592295;592296;592297;592298;592299;592300;592301;592302;592303;592304;592305;592306;592307;592308;592309;592310;592311;592312;592313;592314;592315;592316;592317;592318;592319;592320;592321;592322;592323;592324;592325;592326;592327;592328;592329;592330;592331;592332;592333;592334;592335;592336;592337;592338;592339;592340;592341;592342;592343;592344;592345;592346;592347;592348;592349;592350;592351;592352;592353;592354;592355;592356;592357;592358;592359;592360;592361 592332 115 YPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELR Oxidation (M) 3472.6299 0.62989512 2792;548 A6NL76;P68032;P68133 ACTA1;ACTC1 Actin, alpha cardiac muscle 1;Actin, alpha skeletal muscle no no 0 1 1 3 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growth factor-related protein 2 no no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 3 2 2 135.62 135.62 2;3 5.332E-40 140687 QUIQUE_DMIX3_190116_001 132.84 115.35 3981000000 351590000 372750000 263980000 257830000 387990000 291480000 309670000 107230000 380170000 96726000 447190000 386720000 327730000 51528 0;3463 48122 463860;463861;463862;463863;463864;463865;463866;463867;463868;463869;463870;463871;463872;463873;463874;463875;463876;463877;463878;463879;463880;463881;463882;463883;463884;463885 592382;592383;592384;592385;592386;592387;592388;592389;592390;592391;592392;592393;592394;592395;592396;592397;592398;592399;592400;592401;592402;592403;592404;592405;592406;592407;592408;592409;592410;592411;592412;592413;592414;592415;592416;592417;592418;592419;592420 592408 39 YPIPPPDAK Unmodified 996.52803 0.52803245 2395;2875 Q02750;H3BRW9;P36507;G5E9C7;A0A1B0GUL7 MAP2K1;MAP2K2 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 1;Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 2 no no 0 0 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73.4 6701300000 740360000 576710000 756330000 660800000 491920000 486070000 845110000 462730000 757980000 257820000 0 665510000 0 51530 1436;3862 48124 463919;463920;463921;463922;463923;463924;463925;463926;463927;463928;463929 592462;592463;592464;592465;592466;592467;592468;592469;592470;592471;592472;592473;592474;592475;592476 592462 15 YPITQSR Unmodified 863.45012 0.45011648 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 1 1 18.86 18.86 2 0.019229 11822 QUIQUE_DMIX1_190116_001 113.1 59.548 353750000 0 0 0 0 0 0 0 194700000 159050000 0 0 0 0 51531 1436 48125 463930;463931 592477;592478 592477 2 YPITQSRPGCYGDR Unmodified 1668.7678 0.76783858 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 1 1 32.42 32.42 3 0.00013426 27354 QUIQUE_DMIX1_190116_001 78.814 55.929 86028000 0 0 0 0 0 0 0 86028000 0 0 0 0 0 51532 1436 48126 463932 592479 592479 1 YPIVTPSQR Unmodified 1059.5713 0.57129425 3862 Q96GW7;Q5T3I6 BCAN Brevican core protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 40.342 40.342 2 0.00045618 36775 QUIQUE_C1403_190116_001 125.25 75.126 6937200000 618210000 511990000 913280000 556420000 449190000 472580000 570600000 424940000 573120000 248910000 570900000 514840000 512210000 51533 3862 48127 463933;463934;463935;463936;463937;463938;463939;463940;463941;463942;463943;463944;463945 592480;592481;592482;592483;592484;592485;592486;592487;592488;592489;592490;592491;592492;592493;592494;592495;592496;592497;592498;592499;592500;592501;592502;592503;592504;592505;592506;592507;592508;592509;592510;592511;592512;592513;592514;592515 592490 36 YPLEEFVK Unmodified 1023.5277 0.5276981 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 90.867 90.867 2 0.053364 87573 QUIQUE_DMIX4_190116_001 71.296 50.814 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51534 1198 48128 463946 592516 592516 1 YPLESGVPLPSPMDLMYK Unmodified 2035.9999 0.99987193 4250 Q9NQ66;A0A087WT80;A0A087WW73;A0A1B0GWB6;A0A0D9SF51;A0A0D9SG17;H0YCJ2 PLCB1 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1;Phosphoinositide phospholipase C yes no 0 0 0 1 1 152.74 152.74 2 0.009062 158908 QUIQUE_C1576_190116_001 48.044 3.3534 85115000 0 0 0 0 0 0 36273000 0 0 0 48842000 0 0 51535 4250 48129 463947;463948 592517;592518 592517 2 YPLFEGQETGK Unmodified 1267.6085 0.60846762 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 0 1 1 1 61.191 61.191 2 0.0014333 60527 QUIQUE_C1218_190116_001 109.02 76.701 302040000 105610000 96432000 0 0 0 0 99998000 0 0 0 0 0 0 51536 2440 48130 463949;463950;463951 592519;592520;592521;592522 592520 3 YPLFEGQETGKK Unmodified 1395.7034 0.70343063 2440 P41250 GARS Glycine--tRNA ligase yes yes 0 0 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 37.917 37.917 2;3 0.00013564 34717 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.191 83.714 556580000 103230000 0 62102000 0 0 0 0 58909000 77291000 0 146820000 58291000 49938000 51537 2440 48131 463952;463953;463954;463955;463956;463957;463958;463959;463960;463961;463962 592523;592524;592525;592526;592527;592528;592529;592530;592531;592532;592533;592534 592528 11 YPLIIDPSGQATEFIMNEYK Unmodified 2328.1348 0.13478551 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 0 2 2 2 1 2 1 1 2 2 1 1 1 156.41 156.41 2;3 5.3931E-18 160613 QUIQUE_C1277_190116_001 127.79 113.11 687090000 0 45093000 118200000 61044000 27801000 82123000 68255000 43928000 75990000 37453000 53188000 41131000 32886000 51538 3053 48132 463963;463964;463965;463966;463967;463968;463969;463970;463971;463972;463973;463974;463975;463976;463977;463978;463979;463980 592535;592536;592537;592538;592539;592540;592541;592542;592543;592544;592545;592546;592547;592548;592549;592550;592551;592552;592553;592554;592555;592556;592557;592558;592559 592535 23 YPLIIDPSGQATEFIMNEYKDR Unmodified 2599.2628 0.26283957 3053 Q14204;A0A2R8Y706;A0A2R8YFZ7;A0A2R8Y5T0;A0A2R8Y6H2;H0YJ21 DYNC1H1 Cytoplasmic dynein 1 heavy chain 1 yes no 0 0 1 1 1 1 147.01 147.01 3 8.8643E-45 152447 QUIQUE_DMIX3_190116_001 121.26 109.3 443150000 0 0 0 0 32142000 0 0 0 224690000 0 186320000 0 0 51539 3053 48133 463981;463982;463983 592560;592561;592562;592563;592564 592562 5 YPLLLDNIAK Unmodified 1158.6649 0.66486028 4354 Q9NZN5;E9PMR6 ARHGEF12 Rho guanine nucleotide exchange factor 12 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 105.25 105.25 2 0.0014961 108311 QUIQUE_C1277_190116_001 96.948 75.411 357140000 38464000 35177000 50784000 38244000 0 24488000 37185000 33659000 39345000 20151000 0 0 39642000 51540 4354 48134 463984;463985;463986;463987;463988;463989;463990;463991;463992;463993 592565;592566;592567;592568;592569;592570;592571;592572;592573;592574;592575 592566 11 YPLLLESIIK Unmodified 1187.7166 0.7165615 1480 O15085 ARHGEF11 Rho guanine nucleotide exchange factor 11 yes yes 0 0 0 1 1 136.01 136.01 2 0.038373 140569 QUIQUE_C1277_190116_001 60.828 46.159 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51541 1480 48135 463994;463995 592576;592577 592576 2 YPLNCADPTSER Unmodified 1421.6245 0.62452839 2898 Q06124;A0A1W2PPU4 PTPN11 Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 45.764 45.764 2 6.2982E-07 43518 QUIQUE_DMIX5_190116_001 142.83 130.6 1464400000 114450000 121430000 137980000 125420000 122040000 130730000 149470000 40154000 101030000 38056000 117820000 128120000 137650000 51542 2898 48136 463996;463997;463998;463999;464000;464001;464002;464003;464004;464005;464006;464007;464008;464009 592578;592579;592580;592581;592582;592583;592584;592585;592586;592587;592588;592589;592590;592591;592592;592593;592594;592595;592596;592597 592594 20 YPLQLAELLK Unmodified 1186.6962 0.69616041 202;878 A0A1B0GTF0;A0A1B0GVC4;A0A1B0GV82;A0A1B0GVV2;A0A0A6YYB3;B1AMR4;A0A1B0GTC2;B1AMR3;A0A1B0GV84;A0A1B0GWI5;A0A0A6YYF8;O43307;H0YCT6;E9PFR9;J3KQJ8;A0A0A0MRY4;Q96N96;E7EV07 ARHGEF9;ARHGEF4;SPATA13 Rho guanine nucleotide exchange factor 9;Spermatogenesis-associated protein 13 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 128.36 128.36 2 0.0015194 134008 QUIQUE_C1218_190116_001 96.668 71.849 600930000 50339000 49286000 78044000 57266000 50439000 52608000 41444000 49172000 41751000 23976000 0 51989000 54613000 51543 202;878 48137 464010;464011;464012;464013;464014;464015;464016;464017;464018;464019;464020;464021 592598;592599;592600;592601;592602;592603;592604;592605;592606;592607;592608;592609 592598 12 YPMEHGIVK Unmodified 1072.5376 0.53755128 2716 P61163;R4GMT0;A0A1B0GVS3 ACTR1A Alpha-centractin yes no 0 0 0 1 28.505 28.505 3 0.067242 22325 QUIQUE_C1576_190116_001 26.045 8.5329 25154000 0 0 0 0 0 0 25154000 0 0 0 0 0 0 51544 2716 48138 464022 592610 592610 1 YPMEHGVVR Oxidation (M) 1102.523 0.52296385 2442 P42025 ACTR1B Beta-centractin yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 16.17 16.17 3 0.0051746 8292 QUIQUE_DMIX8_190116_001 64.04 47.837 257110000 33830000 0 0 0 36356000 0 38828000 0 0 0 77137000 0 70961000 51545 2442 48139 464023;464024;464025;464026;464027 592611;592612;592613;592614;592615 592615 1865 5 YPMEHGVVR Unmodified 1086.528 0.52804923 2442 P42025 ACTR1B Beta-centractin yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 23.695 23.695 3 0.012552 16833 QUIQUE_DMIX5_190116_001 45.368 30.699 221550000 45311000 0 0 34570000 34822000 20333000 27802000 0 0 0 31121000 0 27591000 51546 2442 48139 464028;464029;464030;464031;464032;464033;464034 592616;592617;592618;592619;592620;592621;592622;592623;592624;592625 592624 10 YPNAELAWCQEEHK Unmodified 1773.7781 0.77806891 2869;903 E9PCR7;E9PDF2;E9PFG7;Q02218;A0A0D9SFS3 OGDH 2-oxoglutarate dehydrogenase, mitochondrial no no 0 0 0 1 65.001 65.001 3 0.049313 60713 QUIQUE_DMIX4_190116_001 21.314 11.664 16199000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 16199000 0 0 0 51547 903;2869 48140 464035 592626 592626 1 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDAR Unmodified 2925.3702 0.37021776 2777 P63010;A0A087X253;A0A087WU93;A0A087WZQ6;A0A087WYD1;K7EJ01 AP2B1 AP-2 complex subunit beta yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 155.95 155.95 3 1.9275E-10 158499 QUIQUE_DMIX1_190116_001 80.132 69.521 836600000 0 0 94214000 0 0 0 123030000 167050000 129150000 0 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331960000 158610000 271580000 229060000 76964000 340870000 286960000 249540000 51551 2037 48144 464046;464047;464048;464049;464050;464051;464052;464053;464054;464055;464056 592642;592643;592644;592645;592646;592647;592648;592649;592650;592651;592652;592653;592654;592655;592656;592657;592658;592659;592660;592661 592642 20 YPQFISR Unmodified 909.47085 0.47085192 1198 H3BRN4;P80404;H3BNQ7 ABAT 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 54.427 54.427 2 0.019598 52321 QUIQUE_C1563_190116_001 110.9 72.531 5616400000 418120000 478460000 489600000 421390000 390170000 384000000 490090000 448000000 388360000 0 598080000 481700000 628420000 51552 1198 48145 464057;464058;464059;464060;464061;464062;464063;464064;464065;464066;464067;464068 592662;592663;592664;592665;592666;592667;592668;592669;592670;592671;592672;592673;592674;592675;592676;592677;592678;592679;592680;592681;592682;592683;592684;592685;592686;592687;592688;592689 592675 28 YPQLLPGIR Unmodified 1055.6128 0.61276513 2219 P23526 AHCY Adenosylhomocysteinase yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 2 1 1 1 1 92.589 92.589 2 0.00030436 95665 QUIQUE_DMIX5_190116_001 145.04 126.31 1355600000 132380000 122090000 141770000 0 140580000 108450000 0 109720000 135730000 51532000 146110000 119900000 147300000 51553 2219 48146 464069;464070;464071;464072;464073;464074;464075;464076;464077;464078;464079;464080;464081 592690;592691;592692;592693;592694;592695;592696;592697;592698;592699;592700;592701;592702;592703;592704;592705;592706;592707;592708;592709;592710;592711;592712;592713;592714;592715;592716;592717;592718;592719;592720;592721;592722;592723;592724;592725;592726;592727;592728;592729;592730;592731;592732;592733;592734;592735;592736;592737;592738;592739;592740 592729 51 YPSHSFIGEESVAAGEK Unmodified 1806.8424 0.84244331 2286 P29218;H0YBL1;E5RI82;E5RG94;E5RHE9;E5RIP7;E5RGY4;E5RIF4 IMPA1 Inositol monophosphatase 1 yes no 0 0 0 2 2 1 2 1 2 1 2 2 1 2 1 54.874 54.874 2;3 2.9938E-247 53847 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YPSPFFVFGEK Unmodified 1316.6441 0.64412484 2916 Q08211 DHX9 ATP-dependent RNA helicase A yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 131.67 131.67 2 0.001191 134835 QUIQUE_DMIX1_190116_001 88.681 66.444 657820000 59199000 69302000 33366000 41587000 56222000 43085000 41663000 51575000 54019000 21054000 64549000 63691000 58507000 51556 2916 48149 464146;464147;464148;464149;464150;464151;464152;464153;464154;464155;464156;464157;464158 592857;592858;592859;592860;592861;592862;592863;592864;592865;592866;592867;592868;592869;592870;592871;592872;592873;592874;592875;592876;592877;592878;592879;592880;592881;592882;592883;592884;592885;592886 592872 30 YPSPPMGSVSAPNLPTAEDNLEYVR Unmodified 2703.285 0.28503157 2480 P46109 CRKL Crk-like protein yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 126.28 126.28 3 0.00025415 128831 QUIQUE_C1563_190116_001 44.933 36.941 408030000 38626000 51386000 53099000 49901000 0 54919000 0 37742000 0 19544000 0 43679000 59132000 51557 2480 48150 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902 2 YQALLLQVLEQIK Unmodified 1557.913 0.91302948 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 162.62 162.62 2 0.001257 169758 QUIQUE_DMIX5_190116_001 80.979 73.422 66599000 0 0 22196000 0 0 0 0 9215200 0 0 35188000 0 0 51569 228 48161 464254;464255;464256 593002;593003;593004 593004 3 YQANNCPICR Unmodified 1294.5547 0.55467468 621 B4DR12;K7EIM7;K7EPJ5;O60291;A0A3B3ISM3;Q96PX1 MGRN1;RNF157 E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1;RING finger protein 157 yes no 0 0 0 1 22.83 22.83 2 0.01617 15936 QUIQUE_C1277_190116_001 83.206 34.109 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51570 621 48162 464257 593005 593005 1 YQASHPNLR Unmodified 1084.5414 0.5413911 1744 O95721;C9JAF7 SNAP29 Synaptosomal-associated protein 29;Synaptosomal-associated protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.409 14.409 3 0.0057048 6587 QUIQUE_C1438_190116_001 54.982 40.775 545710000 39583000 39311000 41036000 37108000 58786000 84528000 0 45438000 68048000 0 28916000 34029000 68927000 51571 1744 48163 464258;464259;464260;464261;464262;464263;464264;464265;464266;464267;464268 593006;593007;593008;593009;593010;593011;593012;593013;593014;593015;593016 593010 11 YQASTSNTVSK Unmodified 1184.5673 0.56733108 1751 O95810 SDPR Serum deprivation-response protein yes yes 0 0 0 1 13.355 13.355 2 0.00046277 5363 QUIQUE_DMIX4_190116_001 105.98 78.838 8466200 0 0 0 0 0 0 0 0 0 8466200 0 0 0 51572 1751 48164 464269 593017 593017 1 YQAVQEAVEDR Unmodified 1306.6153 0.61534391 2486 P46939 UTRN Utrophin yes yes 0 0 0 1 41.395 41.395 2 0.0029139 35827 QUIQUE_DMIX4_190116_001 75.387 64.558 17771000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 17771000 0 0 0 51573 2486 48165 464270 593018 593018 1 YQCHEEGLVPSK Unmodified 1445.6609 0.66091389 2665 P55268 LAMB2 Laminin subunit beta-2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 23.808 23.808 2 0.0010778 18112 QUIQUE_C1218_190116_001 92.247 71.546 34986000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34986000 0 51574 2665 48166 464271;464272;464273;464274;464275 593019;593020;593021;593022;593023 593019 5 YQCNEGFAQHHVATIR Unmodified 1929.8904 0.89041333 1436 O14594 NCAN Neurocan core protein yes yes 0 0 0 2 1 2 2 2 2 3 1 1 3 2 1 30.211 30.211 2;3;4 7.7059E-19 25011 QUIQUE_C1576_190116_001 144.27 129.29 4263300000 376770000 213120000 419760000 503340000 476730000 348310000 771240000 65081000 113970000 0 456250000 389190000 129530000 51575 1436 48167 464276;464277;464278;464279;464280;464281;464282;464283;464284;464285;464286;464287;464288;464289;464290;464291;464292;464293;464294;464295;464296;464297 593024;593025;593026;593027;593028;593029;593030;593031;593032;593033;593034;593035;593036;593037;593038;593039;593040;593041;593042;593043;593044;593045;593046;593047;593048;593049;593050 593039 25 YQDDFLLDESECR Unmodified 1688.6988 0.69881554 1478;3342 O15075;Q5VZY9 DCLK1 Serine/threonine-protein kinase DCLK1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 99.704 99.704 2 8.0082E-05 103556 QUIQUE_C1576_190116_001 119.03 101.59 1201000000 78807000 112440000 96368000 183240000 67371000 115590000 137430000 68777000 75206000 35008000 91509000 0 139240000 51576 1478;3342 48168 464298;464299;464300;464301;464302;464303;464304;464305;464306;464307;464308;464309 593051;593052;593053;593054;593055;593056;593057;593058;593059;593060;593061;593062;593063;593064;593065 593058 15 YQDEDAPHDHSLPR Unmodified 1678.7336 0.73356156 655 B7Z2T4;E9PN83;A0A3B3ISW2;A0A3B3ITF1;Q15700;E9PIJ9 DLG2 Disks large homolog 2 yes no 0 0 0 1 21.024 21.024 4 0.017039 13976 QUIQUE_C1218_190116_001 38.511 35.672 25797000 25797000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51577 655 48169 464310 593066 593066 1 YQDILVFR Unmodified 1052.5655 0.56548059 2150 P19623;K7EKM4 SRM Spermidine synthase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 95.34 95.34 2 0.0036374 97273 QUIQUE_C1403_190116_001 145.04 102.04 2046200000 182270000 182220000 184090000 122000000 155010000 144910000 147890000 130880000 134050000 54145000 248820000 181280000 178660000 51578 2150 48170 464311;464312;464313;464314;464315;464316;464317;464318;464319;464320;464321;464322;464323 593067;593068;593069;593070;593071;593072;593073;593074;593075;593076;593077;593078;593079;593080;593081;593082 593072 15 YQDLGAYSSAR Unmodified 1229.5677 0.56766543 1767 O96000;H3BPJ9 NDUFB10 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 10 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.513 43.513 2 0.00023219 40736 QUIQUE_C1576_190116_001 121.73 99.602 4125700000 347400000 403500000 328670000 321970000 323380000 299550000 290910000 341240000 358820000 156950000 349470000 375130000 228720000 51579 1767 48171 464324;464325;464326;464327;464328;464329;464330;464331;464332;464333;464334;464335;464336 593083;593084;593085;593086;593087;593088;593089;593090;593091;593092;593093;593094;593095;593096;593097;593098 593091 10 YQDLYTVEPNNAR Unmodified 1581.7423 0.74233534 2640 P54289;E7ERK3 CACNA2D1 Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1;Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2-1;Voltage-dependent calcium channel subunit delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 61.212 61.212 2 1.5035E-24 56784 QUIQUE_DMIX4_190116_001 176.95 143.06 80599000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 80599000 0 0 0 51580 2640 48172 464337;464338;464339 593099;593100;593101 593100 3 YQDSLQSISTK Unmodified 1268.6248 0.62484596 228 A0A0C4DG40;Q8NF91;E7ENN3;F5H6R8 SYNE1 Nesprin-1 yes no 0 0 0 1 45.497 45.497 2 0.0099148 42437 QUIQUE_C1218_190116_001 62.78 38.625 42173000 42173000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51581 228 48173 464340 593102 593102 1 YQDVDSETFISTR Unmodified 1559.7104 0.71036651 3557 Q8IYQ7 THNSL1 Threonine synthase-like 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 75.321 75.321 2 0.00038383 74894 QUIQUE_C1563_190116_001 108.7 82.313 259110000 0 0 41394000 24075000 0 28102000 35195000 0 45096000 0 57952000 27299000 0 51582 3557 48174 464341;464342;464343;464344;464345;464346;464347;464348;464349 593103;593104;593105;593106;593107;593108;593109;593110;593111 593107 7 YQEAAPNVANNTGPHAASCFGAK Unmodified 2374.076 0.07604185 759 C9JZR2;O60716 CTNND1 Catenin delta-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 49.818 49.818 3 5.1906E-11 47870 QUIQUE_DMIX5_190116_001 88.976 80.496 290620000 27494000 42667000 0 45834000 50565000 0 35177000 0 0 0 44967000 0 43913000 51583 759 48175 464350;464351;464352;464353;464354;464355;464356 593112;593113;593114;593115;593116;593117;593118 593117 6 YQEAEPGPLGSAVGSQR Unmodified 1744.838 0.83802663 730 C9JJX6;E9PDC3;O00192 ARVCF Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome yes no 0 0 0 1 1 58.735 58.735 2 1.6921E-12 58121 QUIQUE_C1576_190116_001 124.3 110.49 69597000 0 0 0 0 0 28142000 41455000 0 0 0 0 0 0 51584 730 48176 464357;464358 593119;593120 593120 2 YQEALHLGSQLLR Unmodified 1526.8205 0.82052608 1388 O00231 PSMD11 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 11 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 2 79.345 79.345 2;3 0.00011285 80003 QUIQUE_C1403_190116_001 72.815 61.58 2311900000 233470000 232750000 263060000 151120000 173230000 176440000 232690000 177540000 185380000 21302000 138690000 107650000 218600000 51585 1388 48177 464359;464360;464361;464362;464363;464364;464365;464366;464367;464368;464369;464370;464371;464372;464373;464374;464375;464376;464377;464378;464379;464380;464381 593121;593122;593123;593124;593125;593126;593127;593128;593129;593130;593131;593132;593133;593134;593135;593136;593137;593138;593139;593140;593141;593142;593143;593144;593145;593146;593147 593129 25 YQEDPPAPQPK Unmodified 1268.6037 0.60371659 345 A0A3B3ITE1;A0A1B0GTW1;A0A2R8YDH4;Q9UDY2;A0A3B3IRI3;A0A3B3ISZ5;A0A3B3IU51;A0A3B3ISF1;A0A3B3IRV6;A0A3B3IT83;A0A3B3IS03 TJP2 Tight junction protein ZO-2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 22.982 22.982 2 0.0005713 15974 QUIQUE_DMIX8_190116_001 100.02 84.866 289240000 0 0 0 70340000 0 0 60889000 49544000 0 0 0 0 108470000 51586 345 48178 464382;464383;464384;464385 593148;593149;593150;593151 593151 4 YQEGGVESAFHK Unmodified 1350.6204 0.62042929 2421 P40121;E7ENU9;B8ZZL6 CAPG Macrophage-capping protein yes no 0 0 0 1 1 2 1 2 1 1 1 2 2 1 2 32.311 32.311 2;3 0.00052804 26625 QUIQUE_C1368_190116_001 98.943 89.984 6780700000 236800000 162370000 1235500000 166640000 748440000 177270000 233010000 214200000 1033200000 0 1286100000 236160000 1051000000 51587 2421 48179 464386;464387;464388;464389;464390;464391;464392;464393;464394;464395;464396;464397;464398;464399;464400;464401;464402 593152;593153;593154;593155;593156;593157;593158;593159;593160;593161;593162;593163;593164;593165;593166;593167;593168;593169 593155 16 YQEGPDAER Unmodified 1063.4571 0.45705235 177 A0A0A0MSK4;A0A0A0MRC4;Q86YR5 GPSM1 G-protein-signaling modulator 1 yes no 0 0 0 1 15.79 15.79 2 0.042881 7965 QUIQUE_C1218_190116_001 52.716 30.028 17005000 17005000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51588 177 48180 464403 593170 593170 1 YQELINDIAR Unmodified 1233.6354 0.63535107 2487 P46940;H0YLE8 IQGAP1 Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1 yes no 0 0 0 1 1 75.979 75.979 2 0.0014448 76398 QUIQUE_C1403_190116_001 97.565 33.301 90160000 0 0 36108000 54052000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51589 2487 48181 464404;464405 593171;593172 593172 2 YQELPNSGPPHDR Unmodified 1508.7008 0.70080487 2149 P19525;C9JZT2;F8WBH4 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes no 0 0 0 1 1 2 1 24.849 24.849 3 0.002252 17926 QUIQUE_DMIX8_190116_001 50.843 37.254 189980000 33441000 0 0 0 0 0 0 0 0 27450000 0 47836000 81253000 51590 2149 48182 464406;464407;464408;464409;464410 593173;593174;593175;593176;593177 593177 5 YQELPNSGPPHDRR Unmodified 1664.8019 0.8019159 2149 P19525;C9JZT2;F8WBH4 EIF2AK2 Interferon-induced, double-stranded RNA-activated protein kinase yes no 0 0 1 2 1 18.878 18.878 3;4 2.7805E-05 11592 QUIQUE_DMIX5_190116_001 93.494 54.695 182260000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 135170000 0 47088000 51591 2149 48183 464411;464412;464413 593178;593179;593180 593178 2 YQEQGGEASPQR Unmodified 1348.6008 0.60075648 4460 Q9UJU6;H0Y5J4 DBNL Drebrin-like protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.161 14.161 2 1.3177E-09 5819 QUIQUE_C1563_190116_001 153.12 98.962 945100000 0 83887000 0 95530000 125090000 207340000 0 76129000 0 23472000 84446000 93039000 156180000 51592 4460 48184 464414;464415;464416;464417;464418;464419;464420;464421;464422 593181;593182;593183;593184;593185;593186;593187;593188;593189 593184 9 YQEQGGEASPQSR Unmodified 1435.6328 0.63278489 605 B4DDD6 DBNL yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 14.637 14.637 2 4.0367E-41 6063 QUIQUE_C1563_190116_001 189.58 173.92 569180000 34431000 44811000 44463000 37895000 60771000 57589000 41090000 44276000 54544000 12523000 68331000 0 68457000 51593 605 48185 464423;464424;464425;464426;464427;464428;464429;464430;464431;464432;464433;464434 593190;593191;593192;593193;593194;593195;593196;593197;593198;593199;593200;593201 593195 12 YQEQLLDR Unmodified 1063.5298 0.52982336 1254 I3L4G8;I3L4A1;Q96FZ7 CHMP6 Charged multivesicular body protein 6 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 42.277 42.277 2 0.0089766 38884 QUIQUE_C1368_190116_001 93.195 30.537 386550000 0 0 98106000 0 71952000 85741000 130750000 0 0 0 0 0 0 51594 1254 48186 464435;464436;464437;464438;464439 593202;593203;593204;593205;593206 593202 5 YQETFNVIER Unmodified 1297.6303 0.63026569 2959 Q13011;M0R248;M0QZW4 ECH1 Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 70.286 70.286 2 1.8307E-11 70173 QUIQUE_DMIX3_190116_001 161.92 136.99 5221600000 348470000 370880000 485130000 352770000 435330000 363120000 401370000 314380000 485550000 119530000 557850000 491000000 496260000 51595 2959 48187 464440;464441;464442;464443;464444;464445;464446;464447;464448;464449;464450;464451;464452 593207;593208;593209;593210;593211;593212;593213;593214;593215;593216;593217;593218;593219;593220;593221;593222 593217 14 YQEVQAAQK Unmodified 1063.5298 0.52982336 4661 Q9Y6N6 LAMC3 Laminin subunit gamma-3 yes yes 0 0 0 1 1 50.612 50.612 2 0.04786 39916 QUIQUE_C1218_190116_001 51.335 6.9583 114490000 83387000 0 0 31104000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51596 4661 48188 464453;464454 593223;593224 593223 2 YQEVTNNLEFAK Unmodified 1454.7042 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2 127.48 127.48 2;3 2.8218E-17 133297 QUIQUE_DMIX5_190116_001 135.45 129.61 3021600000 154850000 299350000 194530000 231650000 224310000 159420000 231010000 209710000 251380000 84968000 398500000 335480000 246400000 51644 2596 48236 464782;464783;464784;464785;464786;464787;464788;464789;464790;464791;464792;464793;464794;464795;464796;464797;464798;464799;464800;464801;464802;464803;464804;464805 593629;593630;593631;593632;593633;593634;593635;593636;593637;593638;593639;593640;593641;593642;593643;593644;593645;593646;593647;593648;593649;593650;593651;593652;593653;593654;593655;593656;593657;593658;593659;593660;593661;593662;593663 593655 33 YQVLLDGLVLQGLYQLLEPR Unmodified 2329.3046 0.30456845 2397 P36543;C9J8H1 ATP6V1E1 V-type proton ATPase subunit E 1 yes no 0 0 0 1 1 2 1 1 176.48 176.48 2;3 1.4547E-43 183486 QUIQUE_DMIX5_190116_001 150.98 142.49 479610000 0 0 0 0 0 0 10831000 0 46674000 0 273030000 121930000 27148000 51645 2397 48237 464806;464807;464808;464809;464810;464811 593664;593665;593666;593667;593668;593669;593670 593668 4 YQVSAQGIQSTPLNLAVNWR Unmodified 2244.1651 0.16511485 3996 Q9BQI5;Q6ZV33 SGIP1 SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 2 1 133.9 133.9 2;3 6.5102E-65 138094 QUIQUE_DMIX7_190116_001 216.37 196.79 294740000 0 55166000 0 0 0 0 0 65736000 40445000 0 35567000 59986000 37837000 51646 3996 48238 464812;464813;464814;464815;464816;464817;464818;464819;464820;464821;464822 593671;593672;593673;593674;593675;593676;593677;593678;593679;593680;593681;593682 593680 12 YQYAELGK Unmodified 970.476 0.47599688 3777;1414 O00507;Q93008 USP9Y;USP9X Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y;Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X no no 0 0 0 1 1 1 1 38.927 38.927 2 0.026319 35634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 70.69 46.491 232930000 0 0 0 49399000 0 0 0 56940000 77183000 0 49410000 0 0 51647 1414;3777 48239 464823;464824;464825;464826 593683;593684;593685;593686 593684 4 YQYGGLNSGRPVTPPR Unmodified 1760.8958 0.89581629 2740 P62140 PPP1CB Serine/threonine-protein phosphatase PP1-beta catalytic subunit yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 46.965 46.965 3 1.5414E-09 44609 QUIQUE_C1438_190116_001 87.566 75.65 1305500000 105640000 59607000 37707000 58441000 0 0 80529000 230860000 212230000 0 160770000 148320000 211350000 51648 2740 48240 464827;464828;464829;464830;464831;464832;464833;464834;464835;464836;464837 593687;593688;593689;593690;593691;593692;593693;593694;593695;593696;593697;593698;593699;593700;593701;593702;593703 593691 17 YRADTLGELDLER Unmodified 1549.7736 0.77363546 3487;98 A0A087X0W7;A0A087WT95;P49753;Q86TX2;G3V4F2 ACOT2;ACOT1 Acyl-coenzyme A thioesterase 2, mitochondrial;Acyl-coenzyme A thioesterase 1 no no 0 0 1 1 1 75.579 75.579 3 0.03329 76744 QUIQUE_DMIX5_190116_001 35.816 22.414 169630000 0 0 0 0 0 0 0 130750000 0 0 38878000 0 0 51649 98;3487 48241 464838;464839 593704;593705 593705 2 YRDCLTESNLIK Unmodified 1510.745 0.74497787 2190 P21980 TGM2 Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 2 yes yes 0 0 1 1 53.276 53.276 2 0.033812 50995 QUIQUE_DMIX1_190116_001 67.08 14.501 65792000 0 0 0 0 0 0 0 65792000 0 0 0 0 0 51650 2190 48242 464840 593706 593706 1 YRDLDEDEILGALTEEELR Unmodified 2278.0965 0.096485745 2279 P28289 TMOD1 Tropomodulin-1 yes yes 0 0 1 1 1 1 139.13 139.13 2;3 0.00033306 146091 QUIQUE_DMIX5_190116_001 111.74 99.38 193010000 0 69252000 0 0 0 0 0 0 0 0 40504000 0 83257000 51651 2279 48243 464841;464842;464843 593707;593708;593709 593708 1 YRDPTTVTTLR Unmodified 1321.699 0.69901396 2781 P63151 PPP2R2A Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B alpha isoform yes yes 0 0 1 1 1 2 2 37.493 37.493 2;3 0.0064935 33700 QUIQUE_DMIX1_190116_001 112.89 72.542 408850000 53722000 0 78054000 0 0 0 0 141470000 0 0 0 135600000 0 51652 2781 48244 464844;464845;464846;464847;464848;464849 593710;593711;593712;593713;593714;593715 593713 3 YREDHADSASAYADEVKK Unmodified 2053.9341 0.93411186 3666 Q8TBG4;E7ENR6 ETNPPL Ethanolamine-phosphate phospho-lyase yes no 0 0 2 1 23.517 23.517 4 0.0091905 17103 QUIQUE_DMIX7_190116_001 43.955 34.584 65486000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 65486000 0 51653 3666 48245 464850 593716 593716 1 YREDIINVR Unmodified 1176.6251 0.62512073 3125 Q15276 RABEP1 Rab GTPase-binding effector protein 1 yes yes 0 0 1 1 1 1 42.952 42.952 3 0.0053871 39633 QUIQUE_DMIX1_190116_001 65.404 54.618 104760000 35299000 46473000 0 0 0 0 0 22992000 0 0 0 0 0 51654 3125 48246 464851;464852;464853 593717;593718;593719 593719 3 YREWHHFLVVNMK Oxidation (M) 1773.8773 0.87732945 2307 P30086 PEBP1 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide yes yes 0 1 1 3 3 3 1 1 2 3 3 3 1 3 44.147 44.147 2;3;4 1.6587E-11 40840 QUIQUE_C1576_190116_001 150.46 93.909 8996600000 252510000 390590000 1281200000 71787000 45792000 0 1176800000 1035600000 1598000000 0 1694800000 115100000 1334500000 51655 2307 48247 464854;464855;464856;464857;464858;464859;464860;464861;464862;464863;464864;464865;464866;464867;464868;464869;464870;464871;464872;464873;464874;464875;464876;464877;464878;464879 593720;593721;593722;593723;593724;593725;593726;593727;593728;593729;593730;593731;593732;593733;593734;593735;593736;593737;593738;593739;593740;593741;593742;593743;593744;593745;593746;593747;593748;593749;593750;593751 593733 1693 30 YREWHHFLVVNMK Unmodified 1757.8824 0.88241483 2307 P30086 PEBP1 Phosphatidylethanolamine-binding protein 1;Hippocampal cholinergic neurostimulating peptide yes yes 0 0 1 1 2 2 2 1 1 2 4 3 1 5 4 3 61.029 61.029 2;3;4;5 1.1778E-52 59640 QUIQUE_DMIX3_190116_001 231.42 199.99 18824000000 41991000 206860000 230960000 184650000 124180000 59440000 341500000 2567100000 3055700000 62397000 4982200000 4814500000 2153000000 51656 2307 48247 464880;464881;464882;464883;464884;464885;464886;464887;464888;464889;464890;464891;464892;464893;464894;464895;464896;464897;464898;464899;464900;464901;464902;464903;464904;464905;464906;464907;464908;464909;464910 593752;593753;593754;593755;593756;593757;593758;593759;593760;593761;593762;593763;593764;593765;593766;593767;593768;593769;593770;593771;593772;593773;593774;593775;593776;593777;593778;593779;593780;593781;593782;593783;593784;593785;593786;593787;593788;593789;593790;593791;593792;593793;593794;593795;593796;593797;593798;593799;593800;593801;593802;593803;593804 593777 52 YREYQWIGLNDR Unmodified 1611.7794 0.77938954 3862 Q96GW7 BCAN Brevican core protein yes yes 0 0 1 2 2 1 2 77.719 77.719 2;3 1.8341E-36 78817 QUIQUE_DMIX5_190116_001 188.91 163.21 891140000 0 0 0 0 0 0 0 266570000 235640000 0 143040000 245900000 0 51657 3862 48248 464911;464912;464913;464914;464915;464916;464917 593805;593806;593807;593808;593809;593810;593811;593812;593813;593814 593812 9 YRFEIAAEK Unmodified 1125.5819 0.58185893 3850 Q96FC7 PHYHIPL Phytanoyl-CoA hydroxylase-interacting protein-like yes yes 0 0 1 1 41.1 41.1 3 0.051149 38021 QUIQUE_DMIX8_190116_001 68.657 55.39 60871000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60871000 51658 3850 48249 464918 593815 593815 0 YRGEYKDNALLAQLIQDK Unmodified 2137.1168 0.11676768 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 2 1 1 2 2 2 1 92.418 92.418 2;3;4 2.07E-29 95742 QUIQUE_DMIX5_190116_001 153.24 132.81 764540000 0 0 0 0 20266000 0 0 93792000 147710000 0 195250000 243800000 63722000 51659 273;342 48250 464919;464920;464921;464922;464923;464924;464925;464926;464927 593816;593817;593818;593819;593820;593821;593822;593823;593824 593821 7 YRGPGIFEDLQNYILEK Unmodified 2054.0473 0.047291129 4131 Q9H1E5 TMX4 Thioredoxin-related transmembrane protein 4 yes yes 0 0 1 1 1 141.32 141.32 3 0.00046401 146804 QUIQUE_DMIX3_190116_001 61.477 46.284 66116000 0 0 0 0 0 0 0 0 26592000 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593828;593829;593830;593831;593832;593833;593834;593835;593836;593837;593838;593839;593840;593841;593842;593843;593844;593845;593846;593847;593848;593849;593850;593851;593852;593853;593854;593855;593856;593857;593858;593859;593860;593861;593862;593863;593864;593865;593866;593867;593868;593869 593847 41 YRLPPGVDPAAVTSALSPEGVLSIQAAPASAQAPPPAAAK Unmodified 3836.0472 0.047238134 1433 O14558 HSPB6 Heat shock protein beta-6 yes yes 0 0 1 1 141.6 141.6 3 0.0017373 146805 QUIQUE_DMIX3_190116_001 35.33 31.408 36145000 0 0 0 0 0 0 0 0 36145000 0 0 0 0 51663 1433 48254 464954 593870 593870 1 YRPENTPEPVSTSVSHYGAEPTTVSPCPSSSAK Unmodified 3518.626 0.62599153 1305 J3QRU1;P07947 YES1 Non-specific protein-tyrosine kinase;Tyrosine-protein kinase Yes yes no 0 0 1 1 61.864 61.864 4 0.0012905 60198 QUIQUE_C1563_190116_001 29.385 22.892 45542000 0 0 0 0 0 45542000 0 0 0 0 0 0 0 51664 1305 48255 464955 593871;593872 593872 2 YRPLFDYFLK Unmodified 1360.718 0.71795849 2441 P41252;A0A0A0MSX9;J3KR24;Q5TCD1 IARS Isoleucine--tRNA ligase, cytoplasmic yes no 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 119.57 119.57 3 0.0015337 125109 QUIQUE_C1218_190116_001 74.841 62.628 249610000 13114000 27008000 24081000 18917000 0 17411000 20307000 16385000 23528000 7335400 32957000 23503000 25067000 51665 2441 48256 464956;464957;464958;464959;464960;464961;464962;464963;464964;464965;464966;464967;464968 593873;593874;593875;593876;593877;593878;593879;593880;593881;593882;593883;593884;593885;593886;593887 593874 15 YRPLILDQWQHVELSDGTAHTITDAYAGK Unmodified 3297.6418 0.64184002 2257 P26992 CNTFR Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha yes yes 0 0 1 2 2 2 2 1 1 3 2 2 1 4 2 2 116.82 116.82 3;4;5 7.2279E-93 122185 QUIQUE_C1218_190116_001 170.44 160.55 3305500000 161610000 215470000 252930000 248360000 201940000 77324000 440220000 241370000 385670000 42697000 501510000 274340000 262060000 51666 2257 48257 464969;464970;464971;464972;464973;464974;464975;464976;464977;464978;464979;464980;464981;464982;464983;464984;464985;464986;464987;464988;464989;464990;464991;464992;464993;464994 593888;593889;593890;593891;593892;593893;593894;593895;593896;593897;593898;593899;593900;593901;593902;593903;593904;593905;593906;593907;593908;593909;593910;593911;593912;593913;593914;593915;593916;593917;593918;593919 593889 29 YRPPPQTNLLAPK Unmodified 1493.8354 0.83544786 3060 Q14289 PTK2B Protein-tyrosine kinase 2-beta yes yes 0 0 1 1 1 1 1 46.027 46.027 3 0.003371 42349 QUIQUE_C1368_190116_001 48.277 36.486 78373000 0 0 35976000 22864000 0 0 0 19534000 0 0 0 0 0 51667 3060 48258 464995;464996;464997;464998 593920;593921;593922;593923 593920 4 YRPTIEMER Unmodified 1193.5863 0.58629239 165 A0A0A0MS47;Q96PE5;A0A0A0MTN4 OPALIN Opalin yes no 0 0 1 1 32.224 32.224 3 0.013696 27160 QUIQUE_C1218_190116_001 62.823 37.585 64668000 64668000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51668 165 48259 464999 593924 593924 1 YRQENQEAVGGFFSQIGELYVVHHLWAYK Unmodified 3467.7051 0.70510897 3985 Q9BPW8 NIPSNAP1 Protein NipSnap homolog 1 yes yes 0 0 1 2 3 145.3 145.3 3;4;5 4.1953E-38 150139 QUIQUE_DMIX7_190116_001 130.15 124.55 664140000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 276960000 387180000 0 51669 3985 48260 465000;465001;465002;465003;465004 593925;593926;593927;593928;593929;593930;593931 593931 7 YRVPDVLVADPPIAR Unmodified 1679.9359 0.93589019 3084 Q14697;F5H6X6 GANAB Neutral alpha-glucosidase AB yes no 0 0 1 2 2 2 1 2 1 2 2 2 2 1 1 94.283 94.283 2;3 9.9945E-06 96285 QUIQUE_C1368_190116_001 76.391 70.496 2206000000 187800000 186460000 179450000 124010000 239200000 103060000 218190000 146080000 176260000 0 300000000 158760000 186780000 51670 3084 48261 465005;465006;465007;465008;465009;465010;465011;465012;465013;465014;465015;465016;465017;465018;465019;465020;465021;465022;465023;465024 593932;593933;593934;593935;593936;593937;593938;593939;593940;593941;593942;593943;593944;593945;593946;593947;593948;593949;593950;593951;593952;593953;593954;593955;593956;593957;593958;593959;593960 593936 29 YSAELHVAHWNSAK Unmodified 1611.7794 0.77938954 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RIF9;E5RG43;E5RFE7;H0YBE2 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 3 2 2 2 1 1 4 3 2 37.947 37.947 2;3;4 1.4872E-21 33605 QUIQUE_C1277_190116_001 172.13 148.98 4127700000 95388000 77816000 168900000 481320000 586220000 233020000 167440000 105860000 27985000 157390000 1288000000 738290000 0 51671 1795 48262 465025;465026;465027;465028;465029;465030;465031;465032;465033;465034;465035;465036;465037;465038;465039;465040;465041;465042;465043;465044;465045;465046;465047 593961;593962;593963;593964;593965;593966;593967;593968;593969;593970;593971;593972;593973;593974;593975;593976;593977;593978;593979;593980;593981;593982;593983;593984 593962 21 YSALFLGVAYGATR Unmodified 1487.7773 0.77726428 2679 P56385 ATP5I ATP synthase subunit e, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 1 2 1 120.7 120.7 2;3 7.1552E-14 126718 QUIQUE_DMIX5_190116_001 141.71 120.14 554430000 0 66110000 0 0 0 0 0 119610000 0 0 120960000 137270000 110480000 51672 2679 48263 465048;465049;465050;465051;465052;465053;465054;465055;465056;465057;465058 593985;593986;593987;593988;593989;593990;593991;593992;593993;593994;593995;593996;593997;593998;593999;594000 593994 16 YSAPANLYVR Unmodified 1152.5928 0.59275797 987;1998 P10586;A2A437;Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRF;PTPRD Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F;Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta no no 0 0 0 1 1 60.538 60.538 2 0.020651 56059 QUIQUE_DMIX4_190116_001 59.245 41.336 40842000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 40842000 0 0 0 51673 1998;987 48264 465059;465060 594001;594002 594002 2 YSAQTDITDDSLDR Unmodified 1598.706 0.70600941 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 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594226;594227;594228;594229;594230;594231;594232;594233;594234;594235;594236;594237;594238;594239 594236 13 YSEKEDKYEEEIK Unmodified 1688.7781 0.77811172 435;2791 A0A2R8Y5V9;A0A2R8YH90;K7EMU5;P67936;A0A2R8YE05;K7ENT6;K7EPB9 TPM4 Tropomyosin alpha-4 chain no no 0 0 2 2 2 3 2 2 2 2 1 3 2 2 2 2 23.43 23.43 2;3;4 5.7228E-178 16892 QUIQUE_DMIX3_190116_001 274 231.28 6147800000 461560000 392800000 934210000 527870000 743030000 278300000 586260000 183890000 537040000 113200000 445470000 485770000 458420000 51698 435;2791 48288 465271;465272;465273;465274;465275;465276;465277;465278;465279;465280;465281;465282;465283;465284;465285;465286;465287;465288;465289;465290;465291;465292;465293;465294;465295;465296;465297 594240;594241;594242;594243;594244;594245;594246;594247;594248;594249;594250;594251;594252;594253;594254;594255;594256;594257;594258;594259;594260;594261;594262;594263;594264;594265;594266;594267;594268;594269;594270;594271 594261 30 YSELTTVQQQLIR Unmodified 1577.8413 0.8413211 1534 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protein 2 yes yes 0 0 1 1 154.72 154.72 3 0.0025098 162400 QUIQUE_DMIX5_190116_001 56.215 51.213 35812000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 35812000 0 0 51703 4287 48293 465335 594311 594311 1 YSFLQFDPAPR Unmodified 1339.6561 0.65608651 2758;2789 P62714;H0YBN9;P67775 PPP2CB;PPP2CA Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit beta isoform;Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.95 115.95 2 2.9979E-18 120967 QUIQUE_C1218_190116_001 169.09 153.94 9885800000 822870000 782320000 862310000 788770000 715880000 699210000 842310000 611640000 742040000 304270000 973060000 802330000 938790000 51704 2758;2789 48294 465336;465337;465338;465339;465340;465341;465342;465343;465344;465345;465346;465347;465348 594312;594313;594314;594315;594316;594317;594318;594319;594320;594321;594322;594323;594324;594325;594326;594327;594328;594329;594330;594331 594312 20 YSFLQNPQTSLCFSESIPTPSNR Unmodified 2672.2541 0.25406579 493 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146970000 132450000 112260000 51710 741 48299 465369;465370;465371;465372;465373;465374;465375;465376;465377;465378;465379;465380 594357;594358;594359;594360;594361;594362;594363;594364;594365;594366;594367;594368;594369;594370;594371;594372 594359 16 YSGAYGASVSDEELKR Unmodified 1730.8111 0.81114318 741 C9JRZ6;Q9NX63;F8WAR4;A0A286YEX5 CHCHD3 MICOS complex subunit MIC19 yes no 0 0 1 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 2 2 46.108 46.108 2;3 5.4254E-13 43791 QUIQUE_DMIX1_190116_001 128.06 109.33 1076900000 0 113580000 83219000 24055000 0 95078000 181970000 0 115630000 34900000 145960000 133190000 149370000 51711 741 48300 465381;465382;465383;465384;465385;465386;465387;465388;465389;465390;465391;465392;465393;465394;465395;465396;465397;465398;465399 594373;594374;594375;594376;594377;594378;594379;594380;594381;594382;594383;594384;594385;594386;594387;594388;594389;594390;594391;594392;594393;594394 594384 22 YSGETVQER Unmodified 1067.4884 0.48835248 747 C9JU35;Q9NPL8;C9JR82 TIMMDC1 Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial yes no 0 0 0 1 15.606 15.606 2 0.042848 7513 QUIQUE_C1277_190116_001 61.679 33.797 10103000 0 10103000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51712 747 48301 465400 594395 594395 1 YSGGNYRDNYDN Unmodified 1436.5593 0.55928559 2838 P98179 RBM3 RNA-binding protein 3 yes yes 0 0 1 1 26.761 26.761 2 1.8054E-05 20881 QUIQUE_DMIX1_190116_001 138.22 135.95 25881000 0 0 0 0 0 0 0 25881000 0 0 0 0 0 51713 2838 48302 465401 594396 594396 1 YSGLCPHVVVLVATVR Unmodified 1768.9658 0.96581011 2027;1005 F5H2F4;P11586 MTHFD1 C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic;Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase;Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase;Formyltetrahydrofolate synthetase;C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, N-terminally processed no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 1 2 1 1 1 1 2 95.645 95.645 2;3 1.1964E-05 97634 QUIQUE_DMIX1_190116_001 121.28 104.34 1215400000 51218000 119070000 135180000 83943000 89181000 124040000 24336000 179310000 78179000 40244000 31610000 128540000 130550000 51714 1005;2027 48303 465402;465403;465404;465405;465406;465407;465408;465409;465410;465411;465412;465413;465414;465415;465416;465417;465418;465419;465420;465421 594397;594398;594399;594400;594401;594402;594403;594404;594405;594406;594407;594408;594409;594410;594411;594412;594413;594414;594415;594416;594417;594418;594419;594420 594412 22 YSGRPVNLMGTSL Unmodified 1393.7024 0.70238478 3887 Q96JB5 CDK5RAP3 CDK5 regulatory subunit-associated protein 3 yes yes 0 0 1 1 85.116 85.116 2 0.056611 87505 QUIQUE_DMIX8_190116_001 65.5 53.287 31544000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 31544000 51715 3887 48304 465422 594421 594421 0 YSGSYNDYLR Unmodified 1236.5411 0.54111633 3919 Q96PK6 RBM14 RNA-binding protein 14 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 60.681 60.681 2 0.0011605 60074 QUIQUE_DMIX5_190116_001 100.98 81.89 326420000 0 37051000 33912000 44777000 30362000 0 0 43653000 38395000 24924000 30408000 0 42939000 51716 3919 48305 465423;465424;465425;465426;465427;465428;465429;465430;465431;465432;465433;465434 594422;594423;594424;594425;594426;594427;594428;594429;594430;594431;594432;594433 594431 12 YSGTLNLDR Unmodified 1037.5142 0.5141733 2524 P49327;A0A0U1RQF0 FASN Fatty acid synthase;[Acyl-carrier-protein] S-acetyltransferase;[Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase;3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase;3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase;Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase;Oleoyl-[acyl-carrier-protein] hydrolase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 43.033 43.033 2 0.00164 40184 QUIQUE_C1438_190116_001 101.64 74.389 802240000 76304000 82920000 75483000 77195000 76226000 0 85865000 0 0 0 108240000 102300000 117710000 51717 2524 48306 465435;465436;465437;465438;465439;465440;465441;465442;465443 594434;594435;594436;594437;594438;594439;594440;594441;594442;594443 594439 9 YSGVLSSIGK Unmodified 1009.5444 0.5444108 4348 Q9NZJ7;H0Y8C3 MTCH1 Mitochondrial carrier homolog 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 57.699 57.699 2 0.0019176 57130 QUIQUE_C1438_190116_001 92.838 77.339 1126400000 96974000 97516000 110610000 118350000 65167000 107180000 83481000 90144000 0 45119000 124530000 93205000 94136000 51718 4348 48307 465444;465445;465446;465447;465448;465449;465450;465451;465452;465453;465454;465455 594444;594445;594446;594447;594448;594449;594450;594451;594452;594453;594454;594455 594448 6 YSHDDPEFR Unmodified 1164.4836 0.48360145 3189 Q16678 CYP1B1 Cytochrome P450 1B1 yes yes 0 0 0 1 19.975 19.975 3 0.0026737 12734 QUIQUE_C1403_190116_001 68.893 60.03 44412000 0 0 0 44412000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51719 3189 48308 465456 594456 594456 1 YSHDFNFHINYGDLGFLGPEDLR Unmodified 2725.2561 0.25611471 89 A0A087X054;Q9Y4L1;E9PJ21;A0A087WWI4;K7EQK2 HYOU1 Hypoxia up-regulated protein 1 yes no 0 0 0 2 1 1 1 140.16 140.16 3;4 8.448E-06 146432 QUIQUE_C1576_190116_001 59.356 52.244 260970000 0 0 0 0 0 0 47634000 0 0 0 70326000 94511000 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QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.279 49.493 227650000 54448000 0 0 0 0 36982000 32210000 28241000 0 0 32218000 0 43547000 51725 4078 48314 465494;465495;465496;465497;465498;465499;465500 594498;594499;594500;594501;594502;594503;594504;594505;594506 594503 9 YSIFTEKDEILSDVASR Unmodified 1971.9789 0.97893679 4610 Q9Y4P1;C9JIK8;C9JQ72;H0Y2Y0;F2Z2K8 ATG4B Cysteine protease ATG4B yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 2 1 1 115.6 115.6 2;3 2.8577E-17 119364 QUIQUE_C1277_190116_001 138.08 128.5 641090000 47250000 57510000 81368000 63707000 0 63962000 61889000 42124000 59137000 0 46551000 53683000 63905000 51726 4610 48315 465501;465502;465503;465504;465505;465506;465507;465508;465509;465510;465511;465512;465513;465514 594507;594508;594509;594510;594511;594512;594513;594514;594515;594516;594517;594518;594519;594520 594508 14 YSIGEPTVPSTLAEEFTYNPFMR Unmodified 2648.2469 0.24685515 3195 Q16775;H3BPQ4;H3BPK3;H3BV79 HAGH Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 2 2 1 162.66 162.66 2;3 6.7076E-08 169931 QUIQUE_DMIX5_190116_001 95.57 83.015 211190000 0 0 0 0 16009000 0 0 0 69616000 0 68701000 56869000 0 51727 3195 48316 465515;465516;465517;465518;465519;465520 594521;594522;594523;594524;594525;594526 594525 6 YSIGEPTVPSTLAEEFTYNPFMR Oxidation (M) 2664.2418 0.24176977 3195 Q16775;H3BPQ4;H3BPK3;H3BV79 HAGH Hydroxyacylglutathione hydrolase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 157.57 157.57 3 4.6191E-06 160064 QUIQUE_DMIX1_190116_001 64.422 61.489 59900000 0 0 0 0 0 0 0 59900000 0 0 0 0 0 51728 3195 48316 465521 594527 594527 2623 1 YSIGGLSPFSEYAFR Unmodified 1692.8148 0.814772 1998 P10586;H0Y6Z7;H0Y4H1 PTPRF Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 138.04 138.04 2 1.4232E-05 141194 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.39 95.043 674040000 51409000 64167000 57761000 37838000 74801000 47203000 0 64717000 60172000 0 64442000 72425000 79100000 51729 1998 48317 465522;465523;465524;465525;465526;465527;465528;465529;465530;465531;465532 594528;594529;594530;594531;594532;594533;594534;594535;594536;594537;594538;594539 594535 12 YSIPDLAVDVEQVIGLEK Unmodified 1987.0514 0.051373454 439 A0A2R8Y661;A0A2R8YGD3;Q9Y4G8;H0Y8N8 RAPGEF2 Rap guanine nucleotide exchange factor 2 yes no 0 0 0 1 1 169.71 169.71 2 0.0015996 175939 QUIQUE_C1438_190116_001 78.763 63.887 38739000 0 0 17196000 0 21543000 0 0 0 0 0 0 0 0 51730 439 48318 465533;465534 594540;594541 594541 2 YSLATEEIER Unmodified 1209.5877 0.58773217 3347 Q66K14;H0YB08 TBC1D9B TBC1 domain family member 9B yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 58.512 58.512 2 0.0025891 58283 QUIQUE_C1438_190116_001 89.08 66.932 253460000 0 0 0 53619000 48489000 34976000 0 0 73817000 0 0 0 42564000 51731 3347 48319 465535;465536;465537;465538;465539 594542;594543;594544;594545;594546 594543 5 YSLEGGR Unmodified 780.37662 0.37661719 2856;1255;902 E9PCH6;I6L894;D6RHE1;Q01484;E9PHW9;A0A0U1RQN6;B7Z651 ANK2 Ankyrin-2 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 22.665 22.665 2 0.012374 15664 QUIQUE_C1368_190116_001 137.83 84.309 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425260000 280390000 137660000 51736 2026 48324 465575;465576;465577;465578;465579;465580;465581;465582;465583;465584;465585;465586;465587;465588;465589;465590;465591;465592;465593;465594 594591;594592;594593;594594;594595;594596;594597;594598;594599;594600;594601;594602;594603;594604;594605;594606;594607;594608;594609;594610;594611 594607 21 YSLQYYMGLAEELVR Oxidation (M) 1849.892 0.89203604 2026 P11498 PC Pyruvate carboxylase, mitochondrial yes yes 0 1 0 2 1 150.75 150.75 2 0.0072957 154788 QUIQUE_C1368_190116_001 56.951 46.474 98867000 0 0 66625000 0 0 32243000 0 0 0 0 0 0 0 51737 2026 48324 465595;465596;465597 594612;594613;594614 594612 1340 3 YSLVIIPK Unmodified 931.57425 0.57425436 1735 Q5R3B4;O95563 MPC2 Mitochondrial pyruvate carrier 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 84.05 84.05 2 0.023908 85467 QUIQUE_DMIX1_190116_001 72.875 54.184 224960000 0 27888000 0 0 0 0 0 34903000 50787000 0 62549000 0 48831000 51738 1735 48325 465598;465599;465600;465601;465602 594615;594616;594617;594618;594619 594616 5 YSMVGGNLVINNPDK Oxidation (M) 1635.7927 0.79265635 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 1 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 64.555 64.555 2 8.7408E-07 63423 QUIQUE_C1368_190116_001 118.87 103.33 526890000 56000000 66869000 74329000 64818000 0 47470000 59333000 37780000 63865000 0 0 56430000 0 51739 2948 48326 465603;465604;465605;465606;465607;465608;465609;465610;465611;465612;465613 594620;594621;594622;594623;594624;594625;594626;594627;594628;594629;594630;594631;594632;594633 594622 2422 14 YSMVGGNLVINNPDK Unmodified 1619.7977 0.79774172 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 85.616 85.616 2 1.0048E-06 86962 QUIQUE_C1403_190116_001 117.86 102.66 1544100000 0 0 0 399040000 0 0 442740000 0 342020000 0 360290000 0 0 51740 2948 48326 465614;465615;465616;465617 594634;594635;594636;594637;594638 594634 5 YSMVGGNLVINNPDKQK Unmodified 1875.9513 0.95128225 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 1 2 64.821 64.821 2;3 5.292E-16 65451 QUIQUE_DMIX5_190116_001 136.21 112.84 185150000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 185150000 0 0 51741 2948 48327 465618;465619 594639;594640 594640 2 YSNDLYELQASR Unmodified 1457.6787 0.67867245 533 A6NEM2;P51610 HCFC1 Host cell factor 1;HCF N-terminal chain 1;HCF N-terminal chain 2;HCF N-terminal chain 3;HCF N-terminal chain 4;HCF N-terminal chain 5;HCF N-terminal chain 6;HCF C-terminal chain 1;HCF C-terminal chain 2;HCF C-terminal chain 3;HCF C-terminal chain 4;HCF C-terminal chain 5;HCF C-terminal chain 6 yes no 0 0 0 1 71.175 71.175 2 0.00052647 72561 QUIQUE_DMIX5_190116_001 127.51 101 50919000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 50919000 0 0 51742 533 48328 465620 594641 594641 1 YSNDPVVASLAQDIFK Unmodified 1765.8887 0.88866522 3915 Q96P70 IPO9 Importin-9 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 146.97 146.97 2 0.0040677 152845 QUIQUE_C1218_190116_001 78.529 57.659 296010000 34632000 44180000 0 0 0 0 75435000 33139000 0 20996000 36339000 0 51287000 51743 3915 48329 465621;465622;465623;465624;465625;465626;465627 594642;594643;594644;594645;594646;594647;594648 594642 5 YSNDVTSLPFLLEILTVLPEEVHSR Unmodified 2870.5066 0.50657531 4625 Q9Y5L0;C9J7E5;E9PFH4 TNPO3 Transportin-3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 173.75 173.75 3 1.9784E-19 177979 QUIQUE_DMIX3_190116_001 103.63 92.109 316620000 0 0 0 0 22379000 0 0 27351000 30281000 0 0 175580000 61027000 51744 4625 48330 465628;465629;465630;465631;465632;465633 594649;594650;594651;594652;594653;594654;594655 594652 7 YSNEDTLSVALPYFWEHFDK Unmodified 2460.1274 0.12739194 2255 P26641 EEF1G Elongation factor 1-gamma yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 1 155.14 155.14 3 0.00015546 162122 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.639 58.309 537040000 0 0 0 0 0 50197000 0 90969000 153290000 25674000 216900000 0 0 51745 2255 48331 465634;465635;465636;465637;465638;465639;465640 594656;594657;594658;594659;594660;594661;594662 594662 5 YSNENLDLAR Unmodified 1193.5677 0.56766543 1324 K7EKE6;P36776;K7EJE8;K7ER27 LONP1 Lon protease homolog, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 45.524 45.524 2 0.00018305 42614 QUIQUE_DMIX1_190116_001 119.75 97.255 1166400000 95840000 68379000 105860000 68696000 62380000 78862000 88638000 71674000 96244000 68283000 148200000 96044000 117290000 51746 1324 48332 465641;465642;465643;465644;465645;465646;465647;465648;465649;465650;465651;465652;465653 594663;594664;594665;594666;594667;594668;594669;594670;594671;594672;594673;594674;594675;594676 594671 14 YSNFVSFPLYLNGR Unmodified 1675.8358 0.83584179 2952 Q12931;I3L0K7;I3L239;I3L2D5 TRAP1 Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 135.97 135.97 2 0.00076897 140757 QUIQUE_DMIX3_190116_001 101.35 83.876 210200000 0 0 0 0 0 22619000 0 48654000 52093000 0 43383000 43452000 0 51747 2952 48333 465654;465655;465656;465657;465658 594677;594678;594679;594680;594681 594679 5 YSNSALGHVNCTIK Unmodified 1562.7511 0.75112588 4252;1055 Q9NQC3;H7C106;A0A0U1RQR6;F8W914 RTN4 Reticulon-4;Reticulon no no 0 0 0 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 1 34.726 34.726 2;3 2.6204E-22 30738 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465682;465683;465684;465685;465686;465687;465688;465689;465690;465691;465692;465693;465694;465695 594708;594709;594710;594711;594712;594713;594714;594715;594716;594717;594718;594719;594720;594721;594722;594723;594724;594725;594726;594727;594728;594729;594730;594731;594732;594733;594734 594708 27 YSNSEVVTGSGLDSQK Unmodified 1669.7795 0.7795087 882 E7EVJ5;Q96F07;H7C229;E7EW33 CYFIP2 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 46.227 46.227 2 2.2387E-13 43565 QUIQUE_DMIX1_190116_001 185.51 146.36 347060000 75861000 0 83538000 0 0 0 0 57214000 0 41184000 0 0 89268000 51750 882 48336 465696;465697;465698;465699;465700 594735;594736;594737;594738;594739;594740;594741;594742 594739 8 YSNSEVVTGSGR Unmodified 1254.584 0.58404378 3442;292 A0A0G2JR96;A0A0G2JQT1;Q7L576 CYFIP1 Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 21.974 21.974 2 0.00083723 15301 QUIQUE_DMIX4_190116_001 87.066 63.542 444230000 74501000 58957000 66036000 0 0 52694000 69673000 0 0 57739000 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9.6796E-06 28385 QUIQUE_DMIX3_190116_001 130.98 116.99 2938300000 276480000 359880000 356520000 317390000 228140000 312050000 294360000 59575000 143920000 0 250140000 180270000 159590000 51754 64 48340 465713;465714;465715;465716;465717;465718;465719;465720;465721;465722;465723;465724 594755;594756;594757;594758;594759;594760;594761;594762;594763;594764;594765;594766;594767 594764 13 YSPLEFLR Unmodified 1023.5389 0.53893149 3454 Q7Z2Z2 EFTUD1 Elongation factor Tu GTP-binding domain-containing protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 110.8 110.8 2 0.013433 114719 QUIQUE_C1277_190116_001 87.323 36.357 31705000 0 12411000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19294000 51755 3454 48341 465725;465726 594768;594769 594768 2 YSPLHNVK Unmodified 956.50797 0.50796571 2503 P48147 PREP Prolyl endopeptidase yes yes 0 0 0 1 15.862 15.862 2 0.045132 8304 QUIQUE_DMIX1_190116_001 57.281 23.923 15444000 0 0 0 0 0 0 0 15444000 0 0 0 0 0 51756 2503 48342 465727 594770 594770 1 YSQDMHCLIR Unmodified 1321.5907 0.59072584 3212 Q2M2I8;E9PG46 AAK1 AP2-associated protein kinase 1 yes no 0 0 0 1 1 42.53 42.53 3 0.066834 39760 QUIQUE_C1576_190116_001 25.437 11.155 84751000 0 0 0 0 0 0 44370000 0 0 0 40381000 0 0 51757 3212 48343 465728;465729 594771;594772 594771 2 YSQFINFPIYVWSSK Unmodified 1877.9352 0.93522148 2079 P14625;Q96GW1;A0A1W2PRR1 HSP90B1 Endoplasmin yes no 0 0 0 1 2 2 1 2 2 1 1 2 2 1 2 1 154.87 154.87 2;3 7.644E-07 161923 QUIQUE_DMIX5_190116_001 118.76 106.62 5384600000 304950000 479680000 464280000 349500000 502120000 371410000 474500000 37451000 541050000 168590000 633870000 632030000 425180000 51758 2079 48344 465730;465731;465732;465733;465734;465735;465736;465737;465738;465739;465740;465741;465742;465743;465744;465745;465746;465747;465748;465749 594773;594774;594775;594776;594777;594778;594779;594780;594781;594782;594783;594784;594785;594786;594787;594788;594789;594790;594791;594792;594793;594794;594795;594796 594793 24 YSQKEDKYEEEIK Unmodified 1687.7941 0.79409613 3271;1260;1908 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YSSDYFQAPSDYR Unmodified 1597.6685 0.66850169 2920 Q08380 LGALS3BP Galectin-3-binding protein yes yes 0 0 0 1 1 2 1 1 1 1 81.37 81.37 2 1.4723E-12 83334 QUIQUE_C1218_190116_001 151.15 144.02 148970000 31791000 25446000 0 0 47536000 0 0 0 32199000 12002000 0 0 0 51766 2920 48352 465805;465806;465807;465808;465809;465810;465811;465812 594855;594856;594857;594858;594859;594860;594861;594862 594855 7 YSSGFVTADMIK Unmodified 1317.6275 0.6274885 3354 Q6BCY4 CYB5R2 NADH-cytochrome b5 reductase 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 85.689 85.689 2 0.0021825 86794 QUIQUE_DMIX1_190116_001 82.417 67.479 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51767 3354 48353 465813;465814;465815;465816;465817;465818 594863;594864;594865;594866;594867;594868 594867 6 YSSLAEAASK Unmodified 1025.5029 0.50293991 1795 P00915;E5RHP7;E5RH81;E5RIF9;E5RG43;E5RFE7;H0YBE2;E5RG81;E5RJI8;E5RJF6 CA1 Carbonic anhydrase 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 24.136 24.136 2 0.00047307 17087 QUIQUE_C1368_190116_001 111.06 67.937 9567000000 744680000 582570000 1019500000 486440000 1265200000 785510000 495350000 223150000 344050000 167280000 1333400000 1198600000 921160000 51768 1795 48354 465819;465820;465821;465822;465823;465824;465825;465826;465827;465828;465829;465830;465831 594869;594870;594871;594872;594873;594874;594875;594876;594877;594878;594879;594880;594881;594882 594871 13 YSSLETSR Unmodified 941.44543 0.44542503 2627 P53609 PGGT1B Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta yes yes 0 0 0 1 18.344 18.344 2 0.041989 10723 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.229 46.491 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51769 2627 48355 465832 594883 594883 1 YSSQLSQVQSLITNVESQLAEIR Unmodified 2592.3395 0.33950998 785 CON__Q14525;Q14525;CON__Q9UE12;CON__Q15323;Q15323 KRT33B;KRT31 Keratin, type I cuticular Ha3-II;Keratin, type I cuticular Ha1 no no 0 0 0 1 1 171.82 171.82 2;3 8.9403E-14 176187 QUIQUE_DMIX3_190116_001 124.29 114.44 106100000 0 0 0 0 0 0 0 0 49666000 0 0 56436000 0 + 51770 785 48356 465833;465834 594884;594885 594884 2 YSSSDWVTQYR Unmodified 1390.6153 0.61534391 4429 Q9UHC6;A0A0D9SES4 CNTNAP2 Contactin-associated protein-like 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 77.083 77.083 2 1.7851E-05 77827 QUIQUE_C1368_190116_001 140.83 88.119 378540000 42564000 47085000 44472000 0 47873000 22284000 54150000 20267000 0 0 43418000 26636000 29793000 51771 4429 48357 465835;465836;465837;465838;465839;465840;465841;465842;465843;465844;465845;465846;465847 594886;594887;594888;594889;594890;594891;594892;594893;594894;594895;594896;594897;594898;594899;594900;594901 594888 16 YSSSFLDSGWR Unmodified 1303.5833 0.5833155 3415 Q6VY07;B4DF77;E9PNZ9 PACS1 Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 96.19 96.19 2 0.00058858 98443 QUIQUE_DMIX3_190116_001 99.653 61.36 369710000 60967000 69804000 0 0 0 36017000 61105000 0 41537000 0 0 49902000 50383000 51772 3415 48358 465848;465849;465850;465851;465852;465853;465854 594902;594903;594904;594905;594906;594907;594908;594909 594907 6 YSSVHTIEK Unmodified 1062.5346 0.53457439 744 C9JTE9;Q9UHQ4;C9IYK6;H7C5E2;C9JGJ9;F8WB99 BCAP29 B-cell receptor-associated protein 29 yes no 0 0 0 1 159.9 159.9 2 0.041258 163280 QUIQUE_C1403_190116_001 53.166 1.312 10081000 0 0 0 10081000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51773 744 48359 465855 594910 594910 1 YSSVSNIYSDHR Unmodified 1426.6477 0.64770667 4517 Q9UPA5 BSN Protein bassoon yes yes 0 0 0 1 1 34.642 34.642 2 0.0054484 30508 QUIQUE_C1218_190116_001 69.979 44.405 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51774 4517 48360 465856;465857 594911;594912 594911 2 YSTDVSVDEVK Unmodified 1240.5823 0.58231244 1777 P00367;P49448 GLUD1;GLUD2 Glutamate dehydrogenase 1, mitochondrial;Glutamate dehydrogenase 2, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 49.765 49.765 2 0.00049749 47770 QUIQUE_DMIX1_190116_001 125.48 94.107 54341000000 3946500000 3029500000 5148000000 3466900000 4394400000 3546000000 3990700000 4510900000 4262300000 1942200000 6539400000 4744800000 4819800000 51775 1777 48361 465858;465859;465860;465861;465862;465863;465864;465865;465866;465867;465868;465869;465870 594913;594914;594915;594916;594917;594918;594919;594920;594921;594922;594923;594924;594925 594920 12 YSTHLHLAEDCMK Oxidation (M) 1619.7072 0.70721216 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 1 0 2 1 1 2 1 2 1 1 1 2 1 1 1 23.867 23.867 2;3 4.795E-41 16626 QUIQUE_C1368_190116_001 189.57 172.9 1771100000 392740000 110600000 177140000 287690000 72611000 0 59982000 42474000 77765000 210920000 97229000 159410000 82531000 51776 273;342 48362 465871;465872;465873;465874;465875;465876;465877;465878;465879;465880;465881;465882;465883;465884;465885;465886;465887 594926;594927;594928;594929;594930;594931;594932;594933;594934;594935;594936;594937;594938;594939;594940;594941;594942;594943 594929 207 18 YSTHLHLAEDCMK Unmodified 1603.7123 0.71229754 273;342 A0A0D9SG72;P61764;A0A1B0GWF2;A0A1B0GVQ5;A0A2R8Y5D4;A0A1B0GW76;A0A1B0GTP9 STXBP1 Syntaxin-binding protein 1 no no 0 0 0 1 3 2 2 3 3 3 3 2 2 3 2 1 36.104 36.104 2;3;4 4.3206E-41 32573 QUIQUE_C1218_190116_001 189.13 178.61 15236000000 502690000 2363500000 1554400000 1504000000 1865500000 1454200000 1768900000 712980000 756770000 148070000 1213100000 993670000 398290000 51777 273;342 48362 465888;465889;465890;465891;465892;465893;465894;465895;465896;465897;465898;465899;465900;465901;465902;465903;465904;465905;465906;465907;465908;465909;465910;465911;465912;465913;465914;465915;465916;465917 594944;594945;594946;594947;594948;594949;594950;594951;594952;594953;594954;594955;594956;594957;594958;594959;594960;594961;594962;594963;594964;594965;594966;594967;594968;594969;594970;594971;594972;594973;594974 594944 27 YSTLHTQSAEPPPPPEPAR Unmodified 2074.012 0.011968255 313 A0A0U1RQT8;Q8TCZ2 CD99L2 CD99 antigen-like protein 2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 2 41.256 41.256 2;3 3.2578E-100 36795 QUIQUE_DMIX8_190116_001 261.27 239.52 822440000 51855000 87255000 0 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YSVAGLSPYSDYEFR Unmodified 1752.7995 0.79951586 987 Q3KPI9;F5GWR7;P23468 PTPRD Protein-tyrosine-phosphatase;Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.97 115.97 2 8.788E-09 119669 QUIQUE_C1277_190116_001 140.24 116.26 589350000 53925000 73193000 67604000 65322000 0 62930000 0 46225000 51806000 0 102970000 0 65378000 51781 987 48366 465939;465940;465941;465942;465943;465944;465945;465946;465947 594998;594999;595000;595001;595002;595003;595004;595005;595006 594999 8 YSVFFQSLAVVEQEMK Unmodified 1903.939 0.93898623 3095 Q15008 PSMD6 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6 yes yes 0 0 0 1 1 1 161.84 161.84 2 4.4052E-09 167353 QUIQUE_C1218_190116_001 122.39 104.26 72758000 24215000 28064000 20479000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51782 3095 48367 465948;465949;465950 595007;595008;595009 595007 3 YSVGIHNLLAYVK Unmodified 1475.8136 0.81364979 1975 P09914 IFIT1 Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 yes yes 0 0 0 2 1 1 1 1 1 2 1 1 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595022;595023;595024;595025;595026;595027;595028;595029;595030;595031;595032;595033;595034;595035;595036;595037;595038;595039;595040;595041;595042;595043;595044;595045;595046;595047;595048;595049;595050;595051;595052;595053;595054;595055;595056 595035 32 YSVQLLTPANLLAK Unmodified 1529.8817 0.88172935 4542 Q9Y265;H7C4G5 RUVBL1 RuvB-like 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 129.57 129.57 2 0.0016299 135844 QUIQUE_DMIX5_190116_001 74.53 60.63 1095000000 182760000 191940000 184460000 142030000 0 0 0 167050000 0 0 226720000 0 0 51785 4542 48370 465984;465985;465986;465987;465988;465989 595057;595058;595059;595060;595061;595062 595062 3 YSVQTADHR Unmodified 1075.5047 0.50467125 3187 Q16658 FSCN1 Fascin yes yes 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 1 1 13.786 13.786 2;3 0.00049353 5716 QUIQUE_DMIX4_190116_001 114.5 78.618 1127900000 19164000 56267000 0 7813200 3390000 0 0 602460000 33410000 388650000 0 11120000 5606600 51786 3187 48371 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histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-13 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain no no 0 0 0 1 1 1 2 1 16.685 16.685 2;3 0.00015065 9817 QUIQUE_C1218_190116_001 84.468 73.47 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chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-7 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-3 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-24 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-69 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-11 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-30 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-66 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-26 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-25 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-33 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, A-43 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-13 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-41 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-42 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-14 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-44 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-35 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-53 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-78 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-52 alpha chain;HLA class I histocompatibility antigen, B-51 alpha chain no no 0 0 1 1 2 41.12 41.12 3;4 0.0002509 36988 QUIQUE_DMIX8_190116_001 82.865 77.864 212490000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 53870000 0 158620000 51806 280;324;377;393;1891;1995;2063;2104;2312;2313;2314;2315;2316;2317;2318 48391 466130;466131;466132 595220;595221;595222 595222 3 YTDCLQFYVNSTLK Unmodified 1750.8236 0.82362212 3199 Q16799;Q2NKQ5;A8MT72 RTN1 Reticulon-1;Reticulon yes no 0 0 0 1 1 2 3 1 1 1 1 1 1 119.06 119.06 2 0.00021121 123109 QUIQUE_DMIX7_190116_001 109.6 91.264 748760000 0 90704000 0 50180000 93245000 0 78563000 0 72448000 90724000 94093000 87570000 91233000 51807 3199 48392 466133;466134;466135;466136;466137;466138;466139;466140;466141;466142;466143;466144;466145 595223;595224;595225;595226;595227;595228;595229;595230;595231;595232;595233;595234;595235 595234 12 YTDHLQSYVIYSLGQPLEK Unmodified 2253.1317 0.13174904 4302 Q9NV70 EXOC1 Exocyst complex component 1 yes yes 0 0 0 1 1 118.11 118.11 3 0.0086047 122533 QUIQUE_C1368_190116_001 23.215 14.855 80037000 0 29845000 50192000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51808 4302 48393 466146;466147 595236;595237 595237 2 YTDQGGEEEEDYESEEQLQHR Unmodified 2570.0317 0.031713237 1617 O75208;H3BSJ5;H3BNT2;H3BRC0;H3BPC6;H3BPW3;H3BVA5 COQ9 Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 53.289 53.289 3 7.9514E-45 51220 QUIQUE_C1277_190116_001 157.85 157.17 701570000 91756000 75767000 70403000 62690000 57152000 63664000 0 0 53987000 25336000 56774000 66142000 77903000 51809 1617 48394 466148;466149;466150;466151;466152;466153;466154;466155;466156;466157;466158;466159 595238;595239;595240;595241;595242;595243;595244;595245;595246;595247;595248;595249;595250;595251;595252 595239 15 YTEFYHVPTHSDASK Unmodified 1780.8057 0.80566387 3865 Q96HC4;H0YBI4 PDLIM5 PDZ and LIM domain protein 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 36.509 36.509 2;3 2.465E-05 32239 QUIQUE_C1403_190116_001 77.664 70.773 986030000 53740000 88984000 66257000 102410000 147580000 81234000 46336000 0 168290000 0 78479000 55930000 96788000 51810 3865 48395 466160;466161;466162;466163;466164;466165;466166;466167;466168;466169;466170;466171;466172 595253;595254;595255;595256;595257;595258;595259;595260;595261;595262;595263;595264;595265;595266;595267;595268;595269 595259 17 YTEGVQSLNWTK Unmodified 1424.6936 0.69359423 4620 Q9Y5B9 SUPT16H FACT complex subunit SPT16 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 74.575 74.575 2 8.0169E-16 74834 QUIQUE_DMIX1_190116_001 196.27 164.85 362410000 83410000 87574000 0 69293000 0 55798000 0 66333000 0 0 0 0 0 51811 4620 48396 466173;466174;466175;466176;466177 595270;595271;595272;595273;595274 595274 5 YTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMR Oxidation (M) 2591.2074 0.20744995 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 1 0 2 2 3 3 2 2 2 2 2 2 3 2 2 111.13 111.13 2;3 6.7803E-234 113832 QUIQUE_DMIX1_190116_001 263.15 245.93 9474700000 564180000 882630000 550730000 439470000 689120000 432430000 324840000 1006300000 1202800000 697060000 828660000 1111600000 744780000 51812 267;275;3025 48397 466178;466179;466180;466181;466182;466183;466184;466185;466186;466187;466188;466189;466190;466191;466192;466193;466194;466195;466196;466197;466198;466199;466200;466201;466202;466203;466204;466205;466206 595275;595276;595277;595278;595279;595280;595281;595282;595283;595284;595285;595286;595287;595288;595289;595290;595291;595292;595293;595294;595295;595296;595297;595298;595299;595300;595301;595302;595303;595304;595305;595306;595307;595308;595309;595310;595311;595312;595313;595314;595315;595316;595317 595301 186 43 YTEHSTVGLAQQWDQLDQLGMR Unmodified 2575.2125 0.21253533 267;275;3025 A0A0D9SF54;A0A0D9SGF6;Q13813 SPTAN1 Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1 no no 0 0 0 2 3 3 2 2 3 3 1 2 1 2 2 2 120.86 120.86 2;3 6.5466E-100 124702 QUIQUE_C1277_190116_001 254.2 234.46 8209300000 708020000 781510000 921140000 696980000 610890000 678260000 813200000 427420000 488460000 172840000 788630000 552470000 569510000 51813 267;275;3025 48397 466207;466208;466209;466210;466211;466212;466213;466214;466215;466216;466217;466218;466219;466220;466221;466222;466223;466224;466225;466226;466227;466228;466229;466230;466231;466232;466233;466234 595318;595319;595320;595321;595322;595323;595324;595325;595326;595327;595328;595329;595330;595331;595332;595333;595334;595335;595336;595337;595338;595339;595340;595341;595342;595343;595344;595345;595346;595347;595348;595349;595350;595351;595352;595353;595354;595355;595356;595357;595358;595359;595360;595361;595362;595363 595325 46 YTEIHPEMR Unmodified 1174.5441 0.54409322 2283 P28907 CD38 ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 25.993 25.993 2;3 0.016411 19369 QUIQUE_C1368_190116_001 49.06 39.666 208700000 0 0 50550000 101240000 0 0 0 56906000 0 0 0 0 0 51814 2283 48398 466235;466236;466237;466238;466239 595364;595365;595366;595367;595368 595365 4 YTEITATYFQGVR Unmodified 1547.762 0.76200815 2377 P35573 AGL Glycogen debranching enzyme;4-alpha-glucanotransferase;Amylo-alpha-1,6-glucosidase yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 94.305 94.305 2 7.5368E-06 95943 QUIQUE_DMIX1_190116_001 123.75 94.005 309280000 0 36666000 0 35148000 0 29883000 37881000 40621000 0 32223000 51317000 0 45542000 51815 2377 48399 466240;466241;466242;466243;466244;466245;466246;466247;466248;466249;466250 595369;595370;595371;595372;595373;595374;595375;595376;595377;595378;595379 595374 10 YTELEYIHALTLLHR Unmodified 1870.9941 0.99413335 3797 Q96A65 EXOC4 Exocyst complex component 4 yes yes 0 0 0 2 2 1 1 1 1 1 1 1 113.34 113.34 3;4 8.082E-06 116716 QUIQUE_C1277_190116_001 92.935 86.206 270690000 55865000 58411000 38208000 10893000 27089000 0 0 21787000 28144000 9922800 0 20373000 0 51816 3797 48400 466251;466252;466253;466254;466255;466256;466257;466258;466259;466260;466261 595380;595381;595382;595383;595384;595385;595386;595387;595388;595389;595390;595391;595392 595383 13 YTEQITNEK Unmodified 1124.535 0.53496832 3191 Q16718;A0A087X1G1;H7BYD0;F8WAS3;C9IZN5 NDUFA5 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 5 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 20.781 20.781 2 4.056E-08 13781 QUIQUE_DMIX5_190116_001 167.24 136.01 1875300000 302580000 289500000 0 219100000 200680000 181300000 0 132390000 200850000 53290000 295590000 0 0 51817 3191 48401 466262;466263;466264;466265;466266;466267;466268;466269;466270 595393;595394;595395;595396;595397;595398;595399;595400;595401;595402;595403;595404;595405;595406 595406 14 YTEYNEPHESR Unmodified 1423.6004 0.60042213 262 H0YM62;D6RG14;D6RB91;A0A1B0GTW4;D6RG21;D6RCM6;Q05BX2;D6RJA7;A0A0D9SET2;D6R942;D6RC63;D8L7E9;D6RJG6;A0A0D9SFD0;A0A0R4J2G5;A0A1B0GV32;A0A0D9SGI5;Q06413;Q02078;Q14814 MEF2A;MEF2C;MEF2D Myocyte-specific enhancer factor 2C;Myocyte-specific enhancer factor 2A;Myocyte-specific enhancer factor 2D yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 16.741 16.741 3 0.00030706 8602 QUIQUE_C1403_190116_001 84.507 72.239 184960000 21029000 30616000 15295000 26953000 0 14565000 0 16021000 19172000 6118200 35192000 0 0 51818 262 48402 466271;466272;466273;466274;466275;466276;466277;466278;466279 595407;595408;595409;595410;595411;595412;595413;595414;595415 595410 9 YTFEDAQEHIYK Unmodified 1542.6991 0.69907354 2549;32 A0A0A0MRA9;B7Z2N1;A0A087WTW9;P49758;B7Z7N5;P49802;Q5T3H5 RGS6;RGS7 Regulator of G-protein signaling 6;Regulator of G-protein signaling 7 no no 0 0 0 2 2 2 1 2 2 2 2 2 2 1 2 2 65.275 65.275 2;3 3.3615E-05 64728 QUIQUE_C1277_190116_001 128.17 112.27 1635700000 150010000 164900000 180630000 46655000 102820000 61354000 176810000 143700000 120160000 63221000 59007000 152770000 213620000 51819 32;2549 48403 466280;466281;466282;466283;466284;466285;466286;466287;466288;466289;466290;466291;466292;466293;466294;466295;466296;466297;466298;466299;466300;466301;466302;466303 595416;595417;595418;595419;595420;595421;595422;595423;595424;595425;595426;595427;595428;595429;595430;595431;595432;595433;595434;595435;595436;595437;595438;595439;595440 595419 24 YTFEEIQQETDIPER Unmodified 1896.8741 0.87413737 3017 Q13618;A0A087WTG3 CUL3 Cullin-3 yes no 0 0 0 2 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 104.8 104.8 2 7.4869E-09 108448 QUIQUE_C1277_190116_001 140.24 125.56 597500000 93921000 40766000 0 81539000 55826000 65627000 49014000 26912000 98658000 0 0 41868000 43367000 51820 3017 48404 466304;466305;466306;466307;466308;466309;466310;466311;466312;466313;466314;466315;466316 595441;595442;595443;595444;595445;595446;595447;595448;595449;595450;595451;595452;595453;595454 595443 10 YTFPAEHR Unmodified 1019.4825 0.48247924 4567 Q9Y2T3;Q5SZC6 GDA Guanine deaminase yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 26.611 26.611 2 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Unmodified 2688.1836 0.18360297 2281 P28482 MAPK1 Mitogen-activated protein kinase 1 yes yes 0 0 0 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 1 144.83 144.83 2;3 1.7705E-161 150220 QUIQUE_C1368_190116_001 181.75 174.55 5150200000 235820000 492280000 413800000 372670000 543560000 284610000 419750000 217500000 604240000 129470000 556720000 669250000 210540000 51852 2281 48433 466531;466532;466533;466534;466535;466536;466537;466538;466539;466540;466541;466542;466543;466544;466545;466546;466547;466548;466549;466550;466551;466552;466553;466554 595705;595706;595707;595708;595709;595710;595711;595712;595713;595714;595715;595716;595717;595718;595719;595720;595721;595722;595723;595724;595725;595726;595727;595728;595729;595730;595731;595732;595733;595734;595735;595736;595737;595738;595739;595740;595741 595713 37 YTNNEAYFDVIEEIDAIIDK Unmodified 2374.1216 0.12163786 2632 P53677;E5RJ52;E7ER80 AP3M2 AP-3 complex subunit mu-2 yes no 0 0 0 1 1 1 172.97 172.97 2;3 3.4232E-13 176787 QUIQUE_DMIX7_190116_001 120.66 109.39 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YTPSGQAGAAASESLFVSNHAY Unmodified 2227.0182 0.018175845 1851 P04075;J3KPS3;H3BR68 ALDOA Fructose-bisphosphate aldolase A;Fructose-bisphosphate aldolase yes no 0 0 0 15 14 7 9 10 5 9 13 16 5 18 17 14 110.55 110.55 2;3 3.4675E-132 102373 QUIQUE_C1403_190116_001 223.9 207.77 23357000000 2127800000 2254100000 1252200000 1913900000 1788000000 895120000 1486500000 2372500000 2074400000 866460000 2283600000 2208600000 1834000000 51861 1851 48440 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595987 226 YTPVQQGPVGVNVTYGGDPIPK Unmodified 2285.1692 0.16919718 2178 P21333;Q60FE5;A0A087WWY3 FLNA Filamin-A yes no 0 0 0 1 1 1 1 99.757 99.757 2;3 3.7468E-36 104143 QUIQUE_DMIX5_190116_001 170.49 157.07 288530000 0 0 0 0 124320000 0 85373000 0 0 0 78832000 0 0 51862 2178 48441 466790;466791;466792;466793 596162;596163;596164;596165 596165 3 YTQELTLKR Unmodified 1150.6346 0.63462279 2207 P23229 ITGA6 Integrin alpha-6;Integrin alpha-6 heavy chain;Integrin alpha-6 light chain;Processed integrin alpha-6 yes yes 0 0 1 1 27.581 27.581 3 0.015375 21927 QUIQUE_DMIX1_190116_001 53.756 36.526 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51863 2207 48442 466794 596166 596166 1 YTQGGLENLELSR Unmodified 1478.7365 0.73652168 3094 Q15006 EMC2 ER membrane protein complex subunit 2 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 78.167 78.167 2 6.3788E-13 79878 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.48 123.85 628770000 0 51447000 62997000 52945000 55115000 57421000 48564000 42626000 50717000 0 85699000 65216000 56027000 51864 3094 48443 466795;466796;466797;466798;466799;466800;466801;466802;466803;466804;466805 596167;596168;596169;596170;596171;596172;596173;596174;596175;596176;596177;596178;596179;596180;596181 596177 15 YTQGGLENLELSRK Unmodified 1606.8315 0.83148469 3094 Q15006 EMC2 ER membrane protein complex subunit 2 yes yes 0 0 1 1 92.778 92.778 3 0.04238 93270 QUIQUE_DMIX1_190116_001 23.419 11.629 1026300000 0 0 0 0 0 0 0 1026300000 0 0 0 0 0 51865 3094 48444 466806 596182 596182 1 YTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVR Unmodified 2607.2064 0.20638732 2263;897 E9PBK7;P27361;E9PQW4;E9PJF0 MAPK3 Mitogen-activated protein kinase 3;Mitogen-activated protein kinase no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 139.15 139.15 2;3 2.4242E-62 145653 QUIQUE_DMIX5_190116_001 205.42 194.56 5009200000 378060000 474410000 394340000 393520000 309590000 184900000 354550000 457510000 445530000 72049000 579600000 431910000 533220000 51866 897;2263 48445 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Unmodified 3131.4095 0.40949962 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 0 2 2 2 1 1 3 1 1 1 130.63 130.63 2;3 9.0751E-66 134699 QUIQUE_C1277_190116_001 212.69 202.53 1067100000 96898000 131250000 190790000 112520000 77962000 290660000 0 72626000 0 25484000 68942000 0 0 51881 2009 48459 466928;466929;466930;466931;466932;466933;466934;466935;466936;466937;466938;466939;466940;466941 596325;596326;596327;596328;596329;596330;596331;596332;596333;596334;596335;596336;596337;596338 596328 13 YTVPLPSPVQDSENLSGESGTFYEGTDDKVR Unmodified 3386.579 0.57902457 2009 P11137 MAP2 Microtubule-associated protein 2 yes yes 0 0 1 1 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 119.19 119.19 3 3.7436E-119 123301 QUIQUE_DMIX8_190116_001 185.02 177.26 1761300000 77032000 94982000 162960000 133930000 156780000 120750000 96970000 245800000 125190000 33435000 188740000 143090000 181640000 51882 2009 48460 466942;466943;466944;466945;466946;466947;466948;466949;466950;466951;466952;466953;466954;466955 596339;596340;596341;596342;596343;596344;596345;596346;596347;596348;596349;596350;596351;596352;596353;596354;596355;596356;596357;596358;596359;596360;596361;596362;596363;596364;596365;596366 596365 28 YTVQDESHSEWVSCVR Unmodified 1980.8636 0.86358946 2787 P63244;J3KPE3;H0YAF8;H0Y8W2;D6RHH4;H0YAM7;D6R9Z1;D6R9L0;D6RFX4;D6RBD0;D6RFZ9 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 2 2 2 2 2 2 3 2 1 1 1 1 2 66.491 66.491 2;3 1.7027E-79 64731 QUIQUE_C1563_190116_001 245.85 230.31 2293000000 202260000 320450000 305160000 324620000 145810000 333240000 195930000 132870000 38395000 77092000 48671000 37706000 130790000 51883 2787 48461 466956;466957;466958;466959;466960;466961;466962;466963;466964;466965;466966;466967;466968;466969;466970;466971;466972;466973;466974;466975;466976;466977;466978 596367;596368;596369;596370;596371;596372;596373;596374;596375;596376;596377;596378;596379;596380;596381;596382;596383;596384;596385;596386;596387;596388;596389;596390;596391;596392;596393 596379 27 YTYEHDPITK Unmodified 1265.5928 0.59281755 2444 P42224;J3KPM9 STAT1 Signal transducer and activator of transcription 1-alpha/beta;Signal transducer and activator of transcription yes no 0 0 0 2 2 1 3 1 1 2 1 1 1 1 27.65 27.65 2;3 1.6601E-11 22199 QUIQUE_DMIX1_190116_001 162.49 132.18 889590000 138380000 94213000 116010000 93826000 0 0 49909000 133230000 57125000 28181000 130680000 48027000 0 51884 2444 48462 466979;466980;466981;466982;466983;466984;466985;466986;466987;466988;466989;466990;466991;466992;466993;466994 596394;596395;596396;596397;596398;596399;596400;596401;596402;596403;596404;596405;596406;596407;596408;596409;596410;596411;596412;596413 596408 17 YVAEIEK Unmodified 850.44363 0.44363412 1448 O14818;H0Y586 PSMA7 Proteasome subunit alpha type-7 yes no 0 0 0 1 1 1 23.068 23.068 2 0.038851 16223 QUIQUE_C1368_190116_001 84.244 37.873 395690000 0 0 229310000 0 0 0 0 70718000 0 0 0 95662000 0 51885 1448 48463 466995;466996;466997 596414;596415;596416 596414 3 YVAEIEKEKEENEK Unmodified 1736.8469 0.84685999 1448 O14818;H0Y586 PSMA7 Proteasome subunit alpha type-7 yes no 0 0 2 1 2 1 1 2 2 1 2 1 2 19.8 19.8 2;3;4 0 13050 QUIQUE_DMIX1_190116_001 365.67 324.95 1538700000 83447000 173790000 0 0 48464000 0 98576000 216620000 244520000 23051000 210920000 128130000 311140000 51886 1448 48464 466998;466999;467000;467001;467002;467003;467004;467005;467006;467007;467008;467009;467010;467011;467012 596417;596418;596419;596420;596421;596422;596423;596424;596425;596426;596427;596428;596429;596430;596431 596423 15 YVAHSGIGDR Unmodified 1073.5254 0.52540669 128 G5E9D8;A0A096LP62;C9J2H1;Q86UX2 ITIH5 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5 yes no 0 0 0 1 13.602 13.602 3 0.017787 5611 QUIQUE_DMIX4_190116_001 37.995 24.403 4788800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4788800 0 0 0 51887 128 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223130000 51891 1887 48469 467053;467054;467055;467056;467057;467058;467059;467060;467061;467062;467063;467064;467065;467066;467067;467068;467069;467070;467071;467072;467073;467074 596489;596490;596491;596492;596493;596494;596495;596496;596497;596498;596499;596500;596501;596502;596503;596504;596505;596506;596507;596508;596509;596510;596511;596512;596513 596502 22 YVATLGVEVHPLVFHTNR Unmodified 2051.0952 0.095244374 643 B5MDF5;P62826;J3KQE5;F5H018;H0YFC6 RAN GTP-binding nuclear protein Ran yes no 0 0 0 2 2 1 2 3 1 2 3 3 2 3 3 3 85.682 85.682 2;3;4 0 88772 QUIQUE_C1218_190116_001 348.72 329.67 9106600000 576240000 990860000 82975000 525100000 1290800000 71796000 553080000 666350000 895900000 262070000 1294200000 908310000 988890000 51892 643 48470 467075;467076;467077;467078;467079;467080;467081;467082;467083;467084;467085;467086;467087;467088;467089;467090;467091;467092;467093;467094;467095;467096;467097;467098;467099;467100;467101;467102;467103;467104 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596598;596599;596600;596601;596602;596603;596604;596605;596606;596607;596608;596609;596610;596611;596612;596613;596614;596615;596616 596607 19 YVDLMESSIAQSIHR Unmodified 1747.8563 0.85631924 4494;981;1236 F1T0E5;C9IYE1;A0A087X1P3;Q86UW7;F8W8P5;H7BYR4;H0Y8B5;Q9ULU8;H7C4T6 CADPS;CADPS2 Calcium-dependent secretion activator 2;Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 0 1 97.26 97.26 3 0.0041697 100602 QUIQUE_C1576_190116_001 42.242 37.625 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51899 981;4494;1236 48476 467156 596617 596617 1 YVDMSVK Unmodified 840.40514 0.40514012 2499 P48047 ATP5O ATP synthase subunit O, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 28.322 28.322 2 0.019688 22421 QUIQUE_C1277_190116_001 110.61 73.954 360370000 0 360370000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 51900 2499 48477 467157 596618 596618 1 YVDSEGHLYTVPIR Unmodified 1647.8257 0.82567103 2884 Q03135 CAV1 Caveolin-1 yes yes 0 0 0 1 1 65.451 65.451 3 0.020752 65932 QUIQUE_C1438_190116_001 34.432 19.27 161410000 0 0 0 95522000 65891000 0 0 0 0 0 0 0 0 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Calcium-dependent secretion activator 1 no no 0 0 1 2 1 1 2 1 1 1 1 1 1 129.63 129.63 2;3 3.3372E-09 134097 QUIQUE_C1277_190116_001 109.03 100.09 1221600000 185120000 157010000 130230000 0 132480000 0 115920000 62240000 91434000 0 132780000 110520000 103860000 51904 981;4494 48481 467170;467171;467172;467173;467174;467175;467176;467177;467178;467179;467180;467181 596632;596633;596634;596635;596636;596637;596638;596639;596640;596641;596642;596643;596644 596634 13 YVEAAWYPWWEQQGFFKPEYGRPNVSAANPR Unmodified 3742.7746 0.77458552 2254 P26640;A0A140T936;A0A140T954 VARS Valine--tRNA ligase yes no 0 0 2 1 137.09 137.09 4 6.7697E-25 141582 QUIQUE_DMIX7_190116_001 85.982 79.322 123450000 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 123450000 0 51905 2254 48482 467182 596645 596645 1 YVECSALTQK Unmodified 1197.57 0.56997362 2701 P60953 CDC42 Cell division control protein 42 homolog yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 31.161 31.161 2 0.00069937 25454 QUIQUE_C1368_190116_001 117.81 83.722 8519000000 597010000 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N-methyltransferase yes yes 0 0 1 1 18.635 18.635 2 0.039035 11484 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.006 41.775 138670000 0 0 0 0 0 0 0 138670000 0 0 0 0 0 51912 2555 48489 467248 596724 596724 1 YVFFLDPCNLDLINR Unmodified 1897.9397 0.93965493 3713 Q8WWI5 SLC44A1 Choline transporter-like protein 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 162.4 162.4 2 6.1745E-07 167783 QUIQUE_C1218_190116_001 145.55 123.32 444700000 41805000 69853000 62112000 39722000 36255000 29485000 72506000 11477000 0 12645000 0 26839000 42005000 51913 3713 48490 467249;467250;467251;467252;467253;467254;467255;467256;467257;467258;467259 596725;596726;596727;596728;596729;596730;596731;596732;596733;596734;596735 596725 11 YVFFLDPCNLDLINRK Unmodified 2026.0346 0.034617952 3713 Q8WWI5 SLC44A1 Choline transporter-like protein 1 yes yes 0 0 1 1 144.75 144.75 3 0.035204 147710 QUIQUE_DMIX1_190116_001 38.808 30.467 17091000 0 0 0 0 0 0 0 17091000 0 0 0 0 0 51914 3713 48491 467260 596736 596736 0 YVFLDPLAGAVTK Unmodified 1392.7653 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596771;596772;596773;596774;596775;596776;596777;596778;596779;596780;596781;596782;596783;596784;596785;596786;596787;596788;596789;596790;596791;596792;596793;596794;596795;596796;596797;596798;596799;596800;596801;596802;596803;596804;596805;596806;596807;596808;596809;596810;596811;596812;596813;596814;596815;596816;596817;596818;596819;596820;596821;596822;596823;596824;596825;596826 596779 54 YVGKEPSGLR Unmodified 1104.5928 0.59275797 1700 O94925;H7BZD1 GLS Glutaminase kidney isoform, mitochondrial yes no 0 0 1 1 1 1 2 1 16.676 16.676 2;3 0.0060859 9146 QUIQUE_DMIX3_190116_001 82.261 65.59 1010700000 0 55058000 0 0 0 0 0 132700000 164620000 0 428480000 0 229840000 51921 1700 48498 467334;467335;467336;467337;467338;467339 596827;596828;596829;596830;596831;596832 596829 4 YVGQNIGLSTCR Unmodified 1366.6663 0.66633362 4218 Q9HBL8;I3L543;I3L1Y8;I3L3I6;I3L3Z0 NMRAL1 NmrA-like family domain-containing protein 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 55.329 55.329 2 0.00060873 54334 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596843;596844;596845;596846;596847;596848;596849;596850;596851;596852;596853;596854;596855;596856;596857;596858;596859 596853 16 YVHKDETMSPSTAFQVK Oxidation (M) 1982.9408 0.94077715 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 1 1 1 1 1 28.334 28.334 2;3 2.3745E-29 22887 QUIQUE_DMIX5_190116_001 155.98 139.84 92643000 0 0 69370000 0 0 0 0 0 0 0 23273000 0 0 51925 2948 48501 467363;467364;467365 596860;596861;596862 596862 2423 3 YVHYFSGLLSGSIK Unmodified 1569.8191 0.81912909 422 E9PGF5;E9PF55;A0A2R8Y4T1;Q9HBL0;E7EMG1;E7ERH1 TNS1 Tensin-1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 97.49 97.49 3 0.00047679 100326 QUIQUE_C1277_190116_001 53.136 42.32 102410000 0 19476000 0 0 0 0 22722000 16197000 14152000 0 29867000 0 0 51926 422 48502 467366;467367;467368;467369;467370;467371 596863;596864;596865;596866;596867;596868 596863 6 YVIHTVGPIAR Unmodified 1224.6979 0.69789175 464 A0A2R8YFN3;A1Z1Q3 MACROD2 O-acetyl-ADP-ribose deacetylase MACROD2 yes no 0 0 0 1 46.148 46.148 3 0.0090496 43438 QUIQUE_C1218_190116_001 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YVILDIPLLFETK Unmodified 1562.896 0.89598243 1355 K7ESP4;Q8WVC6 DCAKD Dephospho-CoA kinase domain-containing protein yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 166.71 166.71 2 0.00038522 168622 QUIQUE_DMIX1_190116_001 93.058 81.344 478110000 28180000 29263000 27645000 30113000 28220000 18930000 39158000 27748000 81048000 20809000 54334000 66411000 26255000 51930 1355 48506 467390;467391;467392;467393;467394;467395;467396;467397;467398;467399;467400;467401;467402 596889;596890;596891;596892;596893;596894;596895;596896;596897;596898;596899;596900;596901 596896 13 YVINAIPPTLTAK Unmodified 1399.8075 0.80750177 2179 P21397 MAOA Amine oxidase [flavin-containing] A yes yes 0 0 0 1 2 3 1 1 1 1 2 96.434 96.434 2 0.0028209 97924 QUIQUE_DMIX5_190116_001 76.282 57.502 175170000 0 58749000 0 71550000 0 0 0 0 18791000 26078000 0 0 0 51931 2179 48507 467403;467404;467405;467406;467407;467408;467409;467410;467411;467412;467413;467414 596902;596903;596904;596905;596906;596907;596908;596909;596910;596911;596912;596913 596912 10 YVISAIPPTLGMK Unmodified 1388.7738 0.77375881 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 0 0 3 4 2 3 2 3 2 1 2 1 1 1 1 109.66 109.66 2 0.00045813 113873 QUIQUE_C1563_190116_001 96.171 68.868 943860000 144010000 223510000 68119000 78231000 43048000 0 57127000 0 116260000 34172000 105840000 32944000 40607000 51932 2261 48508 467415;467416;467417;467418;467419;467420;467421;467422;467423;467424;467425;467426;467427;467428;467429;467430;467431;467432;467433;467434;467435;467436;467437;467438;467439;467440 596914;596915;596916;596917;596918;596919;596920;596921;596922;596923;596924;596925;596926;596927;596928;596929;596930;596931;596932;596933;596934;596935;596936;596937;596938;596939;596940;596941 596931 24 YVISAIPPTLGMK Oxidation (M) 1404.7687 0.76867343 2261 P27338 MAOB Amine oxidase [flavin-containing] B yes yes 0 1 0 1 1 1 1 92.205 92.205 2 0.0042702 95289 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115.63 3 0.0018109 119745 QUIQUE_DMIX8_190116_001 59.513 49.725 87484000 0 0 0 0 0 0 0 0 45620000 0 0 0 41864000 51947 4082 48522 467539;467540 597058;597059;597060 597060 3 YVMLPVADQDQCIR Oxidation (M) 1722.8069 0.8069262 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08;H3BS21 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 1 0 1 1 1 79.825 79.825 2 3.8812E-07 80779 QUIQUE_C1438_190116_001 120.06 106.66 118150000 0 58795000 0 0 0 0 0 0 0 59354000 0 0 0 51948 1793 48523 467541;467542;467543 597061;597062;597063;597064 597062 1018 4 YVMLPVADQDQCIR Unmodified 1706.812 0.81201158 1793 P00738;J3QR68;H0Y300;A0A0C4DGL8;J3QLC9;A0A087WU08;H3BS21 HP Haptoglobin;Haptoglobin alpha chain;Haptoglobin beta chain yes no 0 0 0 2 1 1 3 1 2 1 1 1 1 1 1 91.515 91.515 2;3 0.00022368 93353 QUIQUE_C1403_190116_001 104.79 91.132 3615500000 0 501370000 91928000 72918000 462820000 231720000 638200000 182210000 178580000 13449000 697770000 138910000 405640000 51949 1793 48523 467544;467545;467546;467547;467548;467549;467550;467551;467552;467553;467554;467555;467556;467557;467558;467559 597065;597066;597067;597068;597069;597070;597071;597072;597073;597074;597075;597076;597077;597078;597079;597080;597081 597068 15 YVMTTTTLER Unmodified 1213.6013 0.60127375 1883 P05198;G3V4T5;H0YJS4 EIF2S1 Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 52.673 52.673 2 0.0061575 50387 QUIQUE_DMIX7_190116_001 75.043 50.121 634360000 86113000 93264000 0 0 61442000 62898000 54911000 75518000 0 47729000 95114000 57371000 0 51950 1883 48524 467560;467561;467562;467563;467564;467565;467566;467567;467568;467569;467570 597082;597083;597084;597085;597086;597087;597088;597089;597090;597091;597092 597092 7 YVNILPYDHSR Unmodified 1375.6884 0.68844927 2137 P18433 PTPRA Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 59.877 59.877 2;3 0.0095978 58951 QUIQUE_DMIX5_190116_001 63.076 38.231 246650000 22120000 0 0 0 0 33966000 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protein 1 515 kDa subunit;Low-density lipoprotein receptor-related protein 1 intracellular domain yes yes 0 0 1 1 1 1 43.764 43.764 2 0.00080849 40528 QUIQUE_DMIX5_190116_001 120.68 99.219 275890000 0 0 0 0 0 0 0 81456000 84888000 0 109550000 0 0 51980 2911 48553 467760;467761;467762 597317;597318;597319;597320 597320 4 YVVLCESPQDKR Unmodified 1492.7344 0.73441319 3669;706 C9JA93;F8VV61;Q8TC07 TBC1D15 TBC1 domain family member 15 no no 0 0 1 1 1 32.095 32.095 3 0.021354 27643 QUIQUE_DMIX3_190116_001 39.561 28.917 63470000 0 0 0 0 0 0 0 0 32205000 0 0 0 31265000 51981 706;3669 48554 467763;467764 597321;597322 597321 2 YVVLSYLGLLSQEK Unmodified 1610.892 0.89195969 4062 Q9BXK5;E9PDD6;F2Z2C3;A0A087WW80;A0A0A0MR90;F6VJB4 BCL2L13 Bcl-2-like protein 13 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 145.95 145.95 2 0.00032682 150659 QUIQUE_DMIX3_190116_001 122.42 107.74 688910000 47265000 70022000 58379000 76242000 54075000 38019000 62521000 45797000 55885000 22022000 59648000 49453000 49579000 51982 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paraoxonase/arylesterase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 99.26 99.26 3 0.0005209 103434 QUIQUE_C1438_190116_001 72.848 63.844 33115000 0 0 0 0 12572000 20543000 0 0 0 0 0 0 0 51992 2260 48564 467883;467884;467885 597522;597523;597524 597523 3 YVYSVLDDVIPEEILGK Unmodified 1951.019 0.019010693 2474 P45985 MAP2K4 Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 159.84 159.84 2;3 0.00041611 164954 QUIQUE_C1368_190116_001 111.31 93.946 1492300000 118780000 121400000 139110000 96724000 209700000 134620000 147860000 93028000 0 0 143370000 125930000 161750000 51993 2474 48565 467886;467887;467888;467889;467890;467891;467892;467893;467894;467895;467896;467897 597525;597526;597527;597528;597529;597530;597531;597532;597533;597534;597535;597536;597537;597538 597527 14 YWAAHDKEEAANR Unmodified 1559.7117 0.71170391 2948 Q12860 CNTN1 Contactin-1 yes yes 0 0 1 3 3 3 3 3 2 3 2 3 3 3 3 3 14.515 14.515 2;3;4 3.3071E-88 5950 QUIQUE_C1563_190116_001 231.05 195.51 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467935;467936 597578;597579 597579 2 YWALGQKDEALEQNIQALEENHQTQEQESLVQEDKTR Unmodified 4398.1 0.10001458 921 E9PGC8;P78559 MAP1A Microtubule-associated protein 1A;MAP1A heavy chain;MAP1 light chain LC2 yes no 0 0 2 1 116.4 116.4 5 5.1126E-05 118782 QUIQUE_DMIX1_190116_001 44.023 40.318 53842000 0 0 0 0 0 0 0 53842000 0 0 0 0 0 51996 921 48568 467937 597580 597580 1 YWDGWFR Unmodified 1028.4505 0.45045083 4617 Q9Y570 PPME1 Protein phosphatase methylesterase 1 yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 115.34 115.34 2 0.012775 120328 QUIQUE_DMIX5_190116_001 137.44 108.1 752240000 48320000 74256000 69083000 51798000 47699000 51060000 76691000 0 70362000 0 102920000 71963000 88086000 51997 4617 48569 467938;467939;467940;467941;467942;467943;467944;467945;467946;467947;467948 597581;597582;597583;597584;597585;597586;597587;597588;597589;597590;597591;597592;597593 597590 13 YWEAFLPEAK Unmodified 1252.6128 0.61282471 3015;1590 O60749;Q13596;H0YK42 SNX2;SNX1 Sorting nexin-2;Sorting nexin-1 no no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113.84 113.84 2 0.00037849 111562 QUIQUE_DMIX4_190116_001 112.84 100.22 1791400000 121040000 132370000 141680000 151040000 151800000 109090000 152700000 126290000 141910000 77749000 164450000 148710000 172530000 51998 1590;3015 48570 467949;467950;467951;467952;467953;467954;467955;467956;467957;467958;467959;467960;467961 597594;597595;597596;597597;597598;597599;597600;597601;597602;597603;597604;597605;597606;597607;597608;597609;597610;597611;597612;597613;597614;597615;597616;597617 597611 24 YWELIYEDSMDLIAK Oxidation (M) 1903.8914 0.89136734 612 B4DJV2;O75390;A0A0C4DGI3;F8VRI6;F8VPA1;F8VR34 CS Citrate synthase;Citrate synthase, mitochondrial yes no 0 1 0 1 2 1 150.01 150.01 2 0.0017685 152621 QUIQUE_C1563_190116_001 69.451 58.841 63498000 0 45332000 0 0 0 18167000 0 0 0 0 0 0 0 51999 612 48571 467962;467963;467964;467965 597618;597619;597620;597621 597621 400 3 YWETVER Unmodified 981.4556 0.45559579 4296 Q9NUB1 ACSS1 Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 43.337 43.337 2 0.043201 38101 QUIQUE_DMIX4_190116_001 80.462 59.591 97543000 0 0 0 0 0 0 0 67792000 0 29751000 0 0 0 52000 4296 48572 467966;467967 597622;597623 597623 2 YWGTPIPIVHCPVCGPTPVPLEDLPVTLPNIASFTGK Unmodified 4042.0737 0.073652581 3100 Q15031;E9PHM2 LARS2 Probable leucine--tRNA ligase, mitochondrial yes no 0 0 0 1 1 166.69 166.69 3 0.00010885 172807 QUIQUE_C1438_190116_001 40.326 36.252 29856000 0 0 0 12051000 17805000 0 0 0 0 0 0 0 0 52001 3100 48573 467968;467969 597624;597625 597625 2 YWKPTGTPK Unmodified 1076.5655 0.56548059 217 A0A0C4DFN3;Q99685;A0A3B3ITT3;C9JAM4 MGLL Monoglyceride lipase yes no 0 0 1 1 1 22.628 22.628 3 0.01241 15835 QUIQUE_C1438_190116_001 53.089 43.084 202040000 0 0 0 0 92993000 0 0 109050000 0 0 0 0 0 52002 217 48574 467970;467971 597626;597627 597626 2 YWLCAATGPSIK Unmodified 1365.6751 0.67510739 2787 P63244;J3KPE3;D6RAC2;H0YAF8;H0Y8W2;D6REE5;H0YAM7;D6RF23;H0Y8R5;H0Y9P0 GNB2L1 Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1;Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-2-like 1, N-terminally processed yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 88.807 88.807 2 0.00040847 91604 QUIQUE_DMIX5_190116_001 112.75 103.89 3715800000 303210000 352020000 418920000 290300000 357340000 267020000 298230000 219800000 217710000 108560000 313910000 274120000 294690000 52003 2787 48575 467972;467973;467974;467975;467976;467977;467978;467979;467980;467981;467982;467983;467984 597628;597629;597630;597631;597632;597633;597634;597635;597636;597637;597638;597639;597640;597641;597642;597643;597644;597645;597646;597647;597648 597645 20 YWLDTSEACAR Unmodified 1370.5925 0.59249998 4287 Q9NSY0;E9PR11 NRBP2 Nuclear receptor-binding protein 2 yes no 0 0 0 1 75.484 75.484 2 0.0284 77354 QUIQUE_C1438_190116_001 51.927 40.775 31234000 0 0 0 0 31234000 0 0 0 0 0 0 0 0 52004 4287 48576 467985 597649 597649 1 YWLEEAECR Unmodified 1254.5339 0.53392246 2674 P55884;C9JZG1;C9JQN7 EIF3B Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B yes no 0 0 0 1 1 1 1 76.539 76.539 2 0.020522 77307 QUIQUE_C1576_190116_001 70.919 60.089 159430000 42441000 42291000 0 0 0 38369000 36329000 0 0 0 0 0 0 52005 2674 48577 467986;467987;467988;467989 597650;597651;597652;597653 597653 4 YWLGWSQR Unmodified 1094.5298 0.52976379 3405 Q6UVY6;A6PVS1 MOXD1 DBH-like monooxygenase protein 1 yes no 0 0 0 1 93.876 93.876 2 0.033644 96309 QUIQUE_DMIX3_190116_001 64.567 47.791 70965000 0 0 0 0 0 0 0 0 70965000 0 0 0 0 52006 3405 48578 467990 597654 597654 1 YWLMLNEK Unmodified 1095.5423 0.54230231 4184 Q9H7Z7;A6NHH0;X6RJ95 PTGES2 Prostaglandin E synthase 2;Prostaglandin E synthase 2 truncated form yes no 0 0 0 1 1 1 1 100.06 100.06 2 0.0036361 102375 QUIQUE_DMIX1_190116_001 116.88 89.754 150580000 0 60647000 53907000 0 0 0 0 36028000 0 0 0 0 0 52007 4184 48579 467991;467992;467993;467994 597655;597656;597657;597658 597658 4 YWPDEYALK Unmodified 1183.555 0.55497548 2898 Q06124;A0A0U1RRI0 PTPN11 Tyrosine-protein 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597785;597786;597787;597788;597789;597790;597791;597792;597793;597794;597795;597796;597797;597798;597799;597800;597801;597802 597786 18 YYAGWADKYHGK Unmodified 1457.6728 0.67279921 1875 P05091;F8VP50 ALDH2 Aldehyde dehydrogenase, mitochondrial yes no 0 0 1 2 1 1 1 1 32.157 32.157 3;4 0.00089995 26255 QUIQUE_DMIX8_190116_001 81.92 69.862 1748300000 0 0 0 0 0 0 0 647710000 284190000 0 258980000 221140000 336300000 52024 1875 48595 468115;468116;468117;468118;468119;468120 597803;597804;597805;597806;597807;597808 597808 3 YYALCGFGGVLSCGLTHTAVVPLDLVK Unmodified 2909.482 0.48195724 1035 F8VVM2;F8VWQ0 SLC25A3 yes no 0 0 0 1 1 1 156.38 156.38 2 5.9557E-44 163685 QUIQUE_DMIX5_190116_001 179.74 163.34 196580000 0 0 0 0 0 0 0 33317000 0 0 118540000 44726000 0 52025 1035 48596 468121;468122;468123 597809;597810;597811;597812 597810 4 YYASEIAGQTTSK Unmodified 1417.6725 0.67252444 2470 P45954 ACADSB Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial yes yes 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 41.267 41.267 2 0.00061933 38187 QUIQUE_C1576_190116_001 104.79 97.667 918190000 104680000 0 87497000 65927000 106150000 120460000 99287000 0 121860000 0 102440000 0 109890000 52026 2470 48597 468124;468125;468126;468127;468128;468129;468130;468131;468132 597813;597814;597815;597816;597817;597818;597819;597820;597821;597822 597819 10 YYCETCCSK Unmodified 1269.4464 0.44642936 1223 H7BZK6;P62068 USP46 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46 yes no 0 0 0 1 17.168 17.168 2 0.020857 9210 QUIQUE_C1277_190116_001 62.582 54.163 9975800 0 9975800 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52027 1223 48598 468133 597823 597823 1 YYCFQGNQFLR Unmodified 1494.6714 0.671419 1839 P02790;Q9BS19 HPX Hemopexin yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 96.142 96.142 2 7.7057E-09 97152 QUIQUE_C1563_190116_001 157.58 146.41 1851700000 171470000 122600000 59725000 102340000 306200000 134900000 108520000 73393000 101660000 82760000 185580000 145390000 257130000 52028 1839 48599 468134;468135;468136;468137;468138;468139;468140;468141;468142;468143;468144;468145;468146 597824;597825;597826;597827;597828;597829;597830;597831;597832;597833;597834;597835;597836;597837;597838 597829 15 YYDAIACLK Unmodified 1115.5321 0.53213155 1381 O00170;E9PMH2;V9GYQ3 AIP AH receptor-interacting protein yes no 0 0 0 1 74.561 74.561 2 0.047293 74762 QUIQUE_C1403_190116_001 75.738 47.52 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 52029 1381 48600 468147 597839 597839 1 YYDDTYPSVK Unmodified 1249.5503 0.55028404 1034 F8VVA7;P61923;F8VXB1;F8W156;F8VYZ4;F8VUC5;F8VXR1 COPZ1 Coatomer subunit zeta-1 yes no 0 0 0 1 1 49.448 49.448 2 0.049548 46826 QUIQUE_DMIX8_190116_001 59.153 44.371 133200000 0 0 0 70416000 0 0 0 0 0 0 0 0 62787000 52030 1034 48601 468148;468149 597840;597841 597841 1 YYDEIINALEEDPAAQK Unmodified 1980.9317 0.93165225 1473 O15031 PLXNB2 Plexin-B2 yes yes 0 0 0 1 1 1 2 1 132.18 132.18 2;3 5.8079E-05 137252 QUIQUE_C1368_190116_001 126.34 108.15 148950000 0 0 23142000 0 0 0 34540000 0 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597862 5 YYDSRPGGYGYGYGR Unmodified 1729.7485 0.74848335 2838 P98179 RBM3 RNA-binding protein 3 yes yes 0 0 1 2 1 1 1 48.755 48.755 2;3 0.0024657 46551 QUIQUE_DMIX1_190116_001 86.014 76.359 239130000 0 0 0 0 0 0 0 87088000 31935000 0 57851000 62254000 0 52034 2838 48605 468172;468173;468174;468175;468176 597865;597866;597867;597868;597869 597866 4 YYEAADTVTQFDNVR Unmodified 1790.8111 0.81114318 1039 F8VXC8;Q8TAQ2;F8VZW6 SMARCC2 SWI/SNF complex subunit SMARCC2 yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 91.448 91.448 2 1.4834E-18 93673 QUIQUE_C1277_190116_001 146.16 116.69 398510000 0 50804000 0 0 80315000 57765000 0 61102000 72899000 0 0 75629000 0 52035 1039 48606 468177;468178;468179;468180;468181;468182;468183 597870;597871;597872;597873;597874;597875;597876;597877;597878 597872 9 YYEDNKQFFGR Unmodified 1465.6626 0.66262845 4442 Q9UI09;F8VRD8 NDUFA12 NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12 yes no 0 0 1 2 2 51.944 51.944 2;3 0.0058144 49094 QUIQUE_DMIX7_190116_001 112.84 99.667 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protein HSP 90-alpha yes yes 0 1 1 1 65.022 65.022 3 2.2677E-05 63756 QUIQUE_DMIX1_190116_001 94.384 91.047 99282000 0 0 0 0 0 0 0 99282000 0 0 0 0 0 52084 1931 48653 468470 598261 598261 1165 1 YYTSASGDEMVSLKDYCTR Unmodified 2244.9667 0.9667339 1931 P07900 HSP90AA1 Heat shock protein HSP 90-alpha yes yes 0 0 1 2 1 1 2 1 79.872 79.872 2;3 4.5509E-85 80529 QUIQUE_DMIX1_190116_001 186.56 180.91 929960000 0 0 0 0 0 0 0 382940000 125320000 0 141680000 145710000 134310000 52085 1931 48653 468471;468472;468473;468474;468475;468476;468477 598262;598263;598264;598265;598266;598267;598268;598269;598270;598271;598272 598264 11 YYTVFDR Unmodified 962.44978 0.44978213 358 A0A1B0GW44;A0A1B0GVD5;A0A1B0GWE8;P07339;A0A1B0GVP3;A0A1B0GV23;H7C469;H7C1V0 CTSD Cathepsin D;Cathepsin D light chain;Cathepsin D heavy chain yes no 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 64.46 64.46 2 0.019293 64355 QUIQUE_C1277_190116_001 114.02 93.741 4684700000 0 578320000 527610000 566730000 0 626020000 655380000 0 264200000 351170000 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